Index Sample Chr pos CIGAR ref_upstream ref/indel ref_downstream Q(indel) max_gtype Q(max_gtype) max2_gtype bp1_reads ref_reads indel_reads other_reads repeat_unit ref_repeat_count indel_repeat_count 0 CASAVA_Build X 106235 1D AAATCCTAAA G/- CTTTGTGTGG 3070 hom 76 het 33 0 23 10 G 1 0 1 CASAVA_Build X 108142 1I AGTGCTGTGC -/T TTTGATGTGC 3070 hom 60 het 33 0 20 13 T 3 4 2 CASAVA_Build X 111911 1I GTTTCCAAAC -/T TTTTTTTTTT 2887 hom 33 het 17 0 11 6 T 11 12 3 CASAVA_Build X 113063 1I AATTCTAACT -/C CCCCGCCCAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 4 5 4 CASAVA_Build X 134851 1I GGGTCGGGGG -/A ACGTGGGGAC 1593 het 1593 ref 15 10 4 1 A 1 2 5 CASAVA_Build X 141443 2I TTAATGGACT --/CA CAGTTCCACC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 CA 1 2 6 CASAVA_Build X 142009 8D23M2D ATGCACATGC ACACGTGTACACATGTACACACATGCACACATG/--------ACACATGTACACACATGCACACA-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 64 46 34 9 N/A 0 0 7 CASAVA_Build X 142226 2I ATACACATGT --/AC ACACATTTGC 3070 het 3070 hom 84 22 51 11 AC 2 3 8 CASAVA_Build X 143840 4D ATATGTATAT ACAC/---- ACACACATTT 2340 het 1071 hom 11 3 6 2 AC 5 3 9 CASAVA_Build X 157130 2D CATGTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 1443 het 1087 hom 23 5 7 11 TG 8 7 10 CASAVA_Build X 158115 4I CCACAGCTAA ----/TTGT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TTGT 0 1 11 CASAVA_Build X 166539 1I TGGAAGATCT -/G GAAATGAGAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 G 1 2 12 CASAVA_Build X 167218 1I TGGAAGATCT -/G GAAATGAGAT 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 G 1 2 13 CASAVA_Build X 167607 4I AACGGTCACT ----/CTCA CTGTCTGTCA 3070 het 2332 hom 31 10 14 7 CTCA 0 1 14 CASAVA_Build X 203240 13D TACAAAAAAA AAAAAAAAGAAAG/------------- AAAGAAAGAA 1345 het 1345 ref 13 7 4 3 AAAAAAAAGAAAG 1 0 15 CASAVA_Build X 204078 1I AGCGCGGGAC -/G GAGGCCTCTC 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 G 1 2 16 CASAVA_Build X 213782 1I TGTGTGTGTT -/G GGGGGGTGGT 2089 hom 20 het 12 0 7 5 G 6 7 17 CASAVA_Build X 217612 1I ATGGACTGGG -/C CCTCCTGCGG 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 C 2 3 18 CASAVA_Build X 217825 1I CCCTGGCTTT -/C TTTTTTTTGG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 0 1 19 CASAVA_Build X 222445 1D TCTTGTGCCA C/- CCCCCCCCAC 1724 hom 10 het 15 0 6 9 C 9 8 20 CASAVA_Build X 229023 4D TTAATTAACC CTGG/---- CTGGCTGGGC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTGG 3 2 21 CASAVA_Build X 240743 3I GGCGGGGACA ---/CTT CTTAATGTGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CTT 1 2 22 CASAVA_Build X 242035 4D GCCGTGCCGC CTCA/---- CTCACGCTCG 3070 hom 60 het 21 0 20 2 CTCA 2 1 23 CASAVA_Build X 271255 2D TCGAAAAAAT AA/-- AAATAAAAAT 545 het 426 hom 22 4 5 13 A 5 3 24 CASAVA_Build X 274360 3D CCTCAAGCAA TCC/--- TCCTGCCTCG 3011 hom 30 het 11 0 9 3 TCC 2 1 25 CASAVA_Build X 293813 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1270 het 1270 ref 15 7 5 3 A 11 10 26 CASAVA_Build X 305404 1I ACCCCCCCGC -/T CTCTGCTAAA 1628 het 254 hom 8 3 5 0 T 0 1 27 CASAVA_Build X 312329 4I ATGTATGATT ----/GATA GATTGGTTGA 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 GATA 0 1 28 CASAVA_Build X 314531 4D AAGGAGGGAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 GGAA 5 4 29 CASAVA_Build X 317729 2I ATACAGATAC --/AG AGAGAGACGT 3070 hom 7 het 19 0 11 8 AG 3 4 30 CASAVA_Build X 318026 2I AAACAGAGAG --/AT ACAGAGAGAC 2984 het 2984 ref 30 17 9 4 AT 0 1 31 CASAVA_Build X 318115 1I GAAAGGAAAG -/A AAAAACCCCC 2794 het 2794 ref 24 14 8 2 A 5 6 32 CASAVA_Build X 320348 2I CACACACAGG --/CA CACACAGATG 3070 hom 99 het 40 0 32 8 CA 3 4 33 CASAVA_Build X 320990 4I22M4D9M24D ACACGCCTGT ----ACACGTTCACACCCACAGACATATACAGACACACCTGCACACACACACACAGAGGCACA/ACACACACTTTCACACCAACAGACAT----AGACACACC------------------------ TGCACACACA 2797 het 2797 ref 45 51 6 8 N/A 0 0 34 CASAVA_Build X 321322 6D GCACACACAC GCTTGT/------ ACACATACAT 1144 het 1144 ref 36 25 5 8 GCTTGT 1 0 35 CASAVA_Build X 324629 1I GATGCCAGGA -/T TGGGGGGGAT 3070 het 3070 ref 46 20 14 12 T 1 2 36 CASAVA_Build X 325195 1I AACAATAAGA -/C ATTTACTGCT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 C 0 1 37 CASAVA_Build X 326825 3I36M8D TCATTTTCAG ---AAAAGAAGGGAGTTTTACATGGGATAGGGTGGTGTGAAATCAGC/AAAAAAAGAAGGGAGTTTTACATGGGATAGGGTGGTGTG-------- AAATCAGCAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 12 N/A 0 0 38 CASAVA_Build X 334572 4D CTCAAGGGAT CCTC/---- CCTCCCTTCT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 CCTC 2 1 39 CASAVA_Build X 336053 11I CAATGCCATT -----------/ATTTATGTCTC ATTTATGTCT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 ATTTATGTCTC 1 2 40 CASAVA_Build X 336738 4I41M4D TCTGAGGGAC ----TCTATCATCTGTCAATCAATCAATCAATCTCTCAATCTATTATGC/TCTATCTATCATCTGTCAATCAATCAATCCATCTCTCAATCTATT---- ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 45 25 18 25 N/A 0 0 41 CASAVA_Build X 337195 8D ATATAAATCA ATCAATCT/-------- ATCATCTATC 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 ATCAATCT 1 0 42 CASAVA_Build X 337283 4D60M4D CAATCTTTAT TATCTATCTATCATCTATCTACAGATCTATTTATTGACCCATTATCTATCTATCATCTATCTACCTAT/----TATCTATCATCTATCTACAGATCTATTTATTGACCCATTATCTATCTATTATCTATCTAC---- CTATCTAATC 3070 het 3070 ref 40 34 17 13 N/A 0 0 43 CASAVA_Build X 338010 4D ATCATCAATC ATCT/---- ATCTATATCA 3070 het 3070 ref 56 31 18 11 ATCT 2 1 44 CASAVA_Build X 338356 8I31M4I12M4D ATCAATTATC --------ATCTATATCAATTATGCATCATACCTATCAA----CTATCATCAATCATCT/AATCATCTATTTATATCAATTATGCATCATACCTATCAACTATCTATCATCAATC---- ATCTATATCA 3070 het 3070 ref 50 36 27 8 N/A 0 0 45 CASAVA_Build X 339245 6D TGTTTTCTTT TCTTTC/------ TTTTTTTTTT 3070 het 1499 hom 31 7 16 8 TCTTTC 1 0 46 CASAVA_Build X 341543 1D GTTTCCTGAC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 8 7 47 CASAVA_Build X 342389 2I GCATACGCCC --/AT ATGTGTGTCT 3070 hom 114 het 80 0 37 43 AT 1 2 48 CASAVA_Build X 342526 4D TGCGTGGGAG TGTA/---- TGTGCGTGTC 1595 het 1595 ref 94 80 6 9 TGTA 1 0 49 CASAVA_Build X 343018 4D GGATGTGTGT GTGA/---- GTGTGGGCAT 3070 het 3070 ref 80 42 25 18 GTGA 1 0 50 CASAVA_Build X 343070 2D CTGTGTGTCT GC/-- GTATACGCCT 3070 het 3070 ref 95 53 28 14 GC 1 0 51 CASAVA_Build X 343400 2I TGTATATGTG --/TC TGTGTGTGTG 3070 hom 118 het 62 1 54 7 TC 0 1 52 CASAVA_Build X 351927 1D CCAGATGGCA G/- GGGCAGAGAG 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 G 4 3 53 CASAVA_Build X 357745 1D TGTTGTACCT G/- GAGCGAGTTA 2145 het 2145 ref 24 15 5 5 G 2 1 54 CASAVA_Build X 360257 1I AAAAGAAAAA -/G AAAAAATCTG 2117 het 2117 ref 19 8 5 6 G 0 1 55 CASAVA_Build X 363300 1D TTGTTGGTAC G/- GGACCTGACT 3070 hom 72 het 26 0 24 3 G 3 2 56 CASAVA_Build X 370737 2I GGACGCTGAC --/TG TGCGTGAGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TG 1 2 57 CASAVA_Build X 370895 2D AGGCAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 10 A 12 10 58 CASAVA_Build X 383270 4D CACACAAAAT ACAC/---- ACAAACCACA 3070 het 3070 ref 68 37 25 9 AC 3 1 59 CASAVA_Build X 383738 2I ACACTAAACA --/CG CACACACACA 3070 het 3070 ref 62 28 23 11 CG 0 1 60 CASAVA_Build X 385389 1D AAACAAAACC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 8 7 61 CASAVA_Build X 386955 3I TCTATTATCT ---/ATC ATCTATTATA 2430 het 2430 ref 28 18 7 3 ATC 1 2 62 CASAVA_Build X 387076 4D TCTATCTATC ATCT/---- ATCTATCCAT 3070 het 3070 hom 42 12 25 6 ATCT 2 1 63 CASAVA_Build X 396915 4D TTCCCTCGCT TCTC/---- TCTCTTTCTT 2937 het 2937 ref 33 15 8 10 TC 4 2 64 CASAVA_Build X 397784 1I AGTTTCTTCT -/A GCCAAGGTTA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 0 1 65 CASAVA_Build X 398777 1D GGTAGCTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 35 0 28 9 T 10 9 66 CASAVA_Build X 424750 4I TCCTTCCTTC ----/CCTT CCTTCCTCCC 3070 het 2519 hom 38 15 15 8 CCTT 1 2 67 CASAVA_Build X 425364 10D TGAGGAGGTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 2345 het 562 hom 19 3 6 10 TTTTG 4 2 68 CASAVA_Build X 425947 2D CCCAAAGGGT AC/-- ACACCCTGCT 3070 het 3070 hom 22 8 10 6 AC 3 2 69 CASAVA_Build X 428020 4D TTGTGTTCAA CTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 18 1 14 4 CTTT 1 0 70 CASAVA_Build X 429287 1D TAATCAGCTG T/- TCATAACTTC 3070 hom 132 het 47 0 44 3 T 2 1 71 CASAVA_Build X 438394 1D TAGTAGAGAC A/- GGGTTTCACC 2138 het 1433 hom 12 4 5 3 A 1 0 72 CASAVA_Build X 444512 1D TTTTATTGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 32 hom 34 3 29 2 T 10 9 73 CASAVA_Build X 445388 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 6 7 74 CASAVA_Build X 447593 1D ATAAGTAGGT G/- GGTGGATGGT 3070 hom 187 het 69 0 60 10 G 3 2 75 CASAVA_Build X 449327 3D TGCTGCTAAC ATT/--- GTGTTTTACA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 ATT 1 0 76 CASAVA_Build X 452118 1I ATCTCTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 26 1 14 11 A 15 16 77 CASAVA_Build X 452706 1D AATACAGGAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 7 6 78 CASAVA_Build X 459860 12D CATAGATAGA TGATTGATTGAT/------------ TGATTGATTG 3070 hom 130 het 47 0 43 17 TGAT 7 4 79 CASAVA_Build X 460042 2D ATAGAGAGAC AA/-- AGAGATAGAG 3070 hom 153 het 58 0 50 10 A 3 1 80 CASAVA_Build X 460261 8I40M11D AGGTAGATGA --------TAGATAGCTAGATAGATGATAGATAGATAGGCAGATAGATAGATGGTAGAC/TAGATAGCTAGATAGCTAGATAGATGATAGATAGATAGGCAGATAGAT----------- AGATAGATGA 3070 hom 30 het 23 0 11 23 N/A 0 0 81 CASAVA_Build X 460724 3D TAGATAGATA GAT/--- AGATAGATAG 1051 hom 7 het 10 0 3 8 GAT 1 0 82 CASAVA_Build X 461383 10D2M1D4M3D ATATAGATAA TGATTGATGGATAGATAAAT/----------AT-GATA--- GATGGATAGA 2363 het 1970 hom 35 6 7 25 N/A 0 0 83 CASAVA_Build X 463479 10D TCTCTCTCTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3062 hom 8 het 19 0 13 9 T 23 13 84 CASAVA_Build X 475825 1I AGACCAGCCT -/G GCCAACGTGG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 G 1 2 85 CASAVA_Build X 477934 2D TTACACAGCA AC/-- AGCTGACTCA 3070 het 3070 ref 61 30 26 6 AC 1 0 86 CASAVA_Build X 481598 2I CAGACTGTCA --/CT CTGGGGAGCC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 CT 1 2 87 CASAVA_Build X 481688 6D TATAACGGCG AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 AAT 8 6 88 CASAVA_Build X 481899 1D CAATTGTGTG T/- GGGCATTTTC 3070 het 3070 ref 54 27 17 11 T 1 0 89 CASAVA_Build X 482482 2I TCTTTCTCTT --/TC TTTCTTTCTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TC 0 1 90 CASAVA_Build X 482551 2D TTTTTCTTCT TC/-- TCTTTCTTTC 2944 hom 15 het 9 0 6 3 TC 2 1 91 CASAVA_Build X 484628 22D AGGCTGAGGC AGTGGGACTGCTCAAGCCGAGG/---------------------- AGTTCAAGCC 2091 het 2091 ref 29 26 6 3 AGTGGGACTGCTCAAGCCGAGG 1 0 92 CASAVA_Build X 485095 1D AGGCTGAGGC A/- GGAGGATGAC 3070 het 1810 hom 19 5 13 1 A 1 0 93 CASAVA_Build X 485199 1D CTACAAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 8 7 94 CASAVA_Build X 497275 1I AGTCAGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 9 95 CASAVA_Build X 501842 1D AAACAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 35 0 28 7 A 11 10 96 CASAVA_Build X 504871 1I CCTGGGATCC -/T TGGCTCGTCT 1447 het 1447 ref 21 7 5 9 T 1 2 97 CASAVA_Build X 506451 4I TCTATCTCTG ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 65 het 30 0 21 9 TC 6 8 98 CASAVA_Build X 506719 4D TCTCTGTATC TCTG/---- TCTATCTCTG 444 het 444 ref 9 5 1 4 TCTG 1 0 99 CASAVA_Build X 507795 4D TCCCTCTCTC CTCT/---- CTCTCTCTTT 3070 hom 60 het 23 0 20 5 CT 6 4 100 CASAVA_Build X 510127 2D TGTCTCTCTT TC/-- TCTCTCTCCA 3070 het 3070 ref 47 20 15 13 TC 5 4 101 CASAVA_Build X 515062 1I CACTCTCCTT -/A AAAAAAAAAA 2726 het 2726 ref 26 13 8 5 A 11 12 102 CASAVA_Build X 518992 1I TTCTTCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 10 12 T 11 12 103 CASAVA_Build X 527683 2I CAGCCCTAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 12 14 104 CASAVA_Build X 529625 1D5M2D CTCTCCCTTC TCCTTCCT/-CCTTC-- TCCTTCCTTC 1839 hom 36 het 18 0 8 11 N/A 0 0 105 CASAVA_Build X 531842 1I TTGTTATTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 29 0 20 9 T 9 10 106 CASAVA_Build X 532147 1D CAAACAAACA G/- AAAAAAAAAC 3070 hom 30 het 15 0 11 4 G 1 0 107 CASAVA_Build X 533618 10I CATCTCCAGC ----------/CTTGACCAAG CTGTTTTTTA 3070 hom 132 het 50 0 43 7 CTTGACCAAG 0 1 108 CASAVA_Build X 543630 2I TGTGAATCTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 TG 5 6 109 CASAVA_Build X 543863 2I16M2I ATATAGTGTG --TATATATGTGCATCTA--/TATATATATGTGCATATATG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 34 26 10 3 N/A 0 0 110 CASAVA_Build X 548403 1D AAATGCAGGA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 T 7 6 111 CASAVA_Build X 554587 1D CGTCTCTACT A/- AAAAATACAA 2740 hom 15 het 6 0 6 0 A 6 5 112 CASAVA_Build X 555288 1D ATTTTGTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 10 9 113 CASAVA_Build X 555746 2D ACAAAAAGAA AG/-- TAAAGGCCAG 2563 het 2563 ref 18 9 7 3 AG 1 0 114 CASAVA_Build X 562405 4I GGGAGAGAAG ----/AGAA AGACAGAGAG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 AGAA 0 1 115 CASAVA_Build X 562789 4D AAAAAGGGAA AGAG/---- AGAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 14 8 AG 5 3 116 CASAVA_Build X 564152 1I GATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2318 het 2318 ref 27 12 8 7 T 11 12 117 CASAVA_Build X 566236 4D46M4D TCTTTTTCTT TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTCTTTCTTTTC/----TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTCTTTCT---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 26 16 10 5 N/A 0 0 118 CASAVA_Build X 568747 1D CGCTTGAGCC T/- AGGAGTTTGA 3070 het 3070 ref 20 9 7 5 T 1 0 119 CASAVA_Build X 575186 1D CTCAAAAAAA T/- AAATAAATAA 612 het 165 hom 9 1 2 6 T 1 0 120 CASAVA_Build X 584080 1D AAAGGGCTGT G/- GACTGTAGGT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 G 2 1 121 CASAVA_Build X 585992 1D AGAACAAACA G/- GGTCAAGCCT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 G 3 2 122 CASAVA_Build X 595790 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 63 het 25 0 20 5 A 7 6 123 CASAVA_Build X 595876 2I AGAGCAAAAG --/CA CCCTCACAGA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 CA 0 1 124 CASAVA_Build X 602577 1I GCTCAATGGG -/A AAAAAAAAAT 1916 het 1916 ref 15 7 5 3 A 9 10 125 CASAVA_Build X 612027 3D CTGGGATTAC ACG/--- AGGTGTGTGC 1844 hom 10 het 4 0 4 0 ACG 1 0 126 CASAVA_Build X 615235 1D CAGAGAGAGT G/- GGGGGGCCCT 3070 het 1568 hom 27 7 14 6 G 7 6 127 CASAVA_Build X 617621 2D AGTGTATTGA GT/-- GTGTACAAGT 3070 het 3070 hom 71 25 41 6 GT 3 2 128 CASAVA_Build X 620994 1I GAAACATATA -/T TGGGGATGCC 3070 het 2763 hom 26 8 12 6 T 1 2 129 CASAVA_Build X 625041 3D GAAAATCATG TTT/--- TTATCATATA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 T 5 2 130 CASAVA_Build X 630003 6D GAGAAAAAAT AAAGAG/------ AAAGAAGAAA 2067 het 2067 ref 16 10 5 4 AAAGAG 1 0 131 CASAVA_Build X 634360 1D GTGTGGAGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 A 9 8 132 CASAVA_Build X 643246 1D GAGTTCAACA T/- TTTTTTTTTT 2818 het 2818 ref 33 23 7 3 T 13 12 133 CASAVA_Build X 650268 2D ACTTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTAA 2915 het 2915 ref 25 13 7 5 T 10 8 134 CASAVA_Build X 655735 1D TTTTTTGGGG A/- GGGGGGACAG 154 het 154 ref 18 6 3 9 A 1 0 135 CASAVA_Build X 656898 1I TACTACGTGC -/A GGTGCTCTGC 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 0 1 136 CASAVA_Build X 657281 1I TCCGAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 10 137 CASAVA_Build X 661464 4D GATGATAGAT AGAC/---- AGACAGACAG 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 AGAC 4 3 138 CASAVA_Build X 664240 1I TTTTTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 2294 het 815 hom 15 3 7 5 T 11 12 139 CASAVA_Build X 665901 4D TCTCTCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 1841 hom 29 7 16 7 TCTT 4 3 140 CASAVA_Build X 666966 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 30 3 15 13 A 11 10 141 CASAVA_Build X 706609 1D ACAGATGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 494 hom 28 2 19 7 A 11 10 142 CASAVA_Build X 706657 1I TTTTTTTTTT -/C CTGCCTTCTG 1865 het 1240 hom 23 3 8 12 C 1 2 143 CASAVA_Build X 709671 1D AGTCTATTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 231 hom 33 7 16 10 T 9 8 144 CASAVA_Build X 711317 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 2510 het 54 hom 19 1 12 6 A 15 16 145 CASAVA_Build X 712710 5D AAAAAAAAAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 1116 het 154 hom 24 2 9 14 AAAGA 3 2 146 CASAVA_Build X 714732 1I GGGTTCAAGC -/A ATCCTCCTTC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 A 1 2 147 CASAVA_Build X 715879 1D AAAAGTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 11 10 148 CASAVA_Build X 721877 1D GTATAAATTC T/- TTTTTTTTTT 2325 het 2186 hom 35 12 9 14 T 17 16 149 CASAVA_Build X 722454 10D GATTCTGAGT GTGTGTATGA/---------- GTGTGTATGA 3070 het 3070 ref 56 33 20 9 GTGTGTATGA 2 1 150 CASAVA_Build X 723373 4I TGATCTTATA ----/TTTG TTAATACGTA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TTTG 0 1 151 CASAVA_Build X 727857 1D GAAATATATG T/- TTATGTTTAA 2411 het 1860 hom 9 4 5 0 T 3 2 152 CASAVA_Build X 730272 4D TCTCTTCTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2937 het 2937 ref 26 12 7 7 TTTC 5 4 153 CASAVA_Build X 735885 4D TCCTTTCTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3015 het 2974 hom 20 9 8 3 TCTT 3 2 154 CASAVA_Build X 737671 1I ACTGGATTTC -/T TTTTTTTTTT 2623 het 2473 hom 32 9 8 15 T 14 15 155 CASAVA_Build X 744719 1I TCTTTAATGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 T 7 8 156 CASAVA_Build X 745974 2D CACACGATCA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 AC 6 5 157 CASAVA_Build X 746832 3I CACAACACAC ---/AAG AGACACACGC 2314 het 2314 ref 37 27 6 4 AAG 0 1 158 CASAVA_Build X 753188 2I45M2D GTGCGTGTAC --GTGTGTGTGCACGCACGTGTGTGTGCATGTGTGTGTGACTGTGCCTG/GTGTGTGTGTGCACGCACGTGTGTGTGCATGTGTGTGTGACTGTGCC-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 55 27 28 12 N/A 0 0 159 CASAVA_Build X 767671 1D CCGAGTAGCT G/- GGACTACAGG 1994 hom 12 het 5 0 5 0 G 3 2 160 CASAVA_Build X 775036 1I TTCTCCCACC -/A TTCTCTCAGT 1339 het 1339 ref 39 31 4 5 A 0 1 161 CASAVA_Build X 775157 3D ACAGATGATT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 42 8 18 20 TTG 7 6 162 CASAVA_Build X 775910 4I GACATTGTCT ----/CAAA CAAACAAACA 3030 het 3030 ref 31 14 12 5 CAAA 3 4 163 CASAVA_Build X 778808 3D11M3I TCTTAGAATT CTCCTAGTAACAAG---/---CTAGTGACAAGCGT CTGCTTCTTC 3070 het 3070 ref 59 34 9 20 N/A 0 0 164 CASAVA_Build X 779987 6D CCTCCTTCTT TTCTCC/------ TTCTCCTTCT 3032 het 3032 ref 55 16 8 33 TTCTCC 3 2 165 CASAVA_Build X 780037 12D TCCTCCTCTC CCTCCTCTGCTT/------------ CTTCTCCTTC 383 het 383 ref 38 27 2 16 CCTCCTCTGCTT 1 0 166 CASAVA_Build X 788863 8D30M1D TCCATCTCCA ATACATACATACATACATACATACATACATAAAATTAAG/--------ATACATACATACATATATACATAAAATTAA- AGTTGTTCAG 1730 het 1730 ref 36 35 4 7 N/A 0 0 167 CASAVA_Build X 790091 4D ATATGCAGAT AGGG/---- AGGCAGCTAG 3070 het 3070 ref 88 43 37 15 AGGG 1 0 168 CASAVA_Build X 790807 2I TCCCTGAGAC --/TG TGTGGTTTAT 3070 het 3070 ref 58 31 23 7 TG 2 3 169 CASAVA_Build X 792355 1D TTTACAGTCC T/- TTTTTTTTTT 2713 het 1379 hom 19 8 7 4 T 13 12 170 CASAVA_Build X 795177 4D TGGATGGATA ATAG/---- ATAGAGGATG 1859 het 1859 ref 40 35 4 4 ATAG 2 1 171 CASAVA_Build X 795242 8I ATAGACAGCT --------/AGCTAGCC AGATGGATAG 3070 het 3070 ref 77 47 15 15 AGCTAGCC 0 1 172 CASAVA_Build X 795400 12I AAATACATAT ------------/ATAGATAGATGG ATAGATGGAT 1314 het 1314 ref 62 46 3 13 ATAGATAGATGG 0 1 173 CASAVA_Build X 795448 4I TAGGTGATAG ----/ATAC TAGAGAGATG 1356 het 1356 ref 66 46 6 20 ATAC 0 1 174 CASAVA_Build X 795575 11D TAGATAGCTA CAGGGATAGAT/----------- GATAGGTAGA 1531 het 1531 ref 53 41 4 10 CAGGGATAGAT 1 0 175 CASAVA_Build X 795634 1D CAATAGATAA T/- ATATATAGAT 42 het 42 ref 51 37 1 14 T 1 0 176 CASAVA_Build X 800705 31I TCATTATTTT -------------------------------/CCGCAAGTTGTAACCCTTGGCAAATCATTTC CCCCAAGTTT 3070 het 3070 ref 33 19 13 2 CCGCAAGTTGTAACCCTTGGCAAATCATTTC 0 1 177 CASAVA_Build X 801523 1D CAGATTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3024 het 1742 hom 19 6 10 3 T 12 11 178 CASAVA_Build X 813765 4D TTGTTAATAT AATA/---- AATATTCTAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AATA 2 1 179 CASAVA_Build X 815815 11I CAAAAACAGA -----------/GTGTCTTAGGG GTGTCTTAGT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 GTGTCTTAGGG 0 1 180 CASAVA_Build X 819369 1I TAATGAGGGT -/G GGTGTCCCAA 3070 hom 87 het 32 0 27 5 G 2 3 181 CASAVA_Build X 819908 2I TTCTCCTCTT --/TC TCTCTCTCTC 2745 het 2239 hom 21 8 7 6 TC 7 8 182 CASAVA_Build X 824200 4I43M2I TAAAGAGAAG ----GAGAGATAAAGAAACAGAGTCAGCGGCTCTTCATTTGCTGGTC--/GAGAGAGAGATAAAGAAACAGAGTCAGCGGCTCTTCATTTGCTGGTCCA CACACACAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 19 N/A 0 0 183 CASAVA_Build X 827418 2I3M1D CGGTGCAAAT --TGCT/GATGC- CCCCAATTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 N/A 0 0 184 CASAVA_Build X 829687 2D AGACTCAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 25 0 18 7 T 12 10 185 CASAVA_Build X 831106 1D AGTTTTTAGA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 8 7 186 CASAVA_Build X 833168 1D TTTCTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 1347 het 1347 ref 40 32 3 5 A 11 10 187 CASAVA_Build X 841370 2D TTGCAGGGAA GG/-- GGGGGGGGAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 10 8 188 CASAVA_Build X 843500 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1833 hom 23 6 15 2 A 10 9 189 CASAVA_Build X 849234 1D GGGAATGATC T/- TTAAAAAATT 3070 het 3070 ref 51 34 13 4 T 3 2 190 CASAVA_Build X 849538 1D GTGAAAGCAA T/- TGGATTTCAC 3070 het 3070 ref 76 35 30 11 T 2 1 191 CASAVA_Build X 851344 2D TCCTCCGTCT GG/-- GGGATACACC 3070 het 3070 ref 65 44 19 4 G 5 3 192 CASAVA_Build X 853641 1I AGCAGAAGCA -/C AGCCATGAAG 3070 het 3070 ref 81 43 24 14 C 0 1 193 CASAVA_Build X 854331 4D AAAAAAAAAA AGAT/---- GTAACGAAGT 3070 het 3070 hom 45 15 16 15 AGAT 1 0 194 CASAVA_Build X 854436 4D GGCTTGCCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 16 14 T 15 11 195 CASAVA_Build X 854625 1D TCCAGCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 62 23 12 27 A 11 10 196 CASAVA_Build X 856491 2I GTCCTCCCTC --/TG TGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 56 35 14 7 TG 4 5 197 CASAVA_Build X 856765 1D GAGAGAAGGG A/- GCCATCATTT 3070 het 3070 ref 70 43 17 10 A 1 0 198 CASAVA_Build X 857845 1D CCAAGACATG C/- AACCAAACCA 3070 het 3070 ref 76 49 17 10 C 1 0 199 CASAVA_Build X 859345 2D ACACACACAC AT/-- ATATACCCTA 2666 het 2666 ref 23 12 9 3 AT 3 2 200 CASAVA_Build X 859522 1D TGTGGTTGTT G/- AAAGTGCCAG 3070 het 3070 ref 54 34 15 9 G 1 0 201 CASAVA_Build X 861021 1D AGAGGTCAGA G/- TGAAAGAAAC 3070 het 3070 ref 56 34 10 14 G 1 0 202 CASAVA_Build X 861063 1I AGAAAAAGGC -/T ACCTTGACAG 2891 het 2891 ref 47 30 8 10 T 0 1 203 CASAVA_Build X 869873 1I ATAACACACT -/G GGGGGGGATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 7 8 204 CASAVA_Build X 870485 3D CGAGCCTCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 38 1 13 24 T 19 16 205 CASAVA_Build X 873583 4I AAAGAAAAGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 3070 hom 27 het 15 0 10 5 AAGG 3 4 206 CASAVA_Build X 873880 1D GAAGGAAATA T/- TTTTGTAGAC 3070 hom 96 het 38 0 31 7 T 5 4 207 CASAVA_Build X 876984 4D CTTCCTATCA ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 ATCT 3 2 208 CASAVA_Build X 877741 4I TATGTATGTG ----/TGTA TGTATGTATG 3070 hom 208 het 94 0 70 24 TGTA 3 4 209 CASAVA_Build X 877999 4I TATCTATCTC ----/ATCT ATCTTTCTGT 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 ATCT 1 2 210 CASAVA_Build X 878627 4I GGCACGGGGT ----/CCTG CCTTTGTGCA 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 CCTG 0 1 211 CASAVA_Build X 878822 2D TTTCCAAGCA GC/-- GACTCTGAGA 3070 het 3070 ref 66 33 28 5 GC 1 0 212 CASAVA_Build X 879020 1I CCAGAAAGGG -/A GTCTTGCTCC 3070 het 3070 ref 37 27 8 4 A 0 1 213 CASAVA_Build X 884960 1D CCGTGTGTAT A/- TATAAAGACA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 1 0 214 CASAVA_Build X 885141 2I CTTTTTCTTT --/TC TTTTTTTTTT 838 hom 4 het 11 0 5 6 TC 0 1 215 CASAVA_Build X 885504 4D ATATAATAAA ATAT/---- ATATTTTAAG 1144 het 381 hom 6 1 4 1 AT 4 2 216 CASAVA_Build X 888610 1D ACCCTGATCC T/- TCTTTTTTTT 3070 het 410 hom 27 3 15 9 T 2 1 217 CASAVA_Build X 896171 4D ATTTTTCCTG CTGA/---- CTAAGAAATT 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 CTGA 1 0 218 CASAVA_Build X 896545 1D GTGCCCAGCC T/- TCCAGTTTGC 3070 het 3070 ref 35 18 11 8 T 2 1 219 CASAVA_Build X 896750 1I CTCAATCCAG -/T ATTTTAGGTT 3070 het 3070 ref 54 33 18 3 T 0 1 220 CASAVA_Build X 898310 1I GCACCTGATG -/A ACTTCTTTAT 3030 het 3030 ref 28 18 7 3 A 1 2 221 CASAVA_Build X 908515 4I CTGTTTTCTT ----/TCTC TCTTTCTTTG 3070 hom 24 het 13 0 9 4 TC 1 3 222 CASAVA_Build X 915608 1D AGGCAGGTCT G/- CATGGCTAGC 2994 het 2994 ref 32 18 8 6 G 1 0 223 CASAVA_Build X 916047 2D TGGCCAAGGT CC/-- CCCCGTTAGC 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 C 6 4 224 CASAVA_Build X 922372 4D12M4D TCTATGTACT TATCTATCTATCTGCTTGTC/----TATCTATCTGCT---- TGTCTGTCTA 3070 het 3070 ref 42 24 13 10 N/A 0 0 225 CASAVA_Build X 922497 4I TGTCTATGTG ----/TCTA TCTATCTGTG 3070 hom 58 het 31 0 20 12 TCTA 1 2 226 CASAVA_Build X 922658 4D CATCTATCAT ATCA/---- ATCAATTGAT 3070 het 3070 hom 51 19 29 6 ATCA 2 1 227 CASAVA_Build X 922967 4D GATCTCTTTA TCTG/---- TCTATCTCTT 440 het 440 ref 40 26 5 10 TCTG 1 0 228 CASAVA_Build X 924550 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1800 hom 26 9 11 7 A 17 16 229 CASAVA_Build X 926130 2D CAAAAGAGGA AC/-- AGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 AC 1 0 230 CASAVA_Build X 927899 1I GAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 9 10 231 CASAVA_Build X 928608 1D TTCAGAATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 4 A 10 9 232 CASAVA_Build X 931179 16D CCGGGAGGCG GAGGTTGCAGTGAGCT/---------------- GAGATCGTGC 2180 het 350 hom 7 1 6 2 GAGGTTGCAGTGAGCT 1 0 233 CASAVA_Build X 932401 3I AGCCTGGAAA ---/AAG AAGAAGTCTC 3070 het 3070 hom 52 19 23 10 AAG 2 3 234 CASAVA_Build X 935900 4D ATTTATAATT TTTA/---- TTTATTTATT 1206 het 1206 ref 10 6 3 2 TTTA 5 4 235 CASAVA_Build X 939403 8D AAAAGAAATA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 33 15 18 4 AAAC 6 4 236 CASAVA_Build X 939866 1D TTATAGTTAA T/- TTTTTTTCAG 2948 het 2948 ref 18 10 7 1 T 8 7 237 CASAVA_Build X 941973 1D TGAATATATC T/- TTTTTTGGGA 3070 hom 74 het 28 0 25 3 T 7 6 238 CASAVA_Build X 946480 4D TCTGTTCCTC GTTA/---- GTTACCACGT 3070 hom 90 het 33 0 28 7 GTTA 2 1 239 CASAVA_Build X 947410 1I AGAGTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 19 1 16 2 A 10 11 240 CASAVA_Build X 948422 1D54M2I TTGTATTTTT AGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCA--/-GCAGAGATGCGGTCTTGCTATATTACCTATGCTGGTCTAAAACTCCTGGGCTCAAG TGATCCACCC 2020 het 1152 hom 6 5 5 2 N/A 0 0 241 CASAVA_Build X 948685 1D AGGCTAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 12 11 242 CASAVA_Build X 951649 3I GACAGAAAAA ---/AAG AAAGAGAGAA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 AAG 0 1 243 CASAVA_Build X 953703 1D GAGTTCAAGA C/- CAGCCTGGCC 1706 het 1210 hom 14 5 5 4 C 2 1 244 CASAVA_Build X 1130505 2D TATGCGTCTG TC/-- TGTGCATGCA 3070 het 3070 ref 94 51 32 13 TC 1 0 245 CASAVA_Build X 1130639 2D12M8D ATTGTGTGTG CATATGCACGTGTGTTTGTGTA/--TGTGCACATGGG-------- TATGCATGCT 3070 het 3070 ref 71 56 18 17 N/A 0 0 246 CASAVA_Build X 1131804 2I GAGAGAGAGG --/GA GAGAGAGGGA 3070 hom 92 het 38 0 27 11 GA 3 4 247 CASAVA_Build X 1138902 3D AAAGAGAAGA AAG/--- AAGAAAGAAA 2453 het 2453 ref 26 15 8 5 AAG 2 1 248 CASAVA_Build X 1139247 1D ATCTTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2171 hom 20 8 9 3 T 11 10 249 CASAVA_Build X 1139524 1D TTTTTCTTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 T 8 7 250 CASAVA_Build X 1139802 1D TCTTCCCGTA G/- GGTAAATTTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 G 3 2 251 CASAVA_Build X 1140317 2D CCTCAAAGTG TC/-- TCTCTTATCT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 TC 3 2 252 CASAVA_Build X 1145414 4I CAGATAATAC ----/ATAG ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 ATAG 3 4 253 CASAVA_Build X 1147367 4I GGTGCAGGTA ----/TAGG TACAGGTGCA 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 TAGG 0 1 254 CASAVA_Build X 1147446 12D CAGTGCAGAC ACAGGTACAGGT/------------ ACAGGTACAG 2824 het 2824 ref 39 20 12 12 ACAGGT 5 3 255 CASAVA_Build X 1149917 2D CCACACACTA AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 85 50 25 11 AC 5 4 256 CASAVA_Build X 1150073 4I ACATACCACA ----/CACT CACTAACACA 3070 het 3070 ref 79 43 29 7 CACT 1 2 257 CASAVA_Build X 1155786 2I AAACTTAAAC --/AA GAGAGAGAAC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 0 2 258 CASAVA_Build X 1156459 1D ATCCAGGTGT G/- GGGCAGGGCT 2736 het 2497 hom 21 8 8 5 G 4 3 259 CASAVA_Build X 1165442 3I GGGGGATGGT ---/CTC CTACACAGGA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 CTC 0 1 260 CASAVA_Build X 1171003 1I61M4D AGAAAGAAAG -AAGAAGGAGAAAGAAAGAAGAGAGAGGAAAGGAAGGAAGGATGGAAGGAAGGGAAAGAAAGAGAA/AAAGAAGGAGAAAGAAAGAAGAGAGAGGAAAGGAAGGAAGGATGGAAGGAAGGGAAAGAAAG---- AGAAAGAAAG 3070 het 895 hom 28 4 18 19 N/A 0 0 261 CASAVA_Build X 1171891 2D AGAGAGAGAG AC/-- CAAGACCCAC 3070 hom 49 het 32 0 21 11 AC 1 0 262 CASAVA_Build X 1172761 4I CTCCAGCTGG ----/CTCT CTGAGAGTGT 3070 hom 53 het 20 0 15 7 CT 1 3 263 CASAVA_Build X 1179301 1D AGAAAAGAGG A/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 1 0 264 CASAVA_Build X 1179893 4I ACAGAAAGAG ----/AGAC AGACAGAAAG 3070 het 17 hom 36 1 23 12 AGAC 1 2 265 CASAVA_Build X 1181658 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 2615 het 559 hom 10 2 7 1 AT 6 7 266 CASAVA_Build X 1183957 2D AAGGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 2171 hom 13 het 11 0 7 4 AG 7 6 267 CASAVA_Build X 1280177 2D TTTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 83 het 41 0 28 13 TG 10 9 268 CASAVA_Build X 1280529 4D TTAGATAGAT AGAG/---- AGACAGACAG 3070 hom 166 het 60 0 56 6 AG 3 1 269 CASAVA_Build X 1288037 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 2350 het 1152 hom 8 3 5 0 T 5 6 270 CASAVA_Build X 1298199 4D ATAGATAGAC AGAT/---- AGATAGATAT 3070 het 3070 hom 49 19 17 15 AGAT 3 2 271 CASAVA_Build X 1312194 1I ACTCCGTCAG -/A AAAAAAAAAA 2317 het 200 hom 16 1 9 7 A 10 11 272 CASAVA_Build X 1318082 3I GGCAACAGAG ---/AGA AGCTCTGTCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AGA 0 1 273 CASAVA_Build X 1318509 1I TAAATTAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 8 9 274 CASAVA_Build X 1329965 4I GGTGATAGAT ----/GATA GATAAACATA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 GATA 1 2 275 CASAVA_Build X 1330026 4I TGATAGGTGA ----/TATC TATCTAGGTA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 TATC 1 2 276 CASAVA_Build X 1344833 2I TATAATCTTC --/TT TTTTTTTTTT 1479 hom 10 het 11 0 4 7 T 10 12 277 CASAVA_Build X 1347357 2D TGTGTGGAGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 148 het 58 0 47 17 TG 6 5 278 CASAVA_Build X 1348536 10D AAAAGAAAAA AAAAGAGATG/---------- AAAAGAGATG 1926 het 89 hom 13 1 7 6 AAAAGAGATG 2 1 279 CASAVA_Build X 1352165 1D CAAGACAGAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 A 8 7 280 CASAVA_Build X 1358671 2D GACACAACCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 T 12 10 281 CASAVA_Build X 1361105 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 A 9 10 282 CASAVA_Build X 1361493 1I TTTCCCCAAA -/T TCACCTCCCT 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 T 1 2 283 CASAVA_Build X 1364216 1D GGGACGTCCT G/- GGGCCATGTG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 G 4 3 284 CASAVA_Build X 1367797 2D TGTTCACCTC AT/-- GTGAAGAATT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 AT 1 0 285 CASAVA_Build X 1370169 3D GCCTTTCTTC TTT/--- TTTCTTCCTT 3070 hom 50 het 21 0 12 9 T 6 3 286 CASAVA_Build X 1372115 4I TGTTTGTTTG ----/TTTC TTTGTTTTTC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TTTC 0 1 287 CASAVA_Build X 1373941 1I TAGACAAGAA -/G GAGACCCTGC 73 het 73 ref 68 36 3 29 G 1 2 288 CASAVA_Build X 1377643 10D GTAACCCCAC ATGACCCCCA/---------- GTGTAACCCT 3070 hom 39 het 15 0 12 5 ATGACCCCCA 1 0 289 CASAVA_Build X 1378511 3D CAATTTCTGT TTC/--- AGAAAATAAA 2523 het 1431 hom 16 5 7 5 TTC 1 0 290 CASAVA_Build X 1378955 1D CTAAAAATAC A/- ACAAAAATTA 1251 het 1239 hom 10 4 3 3 A 2 1 291 CASAVA_Build X 1379123 5D AAAAATAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 2801 het 1442 hom 13 4 7 2 AAATA 3 2 292 CASAVA_Build X 1389260 1D CATCACATTT A/- AAAAAAAAAA 1339 het 1058 hom 14 4 4 6 A 15 14 293 CASAVA_Build X 1408974 1I13M3D ATGTCCAGCT -CATTTTTTTCTTTTTC/AAATTTTTCTCTTT--- TTTTTGAGAC 3070 het 3070 hom 21 10 10 2 N/A 0 0 294 CASAVA_Build X 1411433 1D CGGTGTTTGG T/- TTTTCTGTTC 3070 het 2230 hom 20 7 9 4 T 5 4 295 CASAVA_Build X 1411951 1D TCGTGATACG C/- CCACCTCGGC 3070 het 874 hom 19 4 14 1 C 3 2 296 CASAVA_Build X 1420195 1D CTCCATCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 13 12 297 CASAVA_Build X 1420268 2I7M2D ATGTACACAC --GTGCAAGCA/ATGTGCAAG-- CACACACACA 3070 hom 150 het 52 0 50 12 N/A 0 0 298 CASAVA_Build X 1420438 2I9M4D CACACTCTGA --TGTGCATGCATGT/CTTCTACATGC---- GCAAAGGCGC 3070 hom 213 het 72 0 68 11 N/A 0 0 299 CASAVA_Build X 1427247 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 8 9 300 CASAVA_Build X 1427779 3I TCCCTTTCGT ---/TTC TTTCTTTTCC 1419 het 1419 ref 16 9 4 3 TTC 0 1 301 CASAVA_Build X 1430233 1I TTTTATTTTT -/A TTTTTTGAGA 3038 het 1990 hom 17 6 8 3 A 0 1 302 CASAVA_Build X 1461564 1I GATAAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 2027 het 2027 ref 21 10 6 5 T 13 14 303 CASAVA_Build X 1470034 1I GTTAAAATAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 2248 hom 19 5 12 2 T 8 9 304 CASAVA_Build X 1472127 3I TCATTTTTTT ---/CTC CCTTCCTTTT 2574 het 2574 ref 17 7 6 4 CTC 0 1 305 CASAVA_Build X 1472744 2I CCTGTTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 16 7 T 12 14 306 CASAVA_Build X 1473985 1I GGAGTTTGCT -/G GGGGAGCTGC 1977 het 1977 ref 19 9 6 4 G 4 5 307 CASAVA_Build X 1476875 1D ACAGACTCTT A/- AGAGTCCAGA 3070 het 2492 hom 24 6 12 6 A 2 1 308 CASAVA_Build X 1477056 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 1612 hom 18 4 11 3 A 7 8 309 CASAVA_Build X 1478752 1D GTAATCCCAG C/- TACTCAGGAG 1358 het 1358 ref 7 3 3 1 C 1 0 310 CASAVA_Build X 1482164 1D CCTGGGCTTC A/- GGGGGCCACT 3070 het 2635 hom 31 10 13 8 A 1 0 311 CASAVA_Build X 1485465 3I ATGGATAGAT ---/GGA GGCATGGATG 3070 het 3070 hom 60 19 26 15 GGA 0 1 312 CASAVA_Build X 1486803 2D GAAGAGAGAG AA/-- AGAGAGACAG 2277 het 2277 ref 20 8 8 5 A 3 1 313 CASAVA_Build X 1490134 2I GAGACAGAGG --/GA GAGAGAAGAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 GA 3 4 314 CASAVA_Build X 1493836 2D TCTTTTTTTA TT/-- TTTTTATTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 T 7 5 315 CASAVA_Build X 1493958 1D CTCAGCCTCC T/- GAATAGGTGG 961 hom 7 het 3 0 3 0 T 1 0 316 CASAVA_Build X 1495352 2I GCACAGATGG --/AC ACACGCAGAC 3070 het 3070 hom 86 23 37 26 AC 2 3 317 CASAVA_Build X 1495484 4D ACACAGACAT ACAC/---- ACATATACCC 3070 het 3070 hom 88 41 42 9 AC 3 1 318 CASAVA_Build X 1495631 4D ATACCACACA CAGT/---- CAGTCATGCA 3070 hom 270 het 98 0 87 18 CAGT 2 1 319 CASAVA_Build X 1495895 4D29M2I CAGAGATGTG CACACACAGACTCAGAAACACACAGAGACACAG--/----CACAGACTCAGAAACACACAGAGACACAGAC ACACAAGCAC 3070 hom 284 het 86 0 93 18 N/A 0 0 320 CASAVA_Build X 1496198 2I ACGGGCACAC --/AG AGACGCACAT 3070 hom 225 het 86 0 74 12 AG 1 2 321 CASAVA_Build X 1496305 4I ACACGTGGAC ----/ACAG ACACAGTCTC 3070 hom 171 het 71 0 54 17 ACAG 0 1 322 CASAVA_Build X 1496410 2I7M2I23M4I ATACAGACAC --AGACATG--CACACACACACACATGCACACAG----/ATAGACATGCACACACACACACACATGCACACAGACAC ACACACAAGC 3070 hom 159 het 54 0 47 23 N/A 0 0 323 CASAVA_Build X 1496615 2D32M18D GCGGATGCAG ACACACACACACACAGACATGCTCACGCACAGACATGCTCCATGTCACAGGT/--ACACACACACACAGACATGCTCACACACAGAC------------------ ATGCTCCAGG 3070 hom 146 het 43 0 47 22 N/A 0 0 324 CASAVA_Build X 1498907 4D CCTGTCTCTG TTTC/---- TTTCTATCTC 636 het 636 ref 30 8 3 22 TTTC 2 1 325 CASAVA_Build X 1498933 6I TCTGTCTCTG ------/TCTCTA TCTCTATGTC 3070 hom 36 het 34 0 19 15 TCTCTA 1 2 326 CASAVA_Build X 1499279 2D TCTCTCTCTC TG/-- TGTCTCCCTG 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 TG 2 1 327 CASAVA_Build X 1507781 4I CCTGTCTCAC ----/TTAA TTTTTTATTT 2016 het 2016 ref 19 10 5 4 TTAA 0 1 328 CASAVA_Build X 1509779 1D TAAAAATATA T/- TTTATATAAT 2590 het 1401 hom 10 4 6 0 T 4 3 329 CASAVA_Build X 1517176 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 19 1 11 8 A 12 11 330 CASAVA_Build X 1522033 3D CGTGGACACA CGC/--- CGCCATCTTG 1376 het 1376 ref 48 29 6 18 CGC 2 1 331 CASAVA_Build X 1522147 3D CGTGGACACA CGC/--- CGCCGTCTTG 3070 het 1544 hom 42 10 17 16 CGC 2 1 332 CASAVA_Build X 1530104 1D CCCCATCCCT A/- AGGGGGTCCC 1765 hom 12 het 5 0 5 0 A 2 1 333 CASAVA_Build X 1541187 2D4M3D43M4D TATCTATCTA ATCTATCTACTATCTATCTAATCTATCTTCTATCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTA/--CTAT---CTATCTATCTAATCTATCTTCTATCTGTCTGTCTGTCTATCTG---- TCTGTCTGTC 3070 het 58 hom 13 1 12 24 N/A 0 0 334 CASAVA_Build X 1541492 1D AAAGCTCATG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 8 335 CASAVA_Build X 1541871 1D TCATACTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 31 0 21 11 A 12 11 336 CASAVA_Build X 1545930 4I AAACCTCAAG ----/ACTC ACTCAGTGTC 1673 het 1599 hom 14 5 4 5 ACTC 1 2 337 CASAVA_Build X 1555486 1D CCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 964 hom 19 4 14 1 A 12 11 338 CASAVA_Build X 1556444 3I TGTTCATCAA ---/TCG TCTATCAATT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 TCG 0 1 339 CASAVA_Build X 1573763 3D15M1D ACCTGGCTAA TTTTTTTTTTTTTTTGTAT/---TTTTTTTTTTTTGTA- TTTTTTTTTA 2340 het 251 hom 12 1 7 6 N/A 0 0 340 CASAVA_Build X 1573878 1D CCCAAAGTGC T/- GGGATTACGG 660 het 660 ref 8 3 2 4 T 1 0 341 CASAVA_Build X 1576533 2I CCTGGGTGAC --/AA GAGTAAACTC 2867 het 970 hom 14 4 7 3 A 0 2 342 CASAVA_Build X 1582789 1I CAAACAAAAC -/A AAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 6 7 343 CASAVA_Build X 1585919 39I CCTAGGAGTC ---------------------------------------/CCCATGGCTAAAGTTAAGATGCAATTTAGTTGGAAGCGA CATGGATTCA 1584 het 1584 ref 18 11 5 2 CCCATGGCTAAAGTTAAGATGCAATTTAGTTGGAAGCGA 0 1 344 CASAVA_Build X 1595192 1D TCTTCACCCC T/- CTCCCACAAA 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 T 1 0 345 CASAVA_Build X 1624671 1I TCTATACATA -/T TTACTTATTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 2 3 346 CASAVA_Build X 1629745 1D AAAATCAGCC G/- GGTGTGGTGT 3070 hom 27 het 10 0 8 2 G 3 2 347 CASAVA_Build X 1635128 1I TTACCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 27 0 23 4 A 9 10 348 CASAVA_Build X 1636618 4I39M4I CATCTATCTT ----TATCTATCTATCTATGTATCATCTATCTGTGTATCTATC----/TATCTATCTATCTATCTATGTATCATCTATCTGTGTATCTATCATCT ATCTATCTAT 3070 het 1670 hom 21 8 18 7 N/A 0 0 349 CASAVA_Build X 1636668 1I3M1D TCTATCTATC -ATCT/TATC- ATCAATCTAT 1989 het 489 hom 28 2 10 16 N/A 0 0 350 CASAVA_Build X 1640156 4D TCTTTGTTCT TTCC/---- TTCTCTCTCT 224 hom 5 het 12 0 2 11 TTCC 1 0 351 CASAVA_Build X 1642393 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1659 het 67 hom 10 1 6 3 A 16 15 352 CASAVA_Build X 1646088 6D TATATGTGTG TATATA/------ TATATATATA 3070 het 86 hom 28 2 15 13 TA 9 6 353 CASAVA_Build X 1646276 5D GATACATATG ATATA/----- ATATATATGG 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 ATATA 2 1 354 CASAVA_Build X 1659330 3D AATTAAATTA AAT/--- AATATCAGCC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 AAT 2 1 355 CASAVA_Build X 1664796 1D TTTATTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 8 7 356 CASAVA_Build X 1666345 1I AAGCCTGCTT -/G GGGTTCACAG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 G 3 4 357 CASAVA_Build X 1674124 28D TCCACTGTCT GGGTCTGCACCGGACATGAGTGGTGAGC/---------------------------- GGTGAGCGGT 3070 hom 57 het 18 0 18 5 GGGTCTGCACCGGACATGAGTGGTGAGC 1 0 358 CASAVA_Build X 1683534 4I CTTCCTTCCT ----/TCCC TCCCTCCCTC 2570 hom 4 het 15 0 10 5 TCCC 3 4 359 CASAVA_Build X 1684911 1D AAATAAAAAA T/- AAAAATCCAC 2797 het 2797 ref 27 13 10 4 T 1 0 360 CASAVA_Build X 1687620 9D AAATGACTCT TGTCCAGGC/--------- TGTCCAGGCT 2948 hom 32 het 15 0 10 8 TGTCCAGGC 2 1 361 CASAVA_Build X 1694933 1I CTTTTTTTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 72 het 36 0 25 11 T 7 8 362 CASAVA_Build X 1705716 1I AGGTCACGAG -/T TTCGAGACCA 1454 het 406 hom 6 2 3 1 T 2 3 363 CASAVA_Build X 1707724 3I CTCCCGTCTT ---/CTC CTTTCTCTCA 2573 het 2573 ref 25 12 7 6 CTC 0 1 364 CASAVA_Build X 1711910 1D TAATAAAAAG A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 365 CASAVA_Build X 1713549 1I TGAGTTAACC -/A CCCCCCCTTT 3070 het 14 hom 24 1 16 7 A 0 1 366 CASAVA_Build X 1715461 1D CAGGTAAGTT G/- TGGGGTTTGC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 G 1 0 367 CASAVA_Build X 1720875 1I CCACCCATCC -/T GATGGTTCAT 3070 het 3070 ref 69 40 20 9 T 0 1 368 CASAVA_Build X 1725107 1I TACCATCACT -/C CCCCATTGGA 3070 hom 90 het 36 0 29 7 C 4 5 369 CASAVA_Build X 1725556 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2460 hom 15 het 7 0 6 1 T 15 14 370 CASAVA_Build X 1725852 4D CCAGATTCAC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 13 hom 15 1 10 5 TCTT 6 5 371 CASAVA_Build X 1729567 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 20 1 14 5 T 12 11 372 CASAVA_Build X 1731984 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 24 het 24 ref 7 1 1 5 A 13 12 373 CASAVA_Build X 1733517 11D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAG/----------- AAAGAAAGAA 2552 het 74 hom 18 1 9 10 AAAAAAAAAAG 1 0 374 CASAVA_Build X 1735398 2D ACACGTGTAT AC/-- ACACACATGT 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 AC 4 3 375 CASAVA_Build X 1735590 2D ATATATACAC GT/-- GTGTATACGC 3070 het 3070 ref 54 35 9 11 GT 3 2 376 CASAVA_Build X 1737434 1I TCAGTTGTGG -/T TATCCAAGCC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 1 2 377 CASAVA_Build X 1737499 4I41M2D TTGCAGGTGA ----TAGTTTCTAAAGATGTGTTTTTCTATTTTTCTTTCTTTCTTTC/TACTTAGTTTCTAAAGATGTGTTTTTCTATTTTTCTTTCTTTCTT-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 13 0 15 7 N/A 0 0 378 CASAVA_Build X 1738305 2I TTTGGGTGTC --/TT TGTGTGTGTG 3070 hom 153 het 58 0 51 7 T 1 3 379 CASAVA_Build X 1738445 4D TGTATGCATT TGTG/---- TGTATGTGCA 3070 het 3070 hom 60 24 28 8 TG 3 1 380 CASAVA_Build X 1738705 2D6M4D56M2I TGCATTTGTA TTTGTATTTGTGTATGTGAATGTGAGCATTTGCACATGTGTGTATACGTGTGTCTGCATGTGTGCATC--/--TGTATT----TATGTGAATGTGAGCATTTGCACATGTGTGTATACGTGTGTCTGCATGTGTGCATCTA TATGTGTGTG 3070 het 3070 ref 49 45 13 34 N/A 0 0 381 CASAVA_Build X 1757960 3I GTTTTGAGAC ---/GGA AGAGTCTCGC 3070 hom 87 het 32 0 29 4 GGA 0 1 382 CASAVA_Build X 1760018 1I AGATCACACC -/A CTGCACTCCA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 0 1 383 CASAVA_Build X 1760346 1I TGGTATATCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 T 9 10 384 CASAVA_Build X 1762743 1D TATCAATTCA T/- TTTTTTTTTT 2206 het 2206 ref 39 24 6 9 T 15 14 385 CASAVA_Build X 1770119 1I TTTTAATTTG -/T TTTTTTTCCT 2927 het 2927 ref 30 11 8 11 T 7 8 386 CASAVA_Build X 1780276 1D CAGGCGTGAG C/- CACCGCGCCT 3070 het 2574 hom 31 8 15 9 C 2 1 387 CASAVA_Build X 1789510 4D TATTAATATG ATAA/---- ATTAATATAC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 ATAA 1 0 388 CASAVA_Build X 1790299 1I ACCCGACTAA -/T TTTTTTGTAT 1146 hom 7 het 3 0 3 0 T 6 7 389 CASAVA_Build X 1795575 4I CATCTGTGTA ----/TCTG TCTATGTATT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 TCTG 0 1 390 CASAVA_Build X 1797657 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 1651 het 952 hom 9 4 5 0 TA 7 8 391 CASAVA_Build X 1799930 1D ATTCTTTTTT C/- CCCTAAGTGA 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 C 4 3 392 CASAVA_Build X 1802774 4D GAATAGATAG ATAC/---- ATACATAGAT 3070 hom 141 het 55 0 47 8 ATAC 2 1 393 CASAVA_Build X 1802966 4I28M4I ACATAGATCA ----ATAGATGATAGATGGATACATAGATGAT----/ATAGATAGATGATAGATGGATACATAGATGATGATA GATACATACA 3070 hom 141 het 37 0 48 7 N/A 0 0 394 CASAVA_Build X 1807770 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 1591 het 1231 hom 9 3 4 2 T 8 7 395 CASAVA_Build X 1815974 1I ATAAAAAAAA -/G TAAATTTCTT 3070 het 1158 hom 16 5 10 1 G 0 1 396 CASAVA_Build X 1816342 2D TTTGTTTTTG TT/-- TTTGTTTGTT 1427 hom 13 het 23 0 9 14 T 5 3 397 CASAVA_Build X 1822692 1D TTTTCAGAGC T/- GCCCTTGGCC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 1 0 398 CASAVA_Build X 1822883 2D AGACATACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 33 7 T 14 12 399 CASAVA_Build X 1836237 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 1752 hom 13 4 9 0 A 9 8 400 CASAVA_Build X 1837813 4D AAAAAAAGAA AAAG/---- AAATAGCCGG 975 het 608 hom 13 4 6 3 AAAG 1 0 401 CASAVA_Build X 1840300 1D ATCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 24 het 10 0 8 2 T 10 9 402 CASAVA_Build X 1841024 1I TGATCTACCC -/G CCTCAGCCTC 3070 hom 63 het 25 0 20 5 G 0 1 403 CASAVA_Build X 1841831 4I AACACATAAT ----/ATTA ATTGTTCCAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 ATTA 0 1 404 CASAVA_Build X 1844768 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2081 hom 23 7 9 7 A 11 10 405 CASAVA_Build X 1847446 2I TGAAGGAGAT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 TC 5 6 406 CASAVA_Build X 1853473 16D GGGATTCAGG ACCCCTGAGTTACAGC/---------------- ACCAATTTAC 3070 hom 84 het 26 0 28 3 ACCCCTGAGTTACAGC 1 0 407 CASAVA_Build X 1856515 4D CTGAAACAAA AGTC/---- AGTCAATCAA 3070 het 3070 ref 38 24 13 4 AGTC 2 1 408 CASAVA_Build X 1858833 5D TTTTACAGAT TAGAG/----- TAGATATTTT 3070 het 3070 ref 48 26 21 1 TAGAG 1 0 409 CASAVA_Build X 1860258 2D GATGAAAGAA AG/-- AGAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 9 AG 3 2 410 CASAVA_Build X 1867111 4I CTAGAAGGGC ----/CTGA CTATCAGTGC 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 CTGA 0 1 411 CASAVA_Build X 1869633 5I AAAAAAAAAA -----/CAAAC AAAAAAAAAC 3070 het 925 hom 22 8 11 3 CAAAC 0 1 412 CASAVA_Build X 1870061 1D ACCTCCCATA C/- CCCCCATCCC 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 C 6 5 413 CASAVA_Build X 1872612 7D TAGATGGTAG ATAGATA/------- ATAGATAGAT 100 het 100 ref 41 24 2 16 ATAGATA 2 1 414 CASAVA_Build X 1874839 14D TACATGTATA TGTATATATGTATG/-------------- TGTATATATG 3070 het 3070 ref 48 25 17 10 TGTATATATGTATG 2 1 415 CASAVA_Build X 1874943 4D32M4D AGTGTATATA TGTGTGTGTATATGTATATGTGCATTTATATGTATATATG/----TGTGTATATGTATATGTGCATTTATATGTATA---- TATATGTGCA 3070 het 3070 ref 51 50 17 14 N/A 0 0 416 CASAVA_Build X 1875448 4D ACATTTATTC TATT/---- TATCTCATAA 3070 het 3070 ref 50 29 20 5 TATT 1 0 417 CASAVA_Build X 1876682 1D ATGTGCCACA T/- TTTCTTCATC 1445 het 996 hom 5 2 3 0 T 4 3 418 CASAVA_Build X 1879898 4I CATGTCTATC ----/ATCT ATCTATTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 ATCT 1 2 419 CASAVA_Build X 1880381 4D CAGCATCTAT TATC/---- TATCTATCAT 3070 het 3070 ref 56 32 18 8 TATC 3 2 420 CASAVA_Build X 1881848 4D28M7I TCGATCTATC ATCTATCTATCATCTATGTATCTCTCATCTCC-------/----ATCTATCATCTATGTATCTCTCATCTCCATCTATT ATCTATTATC 3070 het 3070 ref 40 20 17 14 N/A 0 0 421 CASAVA_Build X 1881922 4D TGTTATCTGC CTAT/---- CTATCTATCA 3070 het 3070 ref 52 29 18 5 CTAT 3 2 422 CASAVA_Build X 1882185 4I ATCTGTCTAT ----/TATC TATCTATTGC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 TATC 1 2 423 CASAVA_Build X 1883026 1I TGCTGTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 10 11 424 CASAVA_Build X 1914901 3D TTCTTCACAA TTC/--- TTCTTCCTCT 3070 het 3070 hom 39 15 17 9 TTC 3 2 425 CASAVA_Build X 1915642 3D GTAATTTATT AAA/--- AAAAAAAAAA 2329 het 2329 ref 21 11 7 3 A 16 13 426 CASAVA_Build X 1941655 4D AAAGAAAGAA AAGG/---- AAGGAAGGAA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 AAGG 4 3 427 CASAVA_Build X 1946797 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2836 hom 24 10 11 3 A 9 8 428 CASAVA_Build X 1948445 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2416 het 809 hom 25 3 7 15 A 17 16 429 CASAVA_Build X 1951138 1D GTCATGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1936 hom 30 8 9 13 T 15 14 430 CASAVA_Build X 1959111 1I AAATATATAC -/A ACCTACTATA 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 A 1 2 431 CASAVA_Build X 1959812 2D23M8D CAAGAAAGAA AGAAAGAGAAAAGAAAAGAAAGAAAGGAAGGAG/--AAAGAGAAAAGAAAAGAAAGAAA-------- GGAAGGAGGG 2940 het 892 hom 15 5 6 9 N/A 0 0 432 CASAVA_Build X 1962955 1D AGTAGTGTCT G/- CCAGACACAG 3070 het 3070 hom 31 15 13 4 G 1 0 433 CASAVA_Build X 1964215 1D CGGGGGCGAT G/- GAACGGTGGA 3070 het 3070 hom 44 16 19 10 G 2 1 434 CASAVA_Build X 1965446 3D ACACTCGGTC CCT/--- TGTTGTTATA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 CCT 1 0 435 CASAVA_Build X 1973439 4I CTCTGCCTCC ----/CTCT CTGTCTCTCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CT 1 3 436 CASAVA_Build X 1979397 1D AGTGCTGGGA T/- TTACAGGTGC 2934 het 1783 hom 19 8 8 4 T 3 2 437 CASAVA_Build X 1983529 27D GATGATGATA GTGATGGTGATAATGGTGATAATGATG/--------------------------- ATGGTGATGA 3051 het 3051 ref 51 39 10 32 GTGATGGTGATAATGGTGATAATGATG 1 0 438 CASAVA_Build X 1983661 3D TAATAGTGGC GAT/--- GATGATGGTG 3070 het 3070 hom 91 32 33 28 GAT 3 2 439 CASAVA_Build X 1989383 3D CTCTTTTGCC CTT/--- CTTTTCTCTC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 CTT 2 1 440 CASAVA_Build X 1990311 3D19M2D TCTGTCTCCC CCTTATTCTCTTTCTTTCTCCTTC/---TATTCTCTTTCTTTCTCCT-- TCTGTCTCTC 3070 het 557 hom 22 3 9 15 N/A 0 0 441 CASAVA_Build X 1990517 2I GTCTTCCTCC --/CT CTCTCTTCCT 3070 hom 89 het 31 0 27 4 CT 3 4 442 CASAVA_Build X 1992336 1I CTAAATGGCT -/A AATAAAAATA 2692 het 2692 ref 14 7 6 1 A 2 3 443 CASAVA_Build X 1996552 1I AGAAAAAGAA -/G GGGGGGGGGC 982 het 982 ref 21 6 4 11 G 9 10 444 CASAVA_Build X 1997144 3I CCTAAATAAT ---/TTC TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 TTC 0 1 445 CASAVA_Build X 2004628 15D TTAAAATTAG AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 2308 het 2308 ref 20 10 8 5 A 25 10 446 CASAVA_Build X 2005328 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1407 het 888 hom 12 3 3 6 A 13 14 447 CASAVA_Build X 2013974 4I AAAGAAGGGA ----/GGAG GGAGGGAGGA 3070 hom 29 het 16 0 12 4 GGAG 2 3 448 CASAVA_Build X 2018825 4D TTGAACACAC TCTT/---- TCTTAGAAAC 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 TCTT 2 1 449 CASAVA_Build X 2027664 1I GTAGGTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 T 12 13 450 CASAVA_Build X 2136089 3I TGGTGGGGCT ---/CAC CACCTGTAGT 1813 het 1813 ref 15 6 5 5 CAC 1 2 451 CASAVA_Build X 2136227 5D AGAAAAAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAT 3070 het 608 hom 37 5 21 13 AAAAG 2 1 452 CASAVA_Build X 2137246 1I7M1I GTCGATAGCA -TAGTCAA-/GTAGTCAAT TAAAAATAGG 3070 het 3070 ref 34 18 16 2 N/A 0 0 453 CASAVA_Build X 2137380 1D GCTAAATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1058 hom 32 4 14 14 T 13 12 454 CASAVA_Build X 2138021 1D ATAAAAAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 13 8 2 A 10 9 455 CASAVA_Build X 2152296 1D CTGCAGCTTA G/- GCCGCTCCTG 3070 het 3070 hom 34 18 16 1 G 2 1 456 CASAVA_Build X 2153007 4I ACACATGCTC ----/ACAT ACATTCACAT 3070 het 3070 hom 93 36 38 19 ACAT 1 2 457 CASAVA_Build X 2153337 4D TTTCACATGT ACAC/---- ACATTCACAT 3070 het 3070 ref 81 43 36 5 AC 3 1 458 CASAVA_Build X 2159627 3I26M3D CTCCATCGTA ---TCCTCCTTTTTCTTTTTTCCCTTATTCTC/TCCTCCTCCTTTTTCTTTTTTCCCTTATT--- CTTTCCCATC 3070 het 3070 ref 28 17 9 8 N/A 0 0 459 CASAVA_Build X 2159994 3I CTCCTCCTTC ---/TCT TCTTTTCTTT 230 het 230 ref 25 18 2 5 TCT 1 2 460 CASAVA_Build X 2160374 6I TTGTTTTGAA ------/AACAAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 AAC 4 6 461 CASAVA_Build X 2161101 12D TTGTTAAGAA AAAGAAAGAAAG/------------ AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 11 AAAG 6 3 462 CASAVA_Build X 2161413 2D TATCTACAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2970 hom 33 13 14 6 T 14 12 463 CASAVA_Build X 2180281 4D TCTGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 1050 hom 20 3 15 3 AAAT 3 2 464 CASAVA_Build X 2180984 1D TGAGCACTTA G/- GGGACACTAA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 G 4 3 465 CASAVA_Build X 2182101 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 7 15 4 A 9 10 466 CASAVA_Build X 2184833 1I TCTTTCATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2947 hom 32 8 15 9 A 11 12 467 CASAVA_Build X 2184896 1D CATCAGAATT C/- CCCCAAAGAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 5 4 468 CASAVA_Build X 2190877 2D CACACCCTTC AG/-- AGCAGAGAGG 3070 hom 91 het 34 0 26 9 AG 2 1 469 CASAVA_Build X 2195585 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1639 het 824 hom 10 2 4 4 A 14 15 470 CASAVA_Build X 2203556 1D GTTTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 20 2 16 2 A 12 11 471 CASAVA_Build X 2204918 1I11M1I AGAGAAGGAG -GGGAGGAAATA-/AGGGAGGAAATAG GGGGAAAGAG 1759 hom 21 het 8 0 7 1 N/A 0 0 472 CASAVA_Build X 2205291 2I AATGGGGGAA --/AG AGAGAGAAAG 1643 het 1221 hom 11 3 6 2 AG 3 4 473 CASAVA_Build X 2210206 2I GAGGGCAAAC --/GA GAGAGGGAGA 852 hom 7 het 3 0 3 0 GA 2 3 474 CASAVA_Build X 2210338 4I GGAAAGAGAG ----/AGAA AGAGAGATGG 1770 hom 24 het 10 0 7 3 AGAA 0 1 475 CASAVA_Build X 2210422 2D AAGGGGAGAG AC/-- AGAGAAAGAG 3070 het 2499 hom 32 9 14 10 AC 1 0 476 CASAVA_Build X 2210819 2D21M1D GCGAGGGAGG GAGGGGGAGAGAGAGAAGAAAGAG/--GGGAGAGAGAGAGAAGAGAGA- AGAAGAGAGA 2609 het 2125 hom 26 9 7 13 N/A 0 0 477 CASAVA_Build X 2210854 4D GAAGAGAGAA AGAG/---- AGAGAGGGAG 2977 hom 7 het 17 0 10 7 AG 5 3 478 CASAVA_Build X 2214734 1I CCCACAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 38 2 25 11 A 13 14 479 CASAVA_Build X 2216168 1D TGAAGGAGAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 77 het 37 0 32 6 A 9 8 480 CASAVA_Build X 2222100 2I AGATAGAAGC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 48 het 28 0 18 10 AG 6 7 481 CASAVA_Build X 2223465 1I AGGGCTTGCT -/G GGGGGGTGGA 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 G 6 7 482 CASAVA_Build X 2227896 2D ACTATGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 578 hom 23 5 12 7 A 13 11 483 CASAVA_Build X 2230353 1I TATTTTCCTT -/A AGAGAAATAC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 1 2 484 CASAVA_Build X 2234061 1D CATGCTGGGC T/- TTAATACTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 3 2 485 CASAVA_Build X 2234968 2D GTCTTGGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1574 hom 40 10 14 16 T 16 14 486 CASAVA_Build X 2241048 1I AAGATATATA -/T TTTTTTTTTT 2119 het 1173 hom 15 5 6 4 T 13 14 487 CASAVA_Build X 2245678 3D AGAAAAAAAA AAG/--- AAGGAGAGTA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 AAG 2 1 488 CASAVA_Build X 2249549 1I TCGTGAAGGT -/G GGGATCCTTA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 G 3 4 489 CASAVA_Build X 2251109 7I GGATTACAGG -------/CGCCAGC CGCCACACCC 3070 hom 77 het 29 0 22 7 CGCCAGC 0 1 490 CASAVA_Build X 2252099 3D CCCTGTCTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 38 0 16 23 A 17 14 491 CASAVA_Build X 2253893 5I CCATTTCTCT -----/TTCTC TTCTCTTCTC 3070 hom 80 het 31 0 28 3 TTCTC 2 3 492 CASAVA_Build X 2264646 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2931 hom 37 9 17 11 T 12 13 493 CASAVA_Build X 2264890 4D ATAGATAGAT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 803 hom 47 8 21 19 ATAG 3 2 494 CASAVA_Build X 2266048 1D CAGCTGAGAC A/- AAAAAAAAAA 1740 het 675 hom 27 6 7 14 A 15 14 495 CASAVA_Build X 2269693 1D TGAACTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2621 het 1056 hom 31 9 9 14 T 14 13 496 CASAVA_Build X 2274297 2I TGACATGCCC --/CT GAGTTGTTAT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 CT 0 1 497 CASAVA_Build X 2274695 5I GGTTTTTTTT -----/TGTTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 36 16 16 12 TGTTG 0 1 498 CASAVA_Build X 2277623 2I AGCTACTTGG --/GA GAGGCTGAGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 GA 1 2 499 CASAVA_Build X 2281797 1D GCTAATTTTG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 1541 hom 17 4 13 0 T 9 8 500 CASAVA_Build X 2292024 3D TGGGTGGGAT GGA/--- GGAGATAAGG 3070 het 3070 hom 52 20 25 11 GGA 2 1 501 CASAVA_Build X 2292755 4D TACCATTTAT TATC/---- TATCAAGTAC 3070 het 3070 ref 43 25 14 7 TATC 2 1 502 CASAVA_Build X 2297530 1D TTAGTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 41 18 18 8 T 9 8 503 CASAVA_Build X 2297852 1D GCCCCAGCTA T/- TTTTTGTATT 1956 het 1288 hom 14 4 5 5 T 6 5 504 CASAVA_Build X 2298222 1I CCAGTTCGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2046 hom 24 9 12 3 T 9 10 505 CASAVA_Build X 2300654 1D TCCTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 2013 hom 15 het 8 0 5 3 T 13 12 506 CASAVA_Build X 2305037 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 15 7 A 12 11 507 CASAVA_Build X 2311026 3I TCACCATCAT ---/CAG CAGCAGCATC 3070 hom 182 het 92 0 67 25 CAG 2 3 508 CASAVA_Build X 2314924 1D GATGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1334 het 1334 ref 40 24 4 12 T 15 14 509 CASAVA_Build X 2318482 1D CCCAGCTGCA T/- TTTTTTTTTT 2311 het 2018 hom 16 6 7 3 T 12 11 510 CASAVA_Build X 2323043 1D GTGGTCCGAG T/- TACAGGTGAT 3070 het 3070 ref 50 25 18 8 T 2 1 511 CASAVA_Build X 2325613 1D ATTCACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 36 1 27 8 A 11 10 512 CASAVA_Build X 2325678 1D GACAGAGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 10 9 513 CASAVA_Build X 2327170 10I TGGAAGGTTA ----------/AAATTAAACC TTACCACCCT 3070 het 2954 hom 19 8 9 2 AAATTAAACC 0 1 514 CASAVA_Build X 2334485 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 11 10 515 CASAVA_Build X 2336918 1I TATTAACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 15 13 A 11 12 516 CASAVA_Build X 2341392 1I AATTAGTGAC -/T TATAATCTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 2 517 CASAVA_Build X 2344934 1I GAAGTTAAAT -/A TTCCCATCTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 0 1 518 CASAVA_Build X 2346963 1D AATCTCAGAA C/- CCCCCCTGCC 3070 hom 129 het 44 0 42 3 C 7 6 519 CASAVA_Build X 2351453 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 76 het 27 0 24 3 A 8 7 520 CASAVA_Build X 2357493 2D TCTGTGATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 23 2 10 12 T 14 12 521 CASAVA_Build X 2363503 1D CCTTAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 28 0 20 8 A 15 14 522 CASAVA_Build X 2375913 4D GGAAGAATGC TTCA/---- TGAAGTGTTT 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 TTCA 1 0 523 CASAVA_Build X 2376417 4D CAGTTACATA AAAG/---- AAATAAATTC 3070 het 3070 hom 25 12 10 5 AAAG 1 0 524 CASAVA_Build X 2378169 1D TTAGTGCCTC A/- AAAAAAAAAG 2055 het 2055 ref 32 15 8 9 A 10 9 525 CASAVA_Build X 2386716 4D GGAAGAATGC TTCA/---- TGAAGTGTTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 TTCA 1 0 526 CASAVA_Build X 2390577 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 10 9 527 CASAVA_Build X 2392247 3I TAAGGGACCG ---/CCA CCGTGTACAC 3070 het 3070 hom 49 21 19 9 CCA 0 1 528 CASAVA_Build X 2411105 1D GAACAAGCAC A/- ACTTCTGCTT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 2 1 529 CASAVA_Build X 2422030 1I AGAAGAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1769 hom 20 6 13 1 A 9 10 530 CASAVA_Build X 2423652 1I TGAACCCACG -/T TAACAGCCAC 3070 het 3070 hom 37 9 18 10 T 1 2 531 CASAVA_Build X 2432066 21D GCCACTGGGT GGGCTCTGGTGCAGATCTAAG/--------------------- ATGATTGGAA 2763 het 2763 ref 35 27 8 8 GGGCTCTGGTGCAGATCTAAG 1 0 532 CASAVA_Build X 2466236 14I TGGATGGAAT --------------/TGTTTTGCACAAGG TCCAGACGGC 3070 hom 84 het 37 0 27 11 TGTTTTGCACAAGG 0 1 533 CASAVA_Build X 2468893 8D TCTGTTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTG 3070 het 119 hom 18 2 12 5 T 17 9 534 CASAVA_Build X 2489249 3D TATATATATA TAC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 16 1 13 2 TAC 1 0 535 CASAVA_Build X 2490444 4D TCTCTCTCTC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 76 het 34 0 24 11 TA 9 7 536 CASAVA_Build X 2493140 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 A 11 10 537 CASAVA_Build X 2507419 1I CTCTCCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 21 1 17 3 T 11 12 538 CASAVA_Build X 2511143 1I TTCCTCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 27 1 19 7 T 12 13 539 CASAVA_Build X 2527547 3I AAAAAAAAAA ---/GAG AGAGAGAATG 3070 het 491 hom 21 4 13 4 GAG 0 1 540 CASAVA_Build X 2544600 4D TTTACATCGA TGTG/---- TGTGAGTACT 3070 hom 77 het 30 0 26 5 TG 4 2 541 CASAVA_Build X 2549430 6I TTTTTCTGTT ------/TATCTC TATACTATAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TATCTC 0 1 542 CASAVA_Build X 2550213 1I ACACCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 340 hom 30 2 17 11 A 15 16 543 CASAVA_Build X 2551734 1D AAATTCTGAG A/- TTTTTTGGAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 1 0 544 CASAVA_Build X 2552413 1D TCTGCAATTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 9 8 545 CASAVA_Build X 2552467 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 33 1 12 20 T 15 14 546 CASAVA_Build X 2553549 1I TAAATTTCTA -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 6 7 547 CASAVA_Build X 2553897 6I CTTATTTCTT ------/TATATA TATATATATA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TA 6 9 548 CASAVA_Build X 2555206 1D CACGCTGCTG T/- TGCTTACACT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 1 549 CASAVA_Build X 2555341 1D AGTTAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 33 6 A 11 10 550 CASAVA_Build X 2560246 3I TGGATAATAG ---/TAC CACTTCCTGG 3070 het 3070 hom 48 15 22 11 TAC 0 1 551 CASAVA_Build X 2573308 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AGAGAGAGAA 2995 hom 48 het 17 0 17 1 AAAAG 1 0 552 CASAVA_Build X 2573447 1I GAAAATTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 385 hom 33 2 27 4 T 9 10 553 CASAVA_Build X 2576267 4I1M3D AGGTCTGTTG ----TTTC/CCCAT--- TGCGCAAATA 3070 hom 102 het 35 0 35 1 N/A 0 0 554 CASAVA_Build X 2578305 4D TGGGTGGATA GATG/---- GATGGATGGA 3070 hom 134 het 63 0 38 25 GATG 6 5 555 CASAVA_Build X 2579834 1D GTTTTTCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 10 9 556 CASAVA_Build X 2586891 1I TTGCATTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 118 hom 36 1 22 13 T 9 10 557 CASAVA_Build X 2587070 4I ATGGTGATAC ----/GAGA GAGAGAGAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 GA 4 6 558 CASAVA_Build X 2599207 1D CTCTCCCAAC A/- AAAAAATGCT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 7 6 559 CASAVA_Build X 2602096 26D TGACTGATAC GATCCTGCCCTCCCTGTCATCTCGGT/-------------------------- GATCCCTTCT 3070 hom 37 het 17 0 10 8 GATCCTGCCCTCCCTGTCATCTCGGT 1 0 560 CASAVA_Build X 2602191 2I GTGTGACAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 13 15 561 CASAVA_Build X 2606539 22D TTCTATCCGG AAGACTCCTACACGTTCCGCAC/---------------------- AACCCAGCTT 2114 het 2114 ref 31 28 5 3 AAGACTCCTACACGTTCCGCAC 1 0 562 CASAVA_Build X 2607492 1I AGTAAATTTT -/G GGATAGCTAG 3070 hom 55 het 25 0 19 6 G 2 3 563 CASAVA_Build X 2608645 4D CTATTCATCC ATCT/---- ATTTTTCTAG 3070 hom 163 het 58 0 54 5 ATCT 1 0 564 CASAVA_Build X 2609898 2D ACCCAATAAC TT/-- TGGTTTACAT 3070 hom 120 het 42 0 40 3 T 3 1 565 CASAVA_Build X 2617754 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1721 hom 14 5 8 1 T 9 10 566 CASAVA_Build X 2620285 19D TTCTTTTTTC ATGTTATAAATTCTTTTTT/------------------- CAATGGTCAG 2786 het 2786 ref 21 11 7 4 ATGTTATAAATTCTTTTTT 1 0 567 CASAVA_Build X 2620710 4I TTCCTAAATG ----/TCCT TCCTTCTTGC 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 TCCT 1 2 568 CASAVA_Build X 2622561 1D GAGAGGCCGA G/- GGCCGGTGGG 3070 hom 32 het 13 0 11 2 G 3 2 569 CASAVA_Build X 2629627 3D AGAGGAAGGG CCT/--- CTTCTCAGCC 3070 het 3070 hom 40 15 13 12 CCT 1 0 570 CASAVA_Build X 2637352 2D CAAGCACATG CA/-- CATACTCCTG 3070 het 3070 hom 99 41 48 13 CA 2 1 571 CASAVA_Build X 2638217 1I GAGGAGAGTT -/C CTAGTTTTAC 3070 hom 111 het 39 0 35 4 C 1 2 572 CASAVA_Build X 2640464 1D GTAAATAAAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 40 18 16 7 A 8 7 573 CASAVA_Build X 2641173 4D GCCTACACAT ACAC/---- ACACAAACCC 3070 het 3070 hom 75 32 36 10 AC 4 2 574 CASAVA_Build X 2641357 2D CACACAAAAA AC/-- ACACTACACA 3070 het 3070 hom 82 31 42 9 AC 3 2 575 CASAVA_Build X 2641442 4D ACAAACCCAC ACAT/---- ACATGCACCT 3070 het 3070 ref 79 28 31 22 ACAT 2 1 576 CASAVA_Build X 2643252 1I CTTATCACTC -/T TATCAGCTTC 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 T 1 2 577 CASAVA_Build X 2656958 6I GCTCACTGCA ------/ACCTCC ACCTCGCGGG 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 ACCTCC 0 1 578 CASAVA_Build X 2657482 1D CAGGAAACTT A/- ACAATCATGG 3070 hom 93 het 38 0 31 11 A 2 1 579 CASAVA_Build X 2661191 4D CCTGCCTTCC TCTG/---- TCTCTCCCTT 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 TCTG 1 0 580 CASAVA_Build X 2663253 2D CAAGCACACG GT/-- GTGTGTGTGT 1538 het 1538 ref 51 35 5 11 GT 7 6 581 CASAVA_Build X 2668621 1I GCAGCATCCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 8 9 582 CASAVA_Build X 2669048 1I CCAAAGGGGG -/A ATAGGCACTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 1 2 583 CASAVA_Build X 2679151 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 53 hom 21 1 18 2 A 12 11 584 CASAVA_Build X 2679664 3I AAAGCCACAT ---/GTC ATCTCCTTTT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 GTC 0 1 585 CASAVA_Build X 2684635 5D CAATTAAAAA TAAAT/----- TAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 20 1 TAAAT 1 0 586 CASAVA_Build X 2686998 4I TCTATCTATT ----/TATC TATCTATCTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TATC 2 3 587 CASAVA_Build X 2687997 11I GCTTCAGAAT -----------/CTGCATGTGGC CAGATTCTGG 3070 het 3070 ref 38 24 10 4 CTGCATGTGGC 0 1 588 CASAVA_Build X 2691207 4I ACAGGTGCAC ----/ACCA ACCACCACGC 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 ACCA 1 2 589 CASAVA_Build X 2713501 1I ACTTAAAAAA -/T ATTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 0 1 590 CASAVA_Build X 2719009 6D TGATAGTAAA TAAATT/------ TAAATGTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 5 TAAATT 1 0 591 CASAVA_Build X 2723282 4I TATATTTATG ----/TATT TATATGTATA 3070 het 973 hom 16 2 11 3 TATT 0 1 592 CASAVA_Build X 2729243 2D CTATGCTGTC TG/-- GGGTACATAC 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 TG 1 0 593 CASAVA_Build X 2735175 2I TGCAAGTGTC --/TG TGTGCACACA 3070 hom 227 het 88 0 73 15 TG 2 3 594 CASAVA_Build X 2735546 22D CAGGTGTAAA CATGTGCACACATCGGTGTGTG/---------------------- CATGTGCACA 3070 hom 241 het 71 0 79 7 CATGTGCACACATCGGTGTGTG 1 0 595 CASAVA_Build X 2739541 1I AGCCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 37 1 31 5 A 11 12 596 CASAVA_Build X 2740120 12I GGTTTAACTA ------------/GCCAAATATAGT CCTGTTCTGT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 GCCAAATATAGT 0 1 597 CASAVA_Build X 2742357 1I TTAATAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 43 2 25 16 T 10 11 598 CASAVA_Build X 2744949 1D CATAGTGAGA C/- CCCCATCTCT 3070 hom 39 het 14 0 12 4 C 5 4 599 CASAVA_Build X 2745823 3I AAATAGGCTC ---/ATT AGTTTAGCTA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 ATT 0 1 600 CASAVA_Build X 2746121 4D GTGTTTGGAT ATTA/---- ATTGTCACTA 3070 hom 42 het 16 0 14 3 ATTA 1 0 601 CASAVA_Build X 2747468 1I AGACCCTGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 9 10 602 CASAVA_Build X 2747834 1D ACATTTTTTT C/- ATTAAACATA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 1 0 603 CASAVA_Build X 2760455 1I AATGCAGCCC -/T TGTCTGCATT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 1 2 604 CASAVA_Build X 2769046 4D AATAGATGAT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 ATAG 4 3 605 CASAVA_Build X 2770785 5D ACTCCTCCTG TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 hom 104 het 43 0 33 10 TGTTT 3 2 606 CASAVA_Build X 2776589 1D AAAAGAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 20 0 15 6 A 12 11 607 CASAVA_Build X 2786128 1I AATGGTTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 8 9 608 CASAVA_Build X 2786319 1D CTGCGCAACA T/- GATGAAACCC 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 1 0 609 CASAVA_Build X 2787321 3D TTGATTACTA TAG/--- TAGTGATAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 TAG 2 1 610 CASAVA_Build X 2788685 2D AAACTTGAGC TT/-- TTTTTTTTTT 2862 hom 39 het 27 0 13 14 T 20 18 611 CASAVA_Build X 2790120 4I AGAAGAAGGT ----/GGAA GGAAGTGTGA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 GGAA 1 2 612 CASAVA_Build X 2792427 1D AATGGTTGCA T/- TTTTTTTTTT 2411 hom 31 het 19 0 10 9 T 15 14 613 CASAVA_Build X 2793916 2I ATCCAGCCAT --/CA CACCACTGGG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CA 1 2 614 CASAVA_Build X 2794878 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAGTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TA 1 0 615 CASAVA_Build X 2795339 1I CTTAGGCTTC -/A AAAACATCAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 4 5 616 CASAVA_Build X 2797058 1I TGAACATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 540 hom 42 3 33 6 A 14 15 617 CASAVA_Build X 2799047 1I CCAAAGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 44 1 30 13 T 11 12 618 CASAVA_Build X 2813129 1D TCGAATCCTG C/- CAAAACCTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 2 1 619 CASAVA_Build X 2813996 1D CTGGCCCCCA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 T 8 7 620 CASAVA_Build X 2823984 1D25M8D ACTCCAGCCT GGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAATAAAT/-GGCGACAGGGTGAGACTCTGTCTCA-------- AAATAAATAG 3070 het 2304 hom 13 6 8 3 N/A 0 0 621 CASAVA_Build X 2838358 3I AAATATGTAT ---/TAA TATTATGCAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TAA 0 1 622 CASAVA_Build X 2842460 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGGGGGGG 1754 het 224 hom 22 3 9 10 G 12 11 623 CASAVA_Build X 2847856 11D CCTTGCGTGT TGTTGAAACTC/----------- ATTTCTGGAG 3070 het 3070 ref 35 26 10 3 TGTTGAAACTC 1 0 624 CASAVA_Build X 2855282 1I CTAACTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2609 het 1433 hom 15 5 6 4 T 10 11 625 CASAVA_Build X 2859760 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAATTT 1738 het 1738 ref 19 7 6 6 A 7 8 626 CASAVA_Build X 2936783 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 10 9 627 CASAVA_Build X 2940650 2D4M4D AATATATATA TGTATGTGTA/--TATG---- TATACACACA 1353 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 628 CASAVA_Build X 2953588 2I CACATAATCC --/TA TATATATATA 3070 het 445 hom 19 1 14 4 TA 5 6 629 CASAVA_Build X 2959174 3D ACACTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 27 0 22 6 A 14 11 630 CASAVA_Build X 2975518 1I ACTCTGCCCA -/G CCGATATGCT 3070 hom 77 het 28 0 26 2 G 0 1 631 CASAVA_Build X 2993678 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2157 het 2157 ref 21 10 5 6 A 15 14 632 CASAVA_Build X 3003530 2I TGTCTGCTTG --/TC TCTCTTTCTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TC 2 3 633 CASAVA_Build X 3003930 4D CTCTCTCTCC ATCT/---- CTCTCTCTGT 3070 het 5 hom 28 2 21 6 ATCT 1 0 634 CASAVA_Build X 3004378 2D TTCTCGTTTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 54 het 22 0 19 5 TC 6 5 635 CASAVA_Build X 3008297 37D CGGGCAGATC ATGAGGTCCGGAGATGCAGACCATCCTGGCCAACATG/------------------------------------- ATGAAACTCC 3070 hom 38 het 12 0 12 5 ATGAGGTCCGGAGATGCAGACCATCCTGGCCAACATG 1 0 636 CASAVA_Build X 3014703 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 114 het 46 0 39 8 A 7 6 637 CASAVA_Build X 3016606 1D CAAATCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 878 hom 43 2 30 11 T 15 14 638 CASAVA_Build X 3019089 4D GTAGCTGGGG CTAT/---- CTATAGGCAC 3070 hom 84 het 29 0 27 4 CTAT 2 1 639 CASAVA_Build X 3019865 4I ATGATGGACT ----/GATA GATAGTTGAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GATA 1 2 640 CASAVA_Build X 3049272 4I CAGTTAACTT ----/AGAC ACTTTCTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AGAC 0 1 641 CASAVA_Build X 3053452 1D CTTTTTTTTT C/- AGAGACAGGT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 C 1 0 642 CASAVA_Build X 3053616 2D CTGTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 14 7 T 13 11 643 CASAVA_Build X 3054113 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 11 10 644 CASAVA_Build X 3113801 1I AAACTGCTCT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 31 10 17 5 A 7 8 645 CASAVA_Build X 3120768 1D25M3I ATTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAATTGCCACATAAAC---/-AAAAAAAAAAAATTGCCACATAAACATA ATAATCAAGT 3070 het 3070 hom 25 9 14 4 N/A 0 0 646 CASAVA_Build X 3124288 3D ACAAATCTAA TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 T 12 9 647 CASAVA_Build X 3130218 1D AGTTTTAAAC T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 7 6 648 CASAVA_Build X 3130347 1I CCTTTAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 A 9 10 649 CASAVA_Build X 3153640 1D TAGAACTCTC T/- TTTTTTTTTT 2697 het 2697 ref 35 14 9 12 T 15 14 650 CASAVA_Build X 3189910 2D TATCTTAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 15 13 651 CASAVA_Build X 3197211 1D CTGCATTTTC G/- GGGCTTCTGC 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 G 4 3 652 CASAVA_Build X 3222132 1D CTTAAAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 T 11 10 653 CASAVA_Build X 3222320 3I CTCTTCTTCT ---/TCC TCCTTTTCCT 1294 het 1294 ref 42 15 8 19 TCC 1 2 654 CASAVA_Build X 3224814 4I TACTATATAT ----/TTTA TCTATCTACT 1350 het 1350 ref 16 11 3 2 TTTA 0 1 655 CASAVA_Build X 3231109 13D GTACTCACCC AGGCTTCTCACTG/------------- AGAGATTCTG 3070 het 3070 ref 45 29 18 1 AGGCTTCTCACTG 1 0 656 CASAVA_Build X 3233870 1D GAGATGATTC T/- TTTGCAGAAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 4 3 657 CASAVA_Build X 3240772 1D CTGGATGGAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 8 7 658 CASAVA_Build X 3246908 1D CTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 53 29 15 10 A 10 9 659 CASAVA_Build X 3253510 2D TAGATATCTA TC/-- TCAATATATA 2327 het 2327 ref 16 9 6 1 TC 2 1 660 CASAVA_Build X 3255256 1D TTTCCTTTTG C/- CCTCCTGACC 3070 het 3070 ref 53 25 19 10 C 3 2 661 CASAVA_Build X 3270058 19I CCATATGCCC -------------------/AACAATGATAGACTGGAAA AAGAAAATGT 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 AACAATGATAGACTGGAAA 0 1 662 CASAVA_Build X 3278051 1D GTTTACTTTA C/- GATGTGAATT 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 C 1 0 663 CASAVA_Build X 3296981 1I AAAGAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 25 2 22 1 A 10 11 664 CASAVA_Build X 3305757 2D18M6D CATGTGTGTA TGTGTGTATGTGTGCGTGTGTGTGTA/--TGTGTATGTGTGCGTGTG------ TGTGCATGTG 3070 hom 178 het 51 0 55 15 N/A 0 0 665 CASAVA_Build X 3305970 2D TGTGTGTTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 118 het 50 0 39 12 GT 7 6 666 CASAVA_Build X 3310333 2D AAGTTTCACC AA/-- AGTTTGCCCT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 3 1 667 CASAVA_Build X 3324504 1I AGAAAGAGAT -/G GGGGAGATGC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 4 5 668 CASAVA_Build X 3327022 2I CCTCAGGAAG --/TT ACCCTACATG 3070 hom 65 het 29 0 20 9 T 0 2 669 CASAVA_Build X 3347412 6I AAACAAAAAC ------/AAAAAA AAAACTCTTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 4 10 670 CASAVA_Build X 3359648 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 12 13 671 CASAVA_Build X 3363876 4I TTCTACAGGC ----/ATAA ACACGATTTC 3070 het 3070 ref 57 23 20 14 ATAA 0 1 672 CASAVA_Build X 3364895 2D GGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 56 24 26 6 TA 8 7 673 CASAVA_Build X 3365439 2D TCTGTTTGCC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 87 29 37 23 TG 9 8 674 CASAVA_Build X 3365654 2I AGTGTGTCTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 66 35 27 4 TG 8 9 675 CASAVA_Build X 3366907 1I GTGAGATGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 8 9 676 CASAVA_Build X 3370625 1D AGTTTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 14 14 T 13 12 677 CASAVA_Build X 3371213 1I AAGAAGGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 10 11 678 CASAVA_Build X 3374970 2D GGTAGTGAAT AA/-- GTCTCACCAG 3070 het 3070 ref 43 24 15 6 A 2 0 679 CASAVA_Build X 3378690 1I AAGGACTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 T 10 11 680 CASAVA_Build X 3394224 6I TTTATACTGA ------/TATATT TATATAAGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TATATT 0 1 681 CASAVA_Build X 3419818 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1270 hom 18 4 9 5 A 14 15 682 CASAVA_Build X 3430279 1D TGACGAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 89 het 37 0 28 10 A 10 9 683 CASAVA_Build X 3443967 4D ATCATCTATC TATT/---- TGTCTACCTA 3070 het 3070 ref 40 19 18 8 TATT 1 0 684 CASAVA_Build X 3450287 1D GCAGTTAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 15 9 12 A 10 9 685 CASAVA_Build X 3523678 1D ACATTACTGA C/- AGCAGATCAT 3070 het 3070 hom 47 18 24 6 C 1 0 686 CASAVA_Build X 3528555 16I10M23I GTTTGATGGG ----------------TGTAAAATAA-----------------------/TGTAAAGTTTCAGTCATGTAAAATAAAAAGTTCTGGAGATCTGCTGGAC AAGACAGAGC 3070 het 3070 ref 40 27 19 4 N/A 0 0 687 CASAVA_Build X 3530419 1D6M5D AATATATATT AACATAAATTAT/-ACATAA----- ATTAATGTAT 3070 het 967 hom 17 2 13 6 N/A 0 0 688 CASAVA_Build X 3534738 2D TTAAAATTAT AC/-- AGTGATTGCT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 AC 1 0 689 CASAVA_Build X 3546512 5I ATTTTTTTCT -----/AAGAG TAGATCTTAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAGAG 0 1 690 CASAVA_Build X 3560505 15I GGGTGGCGAC ---------------/CCTGTCTGAATACAT TCAGCTGTGT 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 CCTGTCTGAATACAT 0 1 691 CASAVA_Build X 3566326 2I AGACTAATAT --/TC TGTTTTAACT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 TC 0 1 692 CASAVA_Build X 3571150 6I TGGCTCTTTA ------/CACCCC CACCCCCACC 3070 het 3070 hom 27 9 10 8 CACCCC 2 3 693 CASAVA_Build X 3603715 3D CTTTGCTTGT TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 TCC 4 3 694 CASAVA_Build X 3619472 55D TCCCCCCGCC CCGGGGGAGTGGGCTACATTACATTCTACCTTCAAGAAAAATAACAATTTTTCGA/------------------------------------------------------- CCATTACACT 3070 het 3070 ref 22 17 11 6 CCGGGGGAGTGGGCTACATTACATTCTACCTTCAAGAAAAATAACAATTTTTCGA 1 0 695 CASAVA_Build X 3629153 1D TTCTTTTTTT C/- CTTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 C 2 1 696 CASAVA_Build X 3648863 18D ATAATGTCAA TGTGGGAAAGCAAAAACG/------------------ TGTGGGAAAG 2977 het 2977 ref 27 13 8 12 TGTGGGAAAGCAAAAACG 2 1 697 CASAVA_Build X 3652957 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 586 het 586 ref 22 9 4 9 A 17 18 698 CASAVA_Build X 3658504 2I AGTCTCCCTG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 33 8 14 11 AC 8 9 699 CASAVA_Build X 3661228 11I CTACTCAAGA -----------/TGGAGTTGCTC TGGTTCAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 TGGAGTTGCTC 0 1 700 CASAVA_Build X 3675502 3D AAGGGTTGAG AAA/--- AAATAAAAAA 2181 het 2181 ref 25 14 5 6 A 6 3 701 CASAVA_Build X 3683507 9I CTCTGAATAT ---------/TCCTAATAG TAGATCCTAT 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 TCCTAATAG 0 1 702 CASAVA_Build X 3684863 1D AAGTAGGGGC T/- TTTTTTTTTT 2226 het 2226 ref 21 10 5 6 T 12 11 703 CASAVA_Build X 3687334 3D TCATTTCATC CAT/--- CATCCACCCA 3070 het 3070 ref 58 29 16 16 CAT 2 1 704 CASAVA_Build X 3687579 2D TATTCATCAT TC/-- TGTCCATTCA 3070 het 3070 ref 52 25 17 11 TC 1 0 705 CASAVA_Build X 3690685 3I AGGGTTTGTC ---/ATA ATGTTTGGCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ATA 0 1 706 CASAVA_Build X 3693742 1I TCTCATGGGC -/T TCAGAGAGAA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 1 2 707 CASAVA_Build X 3697434 1I GCCTAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 1959 het 1959 ref 22 9 6 7 T 9 10 708 CASAVA_Build X 3702605 3D TTCCTTTGCA ACG/--- ACGTATGGGA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 ACG 2 1 709 CASAVA_Build X 3706730 26D3M2I ATAATAAGTG TTGATTGGATTTTAATCCAATTTTAATCC--/--------------------------TCCGT AATGGTAGAT 3070 hom 102 het 27 0 30 11 N/A 0 0 710 CASAVA_Build X 3715469 4I ACAATTTTGT ----/ATCA ATCCACTCCC 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 ATCA 0 1 711 CASAVA_Build X 3717528 1I GGCGGTTGAT -/C AAACTGTCTC 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 C 0 1 712 CASAVA_Build X 3720612 3D GAGGAGGTAA AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 het 2367 hom 33 11 14 8 AGG 5 4 713 CASAVA_Build X 3720888 1I ATAATGTAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 9 10 714 CASAVA_Build X 3730093 2D ACACAGACAC AG/-- AGGAGAAGGC 3070 het 3070 ref 22 13 9 1 AG 2 1 715 CASAVA_Build X 3738476 1I ATGGCCATTT -/C TTTCCCCTGA 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 C 0 1 716 CASAVA_Build X 3741222 1I TCTCTTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 10 11 717 CASAVA_Build X 3743962 1D ATAGGGGGCT C/- CGGGGTGGGC 1309 het 233 hom 12 3 5 4 C 2 1 718 CASAVA_Build X 3749713 5D TAGCTACCAA TCTAC/----- TCTCTATCTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 TCTAC 1 0 719 CASAVA_Build X 3750776 4D GGGGGTGTGA GTGT/---- GTATGTGTGT 3070 het 3070 ref 45 27 13 7 GT 3 1 720 CASAVA_Build X 3754444 1D AAAAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 13 12 721 CASAVA_Build X 3914551 1I GTTGTGGCTT -/A ACACCTGTAA 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 A 1 2 722 CASAVA_Build X 3942857 1D TGTATGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 236 hom 35 4 20 11 T 14 13 723 CASAVA_Build X 3971908 1D TAAAACTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 13 12 724 CASAVA_Build X 3999641 1I TTTGAAAAAA -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 43 26 10 7 T 6 7 725 CASAVA_Build X 4002139 2I ATATATATAA --/TG TATATATATA 3070 het 2362 hom 21 8 8 5 TG 0 1 726 CASAVA_Build X 4002150 2D ATATATATAT GA/-- ATGAATACAT 530 het 530 ref 23 11 2 11 GA 1 0 727 CASAVA_Build X 4009799 5D AGTGTATAAG CATTC/----- CTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 50 23 23 5 CATTC 1 0 728 CASAVA_Build X 4030823 1D TGGTCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3009 hom 40 12 15 14 A 17 16 729 CASAVA_Build X 4035786 4I AGAATGGTGT ----/CCCC AAAGATGTCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 C 0 4 730 CASAVA_Build X 4038110 1D TTTAATAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 11 10 731 CASAVA_Build X 4047608 4D TTGTTCTGAC ATTT/---- ATTATTTTAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 6 ATTT 1 0 732 CASAVA_Build X 4063213 5I TCTTTTCTCC -----/TTTTG TTTTATTTAT 3070 het 3070 hom 37 17 20 0 TTTTG 0 1 733 CASAVA_Build X 4065657 10I GACATTTCTC ----------/AAAAGAGGAT AAAAGAGGAT 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 AAAAGAGGAT 1 2 734 CASAVA_Build X 4065971 1D CATTATAATT A/- AAAAGTCACC 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 A 5 4 735 CASAVA_Build X 4074951 1I CTTTTACTGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2373 hom 29 10 13 6 T 8 9 736 CASAVA_Build X 4093371 3D AATTTTTAGT TTA/--- TTATTATTAT 2884 het 2884 ref 21 10 6 5 TTA 7 6 737 CASAVA_Build X 4097388 1I TGACTCATGC -/A TAAATCTTAC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 0 1 738 CASAVA_Build X 4102071 1D ATGTTGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 11 10 739 CASAVA_Build X 4107519 1D GTTCTGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1232 hom 32 4 18 11 T 15 14 740 CASAVA_Build X 4110570 4D TCAATCTTCT CTGA/---- CTAAGTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 14 7 CTGA 1 0 741 CASAVA_Build X 4116308 19D TCTGCACACA CTCATTGAACATGCACGTG/------------------- CTCATTCTCC 3070 het 3070 ref 27 14 14 6 CTCATTGAACATGCACGTG 1 0 742 CASAVA_Build X 4121734 3I TGATGATGGG ---/GAT GATGATGATC 3070 het 3070 hom 82 28 38 16 GAT 3 4 743 CASAVA_Build X 4129327 1D GCATGACTAT A/- AGTACCAACT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 2 1 744 CASAVA_Build X 4132713 1D AATCTAAGAG A/- AAGATGAACT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 3 2 745 CASAVA_Build X 4142922 1I TTTCTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 2146 het 2146 ref 23 7 6 10 T 11 12 746 CASAVA_Build X 4354797 2D AAGGCAGATG AT/-- ATATATATAT 1347 het 1347 ref 48 39 3 6 AT 7 6 747 CASAVA_Build X 4462403 4I ACATTTATAT ----/AATA AATATATACT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AATA 1 2 748 CASAVA_Build X 4565250 5D GATAAAAATT AAAAG/----- AAAACTACTA 3070 hom 87 het 32 0 30 5 AAAAG 1 0 749 CASAVA_Build X 4584411 1I ATTCCTTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 9 10 750 CASAVA_Build X 4585189 4D TCATTATCTA TCTT/---- CTATTTATCA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 TCTT 1 0 751 CASAVA_Build X 4597477 2I AAAAAGAAAC --/AG ATTTCTTTAG 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 AG 0 1 752 CASAVA_Build X 4600737 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 6 7 753 CASAVA_Build X 4606348 1D TAATTATGTT A/- AAAAACTTAG 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 A 6 5 754 CASAVA_Build X 4607883 4I GTAAGAACTC ----/AAAT AAACTCATCA 3070 het 3070 ref 39 24 15 0 AAAT 0 1 755 CASAVA_Build X 4612112 36D CTGTCTCTAC TATATATATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------------ TATATATATA 2124 hom 15 het 7 0 6 3 TA 25 7 756 CASAVA_Build X 4617252 2I ATAGAAACAC --/AT ATGTAAAATA 1843 het 994 hom 7 2 4 1 AT 1 2 757 CASAVA_Build X 4617332 4D ATATTGATAT TATA/---- TATATTATAT 1461 het 308 hom 4 1 3 0 TA 4 2 758 CASAVA_Build X 4618710 3I CAAACTCCTT ---/AGC AGGCAGTGAG 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 AGC 0 1 759 CASAVA_Build X 4632190 2D TACCTCATAA AT/-- ATATATATAA 3070 het 2649 hom 22 7 14 1 AT 5 4 760 CASAVA_Build X 4632804 2I GGAAGACCTG --/AT ATAAGCAGTT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 AT 1 2 761 CASAVA_Build X 4633748 4I ATTGATTATT ----/TAGA TAGATAAATA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 TAGA 1 2 762 CASAVA_Build X 4684479 1D CCATCTTCAA C/- AACATGCGTG 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 C 1 0 763 CASAVA_Build X 4685183 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTCTTTCTT 162 het 162 ref 11 3 3 6 T 6 3 764 CASAVA_Build X 4698183 1D TTAAAGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 17 10 A 11 10 765 CASAVA_Build X 4702283 6D6M4D50M1D GCGTAAGCAT TTCCACCAACATGGAAAACAGTGATAGTTGTAGTGTGCGCCAGAATCCAGATATCTTCCCAGTATTG/------CAACAT----AACAGTGTTAATGGTAGGGTGCACAGGGATTCAGATATCTTCCCTGTATT- TTTTCCCCAA 3070 het 3070 ref 66 85 12 6 N/A 0 0 766 CASAVA_Build X 4704335 1I TATAAATGAA -/T TTAGAGTCCA 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 T 2 3 767 CASAVA_Build X 4705221 4I TAAATAGATG ----/AATA AATACTTAAA 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 AATA 1 2 768 CASAVA_Build X 4711252 4D AGATAGGTAA AGAT/---- AGATAGATAG 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 AGAT 3 2 769 CASAVA_Build X 4712270 1D GGATTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 11 10 770 CASAVA_Build X 4715635 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1468 het 1468 ref 16 9 6 1 A 12 11 771 CASAVA_Build X 4717369 1I AAAAAACATT -/A AAAAAAATTT 1778 het 1778 ref 18 7 4 7 A 7 8 772 CASAVA_Build X 4717757 6I GTAAATATAA ------/TTAGAC TTAATGAGGC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 TTAGAC 0 1 773 CASAVA_Build X 4735681 6I CTGCTTGTTG ------/TTTATC TTTAATATTT 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 TTTATC 0 1 774 CASAVA_Build X 4776185 1I GCAAAGACTT -/G GAACCAATCC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 G 1 2 775 CASAVA_Build X 4782332 1I ATCACTCACT -/G GATATTTAAC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 G 1 2 776 CASAVA_Build X 4783613 1I15M2I TTCAGATGCA -TTTTTTTTTTGAGAC--/TTTTTTTTTTTGAGACAG AGTCTCACTC 3070 het 3070 hom 35 18 16 5 N/A 0 0 777 CASAVA_Build X 4794097 3I AATATTTCTG ---/TCA TCATAAAGCT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TCA 1 2 778 CASAVA_Build X 4834862 4D TATCTATCTA TATC/---- TATCTTTCTA 3070 het 3070 ref 37 20 17 3 TATC 2 1 779 CASAVA_Build X 4841247 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 743 hom 30 4 20 7 T 13 12 780 CASAVA_Build X 4841949 2I GGAGGTAGAA --/AC ACTGGATAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AC 1 2 781 CASAVA_Build X 4859816 5D TTAATGTCTG AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 13 9 AAAAT 4 3 782 CASAVA_Build X 4870632 1I ATAAAAATAC -/A AGATGCCTAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 A 1 2 783 CASAVA_Build X 4871944 1D ACTAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 13 12 784 CASAVA_Build X 4896733 1I TTCTCACTTA -/T AAGTGGGAGC 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 T 0 1 785 CASAVA_Build X 4902564 6D TGCTCAACAG TCTTTA/------ TCTTTAACTA 2358 het 2358 ref 34 29 5 1 TCTTTA 2 1 786 CASAVA_Build X 4908737 1I GATTCACATA -/T TTTTTATATA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 5 6 787 CASAVA_Build X 4914622 8D TTTGTGTGTT TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 32 12 14 7 TG 9 5 788 CASAVA_Build X 4917222 1D TCCTTCCCTT C/- CTATCCTCTA 3070 hom 92 het 35 0 28 7 C 2 1 789 CASAVA_Build X 4918513 4I TTATTCTGAC ----/TTTG TTTTAGTTAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TTTG 0 1 790 CASAVA_Build X 4920059 1I CTTCCCCAAC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 7 8 791 CASAVA_Build X 4922434 4D CCGTTGATAT TCTG/---- TCTATTAAAT 3070 het 3070 ref 53 26 23 5 TCTG 1 0 792 CASAVA_Build X 4927880 1I GTTCCATTCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 7 8 793 CASAVA_Build X 4939754 1D TTATATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 11 10 794 CASAVA_Build X 4950001 4I CATTCATCTG ----/TCTA TCCATCCATT 3070 het 3070 ref 57 23 17 17 TCTA 0 1 795 CASAVA_Build X 4950851 3I ATTAAATATT ---/TTA TTATTATTTC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 TTA 2 3 796 CASAVA_Build X 4956143 4D GTAGCTATGT TAGA/---- TAGATAGATA 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 TAGA 3 2 797 CASAVA_Build X 4975998 1I TTGCTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 T 10 11 798 CASAVA_Build X 4979552 1I TGGTCTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 4 T 10 11 799 CASAVA_Build X 4982031 4D ATGGATAGAT GATA/---- GATAGATAGA 3070 hom 147 het 52 0 49 4 GATA 5 4 800 CASAVA_Build X 4995950 1I TCTTCAAAAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 9 801 CASAVA_Build X 4997247 2D ATGTAGATGG AT/-- ATATATATAG 3070 hom 105 het 42 0 36 7 AT 5 4 802 CASAVA_Build X 4998692 1I TCTAAACACA -/T TAAGCGATGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 803 CASAVA_Build X 4998992 5D GCTTCCTTTC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 2637 hom 27 het 34 0 10 24 TTTCT 3 2 804 CASAVA_Build X 5003864 2D TTGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 24 1 10 13 T 12 10 805 CASAVA_Build X 5004196 1D TGTCTGTCTT C/- TGAATGCCAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 C 1 0 806 CASAVA_Build X 5008969 3D GGAGAAACGG AGA/--- AGCACTGTGA 3070 hom 93 het 40 0 32 9 AGA 1 0 807 CASAVA_Build X 5020830 2D TAGGTGTTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 57 het 27 0 20 7 AC 9 8 808 CASAVA_Build X 5021362 2I CAAAAACGAG --/AC ACACCACATG 3070 hom 111 het 47 0 37 10 AC 2 3 809 CASAVA_Build X 5026828 9D AAATATTACC AGAGTTTCG/--------- GGAAATTTAT 3070 hom 36 het 11 0 13 0 AGAGTTTCG 1 0 810 CASAVA_Build X 5033707 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 34 0 23 11 A 11 10 811 CASAVA_Build X 5034900 1D GGTAAAACCC T/- GTCTCTACTA 3070 het 3070 ref 22 9 8 7 T 1 0 812 CASAVA_Build X 5041740 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2551 het 2551 ref 28 14 8 6 T 12 13 813 CASAVA_Build X 5046035 1D ATTTAGTGCG T/- TTGCCATGGT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 3 2 814 CASAVA_Build X 5050226 3D GATGATAAAG ATA/--- ATGATGATGA 3070 hom 179 het 64 0 60 5 ATA 1 0 815 CASAVA_Build X 5050410 3D77M1I TTATGATGAA GATGATGATAATGGTAGTGATGATGATGATGAATATGATAATGATGTTGGTGATGAGGGTGTTGACCATGATGATGGCGA-/---GATGATAATGGTAGTGATGATGATGATGAATATGATAATGATGTTGGTGATGAGGGTGTTGATCATGATGATGGCGAT GGTGATGAAG 3070 het 647 hom 77 5 108 15 N/A 0 0 816 CASAVA_Build X 5053028 1D GGGAGATTAT G/- AATGAAGATC 3070 het 3070 ref 45 23 17 6 G 1 0 817 CASAVA_Build X 5054697 5I TGTTTTTAAA -----/TAAAT TAAAGAGAAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TAAAT 0 1 818 CASAVA_Build X 5054854 2I ATTATTAAGA --/TT GTTTCTGTAA 3070 hom 123 het 42 0 42 0 T 0 2 819 CASAVA_Build X 5056059 2D8M12I GAAACTGACA ACACACCTTG------------/--ACACCTTGGGCTCTATCTAA GAGACGGGAT 3070 hom 123 het 43 0 42 5 N/A 0 0 820 CASAVA_Build X 5059705 1D CACTATGTAG T/- TTTTTTATCC 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 7 6 821 CASAVA_Build X 5068430 2I GTTTAAATCC --/TA TAGTCTGTCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TA 1 2 822 CASAVA_Build X 5070618 6D GAAGAATGTC ATACTT/------ ATATAAACGC 3070 het 3070 ref 39 24 12 5 ATACTT 1 0 823 CASAVA_Build X 5071491 1D CTCTGATAAC T/- CTGATAAGAA 3070 het 3070 hom 40 12 17 12 T 1 0 824 CASAVA_Build X 5071535 1D AAGCCTGCTA C/- CAGGAGGCTT 3070 het 3070 hom 38 10 20 8 C 2 1 825 CASAVA_Build X 5073362 1I AGTGAAAAAA -/T AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 0 1 826 CASAVA_Build X 5074333 2I AAGAAAGAAT --/TC TCTCTCTGCG 3010 het 925 hom 25 4 9 12 TC 3 4 827 CASAVA_Build X 5074940 3D AATTTAAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2912 het 2912 ref 29 15 9 5 T 15 12 828 CASAVA_Build X 5078392 1I TTGTTGTTTG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 T 6 7 829 CASAVA_Build X 5079959 1D ATTCTAACAG A/- AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 7 6 830 CASAVA_Build X 5080937 1I GAATTAAAAA -/T TTAAAACAAT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 2 3 831 CASAVA_Build X 5083527 2D TGCTGGGGAG AC/-- ACGGGTTGAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 AC 2 1 832 CASAVA_Build X 5088351 1I CACTTTTCAG -/A AAAAAACGTT 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 A 6 7 833 CASAVA_Build X 5090742 1D TATATATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 49 0 23 26 T 11 10 834 CASAVA_Build X 5094795 1I TTTTGTTTTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 T 7 8 835 CASAVA_Build X 5101762 1D TGAGACTCTG T/- TTTGTACTTT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 4 3 836 CASAVA_Build X 5125489 1I GTTGTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 T 11 12 837 CASAVA_Build X 5127793 5D GCCCAGCTAA TTTTT/----- TTTTTTGTAT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 11 6 838 CASAVA_Build X 5157749 1I TTAAGTTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 447 hom 20 1 19 0 T 9 10 839 CASAVA_Build X 5158157 1D ATAATAATCT C/- CAACCCTGTG 3070 hom 54 het 22 0 19 4 C 2 1 840 CASAVA_Build X 5170149 4I TACTATTCTC ----/AGTT TGTTATTTAT 3070 hom 51 het 18 0 17 1 AGTT 0 1 841 CASAVA_Build X 5184063 8D TGACGGTTAC TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 10 11 12 TTTG 6 4 842 CASAVA_Build X 5190601 1I TTTTTTGGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 8 9 843 CASAVA_Build X 5198146 3D TTCCAAAAGC ATA/--- ATAAGACAAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 ATA 2 1 844 CASAVA_Build X 5205464 1D ACTAGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2214 het 2214 ref 43 30 5 8 A 13 12 845 CASAVA_Build X 5217178 20I GTACTCCAGC --------------------/CTGGGTGACAGAGCAAGACT CTGGCTCAAA 3070 hom 33 het 16 0 11 5 CTGGGTGACAGAGCAAGACT 0 1 846 CASAVA_Build X 5226492 6D AGTTATATAT TATAAA/------ TATAAATATG 1471 hom 7 het 3 0 3 1 TATAAA 2 1 847 CASAVA_Build X 5243838 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1443 het 1443 ref 19 11 4 5 A 13 12 848 CASAVA_Build X 5276321 1D GTGTGTGTGT G/- TTTTTTCCCT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 G 1 0 849 CASAVA_Build X 5307579 1I AAAAACTGGT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 100 het 40 0 36 4 A 8 9 850 CASAVA_Build X 5309150 1D AATTTAAAAA G/- AAATTAATAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 1 0 851 CASAVA_Build X 5381339 1I CTTATGAGGG -/C ACGAATCCCA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 C 0 1 852 CASAVA_Build X 5382138 1D CTTAACTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 6 het 38 1 29 8 T 10 9 853 CASAVA_Build X 5382461 2D TCTCTCTCTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TA 9 8 854 CASAVA_Build X 5395901 1D ATAATGAGTA T/- TTTTTGAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 6 5 855 CASAVA_Build X 5397788 1D ATGAGGATTT A/- AAAAAATCTC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 7 6 856 CASAVA_Build X 5398858 2D TTAGAGTAAC TG/-- TTGTTTACAG 3070 hom 151 het 60 0 51 9 TG 1 0 857 CASAVA_Build X 5400118 13I TAAAATTTGA -------------/TATCTGTTCATGT TAAAAACTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 TATCTGTTCATGT 0 1 858 CASAVA_Build X 5403428 2I TAACTATGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 41 0 32 9 A 12 14 859 CASAVA_Build X 5415934 4I TCCATCTATT ----/TATC TATCTATCAT 3070 hom 154 het 58 0 52 6 TATC 2 3 860 CASAVA_Build X 5416459 1I ATTGAATCTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 32 0 22 10 T 8 9 861 CASAVA_Build X 5417687 3I TATAATAATT ---/ATC ATCATCATAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 ATC 2 3 862 CASAVA_Build X 5418801 1D ATCTAGCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 10 9 863 CASAVA_Build X 5418913 1D TTACTTAAGC A/- CACAGAAATT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 1 0 864 CASAVA_Build X 5419153 7D TTTCTTTTTC TTTTTCT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 TTTTTCT 1 0 865 CASAVA_Build X 5430536 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 7 6 866 CASAVA_Build X 5432109 1D GGCCCATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 70 het 30 0 23 8 T 10 9 867 CASAVA_Build X 5432993 2D AACTACTATT AC/-- ACAGTCATTA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 AC 2 1 868 CASAVA_Build X 5442151 1D GTAGAAAAAA G/- TTTTATGGAG 3070 hom 94 het 36 0 32 5 G 1 0 869 CASAVA_Build X 5467746 1I CTGCATGGGG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 8 9 870 CASAVA_Build X 5477090 1I GTTGTCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1138 hom 34 3 19 12 T 13 14 871 CASAVA_Build X 5479218 1D TTATTATTGA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 7 872 CASAVA_Build X 5491212 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 8 7 873 CASAVA_Build X 5493049 3D AAAAAAAAAA AAC/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAC 1 0 874 CASAVA_Build X 5494164 2D ATATACTCAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 28 0 23 16 TA 6 5 875 CASAVA_Build X 5494277 2D GGCATTACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 32 1 24 7 A 16 14 876 CASAVA_Build X 5494780 1I ATAGGCATGA -/G CCACCCGCGC 1865 hom 12 het 5 0 5 0 G 0 1 877 CASAVA_Build X 5506797 1D GATCAAGTCA G/- GGTAATTGGG 3070 hom 117 het 47 0 39 8 G 3 2 878 CASAVA_Build X 5514033 2D TGAGCACTCA CT/-- CTGTAACAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 5 CT 2 1 879 CASAVA_Build X 5516040 1I AAAATTTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 8 9 880 CASAVA_Build X 5529990 5D TTCTGTGTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 1162 het 205 hom 46 3 12 32 TTTTG 1 0 881 CASAVA_Build X 5538222 1D GACAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 40 1 35 4 A 12 11 882 CASAVA_Build X 5538945 1D GTTGGTAGAT G/- TTGAGACCAG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 G 1 0 883 CASAVA_Build X 5559425 1I8M15I TCTCCCTCCG -TTTAATGC---------------/TTTTAATGCGTGTGTGGACGTGCA CACATCTGTG 3070 hom 75 het 26 0 26 3 N/A 0 0 884 CASAVA_Build X 5559592 1D TCAGCTTGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 401 hom 33 1 29 6 T 10 9 885 CASAVA_Build X 5583392 1I AGGGGTCATA -/T ATAATAGCAG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 0 1 886 CASAVA_Build X 5586148 1I CTGAAAAGAC -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 7 8 887 CASAVA_Build X 5586594 3D TATTAGAATA AGT/--- AATAAGTAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AGT 1 0 888 CASAVA_Build X 5591383 1D ACGAACATGC A/- AAAAAAATGA 733 het 733 ref 72 63 3 6 A 8 7 889 CASAVA_Build X 5591546 1D AACTGACTGC A/- AAAGCACCAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 4 3 890 CASAVA_Build X 5594585 2I AGCCACACCC --/CT GTCGCAAGTC 3070 hom 153 het 56 0 50 6 CT 0 1 891 CASAVA_Build X 5596412 1I AATATTAATC -/A CCAGGTTATA 3070 hom 154 het 60 0 52 8 A 0 1 892 CASAVA_Build X 5628132 1I TATTGAGTGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 8 9 893 CASAVA_Build X 5629870 3D TAAGATAAAA TAT/--- TATAATAAAA 2999 hom 18 het 11 0 7 4 TAT 2 1 894 CASAVA_Build X 5633441 4D TTAGTAACAC TCTG/---- TCTGGGACAT 3070 hom 96 het 36 0 32 5 TCTG 2 1 895 CASAVA_Build X 5650744 1I ATCTAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 29 8 T 12 13 896 CASAVA_Build X 5651357 1I ATATGGTCAC -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 103 het 41 0 35 6 T 6 7 897 CASAVA_Build X 5666600 3D TGTCCTAATA TCT/--- TCTTCTTATA 3070 hom 105 het 36 0 35 1 TCT 3 2 898 CASAVA_Build X 5667316 1D TAAACCTATC T/- TTGACTGGCA 3070 hom 84 het 36 0 28 9 T 3 2 899 CASAVA_Build X 5669788 1D TCTTGCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 13 12 900 CASAVA_Build X 5673984 32D ATAACAGGGC ATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AT 23 7 901 CASAVA_Build X 5681262 14D ATGTAACTGC TTTTTAAAAAATTA/-------------- TTTTTAAAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 5 TTTTTAAAAAATTA 1 0 902 CASAVA_Build X 5682225 1I AGTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 34 0 23 11 A 12 13 903 CASAVA_Build X 5699727 2I TTCACAAACA --/TC TCTGTTTTTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 TC 1 2 904 CASAVA_Build X 5700730 3I AGTTTCCCTC ---/CTT CTTCTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CTT 2 3 905 CASAVA_Build X 5703919 5D TCTTCTACTT ATAGA/----- ATAGAACAAC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 ATAGA 2 1 906 CASAVA_Build X 5706475 13I GACCAGCCTG -------------/GACAACATAGTGA GACCCTGTCT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 GACAACATAGTGA 0 1 907 CASAVA_Build X 5710455 4D TATAGATGGA TATG/---- TATGTAAGTT 3070 hom 111 het 39 0 38 3 TATG 2 1 908 CASAVA_Build X 5717550 4I CCCTCAGGGA ----/ACTT ACTTACAGTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ACTT 1 2 909 CASAVA_Build X 5721686 2D CCATACATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TA 6 5 910 CASAVA_Build X 5738521 1D GTTGAGAAGG C/- AATTTTAAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 C 1 0 911 CASAVA_Build X 5745045 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 A 9 8 912 CASAVA_Build X 5745893 1I AATATCCAAG -/A AAAACACATT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 4 5 913 CASAVA_Build X 5749280 2I GGCACACGGT --/TC TCTCTTGGGA 3070 hom 114 het 41 0 36 5 TC 2 3 914 CASAVA_Build X 5751122 4D GATATTTAAG TATT/---- TATATATTAA 3070 het 2680 hom 14 6 8 0 TATT 1 0 915 CASAVA_Build X 5790658 3I TAATTTGCTC ---/TTG TTGACCCTGA 3070 het 3070 hom 46 21 24 1 TTG 1 2 916 CASAVA_Build X 5793695 3I ACCAATGCCT ---/TGA TTTTAGCCCA 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 TGA 0 1 917 CASAVA_Build X 5794792 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 10 11 918 CASAVA_Build X 5795438 1D CTACTCTTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 25 18 4 T 10 9 919 CASAVA_Build X 5795756 1D AGTATGGGGG A/- AACTGCCCCC 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 3 2 920 CASAVA_Build X 5803031 2D ATCTTTTTTT GG/-- GGGGGGGGGA 1904 het 142 hom 30 3 7 20 G 11 9 921 CASAVA_Build X 5805409 1I TTCTTATTTC -/A ACACACTCCC 3070 hom 132 het 49 0 43 6 A 1 2 922 CASAVA_Build X 5808807 1D AGATAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 15 9 T 12 11 923 CASAVA_Build X 5812902 2D GTCCTGGGGT TG/-- TTCATCTCAT 3070 het 3070 ref 62 34 25 5 TG 1 0 924 CASAVA_Build X 5816163 2D TGTGTTTATA TG/-- TGTGTTTAAT 3070 het 3070 hom 47 21 21 8 TG 3 2 925 CASAVA_Build X 5817175 3D GTCCAAAATG TTA/--- TTATGCTGTG 3070 het 3070 ref 48 27 15 7 TTA 2 1 926 CASAVA_Build X 5826164 4D TTCCCTCTTT TCTC/---- TCTTTCCTTT 2894 het 2894 ref 30 17 9 5 TC 3 1 927 CASAVA_Build X 5852406 1I ACATAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 896 hom 35 2 22 11 A 12 13 928 CASAVA_Build X 5868641 1I TATTCTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1121 hom 33 4 25 4 A 12 13 929 CASAVA_Build X 5885007 2D GTGTGGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1143 het 1143 ref 48 30 4 14 TG 10 9 930 CASAVA_Build X 5888301 1I CCAATTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1463 hom 32 4 19 9 A 13 14 931 CASAVA_Build X 5894818 1I TGTAAAATGT -/C CAAGGCTTCA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 1 2 932 CASAVA_Build X 5909490 4I CAAGAAATTG ----/GTGT GTGTGTTTCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 GT 3 5 933 CASAVA_Build X 5949785 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2040 het 2040 ref 53 36 6 11 T 11 10 934 CASAVA_Build X 5955864 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1477 hom 14 3 10 1 T 13 12 935 CASAVA_Build X 5961081 1D ATGCTACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 11 10 936 CASAVA_Build X 5961277 4I GCAAGCAAAA ----/ACAC ACACAGTAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 AC 2 4 937 CASAVA_Build X 5961770 1D TAAGGATAGC A/- AAAAACTAGC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 A 6 5 938 CASAVA_Build X 5962754 3D TCATCATAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 122 het 51 0 38 16 T 18 15 939 CASAVA_Build X 5963905 1D TTTTCTTAAT G/- GTATTTTCTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 2 1 940 CASAVA_Build X 5965438 2D AGGAAAACCT CA/-- CAGTCACATA 2860 het 2860 ref 20 11 6 3 CA 2 1 941 CASAVA_Build X 5968512 1D TAATTTCTGC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 90 het 40 0 31 10 T 7 6 942 CASAVA_Build X 5973849 4D AATGATGTTC ATCA/---- TCACCATCAT 3070 hom 57 het 22 0 20 9 ATCA 1 0 943 CASAVA_Build X 5978647 4D TCTATCCATC TCTA/---- TCTACCTATA 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 TCTA 2 1 944 CASAVA_Build X 5983687 5D TAAAAATAAT AATAA/----- AATAATGAAA 3070 het 3070 ref 24 11 12 2 AATAA 2 1 945 CASAVA_Build X 5989469 1D TTCTCATCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 10 9 946 CASAVA_Build X 5993404 1D TCTGGCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 23 4 A 11 10 947 CASAVA_Build X 5997329 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1856 hom 22 10 9 4 A 15 14 948 CASAVA_Build X 6006766 10D GAGTGTGGCC CTATTACTCA/---------- CTAAGGAATG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 CTATTACTCA 1 0 949 CASAVA_Build X 6007142 1I ATTAAACCTC -/T TTCCTTTATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 3 950 CASAVA_Build X 6010414 2I GTGTCTCCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 14 7 A 11 13 951 CASAVA_Build X 6021096 2I TGGATAAAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 53 hom 42 1 32 9 A 10 12 952 CASAVA_Build X 6025278 4D CTTTCTTGGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 41 0 33 10 T 14 10 953 CASAVA_Build X 6028855 1I CCACAGTCTT -/G GGAGTTTATA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 G 2 3 954 CASAVA_Build X 6033472 1D AAAGCACAAG C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 35 0 19 16 C 1 0 955 CASAVA_Build X 6036765 1D TGTAGAAATC A/- ATTTTCCATG 3070 het 3070 hom 51 19 27 5 A 2 1 956 CASAVA_Build X 6055053 4I CCCCTTCAAG ----/ATTA ACTTTTCCTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 ATTA 0 1 957 CASAVA_Build X 6061173 3D33M3D CCATCATCAC CATCGTCATCACGATAACCACCATCATCATTATCACCAT/---CGTCATCACGATAACCACCATCATCATTATCAC--- CATCACTATC 3070 het 3070 hom 59 22 29 29 N/A 0 0 958 CASAVA_Build X 6085163 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 548 hom 32 4 22 6 A 11 12 959 CASAVA_Build X 6096383 1D TAAGTTCTGT C/- CGCAACTTCA 3070 het 3070 hom 53 21 23 9 C 2 1 960 CASAVA_Build X 6122230 2I TCTCCAAAAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 63 29 27 7 AT 5 6 961 CASAVA_Build X 6134166 1D GAATTATGAG A/- CCCCCCACTC 3070 hom 137 het 51 0 46 5 A 1 0 962 CASAVA_Build X 6135069 2D TGCACTAGAT TC/-- TCTCTCTCTC 1524 het 1524 ref 57 36 5 17 TC 9 8 963 CASAVA_Build X 6140285 1I GACTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 1320 het 939 hom 14 6 6 4 A 15 16 964 CASAVA_Build X 6143591 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2987 hom 43 14 11 18 A 15 14 965 CASAVA_Build X 6147424 8D CTTTCTTTCC TTCCTTCT/-------- TTCCTTCTTT 1646 het 1646 ref 35 11 7 20 TTCCTTCT 2 1 966 CASAVA_Build X 6183875 3D TTTCTTTCCT TTC/--- TTCTTCTTTC 3070 het 3070 ref 39 15 12 12 TTC 3 2 967 CASAVA_Build X 6187950 4D ATTCACATAC ACAG/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 28 9 13 10 ACAG 1 0 968 CASAVA_Build X 6214752 1D AGGGGAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 706 hom 40 5 25 10 T 15 14 969 CASAVA_Build X 6220228 2D ATATACATGC TA/-- TATATATATA 2114 hom 12 het 6 0 5 2 TA 8 7 970 CASAVA_Build X 6252894 4I TGTATATATG ----/TGTT TGTGTATATA 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 TGTT 0 1 971 CASAVA_Build X 6253989 1D TCTTGCTCTG A/- CTCAAGTGAC 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 A 1 0 972 CASAVA_Build X 6290156 1D AATCTTGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 10 9 973 CASAVA_Build X 6291976 4I GTTATTTATG ----/TATC TATCTATTGC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 TATC 1 2 974 CASAVA_Build X 6305216 1D ATATATCCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 T 10 9 975 CASAVA_Build X 6305712 2D CTTCATATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1739 hom 36 12 14 10 A 14 12 976 CASAVA_Build X 6313392 1D TAAGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2208 het 1897 hom 33 11 8 15 A 17 16 977 CASAVA_Build X 6319169 1D TCTGTGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2763 hom 25 8 11 6 A 12 11 978 CASAVA_Build X 6323800 1I CTCAACTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 564 hom 25 2 17 6 A 12 13 979 CASAVA_Build X 6339738 25I CAAATGTATC -------------------------/TAAAAAAAATTAGTCAGGCATGGGG GTGTGCACCT 3070 hom 99 het 35 0 32 4 TAAAAAAAATTAGTCAGGCATGGGG 0 1 980 CASAVA_Build X 6423942 1I TCCTAAAATT -/G GGCCATGTAA 3070 hom 99 het 36 0 31 5 G 2 3 981 CASAVA_Build X 6430343 1D AGTATCCCCC T/- GTTTTACTGG 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 T 1 0 982 CASAVA_Build X 6433717 1I AAACTGTCCA -/T TTTTATATTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 4 5 983 CASAVA_Build X 6488796 1I AGATCTCTGC -/A AAATCATAGT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 3 4 984 CASAVA_Build X 6529500 1D GGCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTC 2943 het 2943 ref 24 13 7 4 T 10 9 985 CASAVA_Build X 6531024 2I CACTTCTCTC --/TT CTGCCACCCT 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 0 2 986 CASAVA_Build X 6608662 1D AGATTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3056 het 2002 hom 26 7 10 10 T 11 10 987 CASAVA_Build X 6650484 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 13 12 988 CASAVA_Build X 6664074 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 41 1 28 12 A 14 13 989 CASAVA_Build X 6681504 1D CATATAATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 T 9 8 990 CASAVA_Build X 6687942 10I TGCTCGCTAG ----------/CAGTCTGCAA CAGTCTGCAT 3070 hom 123 het 49 0 41 8 CAGTCTGCAA 0 1 991 CASAVA_Build X 6708150 4D GAAAAAATCC TTTG/---- TTTGTGTATA 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 TTTG 2 1 992 CASAVA_Build X 6713648 1D TTACTATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3061 hom 28 7 16 7 A 11 10 993 CASAVA_Build X 6717530 1I AGGGTTTTTT -/A AAAAAGCAGG 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 5 6 994 CASAVA_Build X 6717852 4I GTAGATAGAT ----/ATAG ATAGATAGAG 3070 hom 78 het 34 0 27 8 ATAG 2 3 995 CASAVA_Build X 6717908 4I AAAGACGATT ----/GATA GATAGATGAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 GATA 1 2 996 CASAVA_Build X 6718022 4D TAGATCATAG AGAT/---- AGATAGAGTA 3070 het 3070 ref 44 24 17 5 AGAT 2 1 997 CASAVA_Build X 6719662 3I GCTTTAAAGT ---/GGA GGAGGAAGGA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 GGA 2 3 998 CASAVA_Build X 6722938 1I TTTTCTGCAA -/T TTTTTTTACT 1811 het 1674 hom 17 5 6 6 T 7 8 999 CASAVA_Build X 6726836 1D CCAAATGATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 8 7 1000 CASAVA_Build X 6738130 1D AACGAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 11 9 A 12 11 1001 CASAVA_Build X 6745096 1I ATATATACAC -/A TATATAGTAT 1454 het 1454 ref 6 3 3 0 A 0 1 1002 CASAVA_Build X 6765933 1I TATTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 13 14 1003 CASAVA_Build X 6767935 1D AAAATGTATG C/- CCCCCCCTCC 2615 het 2615 ref 30 20 7 4 C 8 7 1004 CASAVA_Build X 6775387 1D GAATTTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 5 A 10 9 1005 CASAVA_Build X 6780685 2I GAGAGAAAAC --/AA AAGAGGTGAT 3070 het 1763 hom 25 8 13 4 A 2 4 1006 CASAVA_Build X 6781495 1I TTTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 10 8 T 11 12 1007 CASAVA_Build X 6793977 4I TTAAAAAAAA ----/TTTT TTTAAGAGAC 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 T 3 7 1008 CASAVA_Build X 6802177 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 10 9 1009 CASAVA_Build X 6824715 1D CACAGGTGAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 89 het 38 0 28 10 T 9 8 1010 CASAVA_Build X 6836788 2I GTAATATATT --/TC TGTTGTTTAT 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 TC 0 1 1011 CASAVA_Build X 6846500 1I TTTGAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 A 11 12 1012 CASAVA_Build X 6858749 5D ACTTGCTTTC ACTCT/----- ACTCTGCAGA 3070 het 3070 ref 33 21 9 5 ACTCT 2 1 1013 CASAVA_Build X 6869727 1D AAACTTGGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 9 8 1014 CASAVA_Build X 6871462 2D GCTGTGACTC AA/-- AGATGTATTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 A 3 1 1015 CASAVA_Build X 6871592 1D ACTTGATCCA G/- TGTGAGATGT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 G 1 0 1016 CASAVA_Build X 6874756 1D TCTGAAATGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 9 8 1017 CASAVA_Build X 6877420 3D CTCCCTCCTC CTT/--- ATCCTTTTCC 3070 het 3070 ref 48 21 21 8 CTT 1 0 1018 CASAVA_Build X 6878994 2D TGGTTGTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 T 12 10 1019 CASAVA_Build X 6881527 1I AATACACCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 41 het 27 0 20 7 T 9 10 1020 CASAVA_Build X 6883020 3D AAAGACCCTG CCC/--- CCCTACATTC 3070 hom 135 het 48 0 45 6 C 6 3 1021 CASAVA_Build X 6883905 1D ATTACCCCTG A/- ACAATATAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 2 1 1022 CASAVA_Build X 6884443 1D TTTTTAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 13 12 1023 CASAVA_Build X 6890277 1D CTCTGAGGTT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 35 11 17 8 A 9 8 1024 CASAVA_Build X 6890465 1D TCTTCCTTAT A/- AAATAGAAGA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 4 3 1025 CASAVA_Build X 6894332 1I ACATATTGTC -/T TTTCACATAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 4 1026 CASAVA_Build X 6906393 2D TTCTAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 41 13 19 10 AG 9 8 1027 CASAVA_Build X 6907101 5D TCGATTAAAA TTATT/----- TTAATTAATA 3070 het 3070 hom 41 18 21 4 TTATT 1 0 1028 CASAVA_Build X 6920361 7I TCGCCCAGGC -------/CGGACTG TGGAGTGCAG 1107 hom 7 het 4 0 3 1 CGGACTG 0 1 1029 CASAVA_Build X 6927833 2D AAAATAAAAA AT/-- AATAATAATA 713 het 713 ref 23 14 4 5 AT 1 0 1030 CASAVA_Build X 6948379 2I18M4I1M2D ATTCAGGTTG --GCTGTAGTAATTACTTGT----CTT/GTGCACAAGTAATTACTTGTGCACC-- AACCTAACCT 3070 hom 66 het 30 0 20 16 N/A 0 0 1031 CASAVA_Build X 6958157 6D AAAACACTGG CTATTT/------ CTATCTTTCC 2572 het 2572 ref 32 20 7 7 CTATTT 1 0 1032 CASAVA_Build X 6962919 3I GAGTTTTTCA ---/TTT TAAACATCAG 2499 het 2499 ref 23 14 6 3 T 1 4 1033 CASAVA_Build X 6967468 2D GTACCCGGAA TG/-- TGATTGTATT 3070 het 3070 ref 38 25 9 4 TG 2 1 1034 CASAVA_Build X 6969909 3D TCTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2293 het 2293 ref 24 15 6 3 T 14 11 1035 CASAVA_Build X 6970701 1I TTCATTTTTT -/G GGGGGGGGTA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 G 8 9 1036 CASAVA_Build X 6981247 1I CTGCTTGGCT -/A AAGTTGTGAA 3070 het 3070 ref 54 30 18 6 A 2 3 1037 CASAVA_Build X 6982451 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2166 hom 21 6 9 6 A 12 13 1038 CASAVA_Build X 6983831 3D CAAAAAAAGA AAG/--- AAGAATATAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 AAG 2 1 1039 CASAVA_Build X 7012158 1D GCATCTTTGC G/- GGTGAAGACA 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 G 3 2 1040 CASAVA_Build X 7066944 7I TTAGCAAGAT -------/CTTTTTC CTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 CTTTTTC 0 1 1041 CASAVA_Build X 7067601 2I ACACAAGTGG --/GA GAGAGGGTTG 3070 het 3070 hom 67 33 32 2 GA 2 3 1042 CASAVA_Build X 7071183 1I TCCCTAGCAC -/T TTTTTTTTTT 2859 het 2859 ref 26 10 9 7 T 10 11 1043 CASAVA_Build X 7073641 1D CCGAAGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2378 hom 41 16 19 8 T 15 14 1044 CASAVA_Build X 7076988 1D AACAGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 11 9 T 12 11 1045 CASAVA_Build X 7092886 2D CCATCTTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 A 12 10 1046 CASAVA_Build X 7094044 1D TGTCGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 2170 het 1841 hom 34 13 6 15 T 19 18 1047 CASAVA_Build X 7105448 3D TTTTTCTGTG TCA/--- TCATGTCAAT 1415 het 1415 ref 11 8 3 1 TCA 2 1 1048 CASAVA_Build X 7124147 3I GAAAACAAAT ---/AGA AGTTTATTAA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 AGA 0 1 1049 CASAVA_Build X 7124554 1D GTACTGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 25 16 11 A 11 10 1050 CASAVA_Build X 7127918 1D TGCTAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 A 11 10 1051 CASAVA_Build X 7137594 2I GAATTCGAAT --/AC AGATGAATAC 2405 hom 12 het 5 0 5 0 AC 0 1 1052 CASAVA_Build X 7154840 1D GAGGCTGAGG T/- TGGGAGGATT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 2 1 1053 CASAVA_Build X 7155490 1I CAAATCGTTG -/T TTTTTTTTTT 3057 het 3057 ref 37 12 13 12 T 15 16 1054 CASAVA_Build X 7164699 4D TAAAGCTAAC TTAT/---- TTATTAAAGG 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 TTAT 2 1 1055 CASAVA_Build X 7164920 1I AAGACCATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 33 1 26 6 T 11 12 1056 CASAVA_Build X 7166779 3D AGGCTAAGGC AGG/--- AGGATTGCTT 3070 het 3070 hom 35 12 23 1 AGG 2 1 1057 CASAVA_Build X 7167923 1D TCTAAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3016 het 90 hom 27 2 13 12 T 17 16 1058 CASAVA_Build X 7174510 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1106 hom 10 het 5 0 3 2 T 11 12 1059 CASAVA_Build X 7176714 5I AAGAATTTTT -----/CTTAA CTTGTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTTAA 0 1 1060 CASAVA_Build X 7178642 1I TTTAGCATTT -/A AGCAGATTAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 1 2 1061 CASAVA_Build X 7185870 2D GTTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 22 18 7 TG 7 6 1062 CASAVA_Build X 7194216 2D ATATTTTAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 AT 7 6 1063 CASAVA_Build X 7199040 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3007 het 1293 hom 22 7 12 3 T 13 14 1064 CASAVA_Build X 7202163 2D GAAGCTGGGC TG/-- TGTGAGAGTA 3070 het 3070 ref 50 26 21 4 TG 3 2 1065 CASAVA_Build X 7216199 1I TTTTCCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 10 11 1066 CASAVA_Build X 7229275 1I CAACGAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 A 10 11 1067 CASAVA_Build X 7237640 1I ACTTCTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 10 11 1068 CASAVA_Build X 7416403 1I TCTCTATTGT -/A AACTTTTATA 3070 het 2164 hom 33 7 18 8 A 2 3 1069 CASAVA_Build X 7448491 1D AATGAAGATT A/- TATATGAACT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 1 0 1070 CASAVA_Build X 7471677 1D AATCTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2720 hom 27 6 13 8 A 12 11 1071 CASAVA_Build X 7478571 1D TGCATTAACA T/- TTTTTTTTTT 2368 het 2368 ref 45 28 6 11 T 13 12 1072 CASAVA_Build X 7494262 1D TCATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2494 hom 18 7 8 3 T 11 10 1073 CASAVA_Build X 7499041 4I GTAGGAGACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 48 12 21 15 AAAC 3 4 1074 CASAVA_Build X 7504907 1D TTTCCAGAGC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 8 7 1075 CASAVA_Build X 7515786 1D TCCCCCCCCC G/- CCCCACCCCA 1056 het 42 hom 8 0 3 5 G 1 0 1076 CASAVA_Build X 7543008 1I CAGAGGGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 28 1 20 7 A 11 12 1077 CASAVA_Build X 7550765 8D TCCTTTCCTT TTCCTTCC/-------- TTCCTTCCTT 3070 hom 31 het 19 0 11 10 TTCC 5 3 1078 CASAVA_Build X 7550882 4I CTTCCATCCA ----/TCCT TCCTTCCTTC 2571 hom 32 het 20 0 9 11 TCCT 3 4 1079 CASAVA_Build X 7565011 1D AACAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 11 10 1080 CASAVA_Build X 7576204 1I GGCTGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2909 hom 32 12 11 9 A 12 13 1081 CASAVA_Build X 7582076 1I TTTCTAATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 424 hom 37 1 26 10 T 9 10 1082 CASAVA_Build X 7750736 12D ATTATGAGCT ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 41 14 16 16 AC 15 9 1083 CASAVA_Build X 7769345 2D CCAGATGGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 7 A 12 10 1084 CASAVA_Build X 7773011 2D CTCAGGAGAC AG/-- AAAGTACAAT 2349 het 2349 ref 19 13 5 2 AG 1 0 1085 CASAVA_Build X 7775850 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1455 het 757 hom 6 3 3 1 A 14 12 1086 CASAVA_Build X 7783023 1I TATCTACTCC -/A AAAAAAAAAA 2228 het 2228 ref 31 9 12 10 A 11 12 1087 CASAVA_Build X 7784785 1I13M1D CTTTGTGTCA -TTTTTTGTATGTCT/TTTTTTTGTATGTC- TTTGATTTGG 3070 het 3070 ref 35 18 16 7 N/A 0 0 1088 CASAVA_Build X 7790303 1I ATCTAAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 A 10 11 1089 CASAVA_Build X 7795732 1D ATAAGATTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 9 8 1090 CASAVA_Build X 7798316 1I TTTATTTATA -/C TTAGTTCACT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 C 0 1 1091 CASAVA_Build X 7799855 1D CTATAAAGAT G/- AAACTAAGTC 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 G 1 0 1092 CASAVA_Build X 7802678 4D AAAGGAAAAA AGAG/---- AGAAGGCTGC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 AG 3 1 1093 CASAVA_Build X 7803403 4D GCTTCTTTTT TTAA/---- TTAATTAATT 3070 het 2013 hom 15 6 9 1 TTAA 4 3 1094 CASAVA_Build X 7805231 1I AGAGAAACTC -/T TATCACTGGA 3070 het 3070 hom 56 25 29 2 T 1 2 1095 CASAVA_Build X 7813113 1I TAGGGCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 10 11 1096 CASAVA_Build X 7817837 1D CAGCTAATTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 9 8 1097 CASAVA_Build X 7821677 4D AGGAACCTGC TTTA/---- TTTGTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 TTTA 1 0 1098 CASAVA_Build X 7823015 1D TATAATATGC A/- ACCAAAATGT 3070 het 3070 ref 45 25 19 2 A 2 1 1099 CASAVA_Build X 7938042 1I TAAAAAAAAA -/T CATATTATTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 0 1 1100 CASAVA_Build X 7952999 2I TTTTGCCTTT --/AA TTTCAAACAC 3070 hom 75 het 30 0 26 8 A 0 2 1101 CASAVA_Build X 7959365 8I ACTCTCACCA --------/AAACCCCT ACAGAGTCCT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AAACCCCT 0 1 1102 CASAVA_Build X 7960006 1D AAAATCTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 11 10 1103 CASAVA_Build X 7961085 1D GTCTACTTCA C/- CTGACTTCTG 3070 hom 96 het 36 0 32 5 C 2 1 1104 CASAVA_Build X 7981175 1D TCACAGCTGG C/- TTTACTCAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 C 1 0 1105 CASAVA_Build X 7989788 1D TATATATATA T/- CTATATATTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 0 1106 CASAVA_Build X 7999806 2I GCCTGCAGAC --/AT GTGTGATTCA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AT 0 1 1107 CASAVA_Build X 8013081 1D TGTTTGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 11 10 1108 CASAVA_Build X 8016617 1D GAGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1182 het 1182 ref 35 28 3 4 T 12 11 1109 CASAVA_Build X 8018576 1D GCTTCTGGAC T/- TTTCATGGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 4 3 1110 CASAVA_Build X 8031531 1D AGGATGTGAC A/- AAAAAAAAAA 1723 het 1723 ref 44 35 6 4 A 13 12 1111 CASAVA_Build X 8052154 4D TAACTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 928 hom 24 het 11 0 9 2 TTTC 3 2 1112 CASAVA_Build X 8080105 1I AACTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 16 10 T 13 14 1113 CASAVA_Build X 8080219 3D AATTAAAATC CAG/--- CATGTATTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 CAG 1 0 1114 CASAVA_Build X 8091853 10D GGCAAGACTG GGCTAATTCT/---------- AATTCCATTG 3070 hom 54 het 22 0 19 4 GGCTAATTCT 1 0 1115 CASAVA_Build X 8106005 1I TCCCCATGCC -/T TTTTTTTTGA 2124 het 1747 hom 38 9 11 18 T 8 9 1116 CASAVA_Build X 8123600 1I CTTCACGGAT -/C ACTACAAAGT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 0 1 1117 CASAVA_Build X 8140366 1D AAACAAGAAC A/- AAAAAAAAAA 1295 het 1295 ref 36 13 6 17 A 16 15 1118 CASAVA_Build X 8142741 1D AACATTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 11 10 1119 CASAVA_Build X 8154328 1I CTTTAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 11 12 1120 CASAVA_Build X 8186352 1D CATTTAATTT A/- AAAAAATGAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 6 1121 CASAVA_Build X 8189976 2I ATAGATAAAC --/AT AGGAAAAACC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AT 0 1 1122 CASAVA_Build X 8190914 1D AAAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 1553 hom 15 het 8 0 6 2 T 1 0 1123 CASAVA_Build X 8195000 1D GCACTTGGAT A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 8 7 1124 CASAVA_Build X 8196748 2D AAATGAAGAC AG/-- ATCATTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 1 0 1125 CASAVA_Build X 8199169 3D AAGAAACTAC CAT/--- CATCAGAGTG 3070 hom 72 het 25 0 24 1 CAT 2 1 1126 CASAVA_Build X 8200262 1I GCTCCTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 41 1 35 5 A 11 12 1127 CASAVA_Build X 8209699 4D CTCAATAGTT AGTC/---- AGTAACTTTG 3070 hom 96 het 35 0 33 6 AGTC 1 0 1128 CASAVA_Build X 8210738 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 11 10 1129 CASAVA_Build X 8217866 1I CTTGTGGTCT -/G GGGCCAGCTT 3070 hom 56 het 24 0 19 5 G 3 4 1130 CASAVA_Build X 8221105 2I8M7I TGAAATTGAA --AAAAAAAT-------/ACAAAAAAATACAAAAG TGAAATAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 4 N/A 0 0 1131 CASAVA_Build X 8232037 1D GATCCATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 46 0 37 9 T 11 10 1132 CASAVA_Build X 8235342 2D GCAAGACTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 T 13 11 1133 CASAVA_Build X 8246564 1D CCAGCAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 38 0 30 9 A 12 11 1134 CASAVA_Build X 8249003 2D CCTGACTCAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 11 9 1135 CASAVA_Build X 8254663 1D ATAATAGGGC A/- TTTAATTGGG 3070 hom 90 het 37 0 30 9 A 1 0 1136 CASAVA_Build X 8263521 12D GGCCCTGTTT CCAGCTCTCCCA/------------ CCAGCCTCTC 3070 hom 69 het 25 0 24 3 CCAGCTCTCCCA 1 0 1137 CASAVA_Build X 8271626 4D ATTTATTTAT TTAC/---- TTACTTATTT 3070 hom 60 het 26 0 20 7 TTAC 2 1 1138 CASAVA_Build X 8284678 12D GAGACCAGCC TGAACAACATAG/------------ TGACATCCCA 3070 hom 44 het 16 0 15 1 TGAACAACATAG 1 0 1139 CASAVA_Build X 8291640 1I TCATAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 866 hom 35 3 22 10 T 13 14 1140 CASAVA_Build X 8294992 1D ATCACGGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 271 hom 33 1 31 2 A 10 9 1141 CASAVA_Build X 8302424 1I AAGCAACTTC -/A AAAAAAATGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 7 8 1142 CASAVA_Build X 8307993 1I AATCAATGAG -/C CATAATATTT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 C 1 2 1143 CASAVA_Build X 8309595 1D AGATGCATAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 8 7 1144 CASAVA_Build X 8311991 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 11 10 1145 CASAVA_Build X 8317860 1D ACAAACAAAC A/- AACAACAACA 3059 het 1637 hom 46 8 12 26 A 3 2 1146 CASAVA_Build X 8328804 1D TGAAACATAA T/- AAAATTAACC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 1 0 1147 CASAVA_Build X 8331945 1I TTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1031 hom 34 3 29 2 T 10 11 1148 CASAVA_Build X 8336116 8I CTGCAGGCAA --------/GGCTGGAG GGCTGGAGTG 3070 hom 129 het 52 0 42 10 GGCTGGAG 1 2 1149 CASAVA_Build X 8337830 1D TGCTGTCATA T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 7 6 1150 CASAVA_Build X 8340482 1I ACTCGGGAGG -/C TGAGGCAGGA 1460 hom 12 het 6 0 4 2 C 0 1 1151 CASAVA_Build X 8342722 1D ATCATTATAT A/- AAAAAATACA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 6 1152 CASAVA_Build X 8364251 1I ACTTAATAAC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 8 9 1153 CASAVA_Build X 8369440 1I CCTTCCCGTA -/T ATTATCTTGT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 0 1 1154 CASAVA_Build X 8385449 1I AAACTCTTGC -/A ATTTGCTGGA 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 A 1 2 1155 CASAVA_Build X 8399440 1I GCAGGGGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2802 hom 23 7 11 5 T 9 10 1156 CASAVA_Build X 8402342 1D TGGATTAAAA G/- TGAATCCAGT 3070 het 3070 hom 49 15 26 8 G 1 0 1157 CASAVA_Build X 8403850 1D TGGGCAACAG A/- AAAAAAAAAA 2744 het 2744 ref 26 12 8 6 A 14 13 1158 CASAVA_Build X 8408991 3D CAACTGTATG TTA/--- TTATGAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 TTA 2 1 1159 CASAVA_Build X 8417055 1D TTTAGCTATA T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 T 7 6 1160 CASAVA_Build X 8427088 2D AAAGAAAAAA GG/-- AAGAAGAAGG 3070 het 3070 hom 26 8 10 9 G 2 0 1161 CASAVA_Build X 8427202 2I AGAGAGAGAA --/AG AGAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 12 AG 1 2 1162 CASAVA_Build X 8427278 4D AAAGAAAAAG AAGA/---- AAGAAAGAGA 1600 het 1600 ref 22 10 7 8 AAGA 3 2 1163 CASAVA_Build X 8434011 6I ATTTTATTTT ------/ATTTTA ATTTTTATTT 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 ATTTTA 0 1 1164 CASAVA_Build X 8434678 1D GCAATTGTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 10 9 1165 CASAVA_Build X 8440755 3D CATTGTCAAA TTG/--- TTGTTGTTTT 1500 het 1500 ref 31 18 8 5 TTG 3 2 1166 CASAVA_Build X 8443643 1D CTGAGGCAGG A/- GAATGGCATG 1669 het 1669 ref 13 6 5 2 A 1 0 1167 CASAVA_Build X 8448784 2I TGAGAGTAAT --/TA TATATATATA 2155 het 2155 ref 20 10 5 5 TA 7 8 1168 CASAVA_Build X 8462033 3D GAAAGGAGAA AAG/--- AAGAGAGGGA 3070 hom 79 het 33 0 26 8 AAG 2 1 1169 CASAVA_Build X 8487400 1I CTATTGTCCA -/T TTAAAAGTGT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 2 3 1170 CASAVA_Build X 8490513 3I GCAAAAATGG ---/AAT AATATCATAT 3070 hom 116 het 43 0 39 4 AAT 1 2 1171 CASAVA_Build X 8495490 1D CTCTGCCTTC A/- AAAGTGCCCA 3070 het 3070 ref 36 18 13 7 A 4 3 1172 CASAVA_Build X 8502345 1D TCCATTTACC A/- AAAAAAAAAA 1891 het 1891 ref 30 16 5 10 A 17 16 1173 CASAVA_Build X 8588666 1I TAAAAAGAAA -/T ATTTTTAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 1 1174 CASAVA_Build X 8597637 1I CAAAACTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 11 12 1175 CASAVA_Build X 8661874 2D CTCAGGTGAG AA/-- ATCAGTGGCA 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 A 3 1 1176 CASAVA_Build X 8708053 4D AAATGGTAAT AATC/---- AAGCTAAAAT 1383 het 1383 ref 24 19 3 2 AATC 1 0 1177 CASAVA_Build X 8768130 5I GTGTTCACCT -----/AAACA AATTTTTCTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAACA 0 1 1178 CASAVA_Build X 8800195 1D CATGCTTAAT A/- AAGCAGGAAA 3070 het 3070 ref 57 26 25 8 A 3 2 1179 CASAVA_Build X 8822923 4I ATACAGAGAC ----/AATT AATCCAGAAA 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 AATT 0 1 1180 CASAVA_Build X 8826412 1D CTTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 11 10 1181 CASAVA_Build X 8827398 1D AAATTTGATC T/- ATTTTAATGT 3070 het 3070 ref 53 22 20 11 T 1 0 1182 CASAVA_Build X 8844137 1D CCACCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 1183 CASAVA_Build X 8847853 1I TGGCCTCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 8 10 T 11 12 1184 CASAVA_Build X 8849235 1I AAATATTCAG -/A AAAAAATTGC 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 6 7 1185 CASAVA_Build X 8850464 1I TTTTATTAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 47 14 28 5 T 9 10 1186 CASAVA_Build X 8866116 1D AATAATTTTC T/- TTTTCCATTG 3070 het 3070 hom 40 15 23 4 T 5 4 1187 CASAVA_Build X 8875024 1I ATTCACTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 265 hom 27 1 16 10 T 15 16 1188 CASAVA_Build X 8881693 1I AAGCTGAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 9 10 1189 CASAVA_Build X 8899772 1D GCTGATTCTT C/- TGCTTGTTGA 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 C 1 0 1190 CASAVA_Build X 8914078 1I ATTAATGAAA -/C AATAACCAGA 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 C 0 1 1191 CASAVA_Build X 8918892 1I CTGTATCTCA -/T GGTATGAGGC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 0 1 1192 CASAVA_Build X 8921503 1D ATTCTTGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 11 10 1193 CASAVA_Build X 8923041 1D AAAAAAACAT A/- AAAGAACATG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 4 3 1194 CASAVA_Build X 8945351 4D ATACAGTAAT AAAG/---- AAAGTTGTAT 3070 het 3070 hom 23 12 11 2 AAAG 2 1 1195 CASAVA_Build X 9042244 14D CAGTATTCAC AAATATACTAATTA/-------------- ACACCCCGAT 3070 het 3070 ref 40 25 13 5 AAATATACTAATTA 1 0 1196 CASAVA_Build X 9060462 1D GGGTGTGTGT G/- GGGGGGGCGG 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 G 8 7 1197 CASAVA_Build X 9141571 1I AAGAATTCAG -/T TGCACTTAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 1 2 1198 CASAVA_Build X 9144987 2D CGGGGAGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 646 hom 15 het 6 0 5 2 A 12 10 1199 CASAVA_Build X 9167783 1I GCTTTCTTCG -/A AAAACTACTC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 4 5 1200 CASAVA_Build X 9191879 3I GGAACACTGC ---/CAA CAACATACAA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 CAA 1 2 1201 CASAVA_Build X 9195128 1D TAATGTTCAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 A 9 8 1202 CASAVA_Build X 9198690 1I CAGACGCAGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 G 1 2 1203 CASAVA_Build X 9205004 4I TGTTTGTCAT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 TTTG 3 4 1204 CASAVA_Build X 9216193 1I TTACACAGAA -/C AATCCTGCAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 0 1 1205 CASAVA_Build X 9222066 3I ACCAGTTTAC ---/TTG TTGTGATTGG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TTG 1 2 1206 CASAVA_Build X 9230334 1I TATTTATTTG -/T TTTTTTTTTT 2523 het 2523 ref 28 18 6 4 T 13 14 1207 CASAVA_Build X 9233007 1D CTTCATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 26 0 16 10 T 15 14 1208 CASAVA_Build X 9242029 1D ACAAAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 A 10 9 1209 CASAVA_Build X 9249817 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1049 het 339 hom 12 3 3 6 A 16 15 1210 CASAVA_Build X 9260851 1D GCTCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 13 12 1211 CASAVA_Build X 9260952 1D GAAGCCCCTG C/- CCTGTACCCT 3070 hom 83 het 33 0 26 8 C 3 2 1212 CASAVA_Build X 9261451 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 10 9 1213 CASAVA_Build X 9263747 1I52M2I CTTTAATGAG -TTTTTTTTTTTTGGTCTACTTGCAGGTAATTTATAAGTAGGTGAATTTTGAC--/TTTTTTTTTTTTTTGTCTACTTGCAGGTAATTTATAAGTAGGTGTATTTTGACTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 26 16 N/A 0 0 1214 CASAVA_Build X 9293527 8D ACAGTATTTG TTTTTTTT/-------- TTTGTGACTG 3070 het 3070 hom 41 18 19 6 T 11 3 1215 CASAVA_Build X 9296406 1I CCACAGCGCT -/G GTCAACAGCT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 G 1 2 1216 CASAVA_Build X 9309895 12I GCACATTCCT ------------/AGGCCCCACCCC AGATCTATTG 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 AGGCCCCACCCC 0 1 1217 CASAVA_Build X 9313347 1D AAGCATAATG T/- TTTTCCCCTT 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 T 5 4 1218 CASAVA_Build X 9328176 1I AGAAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 2784 het 2784 ref 30 16 10 4 A 11 12 1219 CASAVA_Build X 9335975 1I GTGCACTTGG -/C GTTATTTATT 2189 het 2189 ref 26 20 5 1 C 0 1 1220 CASAVA_Build X 9336183 1D CCTGAATGCT A/- TTGTTCAGCT 3070 het 3070 ref 46 25 16 6 A 1 0 1221 CASAVA_Build X 9344465 1D TTCTCGTATC T/- TTTTATTCCC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 5 4 1222 CASAVA_Build X 9344561 2I TGAAGGAGAC --/AG AGAGAGAGAG 2715 het 2715 ref 41 14 13 14 AG 7 8 1223 CASAVA_Build X 9351449 8D CAGCTAATTT TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 1541 het 1541 ref 13 7 4 2 TTTA 5 3 1224 CASAVA_Build X 9369164 1I CACAAGACTC -/T TAACAGAAAA 2517 het 2517 ref 23 15 6 2 T 1 2 1225 CASAVA_Build X 9385303 2D GGCTCACACC TA/-- TATAATCCCA 2332 het 1901 hom 12 5 7 0 TA 3 2 1226 CASAVA_Build X 9388670 1D AATAATAGGC T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 81 het 30 0 26 5 T 8 7 1227 CASAVA_Build X 9395659 1I TTGTAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 29 2 26 1 T 12 13 1228 CASAVA_Build X 9404816 3I AAGACAGTAA ---/CTT CTTATTAGGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CTT 1 2 1229 CASAVA_Build X 9414280 1I TGATAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 12 13 1230 CASAVA_Build X 9418184 1I TTTTTAAACA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 8 9 1231 CASAVA_Build X 9438556 16D ACTGTGGCCC ACGGGGCCGTGTCCAG/---------------- ACTTGGCACA 3070 het 3070 ref 37 21 17 6 ACGGGGCCGTGTCCAG 1 0 1232 CASAVA_Build X 9442375 1I ACTGTGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 10 11 1233 CASAVA_Build X 9447067 1D GTGCTGACCC A/- ATCTCCTGCC 3070 het 3070 ref 58 32 19 7 A 2 1 1234 CASAVA_Build X 9448802 1I GGGGGAAGGA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 7 8 1235 CASAVA_Build X 9462520 1D TATTGTGGAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 T 8 7 1236 CASAVA_Build X 9469358 2D TCCAGTGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 16 10 A 13 11 1237 CASAVA_Build X 9496759 24D TCTATCTGCA GTGTGCTGTGTGTGTGTCTGTGTT/------------------------ GTGTGCTGTT 3070 het 3070 ref 66 41 23 20 GTGTGCTGTGTGTGTGTCTGTGTT 1 0 1238 CASAVA_Build X 9498719 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2933 het 48 hom 22 2 9 11 T 17 16 1239 CASAVA_Build X 9518417 1I TTTTTTTAAA -/G AAAGTCAGAT 3070 het 3070 ref 36 24 11 1 G 0 1 1240 CASAVA_Build X 9521001 1I CATGGGAAAT -/A ATATTTCTTC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 1 2 1241 CASAVA_Build X 9528516 2I GGGCGGGGGG --/GA GGGGGTACAC 2203 het 135 hom 15 2 8 5 GA 0 1 1242 CASAVA_Build X 9539163 2D GTATGGAAAC TG/-- TGAATGGAGA 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 TG 2 1 1243 CASAVA_Build X 9587109 1I AAGAGATCCT -/C CCCCCCCGGC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 C 7 8 1244 CASAVA_Build X 9587425 1I GTGTGACGTC -/T TTTCACTCAA 3070 hom 150 het 54 0 49 5 T 3 4 1245 CASAVA_Build X 9596414 1D TTGGAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 14 13 A 15 14 1246 CASAVA_Build X 9619768 1I ATGTCAGGGT -/G GGGGGGCGCT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 G 6 7 1247 CASAVA_Build X 9626947 1I ACATGCGTTA -/G CCCAGGGCTC 3070 hom 69 het 27 0 22 5 G 0 1 1248 CASAVA_Build X 9633485 1I CAGTGAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 9 10 1249 CASAVA_Build X 9641003 1D ACACAGCCTT C/- CCCCTGCCCC 3070 het 3070 ref 50 23 17 10 C 5 4 1250 CASAVA_Build X 9645247 1D TTTACAGGAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 23 8 12 4 A 9 8 1251 CASAVA_Build X 9647677 1D CTCTTTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 13 12 1252 CASAVA_Build X 9659838 1D ATAAGGAATT G/- GGGGGGGGGG 405 het 405 ref 32 6 2 24 G 12 11 1253 CASAVA_Build X 9689680 1D TAAACACAAC A/- TTTAAAATTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 A 1 0 1254 CASAVA_Build X 9695214 1D CATACTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 11 10 1255 CASAVA_Build X 9701037 5I GTTGATGCTA -----/TTATT TTAAATGTTT 3070 het 3070 ref 54 23 26 5 TTATT 0 1 1256 CASAVA_Build X 9702185 1I TCTCTTAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 A 8 9 1257 CASAVA_Build X 9702392 3D AGGGCAGCTC ACA/--- ACAAGGCCGG 2267 het 2267 ref 32 13 9 11 ACA 2 1 1258 CASAVA_Build X 9702685 2I ATCCTGGGGT --/GA CTCTAGGTAG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 GA 0 1 1259 CASAVA_Build X 9702884 1D CACATAAGGA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 8 7 1260 CASAVA_Build X 9716033 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2963 het 163 hom 16 1 10 5 T 12 11 1261 CASAVA_Build X 9716322 1D CTTCTAATCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 31 0 26 5 T 11 10 1262 CASAVA_Build X 9717467 1I CAGTTGGTGG -/A AAAAAATGCA 3070 het 462 hom 40 2 35 3 A 6 7 1263 CASAVA_Build X 9718013 1D GCTTGGAGGT C/- CCCCCCACCT 3070 hom 47 het 26 0 18 9 C 7 6 1264 CASAVA_Build X 9719179 1I TTATCTTTTG -/A AAAAAAAAAA 956 het 956 ref 46 35 3 8 A 11 12 1265 CASAVA_Build X 9723771 1I TATCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 30 2 20 8 T 11 12 1266 CASAVA_Build X 9745323 1D TCCCTCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 25 1 12 13 T 15 14 1267 CASAVA_Build X 9749469 3D GGTACTTTGC AAG/--- AAGGAGGGGG 3070 hom 78 het 28 0 27 4 AAG 2 1 1268 CASAVA_Build X 9762721 1I CACAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 31 0 17 19 A 10 11 1269 CASAVA_Build X 9764637 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 1270 CASAVA_Build X 9769297 1D TGCCTGGCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 50 het 24 0 20 4 T 10 9 1271 CASAVA_Build X 9773948 1I CCTTGAGCCT -/C CCCCAACCCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 4 5 1272 CASAVA_Build X 9780217 1I AGTGCCCATG -/A AAAAGGTAGA 3070 hom 143 het 56 0 48 8 A 4 5 1273 CASAVA_Build X 9787334 2I GGCTTTAGAC --/AG AACGTCGCTT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 AG 0 1 1274 CASAVA_Build X 9791645 1I TTATTTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 181 hom 29 1 21 7 T 9 10 1275 CASAVA_Build X 9793071 6D AAAGCAAACC TATGAG/------ TATAAGTAAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TATGAG 1 0 1276 CASAVA_Build X 9822163 1I TCTGTTTGGT -/A AAAAGCCATG 3070 hom 156 het 56 0 52 4 A 4 5 1277 CASAVA_Build X 9825611 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAACT 3070 hom 28 het 25 1 19 5 A 10 8 1278 CASAVA_Build X 9866152 1D CACAGGAGGG C/- CCCCCCCACA 3070 het 2796 hom 26 8 12 6 C 8 7 1279 CASAVA_Build X 9888944 1D CATAGTGAAA C/- CCCCATCTCT 3070 het 1983 hom 14 5 9 0 C 5 4 1280 CASAVA_Build X 9894682 1D ATGAACCACC A/- ATTTCACTCC 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 A 2 1 1281 CASAVA_Build X 9897478 6D TGCACGCGCG CACACA/------ CACACACACA 2364 het 2364 ref 22 9 8 5 CA 8 5 1282 CASAVA_Build X 9899227 2D TTTTACTATT TC/-- TGTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 TC 1 0 1283 CASAVA_Build X 9902704 1I GGGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 9 10 1284 CASAVA_Build X 9905191 1I TATTTCTTCA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 18 het 19 0 12 7 T 7 8 1285 CASAVA_Build X 9940318 12D GCCTCAGCCT GATCCCATGGGG/------------ GATCCCATGG 3070 hom 70 het 31 0 20 12 GATCCCATGGGG 2 1 1286 CASAVA_Build X 10014762 2I TATCCCCAAA --/CT CTGCTTCATT 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 CT 1 2 1287 CASAVA_Build X 10023148 1I AAAGAGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2630 hom 29 8 13 8 T 13 14 1288 CASAVA_Build X 10024314 2I TGTACCAGCT --/GA GAGAGTCTGC 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 GA 2 3 1289 CASAVA_Build X 10025349 2D AAACTCGTGT CG/-- ATAAATTCAC 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 CG 1 0 1290 CASAVA_Build X 10044972 8I CCCAGCCCCA --------/GTGAGCCC GTGGGAGCCC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 GTGAGCCC 0 1 1291 CASAVA_Build X 10076393 12I AGGAGGCTGA ------------/GGTGGGAGAATT GCTTGAGCCC 3070 hom 36 het 13 0 13 1 GGTGGGAGAATT 0 1 1292 CASAVA_Build X 10091404 1I TGTGCAGGAA -/T TTTTTTTTTT 2694 het 2694 ref 22 9 8 5 T 13 14 1293 CASAVA_Build X 10122002 1D ACAGGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 11 14 T 12 11 1294 CASAVA_Build X 10139321 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAGA 3070 het 22 hom 22 1 16 5 G 0 1 1295 CASAVA_Build X 10193585 1I GAGGTCTGAG -/A AAGGCCATTG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 2 3 1296 CASAVA_Build X 10194837 3I GGATTTGCTT ---/ATC ATCCATCCAG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 ATC 1 2 1297 CASAVA_Build X 10202739 1D TATAGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 8 13 10 A 13 12 1298 CASAVA_Build X 10204820 1D CTTTCCGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 10 9 1299 CASAVA_Build X 10206046 1I ACCCCGGCTC -/A AAAAAAAAAA 2503 het 2051 hom 28 9 9 10 A 12 13 1300 CASAVA_Build X 10230121 1I GCTCATGAAT -/A GGAAGAATCA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 0 1 1301 CASAVA_Build X 10235677 1I TCTTTTAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 9 10 1302 CASAVA_Build X 10238362 1D ACTATGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 28 12 T 13 12 1303 CASAVA_Build X 10245650 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2039 hom 18 9 7 2 A 14 12 1304 CASAVA_Build X 10262455 1I TGTTCCTGCT -/C CAGAGCTGGA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 C 1 2 1305 CASAVA_Build X 10263291 4I TCAAAAAATA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 AAAT 3 4 1306 CASAVA_Build X 10263768 1D TCATTACACG T/- TGTATACAGG 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 T 2 1 1307 CASAVA_Build X 10264555 1D ATCTAACTCC A/- TCTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 1 0 1308 CASAVA_Build X 10265606 5D TAATGAAGAC TTTAG/----- TTTATTGAAA 3070 het 3070 ref 38 24 11 4 TTTAG 1 0 1309 CASAVA_Build X 10274002 3D TTTTTCACTG TTA/--- TTATATCTAT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 TTA 2 1 1310 CASAVA_Build X 10275437 1D CCAGCCCTCA T/- TGGATGACTT 3070 het 3070 ref 45 27 14 4 T 2 1 1311 CASAVA_Build X 10277332 2D TTGTCTCCTG TC/-- TCTGAATAAT 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 TC 2 1 1312 CASAVA_Build X 10278385 3D TACACATGTT GTA/--- AAAGCACAAG 3070 het 3070 ref 53 29 23 1 GTA 1 0 1313 CASAVA_Build X 10278700 1D CATTTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 12 11 1314 CASAVA_Build X 10298591 1D TGACTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 11 10 1315 CASAVA_Build X 10321465 1I CTTTTACAGG -/C TGGGGTGTGG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 0 1 1316 CASAVA_Build X 10460812 1D CTAAGAATGG T/- TTTTTTTTTT 1825 het 1613 hom 21 8 5 8 T 13 12 1317 CASAVA_Build X 10460958 3D CAGGCATGTG CCA/--- CCACCATGCC 2283 het 2283 ref 12 6 5 1 CCA 3 2 1318 CASAVA_Build X 10462045 1D TATCCTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 11 10 1319 CASAVA_Build X 10464094 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 16 1 10 5 A 15 14 1320 CASAVA_Build X 10467755 1D CTCAATAGCC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 40 0 37 5 A 9 8 1321 CASAVA_Build X 10470317 1I ATGATTTTCC -/A AAAACAATTA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 4 5 1322 CASAVA_Build X 10480211 1D AAGGAGTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 8 A 14 13 1323 CASAVA_Build X 10499030 4D TTGAACAAGC ACTT/---- ACAAGTTTCC 3070 hom 135 het 50 0 45 9 ACTT 1 0 1324 CASAVA_Build X 10556122 1I ATGGTGTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 9 10 1325 CASAVA_Build X 10698642 1D AAACTCATCA C/- AGGCTAGTGT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 1 0 1326 CASAVA_Build X 10705321 1I TCACTGCAAG -/C TCCGCCTCCC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 0 1 1327 CASAVA_Build X 10748678 1I ACACATGGAC -/A ATAAAAGCAA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 1 2 1328 CASAVA_Build X 10785060 1D CTACATGGAG A/- AACTCTATGT 3070 hom 96 het 36 0 33 5 A 3 2 1329 CASAVA_Build X 10786668 1D6M1I TGATCTTTTG AAAACTG-/-AAACTGA AAATTCACGT 3070 hom 66 het 24 0 23 4 N/A 0 0 1330 CASAVA_Build X 10897752 1I GAACAGATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 12 13 1331 CASAVA_Build X 11059266 2D ACTGACCCTC TA/-- TGTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 47 17 22 8 TA 1 0 1332 CASAVA_Build X 11064913 4I GGAGGGAAAG ----/AACT AACTGATCAG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 AACT 1 2 1333 CASAVA_Build X 11069426 1D AAATGCAAGT A/- AGTAAACAAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 2 1 1334 CASAVA_Build X 11078470 1I TTTGTGTATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 10 1335 CASAVA_Build X 11082191 1I GAACTCTTCA -/T TTTTTTATGG 2777 het 513 hom 14 3 8 3 T 6 7 1336 CASAVA_Build X 11089461 1I AGGATGCTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2780 hom 22 6 13 3 A 9 10 1337 CASAVA_Build X 11090747 1I TTCTCTCTAC -/G TTATCAGTGG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 G 0 1 1338 CASAVA_Build X 11099439 1I TTTCCACTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2964 hom 34 13 14 7 A 14 15 1339 CASAVA_Build X 11100551 1D CTCATTTTTT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 A 8 7 1340 CASAVA_Build X 11103901 1D CCCCAGTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 10 9 1341 CASAVA_Build X 11105412 1D TTTGGTGGGC G/- GGGGGGGGGC 3070 het 196 hom 17 3 12 3 G 10 9 1342 CASAVA_Build X 11107807 2D ATATGTATAC AT/-- ATATATATAT 1446 het 1446 ref 10 6 3 1 AT 9 8 1343 CASAVA_Build X 11109992 1I CTTGGAGGGT -/A AAAAAAAAAA 2099 het 1343 hom 25 7 8 10 A 15 16 1344 CASAVA_Build X 11118564 2I ACACATACAT --/AC ACACACACAC 1612 het 1612 ref 17 7 4 6 AC 6 7 1345 CASAVA_Build X 11129620 1I GAACATACCC -/G GGACTCGGTG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 G 2 3 1346 CASAVA_Build X 11134329 1D ACTCAGAAAT A/- TTCTGCATGG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 1 0 1347 CASAVA_Build X 11135241 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 9 5 T 11 12 1348 CASAVA_Build X 11156466 1I AGCTGTTTCC -/T TTTGACATCT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 3 4 1349 CASAVA_Build X 11171169 1I AGCAAATAAA -/T ATAAGAATGG 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 T 0 1 1350 CASAVA_Build X 11194955 3I CACATAGCCT ---/CTG CTGCTGCTGC 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 CTG 5 6 1351 CASAVA_Build X 11197654 1I GGTCTTAATA -/T TTTTTTAAGA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 6 7 1352 CASAVA_Build X 11199559 1D AGGAAAACAA T/- TTCCTCAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 T 3 2 1353 CASAVA_Build X 11201697 1I TATGGGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 39 1 32 6 T 10 11 1354 CASAVA_Build X 11207595 2D TCCCATTGCC TG/-- TGTTCCAAGA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 TG 2 1 1355 CASAVA_Build X 11207703 1D CACCCCTCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 9 8 1356 CASAVA_Build X 11217253 1I CTCTCACTTT -/A AAAAAATCGT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 6 7 1357 CASAVA_Build X 11229226 1D CATTCTATGG A/- AAAAAGATTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 6 5 1358 CASAVA_Build X 11240035 1I TGAGGCTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 10 11 1359 CASAVA_Build X 11275941 1I ATAGCCCTAG -/A GAACTATGAC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 0 1 1360 CASAVA_Build X 11319539 1I AAAAAGCCAG -/A AAAACTTTAA 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 A 4 5 1361 CASAVA_Build X 11324808 1D AAGCTCAGAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 8 7 1362 CASAVA_Build X 11354401 1D AAAAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2946 hom 36 14 11 12 T 14 13 1363 CASAVA_Build X 11371996 1I AAAGAAAACC -/A AAAAAAAAAA 377 het 377 ref 29 19 4 6 A 13 14 1364 CASAVA_Build X 11403832 1D TTGCTGAAGT A/- AAAAAAAAAA 2273 het 2273 ref 30 18 5 8 A 13 12 1365 CASAVA_Build X 11405203 1D CAAATATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 A 13 12 1366 CASAVA_Build X 11420775 1D AGAGAAAGAA T/- GAACTAGATG 3070 het 3070 ref 42 20 18 5 T 1 0 1367 CASAVA_Build X 11431884 2D TATCCATTTG CA/-- CACACACACA 951 het 951 ref 51 40 3 12 CA 10 9 1368 CASAVA_Build X 11460738 1I ATCTCAGCAT -/C TAAAGATAAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 C 0 1 1369 CASAVA_Build X 11463800 1I AGTACGATCC -/A AAGATGGCCC 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 A 2 3 1370 CASAVA_Build X 11470525 1I CGATAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 10 11 1371 CASAVA_Build X 11476670 1I TTTTTTTTTT -/A TTATTGAGAT 3070 het 3070 hom 27 14 12 1 A 0 1 1372 CASAVA_Build X 11491390 4I TAATAATAAT ----/AAAG AAGTTCAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 AAAG 0 1 1373 CASAVA_Build X 11504875 4I CAAACCAAGA ----/TGTT GGCAGAGTTG 3070 het 3070 hom 51 17 29 5 TGTT 0 1 1374 CASAVA_Build X 11512872 1D GAAACTCAAC A/- AATATTTTAT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 3 2 1375 CASAVA_Build X 11518500 1D ATTATTAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 289 hom 25 2 13 10 A 10 9 1376 CASAVA_Build X 11522343 2I ACCCTACAGG --/TC TCTCAGTTCA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TC 2 3 1377 CASAVA_Build X 11549516 1D ATAAGATTTG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 8 7 1378 CASAVA_Build X 11563369 6D TCCAAGTAAT TATCTC/------ TATAATAAAG 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 TATCTC 1 0 1379 CASAVA_Build X 11569094 1D26M1D GAGTAACCCA TTTTTTTTTTCTGGACTAGTAAGTGGGA/-TTTTTTTTTCTGGACTAGTAAGTGGG- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 31 18 12 8 N/A 0 0 1380 CASAVA_Build X 11579326 11D CCTCTCCCTC CTCCCACTGCT/----------- CACCCTCAGG 3070 het 3070 ref 20 12 9 2 CTCCCACTGCT 1 0 1381 CASAVA_Build X 11585785 1D ATGAGACAAT A/- GGAGGGACAA 3070 het 3070 ref 55 30 19 6 A 1 0 1382 CASAVA_Build X 11587491 3D GGGTATTTAA AAG/--- AAGCATCCCT 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 AAG 2 1 1383 CASAVA_Build X 11590449 2I GGAATTTCCA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 12 23 13 AC 8 9 1384 CASAVA_Build X 11595082 1I CCCTTAGAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 T 8 9 1385 CASAVA_Build X 11605822 1D TAGTAGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2882 hom 33 13 12 8 T 12 11 1386 CASAVA_Build X 11653749 1I ATAATCCAAA -/G GCTAAAGCCC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 G 1 2 1387 CASAVA_Build X 11663005 1I AGACCAAAAG -/T TTTTTTACCT 3070 het 3070 hom 49 26 21 2 T 6 7 1388 CASAVA_Build X 11666572 1I TGCCAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 2729 het 1483 hom 18 7 9 2 T 12 13 1389 CASAVA_Build X 11709715 12D AGAGAGGGAG GAGGAGGATGGA/------------ GAGGAGGAGC 3070 het 3070 ref 29 15 8 10 GAGGAGGATGGA 1 0 1390 CASAVA_Build X 11713044 1D ATAAAGGCTG T/- TTAAACGTGC 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 T 3 2 1391 CASAVA_Build X 11717520 1I TATATATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 10 11 1392 CASAVA_Build X 11730906 1I ATTTGAATGT -/A AAAAGTTTGT 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 A 4 5 1393 CASAVA_Build X 11733124 2I TCACACAAAT --/CC CCCTCCATGT 3070 het 3070 hom 71 30 32 9 C 3 5 1394 CASAVA_Build X 11734701 4D TCTCAAAAAG AAAA/---- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 21 11 9 3 A 11 7 1395 CASAVA_Build X 11737154 6I AACTATTAAC ------/TTATTA TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TTA 3 5 1396 CASAVA_Build X 11748974 1D GTATTATAAG T/- TAATCTAGAG 3070 het 3070 ref 34 23 7 5 T 2 1 1397 CASAVA_Build X 11752296 1I ACAAGTTAAG -/T TTTGGGGCAC 3070 het 3070 hom 57 26 26 5 T 3 4 1398 CASAVA_Build X 11756506 9D ATTGGTGTTT AACTTTTAG/--------- AACTTTTAGA 3070 het 3070 ref 46 21 21 11 AACTTTTAG 2 1 1399 CASAVA_Build X 11765253 4D GAATTATATT ACTG/---- ACTATGAATT 3070 het 3070 hom 34 10 24 4 ACTG 1 0 1400 CASAVA_Build X 11777719 1D AAAGGACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 15 14 1401 CASAVA_Build X 11796609 1D AATTAGTAGA G/- GCTGCTAAGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 2 1 1402 CASAVA_Build X 11797051 1D TGGGCATTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 144 het 61 0 49 13 T 9 8 1403 CASAVA_Build X 11804701 11I TTATTTCCCC -----------/ACTTTAAATGT ACTTTAAATG 3070 hom 123 het 53 0 42 12 ACTTTAAATGT 1 2 1404 CASAVA_Build X 11812194 1D CTCTGCTCAT A/- AAGGACCTTT 3070 hom 159 het 60 0 53 7 A 3 2 1405 CASAVA_Build X 11828231 1D TTTCAGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 21 1 18 4 T 12 11 1406 CASAVA_Build X 11858148 17D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 2839 het 2839 ref 16 10 7 4 A 27 10 1407 CASAVA_Build X 11891148 1I CAAGTGAAAT -/A AACACAAAGG 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 A 2 3 1408 CASAVA_Build X 11905219 2D GGAAAACAAA CT/-- CTGAGCAAAT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 CT 2 1 1409 CASAVA_Build X 11920183 1I ATTAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 10 11 1410 CASAVA_Build X 11969562 4I GAAGTCAGCT ----/GTTA GTTGTATTGT 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 GTTA 0 1 1411 CASAVA_Build X 11987045 1D TTCTATGTCA T/- TTTTTTACAC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 7 6 1412 CASAVA_Build X 11987947 1I GAATAGCGTA -/G CAATAAACAT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 G 0 1 1413 CASAVA_Build X 11998338 1I TAATAGAGAA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 7 8 1414 CASAVA_Build X 12025009 1D TGCCTAAACC A/- AAAAAAAAGT 1353 het 1353 ref 42 36 3 3 A 9 8 1415 CASAVA_Build X 12026313 2D AAAGAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 7 A 12 10 1416 CASAVA_Build X 12032878 21D TATTTGTTGA AGACAACACCGAGTAAGTGGC/--------------------- AGACCTTGGG 3070 hom 148 het 45 0 50 3 AGACAACACCGAGTAAGTGGC 1 0 1417 CASAVA_Build X 12043672 1D TGCTGGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 41 0 29 12 T 12 11 1418 CASAVA_Build X 12045309 1D AATATATTCC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 9 8 1419 CASAVA_Build X 12122467 1D TCTAGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 39 1 31 8 A 12 11 1420 CASAVA_Build X 12124943 5I AGAAACACAC -----/AATTA AATTAAATTG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AATTA 1 2 1421 CASAVA_Build X 12132701 3D AGAGTCTCAT CTC/--- CTGCCTAGAA 3070 hom 96 het 35 0 32 4 CTC 1 0 1422 CASAVA_Build X 12136506 1D CTGCACCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2449 hom 31 10 14 7 A 11 10 1423 CASAVA_Build X 12159896 1I AGAGAAGCAC -/T GTTTAACTGG 3070 hom 105 het 44 0 35 9 T 0 1 1424 CASAVA_Build X 12169991 6D AAGGGGAAGG GGAGGA/------ GGAGGAGGAG 3070 hom 48 het 30 0 24 8 GGA 7 5 1425 CASAVA_Build X 12195660 1D CGCTTGAATA T/- TTTGGAGTCT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 4 3 1426 CASAVA_Build X 12198305 1I GTCTTTTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 9 10 1427 CASAVA_Build X 12201117 1D ACTTGGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1872 het 1872 ref 23 18 4 1 A 13 12 1428 CASAVA_Build X 12209413 1D TAAAAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1316 het 1316 ref 29 17 4 8 T 13 12 1429 CASAVA_Build X 12211675 1D ACCATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 T 13 12 1430 CASAVA_Build X 12218908 1D AGGTAATCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 18 23 8 A 11 10 1431 CASAVA_Build X 12219062 1I CACTTCTCTT -/C GCAAATCTTC 3070 hom 126 het 51 0 41 10 C 0 1 1432 CASAVA_Build X 12225477 1I ATTATGAGAG -/A AAACAGAATT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 3 4 1433 CASAVA_Build X 12274319 1D GTTTTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 935 het 935 ref 37 28 3 6 A 12 11 1434 CASAVA_Build X 12316018 1D AATCAATCTT A/- AAAAAAAAAA 1345 het 1345 ref 44 27 4 13 A 15 14 1435 CASAVA_Build X 12354927 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 T 9 10 1436 CASAVA_Build X 12358216 1D AAAAAGCTAA G/- GGTTGTTCTT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 G 3 2 1437 CASAVA_Build X 12363601 1D TACTATAACA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 16 27 2 T 9 8 1438 CASAVA_Build X 12365441 8D TATATTCTTT TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 21 12 9 TTTC 5 3 1439 CASAVA_Build X 12370224 4D ATAAAATATA TGGT/---- TGGTTATATG 3070 het 3070 ref 53 29 17 7 TGGT 2 1 1440 CASAVA_Build X 12374627 14D CCTACACTTC TCTTGTGGTAGTGA/-------------- ATAAGTCTCA 3070 het 3070 hom 43 15 29 6 TCTTGTGGTAGTGA 1 0 1441 CASAVA_Build X 12378994 1D CTTATTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1411 het 1411 ref 40 30 5 7 A 11 10 1442 CASAVA_Build X 12381802 4I ACAGCATCTG ----/AAAA AAAAATTCAG 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 A 5 9 1443 CASAVA_Build X 12394026 3D CTCATTTCTT CTC/--- TGGAGAATGA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 CTC 1 0 1444 CASAVA_Build X 12413580 1D GTGGATGCTG A/- TAGACCTTCT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 1 0 1445 CASAVA_Build X 12416669 1D GAAAATAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 10 9 1446 CASAVA_Build X 12426699 1D GTAATGATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2876 hom 38 11 13 14 T 12 11 1447 CASAVA_Build X 12436320 1D CAGGTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 2895 het 1330 hom 18 4 8 6 T 12 11 1448 CASAVA_Build X 12450155 1D TTACTTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1697 hom 30 11 12 8 A 17 16 1449 CASAVA_Build X 12464395 1D TGTTATAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 11 10 1450 CASAVA_Build X 12473296 1D TATTATGAGA T/- TTTTTTTTAA 1410 het 1410 ref 14 10 3 1 T 9 8 1451 CASAVA_Build X 12473359 3I CCCAAGACAA ---/TTC TTCTTCTTCC 2158 het 2158 ref 16 9 5 2 TTC 3 4 1452 CASAVA_Build X 12478398 1I GCCAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 11 12 1453 CASAVA_Build X 12478879 8I TAGAGTGTAT --------/ATAAGTAC ATAAGAATAT 3070 het 3070 ref 42 23 13 7 ATAAGTAC 0 1 1454 CASAVA_Build X 12478975 2D TATGCATATG TA/-- TATATATATC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 TA 5 4 1455 CASAVA_Build X 12479748 2D GTGGTTATAT AG/-- AGAGATTTAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 8 AG 3 2 1456 CASAVA_Build X 12482114 3I TCAGCATTCT ---/AGA AGAACATATA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AGA 1 2 1457 CASAVA_Build X 12483484 3D GCTATCACTC TTT/--- CTTTTACTGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 T 3 0 1458 CASAVA_Build X 12484898 4I AGTTTGTTTG ----/TTTA TTTATTTGAG 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 TTTA 1 2 1459 CASAVA_Build X 12485300 6I AGAGAAGAGG ------/CCCAGC TAGCAAAGGT 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 CCCAGC 0 1 1460 CASAVA_Build X 12485868 1I GAACCAGGGA -/T TTTTACCTGT 3070 het 3070 hom 36 9 19 8 T 4 5 1461 CASAVA_Build X 12488067 1D TCGGGAAGTG A/- ACAGAATCTA 3070 het 3070 ref 57 30 23 4 A 2 1 1462 CASAVA_Build X 12489582 1I TAGGTCCCAT -/A AAAAGATTTT 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 A 4 5 1463 CASAVA_Build X 12493127 2I ACTCAGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2407 het 2407 ref 18 8 7 3 A 10 12 1464 CASAVA_Build X 12494985 8I AAGGATACTC --------/TATTCTAA TATTGGATAT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 TATTCTAA 0 1 1465 CASAVA_Build X 12497604 1I GGAAACTTAG -/A AAAAAATAGT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 6 7 1466 CASAVA_Build X 12505256 1D ATCACCAAAA G/- AACCTTCCCT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 1 0 1467 CASAVA_Build X 12509489 5I AGAACTGAAA -----/AATAT GATATCTGAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 AATAT 0 1 1468 CASAVA_Build X 12513267 1I AAATAATCAA -/T TTTTTTTTTT 2698 het 2698 ref 26 10 10 6 T 10 11 1469 CASAVA_Build X 12531794 1I TTCAGCAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 A 10 11 1470 CASAVA_Build X 12539519 6D1M2I GGGATCAGAG TAGTATC--/------CCA TACCTTGTAG 3070 het 3070 ref 39 24 14 2 N/A 0 0 1471 CASAVA_Build X 12539919 1I CATGCTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 12 13 1472 CASAVA_Build X 12554365 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1775 het 1775 ref 26 11 9 6 A 15 16 1473 CASAVA_Build X 12564550 1I CTATTGATAA -/T CTTTGCCAAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 0 1 1474 CASAVA_Build X 12570109 1D AGTTCATAGA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 G 2 1 1475 CASAVA_Build X 12572378 2D TAAAATCTTT CA/-- CAGTTAATTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 4 CA 2 1 1476 CASAVA_Build X 12578488 7D GCATAGTAGG CACTTGT/------- CAAATATCTG 3070 het 3070 ref 47 21 16 11 CACTTGT 1 0 1477 CASAVA_Build X 12597459 12I ATGACCAAGC ------------/TATATATAAATA TAAGCCATGC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 TATATATAAATA 0 1 1478 CASAVA_Build X 12597528 9D TAAGCAACTA GCTTTCTGG/--------- GCTTTCTGGG 3070 het 3070 ref 37 21 13 9 GCTTTCTGG 2 1 1479 CASAVA_Build X 12638174 8D TCTCAAATAT AGATAGAC/-------- AGATAGATAG 3070 hom 47 het 18 0 15 6 AGATAGAC 1 0 1480 CASAVA_Build X 12640259 2D ATTAGCAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2649 hom 30 10 10 10 A 13 11 1481 CASAVA_Build X 12641129 1I TGTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2643 het 2643 ref 31 15 12 4 A 12 13 1482 CASAVA_Build X 12660005 1D AATCTAAATT C/- TTGACTTACC 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 C 1 0 1483 CASAVA_Build X 12667206 1D GGCGGGGGGG C/- CACAATCCTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 C 2 1 1484 CASAVA_Build X 12684399 3I AAAGGAGACA ---/AAC AACAACAACA 2545 het 1459 hom 28 7 11 10 AAC 5 6 1485 CASAVA_Build X 12684777 5I GATGTTGCAG -----/TGCGC TGAGCCAAGA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 TGCGC 0 1 1486 CASAVA_Build X 12685908 4I CTTAACAAAT ----/TAAG TAATTACATG 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 TAAG 0 1 1487 CASAVA_Build X 12689160 1I ACCACTGCTC -/T TAAAAGTCAC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 1 2 1488 CASAVA_Build X 12689252 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAATTTT 3070 het 2153 hom 16 6 9 1 A 7 6 1489 CASAVA_Build X 12692960 4I TCAATAACAC ----/ACAA ACAGAGAGCC 2907 het 2907 ref 27 18 7 2 ACAA 0 1 1490 CASAVA_Build X 12714565 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2287 het 1123 hom 19 4 8 7 T 13 14 1491 CASAVA_Build X 12715101 1D TACAAAAATT A/- GCTTGGTATG 3070 het 3067 hom 20 7 11 2 A 1 0 1492 CASAVA_Build X 12735141 1D GGGAGGGGGG A/- AAAAAAGGAC 3070 het 3070 ref 33 19 13 2 A 7 6 1493 CASAVA_Build X 12750037 2D CTGATTCCTC AG/-- AGAGAAAAGC 3070 hom 164 het 58 0 55 5 AG 3 2 1494 CASAVA_Build X 12752608 1D TAGGCTGCAT A/- AAACTTGTTC 3070 het 3070 ref 70 33 29 8 A 4 3 1495 CASAVA_Build X 12755292 3D GACTGTCTCA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AAC 4 3 1496 CASAVA_Build X 12765220 1D CCAACACCTG T/- TTTTTTTTTT 1566 het 1566 ref 30 16 5 9 T 15 14 1497 CASAVA_Build X 12766685 1I GTTTGCCGAA -/G GTCCACTCCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 1 2 1498 CASAVA_Build X 12772737 1I TGATGCCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 14 15 T 13 14 1499 CASAVA_Build X 12773076 1D TTTTCCAGAA T/- TTTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 6 5 1500 CASAVA_Build X 12775903 2D ACAGTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 38 15 10 14 TC 9 8 1501 CASAVA_Build X 12840149 1D CATAGTGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 55 het 42 1 34 7 T 10 9 1502 CASAVA_Build X 12865766 1I TTTTGGTGTG -/T TTTTTTTTTT 2849 het 2849 ref 27 13 7 7 T 13 14 1503 CASAVA_Build X 12881244 1D TCTAGCACTT A/- ACCTCAATCA 3070 hom 156 het 56 0 52 5 A 2 1 1504 CASAVA_Build X 12882997 1D GCTTGCTTTT G/- CTTGCTTGTC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 G 1 0 1505 CASAVA_Build X 12887745 4D TTTCTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 19 8 TC 5 3 1506 CASAVA_Build X 12889018 3I AATGACCTTA ---/TTC TTAGAAAATG 3070 hom 132 het 48 0 44 4 TTC 0 1 1507 CASAVA_Build X 12890395 1D5M12D TGTGACCTCT CCCTGGAGCACCTCCCCC/-CCTGG------------ AGGCATCTGC 3070 het 3070 ref 39 29 13 7 N/A 0 0 1508 CASAVA_Build X 12892464 1I AATAAAAAAA -/T AATAATAAAA 1044 het 176 hom 6 2 3 1 T 0 1 1509 CASAVA_Build X 12896970 2D TAATAAAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 13 11 1510 CASAVA_Build X 12908257 1I GGAGACTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 9 10 1511 CASAVA_Build X 12934065 12D GGAGAGAGAG AGAGAGAGAGAA/------------ AGAAAGAAAG 3070 het 1201 hom 29 8 18 5 AGAGAGAGAGAA 1 0 1512 CASAVA_Build X 12937683 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2863 het 1989 hom 20 5 9 6 T 9 10 1513 CASAVA_Build X 13007794 1D CACCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1805 het 686 hom 19 5 8 6 T 17 16 1514 CASAVA_Build X 13046838 1D TAAAGTATAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 A 10 9 1515 CASAVA_Build X 13103670 17D TCTATGATGA AGGTGTCTTATAAGAAC/----------------- AGGTGTCTTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 10 AGGTGTCTTATAAGAAC 2 1 1516 CASAVA_Build X 13110199 3I AGCATATGGG ---/AGA AGAAGGGGCA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 AGA 1 2 1517 CASAVA_Build X 13117445 2D AAGTACAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 22 1 12 9 A 13 11 1518 CASAVA_Build X 13122898 1I TGCCATCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 13 14 1519 CASAVA_Build X 13133332 1D TATTTTGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 10 9 1520 CASAVA_Build X 13145847 1D ATGACAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 22 6 T 13 12 1521 CASAVA_Build X 13284713 1I ACTTTCCCCC -/T GAGTCAATTA 2146 het 2146 ref 29 18 7 4 T 0 1 1522 CASAVA_Build X 13302418 1D TGTTAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 10 9 1523 CASAVA_Build X 13323782 2I GTAAGGAAAC --/AA GAGTCAGGGA 3070 hom 113 het 43 0 37 8 A 0 2 1524 CASAVA_Build X 13324696 1I CTACCCAGGA -/T TAACAACATG 3070 het 3070 ref 63 33 22 8 T 1 2 1525 CASAVA_Build X 13327363 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 1799 het 807 hom 10 2 5 3 A 9 10 1526 CASAVA_Build X 13328172 1D CTAGTCAGAT A/- AGAGTTCAGA 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 A 2 1 1527 CASAVA_Build X 13329640 9I AATAGTGAGC ---------/ATAACCAAG GAAACCAAGG 3070 hom 147 het 53 0 49 4 ATAACCAAG 0 1 1528 CASAVA_Build X 13343736 1D GCTGTAAAGT A/- AAGAGTTTTG 3070 het 3070 ref 37 26 9 2 A 3 2 1529 CASAVA_Build X 13344387 8D TCGGAAGGCA TTTGGATG/-------- TTTGGATGCT 3070 hom 116 het 48 0 36 14 TTTGGATG 2 1 1530 CASAVA_Build X 13345745 9I TTTTCTTTTC ---------/TTTTTTCTT TTTTTTCTTT 2688 het 2688 ref 29 10 9 10 TTTTTTCTT 1 2 1531 CASAVA_Build X 13346009 1D TTGTAGAGAT G/- GGGTCTCGCT 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 G 4 3 1532 CASAVA_Build X 13348114 1D AAAGAAGTTC T/- TGACATTATC 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 T 2 1 1533 CASAVA_Build X 13356037 1I TTCATTTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 135 het 55 0 46 9 T 8 9 1534 CASAVA_Build X 13357094 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTA 2200 het 2200 ref 27 11 6 10 T 9 10 1535 CASAVA_Build X 13360327 1D AGACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 9 19 8 A 13 12 1536 CASAVA_Build X 13365417 1D CTTTAAAAAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 38 18 10 10 A 7 6 1537 CASAVA_Build X 13371583 4I CATGCACACA ----/CTCT CTCTCTTTCT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 CT 3 5 1538 CASAVA_Build X 13374216 1D AAGCATCCTG C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 46 26 16 5 C 5 4 1539 CASAVA_Build X 13409754 4I CTGTCTCAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 24 het 15 0 13 2 AAAT 2 3 1540 CASAVA_Build X 13422695 4I AAATTCTTCT ----/CTAA CTGTCTGCTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 CTAA 0 1 1541 CASAVA_Build X 13435645 1I ACCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 29 2 20 7 A 11 12 1542 CASAVA_Build X 13448570 1I AATATCTTAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 8 9 1543 CASAVA_Build X 13451349 7I TGGTCTATTA -------/CATATGC ACTGAAACTA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CATATGC 0 1 1544 CASAVA_Build X 13453915 23D GCCAGGAGTT CGAAACCAGCCTGGGCAACATAG/----------------------- CGAGACCCCA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 CGAAACCAGCCTGGGCAACATAG 1 0 1545 CASAVA_Build X 13454128 2I AAAAGAAAAG --/AA AAAAGAAAAG 3070 het 1032 hom 34 7 16 11 A 4 6 1546 CASAVA_Build X 13456920 1I AATCATGTGG -/T TTTTTGTCTT 3070 het 3070 hom 25 9 16 0 T 5 6 1547 CASAVA_Build X 13457598 7D GCATTCACTG TTTACAT/------- TTTACATATT 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 TTTACAT 2 1 1548 CASAVA_Build X 13466203 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 2589 het 2589 ref 31 20 7 4 A 9 10 1549 CASAVA_Build X 13467882 1I TGCTCAAAAT -/G GCCTTTGAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 2 1550 CASAVA_Build X 13468475 1D CTCTAAAAAA G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 121 het 45 0 38 7 G 6 5 1551 CASAVA_Build X 13487074 1I ACACACATGT -/A AATTAATACC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 2 3 1552 CASAVA_Build X 13514207 13I GACACTTAAT -------------/ATCATTAGCCATC AGAGAAATGC 3070 het 3070 ref 40 24 16 1 ATCATTAGCCATC 0 1 1553 CASAVA_Build X 13520256 1I TTCAGGGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 15 16 1554 CASAVA_Build X 13521062 3D TCAAGTGATT CTC/--- CTGCCTCAGT 3070 het 3070 hom 17 7 9 2 CTC 1 0 1555 CASAVA_Build X 13533088 1D GATTTACTAC T/- TTTTAGTATA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 5 4 1556 CASAVA_Build X 13546930 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 A 11 10 1557 CASAVA_Build X 13568237 2I ACATGCACAG --/TT TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 T 7 9 1558 CASAVA_Build X 13571018 34D ATCTCAGCTA CTCAGGAGGGTTAGGCAGGAGAATCACTTGAACC/---------------------------------- CAGGAGGTGG 2527 het 2527 ref 18 9 6 4 CTCAGGAGGGTTAGGCAGGAGAATCACTTGAACC 1 0 1559 CASAVA_Build X 13582874 4D CCATGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 TTTG 5 4 1560 CASAVA_Build X 13586614 6I TACATTTAAG ------/ATATAC ATACTGAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 ATATAC 0 1 1561 CASAVA_Build X 13596167 4I GTGGGTAGGT ----/TTTA TTTGTTTATT 3070 het 3070 hom 48 16 28 4 TTTA 0 1 1562 CASAVA_Build X 13718919 3D ACACACTCCA ACC/--- ACCCCCTAAA 3070 het 3070 ref 46 20 16 11 ACC 2 1 1563 CASAVA_Build X 13727442 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTTT 1967 het 1686 hom 14 5 8 1 A 1 0 1564 CASAVA_Build X 13730210 2D ATATGAAAAC AT/-- ATAACATAAG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AT 2 1 1565 CASAVA_Build X 13765268 2D AACCTTGATA TC/-- TCATAAAGTT 3070 het 3070 hom 46 17 27 3 TC 2 1 1566 CASAVA_Build X 13765811 1D ACAGTGTCTG A/- AAATTCATGG 2051 het 2051 ref 16 9 6 1 A 4 3 1567 CASAVA_Build X 13795158 6I GAGGCATTTA ------/TTTTTG TTTTTGTTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TTTTTG 1 2 1568 CASAVA_Build X 13796230 8D ACATTTAAAT TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 7 hom 38 1 27 12 TG 11 7 1569 CASAVA_Build X 13798318 4D TGCACTCAAC AAAT/---- AGTTATTTAA 3070 hom 90 het 35 0 30 6 AAAT 1 0 1570 CASAVA_Build X 13806200 1I TAAAGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 11 12 1571 CASAVA_Build X 13811894 1D TCTCTAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 13 12 1572 CASAVA_Build X 13821452 1D CTGAATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3016 het 1685 hom 19 6 8 6 A 13 12 1573 CASAVA_Build X 13836255 2I TGAAAACATT --/AA GTCTTAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 0 2 1574 CASAVA_Build X 13840638 1D TTCAAATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 10 9 1575 CASAVA_Build X 13841365 1D AATTTTCGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 11 10 1576 CASAVA_Build X 13843139 1D GGGACCCCAT C/- TCTACCAGAA 2912 het 2912 ref 19 10 7 3 C 1 0 1577 CASAVA_Build X 13848015 1I GTTTCAGAAG -/A AAAAAGAGGC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 5 6 1578 CASAVA_Build X 13854450 17D ACTCCATCTC AAAAAAACAAACAAACA/----------------- AAAAAAAAAA 2648 het 2439 hom 11 6 7 4 AAAAAAACAAACAAACA 1 0 1579 CASAVA_Build X 13859238 3I ACAAAAACAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 AAC 5 6 1580 CASAVA_Build X 13861083 4I TAATTTACCC ----/TATT TATTTTAGCA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 TATT 1 2 1581 CASAVA_Build X 13867914 5D TATTTTACAT GAAAG/----- GACAGAGATT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 GAAAG 1 0 1582 CASAVA_Build X 13873481 1I GAGACTGTTG -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 6 7 1583 CASAVA_Build X 13919778 2I CCCATCTCCC --/CT GTTTAAACAT 3070 het 3070 ref 54 33 18 3 CT 0 1 1584 CASAVA_Build X 13924334 2D TCAAAGTCAT AA/-- GACAAGGGCT 3070 het 3070 hom 37 14 17 8 A 2 0 1585 CASAVA_Build X 13928638 1D CTCCATCTTG A/- AAAAAAAAAA 2856 het 1009 hom 15 4 8 3 A 12 11 1586 CASAVA_Build X 13940333 2D AATTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2338 het 816 hom 17 6 6 5 T 14 12 1587 CASAVA_Build X 13944033 1I ACCGCTTGAA -/G GAACAGTTGT 3070 het 3070 hom 39 11 26 2 G 1 2 1588 CASAVA_Build X 13948694 1I AAATACCTAC -/T CTACATGAGG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 0 1 1589 CASAVA_Build X 13949855 16D AATGTGTGTG TATATATATATATATA/---------------- TATATATATA 3070 het 419 hom 17 2 13 4 TA 15 7 1590 CASAVA_Build X 13956660 1I CCTATCCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 9 10 1591 CASAVA_Build X 13981851 1I TATTTGCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 10 11 1592 CASAVA_Build X 13985994 1D AAAAAGAACT A/- AAAAATGAAG 3070 het 3070 hom 32 16 16 0 A 6 5 1593 CASAVA_Build X 13999484 1I CCTTAATAGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 8 9 1594 CASAVA_Build X 14002662 2I CTATGAAAAC --/AG AGGAAGAAGC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 AG 1 2 1595 CASAVA_Build X 14003158 1D CCAGTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 A 11 10 1596 CASAVA_Build X 14013157 8D CTCACATCTT TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 1658 het 1658 ref 12 4 5 3 TTTA 6 4 1597 CASAVA_Build X 14021146 2D ATTACTATCA CC/-- CCCCCCCGCG 3070 hom 51 het 21 0 17 4 C 9 7 1598 CASAVA_Build X 14075439 3D TTGGTATCTG TCT/--- TCTTCTTTAC 3070 hom 141 het 56 0 48 8 TCT 3 2 1599 CASAVA_Build X 14193717 1I ATTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 10 11 1600 CASAVA_Build X 14235363 3D GGTAGGTCTC CTT/--- CTAGGCACCT 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 CTT 1 0 1601 CASAVA_Build X 14268201 1D TTATTTTCTT A/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 34 16 9 11 A 1 0 1602 CASAVA_Build X 14319927 1I CCCAGCGTGA -/G CGATGCAGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 G 0 1 1603 CASAVA_Build X 14432455 5D ACAGGTTTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 232 het 232 ref 29 16 3 12 TTTTG 1 0 1604 CASAVA_Build X 14472481 1D GGCAGCTTTC A/- AAAAATGGGT 3070 het 3070 hom 29 7 19 4 A 6 5 1605 CASAVA_Build X 14474643 2D ACACGTGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1739 hom 28 6 20 2 T 13 11 1606 CASAVA_Build X 14476979 3I CAAAAAAATT ---/GAA GAGTAGTTCT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 GAA 0 1 1607 CASAVA_Build X 14496755 4D AAAAAAAAGA AAAG/---- AAAAAAAAGA 452 het 452 ref 10 5 3 2 AAAG 1 0 1608 CASAVA_Build X 14497641 1I CAATAATTTT -/A AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 5 6 1609 CASAVA_Build X 14499812 1I GAACCTTGAA -/G CCAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 G 0 1 1610 CASAVA_Build X 14503674 1I CTGGTTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 9 10 1611 CASAVA_Build X 14507393 1I TTTTTTTTTT -/A AATGGAGTCT 3070 het 1483 hom 26 7 11 8 A 2 3 1612 CASAVA_Build X 14510117 1I TTTTTCCATA -/T TTTTTTTATT 1306 het 1306 ref 19 6 6 7 T 7 8 1613 CASAVA_Build X 14521311 3D CTTCTCGCTT GTG/--- GTGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 8 GTG 2 1 1614 CASAVA_Build X 14524698 3D TCAAAAAGAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 31 12 12 12 AAT 4 3 1615 CASAVA_Build X 14529053 1I TGTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 G 0 1 1616 CASAVA_Build X 14558847 2D TGGTCTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2640 het 1482 hom 45 16 9 20 T 18 16 1617 CASAVA_Build X 14559947 12D ATATGTATAT ATATAGACATAC/------------ ATATGTATAT 1597 het 946 hom 22 4 5 16 ATATAGACATAC 1 0 1618 CASAVA_Build X 14561870 4D ATGAAAACTC ACTT/---- ACTATCATGA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 ACTT 1 0 1619 CASAVA_Build X 14587515 3I AATTAACAGC ---/CAA TTTTGAATCA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 CAA 0 1 1620 CASAVA_Build X 14599572 1I TCTCTTCAGA -/C TTGCCCCAAC 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 C 0 1 1621 CASAVA_Build X 14600614 1I GTGCTTCTGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 T 7 8 1622 CASAVA_Build X 14605919 6D TTTTTGTTTG TTTGTT/------ TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 21 12 10 TTTGTT 2 1 1623 CASAVA_Build X 14607471 1I19M4I GATGATTGTT -AAAAAAAAAAAGAAAAGAA----/AAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAG AAAGACACCT 3070 het 3070 ref 46 30 18 10 N/A 0 0 1624 CASAVA_Build X 14608414 5D CTGAATTAAA TATGC/----- TATGCCTGAA 3070 het 3070 ref 32 14 15 6 TATGC 2 1 1625 CASAVA_Build X 14610039 2I TATATATGTA --/TG TGTGTGTGTG 1569 het 1056 hom 9 3 6 0 TG 8 9 1626 CASAVA_Build X 14623203 1I TAACAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 2981 het 2981 ref 28 14 7 7 A 10 11 1627 CASAVA_Build X 14634098 47D AAATCTAAAT GCCCAGACCCCACCTCAGACCATTAAATCAGAATATTTAGGTGTAGA/----------------------------------------------- GCCCAGACAT 3070 het 3070 ref 29 23 13 6 GCCCAGACCCCACCTCAGACCATTAAATCAGAATATTTAGGTGTAGA 1 0 1628 CASAVA_Build X 14635080 1I TAAAACTTAC -/A AAAAATACCT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 A 5 6 1629 CASAVA_Build X 14635801 2I AGCAAAAAAG --/GT GTGTGTGTGT 3041 het 3041 ref 28 10 11 7 GT 8 9 1630 CASAVA_Build X 14649380 1I TTCTCACCAC -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 A 6 7 1631 CASAVA_Build X 14663868 1I TCTGCTGAAG -/C TGCGCCCACA 3070 hom 38 het 14 0 13 1 C 0 1 1632 CASAVA_Build X 14668308 1I CAGAAAGGTG -/T TTTTTTAGAC 3070 het 3070 ref 59 35 21 3 T 6 7 1633 CASAVA_Build X 14672676 2I AAAATTAAAA --/AG AGCCATGGAG 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 AG 1 2 1634 CASAVA_Build X 14676419 4I GGACAGCACT ----/TTGA TTGTGGCCTT 3070 het 3070 hom 60 27 26 7 TTGA 0 1 1635 CASAVA_Build X 14681192 4D AATTTGAGAA AATT/---- AATATCGCCA 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 AATT 1 0 1636 CASAVA_Build X 14762193 1I CCTTGGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 10 11 1637 CASAVA_Build X 14772246 1I CCAATTAAAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 8 9 1638 CASAVA_Build X 14790192 1D AATATTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 24 10 6 T 12 11 1639 CASAVA_Build X 14791868 4D GTAAATTTAA ATAG/---- ATAATTATAA 2140 het 2140 ref 15 8 6 1 ATAG 1 0 1640 CASAVA_Build X 14799666 2D TATCTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 22 8 9 TG 9 8 1641 CASAVA_Build X 14818239 1I CTCTTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 A 11 12 1642 CASAVA_Build X 14826449 4I CTGTAGACAT ----/AACA AACACAAAAC 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 AACA 1 2 1643 CASAVA_Build X 14831387 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2278 het 2278 ref 23 13 7 3 A 15 16 1644 CASAVA_Build X 14834609 4I GCAACAAAAT ----/AAAC AAACAGATAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 AAAC 1 2 1645 CASAVA_Build X 14840275 1I ATAGTTATCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 9 10 1646 CASAVA_Build X 14876220 1I AGACTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 17 1 13 3 A 13 14 1647 CASAVA_Build X 14882571 1D AGCTATAAGA T/- GAAATTTGGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 1 0 1648 CASAVA_Build X 14884750 1D TTAAGGACAC A/- ACTGTGCCAG 3070 hom 120 het 44 0 41 5 A 2 1 1649 CASAVA_Build X 14884957 5D GCTTCCTGTC TTTGT/----- TTTAAGAACA 3070 hom 111 het 40 0 37 6 TTTGT 1 0 1650 CASAVA_Build X 14885660 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 9 8 1651 CASAVA_Build X 14888484 1D TCTTTTTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 19 0 13 6 T 10 9 1652 CASAVA_Build X 14890053 5D GGTCCAGTGT TATAA/----- TATGTGAATA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 TATAA 1 0 1653 CASAVA_Build X 14891166 5D ATTATATGCT TATAG/----- TATAGTTTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 TATAG 2 1 1654 CASAVA_Build X 14893493 1D TTAAAAACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 10 9 1655 CASAVA_Build X 14894994 1D CATGCCCGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 13 0 12 1 T 12 11 1656 CASAVA_Build X 14895843 1I TTTAAAGCAG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 8 9 1657 CASAVA_Build X 14904210 1I TAACTACTAA -/T TTTTTTCAGT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 6 7 1658 CASAVA_Build X 14928494 1D CCATGTATCA T/- TTTTTATCTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 6 5 1659 CASAVA_Build X 14928619 1D AAACTCAAGG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 7 6 1660 CASAVA_Build X 14930987 1D TAAACAAGGT A/- AAAAAAAAAA 2270 hom 12 het 8 0 5 3 A 12 11 1661 CASAVA_Build X 14933559 1D GTATGAAGAT A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 7 6 1662 CASAVA_Build X 14959562 1I TGTAGAGACA -/G GATTTCATCA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 G 1 2 1663 CASAVA_Build X 14970150 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 42 5 23 14 T 15 14 1664 CASAVA_Build X 15025062 1I ATAATAAAGT -/G CCAAAGGGAT 3070 het 3070 ref 57 26 22 9 G 0 1 1665 CASAVA_Build X 15077206 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 11 12 1666 CASAVA_Build X 15141222 1I ATAGAATGTG -/A AGCCACATAT 3070 hom 114 het 39 0 38 1 A 1 2 1667 CASAVA_Build X 15147828 1D AGAGAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 45 2 35 9 A 12 11 1668 CASAVA_Build X 15155830 2D GATGCAAAAG TC/-- TCTGTGAGGC 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 TC 2 1 1669 CASAVA_Build X 15172735 1I TCCTTTTTTT -/G TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 18 6 G 0 1 1670 CASAVA_Build X 15173479 2D GGTTGAGAAA CT/-- CTGTTATAGG 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 CT 2 1 1671 CASAVA_Build X 15193685 1D ATCATCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1453 hom 24 7 10 7 T 12 11 1672 CASAVA_Build X 15196863 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 2687 het 658 hom 12 4 6 2 A 9 10 1673 CASAVA_Build X 15222926 2I CCTATAAATT --/TC TCTCTTAGTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TC 2 3 1674 CASAVA_Build X 15241520 2I GTATATGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 1679 hom 24 5 13 6 AC 8 9 1675 CASAVA_Build X 15247771 1I TCCATTTGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 8 9 1676 CASAVA_Build X 15253323 2I TCTCCACCTC --/AA AAGATTAGTA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 2 4 1677 CASAVA_Build X 15258131 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2093 hom 17 7 9 2 A 12 11 1678 CASAVA_Build X 15270058 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 A 10 9 1679 CASAVA_Build X 15278763 4I ACTTTCTTTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 het 2678 hom 36 15 16 5 TCTT 3 4 1680 CASAVA_Build X 15278888 8I TTTTCTTTTT --------/TCTCTTTC CTCTTTCTCT 1257 het 1257 ref 17 12 3 2 TCTCTTTC 0 1 1681 CASAVA_Build X 15312222 6I TCAAAATGTT ------/CTCATG CTCCAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 CTCATG 0 1 1682 CASAVA_Build X 15331635 1D TTCTTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 1050 het 1050 ref 28 20 3 7 T 12 11 1683 CASAVA_Build X 15332037 2D CAGCATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1460 het 1460 ref 20 6 6 8 T 16 14 1684 CASAVA_Build X 15336023 1D AGAAATATGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 10 9 1685 CASAVA_Build X 15344290 1D AATGTACTGC T/- TGGGAAGTAG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 2 1 1686 CASAVA_Build X 15345287 1I4M1I AGCCGCAGCG -CCAG-/CCCAGC CTCCGGCTGA 3070 hom 60 het 23 0 19 5 N/A 0 0 1687 CASAVA_Build X 15348362 2D AGATATACGT TC/-- TCTCTCAGGA 3070 hom 111 het 44 0 37 8 TC 4 3 1688 CASAVA_Build X 15403149 1D AGCAAGCTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 A 10 9 1689 CASAVA_Build X 15405728 1I AGCACAAAAG -/T GTGGACAAAG 3070 het 3070 hom 52 25 24 3 T 0 1 1690 CASAVA_Build X 15408220 2I GCACAAACTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 1910 hom 27 7 8 12 T 9 11 1691 CASAVA_Build X 15410525 2I GATGTTGAAT --/TC TGTCGAATGT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 TC 0 1 1692 CASAVA_Build X 15415381 1D GAGATTGTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 10 9 1693 CASAVA_Build X 15427890 1D ATTTGTGGTT C/- CCCCCCCCCC 2009 het 155 hom 22 3 9 11 C 12 11 1694 CASAVA_Build X 15459874 1I AGTTCTTAGT -/A AAGCCCTTCC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 2 3 1695 CASAVA_Build X 15462495 1I TGAAAGTAGG -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 6 7 1696 CASAVA_Build X 15463810 4D GTACATGTGT GATA/---- GATAGGTCCC 3070 het 3070 ref 23 11 9 5 GATA 2 1 1697 CASAVA_Build X 15469087 1D TCACAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2074 hom 38 10 17 11 A 15 14 1698 CASAVA_Build X 15471691 1D GTCTGTCATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 10 9 1699 CASAVA_Build X 15479589 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTTT 2291 het 1983 hom 16 5 5 6 A 0 1 1700 CASAVA_Build X 15486337 1D TTTTTGTGGG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 47 15 27 5 T 8 7 1701 CASAVA_Build X 15504790 1I TCTTTTTTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 47 23 20 4 A 9 10 1702 CASAVA_Build X 15506065 5I TATTTCCTAC -----/ATAAG ATAATAAATA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 ATAAG 0 1 1703 CASAVA_Build X 15509814 4I TTAGCTTTAT ----/TTAA TTATTTTTCA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 TTAA 0 1 1704 CASAVA_Build X 15510801 1I TAATTGGTAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 8 9 1705 CASAVA_Build X 15522365 1D TCCTTTACAG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 8 7 1706 CASAVA_Build X 15524585 1I TGACAGGATG -/T TCATGTTTAC 3070 het 3070 ref 49 21 17 11 T 1 2 1707 CASAVA_Build X 15526025 1I TTATATCACC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 7 8 1708 CASAVA_Build X 15552647 11D CACGAGGGCA TGGATTGTGTT/----------- TGGATTGTGT 1893 het 1893 ref 30 16 7 10 TGGATTGTGTT 2 1 1709 CASAVA_Build X 15553599 1D TAGGGTAGAG A/- AAACAGCCTG 3070 het 3070 ref 37 24 12 2 A 4 3 1710 CASAVA_Build X 15585679 1D TTTCTTCTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 T 10 9 1711 CASAVA_Build X 15590221 1D TGGTCAATGC T/- TTTTTTTTTT 1447 het 1447 ref 43 28 5 10 T 11 10 1712 CASAVA_Build X 15591620 4D TGGCTGTTAT AACA/---- ATCATTACTC 3070 het 3070 ref 37 23 11 4 AACA 1 0 1713 CASAVA_Build X 15630602 2D TGGGAAGGAC TG/-- AGGCTTGAGC 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 TG 1 0 1714 CASAVA_Build X 15633760 2I AAAATATAAG --/AT ATTATTTCTG 3070 het 1366 hom 15 3 10 2 AT 1 2 1715 CASAVA_Build X 15647589 1D TAACCCCTGG A/- AAAAAAAAAA 2880 het 2880 ref 41 12 9 20 A 16 15 1716 CASAVA_Build X 15659238 1I GCAGCTAATA -/T TGAATGGATC 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 T 1 2 1717 CASAVA_Build X 15665842 4D ACACGTTCAG TGTT/---- TGTTTCCCTA 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 TGTT 2 1 1718 CASAVA_Build X 15670421 1I TTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 8 9 1719 CASAVA_Build X 15673890 1D AACAAAAAAA T/- GATACTAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 1 0 1720 CASAVA_Build X 15689224 1I AATTTCTTTC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 6 7 1721 CASAVA_Build X 15698778 2D TCTCTCTCTC TT/-- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 3 1 1722 CASAVA_Build X 15709963 1D CTTTGTCTTT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 42 het 22 0 14 8 A 8 7 1723 CASAVA_Build X 15713909 1I TTGTTTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 9 10 1724 CASAVA_Build X 15714308 1I ACTTGCCCTT -/A ACATCTTATA 3070 het 3070 hom 59 25 28 6 A 1 2 1725 CASAVA_Build X 15714693 4D TGGTGAAAGA CTTC/---- CTTCCTATTG 3070 het 3070 hom 56 18 29 10 CTTC 2 1 1726 CASAVA_Build X 15724564 1D ATTGGATGCG T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 7 6 1727 CASAVA_Build X 15728036 1D AATGAAGTTA T/- TTTATTGGAA 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 T 4 3 1728 CASAVA_Build X 15732922 1D TTGCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 15 14 1729 CASAVA_Build X 15733897 1I ATCACTTGAA -/C CCGGGAGGCA 2626 het 2626 ref 22 13 7 2 C 2 3 1730 CASAVA_Build X 15734761 1I TGCACCAGAC -/T TTTTTTAACA 1637 het 1637 ref 22 15 5 2 T 6 7 1731 CASAVA_Build X 15736084 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2383 hom 22 6 11 5 A 10 9 1732 CASAVA_Build X 15752444 1D GCCTTTTATT A/- ATAATCTATT 3070 het 3070 hom 29 7 17 7 A 2 1 1733 CASAVA_Build X 15772375 9D ACCTTTGGTG ACTAAAAAA/--------- AGACAAGAAC 3070 het 3070 hom 48 22 23 5 ACTAAAAAA 1 0 1734 CASAVA_Build X 15775369 1I AAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 9 9 A 10 11 1735 CASAVA_Build X 15777849 3D CCTCTCACAC CTT/--- CTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 CTT 2 1 1736 CASAVA_Build X 15797998 1D CCTTTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 20 1 12 7 A 17 16 1737 CASAVA_Build X 15799330 3D ATGATATATG AAC/--- AACAGCCAAC 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 AAC 2 1 1738 CASAVA_Build X 15811184 1I TAGAGGGTAA -/C TTTTGAATGT 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 C 0 1 1739 CASAVA_Build X 15815147 3I AGCCCTGACT ---/CAG CTCAGATGGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CAG 0 1 1740 CASAVA_Build X 15826714 1D CAGAATTTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 9 8 1741 CASAVA_Build X 15832237 1D ATTTGGAACA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 9 8 1742 CASAVA_Build X 15840988 1I5M3D AACTATCTGG -ATGGAGAT/AATGGA--- GATGATGATA 3070 hom 181 het 61 0 61 6 N/A 0 0 1743 CASAVA_Build X 15852817 1I TACTGCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 10 11 1744 CASAVA_Build X 15854389 1D GTGCCTGGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 9 8 1745 CASAVA_Build X 15865698 1D TAACTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1220 hom 36 3 23 10 T 12 11 1746 CASAVA_Build X 15868422 1D GGCATGTCAA G/- TGAAAACATG 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 G 1 0 1747 CASAVA_Build X 15889313 1I ATCAATGTTT -/A CTAAGCTGTC 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 A 0 1 1748 CASAVA_Build X 15896527 1I CACAGGTCAC -/T TGTGAAACAA 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 T 1 2 1749 CASAVA_Build X 15902839 4I AAACAGCCCA ----/CAGT CAGGGCCTAT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 CAGT 0 1 1750 CASAVA_Build X 15910785 5D ATATTTGGGA TATAT/----- TAGATTAACT 3070 het 3070 ref 43 19 21 4 TATAT 1 0 1751 CASAVA_Build X 15914508 1D TCTTACATAC T/- AACAATTCTT 3070 het 3070 ref 49 21 22 7 T 1 0 1752 CASAVA_Build X 15918210 4D TGAAAGTAGC TTAT/---- TTAATGAGCA 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 TTAT 1 0 1753 CASAVA_Build X 15922711 1I TCAATAAATA -/T TTGTGAAAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 2 3 1754 CASAVA_Build X 15993928 1D AGTGCTCAAA T/- TTTTTTTTTT 892 het 611 hom 21 4 5 12 T 19 18 1755 CASAVA_Build X 16142605 2I TTGTCTGATT --/TA TATATGTTAC 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 TA 2 3 1756 CASAVA_Build X 16172664 1D AATTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 13 11 T 11 10 1757 CASAVA_Build X 16217722 1I ACAAAAGAAA -/G AGGTTTAATG 3070 hom 99 het 35 0 33 3 G 0 1 1758 CASAVA_Build X 16263713 4I GAGAGGAGAT ----/AGAG AGAGAAACAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AG 2 4 1759 CASAVA_Build X 16337518 2D GCTGGATACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 13 11 1760 CASAVA_Build X 16371613 4I ATTATGATTT ----/ATTG ATTAAAAATA 3070 het 3070 ref 38 18 20 0 ATTG 0 1 1761 CASAVA_Build X 16410708 1I ATGTTCTAGT -/A ACTCCTAAGA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 1 2 1762 CASAVA_Build X 16416122 4I GACTTAAATG ----/ACAA ACAATTTCTC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 ACAA 1 2 1763 CASAVA_Build X 16419444 1D ATTAATGAGA T/- TATTTTCCCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 2 1 1764 CASAVA_Build X 16424946 3I ACTTTTATCC ---/TTT TTTTTTTTTT 2241 het 2241 ref 23 9 8 6 T 11 14 1765 CASAVA_Build X 16431929 2I CGAACTACAC --/AT GTGAGGGATC 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 AT 0 1 1766 CASAVA_Build X 16438063 8I TGCACTTCAG --------/TGCAGTGC CCTGGGCAAC 3070 het 1354 hom 20 4 11 5 TGCAGTGC 0 1 1767 CASAVA_Build X 16442153 4I AGGAAGAAGG ----/AAGA AAGAAAGGAA 1810 het 1810 ref 18 7 5 6 AAGA 1 2 1768 CASAVA_Build X 16449060 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 902 hom 18 5 9 4 A 13 12 1769 CASAVA_Build X 16455570 2D TGTCTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 TG 7 6 1770 CASAVA_Build X 16472382 4D ATAGATAGAT AGAC/---- AGAGAGAGAG 3070 het 1849 hom 24 7 14 4 AGAC 1 0 1771 CASAVA_Build X 16475653 1D GGTCCCAGAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 9 8 1772 CASAVA_Build X 16488657 2D GTTCAGCGCG CA/-- CACACACACA 1344 het 1344 ref 35 24 3 9 CA 10 9 1773 CASAVA_Build X 16516601 1D CAAAGCCAAG C/- CCCCCTTCCT 3070 hom 108 het 39 0 36 5 C 6 5 1774 CASAVA_Build X 16550454 1D ATGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1830 het 1830 ref 37 24 6 7 A 13 12 1775 CASAVA_Build X 16581720 1D GGCAGTCTGT A/- TTTACTAAGG 3070 het 3070 ref 37 16 15 7 A 1 0 1776 CASAVA_Build X 16584918 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 7 8 1777 CASAVA_Build X 16586255 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2042 het 2042 ref 19 7 7 5 A 13 14 1778 CASAVA_Build X 16614457 1D TGAATGGTGG C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 24 7 13 4 C 9 8 1779 CASAVA_Build X 16623191 1I TTTTCTAAGG -/A AAAACCAGAG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 4 5 1780 CASAVA_Build X 16624939 4I ATTTAATCCC ----/CAAA CAATCCTGTT 3070 het 1699 hom 21 6 12 3 CAAA 0 1 1781 CASAVA_Build X 16626601 3D CTTTGTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 2451 hom 29 9 13 7 T 12 9 1782 CASAVA_Build X 16627973 1I TTTTTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 10 11 1783 CASAVA_Build X 16628157 3D TTGTATTACC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 2723 hom 23 6 12 5 ATT 7 6 1784 CASAVA_Build X 16635087 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2434 het 1956 hom 17 5 9 3 A 13 14 1785 CASAVA_Build X 16642834 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2138 hom 18 5 9 4 A 10 9 1786 CASAVA_Build X 16646553 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 987 het 987 ref 32 16 3 13 T 16 15 1787 CASAVA_Build X 16700320 3D GGTTCACAAT ATA/--- ATGTTAAATG 3070 hom 63 het 25 0 22 4 ATA 1 0 1788 CASAVA_Build X 16702753 4I GACAAAACGC ----/ACAA ACAAAGCAAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 ACAA 1 2 1789 CASAVA_Build X 16719415 5D AAGTAATGAG AAGTA/----- AAGTAAAGTG 3070 het 3070 ref 39 19 14 8 AAGTA 2 1 1790 CASAVA_Build X 16722581 3D CTCTCTTTAA CTT/--- CTTGTAAATA 3070 het 3070 hom 36 15 20 3 CTT 2 1 1791 CASAVA_Build X 16730866 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 26 5 10 11 T 17 16 1792 CASAVA_Build X 16733496 3D AAAGAAAGGC CTT/--- CTTCATGCCA 3070 het 3070 hom 34 13 19 4 CTT 2 1 1793 CASAVA_Build X 16740222 1D TAATTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1267 hom 8 het 6 0 3 3 T 11 10 1794 CASAVA_Build X 16751981 2D TGGCCCTTTA CT/-- CTCTATAGAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 CT 3 2 1795 CASAVA_Build X 16752807 1D CTAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1755 het 1470 hom 17 6 8 4 A 13 12 1796 CASAVA_Build X 16758227 1I ATGTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 T 12 13 1797 CASAVA_Build X 16772661 1D GACTCCCCCG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 2228 hom 27 9 9 9 C 9 8 1798 CASAVA_Build X 16781937 1D AAGAGACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2684 hom 34 10 12 12 T 13 12 1799 CASAVA_Build X 16803961 1D ATAAAAAAAA T/- AGATAAAAAA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 1 0 1800 CASAVA_Build X 16816616 1D AGGATTTTGC G/- GGGGTTGGTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 G 5 4 1801 CASAVA_Build X 16831537 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1979 het 1170 hom 13 4 5 5 A 17 16 1802 CASAVA_Build X 16840405 1D CTATTTGTTG A/- AAAAAAAAAA 1839 het 1839 ref 26 9 6 11 A 13 12 1803 CASAVA_Build X 16852297 2I GTGTAGACTG --/AT ATGTCTGGAG 3070 hom 132 het 53 0 44 9 AT 1 2 1804 CASAVA_Build X 16858218 1D AAAGGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 10 T 11 10 1805 CASAVA_Build X 16865947 2D TTTTTCTTCT TC/-- TTTTTTTTTT 930 het 930 ref 44 36 3 5 TC 1 0 1806 CASAVA_Build X 16868392 1D AATTTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1063 hom 38 4 24 11 A 15 14 1807 CASAVA_Build X 16888423 2D AGAAAAAAAA AG/-- AGAGAAAAAC 3070 hom 72 het 26 0 24 4 AG 3 2 1808 CASAVA_Build X 16911239 1I GATTAAATGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 8 9 1809 CASAVA_Build X 16917296 1D TCAATATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 35 1 21 13 A 15 14 1810 CASAVA_Build X 16926128 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 7 6 1811 CASAVA_Build X 16932458 1D AGAACTAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 38 1 15 22 T 17 16 1812 CASAVA_Build X 16932907 1D TTACAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 43 0 33 10 T 11 10 1813 CASAVA_Build X 16937205 4D CCACTGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1710 hom 27 6 15 8 TTTG 3 2 1814 CASAVA_Build X 16971549 2D GCCTTTCTTG CC/-- CCCCCCCCCG 3070 hom 74 het 28 0 21 7 C 11 9 1815 CASAVA_Build X 16984738 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 27 0 23 4 A 11 12 1816 CASAVA_Build X 17001081 5D TGACCAGTAG TTTGC/----- TTTGTGCCTT 3070 het 3070 ref 43 20 21 3 TTTGC 1 0 1817 CASAVA_Build X 17021824 1I AGTAAATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 11 12 1818 CASAVA_Build X 17023569 1D TCAATCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 34 1 20 13 T 15 14 1819 CASAVA_Build X 17056193 1D AGAAGCAGAA C/- CCTGAGATGA 3070 het 251 hom 27 1 23 5 C 3 2 1820 CASAVA_Build X 17058779 1D CCTGAGAATA C/- CTGAGACTGT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 C 2 1 1821 CASAVA_Build X 17071500 5I GGTGGGCCCT -----/TTTAA TTTGGAAACT 3070 hom 93 het 38 0 30 8 TTTAA 0 1 1822 CASAVA_Build X 17372915 1D GTCTTATGCA T/- TTTTTTTTTT 1585 het 1585 ref 50 40 4 6 T 11 10 1823 CASAVA_Build X 17393661 1D CTTCCAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 701 hom 40 4 22 14 A 17 16 1824 CASAVA_Build X 17429400 1I CTATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 334 hom 28 1 19 8 A 11 12 1825 CASAVA_Build X 17439905 3D TGGTTCTGTC CTT/--- CTTATTCAGA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 CTT 2 1 1826 CASAVA_Build X 17440839 1I TTCTAAACCT -/A AGCTAAAATT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 1 2 1827 CASAVA_Build X 17450716 1I TGTGGGCTTG -/C CTGTAGCAGG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 1 2 1828 CASAVA_Build X 17451761 1I CTTCCCAGGT -/C CCCTCACACC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 C 3 4 1829 CASAVA_Build X 17455963 1I TATACCCACT -/G GTCTTATCTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 1 2 1830 CASAVA_Build X 17464048 1I TGGCCAAGTT -/C CCCCTTCATT 3070 hom 106 het 41 0 34 7 C 4 5 1831 CASAVA_Build X 17475937 1I CTGCATTGTT -/G GGTCCTCTCT 3070 hom 109 het 41 0 36 5 G 2 3 1832 CASAVA_Build X 17477253 10D TTCAGTGTCT GCCAGGCCAG/---------- GCCAGGGCCA 3070 hom 6 het 28 1 14 14 GCCAG 3 1 1833 CASAVA_Build X 17483943 1I ACAAACCGGA -/G GAGAAAATTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 1 2 1834 CASAVA_Build X 17490923 1I CTCCTGCATA -/T TTGAGATATA 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 T 2 3 1835 CASAVA_Build X 17516634 1D TTGTGGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 20 17 15 T 12 11 1836 CASAVA_Build X 17524084 1D CCCTCCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 A 11 10 1837 CASAVA_Build X 17526137 1I TCAGGGCCTG -/C CCTACCCAGC 3070 hom 66 het 25 0 20 5 C 2 3 1838 CASAVA_Build X 17582121 1I GCCCTTGGCA -/G GCAGAACTCC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 G 1 2 1839 CASAVA_Build X 17584035 1I TAAGATAAAA -/G GGAAAAGGAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 G 2 3 1840 CASAVA_Build X 17585455 1D CAAAGATAAC G/- AGCATCTAAA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 1 0 1841 CASAVA_Build X 17592077 1I TTTTTAATTC -/T TTTGTCTTTT 3070 hom 81 het 37 0 27 10 T 3 4 1842 CASAVA_Build X 17592249 1I CAAAGTCCAA -/T TTATCAATGT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 2 3 1843 CASAVA_Build X 17615772 1I GCCCTGTTTC -/T TTGTCTTGCA 3070 hom 119 het 47 0 39 8 T 2 3 1844 CASAVA_Build X 17686477 4D ATAAAAAGTT TAAG/---- TATGCAGAAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TAAG 1 0 1845 CASAVA_Build X 17738033 1I GGCTGGTCTT -/G GAACTCCTGG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 G 1 2 1846 CASAVA_Build X 17746552 1I GAAATGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 982 hom 36 3 26 7 T 10 11 1847 CASAVA_Build X 17776533 1D ACCTGTATCT A/- AAAAAAAAAA 2271 het 2271 ref 43 27 6 10 A 15 14 1848 CASAVA_Build X 17989690 2D GATTAGTATG CA/-- CAGCCATAAA 3070 hom 94 het 34 0 30 4 CA 2 1 1849 CASAVA_Build X 18042506 2D CATGCCAGTC TG/-- TGATTTGTAG 3070 het 3070 ref 50 22 15 14 TG 2 1 1850 CASAVA_Build X 18048800 1I TATATGATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 T 11 12 1851 CASAVA_Build X 18060991 1I CTGTGTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 19 11 A 11 12 1852 CASAVA_Build X 18067379 1D17M3I AATGCTCATT AAAAAAACAACAAAATAC---/-AAAAAACAACAAAATACAGA AGAAGAGTGG 3070 het 3070 hom 32 16 16 4 N/A 0 0 1853 CASAVA_Build X 18068635 1I AAATTAGAGT -/A AAAAATCAGT 3070 het 2191 hom 23 6 12 5 A 5 6 1854 CASAVA_Build X 18073090 1I CTAAGCCTTA -/G TGTGCTCTAG 3070 hom 132 het 49 0 44 5 G 0 1 1855 CASAVA_Build X 18107042 1I GACATTCTAG -/T ACCAAAATTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 0 1 1856 CASAVA_Build X 18124343 1D GTCTCAATTG A/- AAAAAAAAAA 1366 het 1366 ref 31 19 4 9 A 12 11 1857 CASAVA_Build X 18127676 1I AAAAGCCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 11 12 1858 CASAVA_Build X 18184762 2D CAAAAACAAC TA/-- TATGTTATAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TA 2 1 1859 CASAVA_Build X 18192096 2I TGGCTGAGTA --/TT TTGTGTCTAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 2 4 1860 CASAVA_Build X 18209149 1D AGTCATAAAG C/- CAAGTCTCAA 3070 hom 114 het 42 0 39 5 C 2 1 1861 CASAVA_Build X 18227734 1I TTAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 366 hom 25 2 19 4 A 9 10 1862 CASAVA_Build X 18227776 1D AAGGGAACTC T/- TTTTTTTTTT 739 het 739 ref 36 20 2 14 T 16 15 1863 CASAVA_Build X 18228832 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 1722 het 1722 ref 27 14 5 8 A 13 14 1864 CASAVA_Build X 18245889 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAGAAA 1006 het 516 hom 12 5 5 2 G 0 1 1865 CASAVA_Build X 18264813 1D ATAAGAAAAG A/- ATGGTCCTGT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 2 1 1866 CASAVA_Build X 18457226 1D TTGTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1362 het 1362 ref 29 22 3 4 T 13 12 1867 CASAVA_Build X 18470701 1D AATATGATGA T/- TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 33 18 6 9 T 15 14 1868 CASAVA_Build X 18530535 1D GGCTTTGCCA T/- TTTAGTGCTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 4 3 1869 CASAVA_Build X 18580710 1I ACTACATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2069 hom 32 8 20 4 A 11 12 1870 CASAVA_Build X 18583075 1D TGCAAAACAA G/- CTCTGAGCAT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 G 1 0 1871 CASAVA_Build X 18586664 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 6 7 1872 CASAVA_Build X 18604711 1I ACCTGTTTCC -/A AACCCCTAGC 3070 hom 105 het 40 0 33 7 A 2 3 1873 CASAVA_Build X 18614917 1D CACAGAGCGC T/- TGGTTTTCGT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 T 2 1 1874 CASAVA_Build X 18639713 3I TGACCATAAA ---/TGT TGTTTATTTC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 TGT 1 2 1875 CASAVA_Build X 18645830 1I CCTCTGGGTT -/C CCCCTTGGCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 4 5 1876 CASAVA_Build X 18654702 1D CAGTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2242 hom 28 7 15 6 T 12 11 1877 CASAVA_Build X 18680767 1I TGTCAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 16 13 T 14 15 1878 CASAVA_Build X 18681270 1D GGTAATTTGT G/- GAGTTTCTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 2 1 1879 CASAVA_Build X 18682092 1D GGAGCGATTT A/- AAAAAAAAAA 2049 het 1303 hom 22 9 9 5 A 15 14 1880 CASAVA_Build X 18682618 4D AGGCCTGAGA TTGT/---- TTGTTCAGTT 3070 het 3070 ref 48 26 15 8 TTGT 2 1 1881 CASAVA_Build X 18694933 1D TACTAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 11 11 5 A 9 8 1882 CASAVA_Build X 18704009 2I CACACACATG --/CT CTGAGGCAGA 3070 het 3070 hom 56 23 24 9 CT 1 2 1883 CASAVA_Build X 18711755 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 10 11 1884 CASAVA_Build X 18722357 1D TATTCCCAAC A/- ATCTCCATTG 3070 het 3070 ref 46 24 16 7 A 2 1 1885 CASAVA_Build X 18725957 1I TAGCCAGGAT -/G GTCTCGACCT 584 het 7 hom 5 0 3 2 G 1 2 1886 CASAVA_Build X 18730893 1D CCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 A 10 9 1887 CASAVA_Build X 18732351 1D ACAGAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 13 12 1888 CASAVA_Build X 18735052 3D GGTTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTTTT 1402 het 1402 ref 32 12 11 10 TTG 1 0 1889 CASAVA_Build X 18736592 2D ACTCAACAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 11 13 A 13 11 1890 CASAVA_Build X 18739655 6D TATATATATA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 30 het 30 ref 8 4 1 3 T 20 14 1891 CASAVA_Build X 18745714 1I TCTACTCATG -/T TATCAGTCTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 1 2 1892 CASAVA_Build X 18753123 1D TGAAATGTAG A/- AATCTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 3 2 1893 CASAVA_Build X 18756932 19I TGGGAGGTGG -------------------/GGTCTTTAAGAAGTGATTA GGTCTTTAAG 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 GGTCTTTAAGAAGTGATTA 0 1 1894 CASAVA_Build X 18779617 1I TGACAGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 T 12 13 1895 CASAVA_Build X 18787455 2I TTTTTGCTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 34 0 24 10 T 13 15 1896 CASAVA_Build X 18788295 1I ACCTGAGGTT -/G GGAGTTTGGT 3070 hom 31 het 13 0 9 4 G 2 3 1897 CASAVA_Build X 18792953 2D TGAAACCCCG TC/-- TCTACTAAAA 2762 het 2587 hom 17 7 9 1 TC 2 1 1898 CASAVA_Build X 18839050 1D AGAACAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 26 11 T 13 12 1899 CASAVA_Build X 18897156 1D CTGTATATTT A/- AAAAAAAAAA 2690 het 2690 ref 31 12 7 12 A 16 15 1900 CASAVA_Build X 18948994 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 10 11 1901 CASAVA_Build X 18953346 1I CATGCCAATG -/C CTGGGTCTCA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 1 2 1902 CASAVA_Build X 18957730 2I AGATGACCAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 T 13 15 1903 CASAVA_Build X 18962063 1I AGGTTGTAAA -/G AACAGGTAAT 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 G 0 1 1904 CASAVA_Build X 18983770 1D AGGTGGGAGA T/- TTTTTTTTTT 1638 het 1638 ref 33 18 7 8 T 17 16 1905 CASAVA_Build X 19095776 1D AATGCAGGAT A/- AAAAACTATA 3070 het 3070 ref 36 16 16 5 A 6 5 1906 CASAVA_Build X 19101840 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1752 het 199 hom 10 1 5 4 T 13 12 1907 CASAVA_Build X 19142169 1I TTTAATGTGG -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 T 1 2 1908 CASAVA_Build X 19213940 1D TTTTGTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 11 10 1909 CASAVA_Build X 19272694 18I GTTATCTCTG ------------------/AAATGTTATCGGTTATTA AAATGTTATC 3070 hom 57 het 29 0 20 10 AAATGTTATCGGTTATTA 0 1 1910 CASAVA_Build X 19288884 2D TGGGAAACAA AC/-- ACAGCTGTCT 3070 het 3070 ref 47 24 16 11 AC 2 1 1911 CASAVA_Build X 19290897 1D AGTCTGGTTT A/- AAAAAAAAAA 760 het 760 ref 34 22 3 9 A 17 16 1912 CASAVA_Build X 19300170 2D GAGACTGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 1200 het 4 hom 14 0 4 10 A 18 16 1913 CASAVA_Build X 19378927 1D TTCATTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 11 0 10 1 A 12 11 1914 CASAVA_Build X 19388258 1I TCTTGCGCCC -/A AAAATGGTTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 4 5 1915 CASAVA_Build X 19388777 1I GAATGGCCAG -/A ATGTTCTGTT 3070 hom 78 het 27 0 23 4 A 1 2 1916 CASAVA_Build X 19398586 1I AACTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 271 hom 21 1 18 2 A 13 14 1917 CASAVA_Build X 19406799 1D TTTAATAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 34 1 21 12 T 14 13 1918 CASAVA_Build X 19406976 1D TAATTCTCCT G/- GGGGACAGAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 5 4 1919 CASAVA_Build X 19450343 1D TCTAGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 27 0 24 3 T 11 10 1920 CASAVA_Build X 19549113 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1576 het 33 hom 16 1 6 9 T 19 18 1921 CASAVA_Build X 19713403 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1375 het 1375 ref 32 12 5 15 A 15 16 1922 CASAVA_Build X 19733565 1D GCTGCATATT A/- AAAAAAAAAA 1414 het 1414 ref 42 17 5 20 A 19 18 1923 CASAVA_Build X 19790702 1D ATTTTGGTGC A/- AAAAAAAAAA 1656 het 1656 ref 41 32 4 6 A 13 12 1924 CASAVA_Build X 19824109 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2213 het 1977 hom 20 9 7 4 A 17 16 1925 CASAVA_Build X 19908978 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1977 het 1416 hom 17 10 5 2 A 17 16 1926 CASAVA_Build X 20036279 2D TTTTATTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 33 0 26 7 T 13 11 1927 CASAVA_Build X 20084935 1D GGTAATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 11 10 1928 CASAVA_Build X 20091336 3I CTGAAGATAA ---/CTT CTTTCTTATT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 CTT 1 2 1929 CASAVA_Build X 20157156 1D AGTAAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 1818 het 1818 ref 40 31 4 6 T 11 10 1930 CASAVA_Build X 20332643 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1937 het 1937 ref 29 13 8 8 A 13 14 1931 CASAVA_Build X 20380756 5I TCCCTCCCAG -----/AACAA AACAAAACAA 3070 het 3070 ref 41 21 11 9 AACAA 3 4 1932 CASAVA_Build X 20383832 2I ACTTTATAAT --/TC TCTTTTACTC 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 TC 1 2 1933 CASAVA_Build X 20401334 1I TGAACTTTGC -/A AAAAGGAGAG 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 A 4 5 1934 CASAVA_Build X 20447781 6I9M1D TGAAATTCTT ------TAGCTCCTGT/TATCTCTAGCTCCTG- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 N/A 0 0 1935 CASAVA_Build X 20448665 1D TCCATCCTCC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 9 8 1936 CASAVA_Build X 20449167 4I CTAAGGAATT ----/TTTC TTTTTTTTTT 1143 het 1143 ref 16 5 4 7 TTTC 0 1 1937 CASAVA_Build X 20449187 5D TCTAAAAGCT TTTTA/----- TTTTATTTTA 652 het 652 ref 15 4 3 9 TTTTA 3 2 1938 CASAVA_Build X 20459621 4I AAAACAGACG ----/AACA AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 AACA 4 5 1939 CASAVA_Build X 20465449 1I CATTGCTCTA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 40 18 15 7 T 6 7 1940 CASAVA_Build X 20467382 1D AGTTAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 2636 het 954 hom 30 7 10 13 T 17 16 1941 CASAVA_Build X 20479075 3I TCCATACCTG ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 65 20 32 13 TGT 4 5 1942 CASAVA_Build X 20486766 1D TTCTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 12 9 T 15 14 1943 CASAVA_Build X 20487062 5D CTTGTTTTGT GTGAG/----- GTAAGAGTCA 3070 het 3070 ref 52 35 14 3 GTGAG 1 0 1944 CASAVA_Build X 20490559 1I TTCTTCTTTC -/T TTGTATAGTG 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 T 2 3 1945 CASAVA_Build X 20492978 1I GTGGCTAGGG -/A AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 6 7 1946 CASAVA_Build X 20502039 1I TTTTATTATC -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 6 7 1947 CASAVA_Build X 20518661 1D GTACTGGGCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 T 9 8 1948 CASAVA_Build X 20543702 1I TAGTTAGAAT -/A AAATATATAA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 3 4 1949 CASAVA_Build X 20550233 1I TTTTCTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 10 11 1950 CASAVA_Build X 20553106 4I TTTCTTTCCT ----/TAAC TATGTGTGCA 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 TAAC 0 1 1951 CASAVA_Build X 20580297 1I TTAGGGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 61 21 16 24 T 15 16 1952 CASAVA_Build X 20589456 1I TTACCCTTAC -/A TCTTTTGATC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 0 1 1953 CASAVA_Build X 20593586 1I ATTAGCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 36 1 23 12 T 12 13 1954 CASAVA_Build X 20596013 2D CTGCCACATG CA/-- CACACACACA 1104 het 1104 ref 64 49 4 11 CA 8 7 1955 CASAVA_Build X 20664411 1I ATGATTAGTA -/G TGCTGTTGAC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 0 1 1956 CASAVA_Build X 20673137 5D AAAACATCTA TTATC/----- TTAAGATGTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 6 TTATC 1 0 1957 CASAVA_Build X 20681488 4D TTGTATTGGG GTCT/---- ATCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 GTCT 1 0 1958 CASAVA_Build X 20698104 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAGAGT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 6 7 1959 CASAVA_Build X 20713121 1D ATCCACATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 12 11 1960 CASAVA_Build X 20752235 1D TGGGCAGGCA T/- TTTTTTTTTT 1052 het 1052 ref 39 22 6 11 T 15 14 1961 CASAVA_Build X 20762039 1I ATTACACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 33 0 20 13 T 12 13 1962 CASAVA_Build X 20788611 1D TCTTTATAGC A/- GTGTGAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 12 5 A 1 0 1963 CASAVA_Build X 20818662 2D GCAAGGTCAC TA/-- TATATATATA 1416 het 1416 ref 26 16 3 7 TA 9 8 1964 CASAVA_Build X 20868033 1D TCCATGAAGA T/- TTTTTTTTTT 1662 het 1662 ref 44 33 4 7 T 12 11 1965 CASAVA_Build X 20965858 2I AAAAATTATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 TA 6 7 1966 CASAVA_Build X 20979681 1D ATAAATTCTA T/- TTTTTTTTTT 2996 het 2996 ref 30 13 8 9 T 13 12 1967 CASAVA_Build X 21044487 1D ATTATATACA G/- GGTGCTACAC 3070 het 3070 hom 48 17 24 8 G 3 2 1968 CASAVA_Build X 21311715 1D GCTCAATATC T/- TTTTTTTTTT 1666 het 1666 ref 35 28 4 3 T 13 12 1969 CASAVA_Build X 21323589 1I GAATGCCTTG -/A AAAAAAAAAA 1065 het 1065 ref 46 34 3 9 A 10 11 1970 CASAVA_Build X 21342459 1I GATTATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 11 12 1971 CASAVA_Build X 21426523 1D GGCCTATGTC T/- TTACAACCAG 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 T 3 2 1972 CASAVA_Build X 21448519 1I TAATTCAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 A 9 10 1973 CASAVA_Build X 21455846 5D TCAAAAACAA TAATT/----- TAAGGTCTCT 3070 het 3070 ref 39 22 16 3 TAATT 1 0 1974 CASAVA_Build X 21464869 1D CTTCTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 1159 het 1159 ref 35 16 4 16 T 14 13 1975 CASAVA_Build X 21492794 1D TAGAAAAATG T/- TTTTTTTTTT 1301 het 1301 ref 34 25 3 6 T 11 10 1976 CASAVA_Build X 21541991 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 131 het 131 ref 18 5 1 13 AAG 1 0 1977 CASAVA_Build X 21545934 1D TCATACACTG C/- CCCCCCCACA 2539 het 2108 hom 25 9 8 8 C 8 7 1978 CASAVA_Build X 21582706 4D AACTGAAGTC AAAT/---- AAATTCAGCT 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 AAAT 2 1 1979 CASAVA_Build X 21591090 1D CATGCAGTAG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 A 8 7 1980 CASAVA_Build X 21671474 4I ACACACGCAT ----/ACAC ACACACAATC 3070 hom 138 het 54 0 47 7 AC 3 5 1981 CASAVA_Build X 21701463 1D ATTAACCAAG A/- AAAAAAACAG 2777 het 2777 ref 22 14 6 3 A 8 7 1982 CASAVA_Build X 21709896 2I AACTTTCTTC --/CT CTCTGCCAAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 CT 2 3 1983 CASAVA_Build X 21721313 1I AGATCAACTG -/A AAAAAAAAAT 1346 het 1346 ref 23 19 3 1 A 9 10 1984 CASAVA_Build X 21737234 2I ATGTTCTCAC --/TT TTCGTGAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 2 4 1985 CASAVA_Build X 21747424 1D TGGCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 28 1 T 11 10 1986 CASAVA_Build X 21769399 1D GTCAGAGGTT A/- ACAATGAAAC 2908 het 2908 ref 39 24 8 8 A 2 1 1987 CASAVA_Build X 21769706 1I TGCATATGTG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 7 8 1988 CASAVA_Build X 21772767 5D AACAATAGAA AAAAG/----- AAATTATTAT 3070 het 3070 hom 37 12 21 6 AAAAG 1 0 1989 CASAVA_Build X 21785743 1D TAAGAGTTTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 22 9 0 A 9 8 1990 CASAVA_Build X 21789871 4D GACCATACTT TGTC/---- TGGCTATTTC 3070 het 3070 hom 40 19 19 4 TGTC 1 0 1991 CASAVA_Build X 21795072 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAAGAAAA 2952 het 1745 hom 18 5 12 3 A 7 5 1992 CASAVA_Build X 21798862 26D TCAGCTCTGA AAAATCAGCTTCCCAATTCTTTATAC/-------------------------- AAAATCAGCT 3070 het 2203 hom 30 5 13 14 AAAATCAGCTTCCCAATTCTTTATAC 2 1 1993 CASAVA_Build X 21818754 1D TTTAGGTGGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 9 8 1994 CASAVA_Build X 21830106 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2355 hom 21 6 11 4 A 13 11 1995 CASAVA_Build X 21832018 1D TATAAGGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 T 10 9 1996 CASAVA_Build X 21836359 1D CCTAGGAGTG A/- AAAAAAAAAA 1727 het 1727 ref 40 29 5 6 A 12 11 1997 CASAVA_Build X 21852333 1I ATCGTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 2380 het 244 hom 18 6 7 5 G 0 1 1998 CASAVA_Build X 21907228 1I AAATTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 17 1 13 3 T 11 12 1999 CASAVA_Build X 21911442 1I ACTTAATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 20 1 17 2 T 10 11 2000 CASAVA_Build X 21928234 3D TGATGGCCAG TGA/--- TGATGAGCAT 3070 hom 27 het 10 0 10 3 TGA 3 2 2001 CASAVA_Build X 21945908 1I CCAAAGTGCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 G 2 3 2002 CASAVA_Build X 21956834 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 36 1 32 3 T 10 11 2003 CASAVA_Build X 21961443 1D GGGTGGAAAA T/- TTTTTATGTG 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 6 5 2004 CASAVA_Build X 21967975 1D CTTCTGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 24 het 21 0 16 5 A 8 7 2005 CASAVA_Build X 21975995 1D AATAGTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 8 10 T 11 10 2006 CASAVA_Build X 21983286 2D AATATTCCCA AC/-- ACACAAAATA 2103 het 2103 ref 17 7 5 5 AC 3 2 2007 CASAVA_Build X 21983608 1D TCAGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2068 het 2068 ref 23 11 7 5 T 11 10 2008 CASAVA_Build X 22034116 1I TGAAAATGTG -/T TTTTTTTGGG 3070 het 373 hom 37 1 29 7 T 7 8 2009 CASAVA_Build X 22037940 3I AGAAATTGAC ---/TAT TATTTGTCAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TAT 1 2 2010 CASAVA_Build X 22046239 1I TTTAACAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 673 hom 31 2 20 9 T 12 13 2011 CASAVA_Build X 22051612 1I TCCTGGCACA -/G GCTGTGGCAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 2012 CASAVA_Build X 22060913 1I AAAGAAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 14 12 T 12 13 2013 CASAVA_Build X 22063486 19D GAAGAGGTGC TTGCATGAATTAGTACAGG/------------------- ACCACCAGGG 3070 het 3070 ref 52 36 13 9 TTGCATGAATTAGTACAGG 1 0 2014 CASAVA_Build X 22064916 1D AAGAGGTCAC G/- AGTAGTTTTT 3070 het 3070 hom 54 22 24 9 G 1 0 2015 CASAVA_Build X 22068956 1D AGGTAGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1467 hom 36 7 16 13 T 15 14 2016 CASAVA_Build X 22160635 14D CCACTTCTGC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 1239 het 567 hom 20 3 3 15 T 30 16 2017 CASAVA_Build X 22207871 5D AGCATAGCTA CCAAC/----- CCAACCCAAC 3070 het 3070 ref 51 25 13 13 CCAAC 3 2 2018 CASAVA_Build X 22215721 1D GGAAAGTATT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 A 9 8 2019 CASAVA_Build X 22223367 2D TCATGTACAT AC/-- ACGCACATAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AC 2 1 2020 CASAVA_Build X 22294746 1D ATCTATTATG A/- AAAAAAAAAA 1722 het 1722 ref 34 27 4 3 A 11 10 2021 CASAVA_Build X 22311487 2D CATTTTAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 23 1 9 14 T 16 14 2022 CASAVA_Build X 22319633 1D CATCTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 1389 het 1389 ref 19 8 5 6 A 15 14 2023 CASAVA_Build X 22321285 1D AGTCCATACA T/- ATGTGAATGC 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 1 0 2024 CASAVA_Build X 22353048 1I TTCCCACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 14 10 T 11 12 2025 CASAVA_Build X 22365083 5I TAATCTTTAC -----/ATCAT ATTGGACTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATCAT 0 1 2026 CASAVA_Build X 22394639 1D AGAAGTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 12 11 2027 CASAVA_Build X 22403974 1I TAAAAGATTA -/T TTTTTTTTTC 2797 het 2797 ref 21 11 8 2 T 9 10 2028 CASAVA_Build X 22414075 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2888 het 2157 hom 20 7 7 6 A 13 12 2029 CASAVA_Build X 22414968 1I AAAATATTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 10 11 2030 CASAVA_Build X 22419546 1I AATTCAAGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 9 10 2031 CASAVA_Build X 22428507 1I ACTTTAATTG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 7 8 2032 CASAVA_Build X 22428629 3D3M2I TGTGTGTGTG TGTGGG--/---GGGAA GGGGGAGGGC 3070 het 2426 hom 18 8 8 3 N/A 0 0 2033 CASAVA_Build X 22439087 1I CTATTTTTAG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 8 9 2034 CASAVA_Build X 22439272 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 9 8 2035 CASAVA_Build X 22442013 1D AATTTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1889 het 1889 ref 17 8 5 4 T 11 10 2036 CASAVA_Build X 22442697 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1981 hom 14 5 7 2 A 10 11 2037 CASAVA_Build X 22461698 1D TAGTTCAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 T 10 9 2038 CASAVA_Build X 22596774 1D ATGCGATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 13 15 9 A 11 10 2039 CASAVA_Build X 22603112 1I AGAAGCTTGC -/T TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 50 11 27 12 T 6 7 2040 CASAVA_Build X 22642813 5I TGTGACACTT -----/TAAAG TATGAAACTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TAAAG 0 1 2041 CASAVA_Build X 22643055 1I AAAAATGGCC -/A AAAAATTTGA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 A 5 6 2042 CASAVA_Build X 22649574 1I GAAGAAATTC -/T TTTTTTAAAA 2599 het 2599 ref 25 12 7 6 T 6 7 2043 CASAVA_Build X 22663036 3D GTTAGTTCCC CTT/--- CTTAATCCTG 3070 het 3070 hom 52 19 27 6 CTT 2 1 2044 CASAVA_Build X 22677520 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2046 het 1815 hom 27 11 9 7 A 15 16 2045 CASAVA_Build X 22678726 1I GGCTTCCTGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 8 9 2046 CASAVA_Build X 22690852 1I AATTTATCTA -/T TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 6 7 2047 CASAVA_Build X 22699508 1I GTATAATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 A 10 11 2048 CASAVA_Build X 22711315 1I GGTTATGGCT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 328 hom 37 1 31 5 A 8 9 2049 CASAVA_Build X 22713607 1D ACAGTAAGAG A/- AAAAAATTAC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 7 6 2050 CASAVA_Build X 22717763 1I AGGAAAAGAC -/A AAATGAGGCA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 3 4 2051 CASAVA_Build X 22722917 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAAAGT 2262 het 2262 ref 23 16 7 1 C 1 0 2052 CASAVA_Build X 22723169 2I TCACAATAGC --/AA AAAGACTTAC 2893 het 2893 ref 15 9 6 0 A 3 5 2053 CASAVA_Build X 22734982 3D TTCAAAAGAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 15 12 2054 CASAVA_Build X 22737551 1I TGGGCAAAGA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 7 8 2055 CASAVA_Build X 22741850 1D ACAATTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 11 10 2056 CASAVA_Build X 22757245 1D CCATACCTTT A/- AAAAAAATTT 2478 het 2478 ref 21 10 7 4 A 8 7 2057 CASAVA_Build X 22761405 5I ATAATATAGT -----/TTAAC TTAATTTTTA 3070 het 2569 hom 18 6 11 1 TTAAC 0 1 2058 CASAVA_Build X 22764661 1D AAATTCTTAA G/- TTTGATTCAA 3070 het 3070 hom 42 14 23 6 G 1 0 2059 CASAVA_Build X 22768076 3D AACTGAAAAA AAG/--- AAGAAAATAA 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 AAG 2 1 2060 CASAVA_Build X 22769081 1D GTATTGTTTT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 A 8 7 2061 CASAVA_Build X 22769590 1D ACTCAATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 10 9 2062 CASAVA_Build X 22773067 3D TTAGCACCTA GAG/--- TAGTATTTCA 3070 het 3070 hom 46 20 21 7 GAG 1 0 2063 CASAVA_Build X 22777012 14I GAGAGAGAAA --------------/AAGTACTTTCACAT AAGTGTAATG 3070 het 3070 hom 46 15 27 4 AAGTACTTTCACAT 0 1 2064 CASAVA_Build X 22785751 4D TGAAACTATT ACAA/---- ACAAAGACAA 3070 het 3070 hom 44 19 24 4 ACAA 2 1 2065 CASAVA_Build X 22787578 1D CTAAGATTAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 9 8 2066 CASAVA_Build X 22787732 1D GGACACTCAG T/- TAAATGTAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 T 2 1 2067 CASAVA_Build X 22793000 1I GCTAGCCAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 8 9 2068 CASAVA_Build X 22801456 1I GTTGCAGGGT -/G GGGGGTGAGG 3070 hom 83 het 34 0 27 7 G 5 6 2069 CASAVA_Build X 22801591 1I GGAAATAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 10 2070 CASAVA_Build X 22815178 2I GCTCAGTCCC --/AA AAGACTGCCC 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 2 4 2071 CASAVA_Build X 22832960 1D ATGAACTTTC A/- ATAAGAATTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 1 2072 CASAVA_Build X 22838052 1I TTCTGATATG -/T TTTTCGGTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 4 5 2073 CASAVA_Build X 22838362 4D ACTCCGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1557 hom 15 het 7 0 5 5 A 25 21 2074 CASAVA_Build X 22838603 1I TTATCATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 10 11 2075 CASAVA_Build X 22862944 4I GAGAAGAGAA ----/TATT TATTTTAAAT 2863 het 2033 hom 12 5 7 0 TATT 1 2 2076 CASAVA_Build X 22863439 1D CAGCTCAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2439 hom 37 15 11 12 A 17 16 2077 CASAVA_Build X 22867983 1D CCTCCTGGAA G/- GCTCTGCTCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 G 2 1 2078 CASAVA_Build X 22875667 3D GAGAAAAGGG GAA/--- GAAGAACTGA 3070 het 3070 ref 51 27 21 8 GAA 3 2 2079 CASAVA_Build X 22883065 1I TCTATTTATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 9 10 2080 CASAVA_Build X 22883628 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2723 hom 18 6 7 5 A 10 9 2081 CASAVA_Build X 22910337 1D TCTCATATGG C/- CCCCTGCTCA 3070 hom 141 het 55 0 48 8 C 5 4 2082 CASAVA_Build X 22911789 1D TATTTTTAAG A/- AAAAAACTAC 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 A 7 6 2083 CASAVA_Build X 22915664 1I TGAGTAAAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 50 19 28 3 A 8 9 2084 CASAVA_Build X 22923469 2I AAACTAAAAC --/AT AATTTTCTCA 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 AT 0 1 2085 CASAVA_Build X 22943589 1I TTTTTAAAAC -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 6 7 2086 CASAVA_Build X 22944772 1I TATGACAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 10 11 2087 CASAVA_Build X 22946328 4D ATAACAGGTG TATA/---- TATATATATA 2812 het 114 hom 12 1 7 5 TA 11 9 2088 CASAVA_Build X 23006417 1D TTGCTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 1700 het 1700 ref 32 22 4 6 A 13 12 2089 CASAVA_Build X 23032864 1I GAAACAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2130 hom 22 6 11 5 A 11 12 2090 CASAVA_Build X 23080091 1I TGTTGATTTT -/C CCCCAAATTG 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 C 4 5 2091 CASAVA_Build X 23083279 3I TACCAAAATA ---/ACT ACATTTCTAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 ACT 0 1 2092 CASAVA_Build X 23084581 1I TAGAAAAAAA -/T GAAATATGTG 3070 het 3070 ref 37 22 8 7 T 0 1 2093 CASAVA_Build X 23087001 1I GGGTCTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 A 10 11 2094 CASAVA_Build X 23090680 1I53M3D GAGTTTGGGA -TTTTTTTTTGAAACATTCTAGAAGGGAAATTAAGTAGATAGTTGAATACATATGAG/TTTTTTTTTTGAAACATTCTAGAAGGGAAATTAAGTAGATAGTTGAATACATAT--- GAGAGCATTG 3070 het 3070 ref 42 24 19 9 N/A 0 0 2095 CASAVA_Build X 23105306 1D TTTTGTTGTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 G 1 0 2096 CASAVA_Build X 23110481 4I ATTTCTTCCC ----/CAGT CAGTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 CAGT 1 2 2097 CASAVA_Build X 23119634 1I GTTCAGGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 60 21 30 9 A 9 10 2098 CASAVA_Build X 23127007 1I AACCACAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 A 10 11 2099 CASAVA_Build X 23134458 1I GCCCGTGCCC -/G GGGGCAGGCT 3070 het 3070 hom 40 18 14 8 G 4 5 2100 CASAVA_Build X 23137937 2D AGCCTCTTGA CT/-- CTCTGTCAGT 3070 het 3070 hom 54 21 28 8 CT 3 2 2101 CASAVA_Build X 23138186 3I AAAAAATGGT ---/GAG GAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 GAG 0 1 2102 CASAVA_Build X 23140075 3D GTATTTTTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 13 10 2103 CASAVA_Build X 23142828 1D TGATCATCTG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 9 8 2104 CASAVA_Build X 23147585 1D CCTTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1210 het 1210 ref 49 36 3 11 A 12 11 2105 CASAVA_Build X 23151774 2I TGACAGTGTT --/AA AGTTACTAGA 3070 het 3070 ref 47 25 21 1 A 1 3 2106 CASAVA_Build X 23154089 3D TATTCCCATG TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 12 9 2107 CASAVA_Build X 23155751 4I CAATTGAAAC ----/AGTT AGACATGCAG 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 AGTT 0 1 2108 CASAVA_Build X 23162815 1D GAAGATGAGA T/- TTTTTTTTTT 1965 het 1965 ref 52 28 7 17 T 15 14 2109 CASAVA_Build X 23163478 1I TTTAAAAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 8 9 2110 CASAVA_Build X 23174864 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2205 het 2205 ref 21 10 5 6 T 11 10 2111 CASAVA_Build X 23176628 1D GGAAATTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 8 7 2112 CASAVA_Build X 23178030 2I TGGAAGTGCT --/TA TACTCATTTT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TA 1 2 2113 CASAVA_Build X 23179882 2I TAGTTTCTAC --/TT TTTATAAATA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 3 5 2114 CASAVA_Build X 23192497 1D TATCCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2730 het 2730 ref 29 15 8 6 A 12 11 2115 CASAVA_Build X 23192887 2I TATTTTTAGT --/AG AGGGGGGTGG 1937 het 179 hom 14 3 6 5 AG 1 2 2116 CASAVA_Build X 23193131 3I AGGTGGAATT ---/TCC TCTAGGTCAT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 TCC 0 1 2117 CASAVA_Build X 23200134 2I CAAAAATAAC --/TT ATGGTTATTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 0 2 2118 CASAVA_Build X 23210761 1I AATTTCTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 A 10 11 2119 CASAVA_Build X 23215333 1I GTTTAATGCA -/T TTTTTTCAGT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 6 7 2120 CASAVA_Build X 23246378 1I TAGCCCCGGA -/C CCCCCAGCCT 3070 het 3070 ref 46 27 11 8 C 5 6 2121 CASAVA_Build X 23260666 1D AATAACGAAG A/- TGAGCACAGA 3070 het 3070 ref 43 18 17 10 A 1 0 2122 CASAVA_Build X 23302642 2D GAGGGAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 2376 het 2376 ref 31 11 7 14 T 16 14 2123 CASAVA_Build X 23303608 3D TGAGCCACCG CGC/--- CGCCCGGCCG 3070 hom 33 het 14 0 11 4 CGC 2 1 2124 CASAVA_Build X 23318993 1D ATGCCAAGGC G/- ATGGAAGCAG 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 G 1 0 2125 CASAVA_Build X 23344288 3D ATCTATCATC CTT/--- CTATCTATCT 3070 het 3070 ref 47 27 18 2 CTT 1 0 2126 CASAVA_Build X 23344953 1D TTGTTTTGCT G/- GGATTGTGAC 3070 hom 134 het 55 0 44 12 G 3 2 2127 CASAVA_Build X 23370508 1I ATGAACTAAG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 7 8 2128 CASAVA_Build X 23376641 4I TCTTATAATC ----/TTCT TTCTCTCTAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TTCT 1 2 2129 CASAVA_Build X 23415897 1D ATCCACAAGC A/- AAAAAAAAAA 2033 het 2033 ref 34 26 6 2 A 13 12 2130 CASAVA_Build X 23419716 1D TCTTTTCACG T/- TTTTGCATTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 5 4 2131 CASAVA_Build X 23424378 1D CATGTAGTCA T/- TCTAATAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 T 2 1 2132 CASAVA_Build X 23427187 1I GAACACAAGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 8 9 2133 CASAVA_Build X 23464744 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGCC 3025 het 1412 hom 28 9 12 7 G 0 1 2134 CASAVA_Build X 23470854 1I CACAAAACAA -/C CAGAAAACAA 3070 het 3070 hom 49 24 23 2 C 1 2 2135 CASAVA_Build X 23473559 1D CAGTATTGCT A/- AAAATGACCC 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 5 4 2136 CASAVA_Build X 23480778 4I TCCTGGCTTC ----/TTTA TTTGACAGCT 3070 het 3070 ref 50 24 16 10 TTTA 0 1 2137 CASAVA_Build X 23488654 1I CTCGATGTTG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 6 7 2138 CASAVA_Build X 23528226 74D TGTCAGTGTA TTCAGCATTTTATCCCCAGGGATAGGGACTGTTTCTTCCTCACTACAAATCACTCACTGACTACAAATCAAGAG/-------------------------------------------------------------------------- CTTCAGAAAA 2290 het 2290 ref 21 33 5 0 TTCAGCATTTTATCCCCAGGGATAGGGACTGTTTCTTCCTCACTACAAATCACTCACTGACTACAAATCAAGAG 1 0 2139 CASAVA_Build X 23532186 15I CGAATCCCAA ---------------/AGAATGCCACTGCCT AGTGGCCACA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AGAATGCCACTGCCT 0 1 2140 CASAVA_Build X 23533341 1D CAATTAAAAC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 8 7 2141 CASAVA_Build X 23543575 3D GGAAGGTAAC CTT/--- CTAGCAAATT 3070 het 3070 hom 43 14 25 6 CTT 1 0 2142 CASAVA_Build X 23544512 2D TAAAGTTGTA TT/-- TTTTTTTTAA 2240 het 2240 ref 25 14 6 5 T 10 8 2143 CASAVA_Build X 23555360 4D AAGAATTCTT AGAA/---- AGAGTTGTTG 3070 het 3070 ref 47 23 23 3 AGAA 1 0 2144 CASAVA_Build X 23562644 2D ATTCAATGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2423 hom 24 8 11 5 T 15 13 2145 CASAVA_Build X 23565075 1D AGGACTGGCT C/- CCCCAGCTGC 1206 het 1206 ref 33 9 5 20 C 5 4 2146 CASAVA_Build X 23585898 5D AAATAAAAAT AAAAA/----- AATTACTAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 7 2 2147 CASAVA_Build X 23586130 14D TTATTACCAC CTCTTTATTACCAT/-------------- CTCTTTATTA 3070 hom 66 het 23 0 23 4 CTCTTTATTACCAT 2 1 2148 CASAVA_Build X 23586979 1I TATATGGGGG -/A ATCTGCATAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 2 2149 CASAVA_Build X 23588420 1I GGCCTTCCTC -/T TTTTACTAAT 3070 hom 39 het 18 0 13 5 T 4 5 2150 CASAVA_Build X 23589892 1I GACTATAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 29 2 20 9 A 15 16 2151 CASAVA_Build X 23594104 4I34M1I GGGATAAAAC ----GCGAGCTATTCAGAGGCAGAAAGGTCAGTTTCCC-/GCGAGCGAGCTATTCAGAGGCAGAAAGGTTAGTTTCCCT TTTGAGGGGC 3070 hom 62 het 20 0 20 7 N/A 0 0 2152 CASAVA_Build X 23594660 1D CATTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 25 0 19 6 A 13 12 2153 CASAVA_Build X 23596853 4D ACTTAGGATG GGTT/---- GGTTGGGAGT 3070 hom 110 het 41 0 37 4 GGTT 2 1 2154 CASAVA_Build X 23597956 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2741 het 2686 hom 22 11 8 3 A 13 12 2155 CASAVA_Build X 23601796 4I CCTGCCACAA ----/AAAG AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 AAAG 0 1 2156 CASAVA_Build X 23602635 1D TAGGAATATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 10 9 2157 CASAVA_Build X 23604830 2D ATCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 16 14 2158 CASAVA_Build X 23609269 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 51 het 22 0 15 7 A 9 8 2159 CASAVA_Build X 23613597 1I TGACCTCAAA -/G GCAAAACTGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 1 2 2160 CASAVA_Build X 23613759 3I TTTTAAGTCT ---/AAC AACAGGATTC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AAC 1 2 2161 CASAVA_Build X 23620461 4I AAGGCCTGTC ----/TGTT CAGATTCCTG 3070 hom 122 het 44 0 40 4 TGTT 0 1 2162 CASAVA_Build X 23623185 2D CATTCTGATG TT/-- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 T 6 4 2163 CASAVA_Build X 23640265 1D TAGTGAAACA C/- CCCCCCATCT 1041 het 556 hom 5 2 3 0 C 7 6 2164 CASAVA_Build X 23648046 1I CTAATTTTTT -/G TATTTTTAGT 1662 het 389 hom 7 1 6 0 G 0 1 2165 CASAVA_Build X 23657109 1D TTACCTGCCA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 29 14 10 5 C 9 8 2166 CASAVA_Build X 23657668 1I GGACAAAAAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 7 8 2167 CASAVA_Build X 23667008 3I TAGGGGTTAA ---/GAG CCCAAAGGCT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 GAG 0 1 2168 CASAVA_Build X 23669836 1D CTCAGCCTCC A/- AAAGTAGCTG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 4 3 2169 CASAVA_Build X 23674423 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2470 het 2470 ref 24 8 7 9 A 15 14 2170 CASAVA_Build X 23686020 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 10 1 9 0 A 11 10 2171 CASAVA_Build X 23698569 21I GATGGAGTCT ---------------------/CCTAGGCTGGACACTCTGTCG CCTAGGCTGG 2546 het 2546 ref 20 8 9 3 CCTAGGCTGGACACTCTGTCG 0 1 2172 CASAVA_Build X 23707127 4D CTGTAAAAAC CACA/---- CACACACATC 3070 het 3070 hom 43 16 20 9 CA 6 4 2173 CASAVA_Build X 23718256 4D ACTGGTGCCA TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 6 TGTT 6 5 2174 CASAVA_Build X 23720031 1D TCTGTGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 12 11 2175 CASAVA_Build X 23725246 1I TTCGCCCTGA -/C CCCCCCCACT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 C 7 8 2176 CASAVA_Build X 23733361 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTAT 1714 het 1714 ref 14 6 5 3 T 8 9 2177 CASAVA_Build X 23738411 3D CACACCTATG GTT/--- TTCATGGCAG 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 GTT 1 0 2178 CASAVA_Build X 23754386 4I TGCACATAAA ----/TGAG TAACAAGAAC 3070 hom 154 het 56 0 52 4 TGAG 0 1 2179 CASAVA_Build X 23755104 1D ACACCTGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 13 10 9 T 10 9 2180 CASAVA_Build X 23756885 4D ACTTCCTTGG CTGT/---- CCTTCTGTCT 3070 hom 72 het 27 0 24 5 CTGT 1 0 2181 CASAVA_Build X 23771497 1I CCAGAAATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 T 9 10 2182 CASAVA_Build X 23779238 1D GGTAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 25 0 17 8 T 12 11 2183 CASAVA_Build X 23782734 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 74 het 26 0 24 2 T 7 8 2184 CASAVA_Build X 23798669 1D ACAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 833 het 833 ref 17 13 3 1 A 11 10 2185 CASAVA_Build X 23806753 7D TTTATTCATT CTTGCTA/------- CTTGCTATTT 3070 hom 58 het 23 0 17 10 CTTGCTA 2 1 2186 CASAVA_Build X 23820030 1I TTCTCCAAAA -/C CTGTTTTTAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 1 2 2187 CASAVA_Build X 23899723 1D GTTTCTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1636 het 1636 ref 43 22 4 17 T 15 14 2188 CASAVA_Build X 23913975 3I AAATAATGTA ---/TTT TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 T 6 9 2189 CASAVA_Build X 23921248 6I46M1I GGATCCTTGA ------GGCTTCATAGATAAGGCTGCTTAATTGCTTTCTGCAATCTGTGTGG-/GGCTTCGGCTTCATAGATAAGGCTGCTTAATTGCTTTCTGCAATCTGTGTGGA AATTGCGATG 3070 het 3070 ref 37 26 24 8 N/A 0 0 2190 CASAVA_Build X 23923515 1I TTAGAGTACA -/T TTTTTTTTTA 2398 het 2398 ref 26 14 5 7 T 9 10 2191 CASAVA_Build X 23925183 6I TCAGGGCAAG ------/ATTCTA AGAGTTTTAG 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 ATTCTA 0 1 2192 CASAVA_Build X 23947003 4I ATTGCGCCAC ----/CATA CTCCAGCCAG 2965 het 2965 ref 18 10 7 1 CATA 0 1 2193 CASAVA_Build X 24009561 1D AGAAAGGCTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 24 14 7 3 A 8 7 2194 CASAVA_Build X 24014150 7D TGATGAGTTT TTTTTTG/------- TTTTTTGTTT 3070 het 2944 hom 18 7 8 3 TTTTTTG 3 2 2195 CASAVA_Build X 24016996 1D CTTGTCAAAT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 589 hom 22 4 12 6 C 12 11 2196 CASAVA_Build X 24022682 4D GAACTATAGG CACA/---- TGCCACTGTG 2619 het 2619 ref 25 15 8 3 CA 2 0 2197 CASAVA_Build X 24025438 1D TATATGAGCC T/- TTTTTTTTTT 2784 het 2784 ref 17 8 7 2 T 11 10 2198 CASAVA_Build X 24027132 1I CTTTTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 T 10 11 2199 CASAVA_Build X 24027632 1D AGTATTTATC T/- TTTTTGAATT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 6 5 2200 CASAVA_Build X 24027908 4D TGTTCTAAAA TTGT/---- TAGTTAGATG 3070 het 3070 hom 44 17 21 13 TTGT 1 0 2201 CASAVA_Build X 24034917 1I CCTTTGCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 T 13 14 2202 CASAVA_Build X 24038216 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 2659 het 2659 ref 28 13 8 7 T 8 9 2203 CASAVA_Build X 24041868 2D TGCAATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 T 14 12 2204 CASAVA_Build X 24044734 1D TAATGACATG T/- TATCCATCCT 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 T 2 1 2205 CASAVA_Build X 24045660 3D ATTTTCTCAG TCT/--- TCTGGCCAGT 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 TCT 2 1 2206 CASAVA_Build X 24050914 2D GGAATCTATG AA/-- AAAGTCCATG 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 A 5 3 2207 CASAVA_Build X 24057923 5I AAAGTGTTTT -----/GACTA GATAGTGTAA 2418 het 2418 ref 17 12 5 0 GACTA 0 1 2208 CASAVA_Build X 24067635 3D ACAACAACAA AAC/--- AACAACAACA 1821 het 1821 ref 24 13 6 5 AAC 7 6 2209 CASAVA_Build X 24093170 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 2832 hom 25 8 12 5 T 8 9 2210 CASAVA_Build X 24098195 1D ATGCTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 871 hom 28 4 12 12 T 17 16 2211 CASAVA_Build X 24103613 1I TAGATTTTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 10 2212 CASAVA_Build X 24114175 1I TATTTCTGAA -/T TCTTATATTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 1 2 2213 CASAVA_Build X 24120932 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2532 het 2131 hom 29 10 8 11 A 17 16 2214 CASAVA_Build X 24142736 1I TTGGAATTCA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 6 7 2215 CASAVA_Build X 24158379 3D CTCAGTTTGT CTC/--- CTCAACTCAG 3070 het 3070 hom 44 18 20 8 CTC 2 1 2216 CASAVA_Build X 24171720 1I TTCCAGACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 593 hom 37 2 28 7 A 12 13 2217 CASAVA_Build X 24172536 2I18M1D TATGCAGTCC --ACAAAGTGCTTGCTCACAC/TTTGTGGGTGCTTGCTCACA- CCACTGTGTG 3070 hom 123 het 40 0 40 11 N/A 0 0 2218 CASAVA_Build X 24175842 4D TTTTGCTTAC TGAG/---- TGTTTTTTTA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 TGAG 1 0 2219 CASAVA_Build X 24175945 1I TGGGGTCATC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 8 9 2220 CASAVA_Build X 24177008 1D GAGTCATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 40 2 26 12 T 15 14 2221 CASAVA_Build X 24182611 1D AATTAATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 4 het 29 1 19 9 T 10 9 2222 CASAVA_Build X 24187198 1D TTATTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 37 1 30 8 T 11 10 2223 CASAVA_Build X 24195876 2D GCATCTCCGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 AT 7 6 2224 CASAVA_Build X 24285956 1D ATGGTCAATC T/- TTTTTTTTTT 1239 het 1239 ref 45 33 3 9 T 12 11 2225 CASAVA_Build X 24348906 1I GTTTACAATA -/T TTTTCTCCCA 946 het 946 ref 36 26 3 7 T 4 5 2226 CASAVA_Build X 24479683 1I AGAAAAAAAT -/A ACGAAAATTA 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 A 1 2 2227 CASAVA_Build X 24487356 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 15 0 11 4 A 15 14 2228 CASAVA_Build X 24492225 1D GTCTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 13 12 2229 CASAVA_Build X 24503375 1D AGTTTACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 38 0 33 5 A 11 10 2230 CASAVA_Build X 24507160 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2821 hom 26 8 14 4 A 13 14 2231 CASAVA_Build X 24507238 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3013 hom 67 het 34 0 17 17 AG 7 8 2232 CASAVA_Build X 24516193 2D TCTGCTGGGA TG/-- TGTGTGTGTG 879 het 879 ref 57 47 3 9 TG 9 8 2233 CASAVA_Build X 24528970 1D ATTCACATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 34 1 23 11 A 15 14 2234 CASAVA_Build X 24551403 16D TGAGATTTAC ATATATATATATATAT/---------------- ATATATATAT 3070 hom 29 het 11 0 10 4 AT 17 9 2235 CASAVA_Build X 24566135 3I ACCTATTACC ---/GTT GTTGTTATTT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 GTT 2 3 2236 CASAVA_Build X 24571331 1D GATTTCCAAG A/- AGGGCTATTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 1 2237 CASAVA_Build X 24590207 4D ACTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 59 het 29 0 20 12 AAAC 6 5 2238 CASAVA_Build X 24611932 1D AAGTCTAGTC T/- TCCAGGGGGA 3070 hom 84 het 31 0 27 4 T 2 1 2239 CASAVA_Build X 24657814 1D TATTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 936 het 936 ref 40 31 3 6 T 11 10 2240 CASAVA_Build X 24705566 1D GTCTTGTATT A/- AAAAAACACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 6 2241 CASAVA_Build X 24736555 1D ATATTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 193 hom 34 3 24 7 T 13 12 2242 CASAVA_Build X 24739681 2D AATTCAAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 17 8 T 16 14 2243 CASAVA_Build X 24760184 5D AGTTTATAAA AGTAG/----- AGGCATTTTG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 AGTAG 1 0 2244 CASAVA_Build X 24818127 1D TTCAGTACGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 900 hom 29 3 17 9 T 17 16 2245 CASAVA_Build X 24825396 1D CTCTTCACTG C/- CCCCCCCCCC 2662 hom 30 het 18 0 12 6 C 11 10 2246 CASAVA_Build X 24854875 1D TCATCAGTAC T/- TTTTTTTTTT 1409 het 1409 ref 25 16 4 5 T 13 12 2247 CASAVA_Build X 24876390 1I CTACTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 922 hom 28 2 17 9 T 11 12 2248 CASAVA_Build X 24895759 6I CAAGCTTACT ------/TAAGAC TAAGACCTCA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TAAGAC 1 2 2249 CASAVA_Build X 24908706 1D TGTATGTGGC T/- TTTTTTTTTT 1839 het 1839 ref 43 28 4 11 T 11 10 2250 CASAVA_Build X 24947305 1D CATTATCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 A 10 9 2251 CASAVA_Build X 24951543 1I TAGTACAGTT -/C CTGGTACCCA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 C 1 2 2252 CASAVA_Build X 24955074 1I ATTTTAATTG -/T TTTGCTATCG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 3 4 2253 CASAVA_Build X 24985700 1D GTTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 975 het 975 ref 29 24 3 2 T 12 11 2254 CASAVA_Build X 25009367 1D ACTTTCTGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 T 9 8 2255 CASAVA_Build X 25045686 2D TCATTTGGGC AT/-- ATATACCCAG 3070 hom 130 het 46 0 42 6 AT 3 2 2256 CASAVA_Build X 25089732 1D TATGCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 16 10 T 13 12 2257 CASAVA_Build X 25096411 2D TCCTATTTTA TT/-- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 9 7 2258 CASAVA_Build X 25120555 1I CTAAAGGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2532 hom 32 8 12 12 A 12 13 2259 CASAVA_Build X 25134472 1D4M1D AAAACCGCAA TTTACT/-TTAC- TTTTGCACCA 2303 hom 18 het 9 0 7 2 N/A 0 0 2260 CASAVA_Build X 25145451 4D TTTCTGTGTG TGTC/---- TGTGAGGGTG 3070 het 3070 hom 46 18 26 4 TGTC 1 0 2261 CASAVA_Build X 25161969 1D CTCCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1987 hom 24 6 11 7 A 13 12 2262 CASAVA_Build X 25181639 13D TGTCTCCTAC ATTTTTCCATGAT/------------- ATTTATCTCT 3070 het 3070 ref 34 22 12 4 ATTTTTCCATGAT 1 0 2263 CASAVA_Build X 25186955 4D CTAAGCTTTG TGCC/---- ATATACTAGT 3070 het 3070 hom 54 19 32 4 TGCC 1 0 2264 CASAVA_Build X 25219896 1I CATTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3032 het 3032 ref 28 14 10 4 T 10 11 2265 CASAVA_Build X 25227646 11D TGAGTGTACT AAAAGCCACTG/----------- AATTGTATAC 3070 het 3070 hom 27 12 15 2 AAAAGCCACTG 1 0 2266 CASAVA_Build X 25249506 2D TTTCTTTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2885 hom 29 9 13 7 T 12 10 2267 CASAVA_Build X 25273909 1I TATTTATTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 8 15 6 T 8 9 2268 CASAVA_Build X 25281858 1D ACCGTTAACA T/- TTTTTTTTTT 430 het 430 ref 30 17 3 10 T 13 12 2269 CASAVA_Build X 25298600 1D AAAGTGGGTA G/- ATTACAAAGC 3070 het 3070 ref 53 26 23 5 G 1 0 2270 CASAVA_Build X 25315560 1I AGGTTTATTT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 A 0 1 2271 CASAVA_Build X 25362244 1D TTTCTATTTT G/- GGGGGGGCAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 G 8 7 2272 CASAVA_Build X 25379864 1I TGAACACAAT -/A AATTTTAAAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 2 3 2273 CASAVA_Build X 25382700 2D AAGACAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2365 hom 30 10 14 6 T 16 14 2274 CASAVA_Build X 25399054 1I ATTTCTACTT -/C CTCCTTGAGG 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 C 1 2 2275 CASAVA_Build X 25400098 1I ATCTTCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1493 hom 31 5 12 14 T 13 14 2276 CASAVA_Build X 25420498 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 18 9 8 1 A 6 7 2277 CASAVA_Build X 25439197 1D GCGTTTGTGG T/- TATTTTCTTT 3070 het 3070 hom 45 16 23 7 T 2 1 2278 CASAVA_Build X 25441426 1D AAACTGTTCA T/- TAACTCCAGC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 2 1 2279 CASAVA_Build X 25453187 2D ACTTTTATGC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 286 hom 41 6 15 21 T 11 9 2280 CASAVA_Build X 25457096 4D GAATTCTGGT CTAA/---- CTGCTTACTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 CTAA 1 0 2281 CASAVA_Build X 25461433 1D AACTTGCACC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 35 21 9 7 A 9 8 2282 CASAVA_Build X 25465131 1I AGAAGATGCT -/C CTGTATTCAC 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 C 1 2 2283 CASAVA_Build X 25475661 1D TGATTCAGCT G/- ATCTAGGCTG 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 G 1 0 2284 CASAVA_Build X 25482459 1I TAACTGAATT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 7 8 2285 CASAVA_Build X 25496142 1I TCACTTATTG -/T TAAACCATCC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 1 2 2286 CASAVA_Build X 25498328 1D AATGAAAATG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 8 7 2287 CASAVA_Build X 25499783 1D GTGTCATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 A 11 10 2288 CASAVA_Build X 25526600 1D GCAGAATGAA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 8 7 2289 CASAVA_Build X 25540015 1D TCTTTCTTTC T/- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 T 3 2 2290 CASAVA_Build X 25543019 3I AGAAATAGTC ---/TTT TGTTGTGCTA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 T 1 4 2291 CASAVA_Build X 25548225 2I GAAAGGCTGT --/GG AGCAATAATT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 G 0 2 2292 CASAVA_Build X 25552185 1D CATGGAAAGC T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 T 7 6 2293 CASAVA_Build X 25554361 2D TTTGAACAGC TA/-- TATATATATC 3048 hom 24 het 11 0 9 2 TA 5 4 2294 CASAVA_Build X 25573619 1D TATCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2919 hom 27 8 9 11 T 15 14 2295 CASAVA_Build X 25574857 1D CTATTTTAGA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 7 6 2296 CASAVA_Build X 25579125 2D GTGTGTGTGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 GA 9 8 2297 CASAVA_Build X 25582019 1D ACTCAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 11 10 2298 CASAVA_Build X 25605920 2D TAATTTTTTG TA/-- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TA 1 0 2299 CASAVA_Build X 25611952 5D AAAGAAACTA AAATT/----- AAATAAATTT 3070 hom 109 het 38 0 37 1 AAATT 1 0 2300 CASAVA_Build X 25613534 1I CTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 28 1 20 7 T 11 12 2301 CASAVA_Build X 25615183 3D TAGGAAGCTT TCC/--- TCCCTGACCC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TCC 2 1 2302 CASAVA_Build X 25621181 7I TTTCTTTTCT -------/CTTGCTG CTTTTAGGAT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 CTTGCTG 0 1 2303 CASAVA_Build X 25647630 1I TCCAAGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 25 1 21 3 T 12 13 2304 CASAVA_Build X 25691173 5D AACCCAAGAC AAAAT/----- AAAACTGAAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 7 AAAAT 1 0 2305 CASAVA_Build X 25694176 3D CTCAAAAGAG AAA/--- AAAATGAAGT 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 A 7 4 2306 CASAVA_Build X 25709051 1I AACAGACAAC -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 1 2 2307 CASAVA_Build X 25712278 1I AAAGAATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 9 10 2308 CASAVA_Build X 25713778 1I GGATGGAATT -/G GCGAACATTT 3060 het 3060 ref 31 23 7 1 G 1 2 2309 CASAVA_Build X 25713969 1I AGGAATAAGG -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 T 6 7 2310 CASAVA_Build X 25714109 2I ATGAATTAGC --/TT AATTATTCCA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 0 2 2311 CASAVA_Build X 25721097 1I ATAGAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 13 14 2312 CASAVA_Build X 25721461 1I AATTGTAAAG -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 6 7 2313 CASAVA_Build X 25729283 2D GTTTTCTTTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TA 6 5 2314 CASAVA_Build X 25731136 1D TCAGGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 25 9 T 14 13 2315 CASAVA_Build X 25734671 4D ATTTATTTGA TTCT/---- TTTTTTATTA 2278 het 2278 ref 21 13 6 2 TTCT 1 0 2316 CASAVA_Build X 25737787 1D ATTATGTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 9 8 2317 CASAVA_Build X 25738570 2D AACATCTCTC AT/-- AGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 AT 1 0 2318 CASAVA_Build X 25745715 3I CAGCTTTACA ---/TAT TATTATTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TAT 2 3 2319 CASAVA_Build X 25750636 4I ACTCCTACAA ----/ATAG ATAGGAAATA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 ATAG 1 2 2320 CASAVA_Build X 25759253 1D CTGGATCACA G/- GGTAGATCTA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 G 3 2 2321 CASAVA_Build X 25760240 1I TAATTCTGTG -/A AAAATGACAT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 4 5 2322 CASAVA_Build X 25763780 1I CTTTTCTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 149 hom 38 1 32 5 T 11 12 2323 CASAVA_Build X 25765413 1I TTGAAACTTA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 6 7 2324 CASAVA_Build X 25773228 1I GAACTTTACC -/T TTTTTTTTTT 1880 het 1544 hom 31 8 9 14 T 15 16 2325 CASAVA_Build X 25775267 1D TTTGTTTGTT G/- GGGGGGGGCA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 G 9 8 2326 CASAVA_Build X 25779187 2I ATAAGTGTAT --/AA ACTCAAAGTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 1 3 2327 CASAVA_Build X 25781556 2I TTGAGTTTAC --/AT ATGTTTTCCA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 AT 1 2 2328 CASAVA_Build X 25789122 1D CCAGCAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 138 hom 28 2 14 12 A 10 9 2329 CASAVA_Build X 25792695 1D AGTTAAATGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 19 2 T 9 8 2330 CASAVA_Build X 25796329 1D AACTGTTAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 T 10 9 2331 CASAVA_Build X 25798688 9D GTGATATAAT TAGAATTTC/--------- TAATGTTTGT 3070 het 3070 ref 38 19 20 1 TAGAATTTC 1 0 2332 CASAVA_Build X 25799750 4I CTAGAGTGAG ----/ACTT ACTTACAAAG 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 ACTT 1 2 2333 CASAVA_Build X 25799804 2I AAAGGCATAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2836 hom 30 8 13 9 A 10 12 2334 CASAVA_Build X 25807649 4I ATGGTTTGAG ----/TGTT TGTTTGTGCT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 TGTT 1 2 2335 CASAVA_Build X 25807940 1D GGACTTCCCA G/- GCCTCCAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 G 2 1 2336 CASAVA_Build X 25809298 2D ATATATATAT AC/-- ACACAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 AC 3 2 2337 CASAVA_Build X 25810166 5I ATTCTACACA -----/AATAT AATAAAAAGG 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 AATAT 0 1 2338 CASAVA_Build X 25812896 1D CCTCACTGTC A/- ACATTAGACA 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 A 2 1 2339 CASAVA_Build X 25813971 5D CAAAATATAC ATAAA/----- ATAAAATGTA 3070 het 2106 hom 18 6 11 5 ATAAA 2 1 2340 CASAVA_Build X 25816233 5D CTTCAGAAAG ATAAA/----- ATTAATTGTG 3070 het 3070 hom 38 14 21 6 ATAAA 1 0 2341 CASAVA_Build X 25817007 5I TACATAAAAA -----/TGTAT TGTATTGTTA 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 TGTAT 1 2 2342 CASAVA_Build X 25820203 11I11M1I AGTTGGTGAA -----------ACAACATTGTT-/ATAATACAAGCAAAACAATGTTG TTGCTTGACC 3070 het 3070 hom 45 21 26 8 N/A 0 0 2343 CASAVA_Build X 25821810 1I GTTATCAGAT -/C AACAGCAACA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 C 0 1 2344 CASAVA_Build X 25827342 7D ATTCTTGGTT GCAGGTA/------- GCCTCAAACC 3070 het 3070 ref 50 24 22 6 GCAGGTA 1 0 2345 CASAVA_Build X 25828834 2D CTTAAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 805 hom 40 7 8 25 T 16 14 2346 CASAVA_Build X 25830825 1D AAAGAAAAAA T/- ATATGGTAGA 3070 het 3070 ref 37 24 9 6 T 1 0 2347 CASAVA_Build X 25836114 1D GCTGATGTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 407 hom 41 1 32 8 A 10 9 2348 CASAVA_Build X 25846427 1D CCTTGATCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 12 27 6 T 10 9 2349 CASAVA_Build X 25848841 1D ACTCCATCTC G/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 21 2 16 3 G 1 0 2350 CASAVA_Build X 25849081 1D CATAAGTTCA T/- TTTTGAGACC 3070 hom 144 het 61 0 47 14 T 5 4 2351 CASAVA_Build X 25851326 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAATAAGC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 6 5 2352 CASAVA_Build X 25853270 31D AGTTAATAAA AATGTTTTATTGAATTAAAATCTACAATTTT/------------------------------- AATAAGGTAT 3070 het 3070 ref 22 17 11 1 AATGTTTTATTGAATTAAAATCTACAATTTT 1 0 2353 CASAVA_Build X 25853970 4I GATATGTAAA ----/TTTC TTTGACTGTA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 TTTC 0 1 2354 CASAVA_Build X 25854117 2D AAAGTTCCCC CT/-- GTTTCATATA 3070 het 3070 ref 48 30 16 2 CT 1 0 2355 CASAVA_Build X 25854943 3D TACAAAAGCA AAG/--- AAGAAACAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 AAG 2 1 2356 CASAVA_Build X 25883299 2D CAAGTGAATG CA/-- CAGTTTAGAA 3070 het 3070 hom 52 24 26 2 CA 2 1 2357 CASAVA_Build X 25883884 1D ACGTGTATCA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 59 29 26 4 T 8 7 2358 CASAVA_Build X 25887651 1D TAAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 13 12 3 A 10 9 2359 CASAVA_Build X 25888268 1D GGTCTCATTC T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 39 23 10 6 T 7 6 2360 CASAVA_Build X 25894702 4D AGCAAAAAAA ATTG/---- ATTTTTAATA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 ATTG 1 0 2361 CASAVA_Build X 25897468 1D ATAGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 11 9 A 11 10 2362 CASAVA_Build X 25957612 1D AGCTATGAGG A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 A 7 6 2363 CASAVA_Build X 25958105 3D AGAGTTTAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 17 6 T 17 14 2364 CASAVA_Build X 25960295 1I TCCGTCTCTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 8 9 2365 CASAVA_Build X 25963138 5I CAAAAAATAA -----/AAAAT AAAATAAAAG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AAAAT 1 2 2366 CASAVA_Build X 25970033 1D CTCTCTGGGG A/- AAAATGGCCA 3070 het 3070 ref 32 16 10 9 A 5 4 2367 CASAVA_Build X 25988975 1D AAAAAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 499 hom 36 2 25 9 T 13 12 2368 CASAVA_Build X 25997186 1D TGACAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 T 11 10 2369 CASAVA_Build X 26000343 2I CCTTTTTTTT --/TC CTTTTCTTTT 2380 het 2216 hom 18 7 8 3 TC 0 1 2370 CASAVA_Build X 26011900 1I CTTAATACTC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 7 8 2371 CASAVA_Build X 26014337 3I CATATATACA ---/TAT TATTATACAT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 TAT 2 3 2372 CASAVA_Build X 26017407 1D TGCTAAGGAT A/- ATGGTCTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 A 2 1 2373 CASAVA_Build X 26028991 1I TACCCCCCAC -/A AAAAACATTA 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 A 5 6 2374 CASAVA_Build X 26029809 6I ACCATAAAAA ------/TAAATT TAAACTCATT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TAAATT 0 1 2375 CASAVA_Build X 26032754 2D AACAATCAAC TA/-- TTGGAAAGGG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 TA 1 0 2376 CASAVA_Build X 26054658 1D TACTCCTTAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 9 8 2377 CASAVA_Build X 26056627 1D ACAAAAAAAA C/- ATTGAATGAG 1274 het 1274 ref 19 14 4 1 C 1 0 2378 CASAVA_Build X 26057671 4I TGGATTTATA ----/TCTG TCTTTCTCAC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TCTG 0 1 2379 CASAVA_Build X 26058589 1D CTACTGCCTT A/- ACACTATTCC 3070 het 3070 ref 52 27 23 2 A 2 1 2380 CASAVA_Build X 26059616 7I GTAAACTCTG -------/TTGATTT TTGATTTTGA 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 TTGATTT 1 2 2381 CASAVA_Build X 26090032 2I AAGATATGTA --/TC TTTCTTTTGT 700 het 700 ref 41 37 2 3 TC 0 1 2382 CASAVA_Build X 26114550 1I AGAGGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 10 11 2383 CASAVA_Build X 26121236 1D TTGTCAACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 10 9 2384 CASAVA_Build X 26123286 5I TATCTTTCTT -----/TTGTC TTGTTACACA 3070 het 3070 ref 52 28 18 6 TTGTC 0 1 2385 CASAVA_Build X 26128920 4D AATAACTTGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 16 12 2386 CASAVA_Build X 26131123 1D AAAATAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 A 13 12 2387 CASAVA_Build X 26131884 2I ATGTATACTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1708 hom 20 5 9 6 TG 6 7 2388 CASAVA_Build X 26138691 2D TATTTTTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 10 10 T 16 14 2389 CASAVA_Build X 26140075 8I GTAAAATCCT --------/CCAGTCAC CCAGTCACTG 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 CCAGTCAC 1 2 2390 CASAVA_Build X 26155422 3D CTCATGTCCA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 52 27 20 7 AAC 4 3 2391 CASAVA_Build X 26165624 1D TTTCAGACAC T/- TTTTGGAGCA 3070 het 3070 ref 53 24 23 7 T 5 4 2392 CASAVA_Build X 26172635 1I TACCCCCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1055 hom 29 4 18 7 A 13 14 2393 CASAVA_Build X 26179870 1D AGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3035 het 3035 ref 25 12 9 4 T 11 10 2394 CASAVA_Build X 26187825 1I AGATATTCAG -/T TTTTAAAATG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 4 5 2395 CASAVA_Build X 26188170 1I TGAGTTTACG -/T TCTGGATCAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 1 2 2396 CASAVA_Build X 26217691 3I TCATATATGA ---/TAT TATTTTGAGG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 TAT 1 2 2397 CASAVA_Build X 26225701 1I TTAAATACAC -/T TTTATCATAC 3070 het 3070 hom 27 7 16 4 T 3 4 2398 CASAVA_Build X 26230962 1D TTTTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2272 hom 24 6 15 3 A 12 11 2399 CASAVA_Build X 26270466 1D GGCTTTATTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 10 9 2400 CASAVA_Build X 26319096 4I AGAAGCCAGT ----/AGTA GCTCAGTCCA 2685 het 2685 ref 35 23 8 4 AGTA 0 1 2401 CASAVA_Build X 26330243 1I AAAATGCAAT -/A AAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 A 4 5 2402 CASAVA_Build X 26518487 1I CACAGTTCTG -/C AGGGCTGGGG 3070 het 3070 hom 20 8 8 4 C 0 1 2403 CASAVA_Build X 26522139 1I TTATCTGTAT -/C TGCAAATATG 3070 het 3070 ref 48 23 23 2 C 0 1 2404 CASAVA_Build X 26523303 1I TGGAGGTTCC -/T TCAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 1 2 2405 CASAVA_Build X 26527211 1I AGAAACTTCA -/T TTTTAACTTC 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 4 5 2406 CASAVA_Build X 26530010 1I ACTGTGTCTG -/A AAAAAAGATC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 6 7 2407 CASAVA_Build X 26535791 1D AGCTATTATT A/- AAAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 A 6 5 2408 CASAVA_Build X 26535868 1D ACATTTACAC A/- CTGTTGGTTG 3070 het 3070 ref 45 28 15 2 A 1 0 2409 CASAVA_Build X 26539932 1I ATAAACAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 A 10 11 2410 CASAVA_Build X 26548190 2I ACTTAACAGC --/AA AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 8 10 2411 CASAVA_Build X 26561968 1I CTCAAAGAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 9 10 2412 CASAVA_Build X 26568464 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1371 het 1371 ref 19 7 4 8 T 11 12 2413 CASAVA_Build X 26579556 1I CCAAGGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 11 11 T 14 15 2414 CASAVA_Build X 26599750 1D TATCAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 T 11 10 2415 CASAVA_Build X 26610740 6D AAATAATAAA TTTGTC/------ TTTGTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 TTTGTC 1 0 2416 CASAVA_Build X 26615386 1I AAGTATAAAT -/A AAAAAAAAAA 2248 het 2248 ref 14 6 5 3 A 10 11 2417 CASAVA_Build X 26623630 1D TAAATTAAAA T/- TAGAAAAGTA 3070 het 2262 hom 16 6 8 3 T 2 1 2418 CASAVA_Build X 26634324 1D TACCTGAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 9 8 2419 CASAVA_Build X 26643629 2D ATATACATAT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 AC 5 4 2420 CASAVA_Build X 26652162 1D GTAATTGTTC G/- GTCCTTATTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 2 1 2421 CASAVA_Build X 26674939 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 11 11 5 A 11 9 2422 CASAVA_Build X 26688648 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 1602 het 1602 ref 13 4 5 4 T 11 12 2423 CASAVA_Build X 26717446 2I TTATATACAA --/AC ACATATATAT 3070 het 3070 hom 46 22 17 7 AC 1 2 2424 CASAVA_Build X 26724532 1I ACATTTTTTT -/A AATAGTAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 A 2 3 2425 CASAVA_Build X 26765916 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 11 12 2426 CASAVA_Build X 26766761 1I TAATGAGGTC -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 G 0 1 2427 CASAVA_Build X 26832520 2D CACAACGATT AA/-- AAAATATCAT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 A 6 4 2428 CASAVA_Build X 26864847 1D8M70D ATCTTCAAAG TTTTGGGAGTTACCATGACTCGTTTTGACCACAGGCCAGATGCTGCCAGACCCATTTCTCTGTTTCTTCATTCTTCACT/-TTTGGGAG---------------------------------------------------------------------- TTTGCCTGGT 3070 het 3070 ref 24 32 11 1 N/A 0 0 2429 CASAVA_Build X 26868432 2I GAAAATAAAC --/TG TTATTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 TG 0 1 2430 CASAVA_Build X 26884577 1I TCTTAGGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 10 11 2431 CASAVA_Build X 26898520 1I CCATTTTTTT -/G TGTGTGAATT 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 G 0 1 2432 CASAVA_Build X 26915134 2I AACACCCCCC --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 45 14 21 10 CA 6 7 2433 CASAVA_Build X 26920627 2I22M1I ATACACACAC --GTATATATGTACATATGTATGT-/ATGTATATATGTACATATGTATGTA TATACACATA 3070 het 3070 ref 31 18 18 5 N/A 0 0 2434 CASAVA_Build X 26921859 4D ATGTGCTAAG CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 CTTT 4 3 2435 CASAVA_Build X 26941112 4D TATATGTATA TGTG/---- TGTGTAAATA 306 het 306 ref 21 15 2 8 TG 4 2 2436 CASAVA_Build X 26952727 1D AGTTTGGGGG T/- GGGGAAGACC 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 1 0 2437 CASAVA_Build X 26964059 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 16 4 A 11 10 2438 CASAVA_Build X 27007825 1I AAACAATCTG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 7 8 2439 CASAVA_Build X 27014532 1I ACTGCAGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 A 9 10 2440 CASAVA_Build X 27021332 13I TACAGGCGCG -------------/GGCCACCAAGCCT GGCCAGAAAT 3070 hom 39 het 17 0 13 4 GGCCACCAAGCCT 0 1 2441 CASAVA_Build X 27024475 1D TCTAGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 36 1 29 7 A 13 12 2442 CASAVA_Build X 27026814 4D TGTTTTCGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 47 het 45 2 40 4 TTTG 5 4 2443 CASAVA_Build X 27033625 2D AATTGACAAA CT/-- CTCTGTGTAA 3070 het 1786 hom 14 4 8 2 CT 3 2 2444 CASAVA_Build X 27035290 4D ATCAAGAATT AGAC/---- AGTATCTGTG 3070 het 3070 ref 38 20 15 6 AGAC 1 0 2445 CASAVA_Build X 27037017 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 8 9 2446 CASAVA_Build X 27043019 4D GGAAAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3010 het 3010 ref 32 14 11 7 AAAG 4 3 2447 CASAVA_Build X 27043493 2D TTCATGGACA TT/-- TTTGTAACTT 3070 het 3070 ref 31 19 9 4 T 5 3 2448 CASAVA_Build X 27045271 2D GTATATACAG TA/-- TATATATATA 2994 hom 18 het 8 0 7 2 TA 8 7 2449 CASAVA_Build X 27047773 1D CCTAAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 8 15 T 13 12 2450 CASAVA_Build X 27048403 1D TAAAGTTGTT G/- TATCTGAGTT 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 G 1 0 2451 CASAVA_Build X 27053760 3D GTAGCACCTT CCC/--- CCCCTTCGCT 2474 het 2474 ref 27 18 6 5 C 7 4 2452 CASAVA_Build X 27060610 1D GTGTCTGAAG A/- AACATCAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 3 2 2453 CASAVA_Build X 27061371 3D TTATCTCCCC CCG/--- CCCCCGCCCT 2747 het 20 hom 16 0 10 7 CCG 1 0 2454 CASAVA_Build X 27062053 4D18M2D25M2I TCTTCTACAT TATATATATATATATACATTTTTATATATATATATAATATGTATATATG--/----TATATATATATACATTTT--TTTATATATATAATATGTATATATGTA TATATATATG 3070 hom 27 het 12 0 10 7 N/A 0 0 2455 CASAVA_Build X 27066422 1I ATCAGATTTT -/A AAAAATTATT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 5 6 2456 CASAVA_Build X 27069869 1D TTATTTCAGT A/- AAAAAGCACA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 6 5 2457 CASAVA_Build X 27081314 1D TGGATTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 12 11 2458 CASAVA_Build X 27099097 4I GCAGAGAACT ----/TGAC TAATTTCTCC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TGAC 0 1 2459 CASAVA_Build X 27101408 12I TAGTAAAACT ------------/CCTGGTGACTCA ATCTATTTAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 CCTGGTGACTCA 0 1 2460 CASAVA_Build X 27109238 2I TACATTTGTA --/TG TTTTTTCTCC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TG 0 1 2461 CASAVA_Build X 27117787 16D CGAAGATAAA ATCACCTAGTGAAGAT/---------------- AAAATCACCT 3070 hom 69 het 25 0 24 3 ATCACCTAGTGAAGAT 1 0 2462 CASAVA_Build X 27121354 1I CCTGCTACTC -/A AGTGTTTTCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 2 2463 CASAVA_Build X 27122836 1D TAGGATTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 12 11 2464 CASAVA_Build X 27132393 5D TACTTTCCTC TTTTG/----- TTTTGTGTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 TTTTG 2 1 2465 CASAVA_Build X 27132627 1I GTTTTATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 T 10 11 2466 CASAVA_Build X 27134994 1I TACATAAATC -/A AAAAATCTAG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 5 6 2467 CASAVA_Build X 27135364 1D TGGGCATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 107 hom 38 3 32 4 T 12 11 2468 CASAVA_Build X 27136303 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAATGATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 6 5 2469 CASAVA_Build X 27136631 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 19 0 17 2 A 11 12 2470 CASAVA_Build X 27138300 1I TTTCAGTCTA -/T TTGTTAATGA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 2 3 2471 CASAVA_Build X 27139250 2D49M2I ACATATACAC ATATATGATATATACTATATATGTCATATATACATATATGTGTACATATAT--/--ATATGATATATACTATATATGTCATATATACATATATGTGTACATATATAC ACACATTATA 1837 hom 15 het 3 0 6 7 N/A 0 0 2472 CASAVA_Build X 27142733 1I CCTCAGAGGA -/T TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 16 9 5 2 T 10 11 2473 CASAVA_Build X 27142914 1I ATTTTTAAAA -/T TTTTTTTTTG 2446 het 2446 ref 23 14 6 3 T 9 10 2474 CASAVA_Build X 27151979 1I TGTAAAAGAT -/A AACTAACGTA 3070 het 3070 ref 44 19 21 4 A 2 3 2475 CASAVA_Build X 27152667 4I GAATTGCTTT ----/TTTA TTTATTTATT 1321 hom 10 het 11 0 4 7 TTTA 3 4 2476 CASAVA_Build X 27156954 1I CTTTGTATTT -/A AATTATCCAC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 3 2477 CASAVA_Build X 27160985 1I AAAAGTAAGG -/A AAATTAATAT 3070 hom 154 het 61 0 52 9 A 3 4 2478 CASAVA_Build X 27162728 4I AATTCTCAGG ----/AGAT AGATAAATAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AGAT 1 2 2479 CASAVA_Build X 27170780 3D TGAATTCCCT GAA/--- GAAGAGTTTT 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 GAA 2 1 2480 CASAVA_Build X 27179665 1I GGAGGAGAAG -/T GGTGTTCGTG 3070 hom 95 het 39 0 30 9 T 0 1 2481 CASAVA_Build X 27182100 2D ATGTATTATT TA/-- TATGTCTATA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TA 2 1 2482 CASAVA_Build X 27186163 16D GTATATATAT TTTTATTTTTATTTAC/---------------- TTTTATTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 8 TTTTATTTTTATTTAC 1 0 2483 CASAVA_Build X 27188179 2D ACTGCAGTTG AT/-- ATATATATAT 1132 het 1132 ref 38 22 3 14 AT 8 7 2484 CASAVA_Build X 27189768 3I CTTTTTCATG ---/TTC TTTAATTCGT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TTC 0 1 2485 CASAVA_Build X 27201457 2I ATAATAAACA --/AC ATGTTACTTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AC 0 1 2486 CASAVA_Build X 27208414 1I GAATCTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 T 13 14 2487 CASAVA_Build X 27233893 2D ACGTGTGCAC AT/-- GTGTGTGCGT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 AT 1 0 2488 CASAVA_Build X 27235259 2I ATTGTCGAAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 AT 8 9 2489 CASAVA_Build X 27238469 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 1739 het 492 hom 8 1 4 3 ATA 4 3 2490 CASAVA_Build X 27238523 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAGA 1461 het 36 hom 7 1 3 3 A 8 9 2491 CASAVA_Build X 27239297 1I GTGTAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 11 2492 CASAVA_Build X 27244767 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2707 het 2707 ref 40 13 12 15 T 15 16 2493 CASAVA_Build X 27254937 1I AGCATACAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 2494 CASAVA_Build X 27261428 4D CTCTCTCTCT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 38 het 32 1 26 5 CA 8 6 2495 CASAVA_Build X 27263194 1I GGAAAAAAAA -/T AACTACAGTT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 0 1 2496 CASAVA_Build X 27270434 1D AATATTAATG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 8 7 2497 CASAVA_Build X 27276281 8I TTACCAATAC --------/GCAGAATG GCAGAATGTA 2939 het 2939 ref 17 8 6 3 GCAGAATG 1 2 2498 CASAVA_Build X 27279110 4I59M1I CATCACAGAA ----TCATTCTGTTATTATACTTAAATTTTCCTTGAAATATATATCCTGAATAATTTTCAGAA-/TCATTCATTCTGTTATTATACTTAAATTTTCCTTGAAATATATATCCTGAATAATTTTCAGAAT TTTTATATAG 3070 hom 169 het 34 0 57 5 N/A 0 0 2499 CASAVA_Build X 27280002 2D AGGAATCATC TA/-- TATATATATA 1187 het 1187 ref 19 9 5 5 TA 7 6 2500 CASAVA_Build X 27287288 1I TCTTTTTTTT -/C CCCTTAAACA 3070 het 352 hom 29 1 23 5 C 3 4 2501 CASAVA_Build X 27289644 10I GCTTTTGGAT ----------/TGTTTTGCTG CTACTGTCAA 3070 hom 77 het 30 0 25 5 TGTTTTGCTG 0 1 2502 CASAVA_Build X 27289881 17I5M4I AAATTGTGTA -----------------AGGGA----/AAAACTTTTTATTTAATAGAGATATT ACATATATAT 1180 het 320 hom 13 2 3 12 N/A 0 0 2503 CASAVA_Build X 27290195 3D GATAGTGTAT GAG/--- AAGAGCCAAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 GAG 1 0 2504 CASAVA_Build X 27293095 1I TGATGGCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 9 10 2505 CASAVA_Build X 27295038 3I ATATCCTGTA ---/AAT AATAAATTGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AAT 1 2 2506 CASAVA_Build X 27296345 2D CTTTACTTCT TA/-- TGTCATTCTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TA 1 0 2507 CASAVA_Build X 27297558 6I AGAAATCACC ------/AAGAAA AAGAAATAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAGAAA 1 2 2508 CASAVA_Build X 27303423 4D ATAAATAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 AAAC 5 4 2509 CASAVA_Build X 27305774 2D ATCATTCACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 CA 8 7 2510 CASAVA_Build X 27308327 7D ACAGAGTTGG TGGGAGC/------- TGGGAGCTGG 3070 hom 70 het 29 0 17 13 TGGGAGC 3 2 2511 CASAVA_Build X 27318281 3I TTCCAATATG ---/TAT TATATTAATA 2082 het 2082 ref 27 17 5 5 TAT 1 2 2512 CASAVA_Build X 27324480 1D GGGAAATGTT A/- AAAAAAATGC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 8 7 2513 CASAVA_Build X 27325801 4D ATATATATGC ATAA/---- ATAAACTCGT 3070 het 3070 hom 42 14 28 3 ATAA 2 1 2514 CASAVA_Build X 27326010 2D TATCATACAA TT/-- TCTCATCCTG 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 T 3 1 2515 CASAVA_Build X 27329507 3D GGAAAATGAT GAA/--- GAAGGGAAAC 3070 het 3070 hom 37 17 16 6 GAA 2 1 2516 CASAVA_Build X 27335754 2D CAGTTATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 2358 het 20 hom 13 1 8 4 T 14 12 2517 CASAVA_Build X 27336547 1D AAAATAATGA T/- TTTTGTTAAG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 5 4 2518 CASAVA_Build X 27337157 1D TGAGACTCCG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 12 het 26 0 15 12 C 11 10 2519 CASAVA_Build X 27357082 36D CTCCAGGCTG ACTTAGAAATCATTTAGTCATTTCCTTCATTTGCTA/------------------------------------ CAAAACTGAA 2229 het 2229 ref 34 33 5 5 ACTTAGAAATCATTTAGTCATTTCCTTCATTTGCTA 1 0 2520 CASAVA_Build X 27360290 1I AAATAAAAAC -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 0 1 2521 CASAVA_Build X 27361029 1D AAAATAAAAT A/- AAAAAAAAAC 1635 het 287 hom 18 1 6 11 A 10 9 2522 CASAVA_Build X 27365179 1D GTTTTGCTGG A/- AAAAAAAAAT 1338 het 1338 ref 41 33 3 5 A 10 9 2523 CASAVA_Build X 27369410 4D CAGTTTGTAC AGAG/---- AGAGAGAGGC 3070 het 1581 hom 36 7 18 14 AG 6 4 2524 CASAVA_Build X 27369440 1D CTGATGGGTA G/- AAAAACTTTT 3070 het 972 hom 31 4 12 16 G 1 0 2525 CASAVA_Build X 27371739 1I TGGAGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 2441 het 2441 ref 21 8 7 6 A 9 10 2526 CASAVA_Build X 27372052 1I CATGTGTCCC -/A GGGGGGAGGG 3070 hom 55 het 28 0 16 12 A 0 1 2527 CASAVA_Build X 27373241 2I TTCAAGTTAA --/TC TCTCTTTCCT 3070 het 3070 hom 45 21 23 1 TC 2 3 2528 CASAVA_Build X 27381483 1D GATCACCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 46 het 23 0 16 7 T 10 9 2529 CASAVA_Build X 27393640 3I AATGGTCTAA ---/TTT TTTTTCTCTG 3070 het 3070 hom 32 8 19 5 T 5 8 2530 CASAVA_Build X 27398187 1D AATCATTCAG A/- AAAAAAAATC 2826 het 2826 ref 27 17 7 4 A 9 8 2531 CASAVA_Build X 27403758 1I AAAATATCAG -/A AAAATGGATT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 4 5 2532 CASAVA_Build X 27419787 1I ACTTTCAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 9 10 2533 CASAVA_Build X 27420694 1D ATTTTTTCTA T/- TTTTAGTAGA 3070 het 477 hom 8 1 7 0 T 5 4 2534 CASAVA_Build X 27422975 1I AATTCTGATC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 T 8 9 2535 CASAVA_Build X 27427875 1I ATTTGGTGGT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 658 hom 33 3 19 11 G 9 10 2536 CASAVA_Build X 27433828 3I CCTTTTGATG ---/ATA ATAAAGCAAA 3070 het 3070 hom 62 26 28 8 ATA 1 2 2537 CASAVA_Build X 27435013 1I ACAAATAGCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 56 23 24 9 T 8 9 2538 CASAVA_Build X 27438448 2D ACATAGAAAC TG/-- AGAATGGGCA 3070 het 1854 hom 16 5 10 1 TG 1 0 2539 CASAVA_Build X 27440151 1I CATAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 A 9 10 2540 CASAVA_Build X 27442162 1I80M4D GTAAAGAAAA -GTGTATATGTACACATATGTATATGTATGTGTGTGCATGCACACATATGTACATGTATGTACCCGTGCACACATATGTACATGT/TGTGTATATGTACACATATGTATATGTATGTGTGTGCATGCACACATATGTACATGTATGTACCCGTGCGCACATATGTAC---- ATGTGTGCTA 3070 het 3070 ref 55 53 24 21 N/A 0 0 2541 CASAVA_Build X 27462247 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 43 3 19 21 A 16 17 2542 CASAVA_Build X 27464686 1I GAAAAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 A 10 11 2543 CASAVA_Build X 27466715 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGTGCCC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 1 2 2544 CASAVA_Build X 27467772 1D ATATATATCC A/- GTGTAAAGTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 1 0 2545 CASAVA_Build X 27470121 5D GATTTTCTTT ATCTA/----- ATCTAATCTA 3070 hom 92 het 34 0 32 4 ATCTA 3 2 2546 CASAVA_Build X 27478873 1D TTTTTTACAC A/- ATTAAGGGTT 3070 het 3070 hom 41 17 14 10 A 2 1 2547 CASAVA_Build X 27488008 2D TTTCCACGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 12 10 2548 CASAVA_Build X 27488306 1D TATCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2112 het 309 hom 17 3 5 10 A 17 16 2549 CASAVA_Build X 27489715 1D CAATATGCAT G/- GGGGGGTTGT 3070 het 3070 ref 38 25 10 3 G 7 6 2550 CASAVA_Build X 27492773 1I TTTGTCAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 251 hom 32 1 27 4 A 9 10 2551 CASAVA_Build X 27508999 4I GAAATTAATT ----/AATA TTTTTATCAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AATA 0 1 2552 CASAVA_Build X 27512545 1I TCCCATATTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 439 hom 40 2 36 2 A 8 9 2553 CASAVA_Build X 27513091 1D AACAATATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 10 9 2554 CASAVA_Build X 27516686 1I GCATATGTTG -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 39 20 18 1 T 7 8 2555 CASAVA_Build X 27517152 2D ATTTAGTGGT AG/-- AGATCCATGA 3070 hom 119 het 44 0 38 6 AG 2 1 2556 CASAVA_Build X 27524836 4D ATTATGGACA TTAT/---- TTATCAATTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTAT 2 1 2557 CASAVA_Build X 27526052 5I CCTTCAAATA -----/TTGTC TTCAAATTAT 3070 het 3070 hom 27 8 18 1 TTGTC 0 1 2558 CASAVA_Build X 27554057 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 9 10 2559 CASAVA_Build X 27569512 1D TTTACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 922 het 922 ref 26 10 4 12 T 16 15 2560 CASAVA_Build X 27574430 1I TGCCTTCTTT -/A ACACTTTATG 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 1 2 2561 CASAVA_Build X 27578888 1D GAGTGGTGAG A/- AGTGGGCATC 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 A 2 1 2562 CASAVA_Build X 27598159 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 14 11 T 11 12 2563 CASAVA_Build X 27601148 1D ACTCCTAAAG C/- AAGCTGGCTA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 C 1 0 2564 CASAVA_Build X 27607355 1I CAGTTTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 10 11 2565 CASAVA_Build X 27628420 1D AGTGTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 20 5 A 11 10 2566 CASAVA_Build X 27630353 1D AAATTCTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 10 9 2567 CASAVA_Build X 27630440 1D49M1D AGATACCAAC AAAAAAAACCTACAAACCATATTCCTTATGAATATAGATCCAAAATCCTCA/-AAAAAAACCTACAAACCATATTCCTTATGAATATAGATCCAAAATCCTC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 20 16 16 N/A 0 0 2568 CASAVA_Build X 27632100 2I ATTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2727 het 2685 hom 22 9 8 5 TA 6 7 2569 CASAVA_Build X 27633594 1I GATGCTGAGC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 7 8 2570 CASAVA_Build X 27637219 1I TCAGCCTCCC -/A AAGTGCTGGG 3070 het 1300 hom 20 4 9 7 A 2 3 2571 CASAVA_Build X 27638002 1D TTTTTCTAGG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 8 7 2572 CASAVA_Build X 27651981 1I ATTTTAGAGT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 A 8 9 2573 CASAVA_Build X 27653156 2I ACATGATAGT --/AA AAGTTGTGGT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 2 4 2574 CASAVA_Build X 27658762 1D TTTATTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 5 A 13 12 2575 CASAVA_Build X 27662252 1D AGAAATTAAA C/- CCCATCTAAA 3070 het 3070 hom 42 17 20 7 C 4 3 2576 CASAVA_Build X 27665751 1D ATAGAGAATC T/- TTTTTTTTTT 2929 het 2289 hom 32 10 12 10 T 15 14 2577 CASAVA_Build X 27680886 4I TGATGAACTT ----/ACTC AATCAATGTT 3070 het 3070 ref 47 30 12 5 ACTC 0 1 2578 CASAVA_Build X 27720986 1I AAAATTGACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 9 10 2579 CASAVA_Build X 27722833 1I CTGTGTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 11 13 A 11 12 2580 CASAVA_Build X 27738823 1I CATGACTCTC -/A GGCTAAGGTA 3070 het 3070 hom 53 22 20 11 A 0 1 2581 CASAVA_Build X 27856402 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 2930 het 2031 hom 20 5 9 6 A 11 12 2582 CASAVA_Build X 27895023 1I TCCCCTTTCT -/C CCCCCCCCCC 894 het 894 ref 28 10 4 14 C 10 11 2583 CASAVA_Build X 27947022 1I TTGCTGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1944 hom 25 9 10 6 T 12 13 2584 CASAVA_Build X 27952494 1I AGCTAGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 T 11 12 2585 CASAVA_Build X 27954521 2D TCAAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 1574 hom 29 6 20 6 A 10 8 2586 CASAVA_Build X 27963266 2I AGCAAGACTC --/TG TTTCAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TG 0 1 2587 CASAVA_Build X 27966985 1D TCCCCAGGGT A/- CCCACACGGT 3070 het 3070 hom 41 16 23 4 A 1 0 2588 CASAVA_Build X 27980225 5D GTTATATCAA TATAT/----- TATATGTATA 2815 het 2815 ref 16 10 6 1 TATAT 2 1 2589 CASAVA_Build X 27981758 1I AGCTGTGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 10 19 14 T 14 15 2590 CASAVA_Build X 28010826 1I GGCAATATGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 8 9 2591 CASAVA_Build X 28018959 7I CCAGCTTCAT -------/CCATGTC CCATGTCCCT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 CCATGTC 1 2 2592 CASAVA_Build X 28029097 1I AAAATGAACT -/A AGAGAGAAGC 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 A 1 2 2593 CASAVA_Build X 28030077 1I TAGCCTTCAG -/T ATTTTGGCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 2594 CASAVA_Build X 28030882 1I ATTCCATGGT -/G TATATGTACC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 0 1 2595 CASAVA_Build X 28037677 1I TGCACATTGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 T 8 9 2596 CASAVA_Build X 28041150 1D GACATTCAAA T/- CAGAAAGCAT 3070 het 3070 ref 44 21 20 4 T 1 0 2597 CASAVA_Build X 28053791 4D TTTAAGAAAT AGAG/---- AGAATAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 AG 3 1 2598 CASAVA_Build X 28061855 1D GCAACTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 12 11 2599 CASAVA_Build X 28064200 2I ATCCTTTCTC --/AT ATGTGTGATT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 AT 1 2 2600 CASAVA_Build X 28065331 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2083 hom 17 5 10 2 A 9 8 2601 CASAVA_Build X 28071418 1D TAAAATTTCC A/- AGATCCTTAG 3070 het 2975 hom 22 7 12 5 A 2 1 2602 CASAVA_Build X 28120714 1D GGTAGCTCTA T/- TTTTAGTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 T 5 4 2603 CASAVA_Build X 28144942 2D AGAGTAGCAG GA/-- GAGAGGTTTC 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 GA 3 2 2604 CASAVA_Build X 28155273 1D ACTGCTTTCC A/- CAGTGACTGA 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 A 1 0 2605 CASAVA_Build X 28158594 1D GCTGACATAA T/- TTATTTAGAT 3070 het 2482 hom 18 5 9 4 T 3 2 2606 CASAVA_Build X 28159342 1I TAACAACGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 10 2607 CASAVA_Build X 28159636 1I CAAACTCAGT -/G GGTTAACAAG 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 G 2 3 2608 CASAVA_Build X 28163547 1D GGGAAAAAAA T/- AATCTGATTT 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 T 1 0 2609 CASAVA_Build X 28182497 1I ATATAACATG -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 6 7 2610 CASAVA_Build X 28187465 2D AAAAATTACT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 TA 6 5 2611 CASAVA_Build X 28187798 1I TAAAATTTGG -/A ACTTACACTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 1 2 2612 CASAVA_Build X 28189614 2D AATGTATAAC AT/-- GTATAATGAG 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 AT 1 0 2613 CASAVA_Build X 28189869 5D GAAAGCAAAC AAACA/----- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 36 17 16 6 AAACA 1 0 2614 CASAVA_Build X 28194717 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 2320 het 1337 hom 21 7 12 2 AC 6 7 2615 CASAVA_Build X 28203849 2D AAGAAAACTC TT/-- GTTTATATCT 3070 het 3070 ref 41 19 15 10 T 2 0 2616 CASAVA_Build X 28209211 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 12 11 2617 CASAVA_Build X 28209724 1I TACCCTTCAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 T 7 8 2618 CASAVA_Build X 28212747 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 607 hom 23 6 13 4 T 17 16 2619 CASAVA_Build X 28214326 1I AAAAAAACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 10 11 2620 CASAVA_Build X 28228270 1I AAAGGAACAA -/G GGTTCTACGG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 2 3 2621 CASAVA_Build X 28231406 3I TAATTACTAG ---/TAT TATTTAATTG 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 TAT 1 2 2622 CASAVA_Build X 28231519 2D AATAAATGGA AT/-- ATACACACCA 3070 het 3070 ref 32 18 7 7 AT 2 1 2623 CASAVA_Build X 28232334 10I2M2I GCTCAGAGAG ----------AG--/CCTTTGTGAAAGCC TAAGTGAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 N/A 0 0 2624 CASAVA_Build X 28232819 1I CACTTTGAGT -/A GTAAAGTTAG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 0 1 2625 CASAVA_Build X 28234199 1D TCACATACCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 19 9 0 T 9 8 2626 CASAVA_Build X 28281666 2I GAATGGTATC --/AG AGAATCATTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AG 1 2 2627 CASAVA_Build X 28298075 3I GTGTGTATGT ---/ACC ACATTTTCTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 ACC 0 1 2628 CASAVA_Build X 28326541 9I AGGAAACCTT ---------/GGGTTTGTG GAAACAAATA 3070 hom 162 het 58 0 53 5 GGGTTTGTG 0 1 2629 CASAVA_Build X 28331657 2I ACGTTGGAAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 TG 7 8 2630 CASAVA_Build X 28359816 1D GTTCAGCAAT C/- CTACTACTGG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 C 2 1 2631 CASAVA_Build X 28360866 1D CATTTTTTTT A/- AAATAATTTC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 4 3 2632 CASAVA_Build X 28361791 1D ACATTTTTTT A/- AACTCCCATC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 3 2 2633 CASAVA_Build X 28366210 16D TGATTTTGAA GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 48 17 19 16 GT 20 12 2634 CASAVA_Build X 28369695 2D CTTAAGGGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 13 11 2635 CASAVA_Build X 28370334 1I GCACACACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 9 10 2636 CASAVA_Build X 28372166 14D CAAATGTTAC TGTATGTATGTAAA/-------------- TGTATGTATG 3070 het 3070 ref 50 26 14 16 TGTATGTATGTAAA 2 1 2637 CASAVA_Build X 28397129 2I TACACACCCA --/AT ACACAATGAT 3070 het 3070 ref 61 28 26 7 AT 0 1 2638 CASAVA_Build X 28400284 3I GAGCAAGTCA ---/CTT CTTAAGTGGA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 CTT 1 2 2639 CASAVA_Build X 28416644 1I CATTTCATTC -/A AAAATTTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 4 5 2640 CASAVA_Build X 28424310 1D AAGAAAGTAC T/- TTTTTTGGAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 7 6 2641 CASAVA_Build X 28428553 1D ATATGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 T 11 10 2642 CASAVA_Build X 28435932 1D GAGGCCTGAC A/- AGTACCTTAG 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 A 2 1 2643 CASAVA_Build X 28438678 1I CAAAAAAATG -/T TTTATCCAGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 4 2644 CASAVA_Build X 28439523 1D AGCTCTATTC A/- AGATAGAATT 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 A 2 1 2645 CASAVA_Build X 28447560 1I ATTAGCCCTT -/A ACTCCTTCAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 1 2 2646 CASAVA_Build X 28452724 2D CATTTTCACC AT/-- ATACCGTAAG 3070 het 3070 hom 71 31 31 9 AT 2 1 2647 CASAVA_Build X 28475214 11I AGCCGAGATC -----------/ACGCCATTGCA ACGCCATTGC 3070 het 3070 hom 28 8 9 11 ACGCCATTGCA 1 2 2648 CASAVA_Build X 28487720 1I CCACATGGCT -/G GGGAAGCCTC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 G 3 4 2649 CASAVA_Build X 28515798 1D TCCTAGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 32 0 21 11 T 11 10 2650 CASAVA_Build X 28526666 1D AATTTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 2061 het 35 hom 15 1 6 8 T 17 16 2651 CASAVA_Build X 28542220 1I TTCGTTCTTG -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 7 8 2652 CASAVA_Build X 28563023 5I ATGAACTCTT -----/TTCTC TGCACTATCT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 TTCTC 0 1 2653 CASAVA_Build X 28568762 1D TCAGGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 14 9 A 12 11 2654 CASAVA_Build X 28572158 2D TCCTAAGTGT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 TA 7 6 2655 CASAVA_Build X 28580830 1D TGTGACGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1137 hom 21 6 9 6 T 14 13 2656 CASAVA_Build X 28581513 1D ACTGGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 11 10 2657 CASAVA_Build X 28582242 1D TTCTTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2491 hom 21 6 8 8 A 11 10 2658 CASAVA_Build X 28587018 4I GGAAAAAAAT ----/TATC TAACGTTCAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TATC 0 1 2659 CASAVA_Build X 28589113 1D CTTCTTTCTT A/- ACAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 20 12 1 A 2 1 2660 CASAVA_Build X 28589433 5D ATGCTGGTGA TATAT/----- TATTTGATTG 2958 het 2958 ref 28 21 7 2 TATAT 1 0 2661 CASAVA_Build X 28591277 1D TCATAGGTGT C/- CCTAGCCTTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 C 3 2 2662 CASAVA_Build X 28591782 3D ATATACAAAT ATA/--- ATCAAATGAT 3070 het 3070 ref 37 21 13 5 ATA 1 0 2663 CASAVA_Build X 28621799 1D GTTATTGACG A/- AGAGATACTT 3070 het 3070 ref 52 28 17 7 A 2 1 2664 CASAVA_Build X 28640399 1I GGTTGGCAGG -/T TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 29 22 3 4 T 11 12 2665 CASAVA_Build X 28664470 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1610 het 1610 ref 33 24 5 4 A 15 14 2666 CASAVA_Build X 28693743 5D ACACTGACTT AAAAA/----- GATAAAGTAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 5 0 2667 CASAVA_Build X 28707673 28D TGTGTGTGTG TATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATA 1548 het 205 hom 7 1 4 3 TA 22 8 2668 CASAVA_Build X 28800510 1I ATAATACATA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 6 7 2669 CASAVA_Build X 28816298 1D ACGTACTGGT A/- AAAAAAAAAA 840 het 840 ref 41 27 3 11 A 13 12 2670 CASAVA_Build X 28860793 1D GGTAAAGTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 A 10 9 2671 CASAVA_Build X 28866511 3D AGCCACATCC AGA/--- AGATTGAAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 AGA 2 1 2672 CASAVA_Build X 28887237 1I TACATATTTC -/T TTATTTAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 2 3 2673 CASAVA_Build X 28893996 4D ACTAAAAAAT ACTC/---- ACGAAGCCCT 3070 het 3070 ref 37 22 13 3 ACTC 1 0 2674 CASAVA_Build X 28916178 1I ATGGGCTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 23 18 10 T 9 10 2675 CASAVA_Build X 28919442 2I AGGTGAAAAC --/AG AGTGAGAGGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AG 1 2 2676 CASAVA_Build X 28928870 1I AGTATAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 14 13 T 14 15 2677 CASAVA_Build X 28975767 1I AAATTCAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 37 2 25 11 T 13 14 2678 CASAVA_Build X 28986390 1I ACTCCAGCCT -/G AGCGACAGAG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 G 0 1 2679 CASAVA_Build X 29025736 1I AACTACACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 58 29 20 9 A 9 10 2680 CASAVA_Build X 29053913 1I TGAAATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1806 hom 39 5 28 6 A 10 11 2681 CASAVA_Build X 29067895 3I AAATTTATAT ---/TAA TAATGTATGT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 TAA 1 2 2682 CASAVA_Build X 29082576 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2391 het 1925 hom 15 8 7 0 A 13 14 2683 CASAVA_Build X 29084901 1I TAAAAAGTTA -/C CCAAAGATCC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 2 3 2684 CASAVA_Build X 29085743 5I CAAATTAGTT -----/TACTC TACTCAGCCT 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 TACTC 1 2 2685 CASAVA_Build X 29092843 2D TTATTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 TG 6 5 2686 CASAVA_Build X 29102710 1I TAAAGTACAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 8 9 2687 CASAVA_Build X 29108074 1I GAAGGAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 9 10 2688 CASAVA_Build X 29110143 1D TTTAGCCTTG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 C 9 8 2689 CASAVA_Build X 29113885 1D TCACAGCAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 9 20 10 A 10 9 2690 CASAVA_Build X 29115708 1I TGCAAGACTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 7 8 2691 CASAVA_Build X 29127505 2D GTTCCCAGTC TT/-- TTTGGCACCG 3070 het 3070 hom 26 9 13 6 T 5 3 2692 CASAVA_Build X 29128191 1I GTGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 40 1 32 7 A 10 11 2693 CASAVA_Build X 29154795 1I TTAACAGATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 9 10 2694 CASAVA_Build X 29155030 1D GAATGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 T 13 12 2695 CASAVA_Build X 29164549 2D ATTCCTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2696 het 1313 hom 22 6 8 8 T 13 11 2696 CASAVA_Build X 29164694 10D GGGTTCACAC CATTCTCCTG/---------- CATTCTCCTG 1259 het 1259 ref 9 6 3 1 CATTCTCCTG 2 1 2697 CASAVA_Build X 29177581 4I CCATTAACAC ----/TGAT TGATAGCACT 3070 het 3070 hom 54 23 26 5 TGAT 1 2 2698 CASAVA_Build X 29180320 2D AAAAGAAAAA AG/-- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 27 2 11 15 AG 1 0 2699 CASAVA_Build X 29191899 2D CTCTCTCTCT CC/-- CCCCCCCCCG 3045 het 39 hom 24 2 13 9 C 11 9 2700 CASAVA_Build X 29204613 4D GAACAGTTAT TTAG/---- TTAATCACTA 3070 hom 105 het 37 0 36 3 TTAG 1 0 2701 CASAVA_Build X 29224560 1D GACAACCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 42 0 34 8 T 13 12 2702 CASAVA_Build X 29235702 1D CATTTGTACA T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 7 6 2703 CASAVA_Build X 29269200 4D CTGTAAAATG AGTT/---- AGTTAGACAA 3070 het 3070 ref 53 27 20 12 AGTT 2 1 2704 CASAVA_Build X 29271770 1D TGATTTGTAG T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 9 8 2705 CASAVA_Build X 29278660 1I GCGTGCACAC -/G CACACACACA 2901 het 29 hom 17 1 8 8 G 0 1 2706 CASAVA_Build X 29283918 3D AGTAAACAGT AAA/--- AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 37 20 14 6 A 9 6 2707 CASAVA_Build X 29298377 1I TGACATGAAG -/T TATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 T 1 2 2708 CASAVA_Build X 29316031 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2039 hom 33 9 15 9 A 12 11 2709 CASAVA_Build X 29316402 4D AGATTAAAAA AAAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 AAAT 1 0 2710 CASAVA_Build X 29317394 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 938 het 242 hom 20 3 5 14 A 19 18 2711 CASAVA_Build X 29321212 4I CGCCCAGGCT ----/GGAG TGCAGTCTCG 3070 het 1833 hom 16 5 10 1 GGAG 0 1 2712 CASAVA_Build X 29321763 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2815 het 2815 ref 28 10 8 10 T 11 12 2713 CASAVA_Build X 29327860 1D GAAGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1215 hom 26 3 13 10 A 15 14 2714 CASAVA_Build X 29327875 1D AAAAAAAAAA G/- AAATGTTAGC 3070 het 1354 hom 21 6 12 3 G 1 0 2715 CASAVA_Build X 29330824 1I CTGTTTTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 9 10 2716 CASAVA_Build X 29332951 1D TTGTTTGTTT G/- TTTGTTTTGT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 1 0 2717 CASAVA_Build X 29340349 1D TTAGTTAGAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 8 7 2718 CASAVA_Build X 29372379 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 829 het 829 ref 21 13 5 3 A 17 16 2719 CASAVA_Build X 29491243 2D TAATGTTCTC AT/-- GTGCAGTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 AT 1 0 2720 CASAVA_Build X 29504938 1I TGTTGGTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 10 11 2721 CASAVA_Build X 29505984 1D GGGGAGCTTT A/- AAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 A 7 6 2722 CASAVA_Build X 29515019 1I ATGGGAACAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 7 8 2723 CASAVA_Build X 29578523 1D AGCTAACTCA T/- TTTTTTTTTT 1091 het 1091 ref 42 32 3 7 T 12 11 2724 CASAVA_Build X 29623044 1I AATGTACAAT -/A GACCAAAAAC 3070 hom 138 het 48 0 46 2 A 0 1 2725 CASAVA_Build X 29712721 1D TTATTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 19 1 15 4 A 12 11 2726 CASAVA_Build X 29716142 2D TGATTTAAAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 59 het 48 1 34 13 TG 8 7 2727 CASAVA_Build X 29730640 1I CTCAGTTTCT -/A ATACTTTTAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 1 2 2728 CASAVA_Build X 29749507 5I AAATAAAATA -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AAAAT 2 3 2729 CASAVA_Build X 29757501 1D ATAATCTGTA C/- AAGAATGAGG 3070 hom 129 het 49 0 44 6 C 1 0 2730 CASAVA_Build X 29760744 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 996 het 996 ref 40 23 4 13 T 15 14 2731 CASAVA_Build X 29764227 8D TTCATTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 19 1 15 4 T 19 11 2732 CASAVA_Build X 29813706 4I AAAATAAAAA ----/AATC AATCAGCTGA 2515 het 2515 ref 20 11 6 3 AATC 1 2 2733 CASAVA_Build X 29816265 1D AACTGAGGAA T/- TTTTTTTTTT 736 het 736 ref 13 5 3 5 T 15 14 2734 CASAVA_Build X 29852703 2D TCTGAAGGGT TA/-- TGTTTCCTTA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 TA 1 0 2735 CASAVA_Build X 29986233 6D AATTTCTTGC TTTTTA/------ TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 18 9 4 TTTTTA 1 0 2736 CASAVA_Build X 30018332 1I ATCAGCATTG -/C TGGGGGGGGC 1829 het 1829 ref 28 17 7 5 C 0 1 2737 CASAVA_Build X 30019380 10I TCCTAATAGG ----------/AGACTAACAT TAGAACTACT 3070 het 3070 hom 49 13 29 7 AGACTAACAT 0 1 2738 CASAVA_Build X 30024874 4D TAAAGGAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2440 het 2075 hom 26 9 9 9 AAAG 5 4 2739 CASAVA_Build X 30025078 5D AAAATACAAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 AAAAT 5 4 2740 CASAVA_Build X 30033962 1D ATCAATACGG A/- GGCTACCCAC 3070 het 3070 hom 20 9 8 3 A 1 0 2741 CASAVA_Build X 30040310 1D AAAGAGAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 9 8 2742 CASAVA_Build X 30043727 7I TTTTTCTTCG -------/AAAAGAA AAAAGTCAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AAAAGAA 0 1 2743 CASAVA_Build X 30056376 1I CACTACCCAA -/C CGTTTTTCTG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 1 2 2744 CASAVA_Build X 30056912 1I AATCAGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 A 10 11 2745 CASAVA_Build X 30060618 1I TGTCTTGGGG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 T 8 9 2746 CASAVA_Build X 30086734 1D TCCCCAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 9 8 A 11 10 2747 CASAVA_Build X 30097173 1D AAAAAAATTT A/- AAAAAAAAAC 2424 het 703 hom 11 3 6 2 A 10 9 2748 CASAVA_Build X 30098988 1D GCAGAGAAAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 8 7 2749 CASAVA_Build X 30105974 1I AACAGCATAT -/A GTTGAATTTA 3070 het 2334 hom 22 6 12 4 A 0 1 2750 CASAVA_Build X 30109728 1D TGTATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 12 11 2751 CASAVA_Build X 30110312 1I TTGAAAGTTG -/A TCAACATGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 2752 CASAVA_Build X 30112737 3D CACAATCATC AGG/--- AGAACTGTTT 3070 het 3070 ref 39 18 18 5 AGG 1 0 2753 CASAVA_Build X 30125569 2I ATCCTCTCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 2758 hom 25 9 8 8 TC 7 8 2754 CASAVA_Build X 30131375 4D TTCAAAGCAT TTAA/---- TTAAGACTTT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 TTAA 2 1 2755 CASAVA_Build X 30134073 1D CAAGCTGAGG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 2756 CASAVA_Build X 30135948 1I ATCTAATGTG -/A AAAAAAAAGG 771 hom 10 het 10 0 4 6 A 8 9 2757 CASAVA_Build X 30135988 1I GGCATGCTTT -/C CTTGGTTAAA 2793 hom 20 het 13 0 7 6 C 1 2 2758 CASAVA_Build X 30139657 1D GTTTTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 17 2 12 3 A 12 11 2759 CASAVA_Build X 30146158 1I AGGGTGGTGG -/A TTGAGGCACC 3070 hom 78 het 32 0 25 7 A 0 1 2760 CASAVA_Build X 30147746 1D ACTTGTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 50 0 30 20 T 11 10 2761 CASAVA_Build X 30149601 1D TAACATAGAC A/- CATTCCCTTC 3070 hom 123 het 47 0 40 7 A 1 0 2762 CASAVA_Build X 30158553 3I TCCTCTCTTT ---/TAC TACCCTTCAG 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 TAC 1 2 2763 CASAVA_Build X 30187756 3I TCTTCTTGTA ---/GTT GTTGTTGTTT 3070 hom 79 het 38 0 21 17 GTT 3 4 2764 CASAVA_Build X 30193359 1D CTCAGACTGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 57 22 26 9 T 9 8 2765 CASAVA_Build X 30203915 1D TTCTTTACTC T/- TTTTTTTTTT 1702 het 1702 ref 48 37 4 7 T 11 10 2766 CASAVA_Build X 30206218 1I AAGATTTTGG -/C TTGTGCCCCA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 C 0 1 2767 CASAVA_Build X 30224899 1I GGTGCCCAAG -/T TTTTTTTTTT 862 het 862 ref 45 33 2 10 T 13 14 2768 CASAVA_Build X 30229787 1D TAATGGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 40 0 30 10 T 13 12 2769 CASAVA_Build X 30235455 16I CCAACCATTT ----------------/ACTTTGGAGTAAGGTC ACTTGGGACC 3070 hom 81 het 48 1 38 9 ACTTTGGAGTAAGGTC 0 1 2770 CASAVA_Build X 30254782 1I ATAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 816 hom 28 2 22 4 A 11 12 2771 CASAVA_Build X 30258535 1D TTTACTTCTC T/- CTTTCCAATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 0 2772 CASAVA_Build X 30262806 1I GGAGAAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 333 hom 55 1 44 10 A 11 12 2773 CASAVA_Build X 30276794 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 34 2 15 17 A 17 18 2774 CASAVA_Build X 30287846 2D GGTAGAGAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 52 hom 28 1 21 7 T 15 13 2775 CASAVA_Build X 30290319 1D TTTCTGATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 43 1 24 19 T 13 12 2776 CASAVA_Build X 30300192 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 7 2777 CASAVA_Build X 30301914 5D AGCAAACTTT AGAGG/----- AGATGCTGGA 3070 hom 111 het 42 0 38 6 AGAGG 1 0 2778 CASAVA_Build X 30325145 1I AAAAAAAGGG -/C GGGGGGGGAA 3070 hom 58 het 29 0 18 11 C 0 1 2779 CASAVA_Build X 30336327 1I CTCTCCCAAG -/T TTCTCTTCCT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 2 3 2780 CASAVA_Build X 30363894 6D GAATACAAAT GGAGAG/------ GGATGTACGA 3070 het 3070 hom 41 18 22 2 GGAGAG 1 0 2781 CASAVA_Build X 30413597 1D GCTTGTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3028 hom 41 het 19 0 13 6 T 13 12 2782 CASAVA_Build X 30450293 6D TGTACAGCTT ATACTC/------ AGCCTCAGCT 2622 het 2315 hom 15 6 8 1 ATACTC 1 0 2783 CASAVA_Build X 30458367 1D ACAGAAACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 9 8 2784 CASAVA_Build X 30461099 4I TTTAATTGAC ----/AAAT AAAATTGTAT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 AAAT 0 1 2785 CASAVA_Build X 30463800 4D GACTAAACAT AAAA/---- AAAGCAGACG 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 A 7 3 2786 CASAVA_Build X 30468820 2D ATATATATAT AA/-- AATGTTGGAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 4 2 2787 CASAVA_Build X 30471704 1I ATGTCCACAT -/A AAAAACCTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 5 6 2788 CASAVA_Build X 30478770 1D TGGCAGAGGG T/- TAAAAACGTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 1 2789 CASAVA_Build X 30488702 1D GTACAGGGGT G/- GGGGGGTCCC 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 G 7 6 2790 CASAVA_Build X 30489899 1I TATAAGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 25 1 19 5 A 15 16 2791 CASAVA_Build X 30493680 5I TTTAATTTAG -----/TTTAA TTTAAATTAA 3070 hom 104 het 38 0 35 3 TTTAA 1 2 2792 CASAVA_Build X 30495317 1D ATGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 511 hom 28 3 17 8 A 15 14 2793 CASAVA_Build X 30498060 1D GTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 24 0 15 9 A 11 10 2794 CASAVA_Build X 30499673 3D CTCAAAAAAA AGG/--- GGGGGGGGGC 2056 het 370 hom 21 4 8 10 AGG 1 0 2795 CASAVA_Build X 30525753 1D TACCAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 34 2 20 14 A 15 14 2796 CASAVA_Build X 30531937 4D TTTAAAAAAA AAAT/---- AAATAAAGTA 3070 het 2227 hom 21 7 14 1 AAAT 2 1 2797 CASAVA_Build X 30539356 1D TACGAAAATT A/- AGCGGGACAT 2597 hom 15 het 7 0 6 1 A 2 1 2798 CASAVA_Build X 30590202 7I AAATATATAC -------/CAGATTT CAAAGACTTA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 CAGATTT 0 1 2799 CASAVA_Build X 30612102 4I TGGTTGTCTT ----/CTAA CTATTATTGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 CTAA 0 1 2800 CASAVA_Build X 30620107 26D AAGTTCCCTT TTTCTGTTTTTGTTTTTTGTGTTTTG/-------------------------- TTGTTGTTTA 3070 het 3070 ref 37 31 12 3 TTTCTGTTTTTGTTTTTTGTGTTTTG 1 0 2801 CASAVA_Build X 30627356 2I ATATAACATG --/TT TTATATATAT 2678 hom 24 het 14 0 8 6 T 2 4 2802 CASAVA_Build X 30628798 4I AAAAAATGAA ----/AAAT AAATCCTATG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AAAT 1 2 2803 CASAVA_Build X 30639166 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 35 1 26 8 T 11 12 2804 CASAVA_Build X 30649335 1I TAGAATAGCC -/T TTTTTTTTTT 1864 hom 30 het 15 0 9 6 T 13 14 2805 CASAVA_Build X 30651650 8D CTATCCTGTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 17 14 12 TTTG 6 4 2806 CASAVA_Build X 30652514 1D CTTCTTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 11 10 2807 CASAVA_Build X 30656374 1I AAAGTGAAAC -/T TTAAAAAAAA 3070 het 347 hom 42 1 36 5 T 2 3 2808 CASAVA_Build X 30657802 1I GTCTTAGCTT -/A AAAAAAAGAA 1093 het 1093 ref 39 29 3 7 A 7 8 2809 CASAVA_Build X 30660315 2I ACTATACATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 242 hom 19 1 14 4 TG 8 9 2810 CASAVA_Build X 30666184 3D ATTTGTGGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 26 1 22 3 T 20 17 2811 CASAVA_Build X 30676208 1I TGGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 G 4 5 2812 CASAVA_Build X 30677208 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 240 het 240 ref 13 6 2 5 TTC 1 0 2813 CASAVA_Build X 30678663 1D ATTTCTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 85 het 33 0 28 5 T 10 9 2814 CASAVA_Build X 30685955 1I TACAAGCCAG -/A AGAGATTGGG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 1 2 2815 CASAVA_Build X 30701337 4D TCGTACAAAC ACTG/---- ACCTACCATA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 ACTG 1 0 2816 CASAVA_Build X 30706055 1I ATTACATTGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 372 hom 50 1 44 5 T 8 9 2817 CASAVA_Build X 30722724 11D7M2D TTGCCTTTGC TTTGCCTTGGTTTGCCTTGC/-----------TTGTCTT-- CTTGTGCCTT 894 het 894 ref 59 57 5 10 N/A 0 0 2818 CASAVA_Build X 30724920 5D CTTTGCTTTG TGCCT/----- TGCCTTGCCT 3070 hom 161 het 70 0 51 27 TGCCT 5 4 2819 CASAVA_Build X 30729754 20D12M5D28M2D4M10D TGCCTTGCCT CACCTTGCCTTGCCTTACCATGCCTTACCTTGCCTCACCTTGTGTTTTGCCCTACATTGCCTTGTGCCTTGCTTTGTGCCC/--------------------TGCCTTACCTTG-----CATTGTGTTGTTCCTTGCATTGCCTTGT--CTTG---------- AGGCTTGCCT 925 het 925 ref 57 98 8 15 N/A 0 0 2820 CASAVA_Build X 30769453 1D TCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 12 11 2821 CASAVA_Build X 30770699 1I TACAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 9 10 2822 CASAVA_Build X 30778887 1D AATGAAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 77 het 28 0 25 3 A 9 8 2823 CASAVA_Build X 30780497 1D CACAAAGAAT A/- AATTCATCAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 3 2 2824 CASAVA_Build X 30818308 1D AGGAAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 305 hom 34 1 19 14 T 13 12 2825 CASAVA_Build X 30822515 5D TGTCACTTGC AAAGA/----- AAAGATTCTA 3070 het 3070 ref 45 20 20 9 AAAGA 2 1 2826 CASAVA_Build X 30823948 1I TTTTAACGTC -/T TTTTTTTTTT 2324 het 229 hom 15 1 12 2 T 13 14 2827 CASAVA_Build X 30838474 1D TCCTCTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 36 0 27 9 T 12 11 2828 CASAVA_Build X 30844438 2D CAAGGACAGG TT/-- TTTTACATAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 6 4 2829 CASAVA_Build X 30847197 1I TCTCTGATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 24 9 2 T 9 10 2830 CASAVA_Build X 30867557 1I GGGGCTTGTC -/A GGGGGTGGGG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 0 1 2831 CASAVA_Build X 30876005 1I TTTATGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 20 0 17 3 T 12 13 2832 CASAVA_Build X 30891708 4I AGAAAAAGGT ----/TTTA TTTATTTGGT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 TTTA 1 2 2833 CASAVA_Build X 30892512 5D ATTTTCTCTT GGAAA/----- GGAAGTTATC 3070 het 3070 hom 55 25 27 4 GGAAA 1 0 2834 CASAVA_Build X 30894904 10D ACACATATAT ATATACACAC/---------- ATATATGTAT 2332 hom 21 het 8 0 8 1 ATATACACAC 1 0 2835 CASAVA_Build X 30895917 4D ACTTCTCTTT TCTC/---- TCTGAGTGTA 3070 het 3070 hom 26 9 15 4 TC 3 1 2836 CASAVA_Build X 30899263 3I CCAAAATAAT ---/AAC AACAACAATA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AAC 2 3 2837 CASAVA_Build X 30910732 1D AGTGGACTTT A/- AATGTACTTA 3070 het 3070 hom 52 20 24 8 A 3 2 2838 CASAVA_Build X 30912925 1D ACCAAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 9 9 A 13 12 2839 CASAVA_Build X 30919862 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 39 1 27 11 T 11 10 2840 CASAVA_Build X 30925079 1D TGCTTTTGAC G/- GAAGGGTGAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 G 2 1 2841 CASAVA_Build X 30926417 1D ATGGGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 38 0 34 4 T 13 12 2842 CASAVA_Build X 30940971 1I TCCTTCCTGT -/G GGAACCACAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 2 3 2843 CASAVA_Build X 30941124 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 993 hom 10 het 4 0 4 0 A 8 9 2844 CASAVA_Build X 30945915 3I TTCATCTTCT ---/CTC CTCTGTCTAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CTC 1 2 2845 CASAVA_Build X 30951721 5D TTTTGTCTTT GACAC/----- TTGTTCATGT 3070 het 3070 ref 35 25 10 5 GACAC 1 0 2846 CASAVA_Build X 30951978 2I TCAACTTAAC --/TT TTTAAAATCT 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 T 3 5 2847 CASAVA_Build X 30956477 1D CAAAGTCCAC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 7 6 2848 CASAVA_Build X 30959852 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 12 11 2849 CASAVA_Build X 30964339 1I CCGGGGCGAA -/G CGGCGTAGGA 3070 hom 120 het 45 0 38 7 G 0 1 2850 CASAVA_Build X 31042214 1D TTGTATATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 11 10 2851 CASAVA_Build X 31063199 5D TGTTCTATGT AATAA/----- AATAAGTATT 3070 hom 65 het 26 0 22 5 AATAA 2 1 2852 CASAVA_Build X 31064036 1D CATTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 623 hom 48 3 33 12 T 13 12 2853 CASAVA_Build X 31068818 4D ACTTTACTGA TTGT/---- TTGTTGCACA 3070 hom 123 het 47 0 41 11 TTGT 2 1 2854 CASAVA_Build X 31069681 13I GCTAAGGAAG -------------/GTATGGAAGGTAA GCAGGTAAAG 3070 hom 114 het 44 0 38 6 GTATGGAAGGTAA 0 1 2855 CASAVA_Build X 31072744 1D TGAGGTAAGA T/- TTGAGAGGAC 3070 hom 184 het 66 0 62 4 T 3 2 2856 CASAVA_Build X 31075589 4D AAAGAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAAAG 3070 hom 81 het 29 0 27 4 AAAG 2 1 2857 CASAVA_Build X 31080577 1D TTAATTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 26 3 18 5 T 13 12 2858 CASAVA_Build X 31080945 1I TTTTGGATCG -/T TGATTTGGAG 3070 hom 135 het 48 0 45 3 T 1 2 2859 CASAVA_Build X 31099538 2D AACTAAAAAG GC/-- ATCGTAATAC 3070 hom 204 het 74 0 68 8 GC 1 0 2860 CASAVA_Build X 31110754 1I AAAAATGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1235 hom 50 3 41 6 T 10 11 2861 CASAVA_Build X 31127310 4I TGTATCTCTT ----/AAAC AAACTCGTTG 3070 hom 138 het 54 0 47 7 AAAC 1 2 2862 CASAVA_Build X 31130574 4D AAATCTATCC AACT/---- AACTATTAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 AACT 2 1 2863 CASAVA_Build X 31131576 1I GGACAGTTTT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 102 het 45 0 35 10 A 8 9 2864 CASAVA_Build X 31135002 2I ATAAATTAAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 61 het 34 0 28 6 A 9 11 2865 CASAVA_Build X 31135426 5D TCACATAACA AATTT/----- ATTAATAAGC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AATTT 1 0 2866 CASAVA_Build X 31142098 19I AAAAAAAATC -------------------/AATTCCTTGGCTGGGTTGG CAAAAGCTAA 3070 hom 96 het 34 0 30 4 AATTCCTTGGCTGGGTTGG 0 1 2867 CASAVA_Build X 31145179 2D AGGGAGAAAG AA/-- AATGCTTAAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 4 2 2868 CASAVA_Build X 31156314 2D ATAAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 984 het 451 hom 7 2 4 1 A 16 14 2869 CASAVA_Build X 31158702 1D AAAAAAAAAA G/- GGAGAGAAGC 3070 het 2406 hom 33 11 16 7 G 3 2 2870 CASAVA_Build X 31169136 1D TCTCTGCCCC T/- GTACTTCTTG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 1 0 2871 CASAVA_Build X 31180737 4D AGTGCTACAC AAAT/---- AAAGTACAAT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 AAAT 1 0 2872 CASAVA_Build X 31181028 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2557 hom 24 10 11 3 A 12 11 2873 CASAVA_Build X 31186988 1I TTTCCAGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 33 0 24 9 A 11 12 2874 CASAVA_Build X 31199917 2D ACTAATTGAA AT/-- ATATATATAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AT 5 4 2875 CASAVA_Build X 31206066 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAATATGAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 AAG 0 1 2876 CASAVA_Build X 31229794 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 9 10 2877 CASAVA_Build X 31238584 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 T 10 9 2878 CASAVA_Build X 31241852 1D TGTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2140 het 1275 hom 18 6 7 5 T 14 13 2879 CASAVA_Build X 31284620 1D CTCTGCCATC A/- AACTGGAAGG 3070 hom 105 het 43 0 35 9 A 3 2 2880 CASAVA_Build X 31320051 4D CTCTAGTGAT TATC/---- TATTTCCACA 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 TATC 1 0 2881 CASAVA_Build X 31367545 1I GGAAACCTTT -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 6 7 2882 CASAVA_Build X 31370584 1D AGCATTGATT A/- AAAAAAAAAA 1563 het 1563 ref 39 30 4 6 A 13 12 2883 CASAVA_Build X 31379319 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1634 het 82 hom 17 1 7 10 T 17 16 2884 CASAVA_Build X 31498735 3I ATCTTATGTT ---/ATC ATTAATTTAT 3070 het 3070 hom 41 11 27 3 ATC 0 1 2885 CASAVA_Build X 31605106 1D TTCCAAAGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 T 12 11 2886 CASAVA_Build X 31799981 1I TTATTAGTGA -/C AAGGAATGGA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 C 0 1 2887 CASAVA_Build X 31807248 2I TCTACATGGC --/GG GGGGGGGGGC 1241 het 1241 ref 30 10 6 14 G 9 11 2888 CASAVA_Build X 31811924 1D CAAGCATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 8 A 11 10 2889 CASAVA_Build X 31824182 2D TTGAATGATC TT/-- TTAAATTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 4 2 2890 CASAVA_Build X 31829977 1D ATTCTTATCA T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 52 17 28 7 T 7 6 2891 CASAVA_Build X 31843278 3D TGTGTTCTCT TGA/--- TGATAAGAAA 3070 het 3070 ref 51 31 15 9 TGA 2 1 2892 CASAVA_Build X 31846662 1D TGTCAACATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 T 9 8 2893 CASAVA_Build X 31855681 1I CAAGAAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2382 hom 27 8 11 8 T 11 12 2894 CASAVA_Build X 31932163 1D AGGAAGCTAA G/- TAACTTATTT 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 G 1 0 2895 CASAVA_Build X 31936671 1I TAGAAAAACA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 6 7 2896 CASAVA_Build X 32006281 1I GTTAAACATT -/A AAAGAGTTAA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 A 3 4 2897 CASAVA_Build X 32019551 1D GCTACAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 11 10 2898 CASAVA_Build X 32037650 1D CAGAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 12 11 2899 CASAVA_Build X 32041994 1D TATTTTCTTG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 T 8 7 2900 CASAVA_Build X 32053018 1D AAAAAAAAAA C/- AAAGTTAGTG 3070 het 1534 hom 42 14 20 8 C 1 0 2901 CASAVA_Build X 32079764 7D ACATGGTTTA TTGTTTT/------- TTGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 55 24 23 10 TTGTTTT 2 1 2902 CASAVA_Build X 32112206 1D ACAATGAGTG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 8 7 2903 CASAVA_Build X 32117666 3D ACTTCTAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 38 0 29 9 T 13 10 2904 CASAVA_Build X 32122024 3D ACAGAGCTGT GAA/--- GAAGTTGAAA 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 GAA 2 1 2905 CASAVA_Build X 32142263 7D TGAAACACTT AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 158 hom 34 3 18 15 A 23 16 2906 CASAVA_Build X 32149396 2I GCGAATAAAT --/AA AAGTTAGTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 4 2907 CASAVA_Build X 32157115 2I GCTTATAGTG --/TA TATGTTTTTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TA 1 2 2908 CASAVA_Build X 32161567 1D ACAATAAATT A/- AAAAAACTTC 3070 hom 75 het 26 0 25 1 A 7 6 2909 CASAVA_Build X 32183476 1D TTGCTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 A 15 14 2910 CASAVA_Build X 32201538 1I TCCAATATTC -/T TTTTTTTTTT 2720 het 2720 ref 42 24 9 9 T 13 14 2911 CASAVA_Build X 32226897 1I TTGATTCTGC -/T TTAAGGCTAC 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 2 3 2912 CASAVA_Build X 32227554 2I TCTGATACAA --/TT TTTTTTTTTT 2380 het 1776 hom 48 7 10 31 T 14 16 2913 CASAVA_Build X 32234085 1D CAGATTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 14 8 T 13 12 2914 CASAVA_Build X 32245878 1I TGATGGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 11 12 2915 CASAVA_Build X 32255233 1D ACTAGGGGCA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 11 C 1 0 2916 CASAVA_Build X 32270060 2D TTTTTGTCTC TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 T 10 8 2917 CASAVA_Build X 32273886 2I CTGATGACTA --/AG AGTCTGAAGC 3070 het 3070 hom 34 11 23 0 AG 1 2 2918 CASAVA_Build X 32284681 4D CTTTTTTCTG GTTA/---- GTATCAATTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 6 GTTA 1 0 2919 CASAVA_Build X 32290328 1D GTAAAGAGGT A/- AAAAAACACC 3070 het 3070 ref 53 29 21 3 A 7 6 2920 CASAVA_Build X 32310398 2D GTCATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 53 22 22 10 TG 6 5 2921 CASAVA_Build X 32310656 1D TTCCCTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 T 11 10 2922 CASAVA_Build X 32313659 23I TTACTATCAT -----------------------/AATTTTAAACCATCAAAGCTCTA AATCTATACA 3070 het 3070 hom 42 16 24 5 AATTTTAAACCATCAAAGCTCTA 0 1 2923 CASAVA_Build X 32322155 1I CATAAAGTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 T 8 9 2924 CASAVA_Build X 32323477 1I GGGGGAGGGG -/C GGAGGGATAG 3070 het 1909 hom 16 5 10 1 C 0 1 2925 CASAVA_Build X 32384139 5I TTTCATAGTA -----/TTGTT TTAATATATA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 TTGTT 0 1 2926 CASAVA_Build X 32416072 1D TTTCCCGTTC A/- GGGGGCTATA 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 A 1 0 2927 CASAVA_Build X 32437228 5D AAAAAGTGTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2927 het 2395 hom 30 12 11 7 A 19 14 2928 CASAVA_Build X 32449514 1D CAAGACCTAG T/- TCATTACCAA 3070 het 3070 ref 43 23 20 0 T 2 1 2929 CASAVA_Build X 32467557 1D ATAGAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 A 11 10 2930 CASAVA_Build X 32469852 1D AAAAGTTGGG A/- AAAAAAAAAA 2745 het 2745 ref 31 16 6 10 A 11 10 2931 CASAVA_Build X 32475089 4D GATCCCAAGA TAAT/---- TTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 9 6 TAAT 1 0 2932 CASAVA_Build X 32496548 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 1838 het 1838 ref 21 7 5 9 A 13 14 2933 CASAVA_Build X 32498449 4D TCTTTGTTCA CAAG/---- CAAGGTGACA 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 CAAG 2 1 2934 CASAVA_Build X 32504675 4D AATTTATGAA TTGT/---- TTATTTCTGG 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 TTGT 1 0 2935 CASAVA_Build X 32524575 1I TATGTGCTAC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 146 het 55 0 49 6 T 7 8 2936 CASAVA_Build X 32529699 30D GTCAAAAGTG TAGCATCTGAAATCAGATTTTCTATGTGTA/------------------------------ ATTCCTGGAA 3070 het 3070 ref 38 27 15 4 TAGCATCTGAAATCAGATTTTCTATGTGTA 1 0 2937 CASAVA_Build X 32533620 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 7 8 2938 CASAVA_Build X 32533821 2D GCCAACAAAC AT/-- ATGAGAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AT 2 1 2939 CASAVA_Build X 32534775 8D ATATATATAT ATATATAC/-------- ACACACACAT 3070 het 676 hom 21 8 10 8 ATATATAC 1 0 2940 CASAVA_Build X 32534844 1I CTACACAGCC -/G TAAGAAAGTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 2941 CASAVA_Build X 32535492 4D TGACTTAGAT AAAA/---- ATTTAATTGT 3070 hom 120 het 42 0 40 2 A 5 1 2942 CASAVA_Build X 32540098 4D ATTTGTGAAC AAAT/---- AAATGGTTTA 3070 het 3070 hom 51 24 22 7 AAAT 2 1 2943 CASAVA_Build X 32542915 1I TGGACTTGTG -/T TTTTTTTTTT 1289 het 1289 ref 48 34 3 11 T 11 12 2944 CASAVA_Build X 32551567 1D AATACTAGTA T/- TTTTTTTTTT 2142 het 2085 hom 28 9 7 12 T 17 16 2945 CASAVA_Build X 32557838 1I AGAGAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 14 15 2946 CASAVA_Build X 32566097 3D CACATTTTTA ATT/--- ATTGACAGAA 3070 het 3070 hom 44 17 24 7 ATT 2 1 2947 CASAVA_Build X 32579177 1D ATAATATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 T 11 10 2948 CASAVA_Build X 32595097 4I ACATTATGGC ----/ACAT ATATATGCAA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 ACAT 0 1 2949 CASAVA_Build X 32627007 2I AGTCTGTCTC --/TG TTTTTGTACA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TG 0 1 2950 CASAVA_Build X 32657791 4I CATGTTCTGG ----/TTCT TTCTTTAATA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 TTCT 1 2 2951 CASAVA_Build X 32682221 5I CTTTTACATG -----/TATTT TATGTAACTA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 TATTT 0 1 2952 CASAVA_Build X 32682585 2D ATAAACCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 A 12 10 2953 CASAVA_Build X 32683355 1I TCAGACAAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 8 9 2954 CASAVA_Build X 32688133 3D CTTGTAATTA TTC/--- TTCTTAAATG 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TTC 2 1 2955 CASAVA_Build X 32688377 1I CATATTTGTT -/A AGTACCTCAT 3070 het 3070 hom 48 16 23 9 A 1 2 2956 CASAVA_Build X 32690219 1I AAAAAAAATC -/A AAAAAAAACA 3070 het 2683 hom 37 16 16 5 A 8 9 2957 CASAVA_Build X 32692996 1D ATTTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 1761 het 1761 ref 32 10 7 15 T 17 16 2958 CASAVA_Build X 32697856 1D GAAAAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 A 13 12 2959 CASAVA_Build X 32701555 1D ATACTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 25 1 14 10 T 17 16 2960 CASAVA_Build X 32705099 1I TAAATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 T 10 11 2961 CASAVA_Build X 32712045 1D GAGCGGGGGT G/- GGGGGGGGAA 3070 het 1485 hom 25 6 13 6 G 9 8 2962 CASAVA_Build X 32715004 1D AATATTACTA T/- GTATGTATTA 3070 het 3070 hom 53 24 26 4 T 1 0 2963 CASAVA_Build X 32719257 1D CAGAGGGTTG C/- CCCCCTCCCA 3070 het 3070 ref 57 23 17 18 C 6 5 2964 CASAVA_Build X 32724154 2D TAAGTATATA TG/-- TAAAGGGAAA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 TG 1 0 2965 CASAVA_Build X 32754007 2I AAATATACTT --/AA AAAGCCACTG 3070 het 3070 hom 45 21 18 6 A 3 5 2966 CASAVA_Build X 32767769 1D AGATAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 12 11 2967 CASAVA_Build X 32776653 1I ATGAAAGCAT -/A AGGTATGTCT 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 A 1 2 2968 CASAVA_Build X 32786040 1I CGAGAGAGAG -/A AAAGCAGTGA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 3 4 2969 CASAVA_Build X 32790648 3I TGGTAAATGC ---/TTT TTTATCTTAT 3070 het 2693 hom 35 7 24 4 T 3 6 2970 CASAVA_Build X 32797613 1D AAGGGAGCTG A/- AAAAACACAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 5 2971 CASAVA_Build X 32799182 1I TTTTCCCGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 8 9 2972 CASAVA_Build X 32813468 1I GAGAAATGAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 8 9 2973 CASAVA_Build X 32815385 1I AATCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 8 9 2974 CASAVA_Build X 32819857 1I ATGAAGCCCT -/A ACACCTAGTA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 A 1 2 2975 CASAVA_Build X 32825134 1I ATTTTATGCG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 T 8 9 2976 CASAVA_Build X 32825915 1I ACGTAATGAG -/A AATCTCATAG 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 A 2 3 2977 CASAVA_Build X 32838640 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTCTGTG 2054 het 2054 ref 15 8 5 2 T 5 6 2978 CASAVA_Build X 32848528 4D CCCATCTCTT TCTC/---- TCTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 44 22 20 4 TC 3 1 2979 CASAVA_Build X 32861213 1D CTAAAGACAC A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 7 6 2980 CASAVA_Build X 32883425 1I TTTAGTAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 9 10 2981 CASAVA_Build X 32919288 9I AAAAAATCAA ---------/GGATTTGAT GGATTTGATT 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 GGATTTGAT 1 2 2982 CASAVA_Build X 32926689 2I ATGTTTATAT --/AC ACACACACAC 2159 het 2159 ref 30 17 6 7 AC 7 8 2983 CASAVA_Build X 32929769 4D AATAATTAAT ATGA/---- ATGAGAAAGG 3070 het 3070 ref 33 20 13 1 ATGA 2 1 2984 CASAVA_Build X 32932211 1D AAGCCTTTCC A/- ATAAAATGAC 3070 het 3070 hom 23 9 11 4 A 2 1 2985 CASAVA_Build X 32933660 1I ATGACAATAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 7 8 2986 CASAVA_Build X 32945417 4D AAGTAGACAC AGAT/---- AGACATTAAT 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 AGAT 1 0 2987 CASAVA_Build X 32946654 5D ATTACTCTAG TTCAA/----- TTCAAAGATT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 TTCAA 2 1 2988 CASAVA_Build X 32946943 1D AAAAAGTTGA G/- GATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 G 2 1 2989 CASAVA_Build X 32949409 1D CAAAAGACTA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 6 2990 CASAVA_Build X 32965404 1D ACTATACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 897 hom 38 2 27 9 A 12 11 2991 CASAVA_Build X 32969930 1I GAGTTCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 32 1 25 6 A 10 11 2992 CASAVA_Build X 32974295 5I CCTGTTAAAT -----/TAAGA TAAAAGAGGA 3070 hom 83 het 36 0 28 8 TAAGA 0 1 2993 CASAVA_Build X 32980913 3I CCATTTATTC ---/TGA TGATGTGATA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 TGA 1 2 2994 CASAVA_Build X 33036217 1I TTTTATTAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 10 2995 CASAVA_Build X 33036521 1I GCCAGGCTGG -/T CTCAAACTCC 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 0 1 2996 CASAVA_Build X 33041629 2D ATCATTCTTG CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 C 11 9 2997 CASAVA_Build X 33045913 1D ATTTGCACAT A/- AAAATATCCT 3070 hom 123 het 46 0 41 6 A 5 4 2998 CASAVA_Build X 33055751 2I ATAAAAATCC --/CT CTCATTAGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 1 2 2999 CASAVA_Build X 33057563 2D GGTTTCAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 11 9 3000 CASAVA_Build X 33068014 2D CCAGCTTCTT CC/-- TTTGCCGATC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 C 2 0 3001 CASAVA_Build X 33073681 2I ATAATACTAA --/AT ATATATATAT 1935 het 1935 ref 20 10 4 6 AT 7 8 3002 CASAVA_Build X 33077229 4D GAGCCCTGAG CTTT/---- CTTTCCTGCA 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 CTTT 2 1 3003 CASAVA_Build X 33080199 9D TTAGCTTTAC TATTATTAT/--------- TATTATTATT 2914 het 282 hom 19 2 7 11 TAT 9 6 3004 CASAVA_Build X 33083838 1D CTCTACAAAG A/- AAAAAAAAAA 3018 het 3018 ref 23 9 9 6 A 13 12 3005 CASAVA_Build X 33092967 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 50 2 31 17 T 15 14 3006 CASAVA_Build X 33097035 1I AGAAGATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 11 12 3007 CASAVA_Build X 33097120 1I CAACAGTATT -/G GGGGCCTCCC 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 G 4 5 3008 CASAVA_Build X 33098377 4D CAAATGCTTG GACA/---- GACAAATGTA 2986 het 2986 ref 24 13 7 4 GACA 2 1 3009 CASAVA_Build X 33099229 3I TTGAACACTC ---/CTT CTTTAAACTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CTT 1 2 3010 CASAVA_Build X 33109385 1D ATAAAACTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 A 10 9 3011 CASAVA_Build X 33111841 1D CTCAACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 802 hom 35 2 31 2 A 11 10 3012 CASAVA_Build X 33119462 1I TTACTTTTAC -/T TTTTTTTTCG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 8 9 3013 CASAVA_Build X 33123771 16D TGTTCTATTT TGTGTGTGTGTGTGTG/---------------- TGTGTGTGTG 3070 het 2080 hom 39 10 21 13 TG 17 9 3014 CASAVA_Build X 33134908 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 8 16 1 T 9 10 3015 CASAVA_Build X 33142089 1D TGAGATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 28 2 18 9 T 15 14 3016 CASAVA_Build X 33167494 1I TTTCCTAAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 9 3017 CASAVA_Build X 33173324 1D TCTGAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 46 1 34 11 A 13 12 3018 CASAVA_Build X 33192751 1D AAGATAAAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 10 9 3019 CASAVA_Build X 33194628 1D AAGTCTTGGA T/- TTTTTCATCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 6 5 3020 CASAVA_Build X 33195559 1D ATATGCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 7 15 1 A 11 10 3021 CASAVA_Build X 33198583 1D CAACAGAGAG T/- TAAGTGCCTT 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 T 2 1 3022 CASAVA_Build X 33200703 2D CATCAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 A 14 12 3023 CASAVA_Build X 33211900 1D ACTAAAAATA C/- AAAAAATTAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 1 0 3024 CASAVA_Build X 33212772 1D AAAAATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 15 0 8 7 T 11 10 3025 CASAVA_Build X 33264553 1D AGAGAAATAA G/- GGAGATTTTT 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 G 3 2 3026 CASAVA_Build X 33268906 1D ATGCCATGTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 T 8 7 3027 CASAVA_Build X 33277193 1D CTGCAGGACA C/- CCTCAGCTTT 3070 het 3070 hom 44 18 20 7 C 3 2 3028 CASAVA_Build X 33287584 1D CAACAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 11 10 3029 CASAVA_Build X 33295476 1D TTTAATGTTG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 8 7 3030 CASAVA_Build X 33309182 1I CCCAGACTAC -/A AAAAAATATG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 6 7 3031 CASAVA_Build X 33310841 2I TTTAAGGCAT --/GG GTCTTAGTGC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 1 3 3032 CASAVA_Build X 33356403 11D CCTAAATGAC ACATTGTTCTT/----------- ACATTGTTCT 3070 hom 63 het 27 0 21 7 ACATTGTTCTT 2 1 3033 CASAVA_Build X 33363314 1I GTCATTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1873 hom 40 4 28 8 A 10 11 3034 CASAVA_Build X 33365620 1D AGCTAGACTT A/- AAAAAAAAAA 2230 het 2230 ref 38 29 5 4 A 12 11 3035 CASAVA_Build X 33380453 1I CTTGAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 24 1 20 3 A 11 12 3036 CASAVA_Build X 33558913 25I GGGCCACAGT -------------------------/GCACTTGCATGTGACCTAATAACAG GCTCTCATTG 3070 het 3070 hom 47 21 21 6 GCACTTGCATGTGACCTAATAACAG 0 1 3037 CASAVA_Build X 33570980 3D GAAATCCAGA CAT/--- CATAATTTAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 CAT 2 1 3038 CASAVA_Build X 33579019 1I TCTTTAGAGT -/A AAAAAAGTAC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 6 7 3039 CASAVA_Build X 33582735 1I AGAACAAAAG -/A AAAATCTGAG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 4 5 3040 CASAVA_Build X 33584350 1D GAGTTAGAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 A 10 9 3041 CASAVA_Build X 33601205 5I TGGTTTCTAC -----/TTTTT TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 6 11 3042 CASAVA_Build X 33609356 5I AGAGAAAGTC -----/AGTTA AGGATAGGCT 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 AGTTA 0 1 3043 CASAVA_Build X 33612794 1D TTTTTAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 11 10 3044 CASAVA_Build X 33613062 1I TGGCCTGTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 8 9 3045 CASAVA_Build X 33613537 1D GTTTAACTTT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 8 7 3046 CASAVA_Build X 33630968 1D GCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1484 het 1484 ref 30 19 4 7 A 11 10 3047 CASAVA_Build X 33641051 2D55M4D GAAGCAGTCC ATATATATATATATATACACACACATATATATGTATATGCACATATGTACATATATGTATA/--ATATATATATATATACACACACATATATATGTATATGCACATATGTACATATATG---- TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 29 14 4 N/A 0 0 3048 CASAVA_Build X 33641489 1D TGCTCTTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 12 11 3049 CASAVA_Build X 33642673 1I TTATTTTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1036 hom 44 4 36 4 A 13 14 3050 CASAVA_Build X 33647229 1I GCTTCTAAGC -/T TTTGAAACTG 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 3 4 3051 CASAVA_Build X 33660223 1I GTATACGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 14 15 14 A 11 12 3052 CASAVA_Build X 33669521 1D GATTTTTTTT G/- GGGGGGGGGA 1466 het 1442 hom 19 6 7 6 G 10 9 3053 CASAVA_Build X 33670575 3I TCAGAAACTT ---/CTC CTGCAAACAG 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 CTC 0 1 3054 CASAVA_Build X 33683482 1D ATAATGAGCA T/- TTTTTTTTTT 2738 het 1707 hom 27 6 6 15 T 11 10 3055 CASAVA_Build X 33690859 4D ATTTTTTTTA TTAT/---- TTTACATTAA 2963 het 2963 ref 24 14 8 5 TTAT 1 0 3056 CASAVA_Build X 33718760 3I CTAATGCCTG ---/ATA ATATGAGGTG 3070 hom 99 het 38 0 32 6 ATA 1 2 3057 CASAVA_Build X 33719338 2D TAATTCCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1779 het 365 hom 33 7 8 18 T 20 18 3058 CASAVA_Build X 33730064 1I ACACTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 10 11 3059 CASAVA_Build X 33730286 1I CTAACTTTAA -/C ACATAGTCAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 0 1 3060 CASAVA_Build X 33732338 1I CTCAATTACG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 375 hom 35 1 31 3 T 8 9 3061 CASAVA_Build X 33738101 1I AAGTTATATA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 7 8 3062 CASAVA_Build X 33741709 1D TACAGAATTC A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 7 6 3063 CASAVA_Build X 33747527 3D CACTTGAGAT CTA/--- CTCTCTTAGC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 CTA 1 0 3064 CASAVA_Build X 33748726 1I AACTCAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2532 hom 29 9 11 9 T 14 15 3065 CASAVA_Build X 33764490 4D TCAGGGTCTA TCTC/---- TCTCTCTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 TC 5 3 3066 CASAVA_Build X 33771952 1I TATCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 12 13 3067 CASAVA_Build X 33784995 3D TAATATGTAT AAC/--- AACAACAATA 1951 het 1951 ref 10 5 4 1 AAC 3 2 3068 CASAVA_Build X 33827380 1I AAAGGTGTGA -/T TTTTAGATTT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 T 4 5 3069 CASAVA_Build X 33829217 1I ATTGCACAAA -/T TTGGTAGACA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 2 3 3070 CASAVA_Build X 33846289 1D TTCTCTCAAC T/- TTTTTTTTTT 2138 het 1833 hom 26 7 8 12 T 17 16 3071 CASAVA_Build X 33847385 1D CAGTGGAGAC G/- GGGGGGTCTC 1745 het 1745 ref 18 8 5 5 G 7 6 3072 CASAVA_Build X 33853688 7D ATAAACTCCA GGAGTTT/------- ACTCCACAGG 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 GGAGTTT 1 0 3073 CASAVA_Build X 33858754 1D CATTTTTTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2597 hom 21 8 12 1 T 9 8 3074 CASAVA_Build X 33863261 1D GAGGGAGCTT A/- ATGCAGGGGA 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 A 2 1 3075 CASAVA_Build X 33867341 1I ATTAAACCTC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 T 7 8 3076 CASAVA_Build X 33897629 21I AGGAACTACC ---------------------/CTCTTTGCAGAGAGCTGGACA CTCACTGGGA 3070 het 3070 ref 45 24 12 9 CTCTTTGCAGAGAGCTGGACA 0 1 3077 CASAVA_Build X 33909768 1D GTGGTGGGTT A/- ATAATAAATT 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 A 2 1 3078 CASAVA_Build X 33918002 1D TAAAATAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 12 25 9 A 11 10 3079 CASAVA_Build X 33953631 1D AATGAGACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 14 9 T 15 14 3080 CASAVA_Build X 33960431 1I GTGATAAACA -/T GTGAATGTCT 3070 hom 93 het 36 0 29 7 T 0 1 3081 CASAVA_Build X 33960739 1D TTTCCATATG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 T 9 8 3082 CASAVA_Build X 33971313 2I GGGAACTCAA --/CT TAACAACAAC 450 het 450 ref 31 5 4 22 CT 0 1 3083 CASAVA_Build X 33989108 1I TCCCAATATA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 6 7 3084 CASAVA_Build X 33993636 1I GGTACAATAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 8 9 3085 CASAVA_Build X 33998023 1D TTTCCATCTG T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 9 8 3086 CASAVA_Build X 33999558 1I CATTAAATGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 8 9 3087 CASAVA_Build X 34022710 1I CAGAAATAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 9 10 3088 CASAVA_Build X 34035481 3D TTTTTTAGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 8 T 30 27 3089 CASAVA_Build X 34037618 1I TATTTTTAGT -/C TGTGTGTGTC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 3090 CASAVA_Build X 34037719 8I GGAGAGTTTA --------/GTTCACTT GTTCACTTTC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GTTCACTT 1 2 3091 CASAVA_Build X 34056020 13D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAGA 3070 het 2471 hom 23 10 11 4 A 21 8 3092 CASAVA_Build X 34062353 2D TTTAACTTTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 11 9 3093 CASAVA_Build X 34063723 1I AACAGAAAAC -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 6 7 3094 CASAVA_Build X 34108927 1D ATACTTGTAA T/- TTTTTTTTTA 2693 het 2693 ref 25 13 7 5 T 10 9 3095 CASAVA_Build X 34109483 2I AATAAAAATG --/AA AAAAAAAAAA 2936 het 2936 ref 33 17 8 8 A 10 12 3096 CASAVA_Build X 34132722 1D CAATGGAGGA T/- TGTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 2 1 3097 CASAVA_Build X 34135802 1D GGCAGATGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1603 hom 30 7 15 8 T 10 9 3098 CASAVA_Build X 34139783 1D GGGAAATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 12 11 3099 CASAVA_Build X 34150669 1I ATGTATAAAC -/T TTTTTGTCGT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 5 6 3100 CASAVA_Build X 34159136 1I GAGTCACAAA -/G GGGTGTCATA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 G 3 4 3101 CASAVA_Build X 34162894 2D ATATATATAT AA/-- AGTTATTTAA 3070 het 3070 ref 39 15 15 11 A 3 1 3102 CASAVA_Build X 34168905 1I AGGCCTGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 15 16 3103 CASAVA_Build X 34206055 1D TAGCCCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 25 15 9 T 11 10 3104 CASAVA_Build X 34261341 1D AAAGTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 12 11 3105 CASAVA_Build X 34293604 1D CAAATTAAGA T/- TGGTTTTACT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 T 2 1 3106 CASAVA_Build X 34298792 1I TTTTGTACAA -/T TTTTTTGTAC 2241 het 2241 ref 26 13 7 6 T 6 7 3107 CASAVA_Build X 34303646 1I AGTGTCCATC -/A AACAGATGAA 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 A 2 3 3108 CASAVA_Build X 34321669 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAAAAAAAA 2897 het 500 hom 12 3 9 1 AAG 1 0 3109 CASAVA_Build X 34325089 3D ATTTATTCAT TTA/--- TTATTTTTAA 1940 het 1940 ref 12 8 4 0 TTA 2 1 3110 CASAVA_Build X 34325610 5I AGTTCTTTCT -----/TATCC TATCTCAGAC 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 TATCC 0 1 3111 CASAVA_Build X 34328909 1I ACAGAACTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 9 10 3112 CASAVA_Build X 34341196 1D ACTGAAGCGA C/- CCCCCCAGCA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 C 7 6 3113 CASAVA_Build X 34344497 1D GGAAGTTTAG A/- GAAAAAACAA 1889 het 1889 ref 17 12 4 1 A 1 0 3114 CASAVA_Build X 34349656 1I GGTCAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 10 11 3115 CASAVA_Build X 34352370 1D TGGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 2336 het 1294 hom 16 5 6 5 T 10 9 3116 CASAVA_Build X 34374667 1D TACCCTTCCC A/- GCCTCTGGTA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 1 0 3117 CASAVA_Build X 34538473 1D TTCCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 480 het 480 ref 35 21 2 12 T 15 14 3118 CASAVA_Build X 34553091 1I TTCTGGTGGG -/T TTTTTTTTTT 2365 het 2365 ref 28 11 6 11 T 10 11 3119 CASAVA_Build X 34569136 1I TTAAAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 2894 het 2894 ref 31 16 10 5 A 13 14 3120 CASAVA_Build X 34843487 4D TCTCTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 947 het 947 ref 40 13 10 17 TC 10 8 3121 CASAVA_Build X 34858595 1I AACAGTATTG -/A AATTAGGACA 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 A 2 3 3122 CASAVA_Build X 34867439 7D ACTTTGGCCA TCGAGTG/------- CTCTTTCAGT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 TCGAGTG 1 0 3123 CASAVA_Build X 34874322 2I CACACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 36 12 10 14 CA 8 9 3124 CASAVA_Build X 34885015 4I GTAATTAAAT ----/AAAC AAATAAAATC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 AAAC 0 1 3125 CASAVA_Build X 34888810 1D TAATTAAATG T/- TTACATATCT 3070 het 3070 ref 53 32 17 4 T 3 2 3126 CASAVA_Build X 34893701 1D TCATCGTAAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 8 7 3127 CASAVA_Build X 34916078 3D9M2I AGTAGTAAGT GAATATTCTTAC--/---TATTCTTACTA CTGCCACTTC 3070 het 3070 hom 58 26 29 13 N/A 0 0 3128 CASAVA_Build X 34925816 1I CAGAACAGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 9 10 3129 CASAVA_Build X 34927541 1D TGCACATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 18 12 T 11 10 3130 CASAVA_Build X 34935443 2D TCCATCTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 2735 het 1225 hom 17 6 6 7 A 16 14 3131 CASAVA_Build X 34938441 1D AAAGGGGAAG A/- AAAAAAAAAC 2665 het 2665 ref 19 9 6 4 A 10 9 3132 CASAVA_Build X 34938905 2D GAAGGGAAGA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 622 hom 16 3 10 3 C 11 9 3133 CASAVA_Build X 34939886 1D AGACCCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 A 12 11 3134 CASAVA_Build X 34942396 1I TTGCTCTTGC -/T TTTCTCACTC 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 3 4 3135 CASAVA_Build X 34956047 1D ATAGAAACTG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 45 19 23 4 A 8 7 3136 CASAVA_Build X 34957058 1I CCTGTGCTGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 8 9 3137 CASAVA_Build X 34967675 1I GAGGGGTTAT -/A AATACTAATT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 2 3 3138 CASAVA_Build X 34990786 2D AAAAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 15 14 6 A 11 9 3139 CASAVA_Build X 34992723 1D CACAGGAGAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 43 21 18 5 A 8 7 3140 CASAVA_Build X 35001639 1D AGTCCAAAGA T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 41 het 31 1 28 2 T 7 6 3141 CASAVA_Build X 35038868 23I TAACAGGCTT -----------------------/CTTGGATTTCTCTCCTGAAAATA CTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 CTTGGATTTCTCTCCTGAAAATA 0 1 3142 CASAVA_Build X 35069036 1D AAAAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 A 11 10 3143 CASAVA_Build X 35069509 3D GTTTTAATTT AAC/--- ACTCCATTGT 3070 het 3070 hom 40 18 19 5 AAC 1 0 3144 CASAVA_Build X 35071458 1D CATTGCTTTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 46 19 24 4 T 8 7 3145 CASAVA_Build X 35084511 1I ACACACATAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 9 het 35 1 31 3 T 9 10 3146 CASAVA_Build X 35086241 1D GAGACAGAGG T/- AATTTGTGAC 2292 het 2292 ref 18 11 5 2 T 1 0 3147 CASAVA_Build X 35090503 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 A 9 10 3148 CASAVA_Build X 35091425 4I TATTATTGAG ----/ATTC ATTATCATCT 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 ATTC 0 1 3149 CASAVA_Build X 35098065 1D CTCTCTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2735 hom 34 9 10 15 T 15 14 3150 CASAVA_Build X 35100787 1I TATAAAAAAC -/A AAAAACAAAC 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 A 5 6 3151 CASAVA_Build X 35102635 1D AGAGAAAACA T/- TTTTCAAAGC 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 T 5 4 3152 CASAVA_Build X 35105840 2I GGAGCCAAAT --/TG TGAGTGTCAG 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 TG 1 2 3153 CASAVA_Build X 35111327 1I GTTGTAGGAG -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 6 7 3154 CASAVA_Build X 35126261 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1253 hom 32 8 14 10 T 15 14 3155 CASAVA_Build X 35130553 1D CTGTGAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 50 1 39 10 T 12 11 3156 CASAVA_Build X 35136330 4I TCTTGCCAGA ----/ACTC ACTCACTATC 3070 hom 114 het 46 0 34 12 ACTC 1 2 3157 CASAVA_Build X 35148280 1D GTAAGCAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 10 9 3158 CASAVA_Build X 35152491 4I TTACTTATGT ----/TAAA TAAATTTACT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TAAA 1 2 3159 CASAVA_Build X 35162830 1D TATGTCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 41 2 34 6 T 13 12 3160 CASAVA_Build X 35166309 1I GTATTTTTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 445 hom 23 1 19 3 A 9 10 3161 CASAVA_Build X 35173632 1D CAATGCTGTA T/- TTTCCTTAAG 3070 hom 88 het 32 0 30 2 T 4 3 3162 CASAVA_Build X 35197409 1I GAAGTTTTCG -/T TTTTTGGCTG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 5 6 3163 CASAVA_Build X 35205066 4I CTTTTTAAAG ----/ATTA ATTATTTGAA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 ATTA 1 2 3164 CASAVA_Build X 35207114 6I TTACGTTCCT ------/AGAAGG AATATCCTAA 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 AGAAGG 0 1 3165 CASAVA_Build X 35212627 2D TTACATATAT TA/-- TATATATATA 1779 het 1012 hom 14 3 5 6 TA 10 9 3166 CASAVA_Build X 35219727 2D ATGAGAAATG AA/-- AAGTCACTAG 3070 het 3070 ref 45 25 18 3 A 4 2 3167 CASAVA_Build X 35221572 1I ACTTTGTGAC -/A GGGGCTGATG 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 A 0 1 3168 CASAVA_Build X 35224992 1I TTAGGCTTAA -/G TTTCATTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 G 0 1 3169 CASAVA_Build X 35226568 2I GCATACAGTT --/GC AAATAGCATT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 GC 0 1 3170 CASAVA_Build X 35231857 1I CAGAATTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 9 10 3171 CASAVA_Build X 35236183 1D GTTAAAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 11 10 3172 CASAVA_Build X 35259570 2D TGTGTCTGTG CT/-- TTCTCATTGT 3070 het 3070 ref 34 21 10 5 CT 1 0 3173 CASAVA_Build X 35262660 2I AAAAATACAC --/AT GTTTAAGATA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 AT 0 1 3174 CASAVA_Build X 35267969 3D TTGTTTCTTC TTT/--- AAGACAGACC 3070 het 3070 ref 49 22 23 5 T 3 0 3175 CASAVA_Build X 35276212 3D CTTATTCCCC TCT/--- TCTTTAATCT 2944 het 2944 ref 24 14 7 3 TCT 2 1 3176 CASAVA_Build X 35278342 3D CCTATATGAT ATC/--- ATACCTTCTC 3070 het 3070 ref 52 28 22 3 ATC 1 0 3177 CASAVA_Build X 35297748 2D ATATATGTTT AA/-- ATTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 3 1 3178 CASAVA_Build X 35309943 6D TCTGGGTGGT CCACTG/------ GACAGGTGAT 2720 het 2720 ref 19 10 6 4 CCACTG 1 0 3179 CASAVA_Build X 35311084 1I CTGCAGAACC -/G GTGCTGAAGA 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 G 1 2 3180 CASAVA_Build X 35312642 2D TTTCTGGAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 26 1 10 15 T 16 14 3181 CASAVA_Build X 35313760 1D ATTCAATGTA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 8 7 3182 CASAVA_Build X 35319527 1I AAATCAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 T 10 11 3183 CASAVA_Build X 35322850 1D ATTAGGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 8 A 11 10 3184 CASAVA_Build X 35329380 1D ATATGAAACC A/- AAAAAAAAAA 1382 het 1382 ref 28 16 3 9 A 11 10 3185 CASAVA_Build X 35338119 1D TAATTTCATC T/- TTTTTTTTTT 1613 het 1613 ref 26 14 5 7 T 15 14 3186 CASAVA_Build X 35339584 5I CCAATGGAAC -----/AGAAT AAACAGAATA 3045 het 3045 ref 21 11 7 3 AGAAT 0 1 3187 CASAVA_Build X 35342218 1D CTTGGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 9 19 8 T 11 10 3188 CASAVA_Build X 35344809 3D GGAGGACCTG GAA/--- GAAGGAGAGG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 GAA 2 1 3189 CASAVA_Build X 35346339 1D AAATAGCTAT A/- ACTAAGAGCT 3070 het 3070 ref 20 10 8 4 A 2 1 3190 CASAVA_Build X 35348374 1D TTTAAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 505 hom 18 2 12 4 T 13 12 3191 CASAVA_Build X 35350742 4I ATTAACAGTC ----/TATA TATATATATA 3070 het 221 hom 22 1 12 9 TA 7 9 3192 CASAVA_Build X 35351814 1D CACTAGATTA T/- TTACTTTGGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 3 2 3193 CASAVA_Build X 35365698 1D ACATCATCTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 9 8 3194 CASAVA_Build X 35374303 5D TCTGTACTTG AATTA/----- TTTTCCAACA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 AATTA 1 0 3195 CASAVA_Build X 35375243 1D GTTTTAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 22 hom 24 1 18 5 A 10 9 3196 CASAVA_Build X 35390811 1D GCAGAAAGTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 28 0 25 4 A 9 8 3197 CASAVA_Build X 35394175 1I AATATTCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 10 11 3198 CASAVA_Build X 35421932 1D TTTGTTATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 9 8 3199 CASAVA_Build X 35423829 1D TAAAAGTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 10 9 3200 CASAVA_Build X 35432452 3I ATTAAATTAT ---/AAC AAATTATTTA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAC 0 1 3201 CASAVA_Build X 35437496 3D TATTTCCTAG TAA/--- TAATAAGATA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAA 3 2 3202 CASAVA_Build X 35441533 1I CAAAACTTCC -/A AAAAAAATGG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 7 8 3203 CASAVA_Build X 35445597 1D TAACATTACT A/- TTTGTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 1 0 3204 CASAVA_Build X 35456148 1I GCCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 348 hom 21 2 17 2 A 14 15 3205 CASAVA_Build X 35464042 4D ATTTACAAAA TAAG/---- TAATACTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 TAAG 1 0 3206 CASAVA_Build X 35468926 1I TAAAGATTAG -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 6 7 3207 CASAVA_Build X 35482751 1I ACAATCAAAT -/G GAAAAACATT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 G 1 2 3208 CASAVA_Build X 35484432 1I CTTAGATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 33 1 28 4 A 10 11 3209 CASAVA_Build X 35487017 3I TGTAGAATAT ---/TAA TAATATGCTC 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 TAA 1 2 3210 CASAVA_Build X 35495761 1I TTAGAGCTAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 8 9 3211 CASAVA_Build X 35497567 1D CCACTGTCTT G/- GTGTTCTGGC 3070 het 3070 ref 40 20 15 6 G 2 1 3212 CASAVA_Build X 35500513 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCAATAC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 6 5 3213 CASAVA_Build X 35503901 3D GATACATTTG ATT/--- ATTATCAATT 3070 het 3070 hom 30 15 15 1 ATT 2 1 3214 CASAVA_Build X 35511022 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 14 14 A 12 11 3215 CASAVA_Build X 35519039 1D GTCCCCCCCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2766 hom 24 8 11 5 A 10 9 3216 CASAVA_Build X 35536510 1D ATACAACTTG T/- TTTTTTTTTA 1110 het 1110 ref 35 26 3 6 T 10 9 3217 CASAVA_Build X 35644889 4D ATGCACTATA TAAT/---- TAAGTGTTAT 3070 het 3070 ref 35 24 10 1 TAAT 1 0 3218 CASAVA_Build X 35649585 1I CCTTTGGGCC -/T TTTTTTTTTG 1222 het 1222 ref 68 56 3 9 T 9 10 3219 CASAVA_Build X 35659458 1D AGTGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 2241 het 2166 hom 23 9 7 7 T 13 12 3220 CASAVA_Build X 35707179 1I TTCCTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1232 het 1232 ref 39 25 3 11 A 11 12 3221 CASAVA_Build X 35734921 4D CCTACCCCTT TCTG/---- TATGGTATAA 3070 het 3070 ref 36 16 17 5 TCTG 1 0 3222 CASAVA_Build X 35739206 1I AAGCTAAGTG -/T TTTTTCGGGA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 5 6 3223 CASAVA_Build X 35741230 1I TGTTTATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 10 11 3224 CASAVA_Build X 35749398 1I CACGTATTTG -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 5 6 3225 CASAVA_Build X 35751144 1D CAAAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 852 het 410 hom 23 7 4 12 T 19 18 3226 CASAVA_Build X 35769911 2I AAAATAAAAC --/AT GTGTTAGATA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 AT 0 1 3227 CASAVA_Build X 35785223 2D TCATTTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2680 het 414 hom 21 3 10 8 T 18 16 3228 CASAVA_Build X 35785639 8D GAACATAAAC ACTTCTAA/-------- ACTAAGTGTT 3070 het 3070 ref 38 22 17 1 ACTTCTAA 1 0 3229 CASAVA_Build X 35787465 1D GGTCAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1898 hom 24 5 11 8 T 13 12 3230 CASAVA_Build X 35794312 1D AGAATATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 T 11 10 3231 CASAVA_Build X 35795930 3D ATGTTAGCAA TTC/--- TTCTAACACA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 TTC 2 1 3232 CASAVA_Build X 35800463 1D TTTCATCACT G/- GGTATAATTT 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 G 3 2 3233 CASAVA_Build X 35813750 20D TATGTGTGTG TATATATATATATATATATA/-------------------- TATATATATA 3070 het 450 hom 15 3 13 1 TA 20 10 3234 CASAVA_Build X 35815911 7D TAGCCAAATT CCTCATC/------- CTTTCCAACT 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 CCTCATC 1 0 3235 CASAVA_Build X 35816349 1D AGTCCAAACA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 8 7 3236 CASAVA_Build X 35851870 2D AAAAAAAGTG TA/-- TATATATATA 3037 het 1843 hom 17 5 10 2 TA 7 6 3237 CASAVA_Build X 35856036 2D TATTCTATTT TA/-- TATATATATA 1279 het 867 hom 11 4 3 4 TA 8 7 3238 CASAVA_Build X 35857026 1D GTGTTCTGCA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 8 7 3239 CASAVA_Build X 35865808 2I TAAAAAAAAC --/TG TGTTGGAGTG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TG 1 2 3240 CASAVA_Build X 35873910 1D TCTCCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 906 het 683 hom 23 10 3 11 T 19 18 3241 CASAVA_Build X 35983077 12D CCCAAAGTGC TGGGATTACAGG/------------ TGGGATTACA 2046 hom 21 het 6 0 7 1 TGGGATTACAGG 2 1 3242 CASAVA_Build X 36024214 1I CCTCTTGTTA -/T TTCTTGTTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 2 3 3243 CASAVA_Build X 36036829 1D TGCTGCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2832 het 660 hom 31 5 12 15 T 15 14 3244 CASAVA_Build X 36056981 1I TACCATTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 T 8 9 3245 CASAVA_Build X 36062510 1I GAATATATCT -/A ACACAAATAT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 A 1 2 3246 CASAVA_Build X 36064235 3I ACAGGATAAC ---/AGT AGTTAGTTGT 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 AGT 1 2 3247 CASAVA_Build X 36069098 1I TGTCCTTAAA -/T TTTTTTTTTT 2556 het 375 hom 21 3 10 8 T 17 18 3248 CASAVA_Build X 36072606 2I TAGGTGTGTC --/TG TGAGGGTGTT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 TG 1 2 3249 CASAVA_Build X 36073917 1I AAAATTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 11 12 3250 CASAVA_Build X 36091542 1I TATTATGAGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 8 9 3251 CASAVA_Build X 36108295 4D TTTTAAAAAA ATTG/---- ATTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 14 8 8 ATTG 2 1 3252 CASAVA_Build X 36189161 1D GTATAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1754 het 1754 ref 44 17 8 19 T 17 16 3253 CASAVA_Build X 36260338 1D TAAAATTATC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 8 3254 CASAVA_Build X 36401308 4I GGCATATGTC ----/ACAG ACATAGTTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ACAG 0 1 3255 CASAVA_Build X 36425810 1I TCTCAACAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 A 8 9 3256 CASAVA_Build X 36446502 2D TGCATGCACG CA/-- CACACACACA 1283 het 1283 ref 68 53 3 13 CA 9 8 3257 CASAVA_Build X 36492086 2I GACTGTGGAT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 CA 7 8 3258 CASAVA_Build X 36557351 2D TTAGCGTGGA AT/-- ATATATATAT 1751 het 1751 ref 35 21 4 10 AT 9 8 3259 CASAVA_Build X 36748472 1I ATGGATGTGC -/A AAAAGCAGTG 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 A 4 5 3260 CASAVA_Build X 36770105 1D ATTTAAATTA T/- TTTTTCAGAT 2879 het 2879 ref 27 17 9 1 T 6 5 3261 CASAVA_Build X 36802220 1I ATTAAAAAAA -/T TTTTTAAAAA 2949 het 2949 ref 34 22 12 0 T 5 6 3262 CASAVA_Build X 36808354 2D ATATTTATTA AC/-- AGTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 38 25 13 0 AC 1 0 3263 CASAVA_Build X 36813707 2D CGTGTGTGTC TA/-- TATATATATA 3070 het 2228 hom 23 8 12 4 TA 9 8 3264 CASAVA_Build X 36840559 1I AATAATAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 8 9 3265 CASAVA_Build X 36867308 1D AAAAAGCTCT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 9 8 3266 CASAVA_Build X 36875907 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 2244 het 1851 hom 18 5 7 6 T 11 12 3267 CASAVA_Build X 36885064 1I ATCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 A 13 14 3268 CASAVA_Build X 36889539 4D AACCAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 2336 het 2336 ref 25 12 8 7 AAAC 4 3 3269 CASAVA_Build X 36900174 1D AATGTACATA C/- CCCCCCCACC 3070 het 582 hom 41 2 32 9 C 8 7 3270 CASAVA_Build X 36900421 1D CAGGTTCAAC T/- TTTGGGAAAT 2418 het 2418 ref 46 34 6 6 T 4 3 3271 CASAVA_Build X 36932328 1I CTCCACTTTG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 6 7 3272 CASAVA_Build X 36980988 1I TATTTGATAC -/A TTTTTTTTCT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 0 1 3273 CASAVA_Build X 37053532 1D CAAGCAGGCC T/- TTTTTTTTTT 1477 het 1477 ref 19 10 6 3 T 15 14 3274 CASAVA_Build X 37153036 3I GCACTGAGAC ---/AAG GAAACCCGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAG 0 1 3275 CASAVA_Build X 37154116 3D GATATTAGAT GAA/--- GAAGTTATTT 3070 het 3070 ref 39 25 12 3 GAA 2 1 3276 CASAVA_Build X 37185325 2I TACCAGAAAC --/AG AAGAAAATGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 0 1 3277 CASAVA_Build X 37214890 1D ATAGATATCC T/- TTTTTTTTTT 1970 het 1970 ref 41 24 5 12 T 15 14 3278 CASAVA_Build X 37325305 2D GAGCACAACA CT/-- CTGAATTACA 3070 het 3070 hom 39 11 22 7 CT 2 1 3279 CASAVA_Build X 37335905 1D AGCTGGTGGT G/- GGGGGGGTAT 3070 het 1326 hom 30 6 19 6 G 8 7 3280 CASAVA_Build X 37379921 2I ACTATATTTA --/AT ATATATATAT 3070 hom 54 het 31 0 19 12 AT 6 7 3281 CASAVA_Build X 37571639 1I CATGTATTGT -/G GTAATTTAAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 G 1 2 3282 CASAVA_Build X 37584309 4I TAAGTACAAC ----/TAAG TGAGGGGAAG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 TAAG 0 1 3283 CASAVA_Build X 37639021 1D CCTGTTTGAG C/- CTGAGACATG 3070 hom 141 het 58 0 48 11 C 2 1 3284 CASAVA_Build X 37685727 4D ACTATTACTC TCTG/---- TCTGAGGGCT 3070 hom 117 het 44 0 39 7 TCTG 2 1 3285 CASAVA_Build X 37686103 1D ACTTGTAGGG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 8 3286 CASAVA_Build X 37704554 2D CTTCAAATCA TC/-- TCTTTCCTCT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 TC 2 1 3287 CASAVA_Build X 37715323 1D TCTTTACATA T/- TTTTAGTATT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 5 4 3288 CASAVA_Build X 37717353 1D GGGTTAAATA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 37 20 11 7 T 7 6 3289 CASAVA_Build X 37724969 1I TCTGGACAAG -/A GTGACCAAGA 3070 het 3070 ref 43 20 21 2 A 0 1 3290 CASAVA_Build X 37752885 1D CCTACTGCCT C/- ACTTTCTCTT 3070 hom 129 het 50 0 44 7 C 1 0 3291 CASAVA_Build X 37768112 4D GTTGGTGTAA AAGT/---- AATTGCAGTT 3070 hom 96 het 34 0 33 3 AAGT 1 0 3292 CASAVA_Build X 37768248 1I AGTTCTGTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 9 10 3293 CASAVA_Build X 37828915 1I CAGAGATCAA -/C AAACCTTTTC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 0 1 3294 CASAVA_Build X 37908337 1D GGTACATGAG A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 31 1 24 7 A 1 0 3295 CASAVA_Build X 37913693 1I TGTAGAAAAC -/A AAAAAATAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 3296 CASAVA_Build X 37921746 1D TTGTTAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1413 hom 45 4 25 16 T 15 14 3297 CASAVA_Build X 37927253 1I TCTTGATAGA -/T TTTTTTTTTT 2925 het 547 hom 32 3 13 16 T 16 17 3298 CASAVA_Build X 37939580 1D GTGTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1050 hom 27 8 14 6 T 19 18 3299 CASAVA_Build X 37957322 1I AAATGATAAA -/T TACTGTGTAA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 1 2 3300 CASAVA_Build X 37963258 1D CAGGAAAGCC A/- GGGATAGGTC 2993 het 2993 ref 29 16 9 4 A 1 0 3301 CASAVA_Build X 37963795 4D CTATTCATTC ATTT/---- ATTTAGGTGC 3070 het 3070 hom 35 17 17 3 ATTT 2 1 3302 CASAVA_Build X 37966013 4D CTCTCATAGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 15 21 8 TTTG 4 3 3303 CASAVA_Build X 38052711 3I TTAAAGACAC ---/TAT TATTATACAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TAT 2 3 3304 CASAVA_Build X 38054722 1I TTACCACAAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 7 8 3305 CASAVA_Build X 38096375 4D TCCAGGGCAC TTCT/---- TTCTATTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 17 6 TTCT 2 1 3306 CASAVA_Build X 38097595 6D GGGGAAGGGA AAGGGG/------ AAGGGGAAGG 3070 het 3070 ref 36 17 17 11 AAGGGG 2 1 3307 CASAVA_Build X 38098630 6D CAAAGCCTGG AACTTA/------ AACTTATACT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 AACTTA 2 1 3308 CASAVA_Build X 38100422 2I CTGATTTTTG --/AC AGTTTCAGGT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 AC 0 1 3309 CASAVA_Build X 38105924 1I CAAGGAAATA -/C AAGCACTATA 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 C 0 1 3310 CASAVA_Build X 38110321 1D TGGCTCTTAA C/- TCCTCACCTT 3070 het 3070 ref 45 19 21 5 C 1 0 3311 CASAVA_Build X 38113712 1D TCCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1348 het 614 hom 16 4 5 8 T 17 16 3312 CASAVA_Build X 38123834 1D ATTTTTAATA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3045 hom 23 9 11 3 T 9 8 3313 CASAVA_Build X 38125500 1I ACTTTAGTTG -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 T 6 7 3314 CASAVA_Build X 38126066 4I TATAACAACC ----/CAAA CAGATTGTCA 3070 het 3070 ref 32 23 7 2 CAAA 0 1 3315 CASAVA_Build X 38129873 1I ATTTTTTTTT -/A AAAAAAGCAC 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 6 7 3316 CASAVA_Build X 38132693 1D CCAGAAGTGA C/- CACCTTCGCG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 C 2 1 3317 CASAVA_Build X 38133600 1I GAATATTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 10 11 3318 CASAVA_Build X 38134032 6D CAAAATGGAG ATACTT/------ ATACTTATCT 3070 het 3070 ref 59 28 24 9 ATACTT 2 1 3319 CASAVA_Build X 38139092 1I GTAGTTTCTG -/A GGGGGGGGCA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 0 1 3320 CASAVA_Build X 38141291 6I AATATCTATC ------/TATAGT TATAGTTATA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 TATAGT 1 2 3321 CASAVA_Build X 38188747 1I TCTTTGTGTT -/G GGAACATTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 2 3 3322 CASAVA_Build X 38209532 1D AGGGAATCGC G/- GGGGGGGGGA 2484 het 2259 hom 35 14 10 12 G 10 9 3323 CASAVA_Build X 38260048 19D ATAAAATACC TAAGATATTTTATTAACTG/------------------- TATGTGTATG 3070 het 3070 ref 33 19 16 4 TAAGATATTTTATTAACTG 1 0 3324 CASAVA_Build X 38359190 1D AGATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 T 11 10 3325 CASAVA_Build X 38359752 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 19 4 T 6 5 3326 CASAVA_Build X 38365926 4I TATTACATTC ----/ATTT GTGATCTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 ATTT 0 1 3327 CASAVA_Build X 38370418 1D AAATTTTATG T/- TTCTGGCTAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 3 2 3328 CASAVA_Build X 38383071 1D TATTCAAGGC T/- TTTCTCTGGA 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 T 4 3 3329 CASAVA_Build X 38391109 1D CCCTCACTGA G/- GTCAGAGCTT 3070 het 3070 ref 38 17 11 11 G 2 1 3330 CASAVA_Build X 38391945 1D GTTTGATTAT G/- GAAGAGTCCA 3070 het 3070 hom 53 21 25 7 G 2 1 3331 CASAVA_Build X 38398918 9D GGATACACCC ATGAATAGG/--------- ATGAATAGGA 3070 het 3070 ref 42 22 17 8 ATGAATAGG 2 1 3332 CASAVA_Build X 38399688 1I AGTTTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 10 11 3333 CASAVA_Build X 38402313 2I GTACAAAAAT --/AA AAAGAGTACC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 3 5 3334 CASAVA_Build X 38403267 2I ACATGTACAC --/AA GAGACAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 A 0 2 3335 CASAVA_Build X 38406032 1I GAGATGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 10 11 3336 CASAVA_Build X 38407979 1D GTAAGATTTG T/- TTCTGGTAGT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 T 3 2 3337 CASAVA_Build X 38469243 1D AGTAACAGTG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 89 het 33 0 26 7 T 9 8 3338 CASAVA_Build X 38477490 41D ATTGGCATCA GATTTTCCTCATTATTCTGCCATAGAGTCAGCATTGAAATT/----------------------------------------- GATGGGAAAC 3070 het 3070 ref 34 30 13 7 GATTTTCCTCATTATTCTGCCATAGAGTCAGCATTGAAATT 1 0 3339 CASAVA_Build X 38504097 1I GGTGAACTAA -/G GGGTCTCTGG 3070 hom 164 het 59 0 54 5 G 3 4 3340 CASAVA_Build X 38526140 4D CTGTCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 2860 het 2860 ref 21 10 8 4 AAAT 5 4 3341 CASAVA_Build X 38556144 1D TGTGGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 1066 het 1066 ref 44 34 4 6 T 11 10 3342 CASAVA_Build X 38560192 1I GTTGTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 11 12 3343 CASAVA_Build X 38566655 4D AATAAAACTA AAAT/---- AAATAAATAA 1253 het 1045 hom 7 3 4 0 AAAT 4 3 3344 CASAVA_Build X 38574120 1I TCAAAACCAC -/A ATGAGATATT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 1 2 3345 CASAVA_Build X 38590423 1D GTGCTGCAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 A 10 9 3346 CASAVA_Build X 38590717 1I GTGGACTGTG -/C CCAGTTGTGC 3070 het 3070 hom 60 22 27 11 C 2 3 3347 CASAVA_Build X 38598380 1D AAAGATTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 11 10 3348 CASAVA_Build X 38658394 1D CTAGTGCATT C/- CCAAAGTTTA 3070 hom 132 het 53 0 42 12 C 3 2 3349 CASAVA_Build X 38689351 1D TTCTTTATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1306 hom 15 5 8 2 T 10 9 3350 CASAVA_Build X 38691183 1D CATTGTTGTT A/- AAAAAAAAAA 1338 het 1338 ref 46 31 3 12 A 13 12 3351 CASAVA_Build X 38691893 1D CATATAAAAC T/- TCTTCAGAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 T 2 1 3352 CASAVA_Build X 38698044 1I AGGAACACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 A 9 10 3353 CASAVA_Build X 38718994 1D GTTCAAGCCT G/- GGGGTCTGAG 3070 hom 138 het 54 0 45 10 G 5 4 3354 CASAVA_Build X 38731151 4D CCTGATCAGC CTAA/---- CTGTCTAGTG 3070 het 3070 hom 53 23 25 8 CTAA 1 0 3355 CASAVA_Build X 38733117 1I TAACCGGGTG -/A TGGTGGCGGG 2392 het 505 hom 10 2 6 2 A 0 1 3356 CASAVA_Build X 38740902 17D AAATGCCAGC AAGTTCTGTTCTTGGTG/----------------- AGGGCCCTCT 3070 het 3070 ref 35 25 15 2 AAGTTCTGTTCTTGGTG 1 0 3357 CASAVA_Build X 38741698 1I AATGTGACAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 456 hom 22 1 16 5 A 8 9 3358 CASAVA_Build X 38742859 1I TGAAAAAAGT -/A ATGAGTAGAC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 A 1 2 3359 CASAVA_Build X 38743258 1D AATAATAGTC A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 A 7 6 3360 CASAVA_Build X 38746757 1I TCCCAAGTCA -/G GGTCACTAAG 3070 hom 101 het 41 0 34 7 G 2 3 3361 CASAVA_Build X 38747965 1I GGTTGTGACT -/G GGAGGGGAAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 G 2 3 3362 CASAVA_Build X 38753069 1I GGATGAAGCC -/A ACCTTTTCCC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 A 1 2 3363 CASAVA_Build X 38754459 1D CTTTTTTTTT G/- GGTAGTGGCT 3070 het 2870 hom 27 8 14 5 G 3 2 3364 CASAVA_Build X 38769196 1I ATTTTGGTTT -/G TTTTTTTGTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 3365 CASAVA_Build X 38782554 1I TTAATAAATG -/T TTTTTTAAGG 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 6 7 3366 CASAVA_Build X 38785138 1D TCCGAGTTCT G/- TGGCTCCTCC 3070 het 3021 hom 30 9 15 7 G 1 0 3367 CASAVA_Build X 38795751 1I GAGATAATAC -/A CATGTAAGTG 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 A 0 1 3368 CASAVA_Build X 38874316 1I TTGTGGCTGG -/C TTCTTTCTTT 2933 hom 18 het 9 0 7 2 C 0 1 3369 CASAVA_Build X 38931426 3D CATTGTTTAG TTC/--- TTCTACATGC 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 TTC 2 1 3370 CASAVA_Build X 38943602 1I TTTGGAGTGA -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 6 7 3371 CASAVA_Build X 38953474 4D AATATATGTG TTTC/---- TTTATGAATG 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 TTTC 1 0 3372 CASAVA_Build X 38980045 1I AGTTAAAAAA -/T AAATATATGC 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 T 0 1 3373 CASAVA_Build X 38986432 1D CTGTTTGGGA C/- CCCATGCTTG 3070 hom 158 het 58 0 52 6 C 4 3 3374 CASAVA_Build X 38987733 2D TTCAGGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 30 0 19 11 T 15 13 3375 CASAVA_Build X 39007088 1D CCACATTTCT G/- GGGTTGTGCT 3070 hom 168 het 59 0 55 5 G 4 3 3376 CASAVA_Build X 39069664 1D TACTAAATAG A/- AAAAAATGAC 3070 het 2304 hom 13 5 8 0 A 7 6 3377 CASAVA_Build X 39089861 1D GCACCCCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 15 10 A 12 11 3378 CASAVA_Build X 39096645 1D AATTTTGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 10 9 3379 CASAVA_Build X 39096979 1I TGTACATTAA -/T TTTTGTATCC 3070 het 2989 hom 18 7 7 4 T 4 5 3380 CASAVA_Build X 39100514 1D GTGGCAAGGC A/- AGCTGTGAGC 3070 hom 48 het 27 0 15 13 A 2 1 3381 CASAVA_Build X 39100559 1D GCCAGACACA G/- GGCCCAGAGC 3070 hom 42 het 25 0 11 14 G 3 2 3382 CASAVA_Build X 39100895 2D AGAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 AG 10 9 3383 CASAVA_Build X 39101602 1I TGGCAGGTAC -/A GGGGCAAAGC 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 A 0 1 3384 CASAVA_Build X 39103599 1D TTATTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 1573 het 1573 ref 36 22 5 9 T 12 11 3385 CASAVA_Build X 39104752 1I GCACTTGCTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 8 9 3386 CASAVA_Build X 39108060 1I TCTATGTAAC -/A AGCCTTCACA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 1 2 3387 CASAVA_Build X 39124418 2D TAAAAAATTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 AC 10 9 3388 CASAVA_Build X 39127131 2I GAGAGGAGAC --/AG AGGGTGCTGA 3070 het 3070 ref 54 35 15 4 AG 1 2 3389 CASAVA_Build X 39135576 2D TATCTCATTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 26 22 6 A 11 9 3390 CASAVA_Build X 39144720 1D CATAAAAAAC T/- TCCTATATTG 3070 het 3070 ref 56 38 13 5 T 2 1 3391 CASAVA_Build X 39152379 1I CCATGCACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2604 hom 25 8 10 7 A 13 14 3392 CASAVA_Build X 39174736 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 1172 hom 22 4 13 6 AAAG 5 4 3393 CASAVA_Build X 39203525 2I GCAAACTGAC --/TT TTCACAGCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 2 4 3394 CASAVA_Build X 39205128 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTGCTTCTGC 3070 het 3070 ref 35 16 14 7 T 4 2 3395 CASAVA_Build X 39227831 2D TGGGATTTGG GA/-- GAGTCAGATC 3070 het 3070 ref 69 31 29 10 GA 2 1 3396 CASAVA_Build X 39243139 1I GGCAACATGG -/T AAAACCCCAT 3070 het 2623 hom 27 8 12 7 T 0 1 3397 CASAVA_Build X 39244271 2D GAGGTGGGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 18 15 16 A 14 12 3398 CASAVA_Build X 39246128 1I TTTAGCTTGA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 91 het 38 0 30 8 T 6 7 3399 CASAVA_Build X 39246836 1D ATATGTTATA T/- TATTATTTTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 1 3400 CASAVA_Build X 39251173 2I AAGACAGACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 36 1 22 13 A 14 16 3401 CASAVA_Build X 39277825 24I CATCCATCTC ------------------------/TGCATTCATCCATTTATCCACCCA TGCATCCATC 3070 hom 93 het 38 0 30 8 TGCATTCATCCATTTATCCACCCA 0 1 3402 CASAVA_Build X 39277836 4I GCATCCATCC ----/ATTT ATCCACCTAT 3070 het 1105 hom 46 9 16 21 ATTT 0 1 3403 CASAVA_Build X 39343387 1D GCCTCAGCCT C/- CCTGAGTAGC 3070 hom 78 het 28 0 26 3 C 3 2 3404 CASAVA_Build X 39364473 4I GCAATTTACA ----/AAAG AAAGAGGTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 AAAG 1 2 3405 CASAVA_Build X 39367633 1I TTGCCCCCCT -/C CCCCCCCCAA 1970 het 1970 ref 34 17 10 7 C 8 9 3406 CASAVA_Build X 39370315 1I TTAATTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 23 1 13 9 T 11 12 3407 CASAVA_Build X 39377035 1I CAGGAAAGAG -/A AAGAGAGGTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 2 3 3408 CASAVA_Build X 39403009 1D TAGTTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 11 10 3409 CASAVA_Build X 39437897 5D CCTTTTCTTC TTATT/----- TTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 TTATT 2 1 3410 CASAVA_Build X 39476874 2D AACAAAAGAC TC/-- TCACAACATT 3070 het 582 hom 23 2 17 4 TC 2 1 3411 CASAVA_Build X 39479529 1D TCAAGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 31 1 22 9 A 11 10 3412 CASAVA_Build X 39490083 1D AATGTTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 36 0 25 12 A 13 12 3413 CASAVA_Build X 39490141 1D CATTAGCAAT A/- GTTGGGAAAC 3070 het 888 hom 26 4 10 12 A 1 0 3414 CASAVA_Build X 39502856 1D TCCCACAGAC A/- ATCCGTAAGC 3070 hom 93 het 39 0 30 10 A 2 1 3415 CASAVA_Build X 39514094 20D AGAAATCACT AGTGCATAATGCATGCATAA/-------------------- AGTGCATAAT 3070 hom 87 het 34 0 28 13 AGTGCATAATGCATGCATAA 1 0 3416 CASAVA_Build X 39518276 1I TTTTGCTTCG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 8 9 3417 CASAVA_Build X 39525682 1D TTCCCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 15 10 T 11 10 3418 CASAVA_Build X 39528768 2I GATACATTGT --/CA CACAAAAAAA 2328 het 2273 hom 33 12 9 12 CA 2 3 3419 CASAVA_Build X 39530694 1I ATCATTCCCA -/T TTTTTTTTTA 3035 het 3035 ref 24 11 10 3 T 9 10 3420 CASAVA_Build X 39533032 3D TTGAAAGGGT ACC/--- ACCTCTCACA 3070 het 3070 hom 36 14 19 6 ACC 2 1 3421 CASAVA_Build X 39533812 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 13 14 3422 CASAVA_Build X 39539752 1D TTTTTTAACT A/- AAAAAAAAAA 1269 het 1269 ref 28 22 4 4 A 12 11 3423 CASAVA_Build X 39543850 1D CACCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 7 A 11 10 3424 CASAVA_Build X 39544444 1D CATAAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 14 13 3425 CASAVA_Build X 39544543 1D TAGCAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 58 1 46 12 A 13 12 3426 CASAVA_Build X 39555384 1I AGACTAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 11 12 3427 CASAVA_Build X 39557508 1I TCCTATCAGC -/T TAAGGACAAT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 1 2 3428 CASAVA_Build X 39560454 1D GAAAGTGGAT G/- GGGTGAGGGG 3070 hom 60 het 24 0 19 5 G 4 3 3429 CASAVA_Build X 39588562 3D CTGTCTCAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 2989 hom 29 10 13 6 AAC 7 6 3430 CASAVA_Build X 39588889 7I CAGGGTTGGG -------/GGATAGA GGAGAGAGGA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 GGATAGA 0 1 3431 CASAVA_Build X 39606823 1D GAAGGTTTTT A/- AATCTCCCAG 3070 het 3070 ref 34 13 15 7 A 3 2 3432 CASAVA_Build X 39610150 1I TCCCCCACCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 A 9 10 3433 CASAVA_Build X 39621956 1D GTTAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 1114 het 1114 ref 33 23 3 7 A 12 11 3434 CASAVA_Build X 39634398 1I CATGTCTGTA -/G TCCCAGCTAC 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 G 0 1 3435 CASAVA_Build X 39672275 5D ACTGATGACC ACTGA/----- ACTGAACTTT 3070 het 3070 hom 42 14 22 7 ACTGA 2 1 3436 CASAVA_Build X 39708124 1I51M2I GCAAAGGCTT -AAATGTGCTGGTGCAGCTGGGCTTGGCCTCTGATGTTTCTGTCATCAGCAT--/GAAATGTGCTGGTGCAGCTGGGCTTGGCCTCTGATGTTTCTGTCATCAGCATGA AAAGAAAGTG 3070 hom 38 het 42 1 37 14 N/A 0 0 3437 CASAVA_Build X 39743968 1D ACACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 13 12 3438 CASAVA_Build X 39744105 1I AATGAGTTAA -/G AGCTGAACTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 3439 CASAVA_Build X 39745276 1I AGACCCAGAT -/C TGGGTAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 3440 CASAVA_Build X 39786519 2D GAGAACCCCC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 32 13 11 10 CA 6 5 3441 CASAVA_Build X 39787097 1D AGTGAGACTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 11 16 7 A 9 8 3442 CASAVA_Build X 39796006 2I CTTTTACTCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 T 9 11 3443 CASAVA_Build X 39867558 1I TTAAGCACAC -/T TTTTTTTTTT 2092 het 2092 ref 32 13 6 13 T 11 12 3444 CASAVA_Build X 39873921 1D CTTGGGAGCA G/- GAGTGGTGGC 2994 het 1994 hom 20 5 8 8 G 2 1 3445 CASAVA_Build X 39874847 1I GAAGGAAAAG -/A AAGAGGACCA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 2 3 3446 CASAVA_Build X 39887680 2I TACAAGAAAC --/AT ATAATTAACA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 AT 1 2 3447 CASAVA_Build X 39888312 9D CTGCAGGAGA CTGCAGTAT/--------- CAGGTGGCAG 3070 hom 108 het 37 0 37 3 CTGCAGTAT 1 0 3448 CASAVA_Build X 39957845 2I ATAATCTCCA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 31 8 15 8 TC 5 6 3449 CASAVA_Build X 39993985 1I TTACTCGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1513 hom 31 5 17 9 T 15 16 3450 CASAVA_Build X 40001368 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1067 het 1067 ref 25 9 5 11 T 13 14 3451 CASAVA_Build X 40061774 3I CCCGCCTCAG ---/CCT CCTCCTAAGT 2972 het 2972 ref 27 16 9 3 CCT 2 3 3452 CASAVA_Build X 40063704 1D ACTGTGTGTT A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 43 14 18 11 A 8 7 3453 CASAVA_Build X 40087343 1D ACAAAAGTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2961 hom 21 7 10 5 T 9 8 3454 CASAVA_Build X 40089328 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAATTAGG 3070 het 1690 hom 20 5 12 5 A 6 5 3455 CASAVA_Build X 40094152 4I CTGCTAATCT ----/CTGA CTGTATTGGA 3070 het 3070 hom 53 25 24 4 CTGA 0 1 3456 CASAVA_Build X 40114794 1I CCCCTGTGCT -/G CTCTCAGCAG 3070 hom 54 het 22 0 17 5 G 0 1 3457 CASAVA_Build X 40117185 4D TGTGCGTATC TGTG/---- TATGTGTCGA 3070 het 3070 ref 79 41 33 9 TG 2 0 3458 CASAVA_Build X 40119119 1D21M1I TAAACAACAG AAAATTCATTTCTCACAGTTCT-/-AAATTCATTTCTCACAGTTCTG GAAGCTGGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 8 N/A 0 0 3459 CASAVA_Build X 40156040 1I GCCTGAGGGC -/T TTTTTTTCTG 1531 het 1531 ref 19 12 4 3 T 7 8 3460 CASAVA_Build X 40175385 1I CAATGTAGTA -/G AAAAGAAAAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 0 1 3461 CASAVA_Build X 40193154 1I TCAACCCACA -/G GGTTGTTGAA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 G 2 3 3462 CASAVA_Build X 40196674 4D TCCTTCCATC TCTT/---- TCTATGTTCC 3070 het 3070 ref 47 24 20 5 TCTT 1 0 3463 CASAVA_Build X 40201029 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 203 hom 18 3 11 4 A 17 16 3464 CASAVA_Build X 40218687 1I TGGAGGAGCT -/G GGCTGTCATT 3070 hom 41 het 18 0 11 7 G 2 3 3465 CASAVA_Build X 40230434 16D CTTTCCTTTC CTTCCTTCCTTCCTTT/---------------- CTTCCTTCCT 3070 het 2846 hom 25 8 11 10 CTTCCTTCCTTCCTTT 2 1 3466 CASAVA_Build X 40271443 1I TAAAATTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 9 10 3467 CASAVA_Build X 40279904 1I GGAGTTGGTT -/G GGGAAGTGGG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 G 3 4 3468 CASAVA_Build X 40286111 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2402 het 2402 ref 23 11 8 5 T 13 12 3469 CASAVA_Build X 40286442 68D TGACTGGGGG ATTTTTTTAATACATATCCAGCTAAGGGGAAGTTGAGTTGAGGATATATTTAAGTTAGGTTTAGTGGA/-------------------------------------------------------------------- ATATTTTGTG 833 het 833 ref 36 28 3 16 ATTTTTTTAATACATATCCAGCTAAGGGGAAGTTGAGTTGAGGATATATTTAAGTTAGGTTTAGTGGA 1 0 3470 CASAVA_Build X 40304020 9I ACTAAAAATA ---------/CAAAATTAT CAAAATTATC 2322 het 1282 hom 13 3 6 4 CAAAATTAT 1 2 3471 CASAVA_Build X 40304081 1D GTGATGAGCC T/- GAGATTGCAC 3070 hom 26 het 11 0 9 3 T 1 0 3472 CASAVA_Build X 40312584 2D CTTTTTTTTT AG/-- AGAGAGACAA 3070 het 3070 hom 34 12 13 10 AG 4 3 3473 CASAVA_Build X 40314739 3I CGCATTCATA ---/AAG AAGGGGAAGT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 AAG 1 2 3474 CASAVA_Build X 40332901 4I TTTTGAGACT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 90 het 38 0 29 9 TTTG 2 3 3475 CASAVA_Build X 40338290 1D ACAAAAAAAA T/- ATAAGTATGT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 1 0 3476 CASAVA_Build X 40347552 1D CATGTTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 A 13 12 3477 CASAVA_Build X 40356454 1D AGGACATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 30 1 22 7 A 15 14 3478 CASAVA_Build X 40357310 4I GAGGAAACAT ----/TGAA TGAACCCCAA 3070 hom 81 het 31 0 25 6 TGAA 1 2 3479 CASAVA_Build X 40360517 2I TGCATATATG --/CA CACACATATG 3070 hom 195 het 70 0 65 5 CA 3 4 3480 CASAVA_Build X 40376791 1D AGGAGGCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 10 22 8 A 10 9 3481 CASAVA_Build X 40384773 2I TGGCTGGCCC --/CT GTCAACAGGT 3070 hom 33 het 13 0 9 4 CT 0 1 3482 CASAVA_Build X 40387135 1I AGCTGCCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2390 hom 19 9 10 0 T 9 10 3483 CASAVA_Build X 40407629 1I CTGGCCTAGT -/G ATTTGCTTCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 0 1 3484 CASAVA_Build X 40414964 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 19 1 14 4 A 15 14 3485 CASAVA_Build X 40418031 1D11M2D AACAAGAGCG AAACTCCATCTCAA/-AACTCCATCTC-- AAAAAAAAAA 2542 het 780 hom 17 3 7 9 N/A 0 0 3486 CASAVA_Build X 40472731 1D GATTTGGTAT A/- AAAAAAAAAA 1263 het 1263 ref 42 26 4 12 A 13 12 3487 CASAVA_Build X 40483386 1D AGGGAGCAAT G/- GGGACCTAGA 3070 hom 159 het 60 0 51 10 G 4 3 3488 CASAVA_Build X 40522337 1D AAAACAGAGG T/- TTTTTTTTTT 884 het 884 ref 35 24 3 8 T 11 10 3489 CASAVA_Build X 40641270 12D CCACCAAAAG AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 1535 het 1351 hom 20 9 6 5 A 24 12 3490 CASAVA_Build X 40670614 1I AAAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 1886 het 1886 ref 23 12 6 5 A 12 13 3491 CASAVA_Build X 40684763 1I AAATCTACCC -/T TTTTTTGGGC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 6 7 3492 CASAVA_Build X 40690063 3I AAATTCATGG ---/TGA TGATATTTAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TGA 1 2 3493 CASAVA_Build X 40700393 4I TTAAAAAGAT ----/AAAG AGAGAAATTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AAAG 0 1 3494 CASAVA_Build X 40703186 4D AAAAAGAGAC AGAG/---- AGAGAGAGAT 3070 het 3009 hom 24 11 12 1 AG 6 4 3495 CASAVA_Build X 40708980 1D TAAGCCAGGG C/- CTGGGGGGCG 3070 het 2289 hom 26 12 11 3 C 2 1 3496 CASAVA_Build X 40709699 1D TTTTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 30 2 22 9 A 15 14 3497 CASAVA_Build X 40709759 1I TTCTGTAGAA -/T TCTCAAATGC 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 T 1 2 3498 CASAVA_Build X 40717627 1D GCTTCTGTTC T/- TTTTTTGCCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 7 6 3499 CASAVA_Build X 40720587 1D TTGTAATAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 9 3500 CASAVA_Build X 40728094 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2759 het 1376 hom 30 6 10 14 A 16 17 3501 CASAVA_Build X 40729361 1I GATCTCATTC -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 6 7 3502 CASAVA_Build X 40729691 1D AAAGAGAAAA C/- TTGTCCAACA 3070 het 3070 ref 49 29 17 3 C 1 0 3503 CASAVA_Build X 40740361 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 501 hom 25 3 9 13 T 16 15 3504 CASAVA_Build X 40741525 1I TTTGGCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 26 1 16 9 A 11 12 3505 CASAVA_Build X 40744614 5I TGTCATACCA -----/CCCAG CCCAGCAATA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 CCCAG 1 2 3506 CASAVA_Build X 40746138 12D GACCCAAGAT GAACCAAACAAA/------------ GCTTTTCCCT 3070 hom 90 het 32 0 30 3 GAACCAAACAAA 1 0 3507 CASAVA_Build X 40769041 5I CAAACAAAAT -----/AACAA AACAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 AACAA 2 3 3508 CASAVA_Build X 40769423 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 10 9 3509 CASAVA_Build X 40769955 1D TCTACCTTGC T/- TTTTTTTTTT 1024 het 1024 ref 30 26 3 1 T 11 10 3510 CASAVA_Build X 40776444 1I TTTCCCCCCC -/T GAGACAGTTT 3070 hom 59 het 22 0 18 4 T 0 1 3511 CASAVA_Build X 40777417 4D ACAAAATGCA CAAT/---- CAAAGCAAGA 3070 het 3070 hom 44 19 22 4 CAAT 1 0 3512 CASAVA_Build X 40778541 4D AGGTACTTAC TCTA/---- TCTATTACAT 3070 het 3070 hom 35 14 21 4 TCTA 2 1 3513 CASAVA_Build X 40781956 4D CCGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 2312 het 2312 ref 13 8 5 2 AAAC 5 4 3514 CASAVA_Build X 40787636 1I GTTTCTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 35 3 18 14 A 15 16 3515 CASAVA_Build X 40790661 1I ACCAGAATGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 8 9 3516 CASAVA_Build X 40809948 1I GGCTGAGGCA -/G CAGAATCTCT 2849 het 1790 hom 14 5 8 1 G 0 1 3517 CASAVA_Build X 40811582 1D GAGGGAGTGA G/- GGGGGGAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 G 7 6 3518 CASAVA_Build X 40817879 1I TTTAGTAGAT -/G GGGGGGGTTT 2717 het 2067 hom 11 5 6 0 G 7 8 3519 CASAVA_Build X 40824443 1D AACTTGGGGT A/- AAAAAAAAAA 988 het 988 ref 36 31 3 2 A 12 11 3520 CASAVA_Build X 40827257 1I CCATTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 912 het 912 ref 37 20 3 14 A 13 14 3521 CASAVA_Build X 40832963 1D ATTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1343 het 1343 ref 50 36 3 11 T 10 9 3522 CASAVA_Build X 40833175 1I CAACCACAAC -/A AAAAAAACTG 2754 het 2754 ref 31 21 8 2 A 7 8 3523 CASAVA_Build X 40835410 2I TTTTTTGTCA --/CT CTAAATAGAA 3070 hom 128 het 50 0 43 7 CT 1 2 3524 CASAVA_Build X 40836880 4D CTAATGAGAA AAAC/---- AATTTGGTGT 3070 het 3070 ref 25 15 7 4 AAAC 1 0 3525 CASAVA_Build X 40841239 2I TTGTTTCTCC --/TG TGTGTGGTCT 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 TG 3 4 3526 CASAVA_Build X 40853961 2D AGCATCACAC TG/-- GGGATGGGGG 3070 het 911 hom 28 4 11 13 TG 1 0 3527 CASAVA_Build X 40855344 8I CTCATGTGAT --------/GGTATTAG GAGGTGGGGC 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 GGTATTAG 0 1 3528 CASAVA_Build X 40860975 1I CATGGCTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 8 9 3529 CASAVA_Build X 40864206 1I GACTTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 10 11 3530 CASAVA_Build X 40869578 1D GGCCGATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 28 1 18 9 T 13 12 3531 CASAVA_Build X 40872605 1D ACTTTCTGAG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 36 9 21 6 T 8 7 3532 CASAVA_Build X 40876948 1D ACCCAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 2026 het 2026 ref 22 7 11 4 T 13 12 3533 CASAVA_Build X 40883527 1D TTTATTAGAG A/- AACTTAGTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 3 2 3534 CASAVA_Build X 40893908 1I GAATAATTAC -/T TTTTTTTTTT 2688 het 2688 ref 24 11 9 4 T 11 12 3535 CASAVA_Build X 40895419 1D ATCTACCTCC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 9 8 3536 CASAVA_Build X 40896976 1D ATGTCTTATC T/- TTTGAAGAGT 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 T 4 3 3537 CASAVA_Build X 40897431 2D CCAGCAGTTT AA/-- GAGTCTTCAC 3070 het 3070 ref 38 23 11 6 A 2 0 3538 CASAVA_Build X 40899902 1I ACTCATTCCT -/A TACATCAACT 3070 het 3070 ref 56 32 19 5 A 0 1 3539 CASAVA_Build X 40904234 1I ATGAACTTTT -/A AAAATAAGTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 4 5 3540 CASAVA_Build X 40907630 1D TCATACACTT A/- ACAGATGTGC 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 A 2 1 3541 CASAVA_Build X 40908544 1D AAGTGCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 T 11 10 3542 CASAVA_Build X 40909369 3D CTTTTTTCTG GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 het 3070 hom 33 12 13 9 GTT 4 3 3543 CASAVA_Build X 40913090 1I AATGCCATCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 8 9 3544 CASAVA_Build X 40913318 1I ATGTAAAAGG -/T TAAACTCTAC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 1 2 3545 CASAVA_Build X 40928022 1I TTTTTGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 T 10 11 3546 CASAVA_Build X 40934011 1D AGATGCCAGG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 T 8 7 3547 CASAVA_Build X 40936639 1D TTTTCTGCTG T/- TTCCACAGCC 3070 het 3070 ref 50 23 20 9 T 3 2 3548 CASAVA_Build X 40941822 3D ATCTTTTCTC TTT/--- TTTAAGAATC 3070 het 3070 hom 26 11 14 2 T 6 3 3549 CASAVA_Build X 40942316 2D GGCAAACCTC TG/-- TTTTGTAAGA 3070 het 3070 hom 37 17 16 6 TG 1 0 3550 CASAVA_Build X 40944414 1D AATTCTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 10 9 3551 CASAVA_Build X 40948772 2I GAAGAGTACT --/AC AGTCATGCAC 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 AC 0 1 3552 CASAVA_Build X 40949353 4D GGGGATAAAC ACTA/---- AATAACTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 4 ACTA 1 0 3553 CASAVA_Build X 40949831 1D ATTGGGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1957 hom 49 12 18 21 T 17 16 3554 CASAVA_Build X 40954957 1I ACTAGTACTT -/A ACATACAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 23 0 A 1 2 3555 CASAVA_Build X 40960034 1I TTGCTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 2858 het 2858 ref 35 17 10 8 T 13 14 3556 CASAVA_Build X 40963641 1D TGTGTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1099 het 1099 ref 36 23 4 9 T 15 14 3557 CASAVA_Build X 40966485 3I TTTAAGAGAC ---/AAG AAGGAGGAGT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 AAG 1 2 3558 CASAVA_Build X 40966594 1D TACTGTGAAG A/- GGGGCCAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 12 11 A 1 0 3559 CASAVA_Build X 40972823 1I AACTTAGTTA -/T TAACTTTTTT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 1 2 3560 CASAVA_Build X 40972923 4D ACTGGTAATA AGTT/---- AGTAAGAGCA 3070 het 3070 hom 28 11 13 6 AGTT 1 0 3561 CASAVA_Build X 40987340 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1481 hom 20 het 10 0 8 2 A 17 18 3562 CASAVA_Build X 40990680 3I CAGCCTCCCG ---/AGT AGCTAGGATT 3070 het 2520 hom 16 6 9 2 AGT 0 1 3563 CASAVA_Build X 41027318 2I AAGTATTATG --/AA TTTGACCCTC 3070 het 3070 ref 40 25 9 6 A 0 2 3564 CASAVA_Build X 41107991 4I AAAACAAAAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 AAAC 3 4 3565 CASAVA_Build X 41114583 1D AATTTTAAAG T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 7 6 3566 CASAVA_Build X 41114989 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 2376 het 2376 ref 23 9 6 8 T 7 6 3567 CASAVA_Build X 41145480 2D TCTCAAAAAA AG/-- AAAAGAAAAG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 AG 1 0 3568 CASAVA_Build X 41149907 1D ACCAGGCTCA G/- CTGGCTTGGC 3070 hom 71 het 28 0 18 11 G 1 0 3569 CASAVA_Build X 41151880 1D CTGTTGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 31 1 26 4 A 11 10 3570 CASAVA_Build X 41158194 3I ATAAATAAAT ---/AAA AAGTATAAAA 1927 het 1531 hom 9 4 4 1 A 2 5 3571 CASAVA_Build X 41165974 1D AGACCCTTTT G/- GGGGGGTCCC 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 G 7 6 3572 CASAVA_Build X 41168641 2D TAAAGGAAAG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 2631 hom 37 7 28 2 T 10 8 3573 CASAVA_Build X 41170893 6D AATTTTTATT TTATTA/------ TTATTATACT 2004 het 1478 hom 12 4 5 3 TTA 4 2 3574 CASAVA_Build X 41176034 5I AGTGTTTTTT -----/TTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 29 7 16 7 TTTTG 0 1 3575 CASAVA_Build X 41180594 1D ACCATGGCTC A/- AAAAAAAAAA 2434 het 2428 hom 30 10 7 15 A 13 12 3576 CASAVA_Build X 41184068 1D CAATAAAATT A/- AAAAAAAAAT 2248 het 2248 ref 30 16 8 6 A 10 9 3577 CASAVA_Build X 41201777 1D CTGCTCCCCC A/- TAACTTTGAC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 1 0 3578 CASAVA_Build X 41204721 1D AATAAATTTT A/- AAAAATTTTA 3070 het 3070 hom 22 11 9 3 A 6 5 3579 CASAVA_Build X 41205178 1I TAGTCATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 10 11 3580 CASAVA_Build X 41209388 1I GCTTCTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 10 11 3581 CASAVA_Build X 41210556 2D AGGTCAAGAC TG/-- TGGTGAACCG 2506 het 2506 ref 21 12 6 3 TG 2 1 3582 CASAVA_Build X 41216027 5D TATATATATA TGTAT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1406 hom 13 4 9 1 TGTAT 1 0 3583 CASAVA_Build X 41222363 4I ACTAACAGTT ----/TTAG TTAGTTGCAA 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 TTAG 1 2 3584 CASAVA_Build X 41229330 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2015 het 362 hom 19 7 7 5 A 19 18 3585 CASAVA_Build X 41235386 1I GCTTTCTCTA -/T TTTTTTTTAG 1674 het 1674 ref 19 8 6 5 T 8 9 3586 CASAVA_Build X 41246816 1D ATATATATAT A/- TATATATATT 160 hom 3 het 3 0 1 2 A 1 0 3587 CASAVA_Build X 41250332 3D TCAGGGCTTG AGA/--- AGATCTGAAG 3070 hom 138 het 50 0 47 5 AGA 2 1 3588 CASAVA_Build X 41289225 1I AGTACTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 10 11 3589 CASAVA_Build X 41300124 1D ACAGCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 29 6 A 12 11 3590 CASAVA_Build X 41403428 1I GTGCAAATTC -/T TTTTTTTTTT 752 het 752 ref 31 20 2 10 T 13 14 3591 CASAVA_Build X 41434543 1I ATTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 10 11 3592 CASAVA_Build X 41439620 3D TCAAGCAATC CTT/--- CTGCTGTAGC 3070 het 3070 ref 38 22 15 3 CTT 1 0 3593 CASAVA_Build X 41446284 1D GTATGATGTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 7 3594 CASAVA_Build X 41469253 1D GGTCTACACT A/- ACTGAAACCA 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 A 2 1 3595 CASAVA_Build X 41573894 48D AGGTCACAAG ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------------------ ATATATATAT 3070 het 230 hom 11 1 11 1 AT 30 6 3596 CASAVA_Build X 41619895 1D AATGATGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 A 10 9 3597 CASAVA_Build X 41622153 3D ATATAATTTT ACC/--- ACAATTAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 ACC 1 0 3598 CASAVA_Build X 41701103 1I ACATCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 A 10 11 3599 CASAVA_Build X 41803250 6D TTACAACTGA TGAACT/------ TATACTGACA 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 TGAACT 1 0 3600 CASAVA_Build X 41825227 1D ATTATGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 15 14 3601 CASAVA_Build X 41832024 1D AGCTAAGTAT G/- TTAATAAATA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 G 1 0 3602 CASAVA_Build X 41836024 1D TGTATAAGTG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 T 8 7 3603 CASAVA_Build X 41854730 1I ATTTTCAGGA -/G GCTCTGCCTA 3070 hom 81 het 31 0 24 7 G 1 2 3604 CASAVA_Build X 41862187 1I ATTGTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 10 11 3605 CASAVA_Build X 41884149 1D ATTGTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 817 het 817 ref 14 9 2 3 T 17 16 3606 CASAVA_Build X 41899642 1I ATGATGAAGC -/A ATCTCATTAT 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 A 1 2 3607 CASAVA_Build X 41907436 8I TACAAGTGTA --------/TAAATGAC AATTAATGCA 1341 het 1341 ref 51 41 3 8 TAAATGAC 0 1 3608 CASAVA_Build X 41927370 1D CGTCTGGGGA G/- GGCCTCAGGC 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 G 3 2 3609 CASAVA_Build X 41946358 1I AAAAAATTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 210 hom 12 2 8 2 T 8 9 3610 CASAVA_Build X 41997914 1D ACTATATAAT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 8 7 3611 CASAVA_Build X 42005588 1I AGGCAGAAGG -/C CTGAGAATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 2 3612 CASAVA_Build X 42006288 4I CTTTTAAACT ----/TAAA TAAACTACCT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 TAAA 1 2 3613 CASAVA_Build X 42020632 1I CTGGCATTTG -/C CATGAGAAGA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 C 1 2 3614 CASAVA_Build X 42068185 1D AGCTTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 1742 het 1742 ref 43 29 4 11 A 12 11 3615 CASAVA_Build X 42088451 1D TGAAATTAGA C/- CCCTTCCTTA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 C 4 3 3616 CASAVA_Build X 42109014 1D TGTTTCGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 12 10 T 11 10 3617 CASAVA_Build X 42122922 4I TGTCCCATGG ----/ACTA ACTATGACAT 3070 het 3070 hom 48 23 21 4 ACTA 1 2 3618 CASAVA_Build X 42156339 1I TCCCTTAACA -/T TTTTTTTTCA 1995 het 1995 ref 24 13 6 5 T 8 9 3619 CASAVA_Build X 42177713 2I TCCCTCTCTC --/TG TCTGTGTGTG 1948 het 1948 ref 24 16 5 3 TG 0 1 3620 CASAVA_Build X 42221551 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 552 hom 28 3 20 5 A 11 12 3621 CASAVA_Build X 42267986 1I TAACGACTAC -/T TTGTAGTCTT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 2 3 3622 CASAVA_Build X 42270463 1I AGTAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1387 het 1387 ref 25 18 3 4 A 11 12 3623 CASAVA_Build X 42271829 2I TGTATGTAAG --/TA TATATATATA 1625 het 1625 ref 15 7 6 2 TA 5 6 3624 CASAVA_Build X 42282934 1I CATTCTGTCA -/T TTTTTTTTTT 739 het 739 ref 59 48 2 9 T 11 12 3625 CASAVA_Build X 42287184 1I AACCTGAGTT -/C TAGCAACCCT 3070 hom 96 het 42 0 29 13 C 0 1 3626 CASAVA_Build X 42368353 1D GATAAGTACG T/- TTAGTTTAAG 3070 hom 102 het 39 0 35 7 T 3 2 3627 CASAVA_Build X 42407406 1I TAAAAATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2100 hom 27 6 16 5 A 11 12 3628 CASAVA_Build X 42411153 1I TGAGCATATG -/A AAATGATGAC 3070 hom 54 het 27 0 19 8 A 3 4 3629 CASAVA_Build X 42495880 2D CAATACACAC TT/-- AATATCTCAC 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 2 0 3630 CASAVA_Build X 42497275 1D CTTTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 1346 het 1346 ref 35 25 4 7 A 12 11 3631 CASAVA_Build X 42531234 1D TCAGTTGGAA T/- TTGTCCAGTC 3070 het 3070 hom 42 16 18 10 T 3 2 3632 CASAVA_Build X 42567339 1I AAATAATGTG -/T GCAACACTAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 3633 CASAVA_Build X 42582617 1D AATCACCCCC A/- AAATAAACTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 4 3 3634 CASAVA_Build X 42595648 1I CCTTGCCCCT -/G GCTTCTGGTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 1 2 3635 CASAVA_Build X 42603423 1D ATTTGTATGC T/- TTTTTTTTTG 1797 het 1797 ref 56 45 4 7 T 10 9 3636 CASAVA_Build X 42657058 1I CGGGCACGGT -/G GCTCACGCCT 2031 hom 12 het 6 0 5 1 G 1 2 3637 CASAVA_Build X 42685560 1D TGTCCATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 10 9 3638 CASAVA_Build X 42689167 2D CAAAACAAAC AA/-- GAGAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 16 14 10 A 2 0 3639 CASAVA_Build X 42695060 1D ATGCTTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 15 9 A 13 12 3640 CASAVA_Build X 42699913 1I CAGAACTAGG -/A AAATCTCCAC 3070 het 3070 hom 36 14 12 10 A 3 4 3641 CASAVA_Build X 42700000 12D AAAGTCAAAG CACACTAGAAAT/------------ CACACCAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 13 15 CACACTAGAAAT 1 0 3642 CASAVA_Build X 42713618 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 12 10 3643 CASAVA_Build X 42832585 1D AAATCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1253 het 1253 ref 21 12 5 4 T 13 12 3644 CASAVA_Build X 42890484 3D TTTACGATAA TCT/--- TCTTTACTTA 3070 het 3070 hom 46 23 20 5 TCT 2 1 3645 CASAVA_Build X 42912888 1I CCTCCTTTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 7 8 3646 CASAVA_Build X 42918992 2D GGAGTGAATC AT/-- GTGGATATAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 AT 1 0 3647 CASAVA_Build X 42926735 1D CACATCTATT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 78 het 35 0 27 10 A 9 8 3648 CASAVA_Build X 42997441 4D CTTGGCTGAT TAAA/---- TAAATATTTG 3070 het 3070 hom 47 19 24 8 TAAA 2 1 3649 CASAVA_Build X 43065074 1D CACACACACA C/- ACATTTTCTT 1460 het 1460 ref 20 13 3 4 C 1 0 3650 CASAVA_Build X 43086696 2D ACAAGATAAC AT/-- ATGTCTCTCA 3070 het 3070 hom 49 19 26 5 AT 2 1 3651 CASAVA_Build X 43088560 1I CTTAAGTCTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 A 8 9 3652 CASAVA_Build X 43089843 4D GCTCTTTAAT TTAA/---- TTAAGTCCCA 3070 het 3070 hom 41 16 19 8 TTAA 2 1 3653 CASAVA_Build X 43109736 1I AAATGGGAAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 7 8 3654 CASAVA_Build X 43114468 4D CAGCCCTGTC AGTA/---- AGTGATAGGT 3070 het 3070 ref 49 23 21 7 AGTA 1 0 3655 CASAVA_Build X 43120137 1I AGGCATTGTA -/C TAGACACTTT 3070 het 3070 hom 49 17 20 12 C 0 1 3656 CASAVA_Build X 43152799 1D GCTGGACTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2410 hom 26 8 15 3 A 10 9 3657 CASAVA_Build X 43154603 2D TCTTCTAGGA GT/-- TTTATAGTTT 3070 het 3070 ref 40 26 12 4 GT 1 0 3658 CASAVA_Build X 43176507 1D GAGTGTGTTT G/- TTAACACTTC 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 G 1 0 3659 CASAVA_Build X 43218139 2D TTTCAAGTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2086 hom 22 9 11 3 A 15 13 3660 CASAVA_Build X 43232596 1I TTGTAATGGG -/A AAAAAAAAAA 2162 het 2162 ref 39 8 9 22 A 15 16 3661 CASAVA_Build X 43243361 25D GCCAAATGTC TGAGCTCTCCATAGCCCAGTGAAGT/------------------------- TGAGCTCTCC 3070 het 3070 ref 50 23 13 21 TGAGCTCTCCATAGCCCAGTGAAGT 2 1 3662 CASAVA_Build X 43259410 1I CAACTCAGAG -/C CCTTTCAGGG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 2 3 3663 CASAVA_Build X 43263773 1I CCATCTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 T 10 11 3664 CASAVA_Build X 43278102 2D CGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 640 hom 17 het 32 0 6 30 TG 8 7 3665 CASAVA_Build X 43278116 3D TGTGTGTGTG TGT/--- TGGGGGGGGG 3070 het 223 hom 34 1 26 9 TGT 1 0 3666 CASAVA_Build X 43282599 1I AAAAAGAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 127 het 50 0 43 7 T 9 10 3667 CASAVA_Build X 43284516 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 33 1 27 5 T 11 10 3668 CASAVA_Build X 43289239 3I TAGGAGAGAG ---/AGA AGAAGAGGTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGA 2 3 3669 CASAVA_Build X 43295139 2D AAGCTGAAAC AA/-- AGAGAGAAGC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 3 1 3670 CASAVA_Build X 43306936 4D AAAAAAAAAA AGGG/---- GGGGGGGTTA 3070 het 859 hom 42 9 26 7 AGGG 1 0 3671 CASAVA_Build X 43322599 1I AAGGCTGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 46 0 30 16 A 12 13 3672 CASAVA_Build X 43324825 1D TTATAAAGGA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 6 3673 CASAVA_Build X 43331721 1I GTATTAGAAC -/T TTTTTTTTTT 2278 het 821 hom 17 3 11 3 T 15 16 3674 CASAVA_Build X 43346664 13I ATTTCTTAAA -------------/GGCAGGAGACTGT ACCTCTTATC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 GGCAGGAGACTGT 0 1 3675 CASAVA_Build X 43352158 1D GTTCTAATAG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 57 het 30 0 20 10 T 8 7 3676 CASAVA_Build X 43363213 4I TCTTTTCCTT ----/CCTC CCTCCCTCCC 3070 hom 32 het 15 0 11 4 CCTC 3 4 3677 CASAVA_Build X 43411195 3I TGGGGTGGGG ---/GAA GGCGGGGGGG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 GAA 0 1 3678 CASAVA_Build X 43434938 1I AAAGATAAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 T 9 10 3679 CASAVA_Build X 43436372 1I AGCTCCCGAA -/G GCTGAGCAGT 3070 hom 129 het 49 0 42 7 G 1 2 3680 CASAVA_Build X 43443546 1D TTGGATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 29 1 12 16 T 15 14 3681 CASAVA_Build X 43466729 4D GATAGGGTTG TTTC/---- TTTCTTGTAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 TTTC 2 1 3682 CASAVA_Build X 43476753 5I ATTTAACAAG -----/ACATA ACATGTAGGG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 ACATA 0 1 3683 CASAVA_Build X 43479110 1D ATTGATGATT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 A 8 7 3684 CASAVA_Build X 43487094 1I TTTTAGTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 46 0 33 13 T 9 10 3685 CASAVA_Build X 43504533 1I ATAGCCCAAA -/G GGCCACCAGC 3070 hom 83 het 31 0 27 4 G 2 3 3686 CASAVA_Build X 43570428 1I AGGTGGGGGA -/C CCTCCTGGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 2 3 3687 CASAVA_Build X 43615073 1D TTCTTCCTCC A/- ACTGTCTGAA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 A 2 1 3688 CASAVA_Build X 43634918 1I TTTAGTCTCG -/C CCTGCTTTCA 807 het 807 ref 47 32 3 12 C 2 3 3689 CASAVA_Build X 43706460 1D TAACCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 2233 het 2233 ref 36 16 6 14 T 17 16 3690 CASAVA_Build X 43707537 1I TCCTGGATGG -/T TTTTTAGACA 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 T 5 6 3691 CASAVA_Build X 43743909 2D AATCCATTAC AT/-- GTTTCTTTCC 3070 het 3070 hom 57 22 28 7 AT 1 0 3692 CASAVA_Build X 43777246 1D AAGGAGATTT A/- AAAAAAAAAA 1345 het 1345 ref 30 23 4 3 A 13 12 3693 CASAVA_Build X 43794117 1I AGCCATTCTA -/G GAGGGTATAA 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 G 1 2 3694 CASAVA_Build X 43803059 1I AAGTTGAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 9 10 3695 CASAVA_Build X 43816876 1D AGATTGTTTA C/- CCGTCTCCTA 3070 het 3070 hom 58 20 30 8 C 3 2 3696 CASAVA_Build X 43819867 2D CCTTTAGAAA GT/-- GAAATTTCAC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 GT 1 0 3697 CASAVA_Build X 43833322 3I GGGGGAGGAA ---/GAG GAGGAGGAGG 3070 hom 96 het 43 0 31 12 GAG 5 6 3698 CASAVA_Build X 43834800 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 27 14 10 3 T 9 8 3699 CASAVA_Build X 43838517 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 70 het 28 0 23 5 T 9 10 3700 CASAVA_Build X 43848625 4D CAGAATCTAG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 TA 9 7 3701 CASAVA_Build X 43857189 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 2684 het 2684 ref 29 14 7 8 A 17 16 3702 CASAVA_Build X 43883735 1D TATCCATATA C/- CAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 33 0 28 5 C 2 1 3703 CASAVA_Build X 43890144 1D TCTAGCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 31 0 26 7 A 13 12 3704 CASAVA_Build X 43934893 1I GTTGATGGGG -/A AAAAAAAAAT 2770 het 2770 ref 32 10 14 8 A 9 10 3705 CASAVA_Build X 43951395 1D AAAATGAACT A/- AAAATGGATT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 A 5 4 3706 CASAVA_Build X 44052124 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1338 hom 20 4 9 8 A 15 14 3707 CASAVA_Build X 44067796 1D GGAAATCAAT C/- CATAGAGAGC 3070 het 3070 ref 55 24 22 9 C 2 1 3708 CASAVA_Build X 44070087 1D AGCATTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3011 het 2257 hom 26 9 9 8 T 14 13 3709 CASAVA_Build X 44073798 1I GATCACAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 T 13 14 3710 CASAVA_Build X 44079179 1I AAAAGGGGAT -/G GGTTGAATAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 G 2 3 3711 CASAVA_Build X 44082557 1I TGGGTATGGT -/G GGTGCATGTC 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 G 2 3 3712 CASAVA_Build X 44087835 1I CAGGCAGCGG -/C CGCCTCCCGG 1968 hom 26 het 11 0 6 5 C 1 2 3713 CASAVA_Build X 44090255 3D TTTTTTTTTT AGA/--- TAGATAGATA 894 het 894 ref 25 13 5 8 AGA 1 0 3714 CASAVA_Build X 44139737 1D ATGATAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1911 het 1911 ref 30 18 5 8 T 11 10 3715 CASAVA_Build X 44233615 1I CACTGCCATG -/A AAAATTTAGT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 A 4 5 3716 CASAVA_Build X 44238939 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 A 9 10 3717 CASAVA_Build X 44264353 19D TTCCTGGCTT CAAACAATCCTCCTGCCTC/------------------- CAAACAATCC 1155 het 1155 ref 10 5 4 2 CAAACAATCCTCCTGCCTC 1 0 3718 CASAVA_Build X 44265077 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 10 3719 CASAVA_Build X 44266572 3D ACTCTGACTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 20 2 15 3 A 17 14 3720 CASAVA_Build X 44270627 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2666 het 2666 ref 20 9 6 5 A 9 10 3721 CASAVA_Build X 44270678 1D AAATAAAAAA G/- GGGGGGGGGC 1397 het 1109 hom 14 4 3 7 G 10 9 3722 CASAVA_Build X 44278797 1I AACTGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 11 12 3723 CASAVA_Build X 44297483 1D TCCCATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 T 11 10 3724 CASAVA_Build X 44313207 1I AAAAAAATAC -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 7 8 3725 CASAVA_Build X 44313506 1I AATTGCTAAA -/C CATGACCTCA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 C 1 2 3726 CASAVA_Build X 44316144 1I CTGTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 27 0 19 8 A 10 11 3727 CASAVA_Build X 44333790 1I CATGGTGAAA -/C CCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 C 4 5 3728 CASAVA_Build X 44336967 2I25M2D TAGACTGCAC --GTTTAACCTGTACAAAACTGATGTTTA/ATGTTTAACCTGTACAAAACTGATGTT-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 11 17 15 N/A 0 0 3729 CASAVA_Build X 44338737 1I CCAGATTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1834 hom 38 9 19 10 G 0 1 3730 CASAVA_Build X 44339199 1D ATGTATCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 T 11 10 3731 CASAVA_Build X 44351018 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 8 11 8 A 13 14 3732 CASAVA_Build X 44362545 1I CCCTATCTTC -/A AAAAAAAAAA 1040 het 1040 ref 28 19 3 6 A 13 14 3733 CASAVA_Build X 44366732 1D ATTCAGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 233 hom 37 2 22 13 A 15 14 3734 CASAVA_Build X 44369424 2D AAAACCTAAC TT/-- AAATATTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 5 T 2 0 3735 CASAVA_Build X 44370520 1I GATACTGGTA -/T TTTTTTTTTT 2480 het 1064 hom 22 5 10 7 T 15 16 3736 CASAVA_Build X 44370856 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 26 1 20 5 T 12 11 3737 CASAVA_Build X 44377161 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1719 hom 31 7 13 11 T 13 12 3738 CASAVA_Build X 44384873 1I TTTAGTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 127 hom 35 2 24 9 T 10 11 3739 CASAVA_Build X 44391583 4I TCACACCTGG ----/CTAA CTTTTTTGTA 1777 hom 21 het 14 0 8 6 CTAA 0 1 3740 CASAVA_Build X 44402395 4D GACAGAGACT GAGA/---- GAGTTTACTA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 GA 3 1 3741 CASAVA_Build X 44406432 3D CATCTCAAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 AAT 4 3 3742 CASAVA_Build X 44418859 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 13 12 3743 CASAVA_Build X 44421583 2I TATTTTATTG --/TT TTTTGGGGTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 4 6 3744 CASAVA_Build X 44422555 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2388 het 1291 hom 31 10 8 13 T 17 16 3745 CASAVA_Build X 44449123 1D TCAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 10 9 3746 CASAVA_Build X 44482896 1I GCCAGTCATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 9 10 3747 CASAVA_Build X 44485383 1I CAGATGGAAC -/A AGTACATCTA 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 A 1 2 3748 CASAVA_Build X 44507919 1I TGATTAGCCC -/G GTCTCAGCCT 2777 hom 24 het 11 0 8 3 G 1 2 3749 CASAVA_Build X 44532825 2I GCGCAACCCC --/CT CTCTACTAAA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 CT 2 3 3750 CASAVA_Build X 44535156 3D AACAAATAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 AAC 7 6 3751 CASAVA_Build X 44619754 1I TGCCTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 1185 het 1185 ref 29 18 4 7 T 15 16 3752 CASAVA_Build X 44625012 4I GTACTCTGAT ----/AGTG AGTACACCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AGTG 0 1 3753 CASAVA_Build X 44640814 1D TATCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1054 hom 25 5 12 8 T 17 16 3754 CASAVA_Build X 44643728 1D TTTCTTGGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 40 0 31 9 T 10 9 3755 CASAVA_Build X 44649325 1I ATGTTGAAAA -/T TTTGGTTCTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 3 4 3756 CASAVA_Build X 44687681 1D ATGAGGGATG C/- CTGTTTGTAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 2 1 3757 CASAVA_Build X 44690929 1I GTCCACTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 9 3758 CASAVA_Build X 44769728 2D ATTTGAAGCA GT/-- GTGCTACCAT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 GT 2 1 3759 CASAVA_Build X 44820869 1D TGATTATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 44 1 30 14 T 13 12 3760 CASAVA_Build X 44844223 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2093 het 2093 ref 27 13 5 9 A 14 13 3761 CASAVA_Build X 44884292 1D AAAGGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 11 10 3762 CASAVA_Build X 44889330 1I CTAAGCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 767 hom 27 2 19 6 T 14 15 3763 CASAVA_Build X 44890774 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 13 12 3764 CASAVA_Build X 44919807 2D CATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 TA 6 5 3765 CASAVA_Build X 44948060 1I ACTGTCTATA -/C CTTTCTTATA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 1 2 3766 CASAVA_Build X 44955579 1I GTGAACTTAG -/A AAAAAATACT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 7 3767 CASAVA_Build X 44962111 1D CCAGAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 33 1 23 10 T 12 11 3768 CASAVA_Build X 44963926 1I CCAAAAGTAT -/A AAAACTCTGG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 4 5 3769 CASAVA_Build X 44965951 1D ATGTTATTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 8 7 3770 CASAVA_Build X 45028776 2I GTCTATTCTG --/AT ATATATATAT 3070 hom 19 het 25 1 21 3 AT 7 8 3771 CASAVA_Build X 45037310 9I AAAATGCGAA ---------/TTATAGGTT TTATTTATTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TTATAGGTT 0 1 3772 CASAVA_Build X 45056880 3D ATTTTATAAA TTC/--- TTCTTATTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TTC 2 1 3773 CASAVA_Build X 45057805 1I TTCCGCCCCC -/T GACCATCATT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 0 1 3774 CASAVA_Build X 45087595 1I TACTGAGACT -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 101 het 39 0 32 7 C 8 9 3775 CASAVA_Build X 45090039 2D TCTGGGAAAG AT/-- ATTGGCATCA 3070 hom 105 het 43 0 36 8 AT 2 1 3776 CASAVA_Build X 45091792 1D GCCCTTCCTG A/- AAAGATTAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 4 3 3777 CASAVA_Build X 45107230 1I TATTTCACAA -/T TTTTTTTTTT 1619 het 1619 ref 44 32 4 8 T 10 11 3778 CASAVA_Build X 45273045 1I ATGGATCAAC -/A AACAACAACA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 A 2 3 3779 CASAVA_Build X 45409858 4D TACTGTCTGG CTGT/---- CTGTTAGTCT 3070 hom 119 het 43 0 39 9 CTGT 2 1 3780 CASAVA_Build X 45411083 10D ACTGAGCCAA AGTGCTTATT/---------- ACCAAGCACA 3070 hom 138 het 51 0 46 7 AGTGCTTATT 1 0 3781 CASAVA_Build X 45416859 1I CAGACAAGAT -/G GCTGACTAGA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 G 1 2 3782 CASAVA_Build X 45420645 1I GATCAAAATC -/A AGTTGCAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 1 2 3783 CASAVA_Build X 45424142 4D AAGCAATGAT ATTA/---- ATTATGATGG 3070 het 3070 hom 56 19 33 5 ATTA 2 1 3784 CASAVA_Build X 45425181 18D AATGGTGTGG AGGGACTCAAGGTAGCCC/------------------ AGGCATCTCA 3070 het 3070 ref 43 24 17 5 AGGGACTCAAGGTAGCCC 1 0 3785 CASAVA_Build X 45429564 1D ATAAAGAGGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 8 7 3786 CASAVA_Build X 45431116 1D CAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 372 het 372 ref 21 11 4 6 T 1 0 3787 CASAVA_Build X 45433891 1D AATTTATCAG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 8 7 3788 CASAVA_Build X 45438258 4I AAAAGTGAAC ----/CTTA CTTAATGCAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 CTTA 1 2 3789 CASAVA_Build X 45442257 4I CACCCCTGGA ----/AAAT AAATAAATGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AAAT 2 3 3790 CASAVA_Build X 45454923 4I TTAAATTACC ----/CAGA AAGGCTGTCC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 CAGA 0 1 3791 CASAVA_Build X 45457401 2I ATTAGGTATT --/GG GGGGGGGTGG 3070 hom 66 het 30 0 22 8 G 7 9 3792 CASAVA_Build X 45461122 1I AAAATATATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 4 het 36 1 32 3 A 9 10 3793 CASAVA_Build X 45466998 1I ACTAGTTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 3794 CASAVA_Build X 45470166 1I AGATTCCACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 9 10 3795 CASAVA_Build X 45473546 1I GCTTTACAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 9 10 3796 CASAVA_Build X 45480888 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 24 1 20 4 A 15 13 3797 CASAVA_Build X 45481283 1D TTTTTGAATT A/- TATACTTAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 1 0 3798 CASAVA_Build X 45494846 1I AATAAAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 43 1 35 7 T 10 11 3799 CASAVA_Build X 45532577 1D CCTTCAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1674 hom 21 6 10 5 T 13 12 3800 CASAVA_Build X 45556651 2D CCATCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 1121 het 1121 ref 28 10 4 15 A 14 12 3801 CASAVA_Build X 45569658 5I GCTGTGTTTC -----/AATAA AATTTTATTT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 AATAA 0 1 3802 CASAVA_Build X 45571460 3D GGATGTGAGG AGC/--- CCAGGAATTT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 AGC 1 0 3803 CASAVA_Build X 45585275 1I TTACATCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 10 11 3804 CASAVA_Build X 45586995 1D ACAGCATGTG C/- AAAAGCATAG 3070 het 3070 ref 56 28 25 3 C 1 0 3805 CASAVA_Build X 45589567 4I TTGAGGACAT ----/TATC TAAGTTAAAT 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 TATC 0 1 3806 CASAVA_Build X 45606790 1D AAAGTTTGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 52 21 24 9 A 10 9 3807 CASAVA_Build X 45684296 2I GAAACAAAAC --/AT GTGAATTATT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 AT 0 1 3808 CASAVA_Build X 45693914 4D CTTGTTATTG CTTT/---- CTAATTTCAT 3070 het 3070 hom 46 18 26 2 CTTT 1 0 3809 CASAVA_Build X 45694988 1D CATATATGGG A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 7 6 3810 CASAVA_Build X 45697134 11I TGCTTTGAAT -----------/ATGTCAGCCCA ATGTTTTGTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 ATGTCAGCCCA 0 1 3811 CASAVA_Build X 45707955 3D TTAGTGCACA TAT/--- GTTTTTAATC 3070 hom 63 het 27 0 22 7 TAT 1 0 3812 CASAVA_Build X 45732670 1D AGATTATTCA T/- TTCTATTTTA 3070 het 3070 ref 49 22 22 8 T 3 2 3813 CASAVA_Build X 45767043 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 23 3 16 5 A 15 14 3814 CASAVA_Build X 45771760 1I ACCTCTTCTA -/T TTTTTTGGAA 3070 hom 56 het 24 0 19 5 T 6 7 3815 CASAVA_Build X 45794432 1I ATGGAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 10 12 5 A 13 14 3816 CASAVA_Build X 45821517 1I AATAGAAAAA -/G AAGGAATTGT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 0 1 3817 CASAVA_Build X 45829534 1D ATACGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 652 hom 38 3 22 14 T 15 14 3818 CASAVA_Build X 45838794 2D TGTTGCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1855 het 745 hom 24 4 6 14 T 16 14 3819 CASAVA_Build X 45839131 1D TTTACTACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 T 11 10 3820 CASAVA_Build X 45862910 1D TAATGCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 19 5 T 13 12 3821 CASAVA_Build X 45884066 1I AAAAAAATTA -/G TGAAAAAGTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 3822 CASAVA_Build X 45890978 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 T 11 10 3823 CASAVA_Build X 45891902 1D TACTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 33 0 20 13 T 11 10 3824 CASAVA_Build X 45921573 14D ATCTATCTCC AGATAGACTGCAGA/-------------- CTTCTTAGGT 3070 het 3070 ref 22 13 10 4 AGATAGACTGCAGA 1 0 3825 CASAVA_Build X 45936255 1I GCCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 9 10 3826 CASAVA_Build X 45995609 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1078 het 1078 ref 43 19 5 19 A 19 18 3827 CASAVA_Build X 46054313 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 44 21 17 6 A 7 8 3828 CASAVA_Build X 46090284 1I TTTTCAAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 400 hom 37 1 29 7 A 8 9 3829 CASAVA_Build X 46100021 1I AATCCCCCTA -/T AACCATTAGG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 1 3830 CASAVA_Build X 46107363 5D AAAAAAAGAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 40 17 18 8 AAAAG 4 3 3831 CASAVA_Build X 46109251 1D GATGGTGAAA C/- CCCCCGTCTC 3070 hom 27 het 12 0 9 3 C 6 5 3832 CASAVA_Build X 46109427 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1129 hom 17 3 10 6 A 10 9 3833 CASAVA_Build X 46123899 4D TTCTTTTCCC TTGT/---- TTGTCTTCTT 3070 het 3070 ref 45 25 15 7 TTGT 2 1 3834 CASAVA_Build X 46135136 4D AAAAAAAAAT TTAA/---- TTATGTAAAT 3070 het 3070 hom 21 9 11 3 TTAA 1 0 3835 CASAVA_Build X 46177530 4I GATTGGAGAT ----/AAAC AATCATATAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 AAAC 0 1 3836 CASAVA_Build X 46177780 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1990 hom 16 6 8 2 T 10 9 3837 CASAVA_Build X 46191383 12D TCCCTGCGGG CGGGAGCTAGGC/------------ CGCTGGAAAG 1978 het 1978 ref 19 8 8 6 CGGGAGCTAGGC 1 0 3838 CASAVA_Build X 46191993 4D AGCGAGTGAC TGAT/---- TGAGTCACTC 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 TGAT 1 0 3839 CASAVA_Build X 46193236 4D ATCAATCAGG CACC/---- TGCTTCCAGG 3070 het 3070 hom 36 13 20 5 CACC 1 0 3840 CASAVA_Build X 46193420 1D CCAAGCTGAA C/- CCTGTTGTCC 3070 het 3070 hom 41 12 22 8 C 3 2 3841 CASAVA_Build X 46196665 1I TTTCTGGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 9 13 T 13 14 3842 CASAVA_Build X 46197829 1D TGCAAGAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 10 9 3843 CASAVA_Build X 46203375 1I TGTCTAAGTG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 7 8 3844 CASAVA_Build X 46205517 1I TCTGGATTGG -/T TAAACAAACT 1805 het 1805 ref 44 33 4 7 T 1 2 3845 CASAVA_Build X 46206889 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2056 het 801 hom 16 3 8 5 A 13 12 3846 CASAVA_Build X 46209313 3D CCAAGGGCAG CTT/--- CTTCTAAAGA 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 CTT 2 1 3847 CASAVA_Build X 46220562 2I GTGGAGAGAA --/AC ACACACAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 AC 3 4 3848 CASAVA_Build X 46242287 2D GTTTATCTAT AC/-- ACACACACTC 3070 het 3070 hom 31 10 18 4 AC 5 4 3849 CASAVA_Build X 46252437 1D AAACTAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 11 10 3850 CASAVA_Build X 46295080 3D GCAAAAAAAA ATT/--- ATTATAAACC 2848 het 2848 ref 30 18 8 7 ATT 2 1 3851 CASAVA_Build X 46299755 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2317 hom 36 13 12 11 T 17 16 3852 CASAVA_Build X 46307455 1I CTATGATTGA -/T TTTTTTTTTT 2860 het 1520 hom 30 7 10 13 T 13 14 3853 CASAVA_Build X 46322956 2I TTAAAAGAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1021 hom 26 4 12 10 T 10 12 3854 CASAVA_Build X 46323955 1D GGAAGCTTTC T/- TTCTAAAGAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 3 2 3855 CASAVA_Build X 46328809 1D CCAGCTACTC G/- GGAGGCTGAG 2544 het 1429 hom 11 5 6 0 G 3 2 3856 CASAVA_Build X 46346431 1D AGGTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 21 9 A 12 11 3857 CASAVA_Build X 46363323 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2830 het 1494 hom 22 7 8 8 A 15 14 3858 CASAVA_Build X 46366403 1D TGGCAACATC A/- AATAATTAAT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 3 2 3859 CASAVA_Build X 46368613 2D GGGTTGGGAA CC/-- CCCCCCTATA 3070 het 3070 ref 48 21 21 7 C 8 6 3860 CASAVA_Build X 46372158 1D TGGGCGGGTT G/- GGGGGGGGGC 1967 het 1171 hom 14 4 7 3 G 10 9 3861 CASAVA_Build X 46378037 1D AGGCACAGGA T/- TTTTTTTTTT 2354 het 487 hom 24 3 9 12 T 19 18 3862 CASAVA_Build X 46381019 1D CTTGTAGGTT A/- AAAAAAAAAA 1785 het 1785 ref 38 26 6 6 A 12 11 3863 CASAVA_Build X 46396816 1I TAGGCATGCG -/C CACTGTGCCT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 C 1 2 3864 CASAVA_Build X 46433972 1D TAATTATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 665 hom 28 2 21 5 T 12 11 3865 CASAVA_Build X 46451023 3D TCCCCATCAG TGT/--- TGTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 46 28 16 4 TGT 2 1 3866 CASAVA_Build X 46478064 6I ACACTAAAGT ------/AGATTG AGATTAAGTT 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 AGATTG 0 1 3867 CASAVA_Build X 46485283 1I TGAAATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 13 14 3868 CASAVA_Build X 46499066 1I GAAAGGTGAT -/A GGGGTGGTGG 3070 het 3070 hom 47 20 18 9 A 0 1 3869 CASAVA_Build X 46502134 1I CGAGGGGGGA -/G GGCAGGGGGC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 G 2 3 3870 CASAVA_Build X 46528330 1I GTATAGATTT -/A GGGGGCATAA 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 A 0 1 3871 CASAVA_Build X 46576023 1I AGACCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1248 hom 33 4 20 9 A 12 13 3872 CASAVA_Build X 46623708 3D GACTACTGAG ATT/--- ATTATTAGAA 2696 het 2696 ref 17 11 6 0 ATT 3 2 3873 CASAVA_Build X 46627611 5D AATCTACATC TTAAG/----- TTAATGAGAT 3070 het 3070 ref 30 18 8 5 TTAAG 1 0 3874 CASAVA_Build X 46641126 3D4M1I CAACTATCAG TATTTGC-/---TTGCT CACACGAAGC 3070 het 3070 ref 28 19 7 4 N/A 0 0 3875 CASAVA_Build X 46717086 1I CAGGCATGTG -/C CCCCATGCCT 3070 hom 27 het 12 0 9 3 C 4 5 3876 CASAVA_Build X 46803861 1I34M1I7M1I17M1I TTCTAATTCC -CTGGTATCTATAAACCCTTTTCAGGGGAGAGACC-GGAGACC-CCATCTTAGATACTGTC-/ACTGGTATCTATAAACCCTTTTCAGGGGAGAGACCAGGAGACCACCATCTTAGATACTGTCA AACTCACTAC 3070 hom 84 het 22 0 29 13 N/A 0 0 3877 CASAVA_Build X 46810576 1D AAATTAATGC A/- AAAAGTGGCT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 5 4 3878 CASAVA_Build X 46810962 1I CCAGACATGC -/A AGGTTGACTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 1 2 3879 CASAVA_Build X 46827424 1I CTCTCCACTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 2914 hom 24 10 9 5 A 7 8 3880 CASAVA_Build X 46833942 16D ATATATATAT ACACACACACACACAC/---------------- ACACACACAC 3070 hom 24 het 10 0 9 2 AC 17 9 3881 CASAVA_Build X 46842255 1D CACGCCTAGC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 9 8 3882 CASAVA_Build X 46851720 1D CAAATAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 562 hom 36 2 25 10 A 11 10 3883 CASAVA_Build X 46853175 1I ACCCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 24 1 20 3 A 10 11 3884 CASAVA_Build X 46853499 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2440 het 19 hom 19 1 9 9 A 13 12 3885 CASAVA_Build X 46860607 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1148 hom 28 3 19 6 A 12 11 3886 CASAVA_Build X 46882804 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 40 het 17 0 14 4 A 10 9 3887 CASAVA_Build X 46895407 1D TTTCATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 22 1 14 7 T 13 12 3888 CASAVA_Build X 46928647 1I TAATTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 7 8 3889 CASAVA_Build X 46960997 8D TCTGCGGTTT GTCTACCA/-------- GTCTACCATT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 GTCTACCA 2 1 3890 CASAVA_Build X 46978107 53D TGACGTGAGC TGAGGGGCGTGCTCTGAGGCCGAGGGACGACAGTGGAGGGGAGGTGGTGCCTA/----------------------------------------------------- TGAGGCAGAA 3070 hom 47 het 13 0 16 1 TGAGGGGCGTGCTCTGAGGCCGAGGGACGACAGTGGAGGGGAGGTGGTGCCTA 1 0 3891 CASAVA_Build X 46997147 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 24 0 23 1 T 11 12 3892 CASAVA_Build X 47007669 1D CTCCAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 17 1 14 2 T 13 12 3893 CASAVA_Build X 47026773 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1721 het 1721 ref 23 11 6 8 T 15 14 3894 CASAVA_Build X 47027712 1D CTGAACCAGA G/- GGGCCAGGTG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 G 4 3 3895 CASAVA_Build X 47038168 1D TGCAGGCATA C/- CCCCCCTCCC 3070 het 1942 hom 25 7 11 9 C 7 6 3896 CASAVA_Build X 47051690 1D ATTAAAAAAA T/- ATATATATAT 2108 het 2108 ref 14 8 5 1 T 1 0 3897 CASAVA_Build X 47052614 1I TTCCTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3038 het 3038 ref 21 9 8 4 T 10 11 3898 CASAVA_Build X 47056969 1I GTTCGGGCTG -/T TGAGACTAAG 1922 het 1922 ref 31 13 7 11 T 1 2 3899 CASAVA_Build X 47073289 2D GTGACCTTGG CT/-- CACTGCAGCC 1369 het 1369 ref 24 17 3 4 CT 1 0 3900 CASAVA_Build X 47077319 1D AAGCGGTCCT C/- CCACCTCAGC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 C 3 2 3901 CASAVA_Build X 47079140 1D AAAAACAAAC A/- AAAACTACCT 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 A 5 4 3902 CASAVA_Build X 47080494 1D ACAAAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 A 10 9 3903 CASAVA_Build X 47085848 1D CTTGTTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 T 11 10 3904 CASAVA_Build X 47086195 1D TCTAGTCGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 20 13 T 11 10 3905 CASAVA_Build X 47088600 1D TTTATTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1327 hom 18 3 10 5 T 13 12 3906 CASAVA_Build X 47107226 3I TGCCTTTCTG ---/GTA CAGCTTAGCA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 GTA 0 1 3907 CASAVA_Build X 47114445 1I GATTGAACCA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 7 8 3908 CASAVA_Build X 47115828 1I CACAAAAAGG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 7 8 3909 CASAVA_Build X 47123757 1I TTTGAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 1808 het 1808 ref 24 7 10 7 T 17 18 3910 CASAVA_Build X 47150343 1D CCTACCCCCC T/- ACCCTTTCTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 T 1 0 3911 CASAVA_Build X 47154180 1I AGAGATGGGG -/T TTCACCCCAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 2 3 3912 CASAVA_Build X 47155776 1I ACCTCAACTT -/A AAAACCTCAC 3070 het 2965 hom 28 9 13 6 A 4 5 3913 CASAVA_Build X 47166749 3I GCAGTGAGCT ---/GAG ATTGTGCCAC 1730 het 1730 ref 16 9 4 3 GAG 0 1 3914 CASAVA_Build X 47171121 1D CCTGTTGCGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 10 9 3915 CASAVA_Build X 47180995 1I CACCTTGGCC -/T CCCAAAGTGC 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 0 1 3916 CASAVA_Build X 47184856 1I TCTTTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 10 4 T 10 11 3917 CASAVA_Build X 47187205 1D AGATATTTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 44 hom 21 2 12 7 T 9 8 3918 CASAVA_Build X 47187266 1I TAGAGTGCAG -/T TGACACTATC 2443 het 2443 ref 28 9 8 11 T 1 2 3919 CASAVA_Build X 47210542 1I TAAAATGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 11 12 3920 CASAVA_Build X 47215071 1D ACTCTATTTC A/- AAAAAAAAAA 2910 het 1847 hom 19 7 7 5 A 14 13 3921 CASAVA_Build X 47221211 1I ACCAGCCTGG -/C CAACATGGTG 3070 hom 21 het 10 0 8 2 C 1 2 3922 CASAVA_Build X 47221350 1I CAGGCACGCG -/C CACCACACCC 2166 hom 24 het 9 0 8 1 C 1 2 3923 CASAVA_Build X 47224050 1D ATGAACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 14 8 A 13 12 3924 CASAVA_Build X 47226944 10I GCCGGTGCGT ----------/GCGTGCGCGC GCGTGCGCGT 3064 het 1328 hom 23 6 9 8 GCGTGCGCGC 0 1 3925 CASAVA_Build X 47227857 1I TAACTTTTCT -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 56 het 25 0 18 7 C 9 10 3926 CASAVA_Build X 47230399 6I CATTTAATCA ------/AGTTTC AAAATGAATG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AGTTTC 0 1 3927 CASAVA_Build X 47233936 1I TTTTTCTGAG -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 0 1 3928 CASAVA_Build X 47235717 3D TGGGTTCGCC CTT/--- CTTGGTGTAG 3070 het 3070 ref 52 31 17 6 CTT 2 1 3929 CASAVA_Build X 47236741 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2212 hom 21 5 13 3 T 8 9 3930 CASAVA_Build X 47240376 16D TTTGTTTTCC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 2945 het 1090 hom 23 6 8 10 T 30 14 3931 CASAVA_Build X 47243367 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1933 hom 16 6 7 3 A 15 14 3932 CASAVA_Build X 47246684 1I ACCCAGATAA -/T TTTTTTTTTT 3013 het 2377 hom 24 7 10 7 T 10 11 3933 CASAVA_Build X 47258982 2D TCCTACAATG CA/-- CAGTCTGCTC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 CA 2 1 3934 CASAVA_Build X 47260906 1I AAGGACACAT -/C AGGTGTGGAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 0 1 3935 CASAVA_Build X 47263127 2D TTTGGGATTC AT/-- ATAGTTATCA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 AT 2 1 3936 CASAVA_Build X 47268341 1I CCAGTCCCCT -/C CTGCGGGCAG 3070 hom 57 het 24 0 16 8 C 1 2 3937 CASAVA_Build X 47269675 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 8 9 3938 CASAVA_Build X 47288915 1I ACAAAAACAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 2640 hom 17 6 9 2 A 7 8 3939 CASAVA_Build X 47295842 7I GGCTGAGGTA -------/GGAGGTT GGAGGATAGC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 GGAGGTT 0 1 3940 CASAVA_Build X 47297753 1D AGCTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 12 11 3941 CASAVA_Build X 47300151 2D31M2D CAGAGCGAGA CTCTGTTTCCAAAAACAAACAAACAAACAAAACAA/--CTGTTTCCAAAAACAAACAAACAAACAAAAC-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 18 12 9 5 N/A 0 0 3942 CASAVA_Build X 47334211 5I ATGATAACTA -----/TAACT TAACTTATAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TAACT 1 2 3943 CASAVA_Build X 47338697 1I TAACATGGTG -/A AACCCCATCT 3070 hom 39 het 15 0 12 3 A 2 3 3944 CASAVA_Build X 47347357 1D ATATTAGTGA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 T 8 7 3945 CASAVA_Build X 47349236 1D CTTGATATCG C/- ACTGCTGATA 3070 hom 102 het 36 0 34 3 C 1 0 3946 CASAVA_Build X 47350639 1I GTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 149 hom 30 2 18 10 T 13 14 3947 CASAVA_Build X 47356203 12D ACAGCCCCTC CAAAGAATAGAG/------------ CAAAGCATTG 3070 hom 90 het 34 0 30 7 CAAAGAATAGAG 1 0 3948 CASAVA_Build X 47365667 5I CAACACATTT -----/TTTTC TTTTAAGAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTTTC 0 1 3949 CASAVA_Build X 47372857 1I TTGGAAGGCT -/G GCATGGCCAA 3070 hom 100 het 42 0 35 7 G 1 2 3950 CASAVA_Build X 47386750 1D TTTCAGGAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 12 15 9 T 10 9 3951 CASAVA_Build X 47408975 2I TCCTCTTTCT --/TC TCTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 TC 2 3 3952 CASAVA_Build X 47423842 1D TATAAGGGGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 8 7 3953 CASAVA_Build X 47425254 1I TCTTTTTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 T 9 10 3954 CASAVA_Build X 47439219 1I ATTATAAGGT -/A AAAAAAAAAA 2793 het 2793 ref 28 20 7 1 A 11 12 3955 CASAVA_Build X 47456188 2I GGACTTGTTT --/GG TACAGGCAAG 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 G 0 2 3956 CASAVA_Build X 47461369 1I TTGCTATTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 23 7 15 1 T 8 9 3957 CASAVA_Build X 47525514 1D TTCTTAAGGA T/- TTTAGAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 4 3 3958 CASAVA_Build X 47539332 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2449 het 7 hom 28 1 9 18 T 18 16 3959 CASAVA_Build X 47551677 11D CATATGCACC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 3 A 22 11 3960 CASAVA_Build X 47565330 8D TTTAAAATAC TCAACCAA/-------- TGGGGCTGTT 3070 hom 66 het 26 0 22 8 TCAACCAA 1 0 3961 CASAVA_Build X 47580687 1D CCTCCTCCCC T/- TGTGGTATGT 3070 hom 80 het 30 0 26 5 T 2 1 3962 CASAVA_Build X 47584278 1I TTTTTTTGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 8 9 3963 CASAVA_Build X 47584702 4D AGGACTCCTT CCTC/---- CGTGGAATGT 3070 hom 54 het 19 0 18 1 CCTC 1 0 3964 CASAVA_Build X 47592262 1I TTAGAAATAA -/T TTTTTTTTTT 2937 het 368 hom 16 1 10 7 T 15 16 3965 CASAVA_Build X 47595743 1D CCAAGCAACA C/- AGTGTCTTGT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 C 1 0 3966 CASAVA_Build X 47628305 1D TTATAAGAGA T/- TGTGGCTGGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 1 3967 CASAVA_Build X 47643634 1I TGTTTCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 25 1 24 0 T 11 12 3968 CASAVA_Build X 47649586 1I AATCAACTCC -/A AAAAAAAAAA 1751 hom 12 het 5 0 5 0 A 11 12 3969 CASAVA_Build X 47684912 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 57 hom 25 1 20 4 A 15 14 3970 CASAVA_Build X 47690942 2D TTTCAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AG 7 6 3971 CASAVA_Build X 47697370 1D TCTGAGAGAC T/- TTTTTGATTT 3070 hom 111 het 41 0 37 5 T 6 5 3972 CASAVA_Build X 47697951 1I CGGGCGTGCT -/G GCAGGCGCCT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 2 3973 CASAVA_Build X 47701875 1I CATCCAATTT -/G GGATCCTCTT 3070 hom 92 het 35 0 30 5 G 2 3 3974 CASAVA_Build X 47702059 1D TCCCGGATGT G/- GGGGGGGCCC 3070 hom 50 het 23 0 16 7 G 8 7 3975 CASAVA_Build X 47707149 1D ATAATAATAA T/- AAAAAAACCA 3070 het 1895 hom 20 5 13 2 T 1 0 3976 CASAVA_Build X 47719660 3I TTAATGAATA ---/CTT CTGTATGTTC 3070 hom 144 het 56 0 49 7 CTT 0 1 3977 CASAVA_Build X 47724694 4D AAGATATAGT TAGA/---- TAGGAGGAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TAGA 1 0 3978 CASAVA_Build X 47737299 3D CACCAGAATA AAG/--- AAGAATTCTC 3070 hom 102 het 35 0 34 3 AAG 2 1 3979 CASAVA_Build X 47748496 1I GGCCAGATGG -/C CGTGCCCACC 3070 hom 60 het 22 0 19 3 C 1 2 3980 CASAVA_Build X 47772543 1I CCCACATGGG -/C CCAGAGGCCC 3070 hom 27 het 13 0 10 3 C 2 3 3981 CASAVA_Build X 47778929 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 201 hom 30 2 23 5 A 11 10 3982 CASAVA_Build X 47786455 1I CTATCTACTT -/G GAGACAGAGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 1 2 3983 CASAVA_Build X 47796537 1I AAAAAAACAA -/C CCCCCCCCCA 3070 het 135 hom 15 1 9 5 C 9 10 3984 CASAVA_Build X 47800257 1D GGCTTGCTGC A/- AAGCACTGAC 3070 hom 74 het 29 0 23 6 A 3 2 3985 CASAVA_Build X 47810660 1I TTTCAGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 43 1 29 13 A 11 12 3986 CASAVA_Build X 47814166 9D ACATTGTCTG TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 231 het 194 hom 20 3 3 17 T 24 15 3987 CASAVA_Build X 47815147 14I GGACACCACA --------------/GGGGCAGAGATTTT TGTTCATTCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 GGGGCAGAGATTTT 0 1 3988 CASAVA_Build X 47824281 1D CCCCTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 9 A 11 10 3989 CASAVA_Build X 47834734 1D GGTGCTCATG T/- TTTAGCATAA 3070 hom 102 het 38 0 34 6 T 4 3 3990 CASAVA_Build X 47838898 1D ACCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 15 1 12 3 A 13 12 3991 CASAVA_Build X 47840369 1D GTTAATTATG A/- AAAAAAAAAA 3019 hom 18 het 11 0 7 5 A 11 10 3992 CASAVA_Build X 47844069 1I TTTACTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 533 hom 21 2 13 6 A 15 16 3993 CASAVA_Build X 47852576 1I TATTTTTTTA -/T TTTTGTATTT 3070 hom 36 het 17 0 12 5 T 4 5 3994 CASAVA_Build X 47853296 1I GCCAGGCTGG -/C CTGGACCTCC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 1 2 3995 CASAVA_Build X 47857301 1I TGGGGTTTAA -/C CCCCATTTGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 4 5 3996 CASAVA_Build X 47884653 1D ATGACAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 13 10 14 A 11 10 3997 CASAVA_Build X 47897763 1I GTTAAAAAAA -/T AATAAAAATT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 0 1 3998 CASAVA_Build X 47933787 7I CATTGTTGTC -------/TGTTGTG TTCTTTTATG 3070 hom 64 het 26 0 20 6 TGTTGTG 0 1 3999 CASAVA_Build X 47936027 1D GAGGCCCTAC G/- GGGGTGAAGC 3070 hom 56 het 23 0 19 4 G 5 4 4000 CASAVA_Build X 47938794 1D ACTCTAAGTC A/- AAAAAAAAAA 1279 het 102 hom 17 2 5 10 A 12 11 4001 CASAVA_Build X 47952321 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1774 het 1774 ref 30 13 8 9 A 11 12 4002 CASAVA_Build X 47960348 14D GACATGCGAC TCTTCCTTTCATTT/-------------- GAACACTTAG 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 TCTTCCTTTCATTT 1 0 4003 CASAVA_Build X 47962215 6D ATTTACACAC CACACA/------ CACACACACA 3070 het 3070 hom 33 12 10 14 CA 11 8 4004 CASAVA_Build X 47965758 7I ATTTCTGGTG -------/GACCACT GACACGTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 GACCACT 0 1 4005 CASAVA_Build X 47968087 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2914 het 2914 ref 19 9 7 3 A 10 11 4006 CASAVA_Build X 47972890 1I ATAATGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2993 hom 30 9 14 7 A 10 11 4007 CASAVA_Build X 47973195 1D TTCTTCATCA T/- ATGGTCAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 1 0 4008 CASAVA_Build X 47987701 4I GATGGGAGGA ----/GAGT GAGTATTACT 3070 hom 76 het 29 0 23 6 GAGT 1 2 4009 CASAVA_Build X 47987763 1D GTTCTGTACC T/- TTTTTTTTTC 2215 het 2215 ref 26 13 5 8 T 10 9 4010 CASAVA_Build X 47989533 1D GAAAATGCAG A/- AAAAAAATGG 2766 hom 18 het 8 0 6 2 A 8 7 4011 CASAVA_Build X 47992499 2I TTTTTGTCTC --/TT GGTAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 0 2 4012 CASAVA_Build X 47995356 6D AACAAAAACA AAAACC/------ AAAACCTAAT 2415 het 2415 ref 23 13 8 3 AAAACC 2 1 4013 CASAVA_Build X 47995653 1I GATTCCATCA -/T TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 6 7 4014 CASAVA_Build X 47998194 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAATT 2327 het 1859 hom 13 6 5 2 A 9 8 4015 CASAVA_Build X 47999107 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3013 hom 22 9 11 2 T 8 7 4016 CASAVA_Build X 48001144 1D CAGAACAGAA C/- CCCCCCATCC 3070 het 3070 hom 34 18 14 3 C 7 6 4017 CASAVA_Build X 48003190 2I AACATGCAAA --/AC AGTAATATGT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AC 0 1 4018 CASAVA_Build X 48003834 2I CTAAACACTG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 1806 hom 24 7 14 3 T 9 11 4019 CASAVA_Build X 48005164 1D TTTAAAAGTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 9 8 4020 CASAVA_Build X 48007843 1D TTTGTAGACC T/- TGTGAATTCT 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 T 2 1 4021 CASAVA_Build X 48009910 14D CATTGATCAA TTACGTTCGTTATC/-------------- TTCTCTAGGT 3070 het 3070 ref 41 27 18 2 TTACGTTCGTTATC 1 0 4022 CASAVA_Build X 48011359 1I CACAACGGTG -/A AAACTTGAGC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 3 4 4023 CASAVA_Build X 48018089 1I GGCCAGAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2823 hom 28 7 17 4 A 9 10 4024 CASAVA_Build X 48018756 1D CCCATCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 21 1 15 6 A 15 14 4025 CASAVA_Build X 48019285 1I CACTGGGGCC -/T TCTGGTTCTT 3070 hom 39 het 16 0 14 3 T 1 2 4026 CASAVA_Build X 48022986 1D TTGAGTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 11 10 4027 CASAVA_Build X 48030852 3D GCCTTATAAG AGA/--- AGAATATAGT 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 AGA 2 1 4028 CASAVA_Build X 48031930 1D CTCTGAAAAT A/- AAAAAAAAAG 2782 het 2782 ref 21 12 6 3 A 10 9 4029 CASAVA_Build X 48034724 1D AACGAAACAT A/- AAATTGAATT 3070 het 3070 ref 31 22 8 3 A 4 3 4030 CASAVA_Build X 48037591 1I CCGTCTCTAT -/A AAAAAAATAC 3070 het 1633 hom 16 6 8 2 A 7 8 4031 CASAVA_Build X 48056113 1I AATTAGGTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 10 4032 CASAVA_Build X 48065186 3D ACCTGGCTAC TTG/--- TTGTATTTTT 3070 hom 44 het 21 0 14 7 TTG 2 1 4033 CASAVA_Build X 48174969 4I CATGTGTGTT ----/AATC AGGCTCAGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AATC 0 1 4034 CASAVA_Build X 48175084 3I TTCTATTGTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TTG 5 6 4035 CASAVA_Build X 48176227 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 690 hom 22 2 11 9 A 15 14 4036 CASAVA_Build X 48187891 1D ACCTTTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 23 1 18 4 A 13 12 4037 CASAVA_Build X 48190813 1D ATAATACCCA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 8 7 4038 CASAVA_Build X 48192562 2D CCCATAAATC TA/-- TATTATTCCC 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 TA 2 1 4039 CASAVA_Build X 48197068 1D CCGACTAATT A/- AAAAAAAAAA 1086 het 757 hom 13 5 3 5 A 12 11 4040 CASAVA_Build X 48198411 4D TGTTGTTTGT TTTG/---- TTTTTTTGTT 3070 hom 47 het 20 0 16 5 TTTG 1 0 4041 CASAVA_Build X 48199603 2D AAACCCTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 1897 het 89 hom 20 2 8 10 A 20 18 4042 CASAVA_Build X 48228832 3I TCACCATAAA ---/AGT AGGAGGAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AGT 0 1 4043 CASAVA_Build X 48243231 1I CTCTGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 2168 het 1685 hom 23 7 7 9 A 13 14 4044 CASAVA_Build X 48244905 1I CCTCAAGCAA -/T TCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 1 2 4045 CASAVA_Build X 48315067 3I AAACAACAAT ---/AAC AACAACAAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AAC 2 3 4046 CASAVA_Build X 48321903 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 218 hom 26 1 15 10 A 13 12 4047 CASAVA_Build X 48335929 1D CAAACTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 17 6 T 11 10 4048 CASAVA_Build X 48344272 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 27 het 10 0 10 2 A 6 5 4049 CASAVA_Build X 48350433 2D ACTCCCAAGA CT/-- CAGTATGTGG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 CT 1 0 4050 CASAVA_Build X 48373652 1D AGAGACAGGT G/- GGGGGGGTGG 1924 het 6 hom 9 0 5 4 G 8 7 4051 CASAVA_Build X 48378347 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 9 8 4052 CASAVA_Build X 48404162 6D TCTCTCTCTG TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 64 het 24 0 21 7 TC 9 6 4053 CASAVA_Build X 48433912 1D TCGACAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2001 hom 25 7 10 8 T 11 10 4054 CASAVA_Build X 48464535 1D GATGACAGAC G/- TAACAACCTG 3070 het 3070 hom 63 28 30 6 G 1 0 4055 CASAVA_Build X 48479871 3D AACTGCAGAG TGT/--- TGTAATAACT 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 TGT 2 1 4056 CASAVA_Build X 48534371 1I GGGGAAAGGA -/G GGAAGAGGAG 3070 hom 54 het 19 0 18 1 G 2 3 4057 CASAVA_Build X 48589696 1D AGAATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 11 10 4058 CASAVA_Build X 48599305 1D ATCTTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 21 0 16 5 A 11 10 4059 CASAVA_Build X 48605742 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1579 het 1177 hom 16 6 4 6 A 19 18 4060 CASAVA_Build X 48626209 1I GTTTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 12 13 4061 CASAVA_Build X 48663358 1D TAGATATCAC T/- TTTTTTTTTT 872 het 872 ref 31 13 4 14 T 17 16 4062 CASAVA_Build X 48676127 2I AATGACTGTA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 AG 7 8 4063 CASAVA_Build X 48753660 1D CCTTTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 1763 het 1763 ref 34 22 4 8 T 12 11 4064 CASAVA_Build X 48785408 1D TACCCCCTAC T/- TTTTTTTTTT 1020 het 1020 ref 24 12 3 9 T 15 14 4065 CASAVA_Build X 48840991 1I ATTGAAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1919 hom 43 5 33 5 T 10 11 4066 CASAVA_Build X 48883713 1D GGCATTTCTC A/- TTTGGGTTTC 3070 het 3070 ref 48 35 10 4 A 1 0 4067 CASAVA_Build X 48902984 1D ATTTTTGTAG A/- AGACTGGGGT 3070 hom 54 het 22 0 16 7 A 2 1 4068 CASAVA_Build X 48909236 1D AGAACGCCTG T/- CAAGGGAGAT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 1 0 4069 CASAVA_Build X 48961005 1I GGGAGGTATC -/G GGGGGCCGCC 3070 hom 92 het 36 0 27 9 G 5 6 4070 CASAVA_Build X 48977948 1D CAAGTGTCAA T/- TTTTTTTTTT 1912 het 1624 hom 26 8 7 11 T 17 16 4071 CASAVA_Build X 48988417 1I CTCTCTGTCA -/C CCCTCTCCCT 3070 hom 76 het 27 0 24 3 C 3 4 4072 CASAVA_Build X 49007911 3D CCATTTATTC TAT/--- TATTATTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 TAT 3 2 4073 CASAVA_Build X 49014875 1I CAAGTGCAAA -/G GTCCTGGGGT 3070 hom 120 het 51 0 41 10 G 1 2 4074 CASAVA_Build X 49016338 1D TTTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 13 12 4075 CASAVA_Build X 49035428 3I TGGTGTCTCC ---/AGG AACAGCGCAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 AGG 0 1 4076 CASAVA_Build X 49038971 1I ATGTTGAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 T 9 10 4077 CASAVA_Build X 49048141 2D AGGTACACAC AT/-- ATGCTTAACT 3070 het 3070 hom 41 11 26 4 AT 2 1 4078 CASAVA_Build X 49052882 4I CTTTACATTG ----/ACTC ATGACTAAAT 3070 het 3070 ref 59 35 18 6 ACTC 0 1 4079 CASAVA_Build X 49061073 1D ACGCGACCAA G/- GCATTATATT 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 G 2 1 4080 CASAVA_Build X 49102258 1D AGACTTTATC T/- AGAGTGAGTC 2443 het 2443 ref 21 11 6 4 T 1 0 4081 CASAVA_Build X 49269667 1D TGTATAATAT A/- AAAATATATT 1941 het 1714 hom 10 4 5 2 A 5 4 4082 CASAVA_Build X 49270815 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1379 het 760 hom 20 6 5 9 A 17 16 4083 CASAVA_Build X 49282905 1D CACACAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 11 10 4084 CASAVA_Build X 49290954 7D TATGATCATA CAATTGC/------- CCTCCAGCCT 3070 het 3070 hom 45 18 22 7 CAATTGC 1 0 4085 CASAVA_Build X 49313791 1I AGCTCTTGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 67 het 30 0 21 9 A 9 10 4086 CASAVA_Build X 49333881 1D CACCACACAA G/- GAATCCCTTC 3070 hom 102 het 36 0 35 3 G 2 1 4087 CASAVA_Build X 49343935 1D AAGACAGAAG T/- TTTTTTTTTA 1343 het 1343 ref 37 29 3 6 T 10 9 4088 CASAVA_Build X 49389328 1I CCGATGATTC -/A ATCCAAAACC 3070 hom 156 het 56 0 52 4 A 1 2 4089 CASAVA_Build X 49392591 3D GAAAACCTCA AAG/--- AAGATTAAAA 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 AAG 2 1 4090 CASAVA_Build X 49544667 1I TAGAGCTACA -/G GCATGCGCCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 2 4091 CASAVA_Build X 49563753 2D TGTTTAGTTT TA/-- TTTAGGAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TA 1 0 4092 CASAVA_Build X 49581130 1D AGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1335 het 1335 ref 32 18 4 10 T 14 13 4093 CASAVA_Build X 49596793 1I GAAATAAGCG -/C CCTTTCGATT 3070 het 317 hom 29 2 25 2 C 2 3 4094 CASAVA_Build X 49603850 1D TCCAGGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 8 14 8 T 11 10 4095 CASAVA_Build X 49611872 1I AGGTAATCTA -/G TTATATAGAT 2463 hom 39 het 27 0 8 19 G 0 1 4096 CASAVA_Build X 49654236 1D ATTTTATGAG A/- AATAAATGAG 3070 hom 157 het 57 0 53 5 A 3 2 4097 CASAVA_Build X 49669164 1D TATTTCTGGA T/- TTTGTTCTGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 4 3 4098 CASAVA_Build X 49707369 4I ACTGTGTCTT ----/TAAG TAATTCCCAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TAAG 0 1 4099 CASAVA_Build X 49717651 1I TTTGCTTTTT -/A CAGCAATGTA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 A 0 1 4100 CASAVA_Build X 49764383 1D AGTAATAGAA T/- TTTTTTTTTT 1711 het 1711 ref 39 20 6 13 T 17 16 4101 CASAVA_Build X 49765581 1I TAAGAAGTTG -/T GGAGACCAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 1 4102 CASAVA_Build X 49856615 1I GGCAGATCAC -/T CTGAGCTCAG 2335 het 2335 ref 23 12 5 6 T 0 1 4103 CASAVA_Build X 49858457 1I GTGATTTCTC -/T TTGACAGAAT 3070 het 3070 ref 91 52 29 10 T 2 3 4104 CASAVA_Build X 49858574 3D GGCAGTAACT GTC/--- TCTGTGTACA 3070 het 3070 ref 92 49 36 11 GTC 1 0 4105 CASAVA_Build X 49859481 3I ATGTGTGAAA ---/TGT TGTCTGTGAG 2574 het 2574 ref 44 33 6 5 TGT 1 2 4106 CASAVA_Build X 49859822 3I TTGCCATCTT ---/AAC AATATTAAGT 3070 het 3070 ref 74 39 30 6 AAC 0 1 4107 CASAVA_Build X 49860087 1I GATATTGTTC -/A TGTAGTTTTC 3070 het 3070 ref 71 40 23 10 A 0 1 4108 CASAVA_Build X 49860210 4I TAGAATTGGT ----/ATTA GTTGTTCTTT 3070 het 3070 ref 44 30 8 6 ATTA 0 1 4109 CASAVA_Build X 50052061 1D TTCCATAGCC T/- TTTTTTTTAA 1331 het 1331 ref 56 40 3 14 T 9 8 4110 CASAVA_Build X 50074703 1D GCTTACAGAG A/- AAAAAATATC 3070 hom 48 het 23 0 16 8 A 7 6 4111 CASAVA_Build X 50081796 1I TTTTTTTTGG -/T TCCATATGAA 3070 het 195 hom 20 1 11 8 T 1 2 4112 CASAVA_Build X 50118688 1D TTTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2446 het 2446 ref 24 13 6 5 A 13 12 4113 CASAVA_Build X 50119355 1D AAACCCCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 30 0 22 8 T 11 10 4114 CASAVA_Build X 50137887 1I ATTTTGATAA -/G GCCTGGTCTC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 G 1 2 4115 CASAVA_Build X 50166777 2D ATGAGGCCTC AT/-- GTGAATATGT 3070 het 3070 ref 49 25 20 5 AT 1 0 4116 CASAVA_Build X 50213732 1D CTTCAGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 15 26 10 A 11 10 4117 CASAVA_Build X 50224062 15D TTTAAGAATA AGGTTTATGCTCTTT/--------------- AGTCATGGAG 3070 het 3070 ref 22 12 10 1 AGGTTTATGCTCTTT 1 0 4118 CASAVA_Build X 50237571 1D TCTGTATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 17 7 T 12 11 4119 CASAVA_Build X 50272451 1I AAACAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 10 11 4120 CASAVA_Build X 50275692 1I TGAGGAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 11 12 4121 CASAVA_Build X 50278921 1D CCCAGAGGGG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 A 8 7 4122 CASAVA_Build X 50283826 2I CAAACAAAAC --/TT TAGGTTTGTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 3 4123 CASAVA_Build X 50303868 1D AAAAATCTAC A/- AAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 7 6 4124 CASAVA_Build X 50305774 1D TTGACATTTA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 10 9 4125 CASAVA_Build X 50305855 1I ATTTTTTAAG -/T TTTTTTTTCG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 8 9 4126 CASAVA_Build X 50308107 1I ATTATATTAT -/A AATGGGAGAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 2 3 4127 CASAVA_Build X 50308184 4I TTTTAAAGAT ----/AGAC AGATAGATAC 3070 het 2594 hom 19 7 9 3 AGAC 0 1 4128 CASAVA_Build X 50316070 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 9 10 4129 CASAVA_Build X 50321872 2D AATAGCTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 A 12 10 4130 CASAVA_Build X 50325521 1D TGATGGTATG A/- AAAAAAAAAA 2230 het 2230 ref 45 31 6 8 A 13 12 4131 CASAVA_Build X 50345599 1I CAAAACTGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 T 9 10 4132 CASAVA_Build X 50346258 2D TTGAAGAAAC TT/-- TTAAGCAGTT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 4 2 4133 CASAVA_Build X 50350617 3D TATTTTCTCC TAA/--- TATTATGTTG 3070 het 3070 hom 48 22 23 5 TAA 1 0 4134 CASAVA_Build X 50353270 1I CCCTGCCCCA -/C CCCCCCCAAA 1135 het 518 hom 11 3 5 3 C 7 8 4135 CASAVA_Build X 50365819 1I TGAAGGATTC -/T TTTTTTTTTT 2249 het 2249 ref 32 9 10 13 T 14 15 4136 CASAVA_Build X 50377363 1D TTAAAAAAAT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2045 hom 25 7 11 7 C 10 9 4137 CASAVA_Build X 50379242 1I GCTTGCCCCC -/T GGGCCCACAG 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 0 1 4138 CASAVA_Build X 50383718 2I CTATAAAGAC --/AG AAAGTAGATT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AG 0 1 4139 CASAVA_Build X 50390806 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 7 A 8 7 4140 CASAVA_Build X 50417523 1I TTGCTTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 10 11 4141 CASAVA_Build X 50451256 16I CAAGAGGTCT ----------------/TTAGCAGGTTAAAAAC ATGTAGACTT 3070 hom 93 het 31 0 31 2 TTAGCAGGTTAAAAAC 0 1 4142 CASAVA_Build X 50454111 1D CCAGCATCTG T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 33 20 3 10 T 13 12 4143 CASAVA_Build X 50478243 1I6M5I AGGCTCAAAG -AGCCTC-----/AAGCAGCTGGGA TCAAAGGATC 3070 hom 87 het 32 0 27 5 N/A 0 0 4144 CASAVA_Build X 50502382 1D TGAATTTTTC G/- GGGGGGGGGG 3070 het 402 hom 32 4 13 15 G 11 10 4145 CASAVA_Build X 50520073 1I CTCTAGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2231 hom 25 6 12 7 T 17 18 4146 CASAVA_Build X 50547512 1I GCGCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 690 hom 37 2 28 7 A 12 13 4147 CASAVA_Build X 50572497 1I ACCCCCCCGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 413 hom 24 1 19 4 A 9 10 4148 CASAVA_Build X 50583770 1D TTGGCTCTGA G/- GGCTACCTTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 3 2 4149 CASAVA_Build X 50584455 4D CTACGCTGCC CAAA/---- CAATTACCCT 3070 hom 102 het 36 0 33 4 CAAA 1 0 4150 CASAVA_Build X 50588096 2D AATCAACATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 93 het 40 0 31 9 CA 9 8 4151 CASAVA_Build X 50598462 1I TAAAGATTTT -/A AAAAAACTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 A 6 7 4152 CASAVA_Build X 50606298 1I AGACATTTTA -/T TTTTACCAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 4 5 4153 CASAVA_Build X 50608965 4D TTTTTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 66 het 25 0 23 6 TTTG 3 2 4154 CASAVA_Build X 50614953 5D2M2D ATTTTAAGTG CCATTTAAT/-----TA-- TAATTCAGTG 3070 hom 51 het 18 0 18 2 N/A 0 0 4155 CASAVA_Build X 50616188 1I GTCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1017 het 1017 ref 12 4 4 4 T 13 14 4156 CASAVA_Build X 50617720 1I GTTCTGAGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 9 10 4157 CASAVA_Build X 50629153 4I ATGGTTGAAT ----/AGTA AGTACTCCAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AGTA 1 2 4158 CASAVA_Build X 50633154 8D CCCAGAAAGG TTAAGAGT/-------- TTAAGAGTCC 3070 hom 69 het 30 0 24 9 TTAAGAGT 2 1 4159 CASAVA_Build X 50647495 6D CTCACTGCAA CCTCTG/------ CCTCCCGGGT 2891 hom 26 het 12 0 9 3 CCTCTG 1 0 4160 CASAVA_Build X 50647579 1D CGCATGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 11 10 4161 CASAVA_Build X 50649158 50D GCAGCTGCAG CATGGCACCATTTTGACAGCCCAGCCCCCATAAACTACGTAGTCTACTCC/-------------------------------------------------- CATGGCACCA 1998 hom 43 het 21 0 11 15 CATGGCACCATTTTGACAGCCCAGCCCCCATAAACTACGTAGTCTACTCC 1 0 4162 CASAVA_Build X 50653271 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAC AAAAAAACAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AAAAC 0 1 4163 CASAVA_Build X 50654180 1I AACAGTCGGG -/A AAAAAACCAA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 6 7 4164 CASAVA_Build X 50699245 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2611 hom 29 11 11 7 A 13 14 4165 CASAVA_Build X 50782504 1D TGAGTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 27 1 18 11 T 15 14 4166 CASAVA_Build X 50786408 1D ATTAGGGGGA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 71 het 28 0 24 4 T 7 6 4167 CASAVA_Build X 50791810 14I CATTCCCAGG --------------/AGCTGATAGGGATC AGCTGATGGG 3070 hom 117 het 42 0 34 9 AGCTGATAGGGATC 0 1 4168 CASAVA_Build X 50812118 2I ACAGGCTAGC --/AG AGAGCAGGAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AG 2 3 4169 CASAVA_Build X 50813583 1D TTTTTTTTTT C/- TGCTCTAACA 3070 het 76 hom 37 3 20 14 C 1 0 4170 CASAVA_Build X 50819068 9I TTTTTATTTT ---------/TTTTTATTA TTTATTTTTT 3070 hom 24 het 14 0 9 5 TTTTTATTA 0 1 4171 CASAVA_Build X 50833040 1D GTCTATATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 416 hom 49 2 42 6 A 10 9 4172 CASAVA_Build X 50833215 1D GTAATTAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 37 1 25 12 A 12 11 4173 CASAVA_Build X 50843767 1I CCAGAGATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 27 1 21 5 A 11 12 4174 CASAVA_Build X 50850252 1I AACTTCTCAT -/A ATATCCAGAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 1 2 4175 CASAVA_Build X 50860980 1D GCAAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 33 6 A 12 11 4176 CASAVA_Build X 50937756 4I TATTCTTATT ----/CTAA CTATTTTCTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 CTAA 0 1 4177 CASAVA_Build X 50938161 2D AAATCGATTT AC/-- ACTCATTGTG 3070 hom 120 het 47 0 40 8 AC 2 1 4178 CASAVA_Build X 50976908 1I GCAGCATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 39 0 29 10 T 10 11 4179 CASAVA_Build X 50980754 3D GCTGCTAGTT TCC/--- TCAATATTCC 3070 hom 102 het 38 0 34 5 TCC 1 0 4180 CASAVA_Build X 50998104 3D ATACTAAGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 308 hom 29 3 16 12 A 17 14 4181 CASAVA_Build X 51054817 4I GAGGTTCTGA ----/GTAG GTAGTGTTAT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 GTAG 1 2 4182 CASAVA_Build X 51056764 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 1998 hom 19 6 13 0 A 7 8 4183 CASAVA_Build X 51067531 3I CTCCTGGATT ---/CAC TGATCTTTTG 1361 het 1361 ref 36 33 3 0 CAC 0 1 4184 CASAVA_Build X 51100539 1I GCAAACATCC -/A AAAAAAAAAA 3031 het 3031 ref 29 12 9 8 A 14 15 4185 CASAVA_Build X 51215058 1I AAAACATGTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 9 10 4186 CASAVA_Build X 51254212 1D AGGGGGCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 38 2 26 10 A 12 11 4187 CASAVA_Build X 51257234 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTATG 2467 hom 15 het 11 0 6 5 T 7 8 4188 CASAVA_Build X 51262017 1D TGATTTATGG A/- TGGTCTGCTT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 A 1 0 4189 CASAVA_Build X 51266499 4D AGGTATATAT ATGA/---- ATAAGTTAAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 ATGA 1 0 4190 CASAVA_Build X 51267120 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 11 12 4191 CASAVA_Build X 51321504 2D AACAGGCATT AC/-- CAAGTTGAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 6 AC 1 0 4192 CASAVA_Build X 51323651 1D CAAATCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 669 hom 39 6 17 16 A 17 16 4193 CASAVA_Build X 51338540 1D AAATAGACAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 8 4194 CASAVA_Build X 51341980 2D ACTTGAGCCC AA/-- GAGTTCAGTG 3070 hom 96 het 36 0 31 5 A 2 0 4195 CASAVA_Build X 51371963 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 9 10 4196 CASAVA_Build X 51380343 1D ATGGGGTTAT G/- TTTTTTTTCT 3070 het 235 hom 43 1 37 5 G 1 0 4197 CASAVA_Build X 51393322 1D GCTTTGGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 10 9 4198 CASAVA_Build X 51417516 1I CTTTGTGGAA -/G GTTTTAAAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 2 4199 CASAVA_Build X 51418181 1D TGTTTCCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 550 hom 31 4 12 15 T 17 16 4200 CASAVA_Build X 51426520 1I CTGCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 35 3 18 14 A 13 14 4201 CASAVA_Build X 51453678 1D TCAAAGCAAT C/- CCATTACCCC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 3 2 4202 CASAVA_Build X 51486566 2D TGTTTTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 33 1 18 14 T 15 13 4203 CASAVA_Build X 51508696 3I CACATAAGTT ---/CTG CTGTCAAAAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 CTG 1 2 4204 CASAVA_Build X 51514471 1D TCCATAAGAA T/- TTTGCCTTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 4 3 4205 CASAVA_Build X 51529421 10I TGGTATCCAC ----------/AATTCTTTAT CTTAACCCAG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 AATTCTTTAT 0 1 4206 CASAVA_Build X 51533022 1D AGTTATTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 12 11 4207 CASAVA_Build X 51537939 1D GGTCTTTAGA T/- TAAACTCAAC 1399 het 1399 ref 27 20 3 5 T 2 1 4208 CASAVA_Build X 51555604 1I GCTCCCATCC -/A CCTCCCATGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 0 1 4209 CASAVA_Build X 51566627 1D CCTAACATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 768 hom 29 2 15 12 T 15 14 4210 CASAVA_Build X 51576572 3D TAAAAGAAAG AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 34 0 29 6 A 12 9 4211 CASAVA_Build X 51635063 2I TGAATTCACT --/GA GATCAGTACT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GA 1 2 4212 CASAVA_Build X 51737070 1D AAAAAAAAAA C/- ATGCAAATGG 3070 het 384 hom 31 1 25 5 C 1 0 4213 CASAVA_Build X 51830463 7D TCCAGCTGTT ATATATC/------- AATCTCTCCT 74 het 3 hom 4 0 1 3 ATATATC 1 0 4214 CASAVA_Build X 51912789 1D CATACTTAAC T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 7 6 4215 CASAVA_Build X 51943298 7I5M1D AGGAGAGATT -------GATATA/AACAGGAGAGAT- TAACAGCTGG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 4216 CASAVA_Build X 51990291 1I AAATTAAAAT -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 6 7 4217 CASAVA_Build X 51995022 1I ATCTGTGGGG -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 7 8 4218 CASAVA_Build X 52007502 1I GGCTTGGAGA -/T TTTTAATGGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 4 5 4219 CASAVA_Build X 52015184 1I TTACTGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 49 1 41 7 T 10 11 4220 CASAVA_Build X 52057871 1D AATTTCTGGC A/- AAAAAAAATA 3070 het 2535 hom 16 6 9 4 A 9 8 4221 CASAVA_Build X 52078236 1D CTTATTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 T 13 12 4222 CASAVA_Build X 52653081 1D GACAAAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 37 0 24 13 T 15 14 4223 CASAVA_Build X 52664574 1D CAAAATCCCC G/- TTTTTTTAGA 1345 het 1345 ref 41 31 4 6 G 1 0 4224 CASAVA_Build X 52678093 9D TTAAAGACTA AAAAACAAC/--------- AAAAACAATT 3070 hom 99 het 33 0 34 2 AAAAACAAC 1 0 4225 CASAVA_Build X 52679970 4I GTTTTCTTGA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 14 12 13 TTTG 3 4 4226 CASAVA_Build X 52700951 1D AAAAATAGTC G/- GATCTGTGAT 1826 het 1826 ref 37 31 4 2 G 2 1 4227 CASAVA_Build X 52709422 1D GTAGATAATT A/- AAAAAAAAAA 2313 het 558 hom 14 2 9 3 A 15 14 4228 CASAVA_Build X 52716253 1I GTGGTGCACA -/C CTGTAGTCCC 1147 hom 9 het 4 0 3 1 C 1 2 4229 CASAVA_Build X 52844051 1I GTCCAGTGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 9 10 4230 CASAVA_Build X 52849907 1I CAACTGTACC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 9 4231 CASAVA_Build X 52874389 2D ACTCTAAGAC AG/-- AGTTACACTC 3070 hom 69 het 26 0 24 4 AG 2 1 4232 CASAVA_Build X 52902444 1I GTGCTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 A 10 11 4233 CASAVA_Build X 52904022 1I TAGGCTAATG -/T TAAGCATGCT 3070 het 3070 ref 57 42 10 5 T 1 2 4234 CASAVA_Build X 52904282 1D TGACCAAATG T/- TTCCCCCTAG 3070 het 3070 ref 65 37 24 5 T 3 2 4235 CASAVA_Build X 52904428 4D TATATTCAAG ATAA/---- ATAGTCTTAA 3070 het 3070 ref 44 34 8 2 ATAA 1 0 4236 CASAVA_Build X 52907741 1D AGGCATCAGT C/- CAACTCATTA 3070 het 3070 ref 53 39 8 6 C 2 1 4237 CASAVA_Build X 52908092 7D ATGCAGTCAT TCATTTA/------- TTTTGCAGTG 2337 het 2337 ref 52 44 6 7 TCATTTA 1 0 4238 CASAVA_Build X 52908345 1D ATAAAAACAG T/- TTTGTGTTGT 3070 het 3070 ref 63 42 16 5 T 4 3 4239 CASAVA_Build X 52908558 1D CTGTAGAGAC T/- TTGAAGATAG 3070 het 3070 ref 60 40 15 5 T 3 2 4240 CASAVA_Build X 53019145 1D TTAAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 10 9 4241 CASAVA_Build X 53029279 1I GCCATAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 429 hom 31 1 24 6 A 9 10 4242 CASAVA_Build X 53029483 1I ACTGATATAA -/T TTTTTCCCTC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 5 6 4243 CASAVA_Build X 53031407 1I62M1D AAATAAAAAT -AACCCAAAGTAAGCAGAATGAGGGAAATAAAGATTGGAGCTGAAATCGATAAGACTGAAAACA/AAACCCAAAGTAAGCAGAATGAGGGAAATAAAGATTGGAGCTGAAATCGATAAGACTGAAAAC- AAAAAAAAGA 3070 hom 172 het 33 0 57 9 N/A 0 0 4244 CASAVA_Build X 53034139 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1372 hom 10 het 5 0 4 1 A 13 12 4245 CASAVA_Build X 53034281 1I GTATAGTGAT -/A AGAGAACAGA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 1 2 4246 CASAVA_Build X 53063411 4I59M2D TGTATATATA ----TGTGTGTGTATATATATACACGTGTATATATGTATGTGTGTGTATATTTATACACATGCAT/TGTTTGTGTGTGTATATATATACACGTGTATATATGTATGTGTGTGTATATTTATACACATGC-- ATATATATAT 3070 het 124 hom 34 1 32 22 N/A 0 0 4247 CASAVA_Build X 53069285 3D CAGGTGTGAG CCA/--- CCATGCCCGG 3070 hom 39 het 15 0 14 2 CCA 2 1 4248 CASAVA_Build X 53090634 3D TTAAATTAGC AAG/--- AAGAAGATAC 3070 het 3070 ref 44 25 10 9 AAG 3 2 4249 CASAVA_Build X 53091670 1I CAAAAAAAAA -/T AATAATAAAA 3070 het 2863 hom 28 9 14 5 T 0 1 4250 CASAVA_Build X 53093223 1D CGAAAGTGCT G/- GGATTACAGG 3070 het 800 hom 14 3 9 3 G 3 2 4251 CASAVA_Build X 53105935 2I ATATATATAT --/AC ATATACACAC 2391 het 559 hom 8 2 6 0 AC 0 1 4252 CASAVA_Build X 53148892 2D GTTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 512 hom 33 9 16 8 T 18 16 4253 CASAVA_Build X 53151401 1D GCAGGACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 38 2 24 12 T 13 12 4254 CASAVA_Build X 53151564 1D ACCTGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 26 2 14 10 T 17 16 4255 CASAVA_Build X 53155666 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1948 hom 19 het 14 0 6 8 T 13 14 4256 CASAVA_Build X 53159234 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 64 het 31 0 20 11 A 9 10 4257 CASAVA_Build X 53163116 3I TTGAACCCAA ---/GAG GAGGAGGTTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 GAG 2 3 4258 CASAVA_Build X 53167507 2D TCTGTTCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 12 10 4259 CASAVA_Build X 53174775 2I CCAAAGAATT --/CA CAGACTTTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CA 1 2 4260 CASAVA_Build X 53176372 1I TAGTTTCTTC -/T GTAAAAATGG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 0 1 4261 CASAVA_Build X 53179272 1D AGACCTTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 28 3 18 7 A 12 11 4262 CASAVA_Build X 53187610 1D AGCACTTTTA T/- TTTTCCTTAC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 5 4 4263 CASAVA_Build X 53213383 1D ACTTCATAGA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 70 het 26 0 24 2 C 8 7 4264 CASAVA_Build X 53216014 2D AATCAGAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 30 0 24 7 A 14 12 4265 CASAVA_Build X 53225142 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 3 A 16 14 4266 CASAVA_Build X 53237985 1I TAGTGCTCCT -/G GCCAGCACTA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 G 1 2 4267 CASAVA_Build X 53253989 2I GCAGGGAGCT --/AA AGATACCTCT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 A 1 3 4268 CASAVA_Build X 53305706 6D GACCCTGTCT CAAAAA/------ CAAAAACAAA 3070 hom 39 het 23 0 14 10 CAAAAA 4 3 4269 CASAVA_Build X 53310832 1I TGTCATGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 264 hom 33 3 22 8 A 15 16 4270 CASAVA_Build X 53335081 12I CCCCTCCACA ------------/CACGCATGCATG CACACATGAA 3070 hom 81 het 35 0 25 10 CACGCATGCATG 0 1 4271 CASAVA_Build X 53466062 1I GAACCCGTAA -/G GGTCCGCGAC 3070 hom 56 het 22 0 15 7 G 2 3 4272 CASAVA_Build X 53496193 1I TAGGATTATA -/G GCATGAGCCA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 G 1 2 4273 CASAVA_Build X 53497184 1I CGGGCGTGGT -/G GCGGGCGCCT 1389 hom 7 het 3 0 3 0 G 1 2 4274 CASAVA_Build X 53503793 1I GCCAATATGG -/T GAAACCCCGT 1394 hom 10 het 4 0 4 0 T 0 1 4275 CASAVA_Build X 53505524 5I CATGTGAGGT -----/CTCAC AGTTCTTTGA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CTCAC 0 1 4276 CASAVA_Build X 53525389 1D TCTCTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1239 het 1239 ref 38 30 3 6 A 12 11 4277 CASAVA_Build X 53545391 2I TGATGGTGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 T 12 14 4278 CASAVA_Build X 53558385 1I GTAATTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 14 1 9 4 A 10 11 4279 CASAVA_Build X 53567503 1I ACAAATAAAT -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 62 het 23 0 21 2 A 7 8 4280 CASAVA_Build X 53584018 1D GTCTAATGCC T/- TTTTTTTTTT 1077 het 1077 ref 35 22 4 9 T 13 12 4281 CASAVA_Build X 53632819 5I TTTCTTATCC -----/CACTT CACTTCTATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CACTT 1 2 4282 CASAVA_Build X 53652066 2D TTTGGAAAAC AT/-- ATTACAGGTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AT 2 1 4283 CASAVA_Build X 53674350 1D CATATCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 39 2 28 9 A 15 14 4284 CASAVA_Build X 53704570 5D TCCTCACCAC TCAAG/----- TCAAGTTTTG 3070 hom 108 het 41 0 36 6 TCAAG 2 1 4285 CASAVA_Build X 53731976 1I TACAGTGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 35 0 29 6 T 9 10 4286 CASAVA_Build X 53772768 1I CTTGACCTCA -/G GGTGAGCCCC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 G 2 3 4287 CASAVA_Build X 53777145 18D TGTAATCCCA GCATTTTGGGAGGCCGAG/------------------ GCAGCCCGAT 3070 hom 39 het 17 0 12 6 GCATTTTGGGAGGCCGAG 1 0 4288 CASAVA_Build X 53786845 1D TAACTTAACA T/- TTTTAATGTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 5 4 4289 CASAVA_Build X 53788842 23D TTATTTCTGT GTAAGATATAAGGTAGTGATCTA/----------------------- ATTTTATTTT 3070 hom 75 het 24 0 26 3 GTAAGATATAAGGTAGTGATCTA 1 0 4290 CASAVA_Build X 53789821 1I AGGGTGGTAT -/G GCTGTAGAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 2 4291 CASAVA_Build X 53791915 1I TATACATGTT -/G GGGGGGGGTG 3070 hom 80 het 37 0 32 5 G 8 9 4292 CASAVA_Build X 53796563 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1001 hom 29 5 14 10 T 15 14 4293 CASAVA_Build X 53807778 4D61M6D CCTCTCTCTC TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTGTATATATGCATATACATACACTTACTTCCATTCTCTTTCTT/----TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTTGTATATATGCATATACATACACTTACTTCCATTCTC------ TATCTTCACA 3070 het 273 hom 44 5 41 29 N/A 0 0 4294 CASAVA_Build X 53812467 4D3M1D GGCAGCAAAA GGGTATTG/----ATT- GATTATTATA 3070 hom 66 het 24 0 21 4 N/A 0 0 4295 CASAVA_Build X 53837112 1I GCCTCCTTTG -/T TTTTTCTTCG 3070 hom 71 het 26 0 23 3 T 5 6 4296 CASAVA_Build X 53926507 2I TAACTGAAAC --/TT TGTACCCTTT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 T 1 3 4297 CASAVA_Build X 53956442 1D ACTCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 657 het 657 ref 19 13 2 4 A 12 11 4298 CASAVA_Build X 53996486 1D ATAGAGAGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 10 9 4299 CASAVA_Build X 54011284 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1269 het 1269 ref 15 10 4 1 A 15 16 4300 CASAVA_Build X 54048594 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 1657 het 1657 ref 24 10 6 8 A 12 13 4301 CASAVA_Build X 54058321 1D GTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 42 0 31 12 T 10 9 4302 CASAVA_Build X 54089096 7D CCCAGAGGAT GGTTTAG/------- GGTTTTTTTT 422 het 132 hom 23 3 3 17 GGTTTAG 1 0 4303 CASAVA_Build X 54089162 1I TGTCAACTCA -/G GGCTGGGCGG 3070 hom 72 het 29 0 23 6 G 2 3 4304 CASAVA_Build X 54110523 1I CAAAGCACTA -/G GAGGGGCTGG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 1 2 4305 CASAVA_Build X 54127873 2D ACCAGGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 30 0 15 16 A 18 16 4306 CASAVA_Build X 54130469 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 15 14 4307 CASAVA_Build X 54154703 1D CAATAGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 231 hom 30 1 24 5 A 11 10 4308 CASAVA_Build X 54192798 1D GCATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 24 0 10 14 A 15 14 4309 CASAVA_Build X 54198822 1D AGGCTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 10 9 4310 CASAVA_Build X 54233209 1I ACTGGTTAAA -/T TTCCTAAGCC 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 2 3 4311 CASAVA_Build X 54260566 1D ATCATGAGGT C/- CAGGAGATCA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 2 1 4312 CASAVA_Build X 54267642 1D ATAACAATTA T/- TACATATGTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 1 4313 CASAVA_Build X 54282362 1I TGAAGCTTTT -/A AAAAAAAAAA 2414 het 2414 ref 33 18 8 7 A 15 16 4314 CASAVA_Build X 54378780 1I CAGAAATATC -/A AATTTGAGAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 2 3 4315 CASAVA_Build X 54474923 1D GTGGCTCACA C/- CCTGTAATCC 2236 hom 21 het 8 0 6 2 C 3 2 4316 CASAVA_Build X 54546710 1D ACCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 557 hom 23 2 18 3 A 15 14 4317 CASAVA_Build X 54596656 1D TTTGTATTTC A/- TGTGGCTTTG 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 A 1 0 4318 CASAVA_Build X 54656722 2D TTTGGGTAGG CT/-- CTGTTAGAGG 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 CT 2 1 4319 CASAVA_Build X 54662679 1D TTTTGCGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 11 10 4320 CASAVA_Build X 54704880 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTAATAG 3070 het 3070 hom 45 20 25 0 T 5 6 4321 CASAVA_Build X 54729652 9D TTTGATGCCT TAATAATAG/--------- TAATAATAGT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 TAATAATAG 2 1 4322 CASAVA_Build X 54737805 5I ACCCCGAACT -----/TAAAA TAAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 TAAAA 1 2 4323 CASAVA_Build X 54741683 1I CCACAAAGAT -/G GGGAAAAAAC 2522 het 1463 hom 14 3 7 4 G 3 4 4324 CASAVA_Build X 54753364 9D2M4D ATGTAGACCC TGTTACATGATTACA/---------AT---- GTTCCTCTTA 3070 het 3070 ref 46 21 22 9 N/A 0 0 4325 CASAVA_Build X 54756005 1D GCCAAAACAC A/- AGCATGATAT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 2 1 4326 CASAVA_Build X 54782937 1D TGTATGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 11 10 4327 CASAVA_Build X 54786611 1I ATGGATCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 12 13 4328 CASAVA_Build X 54819340 1D TTAGAGGAGT A/- AAAAAAAAAA 2358 het 2358 ref 39 21 6 14 A 12 11 4329 CASAVA_Build X 54846235 4D TACCAAAAAT ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 17 3 ACAA 4 3 4330 CASAVA_Build X 54867378 1I GCTGCTGTTT -/C CCACAGCAGT 3070 hom 83 het 32 0 26 6 C 2 3 4331 CASAVA_Build X 54910005 1D TCCTCTTCAA T/- TTTTTTGGAA 3070 hom 95 het 37 0 31 6 T 7 6 4332 CASAVA_Build X 54916266 1I GAGATGAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 9 10 4333 CASAVA_Build X 54917629 1I GATGTAAACA -/T TTTTTTATGC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 6 7 4334 CASAVA_Build X 54925549 2I TTTCGTGAAC --/TG GGAATGCTGC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TG 0 1 4335 CASAVA_Build X 54934253 1I ACTTAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 914 hom 40 4 28 8 A 12 13 4336 CASAVA_Build X 54940499 1D AATATATGTG C/- CCAACACTGG 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 C 3 2 4337 CASAVA_Build X 54951153 4D TAATTGTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 40 1 23 16 T 16 12 4338 CASAVA_Build X 54969715 2D ATTTCTGTCC CT/-- GTCTCCTCTT 3070 het 3070 ref 53 24 18 11 CT 1 0 4339 CASAVA_Build X 55107795 1D GCAATGTTGG T/- TTTTTTTTTA 1346 het 1346 ref 35 28 4 3 T 10 9 4340 CASAVA_Build X 55124224 1D TTATTTCAGG T/- TTTTTTTTTT 1052 het 1052 ref 35 29 3 4 T 11 10 4341 CASAVA_Build X 55151620 12I GTGGCAAGGC ------------/TAAAGAGCCAGT GAGTTGGAGA 3070 hom 126 het 45 0 43 5 TAAAGAGCCAGT 0 1 4342 CASAVA_Build X 55165331 1I TTGTTAATGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 10 4343 CASAVA_Build X 55190458 1D GTCACACAGT A/- ACACTGTCCA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 2 1 4344 CASAVA_Build X 55260001 1I TTTGTTGTAC -/A GATTATTTTG 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 A 0 1 4345 CASAVA_Build X 55260576 1I CACCAGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 11 12 4346 CASAVA_Build X 55266803 1I TAAAAATATA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 7 8 4347 CASAVA_Build X 55297723 1D AACTTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 8 8 4 A 11 10 4348 CASAVA_Build X 55329702 3I GTTTTTGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 19 9 10 TTG 5 6 4349 CASAVA_Build X 55333734 1I TCTTTTCTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 9 10 4350 CASAVA_Build X 55335732 1D TTTAAAGGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 T 10 9 4351 CASAVA_Build X 55338834 1I CCAGCTTTTG -/C CCATTCACTA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 C 2 3 4352 CASAVA_Build X 55347103 1I TTTTGCTTAT -/G GAAGCTTAAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 G 1 2 4353 CASAVA_Build X 55374418 2I CTGGAGAGCC --/CT GACTAATAAT 3070 hom 41 het 17 0 13 4 CT 0 1 4354 CASAVA_Build X 55446940 1D TAAAACAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 9 8 4355 CASAVA_Build X 55455604 2I TGTGCATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2208 hom 26 9 11 6 TA 6 7 4356 CASAVA_Build X 55653723 2D CTAATAGGAG AT/-- ATATATATAT 2978 hom 21 het 10 0 8 2 AT 9 8 4357 CASAVA_Build X 55660038 1I CTTCTCCAAA -/T TTTTTGTCAC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 5 6 4358 CASAVA_Build X 55663068 1I TCCTATGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2888 hom 42 7 24 11 T 12 13 4359 CASAVA_Build X 55663648 1I GCTACCCTCC -/T TTATCAGTCC 3070 het 3070 hom 50 22 19 9 T 2 3 4360 CASAVA_Build X 55702967 2D TATTGGAAAC AT/-- GTGGACACAT 3070 het 3070 ref 50 26 22 4 AT 1 0 4361 CASAVA_Build X 55736437 5D TTTACCAGAT CATCA/----- CATAAGTTTA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 CATCA 1 0 4362 CASAVA_Build X 55737025 1I GAGTCCGCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 9 10 4363 CASAVA_Build X 55737685 1I ATTTATAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 10 11 4364 CASAVA_Build X 55738196 1D AGGCTATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1590 hom 24 5 13 7 A 12 11 4365 CASAVA_Build X 55745796 1D AGTAGGTCCC A/- ACCCCTATGG 3070 het 3070 hom 35 13 14 9 A 2 1 4366 CASAVA_Build X 55751802 1D TCTGTGATGT A/- AAATGATTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 4 3 4367 CASAVA_Build X 55752734 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 1509 hom 20 3 11 8 A 1 0 4368 CASAVA_Build X 55769310 1I GGAAAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 11 12 4369 CASAVA_Build X 55776656 1D TTGTTGGAGG T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 T 7 6 4370 CASAVA_Build X 55782561 1D GAGGTTCCTC T/- TATCAGGAAT 3070 het 3070 hom 46 21 23 3 T 2 1 4371 CASAVA_Build X 55795253 1I TAGCCATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 39 1 25 13 T 13 14 4372 CASAVA_Build X 55805507 4I TCGGCAAGTT ----/AAAG AAAGACCCAG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 AAAG 1 2 4373 CASAVA_Build X 55807533 3D TTATAAAGAA AGG/--- AGGAAATAGC 3070 het 3070 hom 32 11 19 3 AGG 2 1 4374 CASAVA_Build X 55819916 1D TTTGCCAAGG T/- TGAGGATGCA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 2 1 4375 CASAVA_Build X 55840570 1D TTGAGGGTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 T 9 8 4376 CASAVA_Build X 55852930 3D GATAGTTAGG TCT/--- TCTTCTTGAA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 TCT 3 2 4377 CASAVA_Build X 55858563 1D AACCAGTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 13 12 11 A 10 9 4378 CASAVA_Build X 55879159 1D TATTGTTAAC A/- AGGCACATCC 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 2 1 4379 CASAVA_Build X 55887802 1I GCAATTGCAA -/C AAAAGCCAGA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 C 0 1 4380 CASAVA_Build X 55900725 2D AAAATTTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 2916 het 1884 hom 41 15 11 17 A 18 16 4381 CASAVA_Build X 55902108 1I CCAGAAAATG -/T TTTTTTTCTT 1470 het 1470 ref 17 9 4 4 T 7 8 4382 CASAVA_Build X 55904559 2D TAGCATCTAT TG/-- TGTGTATCAT 3070 het 3070 hom 41 13 15 14 TG 3 2 4383 CASAVA_Build X 55913239 1D GGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 1239 het 1239 ref 34 25 3 6 A 10 9 4384 CASAVA_Build X 55916913 1D TTGTCACAGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 9 8 4385 CASAVA_Build X 55923864 2I CAAGAAAGAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 9 11 4386 CASAVA_Build X 55926108 1I ACAGGATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 A 9 10 4387 CASAVA_Build X 55936480 1D TTATTGGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 12 11 4388 CASAVA_Build X 55938991 4D AATTTCATTC CTAT/---- CTAAGGCAAA 3070 het 3070 ref 19 8 9 4 CTAT 1 0 4389 CASAVA_Build X 55959726 14I GATCTAAAGG --------------/CCAGTGAGTGAGGC CTGGTGAGTG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 CCAGTGAGTGAGGC 0 1 4390 CASAVA_Build X 55962818 1I ATAATCCCCC -/T GGGAATATAA 3070 hom 73 het 27 0 20 7 T 0 1 4391 CASAVA_Build X 55963820 3I TCAAACAAGC ---/AGA AGAAAGAACT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AGA 1 2 4392 CASAVA_Build X 55964749 1I TCAAAAGCAA -/T TGCTACGAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 1 2 4393 CASAVA_Build X 55986225 3I TTGACCAGAC ---/TTG TTAATGGAGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TTG 0 1 4394 CASAVA_Build X 55990799 1I GTATAGTAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 8 9 4395 CASAVA_Build X 55992795 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCT 2176 het 2176 ref 14 7 5 2 A 5 4 4396 CASAVA_Build X 55996610 1D CCCAGGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 9 10 T 12 11 4397 CASAVA_Build X 56003044 1I AGGAAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 A 11 12 4398 CASAVA_Build X 56015601 4I TACAACAAAT ----/AGAA AGAAAGAATA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 AGAA 2 3 4399 CASAVA_Build X 56028134 1I GATTGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 20 12 T 10 11 4400 CASAVA_Build X 56030340 1I TTGAAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 2091 het 1805 hom 20 6 5 9 T 11 12 4401 CASAVA_Build X 56037390 1D CTTAATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 7 T 11 10 4402 CASAVA_Build X 56071461 1I TTGGCTAGCA -/C CGCAAAGTTT 2911 het 2911 ref 28 20 7 1 C 1 2 4403 CASAVA_Build X 56077866 8D AACTATAGTC ATCTTACA/-------- ATCTTACAAT 1404 het 1404 ref 13 7 3 3 ATCTTACA 2 1 4404 CASAVA_Build X 56087387 1I GCCTGTACAC -/A CTGTATATGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 0 1 4405 CASAVA_Build X 56089237 1I TTGTCACATG -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 63 28 23 12 T 6 7 4406 CASAVA_Build X 56089766 1I GTTTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 10 11 4407 CASAVA_Build X 56090375 1D AGTTGTGATG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 8 4408 CASAVA_Build X 56096704 6I TTTTCTTTGT ------/TTTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 27 3 17 7 TTTTTG 0 1 4409 CASAVA_Build X 56100214 2D GGACTGCCTC TA/-- TGTGAGTGTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 TA 1 0 4410 CASAVA_Build X 56119154 1D GTGTGATGTT C/- CCCTTCCTAT 3070 het 3070 hom 21 9 9 4 C 4 3 4411 CASAVA_Build X 56119302 1D GAACTCATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 19 7 11 1 T 9 8 4412 CASAVA_Build X 56136174 1D AAAATGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1204 hom 43 5 35 3 A 12 11 4413 CASAVA_Build X 56138650 1I TCTGCACAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2789 hom 23 6 12 5 A 9 10 4414 CASAVA_Build X 56152928 4I TTTCCCTTTC ----/TTTT TTATTTTCTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 6 4415 CASAVA_Build X 56163207 1D GGAAACTTTA C/- TTTTAACTAA 3070 het 3070 hom 36 8 23 6 C 1 0 4416 CASAVA_Build X 56164761 1I CTTCTTCAGC -/T TTTTCTTTAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 4 5 4417 CASAVA_Build X 56172125 2D TGTAATCAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 GA 6 5 4418 CASAVA_Build X 56172903 4D ATGCTTTCTT TCTC/---- AGCTGGCAGG 3070 het 3070 ref 38 19 14 12 TC 2 0 4419 CASAVA_Build X 56177081 1D CAATATCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 245 hom 33 1 23 10 A 13 12 4420 CASAVA_Build X 56180938 1D ACAAAGAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1539 hom 16 4 11 1 A 10 9 4421 CASAVA_Build X 56189871 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 29 1 27 1 A 13 11 4422 CASAVA_Build X 56245718 1I CATTAACCTT -/C CCCCCCCCCT 3070 het 578 hom 26 3 13 10 C 9 10 4423 CASAVA_Build X 56255517 1D ACAATCCACT G/- TCTCTAGGCT 3070 hom 116 het 44 0 33 11 G 1 0 4424 CASAVA_Build X 56270515 1D AGTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 288 hom 22 2 17 3 T 13 12 4425 CASAVA_Build X 56278575 1I TTCTTCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 792 hom 39 3 17 19 T 17 18 4426 CASAVA_Build X 56284155 1D CTTTAAAATT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 10 A 7 6 4427 CASAVA_Build X 56288087 1I TAGCAGACAG -/T TTTTTCAGAA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 5 6 4428 CASAVA_Build X 56291465 1I TTAAAGTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 9 8 7 A 10 11 4429 CASAVA_Build X 56306667 2D TTTTTGACGC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 AG 2 1 4430 CASAVA_Build X 56312351 1D CCTGCTATGC A/- AAAAAAAAAA 1831 het 1831 ref 36 30 4 2 A 12 11 4431 CASAVA_Build X 56312684 4D TCTTTGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 126 hom 54 3 22 30 TG 11 9 4432 CASAVA_Build X 56316528 1D AATTAAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 10 9 4433 CASAVA_Build X 56331101 1D GATCCTTTTT A/- AAGAATTGTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 8 A 3 2 4434 CASAVA_Build X 56331283 2D TAATCCCAGC AA/-- TACTTGAGAG 2521 het 2521 ref 20 8 7 6 A 2 0 4435 CASAVA_Build X 56331727 1I GTCACACAAA -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 40 10 24 6 T 6 7 4436 CASAVA_Build X 56347521 1I CTATTCAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 T 10 11 4437 CASAVA_Build X 56358739 2D TTTCTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 1637 het 1637 ref 22 9 4 9 AG 2 1 4438 CASAVA_Build X 56402115 2I TTAGTCCTGG --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 8 10 4439 CASAVA_Build X 56419481 1D CAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1324 het 1160 hom 12 3 7 3 A 14 13 4440 CASAVA_Build X 56450073 1I TTATTGAGAG -/T TTTTTAACAT 3070 het 2353 hom 17 6 9 2 T 5 6 4441 CASAVA_Build X 56459161 1D TCAGTTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 10 9 4442 CASAVA_Build X 56459514 1D GTTGCTATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 T 10 9 4443 CASAVA_Build X 56461679 2I GGTTAAAACT --/AA GTCCAAGGAG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 0 2 4444 CASAVA_Build X 56485676 1I ATATAAAGGG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 7 8 4445 CASAVA_Build X 56486759 1D AAAGTATTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 10 9 4446 CASAVA_Build X 56502155 2D TGGTTTAAAA TC/-- TGTTTTATCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TC 1 0 4447 CASAVA_Build X 56506084 1I AATGACCATC -/A TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 0 1 4448 CASAVA_Build X 56515010 1D AAATAGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 9 7 T 11 10 4449 CASAVA_Build X 56525649 2D CAATTAAGTC TT/-- TTGAATTCAT 3070 hom 69 het 25 0 23 3 T 4 2 4450 CASAVA_Build X 56535711 1D ATTTCAGATC T/- TTCCTGCTTT 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 T 3 2 4451 CASAVA_Build X 56538965 3D ACAGTGCAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 540 hom 37 5 14 18 T 17 14 4452 CASAVA_Build X 56539059 1I AAATACAAAT -/G TATTAAGTAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 4453 CASAVA_Build X 56540004 2D GTGTGTGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 84 het 40 0 29 16 AC 9 8 4454 CASAVA_Build X 56554641 1D CCTACCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 574 hom 20 2 18 1 A 12 11 4455 CASAVA_Build X 56561087 1D AGTATGGTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2454 hom 27 10 11 6 T 10 9 4456 CASAVA_Build X 56575883 1I TCGGCCTCCC -/A AAGTGCTGAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 2 3 4457 CASAVA_Build X 56579266 1D TCACAGAAAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 9 8 4458 CASAVA_Build X 56580051 1D TGCGGAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 21 1 16 4 A 13 12 4459 CASAVA_Build X 56585590 3I TGCAATACAA ---/AAG AAGATGTTAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAG 1 2 4460 CASAVA_Build X 56586231 1D CCTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3033 het 3033 ref 29 14 10 5 A 13 12 4461 CASAVA_Build X 56590172 1I GAGATTCCTC -/A AAAAAAAAAA 1728 het 1728 ref 27 8 9 10 A 15 16 4462 CASAVA_Build X 56604219 3D TTTTTTCTGT TTG/--- TTAATTCATT 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 TTG 1 0 4463 CASAVA_Build X 56605949 4D TTAATATATT TAAA/---- TAACATTTTA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TAAA 1 0 4464 CASAVA_Build X 56612799 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 1109 hom 18 3 13 2 A 8 9 4465 CASAVA_Build X 56614440 1D AGGGGCTGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 9 8 4466 CASAVA_Build X 56617403 5D TTCAATACTG TACTC/----- TTTTTAAGGA 3070 het 3070 ref 40 19 19 4 TACTC 1 0 4467 CASAVA_Build X 56620915 1D CAATTTTATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 10 9 4468 CASAVA_Build X 56636673 4D GATTTGGCTC TCTG/---- TCTGTTATTG 1813 het 1813 ref 11 6 4 1 TCTG 2 1 4469 CASAVA_Build X 56644469 1D CGAGACTGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 29 hom 30 1 24 5 A 9 8 4470 CASAVA_Build X 56644600 2D AAGTGGAAAC CT/-- CTGAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 CT 2 1 4471 CASAVA_Build X 56661237 26D CCAATTTAGT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1736 hom 17 9 8 2 A 38 12 4472 CASAVA_Build X 56669494 1I CTGAAGCTGC -/T TTTTTTTTTT 2993 het 2953 hom 26 8 10 8 T 14 15 4473 CASAVA_Build X 56686713 1D TAGTGACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 12 13 T 15 14 4474 CASAVA_Build X 56694756 2D GAAGTCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 T 14 12 4475 CASAVA_Build X 56699758 1I TGATGATGAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 T 8 9 4476 CASAVA_Build X 56710855 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 8 7 4477 CASAVA_Build X 56729128 1D GATTCATTGA T/- TTTTTGAAGT 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 T 6 5 4478 CASAVA_Build X 56735981 1I AAATAATTGG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 8 9 4479 CASAVA_Build X 56747165 1I AATTTAAGGC -/T GCAGTAACCA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 0 1 4480 CASAVA_Build X 56749350 5I GTGGTGTTGA -----/TCTTT TCTTCAGATG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 TCTTT 0 1 4481 CASAVA_Build X 56759964 2D ATAGATGCAG AA/-- AAGTATTTTA 3070 het 3070 hom 31 8 12 11 A 4 2 4482 CASAVA_Build X 56760001 1I CCTTCTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 853 hom 31 3 25 3 A 10 11 4483 CASAVA_Build X 56767808 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 31 1 23 7 A 11 12 4484 CASAVA_Build X 56769766 1I GAAAAGCTAA -/T TTTTCAAAAG 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 4 5 4485 CASAVA_Build X 56776132 1D TTTGACTTTT A/- TTTTTATATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 1 0 4486 CASAVA_Build X 56788998 5D TTTCCCATGA TTAGT/----- TTAAGCGTTT 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 TTAGT 1 0 4487 CASAVA_Build X 56792813 1D ATTTGCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 45 3 25 19 T 15 14 4488 CASAVA_Build X 56793626 1I TGGGTTAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 8 9 4489 CASAVA_Build X 56799601 1D GCTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2930 hom 33 11 16 6 A 11 10 4490 CASAVA_Build X 56803559 2D AAACAGAAAC TG/-- GGGCTGGGTG 3070 het 2459 hom 26 9 12 5 TG 1 0 4491 CASAVA_Build X 56825424 3I AATTCCTCTT ---/CTC CTCTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 CTC 1 2 4492 CASAVA_Build X 56829794 3D CTTCTTTCTG CTT/--- CTTCTTTTTC 3070 het 1428 hom 28 5 17 6 CTT 3 2 4493 CASAVA_Build X 56853233 2D ATGTTGAATA TT/-- GGCCCCCACT 3070 het 3070 hom 22 9 10 4 T 2 0 4494 CASAVA_Build X 56863410 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2424 het 2424 ref 20 10 8 2 A 10 11 4495 CASAVA_Build X 56864825 1D GGGGAAAAAA T/- AATAGAGTGG 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 T 1 0 4496 CASAVA_Build X 56867698 3I ATAGGTGGGA ---/ATT ATTGAACAAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 ATT 1 2 4497 CASAVA_Build X 56885914 3I TTAGCCTGGT ---/GTG GTGGTGCACG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 GTG 2 3 4498 CASAVA_Build X 56886904 4D TTCTGCCAGG CTGT/---- CTCTTTGTAG 3070 het 3070 hom 53 22 27 6 CTGT 1 0 4499 CASAVA_Build X 56896593 1I TAAAATCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 10 11 4500 CASAVA_Build X 56899358 1I ATCCCTCAGG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 T 8 9 4501 CASAVA_Build X 56899439 1D ATAATAAAAG T/- TTTTTTTTCT 2925 het 2925 ref 23 14 6 3 T 9 8 4502 CASAVA_Build X 56910357 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 T 10 11 4503 CASAVA_Build X 56918696 1D CAAAAATAAC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 A 8 7 4504 CASAVA_Build X 56921558 1I ATGCTACTGA -/T TTTTTAATGT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 5 6 4505 CASAVA_Build X 56925021 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1607 het 1162 hom 16 8 6 2 A 18 16 4506 CASAVA_Build X 56925569 3D TAGTACACTA CTC/--- CTGCTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 CTC 1 0 4507 CASAVA_Build X 56926133 8I CACCTTTAAA --------/TTTTCTGT TTTTCTGTAT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 TTTTCTGT 1 2 4508 CASAVA_Build X 56926879 1D TTTTAAATTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 21 11 10 0 T 9 8 4509 CASAVA_Build X 56928239 1D GTTTGCGAAA C/- CTTTCTATCA 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 C 2 1 4510 CASAVA_Build X 56933235 2I TTTTGAAAAC --/TG TTCAATTTAT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 TG 0 1 4511 CASAVA_Build X 56936192 1D AAAAAAAGAC A/- AAAAAAGGGC 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 A 7 6 4512 CASAVA_Build X 56957712 1D CAGATATGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 T 9 8 4513 CASAVA_Build X 56966105 1I AATACACTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 10 4514 CASAVA_Build X 56968122 1D GTCAGTAGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 10 9 4515 CASAVA_Build X 56988744 4D TGTCAACAAC TTTG/---- TTTATCTAGA 3070 het 3070 ref 45 22 17 9 TTTG 1 0 4516 CASAVA_Build X 57004461 1D ATTCAGCTTT A/- AAAAAAAATC 1934 het 1612 hom 9 4 5 1 A 9 8 4517 CASAVA_Build X 57007612 1D GCTCAGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 39 0 24 15 A 14 13 4518 CASAVA_Build X 57011340 1I CAACAACCTG -/A AAAAAACTTG 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 6 7 4519 CASAVA_Build X 57019034 1D GTCCACTTTT A/- ACTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 A 2 1 4520 CASAVA_Build X 57023750 1D TTCCTTCATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 10 9 4521 CASAVA_Build X 57049494 1D TGATTTCTAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 T 9 8 4522 CASAVA_Build X 57078139 1I TATTCTTTTC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 8 9 4523 CASAVA_Build X 57081289 27I ATGGCTTCCC ---------------------------/GGTTTTGTGTTTGAAACCCAGGGCCCT GGTCGTGTAG 3070 hom 67 het 28 0 20 8 GGTTTTGTGTTTGAAACCCAGGGCCCT 0 1 4524 CASAVA_Build X 57081905 1I TCAGCAGGAT -/A AAAAAATTTG 2509 het 2509 ref 35 21 10 4 A 6 7 4525 CASAVA_Build X 57082708 1D ATTTGGAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 7 10 T 12 11 4526 CASAVA_Build X 57100359 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1523 het 206 hom 10 1 4 5 T 11 10 4527 CASAVA_Build X 57101537 1D CGTGTCTACT A/- AAAAAAAAAA 961 het 961 ref 42 30 4 9 A 13 12 4528 CASAVA_Build X 57102140 1D ACTGGGGTAC A/- AAAAAAAAAA 1854 het 849 hom 25 6 7 13 A 15 14 4529 CASAVA_Build X 57120388 4D AATTTCCCCC AACT/---- GAGTCCTCAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 8 AACT 1 0 4530 CASAVA_Build X 57133246 2I CATTTTTAGA --/AT TTTCAGCTTT 2655 het 2655 ref 33 21 6 7 AT 0 1 4531 CASAVA_Build X 57154986 1I CTATGAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 A 8 9 4532 CASAVA_Build X 57187507 1I GATATTTATA -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 6 7 4533 CASAVA_Build X 57188412 1D TCATTCTTTT G/- GGGGGGGGTA 3070 het 3070 ref 32 12 15 5 G 9 8 4534 CASAVA_Build X 57197426 1D ATGTTGTATC T/- TTTTTTTTTT 1651 het 1651 ref 35 16 5 14 T 17 16 4535 CASAVA_Build X 57219668 1I TTTATGTTGG -/T TTTTAACTTT 3030 het 3030 ref 29 18 7 4 T 4 5 4536 CASAVA_Build X 57226532 4D ACACTAGAAA AATC/---- AATCAAATCA 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 AATC 2 1 4537 CASAVA_Build X 57240702 1I TATTCAGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 18 8 T 10 11 4538 CASAVA_Build X 57245242 1D ACAGCTATTT A/- TAAATTATCT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 1 0 4539 CASAVA_Build X 57260382 2I CCCACTCTGT --/GG GTTGTCTGTT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 G 1 3 4540 CASAVA_Build X 57262934 1I CCTCTGTTCC -/A AAAAAAAAAA 2640 het 1392 hom 18 6 8 4 A 11 12 4541 CASAVA_Build X 57263496 1I CTATTCTCCT -/C CCCCAACGCC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 C 4 5 4542 CASAVA_Build X 57272260 1D AAAATGAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 14 21 10 A 10 9 4543 CASAVA_Build X 57279046 1I GAAAATATAC -/A AAACATATTT 3070 het 3070 hom 43 12 25 6 A 3 4 4544 CASAVA_Build X 57280072 1D ATGTACCACC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 8 7 4545 CASAVA_Build X 57282633 2I GCAGCTCTTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 TA 7 8 4546 CASAVA_Build X 57284606 1D AAACTACAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 A 9 8 4547 CASAVA_Build X 57305165 3I TTACGTGACT ---/TGG TGGTGTCATC 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 TGG 1 2 4548 CASAVA_Build X 57305225 2D TGGAAATGGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 AT 7 6 4549 CASAVA_Build X 57314951 1D GATAGGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 10 9 4550 CASAVA_Build X 57318909 1I AAGGAAAGCC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 7 8 4551 CASAVA_Build X 57320161 1D GGTACAAAGA G/- GAGCTGGTAC 3070 het 3070 hom 24 11 11 3 G 2 1 4552 CASAVA_Build X 57321797 1D ACAATAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 9 8 4553 CASAVA_Build X 57323694 2I GCTAAAATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 14 14 12 A 10 12 4554 CASAVA_Build X 57323809 1I TGGAAGCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 18 14 13 A 13 14 4555 CASAVA_Build X 57348221 2D TCTGTAATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 1852 hom 49 10 17 22 TG 10 9 4556 CASAVA_Build X 57351076 4D5M3D GTTAATTAGG TTAATTAGGTTA/----TTAGG--- ATAATGACCT 3070 hom 102 het 36 0 35 3 N/A 0 0 4557 CASAVA_Build X 57356318 1D TTGAATACCG T/- TTTTTTCAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 7 6 4558 CASAVA_Build X 57361363 1D CAAACCCTTC A/- AAAAAAATAA 2388 het 1074 hom 16 5 5 6 A 8 7 4559 CASAVA_Build X 57364298 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2540 het 2540 ref 26 10 8 8 A 11 12 4560 CASAVA_Build X 57371094 1D GAGTTTCTGG T/- TTTTTTGCTC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 7 6 4561 CASAVA_Build X 57376758 1I TGCTAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 501 hom 31 3 14 14 A 10 11 4562 CASAVA_Build X 57380135 1I TGAAAAAAAA -/T AATAAATAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 0 1 4563 CASAVA_Build X 57382724 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 7 8 4564 CASAVA_Build X 57384774 1I ATAATAGTTG -/T TTTTTTTTTT 1395 het 1395 ref 40 28 4 8 T 13 14 4565 CASAVA_Build X 57388280 1D CTCTCCTCAA T/- TTTTTTTTTT 2693 het 1954 hom 28 9 8 12 T 15 14 4566 CASAVA_Build X 57396959 1D ATAAACAGAC A/- TTTTTCAAAT 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 A 1 0 4567 CASAVA_Build X 57409291 1D TCTTGCACTA T/- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 48 20 17 12 T 3 2 4568 CASAVA_Build X 57414796 1I TCTATTTTTT -/G GGGGGGGGGG 1017 het 1017 ref 29 15 7 7 G 10 11 4569 CASAVA_Build X 57415254 1D TGAATAGTGC T/- GTGATGAACA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 1 0 4570 CASAVA_Build X 57416548 1I TGCCAACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 12 13 4571 CASAVA_Build X 57432447 2I TACACACACA --/CG CACACATATA 2041 het 89 hom 15 3 8 4 CG 0 1 4572 CASAVA_Build X 57463394 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTTCCA 1933 het 1753 hom 9 4 4 1 T 7 8 4573 CASAVA_Build X 57468200 1I ATTAAAAAAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 A 7 8 4574 CASAVA_Build X 57469019 2D CAGCCTTGAA TG/-- TGTGAATGAA 3070 hom 135 het 52 0 46 7 TG 3 2 4575 CASAVA_Build X 57471002 2D AAACTGAAAC AA/-- GACAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 A 2 0 4576 CASAVA_Build X 57471542 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 51 26 21 6 A 7 6 4577 CASAVA_Build X 57490662 1I CCTTGTCCCT -/G CAGCACACCT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 G 0 1 4578 CASAVA_Build X 57490902 1I TCCCTGGGCT -/G CACACAGCAA 3070 hom 66 het 25 0 17 8 G 0 1 4579 CASAVA_Build X 57497283 2D GAGCCCTGAA AG/-- AGAGTAGGAA 2917 het 2917 ref 33 23 8 3 AG 3 2 4580 CASAVA_Build X 57500656 1I AAAAAGAGAG -/A AAAATCAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 4 5 4581 CASAVA_Build X 57509640 1I AGAGGAACAG -/A AAAAAACGAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 6 7 4582 CASAVA_Build X 57541835 2D GTATTCCATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 386 hom 28 1 21 6 AT 9 8 4583 CASAVA_Build X 57545378 1D TAGAGTAGGT A/- AACAAAGTAG 2193 het 1893 hom 18 6 6 6 A 3 2 4584 CASAVA_Build X 57545864 1D CAAACAGAAA G/- GACATCCACA 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 G 2 1 4585 CASAVA_Build X 57551050 3I AAAAAAAAAA ---/AAC ACAAGAAAAT 3070 hom 69 het 35 0 24 11 AAC 0 1 4586 CASAVA_Build X 57558460 2D GTGTCTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 209 hom 36 4 13 19 T 18 16 4587 CASAVA_Build X 57582636 2D AAAATTACAA AT/-- GAGTAAAACA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 AT 1 0 4588 CASAVA_Build X 57589128 1D ATAAACAAGC A/- AGCTGGAGGC 3070 het 3070 hom 31 10 15 8 A 2 1 4589 CASAVA_Build X 57627587 5D CCTAGGGACA GGGAT/----- GGGATGGGGA 1869 het 1869 ref 21 12 4 6 GGGAT 2 1 4590 CASAVA_Build X 57684617 1I AACCTAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 8 16 11 A 14 15 4591 CASAVA_Build X 57694190 1D ACATGAGAAA G/- GGTAAGATGT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 G 3 2 4592 CASAVA_Build X 57695729 1D TTCTTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 34 1 27 6 A 13 12 4593 CASAVA_Build X 57765994 1I TTTGCCTGTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 8 9 4594 CASAVA_Build X 57792581 1I AAAAAAAAAA -/T ATCAAAAAAT 1759 het 1759 ref 14 7 4 3 T 0 1 4595 CASAVA_Build X 57807642 1D CAAATGAACT A/- AAAATGCATT 3070 het 3070 ref 33 20 9 5 A 5 4 4596 CASAVA_Build X 57844708 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 C 1 0 4597 CASAVA_Build X 57856296 1I13M1I TCATTTTTTA -TGCATCTATTTGA-/TTGCATCTATTTGAT TCTTCTCTCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 N/A 0 0 4598 CASAVA_Build X 57880526 1D TCCATAAATG A/- AAAAAAAAAG 960 het 960 ref 47 34 3 11 A 10 9 4599 CASAVA_Build X 57884379 1D TTATTTCTCC T/- TTTTTGTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 5 4600 CASAVA_Build X 57897993 1D AAATAAATGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 43 19 17 8 A 9 8 4601 CASAVA_Build X 57899176 1I AGATAGATCC -/A TGAAGATGAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 0 1 4602 CASAVA_Build X 57901608 3I CAATAACAAG ---/TTC TGAAATTGAG 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 TTC 0 1 4603 CASAVA_Build X 57923363 4I AATGGTAGAT ----/TAGA TAAAGAAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 TAGA 0 1 4604 CASAVA_Build X 57945758 1D GGTTAATGTG T/- TTTGCATGTG 3070 het 3070 ref 49 25 16 9 T 4 3 4605 CASAVA_Build X 57960350 1D ACTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 916 het 916 ref 42 32 4 7 A 11 10 4606 CASAVA_Build X 57993788 1I TTTTGTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 T 10 11 4607 CASAVA_Build X 58014215 1I TAAAAATAGC -/T TTTTTTTTTT 2558 het 2558 ref 25 11 10 4 T 10 11 4608 CASAVA_Build X 58043140 1I TGAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 938 het 938 ref 45 41 3 1 A 9 10 4609 CASAVA_Build X 58078183 1D GATATCAGAG T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 T 7 6 4610 CASAVA_Build X 58101367 1I TCAGGGTCCA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 C 8 9 4611 CASAVA_Build X 58140939 2D GCCTGCCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2411 het 538 hom 17 5 6 6 T 16 14 4612 CASAVA_Build X 58193025 1D ATTCCATGAT A/- AAAACTAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 A 5 4 4613 CASAVA_Build X 58206205 1I CTTTTTTCGT -/A AAAATATATG 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 4 5 4614 CASAVA_Build X 58226645 1I GGGCTATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 30 2 20 8 A 10 11 4615 CASAVA_Build X 58258733 2I TTCTAAAGAT --/AG AGACTCCTGG 3070 hom 96 het 35 0 31 4 AG 1 2 4616 CASAVA_Build X 58262705 4D GGCTCACCGG CAGT/---- CAGAGTTTAA 3070 hom 33 het 16 0 11 7 CAGT 1 0 4617 CASAVA_Build X 58278094 1I ACCCCAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 27 1 22 4 T 11 12 4618 CASAVA_Build X 58322851 1I GACCCCTGAT -/G GGGCACGCCG 2888 hom 37 het 18 0 11 7 G 3 4 4619 CASAVA_Build X 58337812 1D GAGTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 1475 het 1475 ref 31 14 5 12 T 15 14 4620 CASAVA_Build X 58446789 1D ATTCTGCAAA T/- TAGACATTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 5 T 2 1 4621 CASAVA_Build X 58447592 1D ATCTCACCAA G/- TTAAACCTTT 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 G 1 0 4622 CASAVA_Build X 58458256 1I AAAATATCCC -/T TTTGCAGATT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 3 4 4623 CASAVA_Build X 58517269 1D CGGTGAAAAA G/- GAAATATCTT 3070 het 3070 hom 50 23 22 5 G 2 1 4624 CASAVA_Build X 58552807 3D ATAATGGAAA AGG/--- AAATATCTTC 1353 het 1353 ref 34 26 3 5 AGG 1 0 4625 CASAVA_Build X 58563101 1I AAATATCTTC -/A CATAAAAACT 2955 het 2955 ref 68 36 18 14 A 0 1 4626 CASAVA_Build X 61603654 1D TGCAAACATC T/- CAAAAGAAGT 3070 het 3070 ref 28 17 11 1 T 1 0 4627 CASAVA_Build X 61616891 1D CTTCCGTTTG C/- CTTTTATATG 1340 het 398 hom 6 1 3 3 C 2 1 4628 CASAVA_Build X 61633345 1D GCTTCCGTTT G/- CCTTTTATAT 2302 het 2302 ref 32 27 5 0 G 1 0 4629 CASAVA_Build X 61634374 3D TGTGGTTTTT AGG/--- AGAAGATATT 1039 het 1039 ref 29 25 3 3 AGG 1 0 4630 CASAVA_Build X 61637647 1D ATGTGAAGAT A/- TTTCCTTTTC 3070 het 3070 hom 59 18 37 4 A 1 0 4631 CASAVA_Build X 61637791 1I TTCTGAGAAT -/G CTTCTGTTTA 3070 het 3070 hom 58 12 26 20 G 0 1 4632 CASAVA_Build X 61640892 11D3M4D TGTGAAGATA AAGGAAAAGGCTTTCAGA/-----------TTT---- CCTTTTCCAC 3070 het 3070 ref 42 37 8 2 N/A 0 0 4633 CASAVA_Build X 61642386 1I TCTCTGAGCT -/A AACTCAATCG 3070 het 3070 ref 47 38 8 1 A 2 3 4634 CASAVA_Build X 61642502 1I21M2I CAGATTCTAC -AAAGGAGTGATTGCAAACTGC--/AAAATGAGTGTTTCCAAACTGCTT TCTATCAAAA 3070 het 3070 ref 45 37 7 3 N/A 0 0 4635 CASAVA_Build X 61678911 1I CCTTCATTGG -/A AAACGGTATA 859 het 859 ref 48 33 5 10 A 3 4 4636 CASAVA_Build X 61689185 1I GGATATTTGG -/A GAGCTTTGAG 3070 het 3070 hom 74 30 34 10 A 0 1 4637 CASAVA_Build X 61692586 4D CAGGAAAACT AACA/---- AACAAACAGA 3070 hom 42 het 19 0 15 7 AACA 3 2 4638 CASAVA_Build X 61716179 13I44M1I GATTGAGCAG -------------GTTTGGTAGAACCGGCAAGTGGCTATTTGGAGCCCTTTGTGGCC-/GTTTGAATCTCTCGTTTGGTAGAACCGGCAAGTGGCTATTTGGAGCCCTTTGTGGCCT TTTTTGGAAA 3070 hom 45 het 22 0 15 20 N/A 0 0 4639 CASAVA_Build X 61731717 1I11M1I5M1D TTCAACTTAG -AGAGTTGCACA-TTCCTC/TAGAGTTGAACACTTCCT- CTGATAGAGC 2248 het 2248 ref 63 39 13 17 N/A 0 0 4640 CASAVA_Build X 61736696 1D TTGATAGAGC A/- ATTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 71 34 36 2 A 2 1 4641 CASAVA_Build X 61754874 1I TAAAAACTAG -/A CAGAAACATT 102 het 102 ref 38 29 1 8 A 0 1 4642 CASAVA_Build X 61756201 1I4M1D TTGAGGCCTA -TGTAG/CTGTA- GAAAACGAAA 955 het 955 ref 36 25 10 4 N/A 0 0 4643 CASAVA_Build X 61790542 1D ACCAAAAAAA C/- CGGACTTCTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 2 1 4644 CASAVA_Build X 61825378 3I TCCTTCGAAA ---/CTT CTTCTTCTCT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 CTT 2 3 4645 CASAVA_Build X 61861640 1D CTTCTATCCA T/- TTTTTTATCT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 7 6 4646 CASAVA_Build X 61862062 1I CAGATTCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 A 10 11 4647 CASAVA_Build X 61866916 1D GAGCTGAATG A/- AAAAAAAAAG 1893 het 1893 ref 38 24 4 10 A 10 9 4648 CASAVA_Build X 61880640 1D ATATAGGCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 14 14 1 A 10 9 4649 CASAVA_Build X 61899878 1I ATTTTTCTAG -/T TTTTTTTTTT 1708 het 1708 ref 27 17 5 5 T 11 12 4650 CASAVA_Build X 62007417 14I GCAACCACTG --------------/TCCTGCAACCACTT TCTGACACCC 3070 hom 96 het 35 0 29 6 TCCTGCAACCACTT 0 1 4651 CASAVA_Build X 62012632 4D GAATACTATG CAGC/---- CATAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 11 CAGC 1 0 4652 CASAVA_Build X 62019366 4D TCTTATTCAA TCTT/---- TCTTTCAAAA 3070 het 3070 hom 57 26 29 3 TCTT 2 1 4653 CASAVA_Build X 62056649 1I CAAACTTTCC -/A AAAAAAAAAA 1315 het 1315 ref 39 32 3 4 A 11 12 4654 CASAVA_Build X 62108502 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 A 12 13 4655 CASAVA_Build X 62142044 3D TTGAGGTACA AAC/--- AACAACAGAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 AAC 3 2 4656 CASAVA_Build X 62173146 1I TTTTGATTAA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 8 9 4657 CASAVA_Build X 62464363 2I TCTCAATTTT --/TA TATATATATA 1112 het 1112 ref 12 6 4 2 TA 8 9 4658 CASAVA_Build X 62527255 22D AGTTTCCTTT CTTGAACATTAGTTCAAGTTTC/---------------------- CTTGAACATT 3070 het 3070 ref 46 22 22 9 CTTGAACATTAGTTCAAGTTTC 1 0 4659 CASAVA_Build X 62562391 2I GACAAAAGAG --/AA ACATGGAAAA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 1 3 4660 CASAVA_Build X 62580300 1D CTCCAAGGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1235 hom 42 4 23 16 A 15 14 4661 CASAVA_Build X 62580440 1D CAACATTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 32 1 29 3 A 12 11 4662 CASAVA_Build X 62609845 10D AAAACAAAAG ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 het 1857 hom 31 8 14 11 AC 14 9 4663 CASAVA_Build X 62628766 1D CAACGCAGAA G/- GACGGGTGGT 3070 hom 69 het 24 0 22 2 G 2 1 4664 CASAVA_Build X 62750179 1D GCTGCAGGAG T/- TTTTTTTTCC 2469 het 2469 ref 33 20 10 3 T 9 8 4665 CASAVA_Build X 62807142 1I AAATCTCCAG -/A AAAAAAAAAA 1001 het 1001 ref 45 37 4 4 A 11 12 4666 CASAVA_Build X 62879815 4I CTCAAAAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAAC 2 3 4667 CASAVA_Build X 62953036 1I GCTTAGGAGC -/A AAAAAAAAAA 1617 het 1617 ref 39 14 5 20 A 15 16 4668 CASAVA_Build X 63025737 1D AACCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2549 het 2549 ref 26 14 7 5 A 13 12 4669 CASAVA_Build X 63032266 1D GATTCTATCT A/- AAAAAAAAAA 2040 het 2040 ref 26 12 5 9 A 17 16 4670 CASAVA_Build X 63136066 1I GAATTAAAAT -/A AATTAAAGAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 2 3 4671 CASAVA_Build X 63212274 1D CCATCTCTAC A/- AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 6 5 4672 CASAVA_Build X 63245331 1D ATTGATGGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 10 9 4673 CASAVA_Build X 63316114 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2092 het 2092 ref 34 19 6 9 A 15 14 4674 CASAVA_Build X 63484865 1D ACATTTATAG A/- AAAAAAAAAA 2611 het 2611 ref 38 29 7 3 A 12 11 4675 CASAVA_Build X 63610594 1I CTCCTTTTTT -/C ACGTTATCGC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 4676 CASAVA_Build X 63626532 1I GTGTATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 12 12 T 15 16 4677 CASAVA_Build X 63816066 2D TCCTGAAGGA TG/-- TGTGTGTGTG 1054 het 1054 ref 42 27 3 12 TG 9 8 4678 CASAVA_Build X 63942046 1I TCATCATTGA -/G GCAAAGCCTC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 1 2 4679 CASAVA_Build X 64067627 1D TTAAAATTAC A/- GTTTCAATCT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 1 0 4680 CASAVA_Build X 64207895 1D TTTTTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 1921 het 1921 ref 28 14 5 9 T 17 16 4681 CASAVA_Build X 64245245 1D CAGTTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 33 0 20 15 A 13 12 4682 CASAVA_Build X 64262655 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 1387 het 1387 ref 51 35 4 12 T 13 12 4683 CASAVA_Build X 64378060 3I GCTTCCCCTC ---/CTT CTGGGGGCTT 3070 hom 78 het 31 0 23 8 CTT 0 1 4684 CASAVA_Build X 64482865 1D TGGTACTAGT A/- AAAAAAAAAA 2638 het 2638 ref 33 14 7 12 A 16 15 4685 CASAVA_Build X 64489073 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 15 0 13 2 A 13 12 4686 CASAVA_Build X 64542983 1D CATAGCAACA G/- GAATGAAGCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 2 1 4687 CASAVA_Build X 64595627 1I AAATGATAAT -/G GGGATATCAC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 3 4 4688 CASAVA_Build X 64606986 1D TTCCTACCAA C/- CAGAAAGGGA 3070 hom 83 het 34 0 27 7 C 2 1 4689 CASAVA_Build X 64652993 1I CCCCTGCCTC -/T TTTAGCCTGA 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 T 3 4 4690 CASAVA_Build X 64695048 1D ACACTTAACA T/- TTTTTTTTTT 2087 het 2087 ref 35 21 6 8 T 15 14 4691 CASAVA_Build X 64733455 1I GATGACAGCT -/C CCTCCCTCAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 2 3 4692 CASAVA_Build X 64858144 1D ACAGTAAACC T/- TTTTTTTTTT 1620 het 1620 ref 53 40 4 9 T 11 10 4693 CASAVA_Build X 64996280 1D ACCTCCTCAA G/- TAAGCTCTCC 3070 het 3070 ref 46 28 10 8 G 1 0 4694 CASAVA_Build X 65011487 6D ACAGAAAATC CCCATT/------ CCGAAGGAAA 3070 het 3070 ref 49 25 22 4 CCCATT 1 0 4695 CASAVA_Build X 65026469 1D CTTAAAGAGA T/- TTTGGTCTGA 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 T 4 3 4696 CASAVA_Build X 65033501 1I TGCTCTTCCA -/T TTTTTAATAT 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 T 5 6 4697 CASAVA_Build X 65049888 1I TTGTTGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 10 11 4698 CASAVA_Build X 65063785 1D TGTCAAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 11 10 4699 CASAVA_Build X 65066829 4I CACACATTGC ----/ACAT ACACTCTTTC 3070 het 3019 hom 19 9 7 3 ACAT 0 1 4700 CASAVA_Build X 65069070 1D TCAAATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2049 hom 22 6 13 3 T 12 11 4701 CASAVA_Build X 65078166 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 15 10 A 12 11 4702 CASAVA_Build X 65094519 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2881 hom 37 14 10 13 A 15 16 4703 CASAVA_Build X 65121924 1I TATCTATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 10 11 4704 CASAVA_Build X 65126504 8D TGAGGGGTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 8 TTTG 5 3 4705 CASAVA_Build X 65138588 2I GAAAACAGAA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 TC 6 7 4706 CASAVA_Build X 65184310 1I TCCTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 13 14 4707 CASAVA_Build X 65195391 3I CAGTCTGGTT ---/AAG AAGAACTGAC 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 AAG 1 2 4708 CASAVA_Build X 65196300 4D AAATATTTCC CAAA/---- CAAGGAAAAG 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 CAAA 1 0 4709 CASAVA_Build X 65198228 1I ATCTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 9 10 4710 CASAVA_Build X 65200314 1I ACTAGTGTGA -/T TTTTTTGGGG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 6 7 4711 CASAVA_Build X 65201990 4D TCTTTCCTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 TCTT 5 4 4712 CASAVA_Build X 65206120 1I GGTCAATGAC -/A AAAAAAAAAA 2917 het 2917 ref 37 21 9 7 A 14 15 4713 CASAVA_Build X 65216463 3D CTCTGTAAAA AAG/--- AAGAATAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 AAG 2 1 4714 CASAVA_Build X 65218100 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1155 hom 17 4 8 5 A 16 15 4715 CASAVA_Build X 65221427 1I AATGATAAAT -/A AAATGTTAAA 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 A 3 4 4716 CASAVA_Build X 65222173 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1963 hom 21 5 11 5 A 10 9 4717 CASAVA_Build X 65225223 1I CCAACATCTA -/T TTTTTTTTTA 2995 het 2995 ref 25 12 8 5 T 9 10 4718 CASAVA_Build X 65229221 1D TATCTGGTAG T/- TTTTTTTTTT 2752 het 2752 ref 28 13 6 9 T 13 12 4719 CASAVA_Build X 65229604 4I GCTCTGAATA ----/TCTT TCTTCTACTT 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 TCTT 1 2 4720 CASAVA_Build X 65238278 11I ATTTCCAGCT -----------/AGCAAATCTGA AGTGCCAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 AGCAAATCTGA 0 1 4721 CASAVA_Build X 65245931 4D TATTAAACTT ACTC/---- TGTGTCGAGC 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 ACTC 1 0 4722 CASAVA_Build X 65247565 1I TTGCTTTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 9 10 4723 CASAVA_Build X 65249192 1I TCTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 A 10 11 4724 CASAVA_Build X 65255748 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 13 14 4725 CASAVA_Build X 65265239 1D TTCTTGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 T 11 10 4726 CASAVA_Build X 65266749 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 10 9 AC 1 0 4727 CASAVA_Build X 65270134 2D76M1D CACCTTTTTC TATGACTGTCATTTGTATCTCTTTTTTTGAGGGATTTCAATTGAAATCTTTTGCTCATCTTTTGATCAGATGATTAGAT/--TGACTGTCATTTGTATCTCTTTTTTTGAGGGATTTCAATTGAAATCTTTTGCTCATCTTTTGATCAGATGATTAGA- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 38 20 4 N/A 0 0 4728 CASAVA_Build X 65273306 1D TTAACTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 A 11 10 4729 CASAVA_Build X 65275681 1I AATTTTGATG -/T CTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 0 1 4730 CASAVA_Build X 65276112 4D CACTGTTTGC ACAA/---- ACAAACAAAG 3070 het 3070 hom 48 20 27 2 ACAA 3 2 4731 CASAVA_Build X 65278000 2D AGGTTGATTC TA/-- TGTCTTTGTT 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 TA 1 0 4732 CASAVA_Build X 65285438 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 A 11 12 4733 CASAVA_Build X 65285875 1D AGTGAATGAG A/- AAAAAAGGAG 3070 hom 105 het 46 0 36 11 A 7 6 4734 CASAVA_Build X 65290999 1D AAAGAAATAG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 52 23 23 6 A 8 7 4735 CASAVA_Build X 65308367 1D TGTATTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 12 11 4736 CASAVA_Build X 65310530 1D CTTTGCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 14 23 10 T 11 10 4737 CASAVA_Build X 65314515 1I GATTGAAGAA -/T TTTTTTTTTT 2496 het 2496 ref 18 6 8 4 T 10 11 4738 CASAVA_Build X 65348754 2D TTTTAATGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 14 12 4739 CASAVA_Build X 65351295 5D AGAAAGAAAA TTTTC/----- TTAATAACAT 3070 het 3070 hom 27 9 16 3 TTTTC 1 0 4740 CASAVA_Build X 65355419 2D TATAGATAAC AT/-- AACTGATTAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 AT 1 0 4741 CASAVA_Build X 65372058 1D CATTTTTAGC T/- TTGTTGAAGA 3070 het 3070 hom 49 17 27 5 T 3 2 4742 CASAVA_Build X 65377089 1D GCTAATTATT A/- AAAAAAAAAA 2892 het 2892 ref 31 16 8 7 A 13 12 4743 CASAVA_Build X 65391960 1D TTCTCATTAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 8 4744 CASAVA_Build X 65395648 1I ACAATTAGTT -/A AAAGAGCAGA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 A 3 4 4745 CASAVA_Build X 65402696 1I CAAATTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 T 10 11 4746 CASAVA_Build X 65409131 1D CAACAAGAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 10 9 4747 CASAVA_Build X 65411074 1D GCCAAATCGG A/- AAAAACAATC 3070 het 3070 ref 35 21 10 5 A 6 5 4748 CASAVA_Build X 65411210 1D CAAACAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 6 A 11 10 4749 CASAVA_Build X 65415392 1D CCTGTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2992 hom 35 11 13 11 A 15 14 4750 CASAVA_Build X 65418045 3I CATCAAGAAT ---/GAA GGAGAAATAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 GAA 0 1 4751 CASAVA_Build X 65418639 2D TTGTAGAACT AA/-- ATTGCTTACA 3070 het 3070 ref 32 14 14 7 A 3 1 4752 CASAVA_Build X 65423329 1I TTAAAAAAAC -/A AAAACTTCCC 3070 het 2508 hom 24 6 14 4 A 4 5 4753 CASAVA_Build X 65425336 1D ATTTTAAGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 10 9 4754 CASAVA_Build X 65425921 22D TATTAGCTAT ATATAGCTATATATATTAGCTA/---------------------- TATAAATGAC 3070 het 3070 ref 33 22 16 6 ATATAGCTATATATATTAGCTA 1 0 4755 CASAVA_Build X 65444542 3D GCAAATAGTT TTA/--- TTATTTTGGG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 TTA 2 1 4756 CASAVA_Build X 65445353 1I TTTTTGAAGG -/T TTTTTCATGT 3070 het 2332 hom 24 9 15 0 T 5 6 4757 CASAVA_Build X 65448466 1I GTCTTTCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 10 11 4758 CASAVA_Build X 65464965 1D CCTAGTTTCT G/- GGGGGGGGCG 2763 het 970 hom 16 3 9 4 G 9 8 4759 CASAVA_Build X 65508595 1D GTTTTGATTT G/- CATTTCTCTA 3070 het 3070 hom 24 11 11 4 G 1 0 4760 CASAVA_Build X 65512322 1D TTTGCGCTGG T/- TTTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 46 18 18 10 T 5 4 4761 CASAVA_Build X 65521349 1D AGGATTTGAA C/- CCAGCTATGT 3070 het 3070 ref 56 26 24 6 C 3 2 4762 CASAVA_Build X 65529153 9I GGAGATAATT ---------/GAATCATCA GAGCAGTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 GAATCATCA 0 1 4763 CASAVA_Build X 65534566 1I CAGGCAGAAT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 A 8 9 4764 CASAVA_Build X 65540144 7D CTTCTCCCCA TCATTTT/------- TCATTTTCAG 3070 het 3070 ref 43 21 17 7 TCATTTT 2 1 4765 CASAVA_Build X 65554359 1D TCAAGATATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 9 8 4766 CASAVA_Build X 65560297 1I CACTGCTGCC -/T TGCAGTTTGA 2922 het 2922 ref 23 10 8 5 T 1 2 4767 CASAVA_Build X 65567708 1I TTATTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 10 11 4768 CASAVA_Build X 65581070 2I ATATTTTATC --/TA TATATATAAT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 TA 4 5 4769 CASAVA_Build X 65585925 10D TGTTCTTTGC CTCTGTCCAT/---------- CTCTGTCCAT 3070 het 3070 hom 36 18 17 2 CTCTGTCCAT 2 1 4770 CASAVA_Build X 65601365 1D TGCCTTAGTT A/- AAGGCCCTGA 2991 het 2991 ref 44 34 8 2 A 3 2 4771 CASAVA_Build X 65602137 1I30M1I CAACTAATTC -ATTCTTTTAGTTGCCTCTGGAGTTGATGTT-/AATTTCCTTAGCTGCCTCTGGAGTTAATGTTC TTTTACTATT 3070 het 3070 ref 67 44 31 4 N/A 0 0 4772 CASAVA_Build X 65602730 11D TATAATTAAA GGCCAATCATT/----------- GGGGATCATG 2257 het 2257 ref 37 35 5 2 GGCCAATCATT 1 0 4773 CASAVA_Build X 65607330 3I TTTTATTATC ---/TTA TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 TTA 0 1 4774 CASAVA_Build X 65614012 1I AGTTGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 1954 het 1954 ref 37 23 6 8 T 14 15 4775 CASAVA_Build X 65617067 1D ACAATGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 11 10 4776 CASAVA_Build X 65625117 1D AAGAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 13 12 4777 CASAVA_Build X 65632291 1I ATAAAAATAG -/A AAAAAAAACC 2832 het 2606 hom 18 6 8 4 A 8 9 4778 CASAVA_Build X 65639185 36D ATTGATTGTG ATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------ ATATATATAT 3070 het 11 hom 11 1 10 4 AT 23 5 4779 CASAVA_Build X 65643531 1D CACCTTGACT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 9 8 4780 CASAVA_Build X 65648226 2D AGTCACTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1885 hom 35 12 19 4 T 19 17 4781 CASAVA_Build X 65662198 3D GTTCAAGTGA TTC/--- TTGTGCCTTA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TTC 1 0 4782 CASAVA_Build X 65680856 1I AAGATACAGG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 T 8 9 4783 CASAVA_Build X 65684249 1D AATTTACAAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 1710 hom 15 4 10 1 A 7 6 4784 CASAVA_Build X 65711592 14D GGATATATAA GCAGTAATGGCATT/-------------- GCTGGGTCAA 3070 het 3070 ref 27 19 7 3 GCAGTAATGGCATT 1 0 4785 CASAVA_Build X 65715381 1I TTTATTTGAA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 7 8 4786 CASAVA_Build X 65722993 6D TAGGTCTTAC ATTTAT/------ ATTTAAATCT 2623 hom 15 het 7 0 6 4 ATTTAT 1 0 4787 CASAVA_Build X 65724375 1D AAGGATTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 12 11 4788 CASAVA_Build X 65724785 1D TAATCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2551 hom 14 6 7 1 A 11 10 4789 CASAVA_Build X 65725587 9D4M12D ATGCACAACT GGCATGGCAGTTTAAACTAAACTAA/---------GTTT------------ AGTTTAATTA 1291 het 1291 ref 30 23 3 9 N/A 0 0 4790 CASAVA_Build X 65736012 1I GCTTTTTTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 8 4791 CASAVA_Build X 65765273 1I AAACATTACC -/A AAAAAAAAAA 1659 het 1659 ref 33 16 6 11 A 15 16 4792 CASAVA_Build X 65807566 1I ATCTCTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 33 1 28 4 A 12 13 4793 CASAVA_Build X 65818860 1D ATGCTACTGG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 9 8 4794 CASAVA_Build X 65900286 8D AGTCCTGGGG TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 30 2 21 9 T 20 12 4795 CASAVA_Build X 65919856 1I CAGAATTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 9 10 4796 CASAVA_Build X 65932134 1I CATGCTGCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 9 10 4797 CASAVA_Build X 65944993 1I ACATCACAAG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 8 9 4798 CASAVA_Build X 65989200 1D ATTTACATTG A/- TTTTTTTCAG 3070 hom 148 het 52 0 50 3 A 1 0 4799 CASAVA_Build X 66019799 1D TTGAAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 12 11 4800 CASAVA_Build X 66020503 124D TAGGAAAGCT CTTTCTGTCTGAAATGCTCTCAGTCCCTGCCCCTGACAGCTTTATTGCTCACTCCTTCCTCTCCTTCAAATATTTGTTCAAGTAAAACCTACTGAGACTTAACCACCCTATTTAATATTGCAAA/---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- CTGCCTCCAC 3070 hom 48 het 16 0 16 6 CTTTCTGTCTGAAATGCTCTCAGTCCCTGCCCCTGACAGCTTTATTGCTCACTCCTTCCTCTCCTTCAAATATTTGTTCAAGTAAAACCTACTGAGACTTAACCACCCTATTTAATATTGCAAA 1 0 4801 CASAVA_Build X 66028719 15I CCAAAAGAAA ---------------/AAGAGGTACATGAAC AAGCATTGAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AAGAGGTACATGAAC 0 1 4802 CASAVA_Build X 66051277 2D ACACACACAC AT/-- GTACACACAC 3070 hom 138 het 51 0 47 5 AT 1 0 4803 CASAVA_Build X 66067830 1D GAAAAAATTA T/- AGTATATATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 0 4804 CASAVA_Build X 66076144 1I AACAATCCAA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 105 het 36 0 35 1 T 7 8 4805 CASAVA_Build X 66127354 1I TTTTTCAAGG -/C TTTATCCATA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 C 0 1 4806 CASAVA_Build X 66155147 1I TTCCAAGCCC -/T TTTTGTTTTA 3070 hom 128 het 51 0 42 9 T 4 5 4807 CASAVA_Build X 66168882 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 33 8 18 7 A 6 7 4808 CASAVA_Build X 66196566 2D TTCTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 2414 het 14 hom 28 1 10 17 TG 1 0 4809 CASAVA_Build X 66198946 1D GTGGATAAGC T/- TTTTGATGTG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 5 4 4810 CASAVA_Build X 66200391 1I AACCCCTGCC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 7 8 4811 CASAVA_Build X 66217630 10D AATTACATAA ATATGTGTAT/---------- ATATGTGTAT 332 het 332 ref 35 5 5 26 ATATGTGTAT 2 1 4812 CASAVA_Build X 66223832 12D TTTGATGGGT TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 1849 hom 34 9 17 12 TG 15 9 4813 CASAVA_Build X 66230036 1I GATACAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 41 1 35 5 T 10 11 4814 CASAVA_Build X 66236399 1I CTGGACTCTA -/C CCCCCCCCAG 3070 hom 117 het 40 0 37 3 C 8 9 4815 CASAVA_Build X 66237153 1D GCTGTCTATT G/- CACTCCAAGC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 G 1 0 4816 CASAVA_Build X 66241039 1I CCGTTATGGA -/G AAAACAAAGC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 G 0 1 4817 CASAVA_Build X 66251920 4I GAGAAGCAAT ----/AAGA AAGAGTTATT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 AAGA 1 2 4818 CASAVA_Build X 66257958 1I ATTGATTATC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 8 9 4819 CASAVA_Build X 66275421 1I TTTCATTTCT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 9 4820 CASAVA_Build X 66283154 2D TATATACGTG TA/-- TATATATATG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 5 4 4821 CASAVA_Build X 66284653 1D TCCTTCAGTT C/- TCTGATCTTA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 C 1 0 4822 CASAVA_Build X 66297814 4D TTTGATTAGA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 TTTG 4 3 4823 CASAVA_Build X 66298708 2I AGTCTGAAAT --/AA GTCTTAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 0 2 4824 CASAVA_Build X 66315046 1I ACTAAAAAGG -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1103 hom 34 3 25 6 C 0 1 4825 CASAVA_Build X 66319487 1D AAGTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 A 13 12 4826 CASAVA_Build X 66334365 2D CTAAAATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 29 0 21 8 A 13 11 4827 CASAVA_Build X 66340481 3D AATTCTGACA CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 hom 18 het 22 1 13 8 C 13 10 4828 CASAVA_Build X 66347836 4D GTAAGTCAAG TCCA/---- ACTTTTTAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TCCA 1 0 4829 CASAVA_Build X 66389517 1I TAATTGGAAG -/T GAAACACTCC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 0 1 4830 CASAVA_Build X 66393528 1D TAATAATACA G/- AACCCAGAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 1 0 4831 CASAVA_Build X 66403948 1D ATTGAATTAT A/- ATTTTTTTTT 3070 hom 112 het 42 0 38 4 A 2 1 4832 CASAVA_Build X 66410056 1D CCACTAATAA T/- TTTTTTAGAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 6 4833 CASAVA_Build X 66412355 3I TATTATCAAT ---/GAG GAGTTTTGTG 3070 hom 144 het 51 0 48 3 GAG 1 2 4834 CASAVA_Build X 66423072 1D TCAGAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 31 0 19 12 A 14 13 4835 CASAVA_Build X 66446197 1I CCATGCAAAA -/G CTCTTTAGTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 4836 CASAVA_Build X 66476282 2D CTGCTCTCCT AC/-- ACACACACAC 1380 het 1380 ref 42 26 3 14 AC 8 7 4837 CASAVA_Build X 66605454 1D TGAATGGATG A/- AAAAAAAAAA 1551 het 1551 ref 29 18 6 6 A 15 14 4838 CASAVA_Build X 66743599 1D TGTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 11 10 4839 CASAVA_Build X 66832707 1I ATCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 476 hom 37 2 33 2 T 12 13 4840 CASAVA_Build X 66860845 1D ACAAGCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 22 1 17 4 A 11 10 4841 CASAVA_Build X 66864745 1I GCTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 384 hom 45 1 40 4 T 9 10 4842 CASAVA_Build X 66866748 3D AAAAAGAAAT AAG/--- AAGAGAGAGA 3070 hom 126 het 47 0 43 5 AAG 2 1 4843 CASAVA_Build X 66868863 13D ACCACTCTGG AACTTCAACCTAT/------------- AACACCCAAC 3070 hom 123 het 44 0 39 10 AACTTCAACCTAT 1 0 4844 CASAVA_Build X 66874494 1I GATCAGGTAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 74 het 29 0 25 4 A 8 9 4845 CASAVA_Build X 66885554 1I TATGGCCTAT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 7 8 4846 CASAVA_Build X 66888121 1I AAGAAGTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 35 2 23 10 A 11 12 4847 CASAVA_Build X 66898542 1D ATCTGTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 33 1 26 7 A 12 11 4848 CASAVA_Build X 66908194 1D ATTCTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 22 1 17 4 A 13 12 4849 CASAVA_Build X 66909105 1I CCTAAATATA -/T ATGCACCCAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 4850 CASAVA_Build X 66923029 1D ACCTCAGGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 14 0 10 5 A 10 9 4851 CASAVA_Build X 66928467 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 874 hom 22 3 15 4 A 13 14 4852 CASAVA_Build X 66931692 1D CTGTAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2988 het 2403 hom 26 9 8 9 A 13 12 4853 CASAVA_Build X 66933931 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 8 9 4854 CASAVA_Build X 66934700 1I ATGGTTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 36 0 29 7 T 13 14 4855 CASAVA_Build X 66937519 1I TTAAAAAGTC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 7 8 4856 CASAVA_Build X 66945985 1I GAAAATAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 9 10 4857 CASAVA_Build X 66946427 1D TACAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 29 1 19 10 A 12 11 4858 CASAVA_Build X 66952418 2D TCTATCTATC TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 TA 6 5 4859 CASAVA_Build X 66954951 1D AAAAGATCCT A/- AAAGCAGCCA 3070 hom 45 het 31 1 27 3 A 4 3 4860 CASAVA_Build X 66956768 1D ATTGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 19 1 14 4 A 11 10 4861 CASAVA_Build X 66958093 1I GGAATCCTTT -/C CCCATTGCTT 2203 hom 15 het 6 0 6 0 C 3 4 4862 CASAVA_Build X 66968082 1I TCTTCAGGAT -/A TTATCCAAGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 0 1 4863 CASAVA_Build X 66974441 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 11 10 4864 CASAVA_Build X 66977599 1D GGTATTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 703 hom 30 2 23 6 A 11 10 4865 CASAVA_Build X 66981586 1I TTGGAAGCAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 9 10 4866 CASAVA_Build X 66983073 1D GTGAAACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 710 hom 32 2 27 3 A 11 10 4867 CASAVA_Build X 67007371 1I TTCTACCCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 4868 CASAVA_Build X 67007653 1D AATTAAATCA T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 8 7 4869 CASAVA_Build X 67020213 1I TGCCTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 1058 het 1058 ref 26 15 3 8 T 15 16 4870 CASAVA_Build X 67167330 3I CCCACATGAA ---/AAG AAGAACAACG 3070 hom 88 het 33 0 29 4 AAG 1 2 4871 CASAVA_Build X 67221177 1I CTTCTCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1255 hom 30 3 19 8 A 10 11 4872 CASAVA_Build X 67228689 1D AGTAACAAAG A/- AAACTTAAAA 3070 hom 110 het 43 0 36 7 A 4 3 4873 CASAVA_Build X 67240189 1I AAATTCAACA -/C CCCTCCATGC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 3 4 4874 CASAVA_Build X 67246574 1I TATACGCCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 36 0 25 11 A 9 10 4875 CASAVA_Build X 67260522 1I CTGAATGGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 42 0 31 11 A 9 10 4876 CASAVA_Build X 67265079 5D GGGAGAGAGA GAGAG/----- GAGAGTGATT 3070 het 3070 ref 20 10 9 3 GAGAG 2 1 4877 CASAVA_Build X 67277863 12D TCAGCTACTT AAGTAAAAAGTA/------------ AAAATCTAAG 3070 hom 111 het 41 0 38 6 AAGTAAAAAGTA 1 0 4878 CASAVA_Build X 67283385 26D GTGTGTTTGT GTGTGTCTGTGTGTGTACACAAAGGC/-------------------------- GTGTGTCTGT 3070 het 3070 ref 54 36 18 15 GTGTGTCTGTGTGTGTACACAAAGGC 2 1 4879 CASAVA_Build X 67294287 5D AATAAATAAC AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 14 9 AAAAT 3 2 4880 CASAVA_Build X 67296565 1I CTGGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 A 11 12 4881 CASAVA_Build X 67299850 1I AACCACTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 9 10 4882 CASAVA_Build X 67301983 2I AATATTGCTG --/TA TCTCAGGGAA 3070 hom 102 het 35 0 34 1 TA 0 1 4883 CASAVA_Build X 67308009 1D GAAGTCTACA G/- TAAGAAGATA 2448 het 2448 ref 13 7 6 0 G 1 0 4884 CASAVA_Build X 67314105 1D TAATTTAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 13 13 6 A 9 8 4885 CASAVA_Build X 67315777 3D CTAAATTCTC CTT/--- CTCAGGAATT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 CTT 1 0 4886 CASAVA_Build X 67317526 1D TTGAAAAAAA T/- ATATCACAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 1 0 4887 CASAVA_Build X 67339072 1I TTACGCTACA -/T TTTTTTTTTT 996 het 996 ref 35 26 3 6 T 13 14 4888 CASAVA_Build X 67346560 1D CAGTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 977 hom 32 3 18 11 T 13 12 4889 CASAVA_Build X 67347784 1D GGGGGGCTTA T/- TTTTCACTAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 5 4 4890 CASAVA_Build X 67359420 2I4M1D GGGTGCAGCG --CCAGC/CACCAG- CATGGCACAT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 N/A 0 0 4891 CASAVA_Build X 67376384 2D TCCTTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 22 6 T 14 12 4892 CASAVA_Build X 67376397 2D TTTTTTTTTT TC/-- TTTAGAAGGA 3070 het 54 hom 21 2 14 5 TC 1 0 4893 CASAVA_Build X 67408513 1D GAGTTCCATC A/- AGCTGTCCTC 2674 hom 21 het 9 0 8 1 A 2 1 4894 CASAVA_Build X 67408573 1D14M1I GAGATCCCCC TTCCTCCTGCAACGT-/-TCCTCCTGCAACGTC CCTCCAGCTC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 N/A 0 0 4895 CASAVA_Build X 67424032 1I GTTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 A 16 17 4896 CASAVA_Build X 67466950 1I CAGGCATGAG -/C CACAGCGCTC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 2 4897 CASAVA_Build X 67481004 1D CATGGTGAAA C/- CCCACCTTTA 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 C 4 3 4898 CASAVA_Build X 67536397 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2973 het 194 hom 20 2 13 5 T 13 14 4899 CASAVA_Build X 67538955 5D GAAGAGAGAA AGAAG/----- AGAAGAGAAG 3070 hom 95 het 42 0 29 14 AGAAG 4 3 4900 CASAVA_Build X 67547711 1I GGTGCTTTTA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 7 8 4901 CASAVA_Build X 67550311 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAACAAC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 7 6 4902 CASAVA_Build X 67559582 18D GATATGTAGC TTTCTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTCTTTTTT 2914 hom 18 het 13 0 7 6 TTTCTTTTTTTTTTTTTT 1 0 4903 CASAVA_Build X 67560763 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 A 10 9 4904 CASAVA_Build X 67562235 1D GACAGTGACC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 7 6 4905 CASAVA_Build X 67566612 1D AGAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 638 hom 37 3 27 8 A 13 12 4906 CASAVA_Build X 67583014 1I CCTGCCCCAG -/C CCTCTCTAGT 2302 het 2302 ref 21 11 7 3 C 2 3 4907 CASAVA_Build X 67583309 1I GCCAGAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 29 2 17 10 T 14 15 4908 CASAVA_Build X 67588742 1D AGCAAACTTT G/- TAGATCTCTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 1 0 4909 CASAVA_Build X 67595161 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 21 0 13 8 T 11 12 4910 CASAVA_Build X 67641968 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 140 het 53 0 46 7 CT 1 2 4911 CASAVA_Build X 67827693 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 638 het 638 ref 53 34 3 17 CA 6 5 4912 CASAVA_Build X 67866918 1D TTGAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 38 1 31 6 A 12 11 4913 CASAVA_Build X 67899184 1D TGTTAGAAAT A/- ACCTTCAAGG 3070 hom 108 het 44 0 36 11 A 2 1 4914 CASAVA_Build X 67954943 2D TATCACATTG TA/-- TATATATATA 1676 het 1676 ref 46 37 4 5 TA 7 6 4915 CASAVA_Build X 67968073 18D AGGGGGGAAC GTTGTGAAGTGCTCAGTG/------------------ GTTGTGAAGT 3070 het 3070 ref 33 10 8 20 GTTGTGAAGTGCTCAGTG 2 1 4916 CASAVA_Build X 67973439 1I GTGAACTTTT -/C CACCTCTTCT 3070 hom 105 het 38 0 31 7 C 1 2 4917 CASAVA_Build X 67987020 3I TAACTGTCTT ---/CTC CTTTGAAAAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 CTC 0 1 4918 CASAVA_Build X 68001057 1I CACTTGAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 296 hom 45 1 34 10 A 10 11 4919 CASAVA_Build X 68046859 1D AACCAACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 11 10 4920 CASAVA_Build X 68086178 1D TTTAACTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 10 9 4921 CASAVA_Build X 68091151 1D TAATAAGACA T/- TGCAAAAATA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 2 1 4922 CASAVA_Build X 68111238 8D AAAAGAAAGA GAGAGAAG/-------- GAAGGAAGGA 1408 hom 18 het 7 0 7 0 GAGAGAAG 1 0 4923 CASAVA_Build X 68114242 2I AGGAGGAAAC --/AA GAGAAGTATG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 0 2 4924 CASAVA_Build X 68115067 1D GGGTGGGAGA T/- TTCCCCCAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 3 2 4925 CASAVA_Build X 68206509 1I CAGAGGCTGG -/C CATGGTGGCC 2567 het 2567 ref 32 15 10 7 C 1 2 4926 CASAVA_Build X 68261058 5D TTAAGTTTAT TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 TTTTA 3 2 4927 CASAVA_Build X 68303108 1I GGAAAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 669 hom 31 3 16 12 A 14 15 4928 CASAVA_Build X 68304358 1I GTTCAAGCAA -/T TCTCCTGCCT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 1 2 4929 CASAVA_Build X 68317097 1D GAAGGAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 A 14 13 4930 CASAVA_Build X 68317726 1I TGATGGCAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 9 10 4931 CASAVA_Build X 68321428 2I CTATGTGTCC --/TT TTAAGATCTC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 2 4 4932 CASAVA_Build X 68323601 3I ATAACAACAG ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 53 21 23 9 TAA 5 6 4933 CASAVA_Build X 68326897 1D CTATATCTCA T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 7 6 4934 CASAVA_Build X 68338504 2I AATTAGGTGC --/GG GGGGTGGGGC 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 G 4 6 4935 CASAVA_Build X 68350388 2D AGAAAGAATA CT/-- TACACTGGGC 3070 het 3070 ref 40 22 15 6 CT 1 0 4936 CASAVA_Build X 68359434 1I GAAAATAGGA -/T CCACCCCTCC 3070 hom 84 het 31 0 27 4 T 0 1 4937 CASAVA_Build X 68361260 2D CCAGGATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2139 hom 39 8 20 12 TA 9 8 4938 CASAVA_Build X 68369495 1I TTTATTCCTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 54 16 32 6 A 8 9 4939 CASAVA_Build X 68404936 2D CAATCATTAT CA/-- CAGATTCTCT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 CA 2 1 4940 CASAVA_Build X 68406783 3D TTCTTAGTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2595 hom 15 het 10 0 6 4 T 13 10 4941 CASAVA_Build X 68427671 2D AGAAGAAAAA AG/-- AGTGATTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 AG 2 1 4942 CASAVA_Build X 68441024 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 A 7 6 4943 CASAVA_Build X 68457612 1I TTGCCCCCCC -/T CCACCCTCAC 3070 hom 43 het 20 0 12 8 T 0 1 4944 CASAVA_Build X 68458976 1D CATGGTGAAA C/- CCCCGTCTCT 1973 het 470 hom 7 1 5 1 C 5 4 4945 CASAVA_Build X 68465526 1D CATTTGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1771 hom 35 10 12 13 T 15 14 4946 CASAVA_Build X 68470656 1D CCATTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3039 hom 28 11 9 8 A 15 14 4947 CASAVA_Build X 68473192 5D TTTAAAACTT TTCTC/----- TTAGATTCAG 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 TTCTC 1 0 4948 CASAVA_Build X 68480941 1D CCAACTTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 10 9 4949 CASAVA_Build X 68483756 1D TTTTTTTTTT A/- AATTCGCTTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 3 2 4950 CASAVA_Build X 68511096 1I GTTTCCTCTA -/C TGAGGGACTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 0 1 4951 CASAVA_Build X 68513909 1I GGAAAACATC -/T TATGTTCATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 1 2 4952 CASAVA_Build X 68523408 1D AGTTCTAGGA C/- CCAGCTTGGG 3070 het 3070 hom 43 14 25 5 C 3 2 4953 CASAVA_Build X 68529716 13D AGCCTTTCTG TGGATCAATTCTA/------------- TGGTGGTGGT 3070 het 3070 ref 53 26 25 8 TGGATCAATTCTA 1 0 4954 CASAVA_Build X 68534499 2D AATGTAGAGG CA/-- TTTATTTCAT 3070 het 3070 ref 55 31 23 1 CA 1 0 4955 CASAVA_Build X 68538861 1D GAGTATCCCC T/- ATCCTGATTA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 T 1 0 4956 CASAVA_Build X 68539575 1I CCCCAACATA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 7 8 4957 CASAVA_Build X 68539844 2D ATTCTAGAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 30 2 17 11 A 14 12 4958 CASAVA_Build X 68541348 1I CACCTTGATC -/T CCACAGTTCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 4959 CASAVA_Build X 68551661 1D TCTCCAGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 24 2 13 9 T 15 14 4960 CASAVA_Build X 68576333 1D CTCAGCCTCC T/- GAGTAGCTGG 1477 het 510 hom 6 1 4 1 T 1 0 4961 CASAVA_Build X 68592415 1D CTGTGTATAA T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 6 4962 CASAVA_Build X 68600419 1D TAGGCTGCTC G/- GGGGTCAGGG 1889 het 64 hom 10 1 5 4 G 5 4 4963 CASAVA_Build X 68602627 1D GGTTTCAATG A/- AAAGCTTGAA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 A 4 3 4964 CASAVA_Build X 68603638 3D ATAATTCTAG ACA/--- ACATTTATTG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 ACA 2 1 4965 CASAVA_Build X 68608652 3D AAGGTTGTCT AGA/--- AGGAGTAAAT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 AGA 1 0 4966 CASAVA_Build X 68618649 1D TTGTATTATT A/- TTTTTTTAAT 2355 het 1796 hom 11 4 6 1 A 1 0 4967 CASAVA_Build X 68621650 1I GAGACACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 10 11 4968 CASAVA_Build X 68623960 9D AGTCTTTTGC CAAAAATGG/--------- CAAAAATTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 4 CAAAAATGG 1 0 4969 CASAVA_Build X 68624813 1I TCTCTATCTT -/C CTCCTAAGTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 2 4970 CASAVA_Build X 68645003 1D ACATCAAGTT C/- CTGATGGCCC 3070 het 3070 ref 56 25 18 13 C 2 1 4971 CASAVA_Build X 68650298 1D GCACTTAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 T 10 9 4972 CASAVA_Build X 68674921 1I CCACCCCGCT -/C CCCCGACTCT 2436 het 2436 ref 29 13 9 7 C 4 5 4973 CASAVA_Build X 68678521 1D AATCTAAGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 10 9 4974 CASAVA_Build X 68687084 3D AAGAAAACAT AGG/--- AGAAAACCTT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 AGG 1 0 4975 CASAVA_Build X 68689137 1I AGCAGCCCTA -/C CCAGTTCACA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 C 2 3 4976 CASAVA_Build X 68703183 1D GTCAGTTTCC A/- AAGTTCTGCT 3070 het 3070 ref 42 23 16 5 A 3 2 4977 CASAVA_Build X 68703440 1I GTAGTGGACG -/C CTGTAATCCC 2270 het 984 hom 11 3 6 2 C 1 2 4978 CASAVA_Build X 68715561 1I TCCAATTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1581 hom 29 5 11 13 A 12 13 4979 CASAVA_Build X 68716375 1D TGATTGGAAT C/- CCCTTGCCTA 3070 hom 126 het 52 0 43 9 C 4 3 4980 CASAVA_Build X 68721489 2D CATCAACTAT AC/-- ACACACACAC 1344 het 1344 ref 36 30 3 4 AC 10 9 4981 CASAVA_Build X 68750401 1D GACAGGATAC G/- TATGGAAGCA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 G 1 0 4982 CASAVA_Build X 68770262 1I TCCGTCCTTT -/A TTCCCTTTTA 3070 het 3070 ref 49 29 15 5 A 0 1 4983 CASAVA_Build X 68780105 1D CTTGCCAACA T/- TTTTATCCCA 3070 het 3070 hom 24 10 10 5 T 5 4 4984 CASAVA_Build X 68792103 2D CAGATTACTC AA/-- GTCAAACTAG 3070 het 3070 hom 67 29 32 7 A 2 0 4985 CASAVA_Build X 68798924 4I TTCTCATGAT ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 AGTG 1 2 4986 CASAVA_Build X 68805357 6I TTAGCCAGGA ------/TGATCT TGAACTCTTG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 TGATCT 0 1 4987 CASAVA_Build X 68805776 1D TAGTTGGACC T/- TTTTTTTTTT 2452 het 2452 ref 44 29 6 9 T 12 11 4988 CASAVA_Build X 68810156 3D TACTGTATTC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 12 9 4989 CASAVA_Build X 68811721 1I CCAGCTAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 11 15 11 A 8 9 4990 CASAVA_Build X 68813054 2D TGAGTTTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 1112 het 1112 ref 48 37 4 8 TG 9 8 4991 CASAVA_Build X 68824218 31D AACCCAAGGT CACAAGGATATACATTAATGTTTTCTTCTAA/------------------------------- GAGTTTTATA 3070 het 3070 ref 34 21 14 6 CACAAGGATATACATTAATGTTTTCTTCTAA 1 0 4992 CASAVA_Build X 68826218 3D TTTGTTCTTC TTT/--- ATCAAGATTG 3070 het 3070 hom 21 10 10 2 T 3 0 4993 CASAVA_Build X 68845070 1I GAGCTGTGCT -/A GGAACTGGGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 4994 CASAVA_Build X 68855790 1D AATTGTATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 10 9 4995 CASAVA_Build X 68864813 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 30 0 19 11 A 14 16 4996 CASAVA_Build X 68866954 1I AAAAGAAGGG -/T AAGAGCTAAG 3070 hom 147 het 54 0 49 5 T 0 1 4997 CASAVA_Build X 68868665 4D TTTATTGAAG ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 2815 hom 25 7 14 4 ATTT 4 3 4998 CASAVA_Build X 68870489 1I ATATTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1134 hom 17 3 13 1 T 10 11 4999 CASAVA_Build X 68871940 1I CATATGCTAC -/A AGCATGGATG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 1 2 5000 CASAVA_Build X 68872580 2D TCTGCAAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1949 hom 25 9 8 8 A 12 10 5001 CASAVA_Build X 68874426 1I GGCTGACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 106 het 41 0 36 5 T 9 10 5002 CASAVA_Build X 68900804 8D TTTTTTATTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1159 het 756 hom 25 9 4 13 T 26 18 5003 CASAVA_Build X 68904152 2I AGCAGTATAT --/TG TATAGATATG 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 TG 0 1 5004 CASAVA_Build X 68907317 1I ACTTAATCAC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 8 9 5005 CASAVA_Build X 68907392 1D TTTGCTCATA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 8 7 5006 CASAVA_Build X 68907745 1D CCTGCCTCAG C/- CCCCCCAAGT 1742 het 1742 ref 12 6 4 3 C 7 6 5007 CASAVA_Build X 68911145 1I TTGTTATTTT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 A 7 8 5008 CASAVA_Build X 68916620 1I66M1D TACTTATATC -ATAAAAATGTTTATTAAGCTGTTGTATATGTATATGTATACAGATATGGTTGTGTATAAATGCATTG/AATAAAAATGTTTATTAAGCTGTTGTATATGTATATGTATACAGATATGGTTGTGTATAAATGCATT- GCTCTAAAAG 3070 hom 91 het 37 0 30 26 N/A 0 0 5009 CASAVA_Build X 68927416 1I TCCTCATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 18 7 T 10 11 5010 CASAVA_Build X 68932879 1I ATGTATGCCA -/C CCTGGGCCCC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 2 3 5011 CASAVA_Build X 68936472 2I CCAATATGTC --/AA AGAGATACAT 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 1 3 5012 CASAVA_Build X 68941006 1D TGAGGTTATA C/- TTTAATCATT 3070 het 3070 hom 46 18 23 7 C 1 0 5013 CASAVA_Build X 68950386 1I TGCTGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 A 13 14 5014 CASAVA_Build X 68970076 1I CTCTTTTTTT -/G TTTTTGCTGT 3070 het 2342 hom 26 7 14 5 G 0 1 5015 CASAVA_Build X 68972539 1I ACAGTTAGGT -/C CCTCAGCTGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 2 3 5016 CASAVA_Build X 68972917 2D AGAGGTAGAG TC/-- TAGAGGCAGT 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 TC 1 0 5017 CASAVA_Build X 68973966 1I AGATGATGAC -/T TTTCATTGTA 3070 hom 94 het 37 0 32 5 T 3 4 5018 CASAVA_Build X 68977186 5I ATATTTTTGT -----/TAAGA TAAGGGGAAA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 TAAGA 0 1 5019 CASAVA_Build X 68980320 1I CGGGTGCGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 1 2 5020 CASAVA_Build X 68986666 2I TGCTCGCTTG --/CC ATCTTTATAA 3070 hom 160 het 59 0 53 6 C 0 2 5021 CASAVA_Build X 68996546 1D CTTCCTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 8 5 T 12 11 5022 CASAVA_Build X 68998561 1I TTAAAATAAC -/A AGTACTTATC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 5023 CASAVA_Build X 68999598 2I TTATTTTCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 21 1 12 8 A 14 16 5024 CASAVA_Build X 69010451 1D12M6I AAAACTACAG ACCAATATCCCTG------/-TCAGTATCCCTGATGAAC ATAGATGCAA 652 het 652 ref 52 50 2 8 N/A 0 0 5025 CASAVA_Build X 69028145 1D GCCATAAAAA G/- GAACGAGATC 3070 het 3070 hom 31 11 18 4 G 2 1 5026 CASAVA_Build X 69036101 2D TATTAACAGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 39 0 31 8 TG 9 8 5027 CASAVA_Build X 69049305 1I CTAGAGCTGA -/G GCAGGATGGA 2876 het 2876 ref 26 15 7 4 G 1 2 5028 CASAVA_Build X 69070252 1D AGACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 36 1 31 4 A 12 11 5029 CASAVA_Build X 69076003 1I GCTGTGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 T 9 10 5030 CASAVA_Build X 69077052 1I GTCTTCTCTC -/T TTTTTGTAGT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 5 6 5031 CASAVA_Build X 69087685 1I ATAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 45 hom 16 1 12 3 A 9 10 5032 CASAVA_Build X 69095093 2D TAATAATACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 32 2 21 10 A 17 15 5033 CASAVA_Build X 69096374 1I AAGGAAGGTA -/T CTCTGATAAG 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 0 1 5034 CASAVA_Build X 69103149 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1356 het 957 hom 16 8 3 6 A 17 16 5035 CASAVA_Build X 69117969 1I TTATTTTTTG -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 7 8 5036 CASAVA_Build X 69124195 1I TCCTGTATCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 A 9 10 5037 CASAVA_Build X 69164622 2D GTGAGTTCCC CT/-- GTCTCTCCAC 3070 het 1982 hom 24 9 10 6 CT 1 0 5038 CASAVA_Build X 69168537 3D TAGTACTACC AGA/--- AGAAGTGATG 2853 het 2853 ref 23 10 8 6 AGA 2 1 5039 CASAVA_Build X 69179452 2I CTCCTCCCTC --/TT TTTTTTTTTT 1886 het 1246 hom 18 5 6 7 T 12 14 5040 CASAVA_Build X 69179580 3D CAAAACCCCC TCT/--- TCTTCTTTCC 3070 hom 45 het 19 0 14 5 TCT 3 2 5041 CASAVA_Build X 69184591 1D TTCTCCCGTG C/- CCCCACCCCC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 5 4 5042 CASAVA_Build X 69187372 1D CCTCGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 239 hom 43 1 33 10 A 11 10 5043 CASAVA_Build X 69192162 1D GGAGTCTCTA T/- TTTGTTCATT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 4 3 5044 CASAVA_Build X 69192380 1I TTAAAGGACA -/G GTGGGAGGAT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 1 2 5045 CASAVA_Build X 69192844 1I AAATAAGGGT -/A AAAGGGTGGA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 3 4 5046 CASAVA_Build X 69197091 12D TACAAAAAGT AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 24 12 5047 CASAVA_Build X 69197399 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 21 0 15 6 A 11 10 5048 CASAVA_Build X 69198204 9I GTGGCTCATG ---------/CCTGTAATC CCAGCACTTT 3070 hom 83 het 31 0 26 5 CCTGTAATC 0 1 5049 CASAVA_Build X 69200755 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1120 het 1120 ref 37 21 4 13 A 13 12 5050 CASAVA_Build X 69211288 1D ACCAATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 21 0 10 11 T 15 14 5051 CASAVA_Build X 69211884 1I TGGTTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2863 hom 15 7 8 0 T 10 11 5052 CASAVA_Build X 69216469 1D TATTCAAAAT A/- ATAAATATGG 3070 hom 30 het 12 0 11 2 A 2 1 5053 CASAVA_Build X 69217015 1D TTTCGCAGGC T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 7 6 5054 CASAVA_Build X 69242738 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 7 6 5055 CASAVA_Build X 69245246 1I AATTTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 1790 het 900 hom 9 3 5 1 T 8 9 5056 CASAVA_Build X 69252514 1D AGAAGGCCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 A 10 9 5057 CASAVA_Build X 69269420 1D TTTTTCATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 5 T 10 9 5058 CASAVA_Build X 69282828 1D GATTCTATGA T/- TTTTTTGAAG 3070 hom 86 het 45 0 30 17 T 7 6 5059 CASAVA_Build X 69289044 1D ATTAGACATG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 123 het 45 0 42 5 A 8 7 5060 CASAVA_Build X 69306426 1I GAGGGGATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 42 1 34 7 T 11 12 5061 CASAVA_Build X 69322454 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2019 het 2019 ref 40 29 9 3 T 12 11 5062 CASAVA_Build X 69327002 4I AGTAGAGTCC ----/AACA AACACCAAGG 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 AACA 1 2 5063 CASAVA_Build X 69333208 1I TCTATAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 8 9 5064 CASAVA_Build X 69344694 1I ATTTTAAAGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 8 9 5065 CASAVA_Build X 69361032 2D ATTTACAGAC TG/-- AGAATCACTC 3070 het 3070 ref 25 16 9 0 TG 1 0 5066 CASAVA_Build X 69375734 18D CACTCACTGC CTGAGTGGCCATCCCTTT/------------------ CTGAACCTGT 3070 het 3070 ref 43 24 19 7 CTGAGTGGCCATCCCTTT 1 0 5067 CASAVA_Build X 69383916 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 132 hom 26 2 13 11 A 17 16 5068 CASAVA_Build X 69392111 1D CAAAGAAATG A/- AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 7 6 5069 CASAVA_Build X 69467754 1D TAGGGTTTTT G/- TGAGGGTTAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 7 G 1 0 5070 CASAVA_Build X 69468215 1I TTCAATTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 A 10 11 5071 CASAVA_Build X 69483815 5I CACAGTGTAC -----/CCTGG CCTTGTTCCC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 CCTGG 0 1 5072 CASAVA_Build X 69499820 1D ACTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2723 het 2642 hom 18 9 9 0 T 11 10 5073 CASAVA_Build X 69513100 1I AATAAAATAA -/C AAAGTAACTA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 C 0 1 5074 CASAVA_Build X 69515302 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2361 het 944 hom 13 3 6 4 A 12 11 5075 CASAVA_Build X 69526380 4I9M3I ATCCTGAAAT ----CAGTGTAAG---/CAGGCAGTGTAAGTCC TCCAAAGTTG 3070 het 3070 ref 35 18 17 3 N/A 0 0 5076 CASAVA_Build X 69541103 1I CAACAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 A 11 12 5077 CASAVA_Build X 69549501 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2071 het 252 hom 18 1 9 8 A 13 14 5078 CASAVA_Build X 69573725 9I AACACTGTGA ---------/TTATTTCCT TTATTTCCTT 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 TTATTTCCT 1 2 5079 CASAVA_Build X 69573785 2D TGTCCAGACT CA/-- CAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 49 12 27 11 CA 2 1 5080 CASAVA_Build X 69593327 1D ATGCAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2831 hom 40 12 17 11 T 12 11 5081 CASAVA_Build X 69635259 4D AAGGCTTGAC TCAT/---- GGCACATCCA 3070 het 3070 ref 38 19 10 12 TCAT 1 0 5082 CASAVA_Build X 69668097 4I AAAATGACTT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 44 17 14 13 AAAC 4 5 5083 CASAVA_Build X 69669885 1D CTGGGGATAA G/- GGACAACAAT 472 het 472 ref 23 4 4 16 G 3 2 5084 CASAVA_Build X 69696593 1D TAACACTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 116 het 47 0 38 10 T 10 9 5085 CASAVA_Build X 69717540 4I ATAGACTGCT ----/TAAA TATTGATTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 5 TAAA 0 1 5086 CASAVA_Build X 69725860 1I ATAGACAGTT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 7 8 5087 CASAVA_Build X 69736095 1D ACAAGTATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 10 9 5088 CASAVA_Build X 69740474 3I GAAGGACATG ---/AAC AACAAGTATT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AAC 1 2 5089 CASAVA_Build X 69745316 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1077 het 669 hom 17 5 4 8 A 19 18 5090 CASAVA_Build X 69749151 1I AAAGCTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 A 10 11 5091 CASAVA_Build X 69753920 2I GTGAAGGTTT --/TA TATATATATA 2112 het 2112 ref 17 8 6 3 TA 6 7 5092 CASAVA_Build X 69756109 1D GAGTAAGAAA T/- GAACAAATGA 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 T 1 0 5093 CASAVA_Build X 69756392 1I TGCCAGTATC -/T TTTTTTTTTT 1352 het 1352 ref 33 15 4 14 T 15 16 5094 CASAVA_Build X 69760344 6D ACATTAAGAA ACTTGC/------ TGAAGGTTAC 3070 het 3070 hom 45 18 25 4 ACTTGC 1 0 5095 CASAVA_Build X 69764803 1I AGACTTTGTC -/A AAAAAAAAAA 2197 het 1888 hom 25 9 8 8 A 15 16 5096 CASAVA_Build X 69782125 1I AGAGGCAATG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 8 9 5097 CASAVA_Build X 69792844 1D AACAAAAAAA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 T 7 6 5098 CASAVA_Build X 69794031 1D GTAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 12 11 5099 CASAVA_Build X 69801367 1D TCTTTAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1218 hom 38 4 30 4 T 12 11 5100 CASAVA_Build X 69808456 16D AATTGTTTTG ATATATATATATATAT/---------------- ATATATATAT 3070 het 996 hom 22 5 14 6 AT 15 7 5101 CASAVA_Build X 69810198 1D AGGTCAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 11 10 5102 CASAVA_Build X 69825450 2D TGACAAGAGA CT/-- CTAACAAATG 3070 het 2337 hom 13 5 8 0 CT 2 1 5103 CASAVA_Build X 69835306 1D ATGGGAACCT C/- CCAGCTTGAG 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 C 3 2 5104 CASAVA_Build X 69836684 4D TTACTAGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 45 15 18 12 TTTG 5 4 5105 CASAVA_Build X 69846314 1I TTATATTAAT -/A AAACAATATC 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 A 3 4 5106 CASAVA_Build X 69853748 1I GTGAAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2963 hom 26 9 10 7 A 13 14 5107 CASAVA_Build X 69874259 1D ATTTAAAATA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 C 10 9 5108 CASAVA_Build X 69890045 2D CTCCTGAACA TT/-- TTTCTAAACA 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 T 5 3 5109 CASAVA_Build X 69934602 1I GGCAAGATGA -/G GGGGGGGGGA 2311 het 2311 ref 29 14 10 5 G 9 10 5110 CASAVA_Build X 69935477 1I GAAGAAAACT -/G GGGGGAAAGC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 G 5 6 5111 CASAVA_Build X 69953711 4I TAGATAGATA ----/ATAG ATAAATAATA 2644 het 2644 ref 30 17 9 4 ATAG 0 1 5112 CASAVA_Build X 69954889 3I AAAAAAGAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 33 8 16 9 AAG 5 6 5113 CASAVA_Build X 70013066 1I AGATGTGGCA -/G GGTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 2 3 5114 CASAVA_Build X 70017141 4D CCTTTCTCTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 AAAC 3 2 5115 CASAVA_Build X 70049366 1I GCCATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 11 12 5116 CASAVA_Build X 70049510 1D GACGTAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 12 11 5117 CASAVA_Build X 70066059 1D ACCTTCAACA C/- CCCCCCCCAG 3070 het 3037 hom 27 9 12 7 C 9 8 5118 CASAVA_Build X 70088964 1I CAGCAAGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3025 hom 31 10 17 4 A 9 10 5119 CASAVA_Build X 70093175 1D TACTATTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 813 hom 19 3 14 2 A 12 11 5120 CASAVA_Build X 70104006 3D GAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 AAG 5 4 5121 CASAVA_Build X 70112357 3D ATTTTGACGC AGA/--- AGAAGAAACA 3070 het 3070 hom 41 15 23 4 AGA 3 2 5122 CASAVA_Build X 70114956 1D TAAGAATAAG T/- TTCCCAAACT 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 T 3 2 5123 CASAVA_Build X 70119299 4I ATATTTTGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 72 het 42 0 25 17 TTTG 4 5 5124 CASAVA_Build X 70119322 3I TTGTGTTTGT ---/TTG TTTTGTTTTT 3070 het 2219 hom 45 9 18 18 TTG 0 1 5125 CASAVA_Build X 70131511 9D AATTCAGCAG TGAAGCCAT/--------- TGGGCCCCAG 3070 het 3070 ref 33 18 14 7 TGAAGCCAT 1 0 5126 CASAVA_Build X 70137035 1I GATTGCAAAA -/T TTTTTTTTAC 2568 het 2568 ref 20 9 8 3 T 8 9 5127 CASAVA_Build X 70138811 4D AGAAGAAAGG AAGA/---- AAGAAAGAAA 2606 het 2606 ref 25 11 7 7 AAGA 5 4 5128 CASAVA_Build X 70145074 1I ATTACATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2006 hom 32 9 13 10 T 13 14 5129 CASAVA_Build X 70147137 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2677 het 208 hom 10 2 8 0 A 10 11 5130 CASAVA_Build X 70149646 2I ACAGAGAAAC --/AA AAGAGTAGTT 2311 het 2311 ref 21 14 5 2 A 2 4 5131 CASAVA_Build X 70159696 1I GGGATGGGGC -/A AAAAAAAAAA 1138 het 1138 ref 47 31 5 11 A 11 12 5132 CASAVA_Build X 70178977 1I CAGAAAATTA -/C CATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 C 1 2 5133 CASAVA_Build X 70187834 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 8 9 5134 CASAVA_Build X 70202555 1I CTCTGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 2410 het 1114 hom 15 5 7 3 A 13 14 5135 CASAVA_Build X 70206541 3D AAAGGAAAAG AAA/--- AGAGAGAGAG 1073 het 646 hom 28 4 4 22 A 4 1 5136 CASAVA_Build X 70210905 1D ATAAAGAGGA G/- GGGGGGGAAA 3070 hom 93 het 36 0 29 8 G 8 7 5137 CASAVA_Build X 70220789 6D ACTCCGTCTC AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 1659 het 737 hom 6 2 4 2 AAAAAG 3 2 5138 CASAVA_Build X 70222739 4D TCTATCCATC CACT/---- CACTCCTTTA 3070 hom 87 het 31 0 28 6 CACT 2 1 5139 CASAVA_Build X 70224405 14D GAGGCTGAGG CAGGTGGATCGCTT/-------------- CAGGTTGGGA 1517 hom 23 het 11 0 7 4 CAGGTGGATCGCTT 1 0 5140 CASAVA_Build X 70253006 2D AGACCTTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 1208 het 1208 ref 17 5 3 9 A 16 14 5141 CASAVA_Build X 70257191 1I AGTAGAAGGA -/T TTTTTTTTTT 1918 het 1918 ref 28 12 7 9 T 13 14 5142 CASAVA_Build X 70257848 14I CTTTTCATTT --------------/ACTTTATCTGCTTC ACTTTATCTG 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 ACTTTATCTGCTTC 1 2 5143 CASAVA_Build X 70271984 2D AGCAAATCAC TT/-- AACTTTCCTT 3070 het 3070 ref 51 30 20 1 T 2 0 5144 CASAVA_Build X 70316175 1I GAGTCTTGTT -/C CCCCCTGAGC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 5 6 5145 CASAVA_Build X 70317030 1D CCATCAGCTA G/- ATTTGAATGC 3070 het 3070 ref 52 27 21 6 G 1 0 5146 CASAVA_Build X 70330561 1I CATCCTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 11 12 5147 CASAVA_Build X 70342689 1I AAAATAAAAA -/T TAAAAAATTA 2399 het 1176 hom 12 3 6 3 T 1 2 5148 CASAVA_Build X 70354420 2I AAGGGCAGAG --/AA AAGAGAACAG 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 2 4 5149 CASAVA_Build X 70413796 1D TTCTAATAGG T/- TTTTTTTTTT 1106 het 1106 ref 35 23 3 10 T 13 12 5150 CASAVA_Build X 70646545 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 2416 het 987 hom 9 2 6 1 CT 2 1 5151 CASAVA_Build X 70712956 1D ATGTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 693 het 693 ref 32 27 3 2 A 13 12 5152 CASAVA_Build X 70722446 2I TTTGGAATCA --/CT CTTTGAGATT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 CT 1 2 5153 CASAVA_Build X 70794896 1D ACAAAACAAT A/- AAAAAAAAAA 2217 het 2217 ref 31 17 7 7 A 12 11 5154 CASAVA_Build X 70795828 1D CCAGTTTCCC T/- CACGCCCTCT 3070 hom 103 het 39 0 33 6 T 1 0 5155 CASAVA_Build X 70796139 2I AGAGAGAGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 4 hom 34 1 27 6 TG 8 9 5156 CASAVA_Build X 70806483 1I TTTGTGTGGT -/G GGGGGCGATT 3070 hom 43 het 18 0 15 3 G 5 6 5157 CASAVA_Build X 70948974 1I GTTTCTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 11 12 5158 CASAVA_Build X 70987280 1I ATCTGCATCA -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 7 8 5159 CASAVA_Build X 70989671 1D AAAAAAAAAC A/- AAAGGAAATT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 4 3 5160 CASAVA_Build X 70999892 1D GAGATTTGGG T/- TGGGGACACA 3070 hom 74 het 31 0 25 6 T 2 1 5161 CASAVA_Build X 71020092 13I TGACGAGTTG -------------/ACGGGTTCAGCAA ACCAACATGG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 ACGGGTTCAGCAA 0 1 5162 CASAVA_Build X 71020278 1D ATAGGTTTTT G/- GGGGAACAGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 5 4 5163 CASAVA_Build X 71021374 2D CATATATGCA CG/-- CACATATGTA 3070 hom 151 het 55 0 51 6 CG 1 0 5164 CASAVA_Build X 71021595 10D TATATACATT TATATACATG/---------- TAAATACAGG 3070 hom 57 het 20 0 20 5 TATATACATG 1 0 5165 CASAVA_Build X 71028434 1D TGCTGTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 46 1 34 12 A 11 10 5166 CASAVA_Build X 71029974 1I AAACTAGCAG -/T TTTTTTTATC 3070 het 330 hom 43 1 33 9 T 7 8 5167 CASAVA_Build X 71030989 1I TCATTCCAAA -/T ATCAGGGAAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 0 1 5168 CASAVA_Build X 71032522 2D AGAAAGAAAG AA/-- AGAGAAAAAG 3070 hom 81 het 34 0 27 8 A 3 1 5169 CASAVA_Build X 71044480 1D TCTACTCCAG A/- ATCCACAACG 3070 hom 111 het 43 0 34 10 A 2 1 5170 CASAVA_Build X 71050405 1I AGAAGCAGCA -/G GGGGAGGACA 3070 hom 89 het 35 0 27 8 G 4 5 5171 CASAVA_Build X 71099203 2D ATCTCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2480 het 497 hom 26 7 8 11 T 20 18 5172 CASAVA_Build X 71132007 4D CCCTGCATAC TCTA/---- TCTGACCCCC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TCTA 1 0 5173 CASAVA_Build X 71149847 4D CATTTACACT TAAG/---- TATTTTGTTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 6 TAAG 1 0 5174 CASAVA_Build X 71157636 12D GCGTGCGCAT ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 51 het 37 1 28 12 AC 14 8 5175 CASAVA_Build X 71168665 1D CCACTGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 18 17 5176 CASAVA_Build X 71171931 1I TGGAGGGTTC -/T TTTGTATATG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 3 4 5177 CASAVA_Build X 71205251 10D GTGTGTGTGT GAGAGAGAGA/---------- GAGAGAGAGA 3070 hom 82 het 32 0 25 8 GA 12 7 5178 CASAVA_Build X 71253363 6I AGGACAGCTA ------/GGGGGT GGGGGTGCTC 3070 hom 128 het 48 0 39 9 GGGGGT 1 2 5179 CASAVA_Build X 71261646 9D GCCAGGTCAG TCTGTGATT/--------- CTGACCGATC 3070 hom 72 het 23 0 25 1 TCTGTGATT 1 0 5180 CASAVA_Build X 71270129 1D CTCTCCTTCA C/- CTTAGCCCTC 3070 hom 102 het 43 0 34 9 C 2 1 5181 CASAVA_Build X 71289752 1D GTCTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 33 1 30 2 A 11 10 5182 CASAVA_Build X 71290881 1D GACATCACAT G/- GCAAGAGAGC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 2 1 5183 CASAVA_Build X 71292619 1D GACTCTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 27 1 19 8 A 13 12 5184 CASAVA_Build X 71299709 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 992 hom 24 3 15 6 A 13 12 5185 CASAVA_Build X 71300303 1I CTGATTAGCT -/G GCTTTTTGCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 1 2 5186 CASAVA_Build X 71301713 1I CCACCACGCC -/T CACTAATTTT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 0 1 5187 CASAVA_Build X 71307164 1D TCTTTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 25 1 19 5 A 13 12 5188 CASAVA_Build X 71312592 2D CTATGCAGCC CA/-- CAGACACATG 3070 hom 27 het 14 0 8 6 CA 2 1 5189 CASAVA_Build X 71321047 2I GACCTAGAAC --/TG TGAGATTCCC 3070 hom 159 het 59 0 48 11 TG 1 2 5190 CASAVA_Build X 71364571 1I CTCTTCCTTA -/T TTTGAAGGTG 3028 het 1713 hom 14 6 7 1 T 3 4 5191 CASAVA_Build X 71387938 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 22 1 15 6 A 13 12 5192 CASAVA_Build X 71412114 3I TTTAAAACTT ---/CTA CTTACCCATG 3070 hom 151 het 53 0 51 2 CTA 0 1 5193 CASAVA_Build X 71431034 1D ATTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 664 hom 14 2 9 3 A 17 16 5194 CASAVA_Build X 71433782 1I CTAATTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 38 0 27 11 T 11 12 5195 CASAVA_Build X 71446832 2D TACAGAGTGG TC/-- TCCAGAAACA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TC 2 1 5196 CASAVA_Build X 71455767 1I TATATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 10 11 5197 CASAVA_Build X 71456968 3I GGTGGGAAAA ---/GAT GAAGTTGTAG 3070 hom 86 het 37 0 29 8 GAT 0 1 5198 CASAVA_Build X 71463910 2D CTCTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 33 0 27 6 T 10 8 5199 CASAVA_Build X 71469718 1D AACCCCCTAA C/- CTCAAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 1 5200 CASAVA_Build X 71477139 1I TCTCTTGCAC -/A AAAAAACCTA 3070 hom 135 het 53 0 43 10 A 6 7 5201 CASAVA_Build X 71535421 1I GTACTTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 7 14 8 T 10 11 5202 CASAVA_Build X 71569131 1I CCTTTAGTTA -/T TTTTTTTTTT 1469 het 1469 ref 30 16 5 9 T 13 14 5203 CASAVA_Build X 71608629 5D CAACTTTATT TTTTA/----- TTTTATTTTA 1186 het 324 hom 8 2 4 2 TTTTA 3 2 5204 CASAVA_Build X 71619178 1D TTTCTATTTT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 G 10 9 5205 CASAVA_Build X 71638096 1I GCAATGGGGG -/A AAAGACTCCC 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 3 4 5206 CASAVA_Build X 71729917 1I GTCTTTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 719 hom 32 2 23 7 T 13 14 5207 CASAVA_Build X 71768183 1D CTGTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1248 het 1248 ref 32 22 5 5 T 12 11 5208 CASAVA_Build X 71786567 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 1083 het 1083 ref 21 10 3 8 A 15 16 5209 CASAVA_Build X 71839813 1I GAAGTCAGAA -/G GGAAATATTG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 G 2 3 5210 CASAVA_Build X 71848378 1I ACTTGAATAA -/T TTTTTTTTTT 1152 het 1152 ref 31 21 4 6 T 13 14 5211 CASAVA_Build X 72041744 2D ATAGCACTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1637 hom 23 5 16 2 A 14 12 5212 CASAVA_Build X 72044978 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAA 985 het 985 ref 32 23 3 6 A 10 11 5213 CASAVA_Build X 72087504 1D GCAAATAAGA G/- GGGGGGGGTC 2930 het 18 hom 33 0 8 26 G 9 8 5214 CASAVA_Build X 72116361 1D GATGCCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2519 hom 29 7 11 13 A 11 10 5215 CASAVA_Build X 72125320 1I TATGAGATAT -/A AAATCTCACC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 3 4 5216 CASAVA_Build X 72142929 25I TCTTTCCAAA -------------------------/TTCTTAGTCTCCTATAATTTTATTT TTACTTAGTG 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 TTCTTAGTCTCCTATAATTTTATTT 0 1 5217 CASAVA_Build X 72144795 2I AAATTCCCAC --/TT ATAAAGTTGT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 T 0 2 5218 CASAVA_Build X 72175216 1D TTTATTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 11 10 5219 CASAVA_Build X 72187863 3I TATGTTAATA ---/GAT GATTGGAAGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 GAT 1 2 5220 CASAVA_Build X 72195055 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 22 13 8 2 A 9 8 5221 CASAVA_Build X 72195741 2I GTAGTGGGGG --/GA GGGGGGAAGA 3070 het 1525 hom 33 10 17 6 GA 0 1 5222 CASAVA_Build X 72196076 1I AATAAAAAAA -/T CACAGTGAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 0 1 5223 CASAVA_Build X 72211346 5I GTTTTTTTTT -----/CTGAG CTGTCTATTC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 CTGAG 0 1 5224 CASAVA_Build X 72223537 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 A 8 7 5225 CASAVA_Build X 72236863 1D ATTTTACCCC T/- ATCTCTGTCT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 1 0 5226 CASAVA_Build X 72248726 1I14M2D AGAGTATAAT -AAAAAAAAATTATTAA/AAAAAAAAAATTATT-- AAAAAAAAAG 2619 hom 17 het 5 0 6 1 N/A 0 0 5227 CASAVA_Build X 72268509 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2708 het 1586 hom 25 8 12 5 A 15 16 5228 CASAVA_Build X 72271473 3I CAGGTACAAG ---/CTT CCAAGAGTCC 3070 hom 132 het 50 0 44 6 CTT 0 1 5229 CASAVA_Build X 72288560 1D TGGTCTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 11 10 5230 CASAVA_Build X 72296538 1D TGCTATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 40 1 34 6 T 11 10 5231 CASAVA_Build X 72344384 1D TTTTGGGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 T 11 10 5232 CASAVA_Build X 72364527 1D TAAAAGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 19 1 12 7 A 13 12 5233 CASAVA_Build X 72370038 1D AGAACCAATG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 9 8 5234 CASAVA_Build X 72371514 1D CGCCACCAAC A/- GACACATGAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 1 0 5235 CASAVA_Build X 72442006 1D CACAGTATTG T/- GGGGGGAGTG 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 1 0 5236 CASAVA_Build X 72470856 1D GAAGTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 603 hom 35 2 28 6 T 13 12 5237 CASAVA_Build X 72488028 1I ATGATTTTAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 9 5238 CASAVA_Build X 72495339 1D CAGTTCCCAG A/- AAAAAATTGA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 A 7 6 5239 CASAVA_Build X 72496977 1D CTATTTTTTT G/- TTTTGTAAGC 3070 hom 90 het 37 0 29 9 G 1 0 5240 CASAVA_Build X 72499921 1I CCTTCTATAC -/G TGATTTTGCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 0 1 5241 CASAVA_Build X 72501575 1D CTTTTTGTGT C/- CCCCTTGCAT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 C 5 4 5242 CASAVA_Build X 72564168 1D CTGAAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 2756 het 2756 ref 38 18 8 12 T 15 14 5243 CASAVA_Build X 72571686 1D ATTTGGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 12 11 5244 CASAVA_Build X 72572265 1I GGATGATTCC -/A AAAAAAAAAA 2662 het 318 hom 19 2 10 7 A 15 16 5245 CASAVA_Build X 72597335 2D TTTCTTTCTT TC/-- TCTCTTTCCC 3070 hom 81 het 34 0 28 9 TC 3 2 5246 CASAVA_Build X 72622793 1I GACTACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 11 12 5247 CASAVA_Build X 72624359 7D AATTGAAGAA GATTGAT/------- GATTGATTCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GATTGAT 2 1 5248 CASAVA_Build X 72680878 1I ATCAACAAAA -/G TAATCCATCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 5249 CASAVA_Build X 72696875 1D ACCAAGTGTT G/- GGGATGAATG 3070 het 3070 ref 46 29 13 5 G 4 3 5250 CASAVA_Build X 72747296 1I ACACTTTTTT -/A AATTACTGCT 3070 hom 116 het 42 0 38 4 A 2 3 5251 CASAVA_Build X 72792594 1I TCTCATTGTA -/G TTTTGATTTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 0 1 5252 CASAVA_Build X 72895536 1D AGAATTCAGC T/- GTGAATCCAT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 T 1 0 5253 CASAVA_Build X 72908057 1D GCTCTTGCAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 9 8 5254 CASAVA_Build X 72920203 1D GGCAAGAGAG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 6 5255 CASAVA_Build X 73004598 1D TTTTATAGCC A/- AAAAAAAAAA 1253 het 1253 ref 28 18 4 7 A 15 14 5256 CASAVA_Build X 73045869 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 943 het 943 ref 19 11 3 5 T 15 14 5257 CASAVA_Build X 73176661 8D TGTTTTTTTG TTTTTTTT/-------- TTTTTTTATT 2826 het 1512 hom 20 5 11 4 T 15 7 5258 CASAVA_Build X 73251654 2D GTGTGTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2573 hom 21 7 11 3 AT 9 8 5259 CASAVA_Build X 73287335 1D TGACACAAAC A/- AAAAAAAAAA 1450 het 1450 ref 48 32 6 10 A 12 11 5260 CASAVA_Build X 73332911 1I ATAAACCTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 T 8 9 5261 CASAVA_Build X 73354408 1D GGGGATAGCT G/- GAGTAAAGTT 3070 hom 108 het 38 0 37 3 G 2 1 5262 CASAVA_Build X 73360539 1I TATGAATCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1257 hom 33 3 23 7 A 11 12 5263 CASAVA_Build X 73379144 1D TTGGCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 31 2 10 20 A 15 14 5264 CASAVA_Build X 73393639 1D GGGTTATCAG A/- AATTACTTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 3 2 5265 CASAVA_Build X 73395286 1D TGGCTGGGCT C/- GGCTTTAAGT 3070 hom 96 het 34 0 30 5 C 1 0 5266 CASAVA_Build X 73400992 16I CGGATCACTT ----------------/GAGATCAGGAGTTCAA GACCAGCCTG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 GAGATCAGGAGTTCAA 0 1 5267 CASAVA_Build X 73404523 2I TATCTAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 40 0 28 12 A 13 15 5268 CASAVA_Build X 73406500 3D ATAACCTGTC ATT/--- ATGTGAGCTC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 ATT 1 0 5269 CASAVA_Build X 73408702 1I GCAAAGTACA -/T TAATAGTGGT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 1 2 5270 CASAVA_Build X 73409693 1D TGAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 39 1 34 4 A 12 11 5271 CASAVA_Build X 73413841 1D ACTGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 2624 het 272 hom 32 2 12 19 A 17 16 5272 CASAVA_Build X 73417826 2D GGCAACATAG TT/-- TAAGACCCCC 3070 hom 60 het 24 0 21 5 T 3 1 5273 CASAVA_Build X 73426019 1D TGGAGTCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 783 hom 21 2 15 4 A 13 12 5274 CASAVA_Build X 73438865 3I GAAAAATGAT ---/AAG AAGAAAATAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAG 1 2 5275 CASAVA_Build X 73447466 2I AGAAAAAAAA --/AG AAAAAAGGCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 0 1 5276 CASAVA_Build X 73483174 2D TTAAAATAAC TA/-- TCAACAGTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 TA 1 0 5277 CASAVA_Build X 73497962 1D TACAGCTCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 114 het 48 0 38 10 T 9 8 5278 CASAVA_Build X 73507955 1D TAACTTGATT G/- GCCCAAGGAG 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 G 2 1 5279 CASAVA_Build X 73533462 1D AATTATCTGT G/- GGAAGCTCTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 3 2 5280 CASAVA_Build X 73577362 2D ATAAATGAGG GT/-- GTGTGTGTGT 1499 het 1499 ref 49 29 7 16 GT 10 9 5281 CASAVA_Build X 73584244 1D CTATGTATTT A/- AAAAAAAAAA 1332 het 1332 ref 26 17 3 6 A 13 12 5282 CASAVA_Build X 73634973 1D CCCCCCTCAA C/- CCAGAGGCAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 3 2 5283 CASAVA_Build X 73636687 3I TGTCAAAACT ---/TAA GTCTTGGGAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TAA 0 1 5284 CASAVA_Build X 73659587 2I CCACCACATG --/AC GATCTAAACC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AC 0 1 5285 CASAVA_Build X 73719893 3I TTTTGCTCTT ---/GAG GAGGGGCAGA 3070 het 3070 ref 68 47 16 8 GAG 1 2 5286 CASAVA_Build X 73801429 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 1347 het 1347 ref 48 32 3 13 T 11 12 5287 CASAVA_Build X 73831514 1I GTCTTCATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 10 11 5288 CASAVA_Build X 73839496 4D CCTCAGCTTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 31 0 24 8 TG 11 9 5289 CASAVA_Build X 73868687 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 9 8 5290 CASAVA_Build X 73932864 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 787 hom 12 het 6 0 5 1 AC 7 8 5291 CASAVA_Build X 73940324 1D GTGCTGAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 40 het 17 0 13 4 A 10 9 5292 CASAVA_Build X 73987630 1I TCACTGAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 9 10 5293 CASAVA_Build X 74027877 1D TTCAGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 2357 het 2357 ref 32 18 6 8 T 15 14 5294 CASAVA_Build X 74187216 6I TGAAGTGGTT ------/AAAAGA AAAAGAAATG 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 AAAAGA 1 2 5295 CASAVA_Build X 74193889 1D TGTATCTTAC T/- TTTTTTTTTC 1893 het 1893 ref 37 24 4 9 T 10 9 5296 CASAVA_Build X 74194324 1D TACAAATATC T/- TTTTTTTTTT 1402 het 1402 ref 33 19 4 10 T 12 11 5297 CASAVA_Build X 74237645 1I AGTTTACACC -/A AAAGTGTCAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 4 5298 CASAVA_Build X 74247614 1D GGCCCAGGAG T/- TCGAGAGCAG 3070 hom 129 het 48 0 42 6 T 2 1 5299 CASAVA_Build X 74249311 1I AATTAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 10 11 5300 CASAVA_Build X 74272556 1D CAGGCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 41 0 30 11 A 11 10 5301 CASAVA_Build X 74281177 2D GCATAGCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 13 11 5302 CASAVA_Build X 74283493 3D AACAAAGCTC TAA/--- TAATATCCAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TAA 2 1 5303 CASAVA_Build X 74291421 5I ACAGGACTTA -----/TATTT TATTTTGTTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TATTT 1 2 5304 CASAVA_Build X 74308212 2D AAGAAGGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 29 1 25 3 T 13 11 5305 CASAVA_Build X 74328035 14I CAAACTCTGT --------------/GCTGGGAGAACCAC TACTCTCTTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 GCTGGGAGAACCAC 0 1 5306 CASAVA_Build X 74328902 1I ATGATTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 42 2 33 7 T 10 11 5307 CASAVA_Build X 74342738 1D GGGATAATAT G/- GGGTGAGGAG 3070 hom 97 het 36 0 30 7 G 4 3 5308 CASAVA_Build X 74351875 1I AAGAAACTAG -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 6 7 5309 CASAVA_Build X 74367613 1I ATCTATAAAA -/C CCCCAAAAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 4 5 5310 CASAVA_Build X 74377667 2D TTCTGCACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 12 10 5311 CASAVA_Build X 74379180 1D CAAGTTACTT A/- AAAATCAATA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 5 4 5312 CASAVA_Build X 74405272 1D TCAACAGCCC T/- TCATGCTAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 1 5313 CASAVA_Build X 74418796 1D TTATCTTATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 11 10 5314 CASAVA_Build X 74426004 1D TCAGAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 18 7 A 12 11 5315 CASAVA_Build X 74435072 4D TTCAGCCAAC TTAA/---- TTGTTTCACG 3070 hom 96 het 37 0 33 9 TTAA 1 0 5316 CASAVA_Build X 74463419 1D GGTTGTTGAA T/- TTATAATGCA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 3 2 5317 CASAVA_Build X 74470489 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 22 0 17 5 T 11 12 5318 CASAVA_Build X 74485808 3D TCCATAAATG TCT/--- TCTTTTGAGA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TCT 2 1 5319 CASAVA_Build X 74489224 1I ATGCTGAAAG -/T GATGTGTTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 0 1 5320 CASAVA_Build X 74493865 1D ACAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 A 11 10 5321 CASAVA_Build X 74503934 1I AAGTAAGTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 7 8 5322 CASAVA_Build X 74504972 1D ACAATTTAGG A/- AAAAAAACCA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 A 8 7 5323 CASAVA_Build X 74516463 63D GAGGCCAGCC AGTCAGTGTGAGTTATCCTTGCCACAGAAGGCTGCAAGCTCTCATGCCACTGAGTTAAACAGG/--------------------------------------------------------------- CAGATTCCAG 3070 hom 33 het 12 0 12 4 AGTCAGTGTGAGTTATCCTTGCCACAGAAGGCTGCAAGCTCTCATGCCACTGAGTTAAACAGG 1 0 5324 CASAVA_Build X 74534103 1I AATTAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 9 10 5325 CASAVA_Build X 74537717 1D GAATCTTGTG T/- TTTTTTACAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 7 6 5326 CASAVA_Build X 74544774 1I AATAAATACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 9 10 5327 CASAVA_Build X 74547776 1I CTATTGTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 26 1 18 7 T 11 12 5328 CASAVA_Build X 74561809 2I AAGTTAAAAC --/AT ATAGGTAGAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AT 1 2 5329 CASAVA_Build X 74563852 1I TACTGTGGAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 8 9 5330 CASAVA_Build X 74569844 1D TTAATTTTAC T/- TTTTTTATTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 6 5331 CASAVA_Build X 74575017 1D TTAAAGTCTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 100 het 40 0 33 8 T 9 8 5332 CASAVA_Build X 74576842 1I TTTCTTTTCC -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 25 0 18 7 A 0 1 5333 CASAVA_Build X 74604602 3D ACTGGCATAA TTT/--- TTTTTTTTTT 1896 het 232 hom 32 4 6 22 T 21 18 5334 CASAVA_Build X 74605614 1D TACAAAAGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 10 9 5335 CASAVA_Build X 74611887 1I CCTCTGTGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 8 9 5336 CASAVA_Build X 74613810 3D TCTTTTAAAT TTA/--- TTGAGTCTTG 3070 hom 147 het 57 0 49 9 TTA 1 0 5337 CASAVA_Build X 74623325 1I CAGCCATAAT -/C CCCCTGGGAA 3070 hom 89 het 35 0 25 10 C 4 5 5338 CASAVA_Build X 74654687 1I GCAACAAAAG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 6 7 5339 CASAVA_Build X 74691711 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 8 9 5340 CASAVA_Build X 74704590 1D GCCAAGGCTT G/- GGGACAGGTG 3070 hom 131 het 46 0 41 5 G 4 3 5341 CASAVA_Build X 74704792 1I TTTCCCCTCT -/G GGAGACCTTA 3070 hom 77 het 32 0 25 7 G 2 3 5342 CASAVA_Build X 74764359 2I TTCCTGAGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 23 1 16 6 T 14 16 5343 CASAVA_Build X 74800987 1D AATTTAAGTG T/- TTTTTTTTTT 1993 het 1993 ref 40 22 7 11 T 15 14 5344 CASAVA_Build X 74812072 1I CACAATGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 25 1 18 6 T 15 16 5345 CASAVA_Build X 74905458 1D TCATGCATCA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 8 7 5346 CASAVA_Build X 74966803 1I ATAGTAGAAT -/G ATTTATAATC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 0 1 5347 CASAVA_Build X 74979660 1D GTTGGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1257 hom 41 3 22 16 T 15 14 5348 CASAVA_Build X 74994169 1D TGAACCTAAT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 62 het 29 0 22 8 G 9 8 5349 CASAVA_Build X 75037915 1I TGTCCTAGGA -/C CCCTCGGATA 3070 hom 46 het 19 0 15 4 C 3 4 5350 CASAVA_Build X 75053666 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 9 8 5351 CASAVA_Build X 75058134 1D CTGGAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 918 hom 36 2 24 10 T 13 12 5352 CASAVA_Build X 75066462 1I TGTCTGTTTT -/G GGGGGTGGGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 5 6 5353 CASAVA_Build X 75077547 1I TCTTCTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 599 hom 29 2 23 4 T 10 11 5354 CASAVA_Build X 75079951 2D GATGAAATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 12 10 5355 CASAVA_Build X 75084692 1I TGTTTTTGTA -/G TGGCTGGTAA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 G 0 1 5356 CASAVA_Build X 75085790 1I GGCAGTCAGA -/C CCCTTTTCCA 3070 hom 114 het 40 0 36 4 C 3 4 5357 CASAVA_Build X 75092904 1D TCTGTGCAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 9 8 5358 CASAVA_Build X 75093004 1D CAAATTTCTG A/- ATTTTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 2 1 5359 CASAVA_Build X 75094663 1D AATTCTTGGA G/- CAAAAGTTCA 3070 hom 135 het 46 0 45 1 G 1 0 5360 CASAVA_Build X 75105426 1I CCTGTATTGC -/A AAAAAAGACA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 6 7 5361 CASAVA_Build X 75109093 1I AAATAAGGTG -/C AAACAAGTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 0 1 5362 CASAVA_Build X 75109907 1I TGTGGGGGGA -/G GGGGGAGGGA 3070 hom 54 het 21 0 17 4 G 5 6 5363 CASAVA_Build X 75110256 1D TACTATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 31 2 23 6 A 13 12 5364 CASAVA_Build X 75115156 1D TTTAAATGTC T/- TTTTTGTTGT 3070 hom 123 het 46 0 42 6 T 6 5 5365 CASAVA_Build X 75134058 1I TCATCCCAGA -/G GGGAACCTGC 3070 hom 101 het 37 0 32 5 G 3 4 5366 CASAVA_Build X 75162720 1I CTAGGGCCGA -/G GGCCCCAACC 3070 hom 84 het 34 0 25 9 G 2 3 5367 CASAVA_Build X 75164727 1I AAGATACTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 176 hom 27 2 20 5 A 9 10 5368 CASAVA_Build X 75170157 1I CCATGTTTTC -/T TTATCTAATC 3070 hom 44 het 18 0 15 3 T 2 3 5369 CASAVA_Build X 75213580 1I AAACATCCCC -/A ATCTTACTAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 2 5370 CASAVA_Build X 75233355 1I TTCTAAATGC -/A AAAAAAAAAA 1078 het 1078 ref 48 33 3 12 A 11 12 5371 CASAVA_Build X 75302387 1D CATGCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 2309 het 759 hom 34 11 8 15 T 17 16 5372 CASAVA_Build X 75344356 1I TTAGCAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 12 13 T 14 15 5373 CASAVA_Build X 75356367 5D CTGCTCTGTG GTTCT/----- GTATCATTTA 3070 hom 111 het 43 0 38 7 GTTCT 1 0 5374 CASAVA_Build X 75357403 1D ACCTCCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 921 hom 42 5 21 16 T 17 16 5375 CASAVA_Build X 75369184 1I TCAATTCAGC -/A AAAAAAACTA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 7 8 5376 CASAVA_Build X 75382017 1D AGATTCAAAT A/- AAATCAGAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 4 3 5377 CASAVA_Build X 75383362 1I AAAATATAAC -/T TTTTCATTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 4 5 5378 CASAVA_Build X 75390938 1D TTGAGGGCCT C/- CTAGTATAGG 3070 hom 101 het 40 0 30 11 C 2 1 5379 CASAVA_Build X 75399442 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 69 het 26 0 22 4 T 7 6 5380 CASAVA_Build X 75413330 1I CTTTAAAAAA -/G TCTTTGATTT 3070 hom 80 het 29 0 27 2 G 0 1 5381 CASAVA_Build X 75414496 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 166 het 166 ref 9 6 1 2 T 11 12 5382 CASAVA_Build X 75422311 1D AAAACTGCTC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 8 7 5383 CASAVA_Build X 75438457 1D AAGGATTTTA T/- TTTCTCCTTC 3070 hom 47 het 21 0 16 5 T 4 3 5384 CASAVA_Build X 75444759 1D TGCTTGGGGC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 6 5385 CASAVA_Build X 75446940 1I CATGATCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 11 12 5386 CASAVA_Build X 75453532 1I TAATGGAATA -/C CCTTTTTTTC 3070 hom 65 het 23 0 22 1 C 2 3 5387 CASAVA_Build X 75454950 1D TGTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 628 hom 40 2 30 9 T 13 12 5388 CASAVA_Build X 75466764 1D CAACCACTAT G/- GAAGACAGTT 3070 hom 108 het 41 0 36 6 G 2 1 5389 CASAVA_Build X 75476884 9I CAAAGCTGCA ---------/GGCATCACG ATACCTGACT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 GGCATCACG 0 1 5390 CASAVA_Build X 75481990 1I ATTTCTCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 8 9 5391 CASAVA_Build X 75492874 1D CCAGTTTTCC A/- AAAAAAATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 8 7 5392 CASAVA_Build X 75497651 4I GCTCTCTGTT ----/TGTC TGTCTGTTAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TGTC 1 2 5393 CASAVA_Build X 75498826 1D TTTTTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 31 2 26 3 T 13 12 5394 CASAVA_Build X 75500647 1D TTTAAAGTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 9 8 5395 CASAVA_Build X 75502416 1D ATAGGGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 29 5 15 9 T 17 16 5396 CASAVA_Build X 75517551 1I TGAAGATGAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 89 het 39 0 30 9 A 8 9 5397 CASAVA_Build X 75518422 1D AGCAAAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 10 9 5398 CASAVA_Build X 75520179 1I GAGACACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 26 2 22 2 A 12 13 5399 CASAVA_Build X 75655650 1I ACAAACATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 607 hom 30 3 23 4 A 11 12 5400 CASAVA_Build X 75705751 1I CTGTTAGAAG -/A AAAACTAACA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 4 5 5401 CASAVA_Build X 75724804 1D GTGGATAAGC T/- TTTTGATGTA 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 T 5 4 5402 CASAVA_Build X 75752393 1I TCTGAACAGG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 8 9 5403 CASAVA_Build X 75806002 2I TTATCACCAG --/GC CCCACCTCCA 3070 hom 150 het 55 0 49 6 GC 0 1 5404 CASAVA_Build X 75822829 1I TGGTCTGTTC -/A AAATTTCCAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 3 4 5405 CASAVA_Build X 75878637 1I TGGCTGAAGG -/C CAATCAATAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 1 2 5406 CASAVA_Build X 75926515 1I CATATTACCC -/A AAGCAATGTA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 2 3 5407 CASAVA_Build X 76013716 1D ATGCCCCCAA C/- GTAAAAGGCA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 C 1 0 5408 CASAVA_Build X 76015541 1D GTACACCCAA G/- GGCATTGGGC 3070 hom 96 het 40 0 32 8 G 3 2 5409 CASAVA_Build X 76028995 1I GGTTGGGGGA -/G GCATTGCATC 3070 het 329 hom 17 1 15 1 G 1 2 5410 CASAVA_Build X 76033587 1I TCTGCAGGCA -/G GGCATAGCCA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 G 2 3 5411 CASAVA_Build X 76067182 1I GGTCGGGGGA -/G GGGGGAGGGA 1286 hom 7 het 3 0 3 0 G 5 6 5412 CASAVA_Build X 76068756 1D GATTAAAAGA T/- TAAACTGAAT 3070 hom 111 het 41 0 37 5 T 2 1 5413 CASAVA_Build X 76071818 1I CTGGTGGGTG -/C CCCTCTGGGA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 3 4 5414 CASAVA_Build X 76089430 2D ACTATCCTAA AC/-- ATATATATGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AC 1 0 5415 CASAVA_Build X 76108278 1I GAGATGTAAT -/A TTTTTTGCCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 0 1 5416 CASAVA_Build X 76138300 1I GGCGGGGGTC -/A GGGGAAGGGT 3070 hom 85 het 36 0 26 10 A 0 1 5417 CASAVA_Build X 76139411 1D ATTGGCAAAG A/- TGAAGGAGCA 3070 hom 75 het 28 0 25 4 A 1 0 5418 CASAVA_Build X 76163216 3D CTATGTTAGA GAT/--- GATGATGGCT 3070 hom 135 het 48 0 46 4 GAT 3 2 5419 CASAVA_Build X 76173345 1D ATTTAGTGAT A/- TTTTTCCTAC 3070 hom 93 het 36 0 30 6 A 1 0 5420 CASAVA_Build X 76181588 1I CGTAAAAATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 8 9 5421 CASAVA_Build X 76197930 1I GAGTAGCCCA -/G GGAAGGGGGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 2 3 5422 CASAVA_Build X 76199345 5D TTGAGTGACT TCTAG/----- TCTAGATTCT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TCTAG 2 1 5423 CASAVA_Build X 76205096 1I CTAGACAACA -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 64 het 26 0 22 4 C 8 9 5424 CASAVA_Build X 76208885 2D GATGGAGTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 44 het 35 1 23 13 T 11 9 5425 CASAVA_Build X 76211690 1I AATGCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 41 1 32 8 T 11 12 5426 CASAVA_Build X 76220910 3I GTTAAAAGAA ---/CTT CTAAGACCAG 3070 hom 81 het 28 0 26 2 CTT 0 1 5427 CASAVA_Build X 76221193 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 142 hom 29 1 20 8 A 9 10 5428 CASAVA_Build X 76236851 1I GAGTATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 23 9 T 10 11 5429 CASAVA_Build X 76257355 1D ATAGAACGCA T/- TTTAAAAAAA 1587 het 1587 ref 24 10 9 5 T 4 3 5430 CASAVA_Build X 76277133 1D GTCTGGGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 10 9 5431 CASAVA_Build X 76290844 1D GCAGATAAAT G/- GCTCTCTGAT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 G 2 1 5432 CASAVA_Build X 76295944 1I AAATTTGATT -/A AAAAAACATG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 6 7 5433 CASAVA_Build X 76308555 1D TCTCAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1145 hom 30 5 20 5 A 22 21 5434 CASAVA_Build X 76317191 1I ACATGTACAG -/T TTTTTTTAGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 7 8 5435 CASAVA_Build X 76319349 1I TAACTAACTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 41 0 26 15 T 9 10 5436 CASAVA_Build X 76339684 8D TTTGTTATTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 1592 het 1592 ref 22 14 4 6 TTTG 5 3 5437 CASAVA_Build X 76355476 1D CAGCTATAAC T/- AAGACAGAGT 3070 hom 135 het 50 0 46 6 T 1 0 5438 CASAVA_Build X 76364192 1I AAATTGGAAA -/T AAAATAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 0 1 5439 CASAVA_Build X 76368928 1D TATATTTGTG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 117 het 46 0 39 8 A 9 8 5440 CASAVA_Build X 76371484 1I TCTGCACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 32 1 21 10 A 12 13 5441 CASAVA_Build X 76372896 1D GCCTCAGCCT C/- CCAAGTAGCT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 3 2 5442 CASAVA_Build X 76376876 1D AATTGCTTGA G/- TCTGGGAGAC 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 G 1 0 5443 CASAVA_Build X 76389843 1I TCCAACCCAT -/A AACAAACAGC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 3 5444 CASAVA_Build X 76407601 1I ATCGCACTTA -/C TTCAAAATTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 0 1 5445 CASAVA_Build X 76422910 1I TAAGGAGCTG -/T TTTTTTAATG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 7 5446 CASAVA_Build X 76433104 7D AAAGTATAAT AAAAAAA/------- AAAAAGAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 12 5 5447 CASAVA_Build X 76437339 1D CCTCAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 24 1 17 7 A 15 14 5448 CASAVA_Build X 76439568 1I AAGTATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 52 0 43 9 A 10 11 5449 CASAVA_Build X 76523801 4D ACTAAGAAAA AAAG/---- AGAGAAGACT 3070 het 3070 hom 33 11 19 5 AAAG 1 0 5450 CASAVA_Build X 76534806 1D CTACCACAAG T/- TTTCAAGGGT 3070 hom 138 het 53 0 46 7 T 4 3 5451 CASAVA_Build X 76553298 1D TATCCAGGGA C/- CTAGTCATTA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 C 2 1 5452 CASAVA_Build X 76710281 1D TTAAAATAGG A/- AAAAAAAAAA 1395 het 1395 ref 28 21 3 4 A 13 12 5453 CASAVA_Build X 76790771 1D CAAAGCTGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 35 4 21 10 T 15 14 5454 CASAVA_Build X 76794644 1I GAGTAGTATT -/A AAAAAAAAAA 1636 het 1636 ref 20 11 5 4 A 13 14 5455 CASAVA_Build X 76811454 2D AGATGATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 1088 het 1088 ref 45 31 3 11 T 14 12 5456 CASAVA_Build X 76851789 1D CCAATGGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 461 hom 30 2 18 10 A 16 15 5457 CASAVA_Build X 76937830 1D CAAAGAAACG A/- AAAAAAAAAA 308 het 308 ref 27 22 2 4 A 11 10 5458 CASAVA_Build X 77021349 1I AGCTGGGATT -/A ACAGGCACAC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 1 2 5459 CASAVA_Build X 77068072 2I GTAATAAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 32 0 19 13 T 13 15 5460 CASAVA_Build X 77117127 1I GTGCGCTGCA -/C CCACTAACTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 2 3 5461 CASAVA_Build X 77137326 1D CTGATCCAGG T/- TCTCACAGCC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 1 5462 CASAVA_Build X 77143577 1D AATGGGGTAT C/- CATCTCTTCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 C 2 1 5463 CASAVA_Build X 77173487 1D AAAACAGACC T/- TTTTTCTTAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 6 5 5464 CASAVA_Build X 77186005 1I ATAGACGGGG -/T TTCTCCATGT 1397 hom 7 het 3 0 3 0 T 2 3 5465 CASAVA_Build X 77356832 1I AGTGGACACA -/T TTTTACTATG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 T 4 5 5466 CASAVA_Build X 77380326 2D GGCCTGTAAT GG/-- GGGCATCATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 5 3 5467 CASAVA_Build X 77387421 1I CCAAGAACCA -/C CCCCCCACCC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 6 7 5468 CASAVA_Build X 77387619 3D GTATAATAAC AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AAT 7 6 5469 CASAVA_Build X 77390063 2D TAATATGTTG TC/-- TCTGTGGACT 3070 het 3070 hom 21 10 8 4 TC 2 1 5470 CASAVA_Build X 77395232 1D GATTATTAGA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 7 5471 CASAVA_Build X 77396303 1I AATGCTGAAA -/G TGAGGTGTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 5472 CASAVA_Build X 77404027 1I AAAGAACATC -/T TTTTTTCTGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 5473 CASAVA_Build X 77405207 1I TTTCATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 10 11 5474 CASAVA_Build X 77407009 1D TATATGTATG T/- TCTTTCTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 1 5475 CASAVA_Build X 77407268 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 23 0 16 7 T 12 11 5476 CASAVA_Build X 77407327 1I GTTCCTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 11 12 5477 CASAVA_Build X 77413637 3I CTTTATAGTT ---/ATC ATTTATTTCT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 ATC 0 1 5478 CASAVA_Build X 77422713 1I ATCTACTTTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 8 9 5479 CASAVA_Build X 77445571 1I CTTACAAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 568 hom 44 2 34 8 T 9 10 5480 CASAVA_Build X 77447680 1I AAAAAATTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 8 9 5481 CASAVA_Build X 77480316 1I TTTCCTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 21 1 18 2 T 13 14 5482 CASAVA_Build X 77480897 1D TTTTAAATGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 10 9 5483 CASAVA_Build X 77491344 1I TTGCTCGTTG -/C CCCCATTTGC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 4 5 5484 CASAVA_Build X 77494216 2D AGTTATATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 31 1 19 16 T 15 13 5485 CASAVA_Build X 77495854 2D TTTGTCGGGG GC/-- GGGGGGGGAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 GC 1 0 5486 CASAVA_Build X 77503316 1D ATTTTACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 28 1 26 1 A 10 9 5487 CASAVA_Build X 77514044 1D TAGACTTATT A/- ATTTTCTGTC 3070 hom 57 het 22 0 19 4 A 2 1 5488 CASAVA_Build X 77520705 2D GGATTAAGAC AT/-- GTGGAGACTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AT 1 0 5489 CASAVA_Build X 77537693 1I ACATTTAATC -/T CTAAAGACAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 5490 CASAVA_Build X 77578710 1D CCATATAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 602 hom 25 2 22 1 T 14 13 5491 CASAVA_Build X 77592446 1D TTGATTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 42 1 32 9 T 11 10 5492 CASAVA_Build X 77597534 1I CTTAGGAGGC -/A AACAAGGCAT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 2 3 5493 CASAVA_Build X 77598025 1D AAATGGAAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 91 het 34 0 30 4 T 10 9 5494 CASAVA_Build X 77601682 3D ATTTAGATGA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 6 AAT 4 3 5495 CASAVA_Build X 77602478 1I CTCCAAGCTG -/T TTTTTTTACT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 7 8 5496 CASAVA_Build X 77602688 1I GCTGCAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 284 hom 37 1 30 6 T 12 13 5497 CASAVA_Build X 77603234 2D GGTTCTCTAT TA/-- TGTTTCGTTG 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 TA 1 0 5498 CASAVA_Build X 77605366 1I TTACTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1287 hom 37 3 29 5 T 12 13 5499 CASAVA_Build X 77619846 1D AAAACTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 25 1 21 3 T 12 11 5500 CASAVA_Build X 77702932 1D GTTTGGAGGA T/- TTTTTTTTTG 1385 het 1385 ref 32 26 3 3 T 10 9 5501 CASAVA_Build X 77775923 1I TTTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2933 het 2933 ref 30 14 11 5 T 12 13 5502 CASAVA_Build X 77806471 1D GATTGTGTGA G/- TATAGGAAGT 3070 het 3070 ref 63 34 26 3 G 1 0 5503 CASAVA_Build X 77813460 1D CTGAAATTGG A/- AAAAAAAAAA 2129 het 2129 ref 52 36 6 10 A 13 12 5504 CASAVA_Build X 77868022 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1680 hom 18 het 8 0 6 4 T 13 12 5505 CASAVA_Build X 77924547 1D TTCGTATGCA T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 7 6 5506 CASAVA_Build X 77940800 3I TAATGAACTG ---/ATC ATCTTCTGTG 3070 hom 151 het 54 0 51 3 ATC 1 2 5507 CASAVA_Build X 77976731 1I AAGAAATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1226 hom 29 4 20 5 T 10 11 5508 CASAVA_Build X 77988056 1D ATCCACATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 A 11 10 5509 CASAVA_Build X 78000137 1D AAAAATTCAC T/- TTTTTTTACT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 8 7 5510 CASAVA_Build X 78005778 1I GAAAAAAAAA -/T ATCCTAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 0 1 5511 CASAVA_Build X 78029480 1D TCTGACCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 22 1 18 4 A 14 13 5512 CASAVA_Build X 78030282 1D AACTCTTTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 9 8 5513 CASAVA_Build X 78051052 2D GAATGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1612 het 245 hom 35 5 4 26 T 14 12 5514 CASAVA_Build X 78072538 2I ATTACTTTAT --/AC ACACATTTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AC 2 3 5515 CASAVA_Build X 78097331 1D TGTGCCAACA C/- TGAGGGATTC 3070 hom 126 het 46 0 43 4 C 1 0 5516 CASAVA_Build X 78097449 1I CCTCTCAAGG -/T TTGCTACAAA 3070 hom 126 het 53 0 41 13 T 2 3 5517 CASAVA_Build X 78101200 1D TAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 39 0 34 7 A 11 10 5518 CASAVA_Build X 78116070 1I TTCTGGTCTC -/A ATTTTATTTA 3070 hom 67 het 29 0 21 8 A 1 2 5519 CASAVA_Build X 78124216 1D TCATAAACAC A/- AAAAAATCCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 6 5520 CASAVA_Build X 78146199 1I ATAGTACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 36 1 34 1 A 10 11 5521 CASAVA_Build X 78146956 3D TATACATTGT TGG/--- TGGGATTGTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TGG 2 1 5522 CASAVA_Build X 78149577 1I AAAATTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1321 hom 27 5 17 5 T 13 14 5523 CASAVA_Build X 78155353 4I TCTTTGTTTC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 63 het 28 0 21 7 TTTG 3 4 5524 CASAVA_Build X 78205101 1D TCTTTTTTCA T/- TTTTTTGGCT 3070 hom 89 het 37 0 33 6 T 7 6 5525 CASAVA_Build X 78206229 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 28 3 10 15 T 19 16 5526 CASAVA_Build X 78217891 1I AGAGGAATGC -/A AATTGTCTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 3 5527 CASAVA_Build X 78230180 3D TCTGTGACTA AAT/--- AATTTTATAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAT 2 1 5528 CASAVA_Build X 78230720 2I TCAGTTTCAT --/TA TATCTGTATA 3070 hom 59 het 23 0 20 3 TA 1 2 5529 CASAVA_Build X 78239559 3I ATTGCAATCA ---/AAC AACATACTTT 3070 hom 169 het 60 0 57 3 AAC 1 2 5530 CASAVA_Build X 78265309 3D AAAAACAACA GAT/--- GATGTTTGCA 3070 hom 144 het 49 0 49 1 GAT 2 1 5531 CASAVA_Build X 78278539 1D CGTATGTCCC A/- AAAAAAGCAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 7 6 5532 CASAVA_Build X 78294516 14I AGGACTTGGA --------------/GTTACAGAATGCCT GTTCTTGTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 6 GTTACAGAATGCCT 0 1 5533 CASAVA_Build X 78297836 2I AGAAACAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 92 het 39 0 31 8 AG 8 9 5534 CASAVA_Build X 78300598 4D TTTCTTTCTT TTTC/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 17 4 TTTC 1 0 5535 CASAVA_Build X 78310693 1D TCTCTACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 11 10 5536 CASAVA_Build X 78312545 2D GAACACAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 31 1 21 10 T 14 12 5537 CASAVA_Build X 78317929 1D CCACTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 11 10 5538 CASAVA_Build X 78320963 1D TAATGGGTAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 A 9 8 5539 CASAVA_Build X 78330684 1I TTTTTAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 686 hom 37 2 29 6 T 10 11 5540 CASAVA_Build X 78335386 2D TGCAATAAAC AT/-- ATGTGTGCAT 3070 hom 21 het 12 0 8 4 AT 2 1 5541 CASAVA_Build X 78338628 1D CTGGAGGAGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 8 7 5542 CASAVA_Build X 78343615 1I TGGAAACAAC -/A TATCAAAACA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 0 1 5543 CASAVA_Build X 78356462 1D ACCATTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 T 12 11 5544 CASAVA_Build X 78377064 1D AGGTCTTTCC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 8 7 5545 CASAVA_Build X 78408001 1I ATTTAACTTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 7 8 5546 CASAVA_Build X 78427931 4D GGTGTATTTA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 45 het 24 0 14 11 AC 11 9 5547 CASAVA_Build X 78430445 3I ATAATCAATG ---/GGA GGAGGAGAAC 3070 hom 87 het 34 0 28 6 GGA 2 3 5548 CASAVA_Build X 78433535 8D GGTGCTGGTA CCCACTGT/-------- TGGGAAAGTT 3070 hom 117 het 40 0 40 9 CCCACTGT 1 0 5549 CASAVA_Build X 78451105 3I CAGAAGAGAA ---/ACC ACCACTGTCT 3070 hom 109 het 41 0 37 4 ACC 1 2 5550 CASAVA_Build X 78452978 1D GCATCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 10 5551 CASAVA_Build X 78458610 8D ATTGGTCTAT TTAGGGTA/-------- TCAGGGTATC 3070 hom 66 het 22 0 23 2 TTAGGGTA 1 0 5552 CASAVA_Build X 78459425 2D AAATGTTATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 26 0 18 8 TA 9 8 5553 CASAVA_Build X 78462651 2I ATAAATAAGA --/CT TAGTATTTGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CT 0 1 5554 CASAVA_Build X 78466079 1D TATTATTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 9 8 5555 CASAVA_Build X 78468351 1D GCCCACCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 25 2 18 5 A 13 12 5556 CASAVA_Build X 78472106 1I AGCTCACAAA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 8 5557 CASAVA_Build X 78477851 1I TTTATTAGAG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 7 8 5558 CASAVA_Build X 78478274 1D TCTCTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 981 hom 43 3 35 6 T 12 11 5559 CASAVA_Build X 78491852 1D TATCTAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 12 11 5560 CASAVA_Build X 78500393 1I CCCACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 26 1 21 4 T 10 11 5561 CASAVA_Build X 78503100 1I TGGTTAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 35 1 27 7 T 11 12 5562 CASAVA_Build X 78504002 1D CATGATCTTG T/- TTTTTTTTTG 2129 het 16 hom 36 1 13 22 T 10 9 5563 CASAVA_Build X 78507819 1I GGCGGTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1014 hom 38 5 25 8 A 13 14 5564 CASAVA_Build X 78515564 5I ACTCAAAATA -----/AAGTT ATCTATAACT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 AAGTT 0 1 5565 CASAVA_Build X 78528287 6D TTAATACCTA GGTGAT/------ GGGATGACCC 3070 hom 105 het 36 0 34 2 GGTGAT 1 0 5566 CASAVA_Build X 78529854 1D TGATGGAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 174 hom 34 1 25 8 T 10 9 5567 CASAVA_Build X 78542440 1D AAGCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 29 1 21 8 A 14 13 5568 CASAVA_Build X 78544981 2D ATCTACACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 33 0 23 10 A 16 14 5569 CASAVA_Build X 78547221 4D AGAGTGGACT ATAA/---- TACATACCTA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 ATAA 1 0 5570 CASAVA_Build X 78548112 1D TTCCCAGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 27 0 21 6 A 10 9 5571 CASAVA_Build X 78552187 1I TTGAATTGAA -/C TTCTTTTTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 0 1 5572 CASAVA_Build X 78556383 1D TAAGCCATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 33 2 27 4 A 13 12 5573 CASAVA_Build X 78559377 1D AAGTTGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 14 13 5574 CASAVA_Build X 78566001 1I TTATCTTATG -/A AAAAAAAAAA 440 het 440 ref 38 27 2 9 A 11 12 5575 CASAVA_Build X 78570721 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 21 5 A 13 12 5576 CASAVA_Build X 78577103 1D GTTTAACAAG A/- AAAAAAGATC 3070 hom 106 het 43 0 38 5 A 7 6 5577 CASAVA_Build X 78580519 3I TTTATTAGTT ---/ATC ATGTTGAATG 3070 hom 60 het 27 0 21 7 ATC 0 1 5578 CASAVA_Build X 78582241 1I GAGTAAAACG -/T TGGCTAAGGA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 1 2 5579 CASAVA_Build X 78608665 1D CCATCATAAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 96 het 43 0 33 10 A 8 7 5580 CASAVA_Build X 78630094 5D GTTGTTTAAA TTAAT/----- TTAAACTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTAAT 1 0 5581 CASAVA_Build X 78633244 2I CAAAAATCTG --/AA AAAAAAAAAA 1385 het 597 hom 39 3 9 27 A 12 14 5582 CASAVA_Build X 78643741 4D AAATAAAAAT AAAC/---- AAACAGGAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AAAC 2 1 5583 CASAVA_Build X 78646475 1D ACCAAAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 5584 CASAVA_Build X 78663906 1I AAAAGGCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 22 0 13 9 A 12 13 5585 CASAVA_Build X 78667997 1I CCATATGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 35 0 29 6 A 9 10 5586 CASAVA_Build X 78669359 1D AAATTGAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 9 8 5587 CASAVA_Build X 78671749 1I GGGTTTTTTT -/G GGGGGTCTTT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 5 6 5588 CASAVA_Build X 78672771 1I CGCACTTGCC -/G GCCAGCTAGA 1455 hom 18 het 8 0 6 2 G 1 2 5589 CASAVA_Build X 78672970 1I GCCTCCCTGC -/G GGGCAGGGCT 2288 hom 30 het 11 0 9 2 G 3 4 5590 CASAVA_Build X 78694030 1D ACAACTGCCC A/- CTCCTTATGC 3070 hom 62 het 24 0 21 3 A 1 0 5591 CASAVA_Build X 78709104 1D GGGTTTTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 1 0 5592 CASAVA_Build X 78710077 2D AATGAGAATA AT/-- ATATATATTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AT 5 4 5593 CASAVA_Build X 78718356 1D ATATACACTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 10 9 5594 CASAVA_Build X 78725802 1I AAGTAGCAAC -/A AAAAAACCCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 6 7 5595 CASAVA_Build X 78738551 6I GCCAGGATGG ------/TCTCGA TCTCCTGACC 2030 hom 27 het 10 0 7 3 TCTCGA 0 1 5596 CASAVA_Build X 78739251 4I TATTATTCTT ----/CCTG CCTCTTCTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CCTG 0 1 5597 CASAVA_Build X 78741884 1D AATGTCTGTA T/- CTATGTTGAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 0 5598 CASAVA_Build X 78742031 2D TGATGGGAAT TG/-- TCTCTTCTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 TG 1 0 5599 CASAVA_Build X 78746359 1I TGTCAACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 37 0 27 10 A 10 11 5600 CASAVA_Build X 78747519 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAATG 3070 het 703 hom 33 2 28 3 C 1 0 5601 CASAVA_Build X 78752874 1I ATGTAATAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 9 10 5602 CASAVA_Build X 78753521 2D GTTAAGAAAC AT/-- ATGTGTATAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AT 2 1 5603 CASAVA_Build X 78762247 1D ACTGGCAGAG A/- AAAAAATAGT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 A 7 6 5604 CASAVA_Build X 78763917 4D ATTACTTTCT CAGA/---- CAAACTCCTT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 CAGA 1 0 5605 CASAVA_Build X 78773324 1I TATTCATCCA -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 7 8 5606 CASAVA_Build X 78791964 2D ATATGCAGAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 16 0 14 4 TA 8 7 5607 CASAVA_Build X 78792755 1I ATGTGCCACA -/T TTTCTTAATC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 3 4 5608 CASAVA_Build X 78793464 14I CACTGTTGGT --------------/GGGAGTGTAAACTA GGGAGTGTAA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 GGGAGTGTAAACTA 1 2 5609 CASAVA_Build X 78799045 3D AGGATACCAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 34 2 27 5 A 15 12 5610 CASAVA_Build X 78799740 18D TTAATTTTGT TGATTTTTCTCGATTTTC/------------------ TGTTTTCAGT 3070 hom 72 het 22 0 25 3 TGATTTTTCTCGATTTTC 1 0 5611 CASAVA_Build X 78813086 3D TTTGCTGTGC AGA/--- AGGTTTTGAA 3070 hom 90 het 31 0 31 1 AGA 1 0 5612 CASAVA_Build X 78815380 1I CGGTGTTGAA -/T TTTATCAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 3 4 5613 CASAVA_Build X 78815925 1I TTTATTGGTA -/T ATAATTCCTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 0 1 5614 CASAVA_Build X 78817607 1D TAGCTAAACT G/- GGGGGGGAGT 3070 hom 116 het 44 0 37 7 G 8 7 5615 CASAVA_Build X 78818517 1D TATATATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 12 11 5616 CASAVA_Build X 78821509 1D TCACAGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 10 9 5617 CASAVA_Build X 78826257 9D3M12D GGAGACATTT GAGGCAGCCCCTGCCATCACAGGC/---------CCT------------ CCTGAGGCCT 3070 hom 59 het 19 0 21 1 N/A 0 0 5618 CASAVA_Build X 78846342 1D AATAGCAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 94 het 45 0 38 7 T 10 9 5619 CASAVA_Build X 78849055 2D TAAAAAGAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 43 1 34 8 T 12 10 5620 CASAVA_Build X 78850817 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 9 8 5621 CASAVA_Build X 78852390 1I TTTGAAGAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 9 10 5622 CASAVA_Build X 78853361 9D GAAGCAGTTA AAAATACAT/--------- AAAATACATA 3070 hom 63 het 26 0 22 6 AAAATACAT 2 1 5623 CASAVA_Build X 78859848 1I CAAAATTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 37 het 23 0 15 8 T 9 10 5624 CASAVA_Build X 78862666 1I CATTGAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 9 5625 CASAVA_Build X 78874913 1I ATCTCACCAG -/A AAAAAATCAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 7 5626 CASAVA_Build X 78875902 2D TGCCAACATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 14 12 5627 CASAVA_Build X 78884926 1I ATATATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 22 1 19 2 T 10 11 5628 CASAVA_Build X 78935149 1I GGTGTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 1708 het 1708 ref 38 23 5 10 T 13 14 5629 CASAVA_Build X 78939592 2D TATGGAATAA CT/-- CTGATTAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CT 2 1 5630 CASAVA_Build X 78948263 1D TTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 599 hom 25 3 14 8 T 13 12 5631 CASAVA_Build X 78953253 2I ACCATTTGTT --/AA AAAGACTATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 5 5632 CASAVA_Build X 78964456 2I TCCAAGTAGA --/TT TTTCTCTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 3 5 5633 CASAVA_Build X 78980110 3D GGGGTTTGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TTG 5 4 5634 CASAVA_Build X 78980962 1D ACTGCTTTTC T/- TTTTTTAATT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 7 6 5635 CASAVA_Build X 78981287 4D TTTTTTTCTT TTTA/---- TTTTTTTTGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TTTA 1 0 5636 CASAVA_Build X 78984816 2I TTAAAGTATT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 9 11 5637 CASAVA_Build X 78985812 4I AAGAGAGGAC ----/ACAA ACAAATGGAA 3070 hom 96 het 33 0 33 1 ACAA 1 2 5638 CASAVA_Build X 78987467 2I ATAAAAAAAC --/AA AGATTCCAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 1 3 5639 CASAVA_Build X 78987587 1D GTTATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 12 11 5640 CASAVA_Build X 78988935 11D GGCAGCAAAT TTCCTTCTCAC/----------- CCAGGGTGTG 3070 hom 126 het 41 0 43 1 TTCCTTCTCAC 1 0 5641 CASAVA_Build X 78989233 4D GGCTCTGAGA CCAG/---- CCAGCTCAAC 3070 hom 51 het 20 0 18 3 CCAG 2 1 5642 CASAVA_Build X 78990171 1D CACAGGAACT A/- AAAAAGTGCA 3070 hom 70 het 26 0 24 4 A 6 5 5643 CASAVA_Build X 78992687 1I TCAGGGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 11 5644 CASAVA_Build X 78999322 6D TCTTCCAATA CTTTGT/------ CTTTATCTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CTTTGT 1 0 5645 CASAVA_Build X 79001888 1I TTGACAGAAA -/C TCTCAATTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 0 1 5646 CASAVA_Build X 79004671 1I AGTCAGTTTT -/A AACAATTTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 2 3 5647 CASAVA_Build X 79005155 24I GGAATTGGCA ------------------------/AATTCTGAATATTCTGAATTTCAG AGGTCAAAAT 3070 hom 75 het 23 0 26 1 AATTCTGAATATTCTGAATTTCAG 0 1 5648 CASAVA_Build X 79005786 1D46M5D GAGTTAGGTA TTAAGGAATAAAGATCTGTGAATTTAAGATTCCAAAAACCCATAGGCTTTTT/-TAAGGAATAAAGATCTGTGAATTTAAGATTCCAAAAACCCATAGGC----- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 32 0 30 20 N/A 0 0 5649 CASAVA_Build X 79006013 1D AGCCATTAAA G/- GTCACGCATA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 G 2 1 5650 CASAVA_Build X 79006138 1D AGGGGCTCTG A/- AAAGGGAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 4 3 5651 CASAVA_Build X 79026040 1I AAGTTCAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 288 hom 26 1 21 4 A 9 10 5652 CASAVA_Build X 79026330 1I ACACATATAT -/G TACACACATA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 0 1 5653 CASAVA_Build X 79037511 1D ATAGACGTAG A/- AAAAACTATT 3070 hom 92 het 33 0 31 2 A 6 5 5654 CASAVA_Build X 79047213 1I AAAAACAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 10 11 5655 CASAVA_Build X 79256884 1I TTGTGGGCCA -/G GCCCAGGGCC 2287 hom 35 het 14 0 7 7 G 1 2 5656 CASAVA_Build X 79267026 1I TTAGGATAGC -/T TTGGCTATTC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 2 3 5657 CASAVA_Build X 79349576 1I CTTGTTGCTG -/C CCTCCGGGAA 3070 hom 105 het 41 0 34 7 C 2 3 5658 CASAVA_Build X 79361511 1D AATCACAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 33 4 A 12 11 5659 CASAVA_Build X 79397776 2I TCTAACAGTG --/TA TATATATATA 3070 het 414 hom 38 1 30 7 TA 5 6 5660 CASAVA_Build X 79403476 1I TAGTTTGAAC -/A TTATAGTTCA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 0 1 5661 CASAVA_Build X 79406002 3I CAAGTTTTTG ---/AAT AATAGTAATG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAT 1 2 5662 CASAVA_Build X 79438842 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 945 het 945 ref 34 22 4 8 A 13 12 5663 CASAVA_Build X 79459757 1D ACCTTTTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 34 3 23 8 T 13 12 5664 CASAVA_Build X 79507061 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 8 9 5665 CASAVA_Build X 79559283 1D CAATCCCTGC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 104 het 36 0 35 1 T 9 8 5666 CASAVA_Build X 79569438 2D AATTAGAGGC AT/-- ATGGTTACTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 2 1 5667 CASAVA_Build X 79576306 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 22 1 15 6 A 10 11 5668 CASAVA_Build X 79581990 1D TAATTAACGC T/- TTTTTCTAGG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 6 5 5669 CASAVA_Build X 79592394 3D TACCTTTATA GAT/--- ATACCTTATA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 GAT 1 0 5670 CASAVA_Build X 79592947 3D GAATAAAGTG AGA/--- AGAAGATCTG 3070 hom 141 het 50 0 47 3 AGA 3 2 5671 CASAVA_Build X 79630176 1D GAAAAGTATG A/- AAAAAAGTTA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 7 6 5672 CASAVA_Build X 79642902 1D AGTCATTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 46 1 35 10 A 12 11 5673 CASAVA_Build X 79671024 1D CATTTGGATA C/- CCTCTTTTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 C 3 2 5674 CASAVA_Build X 79671920 1I TCTAAACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 42 1 38 3 A 10 11 5675 CASAVA_Build X 79682028 2D CGTGGAAAAC AT/-- ATTTACTCTG 3070 hom 72 het 31 0 25 8 AT 2 1 5676 CASAVA_Build X 79686913 1I TCAGCAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 10 5677 CASAVA_Build X 79687739 1I AAACCATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 205 hom 33 2 20 11 A 13 14 5678 CASAVA_Build X 79708811 1D TGTTCCATTG T/- TCTGTGTGTC 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 2 1 5679 CASAVA_Build X 79747692 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 C 0 1 5680 CASAVA_Build X 79753619 1D TGGAGATGAG A/- AAAACCATAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 5 4 5681 CASAVA_Build X 79759186 2I CATGCTCTTT --/TA TATATATATA 3070 het 85 hom 30 1 24 5 TA 5 6 5682 CASAVA_Build X 79776967 1D CTTGACTTGC T/- TTTTAGTGGA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 5 4 5683 CASAVA_Build X 79778820 2I AACACTGTGG --/CT CTTATAGACT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CT 1 2 5684 CASAVA_Build X 79818488 4D GTTGTGTTTC GTGT/---- GTGTGTGTCT 3070 hom 115 het 51 0 41 10 GT 6 4 5685 CASAVA_Build X 79826800 3D TGCCTTTCTC CTT/--- CTTGATTTTA 3070 hom 151 het 55 0 51 5 CTT 2 1 5686 CASAVA_Build X 79829256 4D TGTATGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 TA 11 9 5687 CASAVA_Build X 79831150 1D TGAAAAAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 32 0 24 9 A 9 8 5688 CASAVA_Build X 79846415 2D ACCAAAAAAC AT/-- AGTGGAATGG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 AT 1 0 5689 CASAVA_Build X 79861216 1D CTTCAGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 12 11 5690 CASAVA_Build X 79869877 4I AGGAGTTGAC ----/ACTT AAGTTGAGAT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 ACTT 0 1 5691 CASAVA_Build X 79883844 1D CATGTGTCTC T/- TGGCTGCATA 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 T 2 1 5692 CASAVA_Build X 79886453 3I AGCAGAAATT ---/CAC CACAATACCC 3070 hom 123 het 52 0 42 10 CAC 1 2 5693 CASAVA_Build X 79890841 1D ACAAACCAAC T/- TTAAGATTTG 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 T 3 2 5694 CASAVA_Build X 79928672 2I TTAATTTGCC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 10 10 10 TA 8 9 5695 CASAVA_Build X 79941929 1I TTTGCAGCAT -/C CCCAGTTACT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 3 4 5696 CASAVA_Build X 79945254 31D AAGACTCCAT CTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAA/------------------------------- TGTCAAGCAA 3070 hom 93 het 32 0 31 6 CTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAA 1 0 5697 CASAVA_Build X 79951567 1I TCCCTTAGCA -/C CCCCCCCACC 2495 hom 21 het 8 0 8 0 C 7 8 5698 CASAVA_Build X 79995142 1D ACTATTAATT A/- AAAAAAAAAA 2207 het 2207 ref 34 24 6 5 A 13 12 5699 CASAVA_Build X 80016486 3D ATAAAAGCCT AAG/--- AAGTGTCATA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAG 2 1 5700 CASAVA_Build X 80027527 1D TCTGATGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 17 0 14 3 T 10 9 5701 CASAVA_Build X 80047051 1D GACTCTATGT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 45 het 24 0 15 10 A 9 8 5702 CASAVA_Build X 80084713 1I GGATGGGGGA -/G GGATAGGATT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 2 3 5703 CASAVA_Build X 80136975 1D GTCTCCTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 29 1 20 8 A 15 14 5704 CASAVA_Build X 80137078 3I TCCAAAAATA ---/GAG GAGAAGAGGA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 GAG 1 2 5705 CASAVA_Build X 80146420 1D AAAATAAAAT G/- GTGACCTTAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 2 1 5706 CASAVA_Build X 80157896 3I TTTCAGTAAG ---/AAC AACAAGATTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAC 1 2 5707 CASAVA_Build X 80179059 1D GGTCTTGGGG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 31 0 25 7 T 8 7 5708 CASAVA_Build X 80183657 2D TATGAGGACA TG/-- TGATATTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 6 TG 2 1 5709 CASAVA_Build X 80198546 2D CCCCTACAAG AT/-- ATAATATAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AT 2 1 5710 CASAVA_Build X 80201040 4D TTCAAAAGAC ACAT/---- GCATGCATGT 3070 hom 129 het 47 0 42 9 ACAT 1 0 5711 CASAVA_Build X 80205365 1I GGACCACTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 10 5712 CASAVA_Build X 80213432 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 585 hom 39 3 32 4 T 12 11 5713 CASAVA_Build X 80214282 1I TTTTCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 579 hom 36 2 28 6 A 10 11 5714 CASAVA_Build X 80217380 3I CTATTCCAGT ---/TAC TACTATGTTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TAC 1 2 5715 CASAVA_Build X 80223166 1D TCAACAGCTT A/- ATTGATCACA 3070 hom 105 het 40 0 35 6 A 2 1 5716 CASAVA_Build X 80223669 1D AAATGTATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 10 9 5717 CASAVA_Build X 80224094 1D AGACCCTCTG A/- AATAAAGTGG 3070 hom 82 het 35 0 26 9 A 3 2 5718 CASAVA_Build X 80263004 1D ATCCATGCTA C/- CCCAACATCA 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 C 4 3 5719 CASAVA_Build X 80325617 1D CAGCTATGGC T/- TAAAAGGGGC 3070 het 280 hom 36 1 26 10 T 2 1 5720 CASAVA_Build X 80339975 1D TTGCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 38 2 32 4 A 12 11 5721 CASAVA_Build X 80392562 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2989 het 3 hom 13 0 10 3 A 15 14 5722 CASAVA_Build X 80415805 2D GGTTAAATGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1269 hom 35 9 11 15 T 18 16 5723 CASAVA_Build X 80443915 2D GTTTTATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 31 0 20 12 TA 8 7 5724 CASAVA_Build X 80453211 1D TCTGTGTTTC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 7 6 5725 CASAVA_Build X 80456165 1D TTTAAATCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 29 1 19 9 T 11 10 5726 CASAVA_Build X 80464389 1I ATTTTTTCCA -/T TTGTATGGGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 3 5727 CASAVA_Build X 80473827 1I AATTTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 12 13 5728 CASAVA_Build X 80475035 1D TTAGGTTTTA C/- ATTTAAGTCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 0 5729 CASAVA_Build X 80478273 2D ATGTCAGTGA TC/-- TCTTCATTCC 3070 hom 126 het 44 0 43 3 TC 2 1 5730 CASAVA_Build X 80491589 3D GGGCTGTGAT AGA/--- AGAAGTAGAC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 AGA 2 1 5731 CASAVA_Build X 80499876 1I GATAGGGTTG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 8 9 5732 CASAVA_Build X 80507936 1D TTAATATTTT A/- TGAAACAGAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 0 5733 CASAVA_Build X 80514958 1I AATGAATAGG -/A AAAAATACTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 5 6 5734 CASAVA_Build X 80525892 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 420 hom 33 1 28 4 T 10 9 5735 CASAVA_Build X 80529454 1D TAAGAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 34 1 29 4 T 11 10 5736 CASAVA_Build X 80545914 1D GGGTGAAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 386 hom 26 1 21 4 A 10 9 5737 CASAVA_Build X 80547062 4D TGACTAGCTG TTAT/---- TTATTTCCCT 3070 hom 81 het 31 0 28 7 TTAT 2 1 5738 CASAVA_Build X 80605386 1I TTATTTTCTA -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 6 7 5739 CASAVA_Build X 80623213 3D AAACTGAAAC CAG/--- CAGCACATCA 3070 het 3070 hom 41 14 23 5 CAG 2 1 5740 CASAVA_Build X 80642149 1D AAAGTACACA T/- TTTTTTTTTT 1224 het 1224 ref 37 24 3 10 T 13 12 5741 CASAVA_Build X 80671758 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1911 het 1911 ref 32 17 7 8 T 15 14 5742 CASAVA_Build X 80690573 4I ACAATATCTC ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 8 10 14 AT 7 9 5743 CASAVA_Build X 80708942 8I AGAAAAATTG --------/AACAGAAT AACAGAATAA 3070 het 3070 hom 49 15 26 8 AACAGAAT 1 2 5744 CASAVA_Build X 80737288 1D TCTTACACTC T/- TTTTTTTTTT 2957 het 2957 ref 32 17 8 7 T 11 10 5745 CASAVA_Build X 80739975 1I AAATTCTTTT -/A AAAAACACTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 5 6 5746 CASAVA_Build X 80753904 1D TATTTTTAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 9 8 5747 CASAVA_Build X 80763687 12D ATATATATAC ACGTATATATAT/------------ ACGTATATAT 3070 hom 42 het 20 0 15 6 ACGTATATATAT 2 1 5748 CASAVA_Build X 80763794 2I TACGTGTGTG --/TA TATATATATA 1784 het 1784 ref 20 8 6 6 TA 6 7 5749 CASAVA_Build X 80767304 2I CTTTTACATA --/TC TCTGTTTCCA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TC 1 2 5750 CASAVA_Build X 80769791 1D TCTCTGAATC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 129 het 46 0 43 3 T 10 9 5751 CASAVA_Build X 80779147 1I ACCAATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 43 0 36 7 A 10 11 5752 CASAVA_Build X 80780690 1D AATAGGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 480 hom 25 3 14 9 A 15 14 5753 CASAVA_Build X 80781411 1D AGATTTTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 8 5754 CASAVA_Build X 80784662 1I ATCTATCTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 145 hom 43 1 34 8 T 9 10 5755 CASAVA_Build X 80792676 3D ATAGGAACAT AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 12 9 5756 CASAVA_Build X 80803352 1I TCAATTCATT -/A AAAAAAAAAA 2010 het 2010 ref 21 8 6 7 A 13 14 5757 CASAVA_Build X 80810621 2I CAGATATATC --/AT AGTGGGTTTA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AT 0 1 5758 CASAVA_Build X 80834023 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATTC 3070 hom 41 het 29 0 23 6 A 7 8 5759 CASAVA_Build X 80834754 1D TAGTTCTGGG T/- TTTTACAATT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 T 5 4 5760 CASAVA_Build X 80849814 1D TGAGCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 11 10 5761 CASAVA_Build X 80858615 4D ATGTGTAAAC AATT/---- GATTGAAGTG 3070 het 3070 hom 28 13 14 2 AATT 1 0 5762 CASAVA_Build X 80859739 5I TAGTCTCATA -----/TTTAC TTATATTACA 3070 hom 117 het 42 0 40 3 TTTAC 0 1 5763 CASAVA_Build X 80868809 1D CAACATTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 10 9 5764 CASAVA_Build X 80896580 1I TGTACTCTAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 7 8 5765 CASAVA_Build X 80901863 1I AACAAGCAAT -/G GGGAATGAAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 G 3 4 5766 CASAVA_Build X 80906754 1D AAGAATGAAG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 3 A 7 6 5767 CASAVA_Build X 80913572 18D AATACCCCTA TAACCCTGATGTTATTAT/------------------ TACATATTGT 3070 het 3070 ref 30 25 7 2 TAACCCTGATGTTATTAT 1 0 5768 CASAVA_Build X 80943550 1D TGAGTAGCTC T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 8 7 5769 CASAVA_Build X 80949995 1D TTAGTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 2122 het 2122 ref 52 27 8 17 T 17 16 5770 CASAVA_Build X 80955261 1I TACTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 10 11 5771 CASAVA_Build X 81025188 1I ATGTGGCTTG -/C CAATTATCTC 3070 hom 98 het 38 0 34 4 C 1 2 5772 CASAVA_Build X 81037794 14D TTCTAGCTCT CTTGCTGTTTCCAA/-------------- CTTGCTGTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 9 CTTGCTGTTTCCAA 1 0 5773 CASAVA_Build X 81038133 1I AGCAGGCATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 9 10 5774 CASAVA_Build X 81039932 10I TGGGTTGTGG ----------/CACCCCAAAA CAATTACAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CACCCCAAAA 0 1 5775 CASAVA_Build X 81046310 1I ATTCCTAAGG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 7 8 5776 CASAVA_Build X 81048708 1I AGAACAGTAT -/G GGGGAAATGG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 4 5 5777 CASAVA_Build X 81059390 1D TTCCAAATAA T/- TTTTTGTAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 T 6 5 5778 CASAVA_Build X 81090705 1I GAACGGCTAA -/G GGCACACCTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 2 3 5779 CASAVA_Build X 81126324 1D CCACATAATT G/- GGAAGTAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 3 2 5780 CASAVA_Build X 81129055 1I ACAGACACTT -/C CCAAAAGAAG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 C 2 3 5781 CASAVA_Build X 81129181 1I AGCGATCATT -/A AAAAGTCAGA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 4 5 5782 CASAVA_Build X 81142418 2D GCCTGGAGAA TG/-- TGTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 TG 2 1 5783 CASAVA_Build X 81144184 1I TGGGCAGCAG -/C CCCTCTTCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 3 4 5784 CASAVA_Build X 81181959 1D AGGCTGGGGC G/- GTTGGAAGGG 3070 hom 38 het 23 0 13 10 G 2 1 5785 CASAVA_Build X 81192924 1I15M1I6M1I10M1I6M1I13M1I7M1I CTGAATGGAC -AAGAGTAGTAGAATT-CCCTTG-AAACCCACAT-AAAGTA-CCTCTCTCACAAC-TTTATTC-/AAAGAGTAGTAGAATTCCCCTTGAAAACCAACATAAAAGTACCCTCTCTCACAACTTTTATTCA ACGTAGTATT 3070 hom 84 het 23 0 29 2 N/A 0 0 5786 CASAVA_Build X 81227602 1D GATGCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 1078 het 1078 ref 23 15 3 5 A 15 14 5787 CASAVA_Build X 81231686 1D TAGGAATGAT A/- AAAAAAAAAT 1237 het 1237 ref 53 40 3 10 A 10 9 5788 CASAVA_Build X 81294784 1I CAAATGCAAC -/A AAAGCAAATA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 3 4 5789 CASAVA_Build X 81317795 1I ACTATTTTGT -/A AGTTGCAGGA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 1 2 5790 CASAVA_Build X 81319141 1I TCAGTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 947 hom 23 2 18 3 A 11 12 5791 CASAVA_Build X 81346207 1I ATGTTATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 13 14 5792 CASAVA_Build X 81359974 1D ATTTCTCGAG T/- TTTTTTTTTT 1675 het 1675 ref 40 18 8 14 T 11 10 5793 CASAVA_Build X 81433484 1D CTTTTGTTGT A/- AAAAAAAAAA 1166 het 1166 ref 38 24 5 9 A 12 11 5794 CASAVA_Build X 81502878 3I35M3I4M29D4M1I CAGATAACAC ---CAGTAGTTTTGGTCAGGGGTTAATATTATTATTAT---TTTAACCACCAGGGCCAGGTGGTGGTGCCAAGGTCGT-/CCTCTGTAAATTTGGTCAGGGGTTAATATTATTTTTATTTATTTA-----------------------------TCTTA CTAGCTATTT 2918 het 2918 ref 10 7 6 0 N/A 0 0 5795 CASAVA_Build X 81520638 1I TGCTTGGATG -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 6 7 5796 CASAVA_Build X 81604233 1I ATTTTAATGA -/T TTTTCAGTTT 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 T 4 5 5797 CASAVA_Build X 81622584 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 A 8 9 5798 CASAVA_Build X 81638492 7I CTGTACCTGC -------/TATTGTA ATTTGTTTGC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TATTGTA 0 1 5799 CASAVA_Build X 81647855 1D CCTTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1723 het 1723 ref 38 22 4 12 T 15 14 5800 CASAVA_Build X 81667475 1I AGTAATACAG -/C CCTCAACCTC 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 C 2 3 5801 CASAVA_Build X 81677811 1D TTAACTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 873 hom 35 5 12 19 T 14 13 5802 CASAVA_Build X 81683627 5I CTTTTCCACT -----/TTTAA TTTAAAAATA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TTTAA 1 2 5803 CASAVA_Build X 81684821 1I AATTTTTGTG -/T TTTTTTTTTA 1972 het 1972 ref 15 6 7 2 T 9 10 5804 CASAVA_Build X 81697575 1I TTTTATTTTT -/A AAAAATATGT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 5 6 5805 CASAVA_Build X 81703080 4I GGTGAAATAT ----/ATCA ATCAATCATG 3070 het 3070 ref 21 9 7 5 ATCA 2 3 5806 CASAVA_Build X 81705019 1D CAAAAGCTAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 10 9 5807 CASAVA_Build X 81712047 3D GCTCTAATAA TAT/--- TTCCTTTATA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 TAT 1 0 5808 CASAVA_Build X 81712187 1D TTGAAATCTG T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 7 6 5809 CASAVA_Build X 81712662 1I ACAAATATTT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 7 8 5810 CASAVA_Build X 81715644 1D TTCTCTAATA G/- GCCAGCACTG 3070 het 3070 ref 48 28 18 4 G 2 1 5811 CASAVA_Build X 81739932 4D TGGAATTGGC TAGA/---- TAGAGATAAG 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 TAGA 2 1 5812 CASAVA_Build X 81743310 1I CTCCTACTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 9 10 5813 CASAVA_Build X 81743913 1I CTTAGTACTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 T 8 9 5814 CASAVA_Build X 81744681 1I TGGCAGAAAT -/A AAAAATTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 5 6 5815 CASAVA_Build X 81745261 1I TGTACCAACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 9 10 5816 CASAVA_Build X 81746961 1D AATCAACGAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 9 8 5817 CASAVA_Build X 81763455 1I TAGCAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 7 9 A 9 10 5818 CASAVA_Build X 81767941 1D AATAAATTTT A/- AAAAATTCCA 3070 het 3070 hom 25 10 11 5 A 6 5 5819 CASAVA_Build X 81774746 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 12 11 5820 CASAVA_Build X 81778962 1I ACAATATTGA -/C TTTTTTCAAT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 C 0 1 5821 CASAVA_Build X 81785725 2D AATTTTTATG CT/-- CTGTTTCTCT 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 CT 2 1 5822 CASAVA_Build X 81787173 1I ATCTAGAAAC -/T TTTTTTTTTG 2699 het 2699 ref 26 15 7 4 T 9 10 5823 CASAVA_Build X 81801385 1I GATAGTTTTT -/C CAAGATCCCT 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 C 1 2 5824 CASAVA_Build X 81809659 1I TTGACTAGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1411 hom 39 3 29 7 T 9 10 5825 CASAVA_Build X 81814051 1D TTTAACGATT A/- AAACACAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 4 3 5826 CASAVA_Build X 81816324 1D ATTAAATCTG T/- TTTTTTTTTG 1107 het 1107 ref 42 32 3 7 T 10 9 5827 CASAVA_Build X 81821910 1I TAATAGTAAT -/A AGTGATGTTG 3070 het 3070 hom 57 23 31 3 A 1 2 5828 CASAVA_Build X 81823967 1D GACCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2849 hom 31 10 15 6 A 14 13 5829 CASAVA_Build X 81824895 1D ATGTTGAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 10 9 5830 CASAVA_Build X 81847083 1D TCTTTCGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 20 18 11 T 13 12 5831 CASAVA_Build X 81854775 1I20M10I TTAAAGGAAT -AAAATATATGCGTGTGCGTG----------/AAAAATATATGCGTGTGCGTGCATGTGTACA CATATGTATG 3070 het 3070 ref 28 25 9 6 N/A 0 0 5832 CASAVA_Build X 81866710 1I AATTGGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 10 11 5833 CASAVA_Build X 81871739 7D TGGGCTACAG TCACACC/------- TCACACCTCA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 TCACACC 2 1 5834 CASAVA_Build X 81874182 1I GCTCCAACAT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 32 9 14 9 A 7 8 5835 CASAVA_Build X 81881994 1D CATTTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 16 11 5 A 17 16 5836 CASAVA_Build X 81885272 1D ATAGTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 1918 het 1918 ref 36 17 6 15 T 15 14 5837 CASAVA_Build X 81887413 1I CGTGAACTTG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 21 9 12 0 A 7 8 5838 CASAVA_Build X 81890384 1D GGAAAAATGT G/- GGGGACAAAC 3070 hom 108 het 48 0 37 13 G 5 4 5839 CASAVA_Build X 81901162 1I TTCTGCCAAA -/C ATCTGTGGGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 C 0 1 5840 CASAVA_Build X 81902873 20I GCTCCCCACC --------------------/TGCCTCGACAGGCCCCGGTG TGTGTTGTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TGCCTCGACAGGCCCCGGTG 0 1 5841 CASAVA_Build X 81903954 1D AATAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1887 het 837 hom 23 6 5 13 T 15 14 5842 CASAVA_Build X 81911839 5I GTTTGTTGGC -----/CATTG GTATATCTTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 CATTG 0 1 5843 CASAVA_Build X 81914055 1D TTTTGTCTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 T 10 9 5844 CASAVA_Build X 81915799 1I TCAGTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2818 hom 29 9 15 5 T 11 12 5845 CASAVA_Build X 81916012 1I TCATTTTTTT -/A AATTTCATTA 2953 het 2953 ref 22 8 7 7 A 2 3 5846 CASAVA_Build X 81928110 1I AGAATGGCTC -/T TAGAGAAACA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 1 2 5847 CASAVA_Build X 81929417 1I ACTAAACCTC -/T TTTTTTTTTT 2539 het 2539 ref 26 12 9 5 T 11 12 5848 CASAVA_Build X 81966907 13I AGCACATTTG -------------/TAAGCCTCACTTA TAAGCCTCAC 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 TAAGCCTCACTTA 1 2 5849 CASAVA_Build X 81971576 1I GGTTGCCATT -/C CCCCATACTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 C 4 5 5850 CASAVA_Build X 81976081 4D GCTGAAAAAT AAAG/---- AAAGAAATTA 3070 het 3070 hom 49 16 28 7 AAAG 2 1 5851 CASAVA_Build X 81989111 1I AGAATTGGAG -/T TTTTTTTTGT 2896 het 2896 ref 22 11 6 5 T 8 9 5852 CASAVA_Build X 81995395 2I CTGAAGGAGA --/AT ATATATATAT 2082 het 2082 ref 17 7 6 4 AT 6 7 5853 CASAVA_Build X 82002347 16D5M4D TATCCATTAA AATTTTAATGGATATTAAACTTTAA/----------------CAACT---- AATCCAAGTT 3070 het 3070 hom 21 7 15 3 N/A 0 0 5854 CASAVA_Build X 82015581 1I ACAAATAATA -/G TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 G 0 1 5855 CASAVA_Build X 82056684 5D GGGCTGGAGA TCTCT/----- TCTTTCTAGC 3070 het 3070 hom 45 20 21 5 TCTCT 1 0 5856 CASAVA_Build X 82058522 1D AAATTTCATT A/- AAAAAACTAG 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 7 6 5857 CASAVA_Build X 82061799 1D TAAGCATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 10 9 5858 CASAVA_Build X 82070042 1D CTAAGACAGA C/- CTCTTTGTCT 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 C 2 1 5859 CASAVA_Build X 82072251 1D GTTCTCAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 11 10 5860 CASAVA_Build X 82076132 1D ATGCAGCCGT A/- AAAAAAGATC 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 A 7 6 5861 CASAVA_Build X 82080215 1I ATCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 T 13 14 5862 CASAVA_Build X 82089455 1D GTTTTTTTTT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 A 8 7 5863 CASAVA_Build X 82091509 2D TATTTACAAT AA/-- AAAAAAAACC 839 het 839 ref 16 9 3 4 A 10 8 5864 CASAVA_Build X 82092400 1I TGATTTTTTT -/A AAATTATTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 3 4 5865 CASAVA_Build X 82094742 1D CACAGTACAC A/- AAAATGGCTC 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 A 5 4 5866 CASAVA_Build X 82097134 1D TAAGCAGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 10 9 5867 CASAVA_Build X 82097417 2I AAACAAAAAC --/AA AAAAATTTAT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 5 7 5868 CASAVA_Build X 82100186 1D TGTTTATTTA T/- TTTTTTGACA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 7 6 5869 CASAVA_Build X 82103609 3I TAAAACCTGA ---/ATC ATCAACTCAG 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 ATC 1 2 5870 CASAVA_Build X 82104206 1D TATTATAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 A 9 8 5871 CASAVA_Build X 82104504 1D TGAAGGAAAC T/- TTCCCTCACT 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 T 3 2 5872 CASAVA_Build X 82117172 1D CCTTCTCACT C/- CTTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 C 2 1 5873 CASAVA_Build X 82119529 3D AAATCTGATA AAC/--- AACTTTAACA 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 AAC 2 1 5874 CASAVA_Build X 82120354 1I CGTAGAGAAT -/A GGAGAAAATA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 A 0 1 5875 CASAVA_Build X 82124572 4I AAATTAAAAC ----/AATA AATAAATAAA 3070 het 2872 hom 17 7 8 2 AATA 3 4 5876 CASAVA_Build X 82126168 1D TTCTGCCACT G/- GCCCCTCCCA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 G 2 1 5877 CASAVA_Build X 82130957 5I ACACTTTCAT -----/CTTAA CTTAAGTTAC 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 CTTAA 1 2 5878 CASAVA_Build X 82131918 1I TTATCCTCTT -/C TGTGTAGTCT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 0 1 5879 CASAVA_Build X 82134737 1I AATTTAAAAT -/A TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 A 0 1 5880 CASAVA_Build X 82141387 1D ATCAGGGAAG A/- AAAAGGTTCT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 5 4 5881 CASAVA_Build X 82146272 1D GTTTTGGTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 18 hom 30 1 21 8 T 10 9 5882 CASAVA_Build X 82148251 1I TAAAAAAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 9 10 5883 CASAVA_Build X 82148499 1D AAGAAGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1604 hom 29 5 16 8 T 12 11 5884 CASAVA_Build X 82148888 1D AGGAAAGGTG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 89 het 34 0 30 5 A 9 8 5885 CASAVA_Build X 82152414 15I CACTTTCAAC ---------------/AACATCGTTCGGAAT AACTATTGTA 3070 hom 148 het 54 0 50 5 AACATCGTTCGGAAT 0 1 5886 CASAVA_Build X 82159054 4D TTTTGAAAAT AGAG/---- AGAAGTGACT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 AG 3 1 5887 CASAVA_Build X 82159420 1D GAAGAGTAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 5888 CASAVA_Build X 82169206 1D GAATTACCCC T/- ATCTCTCTAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 0 5889 CASAVA_Build X 82178721 1D AGGTAAAAGA T/- CCTTACAAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 1 0 5890 CASAVA_Build X 82185419 7D4M2D TGGCTTATTT CACTTAACATGAT/-------CATG-- GACCTCCAAT 3070 het 3070 ref 56 32 25 9 N/A 0 0 5891 CASAVA_Build X 82185565 1D AGATGCTTCC A/- AATCTTGGCT 3070 hom 126 het 46 0 40 6 A 3 2 5892 CASAVA_Build X 82193343 1D TACTTGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 13 9 T 11 10 5893 CASAVA_Build X 82199628 1D TCTCCCCCAA T/- TTTTTTTTTT 1641 het 1641 ref 34 14 7 13 T 17 16 5894 CASAVA_Build X 82209940 3D TCAACTTATT ATC/--- ATCATCATCA 3070 hom 120 het 49 0 41 10 ATC 5 4 5895 CASAVA_Build X 82213009 4D TTCAGCATTT ACAA/---- ACATTTATTA 3070 het 3070 hom 33 12 16 9 ACAA 1 0 5896 CASAVA_Build X 82230092 1I ATTTTAGAGA -/T TTTTTTACCT 2931 het 2719 hom 14 6 6 2 T 6 7 5897 CASAVA_Build X 82243501 1D TTTAAATATA T/- TTTTTTATGG 3070 het 2731 hom 20 7 10 4 T 7 6 5898 CASAVA_Build X 82250713 2D GTGGGGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 32 0 27 6 TG 8 7 5899 CASAVA_Build X 82296163 1D TCAAATAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 A 11 10 5900 CASAVA_Build X 82307271 1D ATTTTTTCTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 T 8 7 5901 CASAVA_Build X 82309710 1I CTTTGGGAGA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 6 7 5902 CASAVA_Build X 82331797 1I CTTGTGACTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 50 23 22 5 T 8 9 5903 CASAVA_Build X 82332693 1D TTTCTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 11 10 5904 CASAVA_Build X 82345152 1I GATTGCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 15 10 T 11 12 5905 CASAVA_Build X 82351611 1I ATTTGCTTCG -/A AAAAAAATCA 2269 het 2269 ref 20 8 7 5 A 7 8 5906 CASAVA_Build X 82352701 8D TTTTCCACTC CATCAGGT/-------- CATCAGGTCA 3070 het 3070 ref 44 29 11 4 CATCAGGT 2 1 5907 CASAVA_Build X 82359245 1D GCTCCACTGG C/- AAATTCCATC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 C 1 0 5908 CASAVA_Build X 82360709 1I GATTATTAAG -/A AAAAAAGGAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 6 7 5909 CASAVA_Build X 82368474 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 9 10 5910 CASAVA_Build X 82370659 1I AGGCCCATTT -/G TTGAATATGG 3070 het 3070 hom 53 19 30 4 G 0 1 5911 CASAVA_Build X 82381189 1D AACATACAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 10 9 5912 CASAVA_Build X 82398823 1D GCTGCTCTTA T/- TCTTATTCTC 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 T 2 1 5913 CASAVA_Build X 82403074 1I GAGATTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 11 12 5914 CASAVA_Build X 82422978 1D TCATTGTTGG A/- CATTTGGGTT 3070 het 1508 hom 13 4 9 0 A 1 0 5915 CASAVA_Build X 82460167 1I TGCCCTGTGT -/C CCAGCTGCTA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 C 2 3 5916 CASAVA_Build X 82476819 1I CTACAGAATT -/A GTACCAATAT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 A 0 1 5917 CASAVA_Build X 82477698 1I CTAAGATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 479 hom 35 2 25 8 A 12 13 5918 CASAVA_Build X 82478240 1D TTTCTTTCAA G/- GAAATTACAT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 2 1 5919 CASAVA_Build X 82485847 1I GCATTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 13 14 5920 CASAVA_Build X 82538570 2I GCTAAAATCA --/AC ACAAAGAAAT 3070 het 2447 hom 17 6 9 2 AC 1 2 5921 CASAVA_Build X 82541809 1D AAGCAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 10 9 5922 CASAVA_Build X 82547838 1I AGACCCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 48 3 36 9 A 13 14 5923 CASAVA_Build X 82567260 1I AACTAGCAAC -/A CAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 0 1 5924 CASAVA_Build X 82580775 1I CTCTGAGGAG -/C CCCACTCATC 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 C 3 4 5925 CASAVA_Build X 82587554 2D CATATATATG TA/-- TATATATATA 2164 het 2164 ref 16 9 6 1 TA 7 6 5926 CASAVA_Build X 82589928 1D TGCATTGAAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 21 8 3 T 9 8 5927 CASAVA_Build X 82605674 1D TTAAAATCAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 42 20 14 9 A 9 8 5928 CASAVA_Build X 82607933 1D AGTTAGAAAT A/- AAAAAAAAAT 2178 het 2178 ref 25 14 6 6 A 10 9 5929 CASAVA_Build X 82644629 1D GCTATGACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2834 hom 19 6 12 1 T 10 9 5930 CASAVA_Build X 82647934 1I AGCAGTAAAG -/A AATGAGTTCC 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 A 2 3 5931 CASAVA_Build X 82651299 5D CTTTCCTTTC CCCTT/----- CCCTTCCCTT 3070 het 3041 hom 41 13 18 12 CCCTT 4 3 5932 CASAVA_Build X 82665084 1I TTTGAGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 T 12 13 5933 CASAVA_Build X 82680710 1D TTTTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 1771 het 1771 ref 42 28 6 8 T 13 12 5934 CASAVA_Build X 82702169 1D TTCTCTTAAA T/- TTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 6 5 5935 CASAVA_Build X 82712373 2I TGTTTTGTGT --/TC TAACATACGG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 TC 0 1 5936 CASAVA_Build X 82730492 1I TTCTCACCTA -/G GTCAGTGGGG 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 G 1 2 5937 CASAVA_Build X 82773448 1I TGAATCCAAT -/G GGGGGGGGCA 3070 het 3070 ref 51 23 16 12 G 8 9 5938 CASAVA_Build X 82799934 1D TTTCCTTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 9 8 5939 CASAVA_Build X 82824336 1I TATCCATTAG -/T TTTTTTTTTT 2275 het 2275 ref 30 15 6 9 T 11 12 5940 CASAVA_Build X 82830606 1I AGGGGGTATG -/A AAAAAAAAAA 2121 het 2121 ref 37 19 9 9 A 10 11 5941 CASAVA_Build X 82831097 1D GCATAGTGCT G/- CCTGAACTTA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 1 0 5942 CASAVA_Build X 82842690 1I AATAGAAAGT -/C CTTTCCCCAT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 C 1 2 5943 CASAVA_Build X 82847422 5D TTAGATACAA TATAT/----- TATATTGTAT 1733 het 1733 ref 12 7 5 0 TATAT 2 1 5944 CASAVA_Build X 82851023 1D TTTTTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 11 10 5945 CASAVA_Build X 82852848 6D TTTCCTATTT CCTGGC/------ CCTGGCCCTG 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 CCTGGC 2 1 5946 CASAVA_Build X 82871939 3D TTGTCATTAT ATA/--- ATATTATTGT 3070 het 3070 hom 36 14 21 3 ATA 2 1 5947 CASAVA_Build X 82891823 2D TTCAGAGACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 12 10 5948 CASAVA_Build X 82901799 1D AACACTACTG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 7 6 5949 CASAVA_Build X 82905143 1D TGGCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 15 12 A 12 11 5950 CASAVA_Build X 82908789 2D TTGGTATTCA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 76 hom 36 3 17 16 T 11 9 5951 CASAVA_Build X 82911098 1D TTTCCATAGG T/- TTTGGTATGG 3070 het 3070 hom 41 19 21 2 T 4 3 5952 CASAVA_Build X 82914117 1I GCCTGGCTAC -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 6 7 5953 CASAVA_Build X 82916037 1D ATAAAAAGTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 A 9 8 5954 CASAVA_Build X 82917228 1D AAGAATCAGG A/- AGAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 A 2 1 5955 CASAVA_Build X 82933345 1D AAACCAAGGG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 8 7 5956 CASAVA_Build X 82937267 1I GACACCAATC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 A 7 8 5957 CASAVA_Build X 82937978 1I AAGAAGAAAG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 27 15 12 0 A 7 8 5958 CASAVA_Build X 82940914 1D AAATAGCTAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 8 7 5959 CASAVA_Build X 82948167 1D TTCCCCCCCC T/- GAGGAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 15 17 9 T 1 0 5960 CASAVA_Build X 82962192 2D CAAATACATT AA/-- AAAAAAAAAA 2609 het 2609 ref 26 17 7 2 A 13 11 5961 CASAVA_Build X 82966402 2D AACACTTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 19 11 A 15 13 5962 CASAVA_Build X 82973082 5I TTATGTCCAG -----/TTTAT TTTAAGTCCA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TTTAT 0 1 5963 CASAVA_Build X 83012752 1I TGACATAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 A 9 10 5964 CASAVA_Build X 83018770 1D GATGGCACCA C/- CATCCAGCCA 3070 het 3070 hom 41 16 20 7 C 2 1 5965 CASAVA_Build X 83021407 2I ACAGACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 13 11 11 AC 6 7 5966 CASAVA_Build X 83049967 1I ATAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 10 11 5967 CASAVA_Build X 83050085 1D TAATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 12 9 T 15 14 5968 CASAVA_Build X 83056041 2I AATAGGAAAC --/TG TTTTTAAACA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TG 0 1 5969 CASAVA_Build X 83084768 1D TGGATGAGTT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 A 1 0 5970 CASAVA_Build X 83088432 1D GTCTGGTGGT A/- AAAAAAAAAA 1288 het 1288 ref 42 36 3 3 A 12 11 5971 CASAVA_Build X 83092873 1D CAATAGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 566 hom 29 2 19 8 A 13 12 5972 CASAVA_Build X 83098992 3I TGGCAGAGAC ---/ACA ACAACAACAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 ACA 4 5 5973 CASAVA_Build X 83120613 1D AACAAATCAG A/- AAAAAAAAAA 958 het 958 ref 32 26 4 2 A 13 12 5974 CASAVA_Build X 83145780 1I AATAAAAAAG -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 53 25 26 2 A 6 7 5975 CASAVA_Build X 83172273 1I TATCTATTCT -/C CTAACATTGG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 1 2 5976 CASAVA_Build X 83192616 2I AGTTTTATGT --/TC TTTTTCTTGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TC 0 1 5977 CASAVA_Build X 83198447 1I TTTGTTCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 31 2 20 9 A 12 13 5978 CASAVA_Build X 83201319 1I ACATTCTCTA -/T TAATTGTCCA 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 T 1 2 5979 CASAVA_Build X 83203193 1I TTTTTCCCAC -/A AAAAATCCCC 3070 het 3070 hom 43 12 25 6 A 5 6 5980 CASAVA_Build X 83237293 5D TTTTGGATAT ATTAG/----- ATTAAACAAC 3070 het 3070 ref 26 14 10 4 ATTAG 1 0 5981 CASAVA_Build X 83252839 2D AAAAATGAAC AA/-- AGTCTTTGAG 2466 het 1446 hom 13 4 7 3 A 3 1 5982 CASAVA_Build X 83286015 1I ACAATCCAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 9 10 5983 CASAVA_Build X 83291748 1D GCTTCTTTCC T/- TTTTCTCTTC 3070 het 3070 hom 52 15 26 11 T 5 4 5984 CASAVA_Build X 83311093 1I CTGAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 A 13 14 5985 CASAVA_Build X 83318334 4D GTGAAGAAAC TGAT/---- TAATTAAATA 3070 het 3070 hom 40 17 21 4 TGAT 1 0 5986 CASAVA_Build X 83345705 1D TTATTACACA T/- TTTTTGGTAC 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 T 6 5 5987 CASAVA_Build X 83357009 1D AGTATGAAGG T/- TCCTCAAAAA 3070 het 3070 hom 53 21 28 4 T 2 1 5988 CASAVA_Build X 83358403 1I CCCGTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 52 1 41 10 A 11 12 5989 CASAVA_Build X 83371450 1D TTGTTCAAGG T/- TTTTTTTTTT 2847 het 2847 ref 21 11 8 2 T 12 11 5990 CASAVA_Build X 83382002 1D CAGAAGGGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 A 10 9 5991 CASAVA_Build X 83397257 1I ATTTTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 36 1 28 7 A 10 11 5992 CASAVA_Build X 83414470 1D TCTATACATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 44 3 26 16 A 15 14 5993 CASAVA_Build X 83429984 3D ATGTTTTCTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 35 0 28 11 T 15 12 5994 CASAVA_Build X 83431974 1D TGTATGTTGA T/- TTTTGTATCC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 5 4 5995 CASAVA_Build X 83447338 36I GGATGGATAC ------------------------------------/TGCATTCTCTAGAATGTGTTTCACATTGCATGCCTG TATCAAAACA 3070 hom 99 het 27 0 34 0 TGCATTCTCTAGAATGTGTTTCACATTGCATGCCTG 0 1 5996 CASAVA_Build X 83448897 1I CCTGATTTCC -/A GCAAACATTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 0 1 5997 CASAVA_Build X 83449251 1I ATGGCGTGAA -/C CTGGGAGGCG 2334 hom 15 het 6 0 6 1 C 1 2 5998 CASAVA_Build X 83449963 1I ATAAAAATAG -/A TTAGTTTATC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 5999 CASAVA_Build X 83469867 2I TACCAAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 519 hom 21 2 17 2 AT 6 7 6000 CASAVA_Build X 83471126 1I GCAATCCTAC -/T TTGAGGTATT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 2 3 6001 CASAVA_Build X 83476319 1I AATCATGTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 565 hom 25 2 17 6 T 7 8 6002 CASAVA_Build X 83488770 1D AAAGTAAATG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 9 8 6003 CASAVA_Build X 83495313 4I AATGTTTCCC ----/AGAT AGATAGCTGG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGAT 1 2 6004 CASAVA_Build X 83506764 1I TCCTGATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 9 10 6005 CASAVA_Build X 83521904 1I GCCTCCCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 A 11 12 6006 CASAVA_Build X 83526210 1D ACTTGTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1216 hom 33 4 24 5 T 15 14 6007 CASAVA_Build X 83533169 1D CTGCTATTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 5 T 10 9 6008 CASAVA_Build X 83534483 1D TATATACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 11 10 6009 CASAVA_Build X 83535614 1I TCATCTTTTC -/A AAAAACCAAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 6 6010 CASAVA_Build X 83536434 2I TCTCTTTTCA --/CT GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 CT 0 1 6011 CASAVA_Build X 83537025 1D TATTGGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 37 1 22 14 T 12 11 6012 CASAVA_Build X 83552623 3I TGCATAGAGG ---/TGT TGTTCATAAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TGT 1 2 6013 CASAVA_Build X 83556261 1D TGTTCTTACT A/- AATAAGGGCT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 3 2 6014 CASAVA_Build X 83563213 2D TAGTGTGGAC AA/-- AGTGAGTCCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 A 3 1 6015 CASAVA_Build X 83570944 1D TAGGGAAAAT G/- ATATCTTAGC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 1 0 6016 CASAVA_Build X 83571704 3D ATTCAGTATC CTT/--- CTTTTAGCTA 3070 het 3070 ref 40 22 12 7 CTT 2 1 6017 CASAVA_Build X 83572349 1I GTATTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 T 10 11 6018 CASAVA_Build X 83578497 1D TTTGCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 272 hom 44 2 34 8 T 13 12 6019 CASAVA_Build X 83581037 2D CTGTTCATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 48 0 38 12 T 12 10 6020 CASAVA_Build X 83591770 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2800 hom 23 7 13 3 A 9 10 6021 CASAVA_Build X 83614691 1D TATTCATAGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 8 7 6022 CASAVA_Build X 83626194 1I ACCTCCCACA -/G GGTCCCGCCC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 G 2 3 6023 CASAVA_Build X 83641455 2I CAAGTAAAAC --/TT GAGCTCTGCA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 0 2 6024 CASAVA_Build X 83671742 1I GAAAAGATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 9 10 6025 CASAVA_Build X 83679136 1I GACTTTAGAA -/C TTTTTTTGTC 3070 hom 102 het 44 0 34 10 C 0 1 6026 CASAVA_Build X 83684181 1I ATCGAATTAT -/G GGGGGTGGTT 3070 hom 120 het 45 0 39 6 G 5 6 6027 CASAVA_Build X 83685120 3I TAAATAAAAA ---/TTG TTTAGTTTAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TTG 0 1 6028 CASAVA_Build X 83703345 1I ATAATAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 9 6029 CASAVA_Build X 83710334 5D TTCTAAACTG AATAA/----- ACCTTGAATA 3070 hom 87 het 32 0 27 6 AATAA 1 0 6030 CASAVA_Build X 83716895 1I CAGAGACAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 10 6031 CASAVA_Build X 83720374 1I TTTTTTTTTT -/G GTAATGGCCA 3070 hom 90 het 36 0 29 7 G 1 2 6032 CASAVA_Build X 83725440 1I AAAACAGTCT -/G GGGGTGAGTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 4 5 6033 CASAVA_Build X 83731776 1I GAGACACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 29 2 24 3 A 11 12 6034 CASAVA_Build X 83736485 1I AAAAAAAAAA -/T GAGACATCAC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 0 1 6035 CASAVA_Build X 83739344 5D CCTGAAACTC AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 144 het 56 0 49 7 AAAAT 3 2 6036 CASAVA_Build X 83742530 1D AAAATTTTAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 30 het 13 0 11 3 A 9 8 6037 CASAVA_Build X 83744320 1D ACAATATTGA C/- TTTTCCAACC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 1 0 6038 CASAVA_Build X 83751027 1I AATCAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 11 12 6039 CASAVA_Build X 83751440 1I TTACATTGCT -/A GGGGGGATGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 1 6040 CASAVA_Build X 83780415 1I AAATAGAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 9 10 6041 CASAVA_Build X 83792054 1I AGTTTAATTG -/T TTTTTATTTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 5 6 6042 CASAVA_Build X 83796438 2I CTTTATCCCC --/CT CTTTTTAGCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CT 1 2 6043 CASAVA_Build X 83797517 9I ACATATCATT ---------/GGTTCTCCA GGATTTGTCT 3070 hom 99 het 34 0 34 1 GGTTCTCCA 0 1 6044 CASAVA_Build X 83800551 1D GGAAAAAAAA G/- TCACTTAAAA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 G 1 0 6045 CASAVA_Build X 83805488 5D TTCATCTGTT GGTGG/----- ATATTTACGT 3070 hom 96 het 36 0 33 7 GGTGG 1 0 6046 CASAVA_Build X 83806670 2D ACTTCATCTC AA/-- AGATTTATTA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 3 1 6047 CASAVA_Build X 83806879 1I TGAGGTCAAC -/T TTTTTTAGAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 6 7 6048 CASAVA_Build X 83808371 1D GTATCTTATA T/- TTTTATAGCT 3070 hom 93 het 34 0 32 4 T 5 4 6049 CASAVA_Build X 83810306 2D ACTTCCTTTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 58 het 25 0 20 5 T 11 9 6050 CASAVA_Build X 83821298 1D TTGCGGGGGG T/- TGGGGGGGGA 3070 hom 50 het 24 0 18 7 T 2 1 6051 CASAVA_Build X 83823711 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2051 het 51 hom 8 1 7 0 A 15 14 6052 CASAVA_Build X 83828052 1I ATGAGAACAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 6053 CASAVA_Build X 83832137 1D TAAATGCCTT A/- AGGAAATCAG 3070 hom 123 het 45 0 41 7 A 2 1 6054 CASAVA_Build X 83836329 1I TATTATTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 888 hom 31 2 25 4 A 10 11 6055 CASAVA_Build X 83846764 1I AAGAGAATTT -/A ATAAATATTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 2 6056 CASAVA_Build X 83847611 1D CATGAAAAGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 56 32 15 10 T 9 8 6057 CASAVA_Build X 83847872 1I CTGTAATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 41 2 25 14 T 13 14 6058 CASAVA_Build X 83849644 1D CTCACAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 39 1 30 8 T 12 11 6059 CASAVA_Build X 83854369 1D GGGAAAACTA C/- CTTTTGACTT 3070 het 3070 hom 46 14 26 6 C 2 1 6060 CASAVA_Build X 83857779 1D ATTGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 43 4 26 13 T 15 14 6061 CASAVA_Build X 83859905 1I TACAGTCAGA -/T TTTTGACTAT 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 T 4 5 6062 CASAVA_Build X 83864787 7D AGATGTTCTT TGGTGTC/------- TGAGCATTGA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 TGGTGTC 1 0 6063 CASAVA_Build X 83879822 1D AGTGAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1573 hom 34 6 20 8 T 11 10 6064 CASAVA_Build X 83882321 1I8M1I GCCCTGCAGG -CAACAGGG-/CCAACAGGGC CGCAGCTCCA 3070 hom 75 het 26 0 24 4 N/A 0 0 6065 CASAVA_Build X 83882448 1I CCAGGCTGTG -/C CCCCTCTGCG 3070 hom 47 het 20 0 14 6 C 4 5 6066 CASAVA_Build X 83894695 2D GAATGAGCTA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AC 9 8 6067 CASAVA_Build X 83908182 1I CTGTTATATG -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 7 6068 CASAVA_Build X 83910507 1I AAGATTCCTT -/G GCCCAGCCCT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 1 2 6069 CASAVA_Build X 83915460 1I GTGCGCTGCA -/C CCACTAACGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 2 3 6070 CASAVA_Build X 83933636 1I GGACAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 11 12 6071 CASAVA_Build X 83934698 1D AGTGGAAAAC A/- AAAAAAAAGC 558 het 558 ref 46 32 2 12 A 9 8 6072 CASAVA_Build X 83934760 1I CAACAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 33 1 26 6 A 12 13 6073 CASAVA_Build X 83941280 1D TTTTTCAATA T/- TTATTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 3 2 6074 CASAVA_Build X 83942050 3D TTCATTTATC ATA/--- ATAACCTCCA 3070 het 3070 ref 35 24 9 3 ATA 2 1 6075 CASAVA_Build X 83944854 1D TTTGTTTTAA T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 7 6 6076 CASAVA_Build X 83967460 1D AGTTTTCTCT A/- ATATGTGTCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 1 6077 CASAVA_Build X 83970138 3D TTTCTTTAAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 38 0 25 14 T 15 12 6078 CASAVA_Build X 83971088 20D CCGTAAGGCA TCCCTACACTTATTAGAATG/-------------------- CTACAGATAA 3070 het 3070 ref 28 18 15 2 TCCCTACACTTATTAGAATG 1 0 6079 CASAVA_Build X 83976809 2I ACAGATTCAC --/TT TATTTTTTCT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 1 3 6080 CASAVA_Build X 83984936 1I GAAGCTGGAG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 7 8 6081 CASAVA_Build X 84000838 1I CCCCAGAGCA -/T TTTTACCTTT 1159 het 1159 ref 21 14 3 4 T 4 5 6082 CASAVA_Build X 84004801 1I GTCAACCGAA -/G GGAGGTTCAG 3070 hom 96 het 37 0 30 7 G 2 3 6083 CASAVA_Build X 84008080 2D GCAAGATTAA AT/-- ATGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 31 11 19 2 AT 2 1 6084 CASAVA_Build X 84013629 1I TTCTTTTAAG -/T TTTTTTTGCG 2204 het 1181 hom 8 3 5 0 T 7 8 6085 CASAVA_Build X 84026408 1D TTCCCTCAAG A/- ATACTAATAA 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 A 2 1 6086 CASAVA_Build X 84026646 1I AAGCTTCATA -/C AAGCTTCCCC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 C 0 1 6087 CASAVA_Build X 84033082 2D ATGACACTGG AA/-- AAAGTGTCTC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 5 3 6088 CASAVA_Build X 84039257 1I GAAGCCCACC -/T TTTGATGATT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 3 4 6089 CASAVA_Build X 84039887 4I GTGAAGAGAC ----/CCAT CCATTCTCTG 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 CCAT 1 2 6090 CASAVA_Build X 84048538 4I TTTTAGTGGT ----/AGAG AGAGTTACAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AG 2 4 6091 CASAVA_Build X 84049247 1I TATTTACCTA -/C TATTTTGGTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 C 0 1 6092 CASAVA_Build X 84059835 1D AATTTTAAAC A/- AAAAGAACAA 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 A 5 4 6093 CASAVA_Build X 84060199 1I ACCTAGAATA -/C ACCATTCTGG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 C 0 1 6094 CASAVA_Build X 84060313 1D TTCCGCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 41 4 16 21 A 12 11 6095 CASAVA_Build X 84062772 1D GCCAATATCA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3022 hom 24 9 14 1 T 8 7 6096 CASAVA_Build X 84064143 12I GATCTTACAC ------------/CTCCCTGGTTAT CTGTATTGCT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 CTCCCTGGTTAT 0 1 6097 CASAVA_Build X 84065552 1D AGTGCTATAA T/- TTTTTTTTTT 2701 het 968 hom 31 7 6 18 T 17 16 6098 CASAVA_Build X 84072067 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1948 het 467 hom 21 1 9 11 A 15 16 6099 CASAVA_Build X 84074260 1D TTGGAAAACC A/- AAAACCATAT 3070 het 3070 hom 51 21 22 9 A 5 4 6100 CASAVA_Build X 84080122 1I TATGTGTATT -/A GGGGTAAGAT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 A 0 1 6101 CASAVA_Build X 84097937 4I AAAAAGCATT ----/TGAC TAGTCTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 TGAC 0 1 6102 CASAVA_Build X 84105290 10I CCAACTTTTT ----------/TGCCTTTTAC TGTTAGACAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 TGCCTTTTAC 0 1 6103 CASAVA_Build X 84115788 1I GCGTGAGCCA -/C CGTGCCCGGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 2 6104 CASAVA_Build X 84121023 1I GTTGCGGTGA -/G CCAAGATCGT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 0 1 6105 CASAVA_Build X 84125790 1D ATGTGATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 12 11 6106 CASAVA_Build X 84129114 1I49M1I5M1I24M1I10M1I CACTTTGGGG -ACTTCAAGCATTTCAGGGGTCCGAATATGCTGAACATAACTTCAGAAGA-CACTA-TTACTCCTTTCCACTATATAGATG-TGAGAAAATA-/AACTTCAAGCATTTCAGGGGTCCGAATATGCTGAACATAACTTCAGAAGAGCACTATTTACTCCTTTCCACTATATAGATGTTGAGAAAATAT TGATATGTTT 3070 hom 102 het 27 0 34 18 N/A 0 0 6107 CASAVA_Build X 84133851 2I TACATATGTA --/AC CAACCTGCAC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 AC 0 1 6108 CASAVA_Build X 84134577 1I AAGAGATAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 8 9 6109 CASAVA_Build X 84141979 1D GTCTGTTGTT C/- CCCTCTTTAT 3070 het 3070 hom 36 11 14 11 C 4 3 6110 CASAVA_Build X 84147137 1I AGTCTATTTT -/A AATAACTCTT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 2 3 6111 CASAVA_Build X 84147997 1D CATTTTACAG A/- TGGAAAAACG 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 A 1 0 6112 CASAVA_Build X 84156229 4D TTATCTCTCC TTTA/---- TTTATGAAGT 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 TTTA 2 1 6113 CASAVA_Build X 84158315 1D TGTGTCTTCA G/- TGGAGTGCCG 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 G 1 0 6114 CASAVA_Build X 84160605 1D TTCCTTGATG T/- TTTCATTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 4 3 6115 CASAVA_Build X 84164304 6D TCAATGGTGA AAAGCT/------ AAAGCTAAAA 3070 het 3070 ref 58 27 26 9 AAAGCT 2 1 6116 CASAVA_Build X 84170403 9D TGTCCATGAA TTCAATGGT/--------- TTTGATTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 TTCAATGGT 1 0 6117 CASAVA_Build X 84185073 1I AGGCTGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 T 14 15 6118 CASAVA_Build X 84185917 2I CTCATATTTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2695 hom 25 10 11 4 TG 8 9 6119 CASAVA_Build X 84191450 4D CCGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 10 AAAC 4 3 6120 CASAVA_Build X 84191792 1D CCAGAAAGAT A/- AAACACTAAC 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 A 4 3 6121 CASAVA_Build X 84192269 1I ATATAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 1597 het 1597 ref 37 16 5 16 A 16 17 6122 CASAVA_Build X 84196206 4D TGATTAATTT ATTG/---- ATTATTTGTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 ATTG 1 0 6123 CASAVA_Build X 84213104 1D AAAGGATGGA T/- TTTTTTTTTC 1322 het 1322 ref 39 33 3 4 T 10 9 6124 CASAVA_Build X 84230480 49D CTCTTTTTAC AGTGAGCAAATTAGAAGAATAGGTTAGAAGAATAGGGTAGTAGATACTG/------------------------------------------------- TAGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 22 13 4 AGTGAGCAAATTAGAAGAATAGGTTAGAAGAATAGGGTAGTAGATACTG 1 0 6125 CASAVA_Build X 84241884 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 A 8 9 6126 CASAVA_Build X 84246140 1D TTTGTTCAAC T/- TTTTTTGGTG 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 7 6 6127 CASAVA_Build X 84254005 2D CAGAATCAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 CT 2 1 6128 CASAVA_Build X 84257588 2I AGGGTGAGCT --/GA GAGATCAGCC 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 GA 2 3 6129 CASAVA_Build X 84260204 1D AGAAGATTGG A/- AGACATTTAG 3070 het 3070 ref 45 28 15 2 A 2 1 6130 CASAVA_Build X 84301703 4I AGTCCCCCAG ----/TGTT TGTTAGAGCA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 TGTT 1 2 6131 CASAVA_Build X 84309685 1I AACTAAGAAC -/A AAAAAAAAAA 1212 het 1212 ref 39 29 3 7 A 11 12 6132 CASAVA_Build X 84402268 1D TAGCTGTTAG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2956 hom 24 10 10 4 C 10 9 6133 CASAVA_Build X 84483948 1D TCTGATTTTG A/- AAAATATTTT 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 A 5 4 6134 CASAVA_Build X 84495584 1I AATGTTTCAG -/A GTGCCCAACA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 0 1 6135 CASAVA_Build X 84550126 1I TTTCCCTCCA -/T TTTTTTTTTT 2161 het 2161 ref 27 10 9 8 T 13 14 6136 CASAVA_Build X 84558243 2I TGTAAACCAC --/TA TGTTAAACAA 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 TA 0 1 6137 CASAVA_Build X 84572937 1D AACTTACTGA T/- AAAAGCTAGG 3070 het 3070 ref 39 21 11 8 T 1 0 6138 CASAVA_Build X 84605804 1D AGTTGTTTTG A/- AAAAAACTCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 6 6139 CASAVA_Build X 84607036 5I GGAAGGAAAA -----/AAAAG AAGAGAAAAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AAAAG 0 1 6140 CASAVA_Build X 84607630 1I GAAATTCAAC -/A AAGAAACAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 3 6141 CASAVA_Build X 84617023 1D CTAAAATTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 9 8 6142 CASAVA_Build X 84619088 1D TTTATATGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 97 het 38 0 33 5 T 10 9 6143 CASAVA_Build X 84623472 1I TTGAAAAGGG -/A AAAAAAATGT 3070 het 6 hom 33 1 26 6 A 7 8 6144 CASAVA_Build X 84631896 1I GGAAAACTAT -/C CCCCCCCCCA 2329 het 2329 ref 28 11 8 9 C 9 10 6145 CASAVA_Build X 84638047 1I CTGTGCTAAG -/T TGCTTGATTT 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 T 1 2 6146 CASAVA_Build X 84646854 4I CTTGGAGATC ----/ACTT ACTTAGTTTA 3070 het 3070 ref 38 25 9 4 ACTT 1 2 6147 CASAVA_Build X 84649540 1D AAACTAGGCA T/- TTTTTTTTTT 1103 het 1103 ref 44 30 3 11 T 11 10 6148 CASAVA_Build X 84659780 1D ATAGCACAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 A 10 9 6149 CASAVA_Build X 84664572 1D GGTATGGATC T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 42 24 11 8 T 7 6 6150 CASAVA_Build X 84683454 1I CATTCAGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 9 10 6151 CASAVA_Build X 84744617 1D AATTTATATT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 8 7 6152 CASAVA_Build X 84766254 4D AGCAAAGTTT CAGG/---- ATACAAAATT 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 CAGG 1 0 6153 CASAVA_Build X 84785842 1D ACAAAGAAAC A/- AAAAAACAAG 3070 het 3070 ref 46 23 20 5 A 7 6 6154 CASAVA_Build X 84786136 1I TAGACTTTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 19 11 14 A 9 10 6155 CASAVA_Build X 84791053 1D ACTTGGAGTA T/- TGCTGTTCAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 T 2 1 6156 CASAVA_Build X 84814494 1D TTTCCCCAAT G/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 G 1 0 6157 CASAVA_Build X 84818820 2D AGTGTTCAGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 42 hom 21 2 12 7 T 11 9 6158 CASAVA_Build X 84822743 1I GAACTCCCTG -/A AAAAATCTCT 3070 het 3070 ref 44 29 15 0 A 5 6 6159 CASAVA_Build X 84839956 1I GTTTTCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 10 13 T 11 12 6160 CASAVA_Build X 84847663 2I ATTTATGTTT --/TA TATATATATA 2948 het 1283 hom 15 4 9 2 TA 6 7 6161 CASAVA_Build X 84854137 1D TTCTAGATCC T/- TGAGGAATCG 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 T 2 1 6162 CASAVA_Build X 84870167 1D GATTGAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2131 hom 19 6 10 3 T 11 10 6163 CASAVA_Build X 84876034 3D ACACCTCACA CGG/--- CAGGGTACTC 2891 het 1538 hom 10 4 6 0 CGG 1 0 6164 CASAVA_Build X 84877462 1I TTATCTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2535 hom 29 8 13 8 T 10 11 6165 CASAVA_Build X 84879477 1D ATGTTGAGCA T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 T 7 6 6166 CASAVA_Build X 84882945 1D CAACAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2289 hom 26 10 13 3 A 13 12 6167 CASAVA_Build X 84889640 3D TTTTTTATGG TGT/--- TGTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TGT 2 1 6168 CASAVA_Build X 84893034 1D GGTCCTGGAC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 2863 hom 22 6 11 5 T 8 7 6169 CASAVA_Build X 84901706 1D GTAATAGTCT C/- CCCCTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 C 5 4 6170 CASAVA_Build X 84903658 1I ATGCTTAATT -/A TAAGCAATAT 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 A 0 1 6171 CASAVA_Build X 84918112 1I TTGTTTTTTT -/A AAAAAGGTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 5 6 6172 CASAVA_Build X 84922746 1I AAAAAAAAAA -/C CCCAGTTAAA 3070 het 3030 hom 29 11 10 8 C 3 4 6173 CASAVA_Build X 84949160 1I GAGCTTCAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 7 8 6174 CASAVA_Build X 84952032 4D CTGTCTTCTT TAAA/---- TAGTCTGAGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 TAAA 1 0 6175 CASAVA_Build X 84970421 1I AAAGTGACTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 A 7 8 6176 CASAVA_Build X 85029845 1I ATGGGCCAGG -/C CCAGGGCCCC 3070 hom 60 het 23 0 19 4 C 2 3 6177 CASAVA_Build X 85039102 1D GTGTGCGTGT A/- CAAGAGCACT 3070 het 3070 hom 32 10 21 1 A 1 0 6178 CASAVA_Build X 85053722 1I GAAAACAAGC -/A AAAAAAACCC 3070 het 383 hom 45 1 40 4 A 7 8 6179 CASAVA_Build X 85055089 12I AGAGGAGACT ------------/GGAGAGGGGAGG GGAGGACAGG 1920 het 1920 ref 21 13 5 3 GGAGAGGGGAGG 0 1 6180 CASAVA_Build X 85059466 1D AATCTGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 18 5 A 12 11 6181 CASAVA_Build X 85082288 1D TTATCCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 12 11 6182 CASAVA_Build X 85084417 3D CAATGTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTA 239 het 239 ref 23 12 2 9 T 12 9 6183 CASAVA_Build X 85087093 4D TGGCATCTCC CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 32 8 19 6 CT 8 6 6184 CASAVA_Build X 85088091 2I TGCACAACAT --/GC GCTCCCCATA 3070 het 3057 hom 44 12 16 16 GC 1 2 6185 CASAVA_Build X 85091998 5I TATATGAAAT -----/GAATA GAATAAATAA 2081 het 2081 ref 24 11 7 6 GAATA 1 2 6186 CASAVA_Build X 85099282 1D ATGGGGCTAT G/- GGAGCCCTTG 2369 het 2369 ref 20 12 6 3 G 3 2 6187 CASAVA_Build X 85099979 1I TTAATCTGCC -/T TTTGTGAGTT 3070 het 3070 ref 44 27 14 3 T 3 4 6188 CASAVA_Build X 85101042 1I TTCTAAAATA -/T TATTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 1 2 6189 CASAVA_Build X 85103278 1D TAAATGACTT A/- ACATTTTAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 2 1 6190 CASAVA_Build X 85106517 1D GCTTTATGAA T/- TTCTGTGATA 3070 het 3070 hom 36 14 15 9 T 3 2 6191 CASAVA_Build X 85110778 1I AAAATCTTTA -/T TTTTGGTATG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 4 5 6192 CASAVA_Build X 85111764 1I ATGTTCTCAC -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 A 6 7 6193 CASAVA_Build X 85144023 1D TGTCTGGGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 9 8 T 10 9 6194 CASAVA_Build X 85161648 1I GGAAAGACAG -/A ATGAGATTAA 3070 hom 163 het 62 0 54 8 A 1 2 6195 CASAVA_Build X 85173380 3I CATGCCCATA ---/ATC ATCCCAGCTA 3070 het 2123 hom 15 7 7 1 ATC 1 2 6196 CASAVA_Build X 85180980 3I GTGTAAAACT ---/TTA TTTTCTCTAT 3070 het 3070 ref 34 24 9 1 TTA 0 1 6197 CASAVA_Build X 85213808 1I ACACTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1871 het 1871 ref 32 10 7 15 T 15 16 6198 CASAVA_Build X 85237947 5D TTGTTTCTTG TTGTC/----- TTGTCTTCTT 3070 het 3070 ref 32 20 8 5 TTGTC 2 1 6199 CASAVA_Build X 85243501 4I TGACCACTGT ----/GAGA GAGAGACACA 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 GA 3 5 6200 CASAVA_Build X 85249404 1I CTCTGACATA -/C CCTGGAGGCA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 C 2 3 6201 CASAVA_Build X 85261014 1D CCCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 12 11 6202 CASAVA_Build X 85269896 1I ATGCATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 7 14 2 T 10 11 6203 CASAVA_Build X 85270038 1D TTAGTATGTG T/- TTTTTTTTTT 2831 het 2396 hom 24 8 6 10 T 13 12 6204 CASAVA_Build X 85282328 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1256 hom 16 5 9 2 A 11 12 6205 CASAVA_Build X 85283774 1I CAGTAAGAGA -/T CAGAAGAGTG 3070 het 3070 hom 55 24 26 5 T 0 1 6206 CASAVA_Build X 85284813 2D AAACTGAATT CA/-- AATTCAGTTC 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 CA 1 0 6207 CASAVA_Build X 85300537 4I AACTAAAAAT ----/AGTC AGTTATTAAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AGTC 0 1 6208 CASAVA_Build X 85306611 2I TTTAAAATAG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 9 11 6209 CASAVA_Build X 85312888 5D TCCACTCTTC CCTCT/----- CCTCTCCTCA 3070 hom 90 het 32 0 29 3 CCTCT 2 1 6210 CASAVA_Build X 85313128 1I AAGGTTACTT -/A AGAGACTGAG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 1 2 6211 CASAVA_Build X 85324469 1I TATCCATGAG -/C ATGGAATGTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 0 1 6212 CASAVA_Build X 85334734 1I TTAATTTTGT -/A AAATTAATTA 3070 het 9 hom 27 1 21 5 A 3 4 6213 CASAVA_Build X 85335490 1D TTAATCTGCT A/- TTTGTGAATG 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 A 1 0 6214 CASAVA_Build X 85347941 1I CCAAAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 1011 het 1011 ref 45 34 4 7 A 11 12 6215 CASAVA_Build X 85357259 1D TACCTAGTTT C/- CTTTGATTGA 3070 het 3070 hom 53 24 27 3 C 2 1 6216 CASAVA_Build X 85377791 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 979 hom 19 3 11 5 A 11 10 6217 CASAVA_Build X 85427662 1I TTTGCCTTGG -/C ATGGCATATC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 0 1 6218 CASAVA_Build X 85445388 4I GTGAACATAC ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 9 8 9 TA 7 9 6219 CASAVA_Build X 85457795 1D TTTGTATTTT G/- TTTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 G 1 0 6220 CASAVA_Build X 85464595 1I TTAGAGGACA -/T TTTTTCTCCT 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 T 5 6 6221 CASAVA_Build X 85466388 1I CAGGCGCCCG -/C CACCTTGCCT 3070 hom 24 het 11 0 8 3 C 1 2 6222 CASAVA_Build X 85466755 1I ACTGGGAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 8 9 6223 CASAVA_Build X 85489069 2D CGCAAAAGCG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 60 23 28 9 CA 7 6 6224 CASAVA_Build X 85497524 1I CCTTTGTCCA -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 T 6 7 6225 CASAVA_Build X 85500390 1D TTGGTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 10 9 6226 CASAVA_Build X 85501425 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 7 6 6227 CASAVA_Build X 85502358 3D ATCTATCTTT ATC/--- ATCTCTTTGA 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 ATC 2 1 6228 CASAVA_Build X 85504733 1D GATTTTAGGG A/- AAAAATATGT 3070 het 3070 hom 31 9 19 4 A 6 5 6229 CASAVA_Build X 85506032 1D AGAGCCTCAC A/- AATAAGCAGA 3070 het 3070 ref 56 33 21 2 A 3 2 6230 CASAVA_Build X 85506871 1D ACTTGTTCAA T/- TTTGCTAAAA 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 T 4 3 6231 CASAVA_Build X 85506996 1I ACTTGCATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 11 12 6232 CASAVA_Build X 85508880 3I GCATAAATTT ---/TAG TAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TAG 1 2 6233 CASAVA_Build X 85584310 1I GCATCTCCCC -/T AAGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 0 1 6234 CASAVA_Build X 85585164 1I TTTGAATGAA -/T TTTTTTTTTT 1703 het 1703 ref 38 22 7 9 T 15 16 6235 CASAVA_Build X 85595240 1D CCTGTTTGTC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 8 7 6236 CASAVA_Build X 85601542 5I TGATTATTTT -----/TGTTA TATTATTGAT 3070 hom 109 het 42 0 37 5 TGTTA 0 1 6237 CASAVA_Build X 85604954 1D ATCTAGTAGG A/- GAAATAATTC 3070 het 3070 ref 42 25 12 6 A 1 0 6238 CASAVA_Build X 85606001 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAGAATG 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 5 6 6239 CASAVA_Build X 85625491 1I ACCTAGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 9 10 6240 CASAVA_Build X 85629307 5I TTGATGAGAT -----/TTTAG TTTAATCAAC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TTTAG 0 1 6241 CASAVA_Build X 85639868 1I CTTAGGCCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 9 10 6242 CASAVA_Build X 85645752 1D ATGTTGGTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 114 het 41 0 37 4 T 9 8 6243 CASAVA_Build X 85647295 1I TAAGTTGTTT -/A AGCACTTGTA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 1 2 6244 CASAVA_Build X 85664305 3I GATGTTCCAA ---/AAT AATGAAGTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAT 1 2 6245 CASAVA_Build X 85668510 1I ACTTAATTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 31 0 22 9 T 9 10 6246 CASAVA_Build X 85703689 1D AAAATCTTTT G/- AAGGTGTTAT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 G 1 0 6247 CASAVA_Build X 85704789 2D GGTAATTATC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 115 het 44 0 41 3 T 11 9 6248 CASAVA_Build X 85713366 1D TAACGCAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 36 0 29 8 T 10 9 6249 CASAVA_Build X 85713981 1D ATTGAAATGC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 9 8 6250 CASAVA_Build X 85719987 1D GAAAAATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 39 0 34 5 T 12 11 6251 CASAVA_Build X 85723088 1D ACAGAGTGGC A/- AAGTGGGAGA 3070 hom 114 het 47 0 39 10 A 3 2 6252 CASAVA_Build X 85747934 3D20M1I GACATGAGAC ATTGTTAGATTTTTTATTTGAAG-/---GTTAGATTTTTTATTTGAAGT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 N/A 0 0 6253 CASAVA_Build X 85784832 1D CCAGGAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 19 1 13 6 T 15 14 6254 CASAVA_Build X 85791915 6D TACAAAAGAT TATAAC/------ TATACTACAG 3070 hom 85 het 31 0 29 4 TATAAC 1 0 6255 CASAVA_Build X 85793124 1I TGGTCCACTC -/G AGCATCACCT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 G 0 1 6256 CASAVA_Build X 85864179 1I GGCTAATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 11 12 6257 CASAVA_Build X 85876442 1D AATGAGCAAA T/- TTTTTATTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 3 T 6 5 6258 CASAVA_Build X 85895611 1D AAAAAAAAAA C/- AAATGTTCAA 3070 het 800 hom 33 5 21 7 C 1 0 6259 CASAVA_Build X 85911828 1D GAGCCACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 11 10 6260 CASAVA_Build X 85912261 3I TGACAGTTTC ---/CAT TATCATTATT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 CAT 0 1 6261 CASAVA_Build X 85918888 1I TCCTATTTCT -/C CACATCCTCT 3070 het 3070 ref 52 28 23 1 C 1 2 6262 CASAVA_Build X 85924554 1D CAATCAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 9 6263 CASAVA_Build X 85925959 1D ACATCCCCAA C/- AAAAAGTAAG 3070 hom 120 het 42 0 41 2 C 1 0 6264 CASAVA_Build X 85928042 9D TGATTATATC ACAGTTGAT/--------- ACCTGCAACC 3070 hom 126 het 46 0 41 8 ACAGTTGAT 1 0 6265 CASAVA_Build X 85930474 1I TAAGTTTCTC -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 6266 CASAVA_Build X 85946380 4I CCATTCTGAA ----/AGGG AGAAATTGTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AGGG 0 1 6267 CASAVA_Build X 85969696 4D TCTTTCAAGG AGTT/---- AGTTCATAGT 3070 hom 144 het 51 0 48 4 AGTT 2 1 6268 CASAVA_Build X 85973466 1I TATACAAAAA -/G AAAAAGTAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 6269 CASAVA_Build X 85981879 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAAGGA 3070 hom 58 het 24 0 20 4 AC 0 1 6270 CASAVA_Build X 85997976 1D CTTACCAATC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 8 7 6271 CASAVA_Build X 86011647 2D TTTCCTGTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 27 0 16 11 T 16 14 6272 CASAVA_Build X 86021389 5I CAGATCTTAG -----/AGGTC AGGCTTACAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AGGTC 0 1 6273 CASAVA_Build X 86023345 1D48M2D TTTTCTCTCC TTTTTTTTTTGTCAAAGAGATTTTCTCTGGTTATATAATTAATTTCTTGTT/-TTTTTTTTTGTCAAAGAGATTTTCTCTGGTTATATAATTAATTTCTTG-- TTTTTTTTTT 3070 hom 138 het 35 0 47 3 N/A 0 0 6274 CASAVA_Build X 86027416 2I ATGAATGAAT --/CA CAGACAGATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CA 1 2 6275 CASAVA_Build X 86072684 1I10M1I AAACAATTAA -TTAATTGGAT-/TTTAATTGGATA AATAAAAAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 7 N/A 0 0 6276 CASAVA_Build X 86084959 1D TATATTGGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 9 8 6277 CASAVA_Build X 86085610 1D ACGGTTTGTT C/- AACAAATTAC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 1 0 6278 CASAVA_Build X 86122877 1I ACAAAACCAC -/A AGGAAATCTG 3070 hom 129 het 52 0 43 9 A 1 2 6279 CASAVA_Build X 86136275 1I AGGTAGATTT -/C TAATGTTTTT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 C 0 1 6280 CASAVA_Build X 86189793 1I AGTCATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1098 hom 35 4 23 8 T 11 12 6281 CASAVA_Build X 86194761 4I TAGTTTCCTC ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 AT 6 8 6282 CASAVA_Build X 86199311 2D GCAACTTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 38 1 25 13 T 16 14 6283 CASAVA_Build X 86207528 3D ACAATATAAT AAC/--- AAAAGTAGAA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 AAC 1 0 6284 CASAVA_Build X 86207725 2D GTGTGTGTAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 74 het 34 0 25 10 AT 6 5 6285 CASAVA_Build X 86212933 1I CTGAGCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 41 1 31 9 A 11 12 6286 CASAVA_Build X 86216748 2I TATCAAATAA --/AC ACATTTAAGA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AC 1 2 6287 CASAVA_Build X 86217525 2I ATAACAAAAG --/TA TATATATATA 926 hom 7 het 5 0 3 2 TA 5 6 6288 CASAVA_Build X 86230532 1I TCAATGTACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1288 hom 47 6 32 9 A 13 14 6289 CASAVA_Build X 86235399 1I CTACATTTTA -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 7 8 6290 CASAVA_Build X 86235651 1D TTGTCAGATG T/- ATAGTTTATA 3070 hom 78 het 28 0 27 6 T 1 0 6291 CASAVA_Build X 86236009 1I TCCTCATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1433 hom 41 5 26 10 T 10 11 6292 CASAVA_Build X 86238034 5D TTAATTTTTG TGTAA/----- TGTAATTGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 9 TGTAA 2 1 6293 CASAVA_Build X 86241055 1D TTTAACTTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 9 8 6294 CASAVA_Build X 86251051 1D TTGGTGAGGG T/- GTTAAACTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 1 0 6295 CASAVA_Build X 86254028 2D TGCAAAATAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 11 9 6296 CASAVA_Build X 86266224 1D ACAATTATCT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 7 6297 CASAVA_Build X 86266886 1I GGTCCTGAAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 9 10 6298 CASAVA_Build X 86279853 1I AGAGAATACC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 9 6299 CASAVA_Build X 86282184 1D CTCTGTATAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 99 het 42 0 34 9 A 9 8 6300 CASAVA_Build X 86287474 4I TTTCACTTCT ----/TTGA TTAAGTTTAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTGA 0 1 6301 CASAVA_Build X 86294417 1I TTTGGATGGC -/T TTTATTTCTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 3 4 6302 CASAVA_Build X 86300459 1I TATCTGGATA -/C TCCCATATTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 0 1 6303 CASAVA_Build X 86304229 3D ATTTTGTGCT TTC/--- TTCTTTTTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TTC 2 1 6304 CASAVA_Build X 86308662 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 8 9 6305 CASAVA_Build X 86309021 31D GGCTCCCAAA ACCTTGAGCAGCTCTGTCCCTGTGGCTTTGC/------------------------------- AGAGCTCAGC 3070 het 3070 ref 40 27 18 2 ACCTTGAGCAGCTCTGTCCCTGTGGCTTTGC 1 0 6306 CASAVA_Build X 86311971 2D TAATAAAAAC AT/-- ATCTTTTAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AT 2 1 6307 CASAVA_Build X 86319090 1D AGCATAAAAA C/- CCTATAAGAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 3 2 6308 CASAVA_Build X 86327073 1I TGAACTTCAA -/T TTTTTTGGCA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 6 7 6309 CASAVA_Build X 86327196 1I GTATAATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 77 hom 28 1 24 3 A 9 10 6310 CASAVA_Build X 86331770 1I TATTTTTCCA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 9 6311 CASAVA_Build X 86333110 17D CCTGCAATAG TTGAAGCACTAGAATCA/----------------- TTGAAGCACT 3070 hom 84 het 41 0 29 18 TTGAAGCACTAGAATCA 2 1 6312 CASAVA_Build X 86333985 15I AGAGAGTGTG ---------------/CTAATGAGAAGTTAA CACTTTGGAA 3070 hom 84 het 30 0 29 3 CTAATGAGAAGTTAA 0 1 6313 CASAVA_Build X 86334816 1I CAAACTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 42 2 28 12 A 12 13 6314 CASAVA_Build X 86339184 1D TGCAGGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 35 1 26 8 A 13 12 6315 CASAVA_Build X 86339551 5I ATTGATTATT -----/AGGGG ATAGCAACAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGGGG 0 1 6316 CASAVA_Build X 86346652 2I TAAATTTATT --/AA GTTTTATAAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 0 2 6317 CASAVA_Build X 86349859 2D ATAGATAATC TT/-- AAGACTTTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 0 6318 CASAVA_Build X 86359822 2I TTAAAAGGAT --/AA AAAAAATATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 6 8 6319 CASAVA_Build X 86370416 2I TGAAAAGAGT --/TA TTTCTTAATT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TA 0 1 6320 CASAVA_Build X 86374558 1D CATCTGAATA C/- GGCTTTTAAT 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 C 1 0 6321 CASAVA_Build X 86386490 9I CTTTTTATTA ---------/TTATTATAT TTATTATATT 2887 het 2887 ref 23 11 7 5 TTATTATAT 1 2 6322 CASAVA_Build X 86394152 2I CAGGTACCAA --/TT TTTTGGAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 4 6 6323 CASAVA_Build X 86401478 1D TGAGCAATGC A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 26 12 14 3 A 8 7 6324 CASAVA_Build X 86416141 1I GGCCCTATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 9 10 6325 CASAVA_Build X 86421894 1I CTGCAGGGTC -/T TTTTTGTTGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 5 6 6326 CASAVA_Build X 86422234 1D TCACTGCACT G/- GGGGAAATCC 3070 het 3070 ref 36 19 10 8 G 5 4 6327 CASAVA_Build X 86423517 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2639 hom 22 7 11 4 T 10 9 6328 CASAVA_Build X 86425364 1D ACTTTCCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 9 6329 CASAVA_Build X 86440922 1D AAAAAGCCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 10 9 6330 CASAVA_Build X 86442585 2D GAGTGAAGAC TG/-- AGCCAGTCTG 3070 hom 112 het 46 0 35 13 TG 1 0 6331 CASAVA_Build X 86446830 1I GCCAATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 10 11 6332 CASAVA_Build X 86451575 1D CCGAAAAATG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 31 0 23 11 T 9 8 6333 CASAVA_Build X 86454763 1D GAGCTCACCT G/- GATAATCTAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 G 2 1 6334 CASAVA_Build X 86463098 1D TTAAATAGTG T/- TATTTCTCAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 2 1 6335 CASAVA_Build X 86465055 1D6M1D6M1I CAGCCTGGGC TAACAGATCCGAGA-/-AACAGA-GCGAGAC TCCGTCTCAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 N/A 0 0 6336 CASAVA_Build X 86466145 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 8 8 3 A 12 11 6337 CASAVA_Build X 86472333 2I CTAAAGACTT --/TC TCTCTGCAGC 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 TC 2 3 6338 CASAVA_Build X 86478638 4I AAAATATATA ----/TAAT TAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 TAAT 1 2 6339 CASAVA_Build X 86489459 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAAAG 2064 het 1072 hom 14 3 8 3 A 9 10 6340 CASAVA_Build X 86494634 1D GATAGGATAG T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 45 29 13 3 T 7 6 6341 CASAVA_Build X 86500721 1D AAGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 44 0 33 11 A 12 11 6342 CASAVA_Build X 86505581 1I TTAATGATCC -/A AAAAAATAGA 3070 hom 103 het 40 0 35 5 A 6 7 6343 CASAVA_Build X 86506661 1D TAATATCAGC A/- GCTGATTATA 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 A 1 0 6344 CASAVA_Build X 86507483 3D CATCCAAAAT AAA/--- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 A 9 6 6345 CASAVA_Build X 86525928 3I AACATAAATT ---/AAA AGAGTAATTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 4 6346 CASAVA_Build X 86526640 2I TTTTTCTCTC --/TT AGAATAAAAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 0 2 6347 CASAVA_Build X 86530544 1I TCTTGCAACA -/G CGTTTCGGCA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 0 1 6348 CASAVA_Build X 86533819 1D ATGACAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 46 1 42 3 T 11 10 6349 CASAVA_Build X 86557646 3I GCACATAGTT ---/TAA TAATTCCATG 3070 het 3070 hom 47 17 27 3 TAA 1 2 6350 CASAVA_Build X 86561091 3D TACGAGAGAC ACA/--- ACAATAAAGA 3070 het 3070 hom 53 22 24 8 ACA 2 1 6351 CASAVA_Build X 86562581 1I AAACTTTCAA -/C AGAGTAACCA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 C 0 1 6352 CASAVA_Build X 86562698 1I AGTAAAAAAA -/T AAATAAATAA 3070 het 2008 hom 15 5 9 1 T 0 1 6353 CASAVA_Build X 86572223 4D TAAAATTGTT TATA/---- TAAGATGAAG 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 TA 3 1 6354 CASAVA_Build X 86573699 1D ATAAAATAAC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 T 8 7 6355 CASAVA_Build X 86575215 1I CTATTCAAGA -/C AAAAATATGA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 C 0 1 6356 CASAVA_Build X 86582184 1I TATCTCTCTC -/T TCAGCTCTAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 1 2 6357 CASAVA_Build X 86584762 1I TGCTCTATTT -/C TTATTTTTTC 2508 het 586 hom 14 2 6 6 C 0 1 6358 CASAVA_Build X 86593150 2D TTTTGATCAG AT/-- ATGACAATAG 3070 het 2680 hom 19 7 11 1 AT 2 1 6359 CASAVA_Build X 86593444 6I ATTCTTCTTC ------/TTATTA TTATTTTTTT 2764 het 2764 ref 21 8 7 7 TTA 1 3 6360 CASAVA_Build X 86595244 1D TCTGAAGGAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 A 8 7 6361 CASAVA_Build X 86596417 5D TTATGCAGGT AAACC/----- CTTACAGTTG 3070 het 3070 ref 45 23 13 12 AAACC 1 0 6362 CASAVA_Build X 86600411 2I GCCACGACCA --/TC TCTGATCTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 TC 1 2 6363 CASAVA_Build X 86601698 1I AAAATATAAG -/C TTAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 C 0 1 6364 CASAVA_Build X 86601882 1I AAATAGCCCA -/T TCTTATAAAA 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 T 1 2 6365 CASAVA_Build X 86602074 1D AATTTACCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 A 10 9 6366 CASAVA_Build X 86602197 2D TGTTTTTTAT AC/-- AGTAAACAGT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 AC 1 0 6367 CASAVA_Build X 86602548 3D ACCCAAATTT ATG/--- ATAAGTTAAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 5 ATG 1 0 6368 CASAVA_Build X 86608535 1D21M2D AAATAAAAAT AAAAAAATAAAAAATAAAAGAGAA/-AAAAAATAAAAAATAAAAGAG-- AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 9 0 10 1 N/A 0 0 6369 CASAVA_Build X 86631627 1D AAAAGGTTTT A/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 1 0 6370 CASAVA_Build X 86640260 1I GCATCTGTTA -/T TTTTTGACTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 5 6 6371 CASAVA_Build X 86647091 4D AAAATTTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 66 het 26 0 23 6 TC 7 5 6372 CASAVA_Build X 86647377 3D CACAGATCAA TGT/--- TGTTTTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 37 6 TGT 2 1 6373 CASAVA_Build X 86671158 1I TCCTTTTGAC -/A AAAAAAACCT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 7 8 6374 CASAVA_Build X 86678256 2I AACATGAAAA --/TG TATGAAATAG 3070 hom 113 het 44 0 37 7 TG 0 1 6375 CASAVA_Build X 86695307 2D ACACACACAC AT/-- GTCACATTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AT 1 0 6376 CASAVA_Build X 86701455 5D CTAATAACTA TAATC/----- TAAGATGGAA 3070 hom 123 het 42 0 42 1 TAATC 1 0 6377 CASAVA_Build X 86713968 1I ACCCTTTCTT -/C CCTTCCTTAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 2 3 6378 CASAVA_Build X 86715098 4D ACAAATAAAC AAAT/---- AAGTGAACAA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AAAT 1 0 6379 CASAVA_Build X 86731535 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 13 12 6380 CASAVA_Build X 86736679 1D CCCTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 21 1 12 8 T 13 12 6381 CASAVA_Build X 86738897 2D AGTGATCACT CA/-- CTGTTAAGTG 3070 hom 111 het 44 0 38 7 CA 1 0 6382 CASAVA_Build X 86739637 1D AAAAGCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 188 hom 45 1 38 7 T 12 11 6383 CASAVA_Build X 86743670 1D CGTTTTTAAC A/- AAAAAAGTCT 3070 het 2559 hom 21 6 10 5 A 7 6 6384 CASAVA_Build X 86758871 1I AAAGAGACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 821 hom 29 2 22 5 T 11 12 6385 CASAVA_Build X 86761438 3D AAATGTAATA TTG/--- TTGTCTCTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTG 2 1 6386 CASAVA_Build X 86763180 3I TCACTCTACT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 11 14 6387 CASAVA_Build X 86764371 1D AGGCTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 43 0 36 7 T 11 10 6388 CASAVA_Build X 86796146 2D TGTATGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 33 het 48 1 23 25 TG 10 9 6389 CASAVA_Build X 86800952 1I ATTTTTGTTA -/T TTTCAGTAGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 3 4 6390 CASAVA_Build X 86801245 1D CTTTATTATA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 7 6391 CASAVA_Build X 86804679 1D TTTCTGATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 24 0 11 14 T 15 14 6392 CASAVA_Build X 86808746 1I TGTTGAAGCT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 7 8 6393 CASAVA_Build X 86903784 1D CATTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1098 het 1098 ref 21 12 4 5 T 15 14 6394 CASAVA_Build X 86917449 1I TGATTACAGG -/C ATGAGTCACC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 0 1 6395 CASAVA_Build X 86926223 1D AGGAAGCAAG A/- GAGAAAAAGG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 1 0 6396 CASAVA_Build X 86943753 2D AGCATTGCAA TG/-- TGTGTGTGTG 1562 hom 69 het 40 0 21 19 TG 8 7 6397 CASAVA_Build X 86944375 1D CGATTAGTTT A/- AAGGAAGCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 3 2 6398 CASAVA_Build X 86949013 4D GCCTATTATA TATT/---- TATTTTCTCC 3070 hom 87 het 33 0 30 6 TATT 2 1 6399 CASAVA_Build X 86957474 4D ATGGTTCGCA TATT/---- TAAAGTACGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TATT 1 0 6400 CASAVA_Build X 86960603 1D TGAATAGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 T 9 8 6401 CASAVA_Build X 86969067 2I AGAGTATAAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 9 11 6402 CASAVA_Build X 86974371 1D TAATTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 38 0 32 6 T 12 11 6403 CASAVA_Build X 86976388 1D TGTGAATTTA T/- TTTTTATTGA 3070 hom 105 het 37 0 35 3 T 6 5 6404 CASAVA_Build X 86979692 3I TTTTCTTTCC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 22 0 14 8 T 13 16 6405 CASAVA_Build X 86982350 4D CTTTAGTGAA TTTG/---- TTTATCAGAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 6 TTTG 1 0 6406 CASAVA_Build X 86983483 1I CTGCTCTGAT -/C TTTGTTATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 0 1 6407 CASAVA_Build X 86994886 3I GTTGTTGTTA ---/TTT TTATTTTTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 5 6408 CASAVA_Build X 87008227 1D AAAAATCTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 77 het 32 0 26 7 T 9 8 6409 CASAVA_Build X 87013699 1D CCTAAAACTT A/- AAAGTATAAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 4 3 6410 CASAVA_Build X 87021061 2I CTGGACCTCA --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 8 10 6411 CASAVA_Build X 87021182 2D GTACTGCAAC AA/-- ACATAGGGGT 3070 hom 81 het 35 0 28 9 A 3 1 6412 CASAVA_Build X 87022897 1I CTATTCCTAG -/T TTTTTTGAGG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 6 7 6413 CASAVA_Build X 87023546 2D CATATCAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AC 1 0 6414 CASAVA_Build X 87023916 2D ATTTGGATCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TC 6 5 6415 CASAVA_Build X 87024049 4I TGCCCTGATT ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TTTA 1 2 6416 CASAVA_Build X 87028426 1D TTTATGAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 9 6417 CASAVA_Build X 87029099 4I GTTCATACTG ----/AAAT AAATAATTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAAT 1 2 6418 CASAVA_Build X 87030340 5D CCTAGCCTCA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 6 AAAAC 5 4 6419 CASAVA_Build X 87032402 2D ATGTAGAGAC AG/-- GGGGAATAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AG 1 0 6420 CASAVA_Build X 87072750 2D TATAGATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 36 1 24 11 A 14 12 6421 CASAVA_Build X 87079723 1D AGATGAAAAT A/- AAAAAATCTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 7 6 6422 CASAVA_Build X 87091252 2I TTTTCAAAAA --/AG GACATAATAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AG 0 1 6423 CASAVA_Build X 87101409 1D TCTGCACAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 9 6424 CASAVA_Build X 87141004 3D CACATGAAAT GAA/--- GTATGGTGAT 3070 hom 123 het 50 0 42 10 GAA 1 0 6425 CASAVA_Build X 87141778 1D ATGCTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 659 hom 46 4 29 16 T 13 12 6426 CASAVA_Build X 87171073 1D GCAAAACTCA T/- TTTTTTGGTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 6 6427 CASAVA_Build X 87212744 1D AATTTGTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 31 0 23 8 T 13 12 6428 CASAVA_Build X 87230083 1I TTTTGTATAA -/T TTTTTTTTTT 2362 het 2362 ref 22 9 7 6 T 11 12 6429 CASAVA_Build X 87230668 3I TTTGTTAGTT ---/TTC TTCTTTGATA 3070 het 3070 hom 50 19 25 6 TTC 1 2 6430 CASAVA_Build X 87253098 1I TTTTTAATAG -/T TTTTTTTTTT 3023 het 3023 ref 25 9 7 9 T 11 12 6431 CASAVA_Build X 87262345 1I CCACTCAGTA -/C CCCCTTGGGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 4 5 6432 CASAVA_Build X 87273885 1I AAGTAGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 10 11 6433 CASAVA_Build X 87285559 3I TATATATATA ---/TTT TTTTTTTCTA 2399 het 2371 hom 13 5 5 3 T 7 10 6434 CASAVA_Build X 87286559 4I AAATGAAAAT ----/AATC AAAGTCCACC 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 AATC 0 1 6435 CASAVA_Build X 87287424 1D ACACACAGAT G/- GGAGGACATC 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 G 3 2 6436 CASAVA_Build X 87292211 1I TGATGGTTTT -/C ATAAAGGGCA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 0 1 6437 CASAVA_Build X 87293366 2D TGTGTAAAAC TT/-- TTATTTCATA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 4 2 6438 CASAVA_Build X 87293535 2D TATATCTATG TA/-- TAGATGTATG 3070 het 3070 ref 30 18 12 2 TA 2 1 6439 CASAVA_Build X 87303151 20D TTGCAGGCCC TCTACAGTATGACGACTTAT/-------------------- TCTAGTTTCT 3070 het 3070 ref 39 23 18 4 TCTACAGTATGACGACTTAT 1 0 6440 CASAVA_Build X 87318647 1D GATTTTTAAA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 7 6 6441 CASAVA_Build X 87325572 1I CTGAGAAGAG -/A GATAGTTTGA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 0 1 6442 CASAVA_Build X 87325791 3I TTTTTTTTTT ---/AGA TAGAGTCTCG 1569 het 1175 hom 17 7 7 3 AGA 0 1 6443 CASAVA_Build X 87402785 1I AATATGTCTA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 6444 CASAVA_Build X 87412787 2D TTTTATTGGC TG/-- TTTTAAATTT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TG 1 0 6445 CASAVA_Build X 87418837 1D TAACAATACC A/- ATATGAATCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 1 6446 CASAVA_Build X 87429443 4I TCTTTTGCTT ----/GTTA GTTAGTTAGT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 GTTA 2 3 6447 CASAVA_Build X 87430930 1D GCATCTATGT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 8 7 6448 CASAVA_Build X 87431454 1D ACAGAACTAG A/- AAAAAACAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 6 6449 CASAVA_Build X 87431860 26D ACCATAAAAA TTCTAGAAGATGATGTTGGAAAACCC/-------------------------- TTCTAGACAT 3070 het 3070 ref 27 18 8 4 TTCTAGAAGATGATGTTGGAAAACCC 1 0 6450 CASAVA_Build X 87436461 3D AATGGAAAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 635 het 635 ref 43 18 4 21 T 13 10 6451 CASAVA_Build X 87447435 1I TGGTTACTGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 8 9 6452 CASAVA_Build X 87448145 1I ACACAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 10 11 6453 CASAVA_Build X 87449227 1D CACTGTTGGT A/- GGGACTGTAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 1 0 6454 CASAVA_Build X 87449904 1I AACAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 10 11 6455 CASAVA_Build X 87453219 1D TATCAATGAA T/- TACAGGAGCT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 T 2 1 6456 CASAVA_Build X 87453690 2I AGACACAACG --/AA AAAAGAAGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 4 6 6457 CASAVA_Build X 87456290 1I TAATATATAA -/T TGTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 T 1 2 6458 CASAVA_Build X 87458415 1I TCTAATTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 11 12 6459 CASAVA_Build X 87460170 5D GTCACAAAAT ATATA/----- ATATATGTTG 3070 het 3070 hom 26 11 10 7 ATATA 2 1 6460 CASAVA_Build X 87475596 1I GAAATCTAAT -/A AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 65 37 20 8 A 6 7 6461 CASAVA_Build X 87482695 1D TGCCCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 13 12 6462 CASAVA_Build X 87483726 2I ATGAACTGAC --/AG GGGGTCAAAG 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 AG 0 1 6463 CASAVA_Build X 87485439 1I GTGATTCTTC -/A GTTACTTCAG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 0 1 6464 CASAVA_Build X 87488048 18D AAAGAAGTAC ATACCACAGGGAAATGAG/------------------ ATAATCTTCA 3070 het 3070 ref 30 17 14 0 ATACCACAGGGAAATGAG 1 0 6465 CASAVA_Build X 87493074 1D TTATTAAAAA G/- TCAAGAAACA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 1 0 6466 CASAVA_Build X 87495496 2D AAAATGAAAC AT/-- GTAGTAAATT 2266 het 2266 ref 20 14 5 2 AT 1 0 6467 CASAVA_Build X 87495556 4I AGAAATAATC ----/ACTT AATCACAAAG 2124 het 2124 ref 20 13 5 2 ACTT 0 1 6468 CASAVA_Build X 87495723 1D CTGAGTGAGT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 9 8 6469 CASAVA_Build X 87496098 1I TAAAAAAAAA -/T GTGAAGAGAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 0 1 6470 CASAVA_Build X 87497045 2I GCTACAGACA --/GG GCACAAAGCC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 G 1 3 6471 CASAVA_Build X 87499627 11D CGTTAGAAAA AAAACACTATT/----------- AAAAATGAGC 3070 het 3070 ref 29 18 15 3 AAAACACTATT 1 0 6472 CASAVA_Build X 87501048 16D TGGAATTTTA AAGCTGCCTGATTTTG/---------------- AAACTTCCTG 3070 het 3070 ref 33 24 13 5 AAGCTGCCTGATTTTG 1 0 6473 CASAVA_Build X 87501848 1D AATGGATAAT A/- AAAAGTGTTG 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 A 5 4 6474 CASAVA_Build X 87503622 1I TATAATTGTT -/A AAAAGAGTGT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 4 5 6475 CASAVA_Build X 87511753 1I CTTTTTTTTT -/C TTTTTTCGGT 3070 het 1268 hom 29 6 10 13 C 0 1 6476 CASAVA_Build X 87518630 1I ACATTCAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 9 10 6477 CASAVA_Build X 87523790 1D TCTCCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 11 10 6478 CASAVA_Build X 87524449 3D ATCCAGACAC ACA/--- ACAAGTTATT 3070 het 3070 ref 49 26 18 7 ACA 2 1 6479 CASAVA_Build X 87525142 1I AGCTTCCCCC -/T ATGGGTCTTA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 0 1 6480 CASAVA_Build X 87525795 1D CCAGAATAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 10 9 6481 CASAVA_Build X 87528695 4I CCAGTGATAC ----/CATT CATTACACAG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 CATT 1 2 6482 CASAVA_Build X 87529042 7I TTAAGCCAAA -------/AACAAAC AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 AACAAAC 0 1 6483 CASAVA_Build X 87544309 1I CTGACTCCCC -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 58 27 25 6 A 6 7 6484 CASAVA_Build X 87563429 6D TATTATTATA ATTACT/------ ATTACTATTA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 ATTACT 3 2 6485 CASAVA_Build X 87564830 3I TCCTTAAAAA ---/TAT TATTTACCTA 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 TAT 1 2 6486 CASAVA_Build X 87569861 1I AAGTACCTTC -/T TTTTTTTTTT 3043 het 3043 ref 37 11 13 13 T 14 15 6487 CASAVA_Build X 87572669 2D TGTCCCACAC AT/-- GTGTAGTATT 3070 het 3070 ref 53 26 21 9 AT 1 0 6488 CASAVA_Build X 87584421 1I GTTGTAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 9 10 6489 CASAVA_Build X 87586823 23D TCCAGCCACA TTTGGGCTTTTGCTTTTAACCAT/----------------------- TGAATGAGTG 3070 het 3070 hom 37 19 22 2 TTTGGGCTTTTGCTTTTAACCAT 1 0 6490 CASAVA_Build X 87587351 1D TTCATGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 12 11 6491 CASAVA_Build X 87589703 1I TTATTGGCCA -/T TTCTCAAAGG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 2 3 6492 CASAVA_Build X 87590736 4D TTGAGCTGAC AAAG/---- AAAGTGATGA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 AAAG 2 1 6493 CASAVA_Build X 87592141 2D TACATATTAC TT/-- TTTTTTTTTT 2363 het 624 hom 26 5 9 12 T 18 16 6494 CASAVA_Build X 87606543 28I CAATGAAGGC ----------------------------/AAGTTTTTTCCTGCTTCCAATGTGACGG AAGTCAGGTA 3070 het 3070 hom 29 14 15 3 AAGTTTTTTCCTGCTTCCAATGTGACGG 0 1 6495 CASAVA_Build X 87608733 1I CCAGGAAATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 8 9 6496 CASAVA_Build X 87609491 1I AAGATTGCAA -/G GGCCCATTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 2 3 6497 CASAVA_Build X 87613940 1D GGATGCAAAT A/- ATAGAAGTAG 3070 hom 89 het 33 0 31 3 A 2 1 6498 CASAVA_Build X 87627554 6D CCTGTAGTTA TGTTGT/------ TGTTGTTGTT 3070 hom 112 het 42 0 38 7 TGT 8 6 6499 CASAVA_Build X 87628174 1D TGCCCCAAAC T/- CCCCCACGAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 1 0 6500 CASAVA_Build X 87648225 1I GCCTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 10 11 6501 CASAVA_Build X 87700852 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1585 hom 22 4 12 6 A 12 11 6502 CASAVA_Build X 87703194 1I CTCCCTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 30 1 19 10 T 15 16 6503 CASAVA_Build X 87705484 1I TCACATTCCT -/G TCAAAGCTCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 6504 CASAVA_Build X 87719900 2I AATTGTGGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 33 0 24 9 TG 6 7 6505 CASAVA_Build X 87721615 1D GTCTTCAAAA C/- CAAACACAAC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 C 2 1 6506 CASAVA_Build X 87733507 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 11 A 13 12 6507 CASAVA_Build X 87743607 1I TGGTCTATGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 9 10 6508 CASAVA_Build X 87752209 1I TAACTATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 11 6509 CASAVA_Build X 87757734 1I ATGAGCCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1470 hom 42 4 22 16 A 14 15 6510 CASAVA_Build X 87853318 2D ATTGAAAATT TG/-- TGTGTGTGTG 1574 het 1574 ref 48 35 4 9 TG 7 6 6511 CASAVA_Build X 87881489 1D GTCTTTGGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 114 het 43 0 38 6 T 9 8 6512 CASAVA_Build X 87882011 1D TCTTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 1504 het 1504 ref 28 11 4 13 T 17 16 6513 CASAVA_Build X 87892713 2I AAGGGTTTTT --/TG TGTCTCTGTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TG 1 2 6514 CASAVA_Build X 87900339 13D TCTCATCTTC ATGAAAGAGCCAG/------------- ATGAAAGAGC 3070 hom 84 het 37 0 29 15 ATGAAAGAGCCAG 1 0 6515 CASAVA_Build X 87900674 2D TAAAAGATTT AA/-- AAACATTTGG 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 A 5 3 6516 CASAVA_Build X 87905292 1D TGTCATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 11 10 6517 CASAVA_Build X 87907106 1D ACCTTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 11 10 6518 CASAVA_Build X 87915126 2I TACATATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 TA 5 6 6519 CASAVA_Build X 87930228 1D CAGAAAATAG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 9 8 6520 CASAVA_Build X 87938600 1I AAAGTAGTTT -/G GGGATTTCTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 3 4 6521 CASAVA_Build X 87943622 1I AAATGTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 28 1 18 9 A 10 11 6522 CASAVA_Build X 87956990 4D AGGTTTCTAA ACAC/---- AAAATTTATA 3070 het 3070 ref 33 20 12 3 AC 2 0 6523 CASAVA_Build X 87959731 1D AAGTATTTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 52 22 22 8 T 10 9 6524 CASAVA_Build X 87964766 1D TTTGGTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 26 1 21 4 T 13 12 6525 CASAVA_Build X 87969145 4D GTTAATATTT ACAA/---- ACATAGTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 17 1 ACAA 1 0 6526 CASAVA_Build X 87975652 1D AACAGAACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2654 hom 31 8 15 8 T 10 9 6527 CASAVA_Build X 87980358 4I TGTGGGGCCT ----/GAGA AATAGCTGTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GA 0 2 6528 CASAVA_Build X 87985178 1I CTTTTGCCCT -/G TCACGTGTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 6529 CASAVA_Build X 87990776 4D AAAAGAAAAA AAAT/---- AAATCGTATC 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 AAAT 2 1 6530 CASAVA_Build X 87997960 1I GGAAAAGTTA -/G GGAAGCAGGA 3070 het 3070 hom 40 19 16 5 G 2 3 6531 CASAVA_Build X 87999461 1D CTGTTGATAG T/- TTCTTTTGCT 3070 het 3070 hom 31 10 17 5 T 3 2 6532 CASAVA_Build X 88012963 3D CCTTAGATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 56 14 26 16 TTG 5 4 6533 CASAVA_Build X 88014151 1D GTGAATACGA C/- TGGGATACAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 1 0 6534 CASAVA_Build X 88041774 1I CAAAATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 11 12 6535 CASAVA_Build X 88052056 1I GGGGGAGGGA -/G GGGGGGTTAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 6 7 6536 CASAVA_Build X 88053465 2D TCTCTCTCTC TA/-- TATATATATA 3070 het 692 hom 25 8 14 4 TA 9 8 6537 CASAVA_Build X 88053541 2I AGTGTCTGTG --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 TA 4 5 6538 CASAVA_Build X 88070907 2D TTCAACCATT GA/-- GTGGATGACA 2923 het 2923 ref 22 15 6 2 GA 1 0 6539 CASAVA_Build X 88071924 1I TGAAAGTCCG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 8 9 6540 CASAVA_Build X 88076843 2I TACCTCCAGC --/TT TTTTTTTTTT 1788 het 1788 ref 30 7 6 17 T 14 16 6541 CASAVA_Build X 88110313 2D TCTCCTATAC AT/-- ATATATCTAT 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 AT 4 3 6542 CASAVA_Build X 88113534 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 10 9 6543 CASAVA_Build X 88116640 2I TATATATATA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 2588 hom 25 10 13 2 GT 7 8 6544 CASAVA_Build X 88125847 1D CATAGATAAA T/- AAGAGACGAT 3070 het 3070 ref 51 31 15 6 T 1 0 6545 CASAVA_Build X 88127119 1D GGAAAAAAAA T/- AACTTATCTA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 T 1 0 6546 CASAVA_Build X 88145085 1D TGTTAAACAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 A 9 8 6547 CASAVA_Build X 88154923 1D GAGCCAAGAT C/- GCACCACTGC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 1 0 6548 CASAVA_Build X 88162529 1D CTGTGAGTAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 9 8 6549 CASAVA_Build X 88162900 1I CTCTCTAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 9 10 6550 CASAVA_Build X 88164301 1D TTCCTACTTC T/- TTTTTTTATC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 8 7 6551 CASAVA_Build X 88180006 1I AGAAGTGCTC -/T TTTAATGGCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 3 4 6552 CASAVA_Build X 88184398 1I GAATCTTTAG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 9 6553 CASAVA_Build X 88205155 1I TCTTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 26 1 17 8 A 10 11 6554 CASAVA_Build X 88207510 1I TTTTCTGTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 8 9 6555 CASAVA_Build X 88230380 4D AGCTCCTTTT TCTG/---- TCTTTCTCCT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 TCTG 1 0 6556 CASAVA_Build X 88242217 1I TGAGTTGGTT -/G GCCTCCAGCC 3070 hom 108 het 42 0 34 8 G 1 2 6557 CASAVA_Build X 88250915 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TA 8 7 6558 CASAVA_Build X 88253891 1I AATAGCTCAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 2 3 6559 CASAVA_Build X 88254184 1I AAAGATTTTT -/C AATTATGTAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 0 1 6560 CASAVA_Build X 88257102 1I GATTTAAAAT -/A AAAAAAAATC 1629 het 1629 ref 18 9 6 3 A 8 9 6561 CASAVA_Build X 88257441 1D TATCACTAAC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 8 7 6562 CASAVA_Build X 88257557 1I GATTCTGTGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 8 9 6563 CASAVA_Build X 88265507 1I GTAGAATTCA -/C TTGTGAATCC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 C 0 1 6564 CASAVA_Build X 88266332 1I GATAGATTTT -/A GAGTATGTGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 0 1 6565 CASAVA_Build X 88269138 1I CTAGAGGATT -/G GCCATCCCTG 3070 hom 126 het 44 0 41 3 G 1 2 6566 CASAVA_Build X 88271662 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 10 6567 CASAVA_Build X 88277297 4I TCTCTTTCCT ----/TTTC TTTGTTTTCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTTC 0 1 6568 CASAVA_Build X 88278213 1D TTTCTTCTTC T/- TTCCTGCTTT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 T 3 2 6569 CASAVA_Build X 88281806 4I TGTATGAGAC ----/AGAG AGAATGAGTA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 AG 1 3 6570 CASAVA_Build X 88291048 1I TACTACACCC -/T TAGGGGTTAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 2 6571 CASAVA_Build X 88303083 1I TCAATTTTAG -/A AAAAAATGCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 6 7 6572 CASAVA_Build X 88305664 1D GGTCACCCCT C/- CCCCCAGGAG 3047 het 3047 ref 41 20 11 10 C 6 5 6573 CASAVA_Build X 88307521 1I TGGCTGAAGG -/C CAACCAACTC 3070 hom 102 het 38 0 31 7 C 1 2 6574 CASAVA_Build X 88309092 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAAGCATTCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AAAC 0 1 6575 CASAVA_Build X 88309382 1I AAAAACAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 11 12 6576 CASAVA_Build X 88309922 1I AAGATGAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 33 het 30 1 26 3 T 2 3 6577 CASAVA_Build X 88324058 1D TCCAAAGGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 92 het 37 0 31 6 A 10 9 6578 CASAVA_Build X 88334898 1I TCAGTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 10 11 6579 CASAVA_Build X 88344806 6I ATATAGTATA ------/TTCGTC GGTGTCGTGA 1926 het 1926 ref 65 51 6 8 TTCGTC 0 1 6580 CASAVA_Build X 88345359 3D TTCGTCGTTG TCA/--- TGAAATACCG 2505 het 2505 ref 74 64 6 4 TCA 1 0 6581 CASAVA_Build X 88346066 37D AATACCGACG TATATATTATATTCGTAGGTGTCATAAAATAACGTCA/------------------------------------- TATATATTAT 1170 het 1170 ref 73 72 7 22 TATATATTATATTCGTAGGTGTCATAAAATAACGTCA 1 0 6582 CASAVA_Build X 88348852 6I CGTATATAGT ------/ATATTC ATAGGTGTCG 3070 het 3070 ref 98 67 11 20 ATATTC 0 1 6583 CASAVA_Build X 88348894 37D TATTCGTAGG TGTCGTGAAATACCAACATATATCTTATATTCATAGA/------------------------------------- TGTCGTGAAA 3070 het 3070 ref 90 85 22 29 TGTCGTGAAATACCAACATATATCTTATATTCATAGA 1 0 6584 CASAVA_Build X 88353219 1I ATATATGCTG -/T TTTTTTCTAC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 6 7 6585 CASAVA_Build X 88357451 1I ACATTTTTTT -/A ATCTTGGTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 2 6586 CASAVA_Build X 88358177 1D AGATTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 2243 het 517 hom 21 2 8 11 T 15 14 6587 CASAVA_Build X 88362020 2I CCCCATTTTA --/TT TTGTTATTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 2 4 6588 CASAVA_Build X 88368590 3I GCAAACAATT ---/ATA ATAATAATAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 ATA 5 6 6589 CASAVA_Build X 88376188 1D GCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 27 1 20 6 T 13 12 6590 CASAVA_Build X 88382985 1D TAGCCAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 A 11 10 6591 CASAVA_Build X 88387214 1D CCTAAATTAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 9 8 6592 CASAVA_Build X 88389407 1D AGGTATATCT C/- CTAATGCTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 2 1 6593 CASAVA_Build X 88392515 1D TTTAGCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 923 hom 29 7 12 10 T 13 12 6594 CASAVA_Build X 88396277 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 22 1 17 4 AC 0 1 6595 CASAVA_Build X 88405028 1D TTGAAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1518 hom 35 10 14 11 T 15 14 6596 CASAVA_Build X 88407187 1I TAATTTCCGG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 6 7 6597 CASAVA_Build X 88425127 4D ATTGTGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 26 0 20 6 TG 11 9 6598 CASAVA_Build X 88433601 1I CATGCTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 9 10 6599 CASAVA_Build X 88433732 1I ACTACTAGAC -/G GGGGAGGTGG 3070 hom 90 het 38 0 29 9 G 4 5 6600 CASAVA_Build X 88442479 1D CAAAACTGTC A/- AAAGTCATCA 3070 hom 153 het 54 0 51 4 A 4 3 6601 CASAVA_Build X 88442693 5I TCTATTTTTC -----/TAATA TAAGATACTA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 TAATA 0 1 6602 CASAVA_Build X 88453555 4D TTTTATGCCA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 22 1 11 10 T 18 14 6603 CASAVA_Build X 88455290 4I CATTCTTCTC ----/TGTT TGGTTTTTAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TGTT 0 1 6604 CASAVA_Build X 88455394 1D TATGTGTACT C/- CAACCTTTTC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 2 1 6605 CASAVA_Build X 88463483 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 10 9 6606 CASAVA_Build X 88467534 2D AGAACCTTCT TC/-- TCTCTCTTTG 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 TC 4 3 6607 CASAVA_Build X 88468316 1D TTTATTATTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 9 8 6608 CASAVA_Build X 88477425 1D ACACCACAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 A 9 8 6609 CASAVA_Build X 88477883 1I AATAAGATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 10 6610 CASAVA_Build X 88486208 1D TATATTTCAA T/- TTTTTTTTAA 2927 het 2927 ref 46 26 10 10 T 9 8 6611 CASAVA_Build X 88488135 1I GTTTGACTTC -/T TTTTTTTTTC 2241 het 2241 ref 37 18 7 12 T 9 10 6612 CASAVA_Build X 88488158 1D TTTGGTTGTG T/- TTTTTTTTTT 1942 het 1942 ref 35 15 11 9 T 15 14 6613 CASAVA_Build X 88495368 1D ACAACAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 A 10 9 6614 CASAVA_Build X 88500828 16D TCCAGTTTTG TTCTTATTTATCAAGA/---------------- TTGCCTTGCT 3070 het 3070 ref 37 25 17 2 TTCTTATTTATCAAGA 1 0 6615 CASAVA_Build X 88506117 5D ATGTGAACTT AACTC/----- AAAATTCATT 3070 het 3070 ref 50 27 21 2 AACTC 1 0 6616 CASAVA_Build X 88508070 2D CAAAAAAGAT TA/-- TTATCAACAA 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 TA 1 0 6617 CASAVA_Build X 88508195 1I CTTGAAAGAG -/T TACTTATGGT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 1 2 6618 CASAVA_Build X 88510357 1D TCATATTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 T 10 9 6619 CASAVA_Build X 88516805 8D AAAATTTGGT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 2523 het 1068 hom 39 8 10 23 A 26 18 6620 CASAVA_Build X 88517339 1D AGTTCCTTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 14 7 6 T 10 9 6621 CASAVA_Build X 88517652 1D AAATTCCCAC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 T 8 7 6622 CASAVA_Build X 88518919 1D TGCATTTTTG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 8 7 6623 CASAVA_Build X 88522681 1I TTTTTGTAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 T 8 9 6624 CASAVA_Build X 88553148 1I TACTTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 1686 het 1686 ref 34 22 6 6 T 13 14 6625 CASAVA_Build X 88558469 2I AATAGCAAAC --/TT GAGAGCTTGA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 0 2 6626 CASAVA_Build X 88563819 4I CATGGCATTA ----/TTAG TTAGGTATGA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 TTAG 1 2 6627 CASAVA_Build X 88573670 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 2267 het 141 hom 10 1 6 3 T 12 11 6628 CASAVA_Build X 88579540 1D AAGGGATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2351 hom 28 8 15 5 T 11 10 6629 CASAVA_Build X 88583115 1I TATAGTTGTA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 7 8 6630 CASAVA_Build X 88583317 1I ATTTTAAAAG -/T TCACTGCATT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 1 2 6631 CASAVA_Build X 88586127 1D ATGGAAGGAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 8 7 6632 CASAVA_Build X 88604933 1I CATATTCTCG -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 6 7 6633 CASAVA_Build X 88606011 1I AACTATTTAG -/T TTTTAACCTC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 4 5 6634 CASAVA_Build X 88616471 1D GTAACAATGT G/- GAGGAGCATA 3070 het 3070 ref 43 23 20 0 G 2 1 6635 CASAVA_Build X 88618446 2D CTAATCAAAC TA/-- TTTTTATTCA 3070 het 3070 hom 34 12 18 6 TA 1 0 6636 CASAVA_Build X 88622322 1I TAGGCTCAGA -/G GTACATATGC 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 G 1 2 6637 CASAVA_Build X 88623371 2D AATGAACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 19 23 10 TG 7 6 6638 CASAVA_Build X 88629700 1D AAATCCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 13 5 T 11 10 6639 CASAVA_Build X 88647813 1I TTGTCCGAAC -/T TTTATGCTCT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 3 4 6640 CASAVA_Build X 88650354 2D TTCTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2240 hom 23 8 9 7 T 13 11 6641 CASAVA_Build X 88654055 1D TTTGTATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 T 14 13 6642 CASAVA_Build X 88654115 1D ATTAAAAGTG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 11 10 10 A 9 8 6643 CASAVA_Build X 88656657 1I TCCATTTTTT -/A ATATATGACA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 1 2 6644 CASAVA_Build X 88659481 4D TCATTTTGAA TTAT/---- TTATAGAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 TTAT 2 1 6645 CASAVA_Build X 88661070 4D GTTCACCATT CTAA/---- CTGACATGAG 2851 het 2851 ref 15 6 7 2 CTAA 1 0 6646 CASAVA_Build X 88664702 1D CTCAAATATC T/- TTTGTTATTT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 4 3 6647 CASAVA_Build X 88668977 3D TATGTCAATT AAA/--- GTTAAAGTGT 3070 het 3070 hom 41 15 23 4 A 3 0 6648 CASAVA_Build X 88678733 3D TATACAAAGC AGT/--- AGGAGGCACT 3070 het 3070 ref 39 21 13 9 AGT 1 0 6649 CASAVA_Build X 88685621 1I AGTTTTTCCA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 T 7 8 6650 CASAVA_Build X 88687027 2I1M4D TCTTCCACAA --AACTG/TCA---- GTCCCTGGTA 3070 het 3070 hom 55 18 34 4 N/A 0 0 6651 CASAVA_Build X 88698073 2D ATTCCTATGA TT/-- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 52 23 22 9 T 10 8 6652 CASAVA_Build X 88704105 1D ACTATGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 11 10 6653 CASAVA_Build X 88705794 6D ATAATCTCTC TCAGAG/------ TCAATGTTCC 2810 het 2810 ref 22 11 9 3 TCAGAG 1 0 6654 CASAVA_Build X 88720576 6I CATTGCTCAG ------/TTTCAA TTAATGCCCC 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 TTTCAA 0 1 6655 CASAVA_Build X 88728131 2I GGCCTCACAC --/AT GTCACTCCCC 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 AT 0 1 6656 CASAVA_Build X 88735238 4I TAATAATGAC ----/AATA AATAAATCCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AATA 1 2 6657 CASAVA_Build X 88737848 1I TATTTTTAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 8 9 6658 CASAVA_Build X 88738104 1I TATTACATAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 128 hom 34 1 29 4 T 9 10 6659 CASAVA_Build X 88769358 5D ACTATGGGCT TATAG/----- TATAGTTTGA 3070 het 3070 ref 33 18 15 3 TATAG 2 1 6660 CASAVA_Build X 88776558 1D AAACAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 10 11 A 12 11 6661 CASAVA_Build X 88777261 1D TATAGCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 12 11 6662 CASAVA_Build X 88778789 1D ACCAGGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1644 hom 22 4 13 5 T 11 10 6663 CASAVA_Build X 88779420 1I CAGTGTAAAA -/G TTTTCCTATT 1710 hom 10 het 4 0 4 0 G 0 1 6664 CASAVA_Build X 88784623 13D GATGGGTGCA GCAAACCAACATG/------------- GCACATGTAT 3070 het 1040 hom 12 3 7 2 GCAAACCAACATG 1 0 6665 CASAVA_Build X 88787612 2D GAAATGCTAA GG/-- GGAGTTTTTC 2142 het 2142 ref 22 15 6 1 G 4 2 6666 CASAVA_Build X 88789136 4I48M10D ACAAAATAAA ----TATGTGACGTGATGGATATGTTAGTTGATTTAATCATTTCATAATGTGTATATATATA/TAAGTATGTGACGTGATGGATATGTTAGTTGATTTAATCATTTCATAATGTG---------- TATATATATA 3070 het 3070 hom 25 10 21 2 N/A 0 0 6667 CASAVA_Build X 88789314 2I CAAATAAAAA --/AT AAGCAAAGCA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AT 0 1 6668 CASAVA_Build X 88796415 2D3M1D TATTTTCACT GCCCTA/--CCT- AAAATTCTCT 3070 het 3070 hom 51 16 31 7 N/A 0 0 6669 CASAVA_Build X 88806293 10I CCTTTTTGTG ----------/TTGCATCTAT TTGAGGATTT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 TTGCATCTAT 0 1 6670 CASAVA_Build X 88806710 1D TGATTTCTTT G/- GTATTGTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 G 2 1 6671 CASAVA_Build X 88807612 1I AGGCCAGGCA -/G GTTTGTCCTC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 G 1 2 6672 CASAVA_Build X 88813989 1D ATCAATCTGC A/- TATCAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 1 0 6673 CASAVA_Build X 88823113 1I TCTCTGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 11 12 6674 CASAVA_Build X 88827282 1D AAATTCTCTG A/- AAAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 32 22 8 2 A 7 6 6675 CASAVA_Build X 88832859 1D ACCAATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 12 15 T 13 12 6676 CASAVA_Build X 88855372 1D ATACCTTTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 10 9 6677 CASAVA_Build X 88856306 1I TATATACACA -/T CAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 0 1 6678 CASAVA_Build X 88857701 1I AAAGAAGAAG -/A AAAGGAAGAC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 3 4 6679 CASAVA_Build X 88860275 1I AACTGCCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 30 1 19 10 T 10 11 6680 CASAVA_Build X 88860310 2I55M2D TTTGGTATAT --AAAAAAACATTTAAAAGGGCAAAAAGCCTCAACACAGTTATTTTTTTCTTTTTAATT/AAAAAAAAACATTTAAAAGGGCAAAAAGCCTCAACACAGTTATTTTTTTCTTTTTAA-- TTTTTTTTTA 3070 het 838 hom 18 2 8 20 N/A 0 0 6681 CASAVA_Build X 88863399 1D TCCTACCCCC T/- GGCAACCACA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 1 0 6682 CASAVA_Build X 88863530 1I TGTTTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 T 10 11 6683 CASAVA_Build X 88867034 2D TTTTATGCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 30 5 13 12 T 14 12 6684 CASAVA_Build X 88868260 1I GCTTATCCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2234 hom 21 8 10 3 T 9 10 6685 CASAVA_Build X 88868870 1I TGGCATAATC -/T TTGGCTCACT 2637 het 738 hom 12 2 6 4 T 2 3 6686 CASAVA_Build X 88869169 2D AATGTACCAT GA/-- GAACTTGAGA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 GA 2 1 6687 CASAVA_Build X 88875111 1D TTCTATAAAG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 23 13 7 4 A 8 7 6688 CASAVA_Build X 88884075 1I24M1I CATTAAAAAA -AATAATATAGAAATTTAATTTTAC-/CAATAATATAGAAATTTAATTTTACT TTTTTTTCAC 3070 het 2920 hom 30 7 10 15 N/A 0 0 6689 CASAVA_Build X 88886831 1D AGGTCCCTTA T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 48 20 20 9 T 7 6 6690 CASAVA_Build X 88896667 1I GCCCAATATA -/T TTTTCCTTTC 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 4 5 6691 CASAVA_Build X 88900454 1I CAGAAATAAT -/A AAAAATTATC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 5 6 6692 CASAVA_Build X 88907016 1D TCAAGCATCA T/- TTTTTTGAAT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 T 7 6 6693 CASAVA_Build X 88918690 4I TTGGACAGCA ----/TTTG TTTGAGTGTT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TTTG 1 2 6694 CASAVA_Build X 88924789 10D ACTGATAAAC AAATTTAGTA/---------- AAGTTCAAGG 3070 het 3070 ref 30 16 15 4 AAATTTAGTA 1 0 6695 CASAVA_Build X 88926745 1I ACTATGTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 25 1 21 3 A 12 13 6696 CASAVA_Build X 88927552 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 9 8 6697 CASAVA_Build X 88929929 4D TGTATGAGCT CAAA/---- CAATTTGTGT 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 CAAA 1 0 6698 CASAVA_Build X 88945556 1I TTCACCCTTG -/T TGCCTCTGGA 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 T 1 2 6699 CASAVA_Build X 88947607 3D TTCCCAGGAC AGA/--- AGAAGATTGT 3070 het 3070 ref 53 30 20 6 AGA 3 2 6700 CASAVA_Build X 88949131 1I ACAAGCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 9 13 T 13 14 6701 CASAVA_Build X 88961157 2D TCACTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 37 0 22 16 T 16 14 6702 CASAVA_Build X 88973825 1I AATTAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 10 11 6703 CASAVA_Build X 88976091 2D TGTGTGTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 18 22 9 T 12 10 6704 CASAVA_Build X 88978317 9I CAAAATGTAA ---------/CTGCCCAAT GGGTTCTCTT 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 CTGCCCAAT 0 1 6705 CASAVA_Build X 88982127 1D GTCTGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 906 het 164 hom 16 3 5 8 T 17 16 6706 CASAVA_Build X 89000478 1I TATAATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 13 7 T 10 11 6707 CASAVA_Build X 89005385 1I TGTTATGGTA -/C CCTTATTAAC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 2 3 6708 CASAVA_Build X 89006753 4I AGAAAATGGA ----/TAAT TAGTCACTGT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 TAAT 0 1 6709 CASAVA_Build X 89007243 12I TTATTACTAT ------------/CAAATGATTCCA CACTTGAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 CAAATGATTCCA 0 1 6710 CASAVA_Build X 89008291 6I ATATATTCAC ------/ACATAT ACATATACAT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 ACATAT 2 3 6711 CASAVA_Build X 89008864 2D TCCATAAGAC AG/-- AGTTGTATAT 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 AG 2 1 6712 CASAVA_Build X 89021947 1D AACAAAGTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 13 25 5 A 10 9 6713 CASAVA_Build X 89032975 1D TAAACAGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 10 9 6714 CASAVA_Build X 89039166 1D GAGATGCAGC A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 34 19 9 7 A 8 7 6715 CASAVA_Build X 89055166 1D GTTATAGTAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 7 6 6716 CASAVA_Build X 89059878 3I TCTGGAAAGC ---/ATT TTCTTTACAT 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 ATT 0 1 6717 CASAVA_Build X 89063079 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1277 hom 22 10 8 4 A 15 14 6718 CASAVA_Build X 89067529 2D TCTTGGACAC AT/-- GTGCAGAATA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AT 1 0 6719 CASAVA_Build X 89072572 4I AGTTCTAGAC ----/CTAA CTGTCTCCTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTAA 0 1 6720 CASAVA_Build X 89072924 5D AAATGAAAAT AAATA/----- AAATAAATAG 3070 het 3070 hom 31 11 17 7 AAATA 2 1 6721 CASAVA_Build X 89082492 1I CTACTGAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 T 11 12 6722 CASAVA_Build X 89082876 1I GTAACGTATG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 1982 hom 16 6 7 3 T 7 8 6723 CASAVA_Build X 89087516 2I ACTTTTTAAA --/AG AGAGAATATT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 AG 2 3 6724 CASAVA_Build X 89090643 1D GAATGCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 12 11 6725 CASAVA_Build X 89094440 1D AGACCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 32 0 10 22 T 17 16 6726 CASAVA_Build X 89100838 4D TATACTCACT AACA/---- TTTATATCCA 3070 het 3070 hom 44 17 25 4 AACA 1 0 6727 CASAVA_Build X 89105156 4D ACTGCAGTAT ACTC/---- TAAACATAAC 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 ACTC 1 0 6728 CASAVA_Build X 89123260 1I CTCTTAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 9 10 6729 CASAVA_Build X 89125461 15I TCACACGTGA ---------------/TACAATTCATTCATT TAAAGTATAC 3070 het 3070 ref 37 16 14 8 TACAATTCATTCATT 0 1 6730 CASAVA_Build X 89125835 2D CATGTGTGAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2346 hom 17 8 7 2 TA 10 9 6731 CASAVA_Build X 89127653 2I TGTGAAATCC --/AT ATGAGTCTGC 3070 het 3070 hom 45 22 21 2 AT 1 2 6732 CASAVA_Build X 89138968 1D40M1I GAGACTCCAT AAAAAAAAAAAAAAAAATTGGCAACATTATATTAACATTTG-/-AAAAAAAAAAAAAAAATTGGCAACATTATATTAACATTTGT TTTATCATGT 2672 het 2672 ref 20 17 6 7 N/A 0 0 6733 CASAVA_Build X 89150796 1D TCCCCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 36 3 16 17 T 12 11 6734 CASAVA_Build X 89153820 1D GTGGACAATG A/- AATTCAGGCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 A 3 2 6735 CASAVA_Build X 89164005 1D ACATCTTACC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 A 9 8 6736 CASAVA_Build X 89164270 1I TAGTGTTTCT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 8 9 6737 CASAVA_Build X 89168446 1D AAACACTATC T/- ATCATGTATT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 1 0 6738 CASAVA_Build X 89172260 3D GATGTTTGAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 508 hom 31 7 16 9 A 14 11 6739 CASAVA_Build X 89174806 1D GCAGAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 35 1 25 9 T 15 14 6740 CASAVA_Build X 89225053 1D AATTCATCTC T/- TTTTCTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 5 4 6741 CASAVA_Build X 89235619 1I ATACATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 676 hom 32 3 17 12 T 14 15 6742 CASAVA_Build X 89240227 1I ACCAAAATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 10 6743 CASAVA_Build X 89248929 1D TGAAAATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 12 11 6744 CASAVA_Build X 89249253 1D ACAATTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 828 hom 28 2 25 1 A 14 13 6745 CASAVA_Build X 89249773 4D CAATTCCCAT AATA/---- AATCTCTCTC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AATA 1 0 6746 CASAVA_Build X 89249849 4I TATCTCTCTG ----/TCTC TCTATATATG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TC 1 3 6747 CASAVA_Build X 89250658 1D ATTTCTTTTA T/- TTTAAAAAAA 2840 het 2719 hom 17 8 8 1 T 4 3 6748 CASAVA_Build X 89256942 1D GCAGTAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 14 12 11 A 10 9 6749 CASAVA_Build X 89257557 3I ACATTTTTGC ---/AAA AAAAAAAATA 2657 hom 21 het 15 0 8 7 A 8 11 6750 CASAVA_Build X 89261349 5I TTCAAATGAC -----/ATATT ATAAAACTCA 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 ATATT 0 1 6751 CASAVA_Build X 89264466 1I AATCTGCACA -/T TGGGCTACTC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 1 2 6752 CASAVA_Build X 89271835 1D TTTTCTGGGG A/- AAAAATTCAA 3070 hom 60 het 23 0 20 4 A 6 5 6753 CASAVA_Build X 89275972 1D TAGAAAACTG A/- ATTTTTTCCT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 A 2 1 6754 CASAVA_Build X 89283852 2I AAATTATCTC --/TT ATAGATAATT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 0 2 6755 CASAVA_Build X 89287829 1I ATAAAATGCA -/T TTTTTTTCGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 8 6756 CASAVA_Build X 89291256 1D AAAGTGATTA C/- CAAAATTAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 2 1 6757 CASAVA_Build X 89291782 12D42M4D TATTTCATTG TATATATATATATATATATATATATATCATTTTCTTTATCCATTCATCCATTACCAAA/------------TATATATATATATATCATTTTCTTTATCCATTCATCCATTAC---- CACTTAGGTT 3070 hom 72 het 19 0 25 2 N/A 0 0 6758 CASAVA_Build X 89295525 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAATTG 3070 het 40 hom 45 1 42 2 C 1 0 6759 CASAVA_Build X 89300447 1D GTAGTATGTA T/- TTTTTTATCT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 7 6 6760 CASAVA_Build X 89305210 2D AAGGAAATTA AC/-- ACACAAAAAA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 AC 3 2 6761 CASAVA_Build X 89306681 1D AGCAGGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 30 1 21 8 A 11 10 6762 CASAVA_Build X 89306927 1I CAATTGCCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 9 10 6763 CASAVA_Build X 89310194 1I GCCCAGCTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 8 9 6764 CASAVA_Build X 89310418 3I ATATTGTTTA ---/TCT TCTTTAAATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TCT 1 2 6765 CASAVA_Build X 89310984 4I CAGTATAGTT ----/AAAC AATATTAAAA 3070 hom 135 het 46 0 46 0 AAAC 0 1 6766 CASAVA_Build X 89315505 1I TATTTATATA -/T TTATTTATAT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 2 3 6767 CASAVA_Build X 89318851 1D CAGTTGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 754 hom 35 2 18 15 A 15 14 6768 CASAVA_Build X 89322867 1D TTTAGGGGTG A/- AAAAAATCAC 3070 hom 111 het 41 0 38 5 A 7 6 6769 CASAVA_Build X 89325758 1D AATTCACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 37 1 30 7 T 13 12 6770 CASAVA_Build X 89328872 1D TCTCTCTCTA T/- TTTCATTGAC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 4 3 6771 CASAVA_Build X 89345346 28D TTTTTCTCTT CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC/---------------------------- CTTCCTTCCT 3070 hom 54 het 25 0 16 12 CTTC 12 5 6772 CASAVA_Build X 89351209 1D AATTAAAACT A/- AAAAAAAAAT 1094 het 1094 ref 37 30 3 4 A 10 9 6773 CASAVA_Build X 89357770 1D AAGTGGGGCA T/- TTTTTGGTTA 3070 hom 97 het 37 0 30 10 T 6 5 6774 CASAVA_Build X 89399671 1I AGAAAAAGTC -/A AATAATCCCA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 2 3 6775 CASAVA_Build X 89419554 1I CATTTCTGAC -/A AAGCTATTCC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 2 3 6776 CASAVA_Build X 89502119 2D ATTTTAATTC TG/-- TCTTTCCCTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 6 TG 1 0 6777 CASAVA_Build X 89526381 4I TAGATATCTG ----/TGTT TGTTTGTTTC 3070 hom 97 het 37 0 33 4 TGTT 2 3 6778 CASAVA_Build X 89526808 1I GTACAGGCAT -/C TTAAAGTTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 0 1 6779 CASAVA_Build X 89527009 1I AATGCAACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 9 het 43 1 33 9 A 9 10 6780 CASAVA_Build X 89530953 1I TGAGAAACAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 A 8 9 6781 CASAVA_Build X 89541771 6D TTGTCTTTGC GGGGGG/------ GGGGGGGGGG 3070 hom 86 het 32 0 26 7 G 17 11 6782 CASAVA_Build X 89666820 1D ACAGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1427 het 1427 ref 23 11 4 8 T 15 14 6783 CASAVA_Build X 89690590 1I TATAAAAAAA -/C ATAAGCAGAG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 C 0 1 6784 CASAVA_Build X 89693561 1D AAGAATTCAA C/- CCTCTTTTAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 3 2 6785 CASAVA_Build X 89776916 1I TTGGCGTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 677 hom 42 3 32 7 A 12 13 6786 CASAVA_Build X 89802183 1I AGTAGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1452 hom 23 7 12 4 T 15 16 6787 CASAVA_Build X 89807762 1I GAGAAACAAC -/A AAAAAAAAAA 1136 het 1136 ref 44 32 3 9 A 11 12 6788 CASAVA_Build X 89810145 1D ACATAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 1120 het 1120 ref 38 26 3 9 A 12 11 6789 CASAVA_Build X 89821100 2D GGCAATTTGC AT/-- ATATATATAT 1336 het 1336 ref 58 42 4 13 AT 7 6 6790 CASAVA_Build X 89914545 1D ATTATAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 22 0 17 5 A 12 11 6791 CASAVA_Build X 89984961 1I CTTTTCCTCT -/G GGTGGATACA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 2 3 6792 CASAVA_Build X 90019938 2I TCTTCATTTG --/AA AAGTGTCTGA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 2 4 6793 CASAVA_Build X 90025519 1I GGACCTACAT -/A AAAAAAAATA 2846 hom 38 het 15 0 12 3 A 8 9 6794 CASAVA_Build X 90034404 4D CCATGCATAT TCCA/---- TCCACAGGCA 3070 hom 120 het 46 0 40 9 TCCA 2 1 6795 CASAVA_Build X 90036001 1I ATATATATAA -/T TTTTTTCCAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 6 7 6796 CASAVA_Build X 90040425 1D GATTACTTTC T/- TGATTTCTGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 1 6797 CASAVA_Build X 90041345 14D TCTTCATGGT TCAAACTTAGTAGA/-------------- TCATATGTGT 3070 hom 101 het 36 0 31 9 TCAAACTTAGTAGA 1 0 6798 CASAVA_Build X 90045979 1D CTTGTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1904 het 47 hom 17 2 9 7 T 17 16 6799 CASAVA_Build X 90047813 1I ACTTAAAAAT -/A AAAAAAATAA 2190 hom 15 het 8 0 6 2 A 7 8 6800 CASAVA_Build X 90050837 1I AATCAGAATA -/G ATACTAGCCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 0 1 6801 CASAVA_Build X 90052258 1I GAAAACCAGG -/A AAAATAATCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 4 5 6802 CASAVA_Build X 90055117 3D TTGTTATGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 14 11 6803 CASAVA_Build X 90056792 1I TGAGCCCCCC -/A CTCCACGGAC 3070 hom 65 het 29 0 21 8 A 0 1 6804 CASAVA_Build X 90057100 1D TTGAAAAAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 10 9 6805 CASAVA_Build X 90065931 1D TAAGTAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 238 hom 40 1 31 8 A 10 9 6806 CASAVA_Build X 90149260 1I TCTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 169 hom 30 1 27 2 T 9 10 6807 CASAVA_Build X 90149368 1D GCGATTCTCC T/- TGCCTCAGCC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 2 1 6808 CASAVA_Build X 90155486 4I TTTGCCAGTC ----/TCTA TCTTTTAAGT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 TCTA 0 1 6809 CASAVA_Build X 90155984 1D GATAGGTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 796 hom 28 3 19 8 A 13 12 6810 CASAVA_Build X 90159400 1I TCTTAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 44 0 36 8 T 11 12 6811 CASAVA_Build X 90163257 1I TGTTTTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1082 hom 27 4 22 1 T 11 12 6812 CASAVA_Build X 90166742 3D ATAAAACTTT AGA/--- AGAACATATA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AGA 2 1 6813 CASAVA_Build X 90174703 2I GAGATCCTGC --/AT TCCTCTCTGC 3070 hom 153 het 58 0 51 7 AT 0 1 6814 CASAVA_Build X 90182517 1D TCTAAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 T 11 10 6815 CASAVA_Build X 90183653 1D AGAATATACA T/- TTTTTATCAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 6 5 6816 CASAVA_Build X 90184734 1I GCAGCATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 34 0 26 8 A 10 11 6817 CASAVA_Build X 90189214 1I CCCATCTCCG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 406 hom 27 1 21 5 A 9 10 6818 CASAVA_Build X 90191752 1I TAATGGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 20 1 11 8 T 13 14 6819 CASAVA_Build X 90196218 2D GCCCTAGGTT AA/-- GAGTTAACCT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 A 2 0 6820 CASAVA_Build X 90196529 15D TATTGAAGAT TTATATTATATTATA/--------------- TTATATTATA 2018 hom 21 het 8 0 8 3 TTATA 6 3 6821 CASAVA_Build X 90196650 1I TACATTAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 9 10 6822 CASAVA_Build X 90198821 1I AAGTAAAATT -/A TAAAAAATTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 0 1 6823 CASAVA_Build X 90201665 1I TGCACACACT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 64 het 39 1 29 9 A 9 10 6824 CASAVA_Build X 90205922 4D ACTCCACGGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 38 1 18 20 A 18 14 6825 CASAVA_Build X 90207092 1I TACAAATTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 32 hom 35 1 30 4 A 9 10 6826 CASAVA_Build X 90208538 1D GCCAGGTGAC T/- TAAGAGTCTG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 1 6827 CASAVA_Build X 90209082 1D CAATCTGACC T/- TTGGGAGTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 3 2 6828 CASAVA_Build X 90215249 4I AATTTGATTT ----/TATC TATCGAATTA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TATC 1 2 6829 CASAVA_Build X 90232476 1D CTCCTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 1525 het 1001 hom 25 5 7 14 T 19 18 6830 CASAVA_Build X 90258014 1D ACAAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 25 1 18 6 A 15 14 6831 CASAVA_Build X 90263673 1D GAAAGTAATA T/- TTTTTTCCAC 3070 hom 106 het 40 0 36 4 T 7 6 6832 CASAVA_Build X 90264047 1I CTGAATACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 44 1 31 12 T 10 11 6833 CASAVA_Build X 90273789 4I AGCTGCATAT ----/TCAG TCATTCTAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TCAG 0 1 6834 CASAVA_Build X 90275423 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 8 9 6835 CASAVA_Build X 90278259 4D AAGCACTCTC CTAA/---- CTAAGTATGT 3070 hom 127 het 49 0 43 10 CTAA 2 1 6836 CASAVA_Build X 90283718 3I TGCATTTCTC ---/TAA TAATTAGTGA 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 TAA 1 2 6837 CASAVA_Build X 90286256 1I TTTTAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 10 11 6838 CASAVA_Build X 90287549 2I TACTCTCTGA --/TT TTTTTTTTTT 2644 het 2644 ref 53 20 13 20 T 13 15 6839 CASAVA_Build X 90290333 4I TGTACCAAAC ----/TGTT TGGGCTCTGA 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 TGTT 0 1 6840 CASAVA_Build X 90290716 1I TGGCCCCTAC -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 6 7 6841 CASAVA_Build X 90297054 1I TAACTAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 10 11 6842 CASAVA_Build X 90298153 1I TCCAAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 A 10 11 6843 CASAVA_Build X 90300986 1I CCAAAATGAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 8 9 6844 CASAVA_Build X 90309144 1I AAATTGTGGA -/C CCCTCAATAG 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 C 3 4 6845 CASAVA_Build X 90311044 1D ACTGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 748 hom 38 3 25 10 T 12 11 6846 CASAVA_Build X 90318559 4D AAGCCATAGA CACT/---- CAGTGCCGGC 3070 het 3070 hom 37 15 18 7 CACT 1 0 6847 CASAVA_Build X 90321843 4D CAACAAAAAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 217 hom 23 4 14 5 A 14 10 6848 CASAVA_Build X 90326287 3D TCAAGAAGAT ATA/--- ATAATAATAT 3070 het 3070 ref 30 19 8 4 ATA 4 3 6849 CASAVA_Build X 90330601 3D AGTAATTACA CAT/--- CATTGGAGTA 2665 het 2665 ref 24 16 6 2 CAT 2 1 6850 CASAVA_Build X 90335607 1I TGTATCCAAC -/A AACATGAAAA 3070 het 3070 ref 46 23 12 11 A 2 3 6851 CASAVA_Build X 90339023 1D GACATCACCA T/- TTATCAAATT 3070 het 3070 ref 52 31 20 3 T 3 2 6852 CASAVA_Build X 90340067 1I TGCTTTCTAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 29 15 13 1 A 8 9 6853 CASAVA_Build X 90341264 1I ATGTCAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2324 hom 31 7 12 12 T 13 14 6854 CASAVA_Build X 90345843 1I TATATTTTTG -/A AAAAAAAATA 2133 het 2133 ref 25 15 6 4 A 8 9 6855 CASAVA_Build X 90351493 1D GCTCTTACCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 T 8 7 6856 CASAVA_Build X 90364247 4I TAGAAAGGAA ----/GAAG GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 GAAG 2 3 6857 CASAVA_Build X 90364967 1I AAGTGTTCAC -/A AAGTATTTGA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 2 3 6858 CASAVA_Build X 90368191 2D TCCCCTCCAT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 A 10 8 6859 CASAVA_Build X 90370914 1D TACTGAAAAA G/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 G 1 0 6860 CASAVA_Build X 90371123 5I AAACTTACTA -----/GTAAT GTAAATACAC 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 GTAAT 0 1 6861 CASAVA_Build X 90393872 16D CAGAAATAGG CTTTAATTTAAACAGA/---------------- CTTTAATTTA 2661 het 2661 ref 25 13 9 8 CTTTAATTTAAACAGA 2 1 6862 CASAVA_Build X 90401221 6I GGTGTGAGCC ------/ACTGCT ACTGCGCCTG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 ACTGCT 0 1 6863 CASAVA_Build X 90402605 1D CTGAAGCAAA C/- CTTGAGTACT 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 C 2 1 6864 CASAVA_Build X 90410614 5D TGAATTATAC TTTAT/----- TTTAACATAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 TTTAT 1 0 6865 CASAVA_Build X 90411594 1I CCAGATGTGA -/T TCCCATTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 T 1 2 6866 CASAVA_Build X 90413029 2D GCCTGTAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 T 14 12 6867 CASAVA_Build X 90419204 5I TTACAATAAC -----/AACAT AATAACCTTA 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 AACAT 0 1 6868 CASAVA_Build X 90432321 4I TATAAAAAAG ----/AATT AACATCAGTC 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 AATT 0 1 6869 CASAVA_Build X 90444610 1D GAGACAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 A 9 8 6870 CASAVA_Build X 90445622 1D AGACAGGAAT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 A 8 7 6871 CASAVA_Build X 90451574 11D GTATATGTAG ATTCTCTCTAT/----------- ATTCTCTCTA 3070 het 3070 ref 32 18 10 10 ATTCTCTCTAT 2 1 6872 CASAVA_Build X 90451709 3D CTAAGCAAAC AAT/--- AATGATGAGG 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 AAT 2 1 6873 CASAVA_Build X 90460911 1D GTAGATAAAC A/- AAAAGTATCT 2828 het 2828 ref 24 17 7 0 A 5 4 6874 CASAVA_Build X 90461442 1D GATAAAAAAA C/- AGATCATTAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 1 0 6875 CASAVA_Build X 90463742 1D CTTACCAATC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 A 10 9 6876 CASAVA_Build X 90468291 1D TGGAAGGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 A 11 10 6877 CASAVA_Build X 90470562 3D AAAAAAAAAA GAG/--- AGAGAAGATG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 GAG 1 0 6878 CASAVA_Build X 90471050 1I GAAGCAAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 9 10 6879 CASAVA_Build X 90471130 7I TGTTAAAGGG -------/GAATCTA TATGCAGCGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GAATCTA 0 1 6880 CASAVA_Build X 90479317 1D CTTATATCAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 8 7 6881 CASAVA_Build X 90482153 1I AAAAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 2411 het 2411 ref 22 10 6 6 A 10 11 6882 CASAVA_Build X 90482913 2D TTAAACCCAT GG/-- TTACCAGTGT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 G 2 0 6883 CASAVA_Build X 90494629 1I ACTATTCAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 8 9 6884 CASAVA_Build X 90497117 1D CAAAAAAAAA T/- ATCTGATAAG 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 T 1 0 6885 CASAVA_Build X 90498955 1D GAACTAATAT A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 7 6 6886 CASAVA_Build X 90499098 1D AACTCAAAGA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 4 3 6887 CASAVA_Build X 90515301 1D TGAATGGATT A/- AAAAAAGTAG 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 7 6 6888 CASAVA_Build X 90520983 1D AAGTTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 9 8 6889 CASAVA_Build X 90529447 1I AAAAAAAAAA -/T TCAAAATTAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 1 2 6890 CASAVA_Build X 90543187 2D GATAAAAGAC TT/-- TGCCCAACAG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 3 1 6891 CASAVA_Build X 90551837 1D GGAGGCGGCC A/- CCAAGCCCAG 3057 het 1462 hom 18 5 8 6 A 1 0 6892 CASAVA_Build X 90555035 1I CAGATTGGTT -/G GAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 69 29 32 8 G 1 2 6893 CASAVA_Build X 90566075 1I TTTTTTTTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 9 10 6894 CASAVA_Build X 90571676 1D CATTCTGTCA T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 7 6 6895 CASAVA_Build X 90574423 1I CTATTTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 10 11 6896 CASAVA_Build X 90575101 1D GAAAGCAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 41 3 19 19 A 12 11 6897 CASAVA_Build X 90579507 1D CTTGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2176 het 2176 ref 38 27 6 5 A 12 11 6898 CASAVA_Build X 90590416 1I AAGGCTAATT -/A AAAAACAGTA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 5 6 6899 CASAVA_Build X 90592712 1D ACACAGCAAC A/- GGAATACATT 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 A 1 0 6900 CASAVA_Build X 90597135 1D TTTATCCTAG C/- CCAATAATCT 3070 het 3070 ref 49 24 21 6 C 3 2 6901 CASAVA_Build X 90605498 1D TAATGTCCCC T/- GTTACCATTA 2851 het 2851 ref 26 15 6 5 T 1 0 6902 CASAVA_Build X 90606476 1I TGCACTTTTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 8 9 6903 CASAVA_Build X 90616616 5I TTAATCAAAA -----/GAATT GAAATCAGAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 GAATT 0 1 6904 CASAVA_Build X 90622724 1I TTTGTCTCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 9 10 6905 CASAVA_Build X 90639432 1D TAAAATCTAA C/- TGACATTTTC 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 C 1 0 6906 CASAVA_Build X 90642211 1D AGAACCAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 2114 hom 25 7 13 6 A 9 8 6907 CASAVA_Build X 90643225 2I ACCAAGGTCA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 AC 5 6 6908 CASAVA_Build X 90643743 2I CTCAACCATC --/TT TTGCCTTCAA 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 T 2 4 6909 CASAVA_Build X 90644548 1I GAGGAACCAG -/A AAAAAAAAAC 2838 het 2838 ref 31 14 8 9 A 9 10 6910 CASAVA_Build X 90645862 2D CCCCTATCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 17 21 10 AC 8 7 6911 CASAVA_Build X 90654589 1I AATGGAAAAC -/A AAAAAAAGGC 2647 hom 15 het 6 0 6 0 A 7 8 6912 CASAVA_Build X 90672762 1D AGGCTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 11 10 6913 CASAVA_Build X 90774910 1I ATTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 2194 het 1433 hom 18 7 6 5 A 9 10 6914 CASAVA_Build X 90775235 1I CTCAGCACAT -/G TTAATCAGTC 2107 het 2107 ref 43 31 5 7 G 0 1 6915 CASAVA_Build X 90779204 2I ATGCAAAAAG --/TT TAAATGAATG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 1 3 6916 CASAVA_Build X 90799664 1D ATGTTAAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 79 het 34 0 27 7 T 10 9 6917 CASAVA_Build X 90807595 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2966 het 1776 hom 27 7 10 10 T 15 14 6918 CASAVA_Build X 90814001 1I AATATTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2550 hom 24 7 12 5 T 11 12 6919 CASAVA_Build X 90823559 1I CCAAAAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 9 10 6920 CASAVA_Build X 90823725 2I AATAATGACC --/AG AGAGGAGGGA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 AG 2 3 6921 CASAVA_Build X 90830832 1I ATTAAATCAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 9 6922 CASAVA_Build X 91107808 1D AGTTCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1646 het 1646 ref 27 19 4 6 T 13 12 6923 CASAVA_Build X 91133008 1D TAAGACTTTC T/- TTTTTTTTTT 956 het 956 ref 36 12 5 19 T 17 16 6924 CASAVA_Build X 91140157 1I TTATCTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 31 2 24 5 A 11 12 6925 CASAVA_Build X 91158244 1D GCTAACTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 11 10 6926 CASAVA_Build X 91174507 1I TGATAAATGA -/T TTTTTTTTTT 1795 het 1795 ref 32 11 6 15 T 15 16 6927 CASAVA_Build X 91186671 2I CATAATTCCT --/AA GTTTGTAATT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 A 0 2 6928 CASAVA_Build X 91188737 3I GTTTATTTTC ---/TCT TCTTTAGGAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TCT 1 2 6929 CASAVA_Build X 91189895 3D TTTTCTTTTG AAA/--- AAAAAAAAAA 2005 het 2005 ref 34 19 7 8 A 16 13 6930 CASAVA_Build X 91190377 2D GTTGTTGATG AA/-- AAGACTTAAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 4 2 6931 CASAVA_Build X 91191944 5D ATATTTTCAG AAGAT/----- AAGTTAGGTA 3070 het 3070 ref 41 22 16 7 AAGAT 1 0 6932 CASAVA_Build X 91197336 1D CTAGTAGCCA T/- TTTTCCTGAT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 5 4 6933 CASAVA_Build X 91199599 2I ATAAAATTGC --/AA AGTCTACTTG 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 A 1 3 6934 CASAVA_Build X 91207365 1D GATTGTTAGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 8 7 6935 CASAVA_Build X 91209338 8D ATGTTGAATG AGTTTGGC/-------- AACAGTCCCT 3070 het 3070 ref 38 20 16 7 AGTTTGGC 1 0 6936 CASAVA_Build X 91218887 1D GGTAACCTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 9 8 6937 CASAVA_Build X 91224545 10I ACAAATATTT ----------/AAGTATACAA AAATTTAAGT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 AAGTATACAA 0 1 6938 CASAVA_Build X 91226630 1D AAACTATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 11 10 6939 CASAVA_Build X 91227270 1I TTATAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 10 6 A 12 13 6940 CASAVA_Build X 91247945 5I TTACATCATG -----/TCTTT TCTTTTATTC 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 TCTTT 1 2 6941 CASAVA_Build X 91253156 1D TAATATTTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 9 8 6942 CASAVA_Build X 91266846 3D GCTTATAAAT ATA/--- ATATCTTCAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 7 ATA 2 1 6943 CASAVA_Build X 91278091 1D AGGTACCTCA G/- GAGATAAGAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 G 2 1 6944 CASAVA_Build X 91281637 1D CTATTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2187 hom 22 7 9 6 T 12 11 6945 CASAVA_Build X 91286250 8I1M2D AGTCCAATTA --------AAC/GTTTTTCCA-- CTCTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 15 24 4 N/A 0 0 6946 CASAVA_Build X 91301272 1D CATTGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 A 11 10 6947 CASAVA_Build X 91301470 1D GGTTACCTCA T/- TTTTTTTTTT 2805 het 1780 hom 33 10 10 13 T 17 16 6948 CASAVA_Build X 91301577 1D TCCTGTTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 10 9 6949 CASAVA_Build X 91325636 3D TAATAGACTA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 9 17 10 T 12 9 6950 CASAVA_Build X 91349849 5D GACTCCATCT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2703 het 1145 hom 15 4 6 6 A 25 20 6951 CASAVA_Build X 91354530 2D CCCAACACAC TT/-- ATCTTTTGGC 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 T 2 0 6952 CASAVA_Build X 91355559 1D TATAAGGAAG A/- AATCAAGGGT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 A 3 2 6953 CASAVA_Build X 91361343 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAACTAC 1954 het 1954 ref 8 4 4 0 A 6 7 6954 CASAVA_Build X 91366987 1D ACAATAATTC A/- AAAAAAAAAA 1229 het 1229 ref 28 14 3 11 A 15 14 6955 CASAVA_Build X 91369612 2D AATAAGACAA TT/-- TTAAGATTAA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 T 4 2 6956 CASAVA_Build X 91374800 2I GTCGATTGTA --/CT CTCTTAGGTA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 CT 2 3 6957 CASAVA_Build X 91376341 1I ATAAAGGGTT -/A TTATACTCAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 0 1 6958 CASAVA_Build X 91376827 1I AAGCACAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 1020 hom 14 3 10 1 T 7 8 6959 CASAVA_Build X 91395111 1D TTTAGAATTG T/- TTTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 T 6 5 6960 CASAVA_Build X 91403300 1I CTAAAAAAAA -/G ATCTTTTGTG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 G 0 1 6961 CASAVA_Build X 91409956 1I GTATGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 11 6962 CASAVA_Build X 91426362 2D GCCTACAAAT CA/-- CAGTTTATTT 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 CA 2 1 6963 CASAVA_Build X 91429518 1D TATTTCTCCC T/- TGCTGTTCTT 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 T 2 1 6964 CASAVA_Build X 91433529 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 49 het 34 1 32 1 A 9 10 6965 CASAVA_Build X 91435484 1I AAACCTGACG -/A ACTGTCATAG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 1 2 6966 CASAVA_Build X 91446626 1I CTTGCAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 10 11 6967 CASAVA_Build X 91454841 1D AATGTGTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 10 9 6968 CASAVA_Build X 91457670 4I AACATGAATA ----/TTAC TTACATTAAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TTAC 1 2 6969 CASAVA_Build X 91468982 1D ATGATGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 13 12 6970 CASAVA_Build X 91475539 1D TTGAGTTGGG A/- TCTACTTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 1 0 6971 CASAVA_Build X 91476860 1D GTAAAATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 11 10 6972 CASAVA_Build X 91482481 2D GCTATACAAA TC/-- TCTCTGGCAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 9 TC 3 2 6973 CASAVA_Build X 91487545 1D TTAGTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 13 12 6974 CASAVA_Build X 91496972 9I GTCCCAGCTA ---------/CTTGGGAGG CTGAGGCAGG 1336 hom 7 het 3 0 3 0 CTTGGGAGG 0 1 6975 CASAVA_Build X 91498775 1D AAGGCCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 T 11 10 6976 CASAVA_Build X 91502611 2I CTGGGCAGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 10 12 6977 CASAVA_Build X 91505197 1D TTCTAACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 T 12 11 6978 CASAVA_Build X 91508254 2D TTGATTTCAG CT/-- TTCTTTCCAG 2408 het 2408 ref 19 11 5 3 CT 1 0 6979 CASAVA_Build X 91512116 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1003 het 1003 ref 23 10 3 10 T 17 16 6980 CASAVA_Build X 91522509 1D CATAATGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 T 13 12 6981 CASAVA_Build X 91524978 2I AGATAAATGT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 2859 hom 27 12 12 3 TG 0 1 6982 CASAVA_Build X 91534049 8D GCTTAGCACT CAAATACA/-------- CTACTAATTA 3070 het 3070 ref 41 22 19 1 CAAATACA 1 0 6983 CASAVA_Build X 91552630 1I GTATCAGTCA -/C CTGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 C 1 2 6984 CASAVA_Build X 91560681 1D TGTATTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 12 11 6985 CASAVA_Build X 91581578 4I AGAATGGAGT ----/ACAA ACAGTTACAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 ACAA 0 1 6986 CASAVA_Build X 91611509 1I TCCAGTGTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 9 10 6987 CASAVA_Build X 91612761 1D ATATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1814 hom 34 13 13 8 T 13 12 6988 CASAVA_Build X 91619217 1I10M1I TCCTAGATGT -TGGACATCTA-/GGGGACCTCAAG GGTCCACTTC 3070 het 3070 ref 46 23 21 7 N/A 0 0 6989 CASAVA_Build X 91646564 1D CATATGCTTG T/- TGGCCAAGTG 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 2 1 6990 CASAVA_Build X 91649477 1I CACAGGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 T 10 11 6991 CASAVA_Build X 91650408 5D AAATTTTGAA ATAAT/----- ATATTTCTAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 ATAAT 1 0 6992 CASAVA_Build X 91656947 8D AGAATTCAAA GTCCAAAT/-------- GTCCAAATGT 3070 het 3070 ref 33 20 8 6 GTCCAAAT 2 1 6993 CASAVA_Build X 91670066 2D1M4I TCCTGCCTCA GCC----/--CTATA TCCCGAGTAG 3070 hom 66 het 24 0 23 3 N/A 0 0 6994 CASAVA_Build X 91672559 2I TAGAATGCAA --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 8 10 6995 CASAVA_Build X 91673270 1I ACTAATACTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 432 hom 29 1 24 4 A 8 9 6996 CASAVA_Build X 91674314 1D TCCTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 41 0 29 12 A 12 11 6997 CASAVA_Build X 91683358 1D TAACTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 29 0 18 11 A 11 10 6998 CASAVA_Build X 91693049 1I CTTTTGCCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 9 10 6999 CASAVA_Build X 91693873 1D TCCTCCTCAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 8 7 7000 CASAVA_Build X 91694875 2D TTAACTGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 26 1 20 5 T 14 12 7001 CASAVA_Build X 91703087 1I CAAAATTCTA -/T CCAATAAATT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 0 1 7002 CASAVA_Build X 91705155 1D CAGGTCTGGC A/- GCAGACTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 10 4 A 1 0 7003 CASAVA_Build X 91706881 1D CCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 A 12 11 7004 CASAVA_Build X 91708990 4D TTTCAAGAAG TCCT/---- TCCTTCCTTC 3070 het 3070 ref 40 23 15 4 TCCT 4 3 7005 CASAVA_Build X 91717861 1I TGTTCTGCTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 8 9 7006 CASAVA_Build X 91738968 1I TAGAACTGAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 8 9 7007 CASAVA_Build X 91740007 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 A 7 6 7008 CASAVA_Build X 91744550 1I GCTCTACATG -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 6 7 7009 CASAVA_Build X 91749858 1D AAAAAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 11 10 7010 CASAVA_Build X 91776444 3D AAATTATGAG TAA/--- TAATGCTGCT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 TAA 2 1 7011 CASAVA_Build X 91779224 4D TGGCAGTTTC TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 TGTT 3 2 7012 CASAVA_Build X 91783281 3I ATAGCTCAGA ---/GAT GATTAAGTGT 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 GAT 1 2 7013 CASAVA_Build X 91784516 1I TCCTGAATTT -/A AAAAAAAAAA 1807 het 1807 ref 17 7 5 5 A 11 12 7014 CASAVA_Build X 91787405 1I ATGTTTCATC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 7 8 7015 CASAVA_Build X 91787694 1D AAAATACGTT G/- TTACAATTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 1 0 7016 CASAVA_Build X 91788148 2D CTAGTAGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2249 hom 30 10 13 7 T 16 14 7017 CASAVA_Build X 91789728 1I AATTTTCTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 8 9 7018 CASAVA_Build X 91790377 1I CACCTCATAC -/A AAAATCGACT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 A 4 5 7019 CASAVA_Build X 91790672 1D ACTGGTCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 10 9 7020 CASAVA_Build X 91790811 1I TGAAGAATAG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 6 7 7021 CASAVA_Build X 91791495 1D CGTTGGAGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 53 17 28 8 A 10 9 7022 CASAVA_Build X 91793934 1D CCATGCCATA T/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 19 0 T 1 0 7023 CASAVA_Build X 91796321 2I TATGATATGA --/CT CTGAGACAGA 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 CT 1 2 7024 CASAVA_Build X 91800692 1I AATAATAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 16 7 8 1 A 9 10 7025 CASAVA_Build X 91802009 1I TAGATCAAAA -/C CTTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 C 1 2 7026 CASAVA_Build X 91815245 1D AAAACCAAAT A/- CCACATGTTC 3070 het 3070 hom 52 20 24 10 A 1 0 7027 CASAVA_Build X 91823614 1I ACAAAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 10 11 7028 CASAVA_Build X 91826941 1I GTTGTCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 10 11 7029 CASAVA_Build X 91834348 3D GAATGGAGTA GAG/--- GAGAGGAGGA 3070 het 3070 hom 41 17 19 6 GAG 2 1 7030 CASAVA_Build X 91836948 27D ATGATATATG GGGATTTGGGGAACTATAATTCAAAAT/--------------------------- GGGATTTGGG 3070 het 3070 ref 33 18 12 12 GGGATTTGGGGAACTATAATTCAAAAT 2 1 7031 CASAVA_Build X 91848715 1I ACTCTTCTGG -/T TTTTGATATT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 4 5 7032 CASAVA_Build X 91850196 1D GTCGGCTGTA C/- GTAGACAGAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 C 1 0 7033 CASAVA_Build X 91876299 1I CAATTAAGAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 8 9 7034 CASAVA_Build X 91904935 3I CTTCAGAAAT ---/CTC CTAAACAATT 2917 het 2917 ref 26 17 6 3 CTC 0 1 7035 CASAVA_Build X 91906603 1D CATATATAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 10 9 7036 CASAVA_Build X 91930312 4I TAATAAATTC ----/TCAT TCACTCAATA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 TCAT 0 1 7037 CASAVA_Build X 91930412 3I TTTTTTGTTA ---/TTG TTGTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 TTG 1 2 7038 CASAVA_Build X 91940509 1D AAAGAAATTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 A 9 8 7039 CASAVA_Build X 91942369 1D TTATTGGCAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 8 7 7040 CASAVA_Build X 91943785 1D TGGAAATCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 A 17 16 7041 CASAVA_Build X 91944586 1D TGATGTACAA T/- TTTTTTTTTT 1154 het 1154 ref 17 9 3 5 T 15 14 7042 CASAVA_Build X 91946698 1I AGATTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 A 10 11 7043 CASAVA_Build X 91949518 1I TTAAATGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 11 12 7044 CASAVA_Build X 91956825 4D TTAAAACAAA CACT/---- CACAAAGTAG 3070 het 3070 hom 48 20 26 5 CACT 1 0 7045 CASAVA_Build X 91958921 1D CATTGTTAAT A/- TAATTAACGG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 1 0 7046 CASAVA_Build X 91987906 1D ATAATTTTAA T/- TTTTTTTAAT 3061 het 3061 ref 21 10 8 3 T 8 7 7047 CASAVA_Build X 91988964 1I16M2D TGTGTGGATT -AGTTCAATACAAAAGTTA/GAGTTCAATACAAAAGT-- TATATATATA 3070 het 751 hom 12 3 9 2 N/A 0 0 7048 CASAVA_Build X 91989528 1D TACAGCATTA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 37 21 10 7 T 8 7 7049 CASAVA_Build X 91990111 4D TAGAAAAACA ATAT/---- ATATGTAAAC 3070 het 3070 ref 47 25 17 8 AT 4 2 7050 CASAVA_Build X 91998569 4I ACTGGGGAGG ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAAT 2 3 7051 CASAVA_Build X 92000400 1I AAATGAGACA -/G GATGGCAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 2 7052 CASAVA_Build X 92002773 2D GCAACAGCTG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 117 het 48 0 38 10 A 11 9 7053 CASAVA_Build X 92049954 1D CACACAGCAT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 8 7 7054 CASAVA_Build X 92056819 1I ACATTCTATG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 7 8 7055 CASAVA_Build X 92058818 1D CCATGCTTCG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 10 9 7056 CASAVA_Build X 92066181 1D GTTCTTTTGA C/- TCTTGAGAGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 1 0 7057 CASAVA_Build X 92089510 3I ATATTGAAAA ---/GTT GTTGTAGTTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 GTT 1 2 7058 CASAVA_Build X 92099561 1I ATTTTATCAG -/A AAACAGTGAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 3 4 7059 CASAVA_Build X 92101207 2D CGTGACTCTC TT/-- GATTTTAGCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 0 7060 CASAVA_Build X 92113663 1D AATTAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 11 10 7061 CASAVA_Build X 92124066 1I GTCTTTGACC -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 7 8 7062 CASAVA_Build X 92125439 1I CAATAAGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1673 hom 25 5 15 5 T 14 15 7063 CASAVA_Build X 92126705 1I AAAGTAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 8 9 7064 CASAVA_Build X 92132062 1D AGAAAGGGGG A/- AAAATATATA 122 het 122 ref 26 2 2 22 A 5 4 7065 CASAVA_Build X 92134437 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 9 8 7066 CASAVA_Build X 92144590 1D CCATGTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 49 1 39 11 T 12 11 7067 CASAVA_Build X 92146395 1I TAATTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 33 2 24 7 T 12 13 7068 CASAVA_Build X 92154547 1D TTTCTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 33 1 22 11 T 13 12 7069 CASAVA_Build X 92155778 16D TAGGAGAGGC ACAAGATGGTCTCTCT/---------------- ACCTCTGTTT 3070 hom 114 het 39 0 39 6 ACAAGATGGTCTCTCT 1 0 7070 CASAVA_Build X 92156881 4I ATCAGATAAC ----/AGTT AGTTTTACTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AGTT 1 2 7071 CASAVA_Build X 92158036 1I ATTTTATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 10 11 7072 CASAVA_Build X 92158552 1D GAGCAAAGAT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 115 het 44 0 38 6 A 8 7 7073 CASAVA_Build X 92159303 1I CACCATAGCC -/T CATTTACTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 0 1 7074 CASAVA_Build X 92164005 1D AGAAAGAAAT A/- AAAAAAACAT 3070 hom 77 het 29 0 26 3 A 8 7 7075 CASAVA_Build X 92164474 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 8 7076 CASAVA_Build X 92167785 2I CCATACACTC --/TT TTGTCCTCAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 2 4 7077 CASAVA_Build X 92170817 4D TTTAAAAAAC AAAT/---- AAAAACATTA 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 AAAT 1 0 7078 CASAVA_Build X 92176610 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 7 8 7079 CASAVA_Build X 92194201 1I GCTAATATAT -/A AAATGTCAAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 3 4 7080 CASAVA_Build X 92198489 1D CAGCAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 36 3 20 13 T 13 12 7081 CASAVA_Build X 92201781 1D AATGAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 11 10 7082 CASAVA_Build X 92213449 1I CAAGCAGAAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 7 8 7083 CASAVA_Build X 92213776 1D19M1D GAAATAATTC AAAAAAAAAGGCAATAGAACA/-AAAAAAAAGGCAATAGAAC- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 37 20 14 7 N/A 0 0 7084 CASAVA_Build X 92215394 1D ATGGTAATAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 9 8 7085 CASAVA_Build X 92218111 1I AAAAAAACTG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 A 7 8 7086 CASAVA_Build X 92227592 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 9 8 7087 CASAVA_Build X 92246932 1I TTTAGAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 11 12 7088 CASAVA_Build X 92248508 1I CTTTAAAAAA -/T TATATATTTC 3070 het 3070 hom 39 10 23 6 T 1 2 7089 CASAVA_Build X 92249451 2D GGGGCTTGTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 17 16 9 T 11 9 7090 CASAVA_Build X 92250319 1I ATATTGCAGT -/G TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 G 0 1 7091 CASAVA_Build X 92252996 1D TGTGTGTGTA G/- GGGGGGGTGG 1476 hom 10 het 7 0 4 3 G 8 7 7092 CASAVA_Build X 92253572 3I GACCCAAAAC ---/AAA CTTTAACTAG 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 0 3 7093 CASAVA_Build X 92255996 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTTTTTTTTT 2362 het 2362 ref 35 18 10 7 TG 1 0 7094 CASAVA_Build X 92256327 1I CCTCATTTGA -/T TTTTTTGAAC 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 6 7 7095 CASAVA_Build X 92258941 1I ATGTGGAATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 A 9 10 7096 CASAVA_Build X 92259298 1I ACTTAAATAT -/A AAAACCCAAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 4 5 7097 CASAVA_Build X 92265577 1D AGTTCTGAAA T/- TTATTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 3 2 7098 CASAVA_Build X 92268680 2I CTCAGAAGCA --/TT CTTTTCATTG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 0 2 7099 CASAVA_Build X 92270209 3I CAAATGACTG ---/TTC TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTC 0 1 7100 CASAVA_Build X 92285877 1I CAGTGTGAAG -/C TTAAATTGTC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 C 0 1 7101 CASAVA_Build X 92288657 1D TTTTGGAGTT A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 A 7 6 7102 CASAVA_Build X 92291500 4I TTGGATTGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 37 0 27 10 TTTG 2 3 7103 CASAVA_Build X 92306444 3D AATATATTAG ATA/--- ATAATATTAT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 ATA 3 2 7104 CASAVA_Build X 92322279 1D GGTATTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 706 hom 41 3 30 9 T 12 11 7105 CASAVA_Build X 92384078 1D TTCAACGCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 10 9 7106 CASAVA_Build X 92385556 1I AATTAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 A 10 11 7107 CASAVA_Build X 92395806 1I AATTCCTTCT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 8 9 7108 CASAVA_Build X 92398283 1D GAAAACCCAC T/- CTGCATAATA 3070 hom 111 het 41 0 37 7 T 1 0 7109 CASAVA_Build X 92399671 1D TTGTACATAC A/- AGAGAAATTA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 2 1 7110 CASAVA_Build X 92400024 1I GGGCAGGAAA -/G GGGGGAAATG 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 G 5 6 7111 CASAVA_Build X 92400180 1I TTCTCACTAC -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 7 8 7112 CASAVA_Build X 92401318 1I CTTTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 38 2 24 12 T 12 13 7113 CASAVA_Build X 92404620 2I ATTATGAGAA --/TT TTTTTTTTTT 2524 het 2524 ref 24 9 7 8 T 12 14 7114 CASAVA_Build X 92411341 10D TACATACAAA CACCGGCATG/---------- CACAAACACA 3070 het 3070 hom 35 18 18 2 CACCGGCATG 1 0 7115 CASAVA_Build X 92413464 1D ATTTCTTGGG A/- ATAATAATTG 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 A 2 1 7116 CASAVA_Build X 92413883 19I AATTCTGGCC -------------------/TCTATATCCATAGGTATGA TTGTGCTATA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TCTATATCCATAGGTATGA 0 1 7117 CASAVA_Build X 92415524 2I CCTGAGGAAC --/AG AGTGAGATTG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AG 1 2 7118 CASAVA_Build X 92417554 4I TTATCAATTT ----/AGTA AGTATGACTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AGTA 1 2 7119 CASAVA_Build X 92437432 1D CTATTCAATG C/- CCAGATACAG 3070 het 3070 ref 45 17 16 12 C 3 2 7120 CASAVA_Build X 92439068 1I AAGAGCTAAT -/A CTAATTTTCC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 0 1 7121 CASAVA_Build X 92439452 2I TAGAAGGAAC --/AT ATCTCAACAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 1 2 7122 CASAVA_Build X 92445517 1D CTAATTCACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 9 8 7123 CASAVA_Build X 92450968 3D CATGGCCAGG CCT/--- GATGGTTCAT 3070 het 3070 hom 40 20 20 2 CCT 1 0 7124 CASAVA_Build X 92455463 1I GACTTTAGGG -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 6 7 7125 CASAVA_Build X 92463775 1I CTCATGACTC -/T TAAGTGGTGC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 1 2 7126 CASAVA_Build X 92464444 2D TGAAGGTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 34 3 26 6 T 15 13 7127 CASAVA_Build X 92464744 1D TATTCAACAT A/- AGTATTGGAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 2 1 7128 CASAVA_Build X 92464961 1D TTATATACAC A/- AAAAAGGAAC 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 6 5 7129 CASAVA_Build X 92470258 4I AATTTAACAT ----/TGAC TGTACTAATT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TGAC 0 1 7130 CASAVA_Build X 92470419 20I CTCTATTAAT --------------------/AGACAACTGAAAATAATTCA GTATAGACAA 3070 hom 96 het 33 0 33 5 AGACAACTGAAAATAATTCA 0 1 7131 CASAVA_Build X 92487680 15D ACTGATGGGT CAGACCTGAAGCCAG/--------------- CAGTGCAGTT 3070 het 3070 ref 43 27 15 5 CAGACCTGAAGCCAG 1 0 7132 CASAVA_Build X 92496998 1D ACTTTTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 16 12 5 A 9 8 7133 CASAVA_Build X 92498019 13D2M3D3M3D TCTTACCCCA TTGTATCTTACCCCATACAATGGA/-------------CA---AAT--- CTCCAAAGTC 3070 hom 54 het 16 0 19 1 N/A 0 0 7134 CASAVA_Build X 92500266 1D CCTGAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 30 1 23 6 A 12 11 7135 CASAVA_Build X 92504089 3D GAAGCGTAGC ATG/--- ATAATATAGG 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 ATG 1 0 7136 CASAVA_Build X 92526672 1D TAAAAAAGGT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 1869 hom 32 7 12 14 G 10 9 7137 CASAVA_Build X 92533627 1I TTGTGTGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 50 17 18 15 T 9 10 7138 CASAVA_Build X 92558222 4D ACAATAAGAT ATAA/---- ATAGTTACAA 3070 het 3070 hom 40 19 20 3 ATAA 1 0 7139 CASAVA_Build X 92592762 1D TCTAGGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 T 11 10 7140 CASAVA_Build X 92606550 1D GAAATGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 T 11 10 7141 CASAVA_Build X 92607981 4I TCTACTAAAC ----/ACTT ACAGACTTAT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 ACTT 0 1 7142 CASAVA_Build X 92613418 1D CCAAGAGTTG C/- GTTCTTCAAA 3070 het 3070 ref 38 19 18 2 C 1 0 7143 CASAVA_Build X 92620226 1I TCAAAAGCAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 1954 hom 27 5 20 2 A 8 9 7144 CASAVA_Build X 92625500 2I TCTAGGACTC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 AG 5 6 7145 CASAVA_Build X 92627285 2I AAGCTTGAGG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 TC 8 9 7146 CASAVA_Build X 92635381 1I GATGCAAGGA -/C CCCCTGGAAG 3070 het 3070 hom 56 24 22 10 C 4 5 7147 CASAVA_Build X 92660805 1D CAGCTGAGCT A/- AATTAGAATA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 3 2 7148 CASAVA_Build X 92671856 5I AAATATATTC -----/TATAA TATATGTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 TATAA 0 1 7149 CASAVA_Build X 92687306 1I AAGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2905 hom 25 7 9 9 A 10 11 7150 CASAVA_Build X 92689265 7D ACATTGAAGA GAAAAGG/------- GAATGCTTAT 3070 het 3070 hom 35 14 21 3 GAAAAGG 1 0 7151 CASAVA_Build X 92702426 1D GATATATTTA C/- TGAGGTGAAA 3070 het 3070 hom 42 13 24 6 C 1 0 7152 CASAVA_Build X 92812250 1D TTTGCCACCG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 50 het 32 0 16 16 C 10 9 7153 CASAVA_Build X 92818582 4D TTTTGTAGCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2734 het 2734 ref 29 14 6 9 T 14 10 7154 CASAVA_Build X 92875146 1D AGGTAATCAG T/- TTTTTTTTTT 1988 het 1988 ref 35 24 5 6 T 13 12 7155 CASAVA_Build X 92884422 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2125 het 142 hom 16 3 6 8 A 14 12 7156 CASAVA_Build X 92897697 1D AGGAAAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 31 0 23 8 T 12 11 7157 CASAVA_Build X 92915262 1D CTTCAGTGAT A/- AAAAAAAAAA 920 het 920 ref 36 27 3 7 A 13 12 7158 CASAVA_Build X 92917724 1D CCTTTGTTTT G/- TTTTTTGGTT 3070 hom 125 het 46 0 41 5 G 1 0 7159 CASAVA_Build X 92944684 1I AAACATGCAA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 7 8 7160 CASAVA_Build X 93048224 25I TGGTGCTTTC -------------------------/AAGAGAGCACAAGCTGCAGTAATAG AAGGGGGATT 3070 hom 69 het 21 0 24 2 AAGAGAGCACAAGCTGCAGTAATAG 0 1 7161 CASAVA_Build X 93048513 1D TATCAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 34 1 26 8 T 12 11 7162 CASAVA_Build X 93053352 1I GTGGCACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 28 1 19 8 A 13 14 7163 CASAVA_Build X 93057630 1I TTGTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 32 1 24 7 A 13 14 7164 CASAVA_Build X 93069067 1D AAAGTTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 29 8 T 12 11 7165 CASAVA_Build X 93087546 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 1992 hom 12 het 9 0 5 4 A 10 11 7166 CASAVA_Build X 93088099 1I TAATAATGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 9 10 7167 CASAVA_Build X 93090899 3D AACTTTTTAA TAT/--- TATTATTTTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TAT 3 2 7168 CASAVA_Build X 93093942 1D GCTTTGCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 26 7 T 10 9 7169 CASAVA_Build X 93097456 1I GAGGTAATTG -/A ATCATGGGGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 1 2 7170 CASAVA_Build X 93098293 1D TTTTTTATTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 10 9 7171 CASAVA_Build X 93103820 4D TGGAATAGAC ACTT/---- ACTCTGGATA 3070 hom 100 het 40 0 31 10 ACTT 1 0 7172 CASAVA_Build X 93203645 1D ACCAAACCCA G/- CTAATTTTTG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 1 0 7173 CASAVA_Build X 93209280 1I GATGAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1497 hom 39 4 29 6 A 12 13 7174 CASAVA_Build X 93229535 1D TAGCTGCTGT C/- AGATTTGTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 1 0 7175 CASAVA_Build X 93253315 1D GTGTAACCCT C/- CAGAACTCTC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 2 1 7176 CASAVA_Build X 93278661 4I TTATATCTGC ----/CTGT CTAACTCCAC 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 CTGT 0 1 7177 CASAVA_Build X 93283957 4D TGCAAACATA TATC/---- TATCTAAGTG 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 TATC 2 1 7178 CASAVA_Build X 93287347 1I CTATTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 11 11 T 13 14 7179 CASAVA_Build X 93331312 1I TGATATGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 17 13 18 T 14 15 7180 CASAVA_Build X 93345996 5I AGAACATTCC -----/AAGAG AAGAGTGGTC 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 AAGAG 1 2 7181 CASAVA_Build X 93365469 7I TATAATATAT -------/AATATAC ATACATATAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 AATATAC 0 1 7182 CASAVA_Build X 93415404 1D CCATAACTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 285 hom 36 2 24 10 A 15 14 7183 CASAVA_Build X 93422852 1D TCTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2140 het 2140 ref 26 11 6 9 T 15 14 7184 CASAVA_Build X 93423765 1I CATCCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 37 0 25 12 A 12 13 7185 CASAVA_Build X 93432342 1D GTGAGATCCA C/- CCCCTGCCCA 3070 het 4 hom 23 1 21 1 C 5 4 7186 CASAVA_Build X 93438181 1I TGTGGCTTTG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 101 het 41 0 34 7 A 6 7 7187 CASAVA_Build X 93442248 5I TTTTCCACCT -----/CTTTA CTTTAAGTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 CTTTA 1 2 7188 CASAVA_Build X 93454322 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 32 1 15 16 T 15 14 7189 CASAVA_Build X 93489156 1I ATCTTTGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 353 hom 38 1 34 3 T 9 10 7190 CASAVA_Build X 93498553 2D GATATTAGAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 59 het 40 1 31 8 GA 9 8 7191 CASAVA_Build X 93505954 2D TAAGCTCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 1599 het 596 hom 28 9 5 14 T 18 16 7192 CASAVA_Build X 93507428 1I ACAAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 35 1 26 8 A 13 14 7193 CASAVA_Build X 93525626 1I ATAAATAAAT -/G TTTAAAAAAC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 G 0 1 7194 CASAVA_Build X 93531202 4I GTTGAGACAT ----/ACTG ACTTTTACTC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 ACTG 0 1 7195 CASAVA_Build X 93532439 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 31 1 26 4 T 11 12 7196 CASAVA_Build X 93544152 1D TTATAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 10 9 7197 CASAVA_Build X 93556950 2D AAAATAGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 29 0 23 7 T 15 13 7198 CASAVA_Build X 93562964 3D AAATAATTCT CTC/--- CTCCTTTATT 3070 hom 78 het 34 0 27 8 CTC 2 1 7199 CASAVA_Build X 93575345 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1720 het 1399 hom 14 4 4 6 T 13 14 7200 CASAVA_Build X 93577036 2D TAAGGCATAC AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 AT 1 0 7201 CASAVA_Build X 93577418 2D AATATGTCAA AG/-- AAATATATTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 AG 1 0 7202 CASAVA_Build X 93581661 1D CTTCCTGCTG A/- AAAAAAGGCA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 A 7 6 7203 CASAVA_Build X 93582016 4D TCTTTTTAAA CAAC/---- CAACTATTCT 3070 het 3070 hom 36 14 21 3 CAAC 2 1 7204 CASAVA_Build X 93582659 1D TACCCATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2739 hom 36 10 20 6 T 13 12 7205 CASAVA_Build X 93594630 5D CATAGATAAT AAAAC/----- AAAGTAATAC 3070 het 3070 ref 25 14 8 4 AAAAC 1 0 7206 CASAVA_Build X 93597035 3D AATTTATAAT AAA/--- TAATTGGATG 2776 het 2776 ref 28 17 8 3 A 3 0 7207 CASAVA_Build X 93598808 2D AGTATACATT GG/-- GGTTTGGCCC 3070 het 3070 ref 39 18 14 10 G 4 2 7208 CASAVA_Build X 93603703 1I CAGAGCCATA -/T ATATTTTGCT 3070 het 3070 hom 20 7 9 4 T 0 1 7209 CASAVA_Build X 93613560 1I TTAAGACTTT -/G AGGGGCTGTA 3070 het 227 hom 26 1 20 5 G 0 1 7210 CASAVA_Build X 93622779 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2635 het 2635 ref 33 14 8 11 T 15 16 7211 CASAVA_Build X 93628196 5I AAAAACAAAC -----/AAACA AAAATAACAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AAACA 0 1 7212 CASAVA_Build X 93628495 4D AAATCTGTTC TTAT/---- TTAAAGGAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TTAT 1 0 7213 CASAVA_Build X 93631234 2D AGGAGACTGA AG/-- AGAGAGAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AG 4 3 7214 CASAVA_Build X 93642032 1I TTAAAGCTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 8 9 7215 CASAVA_Build X 93648300 1D TTAAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 18 9 A 12 11 7216 CASAVA_Build X 93670662 4D TTCTTTCTAT TGAG/---- TGAGTTGTGT 3070 hom 105 het 41 0 36 7 TGAG 2 1 7217 CASAVA_Build X 93671685 1I CAGAGGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 10 11 7218 CASAVA_Build X 93678685 1D ATCTATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 12 11 7219 CASAVA_Build X 93703286 4D TGCAGAAGTC TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 55 26 22 9 TTTG 3 2 7220 CASAVA_Build X 93703759 1I AGTTTTGTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 8 9 7221 CASAVA_Build X 93704116 1I CTTTTTCAGA -/T TTTTTTGCCT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 6 7 7222 CASAVA_Build X 93704207 1D GTTATCATAG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 8 7 7223 CASAVA_Build X 93733337 3D TTATGATGAT TAA/--- TATTATTATG 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 TAA 1 0 7224 CASAVA_Build X 93736346 2D GAAACCAAAT AC/-- AGATTCACAC 3070 het 3070 ref 42 24 11 8 AC 1 0 7225 CASAVA_Build X 93737099 1D ACAGTTTGAC A/- ATTTCTTATA 3070 het 3070 ref 36 16 16 5 A 2 1 7226 CASAVA_Build X 93749194 1D TGTAGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3012 hom 35 16 10 10 T 15 14 7227 CASAVA_Build X 93750275 3D ACAGTTTTTT TTA/--- TTATTATTTT 2577 het 2577 ref 21 10 7 4 TTA 3 2 7228 CASAVA_Build X 93752779 3D TTTACCTGAT AAC/--- AACAACACTG 3070 het 3070 hom 39 16 19 6 AAC 3 2 7229 CASAVA_Build X 93759267 1I TTGTAACCAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 2441 hom 18 6 10 2 G 0 1 7230 CASAVA_Build X 93768323 6D TTGAAAAAAT AAATAA/------ AAATAAAGAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 AAATAA 2 1 7231 CASAVA_Build X 93770158 1D AGTAGTTGCA T/- TTAATTATGT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 3 2 7232 CASAVA_Build X 93772181 1I ACATAATCGG -/A AGGAGGTTGG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 1 2 7233 CASAVA_Build X 93789776 1I TTGCACCATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 25 18 9 T 9 10 7234 CASAVA_Build X 93790430 2D ATAGCCAAAT AC/-- AGTGTCATGA 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AC 1 0 7235 CASAVA_Build X 93815986 3D CAGAGCCAAG CCA/--- CCATATCACA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CCA 2 1 7236 CASAVA_Build X 93817101 1D AGGGTGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 T 13 12 7237 CASAVA_Build X 93824351 2D CTTTTTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 20 13 T 13 11 7238 CASAVA_Build X 93836372 4D GTTTATTAGA ATTT/---- ATTTTTCATT 3070 het 3070 ref 28 14 11 7 ATTT 2 1 7239 CASAVA_Build X 93837929 1I CCAAAGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1185 hom 38 3 27 8 A 10 11 7240 CASAVA_Build X 93840339 1I ACAACTGCCG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 8 9 7241 CASAVA_Build X 93860332 1I CTCCATGTTT -/C TATTTGTCTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 0 1 7242 CASAVA_Build X 93865175 1I TGAACTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 10 11 7243 CASAVA_Build X 93879680 1I AGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 673 hom 32 3 21 8 T 13 14 7244 CASAVA_Build X 93880977 2I AACTCCTGGA --/TC TCTCTGTGTG 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 TC 2 3 7245 CASAVA_Build X 93885141 1D AGCAGGTTCC T/- TTCTGGCTCA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 3 2 7246 CASAVA_Build X 93900504 1I AAGGGTATTT -/C AGGTGACTAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 0 1 7247 CASAVA_Build X 93917679 2D ATTTTTAAAG AT/-- ATATATATAT 1919 het 826 hom 6 2 4 0 AT 10 9 7248 CASAVA_Build X 93955493 5I ACATGGCTCT -----/TATTA TATTAAAGAA 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 TATTA 1 2 7249 CASAVA_Build X 93995444 1D ACCTGTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 A 12 11 7250 CASAVA_Build X 93997194 1I AGCATAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 9 10 7251 CASAVA_Build X 94011339 1I AGTAAGGAGG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 7 8 7252 CASAVA_Build X 94021896 1I TTCTCCACAG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 0 1 7253 CASAVA_Build X 94066265 1D GAACAATTTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 13 14 4 A 9 8 7254 CASAVA_Build X 94068233 1I TAAGCCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 11 12 7255 CASAVA_Build X 94071800 2I CCACACTATA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 10 12 7256 CASAVA_Build X 94088724 1I CAAAGAGAAT -/A AAATATCTAG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 3 4 7257 CASAVA_Build X 94093064 2D AGGCAAACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 17 9 T 14 12 7258 CASAVA_Build X 94095423 1D CATTCATTGT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 9 8 7259 CASAVA_Build X 94097294 3D TATTGAGAAA AAT/--- AATAATTCAG 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 AAT 3 2 7260 CASAVA_Build X 94110016 2I TCCCCAACTA --/AT ATGTAATCTA 3070 het 3070 ref 60 28 25 7 AT 1 2 7261 CASAVA_Build X 94114457 1D TTTAATGGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2927 hom 28 9 15 4 T 10 9 7262 CASAVA_Build X 94116460 1D TTCCCTTCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 10 9 7263 CASAVA_Build X 94129427 1I GAATGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 10 11 7264 CASAVA_Build X 94131399 1I CACAAAACCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 26 12 9 T 8 9 7265 CASAVA_Build X 94132118 2I AATGAGAGAC --/TT TGACTCACAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 3 7266 CASAVA_Build X 94133335 2I ATGTAAATTA --/GT GTACAACCAC 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 GT 1 2 7267 CASAVA_Build X 94136395 1D TACAATTCCA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 8 7 7268 CASAVA_Build X 94140905 5I TTCTGGACTC -----/CTATT CTGGTTCATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CTATT 0 1 7269 CASAVA_Build X 94150128 4I TAATTTGCAT ----/TTTC TTTATTTTTT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TTTC 0 1 7270 CASAVA_Build X 94150600 1I ATGCACAGCT -/A TTTTTATATA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 0 1 7271 CASAVA_Build X 94156524 2I ATATTCTCAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 AT 7 8 7272 CASAVA_Build X 94162387 1I TGCAGAATGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 46 18 18 10 A 8 9 7273 CASAVA_Build X 94170765 1D AGAACTAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 A 9 8 7274 CASAVA_Build X 94175965 4I TTTCTTACTG ----/TCTT TCTTTGTGGT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 TCTT 1 2 7275 CASAVA_Build X 94180238 1I TACTTTACAA -/T CTGTAAATCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 1 7276 CASAVA_Build X 94180730 1D ACAGGTGTAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 19 8 10 2 T 9 8 7277 CASAVA_Build X 94181795 1D CTAAAACCCT G/- GGGGGGGGGG 1913 het 1913 ref 36 14 5 17 G 11 10 7278 CASAVA_Build X 94183744 1I CTAGACTAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 8 9 7279 CASAVA_Build X 94183872 1D AATTACATAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 8 7 7280 CASAVA_Build X 94187043 11D CCTTAGGTAT CAGCTCAGGCA/----------- CAGAGTGATA 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 CAGCTCAGGCA 1 0 7281 CASAVA_Build X 94188535 4D29M2I AATCAAGGAT AAAGAAAGGATCATAAAAGCAGCAAGAGAAAAG--/----AAAGGATCATAAAAGCAGCAAGAGAAAAGAA AAAAAAAAAA 3070 het 2052 hom 28 5 13 20 N/A 0 0 7282 CASAVA_Build X 94188703 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 A 9 8 7283 CASAVA_Build X 94189956 4I TAAGATCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 8 het 35 2 30 3 AAAC 3 4 7284 CASAVA_Build X 94205303 6I TAGGAGAATA ------/TATGAG TATATTTATT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 TATGAG 0 1 7285 CASAVA_Build X 94208487 1D TGGCAGCATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 A 9 8 7286 CASAVA_Build X 94209972 2I GAAAACAAAC --/TG AACCAAACTC 3070 het 3070 hom 49 16 25 8 TG 0 1 7287 CASAVA_Build X 94213234 1D AAAAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 A 12 11 7288 CASAVA_Build X 94225518 2I ATGACCACAC --/AA AAATTATACA 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 A 3 5 7289 CASAVA_Build X 94228811 5I GAGAAGTGCC -----/AAGAA AAGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 AAGAA 0 1 7290 CASAVA_Build X 94251975 1I TAGATAAAAA -/G ATAGGTAGAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 0 1 7291 CASAVA_Build X 94253010 1I GAAAACCACA -/C GGCATCCATA 3070 het 3070 hom 40 21 18 1 C 0 1 7292 CASAVA_Build X 94257235 1I ATTAAAGGCC -/T TTTCTGGTCT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 3 4 7293 CASAVA_Build X 94262954 47I AATAAATAAT -----------------------------------------------/TACTTTATCATTCAGATTTTATTTACTATATTAGGTCTGAAACTTAA TACCAGGATT 3070 het 3070 ref 29 20 8 3 TACTTTATCATTCAGATTTTATTTACTATATTAGGTCTGAAACTTAA 0 1 7294 CASAVA_Build X 94282646 1I AGGAAGGGCT -/G ATGTGGTCGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 7295 CASAVA_Build X 94285281 1D TGTGATGTTG C/- CATCCTTGAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 2 1 7296 CASAVA_Build X 94309671 4I TTCACACATC ----/ACTT AGTTTACTCA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 ACTT 0 1 7297 CASAVA_Build X 94310401 2I AGTTTCTGTT --/TA TATATAGATG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TA 3 4 7298 CASAVA_Build X 94326612 1D ATCTCCTGAC T/- TTTTTGATAA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 6 5 7299 CASAVA_Build X 94329662 1D ATACAAGGTT C/- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 21 2 C 1 0 7300 CASAVA_Build X 94336535 1D CTTTTTTTTT A/- ATCTTTGTTC 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 A 2 1 7301 CASAVA_Build X 94340118 1D TGTTTTTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 T 9 8 7302 CASAVA_Build X 94341985 4I GTTCTTTCTT ----/TCTC TATCTTGTGA 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 TC 0 2 7303 CASAVA_Build X 94342438 6D GTTGTTTCAG TTTTAT/------ TTAGTTCTGC 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 TTTTAT 1 0 7304 CASAVA_Build X 94346663 11I ACTGAGCTGT -----------/TCTCGGCAGAG TCTTTATACT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 TCTCGGCAGAG 0 1 7305 CASAVA_Build X 94351727 1I TTGAAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2975 hom 28 8 15 5 A 10 11 7306 CASAVA_Build X 94356861 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 9 23 2 A 9 8 7307 CASAVA_Build X 94394043 2D CGTGTGTGGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 TA 9 8 7308 CASAVA_Build X 94443928 1I AAGTCAAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 A 9 10 7309 CASAVA_Build X 94445138 1D AAATGAAAAC A/- AAAAAAAAAC 1367 het 1367 ref 41 32 3 7 A 10 9 7310 CASAVA_Build X 94455906 1D TTTAATGGAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 9 8 7311 CASAVA_Build X 94458028 1D TTATTATTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 T 9 8 7312 CASAVA_Build X 94511540 1I CAAAACAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 10 11 7313 CASAVA_Build X 94530819 1D GAAAGGGGAC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 94 het 33 0 29 4 T 8 7 7314 CASAVA_Build X 94551974 1I TTAAAGAGTA -/T TTTTTTTTTT 1586 het 1586 ref 23 14 4 5 T 11 12 7315 CASAVA_Build X 94718279 1I GGCTTTCCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 9 10 7316 CASAVA_Build X 94730924 1I ACATAGGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 464 hom 35 2 22 11 A 9 10 7317 CASAVA_Build X 94733150 1I AATGAATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 83 hom 35 1 29 5 T 9 10 7318 CASAVA_Build X 94746373 4D ACACACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 91 het 35 0 31 4 AC 10 8 7319 CASAVA_Build X 94749427 2I TATGACTCTC --/TG TATTTCGTCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TG 0 1 7320 CASAVA_Build X 94754620 4D AATGGAAGAA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 51 het 24 0 17 7 TATT 4 3 7321 CASAVA_Build X 94755448 1D TTTTGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 32 1 24 8 T 12 11 7322 CASAVA_Build X 94761754 2D CCTCCATGTT AG/-- CATTTCAACA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AG 1 0 7323 CASAVA_Build X 94764532 1I GAGTTTGAGA -/C CAGTCTGGGC 3070 hom 63 het 25 0 19 6 C 1 2 7324 CASAVA_Build X 94844855 1I TTTTTGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 32 1 25 6 T 10 11 7325 CASAVA_Build X 94859810 1I TTCAGGGAGA -/G GGGGGGCCAC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 G 6 7 7326 CASAVA_Build X 94879932 3I AATAACAATT ---/ACA ACAACTTTTG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 ACA 1 2 7327 CASAVA_Build X 94881697 4I AATAACACCT ----/AGAA AGAGTTGAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AGAA 0 1 7328 CASAVA_Build X 94890050 2D CTTCTCCTTA AT/-- ATATATATAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 AT 5 4 7329 CASAVA_Build X 94894962 1D TATTCCTACG T/- TATTTTATTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 7330 CASAVA_Build X 94901794 6D AAATCTGTGC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 32 1 17 17 A 23 17 7331 CASAVA_Build X 94906355 1I CTTTCCAAAA -/T GTTTCCACAA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 0 1 7332 CASAVA_Build X 94913245 1I GTGGGGGGTT -/A GGGGAGGGAT 1244 hom 18 het 7 0 7 0 A 0 1 7333 CASAVA_Build X 94918002 1D CTAGCCATTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 1878 hom 13 5 7 13 T 9 8 7334 CASAVA_Build X 94923172 1D CACTGTTTCA T/- TTCCTTGGTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 3 2 7335 CASAVA_Build X 94924942 1D GAGTTAAGTG T/- TTTGTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 4 3 7336 CASAVA_Build X 94935826 7I TCCTGGAGAC -------/TGAGTAG TATCTTTTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TGAGTAG 0 1 7337 CASAVA_Build X 94948593 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 13 12 7338 CASAVA_Build X 94955158 2D GGAGTCATCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 30 0 25 5 A 13 11 7339 CASAVA_Build X 94962117 2I AAACGAACAA --/AC AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 AC 0 1 7340 CASAVA_Build X 94964308 1D GTTTTCTACT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 A 8 7 7341 CASAVA_Build X 94980902 4D AAGTTATTTT TCTA/---- TCTATTAAAT 3070 hom 40 het 15 0 14 1 TCTA 2 1 7342 CASAVA_Build X 94984652 9I CTAGGAAGTG ---------/GCATAGCCA GCATTCAAAT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 GCATAGCCA 0 1 7343 CASAVA_Build X 94989625 1I CAGCAGGATA -/G GGCACCTGTC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 2 3 7344 CASAVA_Build X 95015386 1D TAGAAGAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 8 7 7345 CASAVA_Build X 95016507 1I TTCTCCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 34 2 27 5 A 10 11 7346 CASAVA_Build X 95022251 1I ACTGATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 10 11 7347 CASAVA_Build X 95030016 1D TGTCCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 21 0 16 5 T 12 11 7348 CASAVA_Build X 95036106 4I TGTTTAATTC ----/AACA AACATTTATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AACA 1 2 7349 CASAVA_Build X 95042292 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1379 hom 19 4 12 3 A 15 14 7350 CASAVA_Build X 95053767 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1226 het 1226 ref 22 12 3 7 A 15 14 7351 CASAVA_Build X 95066814 1D CACTTAGAGC A/- ATGCAAAATG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 2 1 7352 CASAVA_Build X 95079735 1D TGGTATGAAA C/- CCACTTGATC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 C 3 2 7353 CASAVA_Build X 95089364 1I AAACCAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 8 9 7354 CASAVA_Build X 95126828 1I ACTCACACAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 172 het 59 0 57 2 A 8 9 7355 CASAVA_Build X 95127821 1I TTCCTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 11 12 7356 CASAVA_Build X 95134044 1I ATAGTAACAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 8 9 7357 CASAVA_Build X 95140385 2I TGACTAATCT --/AA GTGTTCCTAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 0 2 7358 CASAVA_Build X 95142252 1I TATAATTTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 10 7359 CASAVA_Build X 95142540 2I ACAAACACAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 104 het 43 0 30 13 AC 5 6 7360 CASAVA_Build X 95145926 1I CATAGAAGAA -/G TTTGACTACC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 0 1 7361 CASAVA_Build X 95146615 1I TTGGCTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 10 11 7362 CASAVA_Build X 95146811 4D TATATATAAA TTAT/---- TTATTTATGT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TTAT 3 2 7363 CASAVA_Build X 95147543 1I AATTCCAGCC -/A GGCACCAGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 1 7364 CASAVA_Build X 95150406 1I AGACACACAC -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 6 7 7365 CASAVA_Build X 95151031 1D ATCGAATTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 10 9 7366 CASAVA_Build X 95176357 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 899 hom 25 2 16 7 A 15 16 7367 CASAVA_Build X 95178599 3I GTTTCAGAAA ---/GCT GCAGGAGCCT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 GCT 0 1 7368 CASAVA_Build X 95181408 7I AAGCTTTCTA -------/CTCTATG CTCTTCCTCA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 CTCTATG 0 1 7369 CASAVA_Build X 95188108 1D GAATTTAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 34 0 29 6 T 10 9 7370 CASAVA_Build X 95189946 8D TCTATAACTA TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 839 het 551 hom 24 4 9 11 TC 9 5 7371 CASAVA_Build X 95211657 4D AAAAAAAAAA GGAG/---- AAAAGGAAAA 1466 hom 36 het 16 0 12 5 GGAG 1 0 7372 CASAVA_Build X 95219492 1I TTTCTTGAAA -/T AGATAAAGAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 7373 CASAVA_Build X 95227419 1I TTATTTATAT -/G GGGGGGGGTG 3070 hom 48 het 21 0 16 5 G 8 9 7374 CASAVA_Build X 95240817 1D CACGGAGAGG A/- AAAAAAAAAC 461 het 461 ref 35 24 2 9 A 10 9 7375 CASAVA_Build X 95264348 1D TAAGAAAAAA T/- TATTAACATC 3070 hom 87 het 34 0 30 6 T 2 1 7376 CASAVA_Build X 95269342 1D TATATACCTG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 8 7 7377 CASAVA_Build X 95298095 5I GATACTAGTC -----/TATTT TATCATTTAC 3070 hom 83 het 34 0 29 5 TATTT 0 1 7378 CASAVA_Build X 95336855 1D22M22D GATTGAGGAA TTTAAGAGTTAGAAAAGACCAAGTATGAAGTTATAAGAACTCTCA/-TTAAGAGTTAGAAAAGACCAAG---------------------- TATACTGCTG 3070 hom 126 het 41 0 43 3 N/A 0 0 7379 CASAVA_Build X 95342500 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 946 hom 52 3 31 20 A 15 14 7380 CASAVA_Build X 95342820 1I CAGAAGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 43 1 24 18 A 14 15 7381 CASAVA_Build X 95391952 1I AAAAAACGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 10 11 7382 CASAVA_Build X 95393627 1I AAAAAAAAAA -/T AATCCAGCTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 0 1 7383 CASAVA_Build X 95422271 1D TAAAAAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 14 0 12 3 A 10 9 7384 CASAVA_Build X 95425860 4I CTAAATAGCA ----/AAAG AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAAG 0 1 7385 CASAVA_Build X 95430293 1D AGAATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 135 het 53 0 43 12 T 11 10 7386 CASAVA_Build X 95439238 1I AGGTTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 26 1 21 4 A 11 12 7387 CASAVA_Build X 95440733 1I AAGAAGATTC -/A AAAAAAACCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 7 8 7388 CASAVA_Build X 95447398 4I CTTTTGTAGT ----/TAAG TAATTGTTCT 3070 hom 84 het 35 0 27 8 TAAG 0 1 7389 CASAVA_Build X 95461354 1I TGATTTTGTA -/C ACTTGAGACT 3070 hom 88 het 35 0 29 6 C 0 1 7390 CASAVA_Build X 95605820 1I TAGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 950 het 950 ref 27 15 4 8 T 13 14 7391 CASAVA_Build X 95622072 22D GATGAACTTT GAAAACATTATGCTAATTGGAA/---------------------- GAAGACAGTC 3070 hom 96 het 30 0 33 2 GAAAACATTATGCTAATTGGAA 1 0 7392 CASAVA_Build X 95622252 1D GTTTTGTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 718 hom 37 3 27 7 G 1 0 7393 CASAVA_Build X 95629256 11D TGATCAAACT ACTACGAGCTA/----------- AAGGAGGAAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 ACTACGAGCTA 1 0 7394 CASAVA_Build X 95644326 2I GTTCCACTGG --/TC TCTGTGTCTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TC 1 2 7395 CASAVA_Build X 95646462 4D ATAAAAATAA AAGT/---- AATAACCACA 2845 hom 18 het 7 0 7 0 AAGT 1 0 7396 CASAVA_Build X 95650432 1I AAATGCCATC -/T TTTGTTATAT 3070 hom 132 het 47 0 44 3 T 3 4 7397 CASAVA_Build X 95651861 1I TAGAAGAGTG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 9 7398 CASAVA_Build X 95652545 1D AAATAGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 27 1 23 3 T 11 10 7399 CASAVA_Build X 95672653 1D TTTAAAAAAG A/- AAAAAGGAAG 3070 hom 88 het 36 0 30 6 A 6 5 7400 CASAVA_Build X 95672995 2D TGGCTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 24 1 15 8 T 16 14 7401 CASAVA_Build X 95696032 2D TTAAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2423 het 2423 ref 21 11 6 4 A 14 12 7402 CASAVA_Build X 95696931 24D AGAGTGCAAT GGCATGATCTTGGCTCACTGCAAC/------------------------ GGCATGATCT 1809 het 1809 ref 15 7 4 6 GGCATGATCTTGGCTCACTGCAAC 2 1 7403 CASAVA_Build X 95703894 1D TCAAGTTGTC T/- TTTTTTGTGG 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 7 6 7404 CASAVA_Build X 95708554 1D TTTGCTAAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 52 13 29 10 A 8 7 7405 CASAVA_Build X 95711770 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 17 7 8 2 A 9 10 7406 CASAVA_Build X 95718133 4I AATATTCTCA ----/TAGT TAGTTATTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 TAGT 1 2 7407 CASAVA_Build X 95719278 1D ATTGAATTTT A/- AAACGTAAGA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 4 3 7408 CASAVA_Build X 95723223 1D AGCCCATTCC T/- TTTTTAGGCG 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 T 6 5 7409 CASAVA_Build X 95747244 1D TGCAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1502 het 1502 ref 21 8 5 8 T 15 14 7410 CASAVA_Build X 95758117 5D AAGAAAATTG ATATA/----- ATATAAGCAA 3070 het 3070 ref 37 16 17 5 ATATA 2 1 7411 CASAVA_Build X 95759282 1I TGAGCATGGG -/C TTTGACATCA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 C 0 1 7412 CASAVA_Build X 95766593 1D GGGGCAAGAA C/- CCCCCCCAAT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 C 8 7 7413 CASAVA_Build X 95767715 5I TCCCGACATT -----/AAATA AAACTCCAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAATA 0 1 7414 CASAVA_Build X 95772710 1I CTTGTTTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 861 hom 36 2 24 10 A 10 11 7415 CASAVA_Build X 95778786 1D CCCTGTCTCA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 36 1 23 12 C 1 0 7416 CASAVA_Build X 95793024 2I CAGGACATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 132 hom 29 1 24 4 AT 7 8 7417 CASAVA_Build X 95798637 1I GCCAGTATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 10 11 7418 CASAVA_Build X 95801042 1D AAGATACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 24 2 16 6 A 15 14 7419 CASAVA_Build X 95810786 4I TACTATAAAC ----/TAAG TAATCATTAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TAAG 0 1 7420 CASAVA_Build X 95813127 1D CATCCACCCC T/- GACTCTGTTT 3070 hom 99 het 36 0 32 4 T 1 0 7421 CASAVA_Build X 95830609 1D CTCTTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 1491 het 1491 ref 37 27 4 7 A 12 11 7422 CASAVA_Build X 95860787 1D GATTATTAGA T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 7 6 7423 CASAVA_Build X 95883130 1D CTCATCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 641 hom 39 5 16 18 T 19 18 7424 CASAVA_Build X 95919114 2D TACTAGAAAC AT/-- ATCAACAAGT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 AT 2 1 7425 CASAVA_Build X 95922470 1I CTCCCTGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1252 hom 17 5 9 3 T 11 12 7426 CASAVA_Build X 95941913 1I ACAAGATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 9 10 7427 CASAVA_Build X 95946878 4I ACACACACAT ----/ACAA ACACACACAT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 ACAA 0 1 7428 CASAVA_Build X 95966599 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1263 het 1263 ref 41 26 3 12 T 13 12 7429 CASAVA_Build X 95991615 1D CAGAAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 11 10 7430 CASAVA_Build X 95998242 1I ATATATATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 9 10 7431 CASAVA_Build X 95998694 1I ACTGCATCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 9 10 7432 CASAVA_Build X 96023710 1D GATTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2163 hom 24 8 15 1 T 12 11 7433 CASAVA_Build X 96028567 1I AAAAAAACTC -/T TTTTTTTTTT 2777 het 2777 ref 29 11 9 9 T 10 11 7434 CASAVA_Build X 96030540 2D AGGCTTTGTA TC/-- TCTCGAGAGC 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 TC 3 2 7435 CASAVA_Build X 96035749 1D AGACAGTTTT G/- GTGACCTCTT 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 G 2 1 7436 CASAVA_Build X 96041642 2I TGAGATAATC --/AT GTGGTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 AT 0 1 7437 CASAVA_Build X 96044789 2I TGTTACTGTG --/AA AAAAAAAAAA 1165 het 1165 ref 39 9 8 22 A 14 16 7438 CASAVA_Build X 96053024 6D GGAGGCATTC TAGAAG/------ TAGAAGTAGA 3070 het 3070 ref 43 18 16 12 TAGAAG 4 3 7439 CASAVA_Build X 96067951 3D CACTTAGGTA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 AAC 4 3 7440 CASAVA_Build X 96076336 1I ATTTATATGG -/A AATTTCACGT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 2 3 7441 CASAVA_Build X 96093183 3D TGTAAAAAGT GCA/--- GAATCACGAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 GCA 1 0 7442 CASAVA_Build X 96103116 1D TTATCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 A 12 11 7443 CASAVA_Build X 96111134 1D AGGTATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 17 23 13 T 13 12 7444 CASAVA_Build X 96117947 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2438 het 1213 hom 11 4 7 0 A 11 10 7445 CASAVA_Build X 96161430 1D CTAACATTAG T/- TTTTATCCAT 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 T 5 4 7446 CASAVA_Build X 96175743 1I AGTGTGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 35 0 26 9 T 11 12 7447 CASAVA_Build X 96193175 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 11 12 7448 CASAVA_Build X 96202652 2I CGTGCGCATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 CA 7 8 7449 CASAVA_Build X 96225663 1D GTGAATAGGC T/- TTTTTTTTTC 1238 het 1238 ref 37 29 3 5 T 10 9 7450 CASAVA_Build X 96225763 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 T 8 9 7451 CASAVA_Build X 96228311 4I38M2I ATATATCCTT ----TTTGTCAATTAAAAATTATTTGCCTTTGTATCTCTGTC--/TTTGTTTGTCAATTAAAAATTATTTGCCTTTGTATCTCTGTCAT AGAATCAGAG 3070 het 3070 hom 43 23 28 6 N/A 0 0 7452 CASAVA_Build X 96234698 1I TAAAAATCAG -/C CCAGGCCTGG 2573 het 2573 ref 23 14 6 3 C 2 3 7453 CASAVA_Build X 96271538 1D TTGATATCCG T/- AATATATAAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 1 0 7454 CASAVA_Build X 96280041 1D AAAGAAATGA T/- CAAAATCAGC 3070 het 3070 hom 44 18 20 8 T 1 0 7455 CASAVA_Build X 96282794 1I TATGGTGAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 8 9 7456 CASAVA_Build X 96288972 1D AAACATTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 T 10 9 7457 CASAVA_Build X 96293159 1I TCCAAACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 37 1 26 10 T 10 11 7458 CASAVA_Build X 96295599 1D GATAGTAAAA G/- TTTAGGGGCA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 1 0 7459 CASAVA_Build X 96299250 1I TGTCCTACTC -/T TGTCTATGGA 3070 het 2867 hom 21 7 12 2 T 1 2 7460 CASAVA_Build X 96308336 1I ATGTAATAGA -/T TAGTATGTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 1 2 7461 CASAVA_Build X 96308888 1D ATTCTGAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 10 9 7462 CASAVA_Build X 96309745 1D TTAGACAGTC T/- TTTTTTTTTT 2860 het 2073 hom 22 6 9 7 T 15 14 7463 CASAVA_Build X 96310792 1D AGTGAGAGTG C/- CAAGTGGTCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 2 1 7464 CASAVA_Build X 96315735 5D ATTATATAAT TATAA/----- TATATAAAAT 2777 hom 15 het 6 0 6 1 TATAA 1 0 7465 CASAVA_Build X 96332489 3D ACTCCATTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1987 hom 18 het 9 0 5 6 A 21 18 7466 CASAVA_Build X 96354039 1I GTTATTTGAG -/A AAAAAGATAT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 5 6 7467 CASAVA_Build X 96362783 1D TCCATTAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 26 het 38 1 33 4 A 10 9 7468 CASAVA_Build X 96370982 1I GTCTTAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 275 hom 36 1 30 5 T 10 11 7469 CASAVA_Build X 96373593 1I TTATTTAGTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 8 9 7470 CASAVA_Build X 96375825 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 14 0 12 2 A 12 13 7471 CASAVA_Build X 96378201 1D TTCATTTTCA T/- TTTTTTTTTT 725 het 725 ref 16 10 2 4 T 17 16 7472 CASAVA_Build X 96399613 14D TTCTTTGTTT AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 83 het 32 0 32 6 A 23 9 7473 CASAVA_Build X 96455901 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1172 het 1172 ref 28 14 4 10 A 17 16 7474 CASAVA_Build X 96478590 1I TTTAAAAGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 8 9 7475 CASAVA_Build X 96485352 1D AAAGCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 12 11 7476 CASAVA_Build X 96490738 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 2966 het 1162 hom 12 4 7 1 T 14 13 7477 CASAVA_Build X 96494304 1I GTGGGCAGAT -/C CACGAGGTCA 2649 het 819 hom 9 2 6 1 C 1 2 7478 CASAVA_Build X 96510369 1D GTAAGATATT G/- GCTATCACAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 2 1 7479 CASAVA_Build X 96511091 5D11M45D TATAACTTCA TTGCCCTTACCAGCAATATTACCTAGTGGCGTGAGGTTAATTTAAGGACCACCATGACCAC/-----CTTGCTAGGTA--------------------------------------------- TAAGTGCTAT 3070 het 3070 ref 42 37 16 3 N/A 0 0 7480 CASAVA_Build X 96511240 2I TTTGATGTTT --/TA TATATATATA 2477 het 2477 ref 29 13 8 8 TA 7 8 7481 CASAVA_Build X 96539016 2D AATGTACTTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 11 9 7482 CASAVA_Build X 96542344 1I CTCTTCCCCC -/A AGCTGTTGGC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 1 2 7483 CASAVA_Build X 96544553 1D GAAACTTGTG A/- AAAATGGACA 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 A 5 4 7484 CASAVA_Build X 96550084 7D GTATGTTAAA TTTACTG/------- TGAGTATATG 3070 het 3070 hom 22 11 11 4 TTTACTG 1 0 7485 CASAVA_Build X 96566276 4D CCCACTTGAC TTTA/---- TTTATTTTGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 4 TTTA 2 1 7486 CASAVA_Build X 96568670 1D TGTCTCTACT G/- AAAAATACAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 1 0 7487 CASAVA_Build X 96576231 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1361 hom 22 5 16 1 T 9 10 7488 CASAVA_Build X 96585951 1I TGAACAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 44 0 37 7 T 12 13 7489 CASAVA_Build X 96608134 1I TATTAAAAAA -/C CAGAATTCTA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 C 1 2 7490 CASAVA_Build X 96619267 4D CTAAAAAAAA ATCT/---- ATCTATCTAT 1261 het 1261 ref 12 7 4 1 ATCT 4 3 7491 CASAVA_Build X 96629434 1I GCCTTTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2342 hom 35 8 16 11 T 10 11 7492 CASAVA_Build X 96661004 1I CATCTGTTTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 8 9 7493 CASAVA_Build X 96674484 4D TCTGTATAGA CTGT/---- CTGAGGACAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 CTGT 1 0 7494 CASAVA_Build X 96675764 4I GCTTAAAAAA ----/AAAG AAAGCATTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAAG 1 2 7495 CASAVA_Build X 96693915 1I AAAGGAAAAA -/G CTAGATATCT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 G 0 1 7496 CASAVA_Build X 96694929 5I ACACCCTAAT -----/TAAGA TAATTAAATA 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 TAAGA 0 1 7497 CASAVA_Build X 96704191 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 33 2 29 2 A 10 11 7498 CASAVA_Build X 96705089 1D TAATAAAAAG A/- AAAAAACTAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 7 6 7499 CASAVA_Build X 96713738 1D TGTGACTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 49 0 31 18 T 15 14 7500 CASAVA_Build X 96716106 1I TACAGGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 11 12 7501 CASAVA_Build X 96719684 1D ATTAGTCTTG T/- TTTAAATCCA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 T 4 3 7502 CASAVA_Build X 96726909 1D CTCCACTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 34 2 16 16 T 17 16 7503 CASAVA_Build X 96727238 1D TTTCCTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 37 2 26 9 A 15 14 7504 CASAVA_Build X 96735839 2I TTGAGCTCAG --/TA TATATATATA 3070 het 903 hom 42 2 28 12 TA 8 9 7505 CASAVA_Build X 96743102 1I CACAAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 684 hom 26 3 16 7 A 11 12 7506 CASAVA_Build X 96744814 2I TTTTTTTTTT --/TA ACAATCATTC 3070 hom 79 het 35 0 29 6 TA 0 1 7507 CASAVA_Build X 96785525 2D TTACCACCTT TG/-- TGTGTGTGTG 1020 het 1020 ref 45 25 3 17 TG 10 9 7508 CASAVA_Build X 96877209 2I TTTATTACTC --/TT AGTTTTCACA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 2 7509 CASAVA_Build X 96878512 1I AAATAAGCAG -/C CACAAAGTCT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 C 1 2 7510 CASAVA_Build X 96896948 1I ACTCACATAT -/A AACTTTTCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 2 3 7511 CASAVA_Build X 96910443 1D CCTTGCGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1019 hom 23 5 12 7 T 12 11 7512 CASAVA_Build X 96919094 1I GCTACAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 A 11 12 7513 CASAVA_Build X 96920172 4D TTTGAGACAA AATC/---- AAGAAGAGAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 AATC 1 0 7514 CASAVA_Build X 96921316 1D GTTAGACTGA T/- TTAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 3 2 7515 CASAVA_Build X 96922959 1I ACAGTAAAGT -/A GTTTACTTCG 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 A 0 1 7516 CASAVA_Build X 96923448 2I TTATTTGAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 20 17 12 A 12 14 7517 CASAVA_Build X 96936986 1I CCCTTTCATC -/T TTTTACTGTA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 4 5 7518 CASAVA_Build X 96938224 1I TAGTTTGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1474 hom 37 5 24 8 T 11 12 7519 CASAVA_Build X 96953435 1I ATTCCCCTTT -/A AAAAAAAAAT 2445 het 2445 ref 34 22 9 3 A 9 10 7520 CASAVA_Build X 96975187 1I AAAAAAGGGT -/G GAAAATATAC 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 G 1 2 7521 CASAVA_Build X 97029764 1D CCATTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 2119 het 2119 ref 47 11 9 28 T 17 16 7522 CASAVA_Build X 97029961 1I AATCTAATCA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 6 7 7523 CASAVA_Build X 97031281 1D AATATTGGTC T/- TTTTTTTTTG 1400 het 1400 ref 30 24 4 2 T 10 9 7524 CASAVA_Build X 97036961 1I AGGCTATACC -/T ATGTAGCCTA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 0 1 7525 CASAVA_Build X 97041706 1D TCCTTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 11 10 7526 CASAVA_Build X 97055950 1I GATTACTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 34 1 25 8 T 11 12 7527 CASAVA_Build X 97074437 1D GGTTATTATA T/- TTTTTCTGGG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 6 5 7528 CASAVA_Build X 97102286 1I AGTAGATACC -/A AAAAAAAAAA 879 het 879 ref 25 21 3 1 A 13 14 7529 CASAVA_Build X 97223498 1I ATCAATGCAA -/T TTTTTTTTTT 1968 het 1968 ref 31 15 7 9 T 17 18 7530 CASAVA_Build X 97264847 2I AATGAAAATG --/AA AAAATATAAC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 4 6 7531 CASAVA_Build X 97266925 1I GGACATCTGG -/A ATATTCACTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 7532 CASAVA_Build X 97271223 3D GCAAATGCAT AGG/--- AGGAGAATGG 3070 hom 126 het 46 0 43 5 AGG 2 1 7533 CASAVA_Build X 97277352 1D CACATGCATT A/- ATATATGCTC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 2 1 7534 CASAVA_Build X 97288981 2I AAAAAAAAAA --/AT AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 18 0 16 2 AT 0 1 7535 CASAVA_Build X 97291252 1I12M1D TGTCTCTACT -AAAAAAAAATAGA/AAAAAAAAAATAG- AAAAAAAAAA 2236 hom 42 het 15 0 15 0 N/A 0 0 7536 CASAVA_Build X 97298619 1I ACAGACACAC -/A AGACTAATAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 7537 CASAVA_Build X 97303912 2I ATGAAGTGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 33 0 23 10 A 10 12 7538 CASAVA_Build X 97306178 1D TCCTTTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 176 hom 41 1 36 4 T 10 9 7539 CASAVA_Build X 97307661 4I CCAAAACATG ----/AATA AATATTGAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AATA 1 2 7540 CASAVA_Build X 97308659 4D TGTGCGTCAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 154 het 55 0 52 3 TG 10 8 7541 CASAVA_Build X 97309846 7D GAGGACAGTC TTTTTTT/------- TTTTTTTGAG 3070 hom 30 het 15 0 10 5 T 14 7 7542 CASAVA_Build X 97310856 3D CCATTTTCCA GAG/--- GAGAAGAGAA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 GAG 2 1 7543 CASAVA_Build X 97311770 2D GCATTATCTC TT/-- TTGTGTACAC 3070 hom 131 het 49 0 44 5 T 4 2 7544 CASAVA_Build X 97313707 7I TAGGTAGCGC -------/TTAAAGA TTAAATTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TTAAAGA 0 1 7545 CASAVA_Build X 97336000 2I CACAAAAGTC --/TA TATGTCTTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TA 1 2 7546 CASAVA_Build X 97338245 7D ATCCCTCACC CACTTCT/------- CACAGTCCCA 3070 hom 117 het 44 0 38 7 CACTTCT 1 0 7547 CASAVA_Build X 97355855 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAG 2513 het 101 hom 11 1 7 3 A 9 10 7548 CASAVA_Build X 97376526 1D CTATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 33 1 29 3 T 11 10 7549 CASAVA_Build X 97412191 1I CTCACAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 332 hom 38 1 33 4 A 11 12 7550 CASAVA_Build X 97415436 3D ATGAAAGGAT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 TTG 7 6 7551 CASAVA_Build X 97418860 1I AGGAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 10 11 7552 CASAVA_Build X 97421837 1D GAGAGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 58 24 23 11 T 17 16 7553 CASAVA_Build X 97432936 1I CATTTCTAGT -/G GGTGGGGGTA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 2 3 7554 CASAVA_Build X 97460491 1D GAAAAGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 25 0 18 8 T 13 12 7555 CASAVA_Build X 97466338 1I TAAAATAAAA -/G TTGAAACAAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 7556 CASAVA_Build X 97481635 1I TTTGTATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 864 hom 40 2 25 13 T 13 14 7557 CASAVA_Build X 97498622 2I TCTGGAGGTG --/TC TCTGTTAAAA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TC 1 2 7558 CASAVA_Build X 97500007 1D AAAAGCTGTA T/- TTTTTTATCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 6 7559 CASAVA_Build X 97516480 1D TGGTGTTGTA G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 G 2 1 7560 CASAVA_Build X 97516575 1I GCAAAAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 36 2 26 8 A 13 14 7561 CASAVA_Build X 97520520 1I ACCTGGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 37 0 26 11 T 10 11 7562 CASAVA_Build X 97552242 1I TCTTTTTCTA -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 C 7 8 7563 CASAVA_Build X 97559831 3I TTTTGCATAG ---/AAT AATATTTGCA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AAT 1 2 7564 CASAVA_Build X 97559928 1D TAATTCATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 10 9 7565 CASAVA_Build X 97565088 1D GTTAAACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 12 11 7566 CASAVA_Build X 97575687 1D AACAGCATTT A/- AAAAAAAAAA 2054 het 2054 ref 42 28 7 7 A 15 14 7567 CASAVA_Build X 97579663 10D26M8D TATATATATG TATATATGTATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA/----------TATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTG-------- TATATATATA 3070 hom 78 het 19 0 27 2 N/A 0 0 7568 CASAVA_Build X 97580339 1D CCTGTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 717 het 717 ref 40 32 3 6 T 11 10 7569 CASAVA_Build X 97598389 1I GTGAATACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 231 hom 45 1 36 8 T 9 10 7570 CASAVA_Build X 97614234 1D TAAGGGTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 29 0 23 6 T 12 11 7571 CASAVA_Build X 97616154 2D TAGGGTTTAT TA/-- TATATATATA 833 het 833 ref 29 19 2 9 TA 7 6 7572 CASAVA_Build X 97645545 1D GAAAGGTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 10 9 7573 CASAVA_Build X 97652424 1D ACCTCAATGT C/- CTTCCTTATA 3070 hom 81 het 30 0 25 5 C 2 1 7574 CASAVA_Build X 97659826 3D GTGGTGTCAC TAT/--- TGCATACCAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TAT 1 0 7575 CASAVA_Build X 97661051 1D ACTTAATCTC A/- AAAAAAAAAA 3058 het 994 hom 21 4 8 10 A 18 17 7576 CASAVA_Build X 97676485 4I AAAACAAAAC ----/AAAA AAAACCCCAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 4 8 7577 CASAVA_Build X 97699042 4D ATTTTCCAAA TAAT/---- TAATATCTGA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 TAAT 2 1 7578 CASAVA_Build X 97701739 2I TATTTTTCTT --/TA TATATATATA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TA 8 9 7579 CASAVA_Build X 97705317 4I TTGTTAACTT ----/TCTC TCTCGTTGAT 1247 hom 7 het 3 0 3 0 TC 2 4 7580 CASAVA_Build X 97726449 1I CTCTGCAGTA -/C ATTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 0 1 7581 CASAVA_Build X 97728836 1D TCTTCTTTGA C/- CCCATTGATT 3070 hom 53 het 19 0 17 4 C 4 3 7582 CASAVA_Build X 97744907 3D TAGAATTATT ATA/--- ATAATTTCTC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ATA 2 1 7583 CASAVA_Build X 97786882 1D TGAAATATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 12 11 7584 CASAVA_Build X 97798389 1D GTTTAATGTA G/- GAGGAAAGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 5 G 2 1 7585 CASAVA_Build X 97799517 1D GATTCTCACC A/- ACATCCCCAT 3070 hom 87 het 31 0 27 4 A 2 1 7586 CASAVA_Build X 97855115 1D ATGGAGAACC T/- TCTGCTGGGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 1 7587 CASAVA_Build X 97882134 1D ATAAAAAAAA T/- ATATACAAAC 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 T 1 0 7588 CASAVA_Build X 97938043 1I AAAACTATGT -/A AAAAAGTATA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 5 6 7589 CASAVA_Build X 97938223 2D ACTCATAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 38 3 23 12 T 16 14 7590 CASAVA_Build X 97952625 1I AACTATAAAG -/A AAAGAGGTTT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 3 4 7591 CASAVA_Build X 97964832 1D ATCAACACTT G/- ACTATATTAC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 G 1 0 7592 CASAVA_Build X 97978947 4D TGCTTTGTAG CAAC/---- TTGCTTTGTA 954 het 954 ref 48 14 6 30 CAAC 1 0 7593 CASAVA_Build X 97980328 1I ACAATCTGAT -/G GGGGGCTGCT 3070 hom 84 het 32 0 27 5 G 5 6 7594 CASAVA_Build X 97983932 42D TTTTTTGGAG ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------------ ATATATATAT 3070 hom 66 het 25 0 23 8 AT 26 5 7595 CASAVA_Build X 97989022 1D GGTTATTTAG T/- TTTTTTATTA 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 7 6 7596 CASAVA_Build X 98000513 1D ATGATTTTAT A/- AAGGCGACTT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 3 2 7597 CASAVA_Build X 98037277 1D TGATTTTGGG A/- AAAAAAAAAA 2228 het 2228 ref 38 24 6 8 A 13 12 7598 CASAVA_Build X 98120536 1I GAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 977 hom 38 3 27 8 A 10 11 7599 CASAVA_Build X 98121185 1I CTCTTCCAAA -/G GGGAAATGTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 3 4 7600 CASAVA_Build X 98126932 1D TCATGCCTTT A/- AAAAAAACCT 3070 hom 57 het 21 0 20 3 A 8 7 7601 CASAVA_Build X 98137549 1D TTCATCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 47 0 34 13 A 15 14 7602 CASAVA_Build X 98160408 1I TTCAGAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 9 10 7603 CASAVA_Build X 98166129 4D GATGACAGTA TGTT/---- TCTTTTTTTA 3070 hom 135 het 47 0 46 7 TGTT 1 0 7604 CASAVA_Build X 98178078 1D AGTCAAAAAG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 7 7605 CASAVA_Build X 98189681 1I CAAGTCCAAA -/G TCTCATCTGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 0 1 7606 CASAVA_Build X 98202011 2D ATCATTTTGC AT/-- ATGTCAGTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 5 AT 2 1 7607 CASAVA_Build X 98206680 2I CTATGCTAGA --/AT ATATATATAT 2622 het 2622 ref 27 11 7 9 AT 7 8 7608 CASAVA_Build X 98208626 4D ACACACGCAC CAAA/---- CAAACAGAAC 3070 hom 66 het 27 0 22 6 CAAA 2 1 7609 CASAVA_Build X 98218470 10D ATAAATGAAC CAACCTCACT/---------- CATTGTATGG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 CAACCTCACT 1 0 7610 CASAVA_Build X 98238238 1D GGATCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 2657 het 2657 ref 44 28 8 8 T 13 12 7611 CASAVA_Build X 98287152 1I ATTCCACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 31 1 24 6 A 11 12 7612 CASAVA_Build X 98316871 1I AAGATAAAAC -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 6 7 7613 CASAVA_Build X 98325529 1I GAAGGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 190 hom 41 2 30 9 T 10 11 7614 CASAVA_Build X 98332097 1D TTTCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 31 1 24 6 A 11 10 7615 CASAVA_Build X 98364214 1D TCTGCAAATG T/- TTTTTTTTTT 1812 het 1812 ref 28 22 4 2 T 12 11 7616 CASAVA_Build X 98418479 13I AAGACACACA -------------/CTGACTGAAAATT AAGAGATGGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CTGACTGAAAATT 0 1 7617 CASAVA_Build X 98419771 1I AAACTATTCC -/A AAAAAGTATT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 5 6 7618 CASAVA_Build X 98420439 1I TTGCAGGATG -/A AAAAATCATT 3070 hom 59 het 23 0 19 4 A 5 6 7619 CASAVA_Build X 98420726 2D ATATTCAGTG CA/-- CAATCCCTAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 CA 2 1 7620 CASAVA_Build X 98421491 3I GCTCAACATC ---/ATT GATTGTCAGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 ATT 0 1 7621 CASAVA_Build X 98426967 2D ATATACACAC AT/-- ATATTATTTC 3070 hom 30 het 14 0 11 5 AT 3 2 7622 CASAVA_Build X 98443700 1D GAGCACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 11 9 A 12 11 7623 CASAVA_Build X 98448149 1I AGTAAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 36 1 25 10 A 10 11 7624 CASAVA_Build X 98464128 1D ATAAGATGAG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 302 hom 39 1 35 3 T 8 7 7625 CASAVA_Build X 98468189 4D CACGGTTTTC ATAA/---- ATAATCTAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 5 ATAA 2 1 7626 CASAVA_Build X 98486657 1I ATTTCCAAAC -/T TTTTAAAAAT 3070 hom 76 het 37 0 28 9 T 4 5 7627 CASAVA_Build X 98493575 1I TTGTTGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 717 hom 35 3 27 5 T 11 12 7628 CASAVA_Build X 98528754 2D TTTTCTGTTT TG/-- TGTGTGTGTG 1050 het 1050 ref 41 28 4 10 TG 9 8 7629 CASAVA_Build X 98529185 2D TTGAGATAAC TG/-- TTTTTTAATA 2669 het 2669 ref 17 9 7 1 TG 1 0 7630 CASAVA_Build X 98625429 5D GAGAAGTGAC ATATT/----- AATTATATTG 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 ATATT 1 0 7631 CASAVA_Build X 98677477 1D ATCCAGAGGT A/- AAAAAAAAAA 2014 het 2014 ref 40 25 5 11 A 15 14 7632 CASAVA_Build X 98928314 1D TTGGTTCCTT G/- GGGCTCCCTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 4 3 7633 CASAVA_Build X 98932383 1D ATCATTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 157 het 64 0 54 10 T 11 10 7634 CASAVA_Build X 98939278 2I AATGGAAGAC --/AA AAAGATTTAC 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 3 5 7635 CASAVA_Build X 98953008 1I ATATATCTAT -/A TATATATAAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 0 1 7636 CASAVA_Build X 98958948 1D AATAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 13 12 7637 CASAVA_Build X 98959017 1I TTTAAACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 31 0 26 5 A 12 13 7638 CASAVA_Build X 98960197 1D39M2I GAGACAAAAG AAAAAAAAAAACATGAAGCACAACTACAGGATCTAGAACA--/-AAAAAAAAAACATGAAGCACAACTACAGGATCTAGAACACC TCATCTCAAA 3070 het 438 hom 19 2 15 13 N/A 0 0 7639 CASAVA_Build X 98980577 1D AAAAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 33 1 26 6 A 12 11 7640 CASAVA_Build X 98987917 5D TACAGAAAAG GTACA/----- GTAAAGATAT 3070 hom 135 het 48 0 46 5 GTACA 1 0 7641 CASAVA_Build X 99014458 1D ATAATCTGAT A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 8 7 7642 CASAVA_Build X 99024268 1I ATCAAGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1995 hom 47 5 28 14 A 13 14 7643 CASAVA_Build X 99026651 4D CAGAGATGAC ACAA/---- ACAAATAGAA 3070 hom 81 het 30 0 28 5 ACAA 2 1 7644 CASAVA_Build X 99028142 2D GGCTTGTGGA GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 51 het 26 0 15 13 G 12 10 7645 CASAVA_Build X 99034244 1D ACTCAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 30 0 23 7 A 13 12 7646 CASAVA_Build X 99038979 1D GTAAAGCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 91 het 39 0 31 8 T 10 9 7647 CASAVA_Build X 99052146 2I ATCTGTTCTC --/TT GTTTCTGACA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 0 2 7648 CASAVA_Build X 99072166 1I ACCAGTAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 447 hom 46 2 34 10 T 9 10 7649 CASAVA_Build X 99077565 1D TTAAAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 30 1 20 10 T 11 10 7650 CASAVA_Build X 99090851 1D ACGTGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 11 10 7651 CASAVA_Build X 99097625 1I ACAGTTTTTA -/T TTTTTAATTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 5 6 7652 CASAVA_Build X 99097710 6I TTTTAGTTGC ------/TGTTTT TGTTGTTGTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TGTTTT 0 1 7653 CASAVA_Build X 99103092 1I21M1D TGAAAAACTT -AACTCTAAGCCAAAGAAATTGA/CAACTCTAAGCCAAAGAAATTG- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 28 0 32 9 N/A 0 0 7654 CASAVA_Build X 99118672 1I GAGATATTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 505 hom 38 2 35 1 A 9 10 7655 CASAVA_Build X 99123311 1I TAGTACCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 A 13 14 7656 CASAVA_Build X 99125066 1I GAAAATCTAT -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 G 1 2 7657 CASAVA_Build X 99128527 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 26 0 19 7 A 12 11 7658 CASAVA_Build X 99130756 1D TAGGGGCCAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 9 8 7659 CASAVA_Build X 99132600 1I ATGTAAACAG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 8 7660 CASAVA_Build X 99136590 1D ACCCACGGAT G/- GGGGGCCTTT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 G 6 5 7661 CASAVA_Build X 99140665 3D TTAATCTACC AGT/--- AAAGAGTTTA 3070 hom 157 het 56 0 52 5 AGT 1 0 7662 CASAVA_Build X 99141810 1D ATGTTGTGTG T/- GTTCCTACTG 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 T 1 0 7663 CASAVA_Build X 99149626 1D TTCATAAAGC T/- TTTTTTTTTT 2215 het 2215 ref 51 40 7 4 T 13 12 7664 CASAVA_Build X 99150533 1D TCTAGGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 44 0 34 10 A 12 11 7665 CASAVA_Build X 99152040 2D TTATAAGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 26 0 15 11 T 14 12 7666 CASAVA_Build X 99168839 2D GAATAAAGGA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 2943 hom 22 9 10 3 AG 5 4 7667 CASAVA_Build X 99170793 1D ATTTTTTTAA T/- TTTTTTGGCT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 7 6 7668 CASAVA_Build X 99181515 4I TTCAGTTTTT ----/AAAC AAACTTTTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAAC 1 2 7669 CASAVA_Build X 99181987 1D TGTCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 1612 het 1612 ref 37 28 4 5 A 11 10 7670 CASAVA_Build X 99272553 1D AAAACACAGA C/- TGTAAACACA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 0 7671 CASAVA_Build X 99272644 1I TAGTTAATTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 8 9 7672 CASAVA_Build X 99283004 1D CTGCTAAAAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 51 het 32 0 18 14 A 9 8 7673 CASAVA_Build X 99283033 1D CTATAATACT G/- AAACAATACA 3070 het 1725 hom 40 4 10 27 G 1 0 7674 CASAVA_Build X 99289430 1I TTACACAATG -/T TTATAGAAAT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 2 3 7675 CASAVA_Build X 99296364 1I CTATCCCCAG -/T GTTTTTAGTG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 0 1 7676 CASAVA_Build X 99297185 1I TGCTCTGATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 360 hom 30 1 25 4 T 9 10 7677 CASAVA_Build X 99310883 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 9 10 7678 CASAVA_Build X 99318801 1D TTGTTGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 31 1 27 3 T 11 10 7679 CASAVA_Build X 99319035 1I ATTCATTTCA -/C AGAATTAAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 7680 CASAVA_Build X 99319379 2D TATGCACAGT TC/-- TCTCTTTGGT 3070 hom 102 het 39 0 35 6 TC 3 2 7681 CASAVA_Build X 99329307 1D TTGGATGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 10 9 7682 CASAVA_Build X 99337451 1I TCCTTTTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 19 15 8 A 9 10 7683 CASAVA_Build X 99355127 7D TTCTTCTTTC CTTTTTT/------- CTTTTTTCTC 2306 het 860 hom 11 4 7 2 CTTTTTT 2 1 7684 CASAVA_Build X 99356476 1D CTGGGGTATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 A 10 9 7685 CASAVA_Build X 99357223 4D TGTGTTACTA AAAC/---- AAAGTCACTC 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 AAAC 1 0 7686 CASAVA_Build X 99359743 1I GAATATAAGA -/T TTTTCTCCCA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 4 5 7687 CASAVA_Build X 99367910 30D CCACTGTATG GTTTTTGAGCACTTACTTCAAAAAGTAAGT/------------------------------ GTTTTTGAGC 3070 hom 66 het 28 0 23 7 GTTTTTGAGCACTTACTTCAAAAAGTAAGT 1 0 7688 CASAVA_Build X 99377745 4D TAGGAAAAAT AAAG/---- AAAGAAATGT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 AAAG 2 1 7689 CASAVA_Build X 99389196 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 26 0 24 4 A 10 11 7690 CASAVA_Build X 99395119 1D GAAAATCTAG A/- AAAAAATGGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 7 6 7691 CASAVA_Build X 99397044 1D GATTTACACG A/- AAAAAAAACA 3070 het 467 hom 20 1 13 6 A 9 8 7692 CASAVA_Build X 99423447 5I TTTAACCCAT -----/TTTGA TTTGATTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TTTGA 1 2 7693 CASAVA_Build X 99430485 1D TCCCTTCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 51 1 39 11 T 11 10 7694 CASAVA_Build X 99446952 1D CAATTATCAG C/- CAAGAATTTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 C 2 1 7695 CASAVA_Build X 99476515 2D TATATGTCTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 25 0 19 7 TA 8 7 7696 CASAVA_Build X 99490018 16D TTTTACATTT AACACAGTTGGTCCCC/---------------- AGAACAGCAT 3070 het 3070 hom 33 15 19 5 AACACAGTTGGTCCCC 1 0 7697 CASAVA_Build X 99506785 1D TATAGCAATT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 G 1 0 7698 CASAVA_Build X 99510357 2I AAGAAGAAAC --/AA GAGAAATCTT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 A 0 2 7699 CASAVA_Build X 99516603 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 9 10 7700 CASAVA_Build X 99531043 1I CAGGGGTTGT -/G GGGTGGGGGA 3070 het 3070 ref 34 12 15 7 G 3 4 7701 CASAVA_Build X 99531661 1I AGTGGGAAAT -/A AAATCATATT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 3 4 7702 CASAVA_Build X 99539650 2D ACGCCCTCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 41 13 14 15 AC 8 7 7703 CASAVA_Build X 99543386 6D TGCATAGATA ATTCTT/------ ATTCTTATTC 2663 het 2663 ref 31 19 10 3 ATTCTT 3 2 7704 CASAVA_Build X 99555771 1D CTGAGATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 13 12 7705 CASAVA_Build X 99566742 22I TCCCAACAAC ----------------------/ACTGTGGATAAGTTGTAGAAAA ACCGTTTTGC 3070 het 3070 ref 54 29 21 5 ACTGTGGATAAGTTGTAGAAAA 0 1 7706 CASAVA_Build X 99576799 1I TGCCAGAGCA -/C CTATTGCACT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 1 2 7707 CASAVA_Build X 99579222 1I ATAAAATTGT -/G GTGTACCCCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 1 2 7708 CASAVA_Build X 99582081 1I TTAAAAGCTC -/A AAAAAAAAAA 1068 het 1068 ref 26 16 4 6 A 13 14 7709 CASAVA_Build X 99583749 1D AAAATAACAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 8 7 7710 CASAVA_Build X 99585040 1I ATTTGAAGAG -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 6 7 7711 CASAVA_Build X 99611496 1I AATAAGTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 71 hom 50 1 46 3 A 9 10 7712 CASAVA_Build X 99612414 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 30 1 24 5 A 12 13 7713 CASAVA_Build X 99618375 1I AAGGCCACTG -/C CCAGCTGCAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 2 3 7714 CASAVA_Build X 99619687 1I GTTTACAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1100 hom 33 4 21 8 A 13 14 7715 CASAVA_Build X 99632880 1I ATCAGCCCAT -/G GCATCCTGCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 2 7716 CASAVA_Build X 99633629 1I GGCTGGTGAG -/C CTTATCTTAG 3070 hom 84 het 41 0 35 6 C 1 2 7717 CASAVA_Build X 99634437 1I GCTCCTCTGA -/G CATCAAAACA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 G 0 1 7718 CASAVA_Build X 99638550 1I CTTTTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1490 hom 45 5 31 9 T 11 12 7719 CASAVA_Build X 99644631 2D ATATTTTTTT AG/-- AGACAGGGTC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AG 2 1 7720 CASAVA_Build X 99651060 1D TAGATTCTTC A/- AAAGAAAGAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 4 3 7721 CASAVA_Build X 99654403 2D CAGGAAAGAC AT/-- GTGTGGAGGG 3070 het 3070 hom 33 15 14 6 AT 1 0 7722 CASAVA_Build X 99659485 1D TTTTGCTTAT C/- CCTGAGTGAT 3070 het 3070 hom 60 25 26 9 C 3 2 7723 CASAVA_Build X 99666761 1D CTTCCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 12 11 7724 CASAVA_Build X 99668891 1D CTTAGCAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 12 21 11 T 10 9 7725 CASAVA_Build X 99679100 1I TCCCTGCAAA -/G GACATGCACT 1356 hom 7 het 3 0 3 0 G 1 2 7726 CASAVA_Build X 99682036 1I CACTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 2657 het 2657 ref 30 16 7 7 T 10 11 7727 CASAVA_Build X 99699182 3I AAAGTATAAT ---/TAA AAAAAAAAAA 1053 het 775 hom 8 3 3 2 TAA 0 1 7728 CASAVA_Build X 99703149 1I AAGCTTTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 9 10 7729 CASAVA_Build X 99713844 1D AGGTAGTCTA C/- TTTTCTTACA 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 C 1 0 7730 CASAVA_Build X 99717231 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2989 het 1946 hom 30 8 10 12 T 15 14 7731 CASAVA_Build X 99727199 1I TTGGTAAGGG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 A 7 8 7732 CASAVA_Build X 99739670 1D AGAGAAGGGC A/- AAAACAATGC 3070 hom 138 het 53 0 47 7 A 5 4 7733 CASAVA_Build X 99740945 2D TGGCTTTAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 7 A 13 11 7734 CASAVA_Build X 99748006 3D AAAACAAACT AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 AAC 3 2 7735 CASAVA_Build X 99749473 1D TTAAAAAGTT A/- ATGCCTTTTG 3070 het 3070 hom 45 20 17 8 A 2 1 7736 CASAVA_Build X 99774580 1I CACTGTCTTT -/A AAAAAAAAAT 1914 het 1914 ref 17 8 5 4 A 9 10 7737 CASAVA_Build X 99782578 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTGTATT 1062 het 1062 ref 10 5 4 1 T 6 5 7738 CASAVA_Build X 99825944 1D GTTGTCACTA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 34 15 16 5 T 9 8 7739 CASAVA_Build X 99840604 1I GAAAATAACC -/G GGGGGAAGTG 3070 hom 88 het 35 0 30 5 G 5 6 7740 CASAVA_Build X 99858890 1I AAATAATCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 22 18 12 A 10 11 7741 CASAVA_Build X 99863883 1D TCTACTGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 13 18 9 A 10 9 7742 CASAVA_Build X 99891085 2I AGGAAAAAAC --/AT AGCATATATA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 0 1 7743 CASAVA_Build X 99906771 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 2385 hom 12 het 5 0 5 0 A 10 9 7744 CASAVA_Build X 99910253 1I TCACTTATCT -/C TACTTCTTTA 3070 hom 163 het 58 0 55 3 C 0 1 7745 CASAVA_Build X 99915085 2D GCTACTCCTG CT/-- CTCTTTTAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 8 CT 3 2 7746 CASAVA_Build X 99915321 1I TTTCTAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 494 hom 38 2 32 4 T 10 11 7747 CASAVA_Build X 99915563 5D AACATGCAGT GTACG/----- GTTTTCTGTT 3070 hom 132 het 51 0 44 10 GTACG 1 0 7748 CASAVA_Build X 99916618 2I GGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TA 6 7 7749 CASAVA_Build X 99940810 1I TTCCTCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3009 hom 22 9 10 3 T 10 11 7750 CASAVA_Build X 99976922 1I TCCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 1760 het 578 hom 28 5 6 17 A 15 16 7751 CASAVA_Build X 99985012 3D GAGCAAAAAT AAG/--- AATAAATTGC 3070 het 3070 ref 33 21 12 0 AAG 1 0 7752 CASAVA_Build X 99988573 1I GTGGCTCATG -/C CTGTAATCCC 3070 hom 69 het 25 0 23 3 C 1 2 7753 CASAVA_Build X 99990736 3I AGAAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAAG 2288 het 2288 ref 23 10 7 6 AAG 2 3 7754 CASAVA_Build X 100040243 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 17 12 A 13 11 7755 CASAVA_Build X 100040471 4I CTTTTTCTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 15 14 13 TTTC 3 4 7756 CASAVA_Build X 100048387 1D TGTTTCACAA G/- GGCTGAAACA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 G 3 2 7757 CASAVA_Build X 100054028 1D CCAAATTAAG T/- TATATAATCC 3070 hom 160 het 57 0 54 4 T 2 1 7758 CASAVA_Build X 100061817 1I TTGTGCTACC -/T TTTTTTTTTC 2817 het 2817 ref 27 12 8 7 T 9 10 7759 CASAVA_Build X 100072480 1D TGGTCCCCCT A/- AACATGAGAG 3070 hom 76 het 31 0 25 6 A 3 2 7760 CASAVA_Build X 100084075 1I ATCTCACATA -/C CCCTCTGGTA 3070 het 3070 ref 43 26 10 7 C 3 4 7761 CASAVA_Build X 100089742 1I TGGAGGGACA -/G GGTTTCACCA 3070 het 2344 hom 26 6 13 7 G 2 3 7762 CASAVA_Build X 100097197 1D GGGCACCTAT A/- ATCCCAGCTA 2921 het 472 hom 8 1 7 0 A 2 1 7763 CASAVA_Build X 100098568 1I CACTGTGGTC -/T CATTGAATGA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 0 1 7764 CASAVA_Build X 100112352 1D CATTTGGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 11 10 7765 CASAVA_Build X 100133590 2D CGGGAGATGA AG/-- AGAGGCTGAT 3002 het 3002 ref 25 15 9 2 AG 3 2 7766 CASAVA_Build X 100137612 1D TTAATATACA T/- TTTTTTTTTT 1669 het 1669 ref 47 29 5 14 T 13 12 7767 CASAVA_Build X 100144994 1D ATCCGATAGC T/- TTTTTTTTTT 2853 het 215 hom 22 2 10 11 T 15 14 7768 CASAVA_Build X 100146150 5D TCGTTTTTGT TTTTG/----- TTTTTTTTTG 9 het 9 ref 27 19 2 6 TTTTG 1 0 7769 CASAVA_Build X 100148448 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 36 3 27 6 A 11 12 7770 CASAVA_Build X 100151187 1D CTACATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1449 het 1449 ref 19 7 6 6 T 17 16 7771 CASAVA_Build X 100153960 1I TCCATTATAA -/T TTTTTTTTTC 2956 het 1136 hom 12 3 8 1 T 9 10 7772 CASAVA_Build X 100156183 1D ACATACTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 11 10 7773 CASAVA_Build X 100173357 1D CTGTCGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2884 hom 28 10 14 5 A 15 14 7774 CASAVA_Build X 100181938 1D GACTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 15 8 A 17 16 7775 CASAVA_Build X 100188853 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 2350 het 1748 hom 36 9 7 20 A 17 16 7776 CASAVA_Build X 100199103 1D AGTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 T 12 11 7777 CASAVA_Build X 100210254 1D AAGATAAAGT A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 A 7 6 7778 CASAVA_Build X 100212035 1D AATCGTACTC T/- TGGCCCAGGC 3070 het 3070 ref 56 29 23 4 T 2 1 7779 CASAVA_Build X 100219145 1I GCAGGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2701 het 2701 ref 35 13 9 13 A 14 15 7780 CASAVA_Build X 100226097 1I TTTCATATAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 182 hom 35 1 30 4 T 8 9 7781 CASAVA_Build X 100237340 1D GTGATAATAT A/- GGAAGTTTCA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 1 0 7782 CASAVA_Build X 100272830 1I GTTTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 T 7 8 7783 CASAVA_Build X 100276659 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1041 het 1041 ref 17 12 3 3 A 12 11 7784 CASAVA_Build X 100278344 3D TCCACACTAA TGT/--- TGTTATATTT 2592 het 2592 ref 25 12 7 7 TGT 2 1 7785 CASAVA_Build X 100294945 1D TTTCTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 T 13 12 7786 CASAVA_Build X 100298396 1I ATATACGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 10 11 7787 CASAVA_Build X 100322768 1D TACGGAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 32 1 22 11 T 12 11 7788 CASAVA_Build X 100325225 1I AACACTCAGC -/T TTTCTCCCAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 3 4 7789 CASAVA_Build X 100347096 1D GGCAGGCAGA T/- CACCTAAGAT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 1 0 7790 CASAVA_Build X 100366060 1D ACAAAAAAAA G/- CCCAAAAAAC 3070 hom 42 het 20 0 15 6 G 1 0 7791 CASAVA_Build X 100404494 1D GCTCAAGGAC T/- TTGGAGGCAT 3070 hom 81 het 34 0 26 8 T 3 2 7792 CASAVA_Build X 100406930 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2764 hom 13 het 13 0 7 6 T 15 14 7793 CASAVA_Build X 100409192 1I TAGGGGCTTG -/C CCAAGGCAAG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 2 3 7794 CASAVA_Build X 100440010 2D AATTAGATTT AC/-- AGTTAGTCTC 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AC 1 0 7795 CASAVA_Build X 100448551 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3044 het 3044 ref 18 10 7 1 A 11 12 7796 CASAVA_Build X 100450317 1D CTGTGTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 12 9 T 12 11 7797 CASAVA_Build X 100456198 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 209 hom 18 4 10 4 A 17 16 7798 CASAVA_Build X 100482998 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1077 hom 30 4 22 4 A 13 12 7799 CASAVA_Build X 100486310 2D TTCATCCAGG TC/-- TCTGTTGGAC 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 TC 2 1 7800 CASAVA_Build X 100486576 3D CTGTGTTTTC ATA/--- ATGATTTAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 ATA 1 0 7801 CASAVA_Build X 100487638 3I GGAAAGGGAG ---/ATC ATCAAGATAA 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 ATC 1 2 7802 CASAVA_Build X 100494544 1D CTGTGTCACC A/- AAAAAAAAAA 1305 het 895 hom 11 4 4 3 A 17 16 7803 CASAVA_Build X 100504933 1I AGCAGCTTCA -/T TTCCCTCATG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 2 3 7804 CASAVA_Build X 100511499 1I CTTCTATCCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 10 18 10 T 7 8 7805 CASAVA_Build X 100517622 1D GGGTTTTGGT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 1659 hom 25 8 11 6 G 10 9 7806 CASAVA_Build X 100523264 1D TCTTCTCCCT C/- CTTAGAGATT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 C 2 1 7807 CASAVA_Build X 100525182 1D CAGACAAATC T/- TTTTTTTTTT 2832 het 2832 ref 34 20 8 6 T 12 11 7808 CASAVA_Build X 100526250 2D ACTCCGTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2088 hom 38 11 12 15 A 18 16 7809 CASAVA_Build X 100537766 5D GTTATAACAG TTAAT/----- TTAATAAAGA 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 TTAAT 2 1 7810 CASAVA_Build X 100540786 6D TTGAAATCCC TTAAAG/------ TTAATTTACT 2381 het 2381 ref 23 14 5 4 TTAAAG 1 0 7811 CASAVA_Build X 100541443 2D TAGTGTGGAG CT/-- CTGAGAAGAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 CT 2 1 7812 CASAVA_Build X 100541859 1D TTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 10 9 7813 CASAVA_Build X 100552928 5D ACATAACCTG TGTTT/----- TGTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 TGTTT 2 1 7814 CASAVA_Build X 100555138 4D TCTTTCTTTA TCTT/---- TCTTTCTCCT 3070 het 3070 hom 35 20 15 0 TCTT 2 1 7815 CASAVA_Build X 100593224 4I CTTTTTTGTG ----/TAGA TAGTTGATAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 TAGA 0 1 7816 CASAVA_Build X 100599788 1I CCAATAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2916 hom 26 7 15 4 T 10 11 7817 CASAVA_Build X 100623252 1I GGTATAAATT -/G GCCAAGCCTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 2 7818 CASAVA_Build X 100624032 5D GGTTTGACTA TTCTT/----- TTCTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 11 15 16 TTCTT 4 3 7819 CASAVA_Build X 100624225 1I TTAATAGACA -/G GGTTTCCCTA 3070 het 348 hom 24 3 16 5 G 2 3 7820 CASAVA_Build X 100625333 1D ATGTTTATGG T/- TTTTTTTTTT 1634 het 1634 ref 38 30 4 5 T 12 11 7821 CASAVA_Build X 100626895 1I GAGTGACAAC -/G GCGTGCGCAC 3070 hom 27 het 10 0 9 1 G 1 2 7822 CASAVA_Build X 100662538 1D CTTTATGAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1368 hom 24 5 14 5 T 9 8 7823 CASAVA_Build X 100671016 1D CTAAAACCAT A/- AAAACCCTAG 1969 het 1868 hom 9 4 5 0 A 5 4 7824 CASAVA_Build X 100690783 1I GAAGCCCAGC -/G GGCTGCACCT 3070 hom 114 het 42 0 35 7 G 2 3 7825 CASAVA_Build X 100691933 1I TCCTCGAAGA -/G GAAGAAAAGG 3070 hom 65 het 27 0 21 6 G 1 2 7826 CASAVA_Build X 100696330 1I14M6D TAAGCAGCAG -AAAAAAAAAAGACGTTGTCC/AAAAAAAAAAAGACG------ TTGTCCTTGT 3070 het 3070 ref 33 17 14 7 N/A 0 0 7827 CASAVA_Build X 100705839 1I ATACAAGTGA -/G GGGAAAAGGG 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 G 3 4 7828 CASAVA_Build X 100708661 1I CCCCTGGAAA -/G GGGGCTGAAG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 G 4 5 7829 CASAVA_Build X 100729032 16I ATTGGTTTCA ----------------/TTAACTCATCTTTCAT TTACCTTTCT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 TTAACTCATCTTTCAT 0 1 7830 CASAVA_Build X 100746384 1I GTATACACGT -/A AAAATCTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 4 5 7831 CASAVA_Build X 100772455 1I ATTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 11 12 7832 CASAVA_Build X 100773241 1I TTAAGTTTTC -/A AAAAAAAAAA 1561 het 1561 ref 49 34 4 11 A 13 14 7833 CASAVA_Build X 100793197 1I GAGACAAATT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 7834 CASAVA_Build X 100799715 3I ACATACCAAC ---/CTT CTGGGATCAA 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 CTT 0 1 7835 CASAVA_Build X 100801357 1I CCCTAGATTA -/C CCCTATTCAG 3070 hom 43 het 19 0 14 5 C 3 4 7836 CASAVA_Build X 100827053 1D GGACATTCCA T/- TCTATATTCC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 2 1 7837 CASAVA_Build X 100835609 21D TGGTATCCTA AACTGCCTTGGTATACTAAAC/--------------------- TTGCTTTGTC 3070 hom 75 het 24 0 25 4 AACTGCCTTGGTATACTAAAC 1 0 7838 CASAVA_Build X 100840627 1I ATGCTGAAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 8 9 7839 CASAVA_Build X 100842063 1D CTTCCTGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 21 1 17 3 A 11 10 7840 CASAVA_Build X 100845610 4D ACACAGCAAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 37 0 30 8 T 18 14 7841 CASAVA_Build X 100847816 1D TTTAACCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 T 11 10 7842 CASAVA_Build X 100848524 2I ACTAGGAGGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 1682 hom 54 4 42 8 GA 6 7 7843 CASAVA_Build X 100905814 1D AAAGAGGTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2355 hom 25 6 15 4 T 9 8 7844 CASAVA_Build X 100912455 1D TTTTTGAGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 9 8 7845 CASAVA_Build X 100933399 1D GGAATACGTT C/- CTAGTGTCCT 3070 hom 72 het 27 0 23 4 C 2 1 7846 CASAVA_Build X 100942325 1I CCATAGAAAG -/A AAATGTTCCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 3 4 7847 CASAVA_Build X 100945333 8D AAGAGATCTA GGAAGGAG/-------- GGAAGGAGGG 3070 het 3070 ref 34 19 10 7 GGAAGGAG 2 1 7848 CASAVA_Build X 100956984 1I AGTTCCAGTA -/G GCGCTGCCCC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 2 7849 CASAVA_Build X 100957066 1I TTCTCCATGA -/G GGCCTTGCCC 3070 hom 81 het 34 0 25 9 G 2 3 7850 CASAVA_Build X 100963666 1I34M1I GGTACTCTGT -CCTTAGCAGAGATGTTGCACTGTGCTGGGAGAAT-/CCCTTAGCAGAGATGTTGCACTGTGCTGGGAGAATC CCTCTTGTCA 3070 hom 102 het 29 0 32 5 N/A 0 0 7851 CASAVA_Build X 100978080 1I AACAGTGCAA -/G GAAGTGGATA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 G 1 2 7852 CASAVA_Build X 100979705 1D ACCTGTGGGG A/- AAGCAGTGAG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 3 2 7853 CASAVA_Build X 100985872 1D CTTCTGTTGC G/- GGGGGGGGGG 3070 het 261 hom 23 4 12 7 G 12 11 7854 CASAVA_Build X 100993835 2D TAAAATTAAA AG/-- AGGGCACACT 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 AG 2 1 7855 CASAVA_Build X 101003225 1I CCTCTGGAAC -/A AACTCTGTAG 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 2 3 7856 CASAVA_Build X 101006088 3I AAGCCTTTCC ---/AAG AAGGACAGCT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 AAG 1 2 7857 CASAVA_Build X 101009935 1D AGCTAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 12 11 7858 CASAVA_Build X 101013318 4I GAAGTCAGAT ----/TATC TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 TATC 0 1 7859 CASAVA_Build X 101024939 1D TCTTATGTTC T/- TTTCTCAGAG 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 4 3 7860 CASAVA_Build X 101028433 1D TAGAACTGGA C/- CAAAAATTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 2 1 7861 CASAVA_Build X 101033469 1D GGAATAAGCA C/- CCAAAGAACG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 3 2 7862 CASAVA_Build X 101038515 2D TTTTATAATT CC/-- CCCTGTATTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 C 5 3 7863 CASAVA_Build X 101056981 1D AAACAAAAAA T/- ATATATATAT 2238 het 1528 hom 15 4 5 6 T 1 0 7864 CASAVA_Build X 101059111 1I TCAAAGCTAC -/A ACGAAATAAC 3070 het 3070 ref 49 26 21 2 A 1 2 7865 CASAVA_Build X 101070725 2I CTAATATTCC --/CT GTTTGCTAGT 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 CT 0 1 7866 CASAVA_Build X 101086039 1I ATATTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 2375 het 2375 ref 35 23 7 5 T 10 11 7867 CASAVA_Build X 101086195 1D TACACTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 907 hom 24 5 10 9 T 15 14 7868 CASAVA_Build X 101097957 4I AAAGTAAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 AAAT 2 3 7869 CASAVA_Build X 101121455 4I TCCCATCAGA ----/AAGT AAGACCATTA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 AAGT 0 1 7870 CASAVA_Build X 101127817 4I CTGGGAATTC ----/TGAG TGTGTGCCTC 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 TGAG 0 1 7871 CASAVA_Build X 101132192 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 8 18 5 TA 9 7 7872 CASAVA_Build X 101135801 1D ATAAATAGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 A 10 9 7873 CASAVA_Build X 101139735 1D GAAATGTAAA C/- CCCCCCGCCA 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 C 7 6 7874 CASAVA_Build X 101145664 3I CCCAAAAATT ---/GAG GAGAAGGGAG 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 GAG 1 2 7875 CASAVA_Build X 101150991 1D GGAATCACTG A/- TTTTTCCATA 3070 het 3070 hom 65 20 33 12 A 1 0 7876 CASAVA_Build X 101156122 2I CACAACTGTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 9 11 7877 CASAVA_Build X 101161975 3I AACAGAATTC ---/AGA AGAAGAGTCT 3070 het 3070 hom 50 26 21 3 AGA 2 3 7878 CASAVA_Build X 101172855 9I ACAGACTTGC ---------/AAATTGGAT AAAGTGTCAA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 AAATTGGAT 0 1 7879 CASAVA_Build X 101173043 1I AAAGAAAGAA -/G GTCATTACAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 1 2 7880 CASAVA_Build X 101183103 1D ATACATATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 12 7 A 12 11 7881 CASAVA_Build X 101197796 4D AATTTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 6 TTGT 3 2 7882 CASAVA_Build X 101198211 28D TATATATATA TATATATATATATATATATATATATATC/---------------------------- TATCTCACAT 2953 het 19 hom 7 1 8 6 TATATATATATATATATATATATATATC 1 0 7883 CASAVA_Build X 101227113 1I TTGAGAGGTA -/G GAGAAAGGTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 2 7884 CASAVA_Build X 101239626 4I GTTAAAAGAA ----/AAAC AAACAAACAA 3067 het 3067 ref 36 19 8 9 AAAC 3 4 7885 CASAVA_Build X 101244880 1I GACAGGGGAC -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 6 7 7886 CASAVA_Build X 101255815 2I TATATATATA --/TG TGTGTAATAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 TG 2 3 7887 CASAVA_Build X 101257706 1D CCCCACCCTA C/- CCCCCACCAC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 C 6 5 7888 CASAVA_Build X 101265317 4D GTTTCCTTTT TGTG/---- TGTGTGTCTC 3070 het 3070 ref 46 24 16 8 TG 5 3 7889 CASAVA_Build X 101269585 3D CTTAACGTTC TTG/--- TTGTCAGAAC 3070 het 3070 ref 36 19 14 6 TTG 2 1 7890 CASAVA_Build X 101278084 1I TCATAACATA -/G GGAGACAATC 3070 hom 86 het 38 0 33 5 G 2 3 7891 CASAVA_Build X 101278817 1D GAGGCAATGA G/- GTCTGATCAA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 G 2 1 7892 CASAVA_Build X 101282437 1I TTGTCCCCTT -/G GGGCGAATGG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 3 4 7893 CASAVA_Build X 101287395 4I TTTTGTCAGG ----/TTGT TTTTATATAT 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 TTGT 0 1 7894 CASAVA_Build X 101293623 1D AACTGTTGTG C/- CCTACAACTT 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 C 3 2 7895 CASAVA_Build X 101296242 1I ATCAGATACA -/G GGCTGTCATT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 G 2 3 7896 CASAVA_Build X 101297479 1I CCGGTCAGCG -/C CCACCTACCT 3070 hom 52 het 30 0 25 5 C 2 3 7897 CASAVA_Build X 101301161 1I AAGAAAAAAG -/A ATCTCCCATC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 7898 CASAVA_Build X 101301279 2I CCCAGTTCTC --/AG AGTTTTGCTA 3070 het 3070 hom 35 8 24 3 AG 1 2 7899 CASAVA_Build X 101302207 1D AAATAATGCC T/- GTCAGGCAGC 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 1 0 7900 CASAVA_Build X 101302904 1I AATTTATAAG -/A AAAAAAAAAA 2863 het 2863 ref 35 21 10 4 A 10 11 7901 CASAVA_Build X 101315173 1I TTTCAAGTGG -/C CCATAAAGAT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 2 3 7902 CASAVA_Build X 101321474 9I TCACTTTAGG ---------/AGGCCTTAA AGGCCTTAAT 2577 het 2577 ref 22 10 9 3 AGGCCTTAA 1 2 7903 CASAVA_Build X 101486462 2D ACACATGTTC AT/-- ACACATTGTA 1180 het 1180 ref 43 35 3 7 AT 1 0 7904 CASAVA_Build X 101488206 1D AGCATATGCT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 8 7 7905 CASAVA_Build X 101516500 1D ATCTTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 2 A 11 10 7906 CASAVA_Build X 101623532 2D ACTCAATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2552 hom 30 10 10 10 A 12 10 7907 CASAVA_Build X 101677608 1D GAGAAAAACA C/- CCTTCACTAA 3070 het 2606 hom 27 8 12 7 C 3 2 7908 CASAVA_Build X 101693224 2D GTCTGAGTCC TG/-- TGATCCTCTC 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 TG 2 1 7909 CASAVA_Build X 101727661 1D TAAGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 11 10 7910 CASAVA_Build X 101822202 1D ATTTGATAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 9 8 7911 CASAVA_Build X 101849661 1D AAAATATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 11 10 7912 CASAVA_Build X 101850391 2I TAACAATAAG --/AA AAAACAATCA 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 A 4 6 7913 CASAVA_Build X 101913625 1D ATTTCAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 38 1 26 11 T 13 12 7914 CASAVA_Build X 101936798 2D CTCTACTTGC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 109 hom 27 3 12 14 T 11 9 7915 CASAVA_Build X 101945290 2D TGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 2888 hom 24 het 13 0 9 4 TA 9 8 7916 CASAVA_Build X 101989215 1I TTTTACAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1327 hom 41 4 29 8 T 11 12 7917 CASAVA_Build X 102011430 1I GCCCCTAACT -/G GGGCTGCTGC 1864 hom 18 het 8 0 4 4 G 3 4 7918 CASAVA_Build X 102011501 1I TGGCTACAGC -/G GCTTTGCCAA 321 het 172 hom 9 2 2 5 G 1 2 7919 CASAVA_Build X 102011752 1I CTGGCTTCAG -/C CCCCTTTCCA 3070 hom 88 het 33 0 28 5 C 4 5 7920 CASAVA_Build X 102019646 1I TATGCCTCAT -/G GCCCAAAGGG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 1 2 7921 CASAVA_Build X 102020418 1D AGATGTCGTT A/- AATAAGGTGA 3070 hom 102 het 39 0 34 6 A 3 2 7922 CASAVA_Build X 102022211 1I AAAGGCTACA -/C CCGTAGGGTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 2 3 7923 CASAVA_Build X 102022428 1D AGTTGGAAGT C/- CCCAAATTTG 3070 hom 104 het 45 0 41 4 C 4 3 7924 CASAVA_Build X 102022543 1D GATGTCAGTC T/- TTTTTTTTCT 1070 het 1070 ref 41 31 3 7 T 9 8 7925 CASAVA_Build X 102024183 5D CCAGCACTTT GGGAG/----- GCTGAGGCAG 1930 het 519 hom 9 1 5 3 GGGAG 1 0 7926 CASAVA_Build X 102059769 1I GGTTGGCAGA -/G CCTCAGGGCT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 G 0 1 7927 CASAVA_Build X 102108653 1I AATATTTTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 8 9 7928 CASAVA_Build X 102154600 1I GACTCACCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 11 12 7929 CASAVA_Build X 102171733 1I CAGGTAAGGT -/G GCGGGCGCCT 2722 hom 15 het 7 0 6 1 G 1 2 7930 CASAVA_Build X 102196674 1D TTTTACCTTT C/- CTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 C 2 1 7931 CASAVA_Build X 102200352 1D GTGTCTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 29 1 23 6 A 11 10 7932 CASAVA_Build X 102200586 1D CCAGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 30 0 26 4 T 12 11 7933 CASAVA_Build X 102201719 1I GCTGTGGTTG -/T TTTTAAAACA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 4 5 7934 CASAVA_Build X 102229974 1I AATTGGCAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 9 10 7935 CASAVA_Build X 102233950 1I CAAGTTATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 A 9 10 7936 CASAVA_Build X 102236969 1I CACCAGCGCA -/T TTTTTTATTA 2936 het 2936 ref 25 11 9 5 T 6 7 7937 CASAVA_Build X 102272270 1I CATCTCTACT -/A AAAAATACAA 2433 het 2057 hom 13 5 7 1 A 5 6 7938 CASAVA_Build X 102283349 1D CCCCATCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2297 hom 23 7 11 5 A 12 11 7939 CASAVA_Build X 102283910 1D ATTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 606 het 89 hom 19 1 4 14 T 19 18 7940 CASAVA_Build X 102287190 1I15M1I GAGATTGAGA -CATCCTGGCTAACAC-/CCATCCTGGCTAACACG GTGAAACCCC 2742 hom 18 het 4 0 7 0 N/A 0 0 7941 CASAVA_Build X 102294478 1D TCATGAATGA T/- TTGGCACCAT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 T 3 2 7942 CASAVA_Build X 102301346 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1472 het 289 hom 13 2 7 4 A 13 14 7943 CASAVA_Build X 102318465 1D AAAATTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2843 hom 30 8 18 4 T 11 10 7944 CASAVA_Build X 102326157 1D CTTCTGATCC T/- TACTAGATGC 3070 het 3070 ref 45 25 11 10 T 2 1 7945 CASAVA_Build X 102330209 1I CCATCTGTAG -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 6 7 7946 CASAVA_Build X 102332759 6I ATTCTCATTG ------/ATGTAT AATATTACAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ATGTAT 0 1 7947 CASAVA_Build X 102345871 1I TTACTGATTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 1361 hom 19 6 12 1 A 8 9 7948 CASAVA_Build X 102358959 1D TTCACATCCA G/- GATCTCATTT 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 G 2 1 7949 CASAVA_Build X 102365406 1I GTGACTCAGT -/A ATATCCTACC 3070 hom 83 het 32 0 29 3 A 1 2 7950 CASAVA_Build X 102365715 1I AAGTGGGCTT -/A ATCCCTGGGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 7951 CASAVA_Build X 102371691 1D CCATGTTAAG A/- ACTTTAAAAA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 A 2 1 7952 CASAVA_Build X 102377515 2D CCTCCAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1936 hom 26 6 15 6 A 12 10 7953 CASAVA_Build X 102387646 1I CAGACTTCTC -/T TAAGACAAAA 3070 het 3070 ref 52 28 21 3 T 1 2 7954 CASAVA_Build X 102388160 1D TAACTAGAAC A/- TTATCTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 1 0 7955 CASAVA_Build X 102391231 23D TGACGCTGAG ATGATGATGACGATGACGCTGAC/----------------------- ATAATGATGA 3070 het 3070 ref 43 32 16 4 ATGATGATGACGATGACGCTGAC 1 0 7956 CASAVA_Build X 102403447 1D CTATCATGTA C/- CCCCATGAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 5 4 7957 CASAVA_Build X 102408823 1D TCGGCCTCCC A/- AAGGTGCTGG 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 3 2 7958 CASAVA_Build X 102420274 3I AAAGGACAGA ---/AAG AAGAAGAAGC 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 AAG 3 4 7959 CASAVA_Build X 102423753 1D TGTGGAAGTA T/- TAAGAAGTTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 2 1 7960 CASAVA_Build X 102432850 1D TAGATTATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 10 9 7961 CASAVA_Build X 102436632 1D CTGTTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 28 0 22 7 A 15 14 7962 CASAVA_Build X 102438689 1D AAAGCTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 T 10 9 7963 CASAVA_Build X 102441702 1D CCAAAAGCAG T/- TTCTGTAGTC 3070 het 3070 ref 29 18 9 4 T 3 2 7964 CASAVA_Build X 102455320 1I CACGGTGAAA -/C CCTGGCTCTA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 2 3 7965 CASAVA_Build X 102462926 24I TTGCTCAGGA ------------------------/TATGGTTGGCTATTCGGGGTCTTT TGTGGTTCCA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 TATGGTTGGCTATTCGGGGTCTTT 0 1 7966 CASAVA_Build X 102468567 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 2387 het 1132 hom 14 5 7 4 A 12 11 7967 CASAVA_Build X 102470119 1I3M1I AGGCTTCAGG -CTG-/CCTGC CCTTGGTACT 3070 hom 72 het 26 0 23 3 N/A 0 0 7968 CASAVA_Build X 102557393 31I TACTTAGGCT -------------------------------/ATACAGCCTATTGCTCCTAGGCTAAAAATTC ATACAGCATG 3070 hom 119 het 37 0 40 2 ATACAGCCTATTGCTCCTAGGCTAAAAATTC 0 1 7969 CASAVA_Build X 102572871 1I GAGAGGTGGT -/G GGGGGGCAGA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 6 7 7970 CASAVA_Build X 102573237 11I ATCTGTGGGG -----------/TCAGCTAGGTT TGCTTTTGTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TCAGCTAGGTT 0 1 7971 CASAVA_Build X 102594439 1D AAAATCAGTT G/- TCCGTGTGTG 3070 hom 144 het 51 0 49 2 G 1 0 7972 CASAVA_Build X 102622187 31D TCCATTTTCT CAGTTTATACGCTATAGGGAGCACAAACAAC/------------------------------- CTGTAGATAC 3070 hom 126 het 36 0 42 4 CAGTTTATACGCTATAGGGAGCACAAACAAC 1 0 7973 CASAVA_Build X 102631115 1D AGTATGGATG C/- CCCCAGAGTA 3070 hom 71 het 29 0 24 5 C 5 4 7974 CASAVA_Build X 102651247 1I TTCCCACTGA -/C TCCTTATCCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 0 1 7975 CASAVA_Build X 102653894 1D TGGTTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 939 het 939 ref 49 31 5 13 T 12 11 7976 CASAVA_Build X 102655075 1I TAAACCGAAA -/G GAAAATATAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 2 7977 CASAVA_Build X 102663970 1D CTTCTAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 30 0 12 19 A 12 11 7978 CASAVA_Build X 102678766 2D GAGCTAGAGG AC/-- ACACACACAC 2375 het 2375 ref 46 28 5 13 AC 8 7 7979 CASAVA_Build X 102724400 1D ATTAGAAAAT C/- CTAGGCAATA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 C 2 1 7980 CASAVA_Build X 102726912 1I CCAACTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 A 10 11 7981 CASAVA_Build X 102729403 3I CTTAAAATTC ---/TTG TTGTGAGGAC 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 TTG 1 2 7982 CASAVA_Build X 102741489 1D AAAAAATTAA C/- CCATCACATG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 C 3 2 7983 CASAVA_Build X 102757839 1D CCCATCCTCC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 8 7 7984 CASAVA_Build X 102783753 1D CTACAACTCC A/- AAAAAAAAAA 1947 het 1835 hom 31 11 7 13 A 17 16 7985 CASAVA_Build X 102804146 1D ACTATTGGCC T/- TTTTTTTTTA 1055 het 1055 ref 46 32 3 12 T 10 9 7986 CASAVA_Build X 102813762 1D AAGCCGGTGA T/- TTTTTTTTTT 2945 het 2461 hom 29 12 9 8 T 13 12 7987 CASAVA_Build X 102817328 1D CAAGCACCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 10 10 A 13 12 7988 CASAVA_Build X 102825862 1D ATGTAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 T 12 11 7989 CASAVA_Build X 102828556 1I CCCTCTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1546 hom 27 7 13 7 T 11 12 7990 CASAVA_Build X 102856637 4I TACAGACATG ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 hom 48 16 22 10 CA 6 8 7991 CASAVA_Build X 102882562 10I AAAAAAAAAC ----------/AAAAAACAAA AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 AAAAAACAAA 1 2 7992 CASAVA_Build X 102884777 1D TTTGGGGACT C/- CCTGTCACAA 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 C 3 2 7993 CASAVA_Build X 102886487 2I TGCAGCAGTC --/TT TTTTTAGATG 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 5 7 7994 CASAVA_Build X 102914589 1I TGTCCATCCT -/C CCCCCAGCCC 3070 hom 33 het 15 0 11 4 C 5 6 7995 CASAVA_Build X 102915104 1D TTGTTCCTTG A/- AACCTTCAGG 3070 hom 103 het 39 0 34 6 A 3 2 7996 CASAVA_Build X 102915417 1I19M1I4M1I TAGCAGATGA -CCCAGGCTTTCACTGGTAC-GCGC-/CCCCAGGCTTTCACTGGTACTGCGCT TTCTCTCTTC 3070 hom 114 het 37 0 37 5 N/A 0 0 7997 CASAVA_Build X 102915826 1I20M1I25M1I CAGCAGGCTG -CACCAAGAAGGCTGGCAGTG-CCTCTTGAGGAATCCCTTGGCAGTG-/CCACCAAGAAGGCTGGCAGTGCCCTCTTGAGGAATCCCTTGGCAGTGC CAGGAGCCTA 3070 hom 57 het 24 0 18 13 N/A 0 0 7998 CASAVA_Build X 102915986 1I TGGAGGACCT -/G GGAAGATACC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 G 2 3 7999 CASAVA_Build X 102916238 4D AGAGACAGAC ACAT/---- AGAGAGAAAC 3070 het 3070 ref 45 25 19 4 ACAT 1 0 8000 CASAVA_Build X 102918357 1I GGGAGGAGAA -/G GGGAGGAGGA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 G 3 4 8001 CASAVA_Build X 102923566 1D68M1D ACATACCCAA GGGACATTTCTTGGACTGTGAAAAATCAAAGGGAGCCCAATGGATCTTTTCTCAGAATGCTTTGATTGTC/-GGACATTTCTTGGACTGTGAAAAATCAAAGGGAGCCCAATGGATCTTTTCTCAGAATGCTTTGATTGT- CAACTACTTT 3070 hom 163 het 35 0 55 8 N/A 0 0 8002 CASAVA_Build X 102924393 1I CACCCCCCGG -/C CTGCAGGCCC 3070 hom 41 het 19 0 14 5 C 1 2 8003 CASAVA_Build X 102931806 1I TGTGGCAAAG -/C CCAAATATTG 3070 hom 106 het 37 0 33 4 C 2 3 8004 CASAVA_Build X 102933183 1D CTCATTTCAT G/- GGGGTATTAT 3070 hom 181 het 68 0 61 7 G 5 4 8005 CASAVA_Build X 102935275 1I TTTGGCTCTG -/C CCTCTGGGAT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 C 2 3 8006 CASAVA_Build X 102938647 1I TATTAAAAAT -/A AAAAAGGAAT 1052 het 1052 ref 12 4 4 4 A 5 6 8007 CASAVA_Build X 102938823 1I CAGGCGACTG -/C CACCATGCTC 3070 hom 63 het 26 0 20 6 C 1 2 8008 CASAVA_Build X 102939160 1I GGCAACTGAG -/C CCTGATTGGT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 C 2 3 8009 CASAVA_Build X 102939391 1I TTCACATTTG -/T TCATAGTACC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 1 2 8010 CASAVA_Build X 102943020 3I TCATTGGGCC ---/TAG TAGCATCTGC 3070 het 3039 hom 34 8 21 5 TAG 1 2 8011 CASAVA_Build X 102944006 1D GCATCCTTTG A/- CTCTTGAGGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 0 8012 CASAVA_Build X 102947352 1D CTTTATAATT A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 23 15 7 1 A 7 6 8013 CASAVA_Build X 102947612 1D CTGAAACCTT G/- GAACTTCTGG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 G 2 1 8014 CASAVA_Build X 102948449 1I TCAGACCGCA -/G GAAGAGATTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 8015 CASAVA_Build X 102949324 1I CTCCCCCAAA -/G GGGCTGTGAC 3070 hom 52 het 25 0 16 9 G 3 4 8016 CASAVA_Build X 102950520 1I CCATGAAGAA -/G GGGCCCAGGC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 3 4 8017 CASAVA_Build X 102953298 1D GAATAACACT A/- CAGATTAGAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 A 1 0 8018 CASAVA_Build X 102962939 2D TACATGTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 30 0 16 16 A 18 16 8019 CASAVA_Build X 102977615 1I ATAGAAAGTA -/T TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 6 7 8020 CASAVA_Build X 102987147 1I AGGGCAAGCT -/G GCTTGCAGCC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 G 1 2 8021 CASAVA_Build X 102989393 9D CATAATAGTC CTTTTATTA/--------- CTTTTATTAA 3070 het 3070 hom 64 25 32 10 CTTTTATTA 2 1 8022 CASAVA_Build X 102998704 1I19M1D TTTGTGATAC -GCTCAGATGACTGGAGGAAC/GGCTCAGATGACTGGAGGAA- CACCAGGGTC 3070 hom 114 het 38 0 39 4 N/A 0 0 8023 CASAVA_Build X 103003062 1D CATCTGAAGC A/- AAGCCACTGG 3070 het 3070 hom 58 20 27 11 A 3 2 8024 CASAVA_Build X 103007400 2D TTTTTTTTTT TG/-- GAGACGGAGT 3034 het 26 hom 15 1 8 6 TG 1 0 8025 CASAVA_Build X 103009115 1D TAAATATTTT A/- AAGTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 3 2 8026 CASAVA_Build X 103015975 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 1750 hom 16 4 12 0 A 8 7 8027 CASAVA_Build X 103018960 4D GAAGGCCAGG CCTC/---- CCTCCTGTCT 3070 het 3070 hom 53 25 23 6 CCTC 2 1 8028 CASAVA_Build X 103019157 3D AGTCTTCTCT TTC/--- CCTTCTGAGT 3070 het 3070 ref 59 36 19 4 TTC 1 0 8029 CASAVA_Build X 103045443 1I CATACAATGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 A 8 9 8030 CASAVA_Build X 103057171 1I CCGGCGTGGT -/G GCGGGCGCCT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 1 2 8031 CASAVA_Build X 103057299 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2422 het 1741 hom 26 8 7 11 A 13 12 8032 CASAVA_Build X 103058688 1D GTATTTGGTG T/- TTTTTTTTTG 1475 het 58 hom 27 2 6 19 T 10 9 8033 CASAVA_Build X 103062948 1I24M1I TAGAGATAAA -CTTTCAGCTGAAACAATAATAGCT-/GCTTTCAGCTGAAACAATAATAGCTG CCTTTGGCTG 3070 hom 66 het 19 0 23 2 N/A 0 0 8034 CASAVA_Build X 103083959 1I CTAATTTTAA -/C ATTTCTCCAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 0 1 8035 CASAVA_Build X 103085506 1D CTCTGTACCA G/- GGTACTATGC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 3 2 8036 CASAVA_Build X 103094159 1I GGCCAGAGGG -/C CAAGATGGCC 3070 het 144 hom 29 1 21 7 C 1 2 8037 CASAVA_Build X 103094303 1D ATGGAGAATG A/- GAGAAAAGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 0 8038 CASAVA_Build X 103094791 1I GGGCGGGCCG -/C CATGTTTACT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 1 2 8039 CASAVA_Build X 103102545 1D GTGTACTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 14 25 10 T 12 11 8040 CASAVA_Build X 103139674 4D ACCAACAAAC AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 AACA 4 3 8041 CASAVA_Build X 103156149 1D TATTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 12 11 8042 CASAVA_Build X 103158853 4I TGTTTTTCCA ----/TTTG TTTGTGTCAC 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 TTTG 1 2 8043 CASAVA_Build X 103162795 4I AAATTTCATA ----/TCTC TCAGCATAAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 TC 1 3 8044 CASAVA_Build X 103168093 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 17 3 10 4 T 11 12 8045 CASAVA_Build X 103174252 2I CATAACAGAC --/AT GTGGACTATT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 AT 0 1 8046 CASAVA_Build X 103176190 1I ATATGTGCCA -/C CTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 C 1 2 8047 CASAVA_Build X 103184992 1D TGAGCCTCCA G/- GGTATGATTC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 G 3 2 8048 CASAVA_Build X 103219069 1I CTTCAGTCCA -/T TGACCTTATC 3070 hom 98 het 37 0 32 5 T 1 2 8049 CASAVA_Build X 103222115 1D CTACAACTTG T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 T 8 7 8050 CASAVA_Build X 103228339 4I TTGTTTAACA ----/AAGT AAGCAACAAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 AAGT 0 1 8051 CASAVA_Build X 103235054 1I ATGGGCCACG -/C CTCTTCTCAC 3070 hom 54 het 19 0 17 2 C 1 2 8052 CASAVA_Build X 103239732 1I AAGAAGGATC -/A AAAAAAGATG 3070 hom 165 het 63 0 54 9 A 6 7 8053 CASAVA_Build X 103241319 9D ATGTGAGGCC AGAGATAGG/--------- ATGTCCTGTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 6 AGAGATAGG 1 0 8054 CASAVA_Build X 103287420 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 951 het 951 ref 24 14 4 7 A 11 10 8055 CASAVA_Build X 103320154 1I TCGGGCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 35 1 29 5 A 11 12 8056 CASAVA_Build X 103398121 1I TCTGCATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1391 hom 32 8 15 9 T 13 14 8057 CASAVA_Build X 103424902 1I CCCCAAAACA -/G CTTCTACCTC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 G 0 1 8058 CASAVA_Build X 103435190 1I GGCTTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 235 hom 39 1 31 7 T 11 12 8059 CASAVA_Build X 103449074 1D AGCACCTTAC A/- AACCTTATCT 3070 het 3070 hom 52 21 24 8 A 3 2 8060 CASAVA_Build X 103465402 1D CGATTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 61 25 25 11 T 10 9 8061 CASAVA_Build X 103520373 1D TGATCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 12 11 8062 CASAVA_Build X 103522769 1D ACCTCAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 15 11 T 12 11 8063 CASAVA_Build X 103540852 1D TGGTCTTTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 9 8 8064 CASAVA_Build X 103545025 1I TTGATCAAGT -/A AGAAGAAAGA 2935 het 2935 ref 23 16 7 0 A 1 2 8065 CASAVA_Build X 103554166 1I TATGTCACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 83 het 39 0 34 5 A 9 10 8066 CASAVA_Build X 103575983 1D GACTTTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 534 hom 16 4 10 2 T 15 14 8067 CASAVA_Build X 103580511 15I TCACAGAGGA ---------------/CCAGAGTAGATTTAG CCACGGCCTA 3070 hom 99 het 36 0 33 5 CCAGAGTAGATTTAG 0 1 8068 CASAVA_Build X 103615149 10D GGAGGGACGC ACATGTTGTG/---------- GGAGGGAGAT 3070 hom 69 het 25 0 22 4 ACATGTTGTG 1 0 8069 CASAVA_Build X 103616528 1D TAATGGTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 422 hom 30 1 26 5 T 10 9 8070 CASAVA_Build X 103655775 1D GGGTGAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 11 10 8071 CASAVA_Build X 103676152 1I AAAATTAAAC -/A TACTTTTACC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 0 1 8072 CASAVA_Build X 103696096 1D ATTGGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 600 hom 32 4 20 9 A 15 14 8073 CASAVA_Build X 103716488 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AT 4 5 8074 CASAVA_Build X 103727256 1D ACCTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 27 1 19 8 T 11 10 8075 CASAVA_Build X 103744028 1D TTTTGAATAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 222 hom 31 1 25 5 T 9 8 8076 CASAVA_Build X 103758831 4I ATAATAAAAT ----/AAAA AAATCAATCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 7 8077 CASAVA_Build X 103761488 2I ACCTGGATAA --/TT TTTTTTTTTT 1768 het 114 hom 10 1 7 2 T 15 17 8078 CASAVA_Build X 103777669 1D CTGGGGATGC A/- AAAAAAAAAA 2897 het 2897 ref 35 19 8 8 A 15 14 8079 CASAVA_Build X 103800020 1I GAATTAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 945 hom 26 3 18 5 T 13 14 8080 CASAVA_Build X 103801923 1I TCCAGTCATG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 319 hom 57 1 44 12 T 8 9 8081 CASAVA_Build X 103835370 1D TGAAATCAGA T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 6 8082 CASAVA_Build X 103838937 1D CTTTCTTTTG A/- AAATCTTATC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 3 8083 CASAVA_Build X 103844182 1I TGTTTTCATA -/T TGCACTGAGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 2 8084 CASAVA_Build X 103846755 1D CTATTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 980 het 980 ref 32 17 3 12 A 17 16 8085 CASAVA_Build X 103861705 1I TGCTATCCCT -/C CCCCTCCCCC 2464 hom 15 het 6 0 6 0 C 4 5 8086 CASAVA_Build X 103876378 1D TGACAAATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 40 0 33 8 A 10 9 8087 CASAVA_Build X 103884474 1D CCACAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 21 3 12 6 T 14 13 8088 CASAVA_Build X 103887616 4I GTCAGGTGAC ----/AAAA AAAGATGCTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 3 7 8089 CASAVA_Build X 103895537 1I GAACATGGAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 9 8090 CASAVA_Build X 103909902 2D GTCTCAAATA AT/-- ATATATATAT 2416 hom 18 het 8 0 7 1 AT 9 8 8091 CASAVA_Build X 103918157 1I GCTAAGGAAA -/C CCAGAGGGGA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 C 2 3 8092 CASAVA_Build X 103919496 1D TAGAAATTTA G/- GGCATCAGTA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 G 3 2 8093 CASAVA_Build X 103926757 1I TCTCCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 43 2 26 15 T 12 13 8094 CASAVA_Build X 103931380 1I TGGCTTATAG -/C CCACCCCCAC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 2 3 8095 CASAVA_Build X 103932781 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 43 0 34 9 T 10 9 8096 CASAVA_Build X 103935062 1I CCATTCTTCC -/T GATTTCATCA 3070 hom 166 het 65 0 56 9 T 0 1 8097 CASAVA_Build X 103944739 1I AGCATAAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 40 hom 35 1 26 8 T 9 10 8098 CASAVA_Build X 103950145 1I CAATAGAGAC -/A ATACACTAGA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 1 2 8099 CASAVA_Build X 103959937 1I CTGGAGACAA -/G GGGGTCAGGG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 G 4 5 8100 CASAVA_Build X 103963815 1I AGGAAGATTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 8 9 8101 CASAVA_Build X 103984974 1D AAGAGTATAG C/- CAGTACTGTA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 2 1 8102 CASAVA_Build X 103988467 1D AAAACTTACA G/- GAATAATATT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 G 2 1 8103 CASAVA_Build X 103990761 1I AATCTTACCG -/A ACTTAGTTCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 8104 CASAVA_Build X 103996219 1D TGATTCCAGA G/- GGACCCAGAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 3 2 8105 CASAVA_Build X 104006731 1D22M1D ACAGTCTAGT GGGAAGAAGAGAGAGAAGTAACTG/-GGAAGAAGAGAGAGAAGTAACT- GGATAATTAA 3070 hom 135 het 45 0 45 10 N/A 0 0 8106 CASAVA_Build X 104011413 1D TGTTTTGCAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 120 het 51 0 41 10 T 9 8 8107 CASAVA_Build X 104015919 1I AGGTGGCTCA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 7 8 8108 CASAVA_Build X 104017698 1I TTGGAAGGGC -/A AAAAAATGCC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 6 7 8109 CASAVA_Build X 104021142 1D CCAAATAGAC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 T 8 7 8110 CASAVA_Build X 104030183 1D CTCTTCCATT A/- GCACTGTAGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 0 8111 CASAVA_Build X 104035563 2D TATCTTCTTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 41 het 23 0 15 9 TA 9 8 8112 CASAVA_Build X 104065560 1D CACTCACAAC T/- TTTTTTTTTT 2250 het 2250 ref 28 17 7 4 T 13 12 8113 CASAVA_Build X 104088608 1I GCTTGGAAAT -/G CCTCAGGCCA 3070 hom 169 het 59 0 57 2 G 0 1 8114 CASAVA_Build X 104095272 6D GTGTGTGTGT GAGAGA/------ GAGAGAGAGA 3070 hom 66 het 32 0 22 10 GA 12 9 8115 CASAVA_Build X 104098863 1D CAAAAAATAG A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 87 het 31 0 28 3 A 7 6 8116 CASAVA_Build X 104108239 1I AGCCAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 35 1 21 13 A 12 13 8117 CASAVA_Build X 104114095 1D5M1D TGCGTTTTCT GGAACAG/-GAACA- GAAACCAACT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 N/A 0 0 8118 CASAVA_Build X 104114927 5D18M3D TAATATATAA TATATTATATGCATAATATATAATAT/-----TATATGCATAATATATAA--- TATATTATAT 1944 hom 10 het 4 0 4 0 N/A 0 0 8119 CASAVA_Build X 104116432 1D TTTTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 11 10 8120 CASAVA_Build X 104116653 1D TCGAACTCCT G/- GGTCACTTGT 3070 hom 33 het 14 0 12 3 G 3 2 8121 CASAVA_Build X 104118767 1D TGTATAATGT A/- AAAAAAAAAA 2941 het 1370 hom 32 5 10 19 A 17 16 8122 CASAVA_Build X 104121756 1I GAGGTGTATG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 9 10 8123 CASAVA_Build X 104134380 1D TAAATATTCC T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 78 het 31 0 26 6 T 8 7 8124 CASAVA_Build X 104158215 1D CTAAGAATAT C/- CCAAAGCTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 3 2 8125 CASAVA_Build X 104167576 1D GAAACACCCT G/- GGAGCATAGA 3070 hom 104 het 42 0 34 9 G 3 2 8126 CASAVA_Build X 104168257 1I TTACTATATA -/T TTTATCTTCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 3 4 8127 CASAVA_Build X 104169136 1I TTTCTCCCTT -/G GCTACTGCCC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 G 1 2 8128 CASAVA_Build X 104169558 1D CCTATTAGAG T/- TCACCAATGA 3070 hom 152 het 57 0 51 6 T 2 1 8129 CASAVA_Build X 104182543 1I CTGGGCTCAG -/C CCCAACCCCA 3070 hom 48 het 20 0 15 5 C 3 4 8130 CASAVA_Build X 104182599 1I51M1I GCCAGGCAGC -GGAGCAGACACCCCGAGCCTGCAGGGACTGGGGGGTCATGTCTGCCCCTGA-/GGGAGCAGACACCCCGAGCCTGCAGGGACTGGGGGGTCATGTCTGCCCCTGAG GGTGCAGGCT 3070 het 99 hom 18 2 22 6 N/A 0 0 8131 CASAVA_Build X 104185656 1D CAAGGATGCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 T 9 8 8132 CASAVA_Build X 104187144 1D TGGGTTTTTT C/- CTGAAAAAGC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 C 2 1 8133 CASAVA_Build X 104188299 1D TATAATTTTT G/- CATCTCCTGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 1 0 8134 CASAVA_Build X 104188482 1I TGAAAGCAAC -/A AAAATGCTTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 4 5 8135 CASAVA_Build X 104214590 1D AAGGCTAGAG A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 7 6 8136 CASAVA_Build X 104217599 14D AAAATGTGAT ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAG 3070 het 3070 ref 37 26 10 3 AC 11 4 8137 CASAVA_Build X 104233021 1I TGGAGATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 A 9 10 8138 CASAVA_Build X 104239990 1I AGTTCTGTCA -/T TTTTTTGCAC 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 6 7 8139 CASAVA_Build X 104245919 2D ACCTTGAATT CC/-- AAACTTACCC 3070 het 3070 ref 55 27 22 7 C 2 0 8140 CASAVA_Build X 104250962 1D TTAGTCTTTG T/- TTTCTCTTTG 3070 hom 163 het 56 0 55 1 T 4 3 8141 CASAVA_Build X 104257694 1I GATTAAAGAG -/T ACATCCACAG 3070 hom 151 het 57 0 51 6 T 0 1 8142 CASAVA_Build X 104261798 1D ACCTTATTAT C/- CCTGCTGATG 3070 hom 150 het 53 0 50 3 C 3 2 8143 CASAVA_Build X 104295434 1D TTGCCTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 A 12 11 8144 CASAVA_Build X 104300737 1I TAATTCAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 A 11 12 8145 CASAVA_Build X 104303314 1I TTAAATCCAA -/C CCCTTCTCTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 3 4 8146 CASAVA_Build X 104313906 1D GGGTCATGTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 8 7 8147 CASAVA_Build X 104315813 4D CATGATATAA ATAC/---- ATACACATTT 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 ATAC 2 1 8148 CASAVA_Build X 104324078 5I TCTCTTGAAA -----/TATCT TATGTTGTAA 3070 het 3070 hom 54 14 27 13 TATCT 0 1 8149 CASAVA_Build X 104329096 1D AACTGATAGC T/- TTTTTTTTTT 1502 het 1502 ref 51 42 4 5 T 11 10 8150 CASAVA_Build X 104330652 1I GGTGGTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1356 het 1319 hom 28 8 10 10 T 15 16 8151 CASAVA_Build X 104334861 1D AACTATTTAT A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 A 8 7 8152 CASAVA_Build X 104347102 1D TATCCACCAC G/- GATCAAGTCA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 2 1 8153 CASAVA_Build X 104350933 1D4M1D CACAACCTCC AACATC/-ACAT- CCCTCTGCTC 2659 hom 30 het 12 0 8 5 N/A 0 0 8154 CASAVA_Build X 104368023 1I GAAGCTCAGG -/A ATGTATTGCT 3070 hom 57 het 25 0 21 4 A 1 2 8155 CASAVA_Build X 104379987 1I ATTTTGTAGG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 7 8 8156 CASAVA_Build X 104381584 1I TCACAGAATA -/T TTTTTAGGGT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 5 6 8157 CASAVA_Build X 104382920 1D AGTGGGGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 T 13 12 8158 CASAVA_Build X 104384280 1I TATTTGGAAC -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 6 7 8159 CASAVA_Build X 104394598 1I AGAAAAGTTG -/C CCTAAGGGGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 2 3 8160 CASAVA_Build X 104397081 3I AGAAAAAAAA ---/TGT TGTTATGAAA 3070 het 3070 ref 44 19 22 3 TGT 1 2 8161 CASAVA_Build X 104397385 1D GATAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 12 15 T 13 12 8162 CASAVA_Build X 104400156 1I63M1D TGCTAAGAGA -TAAATTTTAGGTGCTCTTACCACAAAAATAAACATATGAGGAGATTGATATGCTAATTTGTTTG/GTAGATTTTAGGTGCTCTTACCACAAAAATAAACATATGAGGAGATTGATATGCTAATTTGTTT- GACTGTGGTA 3070 hom 54 het 20 0 19 12 N/A 0 0 8163 CASAVA_Build X 104400255 2D19M1D ATATGTATAA ACAAAAAACATCTTGTTGTATA/--CAAAAACATCTTGTTGTAT- ACCTTAAATA 3070 hom 72 het 31 0 25 9 N/A 0 0 8164 CASAVA_Build X 104417948 2D CAAAACAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 19 8 T 12 10 8165 CASAVA_Build X 104419751 1I TCTACTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 11 12 8166 CASAVA_Build X 104430360 1D GGAAAAGGGG A/- CAATGAATCT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 1 0 8167 CASAVA_Build X 104435606 3I TGGGAGGGAA ---/CCT CCTCCAATCC 3070 het 3070 ref 51 25 16 10 CCT 1 2 8168 CASAVA_Build X 104437377 1I TTCATTTTGT -/G GTTGAAAGGT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 G 1 2 8169 CASAVA_Build X 104440213 1D TTTTGCCAAA G/- GTTCTTGTAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 2 1 8170 CASAVA_Build X 104454224 1D ATGTACAACA G/- TGGTCAAGAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 G 1 0 8171 CASAVA_Build X 104462190 1D AGTCTTCTAT A/- CCCTGTACTA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 1 0 8172 CASAVA_Build X 104463711 1D TCACTTGTGC T/- TGGTTCTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 1 8173 CASAVA_Build X 104475217 1D CAAAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1409 het 1409 ref 32 19 4 10 T 13 12 8174 CASAVA_Build X 104490251 1I AATGTAGTTG -/C CTACGGCCTC 3070 hom 129 het 50 0 43 7 C 1 2 8175 CASAVA_Build X 104490505 1D GGTGCATTGG C/- CCCTAAAGAA 3070 hom 157 het 59 0 53 6 C 4 3 8176 CASAVA_Build X 104538481 1D TAAGGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 22 3 A 13 12 8177 CASAVA_Build X 104540206 1D TAAAGTGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 975 hom 35 3 26 6 A 12 11 8178 CASAVA_Build X 104580681 1D GAGCCAGAGA T/- TTGGAGTCAA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 3 2 8179 CASAVA_Build X 104599105 1I GGCCTCAGGG -/C CATGTGACCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 1 2 8180 CASAVA_Build X 104602229 1D ATGCAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 2251 het 2251 ref 35 23 6 6 T 12 11 8181 CASAVA_Build X 104615419 1I AAAATACAGG -/C CTTCGGTTTC 3070 hom 96 het 33 0 33 0 C 1 2 8182 CASAVA_Build X 104641906 1D TAACAATTTT C/- CTATCACATC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 2 1 8183 CASAVA_Build X 104652278 1D TCATGGGGGC T/- TCCCCCTTTG 2724 het 2724 ref 27 14 6 7 T 2 1 8184 CASAVA_Build X 104677150 6D AAGAAATCCT ATGGTG/------ ATGGTGATTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 ATGGTG 2 1 8185 CASAVA_Build X 104703345 1D ACAGTTATGC A/- CATTCATCTA 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 A 1 0 8186 CASAVA_Build X 104712533 3D TCCAATTATT ATC/--- ATTTTATTTA 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 ATC 1 0 8187 CASAVA_Build X 104716348 1D TGATCTCATT C/- CCTTTTTATG 3070 hom 66 het 32 0 23 10 C 3 2 8188 CASAVA_Build X 104719231 1I TATTGTTCCC -/T TTTTTGTGTC 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 5 6 8189 CASAVA_Build X 104733921 1I CCCAGTCATA -/T TGACACCTAT 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 T 1 2 8190 CASAVA_Build X 104736481 1D GAGGTGCCAA G/- GAACATACAT 3070 hom 96 het 40 0 33 8 G 2 1 8191 CASAVA_Build X 104739900 1D GATAAATATT G/- GGTAATATTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 3 2 8192 CASAVA_Build X 104739998 1D TGTACTTAAT G/- GGCGCTGAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 G 3 2 8193 CASAVA_Build X 104741540 1D GGTTAATTGT A/- AAAACAGCCT 3070 hom 130 het 50 0 43 7 A 5 4 8194 CASAVA_Build X 104749091 1D AGTTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 1060 het 1060 ref 39 32 3 4 A 11 10 8195 CASAVA_Build X 104756458 1I GAAGAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 11 12 8196 CASAVA_Build X 104759592 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2106 het 647 hom 21 4 7 10 A 14 15 8197 CASAVA_Build X 104779434 37D AGCTGATCAC TAATTTCACTTACTTGCCCTAGTGTAGGGAATTTCTG/------------------------------------- TGAAGCCACT 3070 het 3070 ref 45 30 16 7 TAATTTCACTTACTTGCCCTAGTGTAGGGAATTTCTG 1 0 8198 CASAVA_Build X 104787633 1I TTTAGATTTC -/T TTTTACCTTT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 T 4 5 8199 CASAVA_Build X 104789299 1I CAGGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 2 3 8200 CASAVA_Build X 104801264 1I GTCTATATCT -/A AAAAAAAAAA 2369 het 2369 ref 21 7 8 6 A 12 13 8201 CASAVA_Build X 104814197 1D ATAGAACCTA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 C 1 0 8202 CASAVA_Build X 104815459 1I TAGGCAGCTG -/C CCCTCTGGGA 2645 hom 18 het 7 0 7 0 C 3 4 8203 CASAVA_Build X 104823319 1D ATGCTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1528 hom 37 6 19 12 A 13 12 8204 CASAVA_Build X 104841910 2D TTCTGGAGAC TG/-- AGAAATCTAA 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 TG 1 0 8205 CASAVA_Build X 104850950 1D GAAACCATCA C/- CCACAATGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 3 2 8206 CASAVA_Build X 104857689 1I AACATTTTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 T 7 8 8207 CASAVA_Build X 104865300 1I9M1I CTAGCCTTGG -CTCCCAAGG-/CCTCCCAAGGC CTAGAATTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 5 N/A 0 0 8208 CASAVA_Build X 104867699 1D ACACAGCAAT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 6 8209 CASAVA_Build X 104877839 1D TGTGGTGAAA T/- TTTTTTTTTA 1238 het 1238 ref 42 33 3 6 T 10 9 8210 CASAVA_Build X 104881514 1I45M1D CTGTACACAG -AAAAAAAAACTAGAGAGAATGTGTTACTGAGGGAAATGTCCCTGGT/AAAAAAAAAACTAGAGAGAATGTGTTACTGAGGGAAATGTCCCTGG- TTCCCAGGTG 3070 het 3070 hom 42 13 14 27 N/A 0 0 8211 CASAVA_Build X 104885066 1D CCAATACAGC A/- AAAAGAGGAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 5 4 8212 CASAVA_Build X 104893524 1I GATTTAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 11 12 8213 CASAVA_Build X 104894338 1I AACAGAGAGC -/A AGCCAGAATA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 2 8214 CASAVA_Build X 104895765 5I GGTTTTGTTC -----/TGTTT TGTTTTGGAG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 TGTTT 1 2 8215 CASAVA_Build X 104897447 1D TTATAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 T 13 12 8216 CASAVA_Build X 104945784 1D AGCCATAAAC A/- AGCATGAACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 2 1 8217 CASAVA_Build X 104966278 1I ATTGGAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2170 hom 34 7 16 11 T 15 16 8218 CASAVA_Build X 104969915 1D65M1D AGAAAAGTTT CCCTCACATCCTTGCCATTTTGCAAATATAGCTTAATTAAGTCAGCCAACAAATAATGCTTGAGCAC/-CCTCACATCCTTGCCATTTTGCAAATATAGCTTAATTAAGTCAGCCAACAAATAATGCTTGAGCA- CCCTTAAAGC 3070 hom 181 het 48 0 61 12 N/A 0 0 8219 CASAVA_Build X 105009320 1D ACTTTTCTCT G/- GATCAATCAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 G 2 1 8220 CASAVA_Build X 105020001 1I CAGCGTACAG -/C CTCCCTCCTG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 C 1 2 8221 CASAVA_Build X 105078560 4D TTAGCTTATT ACTC/---- AGTTGTTGCC 3070 het 3070 hom 29 8 18 5 ACTC 1 0 8222 CASAVA_Build X 105081659 1D ATCCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1418 het 1418 ref 37 28 4 5 T 13 12 8223 CASAVA_Build X 105099631 1I TTGCAGGTGT -/G GGCTGAAGCC 3070 hom 78 het 34 0 22 12 G 2 3 8224 CASAVA_Build X 105183701 13I CATGCAATTT -------------/ACCTATATAACAA ACCTGCATCT 3070 hom 100 het 39 0 34 6 ACCTATATAACAA 0 1 8225 CASAVA_Build X 105193297 1D GCATGGAATG T/- TTTTTCTATT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 6 5 8226 CASAVA_Build X 105210304 1I ATCTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 10 11 8227 CASAVA_Build X 105214979 1I TAGAAAAAGA -/G GGAATCCTCC 3070 hom 51 het 22 0 16 6 G 2 3 8228 CASAVA_Build X 105230927 1I GGGCTAAAGG -/C AGCTTTGCTG 3070 hom 83 het 33 0 25 8 C 0 1 8229 CASAVA_Build X 105234477 1D CTACAATGCA G/- GGAGGTTTCC 3070 hom 141 het 51 0 48 4 G 3 2 8230 CASAVA_Build X 105236624 1I TCACATCACT -/G GCCCCCAGAG 3070 hom 55 het 24 0 16 8 G 1 2 8231 CASAVA_Build X 105252203 1D CAGGTGTTTT C/- CTTAAGTAAG 3070 hom 90 het 39 0 31 9 C 2 1 8232 CASAVA_Build X 105360297 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 345 hom 21 4 14 3 T 17 16 8233 CASAVA_Build X 105360593 1I TGCACCCTGC -/T TTTTTTTTTT 1894 het 1894 ref 28 10 10 8 T 15 16 8234 CASAVA_Build X 105379862 12D AATTATTTTG TTGTTTTTGTTT/------------ TTGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 19 20 8 TTGTTT 3 1 8235 CASAVA_Build X 105454783 1I CAAATGGGAT -/A AAAAAAAAGG 2235 het 2235 ref 30 22 5 3 A 8 9 8236 CASAVA_Build X 105460127 1D TGGGTTTATT G/- GGGGTCAGTT 3070 het 3070 hom 49 16 24 10 G 5 4 8237 CASAVA_Build X 105512104 1D TGCGGACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2090 hom 27 8 12 7 T 11 10 8238 CASAVA_Build X 105584070 1D CATCCAAGCC A/- AATCAAGAGC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 3 2 8239 CASAVA_Build X 105677479 1D CATCAACACA T/- TTTTTTTTCC 1138 het 1138 ref 46 38 3 5 T 9 8 8240 CASAVA_Build X 105735685 1I AACTTCTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 11 12 8241 CASAVA_Build X 105788851 1D TCCCATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 21 7 T 14 13 8242 CASAVA_Build X 105836273 1I TCCTTATGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 9 10 8243 CASAVA_Build X 105849115 2D CCCATGGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 153 hom 20 1 13 6 T 13 11 8244 CASAVA_Build X 105933341 1I AAGGGAGGCG -/C CCCAATCACA 3070 hom 63 het 27 0 18 9 C 3 4 8245 CASAVA_Build X 105972018 1D TCAATAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1763 het 1763 ref 46 38 5 4 T 12 11 8246 CASAVA_Build X 106009525 1D TTGGGCAAGG T/- TTTTTTTTTT 1758 het 1264 hom 36 14 7 15 T 19 18 8247 CASAVA_Build X 106057815 1I TTCAAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 528 het 528 ref 27 10 4 13 T 10 11 8248 CASAVA_Build X 106117753 1I GTCCTTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1385 hom 44 3 32 9 A 11 12 8249 CASAVA_Build X 106152044 1I TTTTGATTTA -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 6 7 8250 CASAVA_Build X 106194291 1D CTTTGACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 833 hom 32 2 17 13 T 15 14 8251 CASAVA_Build X 106211107 1I TCTAGATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 T 10 11 8252 CASAVA_Build X 106225036 1D ATAAGGAGGC A/- AAAAAAAAAA 1426 het 1426 ref 38 17 5 16 A 19 18 8253 CASAVA_Build X 106233327 1D TGCTGGCAAC T/- TACCAGAGCT 3070 hom 160 het 54 0 54 0 T 2 1 8254 CASAVA_Build X 106238774 1D CTGGATGGAA C/- TATTTGACCT 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 C 1 0 8255 CASAVA_Build X 106284293 1D AAAGATGATT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 A 8 7 8256 CASAVA_Build X 106301761 1I AGAATCAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 9 10 8257 CASAVA_Build X 106399719 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 7 8 8258 CASAVA_Build X 106424141 1D GTATCGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 15 17 T 13 12 8259 CASAVA_Build X 106430689 1I AAGTCCCGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 A 10 11 8260 CASAVA_Build X 106469137 1D CTGCACTCAA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 8 7 8261 CASAVA_Build X 106528479 1I TGGCATTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 11 12 8262 CASAVA_Build X 106628982 1I ATGTCCCACT -/A AAAAAAAAAA 940 het 940 ref 48 34 3 11 A 11 12 8263 CASAVA_Build X 106640096 1I AGGTTGGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 10 11 8264 CASAVA_Build X 106740921 1D TTGGTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1471 het 1471 ref 28 10 5 13 T 18 17 8265 CASAVA_Build X 106742106 1D TATTATACTC T/- TAAGTTTTAG 1567 het 1207 hom 8 4 4 0 T 2 1 8266 CASAVA_Build X 106745063 1D CCGTTACCCC T/- GGTGAAACCC 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 T 1 0 8267 CASAVA_Build X 106788824 4D AAAAAGGAGA AAGG/---- AAGGAAGGAG 3070 het 3070 ref 42 23 14 6 AAGG 3 2 8268 CASAVA_Build X 106794924 4I TTTTTTGTGT ----/GTGA GTGTGTGTAT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 GTGA 0 1 8269 CASAVA_Build X 106819632 1D GAATTGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 44 0 34 10 T 11 10 8270 CASAVA_Build X 106822402 1D CAGATGTATC T/- TTTTTTTTTT 2097 het 419 hom 13 2 6 5 T 13 12 8271 CASAVA_Build X 106826140 12D TAGTAGAGAT GGGATTTCACTG/------------ TGTTAGCCAG 1420 hom 7 het 3 0 3 0 GGGATTTCACTG 1 0 8272 CASAVA_Build X 106841920 1I AAAAAAAACC -/A AAAAAAAAAA 1821 het 1821 ref 21 9 7 5 A 11 12 8273 CASAVA_Build X 106896778 2I AGTAACCTGG --/CT CTGTTACATA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 CT 1 2 8274 CASAVA_Build X 106899602 18D CTTTCTCTTT CACACACACACACACACA/------------------ CACACACACA 3070 het 3070 ref 30 16 11 7 CA 15 6 8275 CASAVA_Build X 106907900 3I CTTCTTCGCT ---/GTC TTTTTTTTTT 633 het 633 ref 30 15 4 11 GTC 0 1 8276 CASAVA_Build X 106915863 1I CTAATATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 11 12 8277 CASAVA_Build X 106928017 2D ATGAGCCTGT AA/-- AAAAAAAAAA 2693 het 1013 hom 33 11 12 10 A 25 23 8278 CASAVA_Build X 106933010 1D TAAGGCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1760 het 1760 ref 38 22 4 12 T 15 14 8279 CASAVA_Build X 106938685 1D GTAGCAGGTA T/- TTTTTTTTTT 2617 het 1793 hom 25 5 10 10 T 15 14 8280 CASAVA_Build X 106944636 1I ATAAAAGTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 9 10 8281 CASAVA_Build X 106946789 2D TGTATATTTA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 49 21 21 8 GT 8 7 8282 CASAVA_Build X 106951624 1D TACCTTAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 T 10 9 8283 CASAVA_Build X 106953276 4D GAGATTGTTT TATA/---- TATATATATA 2071 het 682 hom 15 3 6 7 TA 10 8 8284 CASAVA_Build X 106963314 1I TATATATATA -/T TATTTTTTTT 1292 het 1292 ref 9 4 3 2 T 1 2 8285 CASAVA_Build X 106965541 3I CATTTGTATA ---/TCT TCTTTGGAAA 3070 het 3070 hom 40 10 24 6 TCT 1 2 8286 CASAVA_Build X 106967425 1D CATGCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 17 11 A 12 11 8287 CASAVA_Build X 106974624 4I AGTGAGCCTC ----/CTAA CTGTCTGCAA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 CTAA 0 1 8288 CASAVA_Build X 107024083 1D TGTCCTATCC T/- TTTTTTTTTT 1509 het 1509 ref 44 32 5 7 T 11 10 8289 CASAVA_Build X 107068231 1I TATAAGTCAC -/T ATTTGCAAGC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 0 1 8290 CASAVA_Build X 107090354 1I TATACCCTTT -/C ATTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 C 0 1 8291 CASAVA_Build X 107090709 2D AATTATACTC TT/-- TTAGTTATTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 4 2 8292 CASAVA_Build X 107119733 2D TCTTTGTCTC TT/-- TTGATCTTTG 2930 het 1878 hom 14 6 6 2 T 4 2 8293 CASAVA_Build X 107127967 1I ATAAAAAAAT -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 6 7 8294 CASAVA_Build X 107128084 1D TTAAAGAACC A/- AAAGTAGATC 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 A 4 3 8295 CASAVA_Build X 107131693 1I GAAAATAGAC -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 6 7 8296 CASAVA_Build X 107136548 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3007 het 3007 ref 29 12 11 7 A 13 12 8297 CASAVA_Build X 107169809 3D AATATATAAT ATC/--- ATAATTATAC 2436 het 2436 ref 20 13 6 1 ATC 1 0 8298 CASAVA_Build X 107185598 1D AAAAAAAATA T/- GATCATATCA 3070 het 3070 hom 37 14 18 7 T 1 0 8299 CASAVA_Build X 107216592 3D TCTATGAAAT ATC/--- ATTTTCACAT 3070 het 3070 ref 49 23 21 7 ATC 1 0 8300 CASAVA_Build X 107218790 1D AAAAAGCAAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 45 17 19 9 A 8 7 8301 CASAVA_Build X 107244674 1D GGTTAAAATT A/- AGTGTCATTT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 2 1 8302 CASAVA_Build X 107258561 1D GCCCCATAAT A/- ATGGAATTGA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 A 2 1 8303 CASAVA_Build X 107264304 2D TAAAGTAAGT AA/-- AAGAGTCTGG 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 A 4 2 8304 CASAVA_Build X 107269664 7I AGAAATTTAT -------/GTCTCAC GTCTCACTGT 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 GTCTCAC 1 2 8305 CASAVA_Build X 107279987 1I CAACAGCAGT -/G GGGCCAGGAC 3070 het 3070 ref 52 27 15 10 G 3 4 8306 CASAVA_Build X 107313639 3I CTTTACCAAC ---/CTT CTCTCTACAG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 CTT 0 1 8307 CASAVA_Build X 107333863 1D AGTATTGAGA G/- GGTTGGGAGT 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 G 3 2 8308 CASAVA_Build X 107349747 12D ACCCCCCTCC CCATATTGTATT/------------ CCCTTGATTC 3070 het 3070 ref 44 27 17 8 CCATATTGTATT 1 0 8309 CASAVA_Build X 107373202 1I CCCCCATGTG -/A ACTGTATTGG 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 1 2 8310 CASAVA_Build X 107382585 1D ATGACACAAT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 49 25 17 8 A 7 6 8311 CASAVA_Build X 107389833 1I ACTGAATCAT -/A ACTAATTAGA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 1 2 8312 CASAVA_Build X 107395277 1I ACCTATTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 934 hom 31 2 23 6 T 11 12 8313 CASAVA_Build X 107397571 1D AACACACAAA G/- GTACATTCAT 3070 hom 135 het 53 0 44 10 G 2 1 8314 CASAVA_Build X 107413474 2D GTTTTTTTTT TG/-- GGGGGGGGTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TG 1 0 8315 CASAVA_Build X 107420523 1D AGCCCAAAGC A/- ATGTAGTATG 3070 het 3070 ref 45 22 16 8 A 2 1 8316 CASAVA_Build X 107436997 1D GTGGCAGGGG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 30 8 13 9 A 8 7 8317 CASAVA_Build X 107449019 1I ATCCCAGCAC -/T TTGGGAAGCC 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 T 2 3 8318 CASAVA_Build X 107470725 1D CTAGTGGGGT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 1588 hom 27 5 14 8 G 10 9 8319 CASAVA_Build X 107478240 1I TGTAGGGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 9 10 8320 CASAVA_Build X 107480659 1I CTGTAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 17 10 T 10 11 8321 CASAVA_Build X 107498134 1I CCATATAGCA -/T GTAAGTGAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 0 1 8322 CASAVA_Build X 107527530 1D TAACTCCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 16 13 A 13 12 8323 CASAVA_Build X 107541127 1D TAAGAGCTAC T/- TTTCACTTGG 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 T 4 3 8324 CASAVA_Build X 107563419 1D TCTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1077 het 1077 ref 32 24 3 5 T 11 10 8325 CASAVA_Build X 107652753 1D AAACAAAGGT A/- AAAAAAAAAT 2117 het 609 hom 19 5 9 5 A 10 9 8326 CASAVA_Build X 107708946 1I TACAATTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 T 10 11 8327 CASAVA_Build X 107712582 1D AAGATTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1763 hom 51 13 14 24 T 19 18 8328 CASAVA_Build X 107753326 1I GGTTTTCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 A 10 11 8329 CASAVA_Build X 107827576 2I GATAGAAAAC --/AT ATAGTAATGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AT 1 2 8330 CASAVA_Build X 107828782 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 9 8 8331 CASAVA_Build X 107849446 1I AAAAACAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 938 hom 20 5 10 5 C 0 1 8332 CASAVA_Build X 107859175 1I ATTACTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 12 13 8333 CASAVA_Build X 107869836 2I AACAAATTAT --/AA GAGAGCATCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 0 2 8334 CASAVA_Build X 107872610 1I ACTTAGTAAA -/T TAGCTACTGC 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 T 1 2 8335 CASAVA_Build X 107894104 1I TCCTTAGAGC -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 6 7 8336 CASAVA_Build X 107902920 3D CTTGATGGGG ATT/--- ATGGGTCTGG 3070 het 3070 hom 18 8 9 4 ATT 1 0 8337 CASAVA_Build X 107906467 2I TCTCTTGCCT --/GA GAGGGCTAGG 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 GA 1 2 8338 CASAVA_Build X 107912788 1I TATATAATTG -/A AAAACAGTAT 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 A 4 5 8339 CASAVA_Build X 107914105 1D GAATACCCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 10 9 8340 CASAVA_Build X 107916877 1I ATTCGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 10 11 8341 CASAVA_Build X 107921418 1I TTTTCATTGG -/A GAGTTTAGTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 8342 CASAVA_Build X 107922309 3D TATTGAGGTA TTC/--- TTCTTTGGGT 3070 het 3070 ref 25 12 13 2 TTC 2 1 8343 CASAVA_Build X 107923345 1D ATGATAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 11 10 8344 CASAVA_Build X 107925881 2I GGCCTCACAA --/CT CTGTCCAGTG 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 CT 1 2 8345 CASAVA_Build X 107935062 4I CCAATAACAG ----/ACAA ACAGAGAGCC 2565 het 2565 ref 31 18 6 7 ACAA 0 1 8346 CASAVA_Build X 107938157 1D TTGGAACCAA C/- CCAAATGCCC 3070 het 617 hom 20 2 13 5 C 3 2 8347 CASAVA_Build X 107943145 1I ACTAATTTAC -/A TTCCCACCAA 3070 het 3070 ref 30 21 8 1 A 0 1 8348 CASAVA_Build X 107948644 1D TATTTGCTTC T/- TGAAGTTGTG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 2 1 8349 CASAVA_Build X 107959191 1I TGTTGTCCTT -/A AAAAAATTTA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 6 7 8350 CASAVA_Build X 107964800 1I GCATTTCAAG -/T TTTTTCCTGC 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 5 6 8351 CASAVA_Build X 107969764 2D AAAATTTATC AT/-- ATATATATGC 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 AT 5 4 8352 CASAVA_Build X 107972622 2I CAATTTTTTC --/TA TCTTATCCAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 TA 0 1 8353 CASAVA_Build X 107978706 1D TCAAAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 12 11 8354 CASAVA_Build X 107983122 1D AAAACCCACT G/- AAGTACAAAA 2157 het 2157 ref 30 21 5 4 G 1 0 8355 CASAVA_Build X 107993716 1D AGACATTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 41 1 32 9 T 11 10 8356 CASAVA_Build X 107997057 1I AAAATAATAA -/T AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 0 1 8357 CASAVA_Build X 108004370 1D GAGCCATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 11 10 8358 CASAVA_Build X 108007899 1I GAAGGGAGGT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 A 7 8 8359 CASAVA_Build X 108017437 2I ATAAATTGAA --/AG AGAAATTAAA 3070 het 3070 ref 41 26 10 5 AG 1 2 8360 CASAVA_Build X 108025721 1D AGGCCTCCCC A/- GCCATGTGGA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 1 0 8361 CASAVA_Build X 108030141 1I CAAGATGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 52 17 24 11 A 9 10 8362 CASAVA_Build X 108030462 1D GAAAACCCTT A/- AAAACCTGTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 5 4 8363 CASAVA_Build X 108040879 1D CCAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2413 het 2069 hom 29 8 11 10 T 19 18 8364 CASAVA_Build X 108047422 1D TTTGGCTTTC A/- AAAGGGACTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 A 4 3 8365 CASAVA_Build X 108054060 1I CTGGGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 A 13 14 8366 CASAVA_Build X 108055117 1D TAAAAATCTT A/- ACTAGGCTCT 3070 het 3070 ref 45 24 17 7 A 2 1 8367 CASAVA_Build X 108057456 2D TTGCAATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 12 10 8368 CASAVA_Build X 108084834 1I ATACAACCAT -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 6 7 8369 CASAVA_Build X 108093263 1I CGAAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 T 10 11 8370 CASAVA_Build X 108110581 1D TCTGAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 1362 het 1362 ref 36 23 3 10 T 11 10 8371 CASAVA_Build X 108131813 1I ATTTTCCTCT -/C CCCCCACATT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 C 5 6 8372 CASAVA_Build X 108132807 1I CAATCTATGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 8 9 8373 CASAVA_Build X 108137855 1D TCAAAACTCA C/- CACAAGAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 C 2 1 8374 CASAVA_Build X 108139998 1D ACAGGTTATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 T 10 9 8375 CASAVA_Build X 108148788 1D TACTTCTTTT G/- AAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 G 1 0 8376 CASAVA_Build X 108166915 1I CTTCTTTGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 T 8 9 8377 CASAVA_Build X 108172782 1I TTCATTTTTA -/T TAATTTCTAA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 T 1 2 8378 CASAVA_Build X 108175372 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 10 9 8379 CASAVA_Build X 108176687 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 9 8 8380 CASAVA_Build X 108177201 1I TAAAAATAAC -/A AAACTCACTC 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 A 3 4 8381 CASAVA_Build X 108177621 1I AATAACATGA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 6 7 8382 CASAVA_Build X 108182141 2I ACTATAGTCA --/CT CTGTCTGCTA 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 CT 1 2 8383 CASAVA_Build X 108182835 1D CTCTCCTTTT C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 C 9 8 8384 CASAVA_Build X 108183248 3D GTTTTGATGA TGT/--- TAATTCTTCC 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 TGT 1 0 8385 CASAVA_Build X 108183392 1D TTTATTTTTT G/- TAGCTATTGT 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 G 1 0 8386 CASAVA_Build X 108190206 1D TGTTGGGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2522 hom 32 8 21 3 T 10 9 8387 CASAVA_Build X 108202179 1D CTTCGTGGCT G/- CTTTGTTTAC 3070 het 2039 hom 22 9 8 5 G 1 0 8388 CASAVA_Build X 108203001 5D TGTATATATC CTTAA/----- CTTATCACAG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 CTTAA 1 0 8389 CASAVA_Build X 108207158 1D TGTCTTGGGG T/- TGCTCTTCTT 2019 het 2019 ref 13 8 5 1 T 2 1 8390 CASAVA_Build X 108210305 1D GAACTTTCCA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 8 7 8391 CASAVA_Build X 108222620 2D ACTTTTTGAT GG/-- GGTTGTTTTT 1934 het 156 hom 6 1 5 0 G 4 2 8392 CASAVA_Build X 108235870 1D TGCCCTAAAA G/- TCTCTGATGT 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 G 1 0 8393 CASAVA_Build X 108264902 1I CAAAGTGTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 11 12 8394 CASAVA_Build X 108265959 1I AACTTTAAAC -/A AAAAATACTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 6 8395 CASAVA_Build X 108268043 3D CTCTCTCTCT CTA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 14 11 1 CTA 1 0 8396 CASAVA_Build X 108275694 1D CTCACATCTG A/- ATACTAAAGT 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 A 2 1 8397 CASAVA_Build X 108283641 1I CTGATTTTTT -/A TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 0 1 8398 CASAVA_Build X 108289074 4D AAAGGATAAG AATT/---- AATATTGTGA 3070 het 3070 hom 40 14 24 6 AATT 1 0 8399 CASAVA_Build X 108298903 1D ACCAAAAAAA C/- CTCTATCAAG 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 C 2 1 8400 CASAVA_Build X 108304661 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTATT 3070 het 2537 hom 17 7 10 0 A 1 0 8401 CASAVA_Build X 108333393 1D CACTTTTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 10 9 8402 CASAVA_Build X 108335963 14D CTTCTAGATT TATTTGCATAAAGG/-------------- TATTTGCATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TATTTGCATAAAGG 1 0 8403 CASAVA_Build X 108365009 1D ACAGCTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 12 11 8404 CASAVA_Build X 108369063 1D CAAAACACCA T/- TTTATATTTA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 4 3 8405 CASAVA_Build X 108379840 2I ATTGGCTATT --/TA TATGTCTTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TA 1 2 8406 CASAVA_Build X 108395196 1D CGTGAAGGTG C/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 hom 46 21 22 5 C 1 0 8407 CASAVA_Build X 108420969 2I TAAAAAAAAC --/TT TTGTTTCATT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 2 4 8408 CASAVA_Build X 108429613 2I GCAAGGACTC --/TT GAACTTGACT 3070 het 3070 hom 34 9 22 3 T 0 2 8409 CASAVA_Build X 108456841 1I TATATCAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 10 11 8410 CASAVA_Build X 108458298 1I AATTTATCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 T 9 10 8411 CASAVA_Build X 108475037 1D AGGGAGGTTA G/- GGGCTGACAG 2949 het 1901 hom 16 4 8 5 G 4 3 8412 CASAVA_Build X 108476789 1D CAGAGGACAC A/- ATTATATCAT 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 A 2 1 8413 CASAVA_Build X 108495104 1D GTTGTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1393 het 1393 ref 49 41 5 3 T 11 10 8414 CASAVA_Build X 108504953 1I TGGAGATGCC -/T TTAATGTTTA 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 2 3 8415 CASAVA_Build X 108509270 2D TTCTCACCAC AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 10 8 8416 CASAVA_Build X 108517265 1D CAGGAAGTTT G/- TATGGGTAAA 3070 het 3070 ref 59 34 22 4 G 1 0 8417 CASAVA_Build X 108546405 1D AAGGATAAGT G/- GGGACAATAT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 G 4 3 8418 CASAVA_Build X 108617278 1I GCATTTTCTG -/C CTTTGTGAAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 1 2 8419 CASAVA_Build X 108619365 1D CACCAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 27 1 20 6 A 14 13 8420 CASAVA_Build X 108619649 1D AATTGGTGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 17 0 14 7 T 10 9 8421 CASAVA_Build X 108635690 1D CTAAATTTGT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 9 8 8422 CASAVA_Build X 108635791 1I TTTTATTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 9 10 8423 CASAVA_Build X 108647501 1D TATTTGTTTG T/- TTTTTGAGGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 6 5 8424 CASAVA_Build X 108656284 1D CTTCTTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 32 1 24 7 A 14 13 8425 CASAVA_Build X 108659751 1D ACGTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 12 11 8426 CASAVA_Build X 108799280 1I TTAATCTAAA -/T TTTTTTTTTT 942 het 942 ref 20 5 3 12 T 17 18 8427 CASAVA_Build X 108802623 1I GCAACATAGG -/A GAACATTACT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 0 1 8428 CASAVA_Build X 108827596 1D CTATTGACAT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 41 het 21 0 11 11 G 11 10 8429 CASAVA_Build X 108834302 3D CTAATAATTC TAT/--- TATCATTCAT 3070 hom 117 het 43 0 40 6 TAT 2 1 8430 CASAVA_Build X 108847739 1D ACACCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 46 0 37 9 T 11 10 8431 CASAVA_Build X 108848981 4I CAAACAAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 AAAC 2 3 8432 CASAVA_Build X 108872090 1D GACTCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 22 2 14 6 A 15 14 8433 CASAVA_Build X 108874079 2I TTAAATTTCC --/TT TTTTTTTTTT 1743 hom 33 het 23 0 11 12 T 15 17 8434 CASAVA_Build X 108876714 1D TTGCAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 10 9 8435 CASAVA_Build X 108887314 1I ACAGAAATAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 415 hom 33 1 28 4 A 8 9 8436 CASAVA_Build X 108889033 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 27 0 16 11 A 12 13 8437 CASAVA_Build X 108891204 1I ACTAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 28 2 19 7 A 10 11 8438 CASAVA_Build X 108901899 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1128 hom 21 3 13 5 A 13 14 8439 CASAVA_Build X 108928690 1D AATGATGACA C/- CCCCCCGCTA 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 C 7 6 8440 CASAVA_Build X 108929103 1D AGGTTTTGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 10 9 8441 CASAVA_Build X 108933418 4D CATTCTTCCT TTCC/---- TTCTTTCTTT 1596 het 1596 ref 36 20 11 7 TTCC 1 0 8442 CASAVA_Build X 108939822 2I AATTGAAAAC --/AT ATACCCACCC 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 AT 1 2 8443 CASAVA_Build X 108944727 1I CAGTACCCTC -/A GGGGTGGCAC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 0 1 8444 CASAVA_Build X 108950694 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 11 10 8445 CASAVA_Build X 108951477 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAG 1739 het 1739 ref 19 9 8 2 A 9 10 8446 CASAVA_Build X 108953060 1I CAGGAAGTGG -/C CCCCCCCGCC 1936 het 1936 ref 28 15 5 8 C 7 8 8447 CASAVA_Build X 108960905 1I GTTTCTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2878 hom 37 11 15 11 T 13 14 8448 CASAVA_Build X 108978914 1I CACAAAAAAA -/T GTACTATTAA 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 T 0 1 8449 CASAVA_Build X 108982431 1D CTCCGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1196 het 929 hom 9 4 3 2 A 16 15 8450 CASAVA_Build X 108984211 2I ACACATAGAG --/AC ACATTGTTGT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 AC 1 2 8451 CASAVA_Build X 108990621 1I TCTGAGATTG -/C CCCCAGTGAT 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 C 4 5 8452 CASAVA_Build X 109002565 1D AATAGCATGT A/- AAAAAAAAAT 1331 het 1259 hom 9 5 3 1 A 10 9 8453 CASAVA_Build X 109009460 13I ATGATTCTGT -------------/ACAACTAATAAAA ACAACTAATA 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 ACAACTAATAAAA 1 2 8454 CASAVA_Build X 109044232 1I AGTGAGGCCT -/G GGGCAAAACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 3 4 8455 CASAVA_Build X 109053421 1D AAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 629 het 629 ref 39 30 3 6 A 11 10 8456 CASAVA_Build X 109092624 2D CGCCCTGCCA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2236 hom 32 8 13 11 AT 7 6 8457 CASAVA_Build X 109101463 1I TTTGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1859 het 1859 ref 20 9 5 6 T 10 11 8458 CASAVA_Build X 109114947 5D GTTTTTTCTG TTTTC/----- TTTTTTTTTT 2919 het 2919 ref 23 11 10 2 TTTTC 1 0 8459 CASAVA_Build X 109122773 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 2409 het 2409 ref 28 12 8 8 TA 8 7 8460 CASAVA_Build X 109124869 1I CATCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2013 hom 24 8 11 5 A 10 11 8461 CASAVA_Build X 109139385 3D TAATGTTTCT CCA/--- CCATTAGTGG 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 CCA 2 1 8462 CASAVA_Build X 109151408 2D TGTGTTTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1722 het 1722 ref 52 39 4 11 TG 7 6 8463 CASAVA_Build X 109186826 2I ACTTAATGAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 TA 6 7 8464 CASAVA_Build X 109191297 1D GCCTGTATTC T/- TTAACCACTT 3070 het 3070 ref 49 25 18 7 T 3 2 8465 CASAVA_Build X 109256083 1I AGCTCACAGG -/T TGCCCTCTGG 3070 het 3070 hom 50 20 17 13 T 1 2 8466 CASAVA_Build X 109258997 1I AAATGAATTC -/T TGACCTCAGG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 1 2 8467 CASAVA_Build X 109264950 1D TTATAAAAAA T/- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 T 1 0 8468 CASAVA_Build X 109278968 1D ATCTATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 12 11 8469 CASAVA_Build X 109416556 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1941 het 1465 hom 18 7 6 5 A 17 16 8470 CASAVA_Build X 109439483 1I GACTTTATTG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 7 8 8471 CASAVA_Build X 109574139 2D AACTTTTATT TC/-- TCTCTGTCCA 3070 het 3070 hom 69 25 31 14 TC 3 2 8472 CASAVA_Build X 109759388 1D AAAACCCTTC A/- AAAAACATCA 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 6 5 8473 CASAVA_Build X 109896595 1D AATTACCAAC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 8 7 8474 CASAVA_Build X 109900255 6I ATTTTGTACT ------/AAATGA AAATGAAAAC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 AAATGA 1 2 8475 CASAVA_Build X 109900644 4D ATGCCAGTTA GTTT/---- AACAACATAG 3070 het 3070 ref 44 27 15 3 GTTT 1 0 8476 CASAVA_Build X 109901985 1I AACGCTGATG -/A AAAAAATCAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 7 8477 CASAVA_Build X 109905354 7D TGTGGGGGAA AATGGAT/------- AACCATGTAA 3070 hom 89 het 33 0 28 6 AATGGAT 1 0 8478 CASAVA_Build X 109907238 1D ATTTGGGATG T/- TAAATATCAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 2 1 8479 CASAVA_Build X 109922547 6I AAGACTACTT ------/TTACCG TTAATCCTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTACCG 0 1 8480 CASAVA_Build X 109965499 1D GTCGGGGGGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 35 het 30 0 15 15 G 10 9 8481 CASAVA_Build X 109991945 1I GTTTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 11 12 8482 CASAVA_Build X 110024986 1D TGAAAGTAGA C/- TGTTATGAGC 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 C 1 0 8483 CASAVA_Build X 110043964 1I CAGGTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2539 hom 43 10 19 14 T 11 12 8484 CASAVA_Build X 110046404 1D AAATCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 33 1 27 5 T 12 11 8485 CASAVA_Build X 110049872 1I GTAGGCCACA -/T TTTGAACTAT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 3 4 8486 CASAVA_Build X 110056406 1I AAGTGTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 617 hom 34 3 27 4 A 13 14 8487 CASAVA_Build X 110073781 6I ATAGAGGAGA ------/AAGGGT AAGGGTAGAA 3070 hom 156 het 58 0 52 6 AAGGGT 1 2 8488 CASAVA_Build X 110076239 10I TGACTGGTGG ----------/CACATCACAT CCAAAAAAAA 3070 hom 95 het 38 0 33 5 CACAT 0 2 8489 CASAVA_Build X 110121024 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAA 989 het 361 hom 24 4 9 11 AAAG 1 0 8490 CASAVA_Build X 110122538 4I AAAGGGACTC ----/AGTT AGTGCAATTC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 AGTT 0 1 8491 CASAVA_Build X 110139381 2I CTTAGTCTTC --/TG GTGGCCCCAG 3070 hom 114 het 41 0 37 4 TG 0 1 8492 CASAVA_Build X 110149607 1D AAAAGAAAAA G/- GGGGGGGGGC 1592 het 238 hom 15 2 5 8 G 10 9 8493 CASAVA_Build X 110157108 1D GATTACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 A 12 11 8494 CASAVA_Build X 110173178 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2975 hom 34 13 10 11 A 17 16 8495 CASAVA_Build X 110192726 1D AGGAAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 769 hom 31 6 14 11 T 15 14 8496 CASAVA_Build X 110193705 2D GACTGTCTCG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 34 1 20 13 A 17 15 8497 CASAVA_Build X 110195202 1I GATGATCACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 33 1 18 14 T 11 12 8498 CASAVA_Build X 110217308 1D GCATTATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 44 2 27 15 A 13 12 8499 CASAVA_Build X 110217651 3D AAAAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 854 het 233 hom 33 4 10 20 A 14 11 8500 CASAVA_Build X 110228216 3D TGGCCAAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 41 0 29 12 A 17 14 8501 CASAVA_Build X 110254760 1I TACTTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 364 hom 36 1 26 9 A 9 10 8502 CASAVA_Build X 110293328 1D CTCAAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 1321 het 1321 ref 47 38 3 7 T 11 10 8503 CASAVA_Build X 110317835 2D AGGGAAATGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 41 10 15 16 AT 10 9 8504 CASAVA_Build X 110545899 1I ACTTTCATAT -/G AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 36 0 28 8 G 0 1 8505 CASAVA_Build X 110575228 1D TTCTATGGCA T/- TTTTTTTTTA 1409 het 1409 ref 24 16 3 5 T 10 9 8506 CASAVA_Build X 110689132 4I AAATGATCTG ----/AACT AACTGACTCC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AACT 1 2 8507 CASAVA_Build X 110745830 1I GGGAGGCCGA -/G GCGGGCAGAT 2936 hom 21 het 11 0 7 4 G 1 2 8508 CASAVA_Build X 110747832 1I CAATCAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 10 11 8509 CASAVA_Build X 110847034 1D GAACAGTTAT A/- TAAACAAATT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 1 0 8510 CASAVA_Build X 110871099 7D CTTGTCAGGT CAAAGGG/------- CCCAGGTTCT 3070 het 3070 hom 37 16 21 5 CAAAGGG 1 0 8511 CASAVA_Build X 110935928 1I AAAAGCATTT -/A AAAAAATGTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 6 7 8512 CASAVA_Build X 110990191 1I AGTTGTTAAA -/G GCTGTAGCTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 1 2 8513 CASAVA_Build X 111036573 2D GGCTTATCTT TG/-- GGTCCTTATC 3070 hom 126 het 50 0 43 10 TG 1 0 8514 CASAVA_Build X 111041075 1I CTCAGAGCCT -/G GATCCATGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 2 8515 CASAVA_Build X 111051332 1D CGATTTAACA T/- TTTTTTTTTT 945 het 945 ref 37 24 3 10 T 12 11 8516 CASAVA_Build X 111274525 4D CTTGCTCCGG ATTA/---- ATTAAATCAG 3070 het 3070 ref 46 25 18 5 ATTA 2 1 8517 CASAVA_Build X 111288032 1I CAATGATGAA -/G GGAAGCTCCC 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 G 2 3 8518 CASAVA_Build X 111308271 1I CGTGAAACAG -/T AAAAGGATTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 0 1 8519 CASAVA_Build X 111309231 1I28M1D ATAGGGACAT -AAAAAAAAAGCAGCTTTAAGGACAAATGA/AAAAAAAAAAGCAGCTTTAAGGACAAATG- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 18 12 11 8 N/A 0 0 8520 CASAVA_Build X 111318622 1I ACTCACCCTC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 8 9 8521 CASAVA_Build X 111319649 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1809 hom 22 5 14 4 A 11 10 8522 CASAVA_Build X 111327352 5D CCAGCTCTCT ATGTA/----- ATGTAGCCTT 3070 hom 135 het 48 0 45 4 ATGTA 2 1 8523 CASAVA_Build X 111337524 1D AGTGGCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1985 hom 30 8 12 10 T 15 14 8524 CASAVA_Build X 111343874 1D TCTCCCAAAG T/- TTCCCCTTGC 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 T 3 2 8525 CASAVA_Build X 111383166 2I TTGCAAGCTG --/TT TTCACTGTTT 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 T 2 4 8526 CASAVA_Build X 111384220 1D TTCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1861 hom 22 7 12 3 T 13 12 8527 CASAVA_Build X 111384556 1I GAACAGGGGC -/G GGGGGGCATT 2858 het 2179 hom 16 6 9 1 G 6 7 8528 CASAVA_Build X 111391281 3D ATACACCAAT AGC/--- AGACAAACAG 1696 het 937 hom 7 2 5 0 AGC 1 0 8529 CASAVA_Build X 111405050 1I TTTGATCTCA -/T TTTTTTCTCT 2071 het 2071 ref 48 31 7 10 T 6 7 8530 CASAVA_Build X 111451419 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 855 het 855 ref 15 9 2 4 A 16 15 8531 CASAVA_Build X 111472626 2D ACCCTTTCTG AC/-- ACAGTTGCAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 AC 2 1 8532 CASAVA_Build X 111515280 1D TAAAAGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 11 10 8533 CASAVA_Build X 111535623 1D CTATCTACAC A/- AAAAAAGCAC 3070 hom 116 het 44 0 38 6 A 7 6 8534 CASAVA_Build X 111538358 1I GGGATAAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 8 9 8535 CASAVA_Build X 111545261 1I GTTGTATATA -/C TTACAGATCA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 C 0 1 8536 CASAVA_Build X 111552389 1D AGTCAGCAAA G/- GGGGGGTTCC 3070 hom 121 het 46 0 40 6 G 7 6 8537 CASAVA_Build X 111561140 1I GGCTCTGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 29 0 22 7 A 10 11 8538 CASAVA_Build X 111568119 1I GCCAGGGATT -/C CACTTCTAAG 3070 hom 111 het 45 0 37 8 C 1 2 8539 CASAVA_Build X 111574084 1D TAAGAGACTA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 7 6 8540 CASAVA_Build X 111575067 3I TGACGGGTGT ---/GAA GAAGGGAGCT 3070 hom 151 het 58 0 51 7 GAA 1 2 8541 CASAVA_Build X 111579339 3I ATGTAGATAA ---/TGT TGAAACAGAA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TGT 0 1 8542 CASAVA_Build X 111586001 1D TGGCTTAGGA C/- CTTTGGCTGA 3070 het 3070 hom 55 22 25 8 C 2 1 8543 CASAVA_Build X 111590172 2I AAGAGGGAAA --/CT CTCTAACTCA 3070 hom 181 het 68 0 60 8 CT 2 3 8544 CASAVA_Build X 111605549 5D AGAGGTTATG AATAT/----- GTCTATTACC 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 AATAT 1 0 8545 CASAVA_Build X 111607244 5I GGAATCCACA -----/TACTT TGAAACACTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TACTT 0 1 8546 CASAVA_Build X 111609279 1D TCCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 25 2 16 7 T 11 10 8547 CASAVA_Build X 111609290 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAATCTT 3070 het 28 hom 21 2 16 3 A 7 6 8548 CASAVA_Build X 111609755 4D CCTGAGATAG AGGC/---- AGGCAGCCAG 3070 hom 87 het 36 0 27 9 AGGC 2 1 8549 CASAVA_Build X 111614466 1D TTTAATAATT G/- CCGTTCTGAC 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 G 1 0 8550 CASAVA_Build X 111625728 1D AAATTGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 A 11 10 8551 CASAVA_Build X 111637956 1I TAAAAAATTG -/A AAAAAAAAAG 2293 het 582 hom 10 2 8 0 A 9 10 8552 CASAVA_Build X 111643631 1D AGACCTTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3066 hom 40 14 16 11 A 15 14 8553 CASAVA_Build X 111647720 1D CTAGGCTAAG A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 38 19 17 3 A 7 6 8554 CASAVA_Build X 111654398 6D TTTAATAATA GCTGCT/------ GCTCTAACAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 5 GCT 3 1 8555 CASAVA_Build X 111659801 1D ACCTTTCTCC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 A 9 8 8556 CASAVA_Build X 111689189 5D CAAAAGCCAC AGAAT/----- AGGTCTTCAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 9 AGAAT 1 0 8557 CASAVA_Build X 111693586 1D ATTGGTAAGC A/- AAAAAGATAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 6 5 8558 CASAVA_Build X 111697157 1D CTAGCATGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 9 8 8559 CASAVA_Build X 111700798 1I TATTGATCCT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 A 8 9 8560 CASAVA_Build X 111700974 1I AAAAAAAAAT -/C TTTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 C 0 1 8561 CASAVA_Build X 111703602 3D TAAGAGATAA TTT/--- TTGAATCATG 3070 het 3070 ref 33 14 12 9 T 5 2 8562 CASAVA_Build X 111707877 1D ATATTACTTC A/- TTATGTATAA 3070 het 3070 ref 51 34 13 5 A 1 0 8563 CASAVA_Build X 111709495 12D TGACAATTTG TTCAAATAGACC/------------ TTCCCCAAGT 3070 het 3070 hom 44 16 26 6 TTCAAATAGACC 1 0 8564 CASAVA_Build X 111711432 10D AGTTTGTGTG GGGGGATAAA/---------- TGGCTACAGT 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 GGGGGATAAA 1 0 8565 CASAVA_Build X 111718239 1I AAGGGAATCC -/A AAAAAAAAAA 2410 het 2218 hom 22 7 8 7 A 10 11 8566 CASAVA_Build X 111731628 2D ACAAAAGTTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 11 9 8567 CASAVA_Build X 111744556 1I ATGGCAATTC -/A AAAAAAAAAA 1362 het 1362 ref 28 10 5 13 A 17 18 8568 CASAVA_Build X 111764834 1D AGAGATTATA T/- TCATTGGCAC 3070 hom 138 het 53 0 46 7 T 2 1 8569 CASAVA_Build X 111807546 1I ACAAAGCTTC -/A AAAAAAAAAA 1237 het 1237 ref 37 23 4 10 A 15 16 8570 CASAVA_Build X 111822223 2D AACATAATTT TA/-- TATGTTATAT 2148 hom 12 het 5 0 5 1 TA 2 1 8571 CASAVA_Build X 111837747 1D CTATTCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 35 1 27 7 T 13 12 8572 CASAVA_Build X 111948745 3D GTTAACCAGG AAC/--- AACAAGCCGC 3070 het 3070 ref 41 27 11 4 AAC 2 1 8573 CASAVA_Build X 111950840 1D GTTAAGAGGG A/- AAAAAAAAAA 1062 het 1062 ref 28 14 4 10 A 15 14 8574 CASAVA_Build X 111958392 1D CAAAGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 150 hom 37 2 26 10 T 12 11 8575 CASAVA_Build X 111961714 1I ACTTCTGGGG -/A AAAAAAAAAA 1468 het 1468 ref 37 24 4 9 A 13 14 8576 CASAVA_Build X 111965051 1I ACCTCTGTGA -/G TTATTAATAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 0 1 8577 CASAVA_Build X 111965471 2D CCATCAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 21 1 11 9 T 16 14 8578 CASAVA_Build X 111966780 1D TTTACAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 20 5 A 11 10 8579 CASAVA_Build X 112023036 1D ATGTTGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 33 1 30 2 T 13 12 8580 CASAVA_Build X 112058566 2D GTATATATAT AC/-- ACACACACAC 2717 het 2717 ref 16 9 7 0 AC 9 8 8581 CASAVA_Build X 112065202 2D TGTTGGTATT TC/-- TCTTCTACTG 3070 het 3070 ref 46 22 15 10 TC 2 1 8582 CASAVA_Build X 112071986 1I TTCCTTTTTG -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 6 7 8583 CASAVA_Build X 112073064 1I GAATTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 9 10 T 11 12 8584 CASAVA_Build X 112073303 1I TGCTTCTTTC -/T TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 2 3 8585 CASAVA_Build X 112079460 3D GGGGAAGAGT TAA/--- TAATATATGT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 TAA 2 1 8586 CASAVA_Build X 112104726 1I CTGCCGTGCC -/T TTTTTTTTTT 2976 het 2778 hom 22 8 10 4 T 10 11 8587 CASAVA_Build X 112130833 1I TTATTCAAGT -/C CTTTGCCATT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 C 1 2 8588 CASAVA_Build X 112135412 1D TAAGAAAAAG A/- AAAATCACAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 5 4 8589 CASAVA_Build X 112143656 2I AGAGAGAGGA --/AG AGAGAGAGAG 1256 het 1256 ref 16 9 4 3 AG 7 8 8590 CASAVA_Build X 112156127 9I AAAAAAAGTA ---------/ATTATAAAG ATTAGAGTAG 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 ATTATAAAG 0 1 8591 CASAVA_Build X 112160783 2D TGGTTTGCTA AT/-- ATTTTGTTGA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 AT 2 1 8592 CASAVA_Build X 112198709 2I ATATATGTAG --/AT ATATATATAT 1538 het 1538 ref 26 12 6 8 AT 5 6 8593 CASAVA_Build X 112227410 1I TCTCTACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 10 11 8594 CASAVA_Build X 112248667 4D ATTATGTCAT TCTC/---- TCTTTTATAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 TC 3 1 8595 CASAVA_Build X 112250043 4I CTCTCAGAAA ----/TGAG TGAGTGGAAA 3070 het 3070 hom 54 23 26 5 TGAG 1 2 8596 CASAVA_Build X 112255850 5I GGATATTTTC -----/TCTTT TTTTTCTTTC 1493 het 1493 ref 11 7 4 0 TCTTT 0 1 8597 CASAVA_Build X 112262826 4I AAAAATAGGT ----/GCAA GCATTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 GCAA 0 1 8598 CASAVA_Build X 112267135 1I GGGAGAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 T 10 11 8599 CASAVA_Build X 112276593 17D CCTCACCCCT TGTATGCTTACAGTGAC/----------------- TACTGTAAAA 3070 het 3070 ref 42 26 16 4 TGTATGCTTACAGTGAC 1 0 8600 CASAVA_Build X 112279169 1I ACCAGCCCTG -/C CTGGGGCTAT 3070 hom 77 het 35 0 24 11 C 1 2 8601 CASAVA_Build X 112283605 1I TTTTAAAGTT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 A 7 8 8602 CASAVA_Build X 112284004 2I ATCTGGAAAC --/TT TGTTGAATTA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 1 3 8603 CASAVA_Build X 112284123 1D TTGGATGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 11 10 8604 CASAVA_Build X 112285083 1I ATCTTTGGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 8 9 8605 CASAVA_Build X 112289979 13D TTTTGTATAT GGTGTAAGGAATG/------------- GGTGCAGTTT 2897 het 2897 ref 26 19 9 3 GGTGTAAGGAATG 1 0 8606 CASAVA_Build X 112290352 1I GAATAGCATC -/A AATCTATAAA 3070 het 1745 hom 17 5 7 5 A 2 3 8607 CASAVA_Build X 112290533 1I TATTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2571 hom 30 9 13 8 T 13 14 8608 CASAVA_Build X 112291388 3I ACTTTAGAGA ---/TTG TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 TTG 0 1 8609 CASAVA_Build X 112295065 1I ACTGATATAG -/A AACGTTTTCT 3070 het 3070 ref 56 30 19 7 A 2 3 8610 CASAVA_Build X 112296440 2D TTTTCAGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 17 15 T 14 12 8611 CASAVA_Build X 112298313 4I TTTTCTTTTC ----/TTTT TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 6 10 8612 CASAVA_Build X 112302775 8I TATATATACA --------/TATATATG TATATATGTA 2941 het 2941 ref 23 9 6 8 TATATATG 1 2 8613 CASAVA_Build X 112304992 1I TGAATTTCTT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 C 9 10 8614 CASAVA_Build X 112313552 2D TTTCACTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 TA 6 5 8615 CASAVA_Build X 112314190 1D GGAGACAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 10 9 8616 CASAVA_Build X 112324366 1D TGTGCCTGCG C/- CCCCCCCAGC 3070 het 2176 hom 24 5 15 4 C 8 7 8617 CASAVA_Build X 112324532 1D TATTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2979 het 2647 hom 30 10 12 8 A 15 14 8618 CASAVA_Build X 112325454 2I CCAGAATTGC --/TA TGTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 TA 0 1 8619 CASAVA_Build X 112330011 1D GCTTCGTTGA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 57 het 24 0 19 6 T 8 7 8620 CASAVA_Build X 112331725 1I TTCCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1029 hom 44 4 19 21 T 12 13 8621 CASAVA_Build X 112334122 1I TCTACTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2038 hom 32 10 16 6 G 0 1 8622 CASAVA_Build X 112335171 1I GGTTGGCAGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 T 8 9 8623 CASAVA_Build X 112353630 1I CCTTTTGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 T 10 11 8624 CASAVA_Build X 112357281 3D TGACGGAGAC ATT/--- ATTATCACAC 3070 het 3070 hom 45 22 22 2 ATT 2 1 8625 CASAVA_Build X 112359291 1I TAAAATATAC -/A CTTATGACAT 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 A 0 1 8626 CASAVA_Build X 112365036 3D ACTTTTCAAC TTG/--- TTGTGATCTC 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 TTG 2 1 8627 CASAVA_Build X 112370428 1I AGTCATGTGA -/T TTCCCCCCCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 2 3 8628 CASAVA_Build X 112378304 1D GTAATAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 24 1 15 8 T 17 16 8629 CASAVA_Build X 112378700 7D TGTTGATACG ATTTATT/------- ATTTATTACA 3070 het 3070 hom 35 14 16 10 ATTTATT 2 1 8630 CASAVA_Build X 112381509 1D TGATGCATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 10 9 8631 CASAVA_Build X 112385270 1D CAGAAATGCC A/- CCCAGAATCC 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 A 1 0 8632 CASAVA_Build X 112389156 1D ATGATTTCAG T/- TTTTTTTTTT 1929 het 1197 hom 31 8 8 15 T 19 18 8633 CASAVA_Build X 112396971 2D AAAGAAAAAC AT/-- AGTGAAGTTA 3070 het 3070 hom 38 15 19 6 AT 1 0 8634 CASAVA_Build X 112398891 3D ATAAATAAGT GAA/--- GAAGAAGAAT 2699 het 2699 ref 29 18 7 4 GAA 4 3 8635 CASAVA_Build X 112406691 1I CCACTGGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 A 11 12 8636 CASAVA_Build X 112410483 4I TATTTGAATT ----/ACTC ATTTATGCCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 ACTC 0 1 8637 CASAVA_Build X 112410819 1D GAGATGTGAT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 43 26 16 1 A 8 7 8638 CASAVA_Build X 112412027 1D GTCTATCATA T/- CTATCTATCT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 T 1 0 8639 CASAVA_Build X 112414150 1D ATTCCATCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 8 7 8640 CASAVA_Build X 112414950 4D CCAGAACTTA AAAT/---- AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 24 1 16 9 AAAT 1 0 8641 CASAVA_Build X 112418599 6I CCCTAATAAG ------/TTGTCC TTGTCCTTAT 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 TTGTCC 1 2 8642 CASAVA_Build X 112420151 4D GTGGTATAAT ATAC/---- ATAATATAAA 3070 het 3070 ref 45 25 18 4 ATAC 1 0 8643 CASAVA_Build X 112420418 4D ATATTAATGA ATTT/---- ATTCTTCTGC 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 ATTT 1 0 8644 CASAVA_Build X 112421706 3D CCAAGTGAAA AAG/--- GAGAGGCAGA 3070 het 3070 hom 43 18 21 7 AAG 1 0 8645 CASAVA_Build X 112423566 4I AAAGTATAAT ----/ATAA ATAAATAAAT 1912 het 1912 ref 12 6 4 2 ATAA 4 5 8646 CASAVA_Build X 112423847 22I TTGAGGCCAG ----------------------/GAGTTGGAGACCAGCCTGGCCA ACATGGTGAA 3070 hom 33 het 12 0 12 1 GAGTTGGAGACCAGCCTGGCCA 0 1 8647 CASAVA_Build X 112425012 18D TATGTTTGTG TGTGTGTGTGTGTGTGCA/------------------ TGTGTGTGTG 3070 het 1240 hom 35 7 15 17 TGTGTGTGTGTGTGTGCA 1 0 8648 CASAVA_Build X 112427968 4D AGGCAAAAAA TTAG/---- TAAGTATTTA 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 TTAG 1 0 8649 CASAVA_Build X 112437999 3D AAAGAATAGC TTG/--- TTGTTATTAG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 TTG 2 1 8650 CASAVA_Build X 112439197 11D TTTACATAGC ATTTACATTGT/----------- ATTATGTGTA 3070 het 3070 ref 38 23 18 2 ATTTACATTGT 1 0 8651 CASAVA_Build X 112443680 4I GTATATCTGT ----/TATC TATCTATCTA 3070 hom 123 het 50 0 41 9 TATC 2 3 8652 CASAVA_Build X 112445697 1D CTGGAGCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 12 11 8653 CASAVA_Build X 112448803 4D ACAAGTCAAA TTCT/---- TTCTTTGCCA 3070 het 3070 hom 51 20 28 5 TTCT 2 1 8654 CASAVA_Build X 112449682 3D AACATAAAAT GAG/--- GAGGAAGTAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 GAG 2 1 8655 CASAVA_Build X 112452563 1D TTTGATAGCA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 7 8656 CASAVA_Build X 112456691 6D TAATATTATC CATATT/------ AATAATAGCA 3070 het 3070 hom 43 20 23 0 CATATT 1 0 8657 CASAVA_Build X 112465864 1D TGCTATGAAG T/- AAAAGGTACA 3070 hom 129 het 44 0 44 0 T 1 0 8658 CASAVA_Build X 112472817 1I TTCTGTTCTG -/T TTTTTTCCCC 1892 het 489 hom 7 1 5 1 T 6 7 8659 CASAVA_Build X 112486055 6D TTTTTAAGAG TTTATC/------ TTTATACTGC 3070 het 3070 ref 49 29 15 6 TTTATC 1 0 8660 CASAVA_Build X 112493968 5I ATTTTCTACC -----/TTAAG TTAATTTCTT 3070 het 3070 hom 52 25 23 4 TTAAG 0 1 8661 CASAVA_Build X 112500529 1I CCACGGGTAC -/A AGGCCCAAGG 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 A 1 2 8662 CASAVA_Build X 112540846 3D TGTTAATAAT ATC/--- ATTCTCACTA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 ATC 1 0 8663 CASAVA_Build X 112547912 6D ATACACAAGA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 AAT 5 3 8664 CASAVA_Build X 112591974 3I GATCTCTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 1332 het 1332 ref 17 6 3 8 TTG 5 6 8665 CASAVA_Build X 112596912 1D AGTAAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 12 11 8666 CASAVA_Build X 112603801 4I TAAACATAGA ----/AAAG ATAGAGCAAA 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 AAAG 0 1 8667 CASAVA_Build X 112606248 2D TGATTTCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 804 hom 33 8 13 12 T 18 16 8668 CASAVA_Build X 112606493 1I TCTTTCATAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 8 9 8669 CASAVA_Build X 112621082 1D TGATTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 16 8 A 14 13 8670 CASAVA_Build X 112621436 1I AGTCAATAAA -/G AAGAGGATAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 G 0 1 8671 CASAVA_Build X 112656183 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1513 hom 22 5 13 4 A 14 13 8672 CASAVA_Build X 112682119 3I GTACTGTACA ---/ACC ACCAGTGGGG 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 ACC 1 2 8673 CASAVA_Build X 112684426 1D GGGGCGCCAA C/- CCCACAGCAG 3045 het 1448 hom 33 7 10 16 C 4 3 8674 CASAVA_Build X 112684654 1I GAGTGCAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 T 10 11 8675 CASAVA_Build X 112691275 1D CCAGATAAAA G/- GAACTGAAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 G 2 1 8676 CASAVA_Build X 112697175 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAG 2940 het 1899 hom 14 5 8 1 A 9 10 8677 CASAVA_Build X 112700031 1D TTTTAATGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2123 hom 22 5 10 7 T 10 9 8678 CASAVA_Build X 112707266 1D GGATTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 12 11 8679 CASAVA_Build X 112718358 1D GTGCTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 11 10 8680 CASAVA_Build X 112731367 1D TTTCCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 24 8 A 11 10 8681 CASAVA_Build X 112890433 1I CTTTAGTTTG -/T TTTGGGGTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 3 4 8682 CASAVA_Build X 112946099 1D GCTAGTATTT A/- AAAAAAAAAA 1307 het 1307 ref 39 27 3 10 A 13 12 8683 CASAVA_Build X 113017983 2D TAGAAGAGTT TG/-- TGTAAGATTG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 TG 2 1 8684 CASAVA_Build X 113023588 1D GTTGGGTGAA C/- TGGGCTCACT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 C 1 0 8685 CASAVA_Build X 113027921 1I GATTTTTTTT -/C CCCCCTACAA 3070 het 2709 hom 23 10 10 3 C 5 6 8686 CASAVA_Build X 113053427 1I TATGTACCGC -/T TTTTTTTTTT 2714 het 1914 hom 30 7 11 12 T 13 14 8687 CASAVA_Build X 113161752 1D TCTCCATGGG A/- AAAAAAAAAA 1426 het 1426 ref 28 11 6 11 A 17 16 8688 CASAVA_Build X 113162588 1D AGAGTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 2038 het 2038 ref 37 24 5 9 T 13 12 8689 CASAVA_Build X 113183725 1D TTTTTTTTTT C/- CTCAACATAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 C 2 1 8690 CASAVA_Build X 113193755 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1832 hom 28 7 12 9 A 16 17 8691 CASAVA_Build X 113197623 2I CCGGCTAATT --/AA AAAAAAAAAA 1571 het 1571 ref 25 9 8 8 A 14 16 8692 CASAVA_Build X 113198447 9D GAGAAAAGCA TACCAAACT/--------- TATTTAGCCA 3070 het 3070 hom 44 20 22 3 TACCAAACT 1 0 8693 CASAVA_Build X 113204254 1I GTTTGGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 17 14 1 T 10 11 8694 CASAVA_Build X 113205741 1I TAACTCTTTT -/A ATTTTTATTA 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 A 1 2 8695 CASAVA_Build X 113206302 1I AGCAGACAAC -/A AAAAGAACCA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 4 5 8696 CASAVA_Build X 113206399 1I GAAAATGTCT -/G GAATTACCTG 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 G 1 2 8697 CASAVA_Build X 113207228 1D TTTGTTGACA C/- AAGGTTAAAG 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 C 1 0 8698 CASAVA_Build X 113208370 4D CAATGTGCAG GTTT/---- GTTACATATG 3070 het 2819 hom 25 7 17 2 GTTT 1 0 8699 CASAVA_Build X 113209569 12D TTCCCTTTCA CTCTCTCCCTCT/------------ CTCTCTCCCT 2361 het 2361 ref 27 19 10 1 CTCTCTCCCTCT 2 1 8700 CASAVA_Build X 113227340 4D TGAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 287 het 287 ref 38 23 3 13 AAAG 1 0 8701 CASAVA_Build X 113232436 3I TTGATGATGA ---/TGT TTTGTTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TGT 0 1 8702 CASAVA_Build X 113240357 1I TTCTCCATAT -/C CCCTTGTGGT 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 C 3 4 8703 CASAVA_Build X 113286491 1D TAAACAAAAT A/- ATTAGTAAAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 2 1 8704 CASAVA_Build X 113288011 1D TTGCAGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 5 A 13 12 8705 CASAVA_Build X 113308116 2I TCTGCCACCC --/CT GAGACAGCAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 0 1 8706 CASAVA_Build X 113320539 1I AAAGAAAAGT -/A AAAAAGAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 5 6 8707 CASAVA_Build X 113480685 1D AAACAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 8 A 14 13 8708 CASAVA_Build X 113490782 1I ACAATCACAC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 8 9 8709 CASAVA_Build X 113494509 1I GAGTTACCAA -/T TTTTTTTTTT 1311 het 1311 ref 41 30 3 8 T 11 12 8710 CASAVA_Build X 113499903 3D CCAATAAAAC TAA/--- TGTTTCCAGT 3070 het 3070 hom 36 16 16 6 TAA 1 0 8711 CASAVA_Build X 113502017 1I CTTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2825 het 2825 ref 24 13 7 4 A 11 12 8712 CASAVA_Build X 113543287 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1108 hom 13 3 10 0 A 9 10 8713 CASAVA_Build X 113544063 1I CATGTATAGT -/A CATATATGTA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 0 1 8714 CASAVA_Build X 113551701 5I GAGGCTTAGT -----/AAAGG AAAGTATAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 AAAGG 0 1 8715 CASAVA_Build X 113567813 1I ATCTAATGGA -/T TTTTTTGGGG 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 6 7 8716 CASAVA_Build X 113578069 6D ATGATGCTGA ACGTCT/------ ATTCATGTGC 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 ACGTCT 1 0 8717 CASAVA_Build X 113582701 5D TGCTGTTGTT AAATG/----- AAATGTTTTA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 AAATG 2 1 8718 CASAVA_Build X 113587750 4D ATCTGAATTA TTAG/---- TTTATTATAT 3070 het 3070 ref 35 21 13 2 TTAG 1 0 8719 CASAVA_Build X 113588383 1D GCCTTCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2488 hom 34 9 14 11 T 13 12 8720 CASAVA_Build X 113589105 2D GGAATATATC TG/-- TGTTTGGGTT 3070 het 3070 ref 50 22 24 5 TG 2 1 8721 CASAVA_Build X 113606301 3D CGAGGCTCAT AAC/--- AACAGTAATC 3070 het 3070 ref 33 13 12 10 AAC 2 1 8722 CASAVA_Build X 113614593 2D AAATGGACAC AA/-- ATTTAGAAAC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 3 1 8723 CASAVA_Build X 113614805 2I AAACAAGAAA --/AT ATATATATTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 AT 4 5 8724 CASAVA_Build X 113614987 1D AACAGAACTG A/- AAAAAAAATA 2126 het 2126 ref 25 14 5 7 A 9 8 8725 CASAVA_Build X 113615855 5D ATTAATTTAA TTTTT/----- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 10 9 8 T 14 9 8726 CASAVA_Build X 113616392 1D TTTTTTTTTT G/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 G 1 0 8727 CASAVA_Build X 113616867 1I TATTTATCCA -/T TTTTGATTTG 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 T 4 5 8728 CASAVA_Build X 113616980 1D GTTTGAGGTC T/- TAGATTTAAG 3070 het 3070 ref 40 28 9 4 T 2 1 8729 CASAVA_Build X 113647879 1I CTCCGTCTCA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 1046 hom 26 8 11 7 G 1 2 8730 CASAVA_Build X 113648712 3I GAAGACACTC ---/AAT AAAATTATTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AAT 0 1 8731 CASAVA_Build X 113652036 1D AGAAAAGATT A/- AAAAAAAAAA 976 het 976 ref 35 26 3 6 A 11 10 8732 CASAVA_Build X 113670277 1D AAAATTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2434 hom 33 9 16 8 T 12 11 8733 CASAVA_Build X 113678821 4I GGGGCTGGTT ----/ACTA ACTAACATTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ACTA 1 2 8734 CASAVA_Build X 113680409 2I GTAAAGTCTC --/TT TATCTCACTG 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 1 3 8735 CASAVA_Build X 113681282 1I TACTATGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 13 14 8736 CASAVA_Build X 113681599 1I AATTATTTTA -/C CATAGGTGTT 3070 het 2458 hom 15 7 8 0 C 1 2 8737 CASAVA_Build X 113694780 1I CAGGCGTCTG -/C CACCACGCCC 3070 hom 42 het 19 0 14 5 C 1 2 8738 CASAVA_Build X 113696994 5D GTAAAGCATA TAATC/----- AAACATCGGG 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 TAATC 1 0 8739 CASAVA_Build X 113700737 1I GAACCCGGGA -/G GCACAGCCTG 2292 hom 12 het 5 0 5 0 G 1 2 8740 CASAVA_Build X 113706045 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1605 hom 26 7 13 6 A 17 16 8741 CASAVA_Build X 113707930 9D GGCCATACAG TAGTGCAGA/--------- TAGTGAATGA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 TAGTGCAGA 1 0 8742 CASAVA_Build X 113716786 2D CATCTACAAC AG/-- GGGTTGGTCT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 AG 1 0 8743 CASAVA_Build X 113729373 5I ATGTCTTCTT -----/TAAAC TAATCAGTAA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 TAAAC 0 1 8744 CASAVA_Build X 113734416 2I TTGGAGTTAA --/CT ATGACCTAAG 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 CT 0 1 8745 CASAVA_Build X 113736530 1I ATTAAAACAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 A 9 10 8746 CASAVA_Build X 113739675 2I GCAAAACTGC --/AG AGAGAACTTA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 AG 2 3 8747 CASAVA_Build X 113739910 2D AAATTATGAC TT/-- TTGTTCTTAC 3070 het 3070 ref 42 25 13 6 T 4 2 8748 CASAVA_Build X 113764614 1D CTCTTTTTTT G/- GTGGTGGTTT 3070 hom 49 het 25 0 18 8 G 2 1 8749 CASAVA_Build X 113768949 4I TTGATATCTG ----/TATC TATCTATCTA 3070 hom 57 het 29 0 20 9 TATC 4 5 8750 CASAVA_Build X 113774669 12D ATATATATAT AGAGAGAGAGAG/------------ AGAGAGAGAG 3006 het 3006 ref 23 10 9 8 AG 12 6 8751 CASAVA_Build X 113775867 2I AGGTAAACCT --/GC GTGTTACATG 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 GC 0 1 8752 CASAVA_Build X 113781097 4D GATTAGAAAT AATC/---- AAGGGAGGCT 3070 het 3070 hom 38 17 19 4 AATC 1 0 8753 CASAVA_Build X 113781682 3I CCCCTCCCTC ---/CTT CTTTCTTTCT 1419 het 1419 ref 15 4 4 7 CTT 1 2 8754 CASAVA_Build X 113783555 1I AACAAATTAG -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 6 7 8755 CASAVA_Build X 113793720 3D TTATTAAATC ATT/--- ATTATTATAA 3070 het 3070 hom 25 11 10 5 ATT 3 2 8756 CASAVA_Build X 113798794 1I AGTAAAACAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 8 9 8757 CASAVA_Build X 113800107 2D AGGTTATAAC AT/-- AGTGACAGTT 3070 het 3070 hom 53 23 29 2 AT 1 0 8758 CASAVA_Build X 113807192 2I AAAACTTAAT --/TA TCTTATTTTT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 TA 0 1 8759 CASAVA_Build X 113824104 1I CTTTTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 T 10 11 8760 CASAVA_Build X 113837310 1I AGATAACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 10 11 8761 CASAVA_Build X 113837471 1I CTTTCTTCTA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 7 8 8762 CASAVA_Build X 113839803 1I AATGTCCTCC -/A AATTTTCTTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 2 3 8763 CASAVA_Build X 113840639 1D AAGTTATAAA T/- TTTTTGGCAA 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 T 6 5 8764 CASAVA_Build X 113849476 1D AGATACTACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 9 8 8765 CASAVA_Build X 113851114 1D ATGAGGAGTG A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 7 6 8766 CASAVA_Build X 113856202 4I ATAAAGAGGA ----/TTTG TTTTTCTAGC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 TTTG 0 1 8767 CASAVA_Build X 113858605 1I TCTTCTGCTC -/A AAAATTTGCC 3070 het 3070 hom 59 24 26 10 A 4 5 8768 CASAVA_Build X 113858912 1D CATAGTTTTT A/- AACTTATTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 3 2 8769 CASAVA_Build X 113861181 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 20 4 15 1 T 12 11 8770 CASAVA_Build X 113876338 4D AAAGTAATAG AATT/---- AATAAGAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 AATT 1 0 8771 CASAVA_Build X 113877018 1D GGGGTAGGTG A/- AAAGTATACC 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 A 4 3 8772 CASAVA_Build X 113877878 4D CTGGCTTTTT TTTC/---- TTTTCTTTTC 645 het 645 ref 15 11 3 1 TTTC 1 0 8773 CASAVA_Build X 113881709 4D AGGTGATAGT TAGC/---- TAGCTAGCTA 3070 het 3070 ref 47 20 14 16 TAGC 4 3 8774 CASAVA_Build X 113882307 1I TGGAAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1877 hom 24 7 14 3 A 13 14 8775 CASAVA_Build X 113883422 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 25 het 25 ref 8 1 1 6 T 15 14 8776 CASAVA_Build X 113889822 1D ATAAAATGTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 A 10 9 8777 CASAVA_Build X 113891942 1D ACCTACAGTA T/- TACCAAGCAC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 2 1 8778 CASAVA_Build X 113893809 1D TTCCCTGTGG T/- TTTTTTTTTA 2221 het 2221 ref 33 17 7 9 T 10 9 8779 CASAVA_Build X 113894895 1I AACATATGAA -/T TTTAGGGGGA 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 3 4 8780 CASAVA_Build X 113896437 1D GGAAAAAAAT A/- AAATTTTATT 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 A 4 3 8781 CASAVA_Build X 113896822 1I CCATACAAAA -/C AACCCCCCCC 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 C 0 1 8782 CASAVA_Build X 113912387 2D TGAGTTGTTG GT/-- GTCCTCTCTG 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 GT 2 1 8783 CASAVA_Build X 113919368 1D AGCCTTTTCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 10 9 8784 CASAVA_Build X 113920233 2D ACAGAATATG TT/-- TTTTCTCTTG 3070 het 3070 ref 39 23 13 5 T 6 4 8785 CASAVA_Build X 113938889 5I ATTGCCCTGT -----/TAATA TAATCTCATT 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 TAATA 0 1 8786 CASAVA_Build X 113956613 2D ACTATATGAC TT/-- TTATGGCTAC 3070 het 3070 ref 51 34 14 3 T 4 2 8787 CASAVA_Build X 113957766 1I ATCTAAGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 9 10 8788 CASAVA_Build X 113962065 1D TATCAGATCA C/- AAACAGCAGT 3070 het 3070 hom 48 15 31 3 C 1 0 8789 CASAVA_Build X 113967832 4I GTACAGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TTTG 2 3 8790 CASAVA_Build X 113970322 5I AATTTTTCTA -----/TCTTT TCTTTTCTGC 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 TCTTT 1 2 8791 CASAVA_Build X 113977683 2D AACATTTATC TG/-- TAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 TG 1 0 8792 CASAVA_Build X 113978518 1D TCCTACAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 12 11 8793 CASAVA_Build X 113988414 1I AATAATAATT -/A AAAAAAAAAA 999 het 999 ref 7 3 3 1 A 10 11 8794 CASAVA_Build X 114001439 1D TTTTTGTTAG T/- TTTTTCTTTG 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 T 6 5 8795 CASAVA_Build X 114004887 2D TAGTTGGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 13 11 T 13 11 8796 CASAVA_Build X 114005029 4D TATTTTGTTC CTTT/---- CTTTCTCTTT 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 CTTT 2 1 8797 CASAVA_Build X 114005720 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 14 13 8798 CASAVA_Build X 114007423 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 9 10 8799 CASAVA_Build X 114007777 1I AATGCTGCAA -/C AAACATAGAA 3070 het 3070 ref 26 14 7 5 C 0 1 8800 CASAVA_Build X 114012456 2I TCTTCATCTG --/TT TTTTTTTTTT 2612 het 2612 ref 41 18 10 13 T 11 13 8801 CASAVA_Build X 114012831 3I TTTTTTTTCC ---/TTA TTAACTTTTA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 TTA 1 2 8802 CASAVA_Build X 114013131 1I ATTCACTCTG -/A ATTAATTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 1 2 8803 CASAVA_Build X 114014848 5I GAGATTATAC -----/AGTAT AGTATTTTTC 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 AGTAT 1 2 8804 CASAVA_Build X 114014958 2D ATAATTCTCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 14 11 12 TG 10 9 8805 CASAVA_Build X 114016676 1I TGCTTCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 10 11 8806 CASAVA_Build X 114019696 1I TAGAACATAA -/T TTTTTTAGAA 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 T 6 7 8807 CASAVA_Build X 114020089 3D ATTAAATAAA TGT/--- TGTCTGAAAT 2828 het 2828 ref 16 10 6 1 TGT 2 1 8808 CASAVA_Build X 114061963 1I CTTCCTTCCC -/T TGACACATGA 3070 hom 123 het 45 0 39 6 T 1 2 8809 CASAVA_Build X 114064166 4I ACCAAGAGAC ----/AGAT AGATAGAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 AGAT 1 2 8810 CASAVA_Build X 114072335 3I AGAAGTTTAA ---/TCT TCTCACAATC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TCT 1 2 8811 CASAVA_Build X 114089410 1D TCCTTAAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 10 9 8812 CASAVA_Build X 114095248 1I CCCTCTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 T 10 11 8813 CASAVA_Build X 114114818 1I AATTCAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 11 12 8814 CASAVA_Build X 114118865 1I CAATCACCCC -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 T 7 8 8815 CASAVA_Build X 114120727 1I ACTGAAGCTC -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 6 7 8816 CASAVA_Build X 114139009 1I TTTTGTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1134 het 1134 ref 26 19 3 4 T 10 11 8817 CASAVA_Build X 114144173 1D AGCAAAACGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2771 hom 31 9 12 10 T 13 12 8818 CASAVA_Build X 114144573 2D TCTGACAATA TC/-- TCTGTGGCTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 TC 2 1 8819 CASAVA_Build X 114150026 1I TCTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 11 12 8820 CASAVA_Build X 114153597 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 9 14 4 A 11 9 8821 CASAVA_Build X 114173348 1D GCATTCCATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 A 9 8 8822 CASAVA_Build X 114234274 1I AATAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 2883 het 2374 hom 31 11 13 7 A 15 16 8823 CASAVA_Build X 114246504 1I AAAGACTTGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 8 9 8824 CASAVA_Build X 114246910 1I TAATCTTAGA -/T TGTTAAAGAT 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 1 2 8825 CASAVA_Build X 114249853 1I AGGATATCAT -/A AAAAATTATT 3070 het 3070 ref 17 8 8 1 A 5 6 8826 CASAVA_Build X 114250179 1I AAGTGCACGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 11 12 8827 CASAVA_Build X 114252612 1D GGCACACTAG T/- TTTTTACCTT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 6 5 8828 CASAVA_Build X 114275641 4I TCAAGTCTTA ----/CTAT CTAAGTAATA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CTAT 0 1 8829 CASAVA_Build X 114285385 1I AGACTCCACC -/A AAAAAAAAAA 2875 het 2875 ref 27 15 7 5 A 13 14 8830 CASAVA_Build X 114288891 1D TCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 11 10 8831 CASAVA_Build X 114301936 15D CTTTGGAAGG CCGAGGCGGGTGGAA/--------------- CCCCTGAGGC 2682 het 1658 hom 19 9 8 5 CCGAGGCGGGTGGAA 1 0 8832 CASAVA_Build X 114315411 2D CACAAACACA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 14 hom 34 0 13 22 C 11 9 8833 CASAVA_Build X 114317327 1D TATTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 T 15 14 8834 CASAVA_Build X 114326450 1D GGGGGACTTG A/- AAGACCCTCC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 3 2 8835 CASAVA_Build X 114338853 1D AAGCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 15 14 8836 CASAVA_Build X 114346760 1I12M1D TCTGTCTCAC -AAAAAAAAATGCA/AAAAAAAAAATGC- AAAAAAAATG 1074 hom 15 het 22 0 7 16 N/A 0 0 8837 CASAVA_Build X 114360239 2D CACAAACTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 12 10 8838 CASAVA_Build X 114364274 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAACCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 8 8839 CASAVA_Build X 114364575 1D TCTCTACTGG A/- AAAAAAAAAA 1377 het 686 hom 13 3 4 6 A 13 12 8840 CASAVA_Build X 114380267 1D AACAGAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 21 1 15 5 A 12 11 8841 CASAVA_Build X 114385440 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 7 8 8842 CASAVA_Build X 114390528 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1851 het 232 hom 14 4 6 4 A 22 20 8843 CASAVA_Build X 114392289 1I CACCATATAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 51 30 16 5 A 8 9 8844 CASAVA_Build X 114401610 1D TGAAACATTT A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 A 6 5 8845 CASAVA_Build X 114434773 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 644 het 644 ref 26 17 3 6 A 12 11 8846 CASAVA_Build X 114435689 1I GTATGACTGT -/A AGATCTCATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 8847 CASAVA_Build X 114436303 1D TGATAAATTT C/- CCCCATGTTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 C 5 4 8848 CASAVA_Build X 114451904 1D TATGATGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2708 hom 33 8 16 9 T 15 14 8849 CASAVA_Build X 114455243 2D ATACTCAGAC AT/-- ATTAGAATTT 2672 het 2672 ref 27 20 6 2 AT 2 1 8850 CASAVA_Build X 114464828 1D ATTATGGTTA T/- TTTTTGATTA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 6 5 8851 CASAVA_Build X 114478762 1D AGTTTTCTCA T/- TTTTTTTTTT 1023 het 1023 ref 54 34 3 17 T 15 14 8852 CASAVA_Build X 114546585 1D TCAGAATTCT A/- AAAAAAAAAA 1367 het 1367 ref 41 31 3 7 A 11 10 8853 CASAVA_Build X 114564784 3D AACTTTAGTA TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 hom 77 het 35 0 25 11 TTC 5 4 8854 CASAVA_Build X 114603250 1I ACTTTGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1202 hom 31 3 21 7 A 13 14 8855 CASAVA_Build X 114640831 1I CAGAGGTGTG -/C CACGACGCCT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 C 1 2 8856 CASAVA_Build X 114652411 3I CACAGAGTCT ---/GTG GTGTTGTTAT 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 GTG 1 2 8857 CASAVA_Build X 114660010 9D TACTTGGTAT AATTGGTGA/--------- AATTGATAAG 3070 het 3070 ref 33 16 15 6 AATTGGTGA 1 0 8858 CASAVA_Build X 114662327 2D TCAAAGGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 15 12 T 13 11 8859 CASAVA_Build X 114665134 4D TCACACTGAT AGAG/---- AGAATGGGGA 3070 het 3070 ref 38 25 10 5 AG 3 1 8860 CASAVA_Build X 114667107 9I ATGATGTCGA ---------/ATAGAATTG ATAGAATTGG 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 ATAGAATTG 1 2 8861 CASAVA_Build X 114668876 2D TTTTTGTTCA CT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 589 hom 28 4 13 11 CT 1 0 8862 CASAVA_Build X 114669140 1I TACTTATACT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 52 het 21 0 19 2 A 8 9 8863 CASAVA_Build X 114670523 12I ATAGCTTTTG ------------/TTTTTGTTTTGT TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 TTTTTGTTTTGT 1 2 8864 CASAVA_Build X 114678235 1D ACTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1359 het 1359 ref 35 26 4 5 A 11 10 8865 CASAVA_Build X 114684355 1I TAGGGTACAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 T 8 9 8866 CASAVA_Build X 114697864 1D CCTATGGATC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 12 20 2 A 9 8 8867 CASAVA_Build X 114747856 4D CAACAACAAC AAAA/---- AAAAAACCCA 3070 hom 93 het 38 0 32 8 A 10 6 8868 CASAVA_Build X 114748068 1D TGTTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 2059 het 483 hom 16 2 6 8 T 17 16 8869 CASAVA_Build X 114801335 1I TCTACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 11 12 8870 CASAVA_Build X 114862366 1I TTGTGAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 42 2 31 9 A 10 11 8871 CASAVA_Build X 114925872 1I AAGAGGGTCA -/T CGGGGTGGGG 3070 hom 76 het 30 0 22 8 T 0 1 8872 CASAVA_Build X 114941987 1D AGACTGTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 32 1 27 6 A 11 10 8873 CASAVA_Build X 114942951 3I TTGAGAGCCT ---/ATA ATAAGCATCT 3070 hom 72 het 29 0 22 7 ATA 1 2 8874 CASAVA_Build X 114951109 3D CTTTCCACTA AGC/--- AGCTGATCCT 3070 het 2517 hom 27 8 13 7 AGC 2 1 8875 CASAVA_Build X 114954980 21D TAAATTTAAC CAAGGAGGTGAAAGATTTCTA/--------------------- CAAGGAGGTG 3070 het 2767 hom 20 6 9 9 CAAGGAGGTGAAAGATTTCTA 2 1 8876 CASAVA_Build X 114956437 2D AAGAGAACTC AT/-- ATACTGTTGC 3070 het 3070 ref 40 21 14 7 AT 2 1 8877 CASAVA_Build X 114957205 1I AGACTTGAAA -/G GGTGAGGGAG 3070 hom 99 het 39 0 32 7 G 2 3 8878 CASAVA_Build X 114957354 1I GATAAATGTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 6 7 8879 CASAVA_Build X 114957977 4I CAACATAATC ----/TTTA TTTAACCCTT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 TTTA 1 2 8880 CASAVA_Build X 114960362 4D TCTTCAATTT TTTG/---- TTTGTTTCCT 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 TTTG 2 1 8881 CASAVA_Build X 114961290 1D CTTTTTTTCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 15 17 6 T 8 7 8882 CASAVA_Build X 114962450 4I CCAGCTAAAG ----/GTTA GTCAATTTTG 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 GTTA 0 1 8883 CASAVA_Build X 114962616 1D CACTGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2193 hom 25 7 14 4 T 13 12 8884 CASAVA_Build X 114963847 1I ATTACAGTGA -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1097 hom 27 3 19 5 G 0 1 8885 CASAVA_Build X 114966575 1D GCTCTCCCTT C/- CCCCAGAACA 3070 het 3070 ref 43 27 14 2 C 5 4 8886 CASAVA_Build X 114968217 1D CCTGTCACTG C/- ACTCCAGCCT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 C 1 0 8887 CASAVA_Build X 114968302 1I ACAAGTACTC -/T TTTTTTTTTT 2400 het 2074 hom 13 5 6 2 T 11 12 8888 CASAVA_Build X 114974683 3I CTCAGCAGTG ---/TCT TCTTCTGTAG 3070 het 3070 ref 50 33 14 3 TCT 2 3 8889 CASAVA_Build X 114977247 2D ATAAAATAAC AG/-- AGGGGAAATG 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 AG 2 1 8890 CASAVA_Build X 114978152 2I AATTTTACCC --/AA AAGTTTGGTG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 2 4 8891 CASAVA_Build X 114987347 1I GGAATTTTTT -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 A 6 7 8892 CASAVA_Build X 114990626 7D GAAAGGGAGA CCCCCTT/------- CCCCCTTCTC 3070 hom 81 het 31 0 25 9 CCCCCTT 2 1 8893 CASAVA_Build X 114995399 2D GGGAAAAAAA AC/-- AACAACAAAA 523 het 523 ref 32 24 4 5 AC 1 0 8894 CASAVA_Build X 115016569 1D CAGGAGCTGC T/- TTTTTTTGAA 2374 het 2374 ref 17 10 5 2 T 8 7 8895 CASAVA_Build X 115019935 1D TAGCAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 A 11 10 8896 CASAVA_Build X 115027257 1D GATAATCTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 T 9 8 8897 CASAVA_Build X 115029078 3D ATGCAGCAAG AAA/--- AAGAAGTGGA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 5 2 8898 CASAVA_Build X 115034031 1I TCAGAACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 T 12 13 8899 CASAVA_Build X 115041908 1I TAAATTTCCC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 2757 hom 28 7 11 10 T 8 9 8900 CASAVA_Build X 115043098 9I ATTGGAATCC ---------/AGCACTCAA ACCCCACAAC 3070 hom 99 het 38 0 30 8 AGCACTCAA 0 1 8901 CASAVA_Build X 115091669 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 10 11 8902 CASAVA_Build X 115092097 1I GCGGGTCTTG -/T TTTTTAAAGT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 5 6 8903 CASAVA_Build X 115106188 4D GCAGACTGAC TGTT/---- GAGTTCTCTG 3070 hom 95 het 35 0 32 4 TGTT 1 0 8904 CASAVA_Build X 115124671 1I TCTAAACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 10 11 8905 CASAVA_Build X 115130079 1I GTAGAATTTA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 3 8906 CASAVA_Build X 115131785 2D CTTTTAATTT AC/-- ACGTTTTGGT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AC 2 1 8907 CASAVA_Build X 115137097 8D CCCACAACCC CCCCTTCT/-------- CCCCAGGTGC 3070 hom 54 het 25 0 13 13 CCCCTTCT 1 0 8908 CASAVA_Build X 115141513 1I ATTTTGTTTG -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 9 8909 CASAVA_Build X 115142684 1D ACTTTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 11 10 8910 CASAVA_Build X 115159115 1I CAGAAAACCA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 7 8 8911 CASAVA_Build X 115175091 1D TTAAATGGGT A/- AAATTATATG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 4 3 8912 CASAVA_Build X 115194793 1I ATTCACGCTG -/T TTTTGTATAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 5 8913 CASAVA_Build X 115196821 1D AATTAATAAA C/- AAATTCAGTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 1 0 8914 CASAVA_Build X 115197726 2I AAAATTCAAC --/AA AGTGAAGCGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 3 8915 CASAVA_Build X 115198800 1I AATATATACA -/C CTACTGTGTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 8916 CASAVA_Build X 115210740 3I GGTGCATTTC ---/ATA ATATGTAAAT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 ATA 1 2 8917 CASAVA_Build X 115216517 1I AGCTAATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 11 12 8918 CASAVA_Build X 115222386 1D ACGATCACCA C/- TAATAGCATG 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 C 1 0 8919 CASAVA_Build X 115238112 2D TTTCCTAGGG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 16 5 T 11 9 8920 CASAVA_Build X 115240052 1D AGAAATAGAC T/- TTTTTTTTTT 1033 het 1033 ref 34 26 3 5 T 11 10 8921 CASAVA_Build X 115252158 2I GACCTGAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 A 12 14 8922 CASAVA_Build X 115253352 4I AAGATTACTT ----/TGAC TGAATCGTTC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 TGAC 0 1 8923 CASAVA_Build X 115255547 1D AGTTAGTATT A/- AAAAAAAAAA 1356 het 1356 ref 44 36 3 5 A 11 10 8924 CASAVA_Build X 115265125 1D AATTAGCAAT A/- AAAAACCCTA 3070 het 1667 hom 23 4 15 4 A 6 5 8925 CASAVA_Build X 115265749 2D AATGTTTCTC TT/-- GTTATTAATT 3070 het 3070 hom 39 13 22 5 T 2 0 8926 CASAVA_Build X 115272362 2D AGGATGTAGA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 2956 hom 24 9 13 2 T 10 8 8927 CASAVA_Build X 115281161 1I TATCTGCCCC -/T GACCCTTGCT 3070 het 3070 hom 49 15 29 5 T 0 1 8928 CASAVA_Build X 115283115 1D AATCATTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 T 10 9 8929 CASAVA_Build X 115299217 1D CAAAGAAGTT A/- AAAACATTGA 3070 het 3070 ref 28 20 7 1 A 5 4 8930 CASAVA_Build X 115302792 1D TAAAGTATAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 491 hom 26 2 20 4 T 3 2 8931 CASAVA_Build X 115303366 1D AAAGCCATAT G/- GCCCAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 G 2 1 8932 CASAVA_Build X 115305398 23I TATTATGTAT -----------------------/ATGGCAGTATACATAATATTGAC ATGGCAGAAG 3070 het 3070 ref 42 17 15 12 ATGGCAGTATACATAATATTGAC 0 1 8933 CASAVA_Build X 115305624 1I TCATTTTGGA -/G AATGAATTTT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 G 0 1 8934 CASAVA_Build X 115306931 1D ATTAGTGCTC A/- AAAGATGCTT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 A 4 3 8935 CASAVA_Build X 115308072 1D ACATGAGATA T/- TTTGGTACAG 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 T 4 3 8936 CASAVA_Build X 115310796 5I ATAATTCCCT -----/AAGAA AAGAGCTGGC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AAGAA 0 1 8937 CASAVA_Build X 115313198 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 A 7 6 8938 CASAVA_Build X 115322878 1D TCTTTTTTTT A/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 47 28 12 7 A 1 0 8939 CASAVA_Build X 115324451 3D AGGAGATGTA CAT/--- TGATACATAG 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 CAT 1 0 8940 CASAVA_Build X 115329668 1I AACCACTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 10 11 8941 CASAVA_Build X 115340781 3D CTCTGATGTG GTT/--- ATTATGCATT 3070 het 3070 ref 28 14 12 5 GTT 1 0 8942 CASAVA_Build X 115348240 1D33M1D TATAGTTTTC TTTTTTTTTTATGTGTCTTCTTCTGGTTTATTATC/-TTTTTTTTTATGTGTCTTCTTCTGGTTTATTAT- AGGGTAATAT 3070 het 3070 ref 34 30 14 5 N/A 0 0 8943 CASAVA_Build X 115364982 4D CTTCTTGCTT GTTA/---- GTTAGTTAGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 GTTA 3 2 8944 CASAVA_Build X 115371174 3D ATTATTTTTT TCC/--- TCATCCCTAC 3070 het 3070 ref 48 23 18 9 TCC 1 0 8945 CASAVA_Build X 115384007 5D AGCAAAAGAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 16 11 8946 CASAVA_Build X 115387928 1I GTATATTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 T 13 14 8947 CASAVA_Build X 115388561 1I GCTAAACAAG -/T TTTTTTTTTT 2950 het 2950 ref 29 15 9 5 T 10 11 8948 CASAVA_Build X 115390834 1D GTGGCTTTAG C/- CCCCCTTGAC 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 C 6 5 8949 CASAVA_Build X 115403090 5D TAATTTATAT TAATA/----- TAATAGGTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TAATA 2 1 8950 CASAVA_Build X 115458293 1I CTTTTATAAG -/T TTTTTTTTTT 3030 het 3030 ref 31 19 8 4 T 11 12 8951 CASAVA_Build X 115463831 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 683 het 683 ref 11 3 4 4 C 1 0 8952 CASAVA_Build X 115471025 1I TCAATACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 9 10 8953 CASAVA_Build X 115471119 1D ATCTACAGCA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 89 het 35 0 29 7 T 8 7 8954 CASAVA_Build X 115471969 2D GAGGAATACT AA/-- GAGAGAAGAC 3070 het 3070 ref 24 14 7 4 A 2 0 8955 CASAVA_Build X 115501531 1D GAGGATTACA T/- TTTTTTTTTT 1361 het 1361 ref 41 34 4 3 T 11 10 8956 CASAVA_Build X 115507636 4I GAAGCAAGAG ----/AAGA AAGAGAGAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAGA 1 2 8957 CASAVA_Build X 115511688 1D TAGTAGCACA T/- TTTTTTTTTT 1371 het 1371 ref 41 31 3 8 T 11 10 8958 CASAVA_Build X 115538653 1I TTTTCAAAAC -/T TCAGATGTAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 1 2 8959 CASAVA_Build X 115539830 2D TTCTTATTAC AT/-- GTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 AT 1 0 8960 CASAVA_Build X 115541127 1D CTTTGTCTCA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3057 hom 32 8 15 9 T 9 8 8961 CASAVA_Build X 115544311 1I GAATTGGAGT -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 A 6 7 8962 CASAVA_Build X 115546769 1D TTACATACTC A/- AATTTTGAAC 3070 het 3070 ref 45 26 15 5 A 3 2 8963 CASAVA_Build X 115550285 1I TTGGTGTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 9 8964 CASAVA_Build X 115552837 1I CTAGAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 10 11 8965 CASAVA_Build X 115554687 1D CAATAGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 T 13 12 8966 CASAVA_Build X 115557828 1I CATATATGTC -/T TTTATTGTGT 3070 hom 48 het 24 0 16 8 T 3 4 8967 CASAVA_Build X 115557910 1D ATTTTAGGAA T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 7 6 8968 CASAVA_Build X 115558525 1D TGGTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2789 hom 33 12 12 9 T 13 12 8969 CASAVA_Build X 115582470 1I TACTTCTGTA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 T 7 8 8970 CASAVA_Build X 115585708 1I GTTTAACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2614 hom 21 8 10 3 T 11 12 8971 CASAVA_Build X 115631953 2I ACTGAAGGAG --/AT AGAGACATGA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AT 0 1 8972 CASAVA_Build X 115633406 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 A 6 7 8973 CASAVA_Build X 115637675 2D CTGGCTAATG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 19 18 7 A 11 9 8974 CASAVA_Build X 115640277 1I TGAGGTATTT -/A AAAAATCATG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 5 6 8975 CASAVA_Build X 115650324 1D ATAGGGGTTC T/- TTTTTGGTTC 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 6 5 8976 CASAVA_Build X 115653671 2I TATCAAAGAG --/AT ATCTACACTC 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AT 1 2 8977 CASAVA_Build X 115666141 4D AGTTTATTTT AATA/---- ATCTATCTAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 AATA 1 0 8978 CASAVA_Build X 115666702 5D GAGATGTCTT GGGAA/----- TAAGACCCAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 GGGAA 1 0 8979 CASAVA_Build X 115685241 4D CAACACACAC ACAG/---- ACAGGCAGAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 4 ACAG 2 1 8980 CASAVA_Build X 115687760 4I TTACTAAGTT ----/TATC TTAGAATGTA 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 TATC 0 1 8981 CASAVA_Build X 115690076 3I AATAAAAGCA ---/TGT TGTCAATTAG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TGT 1 2 8982 CASAVA_Build X 115700728 1D GAGAAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 11 10 8983 CASAVA_Build X 115710734 1I TTTTGAACTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 1972 hom 27 5 17 5 T 8 9 8984 CASAVA_Build X 115711837 1D34M2I TTGCGGGAGT GAGGGGGTAAAAGTCTGGGGCTCCTTTGAGCGAAA--/-AAGCGGTAAAAGTCTGGGGCTCCTTTGAGCGAAAAG GAGGAATGAG 1745 het 1745 ref 39 45 4 3 N/A 0 0 8985 CASAVA_Build X 115724024 1D CAAGATGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 T 15 14 8986 CASAVA_Build X 115751989 1D ATTGAATGAA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 80 het 34 0 28 6 C 10 9 8987 CASAVA_Build X 115758024 2I CCAAGGAAAC --/CT CTTTGTTGCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 CT 1 2 8988 CASAVA_Build X 115759323 1D AAGCCTTATT A/- AGGCATTCAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 2 1 8989 CASAVA_Build X 115759406 1D AGTGGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 31 1 27 3 T 12 11 8990 CASAVA_Build X 115762358 1I GATTGCATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 T 9 10 8991 CASAVA_Build X 115764031 1I CTTATTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 40 2 34 4 T 10 11 8992 CASAVA_Build X 115775295 20D TAATAAATCT TCTATCTATCTATCTATCTA/-------------------- TCTATCTATC 3070 hom 54 het 24 0 19 9 TCTA 10 5 8993 CASAVA_Build X 115781207 3D GAAATAAAAT ACA/--- ACGTGTCAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 ACA 1 0 8994 CASAVA_Build X 115784669 1D TTTTTAGTTG T/- TTTTTTTTTA 1104 het 1104 ref 44 37 4 3 T 10 9 8995 CASAVA_Build X 115786049 6D TATTTTAAGC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 57 hom 30 1 19 12 AT 11 8 8996 CASAVA_Build X 115788912 10D CAAACAAACA ACAACAAACC/---------- ACAACAAGCA 3070 hom 54 het 20 0 19 4 ACAACAAACC 1 0 8997 CASAVA_Build X 115790600 1D AAATTAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 414 hom 35 1 30 6 A 10 9 8998 CASAVA_Build X 115802009 1D TTTTTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 11 10 8999 CASAVA_Build X 115802480 1D TAAATAAAAA T/- TAAAAACAAA 3070 hom 56 het 22 0 19 3 T 2 1 9000 CASAVA_Build X 115808507 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAATCC 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 7 8 9001 CASAVA_Build X 115811685 1D AAGTTGCAAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 8 9002 CASAVA_Build X 115817551 2D GCTCTGCCAA GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 31 het 37 0 18 20 G 12 10 9003 CASAVA_Build X 115818529 1I ATATAAACCA -/T TTTTAACTAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 4 5 9004 CASAVA_Build X 115823263 28I TCTGGGCATT ----------------------------/GAAGAGTTACACATTTATTATAATATTC AATCTGGACT 3070 hom 84 het 26 0 29 2 GAAGAGTTACACATTTATTATAATATTC 0 1 9005 CASAVA_Build X 115842164 1D TGTGGAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 397 hom 29 1 24 4 A 10 9 9006 CASAVA_Build X 115854324 1D TTATGTAGGT C/- CCAACCTCCT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 C 3 2 9007 CASAVA_Build X 115860581 4D AAATACTCTG ACAA/---- ACAGATCAAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 ACAA 1 0 9008 CASAVA_Build X 115863042 2D CATCTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 10 12 A 14 12 9009 CASAVA_Build X 115863751 1D TAAACTATGT A/- ACTTATAAAA 3070 het 3070 ref 35 25 9 1 A 2 1 9010 CASAVA_Build X 115879377 1D TCTCTACCTC T/- TTTTTTAGGC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 7 6 9011 CASAVA_Build X 115885359 1D AATGCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 39 0 24 15 T 12 11 9012 CASAVA_Build X 115887195 2I TTTGGCAAAC --/AG TAGCACAAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AG 0 1 9013 CASAVA_Build X 115892839 1I TAAAAAAACG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 306 hom 19 1 13 5 A 9 10 9014 CASAVA_Build X 115893883 1I ATCAGGAACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 9 10 9015 CASAVA_Build X 115894574 5I AAAACTCAAA -----/CAACT CAACAGCAAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 CAACT 0 1 9016 CASAVA_Build X 115894701 4D AGGGAAACAC AAAT/---- AAAAACCACA 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 AAAT 1 0 9017 CASAVA_Build X 115894901 1I GCAGTCCCCC -/T AATGGGTATG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 0 1 9018 CASAVA_Build X 115896127 5D AATTCCTAGG TATTT/----- TATTTTATGC 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 TATTT 2 1 9019 CASAVA_Build X 115906909 1D TTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 34 0 29 5 T 11 10 9020 CASAVA_Build X 115909841 5D CTACCCAAAC TTAAA/----- TTAAATAGGG 3070 het 3070 ref 38 22 13 5 TTAAA 2 1 9021 CASAVA_Build X 115910508 1I ACAGCGGATA -/T TTTTTTTTTT 2851 het 2851 ref 42 24 14 4 T 10 11 9022 CASAVA_Build X 115911064 1D TCTCTATAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 10 9 9023 CASAVA_Build X 115912731 1I TGGAGGAGAA -/T TTGAACTTTA 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 T 2 3 9024 CASAVA_Build X 115914066 1I ATATGAACCG -/T TTACCATGGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 3 9025 CASAVA_Build X 115915946 1I AGCATCTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 9 10 9026 CASAVA_Build X 115922241 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2848 het 2848 ref 51 20 11 20 A 13 14 9027 CASAVA_Build X 115922648 4D TTTATGTGAA TATT/---- TAAGCATATA 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 TATT 1 0 9028 CASAVA_Build X 115928492 1I TTTTCCATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 9 10 9029 CASAVA_Build X 115929119 5I ATTATTCTTG -----/TTTAT TTTATTATTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTTAT 1 2 9030 CASAVA_Build X 115932261 2D TCTACATAAG TA/-- TATGTGTATA 3070 het 3070 ref 61 28 25 9 TA 2 1 9031 CASAVA_Build X 115932403 4D TATATATGTG TATA/---- TATGTACATG 3070 het 3070 hom 35 15 18 4 TA 3 1 9032 CASAVA_Build X 115937609 5D ATTATATTAC ATAAT/----- ATAATATAAA 1916 het 1916 ref 17 10 6 1 ATAAT 2 1 9033 CASAVA_Build X 115947582 1D ATTTACACAA G/- AAGTTTACCT 3070 het 3070 ref 41 28 10 3 G 1 0 9034 CASAVA_Build X 115948325 1D CAATGTTAGA T/- TTTTTTATCA 3070 hom 78 het 30 0 26 5 T 7 6 9035 CASAVA_Build X 115968224 1D TCTCTGAAAT A/- AAAAAGACCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 5 9036 CASAVA_Build X 115979968 1D ATGCAGCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 42 1 33 8 A 13 12 9037 CASAVA_Build X 115982131 4D CTACTTTCTC TTGT/---- TTAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 17 6 TTGT 1 0 9038 CASAVA_Build X 115991405 1I TTTTCCTTGT -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 C 7 8 9039 CASAVA_Build X 115992154 19D46M1I TTTCTAAGTG GCAAAGCATTCAATAAAAAGCAGAGCATAAAAGTTTAAAAAATTTGCAGCCTAATGGTGCAATAG-/-------------------GCAGAGCATAAAAGTTTAAAAAATTTGCAGCCTAATGGTGCAATAGA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 18 9 13 N/A 0 0 9040 CASAVA_Build X 115998964 1I CAAACATATG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 42 het 23 0 15 8 A 8 9 9041 CASAVA_Build X 116005805 4D TTCCTTAAGG AGAT/---- AGATAGATAA 3070 hom 81 het 36 0 28 10 AGAT 3 2 9042 CASAVA_Build X 116014295 1I ACCCCACCCC -/T GAAGCAAACT 3070 hom 37 het 15 0 11 4 T 0 1 9043 CASAVA_Build X 116016839 30D GCCTGTCTCT CATTTCTCTCTTGCCTGCCACCATGTAGGC/------------------------------ CATGCCTTTC 3070 het 3070 ref 26 18 13 6 CATTTCTCTCTTGCCTGCCACCATGTAGGC 1 0 9044 CASAVA_Build X 116026645 1D AATATAGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 11 10 9045 CASAVA_Build X 116028813 2D CAGATCCTAT AG/-- AGTCTTATAG 3070 hom 126 het 47 0 41 6 AG 2 1 9046 CASAVA_Build X 116034717 1D AAAGAACTCA C/- AGGAAGAAGC 3070 hom 126 het 46 0 43 4 C 1 0 9047 CASAVA_Build X 116036029 3I CATTCCACAG ---/ACC ACCAGCCCAT 3070 het 3070 hom 54 19 24 11 ACC 1 2 9048 CASAVA_Build X 116046059 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1995 het 42 hom 16 2 9 5 A 17 16 9049 CASAVA_Build X 116067355 1D TAACTCAAAT G/- ATGCTGAAAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 G 1 0 9050 CASAVA_Build X 116069827 1D GATAAACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 11 10 9051 CASAVA_Build X 116094624 3D CCCAAGATAG CAT/--- CCTTTCATTC 3070 hom 102 het 40 0 34 9 CAT 1 0 9052 CASAVA_Build X 116110280 4D AATAACTAAT TAGC/---- TAGCTAACTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TAGC 2 1 9053 CASAVA_Build X 116110677 4D TAATGGCTGC ATAA/---- ATAAATAATT 3070 hom 105 het 39 0 35 8 ATAA 3 2 9054 CASAVA_Build X 116113892 2D AATAGATCAT AC/-- ATAGTTAACA 3070 hom 132 het 50 0 45 6 AC 1 0 9055 CASAVA_Build X 116120953 2I TCAAGTGGAA --/TT TATCACAGAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 3 9056 CASAVA_Build X 116122149 1D TCTTATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 41 0 31 10 A 12 11 9057 CASAVA_Build X 116122422 1D GAGGATCCTC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 A 8 7 9058 CASAVA_Build X 116132300 1D GGTGGTTACC A/- GGGGCTGGGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 0 9059 CASAVA_Build X 116133025 40D28M4D AAGAAAAGAC AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAGAAAGACAGAGAA/----------------------------------------AAAGAAAGAAAGAAGGAGAGAAAGACAG---- AGAAAGAAAG 2476 het 56 hom 11 1 6 5 N/A 0 0 9060 CASAVA_Build X 116149513 1D GGATATAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 21 1 18 3 A 13 12 9061 CASAVA_Build X 116165070 1D TGGGTATATA C/- CCCAAGGATT 3070 hom 33 het 14 0 13 1 C 4 3 9062 CASAVA_Build X 116179251 1D ACTCTGTCAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 82 het 34 0 28 7 A 9 8 9063 CASAVA_Build X 116230729 1I AGGGATTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1633 hom 29 5 21 3 A 13 14 9064 CASAVA_Build X 116242632 3I TCACCAACGC ---/TTG TTATCTTTTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TTG 0 1 9065 CASAVA_Build X 116245718 3I CATGAAAGCT ---/CCA CCACCCTCAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CCA 1 2 9066 CASAVA_Build X 116247160 1D CTGGAGCTGT G/- GATCACCCTT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 G 2 1 9067 CASAVA_Build X 116248100 1D CTATATTCTC G/- TAGGCTTCTG 3070 hom 41 het 15 0 13 2 G 1 0 9068 CASAVA_Build X 116255989 4I TGTATTCCTC ----/TCTT TCTGAGAATT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TCTT 0 1 9069 CASAVA_Build X 116267626 7D ACTTACACAC ATAGATT/------- ATAAAGATAA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 ATAGATT 1 0 9070 CASAVA_Build X 116267928 1I TATCATGGTG -/C CTTACATGCA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 C 1 2 9071 CASAVA_Build X 116269544 1I ATTTCTATTA -/T TTTTGTCTTC 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 4 5 9072 CASAVA_Build X 116269773 1D ATTCTAATAA T/- TTTTTGGTAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 5 9073 CASAVA_Build X 116271123 1D TTTTTGATGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 26 0 21 6 T 9 8 9074 CASAVA_Build X 116271983 1D GAAGAGGTCC T/- TTTACATCAC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 4 3 9075 CASAVA_Build X 116277923 2I ACTTAGAAAC --/AG GGGGTTTTAA 3070 hom 148 het 57 0 50 7 AG 0 1 9076 CASAVA_Build X 116292936 3D AGGATCACTT GAG/--- TATGGGAGGT 3070 hom 90 het 32 0 31 3 GAG 1 0 9077 CASAVA_Build X 116303214 1D ATAGAATGCC A/- TTTGATAATT 3070 het 3070 ref 25 14 11 3 A 1 0 9078 CASAVA_Build X 116317974 1I TGGGTGCATG -/T TATATTTAGG 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 T 1 2 9079 CASAVA_Build X 116319318 2I GTAAGAAAAC --/TG TGGTCTTTTG 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 TG 1 2 9080 CASAVA_Build X 116322422 1D AGTATGATAC A/- GTGGTACATA 3070 het 3070 ref 49 25 20 5 A 1 0 9081 CASAVA_Build X 116324422 1D AATCATTTTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 8 7 9082 CASAVA_Build X 116345365 1D GAGAAAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 11 10 9083 CASAVA_Build X 116362184 1I TTCAATTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 A 10 11 9084 CASAVA_Build X 116395622 2D CATTTGACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 12 10 9085 CASAVA_Build X 116400867 1D TTGGATTGTT A/- ATGACCCAAA 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 A 2 1 9086 CASAVA_Build X 116403582 1I TTCCCCAGAC -/A ATATACTGCT 3070 het 3070 ref 58 30 27 1 A 1 2 9087 CASAVA_Build X 116421666 1D ATTGTGTTTT C/- TTATTGTTTT 3070 het 3070 ref 44 24 19 1 C 1 0 9088 CASAVA_Build X 116443815 1I ATATTCCATT -/G GTTTTGTCCC 1081 het 1081 ref 12 5 3 4 G 1 2 9089 CASAVA_Build X 116449046 2I TACCAGACTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 11 13 9090 CASAVA_Build X 116460610 2I ACTTCATGAC --/AA AGATACTAAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 A 1 3 9091 CASAVA_Build X 116460961 1I AGAATGGCTA -/T TTATTAAAAC 3070 het 3070 ref 52 27 17 8 T 2 3 9092 CASAVA_Build X 116464579 16D TCAGAGCAGA ACTGAAGGAGATAGAG/---------------- ACACAAAACA 3070 het 3070 hom 29 9 17 8 ACTGAAGGAGATAGAG 1 0 9093 CASAVA_Build X 116465080 1I CCAGCATCAT -/C CTGATATGAA 2891 het 2891 ref 23 13 6 4 C 1 2 9094 CASAVA_Build X 116467725 3I TGCAGCCATA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 AAG 3 4 9095 CASAVA_Build X 116474236 1I TCTACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 22 28 6 T 10 11 9096 CASAVA_Build X 116475183 28D CAGGACTTGC ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 2780 het 110 hom 13 1 9 3 AT 23 9 9097 CASAVA_Build X 116476883 1D GAATCTTTGG A/- TAGGCTGACT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 1 0 9098 CASAVA_Build X 116483081 3I TCTTTTCTTC ---/TTT ATTAGTCTGG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 0 3 9099 CASAVA_Build X 116483477 1D TCAGTTTCCA T/- TGTAGTTGTG 3070 het 3070 ref 36 22 10 5 T 2 1 9100 CASAVA_Build X 116492287 1I AAAGAAAACC -/T TATTGTACAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 1 2 9101 CASAVA_Build X 116493502 9D ACTTAATAAT CTCCAGGTA/--------- CATCCATGTT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 CTCCAGGTA 1 0 9102 CASAVA_Build X 116496392 3D AAACGATCAT ATC/--- ATCAGCAAAC 3070 het 3070 ref 20 12 7 2 ATC 2 1 9103 CASAVA_Build X 116508161 2I AGCTGAGATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 14 11 T 11 13 9104 CASAVA_Build X 116509803 4D AAGACTAGCA TTAT/---- TTATATCCCT 3070 het 3070 ref 41 21 19 2 TTAT 2 1 9105 CASAVA_Build X 116513838 1D ATAAAAAAAA T/- GTGGTACATA 3024 het 2874 hom 19 9 7 3 T 1 0 9106 CASAVA_Build X 116516864 1D AGCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 10 9 9107 CASAVA_Build X 116519048 1I ACACATGAAC -/A ACAGGAAGGG 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 A 1 2 9108 CASAVA_Build X 116519232 5I TCCCAGAACT -----/TAAAA TAAAATAAAA 2697 het 2697 ref 25 14 6 5 TAAAA 2 3 9109 CASAVA_Build X 116524605 1I AAAAGAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 9 10 9110 CASAVA_Build X 116533065 2D GTTTACATTT TA/-- TTTCATTATT 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 TA 1 0 9111 CASAVA_Build X 116539271 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1868 het 1868 ref 31 13 9 9 A 15 16 9112 CASAVA_Build X 116560330 1I TGGTCTTTCC -/A TGTTATTATG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 0 1 9113 CASAVA_Build X 116567446 1I CAGGCATGAG -/C CACCACGCCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 1 2 9114 CASAVA_Build X 116612980 1I TCGGCTGTTT -/A TTTTTTTTTT 1898 het 349 hom 11 4 5 2 A 0 1 9115 CASAVA_Build X 116618797 3I CAAGAAAACA ---/TAT TATCATTTCA 3070 hom 151 het 55 0 51 4 TAT 1 2 9116 CASAVA_Build X 116622685 17D GTACCAATGA AAAATTGGTACCAATGG/----------------- AAAATTGGTA 3070 het 3070 ref 31 18 15 4 AAAATTGGTACCAATGG 1 0 9117 CASAVA_Build X 116640797 5I AATCTAGAGA -----/GGCAG GGCAGTCTGG 2504 het 2504 ref 25 13 10 2 GGCAG 1 2 9118 CASAVA_Build X 116641132 8I GGGGGGGGGG --------/AAAAAAAA AAACTCCTGT 1054 het 1054 ref 29 10 4 16 A 3 11 9119 CASAVA_Build X 116641785 4I ATTAATTGAG ----/TGAA TGAATGAACA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 TGAA 2 3 9120 CASAVA_Build X 116644269 1I TTCCCCATGG -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 A 6 7 9121 CASAVA_Build X 116649873 4D ATACACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 47 22 16 11 AC 9 7 9122 CASAVA_Build X 116651888 1I GTCATGGGGT -/G GGGGGAGGGG 647 het 423 hom 8 3 3 2 G 5 6 9123 CASAVA_Build X 116654557 1I AAATTTTACT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 8 9124 CASAVA_Build X 116655418 1I ATTCAGCCAC -/A CAAAATTATT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 0 1 9125 CASAVA_Build X 116658533 1I GCATCTTTTG -/A GAAATTCTGG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 0 1 9126 CASAVA_Build X 116659494 1I TCACCTTCCC -/A AAATACAAGA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 A 3 4 9127 CASAVA_Build X 116669675 1I CACTTGTACT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 A 8 9 9128 CASAVA_Build X 116676368 1D TAACAGTATA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 7 6 9129 CASAVA_Build X 116676466 1D AAAAGCCAAC T/- TGCCAAAAAT 3070 het 2796 hom 27 8 17 2 T 2 1 9130 CASAVA_Build X 116681013 9I GCTATGGGCC ---------/CAACTAATA CAACTAATAC 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 CAACTAATA 1 2 9131 CASAVA_Build X 116682012 1D GCTCCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 10 13 A 13 12 9132 CASAVA_Build X 116683569 2I ATTTCTTCTT --/AA AAAAAAAAAA 2995 het 2995 ref 20 9 8 3 A 10 12 9133 CASAVA_Build X 116684054 1D CCAGTAATGA G/- ATTGCTGGGT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 G 1 0 9134 CASAVA_Build X 116689763 4D ACTCTGGCAT CTGA/---- CTGCCACAGC 3070 het 2373 hom 22 7 9 8 CTGA 1 0 9135 CASAVA_Build X 116690309 1D CAATTTTGAT G/- AGAGAACCTG 3070 het 3070 hom 29 12 11 7 G 1 0 9136 CASAVA_Build X 116695824 2D TGAAACTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 933 hom 37 10 16 12 A 16 14 9137 CASAVA_Build X 116696283 3D GAACTATGAA AAT/--- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 AAT 1 0 9138 CASAVA_Build X 116696441 12D ACAAACTAGA AAACCTAGAAGG/------------ AAACCTCCCA 3070 het 3070 ref 28 20 9 4 AAACCTAGAAGG 1 0 9139 CASAVA_Build X 116704561 1I CAACAGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 10 11 9140 CASAVA_Build X 116705057 16I TCATTTACAT ----------------/AAATGATTCTATACAC AAAACATTCA 3070 het 3070 hom 54 18 30 7 AAATGATTCTATACAC 0 1 9141 CASAVA_Build X 116786012 12D GAAATACAGC CGAGGGTCATCA/------------ CGAGTGTTGT 3070 het 3070 ref 40 24 20 4 CGAGGGTCATCA 1 0 9142 CASAVA_Build X 116802664 1D ATAGTGTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 G 1 0 9143 CASAVA_Build X 116807971 1I CCTCCCAAAC -/T ATTAAGTCCA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 0 1 9144 CASAVA_Build X 116857992 2I AAAGGGACTC --/TT TGTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 1 3 9145 CASAVA_Build X 116860380 5D AAAAATAAAT AAATA/----- AAATAGCAAA 3070 het 3068 hom 18 9 9 3 AAATA 2 1 9146 CASAVA_Build X 116870462 1D AATGTCTTAA T/- ATAGTTTCTG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 1 0 9147 CASAVA_Build X 116872627 1D AGTCCTAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2005 hom 46 13 17 16 A 16 15 9148 CASAVA_Build X 116874965 1D TATAGTCCCA C/- TAAACAGAAA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 C 1 0 9149 CASAVA_Build X 116878665 1D TATCTGATGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 A 9 8 9150 CASAVA_Build X 116881295 1D GATTTCACCT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 9 8 9151 CASAVA_Build X 116883896 1I TCTCCTTTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 A 9 10 9152 CASAVA_Build X 116907204 4I CATTCTTGTC ----/CTCT CTCTAACTTT 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 CT 2 4 9153 CASAVA_Build X 116909935 13D ACTCAGGCCC TTTGGCAGAGCCA/------------- TTGCTTATTG 3070 het 3070 ref 41 23 20 3 TTTGGCAGAGCCA 1 0 9154 CASAVA_Build X 116919733 3D TGACGCCTGA ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 1910 hom 18 6 8 6 ATT 5 4 9155 CASAVA_Build X 116921503 1I AGTACTGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 T 9 10 9156 CASAVA_Build X 116923644 1I GTTGCCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 13 10 T 10 11 9157 CASAVA_Build X 116929531 1D CTAATGCTAT C/- CCTCCTCTAG 2434 het 2434 ref 27 17 7 3 C 3 2 9158 CASAVA_Build X 116931222 1I TCAGCTAGAA -/G ATCTCCAAAC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 0 1 9159 CASAVA_Build X 116933354 2D TTCCTCTCTC TT/-- GTCTCCTTCC 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 2 0 9160 CASAVA_Build X 116935405 1D CAAAGGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 12 11 9161 CASAVA_Build X 116966125 2I ATCCTACAAA --/AC ACAGGACAGT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 AC 1 2 9162 CASAVA_Build X 116967395 1D AAGCAAGAGT G/- CTCTGCTGAT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 G 1 0 9163 CASAVA_Build X 116977079 1I CACATCATTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 8 9 9164 CASAVA_Build X 116980305 1I GAGGTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 2272 het 2272 ref 33 14 8 11 T 11 12 9165 CASAVA_Build X 116982589 1I GAGCACTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 8 9 9166 CASAVA_Build X 116989490 1D AACTAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 T 11 10 9167 CASAVA_Build X 116996836 1D CCATCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 2321 het 2321 ref 27 16 6 5 A 11 10 9168 CASAVA_Build X 117001101 1I GGCAGAAGAG -/T ACAGAGCTAG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 0 1 9169 CASAVA_Build X 117014822 1D TAGCCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 11 14 10 A 15 14 9170 CASAVA_Build X 117015232 1I TCTCTTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 11 12 9171 CASAVA_Build X 117025362 11D AGACCCTGTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2684 het 2199 hom 22 8 9 6 A 23 12 9172 CASAVA_Build X 117041134 1D TAGGAATTGG T/- TAATTTTCTC 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 T 2 1 9173 CASAVA_Build X 117048798 1D TGCCAGCCTC T/- TTTATCTTGA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 4 3 9174 CASAVA_Build X 117059504 1D TGGATGACAG A/- GTGAGACCCT 3070 het 3070 hom 30 9 19 3 A 1 0 9175 CASAVA_Build X 117060911 1I CATTGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 A 11 12 9176 CASAVA_Build X 117062425 1I TACTCTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 27 2 21 4 A 15 16 9177 CASAVA_Build X 117117114 1I AATAAAATTT -/A AAAAAAATTA 2147 het 486 hom 10 1 6 3 A 7 8 9178 CASAVA_Build X 117145542 19D TAGATAGATT TTAATTTTAAAAAATAATG/------------------- TTAATTTTAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 4 TTAATTTTAAAAAATAATG 1 0 9179 CASAVA_Build X 117146761 1I ATCCCGCCCC -/G GGGGCTAAAA 3070 hom 58 het 27 0 20 7 G 4 5 9180 CASAVA_Build X 117156157 1I TCCCAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 11 12 9181 CASAVA_Build X 117158993 4D AACATTCATA TGCC/---- TGCCTATCTG 3070 het 3070 hom 48 20 24 7 TGCC 2 1 9182 CASAVA_Build X 117188779 2D CCATTAGAAA GT/-- GTCACTTCTC 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 GT 2 1 9183 CASAVA_Build X 117191150 1I AGATTTGTCT -/G GGGAGCTCCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 3 4 9184 CASAVA_Build X 117198636 1I ATTCTAATGG -/C CCCCATTAGA 3070 het 3070 ref 42 23 11 8 C 4 5 9185 CASAVA_Build X 117202945 1D GAAAATGTGG T/- TACACATGCC 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 2 1 9186 CASAVA_Build X 117204251 5D GAAACAAATG AACTT/----- AACTTTACAA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 AACTT 2 1 9187 CASAVA_Build X 117204412 2I AGTCTTATTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 10 12 9188 CASAVA_Build X 117205861 1D TTTTTTTTTT C/- GGAGGGGGGA 3070 het 65 hom 20 1 16 4 C 1 0 9189 CASAVA_Build X 117206207 1I AGTGCATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 10 11 9190 CASAVA_Build X 117210838 2D TATATATATA TG/-- GTAAAGAGGT 3070 het 225 hom 20 1 15 5 TG 1 0 9191 CASAVA_Build X 117211237 2I AGGAGAAAAG --/AC AGTCATTATA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AC 0 1 9192 CASAVA_Build X 117216342 1D GCCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 38 1 28 10 T 13 12 9193 CASAVA_Build X 117216355 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTTCCTAT 3070 het 491 hom 36 3 27 7 C 1 0 9194 CASAVA_Build X 117227880 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 12 1 8 3 A 13 12 9195 CASAVA_Build X 117236232 1I TATATGGGGG -/T GTGTGTATGT 3070 hom 222 het 83 0 74 9 T 0 1 9196 CASAVA_Build X 117272657 2I AGTTTCATTC --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 8 10 9197 CASAVA_Build X 117281375 2D ACAACTATCT AC/-- ACACACACAC 3070 het 2841 hom 37 16 17 5 AC 13 12 9198 CASAVA_Build X 117292366 1I TACAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2843 hom 28 9 14 5 A 11 12 9199 CASAVA_Build X 117293700 1D TTCTGCAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 10 9 9200 CASAVA_Build X 117294995 6D CACATTATTT TTCTTC/------ TTCTTCTTCT 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 TTC 7 5 9201 CASAVA_Build X 117302026 1D AGAATTCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 12 11 9202 CASAVA_Build X 117303465 1D AAGGAATTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 10 9 9203 CASAVA_Build X 117304627 2D AACTCTGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 19 10 A 14 12 9204 CASAVA_Build X 117306065 1I CATCCTCTCC -/T TTTTCCCTTT 3070 het 2993 hom 29 10 16 3 T 4 5 9205 CASAVA_Build X 117317094 1I GAGCCGTTTT -/G ATCAGTTATG 2128 het 2128 ref 30 24 6 0 G 0 1 9206 CASAVA_Build X 117317841 1I GTAAAACATA -/C TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 C 0 1 9207 CASAVA_Build X 117322453 1D ATTCTGCCCC T/- GGCCCCTCCC 2053 het 2053 ref 20 12 6 3 T 1 0 9208 CASAVA_Build X 117326250 1D TAAAACTGGT A/- AAAAAAAAAA 1108 het 1108 ref 28 21 3 4 A 12 11 9209 CASAVA_Build X 117333845 1I AAGAGACAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 8 9 9210 CASAVA_Build X 117334355 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2347 het 186 hom 15 1 8 6 A 15 16 9211 CASAVA_Build X 117339123 1D14M8D11M4D AAAAAAAGAC AAAAAAAAATGAGAAAAATAAGTAAAGAATATCAACAG/-AAAAAAAATGAGAA--------AAAGAATATCA---- ACAATTCACA 3070 het 3070 ref 28 21 11 3 N/A 0 0 9212 CASAVA_Build X 117341624 4I TATCTCTCTC ----/TATA TATATATACA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 TA 4 6 9213 CASAVA_Build X 117362776 1D CAAGTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2555 het 2555 ref 40 14 13 14 T 15 14 9214 CASAVA_Build X 117367243 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 984 het 984 ref 37 21 3 13 T 13 12 9215 CASAVA_Build X 117369947 4I ATAAATAAAT ----/AAAC AAACAATTTA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 AAAC 1 2 9216 CASAVA_Build X 117372009 1D TGTATGGGTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 9 8 9217 CASAVA_Build X 117374378 1D TAATCCCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 11 10 9218 CASAVA_Build X 117374726 2D ATTTGTAATA AT/-- AGTAAAGGGC 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 AT 1 0 9219 CASAVA_Build X 117375502 1D TCAATTTAAA T/- TTTTAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 5 4 9220 CASAVA_Build X 117377071 1D TCTCAAAACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 10 9 9221 CASAVA_Build X 117384060 4D ATAATATTAA TAGT/---- TAGGTACTTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 TAGT 1 0 9222 CASAVA_Build X 117394279 1I TCAAAAGTAA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 T 7 8 9223 CASAVA_Build X 117411999 1D GTTACAAGAA T/- CAAACAAAAA 2860 het 2860 ref 39 18 8 15 T 1 0 9224 CASAVA_Build X 117412557 1I AATTGAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 11 12 9225 CASAVA_Build X 117414035 4I TTAAAATAAT ----/AATA ATAATAATAA 1943 het 1943 ref 13 7 4 2 AATA 0 1 9226 CASAVA_Build X 117421492 3D CTCTATTGAC AAA/--- AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 35 18 12 8 A 9 6 9227 CASAVA_Build X 117425975 7I TTTTGATGTT -------/TACAATC TACAGATAAA 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 TACAATC 0 1 9228 CASAVA_Build X 117440224 1D GTCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 A 12 11 9229 CASAVA_Build X 117444746 13D TACTTGGTAA TTCTACCTTTAAT/------------- AATTTATCAT 3070 het 3070 ref 18 9 8 4 TTCTACCTTTAAT 1 0 9230 CASAVA_Build X 117451935 2I TCAAGGATTT --/AA AAAACCAAGG 3070 het 3070 ref 68 35 28 5 A 4 6 9231 CASAVA_Build X 117454983 3D AGGAAATATT CTG/--- CTGATCTGCA 3070 het 3070 ref 39 20 15 6 CTG 2 1 9232 CASAVA_Build X 117456403 5D TTTCTTTCTC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 23 9 6 TTTCT 4 3 9233 CASAVA_Build X 117462047 1I AAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 9 10 9234 CASAVA_Build X 117462584 7D ATAAAGAATA TTTCTTT/------- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 TTTCTTT 2 1 9235 CASAVA_Build X 117469101 1I TGGTATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 12 9236 CASAVA_Build X 117472635 4D AAAGGCCAAG AGAC/---- AGACAAGTAG 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 AGAC 2 1 9237 CASAVA_Build X 117474380 1D CTCTACCTTC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 45 14 17 15 A 9 8 9238 CASAVA_Build X 117481161 4D CTTCGTACTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 31 11 11 10 TTGT 4 3 9239 CASAVA_Build X 117508662 2D GCGCCTGGCC CT/-- GTTTGCTCAC 3070 het 3070 hom 29 9 15 7 CT 1 0 9240 CASAVA_Build X 117521722 3I GGGTTCAGGA ---/AGG AGAAGAAGAG 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 AGG 0 1 9241 CASAVA_Build X 117543815 1D ACAGAAAAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 42 17 18 8 A 9 8 9242 CASAVA_Build X 117549537 2D TTGAAGTGTG TA/-- TATATATATA 1440 het 689 hom 10 3 4 3 TA 10 9 9243 CASAVA_Build X 117549822 2I AGTGCTGTGA --/TT TTAGAGGTGT 3070 het 3070 ref 19 8 9 2 T 2 4 9244 CASAVA_Build X 117570029 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 31 1 19 11 A 15 16 9245 CASAVA_Build X 117583093 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 40 het 20 0 12 8 T 9 10 9246 CASAVA_Build X 117587725 2D AGTTATGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 33 1 24 8 T 14 12 9247 CASAVA_Build X 117635614 1I GCTTATGCCT -/G TAATCCCAGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 0 1 9248 CASAVA_Build X 117644249 2D TAGTAGAGAC GG/-- GGGGTTTCAC 3070 hom 36 het 14 0 13 3 G 6 4 9249 CASAVA_Build X 117649168 1D ACTTTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 2637 het 2637 ref 25 9 8 9 A 12 11 9250 CASAVA_Build X 117658793 4I CTGTGAGCCC ----/TCTT TCTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 28 6 TCTT 1 2 9251 CASAVA_Build X 117675984 1I AATCTGTTAA -/T CCTCCCATCC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 0 1 9252 CASAVA_Build X 117685414 1I TTTAAGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 22 1 13 8 T 14 15 9253 CASAVA_Build X 117716290 16D GTTTAATTTA TTCCCCTCATTTGGAT/---------------- TTCCCTGTCA 3070 hom 120 het 42 0 41 7 TTCCCCTCATTTGGAT 1 0 9254 CASAVA_Build X 117720498 3I TACTAGACAA ---/AGG AGGAGGAAAT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 AGG 2 3 9255 CASAVA_Build X 117799192 1I TCTTATCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 33 0 27 6 A 10 11 9256 CASAVA_Build X 117834158 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1412 het 1412 ref 21 8 5 8 A 16 17 9257 CASAVA_Build X 117854552 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2879 het 1017 hom 21 3 13 5 A 15 16 9258 CASAVA_Build X 117863217 2D AATTTGTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 12 10 9259 CASAVA_Build X 117863928 1I CAAATGAGAT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 40 1 33 6 G 0 1 9260 CASAVA_Build X 117865436 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 61 het 26 0 21 5 T 9 8 9261 CASAVA_Build X 117869089 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 9 8 9262 CASAVA_Build X 117888020 1D AGTACTATGA T/- TATTCTCATT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 2 1 9263 CASAVA_Build X 117892667 1D ATATATAAAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 2756 hom 25 8 12 6 A 8 7 9264 CASAVA_Build X 117894201 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 640 hom 22 4 11 7 A 17 16 9265 CASAVA_Build X 117897006 3I ACTCAGCAGT ---/CGC CGCCGCCGCC 1582 het 1582 ref 27 13 6 8 CGC 3 4 9266 CASAVA_Build X 117902197 1D CTCTGACTCT G/- ACCTTCCTGC 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 G 1 0 9267 CASAVA_Build X 117913667 5I TCTAGCACAA -----/CAAGG CAAGAAAAGG 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 CAAGG 0 1 9268 CASAVA_Build X 117913777 6D CTTTTTTTTT TAAAAA/------ AAATAAAACA 3070 het 3070 hom 28 12 13 7 TAAAAA 1 0 9269 CASAVA_Build X 117922181 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 A 12 11 9270 CASAVA_Build X 117935936 1I GCCCTGCCTT -/C CCACAGGAAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 C 2 3 9271 CASAVA_Build X 117937452 1I GCATCATTTT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 8 9272 CASAVA_Build X 117946419 4D CAGAGACCAC ACAG/---- ACAAAGACTT 3070 het 3070 ref 52 26 22 5 ACAG 1 0 9273 CASAVA_Build X 117949270 1D TGATGTATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 10 9 9274 CASAVA_Build X 117967846 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 700 hom 37 2 25 10 A 13 14 9275 CASAVA_Build X 117973583 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2515 het 2515 ref 26 10 8 8 TA 8 9 9276 CASAVA_Build X 117989994 2D GGTAACAGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 AT 7 6 9277 CASAVA_Build X 117998562 1I GATGGATTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 40 1 31 8 T 9 10 9278 CASAVA_Build X 118009385 1I CCACCACAGA -/T CTATTCTTGG 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 T 0 1 9279 CASAVA_Build X 118009856 1I ATGTTAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 9 10 9280 CASAVA_Build X 118011113 2I ATTCTAACAC --/CA CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 CA 0 1 9281 CASAVA_Build X 118016177 1I ATGGCAACAC -/A ATTCACAATT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 1 2 9282 CASAVA_Build X 118029104 1D GACTCCGCTT A/- AAAAAAAAAA 1676 het 1676 ref 26 13 6 8 A 17 16 9283 CASAVA_Build X 118037870 3D TTATTAGATA TAT/--- TATTTTTGGC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TAT 2 1 9284 CASAVA_Build X 118040181 13D GAAAAGGAGC CACATAAAGTGTA/------------- CACATTCAAT 3070 het 3070 ref 37 24 13 3 CACATAAAGTGTA 1 0 9285 CASAVA_Build X 118044981 1D AATGTGAACT A/- ATGTGCTGTG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 2 1 9286 CASAVA_Build X 118068492 1I TATGCTTCTT -/A AAAAATGTAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 5 6 9287 CASAVA_Build X 118080169 2D TCACAATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 33 0 25 9 TA 9 8 9288 CASAVA_Build X 118083643 1D GCTCAAGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 35 1 30 4 A 13 12 9289 CASAVA_Build X 118093723 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2329 het 2329 ref 52 34 6 12 T 15 14 9290 CASAVA_Build X 118139564 1I TTGAAGGCTG -/T TTTTTTCTCC 3070 hom 101 het 40 0 33 7 T 6 7 9291 CASAVA_Build X 118154055 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAGT 2493 het 31 hom 8 1 7 0 A 9 8 9292 CASAVA_Build X 118165664 1I TAAGAGCTAG -/C CCCTGGGCCA 3070 hom 108 het 40 0 33 7 C 3 4 9293 CASAVA_Build X 118170754 4I TCCACAGAAA ----/ATCC ATCCATCTTA 3070 het 3070 hom 38 18 14 6 ATCC 1 2 9294 CASAVA_Build X 118194114 3D TTCTTATTCA TGT/--- TGTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 47 30 10 9 TGT 3 2 9295 CASAVA_Build X 118203147 3D CGCAAAATAC TTT/--- TTTTCTTTTT 480 hom 12 het 13 0 5 8 T 7 4 9296 CASAVA_Build X 118206130 1I TTTTGTCCAA -/T TTTTTTGTTC 3070 hom 114 het 44 0 37 7 T 6 7 9297 CASAVA_Build X 118210604 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 23 4 13 6 A 15 14 9298 CASAVA_Build X 118212497 2I TACATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 183 hom 51 1 38 12 TG 7 8 9299 CASAVA_Build X 118213728 1D ATAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 43 1 40 2 A 12 11 9300 CASAVA_Build X 118216663 1I GGGCTTGCTC -/A AAAAAAAGCC 3070 hom 107 het 46 0 35 11 A 7 8 9301 CASAVA_Build X 118217943 1I CCAACACCCC -/T ATAACAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 0 1 9302 CASAVA_Build X 118218568 1D TTTTGGGGGA T/- TTTTTTCTGC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 7 6 9303 CASAVA_Build X 118219688 7I AACTTCTGTT -------/CTTTATA TATTACCCAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CTTTATA 0 1 9304 CASAVA_Build X 118220185 3D CAAGAGAGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 120 het 45 0 40 6 TTG 7 6 9305 CASAVA_Build X 118230423 10I TGCGTTTAGG ----------/ACTATTAAGA ACGAAATGAT 3070 hom 62 het 28 0 22 6 ACTATTAAGA 0 1 9306 CASAVA_Build X 118255163 1D AAAGGTCCAG A/- CCTAGAGAAG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 1 0 9307 CASAVA_Build X 118341704 1I GAATGCAATG -/A AAAAAAAAAA 1030 het 1030 ref 41 29 3 9 A 10 11 9308 CASAVA_Build X 118351151 1D AGCTGTAACA C/- TCACTGTGAA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 C 1 0 9309 CASAVA_Build X 118413220 1I CATTAAAAGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 A 7 8 9310 CASAVA_Build X 118441540 1I AAAAGAAAAG -/A AAAGAAAAGG 1411 het 983 hom 12 7 5 0 A 3 4 9311 CASAVA_Build X 118442660 1D GAGGCCATAG C/- CTTGTCTTAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 C 2 1 9312 CASAVA_Build X 118443056 1D TAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1992 hom 40 7 20 13 A 12 11 9313 CASAVA_Build X 118443494 1I TCAGGGTAGT -/G GGAGAGGAGT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 G 2 3 9314 CASAVA_Build X 118447537 6D TGTATTAAAC ACCTCG/------ ACCTCTACCA 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 ACCTCG 1 0 9315 CASAVA_Build X 118472040 3D CCCCAAAGAC CTT/--- CTGATTGAAG 3070 het 3070 hom 40 16 18 8 CTT 1 0 9316 CASAVA_Build X 118472793 1I TATTTTTTAC -/T TTTTTTAACT 3070 het 2903 hom 27 9 16 2 T 6 7 9317 CASAVA_Build X 118476767 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 A 12 11 9318 CASAVA_Build X 118488582 1I ACATACCTTT -/A AAAATGGCTG 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 A 4 5 9319 CASAVA_Build X 118492500 1I GAGGTGGGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 T 8 9 9320 CASAVA_Build X 118514512 1D TATGGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 17 9 A 11 10 9321 CASAVA_Build X 118524262 1D AAACAAAAAC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 T 9 8 9322 CASAVA_Build X 118526559 1I TTTTATTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 9 10 9323 CASAVA_Build X 118546302 2I ATATATGCGC --/GT GTGTGTATGT 3070 het 3070 ref 55 27 19 9 GT 3 4 9324 CASAVA_Build X 118553595 4D GGTGTTCTTC CTTT/---- CTAATGATTC 3070 het 3070 hom 33 13 19 2 CTTT 1 0 9325 CASAVA_Build X 118553729 1I GTAGAATGGT -/G GTTACCAGGG 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 G 1 2 9326 CASAVA_Build X 118560047 20D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTT 2053 het 2053 ref 21 8 6 7 T 30 10 9327 CASAVA_Build X 118563183 1I TGTCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 het 2168 hom 17 6 7 4 A 4 5 9328 CASAVA_Build X 118569699 3D CCTTCAACAC AGA/--- AGAAGACTTC 3070 het 3070 ref 27 16 8 4 AGA 3 2 9329 CASAVA_Build X 118571225 1D ACAAACAAAC A/- AAAAACTCCT 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 A 6 5 9330 CASAVA_Build X 118575480 8D AAAAAAAAAA AAAAAAAG/-------- AAAAAAGAAA 1859 het 1859 ref 19 9 10 4 AAAAAAAG 1 0 9331 CASAVA_Build X 118577886 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 3070 het 1740 hom 23 6 11 10 A 5 6 9332 CASAVA_Build X 118580583 13I CCCAGCTACT -------------/CGGGAGGCTGACG CAAGAGAATC 2595 het 1858 hom 14 6 6 2 CGGGAGGCTGACG 0 1 9333 CASAVA_Build X 118581311 1D AGGCCTAGGT G/- GGTGGATCAC 3070 het 1167 hom 17 3 11 3 G 3 2 9334 CASAVA_Build X 118583047 1D AAAAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2672 hom 36 12 17 7 A 11 10 9335 CASAVA_Build X 118589036 2I3M5D GTTTTCTTGA --AAGGAAGA/TTATG----- AAGTCCAAGA 3070 het 3070 hom 30 14 15 4 N/A 0 0 9336 CASAVA_Build X 118593596 1I TTGCTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 A 10 11 9337 CASAVA_Build X 118628102 1I AGACGGGGTT -/A TCACCATCTT 1755 het 210 hom 8 1 4 3 A 0 1 9338 CASAVA_Build X 118628790 1D TAGTAGCAAT A/- AAAAAAAAAC 2590 het 2590 ref 22 12 6 4 A 10 9 9339 CASAVA_Build X 118631887 1I CAGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2412 hom 28 10 10 8 A 14 15 9340 CASAVA_Build X 118632544 3I TCTTTAACTT ---/ACA TTAGCTCAGG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 ACA 0 1 9341 CASAVA_Build X 118640045 2I CAACAACAAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 9 11 9342 CASAVA_Build X 118658468 27D GGAATACCTT TCCCATTAGAAATTAGAGGGAGCTTGC/--------------------------- TCCCATCAGA 3070 hom 81 het 25 0 28 4 TCCCATTAGAAATTAGAGGGAGCTTGC 1 0 9343 CASAVA_Build X 118688930 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1285 hom 29 8 13 9 A 15 14 9344 CASAVA_Build X 118715400 5D AGAGAGAGAG AGAAA/----- AGAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 AGAAA 5 4 9345 CASAVA_Build X 118720923 2I CTGTGTACAC --/AT AGATACATGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AT 0 1 9346 CASAVA_Build X 118732593 4D TCAAAATATT CAAA/---- CAGAGGATAA 3070 het 3070 ref 47 25 19 6 CAAA 1 0 9347 CASAVA_Build X 118734075 5D ACTTCCAACT AAGAA/----- AAGCCCAGGA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 AAGAA 1 0 9348 CASAVA_Build X 118734468 14I AGATATAAAA --------------/AAGAAAACCGGCCG GGCGCAGTGG 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 AAGAAAACCGGCCG 0 1 9349 CASAVA_Build X 118744747 5D GATCCTGTCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 hom 65 het 47 1 36 11 CAAAA 5 4 9350 CASAVA_Build X 118747463 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2218 het 2218 ref 31 16 7 9 A 15 14 9351 CASAVA_Build X 118755505 11D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3049 het 1216 hom 15 7 8 3 A 23 12 9352 CASAVA_Build X 118772091 1I TCCCTGCCCA -/C CCCCTTTCTC 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 C 4 5 9353 CASAVA_Build X 118779713 1D AAGCAGTTGC T/- GGCTACAGAC 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 1 0 9354 CASAVA_Build X 118781918 1I AACACTTCTA -/G AGCAATGCTT 3070 het 3070 ref 45 22 22 1 G 0 1 9355 CASAVA_Build X 118783195 1I TAAAAATATG -/A AAAAAAATCA 3070 het 2778 hom 22 7 9 6 A 7 8 9356 CASAVA_Build X 118784423 1I GTGGCCCAGG -/C TGGAGTGCAG 1560 hom 18 het 7 0 5 2 C 0 1 9357 CASAVA_Build X 118785751 2D CCTCAGCCCC CT/-- GAGTAGCTGG 1629 het 1629 ref 16 9 5 2 CT 1 0 9358 CASAVA_Build X 118787918 2I AGCTGTAACA --/CT CACCGCAAGG 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 CT 0 1 9359 CASAVA_Build X 118795257 3D CCTGGGCAAC ACA/--- ACAAGGCTCC 941 het 941 ref 30 16 4 10 ACA 2 1 9360 CASAVA_Build X 118804326 5D ACATTAAAAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 19 12 7 2 AAAAT 3 2 9361 CASAVA_Build X 118805090 1D CCGCATGATA T/- TTTTTTTGAG 2900 het 2338 hom 18 7 8 3 T 8 7 9362 CASAVA_Build X 118819729 2I CTCCCTCCCT --/CC CTTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 C 1 3 9363 CASAVA_Build X 118845453 4I GAGACGGACT ----/CTCA CTCTGTTGCC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 CTCA 0 1 9364 CASAVA_Build X 118866653 2D TGAGGTAATG AT/-- ATATGTTATA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AT 3 2 9365 CASAVA_Build X 118867495 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 6 het 30 1 21 8 AG 7 8 9366 CASAVA_Build X 118873612 4I AATAATAAAT ----/AAAC AAACAAACAG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AAAC 2 3 9367 CASAVA_Build X 118882288 1D GCCAGGGATT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 44 het 19 0 13 6 G 10 9 9368 CASAVA_Build X 118887066 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 631 hom 15 2 9 4 A 15 14 9369 CASAVA_Build X 118902216 2I CCCAAAAAAC --/TA TAATCCCAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TA 1 2 9370 CASAVA_Build X 118910032 3D TCCTGTTGTC CTT/--- CTTAGCTTCT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 CTT 2 1 9371 CASAVA_Build X 118911708 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 906 het 906 ref 17 9 3 5 A 15 14 9372 CASAVA_Build X 118918088 1D CCAGTCCAAC T/- TTTTTTTTTT 1833 het 1833 ref 16 7 6 3 T 13 12 9373 CASAVA_Build X 118967252 4D TTGCAAAATT TAAC/---- TAAACACTAC 3070 hom 93 het 37 0 30 10 TAAC 1 0 9374 CASAVA_Build X 118976714 1D TGGGTGTGGT G/- GGGGGGGGGT 1304 hom 12 het 5 0 3 2 G 10 9 9375 CASAVA_Build X 118987893 1D CTTGCCTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 40 1 29 10 T 11 10 9376 CASAVA_Build X 119055149 2I ATATCCACGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 TG 8 9 9377 CASAVA_Build X 119106401 8I AAACAAAGGC --------/ACAGTTAT AATTGAGACA 1163 het 1163 ref 37 29 3 5 ACAGTTAT 0 1 9378 CASAVA_Build X 119123996 4D CTAAAAAAAT AAAA/---- GAAAGAGAAG 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 A 4 0 9379 CASAVA_Build X 119227240 1I TCCACCCACT -/C CCTCCGGACT 3070 hom 47 het 19 0 15 4 C 2 3 9380 CASAVA_Build X 119239265 4D TCCCTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 72 het 27 0 24 4 AAAT 6 5 9381 CASAVA_Build X 119248849 4I TATATTAAAC ----/TAAA TAGATATTTC 3070 het 3068 hom 26 8 13 5 TAAA 0 1 9382 CASAVA_Build X 119287013 1D TCCCCCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 T 12 11 9383 CASAVA_Build X 119292831 2I TAGAGAACTC --/TT TTAACACTCA 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 T 2 4 9384 CASAVA_Build X 119298302 1I AGCCATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 11 12 9385 CASAVA_Build X 119302420 2D CACGTGCACG CA/-- CACACACACA 1590 het 1590 ref 45 26 4 16 CA 10 9 9386 CASAVA_Build X 119308337 1I TGCACTACAC -/A AAAACAAGGA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 4 5 9387 CASAVA_Build X 119320788 2I CAATCCCCAC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 CT 8 9 9388 CASAVA_Build X 119340780 2I ATACGTATAC --/AT ATATATATAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AT 4 5 9389 CASAVA_Build X 119345147 2I TAATTTGCAC --/AT GTTTGTGAAT 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 AT 0 1 9390 CASAVA_Build X 119358016 1D TCACAAGGGT G/- GGGCCCCCAT 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 G 4 3 9391 CASAVA_Build X 119370487 1D ATGGTGTTGC T/- TCCTGCACTG 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 T 2 1 9392 CASAVA_Build X 119375577 1D CTCCACTCCC A/- AAAAAACAGA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 7 6 9393 CASAVA_Build X 119378248 2D GGCATATTGC TT/-- TTTTTTTTTT 1542 het 1542 ref 43 17 5 21 T 16 14 9394 CASAVA_Build X 119390134 1D CTTTGTGGGG A/- AAAAAATGCC 3070 het 3070 ref 39 20 18 2 A 7 6 9395 CASAVA_Build X 119393113 1D CCTGATGCCA G/- GTCACAGGTA 3070 hom 93 het 37 0 30 7 G 2 1 9396 CASAVA_Build X 119401854 1I GGCAGAAAAT -/G GGAGGTTTGG 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 G 2 3 9397 CASAVA_Build X 119403267 1I TCCCTCCAAA -/G GACATGAACT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 1 2 9398 CASAVA_Build X 119415571 12D GTTACCACAA CCCCCTCCTTGG/------------ GTTCTATTAA 3070 het 3070 ref 36 25 9 7 CCCCCTCCTTGG 1 0 9399 CASAVA_Build X 119421750 4D CTGCTGATGA TGTT/---- TGTTTGTGCA 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 TGTT 2 1 9400 CASAVA_Build X 119422247 8I AAATAAACAA --------/ATACATAC ATACATACAT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 ATAC 2 4 9401 CASAVA_Build X 119426161 1I CTGTCAATAG -/T TTGGTACTGT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 2 3 9402 CASAVA_Build X 119440908 2D CAAATACCAA AT/-- ATATATATAT 1482 het 1482 ref 24 15 4 5 AT 10 9 9403 CASAVA_Build X 119445852 4D ATTTCTTTCT TAAC/---- TAACAGAAAA 3070 het 3070 ref 42 25 16 2 TAAC 2 1 9404 CASAVA_Build X 119459068 1I CCCTTCAAAA -/G GGTTTCATTA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 2 3 9405 CASAVA_Build X 119479432 1I TCCCTTTAGA -/T TAACATTTCT 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 T 1 2 9406 CASAVA_Build X 119496703 3D CTCAACCTTC TTT/--- GTCTGAAGAA 3070 het 3070 ref 44 25 13 8 T 3 0 9407 CASAVA_Build X 119535708 1D GTGAATTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 9 9408 CASAVA_Build X 119547826 1I GCCAACAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 36 1 27 8 T 11 12 9409 CASAVA_Build X 119570127 11D GCCTCCTGGG TTCAACCGATT/----------- CTCATGCCTT 3070 het 3070 hom 21 9 13 1 TTCAACCGATT 1 0 9410 CASAVA_Build X 119584229 30D TGTGTATAGG TATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 2214 hom 21 het 12 0 8 5 TA 22 7 9411 CASAVA_Build X 119590348 1D AAAACTCCTC A/- AAAAAAAAAA 1367 het 31 hom 24 1 7 17 A 19 18 9412 CASAVA_Build X 119595482 1I GACCATGGCC -/A AAAAAAAAAA 2621 het 2621 ref 30 10 12 8 A 17 18 9413 CASAVA_Build X 119634205 4I TCATTGTAGA ----/GATT GATGCATGTA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 GATT 0 1 9414 CASAVA_Build X 119642142 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1614 het 1614 ref 30 20 4 7 A 12 11 9415 CASAVA_Build X 119647461 2I AGAAGGAAAC --/TT AAAACTGCAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 2 9416 CASAVA_Build X 119651933 1I GACTTATGGC -/T TTTTTTTTTT 2659 het 1920 hom 30 7 10 13 T 14 15 9417 CASAVA_Build X 119652593 1D TGTAGAGACA G/- GGGCTTGCTG 3070 hom 81 het 28 0 26 2 G 4 3 9418 CASAVA_Build X 119652707 1D AAGCCAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 561 hom 33 4 21 9 T 16 15 9419 CASAVA_Build X 119658533 1D CCCAGAGTGG T/- TCTTGAACTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 2 1 9420 CASAVA_Build X 119659903 2D TTGGCCCAGG TT/-- TTTTTTTTTT 1164 hom 11 het 9 0 3 6 T 16 14 9421 CASAVA_Build X 119666227 1I CTAAAGGGCT -/A AAAAATAAGT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 5 6 9422 CASAVA_Build X 119676575 1I GCCAGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3015 het 721 hom 17 3 8 6 T 10 11 9423 CASAVA_Build X 119685458 1I AAAAAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 2366 het 2366 ref 30 19 7 4 A 11 12 9424 CASAVA_Build X 119695936 3D TTTTAATTGA TCT/--- TCTCTATTGT 3070 het 3070 ref 40 24 16 1 TCT 2 1 9425 CASAVA_Build X 119697068 1D TTGTTTGGAA T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 8 7 9426 CASAVA_Build X 119698886 3D TGTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1427 hom 15 4 11 0 T 13 10 9427 CASAVA_Build X 119702033 4I TTCTCTTGAA ----/AGAT AGGCCTGTAT 3070 het 3070 ref 55 22 21 12 AGAT 0 1 9428 CASAVA_Build X 119708712 1I CAGCAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 13 14 9429 CASAVA_Build X 119721933 5D GCTGAGTAAC AAATT/----- AAAACATTCC 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 AAATT 1 0 9430 CASAVA_Build X 119722022 2I CAAATATTCT --/CA GTCCAAAACT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 CA 0 1 9431 CASAVA_Build X 119723072 1D CCCACATAAC T/- TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 7 6 9432 CASAVA_Build X 119723189 31I AGTGGTTCCC -------------------------------/CATTTTCCCATGGTGGAAATATTCATTGTGA CAGCCTTACT 3070 het 3070 hom 32 12 18 6 CATTTTCCCATGGTGGAAATATTCATTGTGA 0 1 9433 CASAVA_Build X 119726067 4D TAAAAAATTT TATC/---- TATCTATTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 TATC 2 1 9434 CASAVA_Build X 119726175 1I AGACCCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 14 10 T 10 11 9435 CASAVA_Build X 119727722 4D CTCTCTCTCC CTCT/---- CTCTCTCTCT 151 het 147 hom 30 2 3 26 CT 11 9 9436 CASAVA_Build X 119728917 1D GTGTCGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 30 1 25 4 A 12 11 9437 CASAVA_Build X 119732087 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTATTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 6 7 9438 CASAVA_Build X 119733149 3I TATAGCATCA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 T 12 15 9439 CASAVA_Build X 119734415 1I TTCTCTGAGT -/C CTCACATTCA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 C 1 2 9440 CASAVA_Build X 119751624 2D GTCAGTCTGC AA/-- AGACAATATC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 3 1 9441 CASAVA_Build X 119753980 1D ATCATGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 19 0 A 10 9 9442 CASAVA_Build X 119756060 4D TGCCCCCCCC CCCA/---- ATAGCTATGG 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 CCCA 1 0 9443 CASAVA_Build X 119782267 1I TGTTTTCTAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 T 8 9 9444 CASAVA_Build X 119801794 1D GACTGTTTAT A/- AAAACACTTT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 5 4 9445 CASAVA_Build X 119804979 1D ATACAAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 33 2 22 9 T 11 10 9446 CASAVA_Build X 119811062 2I TTCTAGGGTC --/TT TTTTTATGTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 T 5 7 9447 CASAVA_Build X 119823088 1I ACTATGCTCT -/G GCAGAGCCCT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 2 9448 CASAVA_Build X 119887610 2D AGCGATGTCG CC/-- CCCCCCCCAT 3070 hom 83 het 34 0 27 7 C 10 8 9449 CASAVA_Build X 119890625 1I11M1I ACAGGCATCT -GAAAAAAAAAT-/GGAGAAAAAGATA AAAACAATGA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 9450 CASAVA_Build X 119959369 1D TTATATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 12 11 9451 CASAVA_Build X 119972552 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 85 het 31 0 26 5 T 7 8 9452 CASAVA_Build X 119972790 4I GAAAACAAAC ----/AAAG AAACAAACAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAAG 0 1 9453 CASAVA_Build X 119987699 7D TCTTTCTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 15 7 T 18 11 9454 CASAVA_Build X 120032231 2I ATGTGGGATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 29 16 7 6 TA 5 6 9455 CASAVA_Build X 120065964 3I TTCTACTTGA ---/AGG AGGAGGCAGG 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 AGG 2 3 9456 CASAVA_Build X 120068703 1D AGTTATTGTT G/- GGGGCCTTGT 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 G 5 4 9457 CASAVA_Build X 120073366 1D ATAGTGTCCC T/- TGAATAATTT 3070 het 3070 ref 34 23 8 4 T 2 1 9458 CASAVA_Build X 120073878 1I TTTAGATACC -/T TCTTATAAGT 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 T 1 2 9459 CASAVA_Build X 120075920 1I CAAGAGACCA -/C TTTCTTTACT 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 C 0 1 9460 CASAVA_Build X 120076200 1D TCCTTCCCAG A/- AAGTTTTCAA 3070 het 3070 hom 36 10 19 9 A 3 2 9461 CASAVA_Build X 120077226 1I CCATTGATTT -/A AAGTAAGAGA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 2 3 9462 CASAVA_Build X 120079785 7I AAACAAGTCA -------/AGGAAAC AGCAGAACCT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 AGGAAAC 0 1 9463 CASAVA_Build X 120082030 1I TCCGTCTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 30 1 17 12 A 11 12 9464 CASAVA_Build X 120092104 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1830 hom 14 het 7 0 6 1 A 15 14 9465 CASAVA_Build X 120095497 1I AACTAAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 20 1 16 3 T 10 11 9466 CASAVA_Build X 120111961 4I ATAGGGTTCC ----/TTTG TTTGAAAGAC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TTTG 1 2 9467 CASAVA_Build X 120125701 1I TGGTAAGTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 T 9 10 9468 CASAVA_Build X 120129228 2D TGAATACCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 12 10 9469 CASAVA_Build X 120130233 1D GTTGTCTGCC T/- TTATAATTGT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 3 2 9470 CASAVA_Build X 120137722 3I AATTATTTCA ---/TTT TTTTTTTTTT 2954 het 2954 ref 28 13 7 8 T 11 14 9471 CASAVA_Build X 120139513 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 10 9 9472 CASAVA_Build X 120139677 1D ATGTTATCTA T/- TTCTTTGGAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 3 2 9473 CASAVA_Build X 120153207 1D GCACCCGGCA T/- TTTTTTTTTT 2313 het 2030 hom 18 9 6 3 T 12 11 9474 CASAVA_Build X 120158459 1D CCCAGAAGAG C/- CCCCCAGCCC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 C 6 5 9475 CASAVA_Build X 120190733 1I CTTTTGAATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 T 9 10 9476 CASAVA_Build X 120196477 1I GCTTTTTGTT -/A ACAGCTTTAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 1 2 9477 CASAVA_Build X 120196713 1I CCTCTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 1263 het 1263 ref 43 32 3 8 T 10 11 9478 CASAVA_Build X 120213247 1I TTAACTTCAT -/C CCCCCACTTC 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 C 5 6 9479 CASAVA_Build X 120214038 1I TGCTTTTTTT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 7 8 9480 CASAVA_Build X 120232455 3I TAAAGAAAAT ---/GTG GTACACATAC 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 GTG 0 1 9481 CASAVA_Build X 120246305 1D CATTGTGGTT A/- AAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 7 6 9482 CASAVA_Build X 120246655 1D TTGCACAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 10 9 9483 CASAVA_Build X 120262220 1D ATAATAAAAT A/- AAAAAAATTA 2778 het 2059 hom 14 5 7 2 A 8 7 9484 CASAVA_Build X 120292129 1I AATTTTTTGT -/G ATTTTTAGTA 3070 het 471 hom 13 1 10 2 G 0 1 9485 CASAVA_Build X 120299010 1I AGGTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3055 het 1159 hom 45 17 15 13 G 0 1 9486 CASAVA_Build X 120301001 1I AACTAATTAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 2812 hom 20 7 9 4 T 7 8 9487 CASAVA_Build X 120310719 2I TTTTTCTTAA --/TC TCTCTGTATC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 TC 2 3 9488 CASAVA_Build X 120314751 4I AGGCACAAAT ----/AATC AAAATCAGAC 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 AATC 0 1 9489 CASAVA_Build X 120316385 1I TTTCTCCCGT -/G TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 G 0 1 9490 CASAVA_Build X 120318004 3D CAGTGATTGG GAT/--- ATAAACCCAG 3070 het 2244 hom 20 7 10 3 GAT 1 0 9491 CASAVA_Build X 120318616 1I TTATTATGAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 7 8 9492 CASAVA_Build X 120319005 1I TCACATTTAC -/T TTTTTCATCT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 5 6 9493 CASAVA_Build X 120325441 15I TGCCTACAGA ---------------/TTTGTTCTTATTGCT TAGTCCTGCT 3070 het 3070 ref 47 33 12 2 TTTGTTCTTATTGCT 0 1 9494 CASAVA_Build X 120325750 1D ATTGTGAGAG A/- CGTTGAGTTT 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 A 1 0 9495 CASAVA_Build X 120326458 1D ATTCTGGTTT G/- GGGTTTTGGG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 G 4 3 9496 CASAVA_Build X 120326762 3D GTATGCATAA TGG/--- TGTTCATAGT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 TGG 1 0 9497 CASAVA_Build X 120329959 1I AAGTTGCGTA -/C TATGCATTCA 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 C 0 1 9498 CASAVA_Build X 120333697 1D TTCTTCATAA T/- TTTTTATTCT 3070 het 3070 hom 38 18 16 5 T 6 5 9499 CASAVA_Build X 120336341 4I CTTTTTCTCT ----/TTAA TTAATCATTT 3070 het 3070 hom 36 9 23 4 TTAA 1 2 9500 CASAVA_Build X 120341780 1I CAAGCACCTT -/G CAGGATTCTT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 G 0 1 9501 CASAVA_Build X 120343298 1I TTTTAAATAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 8 9 9502 CASAVA_Build X 120346286 1D ATGAATAGTT A/- AAAGAAAATG 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 A 4 3 9503 CASAVA_Build X 120346580 1D TAATGGATGT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 8 7 9504 CASAVA_Build X 120347285 1I TTATGGCTTG -/C CCTATATTTT 3070 hom 102 het 40 0 32 8 C 2 3 9505 CASAVA_Build X 120358243 1I GTTATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 10 11 9506 CASAVA_Build X 120360414 1I ACTTGTACAC -/A AGTATTCATG 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 A 1 2 9507 CASAVA_Build X 120361776 9D TAATTTTTTT GTATTTTTA/--------- GTATTTTTAG 2070 het 2070 ref 17 12 5 1 GTATTTTTA 2 1 9508 CASAVA_Build X 120397840 1D TGACAAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 9 21 5 A 10 9 9509 CASAVA_Build X 120416427 1I GAGGTGCTTA -/C TGAAGGCAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 C 0 1 9510 CASAVA_Build X 120421200 33I CTTATCATTC ---------------------------------/TTTGTGTTACAAACATTTTAATTAAACTCTTGT AGTTATTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 15 3 TTTGTGTTACAAACATTTTAATTAAACTCTTGT 0 1 9511 CASAVA_Build X 120424157 1D ATGGATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 12 11 9512 CASAVA_Build X 120424623 1I TGGACTATAG -/T TTTTTTTTTT 1950 het 1950 ref 29 13 8 8 T 11 12 9513 CASAVA_Build X 120430749 1D CTGTGTGTGT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 1017 hom 29 5 11 13 G 1 0 9514 CASAVA_Build X 120437419 2I TATAGAATGA --/CT CTGTGTAGCA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 CT 1 2 9515 CASAVA_Build X 120441312 13D GAATTGACTA ATACAAGAAATTG/------------- ATACCACAGA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 ATACAAGAAATTG 1 0 9516 CASAVA_Build X 120446418 1I AATGTCTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 9 10 9517 CASAVA_Build X 120457348 1I CATCCTGCCA -/G ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 10 6 G 0 1 9518 CASAVA_Build X 120487627 2D TGTGGCCAAC AA/-- ACAGATGAAA 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 A 3 1 9519 CASAVA_Build X 120505641 1I CAATTGACAT -/C TGTTGATAAT 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 C 0 1 9520 CASAVA_Build X 120518208 2D GGAAGCAACC TA/-- TAAATGTCCA 3070 het 3070 ref 42 20 19 4 TA 2 1 9521 CASAVA_Build X 120520328 4D TTTATATAGT TATA/---- TATATATATA 3070 het 1991 hom 32 6 14 15 TA 10 8 9522 CASAVA_Build X 120527436 1D AGATAATTAT A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 A 7 6 9523 CASAVA_Build X 120528581 2D AGATTTTAAA AT/-- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 AT 1 0 9524 CASAVA_Build X 120539596 1D TTTTAATACA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 9 8 9525 CASAVA_Build X 120561335 1D AGACAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2776 hom 34 9 16 9 T 13 12 9526 CASAVA_Build X 120568320 1D GACTCACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1356 hom 32 8 19 5 T 12 11 9527 CASAVA_Build X 120573540 1D ATACAATAGC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 50 35 13 2 A 8 7 9528 CASAVA_Build X 120580297 1I CTTAATTTGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 A 8 9 9529 CASAVA_Build X 120584547 4I TATTTTTCTC ----/TGGA TGCTTTTAAA 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 TGGA 0 1 9530 CASAVA_Build X 120590260 1D TACTACCGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 13 12 9531 CASAVA_Build X 120590536 1I TGAAACTACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 A 9 10 9532 CASAVA_Build X 120606322 1I GTGGGTCATA -/C CCAGTGGGAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 2 3 9533 CASAVA_Build X 120610601 14I GTTCTTATCA --------------/TGTGGCAACTTATC TGTTACACTT 3070 het 3070 ref 47 30 15 2 TGTGGCAACTTATC 0 1 9534 CASAVA_Build X 120610826 3I TTGCTTTGTA ---/TGT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 TGT 0 1 9535 CASAVA_Build X 120615418 2D AATCCCTATG TA/-- TATATATATA 3059 het 3059 ref 30 12 11 7 TA 6 5 9536 CASAVA_Build X 120621011 1I TCTTTTTTTT -/A ATTATACTTT 3070 het 3070 hom 41 13 25 3 A 1 2 9537 CASAVA_Build X 120628390 1I TGATTTGGGA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 6 7 9538 CASAVA_Build X 120651897 1D ATCTATATTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 2504 hom 28 7 17 4 T 8 7 9539 CASAVA_Build X 120660453 1D GCTGCTATGA T/- GGGATTTTTA 1935 het 1935 ref 24 15 5 4 T 1 0 9540 CASAVA_Build X 120666506 3D CTAGGAGACT CAG/--- CAGAGCACAG 3070 het 3070 ref 45 24 16 7 CAG 2 1 9541 CASAVA_Build X 120681215 6D ATCTAGCTAA TGAACC/------ TATTTATCAC 3070 het 3070 hom 37 13 23 4 TGAACC 1 0 9542 CASAVA_Build X 120687371 2I CATTTTTAAA --/AT ATGTTTCTAT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 AT 1 2 9543 CASAVA_Build X 120703601 6D CATATTGTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 908 hom 30 7 12 12 T 20 14 9544 CASAVA_Build X 120704717 13I CTTCCTGCAG -------------/GTAGAACCTTGCA GAGGGTAGAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 GTAGAACCTTGCA 0 1 9545 CASAVA_Build X 120725033 3I AAAACAGGAA ---/AAG AAGAAGTAAA 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 AAG 2 3 9546 CASAVA_Build X 120741575 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2151 hom 30 11 13 6 T 12 11 9547 CASAVA_Build X 120761567 3I TCTTTTTTTC ---/TTT ATTAGTCTAG 2750 het 2750 ref 18 8 7 3 T 0 3 9548 CASAVA_Build X 120768116 1D CTGGGTCTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 10 9 9549 CASAVA_Build X 120768335 4D CTTTTTAATT TTTG/---- TTTATCTGTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 TTTG 1 0 9550 CASAVA_Build X 120781704 1D ACAATGTGAC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 8 7 9551 CASAVA_Build X 120782990 1I ACTATAAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 10 25 3 A 9 10 9552 CASAVA_Build X 120785312 3I GTAGCATGGC ---/CTT CTCTTCTCCA 3070 het 3070 ref 70 35 20 15 CTT 0 1 9553 CASAVA_Build X 120787044 3I GATCTCTACA ---/AGG AGAACTATAA 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 AGG 0 1 9554 CASAVA_Build X 120790096 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 A 10 9 9555 CASAVA_Build X 120800141 1I TTTCATATAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 8 9 9556 CASAVA_Build X 120800576 1I TCTACATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 10 13 8 T 13 14 9557 CASAVA_Build X 120804061 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 21 12 9 0 A 8 9 9558 CASAVA_Build X 120811020 4I ACAAAAAATT ----/AGCC AGGCGTGGTG 3070 het 2310 hom 19 8 7 4 AGCC 0 1 9559 CASAVA_Build X 120811353 2D AGAGATTAAC AT/-- AATAAATAAT 3070 het 3070 ref 39 25 12 5 AT 1 0 9560 CASAVA_Build X 120823189 4I AATCAAAAGA ----/AGAT AGATAAATCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 AGAT 1 2 9561 CASAVA_Build X 120823980 5D TAAAAAACTT TAGAA/----- TAGGTTAACT 3070 het 3070 ref 36 21 13 5 TAGAA 1 0 9562 CASAVA_Build X 120826506 1I AGGATGTGTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 8 9 9563 CASAVA_Build X 120830797 1I GTATATGTAG -/T TTTTGGGTTA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 T 4 5 9564 CASAVA_Build X 120833800 3D GTGTTGGTTA ATT/--- ATTTTTTACA 3070 het 3070 ref 48 24 23 2 ATT 2 1 9565 CASAVA_Build X 120834276 1I TTCAAAAAGA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 30 16 7 7 T 7 8 9566 CASAVA_Build X 120845033 6D CTAAAACTTA AAGTAT/------ AATAATAATA 2164 het 1133 hom 9 3 5 1 AAGTAT 1 0 9567 CASAVA_Build X 120850853 3I TAATCAACAA ---/CTT CTTCTCCTTC 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 CTT 1 2 9568 CASAVA_Build X 120857904 4D ATATTCACAC AATT/---- AAATACTATA 3070 het 3070 ref 48 24 21 7 AATT 1 0 9569 CASAVA_Build X 120861569 3D TAAAACAATA ATT/--- AACTTCAGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATT 1 0 9570 CASAVA_Build X 120862914 5D TGCACACATT TTGAG/----- TTATTTGTTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 4 TTGAG 1 0 9571 CASAVA_Build X 120868070 2I CAGGGCTCAT --/AA AGTGATAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 1 3 9572 CASAVA_Build X 120885563 4D CTGCCTTACA AGAG/---- AGAGATCTTG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AG 4 2 9573 CASAVA_Build X 120889199 1I CAAGCATATG -/A AAAAAAGCCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 7 9574 CASAVA_Build X 120890001 4D CCTGGTGACA GAGT/---- GAGACTCACT 3070 het 3070 hom 23 9 13 2 GAGT 1 0 9575 CASAVA_Build X 120894553 1I CAGAAAATGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 8 9 9576 CASAVA_Build X 120902962 1I TTATTTGAAT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 A 6 7 9577 CASAVA_Build X 120903949 4I AAGAGATCAC ----/TGTT TGTTTTTACT 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 TGTT 1 2 9578 CASAVA_Build X 120904723 1I GCTTTTTTTG -/T TTTATTTTTT 3070 het 277 hom 31 1 28 2 T 3 4 9579 CASAVA_Build X 120905058 1I AAAACAAAAC -/A AAACGACCCC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 3 4 9580 CASAVA_Build X 120906724 4I GATACTTTCC ----/CAGA CAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 52 26 24 2 CAGA 0 1 9581 CASAVA_Build X 120908033 5I GTCAAAAAAT -----/AAATC AAAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AAATC 0 1 9582 CASAVA_Build X 120913889 2D GAAAATCATC TA/-- TGTATTTAAT 3070 het 3070 hom 40 19 20 2 TA 1 0 9583 CASAVA_Build X 120916467 1D CATAATTTTT A/- ATTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 8 A 2 1 9584 CASAVA_Build X 120928403 1D ATTTAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 9 T 14 13 9585 CASAVA_Build X 120933898 1D GCAAAAATTT A/- AAAAAAAAAG 1032 het 1032 ref 42 32 3 7 A 10 9 9586 CASAVA_Build X 120962819 1I TAATTTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 11 12 9587 CASAVA_Build X 120970511 1I GTTAACTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1224 hom 39 4 28 7 A 11 12 9588 CASAVA_Build X 120977306 1D GGCATTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 8 9 A 13 12 9589 CASAVA_Build X 120986209 3D GGTCTCTCTC TCT/--- TCTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 45 16 21 13 TCT 2 1 9590 CASAVA_Build X 121023536 1I CATCAACATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 31 1 14 16 A 13 14 9591 CASAVA_Build X 121038585 1I TACCTGGAAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 60 25 24 11 A 8 9 9592 CASAVA_Build X 121039969 1I ATAAAGGTGC -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 T 7 8 9593 CASAVA_Build X 121041923 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 A 15 14 9594 CASAVA_Build X 121045182 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 15 14 9595 CASAVA_Build X 121048693 1I ATGTGGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 T 13 14 9596 CASAVA_Build X 121052161 4I AATAATGGGA ----/AGAG AGAGAGGAGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AG 3 5 9597 CASAVA_Build X 121142664 1D TGATTTATAG T/- TCCTTTGGGT 1227 het 84 hom 6 1 4 1 T 2 1 9598 CASAVA_Build X 121214470 1D ATGGAATGGT A/- AAAAAAAAAA 1854 het 1854 ref 52 41 5 7 A 13 12 9599 CASAVA_Build X 121271728 1D AAATCCAGCA T/- TTTTTTTAAA 2072 het 2072 ref 18 10 6 3 T 8 7 9600 CASAVA_Build X 121318923 4D ACATGTGCAG GTTT/---- GTTACACAGG 3070 het 3070 hom 28 12 12 5 GTTT 1 0 9601 CASAVA_Build X 121322302 1D ATTTTGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 42 1 27 15 T 15 14 9602 CASAVA_Build X 121333374 2I ACCTTCAAAC --/TG TTCTCCATAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TG 0 1 9603 CASAVA_Build X 121336267 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 25 0 16 9 T 12 11 9604 CASAVA_Build X 121337894 1I GCTTTCCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 T 12 13 9605 CASAVA_Build X 121338466 3I TCTTTAGCTC ---/TAA TAATATTTGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TAA 1 2 9606 CASAVA_Build X 121354014 1D AAGGAAAAAA T/- ATATATATAT 413 het 413 ref 24 15 1 8 T 1 0 9607 CASAVA_Build X 121361168 1D AACACTGCTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 10 9 9608 CASAVA_Build X 121382558 1D CTTTAATATA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 9 8 9609 CASAVA_Build X 121394046 2D CTTTCAAGAT TC/-- TCTGTTTGCA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 TC 2 1 9610 CASAVA_Build X 121400940 1I TGGAGGAGGC -/A AGCAGGGAGG 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 A 1 2 9611 CASAVA_Build X 121429718 8I TTTCCGATAG --------/ATAATCTA ATCAGAGGGC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 ATAATCTA 0 1 9612 CASAVA_Build X 121475731 1D AGCAAATACT A/- AGGGAATTCA 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 A 2 1 9613 CASAVA_Build X 121521131 1D TCATTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2465 hom 30 7 15 11 A 13 12 9614 CASAVA_Build X 121526648 1D TGAAGTCATT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 51 19 24 8 A 8 7 9615 CASAVA_Build X 121547152 2I TAAACCAACC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 10 9 9 A 9 11 9616 CASAVA_Build X 121547981 1I GAGACAAGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 9 10 9617 CASAVA_Build X 121548114 3I GGAGGAAGAA ---/GAG GAGGAGGAGG 3070 het 2982 hom 39 13 16 10 GAG 4 5 9618 CASAVA_Build X 121558133 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 A 11 12 9619 CASAVA_Build X 121603825 4I TCTAAATGAG ----/ATTT ATTTTAATGG 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 ATTT 1 2 9620 CASAVA_Build X 121605612 1D73M1I ACATCTCTAC AGTATATTTATCAGACAAGAGGGTGATACTCTCAATATGTAAATTATATATTACTCTTTTGCTTAGAAACCTCC-/-GTATATTTATCAGACAAGAGGGTGATACTCTCAATATGTAAATTATATATTACTCTTTTGCTTAGAAACCTCCA ATATTCTCTC 3070 het 3070 ref 50 43 18 19 N/A 0 0 9621 CASAVA_Build X 121629554 2I TACACCCTTT --/TC TCTCTGCTTT 3070 hom 144 het 55 0 48 7 TC 2 3 9622 CASAVA_Build X 121643042 2D TTTTTATCTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 TA 6 5 9623 CASAVA_Build X 121649131 1D TGGCACCAGA T/- TTTTTATCAG 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 6 5 9624 CASAVA_Build X 121652188 1I TCAACTTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 44 1 36 7 A 10 11 9625 CASAVA_Build X 121653449 1I AATCAATAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 9 10 9626 CASAVA_Build X 121658346 1D28M2D CTCCATGTGA TTTTTTTTTCATTTTTCAGTCATTCATTTTG/-TTTTTTTTCATTTTTCAGTCATTCATTT-- TGTGTGTGTG 3070 het 2104 hom 36 7 21 15 N/A 0 0 9627 CASAVA_Build X 121661539 4D CTTAAACTCT TGTG/---- TGTTTGTTCT 3070 het 3070 ref 43 22 19 4 TG 3 1 9628 CASAVA_Build X 121662447 5I ATCAAAAATA -----/TTTGT TTTAAGTCTA 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 TTTGT 0 1 9629 CASAVA_Build X 121665926 4I TTAGTGAGCT ----/CAAA CAGAGGCTAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 CAAA 0 1 9630 CASAVA_Build X 121668751 6D CCCAGAACTT AAAGTA/------ TAATAATAAG 1631 het 1409 hom 8 5 4 0 AAAGTA 1 0 9631 CASAVA_Build X 121669245 1D CCTGGCCAAT A/- TGGTGAAACC 2663 het 1001 hom 13 3 7 3 A 1 0 9632 CASAVA_Build X 121670566 1I AAATCAGTAC -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 7 8 9633 CASAVA_Build X 121671451 1D ACAGGATGGG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 A 7 6 9634 CASAVA_Build X 121673650 1I GCCTGAACAT -/A AAAAAGGCTA 3070 hom 82 het 35 0 28 7 A 5 6 9635 CASAVA_Build X 121675704 1D TGTGGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 17 7 A 12 11 9636 CASAVA_Build X 121677896 1D TCAGGGTTTT A/- TTTTTGGTTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 1 0 9637 CASAVA_Build X 121682841 1I TCATTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 18 11 A 10 11 9638 CASAVA_Build X 121687248 3D ATCTTCATTA TTG/--- TTATTAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 16 7 TTG 1 0 9639 CASAVA_Build X 121690775 1D TAAAGTATAT G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 2 1 9640 CASAVA_Build X 121704753 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2497 het 730 hom 11 4 7 0 A 12 11 9641 CASAVA_Build X 121708163 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 1481 het 419 hom 18 1 7 10 A 17 18 9642 CASAVA_Build X 121720614 1I TTTGGATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 T 11 12 9643 CASAVA_Build X 121732599 4D CTGTTACTCT TCTG/---- TCTGAGCTTC 3070 het 3070 hom 45 14 27 7 TCTG 2 1 9644 CASAVA_Build X 121738334 1I AAAGATTGAA -/T TTTTTTTTTT 1226 het 1226 ref 25 15 3 7 T 13 14 9645 CASAVA_Build X 121742209 2D AGAGTTTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 14 12 9646 CASAVA_Build X 121754018 3I GAGCAACCAA ---/ATC ATCAAATATG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 ATC 1 2 9647 CASAVA_Build X 121767219 6I AACTGATTGG ------/GCATTA GCATTAATTA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 GCATTA 1 2 9648 CASAVA_Build X 121802540 1D GGAATCCTGA G/- GATTCCATTG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 G 2 1 9649 CASAVA_Build X 121803312 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 7 6 A 13 12 9650 CASAVA_Build X 121809867 1I TAGCAGTGTA -/T TTTGGGGTGA 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 T 3 4 9651 CASAVA_Build X 121818909 1D ACATTTAAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 T 10 9 9652 CASAVA_Build X 121821148 1I TTATCCATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 9 10 9653 CASAVA_Build X 121852962 2D ATGTACACAG AC/-- ACACACACAC 1221 het 1221 ref 51 35 3 14 AC 10 9 9654 CASAVA_Build X 121860513 1I ATTTATGTTT -/C CCCCCCCCCT 3070 hom 88 het 37 0 27 10 C 9 10 9655 CASAVA_Build X 121861947 1D TTTATGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 11 10 9656 CASAVA_Build X 121882689 2I ATCATATGTT --/TG TTGGCCGCAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TG 0 1 9657 CASAVA_Build X 121908364 3I TATTTTATAC ---/TTA TTATTAGTGA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 TTA 2 3 9658 CASAVA_Build X 121925285 4I GACATAACAT ----/CCTA CCTAATTGGG 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 CCTA 1 2 9659 CASAVA_Build X 121940831 6I TAAATGAGAC ------/CATATA CATATATATG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 CATATA 1 2 9660 CASAVA_Build X 121941868 1I ACTCTACTCC -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 39 25 11 3 A 6 7 9661 CASAVA_Build X 121942577 1I AACTTCAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 8 14 T 11 12 9662 CASAVA_Build X 121946987 2I ACACATCTGC --/AG TTACCTCCTC 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AG 0 1 9663 CASAVA_Build X 121958114 2D TTATTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1682 het 1682 ref 19 7 7 5 T 14 12 9664 CASAVA_Build X 121960532 1I TACCTCCAGA -/T TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 41 26 3 12 T 13 14 9665 CASAVA_Build X 121966322 1I CCAGAAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 11 12 9666 CASAVA_Build X 121970185 1D TATAGCTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 T 10 9 9667 CASAVA_Build X 121974528 1I CTATTCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 841 hom 37 2 27 8 A 10 11 9668 CASAVA_Build X 121983646 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1170 het 404 hom 17 4 5 9 A 17 16 9669 CASAVA_Build X 121985935 1D CACAAAAAAA T/- AATAATAATT 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 T 1 0 9670 CASAVA_Build X 121993498 3I CAACTACAAA ---/AGG TTAAAACCTA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 AGG 0 1 9671 CASAVA_Build X 121994155 1I TTTACATATA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 6 7 9672 CASAVA_Build X 121999298 1D CCTCCCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 11 10 9673 CASAVA_Build X 122021158 4I TTGTTTTCTG ----/GTTT GTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 GTTT 3 4 9674 CASAVA_Build X 122033878 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2041 het 348 hom 9 1 5 3 T 11 10 9675 CASAVA_Build X 122039101 1D TTTTCCCTGC A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 7 6 9676 CASAVA_Build X 122050411 9I TCTTCTAGCA ---------/CTACCTTCC CTTCCTTCCC 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 CTACCTTCC 0 1 9677 CASAVA_Build X 122050514 4D GTTACTCTTC CTTA/---- CTAATTGTAA 3070 hom 108 het 37 0 34 3 CTTA 1 0 9678 CASAVA_Build X 122055159 1I TGACTCCTGG -/T TTTAAAAAAA 3070 het 414 hom 30 1 23 6 T 3 4 9679 CASAVA_Build X 122064618 3D TTTAAAGAAC TAA/--- TAATACCAGT 3070 het 3070 ref 36 22 14 0 TAA 2 1 9680 CASAVA_Build X 122066827 1D ATTCGGCCAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 A 9 8 9681 CASAVA_Build X 122067282 1I CACAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 A 10 11 9682 CASAVA_Build X 122077137 1D AAAAAACAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 9 8 9683 CASAVA_Build X 122079930 1I AAGCAAGGAG -/A ATACCTGCCA 3070 hom 94 het 38 0 30 8 A 1 2 9684 CASAVA_Build X 122081329 18D ACAGAAGAGA GAACCCAGAAATAAAGCC/------------------ GAATATTTAC 3070 het 3070 ref 31 18 14 2 GAACCCAGAAATAAAGCC 1 0 9685 CASAVA_Build X 122105741 1D AGAATAAAAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 A 8 7 9686 CASAVA_Build X 122112618 1I GGCTACTATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 A 8 9 9687 CASAVA_Build X 122113462 1I AATAAACTGG -/A AAAAAGAACA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 5 6 9688 CASAVA_Build X 122113813 1D AGAAAAATTG A/- AAAAAAAACT 3070 het 37 hom 30 1 16 13 A 9 8 9689 CASAVA_Build X 122114624 3D ACATAGCATG AAT/--- AATGTCTATG 3070 hom 93 het 36 0 32 6 AAT 2 1 9690 CASAVA_Build X 122115229 1I TATTCCTCCA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 79 het 34 0 27 7 T 6 7 9691 CASAVA_Build X 122115467 1I TGTAATTTTT -/G TATATTTAGT 3070 hom 66 het 29 0 23 7 G 0 1 9692 CASAVA_Build X 122116446 3I AGTCCTTCTC ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 2693 hom 20 7 13 0 TAA 5 6 9693 CASAVA_Build X 122117301 1D CCTTCACATC A/- ATTTTACCAC 3070 hom 126 het 44 0 39 5 A 2 1 9694 CASAVA_Build X 122117622 1D TCATAATCAC A/- GCCTAAAGAA 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 A 1 0 9695 CASAVA_Build X 122120232 1D CCTGAGCCCA G/- GAGTTCAAGG 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 G 2 1 9696 CASAVA_Build X 122120764 4I TTAAAGAGAG ----/GATT GATTGATTAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 GATT 2 3 9697 CASAVA_Build X 122122962 1I ATTATACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 11 9698 CASAVA_Build X 122123272 1D TAAGAAAAAC A/- AAAATTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 5 4 9699 CASAVA_Build X 122123909 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 9 14 13 AC 10 9 9700 CASAVA_Build X 122129225 1I TCTTGATGAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 A 8 9 9701 CASAVA_Build X 122135145 1D AGAACAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 245 hom 30 4 14 12 A 12 11 9702 CASAVA_Build X 122138328 1I AATGATGATC -/A AAAATGTCTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 4 5 9703 CASAVA_Build X 122143438 1D54M1I TGTGTTATCT AAAAAGGAGAAACACCTAGTGCCTGGCACAGAGTAAAGGTTCTTTAAATGTGACA-/-AAAAGGAGAAACACCTAGTGCCTGGCACAGAGTAAAGGTTCTTTAAATGTGACAT TTTTAATATT 3070 hom 72 het 32 0 25 21 N/A 0 0 9704 CASAVA_Build X 122146068 1I TTTAGGCGTA -/G CATGGCCAGG 3070 hom 36 het 16 0 11 5 G 0 1 9705 CASAVA_Build X 122164282 1I TTCACCAGGT -/G GGGCCCGCCA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 3 4 9706 CASAVA_Build X 122197357 1D CAGATACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2606 hom 24 8 9 7 A 12 11 9707 CASAVA_Build X 122198096 3D TTAACCAAGT ACA/--- ACAACTGTAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 ACA 2 1 9708 CASAVA_Build X 122200277 1I TCCTTTATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 52 28 15 9 T 9 10 9709 CASAVA_Build X 122201871 1D TTAACTTGCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 T 9 8 9710 CASAVA_Build X 122219216 4D TATATAAGAG AGAT/---- AGAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 21 8 13 0 AGAT 1 0 9711 CASAVA_Build X 122221039 2I ACACACTCAT --/GC GCGCGCGCAC 3070 het 23 hom 37 1 32 4 GC 4 5 9712 CASAVA_Build X 122238624 1D CCTCTGCCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 T 10 9 9713 CASAVA_Build X 122261457 1I TTATTTAGAG -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 T 6 7 9714 CASAVA_Build X 122265604 3I AATGAATACC ---/CAG TATGTTCAGA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 CAG 0 1 9715 CASAVA_Build X 122272533 2D AGAATCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1258 hom 29 6 12 12 A 17 15 9716 CASAVA_Build X 122274373 3D TGAAAGTTAA AAG/--- AAGACAAGTA 3070 het 3070 hom 46 17 23 7 AAG 2 1 9717 CASAVA_Build X 122274611 3I CAAGGCCTTG ---/ACA ACATTAGCCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACA 1 2 9718 CASAVA_Build X 122275544 1D ATAAGTGAAG C/- CCCCTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 C 5 4 9719 CASAVA_Build X 122289367 1I TCCCCCCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 11 12 9720 CASAVA_Build X 122293703 1I ACCTCTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 T 10 11 9721 CASAVA_Build X 122297746 1I GCATGTAAAT -/A GAGCAATAAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 9722 CASAVA_Build X 122303053 1I GCACCACAGT -/G CTGTGCCAGC 3070 hom 123 het 46 0 40 6 G 0 1 9723 CASAVA_Build X 122331826 1I GGGGTGGTCA -/C TGCTGCTGCA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 C 0 1 9724 CASAVA_Build X 122332299 2D TGCATATGTG TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 TA 5 4 9725 CASAVA_Build X 122338402 9I AACTCCTGCC ---------/CTTTTTTTT CTTTTACAAA 2325 het 2325 ref 23 15 6 2 CTTTTTTTT 0 1 9726 CASAVA_Build X 122340447 1D TTCAGATTAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 9 8 9727 CASAVA_Build X 122348504 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 T 9 8 9728 CASAVA_Build X 122355931 1D ATTCTATCTC A/- AAAAAAAAAG 1289 het 1289 ref 33 29 3 3 A 10 9 9729 CASAVA_Build X 122380942 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1261 het 509 hom 14 4 4 6 A 17 16 9730 CASAVA_Build X 122387539 4D AAATGCTGGT ACAG/---- ACAGAGAAGA 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 ACAG 2 1 9731 CASAVA_Build X 122399066 1I GAAGTACAAA -/G GTCCTGGGGC 3070 hom 93 het 33 0 30 3 G 1 2 9732 CASAVA_Build X 122401326 1D ATTCTTGTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 10 9 9733 CASAVA_Build X 122404366 1D TCTGCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 631 hom 29 2 16 11 T 14 13 9734 CASAVA_Build X 122444644 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 15 14 9735 CASAVA_Build X 122445464 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2654 hom 21 10 8 3 A 11 12 9736 CASAVA_Build X 122453723 1D GATTTTGGGG T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 7 6 9737 CASAVA_Build X 122456895 1D ATGTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 17 16 9738 CASAVA_Build X 122465779 8D AAATCCTAGC CAAAGCAT/-------- CACTTACAAT 3070 hom 93 het 33 0 30 8 CAAAGCAT 1 0 9739 CASAVA_Build X 122467864 1I ATCCAATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 10 11 9740 CASAVA_Build X 122471149 1I GGTAGGTATC -/A AAAAAAAATC 3070 het 421 hom 34 1 27 6 A 8 9 9741 CASAVA_Build X 122496347 2D GATTGTTCTC TT/-- TGTTTCTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 3 1 9742 CASAVA_Build X 122497144 1I TGGATCTTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 9743 CASAVA_Build X 122521661 2I TGTCTATGTG --/TA TATATATATA 1385 het 1385 ref 11 5 3 3 TA 8 9 9744 CASAVA_Build X 122544877 2D TGGCACTTCC TA/-- TATGACTACT 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 TA 2 1 9745 CASAVA_Build X 122546497 8D AAAAGCAAAT GAACAGAA/-------- GAACAGAACT 3070 het 3070 ref 33 20 13 3 GAACAGAA 2 1 9746 CASAVA_Build X 122548215 1I TACATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2663 het 1513 hom 31 6 11 14 T 15 16 9747 CASAVA_Build X 122585034 1I CTAAGATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 T 11 12 9748 CASAVA_Build X 122601820 3I TCAAGTAATA ---/CCT CCAGAAATCA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 CCT 0 1 9749 CASAVA_Build X 122619177 1I GTGTTAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 13 6 A 11 12 9750 CASAVA_Build X 122625071 1I TGATTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 10 10 A 11 12 9751 CASAVA_Build X 122640108 1I CCACGTTTTC -/A AACTTTTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 3 9752 CASAVA_Build X 122667905 1D TAATTTCTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 6 T 9 8 9753 CASAVA_Build X 122682679 1I TGTTTTGGGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 17 19 0 T 7 8 9754 CASAVA_Build X 122686689 1I ATTTCTCACT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 7 8 9755 CASAVA_Build X 122723539 1D AGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 10 19 12 T 13 12 9756 CASAVA_Build X 122726116 2D TCAAAGCATT AA/-- AAAAAAAAAA 1551 het 1024 hom 18 7 4 7 A 18 16 9757 CASAVA_Build X 122765762 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 478 hom 19 1 14 4 A 12 11 9758 CASAVA_Build X 122781175 2D CGGAAAAAAC TG/-- TCCCTCCCAC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TG 1 0 9759 CASAVA_Build X 122801703 2D TTTTTTTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 1341 het 906 hom 21 7 5 9 T 16 14 9760 CASAVA_Build X 122804222 1I TCAAAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 het 385 hom 28 1 26 1 T 0 1 9761 CASAVA_Build X 122813078 1D CTTCTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 643 het 643 ref 34 15 3 17 T 17 16 9762 CASAVA_Build X 122818589 1D TGCTGTTTTT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 8 7 9763 CASAVA_Build X 122825799 9I TGTTTAGCGA ---------/TACCAAATG TAAAATAATG 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 TACCAAATG 0 1 9764 CASAVA_Build X 122831494 1D AGAGGATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2541 hom 26 8 14 4 T 11 10 9765 CASAVA_Build X 122831836 1I TTTAGTAGAG -/A AAGTACTTAC 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 2 3 9766 CASAVA_Build X 122832811 1D TCTCTTAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1725 hom 26 7 13 6 A 10 9 9767 CASAVA_Build X 122835304 1D CTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 1287 het 1287 ref 12 4 5 3 A 12 11 9768 CASAVA_Build X 122842260 2D AAGAGCAAAA CT/-- CTGTTTCAAA 2814 het 1557 hom 29 8 14 7 CT 2 1 9769 CASAVA_Build X 122857030 6D GTGGTTATTC TATATT/------ TAACCTTTTG 3070 het 3070 ref 38 24 11 4 TATATT 1 0 9770 CASAVA_Build X 122857262 3I CATTTGTAAA ---/TCT TCTTTGTAGA 2510 het 2510 ref 24 13 6 5 TCT 1 2 9771 CASAVA_Build X 122857597 5I CCGACCCATT -----/TTTTA TTTTATTTTT 2947 het 2947 ref 23 11 8 4 TTTTA 1 2 9772 CASAVA_Build X 122858219 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTTCCTTAGC 2924 het 2924 ref 18 8 10 1 CTC 1 0 9773 CASAVA_Build X 122859045 1D TAATAAAACC T/- TGTATAAAGG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 2 1 9774 CASAVA_Build X 122862610 1I ATCCCATCAT -/G GGGGGGGTCT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 G 7 8 9775 CASAVA_Build X 122863651 4D ACGCGCTTAA TTGT/---- TTGGCCATAA 3070 het 3070 hom 45 19 22 6 TTGT 1 0 9776 CASAVA_Build X 122871006 5D AATTTGGTCT GTATA/----- GTCTAGACTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 GTATA 1 0 9777 CASAVA_Build X 122873009 3I ACTCTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 2139 het 2139 ref 17 7 6 4 A 13 16 9778 CASAVA_Build X 122879563 3D TAATGTCTAT TTG/--- TTATGTGAAC 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 TTG 1 0 9779 CASAVA_Build X 122882011 1I AGTAATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 10 11 9780 CASAVA_Build X 122905353 1I AAAGCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 10 11 9781 CASAVA_Build X 122916885 1D CCAGAACTTT G/- GGAGGCTAAG 3070 het 3070 hom 32 9 16 8 G 3 2 9782 CASAVA_Build X 122925782 1I CAAAACTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 13 14 9783 CASAVA_Build X 122926250 1D GTGGAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 12 12 T 13 12 9784 CASAVA_Build X 122938976 1D TTTTCTGCTG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 8 7 9785 CASAVA_Build X 122950767 1D TAAAAATAAT G/- ATCCCTGCCC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 G 1 0 9786 CASAVA_Build X 122975254 2D AAGGCAACTC AA/-- GAGACAAATG 3070 het 3070 ref 39 16 16 9 A 2 0 9787 CASAVA_Build X 123001172 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2243 het 1966 hom 24 8 10 6 T 15 14 9788 CASAVA_Build X 123002750 1D AAAACAATCA T/- TTTTTTTTTT 2307 het 2307 ref 32 13 6 13 T 15 14 9789 CASAVA_Build X 123014986 1D GGCAAAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 10 9 10 T 12 11 9790 CASAVA_Build X 123017528 1I CTTGATTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 10 11 9791 CASAVA_Build X 123018428 1D ATAATTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 861 hom 26 2 15 9 T 12 11 9792 CASAVA_Build X 123028164 3D TAATTAAAAA TTG/--- TTGTTCACAT 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 TTG 2 1 9793 CASAVA_Build X 123028345 2D ATATTCAAGA TC/-- TCTCTAGTGA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 TC 3 2 9794 CASAVA_Build X 123029566 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 15 6 A 12 11 9795 CASAVA_Build X 123041465 1D CCTCAGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 20 10 T 12 11 9796 CASAVA_Build X 123042629 1I GGTTTTTTTT -/C CCCCTTTATA 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 C 4 5 9797 CASAVA_Build X 123045925 9D TCTCGGCCCA CTGCAAACT/--------- CTGCCTCCTG 2757 het 2757 ref 26 12 8 6 CTGCAAACT 1 0 9798 CASAVA_Build X 123047688 1I GAACCTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 33 1 25 7 A 10 11 9799 CASAVA_Build X 123056467 1I TTTCCATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 19 7 11 1 T 10 11 9800 CASAVA_Build X 123057708 1D CTTTTATTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 48 27 21 1 T 7 6 9801 CASAVA_Build X 123080385 2D CTTCATGTAT TG/-- TGTGTCTCAT 3070 het 3070 ref 41 24 17 2 TG 3 2 9802 CASAVA_Build X 123080594 1D GGTTACGTTC T/- TTTTTTTTTT 1652 het 1652 ref 46 34 4 8 T 11 10 9803 CASAVA_Build X 123132341 2D TTTGTAAAAC AT/-- GTTTCAAAAT 2873 hom 18 het 9 0 7 2 AT 1 0 9804 CASAVA_Build X 123136770 4D TAGGAAAGAT ACAC/---- ACCAGTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AC 3 1 9805 CASAVA_Build X 123136874 4D AAATATAAAT AAAC/---- ATGTATAGCA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 AAAC 1 0 9806 CASAVA_Build X 123138120 2D GCTCTTCGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 5 A 13 11 9807 CASAVA_Build X 123141718 4D TTGCTGTACA TGTT/---- TATTTATATT 1851 het 1851 ref 44 38 4 4 TGTT 1 0 9808 CASAVA_Build X 123176194 4I ATTTATTATT ----/TATG TATGTATGTA 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 TATG 4 5 9809 CASAVA_Build X 123176370 2D CTTTGAGCAC TT/-- TTTCTTTAGT 3070 het 3070 ref 37 18 12 9 T 5 3 9810 CASAVA_Build X 123189525 1I CCCTCCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 21 21 9 T 10 11 9811 CASAVA_Build X 123197991 1D TTTTTCTTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 8 7 9812 CASAVA_Build X 123204508 1D ATACTAGGTG T/- TTTTTTTTTT 1717 het 1717 ref 29 7 7 15 T 13 12 9813 CASAVA_Build X 123225171 2D CTAGGTGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 118 het 45 0 39 6 T 12 10 9814 CASAVA_Build X 123227206 1I TCTACTAGTG -/A AGCCCAAACT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 1 2 9815 CASAVA_Build X 123246841 8D TGTATTTATG TATTTATT/-------- TATTTATTTA 2769 het 69 hom 19 2 7 10 TATT 7 5 9816 CASAVA_Build X 123248301 3I AACTCTGTAT ---/ACA GTCTGGGCTT 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 ACA 0 1 9817 CASAVA_Build X 123256504 1D AGAGTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2995 hom 26 11 11 4 A 11 10 9818 CASAVA_Build X 123263683 13D AAAAATGTAT ATATATATATATA/------------- ATATATATAT 3070 het 468 hom 14 1 12 3 ATATATATATATA 1 0 9819 CASAVA_Build X 123287660 1I AACCCCAATC -/T TTTTTTTTAA 2279 het 2279 ref 26 15 6 5 T 8 9 9820 CASAVA_Build X 123287996 1I GGTCCTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 18 11 T 12 13 9821 CASAVA_Build X 123300332 1D TCAGTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 13 10 A 12 11 9822 CASAVA_Build X 123300630 8D TATATATATA TTTTTTTT/-------- TTTTTCCAGT 984 het 169 hom 10 2 5 6 T 13 5 9823 CASAVA_Build X 123304218 1D TTCGTGCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 562 hom 43 2 31 10 A 13 12 9824 CASAVA_Build X 123316822 7D GTCAGGTTGG TTGCTTC/------- TTGCTTCTTG 3070 het 3070 hom 44 18 22 6 TTGCTTC 2 1 9825 CASAVA_Build X 123327631 4I GTGAAATCTT ----/AGAA AGCATATCAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AGAA 0 1 9826 CASAVA_Build X 123356453 2I ATCAGAAAGT --/AG AGTTTTTGTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AG 1 2 9827 CASAVA_Build X 123357824 1D TCCAGCTGAG C/- CTCTCCCAAC 3070 hom 45 het 22 0 15 7 C 2 1 9828 CASAVA_Build X 123359874 1I ATTCCACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 20 7 11 2 T 11 12 9829 CASAVA_Build X 123366104 1D TCCTCTTGTC T/- TTGCCCAAAT 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 T 3 2 9830 CASAVA_Build X 123368248 1I TGTTTTACAG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 6 7 9831 CASAVA_Build X 123369819 2D GATTACAAAC GA/-- GTACCACTAC 3070 het 3070 hom 32 8 24 1 GA 1 0 9832 CASAVA_Build X 123369914 1D CCTCATGTGA T/- TCCCCCTGCC 3070 hom 16 het 28 1 22 6 T 2 1 9833 CASAVA_Build X 123389481 1D CTTCTTTTTT G/- GGGGGGTGGG 3070 hom 95 het 39 0 31 8 G 7 6 9834 CASAVA_Build X 123390263 1D GTAATAACAG T/- TTTTATAGTC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 5 4 9835 CASAVA_Build X 123395187 1D TGACAGTAAT G/- TTTTTGGTCC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 1 0 9836 CASAVA_Build X 123404517 1D AAAACTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 27 1 24 2 T 11 10 9837 CASAVA_Build X 123410103 4D TTATGCTTAT AAGG/---- AAGGCCCTTC 3070 hom 153 het 58 0 51 9 AAGG 2 1 9838 CASAVA_Build X 123430484 2D GACCAACCCC CT/-- GTCAATGGAT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 CT 1 0 9839 CASAVA_Build X 123463558 1I GTAGAAACAC -/A AAGCAGATTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 2 3 9840 CASAVA_Build X 123464149 1I TTGACAACAG -/A AAAAAAGTTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 6 7 9841 CASAVA_Build X 123466037 1I TCCCTCTTGG -/T AAACCTGCTC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 0 1 9842 CASAVA_Build X 123479374 1D TAAATTAAAA G/- GAATTGGAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 2 1 9843 CASAVA_Build X 123484203 1D CTAGACAACA G/- GAAGAAAAGT 3070 hom 45 het 20 0 16 5 G 2 1 9844 CASAVA_Build X 123501208 1I TGGATGATTG -/T TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 37 25 3 9 T 10 11 9845 CASAVA_Build X 123511440 1I CTATTAACAG -/T TTTTTTTTTT 988 het 988 ref 37 20 4 13 T 15 16 9846 CASAVA_Build X 123512143 1I TCACACATTC -/A ACATCATCAT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 A 1 2 9847 CASAVA_Build X 123513970 1I50M1I CACCCCTGGA -TTTACTGTATTAGAAAAAAGAAAGTGAGAGAGACTCAAGTGCACTCAGGA-/TTTTACTGTATTAGAAAAAAGAAAGTGAGAGAGACTCAAGTGCACTCAGGAT TTGGCCTGCC 3070 hom 144 het 31 0 49 6 N/A 0 0 9848 CASAVA_Build X 123540922 1I CTTTTCATGC -/T TTTGGGGCTC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 3 4 9849 CASAVA_Build X 123542987 1I GGCATCTAAG -/T TGATCTCAAG 3070 hom 81 het 36 0 27 9 T 1 2 9850 CASAVA_Build X 123559747 1I8M1I GCATACATCC -AAAGACAG-/AAAAGACAGA TTATTACAAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 N/A 0 0 9851 CASAVA_Build X 123564636 1I TGGAGAAGGC -/A AGAAATGTTT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 A 1 2 9852 CASAVA_Build X 123570313 1D AAGAGTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1305 hom 31 3 19 10 T 15 14 9853 CASAVA_Build X 123628416 1I AGACCAAGAC -/A AAACCTCCCT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 3 4 9854 CASAVA_Build X 123637135 1I CCAGGCACTG -/T TTTTTTTTTT 2300 het 2300 ref 34 13 9 12 T 15 16 9855 CASAVA_Build X 123647649 1I AAAGTGGCCT -/A ATCATATACA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 1 2 9856 CASAVA_Build X 123647729 1I GAGGGGTGAT -/A ATAGCCAAAG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 1 2 9857 CASAVA_Build X 123652479 4I TTATAGCAAC ----/ACAA ACAGACTAAG 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 ACAA 0 1 9858 CASAVA_Build X 123698018 1D AGGCTGATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 11 10 9859 CASAVA_Build X 123784857 1I ATCATTTGAG -/C TAAAGCTGAT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 C 0 1 9860 CASAVA_Build X 123877282 1I TGTAGCTTCA -/G CACGGAGTGC 3070 hom 141 het 54 0 48 6 G 0 1 9861 CASAVA_Build X 123889529 1I CAACCAGTGT -/C CATTTGATGA 3070 hom 120 het 43 0 39 4 C 1 2 9862 CASAVA_Build X 123908458 1D TGTAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 1821 het 1821 ref 48 32 5 11 A 15 14 9863 CASAVA_Build X 123916952 1D GTTACTGTCT A/- TTATTTGACA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 0 9864 CASAVA_Build X 123935614 3D AACTCAAAGT ATA/--- ATAATACTAC 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 ATA 3 2 9865 CASAVA_Build X 123953236 1I ATAAGCAGTC -/A GTGTCATTAA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 0 1 9866 CASAVA_Build X 123986465 1I21M1I CAGAGAGGCC -GCCAATTTCCAATCAATTCTG-/TGCCAATTTCCAATCAATTCTGT TTGGCCTTAT 3070 hom 123 het 35 0 42 7 N/A 0 0 9867 CASAVA_Build X 123993704 1D TTTTAAATCA T/- TTTTTTTTTT 1024 het 1024 ref 31 19 3 9 T 13 12 9868 CASAVA_Build X 124063762 2I GGGCCACTCC --/TT TTTTTTTTTT 601 het 601 ref 37 13 4 20 T 16 18 9869 CASAVA_Build X 124063940 1I AGAAAAAAAC -/A CCAACCATAA 3070 hom 102 het 36 0 33 3 A 0 1 9870 CASAVA_Build X 124080981 1D TATTTACTGC T/- TTTTTTTTTT 1521 het 1521 ref 44 34 4 8 T 12 11 9871 CASAVA_Build X 124084379 2D TAATTAAAAA AC/-- AGTCATTTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AC 1 0 9872 CASAVA_Build X 124107177 1D ATCCAATGAC T/- TTTTTATATT 3070 hom 95 het 35 0 32 3 T 6 5 9873 CASAVA_Build X 124108663 23D ATATACACAC ATATGTGTGTATATATATCACAT/----------------------- ATATGTGTGT 2590 het 2590 ref 25 10 7 13 ATATGTGTGTATATATATCACAT 2 1 9874 CASAVA_Build X 124110634 1I53M1I ATACTTTAAG -TGTCCCAATGCCACTGATGCTCTAGCCACACTGGAACATATGACATGCATATC-/TTGTCCCAATGCAACTGATGCTCTAGCCACACTGGAACATATGACATGCATATCA AACAAGTCAA 3070 hom 26 het 49 1 44 24 N/A 0 0 9875 CASAVA_Build X 124111944 1I CCGAGCCTGC -/A ATTCCTTTCA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 1 2 9876 CASAVA_Build X 124114548 1D AACTCAAGAG A/- AGCTTGAGGT 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 A 2 1 9877 CASAVA_Build X 124179883 1I TGGAGTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 41 2 29 10 T 14 15 9878 CASAVA_Build X 124197756 3I5M6D AATGAGGACA ---CCGAAGCTCAG/TTTTTGTA------ ATATTTAAGT 3070 het 3070 ref 50 29 21 6 N/A 0 0 9879 CASAVA_Build X 124223570 2D ATTTATTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 30 0 23 7 TG 8 7 9880 CASAVA_Build X 124271316 1D CTCAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1162 hom 28 5 19 5 A 15 14 9881 CASAVA_Build X 124301124 4I ATATGCTCTC ----/TCTT TCTTGTGAGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TCTT 1 2 9882 CASAVA_Build X 124311376 1D CACTGTAGAG A/- TAAAAAACAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 0 9883 CASAVA_Build X 124318459 1I ATAAATTCCA -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 7 8 9884 CASAVA_Build X 124327325 1D AAATTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 10 9 9885 CASAVA_Build X 124390096 1D GTCCCATCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1961 hom 28 6 16 6 T 10 9 9886 CASAVA_Build X 124410756 6I AAAAAAATAC ------/TTTAAA TTTAAATGAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TTTAAA 1 2 9887 CASAVA_Build X 124412509 3D CACATATAAT ATC/--- ATATGTAATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ATC 1 0 9888 CASAVA_Build X 124419134 2D CTCTCTCTCG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 CT 6 5 9889 CASAVA_Build X 124419306 1D ACATCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 28 1 26 1 T 11 10 9890 CASAVA_Build X 124425592 2I GAATGGGCAC --/AT GTGTGGGAGA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AT 0 1 9891 CASAVA_Build X 124427079 2D TTTTCGAAAC AA/-- AGTACAGGCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 3 1 9892 CASAVA_Build X 124434932 1D CCCTTTAGGT A/- AAAAAAAAAA 2020 het 2020 ref 34 16 6 13 A 15 14 9893 CASAVA_Build X 124438014 2I ACATTTACAC --/AG AGAATCATTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AG 1 2 9894 CASAVA_Build X 124439639 1I GCATGTTTCG -/T TGTCATGACT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 1 2 9895 CASAVA_Build X 124441835 1I AGAGAGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 30 3 20 7 T 13 14 9896 CASAVA_Build X 124442674 1I CGTACTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 10 9897 CASAVA_Build X 124445869 1I ACTATGAATG -/T TTCTTTTAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 2 3 9898 CASAVA_Build X 124452993 3D TTATTTGCCA TTC/--- TTATTCTTAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 TTC 1 0 9899 CASAVA_Build X 124470572 1D GATACAGAGG T/- CCTGACTTTT 3070 hom 80 het 31 0 25 8 T 1 0 9900 CASAVA_Build X 124487418 2D TAACCACGTT AA/-- GTGTATTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 0 9901 CASAVA_Build X 124499931 1I AACAACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 A 13 14 9902 CASAVA_Build X 124500145 1I GAAAGTCAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 8 9 9903 CASAVA_Build X 124502197 1I ACAGAACTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 9 10 9904 CASAVA_Build X 124512435 2D TTTAAAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 2662 het 2662 ref 23 10 7 6 A 14 12 9905 CASAVA_Build X 124515529 1I GACTCCGTCC -/A AAAAAAAAAA 1937 het 756 hom 17 3 5 9 A 13 14 9906 CASAVA_Build X 124529166 1I GGGGCAGGCT -/C CTCCCGACTG 3070 hom 102 het 39 0 32 7 C 1 2 9907 CASAVA_Build X 124531538 1I AATCAGAAAT -/A AAAAAAGGGG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 6 7 9908 CASAVA_Build X 124534578 1I TCTAGGCAGA -/G GCTCCCAAGC 3070 hom 111 het 43 0 36 7 G 1 2 9909 CASAVA_Build X 124543158 1I TAGCTGTACC -/A ACACTTTGAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 1 2 9910 CASAVA_Build X 124543250 1I TTGTCAGAGC -/A ACCCTAGGAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 2 9911 CASAVA_Build X 124556197 1D CCATTTAAGA T/- TTGTCTCAGC 3070 hom 132 het 48 0 45 4 T 3 2 9912 CASAVA_Build X 124558902 1D TTAAAAAATG A/- AAAAAAACCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 9913 CASAVA_Build X 124559461 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 39 0 29 10 T 16 12 9914 CASAVA_Build X 124560653 10I GAGGTTTTCC ----------/TGGGTTTTCT TTTAGAATTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TGGGTTTTCT 0 1 9915 CASAVA_Build X 124561812 2D AATGTTAATT TG/-- GCCAAGACAA 3070 hom 75 het 27 0 25 3 TG 1 0 9916 CASAVA_Build X 124578767 1D TGAGCCAAGA T/- TCGTGCCACT 2812 het 30 hom 15 1 8 6 T 2 1 9917 CASAVA_Build X 124585503 1D TTGTAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 11 10 9918 CASAVA_Build X 124588725 1D11M1I29M1D TGGAAATCAG CCGTGGTACCTT-GGTGGTGTTCATTGACAGTTAGAAGCTCCT/-CGAGCTAACTTAGGTGGTGTTCATAGACAGAGAGAAGCTCC- TTCCTGAGAT 3070 hom 108 het 30 0 33 8 N/A 0 0 9919 CASAVA_Build X 124591360 1D AATGCAGTGG A/- AAGTCTAACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 3 2 9920 CASAVA_Build X 124595979 6D TTGTAGACTT AGAAGC/------ AGGAAGGGCT 3070 hom 81 het 31 0 27 6 AGAAGC 1 0 9921 CASAVA_Build X 124602595 3D GTGTAGAGTC ATT/--- AAACTCTTTG 3070 hom 111 het 40 0 38 4 ATT 1 0 9922 CASAVA_Build X 124604110 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 17 0 14 3 A 14 13 9923 CASAVA_Build X 124608462 1I32M1I GGGGCTTGCA -CCTCTTAGGTAATGTTCCAAGCTGTACCTTGG-/CCCTCTTAAGTAATGTTCCAAGCTGTACCTTGGC CCCTTTTAGC 3070 hom 117 het 36 0 37 8 N/A 0 0 9924 CASAVA_Build X 124609810 1D ATTTTTGGTT C/- CTTTGAGAAA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 C 2 1 9925 CASAVA_Build X 124610041 1D16M1I CATATGTATG TTCTTATTTTAAAAAAA-/-TCTTATTTTAAAAAAAT ATCTATTCAT 3070 hom 87 het 25 0 30 2 N/A 0 0 9926 CASAVA_Build X 124611065 1I ATCTCTTTGG -/T TCAATTTATT 3070 hom 92 het 37 0 32 5 T 1 2 9927 CASAVA_Build X 124612133 1I CAGCCATCTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 8 9 9928 CASAVA_Build X 124613125 1D TTCTTTGTGA G/- GGAGAACATT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 3 2 9929 CASAVA_Build X 124614775 1I TTCTTGAGCA -/T TTTTATCATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 5 9930 CASAVA_Build X 124616099 1I ATTTTCCTGA -/T TTTATTTAGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 3 4 9931 CASAVA_Build X 124617133 1D TATACTTAGT A/- CTATATAAAG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 1 0 9932 CASAVA_Build X 124621464 1I CCGTTTTTAA -/T TTTTCTTTTT 3031 hom 22 het 26 0 14 12 T 4 5 9933 CASAVA_Build X 124621492 1I GATGAGTGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 46 het 25 0 15 10 T 8 9 9934 CASAVA_Build X 124622469 1I TGGAAGACAA -/T TTTCCCACAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 3 4 9935 CASAVA_Build X 124625512 1I GCAGAGTACA -/C CTGACCATGG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 C 1 2 9936 CASAVA_Build X 124630513 1I AATCTATAAG -/A AATTTCAACA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 2 3 9937 CASAVA_Build X 124632832 1I TGATTTAGTT -/A ATGAGTTTTC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 2 9938 CASAVA_Build X 124634814 3I TACTTCTAAT ---/CTC CTACCAAGTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CTC 0 1 9939 CASAVA_Build X 124637361 1I TGCTTTACAA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 8 9940 CASAVA_Build X 124640543 1D12M1I ATCTACTTTC TTCTGCATATAAA-/-TCTGCATATAAAT TAATCTATTC 3070 hom 87 het 29 0 30 1 N/A 0 0 9941 CASAVA_Build X 124640631 1I58M1D AATACCTTTA -GGTTTATCCATCTTATAGTTCTGAAGAATAAAAGTGATGAAGGAAATAATAGTTAAACT/GGGTTTATCCATCTTATAGTTCTGAAGAATAAAAGTGATGAAGGAAATAATAGTTAAAC- TCTTACTGAC 3070 hom 120 het 33 0 40 13 N/A 0 0 9942 CASAVA_Build X 124641781 1D AAGTCCAAAA T/- TCTTCAGAGT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 2 1 9943 CASAVA_Build X 124642451 1D AATATATGCT C/- CCCAGGTGGC 3070 hom 126 het 46 0 43 5 C 4 3 9944 CASAVA_Build X 124649169 1I AGTGATCAGA -/G GGGTGGCTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 3 4 9945 CASAVA_Build X 124652046 1I CATTCACAAA -/C CCTGAGCCAG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 C 2 3 9946 CASAVA_Build X 124666814 1I5M1I CAGCAGGGCA -TGGAC-/GTGGACG GTCCCACACA 3070 hom 102 het 35 0 33 4 N/A 0 0 9947 CASAVA_Build X 124674218 1I TCATTATATG -/A AAAAGACACA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 4 5 9948 CASAVA_Build X 124677883 1I TGATCTCAGA -/C CTCTAGCCTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 2 9949 CASAVA_Build X 124679316 1D GTTAAGATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 8 9950 CASAVA_Build X 124683177 1I4M1I15M1I34M1I GAGACTGCAC -TTAT-AAACCATCAGATCTC-GGAGACTTATTCACTATCATGAGTACAGCACAGG-/TTTATAAAACCATCAGATCTCGGGAGACTTATTCACTATCATGAGTACAGCACAGGA AAAACCTGCC 2082 hom 12 het 17 0 5 16 N/A 0 0 9951 CASAVA_Build X 124686963 1I26M2I CTAATTTGCA -TCCCCAAAACAGTGTATGAGGGGTCC--/TTCCCCAAAACAGTGTATGAGGGGTCCCT TTTCTTCATA 3070 hom 51 het 24 0 18 10 N/A 0 0 9952 CASAVA_Build X 124695417 1D TTTTTTTTTT A/- GATTTTGGTC 3070 het 83 hom 32 3 27 2 A 1 0 9953 CASAVA_Build X 124714408 1D AGAACAGCAT G/- GGGGAAAACC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 G 5 4 9954 CASAVA_Build X 124733860 1D AAATTATAAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 7 9955 CASAVA_Build X 124755876 1D TATAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 34 0 29 6 T 12 11 9956 CASAVA_Build X 124769558 1I TAGTCAAAGG -/A GGGAAAAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 0 1 9957 CASAVA_Build X 124771875 3D TTTTTAACAA AAG/--- AAGTAGGAAA 3070 hom 108 het 39 0 35 7 AAG 2 1 9958 CASAVA_Build X 124792910 5D CACACACACA CACAC/----- AAAAATTTAA 2207 hom 21 het 14 0 8 7 CACAC 1 0 9959 CASAVA_Build X 124793910 15D GGCAATCAGG CAAAAGAAATAAAGA/--------------- CATCCAAATA 3070 hom 99 het 34 0 34 4 CAAAAGAAATAAAGA 1 0 9960 CASAVA_Build X 124796877 1D ATAACATACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 10 9 9961 CASAVA_Build X 124799208 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 1989 het 1348 hom 21 6 7 8 TG 8 9 9962 CASAVA_Build X 124808525 4D GTAACATGTC TTTA/---- TTTATCCTGC 3070 hom 73 het 27 0 25 2 TTTA 2 1 9963 CASAVA_Build X 124811666 2D TGTATTTGTA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 10 8 9964 CASAVA_Build X 124823797 1D CTATCAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 13 12 9965 CASAVA_Build X 124838971 5D CCACCAACAC TAGGA/----- TAGGACTGCA 3070 hom 104 het 40 0 31 12 TAGGA 2 1 9966 CASAVA_Build X 124843905 2I CCTAAACCAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 T 9 11 9967 CASAVA_Build X 124848433 2D TATTCTGTGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 93 het 38 0 30 8 TA 6 5 9968 CASAVA_Build X 124856248 4I TTTTTAAGGC ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TTTA 1 2 9969 CASAVA_Build X 124862998 1I AAGTCTAGAA -/T TTTTTTACTA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 6 7 9970 CASAVA_Build X 124864668 34D ACACACACAC ATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------- ATATATATAT 1546 het 26 hom 11 1 6 6 AT 26 9 9971 CASAVA_Build X 124870848 1I ATCTCAGGTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 7 8 9972 CASAVA_Build X 124878106 4D TATAATGGGG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 TTGT 3 2 9973 CASAVA_Build X 124878526 2D ACCCCATTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 45 10 13 23 T 18 16 9974 CASAVA_Build X 124878780 1I TTAAAAATAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 T 9 10 9975 CASAVA_Build X 124886646 1D TTAATTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2604 hom 29 12 13 4 A 15 14 9976 CASAVA_Build X 124902262 1D TGGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 A 10 9 9977 CASAVA_Build X 124910970 1I GAAATTTATC -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 6 7 9978 CASAVA_Build X 124912225 1D GTTCCATGTG T/- CCTGCAAGAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 0 9979 CASAVA_Build X 124925149 4I GAATCAAAAG ----/GTTA GTTCTTTGAA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 GTTA 0 1 9980 CASAVA_Build X 124925808 4I AGAAGGAAAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 hom 42 het 22 0 13 9 AGAA 3 4 9981 CASAVA_Build X 124929950 2D TTGTTTTAAA AG/-- AGAGAATTAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AG 3 2 9982 CASAVA_Build X 124973919 1I CAAAAAAAAA -/C ACCCAAACAA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 C 0 1 9983 CASAVA_Build X 124974415 5D TATAAAAAGA ATTAT/----- ATTATATCTT 3070 het 3070 ref 45 23 17 6 ATTAT 2 1 9984 CASAVA_Build X 124976164 1D CCTCCTTCAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 T 8 7 9985 CASAVA_Build X 124978493 2D TTTACCTTCA AT/-- GTTATTATTG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 AT 1 0 9986 CASAVA_Build X 124981118 1D40M1D CCTTACACAA TTTTTTTTTGCATTGTGGGTAAAAATCTACTAAAAAGATACT/-TTTTTTTTGCATTGTGGGTAAAAATCTACTAAAAAGATAC- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 26 14 7 N/A 0 0 9987 CASAVA_Build X 124981929 1D AAGTCAAGCC T/- TCATACACTT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 2 1 9988 CASAVA_Build X 124982089 1I TAAAGGGTAT -/G GGTAATTGCC 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 G 2 3 9989 CASAVA_Build X 124984462 1I AGATATCTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 9 10 9990 CASAVA_Build X 124984912 4I AAAGCTAAAA ----/CATG CATAGCAGTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 CATG 0 1 9991 CASAVA_Build X 124989203 1D TGTCGGGCAG T/- TGGGGACAAG 3070 hom 98 het 36 0 29 7 T 2 1 9992 CASAVA_Build X 124990549 1I TATTGTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 T 10 11 9993 CASAVA_Build X 124994867 1I TTCTGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 22 7 T 10 11 9994 CASAVA_Build X 125007863 3D TGAAAAATGC AAA/--- AAAAAAAAAA 1795 het 157 hom 28 3 8 17 A 15 12 9995 CASAVA_Build X 125015297 1I AGACTCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 877 hom 35 3 25 7 A 14 15 9996 CASAVA_Build X 125023112 1I GCCTATGAGG -/C CAACATTACC 3070 hom 86 het 37 0 30 7 C 1 2 9997 CASAVA_Build X 125026313 1I CATGTGGAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 431 hom 27 1 24 2 A 9 10 9998 CASAVA_Build X 125029823 1D CAACCAAAGC A/- AAAAAATGGG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 7 6 9999 CASAVA_Build X 125033095 14D CATTGGCAGT ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 hom 13 het 34 1 22 13 AC 16 9 10000 CASAVA_Build X 125036417 1I CTCTTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 35 1 29 5 T 10 11 10001 CASAVA_Build X 125039259 1D GATTATTCCT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 30 0 25 6 A 9 8 10002 CASAVA_Build X 125040702 29I AATATATTGA -----------------------------/AGTCTGTTATTTATAATTTAAGTCTTCTT AATTTTTAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 AGTCTGTTATTTATAATTTAAGTCTTCTT 0 1 10003 CASAVA_Build X 125041165 3D GATTCTTCTT AAC/--- AAGTGGTTAT 3070 het 3070 ref 43 28 14 5 AAC 1 0 10004 CASAVA_Build X 125056466 3I CTGTAACTCC ---/CTT CTTAGTCTGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CTT 1 2 10005 CASAVA_Build X 125057534 3D TCCAGCCATG CTT/--- CTTCTTCCAA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 CTT 3 2 10006 CASAVA_Build X 125057989 4D TTGATGAGTC AGAA/---- AGAACGTAGT 3070 hom 88 het 33 0 24 10 AGAA 2 1 10007 CASAVA_Build X 125063701 4I CACAAAGAAA ----/CCTT TGGGCCTAGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CCTT 0 1 10008 CASAVA_Build X 125073785 30I TTGCTGGCTA ------------------------------/GCTATATTTATAGCTACTCCCTAATTATAT GCTAAACAAG 3070 het 3070 ref 48 21 19 11 GCTATATTTATAGCTACTCCCTAATTATAT 0 1 10009 CASAVA_Build X 125076397 1D TGCCTTTCAC T/- CTGTAGTTCT 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 T 1 0 10010 CASAVA_Build X 125077057 4D CATTAATAAG TATT/---- TACTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 21 19 3 TATT 1 0 10011 CASAVA_Build X 125085781 1I AACAAAAACT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 106 het 39 0 34 5 A 8 9 10012 CASAVA_Build X 125090523 3I CCATGTGAGG ---/ACA ACATGACACC 3070 hom 141 het 51 0 48 3 ACA 1 2 10013 CASAVA_Build X 125096806 2D GTATGTATTT TC/-- TTTTTTTTGA 3070 hom 46 het 31 0 15 16 TC 1 0 10014 CASAVA_Build X 125097217 1D CATAGTAGTC T/- CTGAGGAACT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 T 1 0 10015 CASAVA_Build X 125106139 3D TTGCAGGTTC TAT/--- TATTCTTTCA 3070 het 3070 ref 39 19 15 7 TAT 2 1 10016 CASAVA_Build X 125109060 3D CCTGAAGTTT TTG/--- TTGTTGTCGT 3070 het 3070 ref 47 25 13 12 TTG 3 2 10017 CASAVA_Build X 125111801 1I TTGTTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2502 hom 36 8 16 12 T 13 14 10018 CASAVA_Build X 125123351 1D GCTTTCTCTC T/- TTTCATTGTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 4 3 10019 CASAVA_Build X 125124713 4D AACAAAACAC AAAT/---- AAAGACCAAG 3070 het 3070 ref 30 14 13 6 AAAT 1 0 10020 CASAVA_Build X 125124916 1I AGTCAACTTT -/A AAAAAACACT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 7 10021 CASAVA_Build X 125137790 1I AATGTAACTT -/A AAAGAAGAAA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 A 3 4 10022 CASAVA_Build X 125139167 1D ACTATCTTTT G/- GGGGTAATTT 3070 hom 81 het 31 0 27 5 G 5 4 10023 CASAVA_Build X 125140063 4D GATGACTATT AATC/---- AACACAGTAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AATC 1 0 10024 CASAVA_Build X 125156890 4I GTGCACAAGC ----/TCTT TCTTTAGGGT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 TCTT 1 2 10025 CASAVA_Build X 125157130 1D GCTTGTTTTT G/- TCGACTTCAT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 G 1 0 10026 CASAVA_Build X 125159631 4D GCAAGGTTAT AAAC/---- AAACACTAGT 3070 hom 108 het 41 0 37 8 AAAC 2 1 10027 CASAVA_Build X 125160512 5D TGAATCTCAT TTAAG/----- TTAACTTTTC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 TTAAG 1 0 10028 CASAVA_Build X 125163487 5I AACGTTACAA -----/TAGTT TAGAAGAAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TAGTT 0 1 10029 CASAVA_Build X 125168771 4D TAGGCTATTT ATTA/---- ATTACTGCCT 3070 hom 72 het 27 0 25 5 ATTA 2 1 10030 CASAVA_Build X 125170513 2D GTATAAAGAC TT/-- ATAGAAATGC 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 2 0 10031 CASAVA_Build X 125176679 2D ACATCTCTCC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 33 0 23 10 AT 9 8 10032 CASAVA_Build X 125179884 5I TAATGATTAA -----/TTTGT TTTGTTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTTGT 1 2 10033 CASAVA_Build X 125181020 1I TACATGCTCA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 T 6 7 10034 CASAVA_Build X 125181719 4D CCAGTGAAAG AATT/---- AATATCAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 20 3 AATT 1 0 10035 CASAVA_Build X 125182270 1I AGAAACAAGC -/T TTTTTTTTTT 1585 het 1585 ref 31 19 5 7 T 14 15 10036 CASAVA_Build X 125183424 1I TTACAGTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 9 10 10037 CASAVA_Build X 125186730 3I TTAATAAATA ---/AAT AATAATAAAA 2264 het 2264 ref 25 12 6 7 AAT 2 3 10038 CASAVA_Build X 125187947 1D GCATATCAAG T/- TTTTTTCCAC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 7 6 10039 CASAVA_Build X 125188002 1D CTAGCTTCCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 43 10 19 14 T 9 8 10040 CASAVA_Build X 125209856 1I CCAGGCCATA -/G GGTAAGTCAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 G 2 3 10041 CASAVA_Build X 125211807 1I GCCTTAGACG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 48 20 24 6 T 6 7 10042 CASAVA_Build X 125215198 1D TATGAATTTT A/- AAATTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 4 3 10043 CASAVA_Build X 125215388 1D AGTGGAGATC T/- TTTTCCTCCC 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 T 5 4 10044 CASAVA_Build X 125215958 4D TTTTTAGTTC TGTT/---- TATGTGATGA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 TGTT 1 0 10045 CASAVA_Build X 125218399 1D ATAGGTCTCT A/- AAAACTTGCT 3070 het 3070 ref 45 31 12 3 A 5 4 10046 CASAVA_Build X 125221446 4D ATCATTACAA ACTT/---- ACTTAGCAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 ACTT 2 1 10047 CASAVA_Build X 125222202 5D ATTATAAATT ATCAA/----- ATCAAGATAT 1719 het 1719 ref 20 13 6 4 ATCAA 2 1 10048 CASAVA_Build X 125223160 3I AAAAGTCTTT ---/TTC TTTTCTAAAT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 TTC 0 1 10049 CASAVA_Build X 125224534 2I CTTTCAAAAC --/TG TAATTAATCC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 TG 0 1 10050 CASAVA_Build X 125227324 1I ATCACCACAC -/T GTCTTCCATG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 0 1 10051 CASAVA_Build X 125231830 1I CAGTGGTGAT -/A ATACACTTTA 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 1 2 10052 CASAVA_Build X 125231868 1I TAATTTCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1782 hom 28 4 14 10 T 9 10 10053 CASAVA_Build X 125231951 1D GATTTGTTGA T/- TTTTTTGAAG 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 T 7 6 10054 CASAVA_Build X 125232659 1I GTCTCCAACT -/A TTATTTGTGT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 0 1 10055 CASAVA_Build X 125237372 1I AAAGTTATTA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 6 7 10056 CASAVA_Build X 125237525 6D TCTGTTCCTT TTTATC/------ TATTCCAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 5 TTTATC 1 0 10057 CASAVA_Build X 125238850 4D TACAATAGAA TGTT/---- TGTTATTTAG 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 TGTT 2 1 10058 CASAVA_Build X 125245083 1D GATGGACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 11 10 10059 CASAVA_Build X 125245159 2I TTTTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 11 9 13 T 9 11 10060 CASAVA_Build X 125245684 2I CTTGAAACTT --/GC ATGTATTACA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 GC 0 1 10061 CASAVA_Build X 125253573 1D AGTTTCTTTC T/- TTTTTCAATT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 6 5 10062 CASAVA_Build X 125260662 7I TATAGGAGTT -------/TATTAAG TATTAACTCA 1351 het 1351 ref 12 5 3 5 TATTAAG 0 1 10063 CASAVA_Build X 125270538 4I GGTTATTTTT ----/TCTC TATTTTATTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TC 0 2 10064 CASAVA_Build X 125274486 3D GTCATTTTGT AGA/--- AGAACACATT 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 AGA 2 1 10065 CASAVA_Build X 125288041 1D GCTGAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 936 hom 27 3 16 8 A 12 11 10066 CASAVA_Build X 125298469 1D CCTTTGCGCT A/- ACCACGAATG 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 2 1 10067 CASAVA_Build X 125301397 3I ATACTCCAAA ---/TAT TATTACAGTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAT 1 2 10068 CASAVA_Build X 125302318 3D TATTTTATTA TTG/--- TTGTTGTTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 TTG 3 2 10069 CASAVA_Build X 125302545 1I TTTAACATTT -/A AAAAATAGCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 5 6 10070 CASAVA_Build X 125316892 2I AAAGACTCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 17 0 11 6 A 12 14 10071 CASAVA_Build X 125323867 1D CCACCTCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 233 hom 27 1 20 7 A 13 12 10072 CASAVA_Build X 125359841 1I GAGCTCTGAG -/T TTTGTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 3 4 10073 CASAVA_Build X 125384324 1D TTCCATCCTC T/- TTTTTTTTTT 2947 het 133 hom 30 3 12 15 T 15 14 10074 CASAVA_Build X 125387185 2I AGCTGGTATC --/TA TGATGCAAGA 3070 hom 88 het 36 0 29 7 TA 0 1 10075 CASAVA_Build X 125387744 1I TTTTCTTTTG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 382 hom 31 1 24 6 T 8 9 10076 CASAVA_Build X 125399783 1D TCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2774 het 2774 ref 29 10 8 12 A 17 16 10077 CASAVA_Build X 125413096 2I AATATATGAA --/TG TGTATATATA 3070 hom 65 het 25 0 22 3 TG 1 2 10078 CASAVA_Build X 125413913 1D AAGATACCTG A/- AAATGTGGAA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 A 4 3 10079 CASAVA_Build X 125416959 3I GTTTGCTAGG ---/AGA AGGAGAGAAC 3070 hom 119 het 46 0 37 9 AGA 0 1 10080 CASAVA_Build X 125419372 3I ACAAACAAAC ---/AAA AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 9 12 10081 CASAVA_Build X 125428414 4I TTGAAAAGTT ----/AAAG AAAACACATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAAG 0 1 10082 CASAVA_Build X 125429900 1D TTTGCACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 32 9 T 11 10 10083 CASAVA_Build X 125431237 2D TCTTCCAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 14 12 10084 CASAVA_Build X 125446121 3D TAAAAGAAAG CCA/--- CCACACCACA 3070 hom 54 het 22 0 19 5 CCA 2 1 10085 CASAVA_Build X 125447537 3I TAAAATCTCA ---/AAT AATAATAAAA 3070 het 11 hom 25 1 21 3 AAT 2 3 10086 CASAVA_Build X 125451510 1I GAAAGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 10 11 10087 CASAVA_Build X 125451592 2I CAATAATGAT --/AA GACTCCAATT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 0 2 10088 CASAVA_Build X 125460085 2I TTAGCCACTA --/TG TGTGTGCTAA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TG 3 4 10089 CASAVA_Build X 125466150 2D TAAAACCTTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 6 5 10090 CASAVA_Build X 125476492 1I CAATGAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 865 hom 44 2 31 11 T 10 11 10091 CASAVA_Build X 125477301 4I ACTAAATATG ----/TATA TATATATATA 3070 het 1678 hom 18 5 9 4 TA 5 7 10092 CASAVA_Build X 125490163 1D GGTATGCCTG T/- ATTCAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 T 1 0 10093 CASAVA_Build X 125518295 1I CAGAAAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1318 hom 46 5 24 17 T 13 14 10094 CASAVA_Build X 125551028 1D CTATTTTTAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 T 8 7 10095 CASAVA_Build X 125554883 1I GCATGCTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2279 hom 21 6 11 4 T 9 10 10096 CASAVA_Build X 125559825 1D GAAACTTATT G/- TACAATAAAG 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 G 1 0 10097 CASAVA_Build X 125574831 1I CTATATATAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 8 9 10098 CASAVA_Build X 125584150 1D TTTTCTTGTG C/- CCCCCCCCTT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 C 9 8 10099 CASAVA_Build X 125594652 4D TGTACCACAT TTTC/---- TTTATCTATT 3070 het 3070 hom 63 28 32 4 TTTC 1 0 10100 CASAVA_Build X 125596590 2D AAAATTCCTC TT/-- GTTATTAATT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 2 0 10101 CASAVA_Build X 125597444 1D ATCCATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 904 hom 35 4 13 19 T 17 16 10102 CASAVA_Build X 125608662 1I GCTCTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 10 11 10103 CASAVA_Build X 125612411 1I AGTACAACAC -/A ATAAGATATT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 1 2 10104 CASAVA_Build X 125666158 14D ATATATATAT ATATATATATACAC/-------------- ACACACACAC 3053 het 1412 hom 12 5 7 0 ATATATATATACAC 1 0 10105 CASAVA_Build X 125667007 1I GGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2771 hom 27 10 12 5 A 10 11 10106 CASAVA_Build X 125682754 6D TGCATTTAGA TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 het 266 hom 33 4 16 15 TC 12 9 10107 CASAVA_Build X 125686275 26D CAAAATTGAT TTCCTATTATTATTATTTCTATTCAG/-------------------------- TTTTGTCCCC 3070 het 3070 ref 43 31 15 5 TTCCTATTATTATTATTTCTATTCAG 1 0 10108 CASAVA_Build X 125700214 5I GAGTTTTCTT -----/AAAGC AAAGCATTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AAAGC 1 2 10109 CASAVA_Build X 125707896 1I TGGCTATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 22 6 A 10 11 10110 CASAVA_Build X 125717982 1D GAGTTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 A 9 8 10111 CASAVA_Build X 125729618 1I ATTCCATGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 9 10 10112 CASAVA_Build X 125742312 4D TCTTTTTTTC TTTT/---- TTTTCTTTTT 3070 het 2371 hom 27 8 18 1 T 8 4 10113 CASAVA_Build X 125748016 1I AGTTTTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2355 hom 25 9 13 3 A 10 11 10114 CASAVA_Build X 125755920 2D TATATTCCAC AT/-- GTTTTGATAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AT 1 0 10115 CASAVA_Build X 125768250 1D ATGCTTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 7 A 11 10 10116 CASAVA_Build X 125771758 1I GTTCTAATTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3002 hom 36 10 16 10 T 9 10 10117 CASAVA_Build X 125778509 1I ATTGTGACAG -/T ATTAAGAGGT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 0 1 10118 CASAVA_Build X 125795957 1D CATATACCAT A/- AAAATGCCCC 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 5 4 10119 CASAVA_Build X 125800644 5D CAAGCCATAT GTTAG/----- GTCACAAAAC 3070 het 3070 ref 35 20 15 1 GTTAG 1 0 10120 CASAVA_Build X 125810036 1D GAAGAGATAG A/- AAAAAAAAAA 2918 het 2203 hom 33 8 12 13 A 14 13 10121 CASAVA_Build X 125815995 1D ACCTTTTGTA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 45 25 14 7 T 8 7 10122 CASAVA_Build X 125819031 1D AGCAATATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 12 11 10123 CASAVA_Build X 125829393 2D GCAGTTTTTC AG/-- GCTCTTAGTA 1803 het 1803 ref 36 29 4 3 AG 1 0 10124 CASAVA_Build X 125829582 2I GCTACAGGGT --/AC ACAGCCCATT 2229 het 2229 ref 17 8 6 3 AC 1 2 10125 CASAVA_Build X 125840083 1D CTTTCAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 19 9 T 11 10 10126 CASAVA_Build X 125841054 3I39M1D GATTCCCACT ---CTCTGAGGACATAGTCTTCCCTTCAACTCTCCTAAGTGGT/CTCCTCTGAGGACATAGTCTTCCCTTCAACTCTCCTAAGTGG- GTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 51 29 37 6 N/A 0 0 10127 CASAVA_Build X 125849990 1D ATTATTAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 55 26 24 7 A 9 8 10128 CASAVA_Build X 125854475 1I ACAAGAATAG -/A AAACCCCATG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 3 4 10129 CASAVA_Build X 125854887 4I AGGGATAAAC ----/AAAA CAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 0 4 10130 CASAVA_Build X 125863124 1D AGGATAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 13 11 A 12 11 10131 CASAVA_Build X 125866773 1I ACAGAACTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 9 9 A 9 10 10132 CASAVA_Build X 125879186 1I CTTTCTAGAA -/T TTTTAATTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 4 5 10133 CASAVA_Build X 125892976 1D TTTAATTTGA T/- TTTTTGTATA 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 6 5 10134 CASAVA_Build X 125930473 1I TTTCTCTCTA -/T TTTTCTCTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 4 5 10135 CASAVA_Build X 125934617 1D AAGAAAAGAA T/- TCAAACATAT 3070 hom 131 het 50 0 43 7 T 2 1 10136 CASAVA_Build X 125936302 1I ACATTGCTAT -/A AATAACTATT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 2 3 10137 CASAVA_Build X 125947241 1D TGGAACGTTT A/- AAAAAAAAAA 1001 het 1001 ref 24 6 7 11 A 19 18 10138 CASAVA_Build X 125965529 1I AAATGAGATA -/T TTTTAGCTAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 4 5 10139 CASAVA_Build X 125979004 1D TATGAAAGAT G/- TTTTTCTAAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 G 1 0 10140 CASAVA_Build X 125991211 1D AGAAATTATT A/- CTGAAACATT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 A 1 0 10141 CASAVA_Build X 126000740 5D GTTGGAAAGA GGGGG/----- CTGAACAAAT 3070 het 3070 hom 51 21 25 7 G 5 0 10142 CASAVA_Build X 126005522 1I4M1I CTACAGATTC -ATGT-/AATGTA ATTTCTATCA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 N/A 0 0 10143 CASAVA_Build X 126005626 1I TCTCTGTGCT -/A AGTTTTGGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 2 10144 CASAVA_Build X 126034053 26D CTTAGTATTG AATTTCTTAGTATTGTTAATTTTTCT/-------------------------- TTCTGGCTAT 3070 hom 63 het 16 0 22 2 AATTTCTTAGTATTGTTAATTTTTCT 1 0 10145 CASAVA_Build X 126044069 1D AATACTAAGC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 8 7 10146 CASAVA_Build X 126046031 4I ACAGAAATAA ----/TTAT TTAAGTAAAA 3070 hom 42 het 20 0 14 6 TTAT 0 1 10147 CASAVA_Build X 126048872 5D TTCTTTCTTA TTTAT/----- TTTATTTTAG 3070 het 3070 ref 44 24 18 3 TTTAT 2 1 10148 CASAVA_Build X 126052570 1D CAACTGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 30 0 26 4 T 13 12 10149 CASAVA_Build X 126057526 2D TAATTTTTTC AG/-- AGAGTTGTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AG 3 2 10150 CASAVA_Build X 126059677 1I TTTTTAAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 10151 CASAVA_Build X 126060174 2I CAAAAAATAC --/AA GAGAAACTGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 0 2 10152 CASAVA_Build X 126063754 1D TGTCAAAGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 10 9 10153 CASAVA_Build X 126078360 3D GTATTATTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1607 hom 3 het 8 0 6 2 T 15 12 10154 CASAVA_Build X 126087591 6D TGTAAAACAT AGAAAA/------ AGAAAAAAAT 3070 hom 114 het 38 0 39 1 AGAAAA 2 1 10155 CASAVA_Build X 126093240 2D AATAAATCTA AT/-- ATATATATTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AT 5 4 10156 CASAVA_Build X 126096097 1I ATTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 10 10157 CASAVA_Build X 126100040 1D GAAAAGGGTG T/- CCCCTTTGGT 3070 hom 132 het 46 0 45 2 T 1 0 10158 CASAVA_Build X 126105042 1D ACAGGTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 684 hom 35 4 13 18 A 17 16 10159 CASAVA_Build X 126111623 1I TGATGGACAC -/T TTGAGTTGTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 2 3 10160 CASAVA_Build X 126112767 4I CAAAAAAAAA ----/AAAT GTTGTTGGGT 3070 hom 75 het 36 0 26 10 AAAT 0 1 10161 CASAVA_Build X 126117484 1D CAGAGGACGA T/- TTTTTTTTTT 1230 het 1230 ref 30 20 3 9 T 11 10 10162 CASAVA_Build X 126120337 1I AAGATGGGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 A 9 10 10163 CASAVA_Build X 126138836 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 2527 het 1715 hom 20 9 11 1 TA 7 6 10164 CASAVA_Build X 126141242 1I ATTTAGAAAC -/T ATTGTTATGT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 T 0 1 10165 CASAVA_Build X 126143720 1D GTTTGCAGAC A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 A 8 7 10166 CASAVA_Build X 126143895 1D CCCCAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 A 11 10 10167 CASAVA_Build X 126147886 9D AGGATTACAA ACGTGAGCC/--------- ACCGTGCCCG 2115 het 1966 hom 12 4 7 5 ACGTGAGCC 1 0 10168 CASAVA_Build X 126150270 1D TATGCAACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 A 10 9 10169 CASAVA_Build X 126160499 4D TTTTGTAAGA CCTC/---- CCTCAAAAGC 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 CCTC 2 1 10170 CASAVA_Build X 126166591 1D GCTGGATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 A 11 10 10171 CASAVA_Build X 126174658 1D TTTAGTAATG C/- CTTAATAAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 C 2 1 10172 CASAVA_Build X 126195755 4D ACTGAGACTT AAAG/---- AAGATAAATG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 AAAG 1 0 10173 CASAVA_Build X 126196216 1D TTATCTATTA T/- ATTTGTAATT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 1 0 10174 CASAVA_Build X 126203125 1I TTGTAAAAGT -/A AAAGCTAGGT 3070 het 3070 hom 20 7 12 1 A 3 4 10175 CASAVA_Build X 126204027 3I1M4D GGCTGTGGGC ---TGTGG/CCAT---- GCTCATGGAA 3070 het 3070 ref 57 30 24 5 N/A 0 0 10176 CASAVA_Build X 126204834 1I GTTACAGAAA -/C AAAGACTGTA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 C 0 1 10177 CASAVA_Build X 126208975 1D AACTCTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 10 9 10178 CASAVA_Build X 126209398 1D GCATGTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 A 11 10 10179 CASAVA_Build X 126211861 2I AAAATATATA --/GT GTATATATAT 1091 het 841 hom 6 3 3 0 GT 1 2 10180 CASAVA_Build X 126239511 21I TACTTTGAAA ---------------------/TTGTGGTAGTATAAGGCCGAC TCCTGGATAT 3070 het 3070 hom 45 19 25 3 TTGTGGTAGTATAAGGCCGAC 0 1 10181 CASAVA_Build X 126239651 3D CATTTAAAAA TAT/--- TATTGTGAAG 3070 het 3070 ref 48 27 18 6 TAT 2 1 10182 CASAVA_Build X 126240946 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1992 hom 24 8 10 6 A 15 14 10183 CASAVA_Build X 126247091 1D CTTGTTTTAT C/- TGCTCAGTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 C 1 0 10184 CASAVA_Build X 126249971 1I AATGAGATGT -/G GGGGGGGAGT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 G 7 8 10185 CASAVA_Build X 126259514 1D TTAGTTAGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 T 9 8 10186 CASAVA_Build X 126261564 1D TTAAAGAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1162 hom 39 9 14 17 A 17 16 10187 CASAVA_Build X 126262493 1D TTTTATTACC T/- TTTTCTACTA 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 T 5 4 10188 CASAVA_Build X 126266285 6I TAGGAATGAT ------/AATAAG AATAAGAATA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 AATAAG 2 3 10189 CASAVA_Build X 126271078 2I CAATTGAAAA --/AG AGGGACTCCT 1896 het 1896 ref 21 12 4 5 AG 1 2 10190 CASAVA_Build X 126271241 1I GCAGCACAAC -/A AAAATCTTAT 2176 het 2176 ref 14 8 6 0 A 4 5 10191 CASAVA_Build X 126273556 4I TAAAAAATGA ----/ATAG ATAAATATTA 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 ATAG 0 1 10192 CASAVA_Build X 126275741 3I TAGGGAATAA ---/TAT TAATATACTT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 TAT 0 1 10193 CASAVA_Build X 126278827 22D TCTTTTGCTC CTCTGGAGGTGGTTGAAAGGAA/---------------------- CTCTGGAGGT 1392 het 1392 ref 19 15 3 4 CTCTGGAGGTGGTTGAAAGGAA 2 1 10194 CASAVA_Build X 126287858 1I ATTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 14 15 7 A 9 10 10195 CASAVA_Build X 126299337 4I GCTTTCCCCG ----/ATGT ATATTCTTGG 3070 het 3070 ref 40 28 11 1 ATGT 0 1 10196 CASAVA_Build X 126299586 1D TTTAGGACTA T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 T 7 6 10197 CASAVA_Build X 126303864 2I ATTTTCTTGA --/AC AGTTATACAA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 AC 0 1 10198 CASAVA_Build X 126304142 1I CATAATAAAG -/A AAAAAAAAAA 1405 het 1405 ref 36 29 4 3 A 11 12 10199 CASAVA_Build X 126310694 4I TGTGTTGAGA ----/TTAT TCATTTACAG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TTAT 0 1 10200 CASAVA_Build X 126311069 9D TTGCTTCACA GTGCAGTAG/--------- GTGCAAATAA 3070 het 3070 hom 33 14 19 2 GTGCAGTAG 1 0 10201 CASAVA_Build X 126313284 1D CATTTTGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 10 9 10202 CASAVA_Build X 126314460 1D14M1D GATTACTACG TTAATATTAAAGAGAT/-TAATATTAAAGAGA- TTTTTTTTTT 3070 het 935 hom 24 3 13 13 N/A 0 0 10203 CASAVA_Build X 126318736 1I TACATTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 10 11 10204 CASAVA_Build X 126320506 4D TTTCTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTG 2903 het 1089 hom 21 6 10 6 TTTC 3 2 10205 CASAVA_Build X 126329900 1D AAACTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 1805 het 513 hom 12 3 6 3 A 15 14 10206 CASAVA_Build X 126335450 1I CTGCAGGCCT -/G GTAGTGAAGG 3070 hom 160 het 58 0 54 4 G 1 2 10207 CASAVA_Build X 126338554 1I CAAAACCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2363 hom 30 9 12 9 A 10 11 10208 CASAVA_Build X 126343263 2I TTTATTGAAC --/AG AGAGTCCTTA 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 AG 2 3 10209 CASAVA_Build X 126347749 1D AGTCAATCTG A/- CACAACTGGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 0 10210 CASAVA_Build X 126348633 1I GCTTGAGCCA -/C CGTGCCCGGC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 1 2 10211 CASAVA_Build X 126349954 3I TGAAGAAAAT ---/AAG AAACAAAAAT 2907 het 2907 ref 29 18 7 4 AAG 0 1 10212 CASAVA_Build X 126372826 1I TGGGCGGATT -/C CCTCTGGCTA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 2 3 10213 CASAVA_Build X 126384674 1I TGTGGGGGAT -/G GGAGTGTGGT 3070 hom 79 het 33 0 24 9 G 2 3 10214 CASAVA_Build X 126392366 1I GTGGAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 11 12 10215 CASAVA_Build X 126407367 1D AAAATGTTTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 41 19 17 6 A 9 8 10216 CASAVA_Build X 126415356 4I AGACACTGAC ----/TAAT TATAACAATT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 TAAT 0 1 10217 CASAVA_Build X 126431437 1D GGTAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2949 hom 42 12 23 8 A 11 10 10218 CASAVA_Build X 126435607 1I AAGGAAATCC -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 23 8 10 5 A 7 8 10219 CASAVA_Build X 126437067 3D TCATTCAACA ACC/--- ACCACAGAAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 ACC 2 1 10220 CASAVA_Build X 126437905 2I AATTACCACC --/AA AAAAGAAGTC 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 4 6 10221 CASAVA_Build X 126438739 1I29M1I TCTATACACC -ACAGCAACCAAGCTGAGAATCAAATAAAG-/AACAGCAACCAAGCTGAGAATCAAATAAAGA ACTCAACCAC 3070 hom 36 het 16 0 13 7 N/A 0 0 10222 CASAVA_Build X 126445153 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1057 hom 13 4 9 0 T 10 11 10223 CASAVA_Build X 126447587 3I TTATATTATT ---/TTC TTCATTTCTT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 TTC 1 2 10224 CASAVA_Build X 126460728 3I ACTGGTGCAA ---/CTT CTTAAATCCT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 CTT 1 2 10225 CASAVA_Build X 126464230 1D ATAAAACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 12 11 10226 CASAVA_Build X 126465039 1D TTGTAGGAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 10 9 10227 CASAVA_Build X 126477485 1D CAATATTAGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 T 8 7 10228 CASAVA_Build X 126480446 2I TCCTTAAGAT --/TA TATATATATA 2297 het 2297 ref 29 17 8 4 TA 6 7 10229 CASAVA_Build X 126484326 2D AAACTGAAGG AT/-- ATATATATAT 2363 het 2363 ref 35 23 5 7 AT 8 7 10230 CASAVA_Build X 126486466 1I AATTTATAAG -/A AAAAAAACAA 2385 het 2385 ref 21 12 6 3 A 7 8 10231 CASAVA_Build X 126487056 1I ACACAAGAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 9 10 10232 CASAVA_Build X 126497178 1I AGGGCGTGGC -/A ATATTAAGCA 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 A 1 2 10233 CASAVA_Build X 126499285 1D TCTTTCCTTA T/- AATGTCATAA 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 T 1 0 10234 CASAVA_Build X 126505417 1I GGTAAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 1242 het 1242 ref 13 6 4 3 T 10 11 10235 CASAVA_Build X 126517270 4D TGCTTTCAGA TCTT/---- TCTATTTTGT 3070 het 3070 ref 38 21 17 1 TCTT 1 0 10236 CASAVA_Build X 126530510 2D TAGTTCCCAC AT/-- ATGAGTCAGA 3070 het 3070 ref 50 29 18 4 AT 2 1 10237 CASAVA_Build X 126539932 1I CACCCCCTCT -/C CCCACCACCA 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 C 3 4 10238 CASAVA_Build X 126553181 1I TTTCCTTCAT -/G GGGTTATTCA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 G 3 4 10239 CASAVA_Build X 126562159 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 25 3 19 3 A 15 14 10240 CASAVA_Build X 126563238 4I ATTTTCTTTT ----/TTTC TTTCTTTTTT 3070 het 3069 hom 33 11 16 6 TTTC 1 2 10241 CASAVA_Build X 126575518 1I AATACAAATC -/A AAAAATTCTT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 5 6 10242 CASAVA_Build X 126579089 1I ATGGACCAAT -/G GGGACAGAAT 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 G 3 4 10243 CASAVA_Build X 126579178 4I GTGGGAAAAG ----/GACA GACAGTCTCT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 GACA 1 2 10244 CASAVA_Build X 126579606 3I AATAATAATA ---/AGG AGAATTTTAA 2722 het 2722 ref 22 10 8 4 AGG 0 1 10245 CASAVA_Build X 126586808 1I GTGAAGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 12 11 A 10 11 10246 CASAVA_Build X 126587256 10D TTGTGATGCC AAGGTGTTAT/---------- GTGGAATACG 3070 het 3070 ref 64 35 28 6 AAGGTGTTAT 1 0 10247 CASAVA_Build X 126595692 1D GTAAAGAGAC T/- TTTTTTTTTT 1590 het 1590 ref 36 14 6 16 T 15 14 10248 CASAVA_Build X 126601581 1I CTGCCCACTT -/A AAAAAATTAT 3070 hom 125 het 50 0 42 8 A 6 7 10249 CASAVA_Build X 126606072 4I AATTGAGTCT ----/CAGA CAATCTTAGC 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 CAGA 0 1 10250 CASAVA_Build X 126630728 2I TACGATTTCT --/CA GTTTGATTTT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 CA 0 1 10251 CASAVA_Build X 126635757 1I TGGGCAAAAC -/A AAATGAAGAT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 A 3 4 10252 CASAVA_Build X 126637079 1D TATGTACCAC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 T 8 7 10253 CASAVA_Build X 126656134 5D TTCCTTCCTT CTTTC/----- CTTTCTTGTT 3070 het 3070 ref 49 23 20 8 CTTTC 2 1 10254 CASAVA_Build X 126659191 3D GTGAAATAGG ACT/--- ACATTTTCAT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 ACT 1 0 10255 CASAVA_Build X 126661758 2I CTCAAGTGAG --/TA TATGACACTA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 TA 1 2 10256 CASAVA_Build X 126664675 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 502 hom 25 6 13 6 A 15 14 10257 CASAVA_Build X 126669943 1I GGCCCTTAGG -/C CTTGAATAAA 3070 hom 123 het 49 0 41 8 C 1 2 10258 CASAVA_Build X 126670405 1I13M1I GGACAGGAGA -GGATGGGTAAAGA-/GGGATGGGTAAAGAG GAATTTGTCT 3070 hom 119 het 39 0 40 3 N/A 0 0 10259 CASAVA_Build X 126671137 1D CTTTCAGGCC T/- TTCAACCACA 3070 hom 90 het 36 0 30 7 T 3 2 10260 CASAVA_Build X 126704021 3D GGAGTTTAGT TAA/--- TAATAATGTG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 TAA 3 2 10261 CASAVA_Build X 126707706 1I48M1I TATGGTGAAA -CCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTGGTGGCGCATG-/CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTGGTGGCGCATGC CTGTAGTTCC 3070 hom 54 het 18 0 19 1 N/A 0 0 10262 CASAVA_Build X 126710083 2I TATTATTAGT --/TG GTGTTTATAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 TG 0 1 10263 CASAVA_Build X 126714216 1I CTCCAGAGAG -/T TGTGTGCTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 10264 CASAVA_Build X 126730141 1D ATAGATGCAG A/- AAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 7 6 10265 CASAVA_Build X 126750705 1I GGTGACAGAC -/G GTACCTGGAA 3070 hom 68 het 28 0 22 6 G 1 2 10266 CASAVA_Build X 126758068 1I15M1I15M1I6M1I12M1I7M1I TGGATCACGA -GTCAGGAGATTCAGA-CATCCTGGCTAACAC-GTGAAA-CCTGTCTCTACT-AAAATAC-/GGTCAGGAGATTCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACA AAAAATTAGC 2498 hom 24 het 11 0 8 3 N/A 0 0 10267 CASAVA_Build X 126761159 4D AGTTTATTTC TTAT/---- TTATTACTTA 2860 het 2860 ref 25 14 9 3 TTAT 2 1 10268 CASAVA_Build X 126765695 1I76M1I CAATACCATG -AAAAAATTAAGAAATTAACTAATAATATAACGGATTTGTTCCTAAGCTTAACTAGATTAAATGAACATAGATTTAT-/AAAAAAATTAAGAAATTAACTAATAATATAACGGATTTGTTCCTAAGCTTAACTAGATTAAATGAACATAGATTTATA ATGCTATTGA 3070 hom 118 het 21 0 40 6 N/A 0 0 10269 CASAVA_Build X 126770374 1I ATAGAAATCG -/A AGGTTTTGGA 3070 hom 116 het 44 0 36 8 A 1 2 10270 CASAVA_Build X 126778140 1I GGGCACTTAG -/C CGTGCAGGAA 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 1 2 10271 CASAVA_Build X 126781558 1I14M1D GTAATAAAAG -CATCTGGCTGGGTGC/CCATCTGGCTGGGTG- CAGTGCCTCA 3070 hom 54 het 16 0 18 3 N/A 0 0 10272 CASAVA_Build X 126796225 1D TGTATATGTG T/- TTTCTGGGGC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 4 3 10273 CASAVA_Build X 126823945 1I CCACATGCAT -/C CCCTGTAGGC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 C 3 4 10274 CASAVA_Build X 126838837 5D ATTTTTTAAA TAACT/----- TAAGTATGAT 3070 het 3070 ref 32 20 11 2 TAACT 1 0 10275 CASAVA_Build X 126841560 1D GTGTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 12 11 10276 CASAVA_Build X 126850488 1D CTCTTTTACA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 32 het 33 0 26 7 T 8 7 10277 CASAVA_Build X 126853471 3D TGGTTTTTAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 30 11 T 13 10 10278 CASAVA_Build X 126862607 1I ATGGGAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 11 10279 CASAVA_Build X 126871851 9D GAGAACTCAT GAACACAAA/--------- GAAAACACAG 3070 hom 72 het 26 0 25 4 GAACACAAA 1 0 10280 CASAVA_Build X 126876689 2I CAATATACAA --/AT ATGTCTTAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AT 1 2 10281 CASAVA_Build X 126885147 1I CAAACCATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 10 11 10282 CASAVA_Build X 126900036 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 23 0 18 5 T 10 9 10283 CASAVA_Build X 126904868 1D TATTTCAAAA T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 6 5 10284 CASAVA_Build X 126906163 3D TGAGGACATG ATA/--- ATATGTGGGA 3070 het 3070 hom 53 22 29 2 ATA 2 1 10285 CASAVA_Build X 126907353 1D AAGTTACAGA G/- CAGGAGTGGA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 G 1 0 10286 CASAVA_Build X 126922050 1D GTGATTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 32 1 24 7 T 11 10 10287 CASAVA_Build X 126933757 1D CTTTAATTTG T/- TAAAAAAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 10288 CASAVA_Build X 126936211 1I TGCTGGCCTG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 77 het 35 0 25 10 T 7 8 10289 CASAVA_Build X 126936503 1I TTTGGGCAGA -/C CCCTTTTGGG 3070 hom 169 het 61 0 57 4 C 3 4 10290 CASAVA_Build X 126940705 4D GTAAACTAAT AACA/---- AACCTTTTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AACA 1 0 10291 CASAVA_Build X 126941505 5I TTTCCACATG -----/AAAAT AAAATAATAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AAAAT 1 2 10292 CASAVA_Build X 126943008 1D AGAAGGTAAT G/- TTTATTCCTG 3070 hom 72 het 25 0 25 1 G 1 0 10293 CASAVA_Build X 126951012 1I ATCCAAAAAT -/G TTTTTAAAAT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 0 1 10294 CASAVA_Build X 126957219 1I AAGAAGACAG -/A AAGAAGGTCA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 A 2 3 10295 CASAVA_Build X 126957953 4D AAATAATAAG AATT/---- AGAGCAGAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AATT 1 0 10296 CASAVA_Build X 126959261 1I TGCCATATAC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 9 A 6 7 10297 CASAVA_Build X 126963092 1D AGCCAACATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 A 9 8 10298 CASAVA_Build X 126964496 2I CTTTAAAAAT --/AA AAAAAAATCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 9 10299 CASAVA_Build X 126967979 2D CGTGCGCGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 118 het 52 0 37 15 CA 10 9 10300 CASAVA_Build X 126968566 1D CCATATTTAG T/- TTTTTTAGAA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 7 6 10301 CASAVA_Build X 126970293 1D GGGATGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 33 1 23 10 T 11 10 10302 CASAVA_Build X 126970683 1I CATGAACATA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 56 het 26 0 19 7 T 9 10 10303 CASAVA_Build X 126971493 1D AAAACACTTC T/- TTCCATCATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 3 2 10304 CASAVA_Build X 126976370 1I GGCAGCTGTG -/C CCCTGTGGCT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 C 3 4 10305 CASAVA_Build X 126985790 1D19M1I GCCTGTAAAA TTCAAAAGCAGGTTAGTAAC-/-TCAAAAGCAGGTTAGTTACT TCCTAGATAC 3070 hom 75 het 25 0 23 10 N/A 0 0 10306 CASAVA_Build X 126986654 1I3M1I14M1I8M1I10M1I GTGATTAACA -TCA-CTCCTTGTCACTTA-TATGCAAA-TTCTGCAGCT-/TTCAGCTCCTTGTCACTTATTATGCAAATTTCTGCAGCTG GCTTGAATTT 3070 hom 75 het 22 0 26 3 N/A 0 0 10307 CASAVA_Build X 126988060 1D GTTTTTACCA C/- CAGAGAAATA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 C 2 1 10308 CASAVA_Build X 126991092 1I CATCAATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 764 hom 39 5 24 10 A 15 16 10309 CASAVA_Build X 126997094 1I GGATGAATAC -/A AATAAGCTGA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 2 3 10310 CASAVA_Build X 127007344 1I TTATGTAGAC -/T TGATTGTGTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 1 2 10311 CASAVA_Build X 127056787 1I ACACTCTACA -/T TTGGGTCTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 3 10312 CASAVA_Build X 127061244 1I CTCCCTCCCC -/T TTTCCCCAGC 3070 hom 39 het 15 0 14 2 T 3 4 10313 CASAVA_Build X 127071309 1D AGATTATTAG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 T 8 7 10314 CASAVA_Build X 127071764 1I GTTTACCGTA -/G GTGTGTGCAT 3070 hom 75 het 27 0 24 3 G 1 2 10315 CASAVA_Build X 127071912 1D AGTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2507 het 2507 ref 40 17 10 13 T 17 16 10316 CASAVA_Build X 127075366 1I CTAAGTATCC -/A AGTATCTCAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 2 10317 CASAVA_Build X 127077693 1I17M1I7M1I7M1I11M1I AGACAAGTTT -CTTGACTCTGAAAGAAC-AAACAAA-GATCAGC-AGTTTTTAAGC-/CCTTGACTCTGAAAGAACAAAACAAAGGATCAGCAAGTTTTTAAGCA AAAAGTCAAA 3070 hom 111 het 31 0 38 5 N/A 0 0 10318 CASAVA_Build X 127084972 1I TTTTGTCCAG -/A AAAAAAAAAA 2024 het 2024 ref 42 30 5 7 A 11 12 10319 CASAVA_Build X 127104884 1I CTCTAAAAGG -/A AAGCTACAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 3 10320 CASAVA_Build X 127114970 1I AAAGGAATAT -/A AATTATTCTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 2 3 10321 CASAVA_Build X 127117094 1I AATGGGTCAG -/T TTGTGTTTCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 2 3 10322 CASAVA_Build X 127121309 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2918 het 14 hom 17 1 10 6 T 15 13 10323 CASAVA_Build X 127136088 1D AATCTGAGAA T/- TCTATATACT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 2 1 10324 CASAVA_Build X 127154807 1I TCCAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 10 11 10325 CASAVA_Build X 127159654 1D TTCAAAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 53 1 44 9 A 11 10 10326 CASAVA_Build X 127164640 1I CTGAATGGGC -/A AAAACTGGAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 4 5 10327 CASAVA_Build X 127166903 1I CTTTAACAAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 10328 CASAVA_Build X 127167747 2I AAAAGTTGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 12 14 10329 CASAVA_Build X 127172660 1D TAGAAAAATG T/- TAAGTTACAA 3070 hom 71 het 28 0 23 5 T 2 1 10330 CASAVA_Build X 127177461 1D AAATGAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 446 hom 27 1 19 7 A 10 9 10331 CASAVA_Build X 127183029 1D AAAACATAAA T/- GTTCCTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 1 0 10332 CASAVA_Build X 127186128 1I GCAATTGCAA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 7 8 10333 CASAVA_Build X 127202235 2D TATAGGAAAC AT/-- GTGTTGTCTG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 AT 1 0 10334 CASAVA_Build X 127202600 1I ACAATAAATA -/T ATTTGTATAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 1 10335 CASAVA_Build X 127206093 4D TTGAATATGA TAAT/---- TAATATATGC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TAAT 2 1 10336 CASAVA_Build X 127213002 1D AAAACATTAC T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 7 6 10337 CASAVA_Build X 127223930 1D AGAATAGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 44 0 37 9 T 10 9 10338 CASAVA_Build X 127224984 1I TTGTTAGAAG -/A AACATTTGTC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 2 3 10339 CASAVA_Build X 127228789 4I TCAACGTATT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TC 7 9 10340 CASAVA_Build X 127244798 1D AGGTTATTTT A/- AAAAGGTATT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 5 4 10341 CASAVA_Build X 127372347 1I ATATCTTAGG -/T TTTTCTTTTT 3070 het 423 hom 40 2 34 4 T 4 5 10342 CASAVA_Build X 127380836 3I TGTCTACAAC ---/AGG AGAAGGCTCT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 AGG 0 1 10343 CASAVA_Build X 127401161 3I AGAAAAAAAT ---/ACC ACATTAGCCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ACC 0 1 10344 CASAVA_Build X 127402412 5I TTTACTACTT -----/AATTA TTCAACTTAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AATTA 0 1 10345 CASAVA_Build X 127425176 1I CTCTTCCACC -/T TCCCCAAGTC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 1 2 10346 CASAVA_Build X 127428983 1D CCGCTGTAAT A/- AATTGGGAAT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 A 3 2 10347 CASAVA_Build X 127429141 1D TAATCCTTGA T/- TTTTTCTTGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 6 5 10348 CASAVA_Build X 127470928 6D GGTTTATGTA TTATTT/------ TTATTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 9 TTATTT 3 2 10349 CASAVA_Build X 127471184 1D TTTTTTTAAC A/- AAAAAAAAAA 2618 het 2618 ref 24 11 9 5 A 11 10 10350 CASAVA_Build X 127472297 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 17 1 12 4 A 10 11 10351 CASAVA_Build X 127477910 1D23M1D CGGGTTTCAG TTTCCCTTTTAGGGCCAGGCCCCTC/-TTACCATATAAGACAAGGCACCT- AAGGTGCATA 3070 hom 66 het 20 0 23 5 N/A 0 0 10352 CASAVA_Build X 127506816 1D CTATTGCATT C/- CCTTTGGTCA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 C 3 2 10353 CASAVA_Build X 127507216 1D AGGTGATGTG T/- TTTTTCTTGC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 6 5 10354 CASAVA_Build X 127536713 1I TTCAAGACAC -/A AGAAGTGAAA 3070 hom 108 het 43 0 35 8 A 1 2 10355 CASAVA_Build X 127543984 2I ACATCAGCCC --/CT GATTGGTCCA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 CT 0 1 10356 CASAVA_Build X 127582797 1I AAGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 31 het 26 1 23 2 A 9 10 10357 CASAVA_Build X 127601407 4D CAAAAGAGAA TATC/---- TACGTTGGAT 3070 het 3070 ref 32 15 16 4 TATC 1 0 10358 CASAVA_Build X 127605966 1D ACTTCAAAAG T/- TTTTTTATAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 6 10359 CASAVA_Build X 127619950 1I CCTGTTAAAG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 6 7 10360 CASAVA_Build X 127627139 1I AAATGATTTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 51 28 15 8 A 8 9 10361 CASAVA_Build X 127644796 1I GTATTTTCAT -/A AACATCTTGA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 2 3 10362 CASAVA_Build X 127682984 1D TTCATCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 29 1 20 8 T 13 12 10363 CASAVA_Build X 127703439 2I TCTCTCTAGC --/TT TTTTTTTTTT 1140 het 1140 ref 31 6 4 21 T 14 16 10364 CASAVA_Build X 127738804 1D ATATTCTGGG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 8 7 10365 CASAVA_Build X 127762878 1I GCAGATAAGT -/A AAACTAAAAA 3070 hom 42 het 23 0 14 9 A 3 4 10366 CASAVA_Build X 127772631 1I AGTATAATGG -/C CTCCAGCTCC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 1 2 10367 CASAVA_Build X 127779200 1I GGGGGAAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 8 9 10368 CASAVA_Build X 127779990 1D TAAATCATCA T/- AAAAAGGTTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 1 0 10369 CASAVA_Build X 127786066 3D AGGGTATGAA GTG/--- GTGACTATTG 3070 hom 167 het 59 0 52 10 GTG 2 1 10370 CASAVA_Build X 127813866 1D CCATGGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 52 0 40 12 A 11 10 10371 CASAVA_Build X 127817880 1I12M1I11M1I AAAGAGAGAG -AAATAGGCATAG-AAAAGTAGGAC-/AAAATAAGCATAGAAAAAGTAGGACA AATAGAAGGT 3070 hom 129 het 38 0 44 1 N/A 0 0 10372 CASAVA_Build X 127828428 2I ATTACTATTA --/TT TTTATTTTAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 3 5 10373 CASAVA_Build X 127847671 10I TGATAACCAA ----------/AGGGTTTCTG ATTGAATTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AGGGTTTCTG 0 1 10374 CASAVA_Build X 127857562 2D ATAAAAAGTG TC/-- TGGCAACTAG 3070 hom 123 het 51 0 42 10 TC 1 0 10375 CASAVA_Build X 127868698 1D TGCCACAATC A/- ATGAACATTG 3070 hom 151 het 61 0 51 10 A 2 1 10376 CASAVA_Build X 127870957 1I CAAAAAGAAG -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 76 het 41 1 39 1 A 7 8 10377 CASAVA_Build X 127873964 2D ACTTTAAGCC AA/-- AAAAAATATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 6 10378 CASAVA_Build X 127880442 1D AGTAATAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 hom 56 het 21 0 18 3 T 3 2 10379 CASAVA_Build X 127882470 6I CAGAATTTCT ------/TAAAAG TTACACCTCC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TAAAAG 0 1 10380 CASAVA_Build X 127883327 1I CAATAGAATA -/T TTCTATGTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 2 3 10381 CASAVA_Build X 127888824 4I TAAGAGAATG ----/GTTA ATTAAAGTAG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 GTTA 0 1 10382 CASAVA_Build X 127897492 1I CTGGGGAGCA -/G GGTCTATAGG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 G 2 3 10383 CASAVA_Build X 127898787 2I GTGTGTATAT --/AC ACACACACAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AC 4 5 10384 CASAVA_Build X 127919540 1D TATTCTCAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 10 9 10385 CASAVA_Build X 127925639 2D GGAAACAATC AA/-- AGTGTCCATT 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 A 3 1 10386 CASAVA_Build X 127926242 2D TAGTAACCTG CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 1080 hom 31 5 19 7 C 11 9 10387 CASAVA_Build X 127950624 1I GGGTTTCAGC -/T TTTCTCCATT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 3 4 10388 CASAVA_Build X 127955512 1D ATCCTCCCAC A/- ATCAGCCTCC 3070 hom 56 het 20 0 16 5 A 2 1 10389 CASAVA_Build X 127961937 2D ATCTACAGCC TT/-- TTGTTTATTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 4 2 10390 CASAVA_Build X 127967379 1D GACATCTGTT C/- CCCCCCCCGC 712 het 712 ref 9 4 3 2 C 9 8 10391 CASAVA_Build X 128029699 1I ATTCAACCTT -/A AAAAAACAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 6 7 10392 CASAVA_Build X 128078644 1D CTTTTGGTCC T/- TTTTTTTTTT 608 het 608 ref 34 14 3 17 T 17 16 10393 CASAVA_Build X 128079524 1I GATTCGGCTT -/G GGTTTTTTAT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 G 2 3 10394 CASAVA_Build X 128083715 1D AAACACCTTT C/- CCCCACCCCC 3070 hom 111 het 42 0 36 6 C 5 4 10395 CASAVA_Build X 128087989 1D ACCTGAAATA G/- TACCCGCAGA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 G 1 0 10396 CASAVA_Build X 128089322 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1355 het 1355 ref 46 33 4 9 A 13 12 10397 CASAVA_Build X 128102937 2I CCGTTGCTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 11 13 10398 CASAVA_Build X 128103838 1I AAAAAAAAAA -/G AAAATTCTTA 3070 hom 67 het 29 0 18 11 G 0 1 10399 CASAVA_Build X 128104059 1D GGCTTTGAAC T/- TTTCCAAAAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 4 3 10400 CASAVA_Build X 128106929 3I AAAAATAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 94 het 39 0 32 7 AAG 3 4 10401 CASAVA_Build X 128117444 1I ACCTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1175 hom 32 4 20 8 T 13 14 10402 CASAVA_Build X 128152935 1I AAGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 9 10 10403 CASAVA_Build X 128154251 2D ATATATTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 29 1 19 9 A 14 12 10404 CASAVA_Build X 128161697 1D ATGGAGTTTT G/- CTCTTGTTGC 3070 het 1180 hom 13 3 10 0 G 1 0 10405 CASAVA_Build X 128169343 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 2261 het 1757 hom 14 4 6 4 T 10 9 10406 CASAVA_Build X 128188040 1D ACTAGACATG A/- AAAAAAAAAT 1342 het 1342 ref 46 40 3 3 A 10 9 10407 CASAVA_Build X 128200867 1I TTTGTACAGC -/T TTTTTCCGGT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 5 6 10408 CASAVA_Build X 128218738 1D TAGTTTTGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 85 het 33 0 29 4 A 10 9 10409 CASAVA_Build X 128239364 1I AGAAAATAAG -/A TGTTTACTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 0 1 10410 CASAVA_Build X 128243144 22D GAACTTTCAT CTTAGGGCTATGAACTTTTCCC/---------------------- CTTAGGGCTA 3070 hom 36 het 23 0 16 10 CTTAGGGCTATGAACTTTTCCC 1 0 10411 CASAVA_Build X 128244677 2I CAATTATTCT --/TA TGTTTGGTCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TA 0 1 10412 CASAVA_Build X 128273017 1D GGTTTTGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 737 hom 33 3 17 13 A 12 11 10413 CASAVA_Build X 128280963 9I CACAACAAAC ---------/TGCCCTGAT ATCTTGGGAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TGCCCTGAT 0 1 10414 CASAVA_Build X 128285622 2I AACGGAAAAT --/CA CATTTATGTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 CA 1 2 10415 CASAVA_Build X 128291158 5D ATTGAAAGAC AAATT/----- AAAGAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 AAATT 1 0 10416 CASAVA_Build X 128304724 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 10 9 10417 CASAVA_Build X 128322442 1D AGTAGAATTA G/- GTTCCATGAG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 2 1 10418 CASAVA_Build X 128327363 1D AGGACACAAA G/- GCATAAGAAT 3070 het 1174 hom 12 3 7 2 G 2 1 10419 CASAVA_Build X 128567197 4I AAACAAACAA ----/ACAG AAAACAACTT 3070 het 2547 hom 40 10 19 11 ACAG 0 1 10420 CASAVA_Build X 128595014 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2404 het 1874 hom 21 6 7 8 A 17 16 10421 CASAVA_Build X 128699529 1I GCCTCTGGGG -/C CCTCCAGGCT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 2 3 10422 CASAVA_Build X 128734106 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1290 het 1290 ref 29 22 3 4 T 11 12 10423 CASAVA_Build X 128789463 4I AGCAGCGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 66 het 28 0 21 7 TTTG 3 4 10424 CASAVA_Build X 128947518 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 977 het 977 ref 37 29 3 5 T 12 11 10425 CASAVA_Build X 128953827 1I GGCACAGTCG -/C TCACGCCTAT 3070 hom 63 het 26 0 20 6 C 0 1 10426 CASAVA_Build X 128955588 1I ATTACAGATG -/C CCCCCCCACC 2540 hom 24 het 11 0 7 4 C 7 8 10427 CASAVA_Build X 128956234 1I GTGTTTAACA -/G GCAGTTAACA 3070 hom 102 het 41 0 32 9 G 1 2 10428 CASAVA_Build X 128973229 9I3M7I AAAATACCAG ---------GGG-------/ACTTTCAGTGGGTAACTTC AGGGAGGCAG 3070 hom 54 het 19 0 19 2 N/A 0 0 10429 CASAVA_Build X 128981759 1I CTGGGGGCCA -/G GACCCCCGGG 3070 hom 57 het 24 0 18 6 G 1 2 10430 CASAVA_Build X 129004645 1I TTAATTAATT -/A AAAAAAAATA 1507 het 1491 hom 12 5 4 3 A 8 9 10431 CASAVA_Build X 129030880 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2362 het 315 hom 27 3 16 8 A 15 16 10432 CASAVA_Build X 129034573 5D CTCTCAGATT TCAGC/----- TTTATGGCTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TCAGC 1 0 10433 CASAVA_Build X 129040756 1I AGGGAGGGAA -/G GTTTTCTTTT 3070 hom 61 het 23 0 20 3 G 1 2 10434 CASAVA_Build X 129046597 1D AGGGGCTCCC T/- TTCTCCAGTG 3070 het 42 hom 31 1 22 10 T 3 2 10435 CASAVA_Build X 129049966 1I GTAGCTGGAA -/G CCAGGAGGTG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 0 1 10436 CASAVA_Build X 129053021 1I GAGGCAGAGG -/T TGCAGTGAGC 2183 hom 12 het 7 0 5 2 T 1 2 10437 CASAVA_Build X 129062132 1D TGAAGCCCAG T/- TGGTCTCCTC 3070 het 121 hom 37 2 19 17 T 2 1 10438 CASAVA_Build X 129064307 1D ATACCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 10 9 10439 CASAVA_Build X 129065786 3I AACGTTAGGC ---/CTT CTCTCAAAGA 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 CTT 0 1 10440 CASAVA_Build X 129073973 1I TCATCCACGA -/G GGTCCCCTCT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 2 3 10441 CASAVA_Build X 129076814 2I TGCAAATCAT --/CC CAGGTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 C 1 3 10442 CASAVA_Build X 129076936 1I CAGTTTCTGT -/G GCCAGAGCCC 3070 hom 60 het 23 0 19 4 G 1 2 10443 CASAVA_Build X 129095287 1D CCCATTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 16 9 T 12 11 10444 CASAVA_Build X 129105353 1I CTAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 1838 het 1838 ref 23 11 8 4 A 12 13 10445 CASAVA_Build X 129117628 1I GTAATTTAGT -/C TTTGGGTAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 10446 CASAVA_Build X 129139977 2D TGTCTGGAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 1732 hom 20 7 9 4 AG 10 9 10447 CASAVA_Build X 129142404 1D AGCCACTGCG C/- CCTGGCCTCC 1427 hom 10 het 6 0 4 2 C 3 2 10448 CASAVA_Build X 129155944 1I CACATGACTG -/C CAAGTGTTGG 3070 het 3070 hom 55 24 27 4 C 1 2 10449 CASAVA_Build X 129161418 2I TGCTAGCCTC --/CA GTTACATGTT 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 CA 0 1 10450 CASAVA_Build X 129163442 3D ATGCAAATAA GTT/--- GTTATTTCTG 3070 het 3070 hom 36 13 20 5 GTT 2 1 10451 CASAVA_Build X 129175876 2D AAGCAAGCCC CT/-- GTGAATGAGG 3070 het 3070 hom 23 8 14 2 CT 1 0 10452 CASAVA_Build X 129193964 1I TGATCCTAAT -/G TGGAATACTT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 G 0 1 10453 CASAVA_Build X 129207440 1I ATTTGAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3021 het 3021 ref 41 16 9 16 T 11 12 10454 CASAVA_Build X 129241849 2D CGCATGACAC TT/-- TCTGTAACCA 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 T 3 1 10455 CASAVA_Build X 129255254 1I TGCTATTTGC -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 A 6 7 10456 CASAVA_Build X 129289117 1I AAATTTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 T 10 11 10457 CASAVA_Build X 129291635 1I GTGCCCTGCC -/T TTTTTTTTTT 2790 het 2790 ref 24 12 8 4 T 11 12 10458 CASAVA_Build X 129304529 1D CATTTAGCTG A/- AAAAAAAAAA 1693 het 1693 ref 38 26 5 7 A 13 12 10459 CASAVA_Build X 129309624 4I TTATCTGGGG ----/CTGA CTATTTCTTT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 CTGA 0 1 10460 CASAVA_Build X 129326678 13D TAGCTTCTAT ATCTAATAAGCAC/------------- ATCTATTATT 3070 het 3070 hom 45 21 23 3 ATCTAATAAGCAC 1 0 10461 CASAVA_Build X 129335915 1D TCAGATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 12 11 10462 CASAVA_Build X 129337904 3I AACAACCCAG ---/ATA ATAATAGCTA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 ATA 2 3 10463 CASAVA_Build X 129343817 1I GCTAATTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 10 11 10464 CASAVA_Build X 129345594 1I ACTTAGTATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 9 10 10465 CASAVA_Build X 129359439 1I TTAAAATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 10 11 10466 CASAVA_Build X 129362495 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2582 het 2582 ref 19 7 10 2 T 11 12 10467 CASAVA_Build X 129440800 1I AAAGTCACTC -/T TGTCCACACA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 10468 CASAVA_Build X 129444993 1D TGTGAGGTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 10 9 10469 CASAVA_Build X 129451565 3D ACTGAATAAT ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 48 het 24 0 16 8 ATA 7 6 10470 CASAVA_Build X 129468013 1I ATCTACTTAC -/T TAAAGTCCTT 3070 hom 86 het 33 0 29 4 T 1 2 10471 CASAVA_Build X 129488436 1D AGCAAAAAAA C/- AATAGAGATA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 1 0 10472 CASAVA_Build X 129493383 1D GTAGACCTGT C/- CCCTTTGGCC 3070 hom 87 het 40 0 29 12 C 4 3 10473 CASAVA_Build X 129501285 1I GTTTATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 39 1 34 4 A 10 11 10474 CASAVA_Build X 129525943 1I TGCTCACCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 23 1 14 8 T 14 15 10475 CASAVA_Build X 129535829 1D TTAAAAAATT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 A 8 7 10476 CASAVA_Build X 129537022 7I CACATTATCT -------/TTTTTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TTTTTTC 0 1 10477 CASAVA_Build X 129674937 1I GATGCCCTGT -/G GGGGATCTTT 3070 hom 91 het 38 0 31 7 G 4 5 10478 CASAVA_Build X 129714078 1D AGACTCTCTT G/- GGTCTCTCTC 3070 hom 70 het 45 0 22 23 G 3 2 10479 CASAVA_Build X 129714115 1I TCTCTCTGTA -/T TTGCCTTTTC 3070 hom 25 het 40 0 14 26 T 2 3 10480 CASAVA_Build X 129715258 1I TCTGTCTCTG -/C CTCTTCTTTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 2 10481 CASAVA_Build X 129950830 52D TATATGTGTG TATATGTATATATACAGATATACGTATATATACGTATATCTGTATATATACA/---------------------------------------------------- TATATGTATA 1903 het 1903 ref 15 14 4 3 TATATGTATATATACAGATATACGTATATATACGTATATCTGTATATATACA 1 0 10482 CASAVA_Build X 129978638 1I TGTTTTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 T 14 15 10483 CASAVA_Build X 130036008 8D GTGTGTGTGT GTGTGTGA/-------- GAGAGAGAGA 3070 hom 117 het 40 0 38 6 GTGTGTGA 1 0 10484 CASAVA_Build X 130055220 1I TGGGAGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 24 16 9 T 10 11 10485 CASAVA_Build X 130063118 4D TAGTTTTCTG TCTC/---- TCTCTCCTCC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 TC 5 3 10486 CASAVA_Build X 130068809 1I TTTTTATTTC -/T TTTTTCCTTG 3070 het 3070 hom 50 24 22 4 T 5 6 10487 CASAVA_Build X 130071783 1D TAGGGTTTTT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 A 7 6 10488 CASAVA_Build X 130073620 1D TATATAGTGA C/- CTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 34 23 11 1 C 2 1 10489 CASAVA_Build X 130082125 4D ATCACAAATA TAGC/---- TATATTTTTC 3070 het 3070 hom 47 13 31 7 TAGC 1 0 10490 CASAVA_Build X 130082778 1I TCTTTATAAT -/C AACTAGTCTT 3070 het 2264 hom 23 5 13 5 C 0 1 10491 CASAVA_Build X 130105780 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2769 het 1937 hom 19 6 8 5 A 13 14 10492 CASAVA_Build X 130110355 1D TAGCCCCCCC T/- TTTTTTTTTA 2553 het 2553 ref 30 11 7 12 T 10 9 10493 CASAVA_Build X 130125886 2D TCGCCTACTC AA/-- GTCTCAGTAA 2458 het 2458 ref 29 18 6 6 A 2 0 10494 CASAVA_Build X 130137132 3I TCAGCATGTA ---/GAT GATATTTAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 GAT 1 2 10495 CASAVA_Build X 130145863 1D ATTGATGTGA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 T 7 6 10496 CASAVA_Build X 130146544 1I TCTTTGACCC -/T TTTTTTTTTT 2679 het 2679 ref 34 17 9 8 T 12 13 10497 CASAVA_Build X 130161502 5D TATGTATATA AAATG/----- AAATGAAATT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AAATG 2 1 10498 CASAVA_Build X 130167060 1D ACTCCATCAG A/- AAAAAAAAAA 1277 het 1277 ref 29 18 6 6 A 15 14 10499 CASAVA_Build X 130180403 5D TATATACACA TATAT/----- TATATATGTA 3070 het 3070 hom 21 8 13 2 TATAT 2 1 10500 CASAVA_Build X 130180660 2D ACTTAAAGCC GG/-- GGGGGGGGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 5 G 10 8 10501 CASAVA_Build X 130190525 1I ATTTCAATCT -/G GGGGGGTGAT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 G 6 7 10502 CASAVA_Build X 130207131 1D TTCTAGTGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 T 10 9 10503 CASAVA_Build X 130222361 2I AGGGAAAAGA --/CT CTAGAAATTG 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 CT 1 2 10504 CASAVA_Build X 130229391 1I TTGCATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 12 25 10 A 12 13 10505 CASAVA_Build X 130241803 1D TAAAGCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 13 12 10506 CASAVA_Build X 130243966 2I TTCCTAGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 57 27 20 10 GT 6 7 10507 CASAVA_Build X 130248712 2D TCAGATATGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 53 het 23 0 17 6 AT 7 6 10508 CASAVA_Build X 130264775 4D ACAATAAAAT AGAA/---- AGGGCACGTA 3070 het 3070 ref 32 15 10 11 AGAA 1 0 10509 CASAVA_Build X 130338713 1I ACCTAAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 30 2 20 8 T 13 14 10510 CASAVA_Build X 130362273 2D CACTTGGCAC AT/-- GTTAGATGCT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AT 1 0 10511 CASAVA_Build X 130457817 1D ACAATAGAAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 1923 hom 15 4 11 0 T 9 8 10512 CASAVA_Build X 130535295 7D TAAATAACTG GAATAGA/------- GAATGGACAT 3070 hom 93 het 34 0 31 5 GAATAGA 1 0 10513 CASAVA_Build X 130535671 2I GCTAGTTAGC --/TA GTAGGTAAAT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 TA 0 1 10514 CASAVA_Build X 130549739 1I GAACTTGCTG -/A AAAAAATCTG 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 A 6 7 10515 CASAVA_Build X 130573830 1I CTTCTGATTG -/A AAAAAAAAAA 1240 het 1240 ref 54 37 3 14 A 10 11 10516 CASAVA_Build X 130597415 1D CACATTTCTA T/- TTTTTTTTTT 2543 het 2543 ref 40 20 6 14 T 17 16 10517 CASAVA_Build X 130605300 1D ACTTTATAAC A/- AAAAAAATCA 1368 het 1368 ref 40 32 3 7 A 8 7 10518 CASAVA_Build X 130606886 6D AAGGAGAAGA AGAAGG/------ AGAAGGAGAA 1393 het 1393 ref 25 14 6 9 AGAAGG 4 3 10519 CASAVA_Build X 130609929 1D ATTCATTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 13 12 10520 CASAVA_Build X 130610053 1D CTTCTATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 12 13 T 14 13 10521 CASAVA_Build X 130610920 1I14M4I TGGGGATGGG -TTTTTTTTTGTAAA----/TTTTTTTTTTGTAAATTTG TTTAAGTTCC 3070 het 3070 ref 27 15 9 5 N/A 0 0 10522 CASAVA_Build X 130614152 1D GATTATACAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 10523 CASAVA_Build X 130616732 1I TGGAAGGGTT -/G GGGGGGGTGG 3070 hom 61 het 26 0 21 5 G 7 8 10524 CASAVA_Build X 130631719 1I CTAGAAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 A 9 10 10525 CASAVA_Build X 130640459 1D AGCAGCCCCC T/- CACTTTGTTC 3070 het 1380 hom 28 8 18 3 T 1 0 10526 CASAVA_Build X 130643301 1D TGGTAGAATA T/- AAACTCTAAG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 1 0 10527 CASAVA_Build X 130663195 1I ATTTTCTACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 9 10 10528 CASAVA_Build X 130708273 1D CTGGGTGGCG T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 T 7 6 10529 CASAVA_Build X 130717900 1I CATTAGTGAC -/A AAGACATAGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 2 3 10530 CASAVA_Build X 130727127 3D CCTGGTTACT TGG/--- TTTTTTTTGT 1383 het 1383 ref 18 6 6 6 TGG 1 0 10531 CASAVA_Build X 130741499 3D TTGAACCTCA GAG/--- GAGATCTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 18 4 GAG 2 1 10532 CASAVA_Build X 130765179 1D GGATGAAGAG A/- AGGATACCAC 2680 het 2680 ref 26 14 9 3 A 2 1 10533 CASAVA_Build X 130766977 1I CCAAGTAGCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 2 3 10534 CASAVA_Build X 130777041 3D CCAAAGAGTC AAT/--- AATTTGCTTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 AAT 2 1 10535 CASAVA_Build X 130786393 1D TTTAAACATT A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 7 6 10536 CASAVA_Build X 130790193 1I TTAAAAAAAC -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 31 15 12 4 A 7 8 10537 CASAVA_Build X 130792595 2D GGTGGAACTA AG/-- ATCCAGCTCA 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 AG 1 0 10538 CASAVA_Build X 130795814 1I CAAAGTGGTA -/T TAGCATGTTG 3070 het 3070 ref 65 35 24 6 T 1 2 10539 CASAVA_Build X 130801303 1I ATGAATGTCT -/A AGCCAGGGGT 2257 hom 18 het 8 0 7 1 A 1 2 10540 CASAVA_Build X 130802416 1I GGAACAAAGT -/G GGGGGGCTGC 3070 het 3070 ref 59 35 9 15 G 6 7 10541 CASAVA_Build X 130803228 2I GCTCCCCACA --/TC TGTTTCTGCG 2909 het 2909 ref 36 15 8 13 TC 0 1 10542 CASAVA_Build X 130815943 2D AACTTTATTT AA/-- GTTACCAGTA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 2 0 10543 CASAVA_Build X 130843632 3D TGGAAAATAT AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 48 20 18 12 AAC 7 6 10544 CASAVA_Build X 130847714 1I CCTTCAAGGG -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 6 7 10545 CASAVA_Build X 130868773 1D GTTTCACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 29 0 19 11 T 13 12 10546 CASAVA_Build X 130870153 2D CAGCTACAGA GG/-- GGGAAGTACC 3070 het 3070 ref 43 20 14 10 G 5 3 10547 CASAVA_Build X 130878190 1D CAACACAACA T/- TTTTTTTTTT 2664 het 2664 ref 41 20 7 14 T 15 14 10548 CASAVA_Build X 130989943 1D CAGGTTCCAT G/- GACATATGTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 G 2 1 10549 CASAVA_Build X 131010688 5D TGTTTGTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 13 9 15 TTTGT 3 2 10550 CASAVA_Build X 131029675 1D CTAGTATATA G/- GTAAAAGGGC 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 G 2 1 10551 CASAVA_Build X 131034271 1I CATATTGGTA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 62 22 30 10 T 6 7 10552 CASAVA_Build X 131042743 1D CATAAAAATC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 A 8 7 10553 CASAVA_Build X 131043478 1I AGACAAGATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 9 10 10554 CASAVA_Build X 131058044 1I GATCTTGGAC -/A AGTCATTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 1 2 10555 CASAVA_Build X 131058318 1D CCTGTAGTCC T/- TGGCGGGAAG 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 T 2 1 10556 CASAVA_Build X 131064157 1D CAGTTCCCCT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 G 8 7 10557 CASAVA_Build X 131068793 1I TGTGTGCTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 A 7 8 10558 CASAVA_Build X 131083306 1I TTTATAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 11 12 10559 CASAVA_Build X 131148615 4D AATTGTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 503 het 503 ref 45 24 6 15 TTTG 1 0 10560 CASAVA_Build X 131158803 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 7 6 10561 CASAVA_Build X 131169714 1D AGGAAAGTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 10 9 10562 CASAVA_Build X 131173755 1D TTGATGTCAG A/- AAAAAAAAAA 2172 het 2172 ref 29 20 5 5 A 12 11 10563 CASAVA_Build X 131173945 4I TAAAAATGAA ----/TAAT TATAGGTATT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TAAT 0 1 10564 CASAVA_Build X 131197465 1I GATGTTTTTT -/C GTAATTTGAC 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 C 0 1 10565 CASAVA_Build X 131199260 3I GTTTGGAAGC ---/CTT CTCCTACAAC 3070 het 3070 ref 51 24 18 9 CTT 0 1 10566 CASAVA_Build X 131201896 1I AGTTAAAATA -/T TTTTTTTTTC 1639 het 1639 ref 17 10 6 1 T 9 10 10567 CASAVA_Build X 131202458 5I TTTCTGAAAA -----/GAAAT TAAGTAGGTG 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 GAAAT 0 1 10568 CASAVA_Build X 131229010 3D CTGCAAAGTT AGA/--- AGATGTATTG 3070 het 3070 hom 48 14 28 7 AGA 2 1 10569 CASAVA_Build X 131229529 1I AAAGTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 1948 het 1948 ref 43 35 5 3 T 13 14 10570 CASAVA_Build X 131237772 4I CTTTATTGAT ----/TTTG TTTAACAGCT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 TTTG 0 1 10571 CASAVA_Build X 131239037 4I ATACATTTCC ----/CTCT GAGTATTGCT 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 CT 0 2 10572 CASAVA_Build X 131240946 1D GAGTTGCAGT C/- CCTTATGGCC 3070 het 3070 ref 56 27 25 6 C 3 2 10573 CASAVA_Build X 131241367 2I TAGGAAGGTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 10 12 10574 CASAVA_Build X 131246005 1I TTAATGGGAC -/T TTTTTTTGTT 2394 het 2394 ref 26 12 6 8 T 7 8 10575 CASAVA_Build X 131282276 10I AAGTATAATT ----------/AAAAAAAGAA AAAAAAAGAA 3070 het 1046 hom 15 3 11 1 AAAAAAAGAA 1 2 10576 CASAVA_Build X 131291079 1D CCCATCTATG A/- AAGGTGGAGC 3070 hom 152 het 56 0 51 5 A 3 2 10577 CASAVA_Build X 131315439 1I CTTATATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 T 13 14 10578 CASAVA_Build X 131350663 1D CCCTGCTGTG A/- TCAGTTACTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 1 0 10579 CASAVA_Build X 131439919 3D TGTTGTTGTC GTT/--- GTTAAACATC 3070 het 3070 ref 44 25 17 4 GTT 2 1 10580 CASAVA_Build X 131488093 3I CAATAGATAC ---/ATA ATAATAACTA 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 ATA 2 3 10581 CASAVA_Build X 131526670 1D AATTGTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1190 het 1190 ref 33 23 3 7 T 13 12 10582 CASAVA_Build X 131564353 5I AGCCCTGCCT -----/AAATC AAATCATTTC 3070 het 3070 ref 51 23 17 11 AAATC 1 2 10583 CASAVA_Build X 131581519 1D TCGTCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2904 het 2283 hom 27 10 10 8 A 13 12 10584 CASAVA_Build X 131583292 1D CAGGACTGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 46 14 24 8 A 10 9 10585 CASAVA_Build X 131587846 6D AATGGCAAAA ATGTAT/------ ATGTATATTT 3070 het 3070 ref 36 17 17 4 ATGTAT 2 1 10586 CASAVA_Build X 131593315 1D GATTATTTGG A/- AAAAAAAAAA 2494 het 2494 ref 48 31 7 10 A 13 12 10587 CASAVA_Build X 131620194 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 T 9 10 10588 CASAVA_Build X 131621289 4I CCTATCCCAT ----/CTAA CTGAGGCCTC 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 CTAA 0 1 10589 CASAVA_Build X 131631218 1D CTCTAGTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2722 hom 30 8 9 14 A 10 9 10590 CASAVA_Build X 131631461 1I CCTGCTTCAT -/G AGTAATTGAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 G 0 1 10591 CASAVA_Build X 131646428 1D AGTGTTATCT G/- CTGTCTACAT 3070 het 3070 ref 70 34 27 10 G 1 0 10592 CASAVA_Build X 131651597 1I TTTTTTTCGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 T 10 11 10593 CASAVA_Build X 131658476 1D TTCCCTTTTG C/- AAAAAGGTCA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 C 1 0 10594 CASAVA_Build X 131679657 1D AACCAGGACC A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 7 6 10595 CASAVA_Build X 131687868 2D AAATAACTAG GT/-- GTGTAATCAG 2243 het 2243 ref 14 7 5 2 GT 3 2 10596 CASAVA_Build X 131691545 1D TCTTTGAGGT C/- CTCAGTCATT 3070 het 3070 hom 34 12 21 2 C 2 1 10597 CASAVA_Build X 131703136 18I AGCATCCCAA ------------------/GTAGCTGGGACTACAGGT GCACGCCACC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 GTAGCTGGGACTACAGGT 0 1 10598 CASAVA_Build X 131717214 1D AAGGCAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2760 hom 28 9 12 7 T 12 11 10599 CASAVA_Build X 131727128 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 123 hom 49 1 32 16 TG 8 9 10600 CASAVA_Build X 131737779 2D TGACAAAATG AA/-- AAAAAAGTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 A 8 6 10601 CASAVA_Build X 131740276 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 11 12 10602 CASAVA_Build X 131754598 1D TTTACCCCTT C/- GTCAGTTGAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 1 0 10603 CASAVA_Build X 131761080 1I TCTCTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 789 hom 48 3 33 12 T 13 14 10604 CASAVA_Build X 131772118 4D GAGAAAGAAA GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 hom 48 het 28 0 16 14 GAAG 5 4 10605 CASAVA_Build X 131774293 1D TTTTTTTTTT G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 36 het 14 0 11 3 G 9 8 10606 CASAVA_Build X 131781916 1D TGCCAGACAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 94 het 37 0 30 7 T 10 9 10607 CASAVA_Build X 131782484 1I AAGGGCCGGA -/G GTGCTCTTCC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 G 1 2 10608 CASAVA_Build X 131783727 1D AAGCACTTGC T/- TATGTGCCAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 2 1 10609 CASAVA_Build X 131786701 4D CTAAAACAAC TACT/---- TAGTGATTGA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TACT 1 0 10610 CASAVA_Build X 131787474 2D CTCTTAGCCA TC/-- TCTCTATATA 3070 hom 171 het 61 0 55 6 TC 3 2 10611 CASAVA_Build X 131799817 1I TCATAAATTC -/T TTTAACCATC 3070 hom 107 het 44 0 34 10 T 3 4 10612 CASAVA_Build X 131801158 4I ACTCAGAAAC ----/AGAA AGTCAAATAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AGAA 0 1 10613 CASAVA_Build X 131808892 1I CTACCTTCAC -/A AGTACAGAGA 3070 hom 111 het 47 0 38 9 A 1 2 10614 CASAVA_Build X 131821377 4D AAGGGAGGAA GAGG/---- GAGGGAGGGA 3070 hom 44 het 29 0 17 12 GAGG 4 3 10615 CASAVA_Build X 131841160 1D AAATACATTC T/- TTTGGGCCTT 3070 hom 136 het 51 0 44 7 T 4 3 10616 CASAVA_Build X 131842243 2D AAAAAAAAAA AG/-- GAAAAAAAAA 2810 hom 36 het 15 0 12 4 AG 1 0 10617 CASAVA_Build X 131848843 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1360 het 1360 ref 26 16 4 7 A 12 11 10618 CASAVA_Build X 131852830 1I GTTCCGATTC -/T TTCCTCAGAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 2 3 10619 CASAVA_Build X 131855993 1I TGGGATTACA -/G GCATGCGCCA 3046 hom 27 het 10 0 9 1 G 1 2 10620 CASAVA_Build X 131864577 1I TGAAAGAATG -/A ATACTTTCCC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 1 2 10621 CASAVA_Build X 131869951 1I AAGACAGCTA -/T TTTGAAAAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 3 4 10622 CASAVA_Build X 131873409 1I GTGCAGTGGC -/G CCATCTCGGC 2143 hom 11 het 11 0 5 6 G 0 1 10623 CASAVA_Build X 131877604 1D CGCCCGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 12 11 10624 CASAVA_Build X 131878169 1I TGATTGGATT -/G ACGGATGCAA 3070 hom 132 het 53 0 45 8 G 0 1 10625 CASAVA_Build X 131890252 1D CCACCTCCAA T/- TATTGTGGAT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 T 2 1 10626 CASAVA_Build X 131896902 1I39M1I31M1I TAAATAATGG -TGGAACAACTAGAAAAAGATCAATGGAGAAATAGAAGTC-TAAACAGCACAATAAACTACCAAGTTTTAGC-/ATGGAACAACTAGAAAAAGATCAATGGAGAAATAGAAGTCTTAAACAGCACAATAAACTAACAAGTTTTAGCA AACATCTATA 3070 hom 129 het 40 0 44 7 N/A 0 0 10627 CASAVA_Build X 131897736 1I55M1I TGAAAAAGAA -TAATAAATTCCATGAAAACAAAAATGGATTCTTTGAAGAGATCAACAAAATTGAT-/TTAATAAATTCAATGAAAACAAAAATGGATTCTTTGAAGAGATCAACAAAATTGATA AAACAGAACT 3070 hom 138 het 37 0 47 7 N/A 0 0 10628 CASAVA_Build X 131914075 2I AAGTAAAACT --/GA GAGCCCAACA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 GA 1 2 10629 CASAVA_Build X 131916291 1I11M1D AATTCTGGAA -CCCTAGGCTATC/CCCCTAGGCTAT- CCCTATTCTT 3070 hom 126 het 44 0 43 9 N/A 0 0 10630 CASAVA_Build X 131918078 1D GAGGGAAGAA G/- TGCGGGCGCC 3070 hom 48 het 17 0 15 3 G 1 0 10631 CASAVA_Build X 131921712 1I54M1I CTTTGTCCAG -TGCAGACATAAGGGATAGTGGATTTTTTGGGAATCCTGAATTTCTAGCACTCCA-/CTGCAGACATAAGGGATAGTGGATTTTTTGGGAATCCTGAATTTCTAGCACTCCAG GCATCTCCTG 3070 hom 158 het 37 0 54 10 N/A 0 0 10632 CASAVA_Build X 131922268 1D TAAACAGTAC G/- GGGGGAAAAG 3070 hom 110 het 43 0 36 7 G 6 5 10633 CASAVA_Build X 131923229 2D CTAATGAGAC TA/-- TATATATATA 560 het 560 ref 47 29 3 15 TA 8 7 10634 CASAVA_Build X 131930294 1I TATGTCTTGA -/G GATTGGAATC 3070 hom 120 het 47 0 37 10 G 1 2 10635 CASAVA_Build X 131933016 1I ATTGAAGAAG -/A AACACACTTT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 A 2 3 10636 CASAVA_Build X 131938299 1D AAGTTGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 38 2 28 9 A 13 12 10637 CASAVA_Build X 131939255 1I34M1I TTTTTAAGAC -GTGTCTCCCTGTGTGTTGCCCAGGCTGCAGTGTA-/GGTGTCTCCCTGTGTGTTGCCCAGGCTGCAGTGTAG TGGCACAATC 3070 hom 144 het 41 0 48 10 N/A 0 0 10638 CASAVA_Build X 131958372 1I TGCTTAAACA -/T TTTTTCCGTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 5 6 10639 CASAVA_Build X 131959332 1D ATAAAAAATA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 42 0 31 12 T 9 8 10640 CASAVA_Build X 131979415 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 60 hom 32 2 22 10 TA 9 8 10641 CASAVA_Build X 131997817 4I TAAAAAAAAT ----/TATA TATATATATA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TA 7 9 10642 CASAVA_Build X 132006680 1D ACTTGGAGAA C/- CTTTTTGTCT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 C 2 1 10643 CASAVA_Build X 132045155 2I CCAAGGAAAC --/AG AGGACTTGTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AG 1 2 10644 CASAVA_Build X 132045879 4D GCACAACTTC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 119 het 47 0 40 11 TTAT 3 2 10645 CASAVA_Build X 132055333 1D TCCAAAAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 88 het 34 0 27 7 A 9 8 10646 CASAVA_Build X 132060572 1D8M1I CGAGCATTGT GGGCTCATG-/-GGCTCATGC CTGTAATCCC 3070 hom 57 het 31 0 22 11 N/A 0 0 10647 CASAVA_Build X 132060842 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 32 0 21 11 A 12 11 10648 CASAVA_Build X 132061998 1I TAATAATCCC -/A ACATTTTATG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 1 2 10649 CASAVA_Build X 132067348 2D16M1D TAATAAATAT AAGTCTCTCCATATATACG/--GTCTCTCCATATATAC- GAATATATAC 2414 hom 12 het 5 0 5 0 N/A 0 0 10650 CASAVA_Build X 132068422 2I CAGACCAATA --/TC TCTTATTAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TC 1 2 10651 CASAVA_Build X 132087686 1I TCAAGTGAAT -/A ATTTGCTCCT 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 A 1 2 10652 CASAVA_Build X 132117720 1I AGATATTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 28 2 20 6 T 11 12 10653 CASAVA_Build X 132125690 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 10654 CASAVA_Build X 132133961 1I ACATTCTTTG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 7 8 10655 CASAVA_Build X 132134866 1I TCCAGAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 34 1 21 12 T 15 16 10656 CASAVA_Build X 132177293 1I AAAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 29 1 16 12 A 13 14 10657 CASAVA_Build X 132234190 1D GTACTCTTGT A/- AAAAAAAAAT 1268 het 1268 ref 34 26 3 5 A 10 9 10658 CASAVA_Build X 132286245 1D AACCAACACC A/- AAAAAAAAAA 2083 het 2083 ref 36 13 7 17 A 19 18 10659 CASAVA_Build X 132287140 1I ACAGCCTAAG -/T GTTAGAGATT 3070 het 115 hom 46 1 42 3 T 0 1 10660 CASAVA_Build X 132396787 1I AGATATAAAA -/T TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 35 15 7 13 T 17 18 10661 CASAVA_Build X 132433137 1D TTTTTTAACC T/- TTTTTTTTTT 2287 het 2287 ref 33 18 6 9 T 13 12 10662 CASAVA_Build X 132473557 1D TTGTATTCTT C/- CCCCATCAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 5 4 10663 CASAVA_Build X 132477036 1D TCTGGGGATT A/- AGGAGGTAGA 3070 hom 147 het 54 0 49 7 A 2 1 10664 CASAVA_Build X 132482194 1I CCAGCCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 251 hom 22 1 15 6 T 12 13 10665 CASAVA_Build X 132484331 1D CTGTGTCTAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 53 het 21 0 17 4 A 9 8 10666 CASAVA_Build X 132486185 1I TGCACTCCAG -/C CTGCGTGACA 3070 hom 42 het 15 0 12 3 C 1 2 10667 CASAVA_Build X 132486285 1D TGGATCGCTT G/- GAGGTCAGGA 3070 hom 37 het 17 0 12 5 G 2 1 10668 CASAVA_Build X 132489483 1I AGATAAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 33 1 27 5 T 11 12 10669 CASAVA_Build X 132494822 1D GACTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 31 1 23 8 A 11 10 10670 CASAVA_Build X 132497186 1I TTTTGAGATA -/C CTTCGGTTTC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 1 2 10671 CASAVA_Build X 132502919 1D GTATCTGGGG A/- ATCAGCCAGT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 2 1 10672 CASAVA_Build X 132507605 1I ACTATTAGCC -/A AAAAAAAAAA 2141 het 2141 ref 60 44 6 10 A 11 12 10673 CASAVA_Build X 132519990 1I CAATTTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 295 hom 33 2 26 5 T 13 14 10674 CASAVA_Build X 132521545 1I CTCTCATGCA -/T TTTCACATCA 3070 hom 96 het 47 0 33 14 T 3 4 10675 CASAVA_Build X 132524595 1D CAAATCTGAG C/- CTTTTGTTGC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 C 2 1 10676 CASAVA_Build X 132580395 1D ACACTGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1711 hom 25 8 12 5 A 19 18 10677 CASAVA_Build X 132646577 1D CATATAGGTC T/- TTTTTTTTTT 1294 het 1294 ref 36 26 3 7 T 13 12 10678 CASAVA_Build X 132704963 1I TATCTTTGAC -/T TTTGTAAAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 3 4 10679 CASAVA_Build X 132859129 1D CACAAACTGA T/- TTTTTTTTTT 730 het 730 ref 33 25 2 7 T 13 12 10680 CASAVA_Build X 132932226 2D AACCAGTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 26 0 22 4 A 13 11 10681 CASAVA_Build X 132938330 1D CAACTCGCCA G/- GGAGCAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 3 2 10682 CASAVA_Build X 132955962 1D TTTTCCTATT A/- GGAAAACCTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 1 0 10683 CASAVA_Build X 132963017 1I AAGTTCTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 9 10 10684 CASAVA_Build X 132967185 1D GTGAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 34 0 27 7 A 13 12 10685 CASAVA_Build X 132983589 1I TCCCTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 2901 het 458 hom 26 1 12 13 T 15 16 10686 CASAVA_Build X 132988052 1D GTTACTCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 38 1 27 10 T 12 11 10687 CASAVA_Build X 132988297 1I GCTTGAGCTC -/A AAGCTCAAAG 3070 hom 99 het 40 0 32 8 A 2 3 10688 CASAVA_Build X 132996200 1I TTTTTGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 29 2 21 6 T 12 13 10689 CASAVA_Build X 132998938 1D CACTTGAGGT C/- CAGGAGTTCG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 2 1 10690 CASAVA_Build X 133014298 3D ACTGGCATGA GAT/--- GATATCTCAT 1690 het 1690 ref 11 6 4 4 GAT 2 1 10691 CASAVA_Build X 133024947 1I TCTACCACAG -/A AAAGCATTGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 3 4 10692 CASAVA_Build X 133026785 1D TGAGTGCCTG A/- AATGATTTTC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 3 2 10693 CASAVA_Build X 133028204 1D AAGGCAGTGG C/- CAGCCTCGCC 3070 hom 73 het 27 0 23 5 C 2 1 10694 CASAVA_Build X 133039983 1D ACAGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 A 14 13 10695 CASAVA_Build X 133045123 1I31M1I AACTCTTAAT -AATTAGGTATTGATGGGACGTATCTCAAAAT-/AAATTAGGTATTGATGGGACGTATCTCAAAATA ATAAGAGCTA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 N/A 0 0 10696 CASAVA_Build X 133048550 1I AACCAGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 780 hom 31 2 22 7 A 11 12 10697 CASAVA_Build X 133056016 1I AATACCATGA -/G AAATATATGT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 0 1 10698 CASAVA_Build X 133058997 1D TGCTTTTTCT G/- GGAATAGACA 3070 hom 124 het 48 0 40 8 G 3 2 10699 CASAVA_Build X 133059616 1I AAAGACTTGG -/A ACCAACCCAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 1 2 10700 CASAVA_Build X 133102349 1D TCAGCATTGG A/- AAAAAAAAAG 1357 het 1357 ref 50 39 3 9 A 10 9 10701 CASAVA_Build X 133147127 1D TACTAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 T 11 10 10702 CASAVA_Build X 133173220 1I TCAAAATAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 46 hom 37 1 30 6 A 9 10 10703 CASAVA_Build X 133186536 1I ACTCTGTCTC -/A AAGAAAAAAA 3070 het 509 hom 12 2 8 2 A 2 3 10704 CASAVA_Build X 133208440 2D CAGTTGACTC TT/-- TACCATTTGT 3070 het 3070 ref 42 19 19 7 T 3 1 10705 CASAVA_Build X 133213039 1D CTCCAGAGGG A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 A 8 7 10706 CASAVA_Build X 133235457 1I CAAGAAGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2870 hom 26 8 12 6 A 10 11 10707 CASAVA_Build X 133241116 1I TCCAACTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 374 hom 36 1 32 3 A 9 10 10708 CASAVA_Build X 133313394 1I GCCTAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 T 10 11 10709 CASAVA_Build X 133323070 1D ACTACATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2885 hom 29 9 13 7 A 13 12 10710 CASAVA_Build X 133346331 12D CTGCCTTTTC TTCTTTCTTTCT/------------ TTCTTTCTTT 3070 hom 53 het 23 0 17 7 TTCT 5 2 10711 CASAVA_Build X 133498060 1I TCTGTCTCTG -/T CTCTCTGTCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 0 1 10712 CASAVA_Build X 133522191 2D TCTTATAAAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 41 24 9 9 GT 9 8 10713 CASAVA_Build X 133523569 1D GCTCGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 1281 het 1281 ref 22 14 3 5 T 11 10 10714 CASAVA_Build X 133544943 5I GAGGGTTTTC -----/TTGTT TTGTTTTGTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TTGTT 3 4 10715 CASAVA_Build X 133545131 1D ATCTGAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 34 3 21 11 T 14 13 10716 CASAVA_Build X 133551728 1I CATCTGTACT -/A AAAAATACAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 5 6 10717 CASAVA_Build X 133557314 2D ATAATGTGTG TA/-- TATATATATA 1836 hom 15 het 7 0 5 2 TA 8 7 10718 CASAVA_Build X 133557893 4D AGAACTATAT CAGA/---- CAGTATTATT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 CAGA 1 0 10719 CASAVA_Build X 133560353 1I AGAAGGGTTG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 7 8 10720 CASAVA_Build X 133570678 1I CCTCTTTTTC -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 36 het 14 0 11 3 T 7 8 10721 CASAVA_Build X 133573229 16D ATATACATAT GTATATATGCATATAC/---------------- ACATATGTAT 505 het 505 ref 19 10 5 8 GTATATATGCATATAC 1 0 10722 CASAVA_Build X 133600459 1I TGGCTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 2729 het 2729 ref 27 11 13 3 A 13 14 10723 CASAVA_Build X 133622686 1D TTTAGACGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 10 9 10724 CASAVA_Build X 133629622 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1246 het 1246 ref 32 16 5 11 A 15 16 10725 CASAVA_Build X 133640588 2I TATAAAAGAC --/AT AGAGGAGAAC 3070 hom 113 het 44 0 35 9 AT 0 1 10726 CASAVA_Build X 133652812 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2447 het 322 hom 16 1 11 4 T 13 14 10727 CASAVA_Build X 133684676 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1933 het 1933 ref 23 8 7 8 A 13 14 10728 CASAVA_Build X 133685684 1I TCTAATCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 31 2 24 5 A 11 12 10729 CASAVA_Build X 133718037 1D TGCCTATATG T/- TTTTTTTTTT 1357 het 1357 ref 21 15 3 3 T 11 10 10730 CASAVA_Build X 133764987 2D GTGCCCTAGG TC/-- TCTCAGAACA 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 TC 3 2 10731 CASAVA_Build X 133805105 1D TGCATAGGGT A/- AAAAAAAAAA 1387 het 1387 ref 37 28 4 5 A 12 11 10732 CASAVA_Build X 133851388 2I AAAGTGTGAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 9 11 10733 CASAVA_Build X 133855072 2I CAAACCCACA --/AT AAAGATAATT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 AT 0 1 10734 CASAVA_Build X 133857035 5I AATAAAAAAT -----/AAAAC AAAATAAGAC 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 AAAAC 0 1 10735 CASAVA_Build X 133858049 1D TTTAATGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 13 12 10736 CASAVA_Build X 133862824 3D CAAATATTTA TTC/--- TTTTCTTTCA 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 TTC 1 0 10737 CASAVA_Build X 133867261 1I ACGAATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3046 hom 20 10 8 2 A 10 11 10738 CASAVA_Build X 133870972 4D AAAAAAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGAG 3070 het 3028 hom 21 7 11 4 AAAG 3 2 10739 CASAVA_Build X 133871602 1D TAAGATTTTT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 A 8 7 10740 CASAVA_Build X 133906481 3D AAAATTCTAA CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 hom 54 het 22 0 17 5 C 14 11 10741 CASAVA_Build X 133912878 1D GCAGGAGCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 9 8 10742 CASAVA_Build X 133915106 1D TTGAAAAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 10 9 10743 CASAVA_Build X 133926876 20I TATGCCCACT --------------------/TCATTTATTATAGAACACTG TCCTCCCCAC 3070 het 3070 ref 54 29 18 8 TCATTTATTATAGAACACTG 0 1 10744 CASAVA_Build X 133954202 1I TTGGGGGGGG -/T GGTTGCTAAG 3070 het 1026 hom 24 7 15 2 T 0 1 10745 CASAVA_Build X 133959054 13D AGGGTTGCAA TATTATGTCATGC/------------- ACCCCTCAGG 3070 het 3070 ref 40 25 15 11 TATTATGTCATGC 1 0 10746 CASAVA_Build X 133959507 1I TATGGCATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 9 10 10747 CASAVA_Build X 133966398 3I CCGTTTGGCA ---/CAC CTTTCCACAG 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 CAC 0 1 10748 CASAVA_Build X 133976934 1D ACTACAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 8 13 7 A 10 9 10749 CASAVA_Build X 133989031 1I ACAAGGAACT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 8 9 10750 CASAVA_Build X 134003930 1D ATACATTATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 10 9 10751 CASAVA_Build X 134141255 1I TTAATGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 10 11 10752 CASAVA_Build X 134212008 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTAAA 2282 het 2282 ref 17 7 6 5 T 8 7 10753 CASAVA_Build X 134219577 1I CCTCCCGGAG -/C CCCCCCACCA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 C 6 7 10754 CASAVA_Build X 134224946 1I GCTGGGAGAA -/C CACTGCTCTC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 1 2 10755 CASAVA_Build X 134295946 1I TGCCTCCAGG -/C CTCTGGTTTC 3070 hom 80 het 32 0 26 6 C 1 2 10756 CASAVA_Build X 134305002 1I CCAACACCAG -/C CAACTCCAGA 2610 het 2610 ref 34 15 8 11 C 1 2 10757 CASAVA_Build X 134308150 2D TTAAATGCAA AG/-- AGATCTATAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 6 AG 2 1 10758 CASAVA_Build X 134308386 1D TTTTATAAAC T/- TTTGAAACTA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 T 4 3 10759 CASAVA_Build X 134347836 86D GTATAGGGTG TATATATATATATATATATGTGTATATATATATATATATATATATATATATGTGTATATATATATATATATATATGTGTGTATATA/-------------------------------------------------------------------------------------- TATATATATA 1802 het 453 hom 11 2 5 7 TATATATATATATATATATGTGTATATATATATATATATATATATATATATGTGTATATATATATATATATATATGTGTGTATATA 1 0 10760 CASAVA_Build X 134359772 4D TCCTGGTGGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1972 het 43 hom 28 1 7 20 T 20 16 10761 CASAVA_Build X 134361608 1I CTCCTCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 13 14 10762 CASAVA_Build X 134388422 7D CAGGAGACCA AAGCCCT/------- GAGCCCTGAG 3070 hom 105 het 37 0 35 5 AAGCCCT 1 0 10763 CASAVA_Build X 134393811 2D TGATATATTC AA/-- AGTGCTAAAA 3070 hom 102 het 45 0 35 12 A 3 1 10764 CASAVA_Build X 134404657 1D AAAACAACTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 10 9 10765 CASAVA_Build X 134434475 1I CCTCCTCCAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 10766 CASAVA_Build X 134448291 1D GCTGAATCGC T/- TAAAGTATTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 2 1 10767 CASAVA_Build X 134478846 1D GTCTTGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 499 hom 35 2 30 3 A 13 12 10768 CASAVA_Build X 134525176 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 2386 hom 18 het 8 0 7 1 AT 5 6 10769 CASAVA_Build X 134538277 1I GCAGATGGGG -/A AGGTGCATTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 1 2 10770 CASAVA_Build X 134543489 4D TAAATTCGGT AAAC/---- ACCACTGCCC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 AAAC 1 0 10771 CASAVA_Build X 134558912 1D GATTTTTCTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 7 10772 CASAVA_Build X 134581387 5I ACAGACTAAT -----/TGAAG TGAAGGATGG 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 TGAAG 1 2 10773 CASAVA_Build X 134581710 1D TATTATTCAG A/- AAAAACCAAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 6 5 10774 CASAVA_Build X 134589965 1I TATGTTAGTG -/T TTTTTCCCTG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 5 6 10775 CASAVA_Build X 134596194 1D CTTTGGAGGC A/- GGAAGACAGC 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 1 0 10776 CASAVA_Build X 134635340 1D AAATAGTATG A/- ACTATGATTG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 2 1 10777 CASAVA_Build X 134657605 1D AGTATGTGGT A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 46 28 14 6 A 7 6 10778 CASAVA_Build X 134674615 1D TTTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 1603 het 1251 hom 12 6 5 1 T 14 13 10779 CASAVA_Build X 134678244 4D GAGTGGGAAG AAGT/---- AAGAGTCAAG 3070 het 3070 ref 35 18 17 2 AAGT 1 0 10780 CASAVA_Build X 134678976 1D GCTCCGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 A 11 10 10781 CASAVA_Build X 134730789 2I CAAAAAATTT --/AC AGTTAGTCAC 2156 het 2156 ref 28 19 6 3 AC 0 1 10782 CASAVA_Build X 134799302 4I AGACTCCATC ----/AAAA AAAAAAAAAA 2322 het 2312 hom 22 6 9 7 A 10 14 10783 CASAVA_Build X 134810596 1D AAAATTTATC T/- TTTCAATCTA 2378 het 2378 ref 30 20 6 4 T 4 3 10784 CASAVA_Build X 134813602 13D GAGAATTATC ATCTTGCTGCCTA/------------- TCAAGGGCAG 3070 hom 81 het 24 0 28 1 ATCTTGCTGCCTA 1 0 10785 CASAVA_Build X 134814436 2D4M4I GAGTATGAAA TTCATC----/--GATCTGTG CATGAGTACT 3070 het 3070 ref 54 27 22 6 N/A 0 0 10786 CASAVA_Build X 134827859 2D GCATGATCTG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 21 9 6 AC 9 8 10787 CASAVA_Build X 134833436 4I AGTTTTTTGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 94 het 39 0 31 8 TTTG 3 4 10788 CASAVA_Build X 134836343 1D CTCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 16 0 13 4 A 10 9 10789 CASAVA_Build X 134838597 1D ATGCAGGCAC T/- ACCTCTTTGG 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 1 0 10790 CASAVA_Build X 134853072 1D TCTAGCCGGC A/- ATAACAAATG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 1 10791 CASAVA_Build X 134890042 1D CAATACATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 17 8 T 15 14 10792 CASAVA_Build X 134893527 1D TGGCTTCGGG T/- TTTTTTTTTT 1470 het 1470 ref 38 17 4 18 T 17 16 10793 CASAVA_Build X 134908987 1I TTCCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1292 het 1292 ref 50 35 3 12 T 13 14 10794 CASAVA_Build X 134943336 1D TAATTGAGGG A/- AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 47 35 3 9 A 11 10 10795 CASAVA_Build X 134960999 1D AACCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 978 het 978 ref 20 11 3 6 T 13 12 10796 CASAVA_Build X 134962270 2D TGGATTATTC GG/-- GGGGGGGGGC 3070 het 1899 hom 29 10 10 10 G 11 9 10797 CASAVA_Build X 134963654 1D AACCTAGCTC T/- TTTTTTTTTT 1138 het 1138 ref 33 19 5 9 T 17 16 10798 CASAVA_Build X 134982083 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 20 11 8 A 9 8 10799 CASAVA_Build X 134982379 1I ACTAGCCTAC -/G TGTTGAGGCA 3070 hom 159 het 60 0 53 7 G 0 1 10800 CASAVA_Build X 134989366 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2800 hom 30 7 17 6 T 9 8 10801 CASAVA_Build X 134989939 1I GTGCTCCACT -/G GGGGTTGCAA 3070 hom 72 het 28 0 23 5 G 4 5 10802 CASAVA_Build X 134990181 3I TCTTGAGGTT ---/AGG AGTTTGAGAC 3070 hom 56 het 20 0 18 2 AGG 0 1 10803 CASAVA_Build X 134993254 1I AGGAGATTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 9 10 10804 CASAVA_Build X 134997853 1D GCATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 29 1 16 13 A 13 12 10805 CASAVA_Build X 135015768 1D TAATGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 21 0 16 5 T 13 12 10806 CASAVA_Build X 135022977 8D TCTGTAAGAT TAGCAATG/-------- AGAAAGAATA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 TAGCAATG 1 0 10807 CASAVA_Build X 135033277 30I GGGACAGGCT ------------------------------/AACGTGGCTGGAACAAGGGAAAGAGGAACA AATTGGTAGG 3070 hom 68 het 25 0 17 9 AACGTGGCTGGAACAAGGGAAAGAGGAACA 0 1 10808 CASAVA_Build X 135033804 1I AACCCCCCCC -/A CTTACAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 0 1 10809 CASAVA_Build X 135042470 1D TCTGTTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 27 1 16 10 A 13 12 10810 CASAVA_Build X 135055856 5I AATTGTATAG -----/AACTA AACACACACA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AACTA 0 1 10811 CASAVA_Build X 135061118 1I AAATGTCGAT -/A ATGCCGAGGT 3070 hom 63 het 22 0 21 1 A 1 2 10812 CASAVA_Build X 135063110 1I TGCGGGAGGT -/G GGGGGGGGGC 3070 het 451 hom 18 2 10 6 G 9 10 10813 CASAVA_Build X 135065640 1D TGAAACCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 11 10 10814 CASAVA_Build X 135068964 2I TAAAACTGCT --/AA AAAAAAAAAA 2337 hom 30 het 16 0 11 5 A 13 15 10815 CASAVA_Build X 135074037 1I GTGTACTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 40 1 30 9 T 13 14 10816 CASAVA_Build X 135076923 4D TTCTAGAAAC AGTG/---- AGTTCTATAT 3070 hom 81 het 28 0 28 2 AGTG 1 0 10817 CASAVA_Build X 135079346 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 95 hom 24 1 16 7 A 9 10 10818 CASAVA_Build X 135079901 1D TTTATTTGTA C/- CAGGAGGTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 1 C 2 1 10819 CASAVA_Build X 135081714 1I TATTGATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 22 0 16 6 T 9 10 10820 CASAVA_Build X 135090279 1I TGAAGTCTAG -/A AGAGGGTTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 10821 CASAVA_Build X 135090628 2I GTGCAAAGGC --/GT GTGATCTCGG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 GT 1 2 10822 CASAVA_Build X 135096980 2D AAGAGGAAAA AG/-- AAAAAATATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AG 1 0 10823 CASAVA_Build X 135107974 1D AGTTGTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 24 1 11 13 T 13 12 10824 CASAVA_Build X 135111327 1D TTGCCTCTTA G/- TGCACATGCT 3070 hom 147 het 56 0 49 7 G 1 0 10825 CASAVA_Build X 135121418 4D CATCCCTGAA AAAG/---- AAAGAAAACG 3070 hom 105 het 42 0 36 12 AAAG 2 1 10826 CASAVA_Build X 135139536 1I CGACCTGTGC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 417 hom 37 1 29 7 T 8 9 10827 CASAVA_Build X 135179511 1D CAATGATTCC T/- TTTTTTTTTT 1815 het 1815 ref 29 17 5 7 T 13 12 10828 CASAVA_Build X 135180763 1D GCTCTCACCT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 133 hom 40 3 22 16 C 11 10 10829 CASAVA_Build X 135190190 1D GGCTAGTCAG A/- AAAAAAACCT 3070 hom 79 het 38 0 31 7 A 8 7 10830 CASAVA_Build X 135194092 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 8 10831 CASAVA_Build X 135256525 33D TACCTCCACA GCCTACAGCTGCTCATTCCTCAGCAACCCCTGT/--------------------------------- GCCTGTTACT 3070 het 3070 ref 48 35 19 9 GCCTACAGCTGCTCATTCCTCAGCAACCCCTGT 1 0 10832 CASAVA_Build X 135283990 1I TGTAGCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 586 hom 25 2 17 6 T 11 12 10833 CASAVA_Build X 135286236 1I AATTTTAGAA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 7 8 10834 CASAVA_Build X 135309623 1D ATGTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 1319 het 1319 ref 45 32 3 11 A 13 12 10835 CASAVA_Build X 135317164 1I CTCTATTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 31 1 24 6 A 12 13 10836 CASAVA_Build X 135344954 1D ATTCATTCAC T/- TTTTTTTTTT 1837 het 1837 ref 41 28 4 9 T 11 10 10837 CASAVA_Build X 135372898 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 935 hom 28 3 18 7 T 11 12 10838 CASAVA_Build X 135381759 1I GATCTGGTCG -/T TTTAAAAGTG 3070 hom 107 het 42 0 33 9 T 3 4 10839 CASAVA_Build X 135384846 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 743 hom 30 2 23 6 A 11 10 10840 CASAVA_Build X 135387416 1D CCTAGAACTG A/- TATTTAGTTT 3070 hom 166 het 61 0 56 6 A 1 0 10841 CASAVA_Build X 135387854 1I GGTGGCTCTG -/C CTCTGCTTAA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 C 1 2 10842 CASAVA_Build X 135403858 1D CTCAAAGAAC T/- TTTTTTTTTT 1435 het 1435 ref 44 35 4 5 T 11 10 10843 CASAVA_Build X 135416308 1I ACATAGAATT -/G TGCCTGGCAC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 0 1 10844 CASAVA_Build X 135437208 1I CTGCCTTTGG -/C CTCAACACTC 3070 hom 138 het 55 0 46 9 C 1 2 10845 CASAVA_Build X 135453586 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 A 13 12 10846 CASAVA_Build X 135477387 1I TTGGAGCCCT -/G GGCCAGCCCT 3070 hom 107 het 42 0 36 6 G 2 3 10847 CASAVA_Build X 135477874 3I TGTCTCATGG ---/CCT CCGGCCTCCA 3070 hom 83 het 34 0 24 10 CCT 0 1 10848 CASAVA_Build X 135494243 1D GTTTAGTGCT C/- CCCCCCACCT 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 C 7 6 10849 CASAVA_Build X 135502334 2D TTTTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2049 het 2049 ref 29 15 6 8 T 14 12 10850 CASAVA_Build X 135504318 4D AGTCCATTAC ACTT/---- ACTTCTATTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 6 ACTT 2 1 10851 CASAVA_Build X 135508580 1D CCGACCTTCC T/- TTTTTTTTTC 824 het 824 ref 36 28 3 5 T 10 9 10852 CASAVA_Build X 135512399 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2432 het 1403 hom 12 4 7 1 A 11 12 10853 CASAVA_Build X 135516678 1I TACAAAATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 9 10 10854 CASAVA_Build X 135517332 2I CATCAATCAA --/AT ATATTTAAGA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 AT 2 3 10855 CASAVA_Build X 135522936 1D TGTGTGTGTT G/- GGGGGCGGGG 1140 het 1111 hom 18 5 4 9 G 6 5 10856 CASAVA_Build X 135523587 2I GTTTATTCCT --/CA GTTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 58 33 23 2 CA 0 1 10857 CASAVA_Build X 135549325 1D AGGAAAAAAA T/- ATATATATAT 81 het 81 ref 16 8 1 7 T 1 0 10858 CASAVA_Build X 135619095 4I ATAGTATTGA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTTG 2 3 10859 CASAVA_Build X 135676120 1I ATATAAGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 682 hom 40 2 32 6 A 9 10 10860 CASAVA_Build X 135676218 1I GGTTTTTTTT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 417 hom 23 1 15 7 G 9 10 10861 CASAVA_Build X 135702368 1D CCTCTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 168 hom 18 1 12 5 A 11 10 10862 CASAVA_Build X 135718250 1I TTGTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 598 hom 32 2 22 8 T 10 11 10863 CASAVA_Build X 135732378 1I ACTCATGCTT -/G TAATCCCAGC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 G 0 1 10864 CASAVA_Build X 135751095 1D ATTTTTTAAC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 61 het 25 0 20 5 T 9 8 10865 CASAVA_Build X 135751854 1D AGAAATTTTA T/- TTTTTTTTTT 1863 het 1863 ref 36 19 4 13 T 12 11 10866 CASAVA_Build X 135774969 5D TAAATAAAGT AATTA/----- AATTAAATTA 3070 hom 33 het 14 0 12 3 AATTA 3 2 10867 CASAVA_Build X 135787278 1D CTTAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 1632 het 173 hom 16 1 4 11 T 17 16 10868 CASAVA_Build X 135826699 6I TCTTGTGAAT ------/TTCCTC TTCCTCTTCC 3070 hom 62 het 28 0 21 7 TTCCTC 2 3 10869 CASAVA_Build X 135829362 1D CTGAAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 2630 het 49 hom 30 1 9 20 T 15 14 10870 CASAVA_Build X 135865915 1D TTAAAAAAGC T/- TTTTTTTTTA 2953 het 2953 ref 29 12 10 7 T 10 9 10871 CASAVA_Build X 135870215 1I TGAGGGCTAA -/T TTCTGGTAGT 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 T 2 3 10872 CASAVA_Build X 135873502 1I CAGTATTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1384 hom 26 6 13 7 T 15 16 10873 CASAVA_Build X 135883774 3D TCTCTTTCTC CTT/--- CTCTTCCTCC 3070 het 3070 ref 45 23 17 6 CTT 1 0 10874 CASAVA_Build X 135898359 1I CCTATGACAG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 7 8 10875 CASAVA_Build X 135925639 1I TTAGTGCTCC -/T CTTAATTGTC 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 T 0 1 10876 CASAVA_Build X 135937121 1D TTTAATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 600 hom 34 7 14 13 T 17 16 10877 CASAVA_Build X 135956013 2D CATGCGGATG CA/-- CACACACACA 1802 het 1802 ref 42 28 4 10 CA 10 9 10878 CASAVA_Build X 136002499 1I CTCTCTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 12 13 10879 CASAVA_Build X 136010808 3I TATATACAAG ---/TGA TGATAAGATA 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 TGA 1 2 10880 CASAVA_Build X 136041595 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 19 0 13 6 A 10 9 10881 CASAVA_Build X 136049746 1I TAAAGTATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 9 10 10882 CASAVA_Build X 136061663 1I AAGTACAGGC -/T CTTGATGTGG 3070 hom 131 het 47 0 43 4 T 0 1 10883 CASAVA_Build X 136065922 1D ACAGTGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 20 1 17 2 A 11 10 10884 CASAVA_Build X 136069891 1D ATCTGGAAAA C/- AAGATTTGGG 3070 hom 78 het 32 0 27 6 C 1 0 10885 CASAVA_Build X 136086851 1D AAGATAGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 11 10 10886 CASAVA_Build X 136095649 1D AGCGACTATT G/- GAATCAGCAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 2 1 10887 CASAVA_Build X 136099301 2I GTAATGTGAC --/TA TTAAATATCT 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 TA 0 1 10888 CASAVA_Build X 136121998 1D CCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 42 1 31 10 T 11 10 10889 CASAVA_Build X 136138603 1I TTAAAAACAA -/T TTTTTTTTTT 1668 het 1668 ref 41 26 4 11 T 13 14 10890 CASAVA_Build X 136158022 1I CAATAGCATC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 102 het 46 0 35 11 A 8 9 10891 CASAVA_Build X 136174749 16D ACTGAAAGGG CCTATAAATTGACAGC/---------------- CCCATAGCAA 3070 hom 87 het 29 0 30 1 CCTATAAATTGACAGC 1 0 10892 CASAVA_Build X 136176820 4D TGGGCAGAAT TACA/---- TACAGGTCAG 3070 hom 160 het 56 0 54 3 TACA 2 1 10893 CASAVA_Build X 136182210 1I TTTTAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 42 2 33 7 A 11 12 10894 CASAVA_Build X 136185921 4I AATATTTTCT ----/TAAC TATTTTCACA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TAAC 0 1 10895 CASAVA_Build X 136192108 1I ATGAATATTT -/C CCCCAAAGAG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 C 4 5 10896 CASAVA_Build X 136196331 1I TAAAAAGCAG -/T TAGAAGCAAA 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 1 2 10897 CASAVA_Build X 136208666 1I CCTAACAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 125 hom 34 1 27 6 T 10 11 10898 CASAVA_Build X 136211404 1I TAGGGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2079 hom 30 7 11 12 T 11 12 10899 CASAVA_Build X 136215439 1I TAAGTCCTGC -/A AAAAGACTAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 4 5 10900 CASAVA_Build X 136231709 4I GAGCATCATA ----/CTAT CTATCTAGTT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 CTAT 1 2 10901 CASAVA_Build X 136258709 1I AGATCAATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 9 10 10902 CASAVA_Build X 136262517 2I AAATTGACAC --/AT GTGTTGGCGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AT 0 1 10903 CASAVA_Build X 136296170 1D AATGAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 1451 het 1451 ref 41 26 4 11 A 13 12 10904 CASAVA_Build X 136297344 1I GCTAATTATG -/A AGGCTAATTT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 1 2 10905 CASAVA_Build X 136299618 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 8 10906 CASAVA_Build X 136303940 4D CCACAGTCTT GCCA/---- GCATTTGTCG 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 GCCA 1 0 10907 CASAVA_Build X 136310454 1I TTCTCAAGTA -/G AAGGAGTCTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 0 1 10908 CASAVA_Build X 136316681 5D TTGGCCATAG AGGTA/----- AGGGGTTATT 3070 het 3070 ref 44 21 18 7 AGGTA 1 0 10909 CASAVA_Build X 136336553 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2804 het 48 hom 25 2 10 13 T 14 13 10910 CASAVA_Build X 136363058 1D CACTTCCATC A/- ATTTTTGGAC 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 A 2 1 10911 CASAVA_Build X 136366252 1D TAAAGTAATT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 7 6 10912 CASAVA_Build X 136370023 1D GCTAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 2611 het 2377 hom 20 7 8 5 T 15 14 10913 CASAVA_Build X 136370887 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 22 1 13 8 A 13 12 10914 CASAVA_Build X 136373746 1I GGTTCCCCCC -/T CCAACCCCTG 3070 het 42 hom 31 2 21 8 T 0 1 10915 CASAVA_Build X 136388350 1D TTTGTTTAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 13 14 14 T 10 9 10916 CASAVA_Build X 136395061 10D TGTGTGTGTT TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 1318 hom 39 11 12 21 TG 14 9 10917 CASAVA_Build X 136402376 1I TGTCTTAACA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 8 9 10918 CASAVA_Build X 136411110 1I TAGAGAGAAG -/C CCAAGGAGAC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 C 2 3 10919 CASAVA_Build X 136413041 1D GACTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1994 hom 23 9 10 5 A 15 14 10920 CASAVA_Build X 136431864 1I AAATAAAACA -/T TTTTTTTTTT 2317 het 2317 ref 29 10 9 10 T 13 14 10921 CASAVA_Build X 136432659 3D TAACTCACAT ATA/--- ATAATATGTC 3070 het 3070 ref 47 21 17 10 ATA 3 2 10922 CASAVA_Build X 136433906 1I GGCTGAGTGG -/A AACTCTTCCT 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 A 2 3 10923 CASAVA_Build X 136465321 1I ATGAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1214 hom 28 5 17 6 A 14 15 10924 CASAVA_Build X 136497892 1D CTGGAGATAT A/- AATATAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 2 10925 CASAVA_Build X 136516133 4D AGAAACAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 72 het 29 0 25 7 AAAC 4 3 10926 CASAVA_Build X 136517956 1I TTAAAATGGC -/T TTTTTTTTTT 2824 het 840 hom 22 3 9 10 T 15 16 10927 CASAVA_Build X 136523533 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 39 0 26 13 A 13 12 10928 CASAVA_Build X 136535938 1D TTTATTCTCA T/- TTTTTTTTCC 1883 het 1883 ref 36 27 4 5 T 9 8 10929 CASAVA_Build X 136552018 2D TCTATCTATC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 39 0 28 11 TG 10 9 10930 CASAVA_Build X 136561065 1I CAAAAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 10931 CASAVA_Build X 136561613 1D TCTGTCCAGG T/- TATGGAGGGC 3070 hom 184 het 68 0 62 6 T 2 1 10932 CASAVA_Build X 136592855 1I63M1D TTTATACTGC -TTTTTCCCCCCCCAGGGGAAGAAGTTTGACTTTATTCTGACCTTTATTTACCCTTGTTTCTTTA/TTTTTTCCCCCCCCAGGGGAAGAAGTTTGACTTTATTCTGACCTTTATTTACCCTTGTTTCTTT- AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 38 2 38 21 N/A 0 0 10933 CASAVA_Build X 136602225 1I TTTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 24 2 18 4 T 11 12 10934 CASAVA_Build X 136614511 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 22 0 17 5 T 11 10 10935 CASAVA_Build X 136625653 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 11 10 10936 CASAVA_Build X 136627505 1I ACATTTCGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 25 1 18 6 T 10 11 10937 CASAVA_Build X 136631315 4D ACAGCAACTC TATT/---- TAAATAAATG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TATT 1 0 10938 CASAVA_Build X 136634817 1D GAAAAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 473 hom 30 3 12 15 T 17 16 10939 CASAVA_Build X 136643715 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2564 het 33 hom 26 2 9 15 T 20 18 10940 CASAVA_Build X 136646259 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 35 1 23 11 T 13 12 10941 CASAVA_Build X 136647250 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 26 1 21 4 A 13 14 10942 CASAVA_Build X 136651526 1D AGCAAGGTTA C/- AGCTGAGGGG 3070 hom 90 het 38 0 30 9 C 1 0 10943 CASAVA_Build X 136662764 1D TAAGGAATCG T/- TTTTTTTTTT 1413 het 1413 ref 38 27 4 7 T 11 10 10944 CASAVA_Build X 136666965 2D ATATCACTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 22 0 13 9 T 16 14 10945 CASAVA_Build X 136680030 1I AAGAAGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 35 1 24 10 T 12 13 10946 CASAVA_Build X 136685033 1I CTGCCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 A 13 14 10947 CASAVA_Build X 136685198 2I TGGATACTTC --/TG TGTGTGCCTT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 TG 3 4 10948 CASAVA_Build X 136692981 1I TATCTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 1240 het 1240 ref 35 23 3 9 A 11 12 10949 CASAVA_Build X 136705198 1D AAGAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 11 10 10950 CASAVA_Build X 136709410 1I GGATAGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 30 1 23 6 A 10 11 10951 CASAVA_Build X 136761035 1I AAAAAAGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 100 het 45 0 38 8 A 9 10 10952 CASAVA_Build X 136775168 1I AAAAGCACTA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 71 het 40 1 34 5 T 7 8 10953 CASAVA_Build X 136777021 2D TAAAGTGCGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 41 het 36 1 23 13 GT 10 9 10954 CASAVA_Build X 136795185 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 9 10955 CASAVA_Build X 136800642 2I TCTCATGTAC --/TA TTTTACAGTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TA 0 1 10956 CASAVA_Build X 136810798 4I ATTAAATAAA ----/TAAG TAATTATGTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TAAG 0 1 10957 CASAVA_Build X 136814456 1I GGCAGTTTTG -/T TTTACATGTG 3070 hom 56 het 21 0 19 2 T 3 4 10958 CASAVA_Build X 136824368 1D CTTTATTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 271 hom 34 3 23 9 A 15 14 10959 CASAVA_Build X 136840865 6D TATTCTGTCT CACACA/------ CACACACACA 3070 hom 72 het 42 1 34 8 CA 12 9 10960 CASAVA_Build X 136843705 1D CCATTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 20 1 12 7 A 15 14 10961 CASAVA_Build X 136855992 1I TGGTCTTCAC -/A AAAAGCTTGT 3070 hom 132 het 51 0 44 7 A 4 5 10962 CASAVA_Build X 136881756 1I ACATCAACAA -/C AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 18 0 16 2 C 0 1 10963 CASAVA_Build X 136909888 3I ACGTTAGGTT ---/TTG TTGTTTTTAA 3070 hom 104 het 39 0 35 4 TTG 1 2 10964 CASAVA_Build X 136911677 1D GTTGAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 47 0 37 10 A 12 11 10965 CASAVA_Build X 136930007 1I TGTGTGTCTG -/T GGTCTTTTGT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 0 1 10966 CASAVA_Build X 136931508 1I AAAAGATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 754 hom 33 2 22 9 A 11 12 10967 CASAVA_Build X 136957303 4D GCATGTGTAT TAAA/---- TAAATGAATG 3070 hom 130 het 52 0 43 11 TAAA 2 1 10968 CASAVA_Build X 136967647 1D ATATACAGAG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 8 7 10969 CASAVA_Build X 137021626 4D TGGATGAATG GATA/---- AAGAAAATGT 3070 hom 138 het 52 0 47 6 GATA 1 0 10970 CASAVA_Build X 137085760 1I GATGAATGGG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 7 8 10971 CASAVA_Build X 137087240 5I GTACAGCCAG -----/ATAAA ATAAAGTTTG 3070 hom 157 het 56 0 53 3 ATAAA 1 2 10972 CASAVA_Build X 137088278 2I TGATAACACG --/CA CACACACACA 1718 hom 17 het 40 0 6 34 CA 7 8 10973 CASAVA_Build X 137090395 3D GTTTTAAGGC AAT/--- AAAAAATTAA 3070 hom 57 het 27 0 18 9 AAT 1 0 10974 CASAVA_Build X 137092687 1D GTCCAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 1577 het 214 hom 8 1 5 2 T 15 14 10975 CASAVA_Build X 137109882 1I GAAGCCCATC -/A GACCAACAGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 0 1 10976 CASAVA_Build X 137114311 5D TTCTGTCTTC TTTAA/----- TTTCTTTCAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TTTAA 1 0 10977 CASAVA_Build X 137118628 5D AATATAAAAC AAATT/----- AAGAAGGAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 AAATT 1 0 10978 CASAVA_Build X 137137875 2D CACGTGGAAC TG/-- TGTGGGTCCA 3070 hom 78 het 32 0 27 7 TG 3 2 10979 CASAVA_Build X 137146710 2D TTTAAAAAAT AA/-- AAAAAAAATG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 10 8 10980 CASAVA_Build X 137150499 1I AAATGAATAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 43 0 36 7 A 8 9 10981 CASAVA_Build X 137318572 1I CTCAGTGGTT -/C CCAATCCTAT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 C 2 3 10982 CASAVA_Build X 137371803 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 11 10983 CASAVA_Build X 137395677 1D TGCCTCCTCC T/- TCTGAGGGCT 3070 hom 117 het 45 0 38 8 T 2 1 10984 CASAVA_Build X 137475031 7I CCCAGGAACT -------/TAAAAAA TAAAAAAACA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TAAAAAA 1 2 10985 CASAVA_Build X 137501845 1I CAGCATTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 11 12 10986 CASAVA_Build X 137541032 1I AAAATTTACA -/T TTTTCCTTCA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 4 5 10987 CASAVA_Build X 137569868 1I AAGCCTGCAC -/A TTCTGCACAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 1 10988 CASAVA_Build X 137576736 4D GAGAACAAAC TAAA/---- TAGATTATTA 3070 het 2825 hom 28 8 17 5 TAAA 1 0 10989 CASAVA_Build X 137598909 1D TGAACCCTGA G/- GGGCAGAGGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 4 3 10990 CASAVA_Build X 137599241 1I AGTGGCAGAG -/C CCTTGCCTCT 3070 hom 96 het 38 0 31 7 C 2 3 10991 CASAVA_Build X 137604280 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1188 het 78 hom 8 1 4 3 T 17 16 10992 CASAVA_Build X 137643710 1I TATGGACAGG -/A AAAAAAAAAA 1452 het 1452 ref 49 38 4 7 A 10 11 10993 CASAVA_Build X 137695428 1D CTAGCCAATC T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 T 4 3 10994 CASAVA_Build X 137696498 1I6M1I TCACCAGCAA -GCCAGA-/GGCCAGAG GGCAGCAATG 3070 hom 96 het 34 0 33 5 N/A 0 0 10995 CASAVA_Build X 137698617 1D TCACATTTTG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 71 35 31 5 T 9 8 10996 CASAVA_Build X 137738131 1I GGCGCGGTGG -/C TCACGCCTGT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 C 0 1 10997 CASAVA_Build X 137809671 1I TTGCCTGCAA -/T TTAGAAGCAT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 2 3 10998 CASAVA_Build X 137814264 1I CACATATGAG -/T GCTGAGCACC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 10999 CASAVA_Build X 137817900 1D AATCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1905 hom 36 10 14 12 T 17 16 11000 CASAVA_Build X 137831987 1I ATTTTCTCAC -/A ACAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 1 2 11001 CASAVA_Build X 137835254 5I TTGAAGAAAG -----/AAGAA AAGGGGATGA 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 AAGAA 0 1 11002 CASAVA_Build X 137843497 16D CATTGGCTTC CGAATTGGTCTTTATG/---------------- CGAATTGGTC 3070 het 3070 hom 54 19 24 16 CGAATTGGTCTTTATG 2 1 11003 CASAVA_Build X 137881188 1I ATAATTGCTA -/G GGGTTTTTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 3 4 11004 CASAVA_Build X 137886563 1D AAATTTTCTG C/- AAAAAAGCCC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 C 1 0 11005 CASAVA_Build X 137890504 8D AGAAGTGTGG TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1867 het 769 hom 41 12 7 22 T 22 14 11006 CASAVA_Build X 137893190 18D TAGAAGAGGC TATTCTTTCCCCATTGTG/------------------ TATTCTTGGC 2889 hom 18 het 11 0 7 4 TATTCTTTCCCCATTGTG 1 0 11007 CASAVA_Build X 137899581 1I CTATTAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 11 12 11008 CASAVA_Build X 137903110 1D4M2I TGTAGTGCAG TTAAT--/-TAGTGC AGTATTGTAT 3070 hom 148 het 54 0 50 5 N/A 0 0 11009 CASAVA_Build X 137904813 3D CTATGTAACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 48 2 26 22 A 18 15 11010 CASAVA_Build X 137907258 1I AAGCTAAGAA -/C CTTGAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 1 2 11011 CASAVA_Build X 137908336 2D AAATGGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 20 1 10 9 A 12 10 11012 CASAVA_Build X 137913452 2D AGTTAGATAC AG/-- AGTTTCCACA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AG 2 1 11013 CASAVA_Build X 137916428 4D TTAAATGATG AATC/---- AATCAAAGAT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 AATC 2 1 11014 CASAVA_Build X 137937745 4I AAAGTGTCAC ----/AAGA AAGTATACAC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AAGA 0 1 11015 CASAVA_Build X 137952400 1D GCATTTATGT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 41 19 16 6 A 8 7 11016 CASAVA_Build X 137984811 1D AGCTCCATCA G/- TGAAGTTCGC 3070 het 3070 hom 40 19 20 2 G 1 0 11017 CASAVA_Build X 138062283 1I TATAAAAGGG -/A ACTCTGGTTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 2 11018 CASAVA_Build X 138105008 1I CGCGATCGTC -/G GGTTCCCAGC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 2 3 11019 CASAVA_Build X 138142899 1I GTTATCACTC -/T AGATAAATGC 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 T 0 1 11020 CASAVA_Build X 138144125 3D CTTTGAATAA AAG/--- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 16 3 AAG 2 1 11021 CASAVA_Build X 138145690 1D CTCATCCCAT C/- CCTGCTACTG 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 C 3 2 11022 CASAVA_Build X 138146400 1I TAGGGCAGGG -/C CCCTTCACCT 3070 hom 132 het 47 0 44 3 C 3 4 11023 CASAVA_Build X 138150914 1I GACCATTAGC -/T TGGCAAGTAA 1164 het 1164 ref 26 20 3 3 T 1 2 11024 CASAVA_Build X 138151788 1I GCGGAAAAGG -/C TTTCGCTAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 0 1 11025 CASAVA_Build X 138153833 1I CACACTGGGG -/C CTGCCAGGGC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 1 2 11026 CASAVA_Build X 138166854 2I ATTCCAATTG --/TT TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 2 4 11027 CASAVA_Build X 138167534 2D TGAGATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 10 16 T 14 12 11028 CASAVA_Build X 138179453 1I ATAAAAATGC -/A AGATAATTAG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 1 2 11029 CASAVA_Build X 138180168 1I ACGATGTGAG -/T TTTCAATTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 3 4 11030 CASAVA_Build X 138180283 1I ATTGACATAC -/A GGATTGGCTC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 0 1 11031 CASAVA_Build X 138189708 1I TTGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 39 1 34 4 A 10 11 11032 CASAVA_Build X 138191554 1D CATATGGTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2213 hom 20 5 9 6 T 10 9 11033 CASAVA_Build X 138194135 1I AACCACCCCC -/A AGATTCAATT 3070 hom 81 het 28 0 25 3 A 1 2 11034 CASAVA_Build X 138203914 1D AATATGGATT G/- GAACCCATAT 3070 hom 138 het 55 0 47 9 G 2 1 11035 CASAVA_Build X 138209509 1I CTCTATCCTG -/C TCCCCCAGTT 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 C 0 1 11036 CASAVA_Build X 138225418 1I GAAAATAATG -/C CTCTCTACTT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 1 2 11037 CASAVA_Build X 138229345 1I CAAAACCTAC -/T AAATGCAGCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 0 1 11038 CASAVA_Build X 138248065 3D TGTTTCATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 42 17 17 9 TTG 4 3 11039 CASAVA_Build X 138267864 11D GAAAATATAG GTGAGAGTCAT/----------- GTTGTTTATG 3070 het 3070 hom 42 22 21 5 GTGAGAGTCAT 1 0 11040 CASAVA_Build X 138271302 1I TTTAGTCAAA -/G ATTTATATCC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 G 0 1 11041 CASAVA_Build X 138300248 1D TTGGGTATCA T/- TTTTTTTTTT 1397 het 1397 ref 38 25 5 8 T 13 12 11042 CASAVA_Build X 138337141 1D ATTTATTGAG C/- CCTTGCTATG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 3 2 11043 CASAVA_Build X 138337378 1I AAGAGCCACG -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 11044 CASAVA_Build X 138338121 4D CTAAGGCTGG CGGT/---- GGGTGGAGGC 3070 hom 129 het 48 0 44 7 CGGT 1 0 11045 CASAVA_Build X 138396984 1I TCTTTCTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 9 10 11046 CASAVA_Build X 138398107 1D AGCAACTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 36 0 29 7 A 12 11 11047 CASAVA_Build X 138398417 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 44 0 33 11 T 11 10 11048 CASAVA_Build X 138399194 7D GAAAGGAGGT TTATTTC/------- TTATTTCTGA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 TTATTTC 2 1 11049 CASAVA_Build X 138408473 1D CACAAAAAAA T/- ATAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 35 10 20 6 T 1 0 11050 CASAVA_Build X 138412197 2D CCTCAGGTAG TT/-- ATCTTTGTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 0 11051 CASAVA_Build X 138412799 4D GTTTAGGGAG ATAT/---- ATATATATAT 969 het 43 hom 10 1 5 4 AT 11 9 11052 CASAVA_Build X 138416232 3I GGCAGGATAT ---/TGG TGGTGGTGGT 3070 hom 93 het 50 0 27 23 TGG 5 6 11053 CASAVA_Build X 138423412 2D CCAAAAGAAA CT/-- CTATATCCAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 CT 2 1 11054 CASAVA_Build X 138428396 1I CTGAAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 10 11 11055 CASAVA_Build X 138474509 2I GAGAGAAGAG --/AC ACTATAATTG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 AC 1 2 11056 CASAVA_Build X 138500375 7D ACAATATCTC TTCCTTA/------- TTCCTTACCA 2929 het 2929 ref 31 22 7 4 TTCCTTA 2 1 11057 CASAVA_Build X 138514145 1I TTTTTTAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2244 hom 27 7 15 5 A 13 14 11058 CASAVA_Build X 138533493 2D3M6D CCTCAAATGT AACAGTATACC/--CAG------ CATGTAACAG 3070 het 3070 ref 43 23 21 3 N/A 0 0 11059 CASAVA_Build X 138541126 4D TTTGTTTTGT TTTG/---- TTTTTTTCAA 516 het 516 ref 24 13 3 11 TTTG 1 0 11060 CASAVA_Build X 138542048 2I TTTAAAAGAC --/AA ATTTTAATTT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 A 1 3 11061 CASAVA_Build X 138549774 3D CTTATATATA TAT/--- TATCTTATTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 TAT 2 1 11062 CASAVA_Build X 138556113 3D AAATTTTGTC TTT/--- AACACACATA 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 T 3 0 11063 CASAVA_Build X 138559471 1D ACGAGTAAAC T/- TTATGAGAAG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 3 2 11064 CASAVA_Build X 138560339 7I TTCTTGTACT -------/CTGAATA CCTAAGAAGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CTGAATA 0 1 11065 CASAVA_Build X 138596889 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 168 hom 61 1 38 22 AC 7 8 11066 CASAVA_Build X 138630786 1I GCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 21 1 14 6 A 11 12 11067 CASAVA_Build X 138644140 2I TCTACCACTC --/TT TGAAAGAGTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 1 3 11068 CASAVA_Build X 138649117 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1557 het 1557 ref 44 33 4 7 T 12 11 11069 CASAVA_Build X 138822575 5I TACGTATGAT -----/TTTTA TTTTGATTGC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTTTA 0 1 11070 CASAVA_Build X 138826054 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3037 het 478 hom 20 3 12 5 A 16 17 11071 CASAVA_Build X 138830200 6D AAGAATTAAG TACTGA/------ TACTGATACA 3070 hom 41 het 20 0 17 3 TACTGA 2 1 11072 CASAVA_Build X 138843147 1D CACTCGGTAG C/- CTTCCTAGCG 2229 hom 27 het 11 0 8 3 C 2 1 11073 CASAVA_Build X 138848281 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 4 A 16 15 11074 CASAVA_Build X 138888913 2D AGTGCATACA CT/-- GTGTCAGAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 5 CT 1 0 11075 CASAVA_Build X 138889727 9D CAGAAAAATC CAATGAAAT/--------- CAAATGCTGC 3070 hom 39 het 17 0 14 4 CAATGAAAT 1 0 11076 CASAVA_Build X 138890114 1I GGGACTGAGG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 64 het 28 0 22 6 A 7 8 11077 CASAVA_Build X 138893262 13I GGTGGCTTCA -------------/CCAGGTGGTCTCT CCAGGTCCTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CCAGGTGGTCTCT 0 1 11078 CASAVA_Build X 138895397 10D AAAAATAAAT AAATAAAATA/---------- AAATAAAATA 3070 hom 48 het 19 0 17 4 AAATA 6 4 11079 CASAVA_Build X 138896609 1I ACCATCCAGA -/G GCAGCTGGTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 2 11080 CASAVA_Build X 138898830 1D TTTTCTAGAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 9 8 11081 CASAVA_Build X 138908706 2D CTTTTTGATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 12 10 11082 CASAVA_Build X 138915926 1D GGAACATCTG A/- ACCCCTGGCC 2803 het 2803 ref 39 23 9 7 A 2 1 11083 CASAVA_Build X 138917865 1I TTTTACATTC -/A GGGGGAACAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 11084 CASAVA_Build X 138933667 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 20 2 13 5 T 13 14 11085 CASAVA_Build X 138954875 1D TTAGAATACT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 G 10 9 11086 CASAVA_Build X 138964927 1I TGTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 23 1 15 7 A 14 15 11087 CASAVA_Build X 138975593 1D AATTATCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 34 1 21 12 T 13 12 11088 CASAVA_Build X 138975939 3D TGAGGTATCA TCT/--- TCTTGCCATG 3070 het 3070 hom 52 24 23 7 TCT 2 1 11089 CASAVA_Build X 138976415 3D GTATTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 24 1 14 9 T 16 13 11090 CASAVA_Build X 139000363 1D TGGAAATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 T 11 10 11091 CASAVA_Build X 139010038 1D GGTAAAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3045 hom 31 8 15 10 A 13 12 11092 CASAVA_Build X 139013410 1D AATTGAGTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 21 8 7 T 10 9 11093 CASAVA_Build X 139013667 1D AATTAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 44 4 23 17 A 17 16 11094 CASAVA_Build X 139024808 1I GATGTTGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 11 10 6 T 9 10 11095 CASAVA_Build X 139028680 1D TCTAGTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 T 11 10 11096 CASAVA_Build X 139032752 2D ATATCCTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 T 13 11 11097 CASAVA_Build X 139039732 4I TCAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 AAAC 3 4 11098 CASAVA_Build X 139048728 2D AGAATTGTTC AT/-- GTTTGTTGAA 1785 het 1785 ref 66 59 4 3 AT 1 0 11099 CASAVA_Build X 139054076 1I TAATTGAGAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 2378 hom 21 8 9 4 A 8 9 11100 CASAVA_Build X 139060136 1I AAAACAAAAA -/C AAAAAAAACA 3070 het 1818 hom 31 7 19 5 C 0 1 11101 CASAVA_Build X 139075525 1D ACTTTACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 11 22 20 T 11 10 11102 CASAVA_Build X 139095392 3D CCTACAGCTG AGA/--- AGAAGTCAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AGA 2 1 11103 CASAVA_Build X 139113463 1I GAAGATGTTT -/A AGTTAAATTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 1 2 11104 CASAVA_Build X 139129867 4D GCATCCAAAT AGAA/---- AGAGAAGTCA 2370 het 2370 ref 45 36 6 4 AGAA 1 0 11105 CASAVA_Build X 139175379 1D CAGCTGTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 20 8 A 12 11 11106 CASAVA_Build X 139270516 4D TATAGTTTTG TTTC/---- TTTTCACCAT 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 TTTC 1 0 11107 CASAVA_Build X 139309588 1I TTTTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 24 3 19 2 A 12 13 11108 CASAVA_Build X 139412065 17D ACTGGAGGAA AGTGGGGAGGGGGATGG/----------------- AGTGGGGAGG 3070 hom 39 het 17 0 10 10 AGTGGGGAGGGGGATGG 2 1 11109 CASAVA_Build X 139420026 5D CCGCAGACTG CCAAA/----- CCCCCACCCC 3070 hom 41 het 17 0 12 5 CCAAA 1 0 11110 CASAVA_Build X 139422569 1D AGCCTGCAAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 8 7 11111 CASAVA_Build X 139424353 51I TGTCACACTT ---------------------------------------------------/TTATTGAAGGTCTACTATAGGCCAGATATTCTTCAAGAACTTGGGGGTACA ACATTCTAGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TTATTGAAGGTCTACTATAGGCCAGATATTCTTCAAGAACTTGGGGGTACA 0 1 11112 CASAVA_Build X 139424972 5D TTATTTATTT ATTTA/----- TTTTTTTTGT 3070 het 155 hom 21 1 18 4 ATTTA 1 0 11113 CASAVA_Build X 139426268 2D31M5I GAATAATAAT AAAAAAAAAAAAAGTAATTCTAATCACCAGCAC-----/--AAAAAAAAAAAGTAATTCTAATCACCAGCACAGAGT AAAGTCTTAT 3070 hom 55 het 23 0 19 5 N/A 0 0 11114 CASAVA_Build X 139450928 1D AGCTTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1048 hom 36 4 22 10 T 15 14 11115 CASAVA_Build X 139472962 1D TCCTTCCTAA T/- TTTTTTTTTT 1557 het 1557 ref 49 37 5 7 T 13 12 11116 CASAVA_Build X 139488973 1I AGGTTAACCT -/G GGGCACCAAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 3 4 11117 CASAVA_Build X 139510200 1D TTTCCACCCA T/- TTTTTAAGGG 3070 het 3070 ref 66 33 26 7 T 6 5 11118 CASAVA_Build X 139520658 1D38M2I GATCTTCTCT ATTTTTTTTTTCTTAGTGTGGCTAAAGGTTTGTCAATTT--/-TTTTTTTTTTCTTAGTCTGGCTAAAGGTTTGATAATTTTG TTTAACTTTT 2756 het 2756 ref 33 27 6 4 N/A 0 0 11119 CASAVA_Build X 139521132 2I GTGACCTAAC --/AT GTGGTCTGTC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 AT 0 1 11120 CASAVA_Build X 139521342 2I TTGGGGCCTA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 TC 8 9 11121 CASAVA_Build X 139521853 1I CTTTCCTTTG -/T TGTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 39 10 18 11 T 1 2 11122 CASAVA_Build X 139553936 1I CCTAATTCCC -/T GATAGCAGCC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 0 1 11123 CASAVA_Build X 139555726 2I CCAGTTCATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 10 12 11124 CASAVA_Build X 139625432 4D TCTAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 20 10 3 AAAG 4 3 11125 CASAVA_Build X 139641578 2I AGGACAAAAC --/AT GTCCACATGG 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 AT 0 1 11126 CASAVA_Build X 139664673 1I GCATAGGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 10 11 11127 CASAVA_Build X 139670968 1D GCATTTACCC T/- CCTTGTAGTT 3070 het 3070 hom 59 23 27 9 T 1 0 11128 CASAVA_Build X 139673234 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2589 hom 32 het 13 0 9 4 A 20 18 11129 CASAVA_Build X 139675574 4I TCAATTCTTA ----/CCAT CCCCTAGAGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CCAT 0 1 11130 CASAVA_Build X 139676770 1D TGTGTTAGAA C/- CTATGAGCTA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 2 1 11131 CASAVA_Build X 139681678 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGCA 2142 hom 12 het 5 0 5 0 T 7 8 11132 CASAVA_Build X 139685679 1D CACTCAAACG T/- TGAAATTTGG 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 2 1 11133 CASAVA_Build X 139689087 1D TGGCAAAAAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 42 12 13 19 A 8 7 11134 CASAVA_Build X 139697010 1I TAGCAAAGTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 8 9 11135 CASAVA_Build X 139698743 6D TATATATATA TATGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 83 hom 18 2 12 6 TATGTG 1 0 11136 CASAVA_Build X 139699260 3D CTTTACAATC TAT/--- TATTTATTTA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TAT 2 1 11137 CASAVA_Build X 139700135 1D AGAGAGTCAG T/- TTTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 7 6 11138 CASAVA_Build X 139700973 1I CTGATAAATG -/C CCCCTTTTCA 3070 het 3070 ref 51 29 21 1 C 4 5 11139 CASAVA_Build X 139702067 4D AGCATTTTCA TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 35 14 18 5 TGTT 5 4 11140 CASAVA_Build X 139750876 3D CTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 31 0 15 16 T 17 14 11141 CASAVA_Build X 139751042 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 6 5 11142 CASAVA_Build X 139755138 1D TCCTTAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 31 0 25 6 T 16 15 11143 CASAVA_Build X 139796876 1D CACTACTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 47 1 36 10 A 12 11 11144 CASAVA_Build X 139800546 1I TGGCTATGAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 8 9 11145 CASAVA_Build X 139813271 2D CTGCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 36 0 15 22 T 20 18 11146 CASAVA_Build X 139813529 1D AGCAACAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 37 1 27 10 T 12 11 11147 CASAVA_Build X 139827142 1I TCCTTTGCTA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 8 11148 CASAVA_Build X 139828391 1I AACTAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 16 7 A 11 12 11149 CASAVA_Build X 139840762 1D TCGCAGCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 30 2 20 8 A 13 12 11150 CASAVA_Build X 139842618 1I GATACAGTCA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 7 8 11151 CASAVA_Build X 139846086 3I CACAGGTAAT ---/CTC CTCATCTCAA 3070 hom 147 het 55 0 49 6 CTC 1 2 11152 CASAVA_Build X 139846882 2I ATTTTCATTG --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 9 11 11153 CASAVA_Build X 139858289 1D GAAGGATGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 16 5 T 10 9 11154 CASAVA_Build X 139867101 1I TCTGTCTCAC -/A AAAAAAAAAA 907 het 907 ref 23 8 4 11 A 15 16 11155 CASAVA_Build X 139869044 4D AAAAGAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 75 het 33 0 25 10 AAAG 4 3 11156 CASAVA_Build X 139885927 1D CAGAGAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 203 hom 33 1 19 13 A 15 14 11157 CASAVA_Build X 139887002 1D GACAACTGTG A/- AAAATGCTGT 3070 hom 138 het 52 0 47 6 A 5 4 11158 CASAVA_Build X 139907797 1I TGAGCAAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 673 hom 32 2 23 7 T 9 10 11159 CASAVA_Build X 139909920 1D TTATGATATT A/- AAAAAAACAC 2934 het 2453 hom 13 5 6 2 A 8 7 11160 CASAVA_Build X 139975323 2D TCTTTTTTTT TA/-- AAATGTTTTC 1311 het 1022 hom 7 3 3 1 TA 1 0 11161 CASAVA_Build X 139987478 2D ATGGTCAAGA GG/-- GATCGAGGGA 2794 het 2794 ref 27 19 6 3 G 3 1 11162 CASAVA_Build X 140011418 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAC 2854 het 725 hom 15 2 11 2 C 1 0 11163 CASAVA_Build X 140017576 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1250 het 216 hom 5 1 3 1 A 12 11 11164 CASAVA_Build X 140086817 1I CTTTCATGAT -/A AAAAAAAAAT 854 het 854 ref 41 34 2 5 A 9 10 11165 CASAVA_Build X 140170091 1D AAACAACGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1125 hom 18 4 12 2 A 13 12 11166 CASAVA_Build X 140233933 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 21 1 18 3 A 12 11 11167 CASAVA_Build X 140236141 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2475 het 31 hom 24 1 10 15 A 20 18 11168 CASAVA_Build X 140238252 1I GGGGTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 30 0 20 10 T 11 12 11169 CASAVA_Build X 140243370 1I AAAGTACAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 8 9 11170 CASAVA_Build X 140251830 2I TTCATGAATC --/AA AATTAGCATT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 2 4 11171 CASAVA_Build X 140254744 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 8 9 11172 CASAVA_Build X 140254945 1D CCAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 518 het 518 ref 33 24 2 7 A 13 12 11173 CASAVA_Build X 140255604 3I CTTGTGATAA ---/TAC TACTCTGCTC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TAC 1 2 11174 CASAVA_Build X 140278219 9D GACTCTGTCT CAACAACAA/--------- CAACAACAAC 2603 het 2603 ref 19 11 7 3 CAA 9 6 11175 CASAVA_Build X 140307124 4I GCTCCCACTT ----/GTAA GTGAGAGCAC 3070 het 3070 ref 48 26 16 7 GTAA 0 1 11176 CASAVA_Build X 140337501 3I CACTCTCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 49 20 23 6 AAC 3 4 11177 CASAVA_Build X 140346185 1D CAAATTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1906 hom 35 9 8 18 T 13 12 11178 CASAVA_Build X 140347975 1I CCAAAAGACA -/T TTTTTTACTG 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 6 7 11179 CASAVA_Build X 140415493 1I TTCTGTTGTG -/T TTTTTTTTTT 495 het 495 ref 16 5 5 6 T 17 18 11180 CASAVA_Build X 140437509 2D TTCCCTCGAT CC/-- CTCTTGACCA 2203 het 2203 ref 23 16 5 2 C 3 1 11181 CASAVA_Build X 140437572 1D TTACCTCTGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 9 8 11182 CASAVA_Build X 140451358 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2300 het 804 hom 11 3 5 3 A 11 10 11183 CASAVA_Build X 140501322 5D TATACAATCC TATAA/----- TATATTTCTA 3070 het 2388 hom 35 5 26 4 TATAA 1 0 11184 CASAVA_Build X 140532995 1I AATTAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 8 9 11185 CASAVA_Build X 140601922 1I AAAAGTTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 T 9 10 11186 CASAVA_Build X 140632364 9D CCCCTCACCC CGCAACAGG/--------- CCCCGGTGTG 1370 het 941 hom 6 3 3 0 CGCAACAGG 1 0 11187 CASAVA_Build X 140640114 2D TTTTTACCCC CT/-- GTTTCCATGT 3070 het 3070 hom 56 25 27 4 CT 1 0 11188 CASAVA_Build X 140642491 1I TCCTTACCCC -/T GATAGCTGCA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 0 1 11189 CASAVA_Build X 140669794 4I TTTTTCTTTA ----/AGAT AGATAGAGTC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AGAT 1 2 11190 CASAVA_Build X 140672141 1I TATTGTGCCT -/C CTTTTTCTAT 3070 hom 141 het 56 0 50 6 C 1 2 11191 CASAVA_Build X 140673635 12D TATACGTGCA TATACAGGTGCG/------------ TATACAGGTG 3070 het 3070 ref 49 19 15 20 TATACAGGTGCG 2 1 11192 CASAVA_Build X 140675220 6D AAACACACAT ACACAC/------ ACACACACAC 3045 het 2518 hom 32 9 15 8 AC 9 6 11193 CASAVA_Build X 140681333 3I ATAATAATAG ---/TGC TGCTAATATT 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 TGC 1 2 11194 CASAVA_Build X 140689705 4I ATATATATAT ----/ATAC ACACATATAT 1480 hom 10 het 5 0 4 1 ATAC 0 1 11195 CASAVA_Build X 140693387 1I CATGTTCCTA -/T TATCATTTGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 1 2 11196 CASAVA_Build X 140694476 4I GGAGACAGAC ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 GA 7 9 11197 CASAVA_Build X 140698144 1D TGCGCCTACA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 29 8 16 6 T 8 7 11198 CASAVA_Build X 140698884 2D ATCTCCAAAC TT/-- ATGTTTGGTT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 2 0 11199 CASAVA_Build X 140707370 1I AAGGAAAGCT -/A AATTGCTTTA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 2 3 11200 CASAVA_Build X 140708102 2I AAGATGATTT --/TA TATATATATA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TA 7 8 11201 CASAVA_Build X 140760383 1D TAATTGGTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 T 9 8 11202 CASAVA_Build X 140770974 2D ATGATATAAC AT/-- GTGTAGAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AT 1 0 11203 CASAVA_Build X 140772023 1I GTATATATCC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 8 9 11204 CASAVA_Build X 140774530 1D TGTTTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 785 hom 30 6 14 10 T 12 11 11205 CASAVA_Build X 140778799 2D GATGGGACAC AG/-- GGGCATTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AG 1 0 11206 CASAVA_Build X 140780602 1I ATTTATAAAT -/A TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 A 0 1 11207 CASAVA_Build X 140785894 1I TAATTTACAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 19 9 7 3 A 8 9 11208 CASAVA_Build X 140786809 1D AAAACAGAGA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 T 8 7 11209 CASAVA_Build X 140809167 1D GGCAGGAATT G/- GGGGGGGGGG 2780 het 927 hom 24 5 9 11 G 11 10 11210 CASAVA_Build X 140843536 7I CTTCTACTAA -------/TTTTAGG TTTTGATTGA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TTTTAGG 0 1 11211 CASAVA_Build X 140844665 1I ATCCGTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 10 11 11212 CASAVA_Build X 140849023 1I CTTTAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 10 11 11213 CASAVA_Build X 140854997 1D TTTATTCTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 A 10 9 11214 CASAVA_Build X 140856583 1I CATCATTGTA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 6 7 11215 CASAVA_Build X 140860435 2I ATTTATCCAT --/GA GAGGGATATG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 GA 1 2 11216 CASAVA_Build X 140863969 3I AACCTTGTCA ---/GAT GATCTTTCCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 GAT 1 2 11217 CASAVA_Build X 140885489 2D TGAAAGACAC TT/-- AGGTTGATTT 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 T 2 0 11218 CASAVA_Build X 140897495 1D GTACTTTCAA G/- AAAGCACCAG 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 G 1 0 11219 CASAVA_Build X 140898358 1I GATAGACTTT -/C CCCCTTTCAA 3070 hom 120 het 45 0 35 10 C 4 5 11220 CASAVA_Build X 140898934 2D GATTGGCTGA AT/-- ATAATGAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 15 3 AT 2 1 11221 CASAVA_Build X 140899547 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 1353 het 459 hom 34 4 7 25 T 20 18 11222 CASAVA_Build X 140902127 1I GAGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 18 1 7 10 T 10 11 11223 CASAVA_Build X 140903628 1I GTTTCATCCA -/T TGTCATTGTA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 1 2 11224 CASAVA_Build X 140919926 1I CAGAGGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 10 25 7 T 10 11 11225 CASAVA_Build X 140920205 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 46 het 29 1 28 0 A 10 9 11226 CASAVA_Build X 140922463 1D AGCAATTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 11 10 11227 CASAVA_Build X 140922678 1D AAAATGAGGA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 6 11228 CASAVA_Build X 140924306 1D TTTTAATGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 10 9 11229 CASAVA_Build X 140925500 2D ATTTCATTCC AT/-- GTGCGTGTGC 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 AT 1 0 11230 CASAVA_Build X 140926742 2D9M4D AGCAATTGTT GGGGGGTGGGGGGGC/--GGGGTGGGG---- GGGCGCTGTG 3070 het 99 hom 18 2 9 11 N/A 0 0 11231 CASAVA_Build X 140928101 14I CAATATGGAC --------------/ACACTGTTTTCCAG TCCCAGTAGC 3070 het 3070 hom 33 12 20 2 ACACTGTTTTCCAG 0 1 11232 CASAVA_Build X 140929448 1D TTCTGCCACA T/- TTTTTCCTTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 6 5 11233 CASAVA_Build X 140931120 1D CTATATCTAC A/- AAAAAAATCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 7 11234 CASAVA_Build X 140935761 1I TATCTGTGAA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 T 7 8 11235 CASAVA_Build X 140938685 1I TTTCCCCATA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 T 8 9 11236 CASAVA_Build X 140944209 2D CGTCTCTGCT AA/-- AAAAAAAAAT 1434 het 791 hom 8 4 3 1 A 11 9 11237 CASAVA_Build X 140949275 5D GGGGGTTGGG TCTTT/----- CTCCTTCTGT 2697 het 2697 ref 23 17 6 0 TCTTT 1 0 11238 CASAVA_Build X 140949571 1D AGTAACATCA T/- TTTTTTTTAT 2292 het 2292 ref 27 13 6 8 T 9 8 11239 CASAVA_Build X 140959310 1I ATTTGTAAGG -/C CTGCCTTCAA 3070 het 3070 hom 61 26 26 9 C 1 2 11240 CASAVA_Build X 140959565 3D TTTATCCATT TTA/--- TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 TTA 1 0 11241 CASAVA_Build X 140969038 1I CTCCAACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 10 11 11242 CASAVA_Build X 140970645 4D ATGAATGAGT TAGA/---- TAAAGAGTCT 3070 het 3070 hom 34 13 19 4 TAGA 1 0 11243 CASAVA_Build X 140971883 1D54M2D CTTCTTCTGG AGAGAAACTTCCCTGGTTAGGTTAACCTTAAGGTTTCCAATGGATATACAGTTCCAA/-GGGGAACTGTCCTTGTTAGCTTTACCTTAAGGGTTCCAATGGGCATATGGTTCC-- GAGTGTGGAG 1223 het 1223 ref 49 62 3 9 N/A 0 0 11244 CASAVA_Build X 140979378 1I AGTTCAGTAC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 8 9 11245 CASAVA_Build X 140991480 1I CCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2393 hom 25 7 14 4 A 14 15 11246 CASAVA_Build X 140997168 1I AGAGTGCGGG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 29 11 13 5 A 7 8 11247 CASAVA_Build X 141020973 1D CATGTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 T 11 10 11248 CASAVA_Build X 141066337 1D CTCAGGGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 11 10 11249 CASAVA_Build X 141074849 1D AAAGTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 A 11 10 11250 CASAVA_Build X 141093234 1I ATGTGCAGGC -/T TTTTACGTAT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 4 5 11251 CASAVA_Build X 141094038 2D TTTTAATGGG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 11 9 11252 CASAVA_Build X 141094307 1I TTTTCTAAGG -/T TTTTTATGGT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 5 6 11253 CASAVA_Build X 141096003 1D TTAAAAAACC A/- CATCTATCTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 1 0 11254 CASAVA_Build X 141103181 2D CACACACACC CA/-- CACACACACA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 CA 7 6 11255 CASAVA_Build X 141144875 1I CCTCTCATAT -/C CCCCCCCACC 3070 het 409 hom 17 1 14 2 C 7 8 11256 CASAVA_Build X 141160761 1D CCTAAGCTGG C/- CCCCCACAGA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 C 6 5 11257 CASAVA_Build X 141219324 1D GACTGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 23 11 T 13 12 11258 CASAVA_Build X 141233861 3D AGACTGCGTC TCA/--- ACAAAAAAAG 3070 hom 81 het 28 0 28 1 TCA 1 0 11259 CASAVA_Build X 141248211 1D38M3I CCTTTCCACT GGAGGTCTGAGAAACCCAGGCTGAGGGAGAACACTTTAT---/-GAGGTCTGAGAAACCCAGGCTGAGGGAGAACACTTTATTTC TTCTCCCAAG 3070 hom 94 het 38 0 28 30 N/A 0 0 11260 CASAVA_Build X 141262085 1D GTTATTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 12 11 11261 CASAVA_Build X 141264018 1I TTCTACTAAG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 20 13 7 0 A 7 8 11262 CASAVA_Build X 141276647 4I TAGCACCATT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 84 het 42 0 28 14 TTTC 3 4 11263 CASAVA_Build X 141284730 1I CAAAAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 561 hom 38 2 26 10 T 13 14 11264 CASAVA_Build X 141285021 10D GTGGCGGGTG CCTGTAGTCC/---------- CCTGTAGTCC 2175 hom 12 het 5 0 5 0 CCTGTAGTCC 2 1 11265 CASAVA_Build X 141286052 1I TATACACTGC -/T TTTTTTTTTT 1591 het 574 hom 28 2 9 17 T 10 11 11266 CASAVA_Build X 141286564 3I TCATCTTAGA ---/CTT CTTCTTTGCT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 CTT 2 3 11267 CASAVA_Build X 141287702 1D AAAATGAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 8 A 10 9 11268 CASAVA_Build X 141301195 1D CCTCCCCCCT C/- CCCCCCACCC 1073 het 114 hom 4 1 3 0 C 7 6 11269 CASAVA_Build X 141308097 1D GGTCATATAC A/- AAAAAAAAAA 1230 het 1230 ref 34 19 4 11 A 15 14 11270 CASAVA_Build X 141310215 1D TCCTCTTGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 9 8 11271 CASAVA_Build X 141314789 1I GTCTACATAT -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 1 11272 CASAVA_Build X 141319451 1D AAACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1136 het 1136 ref 22 11 5 6 A 16 15 11273 CASAVA_Build X 141332719 2D CTAGGGCTGA CT/-- CTATGTGAGG 3070 het 3070 hom 45 19 25 2 CT 2 1 11274 CASAVA_Build X 141333577 10D TGCAAATTCC CTGCTGCTAA/---------- CTGCTGCTAA 3070 het 3070 ref 41 21 17 6 CTGCTGCTAA 2 1 11275 CASAVA_Build X 141334314 1D TGCTATGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 A 12 11 11276 CASAVA_Build X 141336871 2D CATTTTTTTT TA/-- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 TA 1 0 11277 CASAVA_Build X 141337092 6D AAGGGAAATT TATATC/------ TATAAAGAAA 3070 het 3070 ref 38 18 20 2 TATATC 1 0 11278 CASAVA_Build X 141337850 3D GCTCAGAGAG GAC/--- GACAACAACA 3070 hom 108 het 42 0 37 7 GAC 2 1 11279 CASAVA_Build X 141338272 1I TCTCTATAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 8 9 11280 CASAVA_Build X 141350559 3I TGACTAAACT ---/ACA ACATTTCAAT 3070 hom 108 het 48 0 37 11 ACA 1 2 11281 CASAVA_Build X 141351171 4I GGAATAAATT ----/TAAC TAAGAAAATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAAC 0 1 11282 CASAVA_Build X 141351371 1I TAGGAAGAGT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 7 8 11283 CASAVA_Build X 141353329 7D AAATTATTTC TTATAGT/------- TTATAAATAC 3070 het 3070 ref 38 22 13 7 TTATAGT 1 0 11284 CASAVA_Build X 141353812 4I AATTTTCACT ----/TTTA TTTTATTATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTTA 0 1 11285 CASAVA_Build X 141385479 1I CTATTGAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 9 10 11286 CASAVA_Build X 141386565 3D AGCTACCAAA GAT/--- GATATTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 GAT 2 1 11287 CASAVA_Build X 141386703 4D TAACCCTATG AAGT/---- AAGTATTAAC 3070 het 3070 hom 37 16 19 4 AAGT 2 1 11288 CASAVA_Build X 141400125 1D ACATTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 26 2 12 13 A 11 10 11289 CASAVA_Build X 141410448 1D GGAAGGAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2896 hom 38 8 19 11 T 10 9 11290 CASAVA_Build X 141413439 2D CAAATTACAC AA/-- AGAGGAACAA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 A 3 1 11291 CASAVA_Build X 141424362 1D GTTTATGAAG A/- ATTATTAAGG 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 A 2 1 11292 CASAVA_Build X 141427139 1I AATTCATGCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 8 9 11293 CASAVA_Build X 141438970 1I AAACAAAAAT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 6 7 11294 CASAVA_Build X 141452932 2I AGGAGGGGGG --/CT GGGGATCACC 3070 het 853 hom 14 4 10 0 CT 0 1 11295 CASAVA_Build X 141453712 2I GTTAACCTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1316 hom 25 5 15 5 T 12 14 11296 CASAVA_Build X 141485234 1I GTGTGTTTCC -/A GCTGAGCCCT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 0 1 11297 CASAVA_Build X 141488230 1I AAGTAAAAAT -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 6 7 11298 CASAVA_Build X 141489340 5I TGAAATACTT -----/AAATC AAAGAACTGA 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 AAATC 0 1 11299 CASAVA_Build X 141508214 1I TAAAGAATGA -/G CTAAATGAAG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 G 0 1 11300 CASAVA_Build X 141508881 1I AAACAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 11 12 11301 CASAVA_Build X 141514858 1I AGGTTCTGTT -/G TGACTTAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 17 0 G 0 1 11302 CASAVA_Build X 141517561 11D GTTAAAAGCA AAAGCAAAAAC/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 18 3 AAAGCAAAAAC 1 0 11303 CASAVA_Build X 141519543 3I TTCATTTTAG ---/TAA TATTGATTCT 3070 het 3070 ref 36 20 8 8 TAA 0 1 11304 CASAVA_Build X 141521475 2D GTGAGAAGAC TG/-- GGAGAGTCCC 3070 het 3070 hom 43 21 22 1 TG 1 0 11305 CASAVA_Build X 141525701 1I TGTTTCTCTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 8 9 11306 CASAVA_Build X 141526506 1I AGTAGGTGTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 7 8 11307 CASAVA_Build X 141527818 14D TAAACACTCC ACAATACATAAGAA/-------------- AGCCTCCACA 3070 het 3070 ref 44 25 18 5 ACAATACATAAGAA 1 0 11308 CASAVA_Build X 141528335 1I CTACCTCTCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 9 20 6 T 7 8 11309 CASAVA_Build X 141529171 2D ATATATATAT AC/-- ACACATATAT 1726 het 1726 ref 16 8 7 1 AC 3 2 11310 CASAVA_Build X 141529275 4D CATATATGTG TGTA/---- TGTGTGTGTG 3070 het 2431 hom 20 8 11 1 TGTA 1 0 11311 CASAVA_Build X 141536864 1I GAGATAAACT -/A GTTAAGGAGG 3070 het 3070 ref 41 21 20 0 A 0 1 11312 CASAVA_Build X 141536992 1I GAAAAGTAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 A 8 9 11313 CASAVA_Build X 141541001 1I TAAGGTTATC -/A GGCTAAATGA 3070 het 3070 ref 53 29 16 8 A 0 1 11314 CASAVA_Build X 141547640 1D AAGTTGCTTT G/- AAGTTGAATA 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 G 1 0 11315 CASAVA_Build X 141554881 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAA 1959 het 1959 ref 13 6 6 1 T 6 5 11316 CASAVA_Build X 141577082 2D TTAATTTAAC TT/-- CATTGATTAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 2 0 11317 CASAVA_Build X 141582828 4I ATTGGAGAAT ----/TTAA TTCATTTATG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TTAA 0 1 11318 CASAVA_Build X 141593301 1D TTCCTTTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 11 10 11319 CASAVA_Build X 141596384 1D TTCCAAGTAT A/- AAATAATATA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 4 3 11320 CASAVA_Build X 141596819 4D ATGCTGCAGT GTGA/---- GTGTTAGGCA 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 GTGA 1 0 11321 CASAVA_Build X 141597141 17D ATATATATAT ATATATATATATATATA/----------------- TATATATGCA 3070 het 109 hom 10 1 8 3 ATATATATATATATATA 1 0 11322 CASAVA_Build X 141600338 2I AATATATTAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 59 36 18 5 TG 7 8 11323 CASAVA_Build X 141600820 1D CCCACTTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 122 het 51 0 43 8 T 10 9 11324 CASAVA_Build X 141604481 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 TG 7 8 11325 CASAVA_Build X 141619247 5D CCTACCTAAT TTTTG/----- TTTTTTTTTG 148 het 148 ref 21 9 2 10 TTTTG 1 0 11326 CASAVA_Build X 141622716 1I GATTTTTGCC -/A AAAAATGTCA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 5 6 11327 CASAVA_Build X 141635941 4D GATTAACAAA ATAG/---- ATAGACCACT 3070 het 2636 hom 20 6 14 2 ATAG 2 1 11328 CASAVA_Build X 141637755 3I ACGAAAACCA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 AAC 5 6 11329 CASAVA_Build X 141672444 1I CAATGAGCTC -/T TAAGTTGCTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 1 2 11330 CASAVA_Build X 141674744 1D TTAAAACTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 9 8 11331 CASAVA_Build X 141675680 1I AGTGCAGGCT -/G CAGCCTGCCG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 0 1 11332 CASAVA_Build X 141677905 5I ATTGAATAAA -----/GAAAT GAACAGAGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 GAAAT 0 1 11333 CASAVA_Build X 141692374 1I AATATGGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 34 2 26 6 A 11 12 11334 CASAVA_Build X 141703400 1I AGACTATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 32 3 17 12 T 10 11 11335 CASAVA_Build X 141761154 3D ACATGGCTAC AGA/--- AGAAGGAAGT 3070 hom 114 het 45 0 39 9 AGA 2 1 11336 CASAVA_Build X 141773475 2D TTGCTCTTTC TT/-- CTAAAGCACC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 2 0 11337 CASAVA_Build X 141777505 1I ATTTTTCATA -/T TTTTTTTTAG 1300 het 1300 ref 9 5 3 1 T 8 9 11338 CASAVA_Build X 141788727 3I TTCTGATCAT ---/ATC ATCTACAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 ATC 1 2 11339 CASAVA_Build X 141871313 4I ACAGTTTATA ----/TTTC TTAATTAAAC 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 TTTC 0 1 11340 CASAVA_Build X 141896473 1D AATTTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 477 hom 10 1 9 0 T 13 12 11341 CASAVA_Build X 141898707 1I ATGCCAAAAA -/T AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 11342 CASAVA_Build X 141907439 1I CATAAGGCAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 8 9 11343 CASAVA_Build X 141924557 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2222 het 1217 hom 9 3 6 0 A 11 10 11344 CASAVA_Build X 141926925 1I TTGTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 11 12 11345 CASAVA_Build X 141934496 1I AAGACGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 13 14 11346 CASAVA_Build X 141936181 1I GAAATGCAAG -/T TAAAAACTAC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 1 2 11347 CASAVA_Build X 141939316 1D GCAAGAGTCC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 9 8 11348 CASAVA_Build X 141945510 1D TTTTTAGTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 2800 hom 31 13 13 5 G 1 0 11349 CASAVA_Build X 141946048 1D ACATGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 579 hom 42 4 28 10 A 13 12 11350 CASAVA_Build X 141946540 3I GTAAAATAAA ---/AGG AGTAGAATTG 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 AGG 0 1 11351 CASAVA_Build X 141947678 1I GCCAAGTCTC -/T TTTTAAAATG 3070 hom 78 het 35 0 25 10 T 4 5 11352 CASAVA_Build X 141954732 1D GGAATTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 939 hom 27 2 22 3 T 11 10 11353 CASAVA_Build X 141958013 4D CAAAATAATA TGAT/---- TGGGGATAGT 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 TGAT 1 0 11354 CASAVA_Build X 141967109 1D TTTTTGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 33 1 16 16 T 15 14 11355 CASAVA_Build X 141987180 1D GTATATGTCC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 60 30 23 9 A 9 8 11356 CASAVA_Build X 141989628 2D AAATAAGAAG GT/-- GTGGGTGTAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 GT 2 1 11357 CASAVA_Build X 142014655 1I CGTCGTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 T 11 12 11358 CASAVA_Build X 142015435 1D AAGAACTACC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 46 15 27 6 T 9 8 11359 CASAVA_Build X 142015953 5I TTTATAAATT -----/AATTA AATAGTTTCT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AATTA 0 1 11360 CASAVA_Build X 142016141 1D TATTCTAGAA T/- TTTTTTAAGG 3070 het 3062 hom 27 8 16 4 T 7 6 11361 CASAVA_Build X 142017187 1D ATGTAGTTGC T/- ACTGACACTA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 1 0 11362 CASAVA_Build X 142046517 6I CATACTAACT ------/GAATAC AAAAGCATTC 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 GAATAC 0 1 11363 CASAVA_Build X 142102837 20D GAAATATGCA CATATATATATATATGTATC/-------------------- CATATATATA 3070 het 3070 ref 32 19 14 8 CATATATATATATATGTATC 1 0 11364 CASAVA_Build X 142108076 2I ATATATATAA --/TT ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 T 0 2 11365 CASAVA_Build X 142112460 1I GTGAATTGTC -/T ATTAATAATT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 0 1 11366 CASAVA_Build X 142149751 1D AGTTTACCGG A/- AAAAAAAAAA 3049 het 2657 hom 23 9 9 5 A 15 14 11367 CASAVA_Build X 142150733 1D TTAATAGATG A/- AAAAAAAAAA 2349 het 2349 ref 42 30 5 8 A 11 10 11368 CASAVA_Build X 142169895 4D TATAGGAGTT TAAG/---- TATAGTGGAT 3070 het 3070 ref 20 10 9 2 TAAG 1 0 11369 CASAVA_Build X 142170301 1D AATCAGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 32 0 25 7 A 12 11 11370 CASAVA_Build X 142176607 1I CTGGTGACAG -/A AAAAAAAAAA 2849 het 2849 ref 21 11 7 3 A 10 11 11371 CASAVA_Build X 142179380 3D7M1I GGAAATTCCC AGGAGGTGTC-/---AGGTGTCG GGGGGAGATG 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 N/A 0 0 11372 CASAVA_Build X 142199808 1D TTTAGAGCAG A/- AGTGAAAGTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 2 1 11373 CASAVA_Build X 142200962 1D TTCTGCATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 11 10 11374 CASAVA_Build X 142211351 1I ATTATCATTG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 110 het 46 0 39 7 A 8 9 11375 CASAVA_Build X 142221699 1D ATCTCTGATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 9 8 11376 CASAVA_Build X 142222280 1I CCAGGACACA -/T TTTTTTGCGG 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 6 7 11377 CASAVA_Build X 142229649 1D TCATAATATG A/- AAAAAAAAAA 2259 het 2259 ref 52 39 5 8 A 13 12 11378 CASAVA_Build X 142230564 1D CTGGAATATA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 T 8 7 11379 CASAVA_Build X 142236347 1I TGTCAAAATG -/A AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 6 7 11380 CASAVA_Build X 142241866 1I GTAAGATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 17 8 T 10 11 11381 CASAVA_Build X 142254850 3D TCTACTTCAT TCC/--- AAGACTCATT 3070 het 3070 ref 55 27 19 10 TCC 1 0 11382 CASAVA_Build X 142257970 3D GTAATGTGGT TTA/--- TTATTTGTAT 3070 het 2744 hom 40 7 19 15 TTA 2 1 11383 CASAVA_Build X 142258004 1D TTTATACATA T/- TTTTAAGTTG 3070 het 1631 hom 30 5 17 9 T 5 4 11384 CASAVA_Build X 142263684 1I GGATGTTGAA -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 0 1 11385 CASAVA_Build X 142276257 1D TATACACTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 9 8 11386 CASAVA_Build X 142278050 6D ATACAAATGC TACTGG/------ TTTTGTATTT 3070 hom 75 het 30 0 26 7 TACTGG 1 0 11387 CASAVA_Build X 142280737 1I TTTTTATCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 18 0 13 5 A 12 13 11388 CASAVA_Build X 142301319 1D TCATCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 292 hom 20 2 12 6 A 15 14 11389 CASAVA_Build X 142302115 2D AAGCTCACAT AA/-- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 9 7 11390 CASAVA_Build X 142311640 1D TAATTAGCGA T/- TTTATAACTG 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 4 3 11391 CASAVA_Build X 142313941 2I TATACTCTCC --/TG TGTGTGTGTG 1428 het 1190 hom 13 5 5 3 TG 6 7 11392 CASAVA_Build X 142319290 1D ATATTTGACC T/- TTTTTTTTTT 1915 het 1915 ref 38 26 5 7 T 11 10 11393 CASAVA_Build X 142320204 1I ATTTTGAATC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 1916 hom 17 5 12 0 T 8 9 11394 CASAVA_Build X 142392302 1D GCCTAGGAAG A/- AAAAAAAATG 2983 het 2983 ref 33 19 10 4 A 9 8 11395 CASAVA_Build X 142395376 2I CTTTCATAGC --/CA CACACACACC 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 CA 4 5 11396 CASAVA_Build X 142403306 1I TAAAATGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 11 12 11397 CASAVA_Build X 142429795 1I TCTCAGTGAT -/A AAAGTGTCTT 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 A 3 4 11398 CASAVA_Build X 142438734 1I ACATTTTAAC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 6 7 11399 CASAVA_Build X 142444984 3D ATCTACCTGG TGT/--- TCTACTGTAC 3070 het 3070 ref 65 32 27 6 TGT 1 0 11400 CASAVA_Build X 142445606 1I AAGATGCAAG -/A AAAAAAAATG 2767 het 2767 ref 20 9 7 4 A 8 9 11401 CASAVA_Build X 142445680 1D GCCGCTAGCT G/- GGGCAGTCTG 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 G 4 3 11402 CASAVA_Build X 142453204 2D AAACAAACAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1637 hom 26 5 13 8 AC 1 0 11403 CASAVA_Build X 142455226 1I TAATATAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 A 9 10 11404 CASAVA_Build X 142459012 6D TTGCAAACTA TGCATC/------ TGCATCTGAC 3070 het 3070 ref 24 13 12 2 TGCATC 2 1 11405 CASAVA_Build X 142461694 4D GGAGTAAGTG CTAC/---- AGAGGGTGAA 3070 het 3070 ref 57 33 21 6 CTAC 1 0 11406 CASAVA_Build X 142462108 9D GTTCAACACA GCATTCAAC/--------- ACAGGCCCAC 3070 het 3070 ref 37 19 16 6 GCATTCAAC 1 0 11407 CASAVA_Build X 142465603 1I GGACAATGGA -/T TTTTTGACAA 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 T 5 6 11408 CASAVA_Build X 142496053 1I GGGAGGGGGA -/G GGGTTTGTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 3 4 11409 CASAVA_Build X 142510409 4I AATATTTTAA ----/AATC AATCAGGCAA 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 AATC 1 2 11410 CASAVA_Build X 142511399 1I GCCTCAAGTG -/C CCCCCCCCCG 2140 het 292 hom 24 1 10 13 C 9 10 11411 CASAVA_Build X 142513553 1I CAAGGAGATA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 11412 CASAVA_Build X 142515077 1D AAACTAAAAG C/- TTTTCTCTAA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 C 1 0 11413 CASAVA_Build X 142540018 1D AAAGAAAGCG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 37 0 29 9 T 9 8 11414 CASAVA_Build X 142542046 1I GCCAAGCTTC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 386 hom 39 1 34 4 T 7 8 11415 CASAVA_Build X 142550254 4I TCTCTCTCTG ----/TCTC TCTCTCACAC 1696 hom 25 het 12 0 7 5 TC 3 5 11416 CASAVA_Build X 142580249 1I AAAGAAAGTC -/A ATGCTTCAAC 3070 hom 155 het 55 0 51 4 A 1 2 11417 CASAVA_Build X 142580883 1I ATTGCATTTT -/A AAAGGGAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 3 4 11418 CASAVA_Build X 142587406 1D GAGTTTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 26 2 18 6 A 13 12 11419 CASAVA_Build X 142592363 1I CTCTTTCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 9 10 11420 CASAVA_Build X 142600529 22I GTTACCAAGA ----------------------/TTACCAGTTAGATAACCAAACT CGTTAGATTA 3070 hom 141 het 45 0 45 4 TTACCAGTTAGATAACCAAACT 0 1 11421 CASAVA_Build X 142602788 1I TGCATTTAAC -/T TTTTTTTTTT 2943 het 613 hom 25 2 12 11 T 15 16 11422 CASAVA_Build X 142606282 4D TCTAACTGCA AGGG/---- AGTAACGGCT 3070 hom 87 het 34 0 30 6 AGGG 1 0 11423 CASAVA_Build X 142614616 1D GAGCTATGTC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 73 het 27 0 24 3 T 8 7 11424 CASAVA_Build X 142631971 1I AATTATCTCA -/T TTTCCTCCTA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 3 4 11425 CASAVA_Build X 142633272 1D CCTGATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 11 10 11426 CASAVA_Build X 142634340 1D GCTGCAGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 125 hom 16 1 9 6 T 11 10 11427 CASAVA_Build X 142642143 1I TTGTTATCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 896 hom 41 2 32 7 A 9 10 11428 CASAVA_Build X 142694119 1D TCAAAGGAGC A/- AAAAAAATTT 803 het 803 ref 51 42 3 6 A 8 7 11429 CASAVA_Build X 142726932 1D TGGGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 974 het 974 ref 32 19 5 8 A 15 14 11430 CASAVA_Build X 142729002 5I ATAAATAAAC -----/TCGTG TTGTGTAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 TCGTG 0 1 11431 CASAVA_Build X 142733000 1I AGACAATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 10 11 11432 CASAVA_Build X 142733526 1I TTTTTAAAAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2954 hom 29 10 10 9 T 8 9 11433 CASAVA_Build X 142735516 1I TTAAAGGATT -/A ATTATTCCGA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 1 2 11434 CASAVA_Build X 142736130 1I TCCCAAAGTG -/C TGGGATTACA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 C 0 1 11435 CASAVA_Build X 142736242 1I CAAAAACAGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 A 8 9 11436 CASAVA_Build X 142781858 2I AACATGTAAC --/AT GTGTGTAAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AT 0 1 11437 CASAVA_Build X 142782437 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 13 1 A 12 11 11438 CASAVA_Build X 142788265 1D AGTAAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 13 12 11439 CASAVA_Build X 142789218 13I GATCCCAGAC -------------/AAATAAAAGAGAG AAATAAGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAATAAAAGAGAG 0 1 11440 CASAVA_Build X 142795674 5D GGTGTTTTTC TTTAT/----- TTTATTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 TTTAT 2 1 11441 CASAVA_Build X 142799808 2D ATACATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AT 7 6 11442 CASAVA_Build X 142804652 1D CAAGAATTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 10 9 11443 CASAVA_Build X 142815152 1I TCCCCGCCTC -/T TTTTTTTTTT 2417 het 599 hom 37 4 10 23 T 15 16 11444 CASAVA_Build X 142816587 2D TCAGGCAGAC GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 49 13 22 15 GA 9 8 11445 CASAVA_Build X 142818151 1I TGAGATACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 T 9 10 11446 CASAVA_Build X 142824210 1I GTGGTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 A 10 11 11447 CASAVA_Build X 142829761 4I TAATTTTAAA ----/AATT AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 AATT 3 4 11448 CASAVA_Build X 142835551 1I GATAACCTAG -/A AGAATCGGAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 1 2 11449 CASAVA_Build X 142847675 2D CTAGGAAAAC TG/-- TATATCTATA 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 TG 1 0 11450 CASAVA_Build X 142857179 1I TGTAAGTTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 8 9 11451 CASAVA_Build X 142867917 3I CATCTCCAAC ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 ATA 5 6 11452 CASAVA_Build X 142869024 1I AACATCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2268 hom 34 10 13 11 T 13 14 11453 CASAVA_Build X 142880412 1I TTTCATTCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 48 het 28 0 17 11 T 8 9 11454 CASAVA_Build X 142882607 2D ATTCTGCGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 31 2 12 18 T 15 13 11455 CASAVA_Build X 142882920 1D TACTTCTTAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 53 het 37 1 32 4 T 9 8 11456 CASAVA_Build X 142894457 1D TTGTAATGTC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 8 11457 CASAVA_Build X 142897932 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 8 9 11458 CASAVA_Build X 142898947 1D TTACCATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 44 6 19 19 A 13 12 11459 CASAVA_Build X 142903823 2I TATAAAGTTG --/TT TTTATATATT 2248 hom 12 het 7 0 5 2 T 3 5 11460 CASAVA_Build X 142905596 2D TGTTCCTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 24 0 15 9 T 17 15 11461 CASAVA_Build X 142910060 1I TGTCTTGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 38 2 27 9 T 12 13 11462 CASAVA_Build X 142913436 4D CAAGAAAGAA TGTT/---- TGTAAGACTG 3070 hom 93 het 36 0 32 6 TGTT 1 0 11463 CASAVA_Build X 142958459 1I AAGTAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 11 12 11464 CASAVA_Build X 142992478 2D TCACCAAAAC TG/-- TGTGCAATAC 3070 het 3070 ref 42 26 9 8 TG 3 2 11465 CASAVA_Build X 143018973 2D ACAAATAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 17 12 11 A 11 9 11466 CASAVA_Build X 143036243 1D AGAACCCAGG A/- AAAAATGTAT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 A 6 5 11467 CASAVA_Build X 143061608 1D TTCATGATGT A/- AAAAAATAAA 1433 het 1433 ref 11 7 3 1 A 7 6 11468 CASAVA_Build X 143064870 1I TTTATTTCTA -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 6 7 11469 CASAVA_Build X 143065949 1I TATTAGGGCC -/T TTTTTTTTAT 2332 het 2332 ref 22 15 5 2 T 8 9 11470 CASAVA_Build X 143066243 4D TATTGTTGCT TTAG/---- TTGTTTTTAA 3070 het 2245 hom 17 5 11 2 TTAG 1 0 11471 CASAVA_Build X 143075254 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAC 2594 het 2594 ref 19 10 6 3 A 10 9 11472 CASAVA_Build X 143083144 4I AAAGCAGTCT ----/GTTA CTTATTTGAA 2479 hom 12 het 5 0 5 0 GTTA 0 1 11473 CASAVA_Build X 143089837 1D AGTGAGAAGG A/- AAAAAGTTTA 2941 het 2335 hom 23 8 7 8 A 6 5 11474 CASAVA_Build X 143096081 2D GTCAAAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 1845 het 17 hom 8 0 5 3 A 12 10 11475 CASAVA_Build X 143104665 4I ATTCACTTGA ----/ATAT ATATATACAT 1302 hom 7 het 4 0 3 1 AT 3 5 11476 CASAVA_Build X 143108762 1D CTTTTTAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 9 8 11477 CASAVA_Build X 143128206 7D TGGGTGAACT CATTATC/------- CATGGGAATT 3070 het 3070 ref 48 25 21 6 CATTATC 1 0 11478 CASAVA_Build X 143141231 3I GACTTCAAGA ---/ATG ATGAAGCCGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 ATG 1 2 11479 CASAVA_Build X 143142772 4I TTGGAAAGTC ----/TAAG TAAGTCTCTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TAAG 1 2 11480 CASAVA_Build X 143142877 1D AAATATAATA T/- TTTTTTTTTT 1317 het 1317 ref 25 20 4 1 T 13 12 11481 CASAVA_Build X 143146117 1I GGAGGGGCCA -/G GGGTGGAACG 3070 hom 105 het 41 0 34 7 G 3 4 11482 CASAVA_Build X 143156236 1I TAAATGAGAA -/C CTTAAGACTT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 1 2 11483 CASAVA_Build X 143215928 1D GCAATATGCA T/- TTTTTTTTTT 2064 het 2064 ref 49 34 5 10 T 13 12 11484 CASAVA_Build X 143237645 1D GAAATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 A 12 11 11485 CASAVA_Build X 143284576 1D CCTTTTAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 41 0 33 9 T 10 9 11486 CASAVA_Build X 143404916 1I TTAAAAGAAC -/T TAAAAGTATA 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 T 1 2 11487 CASAVA_Build X 143518008 1D GGAGAACTCA T/- CACCCTGATG 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 T 1 0 11488 CASAVA_Build X 143524437 1I TTTGTGGGGC -/A GGGGGGGATA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 0 1 11489 CASAVA_Build X 143532996 2I AATTAGACCC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 9 11 11490 CASAVA_Build X 143538000 2I TTGGAAAGCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 19 20 7 T 9 11 11491 CASAVA_Build X 143539760 4I GTGTGACTAT ----/AGTA AGTAATAATT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 AGTA 1 2 11492 CASAVA_Build X 143554706 5D GATTCCTGCC TTAAT/----- TTAACTATTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTAAT 1 0 11493 CASAVA_Build X 143557504 2D GCACATATAC AT/-- ATGTGTCCAT 3070 hom 146 het 54 0 48 8 AT 2 1 11494 CASAVA_Build X 143569981 1I GCACACAATG -/T TTCACTACTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 2 3 11495 CASAVA_Build X 143595829 1I GCCACAATTT -/A AAAAAAACAG 3070 hom 141 het 58 0 48 10 A 7 8 11496 CASAVA_Build X 143617414 1D ACCCAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 13 12 11497 CASAVA_Build X 143618565 2D GTAAAGGGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 21 1 14 6 A 13 11 11498 CASAVA_Build X 143618763 2I TCCCATATTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 20 1 15 4 A 13 15 11499 CASAVA_Build X 143620133 1D AATTAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 208 hom 35 4 14 17 A 17 16 11500 CASAVA_Build X 143630935 1I ATAGAGAGGG -/T TTTCCCTCCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 3 4 11501 CASAVA_Build X 143640903 1D TTTAATGGCG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 9 8 11502 CASAVA_Build X 143661244 2D TATATTTCTC TT/-- GTTTGATTGC 3070 hom 81 het 31 0 28 5 T 2 0 11503 CASAVA_Build X 143715964 1I GACTTTGATA -/T TTTCTAGTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 4 11504 CASAVA_Build X 143724119 1I CACAAAAATT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 117 het 52 0 39 13 A 6 7 11505 CASAVA_Build X 143738760 1I AAGCAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 A 11 12 11506 CASAVA_Build X 143739170 1D TAGGACTTTT A/- AAATAATCTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 4 3 11507 CASAVA_Build X 143749672 1D TATTTTAATA T/- TTTAATATTC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 4 3 11508 CASAVA_Build X 143750878 1I GTTAAAAAAA -/T CAAGTATTAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 1 11509 CASAVA_Build X 143760459 3D TTTGGGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 95 het 41 0 29 12 TTG 7 6 11510 CASAVA_Build X 143773816 2D CAGTACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 74 het 36 0 25 11 AC 10 9 11511 CASAVA_Build X 143779123 1I GCTTCTCCAG -/A AAACTTTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 4 11512 CASAVA_Build X 143783321 1D GACTCCCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 195 hom 24 1 21 3 A 13 12 11513 CASAVA_Build X 143821610 4D TCCTATAGTT TCTG/---- TCTTTTATTC 3070 hom 114 het 41 0 39 3 TCTG 1 0 11514 CASAVA_Build X 143837276 4D CCTTCTCTCC CTTT/---- CTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CTTT 2 1 11515 CASAVA_Build X 143855752 1D AATGTCAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 77 het 29 0 27 2 A 10 9 11516 CASAVA_Build X 143882780 4I TTCCTCCCTT ----/TCCC TCTCTCTCTC 3070 hom 88 het 34 0 27 7 TCCC 0 1 11517 CASAVA_Build X 143889638 1I GTTTTAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 725 hom 30 2 19 9 T 10 11 11518 CASAVA_Build X 143899342 2I GTAAAATTAT --/TG TGTGTGTTTA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TG 3 4 11519 CASAVA_Build X 143901280 1D AAACCAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 20 4 A 13 12 11520 CASAVA_Build X 143902154 1I TGCAGAAATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 195 hom 28 1 25 2 T 9 10 11521 CASAVA_Build X 143910677 1D ACCCTGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 29 1 20 8 A 11 10 11522 CASAVA_Build X 143912065 1I TACACTGATT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 9 11523 CASAVA_Build X 143920133 1I GTTGCTTCTT -/A AGAGTTGTGC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 A 1 2 11524 CASAVA_Build X 143922555 6I GCCTGCACTC ------/CCATTG TATCTTGGAA 3070 hom 105 het 44 0 33 11 CCATTG 0 1 11525 CASAVA_Build X 143925228 1D ACATTATTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 10 9 11526 CASAVA_Build X 143925716 1I TCTCTTTGTT -/A AATTTATCTG 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 2 3 11527 CASAVA_Build X 143941585 6D ACAGAGACAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 107 het 40 0 36 9 AC 10 7 11528 CASAVA_Build X 143947991 4D AGGAGTTAAA AAAT/---- AAATAGACAC 3070 het 3070 hom 50 20 24 7 AAAT 2 1 11529 CASAVA_Build X 143959110 5I TATATTTTTA -----/TTTAT TTTATTTTAT 3070 het 2818 hom 22 10 10 2 TTTAT 2 3 11530 CASAVA_Build X 143963968 1D GGCATCATTA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 6 11531 CASAVA_Build X 143974458 1I AGCTTTGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 10 11 11532 CASAVA_Build X 143979909 1D AATTGTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 16 11 T 12 11 11533 CASAVA_Build X 143981038 4I GCAAGAAAAT ----/AGAC AGGTGACTTG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 AGAC 0 1 11534 CASAVA_Build X 143984791 1D GTTTTGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 12 7 T 13 12 11535 CASAVA_Build X 143996119 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 116 het 46 0 37 9 A 10 11 11536 CASAVA_Build X 144010084 1D CTTGGATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 11 10 11537 CASAVA_Build X 144010668 1I AGTTTCCTCA -/T TTTTCTTTAA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 T 4 5 11538 CASAVA_Build X 144014368 11D CAACTCAGCC TCAACTCAATA/----------- TGGACTTCAT 3070 het 3070 ref 31 16 14 3 TCAACTCAATA 1 0 11539 CASAVA_Build X 144017916 1I GCAGAGCCTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 T 8 9 11540 CASAVA_Build X 144018625 1I ACCAACGGAC -/A AAACTGTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 3 4 11541 CASAVA_Build X 144018982 2D TGTGTGTATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 45 28 13 6 TA 6 5 11542 CASAVA_Build X 144027148 1D CAGGTATGTG A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 A 7 6 11543 CASAVA_Build X 144027625 1D CTCACATGCC A/- AAAAGGTGGG 3070 het 3070 ref 54 25 22 7 A 5 4 11544 CASAVA_Build X 144029854 1D TGACTATAGG T/- TTCCTATTAT 3070 het 3070 ref 53 24 21 9 T 3 2 11545 CASAVA_Build X 144032750 4D CAAAAACAAC CTAA/---- CTGTCAGTTG 3070 het 3070 ref 48 27 18 4 CTAA 1 0 11546 CASAVA_Build X 144033202 4D TTAATTTGTT TGAC/---- TGTAGTAATC 3070 het 3070 hom 45 17 25 6 TGAC 1 0 11547 CASAVA_Build X 144034929 1D GACGAGCTCA C/- CCCAGTGCAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 C 4 3 11548 CASAVA_Build X 144035155 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1998 het 1461 hom 16 6 5 5 T 1 0 11549 CASAVA_Build X 144036219 1D TAAATTGTGT A/- ATGTGCAATT 3070 het 3070 ref 50 22 23 7 A 2 1 11550 CASAVA_Build X 144036676 12D GTTTGGCACA TTTTTATGTAGC/------------ CTCATTTCTC 3070 het 3070 ref 44 21 20 5 TTTTTATGTAGC 1 0 11551 CASAVA_Build X 144037351 1D CCCTGTAAAC A/- AATTACTTGC 3070 het 3070 hom 55 22 29 4 A 3 2 11552 CASAVA_Build X 144040736 1D AAAGTGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 A 11 10 11553 CASAVA_Build X 144050362 1D CTGCCCCCAT G/- ATCTAATCAC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 G 1 0 11554 CASAVA_Build X 144051822 1I TTTCATATTT -/A AAAAAAAACG 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 8 9 11555 CASAVA_Build X 144059235 6D CTCTCTGTTC CTATGA/------ CTATGACTGT 3070 hom 113 het 44 0 37 9 CTATGA 2 1 11556 CASAVA_Build X 144064113 2I AGGCTGCAGT --/GA GATCCCTTTT 3070 het 3070 ref 57 31 19 7 GA 1 2 11557 CASAVA_Build X 144064709 1I AATGGAATGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 9 10 11558 CASAVA_Build X 144075581 1D GATTGTACAA T/- TTTTTTCAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 6 11559 CASAVA_Build X 144079996 1I TTGAAATCAT -/A AAAGGATTGC 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 A 3 4 11560 CASAVA_Build X 144080264 5I TGAAATTTGA -----/CTTTT CTTCTGGAAT 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 CTTTT 0 1 11561 CASAVA_Build X 144087634 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2888 hom 24 8 13 3 A 8 9 11562 CASAVA_Build X 144104214 9I CTTGAAGCTT ---------/AAGTGTCAC AAGTGTCACT 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 AAGTGTCAC 1 2 11563 CASAVA_Build X 144136306 1I ACTAGCTTGG -/A GGGATTTGAG 857 het 857 ref 38 35 2 2 A 0 1 11564 CASAVA_Build X 144147365 1D ATATCTACTC A/- AAAAAGTTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 6 5 11565 CASAVA_Build X 144166828 1D TGCTTTTTTT C/- CCCCCACTCT 3070 hom 108 het 42 0 33 9 C 6 5 11566 CASAVA_Build X 144187761 1I ATCTACAGGC -/A AAAATTGAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 5 11567 CASAVA_Build X 144209910 1I TTCATGTGCA -/T TTTGTCATCT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 3 4 11568 CASAVA_Build X 144214271 2I TTCTTTCTTT --/TA TATATATATA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TA 6 7 11569 CASAVA_Build X 144214464 2I AAATACACTG --/TT GGTGGGACTG 3070 hom 63 het 22 0 22 1 T 0 2 11570 CASAVA_Build X 144214832 2D TAGTCATATT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 AC 10 9 11571 CASAVA_Build X 144222002 4D CTTGATCCAC TGTT/---- TGTTTATCTC 3070 hom 132 het 46 0 45 2 TGTT 2 1 11572 CASAVA_Build X 144223032 1D ATTTTGGTAC T/- TTTTTTTTCT 2317 hom 36 het 34 0 13 21 T 9 8 11573 CASAVA_Build X 144227462 1D ATGATTAAGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 8 11574 CASAVA_Build X 144242892 1D AACTTACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 11 10 11575 CASAVA_Build X 144248469 1I TGAGCTTTTT -/A AAAAAAAATA 1943 het 1943 ref 14 8 5 1 A 8 9 11576 CASAVA_Build X 144255845 2D CCAGAGAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 26 1 14 11 T 16 14 11577 CASAVA_Build X 144267936 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 927 hom 33 3 19 11 A 15 16 11578 CASAVA_Build X 144285627 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 32 0 22 10 T 11 10 11579 CASAVA_Build X 144293067 4D ACCCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 28 2 12 14 A 20 16 11580 CASAVA_Build X 144293637 2I TCATAGAAAC --/AG AGAGTAAAAT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 AG 2 3 11581 CASAVA_Build X 144308580 2D GGAGCAGGTC AG/-- GGGTAGATAA 3070 hom 111 het 41 0 36 6 AG 1 0 11582 CASAVA_Build X 144317196 2I TGTGAGAGTA --/TC TCCTGACAAA 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 TC 1 2 11583 CASAVA_Build X 144320357 1D ACCAAAACAT C/- AAGGAAAATA 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 C 1 0 11584 CASAVA_Build X 144335143 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2954 het 65 hom 13 1 10 2 A 16 15 11585 CASAVA_Build X 144337259 4D AATATACTCA TAAG/---- TAAGATCATC 3070 het 3070 ref 30 15 14 3 TAAG 2 1 11586 CASAVA_Build X 144346944 1I TTTTTGGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 10 11 11587 CASAVA_Build X 144350339 1D TATTCTTCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 9 8 11588 CASAVA_Build X 144356310 1I AAGCTGCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 14 15 13 A 12 13 11589 CASAVA_Build X 144358375 3D TTCTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 12 9 11590 CASAVA_Build X 144363014 1I ATTTTATGCC -/T AATAATTTAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 1 11591 CASAVA_Build X 144390291 1I TTGGCTGAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 134 het 51 0 45 6 T 8 9 11592 CASAVA_Build X 144392216 1D TCGACAACAG T/- TAACAATTCC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 1 11593 CASAVA_Build X 144397395 3I TGCTTAAAAG ---/TAC TACAATTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TAC 1 2 11594 CASAVA_Build X 144401326 1I CAATCCCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 20 1 17 2 A 11 12 11595 CASAVA_Build X 144411393 1D TCTACTGGAC A/- ATTTGGGATA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 2 1 11596 CASAVA_Build X 144416221 1D TGTCTCTCCA C/- CCCCCACATT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 C 6 5 11597 CASAVA_Build X 144424316 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2698 het 2030 hom 16 6 7 4 A 12 11 11598 CASAVA_Build X 144424583 1D GGTTCTCCAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 102 het 46 0 35 11 A 9 8 11599 CASAVA_Build X 144448430 2I CTTTTATGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 35 0 26 9 A 10 12 11600 CASAVA_Build X 144479767 1D GAATTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 1684 het 1684 ref 28 10 4 15 T 17 16 11601 CASAVA_Build X 144502545 5I GTAAAAACAT -----/ATTAC ATTTGTATCT 3070 het 2363 hom 23 9 12 2 ATTAC 0 1 11602 CASAVA_Build X 144503647 1I CTAGGTTCTT -/G TTGTCAAGAA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 G 0 1 11603 CASAVA_Build X 144506222 1I GGCTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 12 23 9 A 12 13 11604 CASAVA_Build X 144553771 1I CTACTAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 32 0 27 5 A 12 13 11605 CASAVA_Build X 144554508 1I ACAGGCAATG -/T TGAGTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 28 9 T 1 2 11606 CASAVA_Build X 144605302 2I TTCTTCTGCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2366 hom 28 7 13 8 TG 6 7 11607 CASAVA_Build X 144618783 1I TGCTTTGGCA -/T TTTTGGCTCC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 4 5 11608 CASAVA_Build X 144620415 1D TGAAACCACA G/- GTTATCAATT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 2 1 11609 CASAVA_Build X 144621448 4I GCTCTTCACC ----/AGTT AGTTCCCTTG 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 AGTT 1 2 11610 CASAVA_Build X 144628347 1I GTTAAACCAC -/T TTTCCTTTAT 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 T 3 4 11611 CASAVA_Build X 144632868 1I ACTCCATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2683 hom 25 8 11 6 A 11 12 11612 CASAVA_Build X 144677075 4I AGAAAAAAAG ----/AAGT AAGAAGTATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AAGT 0 1 11613 CASAVA_Build X 144683754 1D ATTAATAAGC A/- AAAAAAAAAC 1065 het 1065 ref 43 37 3 3 A 10 9 11614 CASAVA_Build X 144719210 4I ATTCACTAAC ----/AATG AACACTTAAA 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 AATG 0 1 11615 CASAVA_Build X 144720940 1I ATAAATGCTG -/A AAAAATGGTT 3070 het 2991 hom 37 8 23 6 A 5 6 11616 CASAVA_Build X 144721924 1D44M4I CCCTACTACC TTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGATTGTGATGGATTTTCCATTTATC----/-TTTTTTTTTGGGGGGGTGGGATTGTGATGGATTTTCCATTTATCTGTT TATTTTTCAA 3070 het 3070 hom 31 19 16 10 N/A 0 0 11617 CASAVA_Build X 144727504 2I AGACTGCGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 48 21 15 12 TG 8 9 11618 CASAVA_Build X 144744764 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1642 hom 33 het 14 0 11 3 A 15 14 11619 CASAVA_Build X 144780187 1I CCTGGGGGGG -/A AAAAAAACCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 8 11620 CASAVA_Build X 144781203 1D CATGATTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 T 12 11 11621 CASAVA_Build X 144788814 1I ATGCTTGTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 48 4 24 20 G 0 1 11622 CASAVA_Build X 144789471 1I GTGCCATGTT -/G GTGTGCTGCA 3070 het 742 hom 16 2 12 2 G 1 2 11623 CASAVA_Build X 144790241 5D GTAAATCTCA TATAT/----- TATATATATG 3070 het 3070 ref 37 18 17 5 TATAT 2 1 11624 CASAVA_Build X 144790531 3D GTTTGAACAT ATC/--- ATGGGAAAGC 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 ATC 1 0 11625 CASAVA_Build X 144792341 1I CCTATCTGCC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 21 7 11 3 T 7 8 11626 CASAVA_Build X 144792745 1D AATCCTTTTT A/- TTATGACAAA 3070 het 3070 ref 52 31 19 3 A 1 0 11627 CASAVA_Build X 144801235 4I TTAACCACTC ----/ACTT ACTATTGTCC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 ACTT 0 1 11628 CASAVA_Build X 144825861 2D TTCATGATGT TC/-- TCTCTATCAG 3070 het 3070 ref 52 35 16 1 TC 3 2 11629 CASAVA_Build X 144845030 2I AGTCAATAAC --/TT AATTCCACAT 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 T 0 2 11630 CASAVA_Build X 144845751 2D TTGGCAATGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 210 hom 39 6 19 15 T 11 9 11631 CASAVA_Build X 144846429 1D CATAATAAGG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 57 29 22 7 A 7 6 11632 CASAVA_Build X 144903906 6I AGAACAGAAG ------/CATCCC TTTGCTACTT 3070 hom 144 het 53 0 47 6 CATCCC 0 1 11633 CASAVA_Build X 144904812 1D TCATTATGCC A/- AAAAAAAAAA 1114 het 1114 ref 23 11 4 8 A 13 12 11634 CASAVA_Build X 144909804 2D AATAAAACTT AA/-- AAAAACAATT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 A 7 5 11635 CASAVA_Build X 144918673 1D GGTAAAACTC A/- AAAAAAAAAA 969 het 969 ref 34 19 5 10 A 17 16 11636 CASAVA_Build X 144933728 1D58M2I AAAAAACAAT AAAAAAAAATCGTCTGCACAGAATCAGGATTTAGACTTTAAAATATGAAGCATAAGAAC--/-AAAAAAAATAGTCTGCACAGAATCAGGATTTAGACTTTAAAATATGAAGCATAAGAACCT CTCCCTGGAG 3070 het 3070 ref 35 25 20 9 N/A 0 0 11637 CASAVA_Build X 144938186 1D TTAATGAAGG A/- AAATGCTGGG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 4 3 11638 CASAVA_Build X 144940882 1D TTCTCAAGTT A/- AAATAAAGTA 3070 het 3070 hom 51 22 27 2 A 4 3 11639 CASAVA_Build X 144950660 2D TTAAAATAAA TT/-- TTGTGTTAAA 3070 het 3070 hom 22 7 12 3 T 4 2 11640 CASAVA_Build X 144954022 5D ACCACCCCCC CCCCA/----- CCCCCCGCAA 1307 het 307 hom 9 3 4 3 CCCCA 1 0 11641 CASAVA_Build X 144956948 1I ATCAGTTATC -/T TTTTTTATAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 6 7 11642 CASAVA_Build X 144958014 1D GCAGTACGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1759 hom 37 11 22 4 T 15 14 11643 CASAVA_Build X 144968529 2D TTATTAAGAC AA/-- GAGAATTCTG 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 A 2 0 11644 CASAVA_Build X 144969100 1D ACATTTTAAT A/- AAATAAAAGG 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 4 3 11645 CASAVA_Build X 144981664 4D CTTTCGTCAG TTAC/---- TTTGGCTGAA 3070 het 3070 ref 35 22 8 7 TTAC 1 0 11646 CASAVA_Build X 144985032 2D GAGGCTAAAC AT/-- TGAGTACATG 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 AT 1 0 11647 CASAVA_Build X 144985995 1D TCAATTTGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 10 9 11648 CASAVA_Build X 144992548 1D TTCCTCCTCA T/- TTTTTTTTTT 1863 het 1863 ref 39 17 6 16 T 17 16 11649 CASAVA_Build X 145019038 1D TTTTACTTTA G/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 G 1 0 11650 CASAVA_Build X 145021564 5I GCCCCTGTGG -----/TCCCA TCCCAGCTAC 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 TCCCA 1 2 11651 CASAVA_Build X 145045051 1I GTATTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 36 1 24 12 T 12 13 11652 CASAVA_Build X 145105140 1D ATGAGTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 T 12 11 11653 CASAVA_Build X 145117136 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1660 hom 23 6 12 5 T 11 10 11654 CASAVA_Build X 145135039 4D AGAGAGACTC TGTT/---- TGGGGGATAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TGTT 1 0 11655 CASAVA_Build X 145135720 1D GGAGAGAAAA T/- AAAAAAGAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 1 0 11656 CASAVA_Build X 145136121 1I AAGGAAAAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 8 9 11657 CASAVA_Build X 145136180 1D GAAGGAGAAA G/- AAATGCTTTC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 G 1 0 11658 CASAVA_Build X 145136736 4I ATAAAAAGAA ----/AGAC AGGAAGAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AGAC 0 1 11659 CASAVA_Build X 145143299 1D AGGCAATTGC A/- AAAAAAAAAA 1944 het 1944 ref 31 16 6 9 A 17 16 11660 CASAVA_Build X 145155956 5I CAGCAGAAAT -----/AAAAC AAAGCAACTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AAAAC 0 1 11661 CASAVA_Build X 145188333 1D ATACTCTATG C/- ATGTACATGA 3070 het 3070 hom 54 20 29 6 C 1 0 11662 CASAVA_Build X 145233755 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 A 11 10 11663 CASAVA_Build X 145242443 3I ATTAAAAAAT ---/AAC AACTTTCTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAC 1 2 11664 CASAVA_Build X 145254083 2D ACATATATGC AT/-- ATATATATAT 1478 het 1478 ref 12 6 4 2 AT 7 6 11665 CASAVA_Build X 145306181 1I GGTGTGCTGG -/T AAAAAGGCTC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 0 1 11666 CASAVA_Build X 145365229 1D TTCGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2370 het 2150 hom 35 14 11 10 T 19 18 11667 CASAVA_Build X 145378657 1D GCCTGTCAGG A/- AAAAAAAAAA 2555 het 2555 ref 45 21 9 16 A 19 18 11668 CASAVA_Build X 145400858 1I ATATTAAAAA -/C TATTACAGCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 1 11669 CASAVA_Build X 145406313 1I TGGTATTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 9 10 11670 CASAVA_Build X 145406653 1I TTATTTTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 A 9 10 11671 CASAVA_Build X 145409261 1D GTGCTGAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 10 9 11672 CASAVA_Build X 145415600 1D GCAAATGAGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 28 0 21 8 A 9 8 11673 CASAVA_Build X 145416107 1I CCTGTGCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 9 10 11674 CASAVA_Build X 145419194 1D GATAAAACTG T/- TTTATGAATA 3070 het 3070 ref 34 21 8 6 T 4 3 11675 CASAVA_Build X 145419256 1I GAAAACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 6 T 11 12 11676 CASAVA_Build X 145424026 2D TCTCTACTAG AA/-- AAAAAAAAAA 2480 hom 5 het 10 0 7 3 A 15 13 11677 CASAVA_Build X 145424378 2I TCAAAAACAC --/AT ATTAAATAAA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 AT 1 2 11678 CASAVA_Build X 145430736 1D AGAGGATCTC T/- TTTATAAAGT 3070 hom 153 het 58 0 51 8 T 4 3 11679 CASAVA_Build X 145434548 1D TGGTTGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 33 0 21 12 A 11 10 11680 CASAVA_Build X 145445024 1I CAGAAAAAAA -/C ATAAGCTTAT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 C 0 1 11681 CASAVA_Build X 145445302 1I AAGTAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 9 10 11682 CASAVA_Build X 145447570 1I ATGTTTGGTC -/A GAGAAAAGTT 3070 het 3070 hom 52 19 23 10 A 0 1 11683 CASAVA_Build X 145449261 1I TGAGTAGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 10 11 11684 CASAVA_Build X 145458473 2I GAAAAATGGC --/TG TGTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 53 25 24 4 TG 1 2 11685 CASAVA_Build X 145475919 1I ATTAAGCTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 7 8 11686 CASAVA_Build X 145493592 1D ATCAAAACGG A/- AACACTATAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 3 2 11687 CASAVA_Build X 145507941 1D GTTGAATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2817 hom 24 7 14 3 T 12 11 11688 CASAVA_Build X 145535928 1D TATAGTCTTT C/- CCTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 49 28 17 5 C 3 2 11689 CASAVA_Build X 145536465 1I TTTCTTTCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 8 9 11690 CASAVA_Build X 145552438 4I AATATCTGAC ----/TATT TATTATATTT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 TATT 1 2 11691 CASAVA_Build X 145564520 1D ACTCTCAGCT G/- TCACTTTTGG 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 G 1 0 11692 CASAVA_Build X 145605506 1D CTGCTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 11 10 11693 CASAVA_Build X 145615782 1I15M1I ACCCATTTTA -TCTCATTTAATATTC-/TTCTCATTTAATATTCT TTTGGTTGAC 3070 hom 75 het 28 0 26 5 N/A 0 0 11694 CASAVA_Build X 145632597 2I AACAACTCCA --/TT TTGGATGCTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 2 4 11695 CASAVA_Build X 145634405 1D ATTTTATCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 77 het 33 0 26 7 T 9 8 11696 CASAVA_Build X 145636436 6I TTTCCCCATT ------/GTATTG GTGATTAACA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 GTATTG 0 1 11697 CASAVA_Build X 145637515 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAAAAA 2067 hom 30 het 17 0 10 7 ATA 2 3 11698 CASAVA_Build X 145639162 1D AGGGCAATTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 55 het 39 1 32 6 A 10 9 11699 CASAVA_Build X 145639872 2D TACTAAATGC AA/-- AAAAAGGAGC 3070 hom 107 het 40 0 36 6 A 7 5 11700 CASAVA_Build X 145659501 1I TAGCATATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 9 10 11701 CASAVA_Build X 145662105 1D AAGAAGCTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 33 0 30 4 T 10 9 11702 CASAVA_Build X 145669938 1I TAATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 244 hom 34 1 27 6 T 10 11 11703 CASAVA_Build X 145673116 1I TCCTTCTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 12 13 11704 CASAVA_Build X 145674228 32D TAGTTATGGC ATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 30 het 14 0 11 5 AT 22 6 11705 CASAVA_Build X 145677437 4D TGTATCTTGG AACT/---- AACTAACTTG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 AACT 3 2 11706 CASAVA_Build X 145681414 1D AGTATATAGT A/- AAAAAAAAAC 2336 het 2336 ref 22 12 5 5 A 10 9 11707 CASAVA_Build X 145684388 1D AGGCCCCACT G/- GGGCACTGCC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 G 4 3 11708 CASAVA_Build X 145714004 2D GTATATATGG TA/-- TATATATATG 3070 hom 57 het 23 0 20 4 TA 5 4 11709 CASAVA_Build X 145714988 3D CTGATTTAAA GTT/--- GTTGTCAGTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GTT 2 1 11710 CASAVA_Build X 145716097 1I GGTAATATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 45 0 36 9 T 9 10 11711 CASAVA_Build X 145722787 1D ATTATCGGGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 8 7 11712 CASAVA_Build X 145726319 5D AACAACTAAC TACAA/----- TACAAGTGCC 3070 hom 108 het 41 0 37 8 TACAA 2 1 11713 CASAVA_Build X 145727074 1I GCAACCTCCA -/C CCCCCAGGTT 3070 hom 33 het 15 0 11 4 C 5 6 11714 CASAVA_Build X 145736290 1I TCTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 T 9 10 11715 CASAVA_Build X 145739723 10I AATGGTACCA ----------/CATCTATGTG GTCACCTAAC 3070 hom 138 het 48 0 47 2 CATCTATGTG 0 1 11716 CASAVA_Build X 145751784 1D ATCATTCAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 8 11717 CASAVA_Build X 145751888 1D ATTTGTTTTC A/- AAATTTTATA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 4 3 11718 CASAVA_Build X 145752383 1I CCTTAATTTA -/T TTATTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 3 11719 CASAVA_Build X 145752584 5D AAGATAAATG TTTTT/----- CTTTTTGTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 6 T 5 0 11720 CASAVA_Build X 145759114 1D TGCAAATGCA T/- TAAAAATTCC 3070 hom 75 het 31 0 26 7 T 2 1 11721 CASAVA_Build X 145759769 1I TTAACAAGAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 8 9 11722 CASAVA_Build X 145773457 2I ATTTTATCAC --/AT GTGTAGGTTT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 AT 0 1 11723 CASAVA_Build X 145774940 1D GTCTACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 A 11 10 11724 CASAVA_Build X 145782490 2D CCCGAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1634 hom 33 9 10 15 T 18 16 11725 CASAVA_Build X 145790154 1D AATTCATATC A/- AAAAACTTTG 3070 het 3070 hom 49 21 25 4 A 6 5 11726 CASAVA_Build X 145810131 1D CCTAGGTCTT C/- CCCCAAATAA 3070 het 3070 hom 46 21 22 4 C 5 4 11727 CASAVA_Build X 145810335 1D GGCTTTTCAG A/- AAAAAGGATA 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 A 6 5 11728 CASAVA_Build X 145814703 4D TTCACATGGC TAGT/---- TATTTTTCCC 3070 het 3070 hom 32 14 18 0 TAGT 1 0 11729 CASAVA_Build X 145814873 1I ATATGGAACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 25 2 A 9 10 11730 CASAVA_Build X 145817708 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 26 0 23 3 T 11 10 11731 CASAVA_Build X 145821790 2D TATTTTGTAT TA/-- TATATATATA 3070 het 1842 hom 18 5 10 3 TA 6 5 11732 CASAVA_Build X 145822774 1I TGGCTCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 26 1 24 1 T 11 12 11733 CASAVA_Build X 145824905 1I CAGGATCCCA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 7 8 11734 CASAVA_Build X 145828747 1I GCTAATCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 478 hom 39 2 31 6 T 11 12 11735 CASAVA_Build X 145838244 1I TACAAACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 10 11 11736 CASAVA_Build X 145840696 2D TATATTAAAC AT/-- GAGATAACAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AT 1 0 11737 CASAVA_Build X 145844031 1D GCTCATTTAG A/- AAAATCAGGA 3070 het 3070 hom 22 10 12 2 A 5 4 11738 CASAVA_Build X 145864819 1D CTTCAAAAAT G/- AAAACATTAG 3070 het 3070 hom 36 17 16 4 G 1 0 11739 CASAVA_Build X 145869437 4D TTTAGATTTT GTTA/---- GTTTATGTGC 3070 het 3070 hom 26 12 13 3 GTTA 1 0 11740 CASAVA_Build X 145874592 1I TTCAGACCGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 A 12 13 11741 CASAVA_Build X 145885074 1D CCCCTCCCCC T/- CTAGTAGTCC 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 T 1 0 11742 CASAVA_Build X 145885887 1I AATGTCTTAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 8 9 11743 CASAVA_Build X 145892271 1I AATTCTAAGG -/C CCCCCCAACT 3070 hom 37 het 17 0 13 4 C 6 7 11744 CASAVA_Build X 145892329 14D TGTCTCATTA TAACTCTCTGGCAT/-------------- TAACATCAAC 3070 het 3070 hom 34 10 20 5 TAACTCTCTGGCAT 1 0 11745 CASAVA_Build X 145892469 1I AACCCAGATG -/T TTTTTTCCTA 2937 het 2937 ref 24 15 7 2 T 6 7 11746 CASAVA_Build X 145895094 1D GCTGCAGATC T/- TTTGTATTAC 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 4 3 11747 CASAVA_Build X 145896565 2D CTGAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 979 hom 12 het 8 0 4 4 A 16 14 11748 CASAVA_Build X 145902279 1D CTCATTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 188 hom 45 1 31 13 T 13 12 11749 CASAVA_Build X 145904879 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 8 9 11750 CASAVA_Build X 145909090 2D GTTTGTCAAC AA/-- AAAGAGACTC 3070 het 578 hom 12 2 7 5 A 5 3 11751 CASAVA_Build X 145910769 4D GTCCGTAACT AGTA/---- AGTATTGTGG 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 AGTA 2 1 11752 CASAVA_Build X 145914243 3I TTCTTTTCTT ---/TTC TTCTTTTCCC 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 TTC 1 2 11753 CASAVA_Build X 145928651 1I AACTTTGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 10 11 11754 CASAVA_Build X 145928750 3I AATTGAGAAA ---/CGG TGGGAATCTG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 CGG 0 1 11755 CASAVA_Build X 145944286 1I AAATTAAAAA -/T TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 5 6 11756 CASAVA_Build X 145947258 1D CAAGTTCCCC T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 7 6 11757 CASAVA_Build X 145963978 1I CCATGTCCCT -/A ACAAAGGACA 3070 het 480 hom 10 1 8 1 A 1 2 11758 CASAVA_Build X 145981840 1D ACTATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 T 12 11 11759 CASAVA_Build X 145982764 1D GAATACAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 A 14 13 11760 CASAVA_Build X 145997977 2D AATATATATG TA/-- TATATATATA 2838 hom 21 het 8 0 8 1 TA 7 6 11761 CASAVA_Build X 146004096 1D CTTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2133 hom 29 9 16 4 A 15 14 11762 CASAVA_Build X 146007003 1I ATGCTGACAA -/T TTTTTTTTTT 2996 het 2996 ref 28 12 10 6 T 12 13 11763 CASAVA_Build X 146012410 1I TCAATTTAGA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 T 7 8 11764 CASAVA_Build X 146024149 1D TATAAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 T 12 11 11765 CASAVA_Build X 146037856 1I TTATACACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 9 10 11766 CASAVA_Build X 146039326 4D ATGGGGAAAA AGCT/---- AGCTATCTCT 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 AGCT 2 1 11767 CASAVA_Build X 146040433 2D CTGAGTCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 14 12 11768 CASAVA_Build X 146041429 15I AATGTGGTAA ---------------/ATTCAAAAAGGAATT ATTTAGAAAA 2798 het 2798 ref 19 12 6 1 ATTCAAAAAGGAATT 0 1 11769 CASAVA_Build X 146042613 4D ATATCTAAAG ACAT/---- ACATACACAT 973 het 973 ref 16 5 3 9 ACAT 2 1 11770 CASAVA_Build X 146042635 2D ATATGAATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 11 hom 18 1 11 7 TA 10 9 11771 CASAVA_Build X 146047328 1D ACAGCTTACT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 68 het 29 0 23 6 G 9 8 11772 CASAVA_Build X 146054891 1I GGACAGAGAT -/C ATCAATCCTG 3070 hom 138 het 54 0 47 7 C 0 1 11773 CASAVA_Build X 146065198 1D GCTTCAATTC T/- TCCAACCCTT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 T 2 1 11774 CASAVA_Build X 146081006 4D TATTGGGGTG CTCT/---- CTCTGTGTGT 287 het 287 ref 33 16 4 15 CT 4 2 11775 CASAVA_Build X 146109096 23D TGTGATTCTC TTTCAGATTGTTTGTTTTGGATA/----------------------- TTTCAGATTG 3070 het 3070 ref 48 27 13 14 TTTCAGATTGTTTGTTTTGGATA 2 1 11776 CASAVA_Build X 146113605 4I TGCTAAAAAG ----/AGTT AGTTATCACT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 AGTT 1 2 11777 CASAVA_Build X 146118664 1I GGGCATCTCA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 7 8 11778 CASAVA_Build X 146120296 2I80M1D ACAGCGGAAA --ATGTCCCTCACTCCGCCATTTCAGTCAGAATCCCAACACTCTCAGTCCACTAGGAATAAGCAGAATATAGTCAATAGATTA/ATATGTCCCTCACTCCGCCATTTCAGTCAGAATCCCAACACTCTCAGTCCACTAGGAATAAGCAGAATATACTCAATAGATT- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 38 18 10 N/A 0 0 11779 CASAVA_Build X 146121362 1D GGAGTAACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 8 15 7 T 10 9 11780 CASAVA_Build X 146123734 1I CCCACAACTT -/A AAAAAAAAAA 2723 het 2723 ref 23 8 10 5 A 11 12 11781 CASAVA_Build X 146132312 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2704 het 2704 ref 20 10 6 4 A 10 11 11782 CASAVA_Build X 146134560 1I CAGACATACG -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 7 8 11783 CASAVA_Build X 146135088 1I AAAACCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 A 11 12 11784 CASAVA_Build X 146145797 1D AAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 1589 het 456 hom 15 3 7 5 A 19 18 11785 CASAVA_Build X 146148031 1D TGATTGCCAC T/- GTCTGCAGTA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 1 0 11786 CASAVA_Build X 146148707 3I ACCATGTGTC ---/TGG TGATTAGGCA 1680 het 1680 ref 50 44 4 2 TGG 0 1 11787 CASAVA_Build X 146151161 1D ATGGGGAAAG T/- ATCTCCATGG 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 1 0 11788 CASAVA_Build X 146162163 1D TTTTGAAGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 A 10 9 11789 CASAVA_Build X 146164292 2D ATGAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 12 10 11790 CASAVA_Build X 146165808 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 80 het 41 1 38 2 A 9 8 11791 CASAVA_Build X 146174285 1D TTTACCTAAG T/- TTACTTACCT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 3 2 11792 CASAVA_Build X 146177894 1D ATCTTCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 14 12 T 12 11 11793 CASAVA_Build X 146187756 6I TCTCAAAAAC ------/TATATA TATATATATA 1974 hom 10 het 7 0 4 3 TA 6 9 11794 CASAVA_Build X 146230248 4D TATTACTCTC TCTT/---- TCTTTCCTTT 3070 hom 147 het 56 0 49 8 TCTT 2 1 11795 CASAVA_Build X 146234729 1I CATGTACCCT -/A AAACTTAAAG 2849 hom 24 het 10 0 8 2 A 3 4 11796 CASAVA_Build X 146236674 5D TTTGAGACCA GCCTG/----- GCCTGGCCAA 3070 hom 44 het 18 0 13 5 GCCTG 2 1 11797 CASAVA_Build X 146242019 3D TAGGAGCTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 32 0 22 10 T 17 14 11798 CASAVA_Build X 146245568 1D CAAAGTTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 94 het 38 0 32 6 A 10 9 11799 CASAVA_Build X 146248432 4D TCTCAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 288 het 288 ref 23 3 3 20 AAAG 1 0 11800 CASAVA_Build X 146249279 2D TGTCTTTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 20 6 T 16 14 11801 CASAVA_Build X 146290810 1I CCACCAGATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 97 het 38 0 33 5 T 9 10 11802 CASAVA_Build X 146303729 1D TAGGTATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 T 11 10 11803 CASAVA_Build X 146362243 1I AAAAATACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 A 10 11 11804 CASAVA_Build X 146364864 3D AAGAAAGAGA AAC/--- AACAGTTTTG 3070 het 3070 ref 27 14 12 2 AAC 2 1 11805 CASAVA_Build X 146366932 106D AAATAGACAT AAGAAGCTAAACAACACCAGCATGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAAA/---------------------------------------------------------------------------------------------------------- AAGAAGCTAA 2077 het 2077 ref 23 17 5 14 AAGAAGCTAAACAACACCAGCATGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 11806 CASAVA_Build X 146369569 1I GATTTCAGCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 67 28 28 11 T 8 9 11807 CASAVA_Build X 146371104 1D ATGCCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 12 11 11808 CASAVA_Build X 146386276 9I TAAATGTTTG ---------/TGAAATATC TGAATGAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 TGAAATATC 0 1 11809 CASAVA_Build X 146398708 2I ATGTGTGTGC --/AT ATATATATAT 1443 het 1443 ref 14 9 5 0 AT 6 7 11810 CASAVA_Build X 146399215 1D CAAAGTTCAC A/- TCCCTTCCTA 3070 het 3070 ref 45 23 18 7 A 1 0 11811 CASAVA_Build X 146399930 2D AATGGATAAC TT/-- ATAAAAACGT 3070 het 3070 ref 49 24 20 7 T 2 0 11812 CASAVA_Build X 146410314 1D CCTACTAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 10 10 A 10 9 11813 CASAVA_Build X 146422127 2I TATAACAGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 A 11 13 11814 CASAVA_Build X 146453781 1I GGCGTGGTAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 A 7 8 11815 CASAVA_Build X 146459542 1I AATAGCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 38 1 25 12 T 12 13 11816 CASAVA_Build X 146470555 1I AAAAGTACAA -/T TTTTTTTTTT 2916 het 2916 ref 33 15 8 10 T 15 16 11817 CASAVA_Build X 146474420 1I CTCTAAAGTG -/C CCCCCCCTTC 3070 hom 81 het 31 0 24 7 C 7 8 11818 CASAVA_Build X 146477559 1D AGGCTCCAAC A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 A 8 7 11819 CASAVA_Build X 146478848 1D ATCCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 40 0 29 11 A 13 12 11820 CASAVA_Build X 146487201 1D TGCTTCATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 44 18 19 8 A 9 8 11821 CASAVA_Build X 146510294 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACAAAA 3070 het 1054 hom 34 10 15 9 C 0 1 11822 CASAVA_Build X 146584188 1I CTTCTTGAAG -/A AAAAAAAAAA 2181 het 2181 ref 31 24 5 2 A 11 12 11823 CASAVA_Build X 146611193 1D TAGAACCCCG C/- CCCCCCCCCC 2259 het 60 hom 21 2 6 13 C 11 10 11824 CASAVA_Build X 146648859 7D ACTGAAGTAA AGGGAAG/------- AGACTTCCAC 3070 het 3070 ref 53 25 26 3 AGGGAAG 1 0 11825 CASAVA_Build X 146688086 1D16M1D TACACTATGG AAATACTATGCAGCTATA/-AATACTATGCAGCTAT- AAAAAAGGAT 3070 hom 51 het 19 0 18 4 N/A 0 0 11826 CASAVA_Build X 146729487 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 30 3 14 13 A 18 16 11827 CASAVA_Build X 146740314 9I ACTTCTATGT ---------/GTGACCAGA GTGACCAGAG 3070 hom 86 het 36 0 29 7 GTGACCAGA 1 2 11828 CASAVA_Build X 146767667 1I AGATTTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 839 hom 31 3 15 13 T 16 17 11829 CASAVA_Build X 146774445 1D GCATCCTTTG A/- AAAATTCCTA 3070 het 3070 hom 45 11 21 13 A 5 4 11830 CASAVA_Build X 146780123 1D TAACCCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 26 11 T 14 13 11831 CASAVA_Build X 146793987 1D ATATAGTTGA T/- GCTGAACATC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 0 11832 CASAVA_Build X 146810486 1I AGCTATTTTG -/T TCTGTCTTTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 1 2 11833 CASAVA_Build X 146818872 1D GTAGCTATCT C/- CCAAAAGTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 3 2 11834 CASAVA_Build X 146828959 1D AGTACAAAAA T/- TTAGCTGGGT 2933 hom 24 het 11 0 8 4 T 3 2 11835 CASAVA_Build X 146830915 3D15M1D TGTGTAATCT CTCTGTGTGTGTGTCTCTC/---TTTGTGTGTGTTTCT- TCGTAATTAG 3070 hom 141 het 46 0 48 3 N/A 0 0 11836 CASAVA_Build X 146831924 1D CAATGTGTGA T/- TTTTTAAGGT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 6 5 11837 CASAVA_Build X 146834023 1D CTTCTGTTAA C/- CCTCTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 3 2 11838 CASAVA_Build X 146835374 1I CAGGCGTGAG -/C CACTGTGCCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 11839 CASAVA_Build X 146836355 1I CAGGCGCGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 2 11840 CASAVA_Build X 146838998 1D AACTTAGAGC T/- TTTTTTTTTT 756 het 756 ref 34 29 3 2 T 11 10 11841 CASAVA_Build X 146861336 1D CAATCCTAAG C/- CCAAAAGGAC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 C 3 2 11842 CASAVA_Build X 146886050 1D ATTAAAAAAT A/- AAAAATTCTT 3070 hom 62 het 23 0 21 2 A 6 5 11843 CASAVA_Build X 146891635 2D GGACATACTC AA/-- GAGCCACCAT 3070 het 3070 hom 38 14 14 12 A 2 0 11844 CASAVA_Build X 146901426 1D ATTGTTCTTA T/- TAACAGCTAT 3070 hom 99 het 39 0 33 7 T 2 1 11845 CASAVA_Build X 146905373 1I ATGGAATGTC -/T TTTTTTCATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 6 7 11846 CASAVA_Build X 146927418 1D7M1D CAGAAGAGGA CCCAAGGAC/-CCAAGGA- CCAATCCCAA 3070 hom 132 het 48 0 45 5 N/A 0 0 11847 CASAVA_Build X 146935203 1D AGAGGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 11 T 12 11 11848 CASAVA_Build X 146942133 1I AAATTTGGTA -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 C 9 10 11849 CASAVA_Build X 146965981 1D GTTTCTGAGA G/- GGTTAAATTA 3070 hom 105 het 39 0 35 5 G 3 2 11850 CASAVA_Build X 146967719 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2528 het 1518 hom 13 4 6 3 A 13 12 11851 CASAVA_Build X 146972067 2I TTGTTGTTTG --/TT TTTTTTTTAT 2352 het 928 hom 9 3 6 0 T 8 10 11852 CASAVA_Build X 146977345 1I AAGAACATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 9 10 11853 CASAVA_Build X 146980633 1I TATCTGGATT -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 6 7 11854 CASAVA_Build X 147003220 1I TAGCTGAAAA -/T TTTTGCTCCC 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 T 4 5 11855 CASAVA_Build X 147007708 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 11 10 11856 CASAVA_Build X 147020204 1I CTTATCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 17 15 15 A 10 11 11857 CASAVA_Build X 147034221 1D TCCCATCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 T 13 12 11858 CASAVA_Build X 147044760 1I TGTATAGATG -/A AAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 6 7 11859 CASAVA_Build X 147049852 10D ATGGCCAAGT TAACTGACCC/---------- TAACTGACCC 3070 het 3070 ref 34 19 16 4 TAACTGACCC 2 1 11860 CASAVA_Build X 147073908 1I TATATATCTA -/T TTTCATAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 3 4 11861 CASAVA_Build X 147088047 1D GCTCTGAGGT C/- CAGGAAAGCC 2954 het 2618 hom 19 7 8 4 C 2 1 11862 CASAVA_Build X 147088625 1D TCCTTTCCCC T/- ATCCCTTATT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 1 0 11863 CASAVA_Build X 147094851 1I ACTGCGTTAG -/C CAGGATGGTC 1113 hom 7 het 3 0 3 0 C 1 2 11864 CASAVA_Build X 147094926 1I CAGGCGTGAG -/C CACCATGCCC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 1 2 11865 CASAVA_Build X 147101400 1D GTTTTCCATA T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 60 21 31 9 T 8 7 11866 CASAVA_Build X 147131995 1I TCAACAATAT -/A AAAAAAAAAA 2704 het 2299 hom 16 8 8 0 A 10 11 11867 CASAVA_Build X 147135254 4I AATTGGTATT ----/TCTC TCACCCGCTC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 TC 1 3 11868 CASAVA_Build X 147180925 1I CTTTATATAA -/T ATCGATAATC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 0 1 11869 CASAVA_Build X 147201477 6I CAACTCACTC ------/AGAGTA AAAGTCTCCA 3070 hom 40 het 18 0 14 4 AGAGTA 0 1 11870 CASAVA_Build X 147207243 1D AATATTGGGT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 71 het 28 0 23 5 A 8 7 11871 CASAVA_Build X 147213693 5I ATAGAACAAG -----/GGTCT ACCCTGTTTC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 GGTCT 0 1 11872 CASAVA_Build X 147233689 1D GACATTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 675 hom 27 5 16 7 A 17 16 11873 CASAVA_Build X 147255966 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAACCT 3070 het 181 hom 33 1 24 8 A 7 8 11874 CASAVA_Build X 147257186 2D ATTTGATCAC GT/-- GTGCAAGGAC 3070 hom 141 het 53 0 48 6 GT 2 1 11875 CASAVA_Build X 147268825 1D CTCAAATTTT C/- TGGCCACAGC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 1 0 11876 CASAVA_Build X 147274629 2D ACAAAATAAG AC/-- ATTCTGCTTT 3070 het 3070 ref 38 21 15 4 AC 1 0 11877 CASAVA_Build X 147278650 1I CTATGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 20 1 17 2 A 12 13 11878 CASAVA_Build X 147281178 1D TTGGCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 1125 het 1125 ref 29 20 3 6 A 13 12 11879 CASAVA_Build X 147285378 4D TTTGATTTGC ATCT/---- ATCTCTCTAA 3070 hom 120 het 44 0 41 5 ATCT 2 1 11880 CASAVA_Build X 147286108 1D CTTCTTTAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 10 9 11881 CASAVA_Build X 147295966 4D TTAACCTTTT CTTA/---- CTTTAGGATA 3070 het 3070 ref 45 22 20 6 CTTA 1 0 11882 CASAVA_Build X 147297826 1I TTCCCTGGAT -/G GTCCCCACTA 3070 hom 83 het 29 0 27 2 G 1 2 11883 CASAVA_Build X 147298859 2I AACAAAAAAA --/AC CAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AC 0 1 11884 CASAVA_Build X 147309943 1D TATTAGGATG T/- TTTTTTCAAC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 7 6 11885 CASAVA_Build X 147338277 1I ATTACATACC -/T TTTTCTACTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 4 5 11886 CASAVA_Build X 147338733 1D TCTATTTGCT G/- GACAACTCCC 3070 hom 110 het 40 0 37 4 G 2 1 11887 CASAVA_Build X 147338816 1D35M1D CCACAGCACT GGGCAATTCCACTTATTGGGTTATGTTTTGTTTGTTC/-GGCAATTCCACTTATTGGGTTATGTTTTGTTTGTT- CTTTAGCATG 3070 hom 111 het 38 0 38 14 N/A 0 0 11888 CASAVA_Build X 147339132 1D GGTGTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2794 hom 32 11 15 6 T 13 12 11889 CASAVA_Build X 147343843 1D TTATTGTTCA T/- TTTTTACATA 3070 hom 138 het 55 0 47 8 T 6 5 11890 CASAVA_Build X 147347930 23D TCTGATGTAT ATCTTCTGCCTCAGCTGCTGTCC/----------------------- ATCTTCTGCC 3070 het 3070 hom 26 12 11 11 ATCTTCTGCCTCAGCTGCTGTCC 2 1 11891 CASAVA_Build X 147367458 1I AACTGAGGAA -/C CCCCCCCCCC 1755 hom 4 het 22 1 8 13 C 10 11 11892 CASAVA_Build X 147380559 1D55M1D ATATTGAAGA CCATCTGCACTCCCACATTTAGTGTAGCACTATTCACAATAGCCAAGATATGGGATC/-CATCTGCACTCCCACATTTAGTGTAGCACTATTCACAATAGCCAAGATATGGGAT- CAACCTAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 24 N/A 0 0 11893 CASAVA_Build X 147401713 1D GAAATTTGAT C/- CAACCTATTT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 C 2 1 11894 CASAVA_Build X 147419807 1I AATTTGCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 37 3 27 7 T 10 11 11895 CASAVA_Build X 147421122 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 9 8 11896 CASAVA_Build X 147426759 1D ATTTTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 30 2 21 8 T 12 11 11897 CASAVA_Build X 147468699 2I ACAGCTACAC --/AT GTTTTGAAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AT 0 1 11898 CASAVA_Build X 147470151 3I TTACCCAGAT ---/TCC TCCTATGTTG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TCC 1 2 11899 CASAVA_Build X 147470234 2D ACACACAAAC AT/-- ATGTGTATAT 2894 hom 26 het 23 0 17 6 AT 2 1 11900 CASAVA_Build X 147472188 3I CCTTGAAAAC ---/ATT ATGCTAAATG 3070 hom 138 het 47 0 47 0 ATT 0 1 11901 CASAVA_Build X 147492037 1I ACTTCAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 610 hom 36 3 24 9 T 14 15 11902 CASAVA_Build X 147492669 1D CATTAGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 604 hom 35 2 20 13 T 12 11 11903 CASAVA_Build X 147495713 1I CAAAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 35 1 27 7 A 11 12 11904 CASAVA_Build X 147520644 1I CAATGCGCAA -/G CCTGACTGAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 11905 CASAVA_Build X 147535425 1D TTCTAACATT A/- ATATCATGGT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 2 1 11906 CASAVA_Build X 147540958 1I AAGGGAAGAG -/A ATTTTGCTTT 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 1 2 11907 CASAVA_Build X 147573280 3D AATGAATTAG ATC/--- ATCTATGTAC 3070 hom 138 het 50 0 47 4 ATC 2 1 11908 CASAVA_Build X 147583392 1D TTGTGGGGTC G/- GGGGGGGGGA 2657 hom 11 het 12 0 6 6 G 10 9 11909 CASAVA_Build X 147586876 1D TTCCCATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 42 0 31 11 A 11 10 11910 CASAVA_Build X 147594780 2I CAGAGGACTT --/TG AGCTTTTTCA 3070 hom 165 het 67 0 54 13 TG 0 1 11911 CASAVA_Build X 147631827 1D TCTATAAAGT A/- AAAAATGGGA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 6 5 11912 CASAVA_Build X 147665079 1I GATCCTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 28 0 24 4 T 10 11 11913 CASAVA_Build X 147686144 1I GGCCTTGGGG -/C CAACAGGTTA 3070 hom 124 het 47 0 41 6 C 1 2 11914 CASAVA_Build X 147706150 1I AGATCTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 23 2 16 5 A 13 14 11915 CASAVA_Build X 147716003 6I GGGGAGAGGA ------/GTGACT GTCCAGGCAT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 GTGACT 0 1 11916 CASAVA_Build X 147717247 1I CTGTGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 10 11 11917 CASAVA_Build X 147722818 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 224 hom 12 2 10 0 A 14 13 11918 CASAVA_Build X 147726756 5D GTATTAGGTC AGTTA/----- AGTTAAGTTA 3070 hom 138 het 53 0 47 9 AGTTA 3 2 11919 CASAVA_Build X 147768999 1I TTTAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1470 hom 37 5 23 9 A 12 13 11920 CASAVA_Build X 147781599 1I TACCGAACAC -/A AAAAAAGTTG 3070 het 3070 hom 34 11 11 12 A 6 7 11921 CASAVA_Build X 147784864 4D55M2D ACAGAGATAC CGAAACAAATAGAAATTCTGTGCATTACTGATTGGCACACCACTGCCCTCACCTATGGATG/----ACAGACAGAAATTCTGTGCATTACTAATTGGTACACCACTGCCCTCACCTATGGA-- TGTCTGTTCC 1646 het 1646 ref 48 82 4 7 N/A 0 0 11922 CASAVA_Build X 147824020 6D AAAAGTAGCT ATCACC/------ ATCACCATCA 3070 het 3070 hom 60 24 26 13 ATCACC 3 2 11923 CASAVA_Build X 147830963 3I TTGAAAGGTT ---/ACA ACAAATCCAT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 ACA 1 2 11924 CASAVA_Build X 147831072 14D GCTTCTGTTG ATAACCAGTAACAC/-------------- ATACACATTT 3070 het 3070 ref 43 20 21 4 ATAACCAGTAACAC 1 0 11925 CASAVA_Build X 147833789 1I CTTTATATGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 53 18 27 8 T 7 8 11926 CASAVA_Build X 147915472 6D AATAGAAACA TAAAAT/------ TAAAGAAACT 3070 het 3070 hom 21 7 13 4 TAAAAT 1 0 11927 CASAVA_Build X 147946364 1I ACTACCCGAA -/G GAAAAAGGAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 G 1 2 11928 CASAVA_Build X 148030466 2D ACATTTCAAG CT/-- CTGTTAGCAT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 CT 2 1 11929 CASAVA_Build X 148125340 1I CTAACAATAG -/A AAAAAACAAT 3070 hom 52 het 23 0 18 5 A 6 7 11930 CASAVA_Build X 148143560 2D AATTAATCTC TT/-- TTAAGAGGAT 3070 het 3070 ref 37 22 15 2 T 4 2 11931 CASAVA_Build X 148152490 1I AGTTCTTCTA -/C GTTGCTGCAT 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 C 0 1 11932 CASAVA_Build X 148154053 12D TTCTGTTCCA TTTGTCTATATC/------------ TCTGTTTTGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTTGTCTATATC 1 0 11933 CASAVA_Build X 148156158 1D ACCCTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 19 0 12 7 A 12 11 11934 CASAVA_Build X 148160162 1D CAAGTTTCCT A/- ATTACTGTAA 3070 het 3070 hom 48 22 20 6 A 2 1 11935 CASAVA_Build X 148161129 1I TCTTTCAATA -/T TTTTCTATAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 4 5 11936 CASAVA_Build X 148169292 1D CTATAATTAA T/- TTTTGCTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 5 4 11937 CASAVA_Build X 148171800 1D CTTAGAGACA G/- GGGTCTTGCT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 G 4 3 11938 CASAVA_Build X 148173410 1I ACTTCTCTAG -/T TTTTTCTTCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 5 6 11939 CASAVA_Build X 148176484 1D ATCAGTCACA T/- TTTTTGCATG 3070 hom 164 het 62 0 50 13 T 6 5 11940 CASAVA_Build X 148195529 2D GCTTTTTTTT CC/-- CCCCCCCCCT 3070 hom 58 het 27 0 20 8 C 11 9 11941 CASAVA_Build X 148195900 1I TGTCACCAGA -/G GGCACATGGA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 G 2 3 11942 CASAVA_Build X 148235474 3I GAATCTAGCC ---/AAG CCCTCAGGCC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 AAG 0 1 11943 CASAVA_Build X 148237856 1D GCTTCAAAAA C/- AGCCCACATT 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 C 1 0 11944 CASAVA_Build X 148264385 1I ACTCTTACCA -/T TTTTTAACTT 3070 het 3070 ref 50 30 18 2 T 5 6 11945 CASAVA_Build X 148285446 1D CTGTTCCTCC T/- TGCCCCTAGT 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 2 1 11946 CASAVA_Build X 148291084 1I AGCTTCTATC -/T TTTTTTTTTT 1919 het 1919 ref 27 15 5 7 T 13 14 11947 CASAVA_Build X 148292041 1D TGTTTATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1703 hom 25 5 13 7 T 13 12 11948 CASAVA_Build X 148308807 1I CCCAAAAAAA -/T AAGAGCCAAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 0 1 11949 CASAVA_Build X 148313868 3D GAACAGCAGC CCT/--- TCAGTTTGAT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 CCT 1 0 11950 CASAVA_Build X 148314850 2I CAAGCACTAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 20 10 A 10 12 11951 CASAVA_Build X 148318279 1D AATGGTCAAC A/- AACATGAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 16 2 A 3 2 11952 CASAVA_Build X 148323982 1D AGAGCATGGG T/- TTTGAGCCTG 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 T 4 3 11953 CASAVA_Build X 148325412 14D GAGTGCCAGA CAGTGGGTGCAGGT/-------------- CAGTGGGTGC 1640 het 1459 hom 9 4 6 0 CAGTGGGTGCAGGT 1 0 11954 CASAVA_Build X 148331278 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1220 hom 17 4 10 3 A 10 11 11955 CASAVA_Build X 148331734 1I GAATCTTAAG -/A ACCACCAGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 2 11956 CASAVA_Build X 148335324 1I25M1I TAAAGTATGA -CTCAACTTTTTAAAAATATATATTT-/TCTCAACTTTTTAAAAATATATATTTA CAATATATAA 3070 hom 78 het 23 0 27 4 N/A 0 0 11957 CASAVA_Build X 148350708 1I26M1I CTGAGTCTCA -CTATGGGGAAGTAGAAGACCAGCATA-/GCTATGGGGAAGTAGAAGACCAGCATAG CCACATGACA 3070 hom 148 het 41 0 50 7 N/A 0 0 11958 CASAVA_Build X 148351921 1D ATTTGTCAGC A/- AACTTTTTCT 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 A 3 2 11959 CASAVA_Build X 148353859 1I GTTCTACATG -/T TCTAGGTACT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 1 2 11960 CASAVA_Build X 148354559 1I GGGTGACTCT -/G AGGGATGTAT 3070 hom 132 het 51 0 44 7 G 0 1 11961 CASAVA_Build X 148354709 1I GCAGAAGGTG -/A AAGGCATGTC 3070 hom 64 het 26 0 20 6 A 2 3 11962 CASAVA_Build X 148356765 1I14M1I CCAGCCCCAT -AAAAATAAATAAAT-/CAAAAATAAATAAATA AAACCCACAC 3070 hom 87 het 32 0 30 7 N/A 0 0 11963 CASAVA_Build X 148364726 1D TTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTGT 2640 het 2640 ref 20 10 8 2 T 9 8 11964 CASAVA_Build X 148368738 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGCGCCC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 C 1 2 11965 CASAVA_Build X 148390605 1I ATCTACAAAA -/G GTCCCCTCTA 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 G 1 2 11966 CASAVA_Build X 148393002 1I CAAGCAACCG -/C CCTCCCGAGG 3070 hom 85 het 31 0 27 4 C 2 3 11967 CASAVA_Build X 148394766 1D TTCCCTGCGT C/- CCCTCCCCTC 2555 het 11 hom 14 1 9 4 C 4 3 11968 CASAVA_Build X 148401751 1I CAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2226 hom 28 8 13 7 A 13 14 11969 CASAVA_Build X 148420377 1D CTGAGAGACC A/- AAAAAAAAAA 2001 het 2001 ref 52 32 6 15 A 15 14 11970 CASAVA_Build X 148424580 3I TCTCCTCCTT ---/CTC CTCTTCTCTC 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 CTC 1 2 11971 CASAVA_Build X 148424713 1D CTCCTCTCCT A/- AATGGTCCTC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 3 2 11972 CASAVA_Build X 148457830 6D AGTCCTTTCC ACTAGG/------ ACTGTTGGAG 3070 het 3070 ref 54 32 17 8 ACTAGG 1 0 11973 CASAVA_Build X 148488236 2I ATGCACGGGT --/CC TGGCCAGGAG 3070 het 862 hom 15 3 10 2 C 0 2 11974 CASAVA_Build X 148491693 5D TCTTCATTTC ATTTT/----- AATTTTGAGG 3070 het 3070 hom 44 19 24 3 ATTTT 1 0 11975 CASAVA_Build X 148494346 1I TGGCCATCTA -/G GATCCCACCA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 G 1 2 11976 CASAVA_Build X 148523742 1I GCATATTCTT -/G GTGACTTTGG 3070 het 3070 hom 52 21 22 9 G 1 2 11977 CASAVA_Build X 148543776 1D TTTATACTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 10 9 11978 CASAVA_Build X 148592196 1I TTAAATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 11 12 11979 CASAVA_Build X 148613411 2D GCAAACAGCA CT/-- CTCTGATTAC 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 CT 3 2 11980 CASAVA_Build X 148643484 1I ATCGAAGTGG -/C CAGAGTGGCA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 1 2 11981 CASAVA_Build X 148644455 1I TCTGAGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 10 11 A 11 12 11982 CASAVA_Build X 148670042 1I AAAAAAAAAA -/C CCCATCAAAA 3070 het 712 hom 19 6 10 3 C 3 4 11983 CASAVA_Build X 148717130 5D GGGAGAGAAA GAGAG/----- GAGAGAGACA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 GAGAG 2 1 11984 CASAVA_Build X 148777790 1I GTATGTAGTT -/G GCTTTATTTC 3070 hom 105 het 47 0 36 11 G 1 2 11985 CASAVA_Build X 148779454 1D ACCAACTAGG C/- ATGGAAAGAA 3070 het 3070 ref 37 16 17 5 C 1 0 11986 CASAVA_Build X 148875459 1D CTCAAGTGAT C/- CTTCCACCTT 3070 het 2742 hom 21 6 12 3 C 2 1 11987 CASAVA_Build X 148891006 2D TCTGGGGAAC TT/-- AGGCATTTTC 3070 hom 172 het 63 0 58 5 T 2 0 11988 CASAVA_Build X 148893776 1I TGGCTCTTTG -/A AAAAAATCAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 6 7 11989 CASAVA_Build X 148926941 1D CTTTGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 12 11 11990 CASAVA_Build X 148946914 4I AACTATTTTC ----/TATT TATTGTGTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TATT 1 2 11991 CASAVA_Build X 148967888 1I GTTTGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 10 11 11992 CASAVA_Build X 148974797 4D ATAATGAATT ATTA/---- ATTGTGATAA 1907 het 1907 ref 11 6 4 2 ATTA 1 0 11993 CASAVA_Build X 149014126 9I TGGCTTAACA ---------/CATTCTTCC CATTCTTCCC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CATTCTTCC 1 2 11994 CASAVA_Build X 149025499 1D ACATAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 2627 hom 9 het 14 0 7 7 T 17 16 11995 CASAVA_Build X 149026574 1I GGCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 39 1 31 7 T 10 11 11996 CASAVA_Build X 149050285 1D TGAAGTATAC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 8 7 11997 CASAVA_Build X 149050302 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTTATT 1106 hom 15 het 11 0 6 5 T 8 7 11998 CASAVA_Build X 149053941 1D AAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 9 11999 CASAVA_Build X 149063409 1D TGAGTTTATT A/- TTTTGGTTAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 0 12000 CASAVA_Build X 149068275 4D TTTGGTTGAC AGAA/---- AGAGGTTTCC 3070 hom 114 het 40 0 38 6 AGAA 1 0 12001 CASAVA_Build X 149076805 2I ATAAGGTAAC --/AT ATTCACAGGT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AT 1 2 12002 CASAVA_Build X 149094694 8D TAAATGTATT GTCATAAA/-------- GTCATAAAGG 3070 hom 91 het 37 0 31 7 GTCATAAA 2 1 12003 CASAVA_Build X 149094896 2D CAATAATTTT TC/-- TTTGTTTTCC 3070 hom 54 het 23 0 18 6 TC 1 0 12004 CASAVA_Build X 149106162 1D GATCTTTTTT C/- TTTTTTTTCC 1715 het 1715 ref 41 23 8 10 C 1 0 12005 CASAVA_Build X 149107063 1D GTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 21 3 10 8 T 11 10 12006 CASAVA_Build X 149107229 1I CACCCCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 27 0 19 8 T 11 12 12007 CASAVA_Build X 149133995 1I GTGGCCCCGC -/A AAGAGGAGCA 3070 het 2505 hom 25 10 9 6 A 2 3 12008 CASAVA_Build X 149141301 1D TTTTTGCTAG C/- TTGTGACCTG 3070 hom 54 het 22 0 17 5 C 1 0 12009 CASAVA_Build X 149211651 1D TCCATAAGCC A/- AAAAAAAAAA 2378 het 1885 hom 32 11 8 14 A 15 14 12010 CASAVA_Build X 149234193 2D GTGTGCACAC AT/-- GTGTGTGCAT 3070 het 3070 hom 51 20 28 4 AT 1 0 12011 CASAVA_Build X 149294688 1I CCATCCTTGG -/C CAGAGCATCT 3070 het 3070 hom 51 16 23 12 C 1 2 12012 CASAVA_Build X 149305031 1I AACACCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 12 13 12013 CASAVA_Build X 149305736 1D CTTTATGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 11 10 12014 CASAVA_Build X 149311706 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 10 11 12015 CASAVA_Build X 149319272 3D TTGTGGTTTA AGG/--- AGATTTTGGG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 AGG 1 0 12016 CASAVA_Build X 149330850 1I CTCTAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 2210 het 2210 ref 36 23 5 8 A 11 12 12017 CASAVA_Build X 149346499 13I CTGAACCACA -------------/CCTGTCTCCTCAT CCTCACCCTA 3070 het 3070 hom 36 10 18 9 CCTGTCTCCTCAT 0 1 12018 CASAVA_Build X 149348263 1D AAGTTGATTG A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 A 7 6 12019 CASAVA_Build X 149373987 8D AGACACTGTC CACATACA/-------- CACATACAGT 3070 hom 126 het 49 0 42 11 CACATACA 2 1 12020 CASAVA_Build X 149374705 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2818 hom 42 14 12 16 T 14 13 12021 CASAVA_Build X 149416539 1D GACTTATCTA C/- CCCCCTCCAC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 6 5 12022 CASAVA_Build X 149419730 1I GTGATAAGCA -/G TTTCTTTTCC 3070 hom 99 het 45 0 34 11 G 0 1 12023 CASAVA_Build X 149435680 1I ACTCCAGCAT -/C TCAGCACTGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 12024 CASAVA_Build X 149447679 2I TGCATGTGTG --/TA TATATATATG 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 TA 4 5 12025 CASAVA_Build X 149455290 19I TATATCCACA -------------------/CAGGAAAATAGTATTTAGC CATAAAAAGG 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 CAGGAAAATAGTATTTAGC 0 1 12026 CASAVA_Build X 149475479 1D TACCCAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 A 12 11 12027 CASAVA_Build X 149475491 1D AAAAAAAAAA C/- AGGCAAAATA 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 C 1 0 12028 CASAVA_Build X 149478422 1I CAGAACTCTC -/T TCATCCTGCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 2 12029 CASAVA_Build X 149479318 1D TTTACTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1974 het 1974 ref 34 17 5 12 T 15 14 12030 CASAVA_Build X 149480020 1I AGCCACCACA -/C CCAGCCAGGG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 2 3 12031 CASAVA_Build X 149496849 6D ATTTTCTTAA CTGTGC/------ CTGTGCCTGT 3070 het 3070 ref 49 24 22 5 CTGTGC 3 2 12032 CASAVA_Build X 149514168 1D CCTCTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 34 0 26 8 A 11 10 12033 CASAVA_Build X 149529525 6D ACAGACAGAC AGACAG/------ AGACAGAGAC 3070 hom 66 het 40 0 21 19 AGACAG 3 2 12034 CASAVA_Build X 149552812 1D AATCAAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 31 5 A 13 12 12035 CASAVA_Build X 149553739 1D TGATTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 10 15 A 11 10 12036 CASAVA_Build X 149558459 1D ATACTTAGGA T/- TTAGAAAAGT 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 T 3 2 12037 CASAVA_Build X 149561218 1D TACCTTGGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 10 9 12038 CASAVA_Build X 149569361 1D GGACCTAGAT A/- AGAGGTGGTT 3070 het 3070 hom 46 17 27 5 A 2 1 12039 CASAVA_Build X 149570382 4I GAAAGTTCCC ----/ATAT ATATACCCAA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 AT 2 4 12040 CASAVA_Build X 149581909 1D AGCTTTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 T 12 11 12041 CASAVA_Build X 149623013 1I AGCAATTAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 7 8 12042 CASAVA_Build X 149624133 1I ACAAACAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 10 11 12043 CASAVA_Build X 149629263 1I TAACATTTGA -/G GGGTCAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 3 4 12044 CASAVA_Build X 149646262 2I GGAATCACAA --/AT ATATATATTT 3070 het 3070 hom 41 18 15 8 AT 4 5 12045 CASAVA_Build X 149681162 1D ACTGCCCGCT C/- CCGGGGGGCT 3070 hom 42 het 25 0 17 9 C 3 2 12046 CASAVA_Build X 149683779 1D GGCGGAGGCT G/- GGGGGGGCTC 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 G 8 7 12047 CASAVA_Build X 149684814 4D CAAAATGAAA AAAC/---- AAACAACCGA 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 AAAC 2 1 12048 CASAVA_Build X 149717820 1I GGATATGATA -/C CAAAAGCACA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 1 2 12049 CASAVA_Build X 149749691 1D CTGTGTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 40 0 28 12 A 11 10 12050 CASAVA_Build X 149757810 1D ACCAGAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 26 1 11 14 A 17 16 12051 CASAVA_Build X 149779390 1I22M1D AAAAGCATTT -ATTAAATGCAATATCCCTTCATG/AATAAAATGCAATATCCCTTCAT- GGTAAAAACT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 N/A 0 0 12052 CASAVA_Build X 149779449 1D GAAACATACG T/- TCAAAATACT 3070 hom 39 het 26 0 12 14 T 2 1 12053 CASAVA_Build X 149849420 1D CCGCGCCCGG C/- CTAGCACAAC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 2 1 12054 CASAVA_Build X 149874369 1D TGAGAACTGC T/- TTTACTGAAC 3070 het 3070 hom 36 12 18 7 T 4 3 12055 CASAVA_Build X 149880728 1D CTAAAAATAC A/- AAAGTTAGCC 2520 het 1740 hom 14 5 6 5 A 4 3 12056 CASAVA_Build X 149907684 2D TGGCATGAGA AT/-- ATTTTTTTTT 3070 het 174 hom 22 4 10 8 AT 2 1 12057 CASAVA_Build X 149911216 1D TTATTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2608 het 2608 ref 30 12 7 11 T 15 14 12058 CASAVA_Build X 149922645 1D GCTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2629 hom 9 het 13 0 8 5 T 15 14 12059 CASAVA_Build X 149928522 2I ACCCAATCTC --/AG ATATTTTATA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AG 0 1 12060 CASAVA_Build X 149933846 1I TCAGCAATGC -/A ATGATGGTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 2 12061 CASAVA_Build X 149936616 1D TAAATAAATG A/- AAAAAACCTA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 7 6 12062 CASAVA_Build X 149944247 1I GCATTTCTAC -/T TGTATTTGTG 3070 hom 159 het 57 0 53 4 T 1 2 12063 CASAVA_Build X 149946735 4I CTTCTATCTC ----/TATT TGTTTGTGTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TATT 0 1 12064 CASAVA_Build X 149948983 1D ATCCAGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 22 1 20 2 T 11 10 12065 CASAVA_Build X 149954525 10D3M17D AAGAAATATA CCAAATATACTGGAACTCAAGAAATATACC/----------TGG----------------- AAACACACTG 3070 hom 118 het 35 0 39 5 N/A 0 0 12066 CASAVA_Build X 149979203 1D GCTCCCTCTG A/- AAAAAAAAAA 2410 hom 21 het 10 0 7 3 A 13 12 12067 CASAVA_Build X 149983852 1D CCTTGACTTC T/- TTCCCACATC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 3 2 12068 CASAVA_Build X 149988403 1D CTGTCTCCCA C/- CCCAAAAAAA 3070 hom 96 het 34 0 32 3 C 4 3 12069 CASAVA_Build X 149990914 1D CTTCCTTAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 10 9 12070 CASAVA_Build X 149992498 2I CTTTCTCTTT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 3 TA 0 1 12071 CASAVA_Build X 149994707 1I GCCAGAGTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 8 9 12072 CASAVA_Build X 150007306 1D ACACATGAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 10 9 12073 CASAVA_Build X 150013176 7D18M9D TTAGTTTATT TTTGAAATATCAGCCACCCTTCATTCCTCCTATC/-------TATCAGTCACCCTTCATT--------- CCTCCAGCCC 3070 het 3070 ref 37 28 14 3 N/A 0 0 12074 CASAVA_Build X 150034400 11D CTGGTACCTA TGGGCACATGC/----------- TCTGCCTTGC 3070 het 3070 ref 46 25 17 6 TGGGCACATGC 1 0 12075 CASAVA_Build X 150034763 6D AAGCGCAGAG AGGTTA/------ AGTACTTTGC 3070 het 3070 ref 50 22 24 6 AGGTTA 1 0 12076 CASAVA_Build X 150043919 1D AAAAAAAAAA T/- TTTAAATCAA 3070 het 2923 hom 25 7 16 2 T 4 3 12077 CASAVA_Build X 150046451 5D TTCCCAATAG TTTTC/----- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 12 5 TTTTC 1 0 12078 CASAVA_Build X 150048015 1D TGATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 12 11 12079 CASAVA_Build X 150048406 4D CTGATCAGGG TGAT/---- TGATGGTCAC 2044 het 2044 ref 18 12 5 4 TGAT 2 1 12080 CASAVA_Build X 150048559 1I ACAGTAAAAC -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 T 6 7 12081 CASAVA_Build X 150051691 1D GTAAATATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 10 9 12082 CASAVA_Build X 150072050 1D TGGAAACATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 9 8 12083 CASAVA_Build X 150109980 1I AGTGATTATT -/C CCCCCCCCAG 3070 het 3070 ref 35 13 16 6 C 8 9 12084 CASAVA_Build X 150118099 1D TGGAAACCAC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 A 9 8 12085 CASAVA_Build X 150121476 1I GTCCTTAGAG -/A ACCTACAAAG 2295 het 2295 ref 14 7 5 2 A 1 2 12086 CASAVA_Build X 150123664 1I CCAAGACAAT -/C CTAAGCAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 1 2 12087 CASAVA_Build X 150137609 1D ACTCCCATTT A/- ACAAGAAGGA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 2 1 12088 CASAVA_Build X 150144196 1D CTGTCAAGTT A/- AAAATGAATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 5 4 12089 CASAVA_Build X 150156691 1D AGTTTAAGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 10 9 12090 CASAVA_Build X 150160701 6I CCCTAAACAA ------/ATTCTG ATTGATTAGA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 ATTCTG 0 1 12091 CASAVA_Build X 150209642 9I ATAATAAGTA ---------/CCTCTGAAC CCACCATCCA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 CCTCTGAAC 0 1 12092 CASAVA_Build X 150211043 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2622 het 822 hom 18 5 8 5 A 15 14 12093 CASAVA_Build X 150232917 1D AATTGACTTG C/- CGAAGGTCAC 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 C 2 1 12094 CASAVA_Build X 150240945 1D GCTCCCAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 13 12 12095 CASAVA_Build X 150256205 1D AAATCAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 A 10 9 12096 CASAVA_Build X 150262832 1I AGCTTTCTGC -/T TTTTTCTACC 3070 het 3070 hom 58 17 28 13 T 5 6 12097 CASAVA_Build X 150271142 1I TAACCTGTTC -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 7 8 12098 CASAVA_Build X 150275997 1I AGAACTTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 43 1 31 11 A 11 12 12099 CASAVA_Build X 150276070 26D TTGCTTATTT CCTCCCTTCCTCCCATTTTCTCCCAC/-------------------------- CCTCCCTTCC 3070 hom 59 het 27 0 14 23 CCTCCCTTCCTCCCATTTTCTCCCAC 2 1 12100 CASAVA_Build X 150283519 1D TGTCATATCC A/- AAAAAAAAAA 1292 het 1292 ref 32 16 5 11 A 15 14 12101 CASAVA_Build X 150290922 1I GAGAAAGGGT -/A AAATATGAAA 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 A 3 4 12102 CASAVA_Build X 150291002 1I ATATATATAT -/A TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 20 7 12 1 A 0 1 12103 CASAVA_Build X 150294092 1D CAAAAGACAC T/- GCTAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 T 1 0 12104 CASAVA_Build X 150300911 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2097 het 1496 hom 12 6 6 1 A 11 10 12105 CASAVA_Build X 150303155 2I GGTTGTCAGA --/CT CTCTCATTCG 3070 het 3070 ref 62 28 22 12 CT 2 3 12106 CASAVA_Build X 150317452 1I CCCGATAGGC -/A GTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 0 1 12107 CASAVA_Build X 150317539 3D CCATCTGTTC TTG/--- TTGTTTAGTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 7 TTG 2 1 12108 CASAVA_Build X 150318910 1D ATATTAGAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 14 22 9 T 10 9 12109 CASAVA_Build X 150319477 3I TTTACTTAAC ---/ATA ATGTCTTCCA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 ATA 0 1 12110 CASAVA_Build X 150324402 5I TTTGGAAAAG -----/TTAAA TTAGTTACAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 TTAAA 0 1 12111 CASAVA_Build X 150332690 3I5M2I3M6I AAAGCTGGAA ---GGAAG--AGG------/GAGGCAAGGAAGGATTCTC CCCCAGAGCC 3070 het 3070 ref 37 19 16 5 N/A 0 0 12112 CASAVA_Build X 150346936 2I ATTATTTCTT --/GA GAGAGAGATA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 GA 4 5 12113 CASAVA_Build X 150349599 3D2M4I13M1D9M1I5M10I2M2I AATGGGATGA GGGTG----GGAAGGAGGACATGGGGGGAGGC-ACAAC----------AG--/---TGCCATCAAAGCAAGACCT-TGGGGAGGCTTCTGCGCTGTGGGTTAGTC CTTGGAAAAG 3070 het 3070 hom 49 25 29 7 N/A 0 0 12114 CASAVA_Build X 150360716 1I TATCCCATTC -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 7 8 12115 CASAVA_Build X 150385423 1D ACTTATGTAA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 25 9 16 0 T 8 7 12116 CASAVA_Build X 150387154 2D AGCTTTTGAA TT/-- TTTATTAGTT 3070 het 3070 ref 25 15 7 5 T 5 3 12117 CASAVA_Build X 150387747 1D TTGTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 T 12 11 12118 CASAVA_Build X 150406469 4D TTACTTTATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 479 hom 12 1 8 3 TTTA 3 2 12119 CASAVA_Build X 150411237 27I TTATTTAATT ---------------------------/ATAGCAATCCTATTCTAGTGGGTATGA AGTGGCTAAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 ATAGCAATCCTATTCTAGTGGGTATGA 0 1 12120 CASAVA_Build X 150416194 2I TGGTCAGAGA --/AC AAACTTTGCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AC 0 1 12121 CASAVA_Build X 150424044 1D TTTTAAATTC T/- TTTTTTTTTA 2507 het 1666 hom 12 4 6 3 T 10 9 12122 CASAVA_Build X 150428393 4D TCATTCACAT AGTC/---- AGTATACAAT 3070 het 3070 ref 49 23 21 8 AGTC 1 0 12123 CASAVA_Build X 150436080 2D GGGGGCACTC AG/-- ATCATACTGG 3070 het 3070 hom 46 15 15 17 AG 1 0 12124 CASAVA_Build X 150439424 4D AAAAACTTTG TAGA/---- TAGTTAGCTC 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 TAGA 1 0 12125 CASAVA_Build X 150445255 6D GAGAAAGGAC TCAGCT/------ TCAGCTTCAC 3070 het 3070 ref 23 14 8 2 TCAGCT 2 1 12126 CASAVA_Build X 150452237 1I CAATTCAGTG -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 T 6 7 12127 CASAVA_Build X 150472552 1D TCTCTGCCCC T/- AGCAGAGCAT 3070 het 3070 ref 42 25 10 7 T 1 0 12128 CASAVA_Build X 150501954 1I CTCTCTCCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 57 hom 60 1 49 10 T 9 10 12129 CASAVA_Build X 150506743 1D TCACAACGTT G/- GCTCAGGTCA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 G 2 1 12130 CASAVA_Build X 150521841 3D TAATAATAAT AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 90 het 32 0 30 4 AAG 6 5 12131 CASAVA_Build X 150525308 7D GAAAAGTCTG TTCTTTA/------- TTCTTTATTC 3070 hom 85 het 36 0 28 12 TTCTTTA 2 1 12132 CASAVA_Build X 150530068 1D AGTGTCTCCC T/- TTTGGAGACC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 4 3 12133 CASAVA_Build X 150534147 2D TAGAAGGAAA AG/-- AGTCTTTTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AG 2 1 12134 CASAVA_Build X 150534362 2I ATCTTGCTTC --/TT TTTATGTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 3 5 12135 CASAVA_Build X 150536720 8D ATTGGAATTC GTTGTCAG/-------- GTTCATCTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 GTTGTCAG 1 0 12136 CASAVA_Build X 150539570 1D ACATTTCCCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 111 het 42 0 37 6 T 9 8 12137 CASAVA_Build X 150539991 1I TAACACAGAT -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 6 7 12138 CASAVA_Build X 150544786 1I AAAAGAAACA -/C AACGGGCCAG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 C 0 1 12139 CASAVA_Build X 150554923 1D CTGTCAAGAT G/- GTACAGTGTA 3070 hom 87 het 34 0 29 6 G 2 1 12140 CASAVA_Build X 150561482 4D TTGGATCCCT TATC/---- TATTCAGTAT 3070 hom 96 het 37 0 31 7 TATC 1 0 12141 CASAVA_Build X 150576968 1D TTTTGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 13 12 12142 CASAVA_Build X 150580884 1D TCATTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 39 1 20 19 T 14 13 12143 CASAVA_Build X 150604646 1I CAATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 624 hom 36 3 28 5 A 11 12 12144 CASAVA_Build X 150630379 2D CCAAGGCTGA CT/-- CTGTGTCTGC 3070 hom 104 het 39 0 33 9 CT 2 1 12145 CASAVA_Build X 150646202 3D CAGGAATGGC AGG/--- AGATCTCTGT 3070 het 3070 hom 25 11 10 5 AGG 1 0 12146 CASAVA_Build X 150669409 1D TTGTATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 6 A 13 12 12147 CASAVA_Build X 150678498 1I GTTGTTTTAA -/T TTGACACTGA 3070 hom 96 het 40 0 29 11 T 2 3 12148 CASAVA_Build X 150679937 1D ACGGCTTGCT G/- GATTTTAGTT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 2 1 12149 CASAVA_Build X 150680029 1I TTTTTACCTG -/T TATATTTAGG 3070 het 1179 hom 41 4 34 3 T 1 2 12150 CASAVA_Build X 150689639 1D GCTAATAAAA C/- CCACAATGAG 3070 hom 131 het 48 0 45 3 C 3 2 12151 CASAVA_Build X 150696790 5D GGGTGCTCCA CCCCT/----- CCCGTAACTG 3070 het 3070 hom 54 25 24 10 CCCCT 1 0 12152 CASAVA_Build X 150700333 1D TACTCTTTCA C/- CCCGGCGGGA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 C 4 3 12153 CASAVA_Build X 150707258 4D ACATGCCATT CAAA/---- CAAAGAATGA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 CAAA 2 1 12154 CASAVA_Build X 150708555 1D GAGGTAGCAG T/- GGAAGGCTGG 3070 hom 139 het 53 0 46 9 T 1 0 12155 CASAVA_Build X 150710351 1I CAAGTAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1257 hom 42 5 28 9 T 12 13 12156 CASAVA_Build X 150719993 1D TGAGGAGTCG T/- TTTTCCGGCT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 5 4 12157 CASAVA_Build X 150720463 18D ACAGTTCACA GTGCCCCAGCTGGGCCCT/------------------ GACTTTGCTC 3070 het 3070 ref 37 17 19 3 GTGCCCCAGCTGGGCCCT 1 0 12158 CASAVA_Build X 150723211 4D ACTTGTCTTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 28 0 21 8 TG 10 8 12159 CASAVA_Build X 150724309 3D TATATAATTC AGT/--- AGTGTTAAGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AGT 2 1 12160 CASAVA_Build X 150764255 3D TATAGAACAT GCC/--- ATCAAACAGC 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 GCC 1 0 12161 CASAVA_Build X 150765080 1D TTTCAAGAAA T/- GGTGTCAGAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 1 0 12162 CASAVA_Build X 150779137 1D GATAGCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 32 2 19 11 T 13 12 12163 CASAVA_Build X 150798715 1D AAGAAGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 29 3 13 13 T 15 14 12164 CASAVA_Build X 150840991 1I ACCCCACCCC -/T GTCTGAGAAT 3070 hom 70 het 29 0 20 9 T 0 1 12165 CASAVA_Build X 150856720 1D ATCATTTTAG T/- CCTATCAGTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 1 0 12166 CASAVA_Build X 150862240 1I ACTCTGTCAC -/A AAAAAAAAAC 1407 het 1407 ref 20 14 4 2 A 9 10 12167 CASAVA_Build X 150892183 1D AAATCAGATC T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 7 12168 CASAVA_Build X 150896820 2D GTCTAGGTAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 39 18 13 9 GT 9 8 12169 CASAVA_Build X 150919260 1D ATTGAAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 9 13 T 12 11 12170 CASAVA_Build X 150922590 1D CGGATTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 9 12171 CASAVA_Build X 150931660 1D GTACAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 184 hom 29 1 26 2 T 12 11 12172 CASAVA_Build X 150932663 1D CCTCCTTTTC T/- TTAGTTCTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 3 2 12173 CASAVA_Build X 150934033 4D AGAGAGAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 105 het 41 0 36 9 AG 7 5 12174 CASAVA_Build X 150936348 9D TAATAACTCC ATGAGGTGG/--------- CTGTATCAAT 3070 hom 123 het 45 0 42 5 ATGAGGTGG 1 0 12175 CASAVA_Build X 150942856 36D34M26D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATACACACACACACACACACACATATATGTATACCCATATATATACACACACATATATGTGTGTATTC/------------------------------------ACACACACACACACATATATGTATACCCATATAT-------------------------- ATATACACAT 3070 hom 15 het 30 1 27 6 N/A 0 0 12176 CASAVA_Build X 151016041 3D TTGTTGTTTT CTC/--- GCCAGGACGT 3070 hom 138 het 52 0 47 6 CTC 1 0 12177 CASAVA_Build X 151034093 5D GATCTGATTA TTATC/----- AACCACCAGG 3070 hom 87 het 31 0 27 4 TTATC 1 0 12178 CASAVA_Build X 151038938 9D CGGGGTTGAC AGCAGGGGA/--------- AGACCCAGAT 1643 hom 18 het 7 0 6 1 AGCAGGGGA 1 0 12179 CASAVA_Build X 151044378 1D CAAAACTGTG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 8 7 12180 CASAVA_Build X 151046993 1D GGAATTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 27 1 21 5 A 12 11 12181 CASAVA_Build X 151059790 1D GTTAGTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 743 hom 40 2 21 18 T 15 14 12182 CASAVA_Build X 151100217 1I10M1I GACATTGGAA -TTTGATAGAG-/TTTTGATAGAGT TTGCATTTAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 N/A 0 0 12183 CASAVA_Build X 151118630 2I TCAGAATCTC --/TA GAAAGAACTA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 TA 0 1 12184 CASAVA_Build X 151120495 1D GGGTACAATA T/- AAAACACACA 3070 hom 134 het 50 0 44 6 T 1 0 12185 CASAVA_Build X 151164259 1D TTTGTAGGAG A/- ACAAGGGGCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 2 1 12186 CASAVA_Build X 151173542 2D TCTTCTCATA CT/-- CTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 CT 3 2 12187 CASAVA_Build X 151203064 1I AGATAATAGC -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 6 7 12188 CASAVA_Build X 151289480 1D CATTCCACAT G/- TTGTTACCCA 3070 het 3070 hom 57 20 33 4 G 1 0 12189 CASAVA_Build X 151291295 1I GGGTTTTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 A 9 10 12190 CASAVA_Build X 151309052 2I GGTAAATGAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 16 11 11 A 9 11 12191 CASAVA_Build X 151317406 1D TTTTTTTTTT G/- GGCTCTACAG 3070 het 95 hom 28 1 15 12 G 3 2 12192 CASAVA_Build X 151342018 6D AAGGATGTGA GGTAAT/------ GGTAATACAT 3070 hom 117 het 43 0 40 6 GGTAAT 2 1 12193 CASAVA_Build X 151379173 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATGTGTGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TA 2 1 12194 CASAVA_Build X 151402016 1I AAGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 A 9 10 12195 CASAVA_Build X 151405451 1D TGGAATAGTT C/- ATGGCAGGTC 3070 het 2098 hom 23 6 9 9 C 1 0 12196 CASAVA_Build X 151406189 1D ATCACACAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 71 het 30 0 22 8 A 9 8 12197 CASAVA_Build X 151414116 1D TAAGGGGCTT C/- CCACTTCGCT 3070 hom 77 het 29 0 25 4 C 3 2 12198 CASAVA_Build X 151429277 5D AAATAAAAAA TAAAT/----- TAAAAATAAA 988 hom 7 het 3 0 3 1 TAAAT 1 0 12199 CASAVA_Build X 151438674 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 10 9 12200 CASAVA_Build X 151440087 4I CTGTTTAATA ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TTTC 3 4 12201 CASAVA_Build X 151469666 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 10 9 12202 CASAVA_Build X 151477639 1D AATTTTTAGG A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 8 7 12203 CASAVA_Build X 151483189 4D AGAAAACGTG ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 31 het 39 1 24 14 AT 8 6 12204 CASAVA_Build X 151564240 4D TTACACACAG ACAC/---- ACATGTGCTC 3070 het 3070 hom 62 29 28 11 AC 3 1 12205 CASAVA_Build X 151573769 2D GGAGAACACA CT/-- CTCTGCCCAC 3070 het 3070 hom 44 17 25 3 CT 3 2 12206 CASAVA_Build X 151588726 1D TTTTCCTTCC T/- TTTTTTTTAA 2236 het 670 hom 24 3 6 15 T 9 8 12207 CASAVA_Build X 151616003 1D ACATTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 15 1 10 4 A 12 11 12208 CASAVA_Build X 151659080 1I GGTAACACAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 9 10 12209 CASAVA_Build X 151689927 14D GCTTTCCCTG TTTTGTTGCGTAGA/-------------- TTTTGTTGCT 1693 het 1693 ref 12 8 4 1 TTTTGTTGCGTAGA 1 0 12210 CASAVA_Build X 151696727 1D TCGTCTCCTA G/- GAGAACTTTA 2742 het 1355 hom 10 3 7 1 G 2 1 12211 CASAVA_Build X 151716162 1I TGTGCCCAGG -/C CCAACTCAAC 3070 hom 120 het 46 0 39 7 C 2 3 12212 CASAVA_Build X 151716657 3I GTCAAGCATT ---/TTC TTGTAAGAAT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 TTC 0 1 12213 CASAVA_Build X 151717562 1I TCATTTTTAT -/A TTGATGTATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 12214 CASAVA_Build X 151720327 1I69M1I TTTTACAACA -GTTCATTTTATTTTCATCACCCTGTGGGGCGCAAAATGTACTCTAGACCTTGTTGGCTATTTCTCCGGC-/GGTTCATTTTATTTTCATCACCCTGTGGGGCGCAAAATGTACTCTAGACCTTGTTGGCTATTTCTCCGGCG GGGGGTGTGG 3070 het 6 hom 30 1 29 7 N/A 0 0 12215 CASAVA_Build X 151721539 1D TATCTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 2810 het 2810 ref 46 30 6 10 T 13 12 12216 CASAVA_Build X 151733422 74D GAGCTTATGT TGCTAAATCCAGAGGGCAAACTCCAGCCTTCACTAGCTTCACCCAGGTGACCACTTCCTCTCCCTTTGCTTCTG/-------------------------------------------------------------------------- TGCCCTTCCA 3070 het 3070 ref 21 29 8 6 TGCTAAATCCAGAGGGCAAACTCCAGCCTTCACTAGCTTCACCCAGGTGACCACTTCCTCTCCCTTTGCTTCTG 1 0 12217 CASAVA_Build X 151752549 1D TCTTGTCATT C/- CCCCCCGCCC 3070 hom 74 het 31 0 23 8 C 7 6 12218 CASAVA_Build X 151771730 3I ACACCTACAC ---/TCG TGTTTAATGG 3070 hom 135 het 56 0 46 10 TCG 0 1 12219 CASAVA_Build X 151795426 7D TCTCCCAATA TCCCCAT/------- TCCCCATTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 6 TCCCCAT 2 1 12220 CASAVA_Build X 151804717 11D CCGTCAACAC CCTCTGCCCCT/----------- CCTCTGACTC 3070 hom 102 het 39 0 32 7 CCTCTGCCCCT 1 0 12221 CASAVA_Build X 151804812 5D TTTTTACCAG ACTGA/----- ACCCCTCAGG 3070 hom 108 het 37 0 35 3 ACTGA 1 0 12222 CASAVA_Build X 151806920 27D GTACTTAGTT ATCTCCCCCTGATGCAGTTACTACCTG/--------------------------- AGGATAAATG 3070 hom 105 het 31 0 34 4 ATCTCCCCCTGATGCAGTTACTACCTG 1 0 12223 CASAVA_Build X 151810212 2D GGTGAGATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 36 2 19 15 T 16 14 12224 CASAVA_Build X 151858006 32D72M3D TCCTGGGAAG GATAGTGCTCCGAAGAAAACAGCCGCAGCTGAGATAGAGTGATGGCAGTGAGGAGGGTACTACTTAGGTGGGTGGAAAAGGCAACTCAGGCGATCTCCTCTAAAGAG/--------------------------------GATAGAGTGATGGCGGTGAGGAGGGTACTACTTAGGTGGGTGGAAAAGGCAACTCAGGCGATCTCCTCTAAA--- GAGAAGGAGC 2571 het 2571 ref 32 39 9 28 N/A 0 0 12225 CASAVA_Build X 151858458 1I TGAGGCCTTA -/T TTGTGTTTCT 3070 hom 162 het 58 0 54 4 T 2 3 12226 CASAVA_Build X 151861302 2I GTCTGTGGGG --/CT CAGTGAGGAG 3070 hom 57 het 23 0 17 6 CT 0 1 12227 CASAVA_Build X 151864808 3I GAGTGGGTCA ---/TGG TGGTGATTCC 3070 hom 123 het 49 0 40 9 TGG 1 2 12228 CASAVA_Build X 151865580 7I ATTAATAGTT -------/AGATAGG AGGTTATTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGATAGG 0 1 12229 CASAVA_Build X 151868310 6I AGAAAGCCAC ------/TCGACA ATTTCTGGTC 3070 hom 156 het 54 0 45 10 TCGACA 0 1 12230 CASAVA_Build X 151870578 4D TAACCATGAC AAAT/---- AAAATTCCTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAAT 1 0 12231 CASAVA_Build X 151875217 1I TCATTTTAGG -/T TTTCCAGTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 3 4 12232 CASAVA_Build X 151876434 1I TGTCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 19 1 13 5 T 13 14 12233 CASAVA_Build X 151915294 1I CCTAAACTCA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 101 het 38 0 34 4 T 6 7 12234 CASAVA_Build X 151927681 1D ATCCCTGATA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 85 het 34 0 28 6 T 8 7 12235 CASAVA_Build X 151930944 2D CCCTGAAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 2460 hom 30 het 13 0 11 3 T 13 11 12236 CASAVA_Build X 151932534 1D TTAACCTTCT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 8 7 12237 CASAVA_Build X 151954032 2D TTTGTAAAAC AT/-- AGGTATGCTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AT 1 0 12238 CASAVA_Build X 151967169 1I CATGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 30 0 20 10 A 10 11 12239 CASAVA_Build X 151969935 1D AAAGGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 11 10 12240 CASAVA_Build X 151973022 2I AAATTTTGGT --/AC ACACACACAC 3070 hom 108 het 45 0 36 9 AC 6 7 12241 CASAVA_Build X 151979957 4I GAGTGTAGGA ----/GAGT GAGTTTGTGT 3070 het 3070 ref 58 29 26 3 GAGT 1 2 12242 CASAVA_Build X 151980293 1D GTGAATGTGT G/- GGAATGGGTG 3070 hom 141 het 54 0 48 6 G 3 2 12243 CASAVA_Build X 151980392 1I GGGTGATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 27 15 11 T 10 11 12244 CASAVA_Build X 151981625 1D CTCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 A 11 10 12245 CASAVA_Build X 152009644 1D AACAAATGGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 9 8 12246 CASAVA_Build X 152012635 7D CGAATGCAGG CTTTTTT/------- CTTTTTTCTT 3070 hom 117 het 48 0 38 14 CTTTTTT 3 2 12247 CASAVA_Build X 152018723 2I AACTTTTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 18 9 T 12 14 12248 CASAVA_Build X 152052201 2D19M2D CACACATCCT CACACACACACACCCACACACAT/--CACACACACACCCACACAC-- GCACACACCG 1823 hom 10 het 4 0 4 0 N/A 0 0 12249 CASAVA_Build X 152055722 4I TATTATAGTA ----/TTTC TTTATTTGTT 3070 hom 46 het 19 0 16 3 TTTC 0 1 12250 CASAVA_Build X 152069085 1D CTGAAGGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 419 hom 32 1 26 5 A 10 9 12251 CASAVA_Build X 152087843 1D ATAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 208 hom 24 1 20 3 A 12 11 12252 CASAVA_Build X 152094561 1D GTCAATGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 10 9 12253 CASAVA_Build X 152098670 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAATAAGA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 6 5 12254 CASAVA_Build X 152101112 1D AAAAACGGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 56 22 23 12 A 10 9 12255 CASAVA_Build X 152103620 3D GATGTGAAGA TTG/--- CAGGGACCAT 3070 het 3070 hom 50 21 26 4 TTG 1 0 12256 CASAVA_Build X 152107832 1I CACTGCTTGG -/T TTAATTTTAC 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 2 3 12257 CASAVA_Build X 152110665 1D CAGTTGTTTC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 39 22 17 2 A 8 7 12258 CASAVA_Build X 152111947 4D GTGGGAATTT AAAG/---- AAAGAAATTA 3070 het 3070 hom 49 19 23 8 AAAG 2 1 12259 CASAVA_Build X 152113611 1I TAACAGTGTT -/C TTCTCTCCTC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 C 0 1 12260 CASAVA_Build X 152128576 10D CATGGGTGCC AAGGTGACAT/---------- AAGGTGACAT 3070 het 3070 ref 38 23 13 5 AAGGTGACAT 2 1 12261 CASAVA_Build X 152131240 4I TTTCAGAAAG ----/AAAT AGTTTAATTA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 AAAT 0 1 12262 CASAVA_Build X 152143468 1I TATACAGTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 T 8 9 12263 CASAVA_Build X 152144362 2D CATTCTGCAT TC/-- TGTCCTATGA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 TC 1 0 12264 CASAVA_Build X 152151053 9D GTTTTAGACA TGAAGTCCT/--------- TGCCCATGCC 1477 het 1477 ref 7 4 4 1 TGAAGTCCT 1 0 12265 CASAVA_Build X 152152236 2I AGGGGAGGGA --/GT GTACCAATAG 2169 het 1226 hom 10 5 5 0 GT 1 2 12266 CASAVA_Build X 152155521 16D AAGTAAAGCC AAAACTATCTACTTAA/---------------- AAACTGCTTT 3070 het 3070 ref 40 27 13 3 AAAACTATCTACTTAA 1 0 12267 CASAVA_Build X 152165336 5I CAATTCTTTG -----/TTAAC TTAAAGCTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTAAC 0 1 12268 CASAVA_Build X 152167432 1D AATTTTCCAG A/- AAAAAAATGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 8 7 12269 CASAVA_Build X 152184981 2D8M2D CGGTGTGTGC ATGTGTGTGGGT/--GTGTGTGG-- GTGTGTGTGT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 12270 CASAVA_Build X 152234971 4D TGACTCACAA ACTC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 62 38 22 6 ACTC 1 0 12271 CASAVA_Build X 152242684 1D TATTGGAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 10 9 12272 CASAVA_Build X 152245092 1I CTTTGCTCAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 7 8 12273 CASAVA_Build X 152263419 9D TTATGGGAAC GTGACCTCT/--------- GTGGGTAAGG 3070 het 3070 ref 52 29 23 1 GTGACCTCT 1 0 12274 CASAVA_Build X 152279219 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2793 het 148 hom 10 1 9 0 A 12 13 12275 CASAVA_Build X 152281669 6D TGTTTGCTTG TTTGTT/------ TTTGTTTTTG 2050 het 2050 ref 30 12 7 11 TTTGTT 4 3 12276 CASAVA_Build X 152287020 2D CATCAAACAT TA/-- TGTTATAAGT 3070 het 3070 hom 31 16 14 2 TA 1 0 12277 CASAVA_Build X 152287428 1D AAATGGCATC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 9 8 12278 CASAVA_Build X 152301215 4D ACATGAACAC ACAA/---- ACACACCACA 2337 het 2337 ref 54 26 11 21 ACAA 1 0 12279 CASAVA_Build X 152301531 1D AACACACACA C/- CCCCCATATG 3070 het 3070 ref 68 33 23 12 C 6 5 12280 CASAVA_Build X 152304025 1D ATTAGTTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2691 hom 23 6 13 4 A 11 10 12281 CASAVA_Build X 152305225 2D CTATGGAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 T 12 10 12282 CASAVA_Build X 152314067 1I CAGGACAACA -/C CAATCTAAGG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 C 1 2 12283 CASAVA_Build X 152321433 1I CTTCATTCTT -/G AGGAGTATTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 0 1 12284 CASAVA_Build X 152355324 1D TATAGTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 712 hom 34 2 27 5 A 11 10 12285 CASAVA_Build X 152377427 3D TTTTTTCTTA AAC/--- AACAGGGTCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAC 2 1 12286 CASAVA_Build X 152380730 1D CTTCAGATAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 7 12287 CASAVA_Build X 152391786 17D GCAGCCTCCC TGACCTGTGGAGGGTAT/----------------- TGAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 29 15 12 4 TGACCTGTGGAGGGTAT 1 0 12288 CASAVA_Build X 152394474 8D TGCTCCTGCA GAGAGCAG/-------- GAGAGCAGGA 3070 hom 66 het 28 0 20 12 GAGAGCAG 3 2 12289 CASAVA_Build X 152416222 1D GTGTGTGCAG A/- GGGGCTGCGC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 1 0 12290 CASAVA_Build X 152419382 2D CATGTATGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 177 het 73 0 57 17 TG 7 6 12291 CASAVA_Build X 152419396 2D TGTGTGTGTG TA/-- CGTGTGTATA 3070 het 227 hom 67 10 49 13 TA 1 0 12292 CASAVA_Build X 152419837 2I TGTGTGCATC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 86 39 36 11 TG 5 6 12293 CASAVA_Build X 152424409 1D GCATGGACTG A/- ACCTCCTCGA 1716 hom 15 het 7 0 6 1 A 2 1 12294 CASAVA_Build X 152428032 25D CCGCGCAGAT GACACCATCAACCGCCAGAGTCCCA/------------------------- GACACCGGTT 2530 het 2530 ref 19 11 7 5 GACACCATCAACCGCCAGAGTCCCA 1 0 12295 CASAVA_Build X 152435195 1D CTTTCTGTCC T/- TTTGGTCCCT 3070 hom 68 het 26 0 21 5 T 4 3 12296 CASAVA_Build X 152442744 1D TTCTTTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 T 11 10 12297 CASAVA_Build X 152477702 1D AAATTGAGAT A/- AAAAATCACA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 5 12298 CASAVA_Build X 152491281 2D CACAGGCCCC AT/-- ATCCCTCCTC 3070 hom 81 het 33 0 22 11 AT 2 1 12299 CASAVA_Build X 152503910 4I TCTCTCCTCC ----/TCTT TTTTTCTTAT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 TCTT 0 1 12300 CASAVA_Build X 152504080 3I AGAAAATAGA ---/TGG TGTTTACACC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 TGG 0 1 12301 CASAVA_Build X 152520031 2D CATCACACAT CC/-- CCCCCCCACA 3070 het 16 hom 37 1 12 24 C 9 7 12302 CASAVA_Build X 152525078 21D TTAAAATTAG GTAAAGGGATTTTGTTCACCA/--------------------- GTAAAGGGAT 3070 hom 63 het 28 0 21 10 GTAAAGGGATTTTGTTCACCA 1 0 12303 CASAVA_Build X 152526980 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 11 10 12304 CASAVA_Build X 152527656 1I TCTATGAATA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 98 het 40 0 33 7 T 6 7 12305 CASAVA_Build X 152540046 2I GATATATGTG --/TT TTTTTTTTGA 3070 hom 54 het 21 0 19 4 T 8 10 12306 CASAVA_Build X 152542657 2I2M4D AGAAATTGAG --GAAGCC/GTGA---- TGGAGCCCCC 3070 hom 74 het 26 0 22 5 N/A 0 0 12307 CASAVA_Build X 152553467 1I CTAAACAGTG -/C CCCCCCCAAA 3070 hom 121 het 48 0 36 12 C 7 8 12308 CASAVA_Build X 152555230 1I AAGGCAGCAG -/C CCTGCGGCTT 3070 hom 70 het 28 0 23 5 C 2 3 12309 CASAVA_Build X 152555782 1D TCCCACCGGG A/- AAGGCCAGGC 3070 hom 123 het 47 0 34 13 A 3 2 12310 CASAVA_Build X 152567397 1D ATATAAAGTG T/- TCAGGTGTCC 3070 hom 75 het 28 0 24 5 T 2 1 12311 CASAVA_Build X 152569431 1I GGGACCCAGA -/G GTGCAGTGGC 3070 hom 32 het 12 0 8 4 G 1 2 12312 CASAVA_Build X 152572160 2I ATTATATAAC --/AA AGACTATAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 3 12313 CASAVA_Build X 152614715 3D AGGAGTGTGA ATT/--- TATAGATCTA 3044 het 3044 ref 25 13 9 3 ATT 1 0 12314 CASAVA_Build X 152629825 1I TGCGTCCTCG -/C ATTCCGCAAG 3070 hom 48 het 21 0 16 5 C 0 1 12315 CASAVA_Build X 152640499 1D GTCAGCCGAG C/- ACCACACCAC 3070 hom 27 het 13 0 10 3 C 1 0 12316 CASAVA_Build X 152646326 1I GGTGAGAGGA -/C CCCTCGGGTA 3070 hom 96 het 36 0 30 6 C 3 4 12317 CASAVA_Build X 152652228 1I GAGATGGGCA -/G GGCCTGTGGC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 2 3 12318 CASAVA_Build X 152660715 4I41M2D GTATGTGCCT ----TCTTTTAAGGAAGGTTCCAGAAGCCGCCATATTGAATACTTAC/TCTATCTTTTAAGGAAGTTCCCAGAAGCCGCCATATTGAATACTT-- AGTTATATCT 3070 het 3070 ref 41 34 10 11 N/A 0 0 12319 CASAVA_Build X 152666901 4I CATTTACTAA ----/CAGT CACCATGTCC 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 CAGT 0 1 12320 CASAVA_Build X 152669574 1D AGTGCAGAAC A/- AGATGATTTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 2 1 12321 CASAVA_Build X 152674476 1I TGGTCTCGAT -/C TCCTGACCTT 1837 hom 10 het 5 0 4 1 C 0 1 12322 CASAVA_Build X 152721871 3D ACACCCAGAC GAG/--- GAGATGTGTG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 GAG 2 1 12323 CASAVA_Build X 152757776 1I TTTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 956 hom 38 4 25 9 T 13 14 12324 CASAVA_Build X 152802903 1I CTGCCCATCG -/C TGGGATCCTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 0 1 12325 CASAVA_Build X 152812983 1D CTAAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1951 hom 22 7 10 5 A 13 12 12326 CASAVA_Build X 152822036 1D19M3I7M12I GTGCTGCGGG TGTGTGCGTGTGTGGTGTTG---GCTGTGC------------/-CTGTGCGTATGTGGTGTGGTATGGTGTGCAGGTGCATGCAG GTATGTGGTG 3070 het 3070 ref 53 31 20 9 N/A 0 0 12327 CASAVA_Build X 152822420 1I TGGCTTCACA -/G GGCAACAGAG 3070 hom 38 het 17 0 11 6 G 2 3 12328 CASAVA_Build X 152823642 1I ACTGCCACCG -/C ACACGTGCAC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 0 1 12329 CASAVA_Build X 152828014 1I CACTCCCACT -/G GGCCAAAGCC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 G 2 3 12330 CASAVA_Build X 152828062 1I GCACACGTGT -/G GGCCCCCTGA 3070 hom 41 het 24 0 11 13 G 2 3 12331 CASAVA_Build X 152831654 1I AGGGCCCCAG -/C CCCTCAGGGA 3070 hom 47 het 19 0 14 5 C 3 4 12332 CASAVA_Build X 152833872 1I GTGGGTGCCA -/G GGGCTGGGGG 1765 hom 20 het 12 0 7 5 G 3 4 12333 CASAVA_Build X 152839607 1I TAGGGAGAGA -/G GGCCTTTGCC 3070 hom 95 het 35 0 32 3 G 2 3 12334 CASAVA_Build X 152839679 1I CGGTGTTCCT -/C CCCCACTGTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 4 5 12335 CASAVA_Build X 152844473 1D GGGGCACGTT G/- GGTGCATCTG 3070 hom 92 het 34 0 30 5 G 3 2 12336 CASAVA_Build X 152847334 1I GGCCCGCCCA -/G GGACTAGGGA 2618 hom 24 het 11 0 6 5 G 2 3 12337 CASAVA_Build X 152861392 1I TTCCCCAGGT -/G GGGACATCCC 3070 hom 52 het 20 0 16 4 G 3 4 12338 CASAVA_Build X 152864582 1D19M1D TGCACAAAAT GGGTTCCAGCCTCTGGGCGTG/-GGTTCCAGCCTCTGGGCGT- GGTACTGCAC 3070 hom 114 het 42 0 37 6 N/A 0 0 12339 CASAVA_Build X 152864716 1I GAGGCTGATG -/C CCCTGGCAGC 3070 hom 107 het 38 0 32 6 C 3 4 12340 CASAVA_Build X 152865752 1I CTTGCTTCTT -/C CCCTTGGGGG 3070 hom 67 het 27 0 22 5 C 3 4 12341 CASAVA_Build X 152884091 1I GATGGCACAG -/C CAGCCTTCAG 3070 hom 60 het 26 0 19 7 C 1 2 12342 CASAVA_Build X 152894329 1D TGCTCTGTCG C/- CCCAGGCTGG 1292 hom 9 het 4 0 3 1 C 4 3 12343 CASAVA_Build X 152954832 11I GCCTCTAGCA -----------/GTGGTCCAGGT GTGGTCCAGG 3070 hom 50 het 21 0 15 6 GTGGTCCAGGT 1 2 12344 CASAVA_Build X 152957325 1I CTAATCAGAA -/C CCCCCCACAC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 6 7 12345 CASAVA_Build X 152968462 2I CAAACCCAGA --/GG GGGTTCAAGA 3070 hom 81 het 34 0 26 8 G 3 5 12346 CASAVA_Build X 152989097 2I19M7I CTTGTACCAA --AGTTAGCCAAGTTGTGAAT-------/ACAGTTAATGAAGTTGTGAATGCAAAGG CAAAGTTCTT 1337 het 1337 ref 37 42 3 1 N/A 0 0 12347 CASAVA_Build X 152996512 1D ATTCTACCGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 557 hom 17 3 10 6 A 14 13 12348 CASAVA_Build X 152999370 4I ATGCACAGAA ----/ATTG ATTAACAACA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATTG 0 1 12349 CASAVA_Build X 153007054 1D AAAACAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 25 3 T 11 10 12350 CASAVA_Build X 153016536 1D GGAGGGGGGA G/- GTCTCAGCGG 965 hom 15 het 7 0 5 2 G 2 1 12351 CASAVA_Build X 153032913 2D15M3I TTCTCACAGT TCTCCATCTACGTGGCT---/--AACAACAACGTAGATGGA TTCCTGCTCA 3070 het 3070 ref 47 32 18 7 N/A 0 0 12352 CASAVA_Build X 153037531 1I TTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 33 3 21 9 T 15 16 12353 CASAVA_Build X 153037613 1I GCAACCTCCA -/C CCCCCGGGTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 5 6 12354 CASAVA_Build X 153041024 1I GCCAGCTCGG -/C CTGTCTGGCC 3070 hom 98 het 36 0 29 7 C 1 2 12355 CASAVA_Build X 153044785 1I AGGACCCAGT -/C CTAGCGGGAC 3070 hom 68 het 30 0 22 8 C 1 2 12356 CASAVA_Build X 153049300 1I CAGGCGTGCG -/C CACCACACCC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 C 1 2 12357 CASAVA_Build X 153051207 1I CTTGAAGCTA -/G GAGTTGGAGA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 G 1 2 12358 CASAVA_Build X 153055605 1I CTAAGGCAGA -/C CAGAAGGCGC 1796 hom 24 het 10 0 7 3 C 1 2 12359 CASAVA_Build X 153068096 1I CTACTCCGGA -/G GCTGAGGCAG 3070 hom 36 het 13 0 12 1 G 1 2 12360 CASAVA_Build X 153127066 3D ATATTGTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3065 hom 21 het 9 0 8 1 T 15 12 12361 CASAVA_Build X 153173972 1D CTGTCTCTAC T/- TAAAAATACA 2285 hom 15 het 6 0 5 1 T 2 1 12362 CASAVA_Build X 153177954 1I TGTACTGGAT -/C CCCGAGGGTG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 C 3 4 12363 CASAVA_Build X 153180246 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 9 10 12364 CASAVA_Build X 153185175 1D TCTGCTTCTC T/- TTTCCCAACT 3070 hom 52 het 23 0 17 7 T 4 3 12365 CASAVA_Build X 153191878 1I GTGGCGTGGG -/C CTGTAGGCAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 1 2 12366 CASAVA_Build X 153197119 2I GGGCAGCAGG --/CC CAAGGCCACA 3070 hom 117 het 43 0 37 6 C 1 3 12367 CASAVA_Build X 153199301 1I CCAGCAGGAT -/G CCAACGGCAG 3070 hom 74 het 31 0 24 7 G 0 1 12368 CASAVA_Build X 153200993 1D AAAGAGACAG T/- TGGGAGACCC 3070 hom 60 het 22 0 18 4 T 2 1 12369 CASAVA_Build X 153238213 1D GCTGGGGGAT A/- GGGGAAGGGG 3070 hom 39 het 15 0 12 3 A 1 0 12370 CASAVA_Build X 153245509 1D TGTGCCACAA C/- CACTTGAAAT 3070 hom 132 het 47 0 42 5 C 2 1 12371 CASAVA_Build X 153276534 1D TCTACAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1509 hom 21 7 7 7 A 10 9 12372 CASAVA_Build X 153321217 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 16 5 A 12 11 12373 CASAVA_Build X 153326038 2D TCCAGCAGGG CA/-- CACAGAAGCA 2292 het 273 hom 11 2 7 3 CA 3 2 12374 CASAVA_Build X 153403929 3D GAACAGTTAG GTT/--- GTTGTACAAG 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 GTT 2 1 12375 CASAVA_Build X 153491190 5D TAGATGGCAT CTAAC/----- CATGGCCCAG 1950 het 1950 ref 40 32 5 4 CTAAC 1 0 12376 CASAVA_Build X 153562907 1I GTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 10 11 12377 CASAVA_Build X 153590615 2I CCCCCTTCAC --/TT TCTCTTCCTC 2496 het 2496 ref 19 11 6 2 T 1 3 12378 CASAVA_Build X 153616488 4D ATGAATGACC TAAT/---- TAATAGAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TAAT 2 1 12379 CASAVA_Build X 153643692 1D TTGCGGGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 247 hom 39 1 29 9 A 12 11 12380 CASAVA_Build X 153662812 1D GCGGCGGGGA G/- GGGGGGGAAG 3070 hom 33 het 20 0 12 9 G 8 7 12381 CASAVA_Build X 153737212 1I AATGCTGATT -/C CCTTCAGGAC 3070 hom 105 het 40 0 33 7 C 2 3 12382 CASAVA_Build X 153786511 1D CAATAACGAC A/- AAAAAAAAAA 1498 het 1498 ref 33 20 5 8 A 12 11 12383 CASAVA_Build X 153820354 2I AAAGGTGTAA --/AT ATATATATAT 2006 het 1467 hom 15 3 5 7 AT 8 9 12384 CASAVA_Build X 153860179 3D ACATCTGGTG TAA/--- TAATCACTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 TAA 2 1 12385 CASAVA_Build X 153937993 1D TCCTCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 2746 het 2746 ref 24 7 8 9 T 13 12 12386 CASAVA_Build X 153961935 1D TAGCAGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 31 1 25 6 A 12 11 12387 CASAVA_Build X 153993211 3I GGGAGAAAGG ---/AAA AAAAACAGAT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 A 5 8 12388 CASAVA_Build X 153996205 1D GCAAAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 11 10 12389 CASAVA_Build X 153999786 1D AGCATCACAC A/- AAAGGCTACA 3070 het 3070 hom 42 17 21 5 A 4 3 12390 CASAVA_Build X 154006578 1I CTCAAAAAAA -/T AAAACAAAAC 3070 het 1058 hom 16 5 8 3 T 0 1 12391 CASAVA_Build X 154045248 1I AATTTTTTTT -/A AATTTTATTT 2073 hom 15 het 7 0 6 1 A 2 3 12392 CASAVA_Build X 154051071 3I ACAGTCTATA ---/TTT TCTCATAATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 1 4 12393 CASAVA_Build X 154061539 1D CTTTTTAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 40 1 33 6 T 11 10 12394 CASAVA_Build X 154109839 1D GGTACTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 11 15 T 12 11 12395 CASAVA_Build X 154140222 1D TTATCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1951 hom 34 13 13 8 T 11 10 12396 CASAVA_Build X 154147829 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1937 hom 20 6 9 5 T 11 10 12397 CASAVA_Build X 154148863 1I ATGTGCCAGG -/T TTTTTTTTTT 2561 het 2561 ref 25 9 6 10 T 10 11 12398 CASAVA_Build X 154152784 1I TATATAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 9 11 7 T 14 15 12399 CASAVA_Build X 154166738 2D CTCCCTGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 25 10 4 11 T 18 16 12400 CASAVA_Build X 154177948 1I CAAGAAATGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 7 8 12401 CASAVA_Build X 154179292 1I TTAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 9 10 12402 CASAVA_Build X 154206815 4D CAAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 AAAC 4 3 12403 CASAVA_Build X 154215150 3I AAAAGAGGGT ---/TAA TAATAAACCA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 TAA 2 3 12404 CASAVA_Build X 154270225 3D TTTCTGGGTT CTC/--- TATTCTGTCC 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 CTC 1 0 12405 CASAVA_Build X 154275452 1D GCCATTCTCA T/- TTTTTTTTTC 2361 het 2070 hom 15 5 6 4 T 10 9 12406 CASAVA_Build X 154276107 16I ACAACAAAAA ----------------/AACAAAACTTCAGGTG AACAAAACTT 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 AACAAAACTTCAGGTG 1 2 12407 CASAVA_Build X 154304104 1I GTATTTTCTA -/C CCACACTGTC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 C 2 3 12408 CASAVA_Build X 154324602 4I ATGAGAACTT ----/ACTC ACTATCATGA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 ACTC 0 1 12409 CASAVA_Build X 154327926 1I ATCACAGTGG -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 6 7 12410 CASAVA_Build X 154394282 1I TAAATCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 11 11 T 12 13 12411 CASAVA_Build X 154411189 5D TCTTTTAATA TTTTT/----- TTTTATGTCA 3070 het 2930 hom 20 8 10 4 T 9 4 12412 CASAVA_Build X 154413285 21I AGGGGCATGA ---------------------/GGGAGGAAATGGGAGATGTAT GGCTAAGGAC 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 GGGAGGAAATGGGAGATGTAT 0 1 12413 CASAVA_Build X 154430572 1D AACTGATTGT A/- AAAAAAAAAA 3042 het 3042 ref 27 10 9 8 A 13 12 12414 CASAVA_Build X 154431590 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1188 het 1188 ref 19 13 3 4 A 12 11 12415 CASAVA_Build X 154438043 1D TCATCCACGT C/- CCTGCAAAGG 1658 het 1658 ref 21 14 6 1 C 3 2 12416 CASAVA_Build X 154439092 38I ATTCAGCCAA --------------------------------------/CCTGAATGAGGTTACATGTGGATTGTTAGCCATAGCCT CCAGAAAGGA 3070 het 3070 ref 41 20 13 10 CCTGAATGAGGTTACATGTGGATTGTTAGCCATAGCCT 0 1 12417 CASAVA_Build X 154461970 2D TGACAAAAAT GG/-- GGAAAAACAT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 4 2 12418 CASAVA_Build X 154462051 1D CCTACAGATT A/- AATTGCAATC 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 3 2 12419 CASAVA_Build X 154491225 7D AGAAACCAGA AGGCGTC/------- TGCCTTCTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 AGGCGTC 1 0 12420 CASAVA_Build X 154501954 9I GATGTCAAGT ---------/CTTAGAGCC CTTTACTGAA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 CTTAGAGCC 0 1 12421 CASAVA_Build X 154508801 2I ACATTTTGTT --/TA TCTTTTTATT 3070 het 3070 hom 38 13 24 1 TA 0 1 12422 CASAVA_Build X 154528387 5D CTGGTTTAAG TACTC/----- TACTCTCTCC 3070 het 3070 hom 54 22 26 9 TACTC 2 1 12423 CASAVA_Build X 154550888 1D ACAACTTTTT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 40 14 20 8 A 8 7 12424 CASAVA_Build X 154565601 1I AAAAAATACA -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 T 6 7 12425 CASAVA_Build X 154568418 1I TCTCCCTCTT -/C CCACCCTCCA 3070 het 79 hom 33 1 31 1 C 2 3 12426 CASAVA_Build X 154568628 1D ATAGTATTCC T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 7 6 12427 CASAVA_Build X 154583147 2D GGAAAATAAC AA/-- GTGTTGTTGA 3070 het 1869 hom 15 5 8 3 A 2 0 12428 CASAVA_Build X 154594357 1D TTGCTATGTC T/- TTGTGTTTCA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 3 2 12429 CASAVA_Build X 154594544 1D CTTTTTACTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2613 hom 20 8 8 4 T 10 9 12430 CASAVA_Build X 154596626 1D AATGTCTTTG A/- AAAAAACTTC 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 A 7 6 12431 CASAVA_Build X 154601050 1D TTGCTGAAGG C/- TTCACTCTGC 3070 het 3070 ref 28 19 9 1 C 1 0 12432 CASAVA_Build X 154603013 1D AGTAGTCTGA T/- CAATACTCCT 3070 hom 69 het 30 0 21 10 T 1 0 12433 CASAVA_Build X 154605691 1I GCACAACGTG -/C AGGTTTGTTA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 0 1 12434 CASAVA_Build X 154621204 1D ACTCAACAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 A 10 9 12435 CASAVA_Build X 154634577 1I TGCCAAAATA -/T TTTCCCCTTA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 T 3 4 12436 CASAVA_Build X 154636179 1I10M1I TTTCTGGACA -TTCACATAAA-/TTTCACATAAAT TGAATATTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 N/A 0 0 12437 CASAVA_Build X 154637817 2D TAGCTGAACT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 TG 8 7 12438 CASAVA_Build X 154645972 1D CAGGAACAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 A 9 8 12439 CASAVA_Build X 154648144 10D AGCTCTGGAG TGAGACAGCC/---------- TGAGTCAGCC 3070 het 3070 ref 40 26 16 2 TGAGACAGCC 1 0 12440 CASAVA_Build X 154651100 1I CGTGTGTGTG -/C CCGCGCGCTT 3070 hom 37 het 17 0 12 5 C 2 3 12441 CASAVA_Build X 154652399 1D TTGAGTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 10 9 12442 CASAVA_Build X 154661386 1D ACTAATTCAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 T 9 8 12443 CASAVA_Build X 154666735 1I13M1I10M1I33M1I11M1I CATCACACCT -CAATACCCCACCT-CTCCATGCCT-CACTCCCATCCTATGACCTTGCAATATATCACT-GGAAAATAGCC-/CCAATACCCCACCTCCTCCATGCCTCCACTCCCATCCTATGACCTTGCAATATATCACTGGGAAAATAGCCT TTTCTTTTGA 3070 hom 96 het 31 0 33 14 N/A 0 0 12444 CASAVA_Build X 154673345 1D37M1D27M1D ATGAAATTTG AAAAAATTAGAAATGAGAGATTTTGGTTAAATTTACAGAAAAAGAAAACTTGTGAGGTGTAGCTAAC/-AAAAATTAGAAATGAGAGATTTTGGTTAAATTTACAG-AAAAGAAAACTTGTGAGGTGTAGCTAA- AGCAGTGCCT 3070 hom 105 het 23 0 36 4 N/A 0 0 12445 CASAVA_Build X 154673909 1I AGCCAGATAG -/T TTTCACTGGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 4 12446 CASAVA_Build X 154675447 2I GCACAGGAAG --/AA TGGTATATAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 0 2 12447 CASAVA_Build X 154680329 1I TCCCACCAGG -/C CCCACCTCCA 3070 hom 102 het 39 0 32 7 C 3 4 12448 CASAVA_Build X 154681513 1D79M1D AAAGACAGCC GGTTCTTAAAATGATTCTGACTCTGTGGATGGCAGAATTCAAGGGAGAGATTTAAACAAGAGATATACATTTTGTATTATC/-GTTCTTAAAATGATTCTGACTCTGTGGATGGCAGAATTCAAGGGAGAGATTTAAACAAGAGATATACATTTTGTATTAT- CAGCATATAG 3070 hom 114 het 40 0 38 24 N/A 0 0 12449 CASAVA_Build X 154686456 24D CATTCCAGAG CCACGAGCCCTGGATTCTATCCAA/------------------------ GCCACGAGGG 3070 het 429 hom 12 1 11 0 CCACGAGCCCTGGATTCTATCCAA 1 0 12450 CASAVA_Build X 154689543 1I ACCATTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1703 hom 33 8 18 7 T 10 11 12451 CASAVA_Build X 154692240 4I TTAAACGTCC ----/CTGT CTGTCTGACA 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 CTGT 1 2 12452 CASAVA_Build X 154707786 1D CAGAACCCAG C/- AACTTAATCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 12453 CASAVA_Build X 154718732 1I10M2I6M2I10M4I9M3I CAGAATATAC -AGGAATTGAA--CAATCA--CAGCAAAACA----TCCATTTTT---/AAGGAATTGAAACAAATCAACAAGCAAAAAACAATCCCATTTTTTTA AATGAGCATT 3070 hom 66 het 18 0 23 4 N/A 0 0 12454 CASAVA_Build X 154724401 1D AATAGTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 13 11 T 13 12 12455 CASAVA_Build X 154729579 1D ACCACCTGGG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 8 7 12456 CASAVA_Build X 154735018 1D TGGGTATATA C/- CCCAGTAATG 278 hom 5 het 3 0 2 1 C 4 3 12457 CASAVA_Build X 154741029 1I CATGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 3 4 12458 CASAVA_Build X 154742984 1D GCTTATGAAG T/- AATGATCAAA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 1 0 12459 CASAVA_Build X 154744472 1D3M2D9M1D13M1D ACTTTTGGAT AATCCTTTCCATTATGGAGGAAATATTTTA/-ATC--TTTCATTAT-GAGGAAATATTTT- AAACCTATTT 3070 hom 69 het 22 0 24 3 N/A 0 0 12460 CASAVA_Build X 154745090 1D ATTTCTTTCA T/- TGTTTCTTGA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 2 1 12461 CASAVA_Build X 154747085 1D AGAACTTGTG A/- AAACTTTTCT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 4 3 12462 CASAVA_Build X 154747553 1I CAGTCTTAAT -/G GAATGGCTTC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 1 2 12463 CASAVA_Build X 154748248 1I AGGCACCGCA -/G GGAGCCAGGG 3070 hom 53 het 19 0 18 1 G 2 3 12464 CASAVA_Build X 154753418 1I32M1D10M1D TCATGGTCCC -AGTCAAGTTAACATTTTCCATCTTACTGTTACTTCAACCTTTTA/AAGTCAAGTTAACATTTTCCATCTTACTGTTAC-TCAACCTTTT- AGCAGCATAT 3070 hom 108 het 37 0 37 9 N/A 0 0 12465 CASAVA_Build X 154755557 1D CTTCCCAACC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 55 22 29 6 A 9 8 12466 CASAVA_Build X 154757402 1I CGAGCTGGGT -/G GGGAGGAGAA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 G 3 4 12467 CASAVA_Build X 154764325 1I GTGGGGTGCG -/C CCTGCGGGAG 2869 hom 52 het 21 0 13 8 C 2 3 12468 CASAVA_Build X 154769762 1D10M1I TGCCAAGGTC AAGTTTCCTTC-/-AGTTTTCTTCT TGAACCTGCA 3070 hom 150 het 54 0 49 8 N/A 0 0 12469 CASAVA_Build X 154772696 1I49M1D GAAGAAAGAT -GAAATGTTAAATGTAAAAATGACTTTGCTCTAGAGCTGTGTGATATGTGA/GGAAATGTTAAATGTAAAAATGACTTTGCTCTAGAGCTGTGTGATATGTG- AAATAATTCA 3070 hom 178 het 46 0 60 7 N/A 0 0 12470 CASAVA_Build X 154778630 1D CCAACCCCCA G/- GGCTGCAGAC 3070 hom 63 het 30 0 20 10 G 3 2 12471 CASAVA_Build X 154782401 2I AAATTTTATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 CA 7 8 12472 CASAVA_Build X 154788837 1I66M1I AGATCAATTA -GGGAGCCATTTTAACAATATTAAACTTCTGATCCATGAACATGGGCTTTCTTTCTATTCATTTAGG-/GGGGAGCCATTTTAACAATATTAAACTTCTGATCCATGAACATGGGCTTTCTTTCTATTCATTTAGGT TTTCTTTAAT 3070 hom 166 het 42 0 56 7 N/A 0 0 12473 CASAVA_Build X 154791474 4I TTGTGATGTC ----/TTTG TTTGGTTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 TTTG 1 2 12474 CASAVA_Build X 154801153 1I CTGGCTTCAG -/C CCCCTTTCCA 3070 hom 66 het 27 0 20 7 C 4 5 12475 CASAVA_Build X 154804168 1I AGCTCAATTA -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 6 7 12476 CASAVA_Build X 154810426 1I16M1D ATTCTTTCTG -TGTCCTTTATTGTTTTC/TTGTTCTTTATTGTTTT- CTGCAGTTCT 3070 hom 39 het 13 0 14 2 N/A 0 0 12477 CASAVA_Build X 154813348 2D AAAACCAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 26 7 15 4 A 16 14 12478 CASAVA_Build X 154821313 1I17M1D AACCAATATG -TGAAGTATAATATACATA/TTGAAGTATAATATACAT- AAGTGCATCA 3070 hom 111 het 36 0 37 3 N/A 0 0 12479 CASAVA_Build X 154821934 2I12M1I10M1I9M1I TTGGTGAATT --TGCATACATCTG-TGGGACCATA-CCAGAGTGG-/TGTGCATACATCTGTTGGGTACATACCCAGAGTGGA ATTGCTGGAT 3070 hom 63 het 22 0 22 2 N/A 0 0 12480 CASAVA_Build X 154822928 1D AGACATTTCT G/- GTTTATATGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 2 1 12481 CASAVA_Build X 154830911 1D ACTCAGATTG A/- AAGGTTTTGG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 3 2 12482 CASAVA_Build X 154832001 1I GATAAGGAAG -/A GCTAGTTGGA 3070 hom 129 het 47 0 42 5 A 0 1 12483 CASAVA_Build X 154832089 1I TTCCTGTACT -/C CCCAGGGTAT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 C 3 4 12484 CASAVA_Build X 154832779 1D GGCTCAGACT C/- CTGGCAATGG 3070 hom 99 het 37 0 33 5 C 2 1 12485 CASAVA_Build X 154833144 1I TTGGGACCAT -/G GAAAAGGTTG 3070 hom 139 het 49 0 42 7 G 1 2 12486 CASAVA_Build X 154834546 1D TGGTTCATGT C/- TTAGGGTTAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 1 0 12487 CASAVA_Build X 154834811 1D GGCTTGGCTT G/- GGGTTGGGTT 3070 hom 95 het 38 0 30 8 G 4 3 12488 CASAVA_Build X 154835722 4D TGTTCTGGTT TGCC/---- CACATGTAAG 3070 hom 105 het 38 0 34 7 TGCC 1 0 12489 CASAVA_Build X 154838569 1I7M1I GGGGACCGCA -GACCGCA-/GGACCGCAG GCCTATGGGC 3070 hom 87 het 32 0 27 7 N/A 0 0 12490 CASAVA_Build X 154838833 1I ACCTGGGAGA -/C CCCTCTGTGG 3070 hom 74 het 29 0 20 9 C 3 4 12491 CASAVA_Build X 154839006 1D GTTTTACTTT C/- CTCATGTTGT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 C 2 1 12492 CASAVA_Build X 154841048 1I GTGGCGGCAG -/C CCGCGGTGAG 3070 hom 80 het 30 0 25 5 C 2 3 12493 CASAVA_Build X 154841179 1D TTTTTGATCA C/- CCCTTTAAAC 1989 hom 12 het 6 0 5 1 C 4 3 12494 CASAVA_Build X 154848737 4I TTTACCCATG ----/TCTT TCTTCGCATG 3070 het 3070 ref 66 30 29 7 TCTT 1 2 12495 CASAVA_Build X 154848999 3I GAAAAAAAAA ---/AAC CGCGAAAGTG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AAC 0 1 12496 CASAVA_Build X 154849046 1D15M1D GTTCTACCAG CCAATGAATGACAGCTC/-CAATGAATGACAGCT- CTATTGTTCT 3070 hom 54 het 24 0 19 10 N/A 0 0 12497 CASAVA_Build X 154851141 1D7M1D11M1D ATCTTGAGTT CACTACCTAATTGCTTTGTTC/-ACTACCT-ATTGCTTTGTT- CCCCTTACTG 3070 hom 81 het 29 0 27 3 N/A 0 0 12498 CASAVA_Build X 154851246 1I3M1D39M1I TTCTTATCTG -GTGTGCTGTAGCCATGTCTTAGGCAAGTCCCCTTGTGCATGTT-/TGTG-GCTGTAGCCATGTCTTAGGCAAGTCCCCTTGTGCATGTTC CCTTATCTGT 3070 hom 103 het 27 0 34 4 N/A 0 0 12499 CASAVA_Build X 154853080 1I TTTGGCGTAA -/G CTCTATGCTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 0 1 12500 CASAVA_Build X 154855923 1I25M1D GGCTGAAGTG -CCTGTGGCAATGGTTTGGCTTCAATG/CCCTGTGGCAATGGTTTGGCTTCAAT- GACAGCATCC 3070 hom 36 het 14 0 13 2 N/A 0 0 12501 CASAVA_Build X 154856004 1I ATGTGGATTG -/A TGAAGTTGCT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 0 1 12502 CASAVA_Build X 154857641 1I AAGAGCCCTG -/T TTTGTAAAGG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 3 4 12503 CASAVA_Build X 154860894 1D4M1I TCTAAAGTGT AATAG-/-ATAGT TGACTCGCTG 3070 hom 54 het 24 0 18 8 N/A 0 0 12504 CASAVA_Build X 154860957 1I68M1D4M1D8M1D CCTAATAACC -TCCAGAATTGCTTTTAAATAAACTTCTTAAATTGTAGCAATAAAAATGACAGGACACATTTAAAAAATAACTGAAAGCTTATC/TTCCAGAATTGCTTTTAAATAAACTTCTTAAATTGTAGCAATAAAAATGACAGGACACATTTAAAAAAT-ACTG-AAGCTTAT- CAAAGGACAT 3070 hom 45 het 18 0 16 13 N/A 0 0 12505 CASAVA_Build X 154861561 1I ATTTTCAGCA -/T GCATTATGTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 0 1 12506 CASAVA_Build X 154867884 7I CTGCTAGTCT -------/TCACTAC TCACTACTCT 3070 het 3070 ref 62 33 24 5 TCACTAC 1 2 12507 CASAVA_Build X 154868209 14D TTAGCTCTAC TTACTTAGCTCTAT/-------------- CTCTTCCTGG 3070 het 3070 ref 62 43 19 8 TTACTTAGCTCTAT 1 0 12508 CASAVA_Build X 154868347 1D GAAGTGCTCT C/- CCCCTCCCCA 3070 hom 144 het 59 0 47 12 C 5 4 12509 CASAVA_Build X 154875160 1D TTTTGGTTGC T/- TTTTTTTTTT 1115 het 1115 ref 53 36 4 13 T 12 11 12510 CASAVA_Build X 154875446 1I CAGGCGTGAG -/C CTTCCTGCCC 3070 hom 64 het 28 0 16 12 C 1 2 12511 CASAVA_Build X 154877536 1I TCTGTGTCAG -/C CAGGTTGGAG 1670 hom 4 het 7 0 4 4 C 1 2 12512 CASAVA_Build X 154884475 1I11M2I14M1D33M1I GCTGCCCATT -GGTTTGTGCGG--TCCTTTAAGGCTGTAAGTCTGTGTGCGTGTCTGGTTTTTTCCTCCTCC-/GGGGTTGTGCGGGTTCCTTAAGGGCTGT-AGTCTGTGTGCGTGTCTGGTTTTTTCCTCCTCCT TATCAGTAAT 3070 hom 123 het 31 0 40 8 N/A 0 0 12513 CASAVA_Build X 154884933 1I TGGGTCTGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 61 het 24 0 18 6 G 1 2 12514 CASAVA_Build X 154890081 1I GGTTCCTGGA -/G GTGCTGGCTC 3070 hom 41 het 15 0 12 3 G 1 2 12515 CASAVA_Build X 154890545 1D TTGGCTTTCA C/- TGAGGGTTGG 3070 hom 53 het 19 0 17 3 C 1 0 12516 CASAVA_Build X 154900617 1I TAGCATTCCC -/A AAATTTAATT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 3 4 12517 CASAVA_Build X 154904484 3D TGTTAGAAGC AGG/--- AGGTGTGCAG 405 het 405 ref 23 13 3 8 AGG 2 1 12518 CASAVA_Build X 154904682 17D TCCTGAGGCT ACTGGGCAGTCCCTCCA/----------------- TTTCCCCATG 3070 het 3070 ref 73 49 26 19 ACTGGGCAGTCCCTCCA 1 0 12519 CASAVA_Build X 154905081 1D GGGGCCACCA T/- AGGGTTCTGT 1464 het 1464 ref 68 46 6 16 T 1 0 12520 CASAVA_Build X 154909930 1I GGGCCCCTGG -/C CTGGGCTCTG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 1 2 12521 CASAVA_Build X 154911258 1D TTAGACTGGC A/- AAAAATCCAA 3070 hom 112 het 43 0 37 6 A 6 5 12522 CASAVA_Build X 154912516 1D AACGGTGAAT A/- AAAATGTTTC 3070 hom 93 het 34 0 29 8 A 5 4 12523 CASAVA_Build 5 66740 5D TATGGGTAAA ATGTT/----- ATGTTTTCAG 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 ATGTT 2 1 12524 CASAVA_Build 5 66982 3D CTTGTCAGTT GTG/--- GTATAATGAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 9 GTG 1 0 12525 CASAVA_Build 5 67057 1I TTATTTCCCC -/T GATGCTTTCC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 0 1 12526 CASAVA_Build 5 67405 4I50M1I51M1D TCTAACTGTA ----ACAACAATTTAGTAGATTATACTTTTATAAACAGAAATGAGGCATTTATC-TTTTTTCTCTGCCTGATTTCTCCAGAATTTTGAAATTCTAACTGAATACTCT/ACTTACAACAATTTAGTAGATTATACTTTTATAAATAGAAATGAGGCATTTATCTTTTTTTCCCTGCCTGATTTTTCCAGAATTTTGAAATCCTTACTGAATACTC- TTATTTTCAT 3070 het 3070 ref 46 70 9 8 N/A 0 0 12527 CASAVA_Build 5 71049 1I TGTAGTAACA -/C ATATGTGTAA 1841 het 1841 ref 36 27 4 5 C 0 1 12528 CASAVA_Build 5 101936 21D GCACTGCAGC TATTTTAAGTATTCCTTAAAA/--------------------- TATTTTAAGT 2013 het 2013 ref 31 16 5 13 TATTTTAAGTATTCCTTAAAA 2 1 12529 CASAVA_Build 5 109266 4D TCTCTGGTTC AGTT/---- AGTTCCTCTA 3070 het 3070 hom 34 16 18 2 AGTT 2 1 12530 CASAVA_Build 5 119812 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1106 het 1106 ref 54 43 3 8 T 11 10 12531 CASAVA_Build 5 122604 3D CTCTGCACTT CTC/--- CTTGCTGCCA 3070 het 3070 ref 30 17 11 4 CTC 1 0 12532 CASAVA_Build 5 123474 1I GAGGTTCCTC -/A AAAAGCTAAA 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 A 4 5 12533 CASAVA_Build 5 143321 1D ACCAGATCTG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 1366 hom 29 6 11 12 C 10 9 12534 CASAVA_Build 5 215371 32D GCAGACTGCT CGCCTGCGAGCTCCCACGCGCCCCAGACCGCA/-------------------------------- CGCCTGCGAG 2090 het 2090 ref 27 17 7 9 CGCCTGCGAGCTCCCACGCGCCCCAGACCGCA 1 0 12535 CASAVA_Build 5 221027 14D ATAAAAAAAT TAAAAAATACCACC/-------------- TGATTTGGGA 3070 het 3070 ref 27 19 8 2 TAAAAAATACCACC 1 0 12536 CASAVA_Build 5 255601 7D TCGGGAGGCT GAGGCAG/------- GCAAACTACT 3070 het 2413 hom 21 7 11 5 GAGGCAG 1 0 12537 CASAVA_Build 5 369445 1I CCTGCCCCCA -/G GCACATGTCT 3070 hom 74 het 33 0 23 10 G 1 2 12538 CASAVA_Build 5 371846 1I CCTGGCCTGG -/C CCCGAGGGGT 3070 hom 30 het 13 0 9 4 C 3 4 12539 CASAVA_Build 5 380173 3D GACTCTGTCT CAA/--- CAACAACGGC 3070 het 3070 hom 32 8 18 7 CAA 3 2 12540 CASAVA_Build 5 444167 2I ATCCTCAGAC --/AG AGACGGGAGA 3070 het 3070 hom 35 11 13 11 AG 1 2 12541 CASAVA_Build 5 457453 1D TGTTTCACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 21 21 1 T 10 9 12542 CASAVA_Build 5 461498 1D TTCCTGAGCC T/- TTTTTTTTTT 2320 het 2320 ref 39 25 7 7 T 11 10 12543 CASAVA_Build 5 463675 1I AGAAAAAAAA -/C CTTTAAAATG 3070 het 3070 hom 35 10 23 2 C 1 2 12544 CASAVA_Build 5 469034 1I GTGATTCTGC -/A AAAAAAACTC 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 7 8 12545 CASAVA_Build 5 480555 1I ATTCTTGCCA -/G GGGGTTTGCC 3001 hom 33 het 14 0 10 4 G 4 5 12546 CASAVA_Build 5 491852 3D CTGGGGTCTC CTT/--- AAGCACAAAC 3070 hom 51 het 22 0 16 7 CTT 1 0 12547 CASAVA_Build 5 505570 2I TCTTTAAGTT --/AA CCTTAGGCAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 0 2 12548 CASAVA_Build 5 508728 4D CGTGTGAGTT GAAA/---- GAATTTTCTG 3070 hom 39 het 14 0 14 3 GAAA 1 0 12549 CASAVA_Build 5 509516 1I GCTGTGGGGG -/C CGGCTGTGCT 3070 hom 53 het 25 0 18 7 C 1 2 12550 CASAVA_Build 5 510447 1I TCCCATGGTT -/G GGGGGGGTCC 3070 het 435 hom 32 1 18 13 G 7 8 12551 CASAVA_Build 5 512296 1D GAGAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 33 3 14 17 T 14 13 12552 CASAVA_Build 5 512342 1D CGTGGTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 42 hom 36 2 23 11 T 10 9 12553 CASAVA_Build 5 514285 5D TAAATAAAAT AAATA/----- AAATAAGATA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AAATA 2 1 12554 CASAVA_Build 5 514728 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 479 hom 26 2 16 8 A 13 12 12555 CASAVA_Build 5 522841 4I GAGGACACGC ----/TTTG TTTGCTCTCA 3070 hom 88 het 36 0 28 8 TTTG 1 2 12556 CASAVA_Build 5 527619 2D GAGAGAGAGA GC/-- GAGCCAGGTT 2326 hom 42 het 17 0 13 4 GC 1 0 12557 CASAVA_Build 5 527775 1D GAGACCTGGA G/- GGAGAGGAGC 1894 hom 9 het 16 0 8 8 G 3 2 12558 CASAVA_Build 5 532880 1I CTCCTCACTG -/C CCCCATGGCA 2360 hom 30 het 13 0 9 4 C 4 5 12559 CASAVA_Build 5 546232 1I TTGGACTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 227 hom 14 1 10 3 A 13 14 12560 CASAVA_Build 5 548495 2D TCACAGTGCT CC/-- CCGCGCCATC 2806 hom 25 het 10 0 9 1 C 4 2 12561 CASAVA_Build 5 557354 1D CCAGCTCCGG A/- ACCCCCGGGA 1575 het 1211 hom 18 6 8 4 A 2 1 12562 CASAVA_Build 5 570381 4I CTCACTCATT ----/CATC CATCCATCCA 3070 hom 186 het 80 0 58 22 CATC 2 3 12563 CASAVA_Build 5 575230 2I CAGGGTAAGG --/CT CTCGCCTTCC 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 CT 1 2 12564 CASAVA_Build 5 578150 1D15M1D AGCCCAGGGG CCCCCGTGGTCTCCCCT/-CCCCGTGGTCTCCCC- GCCCCATCCC 2278 hom 24 het 9 0 8 2 N/A 0 0 12565 CASAVA_Build 5 603016 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2051 het 994 hom 12 4 6 2 A 13 12 12566 CASAVA_Build 5 622113 1D GGTCCTAACA T/- TTAGAAAGGG 3070 hom 50 het 26 0 14 13 T 3 2 12567 CASAVA_Build 5 625612 1D AATTCACAAT A/- AAAAAAAAAA 1925 het 1925 ref 24 10 8 6 A 11 10 12568 CASAVA_Build 5 641931 1D7M1D AGCAGAGCCC AGGCTGTGC/-TGCTGTG- CTCATTCTGT 3070 het 3070 hom 32 13 17 8 N/A 0 0 12569 CASAVA_Build 5 660513 2D TCCTAAGACA TT/-- ACGATGCGGA 3070 het 3070 ref 36 19 10 9 T 2 0 12570 CASAVA_Build 5 665804 2I ATCGGGTCAC --/TG TGGTTCCGTG 1029 het 1029 ref 16 7 4 5 TG 1 2 12571 CASAVA_Build 5 666493 1D ATCTGAGCGG T/- TTTTTTTTTT 3003 het 2705 hom 29 9 11 9 T 12 11 12572 CASAVA_Build 5 679165 1D GTGGGGGGCA G/- GGGGGGGCGG 2911 het 2911 ref 26 14 9 3 G 8 7 12573 CASAVA_Build 5 680532 4I TTAGGGCTGC ----/TAAA CCTGTACATG 3070 hom 117 het 46 0 38 8 TAAA 0 1 12574 CASAVA_Build 5 682050 1D TTTGTGCAGC G/- TTCTGGAGAA 1102 het 1102 ref 31 18 6 8 G 1 0 12575 CASAVA_Build 5 687239 1I ACAGAGTTAT -/A AAATGAGAAA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 3 4 12576 CASAVA_Build 5 698577 1I AGGTGATGAG -/A AAAAAAAAAA 693 het 693 ref 25 12 3 10 A 15 16 12577 CASAVA_Build 5 706467 1I TTACTCCAAG -/C CCCTCTGCAT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 C 3 4 12578 CASAVA_Build 5 706654 1I ATAAACAAAT -/A ACATTGTTCT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 1 2 12579 CASAVA_Build 5 707449 2I GTGTGTGCGC --/TG TGTGTGTGCG 1009 het 1009 ref 72 38 11 24 TG 4 5 12580 CASAVA_Build 5 716742 8D TCTTGGGAGT CGGGGAGG/-------- CGGGTGGTGC 1845 het 1628 hom 20 6 7 8 CGGGGAGG 1 0 12581 CASAVA_Build 5 749840 4D TGTGTGCACC TGTG/---- TGTGAGAGTG 3070 hom 66 het 25 0 21 4 TG 4 2 12582 CASAVA_Build 5 750004 2I TGTCTCTGTG --/TT TGTATGAGTG 3070 hom 149 het 51 0 50 1 T 1 3 12583 CASAVA_Build 5 750405 1D GAAGCCAAAT G/- GGGGGTGTTC 2192 het 6 hom 14 0 6 8 G 6 5 12584 CASAVA_Build 5 752953 1D AAAAAACATG A/- AAAAAATGCT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 7 6 12585 CASAVA_Build 5 754422 1D ACCTTTTTTT C/- CCCAATTCGA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 4 3 12586 CASAVA_Build 5 755048 16D GTCAAAAGTG TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 10 20 T 30 14 12587 CASAVA_Build 5 761519 2I CCTTTGCTGA --/CT CTCTTTTTGG 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 CT 2 3 12588 CASAVA_Build 5 776220 1I TAAAGATGAT -/G TCAGACTCCG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 G 0 1 12589 CASAVA_Build 5 776489 1D TACTAATATG T/- TCCCATTTCC 3070 het 3070 ref 42 26 15 2 T 2 1 12590 CASAVA_Build 5 779199 1I CCACAGCAAA -/C ACGCAGACCA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 C 0 1 12591 CASAVA_Build 5 780891 1D CCCTGTATGC A/- AAAATAAGTT 3070 het 2572 hom 17 6 9 3 A 5 4 12592 CASAVA_Build 5 782665 2I CTGTGTGCGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 GT 6 7 12593 CASAVA_Build 5 793985 2I AAAAAATGTT --/CA GTCGTAATTG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 CA 0 1 12594 CASAVA_Build 5 794130 2I AAGTCATCAG --/AA AGAGTCTGTG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 1 3 12595 CASAVA_Build 5 795031 11I TTTAACTCCC -----------/ACTAGCAAAAA ACGCAGGAGA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 ACTAGCAAAAA 0 1 12596 CASAVA_Build 5 795606 2I TCACAGAAAC --/TG TGTTTTTTCA 3070 hom 41 het 16 0 11 5 TG 1 2 12597 CASAVA_Build 5 802946 1I GACTTGCTAC -/T AGGGGGAGAA 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 T 0 1 12598 CASAVA_Build 5 806933 1I AGGGCAGGGA -/C CCCCCCGGTG 1859 het 1859 ref 25 11 8 6 C 6 7 12599 CASAVA_Build 5 809385 1I CCTGCACACG -/T TGAGCCCAGC 3070 het 2333 hom 29 9 12 8 T 1 2 12600 CASAVA_Build 5 819423 1I GGGACCCCTG -/C CCGCTGGAAG 3070 het 3070 hom 27 15 10 2 C 2 3 12601 CASAVA_Build 5 827688 20D ACTACGGCCT GGGGTCTGTCACTAGGGCCA/-------------------- GGGGTCTGCC 1671 het 1671 ref 47 29 6 14 GGGGTCTGTCACTAGGGCCA 1 0 12602 CASAVA_Build 5 841360 4I CGTGTGCCTG ----/TGTC TCTGTGTGTG 3070 hom 262 het 101 0 84 17 TGTC 0 1 12603 CASAVA_Build 5 846363 1I TCAAAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 567 hom 35 3 27 5 T 12 13 12604 CASAVA_Build 5 850342 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2632 het 2632 ref 22 15 6 1 TA 7 8 12605 CASAVA_Build 5 860369 1I CCTTTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 31 1 23 7 A 11 12 12606 CASAVA_Build 5 886162 2I AAAAAATGTT --/CA GTCGTAATTG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 CA 0 1 12607 CASAVA_Build 5 887632 4I TGTTTATGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 53 33 16 4 TTTG 2 3 12608 CASAVA_Build 5 887961 2I TGTTGCACAC --/AT GTCATGTAAA 2700 het 2700 ref 58 48 6 4 AT 0 1 12609 CASAVA_Build 5 895414 1I ACTTGCTACT -/G GGGGGAGAAG 2041 het 2041 ref 38 24 6 8 G 5 6 12610 CASAVA_Build 5 984605 1D TCTACATTCC T/- TTTCAAAGAA 3070 het 3070 ref 24 14 10 1 T 4 3 12611 CASAVA_Build 5 1024705 1D ACAGAACTAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 120 het 42 0 40 2 A 8 7 12612 CASAVA_Build 5 1039334 4D TCGCTCATGC TATT/---- GTTTGTGGCT 2061 het 2061 ref 20 12 6 2 TATT 1 0 12613 CASAVA_Build 5 1046792 6D AGTTCAACCT CCACCC/------ CCACTCCCTG 3070 hom 66 het 29 0 20 13 CCACCC 1 0 12614 CASAVA_Build 5 1047003 3D TATGGGGTCT GGA/--- GGAGGAACGA 3070 hom 65 het 24 0 22 3 GGA 3 2 12615 CASAVA_Build 5 1053175 1D AGCAGGATTC T/- TCTTGGAGGC 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 2 1 12616 CASAVA_Build 5 1086147 4I GGACTGTGTC ----/GCGG TATGGGGAGG 3070 hom 53 het 19 0 17 2 GCGG 0 1 12617 CASAVA_Build 5 1094448 4D GAATGAACAA TGAG/---- TGAGTGACAG 3070 hom 191 het 70 0 59 18 TGAG 2 1 12618 CASAVA_Build 5 1095993 2I TGTGAATGAG --/TT GGGTTTGTGA 3070 hom 81 het 38 0 27 11 T 0 2 12619 CASAVA_Build 5 1096048 4I AGTGGGTGAA ----/TGAG TGTGTGAATG 3070 hom 111 het 53 0 37 16 TGAG 0 1 12620 CASAVA_Build 5 1096739 4D9M4D GAATGAATGG GTTAGTTTGTGAATGAG/----GTTTGTGAA---- TGGGTGGGTT 1237 het 1237 ref 63 42 6 20 N/A 0 0 12621 CASAVA_Build 5 1097006 32D TGTGAATGGG TGTGTGAACGAGTGGCTGAGTTAGTGTGTGAA/-------------------------------- TGGGTTAGTG 3070 hom 91 het 35 0 25 21 TGTGTGAACGAGTGGCTGAGTTAGTGTGTGAA 1 0 12622 CASAVA_Build 5 1098596 2I GCTGAACGAC --/TG TGTGAATGGG 3070 hom 139 het 58 0 43 15 TG 2 3 12623 CASAVA_Build 5 1098959 4D AGTGCATGAC TGAG/---- TGGGTGAGTT 3070 het 3070 hom 74 27 34 16 TGAG 1 0 12624 CASAVA_Build 5 1101700 8D GTATGAGTGG GCAAGTTA/-------- GTGTGTGAAT 3070 het 3070 ref 71 29 20 24 GCAAGTTA 1 0 12625 CASAVA_Build 5 1101720 12I GTGTGAATGG ------------/GTGTGTGAACGA GTGGGTGAGT 3070 hom 150 het 58 0 46 12 GTGTGTGAACGA 0 1 12626 CASAVA_Build 5 1112009 4I CATCCAAACC ----/CCGG CTTCTGCAGA 3070 hom 39 het 14 0 10 4 CCGG 0 1 12627 CASAVA_Build 5 1112963 4I ACTTGGTCTT ----/AGAC AGGACAGAAA 3070 hom 47 het 18 0 15 3 AGAC 0 1 12628 CASAVA_Build 5 1134113 21D AGAGAGAGAC AGAGAGAGAGACAGACAGACA/--------------------- GACAGAGAGA 1141 het 52 hom 12 1 7 4 AGAGAGAGAGACAGACAGACA 1 0 12629 CASAVA_Build 5 1134229 2D GGGGAGAGAG AA/-- AGAGTGCCGG 3070 hom 42 het 19 0 13 6 A 3 1 12630 CASAVA_Build 5 1157790 1I GAGGCCCACC -/A GGGGGGTGCG 942 het 942 ref 20 10 5 5 A 0 1 12631 CASAVA_Build 5 1165987 1D TAGAGGGAGT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 40 het 20 0 11 9 C 10 9 12632 CASAVA_Build 5 1193613 1D CTGCTGGTGA G/- GGGGGGTGCT 2117 het 2117 ref 23 10 6 7 G 7 6 12633 CASAVA_Build 5 1194553 18D CTGCTGCCAC GGGCACCACAGCCGCCAT/------------------ GGGCACCAGA 1558 het 1558 ref 25 11 7 10 GGGCACCACAGCCGCCAT 1 0 12634 CASAVA_Build 5 1195909 1D CCATCAGCTG C/- CCCCCCCATA 3070 hom 45 het 17 0 12 5 C 8 7 12635 CASAVA_Build 5 1199482 1D AGGCCTGGGT C/- CCTCTGACCT 2314 het 1973 hom 19 6 9 4 C 3 2 12636 CASAVA_Build 5 1206330 16D ACGGGCTTGC CCAGTCCCTGGGCGGT/---------------- CCAGCCCAGC 3056 het 2529 hom 26 12 9 12 CCAGTCCCTGGGCGGT 1 0 12637 CASAVA_Build 5 1210470 10I GCCACCTGCC ----------/CACACCTGCT CACACCTGTT 3070 het 3070 hom 68 16 19 33 CACACCTGCT 0 1 12638 CASAVA_Build 5 1238362 3D13M2I CACACGTGTC ATGATGAACTTTACAC--/---ATGAACTTTACACAT ATGTGTGATG 3070 hom 239 het 80 0 78 18 N/A 0 0 12639 CASAVA_Build 5 1243000 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 18 0 14 4 A 13 12 12640 CASAVA_Build 5 1255805 1D GGCAGTTCAC G/- GGGGGGCCGT 3070 hom 69 het 27 0 22 6 G 7 6 12641 CASAVA_Build 5 1258036 2D GAGAGAAAAA AG/-- GGGAAGCTTA 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 AG 1 0 12642 CASAVA_Build 5 1258876 1I TCAAGCTCTT -/G GGGAAAAAAA 2390 het 2390 ref 21 11 8 2 G 3 4 12643 CASAVA_Build 5 1258971 1I GAGCCTGCAG -/C CCCCCACACC 2272 het 2272 ref 26 14 9 3 C 5 6 12644 CASAVA_Build 5 1275213 2D GCATGGGCAC TG/-- TGTGAGTGTG 3070 het 3070 ref 68 38 17 16 TG 3 2 12645 CASAVA_Build 5 1329770 53D CACATGAAAA CCAATCCCACAGATCCCCACCTACCCCACACATGAAAACCAATTCCACCAATC/----------------------------------------------------- CCCACCCAGG 3070 hom 54 het 20 0 18 8 CCAATCCCACAGATCCCCACCTACCCCACACATGAAAACCAATTCCACCAATC 1 0 12646 CASAVA_Build 5 1340613 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 12 11 12647 CASAVA_Build 5 1344332 1I GACAGGGACA -/C CCTGGGGCCG 3070 hom 59 het 22 0 18 4 C 2 3 12648 CASAVA_Build 5 1345644 1I TTTTTTTTTT -/A AAAGACAGAG 3070 hom 50 het 26 0 16 10 A 3 4 12649 CASAVA_Build 5 1351806 1D TTAACCCCCC T/- AACCACTCCC 3070 hom 54 het 25 0 19 7 T 1 0 12650 CASAVA_Build 5 1364106 1D CAAAGCAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 10 9 12651 CASAVA_Build 5 1388386 2D TTCCCATCCC TG/-- TGTGGCCCCA 3070 hom 73 het 27 0 19 8 TG 3 2 12652 CASAVA_Build 5 1391524 1D CGCAGGAGTT G/- GGGGGGGGAT 3070 hom 62 het 28 0 20 8 G 9 8 12653 CASAVA_Build 5 1407023 5D ATCACCCAGG CTGGA/----- CTGGAGTGCA 3070 hom 24 het 9 0 8 1 CTGGA 2 1 12654 CASAVA_Build 5 1424805 2D GGATGAAAAT CA/-- CACTGTTTCA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 CA 2 1 12655 CASAVA_Build 5 1425285 3I TAGAGTTAAC ---/CTT CTTCTGCTAG 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 CTT 1 2 12656 CASAVA_Build 5 1425718 1D TTCACCACCA C/- CCCCCTTTCC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 C 6 5 12657 CASAVA_Build 5 1426165 4I AGGGAAGATA ----/TATT CATTATTGGG 2069 het 2069 ref 35 21 6 8 TATT 0 1 12658 CASAVA_Build 5 1427223 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 23 2 9 12 A 10 11 12659 CASAVA_Build 5 1428363 8D42M1D GTTTTCTGGT CACTGACCCACTGACCAAAACAGGATCTGGGCTGGATGGGATGAAGTGGAG/--------CACTGACCAAAACAGGATCTGGGCTGGATGGGATGAAGTGGA- ACAGGAATCA 3070 het 3070 ref 48 33 25 16 N/A 0 0 12660 CASAVA_Build 5 1429410 4I AGAGCCTGTT ----/TCCA TCCAAACAAG 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 TCCA 1 2 12661 CASAVA_Build 5 1429959 3D GTTACCAAAA AAC/--- AAAAACAGTG 2676 het 2676 ref 17 10 6 2 AAC 1 0 12662 CASAVA_Build 5 1431214 1I CAGTGCCTGA -/C CCTGGAGAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 C 2 3 12663 CASAVA_Build 5 1432457 1D CAGACTGTCA C/- CCAGCATTAA 3070 hom 105 het 42 0 34 8 C 3 2 12664 CASAVA_Build 5 1461116 1D GATCCACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 10 7 T 11 10 12665 CASAVA_Build 5 1465145 4I GCACAAACAT ----/ACAC ACACAAACAC 3070 hom 136 het 56 0 43 13 AC 2 4 12666 CASAVA_Build 5 1481903 1D CAGCTCAGCA G/- TCTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 G 1 0 12667 CASAVA_Build 5 1483913 24I GCTTCTCTGC ------------------------/TCACCTCCCGCCTGGCTGTTCCTA TCACCGTGAC 3070 hom 94 het 33 0 28 7 TCACCTCCCGCCTGGCTGTTCCTA 0 1 12668 CASAVA_Build 5 1485967 1I CAAACATGCA -/G GGGAAGGCCC 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 3 4 12669 CASAVA_Build 5 1487736 1D CCAGGAAGAA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 T 7 6 12670 CASAVA_Build 5 1508872 1I ACTATGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 10 11 12671 CASAVA_Build 5 1510094 4I TTGTGCTTCA ----/TTTC TTTCTGTCTG 3070 hom 130 het 48 0 42 6 TTTC 1 2 12672 CASAVA_Build 5 1517996 3I GTGTACACAC ---/ACA AAACAAGTGC 3070 hom 111 het 58 0 37 22 ACA 0 1 12673 CASAVA_Build 5 1518194 2D ACACACGGTA AC/-- ACACATGCGC 3070 hom 58 het 43 0 18 27 AC 3 2 12674 CASAVA_Build 5 1518894 2I CACACGGTAA --/AC ACATGCACAC 3070 hom 144 het 53 0 45 8 AC 1 2 12675 CASAVA_Build 5 1518984 4D TTCAGTACTG AAAC/---- AAACGCACAC 3070 het 3070 ref 60 31 24 8 AAAC 2 1 12676 CASAVA_Build 5 1525578 3D GGTGGAAATG ACT/--- ACAAGTCCCT 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 ACT 1 0 12677 CASAVA_Build 5 1545660 4I TCTGATAAGC ----/TTGT TTGTCACTAT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TTGT 1 2 12678 CASAVA_Build 5 1551767 2D ACATGTACAC AG/-- AGACACAACA 3070 het 3070 ref 90 45 38 9 AG 2 1 12679 CASAVA_Build 5 1558676 5D CCTGCATGCC GGGTA/----- GGGTAGTCAG 2146 het 2146 ref 28 11 9 9 GGGTA 2 1 12680 CASAVA_Build 5 1582938 1I CTTACATAGG -/T TTTTCGAATT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 4 5 12681 CASAVA_Build 5 1615251 2D AACTTATAAA CG/-- CACACACACA 1996 het 1996 ref 83 61 8 15 CG 1 0 12682 CASAVA_Build 5 1615341 2I AAACTTATAA --/AC ACACACACAC 3070 het 232 hom 51 1 38 12 AC 7 8 12683 CASAVA_Build 5 1622134 1I AGACATCATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 A 8 9 12684 CASAVA_Build 5 1644424 1D TATATATGTG T/- TTTTTTTTTT 2175 het 1549 hom 20 7 6 7 T 13 12 12685 CASAVA_Build 5 1680838 1D GAGAAAGCTA G/- TATCTGGAAC 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 G 1 0 12686 CASAVA_Build 5 1691432 1I TCCCCAGCTT -/C CCTGGGAAAT 3070 hom 35 het 18 0 12 6 C 2 3 12687 CASAVA_Build 5 1692797 1I TCTGTATAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 8 9 12688 CASAVA_Build 5 1695503 1D GCTTCCCTAG T/- TGTGTCACTG 3070 hom 70 het 28 0 18 10 T 2 1 12689 CASAVA_Build 5 1696520 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 13 12 12690 CASAVA_Build 5 1698096 2D CCTCTGCTGC AG/-- AGTTTGCTGG 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 AG 2 1 12691 CASAVA_Build 5 1698708 1I AGCGGACCCA -/G GGCCGTCTAC 2336 hom 27 het 11 0 7 4 G 2 3 12692 CASAVA_Build 5 1701719 3D GCTGGGCGTT GTG/--- GTGCATGCCT 3070 het 971 hom 15 2 11 3 GTG 2 1 12693 CASAVA_Build 5 1701914 1I CACAAAGATT -/A AAAAGCTTAG 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 4 5 12694 CASAVA_Build 5 1702568 1I GAAGTAAGCC -/A GGGGTAGAAA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 A 0 1 12695 CASAVA_Build 5 1705674 21D GGAAATCCAT GATCTGGCCGTGTGGCCATGG/--------------------- GATCTGGCCA 2250 het 2250 ref 19 12 8 1 GATCTGGCCGTGTGGCCATGG 1 0 12696 CASAVA_Build 5 1714319 1I CGAGCCATGC -/A GAGTCCTTAC 3070 hom 96 het 42 0 31 11 A 0 1 12697 CASAVA_Build 5 1716059 4I TCCCTGTGTC ----/TGTG TGTTTGTGTG 3070 hom 74 het 43 0 24 19 TG 1 3 12698 CASAVA_Build 5 1730718 1D ATCTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 12 11 12699 CASAVA_Build 5 1730908 1I TAGTAAAGAC -/A AGTGTTTCAC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 1 2 12700 CASAVA_Build 5 1732616 1I TGTCAAATAC -/T TTTTCTGCAT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 T 4 5 12701 CASAVA_Build 5 1751423 4D CAGCCACTCC CTCT/---- GTGTGTACAC 3070 het 3070 ref 56 33 14 12 CT 2 0 12702 CASAVA_Build 5 1760284 1D GCTGCTTTTC T/- GCAGGTTCGC 3070 het 3070 ref 61 32 23 6 T 1 0 12703 CASAVA_Build 5 1776024 2D GAGGCAGGAC CA/-- CACACGTGCC 3070 het 3070 ref 52 22 23 8 CA 3 2 12704 CASAVA_Build 5 1787063 5D TGAGAGATGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1055 het 468 hom 18 3 5 10 T 19 14 12705 CASAVA_Build 5 1788691 1D GTCAGCAGCA G/- GGGTGCCTGG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 4 3 12706 CASAVA_Build 5 1793084 1I ATTTTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 11 12 12707 CASAVA_Build 5 1793521 2D TTTCCATCCC TT/-- GTTATCATTG 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 T 2 0 12708 CASAVA_Build 5 1793595 3D GCATTGTTGC TAT/--- TATTTTGTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 7 TAT 2 1 12709 CASAVA_Build 5 1795547 7I CCACAGTTCT -------/TCTTAGA TAGTGTGTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TCTTAGA 0 1 12710 CASAVA_Build 5 1797259 2D ATAAACACAC AG/-- AGACCCCTGT 3070 hom 90 het 37 0 28 9 AG 2 1 12711 CASAVA_Build 5 1802865 1D GAGGCAGTGG A/- GGACCGGAAC 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 A 1 0 12712 CASAVA_Build 5 1803090 1D AAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2524 hom 28 8 18 2 A 10 9 12713 CASAVA_Build 5 1808110 2I CCAGAGCCTC --/CT CTCTCTCTGC 3070 hom 92 het 34 0 27 7 CT 4 5 12714 CASAVA_Build 5 1812083 2D GCAAATGGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 793 hom 35 9 12 16 A 18 16 12715 CASAVA_Build 5 1813570 2D TCAATGGGAT GG/-- GGAGGGGGTG 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 G 4 2 12716 CASAVA_Build 5 1815564 6D CTGAGTGGAG GAGGCA/------ GAGGCAGAGG 2145 het 1668 hom 27 7 12 11 GAGGCA 3 2 12717 CASAVA_Build 5 1818509 1I TGGAGGAGGA -/G GGGGGGGCTG 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 G 7 8 12718 CASAVA_Build 5 1823542 4I TACAGAAAAG ----/TGTT TGGTGGTTAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TGTT 0 1 12719 CASAVA_Build 5 1832244 4I GCGGGAAGGC ----/AAGG AAGGAGGCGG 2266 het 2266 ref 28 13 9 6 AAGG 1 2 12720 CASAVA_Build 5 1835787 2D AGTGTACATA TG/-- TGTGCACACA 3070 hom 31 het 60 2 45 14 TG 3 2 12721 CASAVA_Build 5 1835900 2I ATGCACACAC --/CA CACACATGCA 3070 hom 212 het 79 0 69 10 CA 3 4 12722 CASAVA_Build 5 1837049 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2204 het 263 hom 12 1 9 2 T 15 14 12723 CASAVA_Build 5 1838444 1I AGCTGCCCCT -/C CCCTGCCTGT 3070 hom 48 het 20 0 14 6 C 3 4 12724 CASAVA_Build 5 1849120 17I CCCTCGTCAT -----------------/GAGGTGTGCCCAGTTAG GGCAGGCGGC 3070 hom 59 het 26 0 19 7 GAGGTGTGCCCAGTTAG 0 1 12725 CASAVA_Build 5 1850163 27D CACACTCATG CATGCACACACACGTGCCATATACACA/--------------------------- CATGCACGCA 3070 het 3070 ref 37 31 12 6 CATGCACACACACGTGCCATATACACA 1 0 12726 CASAVA_Build 5 1856031 1I AATCAGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 22 13 16 T 12 13 12727 CASAVA_Build 5 1863192 1I TGCCTCCCAC -/T TGCGTGTGTG 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 1 2 12728 CASAVA_Build 5 1867396 4D TGGGTTAAAT TGTA/---- TGTAGTTAGC 3070 hom 120 het 43 0 40 5 TGTA 2 1 12729 CASAVA_Build 5 1871395 3D GACGTTCAGC CTT/--- CTTCTTGAGC 3070 het 3070 ref 52 24 21 11 CTT 3 2 12730 CASAVA_Build 5 1884755 7D ATCCCCAGAG GGGGCCT/------- GGGGCCTGGG 2946 hom 28 het 15 0 8 8 GGGGCCT 3 2 12731 CASAVA_Build 5 1894906 1I TTCTTTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 36 2 24 10 A 11 12 12732 CASAVA_Build 5 1895001 1D ACCTGCATAT A/- AAAAAACTAA 3070 hom 132 het 48 0 43 6 A 7 6 12733 CASAVA_Build 5 1897255 4I ATCATAGATC ----/AGAA AGAACCCTGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AGAA 1 2 12734 CASAVA_Build 5 1897546 1D CCCACACTTT C/- CACTTTCTAT 3070 hom 163 het 57 0 55 2 C 2 1 12735 CASAVA_Build 5 1897964 2D TAGCTATGCC TT/-- TGTCTATATC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 T 3 1 12736 CASAVA_Build 5 1898969 6D TCTGTCTCTG TCTCTA/------ TCTCTATATG 3070 het 3070 hom 73 25 36 16 TCTCTA 2 1 12737 CASAVA_Build 5 1904335 2D TGTAGGGAGC AG/-- CCTCCCCGCG 3070 hom 45 het 17 0 10 7 AG 1 0 12738 CASAVA_Build 5 1923178 4I ATGAGTGCCT ----/GTGA GTGTGTCAGT 3070 hom 138 het 76 0 40 36 GTGA 0 1 12739 CASAVA_Build 5 1938111 1D GGGCTGGGAT G/- GGGAGTAGAG 2953 het 840 hom 16 3 9 4 G 4 3 12740 CASAVA_Build 5 1939107 1D ACCGGCTCAG C/- TTCGGGGAGA 3070 het 1940 hom 32 8 17 9 C 1 0 12741 CASAVA_Build 5 1943379 1I TCCAAAGCAT -/C CCTGGGCACT 3070 hom 116 het 43 0 37 6 C 2 3 12742 CASAVA_Build 5 1947421 3I TAAGGCAGCA ---/ATC ATCACCACGT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 ATC 1 2 12743 CASAVA_Build 5 1949909 2D GGAGTGGCTG GA/-- GGGATGCACA 3070 hom 34 het 17 0 11 6 GA 1 0 12744 CASAVA_Build 5 1971777 1I AGAGGGAGGA -/C CCCCCCATGG 3070 hom 41 het 17 0 13 4 C 6 7 12745 CASAVA_Build 5 1973933 2D TAACGATTCT AA/-- GTGTCCACAC 3070 hom 72 het 27 0 25 4 A 2 0 12746 CASAVA_Build 5 1975309 7I TGGAATGAAG -------/TCAAGAA GCCACTGGAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TCAAGAA 0 1 12747 CASAVA_Build 5 1982427 3D TGTGGCATGT TTG/--- TTGTGTTTTG 3070 het 3070 ref 89 38 39 13 TTG 2 1 12748 CASAVA_Build 5 1982639 2D ATTGTGTAGC AT/-- ATGTGTTGTG 3070 het 3070 ref 78 38 28 13 AT 2 1 12749 CASAVA_Build 5 1982757 3I GATACGTATT ---/GTG TGGTGTGTGG 3070 hom 220 het 78 0 73 9 GTG 0 1 12750 CASAVA_Build 5 1983142 7D28M4D CGATGTGTGC TGTGTGGTGTGTATGTGGCATGTGTGTTGTGTGTGTGAC/-------TGTGTATGTGGCATGTGTGTTGTGTGTG---- ATGTGTGTGC 2527 het 2527 ref 65 54 11 26 N/A 0 0 12751 CASAVA_Build 5 1983282 11I ATGTGCGTGA -----------/TGTGTGTGCGT TGTGTGTGCT 3070 hom 74 het 44 0 21 23 TGTGTGTGCGT 0 1 12752 CASAVA_Build 5 1983318 2I GTGTATGTGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 101 het 52 0 32 20 TG 5 6 12753 CASAVA_Build 5 1983419 8D58M4I GTTGTGTGTG TGTTGTGTGTGTGTGCAGCATGTGTGTTGTGCGTGTGTTGTGCTGTGTGCTGTGTGGCATGTGTGT----/--------GTGTGTGCAGCATGTGTGTTGTGCGTGTGTTGTGCTGTGTGCTGTGTGGCATGTGTGTTGTG TGTGCGTTGT 2861 het 215 hom 35 2 11 44 N/A 0 0 12754 CASAVA_Build 5 1989090 2I CATGTTACAC --/AT GTTTCCTTGT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 AT 0 1 12755 CASAVA_Build 5 1989292 2I TTTAATAAAC --/AT AAGTTTTACA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 AT 0 1 12756 CASAVA_Build 5 1989654 1I GTGTCTCCTT -/C GCTATGACGC 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 C 0 1 12757 CASAVA_Build 5 1990125 1D ATCATGTAAT A/- AAAAAATAAT 3070 hom 101 het 36 0 34 2 A 7 6 12758 CASAVA_Build 5 1994755 1D TTTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 29 0 25 4 T 11 10 12759 CASAVA_Build 5 1996836 2D TCACATATTT TC/-- TGTTTGTCTC 3070 hom 181 het 63 0 61 4 TC 1 0 12760 CASAVA_Build 5 1996995 1I AGCACACCAT -/G GTGTCTGACT 3070 hom 165 het 63 0 56 7 G 1 2 12761 CASAVA_Build 5 2001810 2I TCTTTCAGAA --/AT ATTATTGCAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AT 1 2 12762 CASAVA_Build 5 2004025 4D15M4D CGTCTGCTGT GGGCGCGTGAGTCATCTGCTCTG/----GCGTGTGTCGTTTGC---- TGTGCTTGTG 3070 hom 46 het 21 0 15 7 N/A 0 0 12763 CASAVA_Build 5 2014021 2I ATACGCATGC --/CA CACACACACA 3070 het 279 hom 73 1 42 30 CA 7 8 12764 CASAVA_Build 5 2015106 2D AGGCCTCCAC TG/-- ACGCCCTCTC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TG 1 0 12765 CASAVA_Build 5 2015942 1I GCGTGGCAGT -/C CAGCCCTGTC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 C 1 2 12766 CASAVA_Build 5 2036937 1I ACACATCGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 9 12767 CASAVA_Build 5 2039578 1D CTCCTCCCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 10 9 12768 CASAVA_Build 5 2044530 1D GATCCGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 A 11 10 12769 CASAVA_Build 5 2053279 11D AGACACACTC TATCCAATTTT/----------- CAGCCTAAAA 3070 het 3070 ref 23 15 10 3 TATCCAATTTT 1 0 12770 CASAVA_Build 5 2053468 2I CGCATAAGGA --/GT TTCCTACATC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 GT 0 1 12771 CASAVA_Build 5 2056045 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAGGTGGGTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAG 1 2 12772 CASAVA_Build 5 2056679 1I GGGAGGTACA -/G GGGGGGAGAT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 G 6 7 12773 CASAVA_Build 5 2074585 5D CTCCAGGGTC CTTCA/----- CTTGTTCCTG 3070 het 2498 hom 24 9 11 5 CTTCA 1 0 12774 CASAVA_Build 5 2080010 3I ATTCTTTCTT ---/TAC TACTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TAC 1 2 12775 CASAVA_Build 5 2082718 2D TTGCCTTTGG GT/-- GTATATATAT 3070 hom 94 het 43 0 37 6 GT 2 1 12776 CASAVA_Build 5 2084342 1I AAAATATGAA -/T TTTTTTGTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 6 7 12777 CASAVA_Build 5 2090807 3D TTGTAAATCT TCC/--- TCCTCTCCCC 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 TCC 2 1 12778 CASAVA_Build 5 2092954 1D GGGGGGCCCC A/- CGGTGTTCTG 1937 het 1937 ref 21 9 6 6 A 1 0 12779 CASAVA_Build 5 2095226 3D AGTGCAGGAG CCC/--- CTGAAAATCA 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 C 4 1 12780 CASAVA_Build 5 2103846 2D ATATGTATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 TA 7 6 12781 CASAVA_Build 5 2105144 1D AAGTGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 19 19 14 T 15 14 12782 CASAVA_Build 5 2111874 2D GACTGGGAAG GA/-- AAAGAGGTTT 1228 het 1228 ref 33 26 3 5 GA 1 0 12783 CASAVA_Build 5 2116704 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAGGGT 3070 het 3070 hom 22 8 14 0 A 6 7 12784 CASAVA_Build 5 2122796 2I TTGCTGCCAC --/CA CGTAAGAAGT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 CA 0 1 12785 CASAVA_Build 5 2130307 1I AAGAGGGAAG -/C AACAGACACT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 12786 CASAVA_Build 5 2131945 1I ATTTTTTTTT -/C CTGTTTCTTT 3070 het 3070 hom 60 27 26 7 C 1 2 12787 CASAVA_Build 5 2133429 1D ACCTAAGAGG A/- AAAAAAAAAG 2265 het 2265 ref 33 25 5 3 A 10 9 12788 CASAVA_Build 5 2136128 2D TCTCGTTCTC TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 66 35 26 7 TG 5 4 12789 CASAVA_Build 5 2138858 1D GGGGTCACTT G/- AGCTCAGTAG 3070 het 3070 ref 46 23 14 9 G 1 0 12790 CASAVA_Build 5 2143420 1I TGTAGTAAAT -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 A 7 8 12791 CASAVA_Build 5 2144812 1I AAGTTTTATA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 9 12792 CASAVA_Build 5 2145990 2D AGTTAAACAC AT/-- AACTACCATC 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 AT 1 0 12793 CASAVA_Build 5 2146201 1I TATAAAGGTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 8 9 12794 CASAVA_Build 5 2147852 5D GGGAGGAGGC GGCCA/----- GGCCAGCCCT 3070 hom 63 het 27 0 19 11 GGCCA 2 1 12795 CASAVA_Build 5 2151175 2D TCTCCCTCTT TC/-- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 TC 5 4 12796 CASAVA_Build 5 2151604 5D GCTCTCCGCA GGCCT/----- GGCCTGCATC 3070 hom 39 het 16 0 14 3 GGCCT 2 1 12797 CASAVA_Build 5 2152097 1D AGATCTCCCA G/- GGGGTTGGCC 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 G 5 4 12798 CASAVA_Build 5 2153176 5I TATGCTTTTC -----/TCTTT TCTTTTCCTT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TCTTT 1 2 12799 CASAVA_Build 5 2153402 5I ATTTATCTTG -----/TATTT TATTTTACAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 TATTT 1 2 12800 CASAVA_Build 5 2155449 1D AAACTCCTGA C/- CTCAAGTGAT 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 C 2 1 12801 CASAVA_Build 5 2163401 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 36 1 23 13 A 11 10 12802 CASAVA_Build 5 2164708 1D ACTCCCAAAG C/- CTAAGCAAGG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 C 2 1 12803 CASAVA_Build 5 2171492 2D ATTGACTCAC AG/-- GGGAATACCA 3070 het 3070 hom 42 13 26 5 AG 1 0 12804 CASAVA_Build 5 2173728 4D AAAATATAAA TTTT/---- TATTTATTAT 1937 het 1937 ref 13 9 4 0 T 5 1 12805 CASAVA_Build 5 2181590 1D GTATAGGGTT A/- AAAAACCATT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 A 6 5 12806 CASAVA_Build 5 2182071 1I TTTTTTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 10 11 12807 CASAVA_Build 5 2184847 3I GTTTTTTGTG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 T 10 13 12808 CASAVA_Build 5 2185443 1D ATGGCGTCAG C/- CCCCTCTTGG 3070 hom 51 het 24 0 15 9 C 5 4 12809 CASAVA_Build 5 2197107 1D ATGAAGCACT G/- CCACAACAGA 3070 het 3070 ref 38 16 11 11 G 1 0 12810 CASAVA_Build 5 2198936 1I CTAATCACTT -/C CCAGATCCTC 3070 het 3070 ref 75 34 24 17 C 2 3 12811 CASAVA_Build 5 2202445 4I GATGAGTCAC ----/CTGA TCGGGCACTA 3070 hom 108 het 40 0 32 8 CTGA 0 1 12812 CASAVA_Build 5 2202701 3I TTTGGTTACT ---/AGG AGACCACCTG 3070 hom 78 het 29 0 24 5 AGG 0 1 12813 CASAVA_Build 5 2225418 4D AACAAAAAAC AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 34 17 16 3 AACA 3 2 12814 CASAVA_Build 5 2231613 6D CTGGATTGTC CCAACA/------ CCCAGCGTCC 2281 het 2281 ref 18 8 6 6 CCAACA 1 0 12815 CASAVA_Build 5 2237775 2D ATATTCTAAA CT/-- TTTTTCTGTC 3070 het 3070 ref 28 11 12 7 CT 1 0 12816 CASAVA_Build 5 2244906 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 744 hom 19 6 9 5 A 19 15 12817 CASAVA_Build 5 2249793 1I GGCACTCGGT -/G GGGTCTCCTT 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 G 3 4 12818 CASAVA_Build 5 2257365 1D AAAAATAGTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 T 8 7 12819 CASAVA_Build 5 2281823 3D TCAGCAACAC ATT/--- ATGCCAGAAG 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 ATT 1 0 12820 CASAVA_Build 5 2298361 1D CACCTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2233 hom 20 8 8 4 A 11 10 12821 CASAVA_Build 5 2319496 3D49M1I ACTCAGTCTC AAAAAAAAAAAAATAAAATAAAAAAAAATGGGGAAGGCAGGGAAGCAGGGAA-/---AAAAAAAAAATAAAATAAAAAAAAATGGGGAAGGCAGGGAAGCAGGGAAG GAGGGAGAAC 2431 het 2431 ref 19 24 6 6 N/A 0 0 12822 CASAVA_Build 5 2320545 1D AGGTAAGCCA C/- CCTACTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 22 1 C 3 2 12823 CASAVA_Build 5 2326840 1D TTCTAGTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 29 0 21 9 T 10 9 12824 CASAVA_Build 5 2332328 1D ATAAAAACAT A/- AAAAAACCAG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 7 6 12825 CASAVA_Build 5 2336689 4I GCATGCAGAT ----/AGGA AGAGGATTTC 3070 hom 110 het 42 0 36 6 AGGA 0 1 12826 CASAVA_Build 5 2339428 2I TGCACCCCTA --/TG TGTGTGTTTC 3070 hom 233 het 87 0 76 11 TG 3 4 12827 CASAVA_Build 5 2346791 1D TTTTTTTCCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 15 11 7 T 9 8 12828 CASAVA_Build 5 2358340 1I GTTTACTTGG -/C CCCCCCCGCC 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 C 7 8 12829 CASAVA_Build 5 2366026 2I GACGGAGTCT --/CG CACTGTCACC 927 hom 4 het 5 0 3 2 CG 0 1 12830 CASAVA_Build 5 2367996 1I TATTTTAACA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 6 7 12831 CASAVA_Build 5 2368236 2D ACTTCAGGGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 T 11 9 12832 CASAVA_Build 5 2368570 1I TTCTATACAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 8 9 12833 CASAVA_Build 5 2368962 1I GTTTGTCATG -/T TTTTCCCTAC 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 T 4 5 12834 CASAVA_Build 5 2369563 3I TGTAAAATTC ---/AAG AAGAAGAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AAG 2 3 12835 CASAVA_Build 5 2370150 3D TAAATGTTAG TTT/--- TTTTTTTTAA 385 het 385 ref 25 6 3 16 T 11 8 12836 CASAVA_Build 5 2371842 1D GTGGTTTGCT G/- CACCCATCAA 2935 het 2852 hom 17 7 6 4 G 1 0 12837 CASAVA_Build 5 2381692 1D TTAATTTTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 10 9 12838 CASAVA_Build 5 2383883 1D TTAAATATTT A/- ATGAAGAGAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 2 1 12839 CASAVA_Build 5 2395065 7D CATGTCTGAT TTGGCTC/------- TTGGCTTGGC 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 TTGGCTC 1 0 12840 CASAVA_Build 5 2396848 1I TCTTGATTTC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 7 8 12841 CASAVA_Build 5 2403090 1D ACTACTTACA G/- GAGGAATATT 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 G 2 1 12842 CASAVA_Build 5 2403636 1D CAGCTGATCT G/- GGTAAAATGG 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 G 3 2 12843 CASAVA_Build 5 2404838 4D CCCCTGAATC GAGA/---- GAGAATCAAC 3070 het 3070 ref 36 21 10 12 GA 4 2 12844 CASAVA_Build 5 2426180 1I CATGACCTCA -/T TTTTTTTTTT 2931 het 30 hom 13 1 7 5 T 13 14 12845 CASAVA_Build 5 2432692 1D CACAATCCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 10 9 12846 CASAVA_Build 5 2442626 1I TCCTTCTGCT -/G GACACGTCCC 3070 hom 90 het 36 0 27 9 G 1 2 12847 CASAVA_Build 5 2443540 4I CTCTCTGCTC ----/ATTA ATTGTTTATT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 ATTA 0 1 12848 CASAVA_Build 5 2453200 1I ATGACACGCT -/G ACCCCATGCT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 G 0 1 12849 CASAVA_Build 5 2464491 1I CATATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1023 hom 26 3 17 6 T 14 15 12850 CASAVA_Build 5 2486457 1D TTAAAAAAAA G/- AAACAGTGCC 1324 het 1324 ref 39 26 5 9 G 1 0 12851 CASAVA_Build 5 2504590 1I ATTGTTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 9 10 12852 CASAVA_Build 5 2507500 10D ACACAGACCC AGACACACAG/---------- AGACACACAC 3070 het 3070 hom 68 26 18 29 AGACACACAG 1 0 12853 CASAVA_Build 5 2514959 2D TCCCCGCCTT GC/-- AGCAAGCTTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 GC 1 0 12854 CASAVA_Build 5 2521779 1I CAGAAGTGAG -/A ATTTGGAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 1 2 12855 CASAVA_Build 5 2529203 9I CCTCTAAGAT ---------/GTGAACCAC GTGAACCACC 3070 het 3070 ref 41 20 20 1 GTGAACCAC 1 2 12856 CASAVA_Build 5 2530147 2D ATTGTACCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2247 hom 37 11 10 17 T 16 14 12857 CASAVA_Build 5 2536372 2D TACATTCAGC AT/-- ATATATATAT 2305 het 817 hom 14 3 6 5 AT 9 8 12858 CASAVA_Build 5 2539028 2D GAGAGGATGC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 27 10 8 10 AG 10 9 12859 CASAVA_Build 5 2543192 1D AAAGATTACA T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 16 5 T 6 5 12860 CASAVA_Build 5 2552484 5D CATATGTGAC TTATA/----- TTATATTTCT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TTATA 2 1 12861 CASAVA_Build 5 2573412 1I TCTTTTATTA -/C TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 C 0 1 12862 CASAVA_Build 5 2573822 3I CTGTGCAGCC ---/TGA TGATGGCTTT 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 TGA 1 2 12863 CASAVA_Build 5 2579254 2I TGTATATGTA --/TG TGTGTGTGCC 3070 het 3070 hom 65 25 29 11 TG 4 5 12864 CASAVA_Build 5 2584556 4D CACAAAAGCG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 69 32 29 10 CA 10 8 12865 CASAVA_Build 5 2585460 10D79M1I ACAAACACAA ACATACAAACACAAACATACACAAAGATAGACACACACCACAAACACACACATGCCCCATGGAAGAAAGAACACACCAGAATCCAGAGG-/----------ACAAACATACGCAAAGATAGACACACACCACAAACACACACATGCCCCATGGAAGAAAGAACACACCAGAATCCAGAGGA AAATAATCCA 1797 het 1797 ref 59 61 7 33 N/A 0 0 12866 CASAVA_Build 5 2587565 1I TGGCTGCTGT -/G GGGGGACTCA 3070 het 3070 hom 49 20 16 13 G 5 6 12867 CASAVA_Build 5 2588807 1I TATAATATGA -/T TCTGCAATAG 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 T 1 2 12868 CASAVA_Build 5 2593292 4I TCCATCCATC ----/AGCT ATCTATCATC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 AGCT 0 1 12869 CASAVA_Build 5 2605992 1D CATCCTTTTA C/- TTTCAGTGAT 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 C 1 0 12870 CASAVA_Build 5 2611766 1D AATACTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3039 hom 37 9 22 6 T 11 10 12871 CASAVA_Build 5 2614536 4D TCCGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 471 hom 18 2 13 4 AAAT 5 4 12872 CASAVA_Build 5 2615770 1I GCAATCGGCA -/G GGGTGATGGC 3070 het 3070 ref 48 31 14 3 G 3 4 12873 CASAVA_Build 5 2617054 10D TATGATGGCA AGAAAATGGC/---------- AGCTCTGCCT 3070 het 3070 hom 51 20 23 10 AGAAAATGGC 1 0 12874 CASAVA_Build 5 2647390 10D ACACACGGAT ACACACAGAC/---------- ACACACAGAC 3070 het 3070 ref 50 22 17 16 ACACACAGAC 2 1 12875 CASAVA_Build 5 2650335 1I AGCCGAGATC -/A ACACCACTGC 3070 het 809 hom 15 2 13 0 A 1 2 12876 CASAVA_Build 5 2651255 2D TAAACTAAAA AG/-- AGAGAGACGC 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 AG 4 3 12877 CASAVA_Build 5 2654229 2D ATATAATGAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2227 hom 18 5 9 5 AT 8 7 12878 CASAVA_Build 5 2657522 1D TTTTGTTGAT C/- ACCTATTTAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 C 1 0 12879 CASAVA_Build 5 2665858 2I TCTCTAGAGA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 AG 5 6 12880 CASAVA_Build 5 2676995 1D GTCCCTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 A 11 10 12881 CASAVA_Build 5 2691861 2D CTCTTCTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 2751 het 301 hom 27 5 6 17 A 12 10 12882 CASAVA_Build 5 2693786 5D CCTCAGGCTG CCACT/----- CCACTCCCAG 3070 hom 75 het 29 0 21 13 CCACT 2 1 12883 CASAVA_Build 5 2696148 4I GTGTGTCTTG ----/ATTA ATGACCAGCT 3070 hom 65 het 27 0 17 10 ATTA 0 1 12884 CASAVA_Build 5 2703177 1D TGATGGGATT G/- TTTTTTTCTT 3070 het 2408 hom 18 7 9 2 G 1 0 12885 CASAVA_Build 5 2710231 1D GGCGGTCCCT C/- CTATGGTGGC 2185 hom 15 het 8 0 6 2 C 2 1 12886 CASAVA_Build 5 2733538 1D TTTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 8 T 13 12 12887 CASAVA_Build 5 2745162 2D ACTGTAATGT TC/-- TTTTTAAGAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 TC 1 0 12888 CASAVA_Build 5 2750070 1I CACCAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 159 hom 33 1 22 10 T 11 12 12889 CASAVA_Build 5 2750083 1I TTTTTTTTGC -/T TTTGTTTTTA 3070 het 424 hom 30 3 23 4 T 3 4 12890 CASAVA_Build 5 2766534 1I CAGAGCAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2165 hom 23 6 11 6 A 9 10 12891 CASAVA_Build 5 2772298 3I TTGTCTCTGT ---/TAC TGTCTCTAAG 3070 het 3070 hom 54 26 26 2 TAC 0 1 12892 CASAVA_Build 5 2776786 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 824 het 823 ref 16 2 4 10 T 15 16 12893 CASAVA_Build 5 2779571 2D TCTGGTCCCA GG/-- GCTCAGAGCA 3070 hom 96 het 35 0 32 5 G 3 1 12894 CASAVA_Build 5 2779921 1I GTTGGATTGG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 6 7 12895 CASAVA_Build 5 2784195 7I TTGCAGTGAG -------/CTATGAT AGTGCCTCTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CTATGAT 0 1 12896 CASAVA_Build 5 2787226 5D AATTTTGAGG GAACT/----- CTAATCCGTC 3070 hom 168 het 58 0 55 5 GAACT 1 0 12897 CASAVA_Build 5 2792642 1D GGACCCGAAA C/- AGGAGAGACC 1511 hom 5 het 7 0 5 2 C 1 0 12898 CASAVA_Build 5 2796868 2I GTGAAAGATA --/TC TCTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 TC 4 5 12899 CASAVA_Build 5 2800434 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 233 hom 24 1 22 1 T 10 9 12900 CASAVA_Build 5 2806818 2D GCTGAAAAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 34 14 12 9 AG 6 5 12901 CASAVA_Build 5 2807340 1I GCCCTTCCCC -/T CTCTTTAGCT 3070 het 2359 hom 23 6 11 6 T 0 1 12902 CASAVA_Build 5 2808819 2D GAAAACAAAA GC/-- GTTGTTATAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 GC 1 0 12903 CASAVA_Build 5 2810912 10D ACAGCAGATG CCTCTTCACA/---------- CCAATCGATG 1204 het 1204 ref 37 19 5 14 CCTCTTCACA 1 0 12904 CASAVA_Build 5 2811476 1I ATTTTATTTC -/T GAAAACTAGA 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 T 0 1 12905 CASAVA_Build 5 2821362 5I TGTTTTCCAC -----/CTTTA CTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 CTTTA 0 1 12906 CASAVA_Build 5 2825867 1I GTTAGTTTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 8 9 12907 CASAVA_Build 5 2828516 1I CATGTTACTC -/T TTTTTAATTT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 T 5 6 12908 CASAVA_Build 5 2841533 2D ACGTTTCTTT CC/-- CCCCCCCCAA 3016 het 3016 ref 33 19 8 7 C 10 8 12909 CASAVA_Build 5 2842338 4D AACTTTTCTA CTTT/---- CTTTCTATTT 3070 het 3070 ref 39 20 18 3 CTTT 2 1 12910 CASAVA_Build 5 2843773 1D ACTATTTGTT A/- AAAAGATTAT 3070 het 3070 ref 47 27 16 5 A 5 4 12911 CASAVA_Build 5 2846770 1D TTTGTCTTTA T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 T 8 7 12912 CASAVA_Build 5 2847186 1I ATAAAGTTGT -/G GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 3 4 12913 CASAVA_Build 5 2847311 1D ACAGGTTGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 10 9 12914 CASAVA_Build 5 2849298 1I TTAATTCAGT -/A AACATCTCAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 3 12915 CASAVA_Build 5 2850633 1D TTGAGCTAGC T/- GGGGGAGCAC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 1 0 12916 CASAVA_Build 5 2851772 1I TCTGCCTGCC -/T TAGGCCTCCC 2570 het 2570 ref 16 10 6 0 T 1 2 12917 CASAVA_Build 5 2857327 1D CAAATTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 T 12 11 12918 CASAVA_Build 5 2859716 1I GACATTCACA -/C TCCCCACTGC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 0 1 12919 CASAVA_Build 5 2860028 26I TGCTCATGGC --------------------------/ATTTGATGACCTAAAAATCTGTTTAA ATTAGCCATT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 ATTTGATGACCTAAAAATCTGTTTAA 0 1 12920 CASAVA_Build 5 2864540 4D GTACTCGGGA TCCC/---- GGCTGAGGCA 1085 het 1085 ref 17 11 3 4 TCCC 1 0 12921 CASAVA_Build 5 2874681 1I TTTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTG 851 het 851 ref 20 11 6 4 T 9 10 12922 CASAVA_Build 5 2878061 1I TATGTGTTAC -/A AAAGTATCTT 3070 hom 96 het 44 0 33 11 A 3 4 12923 CASAVA_Build 5 2893237 3I TGCCATCACA ---/TCC GGCTAATTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TCC 0 1 12924 CASAVA_Build 5 2896109 11I GCTGATAGGC -----------/GGTGGAGCTCA GGTGGAGCTC 3070 het 3070 ref 46 19 14 13 GGTGGAGCTCA 1 2 12925 CASAVA_Build 5 2899800 1D CTTGAGATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 8 16 5 T 10 9 12926 CASAVA_Build 5 2914161 4D GGCTGTCTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 72 het 31 0 25 13 AAAC 4 3 12927 CASAVA_Build 5 2918356 1D AAGACCTTAG C/- CCCCTGTTTT 3070 hom 124 het 54 0 38 16 C 5 4 12928 CASAVA_Build 5 2918814 1I CGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 T 8 9 12929 CASAVA_Build 5 2931784 7D GACAATGCAG AGAGCTT/------- AGAGCTTAGG 3070 hom 62 het 27 0 21 6 AGAGCTT 2 1 12930 CASAVA_Build 5 2947630 1D CTGGAGACCG C/- CCCCGCCACT 3068 hom 54 het 25 0 13 12 C 5 4 12931 CASAVA_Build 5 2966328 1I AATGGCTACA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 7 8 12932 CASAVA_Build 5 2968626 6I AAATATAGGA ------/TTAGAC TTAGAGTGTC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TTAGAC 0 1 12933 CASAVA_Build 5 2969526 21D GAAAGAAAAG AAAAGAAAAAAGAAAAAAAAA/--------------------- AAAAGAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 9 AAAAGAAAAAAGAAAAAAAAA 1 0 12934 CASAVA_Build 5 2971755 1I TTTTTGCCAG -/A AGATTTGATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 12935 CASAVA_Build 5 2974670 4I CTCACCACGC ----/TTCA TTCAGGTGGC 3070 hom 89 het 34 0 28 6 TTCA 1 2 12936 CASAVA_Build 5 2976784 4I CAATTTCAGC ----/AATT AATTAATTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AATT 2 3 12937 CASAVA_Build 5 2979713 1D TTCACAGCAA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 7 6 12938 CASAVA_Build 5 2996882 1I AACTGTGAAT -/G GGAGTTCATT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 2 3 12939 CASAVA_Build 5 3027497 1D GGCCATAACT A/- AAACTCATTC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 4 3 12940 CASAVA_Build 5 3028181 1I TTATCCCGAA -/G GATTTTCAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 1 2 12941 CASAVA_Build 5 3034612 1D GCCCCCTCCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 A 10 9 12942 CASAVA_Build 5 3038295 4D TGAAAGAAAA TGTT/---- TGTTTGCAGT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TGTT 2 1 12943 CASAVA_Build 5 3056552 1D TCCTTCCTTC T/- TTCTTCTTTT 832 hom 13 het 14 0 5 13 T 3 2 12944 CASAVA_Build 5 3060620 1I TACCGGGAGA -/G GGGTTGGAGA 3070 het 3070 hom 54 21 23 10 G 3 4 12945 CASAVA_Build 5 3069005 16D6M1I AGAATTTTTG TATAAATACATTGCTAATGTAT-/----------------AAGTATA TTATTGCTAA 3070 het 3070 ref 25 19 13 6 N/A 0 0 12946 CASAVA_Build 5 3069619 1I CGATTTTTAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 8 9 12947 CASAVA_Build 5 3071356 1I TCTTTTCAGT -/G TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 0 1 12948 CASAVA_Build 5 3075590 1I TCTGATTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 26 0 18 8 A 10 11 12949 CASAVA_Build 5 3078627 1I ACAAAAAACT -/G GGCGATTCAC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 G 2 3 12950 CASAVA_Build 5 3115762 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 37 0 34 5 A 12 11 12951 CASAVA_Build 5 3118228 1I GAGGGGCATT -/A AAATATATAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 3 4 12952 CASAVA_Build 5 3119068 2I TAGAGTTAAC --/AT GTGGAAACCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 0 1 12953 CASAVA_Build 5 3125178 1D TCTCCCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 30 2 18 10 T 13 12 12954 CASAVA_Build 5 3127178 1D TATATTTTTT A/- AAAAAATTGC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 7 6 12955 CASAVA_Build 5 3128463 1I AGGGTCATCC -/T GCACTTTAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 0 1 12956 CASAVA_Build 5 3132003 4D TTTAGCTGCT ACAA/---- ACAAACAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 ACAA 3 2 12957 CASAVA_Build 5 3133911 1D GCCAGGTCCC A/- AAAAAAATGC 2776 het 2776 ref 37 10 12 15 A 8 7 12958 CASAVA_Build 5 3143712 5I TCACATGCCA -----/ACTGG ACATGTTCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ACTGG 0 1 12959 CASAVA_Build 5 3144915 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AG 1 2 12960 CASAVA_Build 5 3147825 1I TGTCATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 10 11 12961 CASAVA_Build 5 3149129 4D CTCTTTGGCG CTAA/---- CTAATTTATT 3070 het 3070 ref 39 19 16 6 CTAA 2 1 12962 CASAVA_Build 5 3152188 4I CCTAGCAAAA ----/CTCT CTCTCTGTCT 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 CT 3 5 12963 CASAVA_Build 5 3175655 1D AATGGTAGCA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 7 6 12964 CASAVA_Build 5 3177313 1I AATCATGCAA -/C AAAAAGCTTT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 C 0 1 12965 CASAVA_Build 5 3193266 1I ACCAAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 33 1 23 9 A 12 13 12966 CASAVA_Build 5 3197035 2D TCTTTAAGAC AG/-- AGTCTCACAC 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 AG 2 1 12967 CASAVA_Build 5 3200459 1D CTACTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 27 2 12 13 T 13 12 12968 CASAVA_Build 5 3204988 1I ATGTGAGGAG -/C CCCTGCCCTG 3070 hom 66 het 27 0 21 6 C 3 4 12969 CASAVA_Build 5 3208662 3D AGTGGCCAAA GCC/--- GCCGTCACAA 3070 hom 129 het 50 0 41 10 GCC 2 1 12970 CASAVA_Build 5 3208864 1I GATCACAGTG -/C CCGTTGCCCA 3070 hom 99 het 39 0 31 8 C 2 3 12971 CASAVA_Build 5 3210873 1I TGTAAACATA -/T TTTTTTCTGC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 6 7 12972 CASAVA_Build 5 3211000 11D TATATTACAG AAATATACAGA/----------- AAATATACAG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AAATATACAGA 2 1 12973 CASAVA_Build 5 3212137 7D AGTTTAGTGA AAATTTT/------- ACCATTTAAA 393 het 206 hom 20 3 3 17 AAATTTT 1 0 12974 CASAVA_Build 5 3214142 1I ACGCTATGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 227 hom 48 1 42 5 T 9 10 12975 CASAVA_Build 5 3218375 1D ATGAACCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 39 1 34 5 A 11 10 12976 CASAVA_Build 5 3219166 6D CGCATCCGTA TTTATT/------ TTCAAAGGAA 3070 hom 120 het 42 0 39 6 TTTATT 1 0 12977 CASAVA_Build 5 3222287 1D CATACATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 14 13 12978 CASAVA_Build 5 3222688 3I42M1I ATTTTATCAT ---TGATGATATTCATTATATATTTTTATTTCATTAAACATATTT-/TGATGATGATATTCATTATATATTTTTATTTCATTAAACATATTTA AAAAATGTGT 3070 hom 87 het 21 0 30 5 N/A 0 0 12979 CASAVA_Build 5 3227637 26I TGAGAAAGCC --------------------------/AAGCTTTAGCAGAAAGATGCCAGTGA AAGCTTTACC 3070 hom 97 het 34 0 33 6 AAGCTTTAGCAGAAAGATGCCAGTGA 0 1 12980 CASAVA_Build 5 3227833 3I TTTCTTCAGT ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 TAA 5 6 12981 CASAVA_Build 5 3228211 4D AATCTATTGG TCTA/---- TCTATCATCT 3070 het 3070 ref 31 9 7 16 TCTA 2 1 12982 CASAVA_Build 5 3228398 4D CTCTGTCTGC TTGT/---- CTATTTATCT 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 TTGT 1 0 12983 CASAVA_Build 5 3228809 1I CTTATCTATC -/A TTTTGTTGCC 3070 het 3070 hom 48 15 27 6 A 0 1 12984 CASAVA_Build 5 3234605 2D GAACAAAGAT TC/-- TGTTTCCTAT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 TC 1 0 12985 CASAVA_Build 5 3254671 3D TTTTTAACTT TTA/--- TTATTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TTA 2 1 12986 CASAVA_Build 5 3256047 3I TGTTCCTCAT ---/TCC TCCTGGAAAT 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 TCC 1 2 12987 CASAVA_Build 5 3258125 26D TCCCCACATC GGGGCCTTTTACATCTTTCCCCACGT/-------------------------- GGGGCCTTTT 3070 hom 63 het 30 0 21 11 GGGGCCTTTTACATCTTTCCCCACGT 1 0 12988 CASAVA_Build 5 3258873 1D GCTTGACTTT G/- CTTATCACTA 3070 het 3070 ref 52 26 24 2 G 1 0 12989 CASAVA_Build 5 3262418 1D CATATCAACT G/- TGTTTATCAA 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 G 1 0 12990 CASAVA_Build 5 3263462 3D TTTCCCATCT ATA/--- AAGATTATTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 ATA 1 0 12991 CASAVA_Build 5 3265030 4I GGGCGTACAG ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 76 32 28 16 GT 5 7 12992 CASAVA_Build 5 3265137 4D GCATATGGGG GTGT/---- GTGTATGTGC 3070 het 3070 ref 62 30 22 12 GT 4 2 12993 CASAVA_Build 5 3265253 2D GTATGTGCAC AT/-- GTGTATGTGT 3070 het 3070 ref 73 41 20 12 AT 1 0 12994 CASAVA_Build 5 3265550 4D GGGTATAGAG GTGT/---- GTGTGCATGG 3070 het 2947 hom 58 15 24 19 GT 4 2 12995 CASAVA_Build 5 3265568 2D GCATGGGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 392 hom 57 3 17 39 GT 8 7 12996 CASAVA_Build 5 3265622 4I CCTGTGTGTG ----/GTCA GTGTGCATGT 3070 hom 123 het 54 0 39 15 GTCA 0 1 12997 CASAVA_Build 5 3267517 1D GCTCTGCATG C/- TGGCATCTCC 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 C 1 0 12998 CASAVA_Build 5 3269324 5D TGTACTTTTA AAAAT/----- AAAATAACTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAAAT 2 1 12999 CASAVA_Build 5 3270777 2D AGTCACACAC AT/-- GTGTACACAC 3070 het 3070 hom 32 13 12 8 AT 1 0 13000 CASAVA_Build 5 3271741 1I TCCAGCAGTT -/C CCCCAGATCT 3070 het 3070 hom 45 17 15 13 C 4 5 13001 CASAVA_Build 5 3273663 11I CTCCACAGAC -----------/CAGGGGGTACA CAGCCAGGCC 3070 hom 68 het 28 0 18 10 CAGGGGGTACA 0 1 13002 CASAVA_Build 5 3275110 4D TTTTTCTGTC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 54 het 30 0 18 14 TTTA 5 4 13003 CASAVA_Build 5 3281715 1I GTTTTTAGAT -/G GTTATTCCTA 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 G 1 2 13004 CASAVA_Build 5 3283977 1D AACTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3054 hom 25 9 12 4 A 11 10 13005 CASAVA_Build 5 3300914 1D TTGGATACTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 30 het 18 0 11 7 A 8 7 13006 CASAVA_Build 5 3301767 4D TTTGATGGGG TTGT/---- TTGTTTTTTT 2999 het 2999 ref 20 11 7 3 TTGT 2 1 13007 CASAVA_Build 5 3302231 1I TATGTTGTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 T 9 10 13008 CASAVA_Build 5 3311064 1D GCCTTCTGTA C/- TAGGACGAAT 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 C 1 0 13009 CASAVA_Build 5 3317919 1D TCAGTGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2980 hom 25 9 11 6 T 11 10 13010 CASAVA_Build 5 3323898 19I TGGATTTCTG -------------------/TCCTGAATCGATTGCTGAT TCCTTTTTGC 3070 hom 51 het 18 0 16 2 TCCTGAATCGATTGCTGAT 0 1 13011 CASAVA_Build 5 3324104 9D GTGTGGGAAA GGGGGTCAG/--------- AGACAGCGAC 3070 hom 59 het 21 0 20 1 GGGGGTCAG 1 0 13012 CASAVA_Build 5 3328697 1I GGACATTCTG -/A ATAATGATGA 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 1 2 13013 CASAVA_Build 5 3332359 4D ATAAATAAAG TTCT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 40 hom 31 2 15 14 TTCT 1 0 13014 CASAVA_Build 5 3335202 1I TTTTTTTAAT -/G GGGGGGGGTG 3037 het 2761 hom 29 11 10 8 G 8 9 13015 CASAVA_Build 5 3339828 1D GTTTCTGCCC T/- TGAGGAGGTC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 2 1 13016 CASAVA_Build 5 3343370 1I TAGTCATCCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 T 8 9 13017 CASAVA_Build 5 3343923 1D GTATGTTTTT A/- AGAGTTATTT 3070 hom 126 het 49 0 41 8 A 2 1 13018 CASAVA_Build 5 3350962 4D TCATTTTCTC TCTT/---- TGATAGTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 16 3 TCTT 1 0 13019 CASAVA_Build 5 3354187 1D TTCACCCCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 16 9 T 11 10 13020 CASAVA_Build 5 3357093 1I GGAAATCTAT -/G GCCTTAATTC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 1 2 13021 CASAVA_Build 5 3359981 1I GCATCCCATG -/C CTTTTCGGGT 3070 hom 109 het 42 0 34 8 C 1 2 13022 CASAVA_Build 5 3363509 2D GAGGCTGCAA TC/-- TCTCTGTCCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TC 3 2 13023 CASAVA_Build 5 3372959 1D GCTGGGGTGG A/- AGGCCGCCCC 3070 het 2561 hom 36 12 18 6 A 2 1 13024 CASAVA_Build 5 3376731 2I GTGATGTGTG --/TA TTGTGTGCGT 2992 het 2992 ref 66 28 12 26 TA 0 1 13025 CASAVA_Build 5 3377709 10D GACCCGGCGC GGTGGGGCTG/---------- GGTCCCAGGC 3070 hom 45 het 18 0 13 6 GGTGGGGCTG 1 0 13026 CASAVA_Build 5 3384823 1I GGTGTCAGCA -/G GGGTGACTGC 3070 hom 126 het 45 0 41 4 G 3 4 13027 CASAVA_Build 5 3391657 1I TCCTCCACCC -/T CCACAGGGTT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 0 1 13028 CASAVA_Build 5 3402575 1I CATATGACAT -/G GCCTACATCG 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 G 1 2 13029 CASAVA_Build 5 3403436 3I ACTTCCTCGC ---/AGG AGGCGATCAC 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 AGG 1 2 13030 CASAVA_Build 5 3407355 1D TGGGCCTTAA T/- TTTCCCCCAA 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 T 4 3 13031 CASAVA_Build 5 3408713 1I CTCTCCAAGA -/G AGGGCTGCAT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 G 0 1 13032 CASAVA_Build 5 3411309 1D GGTCTTGCCT C/- CTTTATTTCC 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 C 2 1 13033 CASAVA_Build 5 3412262 4I ATTTGTTGAG ----/ATTA ATTAAATACA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 ATTA 1 2 13034 CASAVA_Build 5 3417078 1D ACAAGATACT C/- CGGGGGTGTC 3070 hom 101 het 41 0 34 8 C 2 1 13035 CASAVA_Build 5 3419895 1D AATGACGGGA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 8 7 13036 CASAVA_Build 5 3420099 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 10 13037 CASAVA_Build 5 3420454 4D TTCCATCCGC AGTG/---- AGTGAGTGTT 3070 hom 91 het 39 0 31 8 AGTG 3 2 13038 CASAVA_Build 5 3421652 1D ACACTACTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 8 13039 CASAVA_Build 5 3423026 1D TTTATTTGAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 8 13040 CASAVA_Build 5 3423124 1D TTTTAGTCTC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 54 het 20 0 19 3 T 9 8 13041 CASAVA_Build 5 3423327 4D TTTCTCCATT TTTA/---- TTTGTCTTGA 3070 hom 98 het 36 0 33 4 TTTA 1 0 13042 CASAVA_Build 5 3425673 1I GATTAATTTC -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 6 7 13043 CASAVA_Build 5 3434312 7I GCTGCCTCTG -------/GGGGCAT GAGGCTGGTA 2922 het 2922 ref 45 19 14 12 GGGGCAT 0 1 13044 CASAVA_Build 5 3435294 1D GTAGGTTTGT A/- AAAGGAAGGG 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 A 4 3 13045 CASAVA_Build 5 3445754 9D TGACTAGGGT GGCTGGGGA/--------- GGCTGGGGAG 1861 hom 29 het 14 0 9 8 GGCTGGGGA 2 1 13046 CASAVA_Build 5 3448613 1D GCTATTGAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1883 hom 28 6 11 11 A 10 9 13047 CASAVA_Build 5 3450213 4I AAGGAAGATG ----/AACA AAGAGAGCCT 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 AACA 0 1 13048 CASAVA_Build 5 3452616 1D CTTTTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 2464 het 1640 hom 31 6 7 18 A 15 14 13049 CASAVA_Build 5 3456861 1D TCTCAGTTTA T/- TTTTTTTGTT 3032 het 2449 hom 16 8 7 1 T 8 7 13050 CASAVA_Build 5 3459641 1I CTATTCAGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 9 10 13051 CASAVA_Build 5 3463240 4I CTTTTTACCT ----/TAAG TTAGTACTTC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 TAAG 0 1 13052 CASAVA_Build 5 3466520 6D GTAGGGAAAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 174 hom 33 2 10 21 AC 12 9 13053 CASAVA_Build 5 3466641 2D CAAGCCAGAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 AC 9 8 13054 CASAVA_Build 5 3468496 14D46M10I TCCCCCCTTT TAAAAAAGGTGATATATGGGATAGATGTTCTTGAAGATGGTGGATAAAGATAAATTTTTT----------/--------------TATGGGATTGATGTTCTTGAAGATGGTGGATAAAGATAAATTTTTTAAAAAAGAAA AGAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 18 9 12 13 N/A 0 0 13055 CASAVA_Build 5 3469581 1D CTAACAGGTA T/- GTGTCGAATA 3070 het 3070 ref 28 12 12 5 T 1 0 13056 CASAVA_Build 5 3470365 1D GGAGCTGAAA T/- TCAGTGAATG 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 2 1 13057 CASAVA_Build 5 3470535 1D GCTGTGCTCT G/- GTTCCCTGTC 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 G 2 1 13058 CASAVA_Build 5 3472545 1D ACAGGTGTGG C/- CCTGGAGCCG 3070 hom 98 het 35 0 32 4 C 3 2 13059 CASAVA_Build 5 3473129 1I CCAGCTTGTG -/A AGACCAGGGC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 1 2 13060 CASAVA_Build 5 3476225 2D CTGTGTTTTT TA/-- TGCTAGTAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 3 TA 1 0 13061 CASAVA_Build 5 3478657 1D AAGAAATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 10 9 13062 CASAVA_Build 5 3484144 5D TTTTGTTTCC TTTCT/----- TTTCTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 22 11 8 TTTCT 2 1 13063 CASAVA_Build 5 3486800 1D TAAGATATGA C/- CCCCCAAAAC 3070 het 3070 hom 35 11 20 5 C 6 5 13064 CASAVA_Build 5 3501770 1I ACAAGGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 10 11 13065 CASAVA_Build 5 3520546 1D ATTTAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 12 11 13066 CASAVA_Build 5 3521606 1D GAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2564 hom 30 7 17 6 A 13 12 13067 CASAVA_Build 5 3526969 8D CATAACCCTG ACACCAAA/-------- ACTTGGCAAA 3070 het 3070 ref 46 24 21 2 ACACCAAA 1 0 13068 CASAVA_Build 5 3535747 1D GTTGTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 971 het 197 hom 7 1 5 1 G 1 0 13069 CASAVA_Build 5 3536232 3I CTGGTGGAGG ---/GAA GAAGATGTCT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 GAA 1 2 13070 CASAVA_Build 5 3540548 1I GTCACTGTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 T 7 8 13071 CASAVA_Build 5 3541772 4I CTGTCTCTCT ----/CTCC CTGTCTCTCT 2826 het 2826 ref 32 14 10 8 CTCC 0 1 13072 CASAVA_Build 5 3547148 1I TATTTTGCTC -/T TTTTTTCTAG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 6 7 13073 CASAVA_Build 5 3550538 1I GTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 11 12 13074 CASAVA_Build 5 3556621 1D CCAGAGAAGC G/- TAAGAGCTTT 3070 het 3070 hom 59 22 32 7 G 1 0 13075 CASAVA_Build 5 3564905 1D GTGCATATGT G/- GGGGGGGGGG 1945 het 946 hom 28 7 8 13 G 11 10 13076 CASAVA_Build 5 3570992 1D ATTTGTTTCT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2460 hom 26 8 12 6 C 10 9 13077 CASAVA_Build 5 3574866 1I GCTCCCCCTT -/C ATGCTCCCTT 3070 hom 99 het 39 0 28 11 C 0 1 13078 CASAVA_Build 5 3583067 2I AAAAGATCAC --/AG AGACTCTGAA 3070 het 3070 hom 30 10 10 10 AG 1 2 13079 CASAVA_Build 5 3591210 19D CACAGGTGTC CAGGTGCTATGCAAAGGCA/------------------- CAGGTGCCAT 3070 het 3070 ref 45 22 19 14 CAGGTGCTATGCAAAGGCA 1 0 13080 CASAVA_Build 5 3591965 3D CCACTTCTTG TTC/--- TTTGGTGAAA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 TTC 1 0 13081 CASAVA_Build 5 3592398 7D TAATAAACAT CCATGAC/------- CCATGACCGC 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 CCATGAC 2 1 13082 CASAVA_Build 5 3600212 1D CAAATTAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 15 29 5 A 10 9 13083 CASAVA_Build 5 3601507 1D GTAAAAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 181 hom 22 2 14 6 A 10 9 13084 CASAVA_Build 5 3602080 3D TCGTCTCAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1901 hom 27 12 11 6 A 16 13 13085 CASAVA_Build 5 3605753 4D ACACACACAC AAAT/---- AAATAAATAA 2651 het 2651 ref 27 12 10 7 AAAT 5 4 13086 CASAVA_Build 5 3607286 4D ATGTAAATAA TAGT/---- TAAATAATTG 3070 het 3070 ref 19 10 7 3 TAGT 1 0 13087 CASAVA_Build 5 3607459 1I46M1I ATAACCTTGC -AAACAGAAAGCACTAGGCCCAGATGGGTTCACCAGTGAATTCCACC-/AAAACAGAAAGCACTAGGCCCAGATGGGTTCACCAGTGAATTCCACCA AACATTTAAA 3070 hom 87 het 22 0 30 4 N/A 0 0 13088 CASAVA_Build 5 3607843 1D CCTAGATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 10 9 13089 CASAVA_Build 5 3608449 1I AAAACTGTTG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 A 7 8 13090 CASAVA_Build 5 3609614 1D GAATATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 12 11 13091 CASAVA_Build 5 3646718 2I TGGGCTGGTT --/GA GAGTTAGGAT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 GA 1 2 13092 CASAVA_Build 5 3657554 2D GTGTGTGTGT GG/-- GGGGGGGAAC 2359 het 2359 ref 38 14 11 13 G 9 7 13093 CASAVA_Build 5 3662672 1D ACTTACAGGA T/- TTTTTTTTTT 1372 het 1372 ref 32 25 3 4 T 11 10 13094 CASAVA_Build 5 3694622 2D TTTCCTGAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 27 1 14 12 T 18 16 13095 CASAVA_Build 5 3714861 1I ATTCTGAACA -/C ATTTTTATAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 0 1 13096 CASAVA_Build 5 3717763 5I GCAGAAGCTC -----/TTTAG TTTAATTAGG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TTTAG 0 1 13097 CASAVA_Build 5 3723557 5D TGTGAGGACA TAACT/----- TCATTACATT 3070 hom 114 het 42 0 38 6 TAACT 1 0 13098 CASAVA_Build 5 3735107 2I GTGGACATAA --/AG AGAGTCCAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AG 2 3 13099 CASAVA_Build 5 3735800 1D TATTTTTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 6 het 18 1 16 1 T 10 9 13100 CASAVA_Build 5 3741973 1D TTTCTGTAAT C/- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 C 1 0 13101 CASAVA_Build 5 3749247 2D CAACCAAATC AG/-- GGTATTAATT 3070 het 3070 ref 54 26 26 3 AG 1 0 13102 CASAVA_Build 5 3754004 1D12M1D TTCTTCTCCT CCCTTCTCCTCCTC/-CCTTCTCCTCCT- CCTCCTTCTT 3070 hom 64 het 22 0 21 2 N/A 0 0 13103 CASAVA_Build 5 3754104 3D CCTCCTTCTT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 hom 34 het 19 0 11 9 TTC 5 4 13104 CASAVA_Build 5 3754350 3D TCTTCTTCTT TTC/--- TTCTTCTTCT 2287 hom 30 het 21 0 12 11 TTC 5 4 13105 CASAVA_Build 5 3755336 1D CCTCCATATC T/- ATTGTGGTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 1 0 13106 CASAVA_Build 5 3765384 4I TCATCCATGC ----/ATCT ATCTATTTTC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 ATCT 1 2 13107 CASAVA_Build 5 3768831 1I ATGTTTATTT -/A TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 0 1 13108 CASAVA_Build 5 3773007 1D CATAAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 12 10 T 13 12 13109 CASAVA_Build 5 3780669 2I CACTCACACA --/CT CTCATACACT 3070 het 3070 hom 77 21 41 15 CT 1 2 13110 CASAVA_Build 5 3780863 2I TACACTCACA --/CT CACACACTCA 3070 hom 170 het 78 1 66 11 CT 0 1 13111 CASAVA_Build 5 3781042 2D18M2D ACTCACACTT ACACTTATACACTCACACACAT/--ACTTATACACTCACACAC-- GTACTCACAC 3070 het 3070 ref 70 41 35 14 N/A 0 0 13112 CASAVA_Build 5 3781194 2I AGCACACACA --/CT CATATGCCCA 3070 hom 108 het 52 0 35 17 CT 0 1 13113 CASAVA_Build 5 3783763 1D ATAGAATGAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 9 8 13114 CASAVA_Build 5 3783874 3I TAAATTTTGC ---/ATT TTTTTTAAAA 3070 het 1775 hom 20 5 13 2 ATT 0 1 13115 CASAVA_Build 5 3784640 2I TGGAGATGCA --/CG GTCAACGTGC 3070 hom 138 het 50 0 45 5 CG 0 1 13116 CASAVA_Build 5 3786010 1I AGGCCGAGGC -/A GGCGGATCAC 2337 het 368 hom 9 1 7 1 A 0 1 13117 CASAVA_Build 5 3800285 3D TGCATTCACA AAG/--- AGATGGTTTG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 AAG 1 0 13118 CASAVA_Build 5 3807004 2I ACTCGAGATG --/TA TATGATTTTC 3070 het 3070 ref 53 32 19 2 TA 1 2 13119 CASAVA_Build 5 3826701 1I CAGTAACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 12 13 13120 CASAVA_Build 5 3838518 2D CACTCATATC CA/-- CACACACTCA 980 het 980 ref 81 55 8 18 CA 4 3 13121 CASAVA_Build 5 3839115 4D CTCACATCTA CATC/---- CACACTTCAC 3070 het 3070 ref 100 63 20 21 CATC 1 0 13122 CASAVA_Build 5 3845055 3D ATACTAGATG TGA/--- TGATGATGAT 3070 hom 81 het 36 0 28 9 TGA 7 6 13123 CASAVA_Build 5 3848100 1D TCATCAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 36 2 28 6 A 12 11 13124 CASAVA_Build 5 3867204 1I ATCCTAGATT -/G GATAAAGTTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 1 2 13125 CASAVA_Build 5 3868742 7D3M2I ATTTGTCATC ATGCAAACAG--/-------CAGGC ACACTCTGAA 3070 het 3070 hom 30 14 16 3 N/A 0 0 13126 CASAVA_Build 5 3869092 1I GAAACCATAT -/A AAAATGCTTA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 4 5 13127 CASAVA_Build 5 3872333 1D TTTATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 11 10 13128 CASAVA_Build 5 3873130 1D GTGGCTCATA C/- CTGTAATCCC 3070 het 820 hom 12 2 8 2 C 2 1 13129 CASAVA_Build 5 3880542 1D CTAAACATAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 T 9 8 13130 CASAVA_Build 5 3880721 4D CTGTGATCCT GTAA/---- GTCTCATTGC 3070 het 3070 hom 39 14 22 6 GTAA 1 0 13131 CASAVA_Build 5 3883252 1I AGCTTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 10 11 13132 CASAVA_Build 5 3885356 4D CTATCAATCA GTCT/---- GTCTATCTAC 3070 het 3070 hom 43 20 21 4 GTCT 2 1 13133 CASAVA_Build 5 3891605 1D TAAAGTGGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 15 16 10 T 10 9 13134 CASAVA_Build 5 3893403 2I TTTTCTTGAC --/AA ATCATTTATC 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 A 1 3 13135 CASAVA_Build 5 3900772 1D GGCTCAAATG C/- CCCTGGTCTC 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 C 4 3 13136 CASAVA_Build 5 3904666 1D TTTTTTCCCC A/- AATTCATACG 3070 hom 93 het 36 0 30 6 A 3 2 13137 CASAVA_Build 5 3919009 1D ACTGCCCCCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 304 hom 35 1 26 8 T 10 9 13138 CASAVA_Build 5 3919431 1D CCCAAAGTGC T/- GGGGTTACAG 3070 hom 20 het 21 0 14 7 T 1 0 13139 CASAVA_Build 5 3922034 4D TTATCAAAAC TAAA/---- TAACCAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 7 TAAA 1 0 13140 CASAVA_Build 5 3943749 1I TCTTGCACTT -/C CAGGGCAAAT 3070 het 3070 hom 66 23 34 9 C 1 2 13141 CASAVA_Build 5 3951692 1I TATCTTCGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 16 8 T 13 14 13142 CASAVA_Build 5 3954508 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 10 11 13143 CASAVA_Build 5 3956877 1D TCTCTAGATA T/- TGCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 T 2 1 13144 CASAVA_Build 5 3979767 12D CAACCTGACC CTTTTCCATCTT/------------ CTTTGTCAGA 3070 het 3070 hom 49 20 26 7 CTTTTCCATCTT 1 0 13145 CASAVA_Build 5 3982203 2I TACTCTGATG --/AT ATATTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 AT 2 3 13146 CASAVA_Build 5 3985066 1I TGCAAGTTAG -/A AAAAAAAAAA 2950 het 2950 ref 24 12 9 3 A 10 11 13147 CASAVA_Build 5 3987277 1I GCCTAAACAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 8 9 13148 CASAVA_Build 5 3988438 2D GTAAGAATAT AC/-- ACAGTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 AC 2 1 13149 CASAVA_Build 5 3991007 7D4M6D AGTTTTGTTC AATAGTTAGTTCAATAG/-------AGTT------ TTTTCTATTG 3070 het 3069 hom 23 7 17 2 N/A 0 0 13150 CASAVA_Build 5 3992704 3I CTTTTGTTGC ---/TGT TGTTGTTCTC 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 TGT 2 3 13151 CASAVA_Build 5 4016021 1D TCTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 21 17 3 T 11 10 13152 CASAVA_Build 5 4018689 2I TGCCCCACTG --/CA CAGACTCTCA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 CA 1 2 13153 CASAVA_Build 5 4025003 1D GTAACAACAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 C 1 0 13154 CASAVA_Build 5 4030733 1D TATTTCAAAA T/- TTTTTTGTGC 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 7 6 13155 CASAVA_Build 5 4038651 1D TGAATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 36 2 26 8 A 12 11 13156 CASAVA_Build 5 4057106 1I TGCTGATTTG -/C CAAGCCTAGA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 C 1 2 13157 CASAVA_Build 5 4057491 1D TGCACAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1804 het 1804 ref 45 34 5 6 T 11 10 13158 CASAVA_Build 5 4059723 1I TTCAGGATGC -/T GTTGTTCTTG 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 0 1 13159 CASAVA_Build 5 4061166 3I TAGGCAGCTC ---/TCT CAGCAGTAAA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 TCT 0 1 13160 CASAVA_Build 5 4064966 1I GCCAACTTAC -/A GATTTTGGAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 0 1 13161 CASAVA_Build 5 4071381 2D AACCAAGAAA CT/-- CTCCTCTCAC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 CT 2 1 13162 CASAVA_Build 5 4074991 4I TGCAATAGAT ----/TAAA TAAGCATATT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 TAAA 0 1 13163 CASAVA_Build 5 4078263 1I CAGGCACCAT -/C CCCCTGAGCC 3070 hom 85 het 33 0 27 6 C 4 5 13164 CASAVA_Build 5 4089497 1D TGATAAACGT A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 A 8 7 13165 CASAVA_Build 5 4118110 1D TAATGGCAAC A/- AAGACAGTTG 3070 het 3070 ref 60 29 26 6 A 3 2 13166 CASAVA_Build 5 4129019 1D AGTATCATGA G/- TTCTGAGTCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 0 13167 CASAVA_Build 5 4133609 2I CACACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 92 41 31 20 CA 5 6 13168 CASAVA_Build 5 4133957 2I ATGTTCATGT --/GC GCACACACAC 3070 het 3070 hom 88 38 40 10 GC 1 2 13169 CASAVA_Build 5 4140347 2I TTCGTGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 58 22 25 11 TG 8 9 13170 CASAVA_Build 5 4144539 1I AAGTGTGGGA -/G GGGGTGAGGG 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 G 4 5 13171 CASAVA_Build 5 4145698 1D AAAGTATTCC A/- AAAAACTAAG 3070 hom 138 het 50 0 46 4 A 6 5 13172 CASAVA_Build 5 4152930 1D AAATTCTGTC T/- TGGTGAAATT 3070 het 3070 ref 51 26 23 3 T 2 1 13173 CASAVA_Build 5 4153363 6D AATAAATTTA TAATTT/------ TAATCGTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 TAATTT 1 0 13174 CASAVA_Build 5 4154346 1I AATAGAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 A 9 10 13175 CASAVA_Build 5 4156260 3D AGACAGTCTG TTT/--- TTAACAAAGA 3070 hom 132 het 48 0 44 5 T 5 2 13176 CASAVA_Build 5 4187495 1D CTACAGTGAG A/- AAAAAGCATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 6 5 13177 CASAVA_Build 5 4242378 1I TATCCTGACA -/T AGAAGGTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 0 1 13178 CASAVA_Build 5 4245618 4I AAATTTAAAA ----/AAAT AAATAAAGAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AAAT 1 2 13179 CASAVA_Build 5 4247907 1D AAAAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 30 1 18 11 A 12 11 13180 CASAVA_Build 5 4250688 2D TACCTTCATT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 111 het 44 0 37 8 TC 10 9 13181 CASAVA_Build 5 4253005 1D GAGAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 10 13182 CASAVA_Build 5 4260482 1D AAAACGATTA C/- CCCCAAAGCA 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 C 5 4 13183 CASAVA_Build 5 4270383 1D GTTTGGTTTC T/- GGCTGGTAAT 3070 het 3070 ref 53 26 19 10 T 1 0 13184 CASAVA_Build 5 4279354 2I AAGACATTTG --/GT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 GT 0 1 13185 CASAVA_Build 5 4299353 1D TGCAAATCAC T/- GTCCACAAGG 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 1 0 13186 CASAVA_Build 5 4300727 1D GTCTCAAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 14 6 T 10 9 13187 CASAVA_Build 5 4317985 5D28M1I AACCACTGAT TATAATATATTTATAGACCATAACATTTTTTTC-/-----TATATTTATAGACCATAACATTTTTTTCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 23 14 6 N/A 0 0 13188 CASAVA_Build 5 4319656 1D27M1I AGCAGTCTGG AATTTATCGCACAAATTCCATCAAATTA-/-ATTTATCGCACAAATTCCATCAAATTAT TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 27 0 28 5 N/A 0 0 13189 CASAVA_Build 5 4330083 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 3 A 10 9 13190 CASAVA_Build 5 4330253 3I CAGAAAGATA ---/AAG AAGAAGAAGG 3070 hom 31 het 44 1 36 7 AAG 3 4 13191 CASAVA_Build 5 4340784 5D2M1D GACAGAGTCT GTCTCTGT/-----TG- CTCTGTCGCC 626 het 626 ref 8 5 2 5 N/A 0 0 13192 CASAVA_Build 5 4348004 5D GATAGAAGCA TAAGT/----- TAAGAATCTT 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 TAAGT 1 0 13193 CASAVA_Build 5 4348884 2I TGATTTGATC --/CT CTTTCTTATA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 CT 1 2 13194 CASAVA_Build 5 4349044 4D AATGGCTGCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2143 het 1774 hom 27 7 8 14 T 16 12 13195 CASAVA_Build 5 4349818 1I GAAATGCCAG -/A AAAAAAACTG 3070 het 2947 hom 26 7 14 5 A 7 8 13196 CASAVA_Build 5 4351014 1D CGTGACAAAG A/- AAAACTGGAA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 A 5 4 13197 CASAVA_Build 5 4352752 1D TACATGTAGG C/- CCTGTGATCC 3070 het 3070 ref 52 26 20 8 C 3 2 13198 CASAVA_Build 5 4360733 1D GTGTGTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 13 12 13199 CASAVA_Build 5 4360893 1D TAAAATATGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 9 8 13200 CASAVA_Build 5 4374462 1D CAAAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 20 0 T 11 10 13201 CASAVA_Build 5 4376043 1D CAGTAGCTAC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 8 7 13202 CASAVA_Build 5 4378362 1I AAAAACTAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 8 9 13203 CASAVA_Build 5 4380423 9D TTCCTTCACC TCCTTCACT/--------- TCCTTTCTCA 3070 het 3070 hom 42 22 17 7 TCCTTCACT 1 0 13204 CASAVA_Build 5 4385837 1I CAGGAACAGC -/T GGGTTAGTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 13205 CASAVA_Build 5 4416242 6I TATAGAGCTC ------/TTCTAA TTCTGAGAGA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TTCTAA 0 1 13206 CASAVA_Build 5 4416896 1D TAAGACATTT C/- CCTTATGTAG 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 C 3 2 13207 CASAVA_Build 5 4435488 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2116 hom 31 12 12 7 T 11 12 13208 CASAVA_Build 5 4435599 1D CTTTCAAACA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 8 7 13209 CASAVA_Build 5 4444220 2D CTGTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 1492 het 138 hom 24 2 8 14 TG 1 0 13210 CASAVA_Build 5 4447200 1I GGCAATTTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 A 9 10 13211 CASAVA_Build 5 4450221 16I CACAATAAAA ----------------/ATGATACCTTAAAAAC ATGATAGGGA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 ATGATACCTTAAAAAC 0 1 13212 CASAVA_Build 5 4450332 1D GTACTTGCAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 36 22 9 6 A 8 7 13213 CASAVA_Build 5 4450820 1D CTTCTGACTA T/- TGGTCATCTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 1 13214 CASAVA_Build 5 4453076 1I GAAGAGGAAC -/G GAAGGGAAAA 3070 het 2767 hom 23 9 12 2 G 1 2 13215 CASAVA_Build 5 4453838 4I CTTCCATTTC ----/AAAG AAAGTGAAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAAG 1 2 13216 CASAVA_Build 5 4457315 1I CTGACAATGG -/T TAAGTTCTTT 3070 het 3070 hom 56 27 28 1 T 1 2 13217 CASAVA_Build 5 4471878 2D TGTGTGTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 998 het 998 ref 35 27 3 5 TG 7 6 13218 CASAVA_Build 5 4476417 1D ACTGGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 A 13 12 13219 CASAVA_Build 5 4477159 9I GTATTGGCCC ---------/TAAGAAATT TAAGAAATTA 3070 het 3070 ref 58 29 22 8 TAAGAAATT 1 2 13220 CASAVA_Build 5 4478627 1I ATTGTTAGGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 7 8 13221 CASAVA_Build 5 4482241 1I GATGAGGCTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 8 9 13222 CASAVA_Build 5 4483526 1I GTCTATATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 A 12 13 13223 CASAVA_Build 5 4536045 1D GCAGAGAGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 71 hom 38 1 29 8 T 10 9 13224 CASAVA_Build 5 4556074 1I TTGAATCTCT -/A AATTGCTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 2 3 13225 CASAVA_Build 5 4561430 1D ATAATTTGTC T/- TTTTTTCCTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 7 6 13226 CASAVA_Build 5 4563970 1I TCACTAGTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 10 13227 CASAVA_Build 5 4615257 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 23 10 8 A 9 8 13228 CASAVA_Build 5 4659859 1I AGAGACACAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 A 8 9 13229 CASAVA_Build 5 4675290 1D AATAAAGTTG A/- AAAAAATGGG 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 A 7 6 13230 CASAVA_Build 5 4681039 3D GAGAAGTGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 1327 het 1327 ref 50 19 4 27 T 17 14 13231 CASAVA_Build 5 4691092 1I ATTATGTAAC -/A AAAAAAATAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 7 8 13232 CASAVA_Build 5 4694230 1D GCTGATGAAA C/- CCCCCCCATA 3070 hom 87 het 38 0 26 12 C 8 7 13233 CASAVA_Build 5 4698486 1I TTCAGGGCGT -/G GGGTCGGCCT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 3 4 13234 CASAVA_Build 5 4706525 1D CCCAAGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 818 hom 25 2 13 10 A 12 11 13235 CASAVA_Build 5 4708591 1I TGACCAAAAC -/A AAAGGGTTAC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 3 4 13236 CASAVA_Build 5 4708684 1D GGTCTCACAT C/- CAGGTCACAC 3070 hom 39 het 17 0 13 4 C 2 1 13237 CASAVA_Build 5 4712670 1I AAAGGAAATT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 A 7 8 13238 CASAVA_Build 5 4714920 2I CTTACATTTC --/TT TGTTACTGTC 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 1 3 13239 CASAVA_Build 5 4726906 1I TTTATGAAAA -/T AAAAAGCTAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 0 1 13240 CASAVA_Build 5 4728017 1D TTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 T 12 11 13241 CASAVA_Build 5 4730515 1D TCAATATAAG T/- TTTAATTTGA 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 T 4 3 13242 CASAVA_Build 5 4737081 25D CCAGAGAAGC AAATACCACATGATCCCACCTATAT/------------------------- GTACAATTTA 3070 het 3070 ref 37 24 20 7 AAATACCACATGATCCCACCTATAT 1 0 13243 CASAVA_Build 5 4747111 1D GGCAATTTGC A/- AAGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 53 30 21 4 A 3 2 13244 CASAVA_Build 5 4748684 1I AAAACAGTCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 23 12 10 1 T 7 8 13245 CASAVA_Build 5 4752713 1D AGAAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 597 hom 46 3 36 8 A 12 11 13246 CASAVA_Build 5 4758014 1I AATATATATG -/T TATATAATAT 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 T 1 2 13247 CASAVA_Build 5 4758117 25D TAATATATTG TATATTACATATGTACACATATACA/------------------------- TATATAATAC 3070 het 3070 ref 20 15 8 2 TATATTACATATGTACACATATACA 1 0 13248 CASAVA_Build 5 4782417 1I TTTCCATTTG -/T CCTTTAAACC 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 0 1 13249 CASAVA_Build 5 4796252 1D TTATCTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 8 7 T 11 10 13250 CASAVA_Build 5 4799627 4D TTCAGGAAGG TGAT/---- TGATTTTTCT 2083 het 2083 ref 34 26 6 2 TGAT 2 1 13251 CASAVA_Build 5 4800024 1D GTACAGAATT A/- AGCATTATTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 2 1 13252 CASAVA_Build 5 4806858 3D CTATTTGAAG CCA/--- CCACATTTGT 3070 het 3070 ref 47 27 18 3 CCA 2 1 13253 CASAVA_Build 5 4826436 4D CTCATATCTG TTAT/---- TTGTAGCCAG 3070 het 3070 ref 51 24 21 7 TTAT 1 0 13254 CASAVA_Build 5 4830179 4I GTAGATTATC ----/AGTA AGTGAGTAAA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 AGTA 0 1 13255 CASAVA_Build 5 4848270 1D ACTGTTGGAC T/- TTTATAAATT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 4 3 13256 CASAVA_Build 5 4848485 2D ATGTTTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 AT 6 5 13257 CASAVA_Build 5 4852435 2D ATGCAAAAAC TG/-- TGGCAAAGCA 3070 het 3070 hom 52 24 28 2 TG 2 1 13258 CASAVA_Build 5 4858610 1I GTAACATCGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 T 8 9 13259 CASAVA_Build 5 4860889 2D GCCCAAGGAT TC/-- TCCTCTATTT 3070 het 3070 hom 50 24 21 5 TC 2 1 13260 CASAVA_Build 5 4861500 4D TAATATCTTC TCTT/---- TAACTGTATT 3070 het 3070 ref 39 23 16 1 TCTT 1 0 13261 CASAVA_Build 5 4862850 4I TTTATGTGAC ----/AGAT AGTATATAAA 2533 het 2533 ref 15 7 6 2 AGAT 0 1 13262 CASAVA_Build 5 4866271 1D TTTAATTGAG T/- TTTTTCCCAT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 6 5 13263 CASAVA_Build 5 4866435 1I ATCACAAAAC -/A AAAAAAACCC 2817 het 2817 ref 21 10 8 3 A 7 8 13264 CASAVA_Build 5 4868796 1I GTTTATCCTC -/A AGTTAGAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 7 4 A 1 2 13265 CASAVA_Build 5 4870684 1I CTGCACCTCC -/A ACTGTGGCGG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 1 2 13266 CASAVA_Build 5 4870984 2I ATAACTTGTG --/AC ACACATTTTA 3070 het 3070 ref 58 31 24 3 AC 2 3 13267 CASAVA_Build 5 4871694 9I TGATGTGTGG ---------/CAGAAACCT CAGAAACCTA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 CAGAAACCT 1 2 13268 CASAVA_Build 5 4871924 1D GAAAAATCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 10 9 13269 CASAVA_Build 5 4875518 1I AAAACACTTT -/A AATAGTCATT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 2 3 13270 CASAVA_Build 5 4877919 1D GACCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2500 het 2500 ref 36 11 8 17 A 14 13 13271 CASAVA_Build 5 4882484 1I ACTTCACACA -/G TGGGCTGCTG 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 G 0 1 13272 CASAVA_Build 5 4882840 1I CATTTTGTTG -/A AAAAAAATCG 3070 het 3070 ref 51 24 18 9 A 7 8 13273 CASAVA_Build 5 4883362 4D CCTTCCTTCC TTCT/---- TTCTTTTTTT 3070 het 2030 hom 29 7 16 7 TTCT 2 1 13274 CASAVA_Build 5 4884284 4D TTTAGTTCTA TTTG/---- TTTGTGTTTG 3070 het 3070 ref 32 18 12 7 TTTG 2 1 13275 CASAVA_Build 5 4885460 5I CAGAGACTTA -----/AATAT AATATGATAG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AATAT 1 2 13276 CASAVA_Build 5 4914021 2D ATCAACAAAG GA/-- GACTGGAGCG 3070 het 3070 hom 38 15 18 7 GA 2 1 13277 CASAVA_Build 5 4921526 1D CCTCTGTAAT A/- AAAGGCGAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 A 4 3 13278 CASAVA_Build 5 4922206 1D ATTTTATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2720 hom 32 13 8 11 A 15 14 13279 CASAVA_Build 5 4923679 1I ATTGAATCAT -/G GGGGGTGGTG 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 G 5 6 13280 CASAVA_Build 5 4930661 4I TGACAATTTG ----/TCTC TAATTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 TC 0 2 13281 CASAVA_Build 5 4937449 1D GTGGGGTCCA G/- CCAAGTGTTT 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 G 1 0 13282 CASAVA_Build 5 4937778 2D ATTCACACTC TT/-- TTTTTTTTCC 3070 het 28 hom 45 2 20 23 T 10 8 13283 CASAVA_Build 5 4938474 1I TGTAAGAAGG -/C CTTCTACAGC 3070 hom 93 het 36 0 28 8 C 1 2 13284 CASAVA_Build 5 4953619 1I AAAAAAAAAA -/T AAATATATAT 1836 het 166 hom 8 1 6 2 T 0 1 13285 CASAVA_Build 5 4968658 1I ATAAATGTGC -/A CGTGTTGAAA 3070 hom 123 het 45 0 40 5 A 0 1 13286 CASAVA_Build 5 4970616 1D AAAAAGCTCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 8 13287 CASAVA_Build 5 4971265 1D TCAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 54 1 49 4 A 11 10 13288 CASAVA_Build 5 4972746 1I ACCCTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1258 hom 36 3 28 5 A 15 16 13289 CASAVA_Build 5 4972760 1I AAAAAAAAAA -/C ATTAATGACA 3070 het 1250 hom 42 3 34 5 C 0 1 13290 CASAVA_Build 5 4973079 1I TGTATTTGTG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 13291 CASAVA_Build 5 4983145 2D AGAGAAAGAA AG/-- AGAGGAATTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AG 3 2 13292 CASAVA_Build 5 4999114 4I TAAAAATAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAT 2 3 13293 CASAVA_Build 5 5001186 2D TCTGCTGTGT GA/-- GTCTTCTGGG 3070 hom 78 het 27 0 25 2 GA 1 0 13294 CASAVA_Build 5 5002675 1I TCTGTGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 910 hom 43 2 28 13 T 10 11 13295 CASAVA_Build 5 5009472 1I AGGTTATACA -/G GAGAAAACAA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 1 2 13296 CASAVA_Build 5 5018646 1I TCTAATTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 18 20 11 A 12 13 13297 CASAVA_Build 5 5019852 1I CAAAAATAAC -/A ATATTCTGAC 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 A 1 2 13298 CASAVA_Build 5 5032055 1D AGTTCTCTTC T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 T 7 6 13299 CASAVA_Build 5 5033146 1I AGTTTAATTA -/G GGTCTGATTT 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 G 2 3 13300 CASAVA_Build 5 5041031 1D CCAGGTGGGC T/- TTCCTGGACT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 3 2 13301 CASAVA_Build 5 5043465 1D GTGGGTCTTG A/- AAAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 46 25 19 3 A 4 3 13302 CASAVA_Build 5 5057504 1I GTCCATTGAT -/A GATGAATGGA 3070 het 3070 hom 48 20 20 8 A 0 1 13303 CASAVA_Build 5 5092016 1I CTGTGCTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 39 2 31 6 T 10 11 13304 CASAVA_Build 5 5095139 6I GATGAGGTAA ------/GGAAAG GGAAAGCTCT 3070 hom 97 het 40 0 33 7 GGAAAG 1 2 13305 CASAVA_Build 5 5100962 1D TGTTTTCAAG C/- CTCCATTGCA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 2 1 13306 CASAVA_Build 5 5104447 3D CCTAAAGTCT AAC/--- AACTCTCCCC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAC 2 1 13307 CASAVA_Build 5 5104696 1D TCCCAGACTT C/- CACAGTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 2 1 13308 CASAVA_Build 5 5105577 1D CTTGGAGGCA G/- GGGGCATACC 3070 hom 108 het 40 0 34 6 G 5 4 13309 CASAVA_Build 5 5114416 4I GCAACAGCCA ----/AAAT AAATTAATTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAAT 1 2 13310 CASAVA_Build 5 5127255 1D GTTTAAGTCC A/- ACAGCCTATG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 2 1 13311 CASAVA_Build 5 5135809 1I GCCTGGCTAG -/T TTTTTTATAT 3070 hom 24 het 10 0 8 2 T 6 7 13312 CASAVA_Build 5 5143012 26I TGTGATTTTC --------------------------/ACAGTCATAAGTGTAAAACAGTCAAG AAAGGAATTA 3070 hom 132 het 43 0 45 6 ACAGTCATAAGTGTAAAACAGTCAAG 0 1 13313 CASAVA_Build 5 5144973 8I ACAGATAATT --------/GATATTCA GATATTCATA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 GATATTCA 1 2 13314 CASAVA_Build 5 5148002 1D AAATTATGAC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 7 13315 CASAVA_Build 5 5148695 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 9 10 13316 CASAVA_Build 5 5177913 1D TTTTAGAGAC T/- TTTTTTGTCG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 7 6 13317 CASAVA_Build 5 5178113 4I AACAACATAC ----/GTGT GTAATGGGCT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 GT 1 3 13318 CASAVA_Build 5 5179261 4I CTCCATGTGC ----/ATCT ATCTCTCCCA 3070 hom 151 het 57 0 50 7 ATCT 1 2 13319 CASAVA_Build 5 5185531 4D ACAGATAGAT AGAC/---- TTCCATACAC 2209 het 2209 ref 71 55 8 9 AGAC 1 0 13320 CASAVA_Build 5 5189862 3D TTTTAAAGAA TGT/--- TGTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 59 38 18 5 TGT 2 1 13321 CASAVA_Build 5 5194010 1D TGTTGTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 884 hom 36 4 23 9 T 13 12 13322 CASAVA_Build 5 5195005 1D ATAAAATGTT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 24 10 11 4 A 8 7 13323 CASAVA_Build 5 5197239 1I AAATTATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 A 10 11 13324 CASAVA_Build 5 5211610 5I GAAGCATACA -----/CTCCC CTCCCCAATC 3070 het 3070 ref 59 30 22 7 CTCCC 1 2 13325 CASAVA_Build 5 5235897 1I TATCAGAGTC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 52 23 22 7 T 7 8 13326 CASAVA_Build 5 5245109 1D ATTTATTTAC T/- TTATTTTGAG 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 T 3 2 13327 CASAVA_Build 5 5248292 1D GAACTGAGAT A/- TGTGTTCTCC 3070 het 3070 ref 50 24 18 10 A 1 0 13328 CASAVA_Build 5 5254803 5D AAGAAAAAAA TAGCT/----- TAGCAGCACC 3070 het 3070 ref 38 21 13 7 TAGCT 1 0 13329 CASAVA_Build 5 5277426 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 het 1514 hom 31 6 22 3 AG 2 1 13330 CASAVA_Build 5 5278345 1D TGCTCTGGGA G/- GGGGCGGGAC 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 G 5 4 13331 CASAVA_Build 5 5278714 1D GACTTGGTTT C/- AAAAAAAAAA 3070 het 1810 hom 37 6 16 16 C 1 0 13332 CASAVA_Build 5 5280091 12D GGTCACTGGG GACCTCTCTTGT/------------ GAAATCAAAC 3070 het 3070 hom 49 22 21 7 GACCTCTCTTGT 1 0 13333 CASAVA_Build 5 5284547 1D GAAAGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1058 hom 28 4 12 12 T 11 10 13334 CASAVA_Build 5 5285302 1D54M2D TTGGGTAAGG AAAAAAAAAACAACATTGAATGTACTGTATTTATATTAGGTGCTGCTTGAGTGTAGG/-AAAAAAAAACAACATTGAATGTACTGTATTTATATTAGGTGCTACTTGAGTGTA-- GGGAGGCTAA 3070 hom 108 het 35 0 38 21 N/A 0 0 13335 CASAVA_Build 5 5286151 1I TGACCACAGC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 7 8 13336 CASAVA_Build 5 5288584 8D CACAAAGTAG ATCCTGCA/-------- TGGAAATTGA 3070 het 3070 ref 38 21 16 5 ATCCTGCA 1 0 13337 CASAVA_Build 5 5288935 1I GGGAACATTG -/C CCCGAAAAAA 3070 het 3070 hom 56 20 25 11 C 3 4 13338 CASAVA_Build 5 5289728 1D AAAATGGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 11 10 13339 CASAVA_Build 5 5289912 5D AAATTTAAAG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 hom 87 het 35 0 30 8 AAACA 3 2 13340 CASAVA_Build 5 5294957 2I GAGAAGGTAC --/AA AGTCTAGACA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 1 3 13341 CASAVA_Build 5 5305464 1D TGATTGCCCT G/- GGGGGAAAAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 6 5 13342 CASAVA_Build 5 5333030 6D TTTCTTTCTT TATTTC/------ TCTTTTTCTT 3070 hom 64 het 25 0 21 6 TATTTC 1 0 13343 CASAVA_Build 5 5335149 3I CAGAACAGTA ---/GTG GTATATGCTC 3070 hom 141 het 53 0 46 7 GTG 0 1 13344 CASAVA_Build 5 5335242 1I CCTTGATGCA -/T TAACTGTCAC 3070 hom 105 het 41 0 32 9 T 1 2 13345 CASAVA_Build 5 5342318 1I CAGATAATAG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 8 9 13346 CASAVA_Build 5 5348521 5I AGCTACACCA -----/AATTT AATTATATTA 3070 hom 97 het 37 0 31 6 AATTT 0 1 13347 CASAVA_Build 5 5351606 1I GGATGGCAAG -/C TAATAAGGCC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 C 0 1 13348 CASAVA_Build 5 5351778 3D CATCTCTTTA TTG/--- TTGAATGGGC 3070 hom 114 het 43 0 39 6 TTG 2 1 13349 CASAVA_Build 5 5352360 1D ATCAGCAAAC A/- AAAGACACTG 3070 hom 120 het 42 0 40 2 A 4 3 13350 CASAVA_Build 5 5352628 1D GTCATTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 10 9 13351 CASAVA_Build 5 5356077 1I AAATTTTGCA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 7 13352 CASAVA_Build 5 5358672 3D CACACACACA CAC/--- GTCAGAGCTT 3070 hom 101 het 40 0 33 8 CAC 1 0 13353 CASAVA_Build 5 5364414 2D TGACATAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 17 15 13354 CASAVA_Build 5 5368564 1I TAAATGATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 11 12 13355 CASAVA_Build 5 5370965 1I TCTATCTGAA -/C AACAGGAAGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 C 0 1 13356 CASAVA_Build 5 5373200 1I GATTTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 24 1 15 8 T 10 11 13357 CASAVA_Build 5 5374323 1D TGTGTGTTAT C/- CCCCCCACCT 3070 het 3070 ref 53 27 14 12 C 7 6 13358 CASAVA_Build 5 5404314 1I AGAAAATTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 T 7 8 13359 CASAVA_Build 5 5420705 2D CAAACGCGCG CA/-- CACACACACA 887 het 887 ref 43 24 3 17 CA 9 8 13360 CASAVA_Build 5 5437772 12D CCCCAAGGGA CATCTATGTGGG/------------ CATCTATGTG 3070 het 3070 ref 52 27 18 10 CATCTATGTGGG 2 1 13361 CASAVA_Build 5 5440938 1I CACTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 11 12 13362 CASAVA_Build 5 5441324 1I TAAATATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 10 11 13363 CASAVA_Build 5 5441791 1D GGAACGTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 10 9 13364 CASAVA_Build 5 5442989 1I TTAATTATGA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 T 2 3 13365 CASAVA_Build 5 5447906 2D TGGCCCTATC AT/-- AAGTTTGTGT 1648 het 1648 ref 27 19 4 6 AT 1 0 13366 CASAVA_Build 5 5453337 5D TAAGGTATAA TCTGT/----- TATAGAAGAT 3070 hom 126 het 44 0 43 2 TCTGT 1 0 13367 CASAVA_Build 5 5457438 1I GTATCCTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 36 1 30 5 A 10 11 13368 CASAVA_Build 5 5460335 3D ACACACACAA AAC/--- AATAAGTTAG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 AAC 1 0 13369 CASAVA_Build 5 5461075 1I GCGTCATTTG -/T TTGCAACCTC 3070 hom 105 het 45 0 36 9 T 2 3 13370 CASAVA_Build 5 5461319 2I CAGAAAGCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 12 13371 CASAVA_Build 5 5463355 1D CTGCAATGTG T/- TTTTCAGAGT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 5 4 13372 CASAVA_Build 5 5471056 1I GCCACTGCCA -/G GGTGCGAAAG 3070 hom 117 het 45 0 38 7 G 2 3 13373 CASAVA_Build 5 5476565 1I TGTCTGAGTC -/G TTAGACTCGA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 0 1 13374 CASAVA_Build 5 5529251 1I GTGGAAGGCT -/G GGGGGGTTAA 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 G 6 7 13375 CASAVA_Build 5 5541762 5I AGAATCATAC -----/ACTGT ACTGTAGTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 ACTGT 1 2 13376 CASAVA_Build 5 5544245 1I AGTGGAGAGA -/C CCTGTTAGGA 3070 het 3070 hom 53 20 21 12 C 2 3 13377 CASAVA_Build 5 5546025 1I AAAGAAAAAA -/G AGAGAAAGGA 2654 het 941 hom 10 3 7 0 G 0 1 13378 CASAVA_Build 5 5549040 1I TCCTTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2364 hom 35 11 15 9 A 15 16 13379 CASAVA_Build 5 5571852 1I AAACCCATAT -/A ACTCTCCTAT 1719 het 1719 ref 15 11 4 0 A 1 2 13380 CASAVA_Build 5 5573344 2D AGTCTCATTC TA/-- GACACCAGAC 472 hom 7 het 11 0 2 9 TA 1 0 13381 CASAVA_Build 5 5578053 2D AATTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 39 0 34 5 T 18 16 13382 CASAVA_Build 5 5585182 2I CAGGGTTCCT --/TC TCTGTTTTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TC 1 2 13383 CASAVA_Build 5 5586415 20D GGAGCTGAGT ATGGTGGGCTACAGTGACTG/-------------------- ATGGTCCTGA 3070 het 3070 ref 29 19 12 5 ATGGTGGGCTACAGTGACTG 1 0 13384 CASAVA_Build 5 5587695 16D TCATTTGCAA CAGGTAATGACAGACC/---------------- CACCTCTGGG 3070 hom 192 het 67 0 63 13 CAGGTAATGACAGACC 1 0 13385 CASAVA_Build 5 5589237 4D GCTCTGTGCA CAGT/---- CAGTGTGAGG 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 CAGT 2 1 13386 CASAVA_Build 5 5591960 1D AGGAGTAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 337 hom 48 1 41 6 A 10 9 13387 CASAVA_Build 5 5593411 6D ACGATGATGG TGATGA/------ TGATGATGAT 3070 hom 185 het 62 0 61 8 TGA 6 4 13388 CASAVA_Build 5 5596027 1D ACCTATGTTG T/- TGTCAGTGGG 3070 het 3070 ref 50 19 19 14 T 2 1 13389 CASAVA_Build 5 5596832 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 15 14 13390 CASAVA_Build 5 5597802 15I GGTTTTAGCA ---------------/GCAGTCATTTTCCCT GCAGATGAAT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 GCAGTCATTTTCCCT 0 1 13391 CASAVA_Build 5 5622815 1D TGAGAGAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 A 9 8 13392 CASAVA_Build 5 5634795 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 27 1 17 10 A 13 12 13393 CASAVA_Build 5 5635762 1I GATTCCTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 379 hom 51 1 44 6 T 9 10 13394 CASAVA_Build 5 5638354 1D GACGAATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 22 9 T 11 10 13395 CASAVA_Build 5 5643286 1I ATCTTCTTTG -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 7 8 13396 CASAVA_Build 5 5643645 1D AGAGAGAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 11 10 13397 CASAVA_Build 5 5648549 2D TCTGAATTAG AA/-- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 9 19 2 A 9 7 13398 CASAVA_Build 5 5649746 1D TATTCCAGAT G/- GGTGGTAAAT 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 G 3 2 13399 CASAVA_Build 5 5652706 1I AATTCCGCTA -/G GTGGTCACTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 1 2 13400 CASAVA_Build 5 5654523 1D CATGAGGGCA C/- CACCCCTGTT 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 C 2 1 13401 CASAVA_Build 5 5656011 1I AGTTCTTCTA -/G GACTTATCAA 3070 hom 108 het 59 1 50 8 G 1 2 13402 CASAVA_Build 5 5656322 4D TCAACACGTC TTTA/---- ATTAATTTCT 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 TTTA 1 0 13403 CASAVA_Build 5 5660106 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 9 8 13404 CASAVA_Build 5 5664230 1I CTGTGTCTCT -/G AATCAAGTTG 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 G 0 1 13405 CASAVA_Build 5 5666132 1D AGAATTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 11 10 13406 CASAVA_Build 5 5666468 1D CACTAACTTG C/- TAACATTTGT 3070 het 3070 ref 32 15 12 8 C 1 0 13407 CASAVA_Build 5 5666623 1D GGCAGAGCTC A/- AAAGAGACAC 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 A 4 3 13408 CASAVA_Build 5 5676299 2I ATCCTGGCCC --/TG TGTTAGAGAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TG 1 2 13409 CASAVA_Build 5 5678942 2I CACACACACG --/CA CACACACACT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 CA 4 5 13410 CASAVA_Build 5 5695403 1I AACATCATCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1512 hom 22 6 10 6 A 11 12 13411 CASAVA_Build 5 5719510 1D ATCCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 737 hom 33 2 28 3 A 12 11 13412 CASAVA_Build 5 5723505 1D TACATGTGAG T/- TACATGGGGT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 2 1 13413 CASAVA_Build 5 5726610 1I AATAAATTGA -/T TAGGTGTCTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 1 2 13414 CASAVA_Build 5 5750922 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 770 hom 48 7 23 18 T 18 17 13415 CASAVA_Build 5 5802933 2D AAAGAAAGAC TT/-- TTTATCCAAA 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 5 3 13416 CASAVA_Build 5 5807223 1I CTTGGAGAAA -/G GGAGACTACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 2 3 13417 CASAVA_Build 5 5809808 3I CTTTTTGTTT ---/TTG TTTTGTTTTG 3070 hom 124 het 50 0 43 7 TTG 0 1 13418 CASAVA_Build 5 5858006 2I ATTGCAGACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 27 10 T 10 12 13419 CASAVA_Build 5 5862442 1D TGAGGACTGA C/- TCAGGAAGAC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 1 0 13420 CASAVA_Build 5 5874244 1I AGAGAGGCCA -/G GGGAGGCACT 3070 hom 116 het 45 0 39 6 G 3 4 13421 CASAVA_Build 5 5880929 4I TTTGTATATC ----/TTTG TTTGTCTTTG 3070 hom 135 het 49 0 45 4 TTTG 1 2 13422 CASAVA_Build 5 5884149 2I AACCAAGAAA --/AG AGAGAGAAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AG 3 4 13423 CASAVA_Build 5 5886028 1I CAGAAATAAA -/G CCAAATACTT 3070 hom 78 het 28 0 27 4 G 0 1 13424 CASAVA_Build 5 5890839 4D AAATATAGAT AGAA/---- AGACATTTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 4 AGAA 1 0 13425 CASAVA_Build 5 5912947 1D GAGGAGATGA C/- CTAGTTGTCA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 2 1 13426 CASAVA_Build 5 5920713 1D AATAACCCTG C/- CCTTTCAGAC 3070 hom 151 het 52 0 51 1 C 3 2 13427 CASAVA_Build 5 5931145 2I ATTTTACACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 38 0 30 8 A 11 13 13428 CASAVA_Build 5 5934357 1D ATGAACACAA T/- TTTGGATCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 3 13429 CASAVA_Build 5 5939359 4D AATGAAACAA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 60 het 25 0 18 8 TC 9 7 13430 CASAVA_Build 5 5941925 1I AAATTTAGGG -/T ATATTATATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 0 1 13431 CASAVA_Build 5 5957897 2D GTGTGTATAC AT/-- ATATATATAT 1060 het 618 hom 13 3 7 3 AT 8 7 13432 CASAVA_Build 5 5964934 4I GTGAGGAAGG ----/AAGA GTTACCAAAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 AAGA 0 1 13433 CASAVA_Build 5 5989167 1D TATTTATTTA T/- TTATATTTGA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 3 2 13434 CASAVA_Build 5 6014919 10D GGTTTCACCA GGGCAGAACC/---------- GGGCAGAACC 3070 het 3070 hom 48 16 19 21 GGGCAGAACC 2 1 13435 CASAVA_Build 5 6026038 1I GGAGGACTCA -/C CCAAAGCAGG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 2 3 13436 CASAVA_Build 5 6026658 1I GAAAGGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 499 hom 38 2 28 8 T 11 12 13437 CASAVA_Build 5 6029306 1I AGCAACATGA -/G AAGGTGGGCA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 G 0 1 13438 CASAVA_Build 5 6045361 3D TCAGTGTCTA TTG/--- TTCCCATCTT 3070 het 3070 ref 47 21 19 10 TTG 1 0 13439 CASAVA_Build 5 6054542 1I ACGAGGGGTG -/A AAGGTGATGG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 A 2 3 13440 CASAVA_Build 5 6056928 4I TGCAGGGTAG ----/CAAT CAGTCAGTTC 3070 hom 133 het 51 0 42 9 CAAT 0 1 13441 CASAVA_Build 5 6061834 2I ATGTGTGTGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 16 23 12 TG 8 9 13442 CASAVA_Build 5 6063478 1D TTTTAGAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 9 8 13443 CASAVA_Build 5 6064090 2I AAATTAGCAG --/AA AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 8 10 13444 CASAVA_Build 5 6065121 7D CTGTCAGTGG ATCTACC/------- ATTCTGGGGT 2892 het 2892 ref 19 9 9 6 ATCTACC 1 0 13445 CASAVA_Build 5 6066358 1D CAGTAGTAGT A/- AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 7 6 13446 CASAVA_Build 5 6067981 1I AAGAATTTCC -/A AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 A 6 7 13447 CASAVA_Build 5 6068654 3I TAATTTTTTT ---/TAA AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 TAA 0 1 13448 CASAVA_Build 5 6069280 1I AAAATAAAGC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 7 8 13449 CASAVA_Build 5 6070738 1I TAAATACCAT -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 6 7 13450 CASAVA_Build 5 6074293 1D ACACATCCAC A/- ACTATGGGTA 3070 het 3070 hom 43 12 26 5 A 2 1 13451 CASAVA_Build 5 6076391 1I CAAATACTTA -/T GTATACATCC 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 T 0 1 13452 CASAVA_Build 5 6076613 5I AAAAACTTAT -----/CAAAC CAAACACTCA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 CAAAC 1 2 13453 CASAVA_Build 5 6080099 1D AGGATGAGAG A/- AAAGCATGCG 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 A 4 3 13454 CASAVA_Build 5 6080413 2I29M26D GATTTATGTG --TGTGTGTGTACATATATATATATATATATATATATATATATATATGTACACACAC/TTTGTGTGTGTACACATATATATATATGTGT-------------------------- ACACACACAC 3070 het 168 hom 11 2 11 1 N/A 0 0 13455 CASAVA_Build 5 6081674 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1657 hom 48 6 25 17 A 14 15 13456 CASAVA_Build 5 6088082 2D CACACATTTC CA/-- CAGTCTCATT 3070 het 3070 hom 38 13 19 8 CA 2 1 13457 CASAVA_Build 5 6089495 10D TATTTGTGTT TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 848 hom 26 7 14 7 TG 14 9 13458 CASAVA_Build 5 6091896 1I CTGTTCAACA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 8 9 13459 CASAVA_Build 5 6093177 1D TATTATGTGC A/- ACAATTGTCT 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 A 2 1 13460 CASAVA_Build 5 6101280 2D ATGGTACATG CA/-- CACACACACA 1080 het 1080 ref 63 44 3 17 CA 8 7 13461 CASAVA_Build 5 6108810 1D CTGTTCGTAC T/- TATTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 2 1 13462 CASAVA_Build 5 6120737 1D GTTTCTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 11 8 A 13 12 13463 CASAVA_Build 5 6124972 3I CAAAGAATGG ---/TGA TGATGAGAAC 3070 hom 169 het 65 0 54 11 TGA 2 3 13464 CASAVA_Build 5 6134272 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 211 hom 85 4 64 17 AC 7 8 13465 CASAVA_Build 5 6150623 4D TCTATACTAA AAAT/---- AAATAAACCT 3070 hom 105 het 38 0 36 6 AAAT 2 1 13466 CASAVA_Build 5 6151744 1D AACCTCAGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 23 12 11 0 T 9 8 13467 CASAVA_Build 5 6159041 1D CTTAGGGCTT A/- AAAGGTCTGT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 4 3 13468 CASAVA_Build 5 6161036 1I GTTTATTGCT -/C CCTGCACTGT 3070 hom 108 het 44 0 35 9 C 2 3 13469 CASAVA_Build 5 6168138 3I TATTCCTCCA ---/CTT CTTCTCTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CTT 1 2 13470 CASAVA_Build 5 6175945 2I GTATGTGAGA --/TG TGTGTTGCAG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 TG 2 3 13471 CASAVA_Build 5 6176082 1I CACATGGCTA -/G GGGGGGCCTC 3070 hom 81 het 29 0 25 4 G 6 7 13472 CASAVA_Build 5 6183476 1I AATGACCATA -/C TGCCAAAAGC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 0 1 13473 CASAVA_Build 5 6185296 1I GAAATGATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 9 10 13474 CASAVA_Build 5 6185380 1D TCTAGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 12 11 13475 CASAVA_Build 5 6210084 4D TTAGACTGCC AGTA/---- AGTATTAAAT 3070 het 3070 ref 47 25 20 3 AGTA 2 1 13476 CASAVA_Build 5 6210734 4I ATTTATCTTA ----/AAAT TTCAATTAAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AAAT 0 1 13477 CASAVA_Build 5 6215189 1I TAGAGTGGAG -/A AAAAAATCCC 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 A 6 7 13478 CASAVA_Build 5 6216467 1I AATTATTTGC -/A AAAAAAAAAA 2347 het 2346 ref 20 8 7 5 A 11 12 13479 CASAVA_Build 5 6216833 1D CCTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 T 13 12 13480 CASAVA_Build 5 6222024 1I GATTAAAAAA -/T AATAATAATA 2963 hom 15 het 7 0 6 1 T 0 1 13481 CASAVA_Build 5 6224249 1I TGTTCATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 29 0 24 5 A 11 12 13482 CASAVA_Build 5 6225245 3D GCATAAGAAA AAT/--- AAAATACTTG 3070 hom 54 het 20 0 19 3 AAT 1 0 13483 CASAVA_Build 5 6236537 1D TCATAATGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 59 het 47 1 33 13 T 10 9 13484 CASAVA_Build 5 6243059 4D AAACAAAACA AAAG/---- ACCTTGATGA 3070 hom 114 het 40 0 38 5 AAAG 1 0 13485 CASAVA_Build 5 6256720 4D TGATTTTATT AAAC/---- AGTCACCAGC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 AAAC 1 0 13486 CASAVA_Build 5 6280365 6D ATGTAGACTG GTATTT/------ GACCAAATGT 3070 hom 124 het 44 0 38 7 GTATTT 1 0 13487 CASAVA_Build 5 6296815 2D CCTCCACAAC AG/-- AGAGACAAAT 3070 hom 121 het 48 0 37 13 AG 3 2 13488 CASAVA_Build 5 6313945 18D GTTCCTCCTT GGATCCCTGTTCCTCCTC/------------------ GGATCCCTGT 3070 het 3070 hom 41 17 18 13 GGATCCCTGTTCCTCCTC 2 1 13489 CASAVA_Build 5 6332477 1I GAAAGGTTCT -/C GCCCTCAACA 3070 hom 152 het 58 0 49 9 C 0 1 13490 CASAVA_Build 5 6353244 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2242 hom 18 5 12 1 A 11 10 13491 CASAVA_Build 5 6355994 2I TATGCAACTG --/CC CCCCCCCCAG 2788 het 2788 ref 29 15 9 5 C 8 10 13492 CASAVA_Build 5 6357592 1D TTCAAGGCAA G/- GTCCAGAGGA 2540 het 2540 ref 25 14 7 5 G 2 1 13493 CASAVA_Build 5 6358289 5D TACTTAGGTG ATAAA/----- ATAAATTAAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 ATAAA 2 1 13494 CASAVA_Build 5 6366915 1I TCTTGGGGGC -/T CCCACATCCT 2015 het 2015 ref 45 26 6 13 T 0 1 13495 CASAVA_Build 5 6375304 17D CAGTTGGAGC ACAGTCTCACAGTGGGA/----------------- ACAGTCTCAC 3070 het 3070 hom 61 19 36 16 ACAGTCTCACAGTGGGA 1 0 13496 CASAVA_Build 5 6378803 2D TGTATATTTT TG/-- TTTTTATTTC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 TG 1 0 13497 CASAVA_Build 5 6394854 5D TTTTTGTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 47 20 12 16 TTTGT 3 2 13498 CASAVA_Build 5 6401306 3D GGCAGCTTAA AAC/--- AACAGAAATG 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 AAC 2 1 13499 CASAVA_Build 5 6421037 8D GTTATTGCTT GAATATAA/-------- TGTAAAATTT 3070 het 3070 ref 41 24 16 2 GAATATAA 1 0 13500 CASAVA_Build 5 6439314 1D CTTCTTTACC T/- TTTTTTTTTT 2148 het 2148 ref 29 14 7 8 T 13 12 13501 CASAVA_Build 5 6440175 1I TGTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 1580 het 1580 ref 29 12 8 9 T 13 14 13502 CASAVA_Build 5 6448792 1I ATACTATCCT -/A TTTATGCACT 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 A 0 1 13503 CASAVA_Build 5 6453435 2D ACGTGAGAGA GT/-- GTGTGTGTGA 3070 het 3070 hom 50 19 22 10 GT 5 4 13504 CASAVA_Build 5 6467086 2D ATGAAGTTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 27 0 14 13 T 12 10 13505 CASAVA_Build 5 6485485 1I CCAAATGTGG -/A GGAGCCCTGC 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 0 1 13506 CASAVA_Build 5 6488838 3I CCACTGGTGG ---/TTC TTCTTCTCAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 TTC 2 3 13507 CASAVA_Build 5 6490841 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2931 het 212 hom 23 3 8 12 T 15 14 13508 CASAVA_Build 5 6498042 1I TCGGTAATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 9 10 13509 CASAVA_Build 5 6499732 4I AACAAAAAAC ----/ACAA ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 ACAA 3 4 13510 CASAVA_Build 5 6500297 9D CTCGGCCGCA CACACACAC/--------- CACACACACC 3070 het 3070 ref 58 19 13 28 CACACACAC 2 1 13511 CASAVA_Build 5 6500430 4I ACCGCACACA ----/CACT CACACACACA 3070 hom 93 het 68 0 41 27 CACT 0 1 13512 CASAVA_Build 5 6504362 1I GAAATGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 11 12 13513 CASAVA_Build 5 6520783 1I ATGAGTTTGT -/G TCATTTGTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 0 1 13514 CASAVA_Build 5 6528534 4D CTTTGTCTAC ACTG/---- ACTAAGCTAT 3070 het 3070 ref 50 27 19 8 ACTG 1 0 13515 CASAVA_Build 5 6531736 1D TCTCTTTCGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2582 hom 41 11 16 15 T 13 12 13516 CASAVA_Build 5 6540712 5D CAAAGGAAAT ATCTC/----- AGACTAGATT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 ATCTC 1 0 13517 CASAVA_Build 5 6541920 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 11 12 13518 CASAVA_Build 5 6545542 1D TATTTAATCT C/- CCCCACGGTT 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 C 5 4 13519 CASAVA_Build 5 6546843 1I GATGTAAAAC -/T TCTACCATTG 3070 het 3070 ref 63 38 21 4 T 1 2 13520 CASAVA_Build 5 6549786 3D AAAAAAAAAC AAT/--- GATTCTAGAA 3070 het 3070 ref 50 22 23 6 AAT 1 0 13521 CASAVA_Build 5 6550857 8D TGGAGATGGA AGTGTGCC/-------- AAATCACAAA 3070 het 3070 ref 43 22 22 3 AGTGTGCC 1 0 13522 CASAVA_Build 5 6558575 1I TAACCACGAG -/A AAACATTGCT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 3 4 13523 CASAVA_Build 5 6566198 1I AAGTTGGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 A 9 10 13524 CASAVA_Build 5 6569617 1D AAACCCAGGA C/- CCCCCCCCCG 3070 het 1233 hom 30 5 12 13 C 10 9 13525 CASAVA_Build 5 6575976 2D AGAGGGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 42 16 15 13 AG 6 5 13526 CASAVA_Build 5 6610228 1D AACTTGGTGC G/- GGGAGGAAGC 3070 het 2718 hom 28 8 13 8 G 4 3 13527 CASAVA_Build 5 6617480 1D CCTGAACATA T/- TTTTTTTTTT 2454 het 468 hom 16 3 8 5 T 17 16 13528 CASAVA_Build 5 6622514 2D ATAGTGTCTC GT/-- GTGTGTGTGT 1076 het 1076 ref 48 34 3 12 GT 9 8 13529 CASAVA_Build 5 6628562 4I GTGTCTTAAA ----/AAAG AAAGTAGGCT 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 AAAG 1 2 13530 CASAVA_Build 5 6638905 5I AAATCCAGAA -----/ACTTC ACTCTAGAGA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 ACTTC 0 1 13531 CASAVA_Build 5 6643829 1I AAAGAATGAC -/G CTCCTTATGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 0 1 13532 CASAVA_Build 5 6644211 1D AACCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 20 1 19 0 A 12 11 13533 CASAVA_Build 5 6646531 3I AGCATTTGCT ---/CTG CTACTTGAGA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 CTG 0 1 13534 CASAVA_Build 5 6648333 4I CAGGTATGTC ----/TGTA TGTATTAGCA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TGTA 1 2 13535 CASAVA_Build 5 6650530 3I GCGAAAACTC ---/CTT CTTCAGCTGA 3070 hom 91 het 47 0 37 10 CTT 1 2 13536 CASAVA_Build 5 6650797 2I AGGCTGCTCT --/CA GTGTCTGGTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 CA 0 1 13537 CASAVA_Build 5 6653493 1I6M1D ATTTCATCTG -GATCCGA/TGATCCG- GGGGTAGGTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 9 N/A 0 0 13538 CASAVA_Build 5 6654450 1D TTTGTTCAAA C/- TCTCGTTAAA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 C 1 0 13539 CASAVA_Build 5 6657534 1D GTGGAACCCA C/- CCCCCCCTAG 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 C 8 7 13540 CASAVA_Build 5 6658971 1D CCACACCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 13 11 5 T 9 8 13541 CASAVA_Build 5 6659811 3D TAAAAAGGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1887 hom 24 6 16 2 A 15 12 13542 CASAVA_Build 5 6660126 3D TGCAACATGG AAC/--- GGTTTGCGGC 3070 het 3070 hom 56 24 27 7 AAC 1 0 13543 CASAVA_Build 5 6668729 1D ACCGTGAAGG C/- CATCAACAAC 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 C 2 1 13544 CASAVA_Build 5 6676969 2D ACTCCCTGCC CT/-- CTGTCTTCTC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 CT 2 1 13545 CASAVA_Build 5 6677922 7D GGTAGTAGTT TAGAAAA/------- TAGGAAGGAC 3070 het 3070 ref 36 18 17 5 TAGAAAA 1 0 13546 CASAVA_Build 5 6685325 1I CCTACCGTTA -/T AGTTTTACTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 0 1 13547 CASAVA_Build 5 6690869 2I GCCCAGAGTG --/CA CACAGTCAGA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 CA 2 3 13548 CASAVA_Build 5 6695331 2I TGTTCCTCTC --/TT AGTGTTGATC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 0 2 13549 CASAVA_Build 5 6696149 1I TTGTAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 40 1 30 9 T 10 11 13550 CASAVA_Build 5 6701386 3D TGCTCTCCTC GAG/--- GAGTATCTTT 2335 het 2335 ref 15 9 5 1 GAG 2 1 13551 CASAVA_Build 5 6707175 2D TAATAATATA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 1888 hom 20 6 13 1 T 11 9 13552 CASAVA_Build 5 6712616 3D TGAAGTCCAT GAA/--- GAAGAAATCC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 GAA 3 2 13553 CASAVA_Build 5 6734963 4D TGTGTGTGTG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 77 hom 54 4 24 28 GT 10 8 13554 CASAVA_Build 5 6735898 2I CCCCCCCTTA --/AG AGAACCAATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AG 1 2 13555 CASAVA_Build 5 6743067 1D TCCCTAATTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 9 8 13556 CASAVA_Build 5 6744528 5D TATTTGTAGG TATTT/----- TATTTTATGA 3070 het 3070 hom 21 10 10 5 TATTT 2 1 13557 CASAVA_Build 5 6744676 1I ATTTGAATAC -/T TGTGTAGACT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 1 2 13558 CASAVA_Build 5 6746636 1I CTGGTAAATG -/T TTTCACATGC 3070 het 2750 hom 24 6 15 3 T 3 4 13559 CASAVA_Build 5 6775820 1I TTGGTTAAGG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 T 7 8 13560 CASAVA_Build 5 6776169 2D TCTATTTGAA AC/-- AGTGTTTGAT 3070 het 3070 ref 23 12 10 4 AC 1 0 13561 CASAVA_Build 5 6776513 2I ATTGTGGCTC --/AT GTGTGTGGGG 3070 hom 147 het 57 0 49 8 AT 0 1 13562 CASAVA_Build 5 6783209 1D TGTTTCTCCG C/- CCCCCCCCGG 3070 hom 57 het 23 0 20 5 C 9 8 13563 CASAVA_Build 5 6786825 1D TGTGGCAGAC T/- TTTTGGAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 5 4 13564 CASAVA_Build 5 6793705 2D GGGCATTCAC AT/-- GTTTCTCATT 3070 het 3070 ref 46 22 15 11 AT 1 0 13565 CASAVA_Build 5 6811421 1I AGCCTCTCCA -/G GGGGCAGAGC 3070 hom 63 het 26 0 20 6 G 4 5 13566 CASAVA_Build 5 6815726 5I GAAAATACAC -----/AAAAT AAAAGCGCAC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 AAAAT 0 1 13567 CASAVA_Build 5 6822341 1I GTCAGCTACA -/G GGATACTCTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 2 3 13568 CASAVA_Build 5 6824496 2D GCTCTTGGCA GT/-- GTGTGTGTGT 1379 het 1379 ref 51 33 4 14 GT 10 9 13569 CASAVA_Build 5 6830878 1D GTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1021 het 1021 ref 30 16 4 10 T 13 12 13570 CASAVA_Build 5 6844700 1D GTTGAGACCT A/- GTAACTGTTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 1 0 13571 CASAVA_Build 5 6845266 4I AGAGGATTAC ----/TTAA TTCTTTTGAT 3070 het 3070 ref 43 21 12 10 TTAA 0 1 13572 CASAVA_Build 5 6876886 1I CTAGTACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 997 hom 37 3 26 8 A 12 13 13573 CASAVA_Build 5 6878834 1D AATTTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2321 hom 26 6 12 8 T 13 12 13574 CASAVA_Build 5 6888942 3D TATTTTGGGG GTT/--- GTTTAATCAG 3070 het 3070 ref 23 11 10 5 GTT 2 1 13575 CASAVA_Build 5 6903303 3D GCAAAGGACA GAT/--- GATGGTGTGA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 GAT 2 1 13576 CASAVA_Build 5 6922642 4D TGTGGGTGAG TGTA/---- TGAAAGTATG 3070 het 3070 hom 81 36 43 5 TGTA 1 0 13577 CASAVA_Build 5 6925422 4D ACATCAACTC ACTG/---- GCCACCAGAA 3070 hom 78 het 27 0 24 3 ACTG 1 0 13578 CASAVA_Build 5 6937268 3I TTACATTCTA ---/GTT GTTGTTGTTT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 GTT 3 4 13579 CASAVA_Build 5 6944625 3D TATTTCCAAT GAG/--- TAACAGCCAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 GAG 1 0 13580 CASAVA_Build 5 6949977 5I AATGAAAAAT -----/ATCTC AGCAGGAACT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 ATCTC 0 1 13581 CASAVA_Build 5 6950448 2D AATCCTAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 12 10 13582 CASAVA_Build 5 6950854 2D ATAAGGAAGA CT/-- CTAAAAGCTA 3070 het 3070 hom 47 21 23 6 CT 2 1 13583 CASAVA_Build 5 6951985 1I GAGACTTTAT -/A AAAAAAAAAA 2540 hom 38 het 16 0 12 4 A 13 14 13584 CASAVA_Build 5 6952244 5I ATATGTGTAA -----/CATAT TATATATTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 CATAT 0 1 13585 CASAVA_Build 5 6954875 1D TAGATTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 A 13 12 13586 CASAVA_Build 5 6959907 1D TGGAAAGGGA G/- GCCAGCTGCG 2802 het 2802 ref 21 9 9 3 G 2 1 13587 CASAVA_Build 5 6960190 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 29 1 17 12 A 16 15 13588 CASAVA_Build 5 6961742 4D TTTACTTTTG TTTC/---- TTTCTTCTTT 3070 het 3009 hom 27 12 12 3 TTTC 2 1 13589 CASAVA_Build 5 6963975 1I TTAAAGACTC -/T TATGTAAGAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 1 2 13590 CASAVA_Build 5 6988247 4I GCTATTATTC ----/TTTG TTTTAGTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TTTG 0 1 13591 CASAVA_Build 5 6998097 1D GTTCATCCAG T/- TTTATAATGA 3070 het 3070 ref 52 30 16 7 T 4 3 13592 CASAVA_Build 5 7006141 7I TGACTGTTAG -------/AAGAAAA ACTAACAAAC 3070 hom 45 het 20 0 15 5 AAGAAAA 0 1 13593 CASAVA_Build 5 7011009 3D CAGGATAAAG AAA/--- ATGTGGCACA 3070 het 3070 hom 29 13 16 1 A 4 1 13594 CASAVA_Build 5 7014544 4D TCACAAATGT ACAA/---- ACACAGACAC 3070 het 3070 hom 68 19 38 14 ACAA 1 0 13595 CASAVA_Build 5 7014578 4D ACAAGCACAC ACAA/---- ACACACACAA 3070 het 2188 hom 62 9 29 24 ACAA 1 0 13596 CASAVA_Build 5 7014950 1I CCACAACCAT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 8 13597 CASAVA_Build 5 7016976 1I GGTGTATCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 215 hom 42 1 32 9 T 9 10 13598 CASAVA_Build 5 7018765 3D CAGTAGTCAA TCT/--- TCTTATTATC 2897 het 2897 ref 23 15 6 3 TCT 2 1 13599 CASAVA_Build 5 7024777 15D AAGTATAATA AAAAAAAAAAAAAAG/--------------- AAAAAAGAAA 2665 het 587 hom 8 3 7 1 AAAAAAAAAAAAAAG 1 0 13600 CASAVA_Build 5 7025758 1D AAATAAATGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 9 8 13601 CASAVA_Build 5 7031553 1I GGGTGTGTGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 8 9 13602 CASAVA_Build 5 7039397 2D AAGTGAGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 2790 het 2126 hom 15 6 6 3 CT 2 1 13603 CASAVA_Build 5 7039754 1D GCAGAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2804 hom 34 7 12 16 A 11 10 13604 CASAVA_Build 5 7045124 2D AGATTTTAGT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 11 11 7 TA 6 5 13605 CASAVA_Build 5 7045454 4D TACCCTTGCG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 111 het 43 0 38 8 TA 7 5 13606 CASAVA_Build 5 7046478 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 2851 hom 16 6 10 0 T 8 7 13607 CASAVA_Build 5 7046539 1D GTCTTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 2759 het 2759 ref 18 9 6 3 A 11 10 13608 CASAVA_Build 5 7047016 1I GTTTTTTATA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 8 9 13609 CASAVA_Build 5 7048120 4D CATTGTAAAG TATT/---- TATTCTGTAA 3070 het 3070 hom 35 13 21 3 TATT 2 1 13610 CASAVA_Build 5 7049464 1D TTCCTTGCTA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 7 6 13611 CASAVA_Build 5 7057781 1I ATTTAGTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 A 10 11 13612 CASAVA_Build 5 7072443 1I AGATGATTTT -/C CCCCACTCGG 3070 het 3070 ref 55 25 19 11 C 4 5 13613 CASAVA_Build 5 7074526 3D TCTGAAAGAG ATT/--- GGAATAGAGA 3070 het 3070 hom 39 15 23 2 ATT 1 0 13614 CASAVA_Build 5 7086039 4I AGTATAACTC ----/AAAG CAGAAAGGGG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AAAG 0 1 13615 CASAVA_Build 5 7089522 1D CCTTGTCCTT G/- GTTGTGAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 G 2 1 13616 CASAVA_Build 5 7099658 1I TTAATATGAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 7 8 13617 CASAVA_Build 5 7105554 1D CATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 T 12 11 13618 CASAVA_Build 5 7107823 1I ATCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 1113 het 1113 ref 9 6 3 0 T 9 10 13619 CASAVA_Build 5 7117929 1I AAAACTGGAA -/T TTTTTTTTTT 1959 het 654 hom 19 4 6 9 T 16 17 13620 CASAVA_Build 5 7118158 1I TTTTCATATA -/T TTTAATAATT 532 het 532 ref 20 16 2 2 T 3 4 13621 CASAVA_Build 5 7124877 1I CATGCTCCCG -/C TTCAGCCTCT 3070 het 3070 hom 28 12 16 0 C 0 1 13622 CASAVA_Build 5 7124958 1D GAACAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2890 hom 25 9 11 5 A 14 13 13623 CASAVA_Build 5 7137065 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 6 5 13624 CASAVA_Build 5 7155963 2D ACAAGACTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 35 0 27 9 A 12 10 13625 CASAVA_Build 5 7163782 11D AGCCTGAAGA GACTAACACCC/----------- AACTACAGCA 3070 het 3070 ref 27 13 14 4 GACTAACACCC 1 0 13626 CASAVA_Build 5 7164308 4D CAATTCACAA TAGT/---- TAGTCATTAC 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 TAGT 2 1 13627 CASAVA_Build 5 7166481 2D CACCATTCTA CT/-- CTCTGCTTCT 3070 het 3070 ref 47 21 18 9 CT 3 2 13628 CASAVA_Build 5 7167734 20I TGTGTGTATC --------------------/TATATGTGTGTGTGTATCTA TATATGTGTG 3070 hom 111 het 39 0 38 3 TATATGTGTGTGTGTATCTA 0 1 13629 CASAVA_Build 5 7168778 3D TCCGTTTGTT ATC/--- ATCTACTGGT 3070 hom 147 het 53 0 49 5 ATC 2 1 13630 CASAVA_Build 5 7173258 1I ACCCTTGTTG -/T CATGAGAATC 3070 hom 130 het 45 0 44 1 T 0 1 13631 CASAVA_Build 5 7192545 2I ATATATTGTG --/TA TATATATATA 1194 hom 10 het 6 0 4 2 TA 6 7 13632 CASAVA_Build 5 7193527 1I AGCTTAGTAT -/A AAAATGCAGA 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 A 4 5 13633 CASAVA_Build 5 7203488 1D GTGGTGAACA G/- GGGTTTGTAC 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 G 4 3 13634 CASAVA_Build 5 7205049 1I ATCCAGCTAA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 6 7 13635 CASAVA_Build 5 7205682 6D47M3I AGAAAGTTGG TTTAACTTTAATTTTTTAACCAGAATGTGTAAACTGAGCCAATTGAGATGTCT---/------TTTAATTTTTTAACCAGAATGTGTAAACTGAGCCAATTGAGATGTCTATA ATGTTGGCTA 3070 het 3070 hom 31 10 12 26 N/A 0 0 13636 CASAVA_Build 5 7209737 1I TGTCTATCTC -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 7 8 13637 CASAVA_Build 5 7211223 1I AGAAGCTGAC -/T TTTTTTATTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 6 7 13638 CASAVA_Build 5 7211303 1I TGACTGTTAA -/T TGTATGTTGT 1622 het 1622 ref 24 16 4 4 T 1 2 13639 CASAVA_Build 5 7211527 1I GATGATGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 13 14 13640 CASAVA_Build 5 7214638 4I TTCCTTTGCG ----/TTTT TTTCTCTAAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 3 7 13641 CASAVA_Build 5 7215601 2D CCTTTCTTTC AG/-- AGATGCCCTG 2935 het 2935 ref 21 9 8 4 AG 2 1 13642 CASAVA_Build 5 7215966 1D TTGGGGTATG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 8 7 13643 CASAVA_Build 5 7221691 1D TCTTTTTAAA C/- CCCTAAGGGA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 C 4 3 13644 CASAVA_Build 5 7231710 2D CCAGATTAAC AT/-- AGAATATTCT 3070 het 3070 ref 27 13 11 6 AT 1 0 13645 CASAVA_Build 5 7243354 4D CCTGAGAGTT TCTG/---- TCTGACCTTC 3070 het 3070 ref 51 23 23 7 TCTG 2 1 13646 CASAVA_Build 5 7245076 1D AAGAGAGGCC A/- AAAAAACTAG 3070 het 3070 hom 51 17 27 7 A 7 6 13647 CASAVA_Build 5 7254663 3I GAAAAAAGAA ---/AAG AAGAAGAACA 3070 het 1810 hom 30 6 20 4 AAG 2 3 13648 CASAVA_Build 5 7270289 1I AATTTTACCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 T 8 9 13649 CASAVA_Build 5 7271399 4I TCCCCTTGAC ----/CAGT CAGTCATGTG 3070 het 3070 hom 54 16 22 16 CAGT 1 2 13650 CASAVA_Build 5 7272829 1D CAATATAAGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 24 7 15 4 A 8 7 13651 CASAVA_Build 5 7279282 1I TTTCAGTAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 T 7 8 13652 CASAVA_Build 5 7281425 2D AAATAAAGGA TT/-- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 35 9 22 4 T 9 7 13653 CASAVA_Build 5 7289896 1I ATAGTTCCCT -/A AAAAAAAAAA 2136 het 1397 hom 11 3 5 3 A 13 14 13654 CASAVA_Build 5 7293203 3I AAGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 2532 het 2532 ref 16 7 6 3 AGG 0 1 13655 CASAVA_Build 5 7294024 3I TCTTCTGTAA ---/CTG CTATTATCTT 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 CTG 0 1 13656 CASAVA_Build 5 7299830 3I GAAGGGTAGG ---/AGA AGGAGGAAGG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 AGA 0 1 13657 CASAVA_Build 5 7307592 3D AATTAGTAGT TAA/--- TAATAAGGAC 3070 het 3070 hom 36 12 23 1 TAA 3 2 13658 CASAVA_Build 5 7310955 1I TTTGATCTAA -/G GGGGGGGCAT 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 G 7 8 13659 CASAVA_Build 5 7315420 1D ATTTGACAGT A/- AAAAAGAATG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 6 5 13660 CASAVA_Build 5 7327876 2D GCTAAATAAC AT/-- AATGGACACA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 AT 1 0 13661 CASAVA_Build 5 7334036 1D TTGATATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 T 13 12 13662 CASAVA_Build 5 7339220 1D CCAAAAACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 26 1 15 10 A 12 11 13663 CASAVA_Build 5 7340040 6D AAAAATTATG TATATA/------ TATATATATA 1775 hom 12 het 7 0 4 3 TA 11 8 13664 CASAVA_Build 5 7343820 1I TCTGTCTCCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 1319 hom 20 4 10 6 T 8 9 13665 CASAVA_Build 5 7344453 4I GAGAGAAAAG ----/AGTT AGTTCAGTTG 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 AGTT 1 2 13666 CASAVA_Build 5 7344683 1D ACTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2743 het 2743 ref 26 14 7 6 T 11 10 13667 CASAVA_Build 5 7349375 2D TCTGAATGAC AA/-- AGAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 3 1 13668 CASAVA_Build 5 7352600 1D CAGGTAGAAA T/- TTTTTTTTTT 2128 het 820 hom 24 5 8 11 T 19 18 13669 CASAVA_Build 5 7360167 1I GATTGTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 13 14 13670 CASAVA_Build 5 7361706 3I AATGTTTCTT ---/CTC CTATTTCTGA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 CTC 0 1 13671 CASAVA_Build 5 7362559 1D AGTCTTGGAA C/- CGCCAAACCT 3070 het 3070 ref 57 30 21 7 C 2 1 13672 CASAVA_Build 5 7364427 1D AGACAGGGTC T/- TGCTCTGTTA 3070 het 3070 hom 58 23 29 8 T 2 1 13673 CASAVA_Build 5 7389985 3I AGAGAGGCTT ---/TAA TAGTTCAGTT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 TAA 0 1 13674 CASAVA_Build 5 7392389 4D TGGGTATGGG ATTT/---- ATTTATTTCT 3070 hom 141 het 51 0 46 6 ATTT 3 2 13675 CASAVA_Build 5 7398189 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 41 het 15 0 13 2 G 4 5 13676 CASAVA_Build 5 7402964 1I TGCATGTAGG -/T TCCTGCTTCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 2 13677 CASAVA_Build 5 7407199 1D TAAAACGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 10 9 13678 CASAVA_Build 5 7413149 15I ACAATAGGAA ---------------/GACATTTTCTCACCT GATTGGAAGC 3070 het 3070 ref 49 24 23 2 GACATTTTCTCACCT 0 1 13679 CASAVA_Build 5 7417587 2I TAATGGGGTT --/AA AAACATCTTT 3070 het 3070 ref 54 29 18 7 A 3 5 13680 CASAVA_Build 5 7419307 2D CAGTTCTCAC TG/-- TGTTATACGA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TG 2 1 13681 CASAVA_Build 5 7427870 1D TGTGGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 12 11 13682 CASAVA_Build 5 7430211 1D TCCTAGAATT G/- GGGGGGTGAC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 G 7 6 13683 CASAVA_Build 5 7430688 3D CCACAATTGG GAT/--- GATATCTTAT 3070 het 3070 hom 48 22 23 6 GAT 2 1 13684 CASAVA_Build 5 7446533 1D TGAGTGAATT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 8 7 13685 CASAVA_Build 5 7453213 1I GTTGACATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 T 9 10 13686 CASAVA_Build 5 7458417 1D TGAACTACTC T/- TTTTTTTTTT 1481 het 1481 ref 40 17 5 18 T 17 16 13687 CASAVA_Build 5 7466402 1D AGCCTTGGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1203 hom 32 8 12 13 T 10 9 13688 CASAVA_Build 5 7468081 22D ACAAGGTATA TGTATTTATATCTGTATGTATG/---------------------- TGTATTTATA 3070 het 3070 hom 40 15 16 15 TGTATTTATATCTGTATGTATG 2 1 13689 CASAVA_Build 5 7483636 2I TGTGTGTATG --/TA TATATATATA 1999 hom 15 het 12 0 6 6 TA 6 7 13690 CASAVA_Build 5 7484643 2D GGGAACTATT AA/-- AAAAAAAAAC 1337 het 153 hom 30 2 4 25 A 11 9 13691 CASAVA_Build 5 7486030 3D GCTTATTGTA CTG/--- CATGATGTAC 3070 het 3070 hom 69 18 17 35 CTG 1 0 13692 CASAVA_Build 5 7493027 1D GTGAAGAATT C/- CGGGGGTGAG 3070 hom 96 het 37 0 33 5 C 2 1 13693 CASAVA_Build 5 7530312 1I GGACTTGATG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 T 8 9 13694 CASAVA_Build 5 7532747 1D ACAATTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 T 12 11 13695 CASAVA_Build 5 7564695 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 2109 hom 16 6 8 2 A 9 8 13696 CASAVA_Build 5 7575598 10I AGAGCCTCTC ----------/CTGAGGGTAT CTGTGGGGCA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 CTGAGGGTAT 0 1 13697 CASAVA_Build 5 7576039 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 26 0 20 7 A 10 9 13698 CASAVA_Build 5 7580075 1D AGCCCTTAGT A/- AATTCATGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 3 2 13699 CASAVA_Build 5 7582358 8I GGAATGAGGA --------/AATGAGGG CTTAATGAAA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 AATGAGGG 0 1 13700 CASAVA_Build 5 7590138 2D TTTAATTCTG TA/-- TATCCTATAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TA 2 1 13701 CASAVA_Build 5 7593412 1I GTAACAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 A 11 12 13702 CASAVA_Build 5 7623113 1D CTTACATATC T/- TTTAAACCAG 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 4 3 13703 CASAVA_Build 5 7624203 4D GGAATCTATT AGTC/---- AGGGTTCTCT 3070 het 3070 ref 30 18 8 8 AGTC 1 0 13704 CASAVA_Build 5 7634631 5I TACAGAAGGA -----/AAGAG AAAAGTAGAG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 AAGAG 0 1 13705 CASAVA_Build 5 7645657 1I GGGGAACTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 9 10 13706 CASAVA_Build 5 7649389 1D TCCAAAAACT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 816 hom 26 8 11 7 C 10 9 13707 CASAVA_Build 5 7707098 3D AGAGCTGTTG AGA/--- AGACCAGTGG 3070 het 3070 ref 30 15 15 0 AGA 2 1 13708 CASAVA_Build 5 7713901 1I ATCACATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 34 8 A 10 11 13709 CASAVA_Build 5 7716103 4D CAGTGAAATT CATA/---- CATTCATTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 5 CATA 1 0 13710 CASAVA_Build 5 7727197 2I TCTCAGCGTG --/TC TGTCGTCAGC 3070 hom 98 het 37 0 28 9 TC 0 1 13711 CASAVA_Build 5 7727761 1D CCCACTTTGT G/- GGTATTCAGA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 G 3 2 13712 CASAVA_Build 5 7729630 1D AACATGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 27 1 24 2 A 10 9 13713 CASAVA_Build 5 7741165 4D CTGGGATTTC CAAA/---- TAGATAGCCT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 CAAA 1 0 13714 CASAVA_Build 5 7741548 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTAT 3056 hom 21 het 9 0 8 1 T 8 9 13715 CASAVA_Build 5 7753614 1D TATCCTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 149 hom 28 2 14 12 T 14 13 13716 CASAVA_Build 5 7777522 1D GCATCACGTG T/- TTTTTTTTTT 2774 het 1438 hom 35 10 11 14 T 17 16 13717 CASAVA_Build 5 7783956 1D GGGGGCGGTA T/- TTTCACTATA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 4 3 13718 CASAVA_Build 5 7794732 5D CACCATCACC ATCAT/----- TATCACCATC 2210 het 2210 ref 68 59 5 9 ATCAT 1 0 13719 CASAVA_Build 5 7794873 4I CACCATCCCT ----/ATCA ATCACTGTCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 ATCA 1 2 13720 CASAVA_Build 5 7795026 3I ATCACCTGTT ---/ATC ATCATCACCA 3070 hom 182 het 69 0 61 8 ATC 2 3 13721 CASAVA_Build 5 7800084 1I13M3I CAAAATAGGC -AAAAAAAATGGTG---/AAAAAAAAATGGTGATA ATGATGAATT 3070 het 3070 hom 41 18 20 7 N/A 0 0 13722 CASAVA_Build 5 7806008 2D AGGATTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 901 het 410 hom 29 7 3 19 T 20 18 13723 CASAVA_Build 5 7807844 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 9 13724 CASAVA_Build 5 7811839 9D16M1D CATGAGGGGA AGGGAGAGCAGGGCCTGCTCGATGGA/---------AGGGCCTGCTCGATGG- ATCCTGGAGG 3070 hom 69 het 18 0 19 7 N/A 0 0 13725 CASAVA_Build 5 7815840 1D TTTCTCCGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3039 hom 34 10 15 9 T 11 10 13726 CASAVA_Build 5 7821150 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 17 5 A 11 12 13727 CASAVA_Build 5 7825856 1I CTTTGGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1091 hom 38 3 27 8 T 11 12 13728 CASAVA_Build 5 7832688 1D CCCAGTCCAA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 12 hom 39 1 22 16 C 10 9 13729 CASAVA_Build 5 7840796 4D GGTAGGTAGG TAGA/---- TAGATAGGTA 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 TAGA 2 1 13730 CASAVA_Build 5 7841158 1D CACTGATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 34 0 30 5 T 11 10 13731 CASAVA_Build 5 7843326 1I AAACCATGCC -/T TCCCACACGC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 1 2 13732 CASAVA_Build 5 7844156 1D TTCTGGTCAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 9 8 13733 CASAVA_Build 5 7847695 4D AGTGAGTCTC AGAA/---- AGGGAGAGTT 3070 het 3070 hom 41 13 19 12 AGAA 1 0 13734 CASAVA_Build 5 7850950 1I ACTTCCAGCC -/T TGTGAACAGG 3070 hom 129 het 48 0 40 8 T 1 2 13735 CASAVA_Build 5 7851293 20I CTCCACAGAG --------------------/AAACTCAAAGAAATAGCCCA AAAGCCCGGA 3070 hom 81 het 31 0 26 6 AAACTCAAAGAAATAGCCCA 0 1 13736 CASAVA_Build 5 7875840 2D TGTACATGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 44 het 48 1 41 6 TG 9 8 13737 CASAVA_Build 5 7879649 3D CGCTGAATTA AAC/--- AACATTGTCC 3070 hom 159 het 59 0 52 8 AAC 2 1 13738 CASAVA_Build 5 7882666 1D TGGCTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 36 1 25 11 A 12 11 13739 CASAVA_Build 5 7883205 5D AAAAAAAAAG AAAAA/----- AAAGAAAAAG 3070 hom 68 het 26 0 24 5 A 8 3 13740 CASAVA_Build 5 7886604 4D CACATATATA ATAG/---- ATACATACAC 3070 hom 156 het 53 0 52 6 ATAG 1 0 13741 CASAVA_Build 5 7891444 1D TGAAAACTTT A/- AAAAAAACAT 3070 hom 79 het 35 0 31 4 A 8 7 13742 CASAVA_Build 5 7895427 1D TACAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 28 9 A 13 12 13743 CASAVA_Build 5 7900558 1I CATTAGAGCA -/G GGGGTGGGAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 4 5 13744 CASAVA_Build 5 7908534 1I ATTCCAGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 17 1 13 3 A 12 13 13745 CASAVA_Build 5 7909983 2D GCACATTCCT CA/-- CATAGAGGAA 3070 het 2983 hom 34 8 19 7 CA 2 1 13746 CASAVA_Build 5 7919442 5D AAAAAAAAAA GATAC/----- AGTTGCTCAC 3070 het 1742 hom 37 7 18 15 GATAC 1 0 13747 CASAVA_Build 5 7924264 3D GTAACAACTC CTT/--- AACTGTAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CTT 1 0 13748 CASAVA_Build 5 7925119 1D GAATGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 48 1 41 7 T 11 10 13749 CASAVA_Build 5 7927502 1I GTATTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 10 11 13750 CASAVA_Build 5 7929296 1I GCTGAACTCA -/C CCCTGTGCCC 3070 hom 148 het 54 0 50 4 C 3 4 13751 CASAVA_Build 5 7933251 7D TAATTGCATA GGGCATG/------- GGTCTTACCA 3070 het 3070 ref 48 27 19 6 GGGCATG 1 0 13752 CASAVA_Build 5 7938783 1I GTATAATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 30 0 14 16 T 12 13 13753 CASAVA_Build 5 7939586 1D GAATTTTTTT G/- GCTGAATAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 7 G 2 1 13754 CASAVA_Build 5 7940848 2I TGTATATGTG --/TA TATATATATG 1220 het 160 hom 6 2 4 0 TA 4 5 13755 CASAVA_Build 5 7944102 22D TGAAAACTGG GCACCTCCCTGCAGAAAACTGC/---------------------- GCACCTCCCT 3070 hom 69 het 23 0 24 2 GCACCTCCCTGCAGAAAACTGC 2 1 13756 CASAVA_Build 5 7951031 1I AGTCAGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 13 12 T 10 11 13757 CASAVA_Build 5 7951548 1D GGTGCTTTAC T/- TTGTCACATT 3070 hom 138 het 55 0 47 9 T 3 2 13758 CASAVA_Build 5 7953997 1D TGATACCACT C/- AAGCAGTGTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 1 0 13759 CASAVA_Build 5 7957370 1I ACACTAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 31 0 25 6 T 12 13 13760 CASAVA_Build 5 7966225 7I TTCCAACCTC -------/TACCTGT TACCCAGTTC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TACCTGT 0 1 13761 CASAVA_Build 5 7970990 1I TCAGTAGTTT -/A ATCCCTTGTT 3070 het 3070 hom 46 18 27 1 A 1 2 13762 CASAVA_Build 5 7972466 1D CAATTTCTGC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 13763 CASAVA_Build 5 7973683 1I TTGCAATGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 9 10 13764 CASAVA_Build 5 7977961 5I ACTTTTAGTC -----/ATAAA ATAAGCTTCT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 ATAAA 0 1 13765 CASAVA_Build 5 7978253 2I TTAATTATAA --/AT ATGTGTTATT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 AT 1 2 13766 CASAVA_Build 5 7979797 4D CCCTTCACAG TGTC/---- TGTGCACCCA 3070 het 3070 ref 47 21 15 11 TGTC 1 0 13767 CASAVA_Build 5 7982024 4D ATCGTGAATT ACTC/---- ACACAGCCCT 3070 het 3070 ref 45 23 19 5 ACTC 1 0 13768 CASAVA_Build 5 7982949 4I35M1I TGTAATAGTC ----TCTCAAAGTCTACTTATTGAGTATTTTTTTAAACA-/TCTTTCTCAAAGTCTACTTATTGAGTATTTTTTTAAACAT TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 31 25 12 6 N/A 0 0 13769 CASAVA_Build 5 7985384 1I TCCCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 9 10 13770 CASAVA_Build 5 7987751 1I CAGTTCCATG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 7 8 13771 CASAVA_Build 5 7989517 9D CTTAGAATTT AGTTACAGC/--------- AGGTTAATCC 3070 het 3070 hom 53 22 25 8 AGTTACAGC 1 0 13772 CASAVA_Build 5 7990556 1I CCACAAGGTC -/A AGGAGATCGA 2177 het 2177 ref 15 8 5 2 A 1 2 13773 CASAVA_Build 5 7991510 1D CATATGATGC T/- TTTATAGGTA 3070 het 3070 ref 33 22 8 4 T 4 3 13774 CASAVA_Build 5 7991693 1D GCATCACTGT A/- AAAAGTCAAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 5 4 13775 CASAVA_Build 5 7992391 1I CTAAAATGAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 7 8 13776 CASAVA_Build 5 7992897 4D ACTTTATCCA TCCT/---- TCCTTCCTTC 1806 het 1806 ref 29 17 7 5 TCCT 6 5 13777 CASAVA_Build 5 7995765 1D AAAATTTACT G/- TTACATTTAC 3070 het 3070 ref 46 24 13 10 G 1 0 13778 CASAVA_Build 5 7998906 1D TAAATGCACA T/- GGCAACTCAT 3070 het 2507 hom 24 6 12 7 T 1 0 13779 CASAVA_Build 5 8002530 1D TAATTGGGTT G/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 G 1 0 13780 CASAVA_Build 5 8015984 1D GGGCAGGGAC A/- GGGGCAGGGG 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 A 1 0 13781 CASAVA_Build 5 8036836 1I GGACGGGGCA -/G AATCCAGGCA 1435 het 1435 ref 24 13 5 6 G 0 1 13782 CASAVA_Build 5 8037628 4D CGCTGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 TTTG 6 5 13783 CASAVA_Build 5 8038348 4D GAATGAAGTC TCTT/---- TCTTTTCTGC 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 TCTT 2 1 13784 CASAVA_Build 5 8041375 1D ATATTTATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 10 9 13785 CASAVA_Build 5 8041950 1I TTTTATTTTT -/A CAAGGCCTTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 0 1 13786 CASAVA_Build 5 8043042 2D TTCCTTCCTT CC/-- TTTTTTTTTT 766 het 766 ref 30 11 5 14 C 2 0 13787 CASAVA_Build 5 8043887 1D AAACCTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 11 10 13788 CASAVA_Build 5 8047364 1D AGCATATGGG C/- TAGTGCATCG 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 C 1 0 13789 CASAVA_Build 5 8055194 1I TTATTGTTTT -/A GTTACTTAGG 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 0 1 13790 CASAVA_Build 5 8055626 1D TTGAGTAGCT G/- GTTCCACATG 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 G 2 1 13791 CASAVA_Build 5 8056214 1D CTATTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 35 0 31 4 T 11 10 13792 CASAVA_Build 5 8056529 2D CTTGTAGATG AT/-- ATATAGCAGG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 AT 3 2 13793 CASAVA_Build 5 8066200 1I AAATTGCACA -/C TTACTATGAG 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 C 0 1 13794 CASAVA_Build 5 8068658 8I AAATAGAGAA --------/AAAGATGC AAAGATGCTG 2617 het 2617 ref 20 11 7 3 AAAGATGC 1 2 13795 CASAVA_Build 5 8069451 4I GATTTTTCTC ----/TTAT TTGTCTATTT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TTAT 0 1 13796 CASAVA_Build 5 8069581 1I25M2I TTTCCATTTC -TTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCA--/TTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCAAT GTGTTGCCCA 3070 het 3070 hom 22 13 12 1 N/A 0 0 13797 CASAVA_Build 5 8071846 5I GCTAAAGAAA -----/TGAAT TAATTATAAA 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 TGAAT 0 1 13798 CASAVA_Build 5 8072115 3I AAGACTTATC ---/TAA TAAAACAATT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 TAA 1 2 13799 CASAVA_Build 5 8072261 1D TAAATGCAAG A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 6 5 13800 CASAVA_Build 5 8072368 1D TTCAAAGTGC A/- TGAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 1 0 13801 CASAVA_Build 5 8072567 1I CATAAAAAAA -/T ATGAAACTCA 3070 het 3070 ref 38 20 14 7 T 0 1 13802 CASAVA_Build 5 8072688 4I ATTAAAAAAT ----/AACC AAAGCTATGA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 AACC 0 1 13803 CASAVA_Build 5 8073523 1D106M8D TTTATTCAGC TTTTTTTTTCTCTTTGATTGTCAGTTTTGTAGGCTTTATTAACATATCACAAAGCGAAGAGATTATTTTCTTAGCTGTATCCAGTCTACCAGTGGGCACATGAAAGGTATTCTTT/-TTTTTTTTCTCTTTGATTGTCAGTTTTGTAGGCTTTATTAACATATCACAAAGCAAAGAGATTATTTTCTTAGCTGTATCCAGTCTACCAGTGGGCACATGAAAGG-------- ATTTCTGTTA 3070 het 3070 ref 30 43 15 12 N/A 0 0 13804 CASAVA_Build 5 8074595 3I45M21D TAAGAAGAGT ---TGATTTTTCCATTTGTTTAGGTTTTTACCTGTTGGAATGGGGTAAAAACCTAAACTCGCAGGGTTT/TGGTGATTTTTCCATTTGTTTAGGTTTTTACCTGTTGGAATGGGGTAA--------------------- TTACCTGCGA 3070 het 3070 ref 24 21 14 4 N/A 0 0 13805 CASAVA_Build 5 8075761 7D TTTTTTTCAC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 20 7 T 16 9 13806 CASAVA_Build 5 8076788 1D GTCCTTTTTT A/- AATCTTCATG 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 3 2 13807 CASAVA_Build 5 8079451 1I TAAGAATAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 53 31 19 3 A 7 8 13808 CASAVA_Build 5 8084669 1I TATAGCCTTT -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 6 7 13809 CASAVA_Build 5 8085085 2D ATTTATATAT AC/-- ACACACACAC 1453 het 672 hom 16 6 6 4 AC 8 7 13810 CASAVA_Build 5 8086159 1D TTGATGCACA T/- TGTCTGGAGT 3070 het 3070 ref 28 17 10 2 T 2 1 13811 CASAVA_Build 5 8087683 14D AATTGGAGAG CATTAAGACCCGAA/-------------- CATTCGTGGT 3070 het 3070 hom 24 9 15 6 CATTAAGACCCGAA 1 0 13812 CASAVA_Build 5 8090668 2I GAGGAATTAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 43 17 10 16 AC 6 7 13813 CASAVA_Build 5 8092057 1D GGGAAAAAAA T/- CTCAGTCATT 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 1 0 13814 CASAVA_Build 5 8092535 1I GATCTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 10 11 13815 CASAVA_Build 5 8092832 1D TCTCTGAGGG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 8 7 13816 CASAVA_Build 5 8099417 1I AGAAGACAGG -/A AAAATGTGGG 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 4 5 13817 CASAVA_Build 5 8101041 1I AAATAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 2085 hom 29 6 17 6 A 8 9 13818 CASAVA_Build 5 8104726 1D CTGCAAGTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 10 9 13819 CASAVA_Build 5 8110497 1I AACTTAAAAA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 15 5 T 0 1 13820 CASAVA_Build 5 8113026 3I GTTTTGTTGT ---/GAG GAGGATGACA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GAG 1 2 13821 CASAVA_Build 5 8115389 1D TTGCACATTT C/- TTTTTGTATG 3070 het 3070 ref 41 15 14 12 C 1 0 13822 CASAVA_Build 5 8117662 1D TGTTGAGCTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 39 0 29 10 T 8 7 13823 CASAVA_Build 5 8122062 2I GAACAGGAAG --/AC ACACTCCTTT 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 AC 2 3 13824 CASAVA_Build 5 8123955 9D TCCGTCTCAA AATAATAAT/--------- AATAATAATA 3070 hom 39 het 14 0 14 2 AAT 9 6 13825 CASAVA_Build 5 8143780 1D AATTCTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 35 0 27 8 A 13 12 13826 CASAVA_Build 5 8157908 4D CAATAGTATT GATA/---- GATCTCTTTG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 GATA 1 0 13827 CASAVA_Build 5 8162526 4D TAAACTGATT ATTG/---- ATTATGTGAC 3070 het 3070 ref 47 29 16 3 ATTG 1 0 13828 CASAVA_Build 5 8167512 1D AACAAAGAAC A/- AAAACAGCTA 3070 het 3070 ref 31 16 11 6 A 5 4 13829 CASAVA_Build 5 8167789 2I TATGTTCTCG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 AT 5 6 13830 CASAVA_Build 5 8169277 2D CAATTAACTT TA/-- ACTGTCTGGT 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 TA 1 0 13831 CASAVA_Build 5 8173016 1I TTTCATGATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 8 9 13832 CASAVA_Build 5 8175552 9I CTTTATGTAG ---------/AATGAATTA AATGAATTAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 AATGAATTA 1 2 13833 CASAVA_Build 5 8176208 3I AATTATTTAC ---/TAT TGAGGACGAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TAT 0 1 13834 CASAVA_Build 5 8176708 1D3M5D GCAACTTAAT ATAGTTATT/-TAG----- GGTTATTACC 3070 het 3070 ref 51 29 22 3 N/A 0 0 13835 CASAVA_Build 5 8180425 1D TATACAGTAC T/- TTTTTGCAGT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 6 5 13836 CASAVA_Build 5 8193225 2D ATAAACCCAC AT/-- GTCTTCTCTC 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 AT 1 0 13837 CASAVA_Build 5 8193802 2I AGCTGGGACC --/AG AGGTGAACTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AG 1 2 13838 CASAVA_Build 5 8199939 2D CTATGGACAA AT/-- ATATATAATT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 AT 4 3 13839 CASAVA_Build 5 8202001 4D ATGTGGGTGA TAAT/---- TAAGCACAGG 1948 het 1948 ref 27 13 5 9 TAAT 1 0 13840 CASAVA_Build 5 8202717 1I CTTCAATGAT -/A AAACAATAAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 3 4 13841 CASAVA_Build 5 8204495 2D GCATGTGACA GC/-- ACAGCTTGCA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 GC 1 0 13842 CASAVA_Build 5 8205375 1D TTCAGGAGTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 12 hom 23 0 14 9 G 12 11 13843 CASAVA_Build 5 8222922 1D TAAAACCATT A/- AAACCCTAGA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 4 3 13844 CASAVA_Build 5 8226958 1I GAAGGGGCGC -/A AAGTTAGTGT 3070 hom 45 het 61 1 53 7 A 2 3 13845 CASAVA_Build 5 8228597 2D AAGTTCACAC TT/-- ATTTTTTTTT 3070 hom 138 het 52 0 47 8 T 2 0 13846 CASAVA_Build 5 8241921 1I TGGCCAACGT -/G GCGAAATCCC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 1 2 13847 CASAVA_Build 5 8247035 2I TATTTACCTA --/TG TGTGTGTGTG 1941 het 1941 ref 29 16 6 7 TG 6 7 13848 CASAVA_Build 5 8251152 1D AGTGAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 31 3 16 13 A 11 10 13849 CASAVA_Build 5 8262149 2I GGGCGTGTGT --/GG GGTGTGTTTC 3070 hom 106 het 66 1 51 14 G 2 4 13850 CASAVA_Build 5 8265004 1I ATGATTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 11 12 13851 CASAVA_Build 5 8267398 1I AGTCTCACTC -/T GTCATCCAGG 3070 hom 78 het 30 0 26 5 T 0 1 13852 CASAVA_Build 5 8268448 6D CCAGGGTAAC TATGTA/------ TATGTATAGC 3070 hom 84 het 29 0 29 2 TATGTA 2 1 13853 CASAVA_Build 5 8269536 5D AGTACTGTTG AAGAT/----- AAGGGAAGAA 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 AAGAT 1 0 13854 CASAVA_Build 5 8272567 1D TTGGAACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 11 10 13855 CASAVA_Build 5 8286129 1D CAGCGCAAAT C/- CCTGCCGGAG 3070 hom 54 het 20 0 17 4 C 3 2 13856 CASAVA_Build 5 8287124 3I GAAGTTTGCC ---/ACA ACAATAGACT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ACA 1 2 13857 CASAVA_Build 5 8288979 2I AACTTGGCTG --/TA TGTCTGCCTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TA 0 1 13858 CASAVA_Build 5 8290883 1D CATAAGGAAA G/- GGGTTAGTGT 3070 hom 111 het 46 0 39 7 G 4 3 13859 CASAVA_Build 5 8290989 4D AAAAGAAAAG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 36 0 33 5 A 14 10 13860 CASAVA_Build 5 8301937 1I GGAATGTATG -/A AGCGGGAGGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 13861 CASAVA_Build 5 8317324 1I AAAAAGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 912 hom 35 2 31 2 T 10 11 13862 CASAVA_Build 5 8320378 1D ATAGTTTTCC T/- TTAAGGGTCA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 3 2 13863 CASAVA_Build 5 8324216 1I TGAGAGCCAT -/A AGAGACTATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 13864 CASAVA_Build 5 8330192 1D TTTGAGTCTG A/- AGGCTGGAAA 3070 hom 118 het 44 0 37 7 A 2 1 13865 CASAVA_Build 5 8330740 1I TCCCCTGGGG -/T GGCAAAATCA 3070 hom 87 het 34 0 27 7 T 0 1 13866 CASAVA_Build 5 8334379 15D TGGGAGGAAT TAGCCTCTTCAACAC/--------------- TGGGTGGGAG 3070 hom 78 het 30 0 27 5 TAGCCTCTTCAACAC 1 0 13867 CASAVA_Build 5 8338439 1I AAAAAACTAC -/T TTAAATTTCA 2430 hom 12 het 5 0 5 0 T 2 3 13868 CASAVA_Build 5 8346236 4D TCCTGAGATC ACAG/---- ACAGTTCCTA 3070 het 3070 hom 46 14 26 8 ACAG 2 1 13869 CASAVA_Build 5 8391895 11I ACCATATAGA -----------/GTTTTCTTATG GTTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 GTTTTCTTATG 1 2 13870 CASAVA_Build 5 8396427 1D TGAAGCCACA G/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 G 6 5 13871 CASAVA_Build 5 8420133 5I AAACCCTAGA -----/CTGAG CTGAAATCCC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 CTGAG 0 1 13872 CASAVA_Build 5 8421241 2I TATTGATTTT --/TA TATGATAGTA 3070 het 3070 ref 26 17 8 1 TA 1 2 13873 CASAVA_Build 5 8423614 1D ACTCAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1627 het 1627 ref 27 14 8 5 A 17 16 13874 CASAVA_Build 5 8423999 1I AACTACACCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 T 8 9 13875 CASAVA_Build 5 8430389 2I GATGATAACA --/CT CTGACTTTCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CT 1 2 13876 CASAVA_Build 5 8445376 1I TTTTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 36 1 25 10 A 13 14 13877 CASAVA_Build 5 8451406 4D TTCTTTCTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 TTTC 5 4 13878 CASAVA_Build 5 8453459 1I GTCAAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 T 12 13 13879 CASAVA_Build 5 8454225 1I TGGCAAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 11 12 13880 CASAVA_Build 5 8460079 1I CAAAGCAAAA -/T TCTACCGTAA 3070 het 3070 hom 48 18 28 2 T 1 2 13881 CASAVA_Build 5 8472156 1D AAGATTCTAA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 1268 hom 23 5 12 6 C 9 8 13882 CASAVA_Build 5 8479600 1I ACTTGAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 10 11 13883 CASAVA_Build 5 8486227 2D TGTCTAGCAC CA/-- CAGTCTGAAC 3070 het 3070 ref 52 24 18 11 CA 2 1 13884 CASAVA_Build 5 8490401 1D TTAATGACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 10 9 13885 CASAVA_Build 5 8496840 1I AATGCCCATA -/T TCTCTCCACT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 13886 CASAVA_Build 5 8499791 1D GCTGAGATTG T/- TGACACCATT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 T 2 1 13887 CASAVA_Build 5 8501073 1I CTTTGTGCAC -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 A 6 7 13888 CASAVA_Build 5 8502741 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 1321 hom 13 4 9 0 T 7 8 13889 CASAVA_Build 5 8506933 2D TTTTATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 AT 8 7 13890 CASAVA_Build 5 8507472 1I AACGTTCTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 A 8 9 13891 CASAVA_Build 5 8513028 1I AATTTTAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 9 10 13892 CASAVA_Build 5 8520431 1I AAATTTACAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 A 8 9 13893 CASAVA_Build 5 8532100 1D TCAAGAATCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 9 8 13894 CASAVA_Build 5 8536985 1D GCCCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 10 22 9 A 12 11 13895 CASAVA_Build 5 8540794 1D CACATGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 576 hom 28 3 11 15 A 13 12 13896 CASAVA_Build 5 8541283 4D AGAATATCTC ATTG/---- ATTAAGTACT 3070 het 3070 hom 34 14 19 2 ATTG 1 0 13897 CASAVA_Build 5 8543809 1D GATTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 2897 het 523 hom 43 5 11 28 T 19 18 13898 CASAVA_Build 5 8551878 1I TTCCACTTTC -/A AAAATGGATA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 4 5 13899 CASAVA_Build 5 8571611 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1319 het 1319 ref 22 9 6 7 T 11 12 13900 CASAVA_Build 5 8574347 1I CAAAACAAAA -/C AAAAAAACAA 3070 het 2582 hom 28 10 14 4 C 0 1 13901 CASAVA_Build 5 8577044 2I AGAACCTAGA --/CT CTTACTCTAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 CT 1 2 13902 CASAVA_Build 5 8582510 1D TCTGTAAGTT A/- AGAGTTGCAG 3070 hom 127 het 49 0 40 9 A 2 1 13903 CASAVA_Build 5 8584112 1D CATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 29 2 17 10 T 12 11 13904 CASAVA_Build 5 8591499 4D ATACATACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 AC 11 9 13905 CASAVA_Build 5 8599864 1I GTTTTATTTA -/T TTTGTTCATG 3070 het 3070 ref 47 27 19 1 T 3 4 13906 CASAVA_Build 5 8603417 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 48 29 16 3 A 8 9 13907 CASAVA_Build 5 8612814 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAAAA 3070 het 1370 hom 26 5 14 7 G 1 0 13908 CASAVA_Build 5 8614659 5I TTTTTTTTTT -----/TTTTC GCTCCAGATA 2969 het 2969 ref 29 15 11 3 TTTTC 0 1 13909 CASAVA_Build 5 8614790 1D GACCACTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 T 11 10 13910 CASAVA_Build 5 8616193 1I TCGGAGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 56 24 20 12 A 10 11 13911 CASAVA_Build 5 8617593 1D ATAGAACAGC T/- TTTTTTTTTT 3051 het 3051 ref 43 24 8 12 T 13 12 13912 CASAVA_Build 5 8630541 1D AAAAACTACA T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 7 6 13913 CASAVA_Build 5 8630986 2D AGAACTCAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 12 10 13914 CASAVA_Build 5 8635860 2D AAGGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 1220 het 1220 ref 50 36 3 12 AG 9 8 13915 CASAVA_Build 5 8646338 1D GCATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 25 2 19 5 A 11 10 13916 CASAVA_Build 5 8659685 1D AACAAGAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 T 10 9 13917 CASAVA_Build 5 8668535 2I CACCACACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 523 hom 47 4 17 26 AC 7 8 13918 CASAVA_Build 5 8677741 4I ATTCTTTTTT ----/ATGG ATGAATAGTA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 ATGG 0 1 13919 CASAVA_Build 5 8678696 3D GAATAGAGAA CTC/--- CAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 14 5 CTC 1 0 13920 CASAVA_Build 5 8682669 1D TTTTCTATAT A/- AAAGTTGAAA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 4 3 13921 CASAVA_Build 5 8689501 6I AGTAAAAATG ------/TGTACA TGTACATGTG 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 TGTACA 1 2 13922 CASAVA_Build 5 8693479 1I AAGAAACTAT -/A TATAAACAGA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 0 1 13923 CASAVA_Build 5 8698978 12D TTTGTTATGA TGGAGAGCTGCC/------------ TGTGCACTGA 3070 het 3070 hom 45 19 24 6 TGGAGAGCTGCC 1 0 13924 CASAVA_Build 5 8700309 1D ATTATAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 A 11 10 13925 CASAVA_Build 5 8703870 2I ATTGTTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 11 13 13926 CASAVA_Build 5 8705710 1I GGGGGGGGGG -/A AGCCAGGGGT 1352 het 1305 hom 17 9 4 4 A 1 2 13927 CASAVA_Build 5 8706704 4D ATAAAATTAG AATT/---- AATACTAAAT 2938 het 2938 ref 18 7 6 6 AATT 1 0 13928 CASAVA_Build 5 8707132 11I2M1I CTTCATGCAG -----------AT-/TGAATGAGAATATG GTTAATAATA 3070 het 3070 ref 44 24 19 2 N/A 0 0 13929 CASAVA_Build 5 8707149 5D TAATATGGTT CTATA/----- CAGAATATGG 2116 het 2116 ref 49 30 5 17 CTATA 1 0 13930 CASAVA_Build 5 8707590 3I TTTGTAATCC ---/TGT TGAAATATGA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 TGT 0 1 13931 CASAVA_Build 5 8707853 12D GAAAAAAAAA AAATATATATAT/------------ ATATATATAT 3070 het 1397 hom 25 5 18 2 AAATATATATAT 1 0 13932 CASAVA_Build 5 8760995 1I GGAACATAAA -/G GGAAACAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 G 2 3 13933 CASAVA_Build 5 8762005 1I CACAGTTGGC -/T TTTTTTTACC 2881 het 2814 hom 16 7 6 3 T 7 8 13934 CASAVA_Build 5 8762649 1I CTCATTGTGA -/T TTTTGCATTT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 4 5 13935 CASAVA_Build 5 8772921 1I TTTGTGTAGA -/T TTTTTTCATC 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 T 6 7 13936 CASAVA_Build 5 8778118 2I TTTCTCTTCT --/TA TAGAGACACC 2908 het 2908 ref 24 12 7 5 TA 1 2 13937 CASAVA_Build 5 8780620 28I TGGGAAAAAT ----------------------------/GTTGTAACGCTGGTCTACCAAATGTTAC GTTGTTTGCA 3070 het 3070 hom 39 17 24 4 GTTGTAACGCTGGTCTACCAAATGTTAC 0 1 13938 CASAVA_Build 5 8803942 1D TTTGGTTACT G/- TAGCCTTGTA 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 G 1 0 13939 CASAVA_Build 5 8807729 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTC 1418 het 1418 ref 19 11 6 2 A 1 0 13940 CASAVA_Build 5 8809070 6I ATTAATCTAT ------/AGATTA GTATCTACTT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 AGATTA 0 1 13941 CASAVA_Build 5 8811377 3I AGGATAAAAA ---/AAT AATTTTACTC 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 AAT 1 2 13942 CASAVA_Build 5 8816327 1D AACCTCTGCC T/- CCCAGGTTCA 3070 het 3070 hom 32 8 21 3 T 1 0 13943 CASAVA_Build 5 8816618 1D AAACCTCTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2961 hom 26 10 12 4 T 10 9 13944 CASAVA_Build 5 8821486 10D GGATTTGAAA CTTTGATGTG/---------- CTTTGATGTG 3070 hom 114 het 45 0 39 7 CTTTGATGTG 2 1 13945 CASAVA_Build 5 8829414 1I16M1I ATGTGTCTCA -CACAGAGTTTAAATTC-/CCCCAGAGTTTAATTTCT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 22 13 13 1 N/A 0 0 13946 CASAVA_Build 5 8833468 3I GTAAAGAAGA ---/TAT TGAATTTAGA 3070 het 3070 hom 43 19 23 1 TAT 0 1 13947 CASAVA_Build 5 8838057 4D CCTTTTCTCC TCTT/---- TCTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 TCTT 2 1 13948 CASAVA_Build 5 8845187 1D TTCAGAAATG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 T 9 8 13949 CASAVA_Build 5 8853675 1I GAATGATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 10 11 13950 CASAVA_Build 5 8857379 1I AGGAGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 12 11 T 11 12 13951 CASAVA_Build 5 8862304 1I TGTGCAAGTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 8 9 13952 CASAVA_Build 5 8878205 1D GGTGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3063 hom 39 13 12 14 A 11 10 13953 CASAVA_Build 5 8882868 1D AATACTGGGG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 7 6 13954 CASAVA_Build 5 8890675 1I ACATGAAGTT -/A AACCAAAAGT 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 A 2 3 13955 CASAVA_Build 5 8899200 1D TTTGCTGTTT G/- GTGTGTGCTG 3070 hom 144 het 52 0 49 3 G 2 1 13956 CASAVA_Build 5 8899717 5I TAATAAATCA -----/TAAAT TAAACTGTTA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TAAAT 0 1 13957 CASAVA_Build 5 8906724 15I GGCAAGGTGA ---------------/TCTGTTTTGTGATGC TCTAAAATAC 3070 hom 90 het 33 0 30 5 TCTGTTTTGTGATGC 0 1 13958 CASAVA_Build 5 8919409 1I ATAAGCAGTT -/C CCCCTGCTTC 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 C 4 5 13959 CASAVA_Build 5 8951670 2D AAACAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 11 6 A 13 11 13960 CASAVA_Build 5 8953813 1I TATACCTCAA -/T TTAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 T 2 3 13961 CASAVA_Build 5 8956785 1D TCCTGATTTT G/- TGCATTCGAT 3070 het 3070 ref 50 25 23 3 G 1 0 13962 CASAVA_Build 5 8963349 2I ACTAAATAAA --/CT CTATACTCTA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 CT 1 2 13963 CASAVA_Build 5 8970042 1I AGTATTTAAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 8 9 13964 CASAVA_Build 5 8970716 42D TCTCAGAAGA GAAAAGGGGCCACCATGGCTGGACATTATAAAGAAAAGTAAG/------------------------------------------ GAAGTGTCAG 3070 het 3070 ref 40 33 16 5 GAAAAGGGGCCACCATGGCTGGACATTATAAAGAAAAGTAAG 1 0 13965 CASAVA_Build 5 8973449 1I TATTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2576 het 2576 ref 35 13 9 13 T 13 14 13966 CASAVA_Build 5 8978323 1D GCAGTACCTC T/- ACAAGTCTTT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 1 0 13967 CASAVA_Build 5 8980441 1D GTGATGGGTA C/- CCCCATTTCC 3070 hom 45 het 18 0 16 3 C 5 4 13968 CASAVA_Build 5 8990984 1I TATAACCTTA -/C CCCCAACCCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 4 5 13969 CASAVA_Build 5 9060703 2D GTTTTTCTGC TG/-- TGTTTTTTCC 2151 hom 18 het 8 0 7 1 TG 2 1 13970 CASAVA_Build 5 9082904 1D CCAATGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 36 1 31 4 T 11 10 13971 CASAVA_Build 5 9090269 7D GAGTGATTTT CTACCTC/------- CTCTTTCCTC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 CTACCTC 1 0 13972 CASAVA_Build 5 9096143 1I AAAATATATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 8 het 41 1 36 4 A 9 10 13973 CASAVA_Build 5 9117663 1D GAACAAAAAA C/- CCAAACACTG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 C 3 2 13974 CASAVA_Build 5 9120693 5D AAGCTTTATC ATAAA/----- ATAAAATAAA 3070 hom 96 het 44 0 33 11 ATAAA 5 4 13975 CASAVA_Build 5 9128669 1I AAAAGCCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 742 hom 36 2 24 10 A 11 12 13976 CASAVA_Build 5 9146805 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 2812 het 2429 hom 19 8 9 2 A 9 10 13977 CASAVA_Build 5 9147428 1I AAATTATTTC -/A AAATGAACAG 3070 het 3070 hom 56 25 26 5 A 3 4 13978 CASAVA_Build 5 9178237 1D AACATGAAAA G/- TGTTCGTTGT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 G 1 0 13979 CASAVA_Build 5 9178942 3I GGCAAAGACC ---/CTA CTACCATTTG 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 CTA 1 2 13980 CASAVA_Build 5 9185805 1D TGCTATGTCA T/- TGATCCAAGG 3070 hom 199 het 68 0 67 3 T 2 1 13981 CASAVA_Build 5 9193068 4D TCCTCCTCAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 8 AAAC 3 2 13982 CASAVA_Build 5 9196066 4D TCCATCTCAG ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 12 8 ACAA 5 4 13983 CASAVA_Build 5 9196498 1I TTCATGTATT -/A AAAACTACTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 4 5 13984 CASAVA_Build 5 9198139 1I TCATTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 T 11 12 13985 CASAVA_Build 5 9206182 1D TCCATTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2419 hom 29 11 14 5 A 14 13 13986 CASAVA_Build 5 9211617 4D ATCAACAAGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 17 8 A 16 12 13987 CASAVA_Build 5 9212057 6I TACAGGCTGC ------/CAATTT CAATTTGAAT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 CAATTT 1 2 13988 CASAVA_Build 5 9212663 1D AGTCCAGAAA C/- AACAGATGCT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 C 1 0 13989 CASAVA_Build 5 9214244 1D TAGTGGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 14 12 T 12 11 13990 CASAVA_Build 5 9214533 1I TTTAAAATGG -/A AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 6 7 13991 CASAVA_Build 5 9215619 12D42M14D TGTATATATA GGAATATATGTGTATATGTGTATATATATGTATGTGTGTATATATGTGTGTGTGTGTGTATATATATA/------------TATATGTATATATATGTGTATGTGTATATATATGTGTGTGTG-------------- TATATATATA 3070 hom 42 het 5 0 15 3 N/A 0 0 13992 CASAVA_Build 5 9225181 1D CCCTGACTCC A/- AGGCTGGAAA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 A 2 1 13993 CASAVA_Build 5 9228976 1D ATTTAGAGGG T/- TTTTGGGGGA 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 T 5 4 13994 CASAVA_Build 5 9233897 1I TAGGTGCTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 9 10 13995 CASAVA_Build 5 9237369 1I TCATTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 10 11 13996 CASAVA_Build 5 9242508 2D CAACTTCATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1064 hom 29 7 16 7 A 16 14 13997 CASAVA_Build 5 9242579 1D TTCTTAGAAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 A 8 7 13998 CASAVA_Build 5 9244746 2D AAAAGTAGAT GA/-- GATATTTGTA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 GA 2 1 13999 CASAVA_Build 5 9245690 1D AGTTGTAATT G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 87 het 49 1 40 10 G 9 8 14000 CASAVA_Build 5 9264384 1D GCTTATTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 390 hom 47 1 38 8 A 10 9 14001 CASAVA_Build 5 9268933 1D GCCTATCTTA T/- TTTTTTTTTC 1268 het 1268 ref 45 39 3 3 T 10 9 14002 CASAVA_Build 5 9277518 1I ACAACAATAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 408 hom 36 2 27 7 A 9 10 14003 CASAVA_Build 5 9331226 1D ATGTAAACTT A/- AAAAAAAAAA 691 het 691 ref 34 23 3 8 A 15 14 14004 CASAVA_Build 5 9344702 16D AGCAGGAAAG AGAGAGAGAGAGAGAA/---------------- AGAGAGAGAG 3070 hom 90 het 36 0 29 10 AGAGAGAGAGAGAGAA 1 0 14005 CASAVA_Build 5 9353448 3D CCATTTCTCC TCA/--- TTTCTAATGC 3070 hom 87 het 31 0 30 3 TCA 1 0 14006 CASAVA_Build 5 9357627 5I CTGCAAGATC -----/TAAAA TAAAATAATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TAAAA 1 2 14007 CASAVA_Build 5 9359571 4D ATGTCAGATA TTAT/---- TTGTTTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTAT 1 0 14008 CASAVA_Build 5 9361028 1D TATATTCATG C/- ATCTTCAATT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 1 0 14009 CASAVA_Build 5 9364259 1I TTCGCTCAAC -/G GGGGGGGTCC 3070 hom 82 het 33 0 24 9 G 7 8 14010 CASAVA_Build 5 9378933 1D CTATAAAATC A/- AAGAAAAAAT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 3 2 14011 CASAVA_Build 5 9382341 2I GCTTGTGCCC --/CT GTCTCACCCA 3070 hom 138 het 50 0 45 5 CT 0 1 14012 CASAVA_Build 5 9395204 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 25 het 32 1 29 2 A 9 8 14013 CASAVA_Build 5 9404280 1I TAGGCAGCAA -/G TCTTTAGCTT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 G 0 1 14014 CASAVA_Build 5 9419505 1D TAAAGAATTC T/- TTTTTTTTTT 1642 het 1450 hom 25 9 8 8 T 15 14 14015 CASAVA_Build 5 9427377 1D CAGAGGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 19 17 19 A 11 10 14016 CASAVA_Build 5 9432044 1D AATTATTTGA T/- TTTTTTTTAA 3019 het 3019 ref 28 16 9 3 T 9 8 14017 CASAVA_Build 5 9441038 1I AAACAAGATC -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 T 6 7 14018 CASAVA_Build 5 9450163 2D CAAGGAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 12 10 14019 CASAVA_Build 5 9458746 1D CACAGCCCCC T/- GTCTCTTGGG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 1 0 14020 CASAVA_Build 5 9462972 36D ACTTTGGAAA ACTCTGTGGTTTTAACAAACACATAACAATGCCCCC/------------------------------------ ACCCCCACCG 3070 het 3070 ref 17 11 10 2 ACTCTGTGGTTTTAACAAACACATAACAATGCCCCC 1 0 14021 CASAVA_Build 5 9463307 1I AATAACTGGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 7 8 14022 CASAVA_Build 5 9463986 1D TAAAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 6 A 12 11 14023 CASAVA_Build 5 9465603 1D ACTTCATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 34 1 12 21 T 17 16 14024 CASAVA_Build 5 9472204 1D ATTTCAAGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 T 10 9 14025 CASAVA_Build 5 9475672 1D AAAACAAAAA G/- GCTAACGGAA 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 G 2 1 14026 CASAVA_Build 5 9478327 1D CATAGCACTT A/- ACCACTGGAC 3070 hom 98 het 40 0 33 7 A 2 1 14027 CASAVA_Build 5 9490826 1I CAATCTGTAA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 7 8 14028 CASAVA_Build 5 9498252 1D AATCAGAGAA T/- TTTTCCTGCA 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 T 5 4 14029 CASAVA_Build 5 9501862 7D CTGCTGGCTC TCTGAAA/------- TCCAGGTGGC 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 TCTGAAA 1 0 14030 CASAVA_Build 5 9508370 5D TATTTATTTA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 699 het 699 ref 10 3 4 3 T 16 11 14031 CASAVA_Build 5 9509593 1I GGACAAGTAG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 7 8 14032 CASAVA_Build 5 9518187 7D ATTCTGGATT CTGGATC/------- CTGGATCCCC 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 CTGGATC 2 1 14033 CASAVA_Build 5 9519495 2D AATAAAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 14 0 12 3 A 16 14 14034 CASAVA_Build 5 9521711 25I GGGTGTGTCC -------------------------/TACCTGTAAATTTTATGCATGTAAA TACATTTAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TACCTGTAAATTTTATGCATGTAAA 0 1 14035 CASAVA_Build 5 9525747 1D ATAATAATAA T/- TTTGTTCACT 3070 het 3070 ref 33 20 12 2 T 4 3 14036 CASAVA_Build 5 9526237 2I AAAATAAAAT --/AA ATATATATAT 1227 hom 7 het 5 0 3 2 A 1 3 14037 CASAVA_Build 5 9533193 14D GGCTGCCCTG TGCACTGTAGGACA/-------------- TTCACCAGCA 3070 het 3070 ref 44 31 17 5 TGCACTGTAGGACA 1 0 14038 CASAVA_Build 5 9540131 1D ATTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 249 hom 39 1 35 3 A 11 10 14039 CASAVA_Build 5 9542366 4D AAATGTTAGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 105 het 43 0 35 9 AT 8 6 14040 CASAVA_Build 5 9546395 4D ATGTAGCAGC ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 het 2135 hom 20 5 12 3 ATCT 4 3 14041 CASAVA_Build 5 9559170 1I AACACATCCA -/C CCAGAATAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 2 3 14042 CASAVA_Build 5 9560100 1I CAACCAATAC -/A AAAAATCAAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 5 6 14043 CASAVA_Build 5 9562263 2I9M3I TCCACAGGGG --TGAAGAAAA---/GCTGAAGAAAAGAG GAGCAGGATG 3070 hom 60 het 20 0 21 1 N/A 0 0 14044 CASAVA_Build 5 9565239 12D TGTGGCTTCT AGAAAAGAGAGG/------------ AGCTGACATA 3070 het 3070 ref 48 25 23 6 AGAAAAGAGAGG 1 0 14045 CASAVA_Build 5 9577046 1D GCAAATAGAG T/- TAAATTAAGA 3070 hom 123 het 45 0 42 5 T 2 1 14046 CASAVA_Build 5 9588310 2D AAAACTGTTC AA/-- AGTTAAGTAA 3070 hom 96 het 41 0 32 9 A 3 1 14047 CASAVA_Build 5 9588699 1I AAAAAATGCA -/G GGGAGGAGTG 3070 hom 50 het 21 0 17 4 G 3 4 14048 CASAVA_Build 5 9591372 4I TTGATTCTTC ----/TCTT TCTAAGAGCG 3070 hom 42 het 17 0 13 4 TCTT 0 1 14049 CASAVA_Build 5 9594811 3I GGACCAAAAA ---/AGG AGAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 AGG 0 1 14050 CASAVA_Build 5 9601190 1I ACTTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 11 12 14051 CASAVA_Build 5 9601405 3I GATAATTGTG ---/ATA ATTAATTACA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 ATA 0 1 14052 CASAVA_Build 5 9601679 4I CAGGCTCTTC ----/ATAA ATAAAGTCAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 ATAA 1 2 14053 CASAVA_Build 5 9604235 1D ACTTGGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 33 11 A 11 10 14054 CASAVA_Build 5 9607984 2I CTAAATTGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 11 10 A 10 12 14055 CASAVA_Build 5 9608284 1D GACTTTTGTG A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 46 16 29 3 A 7 6 14056 CASAVA_Build 5 9609604 1D CACTAAAATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 53 20 28 5 A 9 8 14057 CASAVA_Build 5 9620863 1D TATATTCAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 8 7 14058 CASAVA_Build 5 9622476 1D AGCTTTTTTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 11 22 7 T 8 7 14059 CASAVA_Build 5 9632461 2I ATCACTCAGA --/AG AGTCAAATAT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 AG 1 2 14060 CASAVA_Build 5 9633042 6D ACATAGTAAG TATATA/------ TATATATATA 3070 het 79 hom 20 1 11 9 TA 10 7 14061 CASAVA_Build 5 9651839 2I TCGTTCCCTA --/CC CCCCCCCCAT 2953 het 2953 ref 39 21 9 9 C 8 10 14062 CASAVA_Build 5 9652933 1D TGTGACTTTT A/- AAAGACAATA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 4 3 14063 CASAVA_Build 5 9658321 4I CTGGAGGACT ----/CTGA CTAATACAAA 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 CTGA 0 1 14064 CASAVA_Build 5 9660899 1D TTTTTACTGA C/- AGAGATCACA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 C 1 0 14065 CASAVA_Build 5 9667217 1I AATATGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 804 hom 32 3 14 15 A 12 13 14066 CASAVA_Build 5 9667390 1D TTCTGTATTC T/- TTTTTTTTGT 1242 het 1242 ref 29 20 3 6 T 9 8 14067 CASAVA_Build 5 9669027 2D TATAAACATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TA 8 7 14068 CASAVA_Build 5 9669707 1D TGTTATTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2328 hom 27 9 15 4 T 9 8 14069 CASAVA_Build 5 9675657 2D TTATTGTGGC TA/-- TATATATATA 3070 het 2878 hom 25 9 12 6 TA 7 6 14070 CASAVA_Build 5 9686402 7D9M1D TGTGTGTGTG TATATTATATATATATA/-------TATATATAT- TATATATATA 803 het 803 ref 13 5 2 7 N/A 0 0 14071 CASAVA_Build 5 9690098 1D TAATACCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 36 0 28 8 T 11 10 14072 CASAVA_Build 5 9706581 15D AAAGCTGCTA TAAACATGGGTGTAC/--------------- AAATAACTGT 3070 het 3070 ref 62 38 23 5 TAAACATGGGTGTAC 1 0 14073 CASAVA_Build 5 9739471 3D GAAGAAAGAA AAT/--- ATTGGTCTAG 3070 het 3070 hom 55 20 26 9 AAT 1 0 14074 CASAVA_Build 5 9753828 9D AGCAGGATCA GTTTTCTCT/--------- GTTTTCTCTG 3070 het 3070 ref 40 21 15 8 GTTTTCTCT 2 1 14075 CASAVA_Build 5 9757476 1D CTCCACTGAG A/- AAAAAAAAAA 3053 het 10 hom 25 1 8 16 A 12 11 14076 CASAVA_Build 5 9758972 1I GAAACTCCAT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 C 8 9 14077 CASAVA_Build 5 9764009 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 1599 het 775 hom 8 3 4 1 AT 5 6 14078 CASAVA_Build 5 9764951 2I ATTTTTTGTA --/TT TTTTTTTAGT 3070 hom 23 het 19 0 10 9 T 7 9 14079 CASAVA_Build 5 9769658 2D GTACATATAT TA/-- TATATATATA 3070 het 19 hom 27 1 20 6 TA 9 8 14080 CASAVA_Build 5 9782438 1I GGTCTGTCCT -/G GGGTCAGGCT 3070 hom 119 het 46 0 36 10 G 3 4 14081 CASAVA_Build 5 9795009 1I AAACAAGACT -/A GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 0 1 14082 CASAVA_Build 5 9796181 1D ATAGGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 10 11 A 12 11 14083 CASAVA_Build 5 9796421 1I AGTGCTATTC -/T TTTTTTTTTT 2848 het 1709 hom 18 5 9 4 T 11 12 14084 CASAVA_Build 5 9796765 1I CCAAAACTGC -/A ATAAACATGA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 1 2 14085 CASAVA_Build 5 9805669 2I AAATATATCA --/TT TTTTTTTTAT 3070 het 3064 hom 31 11 17 3 T 8 10 14086 CASAVA_Build 5 9811030 1D ATTTTTTTCA T/- GAGAAAAACA 3070 het 3070 hom 24 7 15 2 T 1 0 14087 CASAVA_Build 5 9842040 1D TCCCCACCAC A/- AAAACAGGGG 3070 het 3070 ref 42 18 16 10 A 5 4 14088 CASAVA_Build 5 9849740 1I ATCCTAAGCC -/A AAAACAACAA 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 A 4 5 14089 CASAVA_Build 5 9861048 1D ATTAGAACAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 9 14090 CASAVA_Build 5 9869645 1I AATCTATTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 9 10 14091 CASAVA_Build 5 9884734 4I CATGTTTCTG ----/TTTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 9 13 14092 CASAVA_Build 5 9887866 1I TTACTGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 12 13 14093 CASAVA_Build 5 9899796 2D ACACACATTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 39 15 15 11 CA 7 6 14094 CASAVA_Build 5 9915313 1I CGTTAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 8 9 A 11 12 14095 CASAVA_Build 5 9927116 4D GGAAGGAAGA AAGG/---- AAGGAAGGGA 2104 het 2104 ref 28 9 6 13 AAGG 3 2 14096 CASAVA_Build 5 9933754 1D AATGTCTCCA G/- GCATTTCCAA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 G 2 1 14097 CASAVA_Build 5 9946716 1I TACTTGTAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 A 8 9 14098 CASAVA_Build 5 9963122 12D CTCTAGACAT GAAGGGCTCAGC/------------ GAAGGGCTCA 1933 het 1933 ref 28 12 9 11 GAAGGGCTCAGC 2 1 14099 CASAVA_Build 5 9964409 1I GGTTTTTACT -/G GGAAAAAATC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 G 2 3 14100 CASAVA_Build 5 9967418 1D CTCGCTCTCC T/- GACCTCGTGA 3070 het 2811 hom 21 7 11 3 T 1 0 14101 CASAVA_Build 5 9977018 1I TTTCATTATA -/C AAATATAACA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 C 0 1 14102 CASAVA_Build 5 9978362 1I CTATGCTGAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 8 9 14103 CASAVA_Build 5 9979206 1D AACAACAACT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 31 0 26 6 A 10 9 14104 CASAVA_Build 5 9985898 1D GATGTTTAGG A/- AAAAAATTTA 3070 het 2825 hom 14 6 8 0 A 7 6 14105 CASAVA_Build 5 9995302 1I TATGTACCCC -/T ATACCCATTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 0 1 14106 CASAVA_Build 5 9995631 3D TTATTATCAT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 TTA 5 4 14107 CASAVA_Build 5 10001894 1I CAGCCAGAAG -/A ATAGCAAAGG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 1 2 14108 CASAVA_Build 5 10021299 1D TAAACAGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 10 9 14109 CASAVA_Build 5 10032403 1I ACGTCAACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 138 hom 35 1 29 5 A 9 10 14110 CASAVA_Build 5 10033353 1D ATTGGGAATG C/- CCGGCTTTCC 3070 het 3070 hom 41 16 21 6 C 3 2 14111 CASAVA_Build 5 10037303 1D CTGAGAGGCT G/- GGGATTAATG 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 G 4 3 14112 CASAVA_Build 5 10037351 1D ATGTTCTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 13 10 19 T 10 9 14113 CASAVA_Build 5 10037865 2D ATCACCCCAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 11 9 14114 CASAVA_Build 5 10039169 2D TAAGCGCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 15 14 A 14 12 14115 CASAVA_Build 5 10039626 2D CAATTTGAGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 TA 6 5 14116 CASAVA_Build 5 10042937 1I GGATTTGCCA -/T TACCCTAACC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 1 2 14117 CASAVA_Build 5 10046052 2D CAAATTGGAT AA/-- AGAGTCAAGA 2931 hom 15 het 6 0 6 0 A 3 1 14118 CASAVA_Build 5 10046997 1D ATAGAGACAC A/- AAAAAAACCT 2805 hom 15 het 6 0 6 1 A 8 7 14119 CASAVA_Build 5 10049974 2I TAAAGTATAA --/TT TTTTTTAAAA 3070 hom 36 het 23 0 13 10 T 6 8 14120 CASAVA_Build 5 10051520 1D CTTAAAGACC A/- AAAAACTCAC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 6 5 14121 CASAVA_Build 5 10052288 1I CCTTGTCATA -/G TCCATTATGG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 0 1 14122 CASAVA_Build 5 10053289 4D AGCAAAAAGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 123 hom 38 4 18 17 A 18 14 14123 CASAVA_Build 5 10056667 3D ACGAGTTGGG AGA/--- AGAAGGCTTC 3070 hom 32 het 12 0 11 1 AGA 2 1 14124 CASAVA_Build 5 10061971 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAAGC 2430 hom 15 het 8 0 6 2 A 8 9 14125 CASAVA_Build 5 10062302 1D ATTGAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 26 1 17 8 A 14 13 14126 CASAVA_Build 5 10074015 2I TCCACACCCC --/CT GACAGAAAAC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 CT 0 1 14127 CASAVA_Build 5 10074154 10I CAGACTTTCA ----------/TGTCCAAGAT GCCTCTTGCC 3070 hom 102 het 37 0 34 4 TGTCCAAGAT 0 1 14128 CASAVA_Build 5 10075098 1I TATAGAGAAG -/A AAATTTAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 3 4 14129 CASAVA_Build 5 10075506 1D AAGTGATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 41 3 35 3 A 12 11 14130 CASAVA_Build 5 10075676 2D AATTGGAGAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 11 9 14131 CASAVA_Build 5 10076276 1D GACACAAAGT G/- GCAGAATGGA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 G 2 1 14132 CASAVA_Build 5 10084686 1D TCTTATGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 T 11 10 14133 CASAVA_Build 5 10085032 1I ACCACTCCCG -/C CCTCTCATCC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 2 3 14134 CASAVA_Build 5 10108309 2D AAATGGACAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 22 0 17 6 AT 8 7 14135 CASAVA_Build 5 10116633 1D7M1D CATCTCTACT AAAAATCCA/-AAAATCC- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 4 N/A 0 0 14136 CASAVA_Build 5 10116872 4I CCTCAAGCCA ----/CAGG CAGGTCTTAA 3070 hom 117 het 41 0 37 4 CAGG 1 2 14137 CASAVA_Build 5 10121081 1I CATCTCTGCT -/A AAAAAAAATA 2950 het 1995 hom 13 5 7 1 A 8 9 14138 CASAVA_Build 5 10123670 1I GCCTTCAAAG -/C CCCTGGGTTC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 3 4 14139 CASAVA_Build 5 10143209 13D GTCCTTAAAA GCAGAAGAGGGAG/------------- GCAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 43 21 14 14 GCAGAAGAGGGAG 2 1 14140 CASAVA_Build 5 10146255 1D TCAACTAACA C/- TAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 C 1 0 14141 CASAVA_Build 5 10165162 1I CTTTTCCCTG -/C CCCCCAGCAC 3070 hom 133 het 50 0 44 6 C 5 6 14142 CASAVA_Build 5 10165436 1I ATGAAGTAAC -/A GGGCAAAATG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 0 1 14143 CASAVA_Build 5 10167429 8I CATGAGGGTG --------/ACCAGCTC ACCAGCAGGC 3070 hom 65 het 27 0 20 7 ACCAGCTC 0 1 14144 CASAVA_Build 5 10173916 1D AGAAGCAAGA G/- GGGCCCCCAG 3070 hom 108 het 39 0 33 7 G 4 3 14145 CASAVA_Build 5 10174714 1I CCAAGTAGCT -/G GGATTACAGG 2818 hom 15 het 6 0 6 0 G 2 3 14146 CASAVA_Build 5 10219137 2I8M1I GCATCAGGTT --AGAGTCTT-/ACAGAGTCTTG CAGCCTGGAA 3070 het 3070 hom 42 19 23 6 N/A 0 0 14147 CASAVA_Build 5 10221911 1D AATAAACCCA C/- GATTAGGCAG 3070 het 3070 hom 54 26 22 6 C 1 0 14148 CASAVA_Build 5 10224283 1D CGCCTGGGTG C/- TTGCTTTAGT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 C 1 0 14149 CASAVA_Build 5 10242298 1D TCTGCCCCCA C/- CCCCCCAGTC 3070 hom 29 het 13 0 9 4 C 7 6 14150 CASAVA_Build 5 10249987 1I GAAGAGTATT -/G TTTCTGGGTG 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 G 0 1 14151 CASAVA_Build 5 10259854 4I TTTTCAGACT ----/TCCA TCCATCACTA 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 TCCA 1 2 14152 CASAVA_Build 5 10263131 1I TCCAAAAAAA -/T GTGCAAGATT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 0 1 14153 CASAVA_Build 5 10274221 1D ACCCAAGAAG A/- CCCCCCCATG 3027 het 3027 ref 32 19 8 5 A 1 0 14154 CASAVA_Build 5 10280824 2I CCAAAATTTC --/CT CTGTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 CT 1 2 14155 CASAVA_Build 5 10283254 2I CTCAGAAAAA --/CT CTTCTACATG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 CT 1 2 14156 CASAVA_Build 5 10283378 1I AGCCAGTATA -/G GATTAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 G 1 2 14157 CASAVA_Build 5 10288855 1I AATACTATGT -/A AAAAAAGTGC 3070 het 3070 hom 39 11 15 13 A 6 7 14158 CASAVA_Build 5 10299570 4D AAAAAGAAAG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 25 6 A 15 11 14159 CASAVA_Build 5 10301340 5D CTTTCTTATA CTAGT/----- CTAATGTCAT 3070 hom 117 het 42 0 40 9 CTAGT 1 0 14160 CASAVA_Build 5 10306441 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 11 12 14161 CASAVA_Build 5 10308097 2I AACAAATGTC --/CT GGACTTTCAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 CT 0 1 14162 CASAVA_Build 5 10308450 2D ATAAGTAAAC TG/-- GTATTCGTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 8 TG 1 0 14163 CASAVA_Build 5 10308716 2I TAATAAACAC --/AT GTTTTAGTCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AT 0 1 14164 CASAVA_Build 5 10313657 1I GGGTTCAGCA -/T GAATTACTGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 14165 CASAVA_Build 5 10316452 4D GCCTCTGCGT GGAG/---- GGGGGGGGAT 3070 hom 120 het 44 0 39 6 GGAG 1 0 14166 CASAVA_Build 5 10317231 1I CAAAAAATAC -/A AAAATTAGCC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 4 5 14167 CASAVA_Build 5 10317379 1I ACCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 132 hom 37 1 35 1 A 10 11 14168 CASAVA_Build 5 10318887 5I CATCCCCTAC -----/TCTAT TCTGTTATTT 3070 hom 154 het 57 0 51 6 TCTAT 0 1 14169 CASAVA_Build 5 10319957 4D TTTTTTTCTC TGAA/---- TGTTCTCAAC 3070 hom 114 het 39 0 37 2 TGAA 1 0 14170 CASAVA_Build 5 10322486 1I ACCCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1011 hom 35 5 19 11 A 13 14 14171 CASAVA_Build 5 10325435 1D CTGTCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 36 2 21 13 A 14 13 14172 CASAVA_Build 5 10350297 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 19 0 10 10 A 12 11 14173 CASAVA_Build 5 10354979 2D GCTGTTTGTT GG/-- CTATGAGGAC 2546 hom 20 het 10 0 7 3 G 2 0 14174 CASAVA_Build 5 10362900 7D AAGTGTTATT ACCCAGA/------- ACAAATTCAG 3070 hom 57 het 21 0 19 4 ACCCAGA 1 0 14175 CASAVA_Build 5 10367292 22D GTCATCATAC CTAATTAGCCATGTCATAATGG/---------------------- CTAATTTTGT 3070 hom 72 het 26 0 23 10 CTAATTAGCCATGTCATAATGG 1 0 14176 CASAVA_Build 5 10367847 1I GATTCTCACC -/T TCTAGCAGTC 3070 hom 102 het 41 0 30 11 T 1 2 14177 CASAVA_Build 5 10373073 1I CTGCAACCTC -/T TGCCTCCCAG 3070 hom 51 het 25 0 16 9 T 1 2 14178 CASAVA_Build 5 10377946 1D AGGCCAGAAG T/- CCAAGATCAA 3070 hom 88 het 33 0 28 6 T 1 0 14179 CASAVA_Build 5 10378286 4D TATCTCCCTA TCTG/---- TCTGTCTGTC 3070 hom 126 het 49 0 43 8 TCTG 3 2 14180 CASAVA_Build 5 10410466 1I AAAGCTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 13 14 14181 CASAVA_Build 5 10420144 1D CTTCATGTGA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 85 het 36 0 29 7 T 7 6 14182 CASAVA_Build 5 10425179 1D TGAGTAGGCC A/- AAAAAAAAAA 1741 het 1741 ref 23 17 4 2 A 12 11 14183 CASAVA_Build 5 10425638 1I TTTAGGATTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 8 9 14184 CASAVA_Build 5 10432193 1I TTTTGTCTTT -/A AAAATTTATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 5 14185 CASAVA_Build 5 10432573 1D AAGATAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 21 1 16 4 T 13 12 14186 CASAVA_Build 5 10481177 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1498 het 1498 ref 40 24 5 12 A 12 11 14187 CASAVA_Build 5 10507242 1D TTTTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 28 2 21 5 T 13 12 14188 CASAVA_Build 5 10512354 1I AGTCCGGCCC -/T TTCCCAGGCC 1815 het 1111 hom 17 5 7 5 T 2 3 14189 CASAVA_Build 5 10520404 5D AAAAAACCAG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 34 12 13 10 AAACA 4 3 14190 CASAVA_Build 5 10523388 4D4M7D TACAATTTGT ACAATTGTACAATCC/----TTTT------- CCTGGTTATT 3070 hom 96 het 34 0 33 6 N/A 0 0 14191 CASAVA_Build 5 10548430 1I TTCTGCCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 333 hom 27 2 20 5 A 10 11 14192 CASAVA_Build 5 10551954 1D GTTTTGAAGT A/- AGTTTTTGCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 2 1 14193 CASAVA_Build 5 10567513 2D GTTGATAGAC TT/-- TTGGAATCTC 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 T 4 2 14194 CASAVA_Build 5 10569646 1D CATGGAGAAA C/- CCCGTCTCTA 1760 het 1760 ref 16 12 4 0 C 4 3 14195 CASAVA_Build 5 10583141 1D AATGGGGTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 4 het 13 0 8 5 T 8 7 14196 CASAVA_Build 5 10594687 1D TCACCGTGAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 9 8 14197 CASAVA_Build 5 10595567 1I AGTTAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 708 hom 39 2 29 8 T 12 13 14198 CASAVA_Build 5 10607239 4D ATGTGTATGA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 44 hom 56 2 33 21 GT 11 9 14199 CASAVA_Build 5 10609311 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 37 1 32 4 A 11 10 14200 CASAVA_Build 5 10625005 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 24 1 19 4 T 13 14 14201 CASAVA_Build 5 10628528 2I CAGAGCGAGA --/CT CTGTCTCAAA 2189 hom 45 het 22 0 13 9 CT 1 2 14202 CASAVA_Build 5 10632277 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 28 2 13 14 A 17 16 14203 CASAVA_Build 5 10636816 1I TTGTCAGGTG -/T TTTTTTACAG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 6 7 14204 CASAVA_Build 5 10644308 1D TTTTTAGTGG T/- TTTTTTTTTT 2831 hom 13 het 17 0 9 8 T 15 14 14205 CASAVA_Build 5 10654070 1I TTTGTACATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 335 hom 34 1 23 10 A 9 10 14206 CASAVA_Build 5 10655928 1D TTGCTTGTCA T/- TTTTTTTTTT 1664 het 1664 ref 43 18 5 20 T 15 14 14207 CASAVA_Build 5 10661775 1I CCTCACTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1635 hom 32 4 20 8 A 13 14 14208 CASAVA_Build 5 10677205 5D TGTATTTTTT CTTTA/----- CTTCTTGTTT 2141 het 2141 ref 25 12 7 8 CTTTA 1 0 14209 CASAVA_Build 5 10683172 1I ACATGAAGAC -/A GGCCCACAGG 3070 het 3070 ref 56 27 23 6 A 0 1 14210 CASAVA_Build 5 10686537 5D AAAATAAACT TTTGA/----- TTTGAGAATA 3070 het 3070 ref 25 14 8 5 TTTGA 2 1 14211 CASAVA_Build 5 10687463 8D GAGAGGGGGT GTTCTGGG/-------- GTTCTCTAGG 3070 het 3070 hom 31 12 13 8 GTTCTGGG 1 0 14212 CASAVA_Build 5 10688978 1I TGCTGAACTG -/A AAGGGGCTAG 3070 het 2890 hom 31 9 17 5 A 2 3 14213 CASAVA_Build 5 10689570 1I CAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 12 8 8 T 8 9 14214 CASAVA_Build 5 10690642 2I GGGTGGGAAC --/AG AGGGTGCCAG 3070 het 1734 hom 21 4 12 5 AG 1 2 14215 CASAVA_Build 5 10694914 3D TCTTGGAAAT AAA/--- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 13 13 7 A 11 8 14216 CASAVA_Build 5 10697118 1D GGTAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 16 15 14217 CASAVA_Build 5 10712581 3D GCATCCTGTG TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 12 9 14218 CASAVA_Build 5 10716140 1I GCGACTGAGT -/G GGGACCATGA 3070 hom 60 het 26 0 18 8 G 3 4 14219 CASAVA_Build 5 10720846 1D ACTCCACCAA C/- CCCCCTGCTG 3070 hom 89 het 33 0 29 5 C 6 5 14220 CASAVA_Build 5 10738614 4I TCTGAATTCT ----/AACA AACATTTTAG 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 AACA 1 2 14221 CASAVA_Build 5 10740643 3D AACTGCAGAT GTG/--- GTGAAAACAG 2462 het 2462 ref 28 16 6 8 GTG 2 1 14222 CASAVA_Build 5 10743813 3I ATTCATCTGC ---/TGA TGATGGACAC 3070 het 3070 ref 56 28 23 5 TGA 1 2 14223 CASAVA_Build 5 10745346 2D TTGAGAAGAC TT/-- TTAACATTCT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 4 2 14224 CASAVA_Build 5 10748978 1I TTCACAGAGA -/T TTTTTTTTTT 1253 het 1253 ref 43 22 5 16 T 15 16 14225 CASAVA_Build 5 10752879 1I CAAGGGGAAT -/G TCCAGAGTGT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 G 0 1 14226 CASAVA_Build 5 10781194 2D ATGCAGAACC CA/-- CAGATACAGA 3070 hom 99 het 40 0 32 8 CA 2 1 14227 CASAVA_Build 5 10794300 1D TGGTCTCTAC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 8 7 14228 CASAVA_Build 5 10801035 1D GGGGCACCAG C/- CCCTGGGTGT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 C 4 3 14229 CASAVA_Build 5 10810029 2I CAAACAAGCA --/GT CTCACCCCAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 GT 0 1 14230 CASAVA_Build 5 10812234 1D AGAAGGCGGA G/- GTTGCAGTGA 3070 het 2254 hom 17 5 12 1 G 2 1 14231 CASAVA_Build 5 10822644 2I AATTACTTGG --/TT TTTTTTTTTT 1548 hom 8 het 30 0 6 24 T 10 12 14232 CASAVA_Build 5 10830990 2D AATTGATAAC AT/-- GTGCTCCAGT 3070 het 3070 hom 66 25 36 7 AT 1 0 14233 CASAVA_Build 5 10831804 1I AAAACAAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 13 26 2 A 8 9 14234 CASAVA_Build 5 10837575 11I GAGGTAGAGG -----------/CTGCAGTGAGC CATATTATGC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 CTGCAGTGAGC 0 1 14235 CASAVA_Build 5 10847330 1I CAGGAAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 8 9 14236 CASAVA_Build 5 10849492 1D ATAATCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 12 11 14237 CASAVA_Build 5 10852567 36I TGGGCACTTC ------------------------------------/TTTGTTAGATTTATACCTAGGTATTTCCTTCTCATT TTTGCTACCA 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 TTTGTTAGATTTATACCTAGGTATTTCCTTCTCATT 0 1 14238 CASAVA_Build 5 10852754 1I AAGTGAAAAA -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 6 7 14239 CASAVA_Build 5 10853832 1D AGACGCCATT A/- AAAAAAAAAA 1951 het 619 hom 22 6 8 8 A 17 16 14240 CASAVA_Build 5 10854702 4D ATGGTGTTAG GTCT/---- GTGTTTCTTC 3070 het 3070 hom 32 12 17 6 GTCT 1 0 14241 CASAVA_Build 5 10860801 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AAAC 3 4 14242 CASAVA_Build 5 10863958 2D GCAGGGAATT AG/-- AGAGGAGGCA 3070 het 3070 ref 43 22 18 5 AG 3 2 14243 CASAVA_Build 5 10864562 1D GCAGCCCTGT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 34 4 18 13 G 2 1 14244 CASAVA_Build 5 10868295 1I CTTTTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 983 hom 29 4 14 11 A 13 14 14245 CASAVA_Build 5 10879742 14I AGACAGCAGT --------------/ACAAGCTGAGCAGC ACCAGCTGAG 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 ACAAGCTGAGCAGC 0 1 14246 CASAVA_Build 5 10881111 1D GCAAATTAAC A/- AATGGCATTT 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 A 3 2 14247 CASAVA_Build 5 10881581 2D ATATTCAGAC TG/-- TAAAATTGCC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 TG 1 0 14248 CASAVA_Build 5 10883303 1D TTAGTATAGG T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 T 8 7 14249 CASAVA_Build 5 10884123 2D GGAAAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 24 0 17 7 T 16 14 14250 CASAVA_Build 5 10884998 4I AGAGGGCCTC ----/AGGG AAGATGCTTC 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 AGGG 0 1 14251 CASAVA_Build 5 10903684 1D CCTTGGCCAC A/- GTTGGTTGGA 3070 het 3070 hom 55 24 26 5 A 1 0 14252 CASAVA_Build 5 10909728 30D ACATGTGTGT GCCTGCACCTGTCACTGCATGTATGTGTGC/------------------------------ GCCTGCACCT 3070 het 3070 ref 33 20 11 10 GCCTGCACCTGTCACTGCATGTATGTGTGC 2 1 14253 CASAVA_Build 5 10916113 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCGCTC 3070 het 2454 hom 26 11 11 4 AG 1 2 14254 CASAVA_Build 5 10921673 1D GAGTTGTGTG T/- TTGGAAATTG 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 T 3 2 14255 CASAVA_Build 5 10938552 1D GTAATCCCAG C/- ACTTGGGAGG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 C 1 0 14256 CASAVA_Build 5 10938842 2I TGAATGAGAA --/AC ACAGTACATA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 AC 1 2 14257 CASAVA_Build 5 10947329 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTAGCCA 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 T 5 6 14258 CASAVA_Build 5 10956134 3D AAAGAATGAT CTA/--- CTTCTTCATC 3070 het 3070 ref 49 28 18 4 CTA 1 0 14259 CASAVA_Build 5 10968178 1D AATATATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 11 10 14260 CASAVA_Build 5 10969162 4I CTTTGACACT ----/TGAG TGTTATAAGT 3070 het 3070 hom 36 9 25 2 TGAG 0 1 14261 CASAVA_Build 5 10970417 1D GAGCACACCA T/- TTTTTTTTTT 1736 het 1736 ref 31 13 8 10 T 16 15 14262 CASAVA_Build 5 10974294 1D AAAGGCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 11 10 14263 CASAVA_Build 5 10975749 13I GAGAAGTGAG -------------/AAGGAAAGGATTA GAGGAAAATG 3070 het 3070 ref 40 20 10 10 AAGGAAAGGATTA 0 1 14264 CASAVA_Build 5 10976623 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAGATGAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 5 4 14265 CASAVA_Build 5 10977458 1D ACATGCCTAC T/- TTCAGATATA 3070 het 3070 ref 62 28 27 9 T 3 2 14266 CASAVA_Build 5 10981834 1D CATTAGCTGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 T 9 8 14267 CASAVA_Build 5 10982868 5I AACACATCTC -----/TTTAA TTTTAGTTAT 3070 het 3070 hom 47 23 19 5 TTTAA 0 1 14268 CASAVA_Build 5 10987419 1D AAGGTAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 10 9 14269 CASAVA_Build 5 10996471 4D AGGAAACAGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 504 hom 54 9 24 21 A 14 10 14270 CASAVA_Build 5 10998737 1I TGGATGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 10 11 14271 CASAVA_Build 5 10998986 15D ATTAACCTAG GCATGCATGGGAACT/--------------- GGAGTCCAGG 3070 het 3070 ref 27 15 11 6 GCATGCATGGGAACT 1 0 14272 CASAVA_Build 5 11039723 1I CAACATGTAA -/G GGGGAAACAG 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 G 4 5 14273 CASAVA_Build 5 11040183 2I TCTTCCTCAT --/AG AGCCTATTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AG 1 2 14274 CASAVA_Build 5 11040741 1I CCTCCTGCCC -/T TCCTCTTTCC 2159 het 2159 ref 14 6 6 2 T 1 2 14275 CASAVA_Build 5 11062996 3I CAGATATCAT ---/ATG ATGAGTGTCT 3070 het 3070 ref 61 27 26 8 ATG 1 2 14276 CASAVA_Build 5 11070696 22D ATATCTTTCC ATATATATATATATCTTTCCAT/---------------------- ATATATATAT 2360 het 280 hom 10 1 6 4 ATATATATATATATCTTTCCAT 1 0 14277 CASAVA_Build 5 11073887 4D CAGTGAATGA GACT/---- GACTAAGCAG 3070 het 3070 ref 46 25 15 7 GACT 2 1 14278 CASAVA_Build 5 11083149 1D TGGCTGACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 15 8 T 10 9 14279 CASAVA_Build 5 11083591 1D TTTTCCTGTC T/- TTCAACTTTG 3070 hom 117 het 40 0 38 4 T 3 2 14280 CASAVA_Build 5 11086951 3D ACAACAACAG CAA/--- CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 CAA 5 4 14281 CASAVA_Build 5 11088968 1I AATGAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 910 hom 43 3 35 5 A 11 12 14282 CASAVA_Build 5 11096200 1I TCAGAGCTTA -/T TTTTTTTTTT 2279 het 2279 ref 29 9 11 9 T 13 14 14283 CASAVA_Build 5 11111905 1D CCACAGGGGT G/- AAGCTGCCCA 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 G 1 0 14284 CASAVA_Build 5 11121647 1D AAATTACTTA G/- GAAATCTATG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 2 1 14285 CASAVA_Build 5 11123806 1I TGAAGTGCTG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 7 8 14286 CASAVA_Build 5 11134345 1I GAAGAACAGA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 6 7 14287 CASAVA_Build 5 11162951 4D CTTACTCTGC TTTT/---- TCAAGAAACA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 5 1 14288 CASAVA_Build 5 11185077 1D TCTAGATGGT A/- AAGTTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 17 18 3 A 3 2 14289 CASAVA_Build 5 11186096 1D CAGTTAACTC G/- GCCAGAGATT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 G 2 1 14290 CASAVA_Build 5 11188562 2I CAGAAGAAAC --/AG AGTGGATTCA 3070 het 3070 hom 42 11 27 4 AG 1 2 14291 CASAVA_Build 5 11198459 1D TGCCTCCCCC T/- GTCCCAGCCC 3015 het 3015 ref 29 12 10 7 T 1 0 14292 CASAVA_Build 5 11199265 3I ACAACTGTCA ---/CGT CTTCCTCATC 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 CGT 0 1 14293 CASAVA_Build 5 11200773 2D TCAGCAGTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 A 16 14 14294 CASAVA_Build 5 11200839 3I TGAGAAAAAG ---/AGA AGAATAGGCC 3070 het 3070 ref 39 14 12 14 AGA 1 2 14295 CASAVA_Build 5 11209848 3D AGGTCAAGAG ACT/--- ACTTGCACTT 3070 het 3070 ref 47 23 20 6 ACT 2 1 14296 CASAVA_Build 5 11228754 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 T 8 9 14297 CASAVA_Build 5 11283481 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1108 hom 15 3 10 2 A 10 11 14298 CASAVA_Build 5 11285444 2D GAAAAGCTGC AG/-- ACACTCAACA 3070 het 2661 hom 27 8 18 2 AG 1 0 14299 CASAVA_Build 5 11308421 1D CCATTTCTGC A/- ACAGTTGGGC 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 2 1 14300 CASAVA_Build 5 11353053 1I ACGGCCACTT -/A ATGTGTGCTA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 1 2 14301 CASAVA_Build 5 11354296 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3043 het 34 hom 10 1 7 2 T 7 8 14302 CASAVA_Build 5 11364389 5D CTCCATGCAC CCTCA/----- CCTCACATGC 3070 het 3070 hom 82 28 48 10 CCTCA 2 1 14303 CASAVA_Build 5 11378063 1I TGCATTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 T 13 14 14304 CASAVA_Build 5 11401550 3D AATCAAGGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 2728 het 1819 hom 36 13 9 15 A 19 16 14305 CASAVA_Build 5 11409323 4D AATTGGTATG AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 32 11 4 AAAC 2 1 14306 CASAVA_Build 5 11411889 1I TGTGTAACTA -/T TTTCACCACA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 3 4 14307 CASAVA_Build 5 11415323 1D AACTTAGAAT G/- TTTTTTTACG 3070 hom 111 het 39 0 36 3 G 1 0 14308 CASAVA_Build 5 11415854 1D AGTTAGAAGG T/- TACTATTGCC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 2 1 14309 CASAVA_Build 5 11419793 1D ATGTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 12 11 14310 CASAVA_Build 5 11422898 3I GGATAGGGGG ---/ATC ATCAAGAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 ATC 1 2 14311 CASAVA_Build 5 11425770 1I CAGGAAGTAG -/A AAAGTAGCAC 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 A 3 4 14312 CASAVA_Build 5 11430330 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1643 hom 15 5 9 1 T 10 9 14313 CASAVA_Build 5 11438979 1I TTTCAGCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 9 10 14314 CASAVA_Build 5 11440244 1I CATATATCAG -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 8 9 14315 CASAVA_Build 5 11445929 1I CTCTCTGCAA -/T TTTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 T 5 6 14316 CASAVA_Build 5 11458029 2D GCCAATATTC AT/-- ATGTTTTAAC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 AT 2 1 14317 CASAVA_Build 5 11483535 1D TGACTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 10 A 17 16 14318 CASAVA_Build 5 11485393 1D ACATGGGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 12 11 14319 CASAVA_Build 5 11486459 9D AAATGAGATG CTGATGCAC/--------- CTGATGCACA 3070 het 3070 ref 33 21 9 9 CTGATGCAC 2 1 14320 CASAVA_Build 5 11487751 2D GCATTTGGAA AG/-- AGGGGGTAGA 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 AG 2 1 14321 CASAVA_Build 5 11540323 2D TCCTTCTTAC TA/-- TATACTCTTA 3070 het 3070 hom 32 10 19 5 TA 3 2 14322 CASAVA_Build 5 11542160 1I TAGACACAAG -/T TTTTCATTTC 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 T 4 5 14323 CASAVA_Build 5 11543651 1I AGACATTTCA -/T TTTGAATTTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 3 4 14324 CASAVA_Build 5 11555307 1D GAGAAATAAA T/- GTTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 1 0 14325 CASAVA_Build 5 11561100 1D AAGAAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3023 hom 50 14 25 12 T 14 13 14326 CASAVA_Build 5 11567212 1I AGGGGAGGAC -/T GCTTGAGCCA 3070 hom 78 het 29 0 24 5 T 0 1 14327 CASAVA_Build 5 11567315 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 10 9 14328 CASAVA_Build 5 11571411 3D AAGCTTATAG AAT/--- AATGATAGAA 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 AAT 2 1 14329 CASAVA_Build 5 11580025 1D AGTGAAAAAG A/- AAATAAAATT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 A 4 3 14330 CASAVA_Build 5 11596747 1D AGTAACGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 19 12 16 T 15 14 14331 CASAVA_Build 5 11597295 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2045 het 1573 hom 14 4 5 5 T 10 11 14332 CASAVA_Build 5 11599403 1I CAATAAAGCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 8 9 14333 CASAVA_Build 5 11607642 1I CTCAATGTTC -/T TATCTACAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 2 14334 CASAVA_Build 5 11608822 1I GAATTAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 9 10 14335 CASAVA_Build 5 11609872 1I CTCTCTTTGC -/A AAAAGTTCAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 5 14336 CASAVA_Build 5 11637608 4D TTCCTAGAGG AAGA/---- AACGCCCATA 3070 het 3070 ref 25 15 9 3 AAGA 1 0 14337 CASAVA_Build 5 11638900 1D AGGTGACATT A/- CAGAAAAGAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 1 0 14338 CASAVA_Build 5 11644668 1I TATTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 8 9 14339 CASAVA_Build 5 11646996 3I40M1I CACTAAGTAC ---TCATTAGAATGATTAAAATTCAGAGAGACAGATAATGCCC-/TCATCATTAGAATGATTAAAATTCAGAGAGACAGATAATGCCCA AAATTGGCAA 3070 het 3070 ref 37 29 19 9 N/A 0 0 14340 CASAVA_Build 5 11689144 1I TAATCCCCCC -/G CCACCCCCGC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 0 1 14341 CASAVA_Build 5 11694557 2D GAGTAAAAGG AT/-- ATATATATAT 1419 het 1419 ref 19 12 3 4 AT 10 9 14342 CASAVA_Build 5 11699743 8D ATTTCTTAGG AAATATCA/-------- AGTAAATTTC 3070 het 3070 ref 41 25 19 1 AAATATCA 1 0 14343 CASAVA_Build 5 11705488 1D TGTGAATCAA T/- TAAACCTCTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 2 1 14344 CASAVA_Build 5 11708374 1D GACTTAACTA T/- TTTTTTTTTT 1136 het 1136 ref 37 32 3 3 T 11 10 14345 CASAVA_Build 5 11708800 4D CTTTGCTTAT ATTG/---- ATTGATTATT 3070 het 3070 hom 53 20 26 10 ATTG 2 1 14346 CASAVA_Build 5 11709119 1D TTGATTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 10 23 7 A 11 10 14347 CASAVA_Build 5 11754826 1I AATATAAGCT -/C CCTGTAGTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 2 3 14348 CASAVA_Build 5 11777282 1I TAGTTAACTA -/T TTGAAAGGTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 2 3 14349 CASAVA_Build 5 11801298 11I GCTGACCTTA -----------/AAAGAACAAAT AGAAAACAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AAAGAACAAAT 0 1 14350 CASAVA_Build 5 11807575 4D GTTCTGTAGA TGTT/---- TGTTAGATCT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TGTT 2 1 14351 CASAVA_Build 5 11809886 3I GAATTTATCA ---/TGT TGTTTAAATC 3070 hom 99 het 45 0 34 11 TGT 1 2 14352 CASAVA_Build 5 11812309 1I TATGTCACTG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 7 8 14353 CASAVA_Build 5 11812680 2I CAATTAATTT --/CC CTCTGTCTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 1 3 14354 CASAVA_Build 5 11813910 1D ATTTATGTAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 9 8 14355 CASAVA_Build 5 11814833 1D GGAAACTCTG T/- TTTGGCTGTA 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 T 4 3 14356 CASAVA_Build 5 11821041 4I ATCTCATAGT ----/TTTA TTTGTCTGCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TTTA 0 1 14357 CASAVA_Build 5 11824564 6I AAAATGAAAA ------/ATAAAG ATAAGGAACA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 ATAAAG 0 1 14358 CASAVA_Build 5 11834348 1D CTAAGGAGTG T/- TAGGTGGAAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 1 14359 CASAVA_Build 5 11835459 1D66M1I CACTAAATAC AAAAAAAAAGCTGACCTTTTGTAAACTTACTACGTTTGAAATTTTTAAGAAAATGAGATAGAAGGAG-/-AAAAAAAAGCTGACCTTTTGTAAACTTACTACGTTTGAAATTTTTAAGAAAATGAGATAGAAGGAGA ATTAAACCTA 3070 het 3070 hom 40 21 18 25 N/A 0 0 14360 CASAVA_Build 5 11838769 1D TAAATAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 41 0 33 10 A 11 10 14361 CASAVA_Build 5 11840836 2I CTGTGCACAC --/AT GTGTGTGCAT 3070 hom 83 het 36 0 28 8 AT 0 1 14362 CASAVA_Build 5 11841408 3D3M8D TGCACAAGAC AGTGTGCTAAGGAC/---TTG-------- CCCTAGTCCT 3070 hom 102 het 35 0 35 4 N/A 0 0 14363 CASAVA_Build 5 11845409 2D TCTTTAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 129 het 53 0 44 9 AC 6 5 14364 CASAVA_Build 5 11849718 1D GCATATAACA T/- TTTCAAACAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 4 3 14365 CASAVA_Build 5 11856442 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 65 het 30 0 22 8 A 9 10 14366 CASAVA_Build 5 11856970 1D GAAATTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1874 het 1874 ref 45 30 4 11 T 10 9 14367 CASAVA_Build 5 11863596 2D TGAAAATTAA GT/-- GTGCATTGCA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 GT 2 1 14368 CASAVA_Build 5 11874647 1I TAGCAAAACC -/A AAAAAAAAAA 880 het 880 ref 37 28 3 6 A 11 12 14369 CASAVA_Build 5 11895235 1D TCACAACCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 53 17 30 6 A 10 9 14370 CASAVA_Build 5 11904373 2D TCTCTAATAC AT/-- GCGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 AT 1 0 14371 CASAVA_Build 5 11918543 1I CTTCAAAAAG -/A AAGGGAAAAG 3070 het 2469 hom 27 9 15 3 A 2 3 14372 CASAVA_Build 5 11925788 3D TGCATAAATG TCT/--- TCTTTTGAGA 1929 het 994 hom 6 2 4 1 TCT 2 1 14373 CASAVA_Build 5 11927204 1D AAAACAAACA G/- AAACGCTGGA 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 G 1 0 14374 CASAVA_Build 5 11928092 1D AACAATTGTG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 46 13 24 9 A 7 6 14375 CASAVA_Build 5 11940620 1I TTGAGCAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 11 12 14376 CASAVA_Build 5 11947204 1I TTCTGTGCAA -/T TTTGTTCAAA 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 T 3 4 14377 CASAVA_Build 5 11948781 1D TTATGCTCCC A/- AAATAGGAAC 3070 het 3070 hom 39 12 24 3 A 4 3 14378 CASAVA_Build 5 11958670 9D GTGATCTCCT CCACCCCCC/--------- CCACCCCCCC 3070 het 355 hom 27 2 16 9 CCACCCCCC 2 1 14379 CASAVA_Build 5 11961087 4I TGTTATTACT ----/GTAA GTATTTCCCC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 GTAA 0 1 14380 CASAVA_Build 5 11967487 1I TTGAATCAGT -/G GGTCAAGCTA 3070 het 3070 ref 36 14 15 7 G 2 3 14381 CASAVA_Build 5 11976579 1I TAAACCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 12 13 14382 CASAVA_Build 5 11978132 1D GCAACGTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 A 10 9 14383 CASAVA_Build 5 11979840 1I AGGAGAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 10 11 14384 CASAVA_Build 5 11984223 3I GACATATTAT ---/TTG TTATTTAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 TTG 0 1 14385 CASAVA_Build 5 11984664 1I AAAATCAAAG -/C CCCCCCCCGA 2321 het 2321 ref 27 14 7 6 C 8 9 14386 CASAVA_Build 5 11989750 1D AAGGAAAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 A 10 9 14387 CASAVA_Build 5 11990892 6I AAATAAAATC ------/AGAAAT AGAAGAGGAG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 AGAAAT 0 1 14388 CASAVA_Build 5 12001416 1I CATAAATCTA -/T TTTTTAAGAT 3070 het 3070 hom 44 18 25 1 T 5 6 14389 CASAVA_Build 5 12009740 1I ATAATGGACC -/A AATAATTGCT 3070 het 3070 ref 50 28 19 3 A 2 3 14390 CASAVA_Build 5 12011733 1I GCACAACGAA -/T TTTTTTTTTA 3029 het 2879 hom 24 8 9 7 T 9 10 14391 CASAVA_Build 5 12016405 1I GGTACTCTAA -/G TATGGGATAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 0 1 14392 CASAVA_Build 5 12023139 5I ATGCATATAT -----/ATATA ATATATGTAT 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 ATATA 1 2 14393 CASAVA_Build 5 12023270 2I TATACACATA --/TG TGTGTGTGTA 2500 het 2500 ref 42 20 9 13 TG 4 5 14394 CASAVA_Build 5 12049777 3I TTTCCATTCA ---/TGT TGTTGCAAAT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 TGT 1 2 14395 CASAVA_Build 5 12062739 4I TGGTATTGCT ----/TGGC TGGCAGACAA 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 TGGC 1 2 14396 CASAVA_Build 5 12070916 1D TCTGACATAA C/- TTTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 C 1 0 14397 CASAVA_Build 5 12073518 1D ACCTAGCTGT G/- GGGGGGGGTT 3070 het 2763 hom 33 10 12 11 G 9 8 14398 CASAVA_Build 5 12076307 1I GATGTTGGGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 40 22 9 9 A 8 9 14399 CASAVA_Build 5 12091541 1D AAGCAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 9 7 A 13 12 14400 CASAVA_Build 5 12095219 2D GAAACTGTGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TA 6 5 14401 CASAVA_Build 5 12097984 1I CCTCGGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 T 11 12 14402 CASAVA_Build 5 12107274 2I TGGCAGATAT --/AA GTTACCATGG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 0 2 14403 CASAVA_Build 5 12107954 15D GTATTTTAAA GTGGCAAATAAACAT/--------------- GTGGCTTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 22 7 GTGGCAAATAAACAT 1 0 14404 CASAVA_Build 5 12126839 4I AAGCTATCTT ----/AATG ATGAGACAGA 3070 hom 157 het 58 0 53 5 AATG 0 1 14405 CASAVA_Build 5 12130653 2D ACCTAATAAT AG/-- AGTTTCAAAA 3070 het 3070 hom 67 26 35 8 AG 2 1 14406 CASAVA_Build 5 12136051 1D AAGAAAAAAC T/- TCCAGCCAAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 T 2 1 14407 CASAVA_Build 5 12140731 1D GTTTTCTATT A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 A 8 7 14408 CASAVA_Build 5 12141040 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 404 hom 35 4 11 23 AC 10 9 14409 CASAVA_Build 5 12146241 1D ATTAACATTC T/- TTTTAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 9 T 5 4 14410 CASAVA_Build 5 12155554 3I AGACAGTGAC ---/AAT AATATTTCCT 3070 hom 111 het 39 0 38 2 AAT 1 2 14411 CASAVA_Build 5 12157250 1D TCCATCTAAA C/- CATCAACTAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 2 1 14412 CASAVA_Build 5 12178950 4D CTCACCCAGG AAGT/---- AAGTGCAAGA 3070 het 3070 ref 51 24 17 12 AAGT 2 1 14413 CASAVA_Build 5 12182141 2I TTAGATATGC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 9 11 14414 CASAVA_Build 5 12184764 2D ATAAATAAAT AA/-- AAAGAGAGTA 2890 het 2890 ref 21 9 9 5 A 5 3 14415 CASAVA_Build 5 12200675 4I CCCTCCCTCC ----/CTCT CTTTCTTCTT 3070 hom 89 het 36 0 27 9 CT 1 3 14416 CASAVA_Build 5 12201030 4D TCTTCTTTTT TCTC/---- TCTCTCTATT 2690 het 2690 ref 18 8 7 4 TC 5 3 14417 CASAVA_Build 5 12201829 1D ACATTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 17 8 T 11 10 14418 CASAVA_Build 5 12205777 1D AATACTTCTA G/- TCCAGTTAAA 3070 het 2841 hom 18 7 7 4 G 1 0 14419 CASAVA_Build 5 12209825 1D CAGGATCTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 12 13 8 T 10 9 14420 CASAVA_Build 5 12213537 1D TAGGAATGGC A/- AAAAAAAAAA 1561 het 1561 ref 35 25 4 6 A 12 11 14421 CASAVA_Build 5 12222667 2D AAATTTAAAA AT/-- ATATATATAT 2117 het 2005 hom 11 6 5 1 AT 6 5 14422 CASAVA_Build 5 12223731 3D CACAACTGTC AAA/--- GAAGGCTATC 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 A 3 0 14423 CASAVA_Build 5 12225407 1I TTCACTCAGA -/C AATGGAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 C 0 1 14424 CASAVA_Build 5 12233041 1D TACCAATAAG T/- TTTTTACCCT 3070 het 3022 hom 18 7 10 1 T 6 5 14425 CASAVA_Build 5 12242869 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 2825 hom 21 het 8 0 8 0 T 8 9 14426 CASAVA_Build 5 12249267 5D4M7D GCTAACCACC AATAAAGACTTAAGTT/-----TGAC------- ATGCTCTCTC 3070 het 3070 ref 31 20 14 5 N/A 0 0 14427 CASAVA_Build 5 12255471 2D TATATATAAC AT/-- GTGTGTATAC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 AT 1 0 14428 CASAVA_Build 5 12269708 12D CTCCGTCTCA AAAAACAAAAAC/------------ AAAAACAAAA 2362 het 2362 ref 14 9 6 4 AAAAAC 4 2 14429 CASAVA_Build 5 12274495 5I TGTAGATGTC -----/TTTTA TTTTGTCAGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TTTTA 0 1 14430 CASAVA_Build 5 12275806 3D ATTATTTATT TTC/--- TTCTTCTACC 3070 hom 98 het 35 0 33 3 TTC 3 2 14431 CASAVA_Build 5 12276933 1I TAATATTTTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 1079 hom 25 4 10 11 T 8 9 14432 CASAVA_Build 5 12276963 5D TTATAACCCA TTATT/----- TTAAACTTAT 3070 het 2081 hom 32 5 18 10 TTATT 1 0 14433 CASAVA_Build 5 12277340 1D TTGATGAAAT C/- CCTCAGCTTC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 C 3 2 14434 CASAVA_Build 5 12279823 1I TCCTGGTGTT -/G TTTTCCACTG 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 0 1 14435 CASAVA_Build 5 12282133 1D CACCTGCCCA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 8 7 14436 CASAVA_Build 5 12297603 1I TGTACTCTAG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 8 9 14437 CASAVA_Build 5 12307566 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAA 1938 het 530 hom 7 2 4 1 AG 1 0 14438 CASAVA_Build 5 12310741 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 9 10 14439 CASAVA_Build 5 12316447 1I TTTAAGATGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 10 14440 CASAVA_Build 5 12328633 1D CTTTGATCTC A/- AGACTTCAGA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 2 1 14441 CASAVA_Build 5 12338882 1I AAATATGATT -/C CCTGGACCAG 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 C 2 3 14442 CASAVA_Build 5 12338956 1I TCACTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 10 11 14443 CASAVA_Build 5 12345884 3I GTATAACAGC ---/GAT GATGTTTCCT 3070 hom 116 het 42 0 37 5 GAT 1 2 14444 CASAVA_Build 5 12353895 1D CATTATTGTC A/- AAATGTCAAA 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 A 4 3 14445 CASAVA_Build 5 12360502 5I TTATTTCTCT -----/TAATG TAATGTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 TAATG 1 2 14446 CASAVA_Build 5 12360691 1D TATATACTTG T/- TTTTTGTTGG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 6 5 14447 CASAVA_Build 5 12372802 30I ATGGATTAGG ------------------------------/GGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCA GGTATTAAGA 3070 hom 84 het 28 0 28 4 GGTTTATTGTACAGATTATTTCATCACTCA 0 1 14448 CASAVA_Build 5 12375272 1I CCTCAGAATG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 8 9 14449 CASAVA_Build 5 12390899 2D AACTAATCAC AT/-- ATAAAATATT 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 AT 2 1 14450 CASAVA_Build 5 12404000 2D TATCAGATTA TG/-- TGTGTGTGTG 2646 het 2646 ref 35 23 6 6 TG 7 6 14451 CASAVA_Build 5 12404328 1D ATTTTTACTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 7 14452 CASAVA_Build 5 12406273 4I TTTGTCTGTC ----/TGTT TGTTTGTTTT 3070 het 1414 hom 23 6 11 6 TGTT 2 3 14453 CASAVA_Build 5 12425215 3D TGGAGGGAGT AGC/--- AGATCTGGTG 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 AGC 1 0 14454 CASAVA_Build 5 12427521 5D TGTTGTCAAA TTTTC/----- TTTTCTTATT 3070 het 3070 ref 30 16 13 3 TTTTC 2 1 14455 CASAVA_Build 5 12433417 7I TAGCTATCAA -------/TCTAAAT TGCTTTGGGC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TCTAAAT 0 1 14456 CASAVA_Build 5 12434644 1I TCTCTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 T 15 16 14457 CASAVA_Build 5 12435978 1D ATATTTAGCA C/- CCCCCTAATA 3070 het 3070 ref 49 28 18 4 C 6 5 14458 CASAVA_Build 5 12441759 4D GTTTTTTAAG ATTT/---- ATTAAACTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 ATTT 1 0 14459 CASAVA_Build 5 12444900 4I CTATGTATTT ----/TAGG CCTAACATTT 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 TAGG 0 1 14460 CASAVA_Build 5 12448014 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 22 1 18 3 A 13 12 14461 CASAVA_Build 5 12452971 14I GTGTGTTTAT --------------/ACATACACACACAC ACATACACAC 3070 het 3070 ref 32 11 10 11 ACATACACACACAC 1 2 14462 CASAVA_Build 5 12457243 2I TTAAATCAGC --/AG AGAGTAGGGT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 AG 2 3 14463 CASAVA_Build 5 12461213 1D AAGTCTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 18 8 7 3 T 11 10 14464 CASAVA_Build 5 12463544 1D GTTTCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 21 15 14 T 13 12 14465 CASAVA_Build 5 12463903 5I AACTCTACAC -----/CTTAA CTTCATTCCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CTTAA 0 1 14466 CASAVA_Build 5 12465096 4D TTGATACTTG TAGA/---- TAGATGTTCA 3070 het 3070 ref 46 23 13 14 TAGA 2 1 14467 CASAVA_Build 5 12470718 2D CCCAAATATC CT/-- CTTTTAGGTT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 CT 2 1 14468 CASAVA_Build 5 12480260 5I TAGTTTCTTA -----/TTTTT TTTTATTCCA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 4 9 14469 CASAVA_Build 5 12484603 10I ATTGTACCAG ----------/TACAATAAAT TACAATAAAT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 TACAATAAAT 1 2 14470 CASAVA_Build 5 12486585 1D CTCACTCCCT C/- CCCCCCTCCA 3070 het 887 hom 18 4 9 5 C 7 6 14471 CASAVA_Build 5 12486646 4D29M4D GTTATTTTCC TCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTCTCTTCTTTCTTTCTC/----TCTTTCTTTCTCTTTCTCTCTTCTTTCTT---- TCTCTTTCTT 3070 het 377 hom 16 1 9 9 N/A 0 0 14472 CASAVA_Build 5 12487618 3D GGAAAAAAGA AAG/--- AAGGAGAGAG 3070 het 3070 ref 45 24 14 8 AAG 2 1 14473 CASAVA_Build 5 12488933 4D CTGCTTTAAT TATA/---- TATAGTTATA 2195 het 1291 hom 10 3 6 1 TA 4 2 14474 CASAVA_Build 5 12490444 1D ATAGGGGAAG C/- CCTTTTATGG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 C 3 2 14475 CASAVA_Build 5 12499538 1D GCCCACCCAG A/- AATCAAATCC 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 3 2 14476 CASAVA_Build 5 12499990 5I TTTAAGAAAG -----/AAAGT AAATTTATAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAAGT 0 1 14477 CASAVA_Build 5 12505896 1D GTGTTAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 21 1 12 8 T 11 10 14478 CASAVA_Build 5 12518324 1I ACCCATTGTA -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 27 10 17 0 T 6 7 14479 CASAVA_Build 5 12553036 2I TGTCTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 TG 8 9 14480 CASAVA_Build 5 12576189 1D GCATACCTCT A/- AAGTAAATGC 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 A 3 2 14481 CASAVA_Build 5 12583224 1D ATCCTAAGTC T/- TTTCTCATGT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 4 3 14482 CASAVA_Build 5 12584103 1D TATGTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 12 11 14483 CASAVA_Build 5 12603424 1D TATTTTTTTT G/- TGTGTATATC 3070 hom 126 het 44 0 43 1 G 1 0 14484 CASAVA_Build 5 12604770 1D AGAAGTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 15 14 14485 CASAVA_Build 5 12611935 4D TCTAAATACT TTTA/---- TTTGCTGTCC 3070 het 3070 hom 27 8 15 5 TTTA 1 0 14486 CASAVA_Build 5 12612011 1D CATTACATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 829 hom 21 3 15 3 T 13 12 14487 CASAVA_Build 5 12619838 1I CCCCTGGCAC -/A AAGTGCCAAG 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 A 2 3 14488 CASAVA_Build 5 12626171 4D TCTTCCCTTA AAAG/---- AAAGAGTTAC 3070 het 3070 hom 38 17 21 3 AAAG 2 1 14489 CASAVA_Build 5 12633422 4I ACATTCTTTC ----/TTTT ATCTACTAAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 0 4 14490 CASAVA_Build 5 12636078 1I CTAAAAAAAA -/T AAAAATTTTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 14491 CASAVA_Build 5 12644386 1I TGTACAAAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 T 7 8 14492 CASAVA_Build 5 12652899 2D ATACACATAT AC/-- ACACACATAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AC 4 3 14493 CASAVA_Build 5 12653050 1I ACAGAATTTC -/A AAGTATACAT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 2 3 14494 CASAVA_Build 5 12653916 5D ACTGGAACTT TACTC/----- TACACGTTTC 3070 het 3070 ref 29 15 14 1 TACTC 1 0 14495 CASAVA_Build 5 12668180 1D CTTGTAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 45 0 37 10 A 11 10 14496 CASAVA_Build 5 12669772 4I CTACCCAGTT ----/TGTA TGTAGTACTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TGTA 1 2 14497 CASAVA_Build 5 12674195 1D TCTGTCATCA T/- AATGATTGTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 T 1 0 14498 CASAVA_Build 5 12678333 1I AGATTCCAGA -/G GGAAGTATGG 3070 hom 96 het 36 0 31 5 G 2 3 14499 CASAVA_Build 5 12679433 2D ACAGACTAAT AC/-- ATAGGGGCAA 1389 het 1389 ref 15 9 3 4 AC 1 0 14500 CASAVA_Build 5 12683731 7D TATCTTGGAT ATATACC/------- ACTGATGATT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 ATATACC 1 0 14501 CASAVA_Build 5 12688064 1I TGGTGAACAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 8 9 14502 CASAVA_Build 5 12691215 14D TCACTCAGAG AACACAGCAATAGT/-------------- ATACTAACTG 3070 het 3070 ref 49 24 24 4 AACACAGCAATAGT 1 0 14503 CASAVA_Build 5 12696518 2D TGAAAAATAT AA/-- GAGAAAGTTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 5 A 2 0 14504 CASAVA_Build 5 12702623 1I CTGGATTAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 A 7 8 14505 CASAVA_Build 5 12709852 1I TCAACATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 A 10 11 14506 CASAVA_Build 5 12711972 1D ACACTTATTC T/- TTTCTCAACA 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 T 4 3 14507 CASAVA_Build 5 12716100 1I TTAAGAACTG -/T TAACACTCAC 3070 het 3070 ref 26 9 10 7 T 1 2 14508 CASAVA_Build 5 12720410 3I GGTACTTGCC ---/CCT CCTCTAGAAA 1902 het 1724 hom 10 4 5 1 CCT 1 2 14509 CASAVA_Build 5 12728121 1D AAAAAAACTT A/- ATGAAGTCCT 3070 het 3070 hom 37 16 21 2 A 2 1 14510 CASAVA_Build 5 12731892 3D TAAAGTTTCC AAT/--- AATAATACAT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AAT 3 2 14511 CASAVA_Build 5 12732380 4I TGAAAACAAA ----/AAAC AAATAGAAGT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 AAAC 0 1 14512 CASAVA_Build 5 12733081 5D AATGATTTAT TTAAA/----- TTAAATAATT 1557 het 973 hom 8 3 5 1 TTAAA 2 1 14513 CASAVA_Build 5 12733691 3D11M3I TTTGTAATCT TCATCAAAGAAGAT---/---TCAAAGAAGATAAG AAAGATTTTA 2662 het 2662 ref 35 21 13 5 N/A 0 0 14514 CASAVA_Build 5 12734035 2D TGAATAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 80 hom 20 1 12 8 AT 6 5 14515 CASAVA_Build 5 12736938 4D GTGTATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 20 21 7 AC 9 7 14516 CASAVA_Build 5 12741592 4I CCGATGGCAC ----/CTTT CTTCAGAATA 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 CTTT 0 1 14517 CASAVA_Build 5 12745583 4I TCAGAAAAAA ----/TAAG TAAATAAATA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TAAG 0 1 14518 CASAVA_Build 5 12745889 1I AGCGAGTGAT -/C CATGGTTAAA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 C 1 2 14519 CASAVA_Build 5 12746410 4I ATGTTTTACT ----/TACA TTTCTATTTT 3070 hom 48 het 26 0 17 9 TACA 0 1 14520 CASAVA_Build 5 12747112 1D AAACCAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 14 14 A 17 16 14521 CASAVA_Build 5 12760131 3D AAAAAATGTT AAG/--- AAGTGACAGC 3070 het 3070 hom 44 16 25 4 AAG 2 1 14522 CASAVA_Build 5 12769042 2D TACTTTTACT TC/-- TGTGTTATGT 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 TC 1 0 14523 CASAVA_Build 5 12772027 1D TCTGCTCTAC A/- AATTAATTTA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 A 3 2 14524 CASAVA_Build 5 12772767 5I TGTGTGATTG -----/ATGAA ATGAAACCAG 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 ATGAA 1 2 14525 CASAVA_Build 5 12782265 1I TTGCTAAAAC -/A AATAAAAGAG 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 A 2 3 14526 CASAVA_Build 5 12787692 1D GAGAAATTTT C/- AAACATAGAG 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 C 1 0 14527 CASAVA_Build 5 12789568 4I TTAGAAATAA ----/TATT TATCCATTAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 TATT 0 1 14528 CASAVA_Build 5 12790747 2D ATGAAGTAAC AT/-- GTGCTTAATA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AT 1 0 14529 CASAVA_Build 5 12793257 3D TATAAAACAT AAG/--- AAAATTCTAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 6 AAG 1 0 14530 CASAVA_Build 5 12794047 2I ATTTTAAACC --/CT GTGTTGAGAC 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 CT 0 1 14531 CASAVA_Build 5 12796423 1D CAATAGGTGC A/- ACAGAGGGTC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 2 1 14532 CASAVA_Build 5 12799627 1I TAAGCTTTGA -/T TTTTGAGTAA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 4 5 14533 CASAVA_Build 5 12803938 3D TTTGTGAGAT TAA/--- TATTTTCCTC 3070 het 3070 ref 27 11 11 6 TAA 1 0 14534 CASAVA_Build 5 12814255 1D TATTTATACA G/- TGCTGTATTT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 G 1 0 14535 CASAVA_Build 5 12815342 4D TCCATCACCT CAAA/---- CATTTATCAG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 CAAA 1 0 14536 CASAVA_Build 5 12816922 3D TACATAAGTT CAA/--- CACCAAAATC 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 CAA 1 0 14537 CASAVA_Build 5 12818078 1I TTATTCCTGA -/T TTTTGGCAGA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 4 5 14538 CASAVA_Build 5 12830210 5I ATTTATACTA -----/TACTT TACCATATGA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 TACTT 0 1 14539 CASAVA_Build 5 12841779 1D GAGTCATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 11 10 14540 CASAVA_Build 5 12848860 1D GACCCCCAGA G/- CCCCATCACA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 G 1 0 14541 CASAVA_Build 5 12851317 1D GATGCAGAGC A/- AGGCCGTGGT 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 A 2 1 14542 CASAVA_Build 5 12853172 4I CTAAATTTTG ----/AACT AACTAATTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AACT 1 2 14543 CASAVA_Build 5 12854659 1D TCTCTCTCTC T/- CCCCCCCCCC 684 het 225 hom 24 3 3 18 T 1 0 14544 CASAVA_Build 5 12855362 1D TTTCATGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 13 12 14545 CASAVA_Build 5 12855874 2D CAGCTAATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 784 hom 18 2 15 1 TG 8 7 14546 CASAVA_Build 5 12857332 1I AGAATGGCAG -/A AAATGTGAAG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 A 3 4 14547 CASAVA_Build 5 12860720 1D ATGCAAGTAG T/- TTTGATTATT 3070 het 3070 ref 50 19 18 13 T 4 3 14548 CASAVA_Build 5 12862373 1D ATTTGGAGGT G/- GGGGTCTTTG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 5 4 14549 CASAVA_Build 5 12863259 4I GAGATGGAGT ----/CTCA CTCTGTCGCC 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 CTCA 0 1 14550 CASAVA_Build 5 12864003 4D TAATTTTAAC TTTT/---- TTTGAGTTAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 7 3 14551 CASAVA_Build 5 12874034 1D CTGGCAAAAC A/- AACAGTATAT 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 3 2 14552 CASAVA_Build 5 12874612 2D GTTTCATCCA TG/-- TCTTGCTGCA 3070 hom 123 het 46 0 42 6 TG 1 0 14553 CASAVA_Build 5 12877645 1I ATTGAGACTT -/G CCTTCTGGCC 3070 hom 126 het 44 0 42 2 G 0 1 14554 CASAVA_Build 5 12879061 3D CCTGAAGTTC TCT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 22 3 10 9 TCT 1 0 14555 CASAVA_Build 5 12889747 5D GTCATCCTAT AACTC/----- AACTCTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AACTC 2 1 14556 CASAVA_Build 5 12890375 4D TTTCTATAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 214 het 214 ref 27 12 3 13 AAAC 1 0 14557 CASAVA_Build 5 12890966 3D GAAGAAAAGA GAC/--- GACTGAAGTA 3070 hom 151 het 54 0 51 4 GAC 2 1 14558 CASAVA_Build 5 12891158 1D ACAAGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 1688 het 1688 ref 41 29 4 8 T 12 11 14559 CASAVA_Build 5 12892939 1I TTTCATTTCA -/T TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 6 7 14560 CASAVA_Build 5 12896076 5D TTTTTTCCTA TATTT/----- TATTTTATTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 TATTT 3 2 14561 CASAVA_Build 5 12900920 5D AAAAAAAAAA AAGAG/----- AGAGAGAGAG 2775 het 94 hom 27 2 16 11 AAGAG 1 0 14562 CASAVA_Build 5 12902564 4I AAATAAGATT ----/AATA AATATCAATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AATA 1 2 14563 CASAVA_Build 5 12905417 3D TCATCTTTTG TTC/--- TTCTAATTGC 3070 het 3070 hom 24 9 11 6 TTC 2 1 14564 CASAVA_Build 5 12930823 6I ATTGTGCTAA ------/TTAAAT TTACATTTAG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TTAAAT 0 1 14565 CASAVA_Build 5 12931419 2I TACTTTTCAC --/TG TGTTTCTCAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 TG 1 2 14566 CASAVA_Build 5 12943976 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1905 hom 25 7 11 7 T 11 12 14567 CASAVA_Build 5 12952861 4I TAAATAATTA ----/TAAT TAATATAATT 2867 het 2867 ref 20 11 8 1 TAAT 1 2 14568 CASAVA_Build 5 12955385 1D AGATTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 39 0 28 11 A 13 12 14569 CASAVA_Build 5 12955496 1I CTGTTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 39 1 34 4 T 11 12 14570 CASAVA_Build 5 12956361 1D ACGCAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 876 het 876 ref 41 28 2 11 T 13 12 14571 CASAVA_Build 5 12964071 4D TTATCAGGCA ACAC/---- ACACACACAC 2670 het 2670 ref 35 16 9 10 AC 9 7 14572 CASAVA_Build 5 12966504 26D AGATGGAAGA TTTAATGGTAGATTCCTTACTAGCAG/-------------------------- TTTAATGGTA 3070 het 3070 ref 35 16 11 15 TTTAATGGTAGATTCCTTACTAGCAG 1 0 14573 CASAVA_Build 5 12977549 2I GGTATGTGGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 38 1 27 10 A 10 12 14574 CASAVA_Build 5 12981141 2D ACACAAATAA AC/-- ACTCTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 16 23 3 AC 2 1 14575 CASAVA_Build 5 12984385 3D AGGTCCTGGT AGG/--- AGGTGATTGG 3070 het 3070 ref 43 19 19 7 AGG 2 1 14576 CASAVA_Build 5 12991794 1I GCCACTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 A 10 11 14577 CASAVA_Build 5 12998321 1I TTTTGTTTGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 A 7 8 14578 CASAVA_Build 5 13002196 2D AAGCAAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 28 2 14 14 A 12 10 14579 CASAVA_Build 5 13009088 1D TATATTTCCA T/- ACTTATAAAG 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 T 1 0 14580 CASAVA_Build 5 13011884 1I GCAAACTTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 8 9 14581 CASAVA_Build 5 13019496 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 2606 hom 27 het 11 0 9 2 A 9 10 14582 CASAVA_Build 5 13020810 1D ATGTTGAGCA T/- TTTTTTTTTT 1313 het 1313 ref 41 25 3 13 T 13 12 14583 CASAVA_Build 5 13026047 1D TTTTCCACAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 8 14584 CASAVA_Build 5 13026906 3D ATATATATAG ACC/--- ACAATACTGG 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 ACC 1 0 14585 CASAVA_Build 5 13029179 3I ATTCATTCAA ---/CAT CATTTTTTAA 3070 hom 117 het 40 0 39 1 CAT 1 2 14586 CASAVA_Build 5 13031982 1D AAACTCTACC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 7 6 14587 CASAVA_Build 5 13038698 6I TTAATGAATA ------/ATAAAT ATATTTTCTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATAAAT 0 1 14588 CASAVA_Build 5 13058378 2I AAATTTTCCC --/CT GTGTTATCAC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 CT 0 1 14589 CASAVA_Build 5 13059597 5D TCTTGGGATT TTAAC/----- TTAGACAATT 3070 het 3070 ref 27 14 12 3 TTAAC 1 0 14590 CASAVA_Build 5 13060340 1D TCTACCCACC A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 A 8 7 14591 CASAVA_Build 5 13062171 1I CGAACATAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 287 hom 38 1 30 7 A 9 10 14592 CASAVA_Build 5 13062894 1I AAGTTTATTA -/T TTTTTTTTTA 3004 hom 24 het 12 0 9 3 T 9 10 14593 CASAVA_Build 5 13071103 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAATA 740 het 740 ref 18 7 7 4 T 0 1 14594 CASAVA_Build 5 13084914 1D TATAAAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 37 0 30 7 A 12 11 14595 CASAVA_Build 5 13086339 4I ACAAAGCATC ----/AATT GAGTTATTCA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AATT 0 1 14596 CASAVA_Build 5 13087490 3D TATAATTGAT GTA/--- GTAATATAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 GTA 2 1 14597 CASAVA_Build 5 13087875 1D CGTAGACTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 10 9 14598 CASAVA_Build 5 13089471 3D TTACAGAGAC AAT/--- AATAAATCGG 3070 hom 117 het 45 0 40 8 AAT 2 1 14599 CASAVA_Build 5 13103225 1I TGTCATACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 944 hom 30 2 20 8 T 10 11 14600 CASAVA_Build 5 13107437 1D AGATACTTAT A/- TTTTTTTTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 0 14601 CASAVA_Build 5 13114269 5I CTTTTTTTTT -----/TTTTC TTTATTTTTT 3070 hom 77 het 38 0 30 8 TTTTC 0 1 14602 CASAVA_Build 5 13115461 4I AGTCAGTAAT ----/AATG AATTGTGTGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AATG 0 1 14603 CASAVA_Build 5 13118172 1D ATTTAACAAT A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 7 6 14604 CASAVA_Build 5 13122003 1D ACACTTGGGG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 8 7 14605 CASAVA_Build 5 13123145 3I AAGAAGAAAA ---/AGG AGGAGGTGCT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 AGG 2 3 14606 CASAVA_Build 5 13124982 2D TTATTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 17 9 A 16 14 14607 CASAVA_Build 5 13125145 1I TACAAACTTT -/A AAAAAAAAAA 1728 het 1728 ref 18 10 5 3 A 10 11 14608 CASAVA_Build 5 13131325 5I TAAATGGCAT -----/CATCA CATAATACAT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 CATCA 0 1 14609 CASAVA_Build 5 13141244 1I TTAGAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 13 14 14610 CASAVA_Build 5 13150407 1D CAGGAGATCT A/- CAGGAAATCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 1 0 14611 CASAVA_Build 5 13151386 3I CTGTTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TTG 3 4 14612 CASAVA_Build 5 13152291 1I TTAACTTTTT -/C CCCGCTTAAG 3070 hom 45 het 22 0 16 6 C 3 4 14613 CASAVA_Build 5 13152544 1D ATGATGGTCT A/- TTTAGGAAAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 0 14614 CASAVA_Build 5 13155121 1I AAACTAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 9 10 14615 CASAVA_Build 5 13167470 2I TTAAAGTATT --/TA AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 28 0 25 3 TA 0 1 14616 CASAVA_Build 5 13170710 3D CCATTTTTCA TCT/--- GTACCCATAG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TCT 1 0 14617 CASAVA_Build 5 13178427 3D TACACTGTCG GTA/--- GGAGTGTAAA 3070 hom 42 het 20 0 13 7 GTA 1 0 14618 CASAVA_Build 5 13181882 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 609 het 609 ref 15 9 2 4 A 15 14 14619 CASAVA_Build 5 13184351 2D TTCAAATAAA AG/-- AACATTTTAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AG 1 0 14620 CASAVA_Build 5 13204409 1D AATAATCAAT A/- ACTTGATTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 1 14621 CASAVA_Build 5 13205516 1I TTATCAAAGG -/C CTTTTCTGAA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 C 1 2 14622 CASAVA_Build 5 13206940 7I CAAACCTGCA -------/CATTTTC CATTTTCCAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 CATTTTC 1 2 14623 CASAVA_Build 5 13208632 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 5 hom 28 1 20 7 TA 5 6 14624 CASAVA_Build 5 13214863 3D GCAGGTTCTT GTG/--- GTGTTTTATC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 GTG 2 1 14625 CASAVA_Build 5 13218628 7D TATATAATAA ATAATAT/------- ATAATATATA 1471 hom 7 het 5 0 3 2 ATAATAT 4 3 14626 CASAVA_Build 5 13227493 2I ATGGCTTAAC --/AA GAGAGGATTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 0 2 14627 CASAVA_Build 5 13246769 3I ACAGGTCATA ---/ATC ATTACTCTCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATC 0 1 14628 CASAVA_Build 5 13255176 2I GAGCAGGCAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 AG 5 6 14629 CASAVA_Build 5 13259590 1D CAGAATTTCT G/- CTTTCTAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 1 0 14630 CASAVA_Build 5 13259829 1I ATGTGTTTCC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 9 14631 CASAVA_Build 5 13270210 2I TGTATATATG --/TA TATGTGTTTA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 1 2 14632 CASAVA_Build 5 13281692 4D ATGCATATAA ATAT/---- ATAAATATGT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AT 3 1 14633 CASAVA_Build 5 13283601 1D TCCAAATTTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 8 14634 CASAVA_Build 5 13289905 1I CCAAGGTGTC -/A AGCAGAAATA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 1 2 14635 CASAVA_Build 5 13299416 1I TCTTGTACTT -/C CTTTGCACAC 3070 hom 141 het 51 0 47 4 C 1 2 14636 CASAVA_Build 5 13311613 2D AGACCCACTT GA/-- GAGAAATATA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 GA 3 2 14637 CASAVA_Build 5 13314449 1I GTAGCCAAAT -/C CACTAAAGCT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 C 1 2 14638 CASAVA_Build 5 13315535 13D CTGATCCTTC AGCATTGTGATGA/------------- AGCAACACTG 3070 hom 96 het 37 0 33 6 AGCATTGTGATGA 1 0 14639 CASAVA_Build 5 13316230 1I TCCCTTTAGC -/T TCCCACTTAT 3070 hom 94 het 33 0 30 3 T 1 2 14640 CASAVA_Build 5 13318497 4I GTGTGTATTT ----/ATAC ATACATTTAC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 ATAC 1 2 14641 CASAVA_Build 5 13319564 4D TCACATATAT AGAG/---- AGAGTGTGAT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 AG 4 2 14642 CASAVA_Build 5 13321518 1D GTGAGGGATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 9 14643 CASAVA_Build 5 13322577 3I TATATATTAA ---/TAT TATTACATAG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TAT 1 2 14644 CASAVA_Build 5 13323166 3D AACAATAACT ATA/--- ATAATATTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 5 ATA 3 2 14645 CASAVA_Build 5 13325844 4I CTTGTCACAT ----/ACAC ACACGCACAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AC 2 4 14646 CASAVA_Build 5 13327461 1D TTGAGCACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 41 1 32 8 T 12 11 14647 CASAVA_Build 5 13345478 1D AAGAGATCTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 T 9 8 14648 CASAVA_Build 5 13364240 8D GGTGGGTGGG GGTAGGTA/-------- GGTAGGTAGG 595 hom 5 het 5 0 2 3 GGTA 6 4 14649 CASAVA_Build 5 13370033 4D ATGTATCATC TAAA/---- TAAACTTATA 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TAAA 2 1 14650 CASAVA_Build 5 13375810 2D CCAGACTATT CA/-- CACCCTTGAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 CA 2 1 14651 CASAVA_Build 5 13377144 4D CCAATTTTTG ACTT/---- ACTATTTACT 3070 hom 123 het 44 0 42 5 ACTT 1 0 14652 CASAVA_Build 5 13381991 2D CAGGACAGAC TT/-- TATCAATACG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 3 1 14653 CASAVA_Build 5 13387225 2D TTTACATCTC TT/-- GTCTTAAATG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 2 0 14654 CASAVA_Build 5 13387334 1D AAAGTTATTT A/- AAATGACTAA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 4 3 14655 CASAVA_Build 5 13390512 4D ACCCTTATTC CTTT/---- CTTTCTTTAA 3070 hom 78 het 34 0 27 8 CTTT 3 2 14656 CASAVA_Build 5 13393923 2D TTCAGTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 29 0 19 11 T 14 12 14657 CASAVA_Build 5 13395501 4D ATCTATCCAT CAGA/---- CAAAGTCTGA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 CAGA 1 0 14658 CASAVA_Build 5 13398083 1I CCTATTAAAG -/A AAAAAAGGCA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 6 7 14659 CASAVA_Build 5 13403028 2D TCATTTTTTG GT/-- GTCTTTCTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 7 GT 2 1 14660 CASAVA_Build 5 13406166 4D TTGAAGTCTT CAGA/---- CATACTATAG 3070 hom 142 het 50 0 47 4 CAGA 1 0 14661 CASAVA_Build 5 13407799 4D CTTGGAGGCC TTCT/---- TTCTGGCTTA 3070 hom 120 het 45 0 41 6 TTCT 2 1 14662 CASAVA_Build 5 13407916 3I CCCACCTCTT ---/ACC ACCACCACAT 3070 hom 112 het 44 0 36 8 ACC 2 3 14663 CASAVA_Build 5 13417476 2D AATTGAAAAA AC/-- AGAAAAAGAG 3070 hom 48 het 19 0 17 4 AC 1 0 14664 CASAVA_Build 5 13418104 5D CAGAAGATAG AAGAT/----- AAGGGAATAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAGAT 1 0 14665 CASAVA_Build 5 13418632 1I TGTTTTTATG -/A GAAAAAAAAC 3070 hom 109 het 38 0 37 1 A 0 1 14666 CASAVA_Build 5 13422422 1I ATCCAAATAG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 936 hom 36 3 25 8 A 0 1 14667 CASAVA_Build 5 13423351 2I TGCCAGAAAA --/AC AAAAATTGAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AC 0 1 14668 CASAVA_Build 5 13423743 4D GTCAATTGGT TCAG/---- TCACTGTGAA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 TCAG 1 0 14669 CASAVA_Build 5 13426427 1I AATGAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 36 1 28 7 A 10 11 14670 CASAVA_Build 5 13438759 1D GAAAAATGAG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 8 7 14671 CASAVA_Build 5 13448427 2I CGCGCGCGCG --/CA CACACACACA 3070 het 55 hom 38 2 24 12 CA 7 8 14672 CASAVA_Build 5 13452959 74D TAAATGAGGG ATGCCTCTTTGGATCACCACTGATTTTCAGGGTCAGTGCTGTCATCTTTGCTTTAGCCACCATCTAACTGAGCC/-------------------------------------------------------------------------- ACTCTAAGGA 3070 hom 56 het 16 0 18 4 ATGCCTCTTTGGATCACCACTGATTTTCAGGGTCAGTGCTGTCATCTTTGCTTTAGCCACCATCTAACTGAGCC 1 0 14673 CASAVA_Build 5 13458844 1D AGACATGAGA T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 126 het 51 0 41 10 T 8 7 14674 CASAVA_Build 5 13459857 1D48M1I CTACTCTGGT AACTGTTATTTTTTCTGGTTGTGGCCAGTATTTTTTTTTCCGGTAAGCA-/-ACTGTTATTTTTTCTGGTTGTGGCCAGTATTTTTTTTTCCGGTAAGCAT TTTTTTTAAT 3070 hom 146 het 36 0 49 6 N/A 0 0 14675 CASAVA_Build 5 13465317 2I TCCCCCCACC --/CA CACACACACA 3070 hom 79 het 38 0 22 16 CA 6 7 14676 CASAVA_Build 5 13466343 6D GTCAGTGAGC TAAGAG/------ TAAGTATTGA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TAAGAG 1 0 14677 CASAVA_Build 5 13483144 12D ATATATATAT ATATATATATAC/------------ ACATATATGA 3070 hom 51 het 17 0 18 6 ATATATATATAC 1 0 14678 CASAVA_Build 5 13487706 1I GGGGGAGACA -/G GGCCAGGTGG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 G 2 3 14679 CASAVA_Build 5 13488069 1D CACAACAATT A/- AATAGCAGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 3 2 14680 CASAVA_Build 5 13488650 1I GCCCCCAGAA -/C CCTGGCAAGG 3070 hom 143 het 56 0 47 9 C 2 3 14681 CASAVA_Build 5 13498094 1I ATAATACTTC -/T TGCTTCTTTA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 1 2 14682 CASAVA_Build 5 13510354 1I AAAAGTAGAA -/G CAAAATATTT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 G 0 1 14683 CASAVA_Build 5 13511690 1I ACAATTCTGG -/C ACATAATAGG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 0 1 14684 CASAVA_Build 5 13529539 1D AAACCTAGGC A/- GCAATTTTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 1 0 14685 CASAVA_Build 5 13569415 1I ACTCAGACCA -/G GGCTCAGTCA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 2 3 14686 CASAVA_Build 5 13593802 1I AAGAAAAACC -/A AAACCAATGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 4 14687 CASAVA_Build 5 13620264 1D TGCGGGCCAT A/- AAAAAAAAAA 1278 het 1278 ref 36 28 3 5 A 11 10 14688 CASAVA_Build 5 13651321 1D GCCTTCTGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 9 8 14689 CASAVA_Build 5 13652664 1D TTAAACAAAC A/- AAAAAATGAG 3070 hom 111 het 45 0 38 8 A 7 6 14690 CASAVA_Build 5 13662048 1I TAGTTGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 A 13 14 14691 CASAVA_Build 5 13669267 4D CATGGAAATT AAAC/---- AACACACTCC 3070 hom 69 het 27 0 24 4 AAAC 1 0 14692 CASAVA_Build 5 13674916 1I CTCTGAGCTT -/C CTCCACTCCC 3070 hom 102 het 36 0 34 2 C 1 2 14693 CASAVA_Build 5 13686267 1I28M9I TCAGGGCCAT -CACAGAAAACAAAATCTGCACACACTCA---------/CCACAGAAAACAAAATCTGCACACACTCAGTGTGCTGT AGTCCTGTAG 3070 hom 160 het 47 0 53 3 N/A 0 0 14694 CASAVA_Build 5 13689153 1D GTATTGCTCA T/- TTTTTTTTAT 2458 het 541 hom 11 3 5 3 T 9 8 14695 CASAVA_Build 5 13689836 1I AATTAGTTTT -/A AAAATAGATG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 4 5 14696 CASAVA_Build 5 13691791 1I TGCTGTTTAG -/T TTTTAACTTA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 4 5 14697 CASAVA_Build 5 13706802 1D CTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 16 15 14698 CASAVA_Build 5 13711890 4I GCCAAAAAAG ----/GGAA CCTCGGGGGT 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 GGAA 0 1 14699 CASAVA_Build 5 13721026 2D CTGGTTAAAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 50 hom 38 2 12 25 T 11 9 14700 CASAVA_Build 5 13730084 1D ACTTTACCAG A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 46 het 31 1 27 4 A 7 6 14701 CASAVA_Build 5 13731850 2I GAAATGCGGG --/GA GGGGAGGGGG 2869 hom 24 het 14 0 9 5 GA 0 1 14702 CASAVA_Build 5 13739522 6D TTTACTCCTT TAAATC/------ TAAATTTAGA 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 TAAATC 1 0 14703 CASAVA_Build 5 13741394 1I GTGATAGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 14704 CASAVA_Build 5 13754618 1D ATGTTCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 51 2 38 12 A 12 11 14705 CASAVA_Build 5 13754933 1D CTTAGGTTAC A/- ATTTCAATCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 1 14706 CASAVA_Build 5 13756514 4I TACCCCAAGT ----/TAGA TAGCCCATAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 TAGA 0 1 14707 CASAVA_Build 5 13758943 10D AAAATCATAT CTTCACAAGA/---------- CAAAGGGAGA 3070 het 3070 hom 42 18 20 6 CTTCACAAGA 1 0 14708 CASAVA_Build 5 13771728 4D CATTTTTGAT ATTA/---- ATTATGTCTA 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 ATTA 2 1 14709 CASAVA_Build 5 13773211 1I TTTCAAAAAG -/A AAAAAACACC 586 het 586 ref 34 14 5 15 A 6 7 14710 CASAVA_Build 5 13773316 1D TTATATTTTC T/- TCAGAAATTT 3070 het 3070 ref 43 25 16 3 T 2 1 14711 CASAVA_Build 5 13773971 1I GCTTAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 10 11 14712 CASAVA_Build 5 13775635 2D TGGGTGCCAC AT/-- GAGTCTAGAC 3070 het 3070 ref 51 35 11 7 AT 1 0 14713 CASAVA_Build 5 13785230 2D CTCTGTCTTC AA/-- AAAAAAAAAA 2108 het 1217 hom 28 10 8 11 A 18 16 14714 CASAVA_Build 5 13793436 1D TCAGAATGAT G/- CTACTAAAAC 3070 het 3070 ref 50 20 18 13 G 1 0 14715 CASAVA_Build 5 13795483 1D CTACTCTAAC A/- AAACTGGTCT 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 A 4 3 14716 CASAVA_Build 5 13796730 1I ATCTCAACAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 8 9 14717 CASAVA_Build 5 13803079 1I CAACCATGCG -/A ATTTATGAAG 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 A 1 2 14718 CASAVA_Build 5 13809450 1I TATGCCCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 T 9 10 14719 CASAVA_Build 5 13823758 1I TATGATACAC -/A AAAATGTCTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 4 5 14720 CASAVA_Build 5 13825885 1I TAATGTAATA -/C TTTTATTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 14721 CASAVA_Build 5 13834672 1I CGGCTTCCCC -/A ACAGTGTTCC 3070 hom 69 het 27 0 23 5 A 1 2 14722 CASAVA_Build 5 13848854 1D GAGTCACAAC A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 7 6 14723 CASAVA_Build 5 13874521 1I AGTTACTCTG -/T TGCCAAATAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 T 1 2 14724 CASAVA_Build 5 13875347 1D TTTGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 13 6 T 12 11 14725 CASAVA_Build 5 13882452 1I TGTACTTCTT -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 6 7 14726 CASAVA_Build 5 13883008 30D ACCAAAAGGT TTTCAAAAGGAGGTAAAGTTACAATCCCAA/------------------------------ TTTCCATTCA 3070 het 3070 ref 48 40 16 3 TTTCAAAAGGAGGTAAAGTTACAATCCCAA 1 0 14727 CASAVA_Build 5 13883525 1D AAGGAATATC A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 A 8 7 14728 CASAVA_Build 5 13886241 1D TGTGTTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 22 0 10 12 A 12 11 14729 CASAVA_Build 5 13886606 3I TGATAGCAAG ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 AAT 5 6 14730 CASAVA_Build 5 13887347 1D TTTTTAATAT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 8 7 14731 CASAVA_Build 5 13890670 1D CTATCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 A 11 10 14732 CASAVA_Build 5 13893235 1I TTAGCCTGAG -/C CCCTTTATTC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 C 3 4 14733 CASAVA_Build 5 13893448 3I ACAAATTTCA ---/CTT CTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 CTT 1 2 14734 CASAVA_Build 5 13897043 2I TCTTGAGTGT --/TA AGTACATAAA 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 TA 0 1 14735 CASAVA_Build 5 13897148 1D TAACAAGTGG C/- TTTTAATTGC 3070 het 3070 ref 54 25 25 4 C 1 0 14736 CASAVA_Build 5 13897735 1D TAAACTAGCA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 8 7 14737 CASAVA_Build 5 13900422 1I AAGCTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 2973 het 2973 ref 24 8 7 9 A 10 11 14738 CASAVA_Build 5 13900467 1D TTTCTCTGCA G/- GGGTTATAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 6 G 4 3 14739 CASAVA_Build 5 13900679 1I AAAAAATGCC -/A AAAAAATAGC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 6 7 14740 CASAVA_Build 5 13903280 1D TAACCAAAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 40 15 19 8 A 9 8 14741 CASAVA_Build 5 13905215 1I CCCACAAGGG -/C CCTGGGTTTC 3070 hom 45 het 20 0 15 5 C 2 3 14742 CASAVA_Build 5 13911678 1D AATATAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 65 het 26 0 22 4 A 10 9 14743 CASAVA_Build 5 13912200 3I TGTCTGTAGT ---/AGA AGAAAAACTT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 AGA 1 2 14744 CASAVA_Build 5 13915281 1I TGTCAGCAGC -/A AAGCTGAAAT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 2 3 14745 CASAVA_Build 5 13920726 3I AAGAATTGTG ---/AAA AAAAAAAATG 2358 het 2358 ref 25 16 5 4 A 8 11 14746 CASAVA_Build 5 13921104 1D TAAGATTCCT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 9 8 14747 CASAVA_Build 5 13922434 1I ACAACTGGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 8 9 14748 CASAVA_Build 5 13932989 6I AAAGACAGAG ------/GAAACT GAAACATACT 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 GAAACT 0 1 14749 CASAVA_Build 5 13935465 1D ACTACAATTT A/- AAAAAAAAAA 2008 het 2008 ref 34 14 12 8 A 15 14 14750 CASAVA_Build 5 13944845 1D ATTCAACAAA T/- TTGACTAAAG 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 T 3 2 14751 CASAVA_Build 5 13945219 1I AAGTTTTCTA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 6 7 14752 CASAVA_Build 5 13947175 1D GAGACCTACT G/- GGACACTGGC 3070 het 3070 hom 57 18 35 7 G 3 2 14753 CASAVA_Build 5 13950075 1D AGTACTAGGT C/- CAAAGAGATT 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 C 2 1 14754 CASAVA_Build 5 13952333 1D AGCCACCGTG C/- CCGGCCATCC 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 C 3 2 14755 CASAVA_Build 5 13960026 4D CTGTCAGTTG AAGA/---- AAGGTAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 AAGA 1 0 14756 CASAVA_Build 5 13964701 2D TAATTGCCAG AA/-- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 36 11 19 8 A 8 6 14757 CASAVA_Build 5 13965590 2I TAAAATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AC 6 7 14758 CASAVA_Build 5 13974094 1I AGCAATTTTA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 7 8 14759 CASAVA_Build 5 13979801 3I ATCCAAGTTC ---/AGA AGAAGGACTA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 AGA 1 2 14760 CASAVA_Build 5 13982589 5D ATGGTGAATT TTATG/----- TTATGTGTAT 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 TTATG 2 1 14761 CASAVA_Build 5 13990792 1I TTTGGTTGTT -/A AAAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 A 3 4 14762 CASAVA_Build 5 13994182 6I TACAAGCAGC ------/ACCAGG ACTGGCACAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 ACCAGG 0 1 14763 CASAVA_Build 5 14001904 2D AGGATGAAGT AG/-- AGAGAGACTG 3070 hom 105 het 38 0 36 5 AG 4 3 14764 CASAVA_Build 5 14004492 2I GATTCAGCTA --/AT ATTTCTTACT 3070 het 3070 ref 29 11 9 9 AT 1 2 14765 CASAVA_Build 5 14005246 8I ATTAATTAAC --------/TACCATCA TAGAGGGATC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TACCATCA 0 1 14766 CASAVA_Build 5 14014753 1D ACTCCTTCTG A/- AAAAAAGAAA 2935 het 2935 ref 18 9 7 2 A 7 6 14767 CASAVA_Build 5 14015044 4D TAATTGTGTC TGTT/---- TGTGCTTTGC 3070 het 3070 hom 50 17 22 12 TGTT 1 0 14768 CASAVA_Build 5 14026831 2D CACTTATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 25 2 14 9 A 16 14 14769 CASAVA_Build 5 14030607 2I CCCTCATTCT --/CA CACATCCCAA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 CA 2 3 14770 CASAVA_Build 5 14053745 3I TTAAAAAGCC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 A 12 15 14771 CASAVA_Build 5 14055278 1D AGTGCTGGGA T/- TACAGGTTTG 3070 het 1296 hom 17 4 13 0 T 2 1 14772 CASAVA_Build 5 14055752 2D ACAGATACAT AC/-- ACACACAGTA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 AC 4 3 14773 CASAVA_Build 5 14059173 3I TTCTCCCACC ---/CAA CAACACCTCC 3070 het 3070 hom 36 17 13 6 CAA 1 2 14774 CASAVA_Build 5 14065406 3D CACCCATCAG AAT/--- AATACCTCAT 3070 het 3070 hom 36 15 21 2 AAT 2 1 14775 CASAVA_Build 5 14069577 1I TTTTGCAGAA -/G GAGAGACAGA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 G 1 2 14776 CASAVA_Build 5 14073423 1D TAGACCCCAG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 A 7 6 14777 CASAVA_Build 5 14090042 1I GAAACACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 36 0 29 7 T 10 11 14778 CASAVA_Build 5 14091302 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 26 1 21 4 A 13 12 14779 CASAVA_Build 5 14105311 1D CTGATTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 38 0 32 6 T 11 10 14780 CASAVA_Build 5 14107054 1D GCCAGAGGTT G/- GCAGTGAGCC 2702 hom 15 het 6 0 6 0 G 2 1 14781 CASAVA_Build 5 14114833 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 9 8 14782 CASAVA_Build 5 14117778 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2804 het 70 hom 17 1 10 6 A 14 13 14783 CASAVA_Build 5 14118713 1D TAGTTTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 10 9 14784 CASAVA_Build 5 14122556 4D ATAACTTTTC TTTT/---- TTTATTGTTT 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 T 7 3 14785 CASAVA_Build 5 14124780 1D TAGGAAAACT C/- CCCCCCCACA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 C 8 7 14786 CASAVA_Build 5 14141037 4D CAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAC 3070 hom 78 het 30 0 28 4 AG 6 4 14787 CASAVA_Build 5 14141484 4I TTTTTGTGTA ----/TCAG TCAATTTTCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCAG 0 1 14788 CASAVA_Build 5 14143049 1D CAAAACAAAC A/- AACAAACAAA 3070 hom 5 het 29 1 24 4 A 3 2 14789 CASAVA_Build 5 14146001 1D AATTTCTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 11 10 14790 CASAVA_Build 5 14146766 1D CTTAGATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 12 7 A 12 11 14791 CASAVA_Build 5 14149692 1D ACAACAGCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 12 11 14792 CASAVA_Build 5 14157647 1I AGGAGTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 23 1 18 4 T 11 12 14793 CASAVA_Build 5 14160194 1I GTTTCATCAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 8 9 14794 CASAVA_Build 5 14187206 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 A 10 9 14795 CASAVA_Build 5 14233957 1D GTGCCCCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 15 5 A 12 11 14796 CASAVA_Build 5 14234199 1I CTACAATGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 86 het 38 0 32 6 T 9 10 14797 CASAVA_Build 5 14234282 1I CTGCAGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 37 1 30 6 A 10 11 14798 CASAVA_Build 5 14235209 2D TTGAAGGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 28 8 T 12 10 14799 CASAVA_Build 5 14236703 1D CTGAGTAATT A/- AAAAGAGAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 5 4 14800 CASAVA_Build 5 14236980 2D AACCTTTGGC AG/-- ATAGTGACTG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AG 1 0 14801 CASAVA_Build 5 14243170 1I ACAGTTGACC -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 7 8 14802 CASAVA_Build 5 14247008 2D CTGTGTGTTC GT/-- GTGCCTGGTA 3070 hom 148 het 54 0 50 5 GT 2 1 14803 CASAVA_Build 5 14250413 1D ATCGAGGTGC T/- TCCTGTCTGT 3070 hom 99 het 35 0 33 3 T 2 1 14804 CASAVA_Build 5 14261300 2D ATGTCTGCAC AA/-- AGACTTTTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 3 1 14805 CASAVA_Build 5 14263713 2D AGTGTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 1688 het 1688 ref 37 17 6 15 TG 1 0 14806 CASAVA_Build 5 14265074 1I AAAAAAAACC -/A AAAAAAACAA 3070 het 390 hom 25 2 18 5 A 7 8 14807 CASAVA_Build 5 14272347 2D TTTTCTATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 12 10 14808 CASAVA_Build 5 14273084 1I TGTACAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1286 hom 36 4 21 11 T 15 16 14809 CASAVA_Build 5 14276390 1D ATGGGTCGAC A/- AAAATGTATG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 5 4 14810 CASAVA_Build 5 14289173 4I TAACAAATAA ----/TTTG TTTGTGGTAG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 TTTG 1 2 14811 CASAVA_Build 5 14318499 1I ATCTGCCAGT -/A GTCCTGGGAG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 0 1 14812 CASAVA_Build 5 14325740 1I GAAGTTTTGC -/T TTTACCACAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 3 4 14813 CASAVA_Build 5 14328685 1I ATAGGAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 10 11 14814 CASAVA_Build 5 14329159 1D TGGACATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 15 6 T 12 11 14815 CASAVA_Build 5 14329171 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTAGAATA 3070 het 142 hom 22 3 15 4 C 1 0 14816 CASAVA_Build 5 14334534 2D GCCGTTAGAA CC/-- CCCCCCCCCC 1042 hom 6 het 17 0 6 11 C 12 10 14817 CASAVA_Build 5 14341776 1D ATTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 562 hom 16 3 12 1 A 13 12 14818 CASAVA_Build 5 14345515 11D AATGTTTTCA TTGCAAATGTC/----------- TTAATTGACA 3070 het 3070 ref 42 23 19 7 TTGCAAATGTC 1 0 14819 CASAVA_Build 5 14347131 2D AAAAAAAAAA AT/-- AATAATTAAA 3070 hom 31 het 22 0 19 4 AT 1 0 14820 CASAVA_Build 5 14362204 1I CATCCACACA -/T TTATCTACAC 2681 hom 15 het 8 0 6 2 T 2 3 14821 CASAVA_Build 5 14371564 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2582 het 646 hom 20 4 9 7 A 17 16 14822 CASAVA_Build 5 14373232 1I ATGATCAGAT -/A ATATACATCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 14823 CASAVA_Build 5 14376639 4I AGAGAGAGAG ----/AGAT AGGAGTTTAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AGAT 0 1 14824 CASAVA_Build 5 14405998 1D AGTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 26 1 18 8 T 13 12 14825 CASAVA_Build 5 14409976 1I AGCTGGACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 404 hom 34 1 26 7 A 9 10 14826 CASAVA_Build 5 14411657 1D CTCCTTACAG T/- TTTAACTTCA 3070 hom 62 het 27 0 22 5 T 4 3 14827 CASAVA_Build 5 14433727 1I CTATTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 T 8 9 14828 CASAVA_Build 5 14437979 1I GGCAGCTCAT -/A ATCACAAAGG 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 A 1 2 14829 CASAVA_Build 5 14451903 1D ATTTTTAAAA T/- TGTTGAAAAT 3070 het 3070 ref 49 23 23 4 T 2 1 14830 CASAVA_Build 5 14479337 2D ACGCACATGT AC/-- ACACACATGT 3070 het 3070 ref 50 24 15 11 AC 4 3 14831 CASAVA_Build 5 14485390 1D TAAAGTGAGA T/- TTTCAAAGCA 3070 het 3070 ref 63 31 26 6 T 4 3 14832 CASAVA_Build 5 14516784 1I CTGGTGATGC -/T TTTTTTTTTT 1692 het 1692 ref 47 27 6 14 T 15 16 14833 CASAVA_Build 5 14519509 1I AAGGGCTTCA -/T TTTTCTTAGT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 4 5 14834 CASAVA_Build 5 14521258 4I CTTCCAAATG ----/GAGA GAGAGGTGGT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 GA 2 4 14835 CASAVA_Build 5 14524223 5I ATTCCAACTT -----/TTCTC TTTTCTCCAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTCTC 0 1 14836 CASAVA_Build 5 14528467 1I GCTGAGCTCC -/A ATACTTGCTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 14837 CASAVA_Build 5 14528944 1I TCTGCGCAGC -/G GGGGATAGTA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 G 4 5 14838 CASAVA_Build 5 14534271 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 A 11 10 14839 CASAVA_Build 5 14543270 1I CACCTATAGT -/C CCCAGCTACT 3070 het 1823 hom 18 4 12 2 C 3 4 14840 CASAVA_Build 5 14552165 1I TCTCATGTAG -/A AATGTGCATG 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 2 3 14841 CASAVA_Build 5 14560519 2I TGATTGCTAA --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 42 het 19 0 14 5 TC 5 6 14842 CASAVA_Build 5 14562488 2I TTTATGGTTT --/TG TGTGTGTGTG 2135 het 2135 ref 19 9 5 5 TG 5 6 14843 CASAVA_Build 5 14565001 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 1725 het 715 hom 8 2 4 2 T 10 9 14844 CASAVA_Build 5 14580243 1I TATAGAATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 8 9 14845 CASAVA_Build 5 14580907 1I ACAAAAATTG -/T TTTTTTTTTT 1316 het 1316 ref 31 20 5 7 T 13 14 14846 CASAVA_Build 5 14583941 12D AAACTCTGCC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 23 0 16 11 A 26 14 14847 CASAVA_Build 5 14590011 1I TGCTGGTTTC -/T TTGATTTTTC 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 2 3 14848 CASAVA_Build 5 14593798 10D ACTTAAAGTC CATTTTATCT/---------- CATTTTATCT 3070 hom 99 het 44 0 34 10 CATTTTATCT 3 2 14849 CASAVA_Build 5 14602276 1I AGTCCCTAAG -/A AAAAAATCAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 6 7 14850 CASAVA_Build 5 14603359 1D TCAATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 939 hom 34 4 18 13 A 17 16 14851 CASAVA_Build 5 14632584 4I CTGGCCAGTT ----/TTTC TTTCTTCTGA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TTTC 1 2 14852 CASAVA_Build 5 14666038 1D ATTTTAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 30 1 24 5 T 11 10 14853 CASAVA_Build 5 14667311 2I CAGAAAAAAG --/TA TATATATATA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 TA 5 6 14854 CASAVA_Build 5 14668508 2I TGCTGGACTA --/AG AGATTCATGG 3070 hom 93 het 36 0 29 7 AG 1 2 14855 CASAVA_Build 5 14673729 4D TTATTGTGTT AAAC/---- AAGGGGCAGT 3070 het 3070 hom 51 23 23 6 AAAC 1 0 14856 CASAVA_Build 5 14688778 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 386 hom 38 1 26 11 AC 8 9 14857 CASAVA_Build 5 14696981 1D CAAGCAATCC A/- AATTACACTC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 3 2 14858 CASAVA_Build 5 14698564 1D TTTAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 38 1 32 5 A 11 10 14859 CASAVA_Build 5 14718180 1I AGCGGAGGGT -/C CCTGGGCGTC 2569 hom 24 het 13 0 8 5 C 2 3 14860 CASAVA_Build 5 14733045 1D GATTTTCCAA C/- CTCTAGCCCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 2 1 14861 CASAVA_Build 5 14749103 1D CCTTGGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 30 2 16 12 T 15 14 14862 CASAVA_Build 5 14760406 1D TTGAAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 11 10 14863 CASAVA_Build 5 14762413 1I AGCTGATACA -/T TTGAGATTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 2 3 14864 CASAVA_Build 5 14777429 3I TCTGTCTCAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAC 5 6 14865 CASAVA_Build 5 14782596 1D GCGCCTGACC A/- AAAAAAAAAA 1816 het 1816 ref 18 10 5 3 A 15 14 14866 CASAVA_Build 5 14814873 2D CCCTTTTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 35 0 27 8 T 13 11 14867 CASAVA_Build 5 14815530 16D CTAGCTCCCT TGGTTTCAGAGTACTG/---------------- TGGGACCTAT 3070 hom 98 het 34 0 32 4 TGGTTTCAGAGTACTG 1 0 14868 CASAVA_Build 5 14827995 5D AACGTATACA AATAG/----- AATAAACATT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 AATAG 1 0 14869 CASAVA_Build 5 14828168 1I ATAAGTCCCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 8 9 14870 CASAVA_Build 5 14830260 1D CGGGCGTGGT G/- GGGGGGCACC 3070 hom 51 het 18 0 16 2 G 7 6 14871 CASAVA_Build 5 14838023 1D CTCTGGACAG A/- GGAATATTTG 3070 hom 141 het 51 0 45 6 A 1 0 14872 CASAVA_Build 5 14851601 1I GCGGTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 23 0 17 6 T 11 12 14873 CASAVA_Build 5 14853837 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2234 het 2234 ref 41 21 8 12 T 17 16 14874 CASAVA_Build 5 14864113 1D GAAGAAGGAA G/- GGGGGGAATA 3070 hom 77 het 34 0 25 9 G 7 6 14875 CASAVA_Build 5 14880862 1I CTAAGACCTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 401 hom 40 1 34 5 T 8 9 14876 CASAVA_Build 5 14887347 1I ACCTCAGTTT -/C CCCATCTGTA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 C 3 4 14877 CASAVA_Build 5 14898468 15D TATATATATA TATATATATTTTTTT/--------------- TTTTACCTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 4 TATATATATTTTTTT 1 0 14878 CASAVA_Build 5 14901524 2I GGCAATCCTC --/TT TGGGTCCCCT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 1 3 14879 CASAVA_Build 5 14905505 3D TGATTAGGTC ACA/--- ACAAATTACA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 ACA 2 1 14880 CASAVA_Build 5 14909732 15I CATTTCCCCT ---------------/CTCCTTCCTCTTTGG CTCCTTTTCT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 CTCCTTCCTCTTTGG 0 1 14881 CASAVA_Build 5 14919826 1I TTTCTTTCAT -/C CCCCCCTTGA 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 C 6 7 14882 CASAVA_Build 5 14921507 1D TTTGCATTTC T/- TTTTTTTTTT 2185 het 1718 hom 33 13 9 11 T 17 16 14883 CASAVA_Build 5 14923159 3I GTGGAGCAGG ---/GAA GAAGAAGCCC 3070 hom 66 het 26 0 21 5 GAA 2 3 14884 CASAVA_Build 5 14928645 1D AAAAAGTTAC G/- AAATTGCAAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 G 1 0 14885 CASAVA_Build 5 14932309 1D TGTGTCTGTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 31 12 9 10 T 7 6 14886 CASAVA_Build 5 14950298 1I CCGGCTAATG -/T TTGTATTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 2 3 14887 CASAVA_Build 5 14960724 1I TAGAACCAAT -/A TTTTTTACTT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 0 1 14888 CASAVA_Build 5 14963100 2I GCCAAAATAA --/AG AGAATCATAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 AG 1 2 14889 CASAVA_Build 5 14977291 1I TATAGTTTAC -/A AAATGTGTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 3 4 14890 CASAVA_Build 5 14980262 4I TGTTGTGTCT ----/CTGA CTATGTCCAT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 CTGA 0 1 14891 CASAVA_Build 5 14980409 1I AGGAAAATTG -/A TTTCTAATTC 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 A 0 1 14892 CASAVA_Build 5 14982084 10D ACTGTGTTAT TTTATATATA/---------- TATATATATA 3070 het 2411 hom 20 5 12 4 TTTATATATA 1 0 14893 CASAVA_Build 5 14989808 2D TTTTCTTTCG TT/-- TTTTTTTTTT 2501 het 1580 hom 24 10 6 8 T 14 12 14894 CASAVA_Build 5 14990054 8I TTCCTTTTCA --------/ATCTGGAT ATCTGGATGC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 ATCTGGAT 1 2 14895 CASAVA_Build 5 14990283 1D TGAGATTAGA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 42 17 18 8 T 8 7 14896 CASAVA_Build 5 15010784 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1458 hom 27 4 14 9 T 12 13 14897 CASAVA_Build 5 15039335 1D CTCAACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1135 hom 24 4 12 8 T 17 16 14898 CASAVA_Build 5 15205643 1I GTCACTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 10 11 14899 CASAVA_Build 5 15213887 2I CAAGTATTTC --/AT ATATATATAT 1787 het 1787 ref 17 10 5 2 AT 7 8 14900 CASAVA_Build 5 15216478 1D GAGATTTGGG T/- TGGGGACACA 3070 het 3070 ref 41 27 11 3 T 2 1 14901 CASAVA_Build 5 15224468 2D GTGTTCACAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 13 18 13 A 11 9 14902 CASAVA_Build 5 15258867 6I CTGATGAACT ------/TTAAGA TTAATTTGCC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TTAAGA 0 1 14903 CASAVA_Build 5 15261053 5I AGAAAGAAAG -----/AAAGA AAAAAAAAAA 3070 het 1581 hom 15 4 9 2 AAAGA 0 1 14904 CASAVA_Build 5 15261811 1D CAATAAAGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 18 16 9 T 10 9 14905 CASAVA_Build 5 15266010 3I CTTGCATGAT ---/AGG AGCATCAAAA 3070 het 3070 ref 54 26 25 3 AGG 0 1 14906 CASAVA_Build 5 15276845 3I GGACATGGTT ---/CTC CTTCCTGAGG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 CTC 0 1 14907 CASAVA_Build 5 15278648 1I TTTCCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 A 10 11 14908 CASAVA_Build 5 15291918 1D AGAGTTAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 A 10 9 14909 CASAVA_Build 5 15298838 1I TTTAAATGGG -/A AAAAGGGGAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 4 5 14910 CASAVA_Build 5 15301109 3I AATATTAGAA ---/AAG AAGAAGACAA 3070 het 2870 hom 34 7 21 6 AAG 2 3 14911 CASAVA_Build 5 15303272 1I GCTCTTTGCA -/T TAAGAGCATT 3070 het 3070 ref 54 30 18 6 T 1 2 14912 CASAVA_Build 5 15305108 3I GTGGACAAAA ---/AAC ATATGAAAAA 3070 het 3070 hom 18 7 8 3 AAC 0 1 14913 CASAVA_Build 5 15309869 2D TGGGAAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2566 hom 27 9 9 9 T 13 11 14914 CASAVA_Build 5 15311923 4D CAGAACAGAG TATT/---- TGGTACTTCT 3070 het 3070 hom 57 23 32 4 TATT 1 0 14915 CASAVA_Build 5 15313357 4I AATTGCTCAG ----/TGTT TGTTTAGAGT 3070 het 3070 ref 46 19 16 11 TGTT 1 2 14916 CASAVA_Build 5 15319394 4D ATGTAACAAT AATG/---- AACAGGAATA 3070 het 3070 ref 58 26 26 9 AATG 1 0 14917 CASAVA_Build 5 15320729 1I CTCCAGAATG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 8 9 14918 CASAVA_Build 5 15330545 1D AAAAAAGAGT A/- AAAAAAAAAA 2452 het 1194 hom 12 3 9 1 A 11 10 14919 CASAVA_Build 5 15340953 2I TTATAATGGG --/AA AGAAAAACAA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 1 3 14920 CASAVA_Build 5 15341459 2D CAGCGTTTTA TC/-- ATTCTTCTTA 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 TC 1 0 14921 CASAVA_Build 5 15352066 2D TTTCTAAGAA TG/-- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 TG 1 0 14922 CASAVA_Build 5 15354837 10D AAACTGCTGG GCACGGTGGC/---------- GCACGGTGGC 1391 het 1391 ref 18 8 6 4 GCACGGTGGC 2 1 14923 CASAVA_Build 5 15384297 2D TCTCTTTGTC AT/-- ATTTTAACTG 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 AT 2 1 14924 CASAVA_Build 5 15398586 1I TATGCCACAC -/T TTTCTGTTAG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 3 4 14925 CASAVA_Build 5 15401151 2D CTGGGACAAG GT/-- GAGATGAAAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 GT 1 0 14926 CASAVA_Build 5 15428659 1D AAGAAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 7 A 11 10 14927 CASAVA_Build 5 15441296 3I AGAAAGAAGA ---/AAG AAGATCTGTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 AAG 1 2 14928 CASAVA_Build 5 15445932 1D AGACTCTGTC T/- CAAAAAAAGA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 T 1 0 14929 CASAVA_Build 5 15450476 1D AAAAACTTTG A/- AAAAAATTTA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 7 6 14930 CASAVA_Build 5 15458767 4I TTTTCTTTTC ----/TTGA TTATTTTGCT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TTGA 0 1 14931 CASAVA_Build 5 15459133 1I TTAGAAGTAT -/A TGTTTAATTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 1 14932 CASAVA_Build 5 15462933 1I ATTGTAGCAC -/A AAACCAAAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 3 4 14933 CASAVA_Build 5 15468977 1I AGATAGTTAC -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 14934 CASAVA_Build 5 15472021 2D TCAGTTCTCA TT/-- TTTTCAAGAG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 6 4 14935 CASAVA_Build 5 15474907 3D GTTGGATTTT AAC/--- AACAAGAAAT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 AAC 2 1 14936 CASAVA_Build 5 15475722 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 T 9 8 14937 CASAVA_Build 5 15479250 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1463 het 63 hom 26 1 5 20 T 13 12 14938 CASAVA_Build 5 15481411 4D AAGATGTGAC AGTT/---- AGGTTGAGGT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 AGTT 1 0 14939 CASAVA_Build 5 15483391 4D ACTGGCATCT ATTA/---- ATTGTCTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 ATTA 1 0 14940 CASAVA_Build 5 15485285 1D AATGCAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 32 0 25 7 T 12 11 14941 CASAVA_Build 5 15487658 3D CAAAAAAAAA AAG/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 35 0 33 3 AAG 1 0 14942 CASAVA_Build 5 15490576 2I CTTCACAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 T 13 15 14943 CASAVA_Build 5 15495284 1D31M1D TTCTGATTAC TTTTTTTTCCCCAAAGCATGGTCTTCATGGAGA/-TTTTTTTCCCCAAAGCATGGTCTTCATGGAG- GGTCTTTTTC 3070 hom 96 het 26 0 33 6 N/A 0 0 14944 CASAVA_Build 5 15495503 2D CTGCAATAAT TC/-- TCTCTCTCTC 2032 het 172 hom 34 2 16 18 TC 9 8 14945 CASAVA_Build 5 15505547 1D ACGTAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 34 29 4 2 T 11 10 14946 CASAVA_Build 5 15524345 1D GTCTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1189 het 1189 ref 39 28 3 8 A 13 12 14947 CASAVA_Build 5 15529643 1D AGTAACATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 30 2 22 6 T 11 10 14948 CASAVA_Build 5 15529654 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAGGTG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 7 6 14949 CASAVA_Build 5 15587484 3I GCCCTCTCCA ---/TTG TTTTGCCTTT 3070 hom 134 het 53 0 42 11 TTG 0 1 14950 CASAVA_Build 5 15603643 3D GGCTGTGTCA TCT/--- TCTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 43 22 18 7 TCT 2 1 14951 CASAVA_Build 5 15609194 4I ATTATCTATC ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 ATCT 3 4 14952 CASAVA_Build 5 15614749 1I TCACCATGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 49 25 15 9 T 9 10 14953 CASAVA_Build 5 15652900 4D GTAGGAAAAC TTGT/---- TTGTTATGTC 3070 het 3070 hom 45 14 24 10 TTGT 2 1 14954 CASAVA_Build 5 15654389 1D CTGTGAGATC T/- TGGGAGTGGT 3070 hom 130 het 51 0 44 7 T 2 1 14955 CASAVA_Build 5 15682301 3I AGACTGAGAC ---/ATG ATGAGCTCAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 ATG 1 2 14956 CASAVA_Build 5 15689790 1D GGCTAAAACC T/- TTTTTTTTTT 2852 het 2852 ref 40 15 10 17 T 15 14 14957 CASAVA_Build 5 15708603 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1639 het 1639 ref 24 18 4 3 A 13 12 14958 CASAVA_Build 5 15712392 1D GCAGTGAAGG A/- AAAAAAAATG 1347 het 1347 ref 43 37 3 3 A 9 8 14959 CASAVA_Build 5 15717984 1D ATTTTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 31 2 17 12 T 13 12 14960 CASAVA_Build 5 15742111 1D AAAGACAGAG C/- CAGTGAATCA 3070 het 3070 hom 55 18 31 6 C 2 1 14961 CASAVA_Build 5 15747149 1I CTGGGGACGG -/C TAAGCTGAAA 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 C 0 1 14962 CASAVA_Build 5 15747757 17D TATAAGCTAT TCTGTCATTTTGACACC/----------------- TCTGTCATTT 3070 het 3070 ref 43 21 22 9 TCTGTCATTTTGACACC 2 1 14963 CASAVA_Build 5 15758077 1I TGGGCTAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3062 hom 30 7 14 9 A 13 14 14964 CASAVA_Build 5 15771061 1I CATGGACTCT -/A ATCTATGTTA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 1 2 14965 CASAVA_Build 5 15786495 1I CCACCGCCCC -/T GGCCAGAAAT 3070 het 1867 hom 21 7 14 0 T 0 1 14966 CASAVA_Build 5 15792611 10D GAACTTTTTT TTATCACAAC/---------- AAGAAATCTC 3070 het 3070 ref 49 27 20 4 TTATCACAAC 1 0 14967 CASAVA_Build 5 15803792 1I TGCTTGTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 T 9 10 14968 CASAVA_Build 5 15805281 2I CAGGGGGCTA --/GG GGAGGGATAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 G 2 4 14969 CASAVA_Build 5 15809881 1I ATTAGGTTCC -/A GTCTGCTTTG 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 A 0 1 14970 CASAVA_Build 5 15815471 19D AGATTCTGTT GGTTAGAAGCACCCTTGTA/------------------- GGGTGGGGGA 964 het 964 ref 34 26 5 14 GGTTAGAAGCACCCTTGTA 1 0 14971 CASAVA_Build 5 15825176 3D CACCGTGCCC AGA/--- AGGATTAACT 3070 het 3070 ref 36 17 15 7 AGA 1 0 14972 CASAVA_Build 5 15826011 1D TGAGACTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 11 10 14973 CASAVA_Build 5 15833473 1D ATACATATAT A/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 1 0 14974 CASAVA_Build 5 15847584 1I CCTAAGTTCA -/G GAACAACAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 14975 CASAVA_Build 5 15849588 2D CTTGTTACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 26 8 A 12 10 14976 CASAVA_Build 5 15850921 1D GAGAAATTTG T/- GACGTCTGTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 1 0 14977 CASAVA_Build 5 15853037 1I TCATAAAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 655 hom 50 2 42 6 T 9 10 14978 CASAVA_Build 5 15858116 2D ATTCTGAGAA CT/-- CTCTCTTTGG 3070 hom 85 het 32 0 29 4 CT 4 3 14979 CASAVA_Build 5 15860793 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 30 9 T 11 12 14980 CASAVA_Build 5 15861245 1I TAATTTATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 9 10 14981 CASAVA_Build 5 15863671 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 923 hom 24 2 13 9 A 14 15 14982 CASAVA_Build 5 15871586 3D AAAAAATCTT TAA/--- TAACCATTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAA 2 1 14983 CASAVA_Build 5 15874704 3D AGGACTTGCT TGG/--- TGGTTATCAG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TGG 2 1 14984 CASAVA_Build 5 15880031 1D TACCTGTGGC T/- TTTTTTTTTT 1012 het 1012 ref 43 29 5 9 T 12 11 14985 CASAVA_Build 5 15882596 1I AAAAACAAAC -/A AAAGCATGGT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 A 3 4 14986 CASAVA_Build 5 15893460 12D2M12I TTAGTAAAAA CCCCTCCTCCTCAT------------/------------ATGAGGAGGAGGGG TCTTTTCCAA 3070 hom 93 het 32 0 32 4 N/A 0 0 14987 CASAVA_Build 5 15902323 2D AGTGAATGCA GT/-- GTGTGACTCC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 GT 3 2 14988 CASAVA_Build 5 15919613 6D GTATTTTTTC CTTTAA/------ CTTTATCTGT 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 CTTTAA 1 0 14989 CASAVA_Build 5 15933405 1I ATAGCTATAA -/G GAACAGTGAG 3070 hom 87 het 36 0 27 9 G 1 2 14990 CASAVA_Build 5 15936078 1I ATCATTTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 10 14991 CASAVA_Build 5 15939320 2D TAATTTTGAG GT/-- GTGTGTGTGT 1557 het 1557 ref 62 44 4 15 GT 9 8 14992 CASAVA_Build 5 15944069 1D AGATAATTAG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 9 8 14993 CASAVA_Build 5 15949871 1D ACATGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 955 het 955 ref 41 35 3 3 A 12 11 14994 CASAVA_Build 5 15959546 3D CCTAGAAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2706 het 669 hom 32 9 11 13 T 19 16 14995 CASAVA_Build 5 15966350 1I TCATATTTTC -/T TTTTTTTTTT 2630 het 146 hom 18 1 13 4 T 11 12 14996 CASAVA_Build 5 15996153 4D TCCTAGGCTC AATT/---- AATCCTCCTG 2551 het 2551 ref 21 9 8 4 AATT 1 0 14997 CASAVA_Build 5 16009935 1D TCTTCACCTG C/- TGAGTAAGCA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 C 1 0 14998 CASAVA_Build 5 16012110 2I GTTTCTTAAA --/AC ACAGATTGAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 AC 1 2 14999 CASAVA_Build 5 16014228 1I GGTCTAGGAG -/T TTAAAACATC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 2 3 15000 CASAVA_Build 5 16014428 2D ACACAAGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 29 11 6 AC 6 5 15001 CASAVA_Build 5 16018414 9D AATGAAGCAG ACTTAGATA/--------- AAGGGAACAT 3070 het 3070 ref 32 14 15 5 ACTTAGATA 1 0 15002 CASAVA_Build 5 16037645 1I CTAAGTAAAG -/A CTTTAGTGGT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 A 0 1 15003 CASAVA_Build 5 16043398 1D ATTTGCAGCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 9 8 15004 CASAVA_Build 5 16044169 1D CTAGATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 T 13 12 15005 CASAVA_Build 5 16063082 4D TCAATGTGGT AGTC/---- AGAATGACCT 3070 het 3070 hom 51 17 32 4 AGTC 1 0 15006 CASAVA_Build 5 16094065 1I ATTTTTTGTC -/T TTTTCAAGAT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 4 5 15007 CASAVA_Build 5 16096816 3I TGGTTCATTA ---/CTT CTTATGCCCT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 CTT 1 2 15008 CASAVA_Build 5 16130467 1I GCAAACTCAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 9 10 15009 CASAVA_Build 5 16138103 2D ATCAGAGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 1975 het 1975 ref 24 13 5 6 GT 9 8 15010 CASAVA_Build 5 16138701 1D GGGTGGGGTC G/- GGGGGGGGAT 2262 het 1213 hom 16 4 7 5 G 9 8 15011 CASAVA_Build 5 16142712 1D AGAAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 15 14 15012 CASAVA_Build 5 16144243 1I ATTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 9 10 15013 CASAVA_Build 5 16198851 1I AGATTTTATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 9 10 15014 CASAVA_Build 5 16200808 2I GTTATTCCAC --/AT GAGTCATTCC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AT 0 1 15015 CASAVA_Build 5 16210325 5I AGTAAATGAA -----/AAGAT ATCCCGTGTT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 AAGAT 0 1 15016 CASAVA_Build 5 16216304 1I GCAATAAGAA -/T CTCCGGTTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 15017 CASAVA_Build 5 16219572 5I GATACTTGAT -----/TAGAG TAGAGTACAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TAGAG 1 2 15018 CASAVA_Build 5 16222446 1D TACCGAAAAG A/- GAAGAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 A 1 0 15019 CASAVA_Build 5 16223486 1D AAGCTTTTAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 9 8 15020 CASAVA_Build 5 16234897 1D TCTGAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 11 10 15021 CASAVA_Build 5 16236167 1D ACCTCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 27 2 19 10 A 16 15 15022 CASAVA_Build 5 16240729 4I TACCAGTGGA ----/GCTT GCTTTGTGGG 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 GCTT 1 2 15023 CASAVA_Build 5 16245473 1I CTCTTGGCTT -/C CCCCAAAATG 3070 hom 181 het 67 0 60 7 C 4 5 15024 CASAVA_Build 5 16254832 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 10 9 15025 CASAVA_Build 5 16260485 4D TTTTGACTCT CAGA/---- CAGGAAACTT 3070 het 3070 hom 26 13 13 1 CAGA 1 0 15026 CASAVA_Build 5 16261555 2I AGATATATAT --/AA GATATATCTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 0 2 15027 CASAVA_Build 5 16268130 3I CTGTCTACAC ---/TAT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TAT 0 1 15028 CASAVA_Build 5 16275704 2D TAGGTCTCTC TT/-- TTTATTTCCT 3070 hom 111 het 38 0 38 2 T 5 3 15029 CASAVA_Build 5 16285256 2D TGTCATTTTT AA/-- AAAGACTCAG 3070 het 3070 hom 49 21 24 5 A 5 3 15030 CASAVA_Build 5 16285966 1I GGAGCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 A 11 12 15031 CASAVA_Build 5 16286239 1I GTATTTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 10 11 15032 CASAVA_Build 5 16290621 1I TTTTAGAACA -/T TTTTTATTCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 5 6 15033 CASAVA_Build 5 16325726 2D TGGCCCCTGG AA/-- AAGTTTTGAA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 4 2 15034 CASAVA_Build 5 16331930 1I CCAAGAGGGC -/A GGGTGTTAAC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 0 1 15035 CASAVA_Build 5 16334679 1D ATATTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 214 hom 28 1 17 10 T 13 12 15036 CASAVA_Build 5 16336630 1D TAAGAGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 36 1 27 8 T 11 10 15037 CASAVA_Build 5 16353670 7I CTACAATGAG -------/AAATTCA AAAATCTAGG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAATTCA 0 1 15038 CASAVA_Build 5 16362964 1I TTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 1709 het 1709 ref 34 18 5 11 A 13 14 15039 CASAVA_Build 5 16396983 3D GTAGAGGTGA TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 hom 36 11 18 9 TTC 4 3 15040 CASAVA_Build 5 16426056 4I35M14D TTGTTTGTTT ----TGTGTGTGTGTGTGTTTTTGTTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTC/TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTGTTGTCTTTTTTTTTT-------------- TTTGAGACAG 3070 het 68 hom 30 1 23 11 N/A 0 0 15041 CASAVA_Build 5 16426331 1I GACCTCAGGT -/G ATCTGCCCGC 3070 hom 63 het 26 0 21 5 G 0 1 15042 CASAVA_Build 5 16427669 1D CCATGGGGGG A/- AAAAATGAGC 3070 hom 93 het 36 0 29 8 A 6 5 15043 CASAVA_Build 5 16464711 2I ACAGACACAC --/AG ACACACACAC 3070 hom 146 het 55 0 46 9 AG 0 1 15044 CASAVA_Build 5 16477551 1D TGTGCCCCAA C/- AAAACTTGTC 1431 het 1431 ref 15 10 3 2 C 1 0 15045 CASAVA_Build 5 16480515 1D TGGAAAAAAA T/- AAAAATAAAA 2677 het 2677 ref 33 16 12 5 T 1 0 15046 CASAVA_Build 5 16483752 4D AAAGAGTGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 42 21 13 11 AG 8 6 15047 CASAVA_Build 5 16486863 1I AAATAACTGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 8 9 15048 CASAVA_Build 5 16488716 1I CCAGACCTAC -/T TCCAATCATT 3070 het 3070 hom 53 19 26 8 T 1 2 15049 CASAVA_Build 5 16497458 2D TTCTAATACC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 AT 7 6 15050 CASAVA_Build 5 16509985 1D AAATGAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 11 10 15051 CASAVA_Build 5 16543727 3D CTGTGAGTGA ACT/--- ACTGTTTATT 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 ACT 2 1 15052 CASAVA_Build 5 16548910 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 12 13 15053 CASAVA_Build 5 16555794 1I CGCCATTATA -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 5 6 15054 CASAVA_Build 5 16556996 1D CCAGCTTCAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 T 9 8 15055 CASAVA_Build 5 16559587 3D TGTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1705 hom 27 9 10 10 T 14 11 15056 CASAVA_Build 5 16570061 1D AAAGTAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 10 9 15057 CASAVA_Build 5 16586161 1D TAATATGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 T 13 12 15058 CASAVA_Build 5 16596785 1I ACAACATCTC -/A AAAAAAAAAA 1795 het 405 hom 26 4 11 11 A 16 17 15059 CASAVA_Build 5 16603385 1I TTTAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 12 13 15060 CASAVA_Build 5 16604238 1I CCATGCTACT -/C CTTTTCCCGG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 C 1 2 15061 CASAVA_Build 5 16604410 1D ACATATAAAC A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 A 7 6 15062 CASAVA_Build 5 16606439 1I AACGTGTAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 9 10 15063 CASAVA_Build 5 16607727 1D GATAACTACA T/- TTATGTACCA 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 T 3 2 15064 CASAVA_Build 5 16608190 2I ATCTAACATC --/AT ATATTGCAGT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 AT 2 3 15065 CASAVA_Build 5 16609274 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 2808 het 872 hom 22 5 12 5 T 11 9 15066 CASAVA_Build 5 16612409 1D AGCTAGGGGC A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 8 7 15067 CASAVA_Build 5 16619494 2D ACACACACAC AT/-- ATATACATAT 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 AT 3 2 15068 CASAVA_Build 5 16627312 1I AATCTGGGGT -/G GCCTCAGCAG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 G 1 2 15069 CASAVA_Build 5 16634862 3I AAGAAAAAAA ---/ACT ACGATACATT 2213 het 2213 ref 21 14 6 1 ACT 0 1 15070 CASAVA_Build 5 16635772 1D ATAAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 2497 het 1413 hom 27 11 8 8 A 13 12 15071 CASAVA_Build 5 16645636 1I TACTACCATT -/C AACCCAGCAA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 C 0 1 15072 CASAVA_Build 5 16645827 2D ATGCAGCCAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 A 11 9 15073 CASAVA_Build 5 16654406 3I AAGCTATGAT ---/CTC CTCACTGCAC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 CTC 1 2 15074 CASAVA_Build 5 16664507 1D GAACTTGAAT A/- AAAAAAAAAA 1353 het 1353 ref 33 22 3 8 A 11 10 15075 CASAVA_Build 5 16666207 1D CTACAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3041 het 3041 ref 27 9 10 8 T 11 10 15076 CASAVA_Build 5 16667359 1I AACATCATAG -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 6 7 15077 CASAVA_Build 5 16697934 1D CTCAAAACTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 92 het 35 0 30 5 T 9 8 15078 CASAVA_Build 5 16698499 7D CTAATGCTAT CCCTCCC/------- CCCTCCCCCC 1618 hom 10 het 4 0 4 1 CCCTCCC 2 1 15079 CASAVA_Build 5 16698846 1D ACAGGAAGGC A/- GAGGAGAATC 3070 het 2067 hom 29 7 21 1 A 1 0 15080 CASAVA_Build 5 16698996 1D TCTTTAGGCC T/- TTATTCTAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 3 2 15081 CASAVA_Build 5 16703268 1I TATAAATATG -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 6 7 15082 CASAVA_Build 5 16708049 1I AAGAGCCTTG -/T TGGTTGGTAC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 1 2 15083 CASAVA_Build 5 16710710 1D TATAGAAATT A/- AAACCTGAAC 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 4 3 15084 CASAVA_Build 5 16716662 2I TTGAAAAAAC --/AT TTTTTTTGGT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AT 0 1 15085 CASAVA_Build 5 16722332 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 33 0 25 8 T 11 10 15086 CASAVA_Build 5 16725529 3D CTAAAAAATC AAG/--- AAATACCCAG 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 AAG 1 0 15087 CASAVA_Build 5 16727673 1D AATATCCAAG T/- TTTTTTTTTT 2326 het 2326 ref 25 10 8 7 T 17 16 15088 CASAVA_Build 5 16734289 2I GGCTTAGAAG --/AT ATAAACCAAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 AT 1 2 15089 CASAVA_Build 5 16737833 6I TTTGTAACTT ------/TGTGTA TGTGTCTGGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TGTGTA 0 1 15090 CASAVA_Build 5 16739261 1I AGCAAATAAT -/A AAATCCTCAG 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 3 4 15091 CASAVA_Build 5 16739825 3I CAGTAGAGAT ---/GGG GGGGTTTCAC 3070 het 2532 hom 16 6 9 1 G 4 7 15092 CASAVA_Build 5 16745891 3D CCTGTTCTAT AGG/--- AGGTGACAGA 3070 het 3070 hom 35 11 18 8 AGG 2 1 15093 CASAVA_Build 5 16748791 1D ATCAACATCT G/- ACACACATCT 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 G 1 0 15094 CASAVA_Build 5 16748891 2I TTAAAGTAAG --/TA TATAATCCTA 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 TA 2 3 15095 CASAVA_Build 5 16750141 1I TATTGGATCA -/T AAGGTTCTGA 2907 het 2907 ref 28 19 7 2 T 0 1 15096 CASAVA_Build 5 16750906 3I AGAAAAAGGA ---/AGG AGAAGACAAA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 AGG 0 1 15097 CASAVA_Build 5 16763010 2I GGGAGGTAGT --/AG AGGTCCATCA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 AG 1 2 15098 CASAVA_Build 5 16764366 1D TAAACCATGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 14 23 5 A 10 9 15099 CASAVA_Build 5 16768672 17D GCCTCCCAAA GTGCTGGGATTACAGGC/----------------- ATGAGCCACC 1907 het 1907 ref 11 7 4 1 GTGCTGGGATTACAGGC 1 0 15100 CASAVA_Build 5 16770849 1I TTTGACCCAC -/G GGGGATTTAA 3070 hom 105 het 37 0 36 3 G 4 5 15101 CASAVA_Build 5 16774585 1I TGTTAAACAC -/T TTACACAGTG 3070 hom 69 het 28 0 21 7 T 2 3 15102 CASAVA_Build 5 16775616 1D AATGAAAACG T/- TTTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 7 6 15103 CASAVA_Build 5 16813157 1I TCCTTAGATA -/T TAAACATGTG 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 1 2 15104 CASAVA_Build 5 16817256 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 37 1 30 6 A 11 10 15105 CASAVA_Build 5 16833430 1I AAAAAAAAAA -/T ATCTAAGGTT 3070 het 277 hom 41 1 35 5 T 0 1 15106 CASAVA_Build 5 16838112 2D GGGGAGGTTT GC/-- GCGCACACAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 GC 3 2 15107 CASAVA_Build 5 16839235 1I CCAGGGGCCG -/T GAGAGGAGCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 1 15108 CASAVA_Build 5 16839991 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTGGCCGG 3070 hom 53 het 21 0 17 4 T 5 4 15109 CASAVA_Build 5 16843989 4D TGGAAAATTC AAGT/---- AAGTTTTAAA 1202 het 1202 ref 20 7 4 9 AAGT 2 1 15110 CASAVA_Build 5 16844022 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 783 het 220 hom 15 2 6 7 AC 8 6 15111 CASAVA_Build 5 16868088 1D CCTTGTGTAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 15112 CASAVA_Build 5 16868272 1I ACACTATTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 390 hom 31 1 24 6 A 9 10 15113 CASAVA_Build 5 16869029 2I ATCTAAAGAC --/TG AGGACAAGCT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TG 0 1 15114 CASAVA_Build 5 16875032 2D GAAGAGGGGG AA/-- AAAAAAAAGC 3070 hom 63 het 29 0 20 10 A 10 8 15115 CASAVA_Build 5 16875800 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1533 hom 10 het 15 0 4 11 T 15 14 15116 CASAVA_Build 5 16923329 1D GAAGTGCAAG A/- AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 29 18 11 0 A 7 6 15117 CASAVA_Build 5 16933288 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 6 7 15118 CASAVA_Build 5 16933364 2I ATCCATAGTT --/AA GTCACTCTTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 0 2 15119 CASAVA_Build 5 16935592 1D TCTTACCAGC A/- AAAATACTGG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 5 4 15120 CASAVA_Build 5 16937767 1D TGTTTTCGTC T/- TTTTTTTTTT 2154 het 1896 hom 35 11 8 17 T 13 12 15121 CASAVA_Build 5 16937824 1I TACCAGATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 T 9 10 15122 CASAVA_Build 5 16951365 1I TAATCACATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 8 9 15123 CASAVA_Build 5 16966284 1I GTTATAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 A 9 10 15124 CASAVA_Build 5 16969072 2D CGTCAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 813 hom 20 6 9 7 A 16 14 15125 CASAVA_Build 5 16974374 3I AGAATACGAC ---/CTT CTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 CTT 1 2 15126 CASAVA_Build 5 16976910 1I ATAAAAATCA -/G AAAAATTGGC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 G 0 1 15127 CASAVA_Build 5 16985904 4D GCAGTAAGAG TCTA/---- TCTATTTTGT 3070 het 3070 hom 41 19 19 6 TCTA 2 1 15128 CASAVA_Build 5 16999124 1D CCGTCTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 12 7 T 11 10 15129 CASAVA_Build 5 17001975 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 T 9 10 15130 CASAVA_Build 5 17020170 6I TAGCTACTAT ------/ATAGAG ATAAAGATTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ATAGAG 0 1 15131 CASAVA_Build 5 17030252 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2588 hom 33 10 18 5 T 9 10 15132 CASAVA_Build 5 17031674 2I TCTCCCTCTC --/TT TTTCTTTCCC 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 T 3 5 15133 CASAVA_Build 5 17033380 1D TATTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 683 het 683 ref 14 4 5 5 T 13 12 15134 CASAVA_Build 5 17036998 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 het 1348 hom 21 6 11 4 T 0 1 15135 CASAVA_Build 5 17043807 2D AGCTAGATAC AG/-- AGTGTCCACA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AG 2 1 15136 CASAVA_Build 5 17047938 1D GACACACACA G/- TAGTTTGAGC 3070 hom 117 het 45 0 40 7 G 1 0 15137 CASAVA_Build 5 17048048 4I AGAAAGTCAG ----/AGAA AGGAAGTTTG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AGAA 0 1 15138 CASAVA_Build 5 17050110 2I TGGGGAACTC --/AG GGGAAAGGGT 3070 hom 57 het 20 0 18 2 AG 0 1 15139 CASAVA_Build 5 17053292 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAGAG 3070 het 1498 hom 28 6 17 5 G 0 1 15140 CASAVA_Build 5 17056835 1I CATTCACTTA -/G GAAAAAAAAC 3070 het 380 hom 34 1 28 5 G 1 2 15141 CASAVA_Build 5 17058889 4D CGGTACTTAT TTTA/---- TTTATTTATC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TTTA 3 2 15142 CASAVA_Build 5 17064330 4I CATCATATAC ----/TTAA TTGTTTAATT 2376 hom 12 het 5 0 5 0 TTAA 0 1 15143 CASAVA_Build 5 17070452 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 hom 27 het 10 0 9 1 T 6 5 15144 CASAVA_Build 5 17077169 3I TCAGGAGGCT ---/GAG GAGGAGAATG 1951 hom 15 het 6 0 6 0 GAG 2 3 15145 CASAVA_Build 5 17077561 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 464 het 43 hom 10 1 2 7 A 17 16 15146 CASAVA_Build 5 17077599 21D TAAGCGCTAT AGAAAAAAAATTAATTAGGGA/--------------------- AGGGGAGTGA 1886 het 1886 ref 15 11 6 4 AGAAAAAAAATTAATTAGGGA 1 0 15147 CASAVA_Build 5 17078195 1D GTCATCACTG T/- TGATGGCTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 2 1 15148 CASAVA_Build 5 17078820 1I ATGCAGCCAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 8 9 15149 CASAVA_Build 5 17081135 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 8 7 15150 CASAVA_Build 5 17082968 1D TCTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAT 1323 hom 7 het 4 0 3 1 A 10 9 15151 CASAVA_Build 5 17084746 2D ACTGACTTCA AG/-- AATGAAGCCG 3070 hom 99 het 37 0 29 9 AG 1 0 15152 CASAVA_Build 5 17085214 13D GAGCAGAGTG GTCTGTTTTGACA/------------- GGGCGCTGAT 3070 hom 45 het 15 0 16 1 GTCTGTTTTGACA 1 0 15153 CASAVA_Build 5 17101107 1I51M14D CTATCTACCC -GTTTCCCAAAATAGAAAAAGTGGCATCCTCTCTCTTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACA/AGTTTCCCAAAATAGAAAAAGTGGCATCCTCTCTCTTTCTCTTTCTCTCTCT-------------- CACACACACA 3070 het 26 hom 25 1 36 4 N/A 0 0 15154 CASAVA_Build 5 17101529 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 8 7 15155 CASAVA_Build 5 17103063 2I18M1D ACTCCGTCTC --AAAAAAAAATAAATAAATA/AAAAAAAAAAATAAATAAAT- AAAATTAAAA 2644 hom 17 het 7 0 6 1 N/A 0 0 15156 CASAVA_Build 5 17107346 2I ATTTTCTCTC --/TT GTGTTTATCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 0 2 15157 CASAVA_Build 5 17108696 1D TTTATTTTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 9 8 15158 CASAVA_Build 5 17110038 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 3 A 13 12 15159 CASAVA_Build 5 17117214 3D CATATTTAAT GGG/--- GGGATGCTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 6 3 15160 CASAVA_Build 5 17118502 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 670 hom 20 2 17 1 A 10 9 15161 CASAVA_Build 5 17118705 3D ATGAGTCTCC GTT/--- GTTTGGCATC 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 GTT 2 1 15162 CASAVA_Build 5 17129030 1D GTTCCAGCGA T/- TCTCCTGCCT 2794 hom 8 het 10 0 6 6 T 2 1 15163 CASAVA_Build 5 17133790 1D TCCTTTTTTT C/- CTCTCCCTTT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 C 2 1 15164 CASAVA_Build 5 17134610 12D TGTGTAGTAA TTGAGAACAGAT/------------ TTGAGAACAG 3070 hom 52 het 22 0 17 5 TTGAGAACAGAT 2 1 15165 CASAVA_Build 5 17135561 3I TCTCAAAAAA ---/AAC AACAAAACAA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 AAC 1 2 15166 CASAVA_Build 5 17135622 3D ACTTCAACTA ATT/--- ATTATTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 ATT 3 2 15167 CASAVA_Build 5 17135871 1D AGGTGATCCA C/- CCGCCTAGGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 3 2 15168 CASAVA_Build 5 17136686 4I CCCGGGCAAT ----/GAGG GAGGGGCTTA 1066 hom 10 het 7 0 3 4 GAGG 1 2 15169 CASAVA_Build 5 17142160 1D TAATTTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 573 hom 29 3 18 8 T 15 14 15170 CASAVA_Build 5 17142751 12D TTTTTTTTTA AATTAATTAATT/------------ AATTAATTAA 2164 het 2111 hom 18 6 10 5 AATT 6 3 15171 CASAVA_Build 5 17174836 1I TCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 9 10 15172 CASAVA_Build 5 17180319 17D TCAAGTTATG GACCTCAATCTTTCACA/----------------- GACCTCAATC 3070 het 3070 ref 43 32 8 7 GACCTCAATCTTTCACA 1 0 15173 CASAVA_Build 5 17186479 2D AAGAAGTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2978 hom 28 9 13 6 A 14 12 15174 CASAVA_Build 5 17186639 4D AACACTCATT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 17 12 13 TG 10 8 15175 CASAVA_Build 5 17194333 1D AAAACCCGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2753 hom 26 9 15 3 T 10 9 15176 CASAVA_Build 5 17196588 4I TCCTAACTTT ----/CTAA CTATGTCTGC 3070 het 3070 hom 48 18 18 12 CTAA 0 1 15177 CASAVA_Build 5 17197194 2D AAACTCCGTC AA/-- AAAAAAAAAA 1039 het 1039 ref 24 18 3 5 A 14 12 15178 CASAVA_Build 5 17197741 1D AAAGTCAGAG A/- AAAAAGCATA 3070 het 3070 hom 37 17 20 2 A 6 5 15179 CASAVA_Build 5 17202295 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2450 het 1087 hom 22 6 10 6 T 14 13 15180 CASAVA_Build 5 17204066 12D TGGTATTATA TTTTCTTTTCTT/------------ TTTTCTTTTC 2823 het 2823 ref 30 16 10 6 TTTTCTTTTCTT 2 1 15181 CASAVA_Build 5 17207613 1D TATTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 11 10 15182 CASAVA_Build 5 17207781 2D CCTTTAGTAA CT/-- CTCAGCTACA 3070 het 3070 hom 33 16 17 1 CT 2 1 15183 CASAVA_Build 5 17208649 1I AGTCAACTTT -/C TGAAAATGTA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 C 0 1 15184 CASAVA_Build 5 17213682 4D GTTAGGGTTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 TG 8 6 15185 CASAVA_Build 5 17215176 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2505 het 2505 ref 23 8 8 7 T 13 12 15186 CASAVA_Build 5 17224248 1I TAGGTGGGAC -/T TACAGGCACG 3070 het 2032 hom 18 6 11 3 T 1 2 15187 CASAVA_Build 5 17228002 1D AAAACTAGGG A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 32 12 19 2 A 7 6 15188 CASAVA_Build 5 17238613 4D TCTTCCCTTC CTTT/---- CTTTCCCCTC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 CTTT 2 1 15189 CASAVA_Build 5 17253567 4D GCAGATAAAT TGAA/---- TGAATGAATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TGAA 3 2 15190 CASAVA_Build 5 17262454 4D TCGCATGAGA ACTC/---- ACTCACTAAC 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 ACTC 2 1 15191 CASAVA_Build 5 17262798 1I ACTAAAAATA -/C AAAAAATTAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 0 1 15192 CASAVA_Build 5 17262934 2D GCCTGGCGAC AG/-- AGAGAGAGAC 1453 hom 19 het 11 0 8 3 AG 5 4 15193 CASAVA_Build 5 17269060 3D GTACAGTAGG GTC/--- GTCAAGTGTT 3070 het 3070 hom 51 23 25 5 GTC 2 1 15194 CASAVA_Build 5 17272104 1I ACCTTGTACA -/G GGTTGACAAC 3070 hom 54 het 24 0 18 6 G 2 3 15195 CASAVA_Build 5 17276134 1I TTATAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 11 12 15196 CASAVA_Build 5 17280053 3D TTTTTTTTTT TTC/--- TTTTTTTCGT 2206 het 2111 hom 21 8 6 7 TTC 1 0 15197 CASAVA_Build 5 17284120 1D AAATTGAGAA T/- TAACAATTTA 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 T 2 1 15198 CASAVA_Build 5 17295437 4D TTTGTTCGAC TTTA/---- TTTGTTAGAT 3070 het 3070 ref 41 23 16 5 TTTA 1 0 15199 CASAVA_Build 5 17298413 2D TGAGACTCCG TC/-- TCAAAAAAAA 1775 het 757 hom 27 6 10 11 TC 2 1 15200 CASAVA_Build 5 17307321 3I AAGCAGATTA ---/TCT TCTTTTTAGC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TCT 1 2 15201 CASAVA_Build 5 17308856 5D TCATGTTAAA TGCAT/----- CTCTTTCACT 3070 hom 138 het 51 0 47 5 TGCAT 1 0 15202 CASAVA_Build 5 17310437 5I ACAAAACAAA -----/AAAAG AAGAGTGATT 3070 hom 86 het 35 0 29 6 AAAAG 0 1 15203 CASAVA_Build 5 17325614 5D TTTTATGTAA TATAT/----- TTATGAGTAG 3070 hom 126 het 45 0 43 6 TATAT 1 0 15204 CASAVA_Build 5 17330324 4D AAAATGTAAC TAAT/---- TAAGAAGAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TAAT 1 0 15205 CASAVA_Build 5 17368980 1I TTTTTTTTTT -/C TCTCTCTCTC 2553 het 1365 hom 20 8 9 3 C 0 1 15206 CASAVA_Build 5 17375274 1D AACACTCACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 19 0 14 5 T 10 9 15207 CASAVA_Build 5 17384620 1I TCTCTTGCCA -/C CCCCTATGTA 3070 hom 108 het 40 0 34 6 C 4 5 15208 CASAVA_Build 5 17388843 4I TAGATCTATG ----/CTAT CTGTTTTCCT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 CTAT 0 1 15209 CASAVA_Build 5 17399118 2I GGTTAGAACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 13 15 15210 CASAVA_Build 5 17400808 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 hom 68 het 30 0 21 9 AG 2 1 15211 CASAVA_Build 5 17406068 6D ACCAAAAAAC AAAACA/------ AAACAAAACA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAAACA 1 0 15212 CASAVA_Build 5 17411872 1I ATCCTCTTAA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 7 8 15213 CASAVA_Build 5 17417836 2I TAGGTGGTTC --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 20 0 12 8 AT 6 7 15214 CASAVA_Build 5 17419490 1D TAGTAAGGAG C/- CCCGTGGTAG 3070 hom 72 het 27 0 20 7 C 4 3 15215 CASAVA_Build 5 17421047 1I GCGTGTGTGT -/G GGGGGGTGCA 3070 hom 85 het 34 0 28 6 G 6 7 15216 CASAVA_Build 5 17422849 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 26 1 19 6 T 13 12 15217 CASAVA_Build 5 17423149 1D TGGTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 24 1 18 5 T 11 10 15218 CASAVA_Build 5 17435561 1I ATATGATAGG -/A AAAAAAGGTA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 6 7 15219 CASAVA_Build 5 17436656 1I ATTAAATTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 30 1 23 6 T 12 13 15220 CASAVA_Build 5 17444120 1I ACATTGCCTT -/C CTTTTTGGTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 C 1 2 15221 CASAVA_Build 5 17445455 1D CTGCAGTGAG C/- CCGTGATCTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 3 2 15222 CASAVA_Build 5 17445758 1D TGGGAATTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 9 8 15223 CASAVA_Build 5 17446540 1D TTAAAATAGC A/- AAAAAAAAAA 2819 het 2819 ref 20 10 7 3 A 12 11 15224 CASAVA_Build 5 17452987 7D TAAATACCTC AAGGTGG/------- TGAAATTGTC 3070 hom 87 het 34 0 29 7 AAGGTGG 1 0 15225 CASAVA_Build 5 17455303 5I TCTCTCTCTC -----/TCTTA TATTTTTCCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TCTTA 0 1 15226 CASAVA_Build 5 17456090 14D CCTTTCAGGT TTCCTGTCTCAGGA/-------------- TTCCTGGTAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 6 TTCCTGTCTCAGGA 1 0 15227 CASAVA_Build 5 17458638 13D GGCAAATCTC TGTGTGAGTATTA/------------- TGTGTGAGTA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TGTGTGAGTATTA 2 1 15228 CASAVA_Build 5 17460925 1I TGAATTTCGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 T 9 10 15229 CASAVA_Build 5 17461511 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1465 het 758 hom 9 3 4 2 A 13 12 15230 CASAVA_Build 5 17467295 1I ATCATTCAGG -/A AGGAATACTG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 1 2 15231 CASAVA_Build 5 17492517 1I GCTACTCAGG -/A GGCTGAAGCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 0 1 15232 CASAVA_Build 5 17492887 1D CCTTTTTAAA C/- TAGCGATATT 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 C 1 0 15233 CASAVA_Build 5 17493470 3D TAAATAAAAT ATC/--- ATTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 54 19 32 7 ATC 1 0 15234 CASAVA_Build 5 17494831 1I TTTCTGTCTG -/T TTTTTTTTTT 2378 het 2378 ref 40 13 15 12 T 14 15 15235 CASAVA_Build 5 17498407 1D CACACAACTC T/- GGGGCTAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 T 1 0 15236 CASAVA_Build 5 17507412 16D AGAAAACTGA GAAAGCAAAGCTCAGG/---------------- GAAAGCAAAG 3070 hom 99 het 38 0 33 7 GAAAGCAAAGCTCAGG 1 0 15237 CASAVA_Build 5 17509260 2D GAAGGGAAGT GA/-- GAGGATTCAT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 GA 2 1 15238 CASAVA_Build 5 17516670 1D GTGCTTCTCT G/- GGGGGGAACC 3070 hom 98 het 37 0 33 4 G 7 6 15239 CASAVA_Build 5 17529854 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 13 12 15240 CASAVA_Build 5 17533397 1D AGGAAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 24 0 19 5 T 15 14 15241 CASAVA_Build 5 17550719 3I TCTTTATAAG ---/GGA GGACTGAACC 669 het 669 ref 23 16 3 5 GGA 1 2 15242 CASAVA_Build 5 17553682 8D CACACACAAG GTTAGAAC/-------- ATTAGAACAT 2239 het 2239 ref 44 40 6 4 GTTAGAAC 1 0 15243 CASAVA_Build 5 17554963 1D33M7I CTCCACTATT CCCAAGCACATATTATCTAGGGTCTAGTCTTTAG-------/-CCAAGCACATATTATCTAGGGTCTAATCTTTAGAAGTATA AAGTACAAAG 3070 het 3070 ref 45 47 8 13 N/A 0 0 15244 CASAVA_Build 5 17555233 1D TGGTAGCGCT C/- TGGAAGCGCA 3070 het 3070 ref 64 35 24 6 C 1 0 15245 CASAVA_Build 5 17556682 2D1M8I AGTTCATATT CCT--------/--TTAAAAAAA GTTTTAAAAG 2944 het 2944 ref 66 48 10 9 N/A 0 0 15246 CASAVA_Build 5 17558025 1I CTTTGTCCGG -/T TTTTAAATTG 3070 het 3070 ref 66 32 27 7 T 4 5 15247 CASAVA_Build 5 17558180 1D GCTTTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 73 27 27 20 T 13 12 15248 CASAVA_Build 5 17558702 2D GCTTTTTTAG TT/-- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 58 34 14 11 T 9 7 15249 CASAVA_Build 5 17559289 4I GCTGAAAAAC ----/AGTT GGTTGATTTC 3070 het 3070 ref 72 44 23 5 AGTT 0 1 15250 CASAVA_Build 5 17559516 2D CTTTTTTCTC TA/-- TCTGAAAACA 3070 het 3070 ref 76 41 28 8 TA 1 0 15251 CASAVA_Build 5 17644221 1I TTTAATTCAA -/T TTGTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 2 3 15252 CASAVA_Build 5 17645101 1I GGAGGAAGAT -/G GGGTTTTTTT 2165 het 347 hom 30 2 16 12 G 3 4 15253 CASAVA_Build 5 17647408 1I7M1D ACTCCCCTGT -GGAGATTC/GGGAGATT- CCCCAGCACT 791 het 791 ref 39 30 3 9 N/A 0 0 15254 CASAVA_Build 5 17651423 6D4M1I TTCTTAAAGT ACATTACTAT-/------CTATC TCATAATGTA 1322 het 1322 ref 32 30 3 4 N/A 0 0 15255 CASAVA_Build 5 17653198 1D GGGTGTCACA G/- GGGGCATTTT 3070 hom 102 het 37 0 33 4 G 5 4 15256 CASAVA_Build 5 17654772 2D TCTCCCCACT TC/-- TCTCCTTCAC 2763 hom 18 het 8 0 6 3 TC 3 2 15257 CASAVA_Build 5 17662322 1D GCTCTTCTTA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 80 het 29 0 28 2 T 8 7 15258 CASAVA_Build 5 17669513 2D TCAGAACACT AG/-- AGGAAAAGAG 3070 hom 61 het 28 0 16 12 AG 2 1 15259 CASAVA_Build 5 17669664 3D TAAAGCTGAA CTG/--- CTGAAGACAG 3070 het 1451 hom 25 5 20 1 CTG 2 1 15260 CASAVA_Build 5 17670728 4I CAAGATACCT ----/AACA AATAAAGTGA 2521 het 2521 ref 59 45 6 9 AACA 0 1 15261 CASAVA_Build 5 17673018 1I ATATATTGTT -/A AACTATAGTC 1549 het 1549 ref 71 59 4 10 A 2 3 15262 CASAVA_Build 5 17676507 1I TCCATTTGAA -/T TATCTTCTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 2 15263 CASAVA_Build 5 17679054 1D ATCTTTCATA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 10 9 15264 CASAVA_Build 5 17679919 2I AGGAAGTCTA --/CC AGGTTCCAGG 3070 hom 99 het 37 0 32 5 C 0 2 15265 CASAVA_Build 5 17687819 8D TTGATGTAGA GCTGAAGT/-------- GCTGAAACTC 3070 hom 138 het 53 0 45 12 GCTGAAGT 1 0 15266 CASAVA_Build 5 17696729 1I ATTTTTTCTA -/T TTTTTTAGTA 1416 hom 7 het 3 0 3 0 T 6 7 15267 CASAVA_Build 5 17699969 1D CCTTTCTGTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 9 8 15268 CASAVA_Build 5 17709529 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 48 het 20 0 15 5 A 8 9 15269 CASAVA_Build 5 17717994 1D CTTAATACAG A/- TTTTTTTGAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 1 0 15270 CASAVA_Build 5 17725549 1I GAAAGATCAA -/G AAAAAGTGTG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 0 1 15271 CASAVA_Build 5 17725661 2D CCAGTGAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 28 1 13 14 T 16 14 15272 CASAVA_Build 5 17726397 1D TGGACATTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 10 9 15273 CASAVA_Build 5 17726482 1I ATATGTTTAT -/A AAATGCTATT 3070 hom 117 het 40 0 40 1 A 3 4 15274 CASAVA_Build 5 17740976 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 98 hom 16 1 12 3 A 9 10 15275 CASAVA_Build 5 17745717 1I CCTTGCTTTA -/G GGGAGACTAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 3 4 15276 CASAVA_Build 5 17760327 2D ATGAAAGAAG TA/-- TAAGGCTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TA 2 1 15277 CASAVA_Build 5 17760472 1D CCATATTTCT C/- CCCCCCCTTT 3070 hom 71 het 35 0 24 11 C 8 7 15278 CASAVA_Build 5 17769590 1D GAACACAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 22 19 3 T 10 9 15279 CASAVA_Build 5 17773307 1I CAGATAGCTG -/A TTGGGTACAA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 0 1 15280 CASAVA_Build 5 17782071 1D GTCAGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 2882 het 924 hom 27 6 11 10 T 17 16 15281 CASAVA_Build 5 17793940 1I TGGTCATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 14 21 12 A 14 15 15282 CASAVA_Build 5 17795427 17D GACTAGACTA GTGTCTGTCATATACCT/----------------- GTGTCTGTCA 3070 het 3070 ref 40 19 17 9 GTGTCTGTCATATACCT 2 1 15283 CASAVA_Build 5 17800121 8D TTATGTGAAG CAGTCTAA/-------- CATTTTTTGA 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 CAGTCTAA 1 0 15284 CASAVA_Build 5 17801056 1D ATGACAACTA T/- TTTTTGTATC 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 T 6 5 15285 CASAVA_Build 5 17804342 1D TTCCCCACTC T/- TCTTAATTAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 2 1 15286 CASAVA_Build 5 17812080 1I TTCATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1117 het 1117 ref 43 35 3 5 T 10 11 15287 CASAVA_Build 5 17812737 1D ACCAGTCAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 17 14 11 T 10 9 15288 CASAVA_Build 5 17825432 3I CCTCCCGAGT ---/AGG AGGACACCTT 3070 het 3070 hom 59 24 24 11 AGG 1 2 15289 CASAVA_Build 5 17826871 1I TCTGGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2631 hom 35 11 18 6 A 12 13 15290 CASAVA_Build 5 17827325 1I GCTATCGAAA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 5 6 15291 CASAVA_Build 5 17828056 4I TTCTTGTGAT ----/AGTA AGTGAGTCTC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 AGTA 0 1 15292 CASAVA_Build 5 17829579 2D TAGAGTATAA CT/-- CTGTACTCCT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 CT 2 1 15293 CASAVA_Build 5 17830320 1D TAAGAGACAG C/- CATATAGCTG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 C 2 1 15294 CASAVA_Build 5 17833702 3I10M1I ATCTGATTGA ---TCTTCTTTTA-/TCTTCTTCTTTTAT TTTTTTTCTT 976 het 976 ref 44 21 7 19 N/A 0 0 15295 CASAVA_Build 5 17834702 4I AACACAAAAG ----/AATA AATAAATGAA 3070 het 1990 hom 28 6 17 5 AATA 1 2 15296 CASAVA_Build 5 17836063 1I GTGAGGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 9 10 15297 CASAVA_Build 5 17837285 2D ATAAAATAAC TT/-- AGAATATAAT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 T 2 0 15298 CASAVA_Build 5 17852589 3D CATGGTTCCT TCC/--- TCCTCATTCC 3070 het 3070 hom 54 21 25 9 TCC 2 1 15299 CASAVA_Build 5 17855485 4I TGTGTGTATA ----/TGTG TGTGTATTTA 3070 hom 90 het 35 0 29 6 TG 2 4 15300 CASAVA_Build 5 17857153 1D GACTTTGCTC A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 48 19 20 11 A 8 7 15301 CASAVA_Build 5 17859127 5I TTTATATAAA -----/TATAT TATATTTTAT 1753 hom 10 het 5 0 4 1 TATAT 1 2 15302 CASAVA_Build 5 17861936 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2561 hom 15 het 9 0 6 3 A 12 11 15303 CASAVA_Build 5 17875109 4I TAAAACTTTG ----/AATT AATTAAAATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AATT 1 2 15304 CASAVA_Build 5 17878769 2I ACTTTCTCAC --/AT ATTCCTGTCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AT 1 2 15305 CASAVA_Build 5 17882520 1D CAGAAAGTGC T/- TTTTTTTTTT 2319 het 2319 ref 32 10 7 15 T 14 13 15306 CASAVA_Build 5 17885372 3D TATTTATTTG ATT/--- ATTAAGATTC 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 ATT 2 1 15307 CASAVA_Build 5 17907396 1I TAACAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 A 10 11 15308 CASAVA_Build 5 17907798 1I TTTGTGAGGT -/A AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 A 6 7 15309 CASAVA_Build 5 17910726 1D GATAAGTGTT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 7 6 15310 CASAVA_Build 5 17917431 10D TTTCTGTGAG AGAGATATAT/---------- ATATATATAT 3070 het 373 hom 21 2 11 8 AGAGATATAT 1 0 15311 CASAVA_Build 5 17922728 1D ACGTGTTGTT A/- GGGGGCACCT 3070 hom 94 het 34 0 29 5 A 1 0 15312 CASAVA_Build 5 17927031 1D TATCAAAATT C/- AACAATCTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 0 15313 CASAVA_Build 5 17934688 1D AGGGGCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 A 13 12 15314 CASAVA_Build 5 17940162 2D TGTGTTATTG TT/-- TTATAGGTCC 3070 het 3070 ref 33 21 10 5 T 4 2 15315 CASAVA_Build 5 17940991 2I CTTCATATCT --/TA TATATATATA 2987 het 2388 hom 16 8 7 1 TA 8 9 15316 CASAVA_Build 5 17948068 1D GCATCTTTGC A/- AATATATTCT 3070 het 3070 hom 32 10 20 3 A 3 2 15317 CASAVA_Build 5 17953490 18D GGCATGCACT CATACACACACACACACA/------------------ CATACACACA 3070 het 517 hom 24 4 17 12 CATACACACACACACACA 2 1 15318 CASAVA_Build 5 17957377 1D GAATAATTTG T/- TTTTTTTTTT 2759 het 2759 ref 33 20 6 8 T 11 10 15319 CASAVA_Build 5 17959534 1I TATTATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 13 14 15320 CASAVA_Build 5 17972228 2D AAGTTGAAAA AG/-- AGATTATTCT 3070 het 3070 hom 38 16 21 3 AG 2 1 15321 CASAVA_Build 5 17974589 4D GAGTAGAATA ATAG/---- ATATCAGAGG 3070 het 3070 ref 41 19 20 4 ATAG 1 0 15322 CASAVA_Build 5 17978349 1D AGATTTAAAT A/- TACACACACA 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 A 1 0 15323 CASAVA_Build 5 17980355 1D TAGGGGTAAA G/- TATGAATGCT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 G 1 0 15324 CASAVA_Build 5 17981787 2I TGTGGTCTTT --/TA TGTCTCATCT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 TA 0 1 15325 CASAVA_Build 5 17984106 1D TGTAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 11 10 15326 CASAVA_Build 5 17990950 1D AAGGAGAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 9 8 15327 CASAVA_Build 5 17991132 1I AGGTACAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2982 hom 24 8 8 8 T 13 14 15328 CASAVA_Build 5 17999353 2I AACATTGAAG --/AC ACATTATTAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 AC 1 2 15329 CASAVA_Build 5 18022533 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 11 12 15330 CASAVA_Build 5 18023514 7I TCTGTGTATA -------/GAGTTGG GGAAGTAAAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 GAGTTGG 0 1 15331 CASAVA_Build 5 18026679 1I ATTCTAGAAA -/C ATTGGTTAAT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 C 0 1 15332 CASAVA_Build 5 18034572 1I CATTTGTTTA -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 T 6 7 15333 CASAVA_Build 5 18040806 1I ACTTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 11 11 T 13 14 15334 CASAVA_Build 5 18041078 1D CTTGTGATAG T/- TTGCTGAGAA 2704 het 2704 ref 19 12 6 1 T 3 2 15335 CASAVA_Build 5 18043488 1D TACTGAATAC A/- ATTATCCATA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 2 1 15336 CASAVA_Build 5 18044569 1I CAGCCTCCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 9 15337 CASAVA_Build 5 18050098 2I TATGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 17 9 12 TG 8 9 15338 CASAVA_Build 5 18053817 2D TTAGTATTAC TG/-- TGTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 TG 2 1 15339 CASAVA_Build 5 18054423 1I26M1I TGCCAGCAAT -AAAATGAAAAGAATTGATTAAAACAT-/AAAAATGAAAAGAATTGATTAAAACATA AAAAAAGGAG 3070 het 3070 hom 35 19 19 6 N/A 0 0 15340 CASAVA_Build 5 18072683 1D ATAAATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 12 11 15341 CASAVA_Build 5 18078232 2D ACAAATAATC AG/-- AAATTGAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 6 AG 1 0 15342 CASAVA_Build 5 18079609 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2650 hom 28 10 10 8 T 9 8 15343 CASAVA_Build 5 18083024 5D ATTTCATATG TTATA/----- TTATTATATA 3070 het 3070 hom 31 13 17 6 TTATA 1 0 15344 CASAVA_Build 5 18093167 7D AAAGGCAGTG AAAGTAC/------- AATGATAGGA 3070 het 2956 hom 19 6 13 4 AAAGTAC 1 0 15345 CASAVA_Build 5 18111798 1D CACTGGCATG T/- TTTTTTTTTT 1269 het 1269 ref 27 15 3 9 T 13 12 15346 CASAVA_Build 5 18112565 2D ATATTACATG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 54 26 21 9 AT 6 5 15347 CASAVA_Build 5 18114504 2I AGATTTTCTT --/TC TGAGTCCTCC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TC 0 1 15348 CASAVA_Build 5 18119405 3I AGAAAAGAAA ---/TAT TATACATTGA 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 TAT 1 2 15349 CASAVA_Build 5 18129928 1D GTTTTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 1180 het 1180 ref 39 29 3 7 A 12 11 15350 CASAVA_Build 5 18134342 1I72M1I CTATTATTAC -AAAATTTCCAAGAGAAAAAATGGTCTCTACTTGTTTTTCCTGAGATGTAGGTGTATAAAAGAAGTAAAATAC-/AAAAATTTCCAAGAGAAAAAATGGTCTCTACTTGTTTTTCCTGAGATGTAGGTGTATAAAAGAAGTAAAATACA AAGACCTGTT 3070 hom 48 het 20 0 17 22 N/A 0 0 15351 CASAVA_Build 5 18134615 3D TGTTTCTGTA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 T 12 9 15352 CASAVA_Build 5 18136013 1I TCTGCACTAC -/T TTTAGAGATT 3070 het 3070 hom 39 13 26 0 T 3 4 15353 CASAVA_Build 5 18141309 4D TTATCTACTC AGAA/---- AGAGATGATG 3070 het 3070 ref 34 15 16 5 AGAA 1 0 15354 CASAVA_Build 5 18141945 2I GCCATTTGAT --/AA GAGAGGAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 A 0 2 15355 CASAVA_Build 5 18144347 4I TTTGATAGAT ----/AATC AATATTTTCT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 AATC 0 1 15356 CASAVA_Build 5 18146190 1D CATACCCAAG T/- TGACTATATA 3070 het 3070 ref 25 10 12 3 T 2 1 15357 CASAVA_Build 5 18147804 1D AAGAAAAAAA T/- TTTTCTGTGA 3070 het 3070 hom 38 19 17 3 T 5 4 15358 CASAVA_Build 5 18156648 1D GCAGCACATC A/- AAAAAACTTA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 7 6 15359 CASAVA_Build 5 18157607 4D CAAAAGAGAC AAAG/---- AAGGCCGTTA 3070 het 929 hom 12 3 8 1 AAAG 1 0 15360 CASAVA_Build 5 18162142 1I TTCAAAGTAC -/T TTGGGTTCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 3 15361 CASAVA_Build 5 18163205 3D ATGTCTAAAA AAT/--- AATATATATC 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 AAT 2 1 15362 CASAVA_Build 5 18166258 1I CATATCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 43 1 28 14 T 12 13 15363 CASAVA_Build 5 18166954 2D ATGGTTAGTT AA/-- TACTTAAGTC 3070 hom 153 het 59 0 50 10 A 2 0 15364 CASAVA_Build 5 18169897 5I TGCTTTTCTT -----/TTAAC TTAATTAGCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTAAC 0 1 15365 CASAVA_Build 5 18173315 3D AAAAACTATT GTG/--- GTGATATGAA 3070 het 3070 hom 42 15 21 10 GTG 2 1 15366 CASAVA_Build 5 18174523 1D GCATGGAGCA G/- GGGGGGTGGT 3070 hom 77 het 29 0 22 7 G 7 6 15367 CASAVA_Build 5 18178548 1D AATTACATTG T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 7 6 15368 CASAVA_Build 5 18178727 1I AAATGAGAAC -/A AAAGGCCCAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 15369 CASAVA_Build 5 18182688 1I AAAGCACCCA -/G GGGGAATAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 4 5 15370 CASAVA_Build 5 18190002 5I ATCAACTAAC -----/TTTTA TTTTACTTTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTTTA 1 2 15371 CASAVA_Build 5 18194343 1D GAAAAAGAAA C/- CCACAAATGT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 3 2 15372 CASAVA_Build 5 18195048 1D AAAAGAAATT G/- GAAAGATAAC 3070 het 3070 ref 51 24 18 9 G 2 1 15373 CASAVA_Build 5 18196915 1D TATTTTGGGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 A 9 8 15374 CASAVA_Build 5 18199237 1D AAGAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 617 hom 24 4 8 14 A 13 12 15375 CASAVA_Build 5 18199538 1I TCAATTATCT -/C CCCCCTGGGT 3070 het 3070 ref 44 17 21 6 C 5 6 15376 CASAVA_Build 5 18201218 10D GATGCAAGAG ATGGGCTCCC/---------- ATGGACTTGG 3070 het 3070 hom 43 20 23 4 ATGGGCTCCC 1 0 15377 CASAVA_Build 5 18203235 1I TTCAGATGTC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 54 30 20 4 T 7 8 15378 CASAVA_Build 5 18204667 1D CAACAATTGG T/- AATGCCACCT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 T 1 0 15379 CASAVA_Build 5 18211438 1D AGGTCAGGAG T/- TGGAGACCAG 2840 het 1262 hom 12 4 6 2 T 2 1 15380 CASAVA_Build 5 18215160 2I ATAATACTTC --/AT ATATATATAT 2411 het 2411 ref 16 6 6 4 AT 5 6 15381 CASAVA_Build 5 18216497 1I GAGAGGTGAC -/A GGGGGAAGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 15382 CASAVA_Build 5 18222183 5I CTAGAATGAC -----/TTAAA TTAAGAATTC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TTAAA 0 1 15383 CASAVA_Build 5 18223614 5D ATTTTTACAT ATTAC/----- ATTGTTGATG 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 ATTAC 1 0 15384 CASAVA_Build 5 18223957 1D AGCTTTCAAC T/- TTTTTATTGT 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 T 6 5 15385 CASAVA_Build 5 18224285 1D AATGCTGGCC T/- CCTAAAACGT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 1 0 15386 CASAVA_Build 5 18224408 2D GCTACTGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 743 hom 32 9 11 12 T 16 14 15387 CASAVA_Build 5 18225846 1D GCTGTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 977 hom 22 6 10 6 T 11 10 15388 CASAVA_Build 5 18229862 2I AATATACATA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 10 12 15389 CASAVA_Build 5 18230674 1D GCTGCTACAG A/- AAAAAAAAAA 2327 het 2327 ref 34 15 9 10 A 13 12 15390 CASAVA_Build 5 18231344 5I CTTCCTTCCA -----/TTAAC TTAATTTATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTAAC 0 1 15391 CASAVA_Build 5 18237722 5I AGCTGAACTA -----/TAAAC TAAGTTCCTT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 TAAAC 0 1 15392 CASAVA_Build 5 18237913 1D TAGATGAGAG A/- GCTGGTTGGT 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 A 1 0 15393 CASAVA_Build 5 18244445 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AATTCAAGTT 2891 het 454 hom 21 2 8 11 AAG 0 1 15394 CASAVA_Build 5 18245943 1I AAACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1247 hom 17 3 11 3 A 11 12 15395 CASAVA_Build 5 18249739 1D GGAGTGCATA T/- TTTTTGAAAA 3070 het 3070 hom 40 10 27 4 T 6 5 15396 CASAVA_Build 5 18253082 4I AATGGCAAGT ----/AGAA AGAGCAAACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AGAA 0 1 15397 CASAVA_Build 5 18255749 1D TGACTGTTAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 45 14 30 1 A 8 7 15398 CASAVA_Build 5 18257530 4I ATAAAAAAGG ----/ACAA ACAAACAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 ACAA 2 3 15399 CASAVA_Build 5 18260346 1I ATTTTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 827 hom 21 2 11 8 T 12 13 15400 CASAVA_Build 5 18269960 1D TTCAACTGTT C/- CTTAGAGGTG 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 C 2 1 15401 CASAVA_Build 5 18274425 1I AGTTGTTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 9 10 15402 CASAVA_Build 5 18275025 1D CATTAATATG T/- TTTTTTTTTT 1719 het 1719 ref 27 18 5 4 T 11 10 15403 CASAVA_Build 5 18290632 1I TTGAGAAATT -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 6 7 15404 CASAVA_Build 5 18291654 1I TCTGAATGGG -/A TAAAGGAAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 15405 CASAVA_Build 5 18292738 1I GAGTGAGTCA -/T TTGTTTTCAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 2 3 15406 CASAVA_Build 5 18294825 1D TGATAAAAAC A/- AATTTAGATT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 3 2 15407 CASAVA_Build 5 18295011 4D AGCAAGTATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3057 hom 18 het 10 0 7 3 T 14 10 15408 CASAVA_Build 5 18303000 1I AATATAATAA -/T TTTTTTTTTT 2225 hom 15 het 14 0 6 8 T 11 12 15409 CASAVA_Build 5 18307256 2D ATTCTGATAC CT/-- GTCTTGTAGG 3070 het 3070 hom 33 13 19 2 CT 1 0 15410 CASAVA_Build 5 18309600 3I TTTTAAGGTA ---/ACT ACTATTTCAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ACT 1 2 15411 CASAVA_Build 5 18310273 1D TATGGAAACC T/- TTTTTTTTTT 2247 het 2247 ref 43 21 10 12 T 17 16 15412 CASAVA_Build 5 18314296 1D CAGAGAGAGA G/- AGAAAAAAAA 2381 het 663 hom 41 7 14 21 G 1 0 15413 CASAVA_Build 5 18319191 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1376 hom 23 5 13 6 A 13 11 15414 CASAVA_Build 5 18322787 1I AAAAATATGA -/C TAACCCAAAT 3070 het 150 hom 33 1 28 4 C 0 1 15415 CASAVA_Build 5 18323418 1I CAAGATGTTA -/T TTTTTTTACT 3070 het 2764 hom 29 7 16 6 T 7 8 15416 CASAVA_Build 5 18330302 1I GTAAACTCCT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 7 8 15417 CASAVA_Build 5 18335885 1I ATACTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1709 hom 36 5 25 6 T 11 12 15418 CASAVA_Build 5 18336813 1D ATTTAAAGCC T/- TGAAGCATTT 3070 het 3070 ref 22 10 11 1 T 2 1 15419 CASAVA_Build 5 18340667 4D AGACTGTCTC TAAA/---- TAGTAACAAT 3070 het 3070 hom 32 14 17 6 TAAA 1 0 15420 CASAVA_Build 5 18342604 1D CAAAAAAAAA C/- CAAAAAACAA 3070 het 81 hom 17 1 14 2 C 2 1 15421 CASAVA_Build 5 18344752 1I AACTAAACTA -/T TTTGTATGTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 3 4 15422 CASAVA_Build 5 18347838 4I AAGAGAAAAA ----/AAAG AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AAAG 0 1 15423 CASAVA_Build 5 18349028 5I TCATATAATG -----/TAATA TAATATAAAA 3070 hom 45 het 30 0 16 14 TAATA 1 2 15424 CASAVA_Build 5 18353404 22D TCCCATGCCC AGTGCCCAAGGTGAGAAGCTTT/---------------------- GGTCCTGTAA 2084 het 2084 ref 31 26 6 7 AGTGCCCAAGGTGAGAAGCTTT 1 0 15425 CASAVA_Build 5 18354580 4D TCCACTTCTT AGAC/---- TGAGAGAAAC 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 AGAC 1 0 15426 CASAVA_Build 5 18358692 1I GGAAAGAAGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 437 hom 25 1 22 2 T 8 9 15427 CASAVA_Build 5 18363844 2I TGGGATCAAG --/AA AATGCATTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 4 15428 CASAVA_Build 5 18365608 1D AAAGTCTAGA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 7 6 15429 CASAVA_Build 5 18366045 4I GTTGGTTCTA ----/TTTG TTTGTTAAAA 3070 hom 92 het 38 0 30 8 TTTG 1 2 15430 CASAVA_Build 5 18366094 1I GATAAAATAT -/A AAAAATCTAG 2300 het 2300 ref 37 14 8 15 A 5 6 15431 CASAVA_Build 5 18366370 1I CTATTCTTTT -/G GGGGGGTGGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 6 7 15432 CASAVA_Build 5 18367610 1I TTTTCATATG -/T TTTTTTGGCT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 6 7 15433 CASAVA_Build 5 18371322 1I ATAGTTTTTT -/A AAATTTCTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 3 4 15434 CASAVA_Build 5 18371909 2I AATGTGAAAC --/AT ATTTTAATGC 3070 het 2445 hom 16 7 7 2 AT 1 2 15435 CASAVA_Build 5 18374443 1I ACACTGTATT -/G TACTTTCTGG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 G 0 1 15436 CASAVA_Build 5 18376719 1I TTTCATAAGA -/T ACTGGGAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 0 1 15437 CASAVA_Build 5 18376838 2D CATAGCCATA AT/-- ATATATTAGA 3070 hom 64 het 26 0 22 5 AT 4 3 15438 CASAVA_Build 5 18377297 1D TTTTAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 26 1 19 6 T 12 11 15439 CASAVA_Build 5 18384814 3I TTTTGTTTTA ---/CTC CTCATTTACT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CTC 1 2 15440 CASAVA_Build 5 18387212 3D TTGGGCACAC ACA/--- ACAATACTTC 3070 hom 96 het 33 0 31 6 ACA 2 1 15441 CASAVA_Build 5 18389554 1D TATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 12 11 15442 CASAVA_Build 5 18389936 1I GCATTATTAT -/G ATTACAACGT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 0 1 15443 CASAVA_Build 5 18390991 3D CGCATTAGCC ATT/--- ATTAAGTTTC 3070 hom 125 het 44 0 41 3 ATT 2 1 15444 CASAVA_Build 5 18392282 1D CTTCCTCCAC T/- TTTTTTTATC 3070 hom 84 het 36 0 29 10 T 8 7 15445 CASAVA_Build 5 18394226 1I GACAAGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 10 11 15446 CASAVA_Build 5 18398953 1I TTTTGGCAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 19 14 12 T 9 10 15447 CASAVA_Build 5 18399157 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 45 2 23 20 T 15 14 15448 CASAVA_Build 5 18403397 1D ATAAGATTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 10 9 15449 CASAVA_Build 5 18404907 26D AGAGGTAGAT AGATGGAGATAGAGATAGAGAGAGAG/-------------------------- AGATGGAGAT 3070 het 3070 ref 31 18 17 5 AGATGGAGATAGAGATAGAGAGAGAG 1 0 15450 CASAVA_Build 5 18413986 1D TAAAACTAGC A/- AAACTGAAGA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 4 3 15451 CASAVA_Build 5 18414208 1I TTTCTTAAAT -/G TTAGAAAAGC 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 G 0 1 15452 CASAVA_Build 5 18420412 1D GACTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 16 14 T 13 12 15453 CASAVA_Build 5 18426192 10D GCAATTTTGT TGTTGTGCAA/---------- ACATCAGAAT 3070 het 3070 ref 49 27 19 5 TGTTGTGCAA 1 0 15454 CASAVA_Build 5 18426539 5I GAGCTTGCAA -----/GACTG GAAGTTGTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GACTG 0 1 15455 CASAVA_Build 5 18427941 1I CTGCCTCTGA -/T GAAGGCATCA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 0 1 15456 CASAVA_Build 5 18434454 4D TAGCACACTT TGAA/---- TGAATAACAA 3070 het 3070 ref 33 23 10 1 TGAA 2 1 15457 CASAVA_Build 5 18448010 1D TCCTTTTCTA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 15458 CASAVA_Build 5 18451471 3D GACCTTAAAT ATC/--- ATATGTAACA 3070 het 3070 hom 34 15 15 6 ATC 1 0 15459 CASAVA_Build 5 18452064 1I AACTGAAATT -/A GTTTTTATTT 1832 het 1832 ref 19 13 5 1 A 0 1 15460 CASAVA_Build 5 18452789 1D TTTAGTTCAC T/- TTTTAACATG 3070 hom 35 het 23 0 12 11 T 5 4 15461 CASAVA_Build 5 18452829 1I TTTCTACTCC -/A AAAATCTACT 3070 hom 33 het 23 0 12 11 A 4 5 15462 CASAVA_Build 5 18454052 1D CTACAAATGC T/- AAAGTTAATC 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 T 1 0 15463 CASAVA_Build 5 18454777 34D CTAATCCAAT TTGCTATACTCTTTCCACATTATCACTTAGAAAG/---------------------------------- TGCTATTACC 3070 het 3070 ref 38 31 13 2 TTGCTATACTCTTTCCACATTATCACTTAGAAAG 1 0 15464 CASAVA_Build 5 18458440 6I ATCCTTGAAC ------/TTAAAA TTAAAATTAA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 TTAAAA 1 2 15465 CASAVA_Build 5 18458682 2I CAGATTAAAA --/AT ATATATATAG 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 AT 4 5 15466 CASAVA_Build 5 18459102 1I ATTTAAAAGA -/T AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 T 0 1 15467 CASAVA_Build 5 18462464 4I ATTTTTAACA ----/TAAG TAAGTAACAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TAAG 1 2 15468 CASAVA_Build 5 18466670 2I GAAAAAACAC --/AA ACACACACAC 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 1 3 15469 CASAVA_Build 5 18466962 1I ACAATTTGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 18 7 2 T 9 10 15470 CASAVA_Build 5 18468783 4D TTCCTTCTGA AACT/---- AACTATTCCA 3070 het 3070 ref 18 11 7 1 AACT 2 1 15471 CASAVA_Build 5 18470461 1I ATTATATATA -/T TTTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 T 5 6 15472 CASAVA_Build 5 18471372 6D CAAACTCTAG GAAAGA/------ GAAAGAGAAG 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 GAAAGA 2 1 15473 CASAVA_Build 5 18471517 2I CCTTATATAT --/AA AACAATAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 2 4 15474 CASAVA_Build 5 18471664 4D AAAACAAAAT AATC/---- AAATATTTAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 AATC 1 0 15475 CASAVA_Build 5 18472677 4D AAATTAACAC TTTT/---- GTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 T 4 0 15476 CASAVA_Build 5 18474582 3D GGAAAAAGAG AGA/--- AGAAGCAGGC 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 AGA 2 1 15477 CASAVA_Build 5 18475566 4D TGAAAAACAC TGAT/---- TGATAAAGAG 3070 het 3070 ref 23 12 11 1 TGAT 2 1 15478 CASAVA_Build 5 18476080 3I ACTGGATCAT ---/ATG ATGATAGTTC 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 ATG 1 2 15479 CASAVA_Build 5 18477142 14D TTGGTGTCAA ATACATGAAATTAT/-------------- ATACATGAAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 8 ATACATGAAATTAT 2 1 15480 CASAVA_Build 5 18477724 4I42M4D TGTGTGTGTT ----TGTGTGTGTGTGTATGTGTGTATATATATGTGTGTGTATGTCTATA/TGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTATATATATGTGTGTGTATGTC---- TATATATGTG 3070 het 1318 hom 35 6 15 25 N/A 0 0 15481 CASAVA_Build 5 18478192 4I GTTTCTGACT ----/ACAA ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 ACAA 3 4 15482 CASAVA_Build 5 18478329 1I8M2D ATATGTACAG -TTTTTGACAT/TTTTTTGAC-- ATCAGTTATA 3070 het 3070 ref 36 18 16 7 N/A 0 0 15483 CASAVA_Build 5 18479709 2I ATTTTTAAAA --/AT AGTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 AT 0 1 15484 CASAVA_Build 5 18479817 2I ATATATACAC --/AT GTGTGTATAT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 AT 0 1 15485 CASAVA_Build 5 18480369 4D51M5D TGTGTGTGTG TGTATATATATATATACATAAAATATATCAAGCCCACTTTCTACATGTTCTATGCTAAAG/----TATATATATATACATACAATATATCAAGCCCACTTTCTACATGTTCTATGC----- TAAATTCTTT 3070 het 3070 ref 21 16 11 13 N/A 0 0 15486 CASAVA_Build 5 18480670 1I11M2I CACTGGGCTT -AAAAAAAAATC--/AAAAAAAAAATCAT GTGCTAAAAT 3070 het 3070 hom 45 22 23 9 N/A 0 0 15487 CASAVA_Build 5 18482554 4I AATTAACTGG ----/CTTA CTTTAACTTT 1920 het 1920 ref 20 15 4 1 CTTA 0 1 15488 CASAVA_Build 5 18483435 2I AGTGAATTTT --/TA TGTTATTGTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TA 0 1 15489 CASAVA_Build 5 18484831 1I TTATTTTCTG -/T TTTTTTTCTT 623 het 623 ref 31 21 5 5 T 7 8 15490 CASAVA_Build 5 18484918 2D TGTTTTCCGG TT/-- TTTTTTTTTT 2845 het 2845 ref 22 10 10 3 T 15 13 15491 CASAVA_Build 5 18485676 3I TTTGTCAGCT ---/TTG TTGATTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 TTG 1 2 15492 CASAVA_Build 5 18486263 2I GCCTAATTTC --/AG GTCTATCCTG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 AG 0 1 15493 CASAVA_Build 5 18486916 1D TTTGTACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 40 0 17 23 T 12 11 15494 CASAVA_Build 5 18488414 1I CCAAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 10 11 15495 CASAVA_Build 5 18488578 5I CTATTTATTT -----/ATTTA TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 ATTTA 0 1 15496 CASAVA_Build 5 18489586 1I GAGCTTAAAG -/A AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 A 6 7 15497 CASAVA_Build 5 18490813 4I AAACATTTGG ----/AGAT AGATAGAAAC 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 AGAT 1 2 15498 CASAVA_Build 5 18491220 4D AGTCATGGGA AAAT/---- AAATAAGAAA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 AAAT 2 1 15499 CASAVA_Build 5 18491352 4D AAGCACAAAT ACTC/---- ACACGGAGAA 3070 het 3070 ref 35 23 10 6 ACTC 1 0 15500 CASAVA_Build 5 18491918 3I TGGATGGGTA ---/GAT GATAGATAAA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 GAT 1 2 15501 CASAVA_Build 5 18492048 2I4M4I TAATTACCAT --TGTC----/TATGTCATTA ATAATTTAAT 3070 het 3070 ref 24 13 8 5 N/A 0 0 15502 CASAVA_Build 5 18493920 2I26M4I AGATAGCAAC --AGTTTAAATACTCCTGAGGTTTTCCT----/ATAGTTTAAATACTCCTGAGGTTTTCCTCAGA CAAATGCTTT 3070 het 3070 ref 28 18 9 9 N/A 0 0 15503 CASAVA_Build 5 18494486 6I TATAAAATAT ------/GGAACA GGAACAGGAC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 GGAACA 1 2 15504 CASAVA_Build 5 18494970 2I CTCATCTCAC --/TT TTTGTCCTAT 3070 het 3070 ref 41 23 18 0 T 3 5 15505 CASAVA_Build 5 18497701 1D ATGAAGTGGA T/- GTAAAGGAAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 1 0 15506 CASAVA_Build 5 18501280 4D CATGGGTTTC AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 35 18 17 4 AATT 4 3 15507 CASAVA_Build 5 18501782 4D CTTACTTTTA GTAC/---- GTTGTTCAGA 3070 het 3070 ref 51 29 21 4 GTAC 1 0 15508 CASAVA_Build 5 18502926 4I AAATAATTCT ----/CAAA CAAAGAAACT 3070 hom 95 het 40 0 35 5 CAAA 1 2 15509 CASAVA_Build 5 18504118 1D CAAGGAGTGT G/- GAAAGTATTG 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 G 2 1 15510 CASAVA_Build 5 18505324 1I GGGAGTTGCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 A 8 9 15511 CASAVA_Build 5 18506787 1D ATCATAAAGA T/- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 29 18 11 0 T 7 6 15512 CASAVA_Build 5 18506886 1I CTCCAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1584 hom 20 5 9 6 T 14 15 15513 CASAVA_Build 5 18507645 11I ATCCATCTGA -----------/GTAAATGGATG CCTTTGTAAG 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 GTAAATGGATG 0 1 15514 CASAVA_Build 5 18513591 3I CCTAATGCTA ---/GAT GATGAGTTGG 1863 het 1863 ref 15 11 4 0 GAT 1 2 15515 CASAVA_Build 5 18513888 1D AGAATATTGG A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 37 18 17 3 A 8 7 15516 CASAVA_Build 5 18514175 3I CTTCTTGCTG ---/CAT CATGACTTGG 3070 het 3070 ref 52 26 23 3 CAT 1 2 15517 CASAVA_Build 5 18514580 1D TTATTTTTTT A/- AATTTTATTA 3070 het 2765 hom 28 9 17 2 A 3 2 15518 CASAVA_Build 5 18515542 1D AACTTTTGGA T/- TTTTAGAGCC 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 T 5 4 15519 CASAVA_Build 5 18515937 4D AAAGTATCAA CTTT/---- CTTTATTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 CTTT 2 1 15520 CASAVA_Build 5 18519942 1D CAAAGGCTAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 44 11 26 7 A 9 8 15521 CASAVA_Build 5 18521218 4D AGTAGTTATT AATA/---- AATGTTAGGG 3070 het 3070 hom 31 12 18 3 AATA 1 0 15522 CASAVA_Build 5 18522382 19I TCCTGTGCCC -------------------/TGGTTTCTTTTCTATAATA TGAAGATAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 TGGTTTCTTTTCTATAATA 0 1 15523 CASAVA_Build 5 18524610 1D ATTTTTAGAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 8 15524 CASAVA_Build 5 18526202 2D TTAGAGTGTT AC/-- ACAGAGGTCA 3070 het 3070 hom 54 20 27 10 AC 2 1 15525 CASAVA_Build 5 18528211 1I TGATGCATAC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 7 8 15526 CASAVA_Build 5 18529131 1I AGAATCTGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 37 hom 30 1 17 12 A 9 10 15527 CASAVA_Build 5 18535865 3I ATGGTTTATG ---/AAT AATAACTCAC 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 AAT 1 2 15528 CASAVA_Build 5 18541070 2D AAAGAAAAAC AG/-- AAAGTATTGC 3070 het 3070 hom 46 19 24 5 AG 1 0 15529 CASAVA_Build 5 18543458 1I ACTAAGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 29 1 27 1 A 11 12 15530 CASAVA_Build 5 18544283 2D AACTGCACAC AT/-- GATTGACCAT 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 AT 1 0 15531 CASAVA_Build 5 18545145 3D GGCATTGTGT GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 het 25 hom 17 1 12 7 G 14 11 15532 CASAVA_Build 5 18560864 3D TCTAGATTAG CAT/--- CATCAATTTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 6 CAT 2 1 15533 CASAVA_Build 5 18561696 4I TGTTTGTCAT ----/TAAC TAACTATTAG 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 TAAC 1 2 15534 CASAVA_Build 5 18567819 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 7 8 15535 CASAVA_Build 5 18568239 1D AAATCAGTCT C/- CCCAAGCATT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 C 4 3 15536 CASAVA_Build 5 18573377 1I ATTGTTCCTA -/G CCCGGACTTC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 0 1 15537 CASAVA_Build 5 18589161 3I GCTCCATTGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTG 3 4 15538 CASAVA_Build 5 18592235 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 23 0 15 8 T 12 11 15539 CASAVA_Build 5 18593916 1D TTGAACTATC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 A 10 9 15540 CASAVA_Build 5 18594346 1D ATATAAAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 A 9 8 15541 CASAVA_Build 5 18597335 2D CACACATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TA 6 5 15542 CASAVA_Build 5 18599456 1I ATAGTAACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 9 10 15543 CASAVA_Build 5 18599692 1D TTGAGATAAC T/- AAGATTTATA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 1 0 15544 CASAVA_Build 5 18599807 1D ATATAAATTC A/- AGTTGAGAAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 2 1 15545 CASAVA_Build 5 18605096 5I CAAATTAGCA -----/AAATT AAATTAAGTC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AAATT 1 2 15546 CASAVA_Build 5 18606056 4I TAAGAAGAAT ----/TAAA TAATGCCAGA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 TAAA 0 1 15547 CASAVA_Build 5 18607380 1I ATATTAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 17 10 A 10 11 15548 CASAVA_Build 5 18621381 2D TGATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 27 0 20 8 AT 7 6 15549 CASAVA_Build 5 18634631 4D ATGAGTAAAA TTTT/---- GCTCTCTGAG 3070 hom 60 het 22 0 20 3 T 4 0 15550 CASAVA_Build 5 18638285 1D ATACCTACAC T/- CCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 T 1 0 15551 CASAVA_Build 5 18641543 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 T 8 7 15552 CASAVA_Build 5 18655030 1D AGATCAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 11 10 15553 CASAVA_Build 5 18656790 1D TATTATATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 9 8 15554 CASAVA_Build 5 18657594 1D TATTCATTTA T/- TTTATTTTAT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 T 4 3 15555 CASAVA_Build 5 18665398 2D CGTGGTGGCA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 100 het 53 0 33 20 AG 8 7 15556 CASAVA_Build 5 18673512 4I TTTGGGTCTT ----/ACTA ACTAGTTCAA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 ACTA 1 2 15557 CASAVA_Build 5 18686989 1D CTAGTGTAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 39 0 32 8 T 9 8 15558 CASAVA_Build 5 18687443 1I TTAGGCTCAC -/A AATTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 2 3 15559 CASAVA_Build 5 18691701 1I GATCAATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 9 10 15560 CASAVA_Build 5 18692212 1D TAAATTGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 11 10 15561 CASAVA_Build 5 18692328 1I AACAGAAACC -/A AAAAACTGCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 5 6 15562 CASAVA_Build 5 18693264 1I ACTTACAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 A 10 11 15563 CASAVA_Build 5 18694410 2D CCCACTCTGG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 45 0 38 9 A 11 9 15564 CASAVA_Build 5 18695039 2D ATAGGCGGAA TC/-- TCTGTGTTAT 3070 hom 129 het 46 0 42 4 TC 2 1 15565 CASAVA_Build 5 18698976 1I TCTGAAAATA -/C TAAATACTAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 C 0 1 15566 CASAVA_Build 5 18712095 2D CAATATTAAA AG/-- AGAAGATGAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 AG 2 1 15567 CASAVA_Build 5 18712906 3I TTGAGCTCTC ---/ATT ATTCTGTTTC 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 ATT 1 2 15568 CASAVA_Build 5 18714761 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 11 T 8 7 15569 CASAVA_Build 5 18716953 8I CTTTCTCTCA --------/TCTTTTGC CAGTGTTTCC 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 TCTTTTGC 0 1 15570 CASAVA_Build 5 18717106 4D TTCTCATGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 AGTG 2 1 15571 CASAVA_Build 5 18718338 1D AGCTTAAAAG A/- CGAGAACTAT 3070 het 3070 ref 49 25 22 4 A 1 0 15572 CASAVA_Build 5 18719388 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 10 9 15573 CASAVA_Build 5 18728184 5D CCACAGGTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 40 1 19 22 T 21 16 15574 CASAVA_Build 5 18729101 1D GAAAGAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 10 9 15575 CASAVA_Build 5 18731189 1I CTTGCTTTAA -/T TTTTTTTACC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 7 8 15576 CASAVA_Build 5 18731974 1D AGAGGAAAAG T/- TTTTTTTATA 3070 hom 90 het 35 0 30 6 T 8 7 15577 CASAVA_Build 5 18732435 4I TATTTTTAAA ----/TTAT TTATAAAACT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTAT 1 2 15578 CASAVA_Build 5 18734260 4I AGCCAAGGCG ----/GAGA GAGAGGACAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 GA 2 4 15579 CASAVA_Build 5 18734451 4D CGGGCCTGAC TGAT/---- GTCAGGCCTT 2361 het 1796 hom 30 7 10 14 TGAT 1 0 15580 CASAVA_Build 5 18734942 1I ACAATGGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 9 10 15581 CASAVA_Build 5 18735219 2I TAAATATAAC --/TT TTAAATTTCA 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 T 2 4 15582 CASAVA_Build 5 18740117 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 6 7 15583 CASAVA_Build 5 18741618 2D TTCAAAGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 T 12 10 15584 CASAVA_Build 5 18741905 4I TTTGAACTAA ----/CTAT CCTTTTATTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 CTAT 0 1 15585 CASAVA_Build 5 18743317 1I CCAGTACCGG -/T TTTTTTTTTT 3048 het 2273 hom 35 8 10 17 T 11 12 15586 CASAVA_Build 5 18749733 1D GAAAAAAAGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 15 12 9 A 9 8 15587 CASAVA_Build 5 18752556 1D GACCAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2931 het 2931 ref 26 9 9 8 T 12 11 15588 CASAVA_Build 5 18755636 1D AAAAGATGTA T/- TTTTTTGAAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 7 6 15589 CASAVA_Build 5 18758177 10D AAATTTTTTT CTGCAGCTTC/---------- CTCACCTCCG 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 CTGCAGCTTC 1 0 15590 CASAVA_Build 5 18797385 1D CTGAGAATTT A/- AAAAAAAAAA 2922 het 2036 hom 32 11 10 13 A 19 18 15591 CASAVA_Build 5 18800450 1I TAGGTTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 10 11 15592 CASAVA_Build 5 18803371 1D ATGAAGGAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 95 het 39 0 32 7 A 9 8 15593 CASAVA_Build 5 18813156 1D AAGATATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 A 12 11 15594 CASAVA_Build 5 18813941 1D AGCAATGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 12 11 15595 CASAVA_Build 5 18814085 1D AAATGCAACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 12 21 6 A 10 9 15596 CASAVA_Build 5 18814861 1I GTTCATTTTG -/C TAAAATAGTC 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 C 0 1 15597 CASAVA_Build 5 18830708 6I GTAGAGAGAG ------/AGAGAC AGAGACAGAG 3070 hom 115 het 52 0 39 13 AGAGAC 2 3 15598 CASAVA_Build 5 18831643 1D ATTTGAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 11 10 15599 CASAVA_Build 5 18847469 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 8 15600 CASAVA_Build 5 18874139 1D AGTGTATCAT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 7 15601 CASAVA_Build 5 18874967 4I AGAGATTTAA ----/TACT TACTTAGGGA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TACT 1 2 15602 CASAVA_Build 5 18885015 1I TGTAAAATGC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 63 het 30 0 21 9 T 8 9 15603 CASAVA_Build 5 18887639 4D AAAGAGAGAG ATAA/---- ATAAAGAGAC 3070 hom 93 het 38 0 32 8 ATAA 2 1 15604 CASAVA_Build 5 18910713 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 17 2 10 6 A 17 16 15605 CASAVA_Build 5 18938469 1I TTTTTATTTT -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 0 1 15606 CASAVA_Build 5 18957777 1I GATAAAAAGT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 442 hom 27 1 15 11 G 9 10 15607 CASAVA_Build 5 18992847 3I CTTTGCCACC ---/CAG ATTTATCACT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CAG 0 1 15608 CASAVA_Build 5 19006655 9D TAATGTACAA CAGCCTTTC/--------- CAAATATGTA 1360 het 600 hom 32 4 7 23 CAGCCTTTC 1 0 15609 CASAVA_Build 5 19007284 1D ACAAAAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 547 hom 26 4 17 6 A 14 13 15610 CASAVA_Build 5 19014811 1D GGTAGAAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 115 het 44 0 39 5 T 10 9 15611 CASAVA_Build 5 19020898 1D ATTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 10 9 15612 CASAVA_Build 5 19021997 4D ATTTGGTTAA ATAT/---- ATATATATAT 166 hom 7 het 21 0 3 18 AT 8 6 15613 CASAVA_Build 5 19022081 2I TTAACCAAAT --/TA TATATATATA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TA 7 8 15614 CASAVA_Build 5 19024423 1D AAGGTTAGTG C/- TTTTTGATTA 3070 hom 93 het 39 0 32 9 C 1 0 15615 CASAVA_Build 5 19024796 1I21M2D GTTACACTGA -TGTCCATGGTGTATCACATAAGC/TTGTCCATGGTGTATCACATAA-- AGTAAAGTGG 3070 hom 181 het 59 0 61 3 N/A 0 0 15616 CASAVA_Build 5 19032578 1I GAAATTTGTA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 154 het 56 0 52 4 T 7 8 15617 CASAVA_Build 5 19040391 1I ACTAGGCACA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 108 het 44 0 36 8 T 8 9 15618 CASAVA_Build 5 19043986 3D ATAGTTATAT GAG/--- AAGAGACAAA 3070 hom 138 het 50 0 46 6 GAG 1 0 15619 CASAVA_Build 5 19050902 6I TGTCACTTGG ------/CCCATC CAATGAAACG 3070 hom 114 het 44 0 37 7 CCCATC 0 1 15620 CASAVA_Build 5 19055758 5I TTTTGTAACC -----/CATTT ATTTATAAAA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 CATTT 0 1 15621 CASAVA_Build 5 19063178 1I ATAATTTCAG -/A AGAAAACAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 15622 CASAVA_Build 5 19063436 4D TAAACCTGAC CTAA/---- CTGATTATAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 CTAA 1 0 15623 CASAVA_Build 5 19064166 2I AATTTAAAAC --/TG TAGAAAATTT 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 TG 0 1 15624 CASAVA_Build 5 19066143 2D TCCCTGTGTC TG/-- TGCCCGCTAG 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 TG 2 1 15625 CASAVA_Build 5 19089439 12D CAGCCTTATC CTAGGAAGACTT/------------ CTGGAGTTCG 3070 het 3070 ref 55 32 24 5 CTAGGAAGACTT 1 0 15626 CASAVA_Build 5 19091888 1I AATGTACATG -/T TTTTAAATTT 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 T 4 5 15627 CASAVA_Build 5 19093684 1D CTCAGGCATA C/- ACTCAGCCAA 3070 het 3070 hom 59 23 27 9 C 1 0 15628 CASAVA_Build 5 19098234 1I ATTTATCATA -/T TTTTTCTGAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 5 6 15629 CASAVA_Build 5 19099516 1D CCACACACAC A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 8 7 15630 CASAVA_Build 5 19100725 2I CCCAAAGCAC --/AT GAGTAGAGAT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 AT 0 1 15631 CASAVA_Build 5 19101237 1D ATATGTTTAA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 T 8 7 15632 CASAVA_Build 5 19105040 1D CCTTTTGGAA T/- TTTCTGGGGT 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 T 4 3 15633 CASAVA_Build 5 19114216 2D GTATTGGGTG TA/-- TATATATATA 1713 het 1713 ref 16 10 5 1 TA 6 5 15634 CASAVA_Build 5 19116409 6D CGAGTGTCCC AGGTCG/------ AACTCAGACA 1074 het 1074 ref 26 7 5 15 AGGTCG 1 0 15635 CASAVA_Build 5 19123409 6I GTTTGATCTT ------/TGTTAA TGTTAATTTC 3070 het 3070 hom 40 16 16 9 TGTTAA 1 2 15636 CASAVA_Build 5 19126453 1D TATATACACA C/- TTTATATGTA 3070 het 3070 ref 51 26 21 5 C 1 0 15637 CASAVA_Build 5 19127765 1I TTTCTTAGTC -/T ATGACAAACT 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 T 0 1 15638 CASAVA_Build 5 19130102 1D ACCTAAGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2825 hom 31 12 14 5 A 13 12 15639 CASAVA_Build 5 19135601 1I46M2D23M1I TCATTTGGCC -AAAAAAAGAGATAAAAGGCATTCAGTTTAAAAAGGAAGAAATTAAACTCTTTTTATTTGGAAATGTCATAA-/AAAAAAAAGAGATAAAAGGCATTCAGTTTAAAAAGGAAGAAATTAAA--CTTTTTATTTGGAAATGTCATAAT TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 45 36 16 11 N/A 0 0 15640 CASAVA_Build 5 19137496 2D ATTTATTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1533 het 1448 hom 21 6 4 11 T 14 12 15641 CASAVA_Build 5 19146406 1I TCTATGTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 9 10 15642 CASAVA_Build 5 19148146 2I TTATTGTGAC --/AA AAAGTCATTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 3 5 15643 CASAVA_Build 5 19183130 3I AATCTTTAGT ---/AAC GACGACTGTA 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 AAC 0 1 15644 CASAVA_Build 5 19187350 2D ATATATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 AC 9 8 15645 CASAVA_Build 5 19187857 2D TTTTACAAAA TG/-- TCATACAGTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TG 1 0 15646 CASAVA_Build 5 19193565 1D CACAGGTTTT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 1 0 15647 CASAVA_Build 5 19196827 1D TGATTTCTAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 8 7 15648 CASAVA_Build 5 19206056 1I GATTCCTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 10 11 15649 CASAVA_Build 5 19212450 1I AAATGAAAAA -/C ATCATAATAA 2243 het 2243 ref 17 11 5 1 C 0 1 15650 CASAVA_Build 5 19215798 1D GAGGCAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 12 11 15651 CASAVA_Build 5 19218132 1D TATCTATTCC A/- AAAATCTATC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 A 5 4 15652 CASAVA_Build 5 19221418 1I ATGCTCAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 A 9 10 15653 CASAVA_Build 5 19222148 1D AATGCAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 10 9 15654 CASAVA_Build 5 19228564 2D TATATGTGCA TG/-- TGTGTGTGCA 3070 het 3070 hom 40 14 22 5 TG 5 4 15655 CASAVA_Build 5 19234372 1D TGTGACAACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 10 9 15656 CASAVA_Build 5 19236883 2D GTGCTATGAC TT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 T 2 0 15657 CASAVA_Build 5 19241527 15D ATTTTATATT CATTCAATCCTAAAA/--------------- CATTCAATCC 1431 het 1431 ref 18 11 3 4 CATTCAATCCTAAAA 2 1 15658 CASAVA_Build 5 19244965 1I GGGAGAACTT -/A ACGGTGCTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 1 2 15659 CASAVA_Build 5 19260323 1I GGATATTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 55 40 8 7 A 9 10 15660 CASAVA_Build 5 19262495 19D TCTGATGTGA TTTAAATCACTGCTGCTTT/------------------- TTATTATAAC 1880 het 1880 ref 22 17 5 2 TTTAAATCACTGCTGCTTT 1 0 15661 CASAVA_Build 5 19274566 2I AATCTGACAC --/AG ACTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 AG 0 1 15662 CASAVA_Build 5 19290666 5I TTGGCTACAA -----/TTTGC TTCTTAATAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 TTTGC 0 1 15663 CASAVA_Build 5 19304370 4I TCAGAAGAAT ----/GATA GATACCTAGA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 GATA 1 2 15664 CASAVA_Build 5 19326189 3D ACGTTCAATT CTA/--- CTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 CTA 1 0 15665 CASAVA_Build 5 19328496 1I CTAAAGTAGC -/T GAAAATTAGC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 0 1 15666 CASAVA_Build 5 19346952 1I GGGGGAACGG -/C CCCAATGATC 3070 hom 128 het 46 0 41 5 C 3 4 15667 CASAVA_Build 5 19354449 1D TTTATAATAC A/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 21 17 1 A 1 0 15668 CASAVA_Build 5 19373602 1D CATGTGATAA T/- TTATAGCATA 3070 het 3070 ref 52 24 21 9 T 3 2 15669 CASAVA_Build 5 19397428 1I CAAACCATCC -/A AAAACTTTTG 3070 hom 74 het 33 0 25 8 A 4 5 15670 CASAVA_Build 5 19397800 4D TCTTAATAAA TATT/---- AATTATACAC 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 TATT 1 0 15671 CASAVA_Build 5 19408636 6D CATCTTTCTC CCGTGT/------ CCGTGTTGGA 3070 hom 100 het 39 0 32 8 CCGTGT 2 1 15672 CASAVA_Build 5 19411148 1D AGGAGATATA C/- CTAATGTTAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 2 1 15673 CASAVA_Build 5 19411258 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 84 het 29 0 28 1 A 8 9 15674 CASAVA_Build 5 19416801 1D AAATAATATA T/- TTTTTAGAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 6 5 15675 CASAVA_Build 5 19421743 1D ATATGCATAT A/- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 1 0 15676 CASAVA_Build 5 19433622 1D GTTACAGTAG T/- TTTCATGATT 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 T 4 3 15677 CASAVA_Build 5 19434914 4I ATTTCAAGAT ----/AAAA AAGTAGTACA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 2 6 15678 CASAVA_Build 5 19435307 3I ATAGTAAATA ---/TCC TTGGAACATA 3070 het 3070 hom 42 9 26 7 TCC 0 1 15679 CASAVA_Build 5 19436051 3D TAACATAGCC AGA/--- AGAATACAGT 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 AGA 2 1 15680 CASAVA_Build 5 19437754 4I GTTCCCAAAC ----/AGAT AGCTATAATT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AGAT 0 1 15681 CASAVA_Build 5 19447805 9I TTGGTCAAGA ---------/ATTGAGTTC AGGTCCTGAA 3070 hom 138 het 48 0 47 2 ATTGAGTTC 0 1 15682 CASAVA_Build 5 19449632 2I CAGTTTTAAT --/AA AAGTCTTAAC 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 2 4 15683 CASAVA_Build 5 19450673 1I AGAAAAAAAA -/T AAAACCCATA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 0 1 15684 CASAVA_Build 5 19460920 1I TGTTTCTCGT -/C CCCCCCCCTT 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 C 8 9 15685 CASAVA_Build 5 19466497 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 10 9 15686 CASAVA_Build 5 19470762 4D TCTTCTTTTC TTAG/---- TTAAACTCAT 3070 het 3070 ref 48 25 20 7 TTAG 1 0 15687 CASAVA_Build 5 19473389 1D AATGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 11 10 15688 CASAVA_Build 5 19476819 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 9 10 15689 CASAVA_Build 5 19483161 2D GCACATATAC GT/-- ATATATACAC 3070 hom 105 het 42 0 35 11 GT 1 0 15690 CASAVA_Build 5 19486032 5I TTAGAGACTT -----/TTATA TAAATATACA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTATA 0 1 15691 CASAVA_Build 5 19494098 1D TCTCATTAAT G/- TATCCTTACA 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 G 1 0 15692 CASAVA_Build 5 19494880 3D AACAAAAATA AAG/--- AAGTTTAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 AAG 2 1 15693 CASAVA_Build 5 19497557 12I AAAAACCTGG ------------/TTTGTTTAATTT AACAGTTTAA 2666 hom 15 het 8 0 6 2 TTTGTTTAATTT 0 1 15694 CASAVA_Build 5 19497872 2D ATACAGATAC AA/-- AAAAAAAGGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 7 15695 CASAVA_Build 5 19498461 3D74M2I TGCATACATA ATTATTAGTTATAAAATTTAAGTGTATTTTATGACTAAATAAACTATTTAATCTGATTTTCATCAACAGTAGTAGTT--/---ATTAGTTATAAAATTTAAGTGTATTTTATGACTAAATAAACTATTCAATCTGATTTTCATCAACAGTAGTAGTTTC TGTTTGTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 22 N/A 0 0 15696 CASAVA_Build 5 19499660 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 71 het 38 0 22 16 A 11 9 15697 CASAVA_Build 5 19502912 3I ATTAGTGACA ---/AAG AAGAAGAAAC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAG 2 3 15698 CASAVA_Build 5 19525809 5D AACATACAAC TATAA/----- TATAATAACT 3070 het 3070 hom 42 17 20 6 TATAA 2 1 15699 CASAVA_Build 5 19553256 1D GTAGTTTGTC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 T 8 7 15700 CASAVA_Build 5 19557570 2I AAAAAGTGTC --/TT AAGTAGCTCT 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 T 0 2 15701 CASAVA_Build 5 19559408 2I CAGTTAATAG --/AA GAGATAATAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 0 2 15702 CASAVA_Build 5 19566754 4I GTGCCGCAAT ----/ATAC ATACCCTTGC 2516 het 2516 ref 21 11 6 4 ATAC 1 2 15703 CASAVA_Build 5 19575524 5I GGCAGAAGGC -----/AAAGG AAAGGAGAAG 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 AAAGG 1 2 15704 CASAVA_Build 5 19584171 1D ATTTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 19 5 A 13 12 15705 CASAVA_Build 5 19623521 1I TCTGTGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 31 1 26 4 T 10 11 15706 CASAVA_Build 5 19636419 11D ATTTTAACAG TAAAATATCAA/----------- TAATTTATAC 3070 hom 54 het 20 0 19 3 TAAAATATCAA 1 0 15707 CASAVA_Build 5 19637502 2I AAAAATAGAC --/AA AGACACTAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 3 15708 CASAVA_Build 5 19638832 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 23 10 A 11 10 15709 CASAVA_Build 5 19650997 1D CGGTGACAGA G/- GGAGACTCCA 3070 hom 36 het 24 0 12 14 G 3 2 15710 CASAVA_Build 5 19659729 3D AACTGAACAT TGA/--- TGATTTCTCC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TGA 2 1 15711 CASAVA_Build 5 19660908 1D CAGATTAGTG A/- AAAAAAAAAA 1547 het 1547 ref 28 15 4 10 A 13 12 15712 CASAVA_Build 5 19667547 1D TTTGAACTAC G/- GGAAGATATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 3 2 15713 CASAVA_Build 5 19670804 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 199 hom 28 2 17 10 A 15 14 15714 CASAVA_Build 5 19674413 1D CTTTACTAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 T 10 9 15715 CASAVA_Build 5 19677009 1D TAAATTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 15 14 15716 CASAVA_Build 5 19683237 1D AAATAACAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 10 9 15717 CASAVA_Build 5 19686167 1D TCCATAAAAG A/- AAAATACAGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 5 4 15718 CASAVA_Build 5 19693998 4D CTCTTTATTA TTGC/---- TTTATGCAAT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 TTGC 1 0 15719 CASAVA_Build 5 19698009 1I TAAAGATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 31 1 18 12 T 12 13 15720 CASAVA_Build 5 19700150 1D GTCCTATGGG A/- AAAATTAATG 3070 hom 102 het 41 0 35 7 A 5 4 15721 CASAVA_Build 5 19700472 1I AAGACGTTAA -/G AATATTTAGT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 G 0 1 15722 CASAVA_Build 5 19703521 2D CAATTTAAAC AG/-- ATAAAATTAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AG 1 0 15723 CASAVA_Build 5 19704250 1I TATTAGCATT -/G AAAAAACAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 G 0 1 15724 CASAVA_Build 5 19711149 1I CATTGATAAT -/A TTTTATCAGG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 0 1 15725 CASAVA_Build 5 19726491 1I ACAGAAATAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 8 9 15726 CASAVA_Build 5 19727043 2D GGACAAAAAC AG/-- AGAGTCACAT 3070 hom 135 het 51 0 46 7 AG 3 2 15727 CASAVA_Build 5 19730740 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 22 0 13 9 A 14 15 15728 CASAVA_Build 5 19738917 10D AAATATGTGC GTAAAACTCT/---------- GTTCATGGCT 3070 hom 84 het 29 0 27 5 GTAAAACTCT 1 0 15729 CASAVA_Build 5 19748972 1D ATTCCCAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 39 1 35 4 T 10 9 15730 CASAVA_Build 5 19750148 1D AAAATCTAGA T/- TTTTAACTGC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 5 4 15731 CASAVA_Build 5 19753281 1D AAATGGAAAG T/- TTCCATTCTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 3 2 15732 CASAVA_Build 5 19763590 1D AAAAGTCAAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 8 7 15733 CASAVA_Build 5 19765083 4I AAAAAATAAT ----/AGTC AGGGAAATAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGTC 0 1 15734 CASAVA_Build 5 19774062 1I TTTTAAGGGA -/C CTACGGACCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 1 2 15735 CASAVA_Build 5 19776933 4I TTACTGTTGA ----/AATT AATTATTTAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AATT 1 2 15736 CASAVA_Build 5 19777023 19D TACATCTATG TCATCTATGTATATATGTA/------------------- TATATGTCAT 3070 het 230 hom 20 4 16 2 TCATCTATGTATATATGTA 1 0 15737 CASAVA_Build 5 19777105 2D18M4I ATATATGTAC ATATATGTATGTATATATGT----/--ATATGTATGTATATATGTATAC ATACATATAT 3070 hom 45 het 11 0 16 1 N/A 0 0 15738 CASAVA_Build 5 19783625 1D TAATAATTTG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 9 8 15739 CASAVA_Build 5 19786627 3D TACAGTGAAG CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 hom 5 het 21 0 13 8 C 13 10 15740 CASAVA_Build 5 19800491 4D CTATTTCTTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 57 het 31 0 20 13 AT 12 10 15741 CASAVA_Build 5 19801748 1I TCAAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 30 1 28 1 T 11 12 15742 CASAVA_Build 5 19806489 1I AAAAAAAAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 100 het 41 0 34 7 A 7 8 15743 CASAVA_Build 5 19840818 1D ATTATTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 12 11 15744 CASAVA_Build 5 19845395 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 9 8 15745 CASAVA_Build 5 19850375 8I ATATTTAGCA --------/GGATCCCT GGGCTCTACA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 GGATCCCT 0 1 15746 CASAVA_Build 5 19851431 1D TCTTCATATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 A 9 8 15747 CASAVA_Build 5 19862002 1I TAATCTCAGA -/G CTCAAAGACT 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 G 0 1 15748 CASAVA_Build 5 19869781 2I CTGCTGGATT --/CA GTTTCTCAGT 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 CA 0 1 15749 CASAVA_Build 5 19870323 1D ATTTTGTTAA T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 7 6 15750 CASAVA_Build 5 19873674 1I ATCATCAATC -/A GGGGGATAGA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 0 1 15751 CASAVA_Build 5 19873851 4I TGACACATGC ----/TTAA TTAAACTCTC 3070 het 3070 hom 49 16 29 4 TTAA 1 2 15752 CASAVA_Build 5 19877438 1I CATGAATTTC -/A AAAAAAAAAA 2512 het 2512 ref 18 9 8 1 A 13 14 15753 CASAVA_Build 5 19879362 5D TGGCTAGCAG AAGTT/----- TATTGCAGGG 3070 het 3070 hom 36 10 19 8 AAGTT 1 0 15754 CASAVA_Build 5 19881044 1D TCAAAGAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 9 8 15755 CASAVA_Build 5 19881580 1I TTTATAATTG -/T TTTTTTTTCT 2606 het 2606 ref 28 15 7 6 T 8 9 15756 CASAVA_Build 5 19882792 6D TTTTCTTTTT CTTTTA/------ CCTTTAGCAC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 CTTTTA 1 0 15757 CASAVA_Build 5 19883655 3I TGTAGACATG ---/TCT TCTTTTGACT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TCT 1 2 15758 CASAVA_Build 5 19888806 1D TGAAATTGGA T/- GTGTACATCA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 T 1 0 15759 CASAVA_Build 5 19894066 1D TTCCAGGTCC T/- AAGCAGATTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 1 0 15760 CASAVA_Build 5 19897157 1I TACAGATGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 29 0 20 9 T 9 10 15761 CASAVA_Build 5 19898079 1I TACATTACAG -/A AACATTCAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 3 15762 CASAVA_Build 5 19898890 1I TTAACGGGGG -/A AAAAAATGGG 3070 het 673 hom 41 2 32 7 A 6 7 15763 CASAVA_Build 5 19900405 6I AATAATTTAA ------/AAAAAC AAAAACAACA 3070 het 2478 hom 32 10 19 3 AAAAAC 1 2 15764 CASAVA_Build 5 19903508 40D CAGACTCTAA ATATATATATTTATATATTTATATAATATATATGCATAAT/---------------------------------------- ATGTATAATA 3070 hom 102 het 34 0 35 5 ATATATATATTTATATATTTATATAATATATATGCATAAT 1 0 15765 CASAVA_Build 5 19907258 1D TTATCACATC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 T 7 6 15766 CASAVA_Build 5 19909517 1D CAAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 10 9 15767 CASAVA_Build 5 19911763 1I TAATTGTAAC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 9 15768 CASAVA_Build 5 19912553 1I GTATGGGATA -/C ATGCTTGTCT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 C 0 1 15769 CASAVA_Build 5 19923439 1I TGGGACTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 9 10 15770 CASAVA_Build 5 19931884 1I TTATTTGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 9 10 15771 CASAVA_Build 5 19934219 1I TCTTATAGTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 86 het 35 0 29 6 A 8 9 15772 CASAVA_Build 5 19934498 11I ATATGGAAAA -----------/TAAGAAGAAAT TAAGAAGAAA 3070 hom 39 het 23 0 14 9 TAAGAAGAAAT 1 2 15773 CASAVA_Build 5 19941345 1I ACATTTAGAT -/C CATATCCAAT 3070 het 2452 hom 16 5 9 2 C 1 2 15774 CASAVA_Build 5 19945559 1D GTCAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 A 11 10 15775 CASAVA_Build 5 19948048 2D AACAATAATA AT/-- AAAAAAAAAA 76 het 76 ref 35 21 2 13 AT 1 0 15776 CASAVA_Build 5 19949096 3I ATTTAAATGA ---/GAT GATAAGATTA 3025 het 3025 ref 30 22 7 1 GAT 1 2 15777 CASAVA_Build 5 19960044 1D GGCAACAATC A/- GGGGAGAGGT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 1 0 15778 CASAVA_Build 5 19975269 1D GGCAGTCTAG C/- CTTTTATTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 2 1 15779 CASAVA_Build 5 19983629 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 432 hom 28 1 24 4 A 10 9 15780 CASAVA_Build 5 19993708 2I AGAAAATAAC --/AT ATATATGTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AT 3 4 15781 CASAVA_Build 5 19996856 3D CTGGGAGTGC AGG/--- AGGTTTGTTT 3070 hom 105 het 39 0 35 5 AGG 2 1 15782 CASAVA_Build 5 20007725 2D AAAAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 114 het 46 0 38 9 AG 8 7 15783 CASAVA_Build 5 20008445 1I AAAATATAGC -/T AGGGGAATAA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 0 1 15784 CASAVA_Build 5 20009693 2D ATGAGAATAT AA/-- AAAGTTTTTG 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 5 3 15785 CASAVA_Build 5 20011760 1I TGTTAAAAAT -/A ACCTTTTTGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 2 15786 CASAVA_Build 5 20012664 2D ATATAAAGAC AG/-- AAACAGGGAT 3070 hom 74 het 29 0 25 6 AG 1 0 15787 CASAVA_Build 5 20013582 4I ACCCTTGAAA ----/TTTG TTTGACATTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TTTG 1 2 15788 CASAVA_Build 5 20016079 5I ACAACAGCAA -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 AAAAC 3 4 15789 CASAVA_Build 5 20017284 1D AATAATTTAT A/- AAGAGCAGGC 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 3 2 15790 CASAVA_Build 5 20018900 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 1690 het 204 hom 14 2 5 7 A 17 16 15791 CASAVA_Build 5 20045976 1D CATGAATGAT G/- GATTAGTCTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 2 1 15792 CASAVA_Build 5 20074959 1D TCCCATTCGC A/- ATTGCTACGA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 2 1 15793 CASAVA_Build 5 20080041 1D TTTAACTGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 10 9 15794 CASAVA_Build 5 20085312 2I ATACAACAAA --/CC CCCCCATGAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 5 7 15795 CASAVA_Build 5 20088893 1I CCTCAGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 10 11 15796 CASAVA_Build 5 20110601 1I TAGTTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 38 1 29 8 T 11 12 15797 CASAVA_Build 5 20116595 2I GGAAGAAGGG --/GA GAGAGAGGAG 3070 hom 125 het 46 0 41 5 GA 3 4 15798 CASAVA_Build 5 20117026 1I TCTTTTCCTA -/T TTTTGGTAAC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 4 5 15799 CASAVA_Build 5 20123347 1D TTTTGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 144 hom 34 2 28 4 A 12 11 15800 CASAVA_Build 5 20129223 1I TCCTGTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 37 0 23 14 T 11 12 15801 CASAVA_Build 5 20139679 2I AAACCAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 10 12 15802 CASAVA_Build 5 20142951 1I TATAACTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 26 0 17 9 T 14 15 15803 CASAVA_Build 5 20155484 4I TTAATAAAAA ----/CTAT CTATATCCCT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CTAT 1 2 15804 CASAVA_Build 5 20166268 2D TCTTCCTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 33 1 20 14 T 16 14 15805 CASAVA_Build 5 20182484 2D CTAATTTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 1169 het 130 hom 31 3 5 23 A 14 12 15806 CASAVA_Build 5 20198368 4D TATAATAGAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 748 hom 13 3 8 2 AT 9 7 15807 CASAVA_Build 5 20200388 1D TGATCCGTCC A/- GGTCGGCCTC 3070 het 2810 hom 31 9 19 4 A 1 0 15808 CASAVA_Build 5 20206916 1D TTTTTTTTTT A/- TATATATATA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 A 1 0 15809 CASAVA_Build 5 20219018 5D49M3D TATGTAAAGG GCTCAGAATAGTGTCTAGCATAGAGCTAATTCTAAGTGTTAGCTATCATTACTATTG/-----GAATAGTGTCTAGCATAGAGCTAATTCTAAGTGTTAGCTATCATTACTA--- TTGTTATTGT 3070 het 3070 ref 41 30 24 9 N/A 0 0 15810 CASAVA_Build 5 20221732 1I AATTTATCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 9 10 15811 CASAVA_Build 5 20222617 1D GCAATTCCTT A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 7 6 15812 CASAVA_Build 5 20230536 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAGAATGG 3070 het 3070 hom 45 21 23 1 A 5 4 15813 CASAVA_Build 5 20244318 1I AACCATATCA -/C CAACAATATA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 C 1 2 15814 CASAVA_Build 5 20244532 1I CTGAGCAAAG -/A TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 A 0 1 15815 CASAVA_Build 5 20247741 1I CACCTCTTCT -/C CTCCAAAGGA 2948 het 2948 ref 27 16 7 4 C 1 2 15816 CASAVA_Build 5 20254760 3D AGAGGGGAGT TTA/--- TAGCAATAAG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 TTA 1 0 15817 CASAVA_Build 5 20263701 1I TCTAATCTAG -/A AAATAAGCAC 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 A 3 4 15818 CASAVA_Build 5 20276151 4I AAAAAAAAGT ----/TAGC TGGCAATTAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TAGC 0 1 15819 CASAVA_Build 5 20280052 1I AACAACCTCC -/G GCTGAAGGTG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 G 1 2 15820 CASAVA_Build 5 20282470 4D ATAATGTATT AATA/---- ATTAAGAAGA 3070 het 3070 ref 43 24 18 4 AATA 1 0 15821 CASAVA_Build 5 20284130 1D TTGAGTAAGC A/- AAAAGAGATG 3070 het 3070 hom 50 20 27 4 A 5 4 15822 CASAVA_Build 5 20285796 1I ACATTGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 10 11 15823 CASAVA_Build 5 20286153 1I TTATTTTTTT -/A TTTTATTTTA 3070 het 2955 hom 24 11 11 2 A 0 1 15824 CASAVA_Build 5 20290756 1D AAGATCGGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 12 24 12 A 10 9 15825 CASAVA_Build 5 20291775 2I AAATGTTTAT --/AA GTTATTTTAA 2676 het 2676 ref 20 10 6 4 A 0 2 15826 CASAVA_Build 5 20293339 8D TTTTATCTTG GCTCTATT/-------- GCTCTATTGC 3070 het 3070 hom 44 15 27 7 GCTCTATT 2 1 15827 CASAVA_Build 5 20293875 2I CAAAATTTTC --/TA TGTTATTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 TA 0 1 15828 CASAVA_Build 5 20294326 1D AAAGGGCAAT C/- CTCCATGTGA 3070 het 3070 ref 47 23 16 9 C 2 1 15829 CASAVA_Build 5 20302129 6I AAGAACCCTG ------/ACTAAT ACACTAGAGA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 ACTAAT 0 1 15830 CASAVA_Build 5 20306671 1D ACACAACCAT A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 7 6 15831 CASAVA_Build 5 20319021 1D AAATTACTAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 9 A 8 7 15832 CASAVA_Build 5 20319397 1D AGAGAAATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 10 9 15833 CASAVA_Build 5 20323647 1D CATGTGAAAC A/- AATCAACGTT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 A 3 2 15834 CASAVA_Build 5 20342389 10D GCCTCAACAA ATGGCTGCAT/---------- ATGTTAATCA 3070 het 3070 ref 43 25 17 5 ATGGCTGCAT 1 0 15835 CASAVA_Build 5 20342746 4I71M1D ATGTGATAAT ----TTATTATGGTATAATCAAATTTGTTGAATAACTTGAAATAATTCTCAATGAATTTATGCCATAGTTATAGGA/TTACTTATTATGGTATAATCAAATTTGTTGAATAACTTGAAATAATTCTCAATGAATTTATGCCATAGTTATAGG- AAAAATAACA 3070 het 3070 ref 29 21 16 14 N/A 0 0 15836 CASAVA_Build 5 20344407 1I AGACTCAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1931 hom 26 8 11 7 A 15 16 15837 CASAVA_Build 5 20364793 4I34M1D GACTGCAATG ----TGATTGCACCATTGCACTTCAGCTCCCCTGGGTTA/TGATTGATTGCACCATTGCACTTCAGCTCCCCTGGGTT- CAGAGTAAGA 3070 het 3070 ref 44 24 21 10 N/A 0 0 15838 CASAVA_Build 5 20369768 2D AAAAAGACAT AA/-- GTTATTCCTA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 A 2 0 15839 CASAVA_Build 5 20377411 2I ATTAGAGGGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 AT 7 8 15840 CASAVA_Build 5 20381118 10D GTTGTAATTT GTATATTGGG/---------- GTATATTGGG 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 GTATATTGGG 2 1 15841 CASAVA_Build 5 20400210 4D CTAATTAGAC TGTT/---- TGTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 TGTT 2 1 15842 CASAVA_Build 5 20415669 1D GAAAAAAAAA C/- ATTAAATTAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 4 C 1 0 15843 CASAVA_Build 5 20427812 1I TTGTTATAGC -/A ATAAACAGCC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 1 2 15844 CASAVA_Build 5 20436465 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2501 hom 28 het 18 0 10 8 A 11 12 15845 CASAVA_Build 5 20443364 1I ACCAATGAGG -/A AAAAAAAAAA 2912 het 2912 ref 31 11 10 10 A 13 14 15846 CASAVA_Build 5 20446065 1I AAACTACAGA -/C CAATATACTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 2 15847 CASAVA_Build 5 20450154 1I AGGTGCTCAT -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 6 7 15848 CASAVA_Build 5 20454525 1D ATTTCAATAA T/- TTTTTTGTAC 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 T 7 6 15849 CASAVA_Build 5 20457233 1I AATCACTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 12 11 T 11 12 15850 CASAVA_Build 5 20457694 2I TATATCAATC --/AT ATATATATAT 2161 het 1593 hom 26 6 7 13 AT 7 8 15851 CASAVA_Build 5 20460276 1D TCAGATTATC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 10 9 15852 CASAVA_Build 5 20464684 1I TTTAGTGGCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 7 8 15853 CASAVA_Build 5 20464942 1D CTGATACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 11 10 15854 CASAVA_Build 5 20473014 1I ATTGCTTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 9 10 15855 CASAVA_Build 5 20474103 2D GCCCCCAAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 11 11 7 TA 8 7 15856 CASAVA_Build 5 20475034 5I TTGGATCAAC -----/ATAAT ATAATTCCAC 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 ATAAT 1 2 15857 CASAVA_Build 5 20475317 2I CACAAGATAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 AC 6 7 15858 CASAVA_Build 5 20477656 1I TTAGATCAAT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 7 8 15859 CASAVA_Build 5 20490944 1I CTGTGAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 18 20 13 A 12 13 15860 CASAVA_Build 5 20494900 5D GAAATGATAC ACAAA/----- ACAAAATACT 3070 het 3070 hom 30 10 18 3 ACAAA 2 1 15861 CASAVA_Build 5 20500338 4I TGCCTGTTAT ----/TGAG TGTTTATCTT 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 TGAG 0 1 15862 CASAVA_Build 5 20501133 2D TTCTAGAGAA GG/-- GTAAGGAGTA 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 G 3 1 15863 CASAVA_Build 5 20523625 2D AATAGCATGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 30 0 23 10 AT 7 6 15864 CASAVA_Build 5 20551174 1I AGAGAGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 35 3 17 15 A 14 15 15865 CASAVA_Build 5 20555590 1I CCAAGTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 42 1 39 2 T 11 12 15866 CASAVA_Build 5 20568772 14D TTTTTTTTTC ACTAAAAACCTGAA/-------------- ACTCCCTCGT 3070 het 3070 hom 33 16 19 3 ACTAAAAACCTGAA 1 0 15867 CASAVA_Build 5 20573626 1I AAACTAGAGG -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 7 15868 CASAVA_Build 5 20578140 3D TCAGCAGAAA GAG/--- GAGAAGGGAT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 GAG 2 1 15869 CASAVA_Build 5 20595832 1I CCTAAAGGAG -/T TTTGGTTGAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 3 4 15870 CASAVA_Build 5 20598858 1I AGAAGGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 14 27 10 T 13 14 15871 CASAVA_Build 5 20599356 1I CAGTAAGTTC -/A ACTCGTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 1 2 15872 CASAVA_Build 5 20604492 1D AATTCACTAG A/- AAAAATATGC 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 A 6 5 15873 CASAVA_Build 5 20608091 1I TTTGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 30 1 27 2 A 10 11 15874 CASAVA_Build 5 20608290 1D AATATATTAT C/- TTTACATTTG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 C 1 0 15875 CASAVA_Build 5 20611139 1D ACCTGGAGAT A/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 1 0 15876 CASAVA_Build 5 20612119 2I TGACAAATGC --/TT TTTGCTAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 T 3 5 15877 CASAVA_Build 5 20613223 2D ACCTATCTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 108 hom 29 2 11 17 A 13 11 15878 CASAVA_Build 5 20613818 1I GGTGGATGAC -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 1 2 15879 CASAVA_Build 5 20622539 1I ACGTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 10 11 15880 CASAVA_Build 5 20622985 1D CAAGAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 11 10 15881 CASAVA_Build 5 20628356 4D TTTCACATTG CTCT/---- CTCTATTCTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 CT 4 2 15882 CASAVA_Build 5 20632488 2D TCCTTATCAT AA/-- AAATATTACT 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 A 5 3 15883 CASAVA_Build 5 20634152 1I AGATAGATAA -/G GGGGCTGTTA 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 G 4 5 15884 CASAVA_Build 5 20635587 1D CTTTTCACCC T/- TTTTTTTTTT 1261 het 1261 ref 47 36 3 8 T 11 10 15885 CASAVA_Build 5 20643832 4I CAAGCTAAAC ----/TGAT TGTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 TGAT 0 1 15886 CASAVA_Build 5 20645987 5I GACTTATTTT -----/ATTTA TTCTGTTGTA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 ATTTA 0 1 15887 CASAVA_Build 5 20646288 1I CTTTTCAGTA -/T TGCTATTAAT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 1 2 15888 CASAVA_Build 5 20649430 1I TTTGCTGTTT -/A TATCTAATAA 3070 het 3070 ref 50 29 19 2 A 0 1 15889 CASAVA_Build 5 20650445 1I GCAATAAAGT -/A AATTAGGTGA 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 A 2 3 15890 CASAVA_Build 5 20659670 4I CAGAATATAC ----/ATTG ATTGGTTATG 3070 het 3070 hom 39 16 22 1 ATTG 1 2 15891 CASAVA_Build 5 20671367 4I TTACATAAAT ----/AAAC AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 AAAC 0 1 15892 CASAVA_Build 5 20712445 1D AAAATCCTCC T/- TTTTCTGAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 5 4 15893 CASAVA_Build 5 20718846 1I AATCATAAAA -/C CATGAATAGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 2 15894 CASAVA_Build 5 20719183 1I AAGATTGTCC -/T TTTTTTTTTT 2485 het 2485 ref 34 15 11 8 T 13 14 15895 CASAVA_Build 5 20719691 1D TGCAAAAGTG A/- AAGAGGTGAT 3070 het 3070 ref 48 26 14 9 A 3 2 15896 CASAVA_Build 5 20725643 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2670 het 2670 ref 26 10 10 6 A 11 12 15897 CASAVA_Build 5 20738331 2I TTTTTTTTTT --/TG GTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 25 4 16 5 TG 0 1 15898 CASAVA_Build 5 20744976 4D TTTTAATTCT TTAA/---- TTATCTAAAT 2704 het 2704 ref 22 15 7 2 TTAA 1 0 15899 CASAVA_Build 5 20745853 4D ATATATATGA TTGT/---- TTGTGTATGT 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 TTGT 2 1 15900 CASAVA_Build 5 20749208 1I TTATAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 A 8 9 15901 CASAVA_Build 5 20752836 2I TTTTATTGCA --/TT CTCTTCTGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 0 2 15902 CASAVA_Build 5 20756553 1I CCCAAGCAAC -/A TATTGATTTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 0 1 15903 CASAVA_Build 5 20770841 1I GGTTGTACTA -/T TTTACAGTTT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 3 4 15904 CASAVA_Build 5 20773406 1I ATCTGTATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 10 15905 CASAVA_Build 5 20778320 2D TTTTGGACAC AT/-- ATGAGTCAGT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 AT 2 1 15906 CASAVA_Build 5 20779537 1D TATCAGATCC T/- TTTTTTTTTT 2719 het 1451 hom 19 5 9 5 T 12 11 15907 CASAVA_Build 5 20786272 8I GTTTTATACT --------/TGAAAGTA TTCAAGAGCC 3070 het 438 hom 25 1 22 2 TGAAAGTA 0 1 15908 CASAVA_Build 5 20787536 3D GTTCTCAGAA AAC/--- AGTCTGTATC 2010 het 2010 ref 13 8 5 0 AAC 1 0 15909 CASAVA_Build 5 20792378 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AAAACTCTTG 3070 het 108 hom 18 3 9 6 AAC 0 1 15910 CASAVA_Build 5 20794076 1D ACATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2070 het 1884 hom 15 5 7 3 A 15 14 15911 CASAVA_Build 5 20810061 1D GCCAAGATGA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 9 8 15912 CASAVA_Build 5 20817920 1D GAAGATGTGG A/- AAAAGAGAAC 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 A 5 4 15913 CASAVA_Build 5 20821382 1D CATTAAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 A 8 7 15914 CASAVA_Build 5 20828077 1D AAACAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 35 1 22 13 A 13 12 15915 CASAVA_Build 5 20837110 4D TTCTCGTGAT AGTA/---- AGTAAGTCTC 3070 het 2613 hom 25 7 13 5 AGTA 2 1 15916 CASAVA_Build 5 20837979 2I GAAAAGAAAT --/AA AAAAAATCAG 3070 hom 36 het 28 0 18 10 A 6 8 15917 CASAVA_Build 5 20838095 1D TAGACTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 14 8 A 11 10 15918 CASAVA_Build 5 20839852 3I TAGATTAATC ---/ACT TCTCTGTAGG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 ACT 0 1 15919 CASAVA_Build 5 20842046 3I GAAGTTTATT ---/TTC TTCAATAAAT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 TTC 1 2 15920 CASAVA_Build 5 20845156 1I ATCACCACAA -/T AAACTTTAGA 2939 hom 15 het 6 0 6 0 T 0 1 15921 CASAVA_Build 5 20847088 1I GCCTGGCTTG -/A AAAAAACACA 2053 het 2053 ref 50 37 5 8 A 6 7 15922 CASAVA_Build 5 20849312 1I TTTGATTAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 38 27 8 3 A 8 9 15923 CASAVA_Build 5 20849466 1D ATAAATTGGT A/- GGAAGGAATA 1908 het 1908 ref 25 19 4 2 A 1 0 15924 CASAVA_Build 5 20849813 1I AGCAAAGCTG -/T TTTTTAATAA 3070 het 3070 ref 42 31 9 2 T 5 6 15925 CASAVA_Build 5 20854482 2D ATAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAG 2104 het 239 hom 14 1 8 5 AG 1 0 15926 CASAVA_Build 5 20856183 2I TGGTGTTTTG --/AA ACTTTATGAT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 1 3 15927 CASAVA_Build 5 20864149 2D CTTTTTCTAG CT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 31 1 17 13 CT 1 0 15928 CASAVA_Build 5 20864394 1D TATTTACAGT G/- TTTCATGTAA 2824 het 2824 ref 61 48 6 9 G 1 0 15929 CASAVA_Build 5 20864803 1D TTCCAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 19 1 15 3 T 12 11 15930 CASAVA_Build 5 20869768 1D TATTTAATGC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 36 25 8 3 A 8 7 15931 CASAVA_Build 5 20872833 4D AAGCTTGAAT AGAG/---- AGTGATTAAA 1383 het 1383 ref 31 27 3 2 AG 3 1 15932 CASAVA_Build 5 20873289 1D TATTTTAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 10 9 15933 CASAVA_Build 5 20879436 1D ATGGTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 T 13 12 15934 CASAVA_Build 5 20883559 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 18 11 7 0 A 9 10 15935 CASAVA_Build 5 20885858 1D TTGAACTCTT C/- TCTCATTTAT 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 C 1 0 15936 CASAVA_Build 5 20894565 1D ATTTTTTGAC A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 7 15937 CASAVA_Build 5 20894774 2D TTGGAAAAAA AG/-- AGAGAATATA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AG 3 2 15938 CASAVA_Build 5 20897610 2D TCTGATACAC AT/-- ATATTTATAT 3070 hom 77 het 29 0 26 3 AT 3 2 15939 CASAVA_Build 5 20900350 4I GATGAAATAC ----/TTAT GTGATATAAA 3070 het 3070 ref 36 26 8 2 TTAT 0 1 15940 CASAVA_Build 5 20901758 7D GTCTATGGAG ATGCAGA/------- GATGCAGAGA 2275 hom 15 het 6 0 6 0 ATGCAGA 1 0 15941 CASAVA_Build 5 20903948 3I AGCAACAATC ---/GTT GTAATGCAGG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 GTT 0 1 15942 CASAVA_Build 5 20907361 1D TTTATTAGCC A/- TCCTACATGA 2287 het 2287 ref 29 19 5 5 A 1 0 15943 CASAVA_Build 5 20907672 4D TTTCTCTCTC TCCT/---- CTTAAATCTC 1336 het 1336 ref 40 37 3 2 TCCT 1 0 15944 CASAVA_Build 5 20910901 3D CTAGAATAAT AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 5 AAG 3 2 15945 CASAVA_Build 5 20912419 1D AAGGTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 23 1 19 4 A 14 13 15946 CASAVA_Build 5 20915278 3I AACACTCATA ---/CCT CCTTTCTGGT 2862 het 2862 ref 29 15 6 8 CCT 1 2 15947 CASAVA_Build 5 20916774 4I GAGGAAAGTC ----/TATT TATGAATGCG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TATT 0 1 15948 CASAVA_Build 5 20919347 4I ATAACTACAC ----/AATT AAAGTGTTCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AATT 0 1 15949 CASAVA_Build 5 20931621 1I AAAATGGATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 8 9 15950 CASAVA_Build 5 20934067 1I ATTGGTTACC -/A GGGGTGGCAG 1328 het 1328 ref 35 24 3 8 A 0 1 15951 CASAVA_Build 5 20945472 5I GACATTTCCA -----/CAGCG CAGCGACATG 2752 het 2752 ref 52 37 6 9 CAGCG 1 2 15952 CASAVA_Build 5 20952633 1I ACAAAGAGAA -/C CTTTGTGGGT 3070 het 3070 ref 34 23 7 4 C 1 2 15953 CASAVA_Build 5 20961413 1I CTACATTACA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 29 18 11 0 T 8 9 15954 CASAVA_Build 5 20966406 2D AGTTGACAGA GG/-- GGGGTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 13 1 G 6 4 15955 CASAVA_Build 5 20969785 1D TATTTGAATA T/- TATTCATATA 1830 het 1830 ref 43 32 4 7 T 2 1 15956 CASAVA_Build 5 20969931 2D AGATAGTAAC AT/-- AGAGTATTGT 3070 het 3070 ref 61 44 12 6 AT 1 0 15957 CASAVA_Build 5 20974534 2D GTAAGAAAAT AG/-- AGTCACATTA 3070 het 3070 ref 33 22 8 3 AG 2 1 15958 CASAVA_Build 5 20975183 1I ATTCACTAGA -/T TTTTTTCTGT 2310 het 2310 ref 32 23 5 4 T 6 7 15959 CASAVA_Build 5 20976170 2D TCAGAAAAAA AT/-- AAATGTTGAT 2774 het 2774 ref 31 24 6 2 AT 1 0 15960 CASAVA_Build 5 20979088 1I TAATTATATA -/T TTTTGTTTAA 1349 het 1349 ref 35 28 3 4 T 4 5 15961 CASAVA_Build 5 20997040 1I ATTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 10 11 15962 CASAVA_Build 5 20999882 2D CTCCACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 47 22 14 12 AC 6 5 15963 CASAVA_Build 5 21002351 1I AATGTTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 10 11 15964 CASAVA_Build 5 21003499 1I TTAAGTCTGA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 6 7 15965 CASAVA_Build 5 21005240 1I AAAAAAAGAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 29 1 22 6 G 0 1 15966 CASAVA_Build 5 21006155 4I GTCAAATAAA ----/TAAT TGATTTATAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TAAT 0 1 15967 CASAVA_Build 5 21006507 12I ATGTTTGGTG ------------/CATCCGTTTCCT CATTTAACCA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 CATCCGTTTCCT 0 1 15968 CASAVA_Build 5 21008341 3D AACGAACTCT ACA/--- GTAGACACTT 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 ACA 1 0 15969 CASAVA_Build 5 21011460 1I AGAAGATGGT -/G GGAATCGCCA 3070 het 3070 ref 38 26 11 1 G 2 3 15970 CASAVA_Build 5 21011703 1D GTCATTTCTG T/- TTCTTTCCAA 3070 het 3070 ref 31 15 9 8 T 3 2 15971 CASAVA_Build 5 21013842 4D ATAATAAAAT AAGA/---- AAGAGAGATA 3070 het 3070 hom 26 10 15 3 AAGA 2 1 15972 CASAVA_Build 5 21019426 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2478 het 2478 ref 30 9 9 12 T 13 14 15973 CASAVA_Build 5 21020030 1D55M1I GACTTTATTT ATTTTTTCTTTTATTCAAACCCGTAGCCCCACATGGCACTTAGGAGCCATTTCTGT-/-TTTTTTCTTTTATTCAAACCCGTAGCCCCACATGGCACTTAGGAGCCATTTCTGTG GGGTTTCTGT 3070 het 3070 ref 28 25 9 10 N/A 0 0 15974 CASAVA_Build 5 21028801 1D GGATAATGAT C/- TACTACACAA 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 C 1 0 15975 CASAVA_Build 5 21032331 1I TATTAAAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 506 hom 25 3 19 3 T 2 3 15976 CASAVA_Build 5 21032810 1D AAGATGGTAA G/- GGTAACAATA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 3 2 15977 CASAVA_Build 5 21036057 1D ACAAAGAAAA G/- CCTTTGCAAA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 G 1 0 15978 CASAVA_Build 5 21041066 4D AATTAGAAAC AAAT/---- AGATAAGCAT 3070 het 3070 hom 33 15 18 0 AAAT 1 0 15979 CASAVA_Build 5 21046546 2D GAATAATTCA TT/-- TCTGGGTCAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 3 1 15980 CASAVA_Build 5 21047553 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AC 8 9 15981 CASAVA_Build 5 21048174 1I CCTGGTTAGA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 6 7 15982 CASAVA_Build 5 21051961 1D TTACACTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 519 hom 34 6 11 18 T 12 11 15983 CASAVA_Build 5 21053004 1D AGTATTATAG A/- ATATAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 2 1 15984 CASAVA_Build 5 21053516 1I AAGAGATGAC -/A AAAAAATTCT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 A 6 7 15985 CASAVA_Build 5 21054009 1I CTTTTTTTTT -/C TGAGACAAGA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 C 0 1 15986 CASAVA_Build 5 21062591 1I TTTAAAAAGT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 9 15987 CASAVA_Build 5 21062847 2D AAATGACAAA AT/-- ATTTTCAATG 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 AT 2 1 15988 CASAVA_Build 5 21063209 1I CAAGCAGGGC -/T ACTTAAATTC 3070 het 1076 hom 21 4 14 3 T 0 1 15989 CASAVA_Build 5 21063533 4I ACACACACAC ----/ACAT ATATATATAT 1340 het 1340 ref 21 15 3 3 ACAT 0 1 15990 CASAVA_Build 5 21070451 1D TTCATAATTG C/- CCCAAACTTG 3070 het 3070 hom 53 24 26 4 C 4 3 15991 CASAVA_Build 5 21070710 1D GCATAGGGAG T/- TTTTATGGCA 3070 het 3070 hom 58 25 26 7 T 5 4 15992 CASAVA_Build 5 21071339 1I TAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 199 hom 29 1 25 3 A 10 11 15993 CASAVA_Build 5 21087264 4I TCTCTGTCTC ----/TGAG TGTGTGTGTG 3070 hom 24 het 20 1 19 0 TGAG 0 1 15994 CASAVA_Build 5 21095743 1D CTTATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2522 hom 42 14 15 13 T 13 12 15995 CASAVA_Build 5 21101341 4D AGTATATATT TGTG/---- TGTGTGTGTG 2793 hom 24 het 12 0 9 4 TG 11 9 15996 CASAVA_Build 5 21124045 1I TCTGGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 11 15997 CASAVA_Build 5 21130975 4D CACTAAGATG TTAA/---- TTATTTACAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 TTAA 1 0 15998 CASAVA_Build 5 21152149 2D TTTTTGTACA CT/-- CTAAGTGTAA 3070 het 3070 ref 57 27 25 6 CT 2 1 15999 CASAVA_Build 5 21152928 1D CGCTCAGAAT C/- CCCCCCGTGG 3070 hom 68 het 33 0 22 11 C 7 6 16000 CASAVA_Build 5 21163468 3D TTTGTCTGTT TTA/--- TTATTATTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 TTA 3 2 16001 CASAVA_Build 5 21174636 1I AGAAAATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 10 11 16002 CASAVA_Build 5 21183843 6I4M1I GGTCTTTTGT ------TTAT-/GGTTCCATATA AATTAGAGAA 3070 hom 66 het 22 0 23 2 N/A 0 0 16003 CASAVA_Build 5 21190854 1D TGATGCTAGC A/- AAGTGGAGGA 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 A 3 2 16004 CASAVA_Build 5 21199592 1I AGAGTCTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 17 13 T 13 14 16005 CASAVA_Build 5 21205296 1I TATAATGTAG -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 7 8 16006 CASAVA_Build 5 21205623 2D ACATATATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AT 6 5 16007 CASAVA_Build 5 21209861 1D TTTGAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 24 1 21 2 A 11 10 16008 CASAVA_Build 5 21220602 1D ACCGCTCAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 46 het 24 0 16 9 A 9 8 16009 CASAVA_Build 5 21230621 16D AGACAGAAAG AAGGAAGGAAGGAAGA/---------------- AAGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 33 11 11 15 AAGGAAGGAAGGAAGA 2 1 16010 CASAVA_Build 5 21233205 1I ATGACTGAAA -/T ATAATAAAAC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 0 1 16011 CASAVA_Build 5 21235059 2I GCTGCACTGA --/CT CTGTGCACAC 3070 hom 77 het 32 0 24 8 CT 1 2 16012 CASAVA_Build 5 21237830 4D TATCTATAAT AGAA/---- AGGTGGCTGT 3070 het 3070 hom 27 11 12 6 AGAA 1 0 16013 CASAVA_Build 5 21243316 2I GCCCAACAAA --/TC TCTATCCTTT 2049 het 2049 ref 17 11 5 1 TC 1 2 16014 CASAVA_Build 5 21245629 1I AACAGATGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 T 8 9 16015 CASAVA_Build 5 21264318 1D AGTGACACAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 9 8 16016 CASAVA_Build 5 21274024 4I TTATATTAGA ----/TGTT TGTTTTAGAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TGTT 1 2 16017 CASAVA_Build 5 21277187 1D GACTAGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 29 1 21 7 T 12 11 16018 CASAVA_Build 5 21283390 1I ACAACCACTT -/A AATATTTCTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 3 16019 CASAVA_Build 5 21291480 1D TTCCCATGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 106 het 41 0 36 6 T 9 8 16020 CASAVA_Build 5 21292579 1I TCATTTCTAA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 130 het 50 0 42 8 T 7 8 16021 CASAVA_Build 5 21332569 4I AGGGCATGAC ----/GCAT GTGACCAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GCAT 0 1 16022 CASAVA_Build 5 21368132 1D GGAGTTGTTT A/- AAAATTTAGA 1361 het 1361 ref 33 28 3 2 A 5 4 16023 CASAVA_Build 5 21370274 5I ATATCTTAAT -----/TAAAA TAAATCAACC 3070 het 3070 ref 36 22 8 6 TAAAA 0 1 16024 CASAVA_Build 5 21372028 1D GAAAATATTG T/- TTTGTTATGA 3070 het 3070 ref 37 26 10 1 T 4 3 16025 CASAVA_Build 5 21372162 1I TGTTTTCTAG -/T TTTTTTTATA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 7 8 16026 CASAVA_Build 5 21387765 1I ATTGTTCTAA -/T TTTAAGATGG 1878 het 1878 ref 39 29 4 6 T 3 4 16027 CASAVA_Build 5 21392415 1D AGTAAAAAAA T/- GTTAGGTTTA 3070 het 3070 ref 40 23 15 4 T 1 0 16028 CASAVA_Build 5 21395340 1I ATTGTGGGGT -/G GGGGGGATGG 1876 het 874 hom 10 4 4 2 G 6 7 16029 CASAVA_Build 5 21399437 1D CCCCAGGCTG A/- AAAAAAAAAA 1255 het 1255 ref 31 20 3 8 A 12 11 16030 CASAVA_Build 5 21413602 7I ACCGTACTCC -------/TTCTAAA GAGAGTAGTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTCTAAA 0 1 16031 CASAVA_Build 5 21414485 5D CATTTCTAAA TTTAT/----- TTTATTTCTA 3070 het 459 hom 18 1 15 3 TTTAT 2 1 16032 CASAVA_Build 5 21416653 2D AAGTATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 15 0 10 6 AT 7 6 16033 CASAVA_Build 5 21422685 1I27M4I TAAAAATCTT -GGGATTTTTTCTGATGATCTATTAAAT----/GGGGTTTTTTTCTGATGATCTATTAAATTTTC TTTCTGATTA 3070 het 3070 ref 43 35 11 3 N/A 0 0 16034 CASAVA_Build 5 21423472 2I AATTTAAGAA --/GG GATACTGCAA 1865 het 1865 ref 39 30 5 4 G 1 3 16035 CASAVA_Build 5 21426811 2D GATGAAAGTC TG/-- TGCAAATTAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 TG 2 1 16036 CASAVA_Build 5 21431050 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAA 3070 het 796 hom 47 3 34 10 G 0 1 16037 CASAVA_Build 5 21431842 1I ATAGCAGGAA -/G AAAGACTATA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 G 0 1 16038 CASAVA_Build 5 21432064 4I TATTGAATAA ----/TCAC TCTCATGCGA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 TCAC 0 1 16039 CASAVA_Build 5 21435220 1D5M2D TGGGATTACA GGCATAAG/-GCTTA-- CCACTGTTCC 2316 het 2316 ref 16 11 5 0 N/A 0 0 16040 CASAVA_Build 5 21436592 1I TCTCTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 38 1 28 9 A 11 12 16041 CASAVA_Build 5 21440870 1D GTCAGTGCTT C/- CTTGAGTGTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 C 2 1 16042 CASAVA_Build 5 21445190 4I AAATAAAATT ----/AAAA AAAAAGCAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 5 9 16043 CASAVA_Build 5 21445338 2D TTCTTTCTCA CT/-- CTGTTTCCAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 8 CT 2 1 16044 CASAVA_Build 5 21452533 6D GCAAGGATGG AAATAA/------ AAATAAAATA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 AAATAA 2 1 16045 CASAVA_Build 5 21455336 1I AAAAAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 A 11 12 16046 CASAVA_Build 5 21457624 12D GGGTGGGCAA AGATATACACCT/------------ TTCATTAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 17 3 AGATATACACCT 1 0 16047 CASAVA_Build 5 21462222 3D AGTTGATTTC TGA/--- TGAGGCCTCT 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 TGA 2 1 16048 CASAVA_Build 5 21464188 2I TTCTAAACTC --/TT TTCAGAGCGC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 4 16049 CASAVA_Build 5 21466485 1D TTGTTTGGGC T/- TTTTTTTTTT 2178 het 2178 ref 21 10 5 7 T 13 12 16050 CASAVA_Build 5 21466634 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2092 het 2092 ref 21 10 7 5 T 15 14 16051 CASAVA_Build 5 21467759 3D AAAGTAAAAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 33 4 16 14 A 14 11 16052 CASAVA_Build 5 21467906 3D AGACTGAAGC AGA/--- AGAATTTCTT 3070 het 3070 ref 30 16 8 9 AGA 2 1 16053 CASAVA_Build 5 21470661 2D TATCATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 19 1 11 8 T 14 12 16054 CASAVA_Build 5 21471643 3D TATTTTCTTA TTT/--- TCATAAGAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 1 16055 CASAVA_Build 5 21473800 7D ACCATGTAAG TTAATAC/------- TTAATACGCT 3070 het 3070 ref 20 8 8 4 TTAATAC 2 1 16056 CASAVA_Build 5 21474139 12D GGCAATCTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 1621 hom 28 8 14 6 T 22 10 16057 CASAVA_Build 5 21482076 2I GGTATCTCAC --/TG TGGTTTTGAT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 TG 1 2 16058 CASAVA_Build 5 21489005 2I GCATGGATAT --/AA AACTCTTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 2 4 16059 CASAVA_Build 5 21496399 1I TTTCTATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 12 13 16060 CASAVA_Build 5 21508626 3I AATGAATACA ---/AAG AAGAACATAT 3070 het 3070 ref 67 35 20 12 AAG 1 2 16061 CASAVA_Build 5 21524999 2I CTGGCCAACA --/AT ATATATATTA 2467 het 1484 hom 11 3 7 1 AT 4 5 16062 CASAVA_Build 5 21542643 1D ATCCTGATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 9 8 16063 CASAVA_Build 5 21545210 4I AATACTTGTT ----/ATAA ATAATGAATT 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 ATAA 1 2 16064 CASAVA_Build 5 21546218 4D CCAAGCCACG CCTT/---- AAGGATTCGA 3070 hom 105 het 37 0 34 3 CCTT 1 0 16065 CASAVA_Build 5 21548997 4I23M1I CTGCTATGAA ----TGTGTATGTGTGTATATATATAT-/TGTGTGTGTATGTGTGTGTATATATATG TAAATGTGTA 1938 het 1938 ref 16 9 4 6 N/A 0 0 16066 CASAVA_Build 5 21553110 2I GTGGTTAAAC --/TT TTAGAAAGTA 3070 het 3070 ref 42 26 11 5 T 2 4 16067 CASAVA_Build 5 21554311 2I45M1I ATACATATAT --ACACACACATACACGCACAATGAATACTACACAGCTATAAAAAAT-/ACACACACACATACACGCACAATGAATACTACACAGCTATAAAAAATA AAATCATTTC 3070 het 3070 ref 48 48 7 12 N/A 0 0 16068 CASAVA_Build 5 21555426 5I ACAGAGGGAT -----/ATAAA ATGTGATTAT 3070 het 3070 ref 57 38 10 9 ATAAA 0 1 16069 CASAVA_Build 5 21556527 3D CCTCAAAACA ATT/--- ATTATTTATT 3070 het 3070 ref 52 31 19 2 ATT 3 2 16070 CASAVA_Build 5 21557176 4D CATGTCTTCA CATG/---- CAAAATGCAG 3070 het 3070 ref 42 23 13 8 CATG 1 0 16071 CASAVA_Build 5 21560125 21I TTAAATCAAG ---------------------/ATGGTGGCAATACTAAAATGA ATTCTAATAG 3070 het 3070 ref 69 40 24 10 ATGGTGGCAATACTAAAATGA 0 1 16072 CASAVA_Build 5 21560342 9I TCATTAATTA ---------/ACTCATTTT TTAACTACAG 3070 het 3070 ref 58 33 19 6 ACTCATTTT 0 1 16073 CASAVA_Build 5 21560960 26D TGTATACTAT ACACACACACACACACACACACACAC/-------------------------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 53 25 24 13 AC 22 9 16074 CASAVA_Build 5 21561462 1D TGTTTCTTGA T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 T 7 6 16075 CASAVA_Build 5 21563589 2I CTGAATAAAG --/AT ATGTGAGTGG 3070 het 3070 ref 84 40 31 13 AT 1 2 16076 CASAVA_Build 5 21563670 4I TCTCTCTGTT ----/AAAA TGTCCTCAGA 3070 het 3070 ref 102 50 44 8 A 0 4 16077 CASAVA_Build 5 21563972 2D GCAGATACTA AG/-- AAGAAAATTC 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 AG 1 0 16078 CASAVA_Build 5 21564569 5I CCATTATGAG -----/TGGAC TGGACTATAA 3070 het 3070 hom 64 26 27 11 TGGAC 1 2 16079 CASAVA_Build 5 21564857 5D AGTTAGCACC CTCTT/----- CTCTTCTCTT 3070 het 3070 ref 88 43 35 13 CTCTT 3 2 16080 CASAVA_Build 5 21565062 1D GTGACTCTTA C/- ATCTGTGACT 3070 het 3070 ref 71 33 30 8 C 1 0 16081 CASAVA_Build 5 21565139 2D TGGCTTCTTT TG/-- TGTCTTTAAG 3070 het 3070 ref 83 54 21 8 TG 2 1 16082 CASAVA_Build 5 21565218 1D TTAAACGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 905 hom 84 4 61 19 T 13 12 16083 CASAVA_Build 5 21566008 5D ATTCTGTAAG AAATA/----- AAATTAATTA 3070 het 3070 hom 55 25 28 6 AAATA 1 0 16084 CASAVA_Build 5 21566123 17I TATTAAAAAT -----------------/AATAGGCAAACAGATTA TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 43 23 20 0 AATAGGCAAACAGATTA 0 1 16085 CASAVA_Build 5 21566916 1I CCCTTTTCTT -/C CAAAATAAAT 3070 het 3070 ref 66 31 29 6 C 1 2 16086 CASAVA_Build 5 21569066 7D TATTGAATGT TAATAGC/------- TAATAGCAAA 3070 het 3070 ref 65 31 23 14 TAATAGC 2 1 16087 CASAVA_Build 5 21569457 1D TGGCAACTCA G/- GGGCAGAAAC 3070 het 3070 ref 90 41 39 10 G 4 3 16088 CASAVA_Build 5 21570003 2I CAGGTGTGTC --/TG TGTCACAAAC 3070 het 3070 ref 101 46 42 13 TG 1 2 16089 CASAVA_Build 5 21570182 2I CCCAACGCGA --/AG AGAGACTCCT 3070 het 3070 ref 83 38 35 10 AG 2 3 16090 CASAVA_Build 5 21570764 5D GCAGAATTGA TCGAG/----- TGGGCGAAAG 3070 het 3070 hom 64 26 31 7 TCGAG 1 0 16091 CASAVA_Build 5 21571492 2D GTATAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 55 23 21 12 A 12 10 16092 CASAVA_Build 5 21571837 1I AATTTTCGTA -/C CGCATTTTAA 3070 het 3070 hom 72 26 40 6 C 1 2 16093 CASAVA_Build 5 21572290 6D GTTTATAACA ATAAGC/------ TGGCTGCAGT 3070 het 3070 ref 42 29 11 2 ATAAGC 1 0 16094 CASAVA_Build 5 21572767 5I AAAGATAATA -----/AAATT AAATTAAAAG 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 AAATT 1 2 16095 CASAVA_Build 5 21573137 4I TGAAACAATT ----/AAGG AAGAATTAAT 3070 het 3070 ref 87 34 36 17 AAGG 0 1 16096 CASAVA_Build 5 21574405 1I5M3D TATTTATGGT -AAGTGGAT/GAAGTG--- TTATTTGATA 3070 het 3070 ref 70 36 31 6 N/A 0 0 16097 CASAVA_Build 5 21575373 2I ACAGAAAGAC --/TA ATACTGCCTG 3070 het 3070 hom 87 39 42 6 TA 0 1 16098 CASAVA_Build 5 21575660 1D TTCTCACAGC A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 83 48 28 8 A 7 6 16099 CASAVA_Build 5 21575800 1I TTAATAAAAG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 89 het 56 0 28 28 A 7 8 16100 CASAVA_Build 5 21576022 4I60M5D TCTGTTAAAT ----TTTGTCACCCTCCATGAAACATTTTACATTAAAGTAATACTAGACCATTTTAAGCAGAAGAGAAA/TTTGTTTGTCACCCTCCATGAAACATTTTACATTAAAGTAATACTAGACCATTTTAAGCAGAAG----- TTCCTTTTAT 3070 het 3070 ref 75 55 24 24 N/A 0 0 16101 CASAVA_Build 5 21576126 2D TATGAAAAAG AA/-- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 55 27 12 17 A 10 8 16102 CASAVA_Build 5 21578212 2D28M4D TTACACAAAC TTATACTGAGGAAAGTGTGACAAAATATTTTAAA/--ATACTGAGGAAAGTGTGACAAAATATTT---- TAATTATTTT 3070 het 3070 ref 51 36 29 6 N/A 0 0 16103 CASAVA_Build 5 21580473 2D GACCAGAACA AT/-- ATAGTACAAT 3070 het 3070 hom 92 39 42 13 AT 2 1 16104 CASAVA_Build 5 21581024 5D TGCATTTACA TATGT/----- ATTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 80 49 28 9 TATGT 1 0 16105 CASAVA_Build 5 21584975 1D18M1I AGTCACTGAG ATTTTTTTGCTATTAAAAA-/-TTTTTTTGCTATTAAAAAT TAAAAACATC 3070 het 3070 hom 75 38 43 6 N/A 0 0 16106 CASAVA_Build 5 21585357 1D ATTTAAAAGA T/- TTTTAAGATA 3070 het 3070 hom 74 25 47 2 T 5 4 16107 CASAVA_Build 5 21585965 4I TTTTGAAGAT ----/AAAG GATGTAGTTG 3070 het 3070 hom 77 30 37 10 AAAG 0 1 16108 CASAVA_Build 5 21586678 2I12M2I54M6I GAACTTAAAG --TATAATAAAAAA--AAATATTTGGTTTCATAAGGAAAGCATCAAAATAATCAAAAGAAATTATTAAAA------/TATATAATAAAAAAAGAAATATTTGGTTTCATAAGGAAAGCATCAAAATAATCAAAAGAAATTATTAAAATTAAAC TATTCTTGCA 3070 het 3070 ref 38 46 18 27 N/A 0 0 16109 CASAVA_Build 5 21587189 5I AGATTCTGGA -----/TTTTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 84 38 24 22 T 9 14 16110 CASAVA_Build 5 21587561 1D GTGAAATGAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 85 43 31 11 A 9 8 16111 CASAVA_Build 5 21587679 3I AGAAAAAGGA ---/CTC CTCTGTAAAA 3070 het 3070 hom 91 18 61 14 CTC 1 2 16112 CASAVA_Build 5 21589619 3D CACTACATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 989 het 989 ref 41 19 10 12 T 14 11 16113 CASAVA_Build 5 21590227 5I CTGTGTTTTC -----/TTTTA TAATTTTTCT 3070 het 3070 ref 64 31 27 6 TTTTA 0 1 16114 CASAVA_Build 5 21591069 4I TAATCATAAT ----/TAAA TAAGTAAACA 3070 het 3070 hom 77 32 37 8 TAAA 0 1 16115 CASAVA_Build 5 21591172 8I GCTGTTTATT --------/TTTTGTTC TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 80 36 38 6 TTTTGTTC 0 1 16116 CASAVA_Build 5 21591783 1I CTCTTAACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 52 30 16 7 A 9 10 16117 CASAVA_Build 5 21591828 1D ATGAAAAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 47 25 13 9 A 9 8 16118 CASAVA_Build 5 21591988 4D32M1I GAGAAAAAAA GATGAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAGAGAACATT-/----AAAATGAAAAGAACAAAACAAAAGAGAATATTA AAAGAGCTGT 3070 het 3070 ref 52 36 24 15 N/A 0 0 16119 CASAVA_Build 5 21592856 2D AAATTAATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 74 17 31 27 T 16 14 16120 CASAVA_Build 5 21593369 2D CCACTCCTTG CA/-- AGAGGGAGTG 3070 het 3070 ref 80 51 14 18 CA 1 0 16121 CASAVA_Build 5 21594075 5D TCCGTTGGTT GTTTA/----- GTTTATTCCT 3070 het 3070 ref 71 31 32 12 GTTTA 2 1 16122 CASAVA_Build 5 21594907 4I TCACCTCAAC ----/ACAA ACAGAGTTTT 3070 het 3070 ref 75 36 28 11 ACAA 0 1 16123 CASAVA_Build 5 21597942 1D TAGTATCTAC A/- AAAAATTATA 3070 het 3070 ref 47 23 21 4 A 6 5 16124 CASAVA_Build 5 21598763 2I TGCTTAACTC --/AA GAGAAAGTTA 3070 het 3070 ref 88 53 30 7 A 0 2 16125 CASAVA_Build 5 21600073 2D AAGGAGCCTT TC/-- TCTGCCTGAA 3070 het 3070 ref 74 38 29 8 TC 2 1 16126 CASAVA_Build 5 21600308 4D TTTCACACTT AAAA/---- AAAAATCTGT 3070 het 3070 ref 85 40 40 6 A 9 5 16127 CASAVA_Build 5 21602207 1I68M4I ACATGTGTCC -TTTTTATATAGCTTCTTTTAATTAACATGTTTTGGCAGTACATCCATGTTATACATGTCTCAGTAATT----/TTTTTTCTATAGCTTCTTTTAATTAACATGTTTTGGCAGTACATCCATGTTATACATGTCTCAGTAATTAATG TCTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 87 83 27 33 N/A 0 0 16128 CASAVA_Build 5 21602337 4D TCACATTTTG TCTA/---- TCTATTTAAC 3070 het 3070 ref 88 49 28 16 TCTA 2 1 16129 CASAVA_Build 5 21603243 2D51M1I ACAATACATG TTTTTTTTTTTTAATGCCCAAAGTGTTTTAATTTTGATGAAATACAACTATCT-/--TTTTTTTTTTAATGTCCAAAGGGTTTCAATTTTGATGAAATACAACTATCTG GTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 64 24 39 44 N/A 0 0 16130 CASAVA_Build 5 21603871 1I ACATCTTAAT -/A AAATATGAAG 3070 het 3070 hom 62 24 31 7 A 3 4 16131 CASAVA_Build 5 21604055 2D ACTATCATAG TT/-- TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 57 19 31 8 T 8 6 16132 CASAVA_Build 5 21605125 2D GAATCTTCTC CT/-- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 63 27 27 9 CT 1 0 16133 CASAVA_Build 5 21605252 6D38M1D CATTTTTAAA CTTTATCTTTATTATTTCATTCCTTCTGGGAGCTTTGGGTCTCAT/------CTTTATTATTTCATTCCTTCTGGGAGGTTTGGGTCTCA- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 49 44 13 19 N/A 0 0 16134 CASAVA_Build 5 21606684 1I TTTCTTTTTT -/G TTTTCTTACA 1014 het 1014 ref 74 65 7 2 G 0 1 16135 CASAVA_Build 5 21608955 8I AATCACTTTT --------/ATATGCAC ATATGCACTG 3070 het 3070 ref 83 47 30 7 ATATGCAC 1 2 16136 CASAVA_Build 5 21614792 1D GATGTTTTTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 2862 hom 18 7 10 1 T 8 7 16137 CASAVA_Build 5 21626448 3I GTTGTTGTTG ---/TTT GTTTGTTTTT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 T 0 3 16138 CASAVA_Build 5 21631818 3D TCTTTTTAAA TCT/--- TCTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 35 17 18 0 TCT 2 1 16139 CASAVA_Build 5 21639014 1I TAATGTTATA -/T GCAAATATAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 0 1 16140 CASAVA_Build 5 21649695 1D AAAAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 8 8 T 13 12 16141 CASAVA_Build 5 21710595 2D AGCTAATTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 27 het 30 1 22 8 TG 8 7 16142 CASAVA_Build 5 21736329 1D GTTAGGGACT A/- AAAGAGTCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 3 16143 CASAVA_Build 5 21740663 1D TCCGCTTGGA T/- TCCCACAAAA 3070 hom 147 het 58 0 49 9 T 2 1 16144 CASAVA_Build 5 21756619 1I ATTTCTTGCA -/T TTAATTTTTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 3 16145 CASAVA_Build 5 21786808 5I GAGGAATATT -----/TTTTC TTTTCTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TTTTC 1 2 16146 CASAVA_Build 5 21787125 2D AGACGGTGTC TT/-- TGTTTTATGT 3070 hom 135 het 49 0 46 4 T 3 1 16147 CASAVA_Build 5 21817591 1I CTATTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 A 13 14 16148 CASAVA_Build 5 21820963 4I ATATTATAAC ----/TGTT AGGGTGATCT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TGTT 0 1 16149 CASAVA_Build 5 21823285 4I GTTTTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTTGC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 TTTG 1 2 16150 CASAVA_Build 5 21827549 1D GATTGTTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 12 11 16151 CASAVA_Build 5 21828465 2D TCCTCTGCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 40 6 10 24 T 20 18 16152 CASAVA_Build 5 21831078 1I ATAAATGTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 8 9 16153 CASAVA_Build 5 21832252 1I ACTGAAGGGG -/A AAAAAGGAAT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 A 5 6 16154 CASAVA_Build 5 21847576 4I TAGGACAAGC ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 35 0 24 11 T 14 18 16155 CASAVA_Build 5 21850727 3D TGTTGGAGAC CTT/--- CTTAGGGAAA 3070 het 3070 hom 17 7 10 0 CTT 2 1 16156 CASAVA_Build 5 21853683 4D TAATAGCATT AAGA/---- AAGAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 AAGA 2 1 16157 CASAVA_Build 5 21854133 2D AATTTTAGTT AC/-- ACATTTGTGG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AC 2 1 16158 CASAVA_Build 5 21858084 30D TAGTTAACTT TTATAATATTTGTATATTATAATATTTGTA/------------------------------ TATAATATTT 3070 hom 72 het 20 0 25 2 TTATAATATTTGTATATTATAATATTTGTA 1 0 16159 CASAVA_Build 5 21881422 1D CACTTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1127 hom 36 8 10 19 T 17 16 16160 CASAVA_Build 5 21882293 3D AACCTTGGGG TTC/--- ATTATCCCAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTC 1 0 16161 CASAVA_Build 5 21891440 9D TGAGTTCAGA ACAAAGTGT/--------- AATCAAAAGT 3070 hom 96 het 33 0 33 3 ACAAAGTGT 1 0 16162 CASAVA_Build 5 21909741 22I AGAACATGCG ----------------------/GTATTTGGTTTTCTGCTCCTGC GTTACTTTTC 3070 hom 51 het 23 0 17 6 GTATTTGGTTTTCTGCTCCTGC 0 1 16163 CASAVA_Build 5 21912597 1D GTAAATTTAA T/- TTTGTCCACA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 4 3 16164 CASAVA_Build 5 21918582 4D GCTTCAAGGT GTAG/---- GTAGACCTTT 3070 hom 63 het 22 0 18 6 GTAG 2 1 16165 CASAVA_Build 5 21923779 1D CAATACTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 83 het 42 0 30 12 T 10 9 16166 CASAVA_Build 5 21924463 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 8 7 16167 CASAVA_Build 5 21930884 1I AAATAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 535 hom 41 3 29 9 A 13 14 16168 CASAVA_Build 5 21932537 3I AGAATCAAGT ---/AAG AAGACTGACA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAG 1 2 16169 CASAVA_Build 5 21934751 1D CATGGAAGTT A/- AAACAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 4 3 16170 CASAVA_Build 5 21937787 2D ATTGTATAAC AG/-- ATACTCTATG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AG 1 0 16171 CASAVA_Build 5 21940646 4D GTGTCTCTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 38 0 28 11 AAAC 4 3 16172 CASAVA_Build 5 21941613 2D CATCAATTAC TA/-- TGTTTAAAGT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 TA 1 0 16173 CASAVA_Build 5 21951820 3I GCCTTCATAC ---/TTT TTTTAATTAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 7 16174 CASAVA_Build 5 21952376 1D CATTTTTTCC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 30 1 24 5 A 1 0 16175 CASAVA_Build 5 21954023 2D GATTTTTCAC AT/-- GTTTCACTGT 3070 hom 78 het 27 0 27 3 AT 1 0 16176 CASAVA_Build 5 21961808 1I TGCTTTTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 278 hom 27 1 22 4 A 10 11 16177 CASAVA_Build 5 21963294 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 27 3 A 11 12 16178 CASAVA_Build 5 21981851 1D TCTGGAAATG A/- AAAAAAAAAA 1357 het 1357 ref 45 34 3 9 A 11 10 16179 CASAVA_Build 5 21986225 4D ACTATAAATA AATT/---- AAGATGGAAA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 AATT 1 0 16180 CASAVA_Build 5 22043324 1I CAACTTTTTT -/G TTAGTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 G 0 1 16181 CASAVA_Build 5 22048150 5D ACTTTAACTC TAATA/----- TAATTGTTGT 3070 het 3070 ref 28 18 10 4 TAATA 1 0 16182 CASAVA_Build 5 22061867 2I TCAACCACTC --/AA AGTCATCTGT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 1 3 16183 CASAVA_Build 5 22067789 4D AAAACGTGAC ACAA/---- ACACACAAAG 3070 het 3070 ref 27 17 9 5 ACAA 1 0 16184 CASAVA_Build 5 22068574 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1130 het 492 hom 9 1 4 4 A 12 13 16185 CASAVA_Build 5 22115766 1I ATGCAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 11 12 16186 CASAVA_Build 5 22116034 1I AACTAAAATC -/A AAATCAATGC 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 A 3 4 16187 CASAVA_Build 5 22121042 1D GCAGGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 T 11 10 16188 CASAVA_Build 5 22125721 1D GGGAAATTTT A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 A 7 6 16189 CASAVA_Build 5 22139203 1I ACATTGAACT -/G TAAGACCTGA 3070 het 3070 ref 70 35 25 10 G 0 1 16190 CASAVA_Build 5 22141125 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 693 hom 14 2 9 3 T 8 9 16191 CASAVA_Build 5 22147960 4I TGCTCTGCTA ----/TTTG TTTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 TTTG 1 2 16192 CASAVA_Build 5 22153684 1I ATCCTATGTG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 7 8 16193 CASAVA_Build 5 22176316 4D GTAAAAAGAG AAGT/---- AAGTTTCCTT 3070 het 3070 hom 32 16 14 4 AAGT 2 1 16194 CASAVA_Build 5 22181908 1D ACACTTTACC A/- AAATATGATT 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 A 4 3 16195 CASAVA_Build 5 22186392 2I TATATATAGA --/AC ACACACACAC 3070 het 465 hom 17 1 13 3 AC 7 8 16196 CASAVA_Build 5 22189976 1I GTGTAATGAC -/A AAAAAAATTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 8 16197 CASAVA_Build 5 22193454 1I ATAAAATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 82 het 36 0 28 8 A 9 10 16198 CASAVA_Build 5 22211461 1D GGTGTTAATT A/- AAAAGAATAG 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 5 4 16199 CASAVA_Build 5 22219887 1D CCCTAGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 7 6 A 13 12 16200 CASAVA_Build 5 22224997 1D TAAATTAACA T/- TTTCCAACTT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 4 3 16201 CASAVA_Build 5 22252718 1I AGTTTTCTAA -/C CCGAAGCCAT 1881 het 1881 ref 34 28 4 2 C 2 3 16202 CASAVA_Build 5 22256278 2D TATTTTTGAC AT/-- ATAAATTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 6 AT 2 1 16203 CASAVA_Build 5 22256464 10I AAGCTTGAGA ----------/AAATGAATAG AAGGGATAAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AAATGAATAG 0 1 16204 CASAVA_Build 5 22260271 1D TCAGGTGCAT C/- CTGCATGAGG 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 C 2 1 16205 CASAVA_Build 5 22260690 3D ATTTACACAT AAA/--- AATTATTATA 3070 het 3070 hom 21 8 9 5 A 5 2 16206 CASAVA_Build 5 22264666 1D ATTATGTTCT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 8 7 16207 CASAVA_Build 5 22265227 1I TGCCTTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 10 11 16208 CASAVA_Build 5 22270488 2D CACTAATACA CT/-- GCCTTAGAGC 3070 het 3070 hom 35 13 16 8 CT 1 0 16209 CASAVA_Build 5 22271445 1D AGACTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 21 0 10 12 A 13 12 16210 CASAVA_Build 5 22283185 1I AATGAAGCCT -/G AGTAAAGCTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 0 1 16211 CASAVA_Build 5 22283539 1I AGACTCCGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 9 10 16212 CASAVA_Build 5 22285740 1I TATTCACTCA -/T TTTTTGTGTT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 5 6 16213 CASAVA_Build 5 22289070 3D TTATAAAGTA ATT/--- ATGACATTTT 3070 het 3070 ref 38 25 13 1 ATT 1 0 16214 CASAVA_Build 5 22313499 17I GGGAGTTCCA -----------------/ACCTGAGGTTGGGTCAG GACCAGCCTG 3070 hom 42 het 21 0 18 3 ACCTGAGGTTGGGTCAG 0 1 16215 CASAVA_Build 5 22317859 22D AGCTACAGTA ACCAAAACTGCATGATACTGGT/---------------------- ACCAAAACTG 3070 hom 39 het 22 0 14 12 ACCAAAACTGCATGATACTGGT 2 1 16216 CASAVA_Build 5 22320817 1I AGAAGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 A 12 13 16217 CASAVA_Build 5 22332858 1D TTCTTTCTTT C/- TTTTTTAATT 3070 hom 117 het 42 0 39 4 C 1 0 16218 CASAVA_Build 5 22334417 1I CATTTTTATC -/T CCTAATATCA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 0 1 16219 CASAVA_Build 5 22336930 1I TGAAGGTATT -/A AAAAATTGTG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 5 6 16220 CASAVA_Build 5 22340976 1I TCTATAACAT -/A AAACATATAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 4 16221 CASAVA_Build 5 22341404 4I ATGACCCATC ----/TTCA TTCAGATGGT 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 TTCA 1 2 16222 CASAVA_Build 5 22344845 2D GAGAGAAAGC GA/-- GAGAGAGATG 3070 het 3005 hom 33 14 16 3 GA 5 4 16223 CASAVA_Build 5 22352093 1I ATGCTAAGAG -/T TTTTTTTTTT 2732 het 2732 ref 38 23 7 8 T 13 14 16224 CASAVA_Build 5 22361438 1I AATCATTTCT -/C TTGTGTAAGT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 0 1 16225 CASAVA_Build 5 22362095 1I CAGTTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2990 hom 32 8 13 11 T 12 13 16226 CASAVA_Build 5 22377797 1D GGGCTACTAT A/- AAAAAAAAAC 1260 het 1260 ref 51 41 3 8 A 10 9 16227 CASAVA_Build 5 22388331 1D GGCAAAATAA T/- TACAAAGAAA 3070 het 3070 hom 33 9 21 4 T 2 1 16228 CASAVA_Build 5 22391039 1D TCATAATGAC T/- GTCATTACTA 3070 hom 132 het 50 0 45 6 T 1 0 16229 CASAVA_Build 5 22391389 3D TTAAAAAAAA AAT/--- ATATATATAT 3070 hom 42 het 16 0 14 3 AAT 1 0 16230 CASAVA_Build 5 22394200 1I ACTTGAACCC -/G GGAGGCGGAG 3070 hom 69 het 24 0 22 2 G 2 3 16231 CASAVA_Build 5 22400173 2D AAGAAAAGAC AA/-- TGCTTTCATG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 2 0 16232 CASAVA_Build 5 22404677 2I CTTAGGGTGT --/GA GAGCTACCAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 GA 1 2 16233 CASAVA_Build 5 22416405 1D TAACAAATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 10 9 16234 CASAVA_Build 5 22418962 1I CCTCGCAAAG -/T GCTGGGATTA 3070 hom 33 het 16 0 11 5 T 0 1 16235 CASAVA_Build 5 22425661 3D CTACAGGCGC CCA/--- CCACCACGCC 1666 het 458 hom 7 1 4 2 CCA 3 2 16236 CASAVA_Build 5 22442871 4D GGCTATGGTC ACTT/---- ACTTAATTCT 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 ACTT 2 1 16237 CASAVA_Build 5 22443397 1I TAAAAGATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 9 10 16238 CASAVA_Build 5 22444114 4D TCAAGAAATC ATAG/---- ATAGAGTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 15 7 ATAG 2 1 16239 CASAVA_Build 5 22444715 1I ATTTTCCCCC -/T ATGATGGTGG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 0 1 16240 CASAVA_Build 5 22466691 1I TAGAAACTAC -/T TTTTTTTTTT 1077 het 1077 ref 48 39 3 6 T 11 12 16241 CASAVA_Build 5 22480406 1I TTTTTAACAG -/T TTTTTTTTTT 2341 het 2341 ref 39 19 8 12 T 15 16 16242 CASAVA_Build 5 22506730 2D ACCTTAGCGC TT/-- TTTTTTTTTT 1802 het 1744 hom 19 7 6 6 T 14 12 16243 CASAVA_Build 5 22506966 3I TCTAGGATAA ---/TCT TCTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 TCT 1 2 16244 CASAVA_Build 5 22522910 1I TACATACGGC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 50 26 15 9 T 7 8 16245 CASAVA_Build 5 22529444 1D TTTTGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1600 hom 20 5 12 3 T 11 10 16246 CASAVA_Build 5 22542156 1D TACCTATTCT C/- CCCATTTGTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 C 4 3 16247 CASAVA_Build 5 22559849 2I TTATTATTAT --/TA TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 20 1 13 6 TA 0 1 16248 CASAVA_Build 5 22570059 1I TCTTTACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 18 2 T 10 11 16249 CASAVA_Build 5 22579771 1D TGTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1256 het 1256 ref 39 24 3 12 T 11 10 16250 CASAVA_Build 5 22614253 1D TTGTGTGTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 G 10 9 16251 CASAVA_Build 5 22627843 1I ACCATGTGAA -/C CCCTAAGTCA 3070 hom 147 het 54 0 49 5 C 3 4 16252 CASAVA_Build 5 22630676 1D TGCTGAGGGG A/- AAAAATACAA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 6 5 16253 CASAVA_Build 5 22637267 1D CTGGGATTAG A/- AAAAAATAAC 3070 hom 89 het 37 0 30 7 A 7 6 16254 CASAVA_Build 5 22640939 2I CTTTCAGTAA --/AC AGACTACCCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AC 0 1 16255 CASAVA_Build 5 22650343 10D7M1D10M3D15M3D2M2D GATAAAGAAG TTGCAGGATTGCAATGGTCGTAAGGTGCTCATGTGGAAAGAGATGAGTTAATT/----------ACAGTGG-AGAAAGGAAC---TGTGGAAACATCTGA---AA-- TGTGGAAACA 3070 het 3070 ref 29 32 16 5 N/A 0 0 16256 CASAVA_Build 5 22658556 1I GTAGCCTACC -/A ACCAAAAAAA 2762 hom 21 het 8 0 8 0 A 1 2 16257 CASAVA_Build 5 22667323 1I TTGCAGCCTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 75 hom 34 1 29 4 A 8 9 16258 CASAVA_Build 5 22697838 4D ACCATAATTC TTTG/---- TTTCTTTGTT 3070 het 3070 ref 29 16 11 4 TTTG 1 0 16259 CASAVA_Build 5 22699695 2I TTACAATAAC --/AT AATTATATAT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 AT 0 1 16260 CASAVA_Build 5 22703037 3D GTCCCCAAAT TTC/--- TTCTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 TTC 2 1 16261 CASAVA_Build 5 22703828 1D ATAAGGAGGG A/- AAAAACATTT 3070 het 3070 ref 47 26 20 1 A 6 5 16262 CASAVA_Build 5 22705767 1D TCAAAACTAT G/- AAGTAGTGAG 3070 het 3070 ref 54 25 21 9 G 1 0 16263 CASAVA_Build 5 22706968 2D TTTTTATAAC TT/-- TACTGAGGAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 3 1 16264 CASAVA_Build 5 22707310 1D CTACTGGCAC T/- TGGAATAGGG 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 T 2 1 16265 CASAVA_Build 5 22712693 1I ACTTCTTTGA -/G GGGGGAAAAC 3070 het 2633 hom 26 9 13 4 G 5 6 16266 CASAVA_Build 5 22728690 1D CTTTTTTTTT C/- CTGAATAAAC 3070 het 3070 ref 45 23 17 7 C 2 1 16267 CASAVA_Build 5 22728885 1I TTTTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 568 het 568 ref 32 20 3 9 T 13 14 16268 CASAVA_Build 5 22729625 2D TTATTGAATT TA/-- TATATATATA 3070 het 2475 hom 28 6 17 7 TA 6 5 16269 CASAVA_Build 5 22730587 6D TCCACCCCTT GTACAC/------ GTCTTTCAAT 3070 het 3070 hom 20 9 10 3 GTACAC 1 0 16270 CASAVA_Build 5 22746940 4D TTACGCAGTG TTTT/---- TATCCTAGTA 3070 het 3070 ref 52 25 22 6 T 5 1 16271 CASAVA_Build 5 22748364 1D GGATCATTTC T/- ATAGGATAAC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 T 1 0 16272 CASAVA_Build 5 22749452 4D TACACACTGC GTAA/---- GTGTTTTCAA 3070 het 3070 ref 54 38 12 6 GTAA 1 0 16273 CASAVA_Build 5 22751666 17D GATCCCATCT AAAAAAAAAAAAAAAGA/----------------- AAAAAAAGAA 2255 het 1769 hom 18 7 8 6 AAAAAAAAAAAAAAAGA 1 0 16274 CASAVA_Build 5 22752478 1D CTGAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 9 8 A 13 12 16275 CASAVA_Build 5 22760127 1I AATTGTTTTT -/G GGGGTACAGG 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 G 4 5 16276 CASAVA_Build 5 22775162 1I21M3I22M1I ATATACAACA -TTTTTGAATTTAAAAATTTTA---CTTTTTTTTACTTACATTAAAG-/TTTTTTGAATTTAAAAAATTTATTTTTTTTTTTTACTTACATTAAAGA AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 27 22 8 5 N/A 0 0 16277 CASAVA_Build 5 22787206 2D TATAATATAC AT/-- ATATATATAT 1944 het 1944 ref 15 6 6 3 AT 9 8 16278 CASAVA_Build 5 22790436 5D GAAAGCAGAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 2324 hom 49 18 16 17 A 16 11 16279 CASAVA_Build 5 22798499 1I GAACTAAGAT -/C CGTTGGGTCA 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 C 1 2 16280 CASAVA_Build 5 22805645 3D ACAATACAAA TAG/--- TATTTTCTTA 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 TAG 1 0 16281 CASAVA_Build 5 22807372 3D GATGGGGATA AAC/--- ATCATGATCA 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 AAC 1 0 16282 CASAVA_Build 5 22810597 4D CTTTTTCTGT ATAA/---- ATTAACCAGT 3070 het 3070 ref 32 13 10 10 ATAA 1 0 16283 CASAVA_Build 5 22815266 1D TATATACACT A/- AAAAAAATGC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 8 7 16284 CASAVA_Build 5 22831447 11D ATATAATATA TACATATATAT/----------- TATACACACA 3070 hom 87 het 31 0 30 4 TACATATATAT 1 0 16285 CASAVA_Build 5 22832944 1D TGTCACGCTC A/- AATTCCTATG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 3 2 16286 CASAVA_Build 5 22833678 4D TTTTGAATTC CTTA/---- CTATTTGTGT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 CTTA 1 0 16287 CASAVA_Build 5 22848739 1I ATACAGCATA -/G ATGACCACTG 3070 het 3070 hom 39 11 24 4 G 0 1 16288 CASAVA_Build 5 22861165 3D GAAAAAGGAG ACA/--- ACAAATTAGA 3070 het 3070 ref 40 19 18 5 ACA 2 1 16289 CASAVA_Build 5 22882816 1D TTTTTTAATA C/- CGTTGTTAAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 C 2 1 16290 CASAVA_Build 5 22884856 1I TCAAAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 22 11 T 10 11 16291 CASAVA_Build 5 22891466 1I TTGTGCGCAC -/T TCTATCAGCA 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 1 2 16292 CASAVA_Build 5 22893018 1I TTTCCCAAGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 A 8 9 16293 CASAVA_Build 5 22897646 1I GTGTGATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 18 12 A 11 12 16294 CASAVA_Build 5 22911135 2D ATTTTTAATT AA/-- AAAAATTATT 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 A 7 5 16295 CASAVA_Build 5 22928200 4I TAAAATGAAA ----/TTGT TTGTTTTAAG 3070 het 3070 ref 56 30 23 3 TTGT 1 2 16296 CASAVA_Build 5 22935600 3I GGGGAAAAAA ---/AAG AAGAACTATT 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 AAG 1 2 16297 CASAVA_Build 5 22937490 1I TGAATCCAGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 8 9 16298 CASAVA_Build 5 22941289 2I TTTCTAAATT --/TC TCTTTGTTAC 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 TC 1 2 16299 CASAVA_Build 5 22952754 3D CAATTTACAT AAG/--- AAGGAGATTT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 AAG 2 1 16300 CASAVA_Build 5 22977123 1D GCTTCTCAGA T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 T 7 6 16301 CASAVA_Build 5 23006733 2D GGGGAGTAGC AG/-- AGTCAGGGAC 3070 het 3070 ref 48 25 18 7 AG 2 1 16302 CASAVA_Build 5 23009376 1D AGGGTCAATG T/- TGCCAGTCAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 T 2 1 16303 CASAVA_Build 5 23010090 1I CTAATTTTTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 8 9 16304 CASAVA_Build 5 23012650 1D CTTTGTGCAT C/- TAAAATCCTT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 C 1 0 16305 CASAVA_Build 5 23012927 1I AATATGTAGG -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 T 6 7 16306 CASAVA_Build 5 23013069 1D ACACCGTGGT A/- AGTACCTTTT 1318 het 1318 ref 19 12 4 3 A 2 1 16307 CASAVA_Build 5 23028785 1I TATCCAAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 9 10 16308 CASAVA_Build 5 23030441 1I ATTCCTAGGG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 8 9 16309 CASAVA_Build 5 23030881 1D TCTCCTTGTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 8 7 16310 CASAVA_Build 5 23031782 1D TGAAAAGGCA T/- TGATAGAATT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 2 1 16311 CASAVA_Build 5 23035879 1D CTTTTATTGT A/- GAGTGTTAAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 1 0 16312 CASAVA_Build 5 23056064 1D CTGGACTAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2914 hom 29 9 15 5 T 10 9 16313 CASAVA_Build 5 23064322 1I CTCAAATATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 9 10 16314 CASAVA_Build 5 23065756 1I ATACCTCCAA -/C TGCCTAACAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 C 0 1 16315 CASAVA_Build 5 23071483 3D TTAGTCTGTT CTC/--- GCACTGCTAA 3027 het 3027 ref 24 15 7 3 CTC 1 0 16316 CASAVA_Build 5 23076321 3I ATGACAAAAT ---/ATA ATGCCTATAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 ATA 0 1 16317 CASAVA_Build 5 23077156 1I CTCCGTTTTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 T 7 8 16318 CASAVA_Build 5 23077385 7D TCCACCTACT TATTATC/------- TATGGTTAGA 3070 het 3070 hom 24 11 13 2 TATTATC 1 0 16319 CASAVA_Build 5 23078872 4D TATTGGCTGT CAGA/---- CAATTTGCTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 CAGA 1 0 16320 CASAVA_Build 5 23080653 1I TCTATAAAAA -/T AAGTATTTGT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 0 1 16321 CASAVA_Build 5 23081494 1I CAGGCTAACA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 6 7 16322 CASAVA_Build 5 23089284 1D ATTGTTTAAT A/- AAAAACAACT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 5 16323 CASAVA_Build 5 23095445 3I AGTTTAATAC ---/ATA ATAACTAGAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 ATA 1 2 16324 CASAVA_Build 5 23103828 1I AATGTAAGTT -/A AAAACCATAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 4 5 16325 CASAVA_Build 5 23104249 9I GTGAAAGGAA ---------/GCGTCAAGT GCAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 GCGTCAAGT 0 1 16326 CASAVA_Build 5 23110321 1D GTGAGCAGAG A/- TTGCACCATT 3070 het 2153 hom 20 5 14 1 A 1 0 16327 CASAVA_Build 5 23121773 1D CATTTCCACA T/- TTCCTTCATT 3070 het 3070 hom 54 24 27 3 T 3 2 16328 CASAVA_Build 5 23131691 11D GATCATGCCA CCACACTCCAG/----------- CCTGGGCGAC 3070 het 3070 ref 36 17 16 8 CCACACTCCAG 1 0 16329 CASAVA_Build 5 23136631 2D AGTCCATGAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 46 17 16 14 TC 10 9 16330 CASAVA_Build 5 23138547 1I AGGTCCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 T 10 11 16331 CASAVA_Build 5 23142491 1I TAGTCAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 A 10 11 16332 CASAVA_Build 5 23169540 1I AATTAAAGGT -/A AAAAAAAAAT 3055 het 3055 ref 23 10 7 6 A 9 10 16333 CASAVA_Build 5 23184289 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 6 A 7 6 16334 CASAVA_Build 5 23199962 1D CTCAAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 14 11 T 12 11 16335 CASAVA_Build 5 23223675 8I GAGAAGAGCA --------/TAATTGTC ACCCCAAGAC 1823 het 1823 ref 10 5 4 1 TAATTGTC 0 1 16336 CASAVA_Build 5 23228757 1D ATGAAATCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 26 2 24 0 A 12 11 16337 CASAVA_Build 5 23249099 1I TATTACATGG -/T TGTAAGATAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 1 2 16338 CASAVA_Build 5 23263292 1D AGCAACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 12 11 16339 CASAVA_Build 5 23270603 1D TTTTGTGTCA T/- TTTTATCTAA 3070 het 3070 ref 44 25 16 5 T 5 4 16340 CASAVA_Build 5 23273734 2D AAGAGTGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 1799 het 1225 hom 22 5 7 11 CT 2 1 16341 CASAVA_Build 5 23296320 7I GTAATTGGCA -------/TTACATT ACATTAGTTG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TTACATT 0 1 16342 CASAVA_Build 5 23334408 1I TTACAGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 27 1 24 2 T 10 11 16343 CASAVA_Build 5 23378684 2I CTATATAATA --/AT ATATATAATT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AT 3 4 16344 CASAVA_Build 5 23387175 1I CGCCTTCATA -/G GGAACAATAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 2 3 16345 CASAVA_Build 5 23389123 13I ACAGGCATGA -------------/GCCACCGCACCCG GCCAGGTTAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 GCCACCGCACCCG 0 1 16346 CASAVA_Build 5 23417252 2D ATCCTGGCTC AA/-- AAAAACTCCC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 7 5 16347 CASAVA_Build 5 23451333 1D GATTCATGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 67 het 35 0 28 7 A 10 9 16348 CASAVA_Build 5 23454177 2I TGTATATAGA --/AT ATATGATATA 2641 hom 18 het 7 0 7 0 AT 2 3 16349 CASAVA_Build 5 23477952 1D TAAAAGACAC A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 7 6 16350 CASAVA_Build 5 23498192 1D ACTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 11 10 16351 CASAVA_Build 5 23515118 3D GATACCCCAC ATT/--- ACATCTTTCG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 ATT 1 0 16352 CASAVA_Build 5 23524601 3D ATTTCAGAAC TTG/--- TTGTTGGTCT 3070 het 3070 ref 41 21 19 3 TTG 3 2 16353 CASAVA_Build 5 23526080 1I TAAAAGTCTG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 7 16354 CASAVA_Build 5 23531837 1I TCCCAGGAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 8 9 16355 CASAVA_Build 5 23532438 3D GCATGCAAGC AAG/--- AAGAACTGGC 3070 hom 48 het 18 0 17 3 AAG 2 1 16356 CASAVA_Build 5 23595664 1D TCTGTCTTAG A/- AAAAAAAAAA 2479 hom 18 het 7 0 6 1 A 11 10 16357 CASAVA_Build 5 23595885 2I CTATTTAAAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AC 7 8 16358 CASAVA_Build 5 23598389 1I TGAGTCACCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 288 hom 41 5 26 10 A 13 14 16359 CASAVA_Build 5 23610515 1I CCTATGCCTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 7 8 16360 CASAVA_Build 5 23612940 1I TGGTTGCTAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 A 7 8 16361 CASAVA_Build 5 23613340 1I GAACATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 11 12 16362 CASAVA_Build 5 23625881 1D ACATCTGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 A 12 11 16363 CASAVA_Build 5 23632257 1I CTCTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 12 8 T 11 12 16364 CASAVA_Build 5 23639614 1D CGCACATACA C/- CCCCCCATAT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 C 7 6 16365 CASAVA_Build 5 23639863 4D CAAGATGATA CTAT/---- CTAATTCAGA 3070 het 3070 ref 22 12 9 2 CTAT 1 0 16366 CASAVA_Build 5 23640894 1I GTTTTCAGGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 396 hom 40 1 36 3 T 8 9 16367 CASAVA_Build 5 23641149 4D TTCTACACGC ATAG/---- ATACTCTAAT 3070 het 3070 ref 25 14 11 2 ATAG 1 0 16368 CASAVA_Build 5 23649524 1D GAGTTATGTC T/- TAGCAATGAG 3070 het 3070 ref 44 32 10 2 T 2 1 16369 CASAVA_Build 5 23650384 3D CCACCAGCAG CTT/--- CTACCCTGCA 3070 het 3070 ref 42 19 15 9 CTT 1 0 16370 CASAVA_Build 5 23656183 1I GAAAACTTAT -/A AAGTAGAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 2 3 16371 CASAVA_Build 5 23656596 1I CTTAGTGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 9 10 16372 CASAVA_Build 5 23657571 1I TAAAATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 11 12 16373 CASAVA_Build 5 23661358 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 11 10 16374 CASAVA_Build 5 23668666 1I ATAATACATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 70 het 28 0 24 4 A 8 9 16375 CASAVA_Build 5 23668956 2D ATATATATGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 1311 hom 25 8 14 3 GT 9 8 16376 CASAVA_Build 5 23669627 2D ATATTTATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AC 8 7 16377 CASAVA_Build 5 23672211 1I TTATAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 707 hom 36 2 31 3 A 9 10 16378 CASAVA_Build 5 23694487 1D TTTTATTTTT A/- AAAAAGAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 6 5 16379 CASAVA_Build 5 23705501 1D ATGTAAAGGC A/- AAAAAAAAAG 1051 het 1051 ref 40 31 3 6 A 10 9 16380 CASAVA_Build 5 23708833 1I ACTACATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 29 2 22 5 A 10 11 16381 CASAVA_Build 5 23711822 1D75M1I TCATTTTTAA TTTTTTTTGGTTATTTATTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGAATATTAGACCTTTGTTGAATACATAGTTTATGAATA-/-TTTTTTTGGTTATTTATTTAAGTTCCTTTTAGATTCTGAATATTAGACCTTTGTTGAATACATAGTTTGTGAATAT TTTTTTCCCA 3070 hom 211 het 49 0 71 12 N/A 0 0 16382 CASAVA_Build 5 23717191 1I TCCTATTTTA -/T TACCTGAAGA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 T 1 2 16383 CASAVA_Build 5 23718324 1I TTTTACATTA -/T TTAAAAAAAT 3070 hom 65 het 38 0 30 8 T 2 3 16384 CASAVA_Build 5 23719311 1D CTCTGATTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 8 7 16385 CASAVA_Build 5 23720722 1D TATCGAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 39 0 34 5 T 11 10 16386 CASAVA_Build 5 23725813 1D GTGACAATCA G/- GGCACCTGTG 3070 hom 47 het 19 0 16 3 G 3 2 16387 CASAVA_Build 5 23728162 4D TCATTCTTGA AGTC/---- AGTGAGACCA 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 AGTC 1 0 16388 CASAVA_Build 5 23733399 8D ATTTTCCCAC CACGCTGA/-------- CCGATCCCCT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 CACGCTGA 1 0 16389 CASAVA_Build 5 23736590 1D TCTTAGAATA T/- TTATTCCTAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 3 2 16390 CASAVA_Build 5 23736707 1D ATTGAATTTG C/- TTGTTTTTAG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 C 1 0 16391 CASAVA_Build 5 23738631 1D TAGTACATTA T/- AAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 T 1 0 16392 CASAVA_Build 5 23739304 1D CTGTGATGTC T/- GAATCTTATT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 1 0 16393 CASAVA_Build 5 23739434 1D CCTTCAAAGA T/- TTTTTTCGTT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 T 7 6 16394 CASAVA_Build 5 23743788 1I CTTATTGTTA -/C CTTACTCATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 1 2 16395 CASAVA_Build 5 23747266 13D GAAACTTGAA CTGCTGTAGCCAG/------------- CTGCTGTAGC 3070 hom 133 het 46 0 40 11 CTGCTGTAGCCAG 1 0 16396 CASAVA_Build 5 23749681 3I AAACAAAAAG ---/AGA AGAAGTTACT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AGA 1 2 16397 CASAVA_Build 5 23753100 5D TATATCAAGA AAAAG/----- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 10 AAAAG 2 1 16398 CASAVA_Build 5 23754990 2I AATATGAAAC --/AT ATTAAATTAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AT 1 2 16399 CASAVA_Build 5 23755274 1D TTTGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 39 1 26 13 T 12 11 16400 CASAVA_Build 5 23758580 9I TCCTGCAGCA ---------/CTATCTGTC CTATGGACAT 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 CTATCTGTC 0 1 16401 CASAVA_Build 5 23763662 3D ATCAACATTT AGA/--- AGATTTCAAC 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 AGA 2 1 16402 CASAVA_Build 5 23766951 8D GGGTTGCAAT CCAAGATG/-------- CCTACAAAGT 3070 het 3070 hom 43 21 21 5 CCAAGATG 1 0 16403 CASAVA_Build 5 23769557 1I GTACAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 12 13 16404 CASAVA_Build 5 23775412 2I GTAAATATTT --/TA TATATATATA 2534 het 1375 hom 13 6 6 1 TA 6 7 16405 CASAVA_Build 5 23782379 3I CAAAAAAAAA ---/AAC ATCATAACTG 3070 het 2788 hom 27 9 12 6 AAC 0 1 16406 CASAVA_Build 5 23783592 1D TTTTATGGGA T/- TTTTTCACTT 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 T 6 5 16407 CASAVA_Build 5 23792101 9I GAGTAAAGAA ---------/TGAGTTAGC TTGAAAATAG 2683 het 2683 ref 26 16 6 4 TGAGTTAGC 0 1 16408 CASAVA_Build 5 23792741 1D GTCTTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 T 12 11 16409 CASAVA_Build 5 23793840 1I TGGTTAAACA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 T 6 7 16410 CASAVA_Build 5 23795414 1D TCTTTCCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 A 10 9 16411 CASAVA_Build 5 23795970 1D TCATTATGAG T/- TTTTTTGCGA 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 T 7 6 16412 CASAVA_Build 5 23796155 1I TTCTGGTGGG -/A AAAAAGTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 24 0 A 5 6 16413 CASAVA_Build 5 23796279 1D CTCAAAATAA C/- TTTTGTTGTG 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 C 1 0 16414 CASAVA_Build 5 23797074 1I GTATGGTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 19 19 15 A 10 11 16415 CASAVA_Build 5 23801096 1D CAAAGAGGAA C/- CTGTAATTAC 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 C 2 1 16416 CASAVA_Build 5 23821018 5I AATAATATAA -----/ATTTT ATTTTATTTC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 ATTTT 1 2 16417 CASAVA_Build 5 23822667 4D CTTTGGTACA TAGT/---- TAGGAGTAAA 3070 het 3070 hom 31 12 18 4 TAGT 1 0 16418 CASAVA_Build 5 23825663 3I TAAATATTGT ---/TCC TCCTCATTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 TCC 1 2 16419 CASAVA_Build 5 23832202 1D TGACAATGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 10 9 16420 CASAVA_Build 5 23839114 1I TAAATTAAAA -/T TTTATTAAAT 2951 het 2006 hom 12 5 7 0 T 3 4 16421 CASAVA_Build 5 23853915 1I TAGCAGTTTG -/C TTTTCTCCCT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 C 0 1 16422 CASAVA_Build 5 23860494 4I CCTGGCCCTT ----/TCTC TCTCTCAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 TC 3 5 16423 CASAVA_Build 5 23863701 2D GCCTGGAAGA CT/-- CTGTTTAAGT 3070 het 3070 ref 25 13 11 3 CT 2 1 16424 CASAVA_Build 5 23887174 1I GTTATTTGAG -/T TTTAAACCAG 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 3 4 16425 CASAVA_Build 5 23951971 1D CACAGATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 11 10 16426 CASAVA_Build 5 23973549 1I ATCGATCCCA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 6 7 16427 CASAVA_Build 5 23977117 6I TTTTGTCTGA ------/TATAAT TATAGCTACT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 TATAAT 0 1 16428 CASAVA_Build 5 23977835 1I TGACAAAACA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 6 7 16429 CASAVA_Build 5 23982432 2D CTTTGCAGAA TT/-- TCCACAGGAG 3070 het 3070 hom 39 17 22 0 T 3 1 16430 CASAVA_Build 5 23982872 1I GGGCATGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 14 10 16 T 14 15 16431 CASAVA_Build 5 23984102 5D CCCTTTTATC TCTTA/----- TAATATTGCT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TCTTA 1 0 16432 CASAVA_Build 5 23985761 1I TTTAGATTTG -/T TTTTTTTTTT 2065 het 2065 ref 27 11 10 6 T 13 14 16433 CASAVA_Build 5 23988536 1I TGTAAATTTG -/T TTTAAGTTCC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 3 4 16434 CASAVA_Build 5 24006637 5I TGCATATTGT -----/TATAA TATAATTTAT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 TATAA 1 2 16435 CASAVA_Build 5 24006764 6I TGAGTCATAG ------/GGTATT GGTATGTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 GGTATT 0 1 16436 CASAVA_Build 5 24009803 2I TAAAATATAT --/AC ATACTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 AC 0 1 16437 CASAVA_Build 5 24011428 3I TTGAGGGGGG ---/TAT TATTGTTGTA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 TAT 1 2 16438 CASAVA_Build 5 24011529 1I GAGAAGAAAT -/A AAAGCAAACA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 3 4 16439 CASAVA_Build 5 24014571 1D AGAGTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 9 A 13 12 16440 CASAVA_Build 5 24022173 2D TAATCTGCTT AA/-- CTAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 A 2 0 16441 CASAVA_Build 5 24034988 1I GGCAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 11 12 16442 CASAVA_Build 5 24043250 6D ATATATATAT ATATAC/------ ACACACACAC 2414 het 1387 hom 15 5 9 1 ATATAC 1 0 16443 CASAVA_Build 5 24044015 5I TGCTTTTATT -----/TTTTA TTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 TTTTA 3 4 16444 CASAVA_Build 5 24052285 1D CATATATACA T/- TTTTTTTTTC 2354 het 2354 ref 24 17 5 2 T 10 9 16445 CASAVA_Build 5 24054164 4D CTCCCTGAGC TACA/---- TACAACATTA 3070 het 3070 ref 41 20 16 8 TACA 2 1 16446 CASAVA_Build 5 24061721 2D TTGGGTCAAC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 A 10 8 16447 CASAVA_Build 5 24062325 1D TAAAAAGTTA C/- CACCACCAAC 3070 het 3070 ref 38 25 10 3 C 2 1 16448 CASAVA_Build 5 24073097 1I AACATCCCTA -/T TTTTTTTTAT 2386 het 333 hom 10 1 5 4 T 8 9 16449 CASAVA_Build 5 24078037 1D AGGTAGGTTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 8 7 16450 CASAVA_Build 5 24084881 1D AACTGCAAGA T/- TTTTTACTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 5 16451 CASAVA_Build 5 24085703 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 10 11 16452 CASAVA_Build 5 24087330 2D GAATGAGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 46 22 17 8 GA 6 5 16453 CASAVA_Build 5 24092166 1D TGAATAGAAC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 A 8 7 16454 CASAVA_Build 5 24093128 1D AAAGACAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 A 12 11 16455 CASAVA_Build 5 24095882 2D TTATTTTTTA TT/-- TTTATTTTTT 3070 hom 23 het 37 1 23 13 T 5 3 16456 CASAVA_Build 5 24107909 1I TAGGTATATC -/T CCTGATGCTA 1645 het 1645 ref 13 7 4 2 T 0 1 16457 CASAVA_Build 5 24117192 1D GTTGTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 T 14 13 16458 CASAVA_Build 5 24122812 1D ACTAAAATAG T/- TTAATACTAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 T 3 2 16459 CASAVA_Build 5 24145607 3D CAAGAAAAGT ACA/--- ACGTTTAGGA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 ACA 1 0 16460 CASAVA_Build 5 24145678 1D CAAATCTAAA G/- ATAACCTTCA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 1 0 16461 CASAVA_Build 5 24151513 1I TTCTGAATGA -/T TAGTGGTATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 2 16462 CASAVA_Build 5 24152678 1D CAAAAAAAAA T/- AATAATTAGC 2610 hom 24 het 10 0 9 1 T 1 0 16463 CASAVA_Build 5 24152838 1D ACTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 11 10 16464 CASAVA_Build 5 24155406 2I6M1I TCAGATAGAC --TTCAAC-/TTTTCAACA ACTGTTGCTG 3070 het 3070 hom 39 15 24 4 N/A 0 0 16465 CASAVA_Build 5 24155932 1D TAAGCAGATC A/- AAAGATGCTC 3070 het 1778 hom 16 4 12 0 A 4 3 16466 CASAVA_Build 5 24156486 4I AGATTAGTGA ----/CTGT CTGTGATCAA 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 CTGT 1 2 16467 CASAVA_Build 5 24157530 1I CGTATCATTC -/T GTCTCTTCCC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 0 1 16468 CASAVA_Build 5 24158955 1I GTCCATATCA -/C CATGAGCATT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 1 2 16469 CASAVA_Build 5 24159393 2I AGCAAGAGAG --/AA ATCTGCCCCC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 1 3 16470 CASAVA_Build 5 24162841 1I GTTGGTAGGC -/T AGTAATTACT 3070 hom 46 het 37 1 30 6 T 0 1 16471 CASAVA_Build 5 24165218 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 A 10 9 16472 CASAVA_Build 5 24165823 1I TCAATTTTTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 7 8 16473 CASAVA_Build 5 24168598 1I GTTTGTAATT -/A ATTGTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 1 2 16474 CASAVA_Build 5 24172472 1D TTTTTTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 25 0 18 8 A 11 10 16475 CASAVA_Build 5 24174153 1D AACAATATGT A/- AAAAAAAAAA 1122 het 1122 ref 27 22 3 2 A 17 16 16476 CASAVA_Build 5 24174319 2D56M1I TCAAAGAAAC TGTATGTATCAAAATGTTACTGTTTTTGTTTTTTATTTTATTATTTTTTAATTATGTA-/--TATGTATCAAAATGTTACTGTTTTTGTTTTTTATTTTATTATTTTTTAATTATGTAT TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 24 23 10 9 N/A 0 0 16477 CASAVA_Build 5 24188232 1D TTTGCACTAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 9 8 16478 CASAVA_Build 5 24191496 11D CCACTCTGAA GAGAAGGAAAC/----------- GGTTCTGGCT 3070 het 3070 ref 31 17 12 6 GAGAAGGAAAC 1 0 16479 CASAVA_Build 5 24193915 1D TTAAAACATT A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 7 6 16480 CASAVA_Build 5 24194391 1D AGCTAGATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 8 16481 CASAVA_Build 5 24194821 1D AAGACACATC A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 7 6 16482 CASAVA_Build 5 24203647 8I TTGTTCTTTG --------/AAAGAAAC AAAGAAACTG 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 AAAGAAAC 1 2 16483 CASAVA_Build 5 24204882 6D TTCTGCACAC TTTTTA/------ TTTATTTATT 1429 het 1429 ref 10 4 3 3 TTTTTA 1 0 16484 CASAVA_Build 5 24213179 2I GTTAAATGTG --/CT TTTGCAAGAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 CT 0 1 16485 CASAVA_Build 5 24214148 1I GACTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 11 12 16486 CASAVA_Build 5 24215937 1D ATATTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 2016 het 2016 ref 27 8 9 10 T 15 14 16487 CASAVA_Build 5 24220792 1D TTTTTATTTA T/- TTTTATTTTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 5 4 16488 CASAVA_Build 5 24226354 2D AATTTATCAC AT/-- GTTTAAAGAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 AT 1 0 16489 CASAVA_Build 5 24226469 1D GTTCCAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 11 10 16490 CASAVA_Build 5 24229520 1I ATAAAAAAAA -/T AAAATCTATT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 0 1 16491 CASAVA_Build 5 24235083 1D ATCAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 26 2 13 11 T 15 14 16492 CASAVA_Build 5 24247106 4D ATTTTCTACA TACT/---- TTTGTTGTTG 3070 hom 63 het 24 0 22 4 TACT 1 0 16493 CASAVA_Build 5 24252229 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 540 het 463 hom 22 9 3 10 T 18 16 16494 CASAVA_Build 5 24252678 1I GAGACATACC -/T TTTTGAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 4 5 16495 CASAVA_Build 5 24262073 1D TATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 T 11 10 16496 CASAVA_Build 5 24276652 1I CGTGCCTTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 880 hom 39 2 30 7 A 9 10 16497 CASAVA_Build 5 24276776 3I GTTTTATATG ---/ATA ATAAGGTGAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATA 1 2 16498 CASAVA_Build 5 24279634 1I TTTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTC 330 het 330 ref 8 4 3 1 T 9 10 16499 CASAVA_Build 5 24280437 1I TTAATACTAG -/T TTGTGCATTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 3 16500 CASAVA_Build 5 24286417 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1289 hom 24 6 12 6 A 14 13 16501 CASAVA_Build 5 24293356 1D TAATTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 45 0 34 12 T 10 9 16502 CASAVA_Build 5 24298346 1I TGTGCGTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 26 1 17 8 T 13 14 16503 CASAVA_Build 5 24300713 1I CTAGATACGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 37 het 28 1 24 3 A 9 10 16504 CASAVA_Build 5 24302080 5D TTAAAATACT ATAAA/----- ATAAATGAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 4 ATAAA 2 1 16505 CASAVA_Build 5 24313819 6I3M8I TTGTTTCTAT ------TGA--------/CCACAATGAATATATAG AAACATATTC 3070 hom 57 het 20 0 20 2 N/A 0 0 16506 CASAVA_Build 5 24320970 1D ATCTGTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 9 16507 CASAVA_Build 5 24324695 16D TAAGAGAGGA AAAGAAGAGCTTATTT/---------------- AAAGATTGGG 3070 hom 96 het 30 0 33 1 AAAGAAGAGCTTATTT 1 0 16508 CASAVA_Build 5 24327752 1D GTTTCTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 T 11 10 16509 CASAVA_Build 5 24331793 1D CCACCTAAGG A/- TGGGTGATTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 0 16510 CASAVA_Build 5 24339393 2D TGTAAGTGAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 40 0 30 10 TG 8 7 16511 CASAVA_Build 5 24345286 1D ATTTTCCTGA T/- TTTTTTCTTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 7 6 16512 CASAVA_Build 5 24353883 1I ACTGGGGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 26 0 19 7 A 10 11 16513 CASAVA_Build 5 24354459 4D TGCCAATGTT TAAA/---- TACTCTGTAT 3070 het 3070 ref 51 28 18 6 TAAA 1 0 16514 CASAVA_Build 5 24356508 3D TCTGAGGAAG TAC/--- TACCATATGA 3070 hom 105 het 41 0 36 8 TAC 2 1 16515 CASAVA_Build 5 24357940 1D AAAAGTGAAC A/- AAAAAAGCTC 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 7 6 16516 CASAVA_Build 5 24360075 1I CAATAGGCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 9 10 16517 CASAVA_Build 5 24363602 1D AGCCACAAAA G/- ACTGTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 G 1 0 16518 CASAVA_Build 5 24366246 1I TCAGCATTTC -/A AAAAAAAAAA 2726 het 1250 hom 34 7 11 16 A 15 16 16519 CASAVA_Build 5 24374444 2D GTATTTTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AT 9 8 16520 CASAVA_Build 5 24377110 1I GTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 28 1 15 12 A 11 12 16521 CASAVA_Build 5 24377796 1I TTTTGTTTTT -/C CCCCTTCATA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 C 4 5 16522 CASAVA_Build 5 24391820 1D48M1D CTTTCACCTT CCACCATGATTTTGAAGCTTCCCCAACCATGTGGAACTGTAATTCCATTA/-CACCATGATTTTGAAGCTTCCCCAACCATGTGGAACTGTAATACCATT- AATCTCCTTC 3070 het 3070 ref 38 25 16 10 N/A 0 0 16523 CASAVA_Build 5 24393006 9I TTAATTTCAA ---------/TTAAGGCTT TTTGCTTGTA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 TTAAGGCTT 0 1 16524 CASAVA_Build 5 24394880 1I TCTCCATTTC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 T 6 7 16525 CASAVA_Build 5 24395050 1D30M21D TAAAGCTTCC AATAACTCTCACTGGTCCACTTACAAAGTAGAAAGTGGAACACATCAGAAGT/-ATAACTCTCACTGGTCCACTTACAAAGTAG--------------------- ACATCAAAAG 3070 het 3070 ref 33 28 14 3 N/A 0 0 16526 CASAVA_Build 5 24414467 6D TCAAAGGCTA TAAAAG/------ TAAAAGCTTA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 TAAAAG 2 1 16527 CASAVA_Build 5 24457244 1I TGCTGCTCCT -/A ATCACCAAGC 3070 het 3070 ref 52 25 24 3 A 1 2 16528 CASAVA_Build 5 24506375 1D AGAGGTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 13 12 16529 CASAVA_Build 5 24512082 2I TCTTCTACTC --/TT TGATAGGGAG 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 T 1 3 16530 CASAVA_Build 5 24524658 1D TTGCATGAGA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2377 hom 29 9 15 5 C 10 9 16531 CASAVA_Build 5 24526299 2I AATTATAAAA --/TG TATATTTTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TG 0 1 16532 CASAVA_Build 5 24527249 6I CTATTACTAC ------/AACTAT AACAAAAATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AACTAT 0 1 16533 CASAVA_Build 5 24531751 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 A 9 10 16534 CASAVA_Build 5 24535597 1I TTTGATATGT -/A AAATTAATAA 3070 hom 50 het 30 0 17 13 A 3 4 16535 CASAVA_Build 5 24537917 1D CCCGGTAAGC T/- TGGGACTACA 1571 hom 11 het 15 0 4 11 T 2 1 16536 CASAVA_Build 5 24544324 2D ACCTCTCAAC TT/-- TGATGGCTGT 3070 het 3070 ref 28 14 14 1 T 3 1 16537 CASAVA_Build 5 24548391 1D ATCCTATTTC T/- TACTTGTGAC 3070 het 3070 hom 57 28 27 2 T 2 1 16538 CASAVA_Build 5 24548766 5D TTGCATTTAG TCACT/----- TCCATGAAAG 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 TCACT 1 0 16539 CASAVA_Build 5 24548928 7I TCAGTCACTC -------/AGGCTGG AGTGCTGGAG 2955 het 2955 ref 25 14 7 4 AGGCTGG 0 1 16540 CASAVA_Build 5 24550745 2D TTAGATTGAG AT/-- ATATATATAC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 AT 5 4 16541 CASAVA_Build 5 24551769 1D TACAGGGGAG T/- TTTCCCCTGA 2210 het 2210 ref 31 22 5 5 T 4 3 16542 CASAVA_Build 5 24552140 1I GGACTGATGA -/T TTTTAAGTCA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 4 5 16543 CASAVA_Build 5 24552343 1D TGATTTTCAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 8 7 16544 CASAVA_Build 5 24553448 1I ATCATATTTG -/T TTTTTGACAA 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 5 6 16545 CASAVA_Build 5 24555214 5I TTTCTAAAAC -----/AACAA AACAAAATTT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 AACAA 1 2 16546 CASAVA_Build 5 24556760 1I ACCCGGCAAA -/T TTTTTTTTTT 1880 het 1880 ref 16 6 5 5 T 10 11 16547 CASAVA_Build 5 24556844 1D GATTCGGCCT C/- CCAAAGCATG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 C 3 2 16548 CASAVA_Build 5 24560362 1D ATGCTCCTTA T/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 7 6 16549 CASAVA_Build 5 24562951 3D AAAATATTTA ATT/--- ATTTAGACAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 ATT 2 1 16550 CASAVA_Build 5 24588870 1D TGTTTTCCTC T/- TTTTTTGTGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 6 16551 CASAVA_Build 5 24589099 3D AAGCTTGTAG AGA/--- AGCTTTTGTT 3070 het 3070 ref 47 21 23 6 AGA 1 0 16552 CASAVA_Build 5 24589804 7I ACGCTATCCA -------/GTTGTCT GTTGTCTGGC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 GTTGTCT 1 2 16553 CASAVA_Build 5 24589927 2D AGCAAGACAC AG/-- AGAGAGAGAG 2621 hom 45 het 23 0 15 8 AG 9 8 16554 CASAVA_Build 5 24590055 10D TGCAACTTCG TAAGTAACTC/---------- TAAGTAAAGA 2657 het 2657 ref 25 16 6 6 TAAGTAACTC 1 0 16555 CASAVA_Build 5 24591744 1D ACAGCACATG A/- AAAAAACATG 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 7 6 16556 CASAVA_Build 5 24592836 1D AAGTTTTTTT C/- ATATTTTTCT 3070 het 3070 ref 20 10 9 4 C 1 0 16557 CASAVA_Build 5 24593070 1I AGTTTTTTTT -/A AATTACTTAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 2 3 16558 CASAVA_Build 5 24594078 1I TGGGGTCAAA -/C TTTCTGTAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 0 1 16559 CASAVA_Build 5 24594569 2D AAAACGAAAC AG/-- AGAAACATTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AG 2 1 16560 CASAVA_Build 5 24594997 4I TATTGTACAC ----/AAAT AAATATGCTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAT 1 2 16561 CASAVA_Build 5 24596351 1I AACTATTGTG -/T TTTTTTCATT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 6 7 16562 CASAVA_Build 5 24597881 6I AATAAATGGT ------/TTGTTA TTGTTGTTTC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TTGTTA 0 1 16563 CASAVA_Build 5 24598679 1I GAAAAAAATA -/T CCTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 0 1 16564 CASAVA_Build 5 24599226 4D TTACGCCTTT ACAG/---- ACAGTGATAT 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 ACAG 2 1 16565 CASAVA_Build 5 24604976 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2620 het 2620 ref 19 10 7 2 A 10 11 16566 CASAVA_Build 5 24606518 2I TTACTGTAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 AT 5 6 16567 CASAVA_Build 5 24607575 1I TAGTTCTATG -/A AAAAAAAATA 3070 het 2891 hom 34 8 19 7 A 8 9 16568 CASAVA_Build 5 24611121 23D3M1D TTAGCTACTC AGGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTG/-----------------------CCT- AACCCGGGAG 3070 het 3070 hom 26 12 15 1 N/A 0 0 16569 CASAVA_Build 5 24612873 1D CTAAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 12 11 16570 CASAVA_Build 5 24612943 1D AAAGTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 36 1 16 19 A 12 11 16571 CASAVA_Build 5 24612954 2D AAAAAAAAAA AC/-- CAAAAACTGT 3070 het 414 hom 31 6 13 12 AC 1 0 16572 CASAVA_Build 5 24613473 3I ATAAGTCAAA ---/CAT CATAATATTC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 CAT 1 2 16573 CASAVA_Build 5 24615209 2D GAAAACAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 AT 6 5 16574 CASAVA_Build 5 24615708 1D TACACTCACA T/- TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 38 12 22 5 T 7 6 16575 CASAVA_Build 5 24617129 1D AACCTCTCAA T/- TTTAAAGCAT 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 T 4 3 16576 CASAVA_Build 5 24619071 1I TTTTTTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 631 hom 25 2 14 9 A 14 15 16577 CASAVA_Build 5 24623598 4D AATTATAGAT ATAA/---- ATGTTTTATT 3070 het 2794 hom 29 7 22 0 ATAA 1 0 16578 CASAVA_Build 5 24628770 2D GCAATGTGAA AT/-- ATATATATAT 1593 het 1593 ref 22 9 5 8 AT 9 8 16579 CASAVA_Build 5 24630299 1I GATCATGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 T 9 10 16580 CASAVA_Build 5 24648497 1I GGGGGTAAAA -/G CTACAGAAAC 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 G 0 1 16581 CASAVA_Build 5 24651944 1I47M1D CTTTAAAAAA -AGTATATATTTCATTGCATTACATAAATTTAGTTCTTTCAGAAAGTTA/TAGTATATATTTCATTGCATTACATAAATTTAGTTCTTTCAGAAAGTT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 11 12 N/A 0 0 16582 CASAVA_Build 5 24657694 2I ACGTGTGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 58 18 25 15 AC 6 7 16583 CASAVA_Build 5 24658125 4I GATGTGCGAA ----/TGAT TGTTGACAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TGAT 0 1 16584 CASAVA_Build 5 24661141 1D AGAACTCTCC T/- TGCTCTTTAG 3070 het 3070 ref 59 30 24 6 T 2 1 16585 CASAVA_Build 5 24668204 6D TATATACACC ATTTCA/------ ATTTCAATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 ATTTCA 2 1 16586 CASAVA_Build 5 24668993 1I AAGAAAATAA -/C GAGGAGTAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 16587 CASAVA_Build 5 24670872 1D CCAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 28 2 19 7 A 12 11 16588 CASAVA_Build 5 24671916 1I AAAATACAAC -/A ACACTCAATA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 A 1 2 16589 CASAVA_Build 5 24679398 1D ATCCTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 35 1 31 3 A 11 10 16590 CASAVA_Build 5 24681391 1I CACAGTCTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 396 hom 26 1 22 3 T 8 9 16591 CASAVA_Build 5 24690583 1D TCACTATCTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 33 het 15 0 9 6 T 8 7 16592 CASAVA_Build 5 24697170 1D CCTGGGACAC T/- TTTTTCTGTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 5 16593 CASAVA_Build 5 24698882 1D TTGTAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 32 1 23 8 T 14 13 16594 CASAVA_Build 5 24703798 1D GATCCTCTAA C/- CCCCCCATTT 3070 hom 103 het 40 0 34 6 C 7 6 16595 CASAVA_Build 5 24707001 1D CTAGTCAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1235 hom 45 3 36 6 T 11 10 16596 CASAVA_Build 5 24727266 1D TTACAGGGAT A/- AAAAGTTGGT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 5 4 16597 CASAVA_Build 5 24755940 5I TTTATGAAGA -----/TGTTC CCTCTTTTAT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 TGTTC 0 1 16598 CASAVA_Build 5 24756539 1I CAATTAAAAG -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 88 het 37 0 30 7 T 7 8 16599 CASAVA_Build 5 24768911 1D TTACATCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 222 hom 34 1 27 7 T 13 12 16600 CASAVA_Build 5 24774343 1I GTTTAAAAGG -/C CTTTGGTATT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 1 2 16601 CASAVA_Build 5 24777002 1D34M1I GCATGGTTCC AAATTTTCCTTATCTTAGCCAATACTTATTTCTTG-/-AATTTTCCTTATCTTAGCCAATACTTATTTCTTGT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 25 10 N/A 0 0 16602 CASAVA_Build 5 24784451 2I AAGCAAAAAC --/TT TTGTGGCTGT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 T 2 4 16603 CASAVA_Build 5 24788290 1I GGTCCTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 655 hom 21 4 15 2 T 11 12 16604 CASAVA_Build 5 24795248 1I TTTTTGGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 10 11 16605 CASAVA_Build 5 24846567 1D AATTTACGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 181 hom 30 2 21 7 T 10 9 16606 CASAVA_Build 5 24858803 5I TTTCTTTCTT -----/TTTTC TTTTCTTTTC 2033 het 748 hom 17 8 8 1 TTTTC 2 3 16607 CASAVA_Build 5 24883437 4D CATCCTGATC ATTA/---- AGTTCAGTAG 3070 hom 66 het 24 0 23 3 ATTA 1 0 16608 CASAVA_Build 5 24884939 1I TCTTCATACA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 8 9 16609 CASAVA_Build 5 24885199 2I GAGAAATCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 38 0 29 9 T 10 12 16610 CASAVA_Build 5 24887044 1I CGTCCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1771 hom 42 7 24 11 T 15 16 16611 CASAVA_Build 5 24926176 3I TCTATTTTTC ---/ATA ATAAGGAGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATA 1 2 16612 CASAVA_Build 5 24938364 1I CTAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2129 hom 22 8 10 4 A 13 14 16613 CASAVA_Build 5 24938522 4D AGAAACCCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 204 hom 28 1 14 13 TC 8 6 16614 CASAVA_Build 5 24941003 1I ATTTCTGCCA -/T TTTTTTGGCC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 6 7 16615 CASAVA_Build 5 24942111 1D ATAAGTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 11 10 16616 CASAVA_Build 5 24942762 1I ACATCCTATG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 57 30 22 5 T 8 9 16617 CASAVA_Build 5 24946178 1I TAATTGTGGT -/C TTGGGAACCA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 0 1 16618 CASAVA_Build 5 24953370 1I CATTTTGCAG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 51 24 18 9 T 8 9 16619 CASAVA_Build 5 24985148 1I GCTCAAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 T 9 10 16620 CASAVA_Build 5 24996526 1I TTTGGAATTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 8 9 16621 CASAVA_Build 5 24997089 1D TAAATGCCAT A/- ACTCATTACG 1446 het 1446 ref 17 11 4 2 A 2 1 16622 CASAVA_Build 5 24999116 7D AATTTCTTCT ATTTCTA/------- ATTTGTTGAG 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 ATTTCTA 1 0 16623 CASAVA_Build 5 25012161 1D GTTGTGCAAT A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 46 21 17 9 A 7 6 16624 CASAVA_Build 5 25019430 2D TAAGAAAAAC AT/-- GTGCTTATCT 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 AT 1 0 16625 CASAVA_Build 5 25022595 2D GAAAAGAAAC AG/-- AAATTATTTG 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 AG 1 0 16626 CASAVA_Build 5 25024924 1D ACTTCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 T 12 11 16627 CASAVA_Build 5 25026363 1I TAGGCAAAAC -/A AAAAAATGGG 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 A 6 7 16628 CASAVA_Build 5 25027852 1D ACCCAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 11 10 16629 CASAVA_Build 5 25031558 1D ACCAACAGCA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 8 7 16630 CASAVA_Build 5 25036178 5I AATTTTAGAT -----/GATAA GATAATAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GATAA 1 2 16631 CASAVA_Build 5 25043788 1D TCCTCAGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 9 16632 CASAVA_Build 5 25044554 1I TGTTCATGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 10 11 16633 CASAVA_Build 5 25046104 1I TAGGGCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 11 12 16634 CASAVA_Build 5 25046326 3D TTTATTAATC TGG/--- TGGTGTTCTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 8 TGG 2 1 16635 CASAVA_Build 5 25054587 1D GAGGACTTAC T/- TTTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 34 15 15 5 T 6 5 16636 CASAVA_Build 5 25077735 1D TTTGTGTGTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 16 22 5 T 9 8 16637 CASAVA_Build 5 25096838 3D AGTAAAATAA AAG/--- AAGGTAATGA 3070 het 3070 ref 25 10 11 5 AAG 2 1 16638 CASAVA_Build 5 25098377 1D TGGTGAGCTT A/- AGTCATCTGT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 2 1 16639 CASAVA_Build 5 25101859 4I ACACACACAC ----/ACAG ACAGAGGGTG 3070 hom 105 het 39 0 34 5 ACAG 1 2 16640 CASAVA_Build 5 25109601 1I GGCTGGTCTC -/T TAACTCTTGA 1931 het 1931 ref 18 9 4 5 T 1 2 16641 CASAVA_Build 5 25124007 1I TCCTTATCAC -/T TTTTTCTCCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 5 6 16642 CASAVA_Build 5 25134520 5I AGTCAATAAT -----/AAATC AAATAAATAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AAATC 0 1 16643 CASAVA_Build 5 25135652 2D8M5D TTGTATATTA ATATGTTACATATAT/--ATGTTACA----- TATATGTTAA 3070 het 3070 hom 15 7 9 1 N/A 0 0 16644 CASAVA_Build 5 25138065 1I TAATATTTTG -/A AGGAAATCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 16645 CASAVA_Build 5 25139715 4I CCTTTGAATA ----/TCTT TCTTTATACA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 TCTT 1 2 16646 CASAVA_Build 5 25142929 1D17M2D CAAAGTTGTG AAAAAAAAAATAATAATAAG/-AAAAAAAAATAATAATA-- AGAGTATGGT 3070 het 3070 hom 31 18 17 7 N/A 0 0 16647 CASAVA_Build 5 25146723 2D GAAAAATAAC AA/-- AAAGTTAACC 3070 het 3070 ref 49 31 17 1 A 5 3 16648 CASAVA_Build 5 25149604 1D TAATAATAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 T 9 8 16649 CASAVA_Build 5 25159567 4D AATTATAAGA ATAT/---- ATACATTATA 3070 het 3070 hom 38 17 20 2 AT 3 1 16650 CASAVA_Build 5 25160576 1I GAAACCCCTG -/T TAAAGAAATT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 1 2 16651 CASAVA_Build 5 25161442 2I CACGGTTAGA --/CT CTCAAGGTGT 3070 het 3070 hom 57 24 24 9 CT 1 2 16652 CASAVA_Build 5 25164906 1I47M1D GTAGTAACTA -TTTTTTTAAATTAACCCATATTTTACTGATATTAATTCATTATATACT/TTTTTTTTAAATTAACCCATATTTTACTGATATTAATTCATTATATGC- TATGTAATGT 3070 het 3070 ref 39 26 24 5 N/A 0 0 16653 CASAVA_Build 5 25181280 1I ATAAAATATA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 16 9 7 0 T 6 7 16654 CASAVA_Build 5 25182518 1D AAAGAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 12 11 A 17 16 16655 CASAVA_Build 5 25200490 1D TCACTCATTA T/- TTACTAATTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 T 3 2 16656 CASAVA_Build 5 25203294 4I ACAAAAATAT ----/TTTA TTTTTTATAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TTTA 0 1 16657 CASAVA_Build 5 25205584 3I TATAGATCTG ---/TTT ATTTTATGTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 0 3 16658 CASAVA_Build 5 25230313 2I GTATATAAAC --/AT ATAAATAGAC 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 AT 1 2 16659 CASAVA_Build 5 25247439 1D TATATTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 9 A 11 10 16660 CASAVA_Build 5 25257803 6I CTCATTTCTG ------/ACTTTT ACTTTTATCC 3070 hom 132 het 50 0 44 6 ACTTTT 1 2 16661 CASAVA_Build 5 25267984 1D AAATTCTATT A/- AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 7 6 16662 CASAVA_Build 5 25281215 1D TTGATCTCTT A/- ACAAATGCTC 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 2 1 16663 CASAVA_Build 5 25331231 1D GCTTACTACA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 8 7 16664 CASAVA_Build 5 25354363 4I GTATGATGAC ----/AATA AATAAAGAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AATA 1 2 16665 CASAVA_Build 5 25392166 1D ACCTGCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 11 10 16666 CASAVA_Build 5 25397985 1D TCTGTCTGGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 A 9 8 16667 CASAVA_Build 5 25406110 3I AATTTGAAAT ---/GAA GAAATCAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 GAA 1 2 16668 CASAVA_Build 5 25408200 1D ATTCCATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 12 11 16669 CASAVA_Build 5 25420271 1D CACGGTGCGC T/- GCACCCACTG 1820 het 148 hom 7 1 4 2 T 1 0 16670 CASAVA_Build 5 25441815 3I AGTGCATACT ---/GCA GTAACTTATG 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 GCA 0 1 16671 CASAVA_Build 5 25444801 3D TATCTCATTA TTG/--- TTTTGATTTG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 TTG 1 0 16672 CASAVA_Build 5 25445645 5D AAAAAACAAC AACAA/----- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 AACAA 1 0 16673 CASAVA_Build 5 25450986 1D AGACCTATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 A 10 9 16674 CASAVA_Build 5 25453723 2I ACTGTATTCA --/TT TGAGTTGTTG 3070 het 3070 ref 48 23 23 2 T 1 3 16675 CASAVA_Build 5 25458355 1I TTTTTTTTTT -/C ATTTTACTTT 2928 het 2381 hom 20 8 7 5 C 0 1 16676 CASAVA_Build 5 25459443 1I AGCATGTCAA -/T TTTTTTTTTT 2126 het 2126 ref 29 13 7 9 T 13 14 16677 CASAVA_Build 5 25464517 2I CATTTGACTC --/AA GAGTTCAAGA 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 0 2 16678 CASAVA_Build 5 25476634 2I ACTATTTATT --/TG TGTGTTTAAT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 TG 2 3 16679 CASAVA_Build 5 25478096 1I TAATATAAAA -/T GGGGGTTTGA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 0 1 16680 CASAVA_Build 5 25478935 1I43M1I TACTCCACAA -TGGGAAAGATCCATGTTTTGAAAAGCACAATACTTCTAAGAAG-/TTGGGAAAGATCCATGTTTTGAAAAGCACAATACTTCTAAGAAGT TGGAGTAGAT 3070 hom 75 het 26 0 26 10 N/A 0 0 16681 CASAVA_Build 5 25479161 1I AAAATAAGAA -/T TTGATAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 3 16682 CASAVA_Build 5 25479323 1I TTCTGCCTTC -/T TTGGTATTAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 2 3 16683 CASAVA_Build 5 25480965 2D AAAAGGAAAC AT/-- GTGTACCTAA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 AT 1 0 16684 CASAVA_Build 5 25481114 1I31M1I CTAAGTCCAA -TTGATATCAATTGTAACCCATCATAAAAACA-/TTTGATATCAATTGTAACCCATCATAAAAACAT TTTGTTGTTC 3070 hom 132 het 36 0 45 5 N/A 0 0 16685 CASAVA_Build 5 25483716 4I TGTATATATA ----/TATT TAATAACATT 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 TATT 0 1 16686 CASAVA_Build 5 25487654 1D AAACTTTAGG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 8 7 16687 CASAVA_Build 5 25504104 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 25 4 13 8 T 12 11 16688 CASAVA_Build 5 25516624 1D ATAAGAACCT A/- AAGCTTAGCG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 3 2 16689 CASAVA_Build 5 25550144 1D TTACCCCTTT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 25 1 21 4 G 2 1 16690 CASAVA_Build 5 25554138 1D CATAGGGGAG C/- AATATAGGAT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 C 1 0 16691 CASAVA_Build 5 25573164 1I GTATATATTG -/A TTATTGCAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 0 1 16692 CASAVA_Build 5 25575050 4D AATATAGAGA AAGT/---- AAGCTGTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 AAGT 1 0 16693 CASAVA_Build 5 25575215 2I GGCGAGTGTC --/CA CACACAAAAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 CA 3 4 16694 CASAVA_Build 5 25577596 1D TGGTTCAAAT A/- CACTCAAATG 3070 hom 84 het 29 0 27 2 A 1 0 16695 CASAVA_Build 5 25585192 1D ATCTTTTCAA G/- GGAGCAACTG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 3 2 16696 CASAVA_Build 5 25585330 5I GTTGTTGATT -----/TGAGA TATTTCTTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TGAGA 0 1 16697 CASAVA_Build 5 25591925 4I TACTGTTGAC ----/ATTT ATTTAGTCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATTT 1 2 16698 CASAVA_Build 5 25601182 1I ATTTTTTAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 9 16699 CASAVA_Build 5 25608446 1D GTCTGGGGGT A/- AAAAAAGGCT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 7 6 16700 CASAVA_Build 5 25609037 6D GTCATAAAAA TCTTTT/------ TCTTTTTCGT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TCTTTT 2 1 16701 CASAVA_Build 5 25609183 2D AGTTCAATAA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 22 0 20 3 T 10 8 16702 CASAVA_Build 5 25610097 1I ATATGTTTTT -/A TTTTTATTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 1 16703 CASAVA_Build 5 25610930 1I TGATCCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1238 hom 29 5 11 13 T 16 17 16704 CASAVA_Build 5 25628935 1I CGTTTACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 32 1 21 10 T 13 14 16705 CASAVA_Build 5 25629656 3I TGTGAAATAA ---/TAT TATGTCTAAA 3070 hom 135 het 47 0 45 2 TAT 1 2 16706 CASAVA_Build 5 25646197 17D CTCTGTAAAG AGAAATTGGATTGGAAC/----------------- AGAGCCAATG 3070 hom 80 het 25 0 25 7 AGAAATTGGATTGGAAC 1 0 16707 CASAVA_Build 5 25646362 6I TCTGCAGAAA ------/AAAAAT AAAAATAAAA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 AAAAAT 1 2 16708 CASAVA_Build 5 25649330 1D CAAAAATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 23 8 T 12 11 16709 CASAVA_Build 5 25652507 1D AACTTAAATG A/- AAAAAATCTT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 7 6 16710 CASAVA_Build 5 25666325 1I CAGGAAGTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 9 10 16711 CASAVA_Build 5 25674634 1I GTGAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 10 11 16712 CASAVA_Build 5 25684769 2I CCATATTTAC --/AA AATCCCCAAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 2 4 16713 CASAVA_Build 5 25692870 1D AAGTTGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 13 12 16714 CASAVA_Build 5 25700384 1I CTGCCTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 20 0 13 7 A 13 14 16715 CASAVA_Build 5 25709593 4D GTTCCCCCCC AAAA/---- AAAAAAAAAC 3070 hom 101 het 47 0 36 11 A 13 9 16716 CASAVA_Build 5 25721094 7D TTACTGTTTC ACTTTCT/------- ACTTTCTACT 3070 hom 75 het 37 0 26 12 ACTTTCT 3 2 16717 CASAVA_Build 5 25726029 2I GTACTTGTTC --/AT ATATATATAT 3070 hom 97 het 41 0 33 8 AT 5 6 16718 CASAVA_Build 5 25729515 3I GACTTCCTCT ---/CAA CAACAACAAC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 CAA 5 6 16719 CASAVA_Build 5 25736776 1I GCACTTCATT -/C TTTTTTTATG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 0 1 16720 CASAVA_Build 5 25743855 1I CTAGAAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 29 1 19 9 T 13 14 16721 CASAVA_Build 5 25750468 1I CAGAAGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 10 11 16722 CASAVA_Build 5 25751580 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCACTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AG 1 2 16723 CASAVA_Build 5 25753552 2I TTGTAATCAT --/TA TTTTGCATAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TA 0 1 16724 CASAVA_Build 5 25762073 1D AAATTAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 10 9 16725 CASAVA_Build 5 25769261 10D TTGCTTTTAC AAAGATTTTA/---------- AAAGGAGTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 7 AAAGATTTTA 1 0 16726 CASAVA_Build 5 25778147 1D AATAAATACA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 80 het 43 1 37 5 T 9 8 16727 CASAVA_Build 5 25783312 1D GTTTTAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 9 8 16728 CASAVA_Build 5 25784297 1I TTATTTTCAC -/A AAAAAAACCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 7 8 16729 CASAVA_Build 5 25789314 1D ATGGATGCCA G/- GGGGGCGTGC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 G 6 5 16730 CASAVA_Build 5 25790151 1D GATAAGGACC T/- TTTTTAAGGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 6 5 16731 CASAVA_Build 5 25793775 1D TGAGTTTCTA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 49 het 21 0 17 4 T 8 7 16732 CASAVA_Build 5 25795300 2D ATACATCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 13 11 16733 CASAVA_Build 5 25796900 1D TTTTTTTGTG T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 7 6 16734 CASAVA_Build 5 25797746 1D AATACAAAAA T/- AAAATCAGCT 2921 hom 24 het 9 0 8 1 T 1 0 16735 CASAVA_Build 5 25815149 4I TTGTCACAAG ----/AATT AATAAATAGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AATT 0 1 16736 CASAVA_Build 5 25817433 2I TGATTATTGA --/AT ATGTTATTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AT 1 2 16737 CASAVA_Build 5 25841092 1D TTAGCTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 10 9 16738 CASAVA_Build 5 25851705 3I TATAATAAAA ---/TAT TATTAGATTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TAT 1 2 16739 CASAVA_Build 5 25852204 4I TGATAAAATA ----/ATTG ATTAAATTGC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATTG 0 1 16740 CASAVA_Build 5 25853078 1D TATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 400 het 400 ref 21 10 2 9 T 13 12 16741 CASAVA_Build 5 25854002 1I ACAGGGGCCT -/A AGGAGGCAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 2 16742 CASAVA_Build 5 25857536 5I20M1I AGAATTACCT -----AAAAGATTGCAATTTAAGCC-/AAAACAAAAGATTGCAATTTATGCCA AAAAATTTAC 3070 hom 120 het 35 0 41 3 N/A 0 0 16743 CASAVA_Build 5 25858923 24D CTCACATCCT GCTGATTGGTCCATTTTACAGAGA/------------------------ GCTGATTGGC 3070 hom 58 het 24 0 20 4 GCTGATTGGTCCATTTTACAGAGA 1 0 16744 CASAVA_Build 5 25864033 1D CAAATAACAA C/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 1 0 16745 CASAVA_Build 5 25865261 1I TAGGAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1147 hom 26 3 15 8 A 14 15 16746 CASAVA_Build 5 25868892 3I CTGTAGGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 TTG 5 6 16747 CASAVA_Build 5 25869545 1I TCTAATGTTC -/T TTTTTTATTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 6 7 16748 CASAVA_Build 5 25873767 1D TTTTGAACAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 9 8 16749 CASAVA_Build 5 25874234 1D TGGCTTCTTT C/- CCTTAAACCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 3 2 16750 CASAVA_Build 5 25874817 1I CAAGCCCCTC -/A AATTTTTATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 3 16751 CASAVA_Build 5 25884254 1D TTTCTGTCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 10 9 16752 CASAVA_Build 5 25887849 1D ACAATCTGGC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 71 het 33 0 23 13 A 9 8 16753 CASAVA_Build 5 25890155 1I CATCAGACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 103 hom 23 1 18 4 T 9 10 16754 CASAVA_Build 5 25903982 1I AAGAGTCGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 23 1 18 4 A 10 11 16755 CASAVA_Build 5 25904561 1I ATAGTAGTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 8 16756 CASAVA_Build 5 25906336 1I ATGCAGCATA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 148 het 56 0 50 6 T 7 8 16757 CASAVA_Build 5 25913086 1I AGGAATACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 67 hom 38 1 27 10 A 9 10 16758 CASAVA_Build 5 25913935 4D CCAGCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 AAAC 5 4 16759 CASAVA_Build 5 25918274 1D AATTGCGCCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 132 het 50 0 45 6 T 9 8 16760 CASAVA_Build 5 25923577 2I TTTGAGCCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 34 0 24 10 A 14 16 16761 CASAVA_Build 5 25931906 1I GTGTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 490 hom 33 2 27 4 T 11 12 16762 CASAVA_Build 5 25933907 1D TAAAAAGTCA T/- TAAAAAACCC 3070 het 59 hom 36 1 31 5 T 2 1 16763 CASAVA_Build 5 25935852 1I CAGTGTTGGA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 6 7 16764 CASAVA_Build 5 25939459 1I TGATGAATGG -/A TTCAGTAAGG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 0 1 16765 CASAVA_Build 5 25953601 1I GAAAAAAAAA -/G CAAGAACCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 16766 CASAVA_Build 5 25958877 20I CCAATCAGTA --------------------/TTTGGTGCTTTCTTCATTAC TTTTTTCAGG 3070 hom 114 het 37 0 37 2 TTTGGTGCTTTCTTCATTAC 0 1 16767 CASAVA_Build 5 25960978 2D ATTGTAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 40 0 30 11 A 16 14 16768 CASAVA_Build 5 25970991 1I TATACTGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 44 0 32 12 A 9 10 16769 CASAVA_Build 5 25977750 4I TTACTAATTA ----/TTAG TTAGTATGCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTAG 1 2 16770 CASAVA_Build 5 25978417 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAATTGAT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 6 5 16771 CASAVA_Build 5 25981083 1D TTTTTTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 A 11 10 16772 CASAVA_Build 5 25981650 1D CTTATTGTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 10 9 16773 CASAVA_Build 5 25991185 1D TGTACCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 29 0 26 3 T 13 12 16774 CASAVA_Build 5 25997166 1I CCCAAACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 9 10 16775 CASAVA_Build 5 26001158 1I GAAAAAGGGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 10 16776 CASAVA_Build 5 26008612 10D CAGGATAAGC ATGCTACTAT/---------- ATGCTACTAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 ATGCTACTAT 2 1 16777 CASAVA_Build 5 26008968 1D AAAACAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 40 0 32 10 A 10 9 16778 CASAVA_Build 5 26009648 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 246 hom 37 1 25 11 A 11 12 16779 CASAVA_Build 5 26009767 1D ACACTCTGAT A/- ACCCTCCACC 3070 hom 126 het 44 0 42 3 A 2 1 16780 CASAVA_Build 5 26011176 2I CTATCTTCTG --/TC TCTGAAATTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TC 1 2 16781 CASAVA_Build 5 26011668 1I AACTGAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1295 hom 44 4 33 7 T 11 12 16782 CASAVA_Build 5 26019373 1D TTTATTTGTA T/- ACTTTTTTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 0 16783 CASAVA_Build 5 26021031 2D TGTTTCATTT CA/-- CACACACACA 3070 hom 51 het 27 0 18 9 CA 8 7 16784 CASAVA_Build 5 26022261 1D GATGTTTGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 22 8 T 10 9 16785 CASAVA_Build 5 26022476 1I AACTCAGAAA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 7 8 16786 CASAVA_Build 5 26022630 2D CACTGGTAAA AT/-- AAATTGATGA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AT 1 0 16787 CASAVA_Build 5 26025723 4D TTGCACACTT AATA/---- AAATACAATG 3070 hom 72 het 29 0 25 5 AATA 1 0 16788 CASAVA_Build 5 26026361 1D CTGGGAAACC A/- AAAAAAAACT 3070 het 135 hom 33 1 28 5 A 9 8 16789 CASAVA_Build 5 26030566 1I AACTCCAGAG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 7 8 16790 CASAVA_Build 5 26042360 2D TATGTTGGAG TT/-- CTATTTTACA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 2 0 16791 CASAVA_Build 5 26044893 2I ACAATTACAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 10 12 16792 CASAVA_Build 5 26046799 1I TTTTTCTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 49 het 22 0 17 5 T 9 10 16793 CASAVA_Build 5 26053755 3D AAAAACATAA CAC/--- CACCACCACC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CAC 5 4 16794 CASAVA_Build 5 26064371 1I AAAGTCAGCA -/T TTTTAATGTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 4 5 16795 CASAVA_Build 5 26081086 1I AGAAGACTCC -/A ACCAACAACC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 1 2 16796 CASAVA_Build 5 26081180 1I AATTATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 755 hom 33 3 19 11 A 15 16 16797 CASAVA_Build 5 26083118 1D TCTGGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 29 1 20 8 A 11 10 16798 CASAVA_Build 5 26087888 1D TGATTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 23 1 16 6 A 12 11 16799 CASAVA_Build 5 26089463 1I GTAATTTACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 652 hom 46 3 29 14 A 11 12 16800 CASAVA_Build 5 26094915 1I TGATTAGCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 8 9 16801 CASAVA_Build 5 26101459 1I GTCTCAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1594 hom 42 5 33 4 A 10 11 16802 CASAVA_Build 5 26102179 1D ATTTATTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 26 1 17 8 A 11 10 16803 CASAVA_Build 5 26112700 4D AAGCAAGGGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 28 2 18 12 A 16 12 16804 CASAVA_Build 5 26112910 1I CAATAACAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 396 hom 41 1 36 4 A 8 9 16805 CASAVA_Build 5 26115219 1I GGTTGCTATA -/T TTTTTTGAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 6 7 16806 CASAVA_Build 5 26127170 2D TTGGTAACAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 9 T 14 12 16807 CASAVA_Build 5 26128175 3D ATGCTGAGAA AAC/--- AAGCATGGTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAC 1 0 16808 CASAVA_Build 5 26128437 1I GCTATTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 348 hom 43 1 37 5 T 9 10 16809 CASAVA_Build 5 26129322 2I TGTGCCACCG --/CA CACTTTGTTG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 CA 1 2 16810 CASAVA_Build 5 26131090 1I ATCTTTGAGG -/A AGTGCTCACT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 1 2 16811 CASAVA_Build 5 26137257 1I ATATTTCGGT -/A AAAGTTATGG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 3 4 16812 CASAVA_Build 5 26137742 1D ACTCCTCAAC A/- AAGTAGGCAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 2 16813 CASAVA_Build 5 26152732 1I TTTGAGCAAA -/G ATTTTATTTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 0 1 16814 CASAVA_Build 5 26154233 2D GTACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 75 het 31 0 25 7 AT 6 5 16815 CASAVA_Build 5 26156044 1D TTTATTAGTG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 75 het 26 0 26 1 T 8 7 16816 CASAVA_Build 5 26160112 1D TGCAAAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1737 hom 48 4 31 13 A 14 13 16817 CASAVA_Build 5 26234491 1I CCAATATATA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 7 8 16818 CASAVA_Build 5 26234795 1I TAAAGAAAAA -/G TTTAACATTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 16819 CASAVA_Build 5 26237423 6I CATGTAATAC ------/TATAAA TATAGACATC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TATAAA 0 1 16820 CASAVA_Build 5 26238369 1D CATCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 10 16821 CASAVA_Build 5 26240232 1I AAAAGGTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 31 2 24 5 T 10 11 16822 CASAVA_Build 5 26242349 1I CCGGTGAAAC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 7 8 16823 CASAVA_Build 5 26247626 2I GCCACAATGC --/AT ATATGTGTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 2 3 16824 CASAVA_Build 5 26254619 2D TGGAAGAGAG GA/-- GAGAGGAGGA 3070 hom 85 het 30 0 26 4 GA 3 2 16825 CASAVA_Build 5 26255242 1I TTGCCACGGG -/C CTGGGGTGGT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 C 1 2 16826 CASAVA_Build 5 26261339 1D CTCCTCCCCA T/- TTCTCCAGCT 3070 hom 47 het 20 0 15 5 T 3 2 16827 CASAVA_Build 5 26261544 1I GTCTCCAGCT -/G AAAGACCCTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 0 1 16828 CASAVA_Build 5 26264165 1D CAAATCAACG T/- TATCTTTTAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 2 1 16829 CASAVA_Build 5 26280411 5I ATATTTATAC -----/ATAAT ATATTATAAT 1355 hom 7 het 3 0 3 0 ATAAT 0 1 16830 CASAVA_Build 5 26293375 1D GGTATGCAGC A/- AAAAAAAAAA 1304 het 1304 ref 43 27 3 14 A 13 12 16831 CASAVA_Build 5 26329073 1I ACTATATGGC -/A AAAAATGATG 3070 hom 143 het 54 0 47 7 A 5 6 16832 CASAVA_Build 5 26376478 1D TTGGTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 803 het 803 ref 43 32 3 8 A 11 10 16833 CASAVA_Build 5 26379786 4D AGTATGCTAG GGCT/---- GGCTGCCCAT 3070 hom 120 het 44 0 41 6 GGCT 2 1 16834 CASAVA_Build 5 26383439 1D TGTGACTAAA T/- GGCTTTAATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 0 16835 CASAVA_Build 5 26388575 1I CTTCAAATAT -/A AAAAGTAACT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 4 5 16836 CASAVA_Build 5 26389891 1I ATTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 32 2 26 4 T 12 13 16837 CASAVA_Build 5 26400604 1I AGTCCCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 26 2 17 7 T 10 11 16838 CASAVA_Build 5 26412328 1I TCACAAAAAT -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 16839 CASAVA_Build 5 26415976 2I GTGTGTCCAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 114 het 48 0 39 9 AC 6 7 16840 CASAVA_Build 5 26434363 19I TTATATATTT -------------------/ATATATTATATATAATTAC ATATATTATA 3042 hom 21 het 7 0 8 0 ATATATTATATATAATTAC 0 1 16841 CASAVA_Build 5 26449822 2I ATATCAGACA --/TC TCTGCTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 TC 1 2 16842 CASAVA_Build 5 26460676 1D TGCTTATGCA T/- TTTTTTTTTT 1333 het 1333 ref 36 25 3 8 T 13 12 16843 CASAVA_Build 5 26534921 1D TAATTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 31 9 T 11 10 16844 CASAVA_Build 5 26536575 2D ATAAATAAAC AT/-- GTGTATATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AT 1 0 16845 CASAVA_Build 5 26580705 1D CTTTGTCTGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 34 0 26 9 A 9 8 16846 CASAVA_Build 5 26652827 1I TACATGAGAA -/T TTTTATTTTC 3070 het 3070 hom 50 13 30 7 T 4 5 16847 CASAVA_Build 5 26673796 1I CTCTCAGGAG -/C AACTAGCAAC 3070 hom 85 het 32 0 27 5 C 0 1 16848 CASAVA_Build 5 26687524 1D AGAGAGAAAC A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 115 het 46 0 39 7 A 8 7 16849 CASAVA_Build 5 26750526 3I TGTTACTATT ---/CTC CTATTAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CTC 0 1 16850 CASAVA_Build 5 26757743 3I CTGGAAGCTG ---/AGA AGTTTATGAC 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 AGA 0 1 16851 CASAVA_Build 5 26773084 1D ATCTCCCTCC T/- TTTTTTTTCC 1158 het 1158 ref 53 45 3 6 T 9 8 16852 CASAVA_Build 5 26814852 2D ATTCTAACAC AT/-- GTGTGCTCTG 3070 het 3070 hom 55 19 27 9 AT 1 0 16853 CASAVA_Build 5 26854825 7D TTTAAGCCAG TCTGAAA/------- TCTGAAATAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 TCTGAAA 2 1 16854 CASAVA_Build 5 26855916 2D ATAAATTAGC AA/-- AGTTTCGGAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 3 1 16855 CASAVA_Build 5 26858852 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 10 11 16856 CASAVA_Build 5 26873230 5I ATGTTATAAC -----/ATTAT AAGTAATACA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ATTAT 0 1 16857 CASAVA_Build 5 26894145 1D AGCAGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 A 10 9 16858 CASAVA_Build 5 26900059 64D ATATAGGTGT ATATATATGATATATATCATATATATGACGTCATATATATGATCTATATCATATATATGACGTC/---------------------------------------------------------------- ATATATATGA 2770 het 2770 ref 23 29 10 4 ATATATATGATATATATCATATATATGACGTCATATATATGATCTATATCATATATATGACGTC 1 0 16859 CASAVA_Build 5 26909700 3D TTAAAATCAT TAC/--- TTTTATAAGT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TAC 1 0 16860 CASAVA_Build 5 26940247 1D TGGTAACCCT A/- AAAAGCATTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 5 4 16861 CASAVA_Build 5 26941678 1D GGAAATTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 38 0 31 8 T 10 9 16862 CASAVA_Build 5 26944138 1I63M1I5M1I AGATGAAAGC -AAAATGATAAAGTGATTTACATTCCCCCCACACAAATCACTTTATGATGTGCAGAAGTTCAAC-AAGTG-/AAAAATGATAAAGTGATTTACATTCCCCCCACACAAATCACTTTATGATGTGCAGAAGTTCAACAAAGTGT TTTTTTTTTA 3070 hom 194 het 41 0 67 10 N/A 0 0 16863 CASAVA_Build 5 26947540 1D TGATCACAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 10 9 16864 CASAVA_Build 5 26959102 3D TGCCAGTAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 AAC 5 4 16865 CASAVA_Build 5 26960734 1I ATGTCCCTGC -/A AAGGACATGA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 2 3 16866 CASAVA_Build 5 26962169 1I AATAACAGAC -/A AACAGAGAGA 2466 hom 12 het 6 0 5 1 A 2 3 16867 CASAVA_Build 5 26967994 1I TTGAATATCA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 8 16868 CASAVA_Build 5 26968855 1I TTATATAGAT -/A AAAATTTAGA 1946 hom 10 het 5 0 4 1 A 4 5 16869 CASAVA_Build 5 26970799 1D AAAGATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 35 0 23 12 A 12 11 16870 CASAVA_Build 5 26976028 1I ACTCAGTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 13 14 16871 CASAVA_Build 5 26978756 1I TTTGTTTCTG -/T TTTGTTTTCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 3 4 16872 CASAVA_Build 5 26980107 1D ATTTCCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 11 10 16873 CASAVA_Build 5 26980631 2I AATCCTGATT --/TC TCTGTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TC 1 2 16874 CASAVA_Build 5 26980836 2I CTGAGTGAAA --/CT CTATCATCCA 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 CT 1 2 16875 CASAVA_Build 5 26989837 4D TAGATCAAAA AAAT/---- AAATAAGTGA 3070 het 3070 ref 37 16 15 7 AAAT 2 1 16876 CASAVA_Build 5 26992867 1D TTCCATGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 699 hom 26 4 12 10 T 13 12 16877 CASAVA_Build 5 26993727 11D CATTATTTTA TATACGGATTC/----------- TATTTAAATA 3070 het 3070 ref 36 22 17 1 TATACGGATTC 1 0 16878 CASAVA_Build 5 26995768 1I GTGTATAGGG -/T TTTCTTTTGG 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 3 4 16879 CASAVA_Build 5 26996675 2I CTATCCACAC --/TT TGAAAATCTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 3 16880 CASAVA_Build 5 26996913 3D CCTTGTCCTC CTT/--- CTCTTAAAGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 6 CTT 1 0 16881 CASAVA_Build 5 27000003 2D CAAGAAAAGA CT/-- CTTATCTTCA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 CT 2 1 16882 CASAVA_Build 5 27004160 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 2586 hom 25 9 13 3 T 8 9 16883 CASAVA_Build 5 27005736 1I CTGGCTGGTT -/A AAAAAATGTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 6 7 16884 CASAVA_Build 5 27006622 1D TTATTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 A 11 10 16885 CASAVA_Build 5 27007631 2D GCATTAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 37 0 30 9 AC 8 7 16886 CASAVA_Build 5 27009174 1D ATGACCTAAG A/- AATTGGAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 3 2 16887 CASAVA_Build 5 27010211 1I TGATAGGTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 9 10 16888 CASAVA_Build 5 27014043 1I AACACATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 364 hom 25 1 20 4 A 8 9 16889 CASAVA_Build 5 27014447 1I CAAAAATAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 9 10 16890 CASAVA_Build 5 27014538 1D AATTAAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 9 8 16891 CASAVA_Build 5 27015317 1D TAGAAAAAAA T/- TAAAAAAACA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 2 1 16892 CASAVA_Build 5 27017743 1D TAGGTTTTTT A/- AAATGATTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 4 3 16893 CASAVA_Build 5 27019596 1D ACATATTTTA C/- TTAGATTCTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 0 16894 CASAVA_Build 5 27021929 1I AGTCCCTATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 8 9 16895 CASAVA_Build 5 27033571 1I CAAATGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 33 1 24 8 T 13 14 16896 CASAVA_Build 5 27040800 1D TACATTAAAT A/- AAAAACAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 6 5 16897 CASAVA_Build 5 27044354 1I ACCCTCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 31 1 21 9 A 11 12 16898 CASAVA_Build 5 27053297 1I TCCACTGAAA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 9 16899 CASAVA_Build 5 27053783 2I GTATACATTG --/TT TTTTTTTATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 9 16900 CASAVA_Build 5 27056593 2D TTCACACACG CA/-- CACACACACA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CA 9 8 16901 CASAVA_Build 5 27066213 1D AAAAAGCCAC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 9 8 16902 CASAVA_Build 5 27066674 1I CAAATACATA -/T TAACACTCAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 2 16903 CASAVA_Build 5 27080751 1I TTACTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 2440 het 2440 ref 23 12 8 3 T 13 14 16904 CASAVA_Build 5 27090679 1I CTGCAAGTCC -/T TTTGGTTTGG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 3 4 16905 CASAVA_Build 5 27097649 1I ATTCATACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 10 11 16906 CASAVA_Build 5 27104859 1D GGAAAAAAAA T/- ATTTGTGGGT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 T 1 0 16907 CASAVA_Build 5 27135992 2D CATGCAGTTA TT/-- TTGTTTTATT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 4 2 16908 CASAVA_Build 5 27138641 1I CCTGGAGAGA -/C GTTTTTGGAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 C 0 1 16909 CASAVA_Build 5 27141694 2I TGTGTGTATA --/TG TGTGTGTGTG 2357 het 2357 ref 31 11 8 12 TG 8 9 16910 CASAVA_Build 5 27141741 10D GAATTTAAAA ATATTTTGTC/---------- ATATTTTGTC 3070 hom 93 het 42 0 32 10 ATATTTTGTC 2 1 16911 CASAVA_Build 5 27145204 1I GGGGAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 9 17 10 T 10 11 16912 CASAVA_Build 5 27158094 1I ATTTTTTTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 8 9 16913 CASAVA_Build 5 27158753 1D TCTACAAAAA T/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 37 13 18 6 T 1 0 16914 CASAVA_Build 5 27160431 1I CTGAAACATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 9 10 16915 CASAVA_Build 5 27161729 2I CTAGGGCTCC --/TA TATAACAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 TA 2 3 16916 CASAVA_Build 5 27162907 1D TGATAAGGAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 2432 hom 35 7 18 11 A 9 8 16917 CASAVA_Build 5 27164280 3D19M5I AACTTTTATT TTCTTTAATGAGTTTTTATTTC-----/---TTTAATGAGTTTTTATTTCTCTTA TCTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 42 24 19 3 N/A 0 0 16918 CASAVA_Build 5 27164378 1D GCAATGTTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 9 8 16919 CASAVA_Build 5 27172091 4I AAGGCAGCAG ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 GA 5 7 16920 CASAVA_Build 5 27176257 1D AGAATAGCTT A/- AAATAAGTAT 3070 het 2976 hom 23 8 12 4 A 4 3 16921 CASAVA_Build 5 27184651 2I CACATTAAAC --/AG AAAATTTATC 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 AG 0 1 16922 CASAVA_Build 5 27186654 1I AACCCCGTGT -/C TACTAAAAAT 2546 het 2546 ref 19 11 6 2 C 0 1 16923 CASAVA_Build 5 27195293 3D ACACTGTAAC TCT/--- TCTTGTAGCC 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 TCT 2 1 16924 CASAVA_Build 5 27195409 2D CCAAATAGAA AG/-- AGTCTCTCAT 3070 het 3070 ref 45 21 16 9 AG 2 1 16925 CASAVA_Build 5 27196759 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 A 11 10 16926 CASAVA_Build 5 27197678 1D TAACATAAAC A/- AAAGATAACT 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 A 4 3 16927 CASAVA_Build 5 27197805 1I ACATAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 A 10 11 16928 CASAVA_Build 5 27203406 1D GCTTATAACA C/- CAGATATACA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 2 1 16929 CASAVA_Build 5 27204595 2I GGCAGTAAAT --/AC ATCACATTTT 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 AC 0 1 16930 CASAVA_Build 5 27214597 1I GTTAAATAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 432 hom 29 1 24 4 A 9 10 16931 CASAVA_Build 5 27216132 1D GTGGTTATTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 8 7 16932 CASAVA_Build 5 27217998 1I GAGCAAAATG -/C TTTCCTCATA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 C 0 1 16933 CASAVA_Build 5 27222017 2I TAAAAATAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 T 10 12 16934 CASAVA_Build 5 27223550 2D AGCCTGAGCA AC/-- AGAGTGAAAC 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 AC 1 0 16935 CASAVA_Build 5 27224174 2D CTTCCAGAAA TC/-- TGTTTTGCTA 3070 het 3070 ref 49 23 21 6 TC 1 0 16936 CASAVA_Build 5 27225156 1I36M1D ATATTTATTA -TTTTATCCTCTAGCATTTATCTCTGACAAAACATAGT/TTTTTATCCTCTAGCATTTATCTCTGACAAAACATAG- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 29 19 9 N/A 0 0 16937 CASAVA_Build 5 27228818 5I CTGTGACACA -----/CCATT CCATTTACCT 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 CCATT 1 2 16938 CASAVA_Build 5 27237911 1D GTAGAGACAC A/- ACAAAAAAAA 2778 het 2778 ref 24 17 7 0 A 2 1 16939 CASAVA_Build 5 27238990 1D TACAGTAACC A/- AAACAGCATG 3070 het 1906 hom 14 4 9 2 A 4 3 16940 CASAVA_Build 5 27239519 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAC 2008 het 2008 ref 24 12 6 6 A 10 9 16941 CASAVA_Build 5 27242718 1D ATGAAAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 10 9 16942 CASAVA_Build 5 27245103 1D ATATTTTACA T/- TTTTTTTTTA 2325 het 2325 ref 16 8 5 3 T 10 9 16943 CASAVA_Build 5 27257380 1I GTTACATATA -/T GTGAAAATAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 0 1 16944 CASAVA_Build 5 27263586 2I TATTTTACAC --/TG TCTTAGAAAT 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 TG 0 1 16945 CASAVA_Build 5 27281170 1I ATGAACTCAT -/C CTTTTATATG 2861 het 2861 ref 22 11 7 4 C 1 2 16946 CASAVA_Build 5 27294486 1D GGACCTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 11 10 16947 CASAVA_Build 5 27296607 1I GTTGAACAAT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 7 8 16948 CASAVA_Build 5 27310375 1D CAAGCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 11 10 16949 CASAVA_Build 5 27345391 1I CAGAAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2526 hom 33 9 17 7 A 15 16 16950 CASAVA_Build 5 27349795 1D CAATGAAGCC T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 8 7 16951 CASAVA_Build 5 27368591 1D ACTATTTGTA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 7 6 16952 CASAVA_Build 5 27396304 2I ATGAAAATAC --/AT AGTGTGTTTG 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 AT 0 1 16953 CASAVA_Build 5 27398887 1I TCAAACATTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 8 9 16954 CASAVA_Build 5 27403649 1D CTGAATACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 12 11 16955 CASAVA_Build 5 27412313 1I AAGTCAAATG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 T 6 7 16956 CASAVA_Build 5 27415183 2I TAATTCTATC --/AT ATGTTTCTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AT 1 2 16957 CASAVA_Build 5 27420346 3I TATTAATATA ---/ATT ATTATTCACT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 ATT 2 3 16958 CASAVA_Build 5 27424133 1D AGAAAAAAAA T/- AACAGCAACA 3070 het 3070 hom 28 13 10 5 T 1 0 16959 CASAVA_Build 5 27432876 1D CTATATCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 26 1 9 16 A 13 12 16960 CASAVA_Build 5 27440027 4I ATTTTAAACC ----/AACT GATACTGATA 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 AACT 0 1 16961 CASAVA_Build 5 27441006 1D TATGATTAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 A 9 8 16962 CASAVA_Build 5 27456816 1I TTGTAGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 11 12 16963 CASAVA_Build 5 27468532 4D TGCCAGTCTC ACTT/---- ACGATAATTA 2970 het 2970 ref 35 25 9 4 ACTT 1 0 16964 CASAVA_Build 5 27470163 5I TTAAGGCTAT -----/AAAAG AAAAGTACAG 3070 hom 129 het 44 0 44 0 AAAAG 1 2 16965 CASAVA_Build 5 27472437 3I TACAGAGAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 55 27 20 8 AAC 5 6 16966 CASAVA_Build 5 27474157 4I TACCAAAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AAAT 2 3 16967 CASAVA_Build 5 27486003 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 AAC 3 4 16968 CASAVA_Build 5 27486926 1D CTTGTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1304 hom 49 4 37 8 T 13 12 16969 CASAVA_Build 5 27491434 1I TAGTTGAAAA -/G CATCAGTTCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 0 1 16970 CASAVA_Build 5 27499107 1I AAAGCGAGAC -/T CGAGAAGCCA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 T 0 1 16971 CASAVA_Build 5 27507327 1I CCTTGGGATA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 6 7 16972 CASAVA_Build 5 27507489 1D CAAATGGAAA T/- TTTTTAAATG 3070 hom 90 het 36 0 30 7 T 6 5 16973 CASAVA_Build 5 27509290 1I GGAAAAAGGG -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 7 16974 CASAVA_Build 5 27510594 1I CTTTCTTGAT -/A ACCAGACTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 2 16975 CASAVA_Build 5 27516597 3I AATGATATAC ---/TAT TATTAAGAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TAT 1 2 16976 CASAVA_Build 5 27522233 1I TGTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 5 hom 43 1 33 9 T 9 10 16977 CASAVA_Build 5 27523174 5D TAAATATTAG TTAAA/----- TTAATGAATT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 TTAAA 1 0 16978 CASAVA_Build 5 27530519 1D AATACCTACA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 9 8 16979 CASAVA_Build 5 27546183 3I CAGTGAAACT ---/TTC TTTTTTTTTT 2005 hom 15 het 31 1 12 18 TTC 0 1 16980 CASAVA_Build 5 27562507 1I ATTTTTTTTT -/C CATCTTAAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 1 2 16981 CASAVA_Build 5 27562773 1I ACTTTAAATA -/T TTTTTCTTTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 5 6 16982 CASAVA_Build 5 27563155 1D TCTTCATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 11 10 16983 CASAVA_Build 5 27565198 5D GTTTGGCATG ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 hom 82 het 37 0 28 10 ATTTT 5 4 16984 CASAVA_Build 5 27567780 2D ACAGGATGAC AG/-- AGGATGTGAT 3070 hom 157 het 58 0 53 6 AG 2 1 16985 CASAVA_Build 5 27570374 1D CAGTGCCTCA T/- TTTTTTTTTG 1222 het 1222 ref 35 27 3 6 T 10 9 16986 CASAVA_Build 5 27581417 2D TAAATATGGC TA/-- TGTCATTTTT 3070 hom 111 het 40 0 36 6 TA 1 0 16987 CASAVA_Build 5 27584645 3I ATCCTGGAAT ---/ACC ACACGGCCAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 ACC 0 1 16988 CASAVA_Build 5 27585031 1D ATCTTTTGCA T/- TTTTTTGGCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 6 16989 CASAVA_Build 5 27597911 1I TCAGGAGATC -/T TAGACCATCC 3070 het 231 hom 22 1 15 6 T 1 2 16990 CASAVA_Build 5 27601605 3I TTTTATGATG ---/ATA ATGATGATAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATA 0 1 16991 CASAVA_Build 5 27601947 4I TTACAACAAT ----/TGAG TGTCTTCAAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TGAG 0 1 16992 CASAVA_Build 5 27604150 1I TTCCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 33 1 26 6 A 10 11 16993 CASAVA_Build 5 27606402 2I AATGTCAAAC --/AT ATGATTACAT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 AT 1 2 16994 CASAVA_Build 5 27609887 2I ATTTGCAAAC --/TG TGCATCCAAC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TG 1 2 16995 CASAVA_Build 5 27610126 1I TTATTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 5 A 10 11 16996 CASAVA_Build 5 27610651 2D TATAAATGCC AT/-- ATATATATAT 3070 het 177 hom 28 1 23 5 AT 9 8 16997 CASAVA_Build 5 27611570 1D CTAAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 1333 hom 7 het 3 0 3 0 A 11 10 16998 CASAVA_Build 5 27614865 1I TTGCATGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 18 het 22 1 19 2 T 9 10 16999 CASAVA_Build 5 27665408 1I TAATATGACA -/T TTTTGTGGGA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 4 5 17000 CASAVA_Build 5 27695808 2D TAGACTAGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 12 0 9 3 A 12 10 17001 CASAVA_Build 5 27696630 1D TTTATTGGTA C/- ATTATAGGTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 1 0 17002 CASAVA_Build 5 27713201 1D GTTGTGCAAA T/- ACATTGTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 1 0 17003 CASAVA_Build 5 27717718 1I ACAATCTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 9 10 17004 CASAVA_Build 5 27722733 1D TAAAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 11 10 17005 CASAVA_Build 5 27736926 1D TAAATAACTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 8 17006 CASAVA_Build 5 27739349 4I CGAGAGAAAT ----/GAGG GAGGGAGGGA 3070 het 3070 hom 42 12 14 16 GAGG 3 4 17007 CASAVA_Build 5 27748724 1D ATATACAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 12 11 17008 CASAVA_Build 5 27754151 1D TTTTGTGTGC T/- TTTTTTACTT 3070 het 3070 hom 44 22 19 3 T 7 6 17009 CASAVA_Build 5 27755388 4D CATATGAGAT ACTG/---- ACGGATTTCA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 ACTG 1 0 17010 CASAVA_Build 5 27762547 1D TCATATTCGA T/- TTTGTTATAA 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 4 3 17011 CASAVA_Build 5 27763043 2D ACTCAAAAAG AA/-- ATAGTGAAGG 3070 het 3070 ref 38 17 15 8 A 3 1 17012 CASAVA_Build 5 27769384 1I TTGGCTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 36 1 34 1 T 10 11 17013 CASAVA_Build 5 27777353 1D TACATGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 34 1 18 15 A 17 16 17014 CASAVA_Build 5 27779115 2I GTGTGCTGAA --/AG AGACACTTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AG 1 2 17015 CASAVA_Build 5 27784239 1D AAAAGATAGA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 6 het 28 1 17 12 C 11 10 17016 CASAVA_Build 5 27791529 1D ACTCCAGCAC A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 7 17017 CASAVA_Build 5 27798924 2I TCTTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 1324 hom 18 het 8 0 7 1 T 11 13 17018 CASAVA_Build 5 27804127 3I ATGTTTTGTT ---/TTG TTGTTTGTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTG 1 2 17019 CASAVA_Build 5 27805241 1I TGTGTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 955 hom 27 2 16 9 T 10 11 17020 CASAVA_Build 5 27820182 1D TTAACCCTTT G/- TATTACATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 G 1 0 17021 CASAVA_Build 5 27825764 4D AATCGAAGTC AATT/---- AATTAATGGC 3070 hom 75 het 28 0 26 4 AATT 2 1 17022 CASAVA_Build 5 27829283 4D CTATAATAAA TAAC/---- TGTTATACTA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TAAC 1 0 17023 CASAVA_Build 5 27840712 10I ATCTATAATC ----------/TGCCTTTTTT TGCCTTTTCT 3070 hom 68 het 28 0 22 6 TGCCTTTTTT 0 1 17024 CASAVA_Build 5 27843695 1D AGGGTATGTG T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 6 5 17025 CASAVA_Build 5 27845569 1D AAGAGTATTC A/- AAAAAATTTA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 7 6 17026 CASAVA_Build 5 27845645 1I GATTAGTATG -/T TTGTTGAGAG 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 2 3 17027 CASAVA_Build 5 27858036 1I GTGTGAATTG -/A AAAACAAGAG 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 4 5 17028 CASAVA_Build 5 27867542 1I TCTCAGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 712 hom 24 3 15 6 T 15 16 17029 CASAVA_Build 5 27872753 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 8 7 17030 CASAVA_Build 5 27907901 1D CCTACCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 498 hom 24 2 10 13 A 14 13 17031 CASAVA_Build 5 27913978 1I ATTTATTTTT -/A CCTTATTGCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 0 1 17032 CASAVA_Build 5 27914103 11D TAATGTTAGC TGTAGGTTTCT/----------- TGTAGTTTTT 3070 hom 94 het 36 0 32 7 TGTAGGTTTCT 1 0 17033 CASAVA_Build 5 27914218 1I GCTTTTTTTT -/A ATCTATTGAT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 A 1 2 17034 CASAVA_Build 5 27919942 4D TGTGATGTTC CCCG/---- CCCGCCCTGT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 CCCG 2 1 17035 CASAVA_Build 5 27924498 4I TCAATCACTG ----/ATAC ATACCCTTTC 3070 hom 38 het 17 0 13 4 ATAC 1 2 17036 CASAVA_Build 5 27931096 1I AATTAGTTAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 7 8 17037 CASAVA_Build 5 27937175 1I CATCAAGTCA -/C CATGTGACCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 1 2 17038 CASAVA_Build 5 27940430 1D CCATTGTTAA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 7 17039 CASAVA_Build 5 27941190 5I TTTATTTTGT -----/TTTAC TTTATTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTTAC 0 1 17040 CASAVA_Build 5 27941819 4I ACTGTATACT ----/TATC TATCTATCTA 3070 hom 84 het 46 0 29 17 TATC 4 5 17041 CASAVA_Build 5 27943420 1D GGAGAGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 21 7 A 15 14 17042 CASAVA_Build 5 27944100 4D GTGGATACTT AGAG/---- AGAAGGTGAG 3070 hom 129 het 44 0 42 2 AG 3 1 17043 CASAVA_Build 5 27953210 1I AGTTTTCAAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 8 9 17044 CASAVA_Build 5 27958407 1I AGTGAACTTA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 8 17045 CASAVA_Build 5 27960148 5D AGTTAACACT TTTAA/----- TTAAAGAACT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 TTTAA 1 0 17046 CASAVA_Build 5 27964031 1D TTTGCAGAAG A/- AATGCCAGTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 3 2 17047 CASAVA_Build 5 27967718 1I AACATTATAT -/A AAACAGCAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 3 4 17048 CASAVA_Build 5 27971955 1D TTGCTTTCAT A/- TCACACTGTG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 1 0 17049 CASAVA_Build 5 27973808 1D ATAATTGATA T/- TAATAAGTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 2 1 17050 CASAVA_Build 5 27975709 1D TCTTTTTCAA T/- TTTCTTTAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 1 T 4 3 17051 CASAVA_Build 5 27976121 9D CTGCGACAGT CACTTTTGG/--------- CACTTTTGGT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 CACTTTTGG 2 1 17052 CASAVA_Build 5 27992365 1D AATTTGTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 83 het 35 0 28 7 T 9 8 17053 CASAVA_Build 5 28004819 1I TTAATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 10 7 T 10 11 17054 CASAVA_Build 5 28016923 1D TCAAAATCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 89 het 39 0 29 12 A 10 9 17055 CASAVA_Build 5 28034949 1I AATACCAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 233 hom 39 1 33 5 T 9 10 17056 CASAVA_Build 5 28036175 1I GCCTGTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 569 hom 42 2 25 15 T 13 14 17057 CASAVA_Build 5 28051240 1I CAAAGAACCA -/G GTTATATACC 3070 hom 105 het 41 0 31 10 G 1 2 17058 CASAVA_Build 5 28051897 3I AAATAACTAA ---/CTT CTTGCTCTTT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 CTT 1 2 17059 CASAVA_Build 5 28053799 1I CTCATATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 10 11 17060 CASAVA_Build 5 28056973 1D ACTATTGGAT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 101 het 43 0 34 10 A 8 7 17061 CASAVA_Build 5 28069910 1D GTATTGGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1282 hom 52 8 20 25 T 11 10 17062 CASAVA_Build 5 28073049 3D CTCCAAAGTA GCT/--- GAGACTACAA 3070 het 2906 hom 17 7 10 1 GCT 1 0 17063 CASAVA_Build 5 28078472 11D GATAGCTCTG ACCCAGTGCAA/----------- AGTTCCATTG 3070 het 3070 ref 53 31 20 3 ACCCAGTGCAA 1 0 17064 CASAVA_Build 5 28087263 1I ATGACAACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 9 10 17065 CASAVA_Build 5 28089363 1I ACACACACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 26 0 23 3 T 10 11 17066 CASAVA_Build 5 28090127 1D CCAAAACAAA G/- GAACTACAGG 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 2 1 17067 CASAVA_Build 5 28098487 1I GCTGAAGAAC -/T TTGGAGTCTG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 2 3 17068 CASAVA_Build 5 28099692 10D TGTTTATGAA ATAATGCAAT/---------- ATATACTCTT 3070 het 3070 ref 39 20 20 4 ATAATGCAAT 1 0 17069 CASAVA_Build 5 28105593 4I GTGTTTGTGG ----/ACTT ACTTTAATTG 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 ACTT 1 2 17070 CASAVA_Build 5 28108725 2D TAAAAGATAA AT/-- ATATATATAT 2544 het 1331 hom 14 5 6 3 AT 8 7 17071 CASAVA_Build 5 28109832 2D GCTAATATTT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 49 hom 26 1 13 12 AG 10 9 17072 CASAVA_Build 5 28132269 3D ATTTGAAAAA AAC/--- AATTCTTCCT 3070 het 3070 ref 29 15 11 5 AAC 1 0 17073 CASAVA_Build 5 28132749 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1592 het 1478 hom 17 6 5 6 A 13 14 17074 CASAVA_Build 5 28137581 1D AAAAAACCCA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 8 7 17075 CASAVA_Build 5 28146076 2I AAAGTGAAAC --/AT GTCTATTACT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AT 0 1 17076 CASAVA_Build 5 28154610 3D TTCTGACTAA TAT/--- TATTACATTT 3070 het 1359 hom 32 8 16 8 TAT 2 1 17077 CASAVA_Build 5 28154635 1D GAATGCTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 34 1 19 15 A 11 10 17078 CASAVA_Build 5 28168606 3D AGGGGAGAGG GTT/--- GTTCAATTTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 GTT 2 1 17079 CASAVA_Build 5 28174379 2D TAAGTAAAAT TA/-- TATATATATA 1735 het 1181 hom 9 3 5 1 TA 6 5 17080 CASAVA_Build 5 28180167 3D ATTCTTAAAA CAT/--- CATTTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 CAT 2 1 17081 CASAVA_Build 5 28184151 1I GAAAGCAGGT -/A AGTAGTATGG 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 1 2 17082 CASAVA_Build 5 28184690 1D AGGAATTCTT A/- TGCACATTAT 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 A 1 0 17083 CASAVA_Build 5 28185822 5I CTAAAATGAA -----/ATTTT ATTTTATGTA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 ATTTT 1 2 17084 CASAVA_Build 5 28194441 1D ACATTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 T 12 11 17085 CASAVA_Build 5 28198492 3D TCAATAAGCA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 69 het 31 0 23 9 AAT 7 6 17086 CASAVA_Build 5 28208189 2D ACCTATAAAG AC/-- ACACACACAC 1267 het 1267 ref 48 35 3 10 AC 10 9 17087 CASAVA_Build 5 28211041 1D TTAGCTCATA T/- TTTGGTTCAT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 4 3 17088 CASAVA_Build 5 28213068 2I TGTTTTTTTT --/TG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 TG 0 1 17089 CASAVA_Build 5 28232021 1I ATATACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2707 hom 24 7 13 4 T 10 11 17090 CASAVA_Build 5 28238848 2I AGAAATTTTG --/TT ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 0 2 17091 CASAVA_Build 5 28246233 1D CTTTAAATTT C/- CTTTTGTCTT 3070 het 3070 hom 33 12 21 0 C 2 1 17092 CASAVA_Build 5 28246515 1I TATGAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2049 hom 19 8 8 3 A 10 11 17093 CASAVA_Build 5 28248639 2D AAAATATAAC TG/-- TTATAAGTTT 3070 het 3070 hom 53 22 24 8 TG 1 0 17094 CASAVA_Build 5 28254170 1I CATCTCGGGG -/A AAAAAAAAAA 2167 het 1307 hom 10 5 5 0 A 13 14 17095 CASAVA_Build 5 28255775 1I TTATCATCAG -/T TTTCCAGTTT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 T 3 4 17096 CASAVA_Build 5 28258107 1D TGATGATAAC T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 7 6 17097 CASAVA_Build 5 28271439 1I TCCTGAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 13 14 17098 CASAVA_Build 5 28273621 2D30M2I CCTTTCTTTC TTTCTTTCTGTTTTCTTTCTTCTTTCTTTCTT--/--TCTTTCTGTTTTCTTTCTTCTTTCTTTCTTTC TCTCTCTCTC 2839 het 2839 ref 20 11 8 9 N/A 0 0 17099 CASAVA_Build 5 28278511 1D CTATTTTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 10 9 17100 CASAVA_Build 5 28295141 1I TAAAAATAAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 8 9 17101 CASAVA_Build 5 28301037 1D ACCAGGAAAA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 19 21 0 T 4 3 17102 CASAVA_Build 5 28313528 4I TCTTTCTTTC ----/TCCT TCCTTCCTTC 1273 het 1273 ref 24 11 4 9 TCCT 3 4 17103 CASAVA_Build 5 28321481 1D TTCACACTGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 A 9 8 17104 CASAVA_Build 5 28326820 4D CAAAATATAA TAAT/---- TAAATAAAGT 3070 het 3070 hom 36 15 18 6 TAAT 1 0 17105 CASAVA_Build 5 28340307 1D TGGAAAGAGA C/- GCAAATGAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 0 17106 CASAVA_Build 5 28342164 3I AAAGGATCTT ---/AAC AGGCATTTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAC 0 1 17107 CASAVA_Build 5 28343130 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAAAAA 2127 het 2127 ref 31 15 8 8 A 13 14 17108 CASAVA_Build 5 28355891 1D TGGGTAAATG T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 8 7 17109 CASAVA_Build 5 28357069 1I TTTGTTATAC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 8 9 17110 CASAVA_Build 5 28358568 1D TGTGGTGGAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 9 8 17111 CASAVA_Build 5 28359440 1I CTAATTCCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1354 hom 28 3 21 4 A 9 10 17112 CASAVA_Build 5 28362858 1D TGGTTAAAAA T/- TTCAGACAGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 3 2 17113 CASAVA_Build 5 28366433 9D TTGCTAGTAT TTGCTAGTA/--------- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TTGCTAGTA 1 0 17114 CASAVA_Build 5 28368750 1D TTTTTATTAA C/- TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 34 1 26 7 C 1 0 17115 CASAVA_Build 5 28372622 1D TAGAACATAC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 84 het 39 0 29 10 T 8 7 17116 CASAVA_Build 5 28376748 1D AAAGGAGAAT A/- ATATGTTCCT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 2 1 17117 CASAVA_Build 5 28377398 1D TTAATTCATT G/- GGGGGGGGGG 2478 het 45 hom 20 1 10 10 G 12 11 17118 CASAVA_Build 5 28378960 1D GGACCATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 39 2 28 10 A 15 14 17119 CASAVA_Build 5 28379244 4D ATTTGATAAT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 75 het 33 0 26 10 TTTC 5 4 17120 CASAVA_Build 5 28380581 3I AGTCCATGGA ---/AGG AGAAGACTGA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AGG 0 1 17121 CASAVA_Build 5 28381140 2D GGTGTCTCTT CC/-- TTTTTTTTTT 684 hom 26 het 30 0 8 23 C 2 0 17122 CASAVA_Build 5 28388621 1I CCAATATCCC -/T GATGAACATC 2471 hom 12 het 5 0 5 0 T 0 1 17123 CASAVA_Build 5 28407842 2I TCCTGAAACT --/TG TGTCTAAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TG 1 2 17124 CASAVA_Build 5 28511783 1I ATCTCATGAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 9 17125 CASAVA_Build 5 28512536 6I ACCTCCTAGA ------/GACATT TAAATTAGAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GACATT 0 1 17126 CASAVA_Build 5 28514243 2I AAGATAATAA --/AC ACTTCAGCAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AC 1 2 17127 CASAVA_Build 5 28515308 2D CCTTCTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 13 11 17128 CASAVA_Build 5 28527692 2I GAAACTGTGG --/CA TATATATACA 3070 hom 63 het 24 0 20 4 CA 0 1 17129 CASAVA_Build 5 28528191 2D TTGGAAAATC AG/-- AGTGTTGAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 AG 2 1 17130 CASAVA_Build 5 28531144 4I ATACATTGAA ----/GATT CATTAATTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GATT 0 1 17131 CASAVA_Build 5 28533075 1D AATTTAATAA C/- AATCACATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 C 1 0 17132 CASAVA_Build 5 28553486 1I TGGGACCAAA -/G AAAAAGTGCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 0 1 17133 CASAVA_Build 5 28560925 3I AAATGATGTA ---/TTG TTGTAGGATG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TTG 1 2 17134 CASAVA_Build 5 28569880 1I AAGTTAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 25 19 10 T 9 10 17135 CASAVA_Build 5 28570803 1D GGATGCAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 10 9 17136 CASAVA_Build 5 28575208 1D GTTATGGTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 10 9 17137 CASAVA_Build 5 28578017 2I CACTCATCTC --/TG TGATTTCTCA 3070 hom 148 het 59 0 49 10 TG 1 2 17138 CASAVA_Build 5 28603244 1D AAGAAACAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 9 8 17139 CASAVA_Build 5 28605113 2I AGGACTGTGT --/TA TATATATATA 3070 het 458 hom 22 1 15 6 TA 8 9 17140 CASAVA_Build 5 28608199 6I AAAAAAAAAA ------/AGAGAG AGAGACTTAT 3070 hom 67 het 31 0 21 10 AG 2 5 17141 CASAVA_Build 5 28614840 1I CAGCTATTCC -/A AAAAATTGAG 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 5 6 17142 CASAVA_Build 5 28617386 1D GAAAAACAGC A/- AAAAAATCAC 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 7 6 17143 CASAVA_Build 5 28621879 1I TAATTTTTTT -/C ATACATTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 0 1 17144 CASAVA_Build 5 28626408 1I AGAAAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 189 hom 44 1 37 6 A 9 10 17145 CASAVA_Build 5 28627426 1I GAAAAAAGAA -/G GATCTTAGAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 2 17146 CASAVA_Build 5 28631655 2D TTTTTTTTTT TA/-- AATAAACAAT 2432 het 100 hom 34 2 13 21 TA 1 0 17147 CASAVA_Build 5 28634183 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1141 het 1141 ref 18 7 3 8 T 17 16 17148 CASAVA_Build 5 28638593 4I AGTAAAAATC ----/CTCT CTATTTCTTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CT 1 3 17149 CASAVA_Build 5 28652172 3I TAAGTATCTC ---/CTT GTTTGTTATA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CTT 0 1 17150 CASAVA_Build 5 28652615 1I TAAACACCTG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 8 9 17151 CASAVA_Build 5 28661390 1I CAACGCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 735 hom 32 2 21 9 A 13 14 17152 CASAVA_Build 5 28664356 1D ATACTGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 22 0 17 5 T 12 11 17153 CASAVA_Build 5 28684598 4I AAGACAATAT ----/TAAC TAATAGTGAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TAAC 0 1 17154 CASAVA_Build 5 28702487 4I AGGGGCTGGT ----/AGTC AGTCAGCCTA 3070 hom 78 het 28 0 24 4 AGTC 1 2 17155 CASAVA_Build 5 28705728 5I TCAAAGAAGG -----/AAGAA AAGAAAAGTG 3070 hom 48 het 33 1 31 1 AAGAA 1 2 17156 CASAVA_Build 5 28726490 1D GATTTAAAAA G/- TAAACATTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 1 0 17157 CASAVA_Build 5 28734008 1D16M1I CAAATCTGAA CTTTTTAGAAAAATTTC-/-ATTTTAGAAAAATTTCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 17 16 4 N/A 0 0 17158 CASAVA_Build 5 28736801 1I CACTTCCTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 9 10 17159 CASAVA_Build 5 28739030 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2750 hom 20 9 10 1 A 13 11 17160 CASAVA_Build 5 28743882 2D ACTTTCTCAC TT/-- TTAGAGTTCC 3070 het 3070 hom 49 19 25 7 T 4 2 17161 CASAVA_Build 5 28748034 1I AGAGGTATAT -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 A 6 7 17162 CASAVA_Build 5 28748602 1I TCTCAACAGT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 8 9 17163 CASAVA_Build 5 28749202 9D TACAGAGAGA CAAATACTG/--------- CATGATTTAT 3070 het 3070 ref 55 30 24 4 CAAATACTG 1 0 17164 CASAVA_Build 5 28766009 1I TTTGTATATC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 8 9 17165 CASAVA_Build 5 28767352 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 10 9 17166 CASAVA_Build 5 28782410 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 AC 6 7 17167 CASAVA_Build 5 28782799 4D AATTAAATAG ATAA/---- ATAAATATTT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 ATAA 2 1 17168 CASAVA_Build 5 28802190 4D TTTTCCTAGT AGAG/---- AGATAGCGCT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 AG 3 1 17169 CASAVA_Build 5 28804832 3I TTTTTGTTTC ---/ATT TTTTGCCACT 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 ATT 0 1 17170 CASAVA_Build 5 28821217 3I AGCAACACAC ---/AAA AAAATAGTAT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 4 7 17171 CASAVA_Build 5 28843828 1I ATATACTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 10 11 T 11 12 17172 CASAVA_Build 5 28847177 1D AGAATTGATC T/- TTTTTTTTTT 1301 het 1301 ref 39 23 4 12 T 15 14 17173 CASAVA_Build 5 28849074 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2908 het 2908 ref 28 11 9 8 TA 7 8 17174 CASAVA_Build 5 28857343 1I CCATTCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1623 hom 22 4 13 5 A 11 12 17175 CASAVA_Build 5 28861569 4D GCACACACAT ACAC/---- ACACACATAT 3070 het 3070 hom 44 19 21 6 AC 5 3 17176 CASAVA_Build 5 28869433 1D CCTCTGGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 217 hom 23 1 10 12 T 13 12 17177 CASAVA_Build 5 28869791 1D TAATTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 A 9 8 17178 CASAVA_Build 5 28890691 4I ATCATGTAAT ----/AATA AATTAAGACT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 AATA 0 1 17179 CASAVA_Build 5 28895986 1I GGGATTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 10 11 17180 CASAVA_Build 5 28905817 1D CAATGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 1255 het 1255 ref 37 33 3 1 T 11 10 17181 CASAVA_Build 5 28914943 1I AGTCTCAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 11 12 17182 CASAVA_Build 5 28920113 1I AAATGAGAGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 8 9 17183 CASAVA_Build 5 28924418 1D ATAATAACAC A/- AGTAATCAAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 2 1 17184 CASAVA_Build 5 28926111 2I GAACTAATTT --/TA TATATATATA 3070 het 2530 hom 23 6 10 7 TA 7 8 17185 CASAVA_Build 5 28933206 1I CTGAAGATGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 8 9 17186 CASAVA_Build 5 28934854 2I GAACATAAAC --/AT AGCTCTTTTA 3037 het 3037 ref 27 17 9 1 AT 0 1 17187 CASAVA_Build 5 28937078 1D TCATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 11 9 A 12 11 17188 CASAVA_Build 5 28937867 1I TTCCCTCCTA -/G GTGTATATCT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 G 1 2 17189 CASAVA_Build 5 28938792 1I TGTTCTTTAC -/T TTTTAAATTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 4 5 17190 CASAVA_Build 5 28939064 3D TATTCTTTTG CTC/--- TTCTTGTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 8 CTC 1 0 17191 CASAVA_Build 5 28942433 2I AAGGTCAGAC --/AT GTCATGAGTG 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 AT 0 1 17192 CASAVA_Build 5 28946508 4D TGTCTATCTG TCTA/---- TCTATCTCTC 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 TCTA 2 1 17193 CASAVA_Build 5 28947404 1D CTTTTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 36 1 27 8 T 12 11 17194 CASAVA_Build 5 28951401 1D ATGTTGAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 10 9 17195 CASAVA_Build 5 28952820 1D AACTTTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 A 13 12 17196 CASAVA_Build 5 28952952 1D TCAATTATAC T/- TCACGTGGCG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 1 17197 CASAVA_Build 5 28954410 1I AAAATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 10 11 17198 CASAVA_Build 5 28955161 1I TATATCTTGT -/G GCTTCATATT 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 G 1 2 17199 CASAVA_Build 5 28957110 1I CTCTCTACTC -/T TCCTATAAAC 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 T 1 2 17200 CASAVA_Build 5 28958615 1I TTTTTGGGGA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 50 31 16 3 T 7 8 17201 CASAVA_Build 5 28958968 1D CATCGCATGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 41 17 19 7 T 9 8 17202 CASAVA_Build 5 28959395 4D TTAAATGTTT TTTG/---- TTTAATTTAT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 TTTG 1 0 17203 CASAVA_Build 5 28960862 4D TTTATCTATA AATT/---- AATTAAGGCA 3070 het 3070 hom 40 12 24 6 AATT 2 1 17204 CASAVA_Build 5 28965944 1D AAAAGAAAAA G/- GAAAAAAAAA 1026 het 1026 ref 30 18 7 5 G 2 1 17205 CASAVA_Build 5 28968099 1I ACAGAATGCC -/A AAATATTTAG 3070 het 3070 ref 41 28 8 5 A 3 4 17206 CASAVA_Build 5 28970470 1D TAACAAGATG A/- ATGTTCTAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 2 1 17207 CASAVA_Build 5 28970783 1D TTAATAAAAA T/- ATTTAGAAAT 1454 het 1454 ref 31 24 4 3 T 1 0 17208 CASAVA_Build 5 28972857 3I ATCATCTCAT ---/AAC AACGACACAC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AAC 1 2 17209 CASAVA_Build 5 28973844 1I CTTGTTTTTT -/A TATTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 0 1 17210 CASAVA_Build 5 28986903 3D CCTGAGACAC ACA/--- ACAACAGCAC 3070 hom 114 het 45 0 39 9 ACA 3 2 17211 CASAVA_Build 5 28990527 1D GAAAAGTAGA C/- TAAGTATGTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 0 17212 CASAVA_Build 5 28992438 2I AACTCCACAC --/TT TTGCAGATAG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 2 4 17213 CASAVA_Build 5 28995478 2D CATGATTCTC TT/-- TCTCACTTTA 3070 het 3070 hom 37 17 19 2 T 3 1 17214 CASAVA_Build 5 29001146 1D AATGTACTAA G/- GACATCCTTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 G 2 1 17215 CASAVA_Build 5 29003295 1D CAATTTCAAG T/- TTTTTAAGCC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 6 5 17216 CASAVA_Build 5 29035736 1I ATGCATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1423 hom 38 3 28 7 A 12 13 17217 CASAVA_Build 5 29045787 1D TCAGGAGATC A/- AAGGAGACCC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 2 17218 CASAVA_Build 5 29061932 2D TTATACAATT TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 TA 5 4 17219 CASAVA_Build 5 29067332 15D GTTTAAGAGT GGGTTTGCGGTGTAA/--------------- GGGAGTGAGG 3070 het 3070 ref 35 21 13 10 GGGTTTGCGGTGTAA 1 0 17220 CASAVA_Build 5 29070292 1D TGTAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 11 10 17221 CASAVA_Build 5 29075484 1D CTAAAATAAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 119 het 46 0 38 8 A 9 8 17222 CASAVA_Build 5 29080266 1I AAAAAAAAAA -/T CTTTCAAATT 3070 hom 47 het 21 0 17 4 T 0 1 17223 CASAVA_Build 5 29081721 1I TATTTACCCT -/A AAAATCTACA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 4 5 17224 CASAVA_Build 5 29083909 4D TTCAACAGAA ATCT/---- ATTTTCTCAC 3070 het 3070 hom 46 19 20 9 ATCT 1 0 17225 CASAVA_Build 5 29085812 1I CATACACAAT -/A AATTATAAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 3 17226 CASAVA_Build 5 29086276 4I TTCTGAATTC ----/ATTA ATTAGATAGA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 ATTA 1 2 17227 CASAVA_Build 5 29103204 2I ATGTAATTCA --/CT CTGTGAAATC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 CT 1 2 17228 CASAVA_Build 5 29106142 10I GTATTATAAA ----------/TATATACACT TATATACACT 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 TATATACACT 1 2 17229 CASAVA_Build 5 29122365 1I AGCAGAATTT -/G TGCATAAGTA 3070 het 1738 hom 26 4 20 2 G 0 1 17230 CASAVA_Build 5 29122473 3I TCATCTTGAC ---/TTT TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 5 8 17231 CASAVA_Build 5 29127650 5D GTCTACTTTA TTGAG/----- TTATTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 20 11 6 TTGAG 1 0 17232 CASAVA_Build 5 29132454 2I ACTTAATAGG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 AC 5 6 17233 CASAVA_Build 5 29135799 1I CTATTCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 10 11 17234 CASAVA_Build 5 29148094 1I TTTTCTTTAT -/A GGTTACCTGG 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 0 1 17235 CASAVA_Build 5 29150311 1D TTGGGAAACT G/- GGGAAAGCTG 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 G 4 3 17236 CASAVA_Build 5 29155267 1I TTTAGTCAGA -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 6 7 17237 CASAVA_Build 5 29180041 4I GGAACAAACT ----/TTAA TTATTAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTAA 0 1 17238 CASAVA_Build 5 29185511 1I TATTTTCTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 T 8 9 17239 CASAVA_Build 5 29192208 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 A 7 8 17240 CASAVA_Build 5 29206379 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 C 1 0 17241 CASAVA_Build 5 29210909 4I TTCAAGAGAG ----/AGGT AGGTCCGTAT 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 AGGT 1 2 17242 CASAVA_Build 5 29216968 1D ATTGAGAATT G/- TTAAGAAATA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 G 1 0 17243 CASAVA_Build 5 29220378 1D GGTGTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 12 11 17244 CASAVA_Build 5 29221288 1I AATAATCAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 9 10 17245 CASAVA_Build 5 29228587 5D TGTTTATTTT ATTAA/----- ATTAATTATC 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 ATTAA 2 1 17246 CASAVA_Build 5 29230073 1D TGGCAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 1663 het 1265 hom 30 12 9 9 T 17 16 17247 CASAVA_Build 5 29230163 11I2M3D TTAAATTCCT -----------AGGCA/TTAATTTTCAAAG--- TAAAGTGCTT 3070 het 3070 hom 20 10 9 2 N/A 0 0 17248 CASAVA_Build 5 29233384 1I TTGTCATTTA -/C CACCTTTGGC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 C 1 2 17249 CASAVA_Build 5 29238673 4D6M2I ATATGTTCAA TTATATGACA--/----ACCGCATC TTCCCAATTA 3070 het 3070 hom 25 9 16 1 N/A 0 0 17250 CASAVA_Build 5 29238824 2I ACATTTACAT --/TG TGTGTAACAC 3070 het 3070 hom 24 12 12 0 TG 2 3 17251 CASAVA_Build 5 29243446 1D ATATATATAT A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 A 6 5 17252 CASAVA_Build 5 29246557 2D CATTTAAAAC AG/-- AATAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 AG 1 0 17253 CASAVA_Build 5 29248952 1D AAACATTACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 10 9 17254 CASAVA_Build 5 29249246 1D GTTCCTCCCT G/- GCCCCCACCA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 G 2 1 17255 CASAVA_Build 5 29251263 1D AAGCTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 1404 het 1404 ref 30 17 5 9 A 11 10 17256 CASAVA_Build 5 29292985 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1610 het 92 hom 14 2 7 5 A 16 15 17257 CASAVA_Build 5 29305400 1D TTTCCTTGCA T/- TTTTATATTT 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 T 5 4 17258 CASAVA_Build 5 29315418 1I CATTTTCCAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 8 9 17259 CASAVA_Build 5 29316854 4I GCAAATAGAA ----/AGAT AGATAGATAG 3070 het 3070 ref 45 17 15 13 AGAT 2 3 17260 CASAVA_Build 5 29317273 1D ACGTTGTTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 A 9 8 17261 CASAVA_Build 5 29319528 5D GAGTTTTGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 53 23 20 14 TTTTG 4 3 17262 CASAVA_Build 5 29325592 3I TTATTATGCT ---/TTA TTATAATTTG 2836 het 2836 ref 22 10 9 3 TTA 1 2 17263 CASAVA_Build 5 29326732 1D GTTAGAGGAC T/- TTTTTTTTTT 1727 het 1727 ref 35 23 4 8 T 13 12 17264 CASAVA_Build 5 29343934 2D ATTTGGTAAT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 43 17 23 4 A 10 8 17265 CASAVA_Build 5 29347967 2D TTGCAGAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 17 6 A 13 11 17266 CASAVA_Build 5 29348655 2D ATTAACCTTG AA/-- AAGAGGATTA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 4 2 17267 CASAVA_Build 5 29354195 1D CTATATAAAT A/- ATGAGCAAAA 2323 het 2323 ref 18 11 5 2 A 2 1 17268 CASAVA_Build 5 29356556 2D CAATATACGC AT/-- ATATATATAT 2703 het 2703 ref 26 14 9 5 AT 7 6 17269 CASAVA_Build 5 29357309 8D TGTTTGTGTG TGTGTATA/-------- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 13 17 2 TGTGTATA 1 0 17270 CASAVA_Build 5 29357939 2D GTTAACAAAC TT/-- TTAACAATAT 3070 het 3070 ref 37 21 16 0 T 4 2 17271 CASAVA_Build 5 29359167 1I ACAGATCCCA -/G CATATGTTAC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 0 1 17272 CASAVA_Build 5 29360242 1D TAGATTTATG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 8 7 17273 CASAVA_Build 5 29362322 1I ATATCCACAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 8 9 17274 CASAVA_Build 5 29379478 9I TCCAAAATTA ---------/ATGACACAC ATGAAACCAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 ATGACACAC 0 1 17275 CASAVA_Build 5 29384805 4D18M2D ATAGATAAAT TTAATTAAGTATAAAGAGAGAAAG/----TTAAGTATAAAGAGAGAA-- AGATGGGGGG 2714 het 2714 ref 23 21 7 4 N/A 0 0 17276 CASAVA_Build 5 29387791 1D TCCCACATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 34 1 22 12 T 12 11 17277 CASAVA_Build 5 29388186 1D CATGTTTTCC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 7 6 17278 CASAVA_Build 5 29392447 3D CCCCAAAACA TGT/--- TGTTATAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 TGT 2 1 17279 CASAVA_Build 5 29394398 2D TGCCTGTCTC TT/-- TAATTATTGC 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 T 3 1 17280 CASAVA_Build 5 29401793 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 20 1 15 4 T 12 11 17281 CASAVA_Build 5 29410635 10I ATGTGGGTTT ----------/TTCTTTATTA TTCTTTATTA 2424 het 2424 ref 25 14 5 6 TTCTTTATTA 1 2 17282 CASAVA_Build 5 29413332 13D TCCTATTTTT AGAATGACATTTA/------------- AGAGAACTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 4 AGAATGACATTTA 1 0 17283 CASAVA_Build 5 29415161 1I TCATTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 45 0 33 12 T 11 12 17284 CASAVA_Build 5 29419660 1I TCTCTCTAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 8 9 17285 CASAVA_Build 5 29426769 1I TAAAAGTATT -/C CCCCCCCCCG 2738 hom 29 het 14 0 10 4 C 9 10 17286 CASAVA_Build 5 29429038 1D AACTTGTCCA G/- GGGCCTCTGA 3070 hom 91 het 37 0 31 6 G 4 3 17287 CASAVA_Build 5 29432699 1I CAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 10 1 9 0 C 0 1 17288 CASAVA_Build 5 29445558 1I AAACTAGCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 9 10 17289 CASAVA_Build 5 29455123 1D TTTTGCCTCC A/- AAACACTGCT 3070 hom 51 het 18 0 18 1 A 4 3 17290 CASAVA_Build 5 29461485 1I CAACATTGAG -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 74 35 31 8 A 6 7 17291 CASAVA_Build 5 29461830 1D TGAGTGTAAA T/- TTTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 49 20 19 15 T 6 5 17292 CASAVA_Build 5 29462012 3I AATATACATA ---/ACC AAAAATGTGT 3070 het 3070 hom 53 16 32 5 ACC 0 1 17293 CASAVA_Build 5 29462212 1I ATATATATTC -/A AAAATATAAA 3070 het 3070 hom 59 19 35 5 A 4 5 17294 CASAVA_Build 5 29462432 2I ATAGCAAAAC --/TT TGTTTCCAAA 3070 het 3070 ref 58 31 21 6 T 1 3 17295 CASAVA_Build 5 29463996 2D AATATTAAAC AT/-- GTGATAAATC 3070 het 3070 hom 49 19 24 8 AT 1 0 17296 CASAVA_Build 5 29464194 1D TAATTTTTAG C/- AAAACCATTT 3070 het 3070 ref 54 33 15 6 C 1 0 17297 CASAVA_Build 5 29464307 1I ACATTTGTAA -/T AGAGCTTTTT 3070 het 3070 ref 61 34 24 3 T 0 1 17298 CASAVA_Build 5 29465044 4I AGTGGGGCCT ----/GGTA GGTAGTGCGT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 GGTA 1 2 17299 CASAVA_Build 5 29465618 6D AGGTAAAAAG AAAAAC/------ AAAATTTCTT 3070 het 3070 ref 38 25 9 8 AAAAAC 1 0 17300 CASAVA_Build 5 29465965 4D TGCAGGAAAG AGTA/---- AGTGTGACAA 3070 het 3070 ref 67 40 12 16 AGTA 1 0 17301 CASAVA_Build 5 29466019 1I AGATTTAAGA -/G TTTAAGCATG 3070 het 3070 ref 61 38 14 10 G 0 1 17302 CASAVA_Build 5 29466281 1I TTAGACATAT -/A AATAAGATGG 3070 het 3070 ref 53 32 17 4 A 2 3 17303 CASAVA_Build 5 29466617 4D TATAGGTTTG AAAT/---- AAATAAACAT 3070 het 3070 hom 79 38 39 6 AAAT 2 1 17304 CASAVA_Build 5 29466774 1I AAAGGCACAT -/A ACGGCATTAA 3070 het 3070 ref 62 30 23 9 A 1 2 17305 CASAVA_Build 5 29467598 5I GAATAATGAG -----/CTTGC TTATGAAATT 3070 het 3070 ref 59 29 21 9 CTTGC 0 1 17306 CASAVA_Build 5 29467889 2I AATTTATCAC --/TT ATTCTTCTAA 3070 het 3070 hom 65 30 30 5 T 0 2 17307 CASAVA_Build 5 29468619 1I AGTGAAAAAA -/T AATAATTCTC 3070 het 3070 ref 63 33 28 2 T 0 1 17308 CASAVA_Build 5 29469194 2I TTAATGTGAT --/TG AATATGACAA 1334 het 1334 ref 57 25 5 27 TG 0 1 17309 CASAVA_Build 5 29469224 4D TATTTTAAAT TAAG/---- TAGACTGCCC 3070 het 3070 ref 61 26 17 22 TAAG 1 0 17310 CASAVA_Build 5 29469709 1I TATTTTTCCC -/A ATTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 77 30 38 9 A 1 2 17311 CASAVA_Build 5 29469826 5D6M1D AGAACATACA TTACTTTATTAT/-----TTATTA- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 58 38 19 10 N/A 0 0 17312 CASAVA_Build 5 29470963 1I GGAATTCAAC -/T TTTTTCTTCT 1748 het 1748 ref 59 46 4 9 T 5 6 17313 CASAVA_Build 5 29471711 3D TACTATAATA TTT/--- AGTAGTAGTA 3070 het 1911 hom 18 9 9 0 T 3 0 17314 CASAVA_Build 5 29475698 1D ACTTTTTTTT G/- TCATCTATAA 3070 het 3070 ref 37 17 10 11 G 1 0 17315 CASAVA_Build 5 29479580 1I GAAAACATCA -/T TCTTAAAAGC 3070 het 3070 ref 43 30 9 4 T 1 2 17316 CASAVA_Build 5 29481418 1D TTTTTCTTGC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 7 17317 CASAVA_Build 5 29481891 1I CTAGCATTAT -/A TTATTGTCAT 3070 het 3070 ref 42 28 11 3 A 0 1 17318 CASAVA_Build 5 29482031 3D ATAAAGTGCC CTT/--- CTTCTACCTA 3070 het 3070 ref 62 43 15 7 CTT 2 1 17319 CASAVA_Build 5 29483481 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 2986 het 142 hom 18 1 15 4 TA 6 7 17320 CASAVA_Build 5 29483492 4I ATATATATAT ----/ATAC ATTTATATAT 1239 het 428 hom 20 5 4 11 ATAC 0 1 17321 CASAVA_Build 5 29484264 1D GATAGATGAC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 9 8 17322 CASAVA_Build 5 29486360 3I CCCCAACACA ---/CTC CTCTCTCTCT 3070 het 1068 hom 38 6 25 7 CTC 1 2 17323 CASAVA_Build 5 29486428 2I TGTCATGAGT --/AA AAAAGCTCCC 3070 het 2059 hom 33 7 17 9 A 4 6 17324 CASAVA_Build 5 29487321 2D TACTACGCTG TC/-- TCTCTGATGT 3070 het 3070 ref 45 31 11 3 TC 3 2 17325 CASAVA_Build 5 29489300 1I TATTTAATGG -/C TTCAGCTTGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 0 1 17326 CASAVA_Build 5 29492591 1I GATACTTGAT -/A AATCTACATG 2953 hom 15 het 6 0 6 0 A 2 3 17327 CASAVA_Build 5 29495455 2I TATTATTCAC --/AT ATATTGTTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AT 2 3 17328 CASAVA_Build 5 29497274 1D TTTCTTCATG T/- TGATTCTCCA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 2 1 17329 CASAVA_Build 5 29499797 1I TTTGACCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 12 13 17330 CASAVA_Build 5 29502377 2I ACCTGAGGTC --/AA AGAGTTTCCT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 1 3 17331 CASAVA_Build 5 29504133 1D GAGGTGTTTA T/- TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 2 1 17332 CASAVA_Build 5 29505838 1D TATTAGACTA T/- TTTTTATATA 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 T 6 5 17333 CASAVA_Build 5 29516769 1D CATAGATCAT G/- GTGCAGCGGA 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 G 2 1 17334 CASAVA_Build 5 29517263 1I AGGACTCTTA -/C CCATAAGCCC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 3 17335 CASAVA_Build 5 29526037 2I GTCAGGGGAG --/AA GGGGGAGGGA 1393 hom 7 het 3 0 3 0 A 0 2 17336 CASAVA_Build 5 29526821 1D TTAATGTGCT A/- TTGTAGCCCA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 1 0 17337 CASAVA_Build 5 29527792 1I TTCATTACAT -/A GGTAAATGTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 0 1 17338 CASAVA_Build 5 29530420 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 5 6 17339 CASAVA_Build 5 29531810 5D TGATTTCTCC TTTAA/----- TTTAATTATT 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 TTTAA 2 1 17340 CASAVA_Build 5 29534665 1D GGGATGTGGT G/- GGGGGAGATA 3070 het 3070 hom 49 22 21 7 G 6 5 17341 CASAVA_Build 5 29540019 2I TGAAGAACTC --/TT ATATTGATTT 3070 hom 86 het 41 0 28 13 T 0 2 17342 CASAVA_Build 5 29550985 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 655 hom 21 4 14 3 A 9 8 17343 CASAVA_Build 5 29551232 1D TATATGAAAT A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 19 8 9 3 A 7 6 17344 CASAVA_Build 5 29556029 2I CCACATACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 AC 5 6 17345 CASAVA_Build 5 29560029 1D CAGAAAAAAA C/- ATGGATAGTT 3070 het 3070 hom 44 16 23 6 C 1 0 17346 CASAVA_Build 5 29565712 1D GTAAAACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 11 10 17347 CASAVA_Build 5 29566942 1I AGACTCTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 9 10 17348 CASAVA_Build 5 29567413 2I GTGGATACTG --/AA AAAAAAAAAA 2249 het 2249 ref 31 18 8 5 A 10 12 17349 CASAVA_Build 5 29567713 1D AAAGGAAGTG A/- ATGAGAAGGC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 2 1 17350 CASAVA_Build 5 29569086 125D TACTGTGTTG ATAGTTTATTTTGCTGTGAAGAAGCTCTTTAGTATTGACAAGATCTCACTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTGCGATTGCTTTTGAAATCTTCATTATGAATTCTTTTCAGGTTCCTATGTCCAGAA/----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TGGTATTACT 1479 het 1479 ref 36 46 4 13 ATAGTTTATTTTGCTGTGAAGAAGCTCTTTAGTATTGACAAGATCTCACTTGTCAATTTTTGCTCTTGTTGCGATTGCTTTTGAAATCTTCATTATGAATTCTTTTCAGGTTCCTATGTCCAGAA 1 0 17351 CASAVA_Build 5 29572032 1D TTTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 31 7 12 12 T 15 14 17352 CASAVA_Build 5 29580702 2I TAAATCTATT --/TC TCTTATCTAA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 TC 1 2 17353 CASAVA_Build 5 29588646 2D ATCTCCTGAC TT/-- TGTGATCTGC 3070 het 2584 hom 20 6 12 2 T 3 1 17354 CASAVA_Build 5 29596754 1D CTGGATATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 A 11 10 17355 CASAVA_Build 5 29611718 1D GGAGGGGGGA G/- GGGGGGAGGG 897 het 784 hom 12 4 2 6 G 7 6 17356 CASAVA_Build 5 29611770 1I ACGAGTTAAT -/G GGTGTAGCAC 3070 het 847 hom 23 4 18 1 G 2 3 17357 CASAVA_Build 5 29620292 4D AAATAAAAAC AATT/---- AAGTAGATTA 3070 het 3070 hom 34 12 18 7 AATT 1 0 17358 CASAVA_Build 5 29620777 1D AGGCAACAAA T/- ATCGATTACA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 17359 CASAVA_Build 5 29624981 1I AATAAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 22 1 14 7 T 13 14 17360 CASAVA_Build 5 29625371 1I AAGAAGTGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 9 10 17361 CASAVA_Build 5 29629762 1I ACTGGGGGGT -/G GGGGGGTCTG 3070 hom 29 het 14 0 8 6 G 6 7 17362 CASAVA_Build 5 29637451 1D TCTCTTCAAA T/- TATTTTACAT 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 2 1 17363 CASAVA_Build 5 29642913 3I ATGTATAAAA ---/AAG AAGAAGAGCA 3070 het 2878 hom 33 6 20 7 AAG 2 3 17364 CASAVA_Build 5 29644723 1I TGAATTAAAG -/T TTAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 2 3 17365 CASAVA_Build 5 29645950 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1472 hom 15 4 9 2 A 10 9 17366 CASAVA_Build 5 29652975 1D AATAGTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 A 11 10 17367 CASAVA_Build 5 29653560 1I AAAGAGAAAT -/G TGACTAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 G 0 1 17368 CASAVA_Build 5 29655491 1D GAAAAATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 11 10 17369 CASAVA_Build 5 29657955 4D GGGAGAGAGG GGGT/---- GGGTTGCAAT 3070 het 3070 ref 52 30 11 11 GGGT 2 1 17370 CASAVA_Build 5 29659516 1D ATTCCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 66 1 31 34 T 15 14 17371 CASAVA_Build 5 29661174 1I TGAAAAGAAA -/C CATGTGTCCT 3070 het 3070 ref 84 54 15 15 C 1 2 17372 CASAVA_Build 5 29672575 7I10M5I AGCAGGAACC -------TGTAATAGAT-----/AAAATAATTTTATTTATTGTGA ACACTAAAAA 1937 het 1937 ref 49 41 6 5 N/A 0 0 17373 CASAVA_Build 5 29675388 1D GACAAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 10 9 17374 CASAVA_Build 5 29696510 1D GCCAGGTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 47 het 18 0 17 5 T 10 9 17375 CASAVA_Build 5 29698232 1D CAATGGAATA C/- TACAAAGCCA 3070 het 3070 ref 46 27 13 7 C 1 0 17376 CASAVA_Build 5 29700205 1D GGGGTGGGGG A/- GGGGTTGTAT 3070 hom 57 het 26 0 21 5 A 1 0 17377 CASAVA_Build 5 29710643 1I ATTTATAACA -/G TTAACAATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 17378 CASAVA_Build 5 29711816 2D CTCAACTATA AT/-- ATATATATAT 1490 het 1490 ref 9 5 4 0 AT 6 5 17379 CASAVA_Build 5 29714530 1D TTTGCTAGTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 8 17380 CASAVA_Build 5 29714772 1D TAAGGACATT A/- AAAAAATTCA 3070 hom 117 het 42 0 40 3 A 7 6 17381 CASAVA_Build 5 29714929 1I CTTTGTAAAA -/T TTTTTATTTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 5 6 17382 CASAVA_Build 5 29715912 4I TTTTAGAGTT ----/AAAA AACTTTTAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 2 6 17383 CASAVA_Build 5 29716025 1D TGTAATTACT A/- ATGAGGTAGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 2 1 17384 CASAVA_Build 5 29718610 1I AAGGCTCTCA -/T TTTTTGCCAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 5 6 17385 CASAVA_Build 5 29723272 4I CAATCATCTG ----/TCTA TCTATAAAAT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 TCTA 1 2 17386 CASAVA_Build 5 29723958 1D TTGAGTTTAG T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 75 het 28 0 25 4 T 8 7 17387 CASAVA_Build 5 29726596 3D ACCTTCTGTG TTT/--- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 11 8 17388 CASAVA_Build 5 29728638 3I TAGGATTGCC ---/AGA AGAACAGGCC 3070 hom 126 het 51 0 43 8 AGA 1 2 17389 CASAVA_Build 5 29729444 1D AAAAATGCAT G/- TTTTTTTGGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 0 17390 CASAVA_Build 5 29729787 1I TGGCTTACCG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 25 het 40 1 34 5 T 9 10 17391 CASAVA_Build 5 29731208 1D AGTGGATTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 43 0 37 8 T 10 9 17392 CASAVA_Build 5 29731466 1I GTTATATTTT -/A AAAATATATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 4 5 17393 CASAVA_Build 5 29732752 1I30M3D AATAAAAAAT -AAAAAAAAAAGAATGAAAAGAAAAGAAAACAAA/AAAAAAAAAAAGAATGAAAAGAAAAGAAAAC--- AAAAAAGAGA 1689 het 307 hom 19 3 7 13 N/A 0 0 17394 CASAVA_Build 5 29733007 3I CTGTGTTTAT ---/TTG TTACTCACGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TTG 0 1 17395 CASAVA_Build 5 29733083 1I TAAACCAATC -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 6 7 17396 CASAVA_Build 5 29734449 1I GCAACTACTC -/T TAATACCTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 17397 CASAVA_Build 5 29735457 1I TTTATGTTTT -/G CCAATATTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 0 1 17398 CASAVA_Build 5 29738827 1D AAATAGACAC T/- TTATATGTGT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 T 3 2 17399 CASAVA_Build 5 29745072 2D ATAAAACAAT TC/-- TGTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 31 21 9 2 TC 1 0 17400 CASAVA_Build 5 29745771 2D AGTAAATAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 29 2 22 5 A 16 14 17401 CASAVA_Build 5 29757447 1I TATAGTCAGA -/T TTTTTTACCC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 6 7 17402 CASAVA_Build 5 29763973 1I AGAGGAAAAG -/A GGGGGAGGAA 3070 hom 90 het 38 0 29 9 A 0 1 17403 CASAVA_Build 5 29772468 1D AATTATTTCC T/- TTTTTCTGAT 3070 hom 42 het 17 0 15 3 T 6 5 17404 CASAVA_Build 5 29781247 2D CAATGTCAAT AA/-- GAGAGTGAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 2 A 2 0 17405 CASAVA_Build 5 29790649 1I TGTTTCCTGA -/T TTTTTTAATA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 6 7 17406 CASAVA_Build 5 29790747 1I TTTTCATAGG -/T TTTTTTTGGC 3070 het 441 hom 25 1 19 5 T 7 8 17407 CASAVA_Build 5 29791218 1I ATATGGAACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 9 10 17408 CASAVA_Build 5 29795498 1I TTTTAAACAT -/A AGATATATAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 2 17409 CASAVA_Build 5 29800427 1D TAATTGTATT A/- TTTTTTGCTT 3070 hom 117 het 47 0 38 9 A 1 0 17410 CASAVA_Build 5 29804484 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 14 1 12 1 A 11 12 17411 CASAVA_Build 5 29809179 1I GTATCCAGCC -/A GGGGCAGTGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 17412 CASAVA_Build 5 29813271 1D GCTTGTTCAA C/- TTTTCTTTTC 3070 hom 97 het 38 0 32 6 C 1 0 17413 CASAVA_Build 5 29815755 1D AATTTGCAGC T/- TTTTTTTTTT 1384 het 1384 ref 31 22 3 6 T 12 11 17414 CASAVA_Build 5 29822450 3D TCTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 19 1 14 4 T 14 11 17415 CASAVA_Build 5 29826782 1I CCAGAGGTGA -/C CAGACTGACA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 C 1 2 17416 CASAVA_Build 5 29837599 1I CAAGCTCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1104 hom 37 4 15 18 T 17 18 17417 CASAVA_Build 5 29843828 1D TATCTTTTTT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 8 7 17418 CASAVA_Build 5 29848561 1D ATAATCACTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 423 hom 32 1 27 5 A 9 8 17419 CASAVA_Build 5 29861761 2I TACTATACAC --/AT ATCTTTACAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 AT 1 2 17420 CASAVA_Build 5 29861880 1D GGTATTTTAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 9 8 17421 CASAVA_Build 5 29865705 1I AACTTCAAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 9 17422 CASAVA_Build 5 29869032 2D ACATATTTTT TC/-- TCTCTCAGAT 3070 hom 120 het 44 0 41 5 TC 4 3 17423 CASAVA_Build 5 29870905 1I GATTAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 915 hom 32 2 28 2 A 11 12 17424 CASAVA_Build 5 29877438 1D TATGACCATA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 9 8 17425 CASAVA_Build 5 29879833 9D TATAAGACAT AAGGCATAC/--------- AAGGCATACA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 AAGGCATAC 2 1 17426 CASAVA_Build 5 29884367 2D AGTCTCTCTC TA/-- TATATATAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TA 5 4 17427 CASAVA_Build 5 29886786 1I AAACAGTAAT -/A ATAGCTACAA 3070 hom 115 het 41 0 39 2 A 1 2 17428 CASAVA_Build 5 29889458 1D TTAGTTATTG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 8 7 17429 CASAVA_Build 5 29890000 1I AAAGGCTATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 10 17430 CASAVA_Build 5 29890774 3I AAAAACATTG ---/TAT TATAATAATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TAT 1 2 17431 CASAVA_Build 5 29891617 8D TCATTTATGT ATTTACTC/-------- ATTTGTTCAA 3070 hom 48 het 17 0 17 4 ATTTACTC 1 0 17432 CASAVA_Build 5 29904296 1D AAAGACCCCA T/- TTTTGTTTTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 5 4 17433 CASAVA_Build 5 29904482 1D TGGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 10 9 17434 CASAVA_Build 5 29906236 1I ACACTCATAC -/A AATAGAAATG 1625 hom 15 het 37 0 6 31 A 2 3 17435 CASAVA_Build 5 29914560 1I ACAAAATTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 17436 CASAVA_Build 5 29924843 1D GAAAGTACAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 9 8 17437 CASAVA_Build 5 29927360 1D GTTTCTACTT A/- ACGTTTGCTG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 2 1 17438 CASAVA_Build 5 29928216 1I TCTTTACTTA -/G GGTAACCCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 2 3 17439 CASAVA_Build 5 29929417 1D CATTCTAAAC T/- AGGGTATGTA 3070 het 3070 hom 40 15 17 9 T 1 0 17440 CASAVA_Build 5 29933400 2D TATATGTAAC AT/-- ATATATATGG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 AT 5 4 17441 CASAVA_Build 5 29934199 5I TTCACTACCT -----/TTCAC TACCACACAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TTCAC 0 1 17442 CASAVA_Build 5 29934655 4D GAAGTGGCTA AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AATT 3 2 17443 CASAVA_Build 5 29934876 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 11 9 17444 CASAVA_Build 5 29938393 2D AATAAAAAAA AT/-- AACAAATTAG 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 AT 1 0 17445 CASAVA_Build 5 29951542 1I CAGCCACAAT -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 7 8 17446 CASAVA_Build 5 29960727 1I TAAATTTTTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 2826 hom 22 6 11 5 T 7 8 17447 CASAVA_Build 5 29962138 9D GTTCATTGTG CTATTAATA/--------- CACTTATCTT 2122 het 2122 ref 16 11 5 1 CTATTAATA 1 0 17448 CASAVA_Build 5 29963560 1D ACTTAAAAAT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 36 20 11 7 A 8 7 17449 CASAVA_Build 5 30011569 1I ATTGGATATA -/T ATACATACAG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 17450 CASAVA_Build 5 30013999 1I AAAATCTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 10 17451 CASAVA_Build 5 30018858 1I ACGCTCATGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2761 hom 25 7 15 3 A 9 10 17452 CASAVA_Build 5 30033099 1I TAGAAAGGAA -/G GGGGGGTGGT 2986 het 2986 ref 27 9 9 9 G 6 7 17453 CASAVA_Build 5 30033440 1D CGAATAAGGC A/- AAATTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 4 3 17454 CASAVA_Build 5 30038941 2I AATATTCATG --/AA AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 7 9 17455 CASAVA_Build 5 30039190 4I GAGCACTCCT ----/TAAA TAAACATTTA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 TAAA 1 2 17456 CASAVA_Build 5 30040095 1I TGATTTTCCC -/A TATCTCAATG 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 A 0 1 17457 CASAVA_Build 5 30041004 3D TAATAAGTCT TAA/--- TAACAGTTAT 1749 het 1749 ref 18 14 4 0 TAA 2 1 17458 CASAVA_Build 5 30043052 3D GCTTTGCAAC AAT/--- GAGACATTGT 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 AAT 1 0 17459 CASAVA_Build 5 30044704 1D CAGTTTTTAA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 15 15 5 T 8 7 17460 CASAVA_Build 5 30045936 1D TACCCAACTG T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 T 8 7 17461 CASAVA_Build 5 30047256 1D AGGAATTTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 44 12 27 5 T 8 7 17462 CASAVA_Build 5 30050360 11D CCAGTTTTGA GGCCAGTTTAT/----------- GACCAGATTC 2460 het 2460 ref 31 18 9 8 GGCCAGTTTAT 1 0 17463 CASAVA_Build 5 30050740 4D ACTGAGAAAA CTGT/---- CTAAGTTTTA 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 CTGT 1 0 17464 CASAVA_Build 5 30050921 1D TTAATTTATA G/- GGCTCAAGGA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 G 3 2 17465 CASAVA_Build 5 30055829 1D TAACATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 19 15 4 T 11 10 17466 CASAVA_Build 5 30058689 1D CATTTCAACA C/- CTAACATTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 4 C 2 1 17467 CASAVA_Build 5 30060084 1D ACAGAAAAAA G/- TCCAGGACCA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 G 1 0 17468 CASAVA_Build 5 30062161 1D AGAACTACTA T/- TTGATCCAGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 3 2 17469 CASAVA_Build 5 30062579 4I61M1I ACTTATAGAA ----AAATAAATAAAGTGATTATAATGGTTAACTTTTAAAAATAATAATATAGTCCCTCAATTAC-/AAATAAATAAATAAAGTGATTATAATGGTTAACTTTTAAAAATAATAATATAGTCCCTCAATTACA AAAAAAAAAA 3070 het 219 hom 30 1 26 22 N/A 0 0 17470 CASAVA_Build 5 30063716 1D CACTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 29 2 15 12 T 17 16 17471 CASAVA_Build 5 30071681 1D GCAGCAGGGG T/- GAAACCCTCA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 1 0 17472 CASAVA_Build 5 30073718 1I AATAAGGAAA -/C CCTGCCATTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 2 3 17473 CASAVA_Build 5 30076090 1I ATAAATACAA -/T TTGTTCTAGA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 2 3 17474 CASAVA_Build 5 30084782 2I TTCATAGAAC --/AT AATATATTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 0 1 17475 CASAVA_Build 5 30089224 2I TTCAACTGAA --/GT GTGTGGTTGT 3070 hom 163 het 61 0 55 6 GT 2 3 17476 CASAVA_Build 5 30090166 1D TCGGTTTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 10 9 17477 CASAVA_Build 5 30092099 1I ACTAAAGAGC -/T TCTGGAAAAC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 1 2 17478 CASAVA_Build 5 30093343 1D TAGAAGAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 A 9 8 17479 CASAVA_Build 5 30093632 9D AAATGCTGGG ATTACAGGC/--------- ATGAGCCACC 3070 hom 96 het 34 0 33 3 ATTACAGGC 1 0 17480 CASAVA_Build 5 30096635 2D TTGTACAAAA AT/-- AGACACATAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 1 0 17481 CASAVA_Build 5 30098699 1D TGTTTTCAAG T/- TTACTGATAT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 3 2 17482 CASAVA_Build 5 30099696 1D GCCATATACA T/- TACATATACA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 2 1 17483 CASAVA_Build 5 30110740 2I AGTTGTATTT --/TA AAAAAAAAAT 1722 het 1722 ref 38 24 6 8 TA 0 1 17484 CASAVA_Build 5 30119715 1I CTTTAAAAAC -/G GTGTTTAGAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 G 1 2 17485 CASAVA_Build 5 30120471 1D TACACATTAA C/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 C 1 0 17486 CASAVA_Build 5 30120780 2D GATTCTCCTG CC/-- CCCCCACCTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 7 5 17487 CASAVA_Build 5 30122443 1D CAAAAACTTA T/- TTTCAGAGGT 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 T 4 3 17488 CASAVA_Build 5 30123106 4D TGCAGGACAA AAAC/---- AAACAACCCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 7 AAAC 2 1 17489 CASAVA_Build 5 30127236 2D AAGTAAGAGG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 11 8 7 T 11 9 17490 CASAVA_Build 5 30127454 1D AAATTATTGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 7 17491 CASAVA_Build 5 30129366 1D AATCATTGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 10 9 17492 CASAVA_Build 5 30131347 13I ATTCACAGGA -------------/AATAATCAATAAT AATAATCAAA 3070 het 3070 ref 45 19 14 12 AATAATCAATAAT 0 1 17493 CASAVA_Build 5 30131407 1D TATTTATCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 14 T 9 8 17494 CASAVA_Build 5 30131918 1D TAACATCTAC A/- CTCCTTCTAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 1 0 17495 CASAVA_Build 5 30132746 1D GATGAATGCC T/- CTGATACTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 1 0 17496 CASAVA_Build 5 30137641 5I GGTAACACTA -----/TGTGT AGCACAAAAA 3070 het 3070 hom 39 19 14 6 TGTGT 0 1 17497 CASAVA_Build 5 30138727 1I GGGAGAGTTT -/A AAAAAGTATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 5 6 17498 CASAVA_Build 5 30138920 1I TTTTAAATTA -/T TTTTAACCCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 4 5 17499 CASAVA_Build 5 30140594 2I TCCATATATG --/TA TATATATATA 2731 het 498 hom 14 1 6 7 TA 8 9 17500 CASAVA_Build 5 30146454 1I TTTTACCATG -/T TTTTCTATAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 4 5 17501 CASAVA_Build 5 30146515 22D AGCTGATTAA ATGCGATGTGTATAATTTCAGG/---------------------- ATTGTCTATT 3070 het 3070 hom 37 15 22 8 ATGCGATGTGTATAATTTCAGG 1 0 17502 CASAVA_Build 5 30151364 9D GAAAATGAAA ATGAAATAT/--------- ACACTAGCTG 3070 het 3070 hom 43 20 21 7 ATGAAATAT 1 0 17503 CASAVA_Build 5 30152372 1D TTCAATTCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 9 8 17504 CASAVA_Build 5 30152998 2D GAGTGACTAG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 74 het 37 0 32 5 T 11 9 17505 CASAVA_Build 5 30154887 1D TTGTAATGCT G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 7 G 5 4 17506 CASAVA_Build 5 30156407 1D GCCAAGGAGA G/- AGGCTAAAAC 3070 het 3070 ref 51 28 21 3 G 1 0 17507 CASAVA_Build 5 30159010 2I ACCACTAAGG --/AA AAAAAAAGCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 9 17508 CASAVA_Build 5 30188586 1I GATGCCAGGC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 7 8 17509 CASAVA_Build 5 30201960 1I AGATGTCACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 9 10 17510 CASAVA_Build 5 30205396 1D TTAGCTGTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1989 hom 18 6 9 3 T 10 9 17511 CASAVA_Build 5 30209603 2I TTTTTTTTTT --/TA AAAAAAAAAA 2055 het 281 hom 30 7 9 14 TA 0 1 17512 CASAVA_Build 5 30210833 1D TATTAAATGG A/- AAACTTCAGA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 4 3 17513 CASAVA_Build 5 30211746 1D ATGTACAGGG A/- AAAAAATACA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 7 6 17514 CASAVA_Build 5 30216290 1I TCTCCTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 10 11 17515 CASAVA_Build 5 30223393 1D AGATATGGGG A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 8 7 17516 CASAVA_Build 5 30223771 1I TACATTAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 9 10 17517 CASAVA_Build 5 30233843 4D TGGCCACCCC AGTG/---- AGCAGCAGCA 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 AGTG 1 0 17518 CASAVA_Build 5 30245745 1I AGGTATATTT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 7 8 17519 CASAVA_Build 5 30251759 2D AGGATAAAAC AT/-- ATGTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 AT 2 1 17520 CASAVA_Build 5 30268254 9I CTATGTCAGG ---------/TCCCATCCA TCCCATCCAT 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 TCCCATCCA 1 2 17521 CASAVA_Build 5 30272383 4D AAAAGAAAAG AGAA/---- AGAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 28 13 12 6 AGAA 2 1 17522 CASAVA_Build 5 30290398 5I TTTACTATAT -----/TGATA TAGTCTGTTC 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 TGATA 0 1 17523 CASAVA_Build 5 30304310 5D GTGGCTAATG ATACT/----- TTCTGTGGAT 3070 het 3070 hom 42 16 25 3 ATACT 1 0 17524 CASAVA_Build 5 30305742 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3021 hom 18 het 7 0 7 0 T 8 7 17525 CASAVA_Build 5 30312408 1I AAATAAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 T 10 11 17526 CASAVA_Build 5 30314135 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 29 1 24 5 A 13 12 17527 CASAVA_Build 5 30316980 1I GGGAAAAGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 9 10 17528 CASAVA_Build 5 30317283 1I GGTTTGCTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 T 9 10 17529 CASAVA_Build 5 30317980 1I ATTTGAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 10 10 9 T 11 12 17530 CASAVA_Build 5 30319904 7I5M5I GTGGCTTACC -------TCCTA-----/TCTGTAATCCTAGAACT CTGGGAGGCT 3070 het 3070 hom 29 12 16 5 N/A 0 0 17531 CASAVA_Build 5 30322924 1I TTCTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 898 hom 32 2 24 6 T 12 13 17532 CASAVA_Build 5 30323203 1D CATTTGTGTG T/- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 T 7 6 17533 CASAVA_Build 5 30323842 1I TTTTTCGTTA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 T 6 7 17534 CASAVA_Build 5 30326813 2I ATAAGGACTC --/AG AGAGTGTCAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 AG 2 3 17535 CASAVA_Build 5 30349824 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 476 hom 33 3 12 18 T 18 17 17536 CASAVA_Build 5 30355402 1D CTACTTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 A 11 10 17537 CASAVA_Build 5 30359364 1D ATCTGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2232 hom 23 6 13 4 T 11 10 17538 CASAVA_Build 5 30363214 1I ATATAAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 9 10 17539 CASAVA_Build 5 30367469 1I TCTTCTTTAA -/T TTTTTTAATA 3070 het 27 hom 45 1 37 7 T 6 7 17540 CASAVA_Build 5 30376551 4D GTTACAGTTT CAAG/---- CAAGCAGTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CAAG 2 1 17541 CASAVA_Build 5 30388212 1D AAAAATCACG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 10 9 17542 CASAVA_Build 5 30389886 3D GTAATATATT AGA/--- AGTAATATTA 3070 het 3070 hom 23 10 12 2 AGA 1 0 17543 CASAVA_Build 5 30399013 1I AAATGGGTTT -/C CTGAATACAG 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 C 1 2 17544 CASAVA_Build 5 30402902 1D TATATATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 8 11 9 T 12 11 17545 CASAVA_Build 5 30409562 1I TACCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2419 het 2419 ref 26 9 11 6 A 11 12 17546 CASAVA_Build 5 30413174 4I AATGCCCTTC ----/CTAA CTAAGATCAG 3070 hom 138 het 54 0 46 8 CTAA 1 2 17547 CASAVA_Build 5 30418207 1I GGATTTCCCT -/C CTCAGCTATG 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 C 1 2 17548 CASAVA_Build 5 30426538 3I GTTATAAAAA ---/CTC CTACTACTGT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 CTC 0 1 17549 CASAVA_Build 5 30430189 4D ATTTAGTATA ACTC/---- ACTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 21 12 8 ACTC 2 1 17550 CASAVA_Build 5 30436447 2D AAAAAATGTT AA/-- AGAGTCTCAC 3070 hom 63 het 24 0 19 5 A 3 1 17551 CASAVA_Build 5 30437961 1I GATAGATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 10 11 17552 CASAVA_Build 5 30438485 3I TTTAGGATTC ---/CTA CAAGGTGTGC 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 CTA 0 1 17553 CASAVA_Build 5 30439432 1I TAGGACTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 15 7 A 10 11 17554 CASAVA_Build 5 30439532 1I TGAAAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 A 12 13 17555 CASAVA_Build 5 30439890 1I TTTTAATAAA -/T CTTTTTCTTA 2334 het 2334 ref 24 16 5 3 T 0 1 17556 CASAVA_Build 5 30442971 3I TAAGATCACT ---/GAA GAAGAACAAA 3070 het 3070 hom 30 9 21 0 GAA 2 3 17557 CASAVA_Build 5 30454428 1I CAATCTTAGT -/A AAAAAAGTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 6 7 17558 CASAVA_Build 5 30496086 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 2052 het 365 hom 11 1 7 3 A 17 16 17559 CASAVA_Build 5 30519505 2I GTCTTTGGCA --/CT CTCTCATCCA 3070 hom 105 het 40 0 34 6 CT 2 3 17560 CASAVA_Build 5 30531055 1D TGTTTCTCGT A/- AAGGTGGAAT 3026 hom 18 het 8 0 7 1 A 3 2 17561 CASAVA_Build 5 30540865 1D CCTAGCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 786 hom 37 3 29 5 A 12 11 17562 CASAVA_Build 5 30542236 2I ACAATATCAC --/AT ATGTTTTTTC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AT 1 2 17563 CASAVA_Build 5 30542442 1D AATACTGATT A/- TTTTTCAATT 3070 hom 65 het 28 0 22 8 A 1 0 17564 CASAVA_Build 5 30542919 1I TAATAAATAC -/T GACAAAAATG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 0 1 17565 CASAVA_Build 5 30545375 1D GAAAATGGGG C/- AGAAATAAAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 1 0 17566 CASAVA_Build 5 30546225 2D AGCTGGCCGT AG/-- AGAGAGAGCT 3070 hom 87 het 30 0 29 3 AG 5 4 17567 CASAVA_Build 5 30560307 1I TAAGCCCCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 785 hom 20 2 15 3 T 10 11 17568 CASAVA_Build 5 30562346 2I TCCTCATCTC --/TT ATATATGTGC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 0 2 17569 CASAVA_Build 5 30570448 1D GCCTCAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 11 10 17570 CASAVA_Build 5 30574143 1I AGTGTACAGC -/A AGCATTACAT 3070 hom 135 het 47 0 45 2 A 1 2 17571 CASAVA_Build 5 30576506 3I AAGAGAAGAC ---/AAG AATAGTCTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAG 0 1 17572 CASAVA_Build 5 30577945 1D AACAACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 624 hom 43 2 31 10 A 12 11 17573 CASAVA_Build 5 30580584 1I AAACATTTGC -/A AACTATCTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 3 17574 CASAVA_Build 5 30581817 15D GGAATTTCTT CATGATGAATTTCTC/--------------- CATGACAAAT 3070 hom 110 het 33 0 40 6 CATGATGAATTTCTC 1 0 17575 CASAVA_Build 5 30581934 11I ATAATAGTAT -----------/TTGAAAAGTGC TTGAAAAGTG 3070 hom 85 het 40 0 29 11 TTGAAAAGTGC 1 2 17576 CASAVA_Build 5 30589798 1D TTACCCAGTC T/- TGGGTCTGTC 3070 hom 111 het 40 0 35 5 T 2 1 17577 CASAVA_Build 5 30590251 2D TTTGTGTAAA AT/-- ATACATGCAG 3070 hom 129 het 51 0 44 8 AT 2 1 17578 CASAVA_Build 5 30597592 1D CGTTAGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 T 12 11 17579 CASAVA_Build 5 30605025 2D GTTTTGAAAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 AG 2 1 17580 CASAVA_Build 5 30609241 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 36 14 14 9 A 9 8 17581 CASAVA_Build 5 30619646 2D TATATATCTA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TG 5 4 17582 CASAVA_Build 5 30665014 4D TGTTTTTATT AATA/---- AATAAACATA 3070 hom 135 het 46 0 46 1 AATA 2 1 17583 CASAVA_Build 5 30672659 1D AATATCATGA T/- TTTTTATCGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 6 5 17584 CASAVA_Build 5 30685150 2D TAAGTATAAA CT/-- CTCTCTTAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 7 CT 4 3 17585 CASAVA_Build 5 30687021 3D ATGAATGCTT TTC/--- TTTTTTTGTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TTC 1 0 17586 CASAVA_Build 5 30694038 3I CAGTGCCTAT ---/TCC ATACCACTTA 3070 hom 141 het 50 0 47 3 TCC 0 1 17587 CASAVA_Build 5 30697146 1I ACGATGGTTT -/C CAGTAACCAA 3070 hom 105 het 36 0 33 3 C 1 2 17588 CASAVA_Build 5 30698214 1D TATTTCCATA C/- CTTTAAAAGC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 2 1 17589 CASAVA_Build 5 30700528 1I TCCTATTTGG -/A AAAAAAGGGG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 6 7 17590 CASAVA_Build 5 30757344 1D GAAAACAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 25 2 21 3 A 13 12 17591 CASAVA_Build 5 30759001 4I TCTCAATTAC ----/GTTT GTTTATTTAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GTTT 1 2 17592 CASAVA_Build 5 30759300 5I AGTCTTAGAT -----/TAACA AAAAAAATGC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TAACA 0 1 17593 CASAVA_Build 5 30772406 2I ACCTCAGCTG --/GT GTTAGCTGAG 3070 hom 117 het 48 0 39 9 GT 1 2 17594 CASAVA_Build 5 30783697 1I AAATGATGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 T 9 10 17595 CASAVA_Build 5 30792447 1D CTACAAGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 10 9 17596 CASAVA_Build 5 30795880 12D TGGATATGAC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAGGT 3070 hom 102 het 36 0 34 6 A 19 7 17597 CASAVA_Build 5 30799442 6D ACATACATAC ATATAT/------ ATATATATAT 1346 hom 10 het 6 0 4 3 AT 10 7 17598 CASAVA_Build 5 30801968 1D TGTGACCAAG A/- AAAAAAAAAA 1923 het 1923 ref 50 37 6 7 A 12 11 17599 CASAVA_Build 5 30816558 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 42 het 15 0 15 1 A 9 8 17600 CASAVA_Build 5 30817413 1D GGAAAAAAAA T/- TTTTGGAAGT 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 T 5 4 17601 CASAVA_Build 5 30825921 1I AAGTACTCAA -/T TTGGAGACAG 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 2 3 17602 CASAVA_Build 5 30830350 1D CAGTGACTCA T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 7 6 17603 CASAVA_Build 5 30832617 5D TATGCAGAGG GCAGA/----- AGATCAGGAA 3070 het 3070 ref 46 28 14 7 GCAGA 1 0 17604 CASAVA_Build 5 30832787 1D AGTAATCTTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 8 7 17605 CASAVA_Build 5 30838686 1D CTGTATGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 11 10 17606 CASAVA_Build 5 30848132 1I AAAAGGACAG -/A AAATAAAACA 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 3 4 17607 CASAVA_Build 5 30849761 1D CATCTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2323 hom 34 9 11 14 T 16 15 17608 CASAVA_Build 5 30850490 5I GGTTTTATTG -----/TTTCT TTTAAGAATC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TTTCT 0 1 17609 CASAVA_Build 5 30851348 4D TACATACACA CATG/---- CATGCATGCA 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 CATG 3 2 17610 CASAVA_Build 5 30860706 2I GCTAGCAATC --/TA TCAATCCTGT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TA 0 1 17611 CASAVA_Build 5 30861005 1I ATTTCAAATA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 50 29 15 6 T 7 8 17612 CASAVA_Build 5 30862965 4I ATCTGGAGAT ----/GCTA GCTAGCACTT 3070 het 3070 hom 43 12 26 5 GCTA 1 2 17613 CASAVA_Build 5 30865910 1D TTTATTTCTT A/- ACTTTCAACG 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 A 2 1 17614 CASAVA_Build 5 30885492 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2614 het 2614 ref 19 7 8 5 AAAG 4 3 17615 CASAVA_Build 5 30893882 1D CTTCCTACAC A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 8 7 17616 CASAVA_Build 5 30932742 6D TTGATGATGT TGATGA/------ TGATGATGAT 3070 het 484 hom 53 10 23 22 TGA 12 10 17617 CASAVA_Build 5 30939298 2D GTCAGCCGTT TG/-- CTGTGTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 TG 1 0 17618 CASAVA_Build 5 30941455 5D CTTTCCCTGG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 44 het 44 ref 37 21 4 13 A 15 10 17619 CASAVA_Build 5 30941777 1I CAGGAAATTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 A 8 9 17620 CASAVA_Build 5 30943446 1D CTGTTTGTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 T 9 8 17621 CASAVA_Build 5 30945221 1D ACTGTTAGAA T/- TAGTAAATGA 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 T 2 1 17622 CASAVA_Build 5 30945613 1I CAAAGGATTA -/T AAATCATTCT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 0 1 17623 CASAVA_Build 5 30948153 1D TTTTCATTTG T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 7 6 17624 CASAVA_Build 5 30948913 1D CTGCTGCATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 21 12 7 A 9 8 17625 CASAVA_Build 5 30949192 1I GGAACTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2969 het 2969 ref 23 8 10 5 A 12 13 17626 CASAVA_Build 5 30950705 1I TTGAATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 12 13 17627 CASAVA_Build 5 30952571 1D ATGCTGAACT A/- AAACCCTATC 3070 het 2804 hom 31 7 17 7 A 4 3 17628 CASAVA_Build 5 30955796 1I ACTCCATGCC -/A AAAGAGAACA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 3 4 17629 CASAVA_Build 5 30961900 1I ATATGATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 9 10 17630 CASAVA_Build 5 30966838 1I CTAGTCACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 47 3 23 21 A 11 12 17631 CASAVA_Build 5 30967059 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2882 het 1860 hom 28 8 8 12 A 17 16 17632 CASAVA_Build 5 30967860 35D TAAGAATATA TTCTGCAACATTTTCAAAAATAGATTAAGAATATG/----------------------------------- TTCTGCAACA 3070 het 3070 ref 35 23 15 11 TTCTGCAACATTTTCAAAAATAGATTAAGAATATG 1 0 17633 CASAVA_Build 5 30979138 1I CTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1569 het 1569 ref 20 8 6 6 A 15 16 17634 CASAVA_Build 5 30982314 1I GATGTACTAA -/G AGAGCTGAGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 0 1 17635 CASAVA_Build 5 31005703 2I AAATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 11 10 10 AT 7 8 17636 CASAVA_Build 5 31009679 1I TCCTTTTCAA -/G GGGGGTGAAT 3070 het 3070 ref 45 21 13 11 G 5 6 17637 CASAVA_Build 5 31010089 1I GACAAAGGTC -/G GGGGATGCAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 4 5 17638 CASAVA_Build 5 31012589 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2004 hom 21 het 9 0 8 1 T 15 14 17639 CASAVA_Build 5 31018122 2I TCTGAAAGGA --/TT TTTTTTTTTA 2453 het 2453 ref 22 10 6 6 T 9 11 17640 CASAVA_Build 5 31023912 1D CCTTTAAAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 1972 hom 26 5 18 4 A 9 8 17641 CASAVA_Build 5 31029146 5I GGAAATTATA -----/TTTGT TTTATTTTTT 3070 het 2521 hom 22 7 11 4 TTTGT 0 1 17642 CASAVA_Build 5 31030504 1D TCTCTATTCC T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 44 18 23 4 T 7 6 17643 CASAVA_Build 5 31035849 1I AAAGTGAATC -/T CCAATTTATG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 0 1 17644 CASAVA_Build 5 31036737 4I CGTGATTGTG ----/GTCT GTCTCTCTCT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 GTCT 1 2 17645 CASAVA_Build 5 31040035 13I TTAAGGAGGA -------------/TTCCCTCTTCCTC TATCTTTTGG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 TTCCCTCTTCCTC 0 1 17646 CASAVA_Build 5 31055103 2I ATACAGTGGT --/GC GCAATCTGGG 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 GC 1 2 17647 CASAVA_Build 5 31066021 4I CCGCACGACC ----/CAAA CAAAGTGCAA 3070 het 3070 hom 33 16 12 5 CAAA 1 2 17648 CASAVA_Build 5 31066864 3D TTCCCAACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1841 het 916 hom 19 6 6 7 T 19 16 17649 CASAVA_Build 5 31070674 1D CTGATATTTA G/- TTGGTTAGCC 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 G 1 0 17650 CASAVA_Build 5 31073962 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 19 20 9 A 9 10 17651 CASAVA_Build 5 31076358 1D TGGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2361 hom 30 10 11 9 A 12 11 17652 CASAVA_Build 5 31077500 1I ACAGAACTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 A 9 10 17653 CASAVA_Build 5 31093308 1I TCACTATCAC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 7 8 17654 CASAVA_Build 5 31102869 1I GATATTCTAA -/G ATGTCTTCAA 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 G 0 1 17655 CASAVA_Build 5 31129558 5D TCTCAAGATC CTTAA/----- CTTAACCACA 3070 het 3070 ref 49 24 17 11 CTTAA 2 1 17656 CASAVA_Build 5 31129758 2D AATAATCTCA AT/-- ATGTTACTCA 3070 het 3070 hom 39 17 19 6 AT 2 1 17657 CASAVA_Build 5 31132876 2I GTTTTGGTTT --/TC TTTTTTCTGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 TC 0 1 17658 CASAVA_Build 5 31133030 1I GTAAAACATA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 6 7 17659 CASAVA_Build 5 31135666 9D CAGCAGTTAA CAGGAATTG/--------- CAGTGTAGGA 3070 het 3070 ref 45 26 16 7 CAGGAATTG 1 0 17660 CASAVA_Build 5 31136576 6I AACTATGTGT ------/TCCTCC TCCTCCTATT 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 TCC 2 4 17661 CASAVA_Build 5 31139420 1I AATTAGAAAC -/A ATACTAAAAT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 1 2 17662 CASAVA_Build 5 31140433 2I ACAAAAGAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 57 het 29 0 20 9 AG 7 8 17663 CASAVA_Build 5 31141458 4I AGGAGGGTTT ----/TTTA TTTGTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TTTA 0 1 17664 CASAVA_Build 5 31141680 2D GCTTGCTGTA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 35 hom 36 2 15 19 T 10 8 17665 CASAVA_Build 5 31152780 1D ATTTGGACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2483 hom 31 10 14 7 A 16 15 17666 CASAVA_Build 5 31158697 1D ATGTGAGAGA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 7 6 17667 CASAVA_Build 5 31170983 1D AGGCAGGAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 A 10 9 17668 CASAVA_Build 5 31172902 1D TTTTGAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 552 hom 20 3 14 3 T 17 16 17669 CASAVA_Build 5 31173538 5D TATAGTTTTT CTCTA/----- CTCTACAGCA 3070 het 3070 ref 38 17 16 6 CTCTA 2 1 17670 CASAVA_Build 5 31180562 1D AGCACAAACT A/- AAAAAAAAAA 3026 het 3026 ref 46 15 11 20 A 17 16 17671 CASAVA_Build 5 31185256 1D AGTTTTTAGC T/- TTAAAGTCCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 3 2 17672 CASAVA_Build 5 31190450 1D AACCATCAAA C/- CCCCCCCCCT 3070 hom 11 het 30 1 13 16 C 10 9 17673 CASAVA_Build 5 31206551 1D TGATCATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 14 0 10 4 A 13 12 17674 CASAVA_Build 5 31212303 1I GGAGACACTG -/T TTTTTGGTTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 5 6 17675 CASAVA_Build 5 31224876 1D GAGACATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 43 3 36 4 A 13 12 17676 CASAVA_Build 5 31247274 1I AAAAAAAAAA -/G TGTTCTTCAA 3070 het 339 hom 37 1 30 6 G 0 1 17677 CASAVA_Build 5 31249720 1D GACATAACAT C/- CCCCCTCCTG 3070 hom 106 het 40 0 32 8 C 6 5 17678 CASAVA_Build 5 31252002 1I TACATCTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 670 hom 37 2 25 10 T 11 12 17679 CASAVA_Build 5 31269385 6I TCTCAAAAAA ------/AAAAAC AAAAAACAAA 3070 hom 67 het 30 0 24 6 AAAAAC 0 1 17680 CASAVA_Build 5 31269916 1D CTCAAATACA T/- TTTTTTCATA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 7 6 17681 CASAVA_Build 5 31277164 4I TTCCTAAGAT ----/GATA GATAGACCCA 3070 het 3070 ref 54 25 24 5 GATA 1 2 17682 CASAVA_Build 5 31289690 1D TGATACAGGG T/- TTTTTTTTTT 1319 het 1319 ref 28 20 3 5 T 12 11 17683 CASAVA_Build 5 31302502 1D TCCTCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 32 2 24 6 A 12 11 17684 CASAVA_Build 5 31305466 1D TATTATTGGT A/- AAAAATCCGT 3070 hom 131 het 48 0 44 4 A 6 5 17685 CASAVA_Build 5 31319576 1I ATACAAATAT -/G GGGGGGTCAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 6 7 17686 CASAVA_Build 5 31319687 2D CTCTTTTTTT TA/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 67 het 30 0 23 7 TA 1 0 17687 CASAVA_Build 5 31330426 4I TTGGGCTGAA ----/AGAT AGCAACCTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AGAT 0 1 17688 CASAVA_Build 5 31332650 1D TCTATTCTAT C/- CAGCTTTGTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 2 1 17689 CASAVA_Build 5 31344297 1D TGAAGTCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 41 1 26 14 A 14 13 17690 CASAVA_Build 5 31346083 14I GGGAGATATT --------------/GGCCAAAACCAAGG GGCCACAGGC 3070 hom 69 het 24 0 23 1 GGCCAAAACCAAGG 0 1 17691 CASAVA_Build 5 31382692 1D TCATTATGAC T/- TTTTTTTTTG 1345 het 1345 ref 25 15 3 7 T 10 9 17692 CASAVA_Build 5 31394635 1D TTCCTTTCTT C/- CCTCCTTCCT 981 het 981 ref 12 5 4 3 C 3 2 17693 CASAVA_Build 5 31413063 1D GCCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 38 0 30 9 A 12 11 17694 CASAVA_Build 5 31414903 22I CAACCCAGGT ----------------------/CTTTTGAATCCCAACCCAAAGC CTTTTCTTCT 3070 hom 83 het 32 0 26 8 CTTTTGAATCCCAACCCAAAGC 0 1 17695 CASAVA_Build 5 31416138 4I ACATGCCAAC ----/ATTA GTTACGAAGG 3070 hom 110 het 48 0 35 13 ATTA 0 1 17696 CASAVA_Build 5 31421869 1I ACTAGTCATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 39 0 30 9 A 9 10 17697 CASAVA_Build 5 31426787 1D CCCGTGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 26 1 17 9 T 11 10 17698 CASAVA_Build 5 31435164 1D TCAGGACAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 40 0 32 10 T 10 9 17699 CASAVA_Build 5 31438262 4I TCTGAAAGAC ----/AGAG AGAGAAGGCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AG 2 4 17700 CASAVA_Build 5 31456584 4D TGGCTAAATC CTAA/---- CTATCTTTAA 3070 het 3070 hom 47 22 22 5 CTAA 1 0 17701 CASAVA_Build 5 31481540 5D TAAAAGAATA AAATG/----- ACATGATTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 AAATG 1 0 17702 CASAVA_Build 5 31489793 1D TGCTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 927 het 927 ref 27 17 3 7 A 15 14 17703 CASAVA_Build 5 31498508 1I TCACAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 567 hom 50 3 37 10 A 9 10 17704 CASAVA_Build 5 31501607 2D TGCTTGTTAA AG/-- AGAGTCTGGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AG 3 2 17705 CASAVA_Build 5 31503169 3D AAAAAAAAAA AAT/--- AAGTCAGGAA 3070 het 7 hom 31 1 22 9 AAT 1 0 17706 CASAVA_Build 5 31505569 4I AAAATATCTA ----/TAGT TAGTATCTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TAGT 1 2 17707 CASAVA_Build 5 31516915 1D ACAACTACGT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 8 7 17708 CASAVA_Build 5 31518637 1I AGGAGAAAGA -/T TTTGCAAACA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 3 4 17709 CASAVA_Build 5 31519865 1D TCACTACACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 9 17710 CASAVA_Build 5 31525535 1D TCACCCTAGC A/- AAAAAACTCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 6 17711 CASAVA_Build 5 31525762 19D CTTTTTTTGA CGCGGAGTTTCGCTCTTGT/------------------- CGCCCAGGCT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 CGCGGAGTTTCGCTCTTGT 1 0 17712 CASAVA_Build 5 31533085 1I AGAGGATAAT -/G GTGCCCTTCA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 G 1 2 17713 CASAVA_Build 5 31544691 2I AACAAACTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 38 0 26 12 T 11 13 17714 CASAVA_Build 5 31545928 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAG AACAGACCTA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AAAAG 0 1 17715 CASAVA_Build 5 31547563 1I GACCTCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 31 1 21 9 A 13 14 17716 CASAVA_Build 5 31558319 1D TTCTAATATA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 9 8 17717 CASAVA_Build 5 31569128 1I CATATTGCGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 15 0 12 3 A 15 16 17718 CASAVA_Build 5 31594384 1I TGCAATTACA -/G AGGGTCAAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 0 1 17719 CASAVA_Build 5 31599079 1I AGCTATTAAC -/A ATTGAAGTAT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 1 2 17720 CASAVA_Build 5 31599897 4I CATTCTGGCA ----/ACTG ACTGACCCCA 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 ACTG 1 2 17721 CASAVA_Build 5 31602260 3I CATTTTCCTG ---/TCT TCTTCTGAGC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 TCT 2 3 17722 CASAVA_Build 5 31607643 2D TAAAAATAAC AG/-- GGCTTATGGG 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 AG 1 0 17723 CASAVA_Build 5 31608499 1D CAATCTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1250 het 1250 ref 27 18 3 6 A 11 10 17724 CASAVA_Build 5 31609779 24D CCTCTTTCCA ACTCCTTATGAATAATCATGGGAG/------------------------ ACTCCCATAA 2573 het 2573 ref 29 19 8 7 ACTCCTTATGAATAATCATGGGAG 1 0 17725 CASAVA_Build 5 31612788 1D AAAGCCTAGC G/- GGGGGCTGTG 3070 het 3070 ref 23 12 9 4 G 6 5 17726 CASAVA_Build 5 31613524 2D GATGACAAAT AG/-- AAGAAAGGGG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AG 1 0 17727 CASAVA_Build 5 31614375 2D AGAGAAGAAG GA/-- GAGAGAAAGA 1901 het 1901 ref 12 6 4 2 GA 4 3 17728 CASAVA_Build 5 31640068 1D TCTTATGAAG A/- AAAAAATTAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 6 17729 CASAVA_Build 5 31641061 2D TAGAAAAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 33 1 21 11 T 14 12 17730 CASAVA_Build 5 31644592 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 29 0 21 8 A 12 13 17731 CASAVA_Build 5 31651747 3I GTTTACACTC ---/CCA CCAACAGTGT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 CCA 1 2 17732 CASAVA_Build 5 31653360 1I AATTATGCTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3000 hom 17 9 7 1 A 8 9 17733 CASAVA_Build 5 31661459 1I AAAAAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 10 11 17734 CASAVA_Build 5 31663407 3D CATCATCATC ATT/--- GTCATTAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 24 6 ATT 1 0 17735 CASAVA_Build 5 31665537 4D CCCATCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 29 9 13 12 AAAC 5 4 17736 CASAVA_Build 5 31670213 1I TCTTTCTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 15 hom 31 1 19 11 T 9 10 17737 CASAVA_Build 5 31681910 1D TTTGCACTGC G/- GGGGGGCCTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 G 7 6 17738 CASAVA_Build 5 31687000 1I GTAAGTAAAC -/A TTGGACAAAA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 0 1 17739 CASAVA_Build 5 31687771 2D AACTTCCACC CT/-- CTCTGGGTTC 3070 hom 39 het 16 0 13 3 CT 3 2 17740 CASAVA_Build 5 31691422 2D TATGAGGGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 13 11 17741 CASAVA_Build 5 31700324 2I ATACACACAC --/AG ACACACACAC 3070 hom 113 het 44 0 33 11 AG 0 1 17742 CASAVA_Build 5 31701108 1I CCTCTTCCCC -/T GTGTGTATCT 3070 hom 129 het 51 0 43 8 T 0 1 17743 CASAVA_Build 5 31701509 1I AGTTCCCCCT -/C CCCCCCCCTC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 C 8 9 17744 CASAVA_Build 5 31703720 8D TTTTTTTTCC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1080 het 284 hom 23 4 7 13 T 24 16 17745 CASAVA_Build 5 31711009 4D TCTAAAAGAT GATA/---- GATAACAGGG 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 GATA 2 1 17746 CASAVA_Build 5 31715340 5I TGTGTTGTGG -----/TGTGT TGTGTTGTGT 3070 hom 92 het 33 0 31 2 TGTGT 2 3 17747 CASAVA_Build 5 31720428 1D GCTAGAGCAG T/- TTTTTTTTTT 2904 het 2506 hom 30 9 10 11 T 14 13 17748 CASAVA_Build 5 31773227 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGTTTCAC 2737 hom 15 het 6 0 6 0 G 4 5 17749 CASAVA_Build 5 31787107 3D GTACATCTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 2869 het 828 hom 25 9 9 7 A 15 12 17750 CASAVA_Build 5 31787447 1I TTCCTGCTTG -/T TAAGTTTCCT 3070 het 3070 ref 53 30 19 4 T 1 2 17751 CASAVA_Build 5 31791080 1I CTCCTAATTT -/G TGCTGGTTTC 3070 hom 96 het 35 0 30 5 G 0 1 17752 CASAVA_Build 5 31791481 1D GTGGTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 146 hom 32 3 19 10 T 15 14 17753 CASAVA_Build 5 31797316 1D CGACACTAAG A/- AATTTGAATA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 3 2 17754 CASAVA_Build 5 31800944 2D GCGTCTCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 A 13 11 17755 CASAVA_Build 5 31815335 1I ACCTCCCGGA -/T TCACGCCATT 1970 het 1676 hom 12 6 5 1 T 1 2 17756 CASAVA_Build 5 31820554 21D AGGTGGATCA CGAGGTCAGGAGTTCAAGACC/--------------------- AGCCTGGCCA 682 het 509 hom 10 3 3 4 CGAGGTCAGGAGTTCAAGACC 1 0 17757 CASAVA_Build 5 31832770 1I TATTTACGGG -/T GTTTTTTTTG 2425 het 2425 ref 24 14 7 3 T 0 1 17758 CASAVA_Build 5 31837238 3I AGCAACGCTG ---/ACC ACCACCACCA 3070 het 3070 hom 58 23 27 8 ACC 3 4 17759 CASAVA_Build 5 31839038 9D CATAGCTCAC TGCAGCCTT/--------- GAACTCCTGG 3070 het 3070 ref 26 12 10 7 TGCAGCCTT 1 0 17760 CASAVA_Build 5 31846262 4I GAGTAGCTGG ----/GACT GACTACAGGT 1362 het 1362 ref 7 4 3 0 GACT 1 2 17761 CASAVA_Build 5 31856267 2D GTGACTACAC TT/-- TTTCACTTAA 3070 het 3070 ref 46 32 12 6 T 5 3 17762 CASAVA_Build 5 31857167 1I ATAAATCTAA -/T TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 6 7 17763 CASAVA_Build 5 31860247 2I AGTACTTGAT --/CC CCCTCTCCTG 3070 het 3070 hom 51 19 27 5 C 3 5 17764 CASAVA_Build 5 31861804 1D AAAGGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 28 18 10 T 11 10 17765 CASAVA_Build 5 31868169 1D GTAAAGTTTC A/- GCCTGGTGTG 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 1 0 17766 CASAVA_Build 5 31871308 1I CATGATGAAA -/C CCTGTCTTTA 3070 hom 81 het 28 0 27 1 C 2 3 17767 CASAVA_Build 5 31873768 1I AATAAAAAGC -/A AAAAGTAAAT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 A 4 5 17768 CASAVA_Build 5 31894146 1D AGTTTAAAAA C/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 C 1 0 17769 CASAVA_Build 5 31921784 1D AGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 11 10 17770 CASAVA_Build 5 31922497 23I TTGGAGGACC -----------------------/CAGTGACTGTTACAGGTCTGTTA CAGTGACTGT 2738 het 2738 ref 35 15 6 14 CAGTGACTGTTACAGGTCTGTTA 0 1 17771 CASAVA_Build 5 31924404 1D GTCAGGGCTA C/- GTACTCCGAT 3070 het 3070 ref 30 19 11 1 C 1 0 17772 CASAVA_Build 5 31924704 2D GATACAGGGC AT/-- GGGATCTCAC 3070 het 3070 hom 53 18 31 4 AT 1 0 17773 CASAVA_Build 5 31927508 3I CACTGGAGAA ---/GTG GTGGCATTGT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 GTG 1 2 17774 CASAVA_Build 5 31927778 1I TCATGCCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 32 0 17 15 T 9 10 17775 CASAVA_Build 5 31928674 3D GCTCCAGCAG TCC/--- TCCTGCCTCG 2793 hom 18 het 8 0 7 1 TCC 2 1 17776 CASAVA_Build 5 31929450 1D ACAAAAAGAC A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 8 7 17777 CASAVA_Build 5 31933607 1I GACTGTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 44 1 33 10 T 11 12 17778 CASAVA_Build 5 31936374 1D TTAAGAAGGG A/- AAAGGGGTCA 3070 hom 104 het 42 0 31 11 A 4 3 17779 CASAVA_Build 5 31944506 4I GTTACGTGAT ----/ATCA ATCAAAGACA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATCA 1 2 17780 CASAVA_Build 5 31944570 11D GGGGCTGCAG AGCCCCTTGCA/----------- ATCATGTCAA 3070 hom 51 het 28 0 18 10 AGCCCCTTGCA 1 0 17781 CASAVA_Build 5 31949206 1I TTCCTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 702 hom 30 2 16 12 A 13 14 17782 CASAVA_Build 5 31952545 1I CCTGGGTGTT -/C CCTGATTCTC 3070 hom 103 het 41 0 34 7 C 2 3 17783 CASAVA_Build 5 31956384 6D AAAAAAAAAA AAAAGT/------ CCAGGCACTC 3070 het 1697 hom 25 10 11 4 AAAAGT 1 0 17784 CASAVA_Build 5 31957242 1I TTGTACAGGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 53 het 22 0 18 4 A 9 10 17785 CASAVA_Build 5 31957966 1D TTCTTGTGGG A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 87 het 32 0 29 4 A 8 7 17786 CASAVA_Build 5 31962085 1D CCTGTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 239 hom 19 2 14 3 A 15 14 17787 CASAVA_Build 5 31962719 2D ACAAAGTGTG AT/-- ATATATATAC 3070 hom 131 het 50 0 41 11 AT 5 4 17788 CASAVA_Build 5 31965617 1D CGGGAGGCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 85 het 38 0 34 4 A 10 9 17789 CASAVA_Build 5 31966826 4D GTGACAGGGA ACTC/---- ATTGGCATGA 3070 hom 138 het 50 0 46 7 ACTC 1 0 17790 CASAVA_Build 5 31968769 1D CATAGTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 38 0 30 8 T 13 12 17791 CASAVA_Build 5 31970077 1D CTTTTAAAAG A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 8 7 17792 CASAVA_Build 5 31972430 1I GAGTTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 485 hom 20 2 14 4 A 13 14 17793 CASAVA_Build 5 31974533 3D GGAAAAAAAA AAG/--- ATGTTTTTTG 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AAG 1 0 17794 CASAVA_Build 5 31978247 2D CTTATGGGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 106 het 47 0 35 12 TG 10 9 17795 CASAVA_Build 5 31991153 1D CTTTGGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 42 0 27 15 T 11 10 17796 CASAVA_Build 5 31994123 1D TTGCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 12 11 17797 CASAVA_Build 5 31996210 1D CCTCCTGAGT A/- GCTGGGATTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 0 17798 CASAVA_Build 5 32004734 1I CCTACAGTAA -/T TTGTTACAGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 17799 CASAVA_Build 5 32005753 8D GACTAAATAG TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTTA 5 3 17800 CASAVA_Build 5 32007642 1I GTGGCTCCCC -/A ATTTGCACAA 3070 hom 141 het 53 0 47 6 A 1 2 17801 CASAVA_Build 5 32010225 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 10 9 17802 CASAVA_Build 5 32022905 2I CCTCTAAAAC --/AG AATCTCCTAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AG 0 1 17803 CASAVA_Build 5 32038454 4I TCACACATAC ----/CACA CACACACACA 3070 het 10 hom 37 1 19 17 CA 6 8 17804 CASAVA_Build 5 32055937 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 12 11 17805 CASAVA_Build 5 32056220 2D GAAATGAAAC TG/-- AAATAAAAAT 3070 hom 123 het 45 0 40 6 TG 1 0 17806 CASAVA_Build 5 32063839 1I GACACTGACC -/A GGGGAATGAG 3070 hom 150 het 54 0 50 4 A 0 1 17807 CASAVA_Build 5 32067552 1I CCTGAGACCT -/G GGGGGGAGAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 G 6 7 17808 CASAVA_Build 5 32069487 2D ACCATCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 29 0 18 11 T 14 12 17809 CASAVA_Build 5 32071386 1D GAGAAAGAAA G/- GGTCTTGCGA 2669 het 1760 hom 15 5 7 3 G 3 2 17810 CASAVA_Build 5 32074149 1I ATCCCAACAC -/T TTGGGAGGCT 3070 hom 44 het 19 0 13 6 T 2 3 17811 CASAVA_Build 5 32074957 8D AACATCCTCT CTCTCCCC/-------- CTCTCCCCCT 3070 hom 32 het 27 1 21 8 CTCTCCCC 2 1 17812 CASAVA_Build 5 32091402 1I TGAATCCCGA -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 6 7 17813 CASAVA_Build 5 32096042 1D TTTCCATATG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 7 A 8 7 17814 CASAVA_Build 5 32096743 3I GGGAAAAGAT ---/ATC ATGAGCTTCT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 ATC 0 1 17815 CASAVA_Build 5 32104704 2I TTCTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 56 23 22 11 GT 5 6 17816 CASAVA_Build 5 32106767 23I CTGAGACAGG -----------------------/AGAATTGCTTGAACCCGGGAGGC AGAGGTTTCA 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 AGAATTGCTTGAACCCGGGAGGC 0 1 17817 CASAVA_Build 5 32144446 4I GTATGATTTT ----/GTAA GTAAGTAAAT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 GTAA 2 3 17818 CASAVA_Build 5 32144903 4D AAATATCACA AGTC/---- AGTCAGTCAC 3070 hom 108 het 41 0 37 6 AGTC 3 2 17819 CASAVA_Build 5 32145909 4D ATTGATAGAT ATTG/---- ATTGATTGTT 3070 hom 124 het 48 0 42 10 ATTG 3 2 17820 CASAVA_Build 5 32177026 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 19 1 10 8 A 18 17 17821 CASAVA_Build 5 32177440 6D CTGCAAATGA CTCTCC/------ CTCTCCCTCT 3070 hom 54 het 27 0 17 10 CTCTCC 4 3 17822 CASAVA_Build 5 32182154 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 14 13 17823 CASAVA_Build 5 32191657 8D CCTGTCTCTA CTAAAAAT/-------- ATAAAATTAG 3070 hom 30 het 11 0 11 1 CTAAAAAT 1 0 17824 CASAVA_Build 5 32199539 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 1 0 17825 CASAVA_Build 5 32246280 1I TGAACCCCCT -/G GGGGGGGGTG 3039 het 2673 hom 32 13 11 8 G 8 9 17826 CASAVA_Build 5 32266613 2D TTCTAAAGGG AA/-- AAAGATGTTT 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 A 5 3 17827 CASAVA_Build 5 32273381 1I TGCTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2204 het 2204 ref 21 8 7 6 T 10 11 17828 CASAVA_Build 5 32282033 14I TGAGTAGACA --------------/GTTGTTTTTTTTTT GTTTTTTTTT 2501 het 1853 hom 30 13 10 7 GTTGTTTTTTTTTT 0 1 17829 CASAVA_Build 5 32284311 4I CTTTGTTTTG ----/TTTT TTTAATTTGA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 3 7 17830 CASAVA_Build 5 32290452 12I GCATGGTGGC ------------/TCACACCTGTAA TCTCAACACT 3070 het 2242 hom 27 7 19 1 TCACACCTGTAA 0 1 17831 CASAVA_Build 5 32321762 1I GGAGTGGCCC -/A AAAATCACAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 4 5 17832 CASAVA_Build 5 32328623 2D TCCACTAGGG AA/-- AAAAAACCAC 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 A 8 6 17833 CASAVA_Build 5 32344949 1I GGCTTATTTT -/G AGACTGAACC 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 G 0 1 17834 CASAVA_Build 5 32354793 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTATAG 2788 het 1594 hom 15 6 9 0 T 7 6 17835 CASAVA_Build 5 32359482 1I CACTGAGTGG -/C CTGACTCCAG 1940 hom 31 het 19 0 5 14 C 1 2 17836 CASAVA_Build 5 32366362 6D TGTGTGCATG CAAGTA/------ TGTGTGTGCG 1131 het 1131 ref 54 36 5 15 CAAGTA 1 0 17837 CASAVA_Build 5 32374624 1I CCCTGTTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 9 10 17838 CASAVA_Build 5 32390054 1I CCTGGCCCTC -/T TAAGACTTTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 1 2 17839 CASAVA_Build 5 32395170 1D TTTTTTGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1932 hom 23 8 10 5 T 11 10 17840 CASAVA_Build 5 32400423 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAACC 2859 het 2859 ref 30 12 10 8 A 8 9 17841 CASAVA_Build 5 32404108 1D AAACTTTTTT C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 5 C 8 7 17842 CASAVA_Build 5 32404832 2D CACATGCACA AC/-- AGACTTTGAT 3070 het 3070 hom 59 28 30 4 AC 1 0 17843 CASAVA_Build 5 32414729 1I CTGTAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 943 hom 32 2 21 9 A 10 11 17844 CASAVA_Build 5 32416358 4I AATCCACCTT ----/AATA AATGAGTATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AATA 0 1 17845 CASAVA_Build 5 32420114 1D ACCAGATTGA C/- TCAGGAACTG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 C 1 0 17846 CASAVA_Build 5 32421101 1D AATTTTGAAG T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 97 het 39 0 33 6 T 8 7 17847 CASAVA_Build 5 32428150 1D GATGCTTAAT A/- GTTGGTATTA 3070 het 3070 hom 51 16 29 6 A 1 0 17848 CASAVA_Build 5 32434383 1I CAGTATCATC -/A AAAATTGGGT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 4 5 17849 CASAVA_Build 5 32446470 1I ACCTAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 10 11 17850 CASAVA_Build 5 32451118 1D CAGTATCCTT A/- AAAAGCTGGA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 5 4 17851 CASAVA_Build 5 32451780 1D55M1I CCAAAATCAC GGGGCCAAGCTCATTTTTTGTTCAGTTAAGTAAAAGTACATTAGAACTTTTATCTT-/-GGGCCAAGCTCATTTTTTGTTCAGTTAAGTAAAAGTACATTAGAACTTTTATCTTC TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 19 10 21 N/A 0 0 17852 CASAVA_Build 5 32452975 2D AATTATCAAG TC/-- TCTCTCTAAA 3070 het 159 hom 41 2 15 24 TC 4 3 17853 CASAVA_Build 5 32454122 2D ATTCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 24 0 21 3 A 12 10 17854 CASAVA_Build 5 32461283 5D TAGAATATTC TTAAT/----- TTAAGACATT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TTAAT 1 0 17855 CASAVA_Build 5 32466279 2D CAGAATGCAC AG/-- AGAGAGAGGA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AG 5 4 17856 CASAVA_Build 5 32471754 1D TTATTTTAAG C/- CAAAATTTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 2 1 17857 CASAVA_Build 5 32474605 2D CTCTATATAA AT/-- ATATGATAGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 AT 3 2 17858 CASAVA_Build 5 32477817 1I TTTCAAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 886 hom 38 2 28 8 A 10 11 17859 CASAVA_Build 5 32478845 1I GAGGCAGGAC -/T TCTGCCCAGG 3070 hom 84 het 32 0 28 5 T 1 2 17860 CASAVA_Build 5 32499575 2D AGGTAGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 2483 het 77 hom 24 1 8 15 T 17 15 17861 CASAVA_Build 5 32500030 1I ATGTTTGGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 9 10 17862 CASAVA_Build 5 32501897 1D CAGGAGAATC G/- GCTTGAACCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 2 1 17863 CASAVA_Build 5 32501990 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2175 hom 26 6 14 7 A 9 8 17864 CASAVA_Build 5 32518048 1D TGTAAGCCAA C/- CCCCCCTAAT 3070 hom 91 het 37 0 30 7 C 7 6 17865 CASAVA_Build 5 32526517 1D TTCTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 11 10 17866 CASAVA_Build 5 32542761 1I GTTTGTAGAA -/T TCTGGATTTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 1 2 17867 CASAVA_Build 5 32544763 4D GAGAGCTGAT GGCA/---- CGGGTTGGGG 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 GGCA 1 0 17868 CASAVA_Build 5 32548843 1I GTAAGTAGGA -/T TTTTAACCTG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 4 5 17869 CASAVA_Build 5 32554309 1I TTTGAAAAAT -/C CCCAGGGCAA 3070 hom 58 het 26 0 19 7 C 3 4 17870 CASAVA_Build 5 32556233 1D GTGTACCCCC T/- GATCAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 17 4 T 1 0 17871 CASAVA_Build 5 32557112 1D GTTGTCATTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 46 0 38 8 A 10 9 17872 CASAVA_Build 5 32564020 1I TGTTTTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1424 hom 35 5 21 9 T 12 13 17873 CASAVA_Build 5 32572216 5D AAAAAAAAAA CAAAC/----- AAAAAAAACA 520 het 347 hom 16 4 6 6 CAAAC 1 0 17874 CASAVA_Build 5 32572655 1D CCTGAAACTG C/- CCCCCCCCTT 2373 het 1538 hom 15 5 6 4 C 9 8 17875 CASAVA_Build 5 32589076 1I CAGAGAGGGG -/C CTCACAGTGC 3070 hom 48 het 21 0 14 7 C 1 2 17876 CASAVA_Build 5 32595009 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2045 het 1267 hom 20 6 7 7 A 15 14 17877 CASAVA_Build 5 32606498 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2846 hom 30 het 16 0 10 7 A 12 11 17878 CASAVA_Build 5 32609141 1D AGCAGGTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 18 9 T 12 11 17879 CASAVA_Build 5 32609415 1D ATATATTACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 31 0 27 4 T 10 9 17880 CASAVA_Build 5 32615017 1D GAAGCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 13 12 17881 CASAVA_Build 5 32615458 1I ATATTGCCCC -/T GTCTTAGTCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 0 1 17882 CASAVA_Build 5 32621195 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 37 0 29 8 T 9 8 17883 CASAVA_Build 5 32631047 1D GGCAGATTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 10 9 17884 CASAVA_Build 5 32631844 4I TTGGCCACTT ----/AAAA AAAATGCCAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 4 8 17885 CASAVA_Build 5 32639756 1I CACTCAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 24 14 12 T 13 14 17886 CASAVA_Build 5 32650532 10D CAGACTTTAA AGAAAAGTGT/---------- AGAAACAGTA 2043 het 2043 ref 17 12 5 2 AGAAAAGTGT 1 0 17887 CASAVA_Build 5 32653935 1I AATTTTCTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 T 9 10 17888 CASAVA_Build 5 32655800 1D TTAAGACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 20 8 T 11 10 17889 CASAVA_Build 5 32657034 1I ATCCAGTTAG -/A AAACCTGAGC 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 3 4 17890 CASAVA_Build 5 32671422 1I CCTGAGCAAC -/A AAAAAAAAAT 2679 het 1320 hom 13 3 6 4 A 9 10 17891 CASAVA_Build 5 32684184 1D TCTTCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 525 hom 24 2 14 8 T 15 14 17892 CASAVA_Build 5 32685232 1D TCTCTACAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 33 0 29 4 T 10 9 17893 CASAVA_Build 5 32687592 1D TCAAAAAACG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 17 9 5 A 9 8 17894 CASAVA_Build 5 32706194 1I GCTTTGTGTG -/T TTTGTCCAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 3 4 17895 CASAVA_Build 5 32718547 1D18M1D TGTCATTCTA TTTTTTTTTTTGTTGGGTCA/-TTTTTTTTTTGTTGGGTC- GGGGGGGCGG 3070 het 3070 hom 33 11 12 11 N/A 0 0 17896 CASAVA_Build 5 32728984 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 A 11 10 17897 CASAVA_Build 5 32734231 1D TATAATTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 17898 CASAVA_Build 5 32745695 1D AGAGCGCGTT A/- AAGGCCTCGG 3070 hom 99 het 42 0 31 11 A 3 2 17899 CASAVA_Build 5 32752232 1I AACATGCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 54 2 40 12 T 12 13 17900 CASAVA_Build 5 32837475 1I AAGGTATTGC -/T GTCTAGTACC 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 T 0 1 17901 CASAVA_Build 5 32878474 2D45M1I CCCTGTCTTG AAAAAAAAAAAATACACCTTCTCAGGCCAAAAAAGGAACCACAGAAG-/--AAAAAAAAAATACACCTTCTCAGGCCAAAAAAGGAACCACAGAAGA AAAGAAGAAG 3070 het 3070 ref 36 22 16 13 N/A 0 0 17902 CASAVA_Build 5 32879153 1D TGGGAGGAAA C/- TGCTCACCCA 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 C 1 0 17903 CASAVA_Build 5 32879250 2I CTCGTGGTGC --/CT GTCTCAGCTG 3070 hom 84 het 34 0 27 7 CT 0 1 17904 CASAVA_Build 5 32880458 1D CAAAGCCCTT G/- ATGTGTTCTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 G 1 0 17905 CASAVA_Build 5 32882757 4D AATAAATGAT AGTC/---- AGAGTGAGAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 AGTC 1 0 17906 CASAVA_Build 5 32884755 1D TTGGGTAATT G/- CAGTGAGGTT 3070 het 3070 hom 51 12 28 11 G 1 0 17907 CASAVA_Build 5 32884792 4D TCTCATCCCT TAAG/---- TAAGAGTGGT 3070 het 3070 hom 54 18 23 15 TAAG 2 1 17908 CASAVA_Build 5 32887394 2D GCCTCAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 14 12 17909 CASAVA_Build 5 32891128 1I TGTGAATTTG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 6 7 17910 CASAVA_Build 5 32987748 2D AAGGACATGG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 AC 6 5 17911 CASAVA_Build 5 33017224 1D AATAATGAGG T/- TTTTGGCATT 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 T 5 4 17912 CASAVA_Build 5 33024945 2D CCTCTCTGAG AT/-- AGCCTGGGAG 3070 het 3070 ref 40 23 14 5 AT 1 0 17913 CASAVA_Build 5 33049462 1D ATCCCAAGCA T/- TTTGGATAAG 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 T 4 3 17914 CASAVA_Build 5 33056899 1I ACACTTATAT -/A ACAGTTACTA 3070 hom 154 het 58 0 52 6 A 1 2 17915 CASAVA_Build 5 33060244 1D CATAGTATTC A/- AATAACTTTA 3070 het 3070 hom 57 24 26 7 A 3 2 17916 CASAVA_Build 5 33083859 1I TCCATCCACA -/G TAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 G 0 1 17917 CASAVA_Build 5 33087063 4I GGTACATAAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AAAC 3 4 17918 CASAVA_Build 5 33090081 2D TAATAAAGAC TG/-- TGTATGAAAA 3070 het 3070 ref 53 27 22 4 TG 2 1 17919 CASAVA_Build 5 33109642 1D ACTAGATAGG T/- TATGGATGGT 3070 het 3070 hom 57 28 27 3 T 2 1 17920 CASAVA_Build 5 33112277 1D GGGTTACGGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 25 8 14 4 T 8 7 17921 CASAVA_Build 5 33122418 1D GCTTTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 14 11 A 12 11 17922 CASAVA_Build 5 33125836 1D ACTGGTGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 11 10 17923 CASAVA_Build 5 33126448 1I GGCTTACTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 9 10 17924 CASAVA_Build 5 33127427 2I TCTCTGAGGG --/GT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 GT 0 1 17925 CASAVA_Build 5 33127731 3I TTTTCTCTCT ---/CTC TTTTTCAGGG 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 CTC 0 1 17926 CASAVA_Build 5 33131765 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2863 het 2547 hom 23 9 11 3 T 12 11 17927 CASAVA_Build 5 33138519 11I ACAGTGGTCT -----------/ATTTTTATACC GAGAGTTGTG 3070 het 3070 ref 29 21 7 1 ATTTTTATACC 0 1 17928 CASAVA_Build 5 33141189 1D GATCTTTCTA G/- GGGTGGAGCA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 G 4 3 17929 CASAVA_Build 5 33142160 3D ACGTTTTGTC ATA/--- ATATTTTCAT 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 ATA 2 1 17930 CASAVA_Build 5 33143184 4I TTCTCGTGAC ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 AGTG 1 2 17931 CASAVA_Build 5 33145248 4D ATGAGATCTG TTTA/---- TTTAAATGTG 3070 het 3070 ref 37 19 16 4 TTTA 2 1 17932 CASAVA_Build 5 33148013 1D AGTTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 14 10 T 11 10 17933 CASAVA_Build 5 33155236 4I ATTATCTTTG ----/TCTA TCTATCTAGA 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 TCTA 2 3 17934 CASAVA_Build 5 33156323 1D CAAAACCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 11 10 17935 CASAVA_Build 5 33169672 4D ATACATTTTA TTTC/---- TTTCTTTTGC 3070 het 3070 hom 45 19 22 6 TTTC 2 1 17936 CASAVA_Build 5 33171539 3I TATAGCTACC ---/CCT GCTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 CCT 0 1 17937 CASAVA_Build 5 33174190 1I GGTCCAGGGG -/A AATCTTCTCT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 A 2 3 17938 CASAVA_Build 5 33177330 1D CATTATTGCA G/- AAGTGGGTTT 3070 het 3070 hom 55 23 27 6 G 1 0 17939 CASAVA_Build 5 33189367 1I TTATTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 9 16 14 A 11 12 17940 CASAVA_Build 5 33192078 1I GCATCTGTTG -/T TTTTTGCCTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 5 6 17941 CASAVA_Build 5 33194477 1D TACTGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 7 6 T 12 11 17942 CASAVA_Build 5 33198720 1D TTGTTTTGTT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 C 11 10 17943 CASAVA_Build 5 33201050 1I AATACCTTGG -/T TTTTTTTTTT 2518 het 2518 ref 37 17 8 12 T 13 14 17944 CASAVA_Build 5 33213395 4D ACTCACTAAT TTGA/---- TTGATGATTC 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 TTGA 2 1 17945 CASAVA_Build 5 33213887 2D ATAGAACACG CC/-- CCCCCCCCAC 3070 hom 57 het 20 0 17 4 C 10 8 17946 CASAVA_Build 5 33215937 1D CTTTATTTAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 8 17947 CASAVA_Build 5 33217329 2D AAATGGCATT AC/-- AGAGTAGTTT 3070 hom 157 het 55 0 53 2 AC 1 0 17948 CASAVA_Build 5 33224616 4D TATCTTCAAG CTAA/---- CTAATCATTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 CTAA 2 1 17949 CASAVA_Build 5 33230166 4I AAAGGTTTTT ----/TTTG TTTATTTGTT 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 TTTG 0 1 17950 CASAVA_Build 5 33237417 1D AAAAATAAAA T/- AATGGAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 T 1 0 17951 CASAVA_Build 5 33242017 1I TAGGCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 A 10 11 17952 CASAVA_Build 5 33244878 2D AGATGAGCAA AG/-- AGAGAGGTTT 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 AG 4 3 17953 CASAVA_Build 5 33262813 1I AGGCACATAA -/C CCCAACCTAT 3070 hom 92 het 33 0 30 3 C 3 4 17954 CASAVA_Build 5 33283289 2I CAGAAAATGA --/TG AGGGAGCATC 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 TG 0 1 17955 CASAVA_Build 5 33286465 10D TGTGTGTGTG TGTATATATA/---------- TATATATATA 3070 het 653 hom 14 3 10 3 TGTATATATA 1 0 17956 CASAVA_Build 5 33287606 2I ATATACATAC --/AT ATATATATAT 1955 het 1955 ref 18 8 5 5 AT 6 7 17957 CASAVA_Build 5 33288534 1I TACATACAAA -/T TATCTTCTTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 1 2 17958 CASAVA_Build 5 33297487 1I TGTTTTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 11 12 A 13 14 17959 CASAVA_Build 5 33300439 1I TATCCAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 10 11 17960 CASAVA_Build 5 33307590 2I GTTCTTTCCA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 TC 5 6 17961 CASAVA_Build 5 33309184 4D CTATTCTTCC CTCA/---- CTGTTTACAA 2255 het 2255 ref 19 12 5 4 CTCA 1 0 17962 CASAVA_Build 5 33309246 1I GTATATTTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 7 8 17963 CASAVA_Build 5 33313904 1I GTAGCACATC -/A TAAATTTGCA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 0 1 17964 CASAVA_Build 5 33318109 1D GCAAAAAAAA T/- GTGAACCAGT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 1 0 17965 CASAVA_Build 5 33321837 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 25 14 5 6 A 11 12 17966 CASAVA_Build 5 33327553 6D ACCTTACACC TTCCAT/------ TTCCATTTTT 3070 hom 151 het 53 0 50 3 TTCCAT 2 1 17967 CASAVA_Build 5 33330106 1D CAAACAAACG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 9 8 17968 CASAVA_Build 5 33333727 1I ACTGGGCAAA -/G GTTTTATAGT 3070 het 3014 hom 22 8 9 5 G 1 2 17969 CASAVA_Build 5 33334982 1D TTGCAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 11 10 17970 CASAVA_Build 5 33340970 1I AACAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2699 het 691 hom 14 2 8 4 T 11 12 17971 CASAVA_Build 5 33342039 1D TCTTGTAGAT G/- GAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 G 2 1 17972 CASAVA_Build 5 33350306 2D AGGCTGCAAT AA/-- GTGTCATTAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 2 0 17973 CASAVA_Build 5 33359111 1D CAAGGTGGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 10 9 17974 CASAVA_Build 5 33363820 3D AAAACATCAT GTA/--- TCATTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 GTA 1 0 17975 CASAVA_Build 5 33366503 1I ATATGATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 15 24 10 T 10 11 17976 CASAVA_Build 5 33367937 4D TAATGCCTAT TAGA/---- TGGATGGCAA 3070 het 3070 ref 39 15 15 11 TAGA 1 0 17977 CASAVA_Build 5 33371793 5I GTGGTGCGAT -----/ATCTC AGCTCACTGC 3070 hom 64 het 28 0 21 7 ATCTC 0 1 17978 CASAVA_Build 5 33373505 1D AAAAAAAAAA C/- CACAGGGGAA 3070 het 89 hom 50 1 40 10 C 2 1 17979 CASAVA_Build 5 33376024 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 9 10 17980 CASAVA_Build 5 33377409 1D TGTTCTAAAG A/- AAAAAACCAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 7 6 17981 CASAVA_Build 5 33397103 1D AAGAAAGAAG T/- TTAATGACTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 T 3 2 17982 CASAVA_Build 5 33399693 6I CACACACACA ------/CACACG CACACGCACA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 CACACG 1 2 17983 CASAVA_Build 5 33402997 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1232 hom 35 4 20 11 A 15 14 17984 CASAVA_Build 5 33407137 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 127 hom 26 3 14 9 A 17 16 17985 CASAVA_Build 5 33409395 1I GCGTATACAT -/A TACCTTTAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 1 17986 CASAVA_Build 5 33417706 4I AGAGAGAGAG ----/TCTT TCTCTGTTGC 3070 hom 106 het 41 0 33 8 TCTT 0 1 17987 CASAVA_Build 5 33423054 1D ATACTCTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 85 het 40 0 31 10 A 10 9 17988 CASAVA_Build 5 33426914 8D GATAAAACAG TCTTTAAA/-------- CCAACAAAGA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TCTTTAAA 1 0 17989 CASAVA_Build 5 33430079 11D TGCTGGAGAG GATGTGGAGAA/----------- GATGTGGAGA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 GATGTGGAGAA 2 1 17990 CASAVA_Build 5 33436091 1D TGGCCTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 11 10 17991 CASAVA_Build 5 33440304 2D ATTTACAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 13 11 17992 CASAVA_Build 5 33441889 4D ACTGTCTGTT ACTC/---- AGGAAAATTA 3070 hom 102 het 35 0 35 1 ACTC 1 0 17993 CASAVA_Build 5 33445057 3I CCAGAACCAT ---/CTA CTATTTCAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CTA 1 2 17994 CASAVA_Build 5 33455982 1I CGCCCGGACA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 2170 hom 20 7 10 3 T 6 7 17995 CASAVA_Build 5 33456485 1D TTTAGAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 A 10 9 17996 CASAVA_Build 5 33464917 1D TTTCCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 12 11 17997 CASAVA_Build 5 33466667 2D AAAAAAAGAT AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AG 5 4 17998 CASAVA_Build 5 33477563 1D CCCCGACTTT G/- AGGGCCTCAC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 G 1 0 17999 CASAVA_Build 5 33484720 1I ATCTGTTTAA -/T TTTGCCTACT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 3 4 18000 CASAVA_Build 5 33488632 1D ATTTAGTAGG C/- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 C 2 1 18001 CASAVA_Build 5 33490616 2I AAAAATACAC --/TT TAGTAATTGG 3070 het 3070 hom 46 20 25 1 T 1 3 18002 CASAVA_Build 5 33502496 3I TTTTTTGGAA ---/AAG AAGAATACTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAG 1 2 18003 CASAVA_Build 5 33503031 2D ACATACTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2420 het 2420 ref 17 7 5 5 T 13 11 18004 CASAVA_Build 5 33506760 8D TCTGCCTAAA AAAAAAAT/-------- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 43 26 18 2 AAAAAAAT 1 0 18005 CASAVA_Build 5 33510695 4D TCTTGTGAAA ACTC/---- ACTCACTATC 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 ACTC 2 1 18006 CASAVA_Build 5 33517414 2D TAATATTCAC AT/-- GTTTCCTTAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 AT 1 0 18007 CASAVA_Build 5 33519442 2D GCTTCTCAAA CT/-- CTCTGTGGTA 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 CT 3 2 18008 CASAVA_Build 5 33519562 1D TGAAAATTTT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 A 8 7 18009 CASAVA_Build 5 33525041 1I AGTGTTACAG -/T TAGCTCCTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 1 2 18010 CASAVA_Build 5 33526269 1D TAATTGATGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 9 8 18011 CASAVA_Build 5 33537128 3D TCTCTGTTCC ACA/--- TGGTGTTGGC 3070 hom 93 het 34 0 30 5 ACA 1 0 18012 CASAVA_Build 5 33548594 1I TTGATCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 29 0 20 9 T 12 13 18013 CASAVA_Build 5 33552706 1D TTTCGAGATG T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 8 7 18014 CASAVA_Build 5 33555123 10I AGTGGGAGGT ----------/AACTGAATCA GGGAGGTGGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AACTGAATCA 0 1 18015 CASAVA_Build 5 33556095 1D CTTTTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 11 10 18016 CASAVA_Build 5 33557639 1I CTTTCCCATA -/G GGGGCATGAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 4 5 18017 CASAVA_Build 5 33562620 1D GGGAGGCAAG A/- AAAAAAAAAG 1355 het 1355 ref 39 30 3 6 A 10 9 18018 CASAVA_Build 5 33616298 18D GGGAACAGCT CCCATGATCTAATCATTC/------------------ CCCATGAGTT 3070 hom 60 het 21 0 20 3 CCCATGATCTAATCATTC 1 0 18019 CASAVA_Build 5 33618957 1D ATTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 10 9 18020 CASAVA_Build 5 33623720 1I TCTAGTTATT -/C CTTAGGTTGT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 C 1 2 18021 CASAVA_Build 5 33633546 3D AAAAGAACAA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 12 9 18022 CASAVA_Build 5 33635388 4I GCACTATCTC ----/TTTG TTTAACTGCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTTG 0 1 18023 CASAVA_Build 5 33636167 1I TTAAAAGAAC -/T GTCTTCCTGT 3070 hom 108 het 37 0 37 1 T 0 1 18024 CASAVA_Build 5 33637874 1D AAGTCAGGGA C/- CTCATTCACT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 C 2 1 18025 CASAVA_Build 5 33639652 4I AATTTATGCT ----/TAAA TACTTTGTTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TAAA 0 1 18026 CASAVA_Build 5 33641353 1I TGGAAAACTT -/G AGGAAAATAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 18027 CASAVA_Build 5 33641820 1I CAATCCTCTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 8 9 18028 CASAVA_Build 5 33667969 2I GTCAAAAACA --/TC TGTTTAAAGC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TC 0 1 18029 CASAVA_Build 5 33678873 1I TTTTTGGGAA -/G AAGAAGCCGC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 G 0 1 18030 CASAVA_Build 5 33680601 2D GAAGGGTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2619 hom 30 10 13 7 T 12 10 18031 CASAVA_Build 5 33682598 1D ACGTAATATG T/- TAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 2 1 18032 CASAVA_Build 5 33684600 2D GGATGTTCAG TT/-- ATTTCCAAAT 3070 het 3070 hom 45 13 29 3 T 2 0 18033 CASAVA_Build 5 33685753 1I GGAGCATTGT -/A AGGCATGCTT 3070 het 3070 hom 57 21 28 8 A 1 2 18034 CASAVA_Build 5 33702379 2D CTATTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 AG 2 1 18035 CASAVA_Build 5 33704144 5D ATTTACTGAA TACTC/----- TACTAAAAGT 3070 hom 102 het 37 0 34 6 TACTC 1 0 18036 CASAVA_Build 5 33706020 1I ACTCAACAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 24 hom 42 1 36 5 A 9 10 18037 CASAVA_Build 5 33706919 2I ATCCAGTCTC --/AA AAGTTATATC 3070 hom 105 het 49 0 36 13 A 2 4 18038 CASAVA_Build 5 33708964 2D GGAGACAAAC AG/-- AAAAGCAGAT 3070 hom 151 het 53 0 51 5 AG 1 0 18039 CASAVA_Build 5 33709544 1I CATATCATGA -/C CCATGGCTCA 3070 hom 150 het 55 0 47 8 C 2 3 18040 CASAVA_Build 5 33709748 1D ATTCAACCTC T/- ATTCATTCTT 3070 hom 107 het 40 0 34 6 T 1 0 18041 CASAVA_Build 5 33716375 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 9 10 18042 CASAVA_Build 5 33724220 67D AGGACAGTGA AATGATTTTCCTAAATGGAAGCTAACAGAGTGCAGATGTCTGTCCAGCGTTGTCTGAGGTGCTCAGG/------------------------------------------------------------------- ATACCTGACC 3070 het 3070 ref 47 35 23 4 AATGATTTTCCTAAATGGAAGCTAACAGAGTGCAGATGTCTGTCCAGCGTTGTCTGAGGTGCTCAGG 1 0 18043 CASAVA_Build 5 33725237 1D37M2D TCATCTGCCT AATAAAATTTCAGCATGAGGAATGGAAAGGATCAACTCAA/-AGAAATTTTCAGCATGAGGAATGGAAAGGATCAACTC-- AAAAAAAAAA 3070 het 2050 hom 23 9 10 18 N/A 0 0 18044 CASAVA_Build 5 33729538 2D CTCACAATAT AA/-- AGAGTCACCT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 3 1 18045 CASAVA_Build 5 33730513 5D AAGAACACTT TAGTC/----- TAGAGAAGTC 3070 het 3070 hom 42 18 23 2 TAGTC 1 0 18046 CASAVA_Build 5 33731912 2D AGTCACTAAC AT/-- GTGCTTATTA 3070 het 3070 ref 43 27 11 6 AT 1 0 18047 CASAVA_Build 5 33734490 17I ATCACTAGCC -----------------/CCATTTCCCCAATAGGT CCATTACATT 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 CCATTTCCCCAATAGGT 0 1 18048 CASAVA_Build 5 33736730 1D TCAGTAATAA T/- TTTATTTAAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 T 4 3 18049 CASAVA_Build 5 33749244 18D TCCTCATTAG TTTTAACTTCCTCCTTCA/------------------ TTCTCAGAAG 3070 hom 81 het 26 0 28 5 TTTTAACTTCCTCCTTCA 1 0 18050 CASAVA_Build 5 33750512 1D CACTTGCAGC A/- ACATGGATGG 3070 het 3070 ref 32 16 15 3 A 2 1 18051 CASAVA_Build 5 33752982 1D AAATTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 22 17 9 T 14 13 18052 CASAVA_Build 5 33769070 3D TTTGGTTATT ATA/--- ATAACCAAGT 2347 het 2347 ref 20 10 6 5 ATA 2 1 18053 CASAVA_Build 5 33787147 1I TGAAGATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 A 10 11 18054 CASAVA_Build 5 33800668 1D AATTTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 15 8 T 11 10 18055 CASAVA_Build 5 33806663 3D35M3D CCTTCTCCTC CTTCTTCTTCTTCTCCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCCCCT/---CTTCTTCTTCTCCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCC--- CCTCCTCCTC 3070 het 3070 hom 26 12 11 7 N/A 0 0 18056 CASAVA_Build 5 33816213 1D CATGAAAGAC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 9 8 18057 CASAVA_Build 5 33822324 1D TCTAAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 2676 het 2676 ref 28 14 8 6 T 12 11 18058 CASAVA_Build 5 33822741 1I AAACCAACAA -/T TTAAGATTCC 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 T 2 3 18059 CASAVA_Build 5 33822885 3I ATGAAATAAC ---/CTG CTAAGTGGAT 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 CTG 0 1 18060 CASAVA_Build 5 33825039 2D GACAGAAAGG TC/-- TCTCACACAC 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 TC 3 2 18061 CASAVA_Build 5 33827633 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2944 hom 38 12 13 13 T 13 14 18062 CASAVA_Build 5 33830365 3I AGCCTGCTGC ---/AGG AGCTTATTCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGG 0 1 18063 CASAVA_Build 5 33836495 1D TTCAAAAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 132 het 50 0 44 8 T 10 9 18064 CASAVA_Build 5 33841788 1D CCTCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 13 12 18065 CASAVA_Build 5 33842474 1D GGTACATTAC A/- AGGCTCTGTC 3070 hom 101 het 41 0 34 7 A 2 1 18066 CASAVA_Build 5 33845345 4D TCAAAATTTT TATC/---- TATCTTTGTT 3070 hom 81 het 28 0 27 2 TATC 2 1 18067 CASAVA_Build 5 33856507 1D CTTAATATAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 76 het 33 0 31 2 A 9 8 18068 CASAVA_Build 5 33863703 1I ATTATCTTAT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 7 8 18069 CASAVA_Build 5 33870101 1I AGGTACTGGA -/T GGTTAGGACT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 0 1 18070 CASAVA_Build 5 33871553 1I TGGCCCTACC -/T CCTAATACCA 3070 hom 98 het 36 0 32 4 T 0 1 18071 CASAVA_Build 5 33891533 1I GGGAGAAATG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 8 9 18072 CASAVA_Build 5 33893541 1I GAAACACACA -/G AAAAATTGGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 0 1 18073 CASAVA_Build 5 33898270 2D AGAGAATACC AT/-- AAACACTTCT 2003 hom 12 het 7 0 5 2 AT 1 0 18074 CASAVA_Build 5 33903482 2D AAATAAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 132 het 49 0 45 5 AC 7 6 18075 CASAVA_Build 5 33908409 1D ACTTCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 12 11 18076 CASAVA_Build 5 33914142 1D TTTGGGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 48 1 43 5 T 11 10 18077 CASAVA_Build 5 33919190 2D TTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 874 het 538 hom 21 6 10 6 T 14 12 18078 CASAVA_Build 5 33925149 1I CATCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 797 hom 34 2 27 5 A 10 11 18079 CASAVA_Build 5 33932247 4I TTGTGGGAGG ----/TAGA TAGAAAATAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 TAGA 1 2 18080 CASAVA_Build 5 33938727 1D GTATTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 177 hom 51 6 26 19 A 13 12 18081 CASAVA_Build 5 33942848 2I ATGCTCAGTG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 11 14 6 A 9 11 18082 CASAVA_Build 5 33945370 1I ATTTGTTAGG -/C CACTCAGACA 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 C 1 2 18083 CASAVA_Build 5 33947066 1D GTATACTTAG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 8 7 18084 CASAVA_Build 5 33947490 1D AGACTATAGC T/- TCTATGCTGA 3070 het 3070 hom 73 29 31 14 T 2 1 18085 CASAVA_Build 5 33949688 2I12M1I AAGATGAGGA --TTTTTTTTGGTA-/TTTTTTTTTTGGTAT TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 31 21 9 3 N/A 0 0 18086 CASAVA_Build 5 33950522 1D CTAGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 12 11 18087 CASAVA_Build 5 33957269 1I CACAACAGTT -/G CCATGAAAGC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 G 0 1 18088 CASAVA_Build 5 33958570 2I GTGTATTGTC --/AA GCAAGTTTCC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 0 2 18089 CASAVA_Build 5 33962057 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 24 1 16 7 T 13 14 18090 CASAVA_Build 5 33968184 1D TTTCCAATGT C/- CTCCATTACT 3070 het 3070 hom 54 21 29 5 C 2 1 18091 CASAVA_Build 5 33979807 1D ACCCCTGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 12 11 18092 CASAVA_Build 5 33991899 1D TGAAGTCCTC A/- GGGGCAGACC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 0 18093 CASAVA_Build 5 33992318 1D ATGACAACAG T/- TTTTTTGGGG 3070 hom 153 het 58 0 50 8 T 7 6 18094 CASAVA_Build 5 33999326 2D GTTGGATGCT AC/-- CTGAGAGGAG 3070 hom 99 het 39 0 33 7 AC 1 0 18095 CASAVA_Build 5 33999489 3D CAATTAAAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 126 het 46 0 42 5 AAC 5 4 18096 CASAVA_Build 5 34004510 1I TTTAGTCCAC -/A AACTATGACA 3070 het 3070 hom 48 23 22 3 A 2 3 18097 CASAVA_Build 5 34009695 40D AATCCTTTAG ATGGTTCATTGTGCTGTGCCTGTGACCCTTGCAAGGTGGT/---------------------------------------- TATTAACTAA 3070 het 3070 ref 33 31 15 4 ATGGTTCATTGTGCTGTGCCTGTGACCCTTGCAAGGTGGT 1 0 18098 CASAVA_Build 5 34010315 2D GCAGTGAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 8 9 A 13 11 18099 CASAVA_Build 5 34012822 2I CTGTACTCCC --/CA GATTCCTGTG 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 CA 0 1 18100 CASAVA_Build 5 34016022 2D GAATCTATTC AA/-- TGAGACTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 18 8 A 2 0 18101 CASAVA_Build 5 34016130 1D GCTTTCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 36 1 23 12 A 13 12 18102 CASAVA_Build 5 34021619 3D TCTCATACAC ATT/--- ATTACACATG 3070 het 3070 ref 79 36 35 8 ATT 2 1 18103 CASAVA_Build 5 34026417 1D TTGGTGTAAA T/- TGTCCTTTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 2 1 18104 CASAVA_Build 5 34041172 1I AACCATGGGC -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 7 8 18105 CASAVA_Build 5 34046666 4I AACATGTAGT ----/TAGA TAGAAGGAAT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 TAGA 1 2 18106 CASAVA_Build 5 34052462 2I TTCCCCTTGC --/CT CTCACCAAAT 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 CT 1 2 18107 CASAVA_Build 5 34053622 1I GTTTAAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 21 12 T 12 13 18108 CASAVA_Build 5 34053781 1D TATTTGTAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 A 10 9 18109 CASAVA_Build 5 34054988 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 A 12 13 18110 CASAVA_Build 5 34062356 1D GAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 37 14 12 11 A 9 8 18111 CASAVA_Build 5 34076678 1D GTTGCAGCAC T/- TTTTTTTTTT 2511 het 2486 hom 22 9 8 5 T 12 11 18112 CASAVA_Build 5 34090619 1I GGAATCTGTA -/T TTTTTTTTAC 2986 het 2986 ref 43 26 9 8 T 8 9 18113 CASAVA_Build 5 34099160 2I CCTCTCTCTC --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 CT 5 6 18114 CASAVA_Build 5 34101530 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 30 0 26 4 A 10 11 18115 CASAVA_Build 5 34106562 1I GGTGATGAGG -/T TTACTTGTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 3 18116 CASAVA_Build 5 34117371 3D ATTGACATGA TTC/--- TTAATTATTT 1380 het 1380 ref 32 28 3 2 TTC 1 0 18117 CASAVA_Build 5 34119372 1D ATGAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 27 0 17 10 A 15 14 18118 CASAVA_Build 5 34125698 3I ATCATGCCAT ---/CAC CACTTCTATA 3070 het 3070 ref 44 29 8 7 CAC 1 2 18119 CASAVA_Build 5 34127794 1D ATTGTGCTTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 265 hom 30 1 25 4 A 9 8 18120 CASAVA_Build 5 34138821 1I GTGCACATGT -/A ACCCTAGAAC 1963 hom 10 het 9 0 4 5 A 1 2 18121 CASAVA_Build 5 34140731 1D AATAGATAAC T/- TTTTTTTTTT 2920 het 2920 ref 26 19 7 1 T 11 10 18122 CASAVA_Build 5 34142090 2D TAATTAAAAT AG/-- AGTGACATTT 2873 het 2873 ref 27 21 6 4 AG 2 1 18123 CASAVA_Build 5 34145689 3D TGATACAGAC TGT/--- TTTCTGAGAA 3070 het 3070 ref 76 57 12 9 TGT 1 0 18124 CASAVA_Build 5 34152378 4I GTTAAATGCT ----/TAGA TAAATTTTAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 TAGA 0 1 18125 CASAVA_Build 5 34159485 1D ACAGATATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 26 1 23 2 T 11 10 18126 CASAVA_Build 5 34183001 1I ACTAAAAAGT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 8 9 18127 CASAVA_Build 5 34189903 2I ATAAAAAAAA --/AG AAAATGTCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AG 0 1 18128 CASAVA_Build 5 34191677 3I ATATTAAACC ---/ATT ATTATTAACA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 ATT 2 3 18129 CASAVA_Build 5 34195049 2D CAGAAAAAAA CT/-- CTGTGTATTT 3070 hom 90 het 31 0 31 1 CT 2 1 18130 CASAVA_Build 5 34199344 5I TTATGATTGA -----/TTATT TTATTTTAAT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 TTATT 1 2 18131 CASAVA_Build 5 34202648 1I CTGATGATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 524 hom 36 2 27 7 T 10 11 18132 CASAVA_Build 5 34206749 2D TGACAGAATT AC/-- AGATTCAATT 1388 het 1388 ref 29 25 3 1 AC 1 0 18133 CASAVA_Build 5 34212291 4I CAAAAAAAAA ----/AGAC AGCCAAGGAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AGAC 0 1 18134 CASAVA_Build 5 34220110 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 281 hom 81 1 63 20 A 10 9 18135 CASAVA_Build 5 34224081 2I AAATCCAGGC --/AA AAGTTTGCTG 3070 hom 246 het 87 0 73 14 A 2 4 18136 CASAVA_Build 5 34231238 1I TATACATTAA -/G TCTGCAAATT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 0 1 18137 CASAVA_Build 5 34231996 1I GAAATATCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 59 25 30 4 T 8 9 18138 CASAVA_Build 5 34238662 3D ATACAGTTTT TTG/--- TTTTTTTTTT 1019 het 1019 ref 36 29 3 5 TTG 1 0 18139 CASAVA_Build 5 34244542 4I ATATACAGTG ----/TAAC TAACATACAC 1788 het 1788 ref 31 22 4 5 TAAC 1 2 18140 CASAVA_Build 5 34253197 1I AGAAACTTAA -/T TAAAATGAGA 1535 het 1535 ref 35 27 4 4 T 1 2 18141 CASAVA_Build 5 34257603 1I TTTTCATAGA -/T TTTTAATCTC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 4 5 18142 CASAVA_Build 5 34267199 1D TATTTTTTAG T/- TAATTCTAGA 1704 het 1704 ref 28 20 4 6 T 2 1 18143 CASAVA_Build 5 34268833 3I AGCAAACTAC ---/CTT TTTTACTGTA 3070 hom 36 het 20 0 13 7 CTT 0 1 18144 CASAVA_Build 5 34269565 1D AGGACATGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 24 0 20 4 T 11 10 18145 CASAVA_Build 5 34272253 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 10 9 18146 CASAVA_Build 5 34277605 1I TCTATACAAA -/T TTTTTTTTTT 977 het 977 ref 29 15 3 11 T 15 16 18147 CASAVA_Build 5 34283097 4I TAGCAAAGGT ----/ACAG ACATATATCT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 ACAG 0 1 18148 CASAVA_Build 5 34286645 1I ATATATAGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 12 0 8 4 A 9 10 18149 CASAVA_Build 5 34287370 11D AACAAATATG CCATTAAGATT/----------- TAATTTGCCC 3070 hom 30 het 9 0 10 1 CCATTAAGATT 1 0 18150 CASAVA_Build 5 34290224 1D CAATTCTAAA T/- TTTTAAACAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 5 4 18151 CASAVA_Build 5 34290402 5I AATACTAATA -----/AAAAT AAAATATGTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AAAAT 1 2 18152 CASAVA_Build 5 34294324 1D TTAACTAGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 9 8 18153 CASAVA_Build 5 34297754 1D TAAATCAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 10 9 18154 CASAVA_Build 5 34297814 2D AAATTGAAGG TT/-- TTTTTTTATC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 9 7 18155 CASAVA_Build 5 34302588 1I CTTGCTTCAC -/T TTTCTTTATA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 3 4 18156 CASAVA_Build 5 34302793 1D TCAAGCCAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 9 8 18157 CASAVA_Build 5 34303986 2D AACAATACTC TA/-- TGTTACTATC 3070 hom 33 het 15 0 12 5 TA 1 0 18158 CASAVA_Build 5 34307526 8D AAAAAAAAAA AAAAAACC/-------- CCCTCTGTCA 2721 het 246 hom 25 4 11 14 AAAAAACC 1 0 18159 CASAVA_Build 5 34308951 1I TGAAATATAT -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 7 8 18160 CASAVA_Build 5 34309380 3D ACAAAGACAG AAC/--- AACAACAACA 2305 het 2305 ref 50 40 5 6 AAC 4 3 18161 CASAVA_Build 5 34310959 1D AAAAAGAGAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 8 7 18162 CASAVA_Build 5 34312020 1D CCCTAGTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 298 hom 22 1 19 2 T 10 9 18163 CASAVA_Build 5 34312279 1I CAACTATCTG -/A AAAAATTTAC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 5 6 18164 CASAVA_Build 5 34314884 1D GCTTTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 34 2 30 2 T 13 12 18165 CASAVA_Build 5 34315628 1I AAATAACATA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 6 7 18166 CASAVA_Build 5 34316120 1D TTTCAATGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 10 9 18167 CASAVA_Build 5 34321315 1D CACCCACAAA G/- GTTCTCTTTG 3070 het 2795 hom 25 6 17 2 G 2 1 18168 CASAVA_Build 5 34328321 3D AAAGACTACA AGG/--- AGATCTGCTC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 AGG 1 0 18169 CASAVA_Build 5 34328465 5D TGGTCATGTC GCTGT/----- GCTGTGGAAA 3070 het 3070 ref 32 13 13 9 GCTGT 2 1 18170 CASAVA_Build 5 34331983 1D TCTCAAATGG A/- AATGAGGAAC 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 A 3 2 18171 CASAVA_Build 5 34332615 2D GTAGCAGAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 11 9 18172 CASAVA_Build 5 34335313 1D TAGGTGAAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 10 9 18173 CASAVA_Build 5 34339162 1I TTAAGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 17 12 3 A 10 11 18174 CASAVA_Build 5 34354209 1D CTATGACCTG C/- GTATTGATGA 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 C 1 0 18175 CASAVA_Build 5 34356269 5D ACTAGAAATA AAAAC/----- AAAACAAACA 2386 het 2386 ref 22 10 5 9 AAAAC 2 1 18176 CASAVA_Build 5 34357490 3D CTTTCTTTGC TAG/--- TAGCTTCCAT 3070 het 3070 ref 33 15 15 5 TAG 2 1 18177 CASAVA_Build 5 34359728 1I GATTTGTCAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 7 8 18178 CASAVA_Build 5 34360062 6I ATTTATTTTC ------/CTTTAT CTTTATCTTT 1125 het 1125 ref 20 11 5 4 CTTTAT 1 2 18179 CASAVA_Build 5 34361940 2I TGTAATTTCA --/CT ATCTCTGATC 3070 hom 44 het 19 0 15 4 CT 0 1 18180 CASAVA_Build 5 34362998 2D CTCTGTGAAG AC/-- AGTTTTATTA 1698 het 1698 ref 40 34 4 2 AC 1 0 18181 CASAVA_Build 5 34365109 1D GCTATTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 24 1 22 3 T 11 10 18182 CASAVA_Build 5 34366143 1I ATAATGCTGG -/C CTCAGAATAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 1 2 18183 CASAVA_Build 5 34372614 1D TGCTTGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 17 A 11 10 18184 CASAVA_Build 5 34372755 1D AGAGAACAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 54 27 20 9 A 9 8 18185 CASAVA_Build 5 34377868 1D TATTAGATTA T/- TAAATACATT 2403 het 2403 ref 24 11 5 8 T 2 1 18186 CASAVA_Build 5 34380891 1D TATACCCACA C/- ATTAAAAAAT 3070 het 3070 ref 51 32 18 1 C 1 0 18187 CASAVA_Build 5 34382622 2D TGCAATATAT TC/-- TCTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 29 15 9 TC 3 2 18188 CASAVA_Build 5 34396502 1D GCATTCAATT A/- AAAAAAAGTA 2230 het 2230 ref 49 41 5 3 A 8 7 18189 CASAVA_Build 5 34397283 1I GAACCTGCCT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 1869 hom 18 5 10 3 A 7 8 18190 CASAVA_Build 5 34397939 4I AAAAAAACAT ----/ATAA ATACAGATAC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 ATAA 0 1 18191 CASAVA_Build 5 34398234 3D AAAGGATGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 24 1 12 11 A 14 11 18192 CASAVA_Build 5 34398496 3I TAGTGTGATT ---/GTA GTAGGCTAAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 GTA 1 2 18193 CASAVA_Build 5 34398596 1D TCAGAATAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 A 10 9 18194 CASAVA_Build 5 34403039 1I AAAAGAATAA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 T 7 8 18195 CASAVA_Build 5 34413366 1I ATTTATTTGT -/A AAGGTAGAAA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 2 3 18196 CASAVA_Build 5 34413439 1D TGATAAAATT A/- CAATCATCAT 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 A 1 0 18197 CASAVA_Build 5 34418297 1I ATAAAGTGGG -/T TTGTGCACAG 2980 het 2980 ref 33 20 7 6 T 2 3 18198 CASAVA_Build 5 34422946 2D ATTCTGACCC TA/-- TGTGTATCTT 3070 het 3070 hom 38 18 14 6 TA 1 0 18199 CASAVA_Build 5 34423027 2I TGTGCCAGTC --/TG TGTCTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TG 1 2 18200 CASAVA_Build 5 34424842 1D CACTGAGGGG A/- AAACTGCCTG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 4 3 18201 CASAVA_Build 5 34426166 20D TTATAGTAAA TATATATTTTTAAATCTAAG/-------------------- TATAAAGGAT 2934 het 2934 ref 14 8 7 3 TATATATTTTTAAATCTAAG 1 0 18202 CASAVA_Build 5 34426589 2D TTAGATTAAC TG/-- TATTTAACTT 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 TG 1 0 18203 CASAVA_Build 5 34427354 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAATAA 2421 hom 12 het 6 0 5 1 A 7 8 18204 CASAVA_Build 5 34428868 4D TGTATGCAGT TAAA/---- TAAGCATACA 3070 hom 21 het 11 0 8 3 TAAA 1 0 18205 CASAVA_Build 5 34429258 1D ATAATGTTCA T/- TTTTTTTTTC 1874 het 1874 ref 40 22 4 14 T 10 9 18206 CASAVA_Build 5 34437210 1I TTTTAGAGGA -/C TGGTGCTAGT 3070 hom 21 het 8 0 7 1 C 0 1 18207 CASAVA_Build 5 34437529 1D TTTGAACCTC T/- TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 31 20 6 5 T 12 11 18208 CASAVA_Build 5 34446997 1D TGAACCAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 5 T 10 9 18209 CASAVA_Build 5 34450196 3I AAAAAAAAAA ---/TAT ATATATATAT 3011 hom 30 het 11 0 11 0 TAT 0 1 18210 CASAVA_Build 5 34453861 1I25M1D ATTCTTACTG -AAAAAAAAGGGAGGGTGTTCTTTTTA/AAAAAAAAAGGGAGGGTGTTCTTTTT- AAAAAAAGGT 2538 hom 23 het 12 0 7 8 N/A 0 0 18211 CASAVA_Build 5 34454000 1I TAAAAATAAA -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 0 1 18212 CASAVA_Build 5 34454184 1I AATTTATCTG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 378 hom 19 1 12 6 A 8 9 18213 CASAVA_Build 5 34455477 1D TCTCATGAAG A/- GCTGAAATGC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 1 0 18214 CASAVA_Build 5 34456644 1D12M1D GGTGACAGAA CAAGACTCCATCTC/-AAGACTCCATCT- CAAAAAAAAA 3070 het 1063 hom 18 3 12 3 N/A 0 0 18215 CASAVA_Build 5 34457662 2D AAAGCTGGTT AC/-- AAACAATCCA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AC 1 0 18216 CASAVA_Build 5 34458947 2D TCAGTAAATA AG/-- AGAGATATAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AG 3 2 18217 CASAVA_Build 5 34461469 6I GATTGTTCTA ------/TTTTAT TTTTTTTGTT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 TTTTAT 0 1 18218 CASAVA_Build 5 34461550 1I AAAATCTGTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 8 9 18219 CASAVA_Build 5 34462045 5D TCATTACACC AAAAA/----- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 16 0 14 3 A 14 9 18220 CASAVA_Build 5 34462236 1I TAATTGATTA -/T TTCCCCATCT 3070 hom 59 het 23 0 20 4 T 2 3 18221 CASAVA_Build 5 34464533 5D ACATTTACAA TCTAT/----- TCTATCTGTA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TCTAT 2 1 18222 CASAVA_Build 5 34470245 1D ACCCTGCCCC T/- AGTTGTGGAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 1 0 18223 CASAVA_Build 5 34471907 3D GCTTTATTAC AGT/--- AGCCCTAGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AGT 1 0 18224 CASAVA_Build 5 34474035 1D AAGGTAGTGG A/- AAAAGCAACC 3070 hom 120 het 45 0 41 5 A 5 4 18225 CASAVA_Build 5 34478348 1I TTTTGATGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 9 10 18226 CASAVA_Build 5 34482183 1D CTTTGTGGTG T/- TTTTCTGTAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 5 4 18227 CASAVA_Build 5 34482575 1D TTGTTTAACC T/- TTTTTTCAAG 3070 hom 74 het 30 0 24 6 T 7 6 18228 CASAVA_Build 5 34490900 1D TCCCATTTTT C/- TACAGCTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 18229 CASAVA_Build 5 34491025 5I GGAGGGAGGT -----/TCAGA TCAGAGAGAT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 TCAGA 1 2 18230 CASAVA_Build 5 34495855 1D GTGTATAAGC G/- TTTTTTTATA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 G 1 0 18231 CASAVA_Build 5 34496245 1D AAAAGGACAC T/- TTTTTAGAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 5 18232 CASAVA_Build 5 34499518 1D CCAGGCATCC A/- AATACTATCA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 A 3 2 18233 CASAVA_Build 5 34502997 1D GAGGACTAGT A/- GGGGGGGTCA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 1 0 18234 CASAVA_Build 5 34507963 1I AGATAGAGAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 46 het 21 0 15 6 A 8 9 18235 CASAVA_Build 5 34519148 1D AGAACACAAA G/- GGAATTCCAA 3070 hom 140 het 53 0 45 10 G 3 2 18236 CASAVA_Build 5 34524939 1D AGCCACCCCC G/- CCCCACCACC 3070 hom 62 het 22 0 20 3 G 1 0 18237 CASAVA_Build 5 34528272 2D GCCCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1769 hom 23 het 11 0 8 3 T 13 11 18238 CASAVA_Build 5 34531039 4I ATCTATCAAT ----/CTAG GAGGCAGTCC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 CTAG 0 1 18239 CASAVA_Build 5 34533394 2D GGTGGGAGCC TG/-- TGCATCGGTC 3070 hom 95 het 34 0 28 7 TG 2 1 18240 CASAVA_Build 5 34537291 1I TTTAAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 10 11 18241 CASAVA_Build 5 34541660 4D TATTTTAGTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 45 21 19 9 AAAC 3 2 18242 CASAVA_Build 5 34550024 3I CATCTCATGC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 10 13 18243 CASAVA_Build 5 34554707 1I AATTTTTGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 83 het 31 0 27 4 T 8 9 18244 CASAVA_Build 5 34558074 1I TTTCCACTTA -/T TTTTCACCAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 5 18245 CASAVA_Build 5 34558801 1D CAAGACGCCC T/- TGTGTCTTGT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 T 2 1 18246 CASAVA_Build 5 34558862 4D7M3D GAGAAAATGA AGGCAGGAGCCCTT/----AGGAGCC--- CTTCTTACCA 3070 hom 50 het 18 0 17 7 N/A 0 0 18247 CASAVA_Build 5 34560722 15D ACTCTTTTTA TTTTTATTTTTTTAT/--------------- TTTTTATTTT 3070 hom 70 het 31 0 23 11 TTTTTATTTTTTTAT 2 1 18248 CASAVA_Build 5 34564546 1I AAAGGGAAAA -/T TTGGACACAG 3070 hom 190 het 73 0 62 11 T 2 3 18249 CASAVA_Build 5 34567152 5I AAGAATCAGC -----/TAAGA TAAATCAAAT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 TAAGA 0 1 18250 CASAVA_Build 5 34569949 4I TTGTCCACCT ----/TAAG TAAGTATTGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TAAG 1 2 18251 CASAVA_Build 5 34572897 13D TCCCTCTTTC TCACCCCTTATCA/------------- TCACCCCTTA 3070 hom 84 het 29 0 28 7 TCACCCCTTATCA 2 1 18252 CASAVA_Build 5 34575069 2D AGTTCCAGGG AA/-- AAAAAGTCAG 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 7 5 18253 CASAVA_Build 5 34586685 2I ACTTTTCTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 11 13 18254 CASAVA_Build 5 34587535 1D ACTTGTTGGA T/- TTTAACTCCG 3070 hom 70 het 27 0 18 9 T 4 3 18255 CASAVA_Build 5 34595965 1I TCTGTAAAGG -/C CCCTGCCTCC 3070 hom 84 het 31 0 27 4 C 3 4 18256 CASAVA_Build 5 34598397 13I ACAATAGATG -------------/TTTGCTGAAAAAA TTTGTTTCTA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 TTTGCTGAAAAAA 0 1 18257 CASAVA_Build 5 34599188 1I CCCATGTAGT -/A AAAAATCAAC 3070 hom 102 het 42 0 32 10 A 5 6 18258 CASAVA_Build 5 34604605 1I TCCCACTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1118 hom 30 3 19 8 T 12 13 18259 CASAVA_Build 5 34615759 1D ACATAAACAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 8 T 9 8 18260 CASAVA_Build 5 34631381 24I AATTCTATTC ------------------------/TCTGCAACTGGGCTGAAGTTCATT TTTGCACCAT 3070 het 3070 hom 31 16 14 4 TCTGCAACTGGGCTGAAGTTCATT 0 1 18261 CASAVA_Build 5 34637177 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 11 12 18262 CASAVA_Build 5 34648762 4I TGCTGGTACG ----/AACA AACCCACTGT 3070 hom 120 het 45 0 39 6 AACA 0 1 18263 CASAVA_Build 5 34649543 1I ACTGCTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 10 11 18264 CASAVA_Build 5 34651365 1I CCCCTCTGCC -/A AGGTGGTGGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 2 18265 CASAVA_Build 5 34661101 1I GTGTTACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 11 12 18266 CASAVA_Build 5 34661780 1I CACTGCCAGA -/G GGGGAATTTG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 4 5 18267 CASAVA_Build 5 34662350 1D AAAAAAAAAA C/- AACAAGTTAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 C 1 0 18268 CASAVA_Build 5 34662603 1D TTCTTAATAG A/- AAAAAAGCTG 2924 het 2924 ref 22 12 6 4 A 7 6 18269 CASAVA_Build 5 34664020 1D6M3D GTAACAGAAT CCCCCATTTG/-CCCCAT--- GTAACCTCTC 3070 het 3070 hom 54 25 26 5 N/A 0 0 18270 CASAVA_Build 5 34665286 4I TACTAAGTAC ----/CTAG CTAGCTGCAT 2796 het 2475 hom 20 8 10 2 CTAG 1 2 18271 CASAVA_Build 5 34666861 4D TGAGGCTGTT AGGC/---- AGAGATTAGG 3070 het 3070 ref 46 31 13 3 AGGC 1 0 18272 CASAVA_Build 5 34675230 1D AAAGGGTTTA T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 7 6 18273 CASAVA_Build 5 34685181 1I GTGGAATGTT -/G TTCAGTATCT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 G 0 1 18274 CASAVA_Build 5 34689354 2D CTACAAACTA AG/-- AGAATAGGTT 3070 het 3070 ref 33 19 13 2 AG 2 1 18275 CASAVA_Build 5 34689775 2D GAGAAAAAAG AA/-- AACAAAAGAA 2872 het 2872 ref 29 13 10 7 A 4 2 18276 CASAVA_Build 5 34693163 3I CAGGTTGGTG ---/TCC TCGGTTTAGT 3070 hom 75 het 27 0 21 6 TCC 0 1 18277 CASAVA_Build 5 34704551 1I TTTTTAAATT -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 G 3 4 18278 CASAVA_Build 5 34720883 1I TGTATTTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 579 hom 40 2 31 7 T 9 10 18279 CASAVA_Build 5 34721434 1D TATTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 189 hom 31 1 21 9 A 13 12 18280 CASAVA_Build 5 34726618 8D AGAATAAACA GCATTATG/-------- GAATTTCTAT 3070 hom 132 het 49 0 44 6 GCATTATG 1 0 18281 CASAVA_Build 5 34728474 1D AAGCTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 1582 het 1582 ref 29 21 4 4 T 12 11 18282 CASAVA_Build 5 34758015 1I TGTGGCCCCG -/C CCCACCCCCA 3070 hom 69 het 25 0 22 3 C 3 4 18283 CASAVA_Build 5 34829378 1I GTCTCTGACC -/A ACATTCTGTT 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 A 1 2 18284 CASAVA_Build 5 34833304 1I GAGAATAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 426 hom 32 1 26 5 T 9 10 18285 CASAVA_Build 5 34837356 1I CTGTAATCCA -/G CACTTTGGGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 0 1 18286 CASAVA_Build 5 34837599 1I AAGACTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 18 0 14 4 A 11 12 18287 CASAVA_Build 5 34839433 1D AACAAAAAAA C/- AAACAAACAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 C 1 0 18288 CASAVA_Build 5 34874687 1I ACCGTGGCCA -/G GGATCGTCGC 3070 hom 59 het 23 0 18 5 G 2 3 18289 CASAVA_Build 5 34886328 1I GAGACAGTGT -/G GCAAGGATCT 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 G 1 2 18290 CASAVA_Build 5 34888335 1I CTTGTGTTAT -/A AAAATGAGAG 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 4 5 18291 CASAVA_Build 5 34902508 1I TTCCATTTGC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 42 27 11 4 T 5 6 18292 CASAVA_Build 5 34907187 1D CCCATCCCTG C/- AAATGAAATA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 C 1 0 18293 CASAVA_Build 5 34920945 1D AGTACAAGCA C/- CTTTGTCCTA 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 C 2 1 18294 CASAVA_Build 5 34921608 1I GGCCCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 682 hom 37 2 28 7 A 10 11 18295 CASAVA_Build 5 34929667 4I AGGAAAAAAT ----/AGAA AGGAAATCAG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AGAA 0 1 18296 CASAVA_Build 5 34954680 1D TTTTTGGGCC T/- TTTTTTTTTT 1497 het 1497 ref 35 15 8 13 T 17 16 18297 CASAVA_Build 5 34959801 1I GAAAGGGAAT -/A AACTTGAAGA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 2 3 18298 CASAVA_Build 5 34991407 1D GTTTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 38 1 24 14 T 12 11 18299 CASAVA_Build 5 34993373 1D AGTGGAGGTC A/- AGTCACATCA 3070 hom 105 het 40 0 35 6 A 2 1 18300 CASAVA_Build 5 34999305 5D TTCCATCTTT TGTTA/----- TAATTTTTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 4 TGTTA 1 0 18301 CASAVA_Build 5 35021897 3I TTAAACTGTT ---/TTC TTCCTTTTCT 3070 hom 61 het 25 0 21 4 TTC 1 2 18302 CASAVA_Build 5 35036108 4I TTTGGAATTC ----/CCCA CCCCACTTCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CCCA 0 1 18303 CASAVA_Build 5 35038084 1D AAAAAATCAC A/- GAGCACATCC 3070 hom 138 het 51 0 47 7 A 1 0 18304 CASAVA_Build 5 35038639 1I ATAGCAGGCT -/G GGGGGGGGGG 1373 het 1373 ref 20 8 5 7 G 10 11 18305 CASAVA_Build 5 35041536 1I ATCCTCAGGG -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 7 8 18306 CASAVA_Build 5 35041738 1I TTAAAATTTG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 36 14 16 6 A 7 8 18307 CASAVA_Build 5 35067806 2D GGGATCTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 30 1 19 11 T 27 25 18308 CASAVA_Build 5 35069607 2I GTTAGAAAAC --/AT AGATTTGAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AT 0 1 18309 CASAVA_Build 5 35071465 3I AAATGCCAAG ---/GGA GGAGACTTGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 GGA 1 2 18310 CASAVA_Build 5 35071945 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 10 11 18311 CASAVA_Build 5 35083503 1D CTATGAAAAT G/- GGGCATTGAC 3070 hom 88 het 38 0 29 10 G 4 3 18312 CASAVA_Build 5 35094001 1D AGAAGGTGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 10 9 18313 CASAVA_Build 5 35094423 1I62M1I TCTTCTAGAC -AAGATTAGGAAAAAATTAGTACATTCACGCTTTCAACAGAAATACATTACATATTTTTTCAG-/AAAGATTAGGAAAAAATTAGTACATTCACGCTTTCAACAGAAATACATTACATATTTTTTCAGT TTTGTTTTAC 3070 hom 57 het 23 0 20 23 N/A 0 0 18314 CASAVA_Build 5 35098391 3I AGTGGCTAAT ---/TGG TGTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 TGG 0 1 18315 CASAVA_Build 5 35140664 1D AGGGCATAGT G/- GAAAAAAAGG 2665 het 2665 ref 17 9 6 2 G 2 1 18316 CASAVA_Build 5 35153320 1D AGGGAAGTCA G/- GGGGCTTGGT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 G 5 4 18317 CASAVA_Build 5 35154181 2D ATAAAATAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2171 hom 29 12 11 6 A 16 14 18318 CASAVA_Build 5 35162144 1D TCTTTTGGTC T/- CCATAAGCCA 3070 het 3070 ref 52 29 18 6 T 1 0 18319 CASAVA_Build 5 35165529 1I CTGTAATCAA -/T TTTTTTTTTT 2753 het 2753 ref 39 24 8 7 T 13 14 18320 CASAVA_Build 5 35168985 1D ACTTATACCA G/- GCCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 60 32 22 6 G 2 1 18321 CASAVA_Build 5 35175799 1I AGAAATGAGC -/A AAGTAGAGAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 3 18322 CASAVA_Build 5 35179784 1D AAAAAACGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 21 4 A 10 9 18323 CASAVA_Build 5 35181135 3D GATTTAATAA AAG/--- AAGAACAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 6 AAG 2 1 18324 CASAVA_Build 5 35188316 1I GTAAATATTG -/C CCCCTCCCAC 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 C 4 5 18325 CASAVA_Build 5 35194375 1I CATTCTTTCA -/T TTTTCAGAAC 3070 het 3070 hom 60 23 30 7 T 4 5 18326 CASAVA_Build 5 35196128 2D TTCCACTGGA AC/-- ACAGTCATGC 3070 hom 108 het 39 0 36 5 AC 2 1 18327 CASAVA_Build 5 35203721 5I AATTTTTATA -----/AAGGC AAGCAGGGAT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 AAGGC 0 1 18328 CASAVA_Build 5 35216969 1D CTCAAGGCTC T/- GTGCAAATGG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 1 0 18329 CASAVA_Build 5 35222130 1I CTTTAAAAAA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 0 1 18330 CASAVA_Build 5 35226475 1D TTGCCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1816 het 1816 ref 39 22 7 11 A 13 12 18331 CASAVA_Build 5 35231505 1I CCGGAGGTAA -/C ATCCTCCTCT 3070 hom 108 het 42 0 35 7 C 0 1 18332 CASAVA_Build 5 35235020 1D AGGCTCATGC A/- GTTCCCAAAT 3070 het 3070 ref 45 24 18 4 A 1 0 18333 CASAVA_Build 5 35235452 1D GAAAAAAAAA T/- CATCATCTAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 1 0 18334 CASAVA_Build 5 35237556 5D ATACTTTTAG TTCTC/----- TTCTCTTCTC 3070 het 3070 hom 42 18 22 6 TTCTC 4 3 18335 CASAVA_Build 5 35239708 5I CTAAATATTT -----/AGGGC AGGTAGTTGA 3070 hom 132 het 53 0 43 10 AGGGC 0 1 18336 CASAVA_Build 5 35241350 1I TTCGGCTATC -/G CTCTGCCAAA 3070 het 3070 hom 39 10 16 13 G 0 1 18337 CASAVA_Build 5 35241409 1D TGTATGAAAA T/- TCTCAACTCT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 2 1 18338 CASAVA_Build 5 35245306 1D CAACAAAAAT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 8 7 18339 CASAVA_Build 5 35252131 22I AGGTTGAACC ----------------------/ACTATTAAAATGCAAATTCTGG AAGTGCTCAT 3070 hom 84 het 27 0 29 3 ACTATTAAAATGCAAATTCTGG 0 1 18340 CASAVA_Build 5 35258165 1D CATCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1447 hom 25 5 12 8 A 11 10 18341 CASAVA_Build 5 35260587 1D AAGTTGGGGG A/- AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 33 16 16 2 A 7 6 18342 CASAVA_Build 5 35260783 4I CTAGTGGACA ----/AAAG AAAGAAACCA 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 AAAG 1 2 18343 CASAVA_Build 5 35267223 1D GGTTACTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 11 10 18344 CASAVA_Build 5 35273325 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2796 het 151 hom 12 1 10 1 A 13 14 18345 CASAVA_Build 5 35275217 2I GCTTTTTTTT --/AA AAAAAAAAGA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 8 10 18346 CASAVA_Build 5 35330627 1D ACCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 26 3 15 8 A 15 14 18347 CASAVA_Build 5 35342920 1I GATTTTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1036 hom 33 5 20 8 T 15 16 18348 CASAVA_Build 5 35346288 1I GGAGGCACCA -/G TAGCCTGGAG 3070 hom 96 het 40 0 32 8 G 0 1 18349 CASAVA_Build 5 35356661 1I CCAAAGATAG -/C TTTTTTTTCA 3070 hom 47 het 38 1 31 6 C 0 1 18350 CASAVA_Build 5 35357188 1D ATGGCGTGAA C/- CCCGGGGGGC 939 hom 7 het 3 0 3 0 C 4 3 18351 CASAVA_Build 5 35358695 1I TTTTTCCCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 42 1 34 7 T 9 10 18352 CASAVA_Build 5 35358864 2I TGAAAGTAAA --/TG TCCTGGTCAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TG 0 1 18353 CASAVA_Build 5 35401172 2D ATTTTTAAAC AT/-- AAATATTTTC 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 AT 1 0 18354 CASAVA_Build 5 35408512 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 8 7 18355 CASAVA_Build 5 35410976 1D24M1I CTAGAACTTT AAAAATAATTATGATTAATATGTTC-/-AAAATAATTATGATTAATATGTTCA AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 36 20 17 7 N/A 0 0 18356 CASAVA_Build 5 35424136 3I AATAGCCTAT ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 44 14 15 15 CAA 5 6 18357 CASAVA_Build 5 35428482 6I AGATATATAG ------/ATATAA ATATAGATAT 2111 het 1234 hom 10 4 5 1 ATATAA 0 1 18358 CASAVA_Build 5 35458521 28D ATTTCACAAG ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT/---------------------------- ATCTATCTAT 3070 hom 75 het 25 0 26 4 ATCT 12 5 18359 CASAVA_Build 5 35483643 9D TGGGGTTTCA CCATGTTGG/--------- CCAGGCTGGT 1960 het 1960 ref 13 8 5 3 CCATGTTGG 1 0 18360 CASAVA_Build 5 35488591 2I ACCAGATGTG --/CC CCCCCTTTGA 3070 hom 103 het 39 0 33 6 C 5 7 18361 CASAVA_Build 5 35515485 1I GACACTTAAG -/A AAAAAAAAAA 2514 het 2514 ref 31 15 8 8 A 13 14 18362 CASAVA_Build 5 35528139 2D GTTTAGCACG GT/-- ACTTATTACA 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 GT 1 0 18363 CASAVA_Build 5 35529057 2I AGTGTATATA --/TG TGTGTGTGTG 1855 het 1855 ref 24 10 7 7 TG 6 7 18364 CASAVA_Build 5 35542964 3D TCATCACCCA GGT/--- GTTAAGCCTG 3070 het 3070 ref 43 25 14 5 GGT 1 0 18365 CASAVA_Build 5 35546610 2I ACAATCATTT --/TA TATATATATA 2355 het 1894 hom 16 5 6 5 TA 7 8 18366 CASAVA_Build 5 35558146 2I GGTGAGGGAT --/AA AAGACTATAC 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 2 4 18367 CASAVA_Build 5 35559510 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 2973 het 2973 ref 36 16 13 7 TG 9 8 18368 CASAVA_Build 5 35563012 1D CCACACGCCC A/- ATAAAGCTAG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 2 1 18369 CASAVA_Build 5 35571599 1I GGCAAAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 14 12 16 A 11 12 18370 CASAVA_Build 5 35572752 1I TTTTTATCTA -/C AAGGATTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 C 0 1 18371 CASAVA_Build 5 35601656 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 8 7 18372 CASAVA_Build 5 35613610 1I TCAGCCTCCC -/A AAGTGCTGGG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 2 3 18373 CASAVA_Build 5 35616870 12D CTGTGCGTGC CTAATGACATAG/------------ CTAATGACAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 CTAATGACATAG 2 1 18374 CASAVA_Build 5 35617108 2D AAAAAGAGCC TG/-- TGTGCAGGGC 3070 hom 93 het 33 0 30 3 TG 3 2 18375 CASAVA_Build 5 35618200 7D TTACATGGAT GGCAGGA/------- GGCAAAAAGA 3070 het 3070 ref 25 14 10 5 GGCAGGA 1 0 18376 CASAVA_Build 5 35625335 1I CCCATATCAA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 T 7 8 18377 CASAVA_Build 5 35631729 1D CTATGGAATC T/- TTTTTTTTTC 2784 het 1202 hom 14 4 8 2 T 10 9 18378 CASAVA_Build 5 35637333 1D AACAGAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2497 hom 21 6 13 2 A 10 9 18379 CASAVA_Build 5 35641887 1I TTATTTTTAA -/T TTATATGTGT 3070 het 8 hom 30 1 26 3 T 2 3 18380 CASAVA_Build 5 35655731 17I AGGTGGAGGA -----------------/AGAATGACTTCATTCTG TAAACATAAA 3070 het 3070 ref 22 12 7 4 AGAATGACTTCATTCTG 0 1 18381 CASAVA_Build 5 35657244 3I CAGGTGAGTC ---/AGG AGGAGGAGAG 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 AGG 2 3 18382 CASAVA_Build 5 35662948 5D ATATAATATG TTATA/----- TTATATGTTA 3070 het 3070 ref 23 11 8 5 TTATA 2 1 18383 CASAVA_Build 5 35675524 1D AGAAGATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 12 11 18384 CASAVA_Build 5 35680576 2D CTCTTGCTGA CT/-- CTCACCTCTA 3070 hom 167 het 60 0 52 8 CT 2 1 18385 CASAVA_Build 5 35682930 1D TGTTGAAAAA G/- ATTCTGTGGT 3070 het 3070 hom 47 24 23 1 G 1 0 18386 CASAVA_Build 5 35683756 3D AGGCAATCTC ATT/--- ATATTTCACA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 ATT 1 0 18387 CASAVA_Build 5 35694444 1D ATAGCACTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1932 hom 28 7 20 1 T 10 9 18388 CASAVA_Build 5 35700704 4I GAGGAGAGAG ----/AGAA AGAAAACGAG 3070 hom 79 het 31 0 23 8 AGAA 1 2 18389 CASAVA_Build 5 35702347 1I25M1I ATGCCATCAG -TTGTTAAGGCTGTATCTGTAGAGGG-/TTTGTTAAGGCTGTATCTGTAGAGGGT TTGTAATTAA 3070 hom 132 het 44 0 44 8 N/A 0 0 18390 CASAVA_Build 5 35711389 1D TTAGGATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 30 3 17 10 T 17 16 18391 CASAVA_Build 5 35745516 2D TTATGGACAC AG/-- AGATAAAGAG 3070 hom 120 het 45 0 41 6 AG 2 1 18392 CASAVA_Build 5 35746242 1I CAGGGCAAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 3 4 18393 CASAVA_Build 5 35746608 1I TTTCTGATCA -/G GACCAGCTCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 2 18394 CASAVA_Build 5 35747622 1I TGTGATATTT -/A AATGTAAGTG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 2 3 18395 CASAVA_Build 5 35750725 1I GCCTTGCAAA -/G ATTTTCTTCT 3070 hom 51 het 19 0 17 3 G 0 1 18396 CASAVA_Build 5 35751142 1D TTCTGAAGAC T/- TATGTTTTCA 3070 hom 66 het 23 0 23 1 T 2 1 18397 CASAVA_Build 5 35756821 4D TACCATAAAC TATT/---- TATTTTGCCA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TATT 2 1 18398 CASAVA_Build 5 35757602 4D GTACATACAT AGAC/---- AGGCAGAAGA 3070 hom 96 het 39 0 33 10 AGAC 1 0 18399 CASAVA_Build 5 35758315 1D CAGTGAGAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 9 8 18400 CASAVA_Build 5 35758445 1D TGCACCCACT A/- AACTCGTCGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 3 2 18401 CASAVA_Build 5 35762850 1I CACCCCCCCC -/T CTTTCCTCCC 3070 hom 22 het 22 0 8 14 T 0 1 18402 CASAVA_Build 5 35772782 1D CCAAAAAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 9 8 18403 CASAVA_Build 5 35781422 4D CACTTCCCTG CCTC/---- AGCACCTACA 3070 hom 71 het 26 0 23 4 CCTC 1 0 18404 CASAVA_Build 5 35782483 1D AAAGACAATG A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 6 5 18405 CASAVA_Build 5 35795716 1I ACCAAACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2109 hom 39 5 21 13 T 10 11 18406 CASAVA_Build 5 35799635 1D TATGCTATAA G/- TGGAAAATTG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 G 1 0 18407 CASAVA_Build 5 35837934 2D TGCCCCAAAC AG/-- GGGGGAGCAT 3070 het 3070 ref 48 27 19 6 AG 1 0 18408 CASAVA_Build 5 35839919 2D CTCACATTGC AA/-- AAGTCTTGTA 3070 het 3070 ref 58 32 19 8 A 4 2 18409 CASAVA_Build 5 35840576 1D CTTAAATTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 A 9 8 18410 CASAVA_Build 5 35848289 2D GGCCTTGTAC AA/-- AAAAGTTATT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 6 4 18411 CASAVA_Build 5 35849692 1I ATTGTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 11 12 18412 CASAVA_Build 5 35863109 1D AGTAAATGCC A/- AAAAATGGTG 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 A 6 5 18413 CASAVA_Build 5 35867951 5I TTTCAGAAGA -----/TAACT TTATTCTTTT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TAACT 0 1 18414 CASAVA_Build 5 35870502 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2745 het 104 hom 21 2 11 8 T 17 16 18415 CASAVA_Build 5 35871644 1I GAGATTTTTC -/T TTTGATAAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 4 18416 CASAVA_Build 5 35875288 3I TAAAAGGGAA ---/TAC TACTATGATC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 TAC 1 2 18417 CASAVA_Build 5 35878052 1I GTATCTATCT -/C AGTGAGCAGA 1471 hom 7 het 4 0 3 1 C 0 1 18418 CASAVA_Build 5 35884866 4I TTCAAAAGAA ----/AAAT AAATACTTAG 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 AAAT 1 2 18419 CASAVA_Build 5 35885407 1D TCCTATATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 10 9 18420 CASAVA_Build 5 35888727 1D CAGGGCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1199 het 1199 ref 34 20 5 10 T 11 10 18421 CASAVA_Build 5 35893341 5I GGTAATGTAC -----/AGAAG AGAAGCAATA 3070 het 3070 hom 56 26 22 8 AGAAG 1 2 18422 CASAVA_Build 5 35895817 1I GCCTCACTTT -/C CTATCATGTA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 C 1 2 18423 CASAVA_Build 5 35897572 1I GAAAAGAGTC -/T TGGTTTGAAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 1 2 18424 CASAVA_Build 5 35898088 1D AAAACAGCCA T/- AACAACTCAT 3070 het 3070 ref 49 28 15 7 T 1 0 18425 CASAVA_Build 5 35903773 2D AGTTTTCTAC AA/-- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 A 10 8 18426 CASAVA_Build 5 35908333 1I CTGGGATTAC -/A AGGCATAAGC 3070 het 549 hom 20 2 11 7 A 1 2 18427 CASAVA_Build 5 35908372 1I TGTTTTAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 8 9 18428 CASAVA_Build 5 35919962 1I TGTGGGACAC -/T TTTGTCAGGG 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 T 3 4 18429 CASAVA_Build 5 35922704 16I AATGTAAATT ----------------/AGTACATACTTTTAAG AGGACAATTT 3070 het 3070 hom 37 19 17 3 AGTACATACTTTTAAG 0 1 18430 CASAVA_Build 5 35925244 1D CCAACCATTC A/- ATGCCCTTAA 3070 het 3070 ref 50 23 23 4 A 2 1 18431 CASAVA_Build 5 35930946 5D ATAGAGCAAG ACTCC/----- ACTCCATCTC 3070 hom 54 het 19 0 18 2 ACTCC 2 1 18432 CASAVA_Build 5 35932527 2D TAAAATATAC AT/-- GTTTATAAAT 1890 het 902 hom 9 3 5 1 AT 1 0 18433 CASAVA_Build 5 35942528 2D AGTGTATAAT AA/-- GATTTCCTAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 2 0 18434 CASAVA_Build 5 35957931 3D CAATGTGCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 40 1 22 18 A 15 12 18435 CASAVA_Build 5 35959876 1I TATCTGTCAA -/C TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 C 0 1 18436 CASAVA_Build 5 35962331 1I CAAACTCTCT -/G CCCGCCTGGA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 G 0 1 18437 CASAVA_Build 5 35967298 1D AATGTGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 707 hom 34 3 24 7 A 13 12 18438 CASAVA_Build 5 35971983 1D AAAGACCCAG A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 7 6 18439 CASAVA_Build 5 35974353 1I ACATACCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 A 11 12 18440 CASAVA_Build 5 35979905 5I CTTGCAACTG -----/GAATC TTAGTTGCAA 2153 hom 12 het 6 0 5 1 GAATC 0 1 18441 CASAVA_Build 5 35983946 1I TCTATAAGCC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 T 7 8 18442 CASAVA_Build 5 35995804 3I GAAAACAATT ---/TCA TCAACAATAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TCA 1 2 18443 CASAVA_Build 5 35997890 4D CAACACTGGG ATCC/---- ATCCCATCCA 3070 het 3070 hom 40 18 20 5 ATCC 2 1 18444 CASAVA_Build 5 35999953 4D CCCTTAAAAA TGGT/---- TAAAGTGGTA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TGGT 1 0 18445 CASAVA_Build 5 36007945 1I CGTTCAAAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 57 24 23 10 T 7 8 18446 CASAVA_Build 5 36012693 2I TGCTTGCCTC --/AA AAAAATAATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 5 7 18447 CASAVA_Build 5 36012954 10D AGAAAGAGAA AGAAAGAAAG/---------- AGAAAGAGAG 781 het 781 ref 31 14 10 10 AGAAAGAAAG 1 0 18448 CASAVA_Build 5 36016016 1D ATATTACTTC T/- GTAAAATGCT 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 T 1 0 18449 CASAVA_Build 5 36019041 1D GAGAAGATCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 9 24 5 A 10 9 18450 CASAVA_Build 5 36028447 5D TGCTGGACAG ACAGA/----- GGCTAAACAC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 ACAGA 1 0 18451 CASAVA_Build 5 36029766 4D TGCTGTTATT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 102 het 40 0 33 7 AAAC 6 5 18452 CASAVA_Build 5 36033291 2D GAGGATTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 33 3 19 11 T 14 12 18453 CASAVA_Build 5 36038016 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 35 0 26 10 TG 9 8 18454 CASAVA_Build 5 36057896 1D GGTCCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 2641 het 600 hom 24 8 12 5 T 19 18 18455 CASAVA_Build 5 36062064 4D ATAGATAGAT GATA/---- GATAGATAAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 GATA 3 2 18456 CASAVA_Build 5 36079560 17D AGAAATTCAA AGGATCATTAGAAACAT/----------------- CTGTGAGCAA 3070 het 3070 ref 27 21 8 2 AGGATCATTAGAAACAT 1 0 18457 CASAVA_Build 5 36080598 1D CAATGCCCAC A/- AACAAAATAA 3070 het 3070 hom 42 16 25 2 A 3 2 18458 CASAVA_Build 5 36083515 1D GAAGAAACAT A/- ATTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 A 2 1 18459 CASAVA_Build 5 36090550 1D AAAAGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 11 10 18460 CASAVA_Build 5 36106486 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 7 8 18461 CASAVA_Build 5 36106647 4D CATCTCAATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 258 hom 26 5 12 9 A 18 14 18462 CASAVA_Build 5 36110437 1I TTGTTTTGGG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 42 18 12 12 T 7 8 18463 CASAVA_Build 5 36111133 1I TTGTCTACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 9 10 18464 CASAVA_Build 5 36116661 1D TTCCACATTG C/- AAACAACTTG 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 C 1 0 18465 CASAVA_Build 5 36155272 1I TTCTATCACA -/T TTTTACCGTT 3070 het 306 hom 49 1 45 3 T 4 5 18466 CASAVA_Build 5 36156878 1I TTTATCCTGA -/C CCCCATGGTT 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 C 4 5 18467 CASAVA_Build 5 36191076 2I TGCATTCCAC --/TT TTTTAATTAA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 T 4 6 18468 CASAVA_Build 5 36193020 1I TGGGATCTTC -/A CCAGTCATCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 0 1 18469 CASAVA_Build 5 36198124 1I CTACCTCTGC -/T GCTCTACACT 3070 hom 138 het 55 0 47 8 T 0 1 18470 CASAVA_Build 5 36203473 1I TTGGCCTCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 262 hom 37 1 28 8 T 9 10 18471 CASAVA_Build 5 36205305 1I ACTCCATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 433 hom 19 1 18 0 A 9 10 18472 CASAVA_Build 5 36208140 8I AAACTCTGTT --------/AATAATAA AATAAGTTCA 3070 hom 147 het 52 0 49 3 AATAATAA 0 1 18473 CASAVA_Build 5 36214959 3D ACTAGAATAG AGA/--- AGAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 40 17 17 8 AGA 3 2 18474 CASAVA_Build 5 36215774 1D ACCGGGGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 26 1 19 7 T 13 12 18475 CASAVA_Build 5 36218855 1D TTAAATTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 10 9 18476 CASAVA_Build 5 36226072 14D GCTCGGTGTG CTGCACCCACTGTC/-------------- CTGCACCCAC 3070 hom 33 het 14 0 12 3 CTGCACCCACTGTC 2 1 18477 CASAVA_Build 5 36226318 4I AATAAAAGTC ----/AGCT AGCAGCATTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 AGCT 0 1 18478 CASAVA_Build 5 36227762 3D CCTATACTAA TAT/--- TATGGATAAC 3070 het 3070 ref 45 23 19 5 TAT 2 1 18479 CASAVA_Build 5 36228417 2I TACCTGGCTC --/TA TCTTTCTGCT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 TA 0 1 18480 CASAVA_Build 5 36229429 1D TATGTATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 7 A 11 10 18481 CASAVA_Build 5 36231834 3D GTAATAGTAA TAG/--- TAGTGTGTTC 3070 het 3070 hom 44 20 21 4 TAG 2 1 18482 CASAVA_Build 5 36233687 1I ACACAGTAAC -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 6 7 18483 CASAVA_Build 5 36241183 2I AAAGAGAATG --/TT ACATTTCAAG 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 T 0 2 18484 CASAVA_Build 5 36243306 1I AGAAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 A 13 14 18485 CASAVA_Build 5 36253522 7I TAAAAACAAG -------/TTAATCA TAAATTATTA 3070 hom 135 het 50 0 46 5 TTAATCA 0 1 18486 CASAVA_Build 5 36265067 1D GTAATTTTCG T/- TATGTTCTCA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 2 1 18487 CASAVA_Build 5 36266661 1I TCTAAAAAAA -/T ATTCATCTAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 0 1 18488 CASAVA_Build 5 36268439 7D GCACTGAACC CTAAAGA/------- CTTCTTCACA 3070 het 3070 ref 45 25 15 7 CTAAAGA 1 0 18489 CASAVA_Build 5 36271762 6D ATATATATAT ATATAA/------ AAAATAAATT 2733 hom 30 het 11 0 11 0 ATATAA 1 0 18490 CASAVA_Build 5 36279190 1I ATTAGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 42 1 34 7 A 10 11 18491 CASAVA_Build 5 36290074 1I TTATTGATGT -/G GAAAAATCAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 G 1 2 18492 CASAVA_Build 5 36293720 1D TCCACACTCT C/- ACTAGACTAA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 C 1 0 18493 CASAVA_Build 5 36300025 1I CAATCTGGTA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 52 19 29 4 T 7 8 18494 CASAVA_Build 5 36302617 2D TCTCTCTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 27 0 18 9 T 13 11 18495 CASAVA_Build 5 36307249 1D ATTTGAAGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 10 9 18496 CASAVA_Build 5 36307987 1D TCCTCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 11 10 18497 CASAVA_Build 5 36312354 1D TGTATAGGGG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 A 8 7 18498 CASAVA_Build 5 36345653 1D AAAATATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 11 10 18499 CASAVA_Build 5 36365052 1I GGCCGGTCCA -/G GGGTCCACGG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 G 3 4 18500 CASAVA_Build 5 36369455 1D TCCAAGCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 12 11 18501 CASAVA_Build 5 36373399 1I TGGTTGAATT -/G CTAAGCAAAC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 G 0 1 18502 CASAVA_Build 5 36377137 1I AGGGGCTTTT -/C CCCCTTTTGC 3070 hom 117 het 44 0 38 6 C 4 5 18503 CASAVA_Build 5 36378105 6I ACTAAAAATA ------/AAAATT AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 AAAATT 0 1 18504 CASAVA_Build 5 36379095 2D TTATTTTTTT TC/-- AAATGATATG 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 TC 1 0 18505 CASAVA_Build 5 36379401 1I ATACATTATC -/T GTTCATGAGT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 0 1 18506 CASAVA_Build 5 36380339 1D GAAAACATAG A/- AAAATACCTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 5 4 18507 CASAVA_Build 5 36380903 1I AACCTGATGC -/A AAAAAAAAAA 2711 het 2711 ref 40 11 10 19 A 13 14 18508 CASAVA_Build 5 36388363 5D TTGCAAGTAA TTAAC/----- TTAGCTTTCT 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 TTAAC 1 0 18509 CASAVA_Build 5 36389457 12D ACTCAGTCTC AAAAATAAAAAT/------------ AAAAATAAAA 3070 het 2647 hom 23 6 13 9 AAAAAT 5 3 18510 CASAVA_Build 5 36392182 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1266 hom 24 4 10 10 A 13 12 18511 CASAVA_Build 5 36459852 1I CTCTACTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 36 2 32 2 A 10 11 18512 CASAVA_Build 5 36461974 3I GTTCCCCTCT ---/ATG CATCCATGTG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 ATG 0 1 18513 CASAVA_Build 5 36475001 1I GAAGAAGAAA -/G GGCAAAATGG 3070 hom 117 het 45 0 38 7 G 2 3 18514 CASAVA_Build 5 36489917 1D TGTCTTTTAG A/- TTTTCCCAAT 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 A 1 0 18515 CASAVA_Build 5 36491820 1I TGGTACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 785 hom 54 2 48 4 A 10 11 18516 CASAVA_Build 5 36495687 1D CCTTTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1116 het 1116 ref 33 9 4 20 A 13 12 18517 CASAVA_Build 5 36497283 26D GAGACCAAGA TTAACATCATAACATATGATGTTATG/-------------------------- TTAACATCAT 3070 het 3070 ref 36 26 11 6 TTAACATCATAACATATGATGTTATG 1 0 18518 CASAVA_Build 5 36505160 5I AAACATATCT -----/TAAAA TAATAAGAGC 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 TAAAA 0 1 18519 CASAVA_Build 5 36536658 1D AGTGTCTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 9 8 18520 CASAVA_Build 5 36536925 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 2168 hom 15 6 9 0 A 9 8 18521 CASAVA_Build 5 36544587 1I TCAAGTGGGT -/C CCTGACCCCC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 C 2 3 18522 CASAVA_Build 5 36554477 1D ATTGACTAAT G/- GGATCTACTT 3070 het 3070 ref 53 28 19 7 G 3 2 18523 CASAVA_Build 5 36561899 1D GCATATATAC T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 T 8 7 18524 CASAVA_Build 5 36564164 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 2630 het 772 hom 12 3 6 3 T 6 7 18525 CASAVA_Build 5 36566470 1I TTGCAGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 10 11 18526 CASAVA_Build 5 36569348 1D GAACAGCCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 735 hom 37 3 16 18 A 13 12 18527 CASAVA_Build 5 36570767 1I AAAGTGTGGG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 7 8 18528 CASAVA_Build 5 36571984 1D GGCTGTACAT A/- AACCAAGCAT 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 A 3 2 18529 CASAVA_Build 5 36576405 7I CACATTTTCT -------/TTATCCA TTATCCATTC 3070 het 3070 ref 54 27 14 13 TTATCCA 1 2 18530 CASAVA_Build 5 36578577 1D AAGAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2969 hom 25 9 8 9 A 13 12 18531 CASAVA_Build 5 36584332 1I AAAAAACCAG -/T TAAGGGTATA 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 T 1 2 18532 CASAVA_Build 5 36590564 1D TATGTGGCCC T/- TTGTGACCAG 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 T 3 2 18533 CASAVA_Build 5 36590941 1D TCCCAGTGTC T/- GTTGTTCCCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 1 0 18534 CASAVA_Build 5 36592678 1D ACAAAAATTA G/- TGACATTTCT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 G 1 0 18535 CASAVA_Build 5 36599768 1D ATTCTCCACA T/- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 54 22 23 9 T 7 6 18536 CASAVA_Build 5 36608393 1D AATGAAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 45 1 32 12 T 11 10 18537 CASAVA_Build 5 36610495 1I AAGGTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 937 hom 37 4 23 10 A 15 16 18538 CASAVA_Build 5 36612232 1D CAGGAGAATT G/- CTTGAAGCTG 3070 het 2146 hom 17 5 11 1 G 1 0 18539 CASAVA_Build 5 36613614 6D CAGAAAGAGA CAGAGG/------ CAGACAGACA 2771 het 2771 ref 27 20 7 1 CAGAGG 1 0 18540 CASAVA_Build 5 36618695 2D CAACAACAAC AA/-- AAAATACATA 3070 hom 39 het 14 0 14 2 A 6 4 18541 CASAVA_Build 5 36635561 1I AGAGACGGAG -/T TTCGCCATGT 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 T 2 3 18542 CASAVA_Build 5 36637128 1I TTCCTTTGGT -/G ACTGTATTAT 3070 het 3070 hom 44 18 25 1 G 0 1 18543 CASAVA_Build 5 36638055 1I ATCTGTCTTT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 7 8 18544 CASAVA_Build 5 36639947 1I TATACTGACA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 T 6 7 18545 CASAVA_Build 5 36640199 4I TTCTAGAAGG ----/AAAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 9 13 18546 CASAVA_Build 5 36644485 1I GATTAAAAAC -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 7 8 18547 CASAVA_Build 5 36647694 1I AAGGAAAAGT -/C CTTTGTCATG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 1 2 18548 CASAVA_Build 5 36647945 2I CACACACACG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 49 22 16 11 CA 8 9 18549 CASAVA_Build 5 36658716 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 2638 het 1583 hom 13 5 8 0 A 6 7 18550 CASAVA_Build 5 36685186 35D CAGCCTGGGC AACAAAAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA/----------------------------------- AAAAAAGATT 3070 hom 33 het 22 1 25 3 AACAAAAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA 1 0 18551 CASAVA_Build 5 36688185 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 111 het 47 0 33 18 AC 10 9 18552 CASAVA_Build 5 36700294 1D GCCCGGCCCA T/- TGGCTCCTTT 3070 hom 38 het 15 0 12 3 T 2 1 18553 CASAVA_Build 5 36733752 1D TTTCAGGAAG C/- CTTTCCAGAC 3070 hom 70 het 27 0 23 4 C 2 1 18554 CASAVA_Build 5 36734906 2D GCAATGGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 32 0 22 11 T 14 12 18555 CASAVA_Build 5 36736608 2D GATCCCATAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 32 0 24 8 A 15 13 18556 CASAVA_Build 5 36743809 2D CCCTTGTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 550 hom 44 4 18 23 A 18 16 18557 CASAVA_Build 5 36745304 1I AATGAGAAGA -/C CTATTCTTAT 3070 hom 144 het 53 0 48 5 C 1 2 18558 CASAVA_Build 5 36751796 1I TTTGAGGTAC -/T TAGAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 1 2 18559 CASAVA_Build 5 36752451 1D GAACTGGGAT G/- GGGCCTCAGA 3070 het 3070 ref 42 23 14 7 G 4 3 18560 CASAVA_Build 5 36769633 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 43 0 33 11 A 10 9 18561 CASAVA_Build 5 36776215 1D TAAAATCTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 9 8 18562 CASAVA_Build 5 36801500 1I AACATGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 11 12 18563 CASAVA_Build 5 36808995 1D TGCTGTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 40 0 30 10 A 12 11 18564 CASAVA_Build 5 36812811 1I CAAGACCCCG -/T TCCCCCCCCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 2 18565 CASAVA_Build 5 36813742 5D TGGAAGCAAA TATTT/----- TTTTTTTTTT 2913 hom 18 het 25 1 18 7 TATTT 1 0 18566 CASAVA_Build 5 36814851 3I CTAATAATTC ---/CAA CAACCCCAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 CAA 1 2 18567 CASAVA_Build 5 36815297 1D CAGATGACTA C/- CCTTATATAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 3 2 18568 CASAVA_Build 5 36816222 4I CTTTTAATCC ----/TAAG TAAGTAACTC 3070 hom 157 het 58 0 53 5 TAAG 1 2 18569 CASAVA_Build 5 36817803 3D TTATCTTACT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 TTA 7 6 18570 CASAVA_Build 5 36915998 1I AAATATGAGC -/A AAGCTATACC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 2 3 18571 CASAVA_Build 5 36967645 1D ATGTCTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 30 1 23 7 T 14 13 18572 CASAVA_Build 5 37052263 1D GCTTTAACAA T/- TTTTTTTTTT 1232 het 1232 ref 45 35 4 6 T 13 12 18573 CASAVA_Build 5 37157741 1D CATGTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 859 het 859 ref 23 15 2 6 T 15 14 18574 CASAVA_Build 5 37160124 12D AAGTAAAAGA TAAACTGTAATC/------------ TAAACTGTAA 3070 hom 85 het 30 0 29 4 TAAACTGTAATC 2 1 18575 CASAVA_Build 5 37282012 1D CTTTTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 612 hom 32 4 16 12 T 19 18 18576 CASAVA_Build 5 37371240 1D CCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 23 1 16 7 A 17 16 18577 CASAVA_Build 5 37400500 4D TTTTATTTTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 412 het 412 ref 15 5 3 9 T 14 10 18578 CASAVA_Build 5 37415613 1I TTATGAGAGT -/C CTGGAGAGAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 2 18579 CASAVA_Build 5 37423509 1D TTCATAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 13 1 9 3 T 15 14 18580 CASAVA_Build 5 37426107 1I AATGTAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 28 1 25 2 T 10 11 18581 CASAVA_Build 5 37432045 1I CGTAAGACGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 8 9 18582 CASAVA_Build 5 37433329 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 24 4 16 4 A 17 16 18583 CASAVA_Build 5 37452933 1I CTGCTATGTG -/A ATGGACACTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 2 18584 CASAVA_Build 5 37453400 1D CCCACCGACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 20 2 15 3 T 14 13 18585 CASAVA_Build 5 37458227 1I TATCGACTTA -/C TGCAATCTCC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 0 1 18586 CASAVA_Build 5 37460267 1I TTTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 2833 het 248 hom 24 3 14 7 T 13 14 18587 CASAVA_Build 5 37463254 5D TCTCAAAAAT AAAAA/----- ATAAAAAAAA 3070 hom 47 het 17 0 14 3 A 6 1 18588 CASAVA_Build 5 37474776 4D CGTTTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 136 het 34 hom 19 1 3 15 TTTG 1 0 18589 CASAVA_Build 5 37475485 1D GGCTTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1193 hom 30 6 12 12 T 17 16 18590 CASAVA_Build 5 37481163 1I TAGTTTGGTA -/C TATGTAACTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 0 1 18591 CASAVA_Build 5 37484599 1I GATTTCACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 407 hom 36 2 29 5 T 9 10 18592 CASAVA_Build 5 37486966 1I CATGTTGGTC -/A AGGCTGGTCT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 1 2 18593 CASAVA_Build 5 37487482 1D CTCTAGACAT A/- AAAAATATGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 6 5 18594 CASAVA_Build 5 37491911 1I TAAAGCTTCT -/A ATAAATACTC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 1 2 18595 CASAVA_Build 5 37499132 1D TTCTGTATCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 33 3 18 12 A 13 12 18596 CASAVA_Build 5 37501660 1D ATTTCTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 694 hom 16 3 9 4 T 13 12 18597 CASAVA_Build 5 37509094 1D CTTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 T 11 10 18598 CASAVA_Build 5 37509203 1D ATTCATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 337 hom 31 5 18 8 T 17 16 18599 CASAVA_Build 5 37511063 1D ATAGGTGTGA G/- CCACGGTACC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 G 1 0 18600 CASAVA_Build 5 37512415 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 32 1 23 8 T 11 12 18601 CASAVA_Build 5 37522356 1D GCGCCCGACA C/- CCACGCTGGG 2416 hom 15 het 6 0 6 0 C 3 2 18602 CASAVA_Build 5 37539612 1I TGAGTTTTGT -/A TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 0 1 18603 CASAVA_Build 5 37542854 2I GCCCTTGGGG --/AC ACACACACAC 3070 het 712 hom 30 2 21 7 AC 6 7 18604 CASAVA_Build 5 37545296 1I AACATACTTT -/A AAAAAAAAAA 2772 het 308 hom 24 1 12 11 A 13 14 18605 CASAVA_Build 5 37550257 5I TTCCATTAAC -----/TTTTA TTTTAAGTTC 1950 hom 10 het 6 0 4 2 TTTTA 1 2 18606 CASAVA_Build 5 37553602 2I ATATTTTGAT --/AC AGCCATGCAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AC 0 1 18607 CASAVA_Build 5 37557166 3I AGTGATACAC ---/AAT AAACATTTAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AAT 0 1 18608 CASAVA_Build 5 37564488 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAACT 3067 hom 18 het 10 0 7 3 A 9 8 18609 CASAVA_Build 5 37567447 3D AAAGTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 202 het 202 ref 31 10 1 21 T 20 17 18610 CASAVA_Build 5 37591571 10D GTTCAGTTTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 hom 83 het 35 0 28 7 TTTTG 4 2 18611 CASAVA_Build 5 37591999 2D TTTCTTCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 4 T 15 13 18612 CASAVA_Build 5 37602164 4I CCTCCTGTGA ----/TAAG TAATAGCTTA 3070 hom 57 het 29 0 20 9 TAAG 0 1 18613 CASAVA_Build 5 37613917 1I AGGAATAGAT -/A GGTGAAGGAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 0 1 18614 CASAVA_Build 5 37614194 1I TTTCTTTGCC -/T TTTTTTGGAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 6 7 18615 CASAVA_Build 5 37617962 4D TGTTACAGTA TTAG/---- TTAGTAACTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TTAG 2 1 18616 CASAVA_Build 5 37620857 1I CTTTGTCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 743 hom 33 2 20 11 T 10 11 18617 CASAVA_Build 5 37622525 1D CACACACCTT C/- TTTTTAAAAG 3070 hom 62 het 22 0 19 5 C 1 0 18618 CASAVA_Build 5 37628304 3I AATATGACAT ---/ATC ATTAATACAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 ATC 0 1 18619 CASAVA_Build 5 37636674 1I GTAAAAGGGT -/A ACAGCCACTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 18620 CASAVA_Build 5 37640880 1D CCCCTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 27 0 13 14 T 11 10 18621 CASAVA_Build 5 37649643 1D CTCTATGATA T/- AAATGCTGTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 0 18622 CASAVA_Build 5 37669643 4D GTTAAACAAG ATAC/---- ATACAGTAAG 3070 hom 117 het 40 0 38 4 ATAC 2 1 18623 CASAVA_Build 5 37670158 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 33 3 15 15 A 13 14 18624 CASAVA_Build 5 37672081 1D TGACCGAATC A/- GGGGCAAGTC 3070 hom 72 het 32 0 25 8 A 1 0 18625 CASAVA_Build 5 37680108 1D TGATCATATG T/- TTTTTTGTCC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 6 18626 CASAVA_Build 5 37686824 1I ATGGGCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 896 hom 39 2 29 8 T 14 15 18627 CASAVA_Build 5 37691914 1I TTTGCCCTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 426 hom 28 1 25 2 T 9 10 18628 CASAVA_Build 5 37696311 1D CTCCTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 21 16 11 T 12 11 18629 CASAVA_Build 5 37705260 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 586 hom 24 3 15 6 A 13 12 18630 CASAVA_Build 5 37713553 1D GGTGGTGCTG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 8 7 18631 CASAVA_Build 5 37716018 1D GATGTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 T 12 11 18632 CASAVA_Build 5 37718377 3D GTAATGTTAG GTT/--- GTTAAGTTGA 3070 het 3070 ref 33 20 9 5 GTT 2 1 18633 CASAVA_Build 5 37722050 1I GTGGCTTGTG -/C TTGTAGTCAC 3070 hom 77 het 30 0 21 9 C 0 1 18634 CASAVA_Build 5 37724715 2D AGCCCATGGA GG/-- GGGCAAGCCA 1206 het 1206 ref 26 18 4 4 G 5 3 18635 CASAVA_Build 5 37732527 14D CACAGGTACA CACACACGCGCGTG/-------------- CACACACACC 3070 het 3070 ref 47 19 15 19 CACACACGCGCGTG 1 0 18636 CASAVA_Build 5 37734344 1D TCACATAAGG A/- AAAGAAATAC 3070 het 3070 ref 46 25 13 9 A 4 3 18637 CASAVA_Build 5 37735835 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 11 10 18638 CASAVA_Build 5 37739455 6D TTTCAGATTT AACTTC/------ AACACCTTAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 9 AACTTC 1 0 18639 CASAVA_Build 5 37740742 2D ATCTTGTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 14 6 T 14 12 18640 CASAVA_Build 5 37750386 7I GAAATGACTA -------/GCCTGAG GCCCCAGTGC 3070 hom 80 het 28 0 24 4 GCCTGAG 0 1 18641 CASAVA_Build 5 37760690 3D CAAGACTGTC ATT/--- ATGACTTCCA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 ATT 1 0 18642 CASAVA_Build 5 37764224 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 22 2 18 3 A 12 11 18643 CASAVA_Build 5 37766310 1D ATTGATTTGC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 9 8 18644 CASAVA_Build 5 37769546 1I TCTCCATGAC -/T TTATTAAGTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 3 18645 CASAVA_Build 5 37774423 1I GACAGTCCTG -/C TAATACTTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 0 1 18646 CASAVA_Build 5 37780202 1D AAAAATGCTG A/- AAACCCACAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 4 3 18647 CASAVA_Build 5 37786548 1I ATGGTTTTAC -/A AAAGGACAGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 3 4 18648 CASAVA_Build 5 37794003 1I ATGCGGGGTC -/A AAAAAGTATG 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 5 6 18649 CASAVA_Build 5 37800703 1I GTAGCTACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 T 9 10 18650 CASAVA_Build 5 37806487 1I TAATTCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 12 13 18651 CASAVA_Build 5 37819147 1I TTAGTGTAGG -/T TAAAAATTTA 3070 het 2314 hom 19 5 11 3 T 1 2 18652 CASAVA_Build 5 37827445 1I AAGCAGGTCC -/A GGGGCAGACC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 0 1 18653 CASAVA_Build 5 37833301 4I TCTGAGCTAT ----/CTAG CTAGCCATAA 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 CTAG 1 2 18654 CASAVA_Build 5 37845427 1D AGTGCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 8 8 T 12 11 18655 CASAVA_Build 5 37848680 2D ACTCCTTACG GT/-- ATCAGATGGT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 GT 1 0 18656 CASAVA_Build 5 37856814 1I AAACAACAAA -/T ATTTTTGCTG 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 0 1 18657 CASAVA_Build 5 37859487 2I AGAGGCCCCA --/TC TCTCCGGAAG 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 TC 2 3 18658 CASAVA_Build 5 37900358 1I TATTCTTCCC -/T TTTTAAACTT 3070 het 3070 ref 61 31 23 7 T 4 5 18659 CASAVA_Build 5 37910199 2D TAGAGAGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 1895 het 138 hom 28 2 9 17 GT 9 8 18660 CASAVA_Build 5 37910859 1D ACTGGAATCC G/- GGTCTCCCAG 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 G 3 2 18661 CASAVA_Build 5 37919771 2D ATTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 10 8 18662 CASAVA_Build 5 37921196 1D TGTTGGGATC A/- GGGGGGTGGA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 1 0 18663 CASAVA_Build 5 37927402 1D ATGAATGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 T 12 11 18664 CASAVA_Build 5 37928824 1I TGGAAGTAAA -/G TTTGCATTTT 3070 het 3070 hom 48 22 19 7 G 0 1 18665 CASAVA_Build 5 37929342 6I CATTCTGGAG ------/GGACCA AACTCTAAGG 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 GGACCA 0 1 18666 CASAVA_Build 5 37929896 1I AGTTGTTTTT -/A ACCTCATCTA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 A 1 2 18667 CASAVA_Build 5 37932612 1I ATCCAGGCTT -/G GGACTTGCTA 3070 het 3070 hom 49 16 25 8 G 2 3 18668 CASAVA_Build 5 37937036 1I CTGAAAAAAA -/T ATTTCCCTAT 3070 het 337 hom 48 1 39 8 T 0 1 18669 CASAVA_Build 5 37944031 1D TGGCGGGGAG T/- TGGGGAAGGA 3070 hom 108 het 46 0 34 12 T 2 1 18670 CASAVA_Build 5 37944975 1I TTGTAATTTA -/C CCCCCCCACC 3070 hom 53 het 23 0 17 6 C 7 8 18671 CASAVA_Build 5 37948476 1I TCTCCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 31 1 25 5 A 13 14 18672 CASAVA_Build 5 37950204 1D TTTAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 7 T 11 10 18673 CASAVA_Build 5 37951816 2I CACACCCACC --/CG CCCCCCGACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CG 0 1 18674 CASAVA_Build 5 37954573 1D CACACTACAG T/- TTTGAGTTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 4 3 18675 CASAVA_Build 5 37967398 1I CTTTCCTTGA -/C CCCTAGCCCC 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 C 3 4 18676 CASAVA_Build 5 37985292 1I TCTTCATCAG -/A AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 A 6 7 18677 CASAVA_Build 5 37987416 1D TTAAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 1904 het 1904 ref 31 15 7 9 T 17 16 18678 CASAVA_Build 5 38001093 2D TTTATGTAAC AG/-- AGAATTGCTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 AG 2 1 18679 CASAVA_Build 5 38005453 1I GTAAAATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 A 10 11 18680 CASAVA_Build 5 38017809 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 874 hom 23 2 16 5 T 13 14 18681 CASAVA_Build 5 38025157 4D CAATGTTAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 7 AAAG 5 4 18682 CASAVA_Build 5 38031313 1D GGACAGAAGT A/- AAGTATGTCT 3070 het 3070 ref 48 19 18 11 A 3 2 18683 CASAVA_Build 5 38035686 5I AGAACCTGCA -----/TATTC TATTCAGTTC 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 TATTC 1 2 18684 CASAVA_Build 5 38041846 6D TATTCCATTT TATATA/------ TATATATATA 3070 het 851 hom 23 7 9 7 TA 11 8 18685 CASAVA_Build 5 38042201 1D AGGAGTAAGG T/- TAGTATCGCA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 2 1 18686 CASAVA_Build 5 38045591 18D AAGTGGCAAA GTTGGGATTAGAACTCAG/------------------ GTTTCTCCTG 3070 het 3070 ref 47 34 11 6 GTTGGGATTAGAACTCAG 1 0 18687 CASAVA_Build 5 38045674 1I8M3I CTGAGAGGTT -AACACACA---/AAACACACAAAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 44 29 15 2 N/A 0 0 18688 CASAVA_Build 5 38058386 1D GGCGGGGGTT G/- GGGGGGTGTA 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 G 7 6 18689 CASAVA_Build 5 38059176 1D TGCCAGATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 15 15 18 A 14 13 18690 CASAVA_Build 5 38063862 1I CACTCAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 A 14 15 18691 CASAVA_Build 5 38071451 1I TTGAATATGA -/T TTGTTTCTAC 3070 hom 134 het 51 0 44 7 T 2 3 18692 CASAVA_Build 5 38073748 1D CTATATGGTT C/- CCTGTCTAAC 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 C 3 2 18693 CASAVA_Build 5 38077282 1I AAGGAAAGTT -/A TTAACCCAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 18694 CASAVA_Build 5 38078310 1D TTTTAGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 12 11 18695 CASAVA_Build 5 38124757 1D TCTCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 4 A 12 11 18696 CASAVA_Build 5 38125626 1I AAAACTTCAT -/C AACATTAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 0 1 18697 CASAVA_Build 5 38125892 1I AATGCCAACT -/A CAACTATGAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 18698 CASAVA_Build 5 38127487 4D TAATCTGTTT GTTA/---- AAGTCTCAAA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 GTTA 1 0 18699 CASAVA_Build 5 38128610 1D CTTTAAAAGC T/- GTTGTCCTGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 0 18700 CASAVA_Build 5 38162737 3D AATCTCTCAT ATG/--- ATGAGTATTG 3070 het 3070 ref 43 17 16 11 ATG 2 1 18701 CASAVA_Build 5 38167832 2I AAAATACCAG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 CA 8 9 18702 CASAVA_Build 5 38168225 8D CCCTGATTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 2104 hom 29 12 12 7 T 19 11 18703 CASAVA_Build 5 38177062 2I CTTTTTTTGT --/TA TAAAATATCC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TA 1 2 18704 CASAVA_Build 5 38178451 1D ACTCCAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 11 10 3 A 11 10 18705 CASAVA_Build 5 38189247 8D ATAAAGTCTA AAGTTATG/-------- AAGTTATGAG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 AAGTTATG 2 1 18706 CASAVA_Build 5 38197961 1I AAGTTAACTA -/T TTTTTTGTGC 3070 het 303 hom 52 1 47 4 T 6 7 18707 CASAVA_Build 5 38200076 2I TCGAGGCTTC --/TT GTCTGCCCTT 3070 hom 141 het 52 0 45 7 T 0 2 18708 CASAVA_Build 5 38200540 3I AAGTACAGAA ---/TTT ATTTTTTTTT 3070 hom 146 het 58 0 49 9 T 0 3 18709 CASAVA_Build 5 38202984 1I CCATGCCCCG -/C CCCATCCCAT 3070 hom 82 het 32 0 24 8 C 3 4 18710 CASAVA_Build 5 38262987 14I CTTCTGCAGT --------------/GTTGCCACATGCTA GTTAGCGAGC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 GTTGCCACATGCTA 0 1 18711 CASAVA_Build 5 38263544 1D GATATAAAGG C/- TGTGATTTCT 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 C 1 0 18712 CASAVA_Build 5 38294875 1D ACCTCGCCCT C/- CCCCGAGCCC 2604 het 2230 hom 22 8 7 7 C 5 4 18713 CASAVA_Build 5 38304273 1D TTGTGAGAGA T/- TTTTCTGTGC 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 5 4 18714 CASAVA_Build 5 38306359 1I GAAAAAAAAA -/C AACAACAAGC 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 C 0 1 18715 CASAVA_Build 5 38306504 4D TAGCTTTAAA ATTT/---- ATTTATTGCT 3070 het 3070 hom 37 15 19 5 ATTT 2 1 18716 CASAVA_Build 5 38307006 1I GACTTTGTAC -/A AAAATCAAGA 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 A 4 5 18717 CASAVA_Build 5 38313339 1I AGTTGAAAGC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 7 8 18718 CASAVA_Build 5 38313462 3D CTAAATGGGA AAG/--- AAGAAGTGAA 3070 het 3070 ref 29 13 13 4 AAG 3 2 18719 CASAVA_Build 5 38313630 5D TGAAAAAGTC AAAAA/----- AAATCTTGTG 3070 het 3070 hom 42 18 20 7 A 8 3 18720 CASAVA_Build 5 38313889 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 10 9 18721 CASAVA_Build 5 38314350 1D TGGTCAATGA T/- TTTTTTTTTT 1808 het 1808 ref 42 28 7 7 T 15 14 18722 CASAVA_Build 5 38317231 1D ATAATTTTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 A 9 8 18723 CASAVA_Build 5 38318163 4D CAAACAAAAC AAAT/---- AAGGGGAGGG 3070 het 3070 hom 50 18 26 10 AAAT 1 0 18724 CASAVA_Build 5 38318503 1I AGCACCCACA -/T TTTGGCCATA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 3 4 18725 CASAVA_Build 5 38321967 1D TCAGCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 11 10 18726 CASAVA_Build 5 38326942 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 A 8 7 18727 CASAVA_Build 5 38342164 1I CTCACATATC -/A AAGTTCAACA 3070 hom 148 het 51 0 50 1 A 2 3 18728 CASAVA_Build 5 38377774 1D CTCATGCAAG T/- TTTTTTTTTT 2696 het 2696 ref 44 20 8 16 T 15 14 18729 CASAVA_Build 5 38385812 20D CAGGGGAAGT ACACACACACACACACACAC/-------------------- ACACACACAC 3070 het 2054 hom 35 11 14 13 AC 17 7 18730 CASAVA_Build 5 38388240 4I GGGCGCGGTG ----/GCTC GCTCACACCT 3070 het 2656 hom 22 8 9 5 GCTC 1 2 18731 CASAVA_Build 5 38397769 1I GATTTTTGAT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 G 0 1 18732 CASAVA_Build 5 38411574 1I ATGAAAGCCA -/G GGCCCAGTGT 3070 hom 109 het 46 0 35 11 G 2 3 18733 CASAVA_Build 5 38415688 2D AGGCAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 10 6 A 14 12 18734 CASAVA_Build 5 38553802 1D CATCTCTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 19 0 11 8 A 13 12 18735 CASAVA_Build 5 38566243 1D AAAAGATGAC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 8 7 18736 CASAVA_Build 5 38573526 1I GATTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 33 0 25 8 A 11 12 18737 CASAVA_Build 5 38581325 1I GAAACTAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 19 0 13 6 T 9 10 18738 CASAVA_Build 5 38600100 1I CATGATTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 23 7 T 13 14 18739 CASAVA_Build 5 38600283 1I CATTATGTTG -/C CCAGGCTTGT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 2 3 18740 CASAVA_Build 5 38623340 1D CGAAGGACTG A/- AAAAAAAAAA 2236 het 2236 ref 54 37 9 9 A 13 12 18741 CASAVA_Build 5 38625030 1I CTAATTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 81 hom 25 1 22 2 T 10 11 18742 CASAVA_Build 5 38631733 1D CTGGGACTAC A/- AGGCGCCCGC 1688 hom 15 het 6 0 5 1 A 2 1 18743 CASAVA_Build 5 38632403 2D CTGCTGGACT AG/-- AGACCACACT 3070 hom 131 het 49 0 41 8 AG 2 1 18744 CASAVA_Build 5 38632772 2D GGCATGCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 35 0 26 10 A 12 10 18745 CASAVA_Build 5 38635277 1I AAGTCCTCAG -/T GGTGCAGTTT 3070 hom 144 het 56 0 49 7 T 0 1 18746 CASAVA_Build 5 38646250 1I CTGTCATCCC -/T TGCCCTTTGG 3070 het 4 hom 39 1 31 7 T 1 2 18747 CASAVA_Build 5 38651328 1I GACTCCAGTA -/G GGGGTCTGTT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 G 4 5 18748 CASAVA_Build 5 38676139 2D GAGAGAGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 84 het 42 0 27 18 GT 9 8 18749 CASAVA_Build 5 38684517 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 10 11 18750 CASAVA_Build 5 38699890 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3020 het 30 hom 19 1 8 10 A 15 14 18751 CASAVA_Build 5 38734995 1D TTTGCCACAA T/- TTTTTTTTTT 1339 het 1339 ref 25 20 3 2 T 13 12 18752 CASAVA_Build 5 38750361 10D CAAAGAGTGG GCTGTCCGCT/---------- GCAGGTCGCA 3070 het 3070 ref 47 23 19 9 GCTGTCCGCT 1 0 18753 CASAVA_Build 5 38752122 1D ATGCCAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3043 hom 35 11 12 12 T 14 13 18754 CASAVA_Build 5 38752456 1D ACTCCTCAGC G/- GGGCAGGGAG 3070 het 3070 hom 41 20 17 7 G 4 3 18755 CASAVA_Build 5 38762808 2D ACATGGCGGC GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 51 18 14 21 GA 10 9 18756 CASAVA_Build 5 38772329 1I TATTGTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 10 11 18757 CASAVA_Build 5 38779943 2I CCAGAATACC --/AG AGTCTTGAGA 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 AG 1 2 18758 CASAVA_Build 5 38785458 2I TATAGAAATT --/AA AAGAGTATGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 4 18759 CASAVA_Build 5 38795550 1I AGCCATTATG -/A AAAAAAAAAT 1701 het 1701 ref 23 12 6 5 A 9 10 18760 CASAVA_Build 5 38834992 24D CCCAGCTAGT TTTTTTTTTTTTTTAAAAAAATAG/------------------------ GGTCTTGCTA 3070 het 1014 hom 20 4 12 8 TTTTTTTTTTTTTTAAAAAAATAG 1 0 18761 CASAVA_Build 5 38850813 2D TTATTTAACA CC/-- CCCCCCCCCG 1430 het 1430 ref 32 21 4 7 C 11 9 18762 CASAVA_Build 5 38851836 1D TGTGCACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 35 0 27 8 T 11 10 18763 CASAVA_Build 5 38852519 1D GCAAAAAAAA T/- GGCTTCCCAT 3070 het 3070 hom 43 15 26 3 T 1 0 18764 CASAVA_Build 5 38853450 1D GTATCCCTGG A/- AAAAATGTTT 3070 het 3070 ref 50 23 22 6 A 6 5 18765 CASAVA_Build 5 38854250 1D ATAGTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 8 A 12 11 18766 CASAVA_Build 5 38855150 1D ATATAACAAA C/- CTGCACATGT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 C 2 1 18767 CASAVA_Build 5 38861022 7D TTTGTGAAGT AATGATG/------- AACTTTTAGA 3070 het 3070 ref 24 13 8 6 AATGATG 1 0 18768 CASAVA_Build 5 38864649 1I TTGTGTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 12 18 14 A 13 14 18769 CASAVA_Build 5 38866313 1I AGGTGAAATT -/G TTATGCAAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 18770 CASAVA_Build 5 38893318 1I GTTTTCCCCC -/T GGCTTTAATA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 0 1 18771 CASAVA_Build 5 38899778 8D ATAACAACTT TCTTTTTC/-------- TCTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 34 23 10 4 TCTTTTTC 2 1 18772 CASAVA_Build 5 38906194 1I ATTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 19 1 14 4 C 0 1 18773 CASAVA_Build 5 38926260 1I TTTTGACTTG -/T TTAATCTGAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 2 3 18774 CASAVA_Build 5 38930453 1I TAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 8 9 18775 CASAVA_Build 5 38936622 1D TGTAGAAGTA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 8 7 18776 CASAVA_Build 5 38939921 1D TCAAAAATTC T/- TTTTTTGTCC 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 T 7 6 18777 CASAVA_Build 5 38942031 1I ACGTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 10 11 18778 CASAVA_Build 5 38949409 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 25 0 7 19 A 17 14 18779 CASAVA_Build 5 38971169 3D ATGTGGCTGT CAA/--- CAACTGGCCT 3070 hom 134 het 48 0 43 5 CAA 2 1 18780 CASAVA_Build 5 38976003 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1616 hom 29 9 15 5 A 11 10 18781 CASAVA_Build 5 38977184 1D CTTTATTAAT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 G 1 0 18782 CASAVA_Build 5 38979018 1I TGAGTTTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 39 0 30 9 T 9 10 18783 CASAVA_Build 5 38982856 1D CTACAGAGAA T/- ATATGGATAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 1 0 18784 CASAVA_Build 5 38988413 1D GCGTTTGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 38 1 29 8 A 11 10 18785 CASAVA_Build 5 38989423 1I CTGGAGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 10 18786 CASAVA_Build 5 38996083 1I CCAGTCTCAT -/A AACTAGTGAC 3070 hom 163 het 55 0 54 1 A 2 3 18787 CASAVA_Build 5 38996612 2D TAATCCCCAC AT/-- GTCATGAAAG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 AT 1 0 18788 CASAVA_Build 5 38998035 1D ATATTAAAAA T/- ATATATGAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 0 18789 CASAVA_Build 5 39004597 1D CCTGCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1030 het 809 hom 26 6 5 15 A 17 16 18790 CASAVA_Build 5 39005401 1I AGTCTACAGT -/A AGTGTACAGT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 1 2 18791 CASAVA_Build 5 39008866 1I GAAGCCTTAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 8 9 18792 CASAVA_Build 5 39012169 1D CTGTGCCACC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 40 0 34 7 T 10 9 18793 CASAVA_Build 5 39014015 3D TCATTTCTAG ATA/--- ATAATATTTA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 ATA 3 2 18794 CASAVA_Build 5 39018665 2D ATACACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 29 0 23 7 AT 6 5 18795 CASAVA_Build 5 39019910 1D GAATTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 11 10 18796 CASAVA_Build 5 39020080 1I TTTCCGAATA -/C ACATAAAAAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 0 1 18797 CASAVA_Build 5 39027401 4D CATGAAATTA ATTG/---- ATTAACTTGG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 ATTG 1 0 18798 CASAVA_Build 5 39030593 4I GCAATTAAAA ----/ACTG ACTACTTTAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 ACTG 0 1 18799 CASAVA_Build 5 39038258 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATATATA 3070 het 776 hom 31 7 16 9 TGTA 1 0 18800 CASAVA_Build 5 39086902 14D ACATATATAT ACACACACACACAC/-------------- ACACACACGC 3070 het 1515 hom 32 9 14 15 AC 11 4 18801 CASAVA_Build 5 39087612 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2742 het 2742 ref 19 12 6 1 A 10 11 18802 CASAVA_Build 5 39097094 9I TTACATCTAC ---------/TACTTTTTA TACTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 TACTTTTTA 1 2 18803 CASAVA_Build 5 39115276 1D TTTTTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 13 12 18804 CASAVA_Build 5 39121301 13I25M9D ATAAATCAAG -------------TGGACACTATATAGTGAAAGTACAGAACACTAAA/TGAAATGTACACCTGGACACTATATAGTGAAAGTACAG--------- AACACTAAAA 3070 het 3070 hom 40 22 22 4 N/A 0 0 18805 CASAVA_Build 5 39129700 1D TGACAAGTAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 9 8 18806 CASAVA_Build 5 39149563 3I CTATTTCATC ---/ATT ATTTCATTTG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 ATT 1 2 18807 CASAVA_Build 5 39150958 1I AAACACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 594 hom 27 4 16 7 T 15 16 18808 CASAVA_Build 5 39152703 1D AAAAATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 32 1 27 4 A 11 10 18809 CASAVA_Build 5 39187959 5I CCCTTTTGAA -----/AAAAC AAAGTAGCTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAAAC 0 1 18810 CASAVA_Build 5 39197021 1D TCATTTTCTT C/- CTAGCTAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 2 1 18811 CASAVA_Build 5 39198578 2D CGTTTAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 T 13 11 18812 CASAVA_Build 5 39199712 4I AATAACTGAA ----/TCTG TATTCTTCAA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 TCTG 0 1 18813 CASAVA_Build 5 39202297 1D TCCGTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 893 hom 39 2 21 17 A 15 14 18814 CASAVA_Build 5 39203817 5D AGTTATGACA ATTAT/----- ATTATTTAAC 3070 hom 102 het 39 0 34 7 ATTAT 2 1 18815 CASAVA_Build 5 39208305 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 16 5 A 12 11 18816 CASAVA_Build 5 39217243 5I TTTGAATTTC -----/AATTT AATTTAATTT 3070 hom 58 het 25 0 19 6 AATTT 3 4 18817 CASAVA_Build 5 39223698 1D TAGTGCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 26 7 T 11 10 18818 CASAVA_Build 5 39231833 1I TCATGATCAG -/A AAAGCAACAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 3 4 18819 CASAVA_Build 5 39245189 1D TTTAAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 79 hom 36 2 20 14 T 15 14 18820 CASAVA_Build 5 39247182 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 17 0 9 8 T 16 14 18821 CASAVA_Build 5 39256277 1D TGTCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 1006 het 1006 ref 30 22 3 5 A 12 11 18822 CASAVA_Build 5 39261837 1D TTTCGTCACA G/- CATTTTGCCC 3070 hom 150 het 55 0 50 5 G 1 0 18823 CASAVA_Build 5 39262258 3D CCAAACCTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 14 11 18824 CASAVA_Build 5 39285458 2I AGATGCAAAA --/CT CTATAATAGT 3070 hom 135 het 49 0 44 5 CT 1 2 18825 CASAVA_Build 5 39296150 1D TTTTTATAAA T/- AAAGTTTTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 18826 CASAVA_Build 5 39301838 1D ATTTTTACTG T/- TTTTTTTTTT 1754 het 1754 ref 35 22 4 9 T 15 14 18827 CASAVA_Build 5 39322575 2D TTTGGAGAGT GA/-- GAGTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 GA 2 1 18828 CASAVA_Build 5 39337578 1I AAACACCATT -/A AAAGATGAAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 3 4 18829 CASAVA_Build 5 39349230 15D CCTATGATCA CTTCTTAGCCCTCAT/--------------- CTTCTTAGCC 3070 hom 93 het 38 0 32 8 CTTCTTAGCCCTCAT 2 1 18830 CASAVA_Build 5 39369054 1I TAAATTAAAA -/T TTTTGTCCCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 4 5 18831 CASAVA_Build 5 39385043 1I ACAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1367 hom 24 4 18 2 A 12 13 18832 CASAVA_Build 5 39391321 1I CTCCTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 9 10 18833 CASAVA_Build 5 39403087 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 27 0 15 12 A 15 14 18834 CASAVA_Build 5 39423559 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 8 9 18835 CASAVA_Build 5 39425879 1I CATACTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 10 11 18836 CASAVA_Build 5 39431098 1I GTTTCTATAT -/A GCTGTAGAGA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 0 1 18837 CASAVA_Build 5 39446666 1I TAACCTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 39 1 29 9 A 10 11 18838 CASAVA_Build 5 39462595 2D CTCAATTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 14 12 18839 CASAVA_Build 5 39464351 1D TATGCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 21 1 14 6 T 13 12 18840 CASAVA_Build 5 39472310 1D TTTAAGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 7 A 11 10 18841 CASAVA_Build 5 39473005 16D CATCCATCTG TTCATTCATTCATTCA/---------------- TTCATTCATT 3070 hom 108 het 41 0 37 10 TTCA 8 4 18842 CASAVA_Build 5 39479246 2I TAGAAATCTC --/TT GTTTGCTCCC 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 T 0 2 18843 CASAVA_Build 5 39486204 4D AATATATGTA TTGT/---- TTATTTGTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TTGT 1 0 18844 CASAVA_Build 5 39506791 2D TTAATCCCTC TG/-- TGCTTAGGAA 3070 het 3070 ref 43 26 15 3 TG 2 1 18845 CASAVA_Build 5 39509670 5D ATGTGACCAT AGGCA/----- AGATGCTTTA 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 AGGCA 1 0 18846 CASAVA_Build 5 39512127 1I CACTGGGCCA -/T CTGTGTTGCC 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 T 0 1 18847 CASAVA_Build 5 39513182 2D TGATGTAACC AA/-- AGAGTGGCTG 3070 het 3070 ref 50 23 22 6 A 3 1 18848 CASAVA_Build 5 39513983 1D TTTCCCCCCC A/- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 4 3 18849 CASAVA_Build 5 39518992 1I ACAACCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 19 20 11 A 10 11 18850 CASAVA_Build 5 39522926 1I AGAAGAGCCA -/G CAGTGAAAGA 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 G 0 1 18851 CASAVA_Build 5 39523781 1I GCCTGGTATT -/A AAAAACATCC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 5 6 18852 CASAVA_Build 5 39530678 1D ACTCTTAAGT C/- CCCAGGGCCC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 4 3 18853 CASAVA_Build 5 39534690 1I AAAACGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 T 11 12 18854 CASAVA_Build 5 39539845 12D GCCATCCCTT CCTTACTTCTGC/------------ CCCATTTTCT 3070 het 3070 ref 41 26 13 7 CCTTACTTCTGC 1 0 18855 CASAVA_Build 5 39541233 3D CAAGAATACT ACC/--- ACCAAATCAC 3070 het 3070 ref 49 22 22 7 ACC 2 1 18856 CASAVA_Build 5 39544966 1D ATAGCAGGAG A/- AAAAACCCTG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 6 5 18857 CASAVA_Build 5 39568256 1D TTATCAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2540 hom 20 7 8 5 T 12 11 18858 CASAVA_Build 5 39569168 1D TACAATAGTT A/- AAAAAAAAAA 1650 het 1650 ref 42 35 4 3 A 12 11 18859 CASAVA_Build 5 39610481 2D CCAGACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 64 het 41 1 36 5 AC 9 8 18860 CASAVA_Build 5 39614985 1D ATCAAAGTGG A/- AAAAAAGGGC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 6 18861 CASAVA_Build 5 39619416 1D TTATTATTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3056 hom 31 9 18 4 T 9 8 18862 CASAVA_Build 5 39620205 1D AATCTCCCTC A/- GGGGTTGGTA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 1 0 18863 CASAVA_Build 5 39631113 2D ATTCAGTATG AT/-- ATTGACTGTG 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 AT 2 1 18864 CASAVA_Build 5 39666719 1D TTTTTTATGG T/- CAAACATTTG 3070 het 3070 hom 35 9 20 6 T 1 0 18865 CASAVA_Build 5 39669541 10I TAAATACTTA ----------/TAATAGGAGT TAATAGGAGT 3070 het 3070 hom 57 24 28 6 TAATAGGAGT 1 2 18866 CASAVA_Build 5 39669933 1I ATTCAAGTAA -/C TTTTTACCCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 18867 CASAVA_Build 5 39671701 1D GAAAAGATAG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 8 7 18868 CASAVA_Build 5 39681854 1I TCTATTGATT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 81 het 28 0 27 1 A 7 8 18869 CASAVA_Build 5 39685101 1D TAGGCTGGTC T/- TGAACTCCTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 2 1 18870 CASAVA_Build 5 39702027 2D41M1D CCCAAGTAAA AGAAATGTATCGTTGATTATCCTTACTTACTAATTCAGAATACT/--AAATGTATCGTTGATTATCCTTACTTACTAATTCAGGATAC- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 26 6 N/A 0 0 18871 CASAVA_Build 5 39704029 1D ATTGAAAATA C/- ATAGTGGTTT 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 C 1 0 18872 CASAVA_Build 5 39707145 1I AAGTATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 456 hom 24 1 20 3 A 13 14 18873 CASAVA_Build 5 39717116 3D TTTACACACT AAC/--- AACTGGAAAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AAC 2 1 18874 CASAVA_Build 5 39718195 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2760 het 918 hom 20 3 8 10 A 17 16 18875 CASAVA_Build 5 39731497 1D TGCCTACTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 291 hom 29 1 23 6 T 10 9 18876 CASAVA_Build 5 39732544 2I ATGTATATCC --/AT ATATATATGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AT 4 5 18877 CASAVA_Build 5 39738367 1D AAACTCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 12 11 18878 CASAVA_Build 5 39740509 1I AGAACAAGTG -/A AAAAAAGACT 3070 het 3070 hom 38 11 27 0 A 6 7 18879 CASAVA_Build 5 39742058 2I GCTTTGTCTC --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 26 4 A 9 11 18880 CASAVA_Build 5 39767527 2D CTCTTTCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 46 3 25 18 T 18 16 18881 CASAVA_Build 5 39770726 1D CTGATGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 28 2 20 6 T 15 14 18882 CASAVA_Build 5 39772243 1D GATCTGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 8 18883 CASAVA_Build 5 39772613 1D CAAAAAACAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 A 9 8 18884 CASAVA_Build 5 39778658 1D TTGTTTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 34 0 22 13 T 13 12 18885 CASAVA_Build 5 39785790 1I GCAGGTAAAG -/T TGTGTCACGG 3070 hom 78 het 30 0 25 5 T 1 2 18886 CASAVA_Build 5 39800243 1I TTATCATCAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 9 18887 CASAVA_Build 5 39814148 4D TGGCATTGAT AAAG/---- AAAACAACAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAAG 1 0 18888 CASAVA_Build 5 39833300 4D TTCTTCACTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 1941 hom 58 het 43 0 19 24 TG 10 8 18889 CASAVA_Build 5 39839922 3I CTGGTATCTC ---/CTT CTCTTCTTAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 CTT 0 1 18890 CASAVA_Build 5 39847518 2D TAGGTTGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2041 het 2041 ref 41 14 6 21 T 18 16 18891 CASAVA_Build 5 39850104 1D GGTGACAGAG A/- AAAAAAAAAA 2916 het 6 hom 15 1 11 3 A 13 12 18892 CASAVA_Build 5 39861638 4D TCCTGGCCTC AGTT/---- AGAAGCTGGG 3070 het 3070 ref 56 34 19 6 AGTT 1 0 18893 CASAVA_Build 5 39872338 2D TGTGTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TG 10 9 18894 CASAVA_Build 5 39875928 1I GTTTGGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 505 hom 29 2 26 1 T 10 11 18895 CASAVA_Build 5 39878255 2I TGTGTTTAAG --/CA CACACACAGT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 CA 4 5 18896 CASAVA_Build 5 39892851 5D TTCAGAAGAT ATAAA/----- ATAAAGAGAA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 ATAAA 2 1 18897 CASAVA_Build 5 39895248 5D TTGTATACTT CAGTC/----- CAATCAAGTT 3070 hom 120 het 41 0 41 2 CAGTC 1 0 18898 CASAVA_Build 5 39910501 1I TAATAACACC -/T AGTTCACAGC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 0 1 18899 CASAVA_Build 5 39910874 3I TAGGGAAAAA ---/AAG AAAATAAAGC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 AAG 0 1 18900 CASAVA_Build 5 39914273 1D TTCTCCCAGA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 7 6 18901 CASAVA_Build 5 39929250 2D TGTAAAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 2339 het 820 hom 36 12 7 17 T 18 16 18902 CASAVA_Build 5 39937984 3I GGGAAGTAAT ---/TCA TCATGATGCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TCA 1 2 18903 CASAVA_Build 5 39944156 1D ATCAAAGACC A/- AAGGTAGATA 1854 hom 10 het 4 0 4 0 A 3 2 18904 CASAVA_Build 5 39946776 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAATGATG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 5 6 18905 CASAVA_Build 5 39953376 1I ATAATAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 9 10 18906 CASAVA_Build 5 39960043 3D AGGTAGTGTC ATT/--- ATTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 33 17 14 4 ATT 2 1 18907 CASAVA_Build 5 39960173 2I TGTGTGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 1871 het 1871 ref 31 18 9 4 TG 8 9 18908 CASAVA_Build 5 39968322 6D CAAATGAAGG CATAGT/------ CATCCTACCT 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 CATAGT 1 0 18909 CASAVA_Build 5 39969795 1D TTACATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 23 0 20 3 T 12 11 18910 CASAVA_Build 5 39985591 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAG 1879 hom 18 het 7 0 7 0 A 9 10 18911 CASAVA_Build 5 39986502 1I CTCAACTTTA -/T CTTTTTTTCT 3070 het 369 hom 34 1 31 2 T 0 1 18912 CASAVA_Build 5 39989088 1D TGGTTTTTTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 73 het 29 0 25 4 A 9 8 18913 CASAVA_Build 5 39989772 2D CAAAAACCAC AT/-- GATTGTCTCA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 AT 1 0 18914 CASAVA_Build 5 39994102 2D GCACAAGCAC AT/-- GTTTATTTAT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 AT 1 0 18915 CASAVA_Build 5 39999164 1D ACAAAAATCA T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 8 7 18916 CASAVA_Build 5 39999585 30D TTTAAACGAG ATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------ ATATATATAT 1986 hom 24 het 9 0 9 6 AT 33 18 18917 CASAVA_Build 5 40006684 1I ATTTACACTA -/T TTTTGTTTAC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 4 5 18918 CASAVA_Build 5 40016641 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 935 hom 27 2 20 5 A 12 11 18919 CASAVA_Build 5 40017970 1D GGGCCTGATT G/- GGGGGCGTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 6 5 18920 CASAVA_Build 5 40020619 1D CTATTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 13 10 A 15 14 18921 CASAVA_Build 5 40026256 2D TAACCTTATT AA/-- GACAAATATT 3070 het 3070 hom 34 11 22 1 A 2 0 18922 CASAVA_Build 5 40034963 1I TGTTTGGGGT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 8 9 18923 CASAVA_Build 5 40039418 1D CAATTTCATG A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 1 0 18924 CASAVA_Build 5 40045365 3I TCATTGAATA ---/GAT GATGCAGAAA 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 GAT 1 2 18925 CASAVA_Build 5 40049341 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1980 hom 28 6 17 5 A 10 9 18926 CASAVA_Build 5 40050361 1I TACTGAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1203 hom 39 3 28 8 A 13 14 18927 CASAVA_Build 5 40050799 2I TCTCCAAAAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 11 18928 CASAVA_Build 5 40056549 1I AAAAACCTGG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 8 18929 CASAVA_Build 5 40057206 4D TTTAATGGAG TTAT/---- TTGTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TTAT 1 0 18930 CASAVA_Build 5 40060977 1I TGTTGAGAGG -/T GAGATCTTTA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 0 1 18931 CASAVA_Build 5 40071557 1D GTCTTTTTAC A/- AAAAAACCAT 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 7 6 18932 CASAVA_Build 5 40079747 35D ACACTTACCA TCTCAATGTTGAAAAGCTAATTGGATATGATATGG/----------------------------------- CTCCAACAGA 3070 het 3070 ref 34 23 13 4 TCTCAATGTTGAAAAGCTAATTGGATATGATATGG 1 0 18933 CASAVA_Build 5 40080126 1I CCAGCCTGAC -/T TAACATGGTG 2748 het 2748 ref 24 12 6 6 T 1 2 18934 CASAVA_Build 5 40115865 1D ATGAAATATT C/- CCCCCAGTTG 3070 het 3070 hom 43 20 19 5 C 6 5 18935 CASAVA_Build 5 40125176 1I AATAAAGAGG -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 7 8 18936 CASAVA_Build 5 40126939 1I TGCTGTTTGG -/T TTTTTTGGGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 6 7 18937 CASAVA_Build 5 40139298 1D AGAGAATGCG C/- CCCCTGAGGG 1966 hom 12 het 5 0 5 0 C 5 4 18938 CASAVA_Build 5 40149862 1D GCAGCAAACC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 47 27 15 6 A 9 8 18939 CASAVA_Build 5 40170452 1D GCAAGCTCCA G/- GGGCCTCTAC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 G 4 3 18940 CASAVA_Build 5 40176245 1I GTGGTCATGG -/A AAAGGGTATC 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 A 3 4 18941 CASAVA_Build 5 40179462 1D TCCGGTATTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 9 8 18942 CASAVA_Build 5 40182340 6D29M1I TCCAGGAAGC ATTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTTTGAAAAGCTGA-/------GTTTTTTTTTGTCTTTTTTGAAAAGCTGAT TTTTTTACCC 3070 het 2705 hom 40 14 23 18 N/A 0 0 18943 CASAVA_Build 5 40185302 2D GCTTTATATT AA/-- GACAAATAAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 8 A 2 0 18944 CASAVA_Build 5 40185387 1D TCTAGCATAA T/- TTTTTTGATA 3070 het 3070 ref 43 23 18 3 T 7 6 18945 CASAVA_Build 5 40194205 5I TTCTAATTCT -----/TCTTC TCTTCTATTC 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 TCTTC 1 2 18946 CASAVA_Build 5 40196016 1D TTGCACTCCT C/- CCCCAATTCA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 C 5 4 18947 CASAVA_Build 5 40198040 1D TGTGAGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 266 hom 29 1 22 6 T 12 11 18948 CASAVA_Build 5 40200197 6I TTTTCCTTTA ------/TTAATT TGGGTTAGAG 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TTAATT 0 1 18949 CASAVA_Build 5 40201755 2D CCTCCTCTGA CT/-- CTGACAAGCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 CT 2 1 18950 CASAVA_Build 5 40202656 1I CAAGCTGAGG -/A AAAAAATCCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 6 7 18951 CASAVA_Build 5 40204271 17D AAAGCTGACC ACATGTCCAGCCATTAA/----------------- ACATGTCCAG 3070 het 3070 ref 47 31 11 14 ACATGTCCAGCCATTAA 2 1 18952 CASAVA_Build 5 40205707 1D TCAGGCAAGA G/- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 G 1 0 18953 CASAVA_Build 5 40208230 1D TCAATATGAT A/- AAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 7 6 18954 CASAVA_Build 5 40214694 1D AAAACCCTTT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 7 6 18955 CASAVA_Build 5 40215050 1D TGAAAAGATT A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 7 6 18956 CASAVA_Build 5 40216345 2D AAAAAAAAAA AC/-- ATTTCATGCT 3070 het 2286 hom 24 9 10 5 AC 1 0 18957 CASAVA_Build 5 40216507 3I CCAGACTAAT ---/AAA GAAGAAAAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 0 3 18958 CASAVA_Build 5 40220912 1D TAATTATTGC T/- TTTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 T 6 5 18959 CASAVA_Build 5 40222562 1I TGTGGAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 11 12 18960 CASAVA_Build 5 40226361 1I AGTAGATTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 9 10 18961 CASAVA_Build 5 40227104 1I ACTGCAACTC -/A ACTACTGTCT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 A 1 2 18962 CASAVA_Build 5 40227939 1I CAATGTAATG -/T TTTTTTGGTG 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 6 7 18963 CASAVA_Build 5 40242935 3I GATGAAAGAT ---/AAA AAGTATTGGT 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 A 2 5 18964 CASAVA_Build 5 40243816 2I CAGTGTACAC --/AT GACTCAAAAC 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 AT 0 1 18965 CASAVA_Build 5 40244158 1I TGTTTTCATA -/T TTTTCCCACA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 4 5 18966 CASAVA_Build 5 40247382 1I CTGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 9 10 18967 CASAVA_Build 5 40257776 2D TCTGGGAAAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 85 het 37 0 29 10 TC 6 5 18968 CASAVA_Build 5 40262479 2I GCTTGTTCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 36 1 28 7 A 12 14 18969 CASAVA_Build 5 40276610 1D TCTCCTTTTA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 41 19 19 5 T 8 7 18970 CASAVA_Build 5 40283852 1D TTAATGAAAC A/- AAAAGTTGGT 3070 hom 40 het 20 0 14 6 A 5 4 18971 CASAVA_Build 5 40284509 1I TCAATCAATG -/T AATACATCAC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 0 1 18972 CASAVA_Build 5 40305909 1I ATTTGGTCAG -/A AAAAAAAAAA 1289 het 1289 ref 47 38 3 6 A 10 11 18973 CASAVA_Build 5 40322411 1I AATGCGGGGT -/G GGGGGGGGCT 2474 het 2474 ref 26 15 8 3 G 8 9 18974 CASAVA_Build 5 40333777 1I ATACATCTTC -/A GTTAATTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 0 1 18975 CASAVA_Build 5 40338009 2D CCTGTTTAAG GT/-- GTCTGTCAGC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 GT 2 1 18976 CASAVA_Build 5 40343305 6D TTTACTTCTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2896 het 177 hom 30 4 11 16 T 20 14 18977 CASAVA_Build 5 40351541 1I ATTAAAAAAG -/A AGAAAATTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 18978 CASAVA_Build 5 40362291 1D AATTTCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 A 13 12 18979 CASAVA_Build 5 40373468 1D GAAATAAATG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 29 het 15 0 9 6 A 9 8 18980 CASAVA_Build 5 40407044 1I ATGTCATCTT -/A TAGCAATATG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 0 1 18981 CASAVA_Build 5 40408210 4I TTTTTCCAAG ----/CACA CACACAAAGA 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 CA 3 5 18982 CASAVA_Build 5 40408468 1D ATGCACATTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 T 8 7 18983 CASAVA_Build 5 40410914 3I25M1I GGAGTCACGA ---AACAGTCTGTTCCTAAAGCTGTGCC-/AACAACAGTCTGTTCCTAAAGCTGTGCCA AGTTATGTGA 3070 het 1172 hom 26 5 14 17 N/A 0 0 18984 CASAVA_Build 5 40432698 1D CTTAAACCCC A/- GTGAGTTCAG 3070 het 3070 ref 36 22 13 2 A 1 0 18985 CASAVA_Build 5 40456640 1D ATATTGACAG T/- TGGGGTATTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 1 18986 CASAVA_Build 5 40459484 9D2M3D CCATTCAAGG CATTTTCAATGCCT/---------TG--- TACCTGCACC 3070 het 3070 ref 39 21 17 6 N/A 0 0 18987 CASAVA_Build 5 40460127 1D TGCTAGGGAT A/- AAAAGAACAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 5 4 18988 CASAVA_Build 5 40466357 1I CTTTACTGTT -/G CCATTGACCC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 G 0 1 18989 CASAVA_Build 5 40466812 1I54M1D TATTAGCTAC -TTTTCACAGCCTGTGTACAAAAAGTCCCATGCCCTACTCTGCCATACATGTTGAC/TTTTTCACAGCCTGTGTACAAAAAGTCCCATGCCCTACTCTGCCATACATGTTGA- TGACTAGCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 20 N/A 0 0 18990 CASAVA_Build 5 40470513 5I TAAAATGCAA -----/AATAT AATATATTCA 3070 hom 77 het 27 0 26 1 AATAT 1 2 18991 CASAVA_Build 5 40498336 2D TCAAAAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 39 2 22 17 A 18 16 18992 CASAVA_Build 5 40512805 3D TAGTCCAGGA TTG/--- TTTAGCAAAA 3070 hom 102 het 39 0 34 6 TTG 1 0 18993 CASAVA_Build 5 40525144 1D TGAGAAGCTC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 9 8 18994 CASAVA_Build 5 40534280 1I GCCTTGATGT -/G GATTGATATG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 G 1 2 18995 CASAVA_Build 5 40535873 13I CCTGGAACAG -------------/ACCTCTCGCTAGT ACCTCAGGGA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 ACCTCTCGCTAGT 0 1 18996 CASAVA_Build 5 40538892 1I AATTATGCGT -/G TTTAAGTTAT 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 G 0 1 18997 CASAVA_Build 5 40549905 1D GTCAGGTAGT G/- GGTTTTGCTA 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 G 3 2 18998 CASAVA_Build 5 40551890 1I GCATGCAGAA -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 7 8 18999 CASAVA_Build 5 40557658 3D CAAAAAAAAA AAT/--- AAACAAAGCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AAT 1 0 19000 CASAVA_Build 5 40561848 1I CTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 A 10 11 19001 CASAVA_Build 5 40567032 2I GTTCCTGGCC --/AA AAAAAAAAAA 1686 het 1686 ref 30 9 7 14 A 16 18 19002 CASAVA_Build 5 40585556 1D GATAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 13 12 19003 CASAVA_Build 5 40587673 6I ACTTTACCTT ------/ATGATC AGGTGAGTCA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 ATGATC 0 1 19004 CASAVA_Build 5 40605448 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2346 het 2346 ref 23 6 9 8 A 14 15 19005 CASAVA_Build 5 40606230 1D CCTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 A 13 12 19006 CASAVA_Build 5 40608835 4D AAAAAATTCA TCAT/---- TCATCTTTGG 3070 het 3070 hom 37 16 20 3 TCAT 2 1 19007 CASAVA_Build 5 40609811 5D AGCATGAAAA GTACT/----- GTGTGTCTCG 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 GTACT 1 0 19008 CASAVA_Build 5 40612638 6I AAACAAAAGT ------/ACACAG ACACAGACTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 ACACAG 1 2 19009 CASAVA_Build 5 40627945 1D ATTAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2046 hom 29 9 12 8 T 15 14 19010 CASAVA_Build 5 40631673 1D AATGTCTCAC T/- TTTTTTTTTT 1826 het 1826 ref 23 7 7 9 T 12 11 19011 CASAVA_Build 5 40638178 1D CTCCAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 14 8 A 13 12 19012 CASAVA_Build 5 40645824 1I GATACAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 A 14 15 19013 CASAVA_Build 5 40674231 2D CAAGGGTGCC CT/-- CTCTCAGCAC 2530 het 2530 ref 28 14 8 7 CT 3 2 19014 CASAVA_Build 5 40686222 1D GTAACTATGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 8 7 19015 CASAVA_Build 5 40689210 6D CCCATCAGAG CTGGTA/------ CTGGTACCTG 3070 het 3070 hom 45 18 16 12 CTGGTA 2 1 19016 CASAVA_Build 5 40690653 2D AACAGCACAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 12 10 19017 CASAVA_Build 5 40690974 1D ATAAATTTAA G/- AAAAAAAACA 3070 het 1543 hom 22 4 15 3 G 1 0 19018 CASAVA_Build 5 40702347 4D TTTGTTTGTT TGTC/---- TGTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 33 21 10 3 TGTC 1 0 19019 CASAVA_Build 5 40733554 1I AAATTAGTAA -/T AAATATACAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 0 1 19020 CASAVA_Build 5 40735054 1I GATAAGTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 977 hom 34 3 25 6 A 12 13 19021 CASAVA_Build 5 40735231 2I AATTAAAAAC --/TT TACCCCGCAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 1 3 19022 CASAVA_Build 5 40735805 1I ACTGAAAGTT -/C TAGCAAGTGC 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 C 0 1 19023 CASAVA_Build 5 40736622 2D CCAGCACTCA AG/-- GGGTAGAGGA 3070 het 3070 ref 40 20 18 5 AG 1 0 19024 CASAVA_Build 5 40739082 1D GGTTTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 A 12 11 19025 CASAVA_Build 5 40742472 1I ATAAAACTTC -/T AGCACAAAGC 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 T 0 1 19026 CASAVA_Build 5 40742548 1I ACCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 A 10 11 19027 CASAVA_Build 5 40762476 1D ATATCAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 11 10 19028 CASAVA_Build 5 40764355 1I AAAAAAGACC -/A AAAAAATCTG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 6 7 19029 CASAVA_Build 5 40767227 2D TGCTACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 AC 6 5 19030 CASAVA_Build 5 40787095 1D TGGGCTGAGG A/- AAAGATGCTG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 4 3 19031 CASAVA_Build 5 40801620 1I TAAAAAAAAA -/C ATCAAGGAAC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 19032 CASAVA_Build 5 40802682 1I AATAGCAAGA -/C CCTGTCACTA 3070 hom 99 het 35 0 31 4 C 2 3 19033 CASAVA_Build 5 40803731 1I AGTCAAGAAG -/T TTTGTAAATT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 3 4 19034 CASAVA_Build 5 40805972 6D TTTAAATAGA TATAGT/------ TATAGATATA 2888 het 2888 ref 28 20 7 2 TATAGT 1 0 19035 CASAVA_Build 5 40806284 5I GAGATCGTAC -----/CACTG CACTCCAGCC 3070 het 2020 hom 19 5 8 6 CACTG 0 1 19036 CASAVA_Build 5 40808312 1D TATTCATAAA C/- CAGCAAGCAA 3070 het 3070 ref 54 27 24 3 C 2 1 19037 CASAVA_Build 5 40809213 4D AAAGTAAAAT AGAC/---- AGGCTACAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 AGAC 1 0 19038 CASAVA_Build 5 40809523 1D CCTATAGGGG T/- AGAAACCAGT 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 T 1 0 19039 CASAVA_Build 5 40819229 1I CACAAAAAAA -/T TCATATAAAA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 T 1 2 19040 CASAVA_Build 5 40823565 1I TGCAAAAGAT -/A AAAAAGAAAA 2627 het 2627 ref 42 21 12 9 A 5 6 19041 CASAVA_Build 5 40839294 1I CTGTCTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 10 11 19042 CASAVA_Build 5 40842880 1I TTGTTTTTGG -/T TTTTTTGTTT 2025 het 2025 ref 17 6 7 4 T 6 7 19043 CASAVA_Build 5 40845087 2I CTTTATTCCA --/AC CACCTTAGTT 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 AC 0 1 19044 CASAVA_Build 5 40852604 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 1911 het 66 hom 13 1 9 3 TG 6 7 19045 CASAVA_Build 5 40855340 18D GTGTATATAT ATATATATATATATATAC/------------------ ATATCATACA 3070 het 1008 hom 15 3 12 4 ATATATATATATATATAC 1 0 19046 CASAVA_Build 5 40861213 2I TAACAGATAA --/TC TCTCTGTATC 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 TC 2 3 19047 CASAVA_Build 5 40862393 1D TACTTTGAAA C/- CCAGTGAAAG 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 C 3 2 19048 CASAVA_Build 5 40863819 1I TCCTTTGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 9 10 19049 CASAVA_Build 5 40865520 4D ATCCATCATA GTGT/---- GTGTGTGTGT 1127 het 195 hom 20 2 8 11 GT 9 7 19050 CASAVA_Build 5 40866360 1D AGTTCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 2836 het 2836 ref 29 9 10 10 T 15 14 19051 CASAVA_Build 5 40871324 2D CGTTTAGATT AC/-- AGTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 31 12 12 8 AC 1 0 19052 CASAVA_Build 5 40873226 7D CTGTATCAAC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1693 het 1529 hom 26 8 7 11 T 21 14 19053 CASAVA_Build 5 40874737 1D CTCCACAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2789 hom 26 10 10 6 T 10 9 19054 CASAVA_Build 5 40875489 1D ATTTTTAATA T/- CATATGAGGA 2857 het 2581 hom 21 7 7 7 T 1 0 19055 CASAVA_Build 5 40930517 1D TTTGAGATAC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 8 7 19056 CASAVA_Build 5 40942089 1D GTGATTCACC T/- GCCTCGGCCT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 1 0 19057 CASAVA_Build 5 40954547 1D CAAAAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 A 11 10 19058 CASAVA_Build 5 40957465 1D TAGTTTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 8 A 11 10 19059 CASAVA_Build 5 40962220 9D ACAAAAATGC CCACTTTTG/--------- CCACTTTTGC 3070 het 3070 ref 46 20 16 12 CCACTTTTG 2 1 19060 CASAVA_Build 5 40967441 1I AACAACCATG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 7 8 19061 CASAVA_Build 5 40969909 1D ACTAACATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 13 12 19062 CASAVA_Build 5 40979578 2I ACACACAGAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2964 hom 29 11 15 3 AT 5 6 19063 CASAVA_Build 5 40984112 1I TCATTCTTTT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 7 8 19064 CASAVA_Build 5 40986102 4D GTGTTGCTCC TCTG/---- TCTATTTCCA 3070 het 3070 ref 31 18 13 4 TCTG 1 0 19065 CASAVA_Build 5 40993633 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTTA 2146 het 2146 ref 28 13 8 7 G 0 1 19066 CASAVA_Build 5 41005118 2D TTCAAACATT TA/-- TGTTTACTGT 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 TA 1 0 19067 CASAVA_Build 5 41009967 1I TTAAATGTAT -/G GTTCAGTGGC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 1 2 19068 CASAVA_Build 5 41010281 2D TTATAATACA TT/-- TTTTTTTTTT 2436 het 2415 hom 23 7 10 6 T 12 10 19069 CASAVA_Build 5 41027033 1I CATAAAACTG -/T TTATCAGAAA 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 2 3 19070 CASAVA_Build 5 41028276 1D CTATAAGCCT G/- TAAAATCAAA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 G 1 0 19071 CASAVA_Build 5 41030489 1D TAAATTTGCT A/- ATATCATAAT 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 A 2 1 19072 CASAVA_Build 5 41041285 7I CCCCCCCCCC -------/CCCTCCT TTGAAGTCTC 3070 hom 72 het 30 0 23 7 CCCTCCT 0 1 19073 CASAVA_Build 5 41055203 4I GTGTGTGTGT ----/GAGA GAGAGAGAGT 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 GA 4 6 19074 CASAVA_Build 5 41070475 1I30M1D TAAAATGCCA -TTTTTTTGGGTAGCATTTGTGTATTTTTAAT/TTTTTTTTGGGTAGCATTTGTGTATTTTTAA- TTTTTAAAAA 3070 hom 114 het 34 0 38 8 N/A 0 0 19075 CASAVA_Build 5 41081488 1D GAGGGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 39 1 31 7 T 11 10 19076 CASAVA_Build 5 41082301 1I TAGAAAAGTG -/C TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 29 1 22 6 C 0 1 19077 CASAVA_Build 5 41082929 1D TGCCTTTTAA T/- ATAGAAAACC 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 1 0 19078 CASAVA_Build 5 41142955 4D GTAGATAATT AGTA/---- AGTAGTGGGA 3070 hom 102 het 38 0 35 5 AGTA 2 1 19079 CASAVA_Build 5 41154004 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2056 het 888 hom 21 4 10 9 A 17 16 19080 CASAVA_Build 5 41155403 2I TCCTATTTCT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 14 5 TA 0 1 19081 CASAVA_Build 5 41164494 1I TTTTATTGTA -/T TTTTTTTTTT 1272 het 1272 ref 41 33 3 5 T 11 12 19082 CASAVA_Build 5 41212774 1D GTGCAAAACA G/- GTAAGATTAT 3070 het 3070 ref 47 24 16 9 G 2 1 19083 CASAVA_Build 5 41220000 1I GTTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 11 12 19084 CASAVA_Build 5 41223568 1D TACACACACA C/- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 29 14 8 8 C 1 0 19085 CASAVA_Build 5 41230582 1I TCTTTACTGA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 T 6 7 19086 CASAVA_Build 5 41238152 1D TCTCCAGGGA G/- GAGCTTGTGT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 G 2 1 19087 CASAVA_Build 5 41247178 7I GTACACCAAC -------/ATGGCAT ATGGCATATG 2969 het 688 hom 12 4 7 1 ATGGCAT 1 2 19088 CASAVA_Build 5 41256893 1I TTATGTAGCT -/A AAAAAAAAAA 3021 het 1831 hom 19 5 9 5 A 11 12 19089 CASAVA_Build 5 41270937 1I TTTTTTAATG -/T TTTTTTTTTT 788 het 104 hom 13 2 5 6 T 11 12 19090 CASAVA_Build 5 41280575 2I GTCAAACACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 19 7 T 10 12 19091 CASAVA_Build 5 41281365 1D GGGCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 18 14 2 A 11 10 19092 CASAVA_Build 5 41295146 1I AACAAAGAGT -/A AAAAATAGCT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 5 6 19093 CASAVA_Build 5 41295377 2D TGAAATTACC AA/-- AAAAAAAAAA 2587 het 1489 hom 25 9 8 8 A 18 16 19094 CASAVA_Build 5 41301860 2D GGAGCCTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 21 2 11 8 A 16 14 19095 CASAVA_Build 5 41308785 4D ATCTGAACTG TTTT/---- TTTTTTTTTG 1287 het 179 hom 39 2 9 32 T 13 9 19096 CASAVA_Build 5 41358679 1I ACTAAAATAC -/A AAAAATTAGT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 5 6 19097 CASAVA_Build 5 41358831 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 42 1 26 15 A 14 13 19098 CASAVA_Build 5 41406204 1I CAGTATTTTC -/T TGTAAAATCC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 1 2 19099 CASAVA_Build 5 41411021 2I AGAGGAAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3 hom 31 1 20 11 AG 5 6 19100 CASAVA_Build 5 41417659 1I TTTGAGGTTT -/C CCCCCTGACA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 C 5 6 19101 CASAVA_Build 5 41419717 1I ATTTGAAGCA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 7 8 19102 CASAVA_Build 5 41422828 1I AAAATCTTAA -/T CTTTTTGTTA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 0 1 19103 CASAVA_Build 5 41426191 1I TTGCTGAATA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 T 6 7 19104 CASAVA_Build 5 41428635 1D TAGAAAATTC A/- AAATAGCTGT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 4 3 19105 CASAVA_Build 5 41431861 1I CCCATCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 12 13 19106 CASAVA_Build 5 41436871 1I CTAAAAAAAA -/T AATAAAAAAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 0 1 19107 CASAVA_Build 5 41438670 3D TCTTTTTATC ATT/--- AGTAGTAGCC 3070 het 3070 hom 31 15 15 2 ATT 1 0 19108 CASAVA_Build 5 41448209 1I TATGTGTTTC -/T GAGTTATCTC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 0 1 19109 CASAVA_Build 5 41454374 2I AAAAACACAT --/GA GTCATATTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 GA 0 1 19110 CASAVA_Build 5 41454979 1D GGCAGAGGCA G/- GGGGTGGGGG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 G 5 4 19111 CASAVA_Build 5 41457623 8D AGATGAATGG AAAGCTTA/-------- AATATACGCA 3070 het 3070 ref 27 17 8 3 AAAGCTTA 1 0 19112 CASAVA_Build 5 41463256 3I TAAATTCAGT ---/GAA GAAGACTTGC 3070 hom 88 het 34 0 29 5 GAA 1 2 19113 CASAVA_Build 5 41478760 2D CCTTCCCTTG AC/-- TTTACTCCAA 3070 hom 57 het 27 0 20 8 AC 1 0 19114 CASAVA_Build 5 41481891 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 7 8 19115 CASAVA_Build 5 41505358 1I TGTGAGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 30 0 21 9 T 11 12 19116 CASAVA_Build 5 41506239 1I CAGAAATCTG -/A AAAAAAACAT 3070 het 375 hom 49 1 43 5 A 7 8 19117 CASAVA_Build 5 41554974 1I CCTTTTTTTT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 A 8 9 19118 CASAVA_Build 5 41557418 2D AAAAATAAAC TT/-- AAATATTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 T 2 0 19119 CASAVA_Build 5 41560321 3I GAGTGGATTT ---/GTC GTCACCAAGG 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 GTC 1 2 19120 CASAVA_Build 5 41561388 1I TCATGATCTG -/C CCACCTCGGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 C 2 3 19121 CASAVA_Build 5 41562437 1D CTGGAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 31 1 23 7 A 11 10 19122 CASAVA_Build 5 41582814 1D TTTCATTATA T/- TGTTCTTTCA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 2 1 19123 CASAVA_Build 5 41586980 1I GAGGTTGTAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 7 8 19124 CASAVA_Build 5 41588835 2D TAAAAAGTAA AT/-- ATATATATAT 2882 het 844 hom 11 3 7 2 AT 7 6 19125 CASAVA_Build 5 41594129 3I CTGATTAATA ---/ATG ATTATTATTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 ATG 0 1 19126 CASAVA_Build 5 41596389 1I TTCAAGAAAG -/T TTTCCTGGTA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 3 4 19127 CASAVA_Build 5 41598296 1I GCCATCAGAC -/A AAAATACCCA 3070 hom 126 het 49 0 42 7 A 4 5 19128 CASAVA_Build 5 41599822 4D CCAAAACCAC CTAA/---- CTGACTGCCT 3070 het 3070 hom 44 22 20 5 CTAA 1 0 19129 CASAVA_Build 5 41627253 1I AATAAGTAAC -/A AAAGAATTTT 3070 het 3070 hom 55 22 28 5 A 3 4 19130 CASAVA_Build 5 41632227 1D TGCAGCTCCC A/- AGCAAGAACG 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 A 2 1 19131 CASAVA_Build 5 41645783 1I13M1I TATTCAGCCA -TTTGGAACCCCTA-/TTTTGGAACCCCTAT TTGTTTATTT 3070 hom 99 het 33 0 34 5 N/A 0 0 19132 CASAVA_Build 5 41648904 2I TCAAAAAAAC --/TG TGCTTTTGAG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 TG 1 2 19133 CASAVA_Build 5 41654151 3I TCTGTACTGC ---/AAT AATGACAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 22 0 AAT 1 2 19134 CASAVA_Build 5 41659000 4D ATAATAAAAT TATA/---- TAGGGAGTCT 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 TA 3 1 19135 CASAVA_Build 5 41672062 1D ATTTAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 18 7 10 1 T 13 12 19136 CASAVA_Build 5 41691758 5D TATAAAACGC ATAGA/----- ATAGTGTCTG 2861 het 2861 ref 16 8 6 4 ATAGA 1 0 19137 CASAVA_Build 5 41700779 1I11M1I22M1I GGTCTATCAG -GTTCTCCATAC-GTTAGAAGTAGAGTCCTTAGCA-/TGTTCTCCATACTGTTAGAAGTAGAGTCCTTAGCAT TTTGGGGTCT 3070 hom 42 het 14 0 15 4 N/A 0 0 19138 CASAVA_Build 5 41714588 1I AATGGGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 11 12 19139 CASAVA_Build 5 41725600 2D GTGTGCATGC GT/-- GTGTGTGTGT 2013 het 2013 ref 53 33 7 13 GT 9 8 19140 CASAVA_Build 5 41737644 1I ATAGACTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 10 19141 CASAVA_Build 5 41743127 1I TTTATTATCC -/T TTTTTTTTTT 3061 het 3061 ref 34 16 8 10 T 10 11 19142 CASAVA_Build 5 41756522 1I AATAATGTTG -/T TTTTTTTTTT 1179 het 1179 ref 46 38 3 5 T 10 11 19143 CASAVA_Build 5 41759906 1I13M1I CTCAGATGCA -TGGCCTTCTATAC-/TTGGCCTTCTATACT TTGCTTATAT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 N/A 0 0 19144 CASAVA_Build 5 41759990 1D TTTCTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2077 hom 20 6 9 5 T 11 10 19145 CASAVA_Build 5 41769104 1D TTAGTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 1327 het 154 hom 14 4 4 6 T 19 18 19146 CASAVA_Build 5 41773303 1I CTTTTGCTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 9 10 19147 CASAVA_Build 5 41775569 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3059 hom 27 het 13 0 10 3 A 12 13 19148 CASAVA_Build 5 41783865 1D TTAGGACAGA G/- ACTCTGCCTT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 G 1 0 19149 CASAVA_Build 5 41844942 2I ATATTTAATG --/AT ATCTCATAAT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 AT 1 2 19150 CASAVA_Build 5 41846941 1D AAAGAGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 A 13 12 19151 CASAVA_Build 5 41849990 1D CATCTTTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 10 9 19152 CASAVA_Build 5 41854782 1D TGACTCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 22 10 A 13 12 19153 CASAVA_Build 5 41862493 1D TATTCTGTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 10 17 8 A 10 9 19154 CASAVA_Build 5 41870360 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAAAAC 3070 het 1010 hom 35 11 12 12 C 0 1 19155 CASAVA_Build 5 41871805 1D AGGCTCCTTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 A 9 8 19156 CASAVA_Build 5 41876175 1D TAGATAGAAT G/- GATCCATTTC 3070 het 3070 ref 33 15 15 4 G 2 1 19157 CASAVA_Build 5 41877680 5D TGGCTAAATT AAAGA/----- AATCAAAGAG 3070 het 3070 ref 40 22 16 6 AAAGA 1 0 19158 CASAVA_Build 5 41881426 1D TGCTTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 1020 het 1020 ref 32 24 3 5 A 11 10 19159 CASAVA_Build 5 41890037 1D AAAAACAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 10 9 19160 CASAVA_Build 5 41921426 1D AGATTGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 13 12 19161 CASAVA_Build 5 41944138 1D ATTCACCCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 14 10 T 10 9 19162 CASAVA_Build 5 41953462 1I CTATTACTTT -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 19163 CASAVA_Build 5 41966164 1I TCTTTCTATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 114 het 42 0 37 5 A 8 9 19164 CASAVA_Build 5 42003059 1I GCCTCAGCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 55 22 24 9 T 9 10 19165 CASAVA_Build 5 42016511 1D GTTTTATGGG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 9 8 19166 CASAVA_Build 5 42043059 1D ATGTCTTTAT A/- AAAAAAGGAC 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 7 6 19167 CASAVA_Build 5 42063184 3D TTCCCAATTA ACT/--- ATGAGCATAC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 ACT 1 0 19168 CASAVA_Build 5 42081582 1I ATCAACATGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 8 9 19169 CASAVA_Build 5 42089093 1D CATTCATTCA T/- TTACTTATGT 3070 het 3070 hom 36 18 18 0 T 3 2 19170 CASAVA_Build 5 42381598 1I TCACCAAAAA -/T ATATATAGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 19171 CASAVA_Build 5 42414975 1I CCTCAAGTTG -/T TTTTTGTTTT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 5 6 19172 CASAVA_Build 5 42416372 3D GTCTTAGAAT ATC/--- ATATTAATTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 ATC 1 0 19173 CASAVA_Build 5 42432851 2I AAAAGTCCTC --/TT TGCCTTGCTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 1 3 19174 CASAVA_Build 5 42447162 1I AGAAGATAGA -/G GGTAAAGAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 2 3 19175 CASAVA_Build 5 42456661 1D CCTCTCCAAG A/- AAATAGACAG 3070 hom 120 het 42 0 40 3 A 4 3 19176 CASAVA_Build 5 42494324 1I TACACCATAT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 8 19177 CASAVA_Build 5 42499915 1I TGATATTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 14 1 11 2 A 15 16 19178 CASAVA_Build 5 42501164 1I GAAGAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 24 10 T 10 11 19179 CASAVA_Build 5 42502142 1D ATCAAGGTTC A/- GGGGGTATAG 3070 hom 104 het 40 0 34 6 A 1 0 19180 CASAVA_Build 5 42509841 1D GAGGTCAGGA G/- TTCAAAACCA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 G 1 0 19181 CASAVA_Build 5 42511294 1I ATTATGGTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 8 9 19182 CASAVA_Build 5 42511804 1I TCGCTCTGTC -/G ACCAGGCTGG 1774 hom 17 het 12 0 6 6 G 0 1 19183 CASAVA_Build 5 42530937 2D AATTCCCACG CC/-- CCCCCCCCAT 3070 hom 22 het 36 1 26 9 C 10 8 19184 CASAVA_Build 5 42539655 1I ATTAGATGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 9 10 19185 CASAVA_Build 5 42548674 1I TTTTTTTTTT -/C AACTAGAATT 3070 het 1469 hom 33 5 21 7 C 0 1 19186 CASAVA_Build 5 42550198 4I TGTTGAGATC ----/TCCA TCCAGCCTTG 3070 hom 93 het 39 0 31 9 TCCA 1 2 19187 CASAVA_Build 5 42550871 4I ATTTGCAAAG ----/GGTA GGTACTTAAG 3070 hom 172 het 64 0 58 6 GGTA 1 2 19188 CASAVA_Build 5 42562885 3D GAGAAGCAAA TGT/--- TGTGGGAGTT 3070 hom 78 het 28 0 26 3 TGT 2 1 19189 CASAVA_Build 5 42567338 1D GACCATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 24 0 15 10 T 12 11 19190 CASAVA_Build 5 42583710 1D AATTTCTTCA T/- TTACAAGATG 3070 hom 144 het 55 0 48 7 T 3 2 19191 CASAVA_Build 5 42605929 1D TCCACCACAG T/- TGAGGTTCCA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 2 1 19192 CASAVA_Build 5 42609808 1D ATATTAACGG A/- TTCACCTTAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 1 0 19193 CASAVA_Build 5 42610912 2I TCTGGTACTT --/TG ATCCTATTCT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TG 0 1 19194 CASAVA_Build 5 42619239 1I ATTACTTTGC -/G GTTCCACCTT 3070 hom 111 het 46 0 36 10 G 1 2 19195 CASAVA_Build 5 42621632 1I AGAAACTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 34 1 25 8 A 10 11 19196 CASAVA_Build 5 42622954 8D GACATTTGTA AGTTTGGC/-------- AGCAAGCATT 3070 hom 66 het 28 0 21 7 AGTTTGGC 1 0 19197 CASAVA_Build 5 42639002 1D AGGTTTTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 32 het 39 2 31 6 T 10 9 19198 CASAVA_Build 5 42640573 2D CACCCCTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 33 0 22 11 T 16 14 19199 CASAVA_Build 5 42651475 5D TGTATCATCC CCTTA/----- CCTTTATGTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CCTTA 1 0 19200 CASAVA_Build 5 42651601 3D AACAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 36 0 31 5 A 13 10 19201 CASAVA_Build 5 42660506 4I TTCCTTTCAC ----/TTTA TTTGTTATTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TTTA 0 1 19202 CASAVA_Build 5 42661201 1I GAGAGTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 42 1 36 5 A 10 11 19203 CASAVA_Build 5 42661866 1D4M1D TCAAATAAAA CCCATC/-CCAT- CTGATGAGAA 3070 hom 93 het 32 0 32 2 N/A 0 0 19204 CASAVA_Build 5 42668568 1I TCACATACGT -/G GGTAGCAGCA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 G 2 3 19205 CASAVA_Build 5 42677910 2D AGAAGAAATC AT/-- ATGTTTTCAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AT 2 1 19206 CASAVA_Build 5 42679580 1I ACATTATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1383 hom 45 3 29 13 T 11 12 19207 CASAVA_Build 5 42682018 1I TTTACTAAAC -/T TTTTAGAACA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 4 5 19208 CASAVA_Build 5 42715483 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1551 het 1551 ref 31 21 4 6 A 13 12 19209 CASAVA_Build 5 42835477 3I GTACTAAATT ---/TTA TTATTTCTGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TTA 1 2 19210 CASAVA_Build 5 42845753 3D CTAATATTTT AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AAG 5 4 19211 CASAVA_Build 5 42849090 1D TGTTTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 21 8 A 11 10 19212 CASAVA_Build 5 42850845 1I AGTTCGCTTT -/A AAAAAAAAAA 2965 hom 24 het 13 0 10 3 A 14 15 19213 CASAVA_Build 5 42861955 1I TAAGTGCTTA -/T TAAGAGTGTT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 1 2 19214 CASAVA_Build 5 42865558 1D CCTTCTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 660 hom 28 2 22 5 T 10 9 19215 CASAVA_Build 5 42865962 1I CAGGCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 23 2 17 4 A 13 14 19216 CASAVA_Build 5 42868905 4D CAGATTTACC TAAG/---- TGTTTAATAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TAAG 1 0 19217 CASAVA_Build 5 42868990 2D CCAAATTTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 873 hom 39 9 11 19 T 16 14 19218 CASAVA_Build 5 42878339 1I CTAAAAATAC -/A AGAAAAAAAA 3070 hom 46 het 17 0 16 1 A 1 2 19219 CASAVA_Build 5 42882509 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 27 3 14 10 A 17 16 19220 CASAVA_Build 5 42885326 2D GAAAGGGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2597 hom 39 het 25 0 10 15 T 18 16 19221 CASAVA_Build 5 42887174 1D GCTTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 23 0 18 5 T 13 12 19222 CASAVA_Build 5 42887806 2D45M1I TGATTTTTTC TTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGAG-/--TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGACTGGAGT TGCAGTGGTG 3070 hom 22 het 26 1 18 7 N/A 0 0 19223 CASAVA_Build 5 42895471 1I TGTGCAAGTA -/T TTTTTTCGTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 6 7 19224 CASAVA_Build 5 42922270 3I CCTATTAACA ---/TGT TGTTACATTT 3070 hom 150 het 56 0 50 6 TGT 1 2 19225 CASAVA_Build 5 42957838 1D GTTTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1182 het 1182 ref 22 13 3 6 A 12 11 19226 CASAVA_Build 5 42974531 1I TAGCAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 24 0 20 4 A 11 12 19227 CASAVA_Build 5 42979116 3I TAAAGATGAG ---/AAC AATAGACAAC 3070 hom 89 het 35 0 28 7 AAC 0 1 19228 CASAVA_Build 5 42980367 2D CCTGAGATTT TC/-- TCTGAGATCC 3070 hom 80 het 32 0 27 5 TC 2 1 19229 CASAVA_Build 5 42981828 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 17 4 T 12 11 19230 CASAVA_Build 5 42982654 1D GAATTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 30 0 15 15 A 17 16 19231 CASAVA_Build 5 42983702 3D GCTCCCTACC TCT/--- TGTTTGTTTC 3070 hom 120 het 48 0 41 7 TCT 1 0 19232 CASAVA_Build 5 42987787 1I CACAACAGAC -/A AATGCCTTTA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 2 3 19233 CASAVA_Build 5 42988073 1D GCGCTGCTGC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 45 het 20 0 13 8 A 8 7 19234 CASAVA_Build 5 42988447 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 51 hom 16 1 10 5 A 8 7 19235 CASAVA_Build 5 42988735 1D TTTTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 11 10 19236 CASAVA_Build 5 42990888 1I GTGAGAAAAA -/T ATTTACTCTA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 0 1 19237 CASAVA_Build 5 42999635 1D CATGGGGTAC T/- TAGGGTAGTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 1 19238 CASAVA_Build 5 43004674 1I TAGACTAAAA -/G AATCTTGTAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 0 1 19239 CASAVA_Build 5 43008248 1I TTTCCTAACA -/G GCCACCGACC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 G 1 2 19240 CASAVA_Build 5 43013027 3I CTCTGGCGAT ---/CAA CAACATCCAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CAA 1 2 19241 CASAVA_Build 5 43026423 2D GTCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 36 hom 28 2 14 15 A 10 8 19242 CASAVA_Build 5 43034402 1D GAACAAAGCG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 10 9 19243 CASAVA_Build 5 43048260 1I TTTAAAGATG -/A TTTTTTTGGG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 0 1 19244 CASAVA_Build 5 43052877 1D TCTCAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 43 0 33 11 A 11 10 19245 CASAVA_Build 5 43063632 1D TAGTCTTCTG C/- CCAAGATGGC 2556 het 2556 ref 53 40 8 6 C 3 2 19246 CASAVA_Build 5 43064996 2D CCTGGAATAA AC/-- ACAGAGTTAG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 AC 2 1 19247 CASAVA_Build 5 43074756 1D TAATATAAGT A/- ATTGCGTGGT 3070 het 3070 hom 29 9 12 9 A 2 1 19248 CASAVA_Build 5 43076975 1D AAATTAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 30 0 23 8 A 10 9 19249 CASAVA_Build 5 43080506 1I TCTGTGGGAA -/C CGCTCGTTGA 3070 hom 75 het 27 0 24 3 C 1 2 19250 CASAVA_Build 5 43087540 1D GACTTCACCT A/- AAAAAAAAAA 1897 het 1897 ref 38 23 7 9 A 13 12 19251 CASAVA_Build 5 43097801 1I CTATGAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1670 hom 39 11 15 13 T 17 18 19252 CASAVA_Build 5 43101213 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 34 0 30 4 T 11 10 19253 CASAVA_Build 5 43116081 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 9 10 19254 CASAVA_Build 5 43118493 4D CTTGAAAAAT AAAG/---- AGAGAAAAGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AAAG 1 0 19255 CASAVA_Build 5 43120546 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 23 4 T 11 10 19256 CASAVA_Build 5 43139547 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 23 0 12 11 A 17 16 19257 CASAVA_Build 5 43161644 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAG 1061 het 1061 ref 24 20 3 1 A 10 9 19258 CASAVA_Build 5 43208477 1I TAAGACTCTC -/A AAAAAAAAAA 1690 het 1690 ref 21 13 5 3 A 15 16 19259 CASAVA_Build 5 43235601 3D AGGCAAAGAA AGG/--- AGAAGAGAGT 3070 hom 80 het 33 0 27 8 AGG 1 0 19260 CASAVA_Build 5 43237268 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 20 1 14 5 A 13 12 19261 CASAVA_Build 5 43238633 3D TGGAACGGTC AGA/--- AGGAGGAAAG 3070 hom 126 het 48 0 43 6 AGA 1 0 19262 CASAVA_Build 5 43242259 1D CTTGGGAAGC T/- TAAGGGAGAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 2 1 19263 CASAVA_Build 5 43250186 5D ACAATAAAAA CACAC/----- CCAGAAGTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 CACAC 1 0 19264 CASAVA_Build 5 43255707 4D TCAGCCGCCC GAGT/---- GAGTAGCTGG 3070 hom 42 het 15 0 12 3 GAGT 2 1 19265 CASAVA_Build 5 43256153 1I TGGGTATCTC -/T TTTTTTTTTT 2870 het 1696 hom 40 6 12 22 T 17 18 19266 CASAVA_Build 5 43257307 12D AGACTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAG 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 21 9 19267 CASAVA_Build 5 43259836 1D TGAAAGATTC T/- TTTTTGAGGG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 6 5 19268 CASAVA_Build 5 43267396 1I TATATGAAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 6 7 19269 CASAVA_Build 5 43277193 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 15 14 19270 CASAVA_Build 5 43286092 1D TAAATATAGA T/- TTTTAAAATA 3070 het 3070 hom 21 8 11 3 T 5 4 19271 CASAVA_Build 5 43305036 1I CAGGCATGGT -/G GGGGGCACCT 3070 hom 33 het 17 0 11 6 G 5 6 19272 CASAVA_Build 5 43305447 2D TGGATCCTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 27 11 12 6 TG 8 7 19273 CASAVA_Build 5 43306951 1D CAGCAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 1530 het 1530 ref 43 31 4 8 T 11 10 19274 CASAVA_Build 5 43310259 1D AGTCAGTAAT G/- GGAGAACTGA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 G 3 2 19275 CASAVA_Build 5 43328241 10I CCCAGAGCCC ----------/TTACTATGAA TTACTCTTCT 3070 het 3070 hom 28 13 14 2 TTACTATGAA 0 1 19276 CASAVA_Build 5 43330115 6D TTTAGGCTAT AAGTAA/------ AAGTAGAATC 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 AAGTAA 1 0 19277 CASAVA_Build 5 43332041 1I AGGATTAGTA -/T TTTTTTTTAA 2693 het 2693 ref 24 13 8 3 T 8 9 19278 CASAVA_Build 5 43341744 2I AAAAAATTAC --/GT GTTTTTAATT 2988 het 1355 hom 15 4 7 4 GT 1 2 19279 CASAVA_Build 5 43342564 2D TCCCAAGCAT TG/-- TTCAGATAAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 TG 1 0 19280 CASAVA_Build 5 43350819 2D GTAAGGACAA AC/-- ACAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AC 2 1 19281 CASAVA_Build 5 43375437 15I TACTATTTTC ---------------/TAGGTGTCTTAGGAA TAGGTGTCTT 3070 het 3070 hom 51 16 19 16 TAGGTGTCTTAGGAA 1 2 19282 CASAVA_Build 5 43375803 7I TGGATCAGAA -------/TGCCAAT ATCAAATATG 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 TGCCAAT 0 1 19283 CASAVA_Build 5 43384027 1I AATTTATGTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 8 9 19284 CASAVA_Build 5 43397715 1D TCTATGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 T 12 11 19285 CASAVA_Build 5 43397808 1I CAGCTTTGTT -/C TTTTTGCTTA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 C 0 1 19286 CASAVA_Build 5 43400071 1D AACATTGTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 9 8 19287 CASAVA_Build 5 43406599 5D CTCTCTTTCT CTCTC/----- TTTTTTTTTT 2441 het 2441 ref 37 20 10 7 CTCTC 1 0 19288 CASAVA_Build 5 43434092 1I CTTTTTTTCC -/T TTAGATAAGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 3 19289 CASAVA_Build 5 43434709 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 9 10 19290 CASAVA_Build 5 43453648 3I TTAGAAGGAT ---/GAA GATTTCCAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 GAA 0 1 19291 CASAVA_Build 5 43460029 1D CGTCTCTACT A/- AAAAATACAA 3056 het 178 hom 12 1 8 3 A 6 5 19292 CASAVA_Build 5 43492294 1I TAAGTTGAAC -/T TTATCAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 2 3 19293 CASAVA_Build 5 43515360 1D AAAAAGGTAA T/- AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 T 1 0 19294 CASAVA_Build 5 43515474 2D GTATAACATA AC/-- AATTTGTTCA 3070 het 3070 hom 38 15 22 2 AC 1 0 19295 CASAVA_Build 5 43527440 2D TTGCAAATCT TA/-- TTTCAAATTG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 TA 1 0 19296 CASAVA_Build 5 43531986 4I CAGGACAGCA ----/CAGT CAGCCTGAGA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 CAGT 0 1 19297 CASAVA_Build 5 43532619 1D ATTTTTTAAG T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 64 het 30 0 27 4 T 7 6 19298 CASAVA_Build 5 43533016 4D TATTTTAAAA TTCT/---- TTCTGAGTTT 3070 het 3070 hom 40 17 16 8 TTCT 2 1 19299 CASAVA_Build 5 43537207 20D GTCTAACTGA ACACAAGACTGTGAACTCTT/-------------------- GAGGGCAGGA 3070 het 3070 ref 27 20 13 1 ACACAAGACTGTGAACTCTT 1 0 19300 CASAVA_Build 5 43545220 1I GATAAGATAT -/C CTTCTAAGTC 3070 hom 101 het 44 0 29 15 C 1 2 19301 CASAVA_Build 5 43553187 1D ATGTTGAAAG C/- TAAGATAGGC 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 C 1 0 19302 CASAVA_Build 5 43560796 2I AAACAAACAA --/AC AAAAAAAAAC 3070 het 99 hom 27 2 13 12 AC 0 1 19303 CASAVA_Build 5 43561103 1D CTTTCATTAT G/- TACTGGTGTA 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 G 1 0 19304 CASAVA_Build 5 43561643 3D TTGTCGGTAG CTA/--- CTGTGAGTAG 3070 het 3070 ref 46 23 17 7 CTA 1 0 19305 CASAVA_Build 5 43563156 2I TATAGATGTG --/AC ACATTTTCTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AC 1 2 19306 CASAVA_Build 5 43567176 1I GTTTTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 30 1 22 7 A 10 11 19307 CASAVA_Build 5 43570060 1I CTAGTAGCCA -/T TTTTTTTTTT 1888 het 1888 ref 39 16 7 16 T 12 13 19308 CASAVA_Build 5 43571844 1I AAGCTTTGAA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 32 3 19 10 T 1 2 19309 CASAVA_Build 5 43575137 2I TTATCAAATT --/TA TAATATGTTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 TA 1 2 19310 CASAVA_Build 5 43575435 1D TAATGTGAGG A/- AAAAATTCCC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 6 5 19311 CASAVA_Build 5 43576249 1D ATGAAATAAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 9 8 19312 CASAVA_Build 5 43584261 5D GGGGAAAAAA AAAAC/----- AAAAACAAAA 196 het 196 ref 35 21 4 11 AAAAC 1 0 19313 CASAVA_Build 5 43586249 2D TAGGAGAATA CT/-- GAGTCATATT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 CT 1 0 19314 CASAVA_Build 5 43588923 1I AAAAAGCTCG -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 7 8 19315 CASAVA_Build 5 43596703 1I CAAAAATTAG -/C CAGGCATGGT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 C 1 2 19316 CASAVA_Build 5 43604323 1I ATGTCTCGTC -/T TTTTTTTTTA 3036 het 3036 ref 28 14 9 5 T 9 10 19317 CASAVA_Build 5 43605121 1I GATCAACTTT -/C CCCCAAATGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 4 5 19318 CASAVA_Build 5 43607301 1I TCGTCTCGAA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 6 7 19319 CASAVA_Build 5 43622209 2D ATTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2068 het 2068 ref 18 8 5 6 T 14 12 19320 CASAVA_Build 5 43625237 1D AATACATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1022 hom 42 7 21 14 T 15 14 19321 CASAVA_Build 5 43631975 8I GCCTGGGAGT --------/ATAAATGG ATAAATGGTA 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 ATAAATGG 1 2 19322 CASAVA_Build 5 43632141 1D GTTTTAGGCA T/- TTTTTTTTTT 1492 het 1492 ref 33 8 9 16 T 19 18 19323 CASAVA_Build 5 43634091 2I CATTAGAAAC --/AT GTGCACATTT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 AT 0 1 19324 CASAVA_Build 5 43643797 1I CTTTCTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2110 hom 25 6 10 9 T 11 12 19325 CASAVA_Build 5 43648742 1I AAATATATAT -/A TTTTTTTGCC 1655 het 1655 ref 22 12 5 5 A 0 1 19326 CASAVA_Build 5 43725211 1I GAATGAACTC -/T TGTTGATTAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 1 2 19327 CASAVA_Build 5 43752041 1D TCTTCAGCTC T/- TTTTTTTTTT 1769 het 1769 ref 38 27 4 7 T 11 10 19328 CASAVA_Build 5 43829503 1I AAAGGAACAA -/C TGGTACCAGC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 0 1 19329 CASAVA_Build 5 43843286 2I AAATATAAAA --/AT AGTATAAAAA 1728 hom 12 het 7 0 5 2 AT 0 1 19330 CASAVA_Build 5 43933745 2I GTCAAGGGCT --/AA AAACTGAGAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 5 19331 CASAVA_Build 5 43945634 1D TCTAAAAAGC A/- GAGCACCTCT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 A 1 0 19332 CASAVA_Build 5 43981425 1I GAACAGTATG -/A AAAAAAAAAA 1265 het 1265 ref 32 24 3 5 A 10 11 19333 CASAVA_Build 5 44094413 1D ACCCATGTAC A/- AAAAAAAAAA 1618 het 1299 hom 24 5 4 16 A 15 14 19334 CASAVA_Build 5 44110395 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 24 0 17 7 T 12 10 19335 CASAVA_Build 5 44111870 4D TATCATTGTC CTCT/---- CTATTTAAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 6 CT 3 1 19336 CASAVA_Build 5 44112246 2I CCAATTTAAC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 9 11 19337 CASAVA_Build 5 44116839 1I TCCCAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 10 11 19338 CASAVA_Build 5 44117322 1D GTTATCTGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 394 hom 40 1 35 4 A 10 9 19339 CASAVA_Build 5 44120294 2I TTTTTTTTTT --/AA GTTTTACTGC 3070 hom 115 het 45 0 39 6 A 0 2 19340 CASAVA_Build 5 44124702 1I CATTGGTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 A 14 15 19341 CASAVA_Build 5 44162982 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 2014 hom 19 het 8 0 7 1 AT 8 7 19342 CASAVA_Build 5 44171552 1D CCACAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1704 het 1704 ref 42 25 5 12 T 15 14 19343 CASAVA_Build 5 44179297 1I AGCAACTCCA -/C CTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 C 1 2 19344 CASAVA_Build 5 44190338 1D ACAGGTTCCA C/- CCCCAGGCAA 2026 het 2026 ref 14 8 5 1 C 5 4 19345 CASAVA_Build 5 44205084 1D GTTTAGTGTT A/- AAAAAAAAAA 1403 het 1403 ref 41 34 4 3 A 11 10 19346 CASAVA_Build 5 44296705 1D TATTAAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 42 1 24 18 T 15 14 19347 CASAVA_Build 5 44303702 4I AATCATAAAT ----/AGAG AGATTATTAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 1 3 19348 CASAVA_Build 5 44322120 1D CCTCCCCTCT C/- CCCCCCACCC 855 het 280 hom 4 1 3 0 C 7 6 19349 CASAVA_Build 5 44327286 1D CTGTGTACAA G/- CTCAAAGATA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 G 1 0 19350 CASAVA_Build 5 44327895 1D GAGCTCCCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 10 9 19351 CASAVA_Build 5 44328149 1D AGTATTTCTG A/- TTTTTCATCT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 1 0 19352 CASAVA_Build 5 44347036 1D ATTTTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 38 31 4 3 T 11 10 19353 CASAVA_Build 5 44349448 1D TAAAAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 T 13 12 19354 CASAVA_Build 5 44351042 2D ATGACAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 27 0 17 10 A 15 13 19355 CASAVA_Build 5 44361741 1D ACAAAATTTT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 7 19356 CASAVA_Build 5 44372994 2I TGTTATTACA --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 8 10 19357 CASAVA_Build 5 44377354 1D CCTTGTTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 A 10 9 19358 CASAVA_Build 5 44378372 1D AAGTTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 10 A 13 12 19359 CASAVA_Build 5 44384534 1D TAACGAATGG C/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 C 1 0 19360 CASAVA_Build 5 44385548 1D ATAGAAAACT A/- AAAAAACTCT 3070 het 3070 hom 36 12 23 1 A 7 6 19361 CASAVA_Build 5 44392978 1D AGATTTTCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 18 20 11 A 10 9 19362 CASAVA_Build 5 44404233 1D TGTCTTTGGC T/- AAGTGCCTCA 3070 het 3070 ref 59 28 25 7 T 1 0 19363 CASAVA_Build 5 44410745 1I TGATTACACA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 7 8 19364 CASAVA_Build 5 44419143 1D AATTCTAAAG A/- AATGCACTGG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 3 2 19365 CASAVA_Build 5 44434804 1D AGCCTCAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 11 10 19366 CASAVA_Build 5 44453058 1D AGTTGTTCCA T/- TTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 45 17 26 4 T 6 5 19367 CASAVA_Build 5 44453492 6D CTCTCTTTCT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 29 hom 32 2 16 15 AC 11 8 19368 CASAVA_Build 5 44453804 1D CAATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 13 12 19369 CASAVA_Build 5 44461049 1I CCTAACATTC -/A AATGATTCAA 3070 het 3070 hom 53 18 26 9 A 2 3 19370 CASAVA_Build 5 44481778 1D GAAATTGTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 9 8 19371 CASAVA_Build 5 44485094 1D TAAAGATGTG A/- GCCACCACAC 3070 het 2210 hom 25 7 13 6 A 1 0 19372 CASAVA_Build 5 44524506 1D ATATAATATC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 10 9 19373 CASAVA_Build 5 44526689 1D AAATGTATCC T/- TTTTTTTTTT 1699 het 1699 ref 35 22 5 9 T 13 12 19374 CASAVA_Build 5 44532418 1I CGGGGCTTTA -/G GCTTGAGACG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 1 2 19375 CASAVA_Build 5 44534328 1D TACTGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 12 10 A 12 11 19376 CASAVA_Build 5 44535125 1D CCATTTAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 51 21 27 3 A 9 8 19377 CASAVA_Build 5 44542785 1D GAGCACTCAA C/- GTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 C 1 0 19378 CASAVA_Build 5 44546912 1D TTACGGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2483 hom 27 12 11 5 A 14 13 19379 CASAVA_Build 5 44563497 4I TTTAATTGAA ----/TACT TACTTTTCTA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 TACT 1 2 19380 CASAVA_Build 5 44571994 1I CTGCCCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 T 11 12 19381 CASAVA_Build 5 44575967 1D AGTTTTCCAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 A 8 7 19382 CASAVA_Build 5 44595247 2I ATTGTGGTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AT 5 6 19383 CASAVA_Build 5 44598933 1D CTATTTGTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 10 9 19384 CASAVA_Build 5 44600981 1D AATATTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 32 1 22 10 T 17 16 19385 CASAVA_Build 5 44620879 1D TTTCCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1697 hom 24 8 11 5 A 15 14 19386 CASAVA_Build 5 44621588 1I AATAAAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 9 10 19387 CASAVA_Build 5 44623317 5I TTGAAAGTGG -----/TACCT TACCCTCTTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TACCT 0 1 19388 CASAVA_Build 5 44630217 2D CAAAGGCTTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 13 10 15 AC 8 7 19389 CASAVA_Build 5 44642418 1I AGTCTTCAAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 9 10 19390 CASAVA_Build 5 44663707 1D TATGAGTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 T 9 8 19391 CASAVA_Build 5 44673345 1I ATAAAGAGAT -/C CCCCACATAA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 C 4 5 19392 CASAVA_Build 5 44684350 3I AGATATTTGC ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 TAT 4 5 19393 CASAVA_Build 5 44714669 1D GAAGATAATT A/- AATTCAACAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 3 2 19394 CASAVA_Build 5 44715114 1I GGAGCCCAGA -/G GGTATGATAT 3070 hom 107 het 41 0 34 7 G 2 3 19395 CASAVA_Build 5 44730152 1I ACTGGCCCCC -/T GCCCTTGCCA 3070 het 3070 hom 46 22 19 5 T 0 1 19396 CASAVA_Build 5 44784718 1D GTGTGTGTGT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 521 hom 29 3 12 14 G 12 11 19397 CASAVA_Build 5 44816431 5D3M9D TGTATTGTGT ATTGAAAGAACATTGTA/-----AAG--------- TTGAAAGAAC 3070 het 3070 ref 36 27 11 5 N/A 0 0 19398 CASAVA_Build 5 44818237 1D GGGCCAGTTA T/- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 4 3 19399 CASAVA_Build 5 44831395 1I AACAGTCTAG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 6 7 19400 CASAVA_Build 5 44840541 5I TTGTAATCAT -----/TTTAA TTTAATTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 TTTAA 1 2 19401 CASAVA_Build 5 44845997 1D GCTAGGCCCT G/- GTTCTAAATT 3070 het 3070 ref 51 24 16 12 G 2 1 19402 CASAVA_Build 5 44851825 5D TCTTGGTTTT AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 43 19 21 7 AAAAG 3 2 19403 CASAVA_Build 5 44854613 8D AATATGCACC CAAATGGT/-------- CAAATGGTCA 3070 het 3070 hom 37 17 20 3 CAAATGGT 2 1 19404 CASAVA_Build 5 44856860 2D CAGATTTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 14 3 A 14 12 19405 CASAVA_Build 5 44868655 4I TTTCCTTTTA ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 53 25 16 12 TGTT 4 5 19406 CASAVA_Build 5 44869329 1D TTACCTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 11 10 19407 CASAVA_Build 5 44873012 1I TTATTGTTTT -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 6 7 19408 CASAVA_Build 5 44878550 1D3M4D AGACACATGC TCCAGTTC/-CCA---- ATTGTTATAA 3070 het 3070 ref 65 38 25 7 N/A 0 0 19409 CASAVA_Build 5 44903142 2I AAAAAATTAA --/AG AGTCATGGTG 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 AG 1 2 19410 CASAVA_Build 5 44904078 1D AAAAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 1359 hom 5 het 8 0 6 2 A 13 12 19411 CASAVA_Build 5 44920631 4D TGTAGAAAAT AAAC/---- AATTATTAAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 AAAC 1 0 19412 CASAVA_Build 5 44921584 4I TAGTCATCCA ----/AATT AATTTGTTGA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 AATT 1 2 19413 CASAVA_Build 5 44929000 1I TTCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2760 het 2760 ref 20 8 7 5 A 10 11 19414 CASAVA_Build 5 44932122 2D CTGGATTATT AA/-- AAAAAAATAT 3070 het 1944 hom 16 5 10 1 A 9 7 19415 CASAVA_Build 5 44935062 1D AACTTCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 A 13 12 19416 CASAVA_Build 5 44936147 1D CTGGTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 11 10 19417 CASAVA_Build 5 44939948 5D CATAGCACTT AACTC/----- TACCTAGCTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 4 AACTC 1 0 19418 CASAVA_Build 5 44951976 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 T 10 9 19419 CASAVA_Build 5 44952367 1D TATAAAACAG T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 39 18 14 8 T 8 7 19420 CASAVA_Build 5 44961178 13D CCTCATCTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2245 hom 25 11 9 5 T 25 12 19421 CASAVA_Build 5 44964736 12D CAACCCCAAA CCCTCCCCTTCT/------------ CCCTCCTTCC 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 CCCTCCCCTTCT 1 0 19422 CASAVA_Build 5 44998060 1D TCTCCAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 A 10 9 19423 CASAVA_Build 5 45004984 1D TGGCAATGAG A/- AAAATGATGT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 5 4 19424 CASAVA_Build 5 45029768 1I TATTTACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 11 12 19425 CASAVA_Build 5 45032692 4I ATGTAGAATA ----/AATG AACAGCAGGG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AATG 0 1 19426 CASAVA_Build 5 45036762 1D GCTTTGCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 10 9 19427 CASAVA_Build 5 45069111 1I TGAGGGACAC -/T TTGCATGCCA 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 T 2 3 19428 CASAVA_Build 5 45069637 1D AATAAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 43 3 22 19 T 13 12 19429 CASAVA_Build 5 45119126 6D CTATTCAACA TAGTAC/------ TTAGTCCCAC 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 TAGTAC 1 0 19430 CASAVA_Build 5 45126327 1I AAGGAGCTTG -/T TTTTTCATAA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 5 6 19431 CASAVA_Build 5 45141880 1D TTTTGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 11 16 T 15 14 19432 CASAVA_Build 5 45147418 2D TTTATGTATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 11 10 6 AT 6 5 19433 CASAVA_Build 5 45179731 1I ATCATTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 11 12 19434 CASAVA_Build 5 45199338 1D CCTCACACAG T/- TTCCATATCT 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 T 3 2 19435 CASAVA_Build 5 45199739 1D CCCTAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 11 10 19436 CASAVA_Build 5 45204659 1D GGCAAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 9 8 19437 CASAVA_Build 5 45246609 10D TTTGAAGTCT ATAAATTACC/---------- ACTGGTTAGG 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 ATAAATTACC 1 0 19438 CASAVA_Build 5 45259970 2I TGCCAGAAAA --/AT ATATCTCAAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AT 2 3 19439 CASAVA_Build 5 45289038 1D AGGATGATTG C/- TGCATGCCAG 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 C 1 0 19440 CASAVA_Build 5 45291735 1D ATGCAACCTG T/- TTTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 T 7 6 19441 CASAVA_Build 5 45321239 5I CCTCTGCGGC -----/CATTT CTTTTCTCAT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 CATTT 0 1 19442 CASAVA_Build 5 45333844 1I AGAACATCTG -/A AAAAAAAAAC 1464 het 1464 ref 37 19 5 13 A 9 10 19443 CASAVA_Build 5 45338137 6I TGATGGTTTA ------/AGTGGC AGTTTCCCCT 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 AGTGGC 0 1 19444 CASAVA_Build 5 45364117 1D AAAACTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 11 10 19445 CASAVA_Build 5 45404573 2I CATCTTACTA --/TT GTGTTCTGCA 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 T 0 2 19446 CASAVA_Build 5 45404959 1D TTCATGTGGC T/- TTTTTTTTTC 1163 het 1163 ref 45 39 3 3 T 10 9 19447 CASAVA_Build 5 45410629 2D AATACTATGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2743 hom 27 7 14 6 AT 7 6 19448 CASAVA_Build 5 45415348 1D AATAAAACAC A/- AATAGCCTGG 3070 het 3070 hom 40 13 23 5 A 3 2 19449 CASAVA_Build 5 45440358 1D CTGAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 13 12 19450 CASAVA_Build 5 45448613 7D TGATCCCCAA GAGGCTG/------- GAACTGGGTG 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 GAGGCTG 1 0 19451 CASAVA_Build 5 45465816 1D CAAAGATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 T 11 10 19452 CASAVA_Build 5 45517831 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 37 15 21 2 A 8 7 19453 CASAVA_Build 5 45546751 1D TTGTTGGTGT C/- CATATCCAGT 3070 het 3070 ref 62 32 26 4 C 2 1 19454 CASAVA_Build 5 45551018 8I GCTGATGTTA --------/AAATATGT AAATATGTGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 AAATATGT 1 2 19455 CASAVA_Build 5 45552753 2I ATATTATAGA --/TG TGTTAACTTA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 TG 1 2 19456 CASAVA_Build 5 45563226 3D ATACCATGTT ATC/--- ATCAGCTTAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 ATC 2 1 19457 CASAVA_Build 5 45573262 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 9 8 19458 CASAVA_Build 5 45573893 1D AATAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 47 1 42 4 A 13 12 19459 CASAVA_Build 5 45576186 1D ATTTTACTGA T/- TTTTTTTTTT 2226 het 2226 ref 23 11 7 5 T 15 14 19460 CASAVA_Build 5 45594007 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 G 1 0 19461 CASAVA_Build 5 45597458 1D GAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2719 hom 35 12 17 7 A 12 11 19462 CASAVA_Build 5 45599605 2D TATTTAATGA AT/-- AGTCATCATA 3070 het 3070 hom 49 21 22 8 AT 1 0 19463 CASAVA_Build 5 45603074 1D TTTTCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 11 10 19464 CASAVA_Build 5 45604036 2D AAGAGTATTT TC/-- TCTTTCTTGA 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 TC 2 1 19465 CASAVA_Build 5 45609349 1D GAAAATTGTT A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 7 6 19466 CASAVA_Build 5 45628190 7D ATGTGTAAAT GATTAAA/------- GATATTTGGA 3070 het 3070 ref 39 17 18 9 GATTAAA 1 0 19467 CASAVA_Build 5 45629072 4D CACGCACGCG CACA/---- CACACACACA 1123 het 1123 ref 32 15 7 12 CA 11 9 19468 CASAVA_Build 5 45646917 1D AATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2606 hom 28 9 10 9 T 13 12 19469 CASAVA_Build 5 45650831 1I AACCACAGAG -/A AAAAAAAAAA 1779 het 1779 ref 37 21 5 11 A 13 14 19470 CASAVA_Build 5 45653995 1D CATGTTATAA G/- CAATCAATAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 G 1 0 19471 CASAVA_Build 5 45713837 26D TTAAACACAT ACACACACACATACACACACACACAC/-------------------------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 11 16 14 ACACACACACATACACACACACACAC 1 0 19472 CASAVA_Build 5 45719532 1I ATGTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 781 het 781 ref 46 27 4 15 T 12 13 19473 CASAVA_Build 5 45722862 2D AGTTAATACT AG/-- AGTTCTTAAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 AG 2 1 19474 CASAVA_Build 5 45747943 1D ATTGGCCTTT C/- CCCCCCTGGA 3070 het 3070 ref 39 17 18 6 C 7 6 19475 CASAVA_Build 5 45804334 1D TATGGGGGGG A/- AAACAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 A 4 3 19476 CASAVA_Build 5 45820287 1D CCTCCTCGGG A/- AAAAAAAAAA 2783 het 2783 ref 26 13 8 5 A 13 12 19477 CASAVA_Build 5 45829512 1D TTATACACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 12 11 19478 CASAVA_Build 5 45832441 2D TCACAAACCC CA/-- GAGTCTCTGA 3070 het 3070 ref 46 20 20 9 CA 1 0 19479 CASAVA_Build 5 45841311 10D GTTTTCTCTG TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 22 12 19480 CASAVA_Build 5 45842748 1D GGATAAACGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1870 hom 30 10 12 8 A 17 16 19481 CASAVA_Build 5 45876471 1I TTTTTTTCAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 T 7 8 19482 CASAVA_Build 5 45880021 1I CAAAATCAAA -/G AAGAGGAAGA 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 G 0 1 19483 CASAVA_Build 5 45892328 1I TGAGTATGGG -/T GGCGCAGAAC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 0 1 19484 CASAVA_Build 5 45903975 1I TCTTGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 11 12 19485 CASAVA_Build 5 45917211 3D TAACATTAGG TAT/--- ATCGCCCAAT 1739 het 995 hom 7 3 4 0 TAT 1 0 19486 CASAVA_Build 5 45924176 1D CAAAAGCAAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 T 9 8 19487 CASAVA_Build 5 45950446 1I TTATGTGAAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 28 19 7 2 T 7 8 19488 CASAVA_Build 5 45957104 1D TCTGAAGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 10 9 19489 CASAVA_Build 5 45957626 1D AGATATTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 9 8 19490 CASAVA_Build 5 45986172 2I GTTTGGAAAC --/AT TGCCTTTGTC 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 AT 0 1 19491 CASAVA_Build 5 45987587 3D ATGAGGCCTT TGA/--- TGATGAAGTA 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 TGA 3 2 19492 CASAVA_Build 5 46007798 2I TTTGGAAACA --/CT GTTTTTGCAG 3070 het 3070 ref 35 23 7 5 CT 0 1 19493 CASAVA_Build 5 46031161 4I CCTAGGAAAC ----/TGTT TGTGATGTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 TGTT 0 1 19494 CASAVA_Build 5 46032614 1I GGATACACTG -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 7 8 19495 CASAVA_Build 5 46036571 2D TGTGGTCTTC CA/-- CAGTGTTTTG 2304 het 2304 ref 51 41 5 6 CA 2 1 19496 CASAVA_Build 5 46037685 1D ACAATGCAAG T/- TAAACAATCT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 2 1 19497 CASAVA_Build 5 46057278 4D AAAAAGGAAA TATT/---- TATCTTCAGA 3070 het 3070 ref 45 24 20 1 TATT 1 0 19498 CASAVA_Build 5 46076992 1D GGATAAAAAC T/- AGAAAGAAGC 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 1 0 19499 CASAVA_Build 5 46086554 1D TAAAAGTTTC T/- TTTTTGTTGA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 6 5 19500 CASAVA_Build 5 46099327 1I TCGGCTGTGC -/A AAAAAAGCCT 3070 hom 22 het 35 1 31 3 A 6 7 19501 CASAVA_Build 5 46110394 1D TAGAATCTTA T/- TTTTGAAAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 5 4 19502 CASAVA_Build 5 46124270 1I AGGGATGTTT -/G TAAGCCCTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 G 0 1 19503 CASAVA_Build 5 46126098 1I AATTGAATAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 8 9 19504 CASAVA_Build 5 46129731 1D TTGGAAACAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 375 hom 27 3 13 11 T 9 8 19505 CASAVA_Build 5 46131275 1I TATTTGTGAG -/C TATTTGAGGC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 0 1 19506 CASAVA_Build 5 46135156 1I TGCCTCTAGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 A 8 9 19507 CASAVA_Build 5 46149068 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1254 het 989 hom 23 7 11 5 TA 11 10 19508 CASAVA_Build 5 46153456 1I ATTTCTCAAA -/G TATAACCCAT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 G 0 1 19509 CASAVA_Build 5 46177103 1D AACTTCAGAT A/- AAATCTAGAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 4 3 19510 CASAVA_Build 5 46185385 1I TAAAACTTTC -/T TTGGATTCAG 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 T 2 3 19511 CASAVA_Build 5 46188906 1I TGGCGACATT -/G TTTTGGTAGA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 G 0 1 19512 CASAVA_Build 5 46199229 1I ATTCATCTCA -/C AGAGTTAAAC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 C 0 1 19513 CASAVA_Build 5 46200303 1I GGAAACACTG -/T TTTTTGTAGG 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 T 5 6 19514 CASAVA_Build 5 46204988 1D TTGCAATCAC T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 49 28 19 2 T 8 7 19515 CASAVA_Build 5 46215757 1D CAGAATGGAC A/- AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 7 6 19516 CASAVA_Build 5 46228429 1D TTTCAAACTG C/- CTGAATGAAA 3070 het 3070 ref 39 28 10 1 C 2 1 19517 CASAVA_Build 5 46230261 1D CGGTTCCTCA C/- CAGCAACAGA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 C 2 1 19518 CASAVA_Build 5 46239453 1D TGGTTAAAAA G/- GAATTATCTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 G 2 1 19519 CASAVA_Build 5 46241045 1D GAGAAACAGC T/- TTTTGATGTG 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 T 5 4 19520 CASAVA_Build 5 46245944 1D AGCCAATGGT A/- AAAAAAAGCG 2537 het 2537 ref 36 26 7 5 A 8 7 19521 CASAVA_Build 5 46247060 3I CACAGAGTTA ---/AAC AACTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 AAC 1 2 19522 CASAVA_Build 5 46248874 3D AAAAGGAAGT ATC/--- ATCTTCAGAT 3070 het 3070 hom 48 18 25 7 ATC 2 1 19523 CASAVA_Build 5 46257815 1D TGTGAATGGA T/- TTTTTTAGAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 T 7 6 19524 CASAVA_Build 5 46260653 75D TTCTTTTCAT TCAGCAGTTTGGAAACACTCTTTTCTTAGAAACTGAGAAGAGTTATTTAGTAATGCATTGAGGCCTGTGGTGAAA/--------------------------------------------------------------------------- AAGGAAATAT 3070 het 3070 ref 24 29 8 2 TCAGCAGTTTGGAAACACTCTTTTCTTAGAAACTGAGAAGAGTTATTTAGTAATGCATTGAGGCCTGTGGTGAAA 1 0 19525 CASAVA_Build 5 46261601 1D ATCCCAGGAT A/- AAAAACTAGA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 6 5 19526 CASAVA_Build 5 46275761 1I CTTCAATGAG -/T TCCCAAATAT 3070 het 3070 ref 54 28 21 6 T 1 2 19527 CASAVA_Build 5 46286761 1I GCAGTTTCTC -/A AAGAGCTTCC 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 A 2 3 19528 CASAVA_Build 5 46288839 1I CTAGTTTTTA -/T ATCAAGTTAT 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 T 0 1 19529 CASAVA_Build 5 46290129 2I CAGTCAAAAC --/AA AAAGGTTTAA 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 A 3 5 19530 CASAVA_Build 5 46305746 1D TTTTCCACAA G/- AGGCCTCAAT 3070 het 3070 ref 35 22 11 3 G 1 0 19531 CASAVA_Build 5 46314544 3D CTTCTGTCTA CTT/--- CTTCTCTGAA 3070 het 3070 ref 48 25 22 3 CTT 2 1 19532 CASAVA_Build 5 46340960 3D TCTCCAAAAC CTT/--- CTTTCTAGTT 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 CTT 2 1 19533 CASAVA_Build 5 46349162 4D TTTGAGAAAC TGAT/---- TGATACATGA 2775 het 2775 ref 31 19 6 7 TGAT 2 1 19534 CASAVA_Build 5 46382971 3I CTCTTTGAAA ---/CAT AGGTATGTTC 2071 het 2071 ref 63 33 5 25 CAT 0 1 19535 CASAVA_Build 5 46404512 4I TATAAAAATT ----/AGAC AGAAGCATTC 573 het 573 ref 40 27 7 6 AGAC 0 1 19536 CASAVA_Build 5 46408218 1I TTCCCCATCA -/G GCAACGGAGC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 G 1 2 19537 CASAVA_Build 5 46427552 1D ATATCGTCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1772 hom 20 4 11 6 A 10 9 19538 CASAVA_Build 5 46434193 2D TTTTGAAATA CT/-- CTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 CT 2 1 19539 CASAVA_Build 5 46439499 1I ATCTTCTCAT -/A AAAAAACTTG 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 A 6 7 19540 CASAVA_Build 5 49447690 4I TGTGGATCCC ----/ACAA ACAGAGTGTT 1892 het 1892 ref 18 9 4 5 ACAA 0 1 19541 CASAVA_Build 5 49478883 1D ATATTCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1947 hom 29 11 10 8 T 15 14 19542 CASAVA_Build 5 49497098 10I AGATGAGTGC ----------/ACACATCATA ACACATCATA 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 ACACATCATA 1 2 19543 CASAVA_Build 5 49499029 1I ATCTCCTTTT -/C CACCATAGGC 884 het 884 ref 31 26 2 3 C 1 2 19544 CASAVA_Build 5 49511377 1D ACCAAAAAAA G/- GTTCATCACT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 G 2 1 19545 CASAVA_Build 5 49517685 2D TCAACAAAAG AA/-- AGGTTCAATT 3070 het 3070 ref 44 19 14 13 A 3 1 19546 CASAVA_Build 5 49524092 1D82M2I CAAATATCCA CTTGCAGATCCTTCAAAAAGAGTGTTTCAAAACTGTTCAAGGAAAAGAAAGATTCAACTCTGTGAGATGAATGCAACCATCAC--/-TTGCAGATGGTACAAAAAGTGAGATTCAAAACTGCTCAATCCAAAGGTAGTTTCAACCATGTGATATGAATGCACACAGCACAG AAAATTTTTT 2645 het 2645 ref 50 66 6 2 N/A 0 0 19547 CASAVA_Build 5 49524966 1D TCTAAAAAAA G/- CAGTGTTTCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 0 19548 CASAVA_Build 5 49526610 1D TATGTGACGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 25 0 20 6 T 10 9 19549 CASAVA_Build 5 49529785 1D GAAGTTTGCC A/- GAATGGTTCT 2076 het 2076 ref 26 15 5 6 A 1 0 19550 CASAVA_Build 5 49532571 2D TTCTACAAAA AG/-- AGAGTTTCAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 AG 3 2 19551 CASAVA_Build 5 49533584 1I CAGATTCTAC -/A AAAAAGAGAG 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 A 5 6 19552 CASAVA_Build 5 49533981 1D CTGTGATATG A/- AAGCACACAT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 3 2 19553 CASAVA_Build 5 49552925 2D GGTTCAACTC TG/-- TGAGTTGAAT 3070 het 3070 ref 44 25 10 10 TG 2 1 19554 CASAVA_Build 5 49555541 1D ATGCAACCAT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 7 6 19555 CASAVA_Build 5 49555795 3D TGGTGCAGCA CAC/--- CAACATGACA 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 CAC 1 0 19556 CASAVA_Build 5 49558672 1I CAGAATGTTT -/C TGTCTAGTTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 C 0 1 19557 CASAVA_Build 5 49562382 1I CTGCCTCCTC -/A AAGTGGGTCC 2875 het 2875 ref 35 22 10 3 A 2 3 19558 CASAVA_Build 5 49575819 1I TATTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 10 11 19559 CASAVA_Build 5 49577815 2I TTTTTATCTG --/AA GATATCTCCT 3070 hom 39 het 25 0 14 11 A 0 2 19560 CASAVA_Build 5 49586021 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAATGATG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 5 6 19561 CASAVA_Build 5 49589983 5D TGTAGCCTTG TAGTA/----- TAGTTTGAAG 2067 het 2067 ref 21 14 6 3 TAGTA 1 0 19562 CASAVA_Build 5 49600326 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1661 hom 19 7 10 3 A 10 9 19563 CASAVA_Build 5 49605122 1D TTGTTTATTT G/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 G 1 0 19564 CASAVA_Build 5 49606436 1I AAACTGCTGG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 6 7 19565 CASAVA_Build 5 49635212 1I TTTGCCTATT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 A 8 9 19566 CASAVA_Build 5 49645233 1D CGGCATCTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 10 9 19567 CASAVA_Build 5 49649106 2I48M1I TAAATAACAC --GTCTCACTTATAAGTGGAAACTAAACATTGAGAACACGTGGACACAAA-/ATGTCTCACTTATAAGTGGAAACTAAACATTGAGAACACGTGGACACAAAG GAAGGAATAA 3070 het 3070 ref 29 24 13 11 N/A 0 0 19568 CASAVA_Build 5 49660050 1D TGTTAGAAAG A/- AAAAAAGCAG 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 7 6 19569 CASAVA_Build 5 49669049 1I CTTTGATAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 A 9 10 19570 CASAVA_Build 5 49682501 1I TCAGTAATTT -/G TTTTGTTAAT 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 G 0 1 19571 CASAVA_Build 5 49684865 1I ATTATAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 10 11 19572 CASAVA_Build 5 49685892 4I GAATTTTTAC ----/CAAA CATATATTGT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 CAAA 0 1 19573 CASAVA_Build 5 49686193 3D GGGTGTCTCC ATT/--- ATTATTATTT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 ATT 4 3 19574 CASAVA_Build 5 49697862 6I2M2I CAGGAGCAAG ------AA--/TGTTTAAAGC ACCATGGGCT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 N/A 0 0 19575 CASAVA_Build 5 49702831 9D GGGTCCTAAT GTCTGCCAG/--------- ATAAACTTTA 1941 het 1941 ref 21 11 5 5 GTCTGCCAG 1 0 19576 CASAVA_Build 5 49704625 1I GAGTGGCTAT -/G GGAGGCCTTA 1618 het 1618 ref 22 14 6 2 G 2 3 19577 CASAVA_Build 5 49708312 1D GCCTGGACTC T/- CACTTTGACA 3070 het 3033 hom 21 9 8 5 T 1 0 19578 CASAVA_Build 5 49737277 3D AAATGTTTTC TGT/--- TGTTGTTGTT 2791 het 2791 ref 38 23 10 8 TGT 4 3 19579 CASAVA_Build 5 49739841 1D AAGAGATTTT A/- ACACTGATAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 2 1 19580 CASAVA_Build 5 49743259 10D GGTAGAGAGT ACCCTATAAC/---------- ATGTGCCGTA 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 ACCCTATAAC 1 0 19581 CASAVA_Build 5 49744254 1D GTTTTGGTAA C/- TTTTGTCCAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 C 1 0 19582 CASAVA_Build 5 49744531 2D ATACTGGTGT AA/-- AAAAAAAAAG 1438 het 1438 ref 22 10 4 8 A 11 9 19583 CASAVA_Build 5 49751625 1D TGTCGATGGA G/- GGCAGGGGTG 2960 het 2960 ref 19 10 7 3 G 3 2 19584 CASAVA_Build 5 49762181 1D GTAGGGGTTT G/- GGTCCATAAT 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 G 3 2 19585 CASAVA_Build 5 49764942 1I CTTTAAAAAA -/G ATATAATTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 G 0 1 19586 CASAVA_Build 5 49769266 4I GACTAACAAT ----/GTCA GTCAGACATA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 GTCA 1 2 19587 CASAVA_Build 5 49773798 1I TATCGGCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 9 11 2 A 10 11 19588 CASAVA_Build 5 49774106 2I GCACACATGT --/AC ACACACACAC 3070 het 3008 hom 33 10 13 10 AC 8 9 19589 CASAVA_Build 5 49798372 2D ACTTACACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 9 4 A 14 12 19590 CASAVA_Build 5 49799885 1D CTCTATCTCC T/- TTCAGTTCTT 2432 het 2432 ref 14 7 5 2 T 3 2 19591 CASAVA_Build 5 49802855 1I GCCCCCACTG -/T CCAATGAACT 3070 hom 60 het 24 0 18 6 T 0 1 19592 CASAVA_Build 5 49815345 1D GTTAATAAAT A/- AAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 A 6 5 19593 CASAVA_Build 5 49827427 2I TAAAAACCTT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 9 11 19594 CASAVA_Build 5 49841305 1D GATAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1576 hom 17 5 9 3 T 11 10 19595 CASAVA_Build 5 49842094 4D TAAATGAATA AATG/---- AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 AATG 5 4 19596 CASAVA_Build 5 49844789 1I TCCACTATTA -/T TGTGTATTCT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 1 2 19597 CASAVA_Build 5 49846377 1I TAGCAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 12 13 19598 CASAVA_Build 5 49851587 3I TTCTACCCCT ---/ATC ATCTCTTTCT 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 ATC 1 2 19599 CASAVA_Build 5 49867517 1D AAATTCTACA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 118 hom 23 2 13 8 C 9 8 19600 CASAVA_Build 5 49872222 1I TGTGAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 10 11 19601 CASAVA_Build 5 49878849 1I GTATGTCGAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 67 het 29 0 23 6 A 7 8 19602 CASAVA_Build 5 49881186 5I TATAAAGATG -----/CAAAA CAAAGTATGT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 CAAAA 0 1 19603 CASAVA_Build 5 49895253 1D TTCAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 31 1 25 5 T 13 12 19604 CASAVA_Build 5 49896930 3I AGTTAGTGTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TTG 5 6 19605 CASAVA_Build 5 49899546 4I TCTTCTTGTG ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TGTT 2 3 19606 CASAVA_Build 5 49900490 10I GCATCTTCTC ----------/TGTTAGATAT TAACAACAAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 TGTTAGATAT 0 1 19607 CASAVA_Build 5 49901355 1D AAGACACATT A/- AAAAAAAAAA 2617 het 1154 hom 26 8 7 11 A 17 16 19608 CASAVA_Build 5 49901633 1I CTCCATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 A 10 11 19609 CASAVA_Build 5 49905122 1I AGACTCCGTC -/T TCAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 2 19610 CASAVA_Build 5 49918547 2D ATTTAGGGAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 69 het 32 0 24 8 AC 10 9 19611 CASAVA_Build 5 49921885 5I CTGTTATCTC -----/TTCTT TTCTTTCTCC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TTCTT 1 2 19612 CASAVA_Build 5 49927844 1D CGCTATCCCT C/- CCCCCTCCCC 1627 het 1627 ref 14 8 5 1 C 6 5 19613 CASAVA_Build 5 49942116 1D ATCCCTTATA T/- TGAAATGCTT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 T 2 1 19614 CASAVA_Build 5 49953502 4D AAGAAAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 16 12 7 AAAG 3 2 19615 CASAVA_Build 5 49953755 3I ATAAATTACA ---/ACT ACTCTAGGTG 2331 het 2331 ref 44 35 5 4 ACT 1 2 19616 CASAVA_Build 5 49961210 7I TTGGGGTTTG -------/ACAGACT CTGCCCTTCT 3070 hom 23 het 15 0 11 4 ACAGACT 0 1 19617 CASAVA_Build 5 49968767 1D CTCTTTTTTT A/- TACCATTCTC 2148 het 2148 ref 17 9 6 2 A 1 0 19618 CASAVA_Build 5 49970169 1I ATGCAGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1502 hom 29 5 11 13 A 13 14 19619 CASAVA_Build 5 49976030 1D TCACTCATTC A/- AAAACGATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 5 4 19620 CASAVA_Build 5 49984527 1D TCTAGCCCTG T/- TTTTTTTTTT 2720 het 2720 ref 24 14 8 3 T 13 12 19621 CASAVA_Build 5 49988967 1I CCTTTTTTTT -/A AAATATGATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 3 4 19622 CASAVA_Build 5 49989108 3I CCCACGTGCT ---/GCC TCTCAACACA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 GCC 0 1 19623 CASAVA_Build 5 49992226 1D GGCTTAAAAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 8 7 19624 CASAVA_Build 5 50014532 1D GAGTACATTT G/- GGGAGGGCAG 3070 hom 45 het 22 0 16 6 G 4 3 19625 CASAVA_Build 5 50015224 2I TGTGTAGTTA --/TT TTTTTCCTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 5 7 19626 CASAVA_Build 5 50016036 1I AACTAATATG -/A AAATCAGGGG 3070 hom 18 het 12 0 7 5 A 3 4 19627 CASAVA_Build 5 50025165 4D AGAAGGATAT AAAG/---- AAAGTAAAAC 2799 het 2799 ref 20 10 7 4 AAAG 2 1 19628 CASAVA_Build 5 50027279 1D AAATTTTTTT C/- TAATAACAAA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 C 1 0 19629 CASAVA_Build 5 50040566 2D TTGTAGAGAC AG/-- GGGTCTCAAT 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 AG 1 0 19630 CASAVA_Build 5 50052333 8I TAACTGCCAT --------/ACCATCCA ACTCCTGACG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 ACCATCCA 0 1 19631 CASAVA_Build 5 50056669 2D TGTGTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TA 8 7 19632 CASAVA_Build 5 50079785 2D TTAAGCAGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 49 hom 22 1 9 13 TG 9 8 19633 CASAVA_Build 5 50082511 1I TATTTATAAG -/A AAAAATACTT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 5 6 19634 CASAVA_Build 5 50082695 2D TACAGGACTT TA/-- AGTCAAGGTA 3070 hom 78 het 32 0 27 9 TA 1 0 19635 CASAVA_Build 5 50112523 1D TTTTGGACTG T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 103 het 42 0 36 6 T 7 6 19636 CASAVA_Build 5 50120266 3I AAACAAAAAC ---/CTT CTATTCAGTA 3070 hom 119 het 46 0 39 7 CTT 0 1 19637 CASAVA_Build 5 50140616 1D AACATGGTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 A 9 8 19638 CASAVA_Build 5 50168152 1I CCTGCCAGAA -/G CTAGAGAACA 3070 hom 108 het 43 0 34 9 G 0 1 19639 CASAVA_Build 5 50173334 1D ATGCGGGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 12 11 19640 CASAVA_Build 5 50174692 1I GAACACAAAC -/T TTGATGCTTC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 2 3 19641 CASAVA_Build 5 50178144 4D TTGAAAACTC AGTT/---- AGGCTTTAGA 3070 het 3070 ref 39 25 11 5 AGTT 1 0 19642 CASAVA_Build 5 50185672 1I ATTCAAGTCC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 8 19643 CASAVA_Build 5 50187616 1D GCTAGGCACT G/- GGGGGATGCA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 G 6 5 19644 CASAVA_Build 5 50188641 1D GTACCTGTTT C/- CATTTATCTA 3070 hom 120 het 48 0 41 8 C 2 1 19645 CASAVA_Build 5 50199754 1D ATTGGGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 31 1 22 8 A 13 12 19646 CASAVA_Build 5 50206267 1I GACAAATCTT -/A CATAATTTCT 3070 hom 129 het 52 0 42 10 A 0 1 19647 CASAVA_Build 5 50221246 5D ATATCATAAG GAAGA/----- GAAAACACAT 3070 het 3070 hom 42 17 25 2 GAAGA 1 0 19648 CASAVA_Build 5 50226391 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 A 10 9 19649 CASAVA_Build 5 50227430 2I TTTATTTAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 T 10 12 19650 CASAVA_Build 5 50246804 1D AAAAAAAAAA C/- CAATAATCCT 3070 het 3070 hom 50 24 20 7 C 2 1 19651 CASAVA_Build 5 50256469 1I AAAGAACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 27 1 21 5 A 11 12 19652 CASAVA_Build 5 50262613 1D GTTTTAGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 T 10 9 19653 CASAVA_Build 5 50268350 1D TACATTTGGA G/- TACAGTAAAG 3070 hom 123 het 47 0 40 7 G 1 0 19654 CASAVA_Build 5 50274986 1I CTCAGGAGGC -/T TAAGGCAGAA 2790 het 319 hom 9 1 6 2 T 1 2 19655 CASAVA_Build 5 50292143 1I TTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 T 12 13 19656 CASAVA_Build 5 50311142 1D ATAAACTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 11 10 19657 CASAVA_Build 5 50327908 1I AAAATGAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 9 10 19658 CASAVA_Build 5 50330519 2I TCCATAGAAG --/AT ATATATATAT 3070 het 1510 hom 15 5 8 2 AT 8 9 19659 CASAVA_Build 5 50339780 1D CACAAAAATT A/- AGTATTTCCC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 2 1 19660 CASAVA_Build 5 50374232 3D AAAAAAAAAA GAT/--- GATGACAATG 3070 het 3070 hom 43 17 24 3 GAT 2 1 19661 CASAVA_Build 5 50376543 1I CCAAAATTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 T 9 10 19662 CASAVA_Build 5 50378133 1D CATTTTCAAG A/- AATGAAATAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 3 2 19663 CASAVA_Build 5 50390071 3I TGGAGACTGC ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 AAT 4 5 19664 CASAVA_Build 5 50391222 4I AGTATTTTTG ----/TGTT TGTTCTTTCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TGTT 1 2 19665 CASAVA_Build 5 50396185 11I15M1I TAATGACAAA -----------CTTAGCTGAGGTAAG-/CCCTTAATGACCTTAGCTGAGGTAAGA AAAAGCATGT 3070 het 3070 ref 50 33 20 3 N/A 0 0 19666 CASAVA_Build 5 50403132 4I TTTGATTGAC ----/AAAT AAATATTTTA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 AAAT 1 2 19667 CASAVA_Build 5 50407579 1I AGTGGAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 18 19 9 T 10 11 19668 CASAVA_Build 5 50426676 4I TTCCAAAGTC ----/TCTA TCTACCTAGG 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 TCTA 1 2 19669 CASAVA_Build 5 50427974 1I CAAAATAAAG -/T TATTAACAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 19670 CASAVA_Build 5 50434860 1I CAGTTGAGTC -/A AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 6 7 19671 CASAVA_Build 5 50461985 1I CCACCTTCCA -/C CCTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 C 2 3 19672 CASAVA_Build 5 50463730 1D GTGAATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 7 9 5 T 11 10 19673 CASAVA_Build 5 50471919 1D TGATTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 12 11 19674 CASAVA_Build 5 50472611 3D TTCAACATAG TGT/--- TGTTGGAAGT 3070 hom 36 het 20 0 12 8 TGT 2 1 19675 CASAVA_Build 5 50474627 1D TTAAAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 11 10 19676 CASAVA_Build 5 50475568 1I TTTTTCAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 A 11 12 19677 CASAVA_Build 5 50482402 1I GACACTTCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 9 10 19678 CASAVA_Build 5 50496472 3D TATGAAACCG AGA/--- AGGAGTCAGA 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 AGA 1 0 19679 CASAVA_Build 5 50498623 2D ATTCTTAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 43 0 29 15 T 14 12 19680 CASAVA_Build 5 50499756 1D ATTAACAAGC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 9 8 19681 CASAVA_Build 5 50502734 1I TTCAAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 10 11 19682 CASAVA_Build 5 50507039 2I GTACTCTAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 AT 5 6 19683 CASAVA_Build 5 50507094 2D TTATCAATAT TC/-- TGTGAAGCAG 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 TC 1 0 19684 CASAVA_Build 5 50519993 2D CCTGCCACTA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 101 het 46 0 24 24 GT 9 8 19685 CASAVA_Build 5 50529374 1D TCTTTCAAAA T/- TTTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 7 6 19686 CASAVA_Build 5 50530803 1D AGAGTTGGCG T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 7 6 19687 CASAVA_Build 5 50558502 4D AGTTACTCTC TATT/---- TAATATGTAT 3070 het 3070 hom 42 20 20 5 TATT 1 0 19688 CASAVA_Build 5 50561298 1D TATCATGCCA T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 102 het 40 0 35 7 T 7 6 19689 CASAVA_Build 5 50567457 2I ATTCAATGAT --/AG GTTACTTGTT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 AG 0 1 19690 CASAVA_Build 5 50569345 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 20 1 17 2 T 16 15 19691 CASAVA_Build 5 50569618 1D CAAGATTCAG T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 T 8 7 19692 CASAVA_Build 5 50570879 4D ACTTTATTTA ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 28 14 13 2 ATTT 4 3 19693 CASAVA_Build 5 50573003 1I GAATTGTAGC -/A AAGTGGTATA 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 A 2 3 19694 CASAVA_Build 5 50576082 3I TGATTGGCAG ---/ATA CAGGGGCCAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 ATA 0 1 19695 CASAVA_Build 5 50592589 1D AATTGAACAA C/- CCCCCATTTT 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 C 6 5 19696 CASAVA_Build 5 50592842 4D TTATCCATTC ATTT/---- GTCAATGGAC 3070 het 3070 ref 42 24 14 5 ATTT 1 0 19697 CASAVA_Build 5 50597570 2D AAATACATAG TA/-- TACACAGCAT 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 TA 2 1 19698 CASAVA_Build 5 50601194 1I CAACATCTAA -/T TTTTGGGGGG 3070 hom 108 het 46 0 36 10 T 4 5 19699 CASAVA_Build 5 50607635 1D ATGAGTCAAA G/- GGGGAAACAA 3070 hom 118 het 43 0 39 4 G 5 4 19700 CASAVA_Build 5 50633538 1I AAAATCCACG -/A AATCTAACAA 3070 hom 185 het 65 0 62 3 A 2 3 19701 CASAVA_Build 5 50635261 10D GTGCCGCAGT TTTTTATTGA/---------- TTTTTATTGA 3070 hom 51 het 24 0 17 10 TTTTTATTGA 2 1 19702 CASAVA_Build 5 50643153 1I ATGCTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 37 2 25 10 A 10 11 19703 CASAVA_Build 5 50658578 5D TTCTGCAAGG AGCAA/----- AAAGGTTTTC 3070 hom 166 het 57 0 55 4 AGCAA 1 0 19704 CASAVA_Build 5 50662343 1D CCTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1509 het 396 hom 13 1 6 6 T 15 14 19705 CASAVA_Build 5 50701019 3D TCAAAAAGTG GCT/--- GCTAACAGTG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 GCT 2 1 19706 CASAVA_Build 5 50717173 1I AGAGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 45 2 40 3 T 10 11 19707 CASAVA_Build 5 50726036 2I AATAAAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 25 0 17 8 A 11 13 19708 CASAVA_Build 5 50729201 2D TCTTTTTTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2682 het 137 hom 28 2 16 10 A 20 18 19709 CASAVA_Build 5 50732537 2I TTCCCTCCAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 11 13 19710 CASAVA_Build 5 50733519 1I GAAATATGTT -/A GTCTAATAAA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 0 1 19711 CASAVA_Build 5 50742366 2I TCAAAGTGTT --/TA TTTTTTTTTT 1686 het 153 hom 36 1 11 24 TA 0 1 19712 CASAVA_Build 5 50743078 12D TATTAATACT TTTGTGGTTTCC/------------ TTTAACTGAG 3070 hom 77 het 25 0 26 5 TTTGTGGTTTCC 1 0 19713 CASAVA_Build 5 50749059 1I CAAAATTCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 10 19714 CASAVA_Build 5 50750831 1I TCTTTTTATT -/A TGTGCTATTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 0 1 19715 CASAVA_Build 5 50759042 1D AAAACAAATA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 10 9 19716 CASAVA_Build 5 50760123 16D TTGTTGTTTG TTTGTTGTTGTTGGTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TTTGTTGTTGTTGGTT 1 0 19717 CASAVA_Build 5 50766434 1D TTATAATTTA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 8 7 19718 CASAVA_Build 5 50766884 4D TTTTACTTGA ATTG/---- ATTAAGGAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 ATTG 1 0 19719 CASAVA_Build 5 50767122 1I TATTTAGGCA -/G GGGTTAGGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 3 4 19720 CASAVA_Build 5 50770069 4I GAAAGAAAGA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAAG 2 3 19721 CASAVA_Build 5 50785422 1I GAATGGATTT -/G GCCTTTGGGC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 G 1 2 19722 CASAVA_Build 5 50796423 1D TGTGCCACTT A/- AAAAAAAAAA 1154 het 1154 ref 28 18 3 7 A 12 11 19723 CASAVA_Build 5 50799774 1D CTCTTTACCC T/- CAGTCCTCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 1 0 19724 CASAVA_Build 5 50806257 1I TGAAAAAGTG -/T TATTCTTATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 1 2 19725 CASAVA_Build 5 50814498 1I CTTTCCTGTC -/T TGCCACTCTG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 1 2 19726 CASAVA_Build 5 50815250 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 7 A 11 10 19727 CASAVA_Build 5 50815573 1D AAATCTATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 44 0 38 9 A 10 9 19728 CASAVA_Build 5 50819977 1D TGTCACTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 31 0 22 9 T 11 10 19729 CASAVA_Build 5 50820697 1I ATTCAAAATA -/T CATGAAAGCT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 0 1 19730 CASAVA_Build 5 50825885 5D AAGCTCATTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 27 0 22 6 T 16 11 19731 CASAVA_Build 5 50833676 1I GATTGCCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1811 hom 37 4 24 9 T 11 12 19732 CASAVA_Build 5 50838054 1I TGAAAGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 47 1 40 6 T 11 12 19733 CASAVA_Build 5 50866683 35D CAGACGTGTA TATATATGTCATATATATACATATACATATATATG/----------------------------------- TATATATGTC 3070 hom 39 het 18 0 14 11 TATATATGTCATATATATACATATACATATATATG 2 1 19734 CASAVA_Build 5 50866817 2I TATGTATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 42 het 23 0 15 8 TG 8 9 19735 CASAVA_Build 5 50872139 2I TTTTTCTATA --/CT CTCTGGATTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CT 2 3 19736 CASAVA_Build 5 50912638 1D TCAAAAAAAA T/- AAAATAAATA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 1 0 19737 CASAVA_Build 5 50937751 1D TTAATCTTAA T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 8 7 19738 CASAVA_Build 5 50941710 3D ACTAGATTTA TTC/--- TTCATTTTCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTC 2 1 19739 CASAVA_Build 5 50967821 1I TCTTAGGATA -/T TTTTTTTTTT 1143 het 1143 ref 47 34 3 10 T 10 11 19740 CASAVA_Build 5 50984970 1D TACTCAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 10 9 19741 CASAVA_Build 5 51007386 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 12 11 19742 CASAVA_Build 5 51008944 1D ATAACAAGTA T/- TTAGGGATCT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 3 2 19743 CASAVA_Build 5 51013685 2D ACGGAAAGAA AG/-- AGAAGCAGTG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AG 2 1 19744 CASAVA_Build 5 51019830 1D AGCGTTTTAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 9 8 19745 CASAVA_Build 5 51022023 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1838 het 1838 ref 17 8 8 1 A 12 14 19746 CASAVA_Build 5 51022418 1D TACGTTTCTA T/- TAGAAGTGTT 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 2 1 19747 CASAVA_Build 5 51025753 2I AACTAATTCA --/CT CTGAATGAAA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 CT 1 2 19748 CASAVA_Build 5 51028716 2D CCCCCATGTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 14 12 12 AC 10 9 19749 CASAVA_Build 5 51030360 1I GATGCTGAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 T 9 10 19750 CASAVA_Build 5 51032576 1D CATTCAGGGA T/- TTGGCTCCTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 T 3 2 19751 CASAVA_Build 5 51077169 4I ACATTGCAGA ----/AAAG AAAGAAATAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAG 1 2 19752 CASAVA_Build 5 51084411 2I CACATGCGCG --/CA CACACACACA 2247 het 2247 ref 41 23 8 10 CA 8 9 19753 CASAVA_Build 5 51092512 1I TTTCTTTTTT -/A AAACCTTATA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 4 19754 CASAVA_Build 5 51100579 1D CATAATATAC A/- AAAAAATGTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 6 19755 CASAVA_Build 5 51101561 1D TAGTGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 960 hom 33 3 21 9 A 14 13 19756 CASAVA_Build 5 51101737 2I TAAATGTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 34 0 25 9 T 13 15 19757 CASAVA_Build 5 51102953 2I CCTCTCTTTT --/GA AGCTATTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 GA 0 1 19758 CASAVA_Build 5 51106770 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 195 hom 35 2 27 6 A 11 10 19759 CASAVA_Build 5 51109578 2I68M1I CTTGAAACAA --TTTTTTTTCTCCCTCTAGTGTCCCATTTTTACTAAAGACAAATCATGGTAAGATTGATTAGCTTTATT-/TTTTTTTTTTCTCTCTCCAGTTTCCCATTTTTACTAAAGACAAATCACTGTAAGACTGATTTACTTTATTA TATTTGGCCT 893 het 893 ref 42 50 3 6 N/A 0 0 19760 CASAVA_Build 5 51131997 1D TCTACTTTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 9 8 19761 CASAVA_Build 5 51146073 2I ATGTATTAGC --/TG TGTGTGAGGT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TG 3 4 19762 CASAVA_Build 5 51158218 14I GAGGTGACCT --------------/CTCTATACTACATA CTCAATATGA 3070 hom 129 het 49 0 43 8 CTCTATACTACATA 0 1 19763 CASAVA_Build 5 51158821 2D TATATAAATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TA 9 8 19764 CASAVA_Build 5 51176905 1I TATGAAAGAT -/A AAAAAATGGT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 6 7 19765 CASAVA_Build 5 51177647 1D TCACTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 704 hom 50 2 31 17 A 15 14 19766 CASAVA_Build 5 51180525 1D GAGGGGAGAA C/- TTCATTTCCA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 1 0 19767 CASAVA_Build 5 51206374 4I TTTGTGTGTG ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 TTTA 3 4 19768 CASAVA_Build 5 51206574 1D GGGTGTTAGA T/- TTTTGTCAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 5 4 19769 CASAVA_Build 5 51207595 2D AATTTGTGTG TT/-- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 T 10 8 19770 CASAVA_Build 5 51209505 4D ATTAAAGGAG TCTT/---- TCTTTCTGTG 3070 hom 117 het 44 0 40 5 TCTT 2 1 19771 CASAVA_Build 5 51219118 2I GTTGTTTTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 348 hom 28 1 24 3 AT 5 6 19772 CASAVA_Build 5 51221196 6D TTTATATATA CATATT/------ CATATTCATA 3070 hom 45 het 16 0 16 3 CATATT 2 1 19773 CASAVA_Build 5 51232262 1I TGGATTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 10 11 19774 CASAVA_Build 5 51235819 4D TGGTCCCGGC TGCT/---- GGGGAGGCTG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TGCT 1 0 19775 CASAVA_Build 5 51238905 2I TGCTATCTAC --/TA TATATATAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TA 4 5 19776 CASAVA_Build 5 51243704 1I AGTGAGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 832 hom 32 3 20 9 T 11 12 19777 CASAVA_Build 5 51245897 1I AAAAAAAAAA -/C CAAAAAGTAT 3070 het 296 hom 32 1 27 4 C 1 2 19778 CASAVA_Build 5 51247220 1D AGTAGTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 604 hom 30 3 24 3 T 12 11 19779 CASAVA_Build 5 51249736 2I AGGAAGAAAC --/AT ATAAATTAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AT 1 2 19780 CASAVA_Build 5 51253145 1I ATACACCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 11 12 19781 CASAVA_Build 5 51254159 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 8 19782 CASAVA_Build 5 51262774 5I TAGTCAGCCA -----/GGGAG GCTGAGGCAG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 GGGAG 0 1 19783 CASAVA_Build 5 51263699 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 10 11 19784 CASAVA_Build 5 51264129 2I AGTTTAAAAC --/AT AATGGCAAAA 3070 hom 105 het 44 0 35 9 AT 0 1 19785 CASAVA_Build 5 51269734 4I TGGAAAAGTC ----/AAAG AAACAGGCAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAAG 0 1 19786 CASAVA_Build 5 51271264 1D TGAAAAGACA T/- TGCCCTCAAG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 1 19787 CASAVA_Build 5 51272315 1D TGTAATTAAT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 71 het 32 0 25 7 C 11 10 19788 CASAVA_Build 5 51279259 1D GGGATTCCTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 10 9 19789 CASAVA_Build 5 51280075 1I TGACAATTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 8 9 19790 CASAVA_Build 5 51284495 1D ACTGAGAGAA G/- AAGACTTCAG 3070 hom 48 het 17 0 17 1 G 1 0 19791 CASAVA_Build 5 51325639 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 23 3 14 6 A 16 17 19792 CASAVA_Build 5 51339757 2D GGATTTAAAG AC/-- ACAGAACAGC 3070 hom 114 het 45 0 39 9 AC 2 1 19793 CASAVA_Build 5 51342295 1I ATTATGGGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 10 19794 CASAVA_Build 5 51353895 2I TTATATTTAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 10 12 19795 CASAVA_Build 5 51357993 1D CAACAATAAC A/- AAAAAATTGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 6 19796 CASAVA_Build 5 51360378 3D TATTACACTC ATT/--- AGTTTAATAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 ATT 1 0 19797 CASAVA_Build 5 51362056 3D AAAGTTTTCT TTC/--- TTCAATATTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TTC 2 1 19798 CASAVA_Build 5 51364582 1D GAATTGCCCT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 9 8 19799 CASAVA_Build 5 51366472 1D AAAAGAAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 22 0 19 6 T 10 9 19800 CASAVA_Build 5 51367245 4D ATTTATGTTT CTAA/---- CTATCACGCT 3070 hom 105 het 36 0 36 2 CTAA 1 0 19801 CASAVA_Build 5 51368018 2I AAAAAAAAAA --/AC AACAGATCAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AC 0 1 19802 CASAVA_Build 5 51369111 1D AAACTTACAC T/- TTTTAACTGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 5 4 19803 CASAVA_Build 5 51373142 1I AATTAACTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 9 10 19804 CASAVA_Build 5 51378484 1I ATTTGGTGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 8 9 19805 CASAVA_Build 5 51380476 3D ACTTGATAAA TTG/--- TTATGTCACT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TTG 1 0 19806 CASAVA_Build 5 51381911 2D TTTATATATG TA/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 25 het 10 0 8 2 TA 1 0 19807 CASAVA_Build 5 51389708 42D TGTCATGAAG TCTTTGCTGGGTCTTATGTCCAGAATGGTATCTCCTAGGTTA/------------------------------------------ TCTTCCAGGG 3070 hom 27 het 9 0 10 2 TCTTTGCTGGGTCTTATGTCCAGAATGGTATCTCCTAGGTTA 1 0 19808 CASAVA_Build 5 51390289 3D TTGAGTATAA TAT/--- GACAGTTTTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TAT 1 0 19809 CASAVA_Build 5 51391886 4I AGAACAGTTA ----/TCAG TTCTCAAGCT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TCAG 0 1 19810 CASAVA_Build 5 51395523 1I AATTTGTGTC -/A AAATACCAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 3 4 19811 CASAVA_Build 5 51396495 1I TGAAATATAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 8 9 19812 CASAVA_Build 5 51397401 1I CCTGGTATCC -/A CTCTCAGGTA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 0 1 19813 CASAVA_Build 5 51475473 1I GAGAAGACTG -/T GTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 0 1 19814 CASAVA_Build 5 51480622 1D TGCTAACACA T/- TTTCTTAGTT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 T 4 3 19815 CASAVA_Build 5 51495006 1I GCACCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 17 10 A 11 12 19816 CASAVA_Build 5 51511944 1D TATTTTATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 10 9 19817 CASAVA_Build 5 51520183 2D AAAATTTCAC AT/-- GTTCCAAACC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 AT 1 0 19818 CASAVA_Build 5 51528809 3I AAAAAGACAC ---/CTT CTTCTTGTCT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 CTT 2 3 19819 CASAVA_Build 5 51530923 1I AAGTGTTATG -/T ATAAGAACAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 0 1 19820 CASAVA_Build 5 51531269 1I TTTTACAGAA -/C AAGTGAAACT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 C 0 1 19821 CASAVA_Build 5 51545217 1I3M9I TTGTATTTTT -GTA---------/AGTACAGACGGGT TTTCACCATG 2704 hom 18 het 7 0 7 0 N/A 0 0 19822 CASAVA_Build 5 51564744 1I TCTGAGAAGA -/G GGCAAAACCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 2 3 19823 CASAVA_Build 5 51565743 1D GTGTCAAAAT A/- AAAAAATGTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 7 6 19824 CASAVA_Build 5 51650449 1I GAGAATTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 21 1 15 5 T 10 11 19825 CASAVA_Build 5 51716731 15I AGAATTACTG ---------------/TGCACATGATACACT TGCATTGATT 3070 hom 111 het 38 0 38 1 TGCACATGATACACT 0 1 19826 CASAVA_Build 5 51743554 1I GGTGGGTGAA -/T TAACTTGAGG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 1 2 19827 CASAVA_Build 5 51763746 1D TCATTAGTCA T/- TTTTTTATGA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 7 6 19828 CASAVA_Build 5 51797696 1I CTGGCAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 9 19829 CASAVA_Build 5 51813212 1D GGCAGAAAGG A/- AATCACAATT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 3 2 19830 CASAVA_Build 5 51817035 1D AAACAGTTGA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 96 het 37 0 33 5 T 8 7 19831 CASAVA_Build 5 51820839 1I GACTCTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 11 19832 CASAVA_Build 5 51843610 2I CTTGTATTGC --/AT ATCATGAGAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 1 2 19833 CASAVA_Build 5 51854513 1I TATGACTTTC -/A TTTTTGGGTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 1 19834 CASAVA_Build 5 51858483 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 17 0 11 6 A 15 14 19835 CASAVA_Build 5 51869696 1I CAAGCCTAAC -/A AAAAAGAAGA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 5 6 19836 CASAVA_Build 5 51871048 2I TCAATACATC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 24 1 19 4 A 12 14 19837 CASAVA_Build 5 51873728 1I CAAGGTAAGG -/T TTTTTTTTTT 1280 het 1280 ref 36 24 3 9 T 13 14 19838 CASAVA_Build 5 51878416 1I GAACAGCTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 27 0 18 9 A 9 10 19839 CASAVA_Build 5 51882504 10D CTAAAAGAGG AGCAAGATAT/---------- AGCAAGATAT 3070 hom 114 het 47 0 37 12 AGCAAGATAT 2 1 19840 CASAVA_Build 5 51892288 1I TGCCCTGTTA -/C CTAAAAAAAA 2992 het 2992 ref 29 14 12 3 C 1 2 19841 CASAVA_Build 5 51901250 1I TAGGTATTTT -/A TTGTTTTGGT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 0 1 19842 CASAVA_Build 5 51903305 3D GATGAAAATC AGG/--- AGAAGCATGT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AGG 1 0 19843 CASAVA_Build 5 51907194 1D TCCCTGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 34 0 28 6 T 11 10 19844 CASAVA_Build 5 51914307 1D GTTTAATATC T/- CTTCTGCCTA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 T 1 0 19845 CASAVA_Build 5 51919092 1I AATATGTGTC -/T TTTTGTGACT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 4 5 19846 CASAVA_Build 5 51920702 2D AGGTAAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 13 11 19847 CASAVA_Build 5 51928868 1I TAATTAAAAG -/A AAAAAATAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 6 7 19848 CASAVA_Build 5 51933202 6I GGCTAGAAAA ------/ATATAT AACATCTTTC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AT 0 3 19849 CASAVA_Build 5 51959434 1D AATTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 42 0 31 12 T 12 11 19850 CASAVA_Build 5 51961934 1I TTTTGGAGGT -/A AAAAAGACAC 3070 het 3070 ref 57 29 21 7 A 5 6 19851 CASAVA_Build 5 51969866 1D ACAGCTGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 30 1 21 8 A 14 13 19852 CASAVA_Build 5 51972097 1I TTATTTTGAA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 7 8 19853 CASAVA_Build 5 51977693 23D CCCCCATGAT TGTAAGTTTCCTGAGGTCTCCTC/----------------------- AGCTGTGTGG 3070 hom 90 het 27 0 29 5 TGTAAGTTTCCTGAGGTCTCCTC 1 0 19854 CASAVA_Build 5 51979425 3I GGGTGATTTA ---/AAC AACAATTTTT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 AAC 1 2 19855 CASAVA_Build 5 51981243 2D TATATTGGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 29 0 25 4 A 12 10 19856 CASAVA_Build 5 51984153 1I TAAAACTGCA -/T TTCAAGCCAT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 T 2 3 19857 CASAVA_Build 5 52001040 3D GTGGGTTTTT TTC/--- TTCTGTTGTA 3070 hom 89 het 34 0 30 4 TTC 2 1 19858 CASAVA_Build 5 52015898 1I AGCTACAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 9 10 19859 CASAVA_Build 5 52033751 1I TCTCTTTATC -/T TTATTAAATC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 2 3 19860 CASAVA_Build 5 52035819 2D CTTTGGAAAC TG/-- TGGTTCAACA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 TG 2 1 19861 CASAVA_Build 5 52039119 1I AGTTTGTAGT -/A AAATAACCAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 4 19862 CASAVA_Build 5 52040290 1D AGTACTTGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 A 10 9 19863 CASAVA_Build 5 52043347 1I AACAAGATTG -/T TATATAAGAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 1 2 19864 CASAVA_Build 5 52070790 1I GTGATTGTAT -/A AATAAAGATG 3070 hom 148 het 52 0 50 2 A 2 3 19865 CASAVA_Build 5 52077787 1D AAAAGCTAAA G/- AACTGAAGAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 1 0 19866 CASAVA_Build 5 52080874 4I AAAAATCCAT ----/AAAG AAAGAAAATA 3070 hom 99 het 39 0 32 7 AAAG 1 2 19867 CASAVA_Build 5 52088316 1I8M36D GGAATTTCCC -AACTCAGGGATAGGGCTTTCAAGCTCTCCCTGCCCAGAGTTCAC/AAACTCAGG------------------------------------ AGCTTGAGGT 3070 hom 138 het 40 0 44 6 N/A 0 0 19868 CASAVA_Build 5 52091469 1D GGCATGGTGA C/- CCCCCCAATT 3070 hom 92 het 40 0 35 5 C 7 6 19869 CASAVA_Build 5 52098027 1D TTTTTTTTTT C/- CCACATCTCA 3070 hom 13 het 21 1 17 5 C 3 2 19870 CASAVA_Build 5 52100026 9I GTTGAAAGCT ---------/TCTTTAGTC TCTTTCATCA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TCTTTAGTC 0 1 19871 CASAVA_Build 5 52103160 3D CAAATTCACC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 hom 108 het 52 0 37 16 TGT 6 5 19872 CASAVA_Build 5 52109099 1I GAAATTATCT -/A AAAAAATGAT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 A 6 7 19873 CASAVA_Build 5 52110291 3I CTGCTGTTGC ---/TGT TGTTGTTGCT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TGT 2 3 19874 CASAVA_Build 5 52112096 1D ATTAAATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 21 0 10 11 T 13 12 19875 CASAVA_Build 5 52114797 2D TTCCCCACAC AT/-- GTGTTTAGTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AT 1 0 19876 CASAVA_Build 5 52130002 1I AGGAAGATAA -/T TGACACTTAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 1 2 19877 CASAVA_Build 5 52137809 2D AATTTAGTGT AA/-- AAGTGTTACA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 A 4 2 19878 CASAVA_Build 5 52138686 1D GGAAGTGCCT G/- TTTTCTATAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 G 1 0 19879 CASAVA_Build 5 52139005 1I TTTCTGATGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 78 hom 30 1 24 5 A 8 9 19880 CASAVA_Build 5 52141625 1D AGTATCCATG T/- TTTTGTTGTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 5 4 19881 CASAVA_Build 5 52142363 2I AGCTTAATAA --/GT GTTCAAATTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 GT 1 2 19882 CASAVA_Build 5 52144512 4D AAAGCTGTCT GTCA/---- GAGATTGTGT 3070 hom 114 het 40 0 38 3 GTCA 1 0 19883 CASAVA_Build 5 52151965 1I GGCCTGTTGT -/G GGGTGGGGGG 1611 hom 10 het 4 0 4 0 G 3 4 19884 CASAVA_Build 5 52163130 1I AAGAGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 9 10 19885 CASAVA_Build 5 52163359 2I CTTTCACATG --/GT GGACTTTTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 GT 0 1 19886 CASAVA_Build 5 52164276 1I CTATCACTAG -/A AACTTGGAAG 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 2 3 19887 CASAVA_Build 5 52171500 1D TCATGCTTGG A/- ACATGTGTAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 2 1 19888 CASAVA_Build 5 52181237 1I AACTTAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 A 13 14 19889 CASAVA_Build 5 52197258 1I TCCAAATTTG -/C ACAATTGACT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 0 1 19890 CASAVA_Build 5 52202042 1I AATGTAGTTG -/A TAAGATTTGT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 0 1 19891 CASAVA_Build 5 52203321 1D CATTCACTCT A/- AAGAGTTACT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 2 19892 CASAVA_Build 5 52207899 1I15M1I CATTTGTTTG -TTTGTGATTTGACCC-/TTTTGTGATTTGACCCT TTGTCTGTAA 3070 hom 187 het 53 0 63 2 N/A 0 0 19893 CASAVA_Build 5 52208065 1I GTATCAGCCA -/G GGAACTACAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 G 2 3 19894 CASAVA_Build 5 52212716 1I GAAGGTGGAG -/T TGGGAAGGGC 3070 hom 147 het 56 0 51 5 T 1 2 19895 CASAVA_Build 5 52214157 4I TGTAATCCTC ----/TCTT TCTCCTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 TCTT 0 1 19896 CASAVA_Build 5 52220678 27D ATTTCAGTTG CTGCTCTAAACTACTATCCATTTTTTT/--------------------------- TTTTAAATGG 3070 het 3070 ref 20 15 9 3 CTGCTCTAAACTACTATCCATTTTTTT 1 0 19897 CASAVA_Build 5 52221800 1I CATTCCTCAA -/C CCTGGCTCTA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 2 3 19898 CASAVA_Build 5 52222926 1D CTCACTTAGA T/- TGCCAATTCT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 2 1 19899 CASAVA_Build 5 52229172 1I TTCCCTTCCC -/A AAACCAACAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 3 4 19900 CASAVA_Build 5 52229438 1I TTTTCCACAG -/T GTCAAGGAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 19901 CASAVA_Build 5 52233668 2D GAGAAGAGAC TG/-- AGTGTATTTT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 TG 1 0 19902 CASAVA_Build 5 52246185 1I ATAGCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 7 14 7 A 11 12 19903 CASAVA_Build 5 52253785 1D CTAGTCGGGA G/- GCTGAGGCAG 2279 het 775 hom 11 2 6 3 G 2 1 19904 CASAVA_Build 5 52255800 1I GCTTACAGTC -/T TAACACTGGA 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 T 1 2 19905 CASAVA_Build 5 52270875 5I ATTAAGGTAA -----/TAAAT TAATGAATGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TAAAT 0 1 19906 CASAVA_Build 5 52281489 1D TCAGGACTAT C/- CCTTCTTCCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 3 2 19907 CASAVA_Build 5 52283767 2I7M1D17M1I CAGAGTGAGA --CTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAG-/CTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAGA AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 12 0 15 0 N/A 0 0 19908 CASAVA_Build 5 52285546 1I TTATTTTTTT -/C AAACTAATTT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 C 0 1 19909 CASAVA_Build 5 52286748 1I TCCAGGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 767 hom 39 2 30 7 A 10 11 19910 CASAVA_Build 5 52287526 4D GCGTATATAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 72 het 34 0 25 10 AT 10 8 19911 CASAVA_Build 5 52290871 2I AGCTCCGACC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 26 1 21 4 T 16 18 19912 CASAVA_Build 5 52291732 5I ATTAATTGTT -----/AAATC AAGAAAACAT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 AAATC 0 1 19913 CASAVA_Build 5 52297018 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 11 12 19914 CASAVA_Build 5 52297104 2D TAAGTAAGGC AT/-- AGTTATGATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AT 1 0 19915 CASAVA_Build 5 52317581 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 10 10 A 11 10 19916 CASAVA_Build 5 52323586 5I GATAGTCCTT -----/CCACC CCACCCAGGT 3070 hom 115 het 42 0 37 5 CCACC 1 2 19917 CASAVA_Build 5 52325468 2D AGCATAAAAC AA/-- GAGAAACCAT 3070 het 3070 ref 52 25 21 7 A 2 0 19918 CASAVA_Build 5 52340230 2D TCAGCTAGAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 99 het 42 0 33 11 TC 6 5 19919 CASAVA_Build 5 52343324 1I ATATGTGAGT -/G GGGGGGGAGT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 7 8 19920 CASAVA_Build 5 52347059 1D GTTGGTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 40 0 30 10 T 11 10 19921 CASAVA_Build 5 52353796 1I TTTCACTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 36 3 23 10 T 11 12 19922 CASAVA_Build 5 52353807 1I TTTTTTTTTT -/G GGGGGACAGG 3070 hom 8 het 29 1 21 7 G 5 6 19923 CASAVA_Build 5 52358740 4I TAGGTAGATT ----/GATA GATAGAATGA 3070 het 3070 hom 46 14 28 4 GATA 1 2 19924 CASAVA_Build 5 52364856 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 A 10 9 19925 CASAVA_Build 5 52370897 1D TTTGTTTGAG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 8 7 19926 CASAVA_Build 5 52374437 1I GCAGCAGCCT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 7 8 19927 CASAVA_Build 5 52374865 1D AGTCCAAAAA T/- TTTAGTATAT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 4 3 19928 CASAVA_Build 5 52377491 4D AAATTGTCTT AGAG/---- AGGTTGGGCG 3070 het 2983 hom 24 8 15 2 AG 3 1 19929 CASAVA_Build 5 52408970 1I GTTATATTGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 8 9 19930 CASAVA_Build 5 52410285 4D ATAAGATACT TAAA/---- TAAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 37 24 12 4 TAAA 2 1 19931 CASAVA_Build 5 52414608 1D GGTTTTTAGG T/- TTTTTTACTC 3070 het 3070 ref 44 19 20 7 T 7 6 19932 CASAVA_Build 5 52415880 1I TCTTACTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 T 10 11 19933 CASAVA_Build 5 52422659 3D TATTGATGTT AAC/--- AAGAGGGGAA 3070 het 3070 ref 26 13 13 0 AAC 1 0 19934 CASAVA_Build 5 52424691 4D GACTCTGTCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 17 8 8 6 CAAA 4 3 19935 CASAVA_Build 5 52425069 11I GTCCTAGAAG -----------/GTATGTTTAGC GTATGTTTAG 3070 het 3070 hom 45 14 21 10 GTATGTTTAGC 1 2 19936 CASAVA_Build 5 52425569 4I TGTGAAGAGT ----/AAAG AAAACTAAAG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 AAAG 0 1 19937 CASAVA_Build 5 52425784 25I ACATAAAACA -------------------------/ATTATATAAACAACTTTGTAGGACT ATGCCCTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 ATTATATAAACAACTTTGTAGGACT 0 1 19938 CASAVA_Build 5 52425948 2D TTATGTAAAT AA/-- AGTTTCATAT 3070 het 3070 ref 45 22 20 7 A 3 1 19939 CASAVA_Build 5 52427233 3D CAACATGAGA CCC/--- CCCCCCTCCC 3070 het 2460 hom 27 8 10 9 C 9 6 19940 CASAVA_Build 5 52428082 1D AAGGCTAATT A/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 1 0 19941 CASAVA_Build 5 52432197 1D TAGACAGATG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 A 8 7 19942 CASAVA_Build 5 52434539 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2331 hom 25 10 10 5 A 13 14 19943 CASAVA_Build 5 52447377 3D CAGATGTGTT AAG/--- AAGGAGAGCT 3070 het 3070 ref 22 10 8 7 AAG 2 1 19944 CASAVA_Build 5 52453502 4D GAAGAAAAAG ACAA/---- ACAAACAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 18 9 ACAA 3 2 19945 CASAVA_Build 5 52465199 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 632 het 632 ref 29 19 6 5 AT 8 7 19946 CASAVA_Build 5 52465909 2D AGATGGAATC AA/-- AGAGTCTACT 3070 het 3070 hom 32 12 17 5 A 3 1 19947 CASAVA_Build 5 52467717 3I TCAAAAAAAA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 het 190 hom 20 2 16 2 AAC 0 1 19948 CASAVA_Build 5 52469649 1I CAGGAATATT -/G TGAGAGTGGC 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 G 0 1 19949 CASAVA_Build 5 52479777 4I GGAGAAATAA ----/GGTT GGTTGGGATA 3070 het 3070 hom 47 15 22 10 GGTT 1 2 19950 CASAVA_Build 5 52481118 1I GTTTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 1676 het 1676 ref 25 11 7 7 A 15 16 19951 CASAVA_Build 5 52481728 1D AGTCCAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 11 10 19952 CASAVA_Build 5 52482006 1I AGGGAAGAAA -/C TTTTTGTTAA 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 C 0 1 19953 CASAVA_Build 5 52534266 1I GCCCTGCAGG -/C CCATGGGGCC 3070 hom 69 het 24 0 23 1 C 2 3 19954 CASAVA_Build 5 52535105 1I CTTTGGGAGG -/C CGAGGCGGGC 3070 hom 42 het 17 0 12 5 C 1 2 19955 CASAVA_Build 5 52538961 4D AAATAAAAAT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 34 21 9 6 ATAG 3 2 19956 CASAVA_Build 5 52541798 1I TATTTGTGCA -/T TTTTTTAAAT 2078 het 2078 ref 21 10 6 5 T 6 7 19957 CASAVA_Build 5 52543447 1D CTTTTCCCGC T/- TTTTTTTTTT 1139 het 1139 ref 34 26 3 5 T 13 12 19958 CASAVA_Build 5 52543964 3I ATGATCCTTA ---/AAC AACAATTTCC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 AAC 1 2 19959 CASAVA_Build 5 52544592 3I TGTAAAATAT ---/TTC TTATCTGACT 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 TTC 0 1 19960 CASAVA_Build 5 52550265 1I TCTACCCCTC -/A AGTCTCCCCT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 A 1 2 19961 CASAVA_Build 5 52559003 2D CTTCATTCTC AG/-- ATTGGTTTCA 3070 het 1783 hom 15 4 9 3 AG 1 0 19962 CASAVA_Build 5 52566013 1D GATTGGGGGT G/- GGGGGAACAG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 G 6 5 19963 CASAVA_Build 5 52568410 1D GTTTAAGGAA G/- GGTCATGCTT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 G 3 2 19964 CASAVA_Build 5 52577295 1I TAAAAACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 11 12 19965 CASAVA_Build 5 52582756 1D TTTGTTCTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 10 9 19966 CASAVA_Build 5 52589201 1I GCAAATAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 57 29 23 5 T 9 10 19967 CASAVA_Build 5 52620759 16I CTCTGGAGCC ----------------/ATGATGGTTCTTCAGA ATTGTATTAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 ATGATGGTTCTTCAGA 0 1 19968 CASAVA_Build 5 52625196 1D TCAATGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 A 11 10 19969 CASAVA_Build 5 52642393 1I TGTCATGTTG -/T GTACCCTATG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 0 1 19970 CASAVA_Build 5 52649005 1D GTAGGCATTT G/- AATATGAGGG 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 G 1 0 19971 CASAVA_Build 5 52668838 1D AAAGACAGAA T/- TTTTTTGTCA 3070 hom 123 het 50 0 40 11 T 7 6 19972 CASAVA_Build 5 52679895 10I TCTGAATTCT ----------/CCAATATCCC CCAATATCCC 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 CCAATATCCC 1 2 19973 CASAVA_Build 5 52689336 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAAC 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 A 5 6 19974 CASAVA_Build 5 52707236 1D TTGTCATCAC A/- AGGCATTAAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 2 1 19975 CASAVA_Build 5 52708927 3I AAATGATGGC ---/ATT ATAATTACAG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 ATT 0 1 19976 CASAVA_Build 5 52714315 1I TTTATTTGTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 8 9 19977 CASAVA_Build 5 52714772 1D TGAATCTGTC T/- GTGAAAGAAG 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 1 0 19978 CASAVA_Build 5 52717657 2I TAAGCAGAAA --/CT CTGCAGGAAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 CT 1 2 19979 CASAVA_Build 5 52720543 1I GAGTTCATAC -/G GGGCATGCAA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 G 3 4 19980 CASAVA_Build 5 52721104 2D ATTCTTACAC TT/-- TGTCTGAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 T 3 1 19981 CASAVA_Build 5 52724045 1I GTGGGAGACC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 26 9 13 5 A 7 8 19982 CASAVA_Build 5 52730706 1D TCACTCCCCC T/- TATTAGTTTT 3070 het 3070 ref 51 28 20 4 T 2 1 19983 CASAVA_Build 5 52732343 4D ATATTAAAAC TTTA/---- TTTAATTCCA 3070 het 3070 ref 45 22 19 6 TTTA 2 1 19984 CASAVA_Build 5 52738559 4D TGACAATAAG TGAC/---- TGTGCTCCTG 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 TGAC 1 0 19985 CASAVA_Build 5 52739849 1I TTGAAGATAA -/C TTTTGCTAAT 3070 het 3070 hom 59 26 31 2 C 0 1 19986 CASAVA_Build 5 52743842 3I TGCAGAAATT ---/GTA GTAGAAGTCA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 GTA 1 2 19987 CASAVA_Build 5 52749926 4D GACCTTGCCA TAAT/---- TAATTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 23 15 2 TAAT 2 1 19988 CASAVA_Build 5 52750347 1I TGGCAGTCCT -/A AAAAAATGCC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 6 7 19989 CASAVA_Build 5 52753036 1D ACAACAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1882 hom 28 12 11 5 A 15 14 19990 CASAVA_Build 5 52753548 1D CCATGCTCAC A/- TATGGCCACC 3070 het 3070 hom 41 13 23 6 A 1 0 19991 CASAVA_Build 5 52759873 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1853 het 1853 ref 44 37 4 3 T 10 9 19992 CASAVA_Build 5 52760802 1D TAGATGTGTG T/- TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 7 6 19993 CASAVA_Build 5 52765247 1D AATGGGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 12 11 19994 CASAVA_Build 5 52773539 1I CAATCAAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 25 19 8 T 9 10 19995 CASAVA_Build 5 52778230 1D CTGGTCTGAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 20 10 8 2 A 9 8 19996 CASAVA_Build 5 52797092 2I AAAGCTATTT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 2610 hom 24 8 10 6 TA 0 1 19997 CASAVA_Build 5 52797325 1D TTTGTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 14 22 11 T 13 12 19998 CASAVA_Build 5 52824938 8D TACATATATA ATACATAC/-------- ATACATACAT 1836 het 1836 ref 10 7 5 0 ATAC 4 2 19999 CASAVA_Build 5 52836153 1D AATGTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 1259 het 1259 ref 43 33 3 7 T 13 12 20000 CASAVA_Build 5 52846376 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1028 hom 21 3 11 8 A 12 11 20001 CASAVA_Build 5 52847886 2D TCTCTTTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 39 17 13 11 TC 7 6 20002 CASAVA_Build 5 52857780 8I ATTGCTGATC --------/AAACGATA GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 AAACGATA 0 1 20003 CASAVA_Build 5 52862213 5D ACTCCATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1824 hom 28 8 9 12 A 15 10 20004 CASAVA_Build 5 52868461 7D TTGCAACCAC TGCCTCT/------- TGGGTTTAAG 3070 het 3070 ref 33 18 11 6 TGCCTCT 1 0 20005 CASAVA_Build 5 52868893 18I TATGATGATG ------------------/GGACGGAGAAGGACCGTT GGTCTATGTG 3070 hom 93 het 39 0 30 9 GGACGGAGAAGGACCGTT 0 1 20006 CASAVA_Build 5 52868976 1D TGAAGTGTGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 8 7 20007 CASAVA_Build 5 52871859 3I AACTAGCCAC ---/AGA AGATTTGTGA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 AGA 1 2 20008 CASAVA_Build 5 52874769 1D CTCTCTCTCT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 21 16 8 G 1 0 20009 CASAVA_Build 5 52880402 2D GTGCATGCAG CC/-- CCCCCTGTCA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 C 7 5 20010 CASAVA_Build 5 52885625 2D ATCTGTAATT TC/-- TCTTTTCATC 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 TC 2 1 20011 CASAVA_Build 5 52886591 1D TGCTGAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 14 6 A 13 12 20012 CASAVA_Build 5 52890283 1D AAAGACATAA G/- GACATTTAAC 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 G 2 1 20013 CASAVA_Build 5 52893101 1D TTTGTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 664 hom 40 3 24 14 T 13 12 20014 CASAVA_Build 5 52897463 2D GCGAAGTTTT AA/-- AAAGTCAGTA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 5 3 20015 CASAVA_Build 5 52902272 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 951 het 715 hom 20 5 8 7 T 17 16 20016 CASAVA_Build 5 52906431 1D GTCCATCCAG A/- AAATTGTGGC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 4 3 20017 CASAVA_Build 5 52908225 2D ACAAAAAATA CT/-- CAATGTTTGT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 CT 1 0 20018 CASAVA_Build 5 52909070 2D TAGTCTGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1063 hom 38 7 14 19 T 14 12 20019 CASAVA_Build 5 52910778 1I TCAGAATACA -/T TTATCTTTTG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 2 3 20020 CASAVA_Build 5 52916360 6I TGTTTTCTGT ------/TTTTGG TTTTGTTTTT 3070 hom 12 het 20 1 17 2 TTTTGG 0 1 20021 CASAVA_Build 5 52919168 1D CCCTAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 27 2 11 15 T 15 14 20022 CASAVA_Build 5 52920572 1D TAGCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 11 10 20023 CASAVA_Build 5 52923049 1D TGTTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 2977 het 1444 hom 30 13 9 9 G 12 11 20024 CASAVA_Build 5 52929769 2I GCACTTTGGA --/AG AGAGTCTGGC 3070 het 3070 hom 50 23 25 2 AG 2 3 20025 CASAVA_Build 5 52940204 1D CTCATGCATG A/- GAAGCAACTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 1 0 20026 CASAVA_Build 5 52941401 1I GATGGCTTCC -/T TCCTTAGACC 3070 hom 102 het 38 0 32 6 T 1 2 20027 CASAVA_Build 5 52949969 6D AGCAAGCTGG AATTAT/------ AATTATTATT 3070 het 3070 ref 27 17 10 2 AATTAT 2 1 20028 CASAVA_Build 5 52955337 1I GACGGAATCT -/C CCTCTGTCAC 3070 hom 63 het 26 0 22 5 C 2 3 20029 CASAVA_Build 5 52958609 1D TTAGGTCTTA C/- ATTTAAGTCT 1594 het 1594 ref 20 14 4 2 C 1 0 20030 CASAVA_Build 5 52967484 2D CATAAAATAG TT/-- TCTTAGTAGA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 3 1 20031 CASAVA_Build 5 52971669 1D TTTCAGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 11 10 20032 CASAVA_Build 5 52978166 2D ATATTCAGAT AA/-- GTGTGGCTTA 3070 het 3070 ref 49 28 15 8 A 2 0 20033 CASAVA_Build 5 52984020 1D AATTTGAAAT C/- TTAAATGTTT 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 C 1 0 20034 CASAVA_Build 5 52986954 1D GTTTTGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 15 12 19 T 19 18 20035 CASAVA_Build 5 52987083 2D TGTAAATTTC TG/-- TTTGGGTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 TG 1 0 20036 CASAVA_Build 5 52987803 1I TAGAAGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 209 hom 23 2 17 4 T 10 11 20037 CASAVA_Build 5 52990226 1I GTTTGGTCTG -/T TTTTTGACAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 5 6 20038 CASAVA_Build 5 52991593 1D ATTAATAGAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 9 8 20039 CASAVA_Build 5 52998239 4D ATATATTTCT CTGA/---- CTGGGCACAG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 CTGA 1 0 20040 CASAVA_Build 5 53002022 1D ACTTAGTATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 A 10 9 20041 CASAVA_Build 5 53004193 1D GAAACAAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 59 27 25 7 T 10 9 20042 CASAVA_Build 5 53008433 1I TCATGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 10 11 20043 CASAVA_Build 5 53010925 4D GCTTCTTCTC TGTG/---- TATTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 4 TG 2 0 20044 CASAVA_Build 5 53014534 4D TCTCACAGAG GATT/---- GATTATAAGG 3070 hom 112 het 45 0 40 5 GATT 2 1 20045 CASAVA_Build 5 53015475 4I TAAATATAAG ----/TAGA TAGATAGATA 2314 het 2314 ref 34 10 9 15 TAGA 2 3 20046 CASAVA_Build 5 53015535 4D ATTATGAGTT AAAC/---- AAACACATGC 3070 het 3070 hom 32 11 18 7 AAAC 2 1 20047 CASAVA_Build 5 53028226 4D GAATAAAACA GTTT/---- GTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 GTTT 2 1 20048 CASAVA_Build 5 53029862 3I ACAAAATTAC ---/AGT AATCAAAAGT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AGT 0 1 20049 CASAVA_Build 5 53035719 2D GTCTTGACTC TT/-- TATGCAATTT 3070 het 2428 hom 19 5 13 2 T 3 1 20050 CASAVA_Build 5 53039796 1D TTCCAAGCTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 32 het 29 1 27 2 T 9 8 20051 CASAVA_Build 5 53046233 1D ATTTACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 855 hom 43 7 12 25 A 17 16 20052 CASAVA_Build 5 53047224 2D TCTCTTCAGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 11 9 20053 CASAVA_Build 5 53048502 4D GTTAGAAAAA AAAC/---- AAACTAACAG 3070 het 3070 ref 44 27 15 7 AAAC 2 1 20054 CASAVA_Build 5 53048963 1I GGAACAAAAG -/A TATCGAAGAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 0 1 20055 CASAVA_Build 5 53054660 2D AATATTACTC AA/-- AATTAACGTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 4 2 20056 CASAVA_Build 5 53069051 5I GGGGGTGAGG -----/TGAGA GACTAGGGAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 TGAGA 0 1 20057 CASAVA_Build 5 53069199 1D AGGTAAAATG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 9 8 20058 CASAVA_Build 5 53073464 14D TCATAGCCCT AAATGCCTACATCA/-------------- AAATGCCTAC 3070 hom 39 het 17 0 14 4 AAATGCCTACATCA 2 1 20059 CASAVA_Build 5 53075940 1D TCAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 17 0 10 7 A 11 10 20060 CASAVA_Build 5 53092638 1I TTTTCATGTC -/T TTTTTTTTTT 2624 het 2624 ref 31 12 8 11 T 11 12 20061 CASAVA_Build 5 53126943 1D CCTTACTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 18 4 T 10 9 20062 CASAVA_Build 5 53131291 1D ATATCCCCCG C/- ATGGCTTGGC 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 C 1 0 20063 CASAVA_Build 5 53146127 1I GTTTTGCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 35 1 28 6 T 12 13 20064 CASAVA_Build 5 53164723 1D TCTTAGGGGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 8 7 20065 CASAVA_Build 5 53170938 1I GGAAGCCACA -/C CCCCTAGGAA 3070 het 3070 hom 32 9 14 9 C 4 5 20066 CASAVA_Build 5 53172049 6D TCAAAAAACA AAAAAC/------ AAAAAAAAAA 5 het 5 ref 21 10 1 11 AAAAAC 1 0 20067 CASAVA_Build 5 53173507 1I AAATTGAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 7 8 20068 CASAVA_Build 5 53173814 1I AATTATAGGC -/A GTAAGATTGA 3070 hom 71 het 37 0 31 6 A 0 1 20069 CASAVA_Build 5 53173845 1D AGAAATTGCC A/- AAAAAAAAAA 209 het 209 ref 35 6 1 31 A 13 12 20070 CASAVA_Build 5 53174795 3D AATAGCTGCA AAT/--- AATAATAATA 2577 het 1896 hom 17 5 7 5 AAT 7 6 20071 CASAVA_Build 5 53178900 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 9 20072 CASAVA_Build 5 53188168 1D GTCCAAGAGT C/- CAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 51 32 15 5 C 2 1 20073 CASAVA_Build 5 53192223 1D TAAAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 A 11 10 20074 CASAVA_Build 5 53197560 1I GGGTGCCTTG -/T TTTTTTGTGC 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 6 7 20075 CASAVA_Build 5 53204616 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 14 12 T 12 11 20076 CASAVA_Build 5 53204855 1D GATCCACCCA C/- CTCGGCCTCT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 C 2 1 20077 CASAVA_Build 5 53207018 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2270 het 399 hom 16 2 6 8 A 11 12 20078 CASAVA_Build 5 53216801 1I CAGGGAGCAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 12 19 12 T 8 9 20079 CASAVA_Build 5 53219861 3D TATTTATTTA TTT/--- TTTTATTTTT 3070 het 2554 hom 19 7 10 2 T 7 4 20080 CASAVA_Build 5 53223309 3D ATAACTGACC CTT/--- CTTAAGCCTG 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 CTT 2 1 20081 CASAVA_Build 5 53227361 1I TCATTTTTAA -/C CTCATTTTAT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 C 1 2 20082 CASAVA_Build 5 53229865 1D GGTCTTTAAC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 8 7 20083 CASAVA_Build 5 53231002 1I TTGGTCTTTC -/A AAAAAAACTA 2384 het 2384 ref 21 7 5 9 A 7 8 20084 CASAVA_Build 5 53232136 1I AGGGCACAGA -/C AATGAAAAAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 0 1 20085 CASAVA_Build 5 53245737 2I CACACACACT --/CA CTCACACACA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 CA 0 1 20086 CASAVA_Build 5 53248037 2I AACCCCAGTG --/AC ACACAATTTA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 AC 2 3 20087 CASAVA_Build 5 53260758 2D AATAAGTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 37 0 23 16 A 16 14 20088 CASAVA_Build 5 53266021 2D ATAAATTGAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 118 het 45 0 40 6 A 11 9 20089 CASAVA_Build 5 53269413 2D ATGAAATGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 115 het 45 0 34 13 A 12 10 20090 CASAVA_Build 5 53269837 1D ACATTCTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 13 12 20091 CASAVA_Build 5 53277144 5I CAAGACAGAA -----/TAATG TAAGAGAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TAATG 0 1 20092 CASAVA_Build 5 53285683 1D TCTTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 31 1 15 15 A 19 18 20093 CASAVA_Build 5 53303198 1D TGAAGTGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 10 9 20094 CASAVA_Build 5 53304816 1I TTTTAACGTC -/A AAAAAAATAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 7 8 20095 CASAVA_Build 5 53311714 1I TACTTTTTGC -/A TTTCCTTATG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 0 1 20096 CASAVA_Build 5 53313777 1D TTTTTCTTTT C/- TTTTTTTATA 1681 hom 33 het 17 0 11 6 C 1 0 20097 CASAVA_Build 5 53320882 1D GGGAACACTC A/- ATGTTATTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 1 20098 CASAVA_Build 5 53321836 1D AAAAATAGTT A/- AAAAAAAACA 1377 het 1377 ref 20 9 7 4 A 9 8 20099 CASAVA_Build 5 53346113 1D GTCCCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 33 3 19 11 T 13 12 20100 CASAVA_Build 5 53349795 1I CAAATGCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 9 10 20101 CASAVA_Build 5 53354881 7I6M2I AATCTAAACA -------GACACA--/GATCTGTGACAGATC TTTAAAAATA 3070 hom 72 het 27 0 25 6 N/A 0 0 20102 CASAVA_Build 5 53355121 1D TACACATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 33 1 28 5 A 12 11 20103 CASAVA_Build 5 53360099 1D TTAGTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1707 hom 29 8 14 7 A 15 14 20104 CASAVA_Build 5 53374793 1D CACATGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 26 0 18 8 T 11 10 20105 CASAVA_Build 5 53396318 1D TCTAGTGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 A 13 12 20106 CASAVA_Build 5 53403567 3D TCAAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 1548 hom 17 het 12 0 7 6 A 16 13 20107 CASAVA_Build 5 53407073 1I TATATATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 31 1 24 7 T 11 12 20108 CASAVA_Build 5 53408060 1I TAGTATAGCA -/G GTAATTTGAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 G 1 2 20109 CASAVA_Build 5 53408213 1I AGAATCCTGT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 7 8 20110 CASAVA_Build 5 53408379 1I GTAGGAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 10 11 20111 CASAVA_Build 5 53410297 3I CAAAACAATT ---/ATA ATGAGCATCA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 ATA 0 1 20112 CASAVA_Build 5 53422539 5D TTTTATGGCT GAAAG/----- GAATGACTGA 3070 hom 99 het 37 0 32 7 GAAAG 1 0 20113 CASAVA_Build 5 53428884 18D AGCCTGGTGA CAGAGTGAGACTCCATCT/------------------ CAAAAAACAA 3070 hom 69 het 20 0 21 4 CAGAGTGAGACTCCATCT 1 0 20114 CASAVA_Build 5 53429007 4D AGTTTTAGAT TCTC/---- TCTCTATCTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TC 4 2 20115 CASAVA_Build 5 53431587 1I TATCCTGTGA -/C CCCCCCCGTA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 C 7 8 20116 CASAVA_Build 5 53475309 1I TTTATGCTTT -/A AAAAAAAAAG 2856 het 2856 ref 26 14 8 4 A 9 10 20117 CASAVA_Build 5 53484647 2D CAATAAAAGC TT/-- TGTGTCCAAC 3070 het 3070 hom 34 10 18 8 T 3 1 20118 CASAVA_Build 5 53498546 1I GAGATGCATT -/A ACATTACCAG 3070 het 3070 hom 40 16 23 1 A 1 2 20119 CASAVA_Build 5 53499209 1I CCTTGTGCTC -/A ACTGCCCTCT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 1 2 20120 CASAVA_Build 5 53499987 2D TTCTCCCTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 13 11 20121 CASAVA_Build 5 53510261 3D TGAAGAAAAA AAG/--- AAGCTTCTAA 3070 het 3070 hom 37 16 20 4 AAG 2 1 20122 CASAVA_Build 5 53520135 11I ATTAGACATG -----------/GACAAATTAGA GACAGTATTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 GACAAATTAGA 0 1 20123 CASAVA_Build 5 53523077 1D TTACAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 9 8 20124 CASAVA_Build 5 53523852 1I AAGTATAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2837 hom 31 10 13 8 A 12 13 20125 CASAVA_Build 5 53532111 3D AGGCTATAGA AAC/--- AACAAGTGTT 3070 het 3070 hom 19 8 9 3 AAC 2 1 20126 CASAVA_Build 5 53534463 1D AAATCAATAG A/- AAAAAGTCTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 A 6 5 20127 CASAVA_Build 5 53547220 1D GGAGGGGGGG A/- AAAAGGAACT 3070 hom 52 het 21 0 17 4 A 5 4 20128 CASAVA_Build 5 53548788 1D AATGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 34 1 23 10 T 15 14 20129 CASAVA_Build 5 53550573 2D GCTACTGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2710 hom 30 12 11 8 T 14 12 20130 CASAVA_Build 5 53552353 2D TAAGAGACAA TG/-- TGTGTTGTAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TG 3 2 20131 CASAVA_Build 5 53561934 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1842 het 589 hom 15 4 6 5 A 16 15 20132 CASAVA_Build 5 53566572 4D CACAAAAAAC TTCT/---- TTCTTAAATT 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 TTCT 2 1 20133 CASAVA_Build 5 53570819 2D ATGAATGCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 16 13 T 14 12 20134 CASAVA_Build 5 53576387 3D AGGTAGCCAT AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 12 9 20135 CASAVA_Build 5 53577726 1D CTTCACTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 15 11 T 13 12 20136 CASAVA_Build 5 53578810 1D TAAAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 9 8 T 12 11 20137 CASAVA_Build 5 53580310 1I GGTGTTCTTT -/A AATATTTGCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 3 20138 CASAVA_Build 5 53582725 1D TGAAAGCCCC T/- CCCCTAATTC 3044 het 3044 ref 22 12 7 3 T 1 0 20139 CASAVA_Build 5 53597231 1D ATAAAAAATG T/- TAACTATTGT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 2 1 20140 CASAVA_Build 5 53610802 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 27 1 16 10 T 11 10 20141 CASAVA_Build 5 53610843 1I TTTACAAGAA -/T TTTTTTTTTT 1670 het 1670 ref 19 5 5 9 T 10 11 20142 CASAVA_Build 5 53615028 11I CTTTCAAATA -----------/ATTCCAAACGT TCAACGGTGC 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 ATTCCAAACGT 0 1 20143 CASAVA_Build 5 53615169 1D AAACAAACCA G/- GGGCCATGCC 3070 hom 111 het 47 0 36 11 G 4 3 20144 CASAVA_Build 5 53617705 1I AAAAAGTAAG -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 C 0 1 20145 CASAVA_Build 5 53619691 3D ACACAAAGCA GAG/--- GAGAATAACA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 GAG 2 1 20146 CASAVA_Build 5 53621226 1D TTTCAGTGTT A/- AGACTTTCTG 3070 het 3070 hom 49 20 23 8 A 2 1 20147 CASAVA_Build 5 53625416 2D CATATCATCC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 11 9 20148 CASAVA_Build 5 53630481 1I GGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 237 hom 32 1 29 2 T 9 10 20149 CASAVA_Build 5 53654939 7D CCAGACCACA TACAAAG/------- TACAAAGTAT 3070 hom 62 het 28 0 21 10 TACAAAG 2 1 20150 CASAVA_Build 5 53683012 1D CATCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1417 het 926 hom 34 6 8 20 T 19 18 20151 CASAVA_Build 5 53721951 1I TTCAGGACAG -/T TGCTCCCAGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 2 20152 CASAVA_Build 5 53725433 10D TTGGGTCCCA TTTGTTAATT/---------- TTTGCTTTTG 3070 hom 81 het 28 0 28 3 TTTGTTAATT 1 0 20153 CASAVA_Build 5 53730198 1D GAAACCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2641 het 7 hom 22 1 10 11 A 15 14 20154 CASAVA_Build 5 53739503 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 21 1 13 7 A 15 16 20155 CASAVA_Build 5 53744260 1I TTCTGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 10 11 20156 CASAVA_Build 5 53745022 1I AGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 10 11 20157 CASAVA_Build 5 53745483 3D GTGTGTGGCT AAC/--- AACAGAGCAC 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 AAC 2 1 20158 CASAVA_Build 5 53745684 13I TAGACTGTTT -------------/CATCCAAGAGCAG CACCTTACAC 3070 hom 143 het 53 0 47 6 CATCCAAGAGCAG 0 1 20159 CASAVA_Build 5 53745950 2I GATAAGAAAA --/AG AAATCTCAAG 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 AG 0 1 20160 CASAVA_Build 5 53750066 1I AGAACAATGT -/C CCCTTGGAAC 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 C 3 4 20161 CASAVA_Build 5 53754883 1I GATTTATGGT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 7 8 20162 CASAVA_Build 5 53757821 6I AAAAAAAAAA ------/AAAAAG AAAGAAAAGA 2864 het 355 hom 21 6 9 6 AAAAAG 0 1 20163 CASAVA_Build 5 53773743 1I TTTTTCTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 T 9 10 20164 CASAVA_Build 5 53775644 1D CACCTAGTTA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 8 7 20165 CASAVA_Build 5 53781172 1I TTTAATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 10 11 20166 CASAVA_Build 5 53781995 1I TATGTGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 9 13 14 T 14 15 20167 CASAVA_Build 5 53782668 1I GAATACAAAA -/C AAAGGTAAAA 3070 het 3039 hom 23 11 10 2 C 0 1 20168 CASAVA_Build 5 53785623 1D TATTTACAGT A/- AAAAATTAGG 1341 het 1341 ref 12 8 4 0 A 6 5 20169 CASAVA_Build 5 53786023 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2216 het 2216 ref 28 13 8 7 A 13 14 20170 CASAVA_Build 5 53787142 1I TGCTAAATGC -/A ACTGGGAAAC 3070 het 3070 ref 49 23 23 3 A 1 2 20171 CASAVA_Build 5 53789150 1D CTAAAAGTTA T/- TTTGAAAACA 3070 het 3070 ref 38 18 16 6 T 4 3 20172 CASAVA_Build 5 53791289 88D GAGTGCGACT GTCTCAAAAAACAAAACAAAACAAAAATAAAAAACAAGAGAGAGAGAAACATTACAAAGGAGTGGGGAGGGCATAGAGGCACTGCAAA/---------------------------------------------------------------------------------------- GGAAAGCGGA 3048 het 3048 ref 22 30 7 5 GTCTCAAAAAACAAAACAAAACAAAAATAAAAAACAAGAGAGAGAGAAACATTACAAAGGAGTGGGGAGGGCATAGAGGCACTGCAAA 1 0 20173 CASAVA_Build 5 53794485 2D TGAGGCTCTG GA/-- TATGAGGAAG 3070 hom 108 het 42 0 37 7 GA 1 0 20174 CASAVA_Build 5 53794865 4D TTTATTTTAT TTTA/---- TTTTTTTTTG 821 het 406 hom 21 4 5 13 TTTA 1 0 20175 CASAVA_Build 5 53795000 1I GTAGCACAAA -/T TTTTTTTTTT 2553 hom 15 het 8 0 6 2 T 10 11 20176 CASAVA_Build 5 53797322 1D GAGTTCAAGA C/- CAACCTGGCC 2280 het 2280 ref 19 9 5 5 C 2 1 20177 CASAVA_Build 5 53797988 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 36 0 29 8 A 11 10 20178 CASAVA_Build 5 53804357 1D AGGAAATTTT A/- AAAAAAAATT 2741 het 1641 hom 17 6 9 2 A 9 8 20179 CASAVA_Build 5 53805767 4I CCCCGCCAAT ----/TCTG TCTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 TCTG 0 1 20180 CASAVA_Build 5 53809267 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAATA 2653 het 1444 hom 12 3 7 2 A 9 8 20181 CASAVA_Build 5 53813303 1D CACGTGGCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 71 het 27 0 21 7 T 10 9 20182 CASAVA_Build 5 53814362 1D GCCTGGGGGG T/- GTGAGAGCAT 3070 het 3070 hom 43 19 15 9 T 1 0 20183 CASAVA_Build 5 53816400 1D ATATCCTTCA C/- CAACTTTTTG 3070 het 2686 hom 18 6 12 0 C 2 1 20184 CASAVA_Build 5 53830317 4D TTTGATTTGC AGAG/---- AGATAAAAGC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AG 3 1 20185 CASAVA_Build 5 53834402 1I GTCCATCGGG -/C CCCTCACAGT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 3 4 20186 CASAVA_Build 5 53837954 1I TTTAAAAAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 6 7 20187 CASAVA_Build 5 53846812 2D GCCTCAGCAA TC/-- TCTGAAATTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TC 2 1 20188 CASAVA_Build 5 53848163 2D AGACTTAATA AG/-- AGGGGATTAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AG 2 1 20189 CASAVA_Build 5 53848993 2I TGACTGGGTT --/AA GCCATTCTAG 3070 het 3070 hom 34 15 19 0 A 0 2 20190 CASAVA_Build 5 53858946 1D TCGGGGAGCC G/- GGGGGGGGGG 1694 het 1635 hom 22 9 6 8 G 11 10 20191 CASAVA_Build 5 53863895 1I CTATTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 765 het 765 ref 34 6 12 16 T 11 12 20192 CASAVA_Build 5 53871391 1I18M1D CATACTTGGG -AAAAAATGAGTCTTTGGGT/AAAAAAATGAGTCTTTGGG- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 40 19 18 5 N/A 0 0 20193 CASAVA_Build 5 53872424 2I AACATGGGAC --/TG TGGCTTCCTC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 TG 1 2 20194 CASAVA_Build 5 53873149 2D AGGGGTCTTC CT/-- CTGTCTAGCA 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 CT 2 1 20195 CASAVA_Build 5 53875997 1D CAGTTTTTTG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 A 8 7 20196 CASAVA_Build 5 53876998 1D GGTGGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 13 12 20197 CASAVA_Build 5 53910928 1I AGACCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 30 1 23 6 A 10 11 20198 CASAVA_Build 5 53912518 11D GTGTCAGAAG TGGCGTGAAGC/----------- TGGGGTCAGG 3070 hom 102 het 38 0 35 6 TGGCGTGAAGC 1 0 20199 CASAVA_Build 5 53918033 1I ATTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 9 10 20200 CASAVA_Build 5 53922757 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 10 9 20201 CASAVA_Build 5 53923511 1I TTGGAGATTG -/T TTTGTTGCTA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 T 3 4 20202 CASAVA_Build 5 53927826 5I CTTATGATGT -----/AGTCC TATTTGAAAA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 AGTCC 0 1 20203 CASAVA_Build 5 53929517 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 A 7 8 20204 CASAVA_Build 5 53932830 1I CAAATCATGG -/C ATTTTTGTAG 3070 hom 153 het 62 0 51 11 C 0 1 20205 CASAVA_Build 5 53933475 1D TTTTTTAAAG A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 8 7 20206 CASAVA_Build 5 53943852 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 26 1 19 6 T 12 11 20207 CASAVA_Build 5 53947992 1I AAATAGACTA -/T TGCATTATTA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 2 20208 CASAVA_Build 5 53948363 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 314 hom 42 1 32 9 A 10 11 20209 CASAVA_Build 5 53950534 1I TGAAAAGTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 9 10 20210 CASAVA_Build 5 53970819 1I TATAACCAGC -/A ATCTAGGGAC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 1 2 20211 CASAVA_Build 5 53971198 2I TATTTTTCAC --/AT GAGAATCTTG 3070 hom 135 het 50 0 46 4 AT 0 1 20212 CASAVA_Build 5 53971797 1I AAATAGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 13 14 20213 CASAVA_Build 5 53971988 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 71 het 31 0 24 7 A 8 7 20214 CASAVA_Build 5 54019202 2D CCCAGAATGT AG/-- AGTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 15 5 AG 2 1 20215 CASAVA_Build 5 54019391 1I TAAAATCTCC -/A ATTATGGTAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 20216 CASAVA_Build 5 54023048 2I AATACACACA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 AC 7 8 20217 CASAVA_Build 5 54031675 4D TTCCTTTAGG CTTT/---- CTATTTCCCT 3070 hom 93 het 33 0 31 4 CTTT 1 0 20218 CASAVA_Build 5 54032960 1D TGCTACTGGG C/- TGGCACTCAG 3070 het 3070 hom 45 16 25 5 C 1 0 20219 CASAVA_Build 5 54036777 1I AGTTTGAGTT -/A AAAAAAAAAA 2528 het 2528 ref 34 19 9 6 A 10 11 20220 CASAVA_Build 5 54038407 1D AGTGCTTGCA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 94 het 35 0 32 4 T 9 8 20221 CASAVA_Build 5 54042086 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 7 8 20222 CASAVA_Build 5 54063460 1D TCACAATACA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 8 20223 CASAVA_Build 5 54064133 1I TGTTTTGGGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 351 hom 39 1 31 7 T 8 9 20224 CASAVA_Build 5 54067619 1I TGTGGAAAGC -/A AGGCTTTATA 3070 het 3070 hom 49 15 21 13 A 1 2 20225 CASAVA_Build 5 54068536 1I TGATACTGTC -/T TGGTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 1 2 20226 CASAVA_Build 5 54071045 1I ATTTTGGCAG -/C CCCAGGACAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 3 4 20227 CASAVA_Build 5 54081439 1I ACTGCTCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 9 10 20228 CASAVA_Build 5 54108574 2D TACCGGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 1748 het 1748 ref 48 28 5 17 AG 9 8 20229 CASAVA_Build 5 54116284 1D AGTTTTTTTT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 7 20230 CASAVA_Build 5 54117104 6I TATTCTTTCT ------/ATTCTA ATGCTTTAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 ATTCTA 0 1 20231 CASAVA_Build 5 54126573 3I CAAGCTTCAC ---/CAA CAACAACAAC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 CAA 3 4 20232 CASAVA_Build 5 54134684 1I TCAGGAGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 933 hom 34 3 20 11 A 12 13 20233 CASAVA_Build 5 54150653 1D TGCATGTTGT G/- CACACGTACC 3070 hom 39 het 21 0 13 8 G 1 0 20234 CASAVA_Build 5 54150862 1I AGTACTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 49 0 38 11 T 10 11 20235 CASAVA_Build 5 54153354 1I TCTTTCCAAA -/G TGTCTCCTCA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 0 1 20236 CASAVA_Build 5 54161772 2D TAAAGTGGAA GG/-- GGAGACAGTA 3070 hom 117 het 40 0 40 2 G 4 2 20237 CASAVA_Build 5 54164136 1I GCTAGAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 24 1 17 6 A 13 14 20238 CASAVA_Build 5 54169676 1D ATGGATCCGC T/- TATCGATCCA 3070 hom 144 het 54 0 49 6 T 2 1 20239 CASAVA_Build 5 54175268 2I TTCTTTTAAA --/AT TATTTTCAGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 0 1 20240 CASAVA_Build 5 54185273 1D AAATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1465 het 1465 ref 48 33 4 11 T 13 12 20241 CASAVA_Build 5 54185783 3I ATAAAATTCA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 36 het 20 0 13 7 AAT 5 6 20242 CASAVA_Build 5 54198008 1I GTAACACTCA -/C CCCGAGGGTC 3070 hom 65 het 26 0 20 6 C 3 4 20243 CASAVA_Build 5 54211106 1D AACAAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 31 3 21 7 A 15 14 20244 CASAVA_Build 5 54217841 4I GGGCAAGTCC ----/CTTA CTTAGCCTCT 3070 hom 155 het 61 0 48 13 CTTA 1 2 20245 CASAVA_Build 5 54230905 1D TACCTAACTT C/- CCCCCAACTC 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 C 6 5 20246 CASAVA_Build 5 54243860 10I TGAGCTAGAG ----------/GGTCTAAGAA GACTTCACTC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 GGTCTAAGAA 0 1 20247 CASAVA_Build 5 54244062 1I GAGTAACTCA -/C CAAGGCCAGC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 1 2 20248 CASAVA_Build 5 54252735 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 7 8 20249 CASAVA_Build 5 54262398 1I CACTTTTGTT -/G GGGAAAAAAA 3070 hom 104 het 43 0 35 8 G 3 4 20250 CASAVA_Build 5 54270109 1D TTCAAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 26 5 A 11 10 20251 CASAVA_Build 5 54284650 1D75M3I ATTATTCTGA GTGTAAAGTTGCTCCATCCTCCTAAGTAAATGTAAGAACATAGTTTACTCTTTGAACATTACCTCCTATTGTAATA---/-TGTAAAGTTGCTCCATCCTCCTAAGTAAATGTAAGAACATAGTTTACTCTTTGAACATTACCTCCTATTGTAATATTG TTGTCAAAAT 3070 hom 86 het 33 0 31 26 N/A 0 0 20252 CASAVA_Build 5 54286224 1I ACATTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 20253 CASAVA_Build 5 54296174 1D CAGGAAACTT A/- ACAATCACAC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 A 2 1 20254 CASAVA_Build 5 54296982 7D TGGACAGAAA GGAGAGT/------- GGGCCTGGCA 3070 het 3070 ref 51 28 23 5 GGAGAGT 1 0 20255 CASAVA_Build 5 54304327 1I AAGTGGGAGC -/A AAAAAAAAAA 2224 het 2224 ref 36 16 7 13 A 11 12 20256 CASAVA_Build 5 54305367 2D CACAAAAGAA TG/-- TATACTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 TG 1 0 20257 CASAVA_Build 5 54350901 4I TTGGAAAAAG ----/TATT TATATCATAT 3070 het 3070 hom 55 19 31 5 TATT 0 1 20258 CASAVA_Build 5 54351208 1I CACAGTACTG -/T TATCACAGTA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 T 1 2 20259 CASAVA_Build 5 54357224 1I TTTGGTTTTG -/T TTTTTTGTTT 2467 het 2467 ref 26 17 6 3 T 6 7 20260 CASAVA_Build 5 54358003 1I TTGTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 10 11 20261 CASAVA_Build 5 54360137 1I AGGCATTTGC -/T CATTTTCAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 0 1 20262 CASAVA_Build 5 54363603 1I GGAGGCCTTA -/T AAGACTCAAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 0 1 20263 CASAVA_Build 5 54407101 1I CCTCCCCCCA -/C CCCACACAGT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 C 3 4 20264 CASAVA_Build 5 54431795 1I GAGACACAAC -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 7 8 20265 CASAVA_Build 5 54433551 1D AGCAGGGGTC G/- GGGGGGGGCG 1915 het 28 hom 12 1 5 6 G 9 8 20266 CASAVA_Build 5 54434638 1I TGTATTTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 37 het 33 1 25 7 A 9 10 20267 CASAVA_Build 5 54470318 1D AGGATGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2433 hom 27 6 11 10 A 13 12 20268 CASAVA_Build 5 54485205 1I GTGGACTGAA -/G GGTTTAGTCT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 G 2 3 20269 CASAVA_Build 5 54505278 1I CGTTTTCAGA -/C AGGCAAGAAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 C 0 1 20270 CASAVA_Build 5 54506102 1I TCCAGTAAAT -/C CTTTCAGCAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 1 2 20271 CASAVA_Build 5 54507679 1I ATGCGATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1111 hom 41 3 35 3 T 10 11 20272 CASAVA_Build 5 54507879 2D ACGTGCACAC AT/-- AGAGTCTGGC 3070 hom 102 het 37 0 30 9 AT 1 0 20273 CASAVA_Build 5 54509165 2I TCTGTGTGCC --/CT GTTGCCAGTA 3070 hom 108 het 44 0 36 8 CT 0 1 20274 CASAVA_Build 5 54516192 4I TCAAAAAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAAT 2 3 20275 CASAVA_Build 5 54519153 1I TATCAGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 38 3 25 10 A 13 14 20276 CASAVA_Build 5 54521273 4I CATAAATACT ----/ATTA ATTAGAAGAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 ATTA 1 2 20277 CASAVA_Build 5 54525703 3D ACTCCATCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 1137 het 45 hom 20 1 5 14 A 23 20 20278 CASAVA_Build 5 54526117 3D CTATTTTGAA AAT/--- AATAATAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AAT 3 2 20279 CASAVA_Build 5 54527655 1D AATTTTTGTG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 64 het 26 0 21 6 T 8 7 20280 CASAVA_Build 5 54528542 2I ACAGCCTGGC --/CA CATGGTGAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 CA 1 2 20281 CASAVA_Build 5 54531455 1D TTATTAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 10 9 20282 CASAVA_Build 5 54550068 1D CAAGATTTTT G/- TGTTTTGTTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 1 0 20283 CASAVA_Build 5 54552860 1I ATCAATTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 406 hom 44 1 32 11 T 9 10 20284 CASAVA_Build 5 54567415 1I CGCCACCGCG -/C CTGGCTAATT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 1 2 20285 CASAVA_Build 5 54592113 27I ATGGCACCCG ---------------------------/GCCTGGGGTGTAACATTTTTTAAAATA GCTTTATTGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 GCCTGGGGTGTAACATTTTTTAAAATA 0 1 20286 CASAVA_Build 5 54595372 1I AGTCAGTTGG -/C CCAGAGGGGG 928 hom 4 het 5 0 3 2 C 2 3 20287 CASAVA_Build 5 54597256 1I AACTAGCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1433 hom 36 4 22 10 A 15 16 20288 CASAVA_Build 5 54599533 3D TTTCAATATT TTA/--- TTATGTTTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTA 2 1 20289 CASAVA_Build 5 54680771 1D TTAAAGACTC T/- TTTTTTTTTT 1308 het 1308 ref 32 14 6 12 T 17 16 20290 CASAVA_Build 5 54686256 1I GAGGGCCTGG -/C CCAAGGCTGC 3070 hom 75 het 28 0 24 4 C 2 3 20291 CASAVA_Build 5 54729873 4D ACGAAGTTAT TTAG/---- TTAGTTAATA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TTAG 2 1 20292 CASAVA_Build 5 54730063 2D TGTGGATATC TT/-- TTCCAAAACA 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 T 4 2 20293 CASAVA_Build 5 54736383 1D CTCTGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 37 2 27 8 T 12 11 20294 CASAVA_Build 5 54742083 6I ATTCTGACAT ------/TTTAAA TTTATTCTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TTTAAA 0 1 20295 CASAVA_Build 5 54745016 4I TTTTGTACAG ----/TAAC TACCTTTGTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAAC 0 1 20296 CASAVA_Build 5 54749819 1I ACACCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 18 2 16 0 A 13 14 20297 CASAVA_Build 5 54751446 2I TCCTCAACTC --/TG TCCCCACCAC 3070 hom 143 het 52 0 48 4 TG 0 1 20298 CASAVA_Build 5 54752430 1I TTTAAAATAA -/T TTTATGGTGT 3070 hom 126 het 51 0 42 9 T 3 4 20299 CASAVA_Build 5 54757377 1I ATTTTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 312 hom 30 1 21 8 T 10 11 20300 CASAVA_Build 5 54758158 3D AGCTAATTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 5 T 15 12 20301 CASAVA_Build 5 54758673 3D TGCTCTCATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 30 1 27 3 A 17 14 20302 CASAVA_Build 5 54760860 1I AAGTGCCCCT -/G GGTACTTGCT 3070 hom 127 het 53 0 42 11 G 2 3 20303 CASAVA_Build 5 54763134 3I GGAATAAATT ---/AAG AAAGGAATAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AAG 0 1 20304 CASAVA_Build 5 54764254 3I ATCAAAAAGA ---/TAT TATGCCACGA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 TAT 1 2 20305 CASAVA_Build 5 54764386 1D TTCATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 650 hom 53 4 28 21 A 15 14 20306 CASAVA_Build 5 54767000 1D GATCACCTGG T/- AACAGGGAGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 0 20307 CASAVA_Build 5 54769041 4I AGGAGTTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 TTTG 2 3 20308 CASAVA_Build 5 54769789 3D TGTTCTCCTG AAT/--- AATCAAATAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 AAT 2 1 20309 CASAVA_Build 5 54775456 2D TTTAACAAAC AG/-- ATCATAATAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 AG 1 0 20310 CASAVA_Build 5 54775805 1I TAGCAGGGAT -/C TACAGGCTTG 3070 hom 66 het 24 0 23 2 C 0 1 20311 CASAVA_Build 5 54779172 2I GAAAAGTCAC --/AT GTCTCTGCAG 3070 hom 132 het 48 0 44 4 AT 0 1 20312 CASAVA_Build 5 54784613 1D TTCAATGTGG T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 7 6 20313 CASAVA_Build 5 54798403 4D CTAAAAAAAT CAAA/---- CAAACAAAGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 CAAA 3 2 20314 CASAVA_Build 5 54803544 1I TTATCTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 86 het 34 0 27 7 A 9 10 20315 CASAVA_Build 5 54804328 18D GGAGGAAGAG GAAGAAGAGGAAGAGGAA/------------------ GAAGAAGAGG 3070 hom 83 het 32 0 27 9 GAAGAAGAGGAAGAGGAA 2 1 20316 CASAVA_Build 5 54805409 1D ATACCTGGCC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 53 het 21 0 14 7 T 9 8 20317 CASAVA_Build 5 54808636 1D AAAAAAAAAA T/- AATAAACTAG 3070 het 1254 hom 36 4 29 3 T 1 0 20318 CASAVA_Build 5 54811222 1D GGTCCCTGAA C/- CGGGTGAAAT 3070 hom 149 het 55 0 48 7 C 2 1 20319 CASAVA_Build 5 54817177 1D CAGGTATATG A/- AAAATGAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 5 4 20320 CASAVA_Build 5 54823501 1I62M1D GAAAATGATA -AAACCACAAGTATATATTCAGTAATAAAAATAGAAAGAAAAAGCCTTTTGTTTTCCAAAGACA/GAAACCACAAGTATATATTCAGTAATAAAAATAGAAAGAAAAAGCCTTTTGTTTTCCAAAGAC- AACAAACACC 3070 hom 30 het 17 0 12 16 N/A 0 0 20321 CASAVA_Build 5 54823633 1I ACCAAAATAA -/T TTTCAGTTGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 3 4 20322 CASAVA_Build 5 54829989 4D TACATATAGA TGTG/---- TGTGTATCTA 3070 hom 161 het 62 0 54 8 TG 4 2 20323 CASAVA_Build 5 54830549 2D TAGAAGCACT GA/-- GCTCTCAGCA 3070 hom 88 het 32 0 24 9 GA 1 0 20324 CASAVA_Build 5 54831274 1I CTCAAAAAAA -/T AAATAAATAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 0 1 20325 CASAVA_Build 5 54831663 2D TCTCTAAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 2056 het 18 hom 19 1 7 11 T 20 18 20326 CASAVA_Build 5 54832235 2D TAGCAGGGAG AC/-- ACACAATCCA 3070 hom 99 het 35 0 33 3 AC 3 2 20327 CASAVA_Build 5 54833057 1D GATCTATGAT G/- ATTTCCTTAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 G 1 0 20328 CASAVA_Build 5 54836932 1I TAATCCCAAC -/A ACTTTGGAAG 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 1 2 20329 CASAVA_Build 5 54837033 1I ATACACACGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 564 hom 31 2 23 6 A 11 12 20330 CASAVA_Build 5 54842334 1D TAGTCAAGTA T/- ATCTGGCTGG 3070 hom 111 het 46 0 38 9 T 1 0 20331 CASAVA_Build 5 54845975 1D ACCTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 29 2 21 6 A 15 14 20332 CASAVA_Build 5 54852937 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2948 hom 32 het 13 0 9 5 A 16 14 20333 CASAVA_Build 5 54859435 1I ACTACTCACA -/G GAACAGCTTT 3070 hom 114 het 46 0 38 8 G 1 2 20334 CASAVA_Build 5 54861352 4I GTTAGATTAT ----/ATCA ATCACATCGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 ATCA 1 2 20335 CASAVA_Build 5 54867946 2I ATAACATTAA --/AC ACAGAGTCTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AC 1 2 20336 CASAVA_Build 5 54869812 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 4 A 17 15 20337 CASAVA_Build 5 54870826 1D ACGGTGGCTC A/- ACGCCTGTAA 3070 het 4 hom 19 1 15 3 A 2 1 20338 CASAVA_Build 5 54882810 1I AATAGATGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 73 het 32 0 25 7 A 9 10 20339 CASAVA_Build 5 54884816 1D TGTTGATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 11 10 20340 CASAVA_Build 5 54890777 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 12 11 20341 CASAVA_Build 5 54904463 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 13 14 20342 CASAVA_Build 5 54910879 1D TCTACACACT A/- AAATAATTTG 3070 hom 87 het 39 0 30 10 A 4 3 20343 CASAVA_Build 5 54921954 1D TGTATTTCTG T/- TGGGGGTTTG 3070 hom 96 het 37 0 33 7 T 2 1 20344 CASAVA_Build 5 54922671 1I TAGGATAACT -/C CCCCCTTTCT 3070 hom 96 het 35 0 31 4 C 5 6 20345 CASAVA_Build 5 54928787 1I CCTATGTACA -/G GGGGGAATGC 3070 hom 103 het 40 0 35 5 G 5 6 20346 CASAVA_Build 5 54938521 1I CAAACAATTA -/T GCCAGGCGTG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 T 0 1 20347 CASAVA_Build 5 54940172 9D AAGGCATGTA CATTGTTTT/--------- CATTGTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 1 CATTGTTTT 2 1 20348 CASAVA_Build 5 54954987 1D CACAGCTGTG C/- CCACATCAAG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 3 2 20349 CASAVA_Build 5 54959001 4D AAAGGATATT AAAG/---- AAAGCCATCT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 AAAG 2 1 20350 CASAVA_Build 5 54961527 1D CCACAGAACT C/- AGTGAACCAA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 1 0 20351 CASAVA_Build 5 54975555 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 TTA 1 0 20352 CASAVA_Build 5 54979071 4I AAGAGAAAAC ----/AATT AAGAATCAAG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AATT 0 1 20353 CASAVA_Build 5 54980703 1D TGCTCAGCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 43 het 34 1 28 5 A 10 9 20354 CASAVA_Build 5 54981087 1I GAAAAAAAAC -/A AAAACACTCT 3070 hom 94 het 38 0 34 5 A 4 5 20355 CASAVA_Build 5 54981412 1D ATCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAG 829 het 829 ref 35 27 3 5 A 10 9 20356 CASAVA_Build 5 54983559 3D AAAAAAAAAC ACA/--- CACACACAAC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 ACA 1 0 20357 CASAVA_Build 5 54984347 9D AGATGACAAA AAACAAAAC/--------- AAAACAAAAC 869 het 297 hom 25 4 6 17 AAACAAAAC 1 0 20358 CASAVA_Build 5 54985619 2I CCATTCTCAT --/TG TGTTTCTAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TG 1 2 20359 CASAVA_Build 5 54986843 5I TATCACTATA -----/TAAAG TAAACTGACT 3070 hom 93 het 41 0 32 10 TAAAG 0 1 20360 CASAVA_Build 5 54988446 2I TATAAAAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 10 12 20361 CASAVA_Build 5 54990875 2D CATTTATACG TA/-- TATGTCTGTG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TA 2 1 20362 CASAVA_Build 5 54992532 1D TACTATTCTG T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 39 het 28 0 14 15 T 7 6 20363 CASAVA_Build 5 54992564 1D68M1D TTTTTATAAT AAAAACTGCATATTTGTATATTAGAACTACTGTTACAGAAAAAATGTTAAGATCCCGAGGAAAAAGTCCA/-AAAACTGCATATTTGTATATTAGAACTACTGTTACAGAAAAAATGTTAAGATCCCGAGGAAAAAGTCC- AAAAAAAAGA 3070 hom 27 het 25 0 10 24 N/A 0 0 20364 CASAVA_Build 5 54995726 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 10 20365 CASAVA_Build 5 54998184 1D CACTATCAAG A/- ATAACTGTTT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 2 1 20366 CASAVA_Build 5 54998814 1I37M1I TTATTTAGGG -TTTTTTTTGCTGCATTTGACAATATCTCCAAAAAAAA-/TTTTTTTTTGCTGCATTTGACAATATCTCCAAAAAAAAC CTGATTAATT 3070 hom 79 het 28 0 27 14 N/A 0 0 20367 CASAVA_Build 5 54999155 1I GCACAGGATA -/T TGTTTTGATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 2 20368 CASAVA_Build 5 54999776 1D AAAATAAAAG A/- AAAAACAGTT 3070 het 178 hom 25 1 21 3 A 6 5 20369 CASAVA_Build 5 55001784 3D TCTCCTGACC ATG/--- TCATGATCCA 1243 hom 27 het 11 0 6 5 ATG 1 0 20370 CASAVA_Build 5 55001952 2I CTAAAAAAGC --/AA AAGTTTTAAA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 A 2 4 20371 CASAVA_Build 5 55002775 2D CCAAATTACT TA/-- TATATATTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TA 4 3 20372 CASAVA_Build 5 55004500 1D TTAAGCACAC T/- TTTTTTGTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 7 6 20373 CASAVA_Build 5 55005209 1I TTGGTTCCAC -/A TAACTCCTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 0 1 20374 CASAVA_Build 5 55005295 4D TAATCTAATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 19 0 13 6 T 20 16 20375 CASAVA_Build 5 55007041 1I GAAAAAATAT -/A AACTATATTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 2 3 20376 CASAVA_Build 5 55008437 1I TAGTTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 10 11 20377 CASAVA_Build 5 55010678 4I50M3D ATTTTATCAA ----GATTATGTCTTTCTAATAATTAAAAATTTCTATTATGTTTTATAGAGTATATA/GATTGATTATGTCTTTCTAATAATTAAAAATTTCTATTATGTTTTATAGAGTAT--- ATATGTAAGT 3070 hom 45 het 15 0 16 9 N/A 0 0 20378 CASAVA_Build 5 55011187 1I TAGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 10 11 20379 CASAVA_Build 5 55012182 1I73M1I CAGCTTCCAG -ATTGTGAGAAATAAATTTCTGTTCTTTATAAATTATCCAGTCTCAAGTATTCCTTACACAGCACCAAATGGAC-/AATTGTGAGAAATAAATTTCTGTTCTTTATAAATTACCCAGTCTCAAGTATTCCTTACACAGCACCAAATGGACT AAGGCACTTA 3070 hom 208 het 37 0 70 5 N/A 0 0 20380 CASAVA_Build 5 55013636 2D14M3D TCAGATGTGG AAAAGAGTCTTCCACTCTC/--AAGAGTCTTCCACT--- CTCCTTGACG 3070 hom 93 het 35 0 32 6 N/A 0 0 20381 CASAVA_Build 5 55013747 9D TTTTCCTTCA GGAAAATAG/--------- GTAATATTTA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 GGAAAATAG 1 0 20382 CASAVA_Build 5 55014361 4I TCAAAAACAG ----/ACAA ACGTGTGTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ACAA 0 1 20383 CASAVA_Build 5 55018007 5I CATATATGTC -----/TTCTT TTCAGAAGTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TTCTT 0 1 20384 CASAVA_Build 5 55018222 1D GATCCCATTT G/- TCAATTTTTC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 G 1 0 20385 CASAVA_Build 5 55020292 3D TAAGCAATTA TTT/--- TTAATACCCC 3070 hom 30 het 11 0 11 1 T 5 2 20386 CASAVA_Build 5 55020573 3D TAAATAAAAA AGC/--- AGAAGTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 5 AGC 1 0 20387 CASAVA_Build 5 55022340 9I TAAATATCAT ---------/TTTACTAGA TGTACTAGAT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TTTACTAGA 0 1 20388 CASAVA_Build 5 55024963 2I CTCCTTTTTA --/AT AGAGGAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 0 1 20389 CASAVA_Build 5 55026738 2I AAATTTTTTT --/TA AATATGCAAT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TA 0 1 20390 CASAVA_Build 5 55029841 1D TTTCCTGCGG A/- AAAAAAACTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 7 20391 CASAVA_Build 5 55031310 1D AATTTTTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 A 10 9 20392 CASAVA_Build 5 55031692 1D TGCGGGGGTC G/- AGGTGGGCAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 1 0 20393 CASAVA_Build 5 55031945 4I TAAAACAAGC ----/AAAA CAAAAAAAAA 2228 hom 30 het 12 0 11 1 A 0 4 20394 CASAVA_Build 5 55034788 1D CAATAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 47 0 40 9 A 10 9 20395 CASAVA_Build 5 55036156 1D TAAAATTTTT A/- TATTGTAGGG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 0 20396 CASAVA_Build 5 55042879 1I CTCTTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 11 12 20397 CASAVA_Build 5 55052144 1D TACCAAACTT A/- ACAGAAATAA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 2 1 20398 CASAVA_Build 5 55053877 1I ATATATAAAG -/A TACAAAACAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 0 1 20399 CASAVA_Build 5 55110479 1I ACTTCGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 425 hom 36 1 25 10 A 12 13 20400 CASAVA_Build 5 55117465 4D TGGTCAGTGT ATTA/---- ATTGTTTCTG 3070 het 3070 hom 62 27 29 11 ATTA 1 0 20401 CASAVA_Build 5 55168841 3D ACTCCATATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 21 1 17 3 A 16 13 20402 CASAVA_Build 5 55170183 1D GGTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 10 9 20403 CASAVA_Build 5 55176343 1I ATGTTACACC -/T TTTGCAGTTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 3 4 20404 CASAVA_Build 5 55177015 17I TTAGGTTAGG -----------------/CTCTTGTAAAATAGTTT CTCTTGAGGG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 CTCTTGTAAAATAGTTT 0 1 20405 CASAVA_Build 5 55186333 1I CCGTCTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 15 1 9 5 A 11 12 20406 CASAVA_Build 5 55198568 3D TCTTAAGACT ATG/--- ATCTTTCCAG 3070 hom 93 het 33 0 31 4 ATG 1 0 20407 CASAVA_Build 5 55204218 4D GAAGGAAGGA AGGG/---- AGGGAGGGAG 1476 het 1476 ref 12 4 4 4 AGGG 5 4 20408 CASAVA_Build 5 55204432 1D CTTCTGACTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 15 15 2 A 9 8 20409 CASAVA_Build 5 55213691 3D GCTACAGCCA ATT/--- ATTAGGTTTG 3070 het 3070 hom 38 17 17 8 ATT 2 1 20410 CASAVA_Build 5 55229253 3D GGGAATGCAG AGA/--- AGAAGAAGAG 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 AGA 4 3 20411 CASAVA_Build 5 55241293 1I TTTGTATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 25 3 17 5 T 14 15 20412 CASAVA_Build 5 55242770 1I TGCACATCTT -/A ACATGGTGGC 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 A 1 2 20413 CASAVA_Build 5 55255178 1I AAAGAAAGAG -/C CCCCTGGATC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 4 5 20414 CASAVA_Build 5 55267069 3I CAGAACTTTT ---/CAG CTATGGAGAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CAG 0 1 20415 CASAVA_Build 5 55288742 1D ACTCGGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1275 het 1275 ref 21 14 3 4 A 15 14 20416 CASAVA_Build 5 55293344 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1328 het 1328 ref 28 16 6 7 A 15 14 20417 CASAVA_Build 5 55299114 1I TTCATGAGAC -/A ATAGGGGAAA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 1 2 20418 CASAVA_Build 5 55310442 1I ATTAGACCTT -/A AAAACAAACA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 4 5 20419 CASAVA_Build 5 55315664 1D AGGGCCAGAT A/- ATAAATATTT 3070 het 3070 hom 42 15 16 12 A 2 1 20420 CASAVA_Build 5 55341364 1D ATGTCAGACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 10 9 20421 CASAVA_Build 5 55344719 1D TTATAATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 29 1 22 7 T 11 10 20422 CASAVA_Build 5 55350034 1D GTGATTCCAA T/- TGGGAGATCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 1 20423 CASAVA_Build 5 55359206 1I ACTTGGGGCC -/A AGGTTGAGGA 3070 hom 96 het 36 0 30 6 A 1 2 20424 CASAVA_Build 5 55375443 28I AGATTCCAGT ----------------------------/AGGCAGGTCAGCGGAGGTTCAGCCAGGA AGGCTGTTTA 3070 hom 84 het 29 0 29 3 AGGCAGGTCAGCGGAGGTTCAGCCAGGA 0 1 20425 CASAVA_Build 5 55380388 1I GTAAAGAAAC -/A AAAAAAGAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 7 20426 CASAVA_Build 5 55399280 1D AGAGTGCAGT G/- GTGCAATCTC 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 G 2 1 20427 CASAVA_Build 5 55400855 3D CTTTCTTTCT TTA/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 TTA 1 0 20428 CASAVA_Build 5 55400966 1D ATTCTCCTGC T/- TTCAGGCTCC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 3 2 20429 CASAVA_Build 5 55407397 3D GAGAATTAAG TGT/--- TGTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 TGT 2 1 20430 CASAVA_Build 5 55409779 2D AGTTTCGCTC TT/-- GTTGCCCAGG 3070 het 2626 hom 30 6 20 4 T 2 0 20431 CASAVA_Build 5 55413507 1I CTTTTCACCA -/C CACTTCTTAG 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 C 1 2 20432 CASAVA_Build 5 55413810 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 12 11 20433 CASAVA_Build 5 55413962 1D TCTTAGCAGC A/- TTTTAGAATG 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 A 1 0 20434 CASAVA_Build 5 55414421 2D GTACTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 1834 het 1430 hom 35 12 8 16 T 18 16 20435 CASAVA_Build 5 55419352 3I TCAAAAAAAA ---/AAG AAGTCCCATT 3070 het 2102 hom 21 7 13 1 AAG 1 2 20436 CASAVA_Build 5 55423604 2I TGGCTTGCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 10 12 20437 CASAVA_Build 5 55426367 1I GAGGGGAAAT -/C CCATTTCTGG 3070 hom 108 het 45 0 35 10 C 2 3 20438 CASAVA_Build 5 55438005 7D CTAGGAAAGC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1362 het 1362 ref 20 9 3 8 T 23 16 20439 CASAVA_Build 5 55441635 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2613 het 2213 hom 19 7 8 4 A 13 12 20440 CASAVA_Build 5 55466165 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2862 hom 20 het 11 0 7 4 A 15 14 20441 CASAVA_Build 5 55468896 1D TAGATTATCT G/- GTCATTGAGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 2 1 20442 CASAVA_Build 5 55469152 1D AAAGTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 11 10 20443 CASAVA_Build 5 55472859 1D AATACAAATA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 8 7 20444 CASAVA_Build 5 55478229 1D CAGAACATGA C/- CTCTCCTTTA 3070 hom 122 het 48 0 39 9 C 2 1 20445 CASAVA_Build 5 55480239 1I TCTCAGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 12 11 T 12 13 20446 CASAVA_Build 5 55482027 1I GCCTCTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 594 hom 26 2 16 8 A 12 13 20447 CASAVA_Build 5 55483410 3I AAAAAAAAAA ---/ATC TCTATATATA 2592 hom 18 het 7 0 7 0 ATC 0 1 20448 CASAVA_Build 5 55483514 2D TATGTATATA TG/-- TATATATGTG 3070 hom 63 het 22 0 21 1 TG 1 0 20449 CASAVA_Build 5 55494257 1I TTTTTGGTCA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 1064 hom 34 6 19 9 T 0 1 20450 CASAVA_Build 5 55536616 1I TGAAAAAGCT -/G GGAAGAGAGT 2170 het 2170 ref 34 20 7 7 G 2 3 20451 CASAVA_Build 5 55554215 1I ATGGCTAACT -/A GAATAAATAG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 0 1 20452 CASAVA_Build 5 55559202 2D CATTGATGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 T 13 11 20453 CASAVA_Build 5 55562563 3D TTTTTATATG TTA/--- TTATTTTAGA 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 TTA 2 1 20454 CASAVA_Build 5 55571401 1I AACAGACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2278 hom 30 8 15 7 T 12 13 20455 CASAVA_Build 5 55577043 1I AACTGTAGAT -/A ATATGACAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 1 2 20456 CASAVA_Build 5 55579987 1I ATAACTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 11 0 A 10 11 20457 CASAVA_Build 5 55592782 5I CCCGAAGGAG -----/ATAAC CTTTCAGAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 ATAAC 0 1 20458 CASAVA_Build 5 55598131 1D CCAGCATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2931 hom 39 16 16 7 T 17 16 20459 CASAVA_Build 5 55598407 1D ACCCTGCTAA T/- TTTTTTTTTG 1981 het 1981 ref 27 14 8 5 T 10 9 20460 CASAVA_Build 5 55602123 3I TACCAGCCCA ---/GAG GAGAAGTAGA 3070 hom 116 het 43 0 39 4 GAG 1 2 20461 CASAVA_Build 5 55609718 4D TGAATGAATG AATT/---- GTTTTCAGAA 3070 het 3070 hom 46 22 19 5 AATT 1 0 20462 CASAVA_Build 5 55611505 1D GCACAAGTTT C/- CCCCCCCCAC 3070 het 1368 hom 29 6 18 5 C 9 8 20463 CASAVA_Build 5 55621547 1I TGGAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2428 het 2428 ref 37 22 8 7 A 10 11 20464 CASAVA_Build 5 55624236 1D CAACATTTTT A/- AAGCATCTGG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 3 2 20465 CASAVA_Build 5 55661221 1D ATTTGTACAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 T 8 7 20466 CASAVA_Build 5 55661805 1I AAAATACCTC -/T TTTTTTTTTT 2080 het 1118 hom 26 5 8 13 T 15 16 20467 CASAVA_Build 5 55662765 1I AAGCCAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 14 14 14 A 12 13 20468 CASAVA_Build 5 55666521 1D CCTGTAAAAT A/- AAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 A 7 6 20469 CASAVA_Build 5 55706713 3I GGAGACTGAG ---/CTC CTGGCACAAC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 CTC 0 1 20470 CASAVA_Build 5 55707101 1I TATTGGGGGG -/A AAAAGCAATC 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 A 4 5 20471 CASAVA_Build 5 55708697 1I AGTAAGCACA -/T GAAAATAGTG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 0 1 20472 CASAVA_Build 5 55710496 1I GAACAAACTG -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 6 7 20473 CASAVA_Build 5 55716373 1I ACCACAAAAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 14 het 23 1 18 4 A 8 9 20474 CASAVA_Build 5 55717114 1I GTGAAGACTG -/A AAAAAATGGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 7 20475 CASAVA_Build 5 55717334 1D CTTCCTCCTG C/- CCCCTCCTCT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 C 5 4 20476 CASAVA_Build 5 55725125 4D AGTCAAATTA TCTC/---- TCTGTGTAGA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 TC 3 1 20477 CASAVA_Build 5 55746107 1I TCTTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 889 hom 25 4 15 6 T 13 14 20478 CASAVA_Build 5 55749523 1D AATAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 T 11 10 20479 CASAVA_Build 5 55754547 4D GAAGAACTGA TGCC/---- TGCCTGCCCA 3070 hom 102 het 36 0 33 4 TGCC 3 2 20480 CASAVA_Build 5 55774078 4D ACAATAAAAA CTAT/---- CTATCTAACT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 CTAT 2 1 20481 CASAVA_Build 5 55775556 4I AGTTGCCTGG ----/AAGC AAGCCTCTCT 3070 hom 107 het 44 0 27 17 AAGC 1 2 20482 CASAVA_Build 5 55776818 4I ACAAATGACA ----/GTTT GTATTGACTA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 GTTT 0 1 20483 CASAVA_Build 5 55795347 3D ACAACAACAT CAA/--- CAACAACAAC 3070 hom 45 het 25 0 16 9 CAA 7 6 20484 CASAVA_Build 5 55827675 1I GCATTGAAAG -/A AAAGGGAAGT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 3 4 20485 CASAVA_Build 5 55837885 20D CTCTAAAAGT CAAGGATTCCTTGACTTAAG/-------------------- CAAGGATTCC 3070 hom 81 het 31 0 27 6 CAAGGATTCCTTGACTTAAG 2 1 20486 CASAVA_Build 5 55838851 2D GCCTGGTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 19 0 19 3 T 13 11 20487 CASAVA_Build 5 55847219 1D ACTTTAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 37 2 23 13 A 14 13 20488 CASAVA_Build 5 55851629 1I AGGCAGTATA -/G GTGGAGAGAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 1 2 20489 CASAVA_Build 5 55859242 3D TTACTGAATG AGA/--- AGAAACTCAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AGA 2 1 20490 CASAVA_Build 5 55862437 1I TGTCATCTGG -/C CCCCATCCTA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 C 4 5 20491 CASAVA_Build 5 55862772 1D TATTTGTTAG T/- TTCTTACTTG 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 T 3 2 20492 CASAVA_Build 5 55867893 1D CCCTTATAGA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 21 2 T 7 6 20493 CASAVA_Build 5 55873380 3I TTAGCTCGGT ---/GTG GTGGTGGTGG 1831 hom 12 het 5 0 5 0 GTG 3 4 20494 CASAVA_Build 5 55873520 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 9 20495 CASAVA_Build 5 55887554 1I ACTCCGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 30 0 26 4 A 12 13 20496 CASAVA_Build 5 55888738 1D AGACTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 34 1 27 7 A 13 12 20497 CASAVA_Build 5 55896346 1I AATGACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 110 hom 32 3 21 8 A 13 14 20498 CASAVA_Build 5 55902125 1I GGCAAGACTC -/A AGTTCCTTTT 3070 het 3070 ref 52 21 21 10 A 1 2 20499 CASAVA_Build 5 55903718 1D TCCCCGCAAG C/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 C 1 0 20500 CASAVA_Build 5 55907247 3D AAAGCAAAAA AAC/--- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 AAC 1 0 20501 CASAVA_Build 5 55909063 2I AAATGAACTC --/AT TGGGCAATAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AT 0 1 20502 CASAVA_Build 5 55910797 1I51M1D TTATAATTAC -ACTGTCTTTAATTAAGAAAGATGTTGGCCTAGCTTACAATCAAAATCAAAAC/AACTGTCTTTAATTAAGAAAGATGTTGGCCTAGCTTACAATCAAAATCAAAA- CCCCCCTTAA 3070 het 3070 ref 34 30 10 9 N/A 0 0 20503 CASAVA_Build 5 55910897 1I23M1D TTGCAAAATA -CCAGTTCAAAAGTGTGATTTTTTA/TCCAGTTCAAAAGTGTGATTTTTT- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 6 N/A 0 0 20504 CASAVA_Build 5 55915022 1I AACACAGGGC -/A AAAACTAATA 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 A 4 5 20505 CASAVA_Build 5 55918911 2D TGTGTGTATC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 40 13 16 11 TA 8 7 20506 CASAVA_Build 5 55919636 3D AGGCACCATC TGA/--- TGACTACTGG 3070 het 3070 hom 49 21 19 9 TGA 2 1 20507 CASAVA_Build 5 55923915 4I GTTTTCTCTT ----/ACTC AGCCCTCAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 ACTC 0 1 20508 CASAVA_Build 5 55925729 4I ACAGCTCAAC ----/TCTT TCTTATTTCT 3070 het 3070 hom 56 23 30 3 TCTT 1 2 20509 CASAVA_Build 5 55930867 1I CCTTCAAGAG -/T TTTTTTTTTC 2830 het 2830 ref 26 14 7 5 T 9 10 20510 CASAVA_Build 5 55935740 1I TACCAAAATT -/G AGCGGGGGGA 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 G 0 1 20511 CASAVA_Build 5 55938093 1I TCCTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2630 hom 32 10 11 11 T 13 14 20512 CASAVA_Build 5 55940814 1D AAGTTATTTA G/- CCTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 G 1 0 20513 CASAVA_Build 5 55946968 1I GTACAGCTGG -/T CACAGGAAGA 3070 hom 120 het 54 0 42 12 T 0 1 20514 CASAVA_Build 5 55952091 1I GATTCAAAGG -/A GTTCTTTTGC 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 0 1 20515 CASAVA_Build 5 55971825 2D TGTGTGCGCG CT/-- CTCTCTCTCT 3038 het 3038 ref 44 18 12 14 CT 9 8 20516 CASAVA_Build 5 55972925 4I GACCTTCTGC ----/CTGT CTTTCTCTGT 3070 het 3070 ref 65 31 24 10 CTGT 0 1 20517 CASAVA_Build 5 55973549 4D GTCCTGCTTT TCTC/---- TCTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 TC 4 2 20518 CASAVA_Build 5 55980935 6D TTGTTCAACC TAGAGA/------ TAAAGTGTCT 3070 het 3070 hom 31 16 15 3 TAGAGA 1 0 20519 CASAVA_Build 5 56001581 1D TTCCCCCCCC T/- CCTTTAGCAT 2080 het 2080 ref 35 18 6 13 T 1 0 20520 CASAVA_Build 5 56012736 1D CAAGCAGAGC A/- AAAACACAGA 3070 het 3070 ref 46 28 17 1 A 5 4 20521 CASAVA_Build 5 56018251 1I TGAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2189 hom 29 6 17 6 A 14 15 20522 CASAVA_Build 5 56024815 2D TGTTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 het 27 hom 25 1 20 6 TG 1 0 20523 CASAVA_Build 5 56028583 2D TATTTGGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 13 11 20524 CASAVA_Build 5 56033781 2I TTTTGCAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 38 1 28 9 A 10 12 20525 CASAVA_Build 5 56048025 1D CATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 31 1 16 14 T 15 14 20526 CASAVA_Build 5 56052620 1I GCAAGGCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 40 2 27 11 A 15 16 20527 CASAVA_Build 5 56068835 1D TACTGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 32 0 28 4 A 11 10 20528 CASAVA_Build 5 56071209 1I ATAGAACAGG -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 6 7 20529 CASAVA_Build 5 56115112 1I ACCCAGACTG -/T TAAGACTGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 2 20530 CASAVA_Build 5 56127469 1D GTCATGGTGG T/- GCTCGTCTGT 2948 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 0 20531 CASAVA_Build 5 56133117 3I ATATATTTAT ---/TCC TCCTGGAAGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TCC 1 2 20532 CASAVA_Build 5 56136378 1D TACACAAGAC A/- AAACTGAGAG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 4 3 20533 CASAVA_Build 5 56136532 22I AAACCCCATC ----------------------/TCTACTAAAAATACAAAAATGA TCTGGGTGTG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 TCTACTAAAAATACAAAAATGA 0 1 20534 CASAVA_Build 5 56136682 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 17 0 9 10 A 13 12 20535 CASAVA_Build 5 56146132 11D GGAGGGCCGG GACCTGGCCGA/----------- GGGTGACATT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 GACCTGGCCGA 1 0 20536 CASAVA_Build 5 56151023 1D CAACAAGAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 A 10 9 20537 CASAVA_Build 5 56158074 6D ATGTGGTCTC AGGGAA/------ AAAATGTTGC 3070 hom 114 het 40 0 39 4 AGGGAA 1 0 20538 CASAVA_Build 5 56160467 5D TGTATGCATC TTTTT/----- TTTTTAAGTT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 10 5 20539 CASAVA_Build 5 56160759 1D GTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 630 het 630 ref 33 22 5 6 T 13 12 20540 CASAVA_Build 5 56165724 3I TTTTCTTCAG ---/TAA TAGTAGTTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TAA 0 1 20541 CASAVA_Build 5 56167912 1I TACCTGACTA -/G CAGCCAGTCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 0 1 20542 CASAVA_Build 5 56169828 2I TAATACAATT --/TC TGTGTTACAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TC 0 1 20543 CASAVA_Build 5 56171489 3I AATAATCATC ---/TTG TTATTAATGT 3070 hom 106 het 44 0 36 8 TTG 0 1 20544 CASAVA_Build 5 56179687 1I AATTGACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 10 11 20545 CASAVA_Build 5 56180938 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 29 1 26 2 A 17 16 20546 CASAVA_Build 5 56181339 6D ATAAAGATGG TTTGGT/------ TTTGGTTTTG 3070 hom 96 het 44 0 33 11 TTTGGT 3 2 20547 CASAVA_Build 5 56182698 1D GCCCGGCTAA T/- TTTGTATTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 4 3 20548 CASAVA_Build 5 56183668 2D CCTGGCAGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 46 1 38 7 A 14 12 20549 CASAVA_Build 5 56190784 4I TTGTAAAGAA ----/ACAC ACACACACAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AC 5 7 20550 CASAVA_Build 5 56194373 1D TTTACTTTTT A/- GTAACTGCTT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 1 0 20551 CASAVA_Build 5 56201072 1D TTGCCACAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 7 20552 CASAVA_Build 5 56211150 1I CAGTTTTGTC -/A AAAAAATTTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 6 7 20553 CASAVA_Build 5 56216973 3D TACCAGTCAG TTC/--- TTAAGTATGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTC 1 0 20554 CASAVA_Build 5 56222733 3D CACACACACA CCC/--- CCCCCCCCCA 3070 hom 46 het 30 0 17 13 C 12 9 20555 CASAVA_Build 5 56226949 2D TTTTTTATTT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TG 1 0 20556 CASAVA_Build 5 56228863 3D TAACTTTCTT CTC/--- AGGCAGTGAG 3070 hom 135 het 47 0 46 3 CTC 1 0 20557 CASAVA_Build 5 56258469 1I TATTCAGTGA -/T TAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 50 21 21 8 T 1 2 20558 CASAVA_Build 5 56260243 4I GAAATGCTAT ----/TGGC AAGGGAACAT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 TGGC 0 1 20559 CASAVA_Build 5 56262582 1D CATTCTTGAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 8 7 20560 CASAVA_Build 5 56265538 2D TGGGAAGAGG GA/-- GAAACAGTAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 GA 2 1 20561 CASAVA_Build 5 56309904 2D CTTTTCTTAA CT/-- CTCTGTTTTC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 CT 3 2 20562 CASAVA_Build 5 56323526 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 13 14 20563 CASAVA_Build 5 56328318 1I ATCACTTGAA -/C CCTCGGAGGC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 2 3 20564 CASAVA_Build 5 56331144 1I ATTATAAAAC -/T TTTTTTTTTT 2953 het 120 hom 19 1 10 8 T 11 12 20565 CASAVA_Build 5 56331415 4I2M4I GGTGTGAGCC ----CA----/ACCGCACCTG GACAGAATTG 3070 hom 53 het 20 0 18 3 N/A 0 0 20566 CASAVA_Build 5 56331528 1I AAAAAAAAGT -/G GGGGGTAAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 5 6 20567 CASAVA_Build 5 56332325 1I CAAATTAGAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 381 hom 38 1 32 5 A 8 9 20568 CASAVA_Build 5 56332773 1D GGCAGATAAA G/- GAACTTTGTC 3070 hom 114 het 47 0 37 11 G 2 1 20569 CASAVA_Build 5 56337058 1D GCAAACACTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 10 9 20570 CASAVA_Build 5 56337487 1D AAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2603 hom 33 het 14 0 9 5 T 15 14 20571 CASAVA_Build 5 56339290 1I TTTGTACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 657 hom 37 3 24 10 T 13 14 20572 CASAVA_Build 5 56343788 2D ATCCATAGGC AT/-- ATGTTTTCTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 2 1 20573 CASAVA_Build 5 56348925 1I17M2D TGATTTAGGT -AAAAAACAAAACAAAACAA/AAAAAAAAAAAACAAAAC-- AAAAAACTCT 3068 hom 18 het 9 0 7 2 N/A 0 0 20574 CASAVA_Build 5 56359105 1I44M1D TGGGCCCTGT -CCCCCAAGATAGCTCATTATGTATATGCAGACATTACAAAATCCA/CCCCCCAAGATAGCTCATTATGTATATGCAGACATTACAAAATCC- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 25 23 5 N/A 0 0 20575 CASAVA_Build 5 56364427 1D AGTAGAGTCC T/- TATAGATGGG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 2 1 20576 CASAVA_Build 5 56371494 1D GAAATAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1319 hom 28 4 11 16 T 13 12 20577 CASAVA_Build 5 56372972 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAATT 932 het 932 ref 10 6 3 1 A 8 9 20578 CASAVA_Build 5 56400782 1I TATAAACTAG -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 6 7 20579 CASAVA_Build 5 56412679 1D TATTCTGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 T 10 9 20580 CASAVA_Build 5 56417744 1D GTGGGTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2634 hom 31 10 15 6 T 13 12 20581 CASAVA_Build 5 56450890 7D12M16D TTTCTTTTCT TCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT/-------TTTCTTTCTTTC---------------- TTTTTTTTTT 1833 het 1833 ref 15 11 7 1 N/A 0 0 20582 CASAVA_Build 5 56458652 4D TTGTGTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 TTTG 4 3 20583 CASAVA_Build 5 56462935 1D TCTTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1414 het 1414 ref 19 8 5 6 T 15 14 20584 CASAVA_Build 5 56463447 1I TAAGCATACA -/T TTTTATCATT 3070 het 3070 ref 28 13 14 1 T 4 5 20585 CASAVA_Build 5 56465575 1D TCACATTCAA T/- TTTTTTTCTT 1597 het 1597 ref 31 18 5 8 T 8 7 20586 CASAVA_Build 5 56470443 4D TTATCTGGCA CTGT/---- CTATTAAATT 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 CTGT 1 0 20587 CASAVA_Build 5 56472477 1D GTTCTAATCG T/- TTTTTTTTTT 3031 het 3031 ref 25 12 7 6 T 13 12 20588 CASAVA_Build 5 56473385 1D TGGCCTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 12 13 T 13 12 20589 CASAVA_Build 5 56477812 1D TAAGTAATAG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 8 7 20590 CASAVA_Build 5 56483467 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 25 13 12 0 A 8 9 20591 CASAVA_Build 5 56485847 1D CCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1476 het 1413 hom 20 10 4 6 A 17 16 20592 CASAVA_Build 5 56510956 1D TGTTTGAGAC A/- GGGTCTCGCT 3070 het 3070 hom 46 17 22 9 A 1 0 20593 CASAVA_Build 5 56517973 1I TTGCCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1334 het 1334 ref 24 12 6 6 A 15 16 20594 CASAVA_Build 5 56519471 2D CAGAAACCAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 1846 hom 19 5 10 5 AT 8 7 20595 CASAVA_Build 5 56521146 3I TCAGCCCACT ---/TTC TTTTTTCACT 3070 hom 105 het 43 0 33 10 TTC 0 1 20596 CASAVA_Build 5 56521756 1D CTTTTTTTTA G/- GGGGGGGATT 3070 het 3070 ref 31 16 9 7 G 8 7 20597 CASAVA_Build 5 56523143 5D TATCTTTAGG TTTTT/----- TTTTTTTTTG 90 het 90 ref 23 1 3 19 T 14 9 20598 CASAVA_Build 5 56529286 1D TCTTCATTTG C/- CAGGCAGGTG 3070 hom 85 het 31 0 28 3 C 2 1 20599 CASAVA_Build 5 56541205 1I TGTGCTGTGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 51 25 18 8 T 8 9 20600 CASAVA_Build 5 56541704 1D ACATAACAAG A/- AAGAGAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 3 2 20601 CASAVA_Build 5 56545056 1I CATAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 13 14 20602 CASAVA_Build 5 56548453 1D TCTGGAACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 38 1 27 10 T 11 10 20603 CASAVA_Build 5 56552419 1I ACAATACTTT -/C CTAGTGATAC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 C 1 2 20604 CASAVA_Build 5 56552500 2D AATTAACCTC TT/-- GTTTTCTGCC 3070 het 3070 ref 42 23 14 6 T 2 0 20605 CASAVA_Build 5 56560039 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2528 het 1641 hom 18 5 7 6 A 13 14 20606 CASAVA_Build 5 56560172 1I TGGCTTGGGC -/A ATATAGATCT 3070 hom 56 het 23 0 17 6 A 1 2 20607 CASAVA_Build 5 56566171 1I AGTTTTTATT -/A AAAAAATTAA 3070 het 2908 hom 19 7 8 4 A 6 7 20608 CASAVA_Build 5 56566460 1D AGTGAATCTT C/- CTATAACCCA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 C 2 1 20609 CASAVA_Build 5 56568042 2I AGTGGTTACG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 TA 6 7 20610 CASAVA_Build 5 56577632 1D ACATTCTGAG C/- CACTGTGTAG 3070 het 3070 hom 47 19 27 1 C 2 1 20611 CASAVA_Build 5 56578290 1D AACTTAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1368 het 1368 ref 39 32 3 4 T 12 11 20612 CASAVA_Build 5 56580004 12D TCATATACTA TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2058 het 922 hom 14 3 6 5 T 26 14 20613 CASAVA_Build 5 56586777 10D TCCTCTCTCT CTTCTCTCCC/---------- CTTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 CTTCTCTCCC 1 0 20614 CASAVA_Build 5 56587983 1D TATGTTTTAA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 37 15 19 3 T 8 7 20615 CASAVA_Build 5 56589965 5D ACCTAGGCTA TATGG/----- TATAGACTGT 3070 het 3070 hom 68 27 35 8 TATGG 1 0 20616 CASAVA_Build 5 56610115 2I CATAAATACA --/TG TGTGTGTATA 2604 het 242 hom 16 3 8 5 TG 3 4 20617 CASAVA_Build 5 56623622 2D CAAGCATTCA TT/-- GTTTCATTTA 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 T 2 0 20618 CASAVA_Build 5 56625574 1D CAAGCTTACA T/- TTTTTGCCAG 3070 hom 123 het 48 0 38 10 T 6 5 20619 CASAVA_Build 5 56626317 1I GCTGTTACTA -/G GTGAAGGGGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 1 2 20620 CASAVA_Build 5 56651007 7D GTCATCTATG TGTTTCA/------- TCTGGAAATC 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 TGTTTCA 1 0 20621 CASAVA_Build 5 56654070 1I CTTGGTTTTT -/G GGGTGGAAGA 3070 hom 63 het 27 0 19 8 G 3 4 20622 CASAVA_Build 5 56654779 1D TGCCTGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 11 10 20623 CASAVA_Build 5 56664817 1I AGCTGAAGCA -/G GGGGAGGGCT 3070 hom 104 het 38 0 34 4 G 4 5 20624 CASAVA_Build 5 56699502 1I GACAGTACAG -/T TTTGTGAAAA 3070 hom 120 het 47 0 39 8 T 3 4 20625 CASAVA_Build 5 56706634 1D ATGCACGTGC G/- TGCGCACACA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 G 1 0 20626 CASAVA_Build 5 56715243 2I GTTTTTTACA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 9 11 20627 CASAVA_Build 5 56719132 1I ATTGTCACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 32 2 22 8 T 11 12 20628 CASAVA_Build 5 56722323 1D TCTGTAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 11 10 20629 CASAVA_Build 5 56729058 12D AAGATATTTT GAGAGAGAGAAA/------------ GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 GAGAGAGAGAAA 2 1 20630 CASAVA_Build 5 56730839 4I GCTGCCAAAC ----/ATGT ATGGATGGTG 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 ATGT 0 1 20631 CASAVA_Build 5 56733202 1I ACAATTAAGG -/T TTTTTTTTTT 2002 het 2002 ref 26 12 6 8 T 14 15 20632 CASAVA_Build 5 56744467 1D GTTGTGCAAT C/- AACATCAGTA 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 C 1 0 20633 CASAVA_Build 5 56747231 1D26M1I ACCCTCATAG CTTTTACTCAAAGACAAGGCTGAAGTG-/-TTTTACTCAAAGACAAGGCTGAAGTGT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 16 17 5 N/A 0 0 20634 CASAVA_Build 5 56747479 1D CTTGAACTCC T/- TGACCTCAAG 3070 hom 80 het 32 0 25 7 T 2 1 20635 CASAVA_Build 5 56756844 1I CACATATTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 88 het 36 0 30 6 T 9 10 20636 CASAVA_Build 5 56762251 2I TCAGATCACT --/TC TCTCTTCAGT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 TC 2 3 20637 CASAVA_Build 5 56762761 1I GTGACCATGT -/G GCCCAGCTAA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 G 1 2 20638 CASAVA_Build 5 56841134 1D CTAGCATTGA T/- TTTTTTTTTT 979 het 979 ref 32 24 3 5 T 11 10 20639 CASAVA_Build 5 56846031 1D CCCATTATTT A/- GCCTGCCACA 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 A 1 0 20640 CASAVA_Build 5 56868723 3D ATTAATTCTC TTG/--- TTGTGGTCAG 3070 hom 60 het 25 0 21 7 TTG 2 1 20641 CASAVA_Build 5 56876924 1I GTAGTGGTTC -/T TCCTTTAAGA 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 T 1 2 20642 CASAVA_Build 5 56888504 2D CCCTAGTAAC AG/-- AAAGTTTATA 3070 het 3070 hom 38 18 20 0 AG 1 0 20643 CASAVA_Build 5 56898739 1D GAAAGACTAG A/- AAAAGCAGGC 3070 hom 135 het 48 0 45 3 A 5 4 20644 CASAVA_Build 5 56901824 7I AGGGAAGTGT -------/CTGTGTG CTATAGCTTG 3070 hom 81 het 34 0 28 7 CTGTGTG 0 1 20645 CASAVA_Build 5 56902520 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 16 3 9 4 A 13 12 20646 CASAVA_Build 5 56905375 1I AGAAAACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 11 12 20647 CASAVA_Build 5 56908325 1D AATGGCAAAG A/- AAACTATGAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 4 3 20648 CASAVA_Build 5 56915367 1I TTTCTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 39 1 31 7 T 11 12 20649 CASAVA_Build 5 56943404 1D AGATGACAGA T/- TTTTTTTTTT 1427 het 1427 ref 36 22 3 11 T 13 12 20650 CASAVA_Build 5 56980391 1I ATAAAAAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 9 10 20651 CASAVA_Build 5 56985017 1I GTTTTTCAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 8 9 20652 CASAVA_Build 5 56988073 1I AAACAACAGA -/T TTTTCAATGT 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 T 4 5 20653 CASAVA_Build 5 56989520 1I TTCTTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 10 11 20654 CASAVA_Build 5 56998856 1D TCTTTGTCAA T/- TTTTTTTTTT 1969 het 1969 ref 57 40 5 12 T 13 12 20655 CASAVA_Build 5 57006409 1D TCTGTCTTGT G/- GCCTGCTTCT 3070 hom 51 het 19 0 16 3 G 2 1 20656 CASAVA_Build 5 57010436 1D TTTCCCAGAC T/- TTCTTAGATT 3070 hom 98 het 37 0 32 5 T 3 2 20657 CASAVA_Build 5 57024665 1I TGAAGTTGTT -/A TTTTTTTAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 20658 CASAVA_Build 5 57038110 1D TCCTGTCAAA T/- TTTTGTTAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 5 4 20659 CASAVA_Build 5 57056389 1D AAATAAAACA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 44 0 39 7 T 9 8 20660 CASAVA_Build 5 57056988 1D TGTATTTTTT G/- TTGAGATGGC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 1 0 20661 CASAVA_Build 5 57064316 1I CCTTTGACTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 91 hom 49 1 47 1 T 8 9 20662 CASAVA_Build 5 57065600 1D ATTTAATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 11 9 T 11 10 20663 CASAVA_Build 5 57079000 3I GGAATGAGAC ---/TAA TATTACCGAA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 TAA 0 1 20664 CASAVA_Build 5 57083391 1I TTTATTTAAC -/T TTTTTAGGAT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 5 6 20665 CASAVA_Build 5 57084193 1I TCAGAGCAAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 7 8 20666 CASAVA_Build 5 57086102 1I TTTAAAACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 9 10 20667 CASAVA_Build 5 57087703 1D ATGAAAAGAA G/- ATTGGCCTGG 3070 hom 114 het 41 0 39 3 G 1 0 20668 CASAVA_Build 5 57088760 2D CAGTCTATTC TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 8 20669 CASAVA_Build 5 57089948 1I GATAGAGTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 862 hom 40 2 34 4 T 9 10 20670 CASAVA_Build 5 57099269 11D TTTCTGTTGA ATGTATACAAT/----------- GTATATATAC 3070 het 3070 ref 23 14 12 7 ATGTATACAAT 1 0 20671 CASAVA_Build 5 57099601 1D ATGTCTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 43 0 28 15 T 13 12 20672 CASAVA_Build 5 57101751 1D GAAAGGGTAC A/- GAGACAAGGT 3070 het 3070 ref 41 21 14 7 A 1 0 20673 CASAVA_Build 5 57103928 2I CACTCTCTCG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 481 hom 23 3 12 8 T 13 15 20674 CASAVA_Build 5 57139547 2D ATGTGAAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 879 het 879 ref 51 38 3 11 GT 8 7 20675 CASAVA_Build 5 57145535 1D TTAATGAACT G/- GGAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 G 3 2 20676 CASAVA_Build 5 57153591 1D ATAGTGCTAG A/- ACTCCTTCAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 A 2 1 20677 CASAVA_Build 5 57156090 1D CTTAGTAGCT A/- AAAAAAAAAA 3032 het 3032 ref 26 14 8 5 A 11 10 20678 CASAVA_Build 5 57159286 1I CCTTTTAGGC -/A AAAATTGATT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 4 5 20679 CASAVA_Build 5 57172519 1D AGACTTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 18 9 T 13 12 20680 CASAVA_Build 5 57178845 4D AAAATAAATG TATC/---- TATCTATTAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 TATC 2 1 20681 CASAVA_Build 5 57207923 1D TCTTTGTGGC A/- ACCCCAGCTT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 A 2 1 20682 CASAVA_Build 5 57219126 1D TCCTTATTTG A/- AAAAAAAAAA 1317 het 1317 ref 35 26 3 6 A 11 10 20683 CASAVA_Build 5 57219259 1D TTTACAAACC T/- ACCGCTTTTG 3070 het 3070 ref 37 13 14 11 T 1 0 20684 CASAVA_Build 5 57226627 11D AAAGAAAGAA AGAGAAGAAAG/----------- AGAGAAGAAA 3070 het 3070 hom 26 11 15 2 AGAGAAGAAAG 2 1 20685 CASAVA_Build 5 57227957 3I AATGCTTGTG ---/ATA ATAAATTAAA 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 ATA 1 2 20686 CASAVA_Build 5 57237478 1D CGTCTCTACT A/- AAAAATACAA 3070 hom 15 het 10 0 9 1 A 6 5 20687 CASAVA_Build 5 57242341 1I TTAAGAAAAG -/A AAAAAATCCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 6 7 20688 CASAVA_Build 5 57271011 1D AGTTGGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 37 4 22 12 T 11 10 20689 CASAVA_Build 5 57271216 4I CCCTCCCTCA ----/CTTC CTTCCTTCCT 3070 hom 55 het 25 0 17 8 CTTC 3 4 20690 CASAVA_Build 5 57273220 14D CTTGTTGGAA AATGGAGAGAAGTG/-------------- ATGTTTGCAC 3070 het 3070 ref 47 34 11 6 AATGGAGAGAAGTG 1 0 20691 CASAVA_Build 5 57274735 1D CTATTTAAAA C/- CCACTTAACT 3070 het 3070 ref 40 21 10 9 C 3 2 20692 CASAVA_Build 5 57274779 4D TTTGTGTGAT AGAC/---- AGAAAAGTCC 2389 het 2389 ref 33 23 6 6 AGAC 1 0 20693 CASAVA_Build 5 57277595 2D AGGCTATTAA TT/-- ATTGCCTCAA 1045 het 985 hom 5 2 3 0 T 2 0 20694 CASAVA_Build 5 57278555 1D TGATTTGTCA T/- ACACAATACA 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 T 1 0 20695 CASAVA_Build 5 57286760 7D TTCAGGAGTA TGATATG/------- TGCATTTCAA 3070 het 3070 ref 29 17 12 1 TGATATG 1 0 20696 CASAVA_Build 5 57311659 2I TAAAAATCCA --/AC AGTTATTTGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AC 0 1 20697 CASAVA_Build 5 57313576 1I ATCACTCATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 10 20698 CASAVA_Build 5 57322548 4D CAAGATTCGG CTAT/---- CTGTCAGTTG 3070 het 3070 ref 47 24 20 4 CTAT 1 0 20699 CASAVA_Build 5 57322757 1D TTCAGACTGA T/- TCTCAGCAGC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 T 2 1 20700 CASAVA_Build 5 57323909 1I GAAACTCTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 9 10 20701 CASAVA_Build 5 57335116 2I GTGAATAAAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 AT 4 5 20702 CASAVA_Build 5 57336046 5D GTATATATTA TATAT/----- TATAAGTATA 2479 hom 12 het 5 0 5 0 TATAT 1 0 20703 CASAVA_Build 5 57337811 1I TAGGGCTTAC -/T TTTTAAGTTT 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 T 4 5 20704 CASAVA_Build 5 57345401 1I CAGTGTACCA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 62 23 31 8 T 6 7 20705 CASAVA_Build 5 57348065 1I TACGCAATAA -/G CTCTTTTGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 20706 CASAVA_Build 5 57351062 1D GCCTCAAACC T/- AATGGATTTG 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 T 1 0 20707 CASAVA_Build 5 57356634 1D TTTTTTAAAG T/- TTTGCAATAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 T 4 3 20708 CASAVA_Build 5 57356848 2D TTTATATGGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 TA 7 6 20709 CASAVA_Build 5 57358346 2I ATTAATACAC --/TT TTTGTTCTCA 3070 het 3070 hom 45 12 27 6 T 3 5 20710 CASAVA_Build 5 57372149 14D AATGAAGACA CCTTGAGGTCTTAC/-------------- TACTGAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 13 5 CCTTGAGGTCTTAC 1 0 20711 CASAVA_Build 5 57381627 2D CTCTACACGA AC/-- ACACACACAC 991 het 991 ref 38 30 3 7 AC 7 6 20712 CASAVA_Build 5 57389678 1D CTCAGATTCC T/- TTTTTTTTTT 2038 het 2038 ref 32 12 9 13 T 17 16 20713 CASAVA_Build 5 57464192 1I TCTATTTTAG -/C CCTGGATCTT 3070 hom 50 het 26 0 18 8 C 2 3 20714 CASAVA_Build 5 57471604 1D TCCTCGGATG C/- CCTTGAAATG 3070 hom 71 het 30 0 22 9 C 3 2 20715 CASAVA_Build 5 57473200 1D CACGCATATT C/- CATACATACA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 2 1 20716 CASAVA_Build 5 57477776 1I TCCACTTGAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 A 7 8 20717 CASAVA_Build 5 57478353 1D ATGAGATATG A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 7 6 20718 CASAVA_Build 5 57481672 2D CCTTGGGCCA AG/-- ATAAGTCTTG 3070 het 3070 ref 31 18 10 5 AG 1 0 20719 CASAVA_Build 5 57498225 1I TACCTAGGAG -/T TTGGAAACAC 3070 hom 114 het 42 0 37 5 T 2 3 20720 CASAVA_Build 5 57500959 1I AGATCTACCC -/A AAAGAAAATA 3070 hom 103 het 38 0 34 4 A 3 4 20721 CASAVA_Build 5 57503258 1D ACTTCCTTTT A/- TTTTTTGAGA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 1 0 20722 CASAVA_Build 5 57508431 4D ACACACACAC ATAT/---- ATATATATAT 766 hom 17 het 8 0 6 4 AT 8 6 20723 CASAVA_Build 5 57509522 1I AAATTAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1765 hom 27 5 13 9 T 12 13 20724 CASAVA_Build 5 57512128 1D TTTATAGTTG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 8 7 20725 CASAVA_Build 5 57524164 1D GTGAGGGAAG A/- ATTGCTCATT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 2 1 20726 CASAVA_Build 5 57531635 1I ATAACATTTA -/T AAAGACAACA 3070 hom 99 het 43 0 33 10 T 0 1 20727 CASAVA_Build 5 57531821 12I GAGAATTATT ------------/CTAAGTGCTTTC CTAAGTGCTT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 CTAAGTGCTTTC 0 1 20728 CASAVA_Build 5 57535255 1I CTACCATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 A 10 11 20729 CASAVA_Build 5 57538434 1D ATGATGTCGC T/- TGATGCATTC 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 T 2 1 20730 CASAVA_Build 5 57543412 4D AAATGTGCTT AAAG/---- AAAGAAATTC 3070 het 3070 ref 23 10 10 4 AAAG 2 1 20731 CASAVA_Build 5 57556651 1D AATGCTAGAT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 7 20732 CASAVA_Build 5 57558112 4I TGCCTGGCCT ----/GAAA GAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 GAAA 2 3 20733 CASAVA_Build 5 57582055 2D GTGTTCTTGT TA/-- TATATATATA 3070 het 310 hom 38 1 31 7 TA 6 5 20734 CASAVA_Build 5 57585464 1I ATTTTCACCC -/T TTTTCCCCAA 3070 hom 153 het 56 0 50 6 T 4 5 20735 CASAVA_Build 5 57595002 1I ACATCTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 T 13 14 20736 CASAVA_Build 5 57595354 4I GCCCTTTAGT ----/TTAA TTAATTAGGT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TTAA 1 2 20737 CASAVA_Build 5 57602872 1D GAGAGAAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 10 9 20738 CASAVA_Build 5 57607924 5I GGCTTCTGGG -----/TTTTT TTAAGTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 7 20739 CASAVA_Build 5 57610953 4I AAAAAAAAAC ----/AGAT AGGTTCAGCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AGAT 0 1 20740 CASAVA_Build 5 57612808 2I AGCTACAGGC --/AA AAAAAAAAAA 2265 het 513 hom 34 2 7 25 A 12 14 20741 CASAVA_Build 5 57629469 1I TACTCAAGTT -/A AAAAAAAAAA 1366 het 1366 ref 35 23 4 8 A 13 14 20742 CASAVA_Build 5 57629656 4I GCATATGTAT ----/GTAA GTGAGTACAG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 GTAA 0 1 20743 CASAVA_Build 5 57636801 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 11 10 20744 CASAVA_Build 5 57641339 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 T 7 8 20745 CASAVA_Build 5 57641636 2D TTCTTCTGGG AC/-- TATAATTACA 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 AC 1 0 20746 CASAVA_Build 5 57642495 1I AAAGCACCTT -/A AAAGGCCTAT 3070 hom 105 het 46 0 36 10 A 3 4 20747 CASAVA_Build 5 57644964 1D ACTTTTGTTG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 A 8 7 20748 CASAVA_Build 5 57647216 2D AACAGTTCTC AT/-- AAAATTATCC 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 AT 1 0 20749 CASAVA_Build 5 57648584 1D AAGGCACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 11 10 20750 CASAVA_Build 5 57649963 4D ACTTTCAAAA AATT/---- AATTATAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 16 5 AATT 2 1 20751 CASAVA_Build 5 57659904 1D GGGGCCTCTT G/- GGGGGGTGAT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 7 6 20752 CASAVA_Build 5 57662385 1D ATACCCATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 13 12 20753 CASAVA_Build 5 57664569 23D GCAACAAAAG AACGAAAGCAGGGATTTATTAAA/----------------------- AACGAAAGTA 3070 hom 42 het 15 0 15 3 AACGAAAGCAGGGATTTATTAAA 1 0 20754 CASAVA_Build 5 57670202 2I AAGAGAAAAC --/TG TGAATAAGAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TG 1 2 20755 CASAVA_Build 5 57674185 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 9 8 20756 CASAVA_Build 5 57675883 1D CATACGAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 A 9 8 20757 CASAVA_Build 5 57683949 1D TCAGCTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 13 10 A 10 9 20758 CASAVA_Build 5 57687375 1D TCTCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 28 0 16 12 T 11 10 20759 CASAVA_Build 5 57689273 1I ATATAATCCC -/T TTCTGAAACA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 2 3 20760 CASAVA_Build 5 57691060 1I GCAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 9 10 20761 CASAVA_Build 5 57693575 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1586 het 330 hom 7 1 4 3 A 13 12 20762 CASAVA_Build 5 57697294 13D GCTCTAGTAA TTGAGAATTTCTC/------------- TTAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 25 13 2 TTGAGAATTTCTC 1 0 20763 CASAVA_Build 5 57702349 1D AGTACAAAAT A/- TTAGGACATA 3070 het 3070 hom 58 21 30 7 A 1 0 20764 CASAVA_Build 5 57752465 1D CAAAGCTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 11 24 4 A 10 9 20765 CASAVA_Build 5 57752995 2D TGTAGGTTAT GA/-- TTTTATCCGA 3070 het 3070 ref 40 27 12 4 GA 1 0 20766 CASAVA_Build 5 57754724 1I AGTTATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 44 0 36 8 A 11 12 20767 CASAVA_Build 5 57755499 1D TAAAAATAGG A/- ATAAGATATA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 2 1 20768 CASAVA_Build 5 57762087 1I AAATTCCTTG -/C CTACACACGA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 C 1 2 20769 CASAVA_Build 5 57767047 4D AGAAGACTCA CTAT/---- CTATGTCAGC 3070 het 3070 ref 37 23 12 4 CTAT 2 1 20770 CASAVA_Build 5 57768805 2D TAAAATGAGG TA/-- TATATGTGTG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 TA 3 2 20771 CASAVA_Build 5 57769515 3I TCCTGATAGG ---/GAA GAGCTGAGAC 3070 het 3070 hom 43 12 18 13 GAA 0 1 20772 CASAVA_Build 5 57771970 1D AAATAAATGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 8 7 20773 CASAVA_Build 5 57780197 3I AACCATTATG ---/TAA TAATTATAGA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 TAA 1 2 20774 CASAVA_Build 5 57781419 3D TTGATGAACC ATG/--- ATATTATTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 8 ATG 1 0 20775 CASAVA_Build 5 57781968 9D AGAAGGAGAA GGTAGAAAT/--------- GGTAGAAAAT 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 GGTAGAAAT 1 0 20776 CASAVA_Build 5 57782581 1I TGAGACAGTT -/A TTTTTTTTTC 3070 hom 107 het 47 0 37 10 A 0 1 20777 CASAVA_Build 5 57790247 2D AGATAAAATA CT/-- CTTTGAATAC 3070 het 3070 hom 52 18 25 9 CT 2 1 20778 CASAVA_Build 5 57793649 2I CATACAAAAA --/GG GTTGCTGCAG 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 G 1 3 20779 CASAVA_Build 5 57794203 1D ATTGTCATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 36 het 33 0 12 22 T 9 8 20780 CASAVA_Build 5 57794684 1D TAGAATCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 527 hom 33 2 25 6 A 15 14 20781 CASAVA_Build 5 57796278 1I AATAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 2436 het 1791 hom 13 6 6 1 T 8 9 20782 CASAVA_Build 5 57799856 3D ATGTTACAAA CAT/--- CATAACATGT 3070 het 3070 hom 53 25 26 4 CAT 2 1 20783 CASAVA_Build 5 57800802 2I CATGGACTTT --/TA TATACTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TA 2 3 20784 CASAVA_Build 5 57805189 1D GACTTCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1222 hom 18 5 12 2 A 13 12 20785 CASAVA_Build 5 57809080 1D GAAGAAATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 T 10 9 20786 CASAVA_Build 5 57809610 1D TCTACAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 35 4 15 16 T 13 12 20787 CASAVA_Build 5 57813194 1D GGTGACAGTG A/- GGGGCAGCAT 3070 het 3070 ref 58 36 17 5 A 1 0 20788 CASAVA_Build 5 57818058 2I ACTTATGACC --/AA AAAAAAAAAA 1617 het 1617 ref 45 18 5 22 A 10 12 20789 CASAVA_Build 5 57825428 1D GACAGGTAAT A/- AAGATGATTG 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 A 3 2 20790 CASAVA_Build 5 57849891 1I AAATCCCTTC -/A AAAAATCAAT 3070 het 3070 ref 27 18 9 0 A 5 6 20791 CASAVA_Build 5 57866932 3I AGCTAGTCTC ---/ACA ACATTCCCAG 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 ACA 1 2 20792 CASAVA_Build 5 57867028 3D TAGTGACCTC TTG/--- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 TTG 2 1 20793 CASAVA_Build 5 57875523 1D CCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 13 12 20794 CASAVA_Build 5 57916433 1I GCTTTCTTAC -/A AGAGTTGCTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 2 20795 CASAVA_Build 5 57923483 2D TCTTTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2262 het 2262 ref 26 10 7 9 T 16 14 20796 CASAVA_Build 5 57946065 1I GAAATAGTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 A 9 10 20797 CASAVA_Build 5 57949642 3D48M1D TGAGGGGTGA ATTATTATTATGCCTTGTTGTCATGTGGTGCTCCTTAAGAGTCTTCAGAATA/---ATTATTATGCCTTGTTGTCATGTGGTGCTCCTTAAGAGTCTTCAGAAT- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 27 28 9 N/A 0 0 20798 CASAVA_Build 5 57950229 1D GGTCCAAGGC A/- ATATAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 12 15 4 A 2 1 20799 CASAVA_Build 5 57951449 1I TTCACTCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 T 10 11 20800 CASAVA_Build 5 57952535 5D TGCATTATGC TATAA/----- TATAAGTGTG 3070 het 3070 ref 43 23 17 7 TATAA 2 1 20801 CASAVA_Build 5 57960227 1I ACAGGGTGGC -/A AACTGCTCTG 3070 het 3070 ref 47 15 10 22 A 2 3 20802 CASAVA_Build 5 57960262 1I AAACTTAGTC -/T CCCGGAGCAC 3070 hom 84 het 39 0 29 10 T 0 1 20803 CASAVA_Build 5 57965725 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2010 het 1751 hom 19 8 6 5 A 15 14 20804 CASAVA_Build 5 57979077 1I TCCCACTGGG -/T CCCCCCTCGA 3070 hom 61 het 27 0 20 7 T 0 1 20805 CASAVA_Build 5 57984285 2D TTGATAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 A 13 11 20806 CASAVA_Build 5 57986262 8D CTCTCACTCT CTCTTCTC/-------- CTCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 15 16 2 CTCTTCTC 1 0 20807 CASAVA_Build 5 57988603 2D ATAAAGAAAC TG/-- TGGTATATTT 3070 het 3070 ref 37 20 11 7 TG 2 1 20808 CASAVA_Build 5 58014973 3I TTTCATATAC ---/ATT TTTGTAAACC 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 ATT 0 1 20809 CASAVA_Build 5 58023089 1I ACACTTTTAC -/A ATCTTTAAAT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 1 2 20810 CASAVA_Build 5 58023943 1I TAATGTTCAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 8 9 20811 CASAVA_Build 5 58034171 4I TCTCTTTCTT ----/TTTC TTTCTTTCTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTTC 2 3 20812 CASAVA_Build 5 58047614 1I62M1D AAAGTACAAT -AAAAAAAAAAGAAAAGGAAAAAAAATAATAAATAAATAAATACATAAAAGTCTTTCAGCAGGA/AAAAAAAAAAAGAAAAGGAAAAAAAATAATAAATAAATAAATACATAAAAGTCTTTCAGCAGG- AAAAAAAAAA 3070 het 495 hom 18 2 15 18 N/A 0 0 20813 CASAVA_Build 5 58058708 1D GACAGCATTC T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 7 6 20814 CASAVA_Build 5 58063649 4D TATAGAGAAT TTTA/---- TTTATTTATT 2492 hom 45 het 24 0 16 8 TTTA 5 4 20815 CASAVA_Build 5 58064086 1D TTTAGACTCA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 25 11 4 T 7 6 20816 CASAVA_Build 5 58070126 2D CCTCTATGAC TT/-- TGTGTTTTGG 3070 het 3070 ref 59 29 27 6 T 3 1 20817 CASAVA_Build 5 58079770 1I AGAATTTCAA -/G GGGGGGGGAA 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 G 8 9 20818 CASAVA_Build 5 58080731 7D ATTTTATGAG TAGAATT/------- GTACTTTGCA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 TAGAATT 1 0 20819 CASAVA_Build 5 58085941 1D TCCTTACTTT G/- GGGGCTGAGT 3070 het 3070 hom 47 21 22 5 G 5 4 20820 CASAVA_Build 5 58086470 1I CTTATTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 T 10 11 20821 CASAVA_Build 5 58098602 1I TATAGCCAGC -/G GGGGGGGACT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 G 7 8 20822 CASAVA_Build 5 58100022 2D CCACAAACAG GT/-- GTAGCTGGGA 3070 het 3070 ref 53 28 21 7 GT 2 1 20823 CASAVA_Build 5 58101341 1D TCATCTGCAA G/- ATTCTTCAAG 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 G 1 0 20824 CASAVA_Build 5 58102847 5I AATATGAATA -----/TATGT AATAATTTAT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 TATGT 0 1 20825 CASAVA_Build 5 58116204 1D CAATAAATGA T/- CTTGCTCTTA 3070 hom 133 het 52 0 44 9 T 1 0 20826 CASAVA_Build 5 58117658 1D TCAGACTTTT A/- GACCTACAGA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 A 1 0 20827 CASAVA_Build 5 58125852 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 34 1 26 7 T 10 11 20828 CASAVA_Build 5 58127211 1D GAGCTGACAG A/- AGAGGCTCAG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 2 1 20829 CASAVA_Build 5 58127445 1I AAAAGAAGTG -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 7 8 20830 CASAVA_Build 5 58132733 2I TGGGTTGCTT --/TC TCTTTCTTGG 3070 het 3070 ref 47 19 19 9 TC 1 2 20831 CASAVA_Build 5 58133695 1D CATTTAGAAG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 75 het 32 0 26 7 T 8 7 20832 CASAVA_Build 5 58135644 1I ACTCTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 14 15 20833 CASAVA_Build 5 58151298 5D GTCTCTACTT AAAAA/----- AAATAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 8 3 20834 CASAVA_Build 5 58153581 1I TACAAATCTG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 143 het 55 0 48 7 T 8 9 20835 CASAVA_Build 5 58155929 1D AAAGTTGGTT A/- ATTTGTGTCA 3070 hom 78 het 31 0 26 6 A 2 1 20836 CASAVA_Build 5 58156511 1I GGACATCGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 671 hom 47 2 36 9 T 10 11 20837 CASAVA_Build 5 58158715 1I GAAGAGTCTG -/A AAAAAATGAT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 6 7 20838 CASAVA_Build 5 58160987 1I TAAAATAGAA -/G TAATTTATCT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 0 1 20839 CASAVA_Build 5 58162464 1D GCAATAGGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 136 het 54 0 45 9 T 10 9 20840 CASAVA_Build 5 58164606 1D CGTACCTCAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 8 20841 CASAVA_Build 5 58168261 1D AATATAACGT C/- CCTCCAGTTC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 3 2 20842 CASAVA_Build 5 58169963 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 14 1 10 3 A 15 14 20843 CASAVA_Build 5 58170232 1D CATGCTGATG A/- AAAAAATATG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 7 6 20844 CASAVA_Build 5 58170575 1I ACTTGAAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 420 hom 35 1 28 6 T 9 10 20845 CASAVA_Build 5 58180902 1D GTGGGTTCTT G/- GTATCTTATG 3070 hom 75 het 29 0 26 5 G 2 1 20846 CASAVA_Build 5 58184465 4D TCTCAAAAAT AGAG/---- AGGCTTCCCA 3070 hom 123 het 49 0 42 8 AG 3 1 20847 CASAVA_Build 5 58186430 2D CAGTAAACAA AT/-- ATATATATTT 3070 hom 63 het 29 0 22 8 AT 5 4 20848 CASAVA_Build 5 58187929 2D CAGAGCTCGA GT/-- GTTAAGATCA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 GT 2 1 20849 CASAVA_Build 5 58197334 1D AGCTTGACTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 435 hom 33 3 18 12 A 10 9 20850 CASAVA_Build 5 58218742 4I GATAGGTAGG ----/TAGA TAGATAGGTA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 TAGA 1 2 20851 CASAVA_Build 5 58260256 1I ACTGGGTATA -/T TACCCAAAGG 3070 het 3070 hom 27 7 18 2 T 1 2 20852 CASAVA_Build 5 58267825 1I CACCCGCTAA -/T TTTTTTGTAT 2403 hom 21 het 10 0 8 2 T 6 7 20853 CASAVA_Build 5 58270930 6D TATTTCCATT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 6 TTTTTG 4 3 20854 CASAVA_Build 5 58272456 2D ATTGTGTCTG TT/-- TTTTTTTCCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 9 7 20855 CASAVA_Build 5 58274416 3I GACCCTACTA ---/CTT CCTGGGGAGA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 CTT 0 1 20856 CASAVA_Build 5 58277465 5D CATAGTAATT AAATC/----- TATATAAGCT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 AAATC 1 0 20857 CASAVA_Build 5 58277597 1D TATTAATAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 10 9 20858 CASAVA_Build 5 58281090 1I GGAGTCTGGA -/G GGGGCTCCCT 3070 hom 12 het 34 1 28 5 G 4 5 20859 CASAVA_Build 5 58287629 1D GGTTCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3044 hom 18 het 8 0 7 1 T 12 11 20860 CASAVA_Build 5 58315662 4D CTTAGCCTTG AGTT/---- AGTTAGAAAA 3070 hom 151 het 56 0 50 8 AGTT 2 1 20861 CASAVA_Build 5 58318045 5D CCTGTCAGGA ACTGG/----- GCTGCACAGC 3070 hom 111 het 42 0 35 9 ACTGG 1 0 20862 CASAVA_Build 5 58318547 4I TTTAAGATAG ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AT 6 8 20863 CASAVA_Build 5 58319227 4D AAGCAAAAAT GAAA/---- GAAAGGTGGA 3070 hom 99 het 39 0 34 7 GAAA 2 1 20864 CASAVA_Build 5 58320764 4D TGGCAGGAGG GAAA/---- GAAAGGGGAA 3070 hom 126 het 43 0 43 2 GAAA 2 1 20865 CASAVA_Build 5 58321571 1I GAGTATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 11 12 20866 CASAVA_Build 5 58323311 3D AAAAAAAAAA AAC/--- CCCAATTAAT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 AAC 1 0 20867 CASAVA_Build 5 58327579 7D GCAGGGACAT GGATGAA/------- GCTGGAAACC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 GGATGAA 1 0 20868 CASAVA_Build 5 58329265 2I CTAAAAAAAC --/AG GGGAGGATTT 3070 hom 111 het 49 0 38 11 AG 0 1 20869 CASAVA_Build 5 58330561 4D GTATAATAGA CAAT/---- CAAGTTTTCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CAAT 1 0 20870 CASAVA_Build 5 58349246 1D CATCAAAATA C/- TTAAAAATGT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 C 1 0 20871 CASAVA_Build 5 58361245 1I TTCCAATGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 9 10 20872 CASAVA_Build 5 58363602 4I TTTAGTGATC ----/TATT TATTGCACTG 3070 hom 63 het 29 0 22 7 TATT 1 2 20873 CASAVA_Build 5 58369421 1I AGAAAGGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 38 0 33 5 A 10 11 20874 CASAVA_Build 5 58383543 3I TCTTTCTCTC ---/ATT TTTTTCCCCC 3070 hom 96 het 39 0 30 9 ATT 0 1 20875 CASAVA_Build 5 58398766 1D ATTTGGCTGA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 7 6 20876 CASAVA_Build 5 58407085 1I CATTTGTTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 462 hom 20 1 14 5 A 9 10 20877 CASAVA_Build 5 58415193 3I CAGTATTCTG ---/CTC CTATTTATGG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 CTC 0 1 20878 CASAVA_Build 5 58416113 1I AATAAATGGC -/A AAAAAAGTGT 3070 hom 65 het 24 0 22 2 A 6 7 20879 CASAVA_Build 5 58420885 1D TGATTTCATT C/- AAGATAAGGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 1 0 20880 CASAVA_Build 5 58430127 1D ACAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 21 0 15 6 A 13 12 20881 CASAVA_Build 5 58449392 1I GGTTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 2361 hom 47 het 31 0 16 15 T 15 16 20882 CASAVA_Build 5 58456569 1D CTTTTCTTTT C/- TTTTTTTTTC 2247 het 2247 ref 40 28 7 5 C 1 0 20883 CASAVA_Build 5 58467567 1I45M1I AAACCATCTG -AAAGGATGAATTTGACTACTCAAATATTTTAAAAGACTAAATGAT-/AAAAGGATGAATTTGACTACTCAAATATTTTAAAAGACTAAATGATA AAAAAAAAAA 3070 het 549 hom 24 2 31 8 N/A 0 0 20884 CASAVA_Build 5 58485337 1I GTGGGCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 37 1 25 11 T 11 12 20885 CASAVA_Build 5 58488599 1I TTCATTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 32 1 23 8 A 13 14 20886 CASAVA_Build 5 58490709 8I CTCCTCTGAA --------/GCAAAGAC TTCTTACGAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 GCAAAGAC 0 1 20887 CASAVA_Build 5 58490888 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 481 hom 20 1 13 6 T 10 11 20888 CASAVA_Build 5 58496602 1I TGAGTTCTCA -/G GGATACATTA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 G 2 3 20889 CASAVA_Build 5 58500904 1D GGTTCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 12 11 20890 CASAVA_Build 5 58505902 1I TCTTCAGGGT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 7 8 20891 CASAVA_Build 5 58507801 13D CTGGCCAGTG ACCTACCTTTAAA/------------- ACCTAGCTTT 3070 hom 70 het 29 0 24 5 ACCTACCTTTAAA 1 0 20892 CASAVA_Build 5 58516147 1I GATTTTTTTT -/A AAAAAAATGG 3070 het 284 hom 26 1 22 3 A 7 8 20893 CASAVA_Build 5 58530841 1D AATCTAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 838 hom 38 3 18 17 T 15 14 20894 CASAVA_Build 5 58559006 1D TCTGCACAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 9 8 20895 CASAVA_Build 5 58560023 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 A 12 11 20896 CASAVA_Build 5 58564409 4D ATATATATAT ATAC/---- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 40 20 18 5 ATAC 1 0 20897 CASAVA_Build 5 58566483 1D TCAAATCGAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 9 8 20898 CASAVA_Build 5 58573609 1D CATAATTCTC A/- CACCAGGTAT 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 A 1 0 20899 CASAVA_Build 5 58576035 2D ATACACACAC AT/-- ATATATATAT 2477 het 937 hom 14 5 8 1 AT 6 5 20900 CASAVA_Build 5 58581897 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2538 het 2538 ref 25 13 6 7 A 11 10 20901 CASAVA_Build 5 58583508 1D ACAGAAACAG A/- AAACCAAATA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 4 3 20902 CASAVA_Build 5 58584111 1I ATCATCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 T 10 11 20903 CASAVA_Build 5 58598588 4D CTAAGTTCAT TGTC/---- TGTCAAAGAG 3070 het 3070 ref 46 24 18 6 TGTC 2 1 20904 CASAVA_Build 5 58605009 4D TACATGTAAT TAAA/---- TAAATAAATA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 TAAA 3 2 20905 CASAVA_Build 5 58618501 3I CTTTGGATGT ---/ATC ATATTTTCAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATC 0 1 20906 CASAVA_Build 5 58623328 1I GAAGTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 25 1 14 10 G 0 1 20907 CASAVA_Build 5 58623921 3D TTTTTAAAAT AAC/--- AATCTTGCAA 3070 het 3070 hom 39 13 22 7 AAC 1 0 20908 CASAVA_Build 5 58628000 1I CCAATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 10 11 20909 CASAVA_Build 5 58636963 1D TTTTGTATGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 T 9 8 20910 CASAVA_Build 5 58674553 1I29M4I AGAAATTTTC -TTTTTTTTTTTTGGTTTTGTTATTATTTA----/TTTTTTTTTTTTTGGTTTTGTTATTATTTATTTT AAGTTCAGGG 3070 het 3070 ref 24 17 10 9 N/A 0 0 20911 CASAVA_Build 5 58679054 3D CTTTGAAAAT AAA/--- AAATTAATCT 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 A 6 3 20912 CASAVA_Build 5 58680019 1D ACAAATAGTG C/- CCTTCCCCTC 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 C 3 2 20913 CASAVA_Build 5 58684945 1D TTTTTCCCCA T/- TTTTTTTTTT 2643 het 2643 ref 41 12 11 18 T 13 12 20914 CASAVA_Build 5 58685188 16D CCATTACTGA AAACATGGTTGGCAAT/---------------- CTCTTCTGGG 3070 het 3070 ref 32 17 17 5 AAACATGGTTGGCAAT 1 0 20915 CASAVA_Build 5 58694093 1D TACAAGATCT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 A 8 7 20916 CASAVA_Build 5 58695964 1D TTTTTATATT A/- GAGATTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 1 0 20917 CASAVA_Build 5 58704596 1I GGATAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 10 11 20918 CASAVA_Build 5 58712386 2I GTTTACTTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 27 2 13 12 T 10 12 20919 CASAVA_Build 5 58713082 5D TTTTTTTGAA TAAAG/----- TAAACATACC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 TAAAG 1 0 20920 CASAVA_Build 5 58713432 1I GTTACAGCCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 T 8 9 20921 CASAVA_Build 5 58718275 4D CGCAGGAGGA AGGG/---- AGGGAGGGAG 2334 het 853 hom 20 4 8 8 AGGG 6 5 20922 CASAVA_Build 5 58736679 1I AATTTTAAGA -/T TATTTTTCTA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 1 2 20923 CASAVA_Build 5 58755399 1I GAATGTAACC -/T TTTTTTTTTT 2324 het 1955 hom 55 9 20 26 T 15 16 20924 CASAVA_Build 5 58791674 4D AGACATAAGT AGAA/---- AGAAAGTAGA 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 AGAA 2 1 20925 CASAVA_Build 5 58810492 4I AATTTTCAAT ----/AAAC AAATCACAGT 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 AAAC 0 1 20926 CASAVA_Build 5 58810700 1D CTACTCAGAG T/- TGCTATTGAT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 T 2 1 20927 CASAVA_Build 5 58811201 9D CAGAATAGAG ATCATCACA/--------- TGTATCAGAG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 ATCATCACA 1 0 20928 CASAVA_Build 5 58820847 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 497 hom 18 3 9 6 A 12 11 20929 CASAVA_Build 5 58820869 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 649 hom 26 3 12 11 A 9 10 20930 CASAVA_Build 5 58830931 2D AATCGCACCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 49 7 24 19 A 16 14 20931 CASAVA_Build 5 58831465 1D GAAAGTATTC A/- AAAAAAAAAA 2751 het 1665 hom 32 7 12 14 A 15 14 20932 CASAVA_Build 5 58831790 1I GAGATTTCTC -/A AAGAACTAAT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 2 3 20933 CASAVA_Build 5 58835486 3D TAGAAGTCTT ATA/--- ATATTTCTTA 3070 het 3070 ref 55 28 24 3 ATA 2 1 20934 CASAVA_Build 5 58851493 2D CCCCCCAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 18 11 9 AC 8 7 20935 CASAVA_Build 5 58852694 2D GGAGATCACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 26 4 15 8 A 14 12 20936 CASAVA_Build 5 58862193 1D CCATATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 42 0 35 7 A 11 10 20937 CASAVA_Build 5 58866660 2D GTGTGTGTGT GG/-- GGGGGGGGTC 3070 het 620 hom 26 6 13 8 G 10 8 20938 CASAVA_Build 5 58870088 1I ACATATTGAA -/T TGCCAGTTCC 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 T 1 2 20939 CASAVA_Build 5 58925734 1I ATGGTATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1833 hom 26 4 15 7 A 10 11 20940 CASAVA_Build 5 58934481 3D CTACAGTGAA CTT/--- ATTTTCAACA 3070 het 3070 ref 43 23 18 5 CTT 1 0 20941 CASAVA_Build 5 58967684 4I ATAGACAAAC ----/AGAG AGCCAAATCA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AG 1 3 20942 CASAVA_Build 5 58980304 1I ATCTAACCTC -/A AAAAAAAAAA 1785 het 1785 ref 40 21 7 12 A 15 16 20943 CASAVA_Build 5 59057409 1I AAGTTAGTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 393 hom 45 1 37 7 T 8 9 20944 CASAVA_Build 5 59062806 1I CTGGGTTTAT -/A ATAAGCTGAG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 20945 CASAVA_Build 5 59063153 1D TTAAACTGAC A/- AAAAAAGACT 3070 hom 94 het 40 0 30 11 A 7 6 20946 CASAVA_Build 5 59066277 1I TCATGGACTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 8 9 20947 CASAVA_Build 5 59098734 1I TTGTTTCTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 362 hom 49 1 45 3 T 9 10 20948 CASAVA_Build 5 59100660 2I TTTTTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 12 20949 CASAVA_Build 5 59101424 1I ATGCATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 39 2 25 12 A 11 12 20950 CASAVA_Build 5 59106144 1I TTATATGGGG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 7 8 20951 CASAVA_Build 5 59110162 4D GTAATTATTT AATC/---- AATCAGTTAT 3070 hom 57 het 21 0 20 4 AATC 2 1 20952 CASAVA_Build 5 59115823 1I AGTAACTTCC -/T TTTTTTTTTT 3056 het 457 hom 33 2 16 15 T 13 14 20953 CASAVA_Build 5 59133824 1I TTTGTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 10 11 20954 CASAVA_Build 5 59150454 1D AAAAGTAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 37 1 24 12 A 11 10 20955 CASAVA_Build 5 59161895 1D ACCGCTTGAG T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 5 T 7 6 20956 CASAVA_Build 5 59180155 1I AAACTGCATG -/T TATCTATGTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 1 2 20957 CASAVA_Build 5 59192610 1I ACCTAGATAA -/T TTTTTTTTTT 1893 het 816 hom 14 3 10 1 T 16 17 20958 CASAVA_Build 5 59209710 1D TGTTACCAAG T/- AGGAAGTAGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 0 20959 CASAVA_Build 5 59216468 4I TTTCTTTGTC ----/TGTT TGTCAGGTAG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TGTT 0 1 20960 CASAVA_Build 5 59217313 1I TTACATGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 9 10 20961 CASAVA_Build 5 59240980 1I CTTAGGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 11 20962 CASAVA_Build 5 59245675 1I CTTGTGCAAA -/T CAGCTGTTAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 0 1 20963 CASAVA_Build 5 59264543 9I TTAGAAATGG ---------/TGAAATCTC TGAAATCTCC 3070 het 3070 ref 32 15 7 10 TGAAATCTC 1 2 20964 CASAVA_Build 5 59285698 1I TAGGAGAGAC -/G GGGTTTCACC 1588 het 1233 hom 10 4 5 1 G 3 4 20965 CASAVA_Build 5 59294147 3D TAACAATGTT AAG/--- AATGTATATG 3070 het 3070 hom 25 10 15 2 AAG 1 0 20966 CASAVA_Build 5 59295147 13I TTCTGAAGCA -------------/CAGATTCCTTATC CTAAGTTAAC 3070 het 3070 ref 47 22 17 9 CAGATTCCTTATC 0 1 20967 CASAVA_Build 5 59299837 6I CAAAGTGCTG ------/GGATTA GGATTACAGG 3070 het 3070 hom 17 7 10 0 GGATTA 1 2 20968 CASAVA_Build 5 59300256 1D TAGTGAAACC T/- AGATTTGATA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 1 0 20969 CASAVA_Build 5 59305095 2I CATTCATTCA --/CT GTTTTGCCAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CT 0 1 20970 CASAVA_Build 5 59310956 2I TTTAAAAAAC --/TT AAGTATTCTA 2745 het 2726 hom 14 6 6 2 T 0 2 20971 CASAVA_Build 5 59315831 4I ATGAAAGGTA ----/ATAG ATAGAAAATT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 ATAG 1 2 20972 CASAVA_Build 5 59322127 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 48 15 24 9 A 9 8 20973 CASAVA_Build 5 59337412 1I TATGACCCAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 7 8 20974 CASAVA_Build 5 59353764 1D TTAAAGGTCA T/- TTTTTGTAGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 5 20975 CASAVA_Build 5 59356483 1D ACAAGCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 29 0 26 3 A 11 10 20976 CASAVA_Build 5 59361328 1D TGAGTCTCTG T/- TTGTTCTTCC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 T 3 2 20977 CASAVA_Build 5 59362048 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 2177 hom 18 5 12 1 A 7 8 20978 CASAVA_Build 5 59373491 1I AGCTGCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 244 hom 33 3 20 10 T 13 14 20979 CASAVA_Build 5 59375951 1I TAGTTTTTCC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 8 9 20980 CASAVA_Build 5 59383814 3D TGGCAGAGAC ACA/--- ACAACGAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 ACA 2 1 20981 CASAVA_Build 5 59386264 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 9 10 20982 CASAVA_Build 5 59407753 1I TTCGAATTTT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 1734 hom 22 8 10 4 A 0 1 20983 CASAVA_Build 5 59408275 1I GGAACCTGCT -/G CACTGGAGGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 20984 CASAVA_Build 5 59410896 1I ATAGGAAAAA -/G TTTTCTCCCA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 0 1 20985 CASAVA_Build 5 59413999 2D CCTCCAAAAC TG/-- TGAGATAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 7 TG 2 1 20986 CASAVA_Build 5 59415974 2D GCATCTTAAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 49 het 37 1 27 11 GT 8 7 20987 CASAVA_Build 5 59424164 1I ATGTTTCAAT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 A 7 8 20988 CASAVA_Build 5 59425374 1I TGTAAAAATG -/T TTTTTTGCAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 6 7 20989 CASAVA_Build 5 59448631 1D GCATATTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 19 2 A 11 10 20990 CASAVA_Build 5 59472136 1D ATAAAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 A 13 12 20991 CASAVA_Build 5 59485868 1D TATTAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2676 hom 28 9 15 4 T 11 10 20992 CASAVA_Build 5 59504836 1I CTAGTTGTGC -/A ATCTTGGCTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 20993 CASAVA_Build 5 59537316 1D CTAAAAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2192 hom 20 7 8 6 A 13 12 20994 CASAVA_Build 5 59542339 1I GGTTTCCTAA -/T TTTTTTTTTT 1838 het 1838 ref 22 7 6 9 T 15 16 20995 CASAVA_Build 5 59557039 1D GGATTGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 A 11 10 20996 CASAVA_Build 5 59560087 1D TACTTGGGTG C/- CCCCCAATGA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 C 6 5 20997 CASAVA_Build 5 59567755 2D ATGTTAGGAC TT/-- AGTGCTTGGT 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 2 0 20998 CASAVA_Build 5 59577409 1D TAATGAGTAC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 8 7 20999 CASAVA_Build 5 59577606 12D CATGCCTGTA CCCCATGCCTGT/------------ ACAAAATATC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CCCCATGCCTGT 1 0 21000 CASAVA_Build 5 59577909 1D ATTCTTTTTG T/- TGTCTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 2 1 21001 CASAVA_Build 5 59579137 1D AACCACATGG A/- AAAAAATATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 6 21002 CASAVA_Build 5 59602304 1D GTAGGAATGA T/- AAAGTAGAGA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 1 0 21003 CASAVA_Build 5 59605754 1D TATTGATGAT G/- GGGGTAGAGA 3070 het 3070 ref 50 27 21 2 G 5 4 21004 CASAVA_Build 5 59741481 1I AAGCAGGGAA -/G GAACAAAGCA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 G 1 2 21005 CASAVA_Build 5 59804980 1D ATTACCACAT A/- GGGGTAATGG 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 A 1 0 21006 CASAVA_Build 5 59816397 3D AGCTACAGTC ATA/--- ATAATAGTGT 3070 het 3070 ref 59 27 25 7 ATA 3 2 21007 CASAVA_Build 5 59819500 1D TACTGAGCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 10 9 21008 CASAVA_Build 5 59823308 1D AAAACCATAT C/- TTTGCTTTAA 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 C 1 0 21009 CASAVA_Build 5 59828914 1I AATGCTAATT -/A GGGGGGTTAG 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 A 0 1 21010 CASAVA_Build 5 59835847 1I TCTTTATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 10 11 21011 CASAVA_Build 5 59838453 1D TGCAATATTT C/- TTCTGATTAT 2794 het 2794 ref 26 15 7 4 C 1 0 21012 CASAVA_Build 5 59848359 1I CACTAAGGTA -/T GGTAATGTAA 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 T 0 1 21013 CASAVA_Build 5 59851189 1I TCCTGTTTGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 55 28 19 8 A 8 9 21014 CASAVA_Build 5 59858564 1I GATGGCATAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 9 10 21015 CASAVA_Build 5 59858613 1D AAAAAGAAAC A/- AAAGTGTTTA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 A 4 3 21016 CASAVA_Build 5 59863157 5I AATCCTTAAG -----/TTACT TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TTACT 0 1 21017 CASAVA_Build 5 59867997 1I AATTCTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 10 11 21018 CASAVA_Build 5 59883930 1D TAAATCTTTG A/- CATTGAATAC 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 A 1 0 21019 CASAVA_Build 5 59930596 1I CTATTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 11 12 21020 CASAVA_Build 5 59931504 2D ATTCTATATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 TG 10 9 21021 CASAVA_Build 5 59940237 1I GCTGTAAAAT -/A ATCAGAATTC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 1 2 21022 CASAVA_Build 5 59953615 1I ATGATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 A 10 11 21023 CASAVA_Build 5 59972505 1D ACATTGTGAC T/- TTATAAAGCT 3070 het 3070 hom 64 27 31 6 T 3 2 21024 CASAVA_Build 5 59981760 1D TAAAGCAAGA C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 hom 27 8 16 4 C 5 4 21025 CASAVA_Build 5 59985459 9D CTTTCCCCAC TTTATGTTT/--------- TTCTTTGCTT 1717 het 1717 ref 20 14 5 4 TTTATGTTT 1 0 21026 CASAVA_Build 5 59990166 1I CTTTAAACAT -/G GGGCTTGTAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 G 3 4 21027 CASAVA_Build 5 59991906 2D CAAAGGGGGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 659 hom 20 3 10 7 GA 9 8 21028 CASAVA_Build 5 60007818 3I CCGGCCTTTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 16 4 9 3 TTC 0 1 21029 CASAVA_Build 5 60030973 42I TCACCCTTTA ------------------------------------------/TTGCATATAGTAAGCCTTTGAGGTAGAAATCACTAAAATTAC TTGTTCCAAG 3070 het 3070 hom 24 12 10 3 TTGCATATAGTAAGCCTTTGAGGTAGAAATCACTAAAATTAC 0 1 21030 CASAVA_Build 5 60035509 3D AATATATTAG AAA/--- GTTTTGATCA 3070 het 3070 ref 44 21 19 9 A 3 0 21031 CASAVA_Build 5 60038130 1D ATGTTACCGG A/- AAAAATATTT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 A 6 5 21032 CASAVA_Build 5 60056252 2I GTAGTGGGGG --/GC GGGTCTCTGA 3070 het 3019 hom 27 11 12 4 GC 0 1 21033 CASAVA_Build 5 60056485 1I AGAGCAGTGG -/T TAATGGTTAA 3070 het 3070 hom 43 13 24 6 T 1 2 21034 CASAVA_Build 5 60056540 7D ATTTTAGGAG TGATAGC/------- TGGGAGGACA 3070 het 3070 ref 40 16 13 13 TGATAGC 1 0 21035 CASAVA_Build 5 60058591 1D TTTGGGGGTT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 A 9 8 21036 CASAVA_Build 5 60066704 1D TGTGGGGGAT G/- GGGGGGGCTA 1907 het 1907 ref 16 9 5 2 G 8 7 21037 CASAVA_Build 5 60072584 1D GTGATGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 12 11 21038 CASAVA_Build 5 60082619 1D TCTGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1900 hom 25 7 15 3 T 13 12 21039 CASAVA_Build 5 60087717 1D GTGTATAATA G/- ACATATTTGA 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 G 1 0 21040 CASAVA_Build 5 60091193 1I GCCTATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1697 hom 25 7 12 7 T 11 12 21041 CASAVA_Build 5 60092622 4I GCTATTTTAA ----/TGTT TATTTACAAA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 TGTT 0 1 21042 CASAVA_Build 5 60100390 1D AAATACCCCC T/- GGGAGATCTT 3070 het 3054 hom 28 9 16 4 T 1 0 21043 CASAVA_Build 5 60107037 1I ACCAATGTTA -/T TTTTTTACAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 6 7 21044 CASAVA_Build 5 60120249 1D ATCCCAGCTA C/- TCGGGAGGCT 3070 het 2832 hom 22 7 11 4 C 1 0 21045 CASAVA_Build 5 60127431 2D GGCTTCTAAA AG/-- AGCTGTAACA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 AG 2 1 21046 CASAVA_Build 5 60132363 1D TAGTAGTCTT C/- CCTCCATATT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 C 3 2 21047 CASAVA_Build 5 60139115 1I TCATTTGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 831 hom 24 2 17 5 A 12 13 21048 CASAVA_Build 5 60147120 26D AAATACACGC AATAAAATTTATTTATTTTATAAATA/-------------------------- AATAAAATTT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 AATAAAATTTATTTATTTTATAAATA 1 0 21049 CASAVA_Build 5 60154720 4D TGAGGGGATG AAGT/---- AATAGAGAGA 3070 het 3070 ref 50 27 17 8 AAGT 1 0 21050 CASAVA_Build 5 60156548 1I TCACTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 2486 het 1147 hom 25 10 10 5 C 0 1 21051 CASAVA_Build 5 60159598 1D ACATTTTACA C/- CCCTAGTTCC 3070 hom 128 het 48 0 41 7 C 4 3 21052 CASAVA_Build 5 60160753 1I TAGAGCTTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 9 10 21053 CASAVA_Build 5 60182246 2D ACTGGGGATT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 96 het 40 0 32 9 AC 8 7 21054 CASAVA_Build 5 60207478 2I TTATTTTTTC --/TT TTTTTTTTAT 2497 hom 15 het 7 0 6 1 T 8 10 21055 CASAVA_Build 5 60210318 1I ATCATTTTTT -/A TTGCGTCTAT 2365 het 2365 ref 14 8 5 1 A 0 1 21056 CASAVA_Build 5 60217651 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 2615 het 2615 ref 24 11 8 5 TA 5 6 21057 CASAVA_Build 5 60223247 1I GGGCATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 26 1 21 4 T 12 13 21058 CASAVA_Build 5 60230380 1I TTTTCCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 28 1 23 4 A 10 11 21059 CASAVA_Build 5 60271063 3D GCAATACTTC TTT/--- TTTTTAATTT 3017 het 3017 ref 22 10 7 6 T 8 5 21060 CASAVA_Build 5 60293546 1D CTCTTTCTCT A/- AAAAAAAAAA 998 het 998 ref 33 25 3 6 A 13 12 21061 CASAVA_Build 5 60307889 1I ATGTATGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 12 13 21062 CASAVA_Build 5 60370434 1D CAGCTATAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 T 10 9 21063 CASAVA_Build 5 60377289 4I GAACTTGTTT ----/GTTA GTTCTAACAG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 GTTA 0 1 21064 CASAVA_Build 5 60398188 1D ATTTTTGATC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 8 7 21065 CASAVA_Build 5 60452324 2I CTTCTGAGTC --/AT ATCATTAGTC 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 AT 1 2 21066 CASAVA_Build 5 60469854 10I ACTTATTAGG ----------/AGGCAATAAT AGTCCAAGCA 3070 het 3070 ref 54 30 22 2 AGGCAATAAT 0 1 21067 CASAVA_Build 5 60488465 1I TCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 13 14 21068 CASAVA_Build 5 60501938 1D CCCTGATATG T/- TAACAGGTAG 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 2 1 21069 CASAVA_Build 5 60526409 1D GCTTTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 11 9 A 11 10 21070 CASAVA_Build 5 60531115 9I TTCATTGTTT ---------/TTTCTCTAA TCTTGTCTGC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 TTTCTCTAA 0 1 21071 CASAVA_Build 5 60541506 4D TCAAATACTT TTTA/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 19 19 3 TTTA 1 0 21072 CASAVA_Build 5 60542146 1I CCTTATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 10 11 21073 CASAVA_Build 5 60543088 1D GCTCCTAATG T/- TAATACTTTT 3070 het 3070 hom 55 18 33 4 T 2 1 21074 CASAVA_Build 5 60548706 1D TGTTTGCATA T/- AATTTGAAGC 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 1 0 21075 CASAVA_Build 5 60549216 1D ACCCCTTTAC A/- AATTTCAGGT 3070 hom 31 het 33 0 19 15 A 3 2 21076 CASAVA_Build 5 60562298 2D GTATGTGTGA GT/-- GTGTGTGAGT 3070 het 3070 ref 74 28 27 23 GT 4 3 21077 CASAVA_Build 5 60577963 3I GCACAGGCTT ---/TAA TAATAATAAT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 TAA 4 5 21078 CASAVA_Build 5 60582087 3I CTGGTATCTC ---/ATT GTTGTTTTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATT 0 1 21079 CASAVA_Build 5 60591455 1D TGTTTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 11 10 21080 CASAVA_Build 5 60593062 1D TAATTTTTTG T/- TAAGTTGAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 2 1 21081 CASAVA_Build 5 60600909 4D69M3D AGAGAGAAAG AGAAAGAAAGAAAGAAGGAGAGAAAGAAAGAAAGAAGAAAGAAAAAGAGAAAGAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAGA/----AGAAAGAAAGAAGGAGAGAAAGAAAGAAAGAAGAAAGAAAAAGAGAAAGAAGAAAGAAAAGAAAGAAAG--- AAAGAAAGAA 3070 het 154 hom 14 2 18 21 N/A 0 0 21082 CASAVA_Build 5 60605747 1D CCTGTATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 13 11 A 15 14 21083 CASAVA_Build 5 60614702 2I ATATATATAT --/AG AGAGAGAGAG 1694 hom 18 het 9 0 7 2 AG 5 6 21084 CASAVA_Build 5 60626358 5I CTTGTTCTTT -----/GTCTG GTCTGGTGTC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 GTCTG 1 2 21085 CASAVA_Build 5 60628643 1I GTTTTGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 11 12 21086 CASAVA_Build 5 60629020 1D GGGACTGTTA T/- TTTTTTACAA 3070 het 2673 hom 26 10 14 3 T 7 6 21087 CASAVA_Build 5 60633114 1D CTCAGCTAAA G/- GAAACAAACT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 G 2 1 21088 CASAVA_Build 5 60636836 1I AGTGTGTGTG -/T GGGGGGGGGG 2250 het 2250 ref 24 7 6 11 T 0 1 21089 CASAVA_Build 5 60642757 1I ACATTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 A 10 11 21090 CASAVA_Build 5 60649584 1D CATTAAAAAT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 28 het 30 0 18 12 C 11 10 21091 CASAVA_Build 5 60668870 1I CTCCCCCCCC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 49 het 25 0 17 8 A 8 9 21092 CASAVA_Build 5 60669749 1D GTTTTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1292 hom 29 5 17 7 T 12 11 21093 CASAVA_Build 5 60672830 1I CAATGGGGGT -/G GCATCCCATC 3070 hom 95 het 42 0 31 11 G 1 2 21094 CASAVA_Build 5 60685381 1D ATTTTCTCGA T/- TTTTAGTGGG 3070 hom 128 het 48 0 43 5 T 5 4 21095 CASAVA_Build 5 60691817 1D ACCAGGAAAC A/- AAAAAAGGCC 3070 hom 73 het 29 0 24 5 A 7 6 21096 CASAVA_Build 5 60699801 4D AGCACATGAT AAAG/---- AACTCAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 19 4 AAAG 1 0 21097 CASAVA_Build 5 60708612 1I TGTAATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 260 hom 30 1 28 1 A 10 11 21098 CASAVA_Build 5 60709300 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1681 het 1681 ref 24 10 4 10 A 13 12 21099 CASAVA_Build 5 60718687 1D TAGTTGCTTA T/- GTCAGAAAAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 1 0 21100 CASAVA_Build 5 60733587 1D ACCTGTTCTC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 9 8 21101 CASAVA_Build 5 60738703 2D CATGGAAAAC AT/-- ATCTTACTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 AT 2 1 21102 CASAVA_Build 5 60744551 1D AAATTAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 11 10 21103 CASAVA_Build 5 60752076 1I CAGAACACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 12 15 T 12 13 21104 CASAVA_Build 5 60752501 1I ATTCGTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 26 0 20 6 T 12 13 21105 CASAVA_Build 5 60785447 1D ATAAAATATT G/- GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 G 9 8 21106 CASAVA_Build 5 60786152 1D TATCCCTAAG T/- TTTTTTTTTT 1550 het 477 hom 29 5 7 17 T 19 18 21107 CASAVA_Build 5 60788488 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 49 het 25 0 16 10 T 8 9 21108 CASAVA_Build 5 60799435 1D TACTATTGTC T/- GACTCACTTA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 1 0 21109 CASAVA_Build 5 60811501 1I GTGAACCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 157 hom 27 1 22 4 T 11 12 21110 CASAVA_Build 5 60813948 1D GTGGGGGGTT A/- GGGGAGGGAT 1465 het 1465 ref 15 5 6 4 A 1 0 21111 CASAVA_Build 5 60814491 1D CTTTGGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 26 1 22 3 T 11 10 21112 CASAVA_Build 5 60823398 1I TAATTAAAAG -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 0 1 21113 CASAVA_Build 5 60840887 1D AAATAAGTTC T/- GATAACTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 3 T 1 0 21114 CASAVA_Build 5 60842086 1I TGACGAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 564 hom 51 3 36 12 T 12 13 21115 CASAVA_Build 5 60851151 3D TCCAAAGTTT TTG/--- TTGTTATCAT 2513 het 2513 ref 30 20 9 2 TTG 2 1 21116 CASAVA_Build 5 60858175 1I TAAGCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 37 1 28 8 T 11 12 21117 CASAVA_Build 5 60872309 2D TGATGCAGAA AG/-- AACCATTAAC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 AG 1 0 21118 CASAVA_Build 5 60874812 1I GGATTGGTTC -/T TTTATTATAG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 3 4 21119 CASAVA_Build 5 60876665 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 10 11 21120 CASAVA_Build 5 60878268 1I CACATAATTT -/A ACCATCTTAG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 A 1 2 21121 CASAVA_Build 5 60912826 1I CAGCAAACCT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 49 19 14 16 A 8 9 21122 CASAVA_Build 5 60917127 1I ACAAACCATA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 8 9 21123 CASAVA_Build 5 60935108 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 147 hom 27 1 24 2 T 10 9 21124 CASAVA_Build 5 60937670 1D CAGTGTGAAC G/- GGGGGTGAGT 3070 hom 96 het 38 0 31 7 G 6 5 21125 CASAVA_Build 5 60953943 1D GATGACTTGT A/- AAAGTGTGGG 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 A 4 3 21126 CASAVA_Build 5 60954998 1I TGGGCATCCT -/G GGTATCAGTT 3070 hom 94 het 38 0 29 9 G 2 3 21127 CASAVA_Build 5 60989494 1I AGTATGTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 8 10 6 A 9 10 21128 CASAVA_Build 5 60990447 1I TCCAGGAGAA -/G GGGGGGCCCC 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 G 6 7 21129 CASAVA_Build 5 61012731 1D CGGGAACTAG T/- TTAAAGTTGC 3070 het 3070 ref 48 26 20 4 T 3 2 21130 CASAVA_Build 5 61023578 1D ACATAAACAC A/- AAAAAACTCT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 7 6 21131 CASAVA_Build 5 61031491 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 19 1 17 1 A 15 14 21132 CASAVA_Build 5 61034660 1I CTGTCTCCTG -/C CCCAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 C 3 4 21133 CASAVA_Build 5 61036304 2D TTTTCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2598 het 583 hom 28 4 10 14 T 16 14 21134 CASAVA_Build 5 61042290 1D GCAAATTTAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 33 0 28 5 A 9 8 21135 CASAVA_Build 5 61049802 1D AATAGGTGCA T/- TTTTTATATG 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 T 6 5 21136 CASAVA_Build 5 61054752 1D ACTTCTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 10 12 T 13 12 21137 CASAVA_Build 5 61057656 4I AAATTCAGCC ----/AGGT AGGATGGTCA 3070 het 3070 hom 50 16 31 3 AGGT 0 1 21138 CASAVA_Build 5 61061544 1I GTCAGATTAA -/T GAATGCAATG 3070 hom 123 het 47 0 37 10 T 0 1 21139 CASAVA_Build 5 61062210 13I GTCTTTGGGA -------------/GATTCAGAAGGAC GATACACCAG 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 GATTCAGAAGGAC 0 1 21140 CASAVA_Build 5 61062468 1I ATTAGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 10 11 21141 CASAVA_Build 5 61063394 1I AGAAAGAGAG -/A AGAGAAGAGA 3070 het 3070 hom 49 18 22 9 A 1 2 21142 CASAVA_Build 5 61069243 1D GGGCCCTTTT C/- CCCATTAGCC 3070 het 3070 hom 42 16 20 7 C 4 3 21143 CASAVA_Build 5 61094406 3I ACTCCAAAGG ---/AAT AATAATAGTC 3070 hom 93 het 40 0 31 9 AAT 2 3 21144 CASAVA_Build 5 61108370 3I1M6D TTTACACTGG ---TGGCTCC/AAAT------ CAACCTTCCC 3070 het 3070 hom 42 14 26 3 N/A 0 0 21145 CASAVA_Build 5 61108813 1I TCTACTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 10 11 21146 CASAVA_Build 5 61121802 1D GCAATTTGTT G/- GTAATAGGAT 3070 hom 109 het 44 0 37 8 G 2 1 21147 CASAVA_Build 5 61147267 1I AAAAGAGTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 9 10 21148 CASAVA_Build 5 61188152 8D AATCTAAGAT AGATGGGA/-------- AGATGGGAGT 3070 het 3070 hom 37 14 17 9 AGATGGGA 2 1 21149 CASAVA_Build 5 61224992 5D CATGAATGTA TTAAG/----- TTATTACATG 3070 hom 108 het 39 0 36 4 TTAAG 1 0 21150 CASAVA_Build 5 61236737 2D ACTCCCTCTC CA/-- CACACACACA 3070 hom 102 het 41 0 33 9 CA 8 7 21151 CASAVA_Build 5 61241691 1I GGGCAACGAC -/A GGGGTGGCTG 3070 hom 30 het 11 0 9 2 A 0 1 21152 CASAVA_Build 5 61260807 1I AGATTATAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 190 hom 28 1 23 4 T 9 10 21153 CASAVA_Build 5 61270732 1D AAATTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 45 1 35 9 T 12 11 21154 CASAVA_Build 5 61312609 1D AGTAAAAGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 T 10 9 21155 CASAVA_Build 5 61334734 1D TTCTAAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 10 9 21156 CASAVA_Build 5 61340698 1I AGCCAGGCAT -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 A 6 7 21157 CASAVA_Build 5 61343379 1I TCTGGGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 28 1 19 8 A 11 12 21158 CASAVA_Build 5 61345320 1I AAGTTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2493 hom 22 7 12 3 A 10 11 21159 CASAVA_Build 5 61360353 1I AGATCCTTTG -/C CATACAGCGG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 1 2 21160 CASAVA_Build 5 61376521 1I14M1I GGGAAAAAAA -AAAGAAGAAAAAAA-/CAAAGAAGAAAAAAAT ATTACAAAGT 3070 het 2707 hom 25 8 18 3 N/A 0 0 21161 CASAVA_Build 5 61433732 1I AACCAGTCTA -/C CCACCTCAGC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 C 2 3 21162 CASAVA_Build 5 61434870 1I AACTCTGATG -/A GTCTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 0 1 21163 CASAVA_Build 5 61457363 1D TTCCCTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 14 8 T 12 11 21164 CASAVA_Build 5 61466129 1D TTTGTGGGTT A/- AAATGTCAAC 3070 het 3070 hom 32 9 16 8 A 4 3 21165 CASAVA_Build 5 61472428 2I CAAAGAAGAC --/TT TATGTCAAAG 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 T 1 3 21166 CASAVA_Build 5 61506907 1I CCAAATCACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 9 10 21167 CASAVA_Build 5 61508576 2I AAGATTTGTT --/TC TCCAGACCCT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TC 1 2 21168 CASAVA_Build 5 61512203 1D ACCCTGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2494 hom 32 10 13 9 A 15 14 21169 CASAVA_Build 5 61513377 1D CTTATTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 A 11 10 21170 CASAVA_Build 5 61518239 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 1297 het 1297 ref 40 26 3 12 A 10 9 21171 CASAVA_Build 5 61539101 1I CTTGAGCCCA -/G GGGTTCAAGG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 3 4 21172 CASAVA_Build 5 61565768 1D TGCACAACAC A/- AAGATGAGCC 2189 het 2189 ref 53 44 5 5 A 3 2 21173 CASAVA_Build 5 61579390 5D TTATGTTCTT TAAAA/----- TACCAATTAG 2757 het 2757 ref 47 37 6 9 TAAAA 1 0 21174 CASAVA_Build 5 61583979 1I GGGCTGTCAT -/A TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 0 1 21175 CASAVA_Build 5 61586659 2D GTGGGAGGAC AG/-- AGTGGTAGGG 3070 het 3070 ref 45 31 10 5 AG 2 1 21176 CASAVA_Build 5 61587088 1I CCAGGCCACC -/T GGAATGAATG 3070 het 3070 ref 54 28 25 1 T 0 1 21177 CASAVA_Build 5 61611633 1I GCCAACAGCT -/G GGAACCATAA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 G 2 3 21178 CASAVA_Build 5 61614406 1I GGTAGGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 11 12 21179 CASAVA_Build 5 61622083 8D ACTCTGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 11 12 3 A 18 10 21180 CASAVA_Build 5 61638715 1I TTTGCCACTT -/C CTTGGGAGAA 3070 het 2835 hom 27 8 13 6 C 1 2 21181 CASAVA_Build 5 61640504 4I CTTGTTAAAG ----/TAAT TATGTGAAAT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 TAAT 0 1 21182 CASAVA_Build 5 61649514 1I TCTCTTGCTC -/A ACAAGACTTT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 1 2 21183 CASAVA_Build 5 61657047 1I GCTCTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2310 hom 22 6 16 0 A 10 11 21184 CASAVA_Build 5 61668646 3D GGAAATTGGA TCT/--- TCTTATAATA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 TCT 2 1 21185 CASAVA_Build 5 61669074 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 479 hom 10 1 8 1 A 11 12 21186 CASAVA_Build 5 61669364 1D CACCGTACTT C/- AGCCTGGGCA 3070 het 2419 hom 29 9 11 9 C 1 0 21187 CASAVA_Build 5 61672173 1I TCATTGTTCT -/C CCCCCTAGTG 3070 het 3070 ref 53 29 22 2 C 5 6 21188 CASAVA_Build 5 61672891 1I GTCTCCTTGA -/T TTTTTTTTTT 1815 het 1815 ref 31 13 10 8 T 13 14 21189 CASAVA_Build 5 61673060 1I GATTTTTAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 8 9 21190 CASAVA_Build 5 61691042 1D AGTCAGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 11 10 21191 CASAVA_Build 5 61691761 1D TTTAGTAGAG A/- CGGGGTTTCA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 1 0 21192 CASAVA_Build 5 61701260 2I GAGTCAGTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 11 13 21193 CASAVA_Build 5 61708753 4I ATTTAAGAAA ----/TTAG TTAGTTAAGA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 TTAG 1 2 21194 CASAVA_Build 5 61711244 2I GAAACTCAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 11 6 A 14 16 21195 CASAVA_Build 5 61716715 1D GACAGAGTGA G/- GACTCCATCT 3070 het 71 hom 29 2 24 3 G 2 1 21196 CASAVA_Build 5 61719349 3D TCTTAATGTA TAT/--- TATTTCATAT 3070 hom 54 het 21 0 19 4 TAT 2 1 21197 CASAVA_Build 5 61720640 1D TAGCAATCTG A/- AAAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 39 24 12 4 A 6 5 21198 CASAVA_Build 5 61724094 1I AAAATCCCCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 9 10 21199 CASAVA_Build 5 61725498 1D CCGCCTGGAC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 42 18 14 11 T 8 7 21200 CASAVA_Build 5 61726300 5D TTGGCAGCTG ATTAT/----- AAGGTAGGAG 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 ATTAT 1 0 21201 CASAVA_Build 5 61726611 1D AGATGTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 540 hom 34 7 12 15 T 15 14 21202 CASAVA_Build 5 61727173 1D ATGTGATTAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 A 9 8 21203 CASAVA_Build 5 61731819 2I TTTCACTGAC --/TT TTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 T 3 5 21204 CASAVA_Build 5 61738103 2D ATAAATATAA AT/-- ATATATATAT 2680 hom 15 het 6 0 6 0 AT 10 9 21205 CASAVA_Build 5 61748705 1I TTTTTCTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 20 0 15 5 T 11 12 21206 CASAVA_Build 5 61756107 1I ACCTCTGCCT -/C CTGCCACCTC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 2 21207 CASAVA_Build 5 61762965 1I AGAAATTCCA -/G GGGCAATTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 3 4 21208 CASAVA_Build 5 61765884 1I GCAGTCAGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 301 hom 39 1 28 10 T 9 10 21209 CASAVA_Build 5 61792414 1I TCACATGTAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 7 8 21210 CASAVA_Build 5 61846498 4I CATCATTGCA ----/CTTT CTTCCCCTTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 CTTT 0 1 21211 CASAVA_Build 5 61856941 3D CCTCCCATCC TTT/--- TTTTTTTTTT 1422 het 1422 ref 35 12 8 15 T 13 10 21212 CASAVA_Build 5 61874370 10D CATATTTGAA ATTTGTCAAT/---------- ATTACAGCCG 3070 het 3070 ref 31 22 9 1 ATTTGTCAAT 1 0 21213 CASAVA_Build 5 61896170 1D CAGATGATAA T/- TTTTTGTGGG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 6 5 21214 CASAVA_Build 5 61911470 1I TGTTCCGAGA -/G GAGTATTTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 2 21215 CASAVA_Build 5 61927852 1I GCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1340 het 1340 ref 27 6 7 14 A 15 16 21216 CASAVA_Build 5 61995311 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2993 het 1259 hom 21 5 8 8 T 11 12 21217 CASAVA_Build 5 61999714 1D TTATTAGCCT C/- TCAGTGCCTC 3070 hom 120 het 46 0 40 7 C 1 0 21218 CASAVA_Build 5 62015762 6D GTATGGGAAT GAGGAG/------ GAGGAGGAGG 3070 het 3070 hom 56 26 22 11 GAG 7 5 21219 CASAVA_Build 5 62028296 5D TTCTTAGGTT TGAGG/----- TGAGAAGCCC 3070 het 3070 ref 36 17 14 9 TGAGG 1 0 21220 CASAVA_Build 5 62114953 1D GGCAACCAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 46 17 23 7 T 9 8 21221 CASAVA_Build 5 62119113 1I AGTGTTATTA -/T TGTTGAGCCT 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 T 1 2 21222 CASAVA_Build 5 62120378 1I CATTGTTTTA -/G GTTCCCGGAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 1 2 21223 CASAVA_Build 5 62123483 3D TATTTCTCAC TTG/--- TTGTAATAAT 3070 het 3070 ref 37 22 15 0 TTG 2 1 21224 CASAVA_Build 5 62123815 1I AGTTTGCCTA -/T TTGTAGAGCT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 2 3 21225 CASAVA_Build 5 62136567 1I ATTTGGCCAT -/C TTGGCTCCTC 629 het 629 ref 13 7 3 3 C 0 1 21226 CASAVA_Build 5 62156888 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 15 28 7 T 9 10 21227 CASAVA_Build 5 62167850 5I GACCATACAA -----/CCCAG CAACTTTCCT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 CCCAG 0 1 21228 CASAVA_Build 5 62181274 1D GTTTTCTATA T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 7 6 21229 CASAVA_Build 5 62181972 1D CTTAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1405 hom 30 6 15 10 T 15 14 21230 CASAVA_Build 5 62189970 2D GTCACTTCTT AC/-- AGTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 AC 1 0 21231 CASAVA_Build 5 62190948 3I ACTGAAAAGT ---/CTG CTGCCAGGTG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 CTG 1 2 21232 CASAVA_Build 5 62208320 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 24 14 10 4 AAAC 3 2 21233 CASAVA_Build 5 62216559 4D CTGAGGGTCA TACT/---- TACTAGTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 20 0 TACT 2 1 21234 CASAVA_Build 5 62222433 5D TTCTGCAGAA CTTTT/----- CTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 CTTTT 2 1 21235 CASAVA_Build 5 62233035 2I TGTTTCATGT --/TA TATTTTACTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 TA 1 2 21236 CASAVA_Build 5 62236845 1I TTTCGCATGG -/C TGGGAGGCCT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 C 0 1 21237 CASAVA_Build 5 62238943 1I TCCTGATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 891 hom 36 2 21 13 T 12 13 21238 CASAVA_Build 5 62245333 1D CCTGACCTCG T/- GATCCGCCTG 3070 hom 30 het 17 0 14 3 T 1 0 21239 CASAVA_Build 5 62246536 1I ATAAAAGTGG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 144 het 56 0 49 7 T 8 9 21240 CASAVA_Build 5 62255414 1D TATCTGTCAT G/- GGCTTTCACT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 3 2 21241 CASAVA_Build 5 62256471 1D GCTTAAACCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 41 0 32 10 T 10 9 21242 CASAVA_Build 5 62268507 1D CATTAATACA C/- CAAGGGAGAC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 C 2 1 21243 CASAVA_Build 5 62268794 1D GCAATGAACT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 47 26 18 4 A 8 7 21244 CASAVA_Build 5 62288466 1I GTAATTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 20 20 10 A 10 11 21245 CASAVA_Build 5 62303797 1D ATGAGGATGC A/- AAGGCATAAG 3070 hom 24 het 11 0 8 3 A 3 2 21246 CASAVA_Build 5 62312400 2D TCACCTAATG TT/-- TTTTTTTTCC 3070 hom 51 het 22 0 17 7 T 10 8 21247 CASAVA_Build 5 62316767 1D CTGAAATGAC A/- GATATAGAAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 A 1 0 21248 CASAVA_Build 5 62327606 5D AATTATTGTC TTCTT/----- TTGTGTTTAG 3070 het 3070 hom 40 10 28 4 TTCTT 1 0 21249 CASAVA_Build 5 62328470 1D TAGGTTGGTG T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 8 7 21250 CASAVA_Build 5 62328733 4D GAGATCTCTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 TGTT 6 5 21251 CASAVA_Build 5 62330417 1I TTTAATATTA -/G GTTTAATTCT 3070 hom 96 het 43 0 33 10 G 1 2 21252 CASAVA_Build 5 62331892 1D GCATCACAAG T/- GAGATCTTGC 3070 het 3070 hom 39 16 20 5 T 1 0 21253 CASAVA_Build 5 62332700 1D GTTTCTTGCC T/- TTTCTAGCTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 4 3 21254 CASAVA_Build 5 62336741 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 T 9 8 21255 CASAVA_Build 5 62364081 1D GCCTAGGAGG A/- AAAAATGGTT 3070 het 2776 hom 24 9 12 3 A 6 5 21256 CASAVA_Build 5 62364846 1D CAAGGTAACT A/- ACATGTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 A 2 1 21257 CASAVA_Build 5 62367786 1D ACTCCGTGTC A/- AAAAAAAAAA 2782 het 2162 hom 18 7 8 3 A 11 10 21258 CASAVA_Build 5 62378099 6I ACAGTTCAAA ------/CACAAT CACAATCACA 3070 het 3070 hom 45 17 17 11 CACAAT 1 2 21259 CASAVA_Build 5 62381024 3I CTTTTTTTAA ---/ATT ATTATTATTA 1292 het 625 hom 9 2 3 4 ATT 5 6 21260 CASAVA_Build 5 62411413 2D TGTCAATGAC AG/-- AGTAGCTTGA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 AG 2 1 21261 CASAVA_Build 5 62414675 1I AACTACCAAA -/G GGGGGGTCTT 3065 het 3065 ref 27 15 7 5 G 6 7 21262 CASAVA_Build 5 62426738 1D CAAATATATA T/- TTTTTGTATG 3070 het 3070 hom 21 8 12 2 T 6 5 21263 CASAVA_Build 5 62441165 1I ATTTTTAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 T 9 10 21264 CASAVA_Build 5 62444625 6D ATATGTTCTT ACAAAG/------ ACAAAGTGTC 3070 het 3070 ref 33 21 10 4 ACAAAG 2 1 21265 CASAVA_Build 5 62450562 10I TTTGGTTAAT ----------/CTGTCTAAAG CTGTCTAAAG 2491 het 2491 ref 33 19 6 8 CTGTCTAAAG 1 2 21266 CASAVA_Build 5 62459593 1I TTTGGAAAAG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 21267 CASAVA_Build 5 62469012 1I TCTACTTTCC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 6 7 21268 CASAVA_Build 5 62472767 3I TCCTTTGCTT ---/ATC ATTTCCATCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 ATC 0 1 21269 CASAVA_Build 5 62480888 5D TATTTATCAG GAAAC/----- CAAGAATCTC 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 GAAAC 1 0 21270 CASAVA_Build 5 62481720 2D TATTACCAGT AC/-- AGTGTTATTT 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 AC 1 0 21271 CASAVA_Build 5 62490730 1I TTCACAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 11 12 21272 CASAVA_Build 5 62491410 8D TCTTCATCAA AGTTTTAT/-------- AGTTTTATAG 3070 het 3070 ref 36 19 17 1 AGTTTTAT 2 1 21273 CASAVA_Build 5 62501831 1D GCAATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1135 het 1135 ref 41 32 3 6 T 12 11 21274 CASAVA_Build 5 62518312 1D TTTGAGACTG A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 7 6 21275 CASAVA_Build 5 62520600 1I AGCCCTTATT -/C TATCCCCTAA 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 C 0 1 21276 CASAVA_Build 5 62523871 2D CACACATATG CA/-- CATATATATA 3070 hom 96 het 38 0 33 7 CA 2 1 21277 CASAVA_Build 5 62526631 1I AAGTTTAAAA -/G GCAGTTCAGG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 G 1 2 21278 CASAVA_Build 5 62526822 4D AACAGAAAAA AAAT/---- AAATAAGAAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 7 AAAT 2 1 21279 CASAVA_Build 5 62531999 3I TGTGCTACAT ---/CTC CTCAGGGAAG 3070 het 3070 hom 61 28 27 6 CTC 1 2 21280 CASAVA_Build 5 62533975 3D TTTATGCTTC TGT/--- TGAGTGAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 TGT 1 0 21281 CASAVA_Build 5 62538445 1D TAGGGGCTGA G/- GATGCTCAGC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 G 2 1 21282 CASAVA_Build 5 62544902 4D ATGTGTTCTG TTCA/---- TTCTCCAGTA 3070 het 3070 hom 45 19 23 6 TTCA 1 0 21283 CASAVA_Build 5 62547419 2I AACAGGGGAA --/AG AGAAAGAGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 1 2 21284 CASAVA_Build 5 62561327 2D ATATCTGTAG TC/-- TCTCTGTAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 TC 3 2 21285 CASAVA_Build 5 62562557 1I TACAAAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 42 0 35 7 T 10 11 21286 CASAVA_Build 5 62567235 1I ATTTTAATTG -/C TGAGTAGTAC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 C 0 1 21287 CASAVA_Build 5 62570344 1I TGCAAATCAC -/A TATATAATAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 1 21288 CASAVA_Build 5 62570989 1D ATAAACCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 A 12 11 21289 CASAVA_Build 5 62580508 4D CTCCTTAAGC TCTG/---- TCTGAAGGCC 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 TCTG 2 1 21290 CASAVA_Build 5 62590511 1I CATTTTTGAC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 T 8 9 21291 CASAVA_Build 5 62591585 1D ACTTACCTGC T/- TTTATTGATG 3070 het 3070 hom 41 21 20 1 T 4 3 21292 CASAVA_Build 5 62599349 1D TTAAAAAATA C/- TTTGCTAAAT 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 C 1 0 21293 CASAVA_Build 5 62599945 1D TTGGAATAAA C/- TTTCAAAACT 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 C 1 0 21294 CASAVA_Build 5 62600939 1I TCAGCACTTG -/C GGCTTCCTCA 3070 het 3070 ref 47 27 12 8 C 0 1 21295 CASAVA_Build 5 62601188 1I GAAGCCTGAC -/T TTTGGCCTAT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 3 4 21296 CASAVA_Build 5 62601661 1I TCAATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 19 12 A 12 13 21297 CASAVA_Build 5 62611202 2D GTCATGAAAC AT/-- GTGGTGTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 AT 1 0 21298 CASAVA_Build 5 62612006 1I AATTCCCTGG -/T GGCTAAGATT 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 0 1 21299 CASAVA_Build 5 62614205 2I GTAGTCGTTC --/TG TGACAGGCTG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 TG 1 2 21300 CASAVA_Build 5 62620058 1D AGAAAAGTTG A/- AAAAAATCAT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 7 6 21301 CASAVA_Build 5 62621908 1D TACATGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 541 hom 34 2 19 13 T 16 15 21302 CASAVA_Build 5 62629693 1I TTCTAAAGAA -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 5 6 21303 CASAVA_Build 5 62632644 2I ACCCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 T 10 12 21304 CASAVA_Build 5 62632737 1D ATACAGTTCT G/- TTAGCCAGTA 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 G 1 0 21305 CASAVA_Build 5 62634958 3I ATACTTATAT ---/CTG TGTGCTTCAT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 CTG 0 1 21306 CASAVA_Build 5 62639862 3I GCAAAACAAA ---/TCT TCTTTGTTTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TCT 1 2 21307 CASAVA_Build 5 62641384 1I TAGGTGGTAT -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 6 7 21308 CASAVA_Build 5 62642557 2D AAAAACACTT TA/-- TGACTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 TA 1 0 21309 CASAVA_Build 5 62645663 1D TCAGGAGATT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 8 7 21310 CASAVA_Build 5 62648769 1D AGAGAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 13 22 16 T 13 12 21311 CASAVA_Build 5 62649340 1I TCTGTTCATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 27 0 24 3 T 9 10 21312 CASAVA_Build 5 62662863 2I GGTTGGTAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 14 16 21313 CASAVA_Build 5 62667185 3I GTTTGTATCC ---/TCT TTTCTTTCTT 1866 het 1866 ref 13 6 5 2 TCT 0 1 21314 CASAVA_Build 5 62670197 3I AGAAGAAGAT ---/AAG AAGAAAATAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 AAG 1 2 21315 CASAVA_Build 5 62675477 1D CACTTATGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 10 9 21316 CASAVA_Build 5 62678006 1I ATATGGAGAT -/A ATGAGTTCAT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 1 2 21317 CASAVA_Build 5 62691365 1D GGCTGCCCTT A/- AACATTTTTT 3070 het 3070 ref 26 17 9 0 A 3 2 21318 CASAVA_Build 5 62696034 5D AAATACTACT GTTAA/----- GTTTTAAATA 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 GTTAA 1 0 21319 CASAVA_Build 5 62696867 3D CTATTTGGGC TCT/--- TTTTTGATTC 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 TCT 1 0 21320 CASAVA_Build 5 62698146 1D TATCATATAT A/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 1 0 21321 CASAVA_Build 5 62700774 1I ATCCCAGGAA -/T TTTGGGAGGC 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 3 4 21322 CASAVA_Build 5 62703320 1I AAAATACACT -/C CAGAATGGAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 C 1 2 21323 CASAVA_Build 5 62705519 4D CTAAGTAGAG TCTT/---- TATAGTATTA 3070 het 3070 hom 26 12 14 1 TCTT 1 0 21324 CASAVA_Build 5 62736928 3I TCAGTTGATC ---/AGG AGGACATAAT 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 AGG 1 2 21325 CASAVA_Build 5 62763769 1D GACTCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 10 16 A 15 14 21326 CASAVA_Build 5 62818690 1D ATAGTTTGGA T/- TTTTCATCCC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 5 4 21327 CASAVA_Build 5 62825940 1D44M2I AATTATTTTT CTTTTAGTTTTGGTAGTTTCTACTGACATATCTTTAAGCTCACCA--/-TTTTAGTTTTGGTAGTTTCTACTGACATATCTTTAAGCTCACCATT TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 16 N/A 0 0 21328 CASAVA_Build 5 62828218 2I CACATGATTT --/AG AGAATATTTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AG 1 2 21329 CASAVA_Build 5 62830319 3D GATAAAAGGC ATA/--- ATATGTTACA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ATA 2 1 21330 CASAVA_Build 5 62833110 1I TGCTGTTTCC -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 6 7 21331 CASAVA_Build 5 62835251 1I ATTCTTTGTC -/T TTTTTTGATC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 7 21332 CASAVA_Build 5 62836810 1I ACTTGTACAC -/A AAAAACTAGA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 5 6 21333 CASAVA_Build 5 62839311 1D CCTCCTCTCT G/- GACAGGGCAT 3070 hom 87 het 33 0 26 7 G 2 1 21334 CASAVA_Build 5 62844843 2D AGGGGAACAT CA/-- CACACAGGGG 3070 hom 21 het 10 0 8 2 CA 4 3 21335 CASAVA_Build 5 62862208 1D TAAAACAGTC T/- AAAATTCCCA 3070 hom 138 het 54 0 46 9 T 1 0 21336 CASAVA_Build 5 62865902 14I GAGAGGGATA --------------/AAACTAAATAAGCT AAACCAAAAT 3070 hom 129 het 42 0 43 3 AAACTAAATAAGCT 0 1 21337 CASAVA_Build 5 62871158 2I GATTAACTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 11 13 21338 CASAVA_Build 5 62882916 2I TTTCAATAGG --/TT TTGAAATCTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 4 21339 CASAVA_Build 5 62886648 2D ACAAGGAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 50 0 39 12 T 12 10 21340 CASAVA_Build 5 62892671 1I CACCTTATAC -/A AAAAATTAAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 5 6 21341 CASAVA_Build 5 62914609 1I AAAGAAGTTG -/A AAACTTTGAA 2962 hom 15 het 7 0 6 1 A 3 4 21342 CASAVA_Build 5 62919504 3I AAAGTATAAT ---/AAC AATAATAATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAC 0 1 21343 CASAVA_Build 5 62929026 5I TCACTTTTAA -----/TAGCT TATTTATAGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TAGCT 0 1 21344 CASAVA_Build 5 62936376 1D AATTACAGGG T/- TTTTTTTTTT 1408 het 1408 ref 26 18 3 5 T 12 11 21345 CASAVA_Build 5 63078876 1I CCCCCCCCCC -/A ACCCAAGTTG 2960 het 2960 ref 43 18 11 14 A 1 2 21346 CASAVA_Build 5 63098330 2D AGACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 31 15 12 5 AC 9 8 21347 CASAVA_Build 5 63107892 1I ATTCTTCTCC -/T TTAACTTGCC 3070 het 3070 ref 60 31 21 8 T 2 3 21348 CASAVA_Build 5 63196252 1I AGCAGGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 A 10 11 21349 CASAVA_Build 5 63201061 1D ATCGAATAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 12 12 5 A 10 9 21350 CASAVA_Build 5 63216603 1I TCACATCCTG -/C TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 C 0 1 21351 CASAVA_Build 5 63229298 1D TAGGGAGAAG T/- TAACAAGGCA 3070 hom 128 het 49 0 42 7 T 2 1 21352 CASAVA_Build 5 63247291 1D TTTTAACCTC T/- TTTTTTTTTT 1841 het 1841 ref 39 31 4 4 T 11 10 21353 CASAVA_Build 5 63253342 4D AATATCAAGA TAAT/---- TAATCTTTGA 3070 hom 120 het 48 0 40 9 TAAT 2 1 21354 CASAVA_Build 5 63271705 1D TCTCACTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 11 10 21355 CASAVA_Build 5 63279533 1D TTGCATCTGT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 A 9 8 21356 CASAVA_Build 5 63283891 1D GAGCAGTGGT C/- CCCAAACTTT 3070 het 3070 ref 47 21 20 8 C 4 3 21357 CASAVA_Build 5 63299098 1D TTTTGCAACG T/- TTTTTTTTTT 1403 het 1403 ref 37 28 4 5 T 11 10 21358 CASAVA_Build 5 63301770 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 13 12 21359 CASAVA_Build 5 63305588 1D TAACTATTTA T/- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 T 4 3 21360 CASAVA_Build 5 63319833 7I GACAGCAAGA -------/AACATTT AATTCTACCT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 AACATTT 0 1 21361 CASAVA_Build 5 63321952 1I ATTTGGCTTC -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 6 7 21362 CASAVA_Build 5 63324037 4D AAAAACAAAG TATT/---- TGTTTTTACC 3070 het 3070 hom 40 18 21 4 TATT 1 0 21363 CASAVA_Build 5 63330740 1I TAGATTTTTT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 6 7 21364 CASAVA_Build 5 63351281 1I TAGTTTAATA -/T TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 T 4 5 21365 CASAVA_Build 5 63361202 1I AATAATCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 A 12 13 21366 CASAVA_Build 5 63368619 1D TGGCTCACTC A/- TAGACAAGCA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 1 0 21367 CASAVA_Build 5 63369459 1D GGAACAGTTT G/- GTTGGCTCAG 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 G 2 1 21368 CASAVA_Build 5 63371775 1I GAGAACTCAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 T 9 10 21369 CASAVA_Build 5 63384155 1I TGTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 10 11 21370 CASAVA_Build 5 63384519 1D TTTTTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 11 10 21371 CASAVA_Build 5 63388203 2D AAGGAAACTC AG/-- AGTCATGATA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 AG 2 1 21372 CASAVA_Build 5 63400983 1D CAGCCTGATT A/- AACAAACAAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 3 2 21373 CASAVA_Build 5 63401082 4D GTTGATTTAG AGAT/---- AGATCTGCTC 3070 het 3070 hom 52 21 29 2 AGAT 2 1 21374 CASAVA_Build 5 63402969 1I GATGAGGTCA -/T TATTGGAGAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 1 2 21375 CASAVA_Build 5 63403332 9I AATCTGTTTC ---------/TGCTTAACA TTAACTACCA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TGCTTAACA 0 1 21376 CASAVA_Build 5 63407537 1D TTCTAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 12 11 21377 CASAVA_Build 5 63428120 1D ACTTCTAAAA G/- TCTTCTGTCT 2949 het 2949 ref 20 9 8 3 G 1 0 21378 CASAVA_Build 5 63484792 1D GAGATATTAC T/- TTTTGCATTG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 5 4 21379 CASAVA_Build 5 63511015 14D TCTTATGCTT TTGCTACACATGCA/-------------- TGTATCAATA 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 TTGCTACACATGCA 1 0 21380 CASAVA_Build 5 63527774 1D AGGCACTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 13 12 21381 CASAVA_Build 5 63550807 1D TCTGTATGAG T/- TTGATATGAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 3 2 21382 CASAVA_Build 5 63550952 1I TTTTTGAGGA -/T TTTTTTATGC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 6 7 21383 CASAVA_Build 5 63551264 1D GCTCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1275 hom 15 3 9 3 T 12 11 21384 CASAVA_Build 5 63555140 4I ACTGAGTCTC ----/AGAG TGGTTAAATA 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 AG 0 2 21385 CASAVA_Build 5 63575994 1I GATGGAGCTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 8 9 21386 CASAVA_Build 5 63597986 5D CTATAATAGT TATAA/----- TATACAGGCT 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 TATAA 1 0 21387 CASAVA_Build 5 63608778 1I AAAAAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 2013 het 1138 hom 24 7 8 9 A 13 14 21388 CASAVA_Build 5 63615830 1I TGGGATTCCC -/T TTGTAGGTGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 3 21389 CASAVA_Build 5 63623175 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 1270 het 527 hom 8 3 3 2 T 9 10 21390 CASAVA_Build 5 63632675 1D ACAGTACTGT A/- ATATACACTG 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 A 2 1 21391 CASAVA_Build 5 63635744 2D TCAAAATATC AG/-- TGCTTGTTGA 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 AG 1 0 21392 CASAVA_Build 5 63638695 4D TCTCTTCATG CTTT/---- CTGTCATTTC 3070 het 3070 hom 27 9 17 4 CTTT 1 0 21393 CASAVA_Build 5 63645872 1D CATGCCAACA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 T 9 8 21394 CASAVA_Build 5 63649389 1D TTTTAAATTG A/- AAAATGTAAG 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 A 5 4 21395 CASAVA_Build 5 63667974 4D TTTGTCTATC TATT/---- CACTTTCTAG 3070 het 3070 ref 50 22 24 8 TATT 1 0 21396 CASAVA_Build 5 63676114 4I TGCTAGAAAA ----/AAAG AAAAACACAC 3070 het 3070 hom 51 25 23 3 AAAG 0 1 21397 CASAVA_Build 5 63677571 3I CAATCATTGA ---/TCT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TCT 0 1 21398 CASAVA_Build 5 63701050 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 10 9 21399 CASAVA_Build 5 63722712 1I TTCTGTTCCA -/T TTATCTATGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 2 3 21400 CASAVA_Build 5 63734585 2I TCTATAATTT --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 8 10 21401 CASAVA_Build 5 63736033 1D TCCATGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 A 13 12 21402 CASAVA_Build 5 63738230 1D ATACCAAAAG A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3004 hom 24 10 10 4 A 8 7 21403 CASAVA_Build 5 63759719 1I ACTAACATGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 A 8 9 21404 CASAVA_Build 5 63761212 1I AAGCAAAATG -/A AAAAACTCTT 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 A 5 6 21405 CASAVA_Build 5 63761662 1I GACTCAGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 20 17 12 A 10 11 21406 CASAVA_Build 5 63762472 1I AAAAAGAACC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 8 9 21407 CASAVA_Build 5 63763270 3I TCAGTGACAA ---/ATG ATAATACTGA 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 ATG 0 1 21408 CASAVA_Build 5 63766209 1D GTCCTAGGTA G/- GTAGGTGTGA 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 G 2 1 21409 CASAVA_Build 5 63768345 1I GTTCTTATAT -/A AAAAAAAATC 1719 het 1719 ref 22 10 5 7 A 8 9 21410 CASAVA_Build 5 63768390 1D TACAACTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 5 A 11 10 21411 CASAVA_Build 5 63768565 1D AAAGTAAGTT A/- AAAAACAATC 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 A 6 5 21412 CASAVA_Build 5 63771498 1I TTTCAAAGGG -/A TATTTACACT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 A 0 1 21413 CASAVA_Build 5 63771580 18D AAAGGATGAA TATATAAAGAAAATGTGG/------------------ TATATAAAGA 3070 het 3070 ref 38 19 15 14 TATATAAAGAAAATGTGG 2 1 21414 CASAVA_Build 5 63782041 1I CCACATACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 T 8 9 21415 CASAVA_Build 5 63786970 1I TAAAAGTGGG -/C TTTTTTTTAA 3070 het 1069 hom 30 4 23 3 C 0 1 21416 CASAVA_Build 5 63794552 1I CATTTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 A 11 12 21417 CASAVA_Build 5 63797190 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTC 1821 het 1821 ref 16 7 6 3 T 9 10 21418 CASAVA_Build 5 63815132 1D TTGCTAGGTT G/- GGGGAGTTAT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 5 4 21419 CASAVA_Build 5 63825973 1D CAAAGCAAAA G/- GCCATAAGAC 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 G 2 1 21420 CASAVA_Build 5 63834376 1D CACAGGAAAA G/- GGGATGAATC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 4 3 21421 CASAVA_Build 5 63844453 1I AGTTTAGAAA -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 6 7 21422 CASAVA_Build 5 63854920 1I AAATGTGCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2894 hom 24 6 13 5 T 9 10 21423 CASAVA_Build 5 63863882 1I TGTAATATCC -/T TTTTTTTTTT 2962 het 2962 ref 40 18 8 14 T 13 14 21424 CASAVA_Build 5 63865837 2D TGACAGACTG GA/-- GTGTGGTGAG 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 GA 1 0 21425 CASAVA_Build 5 63873536 1I TCTATTCTAG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 21426 CASAVA_Build 5 63875126 1I AAAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3062 hom 33 9 15 9 A 9 10 21427 CASAVA_Build 5 63876094 1D CCTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 877 hom 17 5 10 3 A 15 14 21428 CASAVA_Build 5 63877911 2I ATGAACAGAC --/AG AGAGATAAGA 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 AG 2 3 21429 CASAVA_Build 5 63878263 1I AGATTAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 T 9 10 21430 CASAVA_Build 5 63900366 1I ATGGTTATTG -/A TTTTTTTTTT 1908 het 1908 ref 30 15 8 7 A 0 1 21431 CASAVA_Build 5 63900522 1D GAAGGCAAGC A/- AGGGACGCAA 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 2 1 21432 CASAVA_Build 5 63908668 1D GGAAAGATTT A/- AAAATCAAAT 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 A 5 4 21433 CASAVA_Build 5 63918482 5D AACATGTAAT GAAAG/----- GAATAAATCC 3070 het 3070 ref 51 25 22 5 GAAAG 1 0 21434 CASAVA_Build 5 63937910 1I TAAGAGGAGC -/A AAACACATCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 3 4 21435 CASAVA_Build 5 63938582 1I TGTTTGATTC -/A ATTTGATATG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 1 2 21436 CASAVA_Build 5 63943756 1D CACCTGAATT C/- CACCACGACC 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 C 2 1 21437 CASAVA_Build 5 63954103 1I ATGTATTAGT -/A ATATTTTTGA 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 A 1 2 21438 CASAVA_Build 5 63967636 1D TTTGCTCAGG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 57 21 29 8 A 8 7 21439 CASAVA_Build 5 63976257 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAACAAA 2580 het 2580 ref 14 7 7 1 A 7 6 21440 CASAVA_Build 5 63977637 2D GCAAAGCTAC AG/-- AGAGTAACAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AG 3 2 21441 CASAVA_Build 5 63977807 1I GGGGGCAGGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 8 9 21442 CASAVA_Build 5 63989338 2D GTTTACAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 28 2 20 6 T 16 14 21443 CASAVA_Build 5 63992950 5D ATTTTCTCTT TACTC/----- TAAATAGGCT 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 TACTC 1 0 21444 CASAVA_Build 5 64000101 1D TGATAATTGA T/- TTTATGTGTC 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 T 4 3 21445 CASAVA_Build 5 64015969 1I TCTTTATGAC -/A ATACCTGATT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 A 1 2 21446 CASAVA_Build 5 64018899 1D CAGCTTTCTC G/- TGACCCCTGC 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 G 1 0 21447 CASAVA_Build 5 64019920 1I ATTTCTGTTG -/T TTAAGCCACC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 2 3 21448 CASAVA_Build 5 64052096 1I CCTTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 2233 het 2100 hom 19 7 7 5 T 13 14 21449 CASAVA_Build 5 64066288 2I AATTTTAACT --/TC TGATTGTTCA 3070 het 3070 ref 38 17 19 2 TC 0 1 21450 CASAVA_Build 5 64066746 1D TGTGACAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 10 9 21451 CASAVA_Build 5 64070121 3D AAGCAATCTT AAG/--- AAGAACAAAG 3070 het 3070 hom 45 17 25 5 AAG 2 1 21452 CASAVA_Build 5 64073571 1D TCTCATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 12 17 T 13 12 21453 CASAVA_Build 5 64093462 1D AGCACAAAAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 8 7 21454 CASAVA_Build 5 64095721 1D GATGAGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 10 9 21455 CASAVA_Build 5 64103258 6D AAAATGGCTT TATAAG/------ TATATTTGCA 3070 het 3070 ref 35 17 17 4 TATAAG 1 0 21456 CASAVA_Build 5 64105122 3I TGATACTGAC ---/CTT CTATGAGAAA 3070 het 3070 hom 52 22 28 2 CTT 0 1 21457 CASAVA_Build 5 64106374 9I TTGGAAGGTA ---------/AATTATGAC TGTTGACTTT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 AATTATGAC 0 1 21458 CASAVA_Build 5 64109816 1I ATGTAATGAC -/T CTCAGGATAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 1 21459 CASAVA_Build 5 64111954 4I ACATTTGTGT ----/GTGA GTATTTGAGT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 GTGA 0 1 21460 CASAVA_Build 5 64114152 2D AGTTAATGTC AT/-- AGTGAAGATA 3070 het 3070 hom 24 9 14 2 AT 1 0 21461 CASAVA_Build 5 64120503 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 T 11 10 21462 CASAVA_Build 5 64122766 1I TTTCTGTCAG -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 6 7 21463 CASAVA_Build 5 64123038 1D TAGTGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 11 10 21464 CASAVA_Build 5 64183351 1D AGCTAAGCAA T/- ACCAAGTAAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 T 1 0 21465 CASAVA_Build 5 64196707 1D TAAGGGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 24 0 15 9 A 13 12 21466 CASAVA_Build 5 64202066 1D TAAATTGGTT A/- AAAAAAAAAA 1221 het 1221 ref 31 16 6 10 A 17 16 21467 CASAVA_Build 5 64274807 2I ATCACGGCCC --/TG TGTGTGTGTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 TG 4 5 21468 CASAVA_Build 5 64281937 1D AACTAAACTT A/- ACATAAATTT 3070 het 2340 hom 27 5 19 3 A 2 1 21469 CASAVA_Build 5 64286234 2I TAGAAAGCAC --/TA TATATATATA 2915 het 2915 ref 28 12 7 9 TA 8 9 21470 CASAVA_Build 5 64286361 2D TTCTATATGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 AT 8 7 21471 CASAVA_Build 5 64291795 1D TTCCTAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 13 12 21472 CASAVA_Build 5 64292371 1I AGTACACTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 9 10 21473 CASAVA_Build 5 64301795 1D ATGAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 1217 het 507 hom 17 3 3 11 T 19 18 21474 CASAVA_Build 5 64304124 2D CAAACTGCCT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 27 7 14 7 TA 7 6 21475 CASAVA_Build 5 64309396 1I CTATACTGGC -/A AAAAAAAAAA 1832 het 1832 ref 42 31 4 7 A 11 12 21476 CASAVA_Build 5 64310189 1D GGTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1476 het 896 hom 28 5 5 18 T 16 15 21477 CASAVA_Build 5 64333471 1D ATAGCTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 11 10 21478 CASAVA_Build 5 64354907 5D TGACTTTCCT ATTTA/----- TTTTCTGAAT 3070 het 3070 hom 24 8 12 5 ATTTA 1 0 21479 CASAVA_Build 5 64361408 1I AATCTGCAAG -/A AAAAAAATCG 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 A 7 8 21480 CASAVA_Build 5 64376403 1D CCACTGCCAT C/- CCCCACCCCA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 C 5 4 21481 CASAVA_Build 5 64465816 1D CCTCCTCTGT C/- TGGAGCAATG 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 C 1 0 21482 CASAVA_Build 5 64536701 1D TTGAATCTTG A/- AAAAAAAAAA 829 het 829 ref 45 38 3 7 A 11 10 21483 CASAVA_Build 5 64637174 1I CAAAGGAGTG -/T TTGGCAAACC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 3 21484 CASAVA_Build 5 64719619 1I CGTGGCAAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 C 2 3 21485 CASAVA_Build 5 64759381 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2413 het 1086 hom 16 3 7 6 A 13 14 21486 CASAVA_Build 5 64797048 1I ATCATTCCCA -/T CTTCAAACAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 0 1 21487 CASAVA_Build 5 64803341 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 673 het 673 ref 17 9 3 5 A 11 12 21488 CASAVA_Build 5 64807641 1I GACTTCCATC -/T TGCTAGCCAC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 1 2 21489 CASAVA_Build 5 64808369 1D TTTTTCTGTA T/- TTTTTTTTAG 913 het 913 ref 26 23 3 0 T 9 8 21490 CASAVA_Build 5 64815724 1D ATACAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 39 0 34 6 A 11 10 21491 CASAVA_Build 5 64815847 5I CCTGTATTTC -----/TAAAA TAAAAGTACT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TAAAA 1 2 21492 CASAVA_Build 5 64816281 1D GGCTGGTCAC G/- AACTCAGCCT 3070 het 3070 hom 24 7 14 3 G 1 0 21493 CASAVA_Build 5 64818643 2D CCAAGAGTCC AA/-- AAGCTGAAGA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 A 4 2 21494 CASAVA_Build 5 64823482 1D AGCTGGGTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 10 9 21495 CASAVA_Build 5 64825498 1I TTGTTTGTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 8 8 A 9 10 21496 CASAVA_Build 5 64830218 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2160 het 2160 ref 30 15 9 6 T 13 12 21497 CASAVA_Build 5 64833191 2I ACTCAAATCT --/TC TGTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 TC 0 1 21498 CASAVA_Build 5 64842360 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 964 het 964 ref 22 16 4 2 A 13 12 21499 CASAVA_Build 5 64846659 5D CTTACTTTGG ATTTA/----- ATTTGCTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 ATTTA 1 0 21500 CASAVA_Build 5 64848284 1I TCTACATGCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 9 10 21501 CASAVA_Build 5 64849945 7D AATAAAAGTA AGATGGC/------- CTATGCGCAT 3070 het 3070 ref 50 27 20 6 AGATGGC 1 0 21502 CASAVA_Build 5 64855070 1I TAACACTAAC -/A AAAATATGTA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 4 5 21503 CASAVA_Build 5 64856264 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1327 het 1327 ref 15 10 3 3 A 13 12 21504 CASAVA_Build 5 64861079 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2405 het 1185 hom 20 4 8 8 T 12 11 21505 CASAVA_Build 5 64871258 2I CCTCTAGCAG --/CT CTCTCTGTCT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 CT 3 4 21506 CASAVA_Build 5 64872392 1D AACTGTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 25 5 11 9 T 17 16 21507 CASAVA_Build 5 64877929 4I CAAAATGAAA ----/AAGG AAGAATCTAG 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 AAGG 0 1 21508 CASAVA_Build 5 64882461 3I AGACAGAAGA ---/CAT CATACAAACT 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 CAT 1 2 21509 CASAVA_Build 5 64882504 6I CTAAAATAAA ------/TTAACT TTATAACTTT 2277 het 2277 ref 24 14 7 3 TTAACT 0 1 21510 CASAVA_Build 5 64885020 11I CCTGGGCCGC -----------/TGGCCCAGGCA AGGTTGGACA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 TGGCCCAGGCA 0 1 21511 CASAVA_Build 5 64886711 1D TATATATACT G/- TAGTATATCA 3070 hom 111 het 38 0 38 1 G 1 0 21512 CASAVA_Build 5 64888967 2I CTGTCTTTAT --/AA AAAGAGAATA 3070 het 3070 ref 61 30 25 6 A 3 5 21513 CASAVA_Build 5 64893359 5D GATAATACTA TACTT/----- AAAGAAACTC 3070 hom 90 het 32 0 31 4 TACTT 1 0 21514 CASAVA_Build 5 64895641 2D ACCCGAAGTC TG/-- TGGTTTTGAA 3070 hom 107 het 39 0 35 5 TG 2 1 21515 CASAVA_Build 5 64899241 1I GAGTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 22 0 17 5 A 13 14 21516 CASAVA_Build 5 64899663 1D TTGAGTGCTG A/- ACATGATACT 3070 hom 114 het 49 0 39 10 A 2 1 21517 CASAVA_Build 5 64904772 1D CCTCCTCATA T/- TCCTCCATTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 2 1 21518 CASAVA_Build 5 64907243 2I AGATCGTTAC --/TA TCTTTTGGAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TA 0 1 21519 CASAVA_Build 5 64907703 6I72M4D TTTTTTATAT ------TGTTGAGATGATATTCTGGATATTTTGAGTTTAATCAAACATTAAAATGAAATTCACCTGTTTTCTTTATACTTTG/TGTTAATGTTGAGATGATATTCTGGATATTTTGAGTTTAATCAAACATTAAAATGAAATTCACCTGTTTTCTTTATAC---- TTTAATGTTA 3070 hom 120 het 34 0 41 10 N/A 0 0 21520 CASAVA_Build 5 64910815 1I TCTGTTTTTT -/A AACCTGAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 2 3 21521 CASAVA_Build 5 64916462 2I AGAGATTATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 11 13 21522 CASAVA_Build 5 64917445 1D AATTTAAGTG T/- TAAGGGTTTA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 2 1 21523 CASAVA_Build 5 64919459 4I AAACTTTATC ----/ATAG ATAGATATAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 ATAG 1 2 21524 CASAVA_Build 5 64920706 3D AATACAGCTG TCT/--- TCTTCTTTGT 3070 het 3070 hom 39 10 23 6 TCT 3 2 21525 CASAVA_Build 5 64922131 1D TCAGAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 33 0 25 8 A 12 11 21526 CASAVA_Build 5 64927309 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 27 1 23 3 A 10 11 21527 CASAVA_Build 5 64928956 3D AGTAAAACTG ACC/--- ACTTTGTCTT 3070 hom 96 het 39 0 32 9 ACC 1 0 21528 CASAVA_Build 5 64929200 1I ACAAAACAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 9 10 21529 CASAVA_Build 5 64934806 4D TCTGGATATC TGTT/---- TAACAATGTG 3070 hom 69 het 24 0 24 1 TGTT 1 0 21530 CASAVA_Build 5 64935546 1I ATATTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1142 hom 41 4 23 14 T 11 12 21531 CASAVA_Build 5 64947111 1I CCTGGCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 12 13 21532 CASAVA_Build 5 64952167 1I AAAGAGCAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 8 9 21533 CASAVA_Build 5 64952373 1I TATCAAATTC -/A TTTAGGCCAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 0 1 21534 CASAVA_Build 5 64952496 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 49 het 20 0 16 4 A 9 10 21535 CASAVA_Build 5 64953382 3I AATCAATCAG ---/ATT ATATTTTATT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 ATT 0 1 21536 CASAVA_Build 5 64956143 1D37M1I TTTTGGGGTG AAAACTCCAGATCCTTTAATGATTTTTCCTCTCGAATC-/-AAACTCCAGATCCTTTAATGATTTTTCCTCTCGAATCG CAAACCAGCC 3070 hom 44 het 19 0 15 7 N/A 0 0 21537 CASAVA_Build 5 64957679 1D TTAACCTGAG C/- AAATGATCTA 3070 hom 144 het 52 0 48 5 C 1 0 21538 CASAVA_Build 5 64963498 1I GGACACTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 655 hom 25 2 17 6 A 12 13 21539 CASAVA_Build 5 64966327 1I TACAAAAAAA -/G AAAAAAATAA 3070 hom 17 het 23 1 19 3 G 0 1 21540 CASAVA_Build 5 64966498 4D AACAAAAAAC ACTT/---- ACTGAGTTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ACTT 1 0 21541 CASAVA_Build 5 64967361 1I GAGATCAGAA -/T TTTTTTTGAC 2956 het 2956 ref 26 16 8 2 T 7 8 21542 CASAVA_Build 5 64974197 1D AGTTAATTTT C/- CTCTGATTCA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 C 2 1 21543 CASAVA_Build 5 64977508 1I TTTCCCTCAA -/T TTTTTTTTTT 2599 het 2599 ref 23 11 8 4 T 10 11 21544 CASAVA_Build 5 64978100 1I GCTTCCCCCC -/T TTCCTTATTT 3070 hom 138 het 53 0 45 8 T 2 3 21545 CASAVA_Build 5 64979978 6D TTATTGAGTG CCTGTC/------ CCTGCCTTTC 3070 hom 141 het 51 0 47 7 CCTGTC 1 0 21546 CASAVA_Build 5 64980811 1I AAAAAGAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 9 10 21547 CASAVA_Build 5 64987493 1D CTTCTTTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 T 10 9 21548 CASAVA_Build 5 64987963 1I TCTGTGGTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 7 8 21549 CASAVA_Build 5 64992733 1I AAAATAACTG -/T TTATTAAGTG 3070 hom 105 het 46 0 36 10 T 2 3 21550 CASAVA_Build 5 64993954 4D TATTTCATTC ATTT/---- GTCACACCCT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 ATTT 1 0 21551 CASAVA_Build 5 64996607 1D ATCGTACTTC A/- AGAGCAGCCA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 A 2 1 21552 CASAVA_Build 5 64998839 2I AGTGTATTCC --/CT CTTTCATTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CT 1 2 21553 CASAVA_Build 5 64999222 4D TCGTTGTAGC TTTG/---- TTTGGCCCAG 3070 hom 102 het 39 0 34 6 TTTG 2 1 21554 CASAVA_Build 5 64999537 6D TCTCTTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 1437 hom 21 5 8 9 T 17 11 21555 CASAVA_Build 5 65000790 3D AAATTATCAC AGA/--- AGATTACATG 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 AGA 2 1 21556 CASAVA_Build 5 65003927 1D TTAGCAAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 98 het 37 0 33 4 T 10 9 21557 CASAVA_Build 5 65005792 1I TTTCCCTAGG -/C CCCTGGAGAT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 C 3 4 21558 CASAVA_Build 5 65013559 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2351 het 1128 hom 13 4 7 3 A 13 14 21559 CASAVA_Build 5 65015268 19I GTTAATAGTG -------------------/GCTGGGCGCAGTGGCTAAC GCCTGTAATC 3070 hom 90 het 32 0 30 4 GCTGGGCGCAGTGGCTAAC 0 1 21560 CASAVA_Build 5 65021489 1I GCTTCAGTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 13 13 0 A 8 9 21561 CASAVA_Build 5 65026617 4I TGGAACTACT ----/GAAA GAAAGCAAGC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 GAAA 1 2 21562 CASAVA_Build 5 65033009 2D GTCAAGTCTG TA/-- AATGGGGAGA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 TA 1 0 21563 CASAVA_Build 5 65036818 6D TTGAGGCCAG GAGTTC/------ GAGTCCAGCC 3070 het 2620 hom 29 9 11 12 GAGTTC 1 0 21564 CASAVA_Build 5 65036851 1I TATAGTGGGA -/C CCCCCCCTCA 3070 het 882 hom 20 3 12 5 C 7 8 21565 CASAVA_Build 5 65040340 1I TATGAATATC -/T TGTGACTGGG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 1 2 21566 CASAVA_Build 5 65040624 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 20 0 18 3 A 12 11 21567 CASAVA_Build 5 65044703 1D AAGAAACAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 41 0 33 8 T 10 9 21568 CASAVA_Build 5 65050439 1I TCTTGGTTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 877 hom 42 2 29 11 A 9 10 21569 CASAVA_Build 5 65056388 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2591 het 6 hom 13 0 9 4 T 15 14 21570 CASAVA_Build 5 65058598 1I AGGCCAGCTT -/G CCAGCTAGGA 3070 hom 117 het 45 0 38 7 G 0 1 21571 CASAVA_Build 5 65068224 1D TTTATATATA T/- TTGCTGTGTT 3070 hom 144 het 53 0 46 7 T 3 2 21572 CASAVA_Build 5 65069719 1D CTCACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 953 hom 28 3 12 14 A 14 13 21573 CASAVA_Build 5 65073853 2D CATTGTTCTT AA/-- GTCTTACTGC 3070 hom 54 het 24 0 19 6 A 2 0 21574 CASAVA_Build 5 65083821 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 26 1 17 10 A 13 12 21575 CASAVA_Build 5 65089180 2I TATATGTACT --/TA TATATATATG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TA 4 5 21576 CASAVA_Build 5 65095328 1D AATCCTAATT A/- CTTTTTCCTT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 1 0 21577 CASAVA_Build 5 65097298 1D TCTCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1687 het 1687 ref 17 10 4 3 A 13 12 21578 CASAVA_Build 5 65117502 1D AGGTTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 1514 het 1514 ref 61 42 5 14 T 12 11 21579 CASAVA_Build 5 65133390 1I12M1I TCATGAATTA -TCATTTGTGTAT-/TTCATTTGTGTATG TTTTTTTCTG 3070 hom 117 het 38 0 39 5 N/A 0 0 21580 CASAVA_Build 5 65138760 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 21 1 15 5 A 13 12 21581 CASAVA_Build 5 65144595 1D TTATTTCCAA G/- GGCTGATGCA 3070 hom 108 het 41 0 37 6 G 3 2 21582 CASAVA_Build 5 65145512 1D AGATTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1884 het 1884 ref 35 25 5 5 A 13 12 21583 CASAVA_Build 5 65152547 1D AATCACTTGA C/- CCCTGGGAGG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 4 3 21584 CASAVA_Build 5 65165910 7D CTAAGACACT TAAAAAA/------- TAACAGTGGG 3070 het 3070 hom 32 14 17 4 TAAAAAA 1 0 21585 CASAVA_Build 5 65170665 2D TTTCTTTTAT AA/-- AAAAAAAATT 584 het 584 ref 26 13 3 10 A 10 8 21586 CASAVA_Build 5 65174639 2D TTCCAGAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2768 het 267 hom 38 5 10 23 T 16 14 21587 CASAVA_Build 5 65177221 5D GAGATTCATC TATGT/----- TATGTTAAGA 1668 het 1668 ref 26 14 5 8 TATGT 2 1 21588 CASAVA_Build 5 65183714 1D ATGCTATTCC T/- TTCTGTTTGT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 T 3 2 21589 CASAVA_Build 5 65189474 2I TTTTGTTTTG --/TT TTGCTTTGGT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 2 4 21590 CASAVA_Build 5 65190371 1D TTTAAAAAAA T/- AGATGACATA 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 T 1 0 21591 CASAVA_Build 5 65193415 1D AGTAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 32 1 24 7 A 14 13 21592 CASAVA_Build 5 65194238 1D ATCACATACC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 T 9 8 21593 CASAVA_Build 5 65224437 1D TGTAAATAGC A/- AACAGAGATA 3070 het 3070 ref 42 23 13 7 A 3 2 21594 CASAVA_Build 5 65226221 1D TTCTACACAG C/- CAGAGGCATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 2 1 21595 CASAVA_Build 5 65242767 3D TGAAATGAGT TTA/--- TTATCTTATT 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 TTA 2 1 21596 CASAVA_Build 5 65245045 1D AAGAAAAATG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 T 8 7 21597 CASAVA_Build 5 65249400 3D TTAATATGGC TTA/--- TTATATTTTA 3070 het 2955 hom 28 7 15 7 TTA 2 1 21598 CASAVA_Build 5 65282375 1D TTCATATGTA T/- TTTTTTTTTT 1649 het 1649 ref 39 27 4 9 T 12 11 21599 CASAVA_Build 5 65297144 11I ATGTGCTACC -----------/ATGCCTGGCTA ATTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 ATGCCTGGCTA 0 1 21600 CASAVA_Build 5 65297700 2D AATGATAGAC TG/-- TATAAACAAT 3070 het 3070 ref 44 29 10 6 TG 1 0 21601 CASAVA_Build 5 65301711 1D TATGAAGACT A/- CACTGTTAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 A 1 0 21602 CASAVA_Build 5 65309933 1I TGTAGTCATA -/T TTTCTAATTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 3 4 21603 CASAVA_Build 5 65310870 3D ACTGCTGACT GTG/--- GTGGTGGTGC 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 GTG 4 3 21604 CASAVA_Build 5 65314265 5I AATTAAGAAA -----/GACTG ACAGTACCAA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 GACTG 0 1 21605 CASAVA_Build 5 65320625 26D GTCGACACTT TCTTCTTCGTTGTGATTAGAAGATTC/-------------------------- TTATGTCTAC 3070 het 3070 ref 39 28 7 11 TCTTCTTCGTTGTGATTAGAAGATTC 1 0 21606 CASAVA_Build 5 65339011 6D CGTTAGGAGA TATACC/------ TATACCTAAT 3070 het 2578 hom 17 6 10 1 TATACC 2 1 21607 CASAVA_Build 5 65346234 1D AAATACATGA T/- TTTTTTTTTG 1296 het 1296 ref 36 30 3 4 T 10 9 21608 CASAVA_Build 5 65346974 2I TTTTGTAAAC --/AA AAGTTTCGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 4 21609 CASAVA_Build 5 65349103 1D TACAATAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1822 hom 30 9 9 12 T 17 16 21610 CASAVA_Build 5 65352260 1I ATTTCATTAC -/A AAACTGGTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 3 4 21611 CASAVA_Build 5 65352754 1D TCTGACTTTT A/- AAATTTTTTA 3070 het 2507 hom 27 7 14 6 A 4 3 21612 CASAVA_Build 5 65372444 1D AAAAAAGAGG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 7 6 21613 CASAVA_Build 5 65383479 1I GCCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2746 het 2746 ref 41 17 8 16 A 14 15 21614 CASAVA_Build 5 65388080 3D TTCAGTACAT AAG/--- AAGCAAGTAG 3070 het 3070 hom 46 16 24 7 AAG 2 1 21615 CASAVA_Build 5 65388427 3D TGACTACACT GTA/--- GTATCTTCTA 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 GTA 2 1 21616 CASAVA_Build 5 65396944 1D GATATGTACA C/- CCTTAAGATT 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 C 3 2 21617 CASAVA_Build 5 65406002 3I GAATTAATAA ---/TAT TAAGAGATTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TAT 0 1 21618 CASAVA_Build 5 65409066 1I TCCTCAAACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 108 hom 28 1 23 4 A 9 10 21619 CASAVA_Build 5 65414217 3I TTTCAGTTGC ---/TCT TCTTTCAAAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TCT 1 2 21620 CASAVA_Build 5 65414601 1D CCAGTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 15 1 9 5 A 11 10 21621 CASAVA_Build 5 65429306 1D CATAATTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 294 hom 34 1 26 7 A 12 11 21622 CASAVA_Build 5 65434083 25D AGCCTCCAAC AAGTCTGGGATTATGTTAATCCAAG/------------------------- AAGTCTGGGA 3070 hom 47 het 16 0 16 6 AAGTCTGGGATTATGTTAATCCAAG 1 0 21623 CASAVA_Build 5 65437527 1I CTAAAAAAAG -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 7 8 21624 CASAVA_Build 5 65439844 1D AATGGAAGGC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 9 8 21625 CASAVA_Build 5 65445065 3D CCCATCTCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 15 2 A 13 10 21626 CASAVA_Build 5 65463479 9D TTTGGGCCAA CAACTTCTC/--------- CACTAAAAGA 3070 het 3070 hom 22 9 15 4 CAACTTCTC 1 0 21627 CASAVA_Build 5 65470176 1I AACCTAGGCC -/A GGGGTGGTGG 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 A 0 1 21628 CASAVA_Build 5 65479953 1I TTTTAAAAAT -/A ATTGTATAGT 2035 het 2035 ref 26 15 8 3 A 1 2 21629 CASAVA_Build 5 65480407 1D TTTTTATGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 9 8 21630 CASAVA_Build 5 65485460 1I TTCTGAAATT -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 6 7 21631 CASAVA_Build 5 65488488 6I ATTAGGACTA ------/TTACTT TAATACTGTG 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 TTACTT 0 1 21632 CASAVA_Build 5 65491007 3D TGCATTTGGA TCT/--- TCTTCTTTTT 2305 het 2305 ref 36 16 12 8 TCT 3 2 21633 CASAVA_Build 5 65495248 14D TTTTGGTTAT TCTGTATATCATTC/-------------- TTACGTGCTT 3070 het 3070 hom 29 12 16 3 TCTGTATATCATTC 1 0 21634 CASAVA_Build 5 65499710 1D AAGTGAGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2742 hom 18 7 9 2 A 12 11 21635 CASAVA_Build 5 65503339 3D TAGTAGTTTA TTT/--- TTAATACCAG 3070 het 3070 hom 31 15 12 6 T 5 2 21636 CASAVA_Build 5 65505717 9I GTGAGATAGA ---------/TCATTGGGT TCATTGGGTA 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 TCATTGGGT 1 2 21637 CASAVA_Build 5 65509789 3D ATAGACGATT ATC/--- ATCATCATCA 3070 het 3070 hom 53 20 28 6 ATC 4 3 21638 CASAVA_Build 5 65513760 2D ATTGAATAAC TT/-- ATAATTTCAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 T 2 0 21639 CASAVA_Build 5 65527562 2I TATAATATTC --/TA TGTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 TA 0 1 21640 CASAVA_Build 5 65531643 1D TTGTTTCTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 T 10 9 21641 CASAVA_Build 5 65537067 1I GTAGATACCA -/G GGGTTAGGGC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 G 3 4 21642 CASAVA_Build 5 65561600 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2795 het 922 hom 12 5 6 1 A 12 11 21643 CASAVA_Build 5 65564318 2I CTGTTTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 49 20 15 14 GT 8 9 21644 CASAVA_Build 5 65579561 3D ATGTGAGGGA CTT/--- CTTTGCTGAA 3070 het 3070 ref 40 24 14 5 CTT 2 1 21645 CASAVA_Build 5 65584283 1D GGAATACTTG T/- TTTAAAGAGA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 4 3 21646 CASAVA_Build 5 65584376 5D TAGTGTGACC TTTAA/----- TTTACACATG 3070 het 3070 hom 43 13 24 7 TTTAA 1 0 21647 CASAVA_Build 5 65587184 1D CTACATCACA C/- CTACTTTTGT 3070 het 3070 ref 63 32 22 11 C 2 1 21648 CASAVA_Build 5 65595097 1I TACTCATCTG -/T TTTTTCCCCA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 5 6 21649 CASAVA_Build 5 65595424 1I AGTATTACTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 A 9 10 21650 CASAVA_Build 5 65598732 4I GTAGTGTCTT ----/TGTC TGTCTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TGTC 1 2 21651 CASAVA_Build 5 65599244 1D TGGCTTCCTT C/- CTTGCTTTGG 3070 hom 66 het 29 0 22 8 C 2 1 21652 CASAVA_Build 5 65600573 1D TCTCTTTGAG T/- TTATCGTAAT 3070 het 3070 ref 55 25 22 8 T 3 2 21653 CASAVA_Build 5 65606490 1D GGCTCCATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1992 hom 25 8 12 5 A 12 11 21654 CASAVA_Build 5 65610674 1I AAGCAGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 A 10 11 21655 CASAVA_Build 5 65610858 1I GACAGAGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 10 11 21656 CASAVA_Build 5 65613049 1I GGCCTCACTC -/T TGTCTCCCAG 2405 het 2254 hom 25 8 6 11 T 1 2 21657 CASAVA_Build 5 65613448 1D AAAAAAACCC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 A 9 8 21658 CASAVA_Build 5 65616630 1I TGCCAGTTAA -/C TTAGGGCTTC 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 C 0 1 21659 CASAVA_Build 5 65653735 2I TTTTATTTTA --/TT TTTTATATAT 1579 het 989 hom 16 4 8 4 T 4 6 21660 CASAVA_Build 5 65662832 3D GTGAATATTA ATC/--- ATCAAGACAA 3070 hom 81 het 33 0 27 7 ATC 2 1 21661 CASAVA_Build 5 65670207 1I TTTTACTGCA -/C CAATGGTGGG 3070 het 302 hom 24 2 15 7 C 1 2 21662 CASAVA_Build 5 65676974 1I TAGGAAGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 10 21663 CASAVA_Build 5 65685215 1I AGAGGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 11 12 21664 CASAVA_Build 5 65688882 7I GGGAAATAGT -------/ATTCCCC ATTCCCCCGT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 ATTCCCC 1 2 21665 CASAVA_Build 5 65692429 5I TGAAGTGAAG -----/TGAAC TGAAGTGATA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 TGAAC 0 1 21666 CASAVA_Build 5 65692681 1I TGTTAAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 9 13 A 11 12 21667 CASAVA_Build 5 65697663 1I CAGCCAAGAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 18 15 4 T 8 9 21668 CASAVA_Build 5 65770287 1I AGGCCAAGAA -/G GGAGGATCAC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 G 2 3 21669 CASAVA_Build 5 65771162 1I TTCTTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 2435 het 2435 ref 28 15 7 6 A 13 14 21670 CASAVA_Build 5 65794718 1D TAGAAAGTAA C/- CAACAACTCT 3070 hom 135 het 48 0 45 4 C 2 1 21671 CASAVA_Build 5 65797832 1I CCCCGTTTTC -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 35 het 15 0 12 3 T 5 6 21672 CASAVA_Build 5 65799097 1I AAGCCTTGGT -/A AAATAACCAG 3070 hom 60 het 23 0 18 5 A 3 4 21673 CASAVA_Build 5 65808566 4D TGTCTGTAAT CCCA/---- GCACTTTGGG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CCCA 1 0 21674 CASAVA_Build 5 65815493 1D ACATTTAGTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 735 hom 46 2 30 15 G 2 1 21675 CASAVA_Build 5 65818987 7I AAATGGCAAA -------/AATTGCT AATTGCTATA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 AATTGCT 1 2 21676 CASAVA_Build 5 65820626 1I TTGGCTATTG -/T TTTAAGCTAC 3070 hom 84 het 35 0 27 8 T 3 4 21677 CASAVA_Build 5 65827657 1D TCTAGGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 980 hom 42 3 32 7 A 13 12 21678 CASAVA_Build 5 65829853 14D ACTGCACTCC AGCCTGGGAGACAG/-------------- ATGGAGACCC 3070 het 3070 ref 24 16 9 1 AGCCTGGGAGACAG 1 0 21679 CASAVA_Build 5 65831013 1I CTCACAATAA -/C CTCTGCCAAG 3070 hom 151 het 56 0 51 5 C 1 2 21680 CASAVA_Build 5 65833291 1D AAAAATCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 12 11 21681 CASAVA_Build 5 65836785 5I CAGCTAGAGA -----/TTTAT TTTAAGTTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTTAT 0 1 21682 CASAVA_Build 5 65841460 1D TATCTGATTG T/- TTCCTCATTC 3070 hom 125 het 48 0 38 10 T 3 2 21683 CASAVA_Build 5 65857562 6I GAATCAATAT ------/TATTAA TATTAATATT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TATTAA 2 3 21684 CASAVA_Build 5 65858500 1I AAGGCTATGG -/A AAATCTCAGT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 3 4 21685 CASAVA_Build 5 65860175 1D ATTCAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 137 het 51 0 46 5 A 11 10 21686 CASAVA_Build 5 65864240 2I AAACATTTTC --/CA CAAAGAGAAT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 CA 1 2 21687 CASAVA_Build 5 65874589 1D TCATGTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2503 hom 28 8 12 8 T 14 13 21688 CASAVA_Build 5 65877138 2I TTTTCTCCAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 32 0 12 20 T 11 13 21689 CASAVA_Build 5 65878042 1D AAGAAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1750 hom 31 9 11 11 A 16 15 21690 CASAVA_Build 5 65879178 10I TCCAATTACA ----------/TTATTTTTAG TTATTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 11 17 10 TTATTTTTAG 0 1 21691 CASAVA_Build 5 65891815 1D GCTCTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 473 hom 26 2 13 11 A 16 15 21692 CASAVA_Build 5 65900691 1I CTCTTTCAGG -/T TTCCTCTGTC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 2 3 21693 CASAVA_Build 5 65901549 3D CTAGACACTC CTT/--- TGTCTGTCCT 3070 het 3070 ref 31 15 14 5 CTT 1 0 21694 CASAVA_Build 5 65902410 4I ATAGAAACGG ----/AAAT AAATAGAAAG 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 AAAT 1 2 21695 CASAVA_Build 5 65903470 6D CATAGCCCAA ATAATG/------ TAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 ATAATG 1 0 21696 CASAVA_Build 5 65903566 1I GCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 9 10 21697 CASAVA_Build 5 65906312 3D TTTGTGAGCT ATG/--- ATAAGGAGTT 2871 het 2385 hom 19 7 7 6 ATG 1 0 21698 CASAVA_Build 5 65907479 1I AGTGGTGCCA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 7 8 21699 CASAVA_Build 5 65907984 5I CAAAAACAGA -----/AAAGT AAAGTCTCAG 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 AAAGT 1 2 21700 CASAVA_Build 5 65909748 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 535 het 535 ref 26 10 4 12 A 11 10 21701 CASAVA_Build 5 65912582 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 T 9 10 21702 CASAVA_Build 5 65913609 1D TCCATTTCCC A/- GTGGATTATT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 1 0 21703 CASAVA_Build 5 65914661 1D TATCCCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 11 10 21704 CASAVA_Build 5 65941141 1D GGCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1039 het 1039 ref 32 19 3 11 T 13 12 21705 CASAVA_Build 5 65942072 1D AGGCTGTTTT A/- CACCCGAGAG 122 het 122 ref 41 5 2 34 A 1 0 21706 CASAVA_Build 5 65945524 1I TTACTGGTAT -/G GGGCCATCTG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 G 3 4 21707 CASAVA_Build 5 65947236 1D AGTCTCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 12 11 21708 CASAVA_Build 5 65949060 1I AGAAGGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 T 11 12 21709 CASAVA_Build 5 65950253 4I ACTTTTGATG ----/TTTA TTTACCCTGA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 TTTA 1 2 21710 CASAVA_Build 5 65950998 1I ATTCATGTTG -/T AATATCAATG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 0 1 21711 CASAVA_Build 5 65956117 1D TTACAGAAAT A/- AAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 7 6 21712 CASAVA_Build 5 65956623 1D ATGAAGTGTT A/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 53 22 26 7 A 1 0 21713 CASAVA_Build 5 65957741 1D AGTTTCAGTT A/- ACGGTAGATG 3070 hom 75 het 31 0 26 6 A 2 1 21714 CASAVA_Build 5 65959308 1D TTTATCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 11 10 21715 CASAVA_Build 5 65965951 1I CCATGGTTTG -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 6 7 21716 CASAVA_Build 5 65968826 1I ATTTCCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 T 13 14 21717 CASAVA_Build 5 65975044 1I AAAAAGAATT -/A AAAAGAGCCA 3070 het 3070 ref 47 28 18 1 A 4 5 21718 CASAVA_Build 5 65975631 1I TGTAAGCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 8 9 21719 CASAVA_Build 5 65994433 2D TAATTTTTTG TT/-- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 4 2 21720 CASAVA_Build 5 65996910 2D TGCCATGTGC TA/-- TGTCTTTTAG 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 TA 1 0 21721 CASAVA_Build 5 66003171 1I TAGCCAGTCT -/G ACAAAGTCTG 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 G 0 1 21722 CASAVA_Build 5 66005020 1I TTACTTACCA -/T CTTATGAAGT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 0 1 21723 CASAVA_Build 5 66008048 2D CCCAAGACTC TT/-- TTCCTCACAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 4 2 21724 CASAVA_Build 5 66015942 10I CTTCCAGCTA ----------/TACCAGGAGC TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 TACCAGGAGC 0 1 21725 CASAVA_Build 5 66020700 2D AAACAGTTCC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 11 9 21726 CASAVA_Build 5 66025375 1D TTTAGAGAGC A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 A 8 7 21727 CASAVA_Build 5 66027942 1D CCAGAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 11 11 A 13 12 21728 CASAVA_Build 5 66031608 14I TTGTGAAACT --------------/AGATATATGATAGA AGCTGCATGG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 AGATATATGATAGA 0 1 21729 CASAVA_Build 5 66032550 1I TTTAAGACTG -/A TTTGCAAATA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 0 1 21730 CASAVA_Build 5 66033403 1I GGTTATAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 8 9 21731 CASAVA_Build 5 66047258 5D GTATAATAAT AATAA/----- AATAAAAATT 2801 het 851 hom 10 3 7 0 AATAA 2 1 21732 CASAVA_Build 5 66051760 1I GGAATGATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 T 7 8 21733 CASAVA_Build 5 66051929 1D AAATTCCATT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 8 7 21734 CASAVA_Build 5 66056985 1I AAGCCTCCTT -/C CCCCAAAGAA 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 C 4 5 21735 CASAVA_Build 5 66064918 2D ACACATGCAC AG/-- AGTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 5 AG 2 1 21736 CASAVA_Build 5 66065351 1D CCAACTTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 10 9 21737 CASAVA_Build 5 66087379 2D CTTAAATCTA CT/-- CTGTGATTTT 3070 het 3070 ref 47 20 23 4 CT 2 1 21738 CASAVA_Build 5 66103341 1I GGTTTCGGGC -/T TTTTTTTTTT 1910 het 1910 ref 26 10 7 9 T 13 14 21739 CASAVA_Build 5 66107241 19D GGTTCTTAAA AATGGTTCTTCAAAAGAAC/------------------- AATGGTTCTT 3070 het 3070 hom 44 15 26 10 AATGGTTCTTCAAAAGAAC 1 0 21740 CASAVA_Build 5 66120811 1I ACACACATGA -/T TTTTTTGAGG 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 T 6 7 21741 CASAVA_Build 5 66122481 1I GACAGAAGTG -/C TTTTTTAGCT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 C 0 1 21742 CASAVA_Build 5 66127275 1I AAATTAGGAT -/A TATCTGTGCT 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 A 0 1 21743 CASAVA_Build 5 66143418 5D TTCCTCAGAA AAGAG/----- AAAAGATATT 3070 het 3070 ref 50 23 23 9 AAGAG 1 0 21744 CASAVA_Build 5 66146431 1D ATCCTAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 10 9 21745 CASAVA_Build 5 66150015 1I CACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 55 20 26 9 A 11 12 21746 CASAVA_Build 5 66150862 1I TTAGCTATTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 8 9 21747 CASAVA_Build 5 66157148 1D TTGAAATGTG T/- TCAACCAAAC 3070 het 3070 hom 33 11 19 5 T 2 1 21748 CASAVA_Build 5 66161295 1D TTTTGATATT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 28 10 17 3 A 8 7 21749 CASAVA_Build 5 66161442 3I ATAATATTAA ---/TAT TATAGGCAAC 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 TAT 1 2 21750 CASAVA_Build 5 66167756 1D CCCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 2904 het 2904 ref 26 13 8 5 A 12 11 21751 CASAVA_Build 5 66172139 1I TACATTCATT -/C CCTTGCTTGG 3070 het 3070 hom 54 18 27 9 C 2 3 21752 CASAVA_Build 5 66196578 1I CATTAGACAT -/A GGGGCAGTGC 3070 het 3070 hom 55 17 33 5 A 0 1 21753 CASAVA_Build 5 66202184 2D TGCACATCAC AT/-- GTGCTTTTGT 3070 het 3070 ref 52 28 19 6 AT 1 0 21754 CASAVA_Build 5 66224967 2I TTTTTTTTTT --/TG TGTGTGTGTG 1547 het 744 hom 16 3 5 8 TG 8 9 21755 CASAVA_Build 5 66232303 2D CACCTCCTTT AA/-- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 9 7 21756 CASAVA_Build 5 66233011 2I CTTGAGTAAG --/TC TCAATTCTGT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 TC 1 2 21757 CASAVA_Build 5 66236268 1D TTGCTTGCTT G/- ATTGATGGAT 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 G 1 0 21758 CASAVA_Build 5 66249179 3I ATTCTCTTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 2682 het 2682 ref 34 11 10 13 T 13 16 21759 CASAVA_Build 5 66251689 5D AGCAAAGAGG AAAGT/----- AATTATAAGC 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 AAAGT 1 0 21760 CASAVA_Build 5 66287557 1D TCTTTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 1881 het 1881 ref 51 40 5 7 T 11 10 21761 CASAVA_Build 5 66289068 1I TTTGTGATGC -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 T 6 7 21762 CASAVA_Build 5 66312782 1D CCAAGTGGGA T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 7 21763 CASAVA_Build 5 66345613 2D TACAAAAATC AA/-- AGACTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 A 3 1 21764 CASAVA_Build 5 66358245 1I TCTAGGGTTT -/G CATACAGTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 0 1 21765 CASAVA_Build 5 66363048 1I GGATGGTGAC -/T TATTTGACAT 3070 hom 156 het 57 0 51 6 T 1 2 21766 CASAVA_Build 5 66369455 1I TGCCCAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 35 1 29 5 T 9 10 21767 CASAVA_Build 5 66391362 3I AAAGATAGGA ---/AAT AATATCCCTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AAT 1 2 21768 CASAVA_Build 5 66407068 1D CTTTGGAGTG T/- TTTTTTTATG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 8 7 21769 CASAVA_Build 5 66409918 1I CCTTGATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1151 hom 38 6 20 12 A 14 15 21770 CASAVA_Build 5 66424433 1I CTGGTTGTCA -/G TTTCCAGATG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 0 1 21771 CASAVA_Build 5 66436282 1D AAAAAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 1609 het 1609 ref 34 21 5 8 A 15 14 21772 CASAVA_Build 5 66447462 1D TTTTAATTTG T/- TTTTTTTTTT 1600 het 1600 ref 33 22 4 7 T 11 10 21773 CASAVA_Build 5 66453033 2I AAATACTATC --/TT ATATATAATC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 0 2 21774 CASAVA_Build 5 66455529 2D TTTCCTCTGG CA/-- CACACACACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CA 5 4 21775 CASAVA_Build 5 66460036 1D AACTAGAAAA C/- CAAAGAAATG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 2 1 21776 CASAVA_Build 5 66461326 1D AAAAGAAAAA G/- GAAAAAAAAG 3070 het 231 hom 34 1 32 1 G 2 1 21777 CASAVA_Build 5 66527668 2D TCCAAGTCCA AG/-- AGAGAGCCAG 3070 het 3070 hom 52 20 26 6 AG 4 3 21778 CASAVA_Build 5 66534983 1I ATTAAAAAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 8 9 21779 CASAVA_Build 5 66547442 1D ATTCAGAGAG C/- CCGTGCCCTT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 C 3 2 21780 CASAVA_Build 5 66563451 3I TAGTTTTAAT ---/TTG TTGTGTTAGA 3070 hom 129 het 46 0 43 3 TTG 1 2 21781 CASAVA_Build 5 66565161 8D AAAAAAAGAG AGAGAGAT/-------- AGACCTATGT 3070 hom 51 het 18 0 17 4 AGAGAGAT 1 0 21782 CASAVA_Build 5 66572350 1I ATCAGATCCA -/C CATTAGATAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 1 2 21783 CASAVA_Build 5 66577017 2D TTACTTGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 35 0 25 10 T 16 14 21784 CASAVA_Build 5 66584254 1I TAGCTAAGAG -/A TGCTCTCTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 0 1 21785 CASAVA_Build 5 66592310 4I ACTTTGAAGT ----/AGAG AGAGATTCTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AG 2 4 21786 CASAVA_Build 5 66594932 1D GGCCTGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 805 hom 33 3 17 13 T 15 14 21787 CASAVA_Build 5 66668116 1D TCTCTTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 T 15 14 21788 CASAVA_Build 5 66683267 1I CATCATGTGG -/C CTTATTCCCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 1 2 21789 CASAVA_Build 5 66683401 1I CCCTCTATCC -/A AATCAGGTCA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 2 3 21790 CASAVA_Build 5 66701630 1I GTTTTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 26 0 23 3 A 10 11 21791 CASAVA_Build 5 66715885 1D CCCAGAAACA T/- TTTTTCACTA 3070 hom 132 het 51 0 44 8 T 6 5 21792 CASAVA_Build 5 66744111 4D AGATTAATAG ACAA/---- ACAAAAATCA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 ACAA 2 1 21793 CASAVA_Build 5 66759574 5I CTCTCTTCTC -----/TCCCT TCCCTTCCCT 2122 het 709 hom 28 5 6 17 TCCCT 3 4 21794 CASAVA_Build 5 66768459 2I CACCAACCTA --/TC TCTCTAACCA 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 TC 2 3 21795 CASAVA_Build 5 66774792 1I ACTGTAGTGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 9 16 8 T 8 9 21796 CASAVA_Build 5 66780680 1I TGGCTACCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 10 11 21797 CASAVA_Build 5 66790557 2D AGCTGTTACA TG/-- TGTGTAAACA 3070 het 3070 ref 48 30 14 5 TG 3 2 21798 CASAVA_Build 5 66791010 1D TGATTGCTCA G/- TAACATATAA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 G 1 0 21799 CASAVA_Build 5 66792727 1D TGCCACATAT C/- GAAAATCAAT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 C 1 0 21800 CASAVA_Build 5 66792944 4I TGGTCCATGG ----/AAAC AAACAATGGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AAAC 1 2 21801 CASAVA_Build 5 66793670 1D AGAAGAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 T 12 11 21802 CASAVA_Build 5 66794757 5D CCCTCATAAA CCACT/----- CCAAAGTGTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 CCACT 1 0 21803 CASAVA_Build 5 66795508 1I ACTCTTCAAT -/A AAAAATGAAT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 5 6 21804 CASAVA_Build 5 66800997 2I GTTTTAACAC --/AT ATAGATTTGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 1 2 21805 CASAVA_Build 5 66802031 4D AATTGGGGTG TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 8 TTAT 3 2 21806 CASAVA_Build 5 66805048 4D ATGAACAAAG AATT/---- ATTTCTCTCT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 AATT 1 0 21807 CASAVA_Build 5 66808534 8D TTATGAGGAA ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 20 21 3 AC 9 5 21808 CASAVA_Build 5 66809140 2D ACTGGGTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 29 7 17 5 T 27 25 21809 CASAVA_Build 5 66840491 20D TATATATATA TATATATATATATATATATG/-------------------- TATGTATTTT 2865 hom 30 het 8 0 11 4 TATATATATATATATATATG 1 0 21810 CASAVA_Build 5 66842335 2D TGCACAACAC AA/-- AGAGTGAACC 3070 het 3070 ref 40 18 16 7 A 3 1 21811 CASAVA_Build 5 66854296 1I AGTGGTTTCC -/A AAACTGTTCA 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 A 3 4 21812 CASAVA_Build 5 66854788 1D CTAGTACTCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 8 T 8 7 21813 CASAVA_Build 5 66876558 8D ATAATGACAA TGCTAGGG/-------- TGGTATAGTT 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 TGCTAGGG 1 0 21814 CASAVA_Build 5 66948321 1D AGTGTACATC A/- GTTATGCTTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 1 0 21815 CASAVA_Build 5 66956657 1I TACTTCACAT -/A AGTAGGATCA 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 A 1 2 21816 CASAVA_Build 5 66963203 1I TCCTCTAACC -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 T 6 7 21817 CASAVA_Build 5 67002680 1D TTAATTTCTA T/- TGTTGGAAAC 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 2 1 21818 CASAVA_Build 5 67015299 1D AATGTTTCAT A/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 A 1 0 21819 CASAVA_Build 5 67018341 1D TTATACCATT A/- AAAATTAGCA 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 A 5 4 21820 CASAVA_Build 5 67019956 1I ACAAATTCCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 9 10 21821 CASAVA_Build 5 67020047 1I ATTAGTAATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 8 9 21822 CASAVA_Build 5 67022808 1I CCTTTCTCTA -/T TAACTCAGAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 1 2 21823 CASAVA_Build 5 67027625 1D TTATATCTTG A/- TTTGCCAAGC 3070 het 3070 ref 35 15 15 7 A 1 0 21824 CASAVA_Build 5 67029378 1I TGCTACACAT -/G GCTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 G 1 2 21825 CASAVA_Build 5 67042343 2I AGAAAATTGC --/AA ATTAAAATAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 1 3 21826 CASAVA_Build 5 67046603 4D ATACTGGTAA TAGT/---- TTGTGACATT 3070 het 3070 ref 37 21 16 1 TAGT 1 0 21827 CASAVA_Build 5 67057206 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 2292 het 2292 ref 44 32 5 7 A 12 11 21828 CASAVA_Build 5 67061857 1D TTGGTGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1175 hom 51 7 34 10 T 15 14 21829 CASAVA_Build 5 67062355 3I TCTCATGTTG ---/GTC GTCGTTTCCT 3070 hom 149 het 51 0 49 2 GTC 1 2 21830 CASAVA_Build 5 67133943 1D GCTCACCTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 15 15 2 A 10 9 21831 CASAVA_Build 5 67144250 4D AAATAAATGG ACTT/---- ACTTAATTAA 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 ACTT 2 1 21832 CASAVA_Build 5 67147992 4I CACTGGCTTT ----/TTTC TTTTTCTATG 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 TTTC 0 1 21833 CASAVA_Build 5 67164628 7I ATAACAAGTT -------/TTAAGTA TTAAGTATCT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 TTAAGTA 1 2 21834 CASAVA_Build 5 67170539 1I GTATTGTCAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 T 7 8 21835 CASAVA_Build 5 67172718 4D TTCTAATGAC TGCT/---- TGCTTTTTCC 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 TGCT 2 1 21836 CASAVA_Build 5 67173669 1I GTTTTATGGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 8 9 21837 CASAVA_Build 5 67186027 4I TTTTATAAAC ----/AAGT GAGGAACAAG 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 AAGT 0 1 21838 CASAVA_Build 5 67194822 2I TTAGCCTCCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 T 10 12 21839 CASAVA_Build 5 67206390 1D CATTTAAAAA C/- GTCTCTTCTT 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 C 1 0 21840 CASAVA_Build 5 67216732 1I AGATTAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 10 11 21841 CASAVA_Build 5 67217186 4D AGAAAGCAAA AAAC/---- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 45 22 20 4 AAAC 1 0 21842 CASAVA_Build 5 67240479 10I ATTTTCTAAG ----------/TTAAAAGAGA TTAAAGAAGC 3070 het 2800 hom 21 8 11 3 TTAAAAGAGA 0 1 21843 CASAVA_Build 5 67240760 1I TTTTCTATAG -/A TGTTCTATTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 0 1 21844 CASAVA_Build 5 67244168 1D ATGAAGAAAT G/- GGTGAGGCAG 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 G 3 2 21845 CASAVA_Build 5 67253885 7D GGAAGGATTT GAGATAA/------- TAATAGGAAA 3070 het 3070 ref 38 19 18 3 GAGATAA 1 0 21846 CASAVA_Build 5 67262570 1D TAAAAATTTA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 8 7 21847 CASAVA_Build 5 67269628 1I CTACCTAGTG -/T TTTGTGCACA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 3 4 21848 CASAVA_Build 5 67270043 1I ATAAATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 925 hom 26 2 20 4 A 10 11 21849 CASAVA_Build 5 67270415 2I TTTTTGTATT --/AA GTCTTGAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 2 21850 CASAVA_Build 5 67272883 5D TTAAAAAAAA AAAAC/----- AAAACACCTT 3070 het 447 hom 28 5 15 10 AAAAC 2 1 21851 CASAVA_Build 5 67274952 1D CCATTCACCA C/- CCCCCCCCCT 2880 het 2880 ref 41 13 9 19 C 10 9 21852 CASAVA_Build 5 67288862 1D TGGAGGAAAA C/- CTGAGAAGGT 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 C 2 1 21853 CASAVA_Build 5 67288979 8D CTGACTACTG ACGAACTA/-------- ACTGAGCAGC 3070 hom 84 het 31 0 27 6 ACGAACTA 1 0 21854 CASAVA_Build 5 67290320 1D AGGGTTTGCC A/- AAATCTACCT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 4 3 21855 CASAVA_Build 5 67316180 8D TGAACAACAT GGGGGTGA/-------- GGGGTACCAA 3070 het 3070 ref 32 17 16 3 GGGGGTGA 1 0 21856 CASAVA_Build 5 67323717 2I CATTTCTTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 10 12 21857 CASAVA_Build 5 67327889 1D GCAAAAAAAA G/- GGGGGGGGAG 3070 het 180 hom 33 2 17 15 G 9 8 21858 CASAVA_Build 5 67328520 17D AAGAAGAGGC AAGGCCTCCTGGGTTAA/----------------- AAGGCCTCCT 3070 hom 132 het 65 0 44 22 AAGGCCTCCTGGGTTAA 2 1 21859 CASAVA_Build 5 67329887 1D AAAGGGCAAA G/- GGGGAAAGTC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 G 5 4 21860 CASAVA_Build 5 67330008 3D TTCGAGACCA GCC/--- GCCTGGCCAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 GCC 2 1 21861 CASAVA_Build 5 67333789 1D ATGATAAACC A/- AAAAATTAGT 3070 het 2593 hom 20 7 11 2 A 6 5 21862 CASAVA_Build 5 67334853 4D GGCTGGAGAG GAGA/---- GAGTTGAGTC 3070 het 3070 hom 57 25 26 9 GA 3 1 21863 CASAVA_Build 5 67335898 28D GGAAGGAAGG AGACATAAATAAATGAAGAAAAGAAAGA/---------------------------- AAGGAAGGAA 2002 het 2002 ref 46 40 7 12 AGACATAAATAAATGAAGAAAAGAAAGA 1 0 21864 CASAVA_Build 5 67336592 1D CTTTTCTCTG T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 44 22 21 2 T 7 6 21865 CASAVA_Build 5 67344479 3I29M1D TATGTAAAAT ---GGTGGTAGGTGACTGTTGAACTAAAAAAAT/GGAGGTGGTAGGTGACTGTTGAACTAAAAAAA- CTCTAAATAT 3070 het 3070 ref 33 21 16 3 N/A 0 0 21866 CASAVA_Build 5 67388243 1D ATTTTATTAT A/- AAAAATTGGA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 A 6 5 21867 CASAVA_Build 5 67398376 1D GACTTGTCCA C/- ATTGCCTCCA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 C 1 0 21868 CASAVA_Build 5 67412096 1I CTGGGATTAC -/A GGCGTGAGCC 2159 het 1709 hom 15 6 6 3 A 0 1 21869 CASAVA_Build 5 67413008 6D CACAAACCAA AATAAT/------ AATAATAATC 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 AAT 5 3 21870 CASAVA_Build 5 67414479 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2077 het 1293 hom 18 6 7 5 A 13 14 21871 CASAVA_Build 5 67416606 1I CTAGGTCTGC -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 7 8 21872 CASAVA_Build 5 67418433 1D AGGTGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1057 het 1057 ref 34 24 3 7 A 11 10 21873 CASAVA_Build 5 67449822 1D TTACAACTGT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 94 het 39 0 34 5 A 9 8 21874 CASAVA_Build 5 67452589 4D TTTTATTTTA TTTT/---- TTTTTTAGAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 T 10 6 21875 CASAVA_Build 5 67458850 15D AAAATAGTAA AGGGATGGGGGTTAG/--------------- AGGGATGGGG 3067 het 2940 hom 21 10 8 5 AGGGATGGGGGTTAG 2 1 21876 CASAVA_Build 5 67459197 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 2469 het 1558 hom 15 4 9 2 A 10 9 21877 CASAVA_Build 5 67459357 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2766 het 637 hom 14 3 11 0 A 11 12 21878 CASAVA_Build 5 67459878 2I TCACTGTGAC --/TG TCTTTCTGCT 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 TG 0 1 21879 CASAVA_Build 5 67467658 1D ATTTCCAAAA C/- TTGTGGAGCA 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 C 1 0 21880 CASAVA_Build 5 67468962 1I ATCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 11 12 21881 CASAVA_Build 5 67474245 1D GCTGAGGGCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 15 15 8 A 10 9 21882 CASAVA_Build 5 67490181 1I TCTAAATCAC -/A ATTGTTAACA 3070 het 2975 hom 22 7 14 1 A 1 2 21883 CASAVA_Build 5 67491212 1D ACCTCCACTT C/- CTGTAGCGTC 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 C 2 1 21884 CASAVA_Build 5 67491601 1D AACTGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2531 hom 29 9 10 10 T 15 14 21885 CASAVA_Build 5 67500042 1I TGCAATCTCC -/G CCTCCTGGGT 1528 het 1528 ref 18 7 4 7 G 0 1 21886 CASAVA_Build 5 67501071 1I TAATAACTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 8 9 21887 CASAVA_Build 5 67505412 1D CTATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2198 het 1457 hom 14 5 5 4 A 11 10 21888 CASAVA_Build 5 67507555 1D TAAATAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 A 12 11 21889 CASAVA_Build 5 67540055 1D AAAACTGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2566 hom 19 9 10 0 T 11 10 21890 CASAVA_Build 5 67548348 28I ATTCTCTGGA ----------------------------/AACCACAGCTCTAACACTAGTGAGCTCT AACCACAGCT 3070 het 3070 ref 35 17 13 7 AACCACAGCTCTAACACTAGTGAGCTCT 0 1 21891 CASAVA_Build 5 67554040 3I CAGAGGTGCT ---/AAG AAGGATACAG 3070 het 3070 ref 46 27 12 7 AAG 1 2 21892 CASAVA_Build 5 67556819 1D CCTTGGATCA T/- TTTTTTTTTT 1556 het 1556 ref 43 30 6 7 T 15 14 21893 CASAVA_Build 5 67560301 5I TCATAAAAAT -----/ATCTC AGTTGAATTA 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 ATCTC 0 1 21894 CASAVA_Build 5 67560714 1D GGAGAGTGTT G/- GGGGGGGGTC 3070 het 1437 hom 22 6 12 4 G 9 8 21895 CASAVA_Build 5 67567457 1I CTGCCAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2953 hom 34 10 17 7 T 11 12 21896 CASAVA_Build 5 67574783 2D4M5D ATAACTTGTA TGTTTCACATA/--TTTC----- TGTTCTTGGT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 N/A 0 0 21897 CASAVA_Build 5 67578490 1D TTAGTAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 30 0 20 10 A 11 10 21898 CASAVA_Build 5 67586421 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 7 8 T 12 11 21899 CASAVA_Build 5 67594131 4I GATACATATC ----/TATA TAATGTATAC 2612 het 2612 ref 31 21 6 4 TA 1 3 21900 CASAVA_Build 5 67594902 1D TGTGTTGTTG T/- TTTTTTTTAA 1639 het 1639 ref 15 7 5 3 T 9 8 21901 CASAVA_Build 5 67596817 1I TGCCTCAAAC -/T TACTGCCCTT 3070 het 3070 ref 43 23 19 1 T 1 2 21902 CASAVA_Build 5 67596964 12D GGGTTACCAT AACAAAACACCA/------------ CAGACTGGTG 3070 het 3070 ref 45 25 20 5 AACAAAACACCA 1 0 21903 CASAVA_Build 5 67599354 3D TATTAGTATT GTG/--- GTCCTTTTGG 3070 het 3070 hom 42 17 19 8 GTG 1 0 21904 CASAVA_Build 5 67601469 1I ATTGCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1455 hom 20 4 13 3 A 13 14 21905 CASAVA_Build 5 67603170 1D TCAGTTAAAA T/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 T 1 0 21906 CASAVA_Build 5 67603389 6D CATGCATCCA TCTATG/------ TACTGCACAT 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 TCTATG 1 0 21907 CASAVA_Build 5 67611080 1D TGCTTCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2832 hom 31 10 13 9 T 15 14 21908 CASAVA_Build 5 67626551 5D TAATAAAAAT AAAAA/----- AATAAAATAA 2120 het 39 hom 8 1 6 2 A 7 2 21909 CASAVA_Build 5 67644471 4I AATATGAAGT ----/AGAA AGAATCAGTG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AGAA 1 2 21910 CASAVA_Build 5 67653751 1D AGTTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 735 hom 26 4 10 12 A 17 16 21911 CASAVA_Build 5 67677617 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2128 het 91 hom 24 2 11 11 T 19 18 21912 CASAVA_Build 5 67698335 1I TCAGTGAGTA -/T TAAGTTCAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 21913 CASAVA_Build 5 67712558 1I TAAGAACAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 9 10 21914 CASAVA_Build 5 67717528 2I ACTTTATTTT --/AA AAGTCTTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 2 4 21915 CASAVA_Build 5 67739322 1I TTAGTTGTAT -/C CAGATTCTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 1 2 21916 CASAVA_Build 5 67749555 3D CCTCTGGTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 32 0 17 15 A 18 15 21917 CASAVA_Build 5 67775727 1I TCTCATCTAT -/A AACTGATTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 3 21918 CASAVA_Build 5 67780180 1I TCCTCCCCCT -/A GACCACTATA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 0 1 21919 CASAVA_Build 5 67780362 6D TACTTTTTCT TCTTCC/------ TCTTCCTCTT 2343 het 2343 ref 39 20 10 9 TCTTCC 3 2 21920 CASAVA_Build 5 67828221 1I TGTGCATCCA -/G GGTTGAGATC 3070 hom 132 het 51 0 44 7 G 2 3 21921 CASAVA_Build 5 67844549 1D ATATCACTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 10 9 21922 CASAVA_Build 5 67848824 1I TGAGTGTGCC -/T TTTTCAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 15 11 T 4 5 21923 CASAVA_Build 5 67853525 1D TTAAAAAAAA G/- TCAGAGGCAA 3070 hom 113 het 48 0 35 13 G 1 0 21924 CASAVA_Build 5 67859128 1D TCTGGGTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 10 9 21925 CASAVA_Build 5 67860772 1I ATGGGTATAA -/C CCTGGCACTG 3070 hom 99 het 38 0 32 6 C 2 3 21926 CASAVA_Build 5 67868376 1I GATCAGGGGC -/A AAAAAAGCAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 6 7 21927 CASAVA_Build 5 67873377 1D AATAAACATT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 7 21928 CASAVA_Build 5 67918143 1D ATGGACTACC T/- TTTTTTTTTT 1533 het 1533 ref 31 21 5 5 T 11 10 21929 CASAVA_Build 5 67938998 1D TTATTTATTA T/- TATTGGGATG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 2 1 21930 CASAVA_Build 5 67945226 1D GAAAAGCAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 7 21931 CASAVA_Build 5 67976637 3D CAACAACAAC AAT/--- GACAATAAAA 3070 hom 75 het 35 0 26 10 AAT 1 0 21932 CASAVA_Build 5 67981362 3D ATTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 32 0 18 14 T 17 14 21933 CASAVA_Build 5 67990423 2D CTTTCATATC AT/-- ACTTCAGAAA 3070 hom 114 het 39 0 38 2 AT 1 0 21934 CASAVA_Build 5 68003776 1D CACAGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 40 1 27 12 A 15 14 21935 CASAVA_Build 5 68015896 5I ATGCACATTC -----/TGTTA TAAGAAACTG 3070 hom 155 het 57 0 52 5 TGTTA 0 1 21936 CASAVA_Build 5 68025480 1I CGGAAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 10 11 21937 CASAVA_Build 5 68031137 1I GGAGAAGACA -/G GGTTGCTGTT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 G 2 3 21938 CASAVA_Build 5 68041476 1D CTCCATGCAT C/- CCCCCATGGG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 6 5 21939 CASAVA_Build 5 68043195 1I GCTTTGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 38 1 25 12 T 10 11 21940 CASAVA_Build 5 68058172 1I AAGAAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 2118 het 2118 ref 37 14 11 12 T 15 16 21941 CASAVA_Build 5 68084434 1D CAAAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 19 18 21942 CASAVA_Build 5 68090233 1I CTGCTGACCA -/C CGAGGCTACC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 C 1 2 21943 CASAVA_Build 5 68098163 1D AACTGTAGTG T/- TAAGAGAAGC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 2 1 21944 CASAVA_Build 5 68107572 1D GCTTTTTGTT C/- TAAAGGTGGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 21945 CASAVA_Build 5 68121942 2D CTCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 29 0 25 4 A 13 11 21946 CASAVA_Build 5 68124343 3I TCTAGTTGAA ---/CTC CTCTCAACGT 3070 hom 123 het 51 0 41 10 CTC 1 2 21947 CASAVA_Build 5 68148474 1D TCTTGTAACA T/- TTTTCCCATC 3070 het 3070 hom 47 20 25 3 T 5 4 21948 CASAVA_Build 5 68151515 1D CAAGGAAGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 10 9 21949 CASAVA_Build 5 68160419 1I TTTTCTGGTT -/A AAAAAAAAAA 1079 het 1079 ref 28 18 4 6 A 15 16 21950 CASAVA_Build 5 68178572 1I AAAGCTTTCT -/A AATGTGGTGA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 A 2 3 21951 CASAVA_Build 5 68182716 1D CATCATGTTT G/- GGTGCAATAC 3070 hom 132 het 47 0 44 4 G 3 2 21952 CASAVA_Build 5 68182921 2D GACCACTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 26 0 20 6 A 16 14 21953 CASAVA_Build 5 68185889 1I GGCATTTAGG -/T TTAATTCCAT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 2 3 21954 CASAVA_Build 5 68214609 1D TCTGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 48 het 48 ref 15 5 1 9 A 15 14 21955 CASAVA_Build 5 68214627 1I AAAAAAAGGC -/T TAGACGAGGT 1532 hom 44 het 20 0 14 6 T 1 2 21956 CASAVA_Build 5 68215705 2D AGGCTGGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2258 het 196 hom 32 3 8 22 A 16 14 21957 CASAVA_Build 5 68274151 1D ACATATACAA T/- TTTTTTTTTT 1456 het 1456 ref 20 7 4 9 T 15 14 21958 CASAVA_Build 5 68290918 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2046 het 836 hom 17 3 7 7 A 13 12 21959 CASAVA_Build 5 68295276 1D TATTTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 45 2 23 20 T 14 13 21960 CASAVA_Build 5 68303653 1I TCAACCAACA -/T TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 4 5 21961 CASAVA_Build 5 68314339 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2115 hom 22 8 11 3 A 12 11 21962 CASAVA_Build 5 68315377 1D ATGAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2637 hom 23 8 11 4 A 11 10 21963 CASAVA_Build 5 68316842 1D CTTAAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 28 9 T 11 10 21964 CASAVA_Build 5 68317441 1I TTCCAAAATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 A 9 10 21965 CASAVA_Build 5 68318079 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2254 het 2254 ref 29 14 6 9 A 11 12 21966 CASAVA_Build 5 68319608 1I GTTGCAGTGC -/G ACGAGATCGC 3070 het 1982 hom 20 5 11 4 G 0 1 21967 CASAVA_Build 5 68322971 4D TTTTTCTCAT TCTC/---- TCTCTCTACT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 TC 5 3 21968 CASAVA_Build 5 68325597 1I ACCCAGAAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 2906 hom 22 6 10 6 T 8 9 21969 CASAVA_Build 5 68332905 1D AACAGAAGGG C/- CCCCCCTCAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 C 7 6 21970 CASAVA_Build 5 68334200 1D CGAGGTCAAG A/- GATCCAGACT 2330 het 2330 ref 20 12 6 2 A 1 0 21971 CASAVA_Build 5 68365411 2I CTTACCTCCC --/CT GTTTTGCAGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 CT 0 1 21972 CASAVA_Build 5 68379624 1D AAGCACATTC A/- AAAAAATAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 6 21973 CASAVA_Build 5 68387492 1D TCTCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 20 1 17 3 A 12 11 21974 CASAVA_Build 5 68387709 2D GTACTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 13 11 21975 CASAVA_Build 5 68393269 1I GTGAAGGTGA -/T TTTTTTCTGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 6 7 21976 CASAVA_Build 5 68395473 8D TTTTGTGTCA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2143 het 6 hom 6 0 5 5 T 19 11 21977 CASAVA_Build 5 68398505 1I TTTTTGGGTG -/T GTTTTTTTTT 2304 hom 27 het 11 0 10 1 T 0 1 21978 CASAVA_Build 5 68401599 4I TGGATGTACA ----/GATT GATTATTTCA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 GATT 1 2 21979 CASAVA_Build 5 68403365 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 10 9 21980 CASAVA_Build 5 68404147 1I CCTGGCCAAC -/A TGGTGAAACC 3070 hom 35 het 14 0 12 2 A 0 1 21981 CASAVA_Build 5 68414067 1I TTTATAATAG -/A AAAAAACCTC 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 6 7 21982 CASAVA_Build 5 68415278 1I CCTGTTTCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 T 9 10 21983 CASAVA_Build 5 68421859 9D AGCTTTACAA AGGTAATTG/--------- AGTTTGGGGG 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 AGGTAATTG 1 0 21984 CASAVA_Build 5 68422080 1D TGATACCTCG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 9 8 21985 CASAVA_Build 5 68423676 1D ACTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 19 3 12 4 T 13 12 21986 CASAVA_Build 5 68426462 1I CCTCGTTGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 9 10 21987 CASAVA_Build 5 68426824 1I CGCTCTTGTT -/G CCCAGGCTGG 3070 hom 10 het 16 0 10 7 G 0 1 21988 CASAVA_Build 5 68428556 1I TTTCCCCTCC -/A AAAAAAAAAC 2633 het 2473 hom 27 11 10 6 A 9 10 21989 CASAVA_Build 5 68432521 1I GGGTGAGTGT -/G GGGGGGGGGT 2462 het 2462 ref 27 14 7 6 G 9 10 21990 CASAVA_Build 5 68436351 3D TCATTTTGAA TAT/--- TATTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 TAT 2 1 21991 CASAVA_Build 5 68437241 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2636 het 2636 ref 22 9 8 5 A 11 12 21992 CASAVA_Build 5 68442234 1I AAAGCAGTGG -/A AAAAAATCAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 21993 CASAVA_Build 5 68445110 3I GCCACTCAAC ---/ATA ATGTTTGCTC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 ATA 0 1 21994 CASAVA_Build 5 68447805 1I TGTGTAAGCA -/T TTCCCCCCTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 21995 CASAVA_Build 5 68448799 1D TACTCCTCCC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 9 8 21996 CASAVA_Build 5 68454424 1D ATTGCACTAT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 8 7 21997 CASAVA_Build 5 68459063 2I ATACAAAAAA --/AT AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 1 AT 0 1 21998 CASAVA_Build 5 68466944 1I GAATAAGACT -/C CCCCACCATA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 C 4 5 21999 CASAVA_Build 5 68480151 4I TTCTGCTTGA ----/TTAT TTCTTTTTAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTAT 0 1 22000 CASAVA_Build 5 68484114 1I GTTTTTTCGG -/T TTTTTTTTTT 2139 het 376 hom 11 1 6 4 T 12 13 22001 CASAVA_Build 5 68495114 1D AGAAATAATT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 A 8 7 22002 CASAVA_Build 5 68497615 1I GTAGGAGGGT -/A GAACTATGAT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 0 1 22003 CASAVA_Build 5 68500114 1D TCTCTGAGGT A/- TTGTCACCTC 3070 het 3070 hom 59 18 34 7 A 1 0 22004 CASAVA_Build 5 68506356 4I ATATGGTGTC ----/ATTA ATTAAGATTT 3070 het 3070 ref 25 14 10 3 ATTA 1 2 22005 CASAVA_Build 5 68519318 1I CATCCTGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 15 13 18 T 14 15 22006 CASAVA_Build 5 68524572 1D TCAGCTACTC G/- GGGAGGCTGA 3070 het 3070 ref 17 9 7 1 G 4 3 22007 CASAVA_Build 5 68527471 7I TGAGTGAATT -------/AGTCAAG AGTCAAGCAC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 AGTCAAG 1 2 22008 CASAVA_Build 5 68530532 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 17 16 12 A 12 11 22009 CASAVA_Build 5 68532412 1I ACCTCTGCCT -/C CCAGGTTCAA 3070 het 1794 hom 16 4 10 2 C 2 3 22010 CASAVA_Build 5 68534958 1D TAATATGGTA T/- TTTTTTTTGG 2915 het 2491 hom 18 8 6 4 T 9 8 22011 CASAVA_Build 5 68536842 5I AAATAGTTTC -----/GCTCT GCTCTGTTGT 1906 het 1906 ref 19 9 5 5 GCTCT 1 2 22012 CASAVA_Build 5 68538464 1I CTTGTCTATT -/C CCCCCATGTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 C 5 6 22013 CASAVA_Build 5 68540553 1D AATTTTTGTG T/- TTTTTGGTAG 2668 het 2082 hom 13 5 6 2 T 6 5 22014 CASAVA_Build 5 68543126 4I TCAGAGTTGG ----/AGAA AGAAAGTGGG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 AGAA 1 2 22015 CASAVA_Build 5 68547666 4I CAGCCTTAAA ----/AAAG AAAGAAATTC 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 AAAG 1 2 22016 CASAVA_Build 5 68555959 1I GGGTGACAGA -/G GGAGACTCCA 2540 het 2540 ref 21 9 6 6 G 2 3 22017 CASAVA_Build 5 68559763 1I TAATAAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 12 13 22018 CASAVA_Build 5 68562294 5I CATCCAAAAA -----/AAAAG AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 AAAAG 1 2 22019 CASAVA_Build 5 68563815 3D TCATTGTGGG AGA/--- AGACCACACA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AGA 2 1 22020 CASAVA_Build 5 68569869 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2819 hom 35 13 10 12 T 15 14 22021 CASAVA_Build 5 68585683 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 A 8 9 22022 CASAVA_Build 5 68597492 1I GACACTAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 10 11 22023 CASAVA_Build 5 68599263 2D AAATCAAGTC TG/-- TATTCAGATT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 TG 1 0 22024 CASAVA_Build 5 68601668 2D AAAAAAAAAA TT/-- AAACTTCTTA 142 het 142 ref 14 7 2 5 T 2 0 22025 CASAVA_Build 5 68603097 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3031 het 2135 hom 26 9 8 9 T 16 14 22026 CASAVA_Build 5 68611427 1I AAGAATACTA -/C CCCAAGACTC 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 C 3 4 22027 CASAVA_Build 5 68613480 1I AATGTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2915 hom 27 11 13 3 G 0 1 22028 CASAVA_Build 5 68616707 5I ACCAAAAAAC -----/AAACA AAACAAAACA 3070 het 1814 hom 19 6 9 4 AAACA 2 3 22029 CASAVA_Build 5 68618847 1D GATTAATCAA T/- TTTTTTTTTT 2713 het 1077 hom 22 6 7 9 T 17 16 22030 CASAVA_Build 5 68622950 1D ATACTGATCA T/- TTTTTTTTTT 872 het 872 ref 23 17 2 4 T 13 12 22031 CASAVA_Build 5 68632406 1D CCGCTCTCAG C/- CCCAGGGCCT 3070 het 3070 hom 41 16 18 10 C 4 3 22032 CASAVA_Build 5 68646466 2D ATAAAGAAAA AC/-- ATGAATATTG 3070 het 3070 ref 27 15 8 5 AC 1 0 22033 CASAVA_Build 5 68660550 1D CTAATTTTTT G/- TATTTTTAGT 3070 het 942 hom 11 2 9 0 G 1 0 22034 CASAVA_Build 5 68672003 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 21 1 15 6 A 15 14 22035 CASAVA_Build 5 68674127 2I TTTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 12 14 22036 CASAVA_Build 5 68676695 2I TGAGCCAAGA --/TG TGTCACCATT 1816 het 1816 ref 12 6 4 2 TG 1 2 22037 CASAVA_Build 5 68684059 1I GTTTGAATTT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 2686 hom 27 9 13 5 C 9 10 22038 CASAVA_Build 5 68685528 1I AAATTTTTTA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 6 7 22039 CASAVA_Build 5 68687995 1I TCCCAGCCCA -/G TACGAGGTAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 G 0 1 22040 CASAVA_Build 5 68693688 4D TTCTTAAAAG CTTT/---- CTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 CTTT 2 1 22041 CASAVA_Build 5 68707210 2I CTTCAGTATG --/TC TCTGTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TC 1 2 22042 CASAVA_Build 5 68708346 1I TCCTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 894 hom 25 2 20 3 T 10 11 22043 CASAVA_Build 5 68719775 1I AAAACAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 10 11 22044 CASAVA_Build 5 68722381 2D CTAATTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1853 hom 18 8 10 0 AT 7 6 22045 CASAVA_Build 5 68726182 4I ACATTTAAAT ----/TTAA TTAAAAATTC 3070 hom 75 het 36 0 25 11 TTAA 1 2 22046 CASAVA_Build 5 68728132 1I ATAAAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2174 hom 34 7 18 9 A 17 18 22047 CASAVA_Build 5 68731269 3I TCAGCATAAC ---/GTT GTGTTGACTA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 GTT 0 1 22048 CASAVA_Build 5 68732210 1I ATCCTTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 10 11 22049 CASAVA_Build 5 68733083 1I TTAATAGTAT -/A TTTTCATTAT 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 A 0 1 22050 CASAVA_Build 5 68734523 1I GGAAATTAAC -/A TTAATACCGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 1 22051 CASAVA_Build 5 68735521 5D69M7D CCTCTCCAAA AAAATAAAATAAAATTTCTGAGATGTTTTGATAAGTTATATGGTAGATTACTAACATTTTTAATATGACACAAATTCTGTT/-----AAAATAAAATTTCTGAGATGTTTTGATAAGTTATATGGTAGATTACTAACATTTTTAATATGACACAAA------- TTCTGTTTTG 3070 het 3070 ref 31 25 15 9 N/A 0 0 22052 CASAVA_Build 5 68737625 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 742 hom 20 3 16 2 A 16 15 22053 CASAVA_Build 5 68744568 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 21 1 15 5 A 13 12 22054 CASAVA_Build 5 68757319 1D ATAATAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 20 5 12 3 T 15 14 22055 CASAVA_Build 5 68761475 4D TAGTTCTGGG TTAT/---- TTATTTATTT 2012 het 2012 ref 17 5 7 5 TTAT 4 3 22056 CASAVA_Build 5 68779340 1D TCAGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 751 hom 20 4 13 3 A 17 16 22057 CASAVA_Build 5 68781574 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1251 het 725 hom 9 2 5 2 A 11 12 22058 CASAVA_Build 5 68782689 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 7 6 22059 CASAVA_Build 5 68785631 20D TATTTGTTTG TTTATTTATTTATTTATTTA/-------------------- TTTATTTATT 1483 het 1070 hom 11 7 6 1 TTTA 10 5 22060 CASAVA_Build 5 68805807 1D AACTATGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1920 hom 28 7 15 6 T 13 12 22061 CASAVA_Build 5 68806569 1D CAAGAGTGAC A/- AAAATTATGA 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 A 5 4 22062 CASAVA_Build 5 68809944 1D CACTAAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1968 hom 23 7 10 6 T 13 12 22063 CASAVA_Build 5 68815479 3I AAAATAAAAC ---/ATT ATACTATGTA 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 ATT 0 1 22064 CASAVA_Build 5 68825769 2D ATGAGGTGCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 46 22 19 5 TG 10 9 22065 CASAVA_Build 5 68828822 1D GTTTTTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 9 16 11 T 12 11 22066 CASAVA_Build 5 68833898 1I AGGAAAAAAA -/T ATCAGATACT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 0 1 22067 CASAVA_Build 5 68859995 9I AACAAAGGCA ---------/CATGGTGAC TGAAACATAC 3070 het 3070 ref 58 35 15 8 CATGGTGAC 0 1 22068 CASAVA_Build 5 68866485 9I CATATAATTG ---------/GTTTTTGTT GTTTTTGTGC 1876 het 1876 ref 18 11 4 3 GTTTTTGTT 0 1 22069 CASAVA_Build 5 68869593 1D GTTTCAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1503 hom 28 7 10 11 T 12 11 22070 CASAVA_Build 5 68898118 1D ATTTTTTTTT G/- TGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 G 1 0 22071 CASAVA_Build 5 68960983 5D CAGTGGGGTC TTTTA/----- TTTTATTTTT 2423 hom 15 het 6 0 6 1 TTTTA 2 1 22072 CASAVA_Build 5 69151937 2I ATCCTTCTTA --/TT TTTTTTTTTT 1150 het 1150 ref 13 9 3 1 T 10 12 22073 CASAVA_Build 5 69268486 1I TCTACTTTTG -/T TTTTTGCTAA 3070 het 477 hom 10 1 9 0 T 5 6 22074 CASAVA_Build 5 69271933 1I AAGGTCCCAC -/A TACTAATACC 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 A 0 1 22075 CASAVA_Build 5 69522188 2D ATTGACTTAA AG/-- ATGTTACATG 1544 het 1544 ref 10 5 4 1 AG 1 0 22076 CASAVA_Build 5 69640312 1I TTGCTACTAT -/A AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 6 7 22077 CASAVA_Build 5 69668510 1I GATTCTTCAA -/T TTTTTTTATT 1438 hom 10 het 5 0 4 1 T 7 8 22078 CASAVA_Build 5 69774587 2D GATATTTAAG AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 AT 1 0 22079 CASAVA_Build 5 70061361 1D CTATTGTGAG A/- AAAAAAAATT 2886 het 1442 hom 9 3 6 0 A 9 8 22080 CASAVA_Build 5 70497089 1D CTCATTAAAA G/- TTATCTGGAG 3070 het 2674 hom 19 6 13 0 G 1 0 22081 CASAVA_Build 5 70521336 2I ATTTCTAGCA --/AC AGTCTATGAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 AC 0 1 22082 CASAVA_Build 5 70523150 10I ATCGGAAAGT ----------/GAAAGGAACG GAAAGGAACT 3070 het 3070 ref 40 31 8 1 GAAAGGAACG 0 1 22083 CASAVA_Build 5 70611451 1D TAAGCCTTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 34 8 4 T 9 8 22084 CASAVA_Build 5 70613646 1I GAAGGTTATC -/A AGAGTCACAC 2591 hom 18 het 8 0 7 1 A 1 2 22085 CASAVA_Build 5 70659842 1I AACTCAGTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 47 30 9 8 T 8 9 22086 CASAVA_Build 5 70698910 1D GTTAATTTGA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 8 7 22087 CASAVA_Build 5 70707938 1D TTGATATGGA C/- CTGTTGGTCC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 2 1 22088 CASAVA_Build 5 70722940 2I CTTTATTCCA --/AT ATGTTTTTTT 2192 het 2192 ref 32 25 5 2 AT 1 2 22089 CASAVA_Build 5 70729125 4D TTCATAGTAA ATAC/---- TCTCCTCCTA 3004 het 3004 ref 24 17 7 1 ATAC 1 0 22090 CASAVA_Build 5 70731173 1I TGTTGGGGTC -/T GGATCAGGGC 3070 het 2851 hom 17 7 10 0 T 0 1 22091 CASAVA_Build 5 70734249 1I TCTTTCTGTC -/T TTTTTTTCAC 2831 het 2831 ref 17 8 6 3 T 7 8 22092 CASAVA_Build 5 70735045 1D TTAAAATATG C/- CCTAATTGAA 3070 hom 48 het 21 0 16 6 C 3 2 22093 CASAVA_Build 5 70746305 1I ATTAATAAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 9 10 22094 CASAVA_Build 5 70757360 1D GGGATAAGCT G/- GGGGGATGTC 3070 het 3070 hom 48 23 21 4 G 6 5 22095 CASAVA_Build 5 70776949 1D TGCACAACCC T/- TCCAGATAGA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 T 2 1 22096 CASAVA_Build 5 70808138 1I TTTCCCTTTT -/G TTTTTAGACA 3070 het 1855 hom 18 6 11 1 G 0 1 22097 CASAVA_Build 5 70833773 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2112 het 2112 ref 33 11 8 14 T 15 14 22098 CASAVA_Build 5 70842773 1D TTTTGAATGC T/- TTTTTCAGAG 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 6 5 22099 CASAVA_Build 5 70850876 1D ATATCCATCA C/- TTCATACTTT 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 C 1 0 22100 CASAVA_Build 5 70853544 1I GCTACTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 15 9 T 11 12 22101 CASAVA_Build 5 70864174 4D AAGCAATGAT TTTG/---- TTTGTTTGTG 3070 het 3070 hom 34 10 20 6 TTTG 3 2 22102 CASAVA_Build 5 70872715 4I GCTGACAGTG ----/CTGT CTGTCTTGAA 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 CTGT 1 2 22103 CASAVA_Build 5 70882050 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 9 22104 CASAVA_Build 5 70887051 4D AGATGGAGTT TCTC/---- TCCTATTGCC 2813 het 2813 ref 25 11 8 6 TC 3 1 22105 CASAVA_Build 5 70889856 1D AGTGGCTCAT G/- GCCTGTAATC 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 G 2 1 22106 CASAVA_Build 5 70895913 3I GGTCTGTCTA ---/TTC TTATGCAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 19 0 TTC 0 1 22107 CASAVA_Build 5 70921693 2D GGTGATTAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 47 19 19 11 AC 10 9 22108 CASAVA_Build 5 70927663 1I GATAGATTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 9 10 22109 CASAVA_Build 5 70927784 7D TATATTTTGG ATTAAGT/------- ATTATGTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 ATTAAGT 1 0 22110 CASAVA_Build 5 70929113 3D TCGGCATAGG GTA/--- GTAGTAGTGG 3070 het 3070 ref 46 19 21 7 GTA 3 2 22111 CASAVA_Build 5 70948626 1D TATTTGCTAC A/- AAACAAAGCT 3070 het 3070 hom 44 19 24 2 A 4 3 22112 CASAVA_Build 5 70953854 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 9 8 10 A 10 11 22113 CASAVA_Build 5 70965135 1D GGGTGATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 11 10 22114 CASAVA_Build 5 70977648 1I ATGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 12 13 22115 CASAVA_Build 5 70995890 1I TTTCTGCTTT -/G GTGATATTAT 3070 hom 142 het 54 0 52 2 G 1 2 22116 CASAVA_Build 5 70996350 2D AATCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 28 2 16 10 A 16 14 22117 CASAVA_Build 5 70996843 4I TCCAGAGTCA ----/TTTC TTTCTGCTCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTTC 1 2 22118 CASAVA_Build 5 71006377 4D TAGTTTAGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 84 het 30 0 28 3 TTTG 6 5 22119 CASAVA_Build 5 71007731 11D AGACCCTGTC TCAATAAAACA/----------- TCAAAAAAAT 3070 hom 59 het 21 0 19 4 TCAATAAAACA 1 0 22120 CASAVA_Build 5 71008887 2D TGCACACATG CA/-- CACACACACA 1333 het 1333 ref 39 26 3 11 CA 9 8 22121 CASAVA_Build 5 71025433 1D AATCTCGAAC T/- TTTTCATCTT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 5 4 22122 CASAVA_Build 5 71025606 1D ATTTGTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 19 9 T 11 10 22123 CASAVA_Build 5 71027054 8I TCCCAAGCAC --------/ATGAAGGT ATGAAGGTGG 3070 het 3070 hom 55 19 28 8 ATGAAGGT 1 2 22124 CASAVA_Build 5 71043703 1I TCTTTTTTTT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 7 8 22125 CASAVA_Build 5 71053410 2I AAATAAATGT --/GA TAACAGCTTC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 GA 0 1 22126 CASAVA_Build 5 71083726 1I TGGCATAGTA -/C TTTGGGATTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 0 1 22127 CASAVA_Build 5 71142543 1I TCTCCTCTTA -/T CCCAGCCTGT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 0 1 22128 CASAVA_Build 5 71147581 1D TTAGGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 T 11 10 22129 CASAVA_Build 5 71149711 2I AGCAGAACAT --/AG AGAAGTGTGT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AG 1 2 22130 CASAVA_Build 5 71157800 3I CTATCAGTAC ---/TTT TTTGAATATA 2290 het 2290 ref 30 10 7 13 T 3 6 22131 CASAVA_Build 5 71160720 5I TAAAATAAAA -----/TAAAT TATAGAGTAT 2540 het 2540 ref 21 12 6 3 TAAAT 0 1 22132 CASAVA_Build 5 71162626 1D TGGCCTTCCT A/- AAAACAAAGC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 5 4 22133 CASAVA_Build 5 71195436 1I CACTGCTTCT -/A AGGAGCTCAT 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 A 1 2 22134 CASAVA_Build 5 71206172 1D ATTTGGTTAG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 8 7 22135 CASAVA_Build 5 71219624 1D TCTTAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 11 10 22136 CASAVA_Build 5 71229097 2D TCTGATGGAC CT/-- TTTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 CT 1 0 22137 CASAVA_Build 5 71245723 1I TTCCAGACGG -/C GGTTGGGAAA 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 C 0 1 22138 CASAVA_Build 5 71251271 1D AGGATACAAC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 A 7 6 22139 CASAVA_Build 5 71253374 1D TTAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2553 hom 29 9 14 6 A 13 12 22140 CASAVA_Build 5 71262099 5I AAGGTGAGGA -----/TAGAG TAGAGTCTGA 3070 het 3070 hom 55 19 27 9 TAGAG 1 2 22141 CASAVA_Build 5 71262387 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2667 het 2023 hom 33 14 10 9 T 15 14 22142 CASAVA_Build 5 71264404 4I GCAGCAACAC ----/TTTG TTTGTTGATC 3070 het 3070 ref 59 31 19 9 TTTG 1 2 22143 CASAVA_Build 5 71266059 2I TTTACACAGA --/TG TGTTTACAAT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 TG 1 2 22144 CASAVA_Build 5 71271872 1I AAATGTATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 T 9 10 22145 CASAVA_Build 5 71272107 2I CCAGGAATGC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 9 11 22146 CASAVA_Build 5 71285738 1D TTAATCTCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 17 20 5 A 10 9 22147 CASAVA_Build 5 71286966 1I CGTTTCTGCT -/G GGGCTCCTTG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 3 4 22148 CASAVA_Build 5 71289567 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 A 9 10 22149 CASAVA_Build 5 71293340 1I GCATCTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 A 10 11 22150 CASAVA_Build 5 71295913 1I AAAATAAAAG -/T TATTTTAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 T 1 2 22151 CASAVA_Build 5 71301689 1D CTCCATCTTG A/- AAAAAAAAAA 2938 het 1664 hom 24 8 8 8 A 15 14 22152 CASAVA_Build 5 71364000 1D TTATAATGGC A/- AAAAAAAAAA 1181 het 1181 ref 39 27 5 7 A 13 12 22153 CASAVA_Build 5 71429134 1D ATTTAATGAC A/- AAAAAAACTT 2565 het 2565 ref 22 13 7 3 A 8 7 22154 CASAVA_Build 5 71457305 1I ATATTATCCA -/T TGCAAATTGG 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 T 1 2 22155 CASAVA_Build 5 71459992 1D ATATTGTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2909 hom 39 12 15 14 A 15 14 22156 CASAVA_Build 5 71461778 1I AAAAAAAAAA -/C AATGAACAAA 3070 het 358 hom 38 1 33 4 C 0 1 22157 CASAVA_Build 5 71466099 3D CATTTTCATT AAG/--- AAGAATTTGG 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 AAG 2 1 22158 CASAVA_Build 5 71482633 1I AAAAAAGAGG -/T GGGTTTGGCT 2316 het 2316 ref 25 13 7 5 T 0 1 22159 CASAVA_Build 5 71491017 4D CTAAAAAGGC AGAT/---- AGATAGTGTA 3070 hom 129 het 50 0 44 8 AGAT 2 1 22160 CASAVA_Build 5 71524839 1I CCCACCAAGG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 T 6 7 22161 CASAVA_Build 5 71533033 1D ATCATTCATG T/- TTTTGGTCAT 3070 het 3070 ref 37 16 18 3 T 5 4 22162 CASAVA_Build 5 71539546 11D TCTCTCTCTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 2790 hom 27 14 9 5 T 21 10 22163 CASAVA_Build 5 71539670 1I TGTTCTCAAT -/A ATGACCACAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 1 2 22164 CASAVA_Build 5 71543527 3D ATACATATTC TTG/--- TTGTTCAGGC 3070 het 3070 hom 43 13 24 6 TTG 2 1 22165 CASAVA_Build 5 71544192 1I TCCATATGAC -/T TATTATTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 T 1 2 22166 CASAVA_Build 5 71550830 3D TTGGATCCTG ACT/--- ACTGCGGTTC 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 ACT 2 1 22167 CASAVA_Build 5 71553473 26D GGTGTTGTGC TCCTGGAGAAGTAAGTATTAAAAACA/-------------------------- TTAATCTATT 3070 het 3070 ref 30 18 14 4 TCCTGGAGAAGTAAGTATTAAAAACA 1 0 22168 CASAVA_Build 5 71558283 1D AATCCTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 8 A 11 10 22169 CASAVA_Build 5 71561002 1D AAAAACAACG C/- CCCCCCCCAA 3070 het 1628 hom 25 6 11 8 C 9 8 22170 CASAVA_Build 5 71607614 1I GTGTGTGTGT -/G GGGGGGGGTA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 G 8 9 22171 CASAVA_Build 5 71615315 1D GTGTACGTAC A/- AAAAAAAAAG 1322 het 1322 ref 50 41 3 6 A 10 9 22172 CASAVA_Build 5 71618158 1I ACATACACAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 9 10 22173 CASAVA_Build 5 71630521 1D ACACAGCCAT A/- AAAAAAAAAA 1358 het 1358 ref 37 30 3 5 A 11 10 22174 CASAVA_Build 5 71647141 1D CTCTGTTTCG A/- AAAAAAAAAA 1883 het 1883 ref 35 19 8 8 A 15 14 22175 CASAVA_Build 5 71664112 2D ATTATTTGAC TA/-- TTTTTAATAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TA 1 0 22176 CASAVA_Build 5 71666134 1D AACTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2245 het 1092 hom 24 9 7 8 T 13 12 22177 CASAVA_Build 5 71672553 1D TTCTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 665 hom 19 5 9 5 T 13 12 22178 CASAVA_Build 5 71679304 1D AATGATTTGA T/- TTTTTTTTTT 2185 het 2185 ref 36 26 5 5 T 12 11 22179 CASAVA_Build 5 71681879 4D ATAAAGGACA ATTT/---- ATTATGTAGC 3070 het 3070 hom 56 25 26 5 ATTT 1 0 22180 CASAVA_Build 5 71688097 2I ATTTTACAAA --/TG GTGCATTTAA 3070 hom 96 het 33 0 32 1 TG 0 1 22181 CASAVA_Build 5 71728978 1I TACAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 A 9 10 22182 CASAVA_Build 5 71750588 1D GTTAATTTTT A/- TACTGGTTAA 2118 het 2118 ref 17 9 7 1 A 1 0 22183 CASAVA_Build 5 71753062 2I TTTTTGATCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TG 5 6 22184 CASAVA_Build 5 71773631 1D CAGTCATGCA T/- TTTTTAAACA 3070 het 3070 ref 54 29 18 7 T 6 5 22185 CASAVA_Build 5 71776947 1I7M1I GCTTCTGGGA -GGGGGTG-/GGGGGGTGC AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 26 13 13 1 N/A 0 0 22186 CASAVA_Build 5 71779837 3I TAGTATCTCA ---/GGT GGTGTACAGG 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 GGT 1 2 22187 CASAVA_Build 5 71805963 1I GGGAGGGGGG -/A AAAATGCCAC 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 A 4 5 22188 CASAVA_Build 5 71816693 1D AAAATTTAGT A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 7 6 22189 CASAVA_Build 5 71829714 1D CTGCGATTCG A/- AAAAAAAATA 1401 het 1401 ref 25 21 3 1 A 9 8 22190 CASAVA_Build 5 71831449 22D CATGGGCTCC ATCCAGGCAGAGGCCCCATTTT/---------------------- GTCCAGGCTT 3070 het 3070 ref 35 24 16 2 ATCCAGGCAGAGGCCCCATTTT 1 0 22191 CASAVA_Build 5 71875089 2D CACATCACTC TT/-- TTGATTGTTT 1497 het 1497 ref 28 18 4 8 T 4 2 22192 CASAVA_Build 5 71922627 1I CCAAGGCAAA -/T TTGTATTATA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 2 3 22193 CASAVA_Build 5 72014669 1D ACCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1621 het 1621 ref 25 14 4 7 A 15 14 22194 CASAVA_Build 5 72150372 1D AAGCTGAGAG A/- ATCAAAGAAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 2 1 22195 CASAVA_Build 5 72152781 4I TTAGAGAAAA ----/AAAC ATTCATATTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AAAC 0 1 22196 CASAVA_Build 5 72153907 1I AAGCAGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 930 hom 33 3 23 7 T 12 13 22197 CASAVA_Build 5 72172704 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 28 1 17 10 C 0 1 22198 CASAVA_Build 5 72177979 3D TGTAAAAAAC GTT/--- GTAGAGTTAG 3070 hom 99 het 35 0 33 3 GTT 1 0 22199 CASAVA_Build 5 72185243 2I TGTTTATGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 11 13 22200 CASAVA_Build 5 72190622 1I AACATATTTT -/G TAAGTGAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 22201 CASAVA_Build 5 72196989 4I GGTGCCACTG ----/CACT CCAGCCTGGG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 CACT 0 1 22202 CASAVA_Build 5 72198754 1I ACCCTGCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1310 hom 33 4 22 7 A 11 12 22203 CASAVA_Build 5 72198970 2D TCTTAAGCGT TC/-- TCTCTCAACG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TC 4 3 22204 CASAVA_Build 5 72226938 1D TTGTCCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 24 11 T 13 12 22205 CASAVA_Build 5 72229072 1I TGGGAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 619 hom 33 3 27 3 T 11 12 22206 CASAVA_Build 5 72240704 1D GTAAAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 26 3 14 9 T 15 14 22207 CASAVA_Build 5 72274863 3I TCCAGTAGTG ---/TGC TGGTACATGT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TGC 0 1 22208 CASAVA_Build 5 72283218 1D TGAAGGAGCA C/- CCGGGAAAGT 3070 hom 147 het 55 0 48 7 C 3 2 22209 CASAVA_Build 5 72291895 1I ACTTTGAAGG -/A AAAAATTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 22210 CASAVA_Build 5 72296588 1D TTATCAGATT A/- AAAAAAAAAA 2293 het 2293 ref 54 38 8 8 A 12 11 22211 CASAVA_Build 5 72314515 4D TTTTTTTTTT CAGA/---- CAGAGTATCT 3070 het 3070 hom 30 10 14 9 CAGA 2 1 22212 CASAVA_Build 5 72317824 1D GTAATTTGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 27 0 23 5 T 10 9 22213 CASAVA_Build 5 72415150 1D CTGACCTCCC A/- GAAATCATGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 A 1 0 22214 CASAVA_Build 5 72425854 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 9 10 22215 CASAVA_Build 5 72432923 3I TCAGTACAAC ---/TAT TATTAGTACT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAT 1 2 22216 CASAVA_Build 5 72441248 1D TTTGTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 32 1 24 8 T 12 11 22217 CASAVA_Build 5 72442592 1D GTTTAATTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 47 25 15 8 T 10 9 22218 CASAVA_Build 5 72444877 11I8M18I TACAGATCAC -----------CATGTGGC------------------/ACATGGTGAGACAGGAGGCAAAGAGGGAGGAGGGAAG CTCCAGGCTT 3070 hom 57 het 20 0 18 4 N/A 0 0 22219 CASAVA_Build 5 72445653 1I TCACATCCAA -/G CCAAAATTAC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 0 1 22220 CASAVA_Build 5 72446808 2D CTATTTCTTT AC/-- AGTCTCCATG 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 AC 1 0 22221 CASAVA_Build 5 72450440 7I CAAGGCCATG -------/TAATAAA AGGGCGTTTT 3070 het 3070 ref 57 28 23 6 TAATAAA 0 1 22222 CASAVA_Build 5 72460272 1I TTTGCCGAAA -/C TTTGGGCAGC 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 C 0 1 22223 CASAVA_Build 5 72466123 1D CAGCAATGTG T/- TGAGGGGTCT 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 T 2 1 22224 CASAVA_Build 5 72473970 2D GAGATTGGGT GG/-- GGACACAGAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 G 4 2 22225 CASAVA_Build 5 72474472 2I CCTTCCAGTC --/TT TCTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 49 29 14 6 T 1 3 22226 CASAVA_Build 5 72476687 1I TCACAATGAA -/T TTTGTGAACA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 3 4 22227 CASAVA_Build 5 72477001 1I CTATTCCAGT -/G GGTCCAAGGG 3070 het 3070 hom 60 26 27 7 G 2 3 22228 CASAVA_Build 5 72478178 1I GCGGGAGCAT -/G GTTTGAGCCC 3070 het 2709 hom 28 9 15 4 G 1 2 22229 CASAVA_Build 5 72478902 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAATCG 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 8 7 22230 CASAVA_Build 5 72479082 2I ATAAATAAAT --/AA AAAAAGAGAG 3070 het 3070 hom 30 16 11 3 A 5 7 22231 CASAVA_Build 5 72481934 1I ATTGAGGGGG -/A AAATTTAATG 3070 het 3070 hom 40 19 16 5 A 3 4 22232 CASAVA_Build 5 72488319 4D ATGCATGGAA GCGC/---- GCGCACACAC 1764 het 1764 ref 41 19 11 14 GC 4 2 22233 CASAVA_Build 5 72488904 1I CCCGCTAAAA -/G AAAAAAAAAT 3070 het 2401 hom 31 13 18 0 G 0 1 22234 CASAVA_Build 5 72494486 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1747 het 722 hom 23 6 7 10 T 19 18 22235 CASAVA_Build 5 72508628 1I AAGTGTTTTT -/C TGAAGAGGGA 3070 hom 119 het 45 0 39 6 C 0 1 22236 CASAVA_Build 5 72512679 3D CAGCCTCCCA AGC/--- AGCTGGGATT 3070 hom 68 het 27 0 22 5 AGC 2 1 22237 CASAVA_Build 5 72519940 6I CAGAGTTTGA ------/AAAATG AAAATGACTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 AAAATG 1 2 22238 CASAVA_Build 5 72526563 2I AGAGAGAGCA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 96 het 45 0 33 12 AG 6 7 22239 CASAVA_Build 5 72526907 1I CTTATCCTCT -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 7 8 22240 CASAVA_Build 5 72530658 26D TAACAAATAA CTCTTCAATCTCACTTTGTTTTCATT/-------------------------- CTCTTCAATC 3070 hom 87 het 44 0 28 21 CTCTTCAATCTCACTTTGTTTTCATT 2 1 22241 CASAVA_Build 5 72534881 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 20 0 17 5 A 11 10 22242 CASAVA_Build 5 72544030 1D CAAACATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 884 hom 20 4 11 5 A 12 11 22243 CASAVA_Build 5 72603775 10D CGACCTCAGG TGATCCGCCC/---------- TCCTCGGCCT 2699 het 714 hom 10 2 7 1 TGATCCGCCC 1 0 22244 CASAVA_Build 5 72611505 1D GGGCAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2764 hom 28 11 12 5 A 15 14 22245 CASAVA_Build 5 72615845 1I ATCAAATATC -/A CTCTCAAGAA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 A 0 1 22246 CASAVA_Build 5 72617426 4I CAATTTAAAT ----/ATCA ATCAATAGAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ATCA 1 2 22247 CASAVA_Build 5 72622445 1D ACAAACAAAA G/- GAACAGTCAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 10 G 2 1 22248 CASAVA_Build 5 72625085 1D AATTAAAAAG A/- AAATTTTAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 A 4 3 22249 CASAVA_Build 5 72626730 1D GTGTTTGTTT G/- TTTTTTTCTT 3070 hom 56 het 28 0 26 4 G 1 0 22250 CASAVA_Build 5 72634240 1D GCCTGTAATT C/- CAGCACTTTG 3070 het 2695 hom 27 8 15 4 C 2 1 22251 CASAVA_Build 5 72640306 1I AGTTAGTAAG -/A AAAAAATCCT 3070 hom 132 het 50 0 44 6 A 6 7 22252 CASAVA_Build 5 72644159 1I GGCTAAATTG -/T TTGGCTGCCT 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 T 2 3 22253 CASAVA_Build 5 72645254 1I TTTGTATCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 103 het 47 0 35 12 T 9 10 22254 CASAVA_Build 5 72651185 1D AAAAAAAAAA G/- CAAACCTCTC 3070 hom 94 het 38 0 32 6 G 1 0 22255 CASAVA_Build 5 72652687 1D ATTTGTTTTT A/- AAAAAAGTTA 2983 het 2983 ref 26 14 8 4 A 7 6 22256 CASAVA_Build 5 72652805 4I CATGGTGAAA ----/TCCC TCCCGTCTGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TCCC 1 2 22257 CASAVA_Build 5 72698713 1I TGACTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 10 11 22258 CASAVA_Build 5 72700136 1I AAAGGACATG -/A TTTCACTCCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 0 1 22259 CASAVA_Build 5 72730986 9I TAATATATAT ---------/TATATGTAA TATATATAAT 1534 hom 10 het 5 0 4 1 TATATGTAA 0 1 22260 CASAVA_Build 5 72766889 2D AGAGAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 955 het 955 ref 32 22 3 8 AG 8 7 22261 CASAVA_Build 5 72804751 1D TGCATAGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 28 0 18 10 T 11 10 22262 CASAVA_Build 5 72809161 1I AAAAAAAAGT -/G GGGGGGGGGT 3070 hom 45 het 27 0 17 10 G 9 10 22263 CASAVA_Build 5 72813800 1I AAATCTTCCA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 8 9 22264 CASAVA_Build 5 72820309 1D TGTGTCTCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 33 1 27 6 A 12 11 22265 CASAVA_Build 5 72831262 6I TTTAAGAGCA ------/GTGACT GTGACTATTA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 GTGACT 1 2 22266 CASAVA_Build 5 72834259 2D AAATGGGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 22 10 T 14 12 22267 CASAVA_Build 5 72841294 1I TTTAAGCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 41 2 28 11 A 12 13 22268 CASAVA_Build 5 72851388 4I AAGGCTTGTA ----/CTGC CTGCCTCTCC 3070 hom 146 het 51 0 45 6 CTGC 1 2 22269 CASAVA_Build 5 72852960 1I AGAGCTGCTC -/A GGCTTCTTTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 0 1 22270 CASAVA_Build 5 72853484 1D ATTATTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 22271 CASAVA_Build 5 72854389 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 17 0 12 12 A 10 11 22272 CASAVA_Build 5 72859859 1D GCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 941 hom 45 8 21 16 A 16 15 22273 CASAVA_Build 5 72866951 2I CCATCGAGAC --/AG AGAGAAAGTG 3070 het 3070 ref 56 33 19 4 AG 2 3 22274 CASAVA_Build 5 72872751 16I GAGAAAGGGT ----------------/CAGGAATTAGCGAGAC CAGGCAGCTG 3070 het 3070 ref 51 21 19 11 CAGGAATTAGCGAGAC 0 1 22275 CASAVA_Build 5 72933806 1I TTCTTTTTTT -/C TGGCCTAATT 3070 het 3070 hom 41 10 25 6 C 0 1 22276 CASAVA_Build 5 72938387 1I TTATGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 10 11 22277 CASAVA_Build 5 72970732 1D GTACCATGTC T/- TAAGGCCAAA 2870 het 2870 ref 22 13 6 3 T 2 1 22278 CASAVA_Build 5 72989573 2D GTCTTTATTT TA/-- TGACTTTGGG 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 TA 1 0 22279 CASAVA_Build 5 73000528 3D TGCCTTTGGA AGG/--- AGATTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 23 14 8 AGG 1 0 22280 CASAVA_Build 5 73025494 1I CAAAGCAGCA -/T GTTCTAGCCA 3070 hom 102 het 41 0 31 10 T 0 1 22281 CASAVA_Build 5 73062593 1D CCTTTAAGCT A/- AAAAAAAAAA 1793 het 1793 ref 33 24 4 5 A 12 11 22282 CASAVA_Build 5 73070712 1I AAAGGAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 16 8 T 10 11 22283 CASAVA_Build 5 73076124 1I TCTGTATAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 9 10 22284 CASAVA_Build 5 73078104 5D AGGATCATGT CAATG/----- CAGATGAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 CAATG 1 0 22285 CASAVA_Build 5 73079927 1I CAACCAGTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 T 8 9 22286 CASAVA_Build 5 73086898 1I GTGTTTTTTT -/G GGGGGGGTGT 2416 het 2416 ref 16 9 5 3 G 7 8 22287 CASAVA_Build 5 73088879 1I CCTAGTAATT -/A TTTCTTCCAG 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 0 1 22288 CASAVA_Build 5 73090145 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 10 9 22289 CASAVA_Build 5 73090739 1I GGGTGGCTTA -/G AGAATTGAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 22290 CASAVA_Build 5 73091886 1D GTTTCCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 T 13 12 22291 CASAVA_Build 5 73107463 50D TATATTCAAG TCTTGAATATACATGACTCTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAA/-------------------------------------------------- CATTTAGGTT 3070 hom 93 het 25 0 32 2 TCTTGAATATACATGACTCTCCAAAAAACACATAATTTGAATCAACACAA 1 0 22292 CASAVA_Build 5 73112231 1D TGCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 10 9 22293 CASAVA_Build 5 73122263 1D CACTTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 41 1 29 11 A 15 14 22294 CASAVA_Build 5 73123148 1D GTGTTTTTGG T/- TGTAAGCTTT 3070 hom 150 het 54 0 50 4 T 2 1 22295 CASAVA_Build 5 73123232 1I TAGAGGTGAG -/A TTTTTTAGGC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 0 1 22296 CASAVA_Build 5 73125380 2D TGGGTGAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 32 1 18 14 T 16 14 22297 CASAVA_Build 5 73126190 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2250 het 42 hom 19 2 7 10 T 16 14 22298 CASAVA_Build 5 73128871 2I AGAACCTGAG --/AC AGAGAAGGGG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AC 0 1 22299 CASAVA_Build 5 73133827 3D TTTGAACATT AAG/--- AAGAATCAAG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 AAG 2 1 22300 CASAVA_Build 5 73178168 1I ATATGAACTA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 7 8 22301 CASAVA_Build 5 73181212 2I GGCAATAAAC --/TT TTAATTTAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 4 22302 CASAVA_Build 5 73187681 1D CTCAAATGTA T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 6 5 22303 CASAVA_Build 5 73189146 4D ATATATGTGT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 114 het 51 0 37 15 AC 11 9 22304 CASAVA_Build 5 73190007 4I ATTTGTATGC ----/CTCA CTGTCTCCAC 3070 hom 165 het 60 0 54 6 CTCA 0 1 22305 CASAVA_Build 5 73199895 1D GATTGAAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 10 9 22306 CASAVA_Build 5 73201487 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 35 het 20 0 13 7 A 9 10 22307 CASAVA_Build 5 73205500 1D TGTATGGGAG T/- TGTATGTTCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 22308 CASAVA_Build 5 73212518 2I ACCCTGCCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 A 10 12 22309 CASAVA_Build 5 73212619 2D TAAGTTCAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 45 2 31 12 T 14 12 22310 CASAVA_Build 5 73213660 1I AAATGAGTGA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 22311 CASAVA_Build 5 73228021 1D ATGTTATTCC A/- AATATGATGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 2 22312 CASAVA_Build 5 73230635 2I TCTATACTTC --/TT TTTTTTTTTT 1506 het 453 hom 31 1 4 26 T 10 12 22313 CASAVA_Build 5 73244929 4I ACCTTATTTA ----/TGTT TGTTTACTTC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 TGTT 1 2 22314 CASAVA_Build 5 73249979 1I TCCACTTAAG -/T TGAGGAGTGA 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 1 2 22315 CASAVA_Build 5 73252015 4D AGAGATCATC TTTT/---- TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 35 11 22 5 T 8 4 22316 CASAVA_Build 5 73252262 1I GTCATCTAGG -/T TTTTAAGCCC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 4 5 22317 CASAVA_Build 5 73254866 1I AAAGCATGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 9 10 22318 CASAVA_Build 5 73255088 1D AATGCTGCTG C/- CCAGTAAATT 3070 het 3070 hom 32 13 16 5 C 3 2 22319 CASAVA_Build 5 73255269 1I AGGTGGGCTT -/A AAGGTAAAAC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 2 3 22320 CASAVA_Build 5 73261082 2D GTATACTTTT CA/-- CAGTTTATTT 3070 het 3070 ref 42 23 14 6 CA 2 1 22321 CASAVA_Build 5 73261561 5I TAAACTGCTA -----/TATAT TATTTCACTT 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 TATAT 0 1 22322 CASAVA_Build 5 73273733 1D ATAGGAACAG A/- AAAAAAAAAA 2295 het 2295 ref 41 13 7 21 A 17 16 22323 CASAVA_Build 5 73276222 1I CATGATGGGA -/C TTGGTTACTT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 C 0 1 22324 CASAVA_Build 5 73277767 1I TCAGCACTCT -/A AAAAATGAGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 5 6 22325 CASAVA_Build 5 73278393 1I CACCTTCCCC -/T TTTTTTATGC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 6 7 22326 CASAVA_Build 5 73279391 3I GTTTGGGGCA ---/GTT GTTTTTACTA 3070 hom 66 het 30 0 23 9 GTT 1 2 22327 CASAVA_Build 5 73293345 8D TAAAGCCTTA GCAAATCT/-------- GCAAAATTGC 3070 hom 117 het 43 0 40 10 GCAAATCT 1 0 22328 CASAVA_Build 5 73300277 1I ACTCACCCTG -/C CAACAGGCTG 3070 hom 102 het 40 0 27 13 C 1 2 22329 CASAVA_Build 5 73301218 2D CCATGAAACG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 25 0 23 5 T 12 10 22330 CASAVA_Build 5 73303156 1D CATCACTGCA T/- TAATTCCTTC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 2 1 22331 CASAVA_Build 5 73311374 1D CTGGTCAAAC A/- ACTCCAATGT 3070 hom 113 het 43 0 37 6 A 2 1 22332 CASAVA_Build 5 73314364 2I CAGAAGACAC --/TG AGAGAAAAAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TG 0 1 22333 CASAVA_Build 5 73315101 1I GCACCAATCT -/G GATTGGTGGA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 G 1 2 22334 CASAVA_Build 5 73316323 1I GCACACTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1205 hom 36 3 21 12 T 13 14 22335 CASAVA_Build 5 73329011 1D AAGTCCCCCC T/- GCTAATGTCT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 1 0 22336 CASAVA_Build 5 73336505 1I ACATTTTTTT -/A AAAAATTTAA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 A 5 6 22337 CASAVA_Build 5 73337115 1I TGATTTGAAG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 9 22338 CASAVA_Build 5 73365849 3I TTCATTCTGC ---/TCA TTTTTATTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TCA 0 1 22339 CASAVA_Build 5 73373063 1D GAGTACCCTG T/- AGTTCAAATG 3070 hom 148 het 53 0 50 4 T 1 0 22340 CASAVA_Build 5 73377069 1I TAAATACATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 9 10 22341 CASAVA_Build 5 73389194 2I TTTAACACAC --/TG TAAGACCAAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 TG 0 1 22342 CASAVA_Build 5 73399469 2D TTCCCAGTGT TC/-- TCAAGTTTCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TC 2 1 22343 CASAVA_Build 5 73427597 17D CCCTCTGCAA CACATCGGGAATGTATG/----------------- CATTTGCAAT 3070 het 3070 ref 51 36 19 4 CACATCGGGAATGTATG 1 0 22344 CASAVA_Build 5 73436168 2I GCACCCCACA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 40 12 15 13 AC 7 8 22345 CASAVA_Build 5 73437593 32I GATCAAATAC --------------------------------/AGATTTAGTAAACTAAGATTTTAGCCCAGTCA AGACACTAAA 3070 hom 78 het 25 0 27 0 AGATTTAGTAAACTAAGATTTTAGCCCAGTCA 0 1 22346 CASAVA_Build 5 73440329 1D ATAGGTGACA T/- TTATATAGCT 3070 het 3070 hom 51 21 25 6 T 3 2 22347 CASAVA_Build 5 73443318 2I AAATAGTGAC --/AT ATTTATACAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AT 1 2 22348 CASAVA_Build 5 73452116 1D GACCTGTGGC T/- TTAAGAGCCT 3070 hom 75 het 32 0 24 8 T 3 2 22349 CASAVA_Build 5 73454307 6D CAATATTTTG TTAAGT/------ TTATCTTCCC 3070 hom 54 het 20 0 19 4 TTAAGT 1 0 22350 CASAVA_Build 5 73461565 1I AAAGCGAACA -/T TTTTTATCCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 5 6 22351 CASAVA_Build 5 73464198 1I ACCTACAGGG -/A AATCAGCCAC 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 A 2 3 22352 CASAVA_Build 5 73465173 1D TGGGTGGAGC A/- AGATGCTGTC 3070 hom 126 het 51 0 41 11 A 2 1 22353 CASAVA_Build 5 73470493 1I CTGCTCATCT -/G GCTCAGGCAG 3070 het 3070 ref 44 25 19 0 G 1 2 22354 CASAVA_Build 5 73472049 14D CCAAAGAAGC CACACACACACACA/-------------- CACACACACA 3070 het 2026 hom 42 9 24 19 CA 16 9 22355 CASAVA_Build 5 73475759 1I AAAGTAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 10 11 22356 CASAVA_Build 5 73490564 1I CAAAATGGCA -/T TTTTGATTAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 4 5 22357 CASAVA_Build 5 73491345 16D AGAGAGAGAG AGAGAGAGAGAGAGAC/---------------- AGAGAGAGAA 2202 het 2202 ref 21 17 8 7 AGAGAGAGAGAGAGAC 1 0 22358 CASAVA_Build 5 73494840 2I GTTTCATCAC --/TG TGTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 TG 1 2 22359 CASAVA_Build 5 73511443 1D AGCTTTTCGT G/- GGGGAGAAAA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 G 5 4 22360 CASAVA_Build 5 73516377 4D AACCTCAGAG GAGA/---- GAGAAAGGAC 3070 het 3070 ref 51 30 16 7 GA 4 2 22361 CASAVA_Build 5 73518222 2I GGACCAAAGC --/AT AGTTTCTCTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AT 0 1 22362 CASAVA_Build 5 73518396 1I ATTCAGCAAG -/T TGGGCCTTTG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 1 2 22363 CASAVA_Build 5 73518882 4I AAGCTGAAAG ----/AAAT AAAGCCATGC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 AAAT 0 1 22364 CASAVA_Build 5 73519086 2I TTCATTCAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 A 10 12 22365 CASAVA_Build 5 73523026 5I ATACATCATA -----/TACAT TACATGTTAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TACAT 1 2 22366 CASAVA_Build 5 73530242 2I GCGCATACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 232 hom 38 4 24 10 AC 8 9 22367 CASAVA_Build 5 73537989 1I ATGAAGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 18 25 11 T 11 12 22368 CASAVA_Build 5 73545773 2D CTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 45 18 16 11 CA 10 9 22369 CASAVA_Build 5 73546035 2I GTGTGTGTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 50 19 15 16 GT 7 8 22370 CASAVA_Build 5 73554771 1D ATACATTGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 T 9 8 22371 CASAVA_Build 5 73555506 2D TTCTATTAGG AT/-- ATATATATAT 670 het 670 ref 30 22 4 4 AT 7 6 22372 CASAVA_Build 5 73557274 23D CTCCTGTCCT TCCTTTCCTTCCTTTCCCTCCTG/----------------------- TCCTTCCTTT 2733 het 413 hom 23 4 14 9 TCCTTTCCTTCCTTTCCCTCCTG 1 0 22373 CASAVA_Build 5 73557628 2D GAGGAGTGAC AT/-- ATGATTTCTT 3070 hom 40 het 20 0 14 6 AT 2 1 22374 CASAVA_Build 5 73581369 1D CCAATAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 12 12 T 13 12 22375 CASAVA_Build 5 73612210 1D CACTTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 2708 het 2708 ref 43 28 6 9 A 12 11 22376 CASAVA_Build 5 73657847 10D AGAACTTTTC TTTCTTTCTT/---------- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 7 14 11 TTTCTTTCTT 3 2 22377 CASAVA_Build 5 73672367 1D GGCTTTTTTC T/- TTCATTTCTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 3 2 22378 CASAVA_Build 5 73688981 1I ACTTGAGCCC -/A AGGAGTTCAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 1 2 22379 CASAVA_Build 5 73690313 3D TAGCCTTCAC ACA/--- ACAAGGACAG 3070 hom 96 het 36 0 33 6 ACA 2 1 22380 CASAVA_Build 5 73690812 1I CCCAGGAGTG -/A AAAAGCTAAA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 4 5 22381 CASAVA_Build 5 73693315 2I AGCAAAGAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 10 12 22382 CASAVA_Build 5 73705303 1D ACACACACAC A/- CACACAAACT 3070 het 3070 ref 36 16 8 12 A 1 0 22383 CASAVA_Build 5 73708456 2D GTAGAGCAAA CT/-- CTATATCAAT 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 CT 2 1 22384 CASAVA_Build 5 73709354 3D TGAAGTAAAC ATG/--- ATTATTTTCT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 ATG 1 0 22385 CASAVA_Build 5 73717736 2D TTTTAAATAA TC/-- TGTTTTGGGA 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TC 1 0 22386 CASAVA_Build 5 73718465 1D GTTCCTGGGC A/- TTAGGGTCCA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 A 1 0 22387 CASAVA_Build 5 73722620 1D AATTTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 2825 het 2270 hom 40 11 11 18 A 17 16 22388 CASAVA_Build 5 73736714 8I CAGCACTGAA --------/GGAAAACT GGAAAACTGG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 GGAAAACT 1 2 22389 CASAVA_Build 5 73757439 1I GTTATTCTAA -/T TTTCTTTATT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 3 4 22390 CASAVA_Build 5 73759463 2D TAATTCCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 1995 hom 21 het 13 0 8 5 A 16 14 22391 CASAVA_Build 5 73766527 1D GCTTGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 34 1 26 7 T 11 10 22392 CASAVA_Build 5 73770740 1I78M1I ATTCTGTGAC -ACTTACTCTCACATGTGTCGAGAAAAAAACTTTATTTATATTGCACTTCATACTTTTTCATAAGTTTATCACTGTTGC-/AACTTACTCTCACATGTGTCGAGAAAAAAACTTTATTTATATTGCACTTCATACTTTTTCATAAGTTTATCACTGTTGCA AAGTATTTTA 3070 het 53 hom 41 3 36 25 N/A 0 0 22393 CASAVA_Build 5 73777651 1D TCAGCTTCCA T/- TGACATACGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 22394 CASAVA_Build 5 73789092 1D ACCTGGCTGA T/- TTTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 6 5 22395 CASAVA_Build 5 73805210 2D GTGTGCGCAC AT/-- GTGTGTGTGT 2418 het 2418 ref 28 14 10 5 AT 1 0 22396 CASAVA_Build 5 73809851 1I TGCTGTGCCG -/C CCCCGCTGCT 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 C 4 5 22397 CASAVA_Build 5 73811098 1I CTTTTTTTCT -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 28 3 G 1 2 22398 CASAVA_Build 5 73812641 1I TCCTCAATAG -/A AAAAAAAAAA 3050 het 3045 hom 25 10 8 7 A 12 13 22399 CASAVA_Build 5 73866748 1D CAATGAATAG A/- AAATGCATGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 4 3 22400 CASAVA_Build 5 73871816 25I TCTTTAAGGA -------------------------/CAGAGGTTCTTTCTGTCACAATGCC CAGAAGATAG 3070 hom 60 het 24 0 18 7 CAGAGGTTCTTTCTGTCACAATGCC 0 1 22401 CASAVA_Build 5 73876911 1I TGCTAGAGTC -/T AATGAAGTCT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 0 1 22402 CASAVA_Build 5 73879400 1D GACAAACTTG A/- AAAATTGGGG 3070 het 3070 hom 59 22 31 7 A 5 4 22403 CASAVA_Build 5 73884223 1I CTTTGAGTCA -/G GGTCTCATTC 3070 hom 60 het 26 0 19 7 G 2 3 22404 CASAVA_Build 5 73906375 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1678 het 466 hom 19 6 4 9 A 19 18 22405 CASAVA_Build 5 73919903 5D TTCATTTTCA CTCAT/----- AACATATAAA 3070 het 3070 ref 39 27 11 1 CTCAT 1 0 22406 CASAVA_Build 5 73923733 1D ATCACACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 34 1 22 11 A 13 12 22407 CASAVA_Build 5 73929087 1D GGCTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 24 9 T 11 10 22408 CASAVA_Build 5 73932111 1I TAGACGTCTC -/A GCCAGAGAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 1 22409 CASAVA_Build 5 73939187 4D ATTAGTGTAG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 66 het 29 0 22 8 GA 8 6 22410 CASAVA_Build 5 73943066 1I GAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 2696 het 1544 hom 19 6 7 6 T 13 14 22411 CASAVA_Build 5 73943640 3D CCAAGAATGC AAA/--- ACCCCTTGAA 3070 het 3070 ref 36 21 14 3 A 4 1 22412 CASAVA_Build 5 73951308 1I CTTTTCATGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 9 10 22413 CASAVA_Build 5 73957561 2D CATGTCCCAG TT/-- CTGGCTACTG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 2 0 22414 CASAVA_Build 5 73959038 1I TCACATTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 13 14 22415 CASAVA_Build 5 73962630 1D ACATTAGGCC A/- AAAGAATGTA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 4 3 22416 CASAVA_Build 5 73963293 1D CACTTTACTT G/- CTCTGTTTCC 3070 het 3070 ref 49 27 21 1 G 1 0 22417 CASAVA_Build 5 73971315 1D GTGTTTCATC T/- CCAGGCCCAC 3070 het 3070 hom 42 15 21 7 T 1 0 22418 CASAVA_Build 5 73976752 1I CTTATGTGTA -/T TTTTGTGAAT 3070 het 3070 ref 46 19 21 6 T 4 5 22419 CASAVA_Build 5 73977537 1I CTGCATACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 426 hom 33 1 26 6 T 9 10 22420 CASAVA_Build 5 73980135 3I TTATACTGTC ---/TAT TTAATAGTGG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 TAT 0 1 22421 CASAVA_Build 5 73985800 5I AGGTATTTAT -----/TTACA CCAGTGCTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTACA 0 1 22422 CASAVA_Build 5 73994090 1D TGTATAACTC T/- TTTTCTATAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 5 4 22423 CASAVA_Build 5 74020634 1I GGTTCTTAAC -/A GGGGCTTCAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 0 1 22424 CASAVA_Build 5 74021592 1D ATTTCTTAAC T/- TTTTGTCTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 5 4 22425 CASAVA_Build 5 74022053 1D CAATATGCTG A/- AACTGCATCC 3070 het 2101 hom 25 6 16 3 A 3 2 22426 CASAVA_Build 5 74026392 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2411 het 2411 ref 17 9 7 1 A 10 11 22427 CASAVA_Build 5 74031529 1I AATATAAGCC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 8 9 22428 CASAVA_Build 5 74052414 15I TGTATGTTAC ---------------/CTAACAAATAGTAAT CTAACAAATA 3070 het 3070 ref 29 12 13 5 CTAACAAATAGTAAT 1 2 22429 CASAVA_Build 5 74087878 2D ACATGCACAC CA/-- CATTTTCTTT 3070 het 3070 hom 51 23 25 4 CA 2 1 22430 CASAVA_Build 5 74260386 5D CTCTTCTCTT CTCTC/----- CTCTCCTCTC 2662 het 2662 ref 29 17 8 6 CTCTC 3 2 22431 CASAVA_Build 5 74260924 2D ATTTCTACTC TT/-- TGAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 33 20 11 4 T 3 1 22432 CASAVA_Build 5 74263081 1D CAGAGAATTG C/- TTGAACCCAG 3070 het 3070 ref 18 9 9 1 C 1 0 22433 CASAVA_Build 5 74268084 1D TTTTGATCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 10 9 22434 CASAVA_Build 5 74275769 1I AGCACATTTG -/C TTAACAAAGT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 C 0 1 22435 CASAVA_Build 5 74285226 1I ACTTGCCCAA -/G GCTTGTTTGA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 G 1 2 22436 CASAVA_Build 5 74303931 1I TATGATTGGT -/G GTCAAGTCAG 3070 het 3070 hom 32 8 23 1 G 1 2 22437 CASAVA_Build 5 74309468 1I GTTTGAACTT -/A AAAAAAAAAG 2664 het 2664 ref 16 7 7 2 A 9 10 22438 CASAVA_Build 5 74312655 1D CCCAAGAGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 T 10 9 22439 CASAVA_Build 5 74319506 1I AACCATCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2182 hom 30 11 10 9 T 15 16 22440 CASAVA_Build 5 74321399 1D CCTGTGTGGG A/- AAAAAACCAT 3070 het 3070 ref 43 24 18 2 A 7 6 22441 CASAVA_Build 5 74333298 3D TTTGTTGCCC TTG/--- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 25 9 4 TTG 1 0 22442 CASAVA_Build 5 74337208 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1252 hom 30 5 13 13 A 13 12 22443 CASAVA_Build 5 74338204 1I TAAATAAATG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 0 1 22444 CASAVA_Build 5 74350184 2D CACCAGTAAC AT/-- GTTTTAAGTG 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 AT 1 0 22445 CASAVA_Build 5 74372526 4I ATCTTTAGAG ----/TTGT TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 49 25 23 1 TTGT 0 1 22446 CASAVA_Build 5 74379366 1D GTTTTAGAGC T/- TGGGGGAGGT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 2 1 22447 CASAVA_Build 5 74380723 2I TGATTAAGAT --/TA TGTTCTTTTT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 TA 0 1 22448 CASAVA_Build 5 74382294 28D TCACGCTGCA CTCTCACACCCTACACAAAACTCATCTG/---------------------------- CTCTCACACC 3070 het 3070 ref 39 20 11 15 CTCTCACACCCTACACAAAACTCATCTG 1 0 22449 CASAVA_Build 5 74392328 1I TGAATAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 10 11 22450 CASAVA_Build 5 74396299 3D TGTTTTAAAA ATT/--- ATTATCTTAA 3070 het 3070 hom 30 14 16 1 ATT 2 1 22451 CASAVA_Build 5 74396738 3I ATTTTAATTA ---/TCT TCTTAAATAA 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 TCT 1 2 22452 CASAVA_Build 5 74400510 1I AGGTAGTGGT -/A ACAAGCTCCT 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 A 1 2 22453 CASAVA_Build 5 74400857 1D GTCTGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 11 10 22454 CASAVA_Build 5 74403935 1I TAGGAAGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 T 10 11 22455 CASAVA_Build 5 74406226 3D TGGTTGACAA AAT/--- AATCTGTACA 3070 het 3070 ref 28 13 12 5 AAT 2 1 22456 CASAVA_Build 5 74407632 2D CTTACTCTGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 AT 7 6 22457 CASAVA_Build 5 74409141 1D AGGTACTTGA T/- TTTTATATAT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 5 4 22458 CASAVA_Build 5 74412503 1D CACAAAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 13 13 T 12 11 22459 CASAVA_Build 5 74427055 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 12 13 22460 CASAVA_Build 5 74442289 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2887 het 2887 ref 23 14 7 2 A 10 11 22461 CASAVA_Build 5 74442784 1D GTTCTTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2743 hom 28 9 10 10 A 11 10 22462 CASAVA_Build 5 74449202 25D TTCTTCTATG AGTCAAGGTTTGAGCATGAGGGAAA/------------------------- AGGAAGAACA 3070 het 3070 ref 34 24 14 6 AGTCAAGGTTTGAGCATGAGGGAAA 1 0 22463 CASAVA_Build 5 74450589 1D TCTACTTGTT C/- AGGACGTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 C 1 0 22464 CASAVA_Build 5 74451669 1I TAAAGAATCG -/T TTACTAACTA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 2 3 22465 CASAVA_Build 5 74453876 1D TCCTCCCAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 10 9 22466 CASAVA_Build 5 74463372 1I CATACTGCCA -/G GGTGTCCCTC 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 G 2 3 22467 CASAVA_Build 5 74477322 1D TAATAATTAT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 25 10 12 4 A 8 7 22468 CASAVA_Build 5 74487495 1D TATGTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 2454 het 1806 hom 20 7 6 7 T 12 11 22469 CASAVA_Build 5 74490619 1I AGAAAGTTTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 A 7 8 22470 CASAVA_Build 5 74491251 1I ATTCACAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 30 0 24 6 A 11 12 22471 CASAVA_Build 5 74494454 1D TTTAGAAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 A 9 8 22472 CASAVA_Build 5 74500317 1D AAACAAGTTG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 41 13 21 8 A 8 7 22473 CASAVA_Build 5 74503947 1I AACTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 2696 het 2696 ref 22 10 7 5 A 13 14 22474 CASAVA_Build 5 74513476 1I TAGTAATGAT -/A AAAAAAAAAG 2160 het 1003 hom 17 3 8 6 A 9 10 22475 CASAVA_Build 5 74521586 1I TTGTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 2737 het 2737 ref 34 15 9 10 T 14 15 22476 CASAVA_Build 5 74522189 2D TGCTTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 TG 9 8 22477 CASAVA_Build 5 74525975 1I ACACTGCAAT -/G TTTAATCTTC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 G 0 1 22478 CASAVA_Build 5 74527472 3D CTCAATGGGT TCA/--- TCAATTCTTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 TCA 2 1 22479 CASAVA_Build 5 74536618 2I TGGATAATTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 TG 5 6 22480 CASAVA_Build 5 74539502 1D TTATACTCTT A/- AAAATTATTG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 5 4 22481 CASAVA_Build 5 74551215 1D ACAGAACCAG A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 A 7 6 22482 CASAVA_Build 5 74552224 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2541 het 2441 hom 27 9 6 12 A 14 13 22483 CASAVA_Build 5 74553387 2D TGAATAGTAA AT/-- ATGTTTTCTC 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 AT 2 1 22484 CASAVA_Build 5 74554074 1I CATTTCTTCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 9 10 22485 CASAVA_Build 5 74560613 2D TTTTCTATTT CA/-- CACTTATTTC 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 CA 2 1 22486 CASAVA_Build 5 74562246 1D AAGGCACAAG T/- TGTTAATGTG 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 T 2 1 22487 CASAVA_Build 5 74564147 2D ATTTTGTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2321 hom 30 7 14 9 T 12 10 22488 CASAVA_Build 5 74566414 1I ATACTTTTTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 0 1 22489 CASAVA_Build 5 74568963 1I52M1D CAAAACAGAT -ACGTTTATCAGAAGTTTTAGCTCATCAACTAATCTCAGTGATGTATTTTGCAT/AACGTTTATCAGAAGTTTTAGCTCATCAACTAATCTCAGTGATGTATTTTGCA- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 33 30 7 N/A 0 0 22490 CASAVA_Build 5 74581414 1I TGGATTCACC -/A AGGTTGAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 1 2 22491 CASAVA_Build 5 74622623 1D TGGGCTTCCC T/- TTTATGGGTA 2401 het 2401 ref 19 10 6 3 T 4 3 22492 CASAVA_Build 5 74657331 1I AAATACTGCA -/T TTTTTTTTTT 2264 het 2264 ref 22 7 8 7 T 13 14 22493 CASAVA_Build 5 74657878 2D TTATTTATTT TA/-- ATTTTAATTT 2990 het 2990 ref 19 11 7 1 TA 1 0 22494 CASAVA_Build 5 74661158 1I CAGTGATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 11 12 22495 CASAVA_Build 5 74672943 1D AAAGCTGCTC T/- TTTTTTTTTT 874 het 874 ref 26 22 3 1 T 15 14 22496 CASAVA_Build 5 74673109 4I AGTTAATGAG ----/CTTA CTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 CTTA 0 1 22497 CASAVA_Build 5 74675301 5D27M2I TTTATTGGAC TTGTATTGTGCTTACATTTATGTTCTCATGAC--/-----TTGTGCTTACATTTATGTTCTCATGACAA TATATAAATG 3070 het 3070 hom 24 14 18 1 N/A 0 0 22498 CASAVA_Build 5 74676724 1I AGAGCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 1749 het 1749 ref 22 11 7 4 T 12 13 22499 CASAVA_Build 5 74676847 1D TTTTTTTCCC T/- AATGGTAATC 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 T 1 0 22500 CASAVA_Build 5 74679755 3I TATTTATTTA ---/TTC TTTTATTCAA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 TTC 0 1 22501 CASAVA_Build 5 74688511 16D ACTCCATTCA TCCATCCGTCTGTCCG/---------------- TCCGTCCGTC 3070 het 3070 ref 52 23 18 17 TCCATCCGTCTGTCCG 1 0 22502 CASAVA_Build 5 74695821 3I AAATAGAGTA ---/TTG TTAGCCCTGC 3070 het 3070 ref 49 24 16 9 TTG 0 1 22503 CASAVA_Build 5 74715284 4I TACTGCACTC ----/AATT AAAAACCATT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 AATT 0 1 22504 CASAVA_Build 5 74717898 4I CATTATTTAC ----/CAAA CATTCTCAAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 CAAA 0 1 22505 CASAVA_Build 5 74734381 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1901 het 1390 hom 15 6 6 3 A 15 16 22506 CASAVA_Build 5 74754966 1D TTTAGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 2354 het 2354 ref 26 16 7 3 A 12 11 22507 CASAVA_Build 5 74759178 1D AGTAAAACTC A/- AGTCTCAAAA 3070 het 3070 hom 45 22 20 3 A 2 1 22508 CASAVA_Build 5 74759895 4I AATCAAAAAA ----/AACT AACGTGCAAT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 AACT 0 1 22509 CASAVA_Build 5 74761425 1D AGAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 2661 het 2338 hom 29 12 10 7 A 15 14 22510 CASAVA_Build 5 74768265 1D TATAATAATA C/- CCCCTACAAC 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 C 5 4 22511 CASAVA_Build 5 74772357 1D CATCCAAAGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 50 21 23 7 A 9 8 22512 CASAVA_Build 5 74785407 2D GTATGTATGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 81 het 40 0 26 16 GA 9 8 22513 CASAVA_Build 5 74789491 4D ATAGGCGCGC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 2809 hom 32 11 10 12 GT 8 6 22514 CASAVA_Build 5 74795941 3I TCACCTACCG ---/CCA CATAGTAACA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 CCA 0 1 22515 CASAVA_Build 5 74801134 1I AAAATAACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 9 10 22516 CASAVA_Build 5 74810685 1I TAAATGGGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 9 10 22517 CASAVA_Build 5 74826085 1D CCTCTACCCT C/- CAAGACCAGA 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 C 2 1 22518 CASAVA_Build 5 74839859 2D TCTCTTAGAG TT/-- AAGTTTAAAC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 2 0 22519 CASAVA_Build 5 74841804 1I AGCCATGTCT -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 6 7 22520 CASAVA_Build 5 74844358 4D ATTAAACCTT AGAA/---- AGAGTACTTT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 AGAA 1 0 22521 CASAVA_Build 5 74852598 1D TGTTATTTGC T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 34 16 18 1 T 8 7 22522 CASAVA_Build 5 74853350 1D GTTGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 11 10 22523 CASAVA_Build 5 74856196 1I GAAAACCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 A 10 11 22524 CASAVA_Build 5 74867119 1I ATCCTGAAAT -/A ATGTTTTCCA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 1 2 22525 CASAVA_Build 5 74873192 5I AAAACTTGAG -----/TTTTC TTTTAGTGTA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 TTTTC 0 1 22526 CASAVA_Build 5 74958364 1D CTAGGCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2963 hom 34 14 13 7 T 12 11 22527 CASAVA_Build 5 74960848 1D AACACACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 10 8 T 11 10 22528 CASAVA_Build 5 74966955 1D TGACTTTCTT A/- GGAGAAATTC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 1 0 22529 CASAVA_Build 5 74989782 1D TGTCTCTAAG A/- AAAAAATTAA 2032 het 2032 ref 14 8 5 1 A 7 6 22530 CASAVA_Build 5 74990658 1I ATATATAGAT -/G TATCATAATT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 G 0 1 22531 CASAVA_Build 5 74997094 4D CATCCTCAAT CTTA/---- CTTCTTTTAG 3070 het 3070 hom 63 19 35 12 CTTA 1 0 22532 CASAVA_Build 5 74998225 2D AAAAAAAAAA AT/-- ATATATATGA 3070 hom 16 het 34 1 23 12 AT 5 4 22533 CASAVA_Build 5 75003357 2D CATTCCATTC TT/-- TTTTTCACAA 3070 het 3070 ref 39 15 17 8 T 7 5 22534 CASAVA_Build 5 75003422 10I GTAAAATTGA ----------/GTATCAGTTT GTGTCAGTTT 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 GTATCAGTTT 0 1 22535 CASAVA_Build 5 75006845 2I ACATGTAAAC --/AT ATGAACAATA 3070 het 3070 ref 53 28 24 1 AT 1 2 22536 CASAVA_Build 5 75008129 1I GCTAGTACTC -/G GGGAAAAAAG 2920 het 2920 ref 34 20 9 5 G 3 4 22537 CASAVA_Build 5 75010191 1I ATTAATATAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 8 9 22538 CASAVA_Build 5 75014821 3D AACAGTGTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 28 1 19 8 T 15 12 22539 CASAVA_Build 5 75038966 1I GGTTACCATC -/T TTTAATTTTA 3070 het 3070 hom 46 14 29 3 T 3 4 22540 CASAVA_Build 5 75041074 1I AAAAATTATT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 21 10 7 4 A 6 7 22541 CASAVA_Build 5 75071869 1D TCTGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 633 het 229 hom 14 3 2 9 A 19 18 22542 CASAVA_Build 5 75079963 1D TTCCTTAAAC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 39 21 9 9 T 8 7 22543 CASAVA_Build 5 75098145 1D TTTTATTTCA T/- TTTTTTTTTG 1539 het 1539 ref 30 22 4 4 T 10 9 22544 CASAVA_Build 5 75099377 3I TTTCATTTAC ---/AAT CCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 AAT 0 1 22545 CASAVA_Build 5 75107447 1D AATCTCACTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 48 21 20 8 A 9 8 22546 CASAVA_Build 5 75110623 1I37M3D GGCTGCATAA -TTTTTTATCATATTTTTATATGAAAATAAGTTTGTAATAT/TTTTTTTATCATATTTTTATATGAAAATAAGTTTGTAA--- TATTTTCTCT 3070 het 3070 ref 22 15 13 5 N/A 0 0 22547 CASAVA_Build 5 75117624 2D GACAAAAATC AT/-- ATGATCATTT 3070 het 3070 ref 44 29 14 2 AT 2 1 22548 CASAVA_Build 5 75131262 2I TCTCAAACTC --/TG TGCTGGGAGA 1931 het 1931 ref 13 8 4 1 TG 1 2 22549 CASAVA_Build 5 75133902 1I CCTATCAACC -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 7 8 22550 CASAVA_Build 5 75134700 2D AAACTCTCAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 AT 6 5 22551 CASAVA_Build 5 75139248 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 1132 hom 23 4 17 2 T 8 7 22552 CASAVA_Build 5 75144683 2I CTAAAAAGAC --/TT TATCTTTCCT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 1 3 22553 CASAVA_Build 5 75146259 16D CAGCTCCCAT GCAACCCAAAGGGCCG/---------------- GCCTCACTCC 3070 het 3070 ref 34 16 14 8 GCAACCCAAAGGGCCG 1 0 22554 CASAVA_Build 5 75164954 3D AGACAAATAG ACC/--- AATGGAACAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ACC 1 0 22555 CASAVA_Build 5 75165063 1D CCCTATTCAA T/- AAATGGTGCT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 1 0 22556 CASAVA_Build 5 75165183 2D AACCCAAAAC TA/-- TAAAAACCCT 2410 hom 12 het 7 0 5 2 TA 2 1 22557 CASAVA_Build 5 75165531 2I GCCAACAAAC --/AT ATGAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AT 1 2 22558 CASAVA_Build 5 75167138 1D TCCATTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 33 1 24 8 T 11 10 22559 CASAVA_Build 5 75171304 1I AAGTATTAGC -/T ATTCTTGTGA 3070 hom 144 het 56 0 49 7 T 0 1 22560 CASAVA_Build 5 75174191 2I AAAGATTGTC --/AG ACAGTCCTTT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 AG 0 1 22561 CASAVA_Build 5 75182219 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAGC 3070 hom 90 het 35 0 30 6 A 10 8 22562 CASAVA_Build 5 75202362 4D GAACGGAAAC AAAT/---- AACATACAAT 3070 het 3070 hom 44 19 22 5 AAAT 1 0 22563 CASAVA_Build 5 75210442 1I ATTAAAAAAA -/G AGGTTTATTT 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 G 0 1 22564 CASAVA_Build 5 75211751 1D GAGATATCTG A/- AAAAATGCCT 2513 het 2513 ref 44 17 11 18 A 6 5 22565 CASAVA_Build 5 75211886 1I TTTATAGCAC -/T TGGCTAGGCT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 T 1 2 22566 CASAVA_Build 5 75216387 3D AATAAAAAAT TAA/--- TAATGAAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 TAA 2 1 22567 CASAVA_Build 5 75219913 3I13M2D CTTGCTTTTT ---AAAAAAAAAAAAATT/TTAAAAAAAAAAAAAA-- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 N/A 0 0 22568 CASAVA_Build 5 75243766 4D AAGCATCTAT AGAC/---- AGACACTTGT 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 AGAC 2 1 22569 CASAVA_Build 5 75247917 3D TCCTCTTCTT CCC/--- CCCTTCTTCC 3070 hom 57 het 26 0 18 9 C 6 3 22570 CASAVA_Build 5 75249398 1D TAACTTAAAG A/- GTGTAATTGG 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 A 1 0 22571 CASAVA_Build 5 75253403 1D TATAGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 11 10 22572 CASAVA_Build 5 75256339 2D AAATTTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 AT 7 6 22573 CASAVA_Build 5 75257339 1D TTTAAAAAAC A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 A 8 7 22574 CASAVA_Build 5 75264039 1I AAGTGGGATC -/A GGGGGCTAAC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 0 1 22575 CASAVA_Build 5 75268650 1I AAAGAAATCT -/A AAAAGATAGT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 4 5 22576 CASAVA_Build 5 75269461 2I GCATTATCTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 71 het 31 0 24 7 T 9 11 22577 CASAVA_Build 5 75269880 2I GAACTGCCTG --/TA TATATGCTCA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TA 2 3 22578 CASAVA_Build 5 75271968 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 9 10 A 10 11 22579 CASAVA_Build 5 75272036 3I TCAGGTTTTG ---/TTC TTCTTAATAT 3070 hom 92 het 39 0 31 8 TTC 1 2 22580 CASAVA_Build 5 75277604 1D CATAAGTTAG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 7 6 22581 CASAVA_Build 5 75304918 1D ATAATAAAAT A/- AAAAAAAATT 1951 het 1737 hom 12 6 5 2 A 9 8 22582 CASAVA_Build 5 75305087 5D AGAAAAAAAG AAAAA/----- AAAGAAAAAG 1950 het 1758 hom 16 6 7 4 A 8 3 22583 CASAVA_Build 5 75321564 1D TTTAATGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 36 0 27 9 T 11 10 22584 CASAVA_Build 5 75326664 1D CTTCTCTGCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 9 8 22585 CASAVA_Build 5 75328955 1I TCTGCGCAGC -/A AAAAAAACCT 2441 het 2441 ref 15 8 5 2 A 7 8 22586 CASAVA_Build 5 75329014 1D ATTTTTGCAA T/- CTACTCATCT 2331 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 0 22587 CASAVA_Build 5 75329929 1D TGATAATAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 A 9 8 22588 CASAVA_Build 5 75331234 1D CTTCTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 162 hom 30 4 12 15 T 13 12 22589 CASAVA_Build 5 75332588 1I CGGTACAATT -/A AAAAAAAAAA 2138 het 2009 hom 31 11 9 11 A 16 17 22590 CASAVA_Build 5 75333172 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2517 het 2517 ref 24 11 7 6 A 11 12 22591 CASAVA_Build 5 75334449 2I TGTGCGTGTG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 8 10 22592 CASAVA_Build 5 75338382 1D GTTGTTCCTC T/- GATATTCTAC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 1 0 22593 CASAVA_Build 5 75345751 4D GGAAGGAAGG AAGA/---- AAGAAAGAAA 3070 hom 66 het 32 0 22 11 AAGA 5 4 22594 CASAVA_Build 5 75355763 1D ATAGATTACC A/- AAATGAGATT 3070 hom 95 het 40 0 30 11 A 4 3 22595 CASAVA_Build 5 75358964 1D TTTATTATCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 9 8 22596 CASAVA_Build 5 75367198 4I CTGAGAGATA ----/GTTT GTTTTAATTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 GTTT 1 2 22597 CASAVA_Build 5 75380395 1D CCAGATTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 20 0 16 4 A 13 12 22598 CASAVA_Build 5 75393543 1D GCTTTTTTTT A/- ACCTGTTATT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 2 1 22599 CASAVA_Build 5 75398997 4D TCTTTGGAAG CAGT/---- CAATGAATTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CAGT 1 0 22600 CASAVA_Build 5 75418221 4I AGCCCCTGGC ----/AGGT ATATATAGTT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 AGGT 0 1 22601 CASAVA_Build 5 75425391 1I TATCAAATTA -/T TTTTCCCCCT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 4 5 22602 CASAVA_Build 5 75440158 4I CATATTAGAG ----/GGGA GGGAGAATAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GGGA 1 2 22603 CASAVA_Build 5 75443076 14D CACCCTGAAT ATTTTCAGCAGTGC/-------------- ATTTCCATTT 3070 het 3070 hom 37 14 22 4 ATTTTCAGCAGTGC 1 0 22604 CASAVA_Build 5 75451866 1I ATAACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 10 11 22605 CASAVA_Build 5 75468111 2D GTGCTTTATG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 T 11 9 22606 CASAVA_Build 5 75470700 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1501 hom 18 7 10 1 A 12 11 22607 CASAVA_Build 5 75471420 118D TTTCCATTTT TAGAAGCTCTTGAAAGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCG/---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TAGAAGCTCT 2983 hom 27 het 12 0 10 7 TAGAAGCTCTTGAAAGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCG 1 0 22608 CASAVA_Build 5 75475595 1I AAACTTGATG -/C GCCTAATTTT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 C 0 1 22609 CASAVA_Build 5 75475856 6D CTGGAAACAG TGAAGC/------ TGACAGCTGA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 TGAAGC 1 0 22610 CASAVA_Build 5 75476407 1D TGATAGGAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 12 26 3 T 9 8 22611 CASAVA_Build 5 75477644 2I GAAAAGCAAG --/GC TGCTGTCTCT 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 GC 0 1 22612 CASAVA_Build 5 75478900 2I GGGCTCACTC --/TT TTCCTGTGTT 3070 het 3070 hom 59 23 32 4 T 2 4 22613 CASAVA_Build 5 75481787 1I ATCTTTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 het 40 hom 25 2 17 6 C 0 1 22614 CASAVA_Build 5 75483395 3D GCAAGTGGTG CCA/--- CCCAGTGAAT 3070 het 3070 hom 46 14 23 10 CCA 1 0 22615 CASAVA_Build 5 75489216 8I ATATTTGCTA --------/ATAATAGC ACAAAGGAGG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 ATAATAGC 0 1 22616 CASAVA_Build 5 75492546 2I TTGGAAAAAA --/CT CTAGCAGTTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 CT 1 2 22617 CASAVA_Build 5 75501562 4D GGTAAAAAAT AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 21 10 9 3 AATA 5 4 22618 CASAVA_Build 5 75509382 2D GAGGTCACTC AG/-- TGGTATTTTG 3070 het 3070 hom 32 12 15 7 AG 1 0 22619 CASAVA_Build 5 75511529 1I ACAACAACAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 8 9 22620 CASAVA_Build 5 75512680 1I TCTCAGCCAT -/C CCCCCTACCT 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 C 5 6 22621 CASAVA_Build 5 75518378 4I AGGACAGCAG ----/GAGA GAGAATGAGC 1308 het 1308 ref 15 11 3 2 GA 2 4 22622 CASAVA_Build 5 75519332 1D TTCAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2459 hom 25 7 11 7 A 15 14 22623 CASAVA_Build 5 75520788 1I GCATAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 22 19 12 A 10 11 22624 CASAVA_Build 5 75530725 1D TTATATATTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 2333 hom 19 6 8 5 T 8 7 22625 CASAVA_Build 5 75558748 5D CTCATGATGC AGATA/----- AGATAAAAGC 3070 het 3070 ref 51 26 18 8 AGATA 2 1 22626 CASAVA_Build 5 75559632 4D TTTCTCTCTA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 35 14 14 8 TC 9 7 22627 CASAVA_Build 5 75588845 12D CTGTAGTGTA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 2076 het 1665 hom 25 9 6 14 TG 13 7 22628 CASAVA_Build 5 75589501 6D GTGTGTGGTG TGTGTA/------ TGTGTATGTG 1853 het 1853 ref 64 29 11 27 TGTGTA 2 1 22629 CASAVA_Build 5 75598371 1D ATTATACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 12 11 22630 CASAVA_Build 5 75606266 1I TTTCTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2892 hom 37 12 19 6 T 13 14 22631 CASAVA_Build 5 75657558 1D AGAGGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2578 hom 36 11 12 14 T 15 14 22632 CASAVA_Build 5 75661646 1D TAATGTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 31 1 18 12 A 15 14 22633 CASAVA_Build 5 75665507 1I TAAAAGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 39 0 27 12 T 10 11 22634 CASAVA_Build 5 75665929 2I GGAGGCAGAA --/AC ACAGACTTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AC 1 2 22635 CASAVA_Build 5 75672966 3D GAAACAAAAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 AAC 3 2 22636 CASAVA_Build 5 75674468 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2655 hom 36 11 12 13 T 16 15 22637 CASAVA_Build 5 75678706 5I AGCTGTGATG -----/CAGCA GAGGCCTCAG 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 CAGCA 0 1 22638 CASAVA_Build 5 75679037 5I TTTTTTGTTG -----/TTGTT TTGTTTTGAG 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 TTGTT 1 2 22639 CASAVA_Build 5 75682594 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3046 het 1484 hom 26 7 12 7 A 15 16 22640 CASAVA_Build 5 75684695 1D CTAATTTTTT A/- ATTTTTTTTT 3070 het 37 hom 20 1 17 2 A 2 1 22641 CASAVA_Build 5 75688712 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 7 6 22642 CASAVA_Build 5 75702906 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1997 het 1997 ref 29 11 9 9 A 15 16 22643 CASAVA_Build 5 75706883 17D TCCCAGCAGG TCCAGGCCCACTGTTGT/----------------- ACCACATCTG 2673 het 2673 ref 27 18 7 4 TCCAGGCCCACTGTTGT 1 0 22644 CASAVA_Build 5 75707100 16D TCTGAGTAGC TGGGACCACAGGTGCA/---------------- TGCCACCACA 2296 het 2296 ref 20 10 7 5 TGGGACCACAGGTGCA 1 0 22645 CASAVA_Build 5 75720099 3I CAACTTTTAG ---/AAC AACAAGACAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAC 1 2 22646 CASAVA_Build 5 75726166 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 8 9 22647 CASAVA_Build 5 75733315 1D GCCATCAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 39 0 30 9 A 12 11 22648 CASAVA_Build 5 75738410 2I TTTTCTACAC --/TT TACAAGATTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 3 22649 CASAVA_Build 5 75740704 3D ACAAACAAAA AAC/--- AACAACACAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AAC 3 2 22650 CASAVA_Build 5 75741354 1I ATAGAAACTT -/G TAGTAGTGAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 0 1 22651 CASAVA_Build 5 75745202 2D TAGCCGAGGT GG/-- GGAGAACATT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 G 4 2 22652 CASAVA_Build 5 75750175 3D ACTCCATCTC GAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 5 GAA 1 0 22653 CASAVA_Build 5 75758610 1D AGAAAATAAC A/- TTAGAGTTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 0 22654 CASAVA_Build 5 75761838 1I GTGGGAATGG -/C CTGTCTCTGC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 1 2 22655 CASAVA_Build 5 75766460 1I TGTTTTTTGA -/T TTTTTATTAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 5 6 22656 CASAVA_Build 5 75770027 1I TTCATTTTCA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 8 22657 CASAVA_Build 5 75770637 3D AACTTGTGTC ATT/--- ATTATCATTC 3070 hom 87 het 32 0 29 5 ATT 2 1 22658 CASAVA_Build 5 75783715 1D TATAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 13 12 22659 CASAVA_Build 5 75792136 1D GTTCTGAGAG T/- TTTATGGGAG 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 T 4 3 22660 CASAVA_Build 5 75792442 7D TGCACACTGC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 952 het 952 ref 27 9 4 14 T 23 16 22661 CASAVA_Build 5 75803290 1D TGATTAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 11 10 22662 CASAVA_Build 5 75804881 2I3M12I AATATAGCTA --TCC------------/ATTCCACCGAAGAATTT ATTGGCTATA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 N/A 0 0 22663 CASAVA_Build 5 75809457 1D TTTAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 8 A 11 10 22664 CASAVA_Build 5 75809604 1D AAGTAAAAAA G/- TTACAGTAAG 3070 het 3070 ref 23 15 7 1 G 1 0 22665 CASAVA_Build 5 75811623 1D GTTTAAGTGT G/- GGAGGAAGAG 3070 hom 120 het 44 0 39 5 G 3 2 22666 CASAVA_Build 5 75815645 1D TCATTGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 T 11 10 22667 CASAVA_Build 5 75818219 1D AATTCAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 10 9 22668 CASAVA_Build 5 75838998 4D AACTCCTAGA TATT/---- TATTGTACAT 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 TATT 2 1 22669 CASAVA_Build 5 75839750 1I CATCTCAACT -/A AAAAAAAATA 2112 het 2112 ref 15 5 5 5 A 8 9 22670 CASAVA_Build 5 75844642 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 36 0 30 6 A 11 12 22671 CASAVA_Build 5 75852705 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTACC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 8 22672 CASAVA_Build 5 75859940 4I TATTCTGCTC ----/TATT TATTTTATAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TATT 1 2 22673 CASAVA_Build 5 75862224 5I GGAGGGCTCT -----/TTACC TTAACAATTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTACC 0 1 22674 CASAVA_Build 5 75907794 1I AGAAAATAGA -/T GGTAAGAATG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 0 1 22675 CASAVA_Build 5 75908806 9I ATGCTAAGTT ---------/ATGATATCA CCTTTCTGGT 3070 het 3070 ref 56 28 24 4 ATGATATCA 0 1 22676 CASAVA_Build 5 75909901 1D GGATGGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1494 hom 30 5 16 10 T 12 11 22677 CASAVA_Build 5 75916149 13D CCTAGGACCA GCAGAACTATATG/------------- GCCCTTCCCT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 GCAGAACTATATG 1 0 22678 CASAVA_Build 5 75918272 1D AGGTTTAGCT A/- AATATTCAGA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 3 2 22679 CASAVA_Build 5 75920707 2I ATCCTGACTA --/AC ACAGTGAAAC 715 het 715 ref 9 5 2 2 AC 1 2 22680 CASAVA_Build 5 75922506 6D TGTCTCTAAG AAAATA/------ AAAATAAAAA 2676 het 2528 hom 18 6 6 6 AAAATA 3 2 22681 CASAVA_Build 5 75924144 1I TTTTTGATCT -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 A 7 8 22682 CASAVA_Build 5 75927020 1D TCTTACCTTA T/- TTTTTTAGAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 T 7 6 22683 CASAVA_Build 5 75929310 1I TGGTCTCACT -/G GGCCCACCTG 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 G 2 3 22684 CASAVA_Build 5 75934164 2D AATGTTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 12 10 22685 CASAVA_Build 5 75935895 1I GAACTCATCC -/T TTTTTTTTTA 2390 het 2142 hom 23 8 7 8 T 9 10 22686 CASAVA_Build 5 75947325 29D GTCATTTACT TACAGGAATATAATGGGTATTAATAACAA/----------------------------- AATTCCATTT 3070 het 3070 ref 33 26 14 6 TACAGGAATATAATGGGTATTAATAACAA 1 0 22687 CASAVA_Build 5 75958612 1I TCTAACTGCC -/G GGGGGAAGCC 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 G 5 6 22688 CASAVA_Build 5 75962297 1D GCCAGTACTC T/- TATTTTCTCT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 2 1 22689 CASAVA_Build 5 75962437 1D GAGAAGTTCT C/- CCCTTCATCT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 C 4 3 22690 CASAVA_Build 5 75965843 1D AATATTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 T 12 11 22691 CASAVA_Build 5 75966489 4D TTTTCTAAGT AACA/---- AACCAACTGT 3070 het 3070 hom 51 24 23 5 AACA 1 0 22692 CASAVA_Build 5 75967370 1I TGGTCACACC -/A ACTGTTCTCC 2174 het 2174 ref 32 13 6 13 A 1 2 22693 CASAVA_Build 5 75971706 4D AACAACTGGA ATCC/---- AGTTACCTGT 3070 het 3070 hom 54 21 28 6 ATCC 1 0 22694 CASAVA_Build 5 75975504 2I GATGGCTGGA --/TT TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 8 10 22695 CASAVA_Build 5 75975869 8D TGCCATTTTT GTAAATCC/-------- TTTTTTTTTT 1530 hom 18 het 11 0 7 7 GTAAATCC 1 0 22696 CASAVA_Build 5 75979107 5I5M1I AGTCTCATGA -----GATGG-/GACCTGATGGT TTTATAAGGG 3070 hom 42 het 14 0 15 1 N/A 0 0 22697 CASAVA_Build 5 75980414 3D TAGAGACTAT AAC/--- AACAGAAATT 3070 het 3070 ref 41 22 17 4 AAC 2 1 22698 CASAVA_Build 5 75983161 2I TGTAGCCTGG --/GT GACAAAATGA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 GT 0 1 22699 CASAVA_Build 5 75983574 4D CTTTTACTTC CTTT/---- CTAATTTGAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 CTTT 1 0 22700 CASAVA_Build 5 75984026 3I AAATTCCATT ---/TTA TTACTCCTTT 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 TTA 1 2 22701 CASAVA_Build 5 75986853 2D TAAATGCTGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 11 9 22702 CASAVA_Build 5 75987807 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 12 11 22703 CASAVA_Build 5 75988070 1D CCGTTTTTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 176 hom 19 1 16 2 T 10 9 22704 CASAVA_Build 5 75988209 1I CATTTTATTC -/A AGGTAAAGTG 3070 het 117 hom 42 1 35 6 A 1 2 22705 CASAVA_Build 5 75988478 2D TTTCTAATTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 11 9 22706 CASAVA_Build 5 75991513 1D ATCAGGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2739 hom 33 10 17 7 A 12 11 22707 CASAVA_Build 5 75991682 4I GTGGCTCATA ----/GGTG GAGCGCCAGC 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 GGTG 0 1 22708 CASAVA_Build 5 75992453 1I CCAAAGCAAT -/A ATGCAGAGGG 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 A 1 2 22709 CASAVA_Build 5 75992815 1I TAGTTCTTTT -/A AAATCAGCAT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 A 3 4 22710 CASAVA_Build 5 75995292 4I ATTTTTAAAA ----/TTTG TTTGTAGAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTTG 1 2 22711 CASAVA_Build 5 75996270 1I TTTCAAAAAA -/T AAAAAAAGAT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 0 1 22712 CASAVA_Build 5 75996575 1I TATGAGAATT -/A AAAAAGGAGT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 5 6 22713 CASAVA_Build 5 75999459 9D GTCCACTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 30 3 14 16 T 23 14 22714 CASAVA_Build 5 76013114 1D ATCAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 642 het 642 ref 48 36 2 10 A 13 12 22715 CASAVA_Build 5 76028165 2D AAATGACCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 12 10 22716 CASAVA_Build 5 76028432 17D TATGAAGAAT TTCTATTTAATGAAGAA/----------------- TTCTATTTAA 3070 hom 72 het 33 0 25 9 TTCTATTTAATGAAGAA 2 1 22717 CASAVA_Build 5 76032093 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAACCTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 22718 CASAVA_Build 5 76034385 4D CAAACCATAG CAGT/---- CAGTTTCTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 5 CAGT 2 1 22719 CASAVA_Build 5 76035235 1D GTTTCTGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 34 1 23 10 A 15 14 22720 CASAVA_Build 5 76035965 8D AGAGAAAGCA ATAATTCC/-------- ATGAGACTTC 3070 hom 120 het 44 0 41 7 ATAATTCC 1 0 22721 CASAVA_Build 5 76044715 3D ATTATTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 17 14 22722 CASAVA_Build 5 76051170 1I ACTCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2334 hom 30 9 12 9 A 11 12 22723 CASAVA_Build 5 76054098 1D CTGCGTTTAC T/- TTCCTGCAAC 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 3 2 22724 CASAVA_Build 5 76057204 1I ATATACTACA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 6 7 22725 CASAVA_Build 5 76084136 1D CCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 A 12 11 22726 CASAVA_Build 5 76087683 4I CTAGCAAAGC ----/AAAG AAAGAGTGAA 3070 hom 102 het 39 0 30 9 AAAG 1 2 22727 CASAVA_Build 5 76102266 1D AGAAAATAAA T/- CATTCTTCCG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 1 0 22728 CASAVA_Build 5 76103442 1I TACTGTAACT -/C CCAAATATTC 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 C 2 3 22729 CASAVA_Build 5 76111248 1I GTCTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 11 12 22730 CASAVA_Build 5 76122152 12D12M2D AGGACAGACT GAGTAACACAGGGAAAAGTAATAACT/------------GAAAAGTAATAA-- CTGTTGATCC 3070 het 3070 hom 34 19 24 6 N/A 0 0 22731 CASAVA_Build 5 76130440 1D TTTTTTCATT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 33 23 8 2 A 8 7 22732 CASAVA_Build 5 76132716 1D ATTTAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 9 5 A 10 9 22733 CASAVA_Build 5 76134815 2D ACCCTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1744 hom 22 8 12 2 A 14 12 22734 CASAVA_Build 5 76137401 1D CTGTCAATGG A/- AAAAAAAAAC 1173 het 1173 ref 34 28 3 3 A 10 9 22735 CASAVA_Build 5 76140586 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 2979 hom 26 9 15 2 CT 2 1 22736 CASAVA_Build 5 76172258 1I ATCAATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 A 10 11 22737 CASAVA_Build 5 76178783 2I TCCTCCCCAT --/CC CCCGTTTATT 3070 hom 95 het 37 0 32 5 C 3 5 22738 CASAVA_Build 5 76191350 1D CAACAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 1980 het 145 hom 27 3 10 14 A 17 16 22739 CASAVA_Build 5 76196634 1I CTCAATTCAT -/A AAAAAAAGCT 3070 hom 104 het 38 0 33 5 A 7 8 22740 CASAVA_Build 5 76204923 2I CGGAGTCTCA --/CT CTGTCACCCA 3070 het 58 hom 23 1 18 4 CT 1 2 22741 CASAVA_Build 5 76205617 1I TCTACCCTTT -/C CCCCCCTTAC 3070 hom 73 het 30 0 24 6 C 6 7 22742 CASAVA_Build 5 76205779 1D GCACTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 1618 het 1618 ref 42 23 5 14 T 15 14 22743 CASAVA_Build 5 76206783 1I GACTATTATG -/T TTTTTAACAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 T 5 6 22744 CASAVA_Build 5 76215604 1I ACACCTTGAA -/G GCGAGGTTAA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 G 1 2 22745 CASAVA_Build 5 76228109 4D TATTGATTTC CTTT/---- CTTTTGGGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 CTTT 2 1 22746 CASAVA_Build 5 76238223 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 29 0 21 9 T 9 10 22747 CASAVA_Build 5 76243673 4I GCGGCGTTGG ----/CTGT CTTAGTGTCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CTGT 0 1 22748 CASAVA_Build 5 76244528 2D AGAGAGAGTC AG/-- AGAGAGGAAG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 AG 4 3 22749 CASAVA_Build 5 76266449 1I AGACAATAAG -/A CTCTAGGAGT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 0 1 22750 CASAVA_Build 5 76270049 2D GGTGAAAGAC AG/-- GAAAGCAGGA 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 AG 1 0 22751 CASAVA_Build 5 76275351 3I CCTTAGAGAT ---/GAG GAGAATGACC 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 GAG 1 2 22752 CASAVA_Build 5 76278580 1D TCCTACCCCC T/- GGCCTCTGGG 2572 het 2572 ref 30 14 6 10 T 1 0 22753 CASAVA_Build 5 76279469 1I GACTTAAGTG -/T TAAGACCTGA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 1 2 22754 CASAVA_Build 5 76286091 2I CGCGGAACTC --/TG TGACGCAATC 1818 het 1818 ref 15 7 5 3 TG 1 2 22755 CASAVA_Build 5 76294447 3D TTCCTTTACA AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 AAG 3 2 22756 CASAVA_Build 5 76305564 6D TTCTAAATCG TTATTA/------ TTATTATTAT 1337 het 995 hom 10 2 3 6 TTA 8 6 22757 CASAVA_Build 5 76313511 4I GATCACTTTT ----/ATTA ATTGGATGAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 ATTA 0 1 22758 CASAVA_Build 5 76318426 1D TTTCTTTCCA C/- CTTGTCACTT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 C 2 1 22759 CASAVA_Build 5 76321237 1D CTTAAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 31 2 22 7 T 17 16 22760 CASAVA_Build 5 76343094 1D TCATGTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 10 9 22761 CASAVA_Build 5 76343557 1D TTATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 17 1 11 5 T 15 14 22762 CASAVA_Build 5 76346079 1D TGTTCTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 25 4 15 6 T 15 14 22763 CASAVA_Build 5 76394847 1I CTAATCATAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 8 9 22764 CASAVA_Build 5 76404917 1I TGTGGAAGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 10 19 9 T 9 10 22765 CASAVA_Build 5 76408272 1I TTAGGAACTC -/T TTTTTTTTTT 1637 het 1637 ref 35 11 10 14 T 16 17 22766 CASAVA_Build 5 76429623 1D TGGCTAAGAC A/- AGGCCTAGGA 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 A 2 1 22767 CASAVA_Build 5 76429864 1D CACCTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 2603 het 2603 ref 35 17 9 9 T 11 10 22768 CASAVA_Build 5 76431192 3D TTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2246 hom 30 14 14 2 T 13 10 22769 CASAVA_Build 5 76454942 1I ATTCCTCCCC -/A CACCGCCCCC 3070 het 2858 hom 26 8 12 6 A 0 1 22770 CASAVA_Build 5 76476184 1D ATTTTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 11 10 22771 CASAVA_Build 5 76489568 1I TGTGTGGGAC -/A ACTTGCCACT 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 1 2 22772 CASAVA_Build 5 76497580 3D AAAGAAAAAG AAA/--- AAAAAAAGGA 1749 het 34 hom 21 1 13 8 A 10 7 22773 CASAVA_Build 5 76509035 2D AACAATAGAC TG/-- TAATAAAAGT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TG 1 0 22774 CASAVA_Build 5 76528624 1D AATTGATGTA T/- TTTTATCTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 5 4 22775 CASAVA_Build 5 76528866 1D CTAATTTAAA T/- TTTTTTTTTT 2066 hom 17 het 14 0 6 8 T 12 11 22776 CASAVA_Build 5 76529283 1I TAATCTTTTC -/A AAAATCCAGC 3070 hom 48 het 17 0 17 3 A 4 5 22777 CASAVA_Build 5 76529467 1D ACAATGCTTG T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 8 7 22778 CASAVA_Build 5 76530420 1D TTCTGGGACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 T 9 8 22779 CASAVA_Build 5 76531649 14I ACTGTACTGG --------------/AAATTTATATCATT AAATTTATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 5 AAATTTATATCATT 1 2 22780 CASAVA_Build 5 76532137 1I GGTGAAGGGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 558 hom 33 2 28 3 T 8 9 22781 CASAVA_Build 5 76537666 2D AAAAACAAAC AA/-- ATAAAATAAC 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 A 3 1 22782 CASAVA_Build 5 76545501 1D CCTAATTTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 A 10 9 22783 CASAVA_Build 5 76580022 3I ATTAAATTAG ---/TTT TTTTTGTTGT 3070 hom 54 het 40 0 33 7 T 5 8 22784 CASAVA_Build 5 76606975 1D AGGACCACTT A/- AAAAATTCTT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 6 5 22785 CASAVA_Build 5 76617248 1I TTCCCATCTA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 T 7 8 22786 CASAVA_Build 5 76617349 1I CCTAGGTCTC -/T TGTTTATTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 2 22787 CASAVA_Build 5 76618163 3I TAGGTTGTCA ---/TTT TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 6 9 22788 CASAVA_Build 5 76642721 1D AAATGACCAC A/- GTCTCTTAGA 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 A 1 0 22789 CASAVA_Build 5 76643384 1I AAATGGATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 392 hom 44 1 36 7 T 9 10 22790 CASAVA_Build 5 76654421 2D TACAATGCAA AG/-- AGTCTTTATT 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 AG 2 1 22791 CASAVA_Build 5 76656754 1I GGGGGGATTG -/T TTTTGGCTTT 3070 hom 83 het 30 0 28 2 T 4 5 22792 CASAVA_Build 5 76668205 1D TTATCTGTTC A/- AATGTTGGAC 3070 het 3070 ref 59 31 24 4 A 3 2 22793 CASAVA_Build 5 76691851 4I CCGATAAGTT ----/TAAC TAAAATTCCA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 TAAC 0 1 22794 CASAVA_Build 5 76724975 1D GACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 30 0 21 9 A 13 12 22795 CASAVA_Build 5 76732452 1I GACCATTAGA -/G GGGAAAAAAA 3070 hom 112 het 41 0 37 4 G 3 4 22796 CASAVA_Build 5 76735405 1I TCTTAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 11 12 22797 CASAVA_Build 5 76742264 3I CAATTGTGGC ---/TGT TGTTGTTACT 3070 hom 56 het 31 0 24 7 TGT 2 3 22798 CASAVA_Build 5 76744323 1D ATCCAAGCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 T 9 8 22799 CASAVA_Build 5 76753174 2I TTTCAAACTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 TG 6 7 22800 CASAVA_Build 5 76756408 2I TTGTTTTTTG --/TT TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 T 6 8 22801 CASAVA_Build 5 76761165 5I TGGTAACTCT -----/TAGAG TAGAGTATTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 TAGAG 1 2 22802 CASAVA_Build 5 76762020 4I AGTCCAAAAA ----/TCTT TCTTAAGGCC 3070 het 3070 hom 48 20 26 2 TCTT 1 2 22803 CASAVA_Build 5 76763464 1D CATATAAGCC T/- TTTCTCATTC 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 T 4 3 22804 CASAVA_Build 5 76765314 3D CCCTACCCTC AAG/--- AAGATTCTGA 3070 het 3070 ref 43 23 18 4 AAG 2 1 22805 CASAVA_Build 5 76767694 2I CTGCACATAC --/TA TATAGCCTAT 3070 het 3070 hom 53 17 31 5 TA 2 3 22806 CASAVA_Build 5 76773459 1I AATACAGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 A 9 10 22807 CASAVA_Build 5 76780823 4D CCCCACCACG AGGA/---- AGGAAGGGAA 3070 hom 107 het 40 0 35 9 AGGA 2 1 22808 CASAVA_Build 5 76789269 1D CAACCCTTAT A/- AAAAATTTTG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 6 5 22809 CASAVA_Build 5 76792751 2D ACTGATACTG AA/-- AAAGAGAGCT 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 A 5 3 22810 CASAVA_Build 5 76796414 1I AAGGGTCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 9 10 22811 CASAVA_Build 5 76797303 1D AAATTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 13 12 22812 CASAVA_Build 5 76800500 1I AGTCTCTTTT -/A TTCTATGGTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 22813 CASAVA_Build 5 76801328 4I GGATAAAAAG ----/AAAC AAACAAAGCC 3070 hom 57 het 26 0 20 8 AAAC 1 2 22814 CASAVA_Build 5 76814441 1D CATCTACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 13 14 A 17 16 22815 CASAVA_Build 5 76818476 1D TGACAGAGCA T/- ATAGGTAACT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 1 0 22816 CASAVA_Build 5 76820039 1I AAATTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 12 13 22817 CASAVA_Build 5 76821699 1I TTTCGCACCA -/C CACGCCCAAC 3070 hom 27 het 31 1 24 6 C 1 2 22818 CASAVA_Build 5 76822174 1D AATGTTTTCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 10 9 22819 CASAVA_Build 5 76827387 1I CAGAAAAAAA -/C ATCACAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 C 0 1 22820 CASAVA_Build 5 76829272 1I TCGTTTAGCA -/G ACCCTCGAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 0 1 22821 CASAVA_Build 5 76831545 1I ATTGCTTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 9 10 22822 CASAVA_Build 5 76840401 1D CGTGAAGCTT C/- TGTACTCATC 3070 het 3070 ref 53 28 22 3 C 1 0 22823 CASAVA_Build 5 76845549 1D TTTGTTTTAC A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 8 7 22824 CASAVA_Build 5 76846396 1I TAGGCAATTG -/T TAACACAATG 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 T 1 2 22825 CASAVA_Build 5 76848177 1I GGGACTTTGG -/C TTTTTCCATG 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 C 0 1 22826 CASAVA_Build 5 76848598 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 13 12 22827 CASAVA_Build 5 76850838 2D GAGTTTTAAT AC/-- TTAAACCTCC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 AC 1 0 22828 CASAVA_Build 5 76860027 4D CTAATTCCAC CAAA/---- CAGTCAAGGA 3070 het 3070 ref 41 20 18 5 CAAA 1 0 22829 CASAVA_Build 5 76861598 8I CTCAAGATAC --------/AGAAAGGA AGAAAGGAAT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 AGAAAGGA 1 2 22830 CASAVA_Build 5 76862577 1D CTTGTTATAC A/- AAAATTAACT 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 A 5 4 22831 CASAVA_Build 5 76865770 1D TTTGCTTATT A/- AAAAATAATC 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 6 5 22832 CASAVA_Build 5 76866301 2D AGGTGTGAGC CA/-- CACTGACCTG 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 CA 2 1 22833 CASAVA_Build 5 76880098 2D GCCAACAAAC AT/-- GTGAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 15 8 6 AT 1 0 22834 CASAVA_Build 5 76886668 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1185 het 1185 ref 37 24 3 10 A 15 14 22835 CASAVA_Build 5 76890468 1D TGAAAAAATA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 8 7 22836 CASAVA_Build 5 76904847 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TATTTTTTTT 2930 het 2930 ref 27 12 10 7 TCTT 1 0 22837 CASAVA_Build 5 76907356 1I CATACAGTAA -/C CTTGATGAAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 C 1 2 22838 CASAVA_Build 5 76911450 3I AACATATGGA ---/AAT AATATAATAT 3070 het 3070 hom 42 13 16 13 AAT 1 2 22839 CASAVA_Build 5 76911487 1I CAATGGCAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 50 10 24 16 A 8 9 22840 CASAVA_Build 5 76912149 1I AAATATAGTG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 6 7 22841 CASAVA_Build 5 76913611 1I TTAATTAGAG -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 6 7 22842 CASAVA_Build 5 76914771 1D AAATTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 19 3 A 11 10 22843 CASAVA_Build 5 76920100 1I CCTTTTTTGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 15 16 9 A 8 9 22844 CASAVA_Build 5 76946391 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAAAG 2564 het 331 hom 10 2 7 1 A 9 10 22845 CASAVA_Build 5 76951337 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTAACA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 7 6 22846 CASAVA_Build 5 76951801 3D AACTCTACCC ACA/--- ACATCACCCT 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 ACA 2 1 22847 CASAVA_Build 5 76952092 1I GAACAATTAG -/C CTTCATGCAT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 C 1 2 22848 CASAVA_Build 5 76955024 1D TGTGAGCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 10 9 22849 CASAVA_Build 5 76963686 1D AGCCTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 20 2 12 7 T 14 13 22850 CASAVA_Build 5 76967495 1I AAAACAAAAA -/C AAAAAAACAA 3070 het 466 hom 23 1 16 6 C 0 1 22851 CASAVA_Build 5 76980434 1I CCATTGACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 36 2 21 13 T 11 12 22852 CASAVA_Build 5 77008802 8I ATTGATAAAC --------/TATAATTT TATACTTCAT 3070 het 2727 hom 19 8 10 1 TATAATTT 0 1 22853 CASAVA_Build 5 77016322 2I GAGGTGAGAC --/AG AAATCTATTT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 AG 0 1 22854 CASAVA_Build 5 77017041 3I CCCTCATTGT ---/ATA ATATCAACTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 ATA 1 2 22855 CASAVA_Build 5 77018328 3D CCATTTGTAT TTC/--- TTCTTCTGTG 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 TTC 3 2 22856 CASAVA_Build 5 77018968 5I AAAAACCCAA -----/GTAAT GTAATGAAGT 3070 hom 89 het 49 1 43 5 GTAAT 1 2 22857 CASAVA_Build 5 77019763 2D TTATATGTCC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 40 16 23 3 AT 1 0 22858 CASAVA_Build 5 77020401 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 10 9 22859 CASAVA_Build 5 77020514 1I GCCTCAGCCT -/C CCGGGTAGCT 3070 het 3070 ref 18 8 7 3 C 2 3 22860 CASAVA_Build 5 77024268 4D ATGATGCTTC CTGT/---- CTTAGATAGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 CTGT 1 0 22861 CASAVA_Build 5 77029545 1I CCCCATCTCT -/A CAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 A 0 1 22862 CASAVA_Build 5 77034879 4D TATGTCTGAC TGAG/---- TGTCATTACT 3070 het 3070 ref 36 24 10 6 TGAG 1 0 22863 CASAVA_Build 5 77035514 1D GAGTGAGTTC T/- CATGAGATCA 3070 het 3070 ref 21 9 10 2 T 1 0 22864 CASAVA_Build 5 77036863 1D ATTGATGGTG A/- AAAAAAGCAG 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 7 6 22865 CASAVA_Build 5 77039803 11D TAGCTATTGT TATTTATGATA/----------- TAATTTTACC 3070 het 3070 hom 30 15 15 2 TATTTATGATA 1 0 22866 CASAVA_Build 5 77040564 1D TACAACTGTC T/- TTTTTTTTTT 2790 het 1415 hom 24 6 9 9 T 17 16 22867 CASAVA_Build 5 77045485 1I CAAGTAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3040 hom 27 10 9 8 T 10 11 22868 CASAVA_Build 5 77049035 3D CCAGTTTTAT GGG/--- GATTTCCACT 3070 hom 63 het 25 0 22 5 G 4 1 22869 CASAVA_Build 5 77056653 2I TACCTGAGAC --/TT GGCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 T 0 2 22870 CASAVA_Build 5 77072401 4D AGAAAACATT TAAG/---- TAAGGGTAAG 3070 het 3070 hom 33 12 15 10 TAAG 2 1 22871 CASAVA_Build 5 77072927 1I AAGAAAAGAC -/A AACACACAGG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 2 3 22872 CASAVA_Build 5 77082333 1D TGAAACAGAC T/- TCAGGAGGTC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 2 1 22873 CASAVA_Build 5 77096096 6D GTCTCCCATC TTTATT/------ TTTAACTCTG 3070 het 3070 ref 29 17 11 3 TTTATT 1 0 22874 CASAVA_Build 5 77096369 2I CAACTCAAAA --/CT CTGTCTCCTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 CT 1 2 22875 CASAVA_Build 5 77097462 8D AACTAGGGCC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 375 hom 38 5 19 16 A 19 11 22876 CASAVA_Build 5 77101250 1D TTGCTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 13 12 22877 CASAVA_Build 5 77102160 1D CCCCCGCTCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 10 9 22878 CASAVA_Build 5 77102319 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 G 1 0 22879 CASAVA_Build 5 77104919 1D TTTAGACAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 10 9 22880 CASAVA_Build 5 77109948 2D CCCCTTTCTC TT/-- TGTTTTAATT 3070 het 3070 hom 41 18 17 8 T 3 1 22881 CASAVA_Build 5 77120415 1D TCACTTTTTT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 8 7 22882 CASAVA_Build 5 77121335 1D AATTAATGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 10 9 22883 CASAVA_Build 5 77123503 1I TTCTCACAGT -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 6 7 22884 CASAVA_Build 5 77132286 2I TATATTTGTT --/TG TAGATGACGT 3070 het 3070 ref 45 23 12 10 TG 0 1 22885 CASAVA_Build 5 77136479 1D ATTTTTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 A 11 10 22886 CASAVA_Build 5 77151391 1D TAAACAGAAG A/- AAAAAAACAT 3070 het 2256 hom 21 9 9 3 A 8 7 22887 CASAVA_Build 5 77162059 8I GCTTTTGAGT --------/GAAGGAGG GAAGGTGCAG 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 GAAGGAGG 0 1 22888 CASAVA_Build 5 77171652 1I CATTGCTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 8 9 22889 CASAVA_Build 5 77175570 24I CATTTTATTT ------------------------/AAGGGATGAGGTCAATGTTTTTTA AACAGTTTAT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 AAGGGATGAGGTCAATGTTTTTTA 0 1 22890 CASAVA_Build 5 77175602 5D TCAGGACGAC TCAAT/----- GAAGGAGGTT 1273 het 1273 ref 27 9 5 15 TCAAT 1 0 22891 CASAVA_Build 5 77177104 1D GCAAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 542 het 542 ref 33 24 3 7 A 13 12 22892 CASAVA_Build 5 77177971 2D36M1I GTTTTTTTTT TCTTCTTTTATGCCTGGGGTGACGTGGCTTTGGCCTGT-/--TTCTTTTATGCCTGGGGTGACGTGGCTTTGGCCTGTA AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 27 0 11 25 N/A 0 0 22893 CASAVA_Build 5 77178544 1I TACGCCTGTC -/T CGTGACTTTA 3070 hom 87 het 33 0 27 6 T 0 1 22894 CASAVA_Build 5 77179218 4D CCCTTATTTA TTTG/---- TTTGTCTGTG 3070 het 3070 hom 41 19 18 6 TTTG 2 1 22895 CASAVA_Build 5 77181991 4D TAGGGGTGGG CAAA/---- CAGAGCTTGG 3070 hom 53 het 19 0 18 3 CAAA 1 0 22896 CASAVA_Build 5 77186454 3D ATGGTCTAAA TCT/--- GAGTTAATCA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TCT 1 0 22897 CASAVA_Build 5 77186863 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 21 1 18 2 A 14 12 22898 CASAVA_Build 5 77188191 1D TATATAAAAG A/- AAAAAAAAAG 815 het 815 ref 14 7 3 4 A 10 9 22899 CASAVA_Build 5 77191154 1D AATTTAAAAG T/- GTAATAGTAG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 1 0 22900 CASAVA_Build 5 77191836 3D TTTGCCACTG ATA/--- ATAATTGGGT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 ATA 2 1 22901 CASAVA_Build 5 77193777 6D CGGACTGTTT CCATCC/------ CCACACACCC 3070 het 3070 ref 45 24 13 9 CCATCC 1 0 22902 CASAVA_Build 5 77210949 1D TCCTAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 12 11 22903 CASAVA_Build 5 77235170 1D CAAATTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 13 12 22904 CASAVA_Build 5 77251442 1D AGTCAGGTTC A/- CTTTAAAGAG 3070 het 3070 hom 27 8 15 7 A 1 0 22905 CASAVA_Build 5 77255179 2D ATTTTTAAAA CT/-- CTATTTGTTA 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 CT 2 1 22906 CASAVA_Build 5 77255850 1I GAATATTTGT -/C CCCCCCCCAC 2301 het 2301 ref 30 13 10 7 C 8 9 22907 CASAVA_Build 5 77260247 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2355 hom 23 8 12 4 A 15 14 22908 CASAVA_Build 5 77265670 12D CTTGTACACA CACCACCACCGC/------------ CGCCACCACC 3070 het 3070 ref 51 29 20 5 CACCACCACCGC 1 0 22909 CASAVA_Build 5 77274127 1D ACTTCAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 23 1 13 9 A 12 11 22910 CASAVA_Build 5 77289438 1I CTTATTAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 62 het 24 0 21 3 T 9 10 22911 CASAVA_Build 5 77305601 3D TCAGCCTCCC TAG/--- TAGTAGCTGG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TAG 3 2 22912 CASAVA_Build 5 77343935 1I ACAAAAGTAC -/A GTTTTATTAA 3070 het 2408 hom 20 6 11 3 A 0 1 22913 CASAVA_Build 5 77347779 1D AAAATGAAAG A/- AAAAATGAGA 3070 het 3070 hom 47 20 24 4 A 6 5 22914 CASAVA_Build 5 77350069 1D TTTTCAGTTA C/- GTATATCTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 C 1 0 22915 CASAVA_Build 5 77359801 1I ATAGCACTTT -/G GGAGGCTGAG 2346 het 420 hom 14 2 6 6 G 2 3 22916 CASAVA_Build 5 77361109 1I TAGGATTTAA -/T TCTCTGACGT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 1 2 22917 CASAVA_Build 5 77365468 1I TGTAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 10 11 22918 CASAVA_Build 5 77537442 1D TCTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 14 10 T 11 10 22919 CASAVA_Build 5 77540518 2I TTCTAATATA --/AT TATATTCCAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AT 0 1 22920 CASAVA_Build 5 77555081 2D AATTAATTCA AC/-- AGTCATTCAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 6 AC 1 0 22921 CASAVA_Build 5 77559825 1I TTGATCTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 9 10 22922 CASAVA_Build 5 77561996 4I GATATCAATC ----/CATT CATCTATACT 3070 het 3070 hom 43 21 19 3 CATT 0 1 22923 CASAVA_Build 5 77565417 2D GGATGCAAAC AG/-- GGGCATGTTC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 AG 1 0 22924 CASAVA_Build 5 77567936 1D AAACATAAAA G/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 45 18 21 6 G 1 0 22925 CASAVA_Build 5 77573994 1D TCTTTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 2726 het 2726 ref 24 13 6 5 T 11 10 22926 CASAVA_Build 5 77587046 1D CAAACAAAAT A/- AGACTTCAAG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 2 1 22927 CASAVA_Build 5 77592446 2D TACAATTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 19 13 7 TG 6 5 22928 CASAVA_Build 5 77597688 1I GTAATTTACA -/T AGTTATTTGT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 0 1 22929 CASAVA_Build 5 77600787 1I TTGCTGAAAA -/C CAATAGTTGT 3070 het 3070 hom 55 21 30 4 C 1 2 22930 CASAVA_Build 5 77603863 1I ATGTCTTACG -/T CTCCTTAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 0 1 22931 CASAVA_Build 5 77606495 1D AGACCCTATC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 T 8 7 22932 CASAVA_Build 5 77607653 1I ATAATGGTAA -/T TTTTTTTTTT 1798 het 1798 ref 29 18 6 5 T 11 12 22933 CASAVA_Build 5 77608553 1I GAATGCTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 21 9 10 2 A 9 10 22934 CASAVA_Build 5 77609509 9D AGGACATCTT CATATTTGC/--------- CATGATCTTT 3070 het 3070 ref 40 22 14 8 CATATTTGC 1 0 22935 CASAVA_Build 5 77611088 1D AAAACCAGGG A/- ATGGCAAAGC 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 A 2 1 22936 CASAVA_Build 5 77612562 1I TTTACCACAA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 6 7 22937 CASAVA_Build 5 77613958 1D CTGAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 13 12 22938 CASAVA_Build 5 77615407 1D CAAGGTGATC T/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 14 27 7 T 5 4 22939 CASAVA_Build 5 77617248 1I TTCCCCCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 A 9 10 22940 CASAVA_Build 5 77620525 1I ATGTTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 11 12 22941 CASAVA_Build 5 77620617 1I TTTAGAACCC -/T ATAGTGAGAC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 0 1 22942 CASAVA_Build 5 77621947 1I GATTACAGGC -/A AGGGGCCACC 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 A 1 2 22943 CASAVA_Build 5 77622169 1D GTTAAAAGAA G/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 G 1 0 22944 CASAVA_Build 5 77623376 1I AATGCTTGGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 A 8 9 22945 CASAVA_Build 5 77624407 1I AAGCCGTAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 8 9 22946 CASAVA_Build 5 77632067 22D CTTACTATGC TTTAGCAAAGAGACCAGTGGCA/---------------------- TTTTGCCCCT 3070 het 3070 ref 26 17 8 5 TTTAGCAAAGAGACCAGTGGCA 1 0 22947 CASAVA_Build 5 77633407 6D CTACCTCTCG CTCTCT/------ CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 8 CT 11 8 22948 CASAVA_Build 5 77640089 1I CCTGTTTGAG -/A AAAACCAATG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 4 5 22949 CASAVA_Build 5 77640462 4D GTGATTAGGC TGAG/---- TGTTAGTCAC 3070 het 3070 hom 41 17 18 7 TGAG 1 0 22950 CASAVA_Build 5 77652654 2D AGATGAACAC AT/-- GTTTACCCCA 3067 het 3067 ref 29 17 9 3 AT 1 0 22951 CASAVA_Build 5 77663638 3D CACTCTAGCA AAT/--- AATGTTACAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAT 2 1 22952 CASAVA_Build 5 77665456 3I AACAAACCAC ---/TAT TATTATATTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAT 2 3 22953 CASAVA_Build 5 77668398 1D AGACGGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 14 13 22954 CASAVA_Build 5 77673371 4I ATATATACAC ----/ATAT ATAAAACGTA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AT 1 3 22955 CASAVA_Build 5 77681130 2D TTGCATAGAC TT/-- TAGGAATAGC 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 3 1 22956 CASAVA_Build 5 77686574 6D GAATTTGTGG AAGAGC/------ AAGAGTGGAA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 AAGAGC 1 0 22957 CASAVA_Build 5 77692814 1I TGCTGCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 118 hom 24 1 18 5 A 11 12 22958 CASAVA_Build 5 77693666 1D ATTTTAAGAC T/- TTTTTTTTTT 2154 het 2154 ref 34 21 5 9 T 12 11 22959 CASAVA_Build 5 77696560 4I ATACATATGT ----/AACA AACCTGTACG 3070 hom 90 het 32 0 29 3 AACA 0 1 22960 CASAVA_Build 5 77704510 1D GATTCCCATC T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 7 6 22961 CASAVA_Build 5 77706262 3I TCTAGAATCT ---/ATA ATAGAGTGTA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 ATA 1 2 22962 CASAVA_Build 5 77735065 5D ACCAACTGTT TTCTC/----- TTAGACCATT 3070 hom 73 het 30 0 24 6 TTCTC 1 0 22963 CASAVA_Build 5 77739057 1D GGAATTATCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 123 het 49 0 41 9 T 10 9 22964 CASAVA_Build 5 77739208 1D CCTTATCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 41 0 32 9 T 13 12 22965 CASAVA_Build 5 77753899 1D GTGCTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 33 0 23 10 T 13 12 22966 CASAVA_Build 5 77755255 2I ACTTGGTATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 31 1 25 5 T 10 12 22967 CASAVA_Build 5 77755265 2I TTTTTTTTTT --/TC CCCCCATTTT 3070 het 446 hom 39 2 28 9 TC 0 1 22968 CASAVA_Build 5 77760945 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 17 hom 25 1 22 2 T 9 8 22969 CASAVA_Build 5 77766140 3I TCCTTCCTTT ---/TCC TCCTCCTCCT 3070 hom 47 het 23 0 14 9 TCC 3 4 22970 CASAVA_Build 5 77778941 1I ATTTGAAGAC -/T TTACTAGAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 2 3 22971 CASAVA_Build 5 77779370 6D CAAAAGAAAC TTTCTT/------ CTTCTTCTTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTTCTT 1 0 22972 CASAVA_Build 5 77780581 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 12 14 22973 CASAVA_Build 5 77781610 1I TAACTGGGGC -/A ATTGGTAAGT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 1 2 22974 CASAVA_Build 5 77792173 2I TTAATGGGGT --/TG TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TG 0 1 22975 CASAVA_Build 5 77794069 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 8 9 22976 CASAVA_Build 5 77794607 1I AAACCACTTT -/G TACTCTTTCA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 G 0 1 22977 CASAVA_Build 5 77795449 1I TTAATGAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 35 1 24 10 T 10 11 22978 CASAVA_Build 5 77795723 1D CACTCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 17 1 12 4 T 11 10 22979 CASAVA_Build 5 77814752 2D AGGAAACAAC AT/-- AGCAGTTTGA 3070 hom 107 het 39 0 35 6 AT 1 0 22980 CASAVA_Build 5 77817542 1I GGAACTCTCC -/T TTGCCAAAAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 3 22981 CASAVA_Build 5 77819612 1I AGCTTGGAGA -/C CCTCAGTCCC 3070 hom 93 het 35 0 29 6 C 2 3 22982 CASAVA_Build 5 77820960 3D ATCCACTAAA AAT/--- TTCTCTTCTA 3070 hom 87 het 32 0 30 6 AAT 1 0 22983 CASAVA_Build 5 77822803 4I CAGGGGTGGA ----/GTAG GTAGAGGGAA 3070 hom 130 het 47 0 42 5 GTAG 1 2 22984 CASAVA_Build 5 77828869 4D AAGGCTGTGG TTAA/---- TTAAATCTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TTAA 2 1 22985 CASAVA_Build 5 77831618 1I AAAAAAAAAG -/A GCAGTATAAT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 0 1 22986 CASAVA_Build 5 77834293 1D CATAGTTACT A/- AAGCTATGGA 3070 hom 144 het 55 0 49 7 A 3 2 22987 CASAVA_Build 5 77834632 1I GACCATCTAC -/A ATAAATGAGC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 1 2 22988 CASAVA_Build 5 77835280 4I TCCATCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAAC 4 5 22989 CASAVA_Build 5 77840451 3I CAAGAGTCTA ---/CTC CTCTACTTCT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 CTC 1 2 22990 CASAVA_Build 5 77842685 1D CTCAGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 12 11 22991 CASAVA_Build 5 77846834 1I AGTCTTCCCA -/C CCCAACCTAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 3 4 22992 CASAVA_Build 5 77847832 1I TTTAGGGTAC -/A GTCTAAACAT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 0 1 22993 CASAVA_Build 5 77865278 1I TGTGCCAAAA -/C CCTCATCTGC 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 C 2 3 22994 CASAVA_Build 5 77869918 1I TCATTAAACA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 7 8 22995 CASAVA_Build 5 77873695 1I GTCATTAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 13 14 22996 CASAVA_Build 5 77878594 1I CTGTACTGGT -/A AAAAAAAAAA 891 het 891 ref 36 11 5 20 A 15 16 22997 CASAVA_Build 5 77888542 1D CTGGCAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2710 hom 42 7 28 7 T 12 11 22998 CASAVA_Build 5 77890112 1I TTCAGAGACA -/G GGTCTTGCTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 2 3 22999 CASAVA_Build 5 77894351 1I TCACAACTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 A 8 9 23000 CASAVA_Build 5 77899577 2D AGTGTAAAGA GT/-- GTGTTTCCTC 3070 het 3070 hom 51 24 23 6 GT 3 2 23001 CASAVA_Build 5 77918826 2I TCACATTTTC --/CA CAGTCTGCTG 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 CA 1 2 23002 CASAVA_Build 5 77922607 2D TTTTTGCCAT AA/-- AAAGTTAGCC 3070 het 3070 ref 36 21 12 5 A 5 3 23003 CASAVA_Build 5 77928397 1I AAAATACAAA -/T TCTTCCTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 1 2 23004 CASAVA_Build 5 77935275 1I CTTGGGAAAC -/A AAGCAAGACC 3070 hom 71 het 28 0 22 6 A 2 3 23005 CASAVA_Build 5 77935903 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTGGCT 2812 hom 21 het 8 0 8 0 A 4 5 23006 CASAVA_Build 5 77942488 1D GACCATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 8 A 12 11 23007 CASAVA_Build 5 77945152 5D CAGTGTCTGG AATAA/----- AATAGATGCT 3070 het 3070 ref 53 29 21 7 AATAA 1 0 23008 CASAVA_Build 5 77947711 1D TTGTTGTTTT G/- GGGGTTTTTT 3070 het 283 hom 27 3 15 9 G 5 4 23009 CASAVA_Build 5 77952549 1D CTCAAACTCC T/- TTTTTTTTTT 1311 het 652 hom 19 2 5 12 T 15 14 23010 CASAVA_Build 5 77958669 4I TCAAAAAAAC ----/AAAG AACAACAACA 3070 het 2645 hom 28 9 16 3 AAAG 0 1 23011 CASAVA_Build 5 77963515 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1723 het 1245 hom 20 5 6 9 A 15 16 23012 CASAVA_Build 5 77976829 1D GGTGTATGGG T/- TTTTTTTTTT 1516 het 1516 ref 42 30 4 8 T 12 11 23013 CASAVA_Build 5 78002074 1D GTCTCAGTTG A/- AAAAAAAAAA 1269 het 1269 ref 39 32 3 4 A 12 11 23014 CASAVA_Build 5 78040244 1D TCAACAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1552 het 88 hom 27 1 6 20 T 19 18 23015 CASAVA_Build 5 78040671 1D TGTGGTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 T 11 10 23016 CASAVA_Build 5 78080151 4D TCCATCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 69 het 25 0 23 5 AAAC 4 3 23017 CASAVA_Build 5 78080536 4D CCTTTAAATG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 87 het 34 0 30 6 AAAC 3 2 23018 CASAVA_Build 5 78080880 6I AGGTATTATT ------/ATTCTC CTTGTACAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 ATTCTC 0 1 23019 CASAVA_Build 5 78081077 2D AAACAAAAAC CA/-- CACACACACA 3070 hom 47 het 29 0 19 11 CA 10 9 23020 CASAVA_Build 5 78081851 2I TATGTGGGTG --/CT CTGTGTGTGT 2332 het 40 hom 59 1 24 34 CT 1 2 23021 CASAVA_Build 5 78082614 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 2 T 11 10 23022 CASAVA_Build 5 78086679 1D GTTTAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 25 2 12 11 A 11 10 23023 CASAVA_Build 5 78093212 2D TTCTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 23 0 12 14 T 13 11 23024 CASAVA_Build 5 78096451 1D AACTTATCTC T/- GAACAAAACT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 1 0 23025 CASAVA_Build 5 78099677 1D GTCTGTCAAT C/- CAGCAAGAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 2 1 23026 CASAVA_Build 5 78099932 13I ACATATTCTC -------------/TTTTTTTTTTTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 14 0 8 6 TTTTTTTTTTTCT 0 1 23027 CASAVA_Build 5 78100927 9D GTCAAGAGTC CCAGACCAG/--------- CCTGGCCAAC 3070 hom 48 het 21 0 16 5 CCAGACCAG 1 0 23028 CASAVA_Build 5 78101364 3I GTAGAAATCA ---/CCT CCTCCTCCTC 3070 hom 120 het 52 0 40 12 CCT 3 4 23029 CASAVA_Build 5 78101659 1I TATGAAAAAC -/A TCACTAAATT 3070 hom 98 het 38 0 32 6 A 0 1 23030 CASAVA_Build 5 78164920 17I GGACGAAGAC -----------------/AGATCAGCCTACTAGAA AGAAGTATTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AGATCAGCCTACTAGAA 0 1 23031 CASAVA_Build 5 78170723 3D GCGGCAGAGC AAG/--- AATAGAATTC 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 AAG 1 0 23032 CASAVA_Build 5 78186209 1D ACAAGGTTTT C/- TCTTGTTTCT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 C 1 0 23033 CASAVA_Build 5 78192086 1D ATCCTGAAGG A/- CTACTGCATA 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 A 1 0 23034 CASAVA_Build 5 78195491 2D ACCTAAGAAC AT/-- GTGAATTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 8 AT 1 0 23035 CASAVA_Build 5 78196690 16I AGCTCCACTA ----------------/GGGGGTGTCCTAGTAG GGACTCCGTA 3070 hom 45 het 16 0 14 2 GGGGGTGTCCTAGTAG 0 1 23036 CASAVA_Build 5 78207254 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 2928 het 2928 ref 15 7 6 2 T 11 10 23037 CASAVA_Build 5 78210143 1D ATTTTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 45 4 20 21 T 12 11 23038 CASAVA_Build 5 78210437 1D AGGAGATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 43 0 33 10 T 11 10 23039 CASAVA_Build 5 78211559 1D ACTTTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 24 1 17 7 A 12 11 23040 CASAVA_Build 5 78216127 1I GAAGTCCTCT -/C CCCCCTGGCC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 C 5 6 23041 CASAVA_Build 5 78236924 1D TATTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 1709 het 1709 ref 39 26 5 9 T 13 12 23042 CASAVA_Build 5 78239993 1I AGATTTTAAG -/A AAAAGGCTCA 3070 hom 82 het 34 0 28 6 A 4 5 23043 CASAVA_Build 5 78244701 1D TTTAATTCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2407 hom 28 8 10 10 T 15 14 23044 CASAVA_Build 5 78252973 2D ATACACACAC AT/-- ATATGTGTAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 AT 3 2 23045 CASAVA_Build 5 78257154 3D TGTATTACTA AGC/--- AAAGCACAGG 3070 het 3070 ref 46 27 16 4 AGC 1 0 23046 CASAVA_Build 5 78263262 2I GAAAACATGA --/CT CTCTACAAAA 1335 het 1335 ref 24 12 5 8 CT 2 3 23047 CASAVA_Build 5 78268061 1D AACTCCTAAG A/- AAAAAAAAAA 2642 het 2288 hom 29 9 8 12 A 13 12 23048 CASAVA_Build 5 78270862 1D TATGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1374 hom 23 6 11 6 T 13 12 23049 CASAVA_Build 5 78283777 4D AAATAGTCAA CTAT/---- CTGTTTGAAA 3070 het 3070 ref 25 12 11 4 CTAT 1 0 23050 CASAVA_Build 5 78289545 1D GTAAAGTTTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 A 8 7 23051 CASAVA_Build 5 78290417 1I CAGATGACCC -/A AAAAAACACC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 6 7 23052 CASAVA_Build 5 78290920 1D CTCAGGCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2414 hom 23 8 8 7 T 12 11 23053 CASAVA_Build 5 78291950 1D AGTATAAATG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 9 8 23054 CASAVA_Build 5 78296436 1D ACACTAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 16 12 T 11 10 23055 CASAVA_Build 5 78296871 2D GTTTTCTCAA AT/-- ATAGTTGTTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 AT 2 1 23056 CASAVA_Build 5 78297973 3D AACAACCAAA TCT/--- TCTCTGATGC 3070 het 3070 hom 48 19 25 5 TCT 2 1 23057 CASAVA_Build 5 78299253 1D CTCCGTATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1567 hom 20 6 12 2 A 16 15 23058 CASAVA_Build 5 78309347 3D GGAAGTAAAA CTT/--- CTTCTACTTG 3070 hom 153 het 54 0 51 4 CTT 2 1 23059 CASAVA_Build 5 78317666 2I CTGAAATATC --/TG TGAGTGGAAG 3070 hom 129 het 51 0 42 9 TG 1 2 23060 CASAVA_Build 5 78319756 4D AGACAGGAAC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TA 10 8 23061 CASAVA_Build 5 78325482 4I AATTTCTAAA ----/AGTT AGACAAAGGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGTT 0 1 23062 CASAVA_Build 5 78326528 6D AAATAATGTA TTACCC/------ TTTTATCATT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 TTACCC 1 0 23063 CASAVA_Build 5 78361252 1D GATGCCTAAT A/- AATGGATTAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 3 2 23064 CASAVA_Build 5 78367321 1D AGTGGTGGGC G/- GGGGGGGAAT 3070 het 1853 hom 27 5 14 8 G 8 7 23065 CASAVA_Build 5 78372503 1D ATTATAACTT C/- CCATCCCAAA 3070 het 3070 ref 67 33 29 7 C 3 2 23066 CASAVA_Build 5 78374355 1D AGTTTTTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 A 9 8 23067 CASAVA_Build 5 78400745 2D GTCAGTGTGT GC/-- TGATATGGAA 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 GC 1 0 23068 CASAVA_Build 5 78402934 4I CACCTCCTAC ----/TACA TACACAGTGA 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 TACA 1 2 23069 CASAVA_Build 5 78408271 2I ATAAAAACTG --/TC TGTCCTGCCT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 TC 0 1 23070 CASAVA_Build 5 78423964 3I AAACTTTCTT ---/GTC TTCTTCATAT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 GTC 0 1 23071 CASAVA_Build 5 78434935 3D TCCTATGAGG TTA/--- TTATATTAGA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 TTA 2 1 23072 CASAVA_Build 5 78446883 1I TGTCTCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3063 het 3024 hom 34 10 10 14 A 15 16 23073 CASAVA_Build 5 78446965 3D TTGATAGAGT AAG/--- AAGACTAGTA 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 AAG 2 1 23074 CASAVA_Build 5 78468556 6D ACACTTCATG TATATA/------ TATATATATA 1586 het 866 hom 13 4 6 3 TA 10 7 23075 CASAVA_Build 5 78488981 1I ACATCCTTTG -/T TTGCACGACT 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 T 2 3 23076 CASAVA_Build 5 78494201 1D AACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 1809 het 848 hom 19 6 7 6 A 17 16 23077 CASAVA_Build 5 78506512 2D TCTATTTTAA TC/-- TGTCTCCATA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 TC 1 0 23078 CASAVA_Build 5 78507681 1I ACCTAGTGTT -/A AAAAAAAAAA 1114 het 1114 ref 51 30 3 18 A 13 14 23079 CASAVA_Build 5 78551458 4D TTTAAAATGC AATA/---- AATATTATAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 4 AATA 2 1 23080 CASAVA_Build 5 78551551 1I TCAGATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 T 10 11 23081 CASAVA_Build 5 78552135 2D TAGAAGTAAC AT/-- ATATACCTCT 2540 het 2540 ref 21 12 7 3 AT 3 2 23082 CASAVA_Build 5 78562316 1D CCGTCGCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 A 9 8 23083 CASAVA_Build 5 78566573 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 8 9 23084 CASAVA_Build 5 78574880 2I AAAACTCAAG --/TA CCCTGCTGAA 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 TA 0 1 23085 CASAVA_Build 5 78588592 1D CACCACTGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1949 hom 18 5 11 2 T 10 9 23086 CASAVA_Build 5 78592312 1D CCCTTGAGTC T/- TTTTTTTTCT 1354 het 1354 ref 21 14 5 3 T 9 8 23087 CASAVA_Build 5 78595837 2D GCTAATTTTT TG/-- TGTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 TG 2 1 23088 CASAVA_Build 5 78599059 5I AGTTGGAATC -----/ATATA ATATATAGCC 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 ATATA 1 2 23089 CASAVA_Build 5 78605713 1I CAGCACTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 8 9 23090 CASAVA_Build 5 78615627 4I GTACAAATTA ----/CTTT CTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 CTTT 2 3 23091 CASAVA_Build 5 78617144 1D CGATTTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 704 hom 31 3 16 12 C 1 0 23092 CASAVA_Build 5 78617541 1D TGACACGCGC T/- TTTTTTCCGT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 7 6 23093 CASAVA_Build 5 78624384 1D CTTGGGGAGT G/- GGGGGGGTCC 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 G 8 7 23094 CASAVA_Build 5 78624983 1D TTTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 17 1 14 2 T 14 13 23095 CASAVA_Build 5 78625478 4D TGCAAGTAAG TCTT/---- TATTTTCAGT 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 TCTT 1 0 23096 CASAVA_Build 5 78630573 1D GTTGTCCCTG T/- ACAGCCAGTC 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 1 0 23097 CASAVA_Build 5 78648643 1I AATACGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 10 11 23098 CASAVA_Build 5 78651153 1D TTTTTTTTTT C/- TCTCTCTCTT 3070 het 170 hom 27 1 21 5 C 1 0 23099 CASAVA_Build 5 78651921 5D CCTGTGAGAG TCTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 806 hom 20 6 11 4 TCTTT 1 0 23100 CASAVA_Build 5 78659162 5D AAAAGAAAAG AAGAA/----- AAGAAACATA 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 AAGAA 2 1 23101 CASAVA_Build 5 78663002 1D AATTTTAAAG A/- TTGACGATTT 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 1 0 23102 CASAVA_Build 5 78689648 1D TCTGAGGTCC T/- TTTTTTTTTT 1218 het 1218 ref 23 18 3 2 T 13 12 23103 CASAVA_Build 5 78731665 1I TTGTCATAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 922 hom 32 2 28 2 T 9 10 23104 CASAVA_Build 5 78740391 3I AGGCCAAGGG ---/GGT GGTGGCTCAT 3070 hom 43 het 19 0 15 4 GGT 1 2 23105 CASAVA_Build 5 78761237 1I GTAGCCTTAG -/T TTTAGGCAGT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 3 4 23106 CASAVA_Build 5 78815625 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1089 het 490 hom 13 5 3 8 A 19 18 23107 CASAVA_Build 5 78831103 4I ATTTGAAAAA ----/ACTT ACAGGTTAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ACTT 0 1 23108 CASAVA_Build 5 78879922 1D AGGTGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 2279 het 2279 ref 58 41 6 12 A 11 10 23109 CASAVA_Build 5 78890371 5D GTAAAAACTG AAAAC/----- AAACAAATAA 3070 het 3070 ref 34 19 14 3 AAAAC 1 0 23110 CASAVA_Build 5 78892129 10D ATGTGCTCCT GGAATCAGGA/---------- GGAATCAGGA 3070 het 3070 ref 32 19 12 5 GGAATCAGGA 2 1 23111 CASAVA_Build 5 78921026 3I ACATGGAGAA ---/ACC CCGTCTCTAC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 ACC 0 1 23112 CASAVA_Build 5 78955359 1D GTTTTTACTG A/- AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 40 30 3 9 A 12 11 23113 CASAVA_Build 5 78967034 1I CATATTTTCC -/A AGTCATTGTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 1 2 23114 CASAVA_Build 5 78967679 1I TCGCCAACCC -/T TGCTCTAGGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 1 2 23115 CASAVA_Build 5 78982975 1D AGTAATATCC A/- AAAAAAAAAG 1561 het 1561 ref 41 32 4 7 A 10 9 23116 CASAVA_Build 5 79018713 3I CTTACTACTG ---/CTT CTTTTCTTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CTT 1 2 23117 CASAVA_Build 5 79045276 2I TTTAACTCTG --/GA GAGAGAAATG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 GA 3 4 23118 CASAVA_Build 5 79045534 1I ATGACTCAAG -/T TTATCTTGGC 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 T 2 3 23119 CASAVA_Build 5 79046873 1I ATAATAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 10 11 23120 CASAVA_Build 5 79050657 1D AGAGAACCCA T/- TTCACTTCTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 3 2 23121 CASAVA_Build 5 79054484 5D ATAAAAACTA AAAAC/----- AAAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 AAAAC 1 0 23122 CASAVA_Build 5 79055150 1I AGAACAACCT -/G GGTGACATGT 3002 het 3002 ref 24 13 7 4 G 2 3 23123 CASAVA_Build 5 79057524 2D AAATTAAAAA AG/-- AATGTTTGGT 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 AG 1 0 23124 CASAVA_Build 5 79073328 6D ATGTTTTGTT TATCTC/------ TATGAGTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 22 3 TATCTC 1 0 23125 CASAVA_Build 5 79074340 1D ATTGAGAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 12 11 23126 CASAVA_Build 5 79075156 1D AAGTCCATTC T/- TTCACTTACG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 3 2 23127 CASAVA_Build 5 79083382 1D ACAAAGCCTA G/- TGAAGAATGG 3070 het 3070 hom 54 20 25 9 G 1 0 23128 CASAVA_Build 5 79087947 2D TGCCTTGCCC CT/-- CTGTTTCCTG 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 CT 2 1 23129 CASAVA_Build 5 79091748 3I TTCTTATCAA ---/AAG ATAGTTGTTG 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 AAG 0 1 23130 CASAVA_Build 5 79091768 1D CTTGGCCTGC T/- TTTTTTTTTT 1911 het 733 hom 50 3 7 40 T 15 14 23131 CASAVA_Build 5 79100342 1I AATCAGATGA -/T TTATGTGTCT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 2 3 23132 CASAVA_Build 5 79100498 2D TCCCTGTCAC TT/-- TCAGCTACAC 2884 het 2438 hom 17 7 6 4 T 3 1 23133 CASAVA_Build 5 79102002 1I AAACCCAGGG -/C CCTGGTGGTG 3070 hom 29 het 11 0 10 1 C 2 3 23134 CASAVA_Build 5 79103701 1I CATTTGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 A 10 11 23135 CASAVA_Build 5 79121854 1I GCATCCCCCA -/T TTTTTTTTTT 2004 het 2004 ref 26 11 10 5 T 11 12 23136 CASAVA_Build 5 79127904 1I TTAACTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 11 12 23137 CASAVA_Build 5 79128435 4I CATGTCAACG ----/TTAC TTACGGATCA 3046 het 3046 ref 20 11 8 1 TTAC 1 2 23138 CASAVA_Build 5 79130807 1I AAATCTAGTG -/A AAGTATTTGG 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 2 3 23139 CASAVA_Build 5 79145916 1D CTTCCTTAAA T/- TAAGTTCTCA 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 2 1 23140 CASAVA_Build 5 79146358 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 C 5 4 23141 CASAVA_Build 5 79153185 1I ATATATACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2670 hom 36 11 15 10 T 13 14 23142 CASAVA_Build 5 79165206 1I TTATTCACCC -/T TGCCCTTGCC 3070 hom 119 het 46 0 36 10 T 1 2 23143 CASAVA_Build 5 79180198 1D AAGAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 A 11 10 23144 CASAVA_Build 5 79186977 1D TTGTCAAGAC T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 8 7 23145 CASAVA_Build 5 79188854 1D GTGGCAGGGG C/- CTGTAATCCC 3070 het 1952 hom 20 7 11 2 C 2 1 23146 CASAVA_Build 5 79191868 4D TTGATTTCTA AATT/---- AATTCAGTTA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 AATT 2 1 23147 CASAVA_Build 5 79193169 1D TCCTTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 2175 het 2175 ref 45 25 5 15 T 12 11 23148 CASAVA_Build 5 79193944 2I TCTTTGTTCC --/TT TTCATCTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 2 4 23149 CASAVA_Build 5 79194312 1I TTATTCCTTT -/A TGCAGATCCA 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 A 0 1 23150 CASAVA_Build 5 79194424 1I6M1I TTGTTTGCCT -AAAATG-/GAAAATGT TTTTTAATTT 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 N/A 0 0 23151 CASAVA_Build 5 79217284 1I AGGAACAGAC -/A ATGGGGGAAA 3070 het 3012 hom 39 10 18 11 A 1 2 23152 CASAVA_Build 5 79221402 2I CAAAGACTGA --/CC CCCCCCCAAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 7 9 23153 CASAVA_Build 5 79224088 2I AGAATCAGTC --/AG AGAGACATGG 3070 het 3070 hom 62 25 25 12 AG 2 3 23154 CASAVA_Build 5 79226550 1I AAATGCTTAA -/G GGGGGGTCAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 G 6 7 23155 CASAVA_Build 5 79230035 24D CAGATAATAC CTTCCTTATCTGCCTAGGCAGATA/------------------------ AGCATAAGGA 3070 het 3070 ref 52 29 24 4 CTTCCTTATCTGCCTAGGCAGATA 1 0 23156 CASAVA_Build 5 79240018 1D TTGAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 A 11 10 23157 CASAVA_Build 5 79252293 1D TAAAAAACCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 9 8 23158 CASAVA_Build 5 79257401 1D GTGTTGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 11 10 23159 CASAVA_Build 5 79259583 1I TGCTGTTCTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 32 1 27 4 G 0 1 23160 CASAVA_Build 5 79267547 1I GTTGCTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 A 10 11 23161 CASAVA_Build 5 79285130 1D GTCATGCAGC A/- ATCTGGCTCC 2889 het 2889 ref 16 7 6 4 A 2 1 23162 CASAVA_Build 5 79288484 2D GCCCAGGGGC CA/-- CCATCAGAAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 CA 1 0 23163 CASAVA_Build 5 79292001 1I TTGTGAAAAT -/G GTGTGCTCTT 3070 het 3070 hom 49 15 23 11 G 1 2 23164 CASAVA_Build 5 79295384 5D AAACCTAGCA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 779 hom 34 6 13 17 T 15 10 23165 CASAVA_Build 5 79298913 1I CAGGGATTGG -/A AAAGGCAAGC 3070 het 3070 ref 53 28 22 3 A 3 4 23166 CASAVA_Build 5 79315067 3I GCATTCTCTT ---/TGA TGTTATTAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 TGA 0 1 23167 CASAVA_Build 5 79320467 1I TTGTTGAATG -/A AATGAATTAC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 2 3 23168 CASAVA_Build 5 79327372 1I ATTACATTAG -/A AAAAAAAATA 1411 het 1411 ref 20 14 4 2 A 8 9 23169 CASAVA_Build 5 79327552 1I AATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1569 het 1569 ref 21 9 4 8 A 15 16 23170 CASAVA_Build 5 79329143 2I TAACTATAAC --/AT ATAAGCTATA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 AT 1 2 23171 CASAVA_Build 5 79332860 3I GAAATATTTT ---/AGG AGAAGTTTGG 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 AGG 0 1 23172 CASAVA_Build 5 79334097 1D CTCCCAGTGA C/- CCCCATGCTC 3070 het 3070 ref 50 26 15 9 C 5 4 23173 CASAVA_Build 5 79430260 1D CTGCATTTGG T/- TTTTTCAAAC 3070 het 1568 hom 25 5 13 7 T 6 5 23174 CASAVA_Build 5 79432527 1I AATTTATTCC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 A 7 8 23175 CASAVA_Build 5 79433197 6I GGAGGCTGAG ------/GCAGGA GCAGGAGAAT 2855 het 582 hom 14 4 8 2 GCAGGA 1 2 23176 CASAVA_Build 5 79434643 1D GCGACTGGAC A/- AAAAAAGGGT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 7 6 23177 CASAVA_Build 5 79440764 1I GCATTTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 907 hom 27 2 17 8 T 13 14 23178 CASAVA_Build 5 79454684 4I TTGTCATCAA ----/TTTT TTTTTCTTTG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 5 9 23179 CASAVA_Build 5 79459542 6D TAATAAATTA TAAATT/------ TAAAGATTTA 3070 het 3070 hom 20 9 11 1 TAAATT 1 0 23180 CASAVA_Build 5 79467864 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 9 8 23181 CASAVA_Build 5 79469220 1D AGACTCTAAC T/- CAAAAAAAAA 1686 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 0 23182 CASAVA_Build 5 79469284 9D ACTTTGGGAG GCTGAGGCA/--------- GGATGATTGC 3070 hom 51 het 17 0 18 1 GCTGAGGCA 1 0 23183 CASAVA_Build 5 79471176 4I AAAGAAGAAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 AG 7 9 23184 CASAVA_Build 5 79473818 1I GTAGCTGCCG -/A AAAGTCACGT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 3 4 23185 CASAVA_Build 5 79476577 1D CTGCCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2021 het 2021 ref 20 10 5 5 A 12 11 23186 CASAVA_Build 5 79480969 1I TGTTGGCAGA -/T TGACAGCCCT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 1 2 23187 CASAVA_Build 5 79484071 4D ACCCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2658 het 2658 ref 28 15 8 7 A 16 12 23188 CASAVA_Build 5 79489131 1I AAACAGGGTC -/T TGCTATGTTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 1 2 23189 CASAVA_Build 5 79493810 1I AATTTTAGGA -/T TGTTTTTCTG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 2 23190 CASAVA_Build 5 79508816 1I TCAGAGGTAC -/T TTGGACTGCG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 3 23191 CASAVA_Build 5 79510387 1I GAGTAAACAA -/T TTGGTGGGTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 3 23192 CASAVA_Build 5 79517119 1I CCAAACAGGC -/T TTGTGTGAGC 3070 hom 66 het 23 0 21 2 T 2 3 23193 CASAVA_Build 5 79522538 1I CTGGATCACC -/A AAATGCTTGG 3070 hom 96 het 37 0 31 6 A 3 4 23194 CASAVA_Build 5 79522873 1I AATAAAATCC -/A ATTCAACTTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 1 2 23195 CASAVA_Build 5 79524013 1I CCATATGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 T 13 14 23196 CASAVA_Build 5 79530346 1I GGCCAGATGG -/C CAGCTCCCTT 3070 hom 82 het 36 0 26 10 C 1 2 23197 CASAVA_Build 5 79531728 3I AGCGAGACTC ---/TTA GTAATTTCTG 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 TTA 0 1 23198 CASAVA_Build 5 79532875 1I GAGTGGTCGG -/T TTGTAAGGGG 3070 hom 63 het 27 0 19 8 T 2 3 23199 CASAVA_Build 5 79541636 5I CTCAAAAAAG -----/AAATA AAATAAAATA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 AAATA 2 3 23200 CASAVA_Build 5 79542971 1D CTGAATCAGG T/- TAAGTTCAAT 2710 het 2710 ref 25 12 7 7 T 2 1 23201 CASAVA_Build 5 79548283 1I GTTTTAAATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2388 hom 29 9 16 4 T 9 10 23202 CASAVA_Build 5 79560035 1I CTATTAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 10 11 23203 CASAVA_Build 5 79561217 1I AAAGAAAAGG -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 A 6 7 23204 CASAVA_Build 5 79562125 4D CATGTAAAAC AAAT/---- AATAATGCAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 9 AAAT 1 0 23205 CASAVA_Build 5 79562355 4D ATAATTTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 1517 het 1517 ref 33 14 6 15 TCTT 4 3 23206 CASAVA_Build 5 79562588 1I GGTTTTGCCC -/A GGCTGGTCTC 2955 het 2955 ref 34 22 7 5 A 0 1 23207 CASAVA_Build 5 79564899 1D CTACTCAGGA G/- GCTGAGACAG 3066 het 480 hom 9 1 7 1 G 2 1 23208 CASAVA_Build 5 79568921 2I TTTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTC 2715 het 2715 ref 35 14 13 8 T 9 11 23209 CASAVA_Build 5 79570364 2D ACTTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1621 het 844 hom 25 6 6 14 A 20 18 23210 CASAVA_Build 5 79570990 1I ACAATCCCCC -/T TTGTCAGCAT 3070 hom 20 het 22 0 14 9 T 2 3 23211 CASAVA_Build 5 79574083 1I9M1I AATCCCAGCA -TTTGGGAGG-/TTTTGGGAGGC CGAGGCGGGT 2158 hom 19 het 8 0 7 1 N/A 0 0 23212 CASAVA_Build 5 79577185 1I TGAATATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2575 hom 29 9 14 6 T 9 10 23213 CASAVA_Build 5 79582542 1I TGAATAAACG -/T TGTTTTTACT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 1 2 23214 CASAVA_Build 5 79600912 3I TTTCAGTTAC ---/AGA AGAACATTTA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 AGA 1 2 23215 CASAVA_Build 5 79603660 1I CGCCTGTAAT -/C CCAGCACTTT 3070 het 1784 hom 17 4 11 2 C 2 3 23216 CASAVA_Build 5 79605886 2D ATAAAGTTGT AG/-- AGAGATATTC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AG 3 2 23217 CASAVA_Build 5 79610597 1I ACTCAGGAGG -/A TAAATTGGGA 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 A 0 1 23218 CASAVA_Build 5 79618340 1D TGTCACATGC A/- AAAAAAAAAG 1936 het 1936 ref 13 9 4 0 A 10 9 23219 CASAVA_Build 5 79634800 1I TGAGCCACCG -/C CCCTGGCCAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 C 3 4 23220 CASAVA_Build 5 79636946 6D TATGATTCAT TTAAAG/------ TTAATTTTCG 3070 het 3070 ref 29 19 9 5 TTAAAG 1 0 23221 CASAVA_Build 5 79639958 3I AAGTGGTAAG ---/TTC TTCTTAGTGT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 TTC 1 2 23222 CASAVA_Build 5 79640512 1D TGGGGGCTGC T/- TTTTTTTTTT 2765 het 2469 hom 26 9 8 9 T 12 11 23223 CASAVA_Build 5 79648544 1D TTTTTTGCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 8 11 11 T 10 9 23224 CASAVA_Build 5 79649505 1I CAGTTTTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 11 12 23225 CASAVA_Build 5 79650865 1D TAAAAGAGCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 A 10 9 23226 CASAVA_Build 5 79655494 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2970 het 540 hom 18 3 9 6 A 17 16 23227 CASAVA_Build 5 79738108 2D ATTCTTGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 38 0 28 10 T 12 10 23228 CASAVA_Build 5 79740556 1D TTTCGCCTAA T/- TTCTTCCTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 3 2 23229 CASAVA_Build 5 79756042 1I TCCAAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 30 2 18 10 T 13 14 23230 CASAVA_Build 5 79761416 4I CAAAAGAGAC ----/AAAG AAAGCCATTA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AAAG 1 2 23231 CASAVA_Build 5 79771155 1D ATCAGTCCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 9 8 23232 CASAVA_Build 5 79773262 2I GGAAGCACAC --/AT GTGAATATCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AT 0 1 23233 CASAVA_Build 5 79776021 1D GACATTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 28 1 19 8 T 15 14 23234 CASAVA_Build 5 79777338 1D TTTTAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 34 1 27 7 T 13 12 23235 CASAVA_Build 5 79780706 1D TGTCAAGATC T/- TTTTTTTTTT 1351 het 1351 ref 52 38 4 10 T 11 10 23236 CASAVA_Build 5 79781843 4D AATCCTTTTT CTTA/---- CTTTATATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 5 CTTA 1 0 23237 CASAVA_Build 5 79796573 1D TGTTTATACA T/- TATGTGCCCA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 2 1 23238 CASAVA_Build 5 79801386 1I TCTCCAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 32 1 25 6 T 10 11 23239 CASAVA_Build 5 79802515 1I AGGACTGTGT -/A AAAGACAATG 3070 hom 21 het 12 0 8 5 A 3 4 23240 CASAVA_Build 5 79804149 1D TTTTAACCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 73 hom 34 1 32 1 A 10 9 23241 CASAVA_Build 5 79812008 1I AAACAGCTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 10 23242 CASAVA_Build 5 79818119 3D TAAAAAACAT AAC/--- AACAAGTACT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 AAC 2 1 23243 CASAVA_Build 5 79823749 1D CAGATAATCC T/- TTTTTTTTTT 1341 het 1341 ref 46 33 3 11 T 11 10 23244 CASAVA_Build 5 79844201 1D GATATTTTTT A/- AAAAAATCAG 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 7 6 23245 CASAVA_Build 5 79849140 13I AACCGCAGAT -------------/TTTGTTTTTCTTA TTTAAGTTTC 3070 hom 45 het 15 0 16 1 TTTGTTTTTCTTA 0 1 23246 CASAVA_Build 5 79859002 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1152 hom 22 4 13 5 A 15 14 23247 CASAVA_Build 5 79869486 5D TCAAAAACTT AATAG/----- AATAAAGACT 3070 het 3070 ref 32 19 12 3 AATAG 1 0 23248 CASAVA_Build 5 79869649 1D ATTTTATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 13 1 9 3 T 13 12 23249 CASAVA_Build 5 79870946 1I TATTTAATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 8 9 23250 CASAVA_Build 5 79880092 7D CTTTTTATTA TTATTTT/------- TTATTTTTAT 1050 het 1050 ref 17 10 4 5 TTATTTT 2 1 23251 CASAVA_Build 5 79894532 1D GAACAAACTG A/- AAAAAGCAAC 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 6 5 23252 CASAVA_Build 5 79917723 4D TCTCTCTCTC TGTT/---- TAACTGAGGT 3070 het 3070 hom 45 19 21 6 TGTT 1 0 23253 CASAVA_Build 5 79930086 4D CTTTTTCTTC TTCT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 26 0 22 4 TTCT 1 0 23254 CASAVA_Build 5 79937257 23I CCCTAGAACT -----------------------/AGATAGAAAGTCATCTCCATCAG AATTTGTGAG 3070 hom 72 het 26 0 24 4 AGATAGAAAGTCATCTCCATCAG 0 1 23255 CASAVA_Build 5 79962323 1D CATTTTTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 36 1 30 5 A 11 10 23256 CASAVA_Build 5 79978073 2I TTAGTAGATT --/CA CAGAGTCGAG 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 CA 1 2 23257 CASAVA_Build 5 79989437 2D GAGGCGTGAC TT/-- GAGAGAATTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 2 0 23258 CASAVA_Build 5 80002698 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1306 hom 28 7 13 8 A 15 14 23259 CASAVA_Build 5 80025174 4D22M8D ATATATATAA ACATACATATATACACACACACATATACACACAC/----ACATATATACACACACACATAT-------- ACACACACAC 1682 het 1682 ref 14 10 5 2 N/A 0 0 23260 CASAVA_Build 5 80030214 2I CAGGACAGAC --/AT GTGTTTTGGA 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 AT 0 1 23261 CASAVA_Build 5 80034289 1I TAATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2849 het 1948 hom 25 8 8 9 A 11 12 23262 CASAVA_Build 5 80045078 1I TTGCCACCTT -/G GGGAGGAGCA 3070 het 3070 hom 38 13 24 1 G 3 4 23263 CASAVA_Build 5 80045374 1D TGCTATTCTT A/- AGTCTGCAGT 3070 het 3070 hom 45 17 20 9 A 2 1 23264 CASAVA_Build 5 80053099 1D GTTGTTTCTG T/- TTTCCGATTG 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 T 4 3 23265 CASAVA_Build 5 80055342 1D CTTTTATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 11 10 23266 CASAVA_Build 5 80055952 5I TATAATGTAG -----/TAATA TAATATATAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 TAATA 1 2 23267 CASAVA_Build 5 80065172 2I TGTATCTAGA --/AT ATATATATAT 1434 het 1434 ref 18 9 3 6 AT 8 9 23268 CASAVA_Build 5 80071936 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 1199 het 1199 ref 28 9 9 10 T 14 15 23269 CASAVA_Build 5 80073393 1D TATCATGTAG T/- TTTTTGGAAA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 T 6 5 23270 CASAVA_Build 5 80073519 5I TTCAGGTTAT -----/AAAAC AGGTTTCTGG 3070 hom 77 het 34 0 25 9 AAAAC 0 1 23271 CASAVA_Build 5 80073579 1I GCAAACTTTC -/T TTTTTTTTTT 1930 het 1930 ref 31 10 7 14 T 13 14 23272 CASAVA_Build 5 80076484 1I GATAGCCAGA -/G GGGAGTTCAT 3070 het 3070 ref 43 22 10 11 G 3 4 23273 CASAVA_Build 5 80082116 1D GAATCGTCTA T/- TCAGACCTTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 2 1 23274 CASAVA_Build 5 80098789 4D TTTTTCACTA TTTG/---- TTAGTCTATT 3070 het 3070 ref 34 18 16 1 TTTG 1 0 23275 CASAVA_Build 5 80101846 1D TTCTACTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1583 hom 34 9 11 14 T 17 16 23276 CASAVA_Build 5 80108897 1D GTACTTTAGA T/- TTGAGTATTG 3070 het 3070 hom 41 17 17 8 T 3 2 23277 CASAVA_Build 5 80112468 1D CTTAAACAGT A/- AAAATTCAGT 3070 het 3070 ref 27 11 12 6 A 5 4 23278 CASAVA_Build 5 80113054 2D TACCAAGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1260 het 1260 ref 43 23 4 16 T 16 14 23279 CASAVA_Build 5 80113929 1D ACATACAGGC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 9 8 23280 CASAVA_Build 5 80118664 5D AATGGGGTTA ATGAG/----- ATGAGATAGA 3070 hom 123 het 44 0 42 4 ATGAG 2 1 23281 CASAVA_Build 5 80124218 2D TCGTACAAAC AG/-- AGTACTGAAA 3070 het 3070 ref 20 13 7 1 AG 2 1 23282 CASAVA_Build 5 80129941 2I GTAAAGATGA --/GG ACAGATTTCC 3070 hom 135 het 53 0 46 7 G 0 2 23283 CASAVA_Build 5 80134657 2D TCTTTTGGGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AT 6 5 23284 CASAVA_Build 5 80140958 3D ACACTGTCAA ATT/--- ATTGATTCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 ATT 2 1 23285 CASAVA_Build 5 80141954 8D ATACATACAA ACAATATT/-------- ACAGTGAACA 3070 het 5 hom 28 1 14 16 ACAATATT 1 0 23286 CASAVA_Build 5 80142608 1D ATTTCAAGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 10 9 23287 CASAVA_Build 5 80145705 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 14 1 11 2 A 13 12 23288 CASAVA_Build 5 80146068 1I GCTAGTCTTG -/A ACTCCTGACC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 1 2 23289 CASAVA_Build 5 80147869 2I CTGTGATCCT --/GG GATATGATCT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 G 1 3 23290 CASAVA_Build 5 80149945 1D ATGACTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 24 2 17 5 T 13 12 23291 CASAVA_Build 5 80157158 1D GTGCACACAA G/- GGAGTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 G 3 2 23292 CASAVA_Build 5 80158420 1D CACCGCGCCC G/- GCCTCCAGAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 G 2 1 23293 CASAVA_Build 5 80165450 1I AGAATGGTAT -/C CAAAGACTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 2 23294 CASAVA_Build 5 80166214 4D TACTTAATAA AAAT/---- AAATACTTAA 3070 hom 21 het 10 0 8 3 AAAT 2 1 23295 CASAVA_Build 5 80169152 1I GACCTTGTCT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 7 8 23296 CASAVA_Build 5 80176303 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1266 hom 23 3 16 4 T 9 10 23297 CASAVA_Build 5 80188465 1D TCCCCATCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 10 9 23298 CASAVA_Build 5 80191687 2D GTACATAAGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 82 het 37 0 30 8 AT 7 6 23299 CASAVA_Build 5 80192019 1I AGGTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 2629 het 451 hom 29 2 15 12 T 15 16 23300 CASAVA_Build 5 80196353 4D AAAATTTAAA AATG/---- AAATAACATT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AATG 1 0 23301 CASAVA_Build 5 80215058 1D TTTAGGTTCA G/- GGGTACATGT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 G 4 3 23302 CASAVA_Build 5 80218674 27D TGACCCTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGTG/--------------------------- AACTTGTCCT 1859 het 1859 ref 29 20 5 8 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAATAGGTG 1 0 23303 CASAVA_Build 5 80240082 4D ATAATAATTC TGTA/---- TGTATGCAGC 3070 het 3070 hom 31 13 17 3 TGTA 2 1 23304 CASAVA_Build 5 80257952 1D ATTTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 972 hom 22 6 9 7 T 12 11 23305 CASAVA_Build 5 80261533 19D GGAGGGCGCT TGAGCCCTGGAGGTTGAGG/------------------- TGAGCCCTGG 3070 hom 73 het 25 0 23 7 TGAGCCCTGGAGGTTGAGG 2 1 23306 CASAVA_Build 5 80272170 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTGAGA 3070 het 2420 hom 22 6 12 4 T 7 6 23307 CASAVA_Build 5 80280088 1I CAGTCTGAGC -/A AAGGTCTGCA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 A 2 3 23308 CASAVA_Build 5 80290677 1D GGGTTGGGGC G/- GGGGGGTGGC 3070 het 1707 hom 23 6 11 7 G 7 6 23309 CASAVA_Build 5 80290895 1I TCCGAAAGAA -/C CTTCGGCATC 3070 hom 144 het 55 0 48 7 C 1 2 23310 CASAVA_Build 5 80302119 1I TCCTCATAGG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 51 18 21 12 T 7 8 23311 CASAVA_Build 5 80306251 1D CCTTCCCACC T/- TGTGAGTTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 2 1 23312 CASAVA_Build 5 80310371 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 478 hom 21 2 13 6 A 9 10 23313 CASAVA_Build 5 80314022 1D CCTGTAGGAA G/- AAGGAAGAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 0 23314 CASAVA_Build 5 80339715 13D CTTTCTTTCC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 1437 het 700 hom 23 6 8 9 T 29 16 23315 CASAVA_Build 5 80341729 1D ATTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 13 12 23316 CASAVA_Build 5 80343328 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3037 hom 25 9 14 2 A 13 12 23317 CASAVA_Build 5 80347252 3D TCCTTTTATA TTG/--- TTGTTGCTTC 3070 het 3070 ref 36 16 16 6 TTG 3 2 23318 CASAVA_Build 5 80352948 1D AAGACCTCCT C/- CCCCACTGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 5 4 23319 CASAVA_Build 5 80355143 1I CAGTGTTTGA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 T 7 8 23320 CASAVA_Build 5 80357474 1D TGGTAACCTG T/- TTGTATGTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 3 2 23321 CASAVA_Build 5 80367199 1I AAACAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2620 hom 22 7 10 5 A 10 11 23322 CASAVA_Build 5 80369986 1D TGAACTGTTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 T 9 8 23323 CASAVA_Build 5 80378717 1I GTTTGTGGGC -/A AAAGATGATG 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 A 3 4 23324 CASAVA_Build 5 80379933 1D TAATTCAACA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 8 7 23325 CASAVA_Build 5 80392026 1I GTAACCTCTG -/C CCCCCCTACT 3070 hom 82 het 32 0 24 8 C 6 7 23326 CASAVA_Build 5 80399966 2D GATAATGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 81 hom 46 3 18 25 T 16 14 23327 CASAVA_Build 5 80403275 1I GATTAATTAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 7 8 23328 CASAVA_Build 5 80411091 1I AGGAGAAAGC -/A AATGATGTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 3 23329 CASAVA_Build 5 80424580 1I CCAAGCACTT -/A ACAAGTTATT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 1 2 23330 CASAVA_Build 5 80427058 1I AAAATTAGGG -/A ACAGAATTTT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 1 2 23331 CASAVA_Build 5 80428545 1D TTTGTTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1898 hom 24 6 11 7 T 10 9 23332 CASAVA_Build 5 80435308 2D TTGAAAAATT AA/-- AAGATAGGAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 A 4 2 23333 CASAVA_Build 5 80468510 1I CGTGTCTGTG -/T TTTTTTTATG 3070 hom 126 het 52 0 40 12 T 7 8 23334 CASAVA_Build 5 80469647 1I AACTTGGGGC -/T TCCCTAAGTA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 1 2 23335 CASAVA_Build 5 80470342 1D GATGTGCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 47 0 40 8 T 12 11 23336 CASAVA_Build 5 80470961 4D CGCCTTTCAT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 39 het 30 0 13 17 TTTC 5 4 23337 CASAVA_Build 5 80472566 1I TTTTCTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 34 1 24 9 T 11 12 23338 CASAVA_Build 5 80475465 1D AATGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 29 1 20 8 A 15 14 23339 CASAVA_Build 5 80476908 1D TGGAACCTTG T/- TATTTGGGTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 2 1 23340 CASAVA_Build 5 80496032 1I ACGTTTGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 36 1 30 5 A 12 13 23341 CASAVA_Build 5 80497486 1I ACTCCTGGTG -/A CTTGACTCTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 23342 CASAVA_Build 5 80498236 1D GGGGAAGGAT G/- GGGGAGGGAC 3070 hom 86 het 34 0 26 8 G 5 4 23343 CASAVA_Build 5 80501564 9D TCACCCATAC CACCTGCAT/--------- CACCTGCATC 3070 het 395 hom 48 7 24 22 CACCTGCAT 2 1 23344 CASAVA_Build 5 80522513 3D ACTTCGATAG CTT/--- CTTATCTCTG 3070 het 3070 hom 42 18 19 8 CTT 2 1 23345 CASAVA_Build 5 80523247 1I ACAGCATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 9 10 23346 CASAVA_Build 5 80531944 3D GACTTACAGG TTC/--- TTCTTATTAA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 TTC 2 1 23347 CASAVA_Build 5 80533558 1I TATGGGGGAT -/G TGTATAAGGT 3070 het 3070 hom 65 26 32 7 G 0 1 23348 CASAVA_Build 5 80537821 4I GAGAGCTGAA ----/TAAC TAACATGTAT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 TAAC 1 2 23349 CASAVA_Build 5 80540249 1D GCCTCAGCCT C/- CCGAGTAGCT 3070 het 1648 hom 12 4 7 1 C 3 2 23350 CASAVA_Build 5 80544926 10D GGCGAGGGGG AAAGGGCCTC/---------- AAAGGGCCTC 3070 het 3070 ref 36 20 13 8 AAAGGGCCTC 2 1 23351 CASAVA_Build 5 80551048 1D AGGCCACATA T/- TGCCAGCTGT 3070 het 3070 ref 40 23 13 6 T 2 1 23352 CASAVA_Build 5 80551500 1D TAGTCTGATT A/- AAAAAAAAAA 1484 het 1484 ref 39 20 6 13 A 17 16 23353 CASAVA_Build 5 80554470 1D AATCCAAGAG A/- AAAATCTAAG 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 A 5 4 23354 CASAVA_Build 5 80554956 1D GTGGCTCACG C/- CTGTAATCCC 2083 het 689 hom 11 3 5 3 C 2 1 23355 CASAVA_Build 5 80562253 1D GTTGAGGGAA G/- GGGGGGTTCG 3070 het 3070 hom 41 17 18 7 G 7 6 23356 CASAVA_Build 5 80565685 4D GCTTGCTTGC TTGG/---- TTGGTTGTCC 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 TTGG 2 1 23357 CASAVA_Build 5 80569090 1D AGACTCATTC A/- AAAAAGGTGG 2867 het 2867 ref 26 15 7 4 A 6 5 23358 CASAVA_Build 5 80573535 2I CAGAACCCCT --/AA AAAAAAAAAA 2696 het 2175 hom 37 10 10 17 A 14 16 23359 CASAVA_Build 5 80581227 9I ATGTTTTCTC ---------/CATTTTCTG CATTTCAGGC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 CATTTTCTG 0 1 23360 CASAVA_Build 5 80587397 1I TTAAACTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2691 hom 29 10 12 7 A 14 15 23361 CASAVA_Build 5 80598199 5D GAAATTAAAT TAATA/----- TAATAAGCAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 TAATA 2 1 23362 CASAVA_Build 5 80606951 1D ATCATGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 A 12 11 23363 CASAVA_Build 5 80617798 1D ACATCTCTGT C/- GAGTTACAAC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 C 1 0 23364 CASAVA_Build 5 80618738 1D TAAAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 20 6 T 12 11 23365 CASAVA_Build 5 80621266 2I CAATAACAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1187 hom 23 8 12 3 A 14 16 23366 CASAVA_Build 5 80627714 16D8M1I TATATAAGAT AATAGATATATCTATAATATATAG-/----------------ATATATAGA TATATATCTT 1461 het 495 hom 6 1 3 2 N/A 0 0 23367 CASAVA_Build 5 80634863 1D TGATCCACCT G/- GCCTTGGCCT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 G 2 1 23368 CASAVA_Build 5 80643519 2I GAAAGAGCAC --/TT TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 T 8 10 23369 CASAVA_Build 5 80646394 1I CTGAGACTTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 6 7 23370 CASAVA_Build 5 80650067 2D TTTTCAAGTT TA/-- TTTTCTCTTG 3070 het 3070 ref 40 23 16 4 TA 1 0 23371 CASAVA_Build 5 80651539 4D GAGTAAACAC AGAG/---- AGAGAAATTA 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 AG 4 2 23372 CASAVA_Build 5 80654044 1I AAAAATAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 13 1 9 3 A 10 11 23373 CASAVA_Build 5 80658735 2D TATATGTGAT TA/-- TATATATGTG 1525 het 1525 ref 20 9 8 3 TA 4 3 23374 CASAVA_Build 5 80661413 4I TAAATGACAC ----/AAGT AAAGTTGTTC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 AAGT 0 1 23375 CASAVA_Build 5 80664639 1D GTGAGATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2381 hom 33 10 11 12 A 15 14 23376 CASAVA_Build 5 80696428 1D GTACCATAAC T/- TTTTTTAGCC 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 T 7 6 23377 CASAVA_Build 5 80700730 1D TTCTAAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 13 12 23378 CASAVA_Build 5 80724326 1D AAATCCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 16 8 A 12 11 23379 CASAVA_Build 5 80726665 3I TGGAAAATGC ---/CTT CTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 CTT 1 2 23380 CASAVA_Build 5 80735350 1I CTCACCTTTT -/C CAAGTCCTTG 3070 het 2928 hom 29 8 18 3 C 1 2 23381 CASAVA_Build 5 80736615 1D TCTCTGTGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 9 8 23382 CASAVA_Build 5 80746400 4D AATGAAAAGT AGTC/---- AAAGGAAATA 3070 het 3070 hom 45 19 20 9 AGTC 1 0 23383 CASAVA_Build 5 80762297 2D TATACTCTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 11 21 8 TG 6 5 23384 CASAVA_Build 5 80763171 1I TTCTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2877 het 2877 ref 25 11 9 5 T 11 12 23385 CASAVA_Build 5 80771743 2D CTTCTGAGAC TG/-- TGTCCACAGA 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 TG 2 1 23386 CASAVA_Build 5 80773093 11D GTTGTATGGT GCAGAATATTG/----------- GCAGAATATT 3070 het 3070 ref 37 21 12 9 GCAGAATATTG 2 1 23387 CASAVA_Build 5 80783419 1I TTTCTTTCAA -/T TTTTTTGCCC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 6 7 23388 CASAVA_Build 5 80783644 3D AAAGACAAAG AGA/--- AGAACTGCTA 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 AGA 2 1 23389 CASAVA_Build 5 80786739 1I TTTAACGTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 9 10 23390 CASAVA_Build 5 80787926 1I TATTTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 11 14 14 T 15 16 23391 CASAVA_Build 5 80793168 1I GTTGCCTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 9 10 23392 CASAVA_Build 5 80801875 5D CTGGTTTCAT ATATG/----- ATATTAGAAA 3070 het 3070 hom 37 12 22 4 ATATG 1 0 23393 CASAVA_Build 5 80828309 3I CATCCTCCTC ---/CTT ATTTTATGTA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 CTT 0 1 23394 CASAVA_Build 5 80836726 1I CCATCACCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 9 10 23395 CASAVA_Build 5 80847258 1D TAATTGCTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 10 9 23396 CASAVA_Build 5 80848946 1D AAATTTCAAG T/- TTTTTTTTTT 1453 het 1453 ref 38 22 4 12 T 17 16 23397 CASAVA_Build 5 80853095 1I GACACTCATC -/A AAACTATAGT 3070 het 3064 hom 34 7 20 7 A 3 4 23398 CASAVA_Build 5 80872507 2D AGAAAGTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 9 A 12 10 23399 CASAVA_Build 5 80873051 1I ATCCTAAGTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 A 8 9 23400 CASAVA_Build 5 80874206 8D GAACAAAGTC ATGGTGAT/-------- ATGGTTTGGT 3070 het 3070 ref 45 28 13 7 ATGGTGAT 1 0 23401 CASAVA_Build 5 80878518 1D GAATTCTCTT A/- AGAATACACG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 2 1 23402 CASAVA_Build 5 80879046 1D GGAGAAAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 T 10 9 23403 CASAVA_Build 5 80888951 1I TCTAAGTTTA -/T TAGTTTGCCT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 1 2 23404 CASAVA_Build 5 80890073 16D AGGTGCTACT TGAATAAATATGAACA/---------------- TGAATAAATA 3070 het 3070 ref 53 28 23 15 TGAATAAATATGAACA 2 1 23405 CASAVA_Build 5 80902272 1I ATAATTAAAA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 6 7 23406 CASAVA_Build 5 80930021 2I GTTCCCTACT --/AC ACACCCTGTC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 AC 2 3 23407 CASAVA_Build 5 80936763 2D AGTTCTTATG CT/-- CTTATTCTTG 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 CT 2 1 23408 CASAVA_Build 5 80944842 1D CAAATACTGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 8 7 23409 CASAVA_Build 5 80954629 4I ACCCGTAGAT ----/AAAC AAGGATACAG 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 AAAC 0 1 23410 CASAVA_Build 5 80978187 1D TACATTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1088 hom 26 8 10 8 T 17 16 23411 CASAVA_Build 5 80993092 1D CACTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 11 10 23412 CASAVA_Build 5 80995262 1I TCTGTCAACC -/A TGACCATAAT 3070 het 3070 ref 47 27 19 1 A 0 1 23413 CASAVA_Build 5 80995705 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2794 het 1925 hom 20 6 10 4 T 11 12 23414 CASAVA_Build 5 81001545 2D GCAGAAGTAT AG/-- AGAGACAGTA 3070 het 3070 hom 53 22 27 4 AG 3 2 23415 CASAVA_Build 5 81003838 2D AATTGAAAAG AT/-- ATTCATCTAC 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 AT 2 1 23416 CASAVA_Build 5 81004314 1I ATCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2384 het 1284 hom 10 3 6 1 T 7 8 23417 CASAVA_Build 5 81009936 1D GTCCCAACTG A/- AAAGCAGAAG 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 4 3 23418 CASAVA_Build 5 81011532 1D AAAAAGGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 16 11 A 15 14 23419 CASAVA_Build 5 81040248 1D ACTCTCCCTG A/- AAAATCCTTC 3070 hom 143 het 54 0 48 6 A 5 4 23420 CASAVA_Build 5 81059125 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 11 12 23421 CASAVA_Build 5 81059724 6D AGTCTAAGTT TTATTC/------ TAAAGGTAAT 3070 het 3070 hom 52 23 26 6 TTATTC 1 0 23422 CASAVA_Build 5 81076187 1I TTAAAACTAG -/A AAAAAAAAAA 2827 het 2518 hom 26 9 8 9 A 11 12 23423 CASAVA_Build 5 81104589 1D ATCTTTTGGG T/- TGGGGGGTGG 3070 hom 89 het 37 0 30 7 T 2 1 23424 CASAVA_Build 5 81114377 1I TACACTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1154 hom 35 3 20 12 T 13 14 23425 CASAVA_Build 5 81124649 1D AACTAGATTC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 A 1 0 23426 CASAVA_Build 5 81128442 2D AGACCTTTAC TT/-- TTTTCAAGAT 3070 het 3070 ref 51 26 17 11 T 6 4 23427 CASAVA_Build 5 81154634 1D AGTAGCAAGA T/- TTATCGCAAA 2365 het 2365 ref 16 9 6 2 T 3 2 23428 CASAVA_Build 5 81189774 1I ATGTGCTGAA -/C CCACTGCAGC 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 C 2 3 23429 CASAVA_Build 5 81196140 2D TTGTAGCAGA TG/-- CTGATGGCCA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 TG 1 0 23430 CASAVA_Build 5 81196333 1D AGTTATCTAT A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 33 20 13 1 A 6 5 23431 CASAVA_Build 5 81208792 1D TTCCCTCCAA C/- AAAACATCAA 2300 het 2300 ref 28 18 6 4 C 1 0 23432 CASAVA_Build 5 81216383 1D GTAATAGTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 9 8 23433 CASAVA_Build 5 81218020 10D ATATAAAAGC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 het 1593 hom 27 5 18 6 AT 12 7 23434 CASAVA_Build 5 81221501 1D GTGGCAGTTT C/- CCCTGCACTC 3070 het 3070 hom 35 13 16 7 C 4 3 23435 CASAVA_Build 5 81234260 1D AACTATTCTG A/- AAAAAAGAGG 3070 het 3070 hom 47 17 25 6 A 7 6 23436 CASAVA_Build 5 81241576 4D ATATATATGT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 22 het 37 1 21 16 AC 10 8 23437 CASAVA_Build 5 81248432 4D TTTATCAGAG TTCT/---- TTGTTGTAAC 3070 hom 93 het 36 0 31 6 TTCT 1 0 23438 CASAVA_Build 5 81251636 1I TTTTGGTCAA -/T TTTTGATGGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 4 5 23439 CASAVA_Build 5 81258706 2D GTCCCATGAA AC/-- ACACATCTCA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 AC 3 2 23440 CASAVA_Build 5 81260021 1D GGTGTTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 784 hom 22 5 11 6 T 13 12 23441 CASAVA_Build 5 81270944 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2853 het 1156 hom 30 10 8 12 A 18 16 23442 CASAVA_Build 5 81292440 1I CCCCCCACCC -/T CAACACTCCT 3070 het 391 hom 24 3 16 5 T 0 1 23443 CASAVA_Build 5 81292544 5D ATTTTGTTGT TTTTA/----- TTTTATTTTA 2504 het 2504 ref 18 8 7 3 TTTTA 3 2 23444 CASAVA_Build 5 81299866 1I ATCCAGGTGC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 8 9 23445 CASAVA_Build 5 81307258 1D CCCCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 A 11 10 23446 CASAVA_Build 5 81311422 1I ATTTTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 882 hom 29 2 18 9 T 11 12 23447 CASAVA_Build 5 81314120 1D AGATTCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2823 hom 26 10 14 2 T 12 11 23448 CASAVA_Build 5 81324483 1I TGGAGCTATA -/C CAGAATAAGA 3070 het 3070 hom 29 8 19 2 C 1 2 23449 CASAVA_Build 5 81340108 4D ATTATCAAAA CTAT/---- CTGAGAAGGA 3070 het 3070 hom 39 16 23 2 CTAT 1 0 23450 CASAVA_Build 5 81354633 1D TCTCAATGCT C/- CCCCCCTGCC 3070 het 2064 hom 15 6 8 1 C 7 6 23451 CASAVA_Build 5 81355872 4I AGGGTAGAGG ----/TAGA TAGATATTTG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 TAGA 1 2 23452 CASAVA_Build 5 81362555 1I TTTACCTCAC -/A AATCATTATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 2 3 23453 CASAVA_Build 5 81362916 1D GGTTAATTAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 49 23 17 10 A 9 8 23454 CASAVA_Build 5 81364915 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2735 het 427 hom 30 5 11 14 T 15 16 23455 CASAVA_Build 5 81385047 1I TAAGAATTCG -/T TTGCATGCCG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 2 3 23456 CASAVA_Build 5 81391233 2I AAAGAGGTGA --/CT ATTTTTGTGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 CT 0 1 23457 CASAVA_Build 5 81421638 1I CAAATGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 12 13 23458 CASAVA_Build 5 81430948 4I GTATAATTAT ----/TAAG TGAGAAAATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TAAG 0 1 23459 CASAVA_Build 5 81434443 1I GCCTCATTTT -/G CACCCAATTT 3070 het 3070 ref 54 28 24 2 G 0 1 23460 CASAVA_Build 5 81449794 1D TAATTAATAG A/- AAAAATTAAT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 6 5 23461 CASAVA_Build 5 81459810 2D GTCTTGACTC TT/-- TATCCAATAT 3070 het 1963 hom 15 4 10 1 T 3 1 23462 CASAVA_Build 5 81472667 3D ACTGCGGAAG GCC/--- GCAGGGTCCT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 GCC 1 0 23463 CASAVA_Build 5 81476303 1D TGTCAAGCAT A/- TGGTCTATCA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 1 0 23464 CASAVA_Build 5 81479070 1D AAGTTAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3053 hom 30 8 17 6 A 10 9 23465 CASAVA_Build 5 81480952 1D TTTACACTCA C/- ATCAAAGTCA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 C 1 0 23466 CASAVA_Build 5 81481622 4I GGAACTGAAA ----/TAAT TAATTATGTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAAT 1 2 23467 CASAVA_Build 5 81483426 1I AAAACCTCTT -/A ACAGCTAGAG 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 A 1 2 23468 CASAVA_Build 5 81514696 1D GTAAGGACTC A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 8 7 23469 CASAVA_Build 5 81539835 1D CTAACTATTC T/- TTTTTTTTTT 2804 het 2804 ref 29 12 8 10 T 11 10 23470 CASAVA_Build 5 81551148 2D TGCTGAGGCT TA/-- TATGTTGCTT 3070 het 3070 ref 49 22 20 9 TA 2 1 23471 CASAVA_Build 5 81564338 1D GCAGCCAACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 T 9 8 23472 CASAVA_Build 5 81577505 2D GATGCTTCTG AC/-- ACATTGCTAG 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 AC 2 1 23473 CASAVA_Build 5 81578493 1D AAGAATGTAG T/- AATTCTTGGT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 0 23474 CASAVA_Build 5 81590061 1D TGTAACAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 492 hom 31 3 18 10 T 19 18 23475 CASAVA_Build 5 81590256 4D GAGATGAGGT CTCA/---- CTATGTTGCC 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 CTCA 1 0 23476 CASAVA_Build 5 81590560 2D ATATGAAATC TG/-- TGTGTGTGTG 2332 het 901 hom 12 2 7 3 TG 7 6 23477 CASAVA_Build 5 81593005 1D TTTAATGTTC T/- TTGAAAATAC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 3 2 23478 CASAVA_Build 5 81598342 2D AACAATGCAT GA/-- GAGATGCAGT 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 GA 3 2 23479 CASAVA_Build 5 81607023 1D TCATGAGAAG A/- TACTGAAAAC 3070 hom 135 het 51 0 44 7 A 1 0 23480 CASAVA_Build 5 81610128 1D ATTTGCATGG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 65 het 26 0 21 5 T 8 7 23481 CASAVA_Build 5 81617731 1D CTCAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 34 1 29 4 A 11 10 23482 CASAVA_Build 5 81668450 11I CATGAAATCA -----------/AATAGTTTGGG AATAGTGTGG 3070 hom 120 het 42 0 41 3 AATAGTTTGGG 0 1 23483 CASAVA_Build 5 81683524 3I CATTCCCTCA ---/TCT TCTTTCTGTT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TCT 1 2 23484 CASAVA_Build 5 81685636 1D TTTTGGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 34 0 21 13 T 12 11 23485 CASAVA_Build 5 81692182 2I AAACCATAGA --/CT CTTACTCATT 3070 hom 149 het 52 0 50 2 CT 1 2 23486 CASAVA_Build 5 81723753 1I TAATGTCCAT -/C TTAAAATTAA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 C 0 1 23487 CASAVA_Build 5 81724847 1I GCAAAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 789 hom 35 3 20 12 A 13 14 23488 CASAVA_Build 5 81727901 1I GAATGGGGGC -/G GGGGGGCACA 3070 hom 58 het 25 0 16 9 G 6 7 23489 CASAVA_Build 5 81740648 3I GCAATTAGGT ---/ATC ATCAGTCTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ATC 1 2 23490 CASAVA_Build 5 81752286 1D AAGGAGAAGT A/- AAAAACTAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 11 A 6 5 23491 CASAVA_Build 5 81752911 1I TCATCAGTCA -/T TTGCTTCATG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 3 23492 CASAVA_Build 5 81753128 4D AGTCTTCTTG ACAC/---- ACACTGCCAT 3070 hom 90 het 34 0 30 5 AC 4 2 23493 CASAVA_Build 5 81754983 1I CTGGCTAATC -/T TTTTTTTTGT 848 hom 7 het 4 0 3 1 T 8 9 23494 CASAVA_Build 5 81756610 13I ACAGTTCCCC -------------/AGGTTGTACACGA AGCATGGCAG 3070 hom 57 het 20 0 19 1 AGGTTGTACACGA 0 1 23495 CASAVA_Build 5 81757135 3I GAGAAGGAGA ---/AGG AGGAGAAGGA 779 het 51 hom 18 1 7 10 AGG 1 2 23496 CASAVA_Build 5 81758032 1D AGATTTATTG A/- ATGTTGGATT 3070 hom 169 het 63 0 54 11 A 2 1 23497 CASAVA_Build 5 81760974 1D TTGGTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 409 het 409 ref 12 6 1 5 T 12 11 23498 CASAVA_Build 5 81768519 1I TGTAATTCAC -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 7 8 23499 CASAVA_Build 5 81769007 1I CTCTTTTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 8 9 23500 CASAVA_Build 5 81770176 2I GCTTGAAGAC --/TT TTATCTGGCC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 2 4 23501 CASAVA_Build 5 81770731 1I TTTTTTTTTT -/A TTTAAAAAAA 3070 het 17 hom 24 1 21 2 A 0 1 23502 CASAVA_Build 5 81780536 2I GAGAATTAAA --/AT AATACGTATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AT 0 1 23503 CASAVA_Build 5 81794698 1I ACAGGACCTG -/A AAAAAACTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 7 23504 CASAVA_Build 5 81799569 1D CGTCATCAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 123 het 49 0 40 11 A 9 8 23505 CASAVA_Build 5 81803898 1D TTTCTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 19 0 14 5 T 12 11 23506 CASAVA_Build 5 81814011 4I AAAAAATATC ----/TATT TGAAAAATAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TATT 0 1 23507 CASAVA_Build 5 81830714 4D CAATGGAAAG AAAT/---- GCACTAGTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 7 AAAT 1 0 23508 CASAVA_Build 5 81840798 5D TTACAATACC TAATA/----- TAATATAAAT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 TAATA 2 1 23509 CASAVA_Build 5 81889101 3D GGTAGTACTA GTT/--- GTGTTGGACT 3070 hom 102 het 36 0 34 5 GTT 1 0 23510 CASAVA_Build 5 81897149 3I TAAGAATGAC ---/AAT AAAATGATAC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 AAT 0 1 23511 CASAVA_Build 5 81903359 1D TAAAAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 11 10 23512 CASAVA_Build 5 81907985 17D GCTCACAGGA GTTCTTTCAGGGCCTAT/----------------- GTCTAAGACT 3070 hom 84 het 29 0 29 4 GTTCTTTCAGGGCCTAT 1 0 23513 CASAVA_Build 5 81913101 20D GTTTATTGAT TTGCATATGGTGAACCAGCC/-------------------- TTGCATCCTG 3070 hom 45 het 15 0 16 3 TTGCATATGGTGAACCAGCC 1 0 23514 CASAVA_Build 5 81914704 1D TTTGCACATG A/- GGTGGCTCTT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 1 0 23515 CASAVA_Build 5 81928788 1I AAGTGCCAAT -/A AAAAATGAAA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 5 6 23516 CASAVA_Build 5 81930957 1I TGAAATAAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 8 23517 CASAVA_Build 5 81939417 1D CCTGAATTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 10 9 23518 CASAVA_Build 5 81950764 1I GCAACACAGG -/T TTTTTTTTTT 2394 het 2394 ref 43 9 17 17 T 15 16 23519 CASAVA_Build 5 81972476 2I AAAATTTAGA --/CT CTCTTATAAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 CT 2 3 23520 CASAVA_Build 5 81984778 1D TAGTTTGAGG T/- CTTAAATTTA 3070 het 3070 ref 34 23 9 2 T 1 0 23521 CASAVA_Build 5 82004438 1I AAGCACTCAC -/A CAATTCCTAA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 0 1 23522 CASAVA_Build 5 82023432 26I GTGATAAATA --------------------------/ATGTGAGCTAATTTTATTGTTTCTTT ATGCTTGCTC 3070 hom 87 het 28 0 30 1 ATGTGAGCTAATTTTATTGTTTCTTT 0 1 23523 CASAVA_Build 5 82025582 1D AAAAAGTACG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 52 27 16 9 A 8 7 23524 CASAVA_Build 5 82027159 10D TGTGTATTAA TACATATTTG/---------- TACATATTTG 3070 het 3070 ref 32 18 12 6 TACATATTTG 2 1 23525 CASAVA_Build 5 82027710 1D GGGAAAAAAA G/- TCTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 G 1 0 23526 CASAVA_Build 5 82028592 4D ATAATTTAAA CAAT/---- CAGTTTGTAG 3070 het 3070 ref 50 24 23 5 CAAT 1 0 23527 CASAVA_Build 5 82031602 2I CACACACACA --/CG CGCGCGCACA 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 CG 3 4 23528 CASAVA_Build 5 82031685 3I GAAAGGAAAA ---/AGG AGGATTCGTT 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 AGG 1 2 23529 CASAVA_Build 5 82041679 1D CCCTAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 11 10 23530 CASAVA_Build 5 82050075 1I GTCTTACGAC -/A AAAAATGTGT 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 A 5 6 23531 CASAVA_Build 5 82052243 1I GAAACAAACT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 23532 CASAVA_Build 5 82056961 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAAACTTA 3070 het 483 hom 24 9 14 2 C 1 0 23533 CASAVA_Build 5 82058847 13I GGCACAGCAT -------------/AGAGGCACCACAA AGGGCTTTCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AGAGGCACCACAA 0 1 23534 CASAVA_Build 5 82075525 2D ATATAGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 TA 6 5 23535 CASAVA_Build 5 82084519 1D AGCACCATAC T/- GTTTTCCAAA 3070 het 3070 ref 48 27 18 4 T 1 0 23536 CASAVA_Build 5 82085811 1D AAAGATCTAC A/- ATGTGGTGTA 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 A 2 1 23537 CASAVA_Build 5 82091488 1D TTCTCTTTTT A/- AAAAATATAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 5 23538 CASAVA_Build 5 82097283 2D GGAAGGAAAG GA/-- GAGAGAGTTC 3070 het 3070 hom 51 17 28 7 GA 4 3 23539 CASAVA_Build 5 82100888 1I GGCCTGCGGG -/T ACACAGAAGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 0 1 23540 CASAVA_Build 5 82101900 1D TTTCCTGAGG C/- CCCCCCACTA 3070 hom 36 het 13 0 12 3 C 7 6 23541 CASAVA_Build 5 82102352 1I ATACTCTCAA -/G GGGGGGTTCC 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 G 6 7 23542 CASAVA_Build 5 82106872 2D ACATTTACTC AG/-- AGATATTTTC 3070 het 3070 hom 40 17 20 5 AG 2 1 23543 CASAVA_Build 5 82124115 9D TCCTCTAAAA GACTATAAT/--------- GAGTGATTTT 3070 het 3070 hom 29 9 20 4 GACTATAAT 1 0 23544 CASAVA_Build 5 82127697 1D AATAATAACC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 A 9 8 23545 CASAVA_Build 5 82129307 1D GATTTTATCA T/- TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 T 7 6 23546 CASAVA_Build 5 82129795 1D CATACAAGCC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 20 13 11 A 9 8 23547 CASAVA_Build 5 82144671 1I AACCCATCTC -/T AGTCATAGGC 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 T 0 1 23548 CASAVA_Build 5 82146864 4D CTCACAGAAC CTTT/---- CTTTATGTAT 3070 het 3070 ref 54 28 25 4 CTTT 2 1 23549 CASAVA_Build 5 82159015 3D TCATTGACAC AAT/--- AATTGCACAT 3070 het 3070 hom 47 20 21 8 AAT 2 1 23550 CASAVA_Build 5 82160913 1I AAAATATTGG -/T TATTTTGCAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 1 2 23551 CASAVA_Build 5 82168441 1D ATTTCATATT G/- TAAGCAATAG 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 G 1 0 23552 CASAVA_Build 5 82171821 5I TTTTGCTTCT -----/TCTTC TCTTTGCCTT 3070 hom 126 het 48 0 41 7 TCTTC 0 1 23553 CASAVA_Build 5 82173819 3D GTATATACCC AGT/--- AGTAATGGGA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AGT 2 1 23554 CASAVA_Build 5 82179510 1I GGTTTTTCCA -/G GTACAGTTTG 3070 hom 125 het 46 0 41 5 G 1 2 23555 CASAVA_Build 5 82181410 3D29M1D TGTCACCTTC ATAATAAGAGAAAATATTTTATTTTATTATTAT/---ATAAGAGAAAATATTTTATTTTATTATTA- TTTTTTTTTT 3070 het 2228 hom 29 8 13 14 N/A 0 0 23556 CASAVA_Build 5 82189998 8I AGAAGAATAC --------/TTGAGTTT TTGCCTGTAC 3070 hom 157 het 55 0 53 2 TTGAGTTT 0 1 23557 CASAVA_Build 5 82207174 1I ATATATACTA -/T TTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 6 7 23558 CASAVA_Build 5 82209085 4D TCTCCTTCAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 40 3 17 22 T 18 14 23559 CASAVA_Build 5 82209248 1D AATTTTTCTT C/- CTGGTTTAAT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 C 2 1 23560 CASAVA_Build 5 82210563 1I ATAGGTGAGG -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 6 7 23561 CASAVA_Build 5 82214672 2D TTAGATCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 127 hom 31 2 10 20 T 12 10 23562 CASAVA_Build 5 82221185 1D GCCTGGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2200 hom 33 14 12 7 T 13 12 23563 CASAVA_Build 5 82224729 1I ATATGAGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 91 het 40 0 31 9 T 9 10 23564 CASAVA_Build 5 82227142 1D TTTATTCATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 19 20 4 A 9 8 23565 CASAVA_Build 5 82228499 1D TTGACTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 A 11 10 23566 CASAVA_Build 5 82229800 4I TTGCTTTTAC ----/TTAT TATCATAAAA 1847 het 1847 ref 21 16 4 1 TTAT 0 1 23567 CASAVA_Build 5 82232072 5I TTCATAAATG -----/TTATT TTATTTTATG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 TTATT 1 2 23568 CASAVA_Build 5 82237309 1D AGACTAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 16 18 5 T 10 9 23569 CASAVA_Build 5 82241442 3D CTGCTATCCT AAA/--- AAAAAGTCCA 3070 het 3070 ref 40 18 18 5 A 8 5 23570 CASAVA_Build 5 82251137 1I CCAGAATTTC -/T GTGCCCTTTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 0 1 23571 CASAVA_Build 5 82254938 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2733 hom 37 12 10 15 T 15 14 23572 CASAVA_Build 5 82259735 1I CTGCCTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 T 10 11 23573 CASAVA_Build 5 82269978 4I TATACATATG ----/TAAC TAACCTGCAC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TAAC 1 2 23574 CASAVA_Build 5 82275405 8I TTTACCCAGT --------/AATTTCAA AATTTCAAAG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AATTTCAA 1 2 23575 CASAVA_Build 5 82279546 1D CCCTTCATGC T/- AAAAACTCTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 0 23576 CASAVA_Build 5 82290865 3D CAATATAATT CAC/--- CACATTAGAA 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 CAC 2 1 23577 CASAVA_Build 5 82305890 2D ACATTTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 990 hom 35 7 18 10 T 19 17 23578 CASAVA_Build 5 82306428 3D TCTTCCCCAC AAG/--- AAGAAAGGAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 AAG 2 1 23579 CASAVA_Build 5 82321559 4I TTTTATTAAT ----/TTTA TTTGTTTGGT 3070 het 2579 hom 28 9 18 1 TTTA 0 1 23580 CASAVA_Build 5 82324964 2D AATGATATTT TA/-- TATATAATTT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 TA 4 3 23581 CASAVA_Build 5 82325684 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1941 hom 32 9 15 8 A 15 14 23582 CASAVA_Build 5 82329687 1D TGTACGTGTA T/- TTTTAGAGAT 3070 het 3070 hom 62 23 32 8 T 5 4 23583 CASAVA_Build 5 82331084 1D AAAGCAAATA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 7 6 23584 CASAVA_Build 5 82335019 1I TGGTGTCCAT -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 C 7 8 23585 CASAVA_Build 5 82342447 1I GCATTCTTTC -/T TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 3 4 23586 CASAVA_Build 5 82368999 3D TTTTCTTTCA TCT/--- TCTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 TCT 2 1 23587 CASAVA_Build 5 82382496 3D CTTCATCTGC AGT/--- AGATCTTAGC 3070 het 3070 ref 63 36 23 6 AGT 1 0 23588 CASAVA_Build 5 82384304 1I TGCAGGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 12 13 A 10 11 23589 CASAVA_Build 5 82387366 1D CTAGCCTATT A/- ATCTAGAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 2 1 23590 CASAVA_Build 5 82395487 1D TTAAACAGTG A/- AGTCATCAAG 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 A 2 1 23591 CASAVA_Build 5 82396982 1D TAATTCTGAA T/- TTTTTTAAGG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 7 6 23592 CASAVA_Build 5 82399556 5D CTTGGGTTTT AATTA/----- AATTGGGTTT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 AATTA 1 0 23593 CASAVA_Build 5 82399699 4D ATATTTTGAA TATG/---- TATGTGAATA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TATG 2 1 23594 CASAVA_Build 5 82414593 1I CCATACAGCT -/A ATTCCTTCAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 23595 CASAVA_Build 5 82417054 1I ATGTTTATGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 8 9 23596 CASAVA_Build 5 82420117 2I ACTAACTTGA --/CT CTGAATAGCT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 CT 1 2 23597 CASAVA_Build 5 82421920 1I TGGTGGGGTT -/G GGGGGGGGCT 1624 het 1624 ref 19 13 5 1 G 8 9 23598 CASAVA_Build 5 82424072 1D ATTCAGAATA T/- TTTTAGGATG 3070 het 3070 ref 35 19 12 6 T 5 4 23599 CASAVA_Build 5 82428926 1D ATAGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 13 12 23600 CASAVA_Build 5 82429125 1D TGAAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 T 11 10 23601 CASAVA_Build 5 82429592 1I TAATACCCAC -/T TTATAGTGTT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 T 2 3 23602 CASAVA_Build 5 82430408 2D CAGTGCTTTT AA/-- AAAATACTAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 A 6 4 23603 CASAVA_Build 5 82432364 1D CTTTTTCAAT G/- ATTGGCATAG 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 G 1 0 23604 CASAVA_Build 5 82433525 28D ACATACATAG AAAAACAACTAAACAAGGTTTAGTTGAT/---------------------------- ATTAAACTCA 3070 het 3070 ref 42 26 21 2 AAAAACAACTAAACAAGGTTTAGTTGAT 1 0 23605 CASAVA_Build 5 82435040 1D ATTCTCATAC T/- ATCAATTGTA 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 T 1 0 23606 CASAVA_Build 5 82443142 7D GAAATAAAAT CAATCAA/------- AATATATCTT 3070 het 3070 hom 23 12 11 3 CAATCAA 1 0 23607 CASAVA_Build 5 82445739 1D CTGGCCCAGG A/- AACTGTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 3 2 23608 CASAVA_Build 5 82449315 10D AAAAAAATTA ATTTAATTTT/---------- ATTTTAAGTT 3070 het 3070 hom 18 8 10 1 ATTTAATTTT 1 0 23609 CASAVA_Build 5 82451168 1D GCCTTTATTT A/- AAATGTTTGC 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 4 3 23610 CASAVA_Build 5 82453477 1D TCATTTTTTA T/- ATGAATATTT 3070 het 3070 ref 45 22 15 10 T 1 0 23611 CASAVA_Build 5 82454607 4I ATGTTTGGGT ----/ATTA ATTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 ATTA 0 1 23612 CASAVA_Build 5 82455126 1D ACAATTACAT A/- AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 7 6 23613 CASAVA_Build 5 82455465 1I TTACATTGAT -/A TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 A 0 1 23614 CASAVA_Build 5 82457319 8I TAATTCCAAC --------/ACTTTGAG AGGCCGAGGC 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 ACTTTGAG 0 1 23615 CASAVA_Build 5 82465378 4D GCAAGCAGCC CTTG/---- CTTGCTCTTG 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 CTTG 2 1 23616 CASAVA_Build 5 82466967 1I GCAGTATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 12 13 23617 CASAVA_Build 5 82470164 1D AAAAACTAGC A/- CACTTTGCTA 3070 het 3070 ref 36 21 10 6 A 1 0 23618 CASAVA_Build 5 82473215 1I CTTTTTCCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 16 22 6 T 8 9 23619 CASAVA_Build 5 82473419 1D AATCTTGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 A 13 12 23620 CASAVA_Build 5 82473868 30D CAGTGTTATG GATGAGGAAACTAACTCTCAGTGGTGTTTA/------------------------------ GATGAGGAAA 3070 het 3070 ref 35 23 13 9 GATGAGGAAACTAACTCTCAGTGGTGTTTA 2 1 23621 CASAVA_Build 5 82474254 1I GAGTCTCCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 8 9 23622 CASAVA_Build 5 82479273 1D AGTAGATTTT A/- AAGTGTTGTC 3070 hom 96 het 40 0 33 8 A 3 2 23623 CASAVA_Build 5 82481053 3D AAGCAAAATG AAT/--- AACTCATTCA 3070 het 3070 hom 27 9 15 4 AAT 1 0 23624 CASAVA_Build 5 82484790 1I TCATTCAAAC -/T TTTTTTTTTT 2910 het 2775 hom 26 8 9 9 T 14 15 23625 CASAVA_Build 5 82487595 1D CACCTCTCAT C/- CCCTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 C 4 3 23626 CASAVA_Build 5 82496894 3I ATCAATAGAC ---/CTT ATTGATTTAT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 CTT 0 1 23627 CASAVA_Build 5 82497463 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1278 het 1278 ref 17 5 4 8 T 16 14 23628 CASAVA_Build 5 82498036 1D TTCCTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1920 hom 36 13 13 10 T 13 12 23629 CASAVA_Build 5 82498806 1D GATGTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 2588 het 2588 ref 30 18 8 4 T 12 11 23630 CASAVA_Build 5 82502315 2D TCTCCTTTTA TT/-- TAAGTCAGTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 3 1 23631 CASAVA_Build 5 82506471 1D TTTGTATTAA T/- TTTTATGAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 5 4 23632 CASAVA_Build 5 82512629 2I TTAAACTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 11 23 10 T 13 15 23633 CASAVA_Build 5 82513049 1I TGCATCAGTT -/C CTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 C 1 2 23634 CASAVA_Build 5 82523818 2D ATGTATATGT AC/-- ATATTATATA 2090 het 2090 ref 23 16 6 1 AC 1 0 23635 CASAVA_Build 5 82531357 1I AAAATTACTA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 7 8 23636 CASAVA_Build 5 82532171 4D GAATTAGCTT GTTA/---- GTTGTTAAGT 3070 het 3070 ref 44 23 18 8 GTTA 1 0 23637 CASAVA_Build 5 82538916 1D CTATTTTCAA T/- TTGGCAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 T 3 2 23638 CASAVA_Build 5 82576154 1I TGATAACTCC -/T TTTGGGGCTC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 3 4 23639 CASAVA_Build 5 82582266 1I TTTTAAAGCC -/A AGGCTTTTCT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 1 2 23640 CASAVA_Build 5 82602369 1I TATGTATATA -/T TTTTTTTTTT 817 het 817 ref 8 4 2 2 T 10 11 23641 CASAVA_Build 5 82608636 3D TATATTGAAC TCA/--- TCTATCTATG 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 TCA 1 0 23642 CASAVA_Build 5 82614626 1D TAGCCAGACC A/- AAAAAAAAAA 1524 het 1524 ref 26 11 6 9 A 16 15 23643 CASAVA_Build 5 82630175 1D ACTTTTCTAC T/- TTATGTGTCC 3070 het 3070 hom 38 10 24 5 T 3 2 23644 CASAVA_Build 5 82635563 1I AGATAAACAG -/A AAAATCACAG 3070 hom 94 het 40 0 34 6 A 4 5 23645 CASAVA_Build 5 82636305 1I ATGTTATTGA -/T TTTTTTCATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 6 7 23646 CASAVA_Build 5 82637708 2I AGGTTGCAGA --/TT TTTCTAGTGA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 3 5 23647 CASAVA_Build 5 82638086 2I TACTTTTCCC --/TT AAGAATGACT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 2 23648 CASAVA_Build 5 82644657 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 33 1 20 12 T 14 13 23649 CASAVA_Build 5 82645521 3I ATGTTATTTA ---/ATT ATTACTACAT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 ATT 1 2 23650 CASAVA_Build 5 82659086 1I ATTCTTATAC -/A AAAAAGGTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 5 6 23651 CASAVA_Build 5 82671850 4I CTAGAGTGGT ----/AGGC AGAATAGTAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 AGGC 0 1 23652 CASAVA_Build 5 82716548 3D AATTTTGAAA AAG/--- AAGAACAAAG 3070 het 3070 hom 30 14 16 2 AAG 2 1 23653 CASAVA_Build 5 82726844 1I GTTTTTATTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 9 10 23654 CASAVA_Build 5 82748705 1I TAGAATAGGA -/T TTCTGTATAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 3 23655 CASAVA_Build 5 82752089 1D TGGTTCAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 A 10 9 23656 CASAVA_Build 5 82776009 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TA 8 7 23657 CASAVA_Build 5 82786137 1I GCACTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 11 12 23658 CASAVA_Build 5 82788780 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1804 het 1804 ref 46 33 5 8 T 13 12 23659 CASAVA_Build 5 82798571 2D CTCAATAAAC TT/-- TTGTTGAATT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 4 2 23660 CASAVA_Build 5 82803848 1D AGGGTGGGGT G/- GGGGGTAAAA 3070 hom 58 het 23 0 20 3 G 6 5 23661 CASAVA_Build 5 82813969 1D AAATCCAATC A/- TTGGAAAAGG 3070 hom 137 het 50 0 45 5 A 1 0 23662 CASAVA_Build 5 82821387 1D TATGCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 39 1 26 12 T 12 11 23663 CASAVA_Build 5 82883459 1D CCAAAATTTG C/- TTCATTTTGA 3070 hom 96 het 42 0 33 10 C 1 0 23664 CASAVA_Build 5 82891580 1D TGAAAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 226 hom 33 1 26 6 A 13 12 23665 CASAVA_Build 5 82894237 1D GGAAAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 31 1 25 5 A 12 11 23666 CASAVA_Build 5 82897637 1I CTCCCGGGTT -/C AAGTGATTCT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 C 0 1 23667 CASAVA_Build 5 82899066 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 4 5 23668 CASAVA_Build 5 82902401 1D GGACCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 40 3 23 15 T 15 14 23669 CASAVA_Build 5 82918394 1D AAATGCTGTG A/- AAAAAAAAAA 1532 het 1532 ref 49 37 4 9 A 12 11 23670 CASAVA_Build 5 82940621 1I GGTGTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 1119 het 1119 ref 25 17 3 5 T 15 16 23671 CASAVA_Build 5 82950750 1D GGAAACCCCA G/- GGGTCTTGCA 3070 hom 86 het 31 0 28 3 G 4 3 23672 CASAVA_Build 5 83052484 2D GAGTGTGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 1339 het 1339 ref 56 38 3 15 GT 7 6 23673 CASAVA_Build 5 83061649 4D AACAGCCTGA CTAC/---- CGTAGTGAAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 CTAC 1 0 23674 CASAVA_Build 5 83071448 13D CCCAGCACTT TGGGAGGACGAAG/------------- TGGGTGGATC 2069 het 2069 ref 15 9 6 2 TGGGAGGACGAAG 1 0 23675 CASAVA_Build 5 83077922 1D CTTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 12 10 T 15 14 23676 CASAVA_Build 5 83085310 1I TCCTTCCTCT -/G GGCAGTCTGA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 G 2 3 23677 CASAVA_Build 5 83093052 1D AAGTAGTTTA C/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 1 0 23678 CASAVA_Build 5 83101878 1I TGTTCCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 11 12 23679 CASAVA_Build 5 83145993 2D ATGGATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 AT 7 6 23680 CASAVA_Build 5 83146741 1I TAATAGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 T 13 14 23681 CASAVA_Build 5 83147997 1D TGCAAAGGAA G/- GGGAGAGTGT 3070 het 3070 ref 53 29 18 6 G 4 3 23682 CASAVA_Build 5 83158508 5D AATAGTTGTG TCGTT/----- TCGTTGCTTT 3070 het 3070 ref 29 18 10 3 TCGTT 2 1 23683 CASAVA_Build 5 83161484 1I CTAACTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 10 11 23684 CASAVA_Build 5 83162018 4I TTTTCTCTTC ----/CTGT CTTAGTTTGC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 CTGT 0 1 23685 CASAVA_Build 5 83162922 1I GTGAAGAACA -/T ACTAATTATG 3070 het 3070 hom 50 19 28 3 T 0 1 23686 CASAVA_Build 5 83173435 1D TACTGCTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 A 10 9 23687 CASAVA_Build 5 83174653 1D GATGATAGCA T/- TTTTTAGCAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 6 5 23688 CASAVA_Build 5 83184506 1I GTTAAAAAAA -/C AATACAATTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 0 1 23689 CASAVA_Build 5 83185490 1D AGGATTAAAT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 8 7 23690 CASAVA_Build 5 83190490 1D TCACAGACAA T/- TTTTTTTTTT 2556 het 2556 ref 40 21 10 9 T 17 16 23691 CASAVA_Build 5 83197640 1D ATAAATCATA T/- GCACACAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 1 0 23692 CASAVA_Build 5 83197932 2I AGCAGAACTA --/AG AGTCTAGAGG 3070 het 3070 ref 50 23 15 12 AG 1 2 23693 CASAVA_Build 5 83199885 4I GAAAGAAAAG ----/GAAA GAAAGAAAGA 3041 het 761 hom 18 5 12 1 GAAA 4 5 23694 CASAVA_Build 5 83220528 1D GACATACAGT A/- AAGGCTATGA 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 A 3 2 23695 CASAVA_Build 5 83233539 3D AGTAACTATG ATA/--- ATATTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 21 15 3 ATA 2 1 23696 CASAVA_Build 5 83241249 1D AAAGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 A 11 10 23697 CASAVA_Build 5 83246709 1I AAAGAAAAAA -/G AAAATTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 G 0 1 23698 CASAVA_Build 5 83246872 1I ACCTAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3017 het 1545 hom 26 5 11 10 A 15 16 23699 CASAVA_Build 5 83246938 1I CCCCACCCCC -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 A 7 8 23700 CASAVA_Build 5 83285766 1I TCCTTGAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 T 9 10 23701 CASAVA_Build 5 83287002 2I TTGCAGAAAC --/AT GTGCTAACTA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AT 0 1 23702 CASAVA_Build 5 83291168 1D TGTCTGGATG A/- AAGCTTGTGG 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 3 2 23703 CASAVA_Build 5 83316778 1I ACACCAGAGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 7 8 23704 CASAVA_Build 5 83325956 1D TTCACAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 9 6 T 12 11 23705 CASAVA_Build 5 83326020 1D TTTATTTAGC A/- AAAAAAAAAA 2062 het 2062 ref 37 25 6 6 A 11 10 23706 CASAVA_Build 5 83356378 1I CTTCTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 35 1 31 3 T 10 11 23707 CASAVA_Build 5 83359245 2D GATCAGTGAG AT/-- AATTGATCTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 1 0 23708 CASAVA_Build 5 83373228 3D TACATATATA CTT/--- ATATGTATAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 CTT 1 0 23709 CASAVA_Build 5 83409558 1I CAATTTTGTT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 24 7 13 4 A 7 8 23710 CASAVA_Build 5 83412189 5D AATGTGACTG GAAAA/----- GAAAAGGTTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 GAAAA 2 1 23711 CASAVA_Build 5 83417767 1I CACTGGGATT -/C CAGGCACCGC 3070 hom 61 het 26 0 18 8 C 1 2 23712 CASAVA_Build 5 83424369 1D ACATTTGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 A 10 9 23713 CASAVA_Build 5 83430130 1D AAATATATAT A/- TTTGAACATA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 1 0 23714 CASAVA_Build 5 83437324 2I GATTTTCTAC --/AT AATATTCCCC 3070 hom 151 het 61 0 51 10 AT 0 1 23715 CASAVA_Build 5 83460065 1D CCCACAAATT A/- ACAATTTAAC 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 2 1 23716 CASAVA_Build 5 83472198 1I GAATTGGAAT -/G GCATTTGCTG 3070 hom 156 het 54 0 52 2 G 1 2 23717 CASAVA_Build 5 83477405 1I CCTGGGCACA -/T TTTATCTAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 3 4 23718 CASAVA_Build 5 83489306 3I AATGATACAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 AAG 3 4 23719 CASAVA_Build 5 83514384 1D GGCTCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 12 11 23720 CASAVA_Build 5 83530332 1D CACATGTCAT A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 7 6 23721 CASAVA_Build 5 83534944 1D TTCTTCAGAT A/- AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 A 7 6 23722 CASAVA_Build 5 83541210 1I TAAACTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 10 11 23723 CASAVA_Build 5 83544766 2D TTTTCAGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 12 10 23724 CASAVA_Build 5 83548074 2I TTGCTGCTGT --/AA AAGATAAGCA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 2 4 23725 CASAVA_Build 5 83551294 1D CTAAGTGTTC A/- TCTACAGATG 3070 het 3070 ref 55 31 22 3 A 1 0 23726 CASAVA_Build 5 83552511 1I ATAAATTTTC -/T GCCACAGAAG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 0 1 23727 CASAVA_Build 5 83553134 4I GAAGTTTAAT ----/TTTG TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 TTTG 0 1 23728 CASAVA_Build 5 83563147 6I GTTAAGGTTA ------/CATCTG CATCTGCGCA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 CATCTG 1 2 23729 CASAVA_Build 5 83563977 1I TGATGTCTAA -/G GAAGGAAGAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 1 2 23730 CASAVA_Build 5 83573294 4D AAAAATAATA AGTC/---- AGTACTTATT 2529 het 2529 ref 25 12 8 7 AGTC 1 0 23731 CASAVA_Build 5 83574646 4D GGTTATTTTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 94 hom 53 3 24 29 TG 9 7 23732 CASAVA_Build 5 83577489 3D TCTAAAATGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 31 2 18 12 A 19 16 23733 CASAVA_Build 5 83586786 1D CCCAACTCTC A/- AAGTGGTAAA 3070 het 3070 hom 39 12 21 7 A 3 2 23734 CASAVA_Build 5 83601002 4I CAAAATTTTT ----/ATTA ATTCTGTCTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATTA 0 1 23735 CASAVA_Build 5 83602065 2I CCATGGGGTT --/TG TGTCAACTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TG 1 2 23736 CASAVA_Build 5 83610591 1D CTTCTATGCC T/- CAATTTCCTT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 1 0 23737 CASAVA_Build 5 83614614 1D CATCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 40 30 3 7 T 11 10 23738 CASAVA_Build 5 83634544 2D AATCAAAATC AG/-- AGAGAGATAG 3070 het 3070 hom 63 24 33 8 AG 4 3 23739 CASAVA_Build 5 83656502 1D TCTCCTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 11 10 23740 CASAVA_Build 5 83658091 6D CTACACTTAA AAATGG/------ TTAGGATGGT 3070 het 3070 ref 26 12 13 4 AAATGG 1 0 23741 CASAVA_Build 5 83671177 4I TTAAAATACT ----/GTAA GTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 GTAA 0 1 23742 CASAVA_Build 5 83673291 1D ATTTCAACTA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 7 6 23743 CASAVA_Build 5 83680168 1D CCTCTGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 169 hom 24 1 15 8 A 15 14 23744 CASAVA_Build 5 83680183 1D AAAAAAAAAA C/- ACCTGTTCGA 3070 het 363 hom 26 6 14 7 C 1 0 23745 CASAVA_Build 5 83687579 1D TGGATCTCTA T/- TTTAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 4 3 23746 CASAVA_Build 5 83696579 2D TAATGGAAAG TA/-- TTGGGTTTTG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 TA 1 0 23747 CASAVA_Build 5 83700820 8I ACACACACAT --------/ATACACAC ATAAATATAC 2751 het 2751 ref 19 12 6 1 ATACACAC 0 1 23748 CASAVA_Build 5 83711869 3D TAAAACACAG AGA/--- AGAACTGAAT 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 AGA 2 1 23749 CASAVA_Build 5 83764938 1D GAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1783 het 1783 ref 36 24 4 9 T 13 12 23750 CASAVA_Build 5 83774592 1D TTCATGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 10 9 23751 CASAVA_Build 5 83775336 1D CATTTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 793 hom 41 5 14 22 A 12 11 23752 CASAVA_Build 5 83775780 24D TTCTAAAGAA ATTTTATGTACATCTAAACTCTTC/------------------------ TAAAGTCAGC 3070 het 3070 ref 25 19 9 3 ATTTTATGTACATCTAAACTCTTC 1 0 23753 CASAVA_Build 5 83838061 5I CTTTAAGAAA -----/TAAAG TAAATAAAGA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 TAAAG 0 1 23754 CASAVA_Build 5 83895692 2D CAAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 19 0 14 6 AT 8 7 23755 CASAVA_Build 5 83901142 1I AATCAGGCAA -/T TTTTTTTTTA 3002 het 3002 ref 37 18 8 11 T 9 10 23756 CASAVA_Build 5 83918615 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 35 2 24 10 A 13 12 23757 CASAVA_Build 5 83953023 1I TTTTTTACTT -/A AAAAAAAAAA 2937 het 2937 ref 23 11 8 4 A 11 12 23758 CASAVA_Build 5 83953226 1I CAAATGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 10 11 23759 CASAVA_Build 5 83960492 1D TCGAATGCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 53 30 15 9 T 10 9 23760 CASAVA_Build 5 83964743 5I CCAAATTTAC -----/ATGAA AGAAGTTTCC 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 ATGAA 0 1 23761 CASAVA_Build 5 83969503 4D CTTCCTTCTT TTCC/---- TTCCTCCCTC 2293 het 1093 hom 22 6 9 8 TTCC 2 1 23762 CASAVA_Build 5 83977873 1D ACAGGGCACC A/- AAAAAAGCCA 3070 hom 117 het 44 0 33 11 A 7 6 23763 CASAVA_Build 5 83980965 1D CTGATGAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 11 10 23764 CASAVA_Build 5 83981305 4I CAAAAGGCAA ----/AAGT AAGTGTGTGT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 AAGT 1 2 23765 CASAVA_Build 5 83982082 1I CCACAGACAC -/A TGCATACTAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 1 23766 CASAVA_Build 5 83995050 1I CCAGAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 45 1 38 6 A 14 15 23767 CASAVA_Build 5 83995140 1D GTTGCTGTGA C/- AAGGGAAATA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 C 1 0 23768 CASAVA_Build 5 84009336 1I GACATGGATG -/A AGCTGGAAAC 3070 het 98 hom 22 1 20 1 A 1 2 23769 CASAVA_Build 5 84010726 4D25M1D TAGGCAAAAC AAATAAATAAGAAAACATGAAAATTCAACT/----AAATAAGAAAACATGAAAATTCAAC- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 27 0 30 5 N/A 0 0 23770 CASAVA_Build 5 84020642 1I CCCACTACTA -/T ACTATATAGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 23771 CASAVA_Build 5 84022181 3I TTTAAAATCT ---/AAG AAGAATAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAG 1 2 23772 CASAVA_Build 5 84042771 3I AATATTATTA ---/AAT AATAATAATA 2133 het 1941 hom 13 4 7 2 AAT 3 4 23773 CASAVA_Build 5 84043141 1D TCTCTCTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 11 11 T 11 10 23774 CASAVA_Build 5 84043983 1I TTTATCTAAC -/A TTAGTATAGC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 0 1 23775 CASAVA_Build 5 84044738 1I TCCCTTCTAC -/A TTTTCACTTC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 0 1 23776 CASAVA_Build 5 84045720 1D ATTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 2203 het 2203 ref 24 9 8 7 A 15 14 23777 CASAVA_Build 5 84050542 3D TACTTCCCAA AGC/--- AATTTACAGA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 AGC 1 0 23778 CASAVA_Build 5 84051749 1D36M1D GTAAAGAAAA TGTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATA/-GTGGTACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCAT- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 38 25 15 6 N/A 0 0 23779 CASAVA_Build 5 84052975 1D GTGCATAATG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 8 7 23780 CASAVA_Build 5 84053164 3I CTCCTACAGG ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 A 9 12 23781 CASAVA_Build 5 84053289 1I AAAAAAAAAA -/C ACCACTATTA 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 C 0 1 23782 CASAVA_Build 5 84055086 1D AAACGTGACA C/- CCTTAAATAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 C 3 2 23783 CASAVA_Build 5 84055330 1D TGACAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 13 12 23784 CASAVA_Build 5 84057574 5D CAGAGCCAAA AAAAT/----- AAAAAAAAAG 2761 het 2761 ref 33 21 7 8 AAAAT 1 0 23785 CASAVA_Build 5 84058037 2D GTGACACATA CT/-- CTCTCTCTAT 3070 het 3070 ref 31 13 13 7 CT 5 4 23786 CASAVA_Build 5 84060719 3I ATATGTAACA ---/TCT TCTTCATATG 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 TCT 1 2 23787 CASAVA_Build 5 84060856 1I TTCTTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 A 13 14 23788 CASAVA_Build 5 84066624 1D CTCCTACTCC T/- TTTTTTTTTT 2221 het 1862 hom 24 9 7 8 T 17 16 23789 CASAVA_Build 5 84070345 2I ACTGTAAAAC --/AG AGAATACAAG 3070 het 2692 hom 24 6 14 4 AG 1 2 23790 CASAVA_Build 5 84078541 1I TCATCTGTAG -/A ACACTTAGAC 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 1 2 23791 CASAVA_Build 5 84080871 1D CTTAACTGAA T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 T 8 7 23792 CASAVA_Build 5 84081258 1D GATAGTTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 12 25 7 T 9 8 23793 CASAVA_Build 5 84081769 1D CTCAAAAAAA T/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 T 1 0 23794 CASAVA_Build 5 84082849 4D CCTAATTATT TAAC/---- TATATTTTAC 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 TAAC 1 0 23795 CASAVA_Build 5 84086838 2D ACATATAACA TC/-- TCTCATCTCT 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 TC 3 2 23796 CASAVA_Build 5 84115322 1I ACTTCATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2347 hom 22 6 10 6 A 11 12 23797 CASAVA_Build 5 84128243 1I TTTCAGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2080 hom 49 6 36 7 T 12 13 23798 CASAVA_Build 5 84145685 1D AGAAATGGAT A/- AAAATACTAT 3070 hom 120 het 49 0 41 10 A 5 4 23799 CASAVA_Build 5 84148689 1I AGGAAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 201 hom 35 1 26 8 A 10 11 23800 CASAVA_Build 5 84172828 4D TTCTAAAATT AAGC/---- AAGGCAATTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AAGC 1 0 23801 CASAVA_Build 5 84177581 1D GAAGTTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1406 hom 46 7 21 18 A 13 12 23802 CASAVA_Build 5 84186337 2D ATTTTTAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 12 10 23803 CASAVA_Build 5 84187549 1D TTTCCCTCTC T/- TTTAAGACTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 4 3 23804 CASAVA_Build 5 84192640 1I TCCTCCTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 49 20 21 8 T 8 9 23805 CASAVA_Build 5 84198918 1I TCCATTAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 9 10 23806 CASAVA_Build 5 84203479 1D AAGAAGTAAT G/- GCACCAAATT 3070 hom 129 het 48 0 44 6 G 2 1 23807 CASAVA_Build 5 84204896 1I ACTCCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 21 2 14 5 A 12 13 23808 CASAVA_Build 5 84204956 2D GAGTTCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 22 1 16 7 T 15 13 23809 CASAVA_Build 5 84207575 4I TTATTGAAAC ----/AAAT AAAGATGGAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AAAT 0 1 23810 CASAVA_Build 5 84208549 2I TCTTAATGAT --/AA AAAAAACCCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 8 23811 CASAVA_Build 5 84208828 1D CTTATATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1386 hom 31 6 18 7 A 13 12 23812 CASAVA_Build 5 84209071 1I20M1D TAATCCGATT -AAAAATGGGCAAAAAGTTGTA/AAAAAATGGGCAAAAAGTTGT- AAAAAAACAA 3070 hom 108 het 34 0 36 5 N/A 0 0 23813 CASAVA_Build 5 84230563 2I GAGTACGTTT --/TC TAGATGATAA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 TC 0 1 23814 CASAVA_Build 5 84232805 1D CATTTGACCA T/- TTTTTTTTTT 1888 het 1888 ref 50 39 5 6 T 11 10 23815 CASAVA_Build 5 84233458 1I CACAGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 33 1 27 5 A 11 12 23816 CASAVA_Build 5 84233753 1I GGCACTGGGA -/T TAACTGGCTA 3070 hom 114 het 42 0 36 6 T 1 2 23817 CASAVA_Build 5 84238625 1I GGACAATGAT -/A AAAGGTTTAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 3 4 23818 CASAVA_Build 5 84241351 1D AATGAAACGG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 8 7 23819 CASAVA_Build 5 84250863 1D TCCAAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 27 1 22 4 A 11 10 23820 CASAVA_Build 5 84251991 2D TTTCCCACGC TA/-- TTCTCATGAT 3070 hom 60 het 23 0 20 4 TA 1 0 23821 CASAVA_Build 5 84254040 2I ACTGTCTTGG --/GT ATGTACTTAT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 GT 0 1 23822 CASAVA_Build 5 84265647 1I ACTCCATCTC -/A AAAAACAAAA 3070 hom 74 het 29 0 25 4 A 5 6 23823 CASAVA_Build 5 84270515 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 6 7 23824 CASAVA_Build 5 84272184 1I CCATTTATGG -/A AAAAGTGGCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 4 5 23825 CASAVA_Build 5 84272655 5D ATACTCCATT CTTAA/----- CTTATTATTT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 CTTAA 1 0 23826 CASAVA_Build 5 84278867 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 23827 CASAVA_Build 5 84286235 8D AACTTTTACA CAAATGCT/-------- CAAATGCTCA 3070 hom 127 het 48 0 43 6 CAAATGCT 2 1 23828 CASAVA_Build 5 84287680 5I TAAAACACAT -----/AAAAC AAAAGGAAAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AAAAC 0 1 23829 CASAVA_Build 5 84292166 40D TGTGTGTGTG TGTATATATATATATGTATATATATATATATATACATATA/---------------------------------------- TATATATATA 703 hom 10 het 1 0 4 1 TGTATATATATATATGTATATATATATATATATACATATA 1 0 23830 CASAVA_Build 5 84294526 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1077 hom 26 3 19 4 A 15 16 23831 CASAVA_Build 5 84294683 4D CCAGATTCAC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 5 TTAT 4 3 23832 CASAVA_Build 5 84296116 1I AATGGAGTTC -/A GTAGGAAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 1 23833 CASAVA_Build 5 84298308 1D CTATTGAGAA C/- CTTTTTAGAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 2 1 23834 CASAVA_Build 5 84300354 4D CAAATGAAAC AATT/---- AAGAGTGAGG 3070 hom 75 het 27 0 26 3 AATT 1 0 23835 CASAVA_Build 5 84303175 2D CATTTTTAAT TC/-- TGTTTCTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TC 1 0 23836 CASAVA_Build 5 84303282 3D GAAACATTAA AAT/--- GACCTAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 8 AAT 1 0 23837 CASAVA_Build 5 84303776 1I TCATTTTTTT -/C TTTAAGTTTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 0 1 23838 CASAVA_Build 5 84305239 11D CACACCCCTC CCACTCTTTCA/----------- CCTTTCCAAG 3070 hom 90 het 31 0 31 3 CCACTCTTTCA 1 0 23839 CASAVA_Build 5 84305484 2I19M1D ATGTATATTT --TATATATATATATATGACTG/TATATATATATATATATGAAT- GATATAGAAA 3070 het 80 hom 21 1 17 11 N/A 0 0 23840 CASAVA_Build 5 84305682 2D ATAGATACAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 AT 6 5 23841 CASAVA_Build 5 84306812 2I AATTTTATGA --/TT TTTTTTCCCT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 6 8 23842 CASAVA_Build 5 84309282 11D GTTTGCTAGG TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 39 2 24 17 T 25 14 23843 CASAVA_Build 5 84310157 1I TCATTGACTC -/A AAAAATTATT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 5 6 23844 CASAVA_Build 5 84313124 2D GTTGCATTCC TA/-- TATATATATA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TA 6 5 23845 CASAVA_Build 5 84324491 1D AGATGAAACT G/- GTGTCTAACC 3070 hom 104 het 43 0 35 9 G 2 1 23846 CASAVA_Build 5 84325247 2I TGGGGAGAGG --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 86 het 35 0 29 6 GA 5 6 23847 CASAVA_Build 5 84325372 1D TTTTACAGGT A/- CATTGTGTCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 0 23848 CASAVA_Build 5 84326761 1D ATTTTAATTG T/- TTTATAATCT 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 T 4 3 23849 CASAVA_Build 5 84327671 2I TTTATTGTGA --/TG TATGCAGTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TG 0 1 23850 CASAVA_Build 5 84338101 1I GATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 31 2 27 2 T 11 12 23851 CASAVA_Build 5 84339485 24I TAGTGACCTG ------------------------/GATGAGATTGGAGACTATTATTCT TAGTGAAGTA 3070 hom 78 het 26 0 27 1 GATGAGATTGGAGACTATTATTCT 0 1 23852 CASAVA_Build 5 84345009 1D TCAAATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 43 0 35 10 T 11 10 23853 CASAVA_Build 5 84348616 1I TTTAGACAGT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 23854 CASAVA_Build 5 84350096 1D AGAGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 11 10 23855 CASAVA_Build 5 84363707 2D GTGGTAAAAA CT/-- CTGATTGTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 CT 2 1 23856 CASAVA_Build 5 84366613 1I TTAGGTTTTT -/G AAACTAGAAA 3070 hom 102 het 46 0 35 11 G 0 1 23857 CASAVA_Build 5 84367704 4I CCAGAAGCTC ----/TTTA TTTATATAAT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 TTTA 1 2 23858 CASAVA_Build 5 84387301 3D GGGTAAAACA AAT/--- AATCTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 AAT 2 1 23859 CASAVA_Build 5 84392190 1D TCCTAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1139 hom 22 3 13 6 T 13 12 23860 CASAVA_Build 5 84400598 9I AATTTGAAGT ---------/GTATCTCAA GTATCTCAAG 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 GTATCTCAA 1 2 23861 CASAVA_Build 5 84407298 1I AAAAAGTTAT -/A AAAAATTGTT 3070 hom 9 het 30 1 25 4 A 5 6 23862 CASAVA_Build 5 84416877 1D CACACCATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 380 hom 39 1 35 3 T 10 9 23863 CASAVA_Build 5 84418152 1D TTAATACCCC A/- TTTACTGACT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 0 23864 CASAVA_Build 5 84435010 1I ACATTCTCAC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 46 10 29 7 T 7 8 23865 CASAVA_Build 5 84444806 1I AATTGCTAAG -/A AAAACAACTT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 4 5 23866 CASAVA_Build 5 84446046 3D TGCCAATTAT TAA/--- TAATACTGCT 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 TAA 2 1 23867 CASAVA_Build 5 84482846 1D AATGATGCAG C/- TGGAGATTCC 3070 het 3070 ref 46 29 11 7 C 1 0 23868 CASAVA_Build 5 84516456 1I GTTGAAATAT -/G GGGGGTTTTC 3070 het 3070 hom 45 13 25 7 G 5 6 23869 CASAVA_Build 5 84522808 1D AATGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 13 12 23870 CASAVA_Build 5 84546144 1D ATTACTTGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 14 19 11 T 10 9 23871 CASAVA_Build 5 84557482 1D CCATATTGGG A/- TTGCATGTAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 1 0 23872 CASAVA_Build 5 84564090 1I TCTGCTTTTG -/C TTTGACTGGA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 C 0 1 23873 CASAVA_Build 5 84566888 3I GAAAGAACTA ---/CTT ATTTACCTGA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 CTT 0 1 23874 CASAVA_Build 5 84576552 1D7M12I TTCTGCCTGC TTTATATT------------/-TTATGTTCTAGCCATGCTA TCAGCTGATT 1337 het 1337 ref 34 28 3 7 N/A 0 0 23875 CASAVA_Build 5 84585034 2D AAAAAGGCTT CA/-- TAGTTACATT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 CA 1 0 23876 CASAVA_Build 5 84586029 4I TTTATGATGT ----/GCAC TAAAGGAGGC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 GCAC 0 1 23877 CASAVA_Build 5 84589954 4D TAGAAGTCAA AAAC/---- AAAATAAGAG 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 AAAC 1 0 23878 CASAVA_Build 5 84590443 1D TACAATCTCC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 9 8 23879 CASAVA_Build 5 84590874 2D AGGACAGATA TT/-- GTCAACTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 T 2 0 23880 CASAVA_Build 5 84592537 3D AATTAAATAA ATG/--- ATAACTGATA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 ATG 1 0 23881 CASAVA_Build 5 84592796 2I TTGGGTCAGA --/CC CTCAGGGCAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 1 3 23882 CASAVA_Build 5 84612523 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2052 hom 14 het 16 0 9 7 A 14 13 23883 CASAVA_Build 5 84620906 5D GAAGGAAGGA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 AAAAG 5 4 23884 CASAVA_Build 5 84622460 2D AAGATAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 T 14 12 23885 CASAVA_Build 5 84623262 1D GAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 39 0 30 9 A 12 11 23886 CASAVA_Build 5 84625888 2D GGCATAATGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 105 het 40 0 35 7 AT 6 5 23887 CASAVA_Build 5 84627045 1D CAGTTTTCAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 19 12 8 A 9 8 23888 CASAVA_Build 5 84631938 3I AATTAGTTGA ---/CTT CTTCTAATGT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTT 1 2 23889 CASAVA_Build 5 84632888 4I GACTATTTGC ----/CTTA CTAAGATACT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 CTTA 0 1 23890 CASAVA_Build 5 84634850 1D TACTTCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 7 T 11 10 23891 CASAVA_Build 5 84635975 2I AAGTGGACTA --/TT TTTTTTTCCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 9 23892 CASAVA_Build 5 84642003 1I TAATTTTGGC -/A GAGTAGATAT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 0 1 23893 CASAVA_Build 5 84643629 1I AGGTGAAAAA -/T ATATATACTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 23894 CASAVA_Build 5 84644256 4D GCCCGGCTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3043 hom 27 het 16 0 8 8 T 16 12 23895 CASAVA_Build 5 84647853 1I CCGGCTAATA -/T TTTTTTTTTG 2978 hom 21 het 9 0 8 1 T 9 10 23896 CASAVA_Build 5 84649562 1I AGGGAGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 23897 CASAVA_Build 5 84649857 3D GATAATCTGT CAA/--- CAATTATTTA 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 CAA 2 1 23898 CASAVA_Build 5 84654668 1D TAAGTTTGGC A/- AAAGCCATTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 4 3 23899 CASAVA_Build 5 84656423 2D ATTTCTTCTA TT/-- TTTTTTTTCC 3070 hom 127 het 49 0 43 6 T 10 8 23900 CASAVA_Build 5 84657080 1D TATGATGATT A/- AAAAAACAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 6 23901 CASAVA_Build 5 84658746 1I TAAAGAGATT -/A CTCTTTTCTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 1 23902 CASAVA_Build 5 84661031 5D ATAAACACAA AAGTT/----- TATACTTTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AAGTT 1 0 23903 CASAVA_Build 5 84662122 1I ATTTTTAATA -/T TTTTAAAGCA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 4 5 23904 CASAVA_Build 5 84662678 4D GAGGAGAGAG AGAT/---- ACACAGATAG 3070 het 3070 ref 36 23 8 8 AGAT 1 0 23905 CASAVA_Build 5 84662732 1I CTAAAATTTA -/T TTATCTATCT 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 T 2 3 23906 CASAVA_Build 5 84663531 1I CCCCAGTGTC -/T TATTGTTCCC 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 1 2 23907 CASAVA_Build 5 84664098 2D TCTGGCAAAC TT/-- ATACATATAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 T 2 0 23908 CASAVA_Build 5 84664588 1I ATCAGTTGGC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 2426 hom 27 13 11 3 T 6 7 23909 CASAVA_Build 5 84670922 5D ATGATGCTGC AGAAT/----- AGTAGTTCAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AGAAT 1 0 23910 CASAVA_Build 5 84671973 6D CATTTGAAAT CAGATA/------ CAAAGACAAA 3070 het 3070 hom 37 15 21 3 CAGATA 1 0 23911 CASAVA_Build 5 84672901 1D GAAAATAAAG A/- AAGTGTTCTC 3070 hom 120 het 47 0 42 5 A 3 2 23912 CASAVA_Build 5 84681828 1D TTATTGTCAC A/- AAAAAACCAA 3070 hom 122 het 47 0 41 7 A 7 6 23913 CASAVA_Build 5 84682747 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 701 hom 34 2 12 20 T 15 14 23914 CASAVA_Build 5 84689384 1D CATTTCCAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 9 8 23915 CASAVA_Build 5 84689815 1I TCTCAAACTG -/T AAGTACAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 0 1 23916 CASAVA_Build 5 84692753 2D AGTCTAGGGG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 A 11 9 23917 CASAVA_Build 5 84693434 2D ATCCATATAT AA/-- GTTACAATTT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 2 0 23918 CASAVA_Build 5 84701419 2I TATATGTTAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AT 5 6 23919 CASAVA_Build 5 84703326 1I TAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 496 het 112 hom 14 1 6 7 C 0 1 23920 CASAVA_Build 5 84705078 1D AAATAAAACG A/- AAAGTGTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 4 3 23921 CASAVA_Build 5 84706274 2D ATAAATGTGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 76 het 30 0 26 5 AT 8 7 23922 CASAVA_Build 5 84706980 1D AATAAGGGAT A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 7 6 23923 CASAVA_Build 5 84715156 4I AATGTTCTGT ----/GTTA GTTAGGTTTA 3070 hom 99 het 41 0 32 9 GTTA 1 2 23924 CASAVA_Build 5 84715339 1D ATTAGATCTA T/- TTTAATATCT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 4 3 23925 CASAVA_Build 5 84716524 1I GATTTCTGAG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 830 hom 29 2 22 5 T 0 1 23926 CASAVA_Build 5 84716843 1D GTTTAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 31 1 25 5 T 11 10 23927 CASAVA_Build 5 84718352 1I CTATAATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 9 10 23928 CASAVA_Build 5 84718888 1D TTTTAAAATT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 8 7 23929 CASAVA_Build 5 84722764 2D AAAATGTCTC TT/-- AAGATAGATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 2 0 23930 CASAVA_Build 5 84722992 1I TTTTGTAATG -/T TTGGAGACAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 2 3 23931 CASAVA_Build 5 84726198 2I AGAAAATAAC --/AA AAAAAAAACT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 8 10 23932 CASAVA_Build 5 84731232 1I TAAAAGTGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 10 23933 CASAVA_Build 5 84733353 1I AATAGCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 546 hom 32 2 23 7 A 11 12 23934 CASAVA_Build 5 84736841 1D GTCATTTCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 48 0 34 14 A 10 9 23935 CASAVA_Build 5 84752309 2D TTTACTTTAT TA/-- TTATTATTAT 437 het 46 hom 12 1 2 9 TA 1 0 23936 CASAVA_Build 5 84761096 1I TGCTCTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 10 11 23937 CASAVA_Build 5 84770023 4I AAGCTGGAAA ----/AAAT AAATAAAATA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 AAAT 1 2 23938 CASAVA_Build 5 84779508 2D TTATCTGTGT TC/-- TCTCTCTGCG 3070 het 3070 ref 60 28 28 4 TC 4 3 23939 CASAVA_Build 5 84780719 1I CCTCCCCCTT -/A TTGGTCCTTA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 0 1 23940 CASAVA_Build 5 84781378 5D26M1I TAAAAAAGAA GTTATGTTATGTTTAGAGATGGAAATACTCT-/-----GTTATGTTTAGAGATGGAAATACTCTG TTAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 43 27 19 5 N/A 0 0 23941 CASAVA_Build 5 84786083 1D TCTATTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2879 hom 31 11 15 6 T 12 11 23942 CASAVA_Build 5 84787283 1I TTTATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 11 12 23943 CASAVA_Build 5 84803559 1I AAAATAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 9 10 23944 CASAVA_Build 5 84807729 1D CTAACATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 44 0 31 14 A 15 14 23945 CASAVA_Build 5 84810953 1I GTAAATAAGA -/T TTTTTTTTTT 2768 het 2768 ref 26 12 10 4 T 11 12 23946 CASAVA_Build 5 84825924 1I TTAATAACGT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 6 7 23947 CASAVA_Build 5 84826937 4D ACCTTAGATC ACAA/---- ACAAACAATT 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 ACAA 3 2 23948 CASAVA_Build 5 84838173 1D TGAAATGGAT A/- AACTCAATAT 3070 het 3070 ref 51 28 17 6 A 3 2 23949 CASAVA_Build 5 84838690 1I ACATTGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 12 13 23950 CASAVA_Build 5 84846657 6I AATTTTGATT ------/TGAGTA TATTTTATTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 TGAGTA 0 1 23951 CASAVA_Build 5 84850234 77D ATAATCCTTA AATCTTTAAGAGAAAACTAGGTGCATATGAGTTTTTAATGATTCAACCTTTATTGACAATTATCTATGATGTATATT/----------------------------------------------------------------------------- AATAAGTAAT 3070 het 3070 ref 32 23 19 3 AATCTTTAAGAGAAAACTAGGTGCATATGAGTTTTTAATGATTCAACCTTTATTGACAATTATCTATGATGTATATT 1 0 23952 CASAVA_Build 5 84853339 1D AACTCATACC A/- AAAAAAAAAA 2088 het 1643 hom 13 5 5 3 A 13 12 23953 CASAVA_Build 5 84853442 1I ATGAGAAGTA -/T CTTTTTTTTC 3070 het 1573 hom 15 5 10 0 T 0 1 23954 CASAVA_Build 5 84868905 3D TCTATTTCTA TTC/--- TTATTTATTC 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 TTC 1 0 23955 CASAVA_Build 5 84879132 1I TTATCATGTC -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 6 7 23956 CASAVA_Build 5 84909145 1I15M1I CAAAAGGCAC -AAAAAAAATCTGCTA-/AAAAAAAAATCTGCTAT TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 41 20 23 3 N/A 0 0 23957 CASAVA_Build 5 84911014 3I ATTATCATTT ---/TGA TGATAAGAAC 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 TGA 1 2 23958 CASAVA_Build 5 84912717 2I GTAGTCCTTA --/GG ATAAATAAAT 3000 het 3000 ref 27 18 7 2 G 0 2 23959 CASAVA_Build 5 84916788 1D TTTTTGAAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 T 9 8 23960 CASAVA_Build 5 84921860 2D TGATCTCCCT CC/-- TCCCACCCTC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 C 2 0 23961 CASAVA_Build 5 84924759 1I GAGAAGATCA -/G AATAGAAATA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 0 1 23962 CASAVA_Build 5 84928866 2I TTTTATCAAC --/AT GTGCTAAATC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 AT 0 1 23963 CASAVA_Build 5 84930032 4D ATTTCCATGT TCTA/---- TCTTTTTATT 3070 het 3070 ref 31 13 15 3 TCTA 1 0 23964 CASAVA_Build 5 84932674 2I AAATGAACTC --/TA TACATCTGAG 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 TA 1 2 23965 CASAVA_Build 5 84934601 1I TCAATAACTG -/T TAAGGAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 1 2 23966 CASAVA_Build 5 84941842 1D TCAATAAAGC T/- GTACAAATGT 3070 het 3070 ref 39 23 12 5 T 1 0 23967 CASAVA_Build 5 84945244 1I TACCTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 19 5 T 11 12 23968 CASAVA_Build 5 84957365 3I TAACCTCTAG ---/TCA TTAACTGCCT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 TCA 0 1 23969 CASAVA_Build 5 84965151 1I TGTGATTTAT -/A AAGACATATC 3070 het 3070 ref 53 32 18 3 A 2 3 23970 CASAVA_Build 5 85006704 2D CCAATAGGAA AC/-- ACAGAGCATT 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 AC 2 1 23971 CASAVA_Build 5 85014646 3D TGCATGAAGA CAT/--- CATAAAAGAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 CAT 2 1 23972 CASAVA_Build 5 85028640 1D TAGCTCAAGG A/- AATCAGAGAT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 3 2 23973 CASAVA_Build 5 85033363 1I AAGAAATGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 9 10 23974 CASAVA_Build 5 85068387 2I TAGATAACTG --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 22 10 7 5 T 9 11 23975 CASAVA_Build 5 85086095 1I CTTCTGCAGG -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 6 7 23976 CASAVA_Build 5 85091569 1I AATCTCTTTT -/A CAGCATATTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 23977 CASAVA_Build 5 85096071 1D CACTTTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 10 9 23978 CASAVA_Build 5 85098973 4D GAACCTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 TTTG 5 4 23979 CASAVA_Build 5 85099952 6D9M9D TTCCATATAT TTTAAATTGTTTAATTTCCAAATA/------TTGTATAAT--------- TTTTAAAATT 3070 hom 72 het 20 0 25 2 N/A 0 0 23980 CASAVA_Build 5 85100219 1I ACAATGTTTC -/T TTGTTGAGTT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 2 3 23981 CASAVA_Build 5 85105669 2I AACAACAGAA --/AG AAGCCTAGGG 3070 hom 123 het 43 0 40 3 AG 0 1 23982 CASAVA_Build 5 85106613 1I GATAAACAAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 7 8 23983 CASAVA_Build 5 85113276 1D TAGATGATGA C/- TGAGCTTGAT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 C 1 0 23984 CASAVA_Build 5 85115576 1D AGATATTTTT A/- TAAAACCCTT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 A 1 0 23985 CASAVA_Build 5 85115703 2D TAGTGTGTGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 15 24 12 TG 10 9 23986 CASAVA_Build 5 85116321 1D TAAAAATTCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 9 8 23987 CASAVA_Build 5 85131060 1I ATTTAAACTA -/T TCAACTTATT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 23988 CASAVA_Build 5 85136625 1D TCCTTTATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2577 hom 33 8 17 8 T 10 9 23989 CASAVA_Build 5 85138127 1I AACTAGAGTC -/T CAGAAATACG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 0 1 23990 CASAVA_Build 5 85138714 2I CCTCCTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2442 het 2442 ref 36 23 7 6 T 13 15 23991 CASAVA_Build 5 85140415 3D TTTTTTTTTT TTA/--- AGGTTTCTTT 3070 het 2503 hom 40 12 24 6 TTA 1 0 23992 CASAVA_Build 5 85141053 2D CTCTCAGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 8 T 13 11 23993 CASAVA_Build 5 85143199 8D TGCCCCCGCC TTTTATTT/-------- ATTTATTTAT 2255 het 404 hom 16 5 9 2 TTTTATTT 1 0 23994 CASAVA_Build 5 85144723 4D AAAAAAGCAA AATG/---- AATGATGGAG 945 het 631 hom 13 3 4 7 AATG 2 1 23995 CASAVA_Build 5 85150100 3I ATAAAAGAAG ---/AAT AATTTGGCCA 3070 het 2935 hom 26 7 17 2 AAT 1 2 23996 CASAVA_Build 5 85150606 3D TCTTACCCTT AGG/--- AGGAGGTGAG 3070 hom 80 het 32 0 26 6 AGG 3 2 23997 CASAVA_Build 5 85150932 1I AACAACCCGT -/A ACATACTCAG 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 1 2 23998 CASAVA_Build 5 85152054 1D GTAAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 2034 het 1017 hom 25 10 8 7 T 17 16 23999 CASAVA_Build 5 85152550 3I ACAGAGCTTT ---/TTG TGTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 TTG 0 1 24000 CASAVA_Build 5 85153958 2D TGAAGTACAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 478 hom 30 1 12 17 AT 7 6 24001 CASAVA_Build 5 85155537 3I AATTACTCAT ---/CTC CTCCTCTTGC 3070 het 3070 hom 49 22 19 8 CTC 2 3 24002 CASAVA_Build 5 85156110 2I CCTCTGGAAT --/TG TTAACCAGAC 3070 het 3070 ref 44 23 20 1 TG 0 1 24003 CASAVA_Build 5 85158029 2I TTTCCTTATT --/TA TATATATATT 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 TA 4 5 24004 CASAVA_Build 5 85158359 1I GCTACAAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 9 10 24005 CASAVA_Build 5 85158655 1I TGTAAATTTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 T 8 9 24006 CASAVA_Build 5 85165333 6I GGATACATGT ------/ACAAAA ACTCAAAGGA 3070 hom 45 het 33 0 16 17 ACAAAA 0 1 24007 CASAVA_Build 5 85169527 1D TTGAATTGTG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 125 hom 37 2 14 21 C 10 9 24008 CASAVA_Build 5 85176035 1D TAATCTCTTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 8 7 24009 CASAVA_Build 5 85181743 30D ACAGCTCCAC TGGGCAGTGCCTCAGTCCCCACTGGGGACT/------------------------------ CCAAATATGA 3070 het 3070 ref 36 22 14 10 TGGGCAGTGCCTCAGTCCCCACTGGGGACT 1 0 24010 CASAVA_Build 5 85193352 1I CTTTCTGTCA -/G GGTTTGGGCA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 G 2 3 24011 CASAVA_Build 5 85194111 1D AAAGCAAAGA T/- TTTTCTCCAG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 5 4 24012 CASAVA_Build 5 85195713 1I GGAAAAAAAA -/T CTAATAATCC 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 0 1 24013 CASAVA_Build 5 85196284 1I TATATTAAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 A 9 10 24014 CASAVA_Build 5 85197374 1D AAAAATAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 T 11 10 24015 CASAVA_Build 5 85198538 2D GAAAGGAGAG AA/-- TGTTTCATCA 3070 het 3070 ref 27 17 7 3 A 2 0 24016 CASAVA_Build 5 85207040 3D AAATTTAGCA AAG/--- AAGAAGATGT 3070 het 3070 hom 48 17 23 10 AAG 3 2 24017 CASAVA_Build 5 85215377 1D TGTTGTATTT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 A 7 6 24018 CASAVA_Build 5 85225039 1I AAATACCCTT -/A AAACATAATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 4 24019 CASAVA_Build 5 85227073 1I GTAAACTAAT -/A AAAAAGATTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 5 6 24020 CASAVA_Build 5 85228811 2I TTTTAAAAAT --/TA TATATATATA 2586 het 1584 hom 13 4 6 3 TA 6 7 24021 CASAVA_Build 5 85229665 3I ACCCCTGTGG ---/CCA CCACCACCAC 3070 hom 84 het 47 0 31 16 CCA 3 4 24022 CASAVA_Build 5 85233607 1I AAACAATTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 10 24023 CASAVA_Build 5 85237920 1D TATAAAGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 405 hom 40 1 33 6 T 10 9 24024 CASAVA_Build 5 85238587 1D CAGTTAATTT A/- AAAAATACAC 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 A 6 5 24025 CASAVA_Build 5 85238865 1D GTTTTACTAT A/- AAAATGTCAC 3070 het 21 hom 39 1 33 5 A 5 4 24026 CASAVA_Build 5 85241779 2I CAGTCACCAA --/GT GTGCCCAGAG 3070 het 3070 ref 62 42 10 10 GT 1 2 24027 CASAVA_Build 5 85245623 1I ACAGCATATC -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 6 7 24028 CASAVA_Build 5 85245715 1D ACAGAATTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 8 24029 CASAVA_Build 5 85257537 1I CACAAAAAAA -/G AGGCTAAATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 0 1 24030 CASAVA_Build 5 85258020 1D TTCAGTTTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 9 24031 CASAVA_Build 5 85259675 1I AAGTATACAA -/C TGGGCCTAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 0 1 24032 CASAVA_Build 5 85260117 2D ATTTTCTGTT CC/-- CCCCCCCACC 2528 het 199 hom 12 3 7 2 C 9 7 24033 CASAVA_Build 5 85262159 4I GGAATTTGTT ----/AGTA AGTGTATATA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 AGTA 0 1 24034 CASAVA_Build 5 85262665 28D TGAGATCATT TTCTTCCTTACAGCTTCACCCCTTAGAA/---------------------------- TTCAGGTGAC 3070 het 3070 ref 38 30 15 3 TTCTTCCTTACAGCTTCACCCCTTAGAA 1 0 24035 CASAVA_Build 5 85263114 2D TACTTGTCTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 11 9 24036 CASAVA_Build 5 85263249 1D AGCTATATTT C/- CCCTATATAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 C 4 3 24037 CASAVA_Build 5 85264136 1I TAGCATAAAG -/T TTTGAAGCCT 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 T 3 4 24038 CASAVA_Build 5 85267348 3D TGCTATAGAT AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 AAC 7 6 24039 CASAVA_Build 5 85275996 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 A 8 9 24040 CASAVA_Build 5 85278286 1I TGGAGATAAC -/T TTGTATTTGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 2 3 24041 CASAVA_Build 5 85280249 1I CAATTTAGTG -/T TTTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 6 7 24042 CASAVA_Build 5 85289283 4D TTCTCATGAT AGTG/---- AGTAAATTCT 3070 het 3070 ref 41 28 12 2 AGTG 1 0 24043 CASAVA_Build 5 85295309 2I TTTTTTCTAA --/CT CTGGACATAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 CT 1 2 24044 CASAVA_Build 5 85298612 4D GTATAAGTAC TTTA/---- TTTATATTAA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 TTTA 2 1 24045 CASAVA_Build 5 85301097 7I CTTATCTGGA -------/TATTCTT TATTCTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 TATTCTT 1 2 24046 CASAVA_Build 5 85301976 17I CTACTGCTTT -----------------/AAAGTCCATTTTCTCTG ATATATTAAT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 AAAGTCCATTTTCTCTG 0 1 24047 CASAVA_Build 5 85307865 1D AAGATACTTA T/- TTTTTCATTG 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 6 5 24048 CASAVA_Build 5 85307962 1I TCTTTTTATA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 7 8 24049 CASAVA_Build 5 85309653 2I TTATATTCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AC 8 9 24050 CASAVA_Build 5 85311254 4I GACTGCTAGA ----/AAAT AAATAATTTG 2686 het 2686 ref 20 9 8 3 AAAT 1 2 24051 CASAVA_Build 5 85311468 2I CTCTTGGCTG --/TT TTTAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 3 5 24052 CASAVA_Build 5 85315772 1D GAGAAAACAA T/- TGGAGAGGTA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 2 1 24053 CASAVA_Build 5 85319794 3I AACCAGCACA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 11 14 24054 CASAVA_Build 5 85323538 1D GAAAGGGGGT G/- GGGGGGGGTA 3070 het 476 hom 30 1 17 13 G 9 8 24055 CASAVA_Build 5 85323863 2I TTATTAGGAA --/AG AATATTAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 AG 0 1 24056 CASAVA_Build 5 85324651 1I GAATCATATA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 T 6 7 24057 CASAVA_Build 5 85325649 1D TTAAAAAAAA T/- ATTCCCTTTG 2180 het 1682 hom 13 6 5 2 T 1 0 24058 CASAVA_Build 5 85328872 1D TGTTTATTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 20 10 7 4 A 10 9 24059 CASAVA_Build 5 85328961 1D GTTATATAAT A/- AAAAAGATGT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 6 5 24060 CASAVA_Build 5 85338044 1I ATGTGTCGGC -/G GGGGGGGGTG 2485 het 2485 ref 21 8 6 7 G 8 9 24061 CASAVA_Build 5 85340590 1D TTTGCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 52 hom 22 2 9 11 T 12 11 24062 CASAVA_Build 5 85341110 1D TGTCCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 20 9 T 12 11 24063 CASAVA_Build 5 85345322 1I ACAGGAATGC -/A ATGTGTAATA 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 A 1 2 24064 CASAVA_Build 5 85345454 1D ATAGTTGCCC T/- TGTTGTGCTG 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 2 1 24065 CASAVA_Build 5 85355423 1I ACGACCAATG -/A TGATGAGCAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 0 1 24066 CASAVA_Build 5 85360862 1I TTTCTCTGCA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 6 7 24067 CASAVA_Build 5 85361665 1I ATGTGTTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 A 9 10 24068 CASAVA_Build 5 85363227 2D TTTCTTTCTC TA/-- TCTTTCTCTT 2542 het 2542 ref 29 16 9 4 TA 1 0 24069 CASAVA_Build 5 85366656 1I TAACTTAGAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 8 9 24070 CASAVA_Build 5 85369574 1D AGAGTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2983 hom 38 11 21 6 A 15 14 24071 CASAVA_Build 5 85370974 1D AATTTTGTAA T/- CAGCAATGTG 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 1 0 24072 CASAVA_Build 5 85427612 1I AGGGTGGGGA -/C CAGTCAGAGG 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 C 1 2 24073 CASAVA_Build 5 85450495 4I GGTGATAATT ----/AATC AAAAGAGACT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AATC 0 1 24074 CASAVA_Build 5 85454383 4D TATATATATG TATA/---- TATATATATA 2393 het 756 hom 17 5 10 2 TA 7 5 24075 CASAVA_Build 5 85463822 4D AGCCCAAGAA GTTT/---- GTTTATTAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 GTTT 2 1 24076 CASAVA_Build 5 85466059 2D ATTTAAACAC TG/-- TATTTCTCAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 6 TG 1 0 24077 CASAVA_Build 5 85483430 17I TCCCAGTTTC -----------------/CCATGAATATTCAAATA CCATTGGCTC 3070 hom 78 het 27 0 27 1 CCATGAATATTCAAATA 0 1 24078 CASAVA_Build 5 85483944 1I AGGTAGTCAA -/T TTTTAAACTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 4 5 24079 CASAVA_Build 5 85486894 2I GTAAAAAAAA --/AT AACAGTTCTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AT 0 1 24080 CASAVA_Build 5 85495827 5I CTCTTACAGG -----/TAGAA TAAAGATCAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TAGAA 0 1 24081 CASAVA_Build 5 85498708 3D AGAATGTAAC TAA/--- TAAGTTTCCA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TAA 2 1 24082 CASAVA_Build 5 85503282 1I51M1I TTCAGTCATC -AAAAAAAAAAAAGTAGCAGAAAATAAGGCGAGGGGATTATCCTTTCACTCA-/AAAAAAAAAAAAAGTAGCAGAAAATAAGGCGAGGGGATTATCCTTTCACTCAC CCCCACTGTC 3070 het 1082 hom 26 3 19 22 N/A 0 0 24083 CASAVA_Build 5 85508881 1D TAATGCATAG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 7 24084 CASAVA_Build 5 85510525 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 11 24085 CASAVA_Build 5 85513770 1D TCACAGCCAC A/- AGTAATGAAG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 2 1 24086 CASAVA_Build 5 85518111 1D TATTTTTTAC T/- TTAATTTTCA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 3 2 24087 CASAVA_Build 5 85522909 1I TAAATAATAT -/A TTTTTTTGTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 0 1 24088 CASAVA_Build 5 85529982 1I TGTTAGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 38 3 23 12 T 11 12 24089 CASAVA_Build 5 85538580 1D TTAATGGCTT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 8 7 24090 CASAVA_Build 5 85539177 1I CAATATAATG -/A AAAAACAACA 3070 hom 163 het 59 0 55 4 A 5 6 24091 CASAVA_Build 5 85541773 1I GAAGGCCCAA -/T AACAAACCTA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 0 1 24092 CASAVA_Build 5 85544970 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 45 1 42 2 T 12 11 24093 CASAVA_Build 5 85546078 2D AACCCCATTG TC/-- TCTGTCCAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TC 2 1 24094 CASAVA_Build 5 85546218 1D ACTCTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 18 0 10 8 T 11 10 24095 CASAVA_Build 5 85549060 2I ATCTGTCTTT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 59 het 26 0 20 6 A 9 11 24096 CASAVA_Build 5 85554090 1I TTCCAAGTTG -/A AAAAAATGAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 6 7 24097 CASAVA_Build 5 85554871 1I CAATTAAAAC -/A AAAAAAGTGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 7 24098 CASAVA_Build 5 85555101 1I19M1I GATAGGGGCA -GGAAGTGCTAGGTAGAGCA-/GGGAAGTGCTAGGTAGAGCAG GGTGAGGTCC 3070 hom 78 het 28 0 26 6 N/A 0 0 24099 CASAVA_Build 5 85555269 1I CCCATAAAAA -/C CCCGAGCCCC 3070 hom 69 het 28 0 22 6 C 3 4 24100 CASAVA_Build 5 85561072 1I GTTTTCTACA -/T TTATTAAATG 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 2 3 24101 CASAVA_Build 5 85561481 13D GACCCAAATA AATTTTGGTCCTT/------------- AAGATTTGCT 3070 hom 81 het 31 0 28 6 AATTTTGGTCCTT 1 0 24102 CASAVA_Build 5 85563321 4I CACGCACTGC ----/TCTA TCTTTGTATA 3070 hom 89 het 35 0 30 5 TCTA 0 1 24103 CASAVA_Build 5 85564868 1D ATAGTTTGCT A/- ATGAATCATT 3070 het 3070 hom 35 15 20 0 A 2 1 24104 CASAVA_Build 5 85566784 14D TCTATTAAAC ATATATATATATAT/-------------- ATATATATAT 1992 hom 11 het 18 0 6 14 AT 16 9 24105 CASAVA_Build 5 85568214 1D TTCTCTTTTC A/- AAAACTTATA 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 5 4 24106 CASAVA_Build 5 85569722 1I CATAAAAAAT -/G ATGAGTTCAT 2402 het 2402 ref 17 8 6 3 G 0 1 24107 CASAVA_Build 5 85570204 3D AAAACTACTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 11 6 A 15 12 24108 CASAVA_Build 5 85570770 4D TATTCGTGCC TTGT/---- TTGTTGAATT 3070 het 3070 ref 39 22 17 3 TTGT 2 1 24109 CASAVA_Build 5 85573261 1D GAAATACACC T/- TTTAGAATAG 3070 het 3070 hom 37 12 25 0 T 4 3 24110 CASAVA_Build 5 85577924 2I ATTCTGACTC --/TG TGTCTTGGAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TG 1 2 24111 CASAVA_Build 5 85579721 1D TAGGGTACAT G/- TGCACATTGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 0 24112 CASAVA_Build 5 85579807 1D TGTTGAATGA T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 7 24113 CASAVA_Build 5 85579917 1D CATCGCAGGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 9 8 24114 CASAVA_Build 5 85586313 9D CTTACAATAA CAGTCCAAG/--------- TACATAGACA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 CAGTCCAAG 1 0 24115 CASAVA_Build 5 85588652 1I AACAAAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 853 hom 33 2 29 2 T 10 11 24116 CASAVA_Build 5 85590025 1D TTGCCAGGGG C/- TCAGGGAAAG 3070 hom 111 het 41 0 37 5 C 1 0 24117 CASAVA_Build 5 85602451 1D GGGAGTGACC T/- GATTTTTCAG 3070 het 3070 ref 28 14 7 7 T 1 0 24118 CASAVA_Build 5 85607879 4I23M1D AAAAAAAGAA ----AAAAACAATGGAATAGAACAAACA/AAACAAAAACAATGGAATAGAACAAAC- CAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 29 25 8 1 N/A 0 0 24119 CASAVA_Build 5 85609818 1I TGACTGCCAG -/T TAAGTACAGG 3070 het 3070 ref 46 27 18 1 T 1 2 24120 CASAVA_Build 5 85624156 2D ATATAGGGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TA 6 5 24121 CASAVA_Build 5 85624350 1I TTAACTTTGA -/T TTTTGTAATC 1423 het 1423 ref 47 33 4 10 T 4 5 24122 CASAVA_Build 5 85642832 1D CAAAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1673 hom 36 13 11 12 A 17 16 24123 CASAVA_Build 5 85646312 1I GTCTTTCCGG -/T GGTATTCTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 0 1 24124 CASAVA_Build 5 85648243 1D ACTAGAATAC A/- AAAAAATAAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 7 6 24125 CASAVA_Build 5 85649590 1D GCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2153 het 229 hom 17 2 6 9 T 17 16 24126 CASAVA_Build 5 85651544 1D CCCTGTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 11 13 A 11 10 24127 CASAVA_Build 5 85651697 5I AGTCCTATTG -----/ATATA ATATAACAAC 3070 het 3070 ref 50 29 16 5 ATATA 1 2 24128 CASAVA_Build 5 85653377 2D TAACATGATC AT/-- ATATATAAAG 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 AT 4 3 24129 CASAVA_Build 5 85653803 1I GAAATAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 34 2 23 9 C 0 1 24130 CASAVA_Build 5 85668071 2I GATATCTGTA --/TT TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 7 9 24131 CASAVA_Build 5 85674708 1D TATAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 1899 het 1899 ref 33 24 5 4 A 13 12 24132 CASAVA_Build 5 85677272 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 TA 7 6 24133 CASAVA_Build 5 85680488 4I AGGTGAATGG ----/ATAA ATAAACTGTG 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 ATAA 1 2 24134 CASAVA_Build 5 85681288 1I22M1I CAGGATAAAA -TGAGGAAGCTAATTCATATCCC-/TTGAGGAAGCTAATTCATATCCCT TGGGGTGAAG 3070 hom 138 het 40 0 47 3 N/A 0 0 24135 CASAVA_Build 5 85683093 1D TGCTTCCCAC T/- TTCTTATGGA 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 3 2 24136 CASAVA_Build 5 85683903 5I AGGTATAAAA -----/TATAT TATAATTATG 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 TATAT 0 1 24137 CASAVA_Build 5 85684418 3I GTGGGAGAGG ---/AGA AGGCCATTAT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 AGA 0 1 24138 CASAVA_Build 5 85688755 1I AGTAATGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 22 18 11 T 11 12 24139 CASAVA_Build 5 85689684 1I CTAGTGTGTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 48 16 23 9 T 8 9 24140 CASAVA_Build 5 85690406 4I TTGGCTTTTC ----/TTCT TTCTGTCTTG 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 TTCT 1 2 24141 CASAVA_Build 5 85697411 1I TTTTATAAAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 A 7 8 24142 CASAVA_Build 5 85723172 1I TCATCTAATA -/T TGGCTACCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 2 24143 CASAVA_Build 5 85724405 4I TGGTATGAAT ----/ATAA ATAAATATTT 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 ATAA 1 2 24144 CASAVA_Build 5 85726979 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 603 hom 27 6 19 2 A 15 14 24145 CASAVA_Build 5 85732576 1I ACGGAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 A 9 10 24146 CASAVA_Build 5 85735391 1I TCAGTCTACC -/A ATTTAAATGT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 24147 CASAVA_Build 5 85758593 26D GTAAATATGC ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 3070 het 398 hom 15 2 11 6 AT 19 6 24148 CASAVA_Build 5 85764816 1I TACTCTGTAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 A 8 9 24149 CASAVA_Build 5 85780751 7D GTACATTCCA GTGCTAT/------- ATGCTCTAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 GTGCTAT 1 0 24150 CASAVA_Build 5 85782023 2D TTGTTTTACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 17 14 T 15 13 24151 CASAVA_Build 5 85783560 3I CTTCCTCTGA ---/TCT TCTCTGATAA 3070 het 3070 ref 53 28 21 4 TCT 1 2 24152 CASAVA_Build 5 85785140 2I CTCTACAGAA --/TT TTTTTTTTTT 2753 het 2019 hom 21 7 8 6 T 14 16 24153 CASAVA_Build 5 85785965 3D CAATAAGGAT ATC/--- ATTGATAACT 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 ATC 1 0 24154 CASAVA_Build 5 85798930 1I CTCTACCAGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 7 8 24155 CASAVA_Build 5 85800481 2D TAGGCGTATA AC/-- ACACTTTAAG 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 AC 3 2 24156 CASAVA_Build 5 85800975 9D GCACATTCTG TATCACTCT/--------- TATCACTCTT 3070 het 3070 hom 44 20 20 6 TATCACTCT 2 1 24157 CASAVA_Build 5 85803271 3D ACTATTTCTC TTG/--- TTGTTGTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 TTG 3 2 24158 CASAVA_Build 5 85806117 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 14 0 12 3 AT 7 6 24159 CASAVA_Build 5 85810893 1D TAATGTATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 10 9 24160 CASAVA_Build 5 85813389 1D TTGAGCGCTT A/- AAAAAGCATC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 6 5 24161 CASAVA_Build 5 85819433 1D AGCTGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 50 2 26 23 A 16 15 24162 CASAVA_Build 5 85820010 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTC 518 het 19 hom 28 1 6 21 T 11 9 24163 CASAVA_Build 5 85823968 1I TTTTTTCATG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 8 24164 CASAVA_Build 5 85830035 4I GACAAAGAAA ----/AGGC AGGTCTGTAC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 AGGC 0 1 24165 CASAVA_Build 5 85831299 1D TGATGATGAT A/- GATAGATAGA 3070 hom 62 het 44 1 39 4 A 1 0 24166 CASAVA_Build 5 85838011 1D ACAAAACAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 53 het 22 0 21 1 A 10 9 24167 CASAVA_Build 5 85848287 7D TAATAAAAAA TAAAAAT/------- AAAAAAATAA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 TAAAAAT 1 0 24168 CASAVA_Build 5 85848680 1D ATCCCAGAGG T/- TTTCAGTATG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 4 3 24169 CASAVA_Build 5 85892755 1D AAATGGGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 11 10 24170 CASAVA_Build 5 85925598 1D ATAGGTTTCT G/- GGGGGGGGAT 3070 hom 102 het 43 0 33 10 G 9 8 24171 CASAVA_Build 5 85995811 1D GGCATGGGTG A/- TTCTAGAAGA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 1 0 24172 CASAVA_Build 5 86010206 1D TATAATATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 10 9 24173 CASAVA_Build 5 86010559 2D ACCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 T 14 12 24174 CASAVA_Build 5 86014855 1I TTTGATTTGA -/G GTTCTGTCCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 2 24175 CASAVA_Build 5 86015245 4D TTTTAAACTC AACA/---- AACAGAGTAT 3070 hom 96 het 35 0 33 6 AACA 2 1 24176 CASAVA_Build 5 86017833 1D AATCCCAAGA T/- TTCTGATTCA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 3 2 24177 CASAVA_Build 5 86020241 4D4M12D GACCCTTGAA ATGCTAGTGAAATTCAAGAC/----TACT------------ CCTGAAGGAC 3070 hom 96 het 32 0 33 3 N/A 0 0 24178 CASAVA_Build 5 86027542 1D GAATCTAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 10 9 24179 CASAVA_Build 5 86028164 28D GATAGCTGCT TGTGGTCAGGAGTTTGTAATTCTTTGAA/---------------------------- TGTGGTCAGG 3070 hom 66 het 31 0 23 14 TGTGGTCAGGAGTTTGTAATTCTTTGAA 2 1 24180 CASAVA_Build 5 86029297 2D AATACAACTC AT/-- GTACTGGGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AT 1 0 24181 CASAVA_Build 5 86035966 3D AGTGTCCAAC AAT/--- GATAGACTGG 3070 hom 44 het 18 0 13 5 AAT 1 0 24182 CASAVA_Build 5 86036850 4D CCATTTGTTT AATA/---- AATGTATTGA 3070 hom 90 het 37 0 25 12 AATA 1 0 24183 CASAVA_Build 5 86039322 1D AAGCTGCTTT A/- AAAAAATGCC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 6 24184 CASAVA_Build 5 86042921 1D AAGTACAGTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 9 8 24185 CASAVA_Build 5 86043145 1D AGCATTCACT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 44 0 33 11 A 10 9 24186 CASAVA_Build 5 86045283 2D CTAGATGAAC TA/-- TATATATATA 3070 het 102 hom 35 2 24 10 TA 9 8 24187 CASAVA_Build 5 86064870 1D TTGTTGACAG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 115 het 41 0 38 3 T 9 8 24188 CASAVA_Build 5 86065862 1D TCCATTTTCA T/- GTTTAAAAGC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 1 0 24189 CASAVA_Build 5 86067633 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 23 1 18 4 T 15 14 24190 CASAVA_Build 5 86069645 1D AGACAGTGAC A/- GATCATCAGG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 0 24191 CASAVA_Build 5 86079907 1I GTGTATGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 11 12 24192 CASAVA_Build 5 86123607 1D GCACCTTACA T/- TTTTTTTTTT 3018 het 3018 ref 31 11 8 12 T 17 16 24193 CASAVA_Build 5 86169552 1D TTTTAGGAAG T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 12 9 T 2 1 24194 CASAVA_Build 5 86181044 6D GGCATCTTTG TCTTGT/------ TCTTGTCCAG 3070 hom 81 het 32 0 27 6 TCTTGT 2 1 24195 CASAVA_Build 5 86214971 4I CATTTTCTTG ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTTA 1 2 24196 CASAVA_Build 5 86233986 1D TTTTCCCTCA C/- TTTTGAACTT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 C 1 0 24197 CASAVA_Build 5 86237085 1D AATGTTAATT A/- AAAAAAGATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 7 6 24198 CASAVA_Build 5 86240790 1D GCAGATTGAA T/- TTTTAAAAGA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 T 5 4 24199 CASAVA_Build 5 86247629 1D TTTCAAGATA G/- GCAATATGAC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 G 2 1 24200 CASAVA_Build 5 86250988 2I ATATATAAAC --/TA TATATATATA 2146 hom 12 het 5 0 5 0 TA 5 6 24201 CASAVA_Build 5 86251150 4D21M3D AGTATCATAT TATATATAATACTACATATTTATATATA/----TATAATACTACATATTTATAT--- ATTATATATA 2940 hom 15 het 6 0 6 0 N/A 0 0 24202 CASAVA_Build 5 86254970 7D ATTGTATCTA TTTTTGT/------- TTGCCTGTGT 3070 hom 117 het 42 0 40 4 TTTTTGT 1 0 24203 CASAVA_Build 5 86263183 2D ACCCTGTCCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 157 hom 28 3 17 9 A 16 14 24204 CASAVA_Build 5 86265572 4D GCTCTAATAG AATT/---- AATTAACTTT 3070 hom 81 het 31 0 27 5 AATT 2 1 24205 CASAVA_Build 5 86266165 1D TCAAAAAAAA G/- GAGCCCTTAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 2 1 24206 CASAVA_Build 5 86278214 8I TTCACATGAT --------/AGAGAGAG AGAGTAAACT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 AG 2 6 24207 CASAVA_Build 5 86280825 1I TCTCAATTTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 30 2 24 4 T 0 1 24208 CASAVA_Build 5 86296290 1I AATAAAGCAG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 72 het 29 0 23 6 T 7 8 24209 CASAVA_Build 5 86298776 1D AAGCTGGAAG A/- AAAAAAAAAC 1143 het 1143 ref 40 30 4 7 A 10 9 24210 CASAVA_Build 5 86299676 1D GCTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 23 6 A 13 12 24211 CASAVA_Build 5 86303910 2I ATAGAATTAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 9 11 24212 CASAVA_Build 5 86331952 1I CTATTTCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 426 hom 33 1 26 6 A 9 10 24213 CASAVA_Build 5 86332338 1I GTTTGGCGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 11 24214 CASAVA_Build 5 86335787 1D GACCAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 787 hom 32 4 18 10 A 15 14 24215 CASAVA_Build 5 86340339 1I CATTTTCTCA -/T TTTGCATGTG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 3 4 24216 CASAVA_Build 5 86353226 2D TTTTTTTTTT TA/-- TTTCAGTAGT 1821 hom 4 het 17 1 10 6 TA 1 0 24217 CASAVA_Build 5 86364577 1D TTTTTTTTCT G/- TTGTTGCTTT 3070 hom 54 het 24 0 22 2 G 1 0 24218 CASAVA_Build 5 86375100 2I GGGACTTCAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 59 het 38 0 27 11 GT 8 9 24219 CASAVA_Build 5 86378345 4I TCTTCAGGTT ----/TTTC TTTCTTCTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTTC 1 2 24220 CASAVA_Build 5 86391523 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAATCT 2594 hom 15 het 7 0 6 1 A 8 7 24221 CASAVA_Build 5 86392233 1D TAATCCCAGC A/- CTTAGGGAGG 2905 het 807 hom 16 3 9 4 A 1 0 24222 CASAVA_Build 5 86394485 1I AAAAATCACA -/T TAAACAAGCC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 1 2 24223 CASAVA_Build 5 86414811 1D TTGTACAGGT A/- AAAAAAGTGA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 7 6 24224 CASAVA_Build 5 86423389 2D CATTTTTTCA TG/-- TGTTTTTTGG 976 hom 7 het 3 0 3 0 TG 2 1 24225 CASAVA_Build 5 86440270 1D ATGTCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 237 hom 25 2 16 7 T 13 12 24226 CASAVA_Build 5 86442372 7D AAGAAAGAAC TTTTTAG/------- TTTAGGACTC 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TTTTTAG 1 0 24227 CASAVA_Build 5 86442490 1D AATGACAGGG C/- CTCCAGCCTC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 C 2 1 24228 CASAVA_Build 5 86450712 4D AAAAAAAAAA AAAT/---- AGTGTTCCAG 1565 het 182 hom 16 3 7 7 AAAT 1 0 24229 CASAVA_Build 5 86453236 2D AACAAGTGAA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 10 8 24230 CASAVA_Build 5 86454698 1D CAGCAGGGGG T/- AAAAAAAAGA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 T 1 0 24231 CASAVA_Build 5 86456405 1D GGATAGAAAA T/- TTTAAAATAC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 4 3 24232 CASAVA_Build 5 86488485 3D ATACAAAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 A 13 10 24233 CASAVA_Build 5 86498838 3I GTAGTGTGAC ---/TTA TTATTTCATT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TTA 1 2 24234 CASAVA_Build 5 86521138 1I AGAGCCGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 10 11 24235 CASAVA_Build 5 86541699 1D CTTGAATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 11 10 24236 CASAVA_Build 5 86560884 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 518 het 518 ref 25 16 2 7 T 13 14 24237 CASAVA_Build 5 86585005 1I ATTTGTAACC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 892 hom 20 3 13 4 T 6 7 24238 CASAVA_Build 5 86593061 1D CTCGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 2888 het 176 hom 19 1 9 9 A 12 11 24239 CASAVA_Build 5 86595732 1I TAAAAAAAAA -/T AAATATATTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 0 1 24240 CASAVA_Build 5 86609964 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 15 14 24241 CASAVA_Build 5 86628196 3D ACACTTTAGT TTA/--- ATTTCATTCT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 TTA 1 0 24242 CASAVA_Build 5 86659896 1I TCCAGTTGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 117 het 50 0 40 10 T 9 10 24243 CASAVA_Build 5 86660539 5D GATGGCTGGA TAATT/----- TAATTGCAGT 3070 hom 83 het 31 0 27 5 TAATT 2 1 24244 CASAVA_Build 5 86672921 1I TATTAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 10 11 24245 CASAVA_Build 5 86673297 1I CAGCAAGGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 9 10 24246 CASAVA_Build 5 86683877 2I ACTTGAAGAT --/AC ACACACACAC 3070 het 1278 hom 17 4 12 1 AC 7 8 24247 CASAVA_Build 5 86689278 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 9 10 24248 CASAVA_Build 5 86690528 1D CAAATGACAC T/- TTACCTAGAC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 3 2 24249 CASAVA_Build 5 86703613 1I GTTGAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 600 hom 38 2 28 8 A 10 11 24250 CASAVA_Build 5 86773314 1D TTTTGTTAGC A/- GAAGGTCTTG 3070 hom 129 het 46 0 44 3 A 1 0 24251 CASAVA_Build 5 86780623 17I GGGAAAAAAA -----------------/TAGACACTGCAGACTAC TAGAGAGGGG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 TAGACACTGCAGACTAC 0 1 24252 CASAVA_Build 5 86855627 1I TTAAAATGGT -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 7 8 24253 CASAVA_Build 5 86891212 2I GGCCCTGAAA --/CT CTTTCCAGGA 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 CT 1 2 24254 CASAVA_Build 5 86893778 5I CTTAAAACTT -----/TAAAC TATTAAAAAA 2574 hom 15 het 7 0 6 1 TAAAC 0 1 24255 CASAVA_Build 5 86894625 1D ATGATCACCA T/- TTCTAACTGG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 3 2 24256 CASAVA_Build 5 86896396 4D CCTAGTTTAT TGAG/---- TGTGTTTTAG 3070 het 3070 ref 46 28 15 7 TGAG 1 0 24257 CASAVA_Build 5 86905179 4I ACTAGCTCTC ----/TCTT TCTCTTAACC 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 TCTT 0 1 24258 CASAVA_Build 5 86913201 1D GTGCTTACTC T/- TTCTCAGTGA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 3 2 24259 CASAVA_Build 5 86922318 1I GTGTAAGATA -/G GCAAACCCAG 3070 het 3070 ref 46 28 13 5 G 1 2 24260 CASAVA_Build 5 86936218 1I ATTAGTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 10 11 24261 CASAVA_Build 5 87056377 8I AGTGTGTCGA --------/ACTACGGG TGTGTATGTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ACTACGGG 0 1 24262 CASAVA_Build 5 87057796 1D CACCAAACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 103 het 40 0 35 5 T 10 9 24263 CASAVA_Build 5 87065223 2D TGGATGCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 1074 het 790 hom 46 11 4 31 A 14 12 24264 CASAVA_Build 5 87068879 1I AATAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 568 hom 34 3 26 5 A 10 11 24265 CASAVA_Build 5 87074605 1D TCTTCTAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 25 1 16 8 A 15 14 24266 CASAVA_Build 5 87075647 2D GAAAAAAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 33 0 19 14 T 18 16 24267 CASAVA_Build 5 87098441 1I ATCTTATATA -/T AAAACAATTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 1 24268 CASAVA_Build 5 87098873 1I TCTTCCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 10 11 24269 CASAVA_Build 5 87100674 1I TCAGTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 36 1 26 9 A 13 14 24270 CASAVA_Build 5 87104690 1D ATTTTTTAGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 A 8 7 24271 CASAVA_Build 5 87105099 1I ATCCCAATGA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 6 7 24272 CASAVA_Build 5 87113310 1D TTTTTCCTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 9 8 24273 CASAVA_Build 5 87117463 1I ATAGGGAAAC -/A AACAGCCACA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 2 3 24274 CASAVA_Build 5 87121070 1I TTTTCTTGTT -/A AAAATCCACC 3070 het 3070 ref 41 19 20 2 A 4 5 24275 CASAVA_Build 5 87129893 1D GGTCTCAGGC T/- TCAGGGCTTA 3070 het 2846 hom 18 7 8 3 T 2 1 24276 CASAVA_Build 5 87136199 7D TTTGCATAAT ATGTATA/------- ATATTTAAGA 3070 het 3070 ref 34 15 15 12 ATGTATA 1 0 24277 CASAVA_Build 5 87140114 1I TAATATATAG -/A AAAAATAGAT 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 5 6 24278 CASAVA_Build 5 87141055 1D TATTGGAAAT A/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 1 0 24279 CASAVA_Build 5 87152354 1D TTTAATGTCC T/- TTTTTTTTTG 1149 het 1149 ref 33 23 3 8 T 10 9 24280 CASAVA_Build 5 87157714 4D ATAGCAAAGA AAGT/---- AATACTACCT 3070 het 3070 ref 46 24 20 3 AAGT 1 0 24281 CASAVA_Build 5 87160492 1D ATTAGATTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 2773 hom 23 7 12 4 T 9 8 24282 CASAVA_Build 5 87170028 1D TTCAAGATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 10 9 24283 CASAVA_Build 5 87170919 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 25 15 12 T 11 10 24284 CASAVA_Build 5 87173732 4D TTGTCATGTT GTAA/---- GTTTTATTTC 3070 het 3070 ref 32 20 9 5 GTAA 1 0 24285 CASAVA_Build 5 87199025 1D CAAAGCCTTA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 38 16 14 9 T 7 6 24286 CASAVA_Build 5 87200054 4I TGTGCAAAAG ----/AGTT AGTCTGAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 AGTT 0 1 24287 CASAVA_Build 5 87202736 3D ACCGCCCCCC CCA/--- CCCCCACACA 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 CCA 1 0 24288 CASAVA_Build 5 87219815 1I TACTTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 10 11 24289 CASAVA_Build 5 87222972 2D AGAAAACAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 14 12 12 AG 12 11 24290 CASAVA_Build 5 87240440 1I AGACCTACAT -/A TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 0 1 24291 CASAVA_Build 5 87282053 1D CAGCCTCCTC T/- TTTGTAAGAT 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 T 4 3 24292 CASAVA_Build 5 87286910 7I TGGGATTACA -------/GGCGCAT GCCACCACAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 GGCGCAT 0 1 24293 CASAVA_Build 5 87288214 4I AAAGGATGAA ----/AAAG AAGAAGAGGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 AAAG 0 1 24294 CASAVA_Build 5 87289782 1I TTTCACAGAC -/T TTTTTTTTTT 2576 het 1003 hom 17 4 7 6 T 13 14 24295 CASAVA_Build 5 87291835 1I TTTTTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 11 12 24296 CASAVA_Build 5 87297338 1D AAACCCTTTC A/- ACTAAGCTCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 1 24297 CASAVA_Build 5 87299561 4D AAAATTTTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 26 9 16 2 AAAT 3 2 24298 CASAVA_Build 5 87301720 3I AAAGCATAAT ---/GTA GTATGTTAGA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 GTA 1 2 24299 CASAVA_Build 5 87307778 1I CCTTCTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 9 10 24300 CASAVA_Build 5 87310621 2I AAAGGCTGTA --/CC CTGTGGAGCC 3070 het 3070 hom 45 13 25 7 C 1 3 24301 CASAVA_Build 5 87316052 4D TATAATTTTG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 GTTT 4 3 24302 CASAVA_Build 5 87336369 1D TGGCCTATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 10 9 24303 CASAVA_Build 5 87336809 1D AATGTGCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 52 23 19 10 A 10 9 24304 CASAVA_Build 5 87339367 1I TCTTAGTGAC -/A AAAAAAAGGT 3070 het 137 hom 47 1 41 5 A 7 8 24305 CASAVA_Build 5 87340994 1I TTCAAACTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 8 9 24306 CASAVA_Build 5 87350481 1D CATAATTACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 8 24307 CASAVA_Build 5 87359177 2I TCCTTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 38 15 11 12 TC 6 7 24308 CASAVA_Build 5 87362154 3D AAGGGGTAAA AAT/--- AATGGGGTAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 AAT 2 1 24309 CASAVA_Build 5 87375994 1I CCATATGGGG -/A AAAAAATGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 7 24310 CASAVA_Build 5 87381703 1I TGCAAAGCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1133 hom 32 4 26 2 A 10 11 24311 CASAVA_Build 5 87389925 1I AAAAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 20 1 14 5 A 13 14 24312 CASAVA_Build 5 87393413 1D GAAAGGATGG T/- GCAGTGCAAC 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 T 1 0 24313 CASAVA_Build 5 87396064 1I AGAATGTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 9 10 24314 CASAVA_Build 5 87396254 1D ATTAAACAAC T/- TTGCTCCTGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 3 2 24315 CASAVA_Build 5 87400448 1I ACAAATATAT -/A GTAAGGTGGA 3070 hom 78 het 37 0 27 10 A 0 1 24316 CASAVA_Build 5 87403654 1I ATTCTTAAAG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 7 8 24317 CASAVA_Build 5 87419294 1D ATAAAATAAT A/- AATAACAAAA 2860 het 2860 ref 17 8 9 0 A 3 2 24318 CASAVA_Build 5 87420269 4I TGAATAAGTG ----/AGTA AGTAAGTGAA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AGTA 1 2 24319 CASAVA_Build 5 87440274 14D ACTTTTAAAG GGCACAAATAAAAC/-------------- GGTGGAGATG 3070 het 3070 ref 35 22 12 7 GGCACAAATAAAAC 1 0 24320 CASAVA_Build 5 87440594 2I GAAAAAGGGC --/TG TGTGTGGGAT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 TG 3 4 24321 CASAVA_Build 5 87441751 1D AAAATAAACC T/- TTTTTTTGTT 2880 het 2250 hom 30 11 10 9 T 8 7 24322 CASAVA_Build 5 87471109 1I CTTTCTAAGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 7 8 24323 CASAVA_Build 5 87474052 2I CACAAACACG --/CA CACACACGCA 1968 het 1968 ref 40 16 10 14 CA 3 4 24324 CASAVA_Build 5 87476210 1D AAGTGAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 12 11 24325 CASAVA_Build 5 87478649 4D GATATCTAAC TAAA/---- TAATCTCCAA 3070 het 3070 ref 28 14 13 3 TAAA 1 0 24326 CASAVA_Build 5 87484285 1D16M1I CTAGAACTTT AAAAAAAAAAAACTATC-/-AAAAAAAAAAACTATCT TTTTCTATTG 3070 hom 39 het 24 1 23 5 N/A 0 0 24327 CASAVA_Build 5 87501116 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTCCAA 3070 het 2591 hom 19 6 12 1 T 6 7 24328 CASAVA_Build 5 87506827 1I AGTCTTATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 T 9 10 24329 CASAVA_Build 5 87514978 3D GTCATTTTCA TAG/--- TAGTTGTACC 3070 het 3070 ref 43 24 18 4 TAG 2 1 24330 CASAVA_Build 5 87519345 4I CGTTTTTAGC ----/TTTA TTAATTTTCT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 TTTA 0 1 24331 CASAVA_Build 5 87531669 1I AGAAAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 A 10 11 24332 CASAVA_Build 5 87532628 1I GATTTTTAAC -/A AAAAATTAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 5 6 24333 CASAVA_Build 5 87534011 1D AAATATCCTT A/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 1 0 24334 CASAVA_Build 5 87536423 1I AAGTGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 10 11 24335 CASAVA_Build 5 87538844 3D ATAAAATTTG ACT/--- ACAACATTTA 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 ACT 1 0 24336 CASAVA_Build 5 87541436 5I ATCATCTGAA -----/CTGCC CTCTTCCCTC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CTGCC 0 1 24337 CASAVA_Build 5 87542990 1I GAAAAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 10 11 24338 CASAVA_Build 5 87545141 4D CAAAAGAAAA CTAT/---- CTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 CTAT 1 0 24339 CASAVA_Build 5 87547071 1I AGGTTTGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 41 1 34 6 A 10 11 24340 CASAVA_Build 5 87549479 1D TACTAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 592 hom 31 3 19 10 A 15 14 24341 CASAVA_Build 5 87550535 1D GAATATCTTT A/- AAAAGAGCTC 3070 het 3070 ref 26 9 9 11 A 5 4 24342 CASAVA_Build 5 87558535 1D TCTCTACAAA T/- TTTTTTTTTT 922 het 922 ref 34 20 4 10 T 11 10 24343 CASAVA_Build 5 87564153 1D CATTTTCTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 190 hom 24 1 16 7 T 10 9 24344 CASAVA_Build 5 87569291 2I AGACTACTAT --/AC ACAGTTTCTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AC 1 2 24345 CASAVA_Build 5 87580288 1D GTCGACTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 747 hom 41 6 23 14 A 17 16 24346 CASAVA_Build 5 87583184 1D GAAGCAAGAT G/- GGAGTCAACT 3070 hom 120 het 41 0 40 1 G 3 2 24347 CASAVA_Build 5 87646495 1I CTCTTATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 14 11 A 13 14 24348 CASAVA_Build 5 87655253 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1024 het 1024 ref 18 11 3 4 A 15 16 24349 CASAVA_Build 5 87678240 4D CAAGGTGATC ATAA/---- ATAGACTACA 2890 het 2890 ref 24 14 7 3 ATAA 1 0 24350 CASAVA_Build 5 87730514 1I ATTTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 2910 het 2910 ref 27 12 11 4 A 13 14 24351 CASAVA_Build 5 87731143 1D TGTAACAGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 9 8 24352 CASAVA_Build 5 87731426 1I GTATCAGCTG -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 57 26 21 10 T 6 7 24353 CASAVA_Build 5 87784383 1I CACAGATGCT -/A GTCTCTGTAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 24354 CASAVA_Build 5 87796159 1I TCTTCTGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1939 hom 32 5 18 9 A 12 13 24355 CASAVA_Build 5 87798847 1I CTTACTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 A 10 11 24356 CASAVA_Build 5 87837320 3I AGGACTTAAT ---/ATA AAACACGCAG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 ATA 0 1 24357 CASAVA_Build 5 87843094 1D TCGCTCTTTG C/- CCAGGTATTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 3 2 24358 CASAVA_Build 5 87845277 1D CTCCAGAACC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 9 8 24359 CASAVA_Build 5 87846193 4I AAGAAAGAAG ----/GAAA GAAAGAAAGA 3070 het 2791 hom 26 10 10 6 GAAA 3 4 24360 CASAVA_Build 5 87858655 1I CTGATATTGA -/C AATTTATCAT 3070 het 3070 ref 44 23 20 1 C 0 1 24361 CASAVA_Build 5 87862693 2D GGATGTCTGG TT/-- TTTTTTTTTT 440 het 440 ref 35 12 6 17 T 15 13 24362 CASAVA_Build 5 87869830 1I TTTTCACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 T 10 11 24363 CASAVA_Build 5 87878515 1I TTTATACCAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 8 9 24364 CASAVA_Build 5 87881922 1D CTATATAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 53 20 23 10 A 10 9 24365 CASAVA_Build 5 87883110 1D AACTGAAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 10 9 24366 CASAVA_Build 5 87931947 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1848 hom 28 6 16 6 T 14 15 24367 CASAVA_Build 5 87959421 1I AATATAGTCA -/G GGCTCTCCAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 2 3 24368 CASAVA_Build 5 87983447 1I CCATCCTACC -/T TGATTTCCAT 3070 hom 119 het 45 0 38 7 T 1 2 24369 CASAVA_Build 5 87987712 1D TATGTTTTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 9 8 24370 CASAVA_Build 5 87990843 1D ATAAAAAAAA T/- CTTAACCTTG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 1 0 24371 CASAVA_Build 5 87999029 1I AGGCACCATG -/A GCTTTTTACC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 A 0 1 24372 CASAVA_Build 5 88009622 1I TACCTGCCTA -/C CTTTATGTAG 3070 hom 101 het 39 0 33 6 C 1 2 24373 CASAVA_Build 5 88028472 1I ATGCCAACAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 7 8 24374 CASAVA_Build 5 88035530 1I TTTCATGGTC -/A AAGTCTAACA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 2 3 24375 CASAVA_Build 5 88035872 1I TGCTTTAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 10 11 24376 CASAVA_Build 5 88052361 1D ACAAGAGTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 8 7 24377 CASAVA_Build 5 88059379 1D AAATAGTGTG A/- ATTGTGAATT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 2 1 24378 CASAVA_Build 5 88061602 1D ATATTGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 15 11 A 11 10 24379 CASAVA_Build 5 88075778 1I TAATGACTAC -/A AAACAACCGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 3 4 24380 CASAVA_Build 5 88077224 1I CTCTATAAGG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 64 het 28 0 20 8 A 7 8 24381 CASAVA_Build 5 88088362 1D ATTTAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 12 11 24382 CASAVA_Build 5 88091247 4I TGCATATAAT ----/AGTC AGTTTTATGA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 AGTC 0 1 24383 CASAVA_Build 5 88094157 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 9 10 24384 CASAVA_Build 5 88096150 4D TGGGAGGCCG AGGC/---- AGGCCGATCA 2768 het 919 hom 19 5 10 5 AGGC 2 1 24385 CASAVA_Build 5 88098986 2I TCTAGAAATG --/AA AAGACACATT 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 A 2 4 24386 CASAVA_Build 5 88105910 1I TTTCTACCTC -/T TTTTTTTTTT 1884 hom 21 het 21 0 7 14 T 14 15 24387 CASAVA_Build 5 88114038 1D AAATCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 286 hom 24 1 19 4 A 14 13 24388 CASAVA_Build 5 88117336 4D ACCTTAGGAA AGTT/---- AGTTATTTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 4 AGTT 2 1 24389 CASAVA_Build 5 88181679 1I CCATAACAGG -/A CCCCGGTGTG 3070 het 2375 hom 21 8 11 2 A 0 1 24390 CASAVA_Build 5 88210336 5D AAATTATATC TCTTT/----- TAAGATATTT 3070 het 3070 ref 32 19 13 2 TCTTT 1 0 24391 CASAVA_Build 5 88210956 2D ATATATATAT TA/-- TATATATATA 2013 het 1221 hom 10 3 5 2 TA 7 6 24392 CASAVA_Build 5 88216633 3I ATTAGACAAT ---/AGG AGTATATTGA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 AGG 0 1 24393 CASAVA_Build 5 88223591 3D AATTAATAAC AAT/--- AAATTATTTT 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 AAT 1 0 24394 CASAVA_Build 5 88225334 2D AGGAAGAAAC AG/-- AATTTTCACT 3070 het 3070 ref 29 17 8 5 AG 1 0 24395 CASAVA_Build 5 88233758 4D AGTGCATGAA ATAC/---- ATACTAATTC 3070 het 3070 hom 37 18 19 0 ATAC 2 1 24396 CASAVA_Build 5 88240539 1D TTTGGTGTCC T/- TTTTTTTTTT 657 het 657 ref 38 25 2 11 T 11 10 24397 CASAVA_Build 5 88246576 3D GGACCAAACT CAG/--- CAACAATAGG 2248 het 2248 ref 44 34 5 5 CAG 1 0 24398 CASAVA_Build 5 88286631 3I TAATTTTTAG ---/TAT ATTCCTGTCT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TAT 0 1 24399 CASAVA_Build 5 88292775 1I AAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 466 hom 21 2 16 3 A 13 14 24400 CASAVA_Build 5 88295188 1I AAGAAAAAAA -/T GTCCGTTACT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 0 1 24401 CASAVA_Build 5 88341333 1I CACCCTCCAA -/C CCCTGGCAAA 3070 hom 109 het 45 0 33 12 C 3 4 24402 CASAVA_Build 5 88348703 1I ATTGAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 10 11 24403 CASAVA_Build 5 88361633 2I AGCAGGATAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 39 0 26 13 T 11 13 24404 CASAVA_Build 5 88371983 1D TTGTAGATGG A/- AAAAAAAAAA 1304 het 1304 ref 27 21 3 3 A 12 11 24405 CASAVA_Build 5 88375157 1I CAACTTGAAG -/T TTTTTTTTTT 2923 het 2923 ref 25 11 9 5 T 11 12 24406 CASAVA_Build 5 88403494 1D GACAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 35 0 21 14 T 12 11 24407 CASAVA_Build 5 88403506 1D TTTTTTTTTT A/- TTATAGGTGA 3070 het 103 hom 27 4 17 6 A 1 0 24408 CASAVA_Build 5 88414917 1I AAATCCAATA -/T TTTGCTCCTG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 3 4 24409 CASAVA_Build 5 88429699 1D CTGGAACTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 15 9 T 10 9 24410 CASAVA_Build 5 88476873 4I ATACTTGTTA ----/CTTT CTTTATTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CTTT 1 2 24411 CASAVA_Build 5 88489178 1D AAATTCAATT A/- AAAAAAAAAA 1248 het 1248 ref 30 22 3 6 A 12 11 24412 CASAVA_Build 5 88502573 1D AACAACAATG A/- AAAAAAAAAA 2390 het 2390 ref 22 14 6 2 A 13 12 24413 CASAVA_Build 5 88539443 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2899 het 2040 hom 21 8 9 4 A 16 15 24414 CASAVA_Build 5 88604233 1D CACAAATGCC T/- TTTTTTTTTC 1172 het 1172 ref 46 36 3 7 T 10 9 24415 CASAVA_Build 5 88661121 1D AAAAAAAAGT G/- GGGGGGGGGG 980 het 87 hom 23 1 6 16 G 11 10 24416 CASAVA_Build 5 88705602 12D TGTGTATATC ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 AT 15 9 24417 CASAVA_Build 5 88712501 1D CTTTCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 11 13 T 13 12 24418 CASAVA_Build 5 88713611 1I CCCAGCATCA -/T GAGCTATAAC 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 0 1 24419 CASAVA_Build 5 88717683 3D TAGCACACAT ACC/--- AAAATTGCTT 3070 het 3070 hom 40 15 22 4 ACC 1 0 24420 CASAVA_Build 5 88732383 1I GGTAATGGCA -/T TTGAATTCTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 2 3 24421 CASAVA_Build 5 88748142 1I CTTCTTTTTT -/C CCCCTCCAAT 3070 het 3070 hom 52 24 22 6 C 4 5 24422 CASAVA_Build 5 88763284 1I AGATCTTCAC -/T GAATCATTTA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 0 1 24423 CASAVA_Build 5 88768548 1I TTGATCTTCT -/A AAAAAAAAAA 2968 het 2790 hom 20 10 9 1 A 12 13 24424 CASAVA_Build 5 88773704 1D GGAGGGGAAA C/- ATTCTATAAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 C 1 0 24425 CASAVA_Build 5 88776607 1I ATATAAGAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 9 10 24426 CASAVA_Build 5 88777821 1D GATTCTTACA T/- TAGCTAGAGC 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 2 1 24427 CASAVA_Build 5 88784458 1D ATTCTCTTAT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 8 7 24428 CASAVA_Build 5 88788023 1D GTGAACTAAT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 8 7 24429 CASAVA_Build 5 88798382 4I TTGCCTAGGG ----/ATTT ATTTGTTTTA 3070 het 2972 hom 23 6 13 4 ATTT 1 2 24430 CASAVA_Build 5 88820717 1I ATAGCATGGG -/A AAAAACCCAT 3070 hom 127 het 51 0 40 11 A 5 6 24431 CASAVA_Build 5 88827971 2I AAATATATGT --/AA AGAGTCCCCT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 1 3 24432 CASAVA_Build 5 88828999 1I ATAAAGGTAG -/A AAAAAATTGC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 6 7 24433 CASAVA_Build 5 88830835 1I TTTTCATGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 A 9 10 24434 CASAVA_Build 5 88834479 1D TTTTAAGGGG A/- ATAAAGACAG 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 A 2 1 24435 CASAVA_Build 5 88848549 2I GGAATACACC --/CT CTCTCTCTTC 3070 het 2806 hom 27 8 14 5 CT 4 5 24436 CASAVA_Build 5 88848661 1I GAGTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 10 11 24437 CASAVA_Build 5 88857644 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 2583 het 2052 hom 24 8 9 7 A 9 10 24438 CASAVA_Build 5 88858911 1I AATAAGTCTT -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 6 7 24439 CASAVA_Build 5 88864940 1D TCCTGGCAGA G/- GAAACAGGGT 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 G 2 1 24440 CASAVA_Build 5 88865521 3I AGAACATACT ---/AAG AAGAAGTTAG 3070 het 3070 hom 46 21 24 1 AAG 2 3 24441 CASAVA_Build 5 88927518 6I CTATCACTCT ------/AAGATA AATACCGATC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 AAGATA 0 1 24442 CASAVA_Build 5 88932984 1I TAATTTTATT -/A ATTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 1 2 24443 CASAVA_Build 5 88933431 1I ATTTAAACAT -/C CAAAAACATC 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 C 1 2 24444 CASAVA_Build 5 88933451 1D TGAATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 41 10 6 26 T 17 16 24445 CASAVA_Build 5 88941799 4D TTTATTTACC TATT/---- TATTTATTTT 3070 het 3023 hom 21 9 11 1 TATT 3 2 24446 CASAVA_Build 5 88946468 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 809 het 740 hom 11 3 3 5 A 17 18 24447 CASAVA_Build 5 88950603 4D GCCAGGCTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2416 het 377 hom 18 4 7 7 T 20 16 24448 CASAVA_Build 5 88951280 1D GCTTCCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 25 1 19 6 T 12 11 24449 CASAVA_Build 5 88959246 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 1923 het 1923 ref 19 9 7 3 A 11 12 24450 CASAVA_Build 5 88960615 4D ATGTTGCTGC AAAG/---- AAACATGATT 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 AAAG 1 0 24451 CASAVA_Build 5 88969972 1D ATTTAAACTA C/- TTTTCCCATC 3070 hom 60 het 24 0 21 5 C 1 0 24452 CASAVA_Build 5 88986624 1I GAGACAAACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 10 11 24453 CASAVA_Build 5 88988700 2D TATTATTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 11 12 11 TG 9 8 24454 CASAVA_Build 5 88991460 1I ATTCAGCCAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 7 8 24455 CASAVA_Build 5 89002010 2I TGTCAGTTTT --/TC TCTGTTTCAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TC 1 2 24456 CASAVA_Build 5 89004889 1I GACCCTATTA -/T TTTTTTTTTT 2634 het 2634 ref 33 12 11 10 T 14 15 24457 CASAVA_Build 5 89005655 9I ATTGATAAGC ---------/TCTAGTTCT TCTAGTTCTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 9 TCTAGTTCT 1 2 24458 CASAVA_Build 5 89005990 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 22 2 14 7 A 11 10 24459 CASAVA_Build 5 89013914 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 10 24460 CASAVA_Build 5 89016497 3D CAAATTAGTG AAC/--- AACAAGTTTA 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 AAC 2 1 24461 CASAVA_Build 5 89017820 1D GCTTTCTTAC T/- TTCTCTCTCT 2838 hom 17 het 33 0 13 20 T 3 2 24462 CASAVA_Build 5 89023465 8I TGAAGATTAT --------/TTCCTTCC TTCCTTCCTT 3070 hom 82 het 38 0 27 11 TTCC 3 5 24463 CASAVA_Build 5 89023875 7D CATGTTGGCC TTGTTGA/------- AGGCTTGTCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TTGTTGA 1 0 24464 CASAVA_Build 5 89042857 1I CCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 935 hom 25 3 14 8 A 13 14 24465 CASAVA_Build 5 89079368 1I TCCTCCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 27 2 16 9 T 10 11 24466 CASAVA_Build 5 89095873 1I ATAAACACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 11 9 T 11 12 24467 CASAVA_Build 5 89106065 2D AGTGCAAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 41 1 28 12 T 16 14 24468 CASAVA_Build 5 89107341 1I AATCTATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 10 11 24469 CASAVA_Build 5 89115473 2D ATATGCATGT AA/-- AACAAACCTA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 4 2 24470 CASAVA_Build 5 89135990 1D CCTACCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 11 10 24471 CASAVA_Build 5 89139135 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 42 het 37 1 32 4 A 7 6 24472 CASAVA_Build 5 89144460 2I ATATTAGAAA --/AC ACAAAACTTT 3070 hom 91 het 37 0 30 7 AC 1 2 24473 CASAVA_Build 5 89152116 1D AAAAAATTGC T/- TCAGAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 T 2 1 24474 CASAVA_Build 5 89162292 1I ATGCTCTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 31 0 26 5 A 9 10 24475 CASAVA_Build 5 89187196 1D TACTGTGAAG A/- AAAAAAAAAA 1270 het 1270 ref 45 38 3 4 A 11 10 24476 CASAVA_Build 5 89196679 1I TGACATCTCA -/G GCCACCTGCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 1 2 24477 CASAVA_Build 5 89211079 1I CATCTTCATC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 8 9 24478 CASAVA_Build 5 89254292 1I TTATGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 10 11 24479 CASAVA_Build 5 89261174 1D ATTATGTAGC T/- TTTTTTTTTT 1589 het 1589 ref 42 28 5 9 T 13 12 24480 CASAVA_Build 5 89285932 1I CAGGTACCAG -/C CACCTTTTGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 2 24481 CASAVA_Build 5 89286273 2D TAATGAAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 13 11 24482 CASAVA_Build 5 89289976 1I TAGAAAACTT -/A ATGTGTGGGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 1 2 24483 CASAVA_Build 5 89291021 1I TAGAAGTTTT -/A AATTTATAGC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 2 3 24484 CASAVA_Build 5 89295055 1I AGAGGAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 778 hom 32 3 20 9 A 13 14 24485 CASAVA_Build 5 89415593 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 725 het 307 hom 12 5 2 5 A 15 14 24486 CASAVA_Build 5 89427757 2I ACACACACAT --/AA AGAGAGAGAC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 1 3 24487 CASAVA_Build 5 89449942 2I AGACATTGTA --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 112 het 43 0 38 5 TC 6 7 24488 CASAVA_Build 5 89460868 1D TAACAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 1791 het 1791 ref 36 17 7 12 T 12 11 24489 CASAVA_Build 5 89477739 4D AAATAAATAA ATAT/---- TTGTGTTTAA 3070 het 1231 hom 21 3 12 7 AT 2 0 24490 CASAVA_Build 5 89485692 1I AAATATTTTT -/A AATGTGAAAT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 2 3 24491 CASAVA_Build 5 89491032 3D CACAAACATT ATA/--- ATATTACTTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 ATA 2 1 24492 CASAVA_Build 5 89496831 1I GTTTGCCTTT -/C CCCCCCAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 C 6 7 24493 CASAVA_Build 5 89506583 1D TGGTGCTATG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 9 8 24494 CASAVA_Build 5 89507439 1D TTTCAAAAAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 8 7 24495 CASAVA_Build 5 89517743 1D CCTTCCCCCC T/- CTCCTCCTCC 2359 het 2359 ref 35 18 8 9 T 1 0 24496 CASAVA_Build 5 89520982 1D ACTTACTGCA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 8 7 24497 CASAVA_Build 5 89521779 5I TTTCCTACGA -----/TTTGT TTTGTCTACC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTTGT 1 2 24498 CASAVA_Build 5 89538444 1D GTTTTACTAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 A 8 7 24499 CASAVA_Build 5 89545933 1I ATAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2462 hom 18 6 11 1 A 9 10 24500 CASAVA_Build 5 89546629 1D GGGGAACTTA T/- GTACAGAGAG 3070 hom 126 het 47 0 43 5 T 1 0 24501 CASAVA_Build 5 89558074 1I TCTTCCTGGT -/G TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 G 0 1 24502 CASAVA_Build 5 89581986 1I GGTTTTTTTT -/G GGGGGGGGGG 3070 het 324 hom 21 1 11 9 G 10 11 24503 CASAVA_Build 5 89600448 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 10 9 24504 CASAVA_Build 5 89600535 1D CAAAAAAAAA C/- GTAATATTAA 3070 het 3070 hom 35 11 23 1 C 1 0 24505 CASAVA_Build 5 89604396 1I TGCTTTATAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 420 hom 33 1 28 4 A 9 10 24506 CASAVA_Build 5 89607316 1D GTTGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1719 het 1719 ref 42 27 5 10 A 12 11 24507 CASAVA_Build 5 89632872 1D GCTTCTATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 8 A 11 10 24508 CASAVA_Build 5 89639323 4D GTATCATAGA TATT/---- TATTATTTCA 3070 hom 138 het 49 0 46 7 TATT 2 1 24509 CASAVA_Build 5 89642809 6D CTAGGAACTA AGACTT/------ AGAACTACAG 3070 het 3070 hom 45 17 27 1 AGACTT 1 0 24510 CASAVA_Build 5 89643526 3D CCATTTAAGA TAC/--- TACAAGATCC 3070 het 3070 hom 51 23 23 6 TAC 2 1 24511 CASAVA_Build 5 89655059 8I CAAAGTAAAC --------/TCATTGTT TCATTGTTTA 3070 het 3070 ref 47 31 9 7 TCATTGTT 1 2 24512 CASAVA_Build 5 89656303 1D TTGGGGAATC T/- GATAATTATG 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 T 1 0 24513 CASAVA_Build 5 89656697 1I GTCAGATCAA -/T TTTGGTCCTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 3 4 24514 CASAVA_Build 5 89661258 2D TTATAAATTC TT/-- TCTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 T 3 1 24515 CASAVA_Build 5 89665813 1D TGTTGTTTAG A/- CAGGGTGACC 3070 het 3070 ref 41 21 15 7 A 1 0 24516 CASAVA_Build 5 89672930 1D AAAAAAAAAA C/- TTAAGATTCT 3040 hom 21 het 17 0 8 9 C 1 0 24517 CASAVA_Build 5 89673998 1D ATTTGAGGGG T/- TTTTTTATTA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 7 6 24518 CASAVA_Build 5 89683723 1D ATCATTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 14 12 16 A 18 17 24519 CASAVA_Build 5 89692746 1I TACACTAAAC -/T CTTGACAGTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 0 1 24520 CASAVA_Build 5 89692888 1D ATCTTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 30 2 13 16 A 13 12 24521 CASAVA_Build 5 89693104 4I TATGGGAAAT ----/AGAG AGCCCTCAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AG 1 3 24522 CASAVA_Build 5 89694380 1I CATCGGCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 9 10 24523 CASAVA_Build 5 89695653 1I10M1I AAAATAAAAG -AAAAAAAAGT-/AAAAAAAAAGTA AAAAAAAAAC 3070 het 250 hom 25 3 14 11 N/A 0 0 24524 CASAVA_Build 5 89697509 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 668 hom 18 5 10 3 T 12 11 24525 CASAVA_Build 5 89700899 1I AGGTACTAGA -/G GGAGAAAGAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 2 3 24526 CASAVA_Build 5 89711267 1D ACTTTGAGGT G/- GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 G 2 1 24527 CASAVA_Build 5 89715941 4I CCCTGTCTGT ----/CAGC CACCAGTTGC 2439 het 2439 ref 25 12 7 6 CAGC 0 1 24528 CASAVA_Build 5 89720878 1I CAAGCATATT -/A AAATCAGAAA 3070 het 3070 hom 35 11 22 2 A 3 4 24529 CASAVA_Build 5 89731917 1I AATCACATGT -/A AATAACATAG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 2 3 24530 CASAVA_Build 5 89741477 1D GAAAAAAAAA T/- TTTTTTTCTG 1281 hom 12 het 5 0 4 1 T 8 7 24531 CASAVA_Build 5 89755861 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1277 het 1277 ref 29 16 4 9 A 15 14 24532 CASAVA_Build 5 89782588 1I TAAGGTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 10 11 24533 CASAVA_Build 5 89787566 1D ACCCTGTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 39 6 25 8 A 17 16 24534 CASAVA_Build 5 89799312 1D GAATACCTTC T/- TTTTTTGGGG 1896 het 1896 ref 36 17 12 7 T 7 6 24535 CASAVA_Build 5 89801044 1I ATTCTAAGAG -/T TTTTTTTTTT 1816 het 1816 ref 26 17 5 4 T 12 13 24536 CASAVA_Build 5 89804045 2I TAATGAAGAC --/TT TTGTTCGGTG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 2 4 24537 CASAVA_Build 5 89809774 1D TAAAATTGAC T/- TTTTTATTTC 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 T 6 5 24538 CASAVA_Build 5 89810574 4D GGTCCCACTC AAAG/---- AAAGGGGGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 6 AAAG 2 1 24539 CASAVA_Build 5 89824591 4I CATATGAGAA ----/AAAG AACCAGAGGA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 AAAG 0 1 24540 CASAVA_Build 5 89831394 8D AAGATACAGT ATATAATC/-------- ATATTTAGCT 244 het 244 ref 28 13 1 16 ATATAATC 1 0 24541 CASAVA_Build 5 89836128 1D GAGCAAGACT C/- CCATCTCAAA 3070 het 1568 hom 16 4 10 2 C 3 2 24542 CASAVA_Build 5 89842442 1D ATCCAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3039 het 1865 hom 26 10 9 7 A 15 14 24543 CASAVA_Build 5 89842909 4D GTCTCAAAAA GTTT/---- GTTTGTTCCA 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 GTTT 2 1 24544 CASAVA_Build 5 89843190 1D GTATCATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2729 hom 37 10 19 9 T 15 14 24545 CASAVA_Build 5 89850361 5I GATGCACATG -----/TGACC TGACCACTAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 TGACC 1 2 24546 CASAVA_Build 5 89851069 1I TGTGGGGGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 8 9 24547 CASAVA_Build 5 89852066 1I TAAATGCAGA -/T TTTTAGATAT 3070 het 3070 ref 56 29 21 6 T 4 5 24548 CASAVA_Build 5 89853586 1I TCTGTTCATC -/A CCTTTCCCAC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 0 1 24549 CASAVA_Build 5 89863773 3I CTACATGCTT ---/TTA TTATTATATT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 TTA 2 3 24550 CASAVA_Build 5 89864146 4D GGAAATACTT TAAG/---- TAATCTCAGA 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 TAAG 1 0 24551 CASAVA_Build 5 89867565 1I ACAAAAGCAG -/A AAAAAAAAAA 2873 het 603 hom 14 3 9 2 A 11 12 24552 CASAVA_Build 5 89873225 1I CCAGCCATGT -/G GAACTGTGAG 3070 het 3070 hom 28 7 16 5 G 1 2 24553 CASAVA_Build 5 89878509 1I AATTTCAGTG -/T TAAGTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 1 2 24554 CASAVA_Build 5 89904694 2I CTTTCCAATT --/CA CAGTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 CA 1 2 24555 CASAVA_Build 5 89905475 2D TTTATTGAAT AG/-- AGAGTCTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 AG 3 2 24556 CASAVA_Build 5 89915419 2D AGAGAGTAAA AT/-- GTGCACGTTT 3070 het 3070 hom 45 21 20 5 AT 1 0 24557 CASAVA_Build 5 89941092 1I GCAAAGATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 10 11 24558 CASAVA_Build 5 89956451 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCTCAGGT 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 C 4 5 24559 CASAVA_Build 5 89964972 1I GTGTAAAAAT -/A TATTGTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 0 1 24560 CASAVA_Build 5 89969044 2D AACCCAGATT AG/-- ACACATTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 4 AG 1 0 24561 CASAVA_Build 5 89970113 1I TCTCAAAGAG -/T TTTTTTTTTT 2341 het 2341 ref 26 10 7 9 T 10 11 24562 CASAVA_Build 5 89979528 1D TGTACTTGTT G/- AACCTTTATG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 0 24563 CASAVA_Build 5 89982961 4D CATCTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 18 1 TC 5 3 24564 CASAVA_Build 5 89992107 1D ATTTAACGTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 A 8 7 24565 CASAVA_Build 5 90022888 2D GGTTAAATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 AT 6 5 24566 CASAVA_Build 5 90024799 10I TGTGACAAGT ----------/ACAGTCATCC CCCTGGTATC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 ACAGTCATCC 0 1 24567 CASAVA_Build 5 90030353 1D GCTGGGAAAG A/- AAAAATTACC 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 A 6 5 24568 CASAVA_Build 5 90037977 1I GGTAAAACTC -/T TTTTTTTTTT 2747 het 2747 ref 34 19 9 6 T 12 13 24569 CASAVA_Build 5 90038304 1D TTCTATTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 A 15 14 24570 CASAVA_Build 5 90047229 1D TCTACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 12 11 24571 CASAVA_Build 5 90053453 2D GGCAGAAAAC TG/-- AGGCATAAAA 3070 het 3070 ref 50 26 23 1 TG 1 0 24572 CASAVA_Build 5 90072951 4I GAGTGACTTA ----/TCAT TCATTCAACA 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 TCAT 1 2 24573 CASAVA_Build 5 90075563 2D CTATTAACTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 227 hom 25 4 13 10 AT 6 5 24574 CASAVA_Build 5 90080040 5D ATTTTTCATA TCTTG/----- TCTTCAAATT 3070 het 3070 ref 33 18 13 7 TCTTG 1 0 24575 CASAVA_Build 5 90084591 1I CAAGGTCTTC -/A CATGCTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 0 1 24576 CASAVA_Build 5 90086841 3I TAAGTAAAAA ---/TCT TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 TCT 1 2 24577 CASAVA_Build 5 90088020 1I TTTCCCCCAT -/C CCCCCAGGAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 C 5 6 24578 CASAVA_Build 5 90088952 1I CTGAACCCCC -/T GCCCCAGTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 0 1 24579 CASAVA_Build 5 90092777 8I ATATAACAAA --------/TAACTGCC TAAGGATTTG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 TAACTGCC 0 1 24580 CASAVA_Build 5 90102800 1D CCTCTCCTTT A/- CTATCTTCGC 3070 hom 84 het 36 0 27 10 A 1 0 24581 CASAVA_Build 5 90144773 4D TCTCATTCTA ATAG/---- AGACACAGAT 3070 hom 33 het 15 0 12 5 ATAG 1 0 24582 CASAVA_Build 5 90146564 1I AGTTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 41 3 29 9 T 11 12 24583 CASAVA_Build 5 90168028 1D CATACTAAGT A/- AAAAAAAAAG 1230 het 1230 ref 45 39 3 3 A 10 9 24584 CASAVA_Build 5 90175013 1I AATAGTGTTG -/A GATGGCTGAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 24585 CASAVA_Build 5 90177175 1D TCTGGTATGA T/- TTTTTTTTTA 1405 het 1405 ref 41 33 4 4 T 10 9 24586 CASAVA_Build 5 90192296 1D GTGGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1354 het 1354 ref 25 17 3 5 A 12 11 24587 CASAVA_Build 5 90193888 1D CCTTAAAATG A/- AAAAAACCTT 3070 hom 138 het 58 0 46 29 A 7 6 24588 CASAVA_Build 5 90194402 2I ACAAGACCCC --/AT ATGTGGACCT 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 AT 1 2 24589 CASAVA_Build 5 90209159 1D CAGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 1351 het 1351 ref 28 22 3 3 T 13 12 24590 CASAVA_Build 5 90231324 2I TACCAACCTA --/TC TCATACCTTC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 TC 1 2 24591 CASAVA_Build 5 90247740 1D TTTTTATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 T 11 10 24592 CASAVA_Build 5 90254603 2I CCTATAAGAA --/CT GTTATGCTTA 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 CT 0 1 24593 CASAVA_Build 5 90264297 4D GCTGCAAAAG ACAA/---- ACAGTGATTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 5 ACAA 1 0 24594 CASAVA_Build 5 90264368 2I TGTCGTGAGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 26 9 9 8 TG 8 9 24595 CASAVA_Build 5 90272404 1D CATTCAGCCA C/- TGCCTCATTT 3070 het 3070 ref 47 26 17 5 C 1 0 24596 CASAVA_Build 5 90272711 1D AAAAGTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 14 13 A 12 11 24597 CASAVA_Build 5 90277561 3D TCTCAAAAAA AAG/--- AAGGGAAGGA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 AAG 2 1 24598 CASAVA_Build 5 90278906 1I TTTAATGGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 8 9 24599 CASAVA_Build 5 90290112 3D GGATGGCTTT AAC/--- AACACTAATT 3070 het 3070 ref 36 21 14 3 AAC 2 1 24600 CASAVA_Build 5 90291271 2I AGGAAAGATG --/AC AGTCTTTCAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 AC 0 1 24601 CASAVA_Build 5 90296301 1D ACTAATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 20 14 9 A 15 14 24602 CASAVA_Build 5 90300283 1D TGCTGAAATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 40 18 20 2 T 9 8 24603 CASAVA_Build 5 90300652 1I TATATTTTAG -/A AGTAGCTTAG 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 1 2 24604 CASAVA_Build 5 90307430 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2633 hom 18 8 9 1 A 10 9 24605 CASAVA_Build 5 90313542 3I AACCTGGATA ---/AAT AATTACTTAC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 AAT 1 2 24606 CASAVA_Build 5 90314320 1I TGGCTCAGCC -/T GGGCCAGGCT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 0 1 24607 CASAVA_Build 5 90322688 8D ACATGCCATA CAGAGGTG/-------- AGAGGACAAT 3070 het 3070 ref 43 24 16 6 CAGAGGTG 1 0 24608 CASAVA_Build 5 90346200 2D CTTGGGAAAG TA/-- TATGTGTCCA 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 TA 2 1 24609 CASAVA_Build 5 90346431 1D TTTCGAATGG T/- TTTTTTGTGT 3070 hom 69 het 27 0 23 5 T 7 6 24610 CASAVA_Build 5 90351165 1I CTTCTGTGGG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 A 7 8 24611 CASAVA_Build 5 90351663 2D TAGTTACGGC AT/-- ATTGGCTATG 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 AT 2 1 24612 CASAVA_Build 5 90362141 6I TTGAGAGTTC ------/TTTTTA TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 TTTTTA 1 2 24613 CASAVA_Build 5 90367678 1D ATTCACAATA T/- ACTTCACATA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 1 0 24614 CASAVA_Build 5 90386970 6D ATACTAAAGT TAATGA/------ TAATAATGGC 3070 het 3070 ref 31 16 15 2 TAATGA 1 0 24615 CASAVA_Build 5 90387849 1D GGTTTCGCCA G/- GATTCAGAAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 G 2 1 24616 CASAVA_Build 5 90391964 10D TATATATATA TATATATATT/---------- TTTTTTTTTA 2293 het 438 hom 7 1 5 1 TATATATATT 1 0 24617 CASAVA_Build 5 90440042 1I CTCTAAAACT -/G ATGATTGAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 G 0 1 24618 CASAVA_Build 5 90454783 2D AACATGTAAA AG/-- AGTGGCTATA 3070 het 3070 hom 43 16 20 10 AG 2 1 24619 CASAVA_Build 5 90463700 14D TATTTTGGGG GTCTCTGTTCTGTT/-------------- CCATTGGCAT 3070 het 3070 ref 31 18 15 3 GTCTCTGTTCTGTT 1 0 24620 CASAVA_Build 5 90468455 1D TTTATTTGGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 8 24621 CASAVA_Build 5 90469811 1I TGGGTTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3004 hom 34 13 14 7 A 12 13 24622 CASAVA_Build 5 90512544 2I TTCTATATAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AT 5 6 24623 CASAVA_Build 5 90514966 18D TCTGCCTGCC TCAGCCTCCCAAAGTGCT/------------------ GGGATTGTTG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TCAGCCTCCCAAAGTGCT 1 0 24624 CASAVA_Build 5 90516730 1D AGTCCTCATA T/- TTTTTTATTA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 7 6 24625 CASAVA_Build 5 90520268 1I ACCCTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 12 13 24626 CASAVA_Build 5 90545170 1I AAATCCACTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 8 9 24627 CASAVA_Build 5 90546171 1I CACCTACAGT -/G GGGGGGGTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 7 8 24628 CASAVA_Build 5 90572472 1I TGACTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 36 0 26 10 T 10 11 24629 CASAVA_Build 5 90591593 1I CCTCCTTGCC -/T TTTTTTATTT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 6 7 24630 CASAVA_Build 5 90597462 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 19 1 12 6 A 10 11 24631 CASAVA_Build 5 90599326 2D AAGAGCAAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 18 het 7 0 7 2 CT 2 1 24632 CASAVA_Build 5 90604535 1I CTGTCCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 36 1 27 8 A 10 11 24633 CASAVA_Build 5 90606318 1D AGTATAATAT A/- AAAAAAAAAA 2942 het 188 hom 10 1 8 2 A 13 12 24634 CASAVA_Build 5 90606548 1D TTTTTTTCAC T/- TTTTTTTTTT 2442 hom 21 het 16 0 8 8 T 13 12 24635 CASAVA_Build 5 90632216 1D TCCCCAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1326 hom 35 4 20 11 T 15 14 24636 CASAVA_Build 5 90634471 4I TTGCTAAAAC ----/TTTA TTTTTCTTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTTA 0 1 24637 CASAVA_Build 5 90635601 1I TCAAGGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 11 24638 CASAVA_Build 5 90636490 1D CTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 15 8 T 15 14 24639 CASAVA_Build 5 90637513 1I AGGAGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 105 hom 43 1 39 3 T 10 11 24640 CASAVA_Build 5 90637785 1D TTGGAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 31 1 23 7 T 11 10 24641 CASAVA_Build 5 90665665 1I GATCAGTTGA -/C AAAAACATTG 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 C 0 1 24642 CASAVA_Build 5 90668875 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAACAA 3070 het 1900 hom 16 6 8 2 A 7 8 24643 CASAVA_Build 5 90669992 1I AGTGATCCTC -/G CCGCCTTGGC 1421 het 105 hom 10 1 5 4 G 0 1 24644 CASAVA_Build 5 90674284 1D TTTTCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1049 hom 19 3 12 6 A 11 10 24645 CASAVA_Build 5 90677380 4I ACAGAGTCTT ----/ACTC TGTCACCAGG 992 het 992 ref 14 6 3 5 ACTC 0 1 24646 CASAVA_Build 5 90715490 1D TTTGCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 T 12 11 24647 CASAVA_Build 5 90737104 3I GGCTGCATTG ---/GAA GAAGAATTGT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 GAA 2 3 24648 CASAVA_Build 5 90788110 1D GCTGTAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2362 hom 25 9 12 4 A 15 14 24649 CASAVA_Build 5 90799559 1I AAGAAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 10 11 24650 CASAVA_Build 5 90824033 22D AAATTGGTCT TGGAAAATTCATTGCACAAGGC/---------------------- TGGCATTTAG 3070 het 3070 ref 31 25 9 2 TGGAAAATTCATTGCACAAGGC 1 0 24651 CASAVA_Build 5 90855322 4D TCCTTTATGG ATAC/---- ATACAATAGC 3070 het 3070 ref 26 16 9 3 ATAC 2 1 24652 CASAVA_Build 5 90859439 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1195 het 1195 ref 37 26 4 8 T 12 11 24653 CASAVA_Build 5 90866981 4I ACAAATTGAA ----/CTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 CTTT 0 1 24654 CASAVA_Build 5 90876659 1D GTAATTTACC A/- AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 47 22 6 19 A 15 14 24655 CASAVA_Build 5 90878698 1D TCCAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 28 16 6 6 T 12 11 24656 CASAVA_Build 5 90886276 2I GTATATAAAT --/AC ACACACACAT 2859 het 2859 ref 24 16 7 1 AC 4 5 24657 CASAVA_Build 5 90906290 1I AAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 2359 het 2359 ref 39 15 10 14 A 15 16 24658 CASAVA_Build 5 90908656 1D ATATTAAGCA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 T 8 7 24659 CASAVA_Build 5 90920900 1D CATGGGAGAG T/- TTTTTTACAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 6 24660 CASAVA_Build 5 90923855 1I GCAACCCAAA -/G CCAATGAACC 3070 het 3070 ref 37 21 9 7 G 0 1 24661 CASAVA_Build 5 90926984 1I TTTAAACAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 9 10 24662 CASAVA_Build 5 90973506 1D TTTTTCTTCC T/- TTTTTATACC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 6 5 24663 CASAVA_Build 5 90993789 1I TGTGGTGCTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 50 15 26 9 T 8 9 24664 CASAVA_Build 5 90999188 4D TGAAAGTGAA ATAG/---- ATAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 ATAG 2 1 24665 CASAVA_Build 5 91027841 1I CCACTTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 10 11 24666 CASAVA_Build 5 91030432 1I52M1D TGATGTAATA -TTTTTTTGGCAGGGTAGAAAAGCTATAGACTTATTTTCCTGGAACATATTACA/TTTTTTTTGGCAGGGTAGAAAAGCTATAGACTTATTTTCCTGGAACATATTAC- AAAACTTAGA 3070 het 3070 hom 25 14 17 4 N/A 0 0 24667 CASAVA_Build 5 91043472 1D TTTAGCTTAT C/- ATATTCTACC 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 C 1 0 24668 CASAVA_Build 5 91047147 1I TTGCATTGGC -/T ATTAGGGCTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 1 24669 CASAVA_Build 5 91050176 1D AAAACAAAAC T/- AATACACTTG 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 T 1 0 24670 CASAVA_Build 5 91055958 1I ATGCTTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 12 12 T 13 14 24671 CASAVA_Build 5 91058674 1D CTGCCATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2580 hom 32 9 12 11 A 12 11 24672 CASAVA_Build 5 91061217 1D ATTACATTCA T/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 T 7 6 24673 CASAVA_Build 5 91061708 1D TTTCTCCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 21 17 3 T 10 9 24674 CASAVA_Build 5 91065601 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 29 2 14 13 T 17 16 24675 CASAVA_Build 5 91075021 1I ATGGCTTCTT -/C TTTAATTTAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 0 1 24676 CASAVA_Build 5 91080734 8D TATCCAATTT GCCAGTCA/-------- GCCAGTCAGT 3070 hom 66 het 21 0 23 0 GCCAGTCA 2 1 24677 CASAVA_Build 5 91090575 1D TTCTGTATGC T/- GCCTTTTTAC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 1 0 24678 CASAVA_Build 5 91101928 1I ATTTTGTTTT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 47 31 12 4 A 7 8 24679 CASAVA_Build 5 91102389 1D AATGCTTTTC T/- TAAATCAAAT 3070 het 3070 ref 43 16 15 13 T 2 1 24680 CASAVA_Build 5 91113250 1D CTGTTAGCAT A/- TTTTGTCTCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 A 1 0 24681 CASAVA_Build 5 91122632 1D ACTATCCTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 9 8 24682 CASAVA_Build 5 91126071 1D TGCAGTGCAG C/- AGGGGGGAGA 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 C 1 0 24683 CASAVA_Build 5 91129043 1D TTCTTTATTT A/- TATTTCCGGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 1 0 24684 CASAVA_Build 5 91133895 1D ATAGGTTTTT A/- AAAAAATGTA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 7 6 24685 CASAVA_Build 5 91138415 1I TTCTTTTTCT -/C TTTTTTTTCT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 C 0 1 24686 CASAVA_Build 5 91138494 6I AGCTTTGAAC ------/TCCTTT TCCTGAGTTT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TCCTTT 0 1 24687 CASAVA_Build 5 91139955 3I TAGGTTTTGA ---/GTT GTTGTATATT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 GTT 1 2 24688 CASAVA_Build 5 91142648 5D TCTGTTTCAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 A 17 12 24689 CASAVA_Build 5 91145433 1I AAGTTACCAT -/A ACCCTTACTA 3070 hom 154 het 59 0 52 7 A 1 2 24690 CASAVA_Build 5 91160177 3I CATTACGTGA ---/ACT AGAACAAGTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 ACT 0 1 24691 CASAVA_Build 5 91167539 1D ACACCACCAC A/- ACCTGGCTAA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 2 1 24692 CASAVA_Build 5 91170390 3D CCGAAACAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 34 6 13 16 T 14 11 24693 CASAVA_Build 5 91189783 5I TTATATTAAG -----/ACCCA ACCCAATTAT 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 ACCCA 1 2 24694 CASAVA_Build 5 91192892 1D CAGTCTATCA T/- TGATGGACAT 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 T 2 1 24695 CASAVA_Build 5 91203722 1D TAGGGCCATC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 53 20 26 9 T 8 7 24696 CASAVA_Build 5 91209066 4D CATGTTATAA CTCT/---- CTCTCAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 CT 4 2 24697 CASAVA_Build 5 91213130 1D GACACATTTT G/- CCTAAAACAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 1 0 24698 CASAVA_Build 5 91213625 1I AAGTTATGTG -/T TGTCTCACAG 3070 het 3070 hom 39 16 22 1 T 1 2 24699 CASAVA_Build 5 91214158 1I GTACAAGGCA -/T TTTTTTCCAC 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 6 7 24700 CASAVA_Build 5 91226166 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 1993 het 1073 hom 17 7 7 3 A 15 16 24701 CASAVA_Build 5 91227212 1I34M1D AGAGAGATGA -TTTTTTTTTTCTCTAGGCCATGTGAGAACAAAACA/TTTTTTTTTTTCTCTAGGCCATGTGAGAACAAAAC- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 41 21 16 15 N/A 0 0 24702 CASAVA_Build 5 91237712 1I GCCCATTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 33 1 26 6 T 12 13 24703 CASAVA_Build 5 91247315 1D ATTTGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 T 14 13 24704 CASAVA_Build 5 91269110 1D TATATGGACA T/- GGTTTGTAGC 3070 het 3070 ref 37 20 16 2 T 1 0 24705 CASAVA_Build 5 91280287 4I GGTTTTAATC ----/TATT TAACTCAGAT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 TATT 0 1 24706 CASAVA_Build 5 91280637 1I ACTTTCCATC -/A AAAAAAAAAA 2013 het 2013 ref 27 7 11 9 A 14 15 24707 CASAVA_Build 5 91286697 1D TCCACCATTT G/- TTTCCCCAAA 3070 het 3070 hom 42 17 24 2 G 1 0 24708 CASAVA_Build 5 91302874 2I GTATAATAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 24 1 21 2 A 10 12 24709 CASAVA_Build 5 91303443 1D CTTTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 11 10 24710 CASAVA_Build 5 91319182 2D ATATATTTCA AT/-- ATATATGTGT 2700 het 2700 ref 24 10 12 2 AT 4 3 24711 CASAVA_Build 5 91381541 1D TGTTCAATGC T/- TTTTTTTTTT 1791 het 1791 ref 38 21 5 12 T 15 14 24712 CASAVA_Build 5 91386719 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1682 hom 17 4 10 3 A 12 11 24713 CASAVA_Build 5 91432364 1D GTTACTTTCT A/- AAGACCACAC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 3 2 24714 CASAVA_Build 5 91444385 1I GGATTTTTTT -/G TGTGTGTGTT 3070 het 234 hom 51 1 46 4 G 0 1 24715 CASAVA_Build 5 91447248 2I TTTTTAATCT --/TA TGATAAATAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TA 0 1 24716 CASAVA_Build 5 91453029 2D18M7D TATATCAATC ATATATATGATTATATATCAATCATAT/--ATATATGATTATATATGA------- ATATGATTAT 1991 hom 12 het 5 0 5 0 N/A 0 0 24717 CASAVA_Build 5 91464935 1I GTGTAAGGAA -/G GGGTCTAGTT 3070 hom 83 het 32 0 27 5 G 3 4 24718 CASAVA_Build 5 91485909 2I TGTGTATGTG --/TA TATATATATA 1353 hom 24 het 10 0 9 1 TA 5 6 24719 CASAVA_Build 5 91488758 1D ATTTAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 38 1 27 10 T 15 14 24720 CASAVA_Build 5 91489813 1I AGTACCTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 423 hom 29 1 27 1 A 9 10 24721 CASAVA_Build 5 91489990 2D GTGTGTGTGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AT 6 5 24722 CASAVA_Build 5 91499263 1D AAGAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 13 12 24723 CASAVA_Build 5 91501813 3D AGAAAAAAAA AAC/--- AATATATCTG 3070 hom 105 het 37 0 36 4 AAC 1 0 24724 CASAVA_Build 5 91501917 1I ATACTAACCT -/A AAAAAATTGC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 6 7 24725 CASAVA_Build 5 91507051 1D GTAAGGACAT A/- AAAATCTACT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 5 4 24726 CASAVA_Build 5 91510327 1D GCAACTTAAT A/- TCTGTTTTTA 3070 hom 99 het 44 0 34 11 A 1 0 24727 CASAVA_Build 5 91515251 1I CCCTGATGAT -/A ATAGGGATAA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 1 2 24728 CASAVA_Build 5 91522242 1I AATATATTAC -/A AAAACTGAGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 4 5 24729 CASAVA_Build 5 91522367 3D CTCTACAAAT TAA/--- TAATAATAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 TAA 7 6 24730 CASAVA_Build 5 91547155 4D AGCTCACGTT TATA/---- TATATATATA 3070 het 56 hom 27 2 12 13 TA 9 7 24731 CASAVA_Build 5 91553712 1I GACTTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 T 10 11 24732 CASAVA_Build 5 91565259 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3060 hom 22 7 10 5 A 11 12 24733 CASAVA_Build 5 91567038 1I TTTCTTAGTA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 7 8 24734 CASAVA_Build 5 91573732 2I TGTATGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 TG 5 6 24735 CASAVA_Build 5 91576223 1I TCTTGCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1148 hom 37 4 28 5 A 10 11 24736 CASAVA_Build 5 91578788 1I ATACTTATTG -/A CTGGTATATA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 0 1 24737 CASAVA_Build 5 91601924 1I CAGCAAAGAT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 A 7 8 24738 CASAVA_Build 5 91622012 29D TTCTTTTGTA TTCTATTGATGTGATGAATTACATTAACC/----------------------------- TTCTATTGAT 3070 het 3070 hom 23 9 12 9 TTCTATTGATGTGATGAATTACATTAACC 2 1 24739 CASAVA_Build 5 91636686 1I TGGTGACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1921 hom 41 4 29 8 A 10 11 24740 CASAVA_Build 5 91646372 1D GGAAACATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 T 10 9 24741 CASAVA_Build 5 91652381 1I ACACTTGTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 8 9 24742 CASAVA_Build 5 91666737 1I GTTCATGGGT -/A ATGTATAGAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 A 1 2 24743 CASAVA_Build 5 91722282 1D CAAAAAGTTT G/- GAAACACCAA 3070 het 3070 hom 51 23 24 5 G 2 1 24744 CASAVA_Build 5 91725295 9I4M8I4M6I14M3I ATTGCACTTT ---------CTGA--------GGGC------TGGATCTTGGAGAT---/AACAGACTCCTGAAGAAATGGGGGCCTAAATAGGAAATTTTAGATGGG GATGTGTGAA 3070 het 3018 hom 19 9 12 7 N/A 0 0 24745 CASAVA_Build 5 91726363 1D TTTTTGTCTA T/- TTTTTTTTTT 641 het 641 ref 22 12 4 6 T 15 14 24746 CASAVA_Build 5 91735218 2D GTATCCCATG TT/-- TTTTTTTTTT 1206 het 1206 ref 38 15 5 18 T 18 16 24747 CASAVA_Build 5 91745942 1D ATAACCCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2080 hom 27 10 13 5 T 10 9 24748 CASAVA_Build 5 91750377 4I AGTTTAACAA ----/AGTT AGAAAAACTC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AGTT 0 1 24749 CASAVA_Build 5 91760831 1D TTAGGGTGAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 A 9 8 24750 CASAVA_Build 5 91762967 1I AACACTAAGG -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 A 6 7 24751 CASAVA_Build 5 91766787 1D TAAGGCCTCT G/- GCCACCACTT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 G 2 1 24752 CASAVA_Build 5 91767188 1I CTATCAACCC -/T ATGACCAGCA 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 T 0 1 24753 CASAVA_Build 5 91772206 1D CTTGATATTA T/- TGTCTATGTT 3070 het 3070 hom 42 16 25 2 T 2 1 24754 CASAVA_Build 5 91772769 1D ATATATGACC A/- AAAGATAACA 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 A 4 3 24755 CASAVA_Build 5 91778963 1D ATCAGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 533 hom 32 3 19 10 T 15 14 24756 CASAVA_Build 5 91790186 1I TTTTTGCTGC -/T AGGGTGAACC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 0 1 24757 CASAVA_Build 5 91806749 10D AAAGAAAGAC AGAAAAGAAA/---------- AGAAAAGAAA 2597 het 2597 ref 34 20 8 8 AGAAA 4 2 24758 CASAVA_Build 5 91809082 1D TATCTCTGAA G/- ACCTCATAGG 3070 het 3070 ref 47 24 22 3 G 1 0 24759 CASAVA_Build 5 91815980 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 13 14 24760 CASAVA_Build 5 91843895 1I AAAGGTGCTC -/A AAAATCACTA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 4 5 24761 CASAVA_Build 5 91848957 17D AAAGGCATAA TGTCTTTCAGTTTTATT/----------------- TGTACAATGG 3070 het 3070 ref 45 28 21 4 TGTCTTTCAGTTTTATT 1 0 24762 CASAVA_Build 5 91851097 1D TCTATCCATA C/- CTCATCCTTC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 C 2 1 24763 CASAVA_Build 5 91855745 1D TTAGCACTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 12 11 24764 CASAVA_Build 5 91889621 2I TAGTATAATC --/TT AGAAATATAA 3070 het 3070 hom 22 7 12 3 T 0 2 24765 CASAVA_Build 5 91891868 1I AAAAAATGTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 7 8 24766 CASAVA_Build 5 91930703 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2943 hom 27 het 13 0 10 3 A 14 15 24767 CASAVA_Build 5 91946759 1I AAAGTATCAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 A 7 8 24768 CASAVA_Build 5 91961626 2D ATGCAACACC TT/-- TGTAAGCAAA 3070 het 3070 hom 49 19 26 6 T 3 1 24769 CASAVA_Build 5 91963314 1D TCTTGAGATG A/- AAAAAATCAC 3070 het 1055 hom 24 5 8 11 A 7 6 24770 CASAVA_Build 5 91963334 1I CATGAACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 21 0 11 10 A 12 13 24771 CASAVA_Build 5 91970422 1D TTGGTTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 12 11 24772 CASAVA_Build 5 91977101 2D TATGGAAGAA AG/-- CATTAGATGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 AG 1 0 24773 CASAVA_Build 5 91984498 1I GATACAGTAC -/A AAAAGTGCTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 4 5 24774 CASAVA_Build 5 92003938 1I TTTGTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 11 12 24775 CASAVA_Build 5 92015071 2I GCCAATTTAA --/CT ATGAAATAAT 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 CT 0 1 24776 CASAVA_Build 5 92036804 2I TTATATAAAC --/TT GAATAGATTC 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 T 0 2 24777 CASAVA_Build 5 92049554 1I AGGAAGGAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2614 hom 23 6 9 8 T 9 10 24778 CASAVA_Build 5 92054412 1I AGGGGATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 A 10 11 24779 CASAVA_Build 5 92059641 2I AAAAAAAAAA --/AC ATTGGCTATT 3070 het 3070 hom 54 20 23 11 AC 0 1 24780 CASAVA_Build 5 92088882 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 9 10 24781 CASAVA_Build 5 92091949 2I CTTTCTATAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1264 hom 25 4 13 8 A 13 15 24782 CASAVA_Build 5 92093105 2D AATCACACAA AC/-- ACACACACAC 937 het 937 ref 45 36 3 6 AC 10 9 24783 CASAVA_Build 5 92096547 1I TAAAATGCCT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 35 1 31 3 A 0 1 24784 CASAVA_Build 5 92105267 1I TAAGAGTCCA -/C CTTTTGTCAG 3070 het 3070 hom 42 11 27 4 C 1 2 24785 CASAVA_Build 5 92109030 2I TTGGTGTCTT --/AC AGTGATAGAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AC 0 1 24786 CASAVA_Build 5 92111451 1I CTAGCTGAAG -/A AAAAACTCTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 5 6 24787 CASAVA_Build 5 92123550 2I TTTTATATTT --/AC AGTTTTATTA 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 AC 0 1 24788 CASAVA_Build 5 92124516 4D CTTTCATATC ACAA/---- ACAAATATTT 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 ACAA 2 1 24789 CASAVA_Build 5 92131451 1D AATAATGAGT A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 33 19 9 6 A 8 7 24790 CASAVA_Build 5 92138373 3D TCACCATCTC CTT/--- CTTCTTCTAA 3070 het 3070 ref 63 35 22 6 CTT 3 2 24791 CASAVA_Build 5 92145862 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 432 hom 31 1 25 5 A 9 10 24792 CASAVA_Build 5 92148305 4D TGTCTATTCT TTCA/---- TTAATACAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 TTCA 1 0 24793 CASAVA_Build 5 92153034 1D GAAGTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3055 het 2352 hom 42 12 14 16 T 15 14 24794 CASAVA_Build 5 92155460 1D ATACACGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 T 11 10 24795 CASAVA_Build 5 92159633 1D TTGCAGTGAA T/- TTTTTTTTTT 1251 het 1251 ref 49 33 3 14 T 13 12 24796 CASAVA_Build 5 92169989 3D AATATTTATC ATT/--- ATTGAACTAG 3070 het 3070 hom 37 14 22 2 ATT 2 1 24797 CASAVA_Build 5 92173525 1D GTGAGGGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 T 15 14 24798 CASAVA_Build 5 92178262 2D ATTAAATTAT AC/-- ACACATAAAG 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 AC 3 2 24799 CASAVA_Build 5 92271761 1D TGACCTCCAC A/- GGGGGAAACT 3070 hom 78 het 31 0 25 7 A 1 0 24800 CASAVA_Build 5 92319352 3D AAGACTCCAG AAT/--- AATATCATAG 3070 het 3070 ref 44 23 19 4 AAT 2 1 24801 CASAVA_Build 5 92340303 30D CATGGAAAGT GCTTTTAAGAATTTAGTTTCTCTTATCTAA/------------------------------ AACAAGGAAA 3070 het 3070 ref 38 22 19 3 GCTTTTAAGAATTTAGTTTCTCTTATCTAA 1 0 24802 CASAVA_Build 5 92346076 1I AAAAATCAAG -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 A 6 7 24803 CASAVA_Build 5 92362307 1I CTAACAATAC -/A AAAAAAATTC 2280 het 2280 ref 11 6 5 0 A 7 8 24804 CASAVA_Build 5 92370475 1I ATTTGACAAA -/T TTTGTTACAT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 3 4 24805 CASAVA_Build 5 92387945 1I ACTCTATAGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 8 9 24806 CASAVA_Build 5 92403560 1D AAAAAAATTA C/- TTTATTCTAC 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 C 1 0 24807 CASAVA_Build 5 92403763 1I GATATGCGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 28 1 21 6 A 11 12 24808 CASAVA_Build 5 92405523 4D TTTAAACAGA TTGT/---- TTATTTAAAA 3070 hom 111 het 38 0 38 2 TTGT 1 0 24809 CASAVA_Build 5 92413090 3D AAAATTATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 14 11 24810 CASAVA_Build 5 92415664 1D TGCCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 31 0 22 9 T 13 12 24811 CASAVA_Build 5 92416333 1I TTTCCTGGGG -/T TTGGAAATAC 3070 hom 105 het 39 0 33 6 T 2 3 24812 CASAVA_Build 5 92465221 1I ATTTCAGACC -/A AAAAAAAAAA 2954 het 2954 ref 34 15 10 9 A 15 16 24813 CASAVA_Build 5 92518436 1I ACTTGAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 T 11 12 24814 CASAVA_Build 5 92559633 1D TACTTTGAAG T/- TTTTTATATG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 6 5 24815 CASAVA_Build 5 92569277 1I CACAGCTCAG -/A AAAAATCAAT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 A 5 6 24816 CASAVA_Build 5 92586779 1D TCTCGGGGAG A/- AAAAAAAAAA 2262 het 2262 ref 23 10 6 7 A 11 10 24817 CASAVA_Build 5 92588904 1D TGTTTCTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 8 7 24818 CASAVA_Build 5 92591439 1D AGCAATCATT A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 41 12 25 6 A 7 6 24819 CASAVA_Build 5 92628380 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGAGGGA 923 hom 7 het 3 0 3 0 G 6 5 24820 CASAVA_Build 5 92633255 3D AAAGAAATCT TAA/--- TTTCACTTAG 3070 het 3070 hom 28 7 14 7 TAA 1 0 24821 CASAVA_Build 5 92637183 1I CATGCTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 10 11 24822 CASAVA_Build 5 92637642 1D TTCTTCAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2949 hom 20 7 12 1 T 10 9 24823 CASAVA_Build 5 92641082 1D AAAATCACAG C/- CCCTCATCTG 3070 het 3070 hom 35 15 19 2 C 4 3 24824 CASAVA_Build 5 92659215 1D AGAAAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 11 10 24825 CASAVA_Build 5 92688067 1D AAAAAAAAAA C/- ATTTTATTTT 1992 het 1726 hom 26 13 8 5 C 1 0 24826 CASAVA_Build 5 92691683 5D TTGTTTGCTG CCGTT/----- CCGTTCCACA 3070 het 3070 ref 34 17 15 4 CCGTT 2 1 24827 CASAVA_Build 5 92699283 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAG 3070 het 1950 hom 20 5 10 5 G 0 1 24828 CASAVA_Build 5 92702373 1I ACAAGAAAGC -/A AAACTCCTAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 3 4 24829 CASAVA_Build 5 92706321 1I GAAGATTTTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 7 8 24830 CASAVA_Build 5 92727439 1I AGTGCTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 23 18 11 A 10 11 24831 CASAVA_Build 5 92739061 1I AAAAGTTGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 9 10 24832 CASAVA_Build 5 92742985 7D GAACAAACCA CCTCCCC/------- CCATCTTTAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 CCTCCCC 1 0 24833 CASAVA_Build 5 92773206 1D TCAGAAATAT C/- ACATACCTGC 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 C 1 0 24834 CASAVA_Build 5 92785770 1D TTATATTATA T/- TTTCTAATAT 2962 het 987 hom 10 2 6 2 T 4 3 24835 CASAVA_Build 5 92854309 1D ATTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 12 11 24836 CASAVA_Build 5 92877147 1I TAAATGGTGA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 T 6 7 24837 CASAVA_Build 5 92892772 2I GTTTGCAAGT --/AA AAAAATTGTA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 A 5 7 24838 CASAVA_Build 5 92944234 2I GTGAGCGTAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 17 het 27 0 18 9 GT 7 8 24839 CASAVA_Build 5 93011621 1D ATCAAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 1468 het 1468 ref 30 18 4 10 A 13 12 24840 CASAVA_Build 5 93023119 1D CTGATCAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 14 10 A 12 11 24841 CASAVA_Build 5 93055038 1D CCTACCAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 10 9 24842 CASAVA_Build 5 93064531 4D CCTTCTGGAA AAGC/---- ACCAAGGTAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 AAGC 1 0 24843 CASAVA_Build 5 93103374 1I AAACTCTGGA -/C CCCTGATCCC 3070 hom 68 het 29 0 23 6 C 3 4 24844 CASAVA_Build 5 93156239 1I TCTTCAGGTC -/T TTGCAGCTAT 3070 hom 102 het 39 0 32 7 T 2 3 24845 CASAVA_Build 5 93183017 1I AAAAGTCCTG -/A AAAAATTGCC 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 A 5 6 24846 CASAVA_Build 5 93186769 5D GGGCACAAAC AAGAT/----- AATTTTTTTT 3070 hom 101 het 36 0 33 4 AAGAT 1 0 24847 CASAVA_Build 5 93234846 6D GGAAAGGAAA GGAAGG/------ GGAAGGGGAA 1040 hom 10 het 7 0 3 6 GGAAGG 4 3 24848 CASAVA_Build 5 93240968 2D GGAGTCTAAA AG/-- AGAGAAAATA 3070 hom 88 het 35 0 30 6 AG 3 2 24849 CASAVA_Build 5 93244874 1I CAAAAGAGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 42 0 32 10 T 8 9 24850 CASAVA_Build 5 93251275 1I CATATTCAGG -/A AAAAAAGTCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 6 7 24851 CASAVA_Build 5 93270700 1I TCCTAATGTG -/C CACTTCAGTG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 1 2 24852 CASAVA_Build 5 93312086 1I CCTGGGTGAC -/A AGAGCAAGAC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 1 2 24853 CASAVA_Build 5 93314969 1D CCAGAGTCTC T/- TCCCTTTGTG 3070 hom 84 het 32 0 27 6 T 2 1 24854 CASAVA_Build 5 93328477 1D TTCAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 8 A 13 12 24855 CASAVA_Build 5 93407673 1D GAGAGTTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 9 8 24856 CASAVA_Build 5 93411409 1I AAGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 10 11 24857 CASAVA_Build 5 93468787 4I TGAAACCTTG ----/AGTA AGTCAGTCAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AGTA 0 1 24858 CASAVA_Build 5 93510119 1D GGCTTATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 104 hom 22 1 17 4 A 13 12 24859 CASAVA_Build 5 93593994 1D TTGGGTTTAC T/- TTTTTTATGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 6 24860 CASAVA_Build 5 93625127 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 9 10 24861 CASAVA_Build 5 93627850 1I CATGATGTCA -/C TAAATCTTCT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 C 0 1 24862 CASAVA_Build 5 93640305 1I CTTTCCTAAA -/C TTTCAATTCT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 C 0 1 24863 CASAVA_Build 5 93673682 2D AATATACATG GT/-- GTGTGTGTGT 871 het 871 ref 37 25 3 9 GT 9 8 24864 CASAVA_Build 5 93675079 1D GGGAGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 34 0 23 11 T 13 12 24865 CASAVA_Build 5 93685018 1D GCTCCAGACC A/- AAAAAAAAAA 2137 het 2137 ref 39 26 6 7 A 15 14 24866 CASAVA_Build 5 93739997 4D TCCATGTCTT TAAC/---- TATTGTGAAT 3070 het 3070 hom 44 20 22 4 TAAC 1 0 24867 CASAVA_Build 5 93765428 6D TTTTAAAAAG ATTCTT/------ CTTCTTTGTA 3070 het 3070 ref 37 22 15 0 ATTCTT 1 0 24868 CASAVA_Build 5 93765939 1I TTCCTTCTTT -/G CTTTACAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 G 0 1 24869 CASAVA_Build 5 93771660 1D GACACTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 673 hom 35 4 25 6 A 15 14 24870 CASAVA_Build 5 93773408 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 13 12 24871 CASAVA_Build 5 93782394 1I AGTTCAAAGA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 49 22 14 13 T 7 8 24872 CASAVA_Build 5 93783549 11D TTAGTCCTGA TCTGGTTTAGG/----------- ATGCACTACC 3070 het 3070 ref 42 29 12 4 TCTGGTTTAGG 1 0 24873 CASAVA_Build 5 93790842 1D TCCTAGAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 15 17 11 T 10 9 24874 CASAVA_Build 5 93801013 1D TTTGTAAGTT G/- CACAAGCACC 3070 het 3070 ref 58 28 27 6 G 1 0 24875 CASAVA_Build 5 93803580 1I AAACTTATAG -/A AAAAAAAATG 2657 het 2657 ref 36 26 6 4 A 8 9 24876 CASAVA_Build 5 93832721 1I AGAGATAGTA -/C CTATCTTACT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 1 2 24877 CASAVA_Build 5 93890917 2I ATATGTAGTG --/TA TATATATATA 2395 het 2395 ref 15 9 5 1 TA 5 6 24878 CASAVA_Build 5 93909198 1I ACTCCCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3025 het 3025 ref 29 16 8 5 A 11 12 24879 CASAVA_Build 5 93917537 1I TTTTTGAGAC -/A AGAGTCTCAC 1155 het 1155 ref 10 5 3 2 A 1 2 24880 CASAVA_Build 5 93924660 2I AAAAAACAAA --/AC AAAAAAAAAA 2347 het 968 hom 23 7 7 9 AC 0 1 24881 CASAVA_Build 5 93980956 1D AAATATTGAC A/- AAAAAAAAAT 794 het 794 ref 32 23 2 7 A 10 9 24882 CASAVA_Build 5 93981348 4D CCTTCCTTTG CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 32 10 15 8 CTTT 4 3 24883 CASAVA_Build 5 94011824 2D ATTTGGAACA TT/-- TTTTTTTTTT 2151 het 2151 ref 28 12 5 11 T 18 16 24884 CASAVA_Build 5 94050498 3I AAATGAGAAA ---/CCT CCTCTAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 CCT 1 2 24885 CASAVA_Build 5 94064355 1I GGGACAAATA -/T TGTCATTTCC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 2 24886 CASAVA_Build 5 94065588 5I TTTTAATTCA -----/TACTT TACTTTACTG 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 TACTT 1 2 24887 CASAVA_Build 5 94069670 1D TAATATTCCT G/- GTTTCCTCCC 3070 hom 66 het 25 0 22 4 G 2 1 24888 CASAVA_Build 5 94073881 1D TTGAGGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 116 het 46 0 37 10 T 11 10 24889 CASAVA_Build 5 94085017 1I CTTGGCAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 755 hom 32 2 24 6 T 10 11 24890 CASAVA_Build 5 94088043 1D GCCCGCAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 10 9 24891 CASAVA_Build 5 94097262 1I CTTTAAAATA -/G TATCTGTGCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 0 1 24892 CASAVA_Build 5 94103557 1D GGTAATAACA T/- TATTAGGGTA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 2 1 24893 CASAVA_Build 5 94104101 1D AGCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 11 10 24894 CASAVA_Build 5 94104603 1D AACCCAATGT A/- AAAAAAAAAA 2016 het 935 hom 28 5 7 16 A 19 18 24895 CASAVA_Build 5 94105972 1I TTCACTAACA -/T TTTTTTTTTT 2254 het 2254 ref 20 8 10 2 T 11 12 24896 CASAVA_Build 5 94116147 3D AAAGCATATC CTT/--- TTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 CTT 1 0 24897 CASAVA_Build 5 94122154 1I AACAAAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2952 hom 39 11 16 12 T 13 14 24898 CASAVA_Build 5 94127926 1I TAGGTGGGAA -/C TGAACAATGA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 C 0 1 24899 CASAVA_Build 5 94138486 1I TCAGATATGA -/T TTTTTATGCT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 T 5 6 24900 CASAVA_Build 5 94141731 1D CCTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 35 0 33 4 T 10 9 24901 CASAVA_Build 5 94141963 1I TGTGAGACTG -/T TCTTAATTTA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 1 2 24902 CASAVA_Build 5 94159563 2D CCTTGATGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 34 1 16 17 A 14 12 24903 CASAVA_Build 5 94169184 1D GGGAAATACT G/- GGCATTTGGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 3 2 24904 CASAVA_Build 5 94174236 1D CTTGCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 30 0 21 10 A 13 12 24905 CASAVA_Build 5 94175313 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAATTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 6 7 24906 CASAVA_Build 5 94193708 1I27M1D GCATAAGCCA -TTGTTCTAAACTAGATTAAGAGAAAATA/TTTGTTCTAAACTAGATTAAGAGAAAAT- CAATGAGAAG 3070 hom 132 het 37 0 45 2 N/A 0 0 24907 CASAVA_Build 5 94206993 1D GACATGAACA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 9 8 24908 CASAVA_Build 5 94207582 1D AAACAGAATT G/- GCTATTCGGC 3070 hom 102 het 35 0 35 1 G 2 1 24909 CASAVA_Build 5 94222339 1D AGTGACTATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 10 9 24910 CASAVA_Build 5 94228008 1D TGATTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 45 1 17 27 T 15 14 24911 CASAVA_Build 5 94228322 1I CACAATACAC -/T GTAAATGCTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 0 1 24912 CASAVA_Build 5 94232714 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2817 het 2817 ref 39 25 7 7 T 13 12 24913 CASAVA_Build 5 94237132 1D TGCAGATGTC A/- ATATTTAATC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 1 24914 CASAVA_Build 5 94244009 2I AATATTTTTT --/AA AAGTTTAATT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 4 24915 CASAVA_Build 5 94249537 1I TTTGCACAAA -/T TGGTCAAGCC 3070 hom 108 het 44 0 36 8 T 1 2 24916 CASAVA_Build 5 94252681 1D GTTTATCACC A/- AAAATCTATT 3070 het 3070 ref 58 28 26 4 A 5 4 24917 CASAVA_Build 5 94267471 1D AAGGCAAGCG A/- AAAATGTGTT 3070 het 3070 hom 52 21 25 7 A 5 4 24918 CASAVA_Build 5 94299302 1I AAATCACCAC -/A ATCGCTGCTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 24919 CASAVA_Build 5 94302719 3D CTCAGTTTTC ATG/--- ATAATAGACT 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 ATG 1 0 24920 CASAVA_Build 5 94311803 5D GTTAAATTGT GGCTA/----- GGCTACATAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 GGCTA 2 1 24921 CASAVA_Build 5 94317785 1D AGCGCAAAAA G/- GCTGAAAATT 3070 het 2959 hom 21 10 8 3 G 2 1 24922 CASAVA_Build 5 94324813 4I ATTGTAATTC ----/TATT TATTTTTTTT 3070 het 2134 hom 38 8 21 9 TATT 1 2 24923 CASAVA_Build 5 94326992 1I GGTTTTTTTT -/A ATCAGTCTTT 3070 het 3070 hom 50 18 27 5 A 1 2 24924 CASAVA_Build 5 94340663 1D GCCTTCATCT G/- GCCTCTTTAT 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 G 2 1 24925 CASAVA_Build 5 94344418 2D CTTTAAGAGC AG/-- AGAGTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 AG 3 2 24926 CASAVA_Build 5 94349772 1D ATATTTAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 10 9 24927 CASAVA_Build 5 94352351 1I CCTGGTTATG -/A ACCAGCCCTC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 A 1 2 24928 CASAVA_Build 5 94353180 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 8 7 24929 CASAVA_Build 5 94353338 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 387 hom 24 1 22 1 A 9 10 24930 CASAVA_Build 5 94354235 16D TGTGTTGGCC CCCATCCCTTCCCCAT/---------------- CTCAACCTTC 3070 het 3070 hom 30 14 14 5 CCCATCCCTTCCCCAT 1 0 24931 CASAVA_Build 5 94366883 1I CATGAGATTT -/A GGGAGGGGCC 2466 het 2466 ref 29 18 8 3 A 0 1 24932 CASAVA_Build 5 94375721 3I ATGTCTCTAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 45 18 17 10 AAC 5 6 24933 CASAVA_Build 5 94379964 1I TAAAGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 12 13 24934 CASAVA_Build 5 94391097 1I GCACTTCTCT -/G CTCCTCTCAC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 G 0 1 24935 CASAVA_Build 5 94415206 1I AACACAATCC -/T TTTAAAAGTG 3070 het 3070 hom 53 17 28 8 T 3 4 24936 CASAVA_Build 5 94419467 3D TAATTAAATT ACA/--- ACAACAACAA 3070 het 3070 hom 36 9 21 8 ACA 6 5 24937 CASAVA_Build 5 94421643 1D TTCTCATCTC T/- GAGATGAGAT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 T 1 0 24938 CASAVA_Build 5 94424263 1D TGTTTTATTG T/- TTTTTTGTTT 1058 het 183 hom 33 1 16 16 T 7 6 24939 CASAVA_Build 5 94425286 1I ATTTTTTATA -/T TTTTTTATTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 6 7 24940 CASAVA_Build 5 94433034 3D AGTGATATTC ATG/--- ATGATTTGTT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 ATG 2 1 24941 CASAVA_Build 5 94437913 1D CTGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 605 hom 38 5 21 13 A 17 16 24942 CASAVA_Build 5 94446865 1I ATCCTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 37 2 28 7 T 13 14 24943 CASAVA_Build 5 94447452 2D TTATAGATAT CA/-- CTCTTCTGTG 2664 het 2664 ref 29 14 8 8 CA 1 0 24944 CASAVA_Build 5 94459062 1I ATTTTGTTGG -/A TTTCCATCAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 24945 CASAVA_Build 5 94477768 5I AAGTAGAAAG -----/ATGAA ATGATGAACC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 ATGAA 0 1 24946 CASAVA_Build 5 94485112 5D CAAGCTCTGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 24 1 18 5 T 16 11 24947 CASAVA_Build 5 94510958 8I GCTGGGAGCC --------/CAAGCCGG CAAGTCTTGC 3070 hom 75 het 29 0 25 5 CAAGCCGG 0 1 24948 CASAVA_Build 5 94534051 2I TATCAAACTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 22 9 T 10 12 24949 CASAVA_Build 5 94535338 1D GATAAGAAAC A/- AATCAGAGAA 3070 hom 48 het 20 0 15 5 A 3 2 24950 CASAVA_Build 5 94585967 1D ACAGACTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 29 4 11 15 T 19 18 24951 CASAVA_Build 5 94632039 1I GGCCAGCTCA -/G GGGTAGGCTG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 G 3 4 24952 CASAVA_Build 5 94632926 1I CTCAAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 43 0 33 10 A 10 11 24953 CASAVA_Build 5 94636087 10I TACTGCTTTC ----------/TTTTTTTCTT TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 35 0 29 9 TTTTTTTCTT 1 2 24954 CASAVA_Build 5 94645302 1I TCCGGCCGCG -/C CCACCGGCAC 1281 hom 10 het 4 0 4 0 C 2 3 24955 CASAVA_Build 5 94661225 3I GATACTAGTA ---/CCT CCTCCGTGCC 3070 hom 101 het 40 0 33 7 CCT 1 2 24956 CASAVA_Build 5 94664923 1I TTCTGCCACT -/A AAAAGTAAGT 3070 hom 110 het 41 0 37 4 A 4 5 24957 CASAVA_Build 5 94666245 1I ATTAAGCAAT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 7 8 24958 CASAVA_Build 5 94677280 2I TAAGTTATGA --/CT CTATTTCTTC 3070 hom 146 het 56 0 48 8 CT 1 2 24959 CASAVA_Build 5 94704172 1I AACGTGCAGG -/T TTGTTACATA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 T 2 3 24960 CASAVA_Build 5 94726538 4D GTTAAAGAAC TTTG/---- TTTATTACCA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 TTTG 1 0 24961 CASAVA_Build 5 94730667 1D AATCAGTGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 10 9 24962 CASAVA_Build 5 94742105 1D AAAAGTAGCA G/- GAGATGGCAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 2 1 24963 CASAVA_Build 5 94745654 1I TGTGATGCAT -/C CCGGGAGGAA 3070 het 3070 ref 50 33 14 3 C 2 3 24964 CASAVA_Build 5 94753124 1I AATGTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2671 hom 29 8 18 3 A 9 10 24965 CASAVA_Build 5 94754934 2I ATTACTTAAC --/CT CTCTGTTTCT 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 CT 2 3 24966 CASAVA_Build 5 94759905 3D TAAATAAATA AAT/--- AAATAAAAAA 1545 het 1545 ref 21 9 4 8 AAT 1 0 24967 CASAVA_Build 5 94781558 4D CACCTAGAAT CAAA/---- CCACTGCTGC 3070 het 3070 ref 33 15 14 6 CAAA 1 0 24968 CASAVA_Build 5 94782177 2D CGAAATCCCC AT/-- ATGTGTCAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 AT 2 1 24969 CASAVA_Build 5 94783139 1I GGTAGAATAC -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 A 7 8 24970 CASAVA_Build 5 94801055 15D AAAGAGAAAG TAAGACAGGGTTATT/--------------- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 14 13 3 TAAGACAGGGTTATT 1 0 24971 CASAVA_Build 5 94805099 1D TTATGCAAAG A/- AAAAGAGTTA 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 A 5 4 24972 CASAVA_Build 5 94812122 2I CATGACTAAC --/AT ATATATATAT 1409 het 1409 ref 16 9 3 4 AT 8 9 24973 CASAVA_Build 5 94834823 1I GCTCACTGCA -/G TCCCAACCTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 24974 CASAVA_Build 5 94949699 1D TGTATCTTAA T/- TTTTTTTTTT 1467 het 1467 ref 30 16 4 11 T 17 16 24975 CASAVA_Build 5 94976469 2D TATAAGACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 8 A 13 11 24976 CASAVA_Build 5 94996044 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1418 hom 40 8 17 15 T 16 15 24977 CASAVA_Build 5 95000429 1D AGGGTCACAG T/- TCGAAAATCA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 2 1 24978 CASAVA_Build 5 95010596 1D AATTTTAATT A/- TAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 1 0 24979 CASAVA_Build 5 95019402 2I AGGCAAAAAC --/TG TAGCCCTGGT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TG 0 1 24980 CASAVA_Build 5 95022425 3D ACACACTCTG TCT/--- TCTTAGTCAA 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 TCT 2 1 24981 CASAVA_Build 5 95028196 3D AAGGCAGCAG CAT/--- CATGAGATTT 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 CAT 2 1 24982 CASAVA_Build 5 95033383 1I TAAAAAAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 9 10 24983 CASAVA_Build 5 95110137 1I TCTCCAAATG -/A AACCTTTTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 3 24984 CASAVA_Build 5 95124049 2D CCTAACTATA CC/-- GCCCACACTA 3070 hom 138 het 48 0 47 2 C 2 0 24985 CASAVA_Build 5 95133420 1I ATTAGCTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 17 het 25 1 21 3 A 9 10 24986 CASAVA_Build 5 95143318 4I TCAAAAAAAG ----/ACTA ACTTAGTATT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 ACTA 0 1 24987 CASAVA_Build 5 95148914 2D ATACAGCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 14 12 24988 CASAVA_Build 5 95168718 1D TGTAGACCCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 T 10 9 24989 CASAVA_Build 5 95176721 12I AGAATAGGAA ------------/ATATTTGGTACC ACCATTAATT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 ATATTTGGTACC 0 1 24990 CASAVA_Build 5 95182932 2D GAGAGAAGGG GA/-- GAGAAACAAC 3070 het 3070 hom 48 16 26 6 GA 3 2 24991 CASAVA_Build 5 95221210 3I GCAAGAGAAC ---/AAG AAGGAGCCTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 AAG 1 2 24992 CASAVA_Build 5 95222383 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2572 hom 22 7 9 7 A 14 13 24993 CASAVA_Build 5 95234589 1I CTTCCTTTCC -/T TTTTTTTTTG 2216 het 17 hom 16 1 7 8 T 9 10 24994 CASAVA_Build 5 95240202 1I AAGGCACTAA -/C CTGACATGCC 3070 hom 147 het 56 0 48 8 C 1 2 24995 CASAVA_Build 5 95249188 1I CACCAGGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 10 11 24996 CASAVA_Build 5 95250457 1D ACTGCAGATG A/- AAAAAAAAAA 1526 het 1526 ref 36 19 5 13 A 18 17 24997 CASAVA_Build 5 95257740 1D ACTAAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 T 13 12 24998 CASAVA_Build 5 95258861 1D TCTTCTATGT G/- GTGGCATGCA 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 G 2 1 24999 CASAVA_Build 5 95259552 1D CTGTAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1858 hom 34 7 12 16 A 17 16 25000 CASAVA_Build 5 95260423 4I CTTAAGCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 2501 hom 31 8 19 4 AAAC 3 4 25001 CASAVA_Build 5 95260914 1I TGCTATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 11 12 25002 CASAVA_Build 5 95263020 3I GTAAGAGATT ---/AAC AACAATAACT 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 AAC 1 2 25003 CASAVA_Build 5 95266698 2I GAGATACGCG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 CA 8 9 25004 CASAVA_Build 5 95266962 3I CATTTATTCT ---/CTC CTTTCTTTTG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 CTC 0 1 25005 CASAVA_Build 5 95270993 1I ATGCTAAAAG -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 48 16 26 6 A 6 7 25006 CASAVA_Build 5 95271404 1I TGACCAGAAG -/C CCTGGCAACA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 2 3 25007 CASAVA_Build 5 95274533 2D AGTTGTTAAG GT/-- CACTGCTCAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GT 1 0 25008 CASAVA_Build 5 95278209 1D ATGCCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 13 12 A 12 11 25009 CASAVA_Build 5 95279215 1I CCTTAAATCC -/T TTTCCAAACA 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 T 3 4 25010 CASAVA_Build 5 95282378 2I AAGATGAAGA --/CT CAGCACTAAC 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 CT 0 1 25011 CASAVA_Build 5 95283532 1I CTAAATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1855 hom 21 6 8 7 T 12 13 25012 CASAVA_Build 5 95284701 1I AAATAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 12 13 25013 CASAVA_Build 5 95288842 2D CACACACACA CG/-- TGTGTATATA 1670 het 1670 ref 31 12 7 12 CG 1 0 25014 CASAVA_Build 5 95292370 1D TTTTGTGCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 T 10 9 25015 CASAVA_Build 5 95297363 1I GAAGCATGTT -/A AAAATGCAAA 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 A 4 5 25016 CASAVA_Build 5 95298190 6D AGGTGACAGA GTAAGG/------ GATGGTTAAA 3070 het 3070 ref 45 28 16 2 GTAAGG 1 0 25017 CASAVA_Build 5 95298964 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 13 14 25018 CASAVA_Build 5 95300825 1D GCCATGCCCA T/- CCCTGCATCT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 T 1 0 25019 CASAVA_Build 5 95309336 1D AAAAAAATAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 16 18 4 T 9 8 25020 CASAVA_Build 5 95311161 2D AAGATACTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2456 hom 20 6 10 5 A 16 14 25021 CASAVA_Build 5 95315141 5I CTCATGATTC -----/TTTTG TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 21 5 TTTTG 1 2 25022 CASAVA_Build 5 95320376 1D TTTTTTTTTT A/- AATTAAGAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 3 2 25023 CASAVA_Build 5 95397538 1D ATTTTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 1163 het 1163 ref 33 20 4 9 A 11 10 25024 CASAVA_Build 5 95397622 1I TATCAATGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 9 10 25025 CASAVA_Build 5 95425924 2I6M1I3M3I GAATGATAGG --CAAAAG-TAT---/TTCAACAGCTATCTG GTAATTGCAG 3070 hom 99 het 34 0 34 3 N/A 0 0 25026 CASAVA_Build 5 95426164 3D TGTGGCCTAC AGG/--- AGAAGAAAGC 3070 hom 80 het 34 0 27 8 AGG 1 0 25027 CASAVA_Build 5 95426862 2D GTTAATGATC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 32 0 23 10 TG 15 14 25028 CASAVA_Build 5 95427855 1D TCTAACAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 39 1 30 8 T 12 11 25029 CASAVA_Build 5 95432132 5D TTTGAATACG TTGAA/----- TTGAAGATAT 3070 hom 129 het 51 0 43 10 TTGAA 2 1 25030 CASAVA_Build 5 95433686 1I ATTGTTAAGG -/C CCTGACCCTC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 C 2 3 25031 CASAVA_Build 5 95435659 5I TTGTTTCTGT -----/AAGTG AAGTGATTCA 3070 hom 110 het 43 0 36 7 AAGTG 1 2 25032 CASAVA_Build 5 95440543 5I CCCATGCACT -----/TAAAA TAAAGTTAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TAAAA 0 1 25033 CASAVA_Build 5 95447444 1I AAGGGATTGC -/T TTCCAGGACC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 3 25034 CASAVA_Build 5 95448137 4I CAGAGAGGCT ----/GAGG GTTAGATGTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 GAGG 0 1 25035 CASAVA_Build 5 95450705 2D GTAGGAATGA AT/-- ATATATTTCG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AT 4 3 25036 CASAVA_Build 5 95452092 5D AAAGACTTTT TTATG/----- TTTTGTTTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 2 TTATG 1 0 25037 CASAVA_Build 5 95480278 1D TTCAGCATAC T/- TTTTTTTTTT 1717 het 1717 ref 46 37 4 5 T 13 12 25038 CASAVA_Build 5 95491310 10I ATTTCTAAAA ----------/AGTATTAATT AGTATTAATT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 AGTATTAATT 1 2 25039 CASAVA_Build 5 95497815 1D CTTTTGTTTT G/- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 G 1 0 25040 CASAVA_Build 5 95506133 1D CCAGACACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2148 hom 36 13 10 13 T 15 14 25041 CASAVA_Build 5 95514241 3I TAAAAGATAA ---/TAT TGTAAATAGA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TAT 0 1 25042 CASAVA_Build 5 95526668 1D AAAATGACAG T/- GTCTTTGGGG 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 T 1 0 25043 CASAVA_Build 5 95527421 19D TTTTTCATTT TCATTATCCATTTCATTAA/------------------- TCATTATCCA 2642 het 2642 ref 34 33 6 5 TCATTATCCATTTCATTAA 1 0 25044 CASAVA_Build 5 95546151 1I GATCTTATTC -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 T 6 7 25045 CASAVA_Build 5 95554413 4I ATTTTTAGGG ----/TTGT TTATTAACAT 3070 het 3070 hom 50 19 28 3 TTGT 0 1 25046 CASAVA_Build 5 95638724 1D GTGCCATATT A/- ACTCTCCAAA 3070 hom 151 het 58 0 51 7 A 2 1 25047 CASAVA_Build 5 95658509 5I TGGAGTATAT -----/GGGGA TTTCAGTGTG 3070 hom 151 het 54 0 51 3 GGGGA 0 1 25048 CASAVA_Build 5 95672035 1I TTTTTTTTTT -/A AAATGGGAGA 3070 het 988 hom 27 3 19 5 A 3 4 25049 CASAVA_Build 5 95682187 1I AGTTGTACAA -/C TAGACAGTCC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 C 0 1 25050 CASAVA_Build 5 95705667 2D GAAGAGTGAC AT/-- AGTTTCTAGT 3070 het 3070 hom 54 25 23 7 AT 1 0 25051 CASAVA_Build 5 95735195 3D ATTTCATTTC TTT/--- TTTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 44 26 14 5 T 7 4 25052 CASAVA_Build 5 95736894 1D GTGTGTGTGT G/- TGTTTTTTTT 1392 het 1392 ref 25 14 5 6 G 1 0 25053 CASAVA_Build 5 95744720 1I GAAATGGAGG -/A AAAGCATTTC 3070 het 3070 hom 51 23 26 2 A 3 4 25054 CASAVA_Build 5 95753635 1D CAAGTGTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 11 10 25055 CASAVA_Build 5 95753722 3I GAAAACTTTC ---/AGA AGAAGGAGAA 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 AGA 1 2 25056 CASAVA_Build 5 95762317 1I GGAGGCCGAG -/A GCGGGCGGAT 3070 hom 20 het 15 0 9 6 A 0 1 25057 CASAVA_Build 5 95773720 3D TTCTTTCCTT CTC/--- CTCATATCCA 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 CTC 2 1 25058 CASAVA_Build 5 95777266 1I CATTTCCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 295 hom 43 2 32 9 T 9 10 25059 CASAVA_Build 5 95782862 1I GGCATTTCTC -/T TGTCTGGAGT 3070 hom 126 het 49 0 40 9 T 1 2 25060 CASAVA_Build 5 95787189 1D TCTCCATCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 546 hom 25 4 13 8 A 15 14 25061 CASAVA_Build 5 95796068 4D GGGAAGTTTG TTTT/---- TTTTTTTGTT 1914 het 922 hom 17 6 8 3 T 11 7 25062 CASAVA_Build 5 95797913 2D TCACCAATAT AA/-- GTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 A 2 0 25063 CASAVA_Build 5 95800795 1I AAGCAATCAC -/A AAAAAATTAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 6 7 25064 CASAVA_Build 5 95806006 1I TCTTATTTAC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 T 6 7 25065 CASAVA_Build 5 95811234 3D AGCCTGCTGG CCT/--- CCTGGACTGT 3070 hom 99 het 37 0 33 7 CCT 2 1 25066 CASAVA_Build 5 95815551 1I CAAATATATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 9 10 25067 CASAVA_Build 5 95822405 2I TGCATTGTGT --/GC GACTACCACA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 GC 0 1 25068 CASAVA_Build 5 95828035 1I TTGTGTGGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 12 24 6 T 9 10 25069 CASAVA_Build 5 95829180 1I ATTAAAAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 9 10 25070 CASAVA_Build 5 95829516 1D CTACTCAGCC A/- AAAAAAGCCT 3070 het 3070 hom 45 20 18 7 A 7 6 25071 CASAVA_Build 5 95831340 4I TATATATATA ----/ATAT ATATATATAT 284 het 284 ref 10 4 2 4 AT 5 7 25072 CASAVA_Build 5 95831662 10I CACACACACA ----------/CACACGCACG CACACACACG 2644 het 2117 hom 17 8 7 2 CACACGCACG 0 1 25073 CASAVA_Build 5 95839742 1I TCTTACTGTG -/A AAAAAACTTA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 6 7 25074 CASAVA_Build 5 95846224 1I GCTGGGGGGC -/T CATCATTAGC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 0 1 25075 CASAVA_Build 5 95848166 1I CTTTTGTGTT -/G GGGGGGGCAG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 7 8 25076 CASAVA_Build 5 95850685 2I AGGTTCCAAT --/AG AGACTCATCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AG 1 2 25077 CASAVA_Build 5 95850884 1I TTATGAAGGG -/A AATAGCTCTC 3070 hom 120 het 51 0 39 12 A 2 3 25078 CASAVA_Build 5 95867779 6I ACCTACTAAT ------/GTTTTA GTTTTAAAGA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 GTTTTA 1 2 25079 CASAVA_Build 5 95876623 1I GGAGTGCTTC -/A AAAAATGAAA 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 5 6 25080 CASAVA_Build 5 95876747 10D TGGGGAACAA TATTGTTCCC/---------- ACAATGTTTG 3070 het 779 hom 45 3 30 14 TATTGTTCCC 1 0 25081 CASAVA_Build 5 95878666 2I ATATATGTTT --/AA AAGTACTAAT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 2 4 25082 CASAVA_Build 5 95883576 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1356 hom 17 4 10 3 A 12 11 25083 CASAVA_Build 5 95887507 4I ATGCCTGCAC ----/TAGT TAGTACCTCA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 TAGT 1 2 25084 CASAVA_Build 5 95895871 20I GAAAAATAGG --------------------/CTGGGCACGGTGACTCACGC CTGTAATCCC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 CTGGGCACGGTGACTCACGC 0 1 25085 CASAVA_Build 5 95896402 4I AGAAAGAAAG ----/AGAA AGAAAGGGAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AGAA 1 2 25086 CASAVA_Build 5 95896847 1I GATAAAATGT -/A AAAAAATCAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 6 7 25087 CASAVA_Build 5 95898295 1I ACAGTATAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 8 9 25088 CASAVA_Build 5 95899019 1D ACAGGAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 129 het 50 0 43 7 A 10 9 25089 CASAVA_Build 5 95900137 1I TTTTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1034 hom 29 3 20 7 A 10 11 25090 CASAVA_Build 5 95900356 2D CAAATGACTC AG/-- AGAGGTATTC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AG 3 2 25091 CASAVA_Build 5 95902795 1D TCATTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 11 10 25092 CASAVA_Build 5 95903916 1D GTATTGTCAG T/- TTTTTTATTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 25093 CASAVA_Build 5 95904040 2D GGCACCAAAG AT/-- GTGTGTATTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AT 1 0 25094 CASAVA_Build 5 95904131 2D TTAATTTTTA AG/-- AGTTATTTAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AG 2 1 25095 CASAVA_Build 5 95906071 3I CCATTAAAAC ---/ATT AATAAAAAAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 ATT 0 1 25096 CASAVA_Build 5 95906290 1I AGGAGTGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 249 hom 24 1 16 7 A 10 11 25097 CASAVA_Build 5 95908014 1D TAGTTATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 12 11 25098 CASAVA_Build 5 95908593 10D TGGGATAGCA CCTGTGTATT/---------- CCCTGGGGTT 3070 hom 93 het 31 0 32 3 CCTGTGTATT 1 0 25099 CASAVA_Build 5 95909447 4I TAAATACAAT ----/GTAA GTAAGTCTTT 3070 het 3070 hom 61 23 26 12 GTAA 1 2 25100 CASAVA_Build 5 95923396 1D GGGACTACAG A/- CGCCCGCTAC 1330 het 793 hom 6 2 3 1 A 1 0 25101 CASAVA_Build 5 95924441 1D TTAGGAAGGA G/- TTTTCTGTCC 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 G 1 0 25102 CASAVA_Build 5 95925119 1I TATAAAAAAA -/T AAGCATTCTT 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 T 0 1 25103 CASAVA_Build 5 95930164 1I TGTGTGCATA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 7 8 25104 CASAVA_Build 5 95933991 2D AACACTTCAC TT/-- TGTGCAAAAG 3070 het 2358 hom 22 6 16 0 T 3 1 25105 CASAVA_Build 5 95935100 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 A 10 11 25106 CASAVA_Build 5 95939744 1D TCTTTTTCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 10 9 25107 CASAVA_Build 5 95944676 1D TCTCTTATTC T/- TTTTTTTTTT 1179 het 1179 ref 27 18 3 6 T 13 12 25108 CASAVA_Build 5 95969502 1I CTGTGTAATA -/G GACACCAGAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 2 25109 CASAVA_Build 5 95971298 1D CAGGGGGGCA T/- TTTTTAAATG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 5 25110 CASAVA_Build 5 95973025 2D GAATTTATGC TT/-- TTAAGACCTC 3070 hom 66 het 23 0 23 1 T 4 2 25111 CASAVA_Build 5 95976197 1D TCCTCAGTGC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 7 6 25112 CASAVA_Build 5 95976380 1D ACTGGGGAGG C/- CCTCAGCGCT 3023 het 3023 ref 27 13 8 6 C 3 2 25113 CASAVA_Build 5 95998003 1I TTTATTTGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 A 9 10 25114 CASAVA_Build 5 96002908 1I TGGGGTAATG -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 7 8 25115 CASAVA_Build 5 96004471 15I TGAGTAATTT ---------------/GCCCTAGGTTACACA GCTGCTAAGG 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 GCCCTAGGTTACACA 0 1 25116 CASAVA_Build 5 96018489 2I AGCTGGAAAC --/AG AAATGCAGGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AG 0 1 25117 CASAVA_Build 5 96029204 1D CTGGGTGCGG T/- TGGCTCACGC 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 2 1 25118 CASAVA_Build 5 96083897 3D TTTAGTAAAT AGC/--- AGACCCAAAT 3070 hom 148 het 52 0 50 3 AGC 1 0 25119 CASAVA_Build 5 96098783 1I GAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 10 25120 CASAVA_Build 5 96100396 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 578 hom 32 5 13 14 A 17 16 25121 CASAVA_Build 5 96112672 1I GATTTTAGTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 8 9 25122 CASAVA_Build 5 96125424 1D TTTTTACCTC A/- AAAAAAAAAA 1221 het 1221 ref 37 26 3 8 A 11 10 25123 CASAVA_Build 5 96128332 1D GATGATTCCT G/- GTTTAAATAG 3070 hom 123 het 44 0 42 3 G 2 1 25124 CASAVA_Build 5 96133895 1D ATTTCCTAGG A/- AAAAAGGAGC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 6 5 25125 CASAVA_Build 5 96136157 1I TGGTTGTGTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 T 7 8 25126 CASAVA_Build 5 96136725 4D AGTCTTCACA AAAG/---- AAAGAAAGAC 3070 hom 108 het 41 0 35 7 AAAG 3 2 25127 CASAVA_Build 5 96136993 4D AAATAGATGA CACT/---- CACTCAGAAT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 CACT 2 1 25128 CASAVA_Build 5 96141788 4D TCCATTTCTA ACTC/---- ACCACACCCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ACTC 1 0 25129 CASAVA_Build 5 96144916 1I TAAGATATCC -/T ATCTACTTAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 0 1 25130 CASAVA_Build 5 96145955 4D AAAAATAAAT AAAC/---- AAACAGATAG 3070 hom 124 het 46 0 42 7 AAAC 2 1 25131 CASAVA_Build 5 96146069 2I TAGGGCTAAC --/AT GTGGATAAGC 3070 hom 141 het 53 0 47 7 AT 0 1 25132 CASAVA_Build 5 96147127 1I AGAAGAACTT -/A AAAGGAAAAC 3070 het 192 hom 56 1 49 6 A 3 4 25133 CASAVA_Build 5 96148533 1I AAAATGATGC -/A ACAACTAAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 2 25134 CASAVA_Build 5 96149244 1I33M2I GTGTATATAT -TATATATATATATGTGTGTGTATATATATACAC--/ATATACATATATATGTGTGTGTATATATATACACAT ATATATATGT 3070 hom 75 het 23 0 26 5 N/A 0 0 25135 CASAVA_Build 5 96150946 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 30 0 22 8 A 10 11 25136 CASAVA_Build 5 96154190 1I TACTTTCTAA -/T TTATGTACAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 2 3 25137 CASAVA_Build 5 96160048 1I ATCTTTTTTT -/G TTTGTTTTGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 25138 CASAVA_Build 5 96179886 3D GGGAAGCCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 25 0 16 9 T 15 12 25139 CASAVA_Build 5 96180022 1D CTTGAGAGGC T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 7 6 25140 CASAVA_Build 5 96184160 1D CATAGCAAGA C/- CCCCATTTGT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 5 4 25141 CASAVA_Build 5 96187319 1D TTTAAACATC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 95 het 35 0 32 5 A 10 9 25142 CASAVA_Build 5 96195252 1D CAAGGCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 19 1 12 6 A 14 13 25143 CASAVA_Build 5 96202172 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 21 1 13 7 T 12 11 25144 CASAVA_Build 5 96206697 1D ATGTTGCAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 10 9 25145 CASAVA_Build 5 96207177 4I ATCTTGAGAT ----/ACTC ACTCACTCCT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 ACTC 2 3 25146 CASAVA_Build 5 96209465 1D CTAGAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 9 25147 CASAVA_Build 5 96210359 1I CTATCAAACT -/G TATTGAACAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 0 1 25148 CASAVA_Build 5 96215310 3I TAAAAGTTCT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 31 0 21 10 A 13 16 25149 CASAVA_Build 5 96237170 1D TGAGTTGTCA G/- GGGTTCTGGT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 G 4 3 25150 CASAVA_Build 5 96239865 3I CCATTCGTAG ---/TAA TAATAATAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TAA 3 4 25151 CASAVA_Build 5 96248203 1D GCCTACATAG T/- TTGTGATTTC 3070 het 3070 ref 58 28 22 10 T 3 2 25152 CASAVA_Build 5 96267405 1I TTCTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1771 het 1771 ref 28 13 7 8 T 15 16 25153 CASAVA_Build 5 96277707 1D AAAACAAAAA C/- AAAAAACAAC 3070 hom 51 het 19 0 18 2 C 1 0 25154 CASAVA_Build 5 96278700 1D CCAAGTAGCT G/- GGACTACAGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 3 2 25155 CASAVA_Build 5 96298285 2D TTTTTCAGTC AA/-- AGACTTGTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 3 1 25156 CASAVA_Build 5 96300445 1D TGTATATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1668 hom 34 5 22 7 A 15 14 25157 CASAVA_Build 5 96301058 5I ACTGAAAACA -----/TAATT TAAATAGTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TAATT 0 1 25158 CASAVA_Build 5 96306710 1D ATTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 11 10 25159 CASAVA_Build 5 96313257 1D AGGATGATCC A/- AAAAACCCCT 3070 hom 44 het 18 0 15 3 A 6 5 25160 CASAVA_Build 5 96314263 2D AAAACATAAT AG/-- AGACACATCA 3070 hom 52 het 21 0 17 5 AG 2 1 25161 CASAVA_Build 5 96314614 1I TGGTTAATCT -/A ATTGGCTTGC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 2 25162 CASAVA_Build 5 96314793 4D ATAGACACAG AGAC/---- AGGTATAATC 3070 hom 102 het 36 0 35 2 AGAC 1 0 25163 CASAVA_Build 5 96317553 8D GTGAAATGGC TGTTTAAA/-------- TGTTTAAATC 3070 hom 99 het 38 0 33 6 TGTTTAAA 2 1 25164 CASAVA_Build 5 96322280 4I61M1D AAAAAGAGAG ----TAGTTTTTTTCTGAAACTATCTACTATACTGTATAACATGAGAAATTTCTCAAAAAATATGT/TAGATAGTTTTTTTCTGAAACTATCTACTATACTGTATAACATGAGAAATTTCTCAAAAAATATG- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 36 0 35 20 N/A 0 0 25165 CASAVA_Build 5 96324103 1D TTCTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 39 2 22 15 T 15 14 25166 CASAVA_Build 5 96326786 1D CCAGGTCCTT A/- AAAAAAAAAA 1333 het 1333 ref 41 29 3 11 A 11 10 25167 CASAVA_Build 5 96332071 1I CCTTTATTCA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 99 het 36 0 32 4 T 8 9 25168 CASAVA_Build 5 96338387 1I CAGAACATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 39 1 34 4 T 11 12 25169 CASAVA_Build 5 96344772 2D CACCAGGGCC AT/-- ATATTTGCCG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AT 3 2 25170 CASAVA_Build 5 96355926 1D CAGGGCTGGA T/- TTTTTTTTTT 1620 het 1620 ref 35 20 7 8 T 15 14 25171 CASAVA_Build 5 96365245 1D TAGCCAGTTG T/- TTTTTTTTTT 1256 het 1256 ref 37 27 4 6 T 11 10 25172 CASAVA_Build 5 96367834 1D CTACCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2053 hom 31 9 16 6 A 15 14 25173 CASAVA_Build 5 96403110 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 1861 hom 37 9 20 8 T 8 9 25174 CASAVA_Build 5 96425928 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2758 het 465 hom 25 2 12 11 A 16 17 25175 CASAVA_Build 5 96427303 1D TAGTGAATTC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 A 7 6 25176 CASAVA_Build 5 96441373 1I TGTACATCAC -/T TGCCTTTTTT 3070 hom 108 het 45 0 36 9 T 1 2 25177 CASAVA_Build 5 96479961 1I GCTCTATTGT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 25178 CASAVA_Build 5 96503077 1I GAGACAAACA -/T CAACTAGATT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 0 1 25179 CASAVA_Build 5 96516418 1I TTTTTGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 10 11 25180 CASAVA_Build 5 96522598 2I ACACTGAGGT --/AG ATACTATTAA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 AG 0 1 25181 CASAVA_Build 5 96522878 1D ACATATCTTC A/- AAAAATAACT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 A 6 5 25182 CASAVA_Build 5 96529887 1D CTCCTGGTCC T/- TGATAAAGGA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 2 1 25183 CASAVA_Build 5 96532452 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 11 10 25184 CASAVA_Build 5 96543588 13I CCTAAATAAA -------------/TGTACTGCTTTAC TGTACAAATG 3070 hom 119 het 46 0 36 11 TGTACTGCTTTAC 0 1 25185 CASAVA_Build 5 96545579 1I TAGAAATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 10 11 25186 CASAVA_Build 5 96551622 3D CTTATTTGTA TTT/--- TCTCTCCTCT 3070 het 3070 ref 28 18 9 4 T 4 1 25187 CASAVA_Build 5 96552925 14I GTCTTTTTCC --------------/ACCCCCTTTACCTT TAGTTTATGT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 ACCCCCTTTACCTT 0 1 25188 CASAVA_Build 5 96555435 1I TTTGTCAATG -/A AAAAATAATA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 5 6 25189 CASAVA_Build 5 96561791 4D TTACCAAAAT AAGA/---- AAGACATGGA 3070 hom 87 het 35 0 30 7 AAGA 2 1 25190 CASAVA_Build 5 96562249 5I50M1D TGAAAAACTT -----AAAATGGATCAAAGATGTAAATGTAAGAGCTCAAGCTATAAAATTCTTAGA/AACTCAAAATGGATCAAAGATGTAAATGTAAGAGCTCAAGCTATAAAATTCTTAG- AAAAAAAACA 3070 hom 135 het 32 0 45 4 N/A 0 0 25191 CASAVA_Build 5 96565155 1D TTTATTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 25192 CASAVA_Build 5 96567550 2D CCCTTTCCCC CT/-- GATTCCCCAA 3070 hom 90 het 33 0 26 8 CT 1 0 25193 CASAVA_Build 5 96579410 1D GCAACTTGAA G/- TTGTTGCACA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 G 1 0 25194 CASAVA_Build 5 96586259 2I ATATAAAATA --/TT GTTTTCAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 0 2 25195 CASAVA_Build 5 96591879 1D CTCTTCCTAG T/- TGTGGTTCTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 25196 CASAVA_Build 5 96593241 1I CACAGACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 11 12 25197 CASAVA_Build 5 96610802 2D TGAAAGTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 39 0 22 20 A 16 14 25198 CASAVA_Build 5 96621966 7D GTTCTCACTT ATTTGTG/------- GGAGATAAAA 3070 hom 51 het 17 0 17 2 ATTTGTG 1 0 25199 CASAVA_Build 5 96622575 1I TACACAATTG -/A AAAAAATCTA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 6 7 25200 CASAVA_Build 5 96626137 4D TTTTGATGCT TAGA/---- TAGATATTCA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TAGA 2 1 25201 CASAVA_Build 5 96627512 1I CAAAAATTAT -/A AAACTACTCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 4 25202 CASAVA_Build 5 96635075 1D CTGAATTCTA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 8 7 25203 CASAVA_Build 5 96636582 1I AAGAGAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 43 1 37 5 A 10 11 25204 CASAVA_Build 5 96639663 20I AATTTTCTAC --------------------/TTTCTCAACAAAGTTCTACA CCATGAACTT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 TTTCTCAACAAAGTTCTACA 0 1 25205 CASAVA_Build 5 96644926 1I AATGGGATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 10 11 25206 CASAVA_Build 5 96651296 1I20M1I ACTTGCCCTA -TGTGCTACTAACACTAGATC-/TTGTGCTACTAACACTAGATCT TGTTCATTCT 3070 hom 84 het 28 0 27 6 N/A 0 0 25207 CASAVA_Build 5 96660859 13D TGTCTGCAGC CTGATTTTACAGG/------------- CTGATTTTAC 3070 hom 44 het 19 0 13 6 CTGATTTTACAGG 1 0 25208 CASAVA_Build 5 96664045 4D CCATTTTCAT ATTG/---- ATTCTTCCTA 2949 hom 15 het 7 0 6 1 ATTG 1 0 25209 CASAVA_Build 5 96668200 2I AGCAAGGCTC --/TG TGGACGTGGG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TG 1 2 25210 CASAVA_Build 5 96670023 4D TTCCATAGGA TTGT/---- TTATTATGTT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 TTGT 1 0 25211 CASAVA_Build 5 96679738 3I GTTAGCTAGA ---/AAC AGAGCGCTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAC 0 1 25212 CASAVA_Build 5 96681340 4D GAACAAATAG CTAT/---- CTATCATTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CTAT 2 1 25213 CASAVA_Build 5 96681882 2I ATAATGAAAC --/TT AAAATGTTCA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 0 2 25214 CASAVA_Build 5 96682777 1D CGTGGTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 28 0 15 13 A 13 12 25215 CASAVA_Build 5 96693852 1I TTTGTTTATC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 8 25216 CASAVA_Build 5 96705520 1I ACGTGAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 8 9 25217 CASAVA_Build 5 96709017 1D GTTCTGATAG T/- TTTTTTTGAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 8 7 25218 CASAVA_Build 5 96711230 1I TTGCCTCATG -/T TAAGTATAGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 2 25219 CASAVA_Build 5 96712212 2D GATGCTGAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 25 1 22 2 T 14 12 25220 CASAVA_Build 5 96712966 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 9 10 25221 CASAVA_Build 5 96714453 1D ATTTTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 608 hom 24 3 14 8 T 14 13 25222 CASAVA_Build 5 96724778 2D TCTAAATAGG AA/-- AAGAGGAAGC 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 A 4 2 25223 CASAVA_Build 5 96755288 1I AAAAGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1294 hom 42 3 34 5 A 10 11 25224 CASAVA_Build 5 96756372 1D AGAAAGTGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 79 het 35 0 27 9 T 10 9 25225 CASAVA_Build 5 96770687 1I TTGCAAAAAA -/C TTCCATATTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 25226 CASAVA_Build 5 96773945 1D TGTAATGTGA T/- TTTTTTTTTT 1286 het 1286 ref 28 22 3 3 T 11 10 25227 CASAVA_Build 5 96777914 2D ATTAAAAAAA CT/-- TTTTTTTTTT 1239 hom 15 het 7 0 6 1 CT 1 0 25228 CASAVA_Build 5 96777946 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCACTC 630 het 87 hom 5 2 2 1 AG 1 2 25229 CASAVA_Build 5 96783506 2I TGACAAGAAT --/AA AGTTTGTGAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 3 25230 CASAVA_Build 5 96798695 1D GACATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 484 hom 23 3 14 6 T 15 14 25231 CASAVA_Build 5 96800106 1D TACAAAAAAA C/- AAAAACCAAA 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 C 1 0 25232 CASAVA_Build 5 96819285 24D ATGAGAACTC TCATGGATGAGGAGAACTCTCATG/------------------------ GAATGAGGAG 3070 hom 90 het 32 0 31 3 TCATGGATGAGGAGAACTCTCATG 1 0 25233 CASAVA_Build 5 96820588 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTCTTTT 3070 het 702 hom 32 3 21 8 T 5 6 25234 CASAVA_Build 5 96822893 2D ACTTCTGGTG GT/-- TCTTTGTGAG 3070 hom 105 het 37 0 36 2 GT 1 0 25235 CASAVA_Build 5 96830905 2I CATGAAAGAA --/AG AGAGAAAGAA 3070 hom 82 het 31 0 27 4 AG 2 3 25236 CASAVA_Build 5 96837234 17I TGTTGGCCAG -----------------/GCTGGTCTCGAACTCCT GACCTCAGGT 3070 hom 63 het 22 0 21 1 GCTGGTCTCGAACTCCT 0 1 25237 CASAVA_Build 5 96839033 1I ATTGAAATTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 7 8 25238 CASAVA_Build 5 96843486 4I CTGTTTTAAG ----/AAAC AAACAATGTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAAC 1 2 25239 CASAVA_Build 5 96847102 1I TTGCCTTTTT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 7 8 25240 CASAVA_Build 5 96849267 2D CCTAAAGAGC TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 10 8 25241 CASAVA_Build 5 96855023 10D CTCTTACAGA ATATTCCTAG/---------- TAAAAACCTA 3070 hom 78 het 29 0 27 7 ATATTCCTAG 1 0 25242 CASAVA_Build 5 97077010 1D GCCATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 1877 het 1877 ref 31 25 4 2 A 11 10 25243 CASAVA_Build 5 97343090 1D AAGATAAATC A/- ATACATGGAA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 2 1 25244 CASAVA_Build 5 97351056 2D TCCTACCTTC TT/-- TTTCCTCCCT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 5 3 25245 CASAVA_Build 5 97372788 1D CCCTTTCTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 36 0 29 8 A 10 9 25246 CASAVA_Build 5 97385632 8D AACACTCTGC AGGATAAT/-------- AGGATAATAT 3070 hom 24 het 9 0 8 2 AGGATAAT 2 1 25247 CASAVA_Build 5 97397393 1I TAGTTCCAAC -/T GGCCAACTGA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 0 1 25248 CASAVA_Build 5 97417782 1I AAAATCTTGA -/T TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 6 7 25249 CASAVA_Build 5 97426319 1D AAAAAAAGGC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 8 25250 CASAVA_Build 5 97430711 1I AATGAAGAAC -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 6 7 25251 CASAVA_Build 5 97431905 2I ACTTTTACTT --/TC TGTTATTCCT 3070 hom 148 het 58 0 50 8 TC 0 1 25252 CASAVA_Build 5 97434597 3I AATATATTTG ---/ATT ATTATATTGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 ATT 1 2 25253 CASAVA_Build 5 97437214 1D CTACTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 28 0 20 9 T 11 10 25254 CASAVA_Build 5 97439599 2I GGTGAAAAAT --/TA TATGACTCTG 3070 hom 105 het 42 0 34 8 TA 1 2 25255 CASAVA_Build 5 97445803 1I TTGGACTGTG -/C CCCCAAAAAA 3070 hom 56 het 20 0 19 1 C 4 5 25256 CASAVA_Build 5 97447177 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 94 het 40 0 34 6 A 8 9 25257 CASAVA_Build 5 97465643 1I46M2I TTTATGATCA -TTTTTTCTTTTGTTTCCATTTCTGCATAAAATGCTTTTTAAACAAC--/TTTTTTTCTTTTGTTTCCATTTCTGCATAAAATGCTTTTTAAACAACAT AGTAGGAGGA 3070 het 3070 hom 50 29 35 11 N/A 0 0 25258 CASAVA_Build 5 97468483 1I ACCAGACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 33 0 22 11 T 13 14 25259 CASAVA_Build 5 97470659 1D AGATGTGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 15 14 25260 CASAVA_Build 5 97471049 2D CCTTCAGAGC AG/-- AGAGTACCAG 3070 het 3070 ref 47 20 15 12 AG 3 2 25261 CASAVA_Build 5 97471547 7I AAGAAAGAAA -------/GAAAAAG AAGAAGAAGA 3070 het 607 hom 36 3 16 17 GAAAAAG 0 1 25262 CASAVA_Build 5 97471692 1I TTTGGCTTAG -/C ATACCATATA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 C 0 1 25263 CASAVA_Build 5 97471793 1D TATTCACATC T/- TTTGCAGACT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 4 3 25264 CASAVA_Build 5 97476619 1I GAAATGAAGG -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 17 8 7 2 A 6 7 25265 CASAVA_Build 5 97478068 1I ATAGAGACAC -/A AAAATCCCTT 1945 hom 10 het 5 0 4 1 A 4 5 25266 CASAVA_Build 5 97482403 1I GGGTCATGTT -/A TTTATAATAC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 0 1 25267 CASAVA_Build 5 97490977 2D ACACTAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2048 hom 22 7 10 5 T 12 10 25268 CASAVA_Build 5 97491153 1D TTTTTTAGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 12 10 T 10 9 25269 CASAVA_Build 5 97510677 1I AAGTGTCATT -/A AAGTGTCATA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 2 3 25270 CASAVA_Build 5 97515703 2D AATCAGTAAT AA/-- AAAGTCTTCA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 5 3 25271 CASAVA_Build 5 97518022 1D TTTGAAACTG A/- AAAAAAAAAC 993 het 993 ref 28 7 4 17 A 10 9 25272 CASAVA_Build 5 97524635 1D TTGTTTGTTT G/- TTTTTTTTGG 3070 het 328 hom 48 1 43 4 G 1 0 25273 CASAVA_Build 5 97527042 4I CCAAATGGAT ----/TAAG TAACGCTAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 TAAG 0 1 25274 CASAVA_Build 5 97536997 1I CTTTAAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 43 0 26 17 A 8 9 25275 CASAVA_Build 5 97541511 1D AACCCACAGA C/- CCTCTGAAGG 3070 het 3070 ref 32 20 12 1 C 3 2 25276 CASAVA_Build 5 97547944 1D CTATAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 9 25277 CASAVA_Build 5 97548799 2I CAGCAAGATA --/AT ATATATCCCA 3070 hom 108 het 40 0 34 6 AT 3 4 25278 CASAVA_Build 5 97548991 2D GATTTGTATG TA/-- TATATATATA 516 hom 15 het 10 0 6 4 TA 8 7 25279 CASAVA_Build 5 97549357 6D CATGCAGTAG GTTCAC/------ GTGACAAATG 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 GTTCAC 1 0 25280 CASAVA_Build 5 97562848 1I TATCATTCCC -/A GGTTTTGAAA 3070 hom 115 het 45 0 37 8 A 0 1 25281 CASAVA_Build 5 97566311 1D ACACAATTGC A/- AAAAAAAAAA 2264 het 2264 ref 44 34 6 4 A 11 10 25282 CASAVA_Build 5 97573674 2D TCATTCTCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 68 het 36 0 23 14 TC 10 9 25283 CASAVA_Build 5 97617408 1D TTAACATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 11 10 25284 CASAVA_Build 5 97623799 3D CTGGGGGATA GAG/--- GAGGAGTAGT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 GAG 3 2 25285 CASAVA_Build 5 97631241 1D CTAAAAAGGG T/- AGCAAGGACA 3070 hom 122 het 47 0 40 9 T 1 0 25286 CASAVA_Build 5 97694795 1D GGAAGAGCTG A/- AAAAAAAAAT 932 het 932 ref 36 29 3 6 A 10 9 25287 CASAVA_Build 5 97713720 4D ACCTCTCCAA ACAG/---- ACAAAGCAAG 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 ACAG 1 0 25288 CASAVA_Build 5 97755402 1D CTGGAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 28 2 15 11 T 17 16 25289 CASAVA_Build 5 97760325 1I AAACAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2935 hom 30 het 11 0 11 0 A 12 13 25290 CASAVA_Build 5 97771608 1D CCATGGTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 107 het 41 0 36 5 A 10 9 25291 CASAVA_Build 5 97785100 3I TGTTACATTC ---/AAG AAGCCTGCAT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 AAG 1 2 25292 CASAVA_Build 5 97793949 1I TCCTCCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 10 11 25293 CASAVA_Build 5 97799868 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1699 het 355 hom 10 2 6 2 T 10 11 25294 CASAVA_Build 5 97800469 1I TGGCCCTGGG -/C CAAGGAATGC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 1 2 25295 CASAVA_Build 5 97818816 1I GCAGTTGAAA -/T TCAAATAATC 3070 het 3070 hom 52 24 22 6 T 1 2 25296 CASAVA_Build 5 97822301 1D TAGGTTTGGG A/- AAATTACTCA 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 A 4 3 25297 CASAVA_Build 5 97828585 1D CCCCTAGGGA C/- AAATTCTAAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 C 1 0 25298 CASAVA_Build 5 97830269 1I CTCTGTATCC -/A AAAAAAAAAA 2909 het 757 hom 30 3 12 15 A 14 15 25299 CASAVA_Build 5 97832779 1D TACAGCTCTT A/- AAGGTGGCAC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 3 2 25300 CASAVA_Build 5 97842663 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2715 het 314 hom 8 1 6 1 A 13 12 25301 CASAVA_Build 5 97869627 2I GCACAGAGAC --/AG GGTACCGTGA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 AG 0 1 25302 CASAVA_Build 5 97872642 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 6 7 25303 CASAVA_Build 5 97873060 2D AAGGGCAAAC TG/-- GGGTGGGAAC 3070 het 3070 hom 54 18 27 10 TG 1 0 25304 CASAVA_Build 5 97882699 1I GTACCATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 A 14 15 25305 CASAVA_Build 5 97885733 2D ACCATAAATG GA/-- GAGAGAGTCT 3070 het 3070 hom 52 15 27 10 GA 4 3 25306 CASAVA_Build 5 97891331 1I ATTCCTAAAC -/T TAAAAGACCT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 1 2 25307 CASAVA_Build 5 97904763 1I AAAAAGAATG -/A AAAAAGAATG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 5 6 25308 CASAVA_Build 5 97907039 2I GCTGGAAATG --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 A 8 10 25309 CASAVA_Build 5 97908405 1D CCCCAGCCTA C/- CCCCCACACA 2631 het 2631 ref 25 9 7 10 C 6 5 25310 CASAVA_Build 5 97918790 1I GTCCTTAAAA -/T TTTTTTTTAT 2172 het 2172 ref 24 14 6 4 T 8 9 25311 CASAVA_Build 5 97919206 3I GCTGCATGCA ---/TCT TCTTCTGTCA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 TCT 2 3 25312 CASAVA_Build 5 97921628 1D AGCTATACTC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 51 20 22 10 T 8 7 25313 CASAVA_Build 5 97924566 2I37M4I ACACATTTGA --TTTTTTTTAAGTCACAAAAAACTTGAGTAACCAAAAT----/TTTTTTTTTTAAGTCACAAAAAACTTGAGTAACCAAAATAAAG AAATCAAAAC 3070 het 3070 hom 17 14 15 5 N/A 0 0 25314 CASAVA_Build 5 97926743 1I TTCTCAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 A 13 14 25315 CASAVA_Build 5 97928682 1I ACTGACTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 10 11 25316 CASAVA_Build 5 97934532 3I CTGCTGAGTG ---/GAA GAAGGTGTAC 3070 het 3070 hom 50 19 27 4 GAA 1 2 25317 CASAVA_Build 5 97942049 2D AAAATTTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 9 A 12 10 25318 CASAVA_Build 5 97966987 3D TAGTGTGGTT ATA/--- ATAATATATT 1602 het 1602 ref 14 9 4 1 ATA 3 2 25319 CASAVA_Build 5 97975172 10D AAAGCAAAAC AAAAAACAAA/---------- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 22 8 14 3 AAAAAACAAA 2 1 25320 CASAVA_Build 5 97980280 1D ACCACAATTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 4 T 9 8 25321 CASAVA_Build 5 97982748 1D GAGGAATTAG A/- AAAGACAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 4 3 25322 CASAVA_Build 5 97994837 1I GCTTTAGGAG -/T TATAGCTCCT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 1 2 25323 CASAVA_Build 5 97998437 2D TCCCCACTCC AA/-- AAAAAAAAAA 1623 hom 15 het 26 0 11 15 A 20 18 25324 CASAVA_Build 5 98007195 6D CTTCTAATCA CATAGC/------ CATAGCGAAT 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 CATAGC 2 1 25325 CASAVA_Build 5 98009572 1D CATTTTAAGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 8 7 25326 CASAVA_Build 5 98010672 1I TAAGGCACAT -/G CTCCTTTGAA 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 G 0 1 25327 CASAVA_Build 5 98014254 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 2757 het 2757 ref 32 18 7 7 A 10 11 25328 CASAVA_Build 5 98023008 1I GACCTTGCCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 8 9 25329 CASAVA_Build 5 98035444 1I TGTTTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 A 10 11 25330 CASAVA_Build 5 98041899 1D CTCCTGGCAC T/- TTTTTTTTTT 2839 het 2839 ref 31 11 7 13 T 12 11 25331 CASAVA_Build 5 98051087 12D AAGCAGAAGG AGGAAGGAAGGA/------------ AGGAAGGAAG 3070 het 3070 ref 34 16 9 10 AGGA 7 4 25332 CASAVA_Build 5 98052510 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 44 21 21 3 A 9 8 25333 CASAVA_Build 5 98054114 1I AGAGAGGGAG -/C GGGGGAAGGG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 0 1 25334 CASAVA_Build 5 98071120 1I AGGTACAGTG -/T TATACGGCCT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 1 2 25335 CASAVA_Build 5 98088028 3I GTCAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAAA 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 AAG 2 3 25336 CASAVA_Build 5 98098522 1I GAGGCTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 A 13 14 25337 CASAVA_Build 5 98122469 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1972 het 1972 ref 26 7 8 11 T 15 14 25338 CASAVA_Build 5 98122855 4D CCAATCTACC AAGG/---- AAGGAATCCT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 AAGG 2 1 25339 CASAVA_Build 5 98126809 1I CATGGGAGCC -/T TGTTGAATTG 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 1 2 25340 CASAVA_Build 5 98173069 1D ATCTCTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 33 1 28 4 T 12 11 25341 CASAVA_Build 5 98174291 2D TTGAAGCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 44 0 37 7 T 12 10 25342 CASAVA_Build 5 98198732 1I GCAGCACTAC -/T TTGGCCTCTC 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 T 2 3 25343 CASAVA_Build 5 98229555 1D AAAGAAATGT G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 27 8 G 6 5 25344 CASAVA_Build 5 98237696 3I CACCAAATAG ---/ATA ATATGAATGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATA 1 2 25345 CASAVA_Build 5 98260396 1I AACACAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 22 9 A 11 12 25346 CASAVA_Build 5 98290523 1D TAAATGAAGT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 73 hom 33 3 18 12 G 11 10 25347 CASAVA_Build 5 98298926 1I TCCTATTAAC -/T ACAGTATTGA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 0 1 25348 CASAVA_Build 5 98305664 3D TCCTATTAAT AAG/--- AAGTCAAGAG 3070 het 3070 ref 27 17 8 3 AAG 2 1 25349 CASAVA_Build 5 98305778 4D AGCTAAAAAG TGTT/---- TGTCTCTTTA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 TGTT 1 0 25350 CASAVA_Build 5 98316687 5D TTAAAAAATT AAGAA/----- AATATATATG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AAGAA 1 0 25351 CASAVA_Build 5 98322311 4D AAACCCATAT CTAC/---- TAAAAAATAC 3070 het 2770 hom 18 8 9 2 CTAC 1 0 25352 CASAVA_Build 5 98322746 1D CTGCCTCTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 10 9 25353 CASAVA_Build 5 98326177 4D GGGCTCTTGT ATCC/---- ATCCTATCTA 3070 hom 117 het 43 0 39 7 ATCC 2 1 25354 CASAVA_Build 5 98348743 1D TGTAACTCAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 9 8 25355 CASAVA_Build 5 98350116 1D TTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 1870 hom 23 6 11 6 T 9 8 25356 CASAVA_Build 5 98350611 1D TTTGTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 12 11 25357 CASAVA_Build 5 98354071 2D ATTAAAAATG AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 A 10 8 25358 CASAVA_Build 5 98354541 4D ACATGGACAT AGAG/---- AGAGGAATAA 3070 het 3070 hom 40 16 23 3 AG 4 2 25359 CASAVA_Build 5 98355079 3I AAAAATTTAA ---/AAT AATAATAAGA 2117 het 2117 ref 23 14 7 2 AAT 2 3 25360 CASAVA_Build 5 98355350 2I GATTTTTTTT --/AA AATTATTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 2 4 25361 CASAVA_Build 5 98356198 21D3M14D CATGCATGTG TCTTTATTGCATGTGTCTTGCAATAAACTGCCTGAACA/---------------------AAT-------------- GTTCATTGCA 3070 het 3070 ref 39 31 13 7 N/A 0 0 25362 CASAVA_Build 5 98356869 7D TAAAAAAAAA AAAAAAC/------- AAAGAGAGAA 2958 het 2958 ref 23 13 8 5 AAAAAAC 1 0 25363 CASAVA_Build 5 98364485 1D AGTAGGCCTT A/- AATAAATATA 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 A 3 2 25364 CASAVA_Build 5 98372381 1I ACCTTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 A 10 11 25365 CASAVA_Build 5 98386719 2D AATATGAGAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 TG 7 6 25366 CASAVA_Build 5 98392569 4I ATCTAACACC ----/CTAT CTATTAAGCC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 CTAT 1 2 25367 CASAVA_Build 5 98409258 1D GAACCTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 T 10 9 25368 CASAVA_Build 5 98410139 3D CCAAAATGAC ATG/--- ATATCACCTG 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 ATG 1 0 25369 CASAVA_Build 5 98418888 1I TAAGAAGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 40 0 29 11 T 11 12 25370 CASAVA_Build 5 98423568 2I AAAAAAAAAA --/AT AAATAAATCT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AT 0 1 25371 CASAVA_Build 5 98441003 5I TATTCTTTTC -----/TGTTT TGTTTTGTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 TGTTT 2 3 25372 CASAVA_Build 5 98446471 5D CTTACTAGAC ATTTT/----- AATGTAATAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 ATTTT 1 0 25373 CASAVA_Build 5 98450045 1I ATCACTTGAG -/C TCAGGAGGCA 3070 hom 50 het 20 0 16 4 C 0 1 25374 CASAVA_Build 5 98461829 5I ATGAGCACAT -----/GTCAA GTTCAAGCAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 GTCAA 0 1 25375 CASAVA_Build 5 98462604 2I TCTTCCCCAC --/TT TTTAGGGGCC 3070 hom 94 het 35 0 30 5 T 3 5 25376 CASAVA_Build 5 98469356 1D AAGATGAGAT A/- AATAATCTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 2 25377 CASAVA_Build 5 98469893 6I GCTTTCAGAT ------/AGTCTC AGTGCTAAAT 3070 hom 141 het 49 0 46 3 AGTCTC 0 1 25378 CASAVA_Build 5 98475367 1D ATAACAAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 10 9 25379 CASAVA_Build 5 98480201 1I TCTACATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 11 12 25380 CASAVA_Build 5 98487775 1D CCATTTTATG T/- TTACTGATAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 3 2 25381 CASAVA_Build 5 98487867 4D TTTGTTGTTG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 21 7 9 5 TTTA 4 3 25382 CASAVA_Build 5 98488245 1I TCTGAATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 617 hom 18 3 14 2 T 9 10 25383 CASAVA_Build 5 98489005 1I GCAAACTCTC -/T GTCTCATTGT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 0 1 25384 CASAVA_Build 5 98489928 2I CCCTGGAGTC --/AT GTGTGGTTTT 3070 het 3070 hom 64 23 29 12 AT 0 1 25385 CASAVA_Build 5 98494987 3D CTCCAAAACT TTC/--- TTATCTTCTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 7 TTC 1 0 25386 CASAVA_Build 5 98495393 1D TCTTATTCTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 9 8 25387 CASAVA_Build 5 98499816 4I TTGGTGTCTG ----/TCTA TCTGTCTATC 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 TCTA 0 1 25388 CASAVA_Build 5 98506073 3D ACAACTCAAT AAG/--- AAGAAAAATT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 AAG 2 1 25389 CASAVA_Build 5 98510963 3D ATGAGTTGAG AGA/--- AGAAGGCTTC 3070 het 3070 hom 17 9 8 0 AGA 2 1 25390 CASAVA_Build 5 98530375 16I GGCACCCCGA ----------------/CTCTCCATGTCTCTGT ATTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 CTCTCCATGTCTCTGT 0 1 25391 CASAVA_Build 5 98538852 1D CTCTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 1375 het 1375 ref 28 17 4 8 T 13 12 25392 CASAVA_Build 5 98549126 1D ATTAAAGGAG T/- TTTTTTTTTT 2827 het 1248 hom 31 12 11 8 T 18 17 25393 CASAVA_Build 5 98560648 2D ACAGTATCAC AG/-- AGGGGTGTAC 3070 het 3070 ref 59 27 23 12 AG 2 1 25394 CASAVA_Build 5 98562412 3I TATTGGGAAT ---/ATC ATCCTCTTCT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 ATC 1 2 25395 CASAVA_Build 5 98564204 1I ATCATCCTTT -/C CCCCCCCCCT 3070 het 2517 hom 33 9 12 12 C 9 10 25396 CASAVA_Build 5 98572328 1D TCACCCTATA C/- CCCCATAGAT 3070 het 3070 hom 59 21 27 13 C 5 4 25397 CASAVA_Build 5 98583793 1D ATATCACAGC G/- GGGGGGGGGT 2825 het 1853 hom 24 7 10 7 G 10 9 25398 CASAVA_Build 5 98584099 1I AGTATCACAG -/A AGGGGTGTAC 3070 hom 111 het 43 0 36 7 A 1 2 25399 CASAVA_Build 5 98589410 1D AAAAATTACA G/- GGGGATGTAC 3070 het 3070 hom 44 18 21 6 G 5 4 25400 CASAVA_Build 5 98590000 3I GGATATTAGG ---/AAT AATATTACAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AAT 1 2 25401 CASAVA_Build 5 98590811 3D TGCGAGTAAT ATC/--- ATACTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 ATC 1 0 25402 CASAVA_Build 5 98591407 1D ATCATAATCT C/- CCCCATTGGA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 C 5 4 25403 CASAVA_Build 5 98591628 3D TGGGACTAAT ATC/--- ATCAGCTGCC 3070 het 3070 hom 38 16 18 7 ATC 2 1 25404 CASAVA_Build 5 98593489 1D GAAGAATCAC A/- AAAACAAGTG 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 A 5 4 25405 CASAVA_Build 5 98593684 1D GCTCCACCCC T/- ATCTCCCTTT 3070 het 3070 ref 27 14 8 6 T 1 0 25406 CASAVA_Build 5 98621857 1I ATAAGGTTAA -/T TTTATAATTA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 3 4 25407 CASAVA_Build 5 98659420 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 31 1 28 2 T 11 12 25408 CASAVA_Build 5 98666165 1I ATATTGCATG -/T TGTCATTTAT 3070 hom 148 het 59 0 50 9 T 1 2 25409 CASAVA_Build 5 98672217 1I TCTATAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 383 hom 37 1 32 4 A 9 10 25410 CASAVA_Build 5 98673167 23D CAAGTTATAC TATTTTCAAGAAGATTATAAACA/----------------------- TATTTTCAAG 3070 hom 45 het 28 0 16 16 TATTTTCAAGAAGATTATAAACA 2 1 25411 CASAVA_Build 5 98691468 1D ACAGAAGTGG T/- TTTTTTGTAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 6 25412 CASAVA_Build 5 98693467 1D AGTTCTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 11 10 25413 CASAVA_Build 5 98786346 2D GCCCTTCCAA AG/-- AGAGCTTATG 2347 het 2347 ref 39 32 5 4 AG 3 2 25414 CASAVA_Build 5 98795794 4D TAGTCCTGTC CTTT/---- CTTTCTCTTC 3070 hom 63 het 28 0 21 8 CTTT 2 1 25415 CASAVA_Build 5 98813129 2D ATATATATAT AA/-- AAATTGTGTA 1123 het 48 hom 12 1 8 5 A 5 3 25416 CASAVA_Build 5 98814211 1D TGTTATTAGT G/- GGGATAATAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 4 3 25417 CASAVA_Build 5 98816218 2I ACCTTTTTTT --/TG TTTTTTTTGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TG 0 1 25418 CASAVA_Build 5 98816500 3I TTAGCAACAT ---/GTA GTTATATTTT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 GTA 0 1 25419 CASAVA_Build 5 98821672 1D AAATTGTGAT C/- CCATGTATTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 3 2 25420 CASAVA_Build 5 98822962 3D TCAAACAAAA AAC/--- AACACATTTA 3070 hom 148 het 55 0 50 6 AAC 2 1 25421 CASAVA_Build 5 98826906 1D ACCAAAATGT G/- TATATCTTCT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 G 1 0 25422 CASAVA_Build 5 98831869 1I GTTGTCCAGG -/C TGGTCTCGAA 3051 het 3051 ref 43 31 7 5 C 0 1 25423 CASAVA_Build 5 98834587 2D CAGTTACCTC TA/-- TGAGCACACC 3070 het 2706 hom 32 6 25 2 TA 1 0 25424 CASAVA_Build 5 98847201 1D TTCCCTTTAG T/- AAATTTTCCA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 1 0 25425 CASAVA_Build 5 98855755 1I TAGAGGAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 10 11 25426 CASAVA_Build 5 98856112 1D TTGTTTGATG T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 7 25427 CASAVA_Build 5 98859285 2D TAATATTCGC AT/-- ATGAGTTTAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AT 2 1 25428 CASAVA_Build 5 98860240 4I ATCTTTCTTC ----/TTAG TTAGGAGAAC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TTAG 1 2 25429 CASAVA_Build 5 98864594 2I TGTATCACTT --/CA GATGGCATGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 CA 0 1 25430 CASAVA_Build 5 98874659 12D GATTTCTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2515 het 172 hom 18 2 8 9 T 23 11 25431 CASAVA_Build 5 98881945 1I ATTTCTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 11 12 25432 CASAVA_Build 5 98884576 1D AAATATTGGG A/- AAAAAAATTG 2351 hom 12 het 6 0 5 1 A 8 7 25433 CASAVA_Build 5 98893171 5D ATTTTGAACC TTTGT/----- TTTAATTCTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TTTGT 1 0 25434 CASAVA_Build 5 98909449 1D ATGTTTCTAG T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 25435 CASAVA_Build 5 98917863 2I TATATTAGAA --/AT AATTGTTTGA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AT 0 1 25436 CASAVA_Build 5 98919975 1D TTTTATAAAC T/- TTTTTAAAAG 3070 hom 66 het 27 0 23 5 T 6 5 25437 CASAVA_Build 5 98928918 1I AATGACTTTT -/A AAAATGTGTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 4 5 25438 CASAVA_Build 5 98930027 1D GTATCTTATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 A 9 8 25439 CASAVA_Build 5 99044840 5I AGATATACTT -----/AAAAG AAAAAAACAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AAAAG 0 1 25440 CASAVA_Build 5 99060934 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 9 10 25441 CASAVA_Build 5 99166386 1D CTGATCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 27 1 22 4 T 12 11 25442 CASAVA_Build 5 99206029 7D TATTTGACAG TTAAGAC/------- TTAAAATATC 3070 het 3070 hom 30 13 15 4 TTAAGAC 1 0 25443 CASAVA_Build 5 99254067 1D AGTATAATAC A/- AAAAAAATCT 3070 hom 51 het 19 0 17 3 A 8 7 25444 CASAVA_Build 5 99262413 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 11 12 25445 CASAVA_Build 5 99267745 1I AACTCAAAGA -/C AGGGGAAAGA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 C 0 1 25446 CASAVA_Build 5 99276537 1I TATTTTCACA -/C CTTAAATTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 C 1 2 25447 CASAVA_Build 5 99277078 2I ACATAAATAT --/TA TATATCTATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TA 2 3 25448 CASAVA_Build 5 99279325 4I59M2I TTATTCATTC ----TTAATGTTTTATTTAATGATGGTCATCACAGAAAATCACATCAATGATTTCAAAATATT--/TTAGTTAATGTTTTATTTAATGATAGTCATCACAGAAAATCACATCAATGATTTCAAAATATTAC AGCTCTTTTA 3070 hom 87 het 27 0 30 12 N/A 0 0 25449 CASAVA_Build 5 99285379 2I ATATACATAT --/AC AGTTATACTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AC 0 1 25450 CASAVA_Build 5 99286228 1I TATTAATTTG -/C CATAGAAGAT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 C 1 2 25451 CASAVA_Build 5 99300300 6D AAATCTGGAA TTATAG/------ TTAGAGGTAT 3070 het 3070 ref 35 18 16 3 TTATAG 1 0 25452 CASAVA_Build 5 99301961 1I ACTTTTTTTC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 6 7 25453 CASAVA_Build 5 99304896 2D TTGAGAGGCC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 11 9 25454 CASAVA_Build 5 99308356 6D AAAGTGAGGA ATTTAT/------ ATATATATAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 ATTTAT 1 0 25455 CASAVA_Build 5 99309947 3D CTTTCAAATA ATG/--- ATAAGGACAT 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 ATG 1 0 25456 CASAVA_Build 5 99311706 1I ACTGAATTAC -/T AAGATTTTCC 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 0 1 25457 CASAVA_Build 5 99311815 1D CAACTACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 13 12 25458 CASAVA_Build 5 99318401 2D TGTTAGTCAC AA/-- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 56 22 24 12 A 10 8 25459 CASAVA_Build 5 99318580 1I TTAAACATAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 49 12 31 6 T 8 9 25460 CASAVA_Build 5 99321648 15D GCACTCTTCT AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3024 het 3024 ref 27 16 9 6 A 26 11 25461 CASAVA_Build 5 99328610 1I TCACCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 10 11 25462 CASAVA_Build 5 99332670 1I TCCTTTTTGA -/T TTTTTTTTTC 2442 het 2442 ref 30 12 5 13 T 9 10 25463 CASAVA_Build 5 99334228 3D CAGAATAAAC CTA/--- CTATTCTTAT 3070 het 3070 hom 43 14 21 9 CTA 2 1 25464 CASAVA_Build 5 99338599 1D TGTCAGCAAA G/- CATAAAGTGT 3070 het 3070 hom 45 21 22 3 G 1 0 25465 CASAVA_Build 5 99340544 1I GAGCTAAAGA -/G ACAAATGTTA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 G 0 1 25466 CASAVA_Build 5 99341093 1D AAAATTCACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 A 10 9 25467 CASAVA_Build 5 99343922 2D CATTTATTCC TA/-- TGTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 TA 1 0 25468 CASAVA_Build 5 99349728 2I AGAGTGAAGA --/AG AGAGAGAGAG 2576 het 2576 ref 26 17 7 2 AG 7 8 25469 CASAVA_Build 5 99358450 5D ACTACAGGTG CCTCC/----- CCAACCACTC 3070 het 3070 hom 25 10 10 6 CCTCC 1 0 25470 CASAVA_Build 5 99364022 3D TTGAAATTAA AAT/--- AATAATGCTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 AAT 3 2 25471 CASAVA_Build 5 99366651 1D CATACCCAGG A/- ACTTGGTTGA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 2 1 25472 CASAVA_Build 5 99376359 1D TTCTTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 A 12 11 25473 CASAVA_Build 5 99386256 4D AGATTAATTA GATC/---- GAAAGCATAA 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 GATC 1 0 25474 CASAVA_Build 5 99399493 5D TATGCGGTTA TTATC/----- TTATCTTCAA 3070 het 2766 hom 18 7 9 3 TTATC 2 1 25475 CASAVA_Build 5 99400544 2D CAGAGACAGG GA/-- GAGAGAGACA 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 GA 5 4 25476 CASAVA_Build 5 99405022 4I54M3I GGCTTTAAAA ----ATTAAGAAATAGACATGCAAATAGTTCAATATTACTTGAACATTTAGCTAATCA---/ATTGATTAAGAAATAGACATGCAAATAGTTCAATATTACTTGAACATTTAGCTAATCAGAT GTTCACTTCT 3070 het 3070 ref 41 40 19 10 N/A 0 0 25477 CASAVA_Build 5 99417096 11D TTCTTCTATG ATAGGAGAAGT/----------- AGCGTCTTGT 3070 het 3070 hom 51 26 27 4 ATAGGAGAAGT 1 0 25478 CASAVA_Build 5 99418581 1I TTATACGGGG -/T AACGCCATGT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 0 1 25479 CASAVA_Build 5 99421072 1I GCAATGACTT -/A AAAAAAAATT 2684 het 2684 ref 25 16 6 3 A 8 9 25480 CASAVA_Build 5 99421569 4D CGGGAAAAAA AGTT/---- AGCGCTAGAA 3070 het 3070 ref 35 25 10 0 AGTT 1 0 25481 CASAVA_Build 5 99423960 2D TGCCAAATAA AC/-- AGTTTTTCTC 1417 het 1417 ref 21 15 3 4 AC 1 0 25482 CASAVA_Build 5 99430281 3I ATCCTCATGC ---/TTG TTGACGCCGT 1965 het 1965 ref 18 11 6 1 TTG 1 2 25483 CASAVA_Build 5 99435887 2D ATATTAGCCC TT/-- TGTCAGATGG 2447 het 2097 hom 13 5 5 5 T 3 1 25484 CASAVA_Build 5 99437639 8I ATAGTACCAA --------/ACTATCTC ACTATCTCTC 3070 het 3070 ref 53 32 13 8 ACTATCTC 1 2 25485 CASAVA_Build 5 99444109 2D AGAAAGAACT AA/-- AGCCACTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 3 1 25486 CASAVA_Build 5 99447814 1I AATCTACAAC -/A ATGTGTAGTG 1385 het 1385 ref 33 26 3 4 A 1 2 25487 CASAVA_Build 5 99450506 1I AAATTTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 A 10 11 25488 CASAVA_Build 5 99452599 1I AATAATATTG -/A AAAAATGAAG 3070 het 3070 ref 45 30 13 2 A 5 6 25489 CASAVA_Build 5 99452899 1D ATTTGTCCTG T/- TTTTTTTCCT 2599 het 2599 ref 19 11 7 1 T 8 7 25490 CASAVA_Build 5 99466603 3I CCAAATTAAC ---/ACA ACAATGGTAA 3070 het 3070 ref 44 28 13 3 ACA 1 2 25491 CASAVA_Build 5 99480884 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2242 hom 29 9 14 6 AT 7 6 25492 CASAVA_Build 5 99483846 9I CTGAAGTAAT ---------/GTATTAAAA GTGCCCATTT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 GTATTAAAA 0 1 25493 CASAVA_Build 5 99489280 4D AATGATGCCC TTCT/---- TTCTGCCTGT 3070 het 3070 ref 41 23 14 5 TTCT 2 1 25494 CASAVA_Build 5 99491068 2I TAATTTTGAC --/AG AAATAAAGCA 3070 het 3070 hom 52 24 22 6 AG 0 1 25495 CASAVA_Build 5 99495544 1D TAACACAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 306 hom 40 5 13 22 T 19 18 25496 CASAVA_Build 5 99503718 2I CTTTCTGCAC --/AA AAAAAGTAGT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 5 7 25497 CASAVA_Build 5 99506823 1I CAAGTATAGG -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 6 7 25498 CASAVA_Build 5 99508425 2I CATATATATG --/TA TATATATATA 1903 het 1903 ref 23 10 7 6 TA 6 7 25499 CASAVA_Build 5 99517910 17D TTGAAGCACT TTTCACAATAGCAAAGA/----------------- CATGGAATTT 3070 het 3070 ref 31 18 15 2 TTTCACAATAGCAAAGA 1 0 25500 CASAVA_Build 5 99518504 1D TGCACAAGTA C/- CCCTTGAGTC 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 C 4 3 25501 CASAVA_Build 5 99538420 4D ATATTGTACT CTAA/---- CTATATTTTG 3070 het 3070 hom 43 17 22 6 CTAA 1 0 25502 CASAVA_Build 5 99543212 1I TGGACTGGAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 A 8 9 25503 CASAVA_Build 5 99545947 1D TTTGTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 13 12 25504 CASAVA_Build 5 99549130 2D GATCCATCTT AA/-- AGTGTTTAAG 3070 het 3070 hom 52 23 24 6 A 3 1 25505 CASAVA_Build 5 99557796 1D TGTTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 12 10 A 13 12 25506 CASAVA_Build 5 99559930 1I AATTAAGACA -/T TTTTTCTAGG 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 5 6 25507 CASAVA_Build 5 99560103 2D TTCAGTTCTT CA/-- CAGTTTTTAT 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 CA 2 1 25508 CASAVA_Build 5 99563789 1I AGAAAGAGAT -/A ATTCACTCAG 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 1 2 25509 CASAVA_Build 5 99645745 2I GAGTCAGGTA --/AT ATGATTCCTC 3070 het 3070 hom 31 7 16 8 AT 1 2 25510 CASAVA_Build 5 99660502 1I CTAAGCAAAT -/A AAAAATCCCT 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 A 5 6 25511 CASAVA_Build 5 99666605 1I CTCCAGAACA -/T TCTCCAGCAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 1 2 25512 CASAVA_Build 5 99667526 1D AACATGCCAC T/- TTCAGGAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 3 2 25513 CASAVA_Build 5 99667964 1I AGTGCAACAT -/A CTATCAGAAG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 0 1 25514 CASAVA_Build 5 99670256 4I ATTACCTTGC ----/TCTT TCAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 TCTT 0 1 25515 CASAVA_Build 5 99676293 1D CCTCCCCACC A/- AAAAAAAGAC 1664 het 1664 ref 21 15 4 3 A 8 7 25516 CASAVA_Build 5 99678164 1I CAAAGCAGAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 8 9 25517 CASAVA_Build 5 99679382 1D TTTACCCATA T/- TAACAAACAG 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 2 1 25518 CASAVA_Build 5 99683003 1I GTGAACCAGG -/A AAAAAAAAAA 1228 het 1228 ref 40 29 3 8 A 10 11 25519 CASAVA_Build 5 99746669 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 A 10 9 25520 CASAVA_Build 5 99746862 1I ACACCGGGCA -/T TGTGGCTCAC 1709 het 1709 ref 13 9 4 0 T 1 2 25521 CASAVA_Build 5 99753332 23D ACACTCGCCC CAAGGGGTGGCTCCCCCAGATCT/----------------------- CAGGCCTCTA 2026 het 2026 ref 28 17 6 8 CAAGGGGTGGCTCCCCCAGATCT 1 0 25522 CASAVA_Build 5 99769613 1D TGTAATTATC T/- ATTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 1 0 25523 CASAVA_Build 5 99773911 1D TTCAGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 13 12 A 13 12 25524 CASAVA_Build 5 99781668 3I AAGCATAGAT ---/TTG TTGATTTATT 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 TTG 1 2 25525 CASAVA_Build 5 99797231 1I AATATGACTT -/G TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 G 0 1 25526 CASAVA_Build 5 99798332 1I ATTGAAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 10 11 25527 CASAVA_Build 5 99819668 1D CTCTTACTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2460 hom 15 5 9 1 T 9 8 25528 CASAVA_Build 5 99836065 2D TATATATGCG TA/-- TATATATATA 3070 het 2606 hom 29 9 12 9 TA 7 6 25529 CASAVA_Build 5 99836569 1I GTAATTTGTA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 6 7 25530 CASAVA_Build 5 99840174 1D CTGCTTGAGG C/- CAGGAATTCA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 C 2 1 25531 CASAVA_Build 5 99841550 1D AATTTACAAG A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 7 6 25532 CASAVA_Build 5 99844559 2I TCTTTAATAA --/AC AGTTTTTAAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 AC 0 1 25533 CASAVA_Build 5 99844752 6D TTTTTTCTAG TTATAT/------ TTATAGCTAT 3070 het 3070 ref 32 19 10 7 TTATAT 1 0 25534 CASAVA_Build 5 99847053 12D ATAATTCTCA AAACTTGAAAGC/------------ AAACTTGAAA 3070 het 3070 ref 35 21 9 6 AAACTTGAAAGC 2 1 25535 CASAVA_Build 5 99851257 1D TAAAGACATA C/- CCGAGACTGA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 C 3 2 25536 CASAVA_Build 5 99877774 1I AATAAAGGAA -/T TTATAACAGC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 2 3 25537 CASAVA_Build 5 99918247 1D AGACAATACA T/- TTATTATTTC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 3 2 25538 CASAVA_Build 5 99927004 1D CTCTTGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 15 14 A 12 11 25539 CASAVA_Build 5 99928698 1I TGATGAACAT -/A GATACAAAAG 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 A 0 1 25540 CASAVA_Build 5 99929608 2I TGGGAAAAAC --/TT TTGCCCCTGT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 2 4 25541 CASAVA_Build 5 99932341 1I CTTTCTAAAA -/G AAAAATGAAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 G 0 1 25542 CASAVA_Build 5 99932995 2I AGGCTATTAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 25 7 14 4 TA 6 7 25543 CASAVA_Build 5 99937794 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 8 7 25544 CASAVA_Build 5 99946078 1D GCACATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 11 10 25545 CASAVA_Build 5 99946685 5D TAAAGAAAAG AAAAT/----- GTTACTAAGA 3070 het 3070 hom 37 15 22 1 AAAAT 1 0 25546 CASAVA_Build 5 99951079 2I AAAACAAACC --/TT ATAAGGCTGC 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 T 0 2 25547 CASAVA_Build 5 99952203 2I TAGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 2280 hom 23 6 13 5 CT 1 2 25548 CASAVA_Build 5 99955710 1I TAAAGCTCAG -/A AAAAATTGCA 3070 het 3070 ref 43 18 20 5 A 5 6 25549 CASAVA_Build 5 99959849 4D TGAAACTGAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 16 9 A 14 10 25550 CASAVA_Build 5 99965863 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2303 hom 27 7 13 8 A 13 12 25551 CASAVA_Build 5 99972700 1D TTCTTTTTAA C/- CTTGATTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 C 2 1 25552 CASAVA_Build 5 99975772 3I AAATAAGTTT ---/AGA AGAAGAAGAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 AGA 3 4 25553 CASAVA_Build 5 99976362 1D TACTTAAGGG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 8 7 25554 CASAVA_Build 5 99980501 1D AAATAAAAGC A/- AAAAACTCAT 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 A 6 5 25555 CASAVA_Build 5 100001778 1D GTTACATATA T/- TCAGCAACTG 3070 het 3070 hom 35 12 20 4 T 2 1 25556 CASAVA_Build 5 100003638 1D GAGCATGTTT G/- TTTTTCTCTG 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 G 1 0 25557 CASAVA_Build 5 100006801 2D TATATGTATG TA/-- TATATATATA 1486 het 1435 hom 11 5 4 2 TA 7 6 25558 CASAVA_Build 5 100008571 1I CAAGGTATTA -/C CCCCCTACCC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 C 5 6 25559 CASAVA_Build 5 100013935 1I CTCCTTTGCC -/A GGATACATTA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 0 1 25560 CASAVA_Build 5 100015832 2D TTCAAAGGCC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CT 9 8 25561 CASAVA_Build 5 100018113 3D TCTTGCATAT GAC/--- GACAATTGTT 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 GAC 2 1 25562 CASAVA_Build 5 100019020 1D ATGACCAAGG A/- AAATCATTAC 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 A 4 3 25563 CASAVA_Build 5 100022494 13I TCTCTTCTGA -------------/CTGTATAGGAAAG CTTAGCTTTT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 CTGTATAGGAAAG 0 1 25564 CASAVA_Build 5 100025042 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 A 11 12 25565 CASAVA_Build 5 100025323 6I TGTAGCTGCA ------/ATAAGT ATATCTGTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATAAGT 0 1 25566 CASAVA_Build 5 100025656 1I GATTAAACAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 9 25567 CASAVA_Build 5 100037123 1D TTTTTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 11 14 T 12 11 25568 CASAVA_Build 5 100044435 4I GCCTGTAGTG ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 hom 102 het 49 0 35 14 TTGT 3 4 25569 CASAVA_Build 5 100059498 1D TGATTTGAAT A/- AAAAAAAAAA 1200 het 1200 ref 45 35 3 8 A 11 10 25570 CASAVA_Build 5 100073758 1I AATAAATTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2967 hom 25 8 12 5 T 7 8 25571 CASAVA_Build 5 100081461 4D TTATCTTATC ACTG/---- ACTATTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 29 4 ACTG 1 0 25572 CASAVA_Build 5 100085124 1D GATAAATTTC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 8 25573 CASAVA_Build 5 100093708 2I ATTTTAAACT --/TG TGACTTAACA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TG 1 2 25574 CASAVA_Build 5 100107035 8I CTTATTTAGT --------/AGAGATAA TTTAACATGA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AGAGATAA 0 1 25575 CASAVA_Build 5 100109756 1I TAAATTTACA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 8 25576 CASAVA_Build 5 100129685 1I AAAATTATGA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 74 het 31 0 25 6 T 7 8 25577 CASAVA_Build 5 100139652 2D ACTTAGTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 23 0 19 4 T 16 14 25578 CASAVA_Build 5 100173958 2D AAATTAATCA TC/-- TCTGTTTTGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TC 2 1 25579 CASAVA_Build 5 100174923 1I TCCAGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 29 1 23 5 A 10 11 25580 CASAVA_Build 5 100185258 2I GAATAATGTA --/AT ACATTCTTGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 0 1 25581 CASAVA_Build 5 100189733 1I AGCAACTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 414 hom 33 1 30 2 T 9 10 25582 CASAVA_Build 5 100202637 1D TGCTATGTTG A/- AAAGCCTGAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 4 3 25583 CASAVA_Build 5 100204391 1D AGAATATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 11 10 25584 CASAVA_Build 5 100213232 1D AAAAATAGAG A/- AAAAAAAAAA 2817 het 96 hom 13 1 11 1 A 13 12 25585 CASAVA_Build 5 100214405 2D TATATATAAC AT/-- GTGTGTGTAT 3070 het 76 hom 35 1 31 3 AT 1 0 25586 CASAVA_Build 5 100216047 1D42M2D ATTCTTTATT AAAAAAAAAAAATACAAAATGTTAATTTGAAAAATGCAGCCCATG/-AAAAAAAAAAATACAAAATGTTAATTTGAAAAATGCAGCCCA-- TGTGGGGCTT 3070 hom 66 het 21 0 23 6 N/A 0 0 25587 CASAVA_Build 5 100217577 24D GGAATGTGTT TGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTG/------------------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 57 het 23 0 19 9 TGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTG 1 0 25588 CASAVA_Build 5 100302467 1I GGAAAACTAG -/T TATCTACACA 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 1 2 25589 CASAVA_Build 5 100319788 1D TGATGGACTG A/- AAAAAAAAAG 1611 het 1611 ref 46 40 4 2 A 10 9 25590 CASAVA_Build 5 100329283 1I AGTATCCCCA -/T TATCTACTCA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 1 2 25591 CASAVA_Build 5 100331911 3D CAAAGAAAAA TGG/--- TGGTGGTGGT 3070 het 3070 hom 39 17 15 8 TGG 4 3 25592 CASAVA_Build 5 100344143 3D TATCATACTA CTT/--- TACATATACT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 CTT 1 0 25593 CASAVA_Build 5 100345029 2I CCTAAAAATA --/CT CTCTTTTTGT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 CT 2 3 25594 CASAVA_Build 5 100375604 1I CAGACGTCAT -/A TTAAATGGAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 0 1 25595 CASAVA_Build 5 100378841 2I ATTCTATTTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 AT 5 6 25596 CASAVA_Build 5 100386949 3D CAAATATACA AAG/--- AAGAAGGGAT 3070 het 3070 hom 42 16 20 7 AAG 3 2 25597 CASAVA_Build 5 100396462 1D AGGAAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 12 9 A 13 12 25598 CASAVA_Build 5 100410860 1D AGGCAGTATC A/- AAAAAAACCA 3070 hom 78 het 33 0 26 8 A 8 7 25599 CASAVA_Build 5 100413970 1I TCTGAGAGAC -/A GGGGATACAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 0 1 25600 CASAVA_Build 5 100416807 2I GTTTTTTTGT --/AA AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 7 9 25601 CASAVA_Build 5 100427572 1I TATATTTCAC -/A TTTGTATTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 0 1 25602 CASAVA_Build 5 100434999 1D GAAGTAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 29 1 21 9 A 12 11 25603 CASAVA_Build 5 100436271 1D ATATTTACTG A/- ATTTCACATT 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 A 2 1 25604 CASAVA_Build 5 100436420 4D TGAAGAAAAA AATG/---- AATGTGTTTT 3070 het 3070 ref 62 34 22 8 AATG 2 1 25605 CASAVA_Build 5 100440319 1D ATGGGCCCTG A/- AAAAGAGAAG 3070 het 3070 hom 45 19 21 6 A 5 4 25606 CASAVA_Build 5 100442841 1I ATTCAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 11 12 25607 CASAVA_Build 5 100447161 1I TGGGATGTGT -/G GGGGGGGTTA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 G 7 8 25608 CASAVA_Build 5 100447949 3D TACATGCTCA GAG/--- GAGAGGTAGC 3070 hom 120 het 45 0 41 5 GAG 2 1 25609 CASAVA_Build 5 100452753 1D GCTAATTAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 T 10 9 25610 CASAVA_Build 5 100455058 4D CTCTGTCTCA GAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 33 17 15 1 GAAC 1 0 25611 CASAVA_Build 5 100455759 12I TCTGTGTCCC ------------/TCTTAGTCTGTG TCTTAGTCTA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TCTTAGTCTGTG 0 1 25612 CASAVA_Build 5 100457735 1I AAGGAAAATC -/T TTTTTAACAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 5 6 25613 CASAVA_Build 5 100457960 1D TTTGTAACAC T/- AAAGGATACA 3070 hom 84 het 38 0 29 10 T 1 0 25614 CASAVA_Build 5 100458511 1I GAATCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 10 11 25615 CASAVA_Build 5 100461026 4D GGTACAAAAA TAGT/---- TAGAAAGAAT 3070 het 3070 hom 37 12 22 4 TAGT 1 0 25616 CASAVA_Build 5 100461662 1I GGGTCTTTTG -/T CTCTTACACA 3070 hom 102 het 35 0 33 2 T 0 1 25617 CASAVA_Build 5 100463598 6I TATATATATT ------/ATAATC ATATATAGTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 ATAATC 0 1 25618 CASAVA_Build 5 100468386 1D GACTATGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 32 1 22 11 A 11 10 25619 CASAVA_Build 5 100468616 1D AAATATTGAG A/- AAAACTTGTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 2 A 5 4 25620 CASAVA_Build 5 100468725 1D AATTCAACTT C/- TATTCATTTG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 C 1 0 25621 CASAVA_Build 5 100470050 4I CATGTTACTT ----/ACTA ACTCAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 21 14 0 ACTA 0 1 25622 CASAVA_Build 5 100472055 1I TTTATTTTTC -/T TTCTTTTTTT 3070 het 682 hom 20 4 12 4 T 2 3 25623 CASAVA_Build 5 100482894 1D AAATAAACCA T/- TCTAAAATTA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 T 2 1 25624 CASAVA_Build 5 100486817 2D AGTTTAAAAC TA/-- TGTTGGGATT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 TA 1 0 25625 CASAVA_Build 5 100486906 1D AGATTTATTT G/- TGACTTAATT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 G 1 0 25626 CASAVA_Build 5 100489537 1D TGGCTATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 11 25 7 A 11 10 25627 CASAVA_Build 5 100490831 3D ATAGTAATTA TTT/--- ATTATTGATT 3070 het 2783 hom 25 7 8 10 T 3 0 25628 CASAVA_Build 5 100490862 3D TATGAATTTA ATT/--- ATTATCATTG 3070 het 970 hom 23 2 12 10 ATT 2 1 25629 CASAVA_Build 5 100494361 2I ATTTACAATA --/TG TGATAAAAAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TG 1 2 25630 CASAVA_Build 5 100496052 1D CCTGGCCAAC T/- TTTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 5 4 25631 CASAVA_Build 5 100496407 2D GAACAATTAT GA/-- GAGAGTTATT 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 GA 3 2 25632 CASAVA_Build 5 100497013 9D GATCCACCCA CCTCTGCCT/--------- CCCAAAGTGC 3070 het 2891 hom 18 6 12 1 CCTCTGCCT 1 0 25633 CASAVA_Build 5 100505979 3D CACTCCATTA GTG/--- GTGGTGAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 14 1 GTG 3 2 25634 CASAVA_Build 5 100512011 1D AACATTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 12 11 25635 CASAVA_Build 5 100512378 3D TAAAGGTGTG CCT/--- GCCACACCTG 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 CCT 1 0 25636 CASAVA_Build 5 100514557 1I TATGAAGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 9 10 25637 CASAVA_Build 5 100524072 2D ATTGACATAT AG/-- AGTCTATTCT 3070 het 3070 ref 38 21 17 0 AG 2 1 25638 CASAVA_Build 5 100525586 2D AGCATCAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2102 het 427 hom 29 7 5 17 T 16 14 25639 CASAVA_Build 5 100525888 4D CTGTTTACTC AGTT/---- GATAGTTTCA 3070 het 3070 ref 33 21 9 6 AGTT 1 0 25640 CASAVA_Build 5 100531156 1D CAAAAAGAAC A/- AAGCTGGAGG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 3 2 25641 CASAVA_Build 5 100541988 6D CCAATGAATT AAAAAA/------ AAAAAAAACT 3070 het 2963 hom 26 10 10 8 A 14 8 25642 CASAVA_Build 5 100549742 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 A 11 9 25643 CASAVA_Build 5 100550111 2I AACACATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 35 18 17 0 TA 6 7 25644 CASAVA_Build 5 100550267 35D CACAATGAAT AAGCAACAAATAACATACACTTAAAATATATTTAA/----------------------------------- AAATTTGACA 3070 het 3070 ref 26 17 12 2 AAGCAACAAATAACATACACTTAAAATATATTTAA 1 0 25645 CASAVA_Build 5 100558477 3I TGTAAAGTAT ---/TCA TCATTTCTAA 3070 het 2930 hom 24 6 13 5 TCA 1 2 25646 CASAVA_Build 5 100561294 8D CTAGGTTTTA AGCCCCAC/-------- ATGCATCAGG 3070 het 3070 ref 31 20 10 7 AGCCCCAC 1 0 25647 CASAVA_Build 5 100565033 1D CTGAGATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 11 10 25648 CASAVA_Build 5 100569505 10D AATAAGTCTC ACAAGAACTG/---------- ATGGTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 7 ACAAGAACTG 1 0 25649 CASAVA_Build 5 100571134 3I TGCTATTTCC ---/ATG ATAGTGAGGA 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 ATG 0 1 25650 CASAVA_Build 5 100577450 1D TAATAACACC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 T 9 8 25651 CASAVA_Build 5 100581911 2D GGGCTTTAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 9 T 14 12 25652 CASAVA_Build 5 100582942 3D AAACAGACTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 12 2 A 13 10 25653 CASAVA_Build 5 100585171 1I ATATGAAATT -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 5 6 25654 CASAVA_Build 5 100586324 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 22 12 9 T 10 9 25655 CASAVA_Build 5 100587887 1D TTGCACTGAT A/- AAAAACAATA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 6 5 25656 CASAVA_Build 5 100588445 1D CACATGTCTG T/- TTTATAGGAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 4 3 25657 CASAVA_Build 5 100589064 1I CATAAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 11 12 25658 CASAVA_Build 5 100591585 5I TATTTGGATT -----/TTCTC TTCTCTTTTC 2066 het 2066 ref 26 16 6 4 TTCTC 1 2 25659 CASAVA_Build 5 100598879 1D TATAGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 1513 het 525 hom 14 2 4 8 T 11 10 25660 CASAVA_Build 5 100599721 1D GAGTTGTTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 9 8 25661 CASAVA_Build 5 100604322 1D GCCATCTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 A 10 9 25662 CASAVA_Build 5 100604553 1D AGCAGCTAAG A/- AAACATCCAC 3070 het 3070 ref 55 24 25 6 A 4 3 25663 CASAVA_Build 5 100609204 11D ATCTCAGAGT AACATCAGCAA/----------- AATGGTAGAG 3070 het 3070 ref 28 15 13 5 AACATCAGCAA 1 0 25664 CASAVA_Build 5 100609344 5I CAAGTGAATG -----/TTAAA TTAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 TTAAA 0 1 25665 CASAVA_Build 5 100613341 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 7 8 25666 CASAVA_Build 5 100615784 5D ATATGTAGAG TATAT/----- TATATGATGA 3070 het 3070 hom 30 13 15 4 TATAT 2 1 25667 CASAVA_Build 5 100616331 2D TTATACAGAC TT/-- ATTATATATT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 T 2 0 25668 CASAVA_Build 5 100624373 2D TTTAAAAGGC AG/-- AGTTTCCCTG 3070 het 3070 hom 56 26 30 0 AG 2 1 25669 CASAVA_Build 5 100624913 1I ATGTGGCTTG -/C TCCTCCTTGC 3070 het 3070 hom 41 18 15 8 C 0 1 25670 CASAVA_Build 5 100626144 2D CTGGAAAAGC CA/-- CAGACACTCT 3070 het 1624 hom 27 8 12 7 CA 2 1 25671 CASAVA_Build 5 100627250 9D CATTGGGTGA AGGATATAT/--------- AGAGGTACTT 3070 het 3070 ref 43 19 19 7 AGGATATAT 1 0 25672 CASAVA_Build 5 100627541 1I CTCAAAGGAC -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 A 6 7 25673 CASAVA_Build 5 100629632 1D CCTGTAAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 10 9 25674 CASAVA_Build 5 100636475 1I CCTTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1860 hom 25 7 12 6 A 11 12 25675 CASAVA_Build 5 100646206 1D GATCTGGGCA T/- CCCTTAACCC 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 1 0 25676 CASAVA_Build 5 100649806 2D GTTGTTGGCG GT/-- GTGGTGGTGA 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 GT 2 1 25677 CASAVA_Build 5 100668401 2D2M2D CTTCAAAGTA TTCCAT/--CC-- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 N/A 0 0 25678 CASAVA_Build 5 100670131 1I GCAACCAAAA -/T TGTCAAAATT 3070 het 3070 hom 32 8 20 4 T 1 2 25679 CASAVA_Build 5 100674221 2I ACACACACAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 AT 6 7 25680 CASAVA_Build 5 100676779 3D TAAATATTTC ACA/--- ACGATAACAA 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 ACA 1 0 25681 CASAVA_Build 5 100681218 1D AACCATCCCC A/- AACTCTGGTG 3070 hom 57 het 23 0 18 5 A 3 2 25682 CASAVA_Build 5 100685187 4I ATAAGCAAAG ----/AAAT AAAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 AAAT 0 1 25683 CASAVA_Build 5 100735805 1D AAAAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 11 10 25684 CASAVA_Build 5 100756928 2I CTTATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 TA 7 8 25685 CASAVA_Build 5 100759339 1D GGAAAAAATG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 8 24 2 T 8 7 25686 CASAVA_Build 5 100763598 1I ATTCCTTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 15 20 14 T 9 10 25687 CASAVA_Build 5 100764961 1D CTAAAAGAAT A/- AAAAAAGACC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 7 6 25688 CASAVA_Build 5 100773031 1D CTCAAACAAA T/- TCAGTAAGCA 3070 het 3070 hom 55 25 26 4 T 2 1 25689 CASAVA_Build 5 100784843 1I AGATATATCC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 7 8 25690 CASAVA_Build 5 100787843 1I TCTCTACTCA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 T 7 8 25691 CASAVA_Build 5 100793688 2D TATGTACATA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 TG 5 4 25692 CASAVA_Build 5 100794641 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 50 22 26 2 A 9 10 25693 CASAVA_Build 5 100797619 1D TATTTATATA T/- TTTTTACTTT 3070 het 967 hom 15 2 13 2 T 6 5 25694 CASAVA_Build 5 100799343 1D AGATGAGTGC A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 7 6 25695 CASAVA_Build 5 100800835 2I GTGTGTGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 289 hom 15 2 11 2 AT 8 9 25696 CASAVA_Build 5 100820364 1I ACTTTACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 10 11 25697 CASAVA_Build 5 100823835 4I ACTGAAGCAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 2992 hom 26 12 7 7 TTTA 2 3 25698 CASAVA_Build 5 100823884 1I TATGACTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2675 hom 36 8 23 5 A 10 11 25699 CASAVA_Build 5 100825055 1I GCTTATTTCA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 7 8 25700 CASAVA_Build 5 100825492 11D ATTTGATACT GCAAGAGCAGG/----------- GCAAGAGCAG 3070 het 3070 ref 49 29 19 2 GCAAGAGCAGG 2 1 25701 CASAVA_Build 5 100825903 4D AATTGCATGA CAGT/---- CAGATTCTGG 3070 het 3070 ref 36 22 12 4 CAGT 1 0 25702 CASAVA_Build 5 100826713 1D AAAACCTTAG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 9 8 25703 CASAVA_Build 5 100827864 10D CTTAGTTTTT TAGAAGACCG/---------- TAAAAGGTAA 463 het 463 ref 28 14 3 13 TAGAAGACCG 1 0 25704 CASAVA_Build 5 100828313 1D TAGACAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 10 9 25705 CASAVA_Build 5 100829029 1D ATGTGCTAAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 A 7 6 25706 CASAVA_Build 5 100829597 1I GAGGATTGCT -/G GGTTGAATGA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 G 2 3 25707 CASAVA_Build 5 100847125 2D TCCAGAACTT CA/-- GTTTCCCCAG 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 CA 1 0 25708 CASAVA_Build 5 100848330 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1687 het 1687 ref 17 7 6 4 A 10 11 25709 CASAVA_Build 5 100848871 4I CAAGCTTAGT ----/TGAC TGACTGATTG 3070 het 3070 ref 76 37 27 12 TGAC 1 2 25710 CASAVA_Build 5 100857136 4D TTATTTCATT ATTA/---- ATTGACACAT 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 ATTA 1 0 25711 CASAVA_Build 5 100860191 1I ACTCAACAAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 44 32 11 1 A 7 8 25712 CASAVA_Build 5 100866250 1D CTAATAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 30 3 21 6 A 12 11 25713 CASAVA_Build 5 100872954 1I ATATAATGTA -/T TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 5 6 25714 CASAVA_Build 5 100876305 1I TGTATTAGTT -/C CCCAGATTAA 3070 het 3070 hom 36 18 18 0 C 3 4 25715 CASAVA_Build 5 100877941 3D AAGATTGCTA AGG/--- AGAAGTATCT 3070 het 3070 ref 39 23 13 5 AGG 1 0 25716 CASAVA_Build 5 100881294 1I ACTCTTCCTC -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 6 7 25717 CASAVA_Build 5 100906667 1I TTAGTAATTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 T 9 10 25718 CASAVA_Build 5 100909908 1I TACCCAGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 15 9 13 T 9 10 25719 CASAVA_Build 5 100911544 6D GAGATGGTGG TTGCTT/------ TTGCCAGAGG 3070 het 3070 ref 46 27 19 1 TTGCTT 1 0 25720 CASAVA_Build 5 100914012 10D TATATATATG TATATATATA/---------- TATATATATA 1989 het 990 hom 6 2 5 0 TA 13 8 25721 CASAVA_Build 5 100917047 3I CTTAGCTCGG ---/AGT AGTTTGATCA 1718 het 1718 ref 19 12 4 3 AGT 1 2 25722 CASAVA_Build 5 100921471 1I TTACATTTAA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 6 7 25723 CASAVA_Build 5 100921584 1D TAAACAAATA C/- TCTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 C 1 0 25724 CASAVA_Build 5 100922896 1D TTAATTTCTA T/- TTTTTATTTC 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 T 6 5 25725 CASAVA_Build 5 100935950 1D GTCTGTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 11 10 25726 CASAVA_Build 5 100956027 1D ATCATTTTTT A/- AAAAAATATA 3070 het 2152 hom 17 6 9 3 A 7 6 25727 CASAVA_Build 5 100956900 2I TTGATCTTTC --/AT ATATATATAT 3070 het 2501 hom 22 10 11 1 AT 6 7 25728 CASAVA_Build 5 100958181 1D ACAGTGGAAC A/- AAAAAAAAAA 2005 het 2005 ref 40 21 8 11 A 13 12 25729 CASAVA_Build 5 100966439 1I CAGTCTACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 13 14 25730 CASAVA_Build 5 100982224 1I CTTTTAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 9 10 25731 CASAVA_Build 5 100994118 2D TCTCTTTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 1225 het 1225 ref 36 23 6 8 TG 8 7 25732 CASAVA_Build 5 100994152 2D TATGTGTTGA GT/-- GTGTGTGTGT 1643 het 1643 ref 47 31 5 11 GT 10 9 25733 CASAVA_Build 5 101002418 1I ATCATTAATG -/T TAAGTTAATA 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 T 1 2 25734 CASAVA_Build 5 101027427 1I TGTTGACTTG -/T TAGATGAGTA 3070 het 3070 ref 57 26 24 7 T 1 2 25735 CASAVA_Build 5 101040364 3I CTTCACAAAT ---/ATC ATCATATTTA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 ATC 1 2 25736 CASAVA_Build 5 101044892 2D TCAAATGTGC AT/-- ATATATATAT 1065 het 1065 ref 49 37 3 10 AT 7 6 25737 CASAVA_Build 5 101057540 2D CTTTGTGCAA AT/-- ATATATATAT 2772 het 932 hom 15 2 8 5 AT 9 8 25738 CASAVA_Build 5 101067156 1I GTGAAGAAAT -/A CTTGAGACTG 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 0 1 25739 CASAVA_Build 5 101071923 1I TTAAGTAATG -/C CCTGCTTTGT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 C 2 3 25740 CASAVA_Build 5 101080192 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 A 11 10 25741 CASAVA_Build 5 101084940 2D CCGAAGAGTC TG/-- TACCTGTGTC 3070 het 3070 ref 22 11 9 3 TG 1 0 25742 CASAVA_Build 5 101103058 3I ATAATAACAA ---/AAT AATGACCTAC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AAT 1 2 25743 CASAVA_Build 5 101105878 1D GAAATCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 36 0 30 8 A 11 10 25744 CASAVA_Build 5 101108165 1D TACAATAACC A/- AAAAAAAAAA 2944 het 2190 hom 36 12 11 13 A 17 16 25745 CASAVA_Build 5 101111554 2D ATAATTAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 34 0 27 8 AC 8 7 25746 CASAVA_Build 5 101127223 1D TAATGACATT A/- TTTCCATTAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 0 25747 CASAVA_Build 5 101129256 2I GTAAATATGA --/TT TTTTTGACTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 5 7 25748 CASAVA_Build 5 101129863 2I GTATACAGAA --/TG TTACATAATT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TG 0 1 25749 CASAVA_Build 5 101134417 4I TTGCTCTCCT ----/AAGA AAGAAACAGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAGA 1 2 25750 CASAVA_Build 5 101135271 1D GTTTTTAATG T/- TTATTTTTTA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 3 2 25751 CASAVA_Build 5 101135381 1D TGACTTTACC A/- AAAAAAGTCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 6 25752 CASAVA_Build 5 101135572 3D AGTTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTTGG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTG 1 0 25753 CASAVA_Build 5 101137509 1D TCGGCCTCCC A/- AAGAATTTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 2 25754 CASAVA_Build 5 101138932 2I TCTTTCTTTC --/CT CTTTCTTTAT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 CT 1 2 25755 CASAVA_Build 5 101143814 1D AACTATGAAG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 7 25756 CASAVA_Build 5 101145329 1I AAGACATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 11 12 25757 CASAVA_Build 5 101148597 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTTAAAC 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 A 2 3 25758 CASAVA_Build 5 101149619 1D TTTTAAAATA T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 7 6 25759 CASAVA_Build 5 101149833 1D ATTTTTTATG A/- AAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 7 6 25760 CASAVA_Build 5 101155039 1D AGGTAAGTCC A/- AAACCAAGCA 3070 het 3070 hom 57 21 26 10 A 4 3 25761 CASAVA_Build 5 101157312 3D TTTACACGCC CAA/--- CAACAGTGTA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 CAA 2 1 25762 CASAVA_Build 5 101157838 11D TTAAGTCTTT AATTCATCTTG/----------- AGTTAATTTT 3070 het 3070 ref 31 22 8 4 AATTCATCTTG 1 0 25763 CASAVA_Build 5 101158328 1D GCATGGAATG T/- TTTTCCATTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 5 4 25764 CASAVA_Build 5 101161904 4I GTGTGTGTGC ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 GT 5 7 25765 CASAVA_Build 5 101164292 1D AAATTTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 T 10 9 25766 CASAVA_Build 5 101169052 4D AAAGGTGTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1038 hom 21 4 9 8 T 16 12 25767 CASAVA_Build 5 101180620 2I GTTACCAGAT --/AG AGTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 AG 1 2 25768 CASAVA_Build 5 101185069 1D TCTATTTTTA T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 8 7 25769 CASAVA_Build 5 101189200 7D AAGGAAGACT AAGCAAA/------- AAGAACAAAC 3070 het 3070 ref 39 22 16 3 AAGCAAA 1 0 25770 CASAVA_Build 5 101193758 1I TTTTGGTTAA -/T TTTTCAGTAT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 T 4 5 25771 CASAVA_Build 5 101195127 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 10 9 25772 CASAVA_Build 5 101196210 2I ATAGAAAAAC --/TT AATTTTTTCA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 0 2 25773 CASAVA_Build 5 101197549 1D TGAGTAAAAT G/- GTATGAAATA 3070 het 3070 ref 49 29 16 5 G 2 1 25774 CASAVA_Build 5 101200386 4I CTCATTGTAC ----/TTAT TTGATCTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 TTAT 0 1 25775 CASAVA_Build 5 101201486 4D CAGGTAGGCC ATGT/---- ATGTTTAAGG 3070 het 3070 ref 37 18 19 3 ATGT 2 1 25776 CASAVA_Build 5 101206272 3D CTAGCAAGAA AGT/--- AGAACAGTTG 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 AGT 1 0 25777 CASAVA_Build 5 101208598 4I TTTATTAATC ----/TAAT TATCTGATTT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 TAAT 0 1 25778 CASAVA_Build 5 101211830 1D AGCAGTTTTT A/- ATATGTCTAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 A 2 1 25779 CASAVA_Build 5 101214581 1D TCTTTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 26 9 10 T 14 13 25780 CASAVA_Build 5 101222193 4I CTTGTCTGAT ----/AGTC AGATTAGCTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 AGTC 0 1 25781 CASAVA_Build 5 101224145 19I AGCCAGCTAG -------------------/CCCCATCCCTGCCAGCAAC CCACTCTTGC 3070 hom 98 het 39 0 32 7 CCCCATCCCTGCCAGCAAC 0 1 25782 CASAVA_Build 5 101225533 1I GGTCAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 29 1 20 8 A 10 11 25783 CASAVA_Build 5 101236671 1I GCAGAGATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 9 10 25784 CASAVA_Build 5 101242419 1D AAAGGAACAG A/- GTTTAATAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 1 0 25785 CASAVA_Build 5 101244253 1I TTTTAAATCC -/A AAAAATAAAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 A 5 6 25786 CASAVA_Build 5 101247342 1I GGCATACAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1188 hom 38 3 29 6 T 9 10 25787 CASAVA_Build 5 101247674 2I ATAAATAGAC --/TG TTATTTTTTG 3070 het 3070 ref 60 31 22 7 TG 0 1 25788 CASAVA_Build 5 101262545 1D CAAAGAAGGC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 9 8 25789 CASAVA_Build 5 101263739 1I CTTGTGTTTG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 T 7 8 25790 CASAVA_Build 5 101265518 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 13 12 25791 CASAVA_Build 5 101266647 1I TTTTCTTTTT -/A AAAAATTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 5 6 25792 CASAVA_Build 5 101274866 1I CTGTTGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 24 2 17 5 T 12 13 25793 CASAVA_Build 5 101276466 1I TTTTATTATT -/A ATACTTTAAG 3070 het 2521 hom 18 7 9 2 A 1 2 25794 CASAVA_Build 5 101279339 1D CTTTCACGTC T/- TGAGTCGTGA 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 T 2 1 25795 CASAVA_Build 5 101284848 3D TTAGACAGAT CAA/--- CGAGACAGAA 3070 het 3070 ref 18 10 7 1 CAA 1 0 25796 CASAVA_Build 5 101288732 1D TTTTCACACC T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 3 2 25797 CASAVA_Build 5 101292053 1I TTCCTCAATT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 26 9 11 12 A 7 8 25798 CASAVA_Build 5 101296607 4D GATACAAATA AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 6 AATT 3 2 25799 CASAVA_Build 5 101297845 2D TTAATACATT CC/-- CCCCCCCCGC 2873 het 483 hom 12 1 7 4 C 10 8 25800 CASAVA_Build 5 101299599 2I AAAAAATATG --/TA TATATATATA 1721 het 1721 ref 16 9 4 6 TA 6 7 25801 CASAVA_Build 5 101299676 1D ATATATCTCA T/- TTTTTTTATC 3070 het 1495 hom 14 4 8 2 T 8 7 25802 CASAVA_Build 5 101299892 1D TTATTATTAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 21 9 9 4 T 9 8 25803 CASAVA_Build 5 101302851 1D TATTAACTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 10 9 25804 CASAVA_Build 5 101303381 1I TGGTCGGGGC -/T TTTTTTTTTT 2461 het 2461 ref 28 13 7 8 T 10 11 25805 CASAVA_Build 5 101307764 1D CCCCTGGGCC A/- TAGACCAGTA 2409 het 2409 ref 33 21 7 7 A 1 0 25806 CASAVA_Build 5 101309610 1D GTCTTATTTT A/- TATTACATCA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 1 0 25807 CASAVA_Build 5 101313450 1I ACTTTGAAAG -/A TGAGATTAGT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 0 1 25808 CASAVA_Build 5 101314895 2I TCGTTACTCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 10 12 25809 CASAVA_Build 5 101318707 3D GTGGACACTC ATT/--- ATTAACCATC 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 ATT 2 1 25810 CASAVA_Build 5 101329092 4I GATCAAATAA ----/TAGT TAATCTATTA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 TAGT 0 1 25811 CASAVA_Build 5 101335528 6I GTAAAATACC ------/TATAAG TATAATTGCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TATAAG 0 1 25812 CASAVA_Build 5 101337008 4D GTACTTCCTC TCTT/---- TATACCTTCT 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 TCTT 1 0 25813 CASAVA_Build 5 101337875 5D ACTTATAAGC TAACT/----- TAACTTATTT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 TAACT 2 1 25814 CASAVA_Build 5 101340935 1D TCTAAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 11 10 25815 CASAVA_Build 5 101341319 1I TTTTTCTCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 T 8 9 25816 CASAVA_Build 5 101342595 1D AGTCACTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 37 2 18 18 A 17 16 25817 CASAVA_Build 5 101344141 3D ACTTGTTTAC CCT/--- CCTAATATAT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 CCT 2 1 25818 CASAVA_Build 5 101345937 6I TTTTTTATTC ------/ATATTT ATATTGTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 ATATTT 0 1 25819 CASAVA_Build 5 101348603 1I AGAGTGCAGC -/A GTATGATTAT 1221 het 1221 ref 23 15 3 6 A 0 1 25820 CASAVA_Build 5 101350105 3D TGAGAAAGCT ACA/--- ACATTTCAAG 3070 het 3070 hom 39 13 26 0 ACA 2 1 25821 CASAVA_Build 5 101354310 1D TGTTATCAGC A/- AGGCTTCTGA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 2 1 25822 CASAVA_Build 5 101366510 1I TAGTCAGAGG -/A AAAACAGAGT 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 A 4 5 25823 CASAVA_Build 5 101369208 1D CATTTAACAA T/- AACAAAACAG 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 T 1 0 25824 CASAVA_Build 5 101371316 1I CTTTGGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 10 11 25825 CASAVA_Build 5 101372133 1I TAGAAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 A 10 11 25826 CASAVA_Build 5 101374282 4I CATAAAAAAC ----/ATAT ATATTTGCTT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 AT 2 4 25827 CASAVA_Build 5 101374577 11I ATGCCATGGT -----------/AATGGAAACCA AACTCCTTCA 3070 het 3070 hom 41 11 27 3 AATGGAAACCA 0 1 25828 CASAVA_Build 5 101386136 7I ACTAATGACA -------/TCTCAAT AAAACCTCAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 TCTCAAT 0 1 25829 CASAVA_Build 5 101387379 1I GACTAAAACA -/C CAAAAGCAAT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 C 1 2 25830 CASAVA_Build 5 101397638 1I TCAATGTAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 A 8 9 25831 CASAVA_Build 5 101398046 3I CTATTTAAAA ---/AAT AATGACTATA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 AAT 1 2 25832 CASAVA_Build 5 101403124 2I AAAATAAATC --/AA GACTTTTTAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 0 2 25833 CASAVA_Build 5 101403249 4D CAAAAAAAAA TTAT/---- TTGTTTTAGA 3070 het 3070 ref 27 15 10 5 TTAT 1 0 25834 CASAVA_Build 5 101407247 7D TTATTAAGAT ATTAATA/------- AGCTACAAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 ATTAATA 1 0 25835 CASAVA_Build 5 101407760 3D TAACATACAC ACA/--- ACAACAACAA 2330 het 2330 ref 26 11 6 10 ACA 5 4 25836 CASAVA_Build 5 101408073 3I CGTATCTCAA ---/AAT AATAAGAGCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAT 1 2 25837 CASAVA_Build 5 101408440 3D ATAATTTACT ATA/--- ATTTCTGCAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 ATA 1 0 25838 CASAVA_Build 5 101413607 1D AAACTATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 A 13 12 25839 CASAVA_Build 5 101415329 4D AATGTATGAG AAAT/---- AGATAGAAGA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 AAAT 1 0 25840 CASAVA_Build 5 101418591 1D CAACAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 25 7 A 11 10 25841 CASAVA_Build 5 101421322 1I CATGCACACG -/T TATGTTTATT 3070 hom 35 het 34 1 30 3 T 1 2 25842 CASAVA_Build 5 101422707 1I TTTCTCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 29 1 21 7 A 11 12 25843 CASAVA_Build 5 101434511 1D CCTTCTAGAC T/- TTTTCTAGTC 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 T 5 4 25844 CASAVA_Build 5 101438116 6D GTATCTCTCC TTTAAA/------ TTTACATTGT 3070 het 3070 ref 50 25 22 4 TTTAAA 1 0 25845 CASAVA_Build 5 101438880 1I GATAATACAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 8 9 25846 CASAVA_Build 5 101439608 1D CTACAGATTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 A 9 8 25847 CASAVA_Build 5 101442651 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 895 hom 29 4 16 9 A 11 12 25848 CASAVA_Build 5 101442932 1I GATTCTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 15 13 15 A 13 14 25849 CASAVA_Build 5 101451853 1I ATTTTACAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 A 9 10 25850 CASAVA_Build 5 101451985 5I AGTTATTTTA -----/TTTTC TTATTTCCTC 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 TTTTC 0 1 25851 CASAVA_Build 5 101460188 4D ATGTGTTTTG TTTT/---- TTTACTTAAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 T 7 3 25852 CASAVA_Build 5 101464099 1D CACATTTTCC T/- TTTTTCATGT 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 T 6 5 25853 CASAVA_Build 5 101489892 1D TAACAGTGAA T/- TCATCTATTT 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 T 2 1 25854 CASAVA_Build 5 101490276 1I CACCCCCTGC -/T TTTTTCAGAA 3070 hom 91 het 38 0 28 10 T 5 6 25855 CASAVA_Build 5 101492333 2D TCTATGAAAC AT/-- GTGTTCAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 AT 1 0 25856 CASAVA_Build 5 101511176 1I CCAGGGTTTA -/G GCTCAAGGAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 G 1 2 25857 CASAVA_Build 5 101525220 1D TCCCAATGAG A/- AAAAAAAAAA 2985 het 2985 ref 44 19 12 13 A 15 14 25858 CASAVA_Build 5 101562987 4I TGTATTTCAT ----/TTTG TTTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TTTG 0 1 25859 CASAVA_Build 5 101587873 2I CCTTTTAATC --/TA TAAAGTGAAC 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TA 1 2 25860 CASAVA_Build 5 101592632 2D ATGTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2031 het 191 hom 34 3 9 22 T 20 18 25861 CASAVA_Build 5 101594514 4D TGGTGCTAAA AAGT/---- AAGGATGTCC 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 AAGT 1 0 25862 CASAVA_Build 5 101598403 6D AAGCCTAAAC TTTCCT/------ TTTCCTTTTT 2772 het 2772 ref 27 16 8 3 TTTCCT 2 1 25863 CASAVA_Build 5 101601043 1I TGTCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 A 11 12 25864 CASAVA_Build 5 101612576 2D CCAGAATTAA AT/-- ATGAATTTGT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 AT 2 1 25865 CASAVA_Build 5 101617408 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 13 12 25866 CASAVA_Build 5 101617557 2D TGAAATTATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TA 7 6 25867 CASAVA_Build 5 101618697 35I TATCTATATA -----------------------------------/TTTATATTTATATTTATATCCTATATCTATATATC CACACACATA 3070 het 3070 ref 31 19 13 0 TTTATATTTATATTTATATCCTATATCTATATATC 0 1 25868 CASAVA_Build 5 101619388 1D TCCATAGCAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 8 7 25869 CASAVA_Build 5 101619577 1D GGGTGGCCGA G/- CCAGGCAGAT 3070 het 2486 hom 20 7 9 4 G 1 0 25870 CASAVA_Build 5 101623785 2I GTATGAGACT --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 GA 5 6 25871 CASAVA_Build 5 101623925 2D TGCTGTACCT AA/-- AAAAAAAATA 1702 hom 12 het 9 0 5 4 A 10 8 25872 CASAVA_Build 5 101623972 5D ATACATATAA TATAT/----- TATATGTATA 916 het 301 hom 6 1 2 4 TATAT 2 1 25873 CASAVA_Build 5 101627077 3D TATGAAAATA TGT/--- TATTATAATA 2842 het 2842 ref 14 6 7 2 TGT 1 0 25874 CASAVA_Build 5 101628442 1I TGAGCTGATA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 T 6 7 25875 CASAVA_Build 5 101629566 1I TGCCTTTCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 T 8 9 25876 CASAVA_Build 5 101631254 3I TTCTTTCCTT ---/CTA CTAATTTTGG 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 CTA 1 2 25877 CASAVA_Build 5 101632956 1D GCTTTCTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 25878 CASAVA_Build 5 101634418 1I GTCTTTGTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 9 10 25879 CASAVA_Build 5 101635901 16D GCACAAATCT CTTGTTATTACTTCAG/---------------- CTTTCTAAGG 3070 het 3070 ref 35 17 14 10 CTTGTTATTACTTCAG 1 0 25880 CASAVA_Build 5 101636384 1I CATGGTAAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 het 2909 hom 32 7 18 7 C 3 4 25881 CASAVA_Build 5 101638737 5D TAAATGAAGT AAAAG/----- AAAAGAAATG 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 AAAAG 2 1 25882 CASAVA_Build 5 101646796 1D TGACATCCAC A/- AAAAAAAAAA 1532 het 1532 ref 49 34 6 10 A 11 10 25883 CASAVA_Build 5 101648236 2D AGCGTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 10 T 12 10 25884 CASAVA_Build 5 101650767 1D ATTAATTTAC A/- GGAAGCTTTC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 1 0 25885 CASAVA_Build 5 101651315 1D ACATGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1463 hom 20 8 9 3 T 10 9 25886 CASAVA_Build 5 101655310 1D TCTTTTTTTT C/- TTAAAATGTA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 C 1 0 25887 CASAVA_Build 5 101656244 1D AAAGTAAAAG A/- AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 7 6 25888 CASAVA_Build 5 101657349 1I ATTATTATAC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 8 9 25889 CASAVA_Build 5 101660402 1I CTATCTTGCG -/T TTTTCTTCCT 3070 het 2419 hom 28 7 17 4 T 4 5 25890 CASAVA_Build 5 101662825 1D CCCTTACATT C/- TTTATGCTGC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 C 1 0 25891 CASAVA_Build 5 101664128 1D ACTTGATCGC T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 2 1 25892 CASAVA_Build 5 101667551 1D ATTAAAAAGA T/- TTTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 6 5 25893 CASAVA_Build 5 101669141 9I TGTTTTAAGA ---------/TTTTCATGG TTTTCATGGT 2723 het 2723 ref 33 11 8 14 TTTTCATGG 1 2 25894 CASAVA_Build 5 101670083 2I TTAAATACTG --/AA AAAAAAAGTG 2731 het 2731 ref 33 23 6 4 A 7 9 25895 CASAVA_Build 5 101670354 1I GTATCCAGAG -/A AAAACTCACA 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 A 4 5 25896 CASAVA_Build 5 101670823 3D TCTGGCACAT AAG/--- AAGGACTCCA 3070 het 3070 hom 44 18 25 2 AAG 2 1 25897 CASAVA_Build 5 101670926 1D TAAAATAGAT A/- ACATCCTTGC 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 2 1 25898 CASAVA_Build 5 101678095 1I TGTTTAGGCA -/T TGAGAGGCTC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 1 2 25899 CASAVA_Build 5 101682392 1D ACTTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 12 10 5 T 12 11 25900 CASAVA_Build 5 101685858 2D ACTCCATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1728 hom 14 5 8 1 A 14 12 25901 CASAVA_Build 5 101687072 1D TGCATCATTA C/- TTATTTGTAC 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 C 1 0 25902 CASAVA_Build 5 101688453 4D ATCACCATTC TCTG/---- TCTGACCTTT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 TCTG 2 1 25903 CASAVA_Build 5 101697705 1I CAGAGCTACT -/A AAAAAAAAAA 2894 het 2894 ref 27 14 7 6 A 12 13 25904 CASAVA_Build 5 101698335 2D TATAAATCCA TT/-- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 19 11 8 T 9 7 25905 CASAVA_Build 5 101701226 1I GAAATTTTCC -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 7 8 25906 CASAVA_Build 5 101706539 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2734 hom 27 10 11 6 A 11 10 25907 CASAVA_Build 5 101713620 1I CATATGAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 9 10 25908 CASAVA_Build 5 101721254 4D GCATAAAAAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 2596 hom 21 7 10 5 AT 8 6 25909 CASAVA_Build 5 101721386 1I CAGCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2848 het 932 hom 9 2 6 1 T 10 11 25910 CASAVA_Build 5 101730879 1D TCAGGAGTTC A/- AGACCAGCCT 2282 het 1558 hom 15 6 6 3 A 2 1 25911 CASAVA_Build 5 101731090 6D AAAGAAAAGA AAGAGC/------ AAGAGAAAGA 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 AAGAGC 1 0 25912 CASAVA_Build 5 101735326 2D ATGTATCTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 AC 10 9 25913 CASAVA_Build 5 101746098 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 12 11 25914 CASAVA_Build 5 101753231 1I TGATAGTACT -/C ATTTTTAATT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 C 0 1 25915 CASAVA_Build 5 101753455 4I TTTATCTCCT ----/GTAA GTATTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 GTAA 0 1 25916 CASAVA_Build 5 101756662 1D TACTGTCATT A/- AAAAATTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 6 5 25917 CASAVA_Build 5 101762706 1D GGTTTTGTTT A/- GAATAATAAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 A 1 0 25918 CASAVA_Build 5 101770603 4I CACCCAAGAG ----/TCTC TCCCTCTATT 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 TC 1 3 25919 CASAVA_Build 5 101771967 4I TAATAAACTA ----/ATAC ATAGTTCCCA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 ATAC 0 1 25920 CASAVA_Build 5 101774853 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 2148 het 2148 ref 46 19 11 16 TG 8 9 25921 CASAVA_Build 5 101775245 1D9M4I TAAGGGATCT GGGGACTCAT----/-GGGAGTCCTTAGA GCCCTTCAAA 3070 het 3070 ref 34 23 12 6 N/A 0 0 25922 CASAVA_Build 5 101779706 3D TCTACACGGT TGG/--- TGGGAATGTA 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 TGG 2 1 25923 CASAVA_Build 5 101790571 1I GTCCTTTGCA -/G GGTCATGGAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 G 2 3 25924 CASAVA_Build 5 101812036 13D CTGTTAGTAT TCTGCCTCAGTGA/------------- TCTGTCCAAT 3070 het 3070 ref 39 24 15 4 TCTGCCTCAGTGA 1 0 25925 CASAVA_Build 5 101814347 11D ACCAATTGGT ATGATTAGCCC/----------- AGGGTGAAGC 3070 het 3070 ref 35 19 11 10 ATGATTAGCCC 1 0 25926 CASAVA_Build 5 101814695 9D AGTCACAGGG GCAGGATTC/--------- CATGTGGAAA 3070 het 3070 hom 47 18 23 9 GCAGGATTC 1 0 25927 CASAVA_Build 5 101826746 1I GAAGATATAC -/A AATGCCCAAT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 2 3 25928 CASAVA_Build 5 101826868 3I AAATAAAAAT ---/TAG TAGATGTTGG 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 TAG 1 2 25929 CASAVA_Build 5 101831014 1D GAATCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 11 10 25930 CASAVA_Build 5 101837681 1I ACAAAAATAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 8 9 25931 CASAVA_Build 5 101844248 1I TTTGAAGCTA -/T TTTTTAACTA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 5 6 25932 CASAVA_Build 5 101844376 4D ACTAATATAA TATT/---- TATTTATCTA 3070 het 2999 hom 21 9 8 5 TATT 2 1 25933 CASAVA_Build 5 101844835 1D AATCACTACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 18 18 8 T 10 9 25934 CASAVA_Build 5 101846926 1D TTCTTTCCAC G/- GGGAGAATTT 3070 het 3070 ref 56 29 19 8 G 4 3 25935 CASAVA_Build 5 101856774 3I ATTTAGCGAA ---/ACT ACTATTACCT 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 ACT 1 2 25936 CASAVA_Build 5 101858733 15D TTAAAAGAAG CCAGAAACAAAAAAA/--------------- CCAGAAACTG 3070 het 3070 ref 29 17 12 2 CCAGAAACAAAAAAA 1 0 25937 CASAVA_Build 5 101859043 1I TTAAAAATAC -/A AAAAATTTAG 2141 het 2065 hom 13 6 6 1 A 5 6 25938 CASAVA_Build 5 101861799 1D TTTGAGCAAT A/- AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 7 6 25939 CASAVA_Build 5 101862629 1I ACGTCCTCCC -/A GGGGGTTGAC 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 A 0 1 25940 CASAVA_Build 5 101862755 1I AGAAGCATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 12 11 A 13 14 25941 CASAVA_Build 5 101877949 3I GTCGCTATGG ---/TCC TCTACGCAAA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 TCC 0 1 25942 CASAVA_Build 5 101891089 1I ATACTTTACC -/T TATAAGTGTA 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 T 1 2 25943 CASAVA_Build 5 101892145 6I AGGTTCCTCT ------/ACCCAC ACCTTCATGA 3070 het 3070 ref 56 28 25 3 ACCCAC 0 1 25944 CASAVA_Build 5 101900166 2I GAAAATTGAC --/AG AGTGTATGTT 3070 het 3070 hom 41 21 19 1 AG 1 2 25945 CASAVA_Build 5 101904140 3I TCTGAAAAAG ---/ACA ACATGTTGAA 3070 het 3070 ref 55 26 25 4 ACA 1 2 25946 CASAVA_Build 5 101904824 4D AGATTGCAGT AAAG/---- AGATTTTAAT 3070 het 3070 hom 50 22 26 2 AAAG 1 0 25947 CASAVA_Build 5 101919474 7I GGAGGAAGAC -------/AGAGAGT AAAGAGGGAG 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 AGAGAGT 0 1 25948 CASAVA_Build 5 101931139 1D CTGTAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 8 T 12 11 25949 CASAVA_Build 5 101932951 24D TGTGTGTGTG TATATATATATATATATATATATA/------------------------ TATATATATA 3070 het 361 hom 16 1 11 5 TA 19 7 25950 CASAVA_Build 5 101936457 1D ACATAATGAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 42 24 11 7 A 9 8 25951 CASAVA_Build 5 101938182 1D TAAATTTCTA T/- TTTTTTGTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 6 25952 CASAVA_Build 5 101944522 2D TATATATATA TT/-- AATGATATAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 5 T 2 0 25953 CASAVA_Build 5 101946382 1D AATATGAGTC A/- AAAGGTATAC 3070 het 3070 ref 50 26 20 5 A 4 3 25954 CASAVA_Build 5 101947446 1D TGTCTCAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 10 9 25955 CASAVA_Build 5 101947794 1I GTTTTTGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 17 18 10 T 12 13 25956 CASAVA_Build 5 101961623 1I TTACATTGTT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 111 het 46 0 37 9 A 7 8 25957 CASAVA_Build 5 101962896 1I AAGATCTACG -/T TATCTCTACA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 1 2 25958 CASAVA_Build 5 101972100 12I AGGAATTACT ------------/TGATGCAAAAAG TGCAAACTAT 3070 hom 168 het 63 0 56 7 TGATGCAAAAAG 0 1 25959 CASAVA_Build 5 101985979 4D TTGACACACA CTCT/---- CTCTCTCTGT 3070 het 3070 ref 39 17 18 5 CT 6 4 25960 CASAVA_Build 5 101987010 1D TATCCGGCAT A/- AAAAGTGCCA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 5 4 25961 CASAVA_Build 5 101996206 1D CTGATGGTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 10 9 25962 CASAVA_Build 5 102004523 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 2323 het 2212 hom 14 5 7 2 A 9 10 25963 CASAVA_Build 5 102006306 1I GTAAGGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 A 12 13 25964 CASAVA_Build 5 102006910 1D GAATGATGCA C/- CCCCACAAGA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 C 5 4 25965 CASAVA_Build 5 102008023 2I GAGTATATAA --/AT ATATATATAT 2039 hom 12 het 10 0 5 5 AT 5 6 25966 CASAVA_Build 5 102008543 2D ATCAATAACA AG/-- AGAAATTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 18 3 AG 2 1 25967 CASAVA_Build 5 102009436 1D ATATTGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 28 1 9 18 A 11 10 25968 CASAVA_Build 5 102011658 1I CACCAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 10 11 25969 CASAVA_Build 5 102012291 1I AATACAAATT -/A TAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 0 1 25970 CASAVA_Build 5 102025814 4D ATTTATAACT TCTC/---- TCTGTTTACC 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 TC 3 1 25971 CASAVA_Build 5 102029718 4D AGCTGTCAGG CTGC/---- CTCAGTTTAA 3070 het 3070 hom 43 14 24 6 CTGC 1 0 25972 CASAVA_Build 5 102032850 1D ACCCAGAGAC A/- ATTCTCCAAC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 2 1 25973 CASAVA_Build 5 102033480 2D GAGGGGAAAG AA/-- AAATAAAATT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 5 3 25974 CASAVA_Build 5 102033629 2D TTTTTAAATT TC/-- TTTTTTCCTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TC 1 0 25975 CASAVA_Build 5 102042515 4I TCTTTGTGAA ----/ACTT ACTTAACCTC 3070 het 3070 ref 41 25 15 1 ACTT 1 2 25976 CASAVA_Build 5 102044746 1D CTAAAATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 57 hom 33 2 13 18 A 11 10 25977 CASAVA_Build 5 102046255 5D TTCATTTTCT CCTGC/----- CCTCAGACAT 3070 het 3070 ref 54 35 17 5 CCTGC 1 0 25978 CASAVA_Build 5 102046560 4D TTCTTTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 854 hom 25 6 12 7 T 16 12 25979 CASAVA_Build 5 102051933 1D ATTCATCTAA T/- TTTTTTTTCA 2795 hom 15 het 8 0 6 3 T 9 8 25980 CASAVA_Build 5 102054377 10D GGGAAGCCAT TTGTCACTGA/---------- TTGTTGTGTT 3070 het 3070 ref 33 24 13 3 TTGTCACTGA 1 0 25981 CASAVA_Build 5 102073731 1D TAACTGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2967 hom 37 10 19 8 T 13 12 25982 CASAVA_Build 5 102079479 6D GATTGGACAC CCATGA/------ TAATGTGTTT 3070 het 3070 hom 56 24 26 7 CCATGA 1 0 25983 CASAVA_Build 5 102083265 1I CAATTAAAGG -/C AGTTTCTGGG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 0 1 25984 CASAVA_Build 5 102084123 1D AATTTCTTAA G/- GTTACTTAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 G 2 1 25985 CASAVA_Build 5 102085340 1I ACAAAGGGAG -/A AAAAATAACT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 5 6 25986 CASAVA_Build 5 102085397 1D GAAGCAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 12 11 25987 CASAVA_Build 5 102087118 1D TGAAGTGTCT A/- ATTCTACAGG 3070 het 3070 ref 54 25 24 6 A 2 1 25988 CASAVA_Build 5 102089789 13I GAAGCATTAT -------------/CAGAATTCAGAAA CATTGTTTCA 3070 het 3070 hom 45 18 17 10 CAGAATTCAGAAA 0 1 25989 CASAVA_Build 5 102089950 2D GAAAAATCTG AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 10 8 25990 CASAVA_Build 5 102090136 2I AGATACAGCC --/TT TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 6 8 25991 CASAVA_Build 5 102090981 1D TAGTTCACTG A/- AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 A 6 5 25992 CASAVA_Build 5 102091628 1D ATCTAAATAA C/- AGCTTCCCAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 C 1 0 25993 CASAVA_Build 5 102091700 1D CAAAAGGGAC T/- TTTGCAGGTG 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 T 4 3 25994 CASAVA_Build 5 102091920 1I TTTAGAATCT -/G GGGAAAGGTA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 G 3 4 25995 CASAVA_Build 5 102097936 1I CTACTCAGGA -/G GCTGTGACAC 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 G 1 2 25996 CASAVA_Build 5 102098771 1I CTCCTACAGC -/T ACTGCAGTTA 1947 het 1947 ref 40 24 6 10 T 0 1 25997 CASAVA_Build 5 102099711 1I ATTTTTTTTT -/A AATGTAGTTT 3070 het 238 hom 26 1 22 3 A 2 3 25998 CASAVA_Build 5 102101354 1I AATTAGTAAT -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 6 7 25999 CASAVA_Build 5 102120276 1I TAAATGGCCT -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 A 6 7 26000 CASAVA_Build 5 102120362 1D GCAAGACCCT G/- TCTCAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 G 1 0 26001 CASAVA_Build 5 102120934 1I CTCAAAAAAA -/C GATAAAACTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 0 1 26002 CASAVA_Build 5 102122789 5I AACCTCAGAA -----/GATAT GATAGGATAG 3070 het 2729 hom 34 9 21 4 GATAT 0 1 26003 CASAVA_Build 5 102132102 5I AACCTCTCCA -----/CTTCC CTTCCCGGTC 3070 het 3070 ref 46 20 14 12 CTTCC 1 2 26004 CASAVA_Build 5 102138972 9D TGGGATACAT GTGCAGGAC/--------- GTGCAGGTTT 3070 het 1626 hom 19 5 12 2 GTGCAGGAC 1 0 26005 CASAVA_Build 5 102148872 1D AGAAAAGGGA G/- GGGGGAGTCC 3070 het 1728 hom 21 7 9 5 G 6 5 26006 CASAVA_Build 5 102149261 4D TTTCTTTCTG AGTT/---- AGTTAAGTGA 3070 het 3070 ref 40 20 15 8 AGTT 2 1 26007 CASAVA_Build 5 102149475 4D TTTTTAAAAA TCAT/---- TCATTCAAGT 3070 het 3070 ref 43 24 15 7 TCAT 2 1 26008 CASAVA_Build 5 102154380 1D AGCAATTATA T/- TTCCCCCCAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 3 2 26009 CASAVA_Build 5 102158158 1I AGGTTAGGTG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 9 26010 CASAVA_Build 5 102158532 17D GTGGCTCACA CCTGTAATCCTAGCACT/----------------- CTGGCAGGCT 3070 het 3070 ref 31 15 16 1 CCTGTAATCCTAGCACT 1 0 26011 CASAVA_Build 5 102165603 5D GGATGGTCTC GATCT/----- GATCTCCTGA 1379 het 974 hom 5 2 3 1 GATCT 2 1 26012 CASAVA_Build 5 102166886 1I AGACGAGGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 45 10 29 6 T 8 9 26013 CASAVA_Build 5 102181334 1D CCAAAACATG T/- TATCAGATCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 1 26014 CASAVA_Build 5 102186491 2D GACTCCTGCT AC/-- ACATGTGCCC 3070 het 3070 ref 55 26 19 10 AC 2 1 26015 CASAVA_Build 5 102188388 1D CAAATCACTT A/- AAAAATTCAC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 6 5 26016 CASAVA_Build 5 102191043 1D CATTTTAGTA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 8 7 26017 CASAVA_Build 5 102194675 6D4M2D CACTTGGAGG CCATAAATTTGA/------ATTT-- CATCCTTCAA 3070 hom 81 het 31 0 28 7 N/A 0 0 26018 CASAVA_Build 5 102195041 2D TTTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 11 9 26019 CASAVA_Build 5 102204652 2I ACTTTGTCTC --/TT TTGGTATAGG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 4 26020 CASAVA_Build 5 102208310 1I ACAAAAAAAA -/T GAATGGGCTC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 0 1 26021 CASAVA_Build 5 102225877 1D TAACTATAAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 9 8 26022 CASAVA_Build 5 102226605 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 A 9 10 26023 CASAVA_Build 5 102227365 1D CCAGAATTAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 1921 hom 20 5 13 2 A 8 7 26024 CASAVA_Build 5 102232999 1I AAGAATGTAG -/A TGCTTGGTGA 3070 het 3070 hom 54 21 26 7 A 0 1 26025 CASAVA_Build 5 102233975 1D GAGGTGGAAA G/- AACCTTAGAC 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 G 1 0 26026 CASAVA_Build 5 102238793 3D AATTATTATC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 1669 hom 19 6 8 10 ATT 7 6 26027 CASAVA_Build 5 102240467 5D GCAGCCTTGA GTCTT/----- GTCTTCTCAA 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 GTCTT 2 1 26028 CASAVA_Build 5 102244392 4D TAAAATCAAT AAAA/---- AGAAATGAAG 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 A 5 1 26029 CASAVA_Build 5 102245514 1D CTTAACTCCC A/- ACTTATGAGT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 A 2 1 26030 CASAVA_Build 5 102258597 2D ATTTTCCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 16 9 A 12 10 26031 CASAVA_Build 5 102262955 1D TTAATTTTTT A/- AATCAAGAAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 3 2 26032 CASAVA_Build 5 102263859 1I TGTGTGTGTG -/T GGGGGGGGGC 2937 het 575 hom 18 5 9 4 T 0 1 26033 CASAVA_Build 5 102269892 1I CCTACCACCT -/C CCTCCCAGCT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 C 2 3 26034 CASAVA_Build 5 102281771 1D TGACCCATGT A/- AAGAAAGTGA 3070 het 3070 hom 45 17 19 10 A 3 2 26035 CASAVA_Build 5 102286420 12D AGCTAACAGC AGTGATATACAA/------------ AGTTCAACAC 3070 het 3070 ref 40 22 16 11 AGTGATATACAA 1 0 26036 CASAVA_Build 5 102309387 1I TGAGTACTGA -/T TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 3 4 26037 CASAVA_Build 5 102309594 2I AAAGTCAGAG --/CA CACACTGCAA 3070 het 3070 hom 54 22 27 5 CA 2 3 26038 CASAVA_Build 5 102312936 6D GTTTATGAAT AAAATA/------ AAAATATAAG 3070 het 3070 ref 36 21 13 4 AAAATA 2 1 26039 CASAVA_Build 5 102317654 1I AAAAAATATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 8 9 26040 CASAVA_Build 5 102324380 2I ATTCTGGCCA --/TT TTTATTAAGA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 3 5 26041 CASAVA_Build 5 102328352 2D ATATGTAAAG CA/-- CATTATTTTA 3070 het 3070 ref 30 14 12 6 CA 2 1 26042 CASAVA_Build 5 102330597 1D AATTAGATAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 15 18 7 T 10 9 26043 CASAVA_Build 5 102334389 1D CTAAAAGGGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 21 10 7 4 T 9 8 26044 CASAVA_Build 5 102334755 1I ATGTTTGACT -/A GGAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 A 0 1 26045 CASAVA_Build 5 102337424 4I TTTCCGTATC ----/AATT AAACTATACT 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 AATT 0 1 26046 CASAVA_Build 5 102355951 1I TGTAAAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 9 10 26047 CASAVA_Build 5 102356091 1I CTGTTAGTTA -/T TTTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 T 6 7 26048 CASAVA_Build 5 102364559 1D ATAGGAGAAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 A 9 8 26049 CASAVA_Build 5 102369976 2D TATTTTTAAA AG/-- AAGTTATATC 3070 het 3070 ref 35 21 14 0 AG 1 0 26050 CASAVA_Build 5 102371797 5I AATTCAGACT -----/AATAA AATAAAATAC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 AATAA 1 2 26051 CASAVA_Build 5 102385837 1D GAAACACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 11 10 26052 CASAVA_Build 5 102392442 2I AGGTAACAGA --/AT CATTGCTGCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AT 0 1 26053 CASAVA_Build 5 102393326 2I ATTAGCTGTC --/AG AGTGTATTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AG 1 2 26054 CASAVA_Build 5 102395843 2D AATAGAACTC TT/-- TTTGTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 11 26 4 T 5 3 26055 CASAVA_Build 5 102396640 1I37M5D AGTAACTGCA -GGTGTTTAATAAAGATTTGTTGACTTAAAAAAAAAGAATATT/GGGTGTTTAATAAAGATTTGTTGACTTAAAAAAAAAGA----- ATATAATTCT 3070 het 3070 hom 33 24 23 0 N/A 0 0 26056 CASAVA_Build 5 102398711 1D GCTTCCTAGG T/- CCCCAACAGT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 1 0 26057 CASAVA_Build 5 102402077 1D CATTAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2533 hom 25 8 11 6 T 15 14 26058 CASAVA_Build 5 102403122 2I TAGGGGATTA --/AC ACAACAGGGC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 AC 1 2 26059 CASAVA_Build 5 102403711 4D AAAAATTTAA AGAG/---- AGAGACTCCC 3070 het 3070 ref 27 18 8 3 AG 4 2 26060 CASAVA_Build 5 102404250 1I AAGAAAACAG -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 55 28 25 2 A 6 7 26061 CASAVA_Build 5 102407261 1I TTTTCAAGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 8 9 26062 CASAVA_Build 5 102421474 2D CAGCAGGCAA AC/-- AGAGAGCTTG 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 AC 1 0 26063 CASAVA_Build 5 102421671 1D ACATAATTTT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 7 6 26064 CASAVA_Build 5 102422264 11I TTTGGTTCTA -----------/AGATCACCTTG ATAACTTTGC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 AGATCACCTTG 0 1 26065 CASAVA_Build 5 102423388 5D GCAAAGCTTT TGTTG/----- TGTTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 22 12 8 TGTTG 2 1 26066 CASAVA_Build 5 102424859 4D TGTAACAGAT ACTA/---- ACTATTTCTC 3070 het 3070 hom 67 31 29 9 ACTA 2 1 26067 CASAVA_Build 5 102433484 3I AAAAAACGAG ---/AAC AACAACAACA 3070 het 2073 hom 26 6 13 7 AAC 5 6 26068 CASAVA_Build 5 102433682 1D CAGAATTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 23 12 7 A 12 11 26069 CASAVA_Build 5 102434860 1D TAGCAATGTT G/- GAACATTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 G 2 1 26070 CASAVA_Build 5 102439344 4I CCAATGAACC ----/TCTT TCTTTAGTAA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 TCTT 1 2 26071 CASAVA_Build 5 102441362 2D TATTGGGTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AT 6 5 26072 CASAVA_Build 5 102444099 1I TCATTCTTTT -/G TGGTCCCACT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 G 0 1 26073 CASAVA_Build 5 102445915 1D ATTTCTTTTT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 8 7 26074 CASAVA_Build 5 102446831 1D AGGTCCTTTT C/- CCTCTCTTCC 3070 het 3070 ref 58 33 19 6 C 3 2 26075 CASAVA_Build 5 102449113 3I AAAAGTTTTG ---/TTT TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 7 10 26076 CASAVA_Build 5 102456305 1I ATTCCAACAC -/T TTGGGAGGTC 3070 hom 122 het 48 0 41 8 T 2 3 26077 CASAVA_Build 5 102460672 3D AGCAGTTAAG ACT/--- ACAGATTTGA 3070 het 3070 hom 47 20 25 4 ACT 1 0 26078 CASAVA_Build 5 102461941 3I TAAACCTTAC ---/AAA AAGTTTTTGA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 2 5 26079 CASAVA_Build 5 102462650 1D GGCTCATAAA T/- TTGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 3 2 26080 CASAVA_Build 5 102473804 1D AATAAGACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 10 9 26081 CASAVA_Build 5 102474786 1I CTCAACTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 10 11 26082 CASAVA_Build 5 102475671 1I CCTATAGTAC -/A AAGGGACAAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 3 26083 CASAVA_Build 5 102475917 3I TGTCTTGGCT ---/CAA CAACAGAACT 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 CAA 1 2 26084 CASAVA_Build 5 102477687 1D TGGAATGAAC T/- TTTATTGCTA 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 T 4 3 26085 CASAVA_Build 5 102479320 1D ATTAAAACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 10 9 26086 CASAVA_Build 5 102480990 1I TTAAAAACAA -/T TGCCAACGCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 1 2 26087 CASAVA_Build 5 102482377 45I AAGCCCATAC ---------------------------------------------/ATACACTACATGGTCCCTAGAAACAACGTATTTGAAAAGTAGTTA ATATGAGAAA 3070 het 3070 ref 15 10 7 2 ATACACTACATGGTCCCTAGAAACAACGTATTTGAAAAGTAGTTA 0 1 26088 CASAVA_Build 5 102482626 1D TTGTAGTTTT G/- CAAGAGGAAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 G 1 0 26089 CASAVA_Build 5 102487028 1D AGGCAAAATA T/- TGGGCCCCAC 3070 het 3070 hom 46 15 24 9 T 2 1 26090 CASAVA_Build 5 102490964 1I TTTATTGGTG -/T GTTTATCACA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 0 1 26091 CASAVA_Build 5 102501515 2I CCATTTAATC --/TT GTCACTGTAT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 0 2 26092 CASAVA_Build 5 102503753 1D GGAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 41 0 24 17 A 17 16 26093 CASAVA_Build 5 102507760 1I AAAAGAAACT -/A AAAAAAAAAA 2535 het 2535 ref 33 16 7 10 A 11 12 26094 CASAVA_Build 5 102509277 1D GTGGGAGCTT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 A 8 7 26095 CASAVA_Build 5 102509386 4I ATAGCAACAC ----/AGTT AGATAGAATA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 AGTT 0 1 26096 CASAVA_Build 5 102526863 12I ATTTAGATAT ------------/CTTTCAATAATA TCTTTAATAT 3070 het 3070 ref 25 13 12 2 CTTTCAATAATA 0 1 26097 CASAVA_Build 5 102527267 3I TATAGCTGCC ---/CTT CTTCAAAATA 3070 het 3070 hom 25 8 16 1 CTT 1 2 26098 CASAVA_Build 5 102536556 3I TTGTTCAGTT ---/CCA CCACCACAAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 CCA 2 3 26099 CASAVA_Build 5 102540470 1I TTTAAAGACC -/A ATGATTCTCA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 1 2 26100 CASAVA_Build 5 102562692 2D TTCTTTACAC AT/-- AGTTATCCTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AT 1 0 26101 CASAVA_Build 5 102567936 4I GCCTATATTC ----/TTAG TTAGTTGGGG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 TTAG 1 2 26102 CASAVA_Build 5 102579689 28I AAATGTTATC ----------------------------/TTTAAGTTGAACTTAAATGCTCACAGAG TTTGAATTTG 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 TTTAAGTTGAACTTAAATGCTCACAGAG 0 1 26103 CASAVA_Build 5 102585663 1I TCTAACACAT -/A TTTTTGATAG 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 0 1 26104 CASAVA_Build 5 102587736 1I TTGGAGAGTG -/C CCTAGCAGTG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 2 3 26105 CASAVA_Build 5 102588279 1I GGGAAGAGGT -/G GGGAGGGCAC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 3 4 26106 CASAVA_Build 5 102593270 5I TATACACACA -----/CAGAG CAAACAGACA 2737 het 2665 hom 15 7 6 2 CAGAG 0 1 26107 CASAVA_Build 5 102606078 2I CTAAGACAAG --/TA TTTAATGATT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 TA 0 1 26108 CASAVA_Build 5 102614276 4I TTATGAATCA ----/TGCT TGCTTTTTGT 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 TGCT 1 2 26109 CASAVA_Build 5 102616890 2I AGAAAGAAAT --/CA CATAGGCCAA 3070 het 3070 hom 52 25 26 1 CA 1 2 26110 CASAVA_Build 5 102619022 1I TAATTTATGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 8 9 26111 CASAVA_Build 5 102625904 1D ACACCCGAAG A/- AAGAACTCAG 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 A 3 2 26112 CASAVA_Build 5 102635964 2I CTTTAGTGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 13 15 26113 CASAVA_Build 5 102655961 7D TATATTTTTA TTTTTAT/------- TTTTTATTTT 1456 het 996 hom 7 2 3 2 TTTTTAT 3 2 26114 CASAVA_Build 5 102662228 1I ATTGCTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 T 11 12 26115 CASAVA_Build 5 102666056 3D TGCTGGCTGG AGC/--- TGTGTTTGTC 3070 het 3070 ref 44 20 13 12 AGC 1 0 26116 CASAVA_Build 5 102667463 4D TTTCCATGGC AGTT/---- AGAGTGAGCT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 AGTT 1 0 26117 CASAVA_Build 5 102693249 1D TCTTAATAAC T/- CTCTTTAAAG 3070 hom 75 het 26 0 25 1 T 1 0 26118 CASAVA_Build 5 102693906 1D GGACAACAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 A 10 9 26119 CASAVA_Build 5 102709710 1I TCAAACAGTG -/T TTTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 6 7 26120 CASAVA_Build 5 102720011 1I TTAAATGCTG -/A AAAAAAATCA 3040 het 3040 ref 37 22 8 9 A 7 8 26121 CASAVA_Build 5 102720086 1D GAGTTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 201 hom 32 2 21 9 T 15 14 26122 CASAVA_Build 5 102721446 1D TGTAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 23 4 12 7 T 12 11 26123 CASAVA_Build 5 102732575 1D TGTTTTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 11 10 26124 CASAVA_Build 5 102739424 1I ACTTCTGGGA -/C CCCCTGCCTG 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 C 4 5 26125 CASAVA_Build 5 102747161 4I TCCGAGAGAC ----/TGTT TGTTATTATT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 TGTT 1 2 26126 CASAVA_Build 5 102760146 1D CGTGCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 14 14 T 13 12 26127 CASAVA_Build 5 102762655 1I GCCTTGGCTA -/C CAGGAAACTT 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 C 1 2 26128 CASAVA_Build 5 102770697 1D GTAGTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 22 11 16 T 15 14 26129 CASAVA_Build 5 102775056 1D GCAGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 8 A 13 12 26130 CASAVA_Build 5 102779107 1D CCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 22 1 14 7 T 13 12 26131 CASAVA_Build 5 102780041 1I GTGTGTGGAG -/C GGGGAGTTGG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 C 0 1 26132 CASAVA_Build 5 102793641 1D CTCAAAAAAA G/- GGGGGGGGGG 1327 het 981 hom 21 4 4 13 G 11 10 26133 CASAVA_Build 5 102806137 4I AATTTAATAA ----/GTAT GTATAATACA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 GTAT 1 2 26134 CASAVA_Build 5 102879147 1I CAGTACATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 37 0 28 9 A 9 10 26135 CASAVA_Build 5 102887693 3D GTTCCTGGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 29 11 10 9 TTG 7 6 26136 CASAVA_Build 5 102895650 1D TGGAATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 A 11 10 26137 CASAVA_Build 5 102903698 2I ATCAATCTTA --/TG TGTTAGCTCA 3070 hom 112 het 44 0 38 6 TG 1 2 26138 CASAVA_Build 5 102910034 1D GGTGTTTTTT G/- GAAATAATAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 G 2 1 26139 CASAVA_Build 5 102918460 1I GGATCTGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 40 1 35 4 A 10 11 26140 CASAVA_Build 5 102924192 1I ACTTCACGAT -/G GGGTGGGGAC 3070 hom 69 het 28 0 22 6 G 3 4 26141 CASAVA_Build 5 102931021 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 488 hom 26 3 20 3 A 13 12 26142 CASAVA_Build 5 102942317 8I GCAAAAAGCT --------/TATAAAAA TATTACCATA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 TATAAAAA 0 1 26143 CASAVA_Build 5 102945230 1D TTTTCAGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 T 10 9 26144 CASAVA_Build 5 102954291 1D TAGCTTTCTT G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 9 8 26145 CASAVA_Build 5 102961943 1D ACTTCAAATA T/- TTTTAATGTC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 5 4 26146 CASAVA_Build 5 102970058 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 40 1 27 12 T 10 11 26147 CASAVA_Build 5 102973091 1D TTGTCCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 11 10 26148 CASAVA_Build 5 102973313 1D GATTTGTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 T 10 9 26149 CASAVA_Build 5 102984319 1D CATTTCTGTG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 T 8 7 26150 CASAVA_Build 5 102984685 1I ATCTCTACTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 9 10 26151 CASAVA_Build 5 102991472 1I TGTTTAATTA -/C CATATGAATT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 C 1 2 26152 CASAVA_Build 5 103007599 1D CAACATGGTG A/- AAACCCCATC 1861 het 1457 hom 10 3 4 3 A 4 3 26153 CASAVA_Build 5 103023652 1I AAATTAAAAC -/A AAGTAAAACT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 3 26154 CASAVA_Build 5 103035109 1D GTATCCTGTG A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 7 6 26155 CASAVA_Build 5 103044313 1I AAAGAATTAG -/T TGCATTAATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 2 26156 CASAVA_Build 5 103051977 3D GCATCTTAAT AAC/--- AAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 AAC 1 0 26157 CASAVA_Build 5 103053058 3I ATAAAATAAA ---/TAG TAGAGTTATT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TAG 1 2 26158 CASAVA_Build 5 103053731 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAA 3070 het 3038 hom 20 7 11 2 T 5 6 26159 CASAVA_Build 5 103061866 1I AAAAAACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2980 hom 32 10 17 5 T 11 12 26160 CASAVA_Build 5 103063465 1D TCTTTGCGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 16 20 8 T 10 9 26161 CASAVA_Build 5 103064540 5D ATCAATAAAC ATCTT/----- ATACATTTTC 3070 het 3070 hom 56 19 26 12 ATCTT 1 0 26162 CASAVA_Build 5 103069835 4D TTATATTATG CTTT/---- CTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 CTTT 2 1 26163 CASAVA_Build 5 103069918 5I TTGTAGATCT -----/TAAAC TAAATAAAGC 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 TAAAC 0 1 26164 CASAVA_Build 5 103074272 1D TTATTTCACA T/- TTTTTTTTTA 2178 het 1834 hom 13 4 5 4 T 10 9 26165 CASAVA_Build 5 103074891 4D CTGCATGTGA TTGT/---- TTGCTTCCTT 3070 het 3070 hom 50 19 23 11 TTGT 1 0 26166 CASAVA_Build 5 103076725 1D CCAGAGCACC T/- TTTTTTTTTT 3065 het 3065 ref 34 11 11 12 T 13 12 26167 CASAVA_Build 5 103081113 1D TCCCTCTCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 T 10 9 26168 CASAVA_Build 5 103089065 1D TTTAACTTGG A/- ACCACCAAAT 2749 het 2749 ref 36 23 8 6 A 2 1 26169 CASAVA_Build 5 103092751 2D AGACTATCAT GA/-- CTACCTTGGG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 GA 1 0 26170 CASAVA_Build 5 103100453 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1856 het 51 hom 11 1 7 3 A 13 14 26171 CASAVA_Build 5 103107090 2I GCTAGGTAAC --/AG AAAAACGGTG 3070 het 3070 hom 59 23 25 11 AG 0 1 26172 CASAVA_Build 5 103111792 1I ACAAAAAATT -/A GCCGGGGCAT 2314 het 2314 ref 17 7 5 5 A 0 1 26173 CASAVA_Build 5 103111957 1I AAGAAAAATA -/T TTTTTTTCCC 2303 het 1727 hom 17 7 8 2 T 7 8 26174 CASAVA_Build 5 103119814 1I ATAATTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2644 het 2207 hom 25 7 8 10 A 15 16 26175 CASAVA_Build 5 103125535 1D CCACTTATTA C/- CAGGTGTATG 3070 het 3070 hom 58 17 34 7 C 2 1 26176 CASAVA_Build 5 103129344 14I TAAGGCAGGC --------------/AGGTGAAAAATTAG ATTAGAGATA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 AGGTGAAAAATTAG 0 1 26177 CASAVA_Build 5 103129511 6D5M8I TTCTCTTAAT AGAGAAATTAA--------/------ATTTATTTCCGTT CAGAGTCCTC 3070 hom 81 het 31 0 28 6 N/A 0 0 26178 CASAVA_Build 5 103132816 3D ACAAAAATGA CTG/--- CTATTCACCA 3070 het 3070 ref 41 27 11 3 CTG 1 0 26179 CASAVA_Build 5 103149399 3I AAGTATTGGT ---/AGG AGGTGCATAA 3070 hom 154 het 55 0 52 3 AGG 1 2 26180 CASAVA_Build 5 103159597 8D CTCCAAAAAA AAAAAAAG/-------- AAAAAAGAAA 2390 het 2390 ref 22 13 8 8 AAAAAAAG 1 0 26181 CASAVA_Build 5 103166116 1D CCTCACTGCC T/- GTATTCTTAA 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 T 1 0 26182 CASAVA_Build 5 103167060 1I TAATACATAC -/T TTTTAATAAG 3070 hom 68 het 38 0 29 9 T 4 5 26183 CASAVA_Build 5 103169187 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 10 9 26184 CASAVA_Build 5 103169871 9D TCATCTGGTT TTGTTGTTG/--------- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 45 18 25 6 TTG 6 3 26185 CASAVA_Build 5 103171261 1D GCTGTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 8 A 12 11 26186 CASAVA_Build 5 103172835 4I AAAGAGTATC ----/TCTT TCTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 TCTT 1 2 26187 CASAVA_Build 5 103177416 2D TTTTTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 9 10 T 13 11 26188 CASAVA_Build 5 103183174 1D AGATGTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 24 13 7 4 T 10 9 26189 CASAVA_Build 5 103201636 8I TCCATATCTT --------/AAACAAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 AAAC 3 5 26190 CASAVA_Build 5 103202459 5I TAACAACCCT -----/TATAG TATGAGATTT 3070 het 3070 ref 43 27 16 0 TATAG 0 1 26191 CASAVA_Build 5 103202857 1I AGCCTGGTGC -/G GGGATCACTG 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 G 3 4 26192 CASAVA_Build 5 103203167 3D AGACATGTTA TTT/--- TTTACATTAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 9 T 6 3 26193 CASAVA_Build 5 103215007 3D GTAGCTAATT ATC/--- ATTTTAGTCA 3070 hom 47 het 35 0 13 30 ATC 1 0 26194 CASAVA_Build 5 103216875 1I TCAACTTGCA -/C CTTTTATGTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 1 2 26195 CASAVA_Build 5 103217849 1D GCAACCTCAG C/- CTTTCTACCT 3070 het 1304 hom 11 3 8 0 C 2 1 26196 CASAVA_Build 5 103226347 1I CAAATATATT -/C TTTTTTTTGC 3070 hom 102 het 36 0 33 3 C 0 1 26197 CASAVA_Build 5 103249023 1I TTTTATGCTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 7 8 26198 CASAVA_Build 5 103253653 1D TCTTGATATG A/- ACCTTTGTCT 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 A 2 1 26199 CASAVA_Build 5 103261024 6I ATAATATCTA ------/TATATC TATATCTATA 3070 het 3070 ref 30 16 7 7 TATATC 2 3 26200 CASAVA_Build 5 103277263 1I ATTCTACTTG -/T TTTTTTAGAT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 6 7 26201 CASAVA_Build 5 103281956 4D AAATCTGTTA TGTG/---- AGTATTTACT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 TG 2 0 26202 CASAVA_Build 5 103293870 1I CTAGAGAAGG -/A AAAACTTTCA 3070 het 3070 hom 33 10 22 1 A 4 5 26203 CASAVA_Build 5 103294130 1I ATAATAACTC -/A AAACTTGATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 26204 CASAVA_Build 5 103311896 5D TTGGTATATT TAATC/----- TAATCTATTA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TAATC 2 1 26205 CASAVA_Build 5 103314397 1I AGTGTCTCAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 8 9 26206 CASAVA_Build 5 103322856 1D TAAGTTAACT G/- TATTCTAGAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 G 1 0 26207 CASAVA_Build 5 103337144 1D GGAGCCTGAA G/- GGGCTTGGTA 3070 het 3070 ref 42 19 16 8 G 4 3 26208 CASAVA_Build 5 103343978 1I AACAGGTATT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 2293 hom 36 7 26 3 C 0 1 26209 CASAVA_Build 5 103347916 3D GTTTTGAATT ATG/--- ATGAATTTAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 ATG 2 1 26210 CASAVA_Build 5 103349205 2I TTCACAGAGG --/GA GATATGGATT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 GA 1 2 26211 CASAVA_Build 5 103352569 9I ACTCAGTGAG ---------/AAGAGATAC AAGAGATACA 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 AAGAGATAC 1 2 26212 CASAVA_Build 5 103355037 1D TACATGAATC T/- TTTTTGGGAA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 6 5 26213 CASAVA_Build 5 103363142 3D AATAGAAATC TAA/--- AAAAAAAAAA 1663 het 523 hom 9 3 5 1 TAA 1 0 26214 CASAVA_Build 5 103363572 1I TTCACAGATT -/A AAAAAAAAAA 1369 het 1369 ref 30 12 5 13 A 15 16 26215 CASAVA_Build 5 103367477 1D ACATTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2760 hom 27 11 10 6 A 15 14 26216 CASAVA_Build 5 103379856 1D GGCCACGTTT G/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 G 1 0 26217 CASAVA_Build 5 103382469 4I TTCAAGTTTG ----/TTGA TTATTTTGTC 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 TTGA 0 1 26218 CASAVA_Build 5 103383392 1D AATCAAACTG T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 T 7 6 26219 CASAVA_Build 5 103386550 4D CTGTTCTGGT TATC/---- TATCTATCTG 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 TATC 3 2 26220 CASAVA_Build 5 103388796 1D CTGAGACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 819 hom 30 3 21 6 T 12 11 26221 CASAVA_Build 5 103395450 2I TTAACTGATG --/AC ACTGTCTTGT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AC 1 2 26222 CASAVA_Build 5 103415118 2D CAGATGTGAG AC/-- ACAAACAAAT 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 AC 2 1 26223 CASAVA_Build 5 103425848 1I CTCAGCTCTC -/T TAAATTTGTT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 1 2 26224 CASAVA_Build 5 103434075 1I GGCTCAGAGG -/C CCTGACAATA 1888 het 1888 ref 23 13 4 6 C 2 3 26225 CASAVA_Build 5 103454654 1I GGCAAGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2390 hom 26 8 11 7 T 13 14 26226 CASAVA_Build 5 103466146 3D GGTGGAGATA ATT/--- ATTCTACTGA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 ATT 2 1 26227 CASAVA_Build 5 103466421 4D TTCTACAGAC TTTT/---- TTTAAGTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 20 4 T 7 3 26228 CASAVA_Build 5 103473195 1D CATATATAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 10 9 26229 CASAVA_Build 5 103474740 8D CTGGAAGTTA CAAGCCTT/-------- CAATAGAACC 1273 het 1273 ref 30 18 4 9 CAAGCCTT 1 0 26230 CASAVA_Build 5 103480689 1D GCTGCAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 9 26231 CASAVA_Build 5 103483295 2I TGAAATAAAT --/TA TGTTTTATTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TA 0 1 26232 CASAVA_Build 5 103487733 4D AAATAGAACT GTAA/---- GTATGTACCA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 GTAA 1 0 26233 CASAVA_Build 5 103492570 1D AATAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 34 0 29 5 A 12 11 26234 CASAVA_Build 5 103493585 1D TCACTGGACA C/- TAAACTTGCT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 C 1 0 26235 CASAVA_Build 5 103501198 1D ATCTATGGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 98 hom 31 1 11 19 A 10 9 26236 CASAVA_Build 5 103502264 4D TTATCAACTT AAAC/---- AAAATTTTAA 3070 het 3070 ref 41 28 10 4 AAAC 1 0 26237 CASAVA_Build 5 103502457 4D AGCCATCTTT ACTC/---- ACTCACAAGT 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 ACTC 2 1 26238 CASAVA_Build 5 103508250 1I TTTTTTTTTT -/C CTCTCAGGAA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 C 1 2 26239 CASAVA_Build 5 103508516 3I AAGCTAAATT ---/ATA ATAAATCTTA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 ATA 1 2 26240 CASAVA_Build 5 103512534 1I AACTAAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 9 10 26241 CASAVA_Build 5 103514412 1D AATTCTTACC T/- TTCCTTACTA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 3 2 26242 CASAVA_Build 5 103516385 2D ACTTTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 102 het 42 0 34 9 TA 6 5 26243 CASAVA_Build 5 103517601 1D TTGTTTCTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 10 9 26244 CASAVA_Build 5 103519083 4D TTTTCAGTTC TCTA/---- TCTTTGTTTC 3070 het 3070 hom 33 18 15 2 TCTA 1 0 26245 CASAVA_Build 5 103530195 4D AAAAAAACTA TATT/---- TATTACTAAT 3070 het 1958 hom 26 6 14 6 TATT 2 1 26246 CASAVA_Build 5 103534000 2I AAATACAATC --/AT GTGAATATTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 0 1 26247 CASAVA_Build 5 103549406 1D CTCCTAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 32 2 22 8 A 13 12 26248 CASAVA_Build 5 103566281 3I AAAATATTGT ---/ATA ATATTTATAA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 ATA 1 2 26249 CASAVA_Build 5 103611490 5I ATAGAGAAAA -----/TAAGT TAATCATGAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TAAGT 0 1 26250 CASAVA_Build 5 103616863 1D24M1I ATACCTTCAA TTTTTTTTTGGACATTAGTGTTTTG-/-TTTTTTTTGGACATTAGTGTTTTGT TTTTTTTCCC 3070 hom 148 het 46 0 50 7 N/A 0 0 26251 CASAVA_Build 5 103623595 4D TGTATTTTTC TTAA/---- TTAATTTAAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTAA 2 1 26252 CASAVA_Build 5 103636935 1D TGTGCCATTT A/- AAAAATAGTT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 A 6 5 26253 CASAVA_Build 5 103638721 1D GTAGGATAAT A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 8 7 26254 CASAVA_Build 5 103640760 1I CACAATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 33 2 25 6 A 11 12 26255 CASAVA_Build 5 103641310 1D TTAATAGCTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 8 7 26256 CASAVA_Build 5 103642397 2D CAAAATTAAT AA/-- AAGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 51 29 15 8 A 4 2 26257 CASAVA_Build 5 103644580 2D TTTGATAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 30 1 25 5 T 15 13 26258 CASAVA_Build 5 103651002 8I GCTAACTTTA --------/TTTATTTT TTTTTTTTAC 3070 hom 77 het 30 0 26 4 TTTATTTT 0 1 26259 CASAVA_Build 5 103652607 3I AGCCATCTGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 67 het 31 0 21 10 TTG 5 6 26260 CASAVA_Build 5 103656532 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2919 het 449 hom 8 1 6 1 A 15 14 26261 CASAVA_Build 5 103657255 1I ATATGAAACC -/A AAATTGAGCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 3 4 26262 CASAVA_Build 5 103657590 1D AGATGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 14 8 T 11 10 26263 CASAVA_Build 5 103657778 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 9 10 26264 CASAVA_Build 5 103666027 1I TATTTGGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 10 26265 CASAVA_Build 5 103669127 4D CCTTCCATTC TCTG/---- TCTATGTTGT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TCTG 1 0 26266 CASAVA_Build 5 103673887 1I AGTACTGAAA -/T ATATAAATAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 0 1 26267 CASAVA_Build 5 103687632 4I TAGGGCTGCA ----/CTCT CTCTCTGAAG 3070 hom 131 het 53 0 42 11 CT 3 5 26268 CASAVA_Build 5 103700439 1I TTAGATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 40 0 31 9 T 10 11 26269 CASAVA_Build 5 103706276 2I ATATAAACAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AT 5 6 26270 CASAVA_Build 5 103707683 2D1M3I ATTTTCTCAC CTT---/--TACA GTAGATGTCA 3070 hom 120 het 46 0 41 10 N/A 0 0 26271 CASAVA_Build 5 103713963 3I CCAATTATTC ---/CTT CTTCAGCTAG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 CTT 1 2 26272 CASAVA_Build 5 103727985 1I ATTGTGAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 9 10 26273 CASAVA_Build 5 103730960 1D CATTTTTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 T 10 9 26274 CASAVA_Build 5 103735332 13D TGCCACCAGG CCAGCTAATTTTT/------------- CCAGCTAATT 3070 hom 29 het 13 0 10 3 CCAGCTAATTTTT 2 1 26275 CASAVA_Build 5 103736910 1I AGTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 11 12 26276 CASAVA_Build 5 103739761 5I ATATTTTTAT -----/TAAAA TAAAGTTAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TAAAA 0 1 26277 CASAVA_Build 5 103743100 2D GATATATGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1575 hom 40 het 31 0 14 18 TG 6 5 26278 CASAVA_Build 5 103800702 4D CTAGAGAACC CTGA/---- CTAATACATC 3070 het 3070 ref 16 9 7 0 CTGA 1 0 26279 CASAVA_Build 5 103820204 4D TCTGTAAGTA AAAT/---- AAATATATTC 3070 het 3070 ref 38 25 9 5 AAAT 2 1 26280 CASAVA_Build 5 103824514 1D TAAATTTTTG C/- CCAGACTAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 1 C 3 2 26281 CASAVA_Build 5 103826453 1I TTGTCTACTA -/T TTTTGGGTTC 3070 hom 92 het 37 0 30 7 T 4 5 26282 CASAVA_Build 5 103826965 4D AACTTTCATG TTTC/---- TTTGTTGATT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TTTC 1 0 26283 CASAVA_Build 5 103828858 2I ATATATACTG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 9 11 26284 CASAVA_Build 5 103833356 4I TTTGAGATTT ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TTTG 1 2 26285 CASAVA_Build 5 103833539 3I TTTAAAACTC ---/GTT GGTTATTCAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GTT 0 1 26286 CASAVA_Build 5 103834725 4D3M1I47M5I ACACTCACAC ACTTATA-TTATAAAACAATATATATATTTCTTATATATAAAAATGTATATATAA-----/----ATACTTATAAAACAATATATATATTTCTTATATATAAAAATGTATATATAATAAAG TACTCAGTAA 3070 hom 33 het 10 0 12 3 N/A 0 0 26287 CASAVA_Build 5 103835107 5I AATTTGATAA -----/TCTTT TCTTTCTAAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TCTTT 1 2 26288 CASAVA_Build 5 103837589 2D ATTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 59 het 24 0 19 6 A 11 9 26289 CASAVA_Build 5 103838143 1D AAAATGAATC T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 141 het 55 0 48 8 T 7 6 26290 CASAVA_Build 5 103845480 9D ATTATTTTCT TCAGTTAAA/--------- TGGTTGTATA 2802 het 2802 ref 16 7 7 4 TCAGTTAAA 1 0 26291 CASAVA_Build 5 103845607 5I AGACTTGATT -----/GTTAA GTTAAGTTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 GTTAA 1 2 26292 CASAVA_Build 5 103845918 4I TTAACCCAAC ----/AGTA AGTAAGTTTT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 AGTA 1 2 26293 CASAVA_Build 5 103846966 4D GTATAGGAAT TTAA/---- TTAATTAATT 3070 hom 69 het 32 0 24 10 TTAA 4 3 26294 CASAVA_Build 5 103847087 4I ATTAACTGAT ----/AAAG AAAATACTGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AAAG 0 1 26295 CASAVA_Build 5 103847306 4I ATGCTGAAAT ----/TTTA TTTATTTTTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TTTA 1 2 26296 CASAVA_Build 5 103848681 5I GCTTTTACTC -----/AAAAG AAAAGAATAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAAG 1 2 26297 CASAVA_Build 5 103850435 4D AATGTCTGTG AAGA/---- GAGAGAACGT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AAGA 1 0 26298 CASAVA_Build 5 103851278 4D GTATTTTATA AGTG/---- AGTGAAGTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AGTG 2 1 26299 CASAVA_Build 5 103852703 1D ATTATTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 T 10 9 26300 CASAVA_Build 5 103852939 1I TCTACATCCC -/T TGAGGCACTG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 1 2 26301 CASAVA_Build 5 103855168 5D AATAAAATAA AAAAG/----- AATTTCCAAA 425 het 285 hom 7 3 4 0 AAAAG 1 0 26302 CASAVA_Build 5 103856497 1I GCTATCCTTT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 7 8 26303 CASAVA_Build 5 103859362 1I AAGTTAGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 11 12 26304 CASAVA_Build 5 103872486 2I TGTCTAAGAC --/AG GGGGAATGAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AG 0 1 26305 CASAVA_Build 5 103873461 4I TTTTTTTTTC ----/ATTT ATTTATCTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 ATTT 1 2 26306 CASAVA_Build 5 103874025 1I TTATTTGGGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 7 8 26307 CASAVA_Build 5 103904842 1D AGGTCATTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 10 9 26308 CASAVA_Build 5 103922185 3D TCCTGTATAC TCT/--- TCAACTATTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 TCT 1 0 26309 CASAVA_Build 5 103926559 2D3M5D6M1D CCACAAGGCA TGCTCATACTTACAAGT/--CTC-----TAAAAG- TTTAGAGTGA 3070 het 3070 ref 43 28 17 7 N/A 0 0 26310 CASAVA_Build 5 103927331 1D CCCCCTCTTG T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 38 17 13 9 T 8 7 26311 CASAVA_Build 5 103931710 1D GCAATTTTCA T/- TTAAAATGTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 3 2 26312 CASAVA_Build 5 103937973 1D TCTGTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 12 11 26313 CASAVA_Build 5 103938329 1I AAAAATAGGG -/A AAATAGAGCA 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 3 4 26314 CASAVA_Build 5 103939456 1D CATTCAGTTA C/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 C 1 0 26315 CASAVA_Build 5 103940146 1D8M2D AAAGAAGTAT AAAAAATCATT/-AAAAATCA-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 17 10 2 N/A 0 0 26316 CASAVA_Build 5 103941602 1I AAAATCAAAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 7 8 26317 CASAVA_Build 5 103941805 1D GGTAGAGAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 10 9 26318 CASAVA_Build 5 103942039 9I TCAGAGATCT ---------/CAAACATGA CAAACATGAC 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 CAAACATGA 1 2 26319 CASAVA_Build 5 103942464 1D AGCTATACTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 8 7 26320 CASAVA_Build 5 103945114 4D TACATACATA TATG/---- TATTTATATT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TATG 1 0 26321 CASAVA_Build 5 103945185 2I43M2I GTATAAATAC --ATGTGTATATATACATGTATATATATATGTTTGTGTATATGTG--/ATATGTGTATATATACGTGTGTATATATATGTTTGTGTATATGTGTA TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 13 24 6 N/A 0 0 26322 CASAVA_Build 5 103945673 2D TAATTCACTC TT/-- TTTCTGTTGT 3070 het 3070 hom 24 8 13 5 T 5 3 26323 CASAVA_Build 5 103946852 2I AAGTTTTCTT --/TA TATATATATA 2694 het 2694 ref 17 7 6 4 TA 6 7 26324 CASAVA_Build 5 103947042 1D TATAAAAGTG T/- TTTCTAGGAT 3070 het 2677 hom 22 8 14 0 T 4 3 26325 CASAVA_Build 5 103952314 1D AAGTTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 973 hom 27 7 20 0 T 12 11 26326 CASAVA_Build 5 103952330 1D TTTTTTGCAT G/- AATTCTCTGC 3070 het 650 hom 30 4 22 5 G 1 0 26327 CASAVA_Build 5 103952556 8I CCAACATCAC --------/AGTGGTCT GGTGTGAAGA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AGTGGTCT 0 1 26328 CASAVA_Build 5 103953373 6D CTTCCCCATT AAAGTG/------ AAAGTCCTGG 3070 het 3070 hom 42 15 21 11 AAAGTG 1 0 26329 CASAVA_Build 5 103954132 1D TTGTAATGTG A/- TAAGTTGAAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 A 1 0 26330 CASAVA_Build 5 103969955 6D CCTTGCTTTA ATTTAT/------ TTTTTTTTCA 3070 het 333 hom 31 2 16 15 ATTTAT 1 0 26331 CASAVA_Build 5 103974449 3I GGAGGTAGTT ---/GAA GAGTTGAAAC 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 GAA 0 1 26332 CASAVA_Build 5 103975997 1D TTTTCTTAGG A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 7 6 26333 CASAVA_Build 5 103977330 5D TTCATATTCA CATAT/----- CATTTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 7 CATAT 1 0 26334 CASAVA_Build 5 103979239 1D TGAAAACTAC T/- TTTTTTAGGA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 7 6 26335 CASAVA_Build 5 103983954 2D TACTGGAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 41 0 31 11 A 12 10 26336 CASAVA_Build 5 103988687 1D CGTTCCCATG A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 41 17 19 7 A 7 6 26337 CASAVA_Build 5 103995032 2D CTTTTGACCT TA/-- TGAGTAAAGA 3070 het 3070 hom 34 11 21 3 TA 1 0 26338 CASAVA_Build 5 103996192 1D GGTGTCTGCT A/- TTCAAATGTT 2487 het 2487 ref 18 11 6 1 A 1 0 26339 CASAVA_Build 5 104000144 4D GAGCTTAATA ATTC/---- ATTTTCTAGT 3070 het 3070 hom 45 18 23 6 ATTC 1 0 26340 CASAVA_Build 5 104000453 2I ACTTCTTTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 AT 5 6 26341 CASAVA_Build 5 104001145 3D TCAAAAAGTT AAA/--- AAAATTAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 11 3 A 7 4 26342 CASAVA_Build 5 104001873 4I GAGTAATAAT ----/CTTA CTGAGGCTGA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 CTTA 0 1 26343 CASAVA_Build 5 104002385 1I GGCAGGCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 A 10 11 26344 CASAVA_Build 5 104004947 1D CCCAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 495 hom 23 2 17 4 A 15 14 26345 CASAVA_Build 5 104014297 2D TCTCTTTCAT TC/-- TCTCTTATTC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TC 3 2 26346 CASAVA_Build 5 104026795 1I TTTATATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 11 12 26347 CASAVA_Build 5 104027578 4D TGATGAACTC ACTT/---- ACTAAGTTCT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 ACTT 1 0 26348 CASAVA_Build 5 104045727 1D AACGAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 1073 het 1073 ref 30 19 3 8 A 12 11 26349 CASAVA_Build 5 104046454 9I AATAAATGTG ---------/ATAAACCAC ATAAACAGAA 3061 het 3061 ref 22 12 9 1 ATAAACCAC 0 1 26350 CASAVA_Build 5 104048502 9D CTGGATAGAA ATGGAGACC/--------- ATGGAGACCA 3070 het 3070 ref 25 14 10 3 ATGGAGACC 2 1 26351 CASAVA_Build 5 104048823 3D TTAAAAAAAA TGT/--- TGTTGTCACT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 TGT 3 2 26352 CASAVA_Build 5 104051995 5I ATTGTTATTC -----/TTCTT TTCTTTTCAT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 TTCTT 1 2 26353 CASAVA_Build 5 104052101 4D TAGAGTTAAA AAAT/---- AAAGCTGAAC 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 AAAT 1 0 26354 CASAVA_Build 5 104053515 1I CAAAAATGAG -/T TTTTTTCTTT 2451 het 2451 ref 14 7 6 1 T 6 7 26355 CASAVA_Build 5 104067463 2I ATATCATATA --/TG TGTGTATATA 3070 het 2027 hom 17 6 10 1 TG 2 3 26356 CASAVA_Build 5 104068578 1I CAACTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 T 10 11 26357 CASAVA_Build 5 104075924 1D TCTAGTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 10 9 26358 CASAVA_Build 5 104081048 1D AAGAATATAT A/- TATGTATATA 2687 het 988 hom 10 2 6 3 A 1 0 26359 CASAVA_Build 5 104087001 2I AAAACAAGAC --/AT GTTCTTGAAA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AT 0 1 26360 CASAVA_Build 5 104087555 2D TGTTTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 225 hom 19 3 8 8 TA 6 5 26361 CASAVA_Build 5 104090435 2D TTTAAATAAC AT/-- AGTGTTCTTG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 AT 1 0 26362 CASAVA_Build 5 104093061 1I TTGTGAAAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 8 9 26363 CASAVA_Build 5 104093563 4D CTCTCAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGCT 3070 het 3070 ref 30 15 8 10 AAAG 3 2 26364 CASAVA_Build 5 104110631 29I AGGAGTGGCT -----------------------------/GCTCAAGGACTCCTTGAACAGCAATTTTG GCTCAAGGAC 3070 het 3070 ref 49 27 14 9 GCTCAAGGACTCCTTGAACAGCAATTTTG 0 1 26365 CASAVA_Build 5 104112735 2D ATACATATAT AC/-- ACACACATAT 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 AC 4 3 26366 CASAVA_Build 5 104113541 5D TGTATTTATC TTTTA/----- TTTTATTTTA 2661 het 1839 hom 15 5 9 2 TTTTA 3 2 26367 CASAVA_Build 5 104119876 4I TGTAAATAAT ----/TAGA TAGATAGAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 TAGA 2 3 26368 CASAVA_Build 5 104122641 1I TCCTAGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 872 hom 40 2 35 3 A 10 11 26369 CASAVA_Build 5 104125491 2D TGTATATATA CT/-- CTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 CT 2 1 26370 CASAVA_Build 5 104129425 3D TGTACTACAA TTT/--- TTTTTTTTAC 3070 het 2313 hom 15 7 8 0 T 11 8 26371 CASAVA_Build 5 104135670 1D CCTATTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 15 14 26372 CASAVA_Build 5 104137855 1I TCACGTGTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 8 9 26373 CASAVA_Build 5 104142172 1I GCAAAGGAAC -/T TTTTATAATT 3070 hom 74 het 27 0 24 3 T 4 5 26374 CASAVA_Build 5 104147517 1I ATCTCAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 13 14 26375 CASAVA_Build 5 104159254 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 25 het 36 1 30 5 CA 12 11 26376 CASAVA_Build 5 104161272 1D AAAAAAAAAA T/- AATAAAGAAT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 1 0 26377 CASAVA_Build 5 104164836 1D GGATATGAAT G/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 G 1 0 26378 CASAVA_Build 5 104167723 1I TAGGAGAAAC -/A AATGCAGGGC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 2 3 26379 CASAVA_Build 5 104172409 2D GGGCAGGATA AC/-- AGAGTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 24 12 4 AC 1 0 26380 CASAVA_Build 5 104185441 4D GTTCAACATC ATTA/---- ATTACCATTT 3070 het 3070 ref 44 23 21 1 ATTA 2 1 26381 CASAVA_Build 5 104187303 4I TTTGTTTTAA ----/TTCT TTCTTTCCTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 TTCT 1 2 26382 CASAVA_Build 5 104192555 3D GCATCCCAGG GAA/--- GAAGCGGACT 1829 het 1829 ref 16 10 5 4 GAA 2 1 26383 CASAVA_Build 5 104209123 1D CAGCCTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 15 14 26384 CASAVA_Build 5 104218586 1D GATACTGAGC T/- TTTTTTCATA 3070 het 3019 hom 20 8 11 1 T 7 6 26385 CASAVA_Build 5 104218666 4D TTTAATGGAG TTGT/---- TTGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 TTGT 2 1 26386 CASAVA_Build 5 104231752 1D35M2I18M4I ATGTGTGTTC ACATATGTGTACATATGTATATATGTGCATATATAT--ACACATATACACACACAC----/-CATATGTGTACATATGTATATATGTGCATATATATACACACATATACACACACACATAT ATATATATAT 2981 het 2981 ref 35 28 10 17 N/A 0 0 26387 CASAVA_Build 5 104231939 2D TAGGAAAGGT AA/-- ACTCTAGACC 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 A 3 1 26388 CASAVA_Build 5 104232147 1D CAAACAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 9 A 11 10 26389 CASAVA_Build 5 104233269 5D TTTATAGTAA TAATT/----- TAATATACAT 3070 het 3070 hom 31 10 21 1 TAATT 1 0 26390 CASAVA_Build 5 104238828 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 270 hom 30 1 26 3 A 11 10 26391 CASAVA_Build 5 104243475 2I AATGAAAAAC --/AG AAGAAACTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AG 0 1 26392 CASAVA_Build 5 104245450 1D TCAGTGCAGT A/- CCCATCAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 A 1 0 26393 CASAVA_Build 5 104250579 1I TAAACCCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 45 0 36 9 A 9 10 26394 CASAVA_Build 5 104251421 4D AGGGTAATAA AAGC/---- AAGTAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 AAGC 1 0 26395 CASAVA_Build 5 104254217 15I AAGTTAAAAC ---------------/TCTTAACTAATGTTT TACTCTTAAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 TCTTAACTAATGTTT 0 1 26396 CASAVA_Build 5 104263744 1D ATAAAAATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 10 9 26397 CASAVA_Build 5 104273895 2D CACAGACACC CA/-- CACACGGGGG 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 CA 3 2 26398 CASAVA_Build 5 104275537 1D TTTGAAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 10 9 26399 CASAVA_Build 5 104276268 1I TACAGCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 11 12 26400 CASAVA_Build 5 104283088 1D TTACTGAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 10 9 26401 CASAVA_Build 5 104305268 1I CCAAGGTATG -/A AATTCTTGAC 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 A 2 3 26402 CASAVA_Build 5 104318948 2I ATGATATCTA --/TT TTATATATAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 2 4 26403 CASAVA_Build 5 104326121 1D TGTTTATGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 A 10 9 26404 CASAVA_Build 5 104343522 1I ATATTAAATC -/T TTTTTTTTTT 2120 het 2120 ref 26 12 7 7 T 11 12 26405 CASAVA_Build 5 104347728 1D TTTTTTCCAT C/- CCCCCCTCCT 3070 het 2708 hom 29 13 12 4 C 7 6 26406 CASAVA_Build 5 104351630 2D ATTTCAGCGT GA/-- GTTTCCAAGA 3070 het 3070 ref 43 26 12 7 GA 1 0 26407 CASAVA_Build 5 104360127 3I TTTGTGAGGT ---/TAC TACTATTAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TAC 1 2 26408 CASAVA_Build 5 104380609 1I GAACTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 A 13 14 26409 CASAVA_Build 5 104392667 1D TATCTCCCCA C/- CCCCCAACTG 3070 het 3070 hom 45 15 27 3 C 6 5 26410 CASAVA_Build 5 104394887 2D TAAATTCAGT AG/-- AGTCTTGGTA 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 AG 2 1 26411 CASAVA_Build 5 104396514 2I GCTCTCTGTC --/TG TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 45 16 26 4 TG 0 1 26412 CASAVA_Build 5 104396619 1I ATAAGCTTAT -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 6 7 26413 CASAVA_Build 5 104398704 2D CAGTAGACAA AG/-- AGAGAGCTTG 3070 het 3070 ref 51 21 25 6 AG 4 3 26414 CASAVA_Build 5 104399704 1I AGCAAGAGAC -/A AGAGCTTCAC 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 1 2 26415 CASAVA_Build 5 104400175 1I ACATGTCACC -/A AGTCTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 1 2 26416 CASAVA_Build 5 104407928 4I GGACTAATGG ----/TTAT TTGTTTTATT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 TTAT 0 1 26417 CASAVA_Build 5 104408131 1D AACTAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 11 10 26418 CASAVA_Build 5 104440942 1D TGTTCCAATA G/- TCTTAAGGGC 3070 het 3070 hom 38 17 21 0 G 1 0 26419 CASAVA_Build 5 104442843 1D GAGAGAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 47 0 37 10 T 12 11 26420 CASAVA_Build 5 104455342 1D TGTCACTCCA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 57 het 28 0 19 10 C 9 8 26421 CASAVA_Build 5 104460966 4I ACAATAAAAT ----/AGAA AGAATGAATA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AGAA 1 2 26422 CASAVA_Build 5 104469569 2D TTTATAGGTG TA/-- TATATATATA 2025 het 2025 ref 18 6 6 7 TA 7 6 26423 CASAVA_Build 5 104469929 2D TTCAATATTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 AT 10 9 26424 CASAVA_Build 5 104489838 3I TTTAAATGAC ---/TAA TTTTTATATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TAA 0 1 26425 CASAVA_Build 5 104493298 1I ATTTTAAAAA -/T TGTTGTGACT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 2 26426 CASAVA_Build 5 104495655 1I TACTTTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 A 15 16 26427 CASAVA_Build 5 104522935 1D GTTCTAGGAC A/- AAAAAGCCAC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 6 5 26428 CASAVA_Build 5 104528187 5D CATGTGCATG CTTAT/----- CTTATCAGCA 3070 het 3070 ref 56 30 23 3 CTTAT 2 1 26429 CASAVA_Build 5 104539484 4I AAATATTATT ----/GATA AATATTTTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GATA 0 1 26430 CASAVA_Build 5 104643795 3D AATTATTAAT TTG/--- TTAATATATT 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 TTG 1 0 26431 CASAVA_Build 5 104659604 1I ACACAATGAC -/A AAAGGGGAGA 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 3 4 26432 CASAVA_Build 5 104698630 6D TGTATGTGTG TATGTA/------ TATGTATATG 2350 het 2350 ref 17 8 8 3 TATGTA 3 2 26433 CASAVA_Build 5 104699442 1D GATATGAAGG A/- AAAAAAAAAA 2858 het 2858 ref 26 14 10 2 A 12 11 26434 CASAVA_Build 5 104699717 1I TAGCTATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 16 18 12 A 13 14 26435 CASAVA_Build 5 104716678 1I AATTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2178 hom 20 7 9 4 A 11 12 26436 CASAVA_Build 5 104717247 1D GGACAAACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 10 9 26437 CASAVA_Build 5 104721325 4I ATATAGAATG ----/TTAT TTAAGAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTAT 0 1 26438 CASAVA_Build 5 104723555 2D GTGGTAAAAC AG/-- GGAAATTTTT 3070 het 3070 ref 44 29 13 2 AG 1 0 26439 CASAVA_Build 5 104729189 1D AATAGTTACC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 17 9 6 A 9 8 26440 CASAVA_Build 5 104732867 4D ACATATACAC ATAG/---- ATAGATAATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATAG 2 1 26441 CASAVA_Build 5 104734478 1I ATTTTTTTTT -/A TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 A 0 1 26442 CASAVA_Build 5 104737643 2D AATATATATC TT/-- TGAAGTAGTG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 3 1 26443 CASAVA_Build 5 104749211 3I TCTCTAAAAT ---/ATA ATGTGAACCA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 ATA 0 1 26444 CASAVA_Build 5 104749380 1D TTTTTGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 28 1 21 6 T 14 13 26445 CASAVA_Build 5 104749537 1D GGAAAATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 34 0 27 8 A 10 9 26446 CASAVA_Build 5 104751695 7D TCTTGGTGTA GGGGGAG/------- GGCTTTCAGT 3070 het 3070 ref 36 17 17 7 GGGGGAG 1 0 26447 CASAVA_Build 5 104772985 1I CTCATCACTG -/T TTTTTTTTTT 2982 het 2982 ref 37 15 9 13 T 14 15 26448 CASAVA_Build 5 104828048 1D GACAATATGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 11 8 A 10 9 26449 CASAVA_Build 5 104840545 4I ATGTTATAAT ----/CAAA CAGTTAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CAAA 0 1 26450 CASAVA_Build 5 104843014 2D AACAAAGAAA GC/-- TGCCCAAGAC 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 GC 1 0 26451 CASAVA_Build 5 104845868 1D AAATAATCAT G/- GTCATTATTA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 G 2 1 26452 CASAVA_Build 5 104851835 1I ACTCTGAGCA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 8 26453 CASAVA_Build 5 104855680 3D GGAAATTGTG TTC/--- TTTTTGTACA 3070 het 3070 ref 38 18 15 8 TTC 1 0 26454 CASAVA_Build 5 104988090 1D CATTAAAAAG A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 A 7 6 26455 CASAVA_Build 5 104988242 2I GTGAAGAAAA --/AC ACATGAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 AC 1 2 26456 CASAVA_Build 5 104989356 10I AAAAAGAGAA ----------/AGAAAAAGAG AGAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 AGAAAAAGAG 1 2 26457 CASAVA_Build 5 104991162 9D CACACACACA CACATATAT/--------- ATACACACAC 3070 het 3070 hom 34 10 21 4 CACATATAT 1 0 26458 CASAVA_Build 5 104991664 1I CTTTTGTGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 T 8 9 26459 CASAVA_Build 5 104992544 18D ACATGGACAA CCTTGATAGTATCATCCT/------------------ CCACTGACAC 3070 het 3070 hom 35 16 20 4 CCTTGATAGTATCATCCT 1 0 26460 CASAVA_Build 5 104992688 1I GCAAAGAAAG -/T TTTTTCTTGT 3070 het 2422 hom 18 5 12 1 T 5 6 26461 CASAVA_Build 5 104993902 1D GAAAATAAAA T/- GAGCAAGAGG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 1 0 26462 CASAVA_Build 5 104995359 3D TGGAATCAAT AAC/--- AACAATACAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AAC 2 1 26463 CASAVA_Build 5 104996335 15D AAAGGATTAT TACTTTACTACCTTA/--------------- TACTTTAGTT 3070 het 3070 ref 27 18 8 3 TACTTTACTACCTTA 1 0 26464 CASAVA_Build 5 104998529 1D CTTTATCCTT C/- CTCCAGAACT 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 C 2 1 26465 CASAVA_Build 5 105013989 3I GGAGGCAGAG ---/GTT GTAGTGAGGC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 GTT 0 1 26466 CASAVA_Build 5 105019094 2I TTGTGCAAAA --/AG AGAAAATACA 3070 het 2165 hom 31 6 22 3 AG 1 2 26467 CASAVA_Build 5 105019215 6I TTTTAAAAAG ------/AAAAAC AGAAACTGCC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 AAAAAC 0 1 26468 CASAVA_Build 5 105019480 3D ATTACAAGGA AAT/--- ATAACTATAG 3070 het 3070 ref 42 23 18 3 AAT 1 0 26469 CASAVA_Build 5 105020823 1D ATGAAATTTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 8 7 26470 CASAVA_Build 5 105021507 6D TACAATGTGA TTAACT/------ TTAGCCAATA 3070 het 3070 hom 22 11 11 4 TTAACT 1 0 26471 CASAVA_Build 5 105023914 16D GGAGCATGGC TCCAAAATACCATGGT/---------------- TAGTATTTTC 3070 het 3070 ref 34 21 12 3 TCCAAAATACCATGGT 1 0 26472 CASAVA_Build 5 105028700 1I GATATACTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 9 10 26473 CASAVA_Build 5 105047126 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 1984 hom 25 9 12 4 AT 6 7 26474 CASAVA_Build 5 105047930 1D CTCTATGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 13 12 26475 CASAVA_Build 5 105052752 5D TGGTGTTGTT TCTTA/----- TGAGTGCTGT 3070 het 3070 hom 42 19 21 4 TCTTA 1 0 26476 CASAVA_Build 5 105053902 1D CTTTGTGGCT A/- AACCATTGAC 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 A 3 2 26477 CASAVA_Build 5 105054080 5D AGTACTATTA TTAAT/----- TTAATCATGC 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 TTAAT 2 1 26478 CASAVA_Build 5 105056776 1I GTTGTATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 10 11 26479 CASAVA_Build 5 105061524 2D GGATCTATCA CT/-- CTCGGTTCTG 3070 het 3070 ref 42 19 16 8 CT 2 1 26480 CASAVA_Build 5 105064115 1D GTGAAAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 956 hom 32 6 15 12 A 15 14 26481 CASAVA_Build 5 105072650 1I GTAGTGAAAA -/G GGGGGGGTGT 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 G 7 8 26482 CASAVA_Build 5 105073221 1D CCTAAAAAAA T/- AATGTCTTCT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 1 0 26483 CASAVA_Build 5 105074723 3I CTGCCTCAAA ---/AAG AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 AAG 0 1 26484 CASAVA_Build 5 105077622 3I GGAAGGTAAA ---/TGT TGTTGTGATT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TGT 2 3 26485 CASAVA_Build 5 105078104 1D AAAAGAGGGG A/- AAAAAGAATT 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 A 6 5 26486 CASAVA_Build 5 105085093 7D TTTAAGAGGG TGCCCAA/------- TGCCCAATTC 3070 hom 117 het 45 0 38 9 TGCCCAA 2 1 26487 CASAVA_Build 5 105086700 6I TCAGACAAAA ------/ATAAAG AGAAAAGAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATAAAG 0 1 26488 CASAVA_Build 5 105091388 5D CATATAAAAT ATATG/----- ATCATCTCAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 ATATG 1 0 26489 CASAVA_Build 5 105094663 1D AGGAGGAGAG A/- GTGCTCATCT 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 A 1 0 26490 CASAVA_Build 5 105095991 1I ATTATTGAGG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 T 6 7 26491 CASAVA_Build 5 105098004 1D CACACAAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 413 hom 29 1 26 4 T 10 9 26492 CASAVA_Build 5 105098197 4I ACCTTATTAA ----/TCTT TCTAAGCCTA 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 TCTT 0 1 26493 CASAVA_Build 5 105106177 9I GTCAATAAGA ---------/CACTATGAG CACTATGAGA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 CACTATGAG 1 2 26494 CASAVA_Build 5 105119241 1D TTACATTAAA T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 7 6 26495 CASAVA_Build 5 105122752 3I CATCAGCACT ---/TGC TGCTGCTTCA 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 TGC 2 3 26496 CASAVA_Build 5 105136345 1D TCATTTTTCT A/- TCTTCTGTTT 3070 het 3070 ref 44 26 15 5 A 1 0 26497 CASAVA_Build 5 105136829 1I CTTTGAGAAT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 7 8 26498 CASAVA_Build 5 105140618 1D TGATTTTCTA T/- TTCTTCTTGA 3070 het 3070 ref 40 27 10 3 T 3 2 26499 CASAVA_Build 5 105147532 1D TACAAACTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 A 10 9 26500 CASAVA_Build 5 105148850 17D CAATAATGAG AGAGATTCATCAATTAT/----------------- AGAGATTCAT 3070 het 3070 hom 27 9 9 11 AGAGATTCATCAATTAT 2 1 26501 CASAVA_Build 5 105148978 16I CATGCAATGG ----------------/TTCAGCTGAAGGCCTT TTCAACCGAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 TTCAGCTGAAGGCCTT 0 1 26502 CASAVA_Build 5 105149844 1I TCCTGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 A 10 11 26503 CASAVA_Build 5 105150268 1D AATACATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 9 7 T 11 10 26504 CASAVA_Build 5 105152579 2D ATATGGTGTT AA/-- GAGATATAAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 2 0 26505 CASAVA_Build 5 105169808 2I GTAGTGAAAC --/AT ATTGATTTCC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 AT 1 2 26506 CASAVA_Build 5 105172015 1D CATGGCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 11 10 26507 CASAVA_Build 5 105174487 1D CGAGAATCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 40 4 21 15 A 16 15 26508 CASAVA_Build 5 105177515 1I TACACTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 11 12 26509 CASAVA_Build 5 105180306 2D ATATAACATA AT/-- ATATATTATA 2959 hom 21 het 8 0 8 0 AT 4 3 26510 CASAVA_Build 5 105186955 1I TTAAACTAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 5 het 32 1 27 4 T 9 10 26511 CASAVA_Build 5 105187407 4I TGACTTACAG ----/TGCT TGCAATCAGT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 TGCT 0 1 26512 CASAVA_Build 5 105213239 2D ATTTCATCTG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 11 9 26513 CASAVA_Build 5 105245074 1D TAAAGAAGAT A/- AATTACACAC 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 A 3 2 26514 CASAVA_Build 5 105258050 1I GGGTGAGTCG -/A AAATATGAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 3 4 26515 CASAVA_Build 5 105260236 4I CTCTTTTGAC ----/TTGT TTGTCTTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTGT 1 2 26516 CASAVA_Build 5 105261279 1D AATGATACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 10 9 26517 CASAVA_Build 5 105264493 1D CTGTTAACCC T/- TTTAGCCTGA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 4 3 26518 CASAVA_Build 5 105266666 1I TATTAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 789 hom 32 3 20 9 T 13 14 26519 CASAVA_Build 5 105270414 1I ATGGTTCAGC -/T ACTCAAAATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 1 26520 CASAVA_Build 5 105280531 1D AGGATTACAT C/- CCTGCTGGAG 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 C 3 2 26521 CASAVA_Build 5 105287271 1D CACTAATTAA T/- TTTTTAATGA 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 T 6 5 26522 CASAVA_Build 5 105293194 1I ATCTGAAAAC -/T TTATGACCCT 3070 het 2831 hom 21 6 14 1 T 2 3 26523 CASAVA_Build 5 105301930 9I TTCCCACCTC ---------/AGCCTCCTG AGGAACAGGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AGCCTCCTG 0 1 26524 CASAVA_Build 5 105305063 1D TTCTGAAACA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 26525 CASAVA_Build 5 105311647 1I TTAAAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3008 hom 26 8 16 2 A 10 11 26526 CASAVA_Build 5 105313239 2D CAATTCAAGT CA/-- CAATCTGGAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 CA 2 1 26527 CASAVA_Build 5 105329447 4D ATGTATACCT TTTA/---- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TTTA 1 0 26528 CASAVA_Build 5 105349817 1D GGAGAAAATA T/- GTATAACCCG 3070 het 3070 hom 29 13 16 0 T 1 0 26529 CASAVA_Build 5 105369242 1I CTTAGGTCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 A 9 10 26530 CASAVA_Build 5 105412834 1D TGTGCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3038 hom 40 13 12 15 T 15 14 26531 CASAVA_Build 5 105437433 5I CAAAATTTTA -----/ATTTT AACACTTTAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATTTT 0 1 26532 CASAVA_Build 5 105440039 1D CTCAAAAAAA T/- AAAACTCAAT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 1 0 26533 CASAVA_Build 5 105441678 1D GTCATGGCTC A/- AATAAATCTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 A 3 2 26534 CASAVA_Build 5 105458526 1I CTTCTCAGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2700 hom 43 19 14 10 G 0 1 26535 CASAVA_Build 5 105465981 1I TTATTAAAAG -/A AAAATAGAAC 3070 het 3070 ref 25 17 8 0 A 4 5 26536 CASAVA_Build 5 105467236 5I AAAAGTTAAC -----/TATAA TATAATACAC 2847 het 2648 hom 15 7 6 2 TATAA 1 2 26537 CASAVA_Build 5 105468571 1D TCTACAGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 11 10 26538 CASAVA_Build 5 105470072 1D TTGCTAGTAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 22 3 T 7 6 26539 CASAVA_Build 5 105470381 1I CACTATATAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 9 10 26540 CASAVA_Build 5 105479692 1D CAACACTAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 9 8 26541 CASAVA_Build 5 105484635 4D AGAAACATGC CAAA/---- CAGTCAATAT 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 CAAA 1 0 26542 CASAVA_Build 5 105499590 4D TTATTGCTCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 36 het 34 0 13 21 TTCC 5 4 26543 CASAVA_Build 5 105508603 1I CTACACCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 5 6 26544 CASAVA_Build 5 105524887 1I TAAAATTATT -/A AATGTATTAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 2 3 26545 CASAVA_Build 5 105528854 1I AAACTGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 12 7 T 13 14 26546 CASAVA_Build 5 105546554 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 9 10 26547 CASAVA_Build 5 105555389 2I ATTTTTGTGA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 T 9 11 26548 CASAVA_Build 5 105560538 1D GCTGGAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 A 10 9 26549 CASAVA_Build 5 105596509 1I ATACATATAG -/C CTGAAGGCAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 2 26550 CASAVA_Build 5 105605167 1D AGGATCTTTG C/- CTAGCAAACA 3070 het 3070 ref 46 23 20 5 C 2 1 26551 CASAVA_Build 5 105612613 11I TCCTGGCTCT -----------/GCTTCCTACCA GCTGTGTGAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GCTTCCTACCA 0 1 26552 CASAVA_Build 5 105620857 5D GGAAATATAA TTATT/----- TTATTTAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 TTATT 2 1 26553 CASAVA_Build 5 105623715 4I AACAGTCTGA ----/TCTC TCTCTCTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TC 3 5 26554 CASAVA_Build 5 105638060 9D TTTTTAATTT GTAGAATCA/--------- ATAGAATCAT 2153 het 2153 ref 34 25 8 7 GTAGAATCA 1 0 26555 CASAVA_Build 5 105643467 1I ATCACAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 A 9 10 26556 CASAVA_Build 5 105654792 1D TTAAGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3052 hom 26 10 11 5 A 12 11 26557 CASAVA_Build 5 105655106 1D AAAGAGCAAT A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 A 6 5 26558 CASAVA_Build 5 105669112 1I AAAATAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 T 9 10 26559 CASAVA_Build 5 105674901 1D CAAGAATAAC A/- GTAGGTAGCT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 A 1 0 26560 CASAVA_Build 5 105684828 6I CATCAGAACT ------/TGGAGC CAGGTCTAAT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 TGGAGC 0 1 26561 CASAVA_Build 5 105693344 1D ATGTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 26 8 T 11 10 26562 CASAVA_Build 5 105700822 1D ATTTTCATAA T/- TTATTGATAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 3 2 26563 CASAVA_Build 5 105715131 1D GTCTAGATAC T/- TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 32 20 5 7 T 15 14 26564 CASAVA_Build 5 105729581 1I CCTTTTTTTA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 7 8 26565 CASAVA_Build 5 105729819 1D GTCCAGGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2151 hom 26 7 12 7 A 14 13 26566 CASAVA_Build 5 105732875 1D AAAAACCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 9 10 A 12 11 26567 CASAVA_Build 5 105738499 1I ATTTTACATC -/T GTTCTAGCTT 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 T 0 1 26568 CASAVA_Build 5 105739226 1I TCTAATGTGC -/A ATTAGATTTA 3070 het 3070 ref 52 29 15 8 A 1 2 26569 CASAVA_Build 5 105745314 10D GTGTTTCACA GTATGTGATT/---------- GCTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 38 18 20 1 GTATGTGATT 1 0 26570 CASAVA_Build 5 105746778 1D TCCTTTGAGT G/- GCCCGCTCTG 3070 het 3070 hom 45 21 17 7 G 2 1 26571 CASAVA_Build 5 105764645 1D GCCTCTCAAG T/- AGGTGGGATC 3070 het 1611 hom 20 4 13 3 T 1 0 26572 CASAVA_Build 5 105770577 10D GACTATTAAT TAAAAGACTA/---------- CTAATAATTA 3070 hom 75 het 26 0 26 3 TAAAAGACTA 1 0 26573 CASAVA_Build 5 105781480 1D AAAAAATATA T/- AGGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 20 0 T 1 0 26574 CASAVA_Build 5 105782070 2I TCACTTTCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 26 0 13 13 A 10 12 26575 CASAVA_Build 5 105788390 1I ATGTGTGTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 14 16 4 T 9 10 26576 CASAVA_Build 5 105788986 1D ATAACCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 10 9 T 12 11 26577 CASAVA_Build 5 105796814 1D CTGTTTTTTT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 8 7 26578 CASAVA_Build 5 105799564 1I TTTGAAACTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 A 9 10 26579 CASAVA_Build 5 105801288 1I CATCTTTTAT -/C TTTACTCTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 0 1 26580 CASAVA_Build 5 105802267 10D TGTGTATGTT TATATGTATG/---------- GGTATGTATT 3070 het 3070 hom 44 18 22 10 TATATGTATG 1 0 26581 CASAVA_Build 5 105804449 1D ATTCTATTGA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 8 7 26582 CASAVA_Build 5 105809150 1D AACTTAGAAT A/- AATAGGCAAA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 3 2 26583 CASAVA_Build 5 105811239 1D GTGTTTGGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 20 6 T 10 9 26584 CASAVA_Build 5 105822366 1D AGCATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1271 het 1271 ref 32 21 3 8 T 15 14 26585 CASAVA_Build 5 105825035 1D GGAAATTTTG T/- TAATAGTTGA 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 T 2 1 26586 CASAVA_Build 5 105826990 3I ATTGCAAAAA ---/AAG AAGATCATCT 3070 het 3070 ref 56 24 26 6 AAG 1 2 26587 CASAVA_Build 5 105846333 1D AAAATTCAGG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 8 7 26588 CASAVA_Build 5 105864207 2D TTATTGACAT CA/-- CATTATTCCA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 CA 2 1 26589 CASAVA_Build 5 105864406 2D CCATTTAACT TA/-- TACTAAGTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TA 2 1 26590 CASAVA_Build 5 105864821 2D GATTCTACTG TC/-- TTTCTACCCA 3070 hom 84 het 36 0 29 9 TC 1 0 26591 CASAVA_Build 5 105870424 2D GCTATTATTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 31 2 22 8 A 13 11 26592 CASAVA_Build 5 105885985 2I TTCATGAGAC --/AG GGGGCAGGGG 3070 hom 126 het 45 0 41 4 AG 0 1 26593 CASAVA_Build 5 105902790 1I TCTTTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 42 1 34 7 T 10 11 26594 CASAVA_Build 5 105917777 1D TTCCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 27 2 13 13 T 15 14 26595 CASAVA_Build 5 105925016 8D CCATTCTACC TCCCAGCT/-------- TCCCAGCTTC 3070 het 3070 ref 41 21 12 10 TCCCAGCT 2 1 26596 CASAVA_Build 5 105925690 2D TAGAAAAAAC AT/-- AGAGTTGGAT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 AT 1 0 26597 CASAVA_Build 5 105927712 4D AAAATCTGTA TTAG/---- TTAGGGTTCT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 TTAG 2 1 26598 CASAVA_Build 5 105932838 1D TTGTTATAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 10 9 26599 CASAVA_Build 5 105932981 2D TGTTTTTGAC TG/-- TACCAATTTC 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 TG 1 0 26600 CASAVA_Build 5 105935229 1D AATGGAAATT A/- AAAAAAAAAA 1752 het 1752 ref 41 32 4 5 A 12 11 26601 CASAVA_Build 5 105939835 1D CCCTCAAGCC T/- TAACAGTCTC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 2 1 26602 CASAVA_Build 5 105940485 1D AAGAAAACTT A/- AAAATTGGCA 949 het 949 ref 22 12 3 9 A 5 4 26603 CASAVA_Build 5 105951118 1I AATGAGTGTT -/A TAATGTTGAT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 0 1 26604 CASAVA_Build 5 105953670 4D GACACACACG CACA/---- CACACACACA 3070 het 2495 hom 26 8 11 9 CA 11 9 26605 CASAVA_Build 5 105956927 1I AAACAAAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 743 hom 28 2 24 2 A 9 10 26606 CASAVA_Build 5 105962651 12I TGACCTAGTA ------------/ATCCGCCCACCT CACCCTCCCA 1921 het 1921 ref 23 13 6 4 ATCCGCCCACCT 0 1 26607 CASAVA_Build 5 105963023 3I TATAGATAAA ---/AAT AATCATTCTG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 AAT 1 2 26608 CASAVA_Build 5 105974982 1D TGAGAGCTCA T/- TTTTTAAAGC 3070 hom 135 het 46 0 46 0 T 6 5 26609 CASAVA_Build 5 105978523 1D GAATGAGACA G/- GGTATAGTGC 3070 hom 24 het 11 0 9 3 G 3 2 26610 CASAVA_Build 5 105985314 1I TCTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 12 13 26611 CASAVA_Build 5 106004456 1D CATCAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 40 hom 40 1 32 7 A 10 9 26612 CASAVA_Build 5 106006131 1D TTTCAAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 20 1 15 5 T 13 12 26613 CASAVA_Build 5 106025196 3D AATATGAAGC TTT/--- TATAAAGGGT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 4 1 26614 CASAVA_Build 5 106031039 1D AAAATACACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 10 9 26615 CASAVA_Build 5 106037340 6D AAGGAATAAC ATAATG/------ ATAATGATAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 ATAATG 3 2 26616 CASAVA_Build 5 106040907 1I TGTACCCCCA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 T 7 8 26617 CASAVA_Build 5 106042040 2I TGAAACAAAC --/AA AGAATAAAGA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 1 3 26618 CASAVA_Build 5 106043488 7D ACTTGGAACC AAGTCAA/------- ATGCCCATCA 2047 hom 15 het 6 0 5 1 AAGTCAA 1 0 26619 CASAVA_Build 5 106046050 2D AAAAAGAGAC AT/-- ATTTTATGCA 3070 het 3070 hom 41 14 21 9 AT 2 1 26620 CASAVA_Build 5 106046150 2D TTAATGGCAT AA/-- GAGACATTCA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 A 2 0 26621 CASAVA_Build 5 106056598 1I TGAAAGTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 9 10 26622 CASAVA_Build 5 106060720 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 17 0 11 6 A 15 14 26623 CASAVA_Build 5 106064835 1I TAACATTTTG -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 7 8 26624 CASAVA_Build 5 106068982 1I TCATTTTCTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 T 8 9 26625 CASAVA_Build 5 106073030 1D GCTTGTGGGG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 T 8 7 26626 CASAVA_Build 5 106075764 2D TTAAATACAA AT/-- ATATATATGA 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 AT 5 4 26627 CASAVA_Build 5 106083648 1D AAATGGGCAT A/- TTTTTAGACA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 1 0 26628 CASAVA_Build 5 106085186 5D GTTATCCCCA AATAT/----- AATATATCTT 3070 het 3070 hom 41 15 24 6 AATAT 2 1 26629 CASAVA_Build 5 106086982 1D CATGCAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 12 11 26630 CASAVA_Build 5 106105647 16D AAATAATTTA GTTATTTTAGTTATGT/---------------- ATTTAGTTAT 669 het 669 ref 37 24 4 13 GTTATTTTAGTTATGT 1 0 26631 CASAVA_Build 5 106105939 1D GTGTTAACAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2528 hom 21 7 11 4 T 10 9 26632 CASAVA_Build 5 106111665 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 2673 hom 27 7 16 5 T 7 6 26633 CASAVA_Build 5 106116745 1D TTTGGTTTAC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 8 7 26634 CASAVA_Build 5 106116797 12I ATATTTACCT ------------/CAATTAGGTGTA CAAAGGAGGT 3070 het 3070 hom 27 7 12 8 CAATTAGGTGTA 0 1 26635 CASAVA_Build 5 106117237 2D ATATAGAAAG AA/-- AAAATAGTCA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 6 4 26636 CASAVA_Build 5 106119516 3D ACTCAGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 32 1 17 16 A 17 14 26637 CASAVA_Build 5 106122756 1I AATCTCATCC -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 6 7 26638 CASAVA_Build 5 106123139 1I AACTTAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 11 12 26639 CASAVA_Build 5 106124159 3D ATTTCTTGTT GTA/--- GAAGTTCTCT 3070 het 3070 ref 44 23 19 3 GTA 1 0 26640 CASAVA_Build 5 106125362 17D AGATCACTTG CACACACAGTTCCCAAT/----------------- TGGGTTTGTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 9 CACACACAGTTCCCAAT 1 0 26641 CASAVA_Build 5 106126994 1I TTTAAGGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 37 2 29 6 A 11 12 26642 CASAVA_Build 5 106128467 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 A 13 12 26643 CASAVA_Build 5 106129004 1D30M1I AAATAATGTC TTTTTTTTTGTTTTACCTATTTCTCATAGAC-/-TTTTTTTTGTTTTACCTATTTCTCATAGACA AAAACTACCA 3070 het 3070 ref 31 17 17 6 N/A 0 0 26644 CASAVA_Build 5 106131464 1D GAGTGCTAAT A/- AAAAGGCCCT 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 A 5 4 26645 CASAVA_Build 5 106134584 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 10 9 26646 CASAVA_Build 5 106142309 1I GGCACTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 A 13 14 26647 CASAVA_Build 5 106155640 3D CAACAGCATC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 989 hom 36 8 14 14 A 15 12 26648 CASAVA_Build 5 106161700 1I GCAGAGGGGT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 8 9 26649 CASAVA_Build 5 106162657 5I CCATTATCTT -----/ATATA ATATATTACA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATATA 1 2 26650 CASAVA_Build 5 106169417 3D AAAAATCTGA AAT/--- AATTTCCCTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 AAT 2 1 26651 CASAVA_Build 5 106172176 3I ACCATAAAAA ---/CTT CTTCATCATT 3070 hom 124 het 49 0 41 8 CTT 1 2 26652 CASAVA_Build 5 106177503 2D TAAAATACTC TG/-- TTTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 38 17 17 6 TG 1 0 26653 CASAVA_Build 5 106183238 4D AAATTTAAAT AGTC/---- AGTTTAAATG 3070 het 3070 hom 44 17 24 5 AGTC 1 0 26654 CASAVA_Build 5 106185059 1D GCCAACTGAT A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 6 5 26655 CASAVA_Build 5 106189935 4D GAAGGCCAAA AAAG/---- AAAGATCATG 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 AAAG 2 1 26656 CASAVA_Build 5 106194998 1D GTCATAAATC T/- CTACATATTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 T 1 0 26657 CASAVA_Build 5 106198850 2I GCCAAAATAT --/TC TGTTTCTGTC 2157 het 2157 ref 21 12 5 4 TC 0 1 26658 CASAVA_Build 5 106201315 1D AAATAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3007 het 3007 ref 28 15 8 5 T 12 11 26659 CASAVA_Build 5 106207786 5D CTGGAGCAGT GGGAG/----- GCCCAGCAGG 3070 het 3070 ref 42 20 19 4 GGGAG 1 0 26660 CASAVA_Build 5 106208857 1D AAAAAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 12 11 26661 CASAVA_Build 5 106240622 1D CTTCTAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 11 10 26662 CASAVA_Build 5 106245707 3D ATACACTTAT TTC/--- TTCTCCAACT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 TTC 2 1 26663 CASAVA_Build 5 106245783 1I CATTTTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 T 11 12 26664 CASAVA_Build 5 106249777 3D CTTGAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 AAG 6 5 26665 CASAVA_Build 5 106253237 2D CTCTCATATT AA/-- GTCTTATATA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 2 0 26666 CASAVA_Build 5 106255206 2I TCTTATTAAT --/TC TGTTATTGTT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 TC 0 1 26667 CASAVA_Build 5 106255446 1I ATGTAGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 T 10 11 26668 CASAVA_Build 5 106257465 4D ATATAATATA TATC/---- TCTCTCCAGA 3070 het 3070 ref 61 27 26 10 TATC 1 0 26669 CASAVA_Build 5 106261989 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 8 9 26670 CASAVA_Build 5 106262545 9D TTTTTAACTA TTTTTATTT/--------- TTTTTATTTT 1582 het 1582 ref 14 7 5 4 TTTTTATTT 2 1 26671 CASAVA_Build 5 106262642 4D CAATGTGCAG GTTT/---- GTTACATATG 2150 het 2150 ref 11 6 5 0 GTTT 1 0 26672 CASAVA_Build 5 106270240 4D CACAGAAGAA AGAT/---- AACACCAAAA 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 AGAT 1 0 26673 CASAVA_Build 5 106272731 1I AAGTTCCTTG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 A 6 7 26674 CASAVA_Build 5 106274207 5I GACTCAGTAC -----/TTACA TTAGAGTCAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 TTACA 0 1 26675 CASAVA_Build 5 106295826 1D CCCAAGCCCA C/- CCCCCCACTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 7 6 26676 CASAVA_Build 5 106305037 1I AACATCTAGA -/G GGCAAGGCTA 3070 het 3070 ref 52 29 18 5 G 2 3 26677 CASAVA_Build 5 106314126 1D TCTGTAAATG A/- GAATATTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 1 0 26678 CASAVA_Build 5 106324383 1I TTGAGGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 556 hom 43 2 36 5 A 9 10 26679 CASAVA_Build 5 106327306 3D GAATGAAAAT AAG/--- AAGCCTAAGC 3070 hom 132 het 48 0 45 4 AAG 2 1 26680 CASAVA_Build 5 106333314 4I CCACAGCTGC ----/CTGT CTTTCATTGG 3070 hom 125 het 48 0 42 6 CTGT 0 1 26681 CASAVA_Build 5 106338763 2I ACATATGTAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 57 het 29 0 20 9 AC 8 9 26682 CASAVA_Build 5 106346862 2I19M2I CTGGCAGGAC --TGCTGAATCTCCTTAGGCA--/TATGCTGAATCTCCTTAGGCACT CTCTAATCAG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 N/A 0 0 26683 CASAVA_Build 5 106349644 2I ATTCAAAAAC --/TT TTTACCATCC 3070 hom 163 het 59 0 55 4 T 3 5 26684 CASAVA_Build 5 106350275 2I TTTTTATTTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 28 1 21 6 A 12 14 26685 CASAVA_Build 5 106350642 4D AATTTCAGAT AAAC/---- AAAGAATAAC 3070 hom 117 het 46 0 40 7 AAAC 1 0 26686 CASAVA_Build 5 106352446 4D TTGGGAATTC ATAA/---- ATAGACATAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 ATAA 1 0 26687 CASAVA_Build 5 106355406 1D TCCTATTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 9 26688 CASAVA_Build 5 106357481 9I ATCTATTCTA ---------/CATTTGAAT CAATTCAGCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CATTTGAAT 0 1 26689 CASAVA_Build 5 106360212 1I GCTGAATCAG -/C CTTCCATCCC 3070 hom 61 het 24 0 21 3 C 1 2 26690 CASAVA_Build 5 106360277 4D TGCTGGATTC TGTT/---- TGTGAGTATG 3070 hom 51 het 19 0 18 4 TGTT 1 0 26691 CASAVA_Build 5 106364292 3D GTTTGGAAAT AAC/--- AAGATTTGCA 3070 hom 93 het 34 0 32 4 AAC 1 0 26692 CASAVA_Build 5 106364749 1I TTAAGGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 740 hom 30 4 22 4 A 11 12 26693 CASAVA_Build 5 106365284 1D TAAAATTGGT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 8 7 26694 CASAVA_Build 5 106365680 4I TTATTCATTC ----/ATTA ATGTTTTCAT 3070 het 117 hom 38 1 33 4 ATTA 0 1 26695 CASAVA_Build 5 106366318 1I CATTTCAAGA -/T TAATCTTTTT 3070 hom 151 het 53 0 51 2 T 1 2 26696 CASAVA_Build 5 106373168 1D GAAATTTGGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 8 7 26697 CASAVA_Build 5 106381553 1I CTTTTGGGGG -/A AAAAAATCGT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 A 6 7 26698 CASAVA_Build 5 106386020 1I AGTATTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 27 2 20 5 T 10 11 26699 CASAVA_Build 5 106390442 1D TGTGATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 36 0 29 8 T 11 10 26700 CASAVA_Build 5 106392273 1I AGCTATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1877 hom 42 5 30 7 A 11 12 26701 CASAVA_Build 5 106446816 1I TCCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1252 hom 30 5 18 7 A 12 13 26702 CASAVA_Build 5 106461549 1I TTCCTTTTTT -/A TAAATATTTT 3070 het 3066 hom 20 7 12 1 A 0 1 26703 CASAVA_Build 5 106474044 1I AATGATGGAA -/G GAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 G 1 2 26704 CASAVA_Build 5 106484609 1D ACAAAAAAAT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 A 7 6 26705 CASAVA_Build 5 106498983 1D GTTTGTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 T 8 7 26706 CASAVA_Build 5 106507903 1I CTATATTCCC -/A GACCCTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 0 1 26707 CASAVA_Build 5 106509543 1I CCTGGATAGG -/T TTTTTTTTTT 2071 het 2071 ref 21 8 8 5 T 13 14 26708 CASAVA_Build 5 106528530 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 17 12 5 A 15 14 26709 CASAVA_Build 5 106530059 2I GACACTTATG --/TA TATATGTATT 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 TA 2 3 26710 CASAVA_Build 5 106532437 1D TGCTGATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2786 hom 30 9 11 10 A 15 14 26711 CASAVA_Build 5 106535045 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 10 9 26712 CASAVA_Build 5 106541717 2D CTATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 AT 6 5 26713 CASAVA_Build 5 106550248 1D AGCAGTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 21 7 4 A 11 10 26714 CASAVA_Build 5 106550920 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAA 3070 het 3070 hom 26 11 15 0 C 1 0 26715 CASAVA_Build 5 106553705 1I AAAACAGAAT -/A AAAAAAGGGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 26716 CASAVA_Build 5 106570299 1D GGGAAATATG A/- CAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 A 1 0 26717 CASAVA_Build 5 106574264 2D TTCTATGGTC TA/-- TATAAATATA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 TA 3 2 26718 CASAVA_Build 5 106575255 1I TTAAACTCAG -/A AGTCAGCTGA 3070 het 3070 ref 54 26 17 11 A 1 2 26719 CASAVA_Build 5 106575966 1I TATTTCAAGC -/A AATGCAACCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 3 26720 CASAVA_Build 5 106577210 2I TTTGTTCATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 9 11 A 10 12 26721 CASAVA_Build 5 106579373 2D GCCACTTTTT CA/-- CAGTCTGCGT 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 CA 2 1 26722 CASAVA_Build 5 106584707 1I GTTTTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 11 11 A 10 11 26723 CASAVA_Build 5 106590185 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 A 11 10 26724 CASAVA_Build 5 106592339 1I ACGTTCCTTG -/A AAAAATACTA 2407 het 2407 ref 20 11 6 3 A 5 6 26725 CASAVA_Build 5 106599280 1I AGAAGAGGGC -/A AGAAAAAGGT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 1 2 26726 CASAVA_Build 5 106606929 2D GAAAGAGAGC GA/-- GAGAGAGAGA 993 het 993 ref 52 34 3 15 GA 7 6 26727 CASAVA_Build 5 106657217 1D TCTTCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 1673 het 1673 ref 35 21 4 11 A 15 14 26728 CASAVA_Build 5 106678020 1D CTGTTTACAC A/- AAAAACAATA 3070 hom 134 het 46 0 45 2 A 6 5 26729 CASAVA_Build 5 106678884 1D GGCATCGTAT A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 0 26730 CASAVA_Build 5 106701328 3D ATTGCTCATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 32 1 14 18 T 17 14 26731 CASAVA_Build 5 106704655 1D CCAGGATAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 134 het 55 0 45 10 A 10 9 26732 CASAVA_Build 5 106751007 1I CCTTTTTTTC -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 7 8 26733 CASAVA_Build 5 106760685 1I CCACTCTTTA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 0 1 26734 CASAVA_Build 5 106761148 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2654 het 680 hom 21 4 9 8 A 11 12 26735 CASAVA_Build 5 106772493 6D TTACACTTTA AAGAGT/------ AAAATACAAA 3070 het 3070 ref 48 24 23 6 AAGAGT 1 0 26736 CASAVA_Build 5 106784129 13D29M3D TTTTAAAAAA AAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAACACACGCAAAC/-------------AAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACACACGCA--- AACAACAACC 3070 het 3070 hom 15 11 13 8 N/A 0 0 26737 CASAVA_Build 5 106794375 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 79 het 71 hom 18 1 2 16 T 21 18 26738 CASAVA_Build 5 106797501 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 13 12 A 17 16 26739 CASAVA_Build 5 106806680 1I AGATGAGCTC -/T TTGGAAAAGT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 2 3 26740 CASAVA_Build 5 106828664 1D TGTGTGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3044 het 2708 hom 26 11 10 5 T 15 14 26741 CASAVA_Build 5 106832995 1I CTTTCTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 9 10 26742 CASAVA_Build 5 106842875 1D TCTAACCCCA G/- GGGTAAATAT 3070 hom 108 het 39 0 37 5 G 4 3 26743 CASAVA_Build 5 106844507 2D AGGTCTGAAC AA/-- AGAGACAGCT 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 A 3 1 26744 CASAVA_Build 5 106853261 2I ACCCCACCTA --/CC CCCCCCCCAC 1832 het 1832 ref 40 22 8 10 C 8 10 26745 CASAVA_Build 5 106864472 2I AATATTCATT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 9 11 26746 CASAVA_Build 5 106865096 3I AATCAGTTTG ---/GTA GCAATAAACC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 GTA 0 1 26747 CASAVA_Build 5 106882182 1I ACACCATGCC -/A AAAAAAAAAA 2995 het 2995 ref 27 10 7 10 A 11 12 26748 CASAVA_Build 5 106884885 4D ATGTATTTAC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 1544 hom 24 5 12 8 TTAT 4 3 26749 CASAVA_Build 5 106907310 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 10 9 26750 CASAVA_Build 5 106911302 1D TTTTAACCAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 9 8 26751 CASAVA_Build 5 106928236 1I TTTTTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 1564 het 1564 ref 33 13 11 9 G 0 1 26752 CASAVA_Build 5 106937964 1I CCTCCCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 43 1 32 10 A 10 11 26753 CASAVA_Build 5 106942201 3I AAATGATAAA ---/TGG TGGCCTACCT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 TGG 1 2 26754 CASAVA_Build 5 106943235 2I AGTCCTTTTC --/TT TCTCTCTCTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 3 26755 CASAVA_Build 5 106953698 1I TCCATACCTT -/G GTTTCCTCAT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 G 1 2 26756 CASAVA_Build 5 106959082 1D TATCACCACA T/- TTTTTTACAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 7 6 26757 CASAVA_Build 5 106963007 2D ATTATAAAAC AT/-- ATATTTGCAT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 AT 3 2 26758 CASAVA_Build 5 106965023 2I TGCACCATCT --/TC TCAGGACTGT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 TC 1 2 26759 CASAVA_Build 5 106966432 4D AAAGGAGGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 AAAG 3 2 26760 CASAVA_Build 5 106983484 2D AAGAGACAGT AC/-- ACAGAGCTAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 AC 2 1 26761 CASAVA_Build 5 107004958 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 146 hom 27 1 17 10 A 14 12 26762 CASAVA_Build 5 107018614 1D GCGCTCATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 A 11 10 26763 CASAVA_Build 5 107024745 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 2313 hom 33 10 14 9 A 9 8 26764 CASAVA_Build 5 107026391 1I TTGAGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1430 hom 26 5 14 7 A 16 17 26765 CASAVA_Build 5 107042039 2D ATATGTTGAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 AC 10 9 26766 CASAVA_Build 5 107049093 1I ATACACACCA -/T TTTGGCAAAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 3 4 26767 CASAVA_Build 5 107051662 2D CCTGGGCAGA AG/-- GGAATCCACT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AG 1 0 26768 CASAVA_Build 5 107052990 2I AGGCAAATCT --/AA GAGTTATTGA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 0 2 26769 CASAVA_Build 5 107054949 1D AAACAAAAAT A/- AAAAAAAATT 2148 het 2148 ref 17 11 5 1 A 9 8 26770 CASAVA_Build 5 107058073 1I TGCTTAGTAT -/A AAACCCAAAA 3070 hom 129 het 46 0 43 3 A 3 4 26771 CASAVA_Build 5 107062316 2D CTGCTTTTAC TT/-- TATAGTGTGG 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 T 3 1 26772 CASAVA_Build 5 107070483 6I CTAAAGACAC ------/ACACTT ACACATTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ACACTT 0 1 26773 CASAVA_Build 5 107071517 2I GATATTATTA --/AC ACAATAAAAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AC 1 2 26774 CASAVA_Build 5 107072372 4I TTATTATCTG ----/GGGT GGTGGAAATA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 GGGT 0 1 26775 CASAVA_Build 5 107077702 1D16M2D ACAAACAAAC AAACAACAACAACAACAAC/-AACAACAACAACAACA-- AAAAAAAACT 3070 het 2174 hom 31 7 9 20 N/A 0 0 26776 CASAVA_Build 5 107081700 1I CACAGATCCA -/G GAAGCTCAGA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 1 2 26777 CASAVA_Build 5 107087513 1D AATACAACTT A/- AAAAAAAAAA 2714 het 2714 ref 24 14 7 3 A 11 10 26778 CASAVA_Build 5 107090967 1I TCACTCTGAT -/G TTGGTTTCAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 0 1 26779 CASAVA_Build 5 107101272 1D GGCAGCAGAG A/- AAAAAATAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 6 26780 CASAVA_Build 5 107104579 1I GTTTAAAGGC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 87 het 41 0 29 12 A 8 9 26781 CASAVA_Build 5 107107640 2D ACACGTACAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 317 hom 24 1 11 12 AT 9 8 26782 CASAVA_Build 5 107113239 1D GTTCCTACTT A/- AGAGTAGGAC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 2 1 26783 CASAVA_Build 5 107120052 19D TCAGATTTAC ACTCTAGAATGTCTCTTTG/------------------- CCTGAAGTAT 3070 het 3070 ref 45 29 19 4 ACTCTAGAATGTCTCTTTG 1 0 26784 CASAVA_Build 5 107133093 1I AGTCAAAGTA -/G AATTTTGAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 0 1 26785 CASAVA_Build 5 107133807 1I TTGAGAAAAA -/G ATGAAGTCCG 3070 hom 95 het 41 0 30 11 G 0 1 26786 CASAVA_Build 5 107134750 5D GATCTGAACA TATAT/----- TATTAATGTA 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 TATAT 1 0 26787 CASAVA_Build 5 107135933 3I TGCAGTCCAG ---/TAT TATTATCCTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TAT 2 3 26788 CASAVA_Build 5 107142030 1I CAAGGGAGGA -/C CCCTTTGGAC 3070 het 3070 ref 65 30 27 8 C 3 4 26789 CASAVA_Build 5 107144808 22D GCTGAGAGGC TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/---------------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 36 0 28 22 TG 18 7 26790 CASAVA_Build 5 107177008 3I GCTGATAGGG ---/TAT TATTATAGCT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 TAT 2 3 26791 CASAVA_Build 5 107178783 1D TTTAAGCTTA C/- GGGACCCAGA 3070 het 3070 hom 45 14 22 9 C 1 0 26792 CASAVA_Build 5 107182128 5I GCAATAACAA -----/TTAAT TTAGTCATTT 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 TTAAT 0 1 26793 CASAVA_Build 5 107182246 1I AACATATTTT -/G TTTAACAGTT 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 G 0 1 26794 CASAVA_Build 5 107188486 1I TTTAAGGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2114 hom 24 8 11 5 T 13 14 26795 CASAVA_Build 5 107189889 1D AATAAAAGTG T/- ATGCACAGCC 3070 het 3070 hom 53 23 28 2 T 1 0 26796 CASAVA_Build 5 107193940 3D AGCTGCAAAT GTG/--- GGGACTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 GTG 1 0 26797 CASAVA_Build 5 107229688 1D AAAGATGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 12 11 26798 CASAVA_Build 5 107229884 1D GTGCCACAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 9 8 26799 CASAVA_Build 5 107241770 1D GTATAAAAAA T/- AATCTTAATT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 1 0 26800 CASAVA_Build 5 107252641 1D CTAGTGGGTA C/- GTAGTAGTAC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 C 1 0 26801 CASAVA_Build 5 107260457 1D AAATTTGGCA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 85 het 36 0 31 6 T 8 7 26802 CASAVA_Build 5 107264216 10I GATATGCTTA ----------/CAGCATGTAG TAACTACTAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CAGCATGTAG 0 1 26803 CASAVA_Build 5 107277707 1I CCAGTAAAAC -/T GGTGAAATGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 1 26804 CASAVA_Build 5 107280200 5D ATTTTAAATG AAGTC/----- AAGTCTAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 6 AAGTC 2 1 26805 CASAVA_Build 5 107292021 1D ACATACTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 14 12 T 11 10 26806 CASAVA_Build 5 107294593 1D AATAAAGACA T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 7 6 26807 CASAVA_Build 5 107295157 1D AGGCTGAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 10 9 26808 CASAVA_Build 5 107296474 1I AAGAAATACA -/T TAAGATGTCT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 1 2 26809 CASAVA_Build 5 107299762 1I TGATAGTTTC -/T TTTTAGTTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 4 5 26810 CASAVA_Build 5 107300155 16I TTAACAACTA ----------------/TTCTTTTGTCCTACTT TTCTTGAATT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TTCTTTTGTCCTACTT 0 1 26811 CASAVA_Build 5 107304718 1D AAATCAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 12 11 26812 CASAVA_Build 5 107315712 1D CACAAGCATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 10 9 26813 CASAVA_Build 5 107316701 1D TTCATACTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 10 9 26814 CASAVA_Build 5 107336785 1I CCTGGCCACA -/G GAAGAGCTAA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 G 1 2 26815 CASAVA_Build 5 107336955 11D TTTTTTGTAA TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 2794 hom 29 12 11 6 T 22 11 26816 CASAVA_Build 5 107344002 1D TTACTTAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 11 10 26817 CASAVA_Build 5 107359344 5D TAACATTAAA TAAAT/----- TAAATAAGTA 3070 het 3070 hom 26 11 14 4 TAAAT 2 1 26818 CASAVA_Build 5 107377682 3I TATCCAAGAG ---/TAC TACTATGCAG 3041 het 3041 ref 27 17 7 3 TAC 1 2 26819 CASAVA_Build 5 107379523 1D ACAAGATGCA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 45 25 12 8 T 8 7 26820 CASAVA_Build 5 107383531 2I TTCTAAATGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 A 10 12 26821 CASAVA_Build 5 107401889 13I AGTTGTAATA -------------/ACAGGACTGTATG ACAGGACTGT 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 ACAGGACTGTATG 1 2 26822 CASAVA_Build 5 107407867 1D GGTCATAATG A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 46 14 26 7 A 8 7 26823 CASAVA_Build 5 107419650 2I TAAAACTATT --/TA TATATATATC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 TA 4 5 26824 CASAVA_Build 5 107441263 1D ATCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 8 15 11 A 15 14 26825 CASAVA_Build 5 107445818 1I CCCCTCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 21 16 13 A 13 14 26826 CASAVA_Build 5 107454520 7I AAACATGAAT -------/ACAAAAC ACATAGTCAC 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 ACAAAAC 0 1 26827 CASAVA_Build 5 107458475 1I ACAAGGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 599 hom 44 2 34 8 A 12 13 26828 CASAVA_Build 5 107458850 1D TCAAATGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 A 12 11 26829 CASAVA_Build 5 107474030 1I ATACAAAACA -/G AAAAACCTAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 G 0 1 26830 CASAVA_Build 5 107475044 2I TTTCTCTAAA --/AC ACACATCATC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 AC 2 3 26831 CASAVA_Build 5 107477998 4I CATCATTTAT ----/ATTA ATTGAGTGTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 ATTA 0 1 26832 CASAVA_Build 5 107480349 1I ATTATGTGCA -/T CATAATTTCT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 T 0 1 26833 CASAVA_Build 5 107493383 1I CAAAATAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 A 8 9 26834 CASAVA_Build 5 107493545 4I AAAAAGTGAC ----/CAGA CAATGTGATA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 CAGA 0 1 26835 CASAVA_Build 5 107505023 2I GCTAACATGC --/TG TATCCCTGCT 3070 het 3070 hom 53 25 25 3 TG 0 1 26836 CASAVA_Build 5 107523616 1I TATCCCTGTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 A 8 9 26837 CASAVA_Build 5 107528934 6I TGAAAAGATG ------/ATCACC TAAATGTAAA 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 ATCACC 0 1 26838 CASAVA_Build 5 107531048 1I AAGAGAACTT -/A AATAAGTTTA 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 A 2 3 26839 CASAVA_Build 5 107535420 1I TGTTGTGGGA -/G GGACTTGGTG 3070 het 2478 hom 28 9 15 4 G 2 3 26840 CASAVA_Build 5 107550096 2D ATTTGGCCAG GC/-- GCGGTGGCTC 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 GC 2 1 26841 CASAVA_Build 5 107564110 2I GCTGACCAAG --/TT TTTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 T 3 5 26842 CASAVA_Build 5 107568409 9D TACCCCTTAA AAGTTTTTT/--------- AATCATTATG 1658 het 1658 ref 19 14 5 2 AAGTTTTTT 1 0 26843 CASAVA_Build 5 107576394 2D ACAGGAGTCA GG/-- GACCCACTTG 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 G 3 1 26844 CASAVA_Build 5 107582292 1I ACACTGAGCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 8 9 26845 CASAVA_Build 5 107582908 1I TTCAAGTTAT -/C TATTTCTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 C 0 1 26846 CASAVA_Build 5 107587420 1I TAAAATTCAA -/T CCAAATATCT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 0 1 26847 CASAVA_Build 5 107594552 1D AATTTTTTTT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 A 8 7 26848 CASAVA_Build 5 107596781 1D TTTCACAATT G/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 44 25 15 5 G 1 0 26849 CASAVA_Build 5 107598167 1D GCCTTCCTTT A/- ACCTCCAGAG 3070 het 3070 hom 42 13 22 9 A 2 1 26850 CASAVA_Build 5 107625292 5D GCAAATATAC AGGAT/----- AGAAGGGTTA 3070 het 3070 hom 36 15 18 6 AGGAT 1 0 26851 CASAVA_Build 5 107626344 1D AACCACCATC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 A 8 7 26852 CASAVA_Build 5 107634688 1D AAGACAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 12 11 26853 CASAVA_Build 5 107641609 2I GAGGGAACAC --/AG GAGTTCAACA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 AG 0 1 26854 CASAVA_Build 5 107644333 1I AGAATGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 10 11 26855 CASAVA_Build 5 107652130 4I AACCGAACAT ----/AGTA AGTACATTAT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 AGTA 1 2 26856 CASAVA_Build 5 107657883 1D ATATATACTG A/- AAAAAAAAAA 1363 het 1363 ref 10 4 3 4 A 11 10 26857 CASAVA_Build 5 107692304 1D TAATATGCAC T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 T 8 7 26858 CASAVA_Build 5 107701800 3I ATGAAAAGCT ---/AGC AGAACATGAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AGC 0 1 26859 CASAVA_Build 5 107707782 1I CTAGGGGGTC -/G GGGGGGGAAA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 G 7 8 26860 CASAVA_Build 5 107721490 2I AAAATAAAAC --/AT ATCAAAATTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AT 1 2 26861 CASAVA_Build 5 107731346 3D CTTAAAAAAC AAG/--- AAGACAGTAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 AAG 2 1 26862 CASAVA_Build 5 107742102 3I CCTCTCTACG ---/CAA CAACCCTTCT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 CAA 1 2 26863 CASAVA_Build 5 107753117 1D ACAGAGGAAG T/- TGTGGCAGGA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 2 1 26864 CASAVA_Build 5 107758428 5D AAAAAGAAAC TTTCA/----- TTTCTTTTTC 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 TTTCA 1 0 26865 CASAVA_Build 5 107759845 1D AACATCTTTC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 30 12 11 8 T 9 8 26866 CASAVA_Build 5 107772665 4I GGAGTTCAAG ----/GTTA GCCTGCAACA 3070 hom 71 het 26 0 24 2 GTTA 0 1 26867 CASAVA_Build 5 107779268 5D TATAATACCG AATAC/----- AATGTAAATG 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 AATAC 1 0 26868 CASAVA_Build 5 107791569 1D TTTTCATTGA T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 49 23 25 1 T 7 6 26869 CASAVA_Build 5 107797594 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2723 het 230 hom 13 2 11 0 T 15 14 26870 CASAVA_Build 5 107813914 1D AAGATGAGTG A/- ACCACATTGG 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 A 2 1 26871 CASAVA_Build 5 107824553 26D ACTGTCTCAA ACACACACACACACACACACACACAC/-------------------------- ACACACACAC 1844 het 1844 ref 20 7 4 14 AC 22 9 26872 CASAVA_Build 5 107832733 14D AATATGCCTA CACACACACACAGG/-------------- CACACACACA 3070 het 3070 ref 49 29 21 5 CACACACACACAGG 1 0 26873 CASAVA_Build 5 107837268 1I CCTTAAGGGG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 6 7 26874 CASAVA_Build 5 107837719 1D CTAGAAGAAA G/- AATTTCAAAG 3070 het 3070 ref 20 8 8 4 G 1 0 26875 CASAVA_Build 5 107844140 1I TTAATACAAA -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 C 0 1 26876 CASAVA_Build 5 107845735 1D ACGAGGCAGA G/- GTTGCAGTGA 3070 het 44 hom 13 1 8 4 G 2 1 26877 CASAVA_Build 5 107846368 1D CCCCAGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 43 1 34 8 A 12 11 26878 CASAVA_Build 5 107861601 4D AAAAGTAAGC CTCT/---- CTTTTATTCA 3070 het 3070 hom 35 16 18 3 CT 3 1 26879 CASAVA_Build 5 107869379 1I GCTTTTAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 T 9 10 26880 CASAVA_Build 5 107877228 2D GCTTTAAGCC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 1451 hom 40 7 13 21 GT 10 9 26881 CASAVA_Build 5 107886892 1D CATGGGGAGT G/- GGGGCAGACA 2943 het 2943 ref 33 15 10 8 G 5 4 26882 CASAVA_Build 5 107898367 1I TTAGAGTAAT -/G GGAACTAGTA 3070 het 3070 ref 30 20 10 0 G 2 3 26883 CASAVA_Build 5 107898798 1I AATCCCTGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 8 9 26884 CASAVA_Build 5 107910690 2I TCCACTAAAC --/AT ATTCAGAATC 3070 hom 104 het 48 0 39 9 AT 1 2 26885 CASAVA_Build 5 107924461 1I CCCAGAAGAC -/T TGACTACATC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 T 1 2 26886 CASAVA_Build 5 107927322 3I CCAGGTGATG ---/GAT GACATCACTG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 GAT 0 1 26887 CASAVA_Build 5 107935757 14I TTTGAAGTTT --------------/TTTCCTAATGTCAG GAGTGGATTG 1916 het 1916 ref 20 15 4 1 TTTCCTAATGTCAG 0 1 26888 CASAVA_Build 5 107948874 4D CCTTTTTCTA CTTT/---- CATGAGGCAT 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 CTTT 1 0 26889 CASAVA_Build 5 107953877 4I ATCTATCATA ----/TTAG TTCTCTCCCT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 TTAG 0 1 26890 CASAVA_Build 5 107954247 1I AATAAACATA -/C TTGGCACTGA 3070 het 3070 ref 58 27 22 9 C 0 1 26891 CASAVA_Build 5 107957601 1D TACCAGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1952 hom 24 7 13 4 A 14 13 26892 CASAVA_Build 5 107965983 1D GATCAACTGT C/- CTGGTTTGCT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 C 2 1 26893 CASAVA_Build 5 107967931 1D GAGAAAAAAA C/- AAGTTGTGCA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 C 1 0 26894 CASAVA_Build 5 107972671 2D ATCTTTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 12 10 26895 CASAVA_Build 5 107974052 3I AAGAGTTAAG ---/GGA GGAGAAGGAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 GGA 1 2 26896 CASAVA_Build 5 107974322 1I AATGGGTTAT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 7 8 26897 CASAVA_Build 5 107974424 1I TATAAAAAAA -/T ATGTATCAAT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 0 1 26898 CASAVA_Build 5 107991050 1D AGTACTCAGT A/- AAAAAATGTA 3070 het 2946 hom 15 6 8 1 A 7 6 26899 CASAVA_Build 5 108004220 2I TGTCATGTTC --/CA CACAGAGTCA 3070 het 3070 hom 59 22 31 6 CA 2 3 26900 CASAVA_Build 5 108005595 14D ACCATATATT CAGCCCTTATTTGA/-------------- TATCTCCACA 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 CAGCCCTTATTTGA 1 0 26901 CASAVA_Build 5 108053456 11I CTGACTAAGA -----------/CACATCTTAGT CAGCATTTAT 764 hom 14 het 13 0 5 8 CACATCTTAGT 0 1 26902 CASAVA_Build 5 108054793 1I CATAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 902 hom 28 2 22 4 A 11 12 26903 CASAVA_Build 5 108057138 6D AGATCTTGTG AGACTT/------ ATTCACTACC 3070 hom 90 het 35 0 29 9 AGACTT 1 0 26904 CASAVA_Build 5 108060966 1D GAAGAAGCAG A/- AAAAAAGTAA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 7 6 26905 CASAVA_Build 5 108062337 3I CATAACTGAC ---/ATT ATAGGAAACT 3070 hom 113 het 44 0 38 6 ATT 0 1 26906 CASAVA_Build 5 108064652 1D CTGATGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 11 10 26907 CASAVA_Build 5 108066095 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2108 hom 15 het 6 0 5 1 A 9 8 26908 CASAVA_Build 5 108129533 1D CATGACTGAA T/- TTTTTTTTTT 1719 het 1719 ref 38 29 4 5 T 15 14 26909 CASAVA_Build 5 108231914 4D TTTTTGAAAG TTTA/---- TTTGTCAGCT 3070 het 3070 hom 31 11 19 4 TTTA 1 0 26910 CASAVA_Build 5 108257569 1D AGGAAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3029 het 3029 ref 36 15 9 12 T 17 16 26911 CASAVA_Build 5 108310405 3I AAAGCATTAG ---/TTC TTCTATTTAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTC 1 2 26912 CASAVA_Build 5 108349895 1D TTTTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1977 het 1977 ref 40 26 6 8 T 12 11 26913 CASAVA_Build 5 108412440 1I CAGATCTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 9 10 26914 CASAVA_Build 5 108417175 1I CAGAACTCTT -/A AAAAATAGAA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 A 5 6 26915 CASAVA_Build 5 108426708 3D ATTATTTATA TTG/--- TTCTCATAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 TTG 1 0 26916 CASAVA_Build 5 108433734 1D TAAAGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2035 hom 27 5 17 5 T 11 10 26917 CASAVA_Build 5 108445656 1I AAATTTGAAC -/T GGGGGACAGG 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 T 0 1 26918 CASAVA_Build 5 108446236 1D GAGAAAGGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 10 9 26919 CASAVA_Build 5 108448108 1D AATTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 A 9 8 26920 CASAVA_Build 5 108448200 1D TTTAAAAAAA T/- ATTTTTGGAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 1 0 26921 CASAVA_Build 5 108449888 1I TCCTTACATC -/T CATTTGTCAA 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 T 0 1 26922 CASAVA_Build 5 108451251 1I TCCTCATTGG -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 7 8 26923 CASAVA_Build 5 108457774 1D CCTTTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2679 hom 25 10 8 8 T 13 12 26924 CASAVA_Build 5 108460275 10D TTAAGATTTG TGCCTATTCC/---------- TGAACCAATC 3070 het 3070 ref 48 22 21 9 TGCCTATTCC 1 0 26925 CASAVA_Build 5 108461001 1D CAAAAGGGGT G/- TGAGTTATCT 3070 het 3070 ref 46 28 16 3 G 1 0 26926 CASAVA_Build 5 108464467 1D TCTATTCTCA T/- TTTCCAAAGA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 T 4 3 26927 CASAVA_Build 5 108464577 2D TTTAATGCTC TT/-- TTGGACAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 T 4 2 26928 CASAVA_Build 5 108480027 1D TCCCCCCGCC A/- AAAAAAAAAA 2877 het 2877 ref 25 11 9 5 A 15 14 26929 CASAVA_Build 5 108486122 1D ATGTGCTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3043 hom 24 9 13 2 A 12 11 26930 CASAVA_Build 5 108488976 4D ATATTTTATC TATT/---- TATGTAAGTG 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 TATT 1 0 26931 CASAVA_Build 5 108493661 2I TGTGCGTAGG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 11 26932 CASAVA_Build 5 108494110 2I AAACAGAAAC --/AG AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 AG 0 1 26933 CASAVA_Build 5 108499140 9I AATGTCATGC ---------/AGAAGAATT AGAAGAATTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 AGAAGAATT 1 2 26934 CASAVA_Build 5 108500694 3I CGTTGTGTCT ---/TAA TGATGTCAGT 3070 het 3070 hom 49 16 29 4 TAA 0 1 26935 CASAVA_Build 5 108505535 4I AGCATAAAAG ----/CCTA CCTACAGACA 3070 het 3070 ref 53 31 19 3 CCTA 1 2 26936 CASAVA_Build 5 108506335 1I AAAGAAACAG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 A 7 8 26937 CASAVA_Build 5 108509009 1D AAACTTTCTC A/- TATCATTTTA 3070 het 3070 hom 38 11 26 1 A 1 0 26938 CASAVA_Build 5 108512687 1I CTGATATATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 A 8 9 26939 CASAVA_Build 5 108516810 1I ATTTTATGGT -/A AAAAAAAAAA 2878 het 2878 ref 29 14 10 5 A 13 14 26940 CASAVA_Build 5 108517678 1I ATACTTACGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 A 10 11 26941 CASAVA_Build 5 108523049 4I GGGATCACTC ----/TGTT TGTTGAATGA 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 TGTT 1 2 26942 CASAVA_Build 5 108530565 1I AGATACAAAA -/G GGGTAGAGAA 3070 het 3070 ref 53 26 24 3 G 3 4 26943 CASAVA_Build 5 108540704 1D TATAAGTGAT A/- TAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 50 15 25 10 A 1 0 26944 CASAVA_Build 5 108541156 6D ACAGAACAAG ACGTGC/------ ACCATTGTGC 3070 het 3070 ref 49 28 15 8 ACGTGC 1 0 26945 CASAVA_Build 5 108542993 5I TTTCTAGATT -----/GTTGA GTTTTACCAA 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 GTTGA 0 1 26946 CASAVA_Build 5 108552520 2I CATGCGCGTG --/CA CACACACACC 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 CA 4 5 26947 CASAVA_Build 5 108563399 1D ATCTTACCTG T/- TTTTGGCATT 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 T 5 4 26948 CASAVA_Build 5 108566292 1D GATCAACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2228 hom 23 8 9 6 A 12 11 26949 CASAVA_Build 5 108572108 4I TTAATGTAGC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 het 1428 hom 27 6 17 4 ATTT 3 4 26950 CASAVA_Build 5 108603055 1I GCCAGAGTGA -/C CCCCCTGACC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 C 5 6 26951 CASAVA_Build 5 108615142 2D TTGCTATCCT CA/-- GTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 53 22 20 13 CA 1 0 26952 CASAVA_Build 5 108619788 1D GGCTATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 A 11 10 26953 CASAVA_Build 5 108631442 1D ACTCTAGCAG C/- CCAGGGTCCA 3070 het 3070 hom 29 9 13 8 C 3 2 26954 CASAVA_Build 5 108632359 1I GTTGTGGGAT -/G GGGGGGAGTG 3028 het 2534 hom 15 6 7 2 G 6 7 26955 CASAVA_Build 5 108633107 3I23M1D GGTGGTCAAA ---AAGAAGAAAGAGGTTGAAAGATTA/AAGAAGAAGAAAGAGGTTGAAAGATT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 26 22 4 N/A 0 0 26956 CASAVA_Build 5 108635233 1D AAAGTTTTCT C/- CCTTTCTGTA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 C 3 2 26957 CASAVA_Build 5 108636919 6D GGGGTGCAGG GGGCTA/------ GGGGAGGGAT 1245 het 1245 ref 16 12 3 1 GGGCTA 1 0 26958 CASAVA_Build 5 108637578 5D AAAAAAAAAA AAAAC/----- CACTTAGGAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 AAAAC 1 0 26959 CASAVA_Build 5 108640928 1D TGACAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 24 0 20 5 A 11 10 26960 CASAVA_Build 5 108650696 2D TCAAACACAC AT/-- GTTTTACAAT 2569 het 2569 ref 16 9 6 1 AT 1 0 26961 CASAVA_Build 5 108654460 1I CTGACCAGTG -/A GAGAGCTCCA 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 0 1 26962 CASAVA_Build 5 108655082 1D TGAGCATTGG C/- CTCCTAAAAT 3070 het 3070 ref 47 20 17 11 C 2 1 26963 CASAVA_Build 5 108656912 4I AATGCAAAAG ----/GACT GACTGAAATC 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 GACT 1 2 26964 CASAVA_Build 5 108657940 1D AAGTAGGCTT A/- TATCCCTGGA 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 A 1 0 26965 CASAVA_Build 5 108677515 1D AAAACAAAGG T/- TTGATAGAAC 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 T 3 2 26966 CASAVA_Build 5 108678780 1D GAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1687 hom 18 5 8 5 A 10 9 26967 CASAVA_Build 5 108683528 1I GGGTGGGGGT -/G GGGGGGGTGG 3070 hom 45 het 21 0 14 7 G 7 8 26968 CASAVA_Build 5 108683967 1D CTCTATCATG C/- CCCTCTAAGG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 C 4 3 26969 CASAVA_Build 5 108687951 1D TTTGTTTGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 9 8 26970 CASAVA_Build 5 108689547 1D GAATAATTGT A/- AAAAAACAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 7 6 26971 CASAVA_Build 5 108694990 2D AAATAAAAAG TC/-- TAACACTCTA 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 TC 1 0 26972 CASAVA_Build 5 108696252 3D TATTTTGACT TAA/--- TAAGGTTCCC 3070 het 3070 ref 27 16 11 3 TAA 2 1 26973 CASAVA_Build 5 108702718 1D GAAACAAGTT G/- GGGGTCTAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 G 5 4 26974 CASAVA_Build 5 108707770 4I TTTTAAATTT ----/TTAA TTAATTATTC 2811 het 2811 ref 36 20 6 10 TTAA 1 2 26975 CASAVA_Build 5 108718380 1D TTAAATATAT C/- AATATTAGAT 940 het 940 ref 9 4 2 3 C 1 0 26976 CASAVA_Build 5 108722982 2I CCCCTAACCC --/CT GTGTTGTTCA 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 CT 0 1 26977 CASAVA_Build 5 108724467 1D GTGGCTCACA C/- CTGTAATCCC 2896 het 1570 hom 13 4 6 3 C 2 1 26978 CASAVA_Build 5 108726016 2I TATTTTACAT --/AC AGAGAAGGAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 AC 0 1 26979 CASAVA_Build 5 108726781 1D AGAATTATGT A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 7 6 26980 CASAVA_Build 5 108727290 4D ATAACTCTGC TTAT/---- TTAAACTATA 3070 het 3070 ref 30 14 13 7 TTAT 1 0 26981 CASAVA_Build 5 108728376 1D60M1I CTTAAAATGT AAAAAAAAAACTGTAAGAAAAACATCAATATATATCAACAGAAAGGAGGCAAAGGATATAA-/-AAAAAAAAACTGTAAGAAAAACATCAATATATATCAACAGAAAGGAGGCAAAGGATATAAT TAATTAGCAG 3070 het 3070 ref 28 18 15 13 N/A 0 0 26982 CASAVA_Build 5 108729183 1D GTATGAATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 10 9 26983 CASAVA_Build 5 108731174 1I CAACAGATGC -/A AAGGACAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 2 3 26984 CASAVA_Build 5 108731557 1I CATTTACATC -/T TTGTCTATGG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 2 3 26985 CASAVA_Build 5 108743577 1D ATAAAAAAAA T/- GAAGACATTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 T 1 0 26986 CASAVA_Build 5 108750480 1I ATTTAGGGTC -/T TATCTAAATA 3070 hom 156 het 54 0 52 2 T 1 2 26987 CASAVA_Build 5 108750906 1D ATATTCCGTC T/- ACCACTTTCT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 1 0 26988 CASAVA_Build 5 108751431 1I GACAAAGGCC -/T TGTTTATTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 26989 CASAVA_Build 5 108751807 6D CAAGTAGACC CACAGA/------ AAGCCCACAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 6 CACAGA 1 0 26990 CASAVA_Build 5 108753505 1D TTGCAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 15 12 4 T 13 12 26991 CASAVA_Build 5 108754285 1I CTTGGTAATT -/A TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 0 1 26992 CASAVA_Build 5 108756545 1D TAAAGAAAGA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 7 6 26993 CASAVA_Build 5 108759966 4D GGTGAAATGT CAGC/---- ATCATTTTCT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 CAGC 1 0 26994 CASAVA_Build 5 108762793 1I CCTGGGTGAC -/A AGAGTGCAAC 3070 hom 7 het 26 1 17 8 A 1 2 26995 CASAVA_Build 5 108767158 1I ACATAGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 14 15 26996 CASAVA_Build 5 108769524 1I TTAGGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 10 11 26997 CASAVA_Build 5 108771837 1D TTCTTCCATA C/- TGTTTAATTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 9 C 1 0 26998 CASAVA_Build 5 108772603 1I CGGATGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 T 13 14 26999 CASAVA_Build 5 108783672 1I AAAGATCCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 8 9 27000 CASAVA_Build 5 108797802 3D AAAATAGAAG AAA/--- AAAAGCAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 7 4 27001 CASAVA_Build 5 108798255 1I GACTCTGCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 10 11 27002 CASAVA_Build 5 108812458 1D7M1D TTTGTATTTT ATTTTTTAT/-TTTTTTA- TTTTTTAGTA 2150 het 2150 ref 23 18 5 1 N/A 0 0 27003 CASAVA_Build 5 108834968 1D2M3D AGGAGATACA TGAATG/-GA--- GAAGCACAGA 3070 het 3070 hom 39 19 20 2 N/A 0 0 27004 CASAVA_Build 5 108835107 1I TCCTTCTCCT -/G GCAAAGCATG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 1 2 27005 CASAVA_Build 5 108846206 4I GACAGATTTG ----/AATT AATTAAACAA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AATT 1 2 27006 CASAVA_Build 5 108849480 3D GGCCTTCAGG TCC/--- TCATGTTATA 3070 het 3070 hom 49 21 26 3 TCC 1 0 27007 CASAVA_Build 5 108852378 4D ATATTTACAG TAAC/---- TAACATTTTA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 TAAC 2 1 27008 CASAVA_Build 5 108859655 1D CTAATGTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 8 7 27009 CASAVA_Build 5 108871505 1I TGTTTGATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 53 23 16 14 T 9 10 27010 CASAVA_Build 5 108876114 2I TTTGTCTTTA --/TC TCTCTCTGTG 3070 hom 88 het 39 0 28 11 TC 3 4 27011 CASAVA_Build 5 108881239 2I AACCACAGAC --/AT ATATTCTTGA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 AT 2 3 27012 CASAVA_Build 5 108886318 1I TGTTTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 11 12 27013 CASAVA_Build 5 108891017 1D TATTCTGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 12 11 27014 CASAVA_Build 5 108895035 1D TGAAATTTTA G/- TTTCTCTATA 3070 het 3070 hom 40 15 19 7 G 1 0 27015 CASAVA_Build 5 108899053 1D GTTGTGGGGT G/- GGGGGAGGGG 629 hom 7 het 4 0 3 1 G 6 5 27016 CASAVA_Build 5 108899370 3I GCTGGTGGGA ---/AGG AGAATGGTAC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AGG 0 1 27017 CASAVA_Build 5 108903153 1I ACCAAGTTGG -/A AAACACTCTT 3070 hom 39 het 24 0 14 10 A 3 4 27018 CASAVA_Build 5 108904814 4D TCAAAAAATC AATG/---- AATCCAGGAG 3070 het 3070 hom 16 7 9 0 AATG 1 0 27019 CASAVA_Build 5 108913631 1D ATTTAAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 27 1 19 7 A 11 10 27020 CASAVA_Build 5 108918783 4D GTTTTACGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 123 het 48 0 41 10 TA 7 5 27021 CASAVA_Build 5 108929794 1I GAAATATCCG -/T TTTTTTTTTC 2671 het 2671 ref 21 8 7 6 T 9 10 27022 CASAVA_Build 5 108940116 1D CATTATGTCT A/- AAAAAATACT 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 A 7 6 27023 CASAVA_Build 5 108940746 1I TGAGGGTTGG -/A AATCAGCTTC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 2 3 27024 CASAVA_Build 5 108941082 1I ATTTTGAAAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 T 9 10 27025 CASAVA_Build 5 108943867 4D CATTTACAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 AAAC 5 4 27026 CASAVA_Build 5 108960459 1I TTTTGAAGTT -/G GGGAGGTGCT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 G 3 4 27027 CASAVA_Build 5 108961123 1I CGTTACCCTC -/T TAAGTTCCGT 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 T 1 2 27028 CASAVA_Build 5 108966760 1I TAATAATTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 9 10 27029 CASAVA_Build 5 108968359 2I CGGCCATGAC --/TT TGATTTTTAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 T 1 3 27030 CASAVA_Build 5 108968643 1D TCTCTACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 22 1 13 9 A 15 14 27031 CASAVA_Build 5 108973950 1D AAGCTTGGTT A/- AAGCATTCAA 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 A 3 2 27032 CASAVA_Build 5 108984061 1I GGTGTGTGGG -/T TTTTTACTTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 5 6 27033 CASAVA_Build 5 108985884 16I CAGCATGATT ----------------/TATAGTCATTTGGGTA TATACCCAGT 1639 het 1639 ref 25 20 4 1 TATAGTCATTTGGGTA 0 1 27034 CASAVA_Build 5 108994735 1I TGAATGTTAA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 6 7 27035 CASAVA_Build 5 109007086 1I GCTTTGATAC -/T TGTTTGATGT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 1 2 27036 CASAVA_Build 5 109015490 1I AGGTTGTTGG -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 6 7 27037 CASAVA_Build 5 109018378 1I GGGGATGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 461 hom 38 2 26 10 A 11 12 27038 CASAVA_Build 5 109019536 1D TTGTACCACC A/- AAAACAGCCC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 A 5 4 27039 CASAVA_Build 5 109021956 1D AGGGACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 13 14 T 15 14 27040 CASAVA_Build 5 109022867 1D CAATTACACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 20 10 8 2 T 10 9 27041 CASAVA_Build 5 109025943 1I ATATCTCATA -/G GTAATAGACA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 G 1 2 27042 CASAVA_Build 5 109025997 5D TTCAGTAAAT ATAAC/----- AATCAATTTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 10 ATAAC 1 0 27043 CASAVA_Build 5 109026076 1I CTTTACAGCA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 6 7 27044 CASAVA_Build 5 109026778 1D GGTCTCCATC T/- TTTTTTTTTT 1536 het 1536 ref 29 20 4 6 T 11 10 27045 CASAVA_Build 5 109028816 1D TTTGTATTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 27046 CASAVA_Build 5 109029023 1I ATTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 27 0 22 5 T 10 11 27047 CASAVA_Build 5 109029577 4D ATTTAAGATA GTTT/---- AAGGGGCATT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 GTTT 1 0 27048 CASAVA_Build 5 109029772 4I GGTAATCATC ----/TAAG TAAGGCAAGT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 TAAG 1 2 27049 CASAVA_Build 5 109033977 6I ATGTCTGAGA ------/TGTGAG TGTGCACTGA 3070 het 3070 ref 53 29 16 8 TGTGAG 0 1 27050 CASAVA_Build 5 109038991 7I ATGATTTTAA -------/ATTAGCT AAAAGCACCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 ATTAGCT 0 1 27051 CASAVA_Build 5 109047666 4I TTATCTATCA ----/ATCT ATCTATTTTC 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 ATCT 1 2 27052 CASAVA_Build 5 109056786 1D GAGATTTATA C/- CCTTCCCAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 C 3 2 27053 CASAVA_Build 5 109057942 1D CTTGTATACC T/- TTTTTTTTTT 1536 het 1536 ref 29 18 4 7 T 13 12 27054 CASAVA_Build 5 109062115 2I TAGTATTAAG --/GT GTTAGTGTTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GT 1 2 27055 CASAVA_Build 5 109063035 1I TAATAAAGCA -/T TGTAGTTTTG 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 1 2 27056 CASAVA_Build 5 109063202 4I TTTGTCAGTT ----/AAAG AGAGCTCGTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAAG 0 1 27057 CASAVA_Build 5 109063465 1I AAAAAATGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 8 9 27058 CASAVA_Build 5 109063882 1D GTTTTGCCGG T/- TTTTTTTTTT 1939 het 1547 hom 29 13 7 9 T 17 16 27059 CASAVA_Build 5 109072774 1I TGGAAGCACA -/G GAGTTTGACT 3070 hom 117 het 50 0 39 11 G 1 2 27060 CASAVA_Build 5 109074297 1I TATTTACCTA -/T TTTTTTTTTT 1826 het 1826 ref 22 8 6 8 T 11 12 27061 CASAVA_Build 5 109075049 2I ATTCATCAAC --/TG TGTACCTGAC 3070 hom 144 het 51 0 48 3 TG 1 2 27062 CASAVA_Build 5 109075512 1D AATGTGTAGA G/- GGGCTCTTTC 3070 hom 139 het 54 0 45 10 G 4 3 27063 CASAVA_Build 5 109077045 1I CACATAATTT -/A AAAAAAAAAA 3005 het 2914 hom 29 9 11 9 A 11 12 27064 CASAVA_Build 5 109080664 1I AGTTGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 749 hom 26 2 19 5 T 11 12 27065 CASAVA_Build 5 109084679 1I CTTTGTGTGA -/T TTTTTTAACC 3070 het 3070 ref 50 21 21 8 T 6 7 27066 CASAVA_Build 5 109092640 1D AATTGAATTA G/- ATACTATAAT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 G 1 0 27067 CASAVA_Build 5 109094161 1I AAAACTGATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 8 9 27068 CASAVA_Build 5 109104328 3D TCTCTCAGAA TCT/--- TCTTATTTAT 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 TCT 2 1 27069 CASAVA_Build 5 109117612 1I AGGCTCAAGC -/A AATCCTCCCA 3070 het 937 hom 17 3 12 2 A 2 3 27070 CASAVA_Build 5 109119329 3D TGTTAAGACT TGA/--- TGACAAGAGG 3070 het 3070 ref 42 24 13 6 TGA 2 1 27071 CASAVA_Build 5 109127122 3D AAATTTATTT TAG/--- TATTATTATT 3070 het 1684 hom 18 5 12 1 TAG 1 0 27072 CASAVA_Build 5 109130321 2D CAATATTACT TA/-- TGTCAGTTTA 3070 het 3070 ref 49 28 17 4 TA 1 0 27073 CASAVA_Build 5 109139080 1D GTTCTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 36 1 30 6 T 11 10 27074 CASAVA_Build 5 109141684 1I AATTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 13 14 27075 CASAVA_Build 5 109151820 1I CTGAATTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1305 hom 28 5 16 7 A 15 16 27076 CASAVA_Build 5 109160194 1D AAGGAAACTT A/- ACGATAGATC 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 A 2 1 27077 CASAVA_Build 5 109161651 3D AATTAAAAAT GAA/--- GAATTAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 GAA 2 1 27078 CASAVA_Build 5 109174592 1D AGTTTTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 28 1 19 8 T 14 13 27079 CASAVA_Build 5 109191705 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3067 het 327 hom 13 1 9 3 A 14 13 27080 CASAVA_Build 5 109192666 2D AAATATAAAC TA/-- TTTCTCAACA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 TA 1 0 27081 CASAVA_Build 5 109198034 1D TTAGTACTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 10 9 27082 CASAVA_Build 5 109199888 1I TTTTGTGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 9 10 27083 CASAVA_Build 5 109213315 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 T 8 9 27084 CASAVA_Build 5 109228051 1D GTATCAATTT A/- AATGATACAT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 3 2 27085 CASAVA_Build 5 109237527 4I CTTGAGTGAC ----/TAAG TAAGTCCACT 3070 het 3070 ref 46 19 16 11 TAAG 1 2 27086 CASAVA_Build 5 109238970 5D AAATCTCATT TCTCA/----- TAGAAGTTTC 3070 het 3070 ref 53 28 22 6 TCTCA 1 0 27087 CASAVA_Build 5 109244919 1I TATGATCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 36 2 27 7 T 10 11 27088 CASAVA_Build 5 109247820 1D CGTGCCTGAC A/- AGGCTTTGCC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 2 1 27089 CASAVA_Build 5 109249038 3D GCACCTGCTG GAT/--- CCCGGGGCCG 1541 het 1298 hom 17 6 6 6 GAT 1 0 27090 CASAVA_Build 5 109250097 1I TTTGAGAGAC -/A AGAGTCTCAC 3070 het 3070 hom 38 12 24 2 A 1 2 27091 CASAVA_Build 5 109329182 1I GGGACACTTT -/G GGGGAATTGT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 G 4 5 27092 CASAVA_Build 5 109342088 3D TTTTTAAAAT CTG/--- CTTGTTTTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CTG 1 0 27093 CASAVA_Build 5 109367405 4D ACTTAGGTAC ACAA/---- ACAAAGACTA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 ACAA 2 1 27094 CASAVA_Build 5 109385621 1I CAGAAAACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 9 10 27095 CASAVA_Build 5 109390794 1I GCAGAGTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 12 13 27096 CASAVA_Build 5 109396073 1I TTCTTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 T 12 13 27097 CASAVA_Build 5 109405096 1I CTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 10 11 27098 CASAVA_Build 5 109408284 1I TTCATTTTCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 7 8 27099 CASAVA_Build 5 109413040 1I ACACCTGCCT -/C CTTATCCTTT 2708 het 2708 ref 23 12 6 5 C 1 2 27100 CASAVA_Build 5 109424392 5I GAAGATAATT -----/AAAGA AAGAAGGAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAAGA 0 1 27101 CASAVA_Build 5 109432356 4D TTTGCCTCTC TGTT/---- TGCCTGTTGT 3070 het 3070 hom 37 16 18 6 TGTT 1 0 27102 CASAVA_Build 5 109435723 1D TTGCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 19 14 T 13 12 27103 CASAVA_Build 5 109437139 1D CTTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 856 hom 39 4 16 19 T 13 12 27104 CASAVA_Build 5 109438086 2I ATTTTTAGTC --/TT TTTTTTTCTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 9 27105 CASAVA_Build 5 109441709 25D CATTCCTTCT AGTTTAACCAATTTGGTAGTATATA/------------------------- AATATTCATA 2031 het 2031 ref 30 27 5 8 AGTTTAACCAATTTGGTAGTATATA 1 0 27106 CASAVA_Build 5 109443373 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 44 0 33 11 A 12 11 27107 CASAVA_Build 5 109443456 2I ACATATATAC --/AT ATATATACAC 3070 hom 123 het 48 0 42 7 AT 3 4 27108 CASAVA_Build 5 109474081 2D GTCAAGCTTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 109 het 46 0 37 9 A 11 9 27109 CASAVA_Build 5 109481059 1D ATGGATGCAA T/- TTCATAGCAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 3 2 27110 CASAVA_Build 5 109487842 7D CTCATTCCTT TTTTATG/------- GCTGCATAGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TTTTATG 1 0 27111 CASAVA_Build 5 109488359 1I GATGGGGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 9 10 27112 CASAVA_Build 5 109500603 1I TGTCAGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 26 1 20 5 T 11 12 27113 CASAVA_Build 5 109501779 1I TTTTCAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 36 0 28 8 T 12 13 27114 CASAVA_Build 5 109506031 1I TAAAAAAATC -/A AATGGCCATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 3 27115 CASAVA_Build 5 109506857 2I ATGAAGGTTA --/TC TTAATTTGCT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 TC 0 1 27116 CASAVA_Build 5 109513547 2D TCAATATCCC CT/-- GTTTAGCTCT 3070 hom 92 het 32 0 30 5 CT 1 0 27117 CASAVA_Build 5 109515045 1D TAAAATTTAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 A 9 8 27118 CASAVA_Build 5 109517499 1I TTAAAAATAG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 86 het 37 0 29 8 T 7 8 27119 CASAVA_Build 5 109524588 2I AGCTGTAGTC --/TG TAATAGGCAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TG 0 1 27120 CASAVA_Build 5 109525835 1D AGATTATATA T/- TGGTATATAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 2 1 27121 CASAVA_Build 5 109562064 4I TGTATATATA ----/TATT TATATGTGTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TATT 0 1 27122 CASAVA_Build 5 109566149 6I TAGTCCTCCA ------/TTTATT TTTATTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TTTATT 1 2 27123 CASAVA_Build 5 109573385 1I ATGGGATTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 T 9 10 27124 CASAVA_Build 5 109575910 1I TTTCTCTTTT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 A 7 8 27125 CASAVA_Build 5 109592358 4I TTTAAAGAAG ----/GTTA GTAAGATACA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 GTTA 0 1 27126 CASAVA_Build 5 109595737 1D CATATTGCCC A/- AAGCAATCTA 2749 het 2749 ref 26 17 7 4 A 3 2 27127 CASAVA_Build 5 109604808 1D AGTCTGTTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 9 8 27128 CASAVA_Build 5 109606284 2D CCTATGGCAC AT/-- ATAAGTAAAA 3070 het 3070 hom 45 22 20 3 AT 2 1 27129 CASAVA_Build 5 109607017 1D TGCTCTGCTG A/- ACAATCCCTA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 2 1 27130 CASAVA_Build 5 109634267 1I TCACTTTGTT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 0 1 27131 CASAVA_Build 5 109748082 1D GTTGCAACTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 9 27132 CASAVA_Build 5 109752239 1I ATCACATCTT -/C CCCAATCCAG 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 C 3 4 27133 CASAVA_Build 5 109797353 1D CGTTTTTAAA T/- TTTAATTCTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 3 27134 CASAVA_Build 5 109797767 1D AGAATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 11 10 27135 CASAVA_Build 5 109805608 1I TGGAGCTCCA -/T TGTATGTGGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 2 27136 CASAVA_Build 5 109817130 1D TTGATCTCCT G/- GACCTCATGA 3070 hom 51 het 31 0 19 12 G 2 1 27137 CASAVA_Build 5 109818513 1D CGTAAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 A 12 11 27138 CASAVA_Build 5 109856983 1D CAAGACATTG A/- AAAAAAAAAA 1266 het 1266 ref 35 24 4 7 A 13 12 27139 CASAVA_Build 5 109863889 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1414 het 200 hom 10 1 3 6 A 19 18 27140 CASAVA_Build 5 110037591 1I AGGTAACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1051 hom 30 3 22 5 A 15 16 27141 CASAVA_Build 5 110038614 24D GTTATTATTC TATTTATTTATTTATTTATTTATT/------------------------ TATTTATTTA 3070 hom 42 het 19 0 15 9 TATT 11 5 27142 CASAVA_Build 5 110043356 4D TCACTCATTA ATAT/---- ATATAATTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 AT 4 2 27143 CASAVA_Build 5 110069336 2I ACACACACAC --/AT ATATGTGTGT 2914 hom 39 het 16 0 14 2 AT 2 3 27144 CASAVA_Build 5 110072193 3I GAAGTTAAAA ---/AGT AGAGTTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AGT 0 1 27145 CASAVA_Build 5 110079361 1I CCTCATTATA -/C CCTCCTCCCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 2 3 27146 CASAVA_Build 5 110089535 4D CCAACCAAAT GATA/---- GAATTTGTTC 3070 hom 66 het 23 0 23 1 GATA 1 0 27147 CASAVA_Build 5 110100603 1D TCCTTATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 33 0 18 16 A 17 16 27148 CASAVA_Build 5 110113277 1I GGAAATTTGC -/T TTTGGGTCTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 4 27149 CASAVA_Build 5 110117911 1I TCCCTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1145 hom 37 4 26 7 T 10 11 27150 CASAVA_Build 5 110123205 1D AAGTAAGCAA G/- GGGGGAATAC 3070 hom 141 het 49 0 46 3 G 6 5 27151 CASAVA_Build 5 110128668 1D TCTGTATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 22 23 8 T 12 11 27152 CASAVA_Build 5 110136238 1D ACTACATGTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 9 8 27153 CASAVA_Build 5 110154275 1D CTATTTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 10 9 27154 CASAVA_Build 5 110164189 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 10 11 27155 CASAVA_Build 5 110165482 1I AGAATTTCTG -/T TAGTTTTCTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 1 2 27156 CASAVA_Build 5 110172329 1I GTCAAATTAC -/A AAAAGAGTTA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 4 5 27157 CASAVA_Build 5 110174610 1I ATGGTGGGCA -/G GGGGAGGTAG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 4 5 27158 CASAVA_Build 5 110184582 1D ATCTTGATTC T/- TTTTTTTTTT 1068 het 1068 ref 35 25 3 7 T 11 10 27159 CASAVA_Build 5 110251799 1I TAAGTCTTTA -/G GTCGTCTTGA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 1 2 27160 CASAVA_Build 5 110258803 1D ACATATAAAC T/- TTGTCTGGTA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 3 2 27161 CASAVA_Build 5 110296670 1I TAGTCACCAG -/T TTTTTTTTTT 3015 het 3015 ref 35 21 9 5 T 10 11 27162 CASAVA_Build 5 110302200 1I CTTCACAGAA -/T TGGAAAAAAC 2418 hom 12 het 5 0 5 0 T 1 2 27163 CASAVA_Build 5 110312147 3D TCTTGCTCTC TAT/--- TTTTATGTTT 3070 het 3070 ref 66 36 30 4 TAT 1 0 27164 CASAVA_Build 5 110312325 3D CACACCTTAA TTT/--- TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 62 29 26 10 T 9 6 27165 CASAVA_Build 5 110313371 1I GAACCTTTTT -/A AGAACTTCCC 3070 het 3070 ref 54 33 18 3 A 1 2 27166 CASAVA_Build 5 110314270 6D GGAACGAGAC CTAGAA/------ CTGTGTCGCT 3070 het 3070 ref 61 47 12 6 CTAGAA 1 0 27167 CASAVA_Build 5 110345455 1D CAGTACTAAG A/- GGACATTTAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 1 0 27168 CASAVA_Build 5 110359253 3I CTCTTCTGTC ---/TCT TCTGCTATCT 3070 hom 143 het 54 0 44 10 TCT 1 2 27169 CASAVA_Build 5 110369203 1I AAACCTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 10 11 27170 CASAVA_Build 5 110399474 1I ATCTAGAAAC -/A AATTTAGAGC 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 2 3 27171 CASAVA_Build 5 110424631 2D TTTGTTTTAT AA/-- AAGGTAAATG 3070 het 3070 hom 26 8 16 3 A 4 2 27172 CASAVA_Build 5 110445402 1I TCCTTACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1929 hom 54 7 34 13 A 14 15 27173 CASAVA_Build 5 110457630 3D GAGTAAAAAG AAA/--- AAAAAAAGGA 3070 hom 120 het 43 0 41 5 A 10 7 27174 CASAVA_Build 5 110464036 1D TATTTCTCAA G/- GGAATGTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 3 2 27175 CASAVA_Build 5 110465728 1I AATTTCTTAA -/T TGAGGTGGCA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 1 2 27176 CASAVA_Build 5 110465900 1D GTTTTCCTCC A/- AAAAAAAAAA 749 het 749 ref 38 31 3 5 A 13 12 27177 CASAVA_Build 5 110477993 1I TACTCAGGAA -/T TGGATAAGCT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 1 2 27178 CASAVA_Build 5 110499393 1D TATTTCAATC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 40 0 33 8 T 9 8 27179 CASAVA_Build 5 110505969 1I TAAAAAAAGA -/T TGGTAGGGGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 2 27180 CASAVA_Build 5 110521092 26D TAGGGTAGTA AGTCCATGAAGCCATTGCTGTTCCAG/-------------------------- GCTCCATCTG 3070 hom 91 het 25 0 31 5 AGTCCATGAAGCCATTGCTGTTCCAG 1 0 27181 CASAVA_Build 5 110575065 6D TTCCTTTTAG GTTTTT/------ GTTTTTGTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 10 GTTTTT 3 2 27182 CASAVA_Build 5 110575967 2D TCTCTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 87 het 39 0 28 12 TC 8 7 27183 CASAVA_Build 5 110594163 2D ATTTTGGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 34 0 23 12 A 14 12 27184 CASAVA_Build 5 110602145 1D GAAAAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 36 0 26 10 T 12 11 27185 CASAVA_Build 5 110611944 7D ATAGCTTTTA AATGTTT/------- GCTGGTCTTT 3070 hom 103 het 36 0 31 10 AATGTTT 1 0 27186 CASAVA_Build 5 110615492 1D GTTCACTGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 10 9 27187 CASAVA_Build 5 110618659 1D CTTAGTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 33 0 25 8 A 12 11 27188 CASAVA_Build 5 110625159 1D ACCCTAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 478 hom 37 2 26 10 T 15 14 27189 CASAVA_Build 5 110631452 2D ATTAGTGAGA AT/-- GCTGATGAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AT 1 0 27190 CASAVA_Build 5 110641978 1I GGCTTGTTTG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 8 9 27191 CASAVA_Build 5 110664573 3D GGGATTTTAT TTA/--- TTATTAAGAA 2253 het 2253 ref 23 15 6 2 TTA 3 2 27192 CASAVA_Build 5 110664725 1I AGACATATGA -/C CCCCCCTCCT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 C 6 7 27193 CASAVA_Build 5 110684095 4D TTTTTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTC 3070 het 3070 ref 53 25 23 7 TTGT 3 2 27194 CASAVA_Build 5 110685107 6D TATTACTGAA TGTCAC/------ TGACAAGCCT 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 TGTCAC 1 0 27195 CASAVA_Build 5 110690281 1I AGCTATAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 9 10 27196 CASAVA_Build 5 110693685 2D TTCTACTCCC CA/-- CCACCCCTAC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 CA 1 0 27197 CASAVA_Build 5 110694100 3D GTTTGGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 TTG 4 3 27198 CASAVA_Build 5 110694339 2I CATAGATAAC --/TG TACTGTAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 0 1 27199 CASAVA_Build 5 110694861 1I CAAAGTTATA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 6 7 27200 CASAVA_Build 5 110695848 1I CCACAACAGT -/C CCCGGAGTGT 1346 het 1346 ref 11 7 3 1 C 3 4 27201 CASAVA_Build 5 110697008 4D TATTTTGAAG CAAA/---- CAAAGAGGAC 3070 het 3070 hom 44 19 23 4 CAAA 2 1 27202 CASAVA_Build 5 110698411 2D CAAAAACAAA AG/-- AATAAAATCA 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 AG 1 0 27203 CASAVA_Build 5 110700078 1D AATATAGGTT A/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 A 1 0 27204 CASAVA_Build 5 110706160 1I TTGGTGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 9 10 27205 CASAVA_Build 5 110707457 2D CAATTGTGAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 A 11 9 27206 CASAVA_Build 5 110715964 1I TGTTCACAAA -/T TGGCAAAATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 27207 CASAVA_Build 5 110717333 3D AAATTAAGAA AAC/--- AATCTCTTTT 3070 het 3070 ref 36 23 10 4 AAC 1 0 27208 CASAVA_Build 5 110718047 1I CACCACAAAA -/T AAAAAAAAAC 3070 het 126 hom 40 2 17 21 T 0 1 27209 CASAVA_Build 5 110718212 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATCACTT 3070 het 2984 hom 22 7 13 2 AGG 1 0 27210 CASAVA_Build 5 110718427 1D CTACACTTTG C/- CACTGTGCCC 3070 het 3070 hom 39 18 16 6 C 2 1 27211 CASAVA_Build 5 110721156 2I CACTGTAAAC --/AG AGGACGAAAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 AG 1 2 27212 CASAVA_Build 5 110726043 2D TGTGTAAAAG AT/-- AACAAAATTT 2256 het 2256 ref 21 11 6 4 AT 1 0 27213 CASAVA_Build 5 110727804 1I GAGAGTTATT -/A AATCAGGATC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 2 3 27214 CASAVA_Build 5 110729119 2D AGGAATGTGT AA/-- TAGTGAAAGG 3070 hom 159 het 59 0 53 7 A 2 0 27215 CASAVA_Build 5 110729776 3D TGTACTTAGC ATA/--- ATATCTCTGG 3070 het 3070 hom 40 19 20 5 ATA 2 1 27216 CASAVA_Build 5 110737025 6D AAATGTAAAA TATATT/------ TATATGTTGC 3070 hom 96 het 34 0 33 3 TATATT 1 0 27217 CASAVA_Build 5 110738599 1I ATAATGAGAA -/G GGGATTCTCC 3070 hom 131 het 50 0 44 6 G 3 4 27218 CASAVA_Build 5 110742502 1D TTCACATGTT C/- CCATGTCCTC 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 C 3 2 27219 CASAVA_Build 5 110742597 2I CTTTAGCTGA --/CT CTTTTTTATG 3070 hom 114 het 44 0 36 8 CT 1 2 27220 CASAVA_Build 5 110745536 7I ACAGAATTAG -------/TAAAGGT TAATGATCTT 3070 hom 113 het 43 0 38 5 TAAAGGT 0 1 27221 CASAVA_Build 5 110755653 1I GCTGTTCTTA -/T TTCTTCGTAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 2 3 27222 CASAVA_Build 5 110758826 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 342 het 342 ref 24 5 6 14 A 11 9 27223 CASAVA_Build 5 110763731 1I TGAGGGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 9 10 27224 CASAVA_Build 5 110765128 1I TCTGAGCATC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 8 9 27225 CASAVA_Build 5 110768526 5D ATAAGATCAA CAATT/----- CAATTCAACA 3070 het 3070 ref 53 32 17 4 CAATT 2 1 27226 CASAVA_Build 5 110769665 1I CATTACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 10 11 27227 CASAVA_Build 5 110769996 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTGTAG 2363 hom 9 het 8 0 6 3 T 6 7 27228 CASAVA_Build 5 110773850 1D TCACAATCAT G/- GCAGAAGGGG 2837 het 2837 ref 25 13 6 7 G 2 1 27229 CASAVA_Build 5 110782043 1I GAGACAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 14 0 8 6 T 10 11 27230 CASAVA_Build 5 110789696 1D ATTCCAAATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 25 9 9 7 A 9 8 27231 CASAVA_Build 5 110809470 1I AAATGCATAG -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 6 7 27232 CASAVA_Build 5 110814836 6D12M10D TTCCCTGTAC TATAGGGAAATTTATATATTTATAAAAC/------AAAATTAATATA---------- TATAAATCAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 5 N/A 0 0 27233 CASAVA_Build 5 110818459 1I GGGCTTAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 9 10 27234 CASAVA_Build 5 110820265 1I GTAAACCATT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 9 27235 CASAVA_Build 5 110827835 1D AAGAAAGAGC T/- TCAGAGCTCG 3070 het 3070 ref 24 13 7 4 T 2 1 27236 CASAVA_Build 5 110836713 1I GCATCCCAAA -/C ACAGATAGAC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 C 0 1 27237 CASAVA_Build 5 110838340 1I CAAACTCTAA -/G TTTACCTGAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 G 0 1 27238 CASAVA_Build 5 110842991 1D CCTTCTGGGG A/- GGTCACTCAC 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 1 0 27239 CASAVA_Build 5 110877213 12D AATAATTTGT TTTATATTTATA/------------ TTTATAATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TTTATA 3 1 27240 CASAVA_Build 5 110877398 3D CCTACTTAAT TCA/--- ATTACATTGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCA 1 0 27241 CASAVA_Build 5 110883431 40D AAATTTACTT CATATATATATTTATATATATGAATAAATATATATATTTA/---------------------------------------- ATTCATATAT 3070 het 3070 hom 18 11 11 2 CATATATATATTTATATATATGAATAAATATATATATTTA 1 0 27242 CASAVA_Build 5 110892187 3D GAACGGAGAG ACA/--- ACAATTCTTA 2451 het 2451 ref 33 25 6 4 ACA 2 1 27243 CASAVA_Build 5 110904976 6D AGCTGAAGTA TCAACT/------ TCATCCTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 17 4 TCAACT 1 0 27244 CASAVA_Build 5 110921855 4I TTCTATTCTC ----/TATT TTATCTCTGA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 TATT 0 1 27245 CASAVA_Build 5 110934609 1I TAGTAGATAC -/T TTGCTATCAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 2 3 27246 CASAVA_Build 5 110937274 1I CCAGTTGGTC -/A CAAGAAAGTT 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 A 0 1 27247 CASAVA_Build 5 110946595 7I GGCTTTAGTA -------/TCTGTTT TCTGTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 TCTGTTT 1 2 27248 CASAVA_Build 5 110947925 1D ACCTGTTTTA T/- TTTTTGCAAC 3070 het 3070 hom 27 10 11 7 T 6 5 27249 CASAVA_Build 5 110948722 1D CTGCAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2952 hom 40 10 21 11 A 15 14 27250 CASAVA_Build 5 110950708 1D CTATCAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 144 het 56 0 49 8 A 10 9 27251 CASAVA_Build 5 110955707 1D CTTAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 11 10 27252 CASAVA_Build 5 110958605 3D ATAATAATGG TAA/--- TAATTGTCAC 3070 hom 138 het 55 0 46 10 TAA 2 1 27253 CASAVA_Build 5 110964399 1D TGCTTACTTG C/- CTGCTTCTCT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 C 2 1 27254 CASAVA_Build 5 110964693 1D GCATTTGAAT A/- AAAAAATGAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 7 6 27255 CASAVA_Build 5 110967787 1D CTGGCTCTGA T/- TTTTCTCTCA 3070 hom 135 het 47 0 46 2 T 5 4 27256 CASAVA_Build 5 110980201 1D CGTCTTAGGG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 8 7 27257 CASAVA_Build 5 110986646 1D AAACTCATTA C/- AAATTTATAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 1 0 27258 CASAVA_Build 5 110994490 4I TGTGTGTGTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 45 het 22 0 15 7 TG 7 9 27259 CASAVA_Build 5 110994504 4I TGTGTGTGTG ----/TGTA TATATATATA 3070 het 25 hom 23 2 17 4 TGTA 0 1 27260 CASAVA_Build 5 111017580 7I TCTCTGTGGC -------/AGGGGCA AAATGCCACC 2570 het 2570 ref 30 20 8 2 AGGGGCA 0 1 27261 CASAVA_Build 5 111018952 1I CAGGTTTTTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 A 7 8 27262 CASAVA_Build 5 111043568 1D ATACATCTCA T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 T 8 7 27263 CASAVA_Build 5 111047889 1D CAGAGAATGT C/- CCGCTTTTAC 3070 hom 148 het 53 0 50 3 C 3 2 27264 CASAVA_Build 5 111052025 3D CCTCCCTCTT CTC/--- CTCTACATAT 3070 hom 90 het 32 0 27 7 CTC 2 1 27265 CASAVA_Build 5 111061353 1I AACAAAGTTT -/A AAAAAATGAT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 6 7 27266 CASAVA_Build 5 111064925 1D GGGTGAGGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 16 16 8 A 10 9 27267 CASAVA_Build 5 111081362 1D TTTCTTAGAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 9 8 27268 CASAVA_Build 5 111081944 1D ATTACATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 15 14 27269 CASAVA_Build 5 111085410 4D TACCATAATT GTAA/---- GTTTCCTGAG 3070 het 3070 hom 47 22 24 4 GTAA 1 0 27270 CASAVA_Build 5 111088035 2I CTGATTAAAC --/AT AAACATATTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AT 0 1 27271 CASAVA_Build 5 111088180 1D TCTATTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 31 2 10 20 T 13 12 27272 CASAVA_Build 5 111088940 3I ACCAATACAC ---/TAT TATTTCTCAT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 TAT 1 2 27273 CASAVA_Build 5 111091704 1D TTTTTTTAAT A/- AAAAAAAAAT 2520 het 2457 hom 20 6 11 3 A 10 9 27274 CASAVA_Build 5 111092635 4I AAAAGTGTAG ----/AAAT AAATAAAAGG 3070 het 3070 ref 56 25 17 14 AAAT 1 2 27275 CASAVA_Build 5 111093596 4I GAAAGAACCC ----/AAAG AAAGAGACAC 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 AAAG 1 2 27276 CASAVA_Build 5 111094140 2I AAAGGTGGGG --/GT GGGGGACTCT 3070 het 2302 hom 24 6 13 5 GT 0 1 27277 CASAVA_Build 5 111102224 2D CAAGAGAAAC AG/-- AGTTTCTGCC 3070 het 3070 ref 45 21 18 8 AG 2 1 27278 CASAVA_Build 5 111105031 2I TCAAAAGCCA --/CT CTCTGTTCCC 3070 het 3070 ref 66 28 29 9 CT 2 3 27279 CASAVA_Build 5 111106753 1D AAACAATGGG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 A 7 6 27280 CASAVA_Build 5 111109835 1D GTGGTTATCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 T 9 8 27281 CASAVA_Build 5 111127351 4D TACGTCTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 450 hom 33 6 13 14 TG 10 8 27282 CASAVA_Build 5 111129611 5I ATTGTCAGAA -----/AACAG AACTAAAAAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AACAG 0 1 27283 CASAVA_Build 5 111130893 1I CCTCCCCGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 10 11 27284 CASAVA_Build 5 111142638 2I TTCCCTACTT --/AC AACATATATA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 AC 0 1 27285 CASAVA_Build 5 111146343 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 T 10 11 27286 CASAVA_Build 5 111154371 1D AAGTTATTTA G/- GATATATTGT 3070 het 3070 ref 50 26 19 6 G 2 1 27287 CASAVA_Build 5 111169366 1I TAGAGAAGAG -/A AAAATTTATC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 4 5 27288 CASAVA_Build 5 111169504 2D GAAAATTGTT GA/-- GAGTATATTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 GA 2 1 27289 CASAVA_Build 5 111183727 1I AATCTCCCAC -/T TTTGACATCT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 3 4 27290 CASAVA_Build 5 111192634 1I CAGAGAAAGA -/C CAAGGTCATT 3070 het 3070 ref 63 27 25 11 C 1 2 27291 CASAVA_Build 5 111192695 1I GTGTATCTGG -/A AAAAAAAAAA 1231 het 1231 ref 54 35 3 16 A 11 12 27292 CASAVA_Build 5 111208245 20D ATATCAACTA ATATATATATTATATATATT/-------------------- ATATATATAT 1794 het 934 hom 11 2 5 4 ATATATATATTATATATATT 1 0 27293 CASAVA_Build 5 111208874 1D TCAATGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 51 0 41 11 T 13 12 27294 CASAVA_Build 5 111215877 1I GTATAGTCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 27295 CASAVA_Build 5 111253863 2D CAGGGCACAC TG/-- TTGTAAGGGG 3070 hom 135 het 47 0 46 1 TG 1 0 27296 CASAVA_Build 5 111258046 1D TCTTGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 24 1 18 5 T 12 11 27297 CASAVA_Build 5 111269924 1D AAAAGATAAA T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 8 7 27298 CASAVA_Build 5 111271774 2D TATTTATTTA AT/-- AGTTTCTTTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AT 1 0 27299 CASAVA_Build 5 111278027 9D AGGTGTTCTT ACCTTTCTC/--------- AGCATTCCAC 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 ACCTTTCTC 1 0 27300 CASAVA_Build 5 111282710 1I TTATGCTGCC -/A AAAAAACATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 6 7 27301 CASAVA_Build 5 111288055 1D GTGGTATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 43 0 31 12 A 12 11 27302 CASAVA_Build 5 111288858 2I4M4I AGTTCTGGAC --GGAG----/CTGGTGACCT ATGTCTCTCC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 N/A 0 0 27303 CASAVA_Build 5 111309371 1D CACAGCCCTG T/- TTTTCCTCAG 3070 hom 130 het 51 0 42 9 T 5 4 27304 CASAVA_Build 5 111330891 1I TTTCTTTATA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 7 8 27305 CASAVA_Build 5 111336862 1D ACCCCCTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 10 9 27306 CASAVA_Build 5 111337650 2D ACTGCAAGAG TT/-- TATACACAAG 3070 hom 132 het 50 0 45 6 T 3 1 27307 CASAVA_Build 5 111372244 10D TTAGATTAGG TTTTCTTTTC/---------- TTTTCTTTTT 3070 hom 60 het 32 0 22 10 TTTTC 3 1 27308 CASAVA_Build 5 111389180 1D AGATATGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 502 hom 45 3 30 12 T 12 11 27309 CASAVA_Build 5 111397916 17D GGAAAAATGT CTACAAACTGTTGGTCA/----------------- CAATTGCTTC 3070 het 3070 ref 22 15 10 2 CTACAAACTGTTGGTCA 1 0 27310 CASAVA_Build 5 111414855 1D ATACACCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1074 hom 45 4 33 9 A 13 12 27311 CASAVA_Build 5 111429470 1I TATTCAGTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 43 0 30 13 T 7 8 27312 CASAVA_Build 5 111445367 1D CCCCAATTTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 A 9 8 27313 CASAVA_Build 5 111463647 2D AAGATTAATA CT/-- GTTTTCATGC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 CT 1 0 27314 CASAVA_Build 5 111465314 1D GTATCAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 910 hom 46 4 37 5 A 13 12 27315 CASAVA_Build 5 111469265 1I TCTCCTCTTC -/T GACCCTCAGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 1 27316 CASAVA_Build 5 111499931 1I ACAAAGGACA -/G TGTAGCTTAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 G 0 1 27317 CASAVA_Build 5 111511509 1D ATGGCACATG A/- CTTTAGTCCC 2682 het 2682 ref 15 7 6 2 A 1 0 27318 CASAVA_Build 5 111514970 4D CAAGAAGAGG ATAA/---- ATATATATTT 1638 hom 15 het 8 0 5 3 ATAA 1 0 27319 CASAVA_Build 5 111519782 1I TTCTTAATTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 8 9 27320 CASAVA_Build 5 111522766 1I CTGAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 10 11 27321 CASAVA_Build 5 111528716 5I ATTTCTTCTC -----/TAAAA TAAAATATAT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TAAAA 1 2 27322 CASAVA_Build 5 111530179 3I CTGAGATGGC ---/CTT CTCTGACCAC 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 CTT 0 1 27323 CASAVA_Build 5 111537155 1D TGTTTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 10 27324 CASAVA_Build 5 111539319 4D TCTGAAGATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 33 het 12 0 12 2 TG 7 5 27325 CASAVA_Build 5 111539628 3D TCTACTCTCT TCA/--- TTTCTCACCA 3070 het 3070 hom 35 17 16 5 TCA 1 0 27326 CASAVA_Build 5 111542177 1D CTGTTCAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 T 10 9 27327 CASAVA_Build 5 111546419 2D GAAGGTGCTA TC/-- TCACAACAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 TC 2 1 27328 CASAVA_Build 5 111546485 1D TTAGGTTGCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 18 10 9 A 9 8 27329 CASAVA_Build 5 111548689 1D CTGTGAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 26 0 13 14 T 15 14 27330 CASAVA_Build 5 111555272 1I ATTTATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1914 hom 37 10 13 14 A 16 17 27331 CASAVA_Build 5 111567364 1D TCGTCTGGGC G/- CAGTGGCTTA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 G 1 0 27332 CASAVA_Build 5 111610815 2I CCACCACTGT --/CC CCAATTACCT 3070 hom 141 het 50 0 47 3 C 2 4 27333 CASAVA_Build 5 111615657 1D AATGTGTGGC T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 8 7 27334 CASAVA_Build 5 111639347 1D AAACCACCCA C/- CTATCATTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 2 1 27335 CASAVA_Build 5 111643566 1D TCTATTTGCC T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 T 6 5 27336 CASAVA_Build 5 111649855 1I TATCTACAGG -/A AAAAAAAAAC 953 het 953 ref 46 36 3 7 A 9 10 27337 CASAVA_Build 5 111653454 1D TAATTTAAAG C/- CCCTACATTT 3070 het 3070 hom 56 21 32 3 C 4 3 27338 CASAVA_Build 5 111678102 22D CATCGCTACT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/---------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2153 hom 24 9 12 3 A 33 11 27339 CASAVA_Build 5 111688483 4D ATAAAATAAA TAAG/---- TATTTATGAT 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 TAAG 1 0 27340 CASAVA_Build 5 111690066 1D TAATTTTAGT A/- AAAAACACTT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 6 5 27341 CASAVA_Build 5 111702630 1I GTGACAGGGT -/G GGGGGAGAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 G 5 6 27342 CASAVA_Build 5 111725308 2D CTAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 435 hom 10 het 12 0 4 8 AT 1 0 27343 CASAVA_Build 5 111726514 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 444 hom 27 1 20 6 T 9 10 27344 CASAVA_Build 5 111727339 3D TAAATTTTTA AAT/--- ATTAAGTTTA 3070 hom 96 het 33 0 33 1 AAT 1 0 27345 CASAVA_Build 5 111729073 1D TAAAGACTGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 7 27346 CASAVA_Build 5 111796157 11D TTGTCAACAT TCGTAGACTCG/----------- TCAACCTGGA 3070 het 3070 ref 53 30 23 3 TCGTAGACTCG 1 0 27347 CASAVA_Build 5 111853803 1I TGTTCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3007 het 3007 ref 30 12 11 7 T 13 14 27348 CASAVA_Build 5 111859517 1I AATTTAATGC -/T CATTTGCAGT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 0 1 27349 CASAVA_Build 5 111861707 1D CTTTCTTCTG T/- TCTTGCTAAT 2067 het 2067 ref 32 17 5 11 T 2 1 27350 CASAVA_Build 5 111862500 1I CTCCAAATGC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 7 8 27351 CASAVA_Build 5 111875162 5D AAAACAAACT GAAAA/----- GAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 GAAAA 3 2 27352 CASAVA_Build 5 111888234 1D ACTTGCCTAC T/- CCATTTGAGT 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 T 1 0 27353 CASAVA_Build 5 111888936 3I CCCTTATTGA ---/GAG GAGGGGCTCC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 GAG 1 2 27354 CASAVA_Build 5 111893220 3D AGATGCACTC CTT/--- CTAAGAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 CTT 1 0 27355 CASAVA_Build 5 111893822 3D CCGAGGTAGC ACA/--- ACAAGTTACA 3070 hom 81 het 29 0 28 4 ACA 2 1 27356 CASAVA_Build 5 111905950 1I AATAAACTAG -/A AAAATCTAGA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 4 5 27357 CASAVA_Build 5 111907242 1I CCAGTATAGC -/A ATGACAATCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 2 27358 CASAVA_Build 5 111907931 1I TTATGCGGCC -/A ACAGACATAT 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 A 1 2 27359 CASAVA_Build 5 111908076 5I TGGAGAAACA -----/GCAAT GCTTTTACAT 2603 het 2603 ref 21 14 6 1 GCAAT 0 1 27360 CASAVA_Build 5 111917544 1D11M2D GACATGGAGA TGAAGTGAGAGAAG/-GACCTCACACA-- TGAGAGAAGT 3070 hom 123 het 40 0 40 4 N/A 0 0 27361 CASAVA_Build 5 111922763 4I TCCTCAACAC ----/TCTT TCTGATTTTG 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 TCTT 0 1 27362 CASAVA_Build 5 111925008 3I TGATAGAACA ---/TAC TGCTGTTTGT 3070 het 3070 ref 53 23 23 10 TAC 0 1 27363 CASAVA_Build 5 111927459 2D CCGATGACTC TG/-- TATCCTGCAG 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 TG 1 0 27364 CASAVA_Build 5 111936996 1I CAGCATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1335 hom 43 4 29 10 T 10 11 27365 CASAVA_Build 5 111938556 1D CTAACCTCCA G/- TCATGGAGAA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 G 1 0 27366 CASAVA_Build 5 111940723 1D GAGCACTAAA T/- TGCTGATGGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 2 1 27367 CASAVA_Build 5 111956084 4D GATTAGACGA TCTC/---- TCTATTTGTG 3070 het 3070 hom 51 22 23 7 TC 3 1 27368 CASAVA_Build 5 111960022 1I TGCCTATATC -/T CATAAGCTCT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 0 1 27369 CASAVA_Build 5 111960976 3D CTTTTGCTTT TTA/--- TTTTAATAAT 3070 het 3070 hom 38 13 19 8 TTA 1 0 27370 CASAVA_Build 5 111964327 1I CAGAAACAGA -/T AAACCAAATA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 0 1 27371 CASAVA_Build 5 111964424 1D GACTAACAGA G/- GGGGAAAGGG 3070 het 3070 hom 41 22 19 0 G 5 4 27372 CASAVA_Build 5 111968753 15D AAAAAAACAG AAAGGGCAAAGTACA/--------------- AAAGGGCACA 2420 het 2420 ref 22 15 6 7 AAAGGGCAAAGTACA 1 0 27373 CASAVA_Build 5 111979802 19D TGTTTTTTTG CCCACTCAGAGAGGTCTAT/------------------- CCACATACTT 3070 het 3070 ref 37 21 17 5 CCCACTCAGAGAGGTCTAT 1 0 27374 CASAVA_Build 5 111985690 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 43 0 35 9 T 11 10 27375 CASAVA_Build 5 111987435 1I CCAGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 10 11 27376 CASAVA_Build 5 111988060 1I GAAGTATCTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 12 25 5 A 8 9 27377 CASAVA_Build 5 112018560 1D TCTACAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 20 3 T 11 10 27378 CASAVA_Build 5 112030560 1I AAACGATTTT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 A 7 8 27379 CASAVA_Build 5 112034465 6I CAGGTGCCAA ------/TTTTCT AATGAGCACT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 TTTTCT 0 1 27380 CASAVA_Build 5 112035353 1I CTTTTACAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 A 9 10 27381 CASAVA_Build 5 112039672 10I GTACCAGCTT ----------/CTCTTTGTAC CTCTGGTAGA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 CTCTTTGTAC 0 1 27382 CASAVA_Build 5 112052725 1D GCTTAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 36 2 12 23 T 12 11 27383 CASAVA_Build 5 112057338 1I TGGCCTATCA -/T TTTTTTAGTC 3070 het 2730 hom 38 9 23 6 T 6 7 27384 CASAVA_Build 5 112059446 1I CATCTCTAAT -/A AAAAAAAAAA 719 het 719 ref 19 7 3 9 A 13 14 27385 CASAVA_Build 5 112061162 2D AGAGTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 38 2 23 14 T 16 14 27386 CASAVA_Build 5 112064262 1D ATTGAATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 10 9 27387 CASAVA_Build 5 112075854 1I CTTGGTTCTG -/T TAACTCCCTA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 1 2 27388 CASAVA_Build 5 112086741 1I CAACATTATT -/A AAAAAAAAAG 2931 het 2931 ref 26 11 8 7 A 9 10 27389 CASAVA_Build 5 112091546 1I CATTTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 11 12 27390 CASAVA_Build 5 112092237 1D GGTGATTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 42 0 33 11 T 10 9 27391 CASAVA_Build 5 112103664 2D AATATATAAC AG/-- AGGTAATTTG 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 AG 2 1 27392 CASAVA_Build 5 112107017 1D TGGTTCTCCA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 101 het 36 0 33 3 T 8 7 27393 CASAVA_Build 5 112108727 2I TAATATGCTG --/TA GTCAGTTATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 0 1 27394 CASAVA_Build 5 112109733 4D AAAACTAGAG GAAA/---- GAAATAGTTT 3070 het 3070 hom 41 16 24 1 GAAA 2 1 27395 CASAVA_Build 5 112110548 2D ACACAAGGGT TA/-- TGAGTTAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 TA 1 0 27396 CASAVA_Build 5 112110838 1I TTTTTCTTGA -/G GGGGGGAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 6 7 27397 CASAVA_Build 5 112114085 4I CTGTTTTTTA ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 TGTT 3 4 27398 CASAVA_Build 5 112119964 5D ATAAACAAAC ATTTT/----- ATTCTTTCCA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 ATTTT 1 0 27399 CASAVA_Build 5 112121910 7D TTTTTGTTTG TTTGTTT/------- TTTGTTTTTT 2009 het 2009 ref 19 6 7 8 TTTGTTT 4 3 27400 CASAVA_Build 5 112126959 1D ATTTTGCAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 6 hom 31 2 25 5 T 10 9 27401 CASAVA_Build 5 112133117 1D TTCGTCAAAT G/- TTTTATGTCC 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 G 1 0 27402 CASAVA_Build 5 112140459 1I AAGAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 11 12 27403 CASAVA_Build 5 112142285 3I TGGGACTACA ---/GGC GCATGCCACC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 GGC 0 1 27404 CASAVA_Build 5 112143264 1I TCATGTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 12 13 27405 CASAVA_Build 5 112153454 1D TTAAAGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 141 hom 29 2 13 14 T 13 12 27406 CASAVA_Build 5 112157094 1D AAGAGACTTA C/- ATGGAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 1 0 27407 CASAVA_Build 5 112157653 1D AAAAAAAAAA G/- GTAGGATGAT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 G 2 1 27408 CASAVA_Build 5 112182051 3D ATTTTAATAA TAT/--- TATCATCTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 5 TAT 2 1 27409 CASAVA_Build 5 112188342 21D CTTGGGGATC TCATTAGTATACCAGGCCAAG/--------------------- TCTTAAGGTC 3070 hom 108 het 37 0 37 4 TCATTAGTATACCAGGCCAAG 1 0 27410 CASAVA_Build 5 112189739 1D CTTCCCAGAT C/- ACTTATTAAA 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 C 1 0 27411 CASAVA_Build 5 112191138 1I ACTAGAGAAG -/T TTTAACTGTG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 3 4 27412 CASAVA_Build 5 112192054 1D GGAGGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 144 hom 26 3 18 5 A 17 16 27413 CASAVA_Build 5 112193944 3D ACAAATTAAA ACT/--- ACAATGAGAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 ACT 1 0 27414 CASAVA_Build 5 112201006 4I ACATGAAATT ----/AGAA AGAACAAAAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AGAA 1 2 27415 CASAVA_Build 5 112208128 1I GTATTTATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 337 hom 52 1 44 7 A 9 10 27416 CASAVA_Build 5 112210016 5I TGAAAATGAA -----/GAGTT CATTCCACAT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 GAGTT 0 1 27417 CASAVA_Build 5 112210264 1D AAGCCCAGCG T/- TGGGAATTAG 3070 hom 107 het 39 0 35 5 T 2 1 27418 CASAVA_Build 5 112211428 4D TTCTTACAAC TCTG/---- TCTAAGATCT 3070 het 3070 hom 40 19 20 4 TCTG 1 0 27419 CASAVA_Build 5 112212971 2I21M3D ATAAAAAAAA --TTAAAAAAAAACAATAGGAAGAGA/ATTAAAAAAAAAACAATAGGAAG--- AGAATAGGTT 3070 hom 48 het 16 0 17 5 N/A 0 0 27420 CASAVA_Build 5 112225971 3D ACGCAGAAAA AGG/--- AGGGGTTGAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AGG 2 1 27421 CASAVA_Build 5 112236537 1D TTACCTTTGG A/- AGTCATTTTG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 2 1 27422 CASAVA_Build 5 112236685 1D TGTGTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 127 hom 26 3 15 8 T 17 16 27423 CASAVA_Build 5 112237369 1I TCCAAGTTCC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 27424 CASAVA_Build 5 112238373 1D TGTGCGCCAA T/- TTTTTTTTTT 2215 het 585 hom 22 4 9 9 T 17 16 27425 CASAVA_Build 5 112241647 4D CTAGAGTGAG TAAC/---- TAACTAACTA 3070 hom 54 het 23 0 19 5 TAAC 4 3 27426 CASAVA_Build 5 112300976 1I AAAAAAAGAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 9 27427 CASAVA_Build 5 112334208 1I CAATGCTGGC -/T TTTTTTTTTT 2050 het 1277 hom 29 11 11 7 T 16 17 27428 CASAVA_Build 5 112344626 1I GACTTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 T 10 11 27429 CASAVA_Build 5 112354480 1D TTTAATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 11 10 27430 CASAVA_Build 5 112356497 1D AAGTAACTTA C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 C 1 0 27431 CASAVA_Build 5 112366761 3I TCAAAAGCTG ---/GTC ACTAATTCCT 3070 hom 93 het 33 0 30 3 GTC 0 1 27432 CASAVA_Build 5 112372073 5I GACAAATAAC -----/TGAAT AAAGCAGTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TGAAT 0 1 27433 CASAVA_Build 5 112383966 2D GGAGAAAGAC TA/-- TAAGTGAATC 3070 hom 84 het 29 0 29 1 TA 2 1 27434 CASAVA_Build 5 112385302 1D TACTGTCAAA G/- TTACTTTGCT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 1 0 27435 CASAVA_Build 5 112387645 1D GGTAACTTTC T/- TTACTACTCC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 3 2 27436 CASAVA_Build 5 112388349 5D TTAATCAGTA TAGTT/----- TAGTTCAGTA 3070 hom 76 het 29 0 26 6 TAGTT 2 1 27437 CASAVA_Build 5 112388620 4I TGGGGGAATT ----/AAAG CTCAGAGAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAAG 0 1 27438 CASAVA_Build 5 112391977 1D AAAAATGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 11 10 27439 CASAVA_Build 5 112403791 1I GGTGGCATGT -/A AGCCTTGGTT 3070 hom 117 het 46 0 37 9 A 1 2 27440 CASAVA_Build 5 112407596 5D ATGAAGGCAC AGAGA/----- AGTTATGCGG 3070 hom 99 het 36 0 32 4 AGAGA 1 0 27441 CASAVA_Build 5 112415724 1I GTATTAGAAC -/T TTTTATTCCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 4 5 27442 CASAVA_Build 5 112417121 1D AATCCCTTAG A/- AATTCAACTC 3070 hom 90 het 35 0 29 8 A 3 2 27443 CASAVA_Build 5 112421102 3I TATTTTAAAA ---/AGG ATGAGAGGGG 3070 hom 111 het 40 0 36 4 AGG 0 1 27444 CASAVA_Build 5 112422742 3I GGAAGGAAAT ---/AAG AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 41 0 30 11 AAG 0 1 27445 CASAVA_Build 5 112438168 3D CAGACGATAG ATA/--- ATAACAAACT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 ATA 2 1 27446 CASAVA_Build 5 112445379 1D AGATTGCCAA T/- TTACCTTAGT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 3 2 27447 CASAVA_Build 5 112464981 1D TAAAATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 11 10 27448 CASAVA_Build 5 112478125 1I ACATGCAACC -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 6 7 27449 CASAVA_Build 5 112495984 2D ATATACATAC AT/-- ATATATATAC 1961 het 571 hom 10 2 7 1 AT 5 4 27450 CASAVA_Build 5 112496020 2D ATATACACAC AT/-- ACATATATAT 378 het 4 hom 9 0 4 5 AT 1 0 27451 CASAVA_Build 5 112501553 1I GGCTACATTA -/G CCCTGTAGCT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 G 0 1 27452 CASAVA_Build 5 112501632 1D CCCAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 28 0 23 5 T 13 12 27453 CASAVA_Build 5 112502497 2I ATCCAGGGGA --/CT CTCTGGTTCT 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 CT 2 3 27454 CASAVA_Build 5 112506449 15D CAGCAGCAGG GATGCTCGTCTCTAA/--------------- GATGGAAGGG 3070 het 3070 ref 51 27 22 7 GATGCTCGTCTCTAA 1 0 27455 CASAVA_Build 5 112509717 1I CGTAAGTTTT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 7 8 27456 CASAVA_Build 5 112511974 1D ACCTACAGGT G/- GATGTCATGA 3070 het 3070 hom 52 16 30 6 G 2 1 27457 CASAVA_Build 5 112536080 5D GCACATCCTC TTCTT/----- TTAAGTAACC 3070 hom 141 het 50 0 48 3 TTCTT 1 0 27458 CASAVA_Build 5 112542523 3I AAAATCTTAT ---/AAC AATATTTACA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAC 0 1 27459 CASAVA_Build 5 112573820 2D AGAGAAGTGA CT/-- CTAACCAGGA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 CT 2 1 27460 CASAVA_Build 5 112574004 9I GTTTTAGTCT ---------/GGAATATAA GGAATATAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GGAATATAA 1 2 27461 CASAVA_Build 5 112717071 2D AACCTCTCTC TT/-- TATGGTCTCT 3070 het 3070 ref 43 24 17 3 T 3 1 27462 CASAVA_Build 5 112723409 4D10M1I ATAAATAGAA TGTTTGGTCCTTTA-/----TGGTCCTTTAG GCCCCTGAAG 3070 het 760 hom 26 3 10 19 N/A 0 0 27463 CASAVA_Build 5 112810022 1D TTGTTAAAAA G/- TGGGCAAAAG 3070 hom 90 het 37 0 31 7 G 1 0 27464 CASAVA_Build 5 112827715 1D TGATTCAATG A/- AGTGACAATA 3070 hom 108 het 40 0 37 5 A 2 1 27465 CASAVA_Build 5 112828211 2I GCTTTGTTTT --/TC TGTTTATTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TC 0 1 27466 CASAVA_Build 5 112828392 1D TAGCAACAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 10 9 27467 CASAVA_Build 5 112834738 2I CCTGTAACTC --/AG AGTCATTTGA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AG 1 2 27468 CASAVA_Build 5 112846066 1D TAAAGTAGAA T/- TCCCATGGTA 3070 hom 114 het 45 0 39 7 T 2 1 27469 CASAVA_Build 5 112850437 1I GATTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 53 hom 28 2 20 6 A 14 15 27470 CASAVA_Build 5 112918934 1D ATTATGCAAA C/- ATTTTTATTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 1 0 27471 CASAVA_Build 5 112919269 3D CTTTCCTTGA TCT/--- TCTTATTCTG 3070 hom 151 het 52 0 51 2 TCT 2 1 27472 CASAVA_Build 5 112975413 1D TATGGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 27 1 22 4 T 11 10 27473 CASAVA_Build 5 113016893 1D AGTACTGATG A/- GTTTTTTTTT 2967 het 502 hom 36 5 23 8 A 1 0 27474 CASAVA_Build 5 113018371 1D AGCTTAGCAT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 9 het 42 1 31 10 C 10 9 27475 CASAVA_Build 5 113059771 1D AAAATGTTTC A/- AAAAAAATCA 3070 hom 116 het 45 0 39 12 A 8 7 27476 CASAVA_Build 5 113060627 1D25M1I CCCTCAAAAG AAAAAAAAGGAGGGTCTATATTATAG-/-AAAAAAAGGAGGGTCTATATTATAGT TTTTTTTTAT 3070 het 230 hom 17 2 14 5 N/A 0 0 27477 CASAVA_Build 5 113061179 3D TGCTGGATCC TTT/--- TCTTCTGCCT 3070 hom 120 het 41 0 41 1 T 4 1 27478 CASAVA_Build 5 113065025 2D ATCATCTCTC TT/-- TGCATTATAG 3070 hom 129 het 50 0 42 9 T 3 1 27479 CASAVA_Build 5 113067697 3I TTTTGAAATA ---/CTT CTTTGCATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTT 1 2 27480 CASAVA_Build 5 113079706 1D TGGGAACAAG C/- CCCCCCTCCC 3070 hom 35 het 14 0 13 1 C 7 6 27481 CASAVA_Build 5 113083681 3I TCATTTTTTC ---/TTT TAAGATATTT 2967 hom 24 het 27 0 9 18 T 1 4 27482 CASAVA_Build 5 113084269 4D AGACAGAGAC AGAG/---- AGAGTTGTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 AG 4 2 27483 CASAVA_Build 5 113098578 1I TAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 850 hom 37 3 24 10 A 11 12 27484 CASAVA_Build 5 113099869 10I CAGGGGTACA ----------/TGTGCAAGGT TGTTACATGG 3070 hom 162 het 56 0 54 2 TGTGCAAGGT 0 1 27485 CASAVA_Build 5 113104558 2I TTAAAACCCA --/CT CTCAAAAGCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CT 1 2 27486 CASAVA_Build 5 113105015 1I TTTCAATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 10 11 27487 CASAVA_Build 5 113105362 1I TGTCCAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 20 0 15 5 T 10 11 27488 CASAVA_Build 5 113106373 1I ATGTATGCAC -/A GTATAAATCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 27489 CASAVA_Build 5 113124453 1D ACTTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 1248 het 1248 ref 38 29 3 6 T 11 10 27490 CASAVA_Build 5 113130018 1I ATGAAAATTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 730 hom 44 2 36 6 A 8 9 27491 CASAVA_Build 5 113135758 1D TTGATGGCGG T/- GGGGTGGTGC 3070 hom 69 het 28 0 22 6 T 1 0 27492 CASAVA_Build 5 113140261 1I GGAGAAAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 77 het 29 0 26 3 A 8 9 27493 CASAVA_Build 5 113141575 1I CTCAGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 10 11 27494 CASAVA_Build 5 113155813 23D AGCACACAAT GGAATATTATTTGACCTTAAGAA/----------------------- GGAATGAAAT 3070 het 3070 ref 28 21 13 2 GGAATATTATTTGACCTTAAGAA 1 0 27495 CASAVA_Build 5 113158243 1D TTTGGTTAAA G/- AATCTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 G 1 0 27496 CASAVA_Build 5 113163930 1I AAACCCTTTT -/C CCCCCTCATT 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 C 5 6 27497 CASAVA_Build 5 113171023 1I CAATAAAAAG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 8 27498 CASAVA_Build 5 113172984 1D CTGTGATAAC A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 A 8 7 27499 CASAVA_Build 5 113180877 3D GAAACTCATC ATG/--- ATAATACTAT 3070 het 3070 ref 27 14 13 3 ATG 1 0 27500 CASAVA_Build 5 113181183 2I ACCCAGGCTG --/GA GTGCAGTGGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 GA 0 1 27501 CASAVA_Build 5 113190085 2D TAACTCATGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 60 het 34 0 21 13 AT 8 7 27502 CASAVA_Build 5 113192782 1I CCAGCATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 29 0 19 10 T 13 14 27503 CASAVA_Build 5 113198435 2D TATTCTGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 35 0 11 24 T 13 11 27504 CASAVA_Build 5 113198498 3D TGATTTGTCA TCC/--- TCCTCTCATA 3048 het 3048 ref 28 10 9 10 TCC 2 1 27505 CASAVA_Build 5 113201206 1I TCACGCCTGT -/A AATCCCAGCA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 A 2 3 27506 CASAVA_Build 5 113216672 1D TTTCTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1189 hom 27 4 16 7 T 13 12 27507 CASAVA_Build 5 113216808 1I TCTTATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 23 1 17 5 T 10 11 27508 CASAVA_Build 5 113223205 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1779 het 410 hom 18 3 7 8 T 17 16 27509 CASAVA_Build 5 113234739 1D GGATTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 909 hom 43 3 31 10 A 13 12 27510 CASAVA_Build 5 113268157 2I TATTTACTTC --/AA GTTTCTCTCT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 0 2 27511 CASAVA_Build 5 113284005 1I CTTACTTTCT -/G GGGGGGTTAA 3070 hom 92 het 37 0 30 7 G 6 7 27512 CASAVA_Build 5 113285429 1D TTTTGGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 30 1 19 10 T 12 11 27513 CASAVA_Build 5 113302099 1D TACACCTAAC T/- GGGAAGCAAG 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 1 0 27514 CASAVA_Build 5 113329873 6I TTATAAAAGT ------/TGGGTG GACCCCAAAT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 TGGGTG 0 1 27515 CASAVA_Build 5 113330643 1D ATGTTTTAAT A/- AAAAATTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 6 5 27516 CASAVA_Build 5 113342874 1D ATCCCACTGT G/- GGGGGCTGCT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 G 6 5 27517 CASAVA_Build 5 113346248 1I TTATTCTGAC -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 7 8 27518 CASAVA_Build 5 113356471 1D AGAGTTTCTG T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 7 6 27519 CASAVA_Build 5 113357796 17I AATAGTGCTG -----------------/CAATAAACATACACGTA CATGTGTCTT 1958 het 1958 ref 24 18 5 1 CAATAAACATACACGTA 0 1 27520 CASAVA_Build 5 113361328 1I TATGAAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 10 11 27521 CASAVA_Build 5 113364842 1I AGACTTCAGA -/C TTAATCAGGG 3070 hom 135 het 55 0 45 10 C 0 1 27522 CASAVA_Build 5 113371854 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 27 het 12 0 10 3 T 6 7 27523 CASAVA_Build 5 113374052 47D TATGATACTT TCTGTTAGTGGAGATCTGAATGGTGGGAAGCCTTCCAAAATGCTTAA/----------------------------------------------- TCAGAGAGTA 3070 het 3070 ref 35 38 9 1 TCTGTTAGTGGAGATCTGAATGGTGGGAAGCCTTCCAAAATGCTTAA 1 0 27524 CASAVA_Build 5 113391189 1D AACATTGTAC T/- GAAGTCCTAG 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 T 1 0 27525 CASAVA_Build 5 113396102 3D AATTTAGTGC CAT/--- CAACTTCCTG 3070 het 3070 ref 56 31 18 8 CAT 1 0 27526 CASAVA_Build 5 113406520 1I TACACCATAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 6 7 27527 CASAVA_Build 5 113411376 1I ACATATAAGT -/A ATACCTGCTG 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 A 1 2 27528 CASAVA_Build 5 113432956 1I TTGCCTCTCA -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 6 7 27529 CASAVA_Build 5 113439325 1I TTTTAGCTAA -/G GGGGGCATTA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 G 5 6 27530 CASAVA_Build 5 113457828 1I GACACTCTTT -/A ACCTGCCCTG 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 A 1 2 27531 CASAVA_Build 5 113467339 1D ATTTGCATAT G/- TTGAATCAGC 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 G 1 0 27532 CASAVA_Build 5 113468978 2I GAGCAAAAGC --/AT TACAGCTTCT 3070 het 3070 hom 48 16 27 5 AT 0 1 27533 CASAVA_Build 5 113471025 1D CCATTGCCCA G/- GCTGGAGTGC 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 G 2 1 27534 CASAVA_Build 5 113471148 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2432 hom 31 8 13 10 T 12 13 27535 CASAVA_Build 5 113471694 1D TCTATCTTTA T/- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 17 7 T 4 3 27536 CASAVA_Build 5 113476266 1I TCAAGATTGT -/C ATTTGTATTA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 C 0 1 27537 CASAVA_Build 5 113501179 5I CCTAGATATG -----/TTAAT TTGTTTTATA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 TTAAT 0 1 27538 CASAVA_Build 5 113509287 1D TCATTAACAT A/- GACCTGATAG 3070 het 3070 ref 23 11 10 3 A 1 0 27539 CASAVA_Build 5 113510899 2D CAGATTAGTC TG/-- TGCCAGCACA 3070 hom 48 het 18 0 17 2 TG 2 1 27540 CASAVA_Build 5 113514703 1I TGTTTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 30 1 23 6 T 10 11 27541 CASAVA_Build 5 113527524 1D ATTTTCTGCC T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 67 het 27 0 23 4 T 8 7 27542 CASAVA_Build 5 113535276 1I TCTTATATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1104 hom 36 3 24 9 T 11 12 27543 CASAVA_Build 5 113536191 2I CATATTTAGT --/TA TATATATATA 1446 het 1446 ref 13 6 3 4 TA 5 6 27544 CASAVA_Build 5 113541231 2I TTCCTGAAAC --/AT AGATATTTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AT 0 1 27545 CASAVA_Build 5 113545610 1D AAGCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 11 10 27546 CASAVA_Build 5 113552334 1I TAAATTGGGG -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 6 7 27547 CASAVA_Build 5 113558483 2D CTTGATTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 42 1 24 17 T 16 14 27548 CASAVA_Build 5 113561922 2D CACCAACCTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 AT 8 7 27549 CASAVA_Build 5 113563209 1I GGGTTTTATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 9 10 27550 CASAVA_Build 5 113566093 4D TTCATGCCTA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 2238 hom 15 5 8 2 AT 10 8 27551 CASAVA_Build 5 113568678 1D TTTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 T 11 10 27552 CASAVA_Build 5 113573534 1D AAATCATTTT A/- TTTTCAGTGC 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 1 0 27553 CASAVA_Build 5 113586678 1D CTAATAAATA T/- TTTTTTGTGT 3070 hom 132 het 58 0 45 14 T 7 6 27554 CASAVA_Build 5 113589722 2I CTGTTTTCTT --/CA GTAGGTTAGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CA 0 1 27555 CASAVA_Build 5 113593204 4D AGATGTAAAT ATTA/---- GTATGTATTT 3070 het 3070 hom 39 11 21 8 ATTA 1 0 27556 CASAVA_Build 5 113593349 3D AATTACTGTT GTG/--- GTACTAATAA 3070 hom 100 het 37 0 34 5 GTG 1 0 27557 CASAVA_Build 5 113593873 3D CTTTTTTTTT TTC/--- TTTCTTTCTT 758 het 304 hom 9 2 5 2 TTC 1 0 27558 CASAVA_Build 5 113595449 2I AAATGCCTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 20 15 14 T 10 12 27559 CASAVA_Build 5 113604024 7D TTTCTTTCTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 21 14 27560 CASAVA_Build 5 113605894 1D ATGGAGAGTT G/- TCTTCAACAA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 G 1 0 27561 CASAVA_Build 5 113606610 2D AGCAAAAGAA AT/-- ATTCTCTGCC 3070 hom 108 het 37 0 37 1 AT 2 1 27562 CASAVA_Build 5 113607094 1I GTATCCACAC -/T ATCTATGCTA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 T 0 1 27563 CASAVA_Build 5 113607940 1D TGGCGGCTCA T/- TGCCACTTGG 3070 hom 41 het 18 0 14 4 T 2 1 27564 CASAVA_Build 5 113609275 1I ATTCTTTGTC -/A AAAAAACCCC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 6 7 27565 CASAVA_Build 5 113611874 16D GAAATTCATC ATGTTTGGAACATTAA/---------------- ATGGTACCTA 3070 het 3070 ref 43 27 17 4 ATGTTTGGAACATTAA 1 0 27566 CASAVA_Build 5 113612121 1I TAAATACTTC -/T TTTTTTTATA 3070 hom 144 het 57 0 49 8 T 7 8 27567 CASAVA_Build 5 113617642 1I AGCACAAGTA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 26 7 12 7 T 7 8 27568 CASAVA_Build 5 113620669 13D ATTCTTCTGC ATATAACTATTTA/------------- ATATTCCCAG 3070 hom 72 het 25 0 25 3 ATATAACTATTTA 1 0 27569 CASAVA_Build 5 113627028 39D AAGCAGGTAG ACTTATCCAGTGAATGCTGGATAAGCAGGTAGACTTATC/--------------------------------------- ACTTATCCAG 3070 hom 72 het 28 0 24 12 ACTTATCCAGTGAATGCTGGATAAGCAGGTAGACTTATC 1 0 27570 CASAVA_Build 5 113628838 1I AATTGTCATA -/T TGTAGAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 27571 CASAVA_Build 5 113637843 3I CTGTAGCCTT ---/GTA GTATAGTTTG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 GTA 1 2 27572 CASAVA_Build 5 113637939 2I TCATATGAAG --/TT TTTAAAGTAG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 T 3 5 27573 CASAVA_Build 5 113659486 7D AAATAAGCTA CCATAAT/------- CCTAAAGTAG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 CCATAAT 1 0 27574 CASAVA_Build 5 113663626 1D AAAAATGGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 8 27575 CASAVA_Build 5 113664649 3I TTATTAAATA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 10 13 27576 CASAVA_Build 5 113682589 2D AGCCATGCCA CT/-- CTGCGATTTT 3070 het 3070 hom 48 21 20 8 CT 2 1 27577 CASAVA_Build 5 113685248 1I ACTGGATTTG -/T TTTTTTTTTT 1020 het 1020 ref 19 12 3 4 T 12 13 27578 CASAVA_Build 5 113694226 7I TCCAAGCCTC -------/CACAAGG CTGTCCTCTT 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 CACAAGG 0 1 27579 CASAVA_Build 5 113732467 1I ACCTATTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 9 10 27580 CASAVA_Build 5 113747061 12D CACTAAATGC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2820 het 2008 hom 30 10 10 11 T 24 12 27581 CASAVA_Build 5 113748558 4D GGAACTGGTC TTAA/---- TTATGTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 TTAA 1 0 27582 CASAVA_Build 5 113751130 1D AAAAACTGCT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 9 8 27583 CASAVA_Build 5 113756403 2D TTTTGTGGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2518 het 2518 ref 30 13 6 11 T 13 11 27584 CASAVA_Build 5 113757570 2D ACAAATAATC AT/-- GTACATTCAC 3070 het 3070 hom 47 10 32 7 AT 1 0 27585 CASAVA_Build 5 113759910 4D CTAGGAAAAC TAAT/---- TAAGAGGGAG 3070 het 3070 ref 28 14 10 6 TAAT 1 0 27586 CASAVA_Build 5 113804431 2D77M1D TATAACAAAC AGGGAATTATTAATAGAAATTTGAACACAATGTGATAGCTAAAACCCACAGATGTTAGTGATCACAATAAATGATATTCT/--GGAATTATTAATAGAAATTTGAACAGAATGTGATGGCTAAAACCCACAGATGTTAGTGATCACAATAAATGATATTC- TTTTTTTATT 3070 het 83 hom 22 1 24 24 N/A 0 0 27587 CASAVA_Build 5 113806571 1I TTTAAAGGTG -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 7 8 27588 CASAVA_Build 5 113807993 1I AAGATACAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 60 26 23 11 A 8 9 27589 CASAVA_Build 5 113828434 4D CTGCATTATC TGTT/---- TGTTTACTAT 3070 hom 87 het 33 0 29 7 TGTT 2 1 27590 CASAVA_Build 5 113829212 1I CCATCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 A 13 14 27591 CASAVA_Build 5 113830071 2D CTTCCTAGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 20 0 16 6 AT 9 8 27592 CASAVA_Build 5 113834927 2D CTTATAATAC TT/-- TTAATACAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 4 2 27593 CASAVA_Build 5 113836147 3I TGTGGAACAC ---/TGA TGAAGCAGTG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 TGA 1 2 27594 CASAVA_Build 5 113840749 1I AAAGAAATCA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 T 6 7 27595 CASAVA_Build 5 113857856 1I TTACAAACTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 9 10 27596 CASAVA_Build 5 113862910 2D CACCCGACTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 37 15 12 11 TA 8 7 27597 CASAVA_Build 5 113930531 1D AGGTTTATTT G/- GGTCACAGTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 G 3 2 27598 CASAVA_Build 5 113935273 1I GGCATGGGAT -/A TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 0 1 27599 CASAVA_Build 5 113943809 1D CTACCTTTAT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 7 6 27600 CASAVA_Build 5 113948220 1I GTCCTGTAGT -/A AATTCCCCAA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 2 3 27601 CASAVA_Build 5 113964678 1I AGATCTAAAA -/T TGGCAAACAC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 1 2 27602 CASAVA_Build 5 113975948 15I AAAAAAGACA ---------------/ACAGAGGATTTCAAT ACGATAATTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 ACAGAGGATTTCAAT 0 1 27603 CASAVA_Build 5 113983023 1I CAAGGGATCA -/G GGTTGTGGAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 2 3 27604 CASAVA_Build 5 113985838 5D TTCTGTATTA TTTTC/----- TTTTATGTCT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 TTTTC 1 0 27605 CASAVA_Build 5 114003474 1D CAGGGTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 12 11 27606 CASAVA_Build 5 114009865 1I GTTTATTATT -/G TTTTTTTAGC 3070 het 2195 hom 19 5 10 4 G 0 1 27607 CASAVA_Build 5 114041667 1I TACATAAAAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 7 8 27608 CASAVA_Build 5 114057387 3D TAATGAAAAT AAC/--- AAATTATTCC 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 AAC 1 0 27609 CASAVA_Build 5 114094092 1D GCTGTTCTTT A/- AGTACATTTG 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 A 2 1 27610 CASAVA_Build 5 114099115 9D GATGCATAGT TTGCAAAAA/--------- TTTTTCTCCC 2745 het 2745 ref 28 17 8 5 TTGCAAAAA 1 0 27611 CASAVA_Build 5 114111800 1I ATAAGAAAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 9 10 27612 CASAVA_Build 5 114112956 1I TGTACTGAAG -/A AGCTGTGAGG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 2 27613 CASAVA_Build 5 114116731 1I TGTGAACTTT -/A AAAAAAAAAA 2782 het 2782 ref 35 11 14 10 A 17 18 27614 CASAVA_Build 5 114139056 7I TAATGTTTCT -------/GCGTCTG GCTTATTTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 GCGTCTG 0 1 27615 CASAVA_Build 5 114154286 1I GTAAAATAGG -/A AGAGTAAAAG 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 1 2 27616 CASAVA_Build 5 114159770 1D TGCTTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 11 10 27617 CASAVA_Build 5 114169788 1I GCCTCTTTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 70 het 32 0 24 8 T 8 9 27618 CASAVA_Build 5 114178615 1I CATTGATTTT -/G TATCCTGAGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 0 1 27619 CASAVA_Build 5 114235006 1I ATATGAAACC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 8 9 27620 CASAVA_Build 5 114247138 4D ACAAAAGTGA GGGG/---- GGGGGGGGGG 3070 het 297 hom 27 4 11 13 G 14 10 27621 CASAVA_Build 5 114250524 1I GGTCCAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 29 2 16 11 T 14 15 27622 CASAVA_Build 5 114293986 5D ATTTTTAAAC TTATT/----- TTAAATTCTG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 TTATT 1 0 27623 CASAVA_Build 5 114296864 4D TTTTCCATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 19 1 11 8 T 18 14 27624 CASAVA_Build 5 114304294 5I TCACTGATTT -----/ATTAG ATTAAATAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 ATTAG 0 1 27625 CASAVA_Build 5 114307743 1D AAACTTGTTT C/- CCAACCCCTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 3 2 27626 CASAVA_Build 5 114317450 1I GCATGGCAAT -/G GGAACTAAAG 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 G 2 3 27627 CASAVA_Build 5 114320416 1D AGCCAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 A 12 11 27628 CASAVA_Build 5 114325178 8D AAAGGGCTAC AGGTCCCA/-------- TGCCAATCTG 3070 het 3070 ref 58 32 23 4 AGGTCCCA 1 0 27629 CASAVA_Build 5 114337816 1D AAAAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2065 hom 30 11 12 8 A 13 12 27630 CASAVA_Build 5 114339522 5I AAAAACATAC -----/TTTAA TTTATCTAAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 TTTAA 0 1 27631 CASAVA_Build 5 114342922 1I AAGGCAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 1234 hom 39 4 27 8 G 0 1 27632 CASAVA_Build 5 114343569 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 956 hom 24 2 14 8 A 14 15 27633 CASAVA_Build 5 114374905 1I GTTCATCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 37 0 29 8 A 10 11 27634 CASAVA_Build 5 114389015 1D AATTGGAGGG A/- AAAAGAGACT 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 A 5 4 27635 CASAVA_Build 5 114395200 3I CACAGAGGGG ---/TCA ACACAGGCTC 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 TCA 0 1 27636 CASAVA_Build 5 114412027 2I TTTTCTGCAT --/TA TAATAAGTAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TA 1 2 27637 CASAVA_Build 5 114416917 1D GAAGAAGGGT G/- GGAGGAAAGG 3070 het 3070 ref 60 32 21 7 G 3 2 27638 CASAVA_Build 5 114417552 1I GAGCATCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 10 10 T 10 11 27639 CASAVA_Build 5 114418064 1I ACCTGCCCCC -/A CAAAGCTCAT 3070 het 3070 hom 48 19 26 3 A 0 1 27640 CASAVA_Build 5 114418749 2I GGCAAGAGAC --/TA TGTGTAGGGG 3070 het 3070 hom 26 9 14 5 TA 0 1 27641 CASAVA_Build 5 114418844 1I TATTCAATTA -/T CCTGCCACCA 3070 het 2693 hom 21 6 11 4 T 0 1 27642 CASAVA_Build 5 114420915 1I CTTTACCATC -/T TGAGGCCATG 2606 het 2606 ref 22 13 6 3 T 1 2 27643 CASAVA_Build 5 114427273 4D3M3I CTATTAAAAA ACTTAAA---/----AAATTT AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 N/A 0 0 27644 CASAVA_Build 5 114429940 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 8 9 27645 CASAVA_Build 5 114430504 2D GGTGCCCCTT AC/-- ACACACATAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 6 AC 4 3 27646 CASAVA_Build 5 114433545 2D GTGTTCTTAC CA/-- CACACACACC 3070 het 3070 ref 47 23 17 8 CA 5 4 27647 CASAVA_Build 5 114435493 3I GACCTGTGCC ---/TCT TCTAACTCCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCT 1 2 27648 CASAVA_Build 5 114436288 1I GGCTCTGAAC -/A AAAAACTCCA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 5 6 27649 CASAVA_Build 5 114460327 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2646 het 2617 hom 30 12 11 7 T 10 11 27650 CASAVA_Build 5 114463457 1I TTTTTAATGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 8 9 27651 CASAVA_Build 5 114468168 1D GTGTCCTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2481 hom 31 11 10 12 A 12 11 27652 CASAVA_Build 5 114474441 1D AACAACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1238 hom 34 5 23 6 A 15 14 27653 CASAVA_Build 5 114507634 2I GCCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 10 12 27654 CASAVA_Build 5 114516936 9I AAAATATCAC ---------/AATCCTAAA AATCCTAAAC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 AATCCTAAA 1 2 27655 CASAVA_Build 5 114517686 1I GCACAGGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 10 11 27656 CASAVA_Build 5 114521731 4I TTTTAAAAAT ----/AAAA GAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 0 4 27657 CASAVA_Build 5 114524792 1I ATGTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 11 12 27658 CASAVA_Build 5 114526556 1D CAAACATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1616 hom 23 10 9 4 T 15 14 27659 CASAVA_Build 5 114539279 3D GCAATATAGT AAA/--- AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 23 13 8 3 A 9 6 27660 CASAVA_Build 5 114540113 1I ACCATTATGC -/T TCTTAGATGT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 1 2 27661 CASAVA_Build 5 114540383 1D TGGAAACCTC T/- CTTTTAATCC 3070 het 3070 hom 37 12 19 7 T 1 0 27662 CASAVA_Build 5 114548084 1D AAAGAAAGGA G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 37 het 36 0 18 19 G 9 8 27663 CASAVA_Build 5 114549197 1D ATATTCTCCT G/- GTTATTGGAT 3070 hom 69 het 25 0 24 3 G 2 1 27664 CASAVA_Build 5 114569533 6I AGGCACTGAT ------/TAAATA TAATCAGTGC 3070 het 3070 hom 48 19 20 10 TAAATA 0 1 27665 CASAVA_Build 5 114575971 1I TGCTACAAAT -/C CCCCCCACCC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 C 6 7 27666 CASAVA_Build 5 114587712 1I AAGAAAAGCT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 7 8 27667 CASAVA_Build 5 114588998 1I TTCAGCTCTG -/T TTATGTTATG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 2 3 27668 CASAVA_Build 5 114596586 17D CCCCAGCTAC AAAAAAAGCCACCCAGT/----------------- AAAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 29 17 13 3 AAAAAAAGCCACCCAGT 1 0 27669 CASAVA_Build 5 114597142 1D AAAAAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 13 12 27670 CASAVA_Build 5 114597763 1D TGTATTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 T 11 10 27671 CASAVA_Build 5 114597812 1D AGCAAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2303 hom 25 6 9 12 A 11 10 27672 CASAVA_Build 5 114606562 2D AACTGTCTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 12 10 27673 CASAVA_Build 5 114620789 1I CAGGCTTAAG -/A ACACGCATAC 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 A 1 2 27674 CASAVA_Build 5 114640232 2D TAATTAGCTG TT/-- TTTTTAAACC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 7 5 27675 CASAVA_Build 5 114642965 1I TGTGTCAACC -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 A 7 8 27676 CASAVA_Build 5 114655969 1D TAATTTCTTT A/- AAGATTTCTA 495 het 495 ref 23 13 5 5 A 3 2 27677 CASAVA_Build 5 114665119 1I AATTGCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 13 13 T 13 14 27678 CASAVA_Build 5 114667523 1I AGTTTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 A 10 11 27679 CASAVA_Build 5 114678764 2I CTTTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2668 het 2668 ref 32 11 11 10 T 12 14 27680 CASAVA_Build 5 114679980 1I GTGTTGCGGC -/A GAGATGGTCA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 0 1 27681 CASAVA_Build 5 114681923 3I TCTCCATGCA ---/AAC AACAATACAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AAC 1 2 27682 CASAVA_Build 5 114682641 2I GTATGTACAC --/AT GAGTCCATTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AT 0 1 27683 CASAVA_Build 5 114685857 1I CTCCCTTTTT -/A ATATATGTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 27684 CASAVA_Build 5 114689988 1D AAACAATGTA T/- TAAAAAATTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 1 27685 CASAVA_Build 5 114694558 1I ATCTAAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 168 hom 22 1 19 2 T 10 11 27686 CASAVA_Build 5 114696193 1I ACTTCCTTTG -/T TTTTTTTTTT 2869 het 408 hom 15 1 8 7 T 10 11 27687 CASAVA_Build 5 114709640 1I GGAATTTTTT -/A TTGTTTAATC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 0 1 27688 CASAVA_Build 5 114730018 1I AGCTGTTTCC -/T AGTTGGCCAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 0 1 27689 CASAVA_Build 5 114751311 16D GATGAGATTT GCAGTATCTTCCTAAA/---------------- GTATCTTCCC 3070 het 3070 ref 36 20 16 3 GCAGTATCTTCCTAAA 1 0 27690 CASAVA_Build 5 114758520 5D CTTAAGTAAC TTAAT/----- TTATCTGAGC 3070 het 3070 ref 35 21 12 5 TTAAT 1 0 27691 CASAVA_Build 5 114760337 1D CAAGTTCCAC A/- GAGGAGCAAT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 A 1 0 27692 CASAVA_Build 5 114764620 1I TGCGATTTTT -/G CACAATGATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 0 1 27693 CASAVA_Build 5 114765098 2D CAGTTCACAT TA/-- TAGATATATT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TA 2 1 27694 CASAVA_Build 5 114765204 2I AGCAATCTAC --/CT CTCTCTATTT 3070 hom 90 het 32 0 31 3 CT 3 4 27695 CASAVA_Build 5 114765522 25D ATGCTGTTCC ACTGATATATTTTCTATTCCTGCAA/------------------------- ACTCTTACTA 3070 hom 108 het 37 0 37 8 ACTGATATATTTTCTATTCCTGCAA 1 0 27696 CASAVA_Build 5 114765934 1D CAGGGGCCAA G/- GGGGGCCTCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 6 5 27697 CASAVA_Build 5 114801872 1I ATATAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1791 hom 16 6 7 3 A 11 12 27698 CASAVA_Build 5 114816454 1I TTACTCATGG -/T TGGAGGCAAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 1 2 27699 CASAVA_Build 5 114827137 1I GGAGTAAAAA -/C AAAAATCTCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 27700 CASAVA_Build 5 114832397 6I CTAAATTGTT ------/AATAAC AGTAACTAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AATAAC 0 1 27701 CASAVA_Build 5 114832673 1D TTCTTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 25 1 12 12 A 13 12 27702 CASAVA_Build 5 114832835 4I GGAAAATTAC ----/AAGT AAGGCAAGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AAGT 0 1 27703 CASAVA_Build 5 114842359 1I CGTTTTTCTT -/C CTTTAAGTTT 2187 het 2187 ref 22 13 7 2 C 1 2 27704 CASAVA_Build 5 114849338 5I GGCTCACTGC -----/CTTTG AACCTTTGCC 2472 het 490 hom 11 1 6 4 CTTTG 0 1 27705 CASAVA_Build 5 114851231 1I CAGAAAACCC -/A GGCAGAAGTG 3070 hom 118 het 45 0 40 5 A 0 1 27706 CASAVA_Build 5 114851367 2D GTCTTCACTC AG/-- AGTTTCTCAG 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 AG 2 1 27707 CASAVA_Build 5 114852345 2I ATACAAATGC --/CT ACGTGTAAAC 3070 het 3070 hom 47 21 18 8 CT 0 1 27708 CASAVA_Build 5 114853243 2D CAACTAAGAC AT/-- GTCGAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 22 15 7 AT 1 0 27709 CASAVA_Build 5 114853729 1I ATGTATCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 10 11 27710 CASAVA_Build 5 114856405 1D TAAAAAATCA T/- TGAGTGAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 2 1 27711 CASAVA_Build 5 114857602 1D TTTTAAAAGA T/- TTGCTTTTAT 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 T 3 2 27712 CASAVA_Build 5 114861599 1I TTTCACTTAC -/A GGCACATCCT 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 A 0 1 27713 CASAVA_Build 5 114885357 2D CAAATTTAAG TA/-- TTTTATTATA 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 TA 1 0 27714 CASAVA_Build 5 114892850 1I ACAACACAGC -/A AAACTGCTGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 3 4 27715 CASAVA_Build 5 114907408 1D ATCCCACACA C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 22 12 9 1 C 8 7 27716 CASAVA_Build 5 114910564 1D GTTCTTTCCT A/- AAATTGATCT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 4 3 27717 CASAVA_Build 5 114914474 1D GTCAGCAGGA G/- GGGGGTGGGA 3070 het 3070 ref 37 22 14 2 G 6 5 27718 CASAVA_Build 5 114940923 1D TTACCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2213 hom 25 9 13 3 T 11 10 27719 CASAVA_Build 5 114946484 2I GGAAAAAAAC --/AT AGAGAATTTC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 AT 0 1 27720 CASAVA_Build 5 114957002 1D ATAAAATTAC A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 A 8 7 27721 CASAVA_Build 5 114963438 1I TGTAAGCCTG -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 5 6 27722 CASAVA_Build 5 114963508 1D AGGTTTTGAA G/- GGAAATGAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 G 3 2 27723 CASAVA_Build 5 114971928 14D AGCCTTGTGA GACCCTAAACAGAG/-------------- GACCCAGTTA 3070 het 3070 hom 42 17 26 4 GACCCTAAACAGAG 1 0 27724 CASAVA_Build 5 114972731 1I CGTGGCCAGG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 8 9 27725 CASAVA_Build 5 114981197 4I GCTTCTAGGA ----/TTTC TTTGCTTTCT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 TTTC 0 1 27726 CASAVA_Build 5 114995492 1I AAGTATACTC -/T TATGATGTTC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 1 2 27727 CASAVA_Build 5 114999465 1D CTCCGTGAAC T/- TTGTCATTTG 3070 het 3070 ref 38 17 12 10 T 3 2 27728 CASAVA_Build 5 115000818 2D29M4D GAACTCTTTA TTTTTTTTTTTTTTCTACTCTGGTTCTGTACTTTA/--TTTTTTTTTTTTCTACTCTGGTTCTGTAC---- TTTGTTTTGA 3070 het 3070 ref 29 19 11 6 N/A 0 0 27729 CASAVA_Build 5 115003278 1D AGAGGGCACT C/- AGTGAATATT 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 C 1 0 27730 CASAVA_Build 5 115004412 4D CCAGCCCTCC CTCT/---- GTCTAATGAG 3070 het 3070 ref 41 25 9 8 CT 2 0 27731 CASAVA_Build 5 115010980 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGTTTCAC 3070 hom 26 het 10 0 9 1 G 5 4 27732 CASAVA_Build 5 115017566 1I CTCTGTAGCC -/T TTTCTGTCCA 3070 het 2869 hom 19 8 8 3 T 3 4 27733 CASAVA_Build 5 115019617 4I AAAATGTAAT ----/TAAC TATCATCAAA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 TAAC 0 1 27734 CASAVA_Build 5 115022659 4I ATTTAGAAAA ----/AAAC AAACTGACAA 3070 het 3070 hom 51 25 23 3 AAAC 1 2 27735 CASAVA_Build 5 115026567 1I ATCTAGTGTG -/T GGGGGGGCAG 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 T 0 1 27736 CASAVA_Build 5 115027020 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 A 9 10 27737 CASAVA_Build 5 115027208 4D TTCCTATACC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1498 het 1498 ref 36 14 4 19 A 18 14 27738 CASAVA_Build 5 115033028 1D TGAAAAAGAT G/- CAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 G 1 0 27739 CASAVA_Build 5 115033750 1D ATATCCAAAA G/- ACAGGCAATA 3070 het 3070 ref 38 21 15 3 G 1 0 27740 CASAVA_Build 5 115033873 4I TAGAGCTACC ----/ATAT ATATGATCCA 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 AT 2 4 27741 CASAVA_Build 5 115034560 7D AAATACAAAT AAAATTA/------- AAAATTAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 7 5 AAAATTA 2 1 27742 CASAVA_Build 5 115034722 7D AATGAGATAT AATCTTA/------- AATCTTACCC 2493 het 2493 ref 25 17 6 4 AATCTTA 2 1 27743 CASAVA_Build 5 115036017 1D TTTCTCCACC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 T 8 7 27744 CASAVA_Build 5 115037796 1D AGGCATTTAT A/- AATTTGCCTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 A 3 2 27745 CASAVA_Build 5 115047772 1D AGCCCAATTT G/- GTAAGTAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 G 2 1 27746 CASAVA_Build 5 115061807 1I GACTAACATA -/G GAAAGCAGGC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 G 1 2 27747 CASAVA_Build 5 115066727 2I GTGTGTTTTT --/TA TGTTTTTCTC 3021 het 2832 hom 18 7 8 3 TA 0 1 27748 CASAVA_Build 5 115068343 2D TTTTAATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 9 8 T 14 12 27749 CASAVA_Build 5 115069870 1I TTTGTTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 11 12 27750 CASAVA_Build 5 115070714 1D AGTTGGGAGG A/- GAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 1 0 27751 CASAVA_Build 5 115072907 1D TAATAGAACA G/- GAGGAGAGTC 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 G 2 1 27752 CASAVA_Build 5 115074440 1I AAAAGGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 9 11 T 11 12 27753 CASAVA_Build 5 115093837 3I TCTCAGACAA ---/AGG TGGAAAGGCT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 AGG 0 1 27754 CASAVA_Build 5 115095752 2D AGACATTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2480 het 1060 hom 29 3 10 17 A 16 14 27755 CASAVA_Build 5 115097154 1D TGATTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 12 11 27756 CASAVA_Build 5 115103557 1I ATCACGGATG -/C CAATGCTTCT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 C 1 2 27757 CASAVA_Build 5 115106071 1I TGTCAATTTT -/G TTTAACTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 G 0 1 27758 CASAVA_Build 5 115108307 4I TTTCTTCTGT ----/TTGA TTATTTCTGC 2527 het 2527 ref 18 11 7 0 TTGA 0 1 27759 CASAVA_Build 5 115108812 2I4M3I GGTCTTGGAC --CATC---/AAGATCTGG CAGAATTCTC 3070 het 3070 ref 48 26 20 3 N/A 0 0 27760 CASAVA_Build 5 115110466 1D TATGAAGATG T/- TTTTTTTTTC 1079 het 1079 ref 47 35 3 9 T 10 9 27761 CASAVA_Build 5 115118397 4I TGAGCCCAGG ----/AGGT AGGTCGAGGC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 AGGT 1 2 27762 CASAVA_Build 5 115128026 1D AATTGCCCCC A/- ATGATTCAAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 A 2 1 27763 CASAVA_Build 5 115143463 1I TTCTGGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 11 12 27764 CASAVA_Build 5 115146572 1I TGTTGTGTTA -/T TTTTTTTTTT 1108 het 1108 ref 28 17 4 7 T 13 14 27765 CASAVA_Build 5 115154310 1D TACAGGATGT C/- AAATGAAAGG 3070 het 3070 ref 43 28 9 7 C 1 0 27766 CASAVA_Build 5 115195495 1D AAACTCAATC T/- TTTATTATTC 3070 het 3070 ref 40 24 11 7 T 4 3 27767 CASAVA_Build 5 115211333 4D GTAAATCAAG CTAA/---- CTAACATGTC 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 CTAA 2 1 27768 CASAVA_Build 5 115238415 1I ACAGACAAGA -/G GGTTGTTAGA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 G 2 3 27769 CASAVA_Build 5 115250961 1D AGTGTAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 33 2 28 3 T 11 10 27770 CASAVA_Build 5 115260908 2D AAATTAGCTG TC/-- TCTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 18 13 0 TC 3 2 27771 CASAVA_Build 5 115277302 2D TCCTATGTGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 30 15 10 T 11 9 27772 CASAVA_Build 5 115287087 1D GTGCTTCCCC T/- GAAGGGACTT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 1 0 27773 CASAVA_Build 5 115302009 1D TTATCAAGAA T/- TTTTTGTCCT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 6 5 27774 CASAVA_Build 5 115302191 1D GGGCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 2601 het 2601 ref 35 18 9 8 A 15 14 27775 CASAVA_Build 5 115314599 1I TCATCACCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 A 9 10 27776 CASAVA_Build 5 115328196 1D CATATCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 T 12 11 27777 CASAVA_Build 5 115331868 1D TCTATTCATA T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 7 6 27778 CASAVA_Build 5 115334296 4D ACATGCTTTT TGTA/---- TGTATCAGTT 3070 het 3070 hom 30 9 16 8 TGTA 2 1 27779 CASAVA_Build 5 115334881 1D GTGGCTTGTC T/- TTGTATTCTT 3070 hom 66 het 33 0 27 6 T 3 2 27780 CASAVA_Build 5 115335555 2D ATAAACATGG TA/-- TATATCTCTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TA 3 2 27781 CASAVA_Build 5 115346463 1D TGAGAAAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 8 7 27782 CASAVA_Build 5 115350631 1D AATTACTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 11 10 27783 CASAVA_Build 5 115351929 1D CTTTAGTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 39 1 29 9 T 14 13 27784 CASAVA_Build 5 115357639 1D ATTGTAAATG T/- TTTTGAAGGT 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 T 5 4 27785 CASAVA_Build 5 115358022 1D GCATGTGCCA C/- CATGCCTAGA 3070 het 3070 hom 31 9 14 9 C 2 1 27786 CASAVA_Build 5 115358239 4D TACTTCATAT TTAA/---- TTAATATTAT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 TTAA 2 1 27787 CASAVA_Build 5 115361848 1D AGAAAATCAT C/- TGTGGTTTGA 3070 het 3070 hom 24 7 14 3 C 1 0 27788 CASAVA_Build 5 115367164 1I TGTCTGTGTG -/T GTTTTTTTTT 646 het 646 ref 14 7 5 2 T 0 1 27789 CASAVA_Build 5 115372200 3I ACATGAATGA ---/ATG TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 ATG 0 1 27790 CASAVA_Build 5 115374787 1I GGTATGCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 33 2 21 10 T 13 14 27791 CASAVA_Build 5 115382274 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 331 hom 27 1 23 3 A 6 7 27792 CASAVA_Build 5 115392961 5D GACTCTTCCT CTTCC/----- CTTCCCTTCA 3070 het 3070 ref 43 28 11 5 CTTCC 2 1 27793 CASAVA_Build 5 115393475 4I ACAGATACTC ----/AAAT GAAGGGAACA 3070 het 3070 hom 46 20 25 1 AAAT 0 1 27794 CASAVA_Build 5 115395136 1I TTGATTCAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 10 10 12 A 8 9 27795 CASAVA_Build 5 115395195 5D AAATTAAACT TAAGA/----- TAAATAAAGT 3070 het 3070 hom 38 14 22 4 TAAGA 1 0 27796 CASAVA_Build 5 115397225 8D AGAGGCACAG AATGAAAA/-------- AATGAAAAAT 3070 hom 75 het 26 0 26 3 AATGAAAA 2 1 27797 CASAVA_Build 5 115398289 1I GATATACCAT -/A TTGAGCTATG 3070 hom 135 het 54 0 46 8 A 0 1 27798 CASAVA_Build 5 115400010 2I GATGTCCAAA --/AC CAAGGAAAAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AC 0 1 27799 CASAVA_Build 5 115400529 1D CAATTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 11 10 27800 CASAVA_Build 5 115401138 10I ATACATGCCC ----------/TGTGAACATG TTCACATGGC 3070 het 3070 hom 50 18 23 9 TGTGAACATG 0 1 27801 CASAVA_Build 5 115402520 4I CCTGTAACAC ----/TTTG TTTGTAATTA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 TTTG 1 2 27802 CASAVA_Build 5 115408098 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TA 5 4 27803 CASAVA_Build 5 115411374 2I ACACAGATAG --/AA GGTGGAGGAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 0 2 27804 CASAVA_Build 5 115413113 1D TAGAATCAGG A/- AGTACCTGTG 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 2 1 27805 CASAVA_Build 5 115416281 2I TTTATGAAAC --/AA AACCATATAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 4 27806 CASAVA_Build 5 115421828 1D AAATGATTAT G/- GTGTAATAAC 3070 hom 111 het 48 0 38 10 G 2 1 27807 CASAVA_Build 5 115424745 2D GGCCAAACTC TT/-- TTTTGTTGTT 3070 hom 105 het 36 0 35 1 T 6 4 27808 CASAVA_Build 5 115430910 1D CCTGAAGGGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 9 8 27809 CASAVA_Build 5 115439720 4I GTTTTTAATC ----/CTTT CTTTCTTTGA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 CTTT 2 3 27810 CASAVA_Build 5 115450060 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 65 het 29 0 21 8 T 8 9 27811 CASAVA_Build 5 115453744 1I AATATGAGGG -/A ACTAAGACAA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 1 2 27812 CASAVA_Build 5 115463027 4I TATCTCTTCA ----/AGAT ACTGATTTCA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 AGAT 0 1 27813 CASAVA_Build 5 115471999 18D TGGCAGTCTG GCTGCAGTGGCTTTTTGA/------------------ GCTGCAGTGG 3070 hom 52 het 32 0 17 16 GCTGCAGTGGCTTTTTGA 2 1 27814 CASAVA_Build 5 115480300 8D AATGCAGAGA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2267 hom 37 het 24 0 8 16 T 26 18 27815 CASAVA_Build 5 115482059 2D52M1I CCTTACAAAC TGTGCTATTTTTAAGTTCACTTTATTCGGTTTCCTTATGAAGAGGGATATTTTT-/--TGCTATTTTTAAGTTCACTTTATTCGGTTTCCTTATGAAGAGGGATATTTTTA TTTATTGACA 3070 hom 132 het 32 0 45 5 N/A 0 0 27816 CASAVA_Build 5 115482350 1D ATTCTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 11 10 27817 CASAVA_Build 5 115484346 1D GTATTAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 339 hom 31 1 25 5 T 13 12 27818 CASAVA_Build 5 115492131 2D ATTAGCTAAC TT/-- AAGGCAAAAC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 2 0 27819 CASAVA_Build 5 115502978 5I ATGATGTTGA -----/TGTCT TGTGAGCAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TGTCT 0 1 27820 CASAVA_Build 5 115516900 1I GTGTGGGTCA -/G GGCTCATTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 2 3 27821 CASAVA_Build 5 115517211 11D TTGGAGCTTT GCAATTAATAA/----------- GCAGTGAGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 GCAATTAATAA 1 0 27822 CASAVA_Build 5 115518384 2D TAGCCCTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 26 0 23 4 T 13 11 27823 CASAVA_Build 5 115526480 1I TTTAAAAAAT -/G TATCAGATAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 0 1 27824 CASAVA_Build 5 115529759 6I TCAAATGGCG ------/ATAGTA ATAGTTGTTC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 ATAGTA 0 1 27825 CASAVA_Build 5 115539226 1D CAAGTATTTA T/- TTGGCAGATG 3070 hom 111 het 39 0 37 2 T 3 2 27826 CASAVA_Build 5 115547815 4D GTTCTGTCTC TCTT/---- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 39 0 37 5 TCTT 1 0 27827 CASAVA_Build 5 115547911 2D ATATCTGACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 27 0 17 11 T 13 11 27828 CASAVA_Build 5 115555859 1D TCTTTAACAA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 51 het 21 0 17 4 C 11 10 27829 CASAVA_Build 5 115563718 4I TGTTACAAAT ----/AATC AAATTATATT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AATC 0 1 27830 CASAVA_Build 5 115570554 1D ATGTTGTATG A/- AAAAAACTTC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 7 6 27831 CASAVA_Build 5 115571128 1I GTATTTCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 44 het 35 1 30 4 T 9 10 27832 CASAVA_Build 5 115572296 1D TGACCACACG T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 123 het 51 0 42 9 T 7 6 27833 CASAVA_Build 5 115582835 2D CCACCCAGTC TG/-- TGGCATTTCG 3070 hom 75 het 29 0 21 8 TG 2 1 27834 CASAVA_Build 5 115584014 1I CCTGTAATTC -/T TTTCATTCCA 3070 hom 148 het 51 0 50 1 T 3 4 27835 CASAVA_Build 5 115584678 1D TGAGATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1218 hom 36 3 23 10 T 17 16 27836 CASAVA_Build 5 115608649 1I TGGTTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 38 1 27 10 A 10 11 27837 CASAVA_Build 5 115611970 2I TATAATATTA --/AG AGAGTTAGGC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 AG 2 3 27838 CASAVA_Build 5 115633644 1I GACAGCATTT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 8 27839 CASAVA_Build 5 115721154 4I TAAGGTAATT ----/AAAG AAAGAATACT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAAG 1 2 27840 CASAVA_Build 5 115765064 1D TTGTACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 34 1 31 2 A 11 10 27841 CASAVA_Build 5 115773004 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3046 het 2022 hom 27 7 11 9 A 16 17 27842 CASAVA_Build 5 115785183 1I GTGTATTGGT -/A AAAACTACAG 3070 het 3070 hom 48 15 24 9 A 4 5 27843 CASAVA_Build 5 115788360 4D60M13D ACAAAACAAA AAACAAACAAACAAACAAAAACCTGGCTACCCAGTTATGTGCTTTCTTTGCTTGTGGGAGGTGCATGTCTTCAGCTG/----AAACAAACAAACAAAAACCTGGCTACCCAGTTATGTGCTTTCTTTGCTTGTGGGAGGTGC------------- GGAGTGCCCA 3070 het 3070 ref 27 27 14 15 N/A 0 0 27844 CASAVA_Build 5 115789049 1D GCCTTCTGAC A/- GTTTCAGAGC 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 1 0 27845 CASAVA_Build 5 115797205 1I AACACTGCCA -/G GGAGCTCAGG 3070 hom 90 het 35 0 28 7 G 2 3 27846 CASAVA_Build 5 115798307 1D TTTAATCAGG T/- TTTTTTTTTT 1322 het 1322 ref 47 35 3 9 T 12 11 27847 CASAVA_Build 5 115803195 6D TAAAGTGCTA CAAATG/------ CAAAATGTCG 3070 het 3070 ref 31 14 12 8 CAAATG 1 0 27848 CASAVA_Build 5 115803590 1D CCCTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2675 het 2675 ref 46 17 15 14 T 15 14 27849 CASAVA_Build 5 115805368 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2112 hom 37 9 17 11 T 9 8 27850 CASAVA_Build 5 115812680 5D GCTGAGTGAC TCTAA/----- TCAAATGCAA 3070 het 3070 hom 48 22 25 1 TCTAA 1 0 27851 CASAVA_Build 5 115815348 5D GTCATGGAAA TAAAT/----- TCTATCTCCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 7 TAAAT 1 0 27852 CASAVA_Build 5 115815563 1D GAATAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 A 12 11 27853 CASAVA_Build 5 115816271 1D TCCTTATTTT A/- AAAAATGTTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 6 5 27854 CASAVA_Build 5 115818385 4D TTTCCTTTAA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 908 hom 41 6 17 18 GT 10 8 27855 CASAVA_Build 5 115825084 5D GCTTAGGCTT AAAAA/----- AAATAAAAGC 3070 het 3070 ref 23 11 8 6 A 8 3 27856 CASAVA_Build 5 115832549 1D CAGTGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 13 12 27857 CASAVA_Build 5 115855020 1D TTAAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 29 0 20 9 T 12 11 27858 CASAVA_Build 5 115858536 1I AGCAAGGCCG -/A TGGTCAAGAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 0 1 27859 CASAVA_Build 5 115867113 1D GAGTCCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 36 2 24 10 T 13 12 27860 CASAVA_Build 5 115869474 1D GGATACAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 560 hom 28 3 19 6 A 13 12 27861 CASAVA_Build 5 115915683 4D TCCCTGACAC CAGT/---- CAAAGAATCA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 CAGT 1 0 27862 CASAVA_Build 5 115915846 1I TAGTCAATCA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 8 9 27863 CASAVA_Build 5 115921257 2I GGCTTCAATT --/CA CAGTCATTGG 3070 hom 102 het 37 0 33 4 CA 1 2 27864 CASAVA_Build 5 115924457 4I AGGAATTTAG ----/GTCC GTCCCAGTTG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 GTCC 1 2 27865 CASAVA_Build 5 115927591 3D GTGACACTTA AAG/--- TGTTTCTCCA 3070 hom 117 het 42 0 40 3 AAG 1 0 27866 CASAVA_Build 5 115975101 1I GGCTCTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 11 12 27867 CASAVA_Build 5 115983831 1D TAAATGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 773 hom 43 4 20 19 T 12 11 27868 CASAVA_Build 5 115990422 1D GGAAGCCCTG T/- TGACTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 2 1 27869 CASAVA_Build 5 115991912 1D CATTGTCAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 10 9 27870 CASAVA_Build 5 115996256 1D TATGTAACTC A/- AAATGTCTTA 3070 het 3070 hom 36 16 20 0 A 4 3 27871 CASAVA_Build 5 115998066 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAGAAA 2196 het 208 hom 17 5 8 4 G 0 1 27872 CASAVA_Build 5 116001330 6D ATGAAAATAA TAATAC/------ TAATATTATG 3070 het 3070 hom 44 14 24 10 TAATAC 1 0 27873 CASAVA_Build 5 116004500 15D ATGGTCATAG TCTGGATACAGGACT/--------------- TCTGGATACA 3070 hom 96 het 41 0 33 11 TCTGGATACAGGACT 2 1 27874 CASAVA_Build 5 116008857 3D CTTGAACACA GTT/--- GTTGTTGTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 GTT 4 3 27875 CASAVA_Build 5 116017071 1I GTTGTAGTGA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 T 7 8 27876 CASAVA_Build 5 116019864 1D TTTTTGAGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 9 8 27877 CASAVA_Build 5 116021013 1I TCTGTTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 9 10 27878 CASAVA_Build 5 116021402 2I CAGAAATCTG --/GA GAGACCCAGC 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 GA 2 3 27879 CASAVA_Build 5 116039657 1D TTCTTATCCT A/- AGAAGTTCTC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 2 1 27880 CASAVA_Build 5 116047389 1I AGTCAATGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 9 10 27881 CASAVA_Build 5 116047531 4I TGATAATCCC ----/TCCT TCCTTACCCT 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 TCCT 1 2 27882 CASAVA_Build 5 116049206 1D TCGTAAGGCT G/- GGGGATTATG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 5 4 27883 CASAVA_Build 5 116052374 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 32 2 24 6 T 12 11 27884 CASAVA_Build 5 116053343 1I TAATTGTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 28 1 14 13 A 14 15 27885 CASAVA_Build 5 116053708 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2977 het 1466 hom 18 6 8 4 A 8 9 27886 CASAVA_Build 5 116053873 6D CAAAAAAAAC AAAACA/------ AAAACAAAAA 2533 het 2533 ref 20 14 6 1 AAAACA 3 2 27887 CASAVA_Build 5 116054920 2I AACTACCAAT --/TA TATGTTCCTA 3070 hom 74 het 44 1 39 4 TA 1 2 27888 CASAVA_Build 5 116057099 1D GATTGAGTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 9 8 27889 CASAVA_Build 5 116060314 1D GCTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 11 10 27890 CASAVA_Build 5 116071921 2D TGTGCTGAAA CT/-- CTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 2 CT 2 1 27891 CASAVA_Build 5 116081120 1I CTCTAATGAT -/G TTATTAGCAA 1793 het 167 hom 25 2 7 16 G 0 1 27892 CASAVA_Build 5 116084641 1D ATGATAAAAC A/- AATAATAAAG 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 A 3 2 27893 CASAVA_Build 5 116085161 1I AAAAAACCTG -/A AAATAACCTA 3070 hom 151 het 54 0 51 3 A 3 4 27894 CASAVA_Build 5 116094229 1I TAATTAAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 T 9 10 27895 CASAVA_Build 5 116099945 1D ATGAACTGCA T/- AACCTGTTAG 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 T 1 0 27896 CASAVA_Build 5 116103908 1D CATGTGCAGT G/- GGGCTGATTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 4 3 27897 CASAVA_Build 5 116112207 1I ACTATGTCTG -/A AAAATTGTTT 3070 hom 132 het 52 0 44 8 A 4 5 27898 CASAVA_Build 5 116116885 7I ATTGATAAAA -------/GACAGTT CACATTTGGC 3070 hom 159 het 61 0 52 9 GACAGTT 0 1 27899 CASAVA_Build 5 116121595 5I TGAGATACTT -----/TTCTC TTCTCCCATT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 TTCTC 1 2 27900 CASAVA_Build 5 116128925 2I TTTTAAAATC --/AG AGTTTAATGG 3068 het 3068 ref 26 12 7 7 AG 1 2 27901 CASAVA_Build 5 116130563 1I GGACAGAGGA -/G GGGGAACATC 3070 het 1778 hom 17 6 8 3 G 4 5 27902 CASAVA_Build 5 116131895 1I TTTTCTAATG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 66 25 29 12 A 7 8 27903 CASAVA_Build 5 116155530 4I TAAACTTATT ----/AATA TTTTGTTATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AATA 0 1 27904 CASAVA_Build 5 116166306 3D TGTCACTGAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 T 13 10 27905 CASAVA_Build 5 116171174 1I TATGTTGGCT -/G GTCTTGAACT 2739 hom 30 het 12 0 9 3 G 1 2 27906 CASAVA_Build 5 116177363 1I TGCTTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 37 3 25 9 A 14 15 27907 CASAVA_Build 5 116182507 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 82 het 29 0 28 1 T 8 9 27908 CASAVA_Build 5 116183577 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 A 8 9 27909 CASAVA_Build 5 116184515 1I AACCCCTGGA -/G TCAGTCATTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 0 1 27910 CASAVA_Build 5 116187028 1D AATCTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 15 14 27911 CASAVA_Build 5 116188226 1D TATTTACAAC T/- TACAGAGTTG 3070 het 3070 ref 52 25 19 10 T 2 1 27912 CASAVA_Build 5 116191675 1D CAGTTAATCC T/- TTTTTTTTTT 1260 het 1260 ref 31 24 4 3 T 12 11 27913 CASAVA_Build 5 116191964 1D TCAGATTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1703 hom 32 9 13 10 A 17 16 27914 CASAVA_Build 5 116202880 2I CTGAGAAAAA --/GT GTTAAAAGAA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 GT 1 2 27915 CASAVA_Build 5 116206096 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1493 het 361 hom 12 4 8 0 A 13 12 27916 CASAVA_Build 5 116210080 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1280 hom 17 4 11 2 A 17 16 27917 CASAVA_Build 5 116213569 1I TATTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1890 hom 29 het 21 0 10 15 T 15 16 27918 CASAVA_Build 5 116236751 1D CACACTGTCA T/- TTTTTTGCTG 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 T 7 6 27919 CASAVA_Build 5 116241109 1I ATTCCAGCAC -/T TTTAGGAGGC 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 T 3 4 27920 CASAVA_Build 5 116242758 4I CACGTTGTAT ----/AGGC AGATGACAAA 3070 het 3070 hom 50 18 27 5 AGGC 0 1 27921 CASAVA_Build 5 116249266 3I CTTTATGGCT ---/TTG TTATTTGCTG 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 TTG 0 1 27922 CASAVA_Build 5 116249973 59D GGGACCACAC TTTGAGAATAACTACCCTAGACTTTTGCAATGATGCCTGAATTTTTCTCTGCTTACACT/----------------------------------------------------------- TTTGCCTACC 1205 het 1205 ref 31 33 3 7 TTTGAGAATAACTACCCTAGACTTTTGCAATGATGCCTGAATTTTTCTCTGCTTACACT 1 0 27923 CASAVA_Build 5 116252321 2D TGCACCATCG AA/-- AAGTCAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 4 A 4 2 27924 CASAVA_Build 5 116254435 1D TCCGAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 43 2 35 6 T 11 10 27925 CASAVA_Build 5 116265951 1D CAACCTTGAC A/- AAATTAACAC 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 A 4 3 27926 CASAVA_Build 5 116270277 1D ATTTACCATT C/- TGAACACCTT 3070 hom 141 het 50 0 47 3 C 1 0 27927 CASAVA_Build 5 116282078 1D GACCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 11 10 27928 CASAVA_Build 5 116287446 1I AAATTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 31 2 22 7 T 11 12 27929 CASAVA_Build 5 116401761 1D CATACAATGA T/- TTTTTACATG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 6 5 27930 CASAVA_Build 5 116417051 4I GATTTCCCAC ----/TTTG TTTGAGAAAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TTTG 1 2 27931 CASAVA_Build 5 116434972 5I ATATTATGCT -----/TCTTA TCTTTTGCAG 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TCTTA 0 1 27932 CASAVA_Build 5 116455884 1I TCTCTATTAC -/A AATAAGTAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 2 3 27933 CASAVA_Build 5 116460829 4I AGGGCAGGTG ----/ATGT ATGTATGCAC 3070 hom 135 het 53 0 42 11 ATGT 1 2 27934 CASAVA_Build 5 116462323 2D TTTTTAAAGA TT/-- CTACTTTTTA 1977 het 1977 ref 32 13 10 9 T 2 0 27935 CASAVA_Build 5 116463217 18I CTGCCATATA ------------------/ATCTCCTGCGAGGGTGGG ACCTCGGGCT 3070 hom 57 het 22 0 18 5 ATCTCCTGCGAGGGTGGG 0 1 27936 CASAVA_Build 5 116466311 2D GTCAGAAACC AG/-- AGAGAGAGAG 1002 het 1002 ref 52 38 3 13 AG 9 8 27937 CASAVA_Build 5 116467212 4D CTTTAAACTA TCTG/---- TCTGTCTGTC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 TCTG 4 3 27938 CASAVA_Build 5 116482686 1D CTTTTAAGTT A/- AAAATCTAGA 3070 hom 114 het 46 0 39 8 A 5 4 27939 CASAVA_Build 5 116490609 1D GCCTCTTCTT A/- ATTGTTACCA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 2 1 27940 CASAVA_Build 5 116491085 1D ATGCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 895 hom 46 2 35 9 T 12 11 27941 CASAVA_Build 5 116492684 2D TGTTTTTTGT CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 38 het 32 0 14 18 C 13 11 27942 CASAVA_Build 5 116492913 1D TGTTCCCCAA G/- GGCCCTGCAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 3 2 27943 CASAVA_Build 5 116495172 1D CACTAGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 36 1 29 6 T 11 10 27944 CASAVA_Build 5 116526490 14D GATATAGTTC TGTGAATTCATTTG/-------------- TGTGAGGGTA 3070 het 3070 ref 36 21 15 3 TGTGAATTCATTTG 1 0 27945 CASAVA_Build 5 116529854 2I CCTTACAATT --/AA AAAAAAAAAA 1804 het 1804 ref 17 7 5 5 A 14 16 27946 CASAVA_Build 5 116555784 1D GTGATACGAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 9 8 27947 CASAVA_Build 5 116563989 1D ATTTATTTTG A/- AAAAAAAAAA 997 het 997 ref 31 14 6 11 A 17 16 27948 CASAVA_Build 5 116566654 1I TTTCCATGTT -/A AGACTACAAT 3070 hom 56 het 21 0 17 4 A 1 2 27949 CASAVA_Build 5 116568012 5D AAAAAAGGTT ATTTA/----- ATTAAAATGG 3070 het 3070 ref 33 17 15 3 ATTTA 1 0 27950 CASAVA_Build 5 116573276 1I GACCTCTTTC -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 T 6 7 27951 CASAVA_Build 5 116576664 1D GAGAATGTTT G/- ATTTCATATC 3070 het 3070 hom 45 16 24 6 G 1 0 27952 CASAVA_Build 5 116584865 2D TGAGCAAAAA CT/-- CTGCTTTTCT 3070 het 3070 ref 55 27 21 8 CT 2 1 27953 CASAVA_Build 5 116593688 1D TGAGCGACAG A/- AAAAAAAAAA 2895 het 1529 hom 20 6 7 7 A 12 11 27954 CASAVA_Build 5 116598092 1I TAAAAACTGC -/A AAAAAAAAAA 1398 het 1398 ref 28 21 3 4 A 10 11 27955 CASAVA_Build 5 116613507 1I TACAATCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 20 5 A 11 12 27956 CASAVA_Build 5 116620657 9I TCAATTTCAA ---------/ATGGTATTT ATAGACTCCC 3070 het 1867 hom 30 5 19 6 ATGGTATTT 0 1 27957 CASAVA_Build 5 116622359 1I GTTTATTCTG -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 T 7 8 27958 CASAVA_Build 5 116624427 1I ATGTTGGTAG -/T AAAAGTATTA 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 0 1 27959 CASAVA_Build 5 116626369 1D AAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 10 9 27960 CASAVA_Build 5 116634308 4D CATCTGCAGA TATC/---- TCACTTTGAA 3070 het 3070 hom 45 20 24 2 TATC 1 0 27961 CASAVA_Build 5 116635974 4I TAGTGAAGAA ----/AGAT AGATAGAACT 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 AGAT 1 2 27962 CASAVA_Build 5 116648184 5I ATCATTTCTA -----/ATTAC ATTCTTCATT 2658 het 2658 ref 18 10 6 2 ATTAC 0 1 27963 CASAVA_Build 5 116664688 5I TTTTTATTTA -----/TTTAC TTTTTATTAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TTTAC 0 1 27964 CASAVA_Build 5 116665038 6D TTTCAGACAT TTTTAC/------ ATTTGCCTTT 3070 het 3070 ref 51 26 21 8 TTTTAC 1 0 27965 CASAVA_Build 5 116665331 1I GGTTTGTTTC -/A GTTTGTTTAG 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 0 1 27966 CASAVA_Build 5 116674006 1I AAGTTTCTTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 A 8 9 27967 CASAVA_Build 5 116675082 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 8 7 27968 CASAVA_Build 5 116677323 5I ACTGTAAATA -----/TAATT TATATTTGAG 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 TAATT 0 1 27969 CASAVA_Build 5 116684600 1D ACAAGATATG T/- TGTAAGGCGT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 2 1 27970 CASAVA_Build 5 116687381 1D GGAAAATCAG A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 A 8 7 27971 CASAVA_Build 5 116699601 2I TTTGGTGGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 T 11 13 27972 CASAVA_Build 5 116700243 1I AAAGATCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 T 10 11 27973 CASAVA_Build 5 116700459 5I AAATCAAACT -----/GGTTA GTTTATTTTA 1947 het 1947 ref 22 13 6 3 GGTTA 0 1 27974 CASAVA_Build 5 116700523 1D TTTGGTTTTC T/- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 T 6 5 27975 CASAVA_Build 5 116701692 1D CACCCATGAA G/- TCCGCCTTGA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 G 1 0 27976 CASAVA_Build 5 116717501 8I GAGGGATCCA --------/GTGGAAGG GTGGAAGGCA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 GTGGAAGG 1 2 27977 CASAVA_Build 5 116719760 1I GACAGTCATG -/T TTTTTATGTA 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 T 5 6 27978 CASAVA_Build 5 116720201 1I TTCCTACTTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 A 8 9 27979 CASAVA_Build 5 116721177 4D48M2I TAACAACACC ACATACATACCACCAACACCACTAACGCCACATAAGGTGGTATTAGTGTGAC--/----ACATACCACCAACACCACTAACACCACATAAAGTGGTATTAGTGTGACTG TAAGACCACA 3070 het 3070 ref 46 44 22 8 N/A 0 0 27980 CASAVA_Build 5 116735044 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 29 0 13 16 T 10 11 27981 CASAVA_Build 5 116736505 1I5M3D12M1D ATTTGTAATT -TGTAATTCAGTAATTTCTAAT/CAGTAA---AGTAATTTCTCA- TTTTTTTTAG 1821 het 1821 ref 37 23 5 17 N/A 0 0 27982 CASAVA_Build 5 116738867 1I TATATATCTT -/A GGGGATAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 17 11 A 0 1 27983 CASAVA_Build 5 116739800 2D AATCAATCTT AA/-- GTCACTCTAT 3070 het 3070 ref 27 18 9 0 A 2 0 27984 CASAVA_Build 5 116740150 1I AAGTTATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 10 11 27985 CASAVA_Build 5 116749096 1I AGAACTGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 10 27986 CASAVA_Build 5 116752588 3D TAAGTGTGTC ATT/--- ATATCTGGTA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 ATT 1 0 27987 CASAVA_Build 5 116752893 1D ATAGGATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 11 10 27988 CASAVA_Build 5 116755655 1D TCTTTTTAAA T/- TCATCTCTAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 2 1 27989 CASAVA_Build 5 116757242 1I CGTTGTAAAG -/A AAAACTAAGC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 4 5 27990 CASAVA_Build 5 116761423 1D CATTTTAATC T/- TTTTTTTTTT 2707 het 2707 ref 45 31 8 6 T 13 12 27991 CASAVA_Build 5 116765019 3D TGTTCAGGAA GCC/--- CATCATATCT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 GCC 1 0 27992 CASAVA_Build 5 116767635 1I CAAATAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 295 hom 39 1 33 5 A 8 9 27993 CASAVA_Build 5 116772047 1D GATCACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 T 12 11 27994 CASAVA_Build 5 116792327 1I GTTATGTCCA -/G GGTTGCCTTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 2 3 27995 CASAVA_Build 5 116801866 1I CTGCTTCTGA -/T TTTTTGTGGC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 5 6 27996 CASAVA_Build 5 116829421 1D CATTCTGTAG T/- TTAGTCTCTT 3070 hom 54 het 21 0 19 6 T 3 2 27997 CASAVA_Build 5 116830769 1D CGGGCATTAA T/- TTTTTTTTTT 779 het 779 ref 41 28 3 10 T 15 14 27998 CASAVA_Build 5 116831604 1I TTGTCTCTAG -/T TTGACCCAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 3 27999 CASAVA_Build 5 116890677 1I38M1I TAGAACTGAT -AAAGATAAAACAAAAAATAAGAATAACCCAATATCTAC-/AAAAGATAAAACAAAAAATAAGAATAACCCAATATCTACA AAAGAAATTG 3070 hom 154 het 39 0 52 3 N/A 0 0 28000 CASAVA_Build 5 116904471 1I CAATAAAAAC -/A AAAGTAGACA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 28001 CASAVA_Build 5 116925735 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATG 3070 hom 18 het 29 1 23 5 TA 5 4 28002 CASAVA_Build 5 116939915 1I CTTAGGACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 10 28003 CASAVA_Build 5 117014082 1D CTTAATCACA T/- TTTTTTTTTT 1862 het 1862 ref 39 24 4 11 T 13 12 28004 CASAVA_Build 5 117070420 1D CCACTCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 44 1 37 6 T 13 12 28005 CASAVA_Build 5 117070844 1D CAGGTAAATC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 8 7 28006 CASAVA_Build 5 117076879 1D CATAATCTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 9 28007 CASAVA_Build 5 117081067 1I ATAACAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 568 hom 24 2 11 11 A 17 18 28008 CASAVA_Build 5 117086008 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 38 0 30 9 T 12 11 28009 CASAVA_Build 5 117086119 4I ACAGATGCAC ----/ACCA ACCATCGCAT 3070 hom 94 het 37 0 31 6 ACCA 1 2 28010 CASAVA_Build 5 117087966 2D AATTTAGTGA TT/-- TGAGTCTTCT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 3 1 28011 CASAVA_Build 5 117090704 1D ATACAAAACC A/- AAAAAATAGT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 7 6 28012 CASAVA_Build 5 117093945 1D TGACTTGCTT C/- CCCTTAGCCT 3070 hom 75 het 29 0 23 7 C 4 3 28013 CASAVA_Build 5 117098344 9D CTAGAGATTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 25 0 24 5 A 19 10 28014 CASAVA_Build 5 117102032 1I GTATTTGGGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 8 9 28015 CASAVA_Build 5 117104220 1D TGTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 12 11 28016 CASAVA_Build 5 117122470 2D TTTAAGAAAC AG/-- TGATTAGAAT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 AG 1 0 28017 CASAVA_Build 5 117124461 1D TCCTTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1557 hom 35 6 24 5 A 11 10 28018 CASAVA_Build 5 117127642 1D ATGTCTCTAA G/- TCTTTATTTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 G 1 0 28019 CASAVA_Build 5 117134288 2D AAGGAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1330 hom 33 11 14 8 A 20 18 28020 CASAVA_Build 5 117147490 1D AAGCCCTGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 A 10 9 28021 CASAVA_Build 5 117159825 1I ACACACAACC -/T TTCATAATCA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 T 2 3 28022 CASAVA_Build 5 117171214 4D TCACATAGAC TCTG/---- TGTGTATGCT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TCTG 1 0 28023 CASAVA_Build 5 117171442 4I TTCCTCAATG ----/ACTT ACTGAGACTG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 ACTT 0 1 28024 CASAVA_Build 5 117172203 1D TTAGTGCCTT A/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 16 15 0 A 1 0 28025 CASAVA_Build 5 117174245 8D TCTCTCTCTC TCTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 TCTTTTTT 1 0 28026 CASAVA_Build 5 117177162 1D TTTAAAAATC T/- CAACCCTTGA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 T 1 0 28027 CASAVA_Build 5 117214904 1D ATGAGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 12 11 28028 CASAVA_Build 5 117219900 6I CAAGGAAAAT ------/ATCCAA AAAGAAATCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATCCAA 0 1 28029 CASAVA_Build 5 117248261 1D TATAGTAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 35 3 14 18 T 15 14 28030 CASAVA_Build 5 117251046 1D ATTCAACAGG C/- TTTATTCTTC 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 C 1 0 28031 CASAVA_Build 5 117252885 2D TGTTCACTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 44 2 23 19 T 12 10 28032 CASAVA_Build 5 117255606 4D CCAAACAAAT AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 20 6 AAAC 2 1 28033 CASAVA_Build 5 117258433 4I CCTCAGACAA ----/TTGG TTGGTTCTTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 TTGG 1 2 28034 CASAVA_Build 5 117267676 1I AGCTTGAGAA -/T TAAGACCAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 1 2 28035 CASAVA_Build 5 117272711 1I62M14I AGTGTTTTCT -AAAAGGCAAAGTGAAGAGTTTGTCCTTAGGCCCCTCACAGTCCCTATTACCAGCAAGAACAA--------------/AAAAAGGCAAAGTGAAGAGTTTGTCCTTAGGCCCCTCACAGTCCCTATTACCAGCAAGAACAACCTTTGGGCACATG CCTGCTTCTA 3070 het 3070 hom 33 16 22 17 N/A 0 0 28036 CASAVA_Build 5 117282617 1I TGTTGTGGGG -/T TGGGGAAGCG 2984 het 198 hom 11 1 7 3 T 1 2 28037 CASAVA_Build 5 117282823 1D TGTTACTATG A/- TATTCTAGAG 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 A 1 0 28038 CASAVA_Build 5 117286891 1D AGCTTTCCAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2961 hom 26 9 14 3 A 10 9 28039 CASAVA_Build 5 117299914 2D CAAAGAGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 23 0 14 9 T 16 14 28040 CASAVA_Build 5 117308433 1D AAAATAAGCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 A 9 8 28041 CASAVA_Build 5 117309505 1D TCTATAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 12 11 28042 CASAVA_Build 5 117310289 1I TATCAACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 A 10 11 28043 CASAVA_Build 5 117312938 1I AAATTTCAAT -/C ATCTTGAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 0 1 28044 CASAVA_Build 5 117314967 1D TTTTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 11 10 28045 CASAVA_Build 5 117322553 1D CCTACAATTG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 108 het 42 0 36 7 A 9 8 28046 CASAVA_Build 5 117323040 1I TGACAGAAAT -/A AAAAAATACT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 6 7 28047 CASAVA_Build 5 117323333 1D CTTTGGTCAA G/- GGGTCCTCAA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 G 4 3 28048 CASAVA_Build 5 117325277 3D TCTTACTTTC TTT/--- TTTATTTAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 6 3 28049 CASAVA_Build 5 117325711 1D ACAAATGAGG T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 T 7 6 28050 CASAVA_Build 5 117326097 3D TAATGACCTT ATC/--- ATACATTTCA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 ATC 1 0 28051 CASAVA_Build 5 117348710 2D GCAACTAGAC TT/-- TCCCACATGA 3070 het 3070 ref 34 21 9 5 T 3 1 28052 CASAVA_Build 5 117352876 9I ACAGGTGGGT ---------/GCCCCCACA CCCAGCTAAT 3070 het 1056 hom 20 4 13 3 GCCCCCACA 0 1 28053 CASAVA_Build 5 117353901 1D TAAATTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 11 10 28054 CASAVA_Build 5 117355175 4I CTCTGTTGGT ----/TTTG TTTGTTTATG 2192 het 2192 ref 18 9 6 3 TTTG 1 2 28055 CASAVA_Build 5 117361791 1I41M6I ATACCTAAAA -CATGAACCACATTTTCAAAAACTGGCAAATTGGACCCTATC------/GCATGAACCACATTTTCAAAAACTGGCAAATTGGACCCTATCAAAATT AAAAACCTTT 3070 het 3070 ref 44 26 16 10 N/A 0 0 28056 CASAVA_Build 5 117371515 1I ATGGATGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 32 10 3 A 9 10 28057 CASAVA_Build 5 117376936 1D AGAGTTTTTT G/- CATATATTCT 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 G 1 0 28058 CASAVA_Build 5 117377024 1D47M1D GTGATTTGCA TTTTTTTTCTTACGTATGGCTTTTCAAGAGCAGAAGTTTTAATTTGATC/-TTTTTTTCTTACGTATGGCTTTTCAAGAGCAGAAGTTTTAATTTGAT- CATCTTATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 12 N/A 0 0 28059 CASAVA_Build 5 117386918 1D CTAGACACAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 9 8 28060 CASAVA_Build 5 117425811 1I TGATGATGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 52 17 26 9 T 9 10 28061 CASAVA_Build 5 117430119 4I ATATATTTTC ----/TAAG TAAGTAAGTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 TAAG 2 3 28062 CASAVA_Build 5 117437103 10D TATGTATATA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 1278 hom 26 4 10 13 TG 14 9 28063 CASAVA_Build 5 117443564 1D ATTTGAAGAG T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 8 7 28064 CASAVA_Build 5 117447414 1D CAGTATTTTT A/- AAAGCTTCCA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 4 3 28065 CASAVA_Build 5 117450161 1D GAAGCCAGTA G/- TGTGCTCAGT 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 G 1 0 28066 CASAVA_Build 5 117454272 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 1096 het 1096 ref 21 9 3 9 A 17 18 28067 CASAVA_Build 5 117456880 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 738 het 355 hom 26 6 2 18 T 11 10 28068 CASAVA_Build 5 117460640 1D AACCTCTTAT G/- TACTAAATAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 G 1 0 28069 CASAVA_Build 5 117468979 8D GAAACTGAAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 28 10 9 10 AAAC 6 4 28070 CASAVA_Build 5 117473213 1I TTTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2715 hom 29 10 13 6 T 11 12 28071 CASAVA_Build 5 117476897 1I AAAATGCAAA -/T ATGATCATAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 0 1 28072 CASAVA_Build 5 117482198 3D TAATTCTAGG AGA/--- AGGTTATTTT 3070 het 3070 ref 30 17 13 2 AGA 1 0 28073 CASAVA_Build 5 117483108 5I TTGGAATATT -----/TTAAC TTAACTTCAG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 TTAAC 1 2 28074 CASAVA_Build 5 117490886 4D ATGCAAAGAA TCTC/---- TCTGTGAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 TC 3 1 28075 CASAVA_Build 5 117491546 4D ATTAGAAAAA TAAT/---- TATTTATTAA 3070 het 2031 hom 22 7 11 5 TAAT 1 0 28076 CASAVA_Build 5 117492919 4D TCAATATTTC AGTG/---- AGTATGAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 AGTG 1 0 28077 CASAVA_Build 5 117493701 1D TAAACCTATA T/- TTTTCAGAAT 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 5 4 28078 CASAVA_Build 5 117494671 3D AGGATGACAA AAG/--- AAGAAGGTAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 8 AAG 3 2 28079 CASAVA_Build 5 117499859 1D AATTTATAAA T/- TTTTTTTAAA 1950 het 1950 ref 10 5 4 1 T 8 7 28080 CASAVA_Build 5 117503498 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 11 12 28081 CASAVA_Build 5 117503759 1I TATATTTCTA -/G ATGGGACCTC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 0 1 28082 CASAVA_Build 5 117507523 3I GGGACTAGAA ---/GGT GGTCCTGGAT 3070 het 3070 ref 19 8 8 3 GGT 1 2 28083 CASAVA_Build 5 117509136 4D TTAAACTAAT AACA/---- AACATTAGTG 3070 het 3070 ref 44 19 19 12 AACA 2 1 28084 CASAVA_Build 5 117514387 1I AGCTTACAAT -/C CATATTCAAA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 1 2 28085 CASAVA_Build 5 117518027 4I CTTACTATTA ----/ATTT ATATGTCTTT 3070 het 3070 ref 60 28 26 6 ATTT 0 1 28086 CASAVA_Build 5 117524586 3D ACAATTAGAC CTA/--- CTGGTCCTCG 3070 het 3070 ref 23 13 10 2 CTA 1 0 28087 CASAVA_Build 5 117526350 3D TTTTTTTTTT AAG/--- AAGTTTTCAC 1139 het 1139 ref 42 15 8 20 AAG 2 1 28088 CASAVA_Build 5 117527633 1D AGATTTGCTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 9 8 28089 CASAVA_Build 5 117537219 1I ATGTTCAGGT -/C TTAAGAAATT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 C 0 1 28090 CASAVA_Build 5 117540891 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAACAA 2774 het 568 hom 9 2 7 0 A 8 7 28091 CASAVA_Build 5 117547832 1I TTGCTAGTAG -/T TTTTTGCTTG 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 5 6 28092 CASAVA_Build 5 117550105 4I CCTGTTCTGG ----/TGAT TGATAGTAAG 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 TGAT 1 2 28093 CASAVA_Build 5 117554058 1D CTAATGTAAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 T 8 7 28094 CASAVA_Build 5 117554477 4D AGTACATATA TAAG/---- TAAGTATGTG 3070 het 3070 hom 31 14 14 6 TAAG 2 1 28095 CASAVA_Build 5 117556419 1I AGTCAATTAC -/A AGTGGGGCAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 1 2 28096 CASAVA_Build 5 117557214 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 10 11 28097 CASAVA_Build 5 117557488 1D AGCTGCTAGG T/- TTCATAGGAA 3070 het 3070 ref 59 35 19 5 T 3 2 28098 CASAVA_Build 5 117565827 1I CATATGTAAA -/C ATGTGAACAC 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 C 0 1 28099 CASAVA_Build 5 117569601 1I GTTTATGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 16 18 15 A 11 12 28100 CASAVA_Build 5 117572612 2I AATTCTTACT --/AC AGAGACTGGG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 AC 0 1 28101 CASAVA_Build 5 117573737 2D GAAAAGCCAC AG/-- ACACTCAACA 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 AG 1 0 28102 CASAVA_Build 5 117582388 4I ATAAAATATC ----/TGAT TGTTTGAGAG 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 TGAT 0 1 28103 CASAVA_Build 5 117593535 5D TTGCTGCCCC CCCCG/----- CCCCCACTCC 3070 hom 33 het 17 0 13 4 CCCCG 1 0 28104 CASAVA_Build 5 117597888 6I GTTAGCAAAG ------/ATACTT AGAAGGTTCA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 ATACTT 0 1 28105 CASAVA_Build 5 117605085 1D TTGTTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 20 12 T 15 14 28106 CASAVA_Build 5 117608683 1I TGAACAAAAA -/G GCAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 45 22 21 2 G 1 2 28107 CASAVA_Build 5 117616637 4D ATACCCTAGC TTGA/---- TTATTACACA 3070 het 3070 hom 52 15 36 1 TTGA 1 0 28108 CASAVA_Build 5 117622087 1D GTTGTATTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 A 10 9 28109 CASAVA_Build 5 117625234 1I ATGGAGGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 10 11 28110 CASAVA_Build 5 117627549 4D TTATTTTTCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1470 hom 32 7 16 9 T 14 10 28111 CASAVA_Build 5 117628667 1I13M1I GTTTGTTTCC -TTTTTTTTTCTTT-/TTTTTTTTTTCTTTC TTTTTTTGCG 3070 het 3070 hom 32 14 17 7 N/A 0 0 28112 CASAVA_Build 5 117629536 1I CAATCCAGAT -/G TTTCTATTTG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 G 0 1 28113 CASAVA_Build 5 117635891 1I CTTCCCCCCC -/A ACCCCAACAC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 1 2 28114 CASAVA_Build 5 117637484 1I CTTTGCCCAC -/T TTTCTGATGC 3070 het 3070 ref 25 15 10 1 T 3 4 28115 CASAVA_Build 5 117638187 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAGAG 2913 het 2913 ref 25 14 7 4 A 8 7 28116 CASAVA_Build 5 117639171 1D GGATACAGCT A/- AAGCAGTACT 1434 het 1434 ref 19 10 3 7 A 3 2 28117 CASAVA_Build 5 117639470 2I CAGGTATAAA --/AT ACAATATCAG 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 AT 0 1 28118 CASAVA_Build 5 117642299 1D CTGATAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 13 12 28119 CASAVA_Build 5 117699065 5I ACAAAATAAC -----/AACTT AACATCATTC 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 AACTT 0 1 28120 CASAVA_Build 5 117699229 1I AATACTAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 8 9 28121 CASAVA_Build 5 117699748 1D ACAGCACATC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 A 7 6 28122 CASAVA_Build 5 117700627 4I ATTCACATAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 45 15 15 15 AAAC 3 4 28123 CASAVA_Build 5 117701701 4D47M2I TGGATGAATG AATAAAGAAAATGTGATATATATACATATACACAAATACACACACATATAC--/----AAGAAAATGTGATATATATACATATATACAAATACACACACATATACAT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 34 14 6 N/A 0 0 28124 CASAVA_Build 5 117702800 1D GAAATGCAAA T/- TATTGGCCCC 3070 het 3070 ref 41 21 19 2 T 2 1 28125 CASAVA_Build 5 117703436 4I TTTTAAAAAA ----/TCCC TTTGTTTACT 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 TCCC 0 1 28126 CASAVA_Build 5 117709164 2I TCTATTAAAA --/AT ATATGTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 AT 2 3 28127 CASAVA_Build 5 117712022 2D CATTACTGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 8 7 A 12 10 28128 CASAVA_Build 5 117744324 2D TTTAAATAAC TT/-- TACTTTTTAG 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 3 1 28129 CASAVA_Build 5 117754147 3D AAAAATCAAC TAA/--- TAAGTATGGA 3070 het 3070 hom 44 20 21 6 TAA 2 1 28130 CASAVA_Build 5 117754986 5D AGTACATATA TTGTG/----- TTGTGTTTCA 3070 het 3070 hom 40 15 21 6 TTGTG 2 1 28131 CASAVA_Build 5 117762227 2D AGTAAACAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 12 10 28132 CASAVA_Build 5 117764274 7D AATGTTTAGC TACCACT/------- TACAAGTGAG 3070 het 3070 ref 53 29 24 6 TACCACT 1 0 28133 CASAVA_Build 5 117781979 3D TACTAAATAG CCT/--- CCTGTTGAAC 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 CCT 2 1 28134 CASAVA_Build 5 117792702 1D CATATACTTC A/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 55 27 28 0 A 1 0 28135 CASAVA_Build 5 117804127 1D TGCTCCTTCA G/- GAAACCATTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 G 2 1 28136 CASAVA_Build 5 117809573 3I CTGAGTTTGT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 het 1090 hom 35 11 16 8 TTG 0 1 28137 CASAVA_Build 5 117824295 1D ACATATCCAT C/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 C 1 0 28138 CASAVA_Build 5 117830833 1I AAATTGCTCC -/T GCATAAACAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 0 1 28139 CASAVA_Build 5 117835904 1D TGCTTACATG C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 43 het 35 0 25 11 C 9 8 28140 CASAVA_Build 5 117836614 1I AACTTTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 10 11 28141 CASAVA_Build 5 117855284 1I GGAAAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 het 71 hom 18 2 14 2 T 0 1 28142 CASAVA_Build 5 117856551 4D AAGGTCAGGA GATC/---- GATCGAGACC 3070 hom 35 het 14 0 11 5 GATC 2 1 28143 CASAVA_Build 5 117861234 1D AAATAGATGC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 8 7 28144 CASAVA_Build 5 117877763 1D GAAATTACAA T/- TTTCATTCTT 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 T 4 3 28145 CASAVA_Build 5 117881644 1D AAAAGTTGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 9 8 28146 CASAVA_Build 5 117908096 3I TTACCACCAC ---/CAA CATCATCATT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CAA 0 1 28147 CASAVA_Build 5 117911983 1D GAATCCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 39 1 25 14 A 12 11 28148 CASAVA_Build 5 117924463 4I AGATACATAT ----/ATAG ATAATCTATA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 ATAG 0 1 28149 CASAVA_Build 5 117941532 1D CAGTGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1619 het 1619 ref 36 16 4 16 T 15 14 28150 CASAVA_Build 5 117944544 1D TAAATTATAA T/- TTTTTTTTTT 1677 het 1677 ref 35 22 5 8 T 12 11 28151 CASAVA_Build 5 117964343 1I GCTTGAACCT -/G GGAGGCAGAG 1429 het 1429 ref 14 10 4 0 G 2 3 28152 CASAVA_Build 5 117966050 1D CTCTAGACAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 T 9 8 28153 CASAVA_Build 5 117977396 11D GGGCTTATAC TAATTGGTATA/----------- TACACAGAAT 3070 het 3070 ref 26 16 9 5 TAATTGGTATA 1 0 28154 CASAVA_Build 5 117982063 4I ATCCTATGCT ----/TTGG TTATTATCCA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TTGG 0 1 28155 CASAVA_Build 5 117987494 4D TTAATATATA TATT/---- TAATATATAT 3070 hom 36 het 13 0 13 1 TATT 1 0 28156 CASAVA_Build 5 117990542 3D TAAAATTTTG TAA/--- TAATAACATT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 TAA 3 2 28157 CASAVA_Build 5 117991085 1I TTAAAAAGTC -/A AAACTTTAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 4 28158 CASAVA_Build 5 117996809 1I ATTCAAACTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 9 10 28159 CASAVA_Build 5 117998186 1I AGATTCTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 9 10 28160 CASAVA_Build 5 118004543 3D AAAAATTGCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 27 1 21 7 A 18 15 28161 CASAVA_Build 5 118006021 4D TACAAGAAAA AAAC/---- AAACAACCCC 1528 het 1328 hom 10 4 4 2 AAAC 2 1 28162 CASAVA_Build 5 118006967 10D ACACACACAC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 653 hom 25 6 12 7 A 27 17 28163 CASAVA_Build 5 118016748 6D TGATATCTGC TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 53 24 26 3 TTG 6 4 28164 CASAVA_Build 5 118018066 1D AAAATTTAGA G/- GATAGGTACA 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 G 2 1 28165 CASAVA_Build 5 118019429 3I ATATATTTAT ---/GGA GTACAAAGTG 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 GGA 0 1 28166 CASAVA_Build 5 118020590 5I CCAGCATTAA -----/AGTCC CTCAAAAGTC 2410 het 2410 ref 21 11 7 3 AGTCC 0 1 28167 CASAVA_Build 5 118023761 1D GTCTTTAGGG T/- TTTCCATATA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 4 3 28168 CASAVA_Build 5 118024770 3I GTTTAACTCT ---/AAA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 9 12 28169 CASAVA_Build 5 118025855 4I TCTAAGTGTT ----/TCTC TCTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TC 1 3 28170 CASAVA_Build 5 118029050 1D GGGTGACAGA G/- TGAGACCCCA 2471 het 466 hom 23 3 7 13 G 1 0 28171 CASAVA_Build 5 118034588 4I TACCATGAGA ----/TTTC TTTCTATTTA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 TTTC 1 2 28172 CASAVA_Build 5 118036252 3D GTTTCTCCTC TTA/--- TTGTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 TTA 1 0 28173 CASAVA_Build 5 118036616 2I TGATTGCATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 TG 6 7 28174 CASAVA_Build 5 118038187 2D AATTTCATAG TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 14 21 2 T 10 8 28175 CASAVA_Build 5 118040771 1D ATTATAGTCA G/- TCCTTACTTA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 G 1 0 28176 CASAVA_Build 5 118042583 1D TTTGTTTTCA T/- TTTTTTTCAA 1573 het 1573 ref 18 9 5 4 T 8 7 28177 CASAVA_Build 5 118056028 1D4M1D ATCATCATGA TTTATA/-TGAT- AACCACATGG 3070 hom 120 het 43 0 41 3 N/A 0 0 28178 CASAVA_Build 5 118066008 1D ACAGTATGGG A/- AAAAACAGCC 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 A 6 5 28179 CASAVA_Build 5 118071578 1I TCATCAGAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 8 9 28180 CASAVA_Build 5 118074006 1D AGGCAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 10 9 28181 CASAVA_Build 5 118077386 2D GAAGAGAGAT AA/-- AGACTTCCTT 3070 het 3070 ref 44 23 15 7 A 3 1 28182 CASAVA_Build 5 118077833 1I GAGATGCAAC -/A AAAGCAGAGG 2271 het 2271 ref 17 9 6 2 A 3 4 28183 CASAVA_Build 5 118084992 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2644 het 2644 ref 15 8 6 1 A 11 10 28184 CASAVA_Build 5 118085679 3D GAACTTAAAA GTT/--- TAAAAAAAAA 1228 het 1228 ref 28 15 5 8 GTT 1 0 28185 CASAVA_Build 5 118086874 1D ACTTGGAAGT A/- AAAAACACTG 3070 het 3070 ref 54 29 23 3 A 6 5 28186 CASAVA_Build 5 118102930 24D ATTTCTTACA TGGGAGAAGCTCTACTCTCCAACG/------------------------ TGGGAGAAGC 3070 hom 70 het 25 0 21 13 TGGGAGAAGCTCTACTCTCCAACG 1 0 28187 CASAVA_Build 5 118128223 1I AAATTCAGGA -/G GTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 36 1 34 1 G 1 2 28188 CASAVA_Build 5 118132393 5D CTCTGGTTAA TCCAT/----- TCCATTGGCC 3070 hom 104 het 37 0 34 4 TCCAT 2 1 28189 CASAVA_Build 5 118135198 1I ACAGCATGTG -/C CAGGGCCCTG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 1 2 28190 CASAVA_Build 5 118139497 2D TTGAATAAAC AT/-- AGAAATTGAC 3070 hom 114 het 42 0 39 5 AT 1 0 28191 CASAVA_Build 5 118147724 4I ATTCCTAATT ----/TAAA TACACATAAT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TAAA 0 1 28192 CASAVA_Build 5 118148692 1I AATTATTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 429 hom 30 1 24 5 T 9 10 28193 CASAVA_Build 5 118150724 4D AAACAGTACC CTTT/---- CTGTTTCCAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CTTT 1 0 28194 CASAVA_Build 5 118152487 1I AGAATTCAAA -/T TTTTCTGGGA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 4 5 28195 CASAVA_Build 5 118152699 2D GAGGGCAATT AA/-- AAAAAAAAAA 1797 het 673 hom 38 8 5 26 A 13 11 28196 CASAVA_Build 5 118167080 3D AGCTATAGTA ATC/--- ATATCAGCAT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 ATC 1 0 28197 CASAVA_Build 5 118251669 2I CTGTTCCATT --/TA TATGTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 TA 1 2 28198 CASAVA_Build 5 118293084 1I GTCACTTCCC -/T TTTTTTTTTT 1971 het 1826 hom 27 10 7 10 T 13 14 28199 CASAVA_Build 5 118300978 1D TTATCACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 996 hom 31 5 21 5 A 16 15 28200 CASAVA_Build 5 118301567 3I GGTGATAAAT ---/TTG TTAATTAGCT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 TTG 0 1 28201 CASAVA_Build 5 118319501 1D TGAATATTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 9 8 28202 CASAVA_Build 5 118324673 1I ACTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 10 11 28203 CASAVA_Build 5 118341710 1D GATTCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 1834 het 1391 hom 20 6 6 8 T 13 12 28204 CASAVA_Build 5 118345141 1I AACTCAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 18 21 11 A 10 11 28205 CASAVA_Build 5 118354791 1D TTTTCCTTTG T/- TTTTTTTTTT 1991 het 811 hom 25 9 6 10 T 17 16 28206 CASAVA_Build 5 118369023 2D AAAAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 6 AG 6 5 28207 CASAVA_Build 5 118462044 1D ATTTAGAATA T/- TTTTTTTTTT 805 het 805 ref 28 15 4 9 T 13 12 28208 CASAVA_Build 5 118462794 4I TTTGTTTGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 2769 hom 30 9 10 11 TTTG 3 4 28209 CASAVA_Build 5 118473648 1D GATATTTGAC T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 28 11 17 0 T 8 7 28210 CASAVA_Build 5 118498920 12D AAATACTATG GATAGAAACAGT/------------ GTTGCAGAAG 3070 het 3070 ref 29 20 10 1 GATAGAAACAGT 1 0 28211 CASAVA_Build 5 118515950 1I TTTTCTCTCC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 8 9 28212 CASAVA_Build 5 118520267 1D TTTTTTTTAG T/- TAAAATTTCT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 T 2 1 28213 CASAVA_Build 5 118535116 1D TCTGAATGCC T/- TTGTAGGGTG 2986 het 2986 ref 35 15 7 14 T 3 2 28214 CASAVA_Build 5 118535160 1D TATTGTCTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 T 10 9 28215 CASAVA_Build 5 118561240 1D CATCTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1188 het 1188 ref 37 31 3 3 T 11 10 28216 CASAVA_Build 5 118610225 2D TTTCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 983 het 516 hom 25 7 4 14 T 20 18 28217 CASAVA_Build 5 118611520 1D CCAGAATAAC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 9 8 28218 CASAVA_Build 5 118629409 16I AATGGGATAA ----------------/AGGAATAGGGAGGACT AGCAAGGGAG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 AGGAATAGGGAGGACT 0 1 28219 CASAVA_Build 5 118645879 2I TAAAGAGTTC --/AG AGTTAACACT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 AG 1 2 28220 CASAVA_Build 5 118655919 3D AGAAGAAAAA AAG/--- AAGAATGGGC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAG 2 1 28221 CASAVA_Build 5 118682246 1D AGTTTTTCAG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 8 7 28222 CASAVA_Build 5 118696640 1I GAATGAGGTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 49 21 18 10 T 8 9 28223 CASAVA_Build 5 118721694 1D TATACGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 13 13 20 T 15 14 28224 CASAVA_Build 5 118730906 5D TGTTGCTGTT GTTTA/----- GTTATTTGAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 GTTTA 1 0 28225 CASAVA_Build 5 118732650 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 912 het 912 ref 32 17 4 11 T 16 15 28226 CASAVA_Build 5 118735213 1D AAAAGACTTG A/- ATTCATTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 2 1 28227 CASAVA_Build 5 118752882 1I ATAGTCAAGG -/A AAAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 51 26 17 8 A 3 4 28228 CASAVA_Build 5 118753005 2D GAGATCACAC AG/-- GGGTGAGGAT 3070 het 3070 ref 48 21 20 8 AG 1 0 28229 CASAVA_Build 5 118755987 1D TGATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 11 10 28230 CASAVA_Build 5 118762275 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 830 het 830 ref 12 7 3 2 A 13 14 28231 CASAVA_Build 5 118772836 1D GTCACAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 A 11 10 28232 CASAVA_Build 5 118786455 1I CTATGTACTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 T 7 8 28233 CASAVA_Build 5 118809724 1D TAAAAAAAAA G/- TTATATGGTA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 G 1 0 28234 CASAVA_Build 5 118821264 1I ATTTTCCTTC -/T CTTTTTATGT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 0 1 28235 CASAVA_Build 5 118855056 1D CTCATCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 26 2 14 10 T 18 17 28236 CASAVA_Build 5 118855116 1I TATAGCAGTG -/A AAAATTTATC 3070 het 1789 hom 20 4 9 7 A 4 5 28237 CASAVA_Build 5 118858836 1D GAAAAGTATA G/- GAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 G 2 1 28238 CASAVA_Build 5 118860804 1I AGGCTCCATT -/G GGGGGGTGTG 3070 het 3070 ref 38 25 12 1 G 6 7 28239 CASAVA_Build 5 118866128 3I AAAAACAAGT ---/CTG CTTTAATAAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 CTG 0 1 28240 CASAVA_Build 5 118868786 1D TCCAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 8 T 12 11 28241 CASAVA_Build 5 118871825 1I GTAACATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3037 hom 26 8 10 8 A 11 12 28242 CASAVA_Build 5 118889879 12I GCATATATTA ------------/TATATATATATG TATATATATA 3070 het 1984 hom 13 4 8 1 TATATATATATG 0 1 28243 CASAVA_Build 5 118893162 15D CCCAAAAAAT GCCCAAAATACCAAG/--------------- GCCCAGTCTC 3070 het 3070 ref 32 19 13 2 GCCCAAAATACCAAG 1 0 28244 CASAVA_Build 5 118894150 1I ATAGTCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 11 12 28245 CASAVA_Build 5 118896884 2I ACAGGATGCC --/CT TTTTTTTTTT 3070 het 2370 hom 40 11 18 11 CT 0 1 28246 CASAVA_Build 5 118905833 1I TCTTCATAAT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 6 7 28247 CASAVA_Build 5 118923478 1D AAAAATTGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 11 10 28248 CASAVA_Build 5 118936515 3I CTCTTGATAT ---/CTA CAATTTAACA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 CTA 0 1 28249 CASAVA_Build 5 118955985 1I11M1I TTCTGGACAC -AACCTCCAGCC-/AAACCTCCAGCCA ACCTTCTTAC 3070 hom 111 het 34 0 38 4 N/A 0 0 28250 CASAVA_Build 5 118958127 1D ATATACCTTT G/- GCATAGCACA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 2 1 28251 CASAVA_Build 5 118981285 1I TTCATACTTA -/C AGAAGATCTT 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 C 0 1 28252 CASAVA_Build 5 118981769 1D ATATTTATGG A/- GTACATGAGA 933 het 933 ref 15 7 3 5 A 1 0 28253 CASAVA_Build 5 118983808 1I ATCTGCAAAT -/A AGGATAATTT 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 A 1 2 28254 CASAVA_Build 5 118988774 3I GGGATTCTCT ---/CGC CGCCTCCTCC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 CGC 1 2 28255 CASAVA_Build 5 118991025 3D CTCATAGGGG AAC/--- ATCTAGATAA 3070 het 3070 ref 48 24 20 8 AAC 1 0 28256 CASAVA_Build 5 118992323 4D TTGAAGATCC CTCT/---- CTCTCTCTGA 3070 het 3070 hom 31 14 15 4 CT 6 4 28257 CASAVA_Build 5 118992791 1I AAAACAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 C 0 1 28258 CASAVA_Build 5 118995326 2D TGTGTGGGGA GT/-- GTGTGTGTGT 1220 het 1220 ref 59 48 4 7 GT 7 6 28259 CASAVA_Build 5 119005563 1D TTTAGGACTA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 C 9 8 28260 CASAVA_Build 5 119034024 1I ACAAACCATC -/A ATAAACCAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 28261 CASAVA_Build 5 119062062 1I CTATTCCTCC -/T TTTGTGACTG 3070 hom 148 het 52 0 50 2 T 3 4 28262 CASAVA_Build 5 119067127 1I TCGCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2830 het 97 hom 23 2 12 9 T 15 16 28263 CASAVA_Build 5 119068733 1I TTTCTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 15 0 13 2 T 10 11 28264 CASAVA_Build 5 119074713 1I CACATGACTT -/G CTTTCACTGC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 0 1 28265 CASAVA_Build 5 119091784 1I GCGTCACGCC -/T TGTCTCAGAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 2 28266 CASAVA_Build 5 119092008 1I TGGGAGGTGA -/T TGGATCATTG 3070 hom 114 het 44 0 35 9 T 1 2 28267 CASAVA_Build 5 119094611 1I GTCACAAAAA -/T TGTTATGTAG 3070 hom 126 het 44 0 42 2 T 1 2 28268 CASAVA_Build 5 119100029 3D AATTATAATT ATG/--- ATTTGATGAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 ATG 1 0 28269 CASAVA_Build 5 119107806 31I ACATGCTTGG -------------------------------/CCTTCTCACAGATACTGCGCAGTCTTACAGT CCTAAGTAAG 3070 hom 110 het 33 0 35 5 CCTTCTCACAGATACTGCGCAGTCTTACAGT 0 1 28270 CASAVA_Build 5 119118408 1I TGGCCATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 74 het 29 0 26 3 A 9 10 28271 CASAVA_Build 5 119118545 1D TGTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 27 0 19 9 A 14 13 28272 CASAVA_Build 5 119120503 2I ATATTCAGAC --/TT AAAGTTATAT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 0 2 28273 CASAVA_Build 5 119129033 1I TACTTCCTTC -/T TGCTATTAGA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 T 1 2 28274 CASAVA_Build 5 119131124 1D AAACCAATGA T/- TCTCAAAAAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 2 1 28275 CASAVA_Build 5 119162484 1I TCCACTGCAA -/T TCCCCTGTCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 2 28276 CASAVA_Build 5 119193041 1I ATCTAACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 889 hom 32 4 22 6 T 16 17 28277 CASAVA_Build 5 119220631 1D TTGAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 11 10 28278 CASAVA_Build 5 119237799 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 848 het 848 ref 13 6 3 4 T 15 14 28279 CASAVA_Build 5 119242407 1I AGTAACTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 10 11 28280 CASAVA_Build 5 119260818 2I GGTACTGTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 10 11 T 14 16 28281 CASAVA_Build 5 119264408 3I TAAGCAAGCT ---/TTC TTCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TTC 1 2 28282 CASAVA_Build 5 119273513 1I TGGTCCTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 9 10 28283 CASAVA_Build 5 119274241 1I TTTGATATAA -/T TTTAATTTTC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 3 4 28284 CASAVA_Build 5 119319869 1I ACCCTCTCTG -/A ATATAGCTAT 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 1 2 28285 CASAVA_Build 5 119320314 1I ATTCTTTTTT -/C TTTTTATAGG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 C 0 1 28286 CASAVA_Build 5 119325578 1I TGTACACACA -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 C 7 8 28287 CASAVA_Build 5 119339487 5I TTAGACAAAT -----/ATTAA ATTCTCATCT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 ATTAA 0 1 28288 CASAVA_Build 5 119435032 1I ACATCATCTC -/A AAAAAAAAAA 619 het 619 ref 29 16 2 11 A 15 16 28289 CASAVA_Build 5 119441050 6I TAATAAATAT ------/AAGATA AAAAAACCCC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAGATA 0 1 28290 CASAVA_Build 5 119444882 10I TGCACTATGT ----------/TATGTTAATA GAGAATAGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TATGTTAATA 0 1 28291 CASAVA_Build 5 119446901 1D CAATAGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 30 2 16 12 T 15 14 28292 CASAVA_Build 5 119449628 3I CTTTAAGAAG ---/GTT TTTTTTTCTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GTT 0 1 28293 CASAVA_Build 5 119450974 2D ACAGTAATTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 TA 6 5 28294 CASAVA_Build 5 119518257 36D TAATATTAAT TTGTAGCCTTTTTCCTATATTTAAAGCAGAAGACTC/------------------------------------ TTGTAGCCTT 3070 het 3070 ref 29 14 14 14 TTGTAGCCTTTTTCCTATATTTAAAGCAGAAGACTC 1 0 28295 CASAVA_Build 5 119520467 1D AAAAAATTGC T/- TTTTTTTTTT 2371 het 2371 ref 27 13 8 7 T 15 14 28296 CASAVA_Build 5 119535012 1I TCAATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 11 12 28297 CASAVA_Build 5 119538658 4D TAATAGCATA ATTG/---- ATTAAGTAGA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 ATTG 1 0 28298 CASAVA_Build 5 119546643 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 A 10 9 28299 CASAVA_Build 5 119552178 1D GTACCCTCAC A/- ATTTTATTAT 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 A 2 1 28300 CASAVA_Build 5 119576634 2I AATAAGTCCA --/GT GTGTTTTCTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 GT 2 3 28301 CASAVA_Build 5 119593078 1I TGCCTACGGT -/G GGGGGGAGGA 3070 het 3070 hom 56 25 25 6 G 6 7 28302 CASAVA_Build 5 119593464 1D ACAGACTCTG T/- TGCTATAGGC 3070 het 3070 ref 63 27 25 12 T 2 1 28303 CASAVA_Build 5 119628725 1I ATAAGTCTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 8 9 28304 CASAVA_Build 5 119632132 2D GCCAAGCTAA CT/-- CTTGTATTTT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 CT 2 1 28305 CASAVA_Build 5 119640074 1D TAACCCCAAC A/- AACCAAAGCT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 A 3 2 28306 CASAVA_Build 5 119643904 1D ATGGTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 27 1 21 5 T 11 10 28307 CASAVA_Build 5 119660277 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 10 18 13 TG 9 8 28308 CASAVA_Build 5 119661763 2D ACTCACACAC AT/-- ACAGTATTAC 3070 het 3070 hom 45 18 24 5 AT 1 0 28309 CASAVA_Build 5 119702348 5I TTTTTGTTAA -----/TTTTG TTACACTTAA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 TTTTG 0 1 28310 CASAVA_Build 5 119720396 1I AAAAGCTTCA -/T TTTTTACACA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 5 6 28311 CASAVA_Build 5 119723322 4I TAAGTAGTCT ----/TAAG TAGTTTTTAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TAAG 0 1 28312 CASAVA_Build 5 119723777 1I GGAGTGCCCC -/T TTTGACTTAC 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 T 3 4 28313 CASAVA_Build 5 119730427 1I TTGGTGAGAC -/T TTTAACTATT 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 T 3 4 28314 CASAVA_Build 5 119735353 16D GCCTGTAATC CCAGCTACTCAGGAGG/---------------- CTGAGGCGGG 3070 het 3070 ref 18 11 8 5 CCAGCTACTCAGGAGG 1 0 28315 CASAVA_Build 5 119744484 1I CAAAAAACCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 8 9 28316 CASAVA_Build 5 119774568 2I TTGAGGGAGG --/GA GAGAGTGCAG 3070 het 3070 hom 64 25 32 7 GA 2 3 28317 CASAVA_Build 5 119775812 1I AATTTCTACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 9 10 28318 CASAVA_Build 5 119778648 1D ATAATATATG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 8 7 28319 CASAVA_Build 5 119806814 4I ACAAAATAAC ----/AGAT AGAAACAAAG 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 AGAT 0 1 28320 CASAVA_Build 5 119814199 16D GCAGTGGCAA ACAAGACAAACATTTT/---------------- ACAAGACAAA 3070 het 3070 ref 39 22 15 7 ACAAGACAAACATTTT 2 1 28321 CASAVA_Build 5 119817277 3D GCAGAAACTC AGA/--- AGAAGATCAG 3070 het 3070 ref 42 20 19 5 AGA 3 2 28322 CASAVA_Build 5 119819132 1I AAACCTTATC -/T GAAAATTGAG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 0 1 28323 CASAVA_Build 5 119838184 1D ATTTGCTATC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 T 8 7 28324 CASAVA_Build 5 119844749 1D TCTTATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 10 9 28325 CASAVA_Build 5 119847954 5I ACATATAAAA -----/TATAT TATATAATAC 2062 hom 12 het 5 0 5 0 TATAT 1 2 28326 CASAVA_Build 5 119854355 1D TTCTGCTCTG T/- TTTTTTCCCC 2906 hom 15 het 6 0 6 0 T 7 6 28327 CASAVA_Build 5 119855743 3I GTGCAGTAGA ---/ATG ATAAGGATCC 3070 hom 51 het 20 0 16 4 ATG 0 1 28328 CASAVA_Build 5 119863361 1D ACTGATTATC T/- TTTTTTTTTT 1454 het 1454 ref 35 22 4 9 T 12 11 28329 CASAVA_Build 5 119868100 4I GAAGTAGTCT ----/TGAC GTCACATACT 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 TGAC 0 1 28330 CASAVA_Build 5 119889205 1D TCAATATTGC T/- TTTTTTTTTT 2247 het 2247 ref 44 19 7 18 T 17 16 28331 CASAVA_Build 5 119903936 3D CTCTTTCCTC CTT/--- AACATGATTT 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 CTT 1 0 28332 CASAVA_Build 5 119904456 2I ACTTTCTAAC --/AT GTGTCATATC 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 AT 0 1 28333 CASAVA_Build 5 119919424 1I TTGAGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 2441 het 2441 ref 26 11 7 8 A 15 16 28334 CASAVA_Build 5 119920543 1D CTGCTACATG A/- AAAAAAAAAA 1649 het 1649 ref 32 23 5 4 A 13 12 28335 CASAVA_Build 5 119924359 5I GGGTCCCACA -----/CTTTT CTTTACTGGG 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 CTTTT 0 1 28336 CASAVA_Build 5 119928098 1D GCGCTGGCTG A/- GGCAAGCATG 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 A 1 0 28337 CASAVA_Build 5 119930212 1I ATCCATGTAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 7 8 28338 CASAVA_Build 5 119936761 14D TAAAACTAAT GTCTGTGACTTTAA/-------------- GTCTGTGAAT 3070 het 3070 ref 41 19 20 7 GTCTGTGACTTTAA 1 0 28339 CASAVA_Build 5 119954105 7I CTGATTCAGT -------/GTTGAAG GTTGAAGTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GTTGAAG 1 2 28340 CASAVA_Build 5 119957116 1I CCCTACCAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 9 10 28341 CASAVA_Build 5 119959029 1I TCAAAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 10 11 28342 CASAVA_Build 5 119959735 2D ATCTCTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 3 T 14 12 28343 CASAVA_Build 5 119961722 8I GGTTACCTTG --------/TGAGAATT TGAGAATTTT 3070 het 3070 hom 40 11 25 4 TGAGAATT 1 2 28344 CASAVA_Build 5 119970499 1I ACCCTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 11 12 28345 CASAVA_Build 5 119974035 1D CATACTGATA T/- GGTTTGGCTA 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 T 1 0 28346 CASAVA_Build 5 119976966 1I TCATAATTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 28347 CASAVA_Build 5 119978647 2I TGTATAACGG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 49 0 39 10 A 9 11 28348 CASAVA_Build 5 119982565 1I AAAAAGTCAG -/A AACAAAAAGT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 A 2 3 28349 CASAVA_Build 5 119993335 3D TAGAAGACTC TGT/--- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 16 2 TGT 1 0 28350 CASAVA_Build 5 119994172 1D AACGAACACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 10 9 28351 CASAVA_Build 5 119996684 2D CTCCTTAAAC AT/-- AACAATTATC 3070 het 3070 ref 41 24 15 3 AT 1 0 28352 CASAVA_Build 5 120001237 1I TTGGGGATTT -/G GGGGGGAAGG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 6 7 28353 CASAVA_Build 5 120003907 1I TTGAAAAAAA -/T ATTCTCATGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 0 1 28354 CASAVA_Build 5 120005855 1D TCAACAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 T 11 10 28355 CASAVA_Build 5 120008019 1I TGATGTTTAA -/T TTTTGTTCAT 3070 hom 126 het 43 0 43 0 T 4 5 28356 CASAVA_Build 5 120018983 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 330 hom 32 1 23 8 A 9 10 28357 CASAVA_Build 5 120019328 1I4M1I ACTTTTTTTT -TTTG-/GTTTGT TTTTTTTTTT 3070 het 253 hom 48 3 24 22 N/A 0 0 28358 CASAVA_Build 5 120027052 1D AAAGTAAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 27 13 9 6 A 8 7 28359 CASAVA_Build 5 120028051 1I AATGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 18 1 12 5 T 10 11 28360 CASAVA_Build 5 120039300 2D AACTAGAAAC TT/-- ATTTTTTATC 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 T 2 0 28361 CASAVA_Build 5 120047096 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2448 hom 34 6 13 15 A 16 17 28362 CASAVA_Build 5 120057364 1I AGGTCAGTTG -/T TATCTTCTGT 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 T 1 2 28363 CASAVA_Build 5 120060577 1D CCAAGAAAAT A/- AAAAGTTAGG 3070 hom 92 het 33 0 31 3 A 5 4 28364 CASAVA_Build 5 120069913 22I TGATTTTTGT ----------------------/CAGTTCCTGAAGAAGAAACTAG CAGTTTGACT 3070 hom 102 het 34 0 35 4 CAGTTCCTGAAGAAGAAACTAG 0 1 28365 CASAVA_Build 5 120074537 1I GAATCCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 562 hom 28 3 21 4 T 10 11 28366 CASAVA_Build 5 120081125 4D TGTATCTTCA ATTT/---- ATTTTCTACT 3070 hom 114 het 44 0 37 8 ATTT 2 1 28367 CASAVA_Build 5 120086437 3I ACCTGGAGTT ---/GTG GGAATTTTCT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 GTG 0 1 28368 CASAVA_Build 5 120098147 1I TGGGATTTTA -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 8 28369 CASAVA_Build 5 120105875 1D TACTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1038 hom 49 10 23 16 T 13 12 28370 CASAVA_Build 5 120110027 1D AACTCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 98 het 37 0 33 4 T 11 10 28371 CASAVA_Build 5 120115345 1I GAACCAATCA -/T TATGGAAATA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 1 2 28372 CASAVA_Build 5 120116581 3I AATATTATTG ---/ATA ATGTCAAATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ATA 0 1 28373 CASAVA_Build 5 120121626 4I AATTTTATTG ----/TCAA TCAAGACTTC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 TCAA 1 2 28374 CASAVA_Build 5 120124231 4D GACTTTACCT AATA/---- AATACTTTCA 3070 het 3070 hom 49 23 25 3 AATA 2 1 28375 CASAVA_Build 5 120126349 1D GACTGTTTCC T/- TTGTTGTGCA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 3 2 28376 CASAVA_Build 5 120126749 1I TAATAGCAAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 17 0 A 0 1 28377 CASAVA_Build 5 120128243 5D AAAAGATTAA ATTTT/----- ATTTTAGTGT 3070 het 3070 ref 32 19 10 5 ATTTT 2 1 28378 CASAVA_Build 5 120132004 1I TAAGCAATGA -/T TTTTTTTACC 3070 het 2217 hom 20 7 10 3 T 7 8 28379 CASAVA_Build 5 120132685 1I CATGCCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 10 11 28380 CASAVA_Build 5 120133534 1D TACTTTTGAC T/- TTCATTTCTT 3070 het 3070 hom 42 12 21 9 T 3 2 28381 CASAVA_Build 5 120133840 2D ATAAAGACAA AC/-- ACATAAGCCA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AC 2 1 28382 CASAVA_Build 5 120134627 1D AATTCTTTAA T/- TTTTAAGATA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 5 4 28383 CASAVA_Build 5 120136180 2I ACTTCTTTAT --/TC TCTTTCTCAC 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 TC 1 2 28384 CASAVA_Build 5 120137666 4I TTTTTGAGTT ----/GATA GATTTCCTGT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 GATA 0 1 28385 CASAVA_Build 5 120140421 1I TTAATGTTCT -/A AAAAGTATTG 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 A 4 5 28386 CASAVA_Build 5 120145313 2D AAAAAGAGAT AC/-- AGTTTCAGAT 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 AC 1 0 28387 CASAVA_Build 5 120145599 1I ACAGTGATTT -/G GCATATAAAT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 G 1 2 28388 CASAVA_Build 5 120149572 1I GTCATTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 10 11 28389 CASAVA_Build 5 120149683 1I AAAGCTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2840 het 2840 ref 28 13 8 7 T 12 13 28390 CASAVA_Build 5 120150128 1D ATATTATATA T/- ATTATTTTAA 1936 het 1466 hom 11 3 4 4 T 1 0 28391 CASAVA_Build 5 120153502 1I ACCATACTTA -/C TGTTTAAACT 3070 het 3070 hom 40 18 22 0 C 0 1 28392 CASAVA_Build 5 120154095 2D TGCAGCAATG CA/-- CAGTCTTAGG 3070 het 3070 hom 74 29 36 9 CA 2 1 28393 CASAVA_Build 5 120154441 2D TTCTTCTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 A 12 10 28394 CASAVA_Build 5 120166408 12D ACCCCTTGGA CTTGGTGTCCTT/------------ CTCCACACTG 3070 het 3070 ref 44 26 17 4 CTTGGTGTCCTT 1 0 28395 CASAVA_Build 5 120172280 3I TATATATATT ---/CTC CTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 CTC 0 1 28396 CASAVA_Build 5 120182754 1I AGCCATCTTG -/A AACCAGAACC 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 2 3 28397 CASAVA_Build 5 120184090 6I ATGTCAATAC ------/TTCATT GTCTTGATCA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TTCATT 0 1 28398 CASAVA_Build 5 120184226 1D CCCCCTTGAC A/- ATGTTTAATG 3045 het 3045 ref 29 17 8 4 A 2 1 28399 CASAVA_Build 5 120200094 1D ATTCAGGACA T/- AGGCATGGGC 1954 het 1484 hom 7 3 4 0 T 1 0 28400 CASAVA_Build 5 120208465 4I AGAACAGAGA ----/TATC TATCAAATAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 TATC 1 2 28401 CASAVA_Build 5 120228989 4D ACACCAGAAA TTAT/---- TTATCTACTC 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 TTAT 2 1 28402 CASAVA_Build 5 120246699 1D GTAGGATATG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 8 7 28403 CASAVA_Build 5 120248151 4D TTTAAAAACG TCAA/---- TCAATCAATG 3070 het 3070 hom 29 12 16 3 TCAA 3 2 28404 CASAVA_Build 5 120299245 1D TCGATATCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 31 0 24 8 A 10 9 28405 CASAVA_Build 5 120304883 1D AGGTAAAGAA G/- GAAGATCTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 2 1 28406 CASAVA_Build 5 120371772 1I GTGTCAAGAT -/G GTATGACAGT 3070 het 3070 hom 58 26 30 2 G 1 2 28407 CASAVA_Build 5 120389546 1D GTTCTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 T 12 11 28408 CASAVA_Build 5 120390566 1D ATTTTTCTCA T/- GAAAATAAGC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 1 0 28409 CASAVA_Build 5 120390782 1D GTGACTTTTC T/- TGCTATCAGA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 2 1 28410 CASAVA_Build 5 120397674 16D GACAGCGATT GGTAACACCAGCTATC/---------------- GGTAACACCA 3070 het 3070 hom 35 12 15 10 GGTAACACCAGCTATC 2 1 28411 CASAVA_Build 5 120400078 1I AGTTTTTATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 8 9 28412 CASAVA_Build 5 120407521 10D AAAGTAAAAA ACAGAAATTG/---------- CATCTGACTC 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 ACAGAAATTG 1 0 28413 CASAVA_Build 5 120408115 1I ATAATAGTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 8 9 28414 CASAVA_Build 5 120433666 1I CACTCTGGGG -/A CTGTTGTGGG 3070 het 1268 hom 13 3 7 3 A 0 1 28415 CASAVA_Build 5 120442336 1D TATATATATA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 2543 hom 19 8 10 1 T 8 7 28416 CASAVA_Build 5 120450170 1I CTCACATAAG -/A GTGAGAACAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 0 1 28417 CASAVA_Build 5 120456357 4I GCCTATGTGT ----/AAAG AAAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 AAAG 1 2 28418 CASAVA_Build 5 120466509 1D AAGCATGTTT A/- AAAATCAGTC 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 5 4 28419 CASAVA_Build 5 120478422 6I AATTATATGT ------/ACAGTC ACTGAATGCA 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 ACAGTC 0 1 28420 CASAVA_Build 5 120496106 2D AGTAATAAAT TA/-- TGATAGAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 TA 1 0 28421 CASAVA_Build 5 120512107 1I CAGCAACATG -/C TCTTTTGGTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 28422 CASAVA_Build 5 120513659 1D ATTTTCTACA T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 41 12 26 3 T 7 6 28423 CASAVA_Build 5 120532299 1I CATACAACAT -/A AGATCCACCA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 1 2 28424 CASAVA_Build 5 120533850 7I AGGATTTGAA -------/TTTTTGT TGGTGAGGTA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 TTTTTGT 0 1 28425 CASAVA_Build 5 120540576 1I GCCATAATCA -/C CCATACATGC 3070 het 3070 ref 56 25 22 9 C 2 3 28426 CASAVA_Build 5 120549088 1I TATCAGTTAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 7 8 28427 CASAVA_Build 5 120549511 4D TTTCTCCTTC TCTT/---- TCTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 TCTT 2 1 28428 CASAVA_Build 5 120552807 1I TGCTTAGCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 49 22 15 12 A 8 9 28429 CASAVA_Build 5 120556694 1I TTTGAGTTTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 8 9 28430 CASAVA_Build 5 120557349 1I TATCTGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 A 10 11 28431 CASAVA_Build 5 120564197 1D ATGTGTGTGT G/- TTTTTTTTTC 3070 hom 52 het 30 0 22 8 G 1 0 28432 CASAVA_Build 5 120566502 4I TCTTATTTAA ----/TTAT TTATACTGAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 TTAT 1 2 28433 CASAVA_Build 5 120571459 1I CAATATTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 10 11 28434 CASAVA_Build 5 120576510 1D ACTTTCTTTC A/- ACTCATAATA 3070 het 3070 ref 42 17 16 11 A 2 1 28435 CASAVA_Build 5 120577077 1I TCTTTTTTTT -/G GTTATATTTA 2137 het 2137 ref 16 8 5 3 G 1 2 28436 CASAVA_Build 5 120579912 1D TCACTGTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 11 13 9 A 10 9 28437 CASAVA_Build 5 120582099 4D AATTAAAAGA AGAG/---- AGAGAGTAGA 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 AG 5 3 28438 CASAVA_Build 5 120583003 4I GAATGAGTTA ----/ATAC ATAAATAAAT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 ATAC 0 1 28439 CASAVA_Build 5 120585026 1I TCTTACAGAT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 7 8 28440 CASAVA_Build 5 120588680 1D CAAACATACG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 A 9 8 28441 CASAVA_Build 5 120591364 2D GACCTGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 32 0 21 11 A 16 14 28442 CASAVA_Build 5 120595923 1D AAAAATGGGC A/- AATTTTTTTT 1339 het 1339 ref 30 14 7 10 A 3 2 28443 CASAVA_Build 5 120597442 1I GCCTAGAAGC -/A AGTGATAGTC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 2 28444 CASAVA_Build 5 120608333 2I TTAGCTGCTC --/TT GTCACATACC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 0 2 28445 CASAVA_Build 5 120619822 1D GATGCAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 40 0 32 8 A 12 11 28446 CASAVA_Build 5 120622124 1D TTTATAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 11 10 28447 CASAVA_Build 5 120625868 4D8M7D TAATCATATA TTTCTTAAAGGTTTTATTC/----TTAAAGGT------- TTTATTCTTT 3070 het 3070 ref 29 19 15 2 N/A 0 0 28448 CASAVA_Build 5 120638272 1I GAGCATGTCC -/T TAATATATAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 2 28449 CASAVA_Build 5 120651202 3D TAATAATAAA ATG/--- ATGATTATTG 3070 het 3070 hom 25 11 13 3 ATG 2 1 28450 CASAVA_Build 5 120652874 5D TAGGCGAACT AATAA/----- AAAAGTAATG 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 AATAA 1 0 28451 CASAVA_Build 5 120656794 2I AATATTTAAA --/AT ATGTGTTCTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 AT 1 2 28452 CASAVA_Build 5 120664032 5I TTATTACTTT -----/AATTC ATCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 AATTC 0 1 28453 CASAVA_Build 5 120668674 2I GTCACATTCT --/AC ACCCCTTCTC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 AC 1 2 28454 CASAVA_Build 5 120671652 5I GAGATAGAGT -----/AATAA AATAATTGAC 3070 het 2877 hom 20 7 11 2 AATAA 1 2 28455 CASAVA_Build 5 120691241 5D TACACAAACG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 AAACA 4 3 28456 CASAVA_Build 5 120691687 1D ACAACTGTTA C/- TACAAATACC 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 C 1 0 28457 CASAVA_Build 5 120694603 2I CACGTGTCAT --/GA GAGAGAGACA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 GA 4 5 28458 CASAVA_Build 5 120696598 1I ATTTTTCCCA -/T ATGTGTCTCC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 0 1 28459 CASAVA_Build 5 120696697 4I TGGTAGTTCA ----/TGAC TGACAGAAGA 2607 het 2607 ref 17 9 6 2 TGAC 1 2 28460 CASAVA_Build 5 120702712 4I TTAATGAATG ----/AATA AATAAACAAG 3070 het 3070 ref 41 18 8 15 AATA 1 2 28461 CASAVA_Build 5 120723508 2D TTATTTTAAC TT/-- AACTATATCT 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 T 2 0 28462 CASAVA_Build 5 120726038 10I TACCTCTTCT ----------/ACCCTCTGCC TTTTCATTCC 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 ACCCTCTGCC 0 1 28463 CASAVA_Build 5 120729509 1I TCATCCCATG -/T TTTTTTTTTT 2267 het 2267 ref 35 17 6 12 T 15 16 28464 CASAVA_Build 5 120730588 1D CATTCCAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 54 22 22 10 T 10 9 28465 CASAVA_Build 5 120732652 1D TATTTTAGTG T/- TTTTTTACAG 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 T 7 6 28466 CASAVA_Build 5 120734308 1D GCTTAGGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 10 6 T 13 12 28467 CASAVA_Build 5 120738547 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1898 hom 19 5 13 3 A 10 9 28468 CASAVA_Build 5 120740945 1I GATATTGAAA -/C TATCTGATAC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 C 0 1 28469 CASAVA_Build 5 120755336 119D2M2D TCACTCTCAT TGTCCGTAATGATGGTTTTGTTTTCTGAAATTATACTATTCTTCTTTAAAAAATAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATCTTCTCATCATCTACACTCCCTTTGGTTCTAGTAAACCTGA/-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CT-- CCTCAAACCT 2005 het 2005 ref 15 25 5 8 N/A 0 0 28470 CASAVA_Build 5 120758289 1I TCAAGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 12 13 28471 CASAVA_Build 5 120763378 2D GAGGACACAG AC/-- AGATATTATA 3070 het 3070 ref 42 27 12 3 AC 1 0 28472 CASAVA_Build 5 120766864 10I AGTATGTAGG ----------/TGGAAGAGAC TTGCCTTGTC 3070 het 3070 ref 65 35 22 8 TGGAAGAGAC 0 1 28473 CASAVA_Build 5 120785867 2D CCAAATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 AT 6 5 28474 CASAVA_Build 5 120809396 1D AGCCTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 24 1 17 6 A 13 12 28475 CASAVA_Build 5 120824922 1I CTCAATTGGA -/T TCATGCTAAA 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 T 1 2 28476 CASAVA_Build 5 120828796 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCGTGCAC 2550 het 2550 ref 24 14 7 5 AG 2 1 28477 CASAVA_Build 5 120829338 2D AACACCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 43 2 16 26 A 14 12 28478 CASAVA_Build 5 120830089 1D ACCCTATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 618 hom 29 4 10 15 A 15 14 28479 CASAVA_Build 5 120850949 1D TTTTTAATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 T 10 9 28480 CASAVA_Build 5 120852296 1I TTATTTCTAA -/T TATAATAATG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 1 2 28481 CASAVA_Build 5 120855389 1D TATAATTGAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 111 het 41 0 38 5 A 9 8 28482 CASAVA_Build 5 120861152 4D GATACCCTTT AGTA/---- AGTAAAGAAA 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 AGTA 2 1 28483 CASAVA_Build 5 120865379 1I52M1I TCTCTTTCTC -TGCTTTTACTGTCAATCAACTTGCATTATTATTAAAAATACCGCAGGAAATA-/TTGCTTTTACTGTCAATCAACTTGCATTATTATTAAAAATACCGCAGGAAATAT TTGCTACATC 3070 hom 87 het 32 0 30 7 N/A 0 0 28484 CASAVA_Build 5 120866156 1I ATTCAGTGGG -/A AAAAAAAAAA 2400 het 2400 ref 28 13 7 8 A 10 11 28485 CASAVA_Build 5 120889687 1D GGCAACAAGG A/- AAAACACCAT 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 A 5 4 28486 CASAVA_Build 5 120892683 1I ATCTGGTCCA -/G GGCTTTTACA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 2 3 28487 CASAVA_Build 5 120923126 1D GAAAAAAAAA C/- AGCCTAGAAT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 C 1 0 28488 CASAVA_Build 5 120923307 1I TGATTGTGAT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 6 7 28489 CASAVA_Build 5 120935745 1D AAATTATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 11 10 28490 CASAVA_Build 5 120940688 1D AGCAAGACTC T/- TGTCTCAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 17 0 T 2 1 28491 CASAVA_Build 5 120950992 1D CAAAGCCAGA C/- AGTAATGAAA 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 C 1 0 28492 CASAVA_Build 5 120956353 1D TGGTGAGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 15 8 A 10 9 28493 CASAVA_Build 5 120964802 1I CTCTCTATCC -/T GTTCCATTTG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 0 1 28494 CASAVA_Build 5 120983672 2I GTCTGTGCCC --/CT GTTTGTTCTC 3070 hom 120 het 42 0 40 2 CT 0 1 28495 CASAVA_Build 5 120989830 2D TGTATATAAA AT/-- ATATATATAT 3030 hom 30 het 12 0 11 2 AT 6 5 28496 CASAVA_Build 5 120993440 2I TGTGATGATC --/TA TGTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 TA 0 1 28497 CASAVA_Build 5 120994532 1I GAGAAGTAGG -/A AATCAGTATG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 2 3 28498 CASAVA_Build 5 120996608 1D AATGTTCCTC T/- TTTACTATGG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 4 3 28499 CASAVA_Build 5 121000990 1I AAATTATGCA -/T TAGACAGGGG 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 T 1 2 28500 CASAVA_Build 5 121004440 1I AGGCTTCTTC -/A GTGGCTCCAC 3070 het 3070 ref 44 16 16 12 A 0 1 28501 CASAVA_Build 5 121025712 2I CAAATTGGAT --/AA AGAGTCAAGA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 1 3 28502 CASAVA_Build 5 121059860 1D CAAACACTAA G/- ATATTTGTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 1 0 28503 CASAVA_Build 5 121060387 1I AATGGTGGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 187 hom 29 1 25 3 T 8 9 28504 CASAVA_Build 5 121082580 2D GAAGTACCAC TA/-- TATAATGTGA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TA 3 2 28505 CASAVA_Build 5 121083779 2D CTATATCCTG CT/-- TTTAGACAAA 3070 hom 99 het 34 0 33 1 CT 1 0 28506 CASAVA_Build 5 121088398 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 10 9 28507 CASAVA_Build 5 121089073 1D TGATTGATTC A/- AGCTGTTTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 2 1 28508 CASAVA_Build 5 121089887 1D TTAAGTCTGG T/- TGAAGACACA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 T 2 1 28509 CASAVA_Build 5 121163657 1D ACAAACCTGC A/- ACGCTGTGCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 2 1 28510 CASAVA_Build 5 121220084 1I ACTCTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 35 1 29 5 T 12 13 28511 CASAVA_Build 5 121233284 1D AAATAAATAC A/- TAAATTGTAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 1 0 28512 CASAVA_Build 5 121292692 1D GATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1584 het 1584 ref 27 20 4 3 T 13 12 28513 CASAVA_Build 5 121314525 2I AATTGTGGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 51 22 17 12 TG 7 8 28514 CASAVA_Build 5 121374232 1D86M4I ACTTACACTT AATGTTCCTTCCCTCACAGTAATGTTCACATATAACATTCTGTATGTATGTATGTGTGTGTGTATCAAATTAAATTTCCCATAAAAT----/-ATGTTCCTTCCCTCACAGTAATGTTCACATATAACATTCTGTATGTATGTATGTGTGTGTGTATCAAATTAAATTTCCCATAAAATTTTA TTTAATTTTC 3070 het 405 hom 40 3 37 27 N/A 0 0 28515 CASAVA_Build 5 121377592 3I GACTACAGTT ---/AAC AATATATTTC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 AAC 0 1 28516 CASAVA_Build 5 121395860 1D TCCTTGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 31 1 26 4 T 12 11 28517 CASAVA_Build 5 121405152 2D TTTTTCAAAC AG/-- AATATTTCAT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 AG 1 0 28518 CASAVA_Build 5 121412619 1I TTTTGAAGGG -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 7 8 28519 CASAVA_Build 5 121430900 1I CTGTGAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 727 hom 32 2 23 7 A 11 12 28520 CASAVA_Build 5 121434663 1I TGCATTATAA -/T CATGCTATGT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 0 1 28521 CASAVA_Build 5 121440312 1D AGAAATCTTC A/- AAAATATTAA 3070 hom 114 het 41 0 38 4 A 5 4 28522 CASAVA_Build 5 121526753 1I CTTCTCCCTG -/C CCACTTCACA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 C 2 3 28523 CASAVA_Build 5 121527546 1I CTGTGTCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 11 12 28524 CASAVA_Build 5 121531942 1D ACATTCATGG T/- TTTTTTACTG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 7 6 28525 CASAVA_Build 5 121532467 1D GACTGATGCA G/- CTCTCTTATA 3070 het 3070 hom 48 23 22 3 G 1 0 28526 CASAVA_Build 5 121556565 1D TTTGTTCCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 T 10 9 28527 CASAVA_Build 5 121557253 2D AAGAAATGAC TT/-- TTGAAGAAAG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 T 4 2 28528 CASAVA_Build 5 121562842 2I CTCTTCCAAC --/AT GTTTGTATAG 3070 het 3070 ref 53 25 24 4 AT 0 1 28529 CASAVA_Build 5 121566473 1I AAGGATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 23 12 15 A 10 11 28530 CASAVA_Build 5 121585386 1D GTCTTCACCA C/- CCCATCCCGT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 C 4 3 28531 CASAVA_Build 5 121601443 2I CCAAAAAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 A 10 12 28532 CASAVA_Build 5 121601989 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2554 het 2360 hom 15 6 7 2 T 11 10 28533 CASAVA_Build 5 121602940 17D GGATGGACTG CAGGACTAAGGAATATT/----------------- CAGAAACATG 3070 het 3070 ref 35 23 18 3 CAGGACTAAGGAATATT 1 0 28534 CASAVA_Build 5 121603204 4D TGTACTGCAG TTTC/---- TTTATCCATT 3070 het 3070 hom 26 10 13 6 TTTC 1 0 28535 CASAVA_Build 5 121603791 6D TTTGTTGATA TATATG/------ TATATTTTCT 3070 het 3070 ref 28 16 11 5 TATATG 1 0 28536 CASAVA_Build 5 121603932 1D TTCCTCTATG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 25 11 9 7 T 8 7 28537 CASAVA_Build 5 121609269 1I GAATCTATCA -/C CCGAAGAGTA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 C 2 3 28538 CASAVA_Build 5 121609995 1I GCATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 811 het 811 ref 44 36 3 5 T 11 12 28539 CASAVA_Build 5 121612362 4D TTAAATACTC TTTA/---- TTGCTTTCTC 2926 het 2926 ref 21 12 6 3 TTTA 1 0 28540 CASAVA_Build 5 121618808 1I TTTAAAAAAA -/T GTTTGATTTC 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 T 0 1 28541 CASAVA_Build 5 121620830 1I TTTTCGTTTG -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 7 8 28542 CASAVA_Build 5 121628305 6I TAATTGTAGG ------/TTTTCC TTTTCCACAC 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 TTTTCC 1 2 28543 CASAVA_Build 5 121630625 1D AGTGAAATAC A/- GGGGTAGAGG 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 1 0 28544 CASAVA_Build 5 121631914 1I TAGCTTAAAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 7 8 28545 CASAVA_Build 5 121633263 1D GCAAAGAAAC A/- AATGGATTTA 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 A 3 2 28546 CASAVA_Build 5 121640493 2D TCAGTAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 9 5 A 14 12 28547 CASAVA_Build 5 121642328 1D TATTATAATC A/- CAATAAGAAA 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 A 1 0 28548 CASAVA_Build 5 121646613 2D TGCTTTCTTT GC/-- GCATCTGTTG 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 GC 2 1 28549 CASAVA_Build 5 121722640 4I CTGGAGCCTT ----/TAAA TATACTTTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TAAA 0 1 28550 CASAVA_Build 5 121725017 1D ACTTCTAACC T/- TACTTGCATT 3070 hom 107 het 42 0 35 7 T 2 1 28551 CASAVA_Build 5 121727279 1I GTAAGGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 988 hom 23 3 15 5 A 11 12 28552 CASAVA_Build 5 121741089 8D GGAGACAGAC AGAGAGAG/-------- AGAGAGAGAG 2912 het 2912 ref 21 8 8 5 AG 13 9 28553 CASAVA_Build 5 121790971 1I AACAGCAGTG -/T TTTTTTTTTT 2452 het 2452 ref 36 20 6 10 T 13 14 28554 CASAVA_Build 5 121806506 1I AAATTTAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 9 10 28555 CASAVA_Build 5 121811100 1D AATATTTTTC T/- TTGACTGTGT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 3 2 28556 CASAVA_Build 5 121846350 1I20M1I ACAATAAGAG -AAAACCATATATGAATAGAT-/AAAAACCATATATGAATAGATA ATGTAAAAGC 3070 het 999 hom 33 6 15 22 N/A 0 0 28557 CASAVA_Build 5 121854066 1I ATGATATTTT -/A GGGATTCAGA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 0 1 28558 CASAVA_Build 5 121857195 2I ACCCAGGCCT --/GC GCTCTGTGTC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 GC 1 2 28559 CASAVA_Build 5 121880155 1I CTGGACTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 A 10 11 28560 CASAVA_Build 5 121886194 1D ATGGCTTTTT C/- TTTTTTTCCC 2150 het 2150 ref 28 16 8 4 C 1 0 28561 CASAVA_Build 5 121903353 1I ATTTTTGTGT -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 A 6 7 28562 CASAVA_Build 5 121907486 1D TGCTACAACA T/- TTTCAAGTTT 3070 het 3070 ref 54 32 15 8 T 4 3 28563 CASAVA_Build 5 121909457 1I CTTATTTTCA -/T TTATATACTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 3 28564 CASAVA_Build 5 121913522 5D AATAAAAGAA AAAAG/----- AAAACAAAGT 3070 het 3070 ref 35 19 14 5 AAAAG 1 0 28565 CASAVA_Build 5 121920163 5I CTATAAAATT -----/ATAAC ATATTCAGAA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 ATAAC 0 1 28566 CASAVA_Build 5 121927748 2I ACTCTGCACA --/CT CTGATTTGGA 2279 het 2279 ref 28 20 5 3 CT 1 2 28567 CASAVA_Build 5 121929612 4D GCTGCGATAA TAGC/---- TAGCAATTAC 3070 het 3070 hom 43 15 26 4 TAGC 2 1 28568 CASAVA_Build 5 121942009 15I AAGGCCACTG ---------------/ATCTGGCAGGTAAAA ATCACACAGC 3070 het 3070 ref 46 24 19 5 ATCTGGCAGGTAAAA 0 1 28569 CASAVA_Build 5 122059025 2I CCAAGTTAAC --/TT TACAAACTCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 1 3 28570 CASAVA_Build 5 122082500 1I AACAAAAGTC -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 28571 CASAVA_Build 5 122086278 1D TGTGGCAGAG A/- ATTGTTAATT 3070 hom 120 het 45 0 41 5 A 2 1 28572 CASAVA_Build 5 122091146 1D CTACAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1506 hom 36 8 15 13 T 15 14 28573 CASAVA_Build 5 122108220 1I GGATATTAAC -/A TACAAGTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 28574 CASAVA_Build 5 122108315 1D AGAACTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 24 1 17 6 A 11 10 28575 CASAVA_Build 5 122117330 1D TGGATGCTAA G/- GGGCCAAAAA 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 G 4 3 28576 CASAVA_Build 5 122126393 1I ATAGATAATA -/C AGATACATAG 3070 het 3070 hom 56 25 25 6 C 0 1 28577 CASAVA_Build 5 122129402 4I CAGATTAAGC ----/AGAA AGAAAGTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 AGAA 1 2 28578 CASAVA_Build 5 122133180 3I AGATAAGGCC ---/CCT CCTCCCTTCA 2091 het 2091 ref 34 18 6 10 CCT 1 2 28579 CASAVA_Build 5 122147505 4D ATAATCTCTC TATT/---- TATTTAGTTA 3070 het 3070 ref 26 13 8 7 TATT 2 1 28580 CASAVA_Build 5 122149097 1D TGAGACTTTT C/- TCCCTACTCT 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 C 1 0 28581 CASAVA_Build 5 122164402 6D TGCATTTAGA TAGTGT/------ TAGACTATTA 3070 het 3070 ref 35 22 11 4 TAGTGT 1 0 28582 CASAVA_Build 5 122164577 1I TTTTTCCCAC -/T TTACTGCTTT 3070 het 3070 hom 45 11 23 11 T 2 3 28583 CASAVA_Build 5 122166908 1D ATGGTTTAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 10 9 28584 CASAVA_Build 5 122175943 1D39M2I CAGACTAACC TTTTGCTGCTTCTCAAACACCCTAGGCATTTTCCTACCTT--/-TTTGCTGCTTCTCAAACACCCTAGGCATTTTCCTACCTTAG AGTCTTTTCA 3070 het 2604 hom 31 9 18 10 N/A 0 0 28585 CASAVA_Build 5 122179888 5D CATTTTAGAG AAAGA/----- GAAAGTTGAA 3070 het 3070 ref 51 26 21 7 AAAGA 1 0 28586 CASAVA_Build 5 122186947 1D TTAAGATTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 7 18 3 T 9 8 28587 CASAVA_Build 5 122189861 1I TTTTTCATAA -/T TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 6 7 28588 CASAVA_Build 5 122192792 4D TAATGTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 779 hom 18 3 11 4 TTTG 5 4 28589 CASAVA_Build 5 122195980 3I AACTTCTATT ---/AAG AAGTAAAACA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 AAG 1 2 28590 CASAVA_Build 5 122198818 1I ACAACGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 10 11 28591 CASAVA_Build 5 122212309 6D TCTCAAAATA AAAAAT/------ AAAAATAAAA 1764 het 1764 ref 21 13 5 6 AAAAAT 2 1 28592 CASAVA_Build 5 122215411 1D CCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAT 1291 het 1291 ref 36 27 3 7 A 10 9 28593 CASAVA_Build 5 122215943 1D GAATAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 1519 het 1519 ref 39 23 5 11 T 13 12 28594 CASAVA_Build 5 122217618 1D CGAGTTTATC T/- ACTGAAATTC 3070 het 3070 ref 26 14 8 6 T 1 0 28595 CASAVA_Build 5 122222881 2D ACTGCACAAC AT/-- ATGGAGATCC 3070 het 3070 ref 29 11 8 12 AT 2 1 28596 CASAVA_Build 5 122227761 4I TAGGAAGCTC ----/AGTT AGGAAGCTAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AGTT 0 1 28597 CASAVA_Build 5 122228933 2D TTTATGTATT TA/-- TATTTTTTGA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 TA 2 1 28598 CASAVA_Build 5 122233492 2I GTGCTATGAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 13 15 28599 CASAVA_Build 5 122243883 1I GGCAGCTTTG -/T TCTAATTGCA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 T 1 2 28600 CASAVA_Build 5 122244829 2I TTTTAAAAAA --/AG CATTTCACAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 0 1 28601 CASAVA_Build 5 122249593 1I CTGTGTGGCT -/G GGTTCCTAAC 3070 hom 62 het 26 0 19 7 G 2 3 28602 CASAVA_Build 5 122252018 13D TATTATTTAA CATTTCTGTGCCT/------------- CAGTTCCTCA 3070 hom 127 het 48 0 43 10 CATTTCTGTGCCT 1 0 28603 CASAVA_Build 5 122256755 1D CCCATGGCTT A/- AAAAAAAAAA 2834 het 2447 hom 36 10 9 17 A 15 14 28604 CASAVA_Build 5 122256842 3D AAGGGATCTC CTT/--- CTAGTCGGCT 3070 hom 63 het 23 0 20 5 CTT 1 0 28605 CASAVA_Build 5 122258578 5D TTTCAGTAAA TCACT/----- TCATTTTAGT 2057 het 2057 ref 29 13 6 14 TCACT 1 0 28606 CASAVA_Build 5 122271485 1D TGAATGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 15 14 28607 CASAVA_Build 5 122280099 1I TATTTTGTGC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 7 8 28608 CASAVA_Build 5 122281109 3D CGCTTCTCTC CTT/--- CTTCAGATTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 CTT 2 1 28609 CASAVA_Build 5 122285225 1D GTAAGGCTTG A/- AAAAAAGATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 7 6 28610 CASAVA_Build 5 122290254 1I GGGAAGACTT -/G GGGGGTTTTG 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 G 5 6 28611 CASAVA_Build 5 122290994 5I GTAGGCTATT -----/AAACC TATCTTTTAT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 AAACC 0 1 28612 CASAVA_Build 5 122293035 1I TCCAATAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 T 10 11 28613 CASAVA_Build 5 122299318 1D TGTATGTCAT A/- TGCCAAATTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 1 0 28614 CASAVA_Build 5 122308031 2D ATTTTTTTTT TC/-- CCCCAAAAAA 3070 hom 98 het 43 0 31 13 TC 1 0 28615 CASAVA_Build 5 122317122 1I AATCTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1112 hom 41 3 26 12 A 11 12 28616 CASAVA_Build 5 122317782 6I CAGTGAACTT ------/TCTCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TC 5 8 28617 CASAVA_Build 5 122319947 1I AACACTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 16 0 12 4 A 10 11 28618 CASAVA_Build 5 122321844 1D TGAATTTTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 463 hom 23 2 18 3 A 10 9 28619 CASAVA_Build 5 122335475 5D ATGGTTTTTT ACCTG/----- ACCTGGTGGA 3070 hom 87 het 33 0 29 6 ACCTG 2 1 28620 CASAVA_Build 5 122338962 1I AAATTTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 10 11 28621 CASAVA_Build 5 122339905 1D AAAAAAAAAA C/- AGGCAAAAAG 3070 het 931 hom 31 9 11 12 C 1 0 28622 CASAVA_Build 5 122348525 1D AACGAAAAAG A/- AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 50 26 22 2 A 7 6 28623 CASAVA_Build 5 122356559 1I AATGTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2737 hom 32 7 14 11 T 13 14 28624 CASAVA_Build 5 122361475 1I TGTGTTACAA -/C ATTAGGCTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 0 1 28625 CASAVA_Build 5 122379287 1D TGAGAACCAC A/- GTCCTAGGGC 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 1 0 28626 CASAVA_Build 5 122380584 1D AATGAGCCTA G/- GTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 G 2 1 28627 CASAVA_Build 5 122384357 4D AGCTAAATGA TGTT/---- TGTTTTCGGA 3070 hom 153 het 53 0 51 2 TGTT 2 1 28628 CASAVA_Build 5 122384705 1I AGTTCCCCCC -/G CCGTCCCCAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 G 0 1 28629 CASAVA_Build 5 122387739 2I1M7D GACTACTAAG --CGTTTTTT/ACC------- ATGCACGCTA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 N/A 0 0 28630 CASAVA_Build 5 122444469 1I CCATAACCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 11 12 28631 CASAVA_Build 5 122448301 1D TAGGGTGGGG A/- GGTCAGAATT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 1 0 28632 CASAVA_Build 5 122468578 1D ATTCTGCTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 9 8 28633 CASAVA_Build 5 122472798 1I AACAAAAAAA -/G GATCAAGTAT 3070 het 3070 hom 44 13 25 6 G 1 2 28634 CASAVA_Build 5 122481373 1D CATTTGCTCA T/- TTGCTTTGCA 3070 het 3070 ref 50 30 15 5 T 3 2 28635 CASAVA_Build 5 122484127 1D GATGTTCATT A/- CCAAAAATTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 0 28636 CASAVA_Build 5 122487571 2I TTTAGAGTAG --/GT GTGACATTCC 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 GT 1 2 28637 CASAVA_Build 5 122488656 1I ACTTACAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 10 12 T 15 16 28638 CASAVA_Build 5 122488987 1I CATTGAAGTT -/A AACAATGTTA 3070 hom 129 het 53 0 44 9 A 2 3 28639 CASAVA_Build 5 122494752 3D GTGAATAAGA TGG/--- TGGTTACTAG 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 TGG 2 1 28640 CASAVA_Build 5 122496327 2D AATATCGCTT AG/-- AAGCACCTTC 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 AG 1 0 28641 CASAVA_Build 5 122497424 1D TTTATCAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 13 12 28642 CASAVA_Build 5 122498592 4I AAGTATTCTT ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 10 14 28643 CASAVA_Build 5 122500456 2I TGGCTGGCAA --/TG TGTGCATGGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TG 2 3 28644 CASAVA_Build 5 122501383 1I AAAGTATAAT -/A AAAAATAGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 6 A 5 6 28645 CASAVA_Build 5 122501622 1I TCTGGGTTCA -/C CCCCCGCACC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 5 6 28646 CASAVA_Build 5 122503788 1I TAATCTGAAA -/T TATCTGCGCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 1 2 28647 CASAVA_Build 5 122503869 1D TTTCTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2665 hom 27 6 18 3 A 12 11 28648 CASAVA_Build 5 122505901 5I AAAGCCCATG -----/CTTCA CAATGGAGCA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 CTTCA 0 1 28649 CASAVA_Build 5 122509329 2D AGATCTAAAA AT/-- ATGTTTTCTG 3070 het 3070 ref 57 28 24 6 AT 2 1 28650 CASAVA_Build 5 122515320 1I GAGGCCTTAT -/C CTACTGGAGG 3070 hom 120 het 46 0 40 7 C 1 2 28651 CASAVA_Build 5 122524181 4I ACATGCACTC ----/ACAT ACACAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 ACAT 0 1 28652 CASAVA_Build 5 122526668 3I TAAAAAGAAG ---/CTT CTTGAGATCA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 CTT 1 2 28653 CASAVA_Build 5 122527752 9D TCTACAAGAG AACACATAA/--------- GCACATAACC 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 AACACATAA 1 0 28654 CASAVA_Build 5 122527842 4D GGCTGTCAGG CTGT/---- CTAAGTCATT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 CTGT 1 0 28655 CASAVA_Build 5 122530036 1I TAAAATTTAT -/G GTTTTTGTTT 330 het 330 ref 38 15 3 20 G 1 2 28656 CASAVA_Build 5 122536784 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1244 het 1244 ref 13 6 4 3 A 15 16 28657 CASAVA_Build 5 122538629 4I TTGCATAAGC ----/TTAT TTATTGCCTA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 TTAT 1 2 28658 CASAVA_Build 5 122543326 1D ATTAAACTGG A/- TAACTGATTT 3070 het 3070 ref 22 9 9 5 A 1 0 28659 CASAVA_Build 5 122546410 1I GCTGTAGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 9 10 28660 CASAVA_Build 5 122551596 1D ATTTTAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 A 13 12 28661 CASAVA_Build 5 122559589 1D GTAAATCCAA G/- GAGTTGCTTT 3070 het 3070 ref 38 20 9 9 G 2 1 28662 CASAVA_Build 5 122564673 1I AGCTCTGTAC -/T TTTGGTCTCA 3070 het 3070 hom 55 21 29 5 T 3 4 28663 CASAVA_Build 5 122597035 4D AAAGGGGGGC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 33 13 11 9 AG 9 7 28664 CASAVA_Build 5 122597812 1I ATCCTGGGTG -/T TTTTACTATA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 4 5 28665 CASAVA_Build 5 122608083 1I CATCAATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 10 11 28666 CASAVA_Build 5 122610579 1I TGCCGTTAGT -/G ACACTTCCAA 3070 het 3070 hom 31 8 15 8 G 0 1 28667 CASAVA_Build 5 122651557 1D CATTTCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2630 hom 21 9 9 3 A 14 13 28668 CASAVA_Build 5 122655193 1I GTCAAGGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 A 9 10 28669 CASAVA_Build 5 122659101 1D TAGTCAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 12 11 28670 CASAVA_Build 5 122674660 2D TCCTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2911 hom 29 12 13 5 A 14 12 28671 CASAVA_Build 5 122678343 1D TTGTTCACCT C/- CCATTTATGA 3070 hom 75 het 30 0 25 7 C 3 2 28672 CASAVA_Build 5 122679483 1I TATATATCTG -/T TTTTGGTACC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 4 5 28673 CASAVA_Build 5 122694473 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTCCAA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 6 7 28674 CASAVA_Build 5 122694934 1D27M1I TAATTGAAAA CCCTTTATTTCTGTCTCTTGCCTGATTG-/-CCTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGC CCTGGCCAAA 3070 hom 21 het 10 0 8 7 N/A 0 0 28675 CASAVA_Build 5 122695390 3D TATATTCACC AGG/--- AATATTAGCC 3070 hom 45 het 17 0 16 4 AGG 1 0 28676 CASAVA_Build 5 122695808 1I CCCTTTATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 10 28677 CASAVA_Build 5 122705507 3D CTAAACTTCT GAG/--- GAGTCTCCAC 3070 hom 86 het 32 0 28 4 GAG 2 1 28678 CASAVA_Build 5 122708480 1I TCAAGAACTC -/A AGAGATGCAC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 2 28679 CASAVA_Build 5 122713806 1D CTGCCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 T 11 10 28680 CASAVA_Build 5 122715363 2D TTTAAATAAT TC/-- TGTGTGAACT 3070 hom 105 het 43 0 35 9 TC 1 0 28681 CASAVA_Build 5 122716488 12I TATATTTTAG ------------/ATGCTACTGTAA ATGGTAGAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATGCTACTGTAA 0 1 28682 CASAVA_Build 5 122717115 3I AAAAAAAAGT ---/AAG AAGCATTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AAG 1 2 28683 CASAVA_Build 5 122718369 1D CCATCCTATG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 18 0 12 6 T 10 9 28684 CASAVA_Build 5 122720206 7D TAATCAAATA ATTTGTC/------- ATTCAGTTTT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 ATTTGTC 1 0 28685 CASAVA_Build 5 122720553 1I AGAACCCAGG -/T TATTTCTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 1 2 28686 CASAVA_Build 5 122723723 4D AAGAAGTTGC ACAA/---- ACAATCTTCT 3070 hom 114 het 40 0 38 3 ACAA 2 1 28687 CASAVA_Build 5 122724625 4I ATTGTTTCAA ----/TAAT TAATTAATGA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TAAT 2 3 28688 CASAVA_Build 5 122727098 2I TACCCATGTC --/TA TATCCTTAGT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TA 1 2 28689 CASAVA_Build 5 122728828 1I ATATATAAAG -/A AAAACACTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 4 5 28690 CASAVA_Build 5 122729599 15D TTTGCATAGT CACACTAACTTAAAA/--------------- CACACTAACT 3070 hom 60 het 25 0 21 9 CACACTAACTTAAAA 2 1 28691 CASAVA_Build 5 122734279 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2715 hom 21 het 9 0 8 1 TA 6 7 28692 CASAVA_Build 5 122739182 8D TCCGAAAGTG TTGGGATT/-------- ACAAGTGTGA 3070 hom 57 het 23 0 19 6 TTGGGATT 1 0 28693 CASAVA_Build 5 122741739 1D ACCTCTTTGT A/- AATAATTATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 3 2 28694 CASAVA_Build 5 122742034 6D AAAATATAGT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 5 A 18 12 28695 CASAVA_Build 5 122744971 8I ATAGAGAGAA --------/GGAGCACT GGAGCACTGG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 GGAGCACT 1 2 28696 CASAVA_Build 5 122745361 1D CACACACATA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 9 8 28697 CASAVA_Build 5 122747881 4D TCACTGAGCC TTGT/---- TTCTCTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 4 TTGT 1 0 28698 CASAVA_Build 5 122751607 56D ATACACTACC TTTTTGACCAGTAATACTTTGACTAGTATTATTATTACTTTTTTTTGACCATTATT/-------------------------------------------------------- ATTATTTTGA 3070 hom 60 het 18 0 21 4 TTTTTGACCAGTAATACTTTGACTAGTATTATTATTACTTTTTTTTGACCATTATT 1 0 28699 CASAVA_Build 5 122755196 6D ATGTTATTGC TTCTTT/------ TTCTGTCTCT 3070 hom 72 het 29 0 25 7 TTCTTT 1 0 28700 CASAVA_Build 5 122762624 1I TTCAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 294 hom 30 2 25 3 A 11 12 28701 CASAVA_Build 5 122764568 3I CGTGTCTCGA ---/TCT TCTTCACAAC 3070 hom 56 het 22 0 16 6 TCT 1 2 28702 CASAVA_Build 5 122765339 1D CTTCATCCAC A/- ATCCTTCTTG 3070 hom 54 het 22 0 18 5 A 2 1 28703 CASAVA_Build 5 122767759 5I TATTCTTCTT -----/CATAA CATATTTCCA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 CATAA 0 1 28704 CASAVA_Build 5 122768871 1I AAAAACTCCA -/G GGGGACCCAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 4 5 28705 CASAVA_Build 5 122769772 1D AGACTGGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 10 9 28706 CASAVA_Build 5 122770076 1D GCCAAACGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 56 het 22 0 18 7 A 10 9 28707 CASAVA_Build 5 122781818 4I CCCAAGGTAT ----/CTTA CTTTGATTAT 3070 hom 66 het 29 0 21 8 CTTA 0 1 28708 CASAVA_Build 5 122819923 1I CAAAGGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 35 1 28 6 T 12 13 28709 CASAVA_Build 5 122846169 1D TTATATTACC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 10 9 28710 CASAVA_Build 5 122873870 5D CCTCCTGCCT CAAGC/----- CTCCCAAGTT 3070 hom 72 het 27 0 24 4 CAAGC 1 0 28711 CASAVA_Build 5 122886739 3I AACTGCACTT ---/CTA CTGCTTTCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CTA 0 1 28712 CASAVA_Build 5 122908568 2D TAAAAAAGAC TT/-- TGAAAATTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 1 28713 CASAVA_Build 5 122915746 1I ATGATCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 12 13 28714 CASAVA_Build 5 122922848 1D CACGGTGATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 79 het 36 0 26 10 A 10 9 28715 CASAVA_Build 5 122933395 9I AAGTTAAAAG ---------/TGGATGTTC TTCTCTTGCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TGGATGTTC 0 1 28716 CASAVA_Build 5 122935372 1D AAAAAAAATC A/- CTTGGAAGTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 0 28717 CASAVA_Build 5 122941146 1I TATTTGTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 75 hom 32 1 25 6 T 9 10 28718 CASAVA_Build 5 122942885 1D AAATTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 20 12 T 16 15 28719 CASAVA_Build 5 122960633 1D GAAAAGTACC T/- AAAATTTGAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 0 28720 CASAVA_Build 5 122963691 2I GTATACTTTA --/GC GCACAGGTTC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 GC 1 2 28721 CASAVA_Build 5 122973504 1I AAGGGCATGG -/C CATATTTATG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 C 1 2 28722 CASAVA_Build 5 122983112 17D GCTATGCGGG TTTTTTTTCTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3070 het 626 hom 36 7 14 19 TTTTTTTTCTTTTTTTT 1 0 28723 CASAVA_Build 5 122985460 1I AGATGTTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 10 11 28724 CASAVA_Build 5 122996108 1I GCAGCACATC -/A AAAAAGCTTA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 5 6 28725 CASAVA_Build 5 123016820 4D CATAGGTGAG TTGA/---- TTGATTGGTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TTGA 2 1 28726 CASAVA_Build 5 123017598 1I AAGCCATAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 8 9 28727 CASAVA_Build 5 123017875 1I CAAATTTAAG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 7 8 28728 CASAVA_Build 5 123019827 10D GCCTGGACAG CCATGTGTTT/---------- CCTTACGTCC 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 CCATGTGTTT 1 0 28729 CASAVA_Build 5 123022036 5I TCTTAAGATC -----/CTTAA CTTAATTATA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 CTTAA 1 2 28730 CASAVA_Build 5 123035640 1I TCCCAAAAAA -/T AATGGCATTT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 0 1 28731 CASAVA_Build 5 123045575 1D AATAATCATT A/- AAAAAAAAAA 2886 het 2886 ref 27 16 7 4 A 12 11 28732 CASAVA_Build 5 123046327 1D TGGTATTTTT G/- TTTTGTTTTT 2199 het 2199 ref 26 18 5 3 G 1 0 28733 CASAVA_Build 5 123050260 1I TAAATAAATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 8 9 28734 CASAVA_Build 5 123054279 23D TGCGAGCTTC TGTTGATTCACAGGAATACCTGA/----------------------- TGTTGATGTC 3070 het 3070 ref 29 17 15 5 TGTTGATTCACAGGAATACCTGA 1 0 28735 CASAVA_Build 5 123058858 24D TGCGAATCTT TTCCAGAAACATCTTTACAGACAC/------------------------ TTCCAGAAAC 3070 hom 81 het 38 0 28 17 TTCCAGAAACATCTTTACAGACAC 2 1 28736 CASAVA_Build 5 123063257 1D AGACTTTTCT A/- AAAGGGTTGC 3070 het 3070 ref 36 19 12 7 A 4 3 28737 CASAVA_Build 5 123063881 1D CTCCTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 2351 het 2351 ref 24 11 7 6 T 15 14 28738 CASAVA_Build 5 123064189 5I AAAGAAACTA -----/TTTAC TTATCAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 TTTAC 0 1 28739 CASAVA_Build 5 123072796 1D TGTAAATGGC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 41 1 38 3 T 8 7 28740 CASAVA_Build 5 123086714 4D GCATCTGTAA GGAG/---- GGAGGAAGAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 GGAG 2 1 28741 CASAVA_Build 5 123090239 2D TAAGTATAAC AG/-- AGATTTGAAT 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 AG 2 1 28742 CASAVA_Build 5 123090413 2I AAAAGAAAAA --/AG AGAATGAAGC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 AG 1 2 28743 CASAVA_Build 5 123095016 1I AATTAAAAGT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 8 9 28744 CASAVA_Build 5 123100071 1I TGAAGAAAAG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 T 8 9 28745 CASAVA_Build 5 123118704 1D TAAACCTCCA T/- CTTCTGAAAT 3070 het 3070 hom 68 30 32 6 T 1 0 28746 CASAVA_Build 5 123118943 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2998 hom 33 9 13 11 T 13 12 28747 CASAVA_Build 5 123126456 1I TGTTTGGTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 21 8 8 T 9 10 28748 CASAVA_Build 5 123129658 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 6 7 28749 CASAVA_Build 5 123132340 1D ACATTTAAGG T/- TAATATTGTT 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 T 2 1 28750 CASAVA_Build 5 123142851 1I GGGTTTATAT -/G GGGGGTAGAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 G 5 6 28751 CASAVA_Build 5 123145113 1I ATATTTAAAA -/T TATTTCTTAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 2 28752 CASAVA_Build 5 123148766 1D CAGAAAGCCC T/- AGATTTAGCA 3070 het 3070 ref 54 32 19 3 T 1 0 28753 CASAVA_Build 5 123155538 1D TGTACATTCA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 8 7 28754 CASAVA_Build 5 123156046 1D TTGGATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 36 1 30 5 T 12 11 28755 CASAVA_Build 5 123156850 1D TTGGGTAAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 8 7 28756 CASAVA_Build 5 123163123 2I CTAGATGAAG --/AA AAAAAAAAAA 1664 het 1664 ref 28 10 5 13 A 14 16 28757 CASAVA_Build 5 123167354 8D GGTTCCCAGA GCAGTTTT/-------- GCAAAGCTGT 3070 het 3070 hom 55 22 32 6 GCAGTTTT 1 0 28758 CASAVA_Build 5 123188101 1I AAATAATAAA -/G TCTTTCCAAG 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 G 0 1 28759 CASAVA_Build 5 123189115 1D CCTCAAGGCA T/- TGTCAGAGAC 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 T 2 1 28760 CASAVA_Build 5 123194624 1I TAAAAAGACC -/A AAAAAAAAAA 2515 het 2515 ref 37 18 9 10 A 11 12 28761 CASAVA_Build 5 123194735 1D GCCATTTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 49 19 22 10 A 8 7 28762 CASAVA_Build 5 123222240 9D TGTTTCTGGT CCATCTATC/--------- CTTTTCACAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 CCATCTATC 1 0 28763 CASAVA_Build 5 123225891 1D GGAAGCAGAG A/- AAAGATTAAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 4 3 28764 CASAVA_Build 5 123238030 1D ACATATTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 10 9 28765 CASAVA_Build 5 123249263 1D CTTTCTTTTT A/- AAAAATCTTG 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 A 6 5 28766 CASAVA_Build 5 123252709 1D AGCCAAAGGG A/- AAAAATAAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 6 5 28767 CASAVA_Build 5 123256185 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 25 1 23 1 A 12 11 28768 CASAVA_Build 5 123268570 1D CCATTGAAAT C/- TATCTTTTCC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 1 0 28769 CASAVA_Build 5 123272259 1D CAACTTGTCT G/- TTTTTCTTAC 3070 het 3070 ref 43 19 20 5 G 1 0 28770 CASAVA_Build 5 123288023 4I TTTATTAAAA ----/TGTT TATGTATATG 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 TGTT 0 1 28771 CASAVA_Build 5 123289394 2D TCCTGAAAGA CT/-- CTGTCAACCT 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 CT 2 1 28772 CASAVA_Build 5 123304371 1I AGTTGTCTAT -/G GGGGGTGGAA 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 G 5 6 28773 CASAVA_Build 5 123311158 1D GCTAATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 11 12 T 13 12 28774 CASAVA_Build 5 123337132 1I CTCACATCCA -/G GGTACACTGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 2 3 28775 CASAVA_Build 5 123345265 1D TTGTAATTAC A/- AAAAAAAATT 1899 het 1899 ref 17 11 5 1 A 9 8 28776 CASAVA_Build 5 123350907 1D CTTTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 12 16 T 16 15 28777 CASAVA_Build 5 123354786 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 12 11 28778 CASAVA_Build 5 123362783 1I ATTAACTGAA -/T TTGCAAAGAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 2 3 28779 CASAVA_Build 5 123383837 4D GACAAGGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 120 het 47 0 40 11 TTTG 5 4 28780 CASAVA_Build 5 123392238 1D AAAATTTTGA T/- TATCTACACA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 2 1 28781 CASAVA_Build 5 123398531 12D GTAAATCAGT ACTATATTTTAG/------------ ACTATGTTTT 3070 het 3070 ref 54 29 24 4 ACTATATTTTAG 1 0 28782 CASAVA_Build 5 123405054 1I GAGGAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 A 13 14 28783 CASAVA_Build 5 123409027 1D AAATCATATC A/- AAAAAGGTTC 3070 het 3070 hom 51 24 25 2 A 6 5 28784 CASAVA_Build 5 123415112 1D ATTATGGTTG T/- TTTTTTTTTT 2347 het 2347 ref 26 13 7 6 T 12 11 28785 CASAVA_Build 5 123417805 1D GTATGCTTTA T/- TTTTTTCAAG 3070 het 3070 hom 38 10 23 6 T 7 6 28786 CASAVA_Build 5 123420001 7I3M1I TTCCTTAGAA -------TTA-/ACACCCTTTAC CCAAGGGTAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 N/A 0 0 28787 CASAVA_Build 5 123443607 2D TGCCACACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 42 0 30 12 T 15 13 28788 CASAVA_Build 5 123450529 1D ACCAGAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 38 2 29 7 T 12 11 28789 CASAVA_Build 5 123451326 1D GGGATTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 14 13 28790 CASAVA_Build 5 123475482 3I ACCCTTATCA ---/AAT AATAGAAAGG 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 AAT 1 2 28791 CASAVA_Build 5 123476851 1I GCCTTTAGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 47 4 37 6 T 11 12 28792 CASAVA_Build 5 123481545 4D AACATACTTC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 47 19 23 7 ATTT 3 2 28793 CASAVA_Build 5 123483275 2I TGTGTGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 384 hom 33 2 23 8 TG 8 9 28794 CASAVA_Build 5 123487337 1D TAGTTTTTGC A/- GAGATTTCTG 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 1 0 28795 CASAVA_Build 5 123488340 4I CCCAGAAACT ----/AACA AACAGTCAAC 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 AACA 1 2 28796 CASAVA_Build 5 123490347 16I AAAAGAGGGG ----------------/CTTTGGAGAAATTAAT CTTCCTCCTA 3006 het 3006 ref 20 11 7 2 CTTTGGAGAAATTAAT 0 1 28797 CASAVA_Build 5 123497143 1I TGGCTTAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 9 10 28798 CASAVA_Build 5 123503963 1D AAAACAAAAC A/- AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 21 20 6 A 4 3 28799 CASAVA_Build 5 123515043 1I TCAGGAACAG -/A AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 49 29 19 1 A 3 4 28800 CASAVA_Build 5 123516010 1D CTATGAGAAT A/- AAAAGGCATA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 5 4 28801 CASAVA_Build 5 123519006 5I GACCAAGAAA -----/AATAC ATAGTATATG 3070 het 3070 hom 37 19 17 1 AATAC 0 1 28802 CASAVA_Build 5 123526031 7I CATGGTGAAA -------/CCTCATC TTTTGTAAAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 CCTCATC 0 1 28803 CASAVA_Build 5 123526372 1D TAATGTCAAT C/- CCCCCAAACT 3070 hom 106 het 39 0 34 6 C 6 5 28804 CASAVA_Build 5 123586465 2I CTTTTCTCTC --/TT TATTTATACC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 1 3 28805 CASAVA_Build 5 123588866 1I AAGTAGAAGG -/A CATGTCCTCT 3070 het 3070 ref 67 38 20 9 A 0 1 28806 CASAVA_Build 5 123649153 1I GTTGGGACCA -/G GGGACATGAG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 G 3 4 28807 CASAVA_Build 5 123652195 1I ATTCTCTGAG -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 2 3 28808 CASAVA_Build 5 123657640 1D TTTGCTTTGG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 A 8 7 28809 CASAVA_Build 5 123662170 1D TATTCTAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 A 13 12 28810 CASAVA_Build 5 123672866 1I ACCTTGTGAA -/C CACCCCCCAC 2137 het 571 hom 8 2 5 1 C 1 2 28811 CASAVA_Build 5 123673034 1D TCACACAAAG C/- CTGTTTGGTG 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 C 2 1 28812 CASAVA_Build 5 123674010 1D TCCCACTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 T 13 12 28813 CASAVA_Build 5 123675624 3D GTCAAACATG ACA/--- ACAAAGAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 8 ACA 2 1 28814 CASAVA_Build 5 123680344 1I GTCTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3004 het 3004 ref 25 10 9 6 A 10 11 28815 CASAVA_Build 5 123730636 1D TGCCTTAGTC T/- TTTTTTAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 7 6 28816 CASAVA_Build 5 123732135 1D CATGTAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 31 2 17 16 T 17 16 28817 CASAVA_Build 5 123734672 1D GTCTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 1310 het 1310 ref 39 35 3 1 A 12 11 28818 CASAVA_Build 5 123747940 1D TAATGCATTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 8 7 28819 CASAVA_Build 5 123768280 1I AAATTATGCC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 7 8 28820 CASAVA_Build 5 123779160 4D CTGAGAGTGT GAGA/---- GAGTCGTTTC 3070 het 3070 hom 28 14 12 3 GA 3 1 28821 CASAVA_Build 5 123783100 1I AAATAAACTG -/T TATTTGGTAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 1 2 28822 CASAVA_Build 5 123794774 1D AATTTATCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 9 28823 CASAVA_Build 5 123797490 1D GTAAGTCCTA C/- TATTCTATTG 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 C 1 0 28824 CASAVA_Build 5 123797563 1D AGAGAATTTT A/- AAAGTTCTCA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 4 3 28825 CASAVA_Build 5 123801213 1I AGCAGTGACC -/A AAAAAAAAAA 1719 het 1719 ref 50 31 5 14 A 12 13 28826 CASAVA_Build 5 123814587 1D TCCTCACCCC T/- GGTGGCCTCT 3070 het 3070 hom 45 16 18 11 T 1 0 28827 CASAVA_Build 5 123817392 1I TCTGCTTGGC -/T TTTCAGACAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 3 4 28828 CASAVA_Build 5 123866443 1D ACCTCATTCT G/- GCGTTGAAAT 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 G 2 1 28829 CASAVA_Build 5 123870871 1I GTTTAAGCAG -/C AGGCAAGTTC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 0 1 28830 CASAVA_Build 5 123872045 1D ATTGGAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 33 4 14 15 T 12 11 28831 CASAVA_Build 5 123877242 1I AAAATATGGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 T 7 8 28832 CASAVA_Build 5 123881253 1D GTCCTGCCAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 9 8 28833 CASAVA_Build 5 123883385 1I TCACCTCCCC -/T GTCCCTGCTA 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 T 0 1 28834 CASAVA_Build 5 123890210 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 10 9 28835 CASAVA_Build 5 123890321 1D CATTACTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 11 10 28836 CASAVA_Build 5 123890635 1I15M1D GATTTTAAAA -TTTTTTATATCAGTCT/TTTTTTTATATCAGTC- TTTTTTTTCT 3070 het 1936 hom 31 7 17 10 N/A 0 0 28837 CASAVA_Build 5 123897972 1I ACCTGGTTAA -/T TTTTTTGTAT 2536 het 2536 ref 18 8 7 3 T 6 7 28838 CASAVA_Build 5 123911476 1I CTAGTTTTTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 6 7 28839 CASAVA_Build 5 123923713 1D TTATTGTAGC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 8 7 28840 CASAVA_Build 5 123925963 2D AGTCCCCTAT TA/-- AAGTGCAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 TA 1 0 28841 CASAVA_Build 5 123931457 1I AAACATTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 40 1 32 7 A 11 12 28842 CASAVA_Build 5 123935310 1D CTATTAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 24 1 14 9 T 15 14 28843 CASAVA_Build 5 123936762 2I GGCCAATGGC --/GG GGGGGGGAAC 3070 hom 67 het 29 0 16 13 G 7 9 28844 CASAVA_Build 5 123942833 1I AGATATACCC -/A AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 6 7 28845 CASAVA_Build 5 123942889 1D TTTGTAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 502 hom 27 2 22 3 A 11 10 28846 CASAVA_Build 5 123949293 3D GTCTGCTCAT CTC/--- CTCATCAGCT 3070 het 3070 hom 23 10 8 8 CTC 2 1 28847 CASAVA_Build 5 123958541 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2866 het 2077 hom 22 9 9 6 A 15 14 28848 CASAVA_Build 5 123959569 1I TCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1802 het 460 hom 5 1 4 0 T 6 7 28849 CASAVA_Build 5 123970040 1I TTGTATGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2334 hom 33 7 16 10 T 13 14 28850 CASAVA_Build 5 123989266 1D TACCGCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 37 1 25 11 T 13 12 28851 CASAVA_Build 5 123992206 1I CCAGGTCCCA -/C CCAGTGCCAG 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 C 2 3 28852 CASAVA_Build 5 123995794 1D ATGAGAAAAC A/- AAAAAAAAGG 2966 het 2966 ref 27 10 8 9 A 9 8 28853 CASAVA_Build 5 124000685 2I TGTAAACATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 11 13 A 13 15 28854 CASAVA_Build 5 124013384 1I TTTTGCCAGC -/A AAGTTCTATT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 2 3 28855 CASAVA_Build 5 124022747 1D AATTACAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 42 1 30 11 T 13 12 28856 CASAVA_Build 5 124037159 1D GCTTTTCATC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 43 27 15 2 T 9 8 28857 CASAVA_Build 5 124039889 2D TATGGAAATG AA/-- GTAGGCACTT 3070 het 3070 ref 48 22 21 7 A 2 0 28858 CASAVA_Build 5 124043942 2D TTATGGCCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 A 12 10 28859 CASAVA_Build 5 124053059 1I CCTGTCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 11 8 A 13 14 28860 CASAVA_Build 5 124066025 18I TTCTGCTGTT ------------------/CATAGATTCCCAGTTATC CACTGTAAGT 3070 hom 84 het 32 0 27 5 CATAGATTCCCAGTTATC 0 1 28861 CASAVA_Build 5 124104104 1I ACTATATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 A 13 14 28862 CASAVA_Build 5 124120469 3I GCTCAAGCAA ---/TCC TCCTACCTCA 3070 hom 90 het 34 0 26 8 TCC 1 2 28863 CASAVA_Build 5 124123411 1I AATTAAATTC -/T TTTTTTTTTT 2436 het 2436 ref 27 13 11 3 T 12 13 28864 CASAVA_Build 5 124125644 5D TTGTTTTTCT TTTTC/----- TTTTTTTTTT 48 het 48 ref 23 14 1 8 TTTTC 1 0 28865 CASAVA_Build 5 124129288 3D GTAATAGTAA TAT/--- TATTTTTTAA 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 TAT 2 1 28866 CASAVA_Build 5 124145428 1D GACGTCAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 A 12 11 28867 CASAVA_Build 5 124162185 1D ATAATTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 T 11 10 28868 CASAVA_Build 5 124171512 1D TTGAAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 26 1 19 6 T 12 11 28869 CASAVA_Build 5 124171986 1D AATAAAAAAT A/- AAAAATTAGC 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 6 5 28870 CASAVA_Build 5 124179085 1D CTTTGTGGGG A/- AACAGCCTTA 2245 het 2245 ref 22 13 7 3 A 3 2 28871 CASAVA_Build 5 124181000 10D CTTAAGAGGC AGTTTAATAT/---------- AGTCAAGACA 3070 het 3070 hom 46 14 31 4 AGTTTAATAT 1 0 28872 CASAVA_Build 5 124186277 2I TAAAAAAAAA --/GG GGGGGGGGGA 2981 het 1054 hom 27 3 12 12 G 9 11 28873 CASAVA_Build 5 124204162 1I ATATGCATAA -/C AAAACTGGAA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 C 0 1 28874 CASAVA_Build 5 124211762 2D ACGTGTACAG TT/-- TGACTTGTAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 3 1 28875 CASAVA_Build 5 124248289 1D GAAAATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 13 12 28876 CASAVA_Build 5 124251596 1D CATTTGATTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 A 8 7 28877 CASAVA_Build 5 124264418 4I ACTTCACTCT ----/GTTA TAACAGAGTT 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 GTTA 0 1 28878 CASAVA_Build 5 124279402 4D TCATAGAATT AAAA/---- AAAAATACCT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 9 5 28879 CASAVA_Build 5 124307036 4I TCCAATTTGC ----/TTTT TTTAAAAAAA 318 het 318 ref 29 8 3 18 T 3 7 28880 CASAVA_Build 5 124309408 1D GTTATTATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 T 10 9 28881 CASAVA_Build 5 124315090 2D CACAGGAAAC TA/-- ATACAGGAGG 3070 het 294 hom 29 2 17 12 TA 1 0 28882 CASAVA_Build 5 124318134 1I GCTAATTTTT -/A AATTTTTTTT 1856 het 1856 ref 24 15 5 5 A 2 3 28883 CASAVA_Build 5 124322204 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 46 hom 32 1 24 7 T 8 9 28884 CASAVA_Build 5 124323804 1D AGCCACCGTG C/- CCAGCCAATT 3070 hom 73 het 31 0 24 7 C 3 2 28885 CASAVA_Build 5 124324753 1D CATGTTGGCC A/- GGCTGGTCTT 2858 het 466 hom 10 1 8 1 A 1 0 28886 CASAVA_Build 5 124328336 18D CCTGGCTTTT CGAATACTTCAGAGGGCC/------------------ CCTGAAATAT 3070 het 3070 ref 28 21 11 2 CGAATACTTCAGAGGGCC 1 0 28887 CASAVA_Build 5 124333798 1I TGCTGCCTGG -/C TGCCTCCTCT 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 C 0 1 28888 CASAVA_Build 5 124343332 1I CCTGCTGGAG -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 6 7 28889 CASAVA_Build 5 124346386 1D TTGTTATGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 23 11 8 T 10 9 28890 CASAVA_Build 5 124347130 1D TGATGGATGA G/- GAAAGGGATC 3070 het 3070 hom 43 16 19 10 G 2 1 28891 CASAVA_Build 5 124349916 1I GGCTTCATCC -/A CGTTTGCAGC 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 A 0 1 28892 CASAVA_Build 5 124351126 1D ACAGAGAGGC T/- TGTGATTCCT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 2 1 28893 CASAVA_Build 5 124352263 2D GTGAAAAATG AT/-- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 53 31 16 11 AT 5 4 28894 CASAVA_Build 5 124409293 1I CGCAGATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 16 11 T 12 13 28895 CASAVA_Build 5 124432360 1I TGACTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 977 het 977 ref 38 19 5 14 T 15 16 28896 CASAVA_Build 5 124439278 1D ATTATATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 8 15 10 A 15 14 28897 CASAVA_Build 5 124441479 5I TATATCAGGC -----/ACTCA ACTCAATAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ACTCA 1 2 28898 CASAVA_Build 5 124441540 4I GACATTTTTC ----/AAAA AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 A 7 11 28899 CASAVA_Build 5 124442457 2D CTGGGGAAAC AT/-- AAATTGAATA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 AT 1 0 28900 CASAVA_Build 5 124460873 1I ATGATCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1335 hom 33 7 11 15 T 12 13 28901 CASAVA_Build 5 124473267 1I ATAAAAAAAT -/A AAGAGACACT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 2 3 28902 CASAVA_Build 5 124474486 4D GGCCACGGGA AGAG/---- AGAGAGTAAA 3070 het 3070 ref 56 28 20 9 AG 5 3 28903 CASAVA_Build 5 124478331 1D GTATCCCCAG A/- AAAAATCAAG 3070 het 3070 ref 32 17 14 2 A 6 5 28904 CASAVA_Build 5 124479687 1D GGTTGAGTTG C/- GGTCACCCAG 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 C 1 0 28905 CASAVA_Build 5 124483903 1D GAATGTAAAT G/- GGTAAGTGCT 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 G 3 2 28906 CASAVA_Build 5 124484283 4D CATTTGTGTA TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 TTTG 2 1 28907 CASAVA_Build 5 124486136 1I AGAAAGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 11 12 28908 CASAVA_Build 5 124489567 1I CATTTATTTT -/A AAAAAATCGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 6 7 28909 CASAVA_Build 5 124493629 4D ATTTTCAGAA AAAG/---- AAAATCATGA 2614 het 2614 ref 17 9 6 3 AAAG 1 0 28910 CASAVA_Build 5 124497216 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 16 14 28911 CASAVA_Build 5 124499602 5I GGGAATACTC -----/ATCTT CTCTGTACTG 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 ATCTT 0 1 28912 CASAVA_Build 5 124501533 1D AGGCCCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 48 1 31 16 T 10 9 28913 CASAVA_Build 5 124504797 1I AATAGTAATG -/C TGGCTCCATT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 C 0 1 28914 CASAVA_Build 5 124506663 1D TCCACAGGCT A/- AATACACAGA 3070 het 3070 ref 35 14 13 9 A 3 2 28915 CASAVA_Build 5 124510386 2D GCAGTAGAAG AC/-- ACACATCGAT 3070 het 3070 hom 44 18 18 11 AC 3 2 28916 CASAVA_Build 5 124510953 4D CCAAGGGGAA AAAG/---- AAAGAAAATT 3070 het 3070 ref 32 18 11 5 AAAG 2 1 28917 CASAVA_Build 5 124511237 5D GATATCTGAC ATCTT/----- ATGAGAGATT 3070 het 3070 hom 37 16 17 7 ATCTT 1 0 28918 CASAVA_Build 5 124512005 1I TGGTTGGTTC -/T TTTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 46 15 24 7 T 6 7 28919 CASAVA_Build 5 124512239 52D CAGTGAGTGG ACAAGAAGAGTTTCCATTGATCATTGTACCTTGGATATCTTCTCCATTCTTT/---------------------------------------------------- ACAAGAAGAG 2589 hom 30 het 27 0 10 27 ACAAGAAGAGTTTCCATTGATCATTGTACCTTGGATATCTTCTCCATTCTTT 2 1 28920 CASAVA_Build 5 124515867 16D TTTTCACTTC TTCTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 2346 het 1428 hom 20 6 11 3 TTCTTTTTTTTTTTTT 1 0 28921 CASAVA_Build 5 124531035 6D TCCAAAAGAT ACAACA/------ ACAACAACAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 6 ACA 5 3 28922 CASAVA_Build 5 124537915 1D AAATTGCAAG A/- AAGCAAGATT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 3 2 28923 CASAVA_Build 5 124544142 2D TAAAAAGGAC AT/-- AATCATATTT 3070 het 3070 ref 36 17 17 4 AT 1 0 28924 CASAVA_Build 5 124545183 1I TGCCAGGTGC -/T TTTTTTTTTT 1601 het 1601 ref 28 7 7 14 T 13 14 28925 CASAVA_Build 5 124555779 2D AGTGTAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 35 1 18 18 A 13 11 28926 CASAVA_Build 5 124562714 1D TCTATTGTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 10 9 28927 CASAVA_Build 5 124573550 2I GGACAAGGTT --/TG TGGGGGCAGT 3070 hom 90 het 39 0 28 11 TG 1 2 28928 CASAVA_Build 5 124577377 3D TCCTCACTGA TCT/--- TCTGCTCCAG 3070 het 3070 hom 38 16 22 3 TCT 2 1 28929 CASAVA_Build 5 124577963 2I CAATTGGTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 10 12 28930 CASAVA_Build 5 124578660 1D AATCTATTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 8 15 9 T 10 9 28931 CASAVA_Build 5 124580581 1D21M2D AGATAAAATT AAAAAAAAAAAAAACCTAAGACTT/-TAAAAAAAAAAAACCTAAGAC-- TTTTTTTTTA 3070 het 1290 hom 33 6 17 15 N/A 0 0 28932 CASAVA_Build 5 124584026 1I CACTGTCCCC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 T 7 8 28933 CASAVA_Build 5 124586358 2D TTGGAACTCT CA/-- CCTTGGCAGC 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 CA 1 0 28934 CASAVA_Build 5 124592096 2D AGAGGGAAAC TG/-- TGTAAATGAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TG 2 1 28935 CASAVA_Build 5 124594044 13D TAGGGTACAA TTGAACTTGTCAC/------------- CTAAGTAGTG 3070 het 3070 hom 30 15 17 0 TTGAACTTGTCAC 1 0 28936 CASAVA_Build 5 124598886 2I ATGACTTCTC --/TT ATATGAAAAT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 0 2 28937 CASAVA_Build 5 124612562 1I GTCAAGATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 10 28938 CASAVA_Build 5 124615876 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAACACT 3070 het 2267 hom 41 11 17 13 AC 0 1 28939 CASAVA_Build 5 124619253 6I ATGGACTGTC ------/ATATTT ATTATGGATA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 ATATTT 0 1 28940 CASAVA_Build 5 124620892 4I CTAGAGAGAG ----/ACAA ACAAACAAAC 3070 hom 89 het 41 0 29 12 ACAA 4 5 28941 CASAVA_Build 5 124623779 1I CTCTAGGCCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 53 22 19 12 A 9 10 28942 CASAVA_Build 5 124630155 4D GTAAACAAAA AATT/---- AATCCCCTAG 3070 het 3070 hom 34 10 22 3 AATT 1 0 28943 CASAVA_Build 5 124639603 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 T 9 8 28944 CASAVA_Build 5 124646994 1I AGTGTAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1462 hom 34 3 19 12 T 13 14 28945 CASAVA_Build 5 124667776 1I TTGCAGTCCT -/A ACCAGTTACA 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 A 1 2 28946 CASAVA_Build 5 124685926 1I GACCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 11 28947 CASAVA_Build 5 124699513 1D GGGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 10 9 28948 CASAVA_Build 5 124702422 2D CTTGCCAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 7 T 14 12 28949 CASAVA_Build 5 124708961 2D CCCTCAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 2613 het 236 hom 40 3 14 23 A 18 16 28950 CASAVA_Build 5 124717782 1I GTGTATTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 0 1 28951 CASAVA_Build 5 124720442 2I CTTTTTTTTT --/TC TTTTCATGTT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 TC 0 1 28952 CASAVA_Build 5 124722539 1D TATTCTTATA T/- TTTTTTTAAA 2354 het 2354 ref 16 8 6 2 T 8 7 28953 CASAVA_Build 5 124728813 1D AATTTTCTGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 8 7 28954 CASAVA_Build 5 124737111 1D CCCCACCCCC T/- TTTTTTTAAT 2613 het 2448 hom 26 8 9 10 T 8 7 28955 CASAVA_Build 5 124770078 1D ACATTTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 11 10 28956 CASAVA_Build 5 124773443 1I TCCATTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 37 1 33 3 T 11 12 28957 CASAVA_Build 5 124774090 4D GTAGAGAATA AAAC/---- AAACAAATCC 3070 hom 122 het 45 0 41 4 AAAC 2 1 28958 CASAVA_Build 5 124775100 1I ACATTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 39 1 28 10 T 12 13 28959 CASAVA_Build 5 124777109 1D GATTTGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 6 T 14 13 28960 CASAVA_Build 5 124793897 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1270 hom 20 6 11 3 T 12 11 28961 CASAVA_Build 5 124795147 4D TTCTTTTCTC ACTG/---- ACTGATAATT 3070 het 3070 hom 41 15 22 7 ACTG 2 1 28962 CASAVA_Build 5 124816736 1I CATCTGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 22 20 12 T 11 12 28963 CASAVA_Build 5 124836375 1I AATAATAATT -/A TAAATAATTA 2568 het 1704 hom 15 4 7 4 A 0 1 28964 CASAVA_Build 5 124836925 7D TTTTTTCATT ATCAATC/------- ATCACCCTTA 3070 het 3070 ref 38 19 13 9 ATCAATC 1 0 28965 CASAVA_Build 5 124838444 4I TTTTGATGAT ----/TAAA TAAATATTTT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 TAAA 1 2 28966 CASAVA_Build 5 124841559 1I GGAAGCACAC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 T 7 8 28967 CASAVA_Build 5 124846143 1D ATAAGTAGAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 46 16 22 9 A 8 7 28968 CASAVA_Build 5 124847049 3I CATAGCAACA ---/GAT GATACATTAA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 GAT 1 2 28969 CASAVA_Build 5 124850634 1I TTAAGTGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 10 11 28970 CASAVA_Build 5 124851297 3D GTAGGAGGAG GAT/--- GAATAGGCCA 3070 hom 117 het 42 0 40 4 GAT 1 0 28971 CASAVA_Build 5 124873322 1I TTGGGTTATA -/T ATTAGTTTTC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 0 1 28972 CASAVA_Build 5 124874145 4I TCTCGTGGAG ----/TTAA TTAGACTTCT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 TTAA 0 1 28973 CASAVA_Build 5 124880684 1I TAAATACTGG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 T 8 9 28974 CASAVA_Build 5 124882310 1D ACATGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 11 10 28975 CASAVA_Build 5 124882462 1I ACTGACACTC -/T TATGTCTTTG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 1 2 28976 CASAVA_Build 5 124886938 1D AAAGTTTTGA T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 7 6 28977 CASAVA_Build 5 124887345 7I AAGAAGAAAA -------/AATCCTG ATACCCTTGT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AATCCTG 0 1 28978 CASAVA_Build 5 124887735 1I ATTTTAGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 9 10 28979 CASAVA_Build 5 124888213 1D ATAAAAGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 12 11 28980 CASAVA_Build 5 124889786 1I CTAAGAACAG -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 47 16 28 3 A 6 7 28981 CASAVA_Build 5 124893487 1D TCCTCTCTCT C/- CAATCAGGTT 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 C 2 1 28982 CASAVA_Build 5 124893703 3I TCTTTCTCTC ---/CCT CCTCCTATTT 3070 hom 94 het 34 0 31 3 CCT 2 3 28983 CASAVA_Build 5 124894136 4D TAAACAATGG AATT/---- ATTTTGCCTC 3070 het 3070 ref 30 14 15 3 AATT 1 0 28984 CASAVA_Build 5 124898110 1D15M1D TGGATAAAGA CAATGTGGCACATATAC/-AATGTGGCACATATA- ATCATGGAAT 3070 hom 26 het 9 0 8 5 N/A 0 0 28985 CASAVA_Build 5 124900887 4I5M8I AAAAGACTAT ----ACCAA--------/TATAAACAATTACGTGC CAACAAATGG 3070 hom 96 het 30 0 33 3 N/A 0 0 28986 CASAVA_Build 5 125005845 1I GCTGAATGGA -/T TTTTTTTTTT 2930 het 2339 hom 22 7 10 5 T 13 14 28987 CASAVA_Build 5 125022174 1I AAATCACCAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 8 9 28988 CASAVA_Build 5 125026934 1I TTGTAAAGGA -/G GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 61 31 17 13 G 3 4 28989 CASAVA_Build 5 125027756 14D TTAATTGGGC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 13 10 T 24 10 28990 CASAVA_Build 5 125038366 13D13M3D TTTTGTATTA GGATTTTTGTATTAGGATTTAGGATTTTG/-------------AGGATGCTCAACT--- TATACTCAAT 3070 hom 90 het 26 0 31 1 N/A 0 0 28991 CASAVA_Build 5 125040380 1D GTGTTGGGGT G/- GGGGGGGGTA 3070 hom 15 het 8 0 7 1 G 9 8 28992 CASAVA_Build 5 125053667 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTAAA 3070 het 1322 hom 19 3 9 9 A 1 0 28993 CASAVA_Build 5 125053703 1I AACACATTAT -/G GGGGGTGGGT 3070 het 2284 hom 23 6 7 10 G 5 6 28994 CASAVA_Build 5 125063273 2D AAAAGGAAAA AG/-- AAGACAAACA 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 AG 1 0 28995 CASAVA_Build 5 125063826 1I TAACTGGCAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 9 28996 CASAVA_Build 5 125064525 1I TAACAAAAAA -/T ATCTAAGAAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 1 28997 CASAVA_Build 5 125073170 1D CTGCTGTAAT A/- AAAAAAAAAA 1365 het 25 hom 22 1 5 18 A 14 13 28998 CASAVA_Build 5 125074964 1D TGGGAGATTG C/- CATCATTGAC 3070 hom 87 het 33 0 29 6 C 2 1 28999 CASAVA_Build 5 125079108 1I CCATAGAGAA -/T TTTTAGTTTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 4 5 29000 CASAVA_Build 5 125084370 3I ATTCACCATT ---/ATA ATACTACCTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATA 1 2 29001 CASAVA_Build 5 125086164 1I AGAGTCAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 9 10 29002 CASAVA_Build 5 125086433 1I TTATATCATA -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 6 7 29003 CASAVA_Build 5 125088328 1D AGAAGATGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 10 9 29004 CASAVA_Build 5 125095229 1I ATGCATACAC -/A AGTATCAATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 2 29005 CASAVA_Build 5 125095325 1D TTAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 A 11 10 29006 CASAVA_Build 5 125097398 1I ACTACCAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 10 11 29007 CASAVA_Build 5 125100711 1I AATCATGTGG -/T TTTTTGTCTT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 5 6 29008 CASAVA_Build 5 125106908 1I CTATGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 18 16 14 A 13 14 29009 CASAVA_Build 5 125108664 1D AAAAGTGAAC T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 7 6 29010 CASAVA_Build 5 125109413 2D GGAGAGAATC AT/-- ATATGTTTCT 2477 het 2477 ref 26 16 6 4 AT 3 2 29011 CASAVA_Build 5 125110152 1I AGTTTTGACC -/A AAAAATGGTG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 5 6 29012 CASAVA_Build 5 125110832 1D ACAATAAAAC T/- TTGTGGGTAG 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 T 3 2 29013 CASAVA_Build 5 125119162 5D31M15I TATATGTATG TATAATATATTATATGTAATATATAATATATTATAC---------------/-----TATATTATATGTAATATATAATATATTATACACATATAATACATAT ACATATAATA 3070 het 1153 hom 15 6 8 3 N/A 0 0 29014 CASAVA_Build 5 125123891 1D TTGTAGGTGT G/- CAGCTTTATT 3070 hom 72 het 26 0 22 4 G 1 0 29015 CASAVA_Build 5 125145353 1I AGGATCATAC -/A ATATGTAGGC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 1 2 29016 CASAVA_Build 5 125146057 4D GTCAGCTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 18 16 11 TTTG 4 3 29017 CASAVA_Build 5 125151676 4I AAAAATATTT ----/GTCA GTAAGTAAGT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 GTCA 0 1 29018 CASAVA_Build 5 125166364 2D TGCCATACAC AT/-- GTGATTGTAA 3070 het 3070 ref 49 24 22 5 AT 1 0 29019 CASAVA_Build 5 125180842 1D TTATTTTTCT C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 73 het 31 0 23 8 C 9 8 29020 CASAVA_Build 5 125189046 1D CACTCTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 51 0 40 11 T 11 10 29021 CASAVA_Build 5 125199293 1D GAGTCAGCTC A/- GCACCTCAAT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 1 0 29022 CASAVA_Build 5 125202405 3D CCTTAACTGA AAG/--- AAGATGTAAA 3070 hom 144 het 57 0 49 9 AAG 2 1 29023 CASAVA_Build 5 125205257 1D AAAAAGGACA C/- CCACACGGCT 3070 hom 27 het 10 0 10 1 C 3 2 29024 CASAVA_Build 5 125207652 1I ATAGAATTAG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 8 29025 CASAVA_Build 5 125209179 1D ATAATAATGC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 9 8 29026 CASAVA_Build 5 125211522 11D TTTAGTAATG AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAATA 1056 het 30 hom 15 1 5 10 A 19 8 29027 CASAVA_Build 5 125216306 1D TCTCTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 29 1 20 8 T 15 14 29028 CASAVA_Build 5 125218178 1D CCGTTGCTTG T/- TTTTTGTCAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 6 5 29029 CASAVA_Build 5 125220799 1D TCAAAGTGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 10 9 29030 CASAVA_Build 5 125222951 1D GTAATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 26 2 16 8 T 17 16 29031 CASAVA_Build 5 125224663 1D TATGTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 13 12 29032 CASAVA_Build 5 125226630 1I TTAGTAATTA -/T TTTCAGTTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 3 4 29033 CASAVA_Build 5 125227440 1D TTTACAGTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 40 0 33 7 A 10 9 29034 CASAVA_Build 5 125229912 2I TTGCAAAATA --/TT TTTTTCTGAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 5 7 29035 CASAVA_Build 5 125230529 1D AAACCCAGAG A/- AGTAGTTATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 1 29036 CASAVA_Build 5 125232150 4D CCCACTGAAT AATA/---- AATGTTTCTG 3070 hom 108 het 39 0 35 6 AATA 1 0 29037 CASAVA_Build 5 125234561 1D TCATGAAACG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 8 7 29038 CASAVA_Build 5 125235628 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 16 0 13 3 T 13 12 29039 CASAVA_Build 5 125235983 1D GCAGAGTATT C/- CATGGTGTAT 1456 hom 7 het 3 0 3 0 C 2 1 29040 CASAVA_Build 5 125239395 1D TATATTCCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 10 9 29041 CASAVA_Build 5 125239644 1I GAGCATTGGT -/G TACTGTGTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 29042 CASAVA_Build 5 125246485 1D5M18D AAAATAAAAG AATATTTTAAAATAAAATAAAATA/-GTATT------------------ TTTTTTCCCT 3070 hom 96 het 33 0 33 3 N/A 0 0 29043 CASAVA_Build 5 125252280 3D CTCTCTTTCT TTC/--- TTATTTATTT 3070 hom 22 het 29 0 17 13 TTC 1 0 29044 CASAVA_Build 5 125252403 4D ATGAGCTTCT TAAG/---- TGTCAGATTT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 TAAG 1 0 29045 CASAVA_Build 5 125280791 1I CAAGCAAATG -/T TATTTAGATT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 1 2 29046 CASAVA_Build 5 125298025 1D CTTTATGATT A/- AAAAAAAACA 1374 het 1374 ref 36 30 3 3 A 9 8 29047 CASAVA_Build 5 125309573 1I ATGATCATGA -/T TGATTAAGCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 1 2 29048 CASAVA_Build 5 125353612 1D TTTGCTACCT G/- GCACATAAAA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 G 2 1 29049 CASAVA_Build 5 125356770 1I ACATGTTTAC -/A TTTTATAAAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 0 1 29050 CASAVA_Build 5 125360019 1I4M1I AAACCAGCAC -AGAC-/AAGACA AGGATGCCCT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 N/A 0 0 29051 CASAVA_Build 5 125371293 8I AAGATGCAAA --------/TATATATT TATATATTTT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 TATATATT 1 2 29052 CASAVA_Build 5 125371680 1D TTATTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 11 10 29053 CASAVA_Build 5 125372263 1D GATGTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 11 10 29054 CASAVA_Build 5 125372409 1I GTGAAACTTT -/G CATCAGGCTG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 G 0 1 29055 CASAVA_Build 5 125375866 1I CCATTTCTGC -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 6 7 29056 CASAVA_Build 5 125376786 1I AAGCTGCTTC -/T TTTATTATCC 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 T 3 4 29057 CASAVA_Build 5 125378631 1I ATTTCCTCAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 8 9 29058 CASAVA_Build 5 125383050 1I GACTCCATCT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 6 7 29059 CASAVA_Build 5 125383920 2D GGAGAAGGTC AG/-- AGAGTGACCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 AG 3 2 29060 CASAVA_Build 5 125394100 1D TAGTTTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 A 10 9 29061 CASAVA_Build 5 125398150 2I CTTATGTTTG --/AT ATATATATTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 AT 4 5 29062 CASAVA_Build 5 125400095 1I AAAATCTCCT -/C CCCTTGTCCT 3070 het 3070 ref 51 28 17 6 C 3 4 29063 CASAVA_Build 5 125408636 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 67 het 28 0 23 5 A 8 9 29064 CASAVA_Build 5 125412774 3I TTTCCACAGA ---/CAG CAGCACCCCA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 CAG 1 2 29065 CASAVA_Build 5 125415498 1D AGAAAAAAAA T/- ATTAAGAATT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 T 1 0 29066 CASAVA_Build 5 125416046 1D TGGCCCCCAA G/- GCATAGTGCT 3070 hom 129 het 50 0 44 7 G 2 1 29067 CASAVA_Build 5 125420273 1D TCTTGGGGGT G/- GGGTGAAGAG 3070 hom 126 het 44 0 42 2 G 4 3 29068 CASAVA_Build 5 125430860 1I TTGGGTGAGA -/C CCAGTTCTGT 3070 hom 120 het 45 0 37 8 C 2 3 29069 CASAVA_Build 5 125433733 3D CCTCCATTTG TTC/--- TTTTAGTTAT 3070 hom 15 het 31 1 24 7 TTC 1 0 29070 CASAVA_Build 5 125434264 8D AGATAGCCAA ATGTTTGC/-------- TGCACAAAGC 3070 hom 57 het 22 0 20 4 ATGTTTGC 1 0 29071 CASAVA_Build 5 125434515 1I TAAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 2480 het 339 hom 13 1 8 4 A 12 13 29072 CASAVA_Build 5 125438262 1D TTTTCATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 23 1 14 8 A 15 14 29073 CASAVA_Build 5 125442379 1D AAATTAGTGC T/- TAAAAGGAAG 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 T 2 1 29074 CASAVA_Build 5 125445231 2I TCAGAAATAA --/AT AGTCAAATCC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 AT 0 1 29075 CASAVA_Build 5 125446139 1D AATACTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 26 1 20 6 T 12 11 29076 CASAVA_Build 5 125447615 2I GTTCGACTGA --/AT ATATATATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AT 6 7 29077 CASAVA_Build 5 125449469 1D TATGGTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 29 1 18 10 T 15 14 29078 CASAVA_Build 5 125449906 1D ATTCAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 10 9 29079 CASAVA_Build 5 125451017 1I AAAAAAGAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 10 29080 CASAVA_Build 5 125456651 2I CTATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 755 hom 33 2 27 4 AT 6 7 29081 CASAVA_Build 5 125457697 4D AAAATAAATG AATT/---- AATTAAAATT 3070 hom 60 het 22 0 21 3 AATT 2 1 29082 CASAVA_Build 5 125458607 1I GGAAGAGAGG -/C CCGATACTAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 2 3 29083 CASAVA_Build 5 125459123 1D GAGATGCTGT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 103 het 41 0 34 12 A 9 8 29084 CASAVA_Build 5 125463644 2I GAACAAACAC --/AT GAGTGATACA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 0 1 29085 CASAVA_Build 5 125466722 1I CAATAACATG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 8 9 29086 CASAVA_Build 5 125472919 1I AGCTTTCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 39 hom 41 2 33 6 T 9 10 29087 CASAVA_Build 5 125480205 4I GAAAGCCATT ----/TTAA TTGTTTGAAG 3070 hom 141 het 56 0 48 8 TTAA 0 1 29088 CASAVA_Build 5 125490749 1I TAAATTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 12 13 29089 CASAVA_Build 5 125503652 1D ATAGCAGCAA G/- AACACAACGA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 1 0 29090 CASAVA_Build 5 125504419 3D CCATAAGCTC TTT/--- GTGATTGATA 3070 hom 141 het 51 0 47 6 T 3 0 29091 CASAVA_Build 5 125509104 1I AGCAATAAAG -/T ATTTTTAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 1 29092 CASAVA_Build 5 125521267 2D ATGCCTTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 32 0 22 10 A 13 11 29093 CASAVA_Build 5 125522932 1I GGAAAATCCA -/C CCCCATGATC 3070 hom 137 het 51 0 42 9 C 4 5 29094 CASAVA_Build 5 125524702 1D GTAATTCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 20 0 13 8 A 12 11 29095 CASAVA_Build 5 125527007 2I ATGAAGATGG --/TT AAGTTAGAAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 0 2 29096 CASAVA_Build 5 125540666 1I TTACAATCTA -/C CCCCCTGACA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 C 5 6 29097 CASAVA_Build 5 125544351 1I ATTATATTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 9 29098 CASAVA_Build 5 125553531 1I ACTTTGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 10 11 29099 CASAVA_Build 5 125553884 1I CACTTGTAAT -/A ATAGGAAGTA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 1 2 29100 CASAVA_Build 5 125554580 1D AGCAGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 47 1 36 10 A 13 12 29101 CASAVA_Build 5 125555927 4I TTTAGGGATT ----/AAAA AAAGAGCTTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 3 7 29102 CASAVA_Build 5 125558524 4I CAAGATTCCC ----/TTGT TTAAGAACTC 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 TTGT 0 1 29103 CASAVA_Build 5 125561486 4D CTCTTGAAAC TCTA/---- TCTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 TCTA 1 0 29104 CASAVA_Build 5 125564636 2D TCCAGTATTC CT/-- CTGTCTGACT 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 CT 2 1 29105 CASAVA_Build 5 125565205 1D GGTGCCCTTT G/- TGTATAGAAG 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 G 1 0 29106 CASAVA_Build 5 125567523 1D AAATACAGTT A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 7 29107 CASAVA_Build 5 125568050 2D TATATACATA TC/-- TGTAACATAA 1940 het 1940 ref 13 7 4 3 TC 1 0 29108 CASAVA_Build 5 125571451 1D ACTCAGCCAT A/- AAAAAGGAAT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 6 5 29109 CASAVA_Build 5 125600635 1D TTTCCCCCCC T/- CTCATTCTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 29110 CASAVA_Build 5 125604629 2I ATTTTCTTCT --/TG GTGTGAAGTG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 TG 0 1 29111 CASAVA_Build 5 125606629 2D TACTCGTCAC TT/-- TGACTTTTTC 3070 hom 114 het 42 0 37 6 T 3 1 29112 CASAVA_Build 5 125609710 1D TCACTCTCAT C/- CCCCCAGGCT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 6 5 29113 CASAVA_Build 5 125610281 1I TTAGCATGAA -/G GGTTGTTGAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 2 3 29114 CASAVA_Build 5 125618068 3D CAAAGTTTAT ATC/--- ATCAGAGGTG 3070 het 3070 ref 21 11 9 3 ATC 2 1 29115 CASAVA_Build 5 125619962 1I TATGTAGTAC -/A ATTCATTTAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 2 29116 CASAVA_Build 5 125628639 1I CAAATGTGTG -/T GTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 13 0 10 3 T 0 1 29117 CASAVA_Build 5 125633162 1I GATTTACAGA -/T TTTTTTAACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 6 7 29118 CASAVA_Build 5 125635453 1D ACATCAAATT A/- AAAAAAACAT 3070 hom 99 het 36 0 33 5 A 8 7 29119 CASAVA_Build 5 125636559 2D GTACAACTTT CA/-- CATAGTTAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CA 2 1 29120 CASAVA_Build 5 125636759 5D TCTATGTATA TTAAC/----- TTAACTTCTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTAAC 2 1 29121 CASAVA_Build 5 125636911 1D CCCCACAACA G/- GGCCCTGGTG 849 hom 10 het 5 0 4 1 G 3 2 29122 CASAVA_Build 5 125637824 1I ATATTAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 10 11 29123 CASAVA_Build 5 125641476 1I CCCAGACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 39 0 28 11 A 11 12 29124 CASAVA_Build 5 125643088 1I ACGAGTCAAC -/A AAACATGTCT 3070 hom 144 het 52 0 48 4 A 3 4 29125 CASAVA_Build 5 125646984 10I GCAGGAAAAG ----------/AACATACACC AACTACAGAT 3070 hom 132 het 49 0 43 6 AACATACACC 0 1 29126 CASAVA_Build 5 125653565 4D CATCAAAAAG AATT/---- AAGTACTTTG 3070 het 3070 hom 27 9 15 5 AATT 1 0 29127 CASAVA_Build 5 125662413 1D ATTTGTTTTT A/- AAACGTTTAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 4 3 29128 CASAVA_Build 5 125663754 1I TTGCCAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 10 11 29129 CASAVA_Build 5 125666312 2D CAGTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2721 hom 32 10 14 8 A 16 14 29130 CASAVA_Build 5 125673780 8I ATAGGAATAG --------/AAAGAAGC AAACCCTCTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAAGAAGC 0 1 29131 CASAVA_Build 5 125677110 4D GAGACAAGTC TCAG/---- TCAATTTAGA 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 TCAG 1 0 29132 CASAVA_Build 5 125680175 1I TAAACACAAC -/T TGTTTCTGCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 1 2 29133 CASAVA_Build 5 125683263 1I TAGGAGCTTC -/T TGTCCAAAAA 3070 hom 114 het 49 0 39 10 T 1 2 29134 CASAVA_Build 5 125684526 1I CTCTGTTGAC -/A GTTTTTGATG 3070 hom 75 het 26 0 26 2 A 0 1 29135 CASAVA_Build 5 125696280 1I TACTGTGAGT -/G TGCTATCTAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 0 1 29136 CASAVA_Build 5 125705464 1I TCTGCGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 963 hom 29 3 22 4 A 13 14 29137 CASAVA_Build 5 125714588 1I CTCTTCCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 10 11 29138 CASAVA_Build 5 125718612 4D AACAGGGGCA AACT/---- AACTAAACAG 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 AACT 2 1 29139 CASAVA_Build 5 125721215 1D TTTTTTTTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 20 15 7 A 10 9 29140 CASAVA_Build 5 125730438 2D AGACCAAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 638 het 264 hom 21 3 4 14 T 20 18 29141 CASAVA_Build 5 125744053 1I TTGATGGAAA -/T TTGCATTGAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 2 3 29142 CASAVA_Build 5 125750865 1D AACTCTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 11 10 29143 CASAVA_Build 5 125758680 1D AGAGTTACAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 106 het 43 0 36 7 T 10 9 29144 CASAVA_Build 5 125764096 5D TGCCAATCAC AAGAT/----- TAGAGTATTC 3070 hom 87 het 34 0 30 6 AAGAT 1 0 29145 CASAVA_Build 5 125772281 1I CCTGAGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 21 1 13 7 T 12 13 29146 CASAVA_Build 5 125790979 1I ACCCAAAATG -/A ATGCTGATAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 2 29147 CASAVA_Build 5 125813114 1D TACTCTCTTA T/- TTTTCGCCAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 5 4 29148 CASAVA_Build 5 125821353 1D GGTTTCTCAT G/- GGGGCTTGGA 2627 het 2627 ref 28 16 7 6 G 5 4 29149 CASAVA_Build 5 125822040 1I CAAAACAAAA -/C AAAAAAAAAG 3070 het 2592 hom 26 13 10 3 C 0 1 29150 CASAVA_Build 5 125836254 3D AACTCACATC CTT/--- AGACATGGAC 3070 het 3070 hom 57 22 30 6 CTT 1 0 29151 CASAVA_Build 5 125836972 1D TGGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 11 10 29152 CASAVA_Build 5 125853392 3I AGGCTTAGAG ---/AGA AGAATTCAGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AGA 1 2 29153 CASAVA_Build 5 125853943 1D CTCTCCCGCT G/- GGCCTGGCCG 3070 hom 81 het 34 0 26 8 G 3 2 29154 CASAVA_Build 5 125857946 1I CTTTGAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3020 hom 30 9 14 7 A 10 11 29155 CASAVA_Build 5 125860610 2D TTCTAATTTG AA/-- AAAAAAAAAA 1192 het 1192 ref 29 21 3 5 A 12 10 29156 CASAVA_Build 5 125861635 11D CAGTTTTGTC TAACAGCACCA/----------- TCCTAACAGC 3070 het 3070 hom 39 18 18 7 TAACAGCACCA 1 0 29157 CASAVA_Build 5 125863735 2D AGGTGCCAGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 TC 8 7 29158 CASAVA_Build 5 125864531 2I TTGTGCACAC --/AT GTGCACACAC 3070 het 3070 ref 56 24 22 10 AT 0 1 29159 CASAVA_Build 5 125876779 1I TTTGGTCTTC -/A TCCCTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 0 1 29160 CASAVA_Build 5 125885317 36D GTCCTTAACA AAGGACTGTACAGTGTACAGTGTAGCACTGTATACC/------------------------------------ AAGTGCTACA 3070 hom 54 het 18 0 19 4 AAGGACTGTACAGTGTACAGTGTAGCACTGTATACC 1 0 29161 CASAVA_Build 5 125887388 1D TGGGATTACA G/- GGCCGCTGCG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 G 3 2 29162 CASAVA_Build 5 125889295 4D AAGTAAAAAG TTTC/---- TGCCCCCTGG 3070 hom 43 het 17 0 13 4 TTTC 1 0 29163 CASAVA_Build 5 125893695 2D ATAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 1549 het 680 hom 8 2 5 1 AT 1 0 29164 CASAVA_Build 5 125902286 4I TCACAAGAAT ----/ACTA ACTATGAGGC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 ACTA 1 2 29165 CASAVA_Build 5 125905559 1I TTTCCAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 20 1 18 2 A 11 12 29166 CASAVA_Build 5 125906854 1D CATTATAACC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 8 7 29167 CASAVA_Build 5 125916671 1I ATGATATGTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 7 8 29168 CASAVA_Build 5 125918257 1I GCCGAGAAAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 T 8 9 29169 CASAVA_Build 5 125923793 11D CCAGGCGTGA TGGCTCATGCC/----------- TGTAATCCCA 1500 het 1500 ref 29 18 5 7 TGGCTCATGCC 1 0 29170 CASAVA_Build 5 125924222 1I AGGTAAGTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 7 8 29171 CASAVA_Build 5 125972119 6I GTTTATCCTG ------/TGTTTT TGTTTTTGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TGTTTT 2 3 29172 CASAVA_Build 5 126008865 1I GTTTTGCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 9 10 29173 CASAVA_Build 5 126009704 5D TCTTTCTTTC TTTCT/----- TTTTTTTTTT 2565 het 1302 hom 21 8 8 6 TTTCT 1 0 29174 CASAVA_Build 5 126010404 1D GAGCTCAGGA G/- TTCAAGACCA 3070 hom 39 het 16 0 13 4 G 1 0 29175 CASAVA_Build 5 126010491 2D TGTTACTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 22 1 9 13 T 13 11 29176 CASAVA_Build 5 126010959 1D ATTTGGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 42 1 29 12 T 12 11 29177 CASAVA_Build 5 126011280 2D CTTCCAGCTA TC/-- TCTTTCCCTG 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 TC 2 1 29178 CASAVA_Build 5 126015701 1D CATCTTTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2629 hom 27 9 9 9 T 10 9 29179 CASAVA_Build 5 126016164 2I ACAAAAATAT --/AA GTTTGTTCTT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 A 0 2 29180 CASAVA_Build 5 126023739 1I TAAACTTGAC -/A AAAATAAACT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 4 5 29181 CASAVA_Build 5 126045082 4I CTGGTAAAAA ----/ATGT AACTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 ATGT 0 1 29182 CASAVA_Build 5 126054113 1I TCTCTCCCAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 1666 hom 26 9 13 4 A 7 8 29183 CASAVA_Build 5 126062933 1D ATCTTTTGCC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 8 7 29184 CASAVA_Build 5 126064643 1D AACACGGTAA G/- ACCCTGTCTC 3070 het 3070 hom 30 13 11 10 G 1 0 29185 CASAVA_Build 5 126067517 1I GCTCTTGTTG -/C CCAAGCTGGA 3070 het 3021 hom 18 7 9 2 C 2 3 29186 CASAVA_Build 5 126068000 7D AAGGAAAGGA CAATGGG/------- CAAATTTCTC 3070 het 3070 ref 42 22 15 8 CAATGGG 1 0 29187 CASAVA_Build 5 126069918 3D TCAAGCAGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2775 hom 30 14 13 3 A 16 13 29188 CASAVA_Build 5 126073696 1D ATGACTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 T 11 10 29189 CASAVA_Build 5 126082621 1D TTCATTACCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 205 hom 40 1 37 2 A 10 9 29190 CASAVA_Build 5 126085362 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAAGA 1721 het 1366 hom 13 7 6 0 C 0 1 29191 CASAVA_Build 5 126087206 2D CTCTGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 17 3 A 13 11 29192 CASAVA_Build 5 126090387 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 23 4 T 12 11 29193 CASAVA_Build 5 126095595 1D CAGCTGCCAC A/- AAAAAAAAAA 2863 het 1020 hom 34 8 15 12 A 15 14 29194 CASAVA_Build 5 126097044 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 709 het 341 hom 11 2 4 5 A 17 16 29195 CASAVA_Build 5 126098068 5I3M1I AGAGTTTCGC -----TAG-/TCTTGTAGC CCAGGCTAGA 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 N/A 0 0 29196 CASAVA_Build 5 126101344 1I AGACTGTCTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 2753 hom 21 7 10 4 A 8 9 29197 CASAVA_Build 5 126114216 1D AGTGTGTTTA G/- GGAGTCATAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 G 3 2 29198 CASAVA_Build 5 126115499 1I GTGGGAGGGG -/C AAAATCACAC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 0 1 29199 CASAVA_Build 5 126118596 2D GTATTTTCTT CC/-- CCCTTTTTTT 3070 hom 44 het 22 0 17 5 C 5 3 29200 CASAVA_Build 5 126118901 1I CGGCCTCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 18 1 14 3 T 12 13 29201 CASAVA_Build 5 126123134 3I TAAGTCAATC ---/ACT ACTACATACG 3070 het 3070 hom 55 24 26 5 ACT 1 2 29202 CASAVA_Build 5 126135126 5D GTGGGTTACT GCTAA/----- GCTTTCAGTC 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 GCTAA 1 0 29203 CASAVA_Build 5 126152497 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 43 1 31 11 T 12 11 29204 CASAVA_Build 5 126167950 2I ATTACAGACG --/TT TAAGCCACTG 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 T 1 3 29205 CASAVA_Build 5 126173604 3I TTTCAAAAAC ---/CTT CTCAACTGAA 3070 hom 162 het 57 0 54 3 CTT 0 1 29206 CASAVA_Build 5 126178132 1D TGCAAGTTGG T/- TTTTTTTTTT 1055 het 1055 ref 26 15 4 7 T 15 14 29207 CASAVA_Build 5 126184431 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 9 10 T 14 13 29208 CASAVA_Build 5 126187040 3D TAGTTACTGA ATT/--- ATTATTAGCT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 ATT 3 2 29209 CASAVA_Build 5 126190731 1I AGGGGGAATG -/T TTAGGCTGGC 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 T 2 3 29210 CASAVA_Build 5 126196463 1D CCAAGAGTGT G/- GTTGGGTTTT 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 G 2 1 29211 CASAVA_Build 5 126197804 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2100 het 2097 ref 23 7 8 9 T 12 13 29212 CASAVA_Build 5 126200736 3D GGCTTTGCCA GTT/--- GTGGAAGATA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 GTT 1 0 29213 CASAVA_Build 5 126202770 4I ATTTTAACCA ----/TATT TATTTTATAG 3070 het 1517 hom 24 4 15 5 TATT 1 2 29214 CASAVA_Build 5 126264212 1D CAGTATTTCA T/- TTATAGTAGC 3070 hom 75 het 27 0 24 3 T 3 2 29215 CASAVA_Build 5 126298024 1I GTAGCCTCTA -/T TTTTTTTTTT 962 het 962 ref 36 25 3 8 T 13 14 29216 CASAVA_Build 5 126305046 1D TGATAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 28 1 23 4 A 12 11 29217 CASAVA_Build 5 126333719 1D TGCTCTGTCA C/- CTAGGCTGGA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 2 1 29218 CASAVA_Build 5 126363882 9I TCACACTCTG ---------/CCTCTTGAT CCTCTTGATG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 CCTCTTGAT 1 2 29219 CASAVA_Build 5 126388900 1D AAAAGTTATT A/- AAAAAAAAAA 2855 het 49 hom 22 2 10 10 A 17 16 29220 CASAVA_Build 5 126458813 1I AACCTGAAAA -/T GCTGGGCTCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 1 29221 CASAVA_Build 5 126463407 1I TTTTCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 952 hom 24 3 20 1 T 11 12 29222 CASAVA_Build 5 126490240 1I TATTTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 36 2 27 7 T 11 12 29223 CASAVA_Build 5 126490516 1D GTTGTTGCTG T/- TTTGTTTCCG 3070 hom 147 het 55 0 49 9 T 4 3 29224 CASAVA_Build 5 126576826 1I CAACCCTTTT -/C CCCCCTCCCT 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 C 5 6 29225 CASAVA_Build 5 126578817 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 33 het 10 hom 7 0 1 6 A 14 11 29226 CASAVA_Build 5 126588356 1D GAAGTTAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 10 9 29227 CASAVA_Build 5 126599570 1I GTCGGCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2974 hom 32 12 12 8 T 13 14 29228 CASAVA_Build 5 126626899 1I AGGGATTCTC -/A GGGGGGGGGG 3070 hom 48 het 24 0 12 12 A 0 1 29229 CASAVA_Build 5 126713286 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 8 9 29230 CASAVA_Build 5 126722100 1I AAAAGAATTT -/C ATGGCTCCAT 3070 het 3070 ref 48 21 15 12 C 0 1 29231 CASAVA_Build 5 126722873 1D TTAGCTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 T 11 10 29232 CASAVA_Build 5 126729654 4D TGTGGAGCAT GTTA/---- GTTATAGAAG 3070 het 3070 ref 45 28 14 5 GTTA 2 1 29233 CASAVA_Build 5 126738815 1D CATAGCTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 10 9 29234 CASAVA_Build 5 126803013 3D AATTCTTATT TAA/--- TACTAATTAG 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 TAA 1 0 29235 CASAVA_Build 5 126824431 2D TTAAAGGCTT CA/-- CATCATGAAA 3070 het 3070 hom 29 10 19 0 CA 2 1 29236 CASAVA_Build 5 126859983 7I TGATAAAGGA -------/GTCATAT GTCCAAGAAG 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 GTCATAT 0 1 29237 CASAVA_Build 5 126870939 4I GACTGAATAC ----/CCAG TGGGTAATGA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 CCAG 0 1 29238 CASAVA_Build 5 126883190 4D GGTTTTCTTC CTTT/---- CTTTTAGCTC 3070 het 3070 hom 54 24 25 7 CTTT 2 1 29239 CASAVA_Build 5 126884982 1D CCCTGCTCTC T/- TTAAAATAGC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 3 2 29240 CASAVA_Build 5 126899889 1D TCTAGAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 21 7 A 10 9 29241 CASAVA_Build 5 126909508 4D TTATATGTAT TTGC/---- TTGCTTGCTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 TTGC 4 3 29242 CASAVA_Build 5 126911236 5D GAATTAATAC AGAGT/----- AATTTTATCT 2349 het 2349 ref 21 13 7 2 AGAGT 1 0 29243 CASAVA_Build 5 126912748 1D TTATGTAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 9 A 13 12 29244 CASAVA_Build 5 126913054 3D TCAGTACATG AAC/--- ATCTGCATTG 3070 het 3070 hom 52 19 29 7 AAC 1 0 29245 CASAVA_Build 5 126918098 2D AAATAATTTA AT/-- ATCAACCTCA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 AT 2 1 29246 CASAVA_Build 5 126920342 5D TAACTGAAAC TTAGA/----- TTAAACTGCT 3070 het 3070 hom 21 9 9 6 TTAGA 1 0 29247 CASAVA_Build 5 126921771 3D GTGGTATCGC TCT/--- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 TCT 1 0 29248 CASAVA_Build 5 126924895 1I AAATTGATCT -/A AAGAAGAGAG 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 2 3 29249 CASAVA_Build 5 126967457 1I CTTTTCCTGC -/A AAGCTCTTGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 2 3 29250 CASAVA_Build 5 127005599 1I CAAAACAGAG -/C CCTAGAAGCC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 C 2 3 29251 CASAVA_Build 5 127078564 1I AATTATTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 32 1 22 9 T 10 11 29252 CASAVA_Build 5 127082081 10D ATACTAATTT GTGCTGTGTA/---------- GTGCTGGCAC 3070 hom 144 het 52 0 49 4 GTGCTGTGTA 1 0 29253 CASAVA_Build 5 127083422 2I TCAGAGGAAG --/GC GGGCGGGGGA 3070 hom 60 het 21 0 17 4 GC 0 1 29254 CASAVA_Build 5 127119387 1D GTATATAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 13 12 29255 CASAVA_Build 5 127123858 1I AATACAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1394 hom 30 4 18 8 T 12 13 29256 CASAVA_Build 5 127170226 2I ATACAGATCA --/TT GTTACAATCC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 0 2 29257 CASAVA_Build 5 127192974 6I TTTTTGGTAA ------/TTAACT TTATAAACAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTAACT 0 1 29258 CASAVA_Build 5 127198723 4D TAAACTAAAG TTCT/---- TTCTATGTGG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TTCT 2 1 29259 CASAVA_Build 5 127205421 1D AGTTTTAATG T/- TTGGACCAGA 3070 hom 132 het 52 0 43 9 T 3 2 29260 CASAVA_Build 5 127222529 1D GTGTGCTTAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 9 8 29261 CASAVA_Build 5 127223137 1D ATTTTAAAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 8 29262 CASAVA_Build 5 127225334 1I ACCATATGAG -/T TTAATTCATG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 2 3 29263 CASAVA_Build 5 127239112 2D GAAACTCTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 42 0 30 12 T 14 12 29264 CASAVA_Build 5 127239847 1D AACAACAAAC A/- AAAAAACTCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 7 6 29265 CASAVA_Build 5 127240946 1D ATTTTTGTGG A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 129 het 44 0 43 1 A 1 0 29266 CASAVA_Build 5 127241267 1I CTCAGAAATC -/T TGGTCACCTT 3070 hom 111 het 41 0 35 6 T 1 2 29267 CASAVA_Build 5 127248710 1I TTGTTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 35 1 30 4 A 11 12 29268 CASAVA_Build 5 127252999 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 20 1 13 6 T 13 12 29269 CASAVA_Build 5 127253473 1I GTTTTATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 763 hom 39 4 25 10 T 14 15 29270 CASAVA_Build 5 127254045 1D CCCTGTATTT A/- AAAAAAAAAA 2354 het 2354 ref 46 19 9 18 A 17 16 29271 CASAVA_Build 5 127254819 2D AATTTTTGTA TT/-- TTTTAGTAGA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 T 6 4 29272 CASAVA_Build 5 127270378 1D TCCTGTCTCC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 81 het 32 0 27 6 A 8 7 29273 CASAVA_Build 5 127297781 1D AGTATTTGTT C/- CCTTCTAAGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 3 2 29274 CASAVA_Build 5 127300184 1D AGAAAGAGGG A/- AAATGATGAA 3070 hom 135 het 51 0 45 7 A 4 3 29275 CASAVA_Build 5 127303279 3D TATTTTTATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 28 0 16 13 T 15 12 29276 CASAVA_Build 5 127307221 2D TTATTTTACC AA/-- AGATTGTTTT 3070 hom 123 het 50 0 40 11 A 3 1 29277 CASAVA_Build 5 127308794 1I TCTCTGCTTA -/T TTCAAAATCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 2 3 29278 CASAVA_Build 5 127323216 1D ATGCTCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 33 0 24 9 T 11 10 29279 CASAVA_Build 5 127324875 1I GCAAAGAATC -/A TAGACCAAAA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 A 0 1 29280 CASAVA_Build 5 127329316 2D TGTATATATG TA/-- TATATATGTG 3070 hom 87 het 30 0 30 1 TA 4 3 29281 CASAVA_Build 5 127332898 17I CAGGGCAAAC -----------------/CAGCATAATTGGTTGGT CACCATATTG 3070 hom 63 het 21 0 21 2 CAGCATAATTGGTTGGT 0 1 29282 CASAVA_Build 5 127337938 4D AATTAAAAAG AAAC/---- AAACTATTGA 3070 hom 78 het 27 0 27 2 AAAC 2 1 29283 CASAVA_Build 5 127342029 1I TTGCCTATCC -/A AAAATGGGGA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 A 4 5 29284 CASAVA_Build 5 127359612 3D TCATCTATAA AAT/--- AAGAGTCTCA 3070 hom 136 het 49 0 46 3 AAT 1 0 29285 CASAVA_Build 5 127373866 2D ATCCATGGGC AT/-- ATGTTTCTTT 2951 het 2951 ref 17 8 8 2 AT 2 1 29286 CASAVA_Build 5 127377798 1I CTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 1923 het 1923 ref 20 10 6 4 A 11 12 29287 CASAVA_Build 5 127434930 1D CTAAGAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 A 12 11 29288 CASAVA_Build 5 127441914 1D AAGCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1159 het 1159 ref 24 15 3 6 T 16 15 29289 CASAVA_Build 5 127452761 1D CTTTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2017 het 33 hom 19 1 10 8 A 17 16 29290 CASAVA_Build 5 127460808 3I AAAGTAATAT ---/AGA AAGTTTGAGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AGA 0 1 29291 CASAVA_Build 5 127462069 1I TGACTGCTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 8 9 29292 CASAVA_Build 5 127492397 1I GTAGATCTTT -/A AAAAAAAAAA 1187 het 1187 ref 38 25 3 10 A 15 16 29293 CASAVA_Build 5 127518564 1I CATTTTACAG -/T TTTTTTTTTT 1279 het 1279 ref 36 21 3 12 T 11 12 29294 CASAVA_Build 5 127531665 2D ACATACATGC AT/-- ATATATATAT 1667 het 1667 ref 47 35 4 8 AT 7 6 29295 CASAVA_Build 5 127535974 1I ATTTCAGCAG -/T TTTACAAAGA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 3 4 29296 CASAVA_Build 5 127550053 1I TTGCTCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 17 14 T 12 13 29297 CASAVA_Build 5 127551701 1D ACATATGTTC A/- AAATCAGATT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 4 3 29298 CASAVA_Build 5 127575347 1I AACCTCCCAT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 6 7 29299 CASAVA_Build 5 127622723 1D TGCTAACAGG A/- AAAAAAAAAA 998 het 998 ref 34 24 3 7 A 13 12 29300 CASAVA_Build 5 127627934 1I GAACGAACAA -/C CTAGTTCAGT 3070 hom 129 het 51 0 43 8 C 1 2 29301 CASAVA_Build 5 127639034 1D CTTGCTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 14 13 29302 CASAVA_Build 5 127648798 4I TTTTGGGTAA ----/GTTT GTTTGATTCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GTTT 1 2 29303 CASAVA_Build 5 127655944 1D TTTTTCGTCG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 65 het 27 0 21 6 T 8 7 29304 CASAVA_Build 5 127663517 4I TTAAAAACAC ----/TAGA TAGTCTTATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TAGA 0 1 29305 CASAVA_Build 5 127665677 1D AAGAAGGCAG C/- AGTTGAATAA 3070 hom 111 het 41 0 38 5 C 1 0 29306 CASAVA_Build 5 127676840 1I AATCTAAGGC -/T TTTTCTTTAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 4 5 29307 CASAVA_Build 5 127683030 1I TACATAATCA -/T TTTTAAATAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 4 5 29308 CASAVA_Build 5 127711376 1D TAAAAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 12 11 29309 CASAVA_Build 5 127721461 1D GAAACATTCA G/- TGGTGGGTAC 3070 hom 129 het 46 0 44 3 G 1 0 29310 CASAVA_Build 5 127723469 2I CTTTGTACTC --/TA TGTTACTTGT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TA 0 1 29311 CASAVA_Build 5 127729727 4D CAGGAGAGTA GTTT/---- GTTAGTGACA 3070 het 3070 ref 38 19 16 8 GTTT 1 0 29312 CASAVA_Build 5 127844773 1I TTACTCAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 13 12 A 11 12 29313 CASAVA_Build 5 127865880 1D TATACAGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 33 1 21 11 A 13 12 29314 CASAVA_Build 5 127879967 1D ACAAGAACTC T/- TTTTTTTTTT 1581 het 1581 ref 45 26 4 16 T 14 13 29315 CASAVA_Build 5 127987783 1I AATAATAATG -/T TTCATTTTGG 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 2 3 29316 CASAVA_Build 5 128034276 17D GGCCCTTGTA GCAGGCTCCTGGGGGAG/----------------- GCAGGCTCCT 1409 het 1409 ref 12 9 4 2 GCAGGCTCCTGGGGGAG 2 1 29317 CASAVA_Build 5 128054103 1D ATTGCTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 16 8 T 14 13 29318 CASAVA_Build 5 128074156 1D ACAGATTTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 10 9 29319 CASAVA_Build 5 128083661 1D AAACGAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 36 19 16 1 A 9 8 29320 CASAVA_Build 5 128084616 3I AACTTAAATT ---/GAA GAAGAGTTAA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 GAA 1 2 29321 CASAVA_Build 5 128088996 5I GAGACATACT -----/TAAAA TAAATAGTTT 2889 het 2889 ref 17 8 6 3 TAAAA 0 1 29322 CASAVA_Build 5 128101795 4I ATATTTTTTC ----/TTAT TTATTTATTA 3070 het 1016 hom 17 4 12 1 TTAT 2 3 29323 CASAVA_Build 5 128107049 2D TTCTCTCAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 10 7 A 14 12 29324 CASAVA_Build 5 128108755 10D TCAGGAACTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 17 3 9 5 T 22 12 29325 CASAVA_Build 5 128117569 1I TGCAACCAAA -/G AACCCTGAAG 3070 het 3070 ref 26 13 13 0 G 0 1 29326 CASAVA_Build 5 128120237 1I AGGTAATTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 A 9 10 29327 CASAVA_Build 5 128124188 1I TGAAGTAAAA -/G TTAACAAAAA 50 het 50 ref 13 7 1 5 G 0 1 29328 CASAVA_Build 5 128124501 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2175 het 1194 hom 13 5 6 2 A 14 15 29329 CASAVA_Build 5 128126740 1D GGAAAATGTT C/- CCAATGGAGA 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 C 3 2 29330 CASAVA_Build 5 128143656 6I TAAATTAAGA ------/CTTTTT CTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 CTTTTT 1 2 29331 CASAVA_Build 5 128151561 1D GGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 25 6 T 11 10 29332 CASAVA_Build 5 128154104 1D TCCATGTCAG A/- AAAAAAAAAA 927 het 927 ref 16 8 4 4 A 15 14 29333 CASAVA_Build 5 128160131 1I ACATGCAGCC -/T TTCCTGTACG 3070 het 3070 hom 53 22 25 6 T 2 3 29334 CASAVA_Build 5 128192155 1D ACTTTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 22 18 12 T 11 10 29335 CASAVA_Build 5 128202785 1D TAATAAGGAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 A 9 8 29336 CASAVA_Build 5 128213181 1D AAATTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 A 12 11 29337 CASAVA_Build 5 128215769 1D ATGAACGGAT A/- AAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 7 6 29338 CASAVA_Build 5 128222044 2D ATTAAAATCA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 11 9 29339 CASAVA_Build 5 128222945 1D TTTGATAAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 9 8 29340 CASAVA_Build 5 128225919 1D CTGTCTCTAA T/- TTATGAATCA 3070 het 3070 hom 46 13 24 9 T 3 2 29341 CASAVA_Build 5 128228059 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1789 het 1789 ref 36 14 7 15 T 13 14 29342 CASAVA_Build 5 128228326 1D CGTGGATATT A/- AAAACAGCCT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 A 5 4 29343 CASAVA_Build 5 128239453 1I TTTTATTACG -/T TTTTACCCAG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 4 5 29344 CASAVA_Build 5 128240166 1D GGAAAAAAAC T/- TTTTTAAACC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 6 5 29345 CASAVA_Build 5 128251120 1D TAATTTAGAA C/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 C 1 0 29346 CASAVA_Build 5 128251522 1I TCAAACAGCT -/A AAAAAAAAAA 3063 het 3063 ref 31 16 9 6 A 10 11 29347 CASAVA_Build 5 128256617 3D TACTTCCCTC TTA/--- TTATTGCTTT 3070 het 3070 ref 32 18 10 7 TTA 2 1 29348 CASAVA_Build 5 128263876 1I CACACACAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 9 10 29349 CASAVA_Build 5 128268210 1D CACACATATA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1993 hom 20 7 13 5 T 9 8 29350 CASAVA_Build 5 128269560 1D CTACCTGGTC G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 G 8 7 29351 CASAVA_Build 5 128281526 3I CTCACCTTGC ---/TTG TTCTTCTGTG 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 TTG 0 1 29352 CASAVA_Build 5 128282604 1I ATGGTAAACG -/T TAATACTTTG 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 1 2 29353 CASAVA_Build 5 128285204 3I ATTGAAAAAA ---/TTG TTGTTAATAT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TTG 1 2 29354 CASAVA_Build 5 128288089 17I GATTCCAGTT -----------------/GGCATTTTTCTTCCCAC AGATGCCATG 3070 het 3070 hom 51 24 21 6 GGCATTTTTCTTCCCAC 0 1 29355 CASAVA_Build 5 128289097 6D GTACTAAAAT TATCTC/------ TATTACTTAG 3070 het 3070 ref 46 29 13 6 TATCTC 1 0 29356 CASAVA_Build 5 128289525 4D TAGTTGACAT ATCA/---- TTCAGGCAGT 3070 het 3070 hom 61 26 32 6 ATCA 1 0 29357 CASAVA_Build 5 128290333 1I ATGAGCTGTG -/T TACTTTGAGC 3070 het 3070 hom 49 16 24 9 T 1 2 29358 CASAVA_Build 5 128291967 1I TTTTCAACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 8 18 5 T 9 10 29359 CASAVA_Build 5 128292206 1I TTTAAACATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 A 8 9 29360 CASAVA_Build 5 128309661 1I TTTTGAAGTG -/T TTTTTTGTGT 1630 het 1630 ref 18 13 4 1 T 6 7 29361 CASAVA_Build 5 128313380 4D AAAGAAAAAA TACT/---- TAATAAATAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 TACT 1 0 29362 CASAVA_Build 5 128327996 1D GGTGTCTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 A 11 10 29363 CASAVA_Build 5 128345086 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 2282 het 2282 ref 30 8 13 9 A 9 10 29364 CASAVA_Build 5 128356767 2D ATGCCTGTTG CA/-- CAGTGTCTGT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 CA 2 1 29365 CASAVA_Build 5 128357059 2D AGAAACAAAC AT/-- ATATTAATGT 3070 hom 108 het 38 0 37 3 AT 3 2 29366 CASAVA_Build 5 128359628 1I TAATTTTTTT -/A GATCTGTTAA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 A 0 1 29367 CASAVA_Build 5 128359911 5D AATTATATCC CCTTT/----- CCTTATTTTG 3070 het 3070 ref 44 22 17 8 CCTTT 1 0 29368 CASAVA_Build 5 128366147 12D CCTCCCTTCC TTTCTTCCTTCG/------------ TTCCTTCGTT 1812 het 1812 ref 27 15 7 10 TTTCTTCCTTCG 1 0 29369 CASAVA_Build 5 128366901 1D GTTTGCAAAC T/- GTAAGATACA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 1 0 29370 CASAVA_Build 5 128370519 1D GTTGAATAGA T/- TTAAAATTAA 3070 het 3070 ref 25 12 13 0 T 3 2 29371 CASAVA_Build 5 128385374 12D CTTCTAGAAA ATGCTGTGATAT/------------ ATTTAATTGC 3070 het 3070 hom 36 17 20 6 ATGCTGTGATAT 1 0 29372 CASAVA_Build 5 128386550 1D AGTAGCTGAA G/- GGATGAGAGG 3070 het 3070 hom 51 22 27 5 G 3 2 29373 CASAVA_Build 5 128392251 1D CCTGCGTGTA T/- TTTTTTTTTT 2332 het 2332 ref 31 17 6 8 T 15 14 29374 CASAVA_Build 5 128399578 2D GCCAACAAAC AT/-- ATGAAAAAAA 1503 het 1503 ref 9 4 4 1 AT 2 1 29375 CASAVA_Build 5 128403685 5I AATAGGACTC -----/TTATA AGATTGTTGA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TTATA 0 1 29376 CASAVA_Build 5 128404334 1I GTATCCCTAA -/G GGGGGGAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 6 7 29377 CASAVA_Build 5 128416988 4I GGCTAAAGTT ----/AGAG AGATCTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 AG 1 3 29378 CASAVA_Build 5 128419102 1D GTGGAGGAAG T/- TATTTACGCT 3070 het 3070 ref 47 25 16 9 T 2 1 29379 CASAVA_Build 5 128446663 1I ACCAAAAGGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 8 9 29380 CASAVA_Build 5 128451269 1D CAAGTCTCTG C/- TTTCATAATG 3070 het 3070 ref 40 18 17 7 C 1 0 29381 CASAVA_Build 5 128454219 23D CCTTCAAGAA ATGAGGGAATGCTAGTCATTAAG/----------------------- AAAAGAGTAA 3070 het 3070 ref 49 38 18 2 ATGAGGGAATGCTAGTCATTAAG 1 0 29382 CASAVA_Build 5 128455303 1D TTTAAAGTTC T/- TTTTCTCTTA 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 5 4 29383 CASAVA_Build 5 128463704 3D GAGTGAAATA ACG/--- ATGCCCCAGG 3070 het 3070 hom 40 18 20 5 ACG 1 0 29384 CASAVA_Build 5 128463846 1I AATTTGCTAT -/G GGGCTGGGTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 3 4 29385 CASAVA_Build 5 128488901 1I AATGTTTATT -/G TTTTAAATGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 0 1 29386 CASAVA_Build 5 128492460 1D TCATACAGTG T/- TTATAAAGTG 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 T 3 2 29387 CASAVA_Build 5 128496125 1I TATAAATGGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 8 9 29388 CASAVA_Build 5 128501445 5D TTTTAAAACT TAAGA/----- TAGATAGTTT 3070 het 3070 ref 30 19 11 3 TAAGA 1 0 29389 CASAVA_Build 5 128507019 1D TTTTGTTTTT G/- TTTTTTCCTT 2506 het 2506 ref 33 22 7 5 G 1 0 29390 CASAVA_Build 5 128514977 3I ATGACCGGGT ---/CTC CTCCTGAATA 2145 het 2145 ref 23 12 6 5 CTC 1 2 29391 CASAVA_Build 5 128515048 1D TTTATTGGGG C/- ATTTAGCTCA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 C 1 0 29392 CASAVA_Build 5 128521261 1I TATGTCTCTA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 50 17 24 9 T 7 8 29393 CASAVA_Build 5 128521501 1D TAAAGGCATG A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 1 0 29394 CASAVA_Build 5 128523888 2I GTGATGACTC --/AT GTGTATTGAT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AT 0 1 29395 CASAVA_Build 5 128524103 4I GGTTTTGGTA ----/TCAG TCAGGATGAT 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 TCAG 1 2 29396 CASAVA_Build 5 128531347 1I AATATTCTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 9 10 29397 CASAVA_Build 5 128532236 1D TGCCCTGTTA C/- AGGGCTGTCT 3070 het 3070 ref 58 27 23 8 C 1 0 29398 CASAVA_Build 5 128532667 1I GGGTTTCTCT -/G GGGAGCCTGG 3070 hom 80 het 31 0 26 5 G 3 4 29399 CASAVA_Build 5 128553512 1D TGCTGAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 14 11 A 12 11 29400 CASAVA_Build 5 128575530 2D AACCTGATAA AC/-- ACAAGCAATG 2815 het 2815 ref 27 18 8 1 AC 2 1 29401 CASAVA_Build 5 128584152 1D GGCTCAGGTT A/- AAAAAAAAAT 1326 het 1326 ref 44 36 3 5 A 10 9 29402 CASAVA_Build 5 128592436 1D CTTTGAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 39 2 28 9 T 13 12 29403 CASAVA_Build 5 128601075 1D CCTCCCCCAG C/- CCCCCCATCC 2045 hom 21 het 8 0 8 0 C 7 6 29404 CASAVA_Build 5 128624745 2I CAATGTATCA --/TT CTTATACCTT 2837 het 2837 ref 26 17 8 1 T 0 2 29405 CASAVA_Build 5 128635311 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2288 hom 34 10 13 11 T 15 14 29406 CASAVA_Build 5 128642145 1D GTCTGAGGAC A/- AAAAAAAAAA 2137 het 1631 hom 27 9 10 8 A 15 14 29407 CASAVA_Build 5 128655456 10I GGTTATGGTC ----------/TAGTAACTAT TACTGTACTG 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 TAGTAACTAT 0 1 29408 CASAVA_Build 5 128675535 3I ATGTGAAGGA ---/CCT CTACAAGGAG 1870 het 1870 ref 16 9 4 3 CCT 0 1 29409 CASAVA_Build 5 128691070 1D CTAATGTTGA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 T 7 6 29410 CASAVA_Build 5 128691416 1I CAGCTACTCA -/G GTGGCTGAGA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 1 2 29411 CASAVA_Build 5 128691978 5I ACATTTTGAA -----/TTGTT TTGTTTTCAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 TTGTT 1 2 29412 CASAVA_Build 5 128702631 1D GAGGACAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2817 hom 41 11 15 15 T 15 14 29413 CASAVA_Build 5 128704252 3I GAAATTGTAT ---/AAG AAGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 AAG 1 2 29414 CASAVA_Build 5 128709009 1D AACTTATAAA C/- AGTGCTGACC 3070 het 3070 hom 49 16 29 4 C 1 0 29415 CASAVA_Build 5 128709574 2D CCTAATGAAT TC/-- TGAGTCAATT 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 TC 1 0 29416 CASAVA_Build 5 128712999 4I TGTAGCTATT ----/AAAC AGTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 AAAC 0 1 29417 CASAVA_Build 5 128713496 3D TGGAAAGTTT CTA/--- CTATTTCCTC 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 CTA 2 1 29418 CASAVA_Build 5 128715816 4D ATGAACTAGT AAGC/---- AAGAAAAGTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 4 AAGC 1 0 29419 CASAVA_Build 5 128716085 1D AAGACTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 29 3 14 12 A 15 14 29420 CASAVA_Build 5 128716882 2D GTATTGGCAT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 36 hom 28 2 11 15 A 10 8 29421 CASAVA_Build 5 128718607 1D ATAGCTATAC A/- AAAAAATGGC 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 A 7 6 29422 CASAVA_Build 5 128720344 1D GCATATCACG T/- TAATTCCTGT 3070 het 3070 hom 46 14 24 8 T 2 1 29423 CASAVA_Build 5 128721944 1I AAGACTGAGA -/C CTAATCAGGA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 C 1 2 29424 CASAVA_Build 5 128722717 3I AGCTAAGAGT ---/ATC ATCATCATCA 3070 het 3070 hom 60 21 21 18 ATC 4 5 29425 CASAVA_Build 5 128726080 1D AAACTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 11 10 29426 CASAVA_Build 5 128733596 1D AAGATTGACC A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 A 8 7 29427 CASAVA_Build 5 128733750 5I AAAATTGCTC -----/AAGAA AAGAAACAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAGAA 1 2 29428 CASAVA_Build 5 128736906 1D TTTCATTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 11 10 29429 CASAVA_Build 5 128737712 1D28M2D TCTCCAAAAG AAAAAAAAAAAGGACTACTTTCTCACACCCT/-AAAAAAAAAAGGACTACTTTCTCACACC-- GTCAAAGGCT 3070 het 3070 ref 35 23 12 15 N/A 0 0 29430 CASAVA_Build 5 128742467 2I TGAATGTCTC --/TT ATCCATTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 0 2 29431 CASAVA_Build 5 128744874 1D TCAAAATGTA T/- TTTAGCATTA 3070 het 3070 ref 62 30 26 6 T 4 3 29432 CASAVA_Build 5 128751366 1I TTGTAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 8 9 29433 CASAVA_Build 5 128754455 1I TCATGCAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 11 12 29434 CASAVA_Build 5 128758886 4D TCAGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 11 AAAT 3 2 29435 CASAVA_Build 5 128765513 4D ACATTTTAAC AATT/---- AAACAGTAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AATT 1 0 29436 CASAVA_Build 5 128767246 1D GAAAAAAATA T/- TTTTAGGTGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 5 4 29437 CASAVA_Build 5 128767844 1I TCTGTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 644 hom 32 2 22 8 T 10 11 29438 CASAVA_Build 5 128769494 1D ACCCGCATAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 9 8 29439 CASAVA_Build 5 128774931 1D ATATAACCTA C/- AGTCAGTGAT 3070 het 3070 hom 44 13 26 5 C 1 0 29440 CASAVA_Build 5 128776500 1I CAGAAACAGT -/A AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 A 6 7 29441 CASAVA_Build 5 128781654 1D AATCAATGTA T/- GTAATTCACC 3070 het 3070 ref 37 18 11 9 T 1 0 29442 CASAVA_Build 5 128784951 3I GTCTACAAAC ---/ATG ATTAGCAAAA 1931 het 1931 ref 21 8 4 9 ATG 0 1 29443 CASAVA_Build 5 128786761 1I AAAAAAAGCA -/C CCCCCCCTTT 3070 het 3070 hom 47 14 25 8 C 7 8 29444 CASAVA_Build 5 128787991 4D TTCCTATTGC CTCT/---- CTTTCATAGT 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 CT 3 1 29445 CASAVA_Build 5 128791952 1D TAGTTTTTTT A/- ATGTATTGAG 3070 het 3070 ref 39 22 13 6 A 2 1 29446 CASAVA_Build 5 128826927 1I TATAAGTAGG -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 6 7 29447 CASAVA_Build 5 128828976 1D ACCTGGCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 320 hom 25 3 14 8 T 10 9 29448 CASAVA_Build 5 128829933 2I AAATAATATT --/AA AAGAGTCTCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 2 4 29449 CASAVA_Build 5 128834463 1I TCTAAATATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 9 10 29450 CASAVA_Build 5 128856991 28I TTTGGCTACT ----------------------------/AAGATCTTAGTGTTTGCCTCTTTGCAAA ACAGGTGTGC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 AAGATCTTAGTGTTTGCCTCTTTGCAAA 0 1 29451 CASAVA_Build 5 128869755 1D AGAAAACCTC A/- AGATTTCCTA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 A 2 1 29452 CASAVA_Build 5 128872926 4I CTAGCTTTAC ----/TTAT TTATTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 TTAT 1 2 29453 CASAVA_Build 5 128877745 1I ATATTTCATT -/G TGTATAAGTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 29454 CASAVA_Build 5 128880353 1D GTTTTATTGA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 7 29455 CASAVA_Build 5 128885921 28D ACACACACAC ACACATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 554 hom 15 het 8 0 5 6 ACACATATATATATATATATATATATAT 1 0 29456 CASAVA_Build 5 128890389 4D TGTATGCATG TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 43 19 16 8 TATT 5 4 29457 CASAVA_Build 5 128894661 11D ACTTAAGAAG AATTTTAGTAA/----------- AATATGTGTA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AATTTTAGTAA 1 0 29458 CASAVA_Build 5 128895792 1I AAAAGATGTT -/C ACACCTTTTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 0 1 29459 CASAVA_Build 5 128904765 5D AATAACTAGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1348 hom 30 6 13 12 T 15 10 29460 CASAVA_Build 5 128914306 1I ATTTTAAGTC -/A TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 0 1 29461 CASAVA_Build 5 128915152 1D CAATACCAGA T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 10 T 7 6 29462 CASAVA_Build 5 128921666 10I AACTCTTGGC ----------/AAAGTAGGGA AAAGTAGGAA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 AAAGTAGGGA 0 1 29463 CASAVA_Build 5 128922518 4D TTTGATGTAG AGAC/---- AGACAGATTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 AGAC 2 1 29464 CASAVA_Build 5 128930567 4I CTGAAAGCAG ----/GACT GAAATGAGAA 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 GACT 0 1 29465 CASAVA_Build 5 128931955 1D AGTAATACAT G/- GGGGGGGATA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 8 7 29466 CASAVA_Build 5 128933916 5D GTTTGACAGT TTAGA/----- TTAAATGGAC 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 TTAGA 1 0 29467 CASAVA_Build 5 128934229 1D AAAATTAAAA G/- AAAAAACGTA 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 G 1 0 29468 CASAVA_Build 5 128950658 4I TATTTTAAAT ----/TAAC TAATCCAGGA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 TAAC 0 1 29469 CASAVA_Build 5 128967800 1D ATGGCACACG T/- TTTACCTATG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 4 3 29470 CASAVA_Build 5 128983050 1D CAACATAATG T/- TTGGGAAACT 3070 het 3070 hom 55 21 29 5 T 3 2 29471 CASAVA_Build 5 128987454 5D GGCTCACACC TGTAA/----- TCCCAGCACT 2968 het 1981 hom 16 6 9 1 TGTAA 1 0 29472 CASAVA_Build 5 128991492 1I TCAAAGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 7 8 A 10 11 29473 CASAVA_Build 5 128994914 1D TTGACAGAAT G/- CATTTCCACA 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 G 1 0 29474 CASAVA_Build 5 128995953 2D ATATATATAG AT/-- ATAGATATAA 374 het 374 ref 33 29 1 3 AT 2 1 29475 CASAVA_Build 5 128996600 2I TCCTGAGAAT --/AC AGTTACACAC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 AC 0 1 29476 CASAVA_Build 5 128996805 7D TCTAAAGTGA AAGTTTC/------- AATTTACTTT 3070 het 3070 hom 32 12 19 4 AAGTTTC 1 0 29477 CASAVA_Build 5 129006443 1I TGAAGCTATT -/C AACTTCTAGA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 C 0 1 29478 CASAVA_Build 5 129007613 1I TTATTTTTAT -/A ATCTGGCACC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 1 2 29479 CASAVA_Build 5 129015546 3D CTGTGACAGT TAA/--- TAATGTCAAG 3070 het 3070 ref 34 15 17 3 TAA 2 1 29480 CASAVA_Build 5 129027691 1D TTTAACAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 10 9 29481 CASAVA_Build 5 129035499 1I ACTTCTCACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 9 10 29482 CASAVA_Build 5 129036402 4D GTCCAAATCT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 20 14 8 AC 11 9 29483 CASAVA_Build 5 129037824 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 13 7 A 13 11 29484 CASAVA_Build 5 129042465 1D TTATTGGCTT A/- AGTTATCAAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 A 2 1 29485 CASAVA_Build 5 129048581 1D TCCATTTCAG A/- AAAAAAAAGA 2990 het 1657 hom 21 7 10 4 A 9 8 29486 CASAVA_Build 5 129053713 2D ACCATGCATC CA/-- CTATTGCTAG 3070 het 3070 ref 45 28 16 2 CA 1 0 29487 CASAVA_Build 5 129063015 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 18 2 14 2 A 18 17 29488 CASAVA_Build 5 129064495 1D GTGTTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 1288 het 1288 ref 44 38 3 3 A 11 10 29489 CASAVA_Build 5 129073250 4I AACAACTCAT ----/AACA AACAAGTGCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AACA 1 2 29490 CASAVA_Build 5 129077414 7D CCTGAGCTGG GGGTTCT/------- GGCCTTGAGA 3070 hom 66 het 27 0 22 6 GGGTTCT 1 0 29491 CASAVA_Build 5 129083184 1I TTACTTCAAA -/T TTATAACTTA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 2 3 29492 CASAVA_Build 5 129098872 1I TCAGGTGGGT -/A AAAAAAGTCC 3070 het 3070 hom 46 16 26 4 A 6 7 29493 CASAVA_Build 5 129108554 1D GAGAATAAAA G/- GGGAAAATGT 3070 het 3070 hom 43 17 17 10 G 4 3 29494 CASAVA_Build 5 129116143 2I GGAGGGGAAC --/AT ATCACACATC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 AT 1 2 29495 CASAVA_Build 5 129116371 1D AATGTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 T 12 11 29496 CASAVA_Build 5 129117395 4I GAGACAGAGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 AAGG 4 5 29497 CASAVA_Build 5 129119118 1I GGTTTGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2538 hom 24 7 10 7 T 10 11 29498 CASAVA_Build 5 129122579 1I TAAGTATGTG -/A AAAAATGCAT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 5 6 29499 CASAVA_Build 5 129123418 4D AGCTATCTAA CAGT/---- CAGTCTTTAC 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 CAGT 2 1 29500 CASAVA_Build 5 129128719 1D ACATTTGAAA C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 C 8 7 29501 CASAVA_Build 5 129131535 1D AGGATTAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2349 hom 24 8 15 1 T 10 9 29502 CASAVA_Build 5 129149106 1D CTCATGTCAA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 C 9 8 29503 CASAVA_Build 5 129154471 1D CAAAATGAAA G/- AAAAATACAG 3070 hom 57 het 21 0 20 2 G 1 0 29504 CASAVA_Build 5 129156571 1I TCATAAAGTC -/T TTGTCTAAGC 3070 het 191 hom 33 1 27 5 T 2 3 29505 CASAVA_Build 5 129176185 1I TCTATGGCCA -/G GGCGGCCCAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 2 3 29506 CASAVA_Build 5 129184178 2D TCAGCAACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 45 0 35 10 A 15 13 29507 CASAVA_Build 5 129185833 1I GCTCTGGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 44 5 27 12 T 13 14 29508 CASAVA_Build 5 129193336 1D GAGACTATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 10 9 29509 CASAVA_Build 5 129194276 1I AAATACAGTC -/T TTTTTTCACA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 6 7 29510 CASAVA_Build 5 129195524 1I TTGCGCTGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 9 10 29511 CASAVA_Build 5 129198661 2D TGTTATGTCT CA/-- CAGAAATTAG 3070 hom 84 het 37 0 29 8 CA 2 1 29512 CASAVA_Build 5 129198821 1I GAATTAGATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 31 1 25 5 T 9 10 29513 CASAVA_Build 5 129204296 18D TTTCTAGGTC GAAACTGGAAACCTTTAT/------------------ TTCTCTTGTG 3070 hom 111 het 38 0 38 5 GAAACTGGAAACCTTTAT 1 0 29514 CASAVA_Build 5 129218949 2D GTGGGCTCAC AT/-- GTCTCCCTCA 3070 hom 148 het 55 0 50 6 AT 1 0 29515 CASAVA_Build 5 129224331 1I TTGATGCATG -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 156 het 59 0 52 7 T 6 7 29516 CASAVA_Build 5 129246937 7I CTTCAAGTAT -------/CATCAAG TTGCTCATAT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 CATCAAG 0 1 29517 CASAVA_Build 5 129263174 1I TTGGCAATAT -/C AAAAATATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 29518 CASAVA_Build 5 129265973 1D AGTTGATGAA T/- TGGGTTATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 2 1 29519 CASAVA_Build 5 129269548 1D CTAAACCAAA G/- GCCATTCCCA 3070 hom 83 het 35 0 27 8 G 2 1 29520 CASAVA_Build 5 129270483 7D TTTTGGCACA AGGAATT/------- AGTGTAATCA 3070 hom 105 het 38 0 36 5 AGGAATT 1 0 29521 CASAVA_Build 5 129274572 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 25 1 15 10 T 17 16 29522 CASAVA_Build 5 129282401 1I ATTCTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 1201 het 228 hom 15 2 8 5 A 15 16 29523 CASAVA_Build 5 129289484 2D TGTGTATATA TG/-- TGTGTGTGCA 3070 hom 114 het 44 0 39 7 TG 5 4 29524 CASAVA_Build 5 129297088 4D TATTTAAAAT ACTA/---- AATAAAGAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ACTA 1 0 29525 CASAVA_Build 5 129309112 1I TGACTTTATA -/C TATCAAGTCC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 C 0 1 29526 CASAVA_Build 5 129320965 2I GAGCCGAGAC --/TA TGGGGTTTTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TA 0 1 29527 CASAVA_Build 5 129341461 1D TATAAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 19 7 A 15 14 29528 CASAVA_Build 5 129344817 1I CGTCTCAAAC -/A AAAAAAAAAA 2929 hom 21 het 11 0 8 3 A 10 11 29529 CASAVA_Build 5 129360714 1I CAAAGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 A 15 16 29530 CASAVA_Build 5 129361111 1I CACTCTTTTT -/C TTTTAATACT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 0 1 29531 CASAVA_Build 5 129361835 1D GCTCACTGTT A/- ATAACACTTC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 2 1 29532 CASAVA_Build 5 129369023 1D ACGAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 23 1 18 5 A 11 10 29533 CASAVA_Build 5 129372630 2I TGTGAAAAAC --/AT ATTTGAGGTT 3070 hom 101 het 38 0 34 4 AT 1 2 29534 CASAVA_Build 5 129374534 1I ATTAAAACCC -/T GAAAAGACCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 0 1 29535 CASAVA_Build 5 129380122 1I TACTGCCTCA -/G GCCTCCCAAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 1 2 29536 CASAVA_Build 5 129382741 1D TAGAAAAAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 9 8 29537 CASAVA_Build 5 129384212 1I ATCTGAATCA -/C CCTGAGATGC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 2 3 29538 CASAVA_Build 5 129388727 1I CCTTTATGGA -/T TTAGTGTTAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 3 29539 CASAVA_Build 5 129397368 1D TATTTGCTTT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 8 7 29540 CASAVA_Build 5 129397794 4I AGCAGTTAAG ----/TTTT TTTTTCTTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 5 9 29541 CASAVA_Build 5 129407349 3I CCTGACGTGT ---/GCA GCATATGTTT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 GCA 1 2 29542 CASAVA_Build 5 129413363 1I TCTCCCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 293 hom 36 1 27 8 T 13 14 29543 CASAVA_Build 5 129425518 2D GGATGCAGAG AA/-- AAGAGAACAC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 4 2 29544 CASAVA_Build 5 129445879 1I TTTGATTTAT -/A AAAGTAATAA 3070 het 3070 hom 33 8 18 7 A 3 4 29545 CASAVA_Build 5 129460236 1D TTTGCTTTGA T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 7 6 29546 CASAVA_Build 5 129474868 1D TTTTTAACCA T/- ATTGCTAGAA 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 1 0 29547 CASAVA_Build 5 129521351 20I AAAGAAATAA --------------------/AAGAATGGCTACTCCATAGG CTGAGCAGTG 3070 hom 90 het 27 0 31 0 AAGAATGGCTACTCCATAGG 0 1 29548 CASAVA_Build 5 129540781 2I ATATATATGA --/AT ATATATATAT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 AT 7 8 29549 CASAVA_Build 5 129543322 1D TTTCATCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 37 1 27 9 T 12 11 29550 CASAVA_Build 5 129545589 2I TGTATGTATG --/TA TATATATATA 3070 het 649 hom 27 2 23 2 TA 6 7 29551 CASAVA_Build 5 129551767 3D CTTCATATAA TCT/--- TCTTCAGGCA 3070 hom 165 het 58 0 55 4 TCT 2 1 29552 CASAVA_Build 5 129552532 1D TTCAGCAAGG A/- AAAAAACTTT 3070 hom 124 het 47 0 41 6 A 7 6 29553 CASAVA_Build 5 129554198 4D TCCAACAGAT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 43 1 27 16 A 17 13 29554 CASAVA_Build 5 129557077 4D CTCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 63 het 27 0 22 7 AAAC 3 2 29555 CASAVA_Build 5 129557878 1I TAAACATTGA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 7 8 29556 CASAVA_Build 5 129560009 3I TAGTTACACA ---/GTT GTTTTTTAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GTT 1 2 29557 CASAVA_Build 5 129567602 10I AAGCATGGAA ----------/AGACCCACCC TTATAATTCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AGACCCACCC 0 1 29558 CASAVA_Build 5 129626176 1D TATTCAGTGG A/- AAAAAATTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 7 6 29559 CASAVA_Build 5 129627891 1D ACGTATTTTT A/- TTATTATTAT 1403 hom 7 het 5 0 3 2 A 1 0 29560 CASAVA_Build 5 129648349 3I TAACAGTTGG ---/TTT TTCTCTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 2 5 29561 CASAVA_Build 5 129654641 1I GCAGGAGAAT -/G GCATGAACCC 2087 hom 15 het 7 0 6 1 G 1 2 29562 CASAVA_Build 5 129654900 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 2499 hom 15 het 6 0 6 0 A 6 7 29563 CASAVA_Build 5 129655358 1D TGTGATTATT A/- AACATTTTAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 2 29564 CASAVA_Build 5 129655429 1D CCCAGATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1927 hom 31 6 23 2 A 13 12 29565 CASAVA_Build 5 129655994 1I ATACAGAATG -/A AAAAAATATT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 6 7 29566 CASAVA_Build 5 129657454 1I TAATAAAGCT -/G GGGGGAATGT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 5 6 29567 CASAVA_Build 5 129660856 1D AAATCATGAC T/- TTATTTGTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 T 3 2 29568 CASAVA_Build 5 129666482 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 T 0 1 29569 CASAVA_Build 5 129667699 1I ATATTTTTAC -/T TTTTAATCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 5 29570 CASAVA_Build 5 129710527 2D TCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1315 het 1315 ref 33 15 5 13 T 17 15 29571 CASAVA_Build 5 129742341 1D AGGATAAGAA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 T 7 6 29572 CASAVA_Build 5 129771524 1D TTTTAAAATG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 T 8 7 29573 CASAVA_Build 5 129805770 1D CTTGAAGCAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2544 hom 29 6 16 7 A 9 8 29574 CASAVA_Build 5 129856550 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2045 het 720 hom 13 4 5 4 A 15 14 29575 CASAVA_Build 5 129867005 1I CCATTCTGCT -/A CAAGTACATG 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 A 0 1 29576 CASAVA_Build 5 129867941 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1688 het 1622 hom 15 6 8 1 A 15 16 29577 CASAVA_Build 5 129884147 1D AATATCGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 13 12 29578 CASAVA_Build 5 129934727 1I CAGAAAATTC -/A TCTTCCAGGG 3070 het 3070 hom 53 17 30 6 A 0 1 29579 CASAVA_Build 5 129970863 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 23 6 14 3 A 11 12 29580 CASAVA_Build 5 129981832 2D AGGGCATGTG TC/-- TTTTTGGTAG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TC 1 0 29581 CASAVA_Build 5 130008568 1D AAGAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 10 9 A 12 11 29582 CASAVA_Build 5 130014567 3D TATTTAAATA CAG/--- CATATCATTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 CAG 1 0 29583 CASAVA_Build 5 130032786 1I ATGTCTTGTT -/G GTGCACATTC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 G 1 2 29584 CASAVA_Build 5 130037146 1D TAAAAACAAA T/- GATTAAGTGG 1911 het 1911 ref 24 15 5 4 T 1 0 29585 CASAVA_Build 5 130042514 20D GGAGGGAGGA AGGGAGGGAGAGAAAAAGGG/-------------------- AGGGAGGGAG 1986 het 1986 ref 28 16 8 11 AGGGAGGGAGAGAAAAAGGG 1 0 29586 CASAVA_Build 5 130052624 1I CAATCTTTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 A 8 9 29587 CASAVA_Build 5 130055072 4I AGATATTCTC ----/AAAT AAGAGAAATT 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 AAAT 0 1 29588 CASAVA_Build 5 130072557 1I AAGAATTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 A 11 12 29589 CASAVA_Build 5 130073535 1I AATCCCCCTT -/G ATAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 60 33 19 8 G 0 1 29590 CASAVA_Build 5 130075037 1I ACCTGGATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 T 9 10 29591 CASAVA_Build 5 130080723 1D TTTATGTTTC T/- GCATAGTTAG 3070 het 3070 hom 29 11 17 2 T 1 0 29592 CASAVA_Build 5 130083003 2D TAATGAAATC AT/-- GTCTTTTGCA 3070 het 3070 ref 42 22 18 5 AT 1 0 29593 CASAVA_Build 5 130121950 4D AGGTGACAGG TTGA/---- TTGATGGGTG 3070 het 2830 hom 16 6 10 3 TTGA 2 1 29594 CASAVA_Build 5 130128531 1D AGTGCTGCAA C/- AAACATAGGA 3070 het 3070 ref 46 26 16 5 C 1 0 29595 CASAVA_Build 5 130130165 1I TAATTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 11 12 29596 CASAVA_Build 5 130132203 1I AGAGATTTTT -/G TTCTATTCCT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 G 0 1 29597 CASAVA_Build 5 130171219 1D AATTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 2772 het 2244 hom 22 8 9 5 T 13 12 29598 CASAVA_Build 5 130177516 1D ACTCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2826 hom 29 9 8 12 T 19 18 29599 CASAVA_Build 5 130201032 1D AAGTGTCCCA T/- CCCACAAAGA 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 T 1 0 29600 CASAVA_Build 5 130286923 1D GCTCCCAACG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 101 het 38 0 32 8 A 9 8 29601 CASAVA_Build 5 130354060 1D AGTTTTTGGT G/- GAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 2 1 29602 CASAVA_Build 5 130360175 2D AACATCCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 41 2 24 15 A 17 15 29603 CASAVA_Build 5 130361718 1D TGGTATTATG T/- TAAAGCAGGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 29604 CASAVA_Build 5 130367123 1D AGCTGTTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 10 9 29605 CASAVA_Build 5 130368173 2I ACAGACAACC --/CA CAGAGTGGGA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 CA 1 2 29606 CASAVA_Build 5 130373262 1I GCTGAAGAGA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 8 29607 CASAVA_Build 5 130373380 3D AACCAAAAAA GAG/--- GAGGAGTATC 3070 hom 81 het 32 0 27 6 GAG 3 2 29608 CASAVA_Build 5 130377718 8I AGAAAGGAAA --------/AGACTAAT AAATTCTACT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 AGACTAAT 0 1 29609 CASAVA_Build 5 130380894 1I ATTCAAAGAA -/T TTTTTTAATT 3070 het 203 hom 43 1 39 3 T 6 7 29610 CASAVA_Build 5 130384025 1I ATTTGGGGTG -/T TTTCCTGGGT 3070 hom 83 het 34 0 27 7 T 3 4 29611 CASAVA_Build 5 130386236 4I CAATTACGAT ----/GAGA GAGATACACG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 GA 2 4 29612 CASAVA_Build 5 130390871 1I TTCCTGGTAT -/A AAAAAAGATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 6 7 29613 CASAVA_Build 5 130406458 1I ACTCAATAAT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 29614 CASAVA_Build 5 130410646 1D TCAATTACCT C/- CCCCCCCCGG 1974 het 573 hom 12 3 5 4 C 9 8 29615 CASAVA_Build 5 130416490 1I CTCAAACAAA -/T TTTTTCGAAA 2539 het 2539 ref 32 20 7 5 T 5 6 29616 CASAVA_Build 5 130416804 1D ATTCTGAAAT C/- TCCTCTTTCA 3070 het 2429 hom 15 6 7 2 C 1 0 29617 CASAVA_Build 5 130426326 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAATAA 2438 het 2438 ref 17 9 5 3 A 8 7 29618 CASAVA_Build 5 130440372 2D GGGTCCTCCA AC/-- CACATGGGTA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 AC 1 0 29619 CASAVA_Build 5 130442406 1D GGTAAGTAAT A/- AGATAAAGGA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 2 1 29620 CASAVA_Build 5 130445450 1I CTTCCTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 10 11 29621 CASAVA_Build 5 130446311 1D CTTTCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1552 het 1552 ref 24 17 4 4 T 11 10 29622 CASAVA_Build 5 130457749 1I AGCCTTAAAC -/T TTTTTTAATG 1759 het 1759 ref 22 15 5 2 T 6 7 29623 CASAVA_Build 5 130462103 4D8M5D AAAAAGATAC AGTTACCTATCAGCTGC/----CCCAAATA----- AGCCATACCC 3070 het 3070 hom 38 21 18 6 N/A 0 0 29624 CASAVA_Build 5 130464023 1D TACTATAAAT C/- CTCCAAAGAG 3070 het 3070 hom 59 25 28 6 C 2 1 29625 CASAVA_Build 5 130464572 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 13 15 29626 CASAVA_Build 5 130465445 7I AAGATGTTTT -------/TAAATAG TCTCAGATCT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 TAAATAG 0 1 29627 CASAVA_Build 5 130466684 7D TATGATATAT ATATCAG/------- ATATATATCA 2991 het 2991 ref 17 9 7 2 ATATCAG 1 0 29628 CASAVA_Build 5 130470589 1D TTCTCATCAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 A 10 9 29629 CASAVA_Build 5 130471071 3D TCACCATTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 21 25 8 A 13 10 29630 CASAVA_Build 5 130472827 1D AAATGCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1227 hom 21 5 10 6 T 12 11 29631 CASAVA_Build 5 130509192 1I AAAATAGTTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 8 9 29632 CASAVA_Build 5 130538755 3I ATGACAAATT ---/ATC ATTGGCTTCA 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 ATC 0 1 29633 CASAVA_Build 5 130540113 1I CATTTATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 13 14 29634 CASAVA_Build 5 130546716 1I CCAGATGTTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 8 9 29635 CASAVA_Build 5 130563634 2D TCAAAAAAAT CA/-- CAGTGTATGC 3070 het 3070 ref 42 24 17 2 CA 2 1 29636 CASAVA_Build 5 130582220 1I TGACTAATAC -/A GTAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 0 1 29637 CASAVA_Build 5 130584894 1D TTTTTTGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 T 12 11 29638 CASAVA_Build 5 130601624 1I TCTTTGTGAA -/C CCACTATCAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 2 3 29639 CASAVA_Build 5 130601698 1I19M1I9M1I TTTTTCATCC -TTTCCCACTGCATGATGCA-TCTAAATAA-/TTTTCCCACTGCATGATGCATTCTAAATAAT ATTCTCGGGG 3070 hom 60 het 20 0 21 3 N/A 0 0 29640 CASAVA_Build 5 130605467 1I TCCTCTTTCT -/A TTAATCTCTG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 0 1 29641 CASAVA_Build 5 130618289 3I AGAAAGAAAA ---/AAG AAGCTTATGT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 AAG 1 2 29642 CASAVA_Build 5 130639249 5D ACTTCATTAT TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 hom 69 het 33 0 23 12 TTTTC 5 4 29643 CASAVA_Build 5 130640321 1D ACCATTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 845 hom 31 2 17 12 T 17 16 29644 CASAVA_Build 5 130642102 3I AGCTCCATGT ---/TCA GTGACATCAT 3070 hom 120 het 42 0 37 5 TCA 0 1 29645 CASAVA_Build 5 130656152 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2765 hom 37 het 17 0 11 6 A 16 14 29646 CASAVA_Build 5 130658719 1I ACTAAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 12 13 29647 CASAVA_Build 5 130660750 2D CTTTATATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 37 1 23 13 T 16 14 29648 CASAVA_Build 5 130662213 1D TAGTTCTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 8 7 29649 CASAVA_Build 5 130668710 2D AATTATACAG TA/-- TATACTCTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TA 3 2 29650 CASAVA_Build 5 130748275 2D TCAGGAAATA TC/-- TCTAAGGGGT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 TC 2 1 29651 CASAVA_Build 5 130845869 2I CGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 46 0 35 11 TG 6 7 29652 CASAVA_Build 5 130858373 9I GATCAGATAT ---------/AATGAAATA ATTAAGTCCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AATGAAATA 0 1 29653 CASAVA_Build 5 130864499 4D6M1D GAACTGAATG AAGAAATGAAT/----AATGAA- GAAATGAAAA 1442 het 676 hom 39 4 10 27 N/A 0 0 29654 CASAVA_Build 5 130870777 4I ATATTATATA ----/TATT TATAGTATGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TATT 0 1 29655 CASAVA_Build 5 130875961 3I TACATTTTTT ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 TTC 2 3 29656 CASAVA_Build 5 130878014 1I TAGGTAAGAA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 8 29657 CASAVA_Build 5 130888924 1I GCAATAACAC -/T GCAAATAAGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 1 29658 CASAVA_Build 5 130889255 1D TTTAGATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 466 hom 44 2 37 5 A 11 10 29659 CASAVA_Build 5 130895550 1I TATTTAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 A 9 10 29660 CASAVA_Build 5 130901522 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 109 het 42 0 37 5 A 9 8 29661 CASAVA_Build 5 130905571 5I ACACATTCTA -----/TACAG TAAAGTGACT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TACAG 0 1 29662 CASAVA_Build 5 130918966 1I54M2I AGGAAACACA -TTTTTTTTCTTAAGGTGAAATAATTTGGTAAATACTTTTAAGAAAAAAATAGTC--/TTTTTTTTTCTTAAGGTGAAATAATTTGGTAAATATTTTTAAGAAAAAAATAGTCAT GTGTCAATGC 3070 het 28 hom 23 1 34 3 N/A 0 0 29663 CASAVA_Build 5 130919351 4D TGTTATGTTA AATT/---- AATTATAATT 3070 hom 108 het 39 0 37 5 AATT 2 1 29664 CASAVA_Build 5 130920843 1I CTGATTTAAA -/G AAGATCTAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 0 1 29665 CASAVA_Build 5 130923259 3D CAAAAACAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 75 het 32 0 25 8 AAC 7 6 29666 CASAVA_Build 5 130931929 1D ATTTTTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 12 11 29667 CASAVA_Build 5 130934533 2D ATCCCCAACT AC/-- TTTTTTTTTT 1160 het 1160 ref 26 15 5 6 AC 1 0 29668 CASAVA_Build 5 130956821 1D CCCTTTTTCC A/- AATCAATATA 3070 hom 85 het 38 0 28 10 A 3 2 29669 CASAVA_Build 5 130958502 4I ATTTTGGAAG ----/TAAC TAACTTGTTT 3070 hom 95 het 34 0 30 4 TAAC 1 2 29670 CASAVA_Build 5 130958888 1I GTCTCCTGCT -/C CACCGTGGTA 3070 hom 132 het 48 0 42 6 C 1 2 29671 CASAVA_Build 5 130959437 4I ACTGTTAAAG ----/ACAA ACATAGATTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACAA 0 1 29672 CASAVA_Build 5 130959827 5D GTAGCCATGC TTACT/----- TTAAGTCAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 4 TTACT 1 0 29673 CASAVA_Build 5 131001240 1I CACTTTTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 884 hom 34 4 20 10 A 17 18 29674 CASAVA_Build 5 131002482 1I ATGTATTTAA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 8 9 29675 CASAVA_Build 5 131019345 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2279 het 366 hom 18 1 13 4 A 16 17 29676 CASAVA_Build 5 131033510 1I ACAATGAGTC -/A AAAAAAAAAA 2357 het 456 hom 33 3 17 13 A 16 17 29677 CASAVA_Build 5 131042219 1I TAGCCAGGAT -/G GTCTCGATCT 3070 het 42 hom 13 1 11 1 G 1 2 29678 CASAVA_Build 5 131045256 1I TGCTGAAATG -/A AAAAAAGCAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 6 7 29679 CASAVA_Build 5 131052745 1I GAAACTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 27 1 22 4 A 11 12 29680 CASAVA_Build 5 131077182 3D CTAACTAGCT AAC/--- AACAATGGAT 3070 hom 105 het 46 0 36 14 AAC 2 1 29681 CASAVA_Build 5 131112289 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2142 hom 5 het 10 0 8 2 A 12 13 29682 CASAVA_Build 5 131117769 1I AATATTTCTC -/T TGTCACATTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 29683 CASAVA_Build 5 131136013 3D AATTCAAACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 34 1 27 7 A 17 14 29684 CASAVA_Build 5 131139056 4I AATATGTATC ----/AACT ATCTAATAAT 1974 hom 10 het 5 0 4 1 AACT 0 1 29685 CASAVA_Build 5 131147046 1I AAAACAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 12 13 29686 CASAVA_Build 5 131149143 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 49 het 21 0 17 4 A 10 9 29687 CASAVA_Build 5 131155471 1D TTATGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 11 10 29688 CASAVA_Build 5 131156450 1I TCAAAAATCC -/A AAAAAATTCC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 6 7 29689 CASAVA_Build 5 131163209 2D AAAAGTAAAC AG/-- AAGTGTAGAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AG 1 0 29690 CASAVA_Build 5 131178716 3I ACCCATTGTC ---/ATG ATATTCCATA 3070 hom 135 het 55 0 46 9 ATG 0 1 29691 CASAVA_Build 5 131202167 1I CAGGAAGGTG -/T TATGTGGAGG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 2 29692 CASAVA_Build 5 131209205 1I CAAAAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 854 hom 26 2 22 2 A 10 11 29693 CASAVA_Build 5 131210486 9I AAGGGGTGAA ---------/GGCAGAGAT GTAAAGGGGC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GGCAGAGAT 0 1 29694 CASAVA_Build 5 131213650 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 9 10 29695 CASAVA_Build 5 131216467 1D TTTTGCCACG A/- AAAAAATCAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 7 6 29696 CASAVA_Build 5 131223940 1I GCCTTCTTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 49 het 22 0 17 5 T 8 9 29697 CASAVA_Build 5 131224211 1I TAATTTTTTT -/A TTTTATTTTT 2549 hom 18 het 7 0 6 1 A 0 1 29698 CASAVA_Build 5 131233735 1D TTATTATGCA T/- TTGTGTGCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 3 2 29699 CASAVA_Build 5 131243997 1D GCCCGGCCTA T/- TTTTTTTTTT 1405 hom 12 het 7 0 5 2 T 15 14 29700 CASAVA_Build 5 131294154 1I ACCTGTCCTC -/A AAGCTCACTA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 2 3 29701 CASAVA_Build 5 131303176 4D TATAAAATCC TTAA/---- TTAATTTTTC 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 TTAA 2 1 29702 CASAVA_Build 5 131350581 1D ACTCACACAC A/- CACACACACA 927 het 927 ref 28 8 4 17 A 1 0 29703 CASAVA_Build 5 131351063 3D GGGAGGCAGG AGA/--- AGGAGGGCCT 3070 hom 88 het 35 0 29 7 AGA 1 0 29704 CASAVA_Build 5 131355412 1I AGGTCTAAGG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 8 29705 CASAVA_Build 5 131379905 1I GATTCGTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 12 het 41 1 33 7 A 9 10 29706 CASAVA_Build 5 131425361 1D TCCCCACCCA T/- TTTTTTTTTT 1182 het 1182 ref 24 8 5 11 T 17 16 29707 CASAVA_Build 5 131466581 1I TCTCTGGTAT -/A GGGGTGCTGT 3070 het 3070 ref 53 27 18 8 A 0 1 29708 CASAVA_Build 5 131533040 4I AACCTTGTTA ----/GTTT GTTTGGTGGG 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 GTTT 1 2 29709 CASAVA_Build 5 131545472 4I CCCTGGTGGG ----/CTGT CTGATTGAAA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 CTGT 0 1 29710 CASAVA_Build 5 131581328 1I TAAGGATGGT -/A TGGGGACTTA 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 A 0 1 29711 CASAVA_Build 5 131588308 1I AGCAAAAGGC -/G GGGGGATTGG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 G 5 6 29712 CASAVA_Build 5 131593861 1D AATTTTTCCC T/- CCCTGATTAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 1 0 29713 CASAVA_Build 5 131605749 9I CCCACCTGCC ---------/CTGCTTTCT CTGTATGAGA 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 CTGCTTTCT 0 1 29714 CASAVA_Build 5 131610272 14D CAAACTCTTA ACAATGAAGTATTC/-------------- ACAATTCCTA 3070 het 3070 hom 39 18 21 2 ACAATGAAGTATTC 1 0 29715 CASAVA_Build 5 131615905 2I AGCTGCTATT --/AA AAAAAAAAAA 2265 het 441 hom 21 6 10 5 A 14 16 29716 CASAVA_Build 5 131619962 1D AGACACCGCA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 2000 hom 37 8 16 13 C 9 8 29717 CASAVA_Build 5 131623542 4D GAGCACCACC TTAT/---- TTATGCCCAG 3070 het 3070 ref 39 16 16 10 TTAT 2 1 29718 CASAVA_Build 5 131626646 4D CTCTGGGGCA TTTG/---- TTTCATTCCT 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 TTTG 1 0 29719 CASAVA_Build 5 131628181 11I CCCTGCAGCC -----------/CCCATCTCCAG CCCTCACACA 3070 het 3070 ref 34 18 8 8 CCCATCTCCAG 0 1 29720 CASAVA_Build 5 131633571 2I GTTGTCCTTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 56 24 18 14 TG 7 8 29721 CASAVA_Build 5 131643418 1I CACTTGGCAA -/G GTCCCCAGAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 1 2 29722 CASAVA_Build 5 131651583 1I AACTAGGGGG -/T GTTTTCTCGG 3070 het 3070 hom 34 16 13 5 T 0 1 29723 CASAVA_Build 5 131692490 2D TATATGTGTG TA/-- TGTGTATATA 100 hom 4 het 11 0 1 10 TA 1 0 29724 CASAVA_Build 5 131693066 1D TTGCTCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 13 12 29725 CASAVA_Build 5 131697309 4D AAGAGAAAAG AAGA/---- GAGAGAGAAA 3070 hom 87 het 36 0 29 10 AAGA 1 0 29726 CASAVA_Build 5 131701167 4D CAGCACCTGG CCTA/---- CCTAATTTTT 3070 hom 60 het 21 0 21 3 CCTA 2 1 29727 CASAVA_Build 5 131710685 7D TTTCTTAATC CTGAGTT/------- CTAATTTGAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 CTGAGTT 1 0 29728 CASAVA_Build 5 131713679 2D AAACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 80 het 36 0 28 8 AC 9 8 29729 CASAVA_Build 5 131723701 1I GGCCGTAGAT -/A ACTGAAACTG 3070 het 111 hom 33 1 21 11 A 1 2 29730 CASAVA_Build 5 131725429 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 10 9 29731 CASAVA_Build 5 131732697 1I ACCTCGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 10 13 T 13 14 29732 CASAVA_Build 5 131756740 1I CCTGTGGTTT -/C CCTGCACATC 3070 hom 129 het 49 0 42 7 C 2 3 29733 CASAVA_Build 5 131757952 1D CTTCAGTGAC A/- AAAGGCCTTT 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 A 4 3 29734 CASAVA_Build 5 131776141 1I AACTCCGTCT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 A 8 9 29735 CASAVA_Build 5 131784769 1I ATTGGTATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1168 hom 32 3 24 5 T 9 10 29736 CASAVA_Build 5 131787831 8I GGGAAAGAGG --------/AAGAAAGA AATGACTTAT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 AAGA 0 2 29737 CASAVA_Build 5 131794663 12D TGTTTAATTT GTGATACCCCAA/------------ GAATACGACA 3070 het 3070 ref 33 18 15 5 GTGATACCCCAA 1 0 29738 CASAVA_Build 5 131804987 1I CTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 29 2 13 14 A 13 14 29739 CASAVA_Build 5 131805242 1I AGGGGCATGA -/G GGGGCCCCCT 3070 het 2080 hom 29 8 15 6 G 4 5 29740 CASAVA_Build 5 131814351 3I AATGATGAAG ---/ATA ATAAATATTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 ATA 1 2 29741 CASAVA_Build 5 131820539 1I CCTGTAGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 159 hom 36 1 27 8 T 9 10 29742 CASAVA_Build 5 131837657 4D AACACAATTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 28 12 10 7 TTTA 4 3 29743 CASAVA_Build 5 131839659 1D AGTACTGCCG A/- AAAGAGACAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 3 29744 CASAVA_Build 5 131840396 24D TTCGCTGTGA CCCATCCCAACTCCAGCTCCTCTC/------------------------ CCCATCCCAA 2581 het 1930 hom 15 6 6 7 CCCATCCCAACTCCAGCTCCTCTC 2 1 29745 CASAVA_Build 5 131845648 1I AACAAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 T 13 14 29746 CASAVA_Build 5 131846728 1D ACACACGTCC T/- TATGTGTTCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 2 1 29747 CASAVA_Build 5 131855552 1I TCCTTGGTAA -/G GGCCCCTACT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 2 3 29748 CASAVA_Build 5 131868341 1I TTTTCTTGAC -/T TTTTTAATAG 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 5 6 29749 CASAVA_Build 5 131870465 3I CTCTAAAAAA ---/AAT AATAATAAGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAT 2 3 29750 CASAVA_Build 5 131871089 1I ATGAGGAGAG -/A AGGAAATCTC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 1 2 29751 CASAVA_Build 5 131873716 6D GCAAGAAGCT CAACAA/------ ACCCCAAGTA 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 CAA 2 0 29752 CASAVA_Build 5 131874862 1D TGGTTTGGTG T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 5 4 29753 CASAVA_Build 5 131883580 1D ATAATAATAA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 292 hom 18 1 17 0 T 1 0 29754 CASAVA_Build 5 131884431 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 34 0 19 15 A 15 14 29755 CASAVA_Build 5 131884855 1D TCAGAATAGT A/- AATCAATATA 3070 het 3070 hom 28 9 16 4 A 3 2 29756 CASAVA_Build 5 131894969 1D GTCATTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 11 8 T 11 10 29757 CASAVA_Build 5 131904324 23I AGAGAATGGA -----------------------/TAATATAGCTGAATATTGTTACT GGGTCTCTCC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TAATATAGCTGAATATTGTTACT 0 1 29758 CASAVA_Build 5 131914215 1I GCCTGGCCAG -/A AAAAAATAAC 3070 hom 49 het 18 0 16 2 A 6 7 29759 CASAVA_Build 5 131919576 1D CACTTTCCGG T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 51 het 24 0 18 7 T 8 7 29760 CASAVA_Build 5 131939163 1D TGATGCTGAA T/- AAAGGAGGTA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 1 0 29761 CASAVA_Build 5 132039065 1D GCTCTTCGGG C/- CTTTAGCTGG 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 C 2 1 29762 CASAVA_Build 5 132041911 2D TGGTATATGT AA/-- AGAGTAAAGA 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 A 3 1 29763 CASAVA_Build 5 132050553 4D AAGCTGTCTG TTCC/---- TTCTAGTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 TTCC 1 0 29764 CASAVA_Build 5 132054245 12D CAGGCCGGGC GCGGTGGCTCAT/------------ GCCTGTAATC 2054 het 2054 ref 17 11 5 1 GCGGTGGCTCAT 1 0 29765 CASAVA_Build 5 132055139 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 13 5 A 12 11 29766 CASAVA_Build 5 132056764 1I CTGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2206 het 2206 ref 26 14 8 4 A 10 11 29767 CASAVA_Build 5 132059263 1D AAAACAAAAT A/- AAAAAGTGTT 3070 hom 57 het 20 0 20 1 A 6 5 29768 CASAVA_Build 5 132059857 1I CAGGACACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 11 12 29769 CASAVA_Build 5 132062381 8D AGTTCAGTGG CATGATCT/-------- CATGATCTCG 3070 hom 24 het 13 0 8 5 CATGATCT 2 1 29770 CASAVA_Build 5 132064723 2D CCTGAGGTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 A 14 12 29771 CASAVA_Build 5 132069941 1I CTTACCTGGT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 7 8 29772 CASAVA_Build 5 132071086 2D TTTAAGAATT AA/-- GTTTTAAAAC 3070 het 3070 hom 38 13 22 4 A 2 0 29773 CASAVA_Build 5 132082653 2D AAAATTAGAA AC/-- ACAGAGTCAA 3070 het 3070 ref 49 20 18 11 AC 2 1 29774 CASAVA_Build 5 132093052 1I TGAAAAAAAC -/A AAAACAAACA 1842 het 1842 ref 24 15 6 3 A 4 5 29775 CASAVA_Build 5 132163025 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 264 hom 23 5 11 8 A 17 16 29776 CASAVA_Build 5 132196031 1I ACAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2920 het 2920 ref 26 12 7 7 A 9 10 29777 CASAVA_Build 5 132205190 1D GGGGCCAGTC A/- TTTCCTTCAA 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 A 1 0 29778 CASAVA_Build 5 132232347 1D TTCTGTGCCA G/- GAGGCCAACA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 G 2 1 29779 CASAVA_Build 5 132235257 2I TCACGTAGAC --/AT ATGTTAAAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AT 1 2 29780 CASAVA_Build 5 132235442 2D GGGCTTCAAG CT/-- CTTTCTTTCC 3070 hom 140 het 48 0 43 6 CT 2 1 29781 CASAVA_Build 5 132261301 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 17 1 16 0 A 15 14 29782 CASAVA_Build 5 132262052 1I30M1D CATCCAAATC -GACAACCAACTTTCTTTTTTTCTTCTTGTCT/GGACAACCAACTTTCTTTTTTTCTTCTTGTC- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 27 1 25 6 N/A 0 0 29783 CASAVA_Build 5 132353218 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2420 hom 19 8 9 2 A 12 11 29784 CASAVA_Build 5 132359916 3I AAAATTGCTA ---/TAT TATAAAGTCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 TAT 1 2 29785 CASAVA_Build 5 132364990 3D TCAAAATAAA AAC/--- AACAACAACA 2641 het 2641 ref 23 16 7 0 AAC 7 6 29786 CASAVA_Build 5 132365660 1I TCATGCCATT -/C TCCTGCCTCA 2127 het 2127 ref 15 6 5 4 C 0 1 29787 CASAVA_Build 5 132366321 1I ATACTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 8 9 29788 CASAVA_Build 5 132369258 5I CACTATTCTG -----/AAAAA CCATCTAGGT 3070 het 3070 ref 57 29 24 5 A 0 5 29789 CASAVA_Build 5 132377391 1D CTATTTTGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 10 9 29790 CASAVA_Build 5 132379348 3D GCCTAGGTCA CTC/--- CTCAATTCCT 3070 het 3070 hom 41 12 27 5 CTC 2 1 29791 CASAVA_Build 5 132379834 1I ATTGCGCTCC -/T AGTTAGTGTC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 0 1 29792 CASAVA_Build 5 132380961 1I CATAGCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 T 11 12 29793 CASAVA_Build 5 132387363 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2387 hom 23 8 10 5 A 12 14 29794 CASAVA_Build 5 132392752 1I GACTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 A 10 11 29795 CASAVA_Build 5 132414302 3D GCAATGTAAT TTC/--- TTCTTTGCTC 3070 het 3070 ref 57 30 24 3 TTC 2 1 29796 CASAVA_Build 5 132426692 1D ATTTACTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 T 10 9 29797 CASAVA_Build 5 132430328 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2593 het 857 hom 16 4 7 5 T 17 16 29798 CASAVA_Build 5 132507526 8D CCCCAAGTCA AAGCTGGC/-------- ATTATACTTA 3070 hom 111 het 38 0 37 2 AAGCTGGC 1 0 29799 CASAVA_Build 5 132516151 1D TGTCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 18 9 A 11 10 29800 CASAVA_Build 5 132516689 1D CTTGTAGGGA T/- GGGTGTTCCT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 1 0 29801 CASAVA_Build 5 132519744 1I CCGAAAGTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 A 7 8 29802 CASAVA_Build 5 132525305 2I GCAGAGGGAG --/GT GTACCACACA 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 GT 1 2 29803 CASAVA_Build 5 132551746 4D CCTTAAATGT TTGA/---- TAATATTCAC 3070 hom 144 het 52 0 49 6 TTGA 1 0 29804 CASAVA_Build 5 132558418 1D AGGCACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 43 0 32 11 T 11 10 29805 CASAVA_Build 5 132560851 5D ATTGGGAGTA AACAT/----- AACATATCAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AACAT 2 1 29806 CASAVA_Build 5 132567563 4D AGTGCCCTAA AGAT/---- AGATAACTGT 3070 hom 105 het 40 0 33 8 AGAT 2 1 29807 CASAVA_Build 5 132568588 2D TGATTTCATA CT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 71 hom 47 2 27 18 CT 1 0 29808 CASAVA_Build 5 132570518 4D TGATATGAAA TAAT/---- TAATAGTCTC 3070 hom 57 het 26 0 20 8 TAAT 2 1 29809 CASAVA_Build 5 132571337 4D TAGGCTCAAG TGAT/---- TGATTCTCCT 3070 het 3070 ref 26 17 8 4 TGAT 2 1 29810 CASAVA_Build 5 132572031 4I18M4D CATCAGTTTA ----GCCTGGACTTGTAGATTCCTTT/AAAGGAATCTACAAGTCCAGGC---- TAATCTACAG 3070 het 3070 ref 41 20 22 5 N/A 0 0 29811 CASAVA_Build 5 132576605 1D AAAGTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 2278 het 1852 hom 27 9 9 9 T 17 16 29812 CASAVA_Build 5 132576654 16D CCCAGGCTGG TGCAATCTTGGCTCAC/---------------- TGCAATCTCT 2160 het 2160 ref 24 11 6 11 TGCAATCTTGGCTCAC 1 0 29813 CASAVA_Build 5 132597160 3D ATGAGACTGG CCT/--- CTTTATTGAA 3070 hom 125 het 45 0 40 7 CCT 1 0 29814 CASAVA_Build 5 132614572 1D ATGTGACTAA C/- GGTGAAGGAA 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 C 1 0 29815 CASAVA_Build 5 132616222 1D AGACGAGGCA G/- GTCTGGTAGG 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 G 2 1 29816 CASAVA_Build 5 132640904 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2325 het 2325 ref 24 9 8 7 A 11 12 29817 CASAVA_Build 5 132671375 1D CCCAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1759 het 1274 hom 23 11 5 7 T 15 14 29818 CASAVA_Build 5 132680449 3D GGAATGCATG CTA/--- CACATGATGC 3070 het 3070 hom 49 18 22 10 CTA 1 0 29819 CASAVA_Build 5 132689384 1D CACCTGAGAA C/- CCCCCCAGAG 3070 het 3070 hom 34 14 12 9 C 7 6 29820 CASAVA_Build 5 132693217 1I CCTTTTCACA -/T TTTTCTGCCT 3070 hom 42 het 20 0 13 7 T 4 5 29821 CASAVA_Build 5 132752043 1D AGAACAGAAT G/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 G 1 0 29822 CASAVA_Build 5 132752437 1I TCCCACAGTA -/T TTTTTTAAAT 2497 het 2497 ref 22 13 6 3 T 6 7 29823 CASAVA_Build 5 132756784 1D CTGACAGAAT C/- CGCGGAGGAG 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 C 2 1 29824 CASAVA_Build 5 132776902 1I TTTTAAAGAG -/T TTTTTTATGC 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 T 6 7 29825 CASAVA_Build 5 132785103 1I ATAAGAGTTT -/C CCCCATTCGC 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 C 4 5 29826 CASAVA_Build 5 132786151 1I GTTTGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 20 6 A 11 12 29827 CASAVA_Build 5 132788816 1I TTCAAAGTGA -/C CCTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 C 2 3 29828 CASAVA_Build 5 132798413 2I AAAAATATAT --/TA TGTTAACTGT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 TA 0 1 29829 CASAVA_Build 5 132820707 1D ATAGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 11 10 29830 CASAVA_Build 5 132823346 6D CGTCAACTCA GGCTTT/------ GGGAAGTGAA 3070 het 3070 ref 50 23 18 11 GGCTTT 1 0 29831 CASAVA_Build 5 132837932 1I GCTGAGAACT -/A GCAAGTGCCA 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 A 0 1 29832 CASAVA_Build 5 132843495 1I AGTTTTTGAG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 7 8 29833 CASAVA_Build 5 132851857 1I ACGAGCTCTC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 7 8 29834 CASAVA_Build 5 132861333 1I AGAAGCCCTG -/C CTACATTTTC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 C 1 2 29835 CASAVA_Build 5 132864860 1D CAATTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 15 10 A 12 11 29836 CASAVA_Build 5 132866350 1I CACTATGCTT -/C CCTGTAGAGC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 2 3 29837 CASAVA_Build 5 132871482 1D AGAATTTTTT A/- AAAATACAGT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 A 5 4 29838 CASAVA_Build 5 132876415 1D ATTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2197 hom 27 8 11 8 T 11 10 29839 CASAVA_Build 5 132893458 1D ATGTTTCGGG T/- TTTTTTTTTT 1127 het 1127 ref 39 26 3 10 T 13 12 29840 CASAVA_Build 5 132939034 3I GATCAAATGA ---/AAT AATAATAAGC 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 AAT 2 3 29841 CASAVA_Build 5 132957816 2D AGTCTCACTC TG/-- TTGCCCAGGC 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 TG 1 0 29842 CASAVA_Build 5 132962310 1I GGTTATCCCA -/G GGGTCCACGG 3070 hom 102 het 40 0 32 8 G 3 4 29843 CASAVA_Build 5 132964012 1D GTAGGATAAA G/- GGGGGGGGGA 3070 het 2712 hom 31 13 9 10 G 10 9 29844 CASAVA_Build 5 132992550 7I CCTATTTGAA -------/TACTCTT TATTTCTTTC 2848 het 2848 ref 17 9 6 2 TACTCTT 0 1 29845 CASAVA_Build 5 132994893 1D CATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 1379 het 1379 ref 13 8 4 1 A 11 10 29846 CASAVA_Build 5 132996669 2I TTTCAATATT --/TA TTTTTATTTG 3070 het 3070 ref 36 19 17 0 TA 0 1 29847 CASAVA_Build 5 133001800 2I TCACTGCCTT --/TA TACAGCCACC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 TA 1 2 29848 CASAVA_Build 5 133002513 1I GTATTTTAGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 8 9 29849 CASAVA_Build 5 133007547 1I TAGTGCTTTG -/C AGGGAGGCCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 0 1 29850 CASAVA_Build 5 133013519 1D AATTTATCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 28 1 24 3 A 11 10 29851 CASAVA_Build 5 133024576 1D CAAAACTTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 9 8 29852 CASAVA_Build 5 133026561 1D ACCCTGAGTT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 111 het 43 0 37 7 A 9 8 29853 CASAVA_Build 5 133030828 1I ATTCTGCTGG -/C CACCCCTCAA 3070 hom 120 het 48 0 40 8 C 1 2 29854 CASAVA_Build 5 133035015 1D CTTATTTTGT A/- GGTAAAACTA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 1 0 29855 CASAVA_Build 5 133044519 2D TCATCATGGG CA/-- CAGTCAGAAC 3070 hom 150 het 55 0 50 6 CA 2 1 29856 CASAVA_Build 5 133046709 1I GGTGTGTCTG -/C CCAAGGGGTG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 2 3 29857 CASAVA_Build 5 133050803 1D AGGCTAAATA G/- GGGGGGCATG 3070 hom 92 het 40 0 28 12 G 7 6 29858 CASAVA_Build 5 133061503 1I AGGGGAAGTA -/C CCCCCAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 C 5 6 29859 CASAVA_Build 5 133061813 1I GCAAGCAGCA -/C CCCCCAGAGA 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 C 5 6 29860 CASAVA_Build 5 133110023 1D CTTACAAAGC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 9 8 29861 CASAVA_Build 5 133124837 2I ATCCAGGAAG --/AA AAGTCATTTC 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 A 2 4 29862 CASAVA_Build 5 133140822 1I TATATATACA -/C ATAGAGAGTT 1422 het 1422 ref 31 14 3 14 C 0 1 29863 CASAVA_Build 5 133141932 1D TGTTTCCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1959 hom 40 7 23 11 A 11 10 29864 CASAVA_Build 5 133144355 1I CTCATTTTCC -/A TGTTGGGAAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 0 1 29865 CASAVA_Build 5 133159213 1D AGAATGGGAC G/- TTTTCCAGGA 3070 hom 107 het 39 0 33 7 G 1 0 29866 CASAVA_Build 5 133165633 1D GTCCTGAGCT A/- ATCTGAACAC 3070 hom 102 het 39 0 33 7 A 2 1 29867 CASAVA_Build 5 133166235 1I TCTGCACAGA -/G GCACCATCAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 1 2 29868 CASAVA_Build 5 133176143 3D GCATGATGGG CTT/--- CTTCTTGTCA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 CTT 3 2 29869 CASAVA_Build 5 133208269 4I TCTCCAAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAT 2 3 29870 CASAVA_Build 5 133218646 1D CTACTCCCCC T/- GACTTCCCTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 0 29871 CASAVA_Build 5 133218840 11D CAGGTTTTTC GTTTCGTGGGG/----------- GTGTTTTTTC 3070 hom 93 het 32 0 32 3 GTTTCGTGGGG 1 0 29872 CASAVA_Build 5 133235083 1D GCCAAATAAG C/- ATATAAAAAG 3070 hom 135 het 51 0 46 6 C 1 0 29873 CASAVA_Build 5 133235665 1D GAACATTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 32 1 27 5 A 11 10 29874 CASAVA_Build 5 133236863 1D TCTAAAGTGG A/- AAATAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 4 3 29875 CASAVA_Build 5 133248842 1D TAGAAAATCA G/- ATGTCCCCCC 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 G 1 0 29876 CASAVA_Build 5 133249872 1I TCTTCTCTCC -/T TAGCACTTAT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 1 2 29877 CASAVA_Build 5 133275713 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 856 hom 20 4 11 5 A 6 7 29878 CASAVA_Build 5 133277635 2D AAGGTAGAGT TA/-- TATAATCCCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TA 3 2 29879 CASAVA_Build 5 133344225 1D GGGCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2254 het 1532 hom 29 8 8 13 A 19 18 29880 CASAVA_Build 5 133364306 1I AGAGCCTGGA -/T TGGCGTCACT 3070 hom 114 het 43 0 37 6 T 1 2 29881 CASAVA_Build 5 133397771 1D TGTCACGCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 27 3 A 12 11 29882 CASAVA_Build 5 133400244 2D AGACACTGTC TT/-- TTTTAAAAAA 189 het 66 hom 7 1 4 2 T 6 4 29883 CASAVA_Build 5 133400555 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAACAAC 3070 hom 12 het 42 1 32 9 A 7 6 29884 CASAVA_Build 5 133403109 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGTTTCAC 2484 hom 20 het 8 0 6 2 G 5 4 29885 CASAVA_Build 5 133419342 4I TAATTGTCTT ----/TTTC TTTTTCTTTA 3070 hom 42 het 16 0 13 3 TTTC 0 1 29886 CASAVA_Build 5 133424758 1D TCTAGCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 657 hom 26 5 15 7 T 17 16 29887 CASAVA_Build 5 133453582 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2609 hom 23 6 12 5 A 9 8 29888 CASAVA_Build 5 133458664 1D CGTGCCATGT A/- AAAAAAGGTG 3070 hom 76 het 29 0 26 3 A 7 6 29889 CASAVA_Build 5 133460199 6I TCTTCTTCTT ------/TTTTTA TTTTTTATTT 3070 hom 59 het 22 0 20 2 TTTTTA 0 1 29890 CASAVA_Build 5 133472718 4D TGCTATGGAT GATC/---- GATCCATCCT 3070 het 3070 ref 33 13 13 9 GATC 2 1 29891 CASAVA_Build 5 133485963 1D TGGGATCCTT C/- CCCCCAGGCT 3070 het 2512 hom 27 10 10 7 C 6 5 29892 CASAVA_Build 5 133492173 2I GAACACATGA --/CT CAAGACCCCT 1529 het 1529 ref 26 12 4 10 CT 0 1 29893 CASAVA_Build 5 133497766 18D CACTACCTTG GGGCAGAGCCCCAACTCT/------------------ GGGCAGAGCA 3070 het 3070 ref 27 14 12 4 GGGCAGAGCCCCAACTCT 1 0 29894 CASAVA_Build 5 133505002 1I AGACTCAGTG -/C CAAATATGCA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 C 1 2 29895 CASAVA_Build 5 133513353 4D TTGGTGTCTC ACTT/---- AGAGTACACA 3070 het 3070 ref 49 24 24 3 ACTT 1 0 29896 CASAVA_Build 5 133513439 1D TCAGATCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 11 9 T 13 12 29897 CASAVA_Build 5 133515817 4I GAATTTAGCT ----/CAAA CACTCAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 CAAA 0 1 29898 CASAVA_Build 5 133522980 1I CAATGGAGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 9 10 29899 CASAVA_Build 5 133525079 3I AAATGGGTTA ---/ATG ATATGTACAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 ATG 0 1 29900 CASAVA_Build 5 133526381 1I TTTTAAACTC -/T TAAACCTGGG 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 T 1 2 29901 CASAVA_Build 5 133538398 1D GAGTTCTGGC A/- AAAAAAAAAA 2698 het 2698 ref 35 16 7 12 A 15 14 29902 CASAVA_Build 5 133539524 1D CATCATATAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 60 het 29 0 21 9 A 9 8 29903 CASAVA_Build 5 133541723 1I AAGGCCAAGC -/A AGCTCCTTGA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 1 2 29904 CASAVA_Build 5 133546416 1D ACCCAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 20 1 18 2 T 11 10 29905 CASAVA_Build 5 133556922 1D TTATACTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 201 hom 22 3 13 6 T 12 11 29906 CASAVA_Build 5 133563030 1I TTAGTACTTT -/A AAAAAAAAAA 2850 het 2850 ref 28 12 10 6 A 11 12 29907 CASAVA_Build 5 133563379 1I TATTGTTCAC -/A AATTTCTTTA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 2 3 29908 CASAVA_Build 5 133566026 4I CACTGATTTA ----/CTTT CTGTCTTGAG 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 CTTT 0 1 29909 CASAVA_Build 5 133568979 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1553 hom 31 5 18 8 T 13 12 29910 CASAVA_Build 5 133569139 1I CCCCGGCTAG -/T TTTTTTGTAC 1479 het 1479 ref 20 7 7 6 T 6 7 29911 CASAVA_Build 5 133569314 5D ATTCTCCTCC TTTTG/----- TTTTGATTCT 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 TTTTG 2 1 29912 CASAVA_Build 5 133572136 3D TGTACAGATG CTC/--- CTCAATTTGT 3070 het 3070 ref 34 18 14 5 CTC 2 1 29913 CASAVA_Build 5 133572870 1D CCGGAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 12 11 29914 CASAVA_Build 5 133573367 1D GACTCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 11 10 29915 CASAVA_Build 5 133573700 1D CAGCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 A 12 11 29916 CASAVA_Build 5 133575710 6I CCATCTCAAA ------/AATAGT AATAGTAATT 3070 hom 48 het 23 0 15 8 AATAGT 1 2 29917 CASAVA_Build 5 133577007 1I TACTGCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 12 13 29918 CASAVA_Build 5 133578355 4D TTTTTGGCAT TTTG/---- TTTCTCTTAT 3070 het 3070 hom 32 14 14 6 TTTG 1 0 29919 CASAVA_Build 5 133579166 6D CTCCATCTCA AAAAAT/------ AAAAATAAAA 3070 het 1909 hom 12 4 8 2 AAAAAT 4 3 29920 CASAVA_Build 5 133585558 2D ACCTTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3026 het 1486 hom 26 8 9 10 A 20 18 29921 CASAVA_Build 5 133586132 1D AACTTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 11 10 29922 CASAVA_Build 5 133593385 2I GATGTTGTTA --/TT TTTATTATTA 2474 het 2474 ref 18 11 6 1 T 3 5 29923 CASAVA_Build 5 133602001 1D TTTTTTGTAG A/- GATGAGGTCT 3070 het 2317 hom 24 8 13 3 A 1 0 29924 CASAVA_Build 5 133602937 2I13M4D CCTGGCTAAC --TTGTATTTTTATTTTTA/TTTTGTATTTTTATT---- TTTATTTATT 1951 het 1799 hom 12 6 6 1 N/A 0 0 29925 CASAVA_Build 5 133608138 1D TGTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2899 het 2391 hom 24 9 8 7 A 15 14 29926 CASAVA_Build 5 133609942 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2334 het 847 hom 9 3 5 1 A 11 12 29927 CASAVA_Build 5 133627254 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2353 het 550 hom 28 5 8 16 A 18 16 29928 CASAVA_Build 5 133645480 4I TTTTCTTATA ----/TATC TATTAAATCA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 TATC 0 1 29929 CASAVA_Build 5 133647131 1I AACAGCATGG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 6 7 29930 CASAVA_Build 5 133665174 1D TTTATTTTTT A/- AAAAAACAGA 2194 het 1873 hom 12 5 6 1 A 7 6 29931 CASAVA_Build 5 133667166 2D AGCTGCAATG GC/-- TCACGCCTGT 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 GC 1 0 29932 CASAVA_Build 5 133673752 5D ATGGCACTTC ATTTT/----- ATTTTTTATT 1910 het 327 hom 7 1 5 1 ATTTT 2 1 29933 CASAVA_Build 5 133677337 1D TTATGTGGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 10 13 4 T 10 9 29934 CASAVA_Build 5 133685510 1I CAGATCAGGG -/A AAAAAAAAAT 2689 het 2689 ref 27 15 7 5 A 9 10 29935 CASAVA_Build 5 133691223 11D TGTGGGAAAG AACCAGGGAAT/----------- AACACAGTTA 3070 het 3070 ref 37 22 18 1 AACCAGGGAAT 1 0 29936 CASAVA_Build 5 133694309 1D TGTCTGAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 8 29937 CASAVA_Build 5 133694463 2I GACTGGACTC --/TT TTGCTTTGAC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 2 4 29938 CASAVA_Build 5 133704671 1I AATAAAAACC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 7 8 29939 CASAVA_Build 5 133710792 1D AGTTTACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 12 11 29940 CASAVA_Build 5 133712169 1I GTGGGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 10 11 29941 CASAVA_Build 5 133712382 1I AGAAATAAAG -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 6 7 29942 CASAVA_Build 5 133719267 4I CATTTAACAA ----/ATGT ATTATGCATG 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 ATGT 0 1 29943 CASAVA_Build 5 133722121 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTCT 1435 het 1435 ref 20 13 4 3 T 8 9 29944 CASAVA_Build 5 133729864 2I GAATCAGTAC --/AT GTGTGAACTA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 AT 0 1 29945 CASAVA_Build 5 133733196 1D TGTTGCGGGA T/- TTTTTTGAGG 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 T 7 6 29946 CASAVA_Build 5 133742275 2D TTTGAATGAC TT/-- TTTTTCATGG 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 7 5 29947 CASAVA_Build 5 133748464 4D TCAGTCCTAG GTAA/---- GTGTTACCCC 3070 het 3070 ref 29 13 9 9 GTAA 1 0 29948 CASAVA_Build 5 133758450 11I GAGAAAGCAA -----------/AGTAACCTTTT AGCCAATTAG 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 AGTAACCTTTT 0 1 29949 CASAVA_Build 5 133762644 2I AAAGAAAGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 12 14 29950 CASAVA_Build 5 133764995 2D GGGTCCAATG TC/-- TCTTATTTGC 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 TC 2 1 29951 CASAVA_Build 5 133779427 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 A 11 12 29952 CASAVA_Build 5 133780222 14D TTGTTTTGAT TTGCATTTTTCTAA/-------------- TAAGTAATGA 3070 het 3070 ref 23 18 7 7 TTGCATTTTTCTAA 1 0 29953 CASAVA_Build 5 133791016 4D AAAAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 33 8 19 7 AAAC 5 4 29954 CASAVA_Build 5 133797374 1D AAATATCATC T/- CTTTGGAATT 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 T 1 0 29955 CASAVA_Build 5 133818801 1I GATGGTTACC -/A GGGAGTAGGG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 0 1 29956 CASAVA_Build 5 133820647 5I CACTTGTCTG -----/TTCTA TTCTATGTGT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TTCTA 1 2 29957 CASAVA_Build 5 133825046 1D38M1D CAAGACCCTG AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGGA/-AAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGG- AAAAAGAAAC 3037 het 3037 ref 21 17 8 5 N/A 0 0 29958 CASAVA_Build 5 133843099 1I CCTCAGGATA -/G GAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 1 2 29959 CASAVA_Build 5 133843460 1D TAACAATAAT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 8 7 29960 CASAVA_Build 5 133848665 1D ACACTGTCAG T/- TCTTCTCACA 3070 het 2585 hom 30 9 13 8 T 2 1 29961 CASAVA_Build 5 133848699 3D TCAATGTAAT TTC/--- TAATAAAAAC 3070 het 362 hom 25 1 14 11 TTC 1 0 29962 CASAVA_Build 5 133859378 1D CTAACCATGA T/- TTTTTTTTTT 1758 het 1665 hom 27 13 6 9 T 17 16 29963 CASAVA_Build 5 133884257 1D CTTTGAATGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 10 9 29964 CASAVA_Build 5 133888135 1I CGGTTTTTAA -/C CCTTTCGGGG 2790 hom 27 het 11 0 10 1 C 2 3 29965 CASAVA_Build 5 133914812 1D TTTTATTTTA T/- TTTATTTATT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 4 3 29966 CASAVA_Build 5 133916952 2I TATTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2622 hom 27 het 15 0 10 5 T 10 12 29967 CASAVA_Build 5 133920628 2D ACACACACAC CA/-- CACACACACC 3070 hom 138 het 59 0 44 16 CA 5 4 29968 CASAVA_Build 5 133920858 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 694 het 24 hom 24 1 6 17 T 11 10 29969 CASAVA_Build 5 133929416 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 826 hom 19 2 15 2 A 13 14 29970 CASAVA_Build 5 133946025 2I ATGGGCACAC --/TG TGGGACTAGC 3070 hom 133 het 50 0 42 8 TG 1 2 29971 CASAVA_Build 5 133963611 1I GAAGGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2571 het 520 hom 14 2 10 2 A 13 14 29972 CASAVA_Build 5 134004748 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 686 het 686 ref 12 9 3 0 A 13 14 29973 CASAVA_Build 5 134015524 1I TTGAAAACTC -/T TTTTTTTTTT 2533 het 769 hom 27 4 13 10 T 17 18 29974 CASAVA_Build 5 134179622 4I TCCAGCCTGT ----/TTCA TTCATTGCAG 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 TTCA 1 2 29975 CASAVA_Build 5 134192184 1D GGTTGGTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 37 0 27 11 T 12 11 29976 CASAVA_Build 5 134197581 1I TTTTGGGAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 9 29977 CASAVA_Build 5 134237060 4D CTGATTTAGC ACTG/---- ACTGGTGGCT 3070 hom 123 het 46 0 42 6 ACTG 2 1 29978 CASAVA_Build 5 134252497 1I TATATTGATG -/A AAATTTTCTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 3 4 29979 CASAVA_Build 5 134266722 1D TGGTTACATC T/- TTTTTTTTTT 1405 het 1405 ref 24 18 3 3 T 12 11 29980 CASAVA_Build 5 134311365 1D TATGAAGTCG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 10 9 29981 CASAVA_Build 5 134319859 1I AATTTGAGGG -/T GTTTTGATGT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 T 0 1 29982 CASAVA_Build 5 134348409 1I CCTGCATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1021 hom 34 4 17 13 T 14 15 29983 CASAVA_Build 5 134358359 1I TTCTAGCCAT -/G GCTGACTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 G 1 2 29984 CASAVA_Build 5 134381260 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1745 hom 10 het 4 0 4 0 A 10 11 29985 CASAVA_Build 5 134382410 5D CCCATGCCTC CCAGG/----- CCAGGGATCC 3070 het 3070 ref 52 26 20 7 CCAGG 2 1 29986 CASAVA_Build 5 134392057 2I GCCCGTGGGA --/AC ACACACACAC 2700 hom 39 het 15 0 13 2 AC 5 6 29987 CASAVA_Build 5 134393608 4D TTTTGCTTCC TATT/---- TAATTTCTTT 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 TATT 1 0 29988 CASAVA_Build 5 134396621 1D CAGCTCGGAC A/- AAAAAAGGCA 1645 het 800 hom 7 3 4 0 A 7 6 29989 CASAVA_Build 5 134418067 1I AGGGTGAACC -/G GGGGGAAAGG 3070 hom 146 het 53 0 45 8 G 5 6 29990 CASAVA_Build 5 134438519 6D TTCCTGTTGG AATGAT/------ AAACGCATCC 3070 hom 144 het 51 0 49 4 AATGAT 1 0 29991 CASAVA_Build 5 134455555 1D CCACAACTTA G/- GGTTGTTATG 3070 het 3070 hom 55 24 27 4 G 3 2 29992 CASAVA_Build 5 134464817 1D GCCTCGTCCG A/- AGCTCAGGTG 3070 hom 117 het 43 0 37 6 A 2 1 29993 CASAVA_Build 5 134508898 1I TTTAAAGTAT -/C TGAAGAAAGT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 C 0 1 29994 CASAVA_Build 5 134528257 1I ACTTGGATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2678 hom 28 8 16 4 A 9 10 29995 CASAVA_Build 5 134533838 1I GGTGAGCCCT -/G GGGGATACCT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 G 4 5 29996 CASAVA_Build 5 134545012 1I TTTTTGACGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 9 10 29997 CASAVA_Build 5 134552597 1I AGTCTTGAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 T 9 10 29998 CASAVA_Build 5 134563655 1D TGTAACATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 T 11 10 29999 CASAVA_Build 5 134568831 1D AATAATTGCC T/- TTTTTTTTTC 1295 het 1295 ref 44 35 3 6 T 10 9 30000 CASAVA_Build 5 134596112 6I AGCACTTCTG ------/GAGGCT GAGGCTGAGG 2906 het 2906 ref 32 10 10 12 GAGGCT 1 2 30001 CASAVA_Build 5 134618859 1D CATATTTTTA G/- GTCTGCCCTG 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 G 2 1 30002 CASAVA_Build 5 134626435 3D TTATGTGTAT TCA/--- TCAAAACTGT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TCA 2 1 30003 CASAVA_Build 5 134630264 4I ATGACGCACA ----/GCCT GCCTGCCCTC 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 GCCT 1 2 30004 CASAVA_Build 5 134631872 1D AATTAAAAAT G/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 G 1 0 30005 CASAVA_Build 5 134637216 4I AGCAGATGAG ----/TTAA TTAATGCAGG 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 TTAA 1 2 30006 CASAVA_Build 5 134639071 1I TTATTACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 42 1 32 9 A 10 11 30007 CASAVA_Build 5 134640988 1I ATGAAGCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 19 8 9 2 T 9 10 30008 CASAVA_Build 5 134644109 2D CACTACACAC TG/-- TGTGCCTGAT 3070 het 3070 ref 45 18 15 12 TG 3 2 30009 CASAVA_Build 5 134661371 1I10M1I AAGCTGTTGC -TTGGTTTTCA-/TTTGGTTTTCAT TGCTCAGCTT 3070 hom 141 het 47 0 48 1 N/A 0 0 30010 CASAVA_Build 5 134661590 1I52M1I ATGGACTGAA -TGTATCCTTCCAAAATTCCTCTGTTGAAGCCCCAATCTCCAGTGTGATGGTA-/TTGTATCCTTCCAAAATTCCTCTGTTGAAGCCCCAATCTCCAGTGTGATGGTAT TTGGAGATGG 3070 hom 123 het 30 0 41 10 N/A 0 0 30011 CASAVA_Build 5 134661749 1I GGAGGGCGCG -/T TGCCTCCTTC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 1 2 30012 CASAVA_Build 5 134675369 2I CTACTTATAC --/AT ATGTTACAAC 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 AT 1 2 30013 CASAVA_Build 5 134676313 2D ATCATTATGT CA/-- CACACACACA 2033 het 2033 ref 35 16 11 8 CA 9 8 30014 CASAVA_Build 5 134700949 6I GTGTAGCCTG ------/GCCCAT GCCCATGCCC 3070 het 3070 hom 43 17 15 11 GCCCAT 2 3 30015 CASAVA_Build 5 134765566 1I GTAGAACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 17 12 A 10 11 30016 CASAVA_Build 5 134778280 12D ATTAAATTAA AATTTAAAAATT/------------ AATTTAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 AATTTAAAAATT 1 0 30017 CASAVA_Build 5 134780685 16D TTTATTTCTT TCTAGTGTGAATACAA/---------------- TTTATTTCTT 1467 het 1467 ref 31 13 7 16 TCTAGTGTGAATACAA 1 0 30018 CASAVA_Build 5 134786388 2I AATATCAAAC --/AT ATATTTATAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AT 2 3 30019 CASAVA_Build 5 134790782 1I CTGGATACAG -/T TTTTTCAGCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 5 6 30020 CASAVA_Build 5 134798055 2D GGTTAGGGCT AG/-- GGGGGGCTAC 3070 het 30 hom 31 1 18 13 AG 1 0 30021 CASAVA_Build 5 134799974 16D GTTAGTTATA GACTAAGGTGTATTGT/---------------- GACATAATAA 3070 het 3070 ref 41 24 15 7 GACTAAGGTGTATTGT 1 0 30022 CASAVA_Build 5 134800508 2D CTGTCACCTG GA/-- GAGAGACCTG 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 GA 4 3 30023 CASAVA_Build 5 134807672 1I TCCCGGATCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 T 8 9 30024 CASAVA_Build 5 134869941 1D ATTGCTTGAA C/- CCGGGAGGCA 2857 het 801 hom 10 2 7 1 C 3 2 30025 CASAVA_Build 5 134878623 1D ACCCTCTCAA T/- TTCTGTACTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 3 2 30026 CASAVA_Build 5 134879886 1I CTGTACTCTT -/G GAACTTCATA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 G 1 2 30027 CASAVA_Build 5 134883593 1I AAGAGAAAAA -/G GGGTCTTTTA 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 G 3 4 30028 CASAVA_Build 5 134893084 13D ACTGAGGGCA TTGGCCGTGACAC/------------- CACAAGTCCC 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 TTGGCCGTGACAC 1 0 30029 CASAVA_Build 5 134895200 1I GTCTCAAAAA -/C AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 C 0 1 30030 CASAVA_Build 5 134896597 3D AAAAAAAAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1655 hom 30 8 15 7 T 23 20 30031 CASAVA_Build 5 134912547 1D GGAGGGGTAT A/- AAGGCATCCT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 3 2 30032 CASAVA_Build 5 134927260 1I TTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 216 hom 22 1 16 5 A 10 11 30033 CASAVA_Build 5 134971633 1I AAATAAATGC -/A AAGCAGTTGA 3070 hom 144 het 56 0 49 7 A 2 3 30034 CASAVA_Build 5 134991334 1I13M1I36M1I TATTACTGCA -TGTGCATATACAG-GTATTTTAGTGTTCATGTTAGGAGAGGAGGGCATCA-/TTGTGCATATACAGTGTATTTTAGTGTTCATGTTAGGAGAGGAGGGCATCAT TGAATGCCCT 3070 hom 153 het 43 0 49 14 N/A 0 0 30035 CASAVA_Build 5 135000571 1D GTTACGAGTA G/- GGTGGAAATA 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 G 3 2 30036 CASAVA_Build 5 135001996 1I TTTGGTAGGT -/G GGGGGAGGGG 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 G 5 6 30037 CASAVA_Build 5 135004941 1I AGAGAGGTCC -/A AGGACTGAGA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 1 2 30038 CASAVA_Build 5 135005101 1I GAAGAACAAC -/A ATAGGCTCCC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 1 2 30039 CASAVA_Build 5 135009853 1I CTCCGGCCGG -/C CTTGGCTCTG 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 C 1 2 30040 CASAVA_Build 5 135010682 1I TACTTATATC -/A ACACGTCATG 3070 hom 93 het 41 0 32 9 A 1 2 30041 CASAVA_Build 5 135014156 3I CTAAAAAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 106 het 46 0 36 10 AAC 3 4 30042 CASAVA_Build 5 135022847 1D CCACCAGATA C/- CATAAATCAT 3070 het 3070 ref 34 24 8 2 C 2 1 30043 CASAVA_Build 5 135024344 1I CGTGTCATAC -/A AATTACCTGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 3 30044 CASAVA_Build 5 135026291 3I TGCCTCTCCC ---/CCT CCTCAGGTCC 3070 hom 96 het 35 0 30 5 CCT 1 2 30045 CASAVA_Build 5 135028259 2D ATAAATGAAG AC/-- ACACAGTATT 3070 het 3070 hom 41 19 17 6 AC 3 2 30046 CASAVA_Build 5 135029354 3I ATTCTTTTTG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 23 9 A 11 14 30047 CASAVA_Build 5 135030246 16D TCAGGGCATC AGAGAGAGAGAGAGAG/---------------- AGAGAGAGAG 3070 hom 53 het 34 0 25 11 AG 17 9 30048 CASAVA_Build 5 135038500 1D TTTAGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 9 T 11 10 30049 CASAVA_Build 5 135040548 2D TGTAAATATC TG/-- TTATATCCAT 3070 hom 117 het 40 0 40 1 TG 1 0 30050 CASAVA_Build 5 135040971 1I TATTTTAAAT -/C CATTCAGCCA 3070 hom 151 het 54 0 51 3 C 1 2 30051 CASAVA_Build 5 135047104 1I TTAAAGTAAG -/A TCTTGGCTAG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 A 0 1 30052 CASAVA_Build 5 135051619 37I TCATCTTGTA -------------------------------------/AAACTGAAGCTCTGTACCCATTAAACAATAGCTCCCC ATTCACCCCT 3070 hom 60 het 22 0 18 4 AAACTGAAGCTCTGTACCCATTAAACAATAGCTCCCC 0 1 30053 CASAVA_Build 5 135052615 4D AACTAAGACT TAGA/---- TAGATTAATT 2974 het 2974 ref 35 24 9 4 TAGA 2 1 30054 CASAVA_Build 5 135055985 1I GATGAGCCAA -/C AAGGAGGGCC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 C 0 1 30055 CASAVA_Build 5 135057549 1I ACATTCTGGA -/G GAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 29 0 26 3 G 1 2 30056 CASAVA_Build 5 135058888 9D GAAATTCTTG TGCTTTTTA/--------- TGTTTTTCTT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 TGCTTTTTA 1 0 30057 CASAVA_Build 5 135068807 2D GAGATTGACT CA/-- CAGAGAGCAG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 CA 2 1 30058 CASAVA_Build 5 135070110 4D ACTCAATATT TATC/---- AACCATCATC 3070 het 3070 hom 43 15 26 3 TATC 1 0 30059 CASAVA_Build 5 135074471 1I CCTCGAAGTA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 7 8 30060 CASAVA_Build 5 135081600 3I GACTCCTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 1622 hom 19 4 10 8 TTG 5 6 30061 CASAVA_Build 5 135083920 1I CCCAGTTGGC -/A ACAGAAGCAC 1463 het 1463 ref 23 15 4 4 A 1 2 30062 CASAVA_Build 5 135085292 1D GGGGACAGTT C/- CTGCAGGAGG 3070 het 3070 ref 53 26 19 9 C 2 1 30063 CASAVA_Build 5 135087993 1I TAGGCGTGAG -/C CCCCTGCGCC 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 C 4 5 30064 CASAVA_Build 5 135089470 1I TAGGGTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 41 1 30 10 A 11 12 30065 CASAVA_Build 5 135090875 4I ATATGTATGT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 2450 hom 28 8 17 3 AC 5 7 30066 CASAVA_Build 5 135091844 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 24 2 11 11 A 17 16 30067 CASAVA_Build 5 135097935 1I GGCCTAATAA -/G GGAACTGGGC 2014 het 2014 ref 20 13 5 2 G 2 3 30068 CASAVA_Build 5 135102096 4D GACCCAAAGC ATCT/---- CCTTTACTCC 3070 het 3070 ref 38 21 13 7 ATCT 1 0 30069 CASAVA_Build 5 135107942 1D TTTCTCTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 10 9 30070 CASAVA_Build 5 135108062 48D CCTCAGCCTC AAGAGTAGGCACGCATCACCATGCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTA/------------------------------------------------ GAGACAGGTT 2704 het 2704 ref 18 9 7 3 AAGAGTAGGCACGCATCACCATGCCAGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTA 1 0 30071 CASAVA_Build 5 135110586 2I TTTTTTGTTG --/TT TTGTTTTTTT 3070 hom 44 het 38 0 15 23 T 2 4 30072 CASAVA_Build 5 135114482 2D GCCTGTTTCA CT/-- CTCTCTCTGG 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 CT 5 4 30073 CASAVA_Build 5 135117884 5D TTGACACTAC ATATG/----- ATATGATAAA 3070 het 3070 ref 52 25 22 7 ATATG 2 1 30074 CASAVA_Build 5 135118369 1D ACACTGTGAT A/- TTAGTGAAAT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 A 1 0 30075 CASAVA_Build 5 135119438 8I TAGTATTAAT --------/GAAATATC GAAATATCGC 3070 het 3070 ref 62 29 24 9 GAAATATC 1 2 30076 CASAVA_Build 5 135119892 3D TGTGATATTT ATA/--- ATATCTAGTG 3070 het 3070 ref 29 14 11 7 ATA 2 1 30077 CASAVA_Build 5 135126420 2D GTGGATGTGT GA/-- GTTTGTAAAA 3070 het 3070 ref 88 45 34 11 GA 1 0 30078 CASAVA_Build 5 135129597 3D GAGAGGGTGA TAT/--- TACTCTCCAT 2281 het 2281 ref 27 13 8 7 TAT 1 0 30079 CASAVA_Build 5 135129943 1D GTAATATCAA G/- GGGGGGGGAA 3070 het 17 hom 48 2 16 30 G 9 8 30080 CASAVA_Build 5 135130253 1D TGATATTACT C/- CCCCATATCA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 C 5 4 30081 CASAVA_Build 5 135130709 1I67M1D TACATTCCCT -TGACATGTTTTGTAATATTTAGGGGGGCAGAGGGTTATATTGCTCCCAATATTTCAGGACAGGTACAC/GTGACATGTTTTGTAATATTTAGGGGGGCAGAGGGTTATATTGCTCCCAATATTTCAGGACAAGTACA- CCCCCCCCCG 3070 het 3070 ref 40 24 19 20 N/A 0 0 30082 CASAVA_Build 5 135132848 2I TTGCAATATT --/TG GGGGGGGGAG 3070 het 114 hom 22 2 9 11 TG 0 1 30083 CASAVA_Build 5 135133308 3D CGTGGGAGAG GAT/--- GATGTTACTC 3070 het 3070 ref 47 26 19 3 GAT 2 1 30084 CASAVA_Build 5 135133674 1I CCTAATAGCC -/G GGGGGGGAGA 2105 het 2105 ref 25 12 7 6 G 7 8 30085 CASAVA_Build 5 135133872 1D GGGGGGTAAA C/- CCCCTCTATG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 C 5 4 30086 CASAVA_Build 5 135134684 1I TCAATATCGT -/G GGGGGTGTAC 1518 het 1518 ref 24 15 6 3 G 5 6 30087 CASAVA_Build 5 135135398 1D TGTAATATTT A/- GGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 A 1 0 30088 CASAVA_Build 5 135138335 1D GGAGTGTACA C/- CCCCCCCGTG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 C 8 7 30089 CASAVA_Build 5 135140178 3D TGAGGGAGAG GAT/--- GATATTACTC 3070 het 3070 hom 37 17 18 4 GAT 2 1 30090 CASAVA_Build 5 135141627 2I AGGCTGATAT --/AA GTCTCAATAT 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 A 0 2 30091 CASAVA_Build 5 135145596 3I TAATATCCAG ---/AGA AGAAGAGGAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AGA 2 3 30092 CASAVA_Build 5 135146527 2I41M1I CAATATCGCA --GGGGGTGTGCACCCCCACTGTGATATTGTTCCTAACATCCA-/GTGGGGGTGTGCACCCCCACTGTGATATTGTTCCTAACATCCAG GGGGGGGAGA 3070 hom 48 het 16 0 15 12 N/A 0 0 30093 CASAVA_Build 5 135147845 2D CCAATAGCGC AG/-- AGAGTGTACA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 AG 3 2 30094 CASAVA_Build 5 135151418 3D CATTTTTTGA TAT/--- TATTCTTAAT 3070 het 3070 hom 53 24 25 6 TAT 2 1 30095 CASAVA_Build 5 135152786 3D GGGTGTACAC CCT/--- CCCCCGCCAC 3070 het 223 hom 22 4 12 6 CCT 1 0 30096 CASAVA_Build 5 135153324 1I TTAATATTAA -/G GGGGGGATAG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 6 7 30097 CASAVA_Build 5 135154582 1D GTATAATTAC G/- GGGGGGGTGT 3070 hom 101 het 43 0 34 9 G 8 7 30098 CASAVA_Build 5 135158541 5D TGGGGCGTAC ACCAT/----- ACCATTCTGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 ACCAT 2 1 30099 CASAVA_Build 5 135165758 3I AGTGGGTTTA ---/CAT CATCATATGA 3070 het 3070 ref 53 29 18 6 CAT 2 3 30100 CASAVA_Build 5 135165953 1I AATATCCTGG -/A AAAAATATTA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 5 6 30101 CASAVA_Build 5 135170929 3I AGATATAAAT ---/ATC ATCATATCTT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 ATC 1 2 30102 CASAVA_Build 5 135176421 1I ACAGCCACTG -/C CAGGCTGCCA 1946 het 1584 hom 24 6 7 11 C 1 2 30103 CASAVA_Build 5 135183668 1D TAGCTATTTA C/- CTAAGAGAAT 3070 het 3070 ref 54 33 17 6 C 2 1 30104 CASAVA_Build 5 135198952 1I GACTGGAGGG -/A AGCAGAGCTC 3070 het 2243 hom 26 12 11 3 A 1 2 30105 CASAVA_Build 5 135200566 8D76M1D CCACCCCCCC CCCCCACACACACACACATTTTGTTTGAGATTTTACTGGTTTGTGAAGTGCCAAGGTCTGGAAATCACTGACCTTATAATCCCAT/--------CACACACACATTTTGTTTGAGATTTTACTGGTTTGTGAAGTGCCAAGGTCTGGAAATCACTGACCTTATAATCCCA- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 10 13 14 6 N/A 0 0 30106 CASAVA_Build 5 135215192 2I GTATATATGC --/AT GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 61 28 24 9 AT 0 1 30107 CASAVA_Build 5 135235758 1I CAGTATAGCA -/G GGACTCTGCA 3070 hom 117 het 49 0 40 9 G 2 3 30108 CASAVA_Build 5 135299728 1I ACCTCCCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 14 12 T 15 16 30109 CASAVA_Build 5 135304101 3D AGCACTTACA GTT/--- GTTTTTATCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 GTT 2 1 30110 CASAVA_Build 5 135305294 1I GTTGTTGTTG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 8 30111 CASAVA_Build 5 135317431 1D ATGTCAAACC A/- ATTTAGCCTA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 2 1 30112 CASAVA_Build 5 135322614 1D TAAGCATAAT A/- CATTAGGTGT 3070 hom 138 het 50 0 47 4 A 1 0 30113 CASAVA_Build 5 135327658 1I ATTCTGGAGG -/T CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 0 1 30114 CASAVA_Build 5 135329728 1I AAATGACGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 924 hom 29 3 22 4 A 11 12 30115 CASAVA_Build 5 135334461 1I GGCTGAAAGA -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 6 7 30116 CASAVA_Build 5 135334583 3I TCTCTCTCTC ---/TTG TTGTTTTCAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTG 1 2 30117 CASAVA_Build 5 135339042 1D GAGACTCCCA C/- CAAGGGAGAG 3070 hom 96 het 36 0 33 5 C 2 1 30118 CASAVA_Build 5 135340760 4I ATTTCCAATA ----/TTAC TTATCTCTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTAC 0 1 30119 CASAVA_Build 5 135359291 1I AAAACAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 40 1 31 8 T 10 11 30120 CASAVA_Build 5 135369752 5D GACAGACACA CGTAT/----- CATAGAAAAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 CGTAT 1 0 30121 CASAVA_Build 5 135431645 2I TAATTTGGGA --/GT GGGGGGGGAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GT 0 1 30122 CASAVA_Build 5 135448042 1D AAGCAGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 8 A 13 12 30123 CASAVA_Build 5 135448844 1I TGATTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 A 10 11 30124 CASAVA_Build 5 135450407 1I TAAGCACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 11 12 30125 CASAVA_Build 5 135452747 2D AAATACTTCA AT/-- ATATCACTTT 3070 het 3070 ref 42 19 15 10 AT 3 2 30126 CASAVA_Build 5 135462082 1I TATTTTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 15 16 30127 CASAVA_Build 5 135473294 1I AGTTATAAAC -/A ACAGGAATTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 1 2 30128 CASAVA_Build 5 135475904 1D CCCAAAGTGC T/- TAGGATTACA 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 T 2 1 30129 CASAVA_Build 5 135478988 2I CTTCACCACC --/AT ACCCCACATC 3070 het 3070 ref 42 21 20 1 AT 0 1 30130 CASAVA_Build 5 135483691 1I CAGCTGTGGT -/A AAATCTGGGG 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 A 3 4 30131 CASAVA_Build 5 135485743 1I TAGAAAGAGA -/G GAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 G 1 2 30132 CASAVA_Build 5 135488254 2D TGCTTAATCA AT/-- ATCAGCTATT 3070 het 3070 ref 56 31 17 11 AT 2 1 30133 CASAVA_Build 5 135497626 3D CTGGAGCTTT GGG/--- GGGGGGGGGG 1523 het 27 hom 8 0 4 5 G 16 13 30134 CASAVA_Build 5 135508705 1I TAAGATGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 T 10 11 30135 CASAVA_Build 5 135511408 1I AAGCAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 10 11 30136 CASAVA_Build 5 135511843 1I CTTTAAGTTG -/T TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 2 3 30137 CASAVA_Build 5 135520544 1I AGCTTGCTGA -/C CCCCCCATGA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 C 6 7 30138 CASAVA_Build 5 135523234 1I TCTTGCTGCC -/T TAATGCCCTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 1 2 30139 CASAVA_Build 5 135524795 3D ATGCCAAGGT ATA/--- ATAGCTGTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 ATA 2 1 30140 CASAVA_Build 5 135526844 1D TTAATTATTA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 8 7 30141 CASAVA_Build 5 135529744 1I TTGTTCTGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2792 hom 37 11 19 7 T 8 9 30142 CASAVA_Build 5 135530759 1D TCGCCTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 20 18 11 T 11 10 30143 CASAVA_Build 5 135531982 5D GTTCATTTAG TTGTT/----- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 21 20 9 TTGTT 2 1 30144 CASAVA_Build 5 135536814 1I TTCATCCTGC -/A AGATAGTTGC 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 A 1 2 30145 CASAVA_Build 5 135540985 1I GATTGAGATT -/C ATCTTCATGG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 0 1 30146 CASAVA_Build 5 135543396 1I AATTTGTAGG -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 A 6 7 30147 CASAVA_Build 5 135550776 5I TAATAACTGA -----/ATAAT AGTGTTACAC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 ATAAT 0 1 30148 CASAVA_Build 5 135555069 1I TCTAATTGGG -/T TGAGTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 1 2 30149 CASAVA_Build 5 135557882 1D GCTGAGAGAG C/- CAGTAGAAAG 3070 het 3070 ref 42 24 14 5 C 2 1 30150 CASAVA_Build 5 135562539 1I CAAGCAGACC -/A CCCCCCTTGT 3070 het 3070 hom 50 15 22 13 A 0 1 30151 CASAVA_Build 5 135580172 13I GTGGCACAAA -------------/TACTGGATCCACG TCTCTGCTCC 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 TACTGGATCCACG 0 1 30152 CASAVA_Build 5 135592024 1I TTATAGTTCC -/T TTTTTTTTTT 1848 het 1280 hom 21 5 8 8 T 15 16 30153 CASAVA_Build 5 135610812 1I CTACATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 11 12 30154 CASAVA_Build 5 135620773 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1451 het 1451 ref 27 10 4 13 T 15 14 30155 CASAVA_Build 5 135651995 1D GAAGTAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 13 12 30156 CASAVA_Build 5 135667983 1D CCTTACCATT C/- CCCCATTTTA 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 C 5 4 30157 CASAVA_Build 5 135683314 1D GACCTACCAA G/- TGCTTTAACA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 G 1 0 30158 CASAVA_Build 5 135688654 1D TTAGGATGAG T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 8 7 30159 CASAVA_Build 5 135695771 1I GAGGGTCCCC -/G GTGCTAAGAG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 G 1 2 30160 CASAVA_Build 5 135696889 1D GTTCAAGAGG T/- TGGAACAGGG 3070 het 3070 hom 51 16 29 6 T 2 1 30161 CASAVA_Build 5 135703553 1I CAGGTGCATT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 38 25 11 2 A 7 8 30162 CASAVA_Build 5 135712720 1I CCCATTTCCT -/C CCTCCTCCTC 3070 het 3070 hom 39 12 26 1 C 2 3 30163 CASAVA_Build 5 135713157 2I CCCTGGGAGG --/TC TCGTTATTCA 3070 het 3070 hom 45 14 26 5 TC 1 2 30164 CASAVA_Build 5 135719193 1D AGACCATCCT G/- GCTAACATGG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 2 1 30165 CASAVA_Build 5 135728660 1D TCTATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 10 9 30166 CASAVA_Build 5 135728800 1I CCTCTACTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 19 19 15 A 9 10 30167 CASAVA_Build 5 135746079 1I TTCTAGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 29 13 2 T 10 11 30168 CASAVA_Build 5 135747743 1I GATGTCAGCC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 8 9 30169 CASAVA_Build 5 135751223 1D CACCCGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 T 6 5 30170 CASAVA_Build 5 135758050 3D TTAGAGATAA TAT/--- TATTATCTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TAT 3 2 30171 CASAVA_Build 5 135775073 1I AAAATAAAAA -/T AAAAAAAAAA 1098 het 11 hom 8 0 4 4 T 0 1 30172 CASAVA_Build 5 135779841 1D CATCTGACCA G/- GAATGAAAGA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 G 2 1 30173 CASAVA_Build 5 135802121 1I TAACCTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 20 7 T 11 12 30174 CASAVA_Build 5 135803852 1I TGAAAAATTT -/C CCCCCTAATT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 C 5 6 30175 CASAVA_Build 5 135899924 3I TTTTATATAG ---/TTC TTCGAGTACT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TTC 1 2 30176 CASAVA_Build 5 135901063 1D CTAAAATCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 9 30177 CASAVA_Build 5 135914961 1I TCAGTGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1284 hom 36 3 24 9 A 12 13 30178 CASAVA_Build 5 135943358 1D TAAAAATAAT A/- AAAAAATGGT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 7 6 30179 CASAVA_Build 5 135945023 4I ACTGATTATT ----/AATG AATATTTAGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AATG 0 1 30180 CASAVA_Build 5 135946413 3I AAAAAAACCA ---/ACC ACCAACCCCA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 ACC 1 2 30181 CASAVA_Build 5 135956172 1D TCATTCTTTC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 31 0 27 5 A 9 8 30182 CASAVA_Build 5 135989284 1I TTTGAGAAAC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 8 9 30183 CASAVA_Build 5 135996363 1D TGTTTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 12 11 30184 CASAVA_Build 5 136009741 1I GAAATGAGCT -/C TAGTACTGTA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 C 0 1 30185 CASAVA_Build 5 136011073 4D ATGCTAGCTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 TTTG 4 3 30186 CASAVA_Build 5 136013322 1D CTTACCACCG C/- CCCCCCCACC 3070 hom 74 het 33 0 26 8 C 8 7 30187 CASAVA_Build 5 136027530 3I ACGCCAGACA ---/TGT TGTGGACATC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 TGT 1 2 30188 CASAVA_Build 5 136028892 1I TCTCCGTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 7 het 40 1 32 7 T 9 10 30189 CASAVA_Build 5 136029982 1D GAATGTGTAG A/- AAAGAGCTCC 3070 het 3070 ref 41 23 14 5 A 4 3 30190 CASAVA_Build 5 136034830 1D CCAACCTCAC T/- ATTCTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 18 13 1 T 1 0 30191 CASAVA_Build 5 136037874 2D CATGCACGTG CA/-- CACACACACA 893 het 893 ref 57 42 3 14 CA 9 8 30192 CASAVA_Build 5 136056674 1I TATTTTAGTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 T 8 9 30193 CASAVA_Build 5 136056802 1D TCACCCTTTT G/- ATCAGGATCT 3070 het 3070 ref 59 34 17 8 G 1 0 30194 CASAVA_Build 5 136068116 1I AGAACACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 T 10 11 30195 CASAVA_Build 5 136074855 1I GTGCTAAGAG -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 7 8 30196 CASAVA_Build 5 136080948 19I AGCCTGCTGG -------------------/CTGGCCTGGCTGCCTGCTC CTGGCCTGTT 3070 hom 114 het 44 0 37 9 CTGGCCTGGCTGCCTGCTC 0 1 30197 CASAVA_Build 5 136084554 2D GGAGTAAGCA GG/-- GGATTTACAA 3070 het 3070 hom 45 18 19 9 G 4 2 30198 CASAVA_Build 5 136085626 1D AATAATTGTG T/- TTTTTTTTTT 1390 het 1390 ref 43 31 4 8 T 11 10 30199 CASAVA_Build 5 136091238 1I TGATGAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2396 hom 28 9 11 8 A 13 14 30200 CASAVA_Build 5 136098232 4D TAAATCATTG AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 8 AATA 3 2 30201 CASAVA_Build 5 136110971 3D AAAAATAAAA AAG/--- ATCTACTATT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 AAG 1 0 30202 CASAVA_Build 5 136112137 1D ATGATAGTGA G/- TGAATTCTCA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 G 1 0 30203 CASAVA_Build 5 136122865 1I ATCAGTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 A 13 14 30204 CASAVA_Build 5 136127148 1I TCCTTCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 35 0 26 9 T 11 12 30205 CASAVA_Build 5 136133905 2I8M2I GCTGAGCTGA --CATATTTC--/CTCATATTTCCT GTTTTCCTTC 3070 het 3070 ref 44 26 18 2 N/A 0 0 30206 CASAVA_Build 5 136146391 2I GTGTGAGTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 17 6 T 10 12 30207 CASAVA_Build 5 136154519 1I GTATATGCAG -/A AAAAAAGGGC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 6 7 30208 CASAVA_Build 5 136156007 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 69 het 27 0 24 5 T 7 8 30209 CASAVA_Build 5 136161574 6I GTTAAATGTC ------/ATTTCT ATTTTCAGTT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 ATTTCT 0 1 30210 CASAVA_Build 5 136191297 8I TCTTGTAGGC --------/TTTGTTTG TTTCTTTTTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TTTG 0 2 30211 CASAVA_Build 5 136194542 1I TAATATCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 26 1 22 3 T 11 12 30212 CASAVA_Build 5 136198824 1I GAAGGAGCCA -/G AAGGCAGATC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 0 1 30213 CASAVA_Build 5 136199847 1D AAGAGAAGTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 9 8 30214 CASAVA_Build 5 136205382 1D TCCTAAGTTT G/- CTGTTAAATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 1 0 30215 CASAVA_Build 5 136241774 1I AAAATCTCCC -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 6 7 30216 CASAVA_Build 5 136249183 1D AATTTTCCAT A/- AAAGACAGAA 3070 hom 150 het 53 0 50 3 A 4 3 30217 CASAVA_Build 5 136249961 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 53 het 31 1 28 2 A 9 10 30218 CASAVA_Build 5 136251790 1I AACGTTGGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 39 0 27 12 T 9 10 30219 CASAVA_Build 5 136281052 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 7 8 30220 CASAVA_Build 5 136297354 1D AATGCACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 30 3 20 7 A 14 13 30221 CASAVA_Build 5 136316888 4I TCCTTCTAAT ----/AGTC AGGCCCCTCT 3070 hom 69 het 24 0 22 2 AGTC 0 1 30222 CASAVA_Build 5 136326445 1I TGCTAACAAA -/G GGCAGTCGAC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 G 2 3 30223 CASAVA_Build 5 136329568 2D AAGAGCAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2185 het 2185 ref 36 18 6 13 T 18 16 30224 CASAVA_Build 5 136330685 1I TGTCTTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 31 0 24 7 T 12 13 30225 CASAVA_Build 5 136331094 1I ATTTTGGGAT -/G GGTTTTTCTA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 G 2 3 30226 CASAVA_Build 5 136341230 1I CTGCAGCCAA -/G GGGGCTTCAA 3070 hom 122 het 44 0 40 4 G 4 5 30227 CASAVA_Build 5 136342032 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 1250 het 355 hom 31 6 6 20 A 10 9 30228 CASAVA_Build 5 136343100 1D GACATGCAGA T/- GATACTCGGG 3070 hom 96 het 39 0 31 9 T 1 0 30229 CASAVA_Build 5 136343770 1D GTTTGCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1081 hom 38 5 17 16 A 17 16 30230 CASAVA_Build 5 136347351 10I TACATAAAGA ----------/ATTTGTAAGC ATTTGTAAGC 3070 hom 87 het 35 0 29 7 ATTTGTAAGC 1 2 30231 CASAVA_Build 5 136347973 15I GCTTCACGGG ---------------/AATAATTCTGTATTA AATAATTCTG 3070 hom 84 het 35 0 28 9 AATAATTCTGTATTA 1 2 30232 CASAVA_Build 5 136354235 1D ATGATGCTGT C/- CCTCAGGGGC 3070 hom 77 het 27 0 23 4 C 3 2 30233 CASAVA_Build 5 136358130 3D TATGATTTTG ATT/--- ATTATTACTA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 ATT 3 2 30234 CASAVA_Build 5 136368911 1D CAATAATAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 82 het 31 0 27 4 T 10 9 30235 CASAVA_Build 5 136368992 1D CTAGGTTTTG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 9 8 30236 CASAVA_Build 5 136387903 4I CCAGTTTGAA ----/GGCG GGGGGGGGGG 3070 hom 75 het 32 0 18 14 GGCG 0 1 30237 CASAVA_Build 5 136388198 1D TCTGACATGT A/- AAAAAAAAAA 999 het 999 ref 37 23 3 11 A 15 14 30238 CASAVA_Build 5 136399878 1D GCCTTGCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 T 11 10 30239 CASAVA_Build 5 136424222 1D TTTTGTACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 9 10 A 11 10 30240 CASAVA_Build 5 136426318 1D ACCTTTCCTG A/- AAAAAACAAA 2200 het 2200 ref 23 14 7 2 A 7 6 30241 CASAVA_Build 5 136426646 1I CAAGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 1542 hom 10 het 5 0 4 1 C 3 4 30242 CASAVA_Build 5 136434608 2D GGCCAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 37 5 14 18 T 18 16 30243 CASAVA_Build 5 136437622 1I GTGAGGCACT -/G GTATTAAAAA 3070 hom 64 het 29 0 21 8 G 1 2 30244 CASAVA_Build 5 136443013 4I GAAGTCATCT ----/CTCA CTATCCATCT 3070 hom 117 het 49 0 39 10 CTCA 0 1 30245 CASAVA_Build 5 136443123 3I CATCTGATTC ---/CCG CCCCCCCCCC 3070 het 98 hom 38 2 12 24 CCG 0 1 30246 CASAVA_Build 5 136443534 10I CTCTAATATT ----------/TTCTTCCCAA TTATAATTTA 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 TTCTTCCCAA 0 1 30247 CASAVA_Build 5 136451464 1D ACACAGGGGT G/- GGCTGTATCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 3 2 30248 CASAVA_Build 5 136462575 1I CAAATGAGAG -/C CAGGCTTTGT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 C 1 2 30249 CASAVA_Build 5 136490388 4D AGAAAGTTGT AAGA/---- AAGAAACTTG 3070 het 3070 hom 37 12 18 9 AAGA 2 1 30250 CASAVA_Build 5 136502290 2D CAAATAATAA CC/-- CCCCCCCCCC 2806 het 1771 hom 26 10 10 6 C 12 10 30251 CASAVA_Build 5 136509884 1I GAGGCACAAG -/C ATACCTGTTG 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 C 0 1 30252 CASAVA_Build 5 136531224 1D TGACCACAAT G/- GAATAAAACT 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 G 2 1 30253 CASAVA_Build 5 136533112 2D TCTGCCCAGG CA/-- CACACACCCA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 CA 4 3 30254 CASAVA_Build 5 136552256 3I TTCGGCCAAT ---/TAA TAATAACACT 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 TAA 2 3 30255 CASAVA_Build 5 136567817 1I GCTAATATTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 7 8 30256 CASAVA_Build 5 136580298 1I GACTTCGTCT -/A AAAAAAAAAG 2818 het 2818 ref 26 10 8 8 A 9 10 30257 CASAVA_Build 5 136586897 1I CTATAACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 18 15 15 A 13 14 30258 CASAVA_Build 5 136602113 5I TTACCACATA -----/GAATC AAGAAGCACA 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 GAATC 0 1 30259 CASAVA_Build 5 136630335 1I CAAATTTCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 8 25 2 T 9 10 30260 CASAVA_Build 5 136684515 2D CTAAAGAAAA AG/-- AGTTATATGA 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 AG 2 1 30261 CASAVA_Build 5 136703679 1I TATTTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 34 1 25 8 A 10 11 30262 CASAVA_Build 5 136725919 1I GTCAGCAACC -/T TTTTTTTTTT 1689 het 539 hom 28 4 9 15 T 17 18 30263 CASAVA_Build 5 136748175 1D TATGTATGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 40 het 20 0 14 7 T 9 8 30264 CASAVA_Build 5 136750016 4D TTGAAGAACA CAGT/---- CAGAGGACTG 3070 hom 90 het 31 0 31 2 CAGT 1 0 30265 CASAVA_Build 5 136751450 1D TAAAACTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 45 0 39 6 A 11 10 30266 CASAVA_Build 5 136767275 1I CTAGAGGGCA -/T TCCAGGCAGC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 2 30267 CASAVA_Build 5 136775491 1D AAATGTTGAC T/- GTTTTTCCAC 3070 het 3070 hom 39 18 16 6 T 1 0 30268 CASAVA_Build 5 136780921 1D AACCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 1998 het 1998 ref 33 14 9 10 T 17 16 30269 CASAVA_Build 5 136787578 1D TGAAGATTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 74 het 30 0 24 6 T 10 9 30270 CASAVA_Build 5 136796013 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 126 het 47 0 43 5 A 7 6 30271 CASAVA_Build 5 136796933 1D CAATAGCCAG T/- TCACTAGGCA 3070 hom 145 het 57 0 46 11 T 2 1 30272 CASAVA_Build 5 136799051 1I TTCTTACCAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 2724 hom 27 6 14 7 T 7 8 30273 CASAVA_Build 5 136799390 1I TTTTCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 2351 het 2351 ref 23 12 6 5 T 11 12 30274 CASAVA_Build 5 136799605 1D TAGCCGAGTG T/- TGGTGGCACA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 2 1 30275 CASAVA_Build 5 136803879 1D GAGAAAAGCT C/- CTAGAAAATA 3070 het 3070 hom 42 15 20 8 C 2 1 30276 CASAVA_Build 5 136811194 1D19M2D TGAAATCATT CCCCCCCCCAATATATGACCCA/-CCCCCCCCAATATATGACC-- CACCACCACC 1964 het 1232 hom 35 14 10 18 N/A 0 0 30277 CASAVA_Build 5 136814463 4I GCTGCTCCAC ----/CTCT CTCTCTCACC 3070 hom 74 het 29 0 23 6 CT 3 5 30278 CASAVA_Build 5 136817166 1D GCCCAGCCAC G/- GGAATCTAGA 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 G 3 2 30279 CASAVA_Build 5 136821089 1D ACTCTGGATT G/- ACTATTCCTT 3070 het 3070 hom 45 17 24 6 G 1 0 30280 CASAVA_Build 5 136824343 1D GATCTACAAA G/- CTCTACATAT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 G 1 0 30281 CASAVA_Build 5 136839623 1D AAATTATAGG T/- TTTTTTTTTT 2129 het 2129 ref 16 7 5 4 T 13 12 30282 CASAVA_Build 5 136884252 10I GTCACCCAGG ----------/CTGGAATGCA TTGGCATGGT 1735 hom 10 het 4 0 4 0 CTGGAATGCA 0 1 30283 CASAVA_Build 5 136896663 2I TCTCCTAGAG --/CC CCTGTGATGG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 2 4 30284 CASAVA_Build 5 136926305 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1050 het 1050 ref 28 16 5 7 T 13 12 30285 CASAVA_Build 5 136928499 1D CCTCTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 39 0 25 14 T 12 11 30286 CASAVA_Build 5 136934254 1D TCATTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 12 11 30287 CASAVA_Build 5 136955046 1D ATGCAAAAAA T/- AACTCGAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 1 0 30288 CASAVA_Build 5 136962910 1I CAATGTATAG -/A AAAAAAGAGA 3070 het 3070 hom 58 25 24 9 A 6 7 30289 CASAVA_Build 5 136970023 1D TCCTTAGAAG A/- AAAAACTTTT 3070 het 260 hom 38 2 27 9 A 6 5 30290 CASAVA_Build 5 136972960 2I CTGCCTCACC --/CA CAGTTATATG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 CA 1 2 30291 CASAVA_Build 5 136988694 1D TTCAGCCCAA G/- GGTTGTTGAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 3 2 30292 CASAVA_Build 5 136993350 2D CCAACAATGG CT/-- CTCTCTAACT 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 CT 4 3 30293 CASAVA_Build 5 137004322 1I AGGCCAGCCA -/C CCCCCCCCAA 2557 het 2557 ref 27 10 9 8 C 8 9 30294 CASAVA_Build 5 137009382 1D CAAAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 42 0 33 9 A 11 10 30295 CASAVA_Build 5 137014480 4D GATTTAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 30 16 8 9 AAAG 4 3 30296 CASAVA_Build 5 137025703 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AGAGAGAGAG 3070 het 2166 hom 29 8 17 4 AAG 0 1 30297 CASAVA_Build 5 137031588 8I GTTAGCAAGC --------/TGTACAAG TGTACAAGGT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 TGTACAAG 1 2 30298 CASAVA_Build 5 137034542 1I GCCTGGGCAA -/C AGAGCGAGAC 1793 het 1793 ref 30 10 7 13 C 0 1 30299 CASAVA_Build 5 137037426 3I AGTGATGCTG ---/GAA GAAGAACAGT 3070 het 3070 hom 44 12 19 13 GAA 2 3 30300 CASAVA_Build 5 137043119 1D TTCTATGCTG T/- GAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 1 0 30301 CASAVA_Build 5 137059924 1D GAAAAGAGGT G/- GGGGGGTATA 1981 het 1981 ref 27 17 5 5 G 7 6 30302 CASAVA_Build 5 137065848 1D CACAAGAGCA C/- CAGGTTTGCT 3070 het 3070 ref 50 23 21 7 C 2 1 30303 CASAVA_Build 5 137108900 3D TAATTTTACT CTC/--- CTCATTTGCC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 CTC 2 1 30304 CASAVA_Build 5 137115701 6D CGGATATAGG AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 8 A 16 10 30305 CASAVA_Build 5 137153904 2D TGGTGAGGCA CT/-- CTTCCAGGTG 2678 het 2678 ref 21 11 6 4 CT 2 1 30306 CASAVA_Build 5 137155100 1I CAAACAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 A 11 12 30307 CASAVA_Build 5 137157825 1I ATAACATATT -/G GATACTTGAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 G 1 2 30308 CASAVA_Build 5 137195574 1D ATGAATGGAT A/- AACAAATTGT 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 A 3 2 30309 CASAVA_Build 5 137209147 3I CTATCCTGTG ---/AGA AGCTCAAGCC 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 AGA 0 1 30310 CASAVA_Build 5 137241803 1D ACCTGATCGA T/- TTTTTTTTTT 1716 het 499 hom 22 7 4 11 T 19 18 30311 CASAVA_Build 5 137260515 1D CATTGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2725 hom 19 8 8 3 T 11 10 30312 CASAVA_Build 5 137264725 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1925 het 1925 ref 22 11 6 5 A 13 14 30313 CASAVA_Build 5 137265000 1D CCTATTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 A 11 10 30314 CASAVA_Build 5 137270359 1D ACGGGTCTTT G/- GGGGCAAGGT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 5 4 30315 CASAVA_Build 5 137274384 1I AAAGAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2194 het 1912 hom 24 9 7 8 A 11 12 30316 CASAVA_Build 5 137279618 6D ACACATTTTT TTTTTC/------ TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 TTTTTC 1 0 30317 CASAVA_Build 5 137284345 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 2734 het 1024 hom 19 6 9 4 A 15 16 30318 CASAVA_Build 5 137288023 21D TTGCTACCAT TCTATTCTTCAAAAAGTGGAA/--------------------- TCTGTCCTGT 3070 het 3070 ref 41 27 17 1 TCTATTCTTCAAAAAGTGGAA 1 0 30319 CASAVA_Build 5 137289953 1D ACTACCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 12 11 30320 CASAVA_Build 5 137300049 1I TGAGCATTTC -/T TTTTTTTTTT 2847 het 2847 ref 42 16 11 15 T 13 14 30321 CASAVA_Build 5 137305875 2I CCAAAGGTAA --/AG AGAAGTGGAT 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 AG 1 2 30322 CASAVA_Build 5 137307333 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2993 hom 19 7 11 1 A 10 11 30323 CASAVA_Build 5 137311769 1D ATGGCTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 44 2 30 12 A 14 13 30324 CASAVA_Build 5 137318208 1D CAGAGTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 8 5 T 12 11 30325 CASAVA_Build 5 137318661 1I TACAAATGTT -/A AGTTTTCAAG 3070 het 2962 hom 28 9 15 4 A 1 2 30326 CASAVA_Build 5 137318951 15D ATTCCTATGT ATAATATATATTTTA/--------------- ATAATACCCA 3070 het 3070 hom 39 13 25 6 ATAATATATATTTTA 1 0 30327 CASAVA_Build 5 137319096 1D TCTTTGCAAA T/- ATAATGTTTG 3070 het 3070 ref 50 22 21 8 T 1 0 30328 CASAVA_Build 5 137320033 1I CATAAAAGGC -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 7 8 30329 CASAVA_Build 5 137320346 2I ATGCAAAAAA --/GG GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 27 11 13 3 G 8 10 30330 CASAVA_Build 5 137325468 2D TCTATTGAGA CT/-- CTACATTAGT 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 CT 2 1 30331 CASAVA_Build 5 137329568 1I ACCTTCATAC -/A ACTTTCAACT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 1 2 30332 CASAVA_Build 5 137329689 2D GTAGCACATT AA/-- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 10 8 30333 CASAVA_Build 5 137331111 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 10 9 30334 CASAVA_Build 5 137346251 3I GAGCCGCCCT ---/TTA TTATTTATCA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TTA 1 2 30335 CASAVA_Build 5 137348223 1D TGTTCTCCCC T/- ATACCATGTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 T 1 0 30336 CASAVA_Build 5 137349282 3D ACACTCTCAC ATA/--- ATAATGACAC 3070 het 3070 ref 47 25 20 5 ATA 2 1 30337 CASAVA_Build 5 137349665 1I GTATACATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 10 11 30338 CASAVA_Build 5 137350024 1D TCCCCCCCCC A/- AAAAAAATTG 3070 het 269 hom 26 7 13 6 A 8 7 30339 CASAVA_Build 5 137353485 1I AGCTGGGGGG -/A AAAAAACCCC 2697 het 2697 ref 27 17 6 4 A 6 7 30340 CASAVA_Build 5 137356590 3I AGGATACTTT ---/ACA ACAACGATAT 3070 het 3070 hom 55 21 28 6 ACA 1 2 30341 CASAVA_Build 5 137367893 15I CTAAATCTCC ---------------/AATGAATCCTTCTAA AATGACTGTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AATGAATCCTTCTAA 0 1 30342 CASAVA_Build 5 137369052 1D AACAAAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 12 11 30343 CASAVA_Build 5 137382751 1D AATGAAAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1232 hom 37 3 19 15 A 10 9 30344 CASAVA_Build 5 137383271 1D CTGTAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 18 1 14 3 T 15 14 30345 CASAVA_Build 5 137388491 2D CAGAGTCTTA CT/-- CTGTCACCCA 3070 het 1572 hom 18 5 11 2 CT 2 1 30346 CASAVA_Build 5 137392618 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 10 9 30347 CASAVA_Build 5 137400670 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 7 6 30348 CASAVA_Build 5 137406228 1D AACTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 36 1 28 7 A 13 12 30349 CASAVA_Build 5 137409534 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1099 het 1099 ref 14 7 3 4 A 15 16 30350 CASAVA_Build 5 137411088 15D GCAAGACTCC ATCTCAAAAAAAAAA/--------------- AAATGAAGAT 3070 het 515 hom 14 3 8 8 ATCTCAAAAAAAAAA 1 0 30351 CASAVA_Build 5 137421261 1I GAACCTGTCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 9 10 30352 CASAVA_Build 5 137426553 1I ATCTTTACTT -/A AAAAAAAAAA 1762 het 1762 ref 24 10 7 7 A 15 16 30353 CASAVA_Build 5 137426978 1D TCTCACATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 12 11 30354 CASAVA_Build 5 137427816 3D GGAAGAGAGA GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 GAG 7 6 30355 CASAVA_Build 5 137437411 1D ATTTTAATTG T/- TTTTTTTTTT 2952 hom 35 het 17 0 10 7 T 15 14 30356 CASAVA_Build 5 137438591 1D AAAAGTGGTC A/- AAAAAAAATG 2805 het 2805 ref 22 10 6 6 A 9 8 30357 CASAVA_Build 5 137446871 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2029 hom 27 het 13 0 7 6 A 16 15 30358 CASAVA_Build 5 137456307 1I CAAAAATGGG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 7 8 30359 CASAVA_Build 5 137457096 2D CACTAGATTT CC/-- CCCCCCCACA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 C 9 7 30360 CASAVA_Build 5 137465966 1I TTGTGGGAGG -/C CTCCCTGTCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 2 30361 CASAVA_Build 5 137470303 1D CTGAGGCCCC T/- ATAACAAAAG 3070 het 3070 ref 32 12 12 9 T 1 0 30362 CASAVA_Build 5 137482815 2D ATTTTTTGAG AC/-- AGAGTCTCGC 2914 het 2914 ref 28 16 11 1 AC 1 0 30363 CASAVA_Build 5 137486269 1D ATTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 15 14 30364 CASAVA_Build 5 137492787 1I TGAAATCAGA -/T TTTTTTTTTT 2536 het 2536 ref 23 10 8 5 T 11 12 30365 CASAVA_Build 5 137535004 2D CAATGCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 147 hom 26 2 9 16 A 16 14 30366 CASAVA_Build 5 137536986 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 189 hom 29 1 23 5 A 13 12 30367 CASAVA_Build 5 137539286 1I TATTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 2619 het 710 hom 19 4 11 4 A 15 16 30368 CASAVA_Build 5 137540956 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAATACA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 6 7 30369 CASAVA_Build 5 137552288 1I CTTGGGGGCC -/A AAAAAAAAAA 1608 het 1608 ref 44 27 5 12 A 11 12 30370 CASAVA_Build 5 137581019 1I ACAACCCAAA -/T TTTTTTTTTT 1896 het 1896 ref 23 8 6 9 T 15 16 30371 CASAVA_Build 5 137631998 1D AAGCAAATGC A/- AAAAAAAAAA 2824 het 338 hom 20 2 9 11 A 17 16 30372 CASAVA_Build 5 137636231 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 10 11 30373 CASAVA_Build 5 137640384 2I GGAGGGTGTT --/AG ACAATCCACT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 AG 0 1 30374 CASAVA_Build 5 137647988 1D CATTGGTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 12 23 8 T 10 9 30375 CASAVA_Build 5 137661752 1D ACACCTTGCA T/- TTTTTTTTTT 2155 hom 36 het 29 0 10 19 T 17 16 30376 CASAVA_Build 5 137665150 1I CAGAAAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 9 10 30377 CASAVA_Build 5 137680566 1D TGGGCAGAAA G/- GTTTCTGGCC 3070 het 3070 ref 36 22 10 5 G 2 1 30378 CASAVA_Build 5 137696911 1D CTTTGAGAAA C/- AAAAGTCAAA 3070 het 3070 ref 41 26 14 1 C 1 0 30379 CASAVA_Build 5 137699724 1D TGTTCATTTG T/- TTTTTTTTTT 2411 het 106 hom 19 1 9 9 T 15 14 30380 CASAVA_Build 5 137711444 2I TGAGGGGCTC --/TA TCTCTCTCTC 3070 hom 84 het 36 0 25 11 TA 0 1 30381 CASAVA_Build 5 137724928 1D CTGAAACTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 44 2 28 14 T 13 12 30382 CASAVA_Build 5 137741034 2D CACAAGAGAC AG/-- GGTCTTGTTC 3070 het 3070 ref 48 25 17 7 AG 1 0 30383 CASAVA_Build 5 137742364 27D AGGGAGATAC ATATATATATAGATTATATATATCATG/--------------------------- ATATATATAT 1909 het 1909 ref 10 7 4 3 ATATATATATAGATTATATATATCATG 1 0 30384 CASAVA_Build 5 137744183 4I ATTTTCACTA ----/ATAC ATATGTCACA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 ATAC 0 1 30385 CASAVA_Build 5 137745551 1D CTACGTCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2285 hom 30 9 13 8 T 13 12 30386 CASAVA_Build 5 137747006 4D TTTACAGGCG CGAA/---- CGAACCACCA 1836 het 1836 ref 17 6 6 7 CGAA 2 1 30387 CASAVA_Build 5 137764342 4I TCTAAAAATC ----/AATT AATTAAAGTA 3070 hom 88 het 35 0 29 7 AATT 1 2 30388 CASAVA_Build 5 137765513 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 825 het 825 ref 42 35 3 4 T 10 9 30389 CASAVA_Build 5 137766925 4D GAGGAGGGAT AATC/---- AATCAATAGG 3070 het 3070 ref 33 19 14 0 AATC 2 1 30390 CASAVA_Build 5 137796015 2D TAAAAAGAAC AA/-- AGAGGGCTGG 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 3 1 30391 CASAVA_Build 5 137814885 1D AGGTGCCCCC T/- GACCCTTCCT 2568 het 2568 ref 25 11 7 7 T 1 0 30392 CASAVA_Build 5 137815192 9D GGTGAGGCTC CTCAATGAT/--------- CTACCTTTCC 2198 het 2198 ref 25 15 6 9 CTCAATGAT 1 0 30393 CASAVA_Build 5 137818386 10I TCCAGGCTGG ----------/TTGTCCAGGT TCTCAAACTC 3070 het 2265 hom 24 5 13 6 TTGTCCAGGT 0 1 30394 CASAVA_Build 5 137841214 2I CCTCCACCCC --/CG CCGGGTTCAA 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 CG 0 1 30395 CASAVA_Build 5 137848130 1D TGCACTCCAG C/- CTGGGCGACA 3070 het 850 hom 13 3 7 3 C 2 1 30396 CASAVA_Build 5 137852499 1I AGTAGGTGTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 8 9 30397 CASAVA_Build 5 137857735 1I TCCTTGATTC -/T TTTTTTTTTT 2302 het 1320 hom 17 4 7 6 T 10 11 30398 CASAVA_Build 5 137867583 3D GTTGGGAGAG GAA/--- GAACCATGAG 3070 hom 116 het 41 0 37 4 GAA 2 1 30399 CASAVA_Build 5 137868964 3D ACCACCTTGG CTC/--- CTCAACTAGG 3070 het 3070 hom 53 14 24 17 CTC 2 1 30400 CASAVA_Build 5 137885703 1D GTTTTTTTGG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 38 12 19 8 T 8 7 30401 CASAVA_Build 5 137889059 3I ATAATTTTAT ---/AAG GAGAACAAGC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AAG 0 1 30402 CASAVA_Build 5 137898514 1I TAAGGGGGGG -/A GGTCAAATGT 3070 het 2435 hom 27 9 12 6 A 0 1 30403 CASAVA_Build 5 137898927 1D AATAATTGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2467 hom 23 7 8 8 T 10 9 30404 CASAVA_Build 5 137905354 1D ACTTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 13 hom 25 1 18 6 G 11 10 30405 CASAVA_Build 5 137905469 1D GAACAACGTT A/- AAAAAAAAAG 2819 het 2819 ref 21 11 7 3 A 10 9 30406 CASAVA_Build 5 137913552 2I GTGTGAAAAT --/TA TATATATATA 2233 het 2233 ref 12 6 5 1 TA 8 9 30407 CASAVA_Build 5 137930768 1D ATGATTTGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 14 21 7 A 10 9 30408 CASAVA_Build 5 137937574 3D ATAATTACAG AGA/--- AGAATAATCA 3070 het 3070 hom 37 17 19 2 AGA 2 1 30409 CASAVA_Build 5 137953691 1I GAACCTTCTC -/A GGGGCAGAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 30410 CASAVA_Build 5 137960067 1D TGGGCCCCCC T/- GGCTGGTCCT 2131 het 2131 ref 24 11 7 8 T 1 0 30411 CASAVA_Build 5 137967572 4D CCATAGTGGC CTGA/---- CTGACCCTGA 3070 hom 81 het 33 0 27 9 CTGA 2 1 30412 CASAVA_Build 5 137975096 1I AAAGTTTCAG -/A AAAAAATGGC 3049 het 3049 ref 26 11 10 5 A 6 7 30413 CASAVA_Build 5 137978998 1D GCTCTGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 14 12 T 13 12 30414 CASAVA_Build 5 137979634 1D ATCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2987 hom 40 11 17 13 A 14 13 30415 CASAVA_Build 5 137987173 1D ATCTGATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 43 2 36 5 A 13 12 30416 CASAVA_Build 5 137995562 1I AATTCCATCT -/A TCTCTGGACT 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 A 0 1 30417 CASAVA_Build 5 137999099 1I TTCCAGTTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 7 8 30418 CASAVA_Build 5 138001588 2D ACTCTCTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2615 het 1198 hom 18 8 7 3 A 15 13 30419 CASAVA_Build 5 138004538 1I GGGCAGACTG -/C CCCCTCAAGC 3070 hom 78 het 38 0 20 18 C 4 5 30420 CASAVA_Build 5 138006062 1D6M1D CCATCCCCCC ACACCATA/-CACCAT- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 N/A 0 0 30421 CASAVA_Build 5 138006380 4I CTGACAGATG ----/GACA GACAATTTTT 3070 hom 94 het 36 0 31 5 GACA 1 2 30422 CASAVA_Build 5 138007360 1D TTTTTTGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 28 0 22 6 T 11 10 30423 CASAVA_Build 5 138018630 1I AAGAGAATGG -/A AAAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 A 4 5 30424 CASAVA_Build 5 138018675 8I AACTGGGGTT --------/GAAGAAAA GAAGAAAAGA 1671 het 1671 ref 18 5 4 10 GAAGAAAA 1 2 30425 CASAVA_Build 5 138025204 4D GCTGGAATCC ATCT/---- ATCTGGCTGG 3070 het 3070 ref 41 16 11 15 ATCT 2 1 30426 CASAVA_Build 5 138040375 2I GGAATGAGTC --/AT ATATAAGCTC 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 AT 2 3 30427 CASAVA_Build 5 138051689 2I TGAGATCACA --/CT CTGGGTTAGG 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 CT 1 2 30428 CASAVA_Build 5 138054010 1I AAAAAAAGGG -/T TTTTTTTTTG 1931 het 1931 ref 23 15 6 2 T 9 10 30429 CASAVA_Build 5 138055171 1D TTAAATCAGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 31 12 10 9 T 9 8 30430 CASAVA_Build 5 138113640 3D TGTTCTTGCA CTG/--- CTAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 CTG 1 0 30431 CASAVA_Build 5 138113959 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAAAA 2193 hom 12 het 16 0 9 7 A 16 15 30432 CASAVA_Build 5 138114317 1D CATGCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2962 hom 37 13 13 12 T 15 14 30433 CASAVA_Build 5 138124051 1D TCCCAAGCTC A/- AAACGATTCT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 4 3 30434 CASAVA_Build 5 138125192 1I ATGAACAGGT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 7 8 30435 CASAVA_Build 5 138126076 1I TTTTCTTTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 9 10 30436 CASAVA_Build 5 138126378 2D TTAAAATGTC TG/-- TCATTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 TG 1 0 30437 CASAVA_Build 5 138126688 1I TATTGCTATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 9 10 30438 CASAVA_Build 5 138130622 4I TTTCATAACT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 25 9 13 3 TTTC 3 4 30439 CASAVA_Build 5 138134539 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2317 het 530 hom 15 2 7 6 A 15 14 30440 CASAVA_Build 5 138137241 2I GTGAGTGATT --/AG AGAGTCCTTT 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 AG 2 3 30441 CASAVA_Build 5 138141749 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGGTA 2333 het 144 hom 10 1 7 2 T 6 7 30442 CASAVA_Build 5 138144537 2D AAAGACTAAC TG/-- TTATTTTCGT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 TG 1 0 30443 CASAVA_Build 5 138145143 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1771 het 1230 hom 15 6 5 4 A 17 16 30444 CASAVA_Build 5 138149115 1I GAGTTTGGGC -/A AGTGTTTGCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 2 30445 CASAVA_Build 5 138152777 1D TCCTGTTTTT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3 hom 46 3 36 8 C 10 9 30446 CASAVA_Build 5 138159977 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 2140 het 75 hom 7 1 6 0 A 6 5 30447 CASAVA_Build 5 138160558 1D CTACAGAAAA T/- TTTAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 4 3 30448 CASAVA_Build 5 138161474 1I AAAAACTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 10 11 30449 CASAVA_Build 5 138166557 1D AGCTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 2715 het 2715 ref 22 9 10 4 T 12 11 30450 CASAVA_Build 5 138167964 1I TTAGTATATT -/C ATTAGGTTGT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 C 0 1 30451 CASAVA_Build 5 138168327 2I ATAGTGACAC --/TG TAAGTATTCA 3070 het 3070 hom 57 26 23 8 TG 0 1 30452 CASAVA_Build 5 138181856 2D CATATCCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 89 het 89 ref 28 16 2 10 T 14 12 30453 CASAVA_Build 5 138182003 1I TGTCATATTT -/A ACTTGCTTTC 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 1 2 30454 CASAVA_Build 5 138182658 1I ATTGGCGTGA -/C TTGGGAAGAA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 C 0 1 30455 CASAVA_Build 5 138184337 1I GTTGTTTTGA -/G GGGGGGTGAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 6 7 30456 CASAVA_Build 5 138191615 1I TGTATGTATG -/T GTATATACAC 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 T 0 1 30457 CASAVA_Build 5 138191959 1I TGATACCCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 9 10 30458 CASAVA_Build 5 138205220 1D TCATTCTCTC A/- AAACTGCCAT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 4 3 30459 CASAVA_Build 5 138207682 2I GCAAGTTTGT --/TA GGAAAGCAAA 3070 het 2911 hom 17 7 8 2 TA 0 1 30460 CASAVA_Build 5 138209504 15D GGTACAGGTT TTTTTTGTTTTTTTG/--------------- TTTTTTGTTT 2881 het 2881 ref 26 12 8 8 TTTTTTGTTTTTTTG 2 1 30461 CASAVA_Build 5 138210886 1I AAGCCGGCGT -/A AGTCCCTCCC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 1 2 30462 CASAVA_Build 5 138211757 1I CTGTTCTAGT -/G CTTGACAGCT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 G 0 1 30463 CASAVA_Build 5 138244525 1I TATGGCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 11 12 30464 CASAVA_Build 5 138245350 3I AATTCATTGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 TTG 5 6 30465 CASAVA_Build 5 138253938 1D CCCAATAAGA T/- TTGCCTTCAC 3070 het 3070 hom 35 18 15 2 T 3 2 30466 CASAVA_Build 5 138259092 1D GCAGTTTTTT G/- GGGGGGGGGA 1031 het 1031 ref 22 8 6 8 G 10 9 30467 CASAVA_Build 5 138260673 1I ATATATACAG -/C TGATTGTGTT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 C 0 1 30468 CASAVA_Build 5 138276347 2D TTTTTAAAAT TA/-- TATAAGTAAG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 TA 3 2 30469 CASAVA_Build 5 138276647 2D CTGAAGTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 T 12 10 30470 CASAVA_Build 5 138281120 4D TAGTACAGTT TTTA/---- TTTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 57 29 25 3 TTTA 1 0 30471 CASAVA_Build 5 138286590 6I GGGTCACTTT ------/GTTTAA TGAACGGAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 GTTTAA 0 1 30472 CASAVA_Build 5 138292529 1I GTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1764 hom 20 5 10 5 A 11 12 30473 CASAVA_Build 5 138298191 3I AACATAATGT ---/ATC ATCATGAAGA 3070 het 3070 hom 55 22 28 5 ATC 1 2 30474 CASAVA_Build 5 138298491 4D ATTACTGTAG TGAT/---- TGATTGATTG 3070 het 3070 hom 38 15 14 12 TGAT 4 3 30475 CASAVA_Build 5 138306615 1I GTTCTCCAAG -/C CTCCCACTCT 2353 het 2353 ref 26 15 9 2 C 1 2 30476 CASAVA_Build 5 138312225 1D CACCCCCGCA T/- TGGCCCCATT 2141 hom 38 het 16 0 9 7 T 2 1 30477 CASAVA_Build 5 138317282 1D CCTGCCCCCC A/- CGACTTGAGA 1083 het 1083 ref 28 12 4 12 A 1 0 30478 CASAVA_Build 5 138345429 1I CTTTTTTTTT -/C TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 49 20 18 11 C 0 1 30479 CASAVA_Build 5 138347441 1D AGACAAGAGC T/- TCCTCTGCTG 3070 het 3070 ref 52 25 19 8 T 2 1 30480 CASAVA_Build 5 138354867 22D TAAATGCAGA ATAAAAGCTGAGAGAAAATGGG/---------------------- ATAGAAATAA 3070 het 3070 ref 46 23 20 6 ATAAAAGCTGAGAGAAAATGGG 1 0 30481 CASAVA_Build 5 138368836 4D TCTGCCAAGT AAAA/---- AAAAATTTTT 3070 het 2956 hom 19 6 13 3 A 9 5 30482 CASAVA_Build 5 138377173 1D TTACAGGGCT A/- CCACATAAAG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 1 0 30483 CASAVA_Build 5 138383512 1D CTCAAGCCTC T/- AAAGCCTTAT 3070 het 3070 ref 46 23 19 7 T 1 0 30484 CASAVA_Build 5 138400583 11D TTTGGAGAAT ATCCTTTAGTC/----------- ATTCTTTCAG 3070 het 3070 ref 29 21 8 5 ATCCTTTAGTC 1 0 30485 CASAVA_Build 5 138403655 1D ATATCTGACA G/- TATTGTCTAT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 G 1 0 30486 CASAVA_Build 5 138409921 1I TCTTATGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2986 hom 24 8 11 5 A 10 11 30487 CASAVA_Build 5 138413706 1I TACCTTTTGA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 7 8 30488 CASAVA_Build 5 138415809 4I TGAGTTCCAC ----/CAGT CAGTCACTCT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 CAGT 1 2 30489 CASAVA_Build 5 138423906 4I GGATTTGAGG ----/TGTT TGTTTATTGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TGTT 1 2 30490 CASAVA_Build 5 138438405 4D TCTTTCTCTC TCTG/---- TCTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 TCTG 1 0 30491 CASAVA_Build 5 138453121 1I TCTTTTTGTT -/A AAAAAAGACA 3070 het 3070 ref 54 25 22 7 A 6 7 30492 CASAVA_Build 5 138466090 3D AAAAAAAAAA GAG/--- AGAGAGAGAG 733 het 733 ref 37 13 8 17 GAG 1 0 30493 CASAVA_Build 5 138466297 1D TGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2093 het 2093 ref 22 11 7 4 T 15 14 30494 CASAVA_Build 5 138476916 1D AATAAATAAA T/- TTAAAAAAAA 1394 het 1394 ref 12 6 5 1 T 3 2 30495 CASAVA_Build 5 138496652 1D CATACCCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 761 hom 47 2 31 15 A 13 12 30496 CASAVA_Build 5 138500977 1I GTTTGGCCCC -/A AAAGCCATGC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 3 4 30497 CASAVA_Build 5 138501733 2D ACACACATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 2293 hom 45 10 17 22 AC 9 8 30498 CASAVA_Build 5 138517819 1D AATATCAGGT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 51 20 21 11 A 9 8 30499 CASAVA_Build 5 138519430 1I AAATAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 130 hom 28 1 17 10 T 11 12 30500 CASAVA_Build 5 138522228 1D CCCCAAGTGT G/- GGGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 5 4 30501 CASAVA_Build 5 138532211 1D GGGCCAATGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 80 het 33 0 25 9 T 10 9 30502 CASAVA_Build 5 138551245 1I57M2I GTGATGGTAC -GGACATATTAATTAAAATGGTAGGATGGGTATACACTGCAATAGGCTTGGAACACCA--/GGGACATATTAATTAAAATGGTAGGATGGGTATACACTGCAATAGGCTTGGAACACCAAG ACAACCTGAT 3070 hom 66 het 24 0 22 20 N/A 0 0 30503 CASAVA_Build 5 138584251 1D AGAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 24 0 18 6 T 13 12 30504 CASAVA_Build 5 138644433 5I TTCATTGGTA -----/TTCTG TTCCTGTATT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TTCTG 0 1 30505 CASAVA_Build 5 138650432 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 19 0 15 5 A 14 12 30506 CASAVA_Build 5 138670897 1I GGCGTTACCA -/T TTTTTGAAGC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 5 6 30507 CASAVA_Build 5 138676916 3D ATAATAGTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2631 hom 42 het 25 0 12 15 T 19 16 30508 CASAVA_Build 5 138685371 7D ACCCTGTCTC AAAAAAG/------- AAAAAAAGTA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AAAAAAG 1 0 30509 CASAVA_Build 5 138690933 2I CTTTGCCACC --/TA TATATGTCTT 3070 het 2712 hom 28 9 12 7 TA 2 3 30510 CASAVA_Build 5 138699492 1D ACTTCCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 31 2 15 14 T 15 14 30511 CASAVA_Build 5 138715799 6I68M4D TCTAAGCATT ------TTGGATAATCACATTTATTTTGTGATTTTCACTAGGGAAATCTGATTTACAAGTATTTTAATGACTACTAGA/TTGTTGTTGGATAATCACATTTATTTTGTGATTTTCACTAGGGAAATCTGATTTACAAGTATTTTAATGACTAC---- TACATTAAGC 3070 hom 8 het 37 1 30 30 N/A 0 0 30512 CASAVA_Build 5 138720478 4D CTGTCTCCAG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 26 1 17 10 A 19 15 30513 CASAVA_Build 5 138733088 3I ATACTGTAAC ---/ATT ATGATTTGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATT 0 1 30514 CASAVA_Build 5 138736742 1D CAAATAATTT G/- TTTTTTTGTG 3070 hom 70 het 29 0 25 5 G 1 0 30515 CASAVA_Build 5 138737153 2D TGGGATCGAC AA/-- AGACTGAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 19 3 A 3 1 30516 CASAVA_Build 5 138749371 16D CAATAACAGC CCTTTCTCAAAGCAGA/---------------- CCTCCTTCTT 3070 het 3070 ref 40 26 12 6 CCTTTCTCAAAGCAGA 1 0 30517 CASAVA_Build 5 138751012 4I AACACTGCAC ----/TCCA TCCAGCCTGG 2137 het 2137 ref 22 9 6 7 TCCA 1 2 30518 CASAVA_Build 5 138752026 1D GGAGGGAGGT G/- GGGGGCAGGA 3070 hom 66 het 28 0 15 13 G 6 5 30519 CASAVA_Build 5 138801904 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 651 het 651 ref 12 6 4 2 A 14 15 30520 CASAVA_Build 5 138801931 1D CATTATGAGA T/- TTTTTTTTGC 1742 het 1742 ref 17 9 5 3 T 9 8 30521 CASAVA_Build 5 138823468 2D AAGCAAGAGT CC/-- CCCTATTTGA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 5 3 30522 CASAVA_Build 5 138825625 1D ACTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 25 0 14 11 A 10 9 30523 CASAVA_Build 5 138844750 1I GGCAGGCCTG -/A GAGAGTGAGG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 0 1 30524 CASAVA_Build 5 138845202 2I TCCATCTCAG --/AA AAAAAAAAAA 2877 hom 35 het 17 0 11 6 A 14 16 30525 CASAVA_Build 5 138872367 1I TCCGTTTTTC -/T TTGAAACTTT 3070 hom 104 het 39 0 34 5 T 2 3 30526 CASAVA_Build 5 138903747 1I AGACAAAGGA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 7 8 30527 CASAVA_Build 5 138904550 1D TGTAGTTTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1434 hom 25 6 17 2 T 10 9 30528 CASAVA_Build 5 138926147 14D AAAGATTTCA GGTCATGCACAGTG/-------------- GGTCATGCAC 3070 hom 52 het 24 0 15 9 GGTCATGCACAGTG 2 1 30529 CASAVA_Build 5 138944231 4I TAAAGTACTC ----/AAAT AAAGAAACTC 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 AAAT 0 1 30530 CASAVA_Build 5 138945960 1D TAGCTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 1466 het 1466 ref 30 19 4 7 T 15 14 30531 CASAVA_Build 5 138979165 1I AGTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2555 het 2035 hom 18 6 8 4 A 15 16 30532 CASAVA_Build 5 138997122 1D TCCGTGTGAC A/- CCCCCCCCCC 3070 hom 12 het 28 0 16 12 A 1 0 30533 CASAVA_Build 5 139016226 2D ATACACACAC AT/-- GTGTGCAGAA 3070 het 3070 ref 50 28 18 5 AT 1 0 30534 CASAVA_Build 5 139021858 1I GGAGGTGACA -/G GGGTGTGCCA 3070 hom 119 het 44 0 37 7 G 3 4 30535 CASAVA_Build 5 139033622 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAGAGAG 3070 hom 37 het 25 0 15 10 AG 0 1 30536 CASAVA_Build 5 139035786 2I ATGAGTCTCC --/CT CTCCTTCCAG 3070 hom 65 het 28 0 18 10 CT 1 2 30537 CASAVA_Build 5 139041333 1D GGATGCCCCC T/- CCCAGTCCTT 2448 het 1645 hom 21 4 8 9 T 1 0 30538 CASAVA_Build 5 139061626 1I AAACCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 24 1 15 8 T 13 14 30539 CASAVA_Build 5 139077565 1I GCGCCTGGCG -/T TAAGTTTTGT 3070 hom 39 het 15 0 12 3 T 1 2 30540 CASAVA_Build 5 139092661 1I CTTTGGGAGG -/C CCAAGGCAGG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 C 2 3 30541 CASAVA_Build 5 139094781 4D AAAAAACAGA TATT/---- TATTTATTCA 3070 hom 45 het 19 0 15 5 TATT 3 2 30542 CASAVA_Build 5 139109602 18D CCATCTCTAC AAAACAAACAAACAAACA/------------------ AAAACAAACA 3070 hom 36 het 16 0 13 7 AAAACAAACAAACAAACA 1 0 30543 CASAVA_Build 5 139114309 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 8 7 30544 CASAVA_Build 5 139145004 1D CCTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 199 hom 23 1 10 13 T 12 11 30545 CASAVA_Build 5 139160974 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1839 hom 23 9 11 3 A 15 14 30546 CASAVA_Build 5 139180137 1I AGAAGAGAAC -/G GGGAGCAAGA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 G 3 4 30547 CASAVA_Build 5 139189780 1I TTTTTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 1021 het 1021 ref 40 30 5 5 A 15 16 30548 CASAVA_Build 5 139197086 1I GCACCCCGAA -/G GCCCCAGGCA 3070 hom 56 het 21 0 16 5 G 1 2 30549 CASAVA_Build 5 139227708 9D ACCCTTGGAG AACAATGAT/--------- AACAATGATA 3070 het 3070 ref 30 15 10 8 AACAATGAT 2 1 30550 CASAVA_Build 5 139243193 1I CCCAGGATTT -/G GGGGGGGCAG 3070 hom 42 het 17 0 12 5 G 7 8 30551 CASAVA_Build 5 139251399 1I TGAGACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 A 11 12 30552 CASAVA_Build 5 139253477 1I ACTTCATCCA -/G TTCTCTTCCT 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 G 0 1 30553 CASAVA_Build 5 139254226 1D AATGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 12 11 30554 CASAVA_Build 5 139265453 1D CAGCTCTGGT G/- GGGGGGGGGC 2631 het 1401 hom 24 7 8 9 G 10 9 30555 CASAVA_Build 5 139272059 1I GCCCAATATA -/G GCATTTATGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 2 30556 CASAVA_Build 5 139340119 1I CAGCATCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 10 14 17 A 15 16 30557 CASAVA_Build 5 139353565 1I TTACGCTGAT -/A AAAGGAGTAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 3 4 30558 CASAVA_Build 5 139358537 1D TACCATCCAA G/- GGCAAAGAAC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 3 2 30559 CASAVA_Build 5 139372001 1I GATTCTTCAA -/C TCCCAAGGCG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 30560 CASAVA_Build 5 139374925 1D CCTCCCTCCA T/- TTTTTTTTCT 2648 het 2648 ref 26 10 6 10 T 9 8 30561 CASAVA_Build 5 139500009 3I GATCTCCCTT ---/CTC CTCTTATTCC 3070 hom 80 het 33 0 26 7 CTC 1 2 30562 CASAVA_Build 5 139524260 3I GAGTGTTTTC ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 113 het 54 0 37 17 TTG 5 6 30563 CASAVA_Build 5 139543864 6I AAGTATGTAT ------/AATATA AATGTACAGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AATATA 0 1 30564 CASAVA_Build 5 139555794 2I GCCTGGCGAC --/AG AGTGAGACTC 3070 hom 60 het 28 0 19 9 AG 1 2 30565 CASAVA_Build 5 139557559 1D ATGGATACAT A/- GGTAGAAATG 3070 hom 126 het 44 0 42 5 A 1 0 30566 CASAVA_Build 5 139559872 1I TTCTTTTGCT -/G GTGCAGAAGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 1 2 30567 CASAVA_Build 5 139594739 1D TCATTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 695 hom 37 3 18 16 T 17 16 30568 CASAVA_Build 5 139638790 1I GATGGGAATC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 8 30569 CASAVA_Build 5 139658079 2D AATTTTACAC AT/-- GTTATTCTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 AT 1 0 30570 CASAVA_Build 5 139664863 2I AGTGCATCAC --/AG GGGAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AG 0 1 30571 CASAVA_Build 5 139665480 1D TTTAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 27 0 20 7 T 15 14 30572 CASAVA_Build 5 139675279 1I AAAAAAAAAG -/A AAAGAAAAGG 2955 hom 47 het 24 0 15 9 A 3 4 30573 CASAVA_Build 5 139716151 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 7 8 30574 CASAVA_Build 5 139744321 1D GGAACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 56 20 30 6 A 11 10 30575 CASAVA_Build 5 139745014 1I TCTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2063 het 1513 hom 23 7 8 8 A 16 17 30576 CASAVA_Build 5 139748145 1D AAATTTTTAG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 82 hom 18 2 11 5 C 11 10 30577 CASAVA_Build 5 139750093 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCGCTC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 AG 1 2 30578 CASAVA_Build 5 139754366 1I AATTTTAAAG -/A AAGGATCTTG 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 A 2 3 30579 CASAVA_Build 5 139774607 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 13 11 A 15 16 30580 CASAVA_Build 5 139779079 1I GTTGATTGGG -/T TTTTTTTTAT 2439 het 2439 ref 27 16 6 5 T 8 9 30581 CASAVA_Build 5 139798181 1D ACTTTTATAC T/- TTTTTTTTTG 1279 het 1279 ref 45 37 3 5 T 10 9 30582 CASAVA_Build 5 139874748 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2163 het 2058 hom 14 7 5 2 A 11 12 30583 CASAVA_Build 5 139886466 4I TTGATTTTAT ----/CTAA CTATGTCATT 3070 het 3070 ref 48 22 22 4 CTAA 0 1 30584 CASAVA_Build 5 139897524 2D GTCCAATTTC AG/-- AGTCTGGAAT 3070 het 3070 ref 45 23 17 6 AG 2 1 30585 CASAVA_Build 5 139903449 7D AGGTAATTAG TTGTTTT/------- TTGTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 9 11 TTGTTTT 3 2 30586 CASAVA_Build 5 139911961 2D GGACTGAAAA GG/-- TACAGCAGGA 2810 het 2810 ref 25 13 7 5 G 2 0 30587 CASAVA_Build 5 139950183 1D TCAACATATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 8 16 6 A 10 9 30588 CASAVA_Build 5 139963448 1I ATATTTGGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 T 9 10 30589 CASAVA_Build 5 139975971 1D ATAATTTCTT G/- GATATGGCAC 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 G 2 1 30590 CASAVA_Build 5 139976637 1I TAACATGATG -/A AACTCTATCT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 2 3 30591 CASAVA_Build 5 139977501 1D AGTCTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2279 het 1250 hom 26 6 8 13 A 17 16 30592 CASAVA_Build 5 139977515 1I AAAAAAAAAA -/G AAACTCAAGG 3070 het 1415 hom 39 9 16 14 G 0 1 30593 CASAVA_Build 5 139986003 1I CCCAGTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2502 het 2502 ref 15 7 6 2 T 10 11 30594 CASAVA_Build 5 139986112 1D AGATATCCAA T/- TTTAATCAGT 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 T 4 3 30595 CASAVA_Build 5 139986973 3D TCTCAGCAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2875 hom 43 10 21 14 T 14 11 30596 CASAVA_Build 5 139987500 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2520 het 2221 hom 17 6 7 4 T 12 11 30597 CASAVA_Build 5 139987953 1D ATATATATAT A/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 22 8 14 1 A 1 0 30598 CASAVA_Build 5 139990086 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 13 3 T 11 12 30599 CASAVA_Build 5 139996249 1D AAAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 2580 het 1129 hom 14 4 8 2 T 1 0 30600 CASAVA_Build 5 140004300 4D TTATGATCTT TGTG/---- TTTCATTCTT 3070 het 3070 hom 46 16 26 6 TG 2 0 30601 CASAVA_Build 5 140009145 1I GCACGACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1827 hom 26 7 16 3 T 11 12 30602 CASAVA_Build 5 140014746 1D ACCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2945 hom 24 8 11 5 T 11 10 30603 CASAVA_Build 5 140015895 1D TCAACTGAAT C/- CATTCACTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 C 2 1 30604 CASAVA_Build 5 140035323 1D CAGCTAATTT A/- AAAAAAAAAA 1643 het 1643 ref 25 13 4 8 A 15 14 30605 CASAVA_Build 5 140044953 1I CAATGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 18 17 16 A 15 16 30606 CASAVA_Build 5 140049222 1D GTTAGATTTC A/- AAAGGTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 4 3 30607 CASAVA_Build 5 140052661 1D ACTCTATCTG A/- AAAAAAAAAA 1775 het 1775 ref 25 15 4 7 A 15 14 30608 CASAVA_Build 5 140055196 9I GATGAGATCC ---------/AGTTGATAT AGGCCCAGTC 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 AGTTGATAT 0 1 30609 CASAVA_Build 5 140059593 3D CACTCTAGAG TGT/--- TGTTGATGAC 3070 het 3070 ref 46 24 21 1 TGT 2 1 30610 CASAVA_Build 5 140065087 1D TCCCCCATAA T/- TTTTTTTTTT 1659 het 1659 ref 36 21 5 14 T 15 14 30611 CASAVA_Build 5 140066688 6I GAACATAATG ------/TTTTTC TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 TTTTTC 0 1 30612 CASAVA_Build 5 140067340 1D GATGCAGAAG A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 A 7 6 30613 CASAVA_Build 5 140077162 13I GCCTCTTGTA -------------/TTTCTCCCATAAC TTTCTCCAAA 3070 het 3070 ref 22 10 7 5 TTTCTCCCATAAC 0 1 30614 CASAVA_Build 5 140086503 2D TTTGAATGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 14 5 T 12 10 30615 CASAVA_Build 5 140097444 1D TAGCCATTGT A/- AAAATGCTTC 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 A 5 4 30616 CASAVA_Build 5 140105474 1D CAGATAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1505 het 1505 ref 17 8 5 4 T 15 14 30617 CASAVA_Build 5 140108705 1D TTTAAAATAG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 8 7 30618 CASAVA_Build 5 140113938 1D AATTGGGGGC T/- TTTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 7 6 30619 CASAVA_Build 5 140114932 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 2569 het 2569 ref 27 11 8 8 T 11 12 30620 CASAVA_Build 5 140123849 11I TTACTTATAC -----------/ATTGAAAGAAA ATTTGTTCTG 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 ATTGAAAGAAA 0 1 30621 CASAVA_Build 5 140129568 1I TGTTCATAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 9 10 30622 CASAVA_Build 5 140134839 1I TTTCCATTTG -/T TTGTGTCCTA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 T 2 3 30623 CASAVA_Build 5 140136090 1D TCTCTCCCCC T/- GGAAGCTCAG 2211 het 2211 ref 38 21 11 7 T 1 0 30624 CASAVA_Build 5 140136514 3D GAGCCTCTAA CTG/--- CTGCTGCTTC 2365 het 2365 ref 26 12 7 9 CTG 3 2 30625 CASAVA_Build 5 140151354 1I GAGGGGGGCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 8 9 30626 CASAVA_Build 5 140166410 1I TACTAGGGTG -/A AAGAGGGTGT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 2 3 30627 CASAVA_Build 5 140170452 1D TTTTCTCTTC T/- TTTTGCTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 5 4 30628 CASAVA_Build 5 140175302 6I TATTGTGTAT ------/ACATTA ACATTATTTT 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 ACATTA 1 2 30629 CASAVA_Build 5 140197286 1I AGCAGTTTAC -/G TTTTTTTGTA 2992 het 2733 hom 21 8 9 4 G 0 1 30630 CASAVA_Build 5 140198935 1I49M1I TTGTTGAAAG -ATATTCAGTTTTGTGGAAAAATCTATAAATATCTTTGACCTTCAAAGAT-/AATATTCAGTTTTGTGGAAAAATCTATAAATATCTTTGACCTTCAAAGATG GTAACTGTAA 3070 het 3070 ref 33 21 13 10 N/A 0 0 30631 CASAVA_Build 5 140199150 3D ATCAATTATT ATG/--- ATGATGATGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATG 5 4 30632 CASAVA_Build 5 140221538 4I CCCTGGAAAT ----/ACCA ACCAAGAGCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ACCA 1 2 30633 CASAVA_Build 5 140222636 1D TGTGACGCTG C/- CAGGTATTAG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 C 2 1 30634 CASAVA_Build 5 140233341 6D TAGTTTGGTT GTTTAA/------ GTATTAAGCT 3070 het 3070 ref 36 26 10 6 GTTTAA 1 0 30635 CASAVA_Build 5 140277646 1D ATTTGGGCTC T/- TTTTTTTTTC 1377 het 1377 ref 43 31 3 10 T 10 9 30636 CASAVA_Build 5 140278591 1D CAAAAAGTGG C/- CCCCTCCCCA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 C 5 4 30637 CASAVA_Build 5 140280921 1D AGCTAATGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 10 9 30638 CASAVA_Build 5 140296809 1I TCCATTTATC -/T TTTTTTTTTT 2268 het 843 hom 19 6 9 4 T 16 17 30639 CASAVA_Build 5 140302389 1D TGCCAATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 11 10 30640 CASAVA_Build 5 140307785 5I AGGAAGTACC -----/CTTTT CTTTCTGGTT 3070 het 3070 hom 40 13 25 2 CTTTT 0 1 30641 CASAVA_Build 5 140310920 4D TTATTGAATA TAGT/---- TATAGTAGCT 3070 het 3070 ref 33 20 10 7 TAGT 1 0 30642 CASAVA_Build 5 140320485 13D AATACTCATC TTATTTTAGTCCA/------------- TGATTTTAGT 3070 het 3070 ref 35 16 19 5 TTATTTTAGTCCA 1 0 30643 CASAVA_Build 5 140325266 1D TGACAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1930 hom 39 7 17 15 T 15 14 30644 CASAVA_Build 5 140358339 1D TGTAAATAAG T/- TTTTTTTTTT 2948 het 62 hom 18 1 8 9 T 12 11 30645 CASAVA_Build 5 140406623 1I GGGTTCCCAA -/T TTTTACCTTC 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 T 4 5 30646 CASAVA_Build 5 140424988 1I CATGTGTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 10 11 30647 CASAVA_Build 5 140454375 1I AGCCGACGCT -/C CCTTACCCAG 3070 hom 54 het 23 0 17 6 C 2 3 30648 CASAVA_Build 5 140457465 1D ATATATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2943 hom 29 11 9 9 T 15 14 30649 CASAVA_Build 5 140460323 1D ATTCACTAGG C/- CGTCTACAAA 3070 het 3070 ref 50 24 20 7 C 2 1 30650 CASAVA_Build 5 140504254 1D GGGTGGAGCT A/- AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 7 6 30651 CASAVA_Build 5 140512663 1I ATCTATTCTT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 36 11 13 12 C 9 10 30652 CASAVA_Build 5 140515011 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAAATTCC 3070 het 351 hom 36 8 14 14 C 1 0 30653 CASAVA_Build 5 140518792 1I TTGTGATTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 9 10 30654 CASAVA_Build 5 140518971 1D CATCTCTACT A/- AAAAATACAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 6 5 30655 CASAVA_Build 5 140519521 5I TTTATACCCG -----/TTCTC TTCTTTCTTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TTCTC 0 1 30656 CASAVA_Build 5 140519959 14I TTAATTTAAA --------------/AGTCATATAATGCT AGTTTTTTCC 3070 het 1243 hom 21 4 9 8 AGTCATATAATGCT 0 1 30657 CASAVA_Build 5 140519983 4D TTATTCAAGT CTGA/---- CTGCCCAGGG 3070 het 2859 hom 23 7 9 8 CTGA 1 0 30658 CASAVA_Build 5 140526183 1I TGTTTTACAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 T 7 8 30659 CASAVA_Build 5 140529132 8D TCAAAGAGTG TGGTAATC/-------- TGGCCAGTCC 3070 het 3070 ref 33 21 9 8 TGGTAATC 1 0 30660 CASAVA_Build 5 140545167 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2300 het 152 hom 16 2 10 4 T 13 12 30661 CASAVA_Build 5 140546159 1D CTAATCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 11 10 30662 CASAVA_Build 5 140548219 1I ATGGAAAGAC -/A ATTTGCTATG 3070 hom 84 het 34 0 26 8 A 1 2 30663 CASAVA_Build 5 140549722 1D TCGTTTTAAA T/- GTCTTTATTG 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 T 1 0 30664 CASAVA_Build 5 140555464 4D AATTTTTAAT AAGC/---- AAGAGGAACT 2677 het 2677 ref 15 8 6 1 AAGC 1 0 30665 CASAVA_Build 5 140562718 4D CTTTTTATAT TAAG/---- TAACAGGTAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TAAG 1 0 30666 CASAVA_Build 5 140567167 1I TTAGTGCATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 9 10 30667 CASAVA_Build 5 140589082 1I ACACAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1412 hom 19 4 9 6 T 10 11 30668 CASAVA_Build 5 140591744 3I ATCTAGAAAC ---/ATT ATATTGAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 ATT 0 1 30669 CASAVA_Build 5 140595686 3D TACACCCTGT TCG/--- TCCGCGAGAA 3070 het 1748 hom 28 7 13 8 TCG 1 0 30670 CASAVA_Build 5 140600406 4D GTTTGTGTAG CCAC/---- TCTATCAGGT 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 CCAC 1 0 30671 CASAVA_Build 5 140600615 1D AATTGTGTCA T/- ATCAGGTGGA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 1 0 30672 CASAVA_Build 5 140601059 3D CGTCCGCGAG AAC/--- AACAGCCCCG 3070 het 1724 hom 20 5 11 6 AAC 2 1 30673 CASAVA_Build 5 140601104 8D CACCGCAGAG ACTCGGGC/-------- ACCAACATCC 806 het 806 ref 22 6 6 11 ACTCGGGC 1 0 30674 CASAVA_Build 5 140607790 1I TGAATTCTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 8 9 30675 CASAVA_Build 5 140612501 2I GAAATGTAAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 9 11 30676 CASAVA_Build 5 140643924 1I GACAAGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 10 11 30677 CASAVA_Build 5 140701862 1D AGGTTTCTCC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 9 8 30678 CASAVA_Build 5 140708994 1D ATAATTTTTA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 8 7 30679 CASAVA_Build 5 140737357 1I TCTCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 13 14 30680 CASAVA_Build 5 140746274 1I AAAAAAAGAC -/T TCTTTTTAGA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 1 2 30681 CASAVA_Build 5 140752057 1D AAGTATCATG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 8 7 30682 CASAVA_Build 5 140906267 3I ATGAGTCGGG ---/CAT CATGATGGCA 3070 het 2365 hom 21 8 11 2 CAT 1 2 30683 CASAVA_Build 5 140918668 1D ACAAGTTGTT A/- AAAAAAAAAA 2813 het 199 hom 28 2 10 16 A 17 16 30684 CASAVA_Build 5 141052618 1I AAGGACCCTT -/G GGGACTTCTC 3070 hom 94 het 33 0 26 7 G 3 4 30685 CASAVA_Build 5 141058391 1I GCCAGCCACA -/G GGGAAGGCCT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 G 3 4 30686 CASAVA_Build 5 141058479 1I AGAGATCCCC -/A ATGATCCTAG 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 1 2 30687 CASAVA_Build 5 141078495 1D GAGTGCGGGG A/- CAAGGGTTTG 3070 hom 120 het 44 0 40 5 A 1 0 30688 CASAVA_Build 5 141085123 3D CCACTTGTTG CTC/--- AACACTTTGC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CTC 1 0 30689 CASAVA_Build 5 141094873 1D AGATGCTGAG T/- TACAGTGAAC 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 T 2 1 30690 CASAVA_Build 5 141114150 1I GAAGTAGGGC -/G GGGGGGGTGG 2751 het 2751 ref 25 12 9 4 G 7 8 30691 CASAVA_Build 5 141127157 4D GCTCAGCACT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 123 het 54 0 42 14 CA 8 6 30692 CASAVA_Build 5 141128035 2D CTTTCCCTGA TG/-- TTGTCCACCG 3070 hom 66 het 24 0 20 6 TG 1 0 30693 CASAVA_Build 5 141130724 7I TCACAGAACT -------/CGGGCAC CTTGCTTCTT 3070 hom 102 het 36 0 33 3 CGGGCAC 0 1 30694 CASAVA_Build 5 141153075 2D GGAATGAATC AG/-- AGTTCTCTAA 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 AG 2 1 30695 CASAVA_Build 5 141161916 3I TATTATTATT ---/ATC ATTATTATTA 2226 het 67 hom 10 2 5 3 ATC 0 1 30696 CASAVA_Build 5 141162688 1D GTCCTCCCTT G/- GGCCCCTCAG 2268 het 2268 ref 24 12 7 7 G 3 2 30697 CASAVA_Build 5 141163857 2D CCTCCCTTCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 85 het 33 0 25 8 TC 7 6 30698 CASAVA_Build 5 141167919 1I AGCCCATGGT -/G GGAAACCATT 3070 hom 84 het 34 0 26 8 G 2 3 30699 CASAVA_Build 5 141170650 1I GTGTGACTTT -/G GGGAAGTTAC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 3 4 30700 CASAVA_Build 5 141175844 2D AGAATGTATG CA/-- CAGTGTCCAG 3070 het 3070 ref 38 27 10 2 CA 2 1 30701 CASAVA_Build 5 141182767 1D ATTTTGATAG C/- AGTGCTGAGC 3070 het 3070 ref 58 30 17 11 C 1 0 30702 CASAVA_Build 5 141189813 15D TTCTCCTCTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 het 819 hom 25 4 14 9 T 25 10 30703 CASAVA_Build 5 141197063 2D TGGGATGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 560 hom 30 7 12 11 T 12 10 30704 CASAVA_Build 5 141216101 20D CCTAGGGCCT GGGAGGTTAGACAAGGGCCC/-------------------- GGGAGGTTAG 3070 het 35 hom 30 2 23 8 GGGAGGTTAGACAAGGGCCC 2 1 30705 CASAVA_Build 5 141225627 4D TGCACTACAT GCAC/---- GCACGCATGC 3070 het 3070 hom 62 20 30 13 GCAC 2 1 30706 CASAVA_Build 5 141263818 37I GGAAAGATAG -------------------------------------/GCATTAAATAAATAAATGCATGAATGAGTATATAATT GCAAATTGTT 3070 het 3070 ref 34 17 17 2 GCATTAAATAAATAAATGCATGAATGAGTATATAATT 0 1 30707 CASAVA_Build 5 141277168 1I ACAATAGCAG -/A AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 A 5 6 30708 CASAVA_Build 5 141336047 10I ACTTTACATC ----------/CACGCATGTG CACGCATGTG 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 CACGCATGTG 1 2 30709 CASAVA_Build 5 141337904 4D TGTACTGTTT TGTA/---- TGTAGCACAG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TGTA 2 1 30710 CASAVA_Build 5 141340436 2D TAGGGAAAAC AG/-- GGGAGGCCTC 3070 hom 102 het 36 0 35 2 AG 1 0 30711 CASAVA_Build 5 141342491 1D TATTCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 273 hom 40 1 33 6 T 12 11 30712 CASAVA_Build 5 141344898 2D AAGTTTTCAA AC/-- ACAGAAAATT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AC 2 1 30713 CASAVA_Build 5 141350272 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 12 11 30714 CASAVA_Build 5 141352231 1D AATTTCAGAA T/- TTTGACTGGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 4 3 30715 CASAVA_Build 5 141353645 4I AAAAAAAGAA ----/AGAG AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 33 0 29 4 AG 0 2 30716 CASAVA_Build 5 141357118 1I GGATGTACTT -/G AGGGGGCAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 G 0 1 30717 CASAVA_Build 5 141358426 1I AGCCCCAGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 9 10 30718 CASAVA_Build 5 141359169 13D GCTTAGTGAA AAAAGCCAGACAC/------------- AAAAGATGTC 3070 hom 87 het 31 0 29 7 AAAAGCCAGACAC 1 0 30719 CASAVA_Build 5 141360078 3I TATTAACTTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 13 16 30720 CASAVA_Build 5 141361023 1I CACAGTGAGG -/C CTTTCACAAA 3070 hom 92 het 37 0 29 8 C 1 2 30721 CASAVA_Build 5 141361374 11D AAGGACTCTC AAGACTCTTCA/----------- AAGAGGTGGT 3070 hom 102 het 34 0 35 3 AAGACTCTTCA 1 0 30722 CASAVA_Build 5 141370264 5I TTCTTTCTTT -----/CTTTC TTTTTTTTTT 3070 het 190 hom 23 2 17 4 CTTTC 0 1 30723 CASAVA_Build 5 141371031 2D GACCCCTCCA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 47 het 26 0 15 12 AC 8 7 30724 CASAVA_Build 5 141376147 5D AGGTACAACA AATAG/----- AAGAGAGACA 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 AATAG 1 0 30725 CASAVA_Build 5 141378140 1D ATACGCTCAG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 8 7 30726 CASAVA_Build 5 141390076 1D TTACTGTGGG C/- CAGGCACTGG 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 C 2 1 30727 CASAVA_Build 5 141415535 1D TTTTCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2300 hom 37 15 12 11 T 15 14 30728 CASAVA_Build 5 141416097 1D GTTGTACAAT C/- TTGTGAATAT 3070 het 3070 ref 44 23 20 1 C 1 0 30729 CASAVA_Build 5 141418017 2D CACTTACATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 731 hom 28 3 14 12 A 14 12 30730 CASAVA_Build 5 141419767 1D TCGGACAAAG C/- CAGCAGACCC 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 C 2 1 30731 CASAVA_Build 5 141423582 3I TGGGCTGTTG ---/GGA GGAGAAGTTC 3070 het 3070 ref 49 30 13 6 GGA 1 2 30732 CASAVA_Build 5 141429499 2D CACACACACA CC/-- CCCACACATG 3070 hom 41 het 41 1 32 10 C 5 3 30733 CASAVA_Build 5 141445359 1I GTCTTGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 26 2 14 10 A 13 14 30734 CASAVA_Build 5 141462465 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 30 0 25 7 T 10 9 30735 CASAVA_Build 5 141464743 1D TTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1685 het 1685 ref 35 19 4 12 T 12 11 30736 CASAVA_Build 5 141466582 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 37 2 29 6 T 11 12 30737 CASAVA_Build 5 141469853 4D AACCCTGGTG CGGC/---- CGGCCGGTTA 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 CGGC 2 1 30738 CASAVA_Build 5 141470604 1D ATTTACATCC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 1 0 30739 CASAVA_Build 5 141486740 1D ATAAGGAGGG A/- AAAAAAAACG 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 9 8 30740 CASAVA_Build 5 141494919 2I TAGTAGAGAC --/AG GGGTTTCACC 2312 hom 15 het 6 0 6 0 AG 0 1 30741 CASAVA_Build 5 141496664 7D AAAACAAAAA TTAGCCG/------- TTAGCCGGGC 2389 het 1608 hom 18 6 7 5 TTAGCCG 2 1 30742 CASAVA_Build 5 141498632 1I AATTCCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 26 1 18 7 T 12 13 30743 CASAVA_Build 5 141499125 3I GTCCCTGACA ---/AGG AGGTTAGTTA 2820 het 2820 ref 22 11 7 4 AGG 1 2 30744 CASAVA_Build 5 141500198 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1489 het 114 hom 9 2 5 2 A 17 18 30745 CASAVA_Build 5 141505952 1D TTTCATTATT A/- AAAAAACTAG 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 A 7 6 30746 CASAVA_Build 5 141510471 1D TCTTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2684 het 2684 ref 26 12 10 4 A 14 13 30747 CASAVA_Build 5 141513358 1D TCTTTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 T 11 10 30748 CASAVA_Build 5 141522404 1I TCTGCAGCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 A 9 10 30749 CASAVA_Build 5 141524174 1D CCCACCGCCA C/- CCCCAGCTTG 3070 het 2403 hom 29 9 15 5 C 5 4 30750 CASAVA_Build 5 141526320 1D TGAGGGTGTC G/- GGGGGGCCCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 G 7 6 30751 CASAVA_Build 5 141527234 1I GATGTGCTAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 7 8 30752 CASAVA_Build 5 141534885 1I CGGTGGGGGA -/G GGGGGGGGTT 3070 hom 99 het 37 0 31 6 G 8 9 30753 CASAVA_Build 5 141537628 4I GTTTCCAGTC ----/TTTG TTTATTTTTT 3070 hom 113 het 42 0 38 4 TTTG 0 1 30754 CASAVA_Build 5 141548953 1I CACTTTGGGA -/G GCCAAGGAGG 3070 hom 40 het 22 0 20 2 G 1 2 30755 CASAVA_Build 5 141554800 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 15 2 12 1 A 11 10 30756 CASAVA_Build 5 141558806 1I TATAACAACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 98 het 42 0 32 10 A 9 10 30757 CASAVA_Build 5 141559624 1I TCAGCCTTCC -/G GAGTAGATGG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 1 2 30758 CASAVA_Build 5 141560170 1D CTAGTACACC T/- GGGAGAGACT 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 T 1 0 30759 CASAVA_Build 5 141573302 4D ATTGTATTAT TTTA/---- TTTATTTATT 1454 hom 12 het 9 0 5 5 TTTA 3 2 30760 CASAVA_Build 5 141574354 1D GTGTAATATG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 92 het 37 0 29 10 T 10 9 30761 CASAVA_Build 5 141594576 1D TTTCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 A 14 13 30762 CASAVA_Build 5 141596241 1D TCTGGCTTCT G/- TACAGCCCGT 2744 het 2744 ref 24 10 8 6 G 1 0 30763 CASAVA_Build 5 141597347 1I GGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2254 hom 26 10 12 4 T 11 12 30764 CASAVA_Build 5 141601829 1D TGGCTAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1639 hom 15 5 9 1 A 13 12 30765 CASAVA_Build 5 141603909 2D TTAAACCCCA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 26 0 17 10 AT 8 7 30766 CASAVA_Build 5 141617266 2D AGGGTCACTC TG/-- GATGAGATTT 3070 het 3070 ref 37 22 13 3 TG 1 0 30767 CASAVA_Build 5 141620683 1I TTGGGTGCTA -/G GGGCTGGGGT 3070 het 3070 ref 31 11 10 10 G 3 4 30768 CASAVA_Build 5 141628581 2D GCATAGGGCC TT/-- TTTTTTTTTT 1138 hom 21 het 14 0 5 9 T 18 16 30769 CASAVA_Build 5 141637126 1I AAACAAATCC -/T TTTTTCTGCT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 5 6 30770 CASAVA_Build 5 141637871 1D CACCACTGGA C/- TCAGGGGAGG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 C 1 0 30771 CASAVA_Build 5 141638160 1D CACTTTGGGA G/- GCTGATACGG 3070 hom 53 het 19 0 17 3 G 2 1 30772 CASAVA_Build 5 141647755 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AAAC 5 4 30773 CASAVA_Build 5 141653538 1I GAAAAGAGAA -/G GCCTGGGGAT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 G 1 2 30774 CASAVA_Build 5 141655869 2D AGCCCAGGCC TG/-- TGCCTGGTAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TG 2 1 30775 CASAVA_Build 5 141658323 6I CAGTCATAAA ------/AATTAT CCAGCTCACC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 AATTAT 0 1 30776 CASAVA_Build 5 141666674 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAACAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 AC 0 1 30777 CASAVA_Build 5 141668575 1D TTGGTAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 601 hom 31 2 19 10 A 12 11 30778 CASAVA_Build 5 141670948 1D AGTTGTGCCC A/- ATCTTTTCTC 3070 hom 102 het 36 0 35 2 A 2 1 30779 CASAVA_Build 5 141671434 1D CCTTCGCTCC T/- TTCCCATGAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 3 2 30780 CASAVA_Build 5 141671833 2I GGGCCCTGGG --/AA AAGTTCTGAG 3070 hom 99 het 34 0 32 2 A 2 4 30781 CASAVA_Build 5 141673574 3D AAAAGAGGAA GGG/--- GGGGGGGGCG 1325 hom 23 het 12 0 7 8 G 11 8 30782 CASAVA_Build 5 141681309 1I TCCCTTCCTT -/A AAAAACTCTG 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 A 5 6 30783 CASAVA_Build 5 141681812 1I ATTATTCACG -/A AAAGTCAGCC 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 3 4 30784 CASAVA_Build 5 141683023 3I CCTCGGTCAG ---/CTA CTACAGACAC 3070 het 3025 hom 26 9 12 5 CTA 1 2 30785 CASAVA_Build 5 141688374 1D CGCCTGTAAT C/- CCAGCTACTC 1931 het 1719 hom 11 5 4 2 C 3 2 30786 CASAVA_Build 5 141690360 3D GAATCTGTAT GGC/--- GGGGGGGGGG 3070 het 55 hom 52 2 24 26 GGC 1 0 30787 CASAVA_Build 5 141699975 1D TTTGTCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2653 hom 25 10 9 6 T 11 10 30788 CASAVA_Build 5 141700096 2D TAAGAGTTTT GA/-- GGCCGGGCAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 GA 1 0 30789 CASAVA_Build 5 141701379 1I GCCGAAGTCG -/A AAGTGGGAGA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 2 3 30790 CASAVA_Build 5 141701598 2D CTGGGAAGCC AG/-- AGAGAGAGAG 2407 het 2192 hom 27 9 10 9 AG 9 8 30791 CASAVA_Build 5 141758823 42I TTGCTCACTG ------------------------------------------/ATATAACTCCTGTTCCTGGACATGCAGGGGAAACTGAGATAT TTGTTGAACT 3070 hom 51 het 17 0 18 2 ATATAACTCCTGTTCCTGGACATGCAGGGGAAACTGAGATAT 0 1 30792 CASAVA_Build 5 141784488 1D AGCATATTCC T/- TTTTTTTTTT 1490 het 1490 ref 41 25 5 12 T 13 12 30793 CASAVA_Build 5 141787499 1D GCCAAGATGT A/- AAACAGGAAC 3070 hom 92 het 35 0 27 9 A 4 3 30794 CASAVA_Build 5 141794915 1I CAAAACAAAC -/A AAAAACCCCA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 5 6 30795 CASAVA_Build 5 141799671 1I GGTGTTTTTA -/T TTTTATTTTT 1879 het 1879 ref 20 12 7 1 T 4 5 30796 CASAVA_Build 5 141836950 1I TCATTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1936 hom 21 5 13 3 T 10 11 30797 CASAVA_Build 5 141842820 1D GGTCTCGAAC T/- CCTGACCTCA 3070 het 1246 hom 17 4 11 2 T 1 0 30798 CASAVA_Build 5 141843836 1I TCCTCCTGCA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 T 6 7 30799 CASAVA_Build 5 141849258 1I TGTTTATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2346 hom 26 8 10 8 T 14 15 30800 CASAVA_Build 5 141854063 1D GATTTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 11 10 T 13 12 30801 CASAVA_Build 5 141855188 1I GTATTAAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 A 9 10 30802 CASAVA_Build 5 141858313 1I TTTTTATAAG -/A AAAAAAAAAA 1905 het 1905 ref 30 13 7 10 A 13 14 30803 CASAVA_Build 5 141872138 1D CTCGAGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 11 10 30804 CASAVA_Build 5 141883603 3D TATTAAAGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 13 10 30805 CASAVA_Build 5 141888622 4D CCTCAGTCTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2451 hom 30 7 9 14 TTTG 5 4 30806 CASAVA_Build 5 141952554 1I ATTTTATGCT -/G GGGGTTGCTG 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 G 4 5 30807 CASAVA_Build 5 141965786 1D ACATATTCAT C/- TACTAGGTGC 3070 het 3070 hom 41 16 17 9 C 1 0 30808 CASAVA_Build 5 141979601 1I CCAAAAAACG -/A AAAAAAAAAC 2660 het 2660 ref 33 19 8 6 A 9 10 30809 CASAVA_Build 5 142004843 1I TCTTAGCTTT -/A AAACCCTGGC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 3 4 30810 CASAVA_Build 5 142016095 1I TATCTTGATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 A 9 10 30811 CASAVA_Build 5 142016654 1I ACTGCAGGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 9 10 30812 CASAVA_Build 5 142025870 2D CTTGCTGAAA AG/-- TTCTCAGACT 3070 hom 63 het 23 0 21 4 AG 1 0 30813 CASAVA_Build 5 142041835 1D TTCTCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 2031 het 2031 ref 30 16 6 8 T 17 16 30814 CASAVA_Build 5 142097810 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 25 1 19 5 T 11 10 30815 CASAVA_Build 5 142120257 1I TTTTCCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 12 13 30816 CASAVA_Build 5 142138709 1D AAAAAAACTT A/- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 1 0 30817 CASAVA_Build 5 142141114 1D TATGGTTAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 T 9 8 30818 CASAVA_Build 5 142217390 4I AATTAATGAC ----/CCTA CCTAGCAAAC 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 CCTA 1 2 30819 CASAVA_Build 5 142344073 1D AAATCTTGCT C/- CCACATATCA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 C 3 2 30820 CASAVA_Build 5 142351817 1I TAATTAGGAC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 8 9 30821 CASAVA_Build 5 142363776 7D ATTTATAGAC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 26 2 22 7 A 21 14 30822 CASAVA_Build 5 142367578 4D ATTTTTATGT TTGA/---- TTGCTGTTTT 3070 hom 103 het 43 0 33 12 TTGA 1 0 30823 CASAVA_Build 5 142381850 1I ATTTCATTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 8 30824 CASAVA_Build 5 142399287 1I GGAGTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 11 12 30825 CASAVA_Build 5 142410107 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2002 het 2002 ref 47 29 7 11 T 13 12 30826 CASAVA_Build 5 142436669 1D AGTTGTTTCT A/- AAGTTTTTAA 3070 hom 123 het 42 0 42 1 A 3 2 30827 CASAVA_Build 5 142463329 1D TAGACTGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 3 A 11 10 30828 CASAVA_Build 5 142468913 11I GGGTAGCAGG -----------/TAACTCACACC TAACTCGCAC 3070 hom 85 het 34 0 29 5 TAACTCACACC 0 1 30829 CASAVA_Build 5 142475117 4D AACAAAAAAC GAAA/---- GAAAGAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 23 8 GAAA 3 2 30830 CASAVA_Build 5 142475760 1I21M1I AAATAGAATC -GACAGGATAAGATGGGAATAG-/AAACAGGATAAGATGGGAATAGA AAATATCAGA 3070 hom 102 het 31 0 35 3 N/A 0 0 30831 CASAVA_Build 5 142513549 1D TCTTAACACA C/- ACGCTCATGC 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 C 1 0 30832 CASAVA_Build 5 142518633 4D GTTATTGTCC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 42 27 13 3 ACAA 5 4 30833 CASAVA_Build 5 142523290 1D CTCACTGCAA C/- CTTTGCCTCC 3070 het 449 hom 9 1 7 2 C 2 1 30834 CASAVA_Build 5 142570655 1D AAGGGCACTG T/- TGACAGGAGC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 2 1 30835 CASAVA_Build 5 142583866 1D TATCTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 T 12 11 30836 CASAVA_Build 5 142607289 4I TGGACAGATT ----/GATA GATAGTAGGT 3070 hom 156 het 64 0 43 21 GATA 1 2 30837 CASAVA_Build 5 142607356 4D AGTAGGTGGG TGGA/---- TGGATGGATG 3070 het 3070 hom 59 16 23 23 TGGA 5 4 30838 CASAVA_Build 5 142607929 7D CAGTCTTATT GGATTAG/------- GGTTCAACCT 3070 het 3070 ref 46 24 19 7 GGATTAG 1 0 30839 CASAVA_Build 5 142612516 12D TTTATATAAC ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 1959 het 157 hom 11 2 6 3 AT 14 8 30840 CASAVA_Build 5 142614573 2I ACAGGCGGGT --/GC GCCACCACGC 1716 het 233 hom 9 1 7 1 GC 1 2 30841 CASAVA_Build 5 142629635 1I GCGTCATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 T 9 10 30842 CASAVA_Build 5 142647877 1I ACAACTGGAA -/T TTTTTTTTTT 923 het 923 ref 32 12 3 17 T 17 18 30843 CASAVA_Build 5 142651286 20I CTGGCTGGGA --------------------/TTACTTTTCTTTAGCCTAAG TATATCCTCT 3070 hom 72 het 27 0 24 5 TTACTTTTCTTTAGCCTAAG 0 1 30844 CASAVA_Build 5 142654133 1D AGGTTTATAA T/- ACCAACTAGT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 T 1 0 30845 CASAVA_Build 5 142656140 5D TTATATAAAA TAAAT/----- TAGACATGAC 3070 het 3070 hom 21 9 12 2 TAAAT 1 0 30846 CASAVA_Build 5 142666120 1I GAAGGTTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 9 10 30847 CASAVA_Build 5 142692369 1D AAGATGGCAG T/- AGCAAGACAG 2280 het 2280 ref 14 6 5 3 T 1 0 30848 CASAVA_Build 5 142692917 1I TACCAAAAAT -/A AGAGTGGGCT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 1 2 30849 CASAVA_Build 5 142694484 1I CTCTGCTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 A 14 15 30850 CASAVA_Build 5 142698999 1D GTTTCACAGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 A 9 8 30851 CASAVA_Build 5 142700108 1I CCCAGCAGGC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 T 7 8 30852 CASAVA_Build 5 142723340 1D CCAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2002 hom 27 6 17 4 A 11 10 30853 CASAVA_Build 5 142726269 1D ATTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1552 het 1552 ref 20 9 5 6 A 15 14 30854 CASAVA_Build 5 142758116 1I GTTTTTTGGT -/G TTTTTTTTTT 1767 het 200 hom 26 4 10 12 G 0 1 30855 CASAVA_Build 5 142773677 1D GGGCATGCAG A/- AAAAAACCCA 3070 hom 73 het 29 0 25 4 A 7 6 30856 CASAVA_Build 5 142784001 1I ATAAAAAAGA -/G GGGGTGTTTA 1930 het 1636 hom 12 5 4 3 G 4 5 30857 CASAVA_Build 5 142800094 2I ATCTGGTTCC --/AT CATTATGTGA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 AT 0 1 30858 CASAVA_Build 5 142800536 4I TTCTTTCTTC ----/TCTT TCTGTCATTC 3070 hom 68 het 28 0 23 5 TCTT 0 1 30859 CASAVA_Build 5 142805745 1D TGCCTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 28 13 T 17 16 30860 CASAVA_Build 5 142807511 1I AAAGCAAGAG -/A AATTGAAGTT 3070 hom 117 het 40 0 39 1 A 2 3 30861 CASAVA_Build 5 142812975 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 759 hom 30 2 21 7 T 13 12 30862 CASAVA_Build 5 142859908 1D AAAATTAGGC T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 7 30863 CASAVA_Build 5 142876188 1I TAAATGCAGA -/T TTTCCCCTAG 3070 het 3070 hom 54 18 24 12 T 3 4 30864 CASAVA_Build 5 142886824 1I TTCTATGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 10 11 30865 CASAVA_Build 5 142888361 1I TAGAAGGCCA -/G GGTAGCAGGA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 G 2 3 30866 CASAVA_Build 5 142889734 3D TAAAGAAGAT ATC/--- ATGTTATTAG 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 ATC 1 0 30867 CASAVA_Build 5 142890367 1I TATGACAGCA -/T TATCAGTGCT 3070 het 3070 hom 26 11 15 0 T 1 2 30868 CASAVA_Build 5 142890978 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2174 het 1052 hom 8 3 5 0 A 11 10 30869 CASAVA_Build 5 142892841 1I GTTTCAGGCC -/T TTGTAAATAA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 T 2 3 30870 CASAVA_Build 5 142899823 1D AACAGATTTC A/- AAAACAAAGT 3070 het 3070 hom 47 16 19 12 A 5 4 30871 CASAVA_Build 5 142899882 1I ACATCAATCC -/T TTTTTTTTTT 2980 het 2980 ref 32 11 10 11 T 12 13 30872 CASAVA_Build 5 142906779 1I CAATGCAGTC -/T TTTTTTTTTT 2659 het 2659 ref 25 12 10 3 T 10 11 30873 CASAVA_Build 5 142909247 1I GGAAAAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 10 11 30874 CASAVA_Build 5 142923489 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 9 10 30875 CASAVA_Build 5 142940721 3I GAACAGGATA ---/AAG AAGATCACCA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AAG 1 2 30876 CASAVA_Build 5 142949795 8D TGTCACCCAG GCTGGAGT/-------- GCAGTGGCGT 3070 het 1859 hom 15 4 10 1 GCTGGAGT 1 0 30877 CASAVA_Build 5 142968256 2D GACTGAGACA AC/-- TCATCTATCA 3070 het 3070 ref 35 22 11 4 AC 1 0 30878 CASAVA_Build 5 142972039 1I CACTTAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 31 0 16 15 T 16 17 30879 CASAVA_Build 5 142984452 1I TTACAGAGTA -/G GGGGCAGGAG 3070 hom 74 het 29 0 24 5 G 4 5 30880 CASAVA_Build 5 142988261 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 692 hom 15 2 12 1 A 9 10 30881 CASAVA_Build 5 143006025 51I GTTTGTCATG ---------------------------------------------------/TTTTTCAGGCTTGTGTGGCCAGGTGTTCTGGCTAGATATTTTCCCCTGCTT TCATTTCGTC 3070 hom 105 het 35 0 34 10 TTTTTCAGGCTTGTGTGGCCAGGTGTTCTGGCTAGATATTTTCCCCTGCTT 0 1 30882 CASAVA_Build 5 143016633 1D AATTTTGGTG T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 7 6 30883 CASAVA_Build 5 143022223 2I ACTATTGGGT --/CC GTCCATGCAT 3070 het 3070 ref 69 32 26 11 C 0 2 30884 CASAVA_Build 5 143033106 2I TAAGTTTCAA --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 AT 4 5 30885 CASAVA_Build 5 143037555 4D TTAAAATTCT GTGA/---- GTGAGTATGA 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 GTGA 2 1 30886 CASAVA_Build 5 143041282 1D GTTCATATTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 9 8 30887 CASAVA_Build 5 143050806 1I AATGCATGAG -/A ATTGCTTCAA 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 A 1 2 30888 CASAVA_Build 5 143066770 1I GCAACCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 10 11 30889 CASAVA_Build 5 143072418 1D CAATTCGGAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 8 7 30890 CASAVA_Build 5 143073122 1I CATTCATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 10 11 30891 CASAVA_Build 5 143077947 1D TCAGAAAGCC A/- CTGCCACTGC 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 A 1 0 30892 CASAVA_Build 5 143080613 1I TGCATATTCC -/A GAGCTGGAAG 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 A 0 1 30893 CASAVA_Build 5 143081529 1D ATTTTTGTTC T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 T 7 6 30894 CASAVA_Build 5 143085069 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 16 11 2 T 10 9 30895 CASAVA_Build 5 143091102 2D CCGCACACTC TG/-- TGTACATAAG 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 TG 2 1 30896 CASAVA_Build 5 143092256 2I ACAATATTTC --/CT CTGTTTTCAG 3070 het 3070 hom 58 27 23 8 CT 1 2 30897 CASAVA_Build 5 143097804 1I TCTGAGGCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 9 10 30898 CASAVA_Build 5 143124751 4D GAAAAAAAAA AAAT/---- AAATATATAT 2669 het 2604 hom 17 8 7 4 AAAT 2 1 30899 CASAVA_Build 5 143139253 1I TGCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 9 10 30900 CASAVA_Build 5 143142082 2D TGAAATCACA GT/-- GTGATCCCAC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 GT 2 1 30901 CASAVA_Build 5 143181351 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1969 hom 27 8 13 7 A 12 11 30902 CASAVA_Build 5 143209810 2D ATAAATTTAT TA/-- TCTCACAGTT 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 TA 1 0 30903 CASAVA_Build 5 143218779 10I TCTCCAAATA ----------/AAGCTACATG GGAATTTGAG 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 AAGCTACATG 0 1 30904 CASAVA_Build 5 143221087 5I ATATGAAGAG -----/GACAC ATAAAATTTC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 GACAC 0 1 30905 CASAVA_Build 5 143249972 2D TGCAGACACG CA/-- CACACACACA 1315 het 1315 ref 44 35 4 6 CA 7 6 30906 CASAVA_Build 5 143276852 1D GACATGACTT A/- ACTGTGCTCT 3070 hom 138 het 50 0 47 4 A 2 1 30907 CASAVA_Build 5 143310777 1I TTCCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 12 20 15 T 11 12 30908 CASAVA_Build 5 143316664 1I TAAGTGTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 32 het 32 1 27 4 T 9 10 30909 CASAVA_Build 5 143327892 1I GCCAAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 1794 het 1794 ref 53 34 5 14 T 13 14 30910 CASAVA_Build 5 143328877 1I AACCCAAAGC -/A ATGCACATCT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 1 2 30911 CASAVA_Build 5 143334158 3I CGGCAGCACA ---/CAT CATGGTGGTT 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 CAT 1 2 30912 CASAVA_Build 5 143337437 2D CTTGGAAATA CT/-- CTCTGAGGAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 CT 3 2 30913 CASAVA_Build 5 143338210 4I TATACACATA ----/TATG TATGTATATA 3070 het 3070 ref 19 9 10 0 TATG 1 2 30914 CASAVA_Build 5 143349162 1D TAGGCATTTA T/- TTTTGTTTTT 3070 het 2031 hom 31 12 14 5 T 5 4 30915 CASAVA_Build 5 143350200 1D TTTACTGCCA C/- CCATGTCAAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 C 3 2 30916 CASAVA_Build 5 143352986 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1567 het 1041 hom 19 7 5 8 A 17 16 30917 CASAVA_Build 5 143361821 1D GTAGACATAT A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 7 6 30918 CASAVA_Build 5 143363780 1I TGAATGAATT -/A AATGCTCTTA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 2 3 30919 CASAVA_Build 5 143368671 2I TTATAACACT --/TA ATCAAAATCA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 TA 0 1 30920 CASAVA_Build 5 143473443 2D CCATAATATT AG/-- AGTTATGTGT 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 AG 2 1 30921 CASAVA_Build 5 143477199 1D CTGTAAGGTT A/- AAATTCTTGG 3070 het 3070 hom 44 19 23 3 A 4 3 30922 CASAVA_Build 5 143488144 1I CCACTGTAGC -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 6 7 30923 CASAVA_Build 5 143491833 1I TGGATTAGAC -/T GTACCACTGA 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 T 0 1 30924 CASAVA_Build 5 143502041 1I CCCTCTTCCC -/T AGCAAGTAAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 0 1 30925 CASAVA_Build 5 143505568 1I TATGAACACC -/A AGTGCAGTTT 3070 het 3070 ref 46 23 14 9 A 1 2 30926 CASAVA_Build 5 143505920 1D CAATTGTAAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 A 8 7 30927 CASAVA_Build 5 143510021 1I AACCAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 8 9 30928 CASAVA_Build 5 143514831 1I CAATAAAAAC -/A AACTTAAAAG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 2 3 30929 CASAVA_Build 5 143515782 1I TGAGTACTTA -/T TTTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 3 4 30930 CASAVA_Build 5 143515954 1D TTAAGCTCAC A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 A 7 6 30931 CASAVA_Build 5 143517019 4D CCACAAAGAA AGAG/---- AAACAACTTG 3070 het 3070 ref 44 21 20 6 AG 2 0 30932 CASAVA_Build 5 143519569 2I GGGTTCACAC --/TT TTCTCCTGCC 1959 het 1959 ref 14 6 5 3 T 2 4 30933 CASAVA_Build 5 143519631 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 870 het 870 ref 13 9 3 1 T 8 7 30934 CASAVA_Build 5 143523529 1D TGCTGTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 10 11 11 A 11 10 30935 CASAVA_Build 5 143531943 1I15M1I AAGGATGTAA -GACCCAACCAAAAAA-/CGACCCAACCAAAAAAC CTAGGATTGT 3070 het 1609 hom 34 8 19 11 N/A 0 0 30936 CASAVA_Build 5 143549252 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1825 hom 17 6 8 4 A 15 14 30937 CASAVA_Build 5 143551579 1D CGTATTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 T 13 12 30938 CASAVA_Build 5 143559893 1I AGAGCAGTAC -/T TTTTTTTTCA 2277 het 2277 ref 34 16 8 13 T 8 9 30939 CASAVA_Build 5 143613881 1D ATGCATATTC T/- TTTTTTTTTT 1236 het 1236 ref 12 7 4 1 T 11 10 30940 CASAVA_Build 5 143614070 2I12M1D TTTTTTTTTT --TTGTTTTTTTAGT/TGTTGTTGTTTTAG- TAGAGATGGG 3070 het 3070 hom 17 9 9 5 N/A 0 0 30941 CASAVA_Build 5 143618561 3D AGTGCTATTA TGT/--- CATTTTATAG 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 TGT 1 0 30942 CASAVA_Build 5 143620500 2D CTGTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 41 17 12 14 TG 1 0 30943 CASAVA_Build 5 143625825 1D CTGGAATTGC G/- AAAACAGATT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 G 1 0 30944 CASAVA_Build 5 143626539 1I AAGATTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 T 10 11 30945 CASAVA_Build 5 143636658 1I AACCCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 1272 het 1272 ref 15 5 3 7 A 13 14 30946 CASAVA_Build 5 143647047 64D TGTGTTTTGT CATCAGTGGGGAGAAGCTGGTGTGAGGCGGGACACCAGTTCAAATGCTGCTGTGGATTTCAGAG/---------------------------------------------------------------- CACAGCTGCC 2169 het 2169 ref 31 50 6 6 CATCAGTGGGGAGAAGCTGGTGTGAGGCGGGACACCAGTTCAAATGCTGCTGTGGATTTCAGAG 1 0 30947 CASAVA_Build 5 143654248 1D TATAAACTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 53 21 27 6 T 10 9 30948 CASAVA_Build 5 143655972 1I CAGAAATGGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 A 8 9 30949 CASAVA_Build 5 143668511 5D TCCTCAGATT GTGGG/----- GTGGGGTGGG 2615 het 2615 ref 23 11 6 6 GTGGG 3 2 30950 CASAVA_Build 5 143668610 1D TCCCTCCCAC T/- TTTTTTTTTA 2640 het 2640 ref 30 18 8 4 T 10 9 30951 CASAVA_Build 5 143669794 1D ACACAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 T 11 10 30952 CASAVA_Build 5 143670221 7D AGCTATTTTG AAAACTC/------- TCCACACTGT 3070 het 3070 ref 28 17 9 8 AAAACTC 1 0 30953 CASAVA_Build 5 143670339 1D AAATATTATA T/- ATTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 1 0 30954 CASAVA_Build 5 143680516 1D TTTTTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 20 11 T 12 11 30955 CASAVA_Build 5 143695298 2I CTAGTGAAAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 AC 7 8 30956 CASAVA_Build 5 143698806 4D TTGACACATC CACA/---- CACAGGACAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 7 CA 4 2 30957 CASAVA_Build 5 143708102 3I TTATCATCAC ---/CAT CATCATCCCA 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 CAT 2 3 30958 CASAVA_Build 5 143710632 1I GACTCTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 11 12 30959 CASAVA_Build 5 143716856 25D GGAGATGAGT TACTCTTATAGGTTACAACTTCTTA/------------------------- TACTCTTATA 3070 het 3070 ref 33 25 10 8 TACTCTTATAGGTTACAACTTCTTA 1 0 30960 CASAVA_Build 5 143724780 1D CAAATCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 13 12 30961 CASAVA_Build 5 143725525 4D GAGCAGGTGA AGGT/---- ATATTAGAGA 3070 het 3070 hom 25 9 16 0 AGGT 1 0 30962 CASAVA_Build 5 143743302 1D AGGGTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 18 8 A 13 12 30963 CASAVA_Build 5 143749433 1D CAATCTGTGG A/- AAAAATTGTC 3070 hom 135 het 51 0 45 6 A 6 5 30964 CASAVA_Build 5 143753720 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2494 het 1203 hom 24 6 9 9 T 17 16 30965 CASAVA_Build 5 143815961 1I CCCTCACAAA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 C 8 9 30966 CASAVA_Build 5 143819716 1D GTCTCCCGAG T/- TAACTGGGAC 2496 het 2496 ref 18 10 6 2 T 2 1 30967 CASAVA_Build 5 143823218 2I GTCATCATGC --/TG TGTGGACAAA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 TG 2 3 30968 CASAVA_Build 5 143840092 6D TGTTAAGTAA AGCTTG/------ AGCTTGTCTC 3070 het 3070 ref 50 22 22 10 AGCTTG 2 1 30969 CASAVA_Build 5 143878130 2D AAACTGGAAA CT/-- CTAAAAAGCA 3070 het 165 hom 24 1 22 1 CT 2 1 30970 CASAVA_Build 5 143878595 1I CTGCCCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 10 11 30971 CASAVA_Build 5 143893151 1I GGATTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 18 0 12 6 T 15 16 30972 CASAVA_Build 5 143895808 1I GCAGGGTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 18 2 11 5 A 14 15 30973 CASAVA_Build 5 143951456 1D AATTTCATTA T/- TTTACCCCAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 4 3 30974 CASAVA_Build 5 143966449 4D TTTGATGGAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TA 10 8 30975 CASAVA_Build 5 143972372 1D GAAACTGCTC G/- GGTGATTTGA 3070 hom 114 het 41 0 39 5 G 3 2 30976 CASAVA_Build 5 144027380 6D GTTAGCTATT ATTATC/------ AGTATCTTTG 3070 hom 129 het 45 0 43 2 ATTATC 1 0 30977 CASAVA_Build 5 144029303 5I GTAAACAAAA -----/TACTC TAAATCTAAG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 TACTC 0 1 30978 CASAVA_Build 5 144031719 4D AATAAAACAA AAAC/---- AAACAAAAAC 3070 hom 94 het 40 0 38 5 AAAC 2 1 30979 CASAVA_Build 5 144033228 5I TATAGAATTA -----/TTTTG TTTTATGATG 3070 hom 84 het 40 0 29 11 TTTTG 0 1 30980 CASAVA_Build 5 144036589 1I ATCATGCCCC -/A AAAGAATTGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 4 30981 CASAVA_Build 5 144041552 4I CTTTATTTTT ----/TAAA TAAATCATTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TAAA 1 2 30982 CASAVA_Build 5 144046507 1D TTGGCTGCAT A/- AATGTCTTCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 3 2 30983 CASAVA_Build 5 144048210 1I TTTCAAGTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 7 8 30984 CASAVA_Build 5 144048421 1D TGCTCTTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 10 9 30985 CASAVA_Build 5 144056332 1D TGATGTGTGC T/- TTTGAGAAAT 3070 hom 129 het 53 0 43 11 T 4 3 30986 CASAVA_Build 5 144060252 2D GCTATTCACT AC/-- AGTTTCTTCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AC 1 0 30987 CASAVA_Build 5 144067205 2I GATACAGAAA --/AC AGTTTTTCTT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 AC 0 1 30988 CASAVA_Build 5 144069733 1D ATGAAATGAC A/- AAAAATAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 6 5 30989 CASAVA_Build 5 144072563 1I TAAGTGATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 642 hom 25 2 21 2 A 10 11 30990 CASAVA_Build 5 144077736 4D ATGATGCGTT AGTG/---- GGTGCAGCGT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AGTG 1 0 30991 CASAVA_Build 5 144077892 1I CTAGGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 20 1 18 1 T 10 11 30992 CASAVA_Build 5 144082262 1D AATCCCATTT C/- CTTTGCTTTA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 2 1 30993 CASAVA_Build 5 144083722 3I TGAAATAAAC ---/ATG ATGCTCTGAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 ATG 1 2 30994 CASAVA_Build 5 144088005 4D CTCACTAATG GTCT/---- GTCTGTTTTG 3070 hom 22 het 25 0 17 10 GTCT 2 1 30995 CASAVA_Build 5 144090615 7D CAGTTGGCAA TTCAGGC/------- TTCCTGCCAA 3070 hom 94 het 33 0 27 10 TTCAGGC 1 0 30996 CASAVA_Build 5 144093322 1I ATATCTGTTG -/T TTTTTGACTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 5 6 30997 CASAVA_Build 5 144095596 1I CCTTGATTTT -/A AAAAATAGTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 5 6 30998 CASAVA_Build 5 144097880 1D AGAAACTGCA G/- CTATAGCAGC 3070 hom 129 het 46 0 43 4 G 1 0 30999 CASAVA_Build 5 144099849 3I TGTACCAAAC ---/CTA CACGTTCTGC 3070 hom 63 het 26 0 21 5 CTA 0 1 31000 CASAVA_Build 5 144113602 2I GGGTTTTCTC --/TT TGTTGATTGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 1 3 31001 CASAVA_Build 5 144151091 1I TTCTCCCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 10 31002 CASAVA_Build 5 144175797 3I ATTTGATGTC ---/TAA TTACTGAGTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TAA 0 1 31003 CASAVA_Build 5 144181241 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2855 het 33 hom 28 1 9 18 T 19 18 31004 CASAVA_Build 5 144193634 1I ACAGAAGGAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 89 hom 44 1 36 7 A 8 9 31005 CASAVA_Build 5 144211721 2I TTATCATCAT --/CA CACACTGTCT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 CA 2 3 31006 CASAVA_Build 5 144222398 4I TTGTACTCTC ----/ACTT ACTCATTTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 ACTT 0 1 31007 CASAVA_Build 5 144222798 1I GACACACTGA -/T TTTTTTGACA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 6 7 31008 CASAVA_Build 5 144229309 1I TTTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 10 11 31009 CASAVA_Build 5 144232396 3I AGTTAGAGAG ---/AAC AACAGTGGAA 3070 hom 153 het 55 0 51 4 AAC 1 2 31010 CASAVA_Build 5 144246850 2I TAATAATCTC --/TT TTATTTTCAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 4 31011 CASAVA_Build 5 144252726 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 10 11 31012 CASAVA_Build 5 144257309 4I TTTATAAATA ----/TAAC TAACTTTTAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TAAC 1 2 31013 CASAVA_Build 5 144264073 1I AAGACTTAGA -/T TTGAATCTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 3 31014 CASAVA_Build 5 144272259 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 20 3 13 4 A 16 17 31015 CASAVA_Build 5 144279830 1I TGATTATGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 700 hom 51 2 41 8 T 9 10 31016 CASAVA_Build 5 144283279 4I CAGCAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AAAC 3 4 31017 CASAVA_Build 5 144296479 1I TACCATACAC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 8 9 31018 CASAVA_Build 5 144298112 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 33 1 24 8 A 12 11 31019 CASAVA_Build 5 144310059 1D TTTTGTGGGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 4 het 46 2 31 14 T 9 8 31020 CASAVA_Build 5 144310730 1I TTTGTATTGC -/A AGTGACAAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 31021 CASAVA_Build 5 144315528 1D TTGAACACTA G/- AACTTAATCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 0 31022 CASAVA_Build 5 144330490 1I TATAGTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 33 1 29 3 T 10 11 31023 CASAVA_Build 5 144330821 1D ATTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 10 9 31024 CASAVA_Build 5 144341857 1D ATGCAGGCAT A/- AATCTAAACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 2 31025 CASAVA_Build 5 144344203 1I AACCACAGAC -/A AAAAATCCTC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 5 6 31026 CASAVA_Build 5 144345297 4D CTCAAAATGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 AAAC 4 3 31027 CASAVA_Build 5 144348065 1I CTTCTGCACA -/G GTAAAAGAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 1 2 31028 CASAVA_Build 5 144354293 1D CAATATTTTC T/- TTTTTTTATT 1599 hom 10 het 7 0 4 3 T 8 7 31029 CASAVA_Build 5 144365201 2I TGGAAGTTGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 A 10 12 31030 CASAVA_Build 5 144386401 2I TTGTTGGCTT --/TA TATATATATA 3070 het 271 hom 17 1 12 4 TA 8 9 31031 CASAVA_Build 5 144387470 1I AGCAGAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2778 hom 39 9 13 17 A 17 18 31032 CASAVA_Build 5 144397826 1I GCATTAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1063 hom 38 4 21 13 T 12 13 31033 CASAVA_Build 5 144405419 1I TTGAATGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 142 hom 24 2 19 3 A 9 10 31034 CASAVA_Build 5 144406148 1D TGTTTATGAA G/- AAGTGTTCTC 3070 hom 90 het 36 0 31 6 G 1 0 31035 CASAVA_Build 5 144406225 3D TTATCAGCAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 34 1 23 11 T 17 14 31036 CASAVA_Build 5 144407833 2D38M2D TGTGTGTGTC TGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATACACACTATATATAC/--TGTGTGTGTGTGTGTATATATATATACACACTATATAT-- ACACACACAC 2178 het 22 hom 20 1 12 10 N/A 0 0 31037 CASAVA_Build 5 144416627 1I AGGCTTCTTC -/A AAAGGCTGGT 3070 hom 148 het 51 0 50 1 A 3 4 31038 CASAVA_Build 5 144420320 1D AATGGGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 T 11 10 31039 CASAVA_Build 5 144421004 2D TAGCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2000 het 187 hom 9 1 5 3 T 12 10 31040 CASAVA_Build 5 144421592 1D AGGAAGACTG C/- CCTGCCTTCC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 C 3 2 31041 CASAVA_Build 5 144427340 2D CTCCCCCAGT CC/-- CCTGACCAAA 3070 hom 135 het 52 0 45 7 C 4 2 31042 CASAVA_Build 5 144441496 1D GAAATTTCAT A/- AATAGCCTAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 3 2 31043 CASAVA_Build 5 144446083 1I TTAAACTTAA -/T TTTAACATAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 3 4 31044 CASAVA_Build 5 144446692 1I AAATTTCCTC -/A CATCCCTCAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 31045 CASAVA_Build 5 144456979 2D TTTTTGATGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1707 hom 20 5 14 1 T 12 10 31046 CASAVA_Build 5 144480481 4I CTGTATTGTG ----/CTTT CTAAGGGTCA 3070 hom 111 het 47 0 38 9 CTTT 0 1 31047 CASAVA_Build 5 144480879 1I51M1D ATATTTTCTG -TTTTTTTCCTTTCATCTAACCTGTAATAAAGCACTGCATTGTGTTAGCATGA/TTTTTTTTCCTTTCATCTAACCTGTAATAAAGCACTGCATTGTGTTAGCATG- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 37 0 36 15 N/A 0 0 31048 CASAVA_Build 5 144481603 1I CCTGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 24 3 14 7 T 15 16 31049 CASAVA_Build 5 144486468 1I CTTTCTGTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 21 hom 26 1 23 2 T 8 9 31050 CASAVA_Build 5 144503863 1I CTTTACTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 378 hom 34 1 31 2 A 9 10 31051 CASAVA_Build 5 144520339 1D TTTTATTTTG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 7 6 31052 CASAVA_Build 5 144523372 1I AAGCTTTCTG -/A AAAAAACTCA 3070 het 394 hom 39 1 36 2 A 6 7 31053 CASAVA_Build 5 144524885 3I TTTTTTTTTC ---/CAG TTGTGCCTAT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 CAG 0 1 31054 CASAVA_Build 5 144532840 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 TA 6 7 31055 CASAVA_Build 5 144540038 1I CCAAACAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 777 hom 36 3 24 9 T 12 13 31056 CASAVA_Build 5 144541463 1I TATAATGGTT -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 8 31057 CASAVA_Build 5 144541910 1I CTTCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 22 1 13 8 A 12 13 31058 CASAVA_Build 5 144548666 2D TTACAAAGTC TT/-- TGCCCACGCC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 3 1 31059 CASAVA_Build 5 144568060 1D TGAAAACATA C/- TCTGCAAGAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 1 0 31060 CASAVA_Build 5 144569255 1I AAATAAAGGC -/A AAAATAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 4 5 31061 CASAVA_Build 5 144576240 3D GAAAAAAAAA AAG/--- ATTTTAAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AAG 1 0 31062 CASAVA_Build 5 144588444 1I CTATTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 546 hom 36 2 22 12 A 13 14 31063 CASAVA_Build 5 144588869 1I CATCGCCCAC -/A AAAAAAGTGG 3070 hom 75 het 30 0 23 7 A 6 7 31064 CASAVA_Build 5 144614673 1D ACTCTGAATT A/- AAAAAAAAAA 1849 het 1849 ref 30 19 6 6 A 15 14 31065 CASAVA_Build 5 144625925 1D TATTTTAACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 13 het 32 1 25 7 T 9 8 31066 CASAVA_Build 5 144631841 1I TGGCAACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 706 hom 42 2 37 3 T 10 11 31067 CASAVA_Build 5 144639587 1D AGTTTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 25 0 16 10 A 12 11 31068 CASAVA_Build 5 144646468 5D GTTTTTTTTT GTTTG/----- TTTGTTTGTT 3070 hom 51 het 20 0 17 4 GTTTG 1 0 31069 CASAVA_Build 5 144650957 1I TGCCAGGCCT -/G GTGTCAGGTG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 2 31070 CASAVA_Build 5 144652421 2D ACTTAAGAAC AT/-- AAAAAACAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 1 0 31071 CASAVA_Build 5 144654177 4D TAAAATCAAA TGAC/---- TTCGAGTTTT 3070 hom 117 het 41 0 40 3 TGAC 1 0 31072 CASAVA_Build 5 144668857 2I TGGTCAAGTC --/AA ATAATAGAGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 3 31073 CASAVA_Build 5 144671948 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 274 hom 30 1 20 9 A 13 14 31074 CASAVA_Build 5 144673306 2D TTATGCTGTT TA/-- TAGCCCAATG 3070 hom 99 het 36 0 32 8 TA 2 1 31075 CASAVA_Build 5 144686719 26D TGGGTCGTAA TCCCAAAAGACACAGTCACAAACGCC/-------------------------- TCCCAAAAGA 3070 hom 57 het 27 0 19 10 TCCCAAAAGACACAGTCACAAACGCC 2 1 31076 CASAVA_Build 5 144690701 8D ACTGCTTTAG TTTTGTCA/-------- CAGAGATTCT 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 TTTTGTCA 1 0 31077 CASAVA_Build 5 144692473 1I TAGAACATGC -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 T 6 7 31078 CASAVA_Build 5 144694528 1D TGTTTGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2681 hom 48 16 15 17 T 17 16 31079 CASAVA_Build 5 144705089 3D GCTTGCTAGT CTA/--- CTGATTGATG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 CTA 1 0 31080 CASAVA_Build 5 144725188 5D AAATTTTATA AATTT/----- AATTTAATCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 AATTT 2 1 31081 CASAVA_Build 5 144727614 2I CCTGCAACCT --/AC ACATCTTGAT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 AC 1 2 31082 CASAVA_Build 5 144747063 1D ATTCAAGGAG C/- AAAAATGTGG 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 C 1 0 31083 CASAVA_Build 5 144761952 1I CTCAGAGAGG -/A AAAGTGATTT 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 A 3 4 31084 CASAVA_Build 5 144773079 5D23M3I TGATTAAAAG ATAAAATATAATAGAAGTTGACATGAAT---/-----ATATAATAGAAGTTGACATGAATGTG GTGAAAAGGG 3070 het 2617 hom 32 8 13 20 N/A 0 0 31085 CASAVA_Build 5 144775014 5D TTGTTTTGTT TTTTA/----- TTTTATTTTC 86 het 86 ref 19 13 2 4 TTTTA 2 1 31086 CASAVA_Build 5 144784827 1I AATGTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 462 hom 17 1 14 2 A 9 10 31087 CASAVA_Build 5 144787456 1D TCGCACCATT A/- AAGGTATAAT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 3 2 31088 CASAVA_Build 5 144788684 1I CAGTGTGGCT -/G GGGCTGAGTG 3070 hom 54 het 25 0 18 7 G 3 4 31089 CASAVA_Build 5 144807196 1I AAATCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2166 hom 25 8 11 6 T 10 11 31090 CASAVA_Build 5 144821105 2D CGCCCAGGCT GG/-- GGGGTGCAGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 6 4 31091 CASAVA_Build 5 144830233 1I CACTAGTTAG -/A GTAATTTTTA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 0 1 31092 CASAVA_Build 5 144919593 1D AAAAAGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 37 2 24 11 A 15 14 31093 CASAVA_Build 5 144960177 1D TCAGGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 1600 het 1539 hom 14 7 4 3 A 15 14 31094 CASAVA_Build 5 145081854 22D TCTTATAGAA ATGTATCAAACATTAAACCCTG/---------------------- ATAATAGAAA 3070 het 3070 ref 18 12 7 1 ATGTATCAAACATTAAACCCTG 1 0 31095 CASAVA_Build 5 145094847 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 3070 hom 39 het 15 0 13 3 A 5 6 31096 CASAVA_Build 5 145096153 4D AACACACAGC TCTA/---- TCTAAGACAG 3070 hom 93 het 36 0 31 6 TCTA 2 1 31097 CASAVA_Build 5 145097180 1I ATGTTATTTA -/T TTTAAAAAAA 3070 hom 79 het 32 0 28 4 T 3 4 31098 CASAVA_Build 5 145099401 3D CAACATTCTC TGA/--- TGTGGTCCCA 3070 hom 57 het 23 0 20 7 TGA 1 0 31099 CASAVA_Build 5 145099722 1D AAAAATAAAT A/- AAAAAACATA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 7 6 31100 CASAVA_Build 5 145100446 3D ATATTTAATA TAT/--- TATTTATATT 1934 hom 10 het 4 0 4 0 TAT 2 1 31101 CASAVA_Build 5 145102288 1D AAGGGATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 27 1 18 9 A 15 14 31102 CASAVA_Build 5 145103360 1I GGAATCCCCA -/C CCCCCCAGCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 6 7 31103 CASAVA_Build 5 145105623 8I CATCTCAAAA --------/AAAAAATG AAAAAAATGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AAAAAATG 0 1 31104 CASAVA_Build 5 145115504 5I CACACTGGAC -----/CAAGT CAAAAGAGAA 3070 hom 101 het 39 0 34 5 CAAGT 0 1 31105 CASAVA_Build 5 145135796 1D ATTTGCAAAG A/- AAAAAAATGC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 8 7 31106 CASAVA_Build 5 145136218 4D TTCTCAAATG AAGA/---- AAGAAAGAAA 3070 hom 117 het 44 0 38 8 AAGA 3 2 31107 CASAVA_Build 5 145139284 4I49M2D TGTGAAAGGG ----ATTATAAAATATTACTTGAAAAAAGCAAGAAATGAAATTGTACTAACACTG/ATTTATTATAAAATATTACTTGAAAAAAGCAAGAAATGAAATTGTACTAACAC-- TTTCATTATG 3070 hom 78 het 29 0 27 14 N/A 0 0 31108 CASAVA_Build 5 145147304 1I GAGGCAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 44 3 31 10 T 13 14 31109 CASAVA_Build 5 145168655 1D AAAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 67 het 30 0 23 8 A 10 9 31110 CASAVA_Build 5 145172408 1I GTCTGAGTCA -/G GGTTTCTGCT 3070 hom 120 het 44 0 39 5 G 2 3 31111 CASAVA_Build 5 145179624 1D CTTTACATCA G/- AAAATGCTGT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 G 1 0 31112 CASAVA_Build 5 145186614 1I TTGCCGAGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 9 10 31113 CASAVA_Build 5 145192775 1I TGTTAATCTC -/A CCCACTACAC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 0 1 31114 CASAVA_Build 5 145225749 4I AAAAAAAATT ----/AGAC AGGCATGGTG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 AGAC 0 1 31115 CASAVA_Build 5 145263286 1D ATTCAGAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1232 hom 38 3 24 11 A 13 12 31116 CASAVA_Build 5 145288661 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 9 8 31117 CASAVA_Build 5 145295638 4I ACCCTGGCAT ----/TAAG TAAGATTGTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TAAG 1 2 31118 CASAVA_Build 5 145358038 1D GCCCATAGTT A/- AAAAAAAAAA 1963 het 1963 ref 43 14 10 20 A 17 16 31119 CASAVA_Build 5 145377130 2I CTCTTTGGGG --/AA AGTCACATGT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 1 3 31120 CASAVA_Build 5 145378652 1I ATATTGAGCA -/T TTTTTATATG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 5 6 31121 CASAVA_Build 5 145385474 3D TCTGTTGTTG TTT/--- TTATTGTGTT 3070 hom 132 het 48 0 45 6 T 5 2 31122 CASAVA_Build 5 145387920 30D70M3D GAGGCCTGCA ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGATAATTCAACAAGAAAGGAAGACAAGAGAAGCAAAATAAAACAGAAGGGCAAA/------------------------------ACACACACACACAGAGAGAGATAATTCAACAAGAAAGGAAGACAAGAGAAGCAAAATAAAACAGAAGGGC--- AGAAAGGGAA 3070 hom 93 het 34 0 30 30 N/A 0 0 31123 CASAVA_Build 5 145388352 6D CCTGTAGCAC CCACCA/------ CCACCACCCA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 CCA 4 2 31124 CASAVA_Build 5 145393208 19D AGCCCTTAGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------- TTTTTTTTTT 2494 hom 27 het 27 1 18 11 T 36 17 31125 CASAVA_Build 5 145394862 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 189 hom 25 2 19 5 A 13 12 31126 CASAVA_Build 5 145395212 9I CCTTAGGAAA ---------/AAAGCTATT AAAGCGTCCC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 AAAGCTATT 0 1 31127 CASAVA_Build 5 145403896 14D TCCGTTTTTG TTTTTTTTTGTTTT/-------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 31 0 20 12 TTTTTTTTTGTTTT 2 1 31128 CASAVA_Build 5 145406181 1I AAAGCATAGT -/C CCTAAAAAGG 3070 hom 169 het 62 0 57 12 C 2 3 31129 CASAVA_Build 5 145418628 1D ATCTCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 36 2 21 13 A 16 15 31130 CASAVA_Build 5 145423993 1I AGGAAGAGGC -/T TAAAGGAGAC 3070 hom 135 het 48 0 45 3 T 1 2 31131 CASAVA_Build 5 145427536 6D CCAAGGCCTG CCCACA/------ CCCACACCCC 3070 hom 93 het 33 0 30 5 CCCACA 2 1 31132 CASAVA_Build 5 145429739 2D ATGGAAACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 43 1 31 11 A 14 12 31133 CASAVA_Build 5 145440113 2I AAACTATAGA --/CT CTTGTGTCTC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 CT 1 2 31134 CASAVA_Build 5 145444825 2D ATATATAGTC TT/-- TTAAAATAGT 3070 het 3070 ref 33 15 10 9 T 4 2 31135 CASAVA_Build 5 145451390 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1664 hom 25 9 11 5 A 11 10 31136 CASAVA_Build 5 145460252 3I AAAATCTAGC ---/ATT ATGTCAATTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 ATT 0 1 31137 CASAVA_Build 5 145468016 4I AAGAATTGCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 AAAC 2 3 31138 CASAVA_Build 5 145468896 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1720 hom 18 5 10 3 A 12 11 31139 CASAVA_Build 5 145471604 3I AGGCACTAAC ---/ATA ATAAGTTATA 3070 het 3070 hom 33 8 19 6 ATA 1 2 31140 CASAVA_Build 5 145471952 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 T 11 12 31141 CASAVA_Build 5 145472853 12D AGAGTTTCAC TCTTGTTGCCTA/------------ AGCTGGAGTG 3070 het 3070 ref 28 19 12 2 TCTTGTTGCCTA 1 0 31142 CASAVA_Build 5 145473094 2I TGCTGGGATT --/AA ATAGGTGTGA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 A 1 3 31143 CASAVA_Build 5 145473421 1I CTCTTCATTT -/A AAAAAAAAAA 2874 het 2874 ref 29 11 8 10 A 10 11 31144 CASAVA_Build 5 145477532 3I AAATGCATAT ---/AAC AACATGATGA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 AAC 1 2 31145 CASAVA_Build 5 145485464 1D AGATTTTTCT G/- GCCCCATAGC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 2 1 31146 CASAVA_Build 5 145488241 15D GAGAGGAAAA CAGCAGCTTTTCCCT/--------------- CAGCATCCAT 3070 het 3070 ref 34 18 16 2 CAGCAGCTTTTCCCT 1 0 31147 CASAVA_Build 5 145488882 6D AGGCTTTTAA AAAAAG/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 46 26 20 1 AAAAAG 1 0 31148 CASAVA_Build 5 145489461 10D CAAGAATACT TACACAAATA/---------- TACACAAATA 3070 het 3070 ref 36 21 13 4 TACACAAATA 2 1 31149 CASAVA_Build 5 145491205 6I AAGCCCAAAA ------/TGCAAC TGCAACATGA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 TGCAAC 1 2 31150 CASAVA_Build 5 145492561 1D TTATTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 495 hom 21 1 11 10 A 12 11 31151 CASAVA_Build 5 145497100 1D AATTTTGTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 10 9 31152 CASAVA_Build 5 145502031 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 10 11 31153 CASAVA_Build 5 145505035 4D GAAATAGGGT CTCA/---- CTATGTTGCC 3070 het 3070 hom 18 7 11 1 CTCA 1 0 31154 CASAVA_Build 5 145505178 1D ACTGCTTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1863 hom 22 5 12 5 A 10 9 31155 CASAVA_Build 5 145506446 1D ATCTTCTCCC A/- TCCAACTTCC 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 A 1 0 31156 CASAVA_Build 5 145509929 2I CACCTCTATC --/TT TTTTTCAGTA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 T 5 7 31157 CASAVA_Build 5 145512577 1D GAGTTGTACA G/- GACTTTGTTA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 G 2 1 31158 CASAVA_Build 5 145513317 1I AAATTCTGTG -/A AACATATTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 3 31159 CASAVA_Build 5 145520407 4I AATTACTTTA ----/ATTT ATTTACTTAA 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 ATTT 1 2 31160 CASAVA_Build 5 145525419 2D ATGATATAAC CA/-- CACTCAAGGG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 CA 2 1 31161 CASAVA_Build 5 145525726 4D ATCAATATGA ACTT/---- ACTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 52 25 19 9 ACTT 2 1 31162 CASAVA_Build 5 145526608 1D ATATTAATTA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 2556 hom 25 7 12 6 T 3 2 31163 CASAVA_Build 5 145530226 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2242 hom 31 14 11 6 A 12 11 31164 CASAVA_Build 5 145531114 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2117 hom 20 5 10 5 A 10 11 31165 CASAVA_Build 5 145548947 1I TTATAGGCAT -/G TGCCACCATG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 0 1 31166 CASAVA_Build 5 145564285 1D TGACTTTTAG A/- TACATAGAGG 3070 het 3070 hom 54 25 27 3 A 1 0 31167 CASAVA_Build 5 145565344 1I TGAATAGGGG -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 7 8 31168 CASAVA_Build 5 145566306 1D CATTTAGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2897 hom 22 8 12 2 A 11 10 31169 CASAVA_Build 5 145577117 1I ACTTTAAGCA -/T TAAAAACTAG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 1 2 31170 CASAVA_Build 5 145577910 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 TA 5 6 31171 CASAVA_Build 5 145581642 3D ATACTCTTTT ATA/--- ATAACATTTT 3070 het 3070 hom 22 8 13 3 ATA 2 1 31172 CASAVA_Build 5 145585324 1D TACCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1186 het 1186 ref 29 8 5 16 T 17 16 31173 CASAVA_Build 5 145594276 1I TTTGTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1057 hom 40 3 32 5 A 11 12 31174 CASAVA_Build 5 145608624 4D TTAGACATAC TTAA/---- TTAGATAGTA 3070 het 3070 ref 41 26 14 5 TTAA 1 0 31175 CASAVA_Build 5 145610810 9D GGATTACAGG CGTGAGCCA/--------- CGTGAGCCAC 1834 het 1834 ref 17 9 6 4 CGTGAGCCA 2 1 31176 CASAVA_Build 5 145614188 1D AATAGGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 T 13 12 31177 CASAVA_Build 5 145622049 3I GCTATTTATT ---/TTG TTTTAGAATC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TTG 0 1 31178 CASAVA_Build 5 145650151 1I CCCAGAAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 6 7 31179 CASAVA_Build 5 145650867 1D CCAACTTCAT A/- AGAGTTTTAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 2 1 31180 CASAVA_Build 5 145653174 2I TATTAGTGTC --/TG TCAAACACTG 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 TG 0 1 31181 CASAVA_Build 5 145654193 1I ATCGAATGCT -/A AAAAAAAAAA 3034 het 3034 ref 25 12 9 4 A 11 12 31182 CASAVA_Build 5 145656489 1D TTTGTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 983 het 983 ref 41 28 3 10 T 11 10 31183 CASAVA_Build 5 145677225 5D GTTTCAGGAA AAAAC/----- AAAAACAAAA 131 het 131 ref 28 11 1 17 AAAAC 1 0 31184 CASAVA_Build 5 145687646 1D CAGTGTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 15 15 13 T 12 11 31185 CASAVA_Build 5 145689617 4I CAACTCAAAG ----/GTTT GTTTGCCTGA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 GTTT 1 2 31186 CASAVA_Build 5 145721307 2D GCCTGTAATG CT/-- CTAGCACTTT 2598 het 2598 ref 26 14 6 7 CT 2 1 31187 CASAVA_Build 5 145726855 2I TTGGCAGGAA --/CT CTCTGCTCCA 3070 het 3070 hom 66 24 34 8 CT 2 3 31188 CASAVA_Build 5 145750162 2I AAAACAAAAC --/TT ATCACTTTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 0 2 31189 CASAVA_Build 5 145752184 1D ATGTCGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 A 12 11 31190 CASAVA_Build 5 145753733 2D TACCACTGAC AA/-- AACCTGTCTG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 4 2 31191 CASAVA_Build 5 145753775 6I3M7I GAAATAAGTG ------GAA-------/AGGTGAGAATAATAAG TGGATAATAG 228 het 3 hom 15 0 1 16 N/A 0 0 31192 CASAVA_Build 5 145756937 1D TTATTGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 13 20 15 T 15 14 31193 CASAVA_Build 5 145757647 1I TTTCACTCCA -/G GGGACTGGGG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 3 4 31194 CASAVA_Build 5 145758094 1I TACCAGGGCT -/A AAACAGGCAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 3 4 31195 CASAVA_Build 5 145759409 1D AGAAACCACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 147 het 55 0 48 8 T 10 9 31196 CASAVA_Build 5 145759824 4I TGGTACTGTA ----/TTTC CTTCACAATG 3070 hom 141 het 54 0 48 6 TTTC 0 1 31197 CASAVA_Build 5 145763472 1I GAAAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 T 10 11 31198 CASAVA_Build 5 145764474 1D GTTAGGATTC T/- TTTTTTTTTC 1986 het 1986 ref 28 15 6 7 T 10 9 31199 CASAVA_Build 5 145766913 1D TCTTTAACAC T/- TTTTCACTTG 3070 het 3070 ref 41 23 16 3 T 5 4 31200 CASAVA_Build 5 145771078 1D TAACTTTTTT G/- TTAACAAACA 3070 het 3070 hom 31 10 12 11 G 1 0 31201 CASAVA_Build 5 145773897 1I TGTTTCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 15 11 T 10 11 31202 CASAVA_Build 5 145774118 1I CTCCATTGGG -/A AAAAAAACTT 1981 het 1981 ref 15 6 7 2 A 7 8 31203 CASAVA_Build 5 145788099 3I CAGAGCGAGA ---/CTC CTCCATCTCA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 CTC 1 2 31204 CASAVA_Build 5 145797290 1D AACAAAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 285 hom 25 1 21 3 A 12 11 31205 CASAVA_Build 5 145798168 1I TGACACTTTT -/G AAGAGTATTG 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 G 0 1 31206 CASAVA_Build 5 145798908 12I TCACCTTTAA ------------/CTGAGTGTTAAT CTTAGCATCA 3070 hom 148 het 55 0 50 6 CTGAGTGTTAAT 0 1 31207 CASAVA_Build 5 145800721 1D ATTTAAGCAG A/- GGCTGTTTTA 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 A 1 0 31208 CASAVA_Build 5 145801405 1I TCTATAGATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 9 10 31209 CASAVA_Build 5 145804410 1I TTTCAGAATA -/G TTGACCAGAA 2435 het 2435 ref 20 10 5 5 G 0 1 31210 CASAVA_Build 5 145820183 2I TAAATAATGA --/TT TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 T 7 9 31211 CASAVA_Build 5 145826162 1D TACAAGAGTA G/- GGGGTGGAGT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 G 5 4 31212 CASAVA_Build 5 145830653 1I CTTAATTCAG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 6 7 31213 CASAVA_Build 5 145832818 5D AGCTTAGTAA GGAAG/----- GCATGTCAAA 3070 het 3070 hom 25 10 15 2 GGAAG 1 0 31214 CASAVA_Build 5 145857851 1D TTCAGTCTTA C/- TCTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 48 20 19 9 C 1 0 31215 CASAVA_Build 5 145860160 1D GTGTATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 9 A 12 11 31216 CASAVA_Build 5 145860761 1D GGATTCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 17 10 A 15 14 31217 CASAVA_Build 5 145865243 1I GCTTTCTTCA -/T TTGTTCCTTG 3070 het 3070 ref 48 28 17 3 T 2 3 31218 CASAVA_Build 5 145871326 3I CTGTTTTTAA ---/AAG AAGCAGCAAA 3070 het 3070 ref 41 27 8 6 AAG 1 2 31219 CASAVA_Build 5 145871641 1I CTCCCGAGTT -/A AAAAAAAAAT 2924 het 2924 ref 20 11 7 2 A 9 10 31220 CASAVA_Build 5 145879434 1D CATCCAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 11 10 31221 CASAVA_Build 5 145884540 2I CTCTCAGATA --/TC TCTCTGCATA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TC 2 3 31222 CASAVA_Build 5 145885235 2I TTGAAAATAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 A 10 12 31223 CASAVA_Build 5 145893608 1D ACTTAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 26 1 20 5 A 15 14 31224 CASAVA_Build 5 145912342 1D GCTTTAAAGA T/- TTTTTTTTTA 1619 het 1619 ref 16 8 4 4 T 10 9 31225 CASAVA_Build 5 145915702 1D AATAAGCCTA T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 7 6 31226 CASAVA_Build 5 145917144 10D TCCCTAGGCT GCACACAGCA/---------- TGGGGACTCT 3070 hom 42 het 17 0 11 6 GCACACAGCA 1 0 31227 CASAVA_Build 5 145919016 1I AATAGTTACC -/A AACATGTAAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 2 3 31228 CASAVA_Build 5 145919755 1D GTCATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 2990 het 1912 hom 38 16 10 12 T 17 16 31229 CASAVA_Build 5 145919960 1D TTTTTGTGTG T/- TTCTGAATCT 3070 het 3070 ref 35 17 14 7 T 3 2 31230 CASAVA_Build 5 145928098 4I GCTGGACTAT ----/GTGG GTGGGACTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 GTGG 1 2 31231 CASAVA_Build 5 145938610 1I TTCTACCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 11 12 31232 CASAVA_Build 5 145941096 6I ACCTTTAAAC ------/AACCAG AACCAGATCT 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 AACCAG 1 2 31233 CASAVA_Build 5 145947867 3I CTTGCCCAGA ---/GAG GAGTTTACAC 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 GAG 1 2 31234 CASAVA_Build 5 145949999 26I21M4I GGCAGAGAGC --------------------------AAAGGCAATGACATATCTTCA----/AAAGGGAGTGACCGAGTATTACGGAGAAAGGCAATGACATATCTTCACTGT CTGTCTTTTC 3070 het 3070 ref 32 25 20 2 N/A 0 0 31235 CASAVA_Build 5 145951430 1D ATTATTTTCC A/- AAAAAAAAAA 1800 het 1800 ref 33 20 4 9 A 17 16 31236 CASAVA_Build 5 145956131 36D CTGATCTTTC ATTAACTAATTTCTTTCCCACTGGACCTCACAACCT/------------------------------------ ATTAACTAAT 3070 het 3070 ref 35 16 11 14 ATTAACTAATTTCTTTCCCACTGGACCTCACAACCT 1 0 31237 CASAVA_Build 5 146006977 41I TGACGTTCAC -----------------------------------------/TAAATAAATACATAAATATAAAAACCAAAAAAAAGTCTATG TATTGCTTAG 3070 hom 72 het 26 0 24 3 TAAATAAATACATAAATATAAAAACCAAAAAAAAGTCTATG 0 1 31238 CASAVA_Build 5 146012517 1D GGAGGCAACA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 72 het 28 0 23 6 C 9 8 31239 CASAVA_Build 5 146017441 1I ACTTCTGAGA -/G GGGACATTTG 3070 hom 117 het 45 0 38 7 G 3 4 31240 CASAVA_Build 5 146018798 1I AGAAATGATC -/A AAAAACCTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 5 6 31241 CASAVA_Build 5 146023245 1I TAACAATATA -/C CAGGCATGTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 2 31242 CASAVA_Build 5 146024771 1I GATGTGCTCT -/C ATTCAGGCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 0 1 31243 CASAVA_Build 5 146027944 4D AAAGAAAACG ATTA/---- ATTCTCTAGC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 ATTA 1 0 31244 CASAVA_Build 5 146033060 4D AATTTCTGTA AAGT/---- AAGTACAAAT 3070 hom 84 het 32 0 24 9 AAGT 2 1 31245 CASAVA_Build 5 146033240 1D ATTTAGAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 10 9 31246 CASAVA_Build 5 146033393 1D ATTCAAAACT A/- AGACCCTTGA 3070 hom 80 het 29 0 26 3 A 2 1 31247 CASAVA_Build 5 146064488 1I GAGTTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 23 18 10 T 10 11 31248 CASAVA_Build 5 146098782 1D AGTGCACCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 41 0 35 10 T 10 9 31249 CASAVA_Build 5 146105718 1D GGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 278 hom 22 1 18 6 A 13 12 31250 CASAVA_Build 5 146106140 1D CTGGGAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 32 1 27 4 A 11 10 31251 CASAVA_Build 5 146142573 3I GAGAGGAAAC ---/AGG AGAAGAAAGA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AGG 0 1 31252 CASAVA_Build 5 146154720 1D CCTGCCCCCT A/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 1 0 31253 CASAVA_Build 5 146168453 2D CATTTCTATC AG/-- GGGAAAGAAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 6 AG 1 0 31254 CASAVA_Build 5 146181534 1D GTACTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 12 11 31255 CASAVA_Build 5 146184079 2D CACATTGGTA GT/-- GAGTTTGCCT 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 GT 1 0 31256 CASAVA_Build 5 146187192 4I AACACATCGG ----/TTAA TTATTTTCAA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 TTAA 0 1 31257 CASAVA_Build 5 146188011 2I TTACTTTTAC --/TT TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 7 9 31258 CASAVA_Build 5 146202244 1I GCCCTTTTTT -/A TTTTTTTTTT 2090 het 1136 hom 20 8 7 5 A 0 1 31259 CASAVA_Build 5 146221613 1D TACAGCATTG T/- TTTTTTTTTT 1974 het 1974 ref 35 20 5 10 T 15 14 31260 CASAVA_Build 5 146245728 1D GACTGAGGAT A/- AAAAAAAAAG 1221 het 1221 ref 43 34 3 7 A 10 9 31261 CASAVA_Build 5 146266966 1I CTAAATTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 T 9 10 31262 CASAVA_Build 5 146268282 1I AATTGTTAGA -/T TTTTTTTTTT 1038 het 1038 ref 36 20 6 10 T 15 16 31263 CASAVA_Build 5 146300268 1D TTGCTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 1404 het 1404 ref 39 29 4 7 A 13 12 31264 CASAVA_Build 5 146313885 2D ACCAAGAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 39 0 25 15 T 16 14 31265 CASAVA_Build 5 146315992 1I TTCCATTCAA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 7 8 31266 CASAVA_Build 5 146331966 2I GAATGGGGTT --/AC AGTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 AC 0 1 31267 CASAVA_Build 5 146332832 3D TCTTTAAAAA TGT/--- TCTGTGGTAT 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 TGT 1 0 31268 CASAVA_Build 5 146336806 1I CAAACAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 7 8 31269 CASAVA_Build 5 146351449 1D TGTACTCCCT A/- AATATGTACA 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 A 3 2 31270 CASAVA_Build 5 146353564 1D TCCAGCACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 11 10 31271 CASAVA_Build 5 146360375 75D AACTCTATTA TGATCAGTAACTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGATTTGCCATTTTTAATGGCAAAAACCACAATTACTT/--------------------------------------------------------------------------- TTGCACCAAC 3070 het 3070 ref 28 19 14 9 TGATCAGTAACTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGATTTGCCATTTTTAATGGCAAAAACCACAATTACTT 1 0 31272 CASAVA_Build 5 146364026 2D TCACTAGAAG AC/-- ACACTGCCCC 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 AC 3 2 31273 CASAVA_Build 5 146365559 3D GAGACAGACA AAG/--- AAGAAGTCAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 AAG 3 2 31274 CASAVA_Build 5 146382314 1D GGCTCCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 11 10 31275 CASAVA_Build 5 146391235 1I TAGGCATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 477 hom 34 2 26 6 T 10 11 31276 CASAVA_Build 5 146395556 1D AACTGAAGGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 389 hom 27 3 14 10 A 9 8 31277 CASAVA_Build 5 146396916 1I AGCTTCAGGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 369 hom 43 1 38 4 A 8 9 31278 CASAVA_Build 5 146401367 1I TATTACACTT -/A AGAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 A 1 2 31279 CASAVA_Build 5 146412982 2D AAAAAAAAAA AC/-- ACACGCGCAC 3070 hom 66 het 27 0 22 8 AC 3 2 31280 CASAVA_Build 5 146414241 1D GTCCAACTGT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 9 8 31281 CASAVA_Build 5 146435700 2D GTTGTTTAAA AT/-- ATATTTCTAA 3070 het 3070 ref 37 19 18 1 AT 3 2 31282 CASAVA_Build 5 146439113 2D ACATACAGTG AT/-- ATATATATAT 1954 het 1954 ref 13 5 6 2 AT 8 7 31283 CASAVA_Build 5 146447158 3D AAATACCTAA TAG/--- TAGGATGGCC 3070 het 3070 ref 39 23 16 3 TAG 2 1 31284 CASAVA_Build 5 146457343 1I ATTTAAAGAA -/T TAAAAAGGGT 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 T 1 2 31285 CASAVA_Build 5 146459183 1I GTTATTAATC -/A ATAGCCTTAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 1 2 31286 CASAVA_Build 5 146460211 1D CTATACACCA G/- GTACCATGCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 2 1 31287 CASAVA_Build 5 146480653 43D AATGTTCTAT GTGTTCATGAAAAGAATGTATATTCTGCAATTGTTGGAGAGAA/------------------------------------------- TATTCTATAA 2590 het 2590 ref 30 27 6 1 GTGTTCATGAAAAGAATGTATATTCTGCAATTGTTGGAGAGAA 1 0 31288 CASAVA_Build 5 146486331 13I GGGTGTATAT -------------/GTATTTAGGATAG GTAGAGATCC 3070 het 3070 hom 38 11 20 8 GTATTTAGGATAG 0 1 31289 CASAVA_Build 5 146494788 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2856 het 2856 ref 26 10 11 5 T 11 10 31290 CASAVA_Build 5 146500752 2D TTGGAGTCTC TG/-- AGTGGCCTCG 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 TG 1 0 31291 CASAVA_Build 5 146501406 3D AGGCACTCTG TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 237 hom 49 2 20 27 T 12 9 31292 CASAVA_Build 5 146506504 1I ATCAACAAGC -/A AAAACCAAAC 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 A 4 5 31293 CASAVA_Build 5 146507526 1D21M2D AGACTTCCTA TTTTTTTTCTCTAATTTTCCCCCT/-TTTTTTTCTCTAATTTTCCCC-- GTTATAGGCT 3070 het 3070 ref 21 16 11 5 N/A 0 0 31294 CASAVA_Build 5 146514078 1I CATCAGTGGG -/A AAATAATGGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 3 4 31295 CASAVA_Build 5 146518000 11D GATGGTTATG ATAAAATTAAT/----------- ATTTATTAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 3 ATAAAATTAAT 1 0 31296 CASAVA_Build 5 146527202 3D TAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAAGA 2180 het 559 hom 31 8 15 8 AAG 1 0 31297 CASAVA_Build 5 146528100 1I TCTCTTAAAA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 31298 CASAVA_Build 5 146529089 2D TCAGGGAGAA AC/-- ACACACACAC 2150 het 2150 ref 42 29 6 8 AC 10 9 31299 CASAVA_Build 5 146530297 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 19 1 15 3 A 12 11 31300 CASAVA_Build 5 146536272 1D TAGCTTAATC A/- AAAAGGAGTA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 A 5 4 31301 CASAVA_Build 5 146537326 1D CACTTCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 56 1 42 14 T 13 12 31302 CASAVA_Build 5 146537510 1I TTATAATTAT -/A AAAACTTTGT 3070 hom 98 het 37 0 33 4 A 4 5 31303 CASAVA_Build 5 146549390 3I ATGTGTCTTT ---/AGG AGATTTCAAC 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 AGG 0 1 31304 CASAVA_Build 5 146555783 1D CACTATCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 A 12 11 31305 CASAVA_Build 5 146574410 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1810 hom 32 12 11 11 T 15 14 31306 CASAVA_Build 5 146586260 1D GGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 10 9 31307 CASAVA_Build 5 146589843 3D ATTATTAATA ATG/--- ATATTACTAT 3070 het 2489 hom 15 6 8 2 ATG 1 0 31308 CASAVA_Build 5 146590243 1I CAATTTCGCA -/G CGGATGTACA 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 G 0 1 31309 CASAVA_Build 5 146594427 1D CCACATCGCA G/- GGGGGGTGAG 1010 het 470 hom 5 2 3 1 G 7 6 31310 CASAVA_Build 5 146598563 2D ATATAATACA AC/-- AGAGTTGATA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AC 1 0 31311 CASAVA_Build 5 146603340 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 1254 het 988 hom 5 2 3 0 A 8 7 31312 CASAVA_Build 5 146603495 7I GACTCTGTCC -------/AAAAAAA AAAAAAAAAC 1087 het 1087 ref 24 13 4 7 A 9 16 31313 CASAVA_Build 5 146603563 5I54M1D AATTATACTA -----TTGTTTTGCAGTTTTAGCTTTTATGTTTTAGGGCAAATCTTAAGTCCTAATTACT/TTGTTTTGTTTTGCAGTTTTAGCTTTTATGTTTTAGGGCAAATCTTAAGTCCTAATTAC- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 26 9 18 N/A 0 0 31314 CASAVA_Build 5 146603822 1I AGTCCCTGTT -/A AACAACCATT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 A 2 3 31315 CASAVA_Build 5 146610542 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 1591 hom 12 het 5 0 5 1 A 7 6 31316 CASAVA_Build 5 146611526 1D ATGAAGTATT G/- GGGGGTTCCA 3070 het 3070 hom 49 24 23 2 G 6 5 31317 CASAVA_Build 5 146611798 1I ATCTCTACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 T 10 11 31318 CASAVA_Build 5 146647611 2I AACCGACTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 13 15 31319 CASAVA_Build 5 146648915 2I ATGTTGCTTG --/TT TTTTGTTTTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 4 6 31320 CASAVA_Build 5 146651308 1D AATTACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 12 11 31321 CASAVA_Build 5 146652618 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 28 1 25 5 A 11 10 31322 CASAVA_Build 5 146653296 1D ATTTTGGAAA G/- TTTGTCAAAT 3070 hom 23 het 18 0 10 8 G 1 0 31323 CASAVA_Build 5 146653668 7I GAATGCCAAA -------/TTTTACT TTTATATTAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TTTTACT 0 1 31324 CASAVA_Build 5 146655599 1I GAAACAAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 9 10 31325 CASAVA_Build 5 146661054 1D CACTAATGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 9 het 44 1 38 6 T 10 9 31326 CASAVA_Build 5 146670540 1I GAGAGCAAAA -/T TGTTGTTATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 1 2 31327 CASAVA_Build 5 146672860 1I TCATGGTGGT -/A ACATGCCTGT 2159 het 2159 ref 21 8 5 8 A 1 2 31328 CASAVA_Build 5 146678532 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 A 17 16 31329 CASAVA_Build 5 146679793 1D GTATATTCAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 8 7 31330 CASAVA_Build 5 146680202 8D CTTTCTTTCT TTGATTCA/-------- TTGATTATGT 3070 het 3070 hom 44 18 24 5 TTGATTCA 1 0 31331 CASAVA_Build 5 146689404 2D TGCACGCACG CA/-- CACACACACA 1064 het 1064 ref 45 35 3 9 CA 7 6 31332 CASAVA_Build 5 146707080 1D CAATAGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 11 10 31333 CASAVA_Build 5 146715266 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAATAC 1894 het 1894 ref 10 6 4 0 A 7 8 31334 CASAVA_Build 5 146722856 1D CAAAACAAAA C/- AAAAAACAAA 1859 het 1859 ref 39 19 8 12 C 1 0 31335 CASAVA_Build 5 146723096 1D GCATGGGAGC A/- ATCACTCTCA 1897 het 1897 ref 27 20 5 3 A 2 1 31336 CASAVA_Build 5 146733371 1I TCTGCTGGGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 8 9 31337 CASAVA_Build 5 146741399 1I AGTCTGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2966 hom 34 8 14 12 A 13 14 31338 CASAVA_Build 5 146756717 2I TACGCATTTT --/TA TGTTTTTAAT 3070 het 1981 hom 17 5 8 4 TA 0 1 31339 CASAVA_Build 5 146756912 4D15M6D ATTTGCACAC ATGTATGTATCTATAGACCTATATA/----ATGTATCTATAGACC------ TATATATATA 2307 het 2307 ref 18 13 6 2 N/A 0 0 31340 CASAVA_Build 5 146756986 4I AAAATCAGAG ----/AAAC AAATAAAGTT 1853 het 1853 ref 15 9 5 1 AAAC 0 1 31341 CASAVA_Build 5 146757641 9I AGTAAGGGTA ---------/TAGAAAGAG GAGAAAGAGG 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 TAGAAAGAG 0 1 31342 CASAVA_Build 5 146799135 1D TCCTAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 A 11 10 31343 CASAVA_Build 5 146802601 1I AAATATAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 11 12 31344 CASAVA_Build 5 146803350 1I ATGTATCCCG -/T TTTTTTTTTT 2071 het 2071 ref 25 9 7 9 T 13 14 31345 CASAVA_Build 5 146824803 3D TTTAAAAATT AGC/--- TGAACGTGGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 AGC 1 0 31346 CASAVA_Build 5 146881021 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 27 8 11 A 13 12 31347 CASAVA_Build 5 146881697 1I AATAGTTTCC -/T ATGAGCGAGT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 T 0 1 31348 CASAVA_Build 5 146884121 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2298 hom 31 8 12 11 A 13 14 31349 CASAVA_Build 5 146905261 2D ATACGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3005 het 3005 ref 47 29 8 11 GT 9 8 31350 CASAVA_Build 5 146909235 5D CACTTCCTTT TTCCC/----- TTCCCTTCCC 3070 het 3070 hom 45 10 15 22 TTCCC 4 3 31351 CASAVA_Build 5 146913318 1I TGGCCTCCCA -/C AAGTGCTGGG 1410 het 1145 hom 14 6 4 4 C 0 1 31352 CASAVA_Build 5 146918623 2D TTGTGTTCTG TT/-- TCTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 T 3 1 31353 CASAVA_Build 5 146921923 2D AGGCGTGAAC CA/-- CACTGTACCT 3070 hom 69 het 24 0 20 5 CA 2 1 31354 CASAVA_Build 5 146923377 1D TCTGGCTTCC A/- AAGATGAGCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 8 A 3 2 31355 CASAVA_Build 5 146927366 1D TCAAAAAAAA G/- GGGGGGGGGA 3070 het 72 hom 31 1 14 16 G 10 9 31356 CASAVA_Build 5 146945731 1D TCAAAAAAAA G/- AAACATCAAC 1390 het 1390 ref 37 21 6 10 G 1 0 31357 CASAVA_Build 5 146947703 1D TTTGTGGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 9 17 19 A 17 16 31358 CASAVA_Build 5 146957750 1D TTCTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 12 11 31359 CASAVA_Build 5 146968759 2I CAACCCCAGC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 9 11 31360 CASAVA_Build 5 147040251 1I TATAAAATAG -/C TTGCGTTCAC 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 C 0 1 31361 CASAVA_Build 5 147062091 5I CGGATAAAAG -----/ACTAC ACATTGAGTA 2984 het 2984 ref 28 17 7 4 ACTAC 0 1 31362 CASAVA_Build 5 147124787 4D AGAGAGAGAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 1067 het 1067 ref 20 10 5 6 AGAA 3 2 31363 CASAVA_Build 5 147141281 2D ATTGTAAATT CA/-- GAGTCCTCAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 CA 1 0 31364 CASAVA_Build 5 147149996 1I TCCAAATTCC -/T TTCTTGTTTC 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 T 2 3 31365 CASAVA_Build 5 147155475 1I TAAAGGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 37 1 31 5 T 10 11 31366 CASAVA_Build 5 147178284 1D AGAGGCAACA G/- CAGCAGTAAA 3070 het 3070 hom 45 14 26 6 G 1 0 31367 CASAVA_Build 5 147209087 1D GTGTAGGTGG A/- AATTCCTTGT 3070 hom 135 het 46 0 46 0 A 3 2 31368 CASAVA_Build 5 147216097 2I TAGGAGAAAC --/AT AGTATATATA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AT 0 1 31369 CASAVA_Build 5 147226413 2D CGCAAAGCTT CA/-- CAGACAGCCC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 CA 2 1 31370 CASAVA_Build 5 147227760 1D TTAGACTGTG C/- CCCCCAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 6 5 31371 CASAVA_Build 5 147265118 1I TGAACGATTT -/A AACCAGTTTC 3070 het 3070 hom 46 16 28 2 A 2 3 31372 CASAVA_Build 5 147280122 2I TATCCTACTA --/AC ACACATAATT 3070 het 2160 hom 17 5 9 3 AC 2 3 31373 CASAVA_Build 5 147285359 4D TTAATTACAC ATTA/---- ATTAATTATG 3070 het 3070 hom 29 11 16 4 ATTA 3 2 31374 CASAVA_Build 5 147290738 4I TTTGCTTTCA ----/TGGT TGGTCTAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 TGGT 1 2 31375 CASAVA_Build 5 147317348 3I GGGAATTCTC ---/GTT GTTGTCGAGG 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 GTT 1 2 31376 CASAVA_Build 5 147318216 1D CAGGCTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 302 hom 23 1 15 7 T 13 12 31377 CASAVA_Build 5 147357554 22I GAAGGGGCTA ----------------------/GCTATTCCATATGCATTCAGAG GCTTTCCAGC 3070 het 3070 hom 37 10 21 8 GCTATTCCATATGCATTCAGAG 0 1 31378 CASAVA_Build 5 147362193 1I ACCCTTAAAG -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 7 8 31379 CASAVA_Build 5 147417988 1I TTCTTTACAA -/T TTTTTTTTTT 1720 het 1720 ref 23 11 6 6 T 14 15 31380 CASAVA_Build 5 147425302 6D GCCTCTCTCT CACACA/------ CACACACACA 3070 het 3020 hom 29 12 16 5 CA 13 10 31381 CASAVA_Build 5 147429209 1D GGGATGTGCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2660 hom 19 7 9 3 A 10 9 31382 CASAVA_Build 5 147431432 1I GAATAAAATT -/G TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 G 0 1 31383 CASAVA_Build 5 147432623 1D GTTCTCTGGT A/- AAAAAAAAAA 2940 het 2940 ref 25 16 7 2 A 13 12 31384 CASAVA_Build 5 147436947 1D ATGTTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 12 11 31385 CASAVA_Build 5 147448592 1I TGCTTTGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 11 12 31386 CASAVA_Build 5 147451526 1I ATTCTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 2290 het 2290 ref 28 13 7 8 A 13 14 31387 CASAVA_Build 5 147455707 1I TGTGTGTGTG -/T GGGGGGTGCG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 0 1 31388 CASAVA_Build 5 147456867 4I CTTTTCCTCC ----/CTCT CTCTCTTTCT 2395 het 2395 ref 28 15 8 5 CT 3 5 31389 CASAVA_Build 5 147457545 5I ATTTCTCTTT -----/TTTAA TTTCTTTGTA 3070 het 2166 hom 23 6 14 3 TTTAA 0 1 31390 CASAVA_Build 5 147458241 4I TACGATAGCT ----/CTTA CTTTATTTGG 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 CTTA 0 1 31391 CASAVA_Build 5 147458433 1I TTTTTTTTTT -/C CACATCTTGT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 C 1 2 31392 CASAVA_Build 5 147459252 2D4M6D TAAAAACTAA CTCTGCAAAAAA/--CTGC------ AAAAAAAAAA 2402 het 2402 ref 28 18 7 7 N/A 0 0 31393 CASAVA_Build 5 147460870 1I GTCTGTACTT -/A ATTATTTCTA 3070 het 3026 hom 35 9 22 4 A 1 2 31394 CASAVA_Build 5 147464659 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 11 10 31395 CASAVA_Build 5 147467012 2D AGTATAGACC GT/-- GAGTTATATA 3070 het 3070 hom 28 12 13 5 GT 1 0 31396 CASAVA_Build 5 147473512 3D TAAAAATAAT AGC/--- AGTTCATATG 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 AGC 1 0 31397 CASAVA_Build 5 147473997 1I TAACTGCCAG -/A AAAAAAAATT 2895 het 2895 ref 30 15 8 7 A 8 9 31398 CASAVA_Build 5 147480841 4D GCGAGCTTGC AGTG/---- AGCTGAGATA 857 het 857 ref 10 7 2 4 AGTG 1 0 31399 CASAVA_Build 5 147481082 1D AATGCACCGA C/- GGACTCCAAT 3070 het 3070 hom 21 9 12 3 C 1 0 31400 CASAVA_Build 5 147481418 4D AAAAAAAAAT AAAG/---- AAAATATGGA 1949 het 1949 ref 14 7 6 1 AAAG 1 0 31401 CASAVA_Build 5 147483269 28D23M2I CAGTGGTGCA ATATATGTGTATATATATATATATATATATATATATATAATCTTGCTTGCA--/----------------------------ATATATATATAATCTTGCTTGCAAT ATATATATAT 1945 het 778 hom 7 3 4 3 N/A 0 0 31402 CASAVA_Build 5 147484499 1I TTACCCTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 9 10 31403 CASAVA_Build 5 147487979 1D ACAAAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 22 7 T 11 10 31404 CASAVA_Build 5 147489269 3D TGTTAAAAAA ATG/--- AAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 40 21 18 4 ATG 1 0 31405 CASAVA_Build 5 147491510 1I ACTGCTATAT -/A AACCCAGCCC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 2 3 31406 CASAVA_Build 5 147497108 3I ACTGAATAAA ---/CTC CTCTACCCTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 CTC 1 2 31407 CASAVA_Build 5 147500244 3D CAATAAATGC TTG/--- TTATCATTAT 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 TTG 1 0 31408 CASAVA_Build 5 147505098 2D GTTAAGTGTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 11 9 31409 CASAVA_Build 5 147510195 1I AATGACATTT -/A AAGAAGGAGT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 A 2 3 31410 CASAVA_Build 5 147521076 3I AATTATATAC ---/TTA TTATGAATTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TTA 1 2 31411 CASAVA_Build 5 147521645 1D TACTAACAAT A/- AAAAAAAAAA 2930 het 2197 hom 22 9 8 5 A 13 12 31412 CASAVA_Build 5 147524861 3D GAGAAAAGAT AAG/--- AAGATCTGTT 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 AAG 2 1 31413 CASAVA_Build 5 147528413 1D TACTGTTCCT G/- TTCCATTTCT 3070 het 3070 ref 49 22 21 7 G 1 0 31414 CASAVA_Build 5 147529087 1D TAGCCCCATC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 9 8 31415 CASAVA_Build 5 147532555 2I GGTGGTTATG --/AC ACACGTCAGA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 AC 2 3 31416 CASAVA_Build 5 147534433 1I CCCTGAATTA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 6 7 31417 CASAVA_Build 5 147535191 7D TCTTCTTTTT TTTTTCC/------- TCCATGTCTC 3069 het 3069 ref 29 18 7 5 TTTTTCC 1 0 31418 CASAVA_Build 5 147537864 6D AATTTGACTA TTTTAT/------ TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 24 9 11 6 TTTTAT 2 1 31419 CASAVA_Build 5 147541690 1D TGTTTTATAG T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 T 7 6 31420 CASAVA_Build 5 147544613 1D ATGTAGAAAA C/- CCCAAATACT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 C 4 3 31421 CASAVA_Build 5 147544893 3I CTCATGGATT ---/AGA AGAATATTGT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 AGA 1 2 31422 CASAVA_Build 5 147545017 10D TCTGGAACCA CGAAAGTCAT/---------- CGAATCGTCA 3070 het 3070 ref 32 19 14 3 CGAAAGTCAT 1 0 31423 CASAVA_Build 5 147547011 1I AAAAGGTATT -/A AAAAACCACA 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 A 5 6 31424 CASAVA_Build 5 147547592 3I AATCACCAAT ---/AAG AAGAATGACA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 AAG 1 2 31425 CASAVA_Build 5 147552079 4I TTTTAAGTCA ----/AAAG AAAGAGATTG 3070 het 1828 hom 21 6 12 3 AAAG 1 2 31426 CASAVA_Build 5 147552216 1I ATAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1056 het 1056 ref 11 7 4 0 A 13 14 31427 CASAVA_Build 5 147553012 1D TCAAAGGGAA G/- GGGGAAAAGC 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 G 5 4 31428 CASAVA_Build 5 147553426 1I TTTCTTTCGG -/C ATATGTGTCC 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 C 0 1 31429 CASAVA_Build 5 147558231 24D5M3D CATAGATGAT ATACTTATTAATGACATAGAAGACAATGACAT/------------------------AATCA--- AGAAGACATA 3070 het 3070 ref 35 28 15 7 N/A 0 0 31430 CASAVA_Build 5 147558704 1D TGCCAAAACA T/- TTAATAATAA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 3 2 31431 CASAVA_Build 5 147563896 1D ATGTACAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 A 10 9 31432 CASAVA_Build 5 147565989 8D GTTTAAAAGA ACCTAACC/-------- ACACATTCTC 832 hom 15 het 30 0 6 26 ACCTAACC 1 0 31433 CASAVA_Build 5 147571844 4I AAATATGGAC ----/TTAA TTGACATTGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TTAA 0 1 31434 CASAVA_Build 5 147572963 12D TTTTTGTTTG TTTGTTTTTGTT/------------ TTTGTTTTTG 3070 hom 67 het 25 0 23 3 TTTGTT 4 2 31435 CASAVA_Build 5 147573185 1D TCCATCTCCT G/- ACCTCGTGAT 3070 hom 30 het 11 0 10 1 G 1 0 31436 CASAVA_Build 5 147585601 1I GTTATGAACA -/T TTTGCCTAGG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 3 4 31437 CASAVA_Build 5 147587202 1I TATTCTGAAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 120 het 50 0 41 9 A 7 8 31438 CASAVA_Build 5 147587830 1I CTAGAATAAT -/C AGTCCTCAAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 C 0 1 31439 CASAVA_Build 5 147588091 1I AACACACTGA -/T TTTAGGTTGG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 4 31440 CASAVA_Build 5 147589447 5I AATCAGAAAT -----/TCTTA TCTTAAGTCA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 TCTTA 1 2 31441 CASAVA_Build 5 147590057 4D TTCAACAAAT AGAC/---- AGTCTCTAAG 3070 hom 126 het 45 0 43 4 AGAC 1 0 31442 CASAVA_Build 5 147596955 2I18M4I TGTGTGTATG --TGTATATATATATGTAAA----/TATATATATATATATGTAAACAAT CCATCCATAT 3070 hom 54 het 16 0 19 0 N/A 0 0 31443 CASAVA_Build 5 147600910 7I TTAAGCAGGT -------/TGCTAAC TGCTAAGCTT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 TGCTAAC 0 1 31444 CASAVA_Build 5 147601148 1I AAAAAATACC -/A AAAAAAACCT 3070 hom 91 het 35 0 31 4 A 7 8 31445 CASAVA_Build 5 147604627 4D AATATGAAGG TATT/---- TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TATT 1 0 31446 CASAVA_Build 5 147606866 1D TGTCTAGGAG T/- TTTGTCCATT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 4 3 31447 CASAVA_Build 5 147611858 1D GGGTTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 11 10 31448 CASAVA_Build 5 147615058 1D TTCAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 45 1 38 6 T 11 10 31449 CASAVA_Build 5 147618643 1D GAGACAGCAA G/- GACAAGTGTT 3070 hom 65 het 25 0 22 3 G 2 1 31450 CASAVA_Build 5 147619599 6D TACTTGTCCC TTCCTT/------ TTCCCTTCAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTCCTT 1 0 31451 CASAVA_Build 5 147620923 1I ATTCTTCTTC -/A AAAAATGTTC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 5 6 31452 CASAVA_Build 5 147648900 2D CTATATATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 14 0 12 3 AT 7 6 31453 CASAVA_Build 5 147652981 1I AAGACCAAAA -/T TTTTTTATCA 3070 hom 16 het 39 1 34 4 T 6 7 31454 CASAVA_Build 5 147665512 2D AGCTGGGAGC TG/-- TGTGTGTGTG 1015 het 1015 ref 42 29 3 12 TG 10 9 31455 CASAVA_Build 5 147668001 1I TTACCAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 9 10 31456 CASAVA_Build 5 147671962 8D TCATGAAGTT TAGAATTC/-------- TTAACAGTCC 3070 hom 138 het 49 0 47 5 TAGAATTC 1 0 31457 CASAVA_Build 5 147675477 3I AATGATATTC ---/TCA TCATCATCAT 3070 hom 114 het 50 0 38 12 TCA 3 4 31458 CASAVA_Build 5 147692698 1D TATACAGTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 T 9 8 31459 CASAVA_Build 5 147699627 1D CACCTGACTC T/- TTTTTTGGGG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 7 6 31460 CASAVA_Build 5 147708089 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 48 0 40 10 A 13 12 31461 CASAVA_Build 5 147721582 5D GAGGACTATA TATAT/----- TATATATATG 3070 hom 96 het 36 0 33 5 TATAT 2 1 31462 CASAVA_Build 5 147729889 1D TATATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 31 1 18 12 A 13 12 31463 CASAVA_Build 5 147730587 2I ATGGAAGGCA --/GG GGGGAGAGAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 4 6 31464 CASAVA_Build 5 147736625 4D TTTATTTAAA TATT/---- TAGGAAGGTT 3070 hom 99 het 38 0 33 9 TATT 1 0 31465 CASAVA_Build 5 147747774 7D ATAATATGAC TTGAAAG/------- TTGAAAGTTC 3070 het 3070 hom 17 9 10 4 TTGAAAG 2 1 31466 CASAVA_Build 5 147781366 4D TTTGATTCTA AGTT/---- AGCATACATA 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 AGTT 1 0 31467 CASAVA_Build 5 147781804 1I GACCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 14 15 31468 CASAVA_Build 5 147789089 1I TGGGAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 13 13 T 13 14 31469 CASAVA_Build 5 147796347 2I AAAAAATATT --/AA GAGGTCTATT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 0 2 31470 CASAVA_Build 5 147836451 1I GGGCACTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 9 10 31471 CASAVA_Build 5 147838070 1D AATCAAGAAA G/- AGGACATTCT 3070 het 3070 hom 31 7 16 8 G 1 0 31472 CASAVA_Build 5 147846859 1D TTGTCATATC T/- TTTTTTCACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 6 31473 CASAVA_Build 5 147867334 1D AAGTTTCTTC A/- AAAAAAAAAA 2846 het 1166 hom 13 3 6 4 A 12 11 31474 CASAVA_Build 5 147875511 1I TTGTCTTTGA -/T TTTTCAGCAA 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 T 4 5 31475 CASAVA_Build 5 147875742 2I TATATGTAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 AT 6 7 31476 CASAVA_Build 5 147877392 5D CTAATTTTTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 15 10 31477 CASAVA_Build 5 147881335 1D GACTGTAGAT C/- TTGTTACTGG 3070 het 3070 ref 61 30 23 8 C 1 0 31478 CASAVA_Build 5 147883752 1I TAAGTCCGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 T 11 12 31479 CASAVA_Build 5 147887443 1D TGATCTTGGC T/- CACTGCAACC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 1 0 31480 CASAVA_Build 5 147888300 1D TAAGTAGGTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 29 7 17 5 A 9 8 31481 CASAVA_Build 5 147909528 1D GTAGAAGTGC A/- AAAAACACAG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 6 5 31482 CASAVA_Build 5 147917122 1D AAACGCCATA T/- TTTAGAATTG 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 T 4 3 31483 CASAVA_Build 5 147925351 1I GTATCTTGAT -/G GGGCATAAGG 3070 hom 144 het 52 0 45 7 G 3 4 31484 CASAVA_Build 5 147930590 6D GTGTGTGTGG GTTTTT/------ GTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 30 15 9 7 GTTTTT 3 2 31485 CASAVA_Build 5 147940779 1D ATTTGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 11 10 31486 CASAVA_Build 5 147941190 1D TGACAAGAAG C/- TTTTCCCCTC 3070 het 3070 ref 38 23 14 2 C 1 0 31487 CASAVA_Build 5 147948284 12D GTTTTAATTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 979 het 979 ref 19 6 5 8 T 24 12 31488 CASAVA_Build 5 147950157 1I CGGTTTCAAG -/T GATTCCCTGC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 0 1 31489 CASAVA_Build 5 148061728 1D AAATATGTCC A/- AAAAAACCTA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 7 6 31490 CASAVA_Build 5 148070985 1D GTGCTATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2805 hom 42 11 18 13 A 15 14 31491 CASAVA_Build 5 148085912 1D ATCCCTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 8 12 T 17 16 31492 CASAVA_Build 5 148087476 6D GTTTATTCAC ATGAGT/------ ATATCAATAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 7 ATGAGT 1 0 31493 CASAVA_Build 5 148116319 1D AATAACCAAC T/- CTTTTATTAA 2428 het 2428 ref 21 13 5 3 T 1 0 31494 CASAVA_Build 5 148116476 1I CTTTATTTTT -/A ATGTAGGTGT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 1 2 31495 CASAVA_Build 5 148117490 3I ATGTATAAAA ---/CTT CTTATTGTTA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 CTT 1 2 31496 CASAVA_Build 5 148121623 1D AACATGCCAC A/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 1 0 31497 CASAVA_Build 5 148124112 1I GCAATAAGCG -/T TTCTTTTAAT 3070 het 3070 hom 39 17 22 0 T 2 3 31498 CASAVA_Build 5 148124466 1I TAAAGTTATT -/G GGTGTGCCAC 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 G 2 3 31499 CASAVA_Build 5 148131140 1I CCACTCATTG -/A ATCCTAGCTC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 1 2 31500 CASAVA_Build 5 148134112 1D AACTATGAAA G/- AAGAAAAACT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 G 1 0 31501 CASAVA_Build 5 148144376 1D AAACCCCGGC A/- AAATTCTATT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 4 3 31502 CASAVA_Build 5 148151563 4D ATCAGAGATG GTAA/---- GTGACTGGAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 8 GTAA 1 0 31503 CASAVA_Build 5 148153327 1D TCCTTGTAGA C/- CCCCCCATCT 3070 het 3070 hom 53 15 29 10 C 7 6 31504 CASAVA_Build 5 148220128 1D GCACCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 19 8 A 13 12 31505 CASAVA_Build 5 148243297 1D CTACCATTTC T/- TTTTTTTTTT 1366 het 1366 ref 44 18 5 21 T 17 16 31506 CASAVA_Build 5 148244486 9I CCAAGGCTTG ---------/CTCTGTTGC CCCATTAGAC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 CTCTGTTGC 0 1 31507 CASAVA_Build 5 148270191 2D CATCTGGCAG CA/-- CACACCAAGG 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 CA 3 2 31508 CASAVA_Build 5 148291569 1D TCCTTCCCCC T/- CTCTCCTCTT 3070 hom 40 het 21 0 13 8 T 1 0 31509 CASAVA_Build 5 148292058 5D TAAATGTTGT ATTGC/----- CCATCTTTGC 3070 het 3070 ref 34 20 14 2 ATTGC 1 0 31510 CASAVA_Build 5 148295912 1I AAAGCTTGTT -/G GGGCCCATGC 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 G 3 4 31511 CASAVA_Build 5 148299350 1D AGCTGGAGTG T/- TTTGTCACCA 3070 het 3070 ref 37 23 9 6 T 4 3 31512 CASAVA_Build 5 148300190 1D ATATTCCCAC A/- AACTTGGTAG 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 A 3 2 31513 CASAVA_Build 5 148323105 1I AGTATCATTA -/T TGAAAACTAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 1 2 31514 CASAVA_Build 5 148331922 2I GGCAGAAAAA --/AC ACACCCAGTC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 AC 2 3 31515 CASAVA_Build 5 148338699 3I AGGGGAAGAT ---/GGA GGGCTATGGG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GGA 0 1 31516 CASAVA_Build 5 148341914 1I GATTCCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 11 31517 CASAVA_Build 5 148344903 1I ACTTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 34 1 21 12 A 12 13 31518 CASAVA_Build 5 148345996 2I AAAAAATGTA --/TC TCTGAAATCA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 TC 1 2 31519 CASAVA_Build 5 148439103 1I CCTACAAGAC -/A AAAAAAAAAA 1360 hom 15 het 7 0 6 1 A 15 16 31520 CASAVA_Build 5 148445646 2I2M8I CTGGGCTCTG --AG--------/GCAGATGAAATC TATTTGAGTA 3070 hom 111 het 39 0 38 3 N/A 0 0 31521 CASAVA_Build 5 148446280 1I AAACACCGTT -/A TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 0 1 31522 CASAVA_Build 5 148459752 1D CAAGCAGAAG A/- AAAAATTTCA 3070 hom 93 het 43 0 32 11 A 6 5 31523 CASAVA_Build 5 148464376 1I ACTTACACAT -/A AAGATAACAC 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 2 3 31524 CASAVA_Build 5 148464930 1I ATACTTTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 8 9 31525 CASAVA_Build 5 148468158 1D ACTCCATCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 32 2 22 8 A 13 12 31526 CASAVA_Build 5 148468436 1I GCTCCAGACT -/C TCTGGGAGCG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 0 1 31527 CASAVA_Build 5 148470512 1D AGGGGGCTGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 8 31528 CASAVA_Build 5 148471585 2I AAGAAAGAAA --/AG AGAGAGAAAG 2225 hom 15 het 6 0 6 0 AG 3 4 31529 CASAVA_Build 5 148475862 1D GCAATGTTCT C/- ACCTTGGCTG 3070 hom 72 het 29 0 25 6 C 1 0 31530 CASAVA_Build 5 148477648 1D TTTAAGCTCA G/- GGTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 G 3 2 31531 CASAVA_Build 5 148478192 4D4M2I AGTTAAATGA AGGTACTA--/----CCTAGT ACCTTTTAGG 3070 hom 81 het 27 0 28 0 N/A 0 0 31532 CASAVA_Build 5 148482689 1D GAGATAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 12 11 31533 CASAVA_Build 5 148498515 1D TAATTAATCA C/- CTGAAAATTT 3070 het 3070 hom 35 12 18 6 C 2 1 31534 CASAVA_Build 5 148505549 2I CGTGTATGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 11 13 31535 CASAVA_Build 5 148520181 5D ACATCTGCAC TCTAG/----- TCTGGGCGAC 3070 het 3070 ref 43 24 10 9 TCTAG 1 0 31536 CASAVA_Build 5 148531665 5D9M8D ACTCCATGAG TTTCTATTGTCCACTATTCTAT/-----AAGGAAAAC-------- TCTATTTCTG 3070 het 3070 hom 38 15 22 6 N/A 0 0 31537 CASAVA_Build 5 148539053 8D ATTAATAAGC TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 35 11 10 17 TGTT 7 5 31538 CASAVA_Build 5 148543728 1I TGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2195 het 2195 ref 28 7 11 10 T 13 14 31539 CASAVA_Build 5 148560957 1D TAAATCACTG T/- TCCCAGATGC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 2 1 31540 CASAVA_Build 5 148563076 2D CATCACTACT AC/-- CACCATAACC 3070 het 3070 hom 94 42 37 18 AC 1 0 31541 CASAVA_Build 5 148563459 3D CATCACCACC ATT/--- ATTATTACCA 3070 het 3070 hom 54 26 19 11 ATT 3 2 31542 CASAVA_Build 5 148566645 1I TCCAGTGTCA -/G GGTGGGAGCA 3070 hom 96 het 39 0 29 10 G 2 3 31543 CASAVA_Build 5 148569742 4I AAGAAATGTT ----/TCTC TCTCCTCAGA 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 TC 2 4 31544 CASAVA_Build 5 148573739 2I CTGCTGTATC --/CA TACCGATACC 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 CA 0 1 31545 CASAVA_Build 5 148575279 1D CCCCCCACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 11 10 31546 CASAVA_Build 5 148584986 7D CAATGTTGTA CAACCCC/------- CACCTCTATC 888 het 888 ref 47 26 5 19 CAACCCC 1 0 31547 CASAVA_Build 5 148598660 1D GTAGAGAGAC A/- AGGAAAGGGT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 2 1 31548 CASAVA_Build 5 148599383 1D TCAGGGAGGA G/- GGGGGTCTCT 3070 het 3070 hom 45 16 23 7 G 6 5 31549 CASAVA_Build 5 148606166 1D TTTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3047 hom 27 12 12 4 A 10 9 31550 CASAVA_Build 5 148623524 1I GTAGAGATGA -/G GGGGGGGTCT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 G 7 8 31551 CASAVA_Build 5 148627060 6I ATCCATGAAA ------/CTCTTT CTCTTTCTCT 3070 het 3070 ref 38 16 11 11 CTCTTT 2 3 31552 CASAVA_Build 5 148632557 1D CTCCCGGGTT C/- AAGCGATTCT 1076 het 1076 ref 13 7 3 3 C 1 0 31553 CASAVA_Build 5 148636426 1D GTAATTACAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 45 21 23 3 T 9 8 31554 CASAVA_Build 5 148642818 1I CCATAGGCTT -/C CATCAGAAGA 3070 het 3070 hom 54 22 27 5 C 1 2 31555 CASAVA_Build 5 148649142 1D CCTCTGCCGT C/- CCTCACACAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 C 3 2 31556 CASAVA_Build 5 148650291 3I AATATCTGTT ---/ATC ATTATTTCTG 3070 hom 157 het 61 0 53 8 ATC 0 1 31557 CASAVA_Build 5 148654572 1D CTGCCCACCT C/- CCCCCAGCCC 3070 hom 77 het 31 0 23 8 C 6 5 31558 CASAVA_Build 5 148655284 4I AAAGAAAGAA ----/AGAG AGACAGAAGG 3070 hom 57 het 23 0 18 5 AG 1 3 31559 CASAVA_Build 5 148657950 1D GGCCCAGGGT G/- GGGAACAGCA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 G 4 3 31560 CASAVA_Build 5 148661984 1D CCTGATGATT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 87 het 35 0 29 7 A 8 7 31561 CASAVA_Build 5 148664720 1I GCTTCCTGGA -/G GGGGGATGTG 3070 hom 97 het 39 0 28 11 G 5 6 31562 CASAVA_Build 5 148786669 2I TTTTTTTTTT --/TA TTATTAGAGA 1881 het 1072 hom 19 8 6 5 TA 0 1 31563 CASAVA_Build 5 148788971 1I CAGTGTGTCC -/A ATCTTAGCAT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 A 1 2 31564 CASAVA_Build 5 148797624 6D CTTCTCTCTG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 28 2 21 6 T 27 21 31565 CASAVA_Build 5 148799689 2D AATTAAGACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 33 0 22 11 T 12 10 31566 CASAVA_Build 5 148801200 3D TCTGAACCTT CTC/--- CTGTTGGCCT 3070 hom 60 het 23 0 18 6 CTC 1 0 31567 CASAVA_Build 5 148802541 6D GCAGTCGTGG AAGGCC/------ AAGGCCAAGG 3070 hom 66 het 27 0 19 9 AAGGCC 3 2 31568 CASAVA_Build 5 148803349 2D CATATGCTCG CA/-- CACACACACA 3070 hom 107 het 65 1 46 19 CA 8 7 31569 CASAVA_Build 5 148805990 1I TTATTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1692 het 153 hom 21 1 8 12 T 11 12 31570 CASAVA_Build 5 148817506 1D CAATGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 26 0 21 5 T 11 10 31571 CASAVA_Build 5 148818161 1I GTTTATACAT -/G GGGGGGACTG 3070 hom 58 het 24 0 18 6 G 6 7 31572 CASAVA_Build 5 148819065 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 14 2 A 12 13 31573 CASAVA_Build 5 148828569 12D AAAACCCTAA ACTAAACCCTCT/------------ ACTAAACCCT 3070 hom 63 het 28 0 22 7 ACTAAACCCTCT 2 1 31574 CASAVA_Build 5 148830944 1D AAGGGCTCAC G/- GAGAAGGTGG 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 G 2 1 31575 CASAVA_Build 5 148843452 6D GAAGAAGAAG AAGAAA/------ AAATTACCCA 2276 het 2180 hom 30 12 11 10 AAGAAA 1 0 31576 CASAVA_Build 5 148844897 2I TATTTTTAGT --/AG AGACAGGTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AG 1 2 31577 CASAVA_Build 5 148845173 11D TTTGCCTTAA AAAAAAAAAAC/----------- AAAAAAAACC 3070 hom 45 het 16 0 15 4 AAAAAAAAAAC 1 0 31578 CASAVA_Build 5 148876103 1D AAAACCCCCC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 5 A 8 7 31579 CASAVA_Build 5 148886535 1I ACCTGAGAAA -/G GGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 G 8 9 31580 CASAVA_Build 5 148891282 4D CTCAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2001 het 2001 ref 13 6 6 2 AAAG 3 2 31581 CASAVA_Build 5 148903244 1D GTTTTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 1507 het 1507 ref 53 40 4 9 T 12 11 31582 CASAVA_Build 5 148904264 2D ATAAAAAAAA TT/-- TAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 21 7 9 6 T 3 1 31583 CASAVA_Build 5 148925586 22D GAAACTCTAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1948 hom 27 7 15 7 T 35 13 31584 CASAVA_Build 5 148928678 1D ACTGTTCTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 9 8 31585 CASAVA_Build 5 148942425 5I GTTCTAGCAT -----/AAAGA AAAGACAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 AAAGA 1 2 31586 CASAVA_Build 5 148944121 4D CCTCCAGGAA AGAG/---- AGAGAGAATG 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 AG 5 3 31587 CASAVA_Build 5 148945441 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 het 1373 hom 14 4 9 1 T 6 5 31588 CASAVA_Build 5 148945991 5D TCAAGCAGAG AAGTA/----- AAGTGACAAA 3070 het 3070 ref 37 24 11 5 AAGTA 1 0 31589 CASAVA_Build 5 148950983 1D GTTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2477 hom 30 10 10 10 A 15 14 31590 CASAVA_Build 5 148964983 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 16 1 15 0 A 15 14 31591 CASAVA_Build 5 148971934 1I TGACTTTCTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 1320 hom 25 4 16 5 T 8 9 31592 CASAVA_Build 5 148973106 1I ATAGATAGAA -/T TTTTTTTTTT 2828 het 441 hom 18 2 10 6 T 15 16 31593 CASAVA_Build 5 148980075 1I CCATGACAGG -/C CATGATTGGA 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 C 1 2 31594 CASAVA_Build 5 148984406 5I GGTGTGCACC -----/TGTAA TCCCAGCTAC 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TGTAA 0 1 31595 CASAVA_Build 5 148986712 6D GTGGGCCCTT CAGTGG/------ CAGAGTTAGG 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 CAGTGG 1 0 31596 CASAVA_Build 5 148996752 7I GGCAGCAGGG -------/CTCTTCC GATCAGCTAA 3070 hom 101 het 41 0 36 5 CTCTTCC 0 1 31597 CASAVA_Build 5 149036338 1I CCTTCTCCAA -/G AAGGAGTGTG 3070 hom 129 het 45 0 43 2 G 0 1 31598 CASAVA_Build 5 149049656 1D GACTTCATTT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 8 7 31599 CASAVA_Build 5 149058310 9D TGTACACTTC GAAATGGTT/--------- GAAATGGTTA 3070 het 3070 ref 38 18 16 6 GAAATGGTT 2 1 31600 CASAVA_Build 5 149058927 2I ACACACACAC --/AT GCTCCTGCAC 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 AT 0 1 31601 CASAVA_Build 5 149059087 1D CTGCCTCTAC A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 18 7 A 6 5 31602 CASAVA_Build 5 149060079 1I GTCTTTTTTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 8 9 31603 CASAVA_Build 5 149061607 1D AACTAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 10 11 14 T 11 10 31604 CASAVA_Build 5 149067635 8I AATTGCAAGC --------/CTAAGCCA CAAAGATGTT 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 CTAAGCCA 0 1 31605 CASAVA_Build 5 149073119 1I GTTTTAATTT -/C TCCACATTTC 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 C 0 1 31606 CASAVA_Build 5 149078038 1I TTTATTTTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 21 9 7 5 T 8 9 31607 CASAVA_Build 5 149080402 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2541 het 962 hom 17 3 8 6 A 16 17 31608 CASAVA_Build 5 149105512 1D TCTAGAGAGT G/- ACTTGGTAGG 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 G 1 0 31609 CASAVA_Build 5 149108802 1D GGGATTTGTG T/- TAAGGATTGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 2 1 31610 CASAVA_Build 5 149110760 5I CTTAAATGTT -----/TTATA TTACTATAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTATA 0 1 31611 CASAVA_Build 5 149117043 1I TAAAGTACAC -/A AAACGATTTG 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 3 4 31612 CASAVA_Build 5 149117105 1D TGTTTGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2636 hom 28 9 10 9 T 12 11 31613 CASAVA_Build 5 149123917 4D CATTCTTTAT ATAG/---- ATAGAGAAAC 3070 het 3070 ref 28 18 9 2 ATAG 2 1 31614 CASAVA_Build 5 149135474 1I GATGCCCACA -/C CTCTTCCCTG 3070 het 3070 ref 54 23 24 7 C 1 2 31615 CASAVA_Build 5 149135745 1D AGCCAGTATT G/- CCCCCTAGTG 3070 het 3070 ref 33 19 13 2 G 1 0 31616 CASAVA_Build 5 149155546 1D GGTGGGGGCA G/- GGGGGGATGA 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 G 7 6 31617 CASAVA_Build 5 149158813 1I TGGTCCAAAC -/T TCAGCCACAG 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 1 2 31618 CASAVA_Build 5 149220410 1I TTTTTGGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 751 hom 22 2 17 3 T 11 12 31619 CASAVA_Build 5 149224000 1D GAGAAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 496 hom 39 4 22 13 T 13 12 31620 CASAVA_Build 5 149269966 3D TCTATGATAT TAA/--- TAACATGGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAA 2 1 31621 CASAVA_Build 5 149273138 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 27 2 12 13 A 17 16 31622 CASAVA_Build 5 149307369 1D AGGTATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1330 het 1330 ref 34 17 6 13 T 16 15 31623 CASAVA_Build 5 149312185 1I TTTTTAAGCC -/A AAAAAAAATT 3070 het 428 hom 22 1 19 2 A 8 9 31624 CASAVA_Build 5 149315075 1D TGAGCCACTG C/- ACCTTCTCTC 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 C 1 0 31625 CASAVA_Build 5 149315933 2D ACCCTCTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 1421 het 74 hom 20 2 8 10 A 19 17 31626 CASAVA_Build 5 149316147 1D GTAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 21 0 12 9 T 13 12 31627 CASAVA_Build 5 149318989 1I TTTCCTCACC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 A 8 9 31628 CASAVA_Build 5 149339486 1I TTAAAGATAA -/G TCTACAATAA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 G 0 1 31629 CASAVA_Build 5 149346030 1D ATTCGTGGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 9 8 31630 CASAVA_Build 5 149349409 1D CTCTTCAGTA C/- TATACCACAG 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 C 1 0 31631 CASAVA_Build 5 149355073 1D CCACCTCTTC T/- TGATCCTCAC 3070 het 3070 ref 55 27 15 15 T 2 1 31632 CASAVA_Build 5 149363391 1I AACTCTTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 21 9 7 5 T 9 10 31633 CASAVA_Build 5 149399127 1D AGTATTTTAC T/- TTTTTTTTTC 1410 het 1410 ref 53 45 4 4 T 10 9 31634 CASAVA_Build 5 149409167 1I GGAACGGAAA -/C CCCCCCCCCT 3070 het 3070 ref 39 14 13 12 C 9 10 31635 CASAVA_Build 5 149413594 1I GTAGGGGAGG -/C GGGGGGTGAG 3070 het 3070 ref 38 13 13 12 C 0 1 31636 CASAVA_Build 5 149450876 1I TCATCATAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 8 9 31637 CASAVA_Build 5 149455520 2D ATTTACCGAG AA/-- AAAAAAAAAA 2140 het 2140 ref 34 19 6 9 A 16 14 31638 CASAVA_Build 5 149469819 3I AGTCCTAATC ---/AGT AGTTCACATC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 AGT 1 2 31639 CASAVA_Build 5 149471995 4D AGAAAAACAA AAAC/---- AAACAAAACA 640 hom 33 het 40 0 10 31 AAAC 2 1 31640 CASAVA_Build 5 149479065 1D TAGAACAAGA G/- GTTCCTGATG 3070 het 3070 ref 44 24 16 6 G 2 1 31641 CASAVA_Build 5 149545725 2D ACTCCACACA CT/-- CTGCAGTGCT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 CT 2 1 31642 CASAVA_Build 5 149547266 4I TTTTGCCATG ----/AATC AATCAAACCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AATC 1 2 31643 CASAVA_Build 5 149551193 1I CTTTTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 1924 het 1055 hom 19 5 9 5 T 12 13 31644 CASAVA_Build 5 149557367 3I CTAGCTGAGA ---/ATG ATGATGATGA 3070 het 3070 ref 48 19 16 13 ATG 5 6 31645 CASAVA_Build 5 149564991 1I47M1I7M1I CCTCAGAAAT -GGCTTGTGCAGGCCTTGGTGTTGGGTCAGCTTCAAGATGGGCTGGCT-AAACCCT-/GGGCTGCTGCAGGCCTTGGTGTTGGGTCAGCTTCGAGCTGGGCTGGCTGAAGCCCTG CAAAGGCTCC 3070 hom 56 het 13 0 18 5 N/A 0 0 31646 CASAVA_Build 5 149565163 1I CGGGCCTTAA -/G GCAGTTTAGA 3070 hom 80 het 32 0 23 9 G 1 2 31647 CASAVA_Build 5 149567833 3D AGGTTAAGAA ACT/--- GGTCTGAGCA 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 ACT 1 0 31648 CASAVA_Build 5 149575157 1I CTCAGATGTG -/A AAAGGGGAGA 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 A 3 4 31649 CASAVA_Build 5 149577498 1I TAGCCCAGGG -/T ACGGGGGAGG 3070 het 2386 hom 29 8 13 8 T 0 1 31650 CASAVA_Build 5 149582126 1I TGGTGGGCAC -/A CAGCCCGGGC 3070 hom 73 het 33 0 22 11 A 0 1 31651 CASAVA_Build 5 149584624 3I TGGAATCTAA ---/AAG AAGTCAGTTT 3070 hom 144 het 50 0 45 5 AAG 1 2 31652 CASAVA_Build 5 149585512 3D ATTATTATTA TTT/--- TTTTTAGATG 3070 hom 58 het 23 0 19 4 T 8 5 31653 CASAVA_Build 5 149608085 2D TTTTTTATTT TA/-- TATATATATA 1790 hom 12 het 8 0 5 3 TA 8 7 31654 CASAVA_Build 5 149609310 2D CTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 43 0 32 11 T 13 11 31655 CASAVA_Build 5 149611208 1I AAACATTCAG -/A AGAGTGCTAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 2 31656 CASAVA_Build 5 149624476 3I CAGCTTTTCC ---/GAA GGAGGCTGCC 3070 hom 80 het 31 0 22 9 GAA 0 1 31657 CASAVA_Build 5 149679653 1D AAATAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2901 hom 33 10 20 4 A 12 11 31658 CASAVA_Build 5 149688579 2I GGCAGGGTGG --/TA TATAGTGGGA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 TA 2 3 31659 CASAVA_Build 5 149695868 1I AGATGGTCCC -/A ATTCAGAGGC 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 A 1 2 31660 CASAVA_Build 5 149732481 1D CCCCAGGCCT G/- GGGCAGGACA 3070 het 2012 hom 28 9 16 3 G 4 3 31661 CASAVA_Build 5 149739259 5D CCTCCAGGCT CTCTC/----- CTCTCATCCT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 CTCTC 2 1 31662 CASAVA_Build 5 149744432 2I GATTCTGGAG --/TC TCTATTTAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TC 1 2 31663 CASAVA_Build 5 149755642 1I ATCACACTGA -/G AAGTGGGTGG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 G 0 1 31664 CASAVA_Build 5 149797730 1I AACTTACCAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 7 8 31665 CASAVA_Build 5 149835398 9I ACTGAAGATC ---------/CCAGTTTAG CCACAGCTTG 3070 hom 101 het 42 0 31 11 CCAGTTTAG 0 1 31666 CASAVA_Build 5 149849784 1I CAAAGAGCCT -/G GAGAGCTGCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 1 2 31667 CASAVA_Build 5 149880087 2I5M8D TGAGTCTTCA --GAATGAAAAGACT/TTCCTTG-------- GATGGAGACT 3070 het 3070 ref 53 29 20 10 N/A 0 0 31668 CASAVA_Build 5 149933266 1D GGGAGACCCT G/- GGTGGGGGGA 2232 het 2232 ref 22 10 8 4 G 3 2 31669 CASAVA_Build 5 149943499 1I ACCTGTGGCT -/G GGGGGGGCAC 3070 het 3070 ref 44 17 11 16 G 7 8 31670 CASAVA_Build 5 150020707 4I CATTCATCCA ----/TCTG TCTATCTATC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TCTG 0 1 31671 CASAVA_Build 5 150095670 1D TAAGGGAATT A/- AAAAAAAAAA 2037 het 2037 ref 30 12 7 11 A 17 16 31672 CASAVA_Build 5 150277446 1I CCAACAGGAC -/T TTTTTTTTTT 2092 het 2092 ref 38 16 10 12 T 17 18 31673 CASAVA_Build 5 150373330 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 6 7 31674 CASAVA_Build 5 150374816 1I CTAACAAAAA -/C CCTGGCATTG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 2 3 31675 CASAVA_Build 5 150408160 1I ACTATCTTCA -/T TTTTACAGAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 4 5 31676 CASAVA_Build 5 150424358 1I GCCCCAGTTG -/C CCTGGTCATG 3070 hom 93 het 37 0 30 7 C 2 3 31677 CASAVA_Build 5 150475281 1D CCTCATTGGC A/- AACCAGGCAC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 3 2 31678 CASAVA_Build 5 150478016 1I AAATGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 2422 het 2422 ref 31 15 12 4 T 15 16 31679 CASAVA_Build 5 150480738 2I GGAAAGGATT --/CA CAGTTGGGTT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 CA 1 2 31680 CASAVA_Build 5 150481213 1D CTTCTGGGCC A/- GGACATAATG 3070 het 3070 ref 53 29 22 3 A 1 0 31681 CASAVA_Build 5 150483415 1D AGGCTCAGGA G/- GGTGATGGAC 3070 hom 86 het 37 0 29 10 G 3 2 31682 CASAVA_Build 5 150483629 4D ACCACAGAAT GAGG/---- GAGGGCTCTT 3070 het 3070 hom 47 22 20 6 GAGG 2 1 31683 CASAVA_Build 5 150490488 7I TCGGGCCTCA -------/GGCCTCT GGCCTCTGGC 3070 hom 100 het 45 0 31 14 GGCCTCT 1 2 31684 CASAVA_Build 5 150499086 1D ACCCCATGGG C/- CCTCCGGTTG 3070 hom 105 het 43 0 33 10 C 3 2 31685 CASAVA_Build 5 150508767 1D GATCTCTATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 8 31686 CASAVA_Build 5 150514724 1D GTTTCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 14 13 31687 CASAVA_Build 5 150580547 1D CCAGTCCCCA C/- CCCCCCTCCG 3070 hom 106 het 40 0 28 12 C 7 6 31688 CASAVA_Build 5 150585861 1D TTTAAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 31 3 20 9 T 13 12 31689 CASAVA_Build 5 150587569 1I AAAAGAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 8 9 31690 CASAVA_Build 5 150596943 1D TTCTTACCAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 9 8 31691 CASAVA_Build 5 150599007 3D AGGCGTGAAA CAC/--- CACCACATCC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 CAC 3 2 31692 CASAVA_Build 5 150599361 1D GCAAATGTTT G/- CTGAAATAGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 1 0 31693 CASAVA_Build 5 150604934 1D CAAGGGCCCC T/- GATACAGAAT 3070 hom 77 het 29 0 26 4 T 1 0 31694 CASAVA_Build 5 150620747 1D ACTTATTCAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 9 8 31695 CASAVA_Build 5 150627570 1D TCTTTCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 12 11 31696 CASAVA_Build 5 150628436 1I42M1I ACTCTGTCTC -AAAAAAAAAGTTTCAATGTTTACTCCTAGAGAAGCCAAAAAT-/AAAAAAAAAAGTTTCAATGTTTACTCCTAGAGAAGCCAAAAATC CCAGATTTGT 3070 hom 111 het 31 0 36 8 N/A 0 0 31697 CASAVA_Build 5 150629919 4D AGCAGACTTT AATA/---- AATGGTGCTG 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 AATA 1 0 31698 CASAVA_Build 5 150632566 4I GAACCTTGTA ----/TTAC TTAGGGTTCT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TTAC 0 1 31699 CASAVA_Build 5 150634642 1I GTGCTGACTG -/C CCATCAGAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 2 3 31700 CASAVA_Build 5 150634816 1D CTTACATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 239 hom 41 1 27 13 T 12 11 31701 CASAVA_Build 5 150635379 6I TTTCATTGGT ------/GTTATA GTTTAAATAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GTTATA 0 1 31702 CASAVA_Build 5 150645451 10D AAAACAAGGA GATGATCCTG/---------- GATTATTCGG 3070 hom 112 het 41 0 38 5 GATGATCCTG 1 0 31703 CASAVA_Build 5 150654821 1D GTCATCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 12 11 31704 CASAVA_Build 5 150673009 11I TCTTATGAAG -----------/GTGCTTTTTTT GTGTACATAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 GTGCTTTTTTT 0 1 31705 CASAVA_Build 5 150675225 3I TCTACGAAAA ---/AAT ACAAAAATTA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 AAT 0 1 31706 CASAVA_Build 5 150679884 1D GAGATTAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 31707 CASAVA_Build 5 150680151 2I TTTGTTATGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 10 12 31708 CASAVA_Build 5 150698436 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1977 het 1977 ref 49 35 5 10 A 11 10 31709 CASAVA_Build 5 150867378 3I GCGGAGACAG ---/AGA AGTAGTCAGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AGA 0 1 31710 CASAVA_Build 5 150873376 1I AGGTTAAGGA -/C CAAAAAACTA 3070 hom 122 het 48 0 40 8 C 1 2 31711 CASAVA_Build 5 150881982 1I TTGCATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 33 0 25 8 A 10 11 31712 CASAVA_Build 5 150884197 3I GGGCCATGTG ---/AGC ATACAATGAG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 AGC 0 1 31713 CASAVA_Build 5 150890006 1D TTAACACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 663 hom 27 2 11 14 A 14 13 31714 CASAVA_Build 5 150897084 5D AGAAAAAAAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 AAAGA 4 3 31715 CASAVA_Build 5 150897194 5D GAGGAAAGGA GAGGG/----- GAGGGGAGGG 3070 hom 55 het 25 0 17 11 GAGGG 4 3 31716 CASAVA_Build 5 150929421 1I TCCTGAACTC -/T TTACTCTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 2 3 31717 CASAVA_Build 5 150934590 4I ATAACAAAAC ----/AAAT AACTGGATGT 3070 hom 87 het 36 0 26 10 AAAT 0 1 31718 CASAVA_Build 5 151124250 2I TTGAATATAA --/AC ACACACATAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AC 3 4 31719 CASAVA_Build 5 151128534 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 38 6 18 14 A 18 16 31720 CASAVA_Build 5 151129797 1D TGAACTCAGG A/- AGGCGGAGGT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 2 1 31721 CASAVA_Build 5 151132925 1I TTTTCTCTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 59 het 29 0 18 11 T 9 10 31722 CASAVA_Build 5 151133087 1D TACAGTATAC T/- ATTTGGACCT 3070 hom 117 het 41 0 40 2 T 1 0 31723 CASAVA_Build 5 151134685 1I AGCTATTTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 7 8 31724 CASAVA_Build 5 151147581 1I2M34D GTATTCAATA -TGAATATTTTCAATTCATAAAATAAAATTTATGAAT/CTG---------------------------------- GTTTTGACAT 3070 hom 93 het 33 0 31 7 N/A 0 0 31725 CASAVA_Build 5 151147670 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 34 het 25 0 18 7 TG 8 9 31726 CASAVA_Build 5 151149123 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 8 A 11 10 31727 CASAVA_Build 5 151157727 1I CGTTGAAACC -/T TTTGCATTTG 3070 hom 98 het 40 0 34 6 T 3 4 31728 CASAVA_Build 5 151164092 1I TTAAAGAAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 9 10 31729 CASAVA_Build 5 151174578 1D AGGGGCTGTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 43 0 36 8 T 9 8 31730 CASAVA_Build 5 151181132 2D4M9D TACTTGTCTA ACTTTCCTAAATGTT/--TTTC--------- AAAGCACCTA 3070 hom 66 het 23 0 23 1 N/A 0 0 31731 CASAVA_Build 5 151199105 1I TTCAAGACAA -/T TATAAAAAAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 1 2 31732 CASAVA_Build 5 151201165 5I CCTAAATCAA -----/TAATC TAACTTTGCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TAATC 0 1 31733 CASAVA_Build 5 151218528 1D CACCCAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 22 hom 29 1 22 6 A 10 9 31734 CASAVA_Build 5 151220481 1D TAGCTTCTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 107 het 41 0 36 5 T 9 8 31735 CASAVA_Build 5 151240347 2D TCAACACACA CT/-- CTCTCTCTCT 1648 het 1648 ref 66 48 5 15 CT 9 8 31736 CASAVA_Build 5 151249990 4I TTGTGGGGTC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 ATTT 2 3 31737 CASAVA_Build 5 151250671 1I CAAGGTAAAT -/G GGGGAGAGTG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 G 4 5 31738 CASAVA_Build 5 151266945 1I GAAGACTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 362 hom 32 1 26 5 A 9 10 31739 CASAVA_Build 5 151285605 1I AGATCCCTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 9 31740 CASAVA_Build 5 151537496 2D TAAACTAAAC TG/-- TGAGAATCTT 3070 hom 120 het 48 0 38 13 TG 2 1 31741 CASAVA_Build 5 151543470 1D TTTAGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 129 het 56 0 43 13 T 12 11 31742 CASAVA_Build 5 151548723 1D ATTGCTTTTT G/- GGGGACATGA 3070 hom 110 het 41 0 37 4 G 5 4 31743 CASAVA_Build 5 151555497 4D ATGTGAAAGT ACTC/---- ACACAAGAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 8 ACTC 1 0 31744 CASAVA_Build 5 151581613 2D CTTTCTTCTG AA/-- AGCATACCTA 3070 hom 135 het 52 0 45 8 A 3 1 31745 CASAVA_Build 5 151630831 1I55M1I ATATAGTAAC -ATAGGTTATTATAATCTTATGGGACCATTGTTATATATGCTGGCCATTGTGGACC-/AATAGGTTATTATAATCTTATGGGACCATTGTTATATATGCTGGCCATTGTGGACCA AAATATTTAT 3070 hom 108 het 26 0 37 5 N/A 0 0 31746 CASAVA_Build 5 151633179 4I AAGAAGAGAC ----/AGAG AGAGAGACAG 3070 hom 141 het 55 0 47 8 AG 3 5 31747 CASAVA_Build 5 151640733 4D ACCTCCTGTT TATC/---- AAGCACTATG 3070 hom 126 het 45 0 43 6 TATC 1 0 31748 CASAVA_Build 5 151653964 1I AAAATCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 39 1 27 11 T 13 14 31749 CASAVA_Build 5 151659707 1I CCCTACTAAT -/A ACCTCTGCAT 3070 hom 141 het 53 0 47 6 A 1 2 31750 CASAVA_Build 5 151662865 19D GTAAATTGAG GATAATAATACCCACACCA/------------------- GAGGATTGCT 3070 hom 111 het 36 0 38 0 GATAATAATACCCACACCA 1 0 31751 CASAVA_Build 5 151666415 1D GAGCTAATCA G/- GGTATCTCCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 3 2 31752 CASAVA_Build 5 151699773 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 1809 hom 15 het 8 0 6 2 T 9 10 31753 CASAVA_Build 5 151725503 1I TTTTCTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 11 12 31754 CASAVA_Build 5 151727682 1I TTTTAATTTT -/A TTTCCTTAAC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 0 1 31755 CASAVA_Build 5 151728494 2I GACTCTATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 29 1 21 7 A 14 16 31756 CASAVA_Build 5 151730176 2D CTCAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 33 1 20 13 A 14 12 31757 CASAVA_Build 5 151733601 1D TGACACCCTC A/- ACCCACTCAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 1 31758 CASAVA_Build 5 151736629 1I AATTGACTTA -/T TTATTCTCCT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 T 2 3 31759 CASAVA_Build 5 151751807 1D CACGTTTATT A/- AAAAAAAAAA 2269 het 2269 ref 46 30 6 10 A 13 12 31760 CASAVA_Build 5 151757350 1D TATTTGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 35 1 24 11 T 15 14 31761 CASAVA_Build 5 151763517 5D GTAACTATAC ATATA/----- ATATATATAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 ATATA 2 1 31762 CASAVA_Build 5 151769062 1D AGTTCTGTAG T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 8 7 31763 CASAVA_Build 5 151794081 5I CAAAAAAACA -----/TTATT TTATTTTATT 3070 hom 75 het 37 0 26 11 TTATT 3 4 31764 CASAVA_Build 5 151800024 1D TCTGCTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 11 10 31765 CASAVA_Build 5 151812508 1D CAAAGGAGGG A/- CCTGGTGAGA 3070 hom 59 het 23 0 20 8 A 1 0 31766 CASAVA_Build 5 151814198 1D CTACTTCTCA T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 7 6 31767 CASAVA_Build 5 151816537 1D ATATTGAGTT G/- AAAAAAATAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 G 1 0 31768 CASAVA_Build 5 151866755 1D GGAACAGCCA G/- GGGCTCTATG 3070 hom 132 het 47 0 43 4 G 4 3 31769 CASAVA_Build 5 151868872 1I TCTTATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 330 hom 34 1 30 3 A 11 12 31770 CASAVA_Build 5 151870288 4I CTGATATGAT ----/AGAA AGAGAACCAC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 AGAA 0 1 31771 CASAVA_Build 5 151871606 7D CAGTTTGAAG AGACATA/------- AGGGGTACTA 3070 hom 66 het 22 0 23 2 AGACATA 1 0 31772 CASAVA_Build 5 151872319 1I30M2I GTGTGAGATT -AAAAAAAAAACATATGGTAAGTGTAAAGAC--/AAAAAAAAAAACATATGGTAAGTGTAAAGACAG AGAAAGAAGA 3070 het 54 hom 35 1 24 14 N/A 0 0 31773 CASAVA_Build 5 151875679 1I TAACACTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 922 hom 32 2 25 5 A 13 14 31774 CASAVA_Build 5 151880033 1I TGGACATCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 214 hom 45 1 36 8 T 12 13 31775 CASAVA_Build 5 151894102 1D TTTTGCTGAC A/- TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 0 31776 CASAVA_Build 5 151901974 4I ATTATTGGTC ----/TTAA TTAATCATTT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 TTAA 1 2 31777 CASAVA_Build 5 151907631 1I TCTTTACTTG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 7 8 31778 CASAVA_Build 5 151908005 3I TCTACTCATT ---/GAA CTTTTGCTCT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 GAA 0 1 31779 CASAVA_Build 5 151908407 2I CAATTGCCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 11 13 31780 CASAVA_Build 5 151908702 7I AGGTCAGGAG -------/ATGGAGA CCATCCTGGC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 ATGGAGA 0 1 31781 CASAVA_Build 5 151928350 1D CCAGGCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 38 2 26 11 T 12 11 31782 CASAVA_Build 5 151945950 1D TCTCAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 20 0 14 6 A 13 12 31783 CASAVA_Build 5 151953099 3D TATATTACAT ATC/--- ATTATATATT 2258 hom 12 het 5 0 5 0 ATC 1 0 31784 CASAVA_Build 5 151954836 1D CTCTTTGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 7 A 11 10 31785 CASAVA_Build 5 151958108 1I TTTTACAGGT -/A AAATTTCTGA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 3 4 31786 CASAVA_Build 5 151963015 1I TTGTAATAGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 9 31787 CASAVA_Build 5 151971026 1I AGAAGCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 36 1 28 7 T 11 12 31788 CASAVA_Build 5 151979445 1D AGATACTGTT G/- TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 31 0 27 4 G 1 0 31789 CASAVA_Build 5 151981113 1I AGGAAAGGGT -/C CCCCCCCCCT 3070 hom 49 het 27 0 18 9 C 9 10 31790 CASAVA_Build 5 151982614 1I GAGGGCCAAG -/C CCTTCCATGG 3070 hom 81 het 30 0 25 5 C 2 3 31791 CASAVA_Build 5 151983151 1D TTCTTCTTAC T/- CATATCCATT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 1 0 31792 CASAVA_Build 5 151987032 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 32 0 26 6 T 11 10 31793 CASAVA_Build 5 151988054 2D CTTAAGTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 43 1 32 11 T 13 11 31794 CASAVA_Build 5 151997982 4I ATGCATGGAT ----/AGAA AGAGATCCAC 3070 hom 126 het 52 0 43 9 AGAA 0 1 31795 CASAVA_Build 5 151999757 11D GTGTAACTAG AATTCATCCTA/----------- AGACAGGCAC 3070 hom 108 het 40 0 36 6 AATTCATCCTA 1 0 31796 CASAVA_Build 5 152002507 11D GAAATGTAGC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 36 1 27 10 A 22 11 31797 CASAVA_Build 5 152002614 1I TTATCAAGAC -/T TTTTTTTTTT 1494 het 1494 ref 38 17 6 15 T 15 16 31798 CASAVA_Build 5 152005147 1D TAATGACTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 9 31799 CASAVA_Build 5 152008621 5I TAAGAAATTG -----/ATGAC ATGAGAGAAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ATGAC 0 1 31800 CASAVA_Build 5 152013683 1D ATAGACCTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 10 9 31801 CASAVA_Build 5 152019837 1D TAACGTTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 10 9 31802 CASAVA_Build 5 152022534 1D TAAAAAGTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 10 9 31803 CASAVA_Build 5 152024617 4D AAAATGAGAC AAAG/---- AACATCATTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AAAG 1 0 31804 CASAVA_Build 5 152026716 1I AAGATCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1076 hom 35 3 23 9 A 11 12 31805 CASAVA_Build 5 152028167 4D TTGGACAAGT GTTA/---- GTTAGATTAG 3070 hom 114 het 43 0 36 7 GTTA 2 1 31806 CASAVA_Build 5 152029571 2I TCTAAATATG --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 10 31807 CASAVA_Build 5 152031255 1I AGACTTCCTA -/T TGGCTCATAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 1 2 31808 CASAVA_Build 5 152037851 2D CCAAAACCAT AA/-- AGTCACCTGA 3070 hom 165 het 60 0 54 8 A 3 1 31809 CASAVA_Build 5 152043889 2D TATTGCACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 33 4 19 10 A 14 12 31810 CASAVA_Build 5 152074794 1I ACATTTTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 183 hom 27 1 26 0 T 9 10 31811 CASAVA_Build 5 152085556 3D AAATGAAGTC TTT/--- TTGACCTCAA 3070 hom 72 het 26 0 25 3 T 5 2 31812 CASAVA_Build 5 152114038 1I AATAGAAGGC -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 26 het 14 0 9 5 A 7 8 31813 CASAVA_Build 5 152117845 1D AGTTGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 6 A 11 10 31814 CASAVA_Build 5 152120813 1D AATTAGTCTG T/- TTTAAAGTAA 3070 hom 141 het 54 0 48 7 T 4 3 31815 CASAVA_Build 5 152130744 1D CAGTGACATG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 4 het 37 1 32 4 T 10 9 31816 CASAVA_Build 5 152154415 1I GTTTTTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 39 hom 38 1 31 6 T 10 11 31817 CASAVA_Build 5 152155803 1D ACTCAATAGG A/- AAAAATCTAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 6 5 31818 CASAVA_Build 5 152164329 2I CCCTATTACA --/AT ATGTCCTTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AT 1 2 31819 CASAVA_Build 5 152178490 1I ATTTCTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 29 2 24 3 T 13 14 31820 CASAVA_Build 5 152201793 4I TTTTATTAAC ----/ACTA ACTACTTATT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 ACTA 1 2 31821 CASAVA_Build 5 152203851 3D TCAAATTAAT ACA/--- ACATTAACTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 ACA 2 1 31822 CASAVA_Build 5 152217212 7D CATTTCATTG GAAGGAA/------- GAGTAGCATT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 GAAGGAA 1 0 31823 CASAVA_Build 5 152217754 3I GACAAAAAAT ---/AAC AAAAAAATTG 3070 hom 123 het 43 0 42 1 AAC 0 1 31824 CASAVA_Build 5 152222796 2D CTCCCCCCCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 23 0 16 7 A 12 10 31825 CASAVA_Build 5 152225106 10D TTTTAACTCA TCCTCTTAAG/---------- TCATGGGGAA 3070 hom 114 het 41 0 39 7 TCCTCTTAAG 1 0 31826 CASAVA_Build 5 152226188 1D TTCAACCATT A/- AAAAAAAAAG 1111 het 1111 ref 34 29 3 2 A 10 9 31827 CASAVA_Build 5 152226941 1I ACTAAAACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 22 het 37 1 32 4 T 9 10 31828 CASAVA_Build 5 152228447 1D ATTTTCATAT A/- TTAATAAAGC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 1 0 31829 CASAVA_Build 5 152256468 1I TAAAAATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 33 1 29 3 A 10 11 31830 CASAVA_Build 5 152257886 8I CTGAGAGGCT --------/TCATCACC TCATCACCTG 3070 hom 147 het 57 0 49 8 TCATCACC 1 2 31831 CASAVA_Build 5 152271433 1I TTTTAATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 10 11 31832 CASAVA_Build 5 152281690 1I AATAAAATCT -/A AAAAAAAAAA 3023 het 234 hom 13 1 9 3 A 13 14 31833 CASAVA_Build 5 152287463 1D TAGAAGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 932 hom 45 3 37 5 A 11 10 31834 CASAVA_Build 5 152287751 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1314 hom 33 3 20 10 T 13 12 31835 CASAVA_Build 5 152324428 1I TTAAAATGAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 A 8 9 31836 CASAVA_Build 5 152330292 1D AGTCAGCAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 9 8 31837 CASAVA_Build 5 152358160 17D GTGAGCCTTA TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 2096 hom 24 het 16 0 7 9 T 31 14 31838 CASAVA_Build 5 152362557 1I AATTTATTTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 7 8 31839 CASAVA_Build 5 152405106 1D TTATGCTTCA T/- TTTTTTCTGC 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 7 6 31840 CASAVA_Build 5 152414842 8I CAGCCCAAGG --------/TTCACTTT TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 TTCACTTT 0 1 31841 CASAVA_Build 5 152417840 1I CTAAAAGACA -/G GCTGTCAGAT 3070 hom 96 het 38 0 30 8 G 1 2 31842 CASAVA_Build 5 152460038 2D GGTTTTTAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 41 0 31 10 AC 9 8 31843 CASAVA_Build 5 152468032 2D TTCATCTGGA AG/-- ACAGAAGGGA 3070 hom 110 het 47 0 34 16 AG 1 0 31844 CASAVA_Build 5 152475940 16D ATCCCGTGAC ATACACAGCACCCCTA/---------------- ATAAAGATGT 3070 hom 81 het 32 0 28 7 ATACACAGCACCCCTA 1 0 31845 CASAVA_Build 5 152492501 9D GTGTGGTGGC TCACACCTG/--------- TCATCCCAGC 3070 hom 87 het 30 0 28 3 TCACACCTG 1 0 31846 CASAVA_Build 5 152505622 2I TTAAAGGGAG --/AC ACAAACTCCA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 AC 1 2 31847 CASAVA_Build 5 152509216 1I AAGAAAAAAA -/C TCTTAATAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 31848 CASAVA_Build 5 152512331 1I ACCAAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 594 hom 36 3 20 13 A 13 14 31849 CASAVA_Build 5 152521313 1D CTTGACAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 32 1 24 7 T 13 12 31850 CASAVA_Build 5 152524271 1D ATTTTACACC T/- CTATTTGAGC 3070 hom 138 het 52 0 46 7 T 1 0 31851 CASAVA_Build 5 152536084 1D CTATGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 11 10 31852 CASAVA_Build 5 152537766 1I CCTAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 27 0 21 6 A 10 11 31853 CASAVA_Build 5 152538022 1D TTTAAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 11 10 31854 CASAVA_Build 5 152538206 1D TTTTGTTAAG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 8 7 31855 CASAVA_Build 5 152544134 1D CAGAAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 366 hom 55 1 46 9 A 10 9 31856 CASAVA_Build 5 152544261 3I TATGGGTCTA ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 9 12 31857 CASAVA_Build 5 152555834 1I GGCTGGGTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 69 het 29 0 20 9 A 8 9 31858 CASAVA_Build 5 152559478 1I TAAAAGTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 601 hom 30 2 20 8 A 14 15 31859 CASAVA_Build 5 152562955 1I TCCTTTGTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 8 9 31860 CASAVA_Build 5 152563772 1I GAAAATGAGC -/A AAAAGGCACT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 5 31861 CASAVA_Build 5 152569169 1D TCCTAAAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 10 9 31862 CASAVA_Build 5 152569399 1I AACCGAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 32 1 26 5 A 13 14 31863 CASAVA_Build 5 152570986 1I CCATTGTTTG -/C TTTTGTCTTG 3070 hom 123 het 44 0 40 4 C 0 1 31864 CASAVA_Build 5 152571494 3I CAAAACGGGC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 28 1 22 5 A 12 15 31865 CASAVA_Build 5 152579935 1I ATTTACAAGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 8 9 31866 CASAVA_Build 5 152582267 3D ACAGCTAAGA TGT/--- TGTTCCAGGC 3070 hom 84 het 32 0 28 6 TGT 2 1 31867 CASAVA_Build 5 152608853 2I ACTCGGTCTC --/TT TACTTGTTAT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 1 3 31868 CASAVA_Build 5 152622340 1D CATTTAAATT G/- AAAAATGCAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 1 0 31869 CASAVA_Build 5 152624284 1I TGAAAGACAA -/G GGAAGGAATC 3070 hom 148 het 57 0 50 7 G 2 3 31870 CASAVA_Build 5 152635058 1I AAAATGCAGT -/A AAAATTTTCC 3070 het 292 hom 19 2 12 5 A 4 5 31871 CASAVA_Build 5 152636416 2I CAGTCAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 22 0 13 9 A 12 14 31872 CASAVA_Build 5 152639176 12D AGTTGCACAA ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 102 het 37 0 35 8 AC 13 7 31873 CASAVA_Build 5 152645866 1I CACACACACA -/C AAAAAAAACC 3070 hom 45 het 24 0 16 8 C 0 1 31874 CASAVA_Build 5 152649279 1D ATGATAACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 219 hom 27 1 23 3 A 10 9 31875 CASAVA_Build 5 152649351 1D TTTAGATGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 22 0 15 7 T 10 9 31876 CASAVA_Build 5 152692311 4I TACACTGTAA ----/TTGT TTGTGATAAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TTGT 1 2 31877 CASAVA_Build 5 152697779 3D TGGGGAAGTT CTC/--- CTGGATAATA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 CTC 1 0 31878 CASAVA_Build 5 152698020 9D GATACTTGTG TATGTTTCA/--------- TATGTTTCAC 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TATGTTTCA 2 1 31879 CASAVA_Build 5 152698956 3D GGCTTTGTGG TGC/--- TGCTGCCAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TGC 3 2 31880 CASAVA_Build 5 152699256 2D TTGATATATC CT/-- CTGATTTCCA 3070 hom 99 het 35 0 34 4 CT 2 1 31881 CASAVA_Build 5 152700888 2I26M1D AGGACAGACT --AAAAAAAAAACGAAGGAGTTTTACAGA/AAAAAAAAAAAACGAAGGAGTTTTACAG- AAAAAATGTT 3070 hom 63 het 27 0 22 7 N/A 0 0 31882 CASAVA_Build 5 152701710 4I TATATTACTA ----/AGTG AAAAAGGAGG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AGTG 0 1 31883 CASAVA_Build 5 152706965 1I GCAGATAGAG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 A 7 8 31884 CASAVA_Build 5 152707608 1D GCCACTAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 9 8 31885 CASAVA_Build 5 152713716 1D GTATCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 184 hom 40 1 32 7 T 12 11 31886 CASAVA_Build 5 152719175 1I AACAGGCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 28 1 21 6 A 10 11 31887 CASAVA_Build 5 152728268 1I TATCACTAGA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 119 het 44 0 40 4 T 6 7 31888 CASAVA_Build 5 152750692 1D TACAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 31 1 23 7 A 13 12 31889 CASAVA_Build 5 152761440 2D AGCATGTAGT TG/-- TGTGTTGCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 4 TG 3 2 31890 CASAVA_Build 5 152773258 1I GTATAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1182 hom 41 3 31 7 T 11 12 31891 CASAVA_Build 5 152804416 8I GTATATATGT --------/GCAGTTGC GCAGTTGCAC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 GCAGTTGC 1 2 31892 CASAVA_Build 5 152808619 1I AGGGCTCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 34 3 27 4 A 13 14 31893 CASAVA_Build 5 152809917 4D TTAATAAGAA AAAT/---- AAAATAGTGT 2304 hom 12 het 5 0 5 2 AAAT 1 0 31894 CASAVA_Build 5 152852541 1I TACTGTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 50 1 38 11 A 10 11 31895 CASAVA_Build 5 152865108 1D ACTCCTTGGG A/- AAAAAATATA 3070 hom 60 het 28 0 20 8 A 7 6 31896 CASAVA_Build 5 152868619 1D AGGATAGGTT A/- AGGCTAAACT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 2 1 31897 CASAVA_Build 5 152883265 1I GCTTTGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 11 12 31898 CASAVA_Build 5 152908733 2D TTCAACAGAG TC/-- TTTATTGGAT 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 TC 1 0 31899 CASAVA_Build 5 152909504 3D TAGAAATTCC AAG/--- AAGATCTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 AAG 2 1 31900 CASAVA_Build 5 152909908 1I AGGTGTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 9 10 31901 CASAVA_Build 5 152910778 1I GGGATTACAG -/T TAAGAAAACC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 1 2 31902 CASAVA_Build 5 152911108 2D CAGTTTTTTT TG/-- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 TG 1 0 31903 CASAVA_Build 5 152916042 1I ATTTAGTTAT -/G GGCCAAGAAA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 G 2 3 31904 CASAVA_Build 5 152927359 4I CTGCCAAATG ----/TTCC TCAGAGAGAA 3070 hom 135 het 52 0 45 7 TTCC 0 1 31905 CASAVA_Build 5 152949979 1D CATCAGTTCG A/- AAAAATTGCA 3070 het 3070 hom 36 12 19 6 A 6 5 31906 CASAVA_Build 5 152955782 1I TATAGACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 584 hom 44 3 36 5 A 11 12 31907 CASAVA_Build 5 152958556 4D CCACGGCAGC TTTT/---- TTTTCTCACT 3070 hom 96 het 37 0 33 6 T 8 4 31908 CASAVA_Build 5 152959201 1D TCCTACAGAT A/- ACCAACATCT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 2 1 31909 CASAVA_Build 5 152960192 1I TAAGGATAGG -/T TTTCAATCAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 3 4 31910 CASAVA_Build 5 152969194 1I TAGGCTGAAA -/C AAGGCAGTGA 3070 het 3070 ref 62 32 26 4 C 0 1 31911 CASAVA_Build 5 152989834 1I CTGCCTACCT -/A ATGTTTTAGT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 A 1 2 31912 CASAVA_Build 5 153006043 5D TGAGAGTTAA GGGCT/----- GGGCTAGACT 3070 het 3070 ref 57 28 28 3 GGGCT 2 1 31913 CASAVA_Build 5 153010046 4D CAAATCCTGA CTGT/---- CTGTCATTTC 3070 het 3070 ref 41 19 14 11 CTGT 2 1 31914 CASAVA_Build 5 153010518 2D TCTATTGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2796 het 2796 ref 25 10 8 7 A 12 10 31915 CASAVA_Build 5 153011192 3D CCACAGAATT AGC/--- AGGATTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 AGC 1 0 31916 CASAVA_Build 5 153030197 1D ATTAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 T 11 10 31917 CASAVA_Build 5 153058352 1D AGGTATTTCC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 A 8 7 31918 CASAVA_Build 5 153077289 1I TATTCATTGG -/C CAAGGGCTCA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 1 2 31919 CASAVA_Build 5 153092020 1I GGAGTGTATT -/G TAGTTTTATT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 G 0 1 31920 CASAVA_Build 5 153092425 1I CCAATTCCAT -/G AATTGCCTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 0 1 31921 CASAVA_Build 5 153098842 1I GGATTTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1714 het 1714 ref 35 14 6 15 A 15 16 31922 CASAVA_Build 5 153101700 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAGAAAAA 3070 het 2899 hom 34 14 12 8 AG 0 1 31923 CASAVA_Build 5 153103346 1I CTCAGTGATA -/G GGACCCTCCC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 G 2 3 31924 CASAVA_Build 5 153105940 1D TCCCTTTGAA G/- AATTGGCTGG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 G 1 0 31925 CASAVA_Build 5 153135657 1D GCAGAAACGG A/- AAAAAAAAAA 2182 het 2182 ref 30 15 6 9 A 11 10 31926 CASAVA_Build 5 153141480 2D AACTTGTAGG TC/-- TCTTTGGCCA 3070 het 3070 ref 64 34 27 4 TC 2 1 31927 CASAVA_Build 5 153144159 1D CATTTGCTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 A 9 8 31928 CASAVA_Build 5 153149635 3D CATAATAATA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 37 11 20 8 TTG 7 6 31929 CASAVA_Build 5 153158835 1D GACTTTTCCA C/- CCCCCCCTGA 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 C 8 7 31930 CASAVA_Build 5 153164888 1D AAATAATGGA T/- TATAAAGAGC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 2 1 31931 CASAVA_Build 5 153175849 3I AACAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 AAG 3 4 31932 CASAVA_Build 5 153178228 2I ACTAAGTAAA --/AC ACAAGTTTCG 3070 het 3070 ref 65 32 27 6 AC 1 2 31933 CASAVA_Build 5 153187136 1I ATGCAAAAAC -/A AAACAAATGA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 3 4 31934 CASAVA_Build 5 153192972 1D CTAAAAAATT C/- CCACTTTAAG 3070 het 3070 ref 50 27 19 5 C 3 2 31935 CASAVA_Build 5 153193821 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTGAAA 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 CT 1 2 31936 CASAVA_Build 5 153241457 1I ATTCCAAGTT -/C CCTGGCCATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 C 2 3 31937 CASAVA_Build 5 153243039 3I TGCTCTTTCC ---/CCA ATCCTTGGCA 3070 hom 162 het 56 0 53 3 CCA 0 1 31938 CASAVA_Build 5 153246822 1I CAATATAACA -/T TTTTTAAAAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 5 6 31939 CASAVA_Build 5 153252698 1D CATCTCTACC A/- AAAATACAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 A 5 4 31940 CASAVA_Build 5 153275505 1D TTTTCCCACT C/- TTTTTTTTAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 1 0 31941 CASAVA_Build 5 153277263 1I CAGAGATTCC -/G GGGCCGGAAT 3070 hom 126 het 49 0 41 8 G 3 4 31942 CASAVA_Build 5 153277817 1I AAAGTTATTC -/T TTTTTTAACA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 6 7 31943 CASAVA_Build 5 153280696 1I ACAGGTGACA -/G TCAATAACTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 31944 CASAVA_Build 5 153284095 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 10 9 31945 CASAVA_Build 5 153287095 7D4M6I GCCTTGAAGG TTGAACAGAAG------/-------GAAGGACCCA TCACCTGCTG 3070 hom 90 het 32 0 30 6 N/A 0 0 31946 CASAVA_Build 5 153290530 4D TTAAAACTCT AAAA/---- AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 29 0 24 8 A 13 9 31947 CASAVA_Build 5 153293712 5I GTCTCATCTG -----/AGACA AGACAAGTCC 2930 het 47 hom 14 1 9 4 AGACA 1 2 31948 CASAVA_Build 5 153300946 18D AAACTGCCCC TCCCACCAAAAGAGATTT/------------------ TCCCACCGAA 3070 hom 91 het 31 0 30 7 TCCCACCAAAAGAGATTT 1 0 31949 CASAVA_Build 5 153313769 5D TTTAAAAAGC TTAAT/----- TTAATTCAAC 3070 hom 117 het 43 0 40 6 TTAAT 2 1 31950 CASAVA_Build 5 153316378 1D TTTGCAGTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 T 9 8 31951 CASAVA_Build 5 153317449 1D AATGGGAAAT A/- ATTGACACAT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 2 1 31952 CASAVA_Build 5 153321237 1I TTCTTTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 9 10 31953 CASAVA_Build 5 153344786 6D22M4D ATTTATATAA ATAAATATAAATAGTACTTATTTATATGGTGT/------ATAAATAGTACTTATTTATATG---- GTGTGTATGT 3070 hom 33 het 16 0 12 12 N/A 0 0 31954 CASAVA_Build 5 153345887 4D TTAATACATA TAAT/---- TAATACATGT 3070 hom 144 het 52 0 49 4 TAAT 2 1 31955 CASAVA_Build 5 153356508 1D CCAGCACTTT G/- GGAGGCCAAC 3070 hom 55 het 22 0 19 3 G 3 2 31956 CASAVA_Build 5 153362266 3D ATAAAGAGTG TCT/--- TCTTCTTCCA 3070 hom 114 het 43 0 38 6 TCT 3 2 31957 CASAVA_Build 5 153364321 1I TCTCTTCTTA -/C CCCCAAATTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 4 5 31958 CASAVA_Build 5 153364486 4D TTCCCGTCTT CCTC/---- CTCCCTATTA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CCTC 1 0 31959 CASAVA_Build 5 153377257 1I AGTGGGGGAC -/T TTTAACACCC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 3 4 31960 CASAVA_Build 5 153380080 1I ATAGAGACAC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 7 8 31961 CASAVA_Build 5 153394739 1I ATGAAAGCCC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 9 31962 CASAVA_Build 5 153404691 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 37 0 28 9 A 12 11 31963 CASAVA_Build 5 153407316 1D GCTCAAAGCC T/- TTCAGCAGGC 3070 hom 120 het 47 0 40 7 T 3 2 31964 CASAVA_Build 5 153412644 1I TTTGCTATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 9 10 31965 CASAVA_Build 5 153422936 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 32 2 29 1 A 11 10 31966 CASAVA_Build 5 153423759 1D TAATGTTTTG T/- TTTTGTTTTT 2788 hom 18 het 8 0 7 1 T 5 4 31967 CASAVA_Build 5 153424093 3I CTGATTTTTA ---/TAT TTTTAGTAGA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TAT 0 1 31968 CASAVA_Build 5 153448545 1D TCAATAAACC T/- TATTCGTTGT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 2 1 31969 CASAVA_Build 5 153498381 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1615 hom 21 het 9 0 7 3 A 18 16 31970 CASAVA_Build 5 153508082 8D AGCTAGAAAT TGAGGCTC/-------- TGAGGCTCTT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 TGAGGCTC 2 1 31971 CASAVA_Build 5 153511788 1D AGGACTATTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 89 het 36 0 30 6 A 9 8 31972 CASAVA_Build 5 153512474 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 26 1 16 10 T 12 11 31973 CASAVA_Build 5 153513417 1D TCTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 12 11 31974 CASAVA_Build 5 153535917 2D7M1I CAGAGCGAGA CTCTGTCTC-/--CTGTCTCA AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 22 0 19 4 N/A 0 0 31975 CASAVA_Build 5 153538951 2I ACAGCGTGTG --/AT ATGTCCAGCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 1 2 31976 CASAVA_Build 5 153550861 1D CCACCTTCTG C/- TGTCTGCCTC 3070 hom 56 het 21 0 18 3 C 1 0 31977 CASAVA_Build 5 153560326 2D AAAATGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 46 0 35 12 TG 7 6 31978 CASAVA_Build 5 153560725 1I CTAATTTCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 9 31979 CASAVA_Build 5 153561157 1I CTTTTCAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 A 9 10 31980 CASAVA_Build 5 153561691 1D CGAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 846 hom 31 4 20 9 A 13 12 31981 CASAVA_Build 5 153603340 2D TTAACCACTC TG/-- TGTCTCAGTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TG 2 1 31982 CASAVA_Build 5 153605291 1I GAGCTCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1774 hom 42 5 26 11 T 11 12 31983 CASAVA_Build 5 153611712 4I CATAAATATA ----/TATT TAAATTAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TATT 0 1 31984 CASAVA_Build 5 153622012 1D GCCTGGCATC A/- ATGCAGGGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 1 31985 CASAVA_Build 5 153622711 1I TTGGTTTGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 39 0 31 9 A 9 10 31986 CASAVA_Build 5 153629760 2D TCTTACTCTT TC/-- TCTTATCAAA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 TC 2 1 31987 CASAVA_Build 5 153632202 1I9M2I AACTAGGCTA -TGGATAACA--/TTGGATAACAGG GGGAGGGGAA 3070 hom 96 het 37 0 32 9 N/A 0 0 31988 CASAVA_Build 5 153632697 5I TACTCTAGAC -----/TATCA GGTAGGAAAT 3070 hom 93 het 37 0 29 8 TATCA 0 1 31989 CASAVA_Build 5 153637218 1I GGAAAGAGAC -/T CCACTTTTGA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 0 1 31990 CASAVA_Build 5 153637738 1D ACCTAAGGCC A/- AAAAAATAGT 3070 hom 98 het 35 0 31 4 A 7 6 31991 CASAVA_Build 5 153637995 3D GGAAGAATCA TGT/--- TGTATTCTCC 3070 hom 123 het 44 0 42 3 TGT 2 1 31992 CASAVA_Build 5 153653366 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 1882 hom 24 het 18 0 7 11 A 1 0 31993 CASAVA_Build 5 153655198 2I GCACAGAAAG --/AA AGAGGCAAAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 1 3 31994 CASAVA_Build 5 153657555 5I TCTTTGTACT -----/TCCCC GAGCAAAAAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TCCCC 0 1 31995 CASAVA_Build 5 153678198 2D TAAAATACTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 14 0 10 6 AT 8 7 31996 CASAVA_Build 5 153681064 2I TCCTCAAAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 11 13 31997 CASAVA_Build 5 153681555 1D ACCTGCCCCC T/- AGACAGCACC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 0 31998 CASAVA_Build 5 153684930 3D CCTAACCGTG CCT/--- CTGAGAGGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CCT 1 0 31999 CASAVA_Build 5 153686972 5I CTGTCTCAAA -----/AAAAT AAAATAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 AAAAT 1 2 32000 CASAVA_Build 5 153687837 1I ATCGAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 492 hom 27 2 20 5 A 11 12 32001 CASAVA_Build 5 153718093 3I TAACAACAAC ---/AAT AATAATAACA 3070 hom 97 het 44 0 33 11 AAT 2 3 32002 CASAVA_Build 5 153731281 46D GAGGCCCCAG ACACACCACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACACACACAC/---------------------------------------------- ACACACACAC 2409 het 1799 hom 29 8 11 18 ACACACCACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACACACACAC 1 0 32003 CASAVA_Build 5 153750046 1I TGAGTCACTA -/C ATTCCATCAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 C 0 1 32004 CASAVA_Build 5 153751627 2I GGAAGGAGAG --/TC TGTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 54 20 30 4 TC 0 1 32005 CASAVA_Build 5 153754097 1I AAAACTCTGA -/T TTTTTTTTTT 1220 het 1130 hom 25 7 7 11 T 10 11 32006 CASAVA_Build 5 153756241 23D TGATAGGGTG GGTCCAGACCTTAGGAAAACACA/----------------------- GTCTCTGTGG 3070 het 3070 ref 43 25 18 9 GGTCCAGACCTTAGGAAAACACA 1 0 32007 CASAVA_Build 5 153756880 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2717 hom 20 9 9 2 A 14 11 32008 CASAVA_Build 5 153756944 2D TCTTTTCTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1676 hom 22 7 11 5 T 16 14 32009 CASAVA_Build 5 153765630 1I GTTGCTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 637 hom 30 2 24 4 T 11 12 32010 CASAVA_Build 5 153775468 1D TCCATAATTT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 8 7 32011 CASAVA_Build 5 153777383 1I GAAGAGGGAG -/C CCCCCCTAGA 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 C 6 7 32012 CASAVA_Build 5 153788084 2D GTGTATATAT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 57 24 23 11 AC 5 4 32013 CASAVA_Build 5 153790547 3D TCACTCACAC ACA/--- ACACCACGGG 3070 het 1877 hom 31 8 14 9 ACA 2 1 32014 CASAVA_Build 5 153790563 1D CCACGGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 488 hom 38 2 17 19 A 12 11 32015 CASAVA_Build 5 153791070 1I ATTACCACTG -/C CCTACAGGTA 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 C 2 3 32016 CASAVA_Build 5 153797367 2D AGGGAAACCC CT/-- CTCTCCAAAC 3070 het 3070 ref 35 14 13 9 CT 3 2 32017 CASAVA_Build 5 153798122 4D AATATGAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AAAG 5 4 32018 CASAVA_Build 5 153803828 1D ACTTGGTATA C/- ATAATGAGTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 C 1 0 32019 CASAVA_Build 5 153804148 1I TACTTATCAT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 7 8 32020 CASAVA_Build 5 153811301 1I ACAGTGTCAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 42 1 32 9 T 8 9 32021 CASAVA_Build 5 153812119 1I GGTTTTCACC -/A AAAAAAAAAA 1526 het 580 hom 24 4 9 11 A 17 18 32022 CASAVA_Build 5 153812497 12I GAGGATAACA ------------/GTTCTTCCCACT GCCCTCCTTT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 GTTCTTCCCACT 0 1 32023 CASAVA_Build 5 153814675 1D TTTAACACAA T/- TTTTTTTTTT 1453 het 1453 ref 38 23 5 10 T 15 14 32024 CASAVA_Build 5 153828659 1D TTCAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 1164 het 1164 ref 23 11 3 9 T 13 12 32025 CASAVA_Build 5 153845032 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 78 het 35 0 28 7 T 8 9 32026 CASAVA_Build 5 153845351 1D GAAATTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 47 0 35 12 A 11 10 32027 CASAVA_Build 5 153849371 1D ACCAGCTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2230 hom 41 7 18 17 T 10 9 32028 CASAVA_Build 5 153849403 1D TCAGGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 13 16 A 15 14 32029 CASAVA_Build 5 153855146 1D CACAATTACA T/- TTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 T 6 5 32030 CASAVA_Build 5 153856455 1D TCTCAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 763 hom 29 3 22 4 A 12 11 32031 CASAVA_Build 5 153866416 1D TGCCTTCAGG C/- ACTTGGTAGG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 1 0 32032 CASAVA_Build 5 153869893 1I TCTATTTTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 T 8 9 32033 CASAVA_Build 5 153881951 1I ACTGTCCTCT -/G GGACAGTTGA 3070 hom 108 het 40 0 34 6 G 2 3 32034 CASAVA_Build 5 153894917 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 24 1 20 3 T 13 12 32035 CASAVA_Build 5 153896491 4D TGTTTTTATG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 51 het 27 0 18 9 CA 11 9 32036 CASAVA_Build 5 153903541 1D ATTCAAGCGA T/- TTACCTGCCT 3070 het 2298 hom 18 7 10 1 T 3 2 32037 CASAVA_Build 5 153933028 5I GGGAGGAGAA -----/ACCAG ACCAGCTCTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ACCAG 1 2 32038 CASAVA_Build 5 153939883 1I ATAGTGAAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 136 hom 25 1 21 3 A 8 9 32039 CASAVA_Build 5 153953365 1D ATATGCCACA T/- TTTGTGTATC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 4 3 32040 CASAVA_Build 5 153959988 2I CAATAATGAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 5 6 32041 CASAVA_Build 5 153972826 4I GCATCATGGC ----/GCAT GCATGCCTGT 2904 het 211 hom 12 2 8 2 GCAT 1 2 32042 CASAVA_Build 5 153984661 9I GCTGTAGGGG ---------/AACAAGGTT AAAATGGGTG 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 AACAAGGTT 0 1 32043 CASAVA_Build 5 153990616 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2942 het 865 hom 21 4 8 9 A 15 16 32044 CASAVA_Build 5 153990710 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 35 3 23 9 A 12 11 32045 CASAVA_Build 5 153992488 2D TTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2435 hom 39 12 13 14 T 16 14 32046 CASAVA_Build 5 153998260 1D TACCAACCAA T/- TTTTGGGTTG 3070 het 3070 ref 50 36 11 3 T 5 4 32047 CASAVA_Build 5 153999622 1D TGCTTTAGTT A/- AAGGCCCTGG 2974 het 2974 ref 53 34 9 13 A 3 2 32048 CASAVA_Build 5 154004868 5D GTGCTAAGTG ACTCC/----- ACGCATTTCT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 ACTCC 1 0 32049 CASAVA_Build 5 154033514 1D ATGGAAGGGT C/- TTTCCTCCAG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 C 1 0 32050 CASAVA_Build 5 154045493 1I GGGAGGCCAA -/G GTGGGAGAAA 3070 hom 57 het 20 0 18 2 G 1 2 32051 CASAVA_Build 5 154045576 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTTAGAG 3070 hom 60 het 22 0 18 4 A 3 2 32052 CASAVA_Build 5 154047541 1I AGGATAACAC -/G GAGAGAACCT 3070 hom 48 het 18 0 14 4 G 1 2 32053 CASAVA_Build 5 154049923 7D CGGGGGAGGG CACACAC/------- ACAAGCCTGC 3070 hom 60 het 23 0 19 4 CACACAC 1 0 32054 CASAVA_Build 5 154050519 1D TGACCCGGGC G/- GGGGGGCTGT 1633 hom 18 het 12 0 6 7 G 7 6 32055 CASAVA_Build 5 154051552 4D ACCCTTTTCG TTCT/---- TTTTTTTTTT 2066 hom 30 het 14 0 9 7 TTCT 1 0 32056 CASAVA_Build 5 154051726 1I TATTTTTAGC -/A AGAGACGGGG 3070 hom 32 het 18 0 11 7 A 1 2 32057 CASAVA_Build 5 154054175 2D TACCTGGCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 40 0 28 15 T 13 11 32058 CASAVA_Build 5 154056124 3D ACAACAACAG CAA/--- CAACAACAAA 3070 hom 126 het 45 0 43 3 CAA 4 3 32059 CASAVA_Build 5 154056956 1I GCTTTTTATC -/T TTTTTTTTTT 2503 het 650 hom 27 3 15 9 T 15 16 32060 CASAVA_Build 5 154059246 2D CTCTTTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 16 0 9 7 A 14 12 32061 CASAVA_Build 5 154076814 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 25 2 15 9 A 13 12 32062 CASAVA_Build 5 154085782 2I TAGTAGAGAC --/AG GGGTTATCTC 3070 hom 50 het 22 0 16 6 AG 0 1 32063 CASAVA_Build 5 154088467 2I TTAGAGTAAC --/AG GGGATTGACT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 AG 0 1 32064 CASAVA_Build 5 154093321 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 28 2 16 10 T 12 11 32065 CASAVA_Build 5 154095515 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCGCCA 1525 hom 10 het 4 0 4 0 G 2 3 32066 CASAVA_Build 5 154098945 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 918 hom 17 het 8 0 4 4 T 10 11 32067 CASAVA_Build 5 154117158 1I CGGCTTGGGT -/G GGGGGGGGCG 1820 het 1312 hom 22 5 9 8 G 8 9 32068 CASAVA_Build 5 154124302 1I TATATTGAGC -/T AAGAGCCACT 3070 hom 25 het 13 0 9 4 T 0 1 32069 CASAVA_Build 5 154138790 1I TTACCCCACC -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 7 8 32070 CASAVA_Build 5 154172854 4I AGGACTTATT ----/AGAC AGGTTAACTG 3070 hom 99 het 40 0 31 9 AGAC 0 1 32071 CASAVA_Build 5 154185116 2I CAAGACTCCA --/TC TCAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 TC 1 2 32072 CASAVA_Build 5 154190171 1D GTTTTCGCAG C/- TGTCTCCCTC 3070 het 3070 ref 60 36 15 9 C 1 0 32073 CASAVA_Build 5 154190533 3I TGCTTTGACC ---/AGG AGAAGTTGCA 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 AGG 0 1 32074 CASAVA_Build 5 154200785 2D AGAGCCTCTC AG/-- GGAGAAATAC 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 AG 1 0 32075 CASAVA_Build 5 154200893 2I ACCCAGAGAC --/AG GGGAATGGGT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 AG 0 1 32076 CASAVA_Build 5 154205427 1D ACAAGCAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 9 8 32077 CASAVA_Build 5 154212635 19D CTCCTGGGTT TAAGCGATTCTCCTGCCTC/------------------- TAAGCGATTC 2112 het 2112 ref 17 11 6 0 TAAGCGATTCTCCTGCCTC 2 1 32078 CASAVA_Build 5 154222014 2D TCACAAGGTC AG/-- GGGTTCAAGA 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 AG 1 0 32079 CASAVA_Build 5 154226726 1D TAAGCAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 21 2 A 10 9 32080 CASAVA_Build 5 154227699 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2207 hom 22 7 11 4 T 9 8 32081 CASAVA_Build 5 154230008 1D TTTTTGTTTG T/- TTTGTTTTTT 2685 het 2685 ref 25 11 9 5 T 4 3 32082 CASAVA_Build 5 154236778 3D TGGGTCTTAA TAT/--- TATAGAATTA 3070 het 3070 hom 31 12 16 5 TAT 2 1 32083 CASAVA_Build 5 154254799 16I GCCACTGTAC ----------------/CTTGTTGCCTGTATCT TCCAGCCTGA 2733 het 2733 ref 19 10 8 1 CTTGTTGCCTGTATCT 0 1 32084 CASAVA_Build 5 154255428 5D TTGATGGGTT ATTAC/----- ATTATTCTGC 3070 het 3070 ref 70 48 14 9 ATTAC 1 0 32085 CASAVA_Build 5 154259373 1D CTTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 41 0 37 4 A 13 12 32086 CASAVA_Build 5 154260639 7I ATGTAGGAGG -------/TCCAAAC TAATTCTAGA 3070 hom 120 het 49 0 40 9 TCCAAAC 0 1 32087 CASAVA_Build 5 154261549 2I TTTTTTTTTT --/TC CCCTTTCCTT 3070 hom 98 het 42 0 36 6 TC 0 1 32088 CASAVA_Build 5 154269307 3D CAAAGTACCT ACC/--- ACCACCACAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 ACC 3 2 32089 CASAVA_Build 5 154272460 1D TCTAAGTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 A 11 10 32090 CASAVA_Build 5 154275648 4D TATACAAAAA TTAT/---- TCATTCATGT 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 TTAT 1 0 32091 CASAVA_Build 5 154282557 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTACCTCAGC 3070 het 910 hom 14 2 12 0 CTC 1 0 32092 CASAVA_Build 5 154284882 4D TGAAAAAAAC AAAT/---- GAGTTCAAAT 3070 het 2698 hom 23 7 14 2 AAAT 1 0 32093 CASAVA_Build 5 154286806 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 169 hom 29 2 18 9 A 12 13 32094 CASAVA_Build 5 154293593 2D AGATCCTCCC CT/-- GACTCCTGCC 3044 het 3044 ref 26 14 9 4 CT 1 0 32095 CASAVA_Build 5 154296111 85D CGGAGCTTGC AGTGAGCCAAGATCCCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTAATA/------------------------------------------------------------------------------------- CTTATTAGTA 3070 hom 39 het 13 0 13 1 AGTGAGCCAAGATCCCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTAATA 1 0 32096 CASAVA_Build 5 154306781 4I GGATGCACTA ----/TATT AATTATTAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TATT 0 1 32097 CASAVA_Build 5 154329610 1D CCCCTGCCTG A/- AAGAGCTGAC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 3 2 32098 CASAVA_Build 5 154355249 1D TACACGAATG A/- AAAAAAAAAA 1973 het 1973 ref 44 31 5 8 A 12 11 32099 CASAVA_Build 5 154357718 4I GCAGGTTTTT ----/AGAA AGGAAATTAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AGAA 0 1 32100 CASAVA_Build 5 154362738 1D TATGACTGGC T/- TTTTTTTTTT 2162 het 937 hom 18 3 7 8 T 12 11 32101 CASAVA_Build 5 154368860 9I TTCTAAAATG ---------/GGGAGCTCA GAGCGGGGCC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 GGGAGCTCA 0 1 32102 CASAVA_Build 5 154384931 1I ATAAGTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 31 3 10 18 A 12 13 32103 CASAVA_Build 5 154386905 1I GAGCAGGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 A 11 12 32104 CASAVA_Build 5 154391167 1D GAGTGATGCT C/- TTCTTATTAA 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 C 1 0 32105 CASAVA_Build 5 154391384 1I TTGTTCAGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 9 10 32106 CASAVA_Build 5 154395305 25D AGTTTTAATC ATAAAGAGATGCTGGATTTTGTCAA/------------------------- ATAAAGAGAT 3070 hom 36 het 12 0 13 1 ATAAAGAGATGCTGGATTTTGTCAA 2 1 32107 CASAVA_Build 5 154395396 1I GTAATTTTTG -/T TTTTTAATTC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 5 6 32108 CASAVA_Build 5 154395593 1I TTTCTATTTT -/G GTTATGTCCT 3070 hom 57 het 20 0 18 2 G 1 2 32109 CASAVA_Build 5 154397082 1D TCCATTCTGC A/- AATTCTGTAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 2 32110 CASAVA_Build 5 154408593 2I CCCCAGGGGG --/AA AACGAGTTAC 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 A 2 4 32111 CASAVA_Build 5 154412070 1I TTTTAATTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 8 9 32112 CASAVA_Build 5 154413695 1D TGCTGTGGGG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 46 20 22 6 A 8 7 32113 CASAVA_Build 5 154418615 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 30 0 24 6 T 13 12 32114 CASAVA_Build 5 154425191 2I CCTTTTTTTT --/TC TTTTTTACTT 3070 het 2380 hom 28 10 13 5 TC 0 1 32115 CASAVA_Build 5 154446486 1D AAAAATCTTC T/- TTTTTTTTTT 1489 het 846 hom 28 11 4 14 T 15 14 32116 CASAVA_Build 5 154487207 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 8 7 32117 CASAVA_Build 5 154488649 2I ATGCACCTCA --/GG AAAGTGGTCA 3070 hom 151 het 54 0 51 3 G 0 2 32118 CASAVA_Build 5 154490159 6D TTCAACTTTA CAGACT/------ CAGACTTATT 3070 hom 114 het 44 0 38 7 CAGACT 2 1 32119 CASAVA_Build 5 154501295 5D TTCCAAAATT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 84 het 36 0 29 11 AAAAC 3 2 32120 CASAVA_Build 5 154502864 2D CATCCCCAGG GA/-- GAGAGTATTA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 GA 3 2 32121 CASAVA_Build 5 154505723 14D GATGTCTGAG GTGTGTGTGTGTGT/-------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 80 het 38 0 32 11 GT 15 8 32122 CASAVA_Build 5 154522060 1D GTTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 2545 hom 15 het 9 0 6 3 T 11 10 32123 CASAVA_Build 5 154522259 1I ATTCATCTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 50 het 21 0 17 4 T 8 9 32124 CASAVA_Build 5 154539485 1D CAGCTGATAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 8 7 32125 CASAVA_Build 5 154546360 16D GTATGATGGA AGTCTTGGGGGTGGGG/---------------- AGTTGAATAG 3070 hom 123 het 41 0 42 5 AGTCTTGGGGGTGGGG 1 0 32126 CASAVA_Build 5 154546713 1I AAGTGTATTA -/T TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 6 7 32127 CASAVA_Build 5 154548684 1D TTAGGGCTTT C/- CCCCCCCGTT 3070 hom 109 het 41 0 34 7 C 8 7 32128 CASAVA_Build 5 154571494 1D CCTGTGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 708 hom 30 2 23 6 T 13 12 32129 CASAVA_Build 5 154571910 1D TTTATAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 12 11 32130 CASAVA_Build 5 154578444 1D ATACTTTTTG C/- TTTTTGACTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 1 0 32131 CASAVA_Build 5 154581988 1I CTCAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1789 het 1789 ref 26 14 7 5 A 11 12 32132 CASAVA_Build 5 154596550 1D TTACAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 11 10 32133 CASAVA_Build 5 154631605 1I AACATTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 26 10 T 10 11 32134 CASAVA_Build 5 154647950 1D TTAAAAACTT A/- ACTGTCATAT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 2 1 32135 CASAVA_Build 5 154662612 1I CAAAAAGAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 1755 hom 19 6 12 1 G 0 1 32136 CASAVA_Build 5 154683370 1D GTGTTAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 11 14 T 12 11 32137 CASAVA_Build 5 154699930 1D TTTTGCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 T 13 12 32138 CASAVA_Build 5 154701629 1D GGTTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 2878 hom 28 11 12 5 G 1 0 32139 CASAVA_Build 5 154702823 4I AGGGAACTCC ----/TAAT CTTGCTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TAAT 0 1 32140 CASAVA_Build 5 154714168 4D ACTCTATCTC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 23 11 9 5 AAAT 6 5 32141 CASAVA_Build 5 154718634 1I ATTAAAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 8 9 32142 CASAVA_Build 5 154719041 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2224 hom 20 7 10 3 A 14 13 32143 CASAVA_Build 5 154729328 2D AGACATTCAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 12 20 6 AC 13 12 32144 CASAVA_Build 5 154731677 3D GTTTTATGAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2172 hom 25 6 16 3 T 14 11 32145 CASAVA_Build 5 154733704 6D TCATCATTCT TACAAA/------ TAAAATATTT 3070 het 3070 hom 25 9 14 4 TACAAA 1 0 32146 CASAVA_Build 5 154734292 1D CATGATCTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 T 9 8 32147 CASAVA_Build 5 154742069 3D AAGAATTGTT AAG/--- AAGATCAAAT 3070 het 3070 ref 49 22 24 4 AAG 2 1 32148 CASAVA_Build 5 154745992 1I CTAACAGCTG -/T TTTTTTTTTT 833 het 833 ref 56 41 4 11 T 10 11 32149 CASAVA_Build 5 154754969 4I ATAAAAGCGC ----/CAAA CAAAGTTCAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CAAA 1 2 32150 CASAVA_Build 5 154757315 3D GCATTGCTAT AAA/--- AAATAAATAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 6 3 32151 CASAVA_Build 5 154759565 3D CCAGGAAAGA AAG/--- AAGATGTCAC 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 AAG 2 1 32152 CASAVA_Build 5 154761994 4D CTTGTTTAAT TGTC/---- TGTTGTCTCC 3070 het 3070 hom 50 22 25 6 TGTC 1 0 32153 CASAVA_Build 5 154769781 1D TTCTATTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 9 8 32154 CASAVA_Build 5 154774852 1I GAGTAAAATA -/G GCTCTTCCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 1 2 32155 CASAVA_Build 5 154775829 2D GAAGCCAAAC AT/-- GTGTGATTTT 3070 het 3070 hom 45 13 29 4 AT 1 0 32156 CASAVA_Build 5 154777194 1D TGTGGTAGGA T/- AAAGTTTGAC 2941 het 2941 ref 16 9 6 1 T 1 0 32157 CASAVA_Build 5 154778711 1I AAAATACAGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2759 hom 25 7 16 2 T 8 9 32158 CASAVA_Build 5 154786688 1I GTTGCCCCTT -/A ATTCCGGTAT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 A 1 2 32159 CASAVA_Build 5 154800597 1I ATATTCAATA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 7 8 32160 CASAVA_Build 5 154801656 1I TGAATGGGCC -/T CTTAACCTAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 0 1 32161 CASAVA_Build 5 154802603 1D TTCCATGGAC T/- CCTTCCCAGT 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 T 1 0 32162 CASAVA_Build 5 154805220 1D ATGACAGCTT C/- TTATTGTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 C 1 0 32163 CASAVA_Build 5 154806598 2D AGTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1233 hom 19 5 12 2 T 12 10 32164 CASAVA_Build 5 154811305 1D GAAGGAGAGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 43 22 21 0 A 8 7 32165 CASAVA_Build 5 154812738 1D ATGCATAAAT G/- AACTCTCTCC 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 G 1 0 32166 CASAVA_Build 5 154813051 2D GGTTCTCCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 877 hom 28 5 11 14 T 14 12 32167 CASAVA_Build 5 154814155 1I TTGATTTCTC -/T TTCCTGTCTC 3070 hom 153 het 57 0 51 6 T 2 3 32168 CASAVA_Build 5 154815473 3D CAGCCAGCAG AGA/--- AGAAGAAGTG 3070 het 3070 ref 28 14 11 5 AGA 3 2 32169 CASAVA_Build 5 154820745 1D GCTGTGACGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 7 6 32170 CASAVA_Build 5 154823503 1D TCCTGAACTA G/- GTCACAAAAG 3070 het 3070 hom 48 19 27 2 G 2 1 32171 CASAVA_Build 5 154824511 1D CACTGGTTTT A/- AGCAATTTGA 3070 het 3070 hom 68 27 34 8 A 2 1 32172 CASAVA_Build 5 154829446 7D GCCTCATCCA CATGTTT/------- CAGTACACCC 3070 het 3070 ref 27 13 13 2 CATGTTT 1 0 32173 CASAVA_Build 5 154832324 7D GGGTCGAGCC TGGATGT/------- TCCCACGATC 3070 het 3070 hom 40 18 18 7 TGGATGT 1 0 32174 CASAVA_Build 5 154836322 1D AGTAAGTTTT G/- GGGTGGTTCA 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 G 4 3 32175 CASAVA_Build 5 154836995 1I ATGCAGCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 9 10 32176 CASAVA_Build 5 154841057 1D AAGGATTTAT C/- CATGGGTATA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 C 2 1 32177 CASAVA_Build 5 154845370 2I TTCTCCAGAC --/TG TTGTGGGATT 3070 het 3070 hom 51 21 21 9 TG 0 1 32178 CASAVA_Build 5 154850376 4D AAATCTACTT TGTC/---- TGATAAGTAG 3070 het 3070 hom 33 11 19 7 TGTC 1 0 32179 CASAVA_Build 5 154851040 1D GTTGTCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 601 hom 37 8 13 16 T 13 12 32180 CASAVA_Build 5 154851990 2I AGGAAAAGCC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 50 24 24 2 AG 6 7 32181 CASAVA_Build 5 154852365 4D AGGAAAAGAA AGTT/---- AAAGACTGTA 3070 het 3070 ref 36 24 12 0 AGTT 1 0 32182 CASAVA_Build 5 154854000 4D TCATGGAGAT AGAG/---- AGAAGAATTA 3070 het 3070 ref 35 23 9 4 AG 3 1 32183 CASAVA_Build 5 154855256 1D TTTCTTGGAA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 8 7 32184 CASAVA_Build 5 154856731 1I CCACTTAGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 7 8 32185 CASAVA_Build 5 154862861 1D TGCTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1489 hom 28 5 16 9 A 11 10 32186 CASAVA_Build 5 154867991 1D AACCTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 12 9 T 13 12 32187 CASAVA_Build 5 154892429 1D GCCACATGCC T/- TTTTTTCCTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 6 32188 CASAVA_Build 5 154897381 1I AATCAACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 11 12 32189 CASAVA_Build 5 154900903 2I ACTTAGTAGA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 17 10 12 AC 8 9 32190 CASAVA_Build 5 154901228 1I TTGCTTGAAT -/A ATTGCCTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 1 2 32191 CASAVA_Build 5 154905356 1I TAAAATTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 T 9 10 32192 CASAVA_Build 5 154906283 4I CAAAATATAC ----/TTAT TTGTCTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TTAT 0 1 32193 CASAVA_Build 5 154910463 1D TTGAAATGGA G/- TCAGAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 G 1 0 32194 CASAVA_Build 5 154911164 1I GTCTGTGGAG -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 6 7 32195 CASAVA_Build 5 154916682 1I TTTGCTGTTT -/C CCTTTAATCC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 2 3 32196 CASAVA_Build 5 154926229 3I AATCCTAACG ---/ACA ACAACAACAA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 ACA 3 4 32197 CASAVA_Build 5 154927980 4I GTTAAAAGAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AAAT 3 4 32198 CASAVA_Build 5 154928698 4D ATATGTAAGA ATGT/---- ATGTATGTAT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 ATGT 3 2 32199 CASAVA_Build 5 154934705 1D CAAACAAACC A/- AAAAAAAAAA 2638 het 308 hom 14 1 9 4 A 16 15 32200 CASAVA_Build 5 154935129 5D TCTCTGCTTG AGTGT/----- TGGACACTCT 3070 hom 75 het 28 0 26 5 AGTGT 1 0 32201 CASAVA_Build 5 154939422 3D GGATGTAGAA ATG/--- ATGAATTCAG 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 ATG 2 1 32202 CASAVA_Build 5 154939502 2D TTAATCTGTT TC/-- TCTCTTTCAC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TC 3 2 32203 CASAVA_Build 5 154944727 2I GGGCAATACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 38 0 26 12 T 12 14 32204 CASAVA_Build 5 154948006 1I AACTTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 894 hom 42 3 33 6 A 11 12 32205 CASAVA_Build 5 154959752 1I AGCCAGTCAA -/T TAAGGAACAA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 T 1 2 32206 CASAVA_Build 5 154970639 1D AGAAAATAAT A/- ATGGCAGTCA 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 A 2 1 32207 CASAVA_Build 5 154989465 1D CCTCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2001 het 1026 hom 27 8 8 11 A 19 18 32208 CASAVA_Build 5 155000032 1D TTTTGATGGG T/- TTTTTTTTTT 2930 het 79 hom 15 1 9 5 T 13 12 32209 CASAVA_Build 5 155010774 1D TACTATTTAC A/- AAAAAATAAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 7 6 32210 CASAVA_Build 5 155032477 2D CTGTAGAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 76 het 37 0 25 12 AC 9 8 32211 CASAVA_Build 5 155032888 3D AAATGAACAC ATA/--- ATAATTGTAG 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 ATA 2 1 32212 CASAVA_Build 5 155042645 3D AAAAAAATTA TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 hom 93 het 36 0 30 8 TTC 3 2 32213 CASAVA_Build 5 155044502 1D TTTCTACTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 51 het 48 1 34 13 T 9 8 32214 CASAVA_Build 5 155045886 1I GCATAGTTGA -/G GTCTTGAGAC 3070 hom 132 het 48 0 44 4 G 1 2 32215 CASAVA_Build 5 155046625 1D AAATAAAATT A/- AAAATATGAG 2119 het 2119 ref 22 14 6 2 A 5 4 32216 CASAVA_Build 5 155051054 1I TTTCTACTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 9 10 32217 CASAVA_Build 5 155055550 1D TACAGTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 229 hom 43 2 33 8 T 11 10 32218 CASAVA_Build 5 155060609 1I AAAAATTGTA -/T TTAATTCAGG 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 2 3 32219 CASAVA_Build 5 155061630 1I TCTCTAGGAT -/C CATATGGTTT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 C 1 2 32220 CASAVA_Build 5 155081991 3I TTAATAGTTT ---/TTA TTGTTAGATG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 TTA 0 1 32221 CASAVA_Build 5 155100451 1D GTTTGTATCA T/- TAGGTCTGTT 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 2 1 32222 CASAVA_Build 5 155106146 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2155 hom 26 8 13 5 A 9 10 32223 CASAVA_Build 5 155127852 8D TTTTGTTTTG TTTTTGTT/-------- TTGTTGTTGT 1469 het 1469 ref 37 13 11 15 TTTTTGTT 1 0 32224 CASAVA_Build 5 155127881 1I GTTGTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 30 10 5 15 T 10 11 32225 CASAVA_Build 5 155138220 9I AAGCTATTGC ---------/AACCACTGT TTAAAATGCA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 AACCACTGT 0 1 32226 CASAVA_Build 5 155160176 1I GCTTATAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 44 0 33 11 T 9 10 32227 CASAVA_Build 5 155182150 1D GGAACAAAGG A/- AAAAATCTAT 3070 het 3070 ref 45 23 22 0 A 6 5 32228 CASAVA_Build 5 155182893 1D AGTGAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 1952 het 773 hom 27 5 9 14 A 19 18 32229 CASAVA_Build 5 155189938 3I TGGTGTCTCC ---/TCT TCTTCTTATA 3070 hom 92 het 43 0 32 11 TCT 2 3 32230 CASAVA_Build 5 155192305 4D AAAAAATTGT TGAG/---- TGAGTGAGTG 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 TGAG 3 2 32231 CASAVA_Build 5 155193786 2I CCTTTAAGAC --/TG TAAATACTCC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TG 0 1 32232 CASAVA_Build 5 155199674 1D TGTGTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 12 11 32233 CASAVA_Build 5 155202402 1D TGAAAATTTT A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 7 6 32234 CASAVA_Build 5 155203704 1I TCAAAAGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 413 hom 35 1 29 5 A 9 10 32235 CASAVA_Build 5 155208607 1I GGCAAATATA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 T 7 8 32236 CASAVA_Build 5 155218531 1I GCAATGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 643 hom 31 2 23 6 T 11 12 32237 CASAVA_Build 5 155224860 1D AATTTATACA T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 7 6 32238 CASAVA_Build 5 155227645 1D GAAGATGATC T/- TTTTTTTTTT 1003 het 1003 ref 37 22 3 12 T 12 11 32239 CASAVA_Build 5 155234592 1D CAAAACTGGG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 A 8 7 32240 CASAVA_Build 5 155241021 1I CATTATGTCT -/A AAAACAATGT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 4 5 32241 CASAVA_Build 5 155245051 1D TCATCAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 456 hom 23 1 16 6 A 10 9 32242 CASAVA_Build 5 155300443 3D AAAACAAACA AAC/--- AACAACAACA 2016 het 2016 ref 14 6 5 4 AAC 7 6 32243 CASAVA_Build 5 155302289 5I GATTTCAGAG -----/GAACA GAACAGAACA 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 GAACA 2 3 32244 CASAVA_Build 5 155303356 1I TGTACACACC -/A AACACAATTT 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 A 2 3 32245 CASAVA_Build 5 155304509 1D CAAAAAAAAA T/- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 1 0 32246 CASAVA_Build 5 155316386 2D GGACTCAGGG CC/-- CCCCCCCCCG 2713 het 2712 ref 23 8 7 8 C 11 9 32247 CASAVA_Build 5 155375490 2D ACATATATTT TA/-- TATATATATA 2577 het 2418 hom 19 7 7 5 TA 8 7 32248 CASAVA_Build 5 155382932 2I TGTTGCCATG --/AA AACTGTGCTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 2 4 32249 CASAVA_Build 5 155384546 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 506 hom 31 3 20 9 A 15 14 32250 CASAVA_Build 5 155443185 1D ACCCGGCCCA T/- TTTTTTTTTT 1755 het 1056 hom 21 7 7 7 T 15 14 32251 CASAVA_Build 5 155444173 1D TATTCTAAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 50 29 15 6 T 9 8 32252 CASAVA_Build 5 155444688 1D GGTTTACTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 23 12 10 T 10 9 32253 CASAVA_Build 5 155459512 1D ATTGTCAAAA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 T 7 6 32254 CASAVA_Build 5 155462936 10D GAATTACTTT GACATTACAA/---------- GACATTACAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 5 GACATTACAA 2 1 32255 CASAVA_Build 5 155471254 4D GAAAGAACTG AGAA/---- AGAAAAGCAG 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 AGAA 2 1 32256 CASAVA_Build 5 155488069 1D GATGTCTAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 A 9 8 32257 CASAVA_Build 5 155496599 1D GAGGAAAGGA G/- CAAAAGTTGA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 G 1 0 32258 CASAVA_Build 5 155498953 1I GCTTTTACAG -/C TTCAAATTCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 0 1 32259 CASAVA_Build 5 155511421 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 T 10 9 32260 CASAVA_Build 5 155525677 1I CCGGTGTCTG -/T TATTATTTGT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 1 2 32261 CASAVA_Build 5 155532346 1D ATTTAGTGAT C/- CCTGGGAGGT 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 C 3 2 32262 CASAVA_Build 5 155533412 1D ATAGTAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 10 9 32263 CASAVA_Build 5 155534999 1D CTCTACTTAG A/- AAAAAAAAAT 2925 het 2925 ref 33 20 8 6 A 10 9 32264 CASAVA_Build 5 155535454 5I GTACCCTAAA -----/TTACT TTAAGGAGTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TTACT 0 1 32265 CASAVA_Build 5 155535537 1I TCTGTGGATC -/T TTTTTTTTTT 3048 het 3048 ref 26 16 7 3 T 11 12 32266 CASAVA_Build 5 155539990 1D ATAAGAACTC A/- AAAAAATAAA 2760 het 2760 ref 21 13 7 1 A 7 6 32267 CASAVA_Build 5 155540436 1D GGAAGGCAAA G/- GGTAGAACTG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 G 3 2 32268 CASAVA_Build 5 155541892 1D AACAGAAAAT A/- AGCTGGGCTG 2804 het 2804 ref 25 12 7 6 A 2 1 32269 CASAVA_Build 5 155548254 3D12M20D ACCACCCCAA CCGCCCCCCCCGACACACATACACACAATCCCTCT/---CCCCCCCCGACA-------------------- CTACATGCAC 3070 het 3070 hom 22 12 13 11 N/A 0 0 32270 CASAVA_Build 5 155551146 1D TGTCTAGTTC T/- TTCTTTGTTG 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 3 2 32271 CASAVA_Build 5 155561310 1D AATTCCCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 12 13 T 13 12 32272 CASAVA_Build 5 155565581 2D ATATATATTT TA/-- TATATATATA 1712 het 802 hom 11 3 7 2 TA 6 5 32273 CASAVA_Build 5 155571196 1D ACTCAGACTC A/- AAAAAAAAAA 700 het 700 ref 15 8 3 4 A 17 16 32274 CASAVA_Build 5 155594834 8I GTGCATGTGG --------/CCTACTGA CTTGGGACTC 3070 hom 138 het 49 0 47 2 CCTACTGA 0 1 32275 CASAVA_Build 5 155602265 1D AAACATTTAA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 T 4 3 32276 CASAVA_Build 5 155611111 1I TTTATACTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 9 8 8 T 11 12 32277 CASAVA_Build 5 155615787 2D ATAAAAACTC TG/-- TTATTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TG 1 0 32278 CASAVA_Build 5 155630400 1D GTTAAGCCAC A/- ATATACAGTG 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 A 2 1 32279 CASAVA_Build 5 155660537 1I TTGGTCTCTA -/C TGGCATGGCA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 C 0 1 32280 CASAVA_Build 5 155674854 1I TTGAGTCTGA -/T TTTTTTTTTT 2926 het 2926 ref 29 16 9 4 T 12 13 32281 CASAVA_Build 5 155684953 1I TTGCTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 10 11 32282 CASAVA_Build 5 155697755 4I CACTGGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 TTTG 3 4 32283 CASAVA_Build 5 155698549 2I GTCTTGACTC --/TG TAATGCTATG 3070 het 3070 hom 66 28 31 7 TG 0 1 32284 CASAVA_Build 5 155702195 2D GATTGATGAC TT/-- TGTTGTGTTC 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 T 3 1 32285 CASAVA_Build 5 155702701 1I TCTAAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 11 12 32286 CASAVA_Build 5 155704000 1I CATCAGTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 9 10 32287 CASAVA_Build 5 155722626 1D TGATTTTACC T/- TTTTTTTTTA 1099 het 1099 ref 42 31 3 8 T 10 9 32288 CASAVA_Build 5 155723958 1D CAGGGCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 T 11 10 32289 CASAVA_Build 5 155741180 1D GCATATTTAT A/- AAATTAATCA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 4 3 32290 CASAVA_Build 5 155749492 2I ATATTATGTT --/AC ACACACACAC 3070 het 2610 hom 30 10 10 10 AC 8 9 32291 CASAVA_Build 5 155749803 1I TCTGTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 A 10 11 32292 CASAVA_Build 5 155761350 1D CCCTCTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 47 14 29 4 A 8 7 32293 CASAVA_Build 5 155763432 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 8 13 9 T 9 10 32294 CASAVA_Build 5 155771497 3I GTGAGTTAGG ---/GTT GTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 GTT 1 2 32295 CASAVA_Build 5 155800920 1I CTTGAGCAAA -/T TTAACATATG 3070 het 3070 hom 62 24 28 10 T 2 3 32296 CASAVA_Build 5 155815038 1D TTTCAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 37 0 27 10 T 13 12 32297 CASAVA_Build 5 155821812 2D AAAAGCTAAC TG/-- TGAAATGTTA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 TG 2 1 32298 CASAVA_Build 5 155827930 3D ACCTTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 25 1 14 11 A 21 18 32299 CASAVA_Build 5 155830555 2I CTAAGCCTTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 9 11 32300 CASAVA_Build 5 155833918 2D TGCAAGCACC GT/-- GTGTCAGGAT 3070 het 3070 ref 44 24 20 1 GT 3 2 32301 CASAVA_Build 5 155837274 3D GTATTTGAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 2631 het 1051 hom 23 5 9 10 A 19 16 32302 CASAVA_Build 5 155839632 8D TCTGACTGGG ATGGCTGA/-------- TGCAACAGCA 3070 het 3070 hom 47 16 23 9 ATGGCTGA 1 0 32303 CASAVA_Build 5 155843522 1D GGCTTTTGCA G/- CCTGATGTTA 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 G 1 0 32304 CASAVA_Build 5 155845944 1I GGGCACTTCC -/A AAAAACATCA 3070 het 3070 hom 50 17 26 7 A 5 6 32305 CASAVA_Build 5 155850076 2D GTAACATATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 41 7 12 23 A 13 11 32306 CASAVA_Build 5 155852885 3D ATACAATAAC TTG/--- TTGTTAAATA 3070 het 3070 ref 49 29 16 7 TTG 2 1 32307 CASAVA_Build 5 155882325 1D CCCAGCACTT A/- AAAAAAAAAA 2479 het 2479 ref 28 18 8 2 A 12 11 32308 CASAVA_Build 5 155885131 1I ATTTTGTTGA -/T TTTTTTTTTT 2182 het 2182 ref 29 18 6 5 T 11 12 32309 CASAVA_Build 5 155889100 1D TGTTGTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 A 11 10 32310 CASAVA_Build 5 155891381 1I AAGTAATGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 9 10 32311 CASAVA_Build 5 155893768 1I ATCATTCTTT -/A TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 0 1 32312 CASAVA_Build 5 155897433 2D GAATGGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 7 A 12 10 32313 CASAVA_Build 5 155905078 1I TGGGGGATGA -/G GGGGGTAGTT 3058 het 2572 hom 23 7 10 6 G 5 6 32314 CASAVA_Build 5 155906197 1D CTATAGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 10 9 32315 CASAVA_Build 5 155908209 1D TTTCCGTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 T 10 9 32316 CASAVA_Build 5 155918603 8I AGAATAGGAC --------/TAATAGAA TAAGAGCTCC 3070 het 3070 ref 73 33 34 6 TAATAGAA 0 1 32317 CASAVA_Build 5 155928684 1I TCCTCCCCTC -/T TTCTAGGTAC 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 2 3 32318 CASAVA_Build 5 155930959 1I TTTAAACATA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 8 9 32319 CASAVA_Build 5 155941661 1I GGGGGCTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 9 10 32320 CASAVA_Build 5 155944213 19D TGTGTGCTCC TGCTTCTTTCTGTCACCTA/------------------- TGCTTCTTTC 3070 het 3070 ref 39 28 13 7 TGCTTCTTTCTGTCACCTA 2 1 32321 CASAVA_Build 5 155945652 1I TACTTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 12 13 32322 CASAVA_Build 5 155957353 1D TTTTATAAAA G/- GTCTATTGAT 3070 het 3070 hom 31 10 17 5 G 2 1 32323 CASAVA_Build 5 155958969 1I ATAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 A 9 10 32324 CASAVA_Build 5 155961933 1I ATTCTAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 T 10 11 32325 CASAVA_Build 5 155967303 1I TTTTTCCCTC -/A ATTTCAGAGC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 1 2 32326 CASAVA_Build 5 155979162 1I TCCTTTCCTA -/T TTAATTATAT 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 T 2 3 32327 CASAVA_Build 5 155980782 1I GAAAGTTAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 8 9 32328 CASAVA_Build 5 155981108 1D CATTTACGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 10 9 32329 CASAVA_Build 5 155982129 1D CAAAGACAGA T/- TTTTTTTTTG 2349 het 1314 hom 10 3 5 2 T 10 9 32330 CASAVA_Build 5 155986377 1D ATAATCCACT C/- CCCCCCACCC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 C 7 6 32331 CASAVA_Build 5 155991932 1I TGCAAAGCAA -/G TAAGTGTTCT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 G 0 1 32332 CASAVA_Build 5 155992597 1D TTATGAGATC T/- TGCAGCTTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 2 1 32333 CASAVA_Build 5 156007233 7D GTGAATACAT AAATTGA/------- AAGAGGTTGG 3070 hom 72 het 26 0 25 5 AAATTGA 1 0 32334 CASAVA_Build 5 156011642 1D TTCTTGATTT G/- GGCTCTCAGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 3 2 32335 CASAVA_Build 5 156012889 3D GGGGTTTCAA CTT/--- CTTCCTGATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CTT 2 1 32336 CASAVA_Build 5 156041877 2D TGTATAGGTT TA/-- TTCTCGTTGA 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 TA 1 0 32337 CASAVA_Build 5 156042390 1I AACACTTAAT -/A AATGACTTTG 3070 het 3070 hom 55 22 24 9 A 2 3 32338 CASAVA_Build 5 156051556 2D GGAGAAGCTC TT/-- AATATATCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 2 0 32339 CASAVA_Build 5 156057533 1I AGGAGAAAGA -/G GGGGAGGAAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 G 4 5 32340 CASAVA_Build 5 156058862 3D GGAAAAGTGG AGT/--- AGAAGAAGGT 1801 het 1801 ref 32 23 6 5 AGT 1 0 32341 CASAVA_Build 5 156059343 1D GTACTTCCTG A/- AAGGTGAGAC 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 A 3 2 32342 CASAVA_Build 5 156062411 3D CTATCTTCTC AAT/--- GATGTTGAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 AAT 1 0 32343 CASAVA_Build 5 156062972 1D TATTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 31 19 3 9 T 13 12 32344 CASAVA_Build 5 156064116 4D CTATAGCTAG ATGA/---- ATGGGAAATG 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 ATGA 1 0 32345 CASAVA_Build 5 156067869 4D GCATTCTATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 33 1 25 9 A 16 12 32346 CASAVA_Build 5 156068254 4I TTCAAATACA ----/TTGT TTGTAAATTC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TTGT 1 2 32347 CASAVA_Build 5 156069423 1D GCCGCCCCCT C/- CCCCCCGACG 1727 hom 18 het 8 0 7 1 C 7 6 32348 CASAVA_Build 5 156087274 1D TTCTGTCTAT C/- TTGGTTTCTT 3070 het 3070 hom 43 20 23 0 C 1 0 32349 CASAVA_Build 5 156091213 16D5M5I TAGCATGCTG CCTCCAGCTTTGTTCTTTTTG-----/----------------TTTTGGTCAC TTTAGGCTAT 254 het 254 ref 21 22 1 3 N/A 0 0 32350 CASAVA_Build 5 156092438 9I AATTTATCTA ---------/TTCTAGATT TTCTAGTTCA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 TTCTAGATT 0 1 32351 CASAVA_Build 5 156095335 1D CGCTGCTTTG C/- CCCCTGGATT 3070 het 3070 ref 41 19 15 8 C 5 4 32352 CASAVA_Build 5 156101462 1I TGTTTTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1220 hom 35 6 13 16 T 13 14 32353 CASAVA_Build 5 156101615 1I CAGGCACCCA -/C CCACCACGCC 1891 het 1891 ref 14 8 4 2 C 2 3 32354 CASAVA_Build 5 156101927 1I GTCGACATAT -/A TTCAAACAAA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 0 1 32355 CASAVA_Build 5 156102093 1I AATCACCATC -/T TTCTTCCACC 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 2 3 32356 CASAVA_Build 5 156103487 2I5M4I5M4D5M2D ATATAATTAG --AGAAG----ATTATGTTCCTTCTTC/GAAGAAGGAACATAAT----CTTCT-- CTATTTTCTG 3070 het 3070 ref 39 20 20 6 N/A 0 0 32357 CASAVA_Build 5 156104743 2I GAAACTGGGA --/CC CCCCCCCAGT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 C 7 9 32358 CASAVA_Build 5 156106826 1I TGCAAAACTA -/T TCCTGGAAAA 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 T 1 2 32359 CASAVA_Build 5 156107806 1I CTCTGGAGGG -/T TGGTGGGTGT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 1 2 32360 CASAVA_Build 5 156108402 3I TTTTTTTTGA ---/GAT GATGGAGTCT 3070 het 2973 hom 39 8 23 8 GAT 1 2 32361 CASAVA_Build 5 156109847 9D ACATACTTAA TGGTAAATT/--------- TGGTAAATTG 3070 het 3070 ref 26 15 9 4 TGGTAAATT 2 1 32362 CASAVA_Build 5 156110693 4I TATGAAGTAT ----/AAAG AAAGAATTTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 AAAG 1 2 32363 CASAVA_Build 5 156117036 1I CTTGACCAGG -/T TTGTAAAGCA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 2 3 32364 CASAVA_Build 5 156118566 1I CTGTATGACA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 55 27 24 4 T 7 8 32365 CASAVA_Build 5 156122751 1I GTGTAATGAG -/A AGTGAAGTAG 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 1 2 32366 CASAVA_Build 5 156130560 5D TTGTTTTCCT TTAAG/----- TTAATTTTCA 3070 het 3070 hom 27 9 15 5 TTAAG 1 0 32367 CASAVA_Build 5 156136014 1I ACCAACCAAA -/T TTTTTTTTTT 1593 het 1593 ref 25 12 6 7 T 13 14 32368 CASAVA_Build 5 156139985 1D AGACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2382 hom 30 9 11 11 A 13 12 32369 CASAVA_Build 5 156155144 4D GGCACTTTTC TCTG/---- TCTTAGAACT 3070 het 3070 ref 45 21 20 5 TCTG 1 0 32370 CASAVA_Build 5 156157011 3I CTCATTGCAT ---/ACA AAAATGACTT 3070 het 3070 hom 57 27 28 2 ACA 0 1 32371 CASAVA_Build 5 156170648 1D TCAATGCCAT C/- CCCATTAAGC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 C 4 3 32372 CASAVA_Build 5 156177509 1D ATATCGCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 12 9 10 T 10 9 32373 CASAVA_Build 5 156189315 1I TTAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 31 3 19 9 A 17 18 32374 CASAVA_Build 5 156190270 1D AATTGATGTC T/- TTTTCAAAAG 3070 het 3070 ref 39 18 11 11 T 5 4 32375 CASAVA_Build 5 156218914 2D TAGGTACTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2856 het 1179 hom 19 8 9 2 A 16 14 32376 CASAVA_Build 5 156224843 1I TATTACAACT -/A AAAAAAAAAA 2841 het 2841 ref 40 17 7 16 A 11 12 32377 CASAVA_Build 5 156229963 1D AGCTCCAGAG C/- CCTGCCTCTT 3070 het 3070 hom 45 13 21 12 C 3 2 32378 CASAVA_Build 5 156231392 4D GAAAATTCCC AAAA/---- AAGAGATTGC 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 A 6 2 32379 CASAVA_Build 5 156235936 6D CCAGCCTGTC TCCTAT/------ TCCTAAAGAT 3070 het 3070 hom 41 16 24 2 TCCTAT 1 0 32380 CASAVA_Build 5 156242670 1I GAAGACTGCC -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 T 6 7 32381 CASAVA_Build 5 156259663 1I AACAAAAAAA -/C AAAAACCCAA 3070 het 2708 hom 25 9 11 5 C 0 1 32382 CASAVA_Build 5 156260886 4I AGAGAGAGAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 2363 het 1908 hom 23 7 9 7 AGAA 2 3 32383 CASAVA_Build 5 156266095 1D CAAAAATATG T/- TTTTTACCAG 1804 het 1804 ref 25 16 5 6 T 6 5 32384 CASAVA_Build 5 156266428 1I GGTGGAGGAC -/A CCTGTAATCC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 0 1 32385 CASAVA_Build 5 156270774 2I GTTGCCAGGG --/CT CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 CT 1 2 32386 CASAVA_Build 5 156283129 1I AAGAAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2658 hom 26 9 14 3 T 10 11 32387 CASAVA_Build 5 156303650 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 688 het 688 ref 23 8 3 12 A 13 14 32388 CASAVA_Build 5 156309709 1D ACCTGGCCAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 65 het 31 0 20 11 T 9 8 32389 CASAVA_Build 5 156313762 1D CCCCTAGATA C/- GTAGCAGCTG 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 C 1 0 32390 CASAVA_Build 5 156318563 1D ATAAATAAAT A/- AAACAATTTC 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 A 4 3 32391 CASAVA_Build 5 156319686 1D GGCACCTATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 10 9 32392 CASAVA_Build 5 156321998 1D GTATCCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 10 9 32393 CASAVA_Build 5 156323273 1D CCCTGTCCCC T/- GGCCTCCTTG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 1 0 32394 CASAVA_Build 5 156340738 12D TCTTTCTCTC TCTTTCTTTCTT/------------ TCTTTCTTTC 2711 het 23 hom 16 1 7 9 TCTT 6 3 32395 CASAVA_Build 5 156347966 1I CCTTCATGCT -/A AAAAACTCTC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 5 6 32396 CASAVA_Build 5 156354330 1D GTTTAAATTT C/- CCTAATTGTC 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 C 3 2 32397 CASAVA_Build 5 156361372 4I AAAAGACAAA ----/CAAC CCCATTAAAA 2435 het 2435 ref 17 10 5 2 CAAC 0 1 32398 CASAVA_Build 5 156375411 2I AAAGTCAAAC --/TT ATCTGTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 0 2 32399 CASAVA_Build 5 156378983 1D TAAGCATAAG A/- AATATGTTTA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 3 2 32400 CASAVA_Build 5 156379970 1I GAGCTGACCA -/T GGTTATGCTC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 0 1 32401 CASAVA_Build 5 156392752 1D TCATTTTTTT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 8 7 32402 CASAVA_Build 5 156394399 1D CTAATCCATT A/- AACCTTGAGT 3070 het 3070 ref 23 15 7 1 A 3 2 32403 CASAVA_Build 5 156394768 1D TAATAATCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 10 9 32404 CASAVA_Build 5 156399888 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1893 hom 22 8 10 4 A 13 12 32405 CASAVA_Build 5 156401078 2I CAGAACAAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 61 het 27 0 19 8 CT 1 2 32406 CASAVA_Build 5 156402727 3D TTTTATATTC AGA/--- AGGAGTAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 20 5 AGA 1 0 32407 CASAVA_Build 5 156404435 1I ACCGGAGTCA -/G ATAAAATTTC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 0 1 32408 CASAVA_Build 5 156412136 15D ACAGTTGTCG TTGGAACAGTCGTCA/--------------- TTGGAACAGT 3070 hom 135 het 71 0 42 39 TTGGAACAGTCGTCA 1 0 32409 CASAVA_Build 5 156412800 1I CTGGGCAACA -/G GGTGAAACCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 2 3 32410 CASAVA_Build 5 156415975 1D GAATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2782 het 37 hom 11 1 7 3 T 12 11 32411 CASAVA_Build 5 156419410 1D CCCTCTCTGC A/- AAAAAAACGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 7 32412 CASAVA_Build 5 156420491 1I GCATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 665 hom 37 3 20 14 T 12 13 32413 CASAVA_Build 5 156426096 1I CCCATCTTCC -/A AAAAAAAAAA 3065 het 329 hom 20 4 11 5 A 10 11 32414 CASAVA_Build 5 156429223 6D ATTTGTTTTG TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 3070 hom 45 het 30 0 16 14 TTTTGT 4 3 32415 CASAVA_Build 5 156431434 4I CATCTACGAA ----/AAAC AAACAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 AAAC 1 2 32416 CASAVA_Build 5 156433447 1D TCAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 12 11 32417 CASAVA_Build 5 156434605 1D AATTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 2811 het 2811 ref 18 8 9 2 A 11 10 32418 CASAVA_Build 5 156437323 3I CCATATTGAA ---/ATG ATAATAGTTT 3070 het 3070 ref 24 13 7 4 ATG 0 1 32419 CASAVA_Build 5 156437762 1D TTAAATAGCC T/- TTTTTTTTTC 2476 het 2476 ref 22 11 7 4 T 10 9 32420 CASAVA_Build 5 156447032 1D GCCAAGAAAT A/- GCAATAAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 0 32421 CASAVA_Build 5 156452670 2D ATAATAATAA AT/-- ATATATATAT 772 het 772 ref 12 6 3 3 AT 7 6 32422 CASAVA_Build 5 156453631 1D AACACACTTC T/- TTTTTTTTTT 1494 het 1494 ref 34 18 4 12 T 17 16 32423 CASAVA_Build 5 156463635 1D TTTACAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 45 0 35 10 A 10 9 32424 CASAVA_Build 5 156464655 2D AGATTTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 16 14 32425 CASAVA_Build 5 156465719 2I TTTTCTTTTC --/TT TTTTCTTTTT 1025 hom 34 het 16 0 11 5 T 4 6 32426 CASAVA_Build 5 156467449 1D TTTTCCTCTG C/- CCCCCCCCCT 3070 het 2503 hom 31 9 9 14 C 10 9 32427 CASAVA_Build 5 156470143 1I TTACAGGCAT -/G AGCCACCGCG 3070 hom 51 het 19 0 15 4 G 0 1 32428 CASAVA_Build 5 156471884 5D TTAAATTTGT TTTAA/----- TTTATTTTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TTTAA 1 0 32429 CASAVA_Build 5 156474102 1D AATACGAATT A/- AAAAATAAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 6 5 32430 CASAVA_Build 5 156476707 3D CTAGGACTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 30 1 21 8 A 17 14 32431 CASAVA_Build 5 156477025 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 231 hom 16 1 14 1 A 13 12 32432 CASAVA_Build 5 156478843 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 100 het 39 0 36 3 T 9 8 32433 CASAVA_Build 5 156489820 4D AAGTAGGTGG GATT/---- GATTACAGGT 2820 het 2820 ref 14 7 7 0 GATT 2 1 32434 CASAVA_Build 5 156491695 5D AACTACCCAG AGTTA/----- AGTTAGGGTA 127 het 98 hom 40 1 2 37 AGTTA 2 1 32435 CASAVA_Build 5 156497682 1D CTAAAATTAA T/- GTCTGTAACT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 1 0 32436 CASAVA_Build 5 156499179 4D TAAAACTAAC ATTT/---- ATGATAGGGA 3070 het 3070 ref 34 15 12 8 ATTT 1 0 32437 CASAVA_Build 5 156511759 1D AATTAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2088 het 1809 hom 23 9 7 7 T 15 14 32438 CASAVA_Build 5 156515869 6D ACAAAAAAAA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1739 het 1739 ref 37 12 9 16 T 22 16 32439 CASAVA_Build 5 156526448 1D AAGCAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1930 hom 26 5 15 6 T 12 11 32440 CASAVA_Build 5 156531644 4D TCCAAATTTT AGAG/---- AGCTTACAAT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 AG 3 1 32441 CASAVA_Build 5 156557213 5D TCTTCCAAAA ATGGG/----- ATGATGCTCC 3070 het 3070 ref 43 21 19 6 ATGGG 1 0 32442 CASAVA_Build 5 156557713 1D ATCTCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 13 12 32443 CASAVA_Build 5 156559688 5I AAGGAAAGAA -----/GAAAG GAAAGGAAAG 3070 hom 96 het 37 0 30 7 GAAAG 2 3 32444 CASAVA_Build 5 156560665 8I TAAGATAATA --------/TACAATAT TACAATATTA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 TACAATAT 1 2 32445 CASAVA_Build 5 156570121 2D AATCTCTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 1581 het 685 hom 13 4 6 3 T 14 12 32446 CASAVA_Build 5 156573142 1I AACTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 9 10 32447 CASAVA_Build 5 156577354 1I CTGTTGTTTT -/C CCTGGGCCCT 3070 hom 68 het 25 0 21 4 C 2 3 32448 CASAVA_Build 5 156578108 1I AGAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAC 3070 het 597 hom 35 5 24 6 G 0 1 32449 CASAVA_Build 5 156583207 1I CCTTTTAAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 9 10 32450 CASAVA_Build 5 156592184 12D AAAGAGAGGA AGGGAGGGAGGG/------------ AGGGAGGGAA 3070 het 3070 hom 29 9 15 8 AGGG 5 2 32451 CASAVA_Build 5 156599106 1I ATAAAACACA -/T TGTTTCTAGC 3070 het 3070 hom 36 10 17 9 T 1 2 32452 CASAVA_Build 5 156645313 1I CAAATACCTT -/C CAGGCTATTC 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 1 2 32453 CASAVA_Build 5 156650147 1D TCAGCAAATT G/- CCTCTTTCCA 3070 hom 104 het 39 0 33 7 G 1 0 32454 CASAVA_Build 5 156652403 4I GTTGTGACAC ----/TGCT TGCCAGATTA 3070 het 3070 ref 51 32 15 4 TGCT 0 1 32455 CASAVA_Build 5 156654442 1I CCGGGCCATT -/C CCCAGGTGAG 3070 hom 100 het 45 0 32 13 C 3 4 32456 CASAVA_Build 5 156658760 19I TGCACCCTAG -------------------/AGTCTGTTCTCCCCACAGT AGCCAATGTG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 AGTCTGTTCTCCCCACAGT 0 1 32457 CASAVA_Build 5 156664236 4D TGGTTGGATA TTTG/---- TTTGCTAAAC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TTTG 2 1 32458 CASAVA_Build 5 156684338 1I ATGAACACAC -/T TTTTTTTTTT 2613 het 519 hom 29 3 10 16 T 16 17 32459 CASAVA_Build 5 156702131 2I TGTTTTATTT --/AA GTCATGCAAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 0 2 32460 CASAVA_Build 5 156728257 1I TCTGAAAAAC -/A AACCTGCTAG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 2 3 32461 CASAVA_Build 5 156728301 26D AAAATGGTCT GACAGTTAAGAGTCACTGGTTCCACA/-------------------------- GACAAGACCA 1805 het 1805 ref 25 24 4 8 GACAGTTAAGAGTCACTGGTTCCACA 1 0 32462 CASAVA_Build 5 156728489 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 392 het 392 ref 23 8 3 12 T 14 13 32463 CASAVA_Build 5 156731505 20D TCTCTTGTAG TTATCATATAGTGGGAATAA/-------------------- TAAACATTAG 3070 het 3070 ref 43 26 22 1 TTATCATATAGTGGGAATAA 1 0 32464 CASAVA_Build 5 156735705 1I CTGCCCCTCC -/T TCTCAGGCCC 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 1 2 32465 CASAVA_Build 5 156751419 1I CTATGTTTAA -/T CTTTTTAGAA 3070 het 3070 hom 49 24 24 1 T 0 1 32466 CASAVA_Build 5 156775144 2D TTATCTAGAC AA/-- AGATTTTATG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 3 1 32467 CASAVA_Build 5 156775531 1I AAATTTTTTT -/A TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 0 1 32468 CASAVA_Build 5 156782501 1D62M1D TTAACAACTG AAAAAAAGAGATTCCCAGATAAATAGAAGTTGAGGGAGTTTGTGACCACTAGACCTGTCCTGCA/-AAAAAAGAGATTCCCAGATAAATAGAAGTTGAGGGAGTTTGTGACCACTAGACCTGCCCTGC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 26 15 12 N/A 0 0 32469 CASAVA_Build 5 156787110 1D TCCAGGAGCT G/- GTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 G 2 1 32470 CASAVA_Build 5 156791852 1D ATGCAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 44 1 36 7 A 12 11 32471 CASAVA_Build 5 156794500 2D TACACACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2676 hom 31 12 14 5 T 12 10 32472 CASAVA_Build 5 156795953 1I AACTGTAAGT -/C CAATTAAACC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 1 2 32473 CASAVA_Build 5 156798954 1I GACTGTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2795 hom 39 13 19 7 A 14 15 32474 CASAVA_Build 5 156800935 1D GGAGAACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 11 10 32475 CASAVA_Build 5 156801124 1D TTTTTAGAAT A/- AAAAAGATTA 3070 het 3070 ref 39 22 17 0 A 6 5 32476 CASAVA_Build 5 156803560 1I TACAAACAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 49 18 17 14 A 8 9 32477 CASAVA_Build 5 156812234 1D GGGACGATCG T/- TAACTACAGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 T 2 1 32478 CASAVA_Build 5 156847249 1I CACCAGGGCT -/G GGTGGGGGAG 1690 het 1690 ref 19 11 5 3 G 2 3 32479 CASAVA_Build 5 156848616 8I ACTCCATCTC --------/AAAAAGAA AAAAAGAAAA 3070 het 1515 hom 18 4 12 2 AAAAAGAA 1 2 32480 CASAVA_Build 5 156857795 2D CCACCGGCCA CT/-- CTCAGGCCAA 2589 het 731 hom 22 3 10 10 CT 2 1 32481 CASAVA_Build 5 156864430 5I CTCATGTCCA -----/GCCGG GCGCGGTGGC 3070 het 2540 hom 16 6 8 2 GCCGG 0 1 32482 CASAVA_Build 5 156881895 5I TTTCATCAAC -----/TTTTA TTTTAAGTTC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TTTTA 1 2 32483 CASAVA_Build 5 156886211 1I ATTGGTGTCA -/T TTTTTTTTTT 2512 het 2373 hom 24 8 9 7 T 14 15 32484 CASAVA_Build 5 156889816 1D ATTTTATGGG C/- ACTCTCACCC 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 C 1 0 32485 CASAVA_Build 5 156899352 1I ATTTGAGGGA -/G GGAGTCACCC 3070 het 3070 ref 55 22 21 12 G 2 3 32486 CASAVA_Build 5 156901846 1D TTTTTAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2452 hom 31 12 14 5 T 12 11 32487 CASAVA_Build 5 156909848 1I TTATCCCAGG -/C CTCTCTCCTG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 C 1 2 32488 CASAVA_Build 5 156919288 1I AGAACATAGA -/G GAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 44 14 17 13 G 1 2 32489 CASAVA_Build 5 156926075 1D CTCTTTTTAC T/- TTATTATTGT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 3 2 32490 CASAVA_Build 5 156942693 48D ACAATTGTAA GTACTTGTGTATCTAAACATAGAAAGTACAACGCAGTGTGCTACGACG/------------------------------------------------ GTACTTGTGT 2550 het 2550 ref 48 28 6 32 GTACTTGTGTATCTAAACATAGAAAGTACAACGCAGTGTGCTACGACG 1 0 32491 CASAVA_Build 5 156944210 2D ATAAAGTCAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 15 14 10 TA 6 5 32492 CASAVA_Build 5 156945197 1I ACTTTACAGA -/T TGAGGCAACT 3070 het 3070 ref 54 26 25 3 T 1 2 32493 CASAVA_Build 5 156947093 3I GTATTTATTT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 TTA 5 6 32494 CASAVA_Build 5 156954313 1D CAGTTGCTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 T 10 9 32495 CASAVA_Build 5 156961307 1D TTCCTAGGCT C/- TTAAAAACCA 1944 het 1944 ref 20 11 6 3 C 1 0 32496 CASAVA_Build 5 156961834 1D TTTTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 1263 het 1263 ref 28 21 4 3 A 13 12 32497 CASAVA_Build 5 156968394 1I AGTTCTCCAT -/A AAAAAACCTC 2267 het 2267 ref 26 10 7 9 A 6 7 32498 CASAVA_Build 5 156970461 1D TTTGAGTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 10 9 32499 CASAVA_Build 5 156973142 3D TGGCTTCTTT TTC/--- TTCTTCTTCT 2542 het 2542 ref 45 15 11 20 TTC 5 4 32500 CASAVA_Build 5 156977235 1I TCCAGAGTCA -/T TTTGTTAGAA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 3 4 32501 CASAVA_Build 5 156983163 1I GCACATGTAT -/C CCAGAACTTA 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 C 2 3 32502 CASAVA_Build 5 156994066 2D GCCTCCCAAA GT/-- GTGTTGGGAT 2370 het 2370 ref 20 8 6 6 GT 3 2 32503 CASAVA_Build 5 157006116 3D TTTTCTTAAC ATT/--- GTTGTTCCAA 3070 het 3070 hom 39 15 21 5 ATT 1 0 32504 CASAVA_Build 5 157008522 2D AATGTGCCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 AC 8 7 32505 CASAVA_Build 5 157012939 2D TCTCCCACTT TA/-- GACTATAAAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 TA 1 0 32506 CASAVA_Build 5 157021476 5I AAAGTGTCCC -----/CTTTT CTTCTATTCT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 CTTTT 0 1 32507 CASAVA_Build 5 157031637 28D CTGGAATCCC CATCTCCACTGACATTTTCTCAGAATGA/---------------------------- CATCTCCACT 2992 het 2992 ref 37 21 7 11 CATCTCCACTGACATTTTCTCAGAATGA 1 0 32508 CASAVA_Build 5 157046087 1D CTCAGCACAG A/- CTCTATGGGT 2540 het 2540 ref 26 15 7 4 A 1 0 32509 CASAVA_Build 5 157048390 10D TGGGCAAAAA GAGAGAAACT/---------- CCGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 5 GAGAGAAACT 1 0 32510 CASAVA_Build 5 157051346 2I CTGCCCACTG --/AT ATGTGAGAAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 AT 1 2 32511 CASAVA_Build 5 157064318 1D CTTTTTTTTT C/- CCCTCTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 C 4 3 32512 CASAVA_Build 5 157066882 1I TTCTTTTATA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 6 7 32513 CASAVA_Build 5 157071265 2D28M3D TCTTTCTTTC TTTCTCTTTCTTTTTCCTTTCTTTTCTTCTGTC/--TCTCTTTCTTTTTCCTTTCTTTTCTTCT--- TTTTTTTCTT 1087 het 1087 ref 35 23 5 12 N/A 0 0 32514 CASAVA_Build 5 157071404 2D CACCTTTGTT TA/-- TGTTTCAAAC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TA 1 0 32515 CASAVA_Build 5 157073162 1D ACAAAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1842 hom 29 10 10 10 T 15 14 32516 CASAVA_Build 5 157073568 4I CTTCACACAA ----/TTGT TTGTCATCAG 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 TTGT 1 2 32517 CASAVA_Build 5 157088682 1D TGTTTTGGGG C/- CCTCTGAACC 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 C 3 2 32518 CASAVA_Build 5 157094526 1D CTTATCTCTA T/- TTTTTTTTTT 1397 het 1397 ref 21 10 3 8 T 15 14 32519 CASAVA_Build 5 157096358 3D ATGTAGAAAA TAG/--- TAGTTTCTAC 3070 het 3070 ref 47 31 13 5 TAG 2 1 32520 CASAVA_Build 5 157101162 1D TTCTGGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 11 10 32521 CASAVA_Build 5 157111171 1D TATCTTCTAT A/- ATATTTAAAG 3070 hom 123 het 43 0 42 2 A 2 1 32522 CASAVA_Build 5 157112913 5I TTTACCTTTG -----/AAGGA AAGAATTGAA 3070 het 3070 ref 63 29 25 9 AAGGA 0 1 32523 CASAVA_Build 5 157113509 1D28M3D TTACTCTGCC TTTTTTTTTTTCCCTGAAAAAGCTATACAAAT/-TTTTTTTTTTCCCTGAAAAAGCTATACA--- AATAATTTTA 3070 het 3070 hom 42 18 16 14 N/A 0 0 32524 CASAVA_Build 5 157120374 1D ACACCTGTCT A/- GAAAGTTAGA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 1 0 32525 CASAVA_Build 5 157132269 1I AGAATAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2349 hom 22 6 11 5 T 15 16 32526 CASAVA_Build 5 157134314 1D CTTATTGGCA C/- CTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 2 1 32527 CASAVA_Build 5 157144856 1D GAAGTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 39 1 30 9 A 12 11 32528 CASAVA_Build 5 157154742 2D CTACCATAGA CT/-- CTTTTCCCTT 3070 het 3070 ref 60 32 26 2 CT 2 1 32529 CASAVA_Build 5 157155253 9D AAAGAAAATG GGGCAAATT/--------- TTCCGTATGC 3070 het 3070 ref 33 19 15 1 GGGCAAATT 1 0 32530 CASAVA_Build 5 157166701 9I TCTCCTTTAA ---------/ACTATGACT ACTGCTGATG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 ACTATGACT 0 1 32531 CASAVA_Build 5 157175001 1I AATGTTCTGG -/A AATTAGACAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 3 32532 CASAVA_Build 5 157180973 1I CAGACATGAG -/A ATGTAATAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 2 32533 CASAVA_Build 5 157186102 1I CTTTCAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1402 hom 34 5 23 6 T 13 14 32534 CASAVA_Build 5 157225567 1D GGAGGGGAGG A/- AAAACTTTTC 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 A 5 4 32535 CASAVA_Build 5 157237644 1D CATGAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 13 12 32536 CASAVA_Build 5 157238836 11I GCCTACCACT -----------/GCACTGTTGGA GCCCCTCTCT 3070 hom 88 het 35 0 25 10 GCACTGTTGGA 0 1 32537 CASAVA_Build 5 157242843 1I CCTCAATGAG -/C CCCAGCTACG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 3 4 32538 CASAVA_Build 5 157244342 4I11M3D CTGGCCTCAC ----TATGGGTAGTTGCA/TGTTTATGGGTAGTT--- GTGGTGGCTG 1665 hom 21 het 20 0 8 12 N/A 0 0 32539 CASAVA_Build 5 157248367 2D16M6D ACTCCCTCTC AAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAC/--AAAAAAAAAAACCAAA------ CGAAAACTTG 3070 het 9 hom 18 1 18 4 N/A 0 0 32540 CASAVA_Build 5 157250628 8D GCCTGCAACC AGTCTGAT/-------- AGTCTGATTG 2090 hom 62 het 31 0 12 20 AGTCTGAT 2 1 32541 CASAVA_Build 5 157256782 1D AGTAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 787 hom 37 3 25 10 T 15 14 32542 CASAVA_Build 5 157260653 1D GACAAATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 26 2 12 12 T 15 14 32543 CASAVA_Build 5 157263543 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2526 hom 15 het 7 0 6 1 T 11 10 32544 CASAVA_Build 5 157264034 1D GCATAGTGGG T/- TGGGGGGCAA 2361 hom 15 het 10 0 6 4 T 2 1 32545 CASAVA_Build 5 157266600 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 18 0 16 5 A 11 10 32546 CASAVA_Build 5 157267351 1I CCCCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 23 2 19 2 A 12 13 32547 CASAVA_Build 5 157268305 1I TGCTAAGGCT -/G TGGCGGTGTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 32548 CASAVA_Build 5 157290745 1I GCTGGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 30 2 17 11 T 13 14 32549 CASAVA_Build 5 157291768 2I TTGGTGCTCA --/GT GTAGGTTAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 GT 1 2 32550 CASAVA_Build 5 157296269 4D GGACGTACAG GTTT/---- GTTAACATAG 3070 hom 54 het 21 0 19 4 GTTT 1 0 32551 CASAVA_Build 5 157299920 1I ATTTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 25 2 18 5 T 10 11 32552 CASAVA_Build 5 157302621 1D TTTTTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 11 10 32553 CASAVA_Build 5 157306369 1D TTTTTTCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 89 het 42 0 29 13 T 10 9 32554 CASAVA_Build 5 157333645 1D CTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 14 8 6 A 9 8 32555 CASAVA_Build 5 157334603 4I TGCTATGTAC ----/TGTG TGTGATAGCG 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 TG 2 4 32556 CASAVA_Build 5 157335002 1I TCTCATTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2887 hom 28 8 17 3 T 9 10 32557 CASAVA_Build 5 157341680 1D ATATCTTTAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 9 8 32558 CASAVA_Build 5 157345683 1D GTTGCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 881 hom 40 3 29 8 T 13 12 32559 CASAVA_Build 5 157351387 1I TCTATTCGAA -/T CAGGAACCAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 0 1 32560 CASAVA_Build 5 157382140 1D CCATGAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2445 hom 19 7 10 2 T 11 10 32561 CASAVA_Build 5 157386777 2D GACACAGGTC AG/-- AGACCCATGT 3070 het 3070 hom 44 15 24 7 AG 2 1 32562 CASAVA_Build 5 157390534 1D GAACTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3014 hom 33 9 21 3 T 13 12 32563 CASAVA_Build 5 157400996 1D TTCAATTGCT A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 7 6 32564 CASAVA_Build 5 157406764 1D GGGCTCTGAA T/- TTTTTTTTTT 2419 het 2419 ref 44 22 7 15 T 17 16 32565 CASAVA_Build 5 157412869 21D CCTTGTTTTG CTTGCCTTACCAGTGGGATGA/--------------------- CTTGCCTTAC 3070 het 2460 hom 21 8 11 9 CTTGCCTTACCAGTGGGATGA 1 0 32566 CASAVA_Build 5 157423147 1I TAATTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 T 11 12 32567 CASAVA_Build 5 157436078 4D AGGAGGTAGA ATTC/---- ATTCATTAGC 3070 het 3070 hom 46 18 22 7 ATTC 2 1 32568 CASAVA_Build 5 157447117 6D TTTTAAAAAA ATTTTG/------ TTTTACGTTC 2852 het 2852 ref 21 11 6 7 ATTTTG 1 0 32569 CASAVA_Build 5 157460717 1I TTGATTAGAA -/T TTTTTCAGAC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 5 6 32570 CASAVA_Build 5 157462409 2D TGGGGGTACA TG/-- TGCAGGTTTA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 TG 2 1 32571 CASAVA_Build 5 157469321 1D TGGCATTGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 9 8 32572 CASAVA_Build 5 157478370 2I TTATAATAAC --/AT ATTTATTTTG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AT 1 2 32573 CASAVA_Build 5 157482417 1I ATTTCCCATA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 7 8 32574 CASAVA_Build 5 157486676 1I TTATTTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 9 10 32575 CASAVA_Build 5 157504398 1I AGGTAATTAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 T 8 9 32576 CASAVA_Build 5 157514387 2D TAGTCACACA CT/-- CTCCTCTAGG 3070 het 3070 hom 45 22 20 4 CT 2 1 32577 CASAVA_Build 5 157514676 1D CGAATAGGAC T/- TTTTTTTTTT 1411 het 1411 ref 55 34 5 16 T 11 10 32578 CASAVA_Build 5 157541283 3I AGTATATCCA ---/TCT TCTTCTATCC 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 TCT 2 3 32579 CASAVA_Build 5 157557101 1I CCTGTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 9 10 32580 CASAVA_Build 5 157572135 1I CCCTGGGTCT -/G GGGGTAACAG 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 G 4 5 32581 CASAVA_Build 5 157576286 1I ACCAGCATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 9 10 32582 CASAVA_Build 5 157591292 1I AAGAAATGCT -/A AAAAAAAAAT 2471 het 2471 ref 26 16 7 3 A 9 10 32583 CASAVA_Build 5 157595099 1I AGACTCCTGG -/C CCCTGCTATC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 3 4 32584 CASAVA_Build 5 157601603 1I GGTCCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 2204 het 2204 ref 35 13 11 11 T 14 15 32585 CASAVA_Build 5 157614598 1I CACATTTTAT -/G ATTGAGGAAA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 G 0 1 32586 CASAVA_Build 5 157622680 5D AGGCTAGAAA CTTCT/----- CTTCTCTGGG 3070 het 3070 hom 45 17 24 6 CTTCT 2 1 32587 CASAVA_Build 5 157623985 1D AACTCCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 10 A 15 14 32588 CASAVA_Build 5 157629058 1I GTAATGCTTC -/A TTTTTTTATT 3070 het 1472 hom 17 5 11 1 A 0 1 32589 CASAVA_Build 5 157630913 1I TGAAACCTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 9 10 32590 CASAVA_Build 5 157641095 3I ATGGAATCTA ---/CTC CTGGTGAAGA 3070 hom 113 het 42 0 38 4 CTC 0 1 32591 CASAVA_Build 5 157641453 1I CAATAAAATA -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 6 7 32592 CASAVA_Build 5 157645661 1D GCCAGCTACT C/- CTAAATGCTC 3070 het 3070 hom 51 17 29 5 C 2 1 32593 CASAVA_Build 5 157647953 8D AAAAAAATTC AGAGAGAG/-------- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 36 12 21 7 AG 9 5 32594 CASAVA_Build 5 157664320 2D GGTTTTTTTC TG/-- TGTTATAGTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 12 TG 2 1 32595 CASAVA_Build 5 157667212 7D TGTTTTCTCT CTCATAA/------- AGCAGAGAAG 3070 het 3070 ref 54 26 24 9 CTCATAA 1 0 32596 CASAVA_Build 5 157667848 5D TTTATGTATA CTTGT/----- CTTAAGGCAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 6 CTTGT 1 0 32597 CASAVA_Build 5 157672134 2D ATTCTCTTCC TT/-- GTAAAATGGT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 2 0 32598 CASAVA_Build 5 157676733 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 A 14 15 32599 CASAVA_Build 5 157683326 1I ATCCAGAATG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 8 9 32600 CASAVA_Build 5 157684251 1I CCTTTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 A 11 12 32601 CASAVA_Build 5 157686556 1I TGCAACTTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 32602 CASAVA_Build 5 157690564 2D AATTGGTCCA TC/-- TCATCTAAGT 3070 het 3070 ref 34 20 10 8 TC 2 1 32603 CASAVA_Build 5 157693128 1D TTATTATGAA G/- GGATGTTGAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 3 2 32604 CASAVA_Build 5 157693850 1D ATCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 16 14 5 T 10 9 32605 CASAVA_Build 5 157694742 1I TTAAAGTCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 T 8 9 32606 CASAVA_Build 5 157695515 1D TTGCCCCCCC T/- CTCTCTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 1 0 32607 CASAVA_Build 5 157697718 1D TTGCTGCACA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 T 9 8 32608 CASAVA_Build 5 157702967 1I CTATCCCCAC -/A AAAAAGCTTG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 5 6 32609 CASAVA_Build 5 157705124 1I AGGGAAAGGG -/A AAAAAGCCTT 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 A 5 6 32610 CASAVA_Build 5 157710837 4D AAGCATTTAT TTTA/---- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 4 TTTA 2 1 32611 CASAVA_Build 5 157712149 3I CTCTCTCTCT ---/CTC TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 CTC 0 1 32612 CASAVA_Build 5 157713391 4D CATTTCTCAC TTAT/---- TTATTTATTC 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 TTAT 3 2 32613 CASAVA_Build 5 157719807 1D CTGTATAATA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 T 6 5 32614 CASAVA_Build 5 157726982 5D TCAGATTGGC CTTTT/----- CTTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 6 CTTTT 2 1 32615 CASAVA_Build 5 157732949 1D GTCCCTCAAT G/- GTACATAAAT 3070 het 3070 hom 49 23 25 1 G 2 1 32616 CASAVA_Build 5 157733875 1I ATGTGGAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 8 9 32617 CASAVA_Build 5 157736749 1I GACAGAAACT -/G ATAACAATGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 G 0 1 32618 CASAVA_Build 5 157743620 1I TCCCAATAAC -/T TTTTTTCTTA 2606 het 2359 hom 18 6 7 5 T 6 7 32619 CASAVA_Build 5 157746417 3I AGAAGAAGAA ---/GAG GAAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 GAG 0 1 32620 CASAVA_Build 5 157763334 1D AGTGTGATAG A/- AAAAAAAAAA 2703 het 2703 ref 27 18 7 3 A 11 10 32621 CASAVA_Build 5 157776533 21D CCCAGACTGG TGACAGTGCAAGGTGGGGGCT/--------------------- TGACAGTGCA 2661 het 2661 ref 34 25 7 7 TGACAGTGCAAGGTGGGGGCT 2 1 32622 CASAVA_Build 5 157784568 1I AATTGTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 10 11 32623 CASAVA_Build 5 157788936 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 10 11 32624 CASAVA_Build 5 157789597 1I TTCAGGTATC -/A AACCTCTCCC 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 A 2 3 32625 CASAVA_Build 5 157796885 2I ATCATCCAAC --/TA TGTTATAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TA 0 1 32626 CASAVA_Build 5 157805117 1I TGAATATTGG -/C CCCCCACTCT 3070 het 1827 hom 13 4 9 0 C 5 6 32627 CASAVA_Build 5 157816739 1D TTATTGAGCA C/- CATCTATTAG 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 C 2 1 32628 CASAVA_Build 5 157823546 1D TTCATTGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 A 13 12 32629 CASAVA_Build 5 157827320 1D AATTTTTTTT A/- TATACATATA 1113 het 1113 ref 10 6 3 1 A 1 0 32630 CASAVA_Build 5 157829817 4I TCAAACAGAA ----/CTGT CTGTTTTAGT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 CTGT 1 2 32631 CASAVA_Build 5 157839167 1D TAAATTTCTT C/- CCTCCACTCT 3070 hom 99 het 42 0 33 9 C 3 2 32632 CASAVA_Build 5 157867885 11I CCATGCTGCC -----------/CAAGCTGGTCT CAAACTCTTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CAAGCTGGTCT 0 1 32633 CASAVA_Build 5 157869389 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 2590 het 2439 hom 19 8 9 2 TG 8 9 32634 CASAVA_Build 5 157880938 1I CATAAAATTT -/A TTTTTTTAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 0 1 32635 CASAVA_Build 5 157919392 1D TGCCTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2723 hom 32 8 15 9 T 13 12 32636 CASAVA_Build 5 157923605 2D TTACAGAACA CC/-- CCACAGCCCC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 C 4 2 32637 CASAVA_Build 5 157926474 1I GATCAGTGAG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 7 8 32638 CASAVA_Build 5 157930764 1D CTCGGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2544 hom 22 10 10 2 A 16 15 32639 CASAVA_Build 5 157938081 1D TTTTGTTTTC A/- ATCCTGTTTA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 2 1 32640 CASAVA_Build 5 157941053 1D TTGTTTAATT A/- AAAAAAAACC 2818 het 2818 ref 24 16 6 3 A 9 8 32641 CASAVA_Build 5 157947063 1I CTGGTTCAAA -/T GCTCCCTTCA 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 T 0 1 32642 CASAVA_Build 5 157962383 1D26M1D GAATGGGATT CCCTGTTGCCTTCTTTTTTCTTTTTTTC/-CCTGTTGCCTTCTTTTTTCTTTTTTT- CTAGCATTTG 3070 het 3070 ref 31 18 14 3 N/A 0 0 32643 CASAVA_Build 5 157972564 1I TCAAGTTTTC -/T TTTTTAATTA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 5 6 32644 CASAVA_Build 5 157998393 1D CTTATTGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3002 hom 28 11 11 6 T 10 9 32645 CASAVA_Build 5 157999191 1I CACTTTCTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 9 32646 CASAVA_Build 5 158005577 1I TTATTAAATT -/A ATTTCTTTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 1 2 32647 CASAVA_Build 5 158006794 1D AAAAATCTTC T/- TTTCTCTTAA 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 4 3 32648 CASAVA_Build 5 158012362 1I ATTCAACCAA -/G GGCTTATATA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 G 2 3 32649 CASAVA_Build 5 158018435 1I CTCTGGTGAC -/A AAAAATAACA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 5 6 32650 CASAVA_Build 5 158020301 7D TTTCTTTTTC TTTTCTT/------- TTTTTTTTTT 2977 het 1049 hom 22 4 11 9 TTTTCTT 1 0 32651 CASAVA_Build 5 158025912 12I GTTTCAGCTT ------------/GAGCATTTCAGA GACTCATAAT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 GAGCATTTCAGA 0 1 32652 CASAVA_Build 5 158026634 1D AATAGAGGAC A/- AAAGAAAACC 3070 het 3070 ref 38 19 14 7 A 4 3 32653 CASAVA_Build 5 158028648 1I TCTGAAGTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 9 10 32654 CASAVA_Build 5 158071261 1I TTTTGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 1453 het 1453 ref 45 30 4 11 T 11 12 32655 CASAVA_Build 5 158162941 2D TTTGCTGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 47 3 20 24 T 18 16 32656 CASAVA_Build 5 158176560 1D AACTTGCCCT G/- GGCTTTCACC 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 G 3 2 32657 CASAVA_Build 5 158183524 1I GTTTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 43 1 32 10 A 10 11 32658 CASAVA_Build 5 158185079 1I TCTTAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 22 11 A 12 13 32659 CASAVA_Build 5 158185850 2D TTTCACGATA TC/-- TGTTATAATT 3070 hom 126 het 43 0 43 0 TC 1 0 32660 CASAVA_Build 5 158190222 1I CTTCCAGTAC -/A AAATCTATGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 3 4 32661 CASAVA_Build 5 158192884 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2574 het 103 hom 25 2 12 12 A 15 14 32662 CASAVA_Build 5 158198478 5I AAATAACTTA -----/GCCAT GCCATTCGGT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 GCCAT 1 2 32663 CASAVA_Build 5 158207898 1I CATTGACCAT -/A TCTGGTTATA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 0 1 32664 CASAVA_Build 5 158211756 1D CTTTTCAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 17 het 16 0 12 4 A 10 9 32665 CASAVA_Build 5 158227237 3I GCAGACAATT ---/CTC CTCACCTGCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CTC 1 2 32666 CASAVA_Build 5 158237287 2I ACTACAAACG --/CA CACACACACA 3070 het 818 hom 35 2 19 14 CA 8 9 32667 CASAVA_Build 5 158252494 1D TTTACTTTGA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 8 7 32668 CASAVA_Build 5 158253983 7I ATAGAAGGCA -------/AAAAAAT GATAAATAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 1 AAAAAAT 0 1 32669 CASAVA_Build 5 158262006 1D CTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 31 1 19 11 T 14 13 32670 CASAVA_Build 5 158268705 1D TGGGCAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 20 8 A 12 11 32671 CASAVA_Build 5 158302918 10D TTTATTGGAT ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 hom 122 het 46 0 37 12 AC 14 9 32672 CASAVA_Build 5 158338212 1D AGTGACATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 22 1 18 3 T 13 12 32673 CASAVA_Build 5 158339266 1D ATTTTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 332 hom 33 1 29 3 A 11 10 32674 CASAVA_Build 5 158342383 2I TATATATATA --/TT GTGGTCTAAA 3070 het 112 hom 25 1 22 2 T 0 2 32675 CASAVA_Build 5 158350039 1D GAAGGCAACT G/- CAATAAGACA 3070 het 3070 hom 50 23 23 5 G 1 0 32676 CASAVA_Build 5 158363047 1D CAACTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 34 0 22 12 A 15 14 32677 CASAVA_Build 5 158363864 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 554 hom 21 3 10 8 A 17 16 32678 CASAVA_Build 5 158366234 19D TAGCCATGTT AAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2200 hom 28 9 14 8 A 29 10 32679 CASAVA_Build 5 158368039 1D CCTCAAATGC A/- TTTATCTGGG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 1 0 32680 CASAVA_Build 5 158369358 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 17 9 A 15 14 32681 CASAVA_Build 5 158376709 1D ATTATTGATG C/- TTTTCATAAT 3070 hom 129 het 45 0 44 2 C 1 0 32682 CASAVA_Build 5 158389682 1I AGAGACACAG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 6 7 32683 CASAVA_Build 5 158391058 3I ACAACGAAAG ---/CCT CCTCCTTTCT 3070 het 3070 ref 50 19 19 12 CCT 2 3 32684 CASAVA_Build 5 158411596 1I AGACACACGC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 A 7 8 32685 CASAVA_Build 5 158411938 1I AAAGATATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 12 11 A 14 15 32686 CASAVA_Build 5 158428801 1I TCTATCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 769 hom 32 3 25 4 A 10 11 32687 CASAVA_Build 5 158444158 1I AATGTGTACC -/A AAAAAAAAAA 2059 het 2059 ref 45 22 11 12 A 15 16 32688 CASAVA_Build 5 158449844 2D AAAAAGAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 1000 hom 33 7 17 10 A 11 9 32689 CASAVA_Build 5 158453956 4I TATTTCAATC ----/AATA TTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AATA 0 1 32690 CASAVA_Build 5 158459113 1D GAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1683 het 974 hom 22 6 7 9 A 15 14 32691 CASAVA_Build 5 158462728 1D AGAGCAGTAG T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 43 19 21 3 T 8 7 32692 CASAVA_Build 5 158467527 1I ATTAAATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 A 9 10 32693 CASAVA_Build 5 158473103 1I TTAAAAAAGA -/T TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 T 6 7 32694 CASAVA_Build 5 158485148 3I ATTCCAACCC ---/TCT TATGGTTAAT 3070 het 3070 hom 42 12 25 5 TCT 0 1 32695 CASAVA_Build 5 158492528 2D AAAACAAAAC AG/-- AAAAATCAGT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AG 1 0 32696 CASAVA_Build 5 158495162 2D TCTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2859 hom 38 15 17 7 TA 1 0 32697 CASAVA_Build 5 158513670 1D CGTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2952 het 681 hom 28 7 10 11 T 15 14 32698 CASAVA_Build 5 158513827 4D GCCACCACAC CTGG/---- CTAATTTTTG 2816 het 1871 hom 15 5 7 3 CTGG 1 0 32699 CASAVA_Build 5 158514122 4D TGCTCATTGA TTTT/---- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 T 10 6 32700 CASAVA_Build 5 158517187 2D ATAAAAAATT AC/-- ATTCCCCCCT 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 AC 1 0 32701 CASAVA_Build 5 158521212 5D CCAGAACCTG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 22 6 A 15 10 32702 CASAVA_Build 5 158547805 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 1272 hom 10 het 5 0 4 1 A 10 9 32703 CASAVA_Build 5 158566548 1D AAAACAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2743 hom 40 12 16 13 A 12 11 32704 CASAVA_Build 5 158576900 1I GAGTCTCTGA -/C CCCCAAGACC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 C 4 5 32705 CASAVA_Build 5 158631997 1D TTCCTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 18 10 T 14 13 32706 CASAVA_Build 5 158645970 5D TAGAACAGAA ATTTT/----- AGAGTATTCA 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 ATTTT 1 0 32707 CASAVA_Build 5 158647403 1D ACTTTTTAGA T/- TTCTACGTAT 3070 hom 89 het 33 0 30 3 T 3 2 32708 CASAVA_Build 5 158660537 1I ATTGAACATC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 7 8 32709 CASAVA_Build 5 158674786 1D ATTTCAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 8 T 11 10 32710 CASAVA_Build 5 158692778 4D GGGGGCCACA TTAG/---- AGCCTCTCTC 3070 het 3070 hom 40 16 18 9 TTAG 1 0 32711 CASAVA_Build 5 158713832 9D TCCCAAAATG CTGGGGTTA/--------- CAGGCTATGC 3070 het 3070 ref 32 16 13 6 CTGGGGTTA 1 0 32712 CASAVA_Build 5 158722712 1D GATGTTCTAG T/- TGCTTTTAAG 3070 het 3070 ref 39 25 12 3 T 2 1 32713 CASAVA_Build 5 158725682 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 739 hom 31 5 11 15 T 11 10 32714 CASAVA_Build 5 158746428 1I CCTGTTCCAA -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 T 6 7 32715 CASAVA_Build 5 158759452 1I CCTTACCTAG -/T TTTATTAGGT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 3 4 32716 CASAVA_Build 5 158767758 4D TTTTTTTTTT TTTC/---- CCTAATCCTA 3070 het 2936 hom 33 12 15 6 TTTC 1 0 32717 CASAVA_Build 5 158770821 2I TTAAGGACTC --/AT GTGGTTGGAT 3070 hom 172 het 64 0 58 6 AT 0 1 32718 CASAVA_Build 5 158772567 2D CCTTGCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 41 0 16 25 T 13 11 32719 CASAVA_Build 5 158775655 9D TTCACTTATG TATTATTAT/--------- TATTATTATT 1950 het 12 hom 13 1 8 5 TAT 8 5 32720 CASAVA_Build 5 158778148 2I AGATCTGGAA --/AG AGAATAAAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AG 1 2 32721 CASAVA_Build 5 158784998 2D CCACCCTACC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 AT 6 5 32722 CASAVA_Build 5 158795271 1I TGCTGACTGT -/G GGTCCAAGAG 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 G 2 3 32723 CASAVA_Build 5 158795991 1I CAAGTCCTGG -/C CATGCATCCA 3070 hom 110 het 44 0 34 10 C 1 2 32724 CASAVA_Build 5 158800961 1D AAATATTTAA G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 12 het 20 0 11 9 G 11 10 32725 CASAVA_Build 5 158814487 3D ACTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 42 0 17 27 T 15 12 32726 CASAVA_Build 5 158842909 2D CTGCAGTGGG AA/-- GTTTCTTTCC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 2 0 32727 CASAVA_Build 5 158845861 3I TTTGATAGAT ---/TAA TAATATTATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TAA 1 2 32728 CASAVA_Build 5 158862693 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 18 1 16 1 A 12 11 32729 CASAVA_Build 5 158879486 1D GGAAGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 14 9 T 12 11 32730 CASAVA_Build 5 158888577 1D TGAACCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 38 2 17 20 T 17 16 32731 CASAVA_Build 5 158892487 5D GGTTTTATGG ATGTT/----- ATAATGCTTA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 ATGTT 1 0 32732 CASAVA_Build 5 158894386 1D AAGCAGAGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 99 hom 21 1 17 3 T 10 9 32733 CASAVA_Build 5 158898848 1D TAAAAAGGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 8 32734 CASAVA_Build 5 158902481 3D AAGCTTGACA TTC/--- AGGACATTCA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 TTC 1 0 32735 CASAVA_Build 5 158905111 1D GCCCATGAAC T/- TTGCATTTTA 3070 hom 137 het 53 0 46 7 T 3 2 32736 CASAVA_Build 5 158907123 4D CCACACTTGG AGAT/---- AGATAGAGAG 3070 hom 98 het 36 0 32 7 AGAT 2 1 32737 CASAVA_Build 5 158909315 1D GGACAGAAAA C/- TTTTAAGTTA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 C 1 0 32738 CASAVA_Build 5 158924584 1D AACCCCAGTT A/- AAAAAAAAAA 2451 het 166 hom 40 4 13 23 A 19 18 32739 CASAVA_Build 5 158940566 1I GGGGCGTCTG -/C CCTTGCACTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 2 3 32740 CASAVA_Build 5 158950084 1D TATGTGTGTG T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 58 23 33 3 T 7 6 32741 CASAVA_Build 5 158968610 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 31 2 21 8 T 15 14 32742 CASAVA_Build 5 158974194 1D AGTATATTGG A/- AAAAAAAAAA 872 het 872 ref 43 30 4 9 A 13 12 32743 CASAVA_Build 5 159005214 1D AAAGTCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 13 12 32744 CASAVA_Build 5 159009216 1I AGAACCTATT -/C CTCCTGTCTA 3070 hom 102 het 40 0 33 7 C 1 2 32745 CASAVA_Build 5 159018872 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1790 hom 19 5 9 5 A 11 10 32746 CASAVA_Build 5 159023944 3I TGCTGGGAAA ---/AGG AGATGAGGCA 3070 hom 150 het 53 0 48 5 AGG 0 1 32747 CASAVA_Build 5 159026360 1D GCTTTACCAT A/- AAAAAATAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 7 6 32748 CASAVA_Build 5 159026687 1D TGTTCATGTG T/- TATGCGTGTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 2 1 32749 CASAVA_Build 5 159029884 1I TCAGTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 10 11 32750 CASAVA_Build 5 159031540 3D TGGAGGGCTC AGA/--- AGAAGACAGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AGA 3 2 32751 CASAVA_Build 5 159036448 1I CATTTCTAGA -/T TATGACCTGG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 1 2 32752 CASAVA_Build 5 159048150 3I ATTTAACTCA ---/AAG AAGAATACCT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 AAG 1 2 32753 CASAVA_Build 5 159051812 1D ACTCTACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 11 10 32754 CASAVA_Build 5 159055189 1I ATATCTTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 9 10 32755 CASAVA_Build 5 159060122 1I CTGTGCCCTT -/G GATGGAGATG 3070 het 3070 hom 48 13 28 7 G 1 2 32756 CASAVA_Build 5 159062971 2D GAGGGGTTAC TT/-- ACTGCTTCTT 3070 hom 132 het 50 0 45 7 T 2 0 32757 CASAVA_Build 5 159063332 18D CTGAGCAAAG GCATGAAGATAGGCAAAA/------------------ GCATGAAGAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 12 GCATGAAGATAGGCAAAA 1 0 32758 CASAVA_Build 5 159070360 7I ACCCTCTGCA -------/GTTCTAC GTGCCTTACT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GTTCTAC 0 1 32759 CASAVA_Build 5 159070948 2D TCACAAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 13 12 T 14 12 32760 CASAVA_Build 5 159078320 1D TTAAAGCTCC T/- TTTTTTTTTT 2109 het 2109 ref 26 14 6 6 T 13 12 32761 CASAVA_Build 5 159082819 1I GCAGAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 A 10 11 32762 CASAVA_Build 5 159089870 1D GTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 10 9 32763 CASAVA_Build 5 159130397 3D TAACATACAC GTT/--- GTTATTTCTA 3070 hom 45 het 22 0 16 7 GTT 2 1 32764 CASAVA_Build 5 159132674 1D GTGGATGGAT G/- AAAGAGAGGG 3070 hom 89 het 33 0 27 6 G 1 0 32765 CASAVA_Build 5 159138807 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 11 12 32766 CASAVA_Build 5 159196965 1I CTTTGGACTC -/T TTTTTTTTTT 2936 het 1743 hom 26 5 13 8 T 15 16 32767 CASAVA_Build 5 159209087 17D TGCTTGCTAA GTATCAAGCACCATGCT/----------------- AGATGCTTGG 3070 het 3070 ref 31 24 9 2 GTATCAAGCACCATGCT 1 0 32768 CASAVA_Build 5 159222509 1I GCAAACACAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 8 9 32769 CASAVA_Build 5 159223685 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 T 7 6 32770 CASAVA_Build 5 159235494 1I ACAACAAGGG -/C CCGGGCATGG 3070 hom 57 het 22 0 20 3 C 2 3 32771 CASAVA_Build 5 159235644 3I AATGGTGGTG ---/CAT CATACCTGTA 3070 hom 62 het 22 0 20 2 CAT 1 2 32772 CASAVA_Build 5 159242349 1I AACTTGCTCC -/T TGGGTGTCTG 3070 hom 126 het 54 0 43 11 T 1 2 32773 CASAVA_Build 5 159267091 1I TTTATGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 35 1 30 4 A 10 11 32774 CASAVA_Build 5 159289333 1I TTTGAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 10 11 32775 CASAVA_Build 5 159319394 1D TTAAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 13 12 32776 CASAVA_Build 5 159338748 1I CTATCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 9 10 32777 CASAVA_Build 5 159384250 1I CCCAGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 1741 het 1741 ref 36 19 8 9 T 15 16 32778 CASAVA_Build 5 159395538 1I GATTTTAGGG -/T TTTTTTTTTT 2467 het 2467 ref 31 21 9 1 T 13 14 32779 CASAVA_Build 5 159397672 1D AAGGTTACGG T/- TTTTTTTTTT 1049 het 1049 ref 26 18 3 5 T 12 11 32780 CASAVA_Build 5 159408535 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 2768 het 2768 ref 32 16 8 8 A 12 11 32781 CASAVA_Build 5 159418779 1D TATAGTGCTG T/- TTTCATCTAC 3070 het 3070 ref 46 25 17 6 T 4 3 32782 CASAVA_Build 5 159434531 1I TATTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 12 13 32783 CASAVA_Build 5 159435276 2D CCTTCGTCAT AA/-- AGAGGTCCCA 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 A 3 1 32784 CASAVA_Build 5 159436670 1I CAAAGACAAG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 7 8 32785 CASAVA_Build 5 159442029 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1711 het 261 hom 9 1 5 4 A 15 14 32786 CASAVA_Build 5 159450281 2D ATCTTTTCAT TA/-- TGAGTTCCAT 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 TA 1 0 32787 CASAVA_Build 5 159461242 1I CATTTTGTTA -/T TTTTTTTTTT 2241 het 2241 ref 29 17 7 5 T 11 12 32788 CASAVA_Build 5 159472744 1D ACTCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1201 hom 21 5 10 6 A 12 11 32789 CASAVA_Build 5 159485841 2D CCTCTGCCTC TG/-- TGTGTGTGTG 1710 het 1710 ref 39 28 4 7 TG 9 8 32790 CASAVA_Build 5 159486605 1D CTCTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 12 11 32791 CASAVA_Build 5 159503060 1I GGTCACTTAA -/T TTTTTTTTTT 1414 het 1414 ref 25 13 7 6 T 13 14 32792 CASAVA_Build 5 159506370 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 8 9 32793 CASAVA_Build 5 159507317 4I TCTCAATCTC ----/TCTT TCTCTTTCCC 2488 het 2488 ref 25 12 9 4 TCTT 0 1 32794 CASAVA_Build 5 159510917 3D CACCTGCAAA CTC/--- CTCCTCCCAG 3070 het 2772 hom 31 8 16 7 CTC 3 2 32795 CASAVA_Build 5 159511512 1D TTGCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 666 hom 28 6 11 11 T 12 11 32796 CASAVA_Build 5 159518246 1D CCAGCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2916 hom 29 9 10 10 A 12 11 32797 CASAVA_Build 5 159523817 1I ATTAGGTGGG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 6 7 32798 CASAVA_Build 5 159524355 1I CCCAGGCATA -/C CCTTGAGCTT 2127 het 2127 ref 23 10 6 7 C 2 3 32799 CASAVA_Build 5 159530613 1D TTGTATTTTT A/- AAAGTAGAGA 2022 het 2022 ref 13 7 6 0 A 4 3 32800 CASAVA_Build 5 159531384 1D GATAGAGCAT A/- GCTGGATATG 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 1 0 32801 CASAVA_Build 5 159534001 12D GTTTTATTCC TCACAAGATACT/------------ GCCATTATCC 3070 het 3070 ref 40 22 20 3 TCACAAGATACT 1 0 32802 CASAVA_Build 5 159537600 1D CGCACCCCCC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 T 9 8 32803 CASAVA_Build 5 159540495 4D TAAAAATAAG AAAT/---- AAAACAAAAA 3070 het 2039 hom 21 7 11 4 AAAT 1 0 32804 CASAVA_Build 5 159544511 1I TTATATGTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 9 10 32805 CASAVA_Build 5 159547651 2I CTAATATTTT --/TA TTATTTCTCC 3070 hom 48 het 20 0 16 4 TA 0 1 32806 CASAVA_Build 5 159551052 4I AACTCCATCT ----/CAAA CAAACAAACA 3070 hom 23 het 9 0 8 1 CAAA 3 4 32807 CASAVA_Build 5 159551919 3I GCCTCGCCAG ---/TCT TCTTATCCCT 3070 hom 106 het 42 0 35 7 TCT 1 2 32808 CASAVA_Build 5 159557366 7I TGCAGGAAGC -------/CGAGAGG GAGAGGCAGT 3070 hom 47 het 19 0 14 5 CGAGAGG 0 1 32809 CASAVA_Build 5 159559879 2I GAGGTGGCAG --/AC ACCTAGGCCC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AC 1 2 32810 CASAVA_Build 5 159560427 1D CCTTCAAACC T/- AGCCCTTGGG 3070 het 3070 hom 42 20 16 6 T 1 0 32811 CASAVA_Build 5 159561314 1I TCTCCAGCCC -/A ACAGTGAGGT 1945 het 1945 ref 19 11 4 4 A 1 2 32812 CASAVA_Build 5 159561726 3D TAGGCAGACT CTA/--- CTTTCTGCTC 3070 hom 101 het 39 0 33 8 CTA 1 0 32813 CASAVA_Build 5 159563289 1D ATTATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1983 hom 27 10 9 8 T 15 14 32814 CASAVA_Build 5 159579273 1D GCAACTAAGG A/- AAAAAACAGC 3070 hom 83 het 33 0 23 10 A 7 6 32815 CASAVA_Build 5 159581294 1I ATGGATGGAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 T 8 9 32816 CASAVA_Build 5 159584388 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTACTC 3070 het 2941 hom 30 13 11 6 AG 1 2 32817 CASAVA_Build 5 159599021 1D CGGCTGGGAA G/- GGGGGGCGGG 3070 het 2469 hom 20 8 10 3 G 7 6 32818 CASAVA_Build 5 159600332 4D AGAGAGAAAG AGGA/---- AGGAAGAGGA 2721 het 2721 ref 25 12 10 4 AGGA 2 1 32819 CASAVA_Build 5 159649860 1D ATTTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 11 10 32820 CASAVA_Build 5 159655718 2I AATAAACATG --/CA CAGATATTCA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 CA 1 2 32821 CASAVA_Build 5 159656984 4I TGCTTGGCTT ----/CTTC CTTCCTAACT 3070 hom 134 het 48 0 45 3 CTTC 1 2 32822 CASAVA_Build 5 159659198 1D TTGTTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 13 12 32823 CASAVA_Build 5 159663524 4I CCACTCCCTT ----/AGAC AGCACAGGCT 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 AGAC 0 1 32824 CASAVA_Build 5 159675135 106D GCTGTCTTTA AGGGGATGAATAAAAACAAAAAAAGATTAGAGTACGATCCCAGTTAAACTACATTCATGCACACACACATATGCAAAAATATTAACTGTGTAATCAGAGTGGTAGG/---------------------------------------------------------------------------------------------------------- ATTATGGTAA 1746 het 1746 ref 17 30 4 4 AGGGGATGAATAAAAACAAAAAAAGATTAGAGTACGATCCCAGTTAAACTACATTCATGCACACACACATATGCAAAAATATTAACTGTGTAATCAGAGTGGTAGG 1 0 32825 CASAVA_Build 5 159676006 1D ATATATCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 13 12 32826 CASAVA_Build 5 159690256 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2365 hom 26 7 11 8 T 11 10 32827 CASAVA_Build 5 159694170 1D GAAAGGTTAA G/- AGACTTGTCC 3070 het 3070 ref 49 21 18 11 G 1 0 32828 CASAVA_Build 5 159697819 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAACACA 3021 het 3021 ref 30 19 8 4 A 7 6 32829 CASAVA_Build 5 159697981 1D CCTGTCCCCC T/- CAACTCCCCC 2201 het 2201 ref 19 7 8 5 T 1 0 32830 CASAVA_Build 5 159698375 3I CTAAAACTAC ---/TCT TCTTCTTCTT 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 TCT 4 5 32831 CASAVA_Build 5 159698853 6D TTTATATATA TATATG/------ TATGGTATAA 3070 het 3041 hom 16 7 9 1 TATATG 1 0 32832 CASAVA_Build 5 159718052 1D CTTTCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3008 hom 21 9 8 4 T 11 10 32833 CASAVA_Build 5 159725543 1D TTTTAAAAAA T/- TTTTTAATTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 6 5 32834 CASAVA_Build 5 159728381 1D ATAGCGAGAC A/- GGGGGGAGGA 3070 het 3070 ref 49 21 18 12 A 1 0 32835 CASAVA_Build 5 159731928 1I CTCATTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 A 10 11 32836 CASAVA_Build 5 159736005 9D CAGAACAATG TATATAGTT/--------- TGCTACTATA 3070 het 3070 hom 45 21 23 2 TATATAGTT 1 0 32837 CASAVA_Build 5 159738005 2D AAAAAAGGTT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 38 0 27 12 AC 8 7 32838 CASAVA_Build 5 159747116 1D CTATTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 13 12 32839 CASAVA_Build 5 159747956 5I AGGTTATTGA -----/CTTTT CTTTTCTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 CTTTT 2 3 32840 CASAVA_Build 5 159759758 1I CCCTTCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 T 10 11 32841 CASAVA_Build 5 159760871 3D1M4I TGTAACTTCT TGAA----/---ACCTC CCGGGTTCAA 3070 het 1644 hom 16 4 12 1 N/A 0 0 32842 CASAVA_Build 5 159761596 2I ACTGATTCTA --/CT CTGTCAGTAT 3070 hom 135 het 48 0 43 5 CT 1 2 32843 CASAVA_Build 5 159766909 4I CATACAAAAT ----/TGTA TACCATCTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TGTA 0 1 32844 CASAVA_Build 5 159768453 3I TATTTATTAT ---/ATA ATAATATATA 2098 hom 12 het 6 0 5 1 ATA 2 3 32845 CASAVA_Build 5 159768950 4I CACTAACGTG ----/GTCA GTATTTCATC 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 GTCA 0 1 32846 CASAVA_Build 5 159772918 3I TATACAGTAG ---/TAC TACTACTATT 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 TAC 2 3 32847 CASAVA_Build 5 159788339 1I TCCTAGTATT -/G GTGGTTGCTT 3070 het 3070 hom 41 21 17 3 G 1 2 32848 CASAVA_Build 5 159790549 1I GAGTATGGGT -/A AAGGTACCTA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 2 3 32849 CASAVA_Build 5 159791943 1D TGGCAGGTGC T/- TCAGGGACTT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 2 1 32850 CASAVA_Build 5 159815771 1D ACATGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 29 1 20 8 T 12 11 32851 CASAVA_Build 5 159819886 2D GGATTAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 42 het 23 0 15 8 AC 7 6 32852 CASAVA_Build 5 159822464 1D ATATGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 27 1 16 10 T 15 14 32853 CASAVA_Build 5 159864161 2I GGTGTAAGGG --/GT GTGTGTGGGG 3070 hom 110 het 46 0 34 12 GT 3 4 32854 CASAVA_Build 5 159869120 1I GACTCATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 11 12 32855 CASAVA_Build 5 159875164 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2942 hom 27 13 11 3 A 13 12 32856 CASAVA_Build 5 159883450 1D CTAAGTAAGA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 8 7 32857 CASAVA_Build 5 159888508 2I AAATTAGAGT --/TA TATATATATA 2264 het 2264 ref 17 6 8 3 TA 8 9 32858 CASAVA_Build 5 159888580 1D AAATGCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 22 3 14 5 T 13 12 32859 CASAVA_Build 5 159890763 2D ATATATTGTA TT/-- TTATATATAT 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 T 4 2 32860 CASAVA_Build 5 159903813 1I TAATGGGTAT -/A AAAATACATT 3070 hom 91 het 34 0 28 6 A 4 5 32861 CASAVA_Build 5 159905961 6D CGCTTCACAG TGTATA/------ TGTATATCAA 3070 het 3070 ref 44 25 16 5 TGTATA 2 1 32862 CASAVA_Build 5 159908349 7I TATCATTGCA -------/AAGTTTG AAGACCCATT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 AAGTTTG 0 1 32863 CASAVA_Build 5 159927886 1I TAGTGATTGC -/T TTTTTATGGA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 5 6 32864 CASAVA_Build 5 159930563 4D AGGAAATCTT TATC/---- TCTTAAAGCC 3070 het 3070 ref 41 26 13 6 TATC 1 0 32865 CASAVA_Build 5 159931774 1I TTTTAAAGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 9 10 32866 CASAVA_Build 5 159940051 4D ATTACATTTA TTGT/---- TTATGTATGT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 TTGT 1 0 32867 CASAVA_Build 5 159950148 1D TTCTTGCTAC T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 46 27 15 6 T 7 6 32868 CASAVA_Build 5 159975687 1I TTCTCAAAGA -/T CTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 0 1 32869 CASAVA_Build 5 159978450 1D TGGATTGAGA T/- TTTTTAAAGG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 6 5 32870 CASAVA_Build 5 159983111 1D GCATGACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 T 12 11 32871 CASAVA_Build 5 160002618 9I GTGGAGATTG ---------/CTGGAGAGT CTGGAGAGTT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 CTGGAGAGT 1 2 32872 CASAVA_Build 5 160023246 22D AGCGGGGAGG GATAGCATTAGGAGATATACCT/---------------------- AATGCTAAAT 2987 hom 21 het 8 0 8 0 GATAGCATTAGGAGATATACCT 1 0 32873 CASAVA_Build 5 160023375 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 9 10 32874 CASAVA_Build 5 160027946 4D GCATGTGTGA GTGT/---- GTGTGTATCT 3070 hom 168 het 59 0 56 5 GT 5 3 32875 CASAVA_Build 5 160033119 8D TTTTGTTTTG TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 510 het 429 hom 28 4 4 21 T 18 10 32876 CASAVA_Build 5 160033323 4D TTGTAACAGT CAAA/---- CACCTCGTGG 3070 hom 96 het 36 0 33 4 CAAA 1 0 32877 CASAVA_Build 5 160034888 1D ATAAGACAAA T/- CAACATGGCT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 T 1 0 32878 CASAVA_Build 5 160063067 2D ATGATATTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 22 2 17 3 T 14 12 32879 CASAVA_Build 5 160069194 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2295 het 230 hom 10 1 7 2 T 13 14 32880 CASAVA_Build 5 160069339 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCCTCCC 966 hom 5 het 3 0 2 1 C 7 6 32881 CASAVA_Build 5 160087686 1I CTTCCTTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 9 10 32882 CASAVA_Build 5 160088410 1D GAATGTGTTG T/- TTTCATCTCT 3070 hom 101 het 38 0 31 7 T 4 3 32883 CASAVA_Build 5 160093276 6D ATACACACAC ACATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 51 het 18 0 18 3 ACATAT 1 0 32884 CASAVA_Build 5 160101980 1D TTGCCACTTG A/- AAAAAAAAAA 1158 het 1158 ref 35 26 4 5 A 11 10 32885 CASAVA_Build 5 160125747 1I TTAAAGAACT -/A AAAGTAGAAC 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 A 3 4 32886 CASAVA_Build 5 160125858 16D ATAGCAGCAC AATTTGCAATTGCAAA/---------------- AATACGGAAC 2472 het 2472 ref 15 8 8 1 AATTTGCAATTGCAAA 1 0 32887 CASAVA_Build 5 160132656 4I TTTGTTGTCG ----/TTAT TTGTTAATTA 3070 het 3070 hom 58 25 24 9 TTAT 0 1 32888 CASAVA_Build 5 160155157 1I AACCTATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 185 hom 38 1 29 8 T 12 13 32889 CASAVA_Build 5 160169987 1I AAAAGTTATC -/T TTTTTATCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 5 6 32890 CASAVA_Build 5 160172315 3D AAAAAAGAAT AAA/--- AAAGAATAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 6 3 32891 CASAVA_Build 5 160174395 2D TACAAGCCAG AA/-- GAGAGTGGGG 2778 hom 18 het 7 0 7 0 A 2 0 32892 CASAVA_Build 5 160179730 1I GAGATTAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 158 hom 31 1 23 7 A 9 10 32893 CASAVA_Build 5 160184549 1I CCTTAAACTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 8 9 32894 CASAVA_Build 5 160190697 1D TTCAACACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 11 10 32895 CASAVA_Build 5 160197218 3I TGTTGTAGTT ---/CTC CTCTCTGAAG 3070 hom 144 het 51 0 49 2 CTC 1 2 32896 CASAVA_Build 5 160212492 1I TAAGGGTAGT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 8 9 32897 CASAVA_Build 5 160226787 4I ATATATATGC ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 60 het 32 0 21 11 AT 7 9 32898 CASAVA_Build 5 160232700 1I ATTCCTAAGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 402 hom 45 2 31 12 T 8 9 32899 CASAVA_Build 5 160242183 1I ATAAATTCAT -/A AAAAAAGTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 6 7 32900 CASAVA_Build 5 160243072 1I TGTGTAGTGA -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 138 het 57 0 47 10 T 7 8 32901 CASAVA_Build 5 160250144 3I TTGTGTCTGG ---/CTT CTTTCACTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CTT 1 2 32902 CASAVA_Build 5 160250588 2D ATGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 102 het 46 0 33 16 GT 9 8 32903 CASAVA_Build 5 160254820 1I AGGCTAAATG -/C CCCCATTAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 C 4 5 32904 CASAVA_Build 5 160255825 2D AAAACCCTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 6 A 13 11 32905 CASAVA_Build 5 160260386 4I CATTTTTTTT ----/TTGC TTATTTGTGG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TTGC 0 1 32906 CASAVA_Build 5 160263718 1I GTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 16 21 11 T 10 11 32907 CASAVA_Build 5 160287601 2D AGAAGGAAAC AG/-- AGCAACAGCC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 AG 2 1 32908 CASAVA_Build 5 160298030 4D GGACCAAAGG CTCA/---- CTCACCTCAG 3070 het 3070 ref 59 32 17 12 CTCA 2 1 32909 CASAVA_Build 5 160307854 1D CTCTGCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 498 hom 27 2 12 13 T 13 12 32910 CASAVA_Build 5 160311185 3D AGAAAGTGAC ACT/--- ACATTTTTCA 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 ACT 1 0 32911 CASAVA_Build 5 160321750 1I CTTTTCCCTG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 A 7 8 32912 CASAVA_Build 5 160322147 1D CTTTTTAAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 T 10 9 32913 CASAVA_Build 5 160334210 21D AGATTTGAGG GGTCAAGGGGAGAGAAAACAC/--------------------- GGTATCCTAC 3070 het 3070 ref 41 24 19 1 GGTCAAGGGGAGAGAAAACAC 1 0 32914 CASAVA_Build 5 160348319 1D GGAAAAACAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 9 8 32915 CASAVA_Build 5 160350887 3D CTGATGAACC TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 617 hom 38 3 15 20 TTA 7 6 32916 CASAVA_Build 5 160361142 1I ACAGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 10 11 32917 CASAVA_Build 5 160361460 1D GAAAGCATTT C/- TTTGTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 28 9 3 C 1 0 32918 CASAVA_Build 5 160363005 2D TCCTTAAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 2045 het 644 hom 37 7 6 24 T 16 14 32919 CASAVA_Build 5 160369204 2I GAGAGGACTT --/GG GGGGAGTGGT 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 G 4 6 32920 CASAVA_Build 5 160372407 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 T 11 10 32921 CASAVA_Build 5 160372729 1D CAGTCCACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 14 6 T 13 12 32922 CASAVA_Build 5 160378732 1I CATGTATAGG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 A 7 8 32923 CASAVA_Build 5 160379363 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1823 hom 36 het 16 0 10 7 TA 8 7 32924 CASAVA_Build 5 160383525 1D TGAAAGGTGA T/- TTTCAACTAT 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 T 4 3 32925 CASAVA_Build 5 160387138 1D CAAAGCCACA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 20 10 2 T 8 7 32926 CASAVA_Build 5 160407181 6D CCCAGGTGAT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 2820 het 1120 hom 23 4 8 11 TTG 7 5 32927 CASAVA_Build 5 160409787 6I AGGGTAAAAT ------/AATAGA AATAGAGTAC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 AATAGA 1 2 32928 CASAVA_Build 5 160417535 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3005 hom 29 9 14 6 A 12 11 32929 CASAVA_Build 5 160420520 1I ATAGTTTTCA -/T TGTAATTCAG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 1 2 32930 CASAVA_Build 5 160423964 1D CTGATAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 280 hom 32 1 29 3 A 11 10 32931 CASAVA_Build 5 160429102 1D ACAGAGGAAA G/- GGAAACTTTC 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 G 3 2 32932 CASAVA_Build 5 160438543 2I TGCTGAGCAC --/AG AGTCTGAGGC 3070 hom 157 het 58 0 52 6 AG 1 2 32933 CASAVA_Build 5 160442147 1D TGAATAAACC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 T 9 8 32934 CASAVA_Build 5 160442347 5I GTTGTTAGGG -----/TCTTC TCTTAACTAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TCTTC 0 1 32935 CASAVA_Build 5 160452017 4D TTGTGGATCA ATCC/---- ATCCCTGTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 ATCC 2 1 32936 CASAVA_Build 5 160453029 3D CAGATAGCAG CCT/--- CCTCCCTGCT 3070 hom 53 het 23 0 13 10 CCT 2 1 32937 CASAVA_Build 5 160458236 4D AATATAATAT AATA/---- GTTATTTATT 3070 het 3070 hom 39 15 22 6 AATA 1 0 32938 CASAVA_Build 5 160467867 1D AGGCCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 33 1 25 8 A 12 11 32939 CASAVA_Build 5 160472710 4I CTCTTTTGAG ----/ATTT ATTTACCCTT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 ATTT 1 2 32940 CASAVA_Build 5 160485759 1D ACATTGTGAA T/- TTAAGAGCTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 3 2 32941 CASAVA_Build 5 160527469 1I AGTTTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 345 hom 35 3 21 11 T 14 15 32942 CASAVA_Build 5 160529807 2D TTATTCCGTT TG/-- TGTGTGTGTG 929 hom 18 het 12 0 7 5 TG 10 9 32943 CASAVA_Build 5 160530393 1D CTCACCAGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 85 het 35 0 28 7 T 10 9 32944 CASAVA_Build 5 160531759 2D GTTTAAATTT AA/-- GTTTCCTGTA 3070 hom 111 het 39 0 37 4 A 2 0 32945 CASAVA_Build 5 160534645 1I GTTATAAATT -/C ATAACTATAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 C 0 1 32946 CASAVA_Build 5 160535805 1I GTTTTATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1016 hom 48 3 39 6 T 10 11 32947 CASAVA_Build 5 160537884 1D TTTTAAAAAA G/- ATTGGATGGT 3070 hom 111 het 41 0 38 5 G 1 0 32948 CASAVA_Build 5 160542747 2D AAAAAAAAAA AG/-- AATGAGATCC 3070 het 115 hom 34 4 19 11 AG 1 0 32949 CASAVA_Build 5 160543878 4I GGCTGCTGTG ----/TATT TATTTGTGTG 3070 hom 93 het 37 0 29 8 TATT 1 2 32950 CASAVA_Build 5 160544810 11I CTGGGAGTGG -----------/TGGCTCATGCC TGTAATTCCA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 TGGCTCATGCC 0 1 32951 CASAVA_Build 5 160547731 5I TTCTTTTTTT -----/TTTTC TTTTGAGATG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TTTTC 0 1 32952 CASAVA_Build 5 160548540 1D TATGTATATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 9 32953 CASAVA_Build 5 160553690 5I ACACAGAGAG -----/TTAAT TTAAGTTCTT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TTAAT 0 1 32954 CASAVA_Build 5 160562921 1I GACCATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 770 hom 37 4 19 14 T 13 14 32955 CASAVA_Build 5 160566258 1D CCACACTAAT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 8 7 32956 CASAVA_Build 5 160573454 1D AATTGGGCCC T/- TTCTGTTGAC 3070 hom 102 het 41 0 35 8 T 3 2 32957 CASAVA_Build 5 160576209 1D GGGTCCTCAC T/- ACAGATTCTA 3070 hom 41 het 20 0 12 8 T 1 0 32958 CASAVA_Build 5 160581580 1D AGATAAGAAC A/- ATATTTGCAA 3070 hom 129 het 51 0 44 9 A 2 1 32959 CASAVA_Build 5 160582028 1D GTCAAAGACG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 8 7 32960 CASAVA_Build 5 160583963 4D46M4I CAAATGGGAC TTAATTAAACTAAAGAGTGTCTGCATAGCAAAAGAAACTCTCAACAGAGT----/----TTAAACTAAAGAGTGTCTGCATAGCAAAAGAAACTCTCAACAGAGTAAAC AAACAATCTG 3070 hom 102 het 34 0 35 9 N/A 0 0 32961 CASAVA_Build 5 160585780 1I TTGTTTCTGA -/C TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 37 1 32 4 C 0 1 32962 CASAVA_Build 5 160586564 1D TTCAAAAAAG A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 6 32963 CASAVA_Build 5 160586936 1D CCTGGCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 32964 CASAVA_Build 5 160594649 1D AGAGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 1133 het 1133 ref 37 25 3 10 A 12 11 32965 CASAVA_Build 5 160603688 3I AGCCCTCACT ---/TAA CTTGCAAAAG 3070 hom 69 het 26 0 22 4 TAA 0 1 32966 CASAVA_Build 5 160605673 1D GTCCCACCCC T/- ATCTCCCTTA 3070 hom 92 het 32 0 31 1 T 1 0 32967 CASAVA_Build 5 160687437 1D TTGATCTTGG A/- AAAAAAAAAA 1298 het 1298 ref 34 26 3 5 A 11 10 32968 CASAVA_Build 5 160738333 1I TACTAGAAGT -/G GAAATGCCAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 1 2 32969 CASAVA_Build 5 160740450 1I TTACAAGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 33 1 24 8 A 10 11 32970 CASAVA_Build 5 160823224 3I GAGAAAAAAC ---/AAT AATGCTGGAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AAT 1 2 32971 CASAVA_Build 5 160829094 1I CTTAAAAACC -/A AAAAAAAACC 3070 het 328 hom 52 1 46 5 A 8 9 32972 CASAVA_Build 5 160847640 1D AAGAATAATT G/- ATCAGGTGAA 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 G 1 0 32973 CASAVA_Build 5 160848905 1D GCAACATAAA T/- GAGGCAGATA 3070 het 3070 ref 52 28 18 7 T 1 0 32974 CASAVA_Build 5 160849169 17D CTTAGCATCT CAGTGAAATTACTGAGA/----------------- CAGGCTACAT 3070 het 3070 ref 52 40 15 5 CAGTGAAATTACTGAGA 1 0 32975 CASAVA_Build 5 160857935 1D AAATCTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 38 0 27 11 T 12 11 32976 CASAVA_Build 5 160909120 1D AGGATCGGGG T/- TGGGGGGGTG 2689 hom 30 het 14 0 9 5 T 2 1 32977 CASAVA_Build 5 160921116 1I GGAGAGTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 17 hom 15 1 11 3 T 9 10 32978 CASAVA_Build 5 160938481 2D CTGTTGCCCT CA/-- TATGCCACAC 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 CA 1 0 32979 CASAVA_Build 5 160945322 1I GTATCAATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 9 10 32980 CASAVA_Build 5 160947839 3I AGAAGTGTCT ---/GAC GTTCATGTCC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 GAC 0 1 32981 CASAVA_Build 5 160952493 4I AGAAATCAAT ----/ATAA ATATTTTGAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 ATAA 0 1 32982 CASAVA_Build 5 160957270 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2390 hom 33 12 17 4 A 12 11 32983 CASAVA_Build 5 160958559 1I AAACTCTCCC -/A AAAAATGAAG 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 5 6 32984 CASAVA_Build 5 160959130 1I TTCTGTAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 41 het 32 1 28 3 T 8 9 32985 CASAVA_Build 5 160961067 12D AACTCTGTAG AAGGTACTGTGC/------------ AAGGTACTGA 3070 het 3070 ref 40 21 19 6 AAGGTACTGTGC 1 0 32986 CASAVA_Build 5 160962382 1D CCTTTTAAAT A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 7 6 32987 CASAVA_Build 5 160981975 1D AGATTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 15 1 12 2 A 12 11 32988 CASAVA_Build 5 160982265 1D TGCCTATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 20 3 9 8 T 17 16 32989 CASAVA_Build 5 160984773 1D CTATCTCCTC A/- ATAAATAGCA 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 A 2 1 32990 CASAVA_Build 5 160991149 1I TATTTTATCA -/C TTCTTTCGTA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 C 0 1 32991 CASAVA_Build 5 161017195 4I AAAAATGGAA ----/ATAG ATAGGAGCAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 ATAG 1 2 32992 CASAVA_Build 5 161021357 1D TGAGAAAGTG A/- AAAAACAATC 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 A 6 5 32993 CASAVA_Build 5 161021710 1I AGCCACTGAG -/A AAAAAGAGTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 5 6 32994 CASAVA_Build 5 161025384 2D CAATTTCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 1271 het 1271 ref 45 33 3 9 TC 9 8 32995 CASAVA_Build 5 161028455 5I CTTCCATTCC -----/TCTGT TCTAAGTATT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TCTGT 0 1 32996 CASAVA_Build 5 161034813 1D CATTTTCCTA G/- GTTTCAATAG 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 G 2 1 32997 CASAVA_Build 5 161035097 1I TTTTCTAGTG -/T TAAGAAATGT 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 T 1 2 32998 CASAVA_Build 5 161038047 1D AGCCCTCTCC T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 110 het 44 0 36 8 T 7 6 32999 CASAVA_Build 5 161053242 1D CTGCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 28 2 11 15 A 11 10 33000 CASAVA_Build 5 161053894 1I AGTAAGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 A 11 12 33001 CASAVA_Build 5 161072200 1I GACACAGGAA -/G GGGAACATCA 1814 hom 10 het 4 0 4 0 G 3 4 33002 CASAVA_Build 5 161073789 3I AAAGGAAAAA ---/ATG ATGAGGGACA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 ATG 1 2 33003 CASAVA_Build 5 161074305 2I TTCAATAGCA --/TT TTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 6 8 33004 CASAVA_Build 5 161075088 5D ACTCCATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1245 het 149 hom 11 2 4 6 A 21 16 33005 CASAVA_Build 5 161079332 4I TTTCAAAGTG ----/TTAA TTGTCAGTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTAA 0 1 33006 CASAVA_Build 5 161081699 2D AGCAAGAAAC TT/-- TTACTTTTCT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 T 4 2 33007 CASAVA_Build 5 161091500 1D TTGCTAATTT A/- TTATTGATAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 1 0 33008 CASAVA_Build 5 161091901 1I GTTCTATGTT -/G TAAAGTCAGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 0 1 33009 CASAVA_Build 5 161096142 1I AGTTTTATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2892 hom 34 10 18 6 T 8 9 33010 CASAVA_Build 5 161096934 1I TACCACAAAA -/T ATAAGAATAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 0 1 33011 CASAVA_Build 5 161101241 1D TCTCCAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2325 hom 33 13 13 7 T 17 16 33012 CASAVA_Build 5 161105766 2I GTGTATGTGT --/GA GTGTGTATAT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 GA 0 1 33013 CASAVA_Build 5 161107321 1I GGGTTAAGAA -/G GCTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 1 2 33014 CASAVA_Build 5 161110034 1I CTTCATTTTA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 7 8 33015 CASAVA_Build 5 161119846 1I ATAAGATTAC -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 A 6 7 33016 CASAVA_Build 5 161142102 1D CCTTTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 13 13 A 11 10 33017 CASAVA_Build 5 161146006 1D TAAGTATATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 A 9 8 33018 CASAVA_Build 5 161148693 4I ATCAATTAAA ----/TAAT TAATCAACAC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 TAAT 1 2 33019 CASAVA_Build 5 161154308 2I TCCATGACTC --/TT TCTTTTATTC 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 1 3 33020 CASAVA_Build 5 161156499 3I CAACTAAGTG ---/AAC AACATTTAAT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 AAC 1 2 33021 CASAVA_Build 5 161165411 3D GAAACAAAAT ATC/--- ATGTGAACAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 ATC 1 0 33022 CASAVA_Build 5 161168630 1D TTTGTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 13 12 33023 CASAVA_Build 5 161173704 1I AACAAAGGAA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 8 33024 CASAVA_Build 5 161175409 1D CTTTTCACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 A 10 9 33025 CASAVA_Build 5 161200260 1D CCTAAAAAAA T/- ATATATATTT 2640 het 2640 ref 16 9 6 1 T 1 0 33026 CASAVA_Build 5 161213419 1D GTTTTCTCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 9 8 33027 CASAVA_Build 5 161216229 1D GAGATTTATG A/- AAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 A 7 6 33028 CASAVA_Build 5 161224403 5D TTTAAAAAGT AAATA/----- AAATAAAATA 2622 hom 18 het 8 0 7 1 AAATA 5 4 33029 CASAVA_Build 5 161228005 1D AAAATTGATG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 T 8 7 33030 CASAVA_Build 5 161232103 4D GTAGAAGCAG TTTC/---- TTTGTTTTCA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TTTC 1 0 33031 CASAVA_Build 5 161234030 1I TTGAAATATT -/C CCCCCCTGAT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 C 6 7 33032 CASAVA_Build 5 161241962 1D ATAAATGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 41 2 35 4 A 12 11 33033 CASAVA_Build 5 161245933 1D ATTTTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 T 12 11 33034 CASAVA_Build 5 161254300 1D CTTTTGTACT G/- AGTATAGTGC 3070 het 3070 hom 43 14 24 6 G 1 0 33035 CASAVA_Build 5 161254499 1I TATCAGAAAG -/A AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 6 7 33036 CASAVA_Build 5 161275969 1I TGACTCCTGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 8 9 33037 CASAVA_Build 5 161290339 1D TTGTTCTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 9 8 33038 CASAVA_Build 5 161319728 1D TTAGAGAAAG A/- ATATCTGGCT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 2 1 33039 CASAVA_Build 5 161320292 1I AAAAGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 10 11 33040 CASAVA_Build 5 161325403 20I AGTCCTTGCT --------------------/CCTAAATTACAATGTAATTA CCTAAATTAC 3070 het 3070 ref 53 28 18 8 CCTAAATTACAATGTAATTA 0 1 33041 CASAVA_Build 5 161333503 1I AGATTAAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 9 10 33042 CASAVA_Build 5 161334180 1I TGTGCAATGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 8 9 33043 CASAVA_Build 5 161343868 1D AGATATTCAC A/- AGGTCTTTTG 3070 het 3070 hom 33 16 15 4 A 2 1 33044 CASAVA_Build 5 161362977 4D TCTTTCCTCA AGAC/---- AGACGTGCAT 3070 het 3070 hom 47 19 20 10 AGAC 2 1 33045 CASAVA_Build 5 161364888 1D TGTAACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 13 12 33046 CASAVA_Build 5 161400256 1I ACCCACTACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 T 9 10 33047 CASAVA_Build 5 161406254 1I CAGCTACAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 88 het 39 0 30 9 A 8 9 33048 CASAVA_Build 5 161422290 3I CAAGACTCTG ---/TAA TAATAATAAC 3070 het 3070 ref 27 8 9 10 TAA 3 4 33049 CASAVA_Build 5 161430596 3I ATTTAACTTC ---/AAT AATCTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 AAT 1 2 33050 CASAVA_Build 5 161451224 1D CTGAAGTGTG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 34 14 13 8 A 9 8 33051 CASAVA_Build 5 161464347 5I GGAATTGAGA -----/TTTAT TTTAAGACAA 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 TTTAT 0 1 33052 CASAVA_Build 5 161466501 2I TTGTGTCTTG --/GC GGTGGGGGGT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 GC 0 1 33053 CASAVA_Build 5 161471845 1D CAAAAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 T 11 10 33054 CASAVA_Build 5 161471994 1D TTGAAAGACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 T 10 9 33055 CASAVA_Build 5 161475823 1D TCTACCAATC T/- ATCTATCTAT 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 T 1 0 33056 CASAVA_Build 5 161476030 8D TCTCATAGCC AAAAGGGG/-------- AAATAATAGA 3070 het 3070 hom 30 13 17 4 AAAAGGGG 1 0 33057 CASAVA_Build 5 161508023 1D ATAATAATCT A/- AAAAGAATCC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 5 4 33058 CASAVA_Build 5 161515072 2D ATTGCCTAAC AT/-- GTGGACTTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AT 1 0 33059 CASAVA_Build 5 161517963 1D TGCCTCGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 36 2 29 6 T 11 10 33060 CASAVA_Build 5 161524687 2I GGACCCCCCC --/CA CCCCACCACC 3070 hom 83 het 34 0 27 7 CA 0 1 33061 CASAVA_Build 5 161527172 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1909 het 92 hom 14 1 10 4 A 13 12 33062 CASAVA_Build 5 161527702 1D CCTTCAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 606 hom 24 3 13 8 A 13 12 33063 CASAVA_Build 5 161532408 1D CATCTCTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 15 8 A 14 13 33064 CASAVA_Build 5 161557541 1D AAGAATCTTC T/- TTTTTTTTTT 1672 het 1672 ref 43 27 4 12 T 13 12 33065 CASAVA_Build 5 161574598 3D CAAAGGAGAA GTT/--- GTTGTTACAG 3070 hom 96 het 39 0 32 9 GTT 3 2 33066 CASAVA_Build 5 161575416 1I TTGCAAGATA -/T TTAATAGAGG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 2 3 33067 CASAVA_Build 5 161580045 1D TTTCATGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 11 10 33068 CASAVA_Build 5 161581126 1D CAGGAAATAG A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 A 7 6 33069 CASAVA_Build 5 161585095 3I AATATATTTC ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 9 12 33070 CASAVA_Build 5 161585583 8D TGCCATTTAT TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 29 8 15 10 TTTA 6 4 33071 CASAVA_Build 5 161588638 1I GGAACACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 64 23 29 12 A 11 12 33072 CASAVA_Build 5 161592229 1I AGCATTTTGA -/G GGGCCAGGTC 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 G 3 4 33073 CASAVA_Build 5 161603061 3I CATGGCCACA ---/GAG GAGACTTACT 3070 hom 98 het 51 0 42 9 GAG 1 2 33074 CASAVA_Build 5 161605871 1I19M1D14M1D TATTCCAGCA -TTTTTTGTGGAATTATATCATTTTTTAGCTTTAAT/TTTTTTTGTGGAATTATATC-TTTTTTAGCTTTAA- TTTTATTCTC 3070 het 77 hom 21 1 13 11 N/A 0 0 33075 CASAVA_Build 5 161605960 4D CATTCATTTA TCTT/---- TCTTTATATT 3070 het 3070 ref 23 12 9 4 TCTT 2 1 33076 CASAVA_Build 5 161608386 1I GCAGCTGGGA -/G GCTCTTCTGC 3070 hom 108 het 42 0 35 7 G 1 2 33077 CASAVA_Build 5 161608629 1I ATTTTTATTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 8 9 33078 CASAVA_Build 5 161609564 1I AAGTATATCA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 7 8 33079 CASAVA_Build 5 161610745 3D AACGTACTGT CCC/--- CCCCCCCCAA 3070 het 1908 hom 32 9 16 7 C 11 8 33080 CASAVA_Build 5 161611245 1I TCTAGAATGC -/T GAGAAAGGAA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 0 1 33081 CASAVA_Build 5 161611800 6I TTCTCTGTTA ------/TTTATC TCTCGTTTCA 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 TTTATC 0 1 33082 CASAVA_Build 5 161614360 4I CTATTGCAAG ----/AGTT AGTTAGTCTC 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 AGTT 1 2 33083 CASAVA_Build 5 161615921 1D TTTAAAGGAA G/- GGATATCAAT 3070 hom 138 het 54 0 47 7 G 3 2 33084 CASAVA_Build 5 161616242 25D CTGCACTGGC TGTGACTTGTCAATAGAAGGAGCCT/------------------------- CTTGCAATTA 3070 het 3070 ref 61 32 31 5 TGTGACTTGTCAATAGAAGGAGCCT 1 0 33085 CASAVA_Build 5 161622539 1I CAGAATGAAG -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 6 7 33086 CASAVA_Build 5 161625211 1I TTTCTTGGGA -/T TCTGAAATTA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 1 2 33087 CASAVA_Build 5 161626829 1I TGTCCTGTGC -/T TTTCCTTTGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 3 4 33088 CASAVA_Build 5 161649750 1I AAAACACTTT -/A AAAAAATCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 33089 CASAVA_Build 5 161649955 4I ATGTGCCAAA ----/GTTT GTTTGTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 GTTT 2 3 33090 CASAVA_Build 5 161660869 2D ACCAAAATTG CA/-- CAGTCTAAGA 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 CA 2 1 33091 CASAVA_Build 5 161662199 4I TAAAGAAGTG ----/CAAA CAAAGTAGAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CAAA 1 2 33092 CASAVA_Build 5 161664650 1D AACCACATGA T/- TTATCTCAAT 3070 hom 98 het 38 0 35 3 T 3 2 33093 CASAVA_Build 5 161666964 1D CTATACATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 A 11 10 33094 CASAVA_Build 5 161667418 2I TCCAAATATT --/TA TATATATATA 2910 het 2565 hom 22 7 8 7 TA 6 7 33095 CASAVA_Build 5 161668440 4D TTAATGTGAC AATT/---- AAATAATGTA 3070 het 3070 hom 57 26 29 3 AATT 1 0 33096 CASAVA_Build 5 161669748 2D AGTTATCTTC CT/-- CTCTGTCACT 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 CT 3 2 33097 CASAVA_Build 5 161671947 5D AATTAATAGA TAAAT/----- TAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 TAAAT 1 0 33098 CASAVA_Build 5 161672562 1D GTTTATGATA T/- TTTTTGTAGC 3070 het 3070 hom 36 10 22 4 T 6 5 33099 CASAVA_Build 5 161672628 3D TGTGATTGAT AGA/--- AGTAGACAGA 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 AGA 1 0 33100 CASAVA_Build 5 161673528 6I CTAGAAAAAA ------/AGAATT AGAATATTCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AGAATT 0 1 33101 CASAVA_Build 5 161674281 6D TCCACAAACT TATAAA/------ TAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 20 10 4 TATAAA 1 0 33102 CASAVA_Build 5 161677159 6I CTCTGTGAGA ------/TATATG GATATATATA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TATATG 0 1 33103 CASAVA_Build 5 161677654 4D TCATTAAACC TCTT/---- TCTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 TCTT 2 1 33104 CASAVA_Build 5 161681155 1D GAAGTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2350 het 2350 ref 36 23 6 7 T 13 12 33105 CASAVA_Build 5 161683903 2D AGAAAATAAA TC/-- TCTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 TC 2 1 33106 CASAVA_Build 5 161684473 1I CCTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 9 10 33107 CASAVA_Build 5 161685848 2I CTTCAGCAAC --/CA CAGAGTTCAG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 CA 1 2 33108 CASAVA_Build 5 161695699 1I TTTTAGTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 41 2 33 6 T 10 11 33109 CASAVA_Build 5 161701971 1D ACACCACCCC T/- GGCACACACA 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 T 1 0 33110 CASAVA_Build 5 161703255 2D TGACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 18 0 14 5 AT 9 8 33111 CASAVA_Build 5 161704113 1D AAGACAGGAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 12 20 6 A 9 8 33112 CASAVA_Build 5 161705114 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 5 6 33113 CASAVA_Build 5 161707924 2I ACTTTTTCAT --/CC ATAATAACTT 3070 het 3070 hom 48 15 29 4 C 0 2 33114 CASAVA_Build 5 161709174 1D TGTGTTTCCG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 75 het 31 0 25 7 T 8 7 33115 CASAVA_Build 5 161712695 1D17M2I GAGATTTTTC TATCCACTTCCTGTACCA--/-ATCCACTTCCTGTACCATT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 17 14 6 N/A 0 0 33116 CASAVA_Build 5 161716392 15D TCACATACTG GTCAGCCATTTGTAT/--------------- GTCTTCATTT 3070 het 3070 ref 22 12 8 4 GTCAGCCATTTGTAT 1 0 33117 CASAVA_Build 5 161734052 1D ATGAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 784 het 784 ref 41 34 3 4 A 12 11 33118 CASAVA_Build 5 161741595 8D ACACATTCAC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 1785 hom 28 7 19 5 AT 10 6 33119 CASAVA_Build 5 161741925 9I GATGAGGATA ---------/ATGATGATG ATGATGATAA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 ATG 2 5 33120 CASAVA_Build 5 161764379 1I CCAACCATTA -/C CACTGCCTCT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 C 1 2 33121 CASAVA_Build 5 161765762 1D GGCCTGGATT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 A 8 7 33122 CASAVA_Build 5 161770745 4D CTCAGGGGAA AAAT/---- AAATAAGTAA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 AAAT 2 1 33123 CASAVA_Build 5 161772676 4D GCAGGCCAAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2752 het 2752 ref 36 19 7 12 T 14 10 33124 CASAVA_Build 5 161776259 1D TAAAAAATGC A/- AAAAAAATTA 3070 het 829 hom 16 4 10 2 A 8 7 33125 CASAVA_Build 5 161783168 1I AGGTCAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 26 1 15 10 A 10 11 33126 CASAVA_Build 5 161783178 2I AAAAAAAAAA --/AT GCCTAAATCT 3070 het 255 hom 26 2 13 11 AT 0 1 33127 CASAVA_Build 5 161789058 4D ACCTCATCTT ACTC/---- ACATACATCT 3070 het 3070 hom 38 18 19 4 ACTC 1 0 33128 CASAVA_Build 5 161794913 1D AAATGTGTGC A/- AATGTATGTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 3 2 33129 CASAVA_Build 5 161795762 2D TATTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2556 het 2556 ref 24 14 8 2 T 12 10 33130 CASAVA_Build 5 161797320 1D TCAACACTGA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 7 6 33131 CASAVA_Build 5 161797450 2D CACAGATACT GC/-- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 GC 1 0 33132 CASAVA_Build 5 161806076 1D TTAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 5 A 12 11 33133 CASAVA_Build 5 161816410 1I ATTTTCCCCC -/T GGTACCTCTG 3070 hom 98 het 37 0 32 5 T 0 1 33134 CASAVA_Build 5 161816857 1D GGTTAAGGAA C/- CTAATAAACA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 C 2 1 33135 CASAVA_Build 5 161827108 1I TCTTGGAGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 10 33136 CASAVA_Build 5 161839510 4D TTAATTATTC TTTA/---- TTTATTTTAT 3070 hom 57 het 20 0 20 2 TTTA 2 1 33137 CASAVA_Build 5 161845910 1D TCATCTTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 9 8 33138 CASAVA_Build 5 161850659 1I ATGGTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 28 2 21 5 T 11 12 33139 CASAVA_Build 5 161853155 1I AGCTGGGGGG -/C GGTGCTTCTT 3070 hom 102 het 41 0 29 12 C 0 1 33140 CASAVA_Build 5 161861466 2D TACATAAAAC AT/-- ATTTACATGC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AT 2 1 33141 CASAVA_Build 5 161867446 2D CCTTTGGAAC TG/-- TGTGAACCAT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TG 3 2 33142 CASAVA_Build 5 161868537 2D AATGAGCAAG TT/-- TTCCTACAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 4 2 33143 CASAVA_Build 5 161869113 2I GTTGTGTACT --/GC TTCCTTCTGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 GC 0 1 33144 CASAVA_Build 5 161872624 1I CCTCTCTTCC -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 69 het 35 0 20 15 T 6 7 33145 CASAVA_Build 5 161872666 4I TTCTGTCTTC ----/CTTT CTTTCTTTCT 3070 hom 25 het 22 0 10 12 CTTT 2 3 33146 CASAVA_Build 5 161877916 4D TTTGTTGTTT CTAA/---- CTATTTTTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CTAA 1 0 33147 CASAVA_Build 5 161881557 1I TTGTTGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 26 1 20 5 T 10 11 33148 CASAVA_Build 5 161882710 1D GCCATTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1432 hom 42 6 25 12 T 13 12 33149 CASAVA_Build 5 161886548 7I TTTTTCCCAT -------/ACTTCTG ACTTCTGGTA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 ACTTCTG 1 2 33150 CASAVA_Build 5 161890171 3I CAAATAAACA ---/AAC AAAAAACCAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAC 0 1 33151 CASAVA_Build 5 161891078 10D AGTGAGGCAA TGCCTCGCCC/---------- TGCTTTGGCT 2886 hom 18 het 8 0 7 2 TGCCTCGCCC 1 0 33152 CASAVA_Build 5 161891185 1D GGAAATGCAG A/- AATCACCGTC 3070 hom 72 het 27 0 24 4 A 3 2 33153 CASAVA_Build 5 161891515 4D CTCAAATAAC AAAT/---- GAATTAATAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 9 AAAT 1 0 33154 CASAVA_Build 5 161893131 1I AGTAATTGGA -/T TCAAAGTAAC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 2 33155 CASAVA_Build 5 161899158 3D ATATATAATA ATG/--- ATTACTTGTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ATG 1 0 33156 CASAVA_Build 5 161900810 4D CTCCTTATTA CTAG/---- CTATTATTGA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 CTAG 1 0 33157 CASAVA_Build 5 161903813 3D TTAATGTAAA TAT/--- TATTTAGACA 3070 het 3070 hom 21 10 11 1 TAT 2 1 33158 CASAVA_Build 5 161905739 1I ACAACTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 10 11 33159 CASAVA_Build 5 161906200 1D TACTTTATGG T/- TTTTTTTTTT 921 het 921 ref 37 25 4 8 T 13 12 33160 CASAVA_Build 5 161907386 2I AATGACTTTA --/TG TTTTTCCTGT 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 TG 0 1 33161 CASAVA_Build 5 161911818 1D AAATGTAGCC T/- TTGAGTTTTA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 3 2 33162 CASAVA_Build 5 161912404 5I TCCTCATAGA -----/TATGT TATGTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 TATGT 1 2 33163 CASAVA_Build 5 161923204 4I ATACAGCGTT ----/CTTA TACAAAAGTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CTTA 0 1 33164 CASAVA_Build 5 161928348 1D AGAGTGGGGC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 8 7 33165 CASAVA_Build 5 161932073 1D ATTTAAAAAC A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 7 6 33166 CASAVA_Build 5 161936446 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 47 het 19 0 16 3 A 8 7 33167 CASAVA_Build 5 161944651 3D AGCTCTAGAA TTT/--- TTATTTCATT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 5 2 33168 CASAVA_Build 5 161946547 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 18 7 A 14 15 33169 CASAVA_Build 5 161946835 1D ATCTCAGCAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2388 hom 35 6 21 8 T 9 8 33170 CASAVA_Build 5 161948559 3I GTGAAATGTA ---/AAG AAGTTCTCAA 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 AAG 1 2 33171 CASAVA_Build 5 161949393 1I ATGAGGGTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 20 8 9 T 9 10 33172 CASAVA_Build 5 161950796 1D GGACGACTGA T/- TTTTTTGTAC 3070 het 3070 ref 48 25 19 5 T 7 6 33173 CASAVA_Build 5 161955917 1D CATAATCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 714 hom 45 2 35 9 T 11 10 33174 CASAVA_Build 5 161959208 5D TTCGAAAACA TTACT/----- TTACTCCTAT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TTACT 2 1 33175 CASAVA_Build 5 161963226 1D GTTGCTTCTT A/- ACAGCAGGCA 3070 het 3070 hom 47 22 22 4 A 2 1 33176 CASAVA_Build 5 161963517 2D43M2D GCAGAATGGC TTTTTTTTTTTTTCTATCTCTTTCAATGATTCTCTCTGCTGAGGTAG/--TTTTTTTTTTTCTATCTCTTTCAATGATTCTCTCTGCTGAGGT-- GTAGCCTATT 3070 het 3070 ref 36 23 12 20 N/A 0 0 33177 CASAVA_Build 5 161963922 1D GAGCCCTTAA C/- TTCTTAGTTA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 C 1 0 33178 CASAVA_Build 5 161964384 5D TTTTTTCTTT TTAAA/----- TTGAGTATAG 2427 het 2427 ref 23 13 6 6 TTAAA 1 0 33179 CASAVA_Build 5 161965857 9I TGATATAGTA ---------/AAAATAGTT AAGGTAAGGA 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 AAAATAGTT 0 1 33180 CASAVA_Build 5 161967089 1D GTATTTATTG T/- TTTTTTCCTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 6 33181 CASAVA_Build 5 161967631 2D TTTTTGCAGT AG/-- AGTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 AG 2 1 33182 CASAVA_Build 5 161969652 1D TTGCATAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1575 hom 28 7 14 7 A 17 16 33183 CASAVA_Build 5 161973132 2D ATTTTATCTA CT/-- CTCTTTTTCC 3070 het 3070 hom 49 24 23 3 CT 3 2 33184 CASAVA_Build 5 161983344 4D AGGTGAAGGA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 24 het 22 0 13 12 AT 10 8 33185 CASAVA_Build 5 161983432 2I AAAAAAAATC --/TA TATATTTTTC 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 TA 2 3 33186 CASAVA_Build 5 161991521 1D AAAGTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1411 het 1411 ref 34 23 3 8 A 12 11 33187 CASAVA_Build 5 161992472 1D TTCTCCGATC A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 8 7 33188 CASAVA_Build 5 162009199 4D ATAGCTGATT ATTA/---- ATTATTCTAG 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 ATTA 2 1 33189 CASAVA_Build 5 162015542 3D ACTAAAAAAC TAT/--- TATTGGAATG 3070 het 2021 hom 25 6 17 4 TAT 2 1 33190 CASAVA_Build 5 162021014 4D TTAGTGATGT TGAG/---- TAATTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TGAG 1 0 33191 CASAVA_Build 5 162039023 3I CTCCATGAAC ---/ATG ATAACCATCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 ATG 0 1 33192 CASAVA_Build 5 162041427 1D GTGAGATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 15 13 A 12 11 33193 CASAVA_Build 5 162049252 2D TGTGTGCATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 TG 8 7 33194 CASAVA_Build 5 162049348 2D TATATGTGCG TA/-- TATATGTGTG 3070 het 3070 ref 39 16 19 5 TA 3 2 33195 CASAVA_Build 5 162059038 1D CGACACTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 12 11 33196 CASAVA_Build 5 162074526 4D TGTTTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 602 het 602 ref 35 15 6 16 TTTG 1 0 33197 CASAVA_Build 5 162085984 1D GCATCTTCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 60 24 28 8 T 10 9 33198 CASAVA_Build 5 162088613 1I ATTCTTGGCA -/T TTTGAATAAA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 3 4 33199 CASAVA_Build 5 162089429 1I GCCATGTTTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 7 8 33200 CASAVA_Build 5 162090612 1I TTTATTTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 274 hom 16 4 9 3 A 0 1 33201 CASAVA_Build 5 162113526 1I AAAAAAGTGA -/G GGGGGGTAAT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 G 6 7 33202 CASAVA_Build 5 162114653 1D TCCCTCTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2694 hom 31 8 15 8 A 10 9 33203 CASAVA_Build 5 162135478 1D AAGAGACGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2393 hom 19 5 10 4 T 10 9 33204 CASAVA_Build 5 162140711 4D AATTGATTTT TTTA/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 15 18 1 TTTA 1 0 33205 CASAVA_Build 5 162148436 1I ACCACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 12 21 13 T 14 15 33206 CASAVA_Build 5 162148892 2I ATGGATTGTC --/CT CTCTCTGCCA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 CT 3 4 33207 CASAVA_Build 5 162158509 1I ATATTAGCTA -/G TTTTGTTGCT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 G 0 1 33208 CASAVA_Build 5 162159616 5D TCTCAAAATT CTTAA/----- CTTAATTATA 3070 het 3070 ref 32 21 9 3 CTTAA 2 1 33209 CASAVA_Build 5 162168332 21I AACTGTTCTG ---------------------/TGAAATAAGCTACAGCCCATT TGAATATGAC 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 TGAAATAAGCTACAGCCCATT 0 1 33210 CASAVA_Build 5 162170046 1I ATGAAATATC -/A GGGGTGAATT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 0 1 33211 CASAVA_Build 5 162174129 1D TTGTTTATTT C/- CATTGGCTTT 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 C 2 1 33212 CASAVA_Build 5 162176355 1I TAAAGTATAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 935 hom 19 4 10 5 T 2 3 33213 CASAVA_Build 5 162177513 1I AAGCATGATC -/A AAATTTATTC 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 3 4 33214 CASAVA_Build 5 162182191 6D TGAGAATCAT TTGGTA/------ TTTTATACCA 3070 het 3070 hom 49 19 25 6 TTGGTA 1 0 33215 CASAVA_Build 5 162190305 1I9M23I3M2D TTAATAATAG -CCCATTTAT-----------------------ACTGA/ATAGATTTCTGTTCACGTAAAGGAAAACACACAACT-- ATTTATACTG 3070 het 3070 ref 21 16 7 3 N/A 0 0 33216 CASAVA_Build 5 162197385 1I TTATCAAGGG -/A AAAAATCTGC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 5 6 33217 CASAVA_Build 5 162197693 1I GAAAGTCCAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 6 7 33218 CASAVA_Build 5 162198005 1D ATTATGCCCT A/- ACTAATCTCC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 2 1 33219 CASAVA_Build 5 162199942 3I CAGGATTTTG ---/TTC TTTTTTTTGG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 TTC 0 1 33220 CASAVA_Build 5 162202639 1D CTTTAAGAGT C/- CCATTAAACA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 C 3 2 33221 CASAVA_Build 5 162204457 1D TTCCAAAGGG A/- AAAAAAAAAG 2224 het 2224 ref 24 16 7 2 A 10 9 33222 CASAVA_Build 5 162205106 4D ATAGACTTCC CTGA/---- CTGTCTTTCT 3070 het 3070 hom 44 19 24 4 CTGA 1 0 33223 CASAVA_Build 5 162212589 1D GGCCACAACA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 1 0 33224 CASAVA_Build 5 162219270 1D AAAATAGCAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 2439 hom 22 6 13 4 A 8 7 33225 CASAVA_Build 5 162222994 1I GATTCAATAG -/A AAAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 5 6 33226 CASAVA_Build 5 162225790 3D ATTGACAGCG ATA/--- ATGTCACTCA 3070 het 3070 ref 29 12 13 5 ATA 1 0 33227 CASAVA_Build 5 162226894 1D AGAAAAGGTG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 31 12 16 5 A 8 7 33228 CASAVA_Build 5 162237792 1I ATGATGGATA -/T TTTTTTCCTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 7 33229 CASAVA_Build 5 162241119 1D TTTCTTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 16 9 T 12 11 33230 CASAVA_Build 5 162241258 9I AGTGATTTTC ---------/CTACCTCAG CTACCTCAGC 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 CTACCTCAG 1 2 33231 CASAVA_Build 5 162241633 1D GGGATATGGC G/- GGGGGGGTGC 3070 hom 56 het 29 0 18 12 G 8 7 33232 CASAVA_Build 5 162242068 2I TTGTCATTAT --/TA GTTTATTTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TA 0 1 33233 CASAVA_Build 5 162244088 4D CCATTTGAAA TAAT/---- TAATTTTGAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TAAT 2 1 33234 CASAVA_Build 5 162245279 1D GACACTAAAG T/- TTGAGACCCC 3070 het 3070 ref 39 18 14 10 T 3 2 33235 CASAVA_Build 5 162259141 1D TGAGTAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 10 9 33236 CASAVA_Build 5 162260248 2D CATTTTTCAC AT/-- GACTAGGAAA 3070 het 3070 hom 38 18 19 2 AT 1 0 33237 CASAVA_Build 5 162261215 3D TTTTCTTTCA TTT/--- TTTTCTTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 7 4 33238 CASAVA_Build 5 162264056 1D CTCTGTCTTC A/- AGCATTTATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 1 33239 CASAVA_Build 5 162264367 1D ATTGATTTCA T/- TTTTTTTTTT 2617 het 1783 hom 31 11 8 12 T 17 16 33240 CASAVA_Build 5 162265464 2I TGCATGTGCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 TG 8 9 33241 CASAVA_Build 5 162268936 2I TGATATATAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 AT 5 6 33242 CASAVA_Build 5 162271452 1I AAAAACAAAC -/A AAACACTCAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 3 4 33243 CASAVA_Build 5 162276777 4I ATTTTTTGGG ----/GGTA GGGTGGGCAT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 GGTA 0 1 33244 CASAVA_Build 5 162276810 6D GTTTTTTTTA ATAAAT/------ ATATTTTTCT 631 het 631 ref 19 5 2 14 ATAAAT 1 0 33245 CASAVA_Build 5 162279056 1I TGTTTTGTGG -/T TTTCTGTGTA 3070 het 3070 hom 55 24 26 5 T 3 4 33246 CASAVA_Build 5 162281684 4I TGTTTTGTCA ----/CTCT CTCTCTCGTT 3070 hom 75 het 39 0 26 13 CT 3 5 33247 CASAVA_Build 5 162291112 1I GTCCACTCTT -/G GCAGCTGTTT 3070 het 3070 ref 54 31 20 3 G 1 2 33248 CASAVA_Build 5 162296459 3I TTAGATGATC ---/TAT TATTAGAAAT 3070 het 3070 ref 46 24 21 1 TAT 1 2 33249 CASAVA_Build 5 162301023 1D TCTCTTTAGC A/- ATGTTGACTC 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 A 2 1 33250 CASAVA_Build 5 162307077 1I CTCTTTCAAA -/G TTTCCTACAC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 G 0 1 33251 CASAVA_Build 5 162321901 1D TTAGCAATAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 351 hom 57 1 47 10 T 10 9 33252 CASAVA_Build 5 162337147 1I CGAAATTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 11 12 33253 CASAVA_Build 5 162338071 2I TACTACACTC --/TG TGGTTTTATC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TG 1 2 33254 CASAVA_Build 5 162342235 3D CCCTGGGAGA CAG/--- CAGGTTTCAT 3070 hom 159 het 59 0 53 8 CAG 2 1 33255 CASAVA_Build 5 162346030 3I AATAAACCTT ---/CTC CTAAGATTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTC 0 1 33256 CASAVA_Build 5 162379358 1I ATATTTAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 9 10 33257 CASAVA_Build 5 162382282 4I GAAGAAGGGA ----/AGGG AGGGAGGGAG 1828 hom 15 het 10 0 5 5 AGGG 3 4 33258 CASAVA_Build 5 162393946 1I CAATTAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 564 hom 21 3 11 7 T 13 14 33259 CASAVA_Build 5 162395033 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 9 10 33260 CASAVA_Build 5 162404037 1I TGCCTACATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 A 10 11 33261 CASAVA_Build 5 162421380 1D GCTTGTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 25 0 18 7 A 13 12 33262 CASAVA_Build 5 162425609 4I TTAATCTTTC ----/TTTT GTTTCAGAGA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 0 4 33263 CASAVA_Build 5 162425975 1D GTTCCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 11 10 33264 CASAVA_Build 5 162430609 1D GCCCATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 295 hom 32 1 24 8 T 11 10 33265 CASAVA_Build 5 162447265 1I TTCTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 29 2 25 2 C 0 1 33266 CASAVA_Build 5 162456856 1D CTTTTGCTAT C/- CCACTGGTAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 3 2 33267 CASAVA_Build 5 162461178 1I TTTTCTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 30 0 19 11 T 10 11 33268 CASAVA_Build 5 162465500 1I TCGTTCTTTC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 7 8 33269 CASAVA_Build 5 162470653 2I AAAATAATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AT 6 7 33270 CASAVA_Build 5 162471461 3D CACCTAAATG CTT/--- CTTATTATGT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CTT 2 1 33271 CASAVA_Build 5 162472545 8I TTCCCTTAGA --------/GCAAATAG GCAAATAGAT 3070 hom 132 het 47 0 45 3 GCAAATAG 1 2 33272 CASAVA_Build 5 162485187 5D TGGCATGGTT TTCTG/----- AGCCTGGTGC 3070 hom 126 het 44 0 42 2 TTCTG 1 0 33273 CASAVA_Build 5 162486238 1I GTTAATGATC -/A TCTTTTCAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 0 1 33274 CASAVA_Build 5 162491209 3I CTGGGGCCAG ---/AAA AAAAAAAAAA 1785 hom 15 het 12 0 6 6 A 15 18 33275 CASAVA_Build 5 162491685 2D TTTCTCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 6 T 12 10 33276 CASAVA_Build 5 162493497 2D AGAGTTCCCC CT/-- GTTAACCAGG 3070 hom 117 het 43 0 38 6 CT 1 0 33277 CASAVA_Build 5 162494985 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 18 1 15 2 A 14 15 33278 CASAVA_Build 5 162520527 1D AGGTCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 33 2 28 3 A 11 10 33279 CASAVA_Build 5 162521323 4D CTGAGTTGTT TTTG/---- TTTGTGTTGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTTG 2 1 33280 CASAVA_Build 5 162526959 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAG 2332 het 250 hom 10 1 7 2 A 9 10 33281 CASAVA_Build 5 162540488 1D GCTGAAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 9 8 33282 CASAVA_Build 5 162542961 1I CTTTTAGGGG -/A AAAAAATGCA 3070 het 546 hom 33 2 28 3 A 6 7 33283 CASAVA_Build 5 162544691 5I TCTTATTATA -----/TTTAT TTTATCTAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TTTAT 1 2 33284 CASAVA_Build 5 162550661 1D TTTGAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 237 hom 44 1 35 8 A 12 11 33285 CASAVA_Build 5 162555017 1I AAAAAAAAAA -/T TAAGCTTCTG 3070 het 10 hom 30 1 22 7 T 1 2 33286 CASAVA_Build 5 162559237 30D GGAGCTCTCT ATTAATATCTTCACAATTAATATTGTGAAG/------------------------------ ATACTATTAA 3070 hom 99 het 30 0 34 1 ATTAATATCTTCACAATTAATATTGTGAAG 1 0 33287 CASAVA_Build 5 162577699 1D TAAAGTATTT A/- AAAAAAAAAA 2075 het 1906 hom 16 8 6 2 A 15 14 33288 CASAVA_Build 5 162582237 5D ACAGATACTA TATTT/----- TATATTATTT 3070 het 3070 hom 48 22 25 4 TATTT 1 0 33289 CASAVA_Build 5 162623148 1D AATAACCACT A/- AAAATGTAAG 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 A 5 4 33290 CASAVA_Build 5 162624051 2D TATATGAGAA CT/-- CTCTGTATTA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 CT 3 2 33291 CASAVA_Build 5 162624298 2D3M3D AACGTTAGGG CTCATAGG/--GAT--- CATGATAATA 3070 het 3070 ref 27 14 13 3 N/A 0 0 33292 CASAVA_Build 5 162627682 1I AGTTGTTACC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 7 8 33293 CASAVA_Build 5 162628042 1I17M1I AGTAGCTAGG -AAAAAAAAAAATCTGGG-/AAAAAAAAAAAATCTGGGT TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 16 10 3 N/A 0 0 33294 CASAVA_Build 5 162628691 1D CACTTCGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 11 10 33295 CASAVA_Build 5 162629306 1D ACAGCCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 10 10 T 12 11 33296 CASAVA_Build 5 162632534 5I AAGGGAGAAG -----/AGAGA AGAGAAGAAT 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 AGAGA 1 2 33297 CASAVA_Build 5 162641969 1D TGTGACCTTA C/- TTTTTCATGA 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 C 1 0 33298 CASAVA_Build 5 162642353 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 2954 het 1541 hom 12 4 8 0 A 6 7 33299 CASAVA_Build 5 162642774 1I AAACCAGAAC -/A AAAGTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 3 4 33300 CASAVA_Build 5 162643351 2I GATCTTGTAT --/CA CACAGTGTCT 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 CA 2 3 33301 CASAVA_Build 5 162651013 1D AAACTATTTC A/- AAAAACATTA 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 A 6 5 33302 CASAVA_Build 5 162655713 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 6 7 33303 CASAVA_Build 5 162663979 1D ATAATAATTT A/- AATTAAAAAA 3070 het 788 hom 28 2 22 4 A 3 2 33304 CASAVA_Build 5 162669031 1D ACCAACATCC A/- AAAAAAAAAA 1766 het 1766 ref 37 25 6 6 A 15 14 33305 CASAVA_Build 5 162674716 1D GATATACTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 9 8 33306 CASAVA_Build 5 162676044 1D CAATGTCTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 T 9 8 33307 CASAVA_Build 5 162676999 1I ACACACAGAA -/T TTTTTTTTTA 2789 het 2789 ref 22 11 6 5 T 9 10 33308 CASAVA_Build 5 162680663 1D GACATAATCC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 38 19 15 4 A 8 7 33309 CASAVA_Build 5 162683483 2D AGAGGGAATC AG/-- GGGTGTAGGG 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 AG 1 0 33310 CASAVA_Build 5 162697959 1I TTTTTAGACC -/A AAAAAAAATC 3070 het 237 hom 28 1 23 4 A 8 9 33311 CASAVA_Build 5 162705497 4D TGAAATCAGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 12 9 A 15 11 33312 CASAVA_Build 5 162710060 5I AGCATAATAA -----/GTTTT TGGAAGCATG 3070 het 3070 hom 63 28 28 7 GTTTT 0 1 33313 CASAVA_Build 5 162717942 3I TGCTACAATG ---/TAA TAATAATAGA 3070 het 3070 hom 40 9 27 4 TAA 2 3 33314 CASAVA_Build 5 162727033 1D CCCTAAACTG A/- AAAAAATAGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 7 6 33315 CASAVA_Build 5 162731628 2I GAGGAGAAGA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 662 hom 34 2 30 2 AG 7 8 33316 CASAVA_Build 5 162732296 2I TATATAAAAT --/TA TATATATAAT 1928 hom 10 het 5 0 4 1 TA 4 5 33317 CASAVA_Build 5 162732445 18D AAGTAGCATG TTAGAAGGATAAGATGTT/------------------ TTATGTAAAC 3070 hom 39 het 15 0 13 3 TTAGAAGGATAAGATGTT 1 0 33318 CASAVA_Build 5 162755326 1I AAAACCAAAT -/A AACCCCATTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 2 3 33319 CASAVA_Build 5 162760043 1D AACTGTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 37 2 26 9 T 15 14 33320 CASAVA_Build 5 162761293 1D ATATTTATTG A/- AAAAAACGAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 7 6 33321 CASAVA_Build 5 162762472 1D GCAAAAGTCA G/- AGTTAGAACT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 0 33322 CASAVA_Build 5 162767585 1D AAAAATAAAC T/- GATTTATTTT 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 T 1 0 33323 CASAVA_Build 5 162771843 3D AAGCCAAATG TCC/--- TCATCATCCT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 TCC 1 0 33324 CASAVA_Build 5 162774554 4D GTTAAGTACA AAAT/---- AAATAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAT 2 1 33325 CASAVA_Build 5 162820801 2D TATTGAAAAC AT/-- AAACAATGAA 3070 het 3070 hom 48 21 22 7 AT 1 0 33326 CASAVA_Build 5 162825136 5D CCAGTTGGGC AGGCT/----- AGGCTGGTCT 3070 hom 58 het 21 0 18 3 AGGCT 2 1 33327 CASAVA_Build 5 162866388 3D CTTTCACAAA AAG/--- AAGTTCAGTA 3070 hom 141 het 48 0 48 0 AAG 2 1 33328 CASAVA_Build 5 162866671 1D GTAATGTTTA C/- CTTAAGGGTC 3070 hom 96 het 38 0 32 7 C 2 1 33329 CASAVA_Build 5 162869903 4D GTGTGTAATA ATTT/---- ATTTGTTTCA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 ATTT 2 1 33330 CASAVA_Build 5 162870859 1I ATTAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 24 0 17 7 T 10 11 33331 CASAVA_Build 5 162874197 1I TCACAACCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 47 0 36 11 T 8 9 33332 CASAVA_Build 5 162875417 1I GGAGTGCAGT -/G AGGGTGAACA 3070 hom 50 het 20 0 16 4 G 0 1 33333 CASAVA_Build 5 162878889 5D GTATTGAAAT AAAAC/----- ACAATAAAAT 3070 het 3070 ref 32 19 10 7 AAAAC 1 0 33334 CASAVA_Build 5 162882424 1D AAAGAAACAA C/- TCTAGATTCA 3070 hom 135 het 51 0 45 7 C 1 0 33335 CASAVA_Build 5 162884543 1D GAAGATCAAT C/- TTTTTATTCT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 C 1 0 33336 CASAVA_Build 5 162887722 1I TTGCTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 592 hom 20 3 13 4 T 13 14 33337 CASAVA_Build 5 162896651 1I AGTGATGAGC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 8 9 33338 CASAVA_Build 5 162901854 1I CATCTGAAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 8 9 33339 CASAVA_Build 5 162904255 4D GAGATAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAC 3070 hom 39 het 25 0 14 15 AAAG 3 2 33340 CASAVA_Build 5 162909559 1D CATGTGTAAA T/- TTTTTTGTGG 3070 hom 108 het 41 0 35 6 T 7 6 33341 CASAVA_Build 5 162909969 2D CGTTAAACAC AT/-- GTTTCCAAAC 3070 hom 99 het 40 0 34 8 AT 1 0 33342 CASAVA_Build 5 162911343 7D ACATATTATA AATAAAC/------- AGACTTTGAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AATAAAC 1 0 33343 CASAVA_Build 5 162912146 3I CTATAAACAT ---/TTA TTATTAATAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTA 2 3 33344 CASAVA_Build 5 162915473 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 25 1 16 8 A 12 11 33345 CASAVA_Build 5 162916731 1I ATGCTGACTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 33346 CASAVA_Build 5 162921519 1I TTTCACTGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2294 hom 33 7 18 8 A 9 10 33347 CASAVA_Build 5 162924819 1D TGTCCATTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 8 7 33348 CASAVA_Build 5 162925101 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 39 1 29 9 A 11 10 33349 CASAVA_Build 5 162928295 1I TTTGGAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 12 33350 CASAVA_Build 5 162928845 1D AGGCTGCAGA C/- CTAAAGAAGA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 C 2 1 33351 CASAVA_Build 5 162930636 1D CAGCTCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 11 10 33352 CASAVA_Build 5 162933156 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2437 het 363 hom 17 1 10 6 A 13 12 33353 CASAVA_Build 5 162934631 1I AAAATCTGAC -/T TTTTTTGCAT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 6 7 33354 CASAVA_Build 5 162934748 1I GGAACACAAT -/A AAAAAATTAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 6 7 33355 CASAVA_Build 5 162941698 1I ATTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 747 hom 19 2 12 5 T 11 12 33356 CASAVA_Build 5 162941792 2D TCTCTCTCTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 32 het 12 0 11 1 TA 9 8 33357 CASAVA_Build 5 162953080 3D AAAAAAATTG TGA/--- TGAACTAGTC 3070 het 3070 hom 54 22 31 2 TGA 2 1 33358 CASAVA_Build 5 162959848 1D TTGCCTTCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2087 hom 26 6 14 6 T 11 10 33359 CASAVA_Build 5 162971702 3D TCATCCCAAG AAA/--- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 7 A 10 7 33360 CASAVA_Build 5 162983143 9D ATAGGTTAGA TATCTTACT/--------- TTCTGGAATT 3070 het 3070 ref 33 16 16 4 TATCTTACT 1 0 33361 CASAVA_Build 5 162992369 1I GGATAAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 10 11 33362 CASAVA_Build 5 162998667 1I AAGCATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 975 hom 10 3 7 0 A 9 10 33363 CASAVA_Build 5 163004622 9I AACTGTATAC ---------/AGTTTTCTA AGTGTTTCAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AGTTTTCTA 0 1 33364 CASAVA_Build 5 163007208 1D TAGAATATTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 9 8 33365 CASAVA_Build 5 163010543 1I GTTAATTTTA -/T TCTTAGGTAT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 1 2 33366 CASAVA_Build 5 163011366 1I TATTGTCTAA -/T TTTTTTGGCA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 6 7 33367 CASAVA_Build 5 163011569 1I TGGTCCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 33 2 30 1 T 10 11 33368 CASAVA_Build 5 163012943 4I TGCTTTTAAG ----/TTAT TTATTTATTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TTAT 2 3 33369 CASAVA_Build 5 163013160 1I TAATCACTCT -/A CTAAGCTATC 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 0 1 33370 CASAVA_Build 5 163019064 12D GGCACTGGGT GCTCTAGTGCCC/------------ GCTCTAGTGC 3070 hom 80 het 32 0 24 10 GCTCTAGTGCCC 2 1 33371 CASAVA_Build 5 163019473 12I CAGATGCTCA ------------/TCCGGGGGTGCT TGCCAGGTTG 3070 hom 100 het 40 0 31 9 TCCGGGGGTGCT 0 1 33372 CASAVA_Build 5 163034050 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1240 het 1240 ref 46 27 4 17 TG 8 7 33373 CASAVA_Build 5 163056781 1I AATTTGTACA -/T CTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 27 1 18 8 T 0 1 33374 CASAVA_Build 5 163056878 1D GAGCCTAGGA G/- GGGGGGTTTG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 7 6 33375 CASAVA_Build 5 163060585 1D TTCATAACCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 32 hom 47 1 44 4 T 9 8 33376 CASAVA_Build 5 163061390 1I65M3I GTATTGTTTT -CAGACACAACTGTATTGTAAAGGTTCCATAAAAATAGACATCGCTTAAAATAATCATATGAATGA---/CCAGACACAACTGTATTGTAAAGGTTCCATAAAAATAGACATCGCTTAAAATAAACATATGAATGAAAT AATAACTAAT 3070 hom 194 het 45 0 65 10 N/A 0 0 33377 CASAVA_Build 5 163065422 1D TTCTTCCCCC A/- TATTTGCTTG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 1 0 33378 CASAVA_Build 5 163066257 1I AATTTTCTAC -/A AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 6 7 33379 CASAVA_Build 5 163068701 3D GTGAGTTGTC GTT/--- GTTGTTGTTT 3070 het 3070 ref 44 21 21 4 GTT 4 3 33380 CASAVA_Build 5 163088135 4D TCATCTATCC ATCT/---- GTCTATTCTA 3070 het 3070 ref 40 21 17 5 ATCT 1 0 33381 CASAVA_Build 5 163088789 1I GATCTCATTC -/T TTTTTTATGG 3070 het 1804 hom 38 8 27 3 T 6 7 33382 CASAVA_Build 5 163112974 1D TTCCTAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 25 1 19 5 T 11 10 33383 CASAVA_Build 5 163135281 8I AATGTATCAA --------/TTTTCCCC TAAGAGTAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTTTCCCC 0 1 33384 CASAVA_Build 5 163135487 3D TTAAAAAATT GTA/--- GTCTGTTAAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 GTA 1 0 33385 CASAVA_Build 5 163148587 1D CTGTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 T 13 12 33386 CASAVA_Build 5 163149503 14I TATTATGTGT --------------/CAATGAAAAAAGAA CAATGAAACT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CAATGAAAAAAGAA 0 1 33387 CASAVA_Build 5 163157387 2I CCATGGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 78 het 35 0 26 9 TA 6 7 33388 CASAVA_Build 5 163164006 2I TCTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 14 9 T 11 13 33389 CASAVA_Build 5 163171389 2D TAATTGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 13 11 33390 CASAVA_Build 5 163173525 1I ACTTTCTGTT -/A AAAAAAATTC 3070 hom 109 het 43 0 37 6 A 7 8 33391 CASAVA_Build 5 163201365 1I CAAAATCAGT -/A GGACATATTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 0 1 33392 CASAVA_Build 5 163202677 1I CCTAAAACTT -/A AAAGTATAAT 3070 hom 32 het 12 0 11 1 A 3 4 33393 CASAVA_Build 5 163202986 1D ACGATGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 634 hom 23 2 15 6 A 17 16 33394 CASAVA_Build 5 163215119 1I ATTCACAGGC -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 6 7 33395 CASAVA_Build 5 163222212 1I AAAATCACAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 9 10 33396 CASAVA_Build 5 163243301 2D TCTTTAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 34 2 27 5 A 14 12 33397 CASAVA_Build 5 163244610 3I TAATCTTCTT ---/AAG AAGCAGTTTC 3070 hom 82 het 38 0 28 10 AAG 1 2 33398 CASAVA_Build 5 163270050 1I CTTACATCAT -/A TGCCAGGGAT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 0 1 33399 CASAVA_Build 5 163278665 1I TAACAACAAT -/G TATTTTTCAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 0 1 33400 CASAVA_Build 5 163283337 2I AGGAGAGAGG --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 8 10 33401 CASAVA_Build 5 163286049 1I CAAGGGATAT -/G GGGGGGTCTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 6 7 33402 CASAVA_Build 5 163286780 1I TTGGGAACAA -/T TTTTTATTAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 5 6 33403 CASAVA_Build 5 163287530 2D AAGGGGGAAA TC/-- TGCCCAGAGG 3070 hom 93 het 32 0 32 1 TC 1 0 33404 CASAVA_Build 5 163287806 1I AAGTATAGTC -/A GGGGGCAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 1 33405 CASAVA_Build 5 163291752 3D ATTTACAAAG CTT/--- CTGAAAATGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTT 1 0 33406 CASAVA_Build 5 163293123 1I TTGACAGACA -/C CTCACACAGG 3070 hom 86 het 33 0 27 6 C 1 2 33407 CASAVA_Build 5 163315678 1I CCTTCTTCTG -/A AGAATATAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 2 33408 CASAVA_Build 5 163324962 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTTA 2832 hom 21 het 13 0 8 5 T 9 10 33409 CASAVA_Build 5 163326126 1I CAGAGTTATC -/T TTTTTTGCAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 6 7 33410 CASAVA_Build 5 163336520 2D GACTGGAATC TT/-- TTCCAAAGAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 4 2 33411 CASAVA_Build 5 163337475 4D ACAACAAAAT AATA/---- AATAACTCAA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 AATA 2 1 33412 CASAVA_Build 5 163338491 10D ATGTGGATTC TGTTTTGTTT/---------- TGTTTTGTTT 3070 hom 105 het 46 0 36 16 TGTTT 6 4 33413 CASAVA_Build 5 163396078 1D AGTATTCTGT A/- AAAAAAAAAA 1440 het 1440 ref 33 25 4 5 A 15 14 33414 CASAVA_Build 5 163406356 1D CCGCAGATTC T/- TTTTTTTTTT 1822 het 1822 ref 51 38 4 9 T 11 10 33415 CASAVA_Build 5 163446769 4D AAGAACTGTT AGAA/---- AGAGTATAAT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 AGAA 1 0 33416 CASAVA_Build 5 163456491 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 721 het 721 ref 37 20 3 14 A 13 14 33417 CASAVA_Build 5 163457850 1D TTTAACCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 11 10 33418 CASAVA_Build 5 163466443 2D ATTCCTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2963 hom 30 12 11 9 T 14 12 33419 CASAVA_Build 5 163471867 4I AGAAAAGAAT ----/TTAA TTGAGGAATG 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 TTAA 0 1 33420 CASAVA_Build 5 163494240 4D CTTCAATGAT AAAC/---- AAACAATTGT 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 AAAC 2 1 33421 CASAVA_Build 5 163501861 1D TTCTGAAATC A/- AACAACTGTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 A 3 2 33422 CASAVA_Build 5 163502770 1D CAATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2601 hom 19 9 9 1 A 13 12 33423 CASAVA_Build 5 163503715 2D TCTAGAATTT GG/-- AGTTATTGCA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 G 2 0 33424 CASAVA_Build 5 163505419 1I CTCTACTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1643 hom 25 7 14 4 A 15 16 33425 CASAVA_Build 5 163505658 1D CGCTATCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 10 9 33426 CASAVA_Build 5 163513529 1I TTGGCTCCTA -/C CCCCCAGAAG 3070 hom 160 het 55 0 54 1 C 5 6 33427 CASAVA_Build 5 163519952 1I AATAAAAAAT -/A AAATAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 A 3 4 33428 CASAVA_Build 5 163527190 1I ATAAATATTG -/T TAAGTATTAT 2434 het 2434 ref 21 11 5 5 T 1 2 33429 CASAVA_Build 5 163533567 1I31M1I GAAAAAATGC -AAAAAAATCGTATCAAATAGTAATTTTTTGG-/AAAAAAAATCTTATCAAATAGTAATTTTTTGGA AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 25 17 19 0 N/A 0 0 33430 CASAVA_Build 5 163542448 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 21 9 12 1 A 8 7 33431 CASAVA_Build 5 163551375 4I ACACACGGAG ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 AC 6 8 33432 CASAVA_Build 5 163563518 13I CTTCTGCCTG -------------/AACATTGTGTCTA AACTTCTTCA 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 AACATTGTGTCTA 0 1 33433 CASAVA_Build 5 163564334 1D ATTACTAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 A 8 7 33434 CASAVA_Build 5 163570566 1D GGTAAGATTC T/- CATCAAACAC 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 T 1 0 33435 CASAVA_Build 5 163577521 1D ATACTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 11 10 33436 CASAVA_Build 5 163602503 1I TTGTGATCTG -/C CCCCCCTCAG 3070 het 3070 hom 20 10 9 2 C 6 7 33437 CASAVA_Build 5 163620407 1I TCAATTATTA -/T TGGGTAAAAT 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 T 1 2 33438 CASAVA_Build 5 163638756 12D GATATTTGTG TGTGTGTGTGTA/------------ TGTGTGTGAT 3070 het 3070 ref 27 17 13 5 TGTGTGTGTGTA 1 0 33439 CASAVA_Build 5 163642953 1D CCAAGTCCCT A/- AAGTCCAATG 2071 het 2071 ref 31 19 5 7 A 3 2 33440 CASAVA_Build 5 163666096 3I CTACAGTACC ---/TGA TGAGAATGTG 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 TGA 1 2 33441 CASAVA_Build 5 163666840 2I TAATACTGTC --/AG GGTCATCAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 AG 0 1 33442 CASAVA_Build 5 163670004 2D TATAATTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 27 het 15 0 10 5 TA 10 9 33443 CASAVA_Build 5 163712547 1I CTGGCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 35 1 22 12 A 13 14 33444 CASAVA_Build 5 163754975 1D TGGTAAAATG A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 A 7 6 33445 CASAVA_Build 5 163778362 1D TTGTCTCTCA G/- GGGTTCCAAT 3070 het 3070 hom 49 18 19 12 G 4 3 33446 CASAVA_Build 5 163781226 1I TTAGTTTTAC -/G GGGGGGGTAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 G 7 8 33447 CASAVA_Build 5 163789222 3D AATAATTATT TTG/--- TGGTTTTGGC 3070 het 3070 hom 41 15 21 8 TTG 1 0 33448 CASAVA_Build 5 163790787 5D CCACATGCTG AGCCT/----- GACCTTTAGT 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 AGCCT 1 0 33449 CASAVA_Build 5 163793570 2D TATCATTTAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 49 23 24 3 GT 6 5 33450 CASAVA_Build 5 163796857 1D AGAATAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2878 hom 27 9 14 4 A 12 11 33451 CASAVA_Build 5 163798350 1D ATTTTCTGTC T/- ACTTTTATAT 3070 het 3070 hom 36 14 20 4 T 1 0 33452 CASAVA_Build 5 163811023 3D TTTGGGACTT GAC/--- GAACTCTTGG 3070 het 3070 hom 60 28 28 4 GAC 1 0 33453 CASAVA_Build 5 163812637 3D ATATAAAATA AAC/--- AACAAGTAAT 3070 het 1969 hom 18 4 13 3 AAC 2 1 33454 CASAVA_Build 5 163818724 4D CTTAAGTTTT CTTA/---- CTTGTCGTTC 3070 het 3070 hom 49 19 26 6 CTTA 1 0 33455 CASAVA_Build 5 163824918 3I ATTGCTAAAA ---/AAC AGCCATCTAG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 AAC 0 1 33456 CASAVA_Build 5 163833884 1D AAGATTCACA G/- GGGGAGGAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 5 4 33457 CASAVA_Build 5 163834877 1I GTTGGGGATT -/G GGGCAGATGC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 3 4 33458 CASAVA_Build 5 163841767 1D AGCTCATTGA T/- TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 30 20 4 6 T 15 14 33459 CASAVA_Build 5 163864564 2D CCAAAGTAAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 41 het 20 0 14 6 AT 10 9 33460 CASAVA_Build 5 163876305 1D TATTTGATGA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 8 7 33461 CASAVA_Build 5 163885311 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1092 het 331 hom 17 7 4 6 T 19 18 33462 CASAVA_Build 5 163893667 1D ATTTATTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 53 27 15 11 T 10 9 33463 CASAVA_Build 5 163910849 1I AGTGGCAAGG -/T TTTTTTTTTT 1062 het 1062 ref 41 27 3 11 T 10 11 33464 CASAVA_Build 5 163914836 1D GTAGTCGGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 8 7 33465 CASAVA_Build 5 163920152 1D AAAGCAAGAC A/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 A 1 0 33466 CASAVA_Build 5 163956740 1I AGGACTTGAT -/A ATCTGCTAAT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 1 2 33467 CASAVA_Build 5 163958896 1D TTTCTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 1138 het 1138 ref 31 19 4 8 T 15 14 33468 CASAVA_Build 5 164038753 2I ATCAGATCTC --/TT TCACTGTCAT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 1 3 33469 CASAVA_Build 5 164042229 16D AACAGACTCT CTCTGCTTGTCCAGTG/---------------- CTACCTTTCT 3070 het 3070 ref 54 34 22 9 CTCTGCTTGTCCAGTG 1 0 33470 CASAVA_Build 5 164060825 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 10 9 33471 CASAVA_Build 5 164082323 1D AATTTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2701 hom 27 9 10 8 T 15 14 33472 CASAVA_Build 5 164103569 3D TCTCAATCAT ATC/--- ATCATCCATC 3070 het 3070 ref 43 21 17 7 ATC 3 2 33473 CASAVA_Build 5 164151230 1D AAAAGACCTA C/- TTTTTATGGA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 C 1 0 33474 CASAVA_Build 5 164169470 4D ATAATTGGTG ATCT/---- ATCTATCTGT 3070 hom 102 het 40 0 34 9 ATCT 3 2 33475 CASAVA_Build 5 164170009 1D TATCGTGTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 9 8 33476 CASAVA_Build 5 164171508 1I CTACAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 37 0 32 5 A 11 12 33477 CASAVA_Build 5 164173245 1I AACAACAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 35 4 28 3 T 10 11 33478 CASAVA_Build 5 164177885 1D ATGAAGTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 9 8 33479 CASAVA_Build 5 164200134 1I TGAACAAAAA -/G TTCTGCTAAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 0 1 33480 CASAVA_Build 5 164215699 1D CTCCCTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 522 hom 28 4 15 9 A 15 14 33481 CASAVA_Build 5 164226345 4D ATAGTTCCTC CTGA/---- CTATTTTAGC 3070 het 3070 hom 44 16 27 3 CTGA 1 0 33482 CASAVA_Build 5 164259001 1D ACCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 404 hom 40 1 32 7 A 10 9 33483 CASAVA_Build 5 164268057 4D ATATAGCATC TCTA/---- TCTAGGTTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TCTA 2 1 33484 CASAVA_Build 5 164269604 1D AAATACAGTG A/- AAAAAATCAC 3070 hom 141 het 50 0 48 3 A 7 6 33485 CASAVA_Build 5 164270715 6I AAGAATAAAG ------/GTAAAA GTAAAATATA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 GTAAAA 1 2 33486 CASAVA_Build 5 164272442 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 12 18 9 TA 6 5 33487 CASAVA_Build 5 164275136 1I TTATGCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 T 11 12 33488 CASAVA_Build 5 164279854 1D TATATTTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 10 9 33489 CASAVA_Build 5 164281268 1D TGACTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 1404 het 1404 ref 29 12 8 10 A 17 16 33490 CASAVA_Build 5 164297587 1I GAGGGCTGTG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 7 8 33491 CASAVA_Build 5 164299732 3D14M22D23M2D10M10D8M5D12M7D13M4D3M1D TATATTTTCT TTATTTTCCCTAATCTTATCATCTCAGACCCTAGTACAATTTCTAGTACATAGCAAGTGCTCAGTTATTATTTGCTATCAGCTTTTCCAAATGTTGCCATAAGTAGCTAATTGCACAGAACAATTTATACTTTTTAT/---TCTTCCCAAATGTT----------------------TTTTTGGTGTATTTTTAGTCCTC--TTTCTCTTTG----------TTCTAAAT-----AAACAATAGCTA-------TAAATAACTTAGA----TTA- ACAATTAGTC 2998 het 2998 ref 32 41 7 4 N/A 0 0 33492 CASAVA_Build 5 164301326 1D AAGAACAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 40 1 31 8 A 11 10 33493 CASAVA_Build 5 164305035 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTTG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 0 1 33494 CASAVA_Build 5 164305647 10D GCAAAATTAA TTGGTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2107 het 233 hom 26 4 8 15 TTGGTTTTTT 1 0 33495 CASAVA_Build 5 164306556 12D GTCCACCGGC ATCCTCCCAGTA/------------ ATCTCCACCA 3070 hom 99 het 36 0 32 10 ATCCTCCCAGTA 1 0 33496 CASAVA_Build 5 164307617 1I TGCAGTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 13 14 33497 CASAVA_Build 5 164308137 2I TGGTGTTTCA --/AT ATATATATAT 3070 het 223 hom 28 1 21 6 AT 6 7 33498 CASAVA_Build 5 164309910 4I CTATTTGACA ----/TAAT TAATTCATAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TAAT 1 2 33499 CASAVA_Build 5 164365122 1D GATCTAGTGC A/- AAAAAAAAAA 966 het 966 ref 40 32 3 5 A 13 12 33500 CASAVA_Build 5 164370635 1I CCTTTCATGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 7 8 33501 CASAVA_Build 5 164371889 1I46M1D TTTCATGTGA -TTTTTTTGTAAATAAAATGGAAGTTTTCTTTCTATATTACATCTTTG/TTTTTTTTGTAAATAAAATGGAAGTTTTCTTTCTATATTACATCTTT- GAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 25 21 17 2 N/A 0 0 33502 CASAVA_Build 5 164372930 1D AAAATAAGTT A/- ACAAAGTTTT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 2 1 33503 CASAVA_Build 5 164373549 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 12 11 33504 CASAVA_Build 5 164373695 1D TTTTATTGTG T/- TTTTTTTTCC 2043 het 2043 ref 34 19 6 9 T 9 8 33505 CASAVA_Build 5 164375879 1I ATAGAAATGC -/A AAAAAACTTA 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 A 6 7 33506 CASAVA_Build 5 164376300 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2820 hom 24 8 11 5 T 10 9 33507 CASAVA_Build 5 164379575 4D TACAAATAAG TGAA/---- TGACTGATGT 3070 het 3070 hom 52 22 29 4 TGAA 1 0 33508 CASAVA_Build 5 164382595 1D TGGATTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 15 9 T 11 10 33509 CASAVA_Build 5 164389120 1D GTTTTGTTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 59 34 16 10 A 10 9 33510 CASAVA_Build 5 164390868 3I GAAAATGTGA ---/ATG ATATTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 ATG 0 1 33511 CASAVA_Build 5 164392183 4I TACTCAGAAA ----/ATAC ATACAAGAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATAC 1 2 33512 CASAVA_Build 5 164392268 1I AAAATATATG -/A AAAATATAAT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 4 5 33513 CASAVA_Build 5 164397898 1D39M4D GATTAAGGAA TTTTTTATTCCAAATTCCAATCACAAGTTATTTGTAGAATTTTG/-TTTTTATTCCAAATTCCAATCACAAGTTATTTGTAGAAT---- TTTTACTTTT 3070 het 3070 ref 31 22 12 7 N/A 0 0 33514 CASAVA_Build 5 164398637 1D TTTGCCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2231 hom 28 7 14 7 T 13 12 33515 CASAVA_Build 5 164404010 2D TTTGCCAGTC TG/-- TGTCTTTTAA 2784 het 2784 ref 28 19 7 2 TG 2 1 33516 CASAVA_Build 5 164409122 1D AAATTTACAT A/- AAAATTGTGA 3070 het 3070 ref 52 27 23 2 A 5 4 33517 CASAVA_Build 5 164409210 4D TATTTTTGAC CATT/---- AATGAGCCAA 3070 het 3070 ref 44 20 19 6 CATT 1 0 33518 CASAVA_Build 5 164410657 1D TTAAGTTAGA T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 7 6 33519 CASAVA_Build 5 164411417 1I CAGTGAGCTA -/G GGTCATGCTA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 G 2 3 33520 CASAVA_Build 5 164413254 6D TTGGGGTGCT ATTTTA/------ ATTGGTAGTT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 ATTTTA 1 0 33521 CASAVA_Build 5 164414146 1I CACATGTATA -/C ATATGTAACA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 C 0 1 33522 CASAVA_Build 5 164422163 1I TCTTTTTTTT -/C CATCACTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 1 2 33523 CASAVA_Build 5 164422709 1I TACTACTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 A 10 11 33524 CASAVA_Build 5 164428049 3I CCATTAGCTG ---/TTC TTCTTGATGT 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 TTC 1 2 33525 CASAVA_Build 5 164431029 3I ATCTTTCTTG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 1914 hom 29 7 13 9 T 13 16 33526 CASAVA_Build 5 164432221 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 652 het 652 ref 28 10 5 13 T 10 9 33527 CASAVA_Build 5 164432735 1I CTTTGGTGTG -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 7 8 33528 CASAVA_Build 5 164433459 7I TTATGTTCCT -------/CTCTAAA CTCTAAACTG 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 CTCTAAA 1 2 33529 CASAVA_Build 5 164435918 12I ATAGGGCAGG ------------/TGAGTGGATGGA TGAGGAGAAG 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 TGAGTGGATGGA 0 1 33530 CASAVA_Build 5 164440768 1I AATGCCAGGG -/T TTTATATAAA 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 T 3 4 33531 CASAVA_Build 5 164441131 1D CTTGCTTTCT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 A 8 7 33532 CASAVA_Build 5 164441484 4I ATCTCTATTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 2647 het 2186 hom 18 8 6 4 TTTC 2 3 33533 CASAVA_Build 5 164443712 1I TTCATTAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 9 10 33534 CASAVA_Build 5 164445338 1I TTTCTCCCCC -/A CCAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 0 1 33535 CASAVA_Build 5 164450047 1I TTCCCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 10 11 33536 CASAVA_Build 5 164452597 3D AATTCTAGTT GTC/--- TTCTTTCACA 3070 het 3070 ref 40 24 16 5 GTC 1 0 33537 CASAVA_Build 5 164453233 6D CTGACATAAC CCAAAG/------ CCACAAATAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 CCAAAG 1 0 33538 CASAVA_Build 5 164453486 1I TTAGTGCCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 9 10 33539 CASAVA_Build 5 164455155 1D TTTGCCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 16 7 A 15 14 33540 CASAVA_Build 5 164455912 8I7M4D TCATTGCCAT --------ATTATATCTGC/GCTGGATAATTATAT---- CTGCCTGCCT 3070 het 3070 ref 35 18 19 4 N/A 0 0 33541 CASAVA_Build 5 164457766 7I GTCTCTTTGC -------/TAAAATA TAACAAGAGT 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 TAAAATA 0 1 33542 CASAVA_Build 5 164475276 1I AATAGGTGTG -/A AATATATATT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 2 3 33543 CASAVA_Build 5 164476150 2I CATTGGAAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 AT 5 6 33544 CASAVA_Build 5 164478894 3D AACTTTCCTT AAC/--- AACCATTTCC 2512 het 2512 ref 39 19 7 14 AAC 2 1 33545 CASAVA_Build 5 164479462 1D CAAATGAGAG A/- AAAATCTGGG 3070 het 3070 hom 38 18 20 0 A 5 4 33546 CASAVA_Build 5 164482328 5I TGAAATGCCA -----/CAGAT CTGAATAATT 3070 het 3070 hom 46 21 22 4 CAGAT 0 1 33547 CASAVA_Build 5 164485751 1D AAGATGAGGG A/- AGAGCATTTC 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 A 2 1 33548 CASAVA_Build 5 164489824 1I AATAATTGTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 8 9 33549 CASAVA_Build 5 164489983 2D TGTTGGTGAC TG/-- TTTTTCAGGC 3070 het 3070 ref 39 21 15 6 TG 1 0 33550 CASAVA_Build 5 164492138 1D ACTTGGGACG C/- CGGAGGTTGC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 2 1 33551 CASAVA_Build 5 164497591 1D GTCACCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 23 6 T 13 12 33552 CASAVA_Build 5 164499486 1I GGGAAGTGGA -/T TTTTTTTTTT 2359 het 2359 ref 33 11 10 12 T 15 16 33553 CASAVA_Build 5 164500337 8D TAATAGTTTT AACTTTAC/-------- AAATTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 22 25 2 AACTTTAC 1 0 33554 CASAVA_Build 5 164500658 5I TAAGTTTCAA -----/AATAT AATAAGTTAA 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 AATAT 0 1 33555 CASAVA_Build 5 164508886 1D TAAGTAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 12 11 33556 CASAVA_Build 5 164510271 1D AGAAATTTTG A/- AAAAAAAAAA 2478 het 1903 hom 24 8 9 7 A 12 11 33557 CASAVA_Build 5 164518342 1D ATAACTGTTG C/- CACATCCGTA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 C 2 1 33558 CASAVA_Build 5 164521793 2D ATATACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 56 26 16 16 AC 8 7 33559 CASAVA_Build 5 164522439 1D ATGAGTTAGA T/- TAAGCTTCGT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 2 1 33560 CASAVA_Build 5 164527180 2D GTATGTGTAT TA/-- TATATATATA 2483 het 2261 hom 14 8 6 2 TA 7 6 33561 CASAVA_Build 5 164533857 2D AAGCATTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 13 11 33562 CASAVA_Build 5 164538913 1I AATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 10 11 33563 CASAVA_Build 5 164540524 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2521 het 2521 ref 21 8 6 7 T 14 12 33564 CASAVA_Build 5 164552484 2D TTCTTCCTAA AG/-- AGAATCATTG 3070 het 3070 hom 47 24 21 2 AG 2 1 33565 CASAVA_Build 5 164557712 1D TGTGGAGGGG A/- AAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 A 7 6 33566 CASAVA_Build 5 164559375 1I ATAAATTGCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 2930 hom 33 7 23 3 T 7 8 33567 CASAVA_Build 5 164560734 1I ACTATTTAAG -/A AAAAATCTAT 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 A 5 6 33568 CASAVA_Build 5 164563936 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 A 10 11 33569 CASAVA_Build 5 164569212 1I TGACCATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 20 17 12 T 10 11 33570 CASAVA_Build 5 164569707 1I CAAGGAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 8 14 10 T 10 11 33571 CASAVA_Build 5 164576685 1D ATCAAACGCT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 8 7 33572 CASAVA_Build 5 164578598 1D CAATTTAGGG A/- GGTACGGTTA 3070 het 1516 hom 14 5 8 1 A 1 0 33573 CASAVA_Build 5 164580106 4D ATCTGTTACT CTTC/---- CTTTATTCCT 3070 het 3070 hom 33 17 15 2 CTTC 1 0 33574 CASAVA_Build 5 164581948 1I AATTAAAAAA -/G AAAGGAAAAA 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 G 0 1 33575 CASAVA_Build 5 164587603 1I ATATTGCTTA -/C CCCTCCCCCA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 C 3 4 33576 CASAVA_Build 5 164589991 4D AAAGATAAAT AAAA/---- CATCTGTTCA 3070 het 3070 ref 54 25 24 6 A 4 0 33577 CASAVA_Build 5 164599036 6D ATATAAATAT TAATAA/------ TGATAATCAT 3070 het 3070 ref 45 27 18 2 TAA 2 0 33578 CASAVA_Build 5 164604369 1I TTTACAAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 T 9 10 33579 CASAVA_Build 5 164605226 1D AAGTTAATTT G/- GGGGGGGCAG 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 G 8 7 33580 CASAVA_Build 5 164608315 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 21 9 10 2 A 1 0 33581 CASAVA_Build 5 164613562 2D TTGGCAGGTC AA/-- AAAAAAAAAA 2127 het 494 hom 27 5 9 13 A 20 18 33582 CASAVA_Build 5 164622267 1D AAAAAAAAAA C/- TAAAATTTGA 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 C 1 0 33583 CASAVA_Build 5 164623063 1D AAAATGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 12 11 33584 CASAVA_Build 5 164628363 2I TCTCTCAGAT --/TA TATATATATA 3070 het 1076 hom 33 3 20 10 TA 7 8 33585 CASAVA_Build 5 164635208 3I ACTTATTTTC ---/ATA ATATTTCTTA 3070 het 3070 ref 49 30 18 1 ATA 1 2 33586 CASAVA_Build 5 164657067 1I CTACTATAAA -/G TTAGCTTCTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 0 1 33587 CASAVA_Build 5 164662066 1D AATACACAGT G/- GTTATAATCC 3070 het 3070 ref 54 26 20 8 G 2 1 33588 CASAVA_Build 5 164672480 1D AAGTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 A 11 10 33589 CASAVA_Build 5 164675329 1I TCAAATATAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 9 10 33590 CASAVA_Build 5 164675629 2D AGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 12 13 8 TA 6 5 33591 CASAVA_Build 5 164678611 1I ACTCTGTGTA -/G GGGTTCCCAC 3070 hom 47 het 17 0 13 4 G 3 4 33592 CASAVA_Build 5 164680274 1I TATAAGGATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 A 9 10 33593 CASAVA_Build 5 164683829 1I ATAGAATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 38 1 34 3 T 10 11 33594 CASAVA_Build 5 164695026 1D TTTTCCCCCC A/- AAAGCCCTTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 4 3 33595 CASAVA_Build 5 164695582 4I TTCTGGAAAA ----/AGAT AGAAAGAACA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 AGAT 0 1 33596 CASAVA_Build 5 164696026 1D AAAAAGAGAT A/- AAGATATTAA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 3 2 33597 CASAVA_Build 5 164704666 2I AATGTGACAC --/AT ATATATATAT 1235 het 1235 ref 13 6 4 3 AT 5 6 33598 CASAVA_Build 5 164704858 2D TAATATATAC AT/-- ATATATGTAT 1752 hom 12 het 5 0 5 0 AT 4 3 33599 CASAVA_Build 5 164705396 1I TGGGAGGGTC -/A GGGGTGGGAG 3070 hom 112 het 40 0 37 3 A 0 1 33600 CASAVA_Build 5 164707508 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 9 8 33601 CASAVA_Build 5 164710416 1D CAGTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 684 hom 31 2 20 9 T 13 12 33602 CASAVA_Build 5 164711256 1I CTTGTACTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 10 11 33603 CASAVA_Build 5 164717284 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 2000 het 2000 ref 37 22 7 9 GT 10 9 33604 CASAVA_Build 5 164722504 1I TTTTTTTTTT -/G TAGCCATCTT 3070 het 303 hom 37 2 19 16 G 0 1 33605 CASAVA_Build 5 164724863 1D TTCAAAAGCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 T 9 8 33606 CASAVA_Build 5 164725871 1I GAAGGGAGGG -/A AAAAAAGGGA 3070 hom 75 het 32 0 21 11 A 6 7 33607 CASAVA_Build 5 164737890 1D TTTGATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2009 hom 34 9 14 11 T 17 16 33608 CASAVA_Build 5 164738981 1I TAATAATTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 9 10 33609 CASAVA_Build 5 164768955 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 579 het 579 ref 21 11 3 7 A 17 16 33610 CASAVA_Build 5 164769147 1I AATAGCAGTC -/A AAATGTGGAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 3 4 33611 CASAVA_Build 5 164771811 1I ATCAAGCATT -/A GAAAAATATG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 0 1 33612 CASAVA_Build 5 164778577 1D GATTTTTTGC T/- TTTTTAATCT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 6 5 33613 CASAVA_Build 5 164783421 1D TGTTCACCTG C/- CATTATTCTC 3070 het 2797 hom 18 8 8 3 C 2 1 33614 CASAVA_Build 5 164788976 1I GTTAACATGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 T 8 9 33615 CASAVA_Build 5 164790785 3D GCACGGCTTC AGA/--- AGAAGGAGAC 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 AGA 2 1 33616 CASAVA_Build 5 164792518 1I TTTTTAATCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 699 hom 37 4 17 16 T 13 14 33617 CASAVA_Build 5 164794189 1I TCTCTCTTTC -/T TTGTAATATT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 T 2 3 33618 CASAVA_Build 5 164795622 3D TTATTTTCTC CTT/--- CTTCATTAGT 3070 het 3070 hom 35 15 18 4 CTT 2 1 33619 CASAVA_Build 5 164811217 2D TAAGCATTTA AC/-- ACACATATTT 3070 het 3070 hom 44 19 19 9 AC 3 2 33620 CASAVA_Build 5 164814479 1D ACCTTGTATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 12 8 9 A 9 8 33621 CASAVA_Build 5 164823824 1D ACAGAGCAGC G/- GTGCAGAGGA 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 G 2 1 33622 CASAVA_Build 5 164829416 1I10M3D ACACTGCTGA -AGAAATCACAGAT/TAGAAATCATA--- GATACAAACA 2808 het 2808 ref 37 37 6 3 N/A 0 0 33623 CASAVA_Build 5 164835456 5I TAAATTAAGA -----/TATGT TATGTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TATGT 1 2 33624 CASAVA_Build 5 164839085 6I TTAATGACAC ------/TTAATA TTAATATAGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TTAATA 1 2 33625 CASAVA_Build 5 164846560 1D CTGGGTTTCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 T 8 7 33626 CASAVA_Build 5 164877622 1D TGTTTTTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 9 8 33627 CASAVA_Build 5 164883598 1I TTCTGGGGGA -/T TTTTTCCATA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 5 6 33628 CASAVA_Build 5 164884066 2I ACTATTATGA --/AG AGTCAATGAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 AG 1 2 33629 CASAVA_Build 5 164912318 1D CCTTTCAAAT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 2365 hom 37 12 14 12 G 1 0 33630 CASAVA_Build 5 164918954 13I GGCATGAGCC -------------/TCATTTTGTTATT ACCACACCTG 3070 hom 78 het 26 0 27 0 TCATTTTGTTATT 0 1 33631 CASAVA_Build 5 164936711 1I CTCTATGTCA -/C CCATTAACTA 3070 hom 128 het 47 0 41 6 C 2 3 33632 CASAVA_Build 5 164945954 2D CCTAATAACT CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 75 het 33 0 22 12 C 12 10 33633 CASAVA_Build 5 164950390 1I CCAAAACACA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 83 het 31 0 29 2 T 7 8 33634 CASAVA_Build 5 164959095 1I ACAGCACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1895 hom 40 8 14 18 T 17 18 33635 CASAVA_Build 5 164959255 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 21 0 18 3 T 11 12 33636 CASAVA_Build 5 164962772 1D GCCCGACTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 8 7 33637 CASAVA_Build 5 164966481 1D TTTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 30 0 24 6 A 13 12 33638 CASAVA_Build 5 164968579 1D AACTAATATC A/- TAACAAATGT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 1 0 33639 CASAVA_Build 5 165019733 1D AAATATGTAT C/- CAAATATATT 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 C 2 1 33640 CASAVA_Build 5 165038842 1I AGAGGTACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 35 1 31 3 T 9 10 33641 CASAVA_Build 5 165060713 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 37 2 25 10 A 13 12 33642 CASAVA_Build 5 165065921 3D AAGACAGCAT CCA/--- CCACAGCTTT 3070 het 3070 ref 46 24 19 4 CCA 2 1 33643 CASAVA_Build 5 165066677 1I TAAAGCAATG -/T TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 8 9 33644 CASAVA_Build 5 165078789 1D TGTTTTAGGC A/- AAAAAAAAAA 2633 het 335 hom 38 2 9 27 A 19 18 33645 CASAVA_Build 5 165084695 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1410 hom 20 5 13 2 A 10 11 33646 CASAVA_Build 5 165085083 3I CACATATAAA ---/AAC AACATGTTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAC 1 2 33647 CASAVA_Build 5 165103272 3D ATACAAATAA TAT/--- TCAGTTTCAC 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 TAT 1 0 33648 CASAVA_Build 5 165105832 2D GTCGATGAAC TA/-- TGAAATGTAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 5 TA 1 0 33649 CASAVA_Build 5 165117627 1D TGGCAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 19 20 11 A 13 12 33650 CASAVA_Build 5 165117970 2I AATTTCCAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 58 17 25 16 A 10 12 33651 CASAVA_Build 5 165118879 1I ATATCCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2880 hom 27 8 14 5 T 11 12 33652 CASAVA_Build 5 165122174 1D TTGCCTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 12 11 33653 CASAVA_Build 5 165135255 1I ATGGACAAAC -/A AAAACCTAGC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 4 5 33654 CASAVA_Build 5 165139809 1I TCTAGTAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 486 hom 33 2 22 9 A 13 14 33655 CASAVA_Build 5 165145338 1I GTATGGAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 9 10 33656 CASAVA_Build 5 165148547 1I GGGAACACAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2588 hom 25 7 13 5 T 8 9 33657 CASAVA_Build 5 165164672 1I AACTTTGTAC -/A AAAAATTTTT 3070 hom 65 het 27 0 24 3 A 5 6 33658 CASAVA_Build 5 165179011 1D TAGACAGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 T 10 9 33659 CASAVA_Build 5 165180185 2D TTACTGAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2207 hom 32 6 20 7 T 12 10 33660 CASAVA_Build 5 165182105 1D AAACAAAAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 9 8 33661 CASAVA_Build 5 165182860 1I TCTCTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 10 11 33662 CASAVA_Build 5 165184393 1I GCCTGGTGTT -/A TATTCTAAAT 3070 het 1471 hom 17 3 12 2 A 0 1 33663 CASAVA_Build 5 165192711 1I AAATTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 22 0 19 3 T 12 13 33664 CASAVA_Build 5 165193456 1I AGAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 1356 het 1356 ref 31 12 7 12 A 13 14 33665 CASAVA_Build 5 165199945 1I CTTTTTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 564 hom 28 3 16 9 T 11 12 33666 CASAVA_Build 5 165200985 1D AATAAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2648 hom 27 9 13 5 T 12 11 33667 CASAVA_Build 5 165204919 1D AAAAAGGGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2313 hom 26 8 14 4 A 9 8 33668 CASAVA_Build 5 165222230 4D AAATAATGAA TAGG/---- TAGGTAGGTA 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 TAGG 5 4 33669 CASAVA_Build 5 165225415 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1847 het 385 hom 21 6 7 8 T 17 16 33670 CASAVA_Build 5 165240283 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2560 het 550 hom 9 2 6 2 A 12 11 33671 CASAVA_Build 5 165408346 1I ACATGACCAC -/A TAGGCTTTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 33672 CASAVA_Build 5 165435597 30D AAGGCCGGGC TTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAATATT/------------------------------ TTGGTGGCTC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAATATT 1 0 33673 CASAVA_Build 5 165436630 1D GATTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 10 T 12 11 33674 CASAVA_Build 5 165436961 1I ACTTTTAGTG -/A CCCGCGTTGA 3070 hom 122 het 46 0 40 6 A 0 1 33675 CASAVA_Build 5 165438561 1I TCTCTGAAGA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 99 het 42 0 33 9 T 7 8 33676 CASAVA_Build 5 165440398 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2812 het 46 hom 25 2 13 10 T 15 14 33677 CASAVA_Build 5 165443489 1I CTTCTGTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 10 33678 CASAVA_Build 5 165444073 2D CTGGCTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 46 0 39 9 A 13 11 33679 CASAVA_Build 5 165445249 18D AGAGGGGCCT AGAAGAATCTAACTAGAG/------------------ AGAAGAATCT 3070 hom 54 het 24 0 19 7 AGAAGAATCTAACTAGAG 2 1 33680 CASAVA_Build 5 165447154 1I GAGGTCCTCC -/A AAAAAAAAAA 1177 het 1177 ref 27 10 4 13 A 17 18 33681 CASAVA_Build 5 165447475 1I AGAACATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 129 het 53 0 44 9 A 9 10 33682 CASAVA_Build 5 165447873 6D AGAATGAGGC TGGGTT/------ TTGGAAAGAG 3070 hom 111 het 41 0 38 5 TGGGTT 1 0 33683 CASAVA_Build 5 165449295 1D CAATACTGCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 8 7 33684 CASAVA_Build 5 165450700 2I TTAGCTTCCT --/TG TCTTTTGTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TG 0 1 33685 CASAVA_Build 5 165451864 3I TGCCAAACAC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 10 13 33686 CASAVA_Build 5 165452200 4D TTTCACAAGA ACTC/---- ACTCACTATC 3070 hom 96 het 37 0 30 8 ACTC 2 1 33687 CASAVA_Build 5 165452998 1D CTCTGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 42 1 25 16 A 15 14 33688 CASAVA_Build 5 165480294 1I TATTCAAGTG -/T TTATTTTAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 2 3 33689 CASAVA_Build 5 165512131 2D CCATGTACAT AC/-- ACACACTCTC 3070 hom 132 het 47 0 45 3 AC 4 3 33690 CASAVA_Build 5 165520384 1D AAGACAATAT A/- AGCCTTAGTC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 A 2 1 33691 CASAVA_Build 5 165520908 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 36 2 24 10 A 13 12 33692 CASAVA_Build 5 165526961 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1339 hom 23 5 12 6 A 15 16 33693 CASAVA_Build 5 165557648 1I TTTAAGTTCA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 7 8 33694 CASAVA_Build 5 165562369 1I ACTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2348 hom 24 6 13 5 T 10 11 33695 CASAVA_Build 5 165563759 1I GGGAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 2978 het 1607 hom 22 6 10 6 T 13 14 33696 CASAVA_Build 5 165567434 1I CTAAATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 T 10 11 33697 CASAVA_Build 5 165573682 2D TTCATGAGAG CT/-- CTCTGCCTTT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 CT 3 2 33698 CASAVA_Build 5 165573800 1I CGTACCAGAC -/A ATTAGTTTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 2 33699 CASAVA_Build 5 165586204 1I GATCTGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 31 1 26 4 T 11 12 33700 CASAVA_Build 5 165595262 1D ACTTTACGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1742 hom 26 7 12 7 T 13 12 33701 CASAVA_Build 5 165595502 3D TAAAAGGTAG TAT/--- TATTATAACT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 TAT 3 2 33702 CASAVA_Build 5 165599169 1D15M1I AATGCTGTAC AAAAAAAAAACAACAA-/-AAAAAAAAACAACAAC AAAAAAAAAA 3070 het 876 hom 30 5 13 15 N/A 0 0 33703 CASAVA_Build 5 165601617 1D TTAATACGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 48 2 37 10 T 12 11 33704 CASAVA_Build 5 165602961 1D TTAAGGTAAG A/- AATATCTCAA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 A 3 2 33705 CASAVA_Build 5 165605035 1D TTTCTTCTTA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 69 het 28 0 23 6 T 9 8 33706 CASAVA_Build 5 165609020 2I AATTTAACTC --/AT GTGGAAATGT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AT 0 1 33707 CASAVA_Build 5 165613373 1D AGAAGCCTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 9 8 33708 CASAVA_Build 5 165630791 2D GCTCCTACCA GT/-- GTTACAGCTT 3070 het 3070 ref 46 23 21 4 GT 2 1 33709 CASAVA_Build 5 165658223 1D AAAATGATTG A/- AAAAAATTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 7 6 33710 CASAVA_Build 5 165659599 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1457 het 221 hom 14 3 4 8 A 19 18 33711 CASAVA_Build 5 165699699 1I TACTTCTGGC -/A AAAAAATTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 33712 CASAVA_Build 5 165703362 1I AAACACTGTG -/C TACCCAACTA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 0 1 33713 CASAVA_Build 5 165712148 6I TTAGCAGGTT ------/GAACTC TGCCAGAGTT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 GAACTC 0 1 33714 CASAVA_Build 5 165722461 2D CAGTGGCTTT GC/-- GCACTAGTCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 GC 2 1 33715 CASAVA_Build 5 165754647 1I CAGGTGCACT -/C TCTCCGAGCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 0 1 33716 CASAVA_Build 5 165766370 1I CATGTTTACC -/A AGACTAGCTC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 1 2 33717 CASAVA_Build 5 165788964 1I GTGGCTCACA -/C CCCATAATCC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 C 3 4 33718 CASAVA_Build 5 165816298 1I AACCTTTCAG -/T CATGCTTTAG 3070 hom 74 het 33 0 21 12 T 0 1 33719 CASAVA_Build 5 165817613 2D TGTTTGGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 234 hom 26 1 13 12 T 16 14 33720 CASAVA_Build 5 165819819 2D TGACCATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 36 2 24 10 T 15 13 33721 CASAVA_Build 5 165822308 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2032 het 463 hom 12 1 7 4 A 17 18 33722 CASAVA_Build 5 165835725 1I TGGAACAATG -/T TTTTTACTCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 5 6 33723 CASAVA_Build 5 165843507 4D GATTTGAGAA TCTT/---- TCTTTCACTT 3070 hom 129 het 46 0 44 3 TCTT 2 1 33724 CASAVA_Build 5 165852396 1I CTGGCCAACA -/C GGTGAAACCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 0 1 33725 CASAVA_Build 5 165856823 1D GACTGCCCAC T/- TTTTTTCATA 3070 hom 128 het 47 0 42 6 T 7 6 33726 CASAVA_Build 5 165861960 1I ATTAATTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 245 hom 53 2 42 9 T 9 10 33727 CASAVA_Build 5 165864409 4I AAGACATATG ----/TCTC TCTCTCTCTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 TC 4 6 33728 CASAVA_Build 5 165865169 1I CAATGAATAC -/A AGGCTTTTTT 3070 hom 51 het 30 0 17 13 A 1 2 33729 CASAVA_Build 5 165870723 1I GCTTCTTTAT -/A TTAGTAGCAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 0 1 33730 CASAVA_Build 5 165871195 3D ATCCTGCCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 40 2 24 15 A 19 16 33731 CASAVA_Build 5 165882063 4D AAAAAAAGAA AAGG/---- AAAAAGAAGA 1315 het 115 hom 18 2 9 8 AAGG 1 0 33732 CASAVA_Build 5 165888185 5D TAACAGAAAA AAAAC/----- AAAACAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 AAAAC 2 1 33733 CASAVA_Build 5 165893582 1I CCAAGTAGCT -/G GGATTACACG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 G 2 3 33734 CASAVA_Build 5 165893809 4I TATGCCACAG ----/TTTA TTTGTTTACA 3070 het 3070 ref 48 26 22 0 TTTA 0 1 33735 CASAVA_Build 5 165894925 1I ATATAAATTA -/T TATAGGTACC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 33736 CASAVA_Build 5 165898960 1I AGAAATATAA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 6 7 33737 CASAVA_Build 5 165909086 1D CCCACGGATC T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 8 7 33738 CASAVA_Build 5 165909801 1D TTCTCCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 12 11 33739 CASAVA_Build 5 165911515 1I TCTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 11 12 33740 CASAVA_Build 5 165911769 6I TGACTCAAAT ------/ATCTGG ATCACTTGTG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 ATCTGG 0 1 33741 CASAVA_Build 5 165912979 3I TCAATAATTT ---/TAA TAATAATACT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 TAA 2 3 33742 CASAVA_Build 5 165919575 1D AATAGGTAAA G/- GATGTGGATC 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 G 2 1 33743 CASAVA_Build 5 165928398 5D ACTTTTTTAA TATGT/----- TATGTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 TATGT 2 1 33744 CASAVA_Build 5 165955227 2I ATACATGGGG --/AA AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 A 6 8 33745 CASAVA_Build 5 165978845 1D CTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 24 2 12 10 T 17 16 33746 CASAVA_Build 5 165982436 1D CTCAAAATAT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 64 hom 30 1 18 11 G 11 10 33747 CASAVA_Build 5 165986133 4D ATATTAGGGG GTGC/---- TCTCACCGAG 3070 hom 102 het 39 0 35 9 GTGC 1 0 33748 CASAVA_Build 5 165986640 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 12 11 33749 CASAVA_Build 5 165987619 2I CTCTGTGTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 23 1 19 3 T 11 13 33750 CASAVA_Build 5 165987964 1D TTTTTTTTTT G/- TTGTTGTTAT 3070 het 1056 hom 30 3 22 6 G 1 0 33751 CASAVA_Build 5 165989887 1I TCTAGGCTGA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 7 8 33752 CASAVA_Build 5 166006110 2I GATTTTGCAT --/TC TTTCTCATTT 3070 hom 132 het 50 0 44 6 TC 0 1 33753 CASAVA_Build 5 166010875 1D AGTTGGATTA T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 7 6 33754 CASAVA_Build 5 166020589 1D TCTGACTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 34 9 A 11 10 33755 CASAVA_Build 5 166036006 1D GGGGAAAGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 9 8 33756 CASAVA_Build 5 166036813 1D AGCCTCCTGA G/- TAGCTGGGAT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 G 1 0 33757 CASAVA_Build 5 166049083 1I ATGCCATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 24 14 14 T 10 11 33758 CASAVA_Build 5 166051953 2D CTTTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1340 het 247 hom 27 4 5 18 T 18 16 33759 CASAVA_Build 5 166052591 1D CAGGGTGGGG T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 T 7 6 33760 CASAVA_Build 5 166054614 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1837 het 1250 hom 32 8 9 15 T 17 16 33761 CASAVA_Build 5 166097918 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 986 het 986 ref 21 17 3 1 A 11 10 33762 CASAVA_Build 5 166110432 1I CCTGACCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 10 11 33763 CASAVA_Build 5 166112052 1I TGAGCTCATT -/C CTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 26 17 8 1 C 1 2 33764 CASAVA_Build 5 166115995 2I ACATTCATAG --/CT CAAGAGAGCA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 CT 0 1 33765 CASAVA_Build 5 166120430 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTTTCCAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 CT 1 2 33766 CASAVA_Build 5 166120492 7I TCTCCCTAGG -------/TAGCACA TAGCACATTC 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 TAGCACA 1 2 33767 CASAVA_Build 5 166121103 1I AAAAAAAGCC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 8 9 33768 CASAVA_Build 5 166141955 1I CCCCAGGACT -/C CCCCCCCACC 1895 het 1895 ref 25 16 5 4 C 7 8 33769 CASAVA_Build 5 166156286 1I TTAATACATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 T 9 10 33770 CASAVA_Build 5 166159126 1D AAAAAAAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 287 hom 44 1 29 14 A 10 9 33771 CASAVA_Build 5 166162310 1I TTCAGTTCAA -/T TTAATAGTGA 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 T 2 3 33772 CASAVA_Build 5 166164030 9D AGTGATCTGC CCTCCTCGG/--------- CCTCCCAAAG 3070 het 3070 hom 37 15 20 4 CCTCCTCGG 1 0 33773 CASAVA_Build 5 166168742 1I GAGGATTAGT -/G GGGGGTTCTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 G 5 6 33774 CASAVA_Build 5 166191430 1D GGAAAACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 37 0 32 5 A 12 11 33775 CASAVA_Build 5 166197360 4I TCTATCAATG ----/TTAC TTACTACTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTAC 1 2 33776 CASAVA_Build 5 166202194 3D TTTTATTTAC TTT/--- ATTCTCTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 T 3 0 33777 CASAVA_Build 5 166215477 3D TCTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1866 het 580 hom 20 5 7 9 T 17 14 33778 CASAVA_Build 5 166216110 1I GTGTGAGCAA -/T TTTTTGCAAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 5 6 33779 CASAVA_Build 5 166217785 1D ATAGCACATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 9 8 33780 CASAVA_Build 5 166226204 4I AGATTTGAAG ----/TATC TATCCTCTCT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 TATC 1 2 33781 CASAVA_Build 5 166241831 1I CCCCCTCCCC -/T AGCTCTTTCC 3070 hom 77 het 31 0 25 6 T 0 1 33782 CASAVA_Build 5 166249871 1D TAGATAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 574 hom 28 2 14 12 T 17 16 33783 CASAVA_Build 5 166254370 21I CTACAGGCGC ---------------------/ATGCCACCAGGCCTGGCTAAT TATTGTATTT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 ATGCCACCAGGCCTGGCTAAT 0 1 33784 CASAVA_Build 5 166255879 7D TGCTTTACTT AACTGCA/------- ACTAGTCGTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AACTGCA 1 0 33785 CASAVA_Build 5 166263736 1I AAACTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 2740 het 2120 hom 25 12 10 3 A 15 16 33786 CASAVA_Build 5 166272653 1I ATGCTGGGAG -/T TTAATGGCCA 3070 hom 110 het 39 0 36 3 T 2 3 33787 CASAVA_Build 5 166273147 1I TATTTAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 28 1 22 5 A 13 14 33788 CASAVA_Build 5 166277473 4D CAGTGAACTA AAAC/---- AAACAAACAC 3070 het 3070 hom 46 18 23 7 AAAC 3 2 33789 CASAVA_Build 5 166278597 10D ATATTAGCAT GCTACATAAA/---------- GCAATGTGTT 3070 het 3070 ref 37 25 16 3 GCTACATAAA 1 0 33790 CASAVA_Build 5 166291355 1I GTGCAACTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 8 9 33791 CASAVA_Build 5 166319145 1I AATATCAAGA -/T TAAGAAACGA 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 T 1 2 33792 CASAVA_Build 5 166323807 1I AAAAAAAAAA -/G GATACTATAC 3070 het 876 hom 31 4 17 10 G 1 2 33793 CASAVA_Build 5 166334519 1I ATTCTGGGGA -/G GGGGGGTGGA 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 G 6 7 33794 CASAVA_Build 5 166339367 1D ATGAGTTTCA G/- GGGGGGAGGG 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 G 7 6 33795 CASAVA_Build 5 166346498 1D GAGAAGAGCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 9 8 33796 CASAVA_Build 5 166347118 1D TTCTGTACTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 8 33797 CASAVA_Build 5 166350747 1D TGGTTTGGTG T/- TTTGATTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 T 4 3 33798 CASAVA_Build 5 166368746 1I TATGTGTCAT -/G ATCGTTTATA 3070 het 3070 hom 54 23 28 3 G 0 1 33799 CASAVA_Build 5 166372446 1D TGTGTGTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 T 10 9 33800 CASAVA_Build 5 166378726 1D AGATAAGGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 9 8 33801 CASAVA_Build 5 166380723 5D TCAAAAAATA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 6 AAAAT 3 2 33802 CASAVA_Build 5 166399198 3I GTCAATTAAC ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 50 27 15 8 A 9 12 33803 CASAVA_Build 5 166399315 1I TAAAGATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 T 9 10 33804 CASAVA_Build 5 166406324 1I AGAACATCCA -/G GGTTCGTTAC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 G 2 3 33805 CASAVA_Build 5 166407539 4I CCTATAGCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 AAAC 3 4 33806 CASAVA_Build 5 166413797 1D CCTGCTAATT C/- CTGTAAATAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 C 2 1 33807 CASAVA_Build 5 166429445 2D GCATGTAAAC TG/-- TAACAGAAAT 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 TG 1 0 33808 CASAVA_Build 5 166448233 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 9 10 33809 CASAVA_Build 5 166450471 1I TGTTTGCAGG -/C CCCTTTATAA 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 C 3 4 33810 CASAVA_Build 5 166463429 1D AGCAATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 20 24 10 A 11 10 33811 CASAVA_Build 5 166508592 1I TTTTAAAAAG -/A AAAAAATGAA 3070 het 1315 hom 14 3 11 0 A 6 7 33812 CASAVA_Build 5 166563744 1I CCTTAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 A 11 12 33813 CASAVA_Build 5 166564282 4D ACAGTCACTC AGGG/---- AGAACTGTGT 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 AGGG 1 0 33814 CASAVA_Build 5 166567767 2D AGGGTCAGAA AG/-- AGAGAGAGAT 3070 het 3070 hom 44 20 20 6 AG 5 4 33815 CASAVA_Build 5 166568852 1I TTTTTAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 884 hom 18 4 9 5 T 13 14 33816 CASAVA_Build 5 166571851 1D AGGTGAAAAG A/- ATTCTCTTCT 3070 het 3070 hom 34 11 12 11 A 2 1 33817 CASAVA_Build 5 166575745 1D GGCTAGAGCC A/- GAATGGAAAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 1 0 33818 CASAVA_Build 5 166577486 1D GATGTCCCCT C/- CATGTGATGC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 C 2 1 33819 CASAVA_Build 5 166580413 1D ATCATACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 13 12 33820 CASAVA_Build 5 166582194 1I ATCACTTTTA -/T TTTATGGACA 3070 het 3070 hom 34 9 22 3 T 3 4 33821 CASAVA_Build 5 166583407 1D ATATGTTCCC T/- TTTCCCCACA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 4 3 33822 CASAVA_Build 5 166585853 1D ATATCCCTAC T/- TTTTTGATGT 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 T 6 5 33823 CASAVA_Build 5 166588222 1D ATTTCCTTAA T/- TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 7 6 33824 CASAVA_Build 5 166592331 1I ATACAAACAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 7 8 33825 CASAVA_Build 5 166592601 3I TTGGACAGAC ---/AGG AGGACATGTA 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 AGG 1 2 33826 CASAVA_Build 5 166592925 1I AAGATAGCGG -/C CCCCCCTTCT 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 C 6 7 33827 CASAVA_Build 5 166593522 1I GGATGAAAAT -/A AATAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 A 2 3 33828 CASAVA_Build 5 166593618 1I AGCAAGTAAA -/G AGCACTTTAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 G 0 1 33829 CASAVA_Build 5 166597117 2D TATATGAAAC AA/-- TGATGTTTAA 3070 het 3070 ref 49 31 16 3 A 2 0 33830 CASAVA_Build 5 166597886 1I CTTAGTCATT -/A ATACAGTAAT 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 A 1 2 33831 CASAVA_Build 5 166608392 2D CGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 28 0 20 9 TA 7 6 33832 CASAVA_Build 5 166609416 1I TGTTTCTCTA -/T TGATAGACAG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 1 2 33833 CASAVA_Build 5 166622741 5I CCCGGTAGCA -----/TTTTG TTTTAAGTAA 3070 het 3070 hom 53 19 25 9 TTTTG 0 1 33834 CASAVA_Build 5 166622944 1D GGTTTCACAG A/- TAGTAAACAG 3070 het 3070 ref 59 30 22 7 A 1 0 33835 CASAVA_Build 5 166627512 1I ACAAAGAGTC -/T TTTTTAAATA 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 T 5 6 33836 CASAVA_Build 5 166627615 6D GGTATGAGCT TCTTTC/------ TCTGCATGTG 3070 het 3070 ref 32 24 8 1 TCTTTC 1 0 33837 CASAVA_Build 5 166627698 5D AATATCTTTA TTATC/----- TTAAGTGCAA 3070 het 3070 ref 37 21 14 4 TTATC 1 0 33838 CASAVA_Build 5 166629220 1D GGGATGGAGT A/- AAAAAGGATT 3070 het 3070 hom 45 18 18 10 A 6 5 33839 CASAVA_Build 5 166634169 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 T 11 10 33840 CASAVA_Build 5 166636803 1D GATTTGAGGC T/- TTTTCTGTTG 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 T 5 4 33841 CASAVA_Build 5 166637400 6D TTTAGAATTG CCATGT/------ CCATGTCCTC 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 CCATGT 2 1 33842 CASAVA_Build 5 166640696 1D GACAATCAAT G/- TTTTTTTTTT 1607 het 641 hom 18 7 8 3 G 1 0 33843 CASAVA_Build 5 166643047 1D GAACTCCTGG T/- GTGAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 T 1 0 33844 CASAVA_Build 5 166643834 6D TTATGTTAGT TGAATG/------ TGACTTGGTA 3070 het 3070 ref 43 26 16 4 TGAATG 1 0 33845 CASAVA_Build 5 166680151 1I TGTAACAGTA -/T TAAGAGCTGG 3070 het 3070 ref 56 28 22 6 T 1 2 33846 CASAVA_Build 5 166680530 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 A 9 10 33847 CASAVA_Build 5 166681797 1D AAAATATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2062 hom 25 7 13 5 T 13 12 33848 CASAVA_Build 5 166687716 1D TGAACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2250 hom 25 7 9 10 A 12 11 33849 CASAVA_Build 5 166711437 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 11 10 33850 CASAVA_Build 5 166714059 1I ATTCTCTACA -/G AGCTTTCCCT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 G 0 1 33851 CASAVA_Build 5 166714959 1D TTATCCGAAT G/- GAGATTGAAC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 G 2 1 33852 CASAVA_Build 5 166725688 1D CTTTTGAAAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 7 33853 CASAVA_Build 5 166729246 2I CATTCGTGAC --/TA TTTTCATGTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 TA 0 1 33854 CASAVA_Build 5 166737964 1I TCTTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 1577 het 72 hom 32 2 15 15 C 0 1 33855 CASAVA_Build 5 166742519 4I GCACACAAAT ----/ATAA ATATAAAACT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 ATAA 0 1 33856 CASAVA_Build 5 166744286 2I CACACGCGTG --/CA CGCGCACACA 3070 het 5 hom 33 2 26 5 CA 0 1 33857 CASAVA_Build 5 166752776 2D TAAAGAAAAA AG/-- AGAGAAAATA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 AG 3 2 33858 CASAVA_Build 5 166762749 1D ATAGTTATTA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 T 8 7 33859 CASAVA_Build 5 166762902 1I TTTTGGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 38 0 28 10 A 10 11 33860 CASAVA_Build 5 166768525 2D CCCAAATCTA AT/-- ATATATATAT 674 het 674 ref 18 12 2 4 AT 9 8 33861 CASAVA_Build 5 166771466 4I TTGTGTTGAC ----/TGAA TGACTGCTGA 3070 het 3070 hom 60 29 29 2 TGAA 0 1 33862 CASAVA_Build 5 166771885 2D GCCTGAGGAG AA/-- AAGAGAGGGA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 4 2 33863 CASAVA_Build 5 166800460 5D GATTAGAAAG GCAGC/----- GCAGCACTGT 3070 hom 117 het 42 0 39 5 GCAGC 2 1 33864 CASAVA_Build 5 166802167 1I ATTTTATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 10 11 33865 CASAVA_Build 5 166803882 8D ACATACACAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 394 hom 39 4 26 12 AC 11 7 33866 CASAVA_Build 5 166806283 1D CAACTTTTTT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 10 9 33867 CASAVA_Build 5 166815997 18D ATCCAACCTC TAATTCTTTTCCAAGCAA/------------------ AAATAATTAT 3070 het 3070 ref 37 28 11 3 TAATTCTTTTCCAAGCAA 1 0 33868 CASAVA_Build 5 166820187 1D GCAAAACGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2682 hom 36 11 16 9 T 12 11 33869 CASAVA_Build 5 166837021 1D GTTGGCGGGT G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 G 8 7 33870 CASAVA_Build 5 166838574 2I TTTATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TG 7 8 33871 CASAVA_Build 5 166854828 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 43 0 30 13 T 12 11 33872 CASAVA_Build 5 166870534 4D AAAAAAAAAT AAAA/---- GAAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 49 15 29 7 A 4 0 33873 CASAVA_Build 5 166880516 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1816 hom 48 10 15 24 T 17 16 33874 CASAVA_Build 5 166882405 1D TCTGCCCTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 10 9 33875 CASAVA_Build 5 166896042 1D CCATATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3010 hom 24 11 11 3 A 11 10 33876 CASAVA_Build 5 166902069 11D GTCTTCCTCC TTCTGAATCCA/----------- TGAAGGGTCA 3070 het 3070 ref 54 32 17 8 TTCTGAATCCA 1 0 33877 CASAVA_Build 5 166909339 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 1111 het 1111 ref 54 45 4 5 T 10 9 33878 CASAVA_Build 5 166929955 19I TGGCATTTTA -------------------/AGAAGGTGATTCTGGCTTG AGAAGGATGA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 AGAAGGTGATTCTGGCTTG 0 1 33879 CASAVA_Build 5 166994062 1I ACTTAACTGA -/T TTTTTTTTTT 2647 het 2647 ref 33 12 10 11 T 16 17 33880 CASAVA_Build 5 166994244 1D ATAAAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 1267 het 1267 ref 30 21 4 5 T 12 11 33881 CASAVA_Build 5 167012183 2I ACCAAGCAAC --/TA TAGCTTCTGA 3070 het 3070 ref 45 18 18 9 TA 1 2 33882 CASAVA_Build 5 167028947 1I GTGTATATAG -/C TTTTGTTCAA 3070 het 3070 ref 50 24 25 1 C 0 1 33883 CASAVA_Build 5 167029446 1I ACTTTTGAGG -/T TTTTTTTTTT 2769 het 2769 ref 31 12 9 10 T 11 12 33884 CASAVA_Build 5 167030083 1D TCTCATCACA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 T 9 8 33885 CASAVA_Build 5 167039895 1D AGAATAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 13 12 33886 CASAVA_Build 5 167040511 5I TGTCATAAAC -----/TGTCT TTGAATGATG 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 TGTCT 0 1 33887 CASAVA_Build 5 167042833 4I GGACCATGTC ----/TTTT TTTTTTTTTT 575 het 575 ref 35 18 5 12 T 11 15 33888 CASAVA_Build 5 167086688 13D CATTAATTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 2529 het 1966 hom 19 6 8 5 T 23 10 33889 CASAVA_Build 5 167107972 1I TAGAGGACAA -/T TTTTTTAAGA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 6 7 33890 CASAVA_Build 5 167109221 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 26 1 17 9 A 14 13 33891 CASAVA_Build 5 167111325 1D TTTTTTAAGC T/- TCACATACAC 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 2 1 33892 CASAVA_Build 5 167115042 1I ATTTCACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 10 11 33893 CASAVA_Build 5 167119490 1D GTGATTTTTT A/- AAAAAACATA 3070 hom 154 het 56 0 52 4 A 7 6 33894 CASAVA_Build 5 167144557 1D TGAATTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 11 10 33895 CASAVA_Build 5 167156197 2D TTTGGGGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1354 het 1354 ref 43 25 3 15 GT 10 9 33896 CASAVA_Build 5 167167208 5D CATTTTTTTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 27 11 A 15 10 33897 CASAVA_Build 5 167176432 1D TGTAAGGCAA G/- AAATGTTCAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 1 0 33898 CASAVA_Build 5 167182268 1I TCCAGGGGTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 419 hom 31 1 28 2 T 8 9 33899 CASAVA_Build 5 167193674 6D AAGGTGAGAC AAACAT/------ AAACAGGTAA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 AAACAT 1 0 33900 CASAVA_Build 5 167200645 1I GTCATCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 23 1 16 6 T 12 13 33901 CASAVA_Build 5 167202879 1I TTTGAGGACG -/T TTTTTGTTTG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 5 6 33902 CASAVA_Build 5 167220623 1D AATTATCAAT A/- AAAAAAAAAA 99 het 52 hom 17 1 2 14 A 11 10 33903 CASAVA_Build 5 167235459 1D AGTTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1114 hom 39 4 23 12 T 15 14 33904 CASAVA_Build 5 167240123 1D ACCCCATGAG A/- TAAAAGCAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 1 0 33905 CASAVA_Build 5 167254050 2I CCACTCTGTG --/AC ACTAGACTTC 3070 hom 168 het 64 0 54 10 AC 1 2 33906 CASAVA_Build 5 167256875 1I AACTGGTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 731 hom 33 2 19 12 T 10 11 33907 CASAVA_Build 5 167330846 4D AGAGAGAGAG AGAA/---- AGAAAGGGGA 3070 hom 68 het 26 0 23 5 AGAA 2 1 33908 CASAVA_Build 5 167330952 3I AGAAAATATT ---/AGA AGAAGGAGTC 3070 hom 30 het 26 0 11 15 AGA 1 2 33909 CASAVA_Build 5 167342767 1D AAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 1299 het 1299 ref 46 37 3 7 A 12 11 33910 CASAVA_Build 5 167421628 1D TGTTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 791 hom 45 3 34 8 T 12 11 33911 CASAVA_Build 5 167428653 1D TCCTTATTTG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 92 het 36 0 31 6 A 8 7 33912 CASAVA_Build 5 167434192 1I CAGAAGATCA -/G TCTCTGTGGC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 0 1 33913 CASAVA_Build 5 167460022 1D CACACGTATG T/- TTTATTGCAG 2291 het 2291 ref 21 13 5 3 T 4 3 33914 CASAVA_Build 5 167461435 1D TCCCTTAGTA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 7 6 33915 CASAVA_Build 5 167467139 1D CAAGCCTCCT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 1750 hom 37 8 18 12 G 10 9 33916 CASAVA_Build 5 167482719 2I ATTTCTAGAG --/GA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 GA 0 1 33917 CASAVA_Build 5 167488547 1D CCGTTATGGG A/- AAAAAAAAAA 1993 het 1371 hom 29 9 7 13 A 15 14 33918 CASAVA_Build 5 167509092 1I CGAGGCATGT -/G TAGGAAAACA 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 G 0 1 33919 CASAVA_Build 5 167509772 1D CTACTGTATG C/- CCCTTGTCTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 4 3 33920 CASAVA_Build 5 167514950 1D36M2D AAAAACAAAC AAAAAAAAAACAGTGATATTTAAAACAGTTGGTGAAAGG/-AAAAAAAAACAGTGATATTTAAAACAGTTGGTGAAA-- GGGGGGGGGT 3070 het 2380 hom 20 6 14 10 N/A 0 0 33921 CASAVA_Build 5 167530371 6D AAAGTTATTG TGGTTT/------ TGGCCATTGA 3070 het 3070 ref 50 24 23 6 TGGTTT 1 0 33922 CASAVA_Build 5 167542966 1D GGCCCAGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 A 11 10 33923 CASAVA_Build 5 167545232 1D TCTTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 11 10 33924 CASAVA_Build 5 167545410 1D CTTTTGCATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2908 hom 15 7 7 1 T 9 8 33925 CASAVA_Build 5 167548380 1D CTCCCTGGGG A/- GATGTGGGGT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 1 0 33926 CASAVA_Build 5 167555308 1I TAGTGTCCTG -/T TGGTGATCCC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 1 2 33927 CASAVA_Build 5 167570196 1D TTTAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 T 15 14 33928 CASAVA_Build 5 167583507 2I CCCCTCCCTG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 12 19 10 A 9 11 33929 CASAVA_Build 5 167587077 2I CAAAAGGAGG --/AA AAAACTGAAG 3070 het 2433 hom 27 6 14 7 A 4 6 33930 CASAVA_Build 5 167588184 4I ATGTTCTTTG ----/CACT CACTCAAGGA 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 CACT 1 2 33931 CASAVA_Build 5 167600201 1I GCTGTGGTTT -/A TTCTTCCTTG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 0 1 33932 CASAVA_Build 5 167600846 1D CTTTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2652 hom 23 7 11 5 T 11 10 33933 CASAVA_Build 5 167604360 1D TTCCGGCTTC T/- TTTTTTTTTT 1037 het 1037 ref 20 10 3 7 T 11 10 33934 CASAVA_Build 5 167605819 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 942 het 942 ref 18 7 5 6 A 15 16 33935 CASAVA_Build 5 167611949 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2331 het 2331 ref 32 16 8 8 A 17 16 33936 CASAVA_Build 5 167641638 4I GGGGAAAAAT ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 34 11 22 1 AG 5 7 33937 CASAVA_Build 5 167667886 3D AAATAATAAA AAC/--- AAGCAAAATA 3070 het 3070 ref 52 27 22 4 AAC 1 0 33938 CASAVA_Build 5 167670909 2I TGGAAAAAAG --/CT CACAGGAATC 3070 hom 83 het 35 0 27 8 CT 0 1 33939 CASAVA_Build 5 167671191 1D CAGTGGCTCA C/- GTCTGTAATC 3070 het 2674 hom 27 7 18 2 C 1 0 33940 CASAVA_Build 5 167671800 1D ACGCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2099 het 2099 ref 24 13 6 7 A 13 12 33941 CASAVA_Build 5 167672731 1D TAAATTGCTC T/- GAATGCTCAT 3070 het 3070 hom 28 13 12 4 T 1 0 33942 CASAVA_Build 5 167673807 1D AAGTTTCCCA G/- GCAGGGAGTT 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 G 2 1 33943 CASAVA_Build 5 167673964 11D CAGCCTGACC AACATGGAGAA/----------- ACCCCATCTC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AACATGGAGAA 1 0 33944 CASAVA_Build 5 167674759 1D CACAAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2057 hom 38 7 21 10 T 15 14 33945 CASAVA_Build 5 167686476 1D ATAAGCATGT G/- GGAAAGTTTA 3070 het 3070 hom 35 14 18 5 G 3 2 33946 CASAVA_Build 5 167696933 1I GGTGTAACTA -/G GGAAGGTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 2 3 33947 CASAVA_Build 5 167712170 1D ATATATATAA T/- TTTTTTTTTT 1095 het 481 hom 13 7 3 3 T 15 14 33948 CASAVA_Build 5 167715508 4I AGAGAGAGAA ----/AGAG AGAGAGACGG 3070 het 3070 hom 42 17 14 11 AG 3 5 33949 CASAVA_Build 5 167727117 12I GGTTTCACCG ------------/TGTTAGCCAGGA TGGTCTCGAT 2689 hom 19 het 8 0 6 2 TGTTAGCCAGGA 0 1 33950 CASAVA_Build 5 167729671 2I TTTAGTAGAG --/AC AGAGTTTCAC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AC 0 1 33951 CASAVA_Build 5 167736275 1D AGCCACACAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 98 hom 40 1 34 5 A 10 9 33952 CASAVA_Build 5 167737176 4D AGCAAAAAAC AAAT/---- AACCCCATTA 3070 het 3070 ref 32 18 9 6 AAAT 1 0 33953 CASAVA_Build 5 167743754 1I ACACTTATTT -/C CTGTGTGACT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 33954 CASAVA_Build 5 167747492 2D CAAAGTGATT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 37 15 13 10 TC 8 7 33955 CASAVA_Build 5 167747873 1I TTAGACTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 T 10 11 33956 CASAVA_Build 5 167749896 1D GAAAAAGAGG T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 8 7 33957 CASAVA_Build 5 167758811 3I CTCCTGTCCA ---/CCT CCTGTTTCCC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 CCT 1 2 33958 CASAVA_Build 5 167766906 1D CATCCTACAG A/- AAAAAGACTG 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 A 6 5 33959 CASAVA_Build 5 167767928 1D ACAGCAAGGA C/- CCACTCACTG 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 C 3 2 33960 CASAVA_Build 5 167769596 1D GGCTGGGGCT A/- GGGGCGGGAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 1 0 33961 CASAVA_Build 5 167774468 1D CTCTATATAA C/- TTAAAGCAGT 3070 het 3070 ref 64 33 26 5 C 1 0 33962 CASAVA_Build 5 167776774 3I AAAAAATGAC ---/ATT ATTTAAGAAT 3070 het 3070 hom 37 19 15 3 ATT 1 2 33963 CASAVA_Build 5 167778433 1D TCATTGTGTT G/- AAAGTCAAGG 3070 het 3070 ref 57 28 27 3 G 1 0 33964 CASAVA_Build 5 167778942 1D AACTGTGCCT G/- GCTTCATCTG 3070 het 3070 hom 50 24 23 4 G 2 1 33965 CASAVA_Build 5 167790236 2I ACACCAGTCA --/CT CTGCTTCTCT 3070 het 3070 ref 57 25 23 9 CT 1 2 33966 CASAVA_Build 5 167798230 7I CAGAGTCTGG -------/GTAGCCC TTCCACCCAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 GTAGCCC 0 1 33967 CASAVA_Build 5 167802657 1D CGACCACATC A/- AAAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 A 6 5 33968 CASAVA_Build 5 167808737 1I TATTACCAGA -/T TTTTTTTCCG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 7 8 33969 CASAVA_Build 5 167810650 16D CCAGGCTGCG ATCTCGGCTCACTGCA/---------------- ATCTCGGCTC 3070 hom 21 het 11 0 8 5 ATCTCGGCTCACTGCA 2 1 33970 CASAVA_Build 5 167812348 3D CTCTCCCTCT TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 hom 62 het 39 0 20 20 TCC 7 6 33971 CASAVA_Build 5 167812813 1I ATTCAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 288 hom 36 2 27 7 A 11 12 33972 CASAVA_Build 5 167821652 1D AAAAAAAAAG A/- AAGAAAGAAA 3070 het 348 hom 16 1 14 1 A 3 2 33973 CASAVA_Build 5 167821826 3I AACTGGAGAG ---/AGC AGGAGAGAGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AGC 0 1 33974 CASAVA_Build 5 167829655 1D CCCCAACCCA G/- GGGCTGGTAG 3070 hom 96 het 35 0 31 5 G 4 3 33975 CASAVA_Build 5 167834354 2D ATTTATAGTC AT/-- ATTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 AT 2 1 33976 CASAVA_Build 5 167840723 2D TTTTATAATA AC/-- AGTTGTTTAA 3070 het 2945 hom 23 7 13 4 AC 1 0 33977 CASAVA_Build 5 167864869 1I AGCACTCTTA -/T ATAGCTGCTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 0 1 33978 CASAVA_Build 5 167868455 2D ACATGAGCTC CT/-- CTCTGAAAGA 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 CT 3 2 33979 CASAVA_Build 5 167891623 1D TGGCTAATTT A/- AAAAAAAAAT 2708 het 2520 hom 18 7 7 4 A 10 9 33980 CASAVA_Build 5 167893402 1D CCCAAATATA G/- TAACACTGGG 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 G 1 0 33981 CASAVA_Build 5 167898701 2I CTTATACTCC --/AG ACCTTCATTA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 AG 0 1 33982 CASAVA_Build 5 167902935 2D CTTAAAACTT AA/-- AAAGTATAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 1 A 5 3 33983 CASAVA_Build 5 167914182 1I TAGAATTTAG -/A ACTGTTTGAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 1 2 33984 CASAVA_Build 5 167923263 1D CTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 11 23 10 A 12 11 33985 CASAVA_Build 5 167932958 4I CCAGAAAAAT ----/AATC AATCACTATT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 AATC 1 2 33986 CASAVA_Build 5 167935039 3I GGAAGCAGAG ---/AAC AACACTAACA 3070 het 3070 ref 53 25 23 5 AAC 1 2 33987 CASAVA_Build 5 167936374 1D TAATTATGCC A/- AAAAAAACCC 1426 het 1426 ref 19 12 3 4 A 8 7 33988 CASAVA_Build 5 167938391 3D CTCCAACTGT AAC/--- AACAGTGACA 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 AAC 2 1 33989 CASAVA_Build 5 167945686 4D TGAAGGAAAT AGTC/---- AGGTTGATGT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 AGTC 1 0 33990 CASAVA_Build 5 167960409 2I TAGTTTTCTT --/AA AAAAAAAAAA 2283 het 2283 ref 19 10 7 2 A 10 12 33991 CASAVA_Build 5 167996609 2I TAGAACAACA --/AC AAAAAAAAGA 2309 het 2309 ref 18 11 6 1 AC 0 1 33992 CASAVA_Build 5 168008208 4D AAAGGAAAAA AGTT/---- AGAGTAAGCT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 AGTT 1 0 33993 CASAVA_Build 5 168010676 1D CCAGTTAAGA C/- TTATCAAGGG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 C 1 0 33994 CASAVA_Build 5 168024095 13D TCCCTTCCTT CTTTCCTTCCTTC/------------- CTTCTTCCAG 3070 hom 117 het 42 0 39 12 CTTTCCTTCCTTC 1 0 33995 CASAVA_Build 5 168033489 1I ACCTTCTCAA -/T TCCTGCTCTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 2 33996 CASAVA_Build 5 168036310 2I GTGTGTCAAC --/AG ATGCTGGACA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AG 0 1 33997 CASAVA_Build 5 168050386 2I CTCATTGAGC --/AA AACCAGAGCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 2 4 33998 CASAVA_Build 5 168070192 1I ACAAAAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 A 13 14 33999 CASAVA_Build 5 168083441 1I CAGTAGCTTG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 7 8 34000 CASAVA_Build 5 168088520 1I CCAAAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 687 het 687 ref 27 21 5 1 A 10 11 34001 CASAVA_Build 5 168089696 2D ATAAAACAGT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 71 hom 41 3 23 17 A 10 8 34002 CASAVA_Build 5 168092685 1D ACTTGACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 7 12 8 A 10 9 34003 CASAVA_Build 5 168102548 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2597 het 2597 ref 20 8 9 3 A 10 11 34004 CASAVA_Build 5 168105378 1I TTTCATGAAG -/A AAGACTCCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 3 34005 CASAVA_Build 5 168105849 5I GATGTGTGTG -----/GGTGT GGTGTGGTGA 3070 hom 99 het 44 0 31 13 GGTGT 1 2 34006 CASAVA_Build 5 168116544 3D AATGGAAAAC AGA/--- AGGAGAGTAA 3070 het 3070 hom 39 17 20 5 AGA 1 0 34007 CASAVA_Build 5 168128011 1I CCCCACCCCA -/G GGGAGACACA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 3 4 34008 CASAVA_Build 5 168131570 1I AGTTTGGTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 11 19 0 T 8 9 34009 CASAVA_Build 5 168131837 1D TGGAGGAGCT A/- AGCTAGTGAA 3070 het 3070 ref 57 32 21 4 A 2 1 34010 CASAVA_Build 5 168134305 1I ATTGGAAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 A 8 9 34011 CASAVA_Build 5 168135117 2I TCACACCCCC --/CT GTTTATTTCC 2801 het 2801 ref 27 13 9 5 CT 0 1 34012 CASAVA_Build 5 168142860 1D CGCAGCCTCT A/- AAAAAACGGA 3070 het 3070 ref 45 22 17 8 A 7 6 34013 CASAVA_Build 5 168153384 1D AAAATGAATT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 1552 hom 37 6 17 14 G 10 9 34014 CASAVA_Build 5 168153940 11I TGTGCAGAAC -----------/TGTAATACCTG TGATGGCAAT 3070 het 3070 hom 52 17 23 12 TGTAATACCTG 0 1 34015 CASAVA_Build 5 168162599 4D AACCTCTTGG TTGT/---- TTGTATCTCC 3070 het 3070 ref 58 29 20 11 TTGT 2 1 34016 CASAVA_Build 5 168167763 3D ATGCCCGAAA GAT/--- GATGACTTAC 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 GAT 2 1 34017 CASAVA_Build 5 168176121 1I TGGGTTACTC -/A AGCCACCTCC 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 1 2 34018 CASAVA_Build 5 168177085 1I ATGGTCACAG -/A GTGAAGTGTG 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 A 0 1 34019 CASAVA_Build 5 168195394 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2416 hom 25 10 11 4 A 15 16 34020 CASAVA_Build 5 168200027 1D GAGTTAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 T 13 12 34021 CASAVA_Build 5 168201183 4D CATTTCTTCT CATA/---- CATAGTCAGT 3070 het 3070 hom 50 24 23 4 CATA 2 1 34022 CASAVA_Build 5 168206521 1D GAAAGAGAAT A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 48 18 24 7 A 7 6 34023 CASAVA_Build 5 168213994 4I CTTGTCTCTC ----/AGTT AGATTCCTTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 AGTT 0 1 34024 CASAVA_Build 5 168233752 1I GTAATGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 10 11 34025 CASAVA_Build 5 168237447 1I GGGGACATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 A 9 10 34026 CASAVA_Build 5 168246610 6I GCAAATTTAT ------/TATTGC TATTGCTTCA 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 TATTGC 1 2 34027 CASAVA_Build 5 168255455 1D TCTGGCCATT A/- AGCCTGAAAG 3070 hom 101 het 38 0 34 4 A 2 1 34028 CASAVA_Build 5 168256715 10D TACTAGGGTG ACTACTATGT/---------- ACCCAGGGCG 3070 hom 126 het 41 0 42 5 ACTACTATGT 1 0 34029 CASAVA_Build 5 168257479 1D CTCTGAGACA C/- CCCCCCACCT 2719 het 2719 ref 29 17 8 5 C 7 6 34030 CASAVA_Build 5 168259389 4I ATTGCCCCTA ----/AGTG AGATGACAGG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 AGTG 0 1 34031 CASAVA_Build 5 168263398 2I TTCACTGGTT --/TC TGAATTATTA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 TC 0 1 34032 CASAVA_Build 5 168264769 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 2585 hom 27 9 15 3 A 8 9 34033 CASAVA_Build 5 168280392 1D TCTCTCCCTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 45 12 27 6 T 8 7 34034 CASAVA_Build 5 168281484 1D TTTAATTATG A/- GCTCATTTAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 1 0 34035 CASAVA_Build 5 168286276 27D ATGGGTAAAG GACTTGGATAGACTTTTCTACGAAGAA/--------------------------- GACTTGGATA 3070 het 3070 ref 41 15 12 20 GACTTGGATAGACTTTTCTACGAAGAA 2 1 34036 CASAVA_Build 5 168291844 2I TTGTTGTGTT --/TG TTTTTTTTTT 1604 het 215 hom 48 4 19 25 TG 0 1 34037 CASAVA_Build 5 168302319 13D3M12D TTGGCTGGTC TGGTTTTGCCTTTCAGGGCCTCTGGAGT/-------------CAG------------ TTGTGGGGGG 3070 het 3070 ref 32 18 14 10 N/A 0 0 34038 CASAVA_Build 5 168304830 2I GGTATCCACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 533 hom 31 2 19 10 T 13 15 34039 CASAVA_Build 5 168307563 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGGTCTCG 3070 hom 19 het 16 0 14 2 G 5 6 34040 CASAVA_Build 5 168313593 1I GGGAACTGAG -/A ACATTTTACT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 1 2 34041 CASAVA_Build 5 168316526 1I CATCCACTTT -/A AAAAAAAAAA 2616 het 1066 hom 26 5 11 10 A 11 12 34042 CASAVA_Build 5 168317355 1D TGTGTATGTG T/- TGGGGGCGGG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 2 1 34043 CASAVA_Build 5 168322363 1I GCCTTTTAGC -/T TCTTAGACTC 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 1 2 34044 CASAVA_Build 5 168332716 1I CTTGTTTCCA -/T TGACAGCCAT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 1 2 34045 CASAVA_Build 5 168368682 1I ATTTTTTTTT -/A AAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 4 5 34046 CASAVA_Build 5 168377972 1D CTTCTTTTTT G/- CAGGGAGGTG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 G 1 0 34047 CASAVA_Build 5 168379716 1D GAGAAACAGT A/- TGACCTACAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 A 1 0 34048 CASAVA_Build 5 168383189 1I CCCTCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 T 10 11 34049 CASAVA_Build 5 168391022 1D AAATCGTAAT A/- AAAGCTATGC 3070 het 3070 hom 56 22 25 9 A 4 3 34050 CASAVA_Build 5 168392183 1D TTTAGTTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 934 hom 30 6 14 10 T 13 12 34051 CASAVA_Build 5 168396243 1D TTAATAGTAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 9 8 34052 CASAVA_Build 5 168396716 1I GTCTCATTCG -/T TGCCTCTAAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 T 1 2 34053 CASAVA_Build 5 168398359 1I GGCACCACAT -/G TGTTCAGTGG 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 G 0 1 34054 CASAVA_Build 5 168401028 5D ATCTATCATG GATTT/----- GATTTGAGAG 3070 het 3070 hom 47 14 29 5 GATTT 2 1 34055 CASAVA_Build 5 168410275 1D ATAATAGCAC T/- TTTTTTTTTT 1219 het 1219 ref 54 38 4 12 T 12 11 34056 CASAVA_Build 5 168428426 1I TAAAAGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 10 11 34057 CASAVA_Build 5 168457203 2I TTATTCTACG --/AA AAGAGTAGTT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 2 4 34058 CASAVA_Build 5 168479287 27D AAACACCCAA CTGTGGCACGCTGCCTCTGTGGGTCTC/--------------------------- CTGTCTTCCC 3070 het 3070 ref 47 37 16 3 CTGTGGCACGCTGCCTCTGTGGGTCTC 1 0 34059 CASAVA_Build 5 168508466 1D AGTGTTACTT A/- AAAAAAAAAA 1072 het 1072 ref 39 27 3 9 A 13 12 34060 CASAVA_Build 5 168509625 1I GGGATTTCAA -/C CCTGGAAGTT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 C 2 3 34061 CASAVA_Build 5 168525743 3I TTTTTTTCTC ---/CTT CTCCTCCTCT 3070 het 3070 hom 59 22 29 9 CTT 0 1 34062 CASAVA_Build 5 168528463 1I TTGCTGGCAT -/A TGGCCAGTGG 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 A 0 1 34063 CASAVA_Build 5 168528620 1D AGCCCAGAGT G/- GGGGGGGGAT 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 G 9 8 34064 CASAVA_Build 5 168534543 1D ACAACTGTTT G/- GGCTGTTCTT 3070 het 3070 hom 46 18 23 7 G 3 2 34065 CASAVA_Build 5 168546445 8D AATCTGCTCC ACCATGAT/-------- ACCATGATAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 12 ACCATGAT 2 1 34066 CASAVA_Build 5 168546595 2D CTCAGTGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 19 6 T 12 10 34067 CASAVA_Build 5 168547140 2D TTTCTTTCTT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1514 hom 20 6 11 3 TC 1 0 34068 CASAVA_Build 5 168555744 1D ACTAAAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 A 11 10 34069 CASAVA_Build 5 168560114 15D TGCTCCAGGC CAGCAAGCGCCAGGG/--------------- ATGATGACTA 3070 het 3070 ref 35 20 12 6 CAGCAAGCGCCAGGG 1 0 34070 CASAVA_Build 5 168561566 17D ACAGTCCTGG CACTTTGGGAGGCCAAA/----------------- GCAGGAGGAT 3070 het 3070 ref 37 25 13 7 CACTTTGGGAGGCCAAA 1 0 34071 CASAVA_Build 5 168566628 1I TTCCTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3023 het 2876 hom 29 11 10 8 T 13 14 34072 CASAVA_Build 5 168569528 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 9 8 34073 CASAVA_Build 5 168572854 1I TGAAGGCCCT -/C CTTCAAGGAG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 C 1 2 34074 CASAVA_Build 5 168573695 3D GTTAAATGGA AAG/--- AAGACAAACA 3070 het 3070 hom 42 21 19 5 AAG 2 1 34075 CASAVA_Build 5 168575097 1I CCATGGTGTC -/T TGTCAACATT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 1 2 34076 CASAVA_Build 5 168588797 1I CCTTCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 10 11 34077 CASAVA_Build 5 168589897 1I AGGTTTATCC -/T TAACTCTAAA 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 T 1 2 34078 CASAVA_Build 5 168591702 3I CTTTCAATAA ---/CAT TGTATTTTGG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 CAT 0 1 34079 CASAVA_Build 5 168601294 1D ACAGTCATGG T/- TTTGGGAAGA 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 T 4 3 34080 CASAVA_Build 5 168606326 2D CATGGTGAAA CT/-- CTGTCTCTAC 2696 het 1110 hom 12 3 7 2 CT 2 1 34081 CASAVA_Build 5 168606830 2I TTCCCTTCTC --/TT GTCTTCCTTT 3070 het 59 hom 24 2 22 0 T 0 2 34082 CASAVA_Build 5 168612666 1D GGTTTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 14 10 A 12 11 34083 CASAVA_Build 5 168622312 4D CTTGCCTCAT TTAA/---- TTCTTTCTTC 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 TTAA 1 0 34084 CASAVA_Build 5 168641203 1D GAAATGGACA C/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 C 1 0 34085 CASAVA_Build 5 168641458 1I AGGTAATTTT -/C CCCCCCCAGG 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 C 7 8 34086 CASAVA_Build 5 168645813 4D ACTATAGAGG AAGC/---- AAAATTATGT 3070 het 3070 ref 38 21 12 7 AAGC 1 0 34087 CASAVA_Build 5 168647938 1I CCCCCTTGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 9 10 34088 CASAVA_Build 5 168653842 1D ATGAGCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2019 hom 31 6 16 9 A 15 14 34089 CASAVA_Build 5 168654023 1I GCTCTGCTGT -/G GGGGGCAGGA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 G 5 6 34090 CASAVA_Build 5 168667770 1I TTCAATTTTG -/C CCTGGTCTGA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 C 2 3 34091 CASAVA_Build 5 168671799 1D AAAAAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 19 10 T 12 11 34092 CASAVA_Build 5 168685405 5I TGTAATAAGG -----/TAAGA AAAAATGGTT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 TAAGA 0 1 34093 CASAVA_Build 5 168687770 4I AATCAATAAT ----/ACAA AGTGCTGGTA 3070 hom 92 het 33 0 30 3 ACAA 0 1 34094 CASAVA_Build 5 168688764 1D ATATTTTCCA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 T 7 6 34095 CASAVA_Build 5 168696893 1I AGAATCCAGA -/G GACTGGGCAC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 1 2 34096 CASAVA_Build 5 168698304 18I AGGAAACAGG ------------------/GAGAGCTGGGGCTGGAGA GGGCCCACCC 3070 hom 99 het 39 0 30 9 GAGAGCTGGGGCTGGAGA 0 1 34097 CASAVA_Build 5 168701102 1I GAATCTTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 T 9 10 34098 CASAVA_Build 5 168787983 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 A 13 12 34099 CASAVA_Build 5 168790799 5I ATTAAGACTA -----/CTGCC CTAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 15 29 5 CTGCC 0 1 34100 CASAVA_Build 5 168809806 1D GACACAAACT A/- TTGGACAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 6 A 1 0 34101 CASAVA_Build 5 168810046 1I AGACAGATTG -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 A 6 7 34102 CASAVA_Build 5 168816212 1I TATGTCATAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 34103 CASAVA_Build 5 168825397 1I TGATAGACCT -/A ACTTTAGGCT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 1 2 34104 CASAVA_Build 5 168825781 1D GTTTCCTTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 10 9 34105 CASAVA_Build 5 168831857 1I CCAAGTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 22 2 A 11 12 34106 CASAVA_Build 5 168833057 1D TCAGCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1675 het 1675 ref 20 11 7 2 A 11 10 34107 CASAVA_Build 5 168836336 1D GTTGGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 31 5 15 11 T 11 10 34108 CASAVA_Build 5 168841982 1I GGGGTATATC -/A ATTATGGGTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 1 2 34109 CASAVA_Build 5 168842720 1D TAATTTGTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 T 9 8 34110 CASAVA_Build 5 168843492 3D GCTTCACGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 2560 het 1752 hom 29 10 7 12 T 17 14 34111 CASAVA_Build 5 168847687 1D TCTGGAGCCG A/- AAAATGCAAT 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 A 5 4 34112 CASAVA_Build 5 168848781 1I CAAAAAGTTT -/A AAAGTGGGGT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 3 4 34113 CASAVA_Build 5 168857427 1D GCTAAATAGG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 T 8 7 34114 CASAVA_Build 5 168863460 2D TCCCAGAGAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 11 9 34115 CASAVA_Build 5 168866605 3I CAGTGTCCAA ---/ATC ATCATCAGCA 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 ATC 2 3 34116 CASAVA_Build 5 168880258 1D CATTAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 11 10 34117 CASAVA_Build 5 168886586 1D CCAACCTCTG C/- CTGTTACCCA 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 C 2 1 34118 CASAVA_Build 5 168898875 2I TCAACAAAAA --/AG GACAAAACAG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 AG 0 1 34119 CASAVA_Build 5 168901480 1D GACCTGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2639 hom 37 11 18 8 A 15 14 34120 CASAVA_Build 5 168901956 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 4 A 12 11 34121 CASAVA_Build 5 168902458 3I CCAATTTTGA ---/AAG AAGTTTACTC 3070 hom 138 het 55 0 46 9 AAG 1 2 34122 CASAVA_Build 5 168903817 1D GTCAGCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 A 14 13 34123 CASAVA_Build 5 168904345 1D CTGACTTGAC A/- TTTTTATTTA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 1 0 34124 CASAVA_Build 5 168904440 1D TATTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 11 10 34125 CASAVA_Build 5 168904935 1D TTCATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 48 1 37 10 A 13 12 34126 CASAVA_Build 5 168907074 1D AAAAAACAAA C/- AAAAAATGGT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 C 1 0 34127 CASAVA_Build 5 168910763 9I ATATTAAATA ---------/TGATTTCAT ACACTCGGTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TGATTTCAT 0 1 34128 CASAVA_Build 5 168917827 7D AACCATTCTA TTTTCTC/------- TTTTCTCTTT 3070 hom 54 het 19 0 19 4 TTTTCTC 2 1 34129 CASAVA_Build 5 168918870 18I4M18I TTTTTTAATT ------------------CTCA------------------/GAGTCGTTAGCCTTCTTACTGAACTGTAAGAGTTCTTTGT ATATTCTCAA 3070 hom 105 het 30 0 35 4 N/A 0 0 34130 CASAVA_Build 5 168920530 2I TAGTGTTTGA --/GC TAGTGTTTGT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 GC 0 1 34131 CASAVA_Build 5 168928634 2I AGTTAAAATA --/AT ATGTTATCTG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 AT 1 2 34132 CASAVA_Build 5 168935167 1I TCACCCAAGG -/A TTTTTGAAAA 3070 hom 144 het 52 0 48 4 A 0 1 34133 CASAVA_Build 5 168944599 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1921 hom 36 het 17 0 11 6 A 14 15 34134 CASAVA_Build 5 168962184 4I TTTAAAAGGG ----/CTTC CTTATATGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CTTC 0 1 34135 CASAVA_Build 5 168966475 1D AAGAAGAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 780 hom 41 2 35 4 A 10 9 34136 CASAVA_Build 5 168968462 6D AAAAAGAAAC AGAGTT/------ AGAGGACTTA 3070 het 3070 ref 37 21 13 8 AGAGTT 1 0 34137 CASAVA_Build 5 168971363 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 T 11 12 34138 CASAVA_Build 5 168975508 1I TAATAGACCA -/T TTTTGAGGCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 4 5 34139 CASAVA_Build 5 168984723 1D TTTTGAAGGG T/- TTTTGTGTCT 3070 hom 62 het 27 0 21 8 T 5 4 34140 CASAVA_Build 5 169002950 1I TTCAGCACCA -/G GGGCTGGTTT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 G 3 4 34141 CASAVA_Build 5 169020055 3D CTCTATGTAC TAT/--- TCTGAGACCT 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 TAT 1 0 34142 CASAVA_Build 5 169020556 1D ACTTTAGTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 10 9 34143 CASAVA_Build 5 169042256 1D TAAGATATAA T/- TTTCATATAG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 4 3 34144 CASAVA_Build 5 169042979 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 8 9 34145 CASAVA_Build 5 169058672 12I AGGAGCAACT ------------/CAAGTCTTTACC CTTGCTAAGC 3070 hom 189 het 67 0 61 6 CAAGTCTTTACC 0 1 34146 CASAVA_Build 5 169060113 1D ATTTTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 11 10 34147 CASAVA_Build 5 169061665 1D GTCCCTACTT C/- CCTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 50 24 25 1 C 3 2 34148 CASAVA_Build 5 169071500 1I TTCTGAGCTC -/T TGTTTCTGTC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 1 2 34149 CASAVA_Build 5 169143708 2D ATTTCATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 45 0 38 8 T 13 11 34150 CASAVA_Build 5 169147289 1D CCACTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 30 2 12 17 T 15 14 34151 CASAVA_Build 5 169149471 1I AAATGGCTGT -/G GGTTTTTTCC 3070 hom 59 het 32 0 27 5 G 2 3 34152 CASAVA_Build 5 169157906 3D CTATCTATAG ACA/--- GCAACCTACT 3070 hom 129 het 47 0 44 5 ACA 1 0 34153 CASAVA_Build 5 169161395 1D TTGGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 45 2 29 14 T 15 14 34154 CASAVA_Build 5 169190799 1D ATAAATTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 10 9 34155 CASAVA_Build 5 169202889 1I TCTCTTTACC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 39 het 21 0 14 7 T 8 9 34156 CASAVA_Build 5 169204319 2I GCTCTGCCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 12 14 34157 CASAVA_Build 5 169210131 1I AGAAAATAGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 8 9 34158 CASAVA_Build 5 169253549 1D AGAAATTATG A/- ATAAAATTGG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 2 1 34159 CASAVA_Build 5 169264876 1I AGAGCCAGTG -/T TTTTTTTTTT 2039 het 2039 ref 25 9 8 8 T 14 15 34160 CASAVA_Build 5 169276272 2I TATGAGAGAC --/TG TTTTTAATAA 3070 het 2932 hom 38 8 26 4 TG 0 1 34161 CASAVA_Build 5 169285311 2D CATATAGGGT TG/-- TGTGTTGGGA 3070 hom 93 het 38 0 31 11 TG 3 2 34162 CASAVA_Build 5 169307879 1I AACGTTTTTT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 98 hom 38 1 33 4 A 7 8 34163 CASAVA_Build 5 169317811 1D TTTGTTTTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 10 9 34164 CASAVA_Build 5 169318168 1I CCTGGGTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 656 hom 41 2 32 7 T 9 10 34165 CASAVA_Build 5 169330771 4I AAAGAAAGGC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 30 8 A 11 15 34166 CASAVA_Build 5 169349671 1D CCTCTTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 T 11 10 34167 CASAVA_Build 5 169352358 1I TACTGTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 36 2 29 5 A 10 11 34168 CASAVA_Build 5 169354612 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 550 hom 31 5 16 10 T 19 18 34169 CASAVA_Build 5 169361819 1D GTTGCTAGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 29 1 25 3 A 15 14 34170 CASAVA_Build 5 169364650 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 214 hom 15 1 10 6 A 15 14 34171 CASAVA_Build 5 169371071 1I GGTTGGTTGC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 126 het 51 0 42 9 A 8 9 34172 CASAVA_Build 5 169447870 1D AGTATCTAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 55 25 20 11 A 10 9 34173 CASAVA_Build 5 169454307 4I TACTAAAAAT ----/ACAC ACACACACAC 2600 het 1045 hom 14 3 7 4 AC 7 9 34174 CASAVA_Build 5 169454474 1D AGACTCTGCG A/- AAAAAAAAAA 1041 het 1041 ref 32 14 4 15 A 17 16 34175 CASAVA_Build 5 169458436 4I CAAAGCCTTC ----/GTGA GTGAGTTGAG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 GTGA 1 2 34176 CASAVA_Build 5 169463069 2I TATTTGTACT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 9 11 34177 CASAVA_Build 5 169474673 1D GCATGTTTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 9 8 34178 CASAVA_Build 5 169480457 1I AGATCAGGAT -/G CCAGAATGGT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 G 0 1 34179 CASAVA_Build 5 169481040 1I CTGTGAAGAC -/A AAAATGAGAT 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 A 4 5 34180 CASAVA_Build 5 169481988 6I TGAAATAAAA ------/AAGAAG AAGAAGAAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAG 4 6 34181 CASAVA_Build 5 169494108 2D ACCTCCTCTT TC/-- TGGTAACAGC 3070 het 3070 hom 40 14 19 8 TC 1 0 34182 CASAVA_Build 5 169494846 1D AATTCTTACC A/- AAAAAAAAAA 1690 het 115 hom 20 2 8 10 A 16 15 34183 CASAVA_Build 5 169497021 1D AAAAATGGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 377 hom 44 1 37 7 T 10 9 34184 CASAVA_Build 5 169498475 1D GAACACTAGG A/- GAGAAGTATT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 1 0 34185 CASAVA_Build 5 169499552 1D CATGTGGCCT C/- CCTTGCCCAC 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 C 3 2 34186 CASAVA_Build 5 169507570 18D TCCTAATTGT ATTTCTGGCCTTTGAAAA/------------------ ATAGTGCTTA 3070 het 3070 ref 31 18 15 3 ATTTCTGGCCTTTGAAAA 1 0 34187 CASAVA_Build 5 169517653 1D CCTGTGATCC T/- TTTGTCAAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 4 3 34188 CASAVA_Build 5 169538059 1I TCCTTATAGA -/C CCCCCCACAT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 C 6 7 34189 CASAVA_Build 5 169540491 1D ATTTCATTAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 2444 hom 25 7 13 5 A 9 8 34190 CASAVA_Build 5 169540920 2I ACTCAGAGAT --/AA GCAAGGTTGA 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 A 0 2 34191 CASAVA_Build 5 169542036 1D GAACTTTGGC T/- TTTCTCAATC 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 T 4 3 34192 CASAVA_Build 5 169543223 1I TTCTATCAGG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 7 8 34193 CASAVA_Build 5 169550191 1I TTTAAAATCT -/A AACGTTGAAT 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 A 2 3 34194 CASAVA_Build 5 169550694 13I AATATGGTTA -------------/AGAAATGGAAATG AGTTTCTCCC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 AGAAATGGAAATG 0 1 34195 CASAVA_Build 5 169553964 3D AGGCTGAGGC AGA/--- AGAATTGCTT 3070 het 3070 hom 21 8 13 1 AGA 2 1 34196 CASAVA_Build 5 169565855 2D AGAACTGCAA CT/-- CTCTGTGACT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CT 3 2 34197 CASAVA_Build 5 169568520 18D AAGAATCTAT AAGACATTTGTCTAGTAC/------------------ AAGACATTTG 3070 het 3070 ref 28 10 8 11 AAGACATTTGTCTAGTAC 2 1 34198 CASAVA_Build 5 169570524 1I TATATGTAGG -/T TCATCATACT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 1 2 34199 CASAVA_Build 5 169608272 1D TGCTCGGCTA T/- AACTTGCTAT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 1 0 34200 CASAVA_Build 5 169632624 3I TAAACTCCTT ---/AAA AAAAAAAAAA 1505 het 1505 ref 30 13 7 10 A 15 18 34201 CASAVA_Build 5 169633502 1D TTTTTGGAGA C/- GGGGGGGTAG 3070 het 2727 hom 29 10 17 2 C 1 0 34202 CASAVA_Build 5 169640870 1I GCCATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 10 11 34203 CASAVA_Build 5 169644039 1D GTAATATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 32 10 T 13 12 34204 CASAVA_Build 5 169674738 1I CTTTTAATAA -/G ATGAACTTCA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 G 0 1 34205 CASAVA_Build 5 169684667 1I TCTGGAACTT -/A ACATTTATCC 3070 het 3070 ref 54 23 20 11 A 1 2 34206 CASAVA_Build 5 169692416 1I AATACTTTGA -/T TTTTTTTTTT 1167 het 1167 ref 41 30 3 8 T 11 12 34207 CASAVA_Build 5 169694721 1D ACAGCTCATG A/- ACTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 A 2 1 34208 CASAVA_Build 5 169705016 2I TTCACTATTC --/TG TGAGATGAAC 3070 het 3070 hom 60 28 28 4 TG 1 2 34209 CASAVA_Build 5 169705714 1I GTTCCAGGCA -/T TTTTTTGACT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 T 6 7 34210 CASAVA_Build 5 169767472 1D AGTGACCTTC A/- AACTATGGTG 3070 het 3070 ref 56 28 25 4 A 3 2 34211 CASAVA_Build 5 169769575 2I TTTTTAAGTG --/TC TGTTTTGCTA 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 TC 0 1 34212 CASAVA_Build 5 169771224 1D ATGATTATAT C/- CCCCCAACAA 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 C 6 5 34213 CASAVA_Build 5 169771817 1D TTGGCTTTCC A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 1 0 34214 CASAVA_Build 5 169776291 1D TCCTGCCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 11 10 34215 CASAVA_Build 5 169782870 1D TTCTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 23 9 6 T 12 11 34216 CASAVA_Build 5 169788007 1D TAATGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 13 26 10 T 13 12 34217 CASAVA_Build 5 169788972 2D CATATATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 TA 7 6 34218 CASAVA_Build 5 169791619 1D TCTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 828 het 828 ref 35 24 4 7 T 13 12 34219 CASAVA_Build 5 169811576 4I GGAGTGGTAA ----/CTGT CTGTAAGGCC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 CTGT 1 2 34220 CASAVA_Build 5 169828487 2D GGCTATAATG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 A 11 9 34221 CASAVA_Build 5 169868957 1I GATGGAAAAG -/A AATGGAAGAC 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 A 2 3 34222 CASAVA_Build 5 169880183 4D TAGGGGAATG CATT/---- ATAAACCAAC 3070 het 3070 hom 38 16 16 8 CATT 1 0 34223 CASAVA_Build 5 169940433 1D TAAGGAAAAG C/- TTTTGAATAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 C 1 0 34224 CASAVA_Build 5 169946878 4I CTGCAGGCAC ----/CTAT CTATAGTCCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 CTAT 1 2 34225 CASAVA_Build 5 169950968 3I GGGGAAAGAA ---/AGG AGGAGAGTGA 3070 hom 128 het 46 0 42 4 AGG 1 2 34226 CASAVA_Build 5 169960952 1D AGGAGAAGGA G/- GCAGAAGCTG 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 G 2 1 34227 CASAVA_Build 5 169963487 2I AGGAAAACCA --/CT CTGTCTTCAC 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 CT 1 2 34228 CASAVA_Build 5 169968343 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2812 hom 24 10 11 3 A 15 14 34229 CASAVA_Build 5 169975902 2D CTGGGCCAGG CA/-- CACTGAGGTG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CA 2 1 34230 CASAVA_Build 5 169992561 1D ACCTGGAAGA G/- GCCATTTCCC 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 G 2 1 34231 CASAVA_Build 5 170002972 1I TTATGACAGC -/A GCTATGAGAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 A 0 1 34232 CASAVA_Build 5 170009266 1I CACAAAGGCA -/T TTTTTTAGAT 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 T 6 7 34233 CASAVA_Build 5 170023508 1I ATACTCTCCT -/C CAATCCTATC 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 C 1 2 34234 CASAVA_Build 5 170035559 1D AAGACTTTTT A/- ATCTATCTGC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 2 1 34235 CASAVA_Build 5 170047603 3I TGACTGTATT ---/ATA ATAATAGGTA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 ATA 2 3 34236 CASAVA_Build 5 170052841 2I CATCCCCCCG --/AC ACACACACAC 3070 hom 36 het 31 1 20 10 AC 5 6 34237 CASAVA_Build 5 170055948 2I AGCTCAACAA --/AT ATTTGTTAAA 3070 het 3070 hom 58 20 31 7 AT 1 2 34238 CASAVA_Build 5 170071418 18D AGGAAATGAG TGAAAACACTCCAATGGA/------------------ TGCCCACCTA 3070 het 3070 ref 34 21 14 1 TGAAAACACTCCAATGGA 1 0 34239 CASAVA_Build 5 170083240 1D CTTATTAGGT G/- TTCTAGGTGC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 G 1 0 34240 CASAVA_Build 5 170086542 1I TGGATATTTA -/C CCCCCAAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 5 6 34241 CASAVA_Build 5 170091292 8D AAAAAAAAAG AAAAAAGA/-------- AAAAAAGAAT 704 het 704 ref 16 9 5 3 AAAAAAGA 2 1 34242 CASAVA_Build 5 170091396 89D AATATTAGTT GAAAAGCTGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCCACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------------------------------------------------------------------------------- GAAAAGCTGA 3070 hom 45 het 13 0 15 5 GAAAAGCTGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCCACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 34243 CASAVA_Build 5 170093837 1D AGCTGGGGGG A/- AAAAAACCTA 3070 het 9 hom 52 3 45 5 A 7 6 34244 CASAVA_Build 5 170128458 1D TTAAGAAAAC A/- GAGACTCAAA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 1 0 34245 CASAVA_Build 5 170135858 1D GACACCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 12 11 34246 CASAVA_Build 5 170141573 4I TTAAACACAG ----/GATA GATAGACAGA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 GATA 1 2 34247 CASAVA_Build 5 170143176 25D ATCTCCAGAA ACTCAGGACCAGACGATCTCCAGAC/------------------------- ACTCAGGACA 3070 het 3070 ref 42 25 13 14 ACTCAGGACCAGACGATCTCCAGAC 1 0 34248 CASAVA_Build 5 170183710 25D TAGTCTTAAG TGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTT/------------------------- TGTTTTGTTT 2464 het 877 hom 15 3 6 8 TGTTT 9 4 34249 CASAVA_Build 5 170193353 1I TGAAGCTCCT -/G GACTTTTTTA 3070 het 3070 ref 56 32 17 9 G 1 2 34250 CASAVA_Build 5 170193450 3D AGATCACGTT GGG/--- ATGCCCCAGT 3070 het 3070 ref 61 42 18 1 G 3 0 34251 CASAVA_Build 5 170193570 3I TTTAAGGAGG ---/AGA AGAGTCCCTA 3070 het 3070 ref 63 35 23 5 AGA 1 2 34252 CASAVA_Build 5 170251712 1D CACAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 2169 het 1474 hom 29 8 6 15 T 19 18 34253 CASAVA_Build 5 170406303 1I TTGCTGGATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 9 10 34254 CASAVA_Build 5 170442496 1D CTCTTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 A 12 11 34255 CASAVA_Build 5 170529307 4D ATAACTGCCT TAAA/---- TAATCCTGAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 5 TAAA 1 0 34256 CASAVA_Build 5 170542408 2D GGTCTTTTAT AA/-- AATTATTTCA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 4 2 34257 CASAVA_Build 5 170544140 2D AGAAAGAATA AG/-- AGATCTGTTG 3070 het 3070 hom 47 19 21 8 AG 2 1 34258 CASAVA_Build 5 170593100 1D CTAAAACTGA T/- TTTTTTCAAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 7 6 34259 CASAVA_Build 5 170597994 3I TATGATTCTA ---/AAT AATATTTCTT 3070 het 2529 hom 31 7 19 5 AAT 1 2 34260 CASAVA_Build 5 170628271 1D CACACTGAAG A/- AAAAAAAAAA 755 het 755 ref 35 28 2 5 A 12 11 34261 CASAVA_Build 5 170632458 1I AGTGGCTTTG -/C CAGTTGCTGC 3070 hom 93 het 33 0 30 3 C 1 2 34262 CASAVA_Build 5 170662490 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 13 14 34263 CASAVA_Build 5 170667520 1D ATTATTTTCC T/- TTTTTGCAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 6 5 34264 CASAVA_Build 5 170693682 1I TGCCCCCACC -/A AAAAAAAAAA 1614 het 1246 hom 21 7 6 8 A 12 13 34265 CASAVA_Build 5 170696478 1I CATTTTGATT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 7 8 34266 CASAVA_Build 5 170698699 1I CTTTGGGAGG -/C CAAGGCAGGC 2752 hom 24 het 9 0 9 0 C 1 2 34267 CASAVA_Build 5 170699631 4D ATTTGATAAT AAGA/---- AAGTATTTTA 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 AAGA 1 0 34268 CASAVA_Build 5 170705971 2D ATACATATCT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 22 13 4 AC 10 9 34269 CASAVA_Build 5 170706834 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 8 9 34270 CASAVA_Build 5 170708670 1D ACCGCACCCT G/- GCCCATATAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 2 1 34271 CASAVA_Build 5 170720377 5I CAAAATAAAT -----/AAATA AAATTAAATA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 AAATA 0 1 34272 CASAVA_Build 5 170729769 6I AACTCAATAG ------/TATTAT TATTATTATT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 TAT 3 5 34273 CASAVA_Build 5 170742086 1D TGAATGTGAG A/- AAAAAAACTT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 8 7 34274 CASAVA_Build 5 170745654 1I CTTCGGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2712 het 125 hom 17 1 11 5 A 14 15 34275 CASAVA_Build 5 170746557 1I CTGGGGTGCC -/T TCGGAGTTTG 3070 hom 53 het 22 0 18 4 T 1 2 34276 CASAVA_Build 5 170750337 1D ACCTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 25 0 12 13 T 11 10 34277 CASAVA_Build 5 170750553 1I GGCTGGTCTC -/A AAACTCCTGA 3070 hom 84 het 31 0 26 5 A 3 4 34278 CASAVA_Build 5 170752196 3D CCATGTGCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 21 9 T 17 14 34279 CASAVA_Build 5 170753236 3D GCATTGAATA CTT/--- TGATTTGGCT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 CTT 1 0 34280 CASAVA_Build 5 170755573 1D TAAAGCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 23 1 11 11 T 17 16 34281 CASAVA_Build 5 170757211 4D TTAAATCCAT TTAC/---- TTCTCTTTGT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 TTAC 1 0 34282 CASAVA_Build 5 170757545 1D ATTACAGGCA C/- CCCCCCCACC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 8 7 34283 CASAVA_Build 5 170760070 2D TTTTCCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 31 2 13 16 T 16 14 34284 CASAVA_Build 5 170765373 4D CATTAAAATT ACAA/---- ACAGCTGGAA 3070 hom 105 het 40 0 36 6 ACAA 1 0 34285 CASAVA_Build 5 170767757 1I GGTAGAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1259 hom 33 4 23 6 T 14 15 34286 CASAVA_Build 5 170769421 1I TGGCCAGCTG -/T TTTTTTTTGT 1812 hom 23 het 21 0 7 14 T 8 9 34287 CASAVA_Build 5 170769828 2I AGCTGATCTC --/AG GGGAGATGAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AG 0 1 34288 CASAVA_Build 5 170770339 1D CCAAAATGCC T/- GTTTAGTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 1 0 34289 CASAVA_Build 5 170771590 4I GTGAATTTTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTTC 2 3 34290 CASAVA_Build 5 170771944 1D TTTTGCCTTT A/- ACTTTCTAGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 1 34291 CASAVA_Build 5 170772280 7D TGGAAAGTAC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 38 0 25 17 T 18 11 34292 CASAVA_Build 5 170773568 1I CTTTTAAAAC -/T TTTGACTCAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 4 34293 CASAVA_Build 5 170774077 1I TGCCTGAGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 401 hom 42 1 33 8 T 9 10 34294 CASAVA_Build 5 170777521 1I CACAAGTAAT -/A AAAAAATAGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 34295 CASAVA_Build 5 170803669 1I CTGAGGGTTT -/C CCCATCTCCC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 C 3 4 34296 CASAVA_Build 5 170824522 2I TTATTTTTTA --/TT TTTTTTTTTT 1957 het 1957 ref 27 14 6 7 T 10 12 34297 CASAVA_Build 5 170826783 1I GTGTGGTGGT -/G GGGTACCACA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 3 4 34298 CASAVA_Build 5 170832345 4D GTTTAAACAC TTTA/---- TTTAATATAT 3070 het 3070 hom 45 20 23 3 TTTA 2 1 34299 CASAVA_Build 5 170864426 1D GGAGAGTTGA G/- GGGGGACAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 6 5 34300 CASAVA_Build 5 170870112 1D AACTTTGAAC T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 32 19 4 9 T 12 11 34301 CASAVA_Build 5 170882408 3D TTCTTGCTCT GTC/--- GTCACCCAAG 3070 hom 65 het 24 0 22 2 GTC 2 1 34302 CASAVA_Build 5 170885395 1D CTAAAAACCA C/- CCCTTCGGCA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 4 3 34303 CASAVA_Build 5 170889701 1D TTTAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 2574 hom 15 het 8 0 6 2 T 12 11 34304 CASAVA_Build 5 170904507 18D CAAGGGGAAC AGGGCTATGAGACAGAGA/------------------ AGGGCTATGA 3070 hom 93 het 33 0 29 8 AGGGCTATGAGACAGAGA 2 1 34305 CASAVA_Build 5 170905535 3I AGCGGCTCAG ---/AGA AGGTCAGTTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 AGA 0 1 34306 CASAVA_Build 5 170908732 3I TGGCATCCTT ---/CTC CTTTACGATT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 CTC 0 1 34307 CASAVA_Build 5 170928611 1D AAGACTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 18 22 11 T 13 12 34308 CASAVA_Build 5 170929924 1D AGACAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 742 hom 46 2 31 14 A 13 12 34309 CASAVA_Build 5 170940141 1D AAAAGATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 55 1 47 9 T 11 10 34310 CASAVA_Build 5 170948323 1D ATGCTAACAC A/- AAAAAACAGC 3070 hom 101 het 43 0 32 12 A 7 6 34311 CASAVA_Build 5 170949569 1D ATTGTTGCCA T/- GAAATCTCCA 3070 hom 97 het 39 0 29 10 T 1 0 34312 CASAVA_Build 5 170954867 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2662 het 96 hom 15 1 10 4 A 15 14 34313 CASAVA_Build 5 170954969 1D AAATGTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 28 1 17 11 A 14 13 34314 CASAVA_Build 5 170958860 1I TGGATGCGTT -/G GGGGGGGCCA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 G 7 8 34315 CASAVA_Build 5 170974482 1I TTAGATGGGG -/A AATTGCTCAT 1083 het 1083 ref 23 13 3 7 A 2 3 34316 CASAVA_Build 5 170982664 1D CTGAGCTCCC T/- TGCTCCCTCT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 T 2 1 34317 CASAVA_Build 5 170994071 1D GTACCTTGAC A/- AATAATCACG 3070 het 3070 hom 54 21 25 8 A 3 2 34318 CASAVA_Build 5 170997464 1I CAAGAGGTGA -/T TTTTAAGAAA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 4 5 34319 CASAVA_Build 5 171020571 4D GCCCCATGAA GTAG/---- GAAGGAGTAG 3070 het 2867 hom 30 11 16 4 GTAG 1 0 34320 CASAVA_Build 5 171020742 4D TAAACACAAA AGAC/---- CTTTTATGCT 3070 het 3070 ref 42 22 14 8 AGAC 1 0 34321 CASAVA_Build 5 171028862 1I AAGCATTTGT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 8 9 34322 CASAVA_Build 5 171037062 1I TTTGACAAAA -/G GTGCTCTGTG 3070 hom 143 het 53 0 46 7 G 1 2 34323 CASAVA_Build 5 171037620 8I GAACTCTTAG --------/TACTATCT TACTATCTTA 3070 het 3070 ref 46 23 13 10 TACTATCT 1 2 34324 CASAVA_Build 5 171047796 4I TCCAGGACTT ----/TTTG TTTAGAGGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TTTG 0 1 34325 CASAVA_Build 5 171060155 1D TGAGCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 11 10 34326 CASAVA_Build 5 171063211 1D TGGAGAAAAC T/- TTTGTTTCTT 3070 het 3070 hom 70 31 29 10 T 4 3 34327 CASAVA_Build 5 171068922 1I TTTAGTAGAG -/A ATGGGGTTTC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 1 2 34328 CASAVA_Build 5 171074871 1I TTAGCTCCTG -/C TTGAGCTGGA 3070 hom 138 het 54 0 46 8 C 0 1 34329 CASAVA_Build 5 171080906 2I AACACTTATT --/TC TCTGAAATAA 3070 het 3070 hom 28 8 19 1 TC 1 2 34330 CASAVA_Build 5 171088017 4I AAGGATAGGG ----/TTAA TTAAACTATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTAA 1 2 34331 CASAVA_Build 5 171092752 16D ACCAGACTTA AAAGTCGGCCAGGTGC/---------------- AGTGGCTCAC 3067 het 3067 ref 35 23 8 4 AAAGTCGGCCAGGTGC 1 0 34332 CASAVA_Build 5 171110064 2I GACCCAGTGA --/CT CTCTGACCAT 3070 hom 60 het 25 0 19 6 CT 2 3 34333 CASAVA_Build 5 171111743 1I TTAAAATGCG -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 53 25 24 4 T 7 8 34334 CASAVA_Build 5 171132069 1D TTTGAATGAA C/- CTGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 C 2 1 34335 CASAVA_Build 5 171143227 1D AACAAAAATA G/- GAGAAAATCT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 G 2 1 34336 CASAVA_Build 5 171151772 5I TAAGGTATTT -----/TGTTA TAACTGCCCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TGTTA 0 1 34337 CASAVA_Build 5 171158813 3D GGTGCATAAT AGC/--- AGAACCTGCC 3070 het 3070 hom 48 20 24 5 AGC 1 0 34338 CASAVA_Build 5 171163670 1I GTCGGGGAAT -/G GGGGGGCTAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 G 6 7 34339 CASAVA_Build 5 171200091 1D TTTTTCCTTC T/- TTTTTTTGTT 3019 het 2507 hom 23 9 7 7 T 8 7 34340 CASAVA_Build 5 171208554 3I TCTTCTCTGA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 12 15 34341 CASAVA_Build 5 171217248 1I ACAGACCTGG -/C CCCCCGTCTG 2350 het 2302 hom 21 9 6 6 C 5 6 34342 CASAVA_Build 5 171222042 1I TCAGAGCCCA -/G GGGCCTTCCC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 3 4 34343 CASAVA_Build 5 171234860 12D CTGTACTTTT AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAGA 3070 hom 97 het 38 0 35 5 A 20 8 34344 CASAVA_Build 5 171242317 1I TTCCAGCTTC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 9 34345 CASAVA_Build 5 171243692 1D TAGTATTTGC T/- TTTGGTTCTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 4 3 34346 CASAVA_Build 5 171253638 1I TCCATGCTCT -/C CCGCTGCTCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 2 3 34347 CASAVA_Build 5 171259309 1I CCAAATCCCA -/T TCAAACTATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 2 34348 CASAVA_Build 5 171263806 2D GCAGGATGAG GC/-- GCGCGAGAAC 3070 hom 87 het 35 0 28 8 GC 3 2 34349 CASAVA_Build 5 171283339 1D CTAAGATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 10 34350 CASAVA_Build 5 171310817 1I CACAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 10 11 34351 CASAVA_Build 5 171311176 1I AAAGTGGCTA -/T TTTTTTTTTG 2998 het 385 hom 13 1 9 3 T 9 10 34352 CASAVA_Build 5 171319677 3D TGGATGGGCA AAG/--- AAGAGAGTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 7 AAG 2 1 34353 CASAVA_Build 5 171322796 6D AAATACACAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 81 het 36 0 28 13 AC 10 7 34354 CASAVA_Build 5 171328066 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 212 hom 21 2 14 7 A 15 16 34355 CASAVA_Build 5 171331241 1D AGTGAGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 26 1 21 4 A 11 10 34356 CASAVA_Build 5 171337783 1D AGAGAAAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 50 0 40 11 A 9 8 34357 CASAVA_Build 5 171340757 1D GACCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 11 10 34358 CASAVA_Build 5 171341993 4D ATTCTCCTGC CTCA/---- CTCAGCCTTC 3070 hom 45 het 17 0 16 2 CTCA 2 1 34359 CASAVA_Build 5 171346347 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 31 het 26 1 23 2 A 10 9 34360 CASAVA_Build 5 171365531 1I AAGCTCCCTG -/C CCCCCCCAGC 1837 het 1837 ref 19 10 5 4 C 7 8 34361 CASAVA_Build 5 171373163 7I CCAGGTCCCA -------/CTTCCAG CACTAAGAAT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 CTTCCAG 0 1 34362 CASAVA_Build 5 171413047 3I AGCATCATGG ---/TAT TTTGTTATGG 3070 hom 54 het 27 0 19 8 TAT 0 1 34363 CASAVA_Build 5 171414787 1I AAGACCTTAT -/A GGCGGGTGGG 3070 hom 83 het 32 0 25 7 A 0 1 34364 CASAVA_Build 5 171425471 3D TCCAGAGATG AGA/--- AGAAGAATCC 3070 het 3070 hom 45 20 18 10 AGA 3 2 34365 CASAVA_Build 5 171425934 1I AAGTTTCCTA -/T TTTTTTTTTT 2772 het 2772 ref 25 14 6 5 T 10 11 34366 CASAVA_Build 5 171427949 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1530 hom 20 6 11 3 A 11 12 34367 CASAVA_Build 5 171436670 1D AGTATCCCCC G/- AGGACATTCA 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 G 1 0 34368 CASAVA_Build 5 171464022 1I CCAGGCAAAG -/A AGTGGCTCAC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 1 2 34369 CASAVA_Build 5 171464180 1I AATGGATGTC -/G GATGCTGTGT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 G 1 2 34370 CASAVA_Build 5 171464291 3D AGAAAGGGCC GCT/--- AACAAGGTTG 3070 het 3070 ref 30 16 12 4 GCT 1 0 34371 CASAVA_Build 5 171466730 1I GGAGCAAAAA -/C AAAAGGGGCG 2110 het 2110 ref 13 7 5 1 C 0 1 34372 CASAVA_Build 5 171467288 19I CAGGGCGTGT -------------------/GCCCACAGGCTGACCGGGC AGCCCTTGTC 1664 het 1664 ref 30 13 11 6 GCCCACAGGCTGACCGGGC 0 1 34373 CASAVA_Build 5 171490543 5D ATTCCTAGGG AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 AAAAC 3 2 34374 CASAVA_Build 5 171491939 9D GACTTTTAAA TTTTTAATT/--------- TTTTTAATTT 3070 het 2013 hom 27 10 17 3 TTTTTAATT 3 2 34375 CASAVA_Build 5 171496439 1D TTATTATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2983 hom 20 8 8 4 T 12 11 34376 CASAVA_Build 5 171502222 1I TAGGTATCCT -/A AAAAAATGCC 3070 het 3070 ref 62 29 27 6 A 6 7 34377 CASAVA_Build 5 171509169 8I AACCGGGTGC --------/CCCAAAGG CCCAATCCAG 3070 het 1549 hom 27 5 12 10 CCCAAAGG 0 1 34378 CASAVA_Build 5 171517892 1I GTATATACCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 A 10 11 34379 CASAVA_Build 5 171525243 1I ACCCTGGGCC -/A GGGGCATACC 2344 het 2344 ref 29 10 10 9 A 0 1 34380 CASAVA_Build 5 171525403 8D GGTTGTTTGC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTGA 2529 het 1061 hom 15 4 7 5 T 16 8 34381 CASAVA_Build 5 171539231 10I CGCAGAAGCC ----------/GGGCCCCCTT GAAGGGCGTC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 GGGCCCCCTT 0 1 34382 CASAVA_Build 5 171554014 1I TGTTAGTACA -/T TTTTTTTTTT 2382 het 2382 ref 41 21 9 11 T 13 14 34383 CASAVA_Build 5 171554537 1I TCATAGTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 10 11 34384 CASAVA_Build 5 171556299 1D GAGCCATTTC T/- TATGCAGGAG 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 T 2 1 34385 CASAVA_Build 5 171572439 1D ATACCCGGCT A/- ATTTTTTGTA 3070 het 1401 hom 14 3 9 2 A 2 1 34386 CASAVA_Build 5 171576867 1D GTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 15 2 9 4 A 12 11 34387 CASAVA_Build 5 171579645 5I CATTACAAGC -----/AAAGA AAACTACAGA 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 AAAGA 0 1 34388 CASAVA_Build 5 171583868 3D AGCTCTTCTC ATA/--- ATAATGAGTT 2328 het 2328 ref 17 7 5 5 ATA 2 1 34389 CASAVA_Build 5 171585897 1I ATAGAGGGAC -/A ATAAGACTCC 3070 het 3070 ref 55 28 22 5 A 1 2 34390 CASAVA_Build 5 171586025 1D TATAGTACCT C/- CCTTATGAGG 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 C 3 2 34391 CASAVA_Build 5 171587135 4I TTAACTTATC ----/AATT AACTTTGTTA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 AATT 0 1 34392 CASAVA_Build 5 171589976 1I ATCAAAATCT -/A TAATTCAGAA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 A 0 1 34393 CASAVA_Build 5 171590148 1D CCCAAGAGGT A/- AGACAGTTAT 3070 hom 138 het 53 0 45 9 A 2 1 34394 CASAVA_Build 5 171593043 3I ATGAAAAATT ---/CTC CTATGTTTCT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 CTC 0 1 34395 CASAVA_Build 5 171594465 47D TGCAGTGAGC CATGATCATGCCACTGCACTTCAGCCTGGGCGAGAGTGAAACCTCAT/----------------------------------------------- CTCAAACAAA 2869 het 2869 ref 28 28 6 4 CATGATCATGCCACTGCACTTCAGCCTGGGCGAGAGTGAAACCTCAT 1 0 34396 CASAVA_Build 5 171594691 1I AAACTGCTCT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 A 7 8 34397 CASAVA_Build 5 171595138 13D CCAAGGGATT AGCTCCGAACCAC/------------- AAGGAGCAGA 3070 het 3070 ref 47 29 20 6 AGCTCCGAACCAC 1 0 34398 CASAVA_Build 5 171598697 1D ACTAACTGCC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 A 9 8 34399 CASAVA_Build 5 171608556 1D TGGGGGGGAA G/- AAAATTAGAG 3070 het 1902 hom 17 6 10 1 G 1 0 34400 CASAVA_Build 5 171613381 1I GAATTCTTAA -/C ATTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 C 0 1 34401 CASAVA_Build 5 171616140 1D CATGCCCAGC T/- TTTTTTTTTT 2377 het 862 hom 22 6 9 7 T 17 16 34402 CASAVA_Build 5 171616593 4D AATTCTTTTT TTTC/---- TTCTTCTTCC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 TTTC 1 0 34403 CASAVA_Build 5 171620119 1I GCCTTATGCA -/G GGTATATCAT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 G 2 3 34404 CASAVA_Build 5 171625537 1I CCACCCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2211 hom 23 11 10 2 T 11 12 34405 CASAVA_Build 5 171632902 1I CAAGATTCTT -/C TTTAAAAATG 3070 hom 42 het 22 0 15 7 C 0 1 34406 CASAVA_Build 5 171641244 2I TAAGCAATAA --/TT TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 8 10 34407 CASAVA_Build 5 171643937 1D GGAAAGCAGG A/- AAAAGCCGAA 3070 hom 45 het 17 0 14 3 A 5 4 34408 CASAVA_Build 5 171647173 1D CGTATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 20 10 T 12 11 34409 CASAVA_Build 5 171648502 1I TACTTGCTCA -/T TTTTTTTTTT 1477 het 44 hom 16 2 7 7 T 15 16 34410 CASAVA_Build 5 171657729 1I CCCGGCCCAG -/T TGACTGTTTC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 1 2 34411 CASAVA_Build 5 171663446 2D CAGACCATAC CA/-- CACACCTCTA 3070 het 3070 ref 37 23 14 0 CA 3 2 34412 CASAVA_Build 5 171668204 1I CAGAGTGAGA -/C CCCCCGTCTC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 C 5 6 34413 CASAVA_Build 5 171668377 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 13 12 34414 CASAVA_Build 5 171668875 1D GCCTCCTGAC T/- TCAAGTGATT 2757 het 2214 hom 17 8 6 3 T 2 1 34415 CASAVA_Build 5 171669095 1I CTGATTATAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 9 10 34416 CASAVA_Build 5 171671076 1I AAAAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3012 het 2832 hom 25 11 9 5 A 12 13 34417 CASAVA_Build 5 171675490 21D GATCCGAGAA CCCTCTCTTGGGGACCGAGAC/--------------------- CCCTCTCTTG 3045 het 3045 ref 30 21 13 3 CCCTCTCTTGGGGACCGAGAC 2 1 34418 CASAVA_Build 5 171676932 4D TGCAGAGTTT CAAA/---- CAGTGTCACC 3070 het 3070 hom 48 21 22 6 CAAA 1 0 34419 CASAVA_Build 5 171692030 1D ACCTGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 25 1 14 11 T 15 14 34420 CASAVA_Build 5 171692197 4I GGGGACACAG ----/ATTA ATTAATATAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 ATTA 1 2 34421 CASAVA_Build 5 171692720 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 2471 hom 21 het 8 0 8 0 T 4 5 34422 CASAVA_Build 5 171693150 1D TTTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 28 2 20 6 A 13 12 34423 CASAVA_Build 5 171695048 1I AACAACAAAA -/C CCAAACAAAC 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 C 2 3 34424 CASAVA_Build 5 171711387 1D GTTTTAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 11 10 34425 CASAVA_Build 5 171721823 1I AATGAAGGCA -/C CTGAACCACT 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 C 1 2 34426 CASAVA_Build 5 171731271 1D GGTGAATGAC G/- TAACAGCAGT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 G 1 0 34427 CASAVA_Build 5 171732197 1I GTATTTTAAG -/T TAACAGTAGT 2024 het 2024 ref 35 25 6 4 T 1 2 34428 CASAVA_Build 5 171739834 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 T 10 9 34429 CASAVA_Build 5 171746195 7I TGTTTTATTG -------/TTTTTAT TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 50 29 14 7 TTTTTAT 1 2 34430 CASAVA_Build 5 171747530 2D GTAATATTGC CT/-- CTTACATTTA 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 CT 2 1 34431 CASAVA_Build 5 171781609 2I ATGGATGTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1964 hom 27 6 14 7 T 12 14 34432 CASAVA_Build 5 171788952 1D AACATGTTTT G/- GGGGAGCAGC 3070 het 3070 ref 33 11 12 10 G 5 4 34433 CASAVA_Build 5 171790478 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1918 het 1918 ref 18 7 6 6 T 11 10 34434 CASAVA_Build 5 171792745 4D CTAGTCAAAT ACTC/---- ACCATTGTGT 3070 het 3070 hom 52 21 23 9 ACTC 1 0 34435 CASAVA_Build 5 171799446 3D CCACTCTTGC CGA/--- CGACTGAGAC 3070 het 2394 hom 28 8 11 9 CGA 2 1 34436 CASAVA_Build 5 171816530 1D AACACTGAGT C/- CCCCCCCACT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 C 8 7 34437 CASAVA_Build 5 171824518 1I GTAGGTACTA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 6 7 34438 CASAVA_Build 5 171830136 1I CAATTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 T 13 14 34439 CASAVA_Build 5 171875571 2I TAGATATATG --/TA TATATATATA 2576 het 2576 ref 29 17 6 6 TA 7 8 34440 CASAVA_Build 5 171893449 1I GAGAGAGTCA -/G GGACTACTTG 3070 hom 90 het 33 0 28 5 G 2 3 34441 CASAVA_Build 5 171919428 1D GGTCCATTCC T/- TTTTTTTTTT 1333 het 1333 ref 34 24 3 7 T 13 12 34442 CASAVA_Build 5 171969925 4I CTCACGCGCG ----/CGCA CACACACACA 3070 het 2739 hom 32 13 15 4 CGCA 0 1 34443 CASAVA_Build 5 172035226 9I AGGCCATGCG ---------/CTCCCTTCC CTCCCTTCCC 3009 het 3009 ref 29 14 9 6 CTCCCTTCC 1 2 34444 CASAVA_Build 5 172035762 1D TCACTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 2100 het 2100 ref 43 25 6 13 A 15 14 34445 CASAVA_Build 5 172051113 1I TTTCCTGTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 264 hom 30 2 24 4 A 7 8 34446 CASAVA_Build 5 172058136 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2411 het 13 hom 15 1 8 7 A 13 12 34447 CASAVA_Build 5 172061044 4D TTCTTCACTT AAAC/---- AAATGACCAC 3070 hom 107 het 40 0 32 8 AAAC 1 0 34448 CASAVA_Build 5 172087106 1D TCCTGAGGCT C/- CCCCTGGCCG 1453 het 558 hom 20 7 7 6 C 5 4 34449 CASAVA_Build 5 172087690 1I GAGAGGTCCT -/G GGGGGGGATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 7 8 34450 CASAVA_Build 5 172091637 5I CACATTCATC -----/ACTTA ACCCCCACAG 3070 hom 64 het 27 0 19 8 ACTTA 0 1 34451 CASAVA_Build 5 172101475 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 2704 het 1943 hom 13 5 6 2 A 7 8 34452 CASAVA_Build 5 172106720 1D CACAGGTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 35 2 14 19 A 13 12 34453 CASAVA_Build 5 172119206 8D GAGAAAGAAA GGAGGGAG/-------- GGAGGGAGGG 3070 het 634 hom 30 2 15 13 GGAG 6 4 34454 CASAVA_Build 5 172119432 1D CAAGGGAGAT C/- CTGGCACACC 2294 het 2294 ref 25 11 8 6 C 2 1 34455 CASAVA_Build 5 172119467 1I AGTATTACCC -/A AAAAAAAAAA 2685 het 243 hom 21 1 9 11 A 15 16 34456 CASAVA_Build 5 172123296 1I AGTATGCAGT -/G CCCCCCCCGG 3070 hom 89 het 36 0 30 6 G 0 1 34457 CASAVA_Build 5 172127836 1D GTTGGCAACT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 21 0 18 3 A 10 9 34458 CASAVA_Build 5 172132323 1D CATGGAGTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 10 9 34459 CASAVA_Build 5 172132571 2D GAGCATTTAT TA/-- TACCTTCCCC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TA 2 1 34460 CASAVA_Build 5 172132666 1I GGGAGGCCGT -/G GGGGGGGCGG 1655 hom 15 het 6 0 5 1 G 7 8 34461 CASAVA_Build 5 172138960 1I TCTCTAAATA -/T TTTTTTTTTT 2657 het 351 hom 21 1 8 12 T 13 14 34462 CASAVA_Build 5 172145868 1D TGAGAATAAG A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 A 7 6 34463 CASAVA_Build 5 172164873 3D ATAGATAGAT AGA/--- TAGATAGATA 886 het 886 ref 23 6 3 15 AGA 1 0 34464 CASAVA_Build 5 172170845 1D ACTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 83 het 30 0 28 2 A 10 9 34465 CASAVA_Build 5 172172496 1I TGGCTATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 10 11 34466 CASAVA_Build 5 172174250 19D GTATAGACAT ATATACACATGTATACAAC/------------------- ATATACACAT 2956 het 2956 ref 17 13 7 1 ATATACACATGTATACAAC 1 0 34467 CASAVA_Build 5 172176581 1D TCAGGGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 745 hom 32 4 19 9 A 13 12 34468 CASAVA_Build 5 172177355 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 4 A 11 10 34469 CASAVA_Build 5 172184263 1I AAATACAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 11 12 34470 CASAVA_Build 5 172188005 7I CTTCCTTCCT -------/TCTTATC TTTTTCTTTT 3070 hom 66 het 34 0 21 13 TCTTATC 0 1 34471 CASAVA_Build 5 172198990 7D CAACATAGCA AGACCCC/------- AGACCCCATC 3070 hom 48 het 18 0 15 5 AGACCCC 2 1 34472 CASAVA_Build 5 172199764 6D CAGTTTTCCC ACGCTG/------ ACCAGTGGGG 3070 hom 123 het 43 0 40 5 ACGCTG 1 0 34473 CASAVA_Build 5 172212711 2D TGTGTGAAAC TG/-- TGTGTTCATG 3070 hom 109 het 39 0 37 2 TG 3 2 34474 CASAVA_Build 5 172216027 1D GGAGTGAATC A/- GGGTGCTTCC 3070 het 3070 hom 48 17 19 13 A 1 0 34475 CASAVA_Build 5 172219763 1D AGGTGAACAA G/- ACATGTCTCC 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 G 1 0 34476 CASAVA_Build 5 172237218 1D TAACAGAATG C/- AGCGTTCTGC 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 C 1 0 34477 CASAVA_Build 5 172250450 1D TTGGAGTCCA C/- TTCTCCCAGG 3070 het 3070 hom 32 16 12 4 C 1 0 34478 CASAVA_Build 5 172251670 19I TTAAAGAGTA -------------------/TTTTTTTTTTGTTTTGTTT TGTTTTTTTT 2035 het 1113 hom 27 11 5 11 TTTTTTTTTTGTTTTGTTT 0 1 34479 CASAVA_Build 5 172259044 1I CTTGTGCTTT -/A GCCTCCTGAG 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 0 1 34480 CASAVA_Build 5 172265348 4I CTCGAGCCGG ----/AACA AACACAGACC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AACA 1 2 34481 CASAVA_Build 5 172272678 2I GTGCCCAGTC --/CT GTTTTACTTT 3070 hom 84 het 34 0 24 10 CT 0 1 34482 CASAVA_Build 5 172274636 1I CTCCCTGGGG -/T TTTTAAGCCC 2163 het 1159 hom 23 9 5 9 T 4 5 34483 CASAVA_Build 5 172281379 1D ACTCTTAGTT C/- CTTAGACAGC 3070 het 3070 ref 34 22 8 4 C 2 1 34484 CASAVA_Build 5 172292424 1I AAAGGTCCTG -/A GGGTTGCAGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 34485 CASAVA_Build 5 172293257 1D TTCCCGGGAG C/- CCCTGTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 4 3 34486 CASAVA_Build 5 172308507 1D ATTAAAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 A 8 7 34487 CASAVA_Build 5 172308558 6D GGCTACCCCG GAGGCT/------ GAGGCAGGAG 2076 het 2076 ref 29 17 5 7 GAGGCT 1 0 34488 CASAVA_Build 5 172320211 3D TGGATTTGGC AGG/--- AGAACTGGTA 3070 hom 105 het 42 0 36 9 AGG 1 0 34489 CASAVA_Build 5 172326251 1I CTTGATGGTA -/G TTAACAAGAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 34490 CASAVA_Build 5 172334399 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 673 hom 8 het 6 0 3 3 A 7 6 34491 CASAVA_Build 5 172334694 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 1110 hom 7 het 5 0 3 2 A 9 8 34492 CASAVA_Build 5 172335733 1I AATGAGTTTG -/C TTTTAATGCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 34493 CASAVA_Build 5 172390051 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1422 het 130 hom 18 3 6 9 T 17 16 34494 CASAVA_Build 5 172400490 2D AGAGAAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 677 hom 25 6 10 9 T 16 14 34495 CASAVA_Build 5 172412043 5I CCCCAAAGAA -----/TTATT TTATTTTATT 3070 hom 84 het 37 0 28 9 TTATT 2 3 34496 CASAVA_Build 5 172414989 2I CTTTATTCCC --/CA GTCTTCCTTT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 CA 0 1 34497 CASAVA_Build 5 172415334 4D TGTCACGGAG GTTT/---- GTTTGTCTAG 3070 het 3070 ref 59 27 27 12 GTTT 2 1 34498 CASAVA_Build 5 172416852 1D GCGGTGCCGC G/- GGGGGGCCAC 1380 hom 21 het 9 0 5 4 G 7 6 34499 CASAVA_Build 5 172430801 1I TTGGAAAGAT -/A AGTGTCATTG 3070 hom 189 het 70 0 62 8 A 1 2 34500 CASAVA_Build 5 172441912 12I GTGAGCCACC ------------/GTGCCTGGCCGA GTGCCTGGCC 3070 het 2520 hom 15 6 7 2 GTGCCTGGCCGA 1 2 34501 CASAVA_Build 5 172444234 1D GCAAAAATGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 69 het 24 0 24 1 T 8 7 34502 CASAVA_Build 5 172456880 2I TGTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 1 2 34503 CASAVA_Build 5 172460839 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 8 7 34504 CASAVA_Build 5 172465309 2I TCCTGACCTC --/AT GTGATCTACC 3070 hom 42 het 15 0 14 1 AT 0 1 34505 CASAVA_Build 5 172475255 1I TTTTGCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2280 hom 24 7 12 5 T 10 11 34506 CASAVA_Build 5 172481470 1I TTCCTTGCCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 43 12 21 10 T 8 9 34507 CASAVA_Build 5 172483932 24D TTTGGGAGGC CAAGGCGGGCAGATCACTTGAGGT/------------------------ CAGGAGTTCG 3070 hom 33 het 13 0 10 3 CAAGGCGGGCAGATCACTTGAGGT 1 0 34508 CASAVA_Build 5 172484529 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 243 hom 28 5 10 14 T 17 15 34509 CASAVA_Build 5 172485318 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAGC 1552 hom 18 het 7 0 6 1 A 9 8 34510 CASAVA_Build 5 172493865 18D GCTCAAGATG ATATATATAAATATATAT/------------------ ATATATATAT 3070 het 724 hom 18 2 15 2 ATATATATAAATATATAT 1 0 34511 CASAVA_Build 5 172499566 9I TTTTCATGGA ---------/CACAGGTAC CACATCCAGT 3070 hom 169 het 60 0 57 4 CACAGGTAC 0 1 34512 CASAVA_Build 5 172501335 1I ATCTAAGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 38 1 24 13 A 14 15 34513 CASAVA_Build 5 172502462 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1340 hom 4 het 14 0 5 9 T 19 18 34514 CASAVA_Build 5 172507197 1I CACTCCTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 817 hom 39 3 31 5 T 9 10 34515 CASAVA_Build 5 172508369 3I TTGTTCATGA ---/TTC TTCTTCTTCA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTC 3 4 34516 CASAVA_Build 5 172518534 1D CTCTTGTTTT C/- AGCTTGGTGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 C 1 0 34517 CASAVA_Build 5 172526295 1D AGGTATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 11 4 T 13 12 34518 CASAVA_Build 5 172531586 6D TCAAATGGTG CTAGTT/------ CTAGATCCTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CTAGTT 1 0 34519 CASAVA_Build 5 172538971 1I CTGCAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 T 11 12 34520 CASAVA_Build 5 172540367 1D GAACATCAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 44 0 35 9 T 9 8 34521 CASAVA_Build 5 172544122 1I CAAACAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2069 hom 27 8 16 3 A 11 12 34522 CASAVA_Build 5 172554940 1I GTACGATCTC -/A GCTCACTGCA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 0 1 34523 CASAVA_Build 5 172575509 4D TGGGCAACAT AGTG/---- AGCCCCCATC 3070 het 3070 ref 27 14 12 2 AGTG 1 0 34524 CASAVA_Build 5 172578166 3I GCTAATGTTT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 TTA 3 4 34525 CASAVA_Build 5 172588902 1I TTTATCTCCA -/T TTTTTTTTAA 2669 het 2669 ref 22 10 9 3 T 8 9 34526 CASAVA_Build 5 172603218 1I TCTTAGAGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 9 10 34527 CASAVA_Build 5 172606586 1D AGCCTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1474 hom 33 5 17 11 A 15 14 34528 CASAVA_Build 5 172607889 1I TCTACTCAGC -/A GTTTTCCAAC 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 0 1 34529 CASAVA_Build 5 172629158 1D TCCATCCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 38 4 17 17 T 15 14 34530 CASAVA_Build 5 172647722 2D CCTGTGTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 138 het 59 0 45 14 A 12 10 34531 CASAVA_Build 5 172651376 3I GTGCAACCAT ---/CAC CACAATTAGT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 CAC 1 2 34532 CASAVA_Build 5 172652342 2D CTATCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 6 T 14 12 34533 CASAVA_Build 5 172654021 1I GGTTTGGATG -/C AGGTTCAGGC 3070 hom 147 het 53 0 48 5 C 0 1 34534 CASAVA_Build 5 172660482 4D CTTTCTTTCC TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 hom 56 het 28 0 18 11 TTCT 5 4 34535 CASAVA_Build 5 172663244 1D GGAACACCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 9 34536 CASAVA_Build 5 172706570 2D CGATTGGTGT CA/-- CAGTCACACA 3070 het 3070 hom 43 18 21 6 CA 2 1 34537 CASAVA_Build 5 172706870 1D42M1I8M12I ATGACACACC TTTTTTGTTTTTTTGGTATTTCTAGGCTACACAGTTAGTGAGA-ATTTCAAA------------/-TTTTTGTTTTTTTGGTATTTCTAGGCTACACAGTTAGTGAGATTTTTCAAATGGTCGCTAATC TTCAAAAAAT 3070 hom 111 het 33 0 38 9 N/A 0 0 34538 CASAVA_Build 5 172707498 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 22 1 17 4 A 11 12 34539 CASAVA_Build 5 172708209 1D TCATGATGTT G/- GTCAGGCTGG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 G 2 1 34540 CASAVA_Build 5 172712012 1D GGAGGGGAGG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 91 het 36 0 29 7 A 9 8 34541 CASAVA_Build 5 172727082 1I CTGTTGGTTG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 8 9 34542 CASAVA_Build 5 172735503 1D CAGAACCACT A/- AATCCCCTGT 3070 het 3070 ref 52 24 25 5 A 3 2 34543 CASAVA_Build 5 172748752 13I TTCTCAAGGT -------------/ACCACATCTGCAC ACTCACTCAC 3070 het 3070 hom 44 21 24 0 ACCACATCTGCAC 0 1 34544 CASAVA_Build 5 172772676 1D CCCGGGCTGT G/- GGGGGGATGC 3070 het 2385 hom 28 8 13 7 G 7 6 34545 CASAVA_Build 5 172774850 4D TTTATATAAC TATA/---- TATTTATAAG 1941 het 435 hom 8 2 4 2 TA 3 1 34546 CASAVA_Build 5 172776498 3I TGCTCTTGTG ---/GCT GCTGCTGCTG 3070 hom 84 het 36 0 23 13 GCT 4 5 34547 CASAVA_Build 5 172779696 1I GAGAGGGGGG -/A AAAAAGCTGT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 5 6 34548 CASAVA_Build 5 172781922 1I TTCAAAACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 9 10 34549 CASAVA_Build 5 172784914 1I CAGTCATTTT -/A AATTAGGCAA 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 A 2 3 34550 CASAVA_Build 5 172786242 1I CAGTCTCTCC -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 6 7 34551 CASAVA_Build 5 172813876 1I TAGCCTCCAG -/A ACTGTGAGAG 3070 hom 162 het 58 0 54 4 A 1 2 34552 CASAVA_Build 5 172842537 1I TCATTATTTT -/C TTACAGTTAT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 0 1 34553 CASAVA_Build 5 172857949 1I TGAGCCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 T 10 11 34554 CASAVA_Build 5 172866235 1I CTTCTCTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 40 0 32 8 T 9 10 34555 CASAVA_Build 5 172869297 4D GAAATACGAT TGAG/---- TTTTACATAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TGAG 1 0 34556 CASAVA_Build 5 172869600 1D TCTGTAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 11 10 34557 CASAVA_Build 5 172873925 10D GACTCTGTCT AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAGGAA 3070 hom 58 het 25 0 23 5 A 16 6 34558 CASAVA_Build 5 172881022 1D TTTAAATTGA T/- TTTTCTACTC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 5 4 34559 CASAVA_Build 5 172881957 3D GCTGGCACCT AAG/--- GGATATTGGA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 AAG 1 0 34560 CASAVA_Build 5 172884310 10D TTGATAAAAT ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 AC 13 8 34561 CASAVA_Build 5 172885553 1D TAATTCCCTG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 88 het 35 0 30 5 T 8 7 34562 CASAVA_Build 5 172886667 1I TGTAAAAGAG -/A AAAATGTTAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 4 5 34563 CASAVA_Build 5 172887035 1D TCTAATATTA G/- TAGCATAAAG 3070 hom 126 het 46 0 43 4 G 1 0 34564 CASAVA_Build 5 172889528 1D ACTTCAGGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 10 9 34565 CASAVA_Build 5 172891985 1I AGAGCCAACT -/C CAGGCCTGGG 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 C 1 2 34566 CASAVA_Build 5 172901930 12D AGAAAGTTGC TGTGTGTGCACG/------------ TGTGTGTGCA 2775 het 2775 ref 39 18 7 20 TGTGTGTGCACG 2 1 34567 CASAVA_Build 5 172901992 8D CCTGTGTGTA TGTGCATG/-------- TGTGCATGTG 3070 het 3070 hom 47 21 21 8 TGTGCATG 2 1 34568 CASAVA_Build 5 172905512 16I27M1D GAATGAATGA ----------------GATGCTGCCCCCCTCCCCTCTTCCCACA/GATGCTGCCCACACTGGATGCTGCCCCCCTCCCCTCTTCCCAC- AGGAGCTCAT 2075 het 2075 ref 18 16 8 4 N/A 0 0 34569 CASAVA_Build 5 172924359 1D GGGTTATTTT G/- CCACGAGAAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 2 G 1 0 34570 CASAVA_Build 5 172931200 10D AGTTTAGGTC ATGGGGGCAG/---------- ATCCCTCTTG 2668 het 780 hom 35 4 9 23 ATGGGGGCAG 1 0 34571 CASAVA_Build 5 172932481 1D CTGCATTCTG T/- TTTTTCAGAC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 6 5 34572 CASAVA_Build 5 172933441 2I CCCCGACACA --/CT AGGAAGGGCG 3070 hom 92 het 33 0 31 2 CT 0 1 34573 CASAVA_Build 5 172934391 1D TATCTCATCT G/- CAGACCTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 G 1 0 34574 CASAVA_Build 5 172948812 1I CACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 2376 het 1355 hom 12 4 8 0 A 9 10 34575 CASAVA_Build 5 172951315 1D ATTTCTACTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 T 10 9 34576 CASAVA_Build 5 172951829 1D CTGCAATCAG C/- CTTCCATTGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 C 2 1 34577 CASAVA_Build 5 172954205 4I GAGAGATTTT ----/AACA AACACTTATT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 AACA 1 2 34578 CASAVA_Build 5 172966343 1D ACAGGACTGG T/- TAATTCTGGC 3070 het 3070 ref 53 23 19 11 T 2 1 34579 CASAVA_Build 5 172981723 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 852 het 131 hom 17 2 4 11 T 17 16 34580 CASAVA_Build 5 173010571 1I TGGTCCTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 424 hom 30 1 26 3 T 9 10 34581 CASAVA_Build 5 173046822 1I ACACACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1356 hom 26 4 11 11 T 11 12 34582 CASAVA_Build 5 173048743 2I ATTCTTTTGC --/GG GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 G 6 8 34583 CASAVA_Build 5 173054730 1D ATCATTCCCA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 34 14 20 0 T 8 7 34584 CASAVA_Build 5 173060460 1D CCTCCCGAAG T/- GTTGGGATTA 1441 het 744 hom 10 4 4 2 T 1 0 34585 CASAVA_Build 5 173067840 1I GTCAGGTCTT -/G GGGGGGTGGC 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 G 6 7 34586 CASAVA_Build 5 173068596 1I CTCTGTTTGG -/C CCCCCAGCTG 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 C 5 6 34587 CASAVA_Build 5 173082306 1D GTGTGTGTGT A/- TGTGTGCACA 3070 het 3070 hom 43 19 18 8 A 1 0 34588 CASAVA_Build 5 173082602 2D TTGGAGAGAG GT/-- GTGAGCAGCC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 GT 2 1 34589 CASAVA_Build 5 173085252 20D ACACACACAC ACACACACACACACATACAG/-------------------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 24 16 13 3 ACACACACACACACATACAG 1 0 34590 CASAVA_Build 5 173087313 1I AAGTCGAAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 13 10 11 A 7 8 34591 CASAVA_Build 5 173092327 1I TTTCGTAGAC -/G TGGGGTTTCA 3070 het 2258 hom 19 8 9 2 G 0 1 34592 CASAVA_Build 5 173098855 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 269 hom 30 1 23 6 A 12 13 34593 CASAVA_Build 5 173108975 1I GTAGACTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 11 12 34594 CASAVA_Build 5 173109913 4D CACCCAGCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2695 hom 31 het 18 0 8 12 T 16 12 34595 CASAVA_Build 5 173112175 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 1940 het 1940 ref 30 11 11 8 A 13 14 34596 CASAVA_Build 5 173138342 4D AGAACATAAA CAGT/---- CAATTAACAT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 CAGT 1 0 34597 CASAVA_Build 5 173175858 2D ATAGGCAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 17 19 11 AC 8 7 34598 CASAVA_Build 5 173183105 2D TGGAAAGAGG AA/-- AGAGAGCTCT 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 A 3 1 34599 CASAVA_Build 5 173193330 1I TTAGGGAGAA -/G GGGGGGACCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 6 7 34600 CASAVA_Build 5 173194825 9D2M1D TCCATGAAGA GTGTCGTCTTGC/---------TG- TCTTTGCAAA 3070 het 3070 ref 40 23 15 6 N/A 0 0 34601 CASAVA_Build 5 173201669 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 10 11 34602 CASAVA_Build 5 173204417 1D GCATCATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 578 hom 50 5 23 22 T 17 16 34603 CASAVA_Build 5 173204849 1I CAAAAGAAAT -/A TAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 0 1 34604 CASAVA_Build 5 173206003 1I TAAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 67 het 31 0 22 9 A 9 10 34605 CASAVA_Build 5 173222432 1D TGGGGGGCTG A/- AGCGGGTGGA 2059 het 2059 ref 16 9 5 3 A 2 1 34606 CASAVA_Build 5 173222661 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 33 1 26 7 A 13 12 34607 CASAVA_Build 5 173224873 3D ACTTCATTAG ATC/--- ATATCATTGG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 ATC 1 0 34608 CASAVA_Build 5 173241586 1D AAAAAAAAAA C/- CAAACAAATT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 2 1 34609 CASAVA_Build 5 173244673 1D AGCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 14 20 15 T 15 14 34610 CASAVA_Build 5 173254230 1D ACTCCGACTC A/- AAAAAAAAAA 1214 het 1214 ref 28 14 5 9 A 19 18 34611 CASAVA_Build 5 173260015 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1224 het 1224 ref 15 6 6 3 A 13 14 34612 CASAVA_Build 5 173263472 1D GTCCTCTCTG A/- AACATTCATT 3070 het 3070 hom 47 19 25 4 A 3 2 34613 CASAVA_Build 5 173264337 1I GGGTTTGAAT -/C CTGACTATGC 2623 het 2623 ref 25 16 7 2 C 1 2 34614 CASAVA_Build 5 173269141 1D GTCTACGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 20 0 15 5 T 12 11 34615 CASAVA_Build 5 173270691 1I GTATTATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 A 9 10 34616 CASAVA_Build 5 173270883 1I GGCTTGCATG -/T TTTTTATTTT 1009 het 1009 ref 19 7 6 6 T 5 6 34617 CASAVA_Build 5 173287350 5D CGCACTACTG CACTC/----- CAGCCTGGGT 1013 het 1013 ref 20 13 5 6 CACTC 1 0 34618 CASAVA_Build 5 173295390 1I TAATTAAAAG -/A AAAAAAGTCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 7 34619 CASAVA_Build 5 173296424 1D TGCATTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2083 hom 33 8 13 13 T 15 14 34620 CASAVA_Build 5 173299363 1D ATTTTGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 13 12 34621 CASAVA_Build 5 173301261 1I GTGGGCAGAT -/C CACTTGAGAT 3070 het 2179 hom 27 5 19 3 C 1 2 34622 CASAVA_Build 5 173321327 1D TTTCTAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 29 1 19 9 T 15 14 34623 CASAVA_Build 5 173327759 3I TATCATCATC ---/ATT GTTGTTTGCT 3070 het 3070 ref 54 34 14 6 ATT 0 1 34624 CASAVA_Build 5 173450649 2D TTCTTCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1812 het 1812 ref 34 16 5 14 T 20 18 34625 CASAVA_Build 5 173474056 1I AACCATAAGG -/T TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 6 7 34626 CASAVA_Build 5 173474726 1I ATTTATTATT -/C TTTTTAGAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 4 C 0 1 34627 CASAVA_Build 5 173489230 5D AAACACACAC AAAAG/----- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 AAAAG 1 0 34628 CASAVA_Build 5 173491170 1D TGTGACCCCC T/- CCCCAACCCT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 1 0 34629 CASAVA_Build 5 173505883 1D CAGCCTCAGG A/- GGCATGTTCT 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 A 1 0 34630 CASAVA_Build 5 173527571 3D TATGATGGAA TTG/--- TTGTTCTTTT 3070 het 3070 ref 46 25 18 4 TTG 2 1 34631 CASAVA_Build 5 173531788 1D TATTTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 936 het 936 ref 26 8 5 14 A 11 10 34632 CASAVA_Build 5 173539819 1I CAAGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 1803 hom 10 het 4 0 4 0 C 4 5 34633 CASAVA_Build 5 173549947 1D GGAAGCTGGT G/- GGGGGCTCTA 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 G 6 5 34634 CASAVA_Build 5 173551183 7D ACCTCTTTTG TCCTTTC/------- TCCTTTCCCT 3070 het 3070 hom 29 11 12 10 TCCTTTC 2 1 34635 CASAVA_Build 5 173563530 1I TTCTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 1973 het 336 hom 31 2 12 17 T 13 14 34636 CASAVA_Build 5 173564304 1D ATGCTGTGAC G/- GGGGGGGAGC 3070 hom 99 het 37 0 32 5 G 8 7 34637 CASAVA_Build 5 173570115 1D CTCTCACTCT G/- GGGGGGTCAT 3070 hom 102 het 40 0 33 7 G 7 6 34638 CASAVA_Build 5 173570566 1I GGCTTTATTT -/C CCCCCAGAGA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 C 5 6 34639 CASAVA_Build 5 173573994 2D CCCAGGGAGC TG/-- TGTGGGTGAA 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 TG 3 2 34640 CASAVA_Build 5 173574317 1D ACCTGGATAC A/- AACAAAACAT 3070 het 3070 hom 66 29 30 8 A 3 2 34641 CASAVA_Build 5 173588568 1D GGCCACCACG T/- TACACTGTGT 3070 hom 120 het 47 0 39 8 T 2 1 34642 CASAVA_Build 5 173590498 1I ATTTTCTGTA -/T TTTTTTTTTT 1073 hom 7 het 3 0 3 0 T 13 14 34643 CASAVA_Build 5 173593404 4D GGGAAATTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2216 het 2216 ref 25 8 10 7 TTTG 4 3 34644 CASAVA_Build 5 173596892 1I TCTTACTCCC -/T TGTATGCTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 2 34645 CASAVA_Build 5 173596984 1I TTTATTAGCA -/T TTTTGTGTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 4 5 34646 CASAVA_Build 5 173602004 1I TGGGACTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 861 hom 34 3 25 6 A 12 13 34647 CASAVA_Build 5 173603794 2D CAGCAAAAGT GA/-- GAGAGCAAGA 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 GA 3 2 34648 CASAVA_Build 5 173604634 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 29 0 19 10 A 10 12 34649 CASAVA_Build 5 173608751 4D TCAAAAACAA AAAC/---- AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 AAAC 1 0 34650 CASAVA_Build 5 173609013 1I TTAGGATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 11 12 34651 CASAVA_Build 5 173612840 1I TTTAAACTCT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 6 7 34652 CASAVA_Build 5 173613652 1I TAAATGGGTT -/A AAAAACGAAA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 5 6 34653 CASAVA_Build 5 173617255 2D CTTGACTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 45 0 24 21 T 14 12 34654 CASAVA_Build 5 173619668 1D TTTTGTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 33 0 31 2 T 11 10 34655 CASAVA_Build 5 173630533 1D ACCCAGTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 122 het 49 0 41 9 A 10 9 34656 CASAVA_Build 5 173650563 1D AAAAGAGGTA C/- AAAGAAATCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 1 0 34657 CASAVA_Build 5 173654281 2D ACTCCAACTC AA/-- AAAAAAAAAA 1081 het 450 hom 11 3 5 4 A 18 16 34658 CASAVA_Build 5 173660307 3D CAAGAGAGTC ACA/--- ACAATGACCT 3070 hom 166 het 63 0 56 8 ACA 2 1 34659 CASAVA_Build 5 173660827 2D ACATTATTTT AA/-- AAAACAGTGC 3070 hom 87 het 37 0 29 9 A 6 4 34660 CASAVA_Build 5 173666924 1I AACTCGCCTT -/G CTCTCTGTAG 3070 hom 119 het 42 0 38 4 G 0 1 34661 CASAVA_Build 5 173677669 1I TTCCTAAATA -/T TTTTTTGCTC 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 6 7 34662 CASAVA_Build 5 173678479 2I CCTAAAATGC --/CT TTTGTTATTT 3070 het 3070 ref 47 31 15 1 CT 0 1 34663 CASAVA_Build 5 173678736 2D GTTGTGTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 42 3 17 22 T 14 12 34664 CASAVA_Build 5 173682802 2D AGCAACATCC AA/-- AAAAAAAAAA 2207 het 516 hom 21 6 7 8 A 16 14 34665 CASAVA_Build 5 173683126 4I AACAAAAAAC ----/AAAA AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 6 10 34666 CASAVA_Build 5 173683564 2D ATCCACCATT CA/-- CACACATCCT 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 CA 4 3 34667 CASAVA_Build 5 173684250 1D TTCAAGGGGG A/- AAAAAATGAC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 A 7 6 34668 CASAVA_Build 5 173684689 4I TAAAATACTC ----/CCTT CATTTCCAAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 CCTT 0 1 34669 CASAVA_Build 5 173684818 1D ATTAAAGACA T/- TTGCATAAAC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 3 2 34670 CASAVA_Build 5 173692404 1I CCGTCTAGGG -/A AAAAAAAAAA 2768 het 1923 hom 19 6 9 4 A 13 14 34671 CASAVA_Build 5 173709007 1D TGCAAAGCTG C/- CCCCCAAACA 3070 het 3070 hom 29 12 17 1 C 6 5 34672 CASAVA_Build 5 173710026 10I AACATGGTAC ----------/ATAAAAGAGG ACATAAAAGA 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 ATAAAAGAGG 0 1 34673 CASAVA_Build 5 173711985 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 8 7 34674 CASAVA_Build 5 173712902 4I AACATTGCTC ----/TTCT TTCTTTTTTT 3070 hom 71 het 29 0 23 6 TTCT 1 2 34675 CASAVA_Build 5 173720955 1I CACCTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 11 12 34676 CASAVA_Build 5 173729540 7I CAAAGCCATT -------/AAGCCTA CATATCCCCA 2150 het 2150 ref 29 17 7 5 AAGCCTA 0 1 34677 CASAVA_Build 5 173737647 1I TTTAGAAACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 9 10 34678 CASAVA_Build 5 173741726 1D ATTGATAGGT G/- GGGGTCTATG 3070 het 3070 hom 40 17 16 9 G 5 4 34679 CASAVA_Build 5 173741988 5D AGCCTCCTGA GTAGC/----- TGGGACTACA 2985 het 679 hom 13 2 7 4 GTAGC 1 0 34680 CASAVA_Build 5 173744363 6D TTGCACACAC GGTGTG/------ TTATGAGATG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 GGTGTG 1 0 34681 CASAVA_Build 5 173755890 1I TTGTGGAGAT -/G GGGGTCTCTT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 G 4 5 34682 CASAVA_Build 5 173761963 1I CCTGTCCTTG -/A AAAAAATCTC 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 6 7 34683 CASAVA_Build 5 173763565 1I TCCTTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 T 13 14 34684 CASAVA_Build 5 173766141 5I CAAGAGTTGC -----/TTAGA TTAATGTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 TTAGA 0 1 34685 CASAVA_Build 5 173768244 1D CAAACAAAAC A/- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 4 3 34686 CASAVA_Build 5 173796154 1I CTCCCATCCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 306 hom 18 1 15 2 A 10 11 34687 CASAVA_Build 5 173798717 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 18 1 13 4 A 12 11 34688 CASAVA_Build 5 173800252 1D CCTACCCATC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 98 het 38 0 32 6 A 9 8 34689 CASAVA_Build 5 173814166 1I AAAAAAAAAA -/C TGAGGAGGAA 2311 het 1423 hom 31 8 12 11 C 0 1 34690 CASAVA_Build 5 173816577 4D CAATTTTAAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 1459 hom 11 3 7 2 AT 7 5 34691 CASAVA_Build 5 173826483 1I CAACATCAAC -/A AAAAAGGACA 962 het 962 ref 6 3 3 0 A 5 6 34692 CASAVA_Build 5 173834066 1I AAAAAAAAAA -/G GAAGTAAATG 3070 het 928 hom 20 4 11 5 G 1 2 34693 CASAVA_Build 5 173834690 6D AAGAAATAAC AATTAT/------ AAATAGATGT 3070 het 3070 ref 44 23 19 5 AATTAT 1 0 34694 CASAVA_Build 5 173855879 2D GGATGAAGGG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 A 11 9 34695 CASAVA_Build 5 173856341 1D AGCCCCCAAC T/- TTTTTTTTTT 1938 het 1938 ref 27 11 8 8 T 12 11 34696 CASAVA_Build 5 173858728 1D AGGGAAATGT G/- GGATCCGAGC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 G 3 2 34697 CASAVA_Build 5 173867038 1I TGAGGTCTTA -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 5 6 34698 CASAVA_Build 5 173883080 3I TATAAAGGAG ---/GAA GAAGGAAGGA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 GAA 1 2 34699 CASAVA_Build 5 173886153 9I CTTCTCAGCC ---------/CCCAGCCGG CCCAGCTTCC 3070 hom 64 het 26 0 20 7 CCCAGCCGG 0 1 34700 CASAVA_Build 5 173886428 1I14M1I TCTCAAAAGA -TTTTTTTTTTCTCA-/TTTTTTTTTTTCTCAT TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 22 0 21 5 N/A 0 0 34701 CASAVA_Build 5 173888830 1D AAGGTATGTC A/- GCAAGCTGGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 1 0 34702 CASAVA_Build 5 173897032 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 17 0 12 5 A 13 12 34703 CASAVA_Build 5 173899962 2D AAGTATAATG AA/-- AAAAAAAAAA 2917 het 8 hom 10 0 8 2 A 17 15 34704 CASAVA_Build 5 173901836 13D GAAAGAAAAG AAAGAAAGAAAGA/------------- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 3 AAAGAAAGAAAGA 2 1 34705 CASAVA_Build 5 173915262 1D TCTATAAACA T/- TCCTCCCCTG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 2 1 34706 CASAVA_Build 5 173917300 2I TAGTAGAGAC --/AG GGGTTTCTGG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 AG 0 1 34707 CASAVA_Build 5 173928707 1I TAATTTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2190 hom 40 8 15 17 T 15 16 34708 CASAVA_Build 5 173929873 5D ACCATGGTGT TTGCA/----- TTGCAATGCA 3070 het 3070 hom 39 18 17 8 TTGCA 2 1 34709 CASAVA_Build 5 173940697 1D TCTGCCGTAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 24 hom 39 1 32 6 A 9 8 34710 CASAVA_Build 5 173942050 3D TTGGGAGGCC AAG/--- GTGGGCAGAT 2180 het 1295 hom 12 5 6 1 AAG 1 0 34711 CASAVA_Build 5 173946077 1D CTTTTGCCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 T 9 8 34712 CASAVA_Build 5 173950600 4D AGGGGAGGGA AGAG/---- AGAGAGAGAG 2026 het 2026 ref 29 14 9 6 AG 7 5 34713 CASAVA_Build 5 173951564 1D CAAGGACCAT A/- CTTTGTTTCA 3070 het 3070 ref 51 22 25 5 A 1 0 34714 CASAVA_Build 5 173954948 11I TTAACCACTA -----------/TTCTGCTGCCT TTCTTAGTCT 3070 het 3070 hom 48 20 20 8 TTCTGCTGCCT 0 1 34715 CASAVA_Build 5 173966759 2I GTTCATGCAC --/AT GTCTATAACC 3070 hom 129 het 47 0 41 6 AT 0 1 34716 CASAVA_Build 5 173970472 1D CTGGAGGATG A/- CCTTAGCCAC 3070 het 3070 ref 53 24 16 15 A 1 0 34717 CASAVA_Build 5 173986143 2I TGCGAGTGGT --/TC TCGTGTGCTC 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 TC 1 2 34718 CASAVA_Build 5 174006678 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 3070 het 1808 hom 25 5 18 3 A 1 0 34719 CASAVA_Build 5 174031350 1I CATGTGTATT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 56 26 21 9 A 7 8 34720 CASAVA_Build 5 174037557 1I AACAAAATTC -/T CAGGGCTTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 0 1 34721 CASAVA_Build 5 174043210 1D TTAAAACTAG C/- AAACAAATAA 3070 het 2716 hom 19 6 10 4 C 1 0 34722 CASAVA_Build 5 174045032 3I TTTTTTTTTT ---/AAA AAAAAGTAGA 998 hom 24 het 15 0 8 7 A 5 8 34723 CASAVA_Build 5 174051656 1D GGATTTCAGC A/- GTTTTCAGAG 3070 hom 114 het 44 0 37 7 A 1 0 34724 CASAVA_Build 5 174054236 1I GAGGAGCCCT -/G GGTGAGCTGG 2202 het 2202 ref 25 16 6 3 G 2 3 34725 CASAVA_Build 5 174054648 3I AAATGGTGGA ---/CTT CTTCTCAGAA 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 CTT 1 2 34726 CASAVA_Build 5 174058183 19D CTTGCTCTCT GGGGCTTCTGCTGGTGGCC/------------------- GGGGCTTCTG 3070 het 3070 ref 34 20 17 3 GGGGCTTCTGCTGGTGGCC 2 1 34727 CASAVA_Build 5 174059332 3D ATTCAAACAA TCC/--- TCCTGCCTCA 2678 het 2678 ref 28 14 9 6 TCC 2 1 34728 CASAVA_Build 5 174065769 1D AAAAAATATT A/- AAAAAAAAAA 2885 het 1756 hom 23 10 9 4 A 13 12 34729 CASAVA_Build 5 174066758 1D AAAAATAAGG T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 T 6 5 34730 CASAVA_Build 5 174066855 1I TAAACCCCAG -/A AAAACATGCC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 4 5 34731 CASAVA_Build 5 174086680 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2235 hom 36 8 19 9 A 10 9 34732 CASAVA_Build 5 174088037 1I AATGACAGCT -/G TGTGACTGTT 3070 hom 93 het 37 0 30 7 G 0 1 34733 CASAVA_Build 5 174090190 1I ATCCAGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 10 34734 CASAVA_Build 5 174092492 2D AACTAGGCTT CC/-- CCCCCCCCCG 715 hom 9 het 19 0 7 12 C 11 9 34735 CASAVA_Build 5 174094673 1I TTTCTCTTCC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 T 6 7 34736 CASAVA_Build 5 174110324 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 9 12 T 13 14 34737 CASAVA_Build 5 174112063 4D AAAAGGTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 30 10 15 7 AAAC 4 3 34738 CASAVA_Build 5 174114253 1I TCTATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2475 hom 33 12 12 9 T 12 13 34739 CASAVA_Build 5 174128868 4D AAAGGAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 2897 hom 31 10 13 8 AAAG 4 3 34740 CASAVA_Build 5 174132435 1D TTTCTTACTA T/- TTATAATTTC 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 T 3 2 34741 CASAVA_Build 5 174135113 1D TCCATTGCTA G/- GTGTAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 14 12 7 G 2 1 34742 CASAVA_Build 5 174139894 14D ACAGAGCAAG ACCATGCCTAAAAC/-------------- ACCGAATGTG 3070 het 3070 ref 40 23 14 10 ACCATGCCTAAAAC 1 0 34743 CASAVA_Build 5 174142538 1I TTCTGCTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 T 9 10 34744 CASAVA_Build 5 174147218 1D GACTAGAAGT C/- CAAGATTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 19 2 C 2 1 34745 CASAVA_Build 5 174148853 1I TGTCTCACCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 28 0 19 9 A 11 12 34746 CASAVA_Build 5 174152396 7I GCAGAGAGAT -------/CTATATA CTTAAGCTGA 3070 hom 111 het 38 0 38 1 CTATATA 0 1 34747 CASAVA_Build 5 174157644 5D AACCCTGGTG TTTAC/----- TTTACCTATG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TTTAC 2 1 34748 CASAVA_Build 5 174158597 1I CCTCTCGGGC -/T TAGTTCTCTC 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 T 1 2 34749 CASAVA_Build 5 174159468 2I CCACATATAC --/TA TATCTGTGTA 3070 hom 161 het 59 0 54 5 TA 1 2 34750 CASAVA_Build 5 174161719 1I AGCCTTGGGT -/A GGGGGGGTGG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 0 1 34751 CASAVA_Build 5 174161910 1D AGGCCAGTTA G/- TATGGGAAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 G 1 0 34752 CASAVA_Build 5 174165416 1I TTTCCAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 610 hom 34 2 20 12 T 12 13 34753 CASAVA_Build 5 174166006 1D AATTTTTGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 44 het 20 0 13 7 T 10 9 34754 CASAVA_Build 5 174167443 4D GCCAGGCCAC TTTG/---- TTTGATGTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TTTG 2 1 34755 CASAVA_Build 5 174174442 1I TGATGAATGT -/A TTTCATTAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 34756 CASAVA_Build 5 174175733 1D TCATAATGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 9 8 34757 CASAVA_Build 5 174179816 2D GTGAGGGGGG GA/-- GGTGGCATCA 2583 hom 27 het 14 0 9 5 GA 1 0 34758 CASAVA_Build 5 174185715 1D TAGTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 12 11 34759 CASAVA_Build 5 174208355 1D TATTTAATGA G/- GGGGGATAAA 3070 hom 114 het 46 0 39 8 G 6 5 34760 CASAVA_Build 5 174215159 1D TCTTAGAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 32 1 27 4 T 13 12 34761 CASAVA_Build 5 174219319 1D TTTTTCTTGT A/- AATATAAGTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 3 2 34762 CASAVA_Build 5 174225579 1D CTGGTTTATC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 43 1 36 6 T 8 7 34763 CASAVA_Build 5 174228285 1I GGTGAGTGTT -/A ACAGCTCATA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 34764 CASAVA_Build 5 174233263 2I GATGAATGGA --/GG GAAGGGTAAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 1 3 34765 CASAVA_Build 5 174246567 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 10 9 34766 CASAVA_Build 5 174247796 1D ATTTTTTTTT G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 39 het 16 0 14 3 G 9 8 34767 CASAVA_Build 5 174248756 1D CCTCCGCTCT C/- CGAGGACACC 3070 hom 63 het 26 0 22 6 C 2 1 34768 CASAVA_Build 5 174252326 1I AGTCCTGGAG -/A AAGCTCAACA 3070 hom 99 het 39 0 31 8 A 2 3 34769 CASAVA_Build 5 174288707 2I AGATGGGGTA --/TT GCCATGTTGC 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 0 2 34770 CASAVA_Build 5 174309263 1D ACTTAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 37 1 25 11 T 13 12 34771 CASAVA_Build 5 174315324 1I AGGAACTAGA -/G TGTGGCTTAC 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 G 0 1 34772 CASAVA_Build 5 174315850 2I ACAGGACAAG --/CA CACTCCGGCA 3070 het 3070 ref 35 21 8 6 CA 1 2 34773 CASAVA_Build 5 174317645 2D AATAAACTTG CT/-- CTTACTTTAC 2431 het 2431 ref 24 16 6 2 CT 2 1 34774 CASAVA_Build 5 174319485 1D GGTGGCGGGG A/- GGGGTCCTAG 2786 het 2786 ref 39 22 9 8 A 1 0 34775 CASAVA_Build 5 174325129 1D ATCTTTGCCA G/- GGCCTATGTC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 G 3 2 34776 CASAVA_Build 5 174345401 2D CTGGGCACAC AA/-- AGAGTCATTG 3070 het 3070 ref 38 18 19 1 A 3 1 34777 CASAVA_Build 5 174363453 1D GGAAGGGAGA G/- GAGACTGGTG 3070 het 2643 hom 23 8 10 5 G 2 1 34778 CASAVA_Build 5 174364771 4I CCCCGCAGGC ----/AGTT AGTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 AGTT 1 2 34779 CASAVA_Build 5 174365142 1D AGGCAGGTGT G/- GTCTGGGGAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 6 G 2 1 34780 CASAVA_Build 5 174370679 14D CTCAGCAGAA GGTTTGGCCCAAAG/-------------- AATACTGGAT 3070 het 3070 ref 52 32 21 4 GGTTTGGCCCAAAG 1 0 34781 CASAVA_Build 5 174373249 2D GTACCCCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2314 hom 30 9 12 9 T 18 16 34782 CASAVA_Build 5 174384239 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 2508 het 606 hom 10 2 6 2 T 8 7 34783 CASAVA_Build 5 174385453 1D ATTGAATCAT G/- GGGGCAAGTA 3070 het 2258 hom 23 6 15 2 G 5 4 34784 CASAVA_Build 5 174390256 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 7 6 34785 CASAVA_Build 5 174404856 1D GGTACATGTA T/- TTTTTTTTTT 2210 het 2210 ref 23 15 7 1 T 11 10 34786 CASAVA_Build 5 174405522 1D GTGAGTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 10 9 34787 CASAVA_Build 5 174409183 2D28M1D ATGTCAAAGG TTTTTTTTTTTTAAATAAAAGTACATTATTA/--TTTTTTTTTTAAATAAAAGTACATTATT- AAAAAAAAAT 3070 hom 80 het 30 0 26 12 N/A 0 0 34788 CASAVA_Build 5 174433761 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 2742 het 2742 ref 23 9 6 9 A 10 9 34789 CASAVA_Build 5 174433858 4I AAACTGTTAC ----/AAAT AAATAAAATA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 AAAT 1 2 34790 CASAVA_Build 5 174436083 1D ACTGCAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1439 hom 33 8 21 4 T 18 17 34791 CASAVA_Build 5 174436169 1I GATATTTTAC -/A ATTTTATCAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 1 2 34792 CASAVA_Build 5 174461462 2D GTTTGTGTGC AG/-- ATGTTTTAAT 3070 het 3070 hom 26 11 14 2 AG 1 0 34793 CASAVA_Build 5 174467494 1D AAACAACAAC A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 A 7 6 34794 CASAVA_Build 5 174481240 1I GGTGTGGCAA -/G GAAAGGCAGG 3070 het 3070 ref 57 29 22 6 G 1 2 34795 CASAVA_Build 5 174486506 5I TCACTAAAAT -----/TAAAA TAAAGAATTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TAAAA 0 1 34796 CASAVA_Build 5 174487431 1D AATGAAAATG A/- AAACACAGCA 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 A 4 3 34797 CASAVA_Build 5 174487632 1D39M1D CAACAAAACC AAAAAAAAACCAAACAGAAAATTGATGAAACCCTAAGCTGT/-AAAAAAAACCAAACAGAAAATTGATGAAACCCTAAGCTG- TTTTTTTAAG 3070 het 1163 hom 26 6 11 15 N/A 0 0 34798 CASAVA_Build 5 174489785 4D AAAGCCACTC ACTT/---- GGAGAAGATG 3070 het 3070 hom 44 18 23 5 ACTT 1 0 34799 CASAVA_Build 5 174492884 1D CAAGCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 11 10 34800 CASAVA_Build 5 174501306 1I ATGGAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 221 hom 47 1 21 25 A 11 12 34801 CASAVA_Build 5 174508232 1D AGAAATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1809 hom 28 8 16 4 A 14 13 34802 CASAVA_Build 5 174531515 5I TTCATCCATC -----/TATTG ATCCACCCAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TATTG 0 1 34803 CASAVA_Build 5 174533357 1I TTTAGGTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 34 1 27 6 T 10 11 34804 CASAVA_Build 5 174533605 4I TCTTGCTTTT ----/TTTG CTTAACAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTTG 0 1 34805 CASAVA_Build 5 174534202 1I TCAAAAAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 8 9 34806 CASAVA_Build 5 174535467 4I AGCTAGCTAG ----/CTAC CTACCTACGT 3070 het 3070 hom 51 22 28 1 CTAC 2 3 34807 CASAVA_Build 5 174537036 4I AGCAAGACCT ----/TCTC TCTACTAAAT 981 het 981 ref 19 8 4 7 TC 1 3 34808 CASAVA_Build 5 174539960 2I TAAGATGGTG --/CC CAGCCACCCC 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 C 1 3 34809 CASAVA_Build 5 174540948 1I TAGTGCAGAC -/A AAATCACAAA 3070 hom 132 het 54 0 45 9 A 3 4 34810 CASAVA_Build 5 174550437 14D CCCTCTCAAG AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 23 0 22 7 A 24 10 34811 CASAVA_Build 5 174551797 1D TAATTTATTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 34 0 29 6 A 9 8 34812 CASAVA_Build 5 174553883 18D GACAGCTCCA GGCAAAGGATACAGCATG/------------------ GGCAAAGGAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 7 GGCAAAGGATACAGCATG 2 1 34813 CASAVA_Build 5 174556058 1D CCAGCCTAAT A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 A 7 6 34814 CASAVA_Build 5 174566912 1D TTTCAAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 12 11 34815 CASAVA_Build 5 174570855 23D CTGACCTCAA GTCTCTGAGTCACATTTCCTCAC/----------------------- GTCTCTGAGT 3070 hom 78 het 29 0 26 13 GTCTCTGAGTCACATTTCCTCAC 2 1 34816 CASAVA_Build 5 174574150 2D AGCCAAAGAC TT/-- TGTGTGGCTT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 T 3 1 34817 CASAVA_Build 5 174575878 2I GAAGAGAGAC --/AA GAGCCAAGGA 3070 hom 96 het 40 0 30 10 A 0 2 34818 CASAVA_Build 5 174577296 14D CCCTCTGGAG GAAGGATGATAGGA/-------------- GAAGGATGAT 3070 het 3070 ref 37 22 11 10 GAAGGATGATAGGA 2 1 34819 CASAVA_Build 5 174579072 2D CAGATTCCTC CT/-- CTGTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 CT 2 1 34820 CASAVA_Build 5 174579468 1I AGCAGCAGCA -/T TTTGTCTCAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 T 3 4 34821 CASAVA_Build 5 174597008 1I AGATGATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 327 hom 52 1 47 4 A 10 11 34822 CASAVA_Build 5 174621951 1D GGGTCTTTTC A/- AGCAAATGGT 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 A 2 1 34823 CASAVA_Build 5 174635862 1I CAATGGTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 10 11 34824 CASAVA_Build 5 174639225 1I AGCAGTGATA -/C CCTGGACCAC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 C 2 3 34825 CASAVA_Build 5 174660557 1I TTAAAACAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 8 9 34826 CASAVA_Build 5 174667651 2D ACACACACAC AT/-- GGAATATCCT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 AT 1 0 34827 CASAVA_Build 5 174697856 3D TTCCTGTCTC CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 het 3070 ref 40 11 9 20 CTT 6 5 34828 CASAVA_Build 5 174708642 4D ATATCTTAGA TTAT/---- TTATTTGATT 3070 het 3070 ref 39 18 18 6 TTAT 2 1 34829 CASAVA_Build 5 174708911 3I CCAGGGTCTT ---/CTC CTACTCAGAG 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 CTC 0 1 34830 CASAVA_Build 5 174710005 2I GTCAGGAGAC --/AG AGGGCATACG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AG 1 2 34831 CASAVA_Build 5 174710441 1I CGTCTCACCG -/C CCCCCCACCC 1234 het 1234 ref 21 8 5 8 C 6 7 34832 CASAVA_Build 5 174713949 1D AAGTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1094 het 1094 ref 12 3 5 4 A 11 10 34833 CASAVA_Build 5 174718992 1D TCCCCACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 11 10 34834 CASAVA_Build 5 174722272 2D CAAAATAAGG GA/-- ATCCGAGAGA 3070 het 3070 hom 31 10 15 7 GA 1 0 34835 CASAVA_Build 5 174730732 2I AATCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 31 1 23 7 A 14 16 34836 CASAVA_Build 5 174733480 1I GAAAGAAATC -/A AAAAAGGATG 3070 hom 65 het 24 0 22 2 A 5 6 34837 CASAVA_Build 5 174733572 2I GTAAAAGTAA --/CT CTGTTGATGA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 CT 1 2 34838 CASAVA_Build 5 174737744 2I ATGAAGTGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 47 0 36 11 A 12 14 34839 CASAVA_Build 5 174740977 2I TGGGCCTGGA --/AT ACGATTAAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 0 1 34840 CASAVA_Build 5 174741225 1D TAATCTCTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 9 34841 CASAVA_Build 5 174744549 4D AGAAAGGAAA GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 GAAG 5 4 34842 CASAVA_Build 5 174744790 1I TATTGATAAG -/C TAGAGGCTTG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 0 1 34843 CASAVA_Build 5 174757216 1D TCACTATTCT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 1886 hom 22 5 13 4 A 8 7 34844 CASAVA_Build 5 174783229 11I CAGCAAGCTG -----------/GTTCTTTGAAA GTTTCAATAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 GTTCTTTGAAA 0 1 34845 CASAVA_Build 5 174788247 1D GATTTTATTC T/- TTTTCATGGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 5 4 34846 CASAVA_Build 5 174789044 1D TGGAAAGTAG T/- TAGGATCCAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 2 1 34847 CASAVA_Build 5 174813696 2I CTAGACACCA --/AG AGAGGGTTCT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AG 2 3 34848 CASAVA_Build 5 174815254 1D GCCTTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 11 10 34849 CASAVA_Build 5 174827648 1I TAATTGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 34 1 25 8 A 10 11 34850 CASAVA_Build 5 174827982 1D TGCTCTGTCA G/- GGAAGCAGGA 3070 hom 147 het 53 0 49 4 G 3 2 34851 CASAVA_Build 5 174848730 1I TAGACCTTCT -/A GAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 0 1 34852 CASAVA_Build 5 174850469 1I GCAAAAAAAA -/T CAAGATCTTA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 0 1 34853 CASAVA_Build 5 174851998 2D TCTTTTGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2720 hom 31 8 18 5 A 13 11 34854 CASAVA_Build 5 174856508 1I ATACTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 43 1 28 14 T 11 12 34855 CASAVA_Build 5 174857669 4I TCAAAACAAA ----/AAAT AAAATCACAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAAT 0 1 34856 CASAVA_Build 5 174857956 1I TTAACCCTCA -/C CAACCTTTGA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 C 1 2 34857 CASAVA_Build 5 174858867 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 25 1 20 4 A 12 11 34858 CASAVA_Build 5 174864026 2D TCTACTACAA AC/-- ACAAAAACTA 2958 het 2787 hom 20 8 8 7 AC 2 1 34859 CASAVA_Build 5 174876158 1D CAAATGGTTG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 A 9 8 34860 CASAVA_Build 5 174880863 1I CATTTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 A 13 14 34861 CASAVA_Build 5 174882259 1I TTGAAAATGC -/T TTTATTCTTT 3070 het 3067 hom 27 8 19 0 T 3 4 34862 CASAVA_Build 5 174886820 1D TAAAAACTTA C/- CCTGAAATAT 3070 het 3070 hom 40 11 26 3 C 3 2 34863 CASAVA_Build 5 174889094 4I AAGAACAAAT ----/AAAC CAAGATTGGC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 AAAC 0 1 34864 CASAVA_Build 5 174900818 1I GGAGCCACGG -/C CCCCCCGCCC 2064 het 2037 hom 26 9 7 10 C 6 7 34865 CASAVA_Build 5 174927123 1I GAGGCTGAGG -/C AGGAGAATGG 920 het 920 ref 9 5 3 1 C 0 1 34866 CASAVA_Build 5 174929008 3D TTTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2136 het 305 hom 22 4 8 10 T 19 16 34867 CASAVA_Build 5 174944634 1I ATTTGTTTGC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 67 27 30 10 A 6 7 34868 CASAVA_Build 5 174946005 8I TTGGGGGGAC --------/AGGAGAGT AGGAGAGTGG 3070 het 3070 hom 44 16 14 14 AGGAGAGT 1 2 34869 CASAVA_Build 5 174946182 1I CAGACTATAC -/A AGAAGCACAG 3070 hom 72 het 32 0 23 9 A 1 2 34870 CASAVA_Build 5 174960194 7D TGTCTCAAAT AAAAAAA/------- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 24 5 A 11 4 34871 CASAVA_Build 5 174979253 1D GCCCTAGAAA T/- TTTTTTTTTA 1113 het 1113 ref 34 22 3 10 T 10 9 34872 CASAVA_Build 5 174998633 14D GGGTTGAGAA GCTCTGCACTGGAG/-------------- GCCTATGATG 3070 het 3070 hom 34 11 16 10 GCTCTGCACTGGAG 1 0 34873 CASAVA_Build 5 175000576 2D TCTCTCTCAT TC/-- TCTCTCTCTC 1205 het 1205 ref 46 33 4 9 TC 10 9 34874 CASAVA_Build 5 175056102 2D AAGACTCCCT CA/-- CATCTGTTAG 3070 hom 81 het 36 0 27 9 CA 2 1 34875 CASAVA_Build 5 175113465 10D CGACAGAGGC TAATTAAGAA/---------- TTTATTTTTG 3070 hom 75 het 25 0 25 4 TAATTAAGAA 1 0 34876 CASAVA_Build 5 175133648 3I GATTTCCACA ---/TCT TCTATAATAA 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 TCT 1 2 34877 CASAVA_Build 5 175135965 1I AGCTGGGGAG -/T TTGAGGCTGC 3070 het 2893 hom 24 10 14 0 T 2 3 34878 CASAVA_Build 5 175136386 2D TGTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 T 13 11 34879 CASAVA_Build 5 175142184 1I CACTATTTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 T 8 9 34880 CASAVA_Build 5 175144138 1D GCCTCATCCA G/- GGAAATAACC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 G 3 2 34881 CASAVA_Build 5 175165806 1I CCCGCCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 98 het 43 0 33 10 T 11 12 34882 CASAVA_Build 5 175167674 3D GGTTGTCCTG GGA/--- GGAGGACATT 3070 hom 104 het 39 0 34 7 GGA 3 2 34883 CASAVA_Build 5 175169909 2D AGTGTCACAC AG/-- AGAGTCGGGG 3070 het 3070 hom 47 22 20 7 AG 3 2 34884 CASAVA_Build 5 175185014 1I AAACAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 440 het 440 ref 41 26 3 12 A 11 12 34885 CASAVA_Build 5 175201010 2I GTGCACCTGG --/GA GAGTCACGCT 3070 het 3070 ref 61 35 21 5 GA 1 2 34886 CASAVA_Build 5 175223788 3D AGAGATCACT CCC/--- CCATTTCACC 3070 het 3070 hom 49 12 27 11 C 5 2 34887 CASAVA_Build 5 175232871 2D GGCAAAACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 14 14 9 AC 7 6 34888 CASAVA_Build 5 175253880 1D CTGCGGGGGG T/- AAGGAAAGAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 1 0 34889 CASAVA_Build 5 175262614 2I AAAAAAAAAG --/GA GAGAGAGACA 236 het 236 ref 22 12 2 8 GA 4 5 34890 CASAVA_Build 5 175267984 6I AACAAACGCT ------/CCACGA CCACGACGTG 3070 het 2944 hom 31 8 18 5 CCACGA 1 2 34891 CASAVA_Build 5 175270098 1I CCAGGCCACC -/T GGCAAACTCC 3070 het 2253 hom 32 7 17 8 T 0 1 34892 CASAVA_Build 5 175274616 4I46M3D TCAAATGAGT ----AAATAGTAAGGTGCATATTTTCATAATTTTAAAAAATCAAATTGTAAAG/AAACAAATAGTAAGGTGCTTATTTTCATAATTTTAAAAAATCAAATTGTA--- AAGATTAATT 2397 het 2397 ref 26 31 6 2 N/A 0 0 34893 CASAVA_Build 5 175274953 2D TGTTTTCTTT CA/-- GTTTTGGTTT 3070 het 3070 ref 52 29 21 2 CA 1 0 34894 CASAVA_Build 5 175278366 4D GAAAACAAAT AAAC/---- AAACAGACCA 3070 het 3070 ref 60 41 14 9 AAAC 2 1 34895 CASAVA_Build 5 175278758 3D GAGACTGCCC TTA/--- TTTTTAAGAG 3070 het 3070 ref 69 57 10 4 TTA 1 0 34896 CASAVA_Build 5 175279134 1I TTAGGCAGAG -/T GTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 61 24 30 7 T 0 1 34897 CASAVA_Build 5 175279964 15D ACTTCATCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 2392 het 1550 hom 22 10 8 6 A 25 10 34898 CASAVA_Build 5 175280648 3D AGTGAGGATA ATG/--- AGATTGACCT 3070 het 3070 ref 94 47 37 10 ATG 1 0 34899 CASAVA_Build 5 175285104 5D AACACCTGAC AAAGT/----- AAAATTCACA 2413 het 2413 ref 61 47 7 7 AAAGT 1 0 34900 CASAVA_Build 5 175285679 3I AGGAAAAATA ---/TAT TGTCTAAGAT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 TAT 0 1 34901 CASAVA_Build 5 175287107 1D AACTTCAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 84 43 33 9 T 9 8 34902 CASAVA_Build 5 175290179 2D ATGTAGAGAG AA/-- ATCAAAATAA 3070 het 3070 ref 47 34 9 4 A 3 1 34903 CASAVA_Build 5 175293901 1I CAAAAAATCA -/C ACTTACTGAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 C 0 1 34904 CASAVA_Build 5 175294094 1I AAAGAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 35 7 9 A 10 11 34905 CASAVA_Build 5 175295215 5I AACAACAACA -----/TAGAT TAATCTCAAA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 TAGAT 0 1 34906 CASAVA_Build 5 175296654 4D CACTATGCCC GGCG/---- GGCGTCAAGT 2716 het 2095 hom 12 5 6 1 GGCG 2 1 34907 CASAVA_Build 5 175300781 3D AACATAACCC ATA/--- ATAAGGCAAA 3070 het 3070 hom 45 22 23 2 ATA 2 1 34908 CASAVA_Build 5 175313748 1D CAGGATCAAG A/- AAAATTGACC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 5 4 34909 CASAVA_Build 5 175318190 2D CACCTGCTCA AC/-- ACATCACTCA 3070 het 3070 ref 66 40 22 4 AC 2 1 34910 CASAVA_Build 5 175332047 1D TTCTTTATAG C/- CCTTCTTTTC 1377 het 1377 ref 34 28 3 4 C 3 2 34911 CASAVA_Build 5 175336919 1I TCTAAATTGG -/A AAAAAAAACA 1872 het 1872 ref 41 30 4 7 A 8 9 34912 CASAVA_Build 5 175359878 1D ACTCTACGTC A/- AAAAAAAATA 1394 het 1394 ref 33 23 3 7 A 9 8 34913 CASAVA_Build 5 175362154 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 9 8 34914 CASAVA_Build 5 175370862 3D GGACCCTTAG AAC/--- AACCAGTGGA 3070 het 3070 ref 61 36 17 10 AAC 2 1 34915 CASAVA_Build 5 175373812 5I AAAAAAAAAA -----/GAAAG AAAGAAAAGG 2514 het 2119 hom 29 19 7 3 GAAAG 0 1 34916 CASAVA_Build 5 175396701 1D TACAGTTGGG A/- AAAAAAGAAA 2750 het 2750 ref 19 8 6 6 A 7 6 34917 CASAVA_Build 5 175397062 1D GAAGGTGCCC A/- GGGGGAGTGG 2361 het 2361 ref 70 51 9 11 A 1 0 34918 CASAVA_Build 5 175397885 1I TTTGCAGAAG -/C TTTTAAGTTT 3070 het 3070 hom 41 12 24 5 C 0 1 34919 CASAVA_Build 5 175407456 18D TGGGTCTGAA TTTCGCCTGGGGTCTGAT/------------------ GTCCATTTGG 1420 het 1420 ref 22 20 4 1 TTTCGCCTGGGGTCTGAT 1 0 34920 CASAVA_Build 5 175418836 1I TTAACAGGTT -/A AAAAAAGTGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 7 34921 CASAVA_Build 5 175423987 5I ACTGTGTTCT -----/ATATA TACAATAAAG 2608 het 2608 ref 45 33 6 6 ATATA 0 1 34922 CASAVA_Build 5 175425004 4D TACACAATCA TTTG/---- TTTATTTATT 1369 het 1369 ref 39 30 3 7 TTTG 1 0 34923 CASAVA_Build 5 175447959 1I TATGTGGGCA -/T TTTTTTTTTA 2067 het 2067 ref 19 9 6 4 T 9 10 34924 CASAVA_Build 5 175457166 2D ATTTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2935 het 2935 ref 42 25 7 10 A 14 12 34925 CASAVA_Build 5 175473307 1D GCTGGAGGGA C/- CCCCCAGTGA 1160 het 1160 ref 27 20 5 2 C 6 5 34926 CASAVA_Build 5 175476062 1D TCATCCCTAC A/- AAAAAAAAAA 2746 het 2746 ref 30 15 9 6 A 12 11 34927 CASAVA_Build 5 175477641 1I TATGCATGGC -/T TTGAAGGCCA 3070 het 3070 hom 49 12 32 5 T 2 3 34928 CASAVA_Build 5 175482062 1D TCTAAAACAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 9 8 34929 CASAVA_Build 5 175482305 4D TTCATAAAAT ATTG/---- ATTGTCTTTC 1248 het 1248 ref 41 32 3 8 ATTG 2 1 34930 CASAVA_Build 5 175482476 3D CTTGTTATAA TAT/--- TATTGTGTAT 3070 het 3070 ref 54 39 11 4 TAT 2 1 34931 CASAVA_Build 5 175489085 2I AAGATCAGAC --/TT ATATGATAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 0 2 34932 CASAVA_Build 5 175490317 1I ACTATATGCA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 6 7 34933 CASAVA_Build 5 175490439 3I CTTTGGTCTG ---/AGA AGATACTTGC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AGA 1 2 34934 CASAVA_Build 5 175493584 2D TTAGACAATC AT/-- AGGGGCTGAG 2569 het 2569 ref 26 17 8 1 AT 1 0 34935 CASAVA_Build 5 175499273 1I ACCTACTCTC -/T AAGCATTTCT 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 T 0 1 34936 CASAVA_Build 5 175500080 8D TTTTTGCTTA TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 22 8 8 6 TTTG 4 2 34937 CASAVA_Build 5 175500827 1D TCTGGGTGAC A/- AGAGACTGTC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 2 1 34938 CASAVA_Build 5 175501046 1D ATGTGGCTTT A/- TATTGTGTAG 3070 het 3070 ref 34 15 13 8 A 1 0 34939 CASAVA_Build 5 175501565 2I57M1D GAGTGGGACA --GTTTTGAAGACACCTTAAAATATGGAAGCAGCTTTGGAACTGGTAATCATCTGCAGCT/CTGTTTTGAAGATACCTTAAAATATGGAAGCAGCTTTGGAACTGGTAATCATCTGCAGC- TGTGAGGGTT 3070 het 3070 ref 31 35 8 19 N/A 0 0 34940 CASAVA_Build 5 175505670 1I ATGAGTAAAA -/C CTTGTCATTA 3070 het 3070 ref 45 17 16 12 C 1 2 34941 CASAVA_Build 5 175529207 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2334 het 1438 hom 14 5 6 3 A 13 14 34942 CASAVA_Build 5 175531536 1D TATGTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2031 hom 21 het 17 0 7 10 T 12 11 34943 CASAVA_Build 5 175531790 1D TGCCCGCCTC G/- GGCCTCCCAA 2264 hom 26 het 13 0 6 7 G 3 2 34944 CASAVA_Build 5 175532948 1D ACAAAGATCC A/- AAAAAAACTA 3070 hom 71 het 33 0 26 9 A 8 7 34945 CASAVA_Build 5 175533793 4D AGTAAAAAAC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 23 14 6 TG 7 5 34946 CASAVA_Build 5 175551652 1D GCATCCCCCA G/- GGTCATGACT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 G 3 2 34947 CASAVA_Build 5 175552724 4D CAAAGGGTGC AGTT/---- AGTTACTGCA 3070 hom 66 het 23 0 20 4 AGTT 2 1 34948 CASAVA_Build 5 175568816 1D TCTTCCTGTC G/- GTTTTCTGAG 3070 hom 77 het 36 0 26 10 G 2 1 34949 CASAVA_Build 5 175570679 2D CCTTCTTGTG TT/-- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 8 6 34950 CASAVA_Build 5 175570913 3I AGATTTTCCA ---/CTT CTTCTTGAGT 3070 hom 31 het 19 0 11 8 CTT 2 3 34951 CASAVA_Build 5 175573376 1I TAAATTTTAC -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 6 7 34952 CASAVA_Build 5 175576977 1I GATAAATGGG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 7 8 34953 CASAVA_Build 5 175577462 1D GGCAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 19 2 13 4 A 13 12 34954 CASAVA_Build 5 175577540 1I TCGATTTTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 8 9 34955 CASAVA_Build 5 175582934 1D GGAATAGGGA T/- TGGTTACAAA 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 T 2 1 34956 CASAVA_Build 5 175592422 1I TTTTCTATAT -/A AAAGCAAATA 2748 het 2748 ref 28 21 6 1 A 3 4 34957 CASAVA_Build 5 175597470 1I GTGAAATCGC -/A AAACTGGTAC 3070 het 3070 ref 49 31 12 6 A 3 4 34958 CASAVA_Build 5 175601664 1D GTATATGTGG A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 ref 64 47 13 4 A 7 6 34959 CASAVA_Build 5 175620223 1I TTAAAAAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 8 9 34960 CASAVA_Build 5 175631994 1I GCAATAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 11 12 34961 CASAVA_Build 5 175644035 1D AATGACTACT G/- GGGTACATAA 1380 het 1380 ref 18 14 3 1 G 4 3 34962 CASAVA_Build 5 175653901 4I CTTTTTTGTC ----/TGTT TGTTTTGATT 2448 het 2448 ref 21 15 6 0 TGTT 1 2 34963 CASAVA_Build 5 175660095 1I ACTCAGCTAA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 T 6 7 34964 CASAVA_Build 5 175666531 2D AAAATAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 166 het 166 ref 16 7 2 8 A 12 10 34965 CASAVA_Build 5 175680356 1D GCTATTGAAG T/- TTTTTTTTTT 1422 het 1422 ref 40 26 4 11 T 12 11 34966 CASAVA_Build 5 175714548 1D AAGACTTAAA G/- GATACCAGTT 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 G 2 1 34967 CASAVA_Build 5 175715027 1I TCTTAAAAAA -/G AAAAAAAAGA 3070 het 2732 hom 28 11 12 5 G 0 1 34968 CASAVA_Build 5 175743701 2I GAGTGTGCAC --/GT GTGTGTGTAA 3070 hom 98 het 39 0 29 10 GT 4 5 34969 CASAVA_Build 5 175746672 4D GGAGGCTTTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 2645 hom 34 8 18 8 TC 7 5 34970 CASAVA_Build 5 175746876 1D TAGTAGAGAT G/- GGGTTTTGCC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 4 3 34971 CASAVA_Build 5 175754258 1D CGTCTCTACT A/- AAAAATACAC 1864 het 1864 ref 10 5 5 0 A 6 5 34972 CASAVA_Build 5 175774040 1D CTATAGAATC T/- TTTTTTTTTT 2564 het 582 hom 28 3 14 11 T 17 16 34973 CASAVA_Build 5 175801501 2I CCAGCAACAA --/TC TCTACAAAGA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 TC 1 2 34974 CASAVA_Build 5 175805596 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1290 hom 19 3 15 1 A 10 9 34975 CASAVA_Build 5 175816184 2I GCAGTCCACC --/CA CCTTGGCCTC 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 CA 0 1 34976 CASAVA_Build 5 175832327 2D TCATCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 1893 het 1151 hom 12 4 6 2 A 16 14 34977 CASAVA_Build 5 175834054 1D TTTCTTAGCA C/- CCCCCTTCCC 3070 het 3070 ref 46 23 21 4 C 6 5 34978 CASAVA_Build 5 175846281 1D AAACTACTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 10 9 34979 CASAVA_Build 5 175851376 2I ATTTTAATTG --/TA TATGTAATAG 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 TA 1 2 34980 CASAVA_Build 5 175884669 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 41 het 17 0 14 3 A 10 9 34981 CASAVA_Build 5 175898301 7D GGTGGGCCAT GGGGCAG/------- GGGGATGGGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 GGGGCAG 1 0 34982 CASAVA_Build 5 175898485 3I TGATTAACAA ---/TTG TTGTCCTTAG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TTG 1 2 34983 CASAVA_Build 5 175903983 2I CTTTCTTTCC --/TT TTTTTTTCTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 7 9 34984 CASAVA_Build 5 175904045 18I14M4I TTTCTTTCTT ------------------TCTTTCTCTCTTTC----/TCTTTCTTTCTCTCTTTCTCTTTCTCTCTTTCCTTT CTTTTTTTGA 3070 hom 24 het 9 0 9 2 N/A 0 0 34985 CASAVA_Build 5 175907007 2D TTGAAGGCAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 27 0 20 8 AT 8 7 34986 CASAVA_Build 5 175915396 1D CGCCTGTAAT C/- CTTCGGGAGG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 C 2 1 34987 CASAVA_Build 5 175915517 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 8 7 34988 CASAVA_Build 5 175916622 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TTTTTTTTTT 879 het 72 hom 9 1 7 1 TCTT 1 0 34989 CASAVA_Build 5 175916756 8I ACGAGTAGCT --------/AGGACCAC AGGACCACAG 3070 hom 38 het 19 0 11 8 AGGACCAC 1 2 34990 CASAVA_Build 5 175916805 3D TAATAATATT TTG/--- TTGTTTTGCT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 TTG 2 1 34991 CASAVA_Build 5 175917294 8D TTGATTTTTT TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 3050 hom 27 het 14 0 10 4 TTTC 6 4 34992 CASAVA_Build 5 175919321 1D AATTCCTGCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 7 34993 CASAVA_Build 5 175920598 1D AGGGCACACT G/- GGGGAGGAGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 5 4 34994 CASAVA_Build 5 175921960 1I AAACAGAGGA -/G GGCTGCACGG 3070 hom 77 het 29 0 25 4 G 2 3 34995 CASAVA_Build 5 175926780 1I TGCACAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 18 6 T 14 15 34996 CASAVA_Build 5 175944901 1D AATGCCATTA T/- TTTACAAGAT 3070 hom 154 het 57 0 52 7 T 4 3 34997 CASAVA_Build 5 175947811 2D GTGCACGCCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 174 het 61 0 55 6 GT 6 5 34998 CASAVA_Build 5 175947971 2I TGAGTGTATT --/TG TGTGTGAGTG 3070 hom 107 het 50 0 30 20 TG 3 4 34999 CASAVA_Build 5 175948080 2I36M2I GAGTGTATGT --GAGTGTGAGAGGATAAGTGTGTGAGGGTGTGTATGA--/GAGAGTGTGAGAGGATAAGTGTGTGAGGGTGTGTATGAGT GTGTGTGCAT 1052 het 1052 ref 22 13 6 20 N/A 0 0 35000 CASAVA_Build 5 175948146 2I58M2I GTGTTAGGGT --GAGTGAGTGTATGTGTGAGTGGGACAGTGTGTGAGAGTGTGTGTGAGGGTGTGTATGA--/GAGAGTGAGTGTATGTGTGAGTGGGACAGTGTGTGAGAGTGTGTGTGAGGGTGTGTATGAGT GTGTGTGTGC 3070 het 563 hom 32 4 10 45 N/A 0 0 35001 CASAVA_Build 5 175948245 2I AGGGTGAGAC --/TG TGAGTGTGAG 3070 hom 101 het 55 0 33 22 TG 1 2 35002 CASAVA_Build 5 175951567 3I TGATGATGAC ---/GAT GGTGGTGGTG 3070 hom 140 het 87 0 36 51 GAT 0 1 35003 CASAVA_Build 5 175958726 24D ATCCACCTTT CTCAAAGACCCAGGATCCTCCTTC/------------------------ CTCGGTGACA 3070 hom 135 het 42 0 44 8 CTCAAAGACCCAGGATCCTCCTTC 1 0 35004 CASAVA_Build 5 175994281 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1426 het 883 hom 26 5 11 10 T 13 14 35005 CASAVA_Build 5 176003812 1D CTGTGGAAAA G/- GTGGGTCTTG 3070 het 3070 ref 30 10 10 10 G 2 1 35006 CASAVA_Build 5 176026658 1I GCCTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 4 A 11 12 35007 CASAVA_Build 5 176030695 3D TTGACTACTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 24 1 13 10 T 17 14 35008 CASAVA_Build 5 176032220 1D ACTTGGGGCT G/- GGGGGGGCAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 8 7 35009 CASAVA_Build 5 176033253 1I TGTAGCCCCC -/T GGTGCCCCCC 3070 hom 63 het 25 0 19 6 T 0 1 35010 CASAVA_Build 5 176041693 7D AGTGGAAAAA GAAAAAG/------- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 GAAAAAG 1 0 35011 CASAVA_Build 5 176054326 1I TGTCCTTCTC -/A AAAGCCAAAG 3070 hom 71 het 27 0 23 4 A 3 4 35012 CASAVA_Build 5 176065368 8I CTGGGTTCCC --------/CTGCCTGG CTGCCTGGGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CTGCCTGG 1 2 35013 CASAVA_Build 5 176067582 1I GAGACAACAG -/C CCCCAGTGAC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 4 5 35014 CASAVA_Build 5 176068575 2I CTGCAGGTCC --/CT CTCTGCTCCC 3070 hom 112 het 43 0 36 7 CT 2 3 35015 CASAVA_Build 5 176076212 1I AAGCTGGGCA -/G GGGGGGTCCC 3070 hom 60 het 21 0 19 2 G 6 7 35016 CASAVA_Build 5 176083890 1D ACCTTTTTCG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 82 het 30 0 27 3 T 8 7 35017 CASAVA_Build 5 176097702 1I AGCACCCAGA -/G GGGGGAGTCC 3070 hom 65 het 23 0 22 1 G 5 6 35018 CASAVA_Build 5 176126596 1I CTTTTTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 11 12 35019 CASAVA_Build 5 176131637 1D GTCAGAATCC T/- GAGATGAGGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 0 35020 CASAVA_Build 5 176136940 1I TTGAACTGTG -/C CCCCCAAAAA 3070 hom 88 het 33 0 29 4 C 5 6 35021 CASAVA_Build 5 176155044 1D TCCACACACA C/- AAAAAAATAG 3070 hom 53 het 20 0 18 2 C 1 0 35022 CASAVA_Build 5 176156173 1D CCACCCTAAA C/- CCCCCCCTTT 3070 hom 87 het 36 0 25 12 C 8 7 35023 CASAVA_Build 5 176159989 2I TGGGTGTGGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 161 het 65 0 46 19 GT 6 7 35024 CASAVA_Build 5 176160922 2I TGTGTGTTTC --/TG TGTGTGTGCA 641 het 641 ref 67 42 3 22 TG 4 5 35025 CASAVA_Build 5 176171214 1I TCCCTTGGGA -/G GGGGCTTGGG 3070 hom 75 het 35 0 24 11 G 4 5 35026 CASAVA_Build 5 176190169 2D ATGTGTCCTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 92 het 44 0 29 17 GT 9 8 35027 CASAVA_Build 5 176221432 10I AGCCCCAGGG ----------/GAGGCCAGGC AGGCTGAGGA 3070 hom 54 het 20 0 17 3 GAGGCCAGGC 0 1 35028 CASAVA_Build 5 176241477 2I GTGTGCACTC --/AG GGCAGAAGGC 3070 het 3070 hom 40 14 12 14 AG 0 1 35029 CASAVA_Build 5 176261345 12D AGACTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2828 het 2382 hom 23 10 8 8 A 25 13 35030 CASAVA_Build 5 176270740 43D AAGAAAAGAA AAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAG/------------------------------------------- AAAATTCAGG 2317 het 2317 ref 10 8 6 5 AAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAG 1 0 35031 CASAVA_Build 5 176293135 1D CTAGTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2920 hom 43 10 17 16 T 13 12 35032 CASAVA_Build 5 176297848 1I CTTCCACAGT -/A AAAAAAAAAA 1236 het 1236 ref 21 9 5 7 A 13 14 35033 CASAVA_Build 5 176301456 1D TGGTACAGAC T/- TTTTTTTTTT 1139 het 1139 ref 30 18 3 9 T 12 11 35034 CASAVA_Build 5 176308610 1I ACTTTTTTTT -/A AAAATATTTT 3042 het 3042 ref 26 11 12 3 A 4 5 35035 CASAVA_Build 5 176326897 1D TTTCACATCC A/- AAAAAAAAAA 1628 het 1628 ref 40 29 5 6 A 13 12 35036 CASAVA_Build 5 176354563 1I ACTCTGGGGC -/G GGGGTGTGGG 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 G 4 5 35037 CASAVA_Build 5 176356748 2D TTATCTTTAA CT/-- CTCTTTCCCT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 CT 3 2 35038 CASAVA_Build 5 176379536 1I CTCCGTCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1774 hom 20 6 9 5 A 13 14 35039 CASAVA_Build 5 176385231 2D TTTCCTAAAG AC/-- TGATAATACT 3070 het 3070 hom 43 18 18 10 AC 1 0 35040 CASAVA_Build 5 176387573 4D TTTTCTTTGT GGAA/---- AGGTATTTGA 2986 het 2986 ref 17 8 7 3 GGAA 1 0 35041 CASAVA_Build 5 176395381 1I TAGCTGGGAC -/T ACAGGCACCT 1774 hom 12 het 5 0 5 0 T 0 1 35042 CASAVA_Build 5 176397688 1D CCCATGATGA T/- TTTTTTTTTT 2139 het 2139 ref 39 13 7 19 T 17 16 35043 CASAVA_Build 5 176403893 1I TAATGTGTGA -/G GGGGGGCCAT 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 G 6 7 35044 CASAVA_Build 5 176416936 5I TTTCTTTTAA -----/GTTTT GTTTTTTCTC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 GTTTT 1 2 35045 CASAVA_Build 5 176419217 3I GTTACTGAAA ---/TCC TCCTCTGCTT 3070 hom 94 het 35 0 32 3 TCC 1 2 35046 CASAVA_Build 5 176423524 1D AAAAAGCCTC T/- AATTCTGTAA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 T 1 0 35047 CASAVA_Build 5 176429060 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1873 hom 27 6 14 7 A 13 14 35048 CASAVA_Build 5 176448198 1I GCAGTGGTCA -/C CCGATTCCTT 3070 hom 93 het 37 0 29 8 C 2 3 35049 CASAVA_Build 5 176448422 7I51M1D CAACACTCTG -------CGTGCCGACGCACGTTCTCTCTTTTATCCTCAAAACAGTCCTATGAGGATAG/TGTGCCCAGTGCCGACGCACGTTCTCTCTTTTATCCTCAAAACAGTCCTATGAGGATA- TAAGCCAGAG 3070 hom 90 het 31 0 30 20 N/A 0 0 35050 CASAVA_Build 5 176459646 4D TTCTCTCTCT CCTC/---- CCTCCCTCCC 2557 hom 22 het 20 0 8 13 CCTC 5 4 35051 CASAVA_Build 5 176462677 2D AGCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2403 het 146 hom 22 3 10 9 A 16 14 35052 CASAVA_Build 5 176462970 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 28 3 9 18 A 13 11 35053 CASAVA_Build 5 176464925 1D AGTTTTAAAG A/- AGTCAATAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 2 1 35054 CASAVA_Build 5 176484798 1D TACTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 28 0 15 13 T 13 12 35055 CASAVA_Build 5 176488188 1I GGACTCAGGG -/A AAAATGGCTG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 4 5 35056 CASAVA_Build 5 176503990 1D TAAGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 30 1 25 4 T 11 10 35057 CASAVA_Build 5 176527143 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1319 het 1319 ref 20 17 3 2 A 13 12 35058 CASAVA_Build 5 176605581 1D TTTTTTATTT A/- TTTTTTTTTT 3018 hom 27 het 10 0 10 0 A 1 0 35059 CASAVA_Build 5 176614404 1D GTTTTGTATT A/- AAGTTTTGCA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 A 3 2 35060 CASAVA_Build 5 176621980 1D TGGCCAAGGT G/- GGGAGGATTG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 G 4 3 35061 CASAVA_Build 5 176627561 1D TTGTGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 27 2 18 8 T 17 16 35062 CASAVA_Build 5 176636736 1D CTTTACTCCA T/- TTTTTTTTTT 1260 het 1260 ref 36 19 4 14 T 17 16 35063 CASAVA_Build 5 176640941 1I TTGTATAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 32 3 19 10 T 14 15 35064 CASAVA_Build 5 176673172 1D AGCCACCGTT C/- CTGGCCGGGA 3070 hom 34 het 14 0 10 4 C 2 1 35065 CASAVA_Build 5 176675169 1D TCTGGAACGC A/- CCCCCCCCCC 2970 hom 32 het 13 0 10 3 A 1 0 35066 CASAVA_Build 5 176683639 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 2045 hom 12 het 6 0 5 1 A 10 9 35067 CASAVA_Build 5 176687127 1D CATTTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 16 3 A 13 12 35068 CASAVA_Build 5 176690562 2I10M2I GGACGAGGAA --GACAAGATCA--/GTGGGAAGGACACC TCGGCTCAGC 3070 hom 60 het 21 0 18 4 N/A 0 0 35069 CASAVA_Build 5 176693459 3D GACCAGCAGC ACG/--- ACTTCTTCCA 3070 hom 73 het 26 0 23 4 ACG 1 0 35070 CASAVA_Build 5 176712853 1D TTTTTTACCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 26 2 15 9 A 15 14 35071 CASAVA_Build 5 176715888 1D ACATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1739 hom 23 5 17 1 A 11 10 35072 CASAVA_Build 5 176717370 2I GTGCGTGAAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 18 het 25 1 16 8 GT 6 7 35073 CASAVA_Build 5 176736574 1D GCCATGATTT C/- CTCTGAGACT 2878 het 1617 hom 22 5 7 10 C 2 1 35074 CASAVA_Build 5 176772691 1I TGCACAGAAG -/C CCTGAATGCA 3070 hom 78 het 33 0 25 8 C 2 3 35075 CASAVA_Build 5 176805469 1D CTTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 34 1 22 11 T 11 10 35076 CASAVA_Build 5 176852494 4D AGTCACACTG CTTA/---- TTTATTCACT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 CTTA 1 0 35077 CASAVA_Build 5 176859626 5D TATTGCACTC AAAAT/----- AAAACTGAAG 2964 het 2964 ref 30 20 9 3 AAAAT 1 0 35078 CASAVA_Build 5 176859828 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1757 het 553 hom 14 5 6 3 T 12 11 35079 CASAVA_Build 5 176862778 3D AGCAGGAGCA GAG/--- GAGGGAACGC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 GAG 2 1 35080 CASAVA_Build 5 176867822 1D AGCCCAATCG C/- CCCCCTGCTC 3070 hom 47 het 22 0 12 10 C 6 5 35081 CASAVA_Build 5 176870516 1I GCCTGTGCCG -/T TCCCTGCCTA 3070 hom 138 het 50 0 44 6 T 1 2 35082 CASAVA_Build 5 176909475 5D AATCCTTACT TATTA/----- TAATTTTTAA 3070 hom 81 het 28 0 27 4 TATTA 1 0 35083 CASAVA_Build 5 176910877 1D TTGTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 11 10 35084 CASAVA_Build 5 176939390 18D TGAACTCCTG ACCTCAGGTGATCTGACC/------------------ ACCTCAGGTG 3070 hom 47 het 12 0 15 6 ACCTCAGGTGATCTGACC 2 1 35085 CASAVA_Build 5 176939636 6D CTTTACAAAT ATAATA/------ ATAATTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 ATA 3 1 35086 CASAVA_Build 5 176942914 1D GCCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 24 0 17 7 T 14 13 35087 CASAVA_Build 5 176950086 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1398 hom 46 4 29 13 T 11 12 35088 CASAVA_Build 5 176951046 1I GTAAGGATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 8 9 35089 CASAVA_Build 5 176956720 1I CTTCCACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 719 hom 32 5 21 6 A 10 11 35090 CASAVA_Build 5 176957332 1I TCTCCATGTC -/A AAAAAAAAAA 1837 het 1837 ref 29 16 7 6 A 16 17 35091 CASAVA_Build 5 176975456 2D TACGTTGATG CT/-- CTGTTGTTAG 3070 hom 114 het 44 0 38 7 CT 2 1 35092 CASAVA_Build 5 176988324 1I ATTATGTGGG -/T TGGTAGAATT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 1 2 35093 CASAVA_Build 5 176989521 2D GTCTCTACTA GT/-- AAAGTACAAA 2878 hom 21 het 9 0 8 2 GT 1 0 35094 CASAVA_Build 5 177002544 3I AAAATTGTTC ---/ATA ATATTTCCTG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 ATA 1 2 35095 CASAVA_Build 5 177028198 1D CTCTCCTGGG T/- TTTTTTCCAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 6 35096 CASAVA_Build 5 177041805 4I AATTAAGATA ----/CCCC AGCCACTGCA 1431 het 1431 ref 29 20 4 5 C 0 4 35097 CASAVA_Build 5 177043000 22D TGTTCAACGT GTGTGTGTGTGCGCTCACACGC/---------------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 43 41 16 4 GTGTGTGTGTGCGCTCACACGC 1 0 35098 CASAVA_Build 5 177048985 4D CTTGCTGCTG CTCA/---- CTCACTCTTT 2406 het 2406 ref 32 21 7 5 CTCA 2 1 35099 CASAVA_Build 5 177051160 1D TTTGCCTTAC A/- GGCCATCTCT 3070 het 3070 ref 70 40 22 8 A 1 0 35100 CASAVA_Build 5 177052407 1I GAGCTCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 10 11 35101 CASAVA_Build 5 177057554 3D GTGGTTGTTG CTC/--- CTCTTCTTTT 2306 het 2306 ref 22 11 7 6 CTC 2 1 35102 CASAVA_Build 5 177059496 1D CCAAAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2327 hom 27 9 10 8 A 11 10 35103 CASAVA_Build 5 177061201 6I AAAAAATAAA ------/TAAAAT TAAAATTACC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TAAAAT 1 2 35104 CASAVA_Build 5 177066757 2D GAAAAGTAAC AA/-- AGACCAGACT 1813 het 1813 ref 46 40 4 4 A 3 1 35105 CASAVA_Build 5 177072461 1D TGCCAAGCTG A/- AAGACTTTTC 3070 het 3070 hom 54 22 29 4 A 3 2 35106 CASAVA_Build 5 177073934 1D TTAAAATTGC T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 T 7 6 35107 CASAVA_Build 5 177081572 3D GAAAGCACAA AAG/--- AAGTCTATCA 3070 het 3070 ref 31 19 12 1 AAG 2 1 35108 CASAVA_Build 5 177082921 2I TACATTTGAA --/AG AGTGAAAAAC 464 het 3 hom 4 0 1 6 AG 1 2 35109 CASAVA_Build 5 177085888 1I CTCTATTCAC -/A AAAAAAATGC 1602 het 1602 ref 15 8 4 3 A 7 8 35110 CASAVA_Build 5 177086835 2D TGCAGGGATG CC/-- ACAACAAAAA 1647 het 1647 ref 23 12 5 7 C 2 0 35111 CASAVA_Build 5 177094739 1D GTGCACACCA C/- GCAGTGCAGG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 C 1 0 35112 CASAVA_Build 5 177096389 1I CAAGATTTTC -/A ATTGTTTTTG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 2 35113 CASAVA_Build 5 177103208 3D CTCAGTTTCC CAG/--- CAGAACTCGC 1798 het 1798 ref 15 9 4 2 CAG 2 1 35114 CASAVA_Build 5 177120919 1D TTACAATCAA T/- TTTTTTTTTT 1479 het 1479 ref 38 23 4 11 T 11 10 35115 CASAVA_Build 5 177126050 4I ATAATATAAC ----/AAAA GAAAGACCAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 0 4 35116 CASAVA_Build 5 177138417 4D ATAAATAAAT AAAC/---- AAATGATTGT 1745 het 1745 ref 20 14 4 3 AAAC 1 0 35117 CASAVA_Build 5 177138897 2D CTTTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 45 het 30 0 17 16 GT 8 7 35118 CASAVA_Build 5 177139799 2I AAGTAAATGA --/TT TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 8 10 35119 CASAVA_Build 5 177143673 1D CGTAAAAGAT A/- AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 38 28 9 1 A 6 5 35120 CASAVA_Build 5 177144469 1D CACTTTTTTT A/- ACCTGTTAAA 3070 het 3070 ref 39 30 7 2 A 2 1 35121 CASAVA_Build 5 177153207 2D TGTAAAGAAA AC/-- ACACCTATGG 2874 het 2874 ref 18 11 6 2 AC 3 2 35122 CASAVA_Build 5 177165036 4I GGAGAGACAG ----/AGAC AGACAGACAG 3070 hom 48 het 21 0 16 5 AGAC 3 4 35123 CASAVA_Build 5 177192552 2D CTAAGAGATA GT/-- ATCATCCTTA 2853 hom 15 het 7 0 6 1 GT 1 0 35124 CASAVA_Build 5 177200971 1I CCCAGCCTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 9 10 35125 CASAVA_Build 5 177201062 4D CTTTCTCAAA ATTG/---- ATTGTTTGCT 1333 het 1333 ref 42 37 4 2 ATTG 2 1 35126 CASAVA_Build 5 177217200 8I CTTTCCTCCC --------/AGTCTAAT AGTCTAATTA 1422 het 1422 ref 19 14 3 2 AGTCTAAT 1 2 35127 CASAVA_Build 5 177227052 2D TAGGGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2712 hom 17 het 14 0 8 6 T 14 12 35128 CASAVA_Build 5 177234680 1I ATTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2083 het 1435 hom 15 7 6 2 A 11 12 35129 CASAVA_Build 5 177244820 2D TAGTGAGTGA TG/-- TGTTGAGCAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TG 2 1 35130 CASAVA_Build 5 177258282 3I CATCTGTATG ---/TCT TCTTTGGTGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TCT 1 2 35131 CASAVA_Build 5 177260050 2D TGTTATATGC AT/-- AGACTGTTTA 1396 het 1052 hom 7 3 3 1 AT 1 0 35132 CASAVA_Build 5 177263034 5I TTAGAAGGAA -----/CCTTC CTTTGTAACA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 CCTTC 0 1 35133 CASAVA_Build 5 177263413 1I TTTCCTAATG -/C CCCCTTCCCA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 4 5 35134 CASAVA_Build 5 177266320 4I AGAAACTTGA ----/CGCC CGCCGGGCAT 2732 het 2732 ref 41 32 6 3 CGCC 1 2 35135 CASAVA_Build 5 177269132 1I GGTTTGCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 786 hom 23 3 18 2 T 9 10 35136 CASAVA_Build 5 177269232 3I AATGCTTTTT ---/ATG TCTGTGTAAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 ATG 0 1 35137 CASAVA_Build 5 177275127 1D TAACCAAGTA T/- TTTTTAATGC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 6 5 35138 CASAVA_Build 5 177275449 1I TCTTAGGGGG -/A AGACATCCAG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 A 1 2 35139 CASAVA_Build 5 177275619 1D GAGCATATGA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 27 het 17 0 10 7 T 7 6 35140 CASAVA_Build 5 177277034 3I GATAGAGGAT ---/TAG TATCATTTCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TAG 0 1 35141 CASAVA_Build 5 177277573 1D GCTCACTGGA G/- CCTTTGCCTC 2338 hom 10 het 7 0 5 2 G 1 0 35142 CASAVA_Build 5 177283757 1I AGGGGACTTC -/T GTTTTCAATG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 0 1 35143 CASAVA_Build 5 177288073 2I CCTTAGAGAT --/AG AGTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 AG 1 2 35144 CASAVA_Build 5 177289076 1D TTTTTTTTTT C/- CTGTGGTGAG 3070 het 1313 hom 26 5 17 4 C 2 1 35145 CASAVA_Build 5 177295416 3D TACCTTCTGA CCT/--- CCTTGACCAG 3070 het 3070 hom 42 9 31 3 CCT 2 1 35146 CASAVA_Build 5 177299579 2D CGCGAGCAGC GG/-- GGCTGGTGCC 1619 hom 9 het 7 0 5 3 G 4 2 35147 CASAVA_Build 5 177302902 1I GAGGGAAGGG -/C CCCCCCCCAC 2815 het 162 hom 20 1 11 8 C 8 9 35148 CASAVA_Build 5 177305490 4D TGTGATGCAG TAAC/---- TAACTGCACC 1275 het 1275 ref 29 19 5 7 TAAC 2 1 35149 CASAVA_Build 5 177306001 5I TAAAATCAAT -----/AAAAG TAAAGTGCAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AAAAG 0 1 35150 CASAVA_Build 5 177306319 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 18 1 13 4 T 12 13 35151 CASAVA_Build 5 177307502 4I CTGCTCATTT ----/TTTG TTTGTTTCTT 3070 hom 77 het 30 0 23 7 TTTG 1 2 35152 CASAVA_Build 5 177309642 2D CGTTTTGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 9 5 A 14 12 35153 CASAVA_Build 5 177309710 2I TGTTAGTTGT --/CA CAGTTACCAC 3070 hom 27 het 25 0 12 13 CA 1 2 35154 CASAVA_Build 5 177313470 2I TTCATCAATA --/AG AGAGTAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AG 2 3 35155 CASAVA_Build 5 177313789 1I GGGGAATGGA -/G GGAGGGTGAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 G 2 3 35156 CASAVA_Build 5 177315812 4I AATAAAGAGA ----/CACT CACCCATCCC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 CACT 0 1 35157 CASAVA_Build 5 177316744 6D ACCCTGTCTC AAAAAT/------ AAAATAGTAA 3070 hom 48 het 17 0 15 4 AAAAAT 1 0 35158 CASAVA_Build 5 177318673 16D GCAATGGGAA AACGGGCTTTCCCTGG/---------------- AATCCCGTTC 3070 hom 85 het 28 0 29 3 AACGGGCTTTCCCTGG 1 0 35159 CASAVA_Build 5 177319267 2D TCGACTCTAA CT/-- CTCCCCTTTC 3070 het 1608 hom 27 9 12 7 CT 2 1 35160 CASAVA_Build 5 177320263 3I AAGAGGAGTC ---/AGT GGGATTTAGC 3070 hom 108 het 45 0 34 11 AGT 0 1 35161 CASAVA_Build 5 177325473 1D AACAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 37 0 30 7 A 11 10 35162 CASAVA_Build 5 177327375 2D CCTTCTTTCA TC/-- TCTCTCTCTC 1143 hom 22 het 21 0 8 13 TC 10 9 35163 CASAVA_Build 5 177333424 1I ACGCTGTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 15 3 A 11 12 35164 CASAVA_Build 5 177336060 3I12M1I TACTGAAAAA ---AAAAACAAAAAC-/AACAAAAACAAAAACA AAAAAAAATT 1179 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 35165 CASAVA_Build 5 177343088 1D ACATCCACAT A/- ACCTGGGCAA 3070 hom 114 het 40 0 36 4 A 2 1 35166 CASAVA_Build 5 177346454 1I TACCTTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 A 10 11 35167 CASAVA_Build 5 177349266 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 29 2 22 5 A 15 14 35168 CASAVA_Build 5 177350986 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 9 8 35169 CASAVA_Build 5 177354515 3D CCTGGCAACT CTA/--- CTGTCTGCCC 3070 het 3070 ref 44 22 15 8 CTA 1 0 35170 CASAVA_Build 5 177359775 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 709 hom 29 2 21 6 A 10 11 35171 CASAVA_Build 5 177361404 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 het 2110 hom 20 6 12 2 T 4 5 35172 CASAVA_Build 5 177371017 1I CACCTTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 20 15 4 T 9 10 35173 CASAVA_Build 5 177375530 4I CTTCTTTGTT ----/GATG ATTGTTGCTG 3070 het 3070 ref 27 14 7 6 GATG 0 1 35174 CASAVA_Build 5 177383229 4D CATATATGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 1232 hom 26 6 11 9 TA 8 6 35175 CASAVA_Build 5 177394523 1D CTTCTGTGGC T/- TTCCTGATGG 1873 het 1873 ref 20 11 5 4 T 3 2 35176 CASAVA_Build 5 177399897 1I TGACCATAAG -/A TAATGGGGCC 3070 het 2604 hom 21 7 9 5 A 0 1 35177 CASAVA_Build 5 177407486 4D CACATATGAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 1983 hom 26 5 14 11 TG 9 7 35178 CASAVA_Build 5 177419260 1D TTGAACCTGC T/- TTTTTTTTTT 1184 het 334 hom 13 2 6 5 T 13 12 35179 CASAVA_Build 5 177421702 4I CCTGGCCTAA ----/GTAT ATATTTATTT 661 het 661 ref 19 3 2 14 GTAT 0 1 35180 CASAVA_Build 5 177421730 3I TGTTTGAATT ---/CTC CTTTTTGTAC 3070 hom 36 het 22 0 13 9 CTC 0 1 35181 CASAVA_Build 5 177429261 4I AAAAACACAC ----/AAAA AATTATCCAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 2 6 35182 CASAVA_Build 5 177437789 1I CACAAAAAAA -/G TCTTCTCCTG 3070 hom 83 het 35 0 28 7 G 0 1 35183 CASAVA_Build 5 177438608 2I29M4D TTTGAAATGT --TGATTTTTTGAGTTGGTTATTAGTTTTTCTTTT/TCTGATTTTTTGAGTTGGTTATTAGTTTTTC---- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 21 1 17 4 N/A 0 0 35184 CASAVA_Build 5 177439034 1D CTCAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 7 6 35185 CASAVA_Build 5 177439302 1I GGTGCTGGCC -/A GGGACAGTGG 3070 hom 30 het 12 0 10 3 A 0 1 35186 CASAVA_Build 5 177441276 1D TCAGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 557 hom 40 5 15 20 A 15 14 35187 CASAVA_Build 5 177449318 1D TCTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2092 hom 17 het 17 0 7 10 A 17 16 35188 CASAVA_Build 5 177472198 1I ACATCAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1689 hom 24 7 12 5 T 11 12 35189 CASAVA_Build 5 177476000 5I TAATCCAGTC -----/AGAGA AGTCAGCCAG 3070 hom 65 het 26 0 19 7 AGAGA 0 1 35190 CASAVA_Build 5 177485891 3D GTTCAAGCAG TTC/--- TTCTGCCTCA 1335 het 435 hom 6 2 3 1 TTC 2 1 35191 CASAVA_Build 5 177494427 1D TACAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 2836 het 2836 ref 20 10 9 1 A 13 12 35192 CASAVA_Build 5 177494790 2I GGTCTCACTC --/TG TTGCTCAGGC 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 TG 0 1 35193 CASAVA_Build 5 177502906 1D TGGTAAAAGT A/- AAAGATTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 4 3 35194 CASAVA_Build 5 177509992 1D CCAGCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2182 hom 28 8 10 10 T 12 11 35195 CASAVA_Build 5 177527234 4D GGCTCTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2616 het 2616 ref 25 14 6 7 TTTG 3 2 35196 CASAVA_Build 5 177532062 1I AAAAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 651 hom 16 5 9 2 C 0 1 35197 CASAVA_Build 5 177537679 4D ATAGCAGGTG AGTT/---- AGTTGCTTGC 3070 hom 100 het 36 0 34 2 AGTT 2 1 35198 CASAVA_Build 5 177543984 1D ATTAAGAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 8 7 35199 CASAVA_Build 5 177551775 1D CTCAGCCTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 8 35200 CASAVA_Build 5 177552102 2I AGAAAGAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 46 het 23 0 16 7 AG 7 8 35201 CASAVA_Build 5 177557288 10D TTATATATAT ACATATATAC/---------- ACATATATAC 3070 hom 27 het 12 0 10 3 ACATATATAC 2 1 35202 CASAVA_Build 5 177562246 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2457 hom 24 10 8 7 A 10 9 35203 CASAVA_Build 5 177562299 1I CTGTGTTTAC -/A AAAAAATTCG 2988 het 2988 ref 22 11 7 4 A 6 7 35204 CASAVA_Build 5 177563445 4D AAAGGAAGAA AAAG/---- AAAGACAAAT 2673 het 2673 ref 17 11 6 1 AAAG 2 1 35205 CASAVA_Build 5 177569597 1D CCCAGGGCCC T/- TATACACCAG 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 2 1 35206 CASAVA_Build 5 177586586 3D AAAGCCAAAA AAG/--- AAGAAGTGAT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 AAG 3 2 35207 CASAVA_Build 5 177591232 1D TTCTGGTGGC G/- GGGGGGAAAT 3070 hom 39 het 28 0 11 17 G 7 6 35208 CASAVA_Build 5 177602800 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAAGAG 2184 het 2184 ref 20 11 6 3 AAAC 2 1 35209 CASAVA_Build 5 177614553 1I CCAGGAACAC -/T TACCTTGAGG 3070 het 3070 ref 40 16 18 6 T 1 2 35210 CASAVA_Build 5 177617844 10D CTGTCTTAAA ATATATATAT/---------- ATATATATAT 2911 het 282 hom 16 4 8 5 AT 13 8 35211 CASAVA_Build 5 177660646 4I TCTTTCTCTC ----/TCTT CTCTGCTTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TCTT 0 1 35212 CASAVA_Build 5 177664924 1I ACACTGCAAA -/C CCAGTGGAAC 3070 het 3070 hom 57 24 24 9 C 2 3 35213 CASAVA_Build 5 177665019 1D TTGGGCCCAG T/- TGGCCCGGGG 2919 het 2919 ref 37 10 11 19 T 2 1 35214 CASAVA_Build 5 177665926 2I GGCTTAGGGA --/AG AGTCCCTGGG 3070 hom 72 het 25 0 23 2 AG 1 2 35215 CASAVA_Build 5 177669310 1D AAGCCAGAGA C/- CCCCCCCCGG 3070 hom 40 het 21 0 14 7 C 9 8 35216 CASAVA_Build 5 177669547 1D GGAGGAAGGG C/- GGGGGGGAGA 894 het 333 hom 8 2 3 3 C 1 0 35217 CASAVA_Build 5 177673836 1D CTGCTTACGT C/- CCCCCCAGAG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 C 7 6 35218 CASAVA_Build 5 177679495 8I AGGCCTCCCC --------/CGCCCTAT CGCCCTATCT 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 CGCCCTAT 1 2 35219 CASAVA_Build 5 177679718 1D TTTGTTGTCA C/- ATTTTCCTCT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 C 1 0 35220 CASAVA_Build 5 177682192 1I5M18D GCTGCCAAAC -GAGCTGGCTCCTGCCTGGGGGTC/TGAGGT------------------ CCTGACCCCT 1607 het 1607 ref 22 16 6 5 N/A 0 0 35221 CASAVA_Build 5 177684941 16I GACAGCGCTC ----------------/CCTGGCCAAGGCCCTT CCTGGCCAGC 2839 het 2588 hom 33 8 11 14 CCTGGCCAAGGCCCTT 0 1 35222 CASAVA_Build 5 177689544 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 30 1 16 14 A 16 15 35223 CASAVA_Build 5 177695803 2D AAAAAGCTAA AC/-- ACAGAGTTAC 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 AC 2 1 35224 CASAVA_Build 5 177696600 1I CACTCCTCCC -/G CGGAGCCAGC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 0 1 35225 CASAVA_Build 5 177701664 1D GCTCCATGGC A/- GGGGGACCGC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 1 0 35226 CASAVA_Build 5 177702402 4D AAGAAAAAAA AAAC/---- AAACAAACAG 3070 het 3070 ref 34 18 11 7 AAAC 3 2 35227 CASAVA_Build 5 177704918 10I AATCACTTGG ----------/AGTTATACTA AGCAATTCGG 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 AGTTATACTA 0 1 35228 CASAVA_Build 5 177705745 1I TAGATTTGTT -/A AAAAAAAAAT 2802 het 2802 ref 24 13 7 4 A 9 10 35229 CASAVA_Build 5 177709476 1I CCTGACTGGA -/G GGGGGACCTC 3070 hom 57 het 23 0 15 8 G 5 6 35230 CASAVA_Build 5 177714884 1I AACCTCAAAT -/A AAAATAAGAT 3070 hom 48 het 26 0 16 10 A 4 5 35231 CASAVA_Build 5 177715987 1I AGCTGTTATG -/A AAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 6 7 35232 CASAVA_Build 5 177716228 1D GAGACACAGG A/- AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 8 7 35233 CASAVA_Build 5 177753187 1I TCAGATCATG -/T TGAGACCAGC 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 T 1 2 35234 CASAVA_Build 5 177754384 1D AGCAGGGCTA G/- AATTACAAGG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 G 1 0 35235 CASAVA_Build 5 177760081 1I CGTCAGCCCC -/A AAACTCCCTC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 3 4 35236 CASAVA_Build 5 177769097 2I ATTTACACTA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 54 21 22 11 GT 7 8 35237 CASAVA_Build 5 177771146 1D TAATCCAGAC A/- AAAGGTGTTG 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 A 4 3 35238 CASAVA_Build 5 177772631 1I CCATTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 36 0 25 11 A 11 12 35239 CASAVA_Build 5 177774018 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 13 12 35240 CASAVA_Build 5 177774744 1D CCAGTGAGCT G/- GGCTGCTTGG 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 G 3 2 35241 CASAVA_Build 5 177809865 3I CGCAAGGATC ---/AAA GTTTTCCCCT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 0 3 35242 CASAVA_Build 5 177816350 1D ATTGTACTAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 2934 hom 18 6 11 1 A 9 8 35243 CASAVA_Build 5 177818245 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2174 het 2174 ref 28 12 7 10 A 11 10 35244 CASAVA_Build 5 177818267 8D ACAAGAAACA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 2395 het 2395 ref 28 16 9 6 AAAC 5 3 35245 CASAVA_Build 5 177827797 11D GATGAACACA CCCACCCAGAC/----------- CCCACCCAGA 3070 hom 59 het 38 0 22 16 CCCACCCAGAC 3 2 35246 CASAVA_Build 5 177830401 1I CTCCTGTCTC -/A AAGGAGCCCA 3070 hom 94 het 35 0 25 10 A 2 3 35247 CASAVA_Build 5 177830857 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 T 9 8 35248 CASAVA_Build 5 177831141 1D CCACTGTGCC T/- TGGCCTGCTT 3070 hom 96 het 33 0 32 1 T 2 1 35249 CASAVA_Build 5 177832679 23D3M10D GCAGTGAGCT GTGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA/-----------------------CCT---------- GCAAGACTCT 3070 het 3070 hom 21 14 14 1 N/A 0 0 35250 CASAVA_Build 5 177834132 1D GTGAGATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 18 8 A 11 10 35251 CASAVA_Build 5 177846150 1I GGGAGGGTTG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 48 23 10 15 A 7 8 35252 CASAVA_Build 5 177849183 3I CAGGAAGCAG ---/GGC TTCATCACAG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 GGC 0 1 35253 CASAVA_Build 5 177858533 1D CATCTCTTCT A/- AAAAAAAAAA 943 het 943 ref 24 21 3 0 A 15 14 35254 CASAVA_Build 5 177862956 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAACA 1347 het 1347 ref 47 38 3 7 A 9 8 35255 CASAVA_Build 5 177864864 1I TCCCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1166 hom 30 4 14 12 T 11 12 35256 CASAVA_Build 5 177870281 13D CAATAATAAT AAAATAAAAAATA/------------- AAAATAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 3 AAAATAAAAAATA 2 1 35257 CASAVA_Build 5 177873480 1D TAAAAAATTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 7 35258 CASAVA_Build 5 177877341 1D GCTAATTTTT G/- TATGTTTAGT 2129 het 1798 hom 11 4 5 2 G 1 0 35259 CASAVA_Build 5 177881178 2D AAAAAAAAAA AC/-- TATTTAAAGC 1257 het 1034 hom 14 11 3 1 AC 1 0 35260 CASAVA_Build 5 177894130 1D CTCACACCTG T/- TAATCCCAGC 3070 het 2992 hom 21 9 8 6 T 2 1 35261 CASAVA_Build 5 177928147 4D CAATCACCCC CTCT/---- ATTTTCAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 6 CT 2 0 35262 CASAVA_Build 5 177931208 1D CTGGCAGAAG A/- ATAAGAAGTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 A 2 1 35263 CASAVA_Build 5 177933466 1D CATAGGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2610 hom 36 10 20 6 T 11 10 35264 CASAVA_Build 5 177933978 3D ATCTGTGATT TTA/--- TTGTGTGTAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 TTA 1 0 35265 CASAVA_Build 5 177934795 1D TCCTCCTTTA G/- GAAACAGGAA 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 G 2 1 35266 CASAVA_Build 5 177953626 1D CTAAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 20 1 15 4 A 13 12 35267 CASAVA_Build 5 177956435 1D TGCCTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1585 het 207 hom 23 4 6 14 T 17 16 35268 CASAVA_Build 5 177966731 1I AAGAGACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2294 hom 25 7 13 5 A 13 14 35269 CASAVA_Build 5 177980143 9D ACAGGCTATG GACAGGGTA/--------- GACAGGATGA 3070 hom 99 het 35 0 34 3 GACAGGGTA 1 0 35270 CASAVA_Build 5 177981430 1I GAAACAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 10 11 35271 CASAVA_Build 5 177991207 2D CTGGATATAC AG/-- AGACATTTGC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 AG 2 1 35272 CASAVA_Build 5 177991672 2D AGGGTTACTC TT/-- TATTTTAATG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 3 1 35273 CASAVA_Build 5 178015042 1D GGCAATTTTT G/- TTGGCTATTT 3070 hom 88 het 38 0 29 10 G 1 0 35274 CASAVA_Build 5 178020365 32I GCTCGGTCTT --------------------------------/CCGGGTTCACACCATTCTCCCGCCTCAGCCTC CCGAGTAGCT 3070 hom 45 het 15 0 16 1 CCGGGTTCACACCATTCTCCCGCCTCAGCCTC 0 1 35275 CASAVA_Build 5 178022814 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 T 9 10 35276 CASAVA_Build 5 178029358 1I GAGGAACTTT -/C CCCTGGTATG 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 C 3 4 35277 CASAVA_Build 5 178035512 5D ATGATCATGG GTTTA/----- TTTTCTTTAT 3070 het 3070 hom 48 23 24 4 GTTTA 1 0 35278 CASAVA_Build 5 178041354 1I GAGTTTAGCC -/T TTTTTTTTTC 2380 het 1808 hom 20 7 7 6 T 9 10 35279 CASAVA_Build 5 178047387 14I CTTTGTCTCA --------------/AAAAAAAAGAAAAG AAAAAAAAGA 1940 het 1940 ref 14 8 4 2 AAAAAAAAGAAAAG 1 2 35280 CASAVA_Build 5 178047556 1I ATATATCCAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 A 7 8 35281 CASAVA_Build 5 178048784 1I GGCAGGACTT -/C CTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 1 2 35282 CASAVA_Build 5 178058052 1I ATTAGGGATG -/C CCCTCAGAAC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 3 4 35283 CASAVA_Build 5 178092405 1D CTTCAGGAAG A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 7 6 35284 CASAVA_Build 5 178093426 4I TGCCAGGCCC ----/TAAA TAAACACCCC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TAAA 1 2 35285 CASAVA_Build 5 178093486 1D TGCAACCTTA C/- CCCCAACAAC 1503 het 1503 ref 22 10 4 8 C 5 4 35286 CASAVA_Build 5 178094374 2D CTTTGTGTGC AT/-- AAGTTCTGAT 3070 het 3070 ref 43 28 13 2 AT 1 0 35287 CASAVA_Build 5 178095054 5I TTAAGTTCCT -----/TATAA TATATGATAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 TATAA 0 1 35288 CASAVA_Build 5 178098662 1D GTCATTAAAT C/- CCGGAATTTT 3070 het 3070 hom 55 25 28 4 C 3 2 35289 CASAVA_Build 5 178099159 2I34M1D TAGCATATCT --TGTGTCTTCATTAAACAAGGACAGAGCCTAGTGAC/TCTGTGTCTTCATTAAACAAGGACAGAGCCTAGTGA- CCCCCCCATT 3070 het 3070 ref 48 39 20 4 N/A 0 0 35290 CASAVA_Build 5 178103304 5I ATTAAACTTC -----/TTAAA TTAAAGAGCT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 TTAAA 1 2 35291 CASAVA_Build 5 178103821 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1725 het 1008 hom 20 7 8 5 A 15 14 35292 CASAVA_Build 5 178106938 28D ACTTGCCCAC ATCAAATCAAAAACAAATGGGATAAGAA/---------------------------- ATAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 21 9 14 4 ATCAAATCAAAAACAAATGGGATAAGAA 1 0 35293 CASAVA_Build 5 178108467 1I TGTAGAAATT -/A AGAGTGTGGA 2634 het 2634 ref 28 17 6 5 A 1 2 35294 CASAVA_Build 5 178112271 2I AATTTGAAAA --/AC ACAAACTAAT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 AC 1 2 35295 CASAVA_Build 5 178122853 2I TTCTGTGGGG --/CC TTCTCTGGGA 3070 hom 74 het 33 0 24 9 C 0 2 35296 CASAVA_Build 5 178165630 4I TCTCAAGAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 1936 hom 19 6 10 3 AAAC 2 3 35297 CASAVA_Build 5 178169878 1I CGCCACTGCA -/C TCCATTCTGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 C 0 1 35298 CASAVA_Build 5 178170093 4D ATGTTTTGTC TTGA/---- TTAATCACCA 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 TTGA 1 0 35299 CASAVA_Build 5 178180148 7I AGATATTTGC -------/CTCTATG TTCATCACAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 CTCTATG 0 1 35300 CASAVA_Build 5 178184983 2D ATCTCATCAG AT/-- TGTCCAACAG 3070 het 3070 ref 44 18 20 7 AT 1 0 35301 CASAVA_Build 5 178185206 1D CAAGACCCAC G/- GGGAAGTGAG 3070 het 3070 hom 46 15 25 8 G 4 3 35302 CASAVA_Build 5 178186095 6I ATTCCAATAC ------/TCAGAT TCAAACAGAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 TCAGAT 0 1 35303 CASAVA_Build 5 178186154 21I TCCATAAGAA ---------------------/AAAAGGCTTAGATTCAATCTT AAAAACCTTT 3070 het 3070 hom 23 7 15 3 AAAAGGCTTAGATTCAATCTT 0 1 35304 CASAVA_Build 5 178188893 6D ATAAGTGTAC ATGTGT/------ ATGTATATAA 3070 het 3070 ref 51 31 18 3 ATGTGT 1 0 35305 CASAVA_Build 5 178189110 3I TCTGCCCCTC ---/CTT CTCTCTCCTT 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 CTT 0 1 35306 CASAVA_Build 5 178190119 3I TGAAGAACAC ---/GAT GATGATGATG 3070 het 3070 ref 43 17 11 15 GAT 5 6 35307 CASAVA_Build 5 178190662 3I CCATTGCTGT ---/CAC CGCCACAACC 1860 het 1860 ref 27 8 7 12 CAC 0 1 35308 CASAVA_Build 5 178190940 7I CTGGCCTCCT -------/GACCTGG GACCTGGGAT 2686 het 2141 hom 23 7 7 9 GACCTGG 1 2 35309 CASAVA_Build 5 178193112 2I19M1D AGATGGAAAA --AGAGTGATGAGAGAGTAATG/AGAGAGTGATGAGAGAGTAAT- GGGGGTGAGC 3070 het 3070 hom 29 13 17 6 N/A 0 0 35310 CASAVA_Build 5 178193804 1D GATTCTCTTC T/- TTTTTTTTCT 2385 het 2385 ref 24 17 5 2 T 9 8 35311 CASAVA_Build 5 178193959 7I TTTAGGAAGA -------/CAAAGAG TTGTATTTGG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 CAAAGAG 0 1 35312 CASAVA_Build 5 178194718 1D TAAAGCTTTG T/- TATGCTCTGT 1862 het 1862 ref 34 22 4 8 T 2 1 35313 CASAVA_Build 5 178195059 3D AGATGTTTAC ATT/--- ATAAAATCAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 ATT 1 0 35314 CASAVA_Build 5 178195225 4D GATTTATTTT TCTG/---- TCTGTGTCCA 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 TCTG 2 1 35315 CASAVA_Build 5 178195532 2D ACACATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 AT 6 5 35316 CASAVA_Build 5 178197263 8D ACACACACAC ACACACAT/-------- ATATATGTAT 3070 het 3070 hom 30 10 16 6 ACACACAT 1 0 35317 CASAVA_Build 5 178198768 2D CTGAAGTAGC AA/-- GGCTCCTGGA 928 het 928 ref 14 7 4 3 A 2 0 35318 CASAVA_Build 5 178206129 1I AATCAAGCAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 T 7 8 35319 CASAVA_Build 5 178206988 2I TACAATAGCC --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 A 8 10 35320 CASAVA_Build 5 178207615 8D TGGGAGTGGC TCTAGTGT/-------- TTGAACGTCA 3070 het 3070 ref 47 29 17 3 TCTAGTGT 1 0 35321 CASAVA_Build 5 178207868 2D GCTTCTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 T 12 10 35322 CASAVA_Build 5 178208810 4D AATGTGGTGG TGAC/---- TGACTCCCCA 3070 hom 138 het 49 0 45 4 TGAC 2 1 35323 CASAVA_Build 5 178209450 1D CTACTTTTTT A/- TTTTTTTTAA 3070 hom 38 het 27 1 23 3 A 1 0 35324 CASAVA_Build 5 178211590 1I ATTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1865 hom 27 7 12 8 A 13 14 35325 CASAVA_Build 5 178212859 1D GTCTGTGGGA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 7 35326 CASAVA_Build 5 178213091 2D TTAGAGCTGT GC/-- CCCACACATT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GC 1 0 35327 CASAVA_Build 5 178214590 8D TGGTCTCAAA CTTCTGAC/-------- CTTAAGCAAT 3070 hom 111 het 38 0 37 4 CTTCTGAC 1 0 35328 CASAVA_Build 5 178216897 2D ATTTTCATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 19 0 11 8 T 13 11 35329 CASAVA_Build 5 178217811 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 264 hom 36 2 28 6 A 9 8 35330 CASAVA_Build 5 178218539 4I CATCAACAGA ----/TACT TAGTTGTTTC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 TACT 0 1 35331 CASAVA_Build 5 178221275 4I CGCAGGACAC ----/AGAG AGAAGACCCC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 AG 1 3 35332 CASAVA_Build 5 178223004 1D AAGATTAAAA C/- CTAGCTGAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 C 2 1 35333 CASAVA_Build 5 178241246 4I CAGCTACTTC ----/AGTG AGTGAGTTTT 3070 hom 109 het 41 0 37 4 AGTG 1 2 35334 CASAVA_Build 5 178249060 1D CTGGTGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3030 hom 36 11 18 8 T 14 13 35335 CASAVA_Build 5 178260767 5D TGTGGATATA TACTT/----- TAATTTCTCT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 TACTT 1 0 35336 CASAVA_Build 5 178261384 1I TGGAAAATGC -/T ATCTTGTGGT 3070 hom 30 het 33 0 13 20 T 0 1 35337 CASAVA_Build 5 178262201 8D TGATGTTTGC TGATAATT/-------- TGATTCAGAT 3070 het 3070 ref 37 21 16 1 TGATAATT 1 0 35338 CASAVA_Build 5 178265262 2D GGGAAAATGA CT/-- CATACTAAAT 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 CT 1 0 35339 CASAVA_Build 5 178265995 5D ATTCTCCCTT ATCTG/----- ATAACGTTAT 3070 het 3070 hom 55 27 27 3 ATCTG 1 0 35340 CASAVA_Build 5 178268466 1I GAGTGTTGGG -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 7 8 35341 CASAVA_Build 5 178275755 1D GGGCCCAGCA G/- GAGAACATGG 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 2 1 35342 CASAVA_Build 5 178279575 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1525 hom 24 5 10 9 A 13 12 35343 CASAVA_Build 5 178283980 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2788 hom 4 het 16 0 9 7 A 16 15 35344 CASAVA_Build 5 178284734 8D ATATATATAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 30 het 13 0 11 5 AC 12 8 35345 CASAVA_Build 5 178284991 12D CTGTTGCAAG GTGGAGTTACTA/------------ GTGGAGTTAC 3070 het 3070 hom 42 22 20 9 GTGGAGTTACTA 2 1 35346 CASAVA_Build 5 178290827 2D TGCATTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 41 1 29 11 T 14 12 35347 CASAVA_Build 5 178294648 2D TACTAAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 69 het 27 0 21 7 AC 10 9 35348 CASAVA_Build 5 178318628 1I ATCAGAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 39 1 25 13 T 10 11 35349 CASAVA_Build 5 178321425 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2984 het 1574 hom 23 7 11 5 A 16 17 35350 CASAVA_Build 5 178323733 1D GGCCTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 14 0 9 5 T 13 12 35351 CASAVA_Build 5 178342300 1D TGAAAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 40 1 34 6 A 12 11 35352 CASAVA_Build 5 178343897 9D GAGCGAGCGA GCACGCCTC/--------- ACTCGGAACG 3070 hom 81 het 28 0 27 2 GCACGCCTC 1 0 35353 CASAVA_Build 5 178351886 10I GGAAGCTGTG ----------/GGCAAGGTCT GTGTTTTGCG 3070 hom 89 het 31 0 27 4 GGCAAGGTCT 0 1 35354 CASAVA_Build 5 178352003 1I TGAACAAGGA -/C CCCCCAGCAG 3070 hom 99 het 36 0 31 5 C 5 6 35355 CASAVA_Build 5 178358809 1D CCCTCCATAG A/- CCCTCTGACT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 1 0 35356 CASAVA_Build 5 178363503 1I TGGTCTTGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 9 35357 CASAVA_Build 5 178365140 1D CAGAATGTAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 A 8 7 35358 CASAVA_Build 5 178371250 1I GCAAATGCCA -/C CCCCCCAAAA 3070 hom 54 het 29 0 19 10 C 6 7 35359 CASAVA_Build 5 178377476 1D GTTGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 11 0 8 3 T 12 11 35360 CASAVA_Build 5 178404045 1I GTTATCTTAT -/C CCCCCCCTTA 3070 het 2631 hom 25 8 11 6 C 7 8 35361 CASAVA_Build 5 178428232 1D AAAAGAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 16 12 T 15 14 35362 CASAVA_Build 5 178440354 4D CAAAGGTAGA CTCT/---- CTTTCTTTTA 3070 hom 57 het 30 0 20 11 CT 3 1 35363 CASAVA_Build 5 178441958 4I TTTAATTAAA ----/TCTT TCTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 TCTT 1 2 35364 CASAVA_Build 5 178442813 1I TCTGATTCAT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 33 16 8 9 A 7 8 35365 CASAVA_Build 5 178443140 3D TGATTGGATA AAG/--- AAGTGATGAA 3070 het 3070 ref 35 19 15 4 AAG 2 1 35366 CASAVA_Build 5 178443553 4I CTTTTCTTCC ----/CTCA CTATCTATCT 3070 hom 130 het 50 0 43 7 CTCA 0 1 35367 CASAVA_Build 5 178445429 4D CATCAGCTGA TGAG/---- TGAGTAGGCA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 TGAG 2 1 35368 CASAVA_Build 5 178446230 3D TGGAGATATC TCT/--- TCTTATTTTA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TCT 2 1 35369 CASAVA_Build 5 178447060 7D ACTGTGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2578 hom 27 het 12 0 8 6 A 19 12 35370 CASAVA_Build 5 178447962 5D TTCTTTTCTT TTTTA/----- GAGTTTCCAT 3070 hom 93 het 33 0 32 3 TTTTA 1 0 35371 CASAVA_Build 5 178449462 1D TGAGTTTTGT A/- AAAAAAACAA 2412 het 2412 ref 35 13 7 15 A 8 7 35372 CASAVA_Build 5 178450661 1I CCTTTATAAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2877 hom 22 8 11 3 T 8 9 35373 CASAVA_Build 5 178452484 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1807 hom 19 4 11 4 T 10 11 35374 CASAVA_Build 5 178457291 1I TATCCAGTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 9 10 35375 CASAVA_Build 5 178459413 1D CATTCATGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 51 hom 38 1 19 19 A 10 9 35376 CASAVA_Build 5 178486508 2D GTGGGACATG GT/-- GTGTATCCAG 3070 het 2926 hom 26 10 10 6 GT 3 2 35377 CASAVA_Build 5 178508574 1I TCTCTTTCCT -/G GGCACCATTA 3070 hom 78 het 28 0 20 8 G 2 3 35378 CASAVA_Build 5 178531129 1I CAGCCCAGAA -/C CCCCCCAGAG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 C 6 7 35379 CASAVA_Build 5 178550072 6D AAGGAGAAAA ACAGGT/------ ATTAAAGGAC 2796 het 2796 ref 26 18 7 3 ACAGGT 1 0 35380 CASAVA_Build 5 178563500 2D AGAGTCTGGA AC/-- ACCCACGTTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AC 2 1 35381 CASAVA_Build 5 178574143 3I CACATAAAAT ---/AAG AATGCAAAGA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 AAG 0 1 35382 CASAVA_Build 5 178583253 2D GCACACACAC AT/-- ACACTCACAG 3070 het 3070 hom 96 42 46 10 AT 1 0 35383 CASAVA_Build 5 178586730 2I GTGTGTACAC --/AT ATGTGTATAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AT 1 2 35384 CASAVA_Build 5 178592387 1D GCACAATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 T 11 10 35385 CASAVA_Build 5 178592992 1D GTGTCACATT A/- AAAAACAAAA 3070 hom 112 het 43 0 37 6 A 6 5 35386 CASAVA_Build 5 178602758 2D TATTTACTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 33 1 18 15 A 16 14 35387 CASAVA_Build 5 178603749 1I AAATTTGGTG -/A AAAACATTAA 3070 hom 110 het 41 0 37 4 A 4 5 35388 CASAVA_Build 5 178607412 1D AAGAAAAATT A/- AGACACTTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 1 35389 CASAVA_Build 5 178616137 4D GCGTGTGTGT GAGA/---- GAGAGAGAGG 3070 hom 101 het 39 0 31 8 GA 6 4 35390 CASAVA_Build 5 178630124 2I GGTCCCCTAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 92 het 49 1 40 8 AC 6 7 35391 CASAVA_Build 5 178647211 1D GTTGGAAGAC G/- GGGTATGCAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 G 4 3 35392 CASAVA_Build 5 178653219 4I AGGGTAGGGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 86 het 43 0 26 18 TTTG 3 4 35393 CASAVA_Build 5 178664663 1D TAAAATGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 A 15 14 35394 CASAVA_Build 5 178673669 1D ATGGTGGGGC G/- GGGGGGTTCC 3070 hom 57 het 25 0 15 10 G 7 6 35395 CASAVA_Build 5 178684536 1D TCCTCAGGGA C/- CCCCCCACTG 3070 hom 128 het 46 0 40 9 C 7 6 35396 CASAVA_Build 5 178701322 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2453 het 844 hom 21 6 10 5 A 18 13 35397 CASAVA_Build 5 178714187 1D GACCCAGACA C/- GCAGACGCAC 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 C 1 0 35398 CASAVA_Build 5 178719032 1D CCTGAAAGCC T/- TAACCACTCA 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 T 2 1 35399 CASAVA_Build 5 178719865 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2330 het 1517 hom 19 5 7 7 A 11 12 35400 CASAVA_Build 5 178736327 2D GAGAATCGCT TG/-- TGAACCTGGG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TG 2 1 35401 CASAVA_Build 5 178752191 1I AATGAAAACC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 35402 CASAVA_Build 5 178752522 4I TTTCTGTATG ----/ACAA ACAAAAACTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ACAA 1 2 35403 CASAVA_Build 5 178755510 2I ATGTTGGAAC --/AT GATAAACTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AT 0 1 35404 CASAVA_Build 5 178756647 2I CACACCCCCT --/CC CTATGAGCCA 3070 hom 151 het 55 0 51 5 C 1 3 35405 CASAVA_Build 5 178762093 1I AACTATGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 408 hom 28 1 24 3 A 9 10 35406 CASAVA_Build 5 178762864 1D AAATAAAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 10 9 35407 CASAVA_Build 5 178765401 1D CTCGCCCCCA C/- CCCCCAGGCT 3070 hom 65 het 31 0 20 11 C 6 5 35408 CASAVA_Build 5 178774961 5D TCTTGGTGCT GCTCA/----- GCTCAGTCAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 GCTCA 2 1 35409 CASAVA_Build 5 178794091 6D CAGGAATGAG TCTAAT/------ TATTTCACCA 3070 hom 48 het 18 0 17 3 TCTAAT 1 0 35410 CASAVA_Build 5 178795733 1D CCTGAGCTGT G/- GGGGGGACAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 7 6 35411 CASAVA_Build 5 178797882 1D CAACAACCAG A/- GCCGTCAGCT 3070 hom 44 het 18 0 13 5 A 1 0 35412 CASAVA_Build 5 178803597 1D GTGTGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 677 hom 28 3 19 7 A 15 14 35413 CASAVA_Build 5 178809085 1I GTCTTGGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 22 0 16 6 T 10 11 35414 CASAVA_Build 5 178813284 1I GATCCCCCCC -/A CCAGCTTCCA 3070 hom 80 het 30 0 25 5 A 0 1 35415 CASAVA_Build 5 178823044 1D TTTTTGCGAA T/- TTTTTTTTTT 374 het 265 hom 9 3 3 3 T 13 12 35416 CASAVA_Build 5 178826116 1D CTTATTAATG T/- TGACCTCGTG 3070 hom 96 het 38 0 31 7 T 2 1 35417 CASAVA_Build 5 178826375 1I TGTCTCTACT -/A AAAGTACAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 3 4 35418 CASAVA_Build 5 178829091 1I GGCATGGGAC -/A GGGGCCTCTC 2706 hom 44 het 17 0 12 5 A 0 1 35419 CASAVA_Build 5 178834148 1D GGATAAATAC A/- TTTTTTTGTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 1 0 35420 CASAVA_Build 5 178837240 1I AAGAAAAGAA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 T 7 8 35421 CASAVA_Build 5 178838815 1D TACAGGTGCA C/- CCCACCATGC 3070 het 2422 hom 20 7 11 2 C 4 3 35422 CASAVA_Build 5 178850214 2D CAGTTTTACC TT/-- TTTTTTTTTT 1175 het 314 hom 15 5 4 6 T 16 14 35423 CASAVA_Build 5 178856963 1D ACAGAATCAG A/- AAAAAAAAAA 2496 het 2496 ref 23 10 7 6 A 11 10 35424 CASAVA_Build 5 178860795 2D CAGATAGAAT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 A 11 9 35425 CASAVA_Build 5 178874718 1D TGGGAAAACT G/- TCTTCATCAT 3070 het 3070 ref 50 38 10 3 G 1 0 35426 CASAVA_Build 5 178880127 4D AAGAAAAGGG GAAA/---- GAAAGAATTA 3070 het 3070 hom 29 9 18 3 GAAA 2 1 35427 CASAVA_Build 5 178881386 8D TATATGTGTG TGTGTGTA/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 12 10 7 TGTGTGTA 1 0 35428 CASAVA_Build 5 178882870 1D AGGAAACCAG A/- AAAAGGTTAT 3070 het 1739 hom 19 4 10 5 A 5 4 35429 CASAVA_Build 5 178895934 1I TGAAGATTTT -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 36 0 29 7 C 0 1 35430 CASAVA_Build 5 178898999 23I ATAGTGTATT -----------------------/ACAAGTGTATTTCAAGTGTAATA GTACACTTGA 3070 hom 48 het 16 0 17 2 ACAAGTGTATTTCAAGTGTAATA 0 1 35431 CASAVA_Build 5 178904537 1I TTAAGCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 981 hom 30 4 19 7 T 14 15 35432 CASAVA_Build 5 178908435 4D TTGGCCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 24 het 12 0 9 4 AAAC 4 3 35433 CASAVA_Build 5 178909193 1D AATTTTAGTG T/- TTTTTCTGAG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 6 5 35434 CASAVA_Build 5 178909747 1D TCATTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 26 1 21 5 A 15 14 35435 CASAVA_Build 5 178915411 1D ATTTTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 18 2 13 3 T 15 14 35436 CASAVA_Build 5 178924292 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAAAAAAT 3070 het 2749 hom 27 10 14 3 G 1 0 35437 CASAVA_Build 5 178924375 3I AAAATGACAC ---/AGA ATGTACAGAA 2336 het 2336 ref 18 9 5 8 AGA 0 1 35438 CASAVA_Build 5 178944369 10D ACCCTGTTTC AAAAACAAAA/---------- AAAAACAAAA 1401 het 1401 ref 24 20 3 4 AAAAACAAAA 2 1 35439 CASAVA_Build 5 178962873 1D AATCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1751 het 1751 ref 17 7 6 4 A 12 11 35440 CASAVA_Build 5 178965348 1D GCGGAAGGCA T/- TTTAACAACT 3070 het 3070 hom 43 12 24 8 T 4 3 35441 CASAVA_Build 5 178970112 1I CGCGACCCTA -/C CCCTCCCTTC 3070 het 2456 hom 24 8 13 3 C 3 4 35442 CASAVA_Build 5 178971649 1D AGTCCTGGTA G/- GGGCAAGCAA 3070 hom 95 het 41 0 32 9 G 4 3 35443 CASAVA_Build 5 178972572 8D TTACTCAGAG ATGGTACC/-------- ATCAAGCCCC 2881 het 2881 ref 31 18 7 7 ATGGTACC 1 0 35444 CASAVA_Build 5 178976589 2I AAAGGCATAC --/AA AAGGTTAGCT 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 2 4 35445 CASAVA_Build 5 178978095 1I CCAGAAATTC -/A ACTCAATAAA 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 A 1 2 35446 CASAVA_Build 5 178987111 4I CCCTGATTTA ----/TGAT TGCCTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 TGAT 0 1 35447 CASAVA_Build 5 178991679 9D TTTGGGAGGC CGAGGCGGG/--------- CGGATCACGA 1132 het 4 hom 7 0 3 6 CGAGGCGGG 1 0 35448 CASAVA_Build 5 178991915 7D ACTCCGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAGAA 1533 het 1054 hom 11 4 6 3 A 14 7 35449 CASAVA_Build 5 179008522 3D CATTTTGCTT CTC/--- CTCAAGTTCC 2765 het 1751 hom 17 6 8 3 CTC 2 1 35450 CASAVA_Build 5 179023266 1I GATGACCAAA -/C TTTTTTCCTA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 0 1 35451 CASAVA_Build 5 179054690 4D GGAATCTTGC TCTG/---- TCTCCCAGGC 3070 hom 69 het 25 0 23 3 TCTG 1 0 35452 CASAVA_Build 5 179056561 2D AATTCGTATA AT/-- ATGTTTTCAT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 AT 2 1 35453 CASAVA_Build 5 179070878 1I AAATCTTAAG -/A AATTAACTGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 2 3 35454 CASAVA_Build 5 179072522 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 1755 hom 16 het 10 0 5 5 T 13 12 35455 CASAVA_Build 5 179089901 1D TCTTTTTAAA G/- TTTGTTCACT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 G 1 0 35456 CASAVA_Build 5 179098562 6D CTCATTGGCA TCTTAG/------ TCATCATTCT 3070 hom 71 het 26 0 24 4 TCTTAG 1 0 35457 CASAVA_Build 5 179098976 5D GAATAGAATA GAACG/----- GAACGGAACG 3070 hom 93 het 35 0 32 5 GAACG 3 2 35458 CASAVA_Build 5 179108462 2D AATTGGAACA AT/-- GTCTTCAAAA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 AT 1 0 35459 CASAVA_Build 5 179110013 1I TGTTTGCTTG -/T TTTCTCTGCT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 3 4 35460 CASAVA_Build 5 179115376 1D CCCAAGACAG T/- TTTTTTTTTT 1241 het 1241 ref 22 13 3 6 T 14 13 35461 CASAVA_Build 5 179120705 5I CGTCTCAAAA -----/AAAAG AAAAGATGGA 1057 hom 9 het 5 0 3 2 AAAAG 1 2 35462 CASAVA_Build 5 179123941 1I ACACCAGACA -/T GATTATGTTC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 0 1 35463 CASAVA_Build 5 179141043 1I AGACTGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 657 hom 25 2 20 3 T 11 12 35464 CASAVA_Build 5 179157173 1I GCCAACCGCA -/G GGGCAGAGGG 3070 hom 89 het 36 0 28 8 G 3 4 35465 CASAVA_Build 5 179172592 2D AAAACATGGT CC/-- CCCCCCCCCC 3039 hom 41 het 17 0 12 5 C 12 10 35466 CASAVA_Build 5 179181553 1D TCCTATTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 A 13 12 35467 CASAVA_Build 5 179186813 2D TGCTTGGGGT CA/-- CACTGTCTCA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 CA 2 1 35468 CASAVA_Build 5 179188426 1I GGGCTTACAC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 6 7 35469 CASAVA_Build 5 179189290 14I8M14D ATAGAGATAG --------------TTTTTTTATCTTTCCTCTCCTC/GAGGAGAGGAAAGATAAAAAAA-------------- CTAATGTAGG 3070 het 3070 ref 31 19 14 1 N/A 0 0 35470 CASAVA_Build 5 179200075 2I TACAAGAGTC --/CA CACAGCAGGG 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 CA 2 3 35471 CASAVA_Build 5 179217802 1D TGGCACGCTG A/- AAGTTAGGGA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 3 2 35472 CASAVA_Build 5 179219814 2D ATTTTCTGGC GT/-- GTGTGTGTGT 2183 het 2183 ref 47 34 5 8 GT 9 8 35473 CASAVA_Build 5 179220229 2I TCCCTTGCTG --/TA TAGCAAGCTC 3070 het 3070 ref 51 28 15 8 TA 1 2 35474 CASAVA_Build 5 179240405 2D CCTCTGGCCC CT/-- GTGATGTTAG 3070 het 3070 hom 21 10 11 1 CT 1 0 35475 CASAVA_Build 5 179245201 1D TCCCCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 1548 het 84 hom 11 2 6 4 A 11 10 35476 CASAVA_Build 5 179255695 2D TTTATCTTCT CA/-- CAGTTTCCTG 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 CA 2 1 35477 CASAVA_Build 5 179269677 2I TTTACCCCTC --/TT GTCTATTATA 3070 het 3070 ref 50 21 16 13 T 0 2 35478 CASAVA_Build 5 179280386 2I CATATATATT --/TA TATATATATA 1117 het 550 hom 6 2 4 0 TA 8 9 35479 CASAVA_Build 5 179284895 1D ATGGCCAACA G/- TTTAATCAGT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 G 1 0 35480 CASAVA_Build 5 179286158 1I GGGAGGCTGA -/G GCAGGGGAAT 2023 het 1760 hom 12 5 5 2 G 1 2 35481 CASAVA_Build 5 179286949 3D TATTGGCTAC ATA/--- ATGTTATTAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 ATA 1 0 35482 CASAVA_Build 5 179291823 1D ATTTTAAGTT C/- CATGTGTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 C 2 1 35483 CASAVA_Build 5 179295387 1I ATCATTTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 T 9 10 35484 CASAVA_Build 5 179298046 1I TTAATGAGTA -/G GGGGGTTTCT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 G 5 6 35485 CASAVA_Build 5 179298884 1D TTTAAGACAG A/- AAAAAAGTGG 3070 het 3070 ref 26 14 11 2 A 7 6 35486 CASAVA_Build 5 179305528 1I GGCGGGGGCA -/G GGGATATTTA 1383 hom 15 het 8 0 6 2 G 3 4 35487 CASAVA_Build 5 179312729 4I AAAATATGAG ----/AACT AATAAATGAG 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 AACT 0 1 35488 CASAVA_Build 5 179320452 1D AATTAAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 13 12 35489 CASAVA_Build 5 179340781 1I AAAGAACAGG -/T TATGTGAAGA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 1 2 35490 CASAVA_Build 5 179358714 12I CTGCAGCCTC ------------/TGCCTTGCAGGT TGCCTTGCAG 3070 het 2915 hom 24 8 15 1 TGCCTTGCAGGT 1 2 35491 CASAVA_Build 5 179363295 1I AAAGCCACTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 7 8 35492 CASAVA_Build 5 179375949 13I GGCCCAGTTT -------------/CAGGAGGGATACA CACGCCAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 CAGGAGGGATACA 0 1 35493 CASAVA_Build 5 179378796 4D CAAAACCATC CTGA/---- CTAACACGGT 3070 het 833 hom 14 2 9 3 CTGA 1 0 35494 CASAVA_Build 5 179380649 16I GTGCAGTGGC ----------------/GCAATCTCGACTCACT GCAATCTCTG 2625 het 2625 ref 27 18 7 3 GCAATCTCGACTCACT 0 1 35495 CASAVA_Build 5 179388169 4D ACCTGGGTCA GAAC/---- CCCTTTCGTA 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 GAAC 1 0 35496 CASAVA_Build 5 179389647 1I AGAGATGAGG -/A TTTCATCATG 3070 het 1488 hom 16 4 9 3 A 0 1 35497 CASAVA_Build 5 179393303 1D CTCTGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2970 hom 27 10 11 6 A 12 11 35498 CASAVA_Build 5 179393380 4D CTTTCAAGAC TTGT/---- TTATTACATC 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 TTGT 1 0 35499 CASAVA_Build 5 179393700 1I TGTTAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 12 13 35500 CASAVA_Build 5 179394198 5I TAGGAATTTG -----/TTCAT TTCATCTAAG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 TTCAT 1 2 35501 CASAVA_Build 5 179396452 4D CACTCAGCTT AAGA/---- AATAAAACAT 3070 het 3070 ref 28 15 13 2 AAGA 1 0 35502 CASAVA_Build 5 179406615 2D GGCAAAGAGT TC/-- TCTGTTTCAC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 TC 2 1 35503 CASAVA_Build 5 179415860 1D ATCTGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 A 13 12 35504 CASAVA_Build 5 179424534 2D TCCACTTACT TC/-- TCTCTAGGAT 3070 hom 102 het 36 0 35 3 TC 3 2 35505 CASAVA_Build 5 179425418 1D CAGAAAAAAA T/- GTTTCCTTCC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 1 0 35506 CASAVA_Build 5 179436748 14I GTGAAGAATT --------------/CAGTGAGGGCCAGG CACGGTGGCT 3070 het 2696 hom 23 10 10 4 CAGTGAGGGCCAGG 0 1 35507 CASAVA_Build 5 179475044 7D CGCCTGTGAA GGGCTGC/------- GGGCTGCGTG 2442 het 1928 hom 23 8 10 6 GGGCTGC 2 1 35508 CASAVA_Build 5 179482384 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAATC 2457 het 2457 ref 29 10 10 9 A 9 8 35509 CASAVA_Build 5 179483838 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 19 0 13 6 A 14 13 35510 CASAVA_Build 5 179486591 1D CTGAGAAGTG A/- AAAATGCAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 5 4 35511 CASAVA_Build 5 179506875 1D GCTTTTTAAA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 6 35512 CASAVA_Build 5 179507994 2D CATTTTGCTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 11 9 35513 CASAVA_Build 5 179510137 1D CCCAGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 21 2 11 8 A 13 12 35514 CASAVA_Build 5 179518753 1D TTTTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 18 0 9 9 T 11 10 35515 CASAVA_Build 5 179520274 1I TTTAAAGCTG -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 5 6 35516 CASAVA_Build 5 179521469 2D CTCACAGCCC CT/-- GTCACCGACT 2614 het 2614 ref 26 12 7 8 CT 1 0 35517 CASAVA_Build 5 179533519 3I ACTGTCTCAA ---/AAC AACAACCACC 1262 hom 10 het 7 0 3 4 AAC 2 3 35518 CASAVA_Build 5 179534087 2D67M2I38M2D TATGTGTGTC TGTGTGTGCGCGTGTGTGTCTGTGTGTGCGTGCGCGTACACACGTGTGTCTCTGTGTGTGCGTGTGTGC--GTGTGTCTGTGTGTGCACGTGTGTCTGTGTGTGCGCACGT/--TGTGCGCGCGTGTGTGTCTGTGTGTGCGTGCGCATACACACGTGTGTCTCTGTGTGTGCGTGTGTGCATGTGTGTCTGTGTGTGCACGTGTGTCTGTGTGTGTGCAC-- GTGTGTGTGT 3070 het 406 hom 44 9 68 15 N/A 0 0 35519 CASAVA_Build 5 179543100 1D AAGAAGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 31 1 26 4 A 11 10 35520 CASAVA_Build 5 179550970 1D TATTTACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 T 11 10 35521 CASAVA_Build 5 179552357 2D TTGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 782 hom 19 3 12 4 T 12 10 35522 CASAVA_Build 5 179563261 3D CACTAGGTCA ATG/--- ATAACTTAGT 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 ATG 1 0 35523 CASAVA_Build 5 179573136 1D GCACTTGTGT G/- AATGTGTGGT 3070 hom 199 het 70 0 66 4 G 1 0 35524 CASAVA_Build 5 179573202 4D27M3I GTTGTATGCT TGTGTATGTAGCGCTGTTTTGTGCACGTGTG---/----TATGTAGCGCTGTTTTGTGCACGTGTGTGC TGTATATATG 3070 het 2414 hom 53 8 14 38 N/A 0 0 35525 CASAVA_Build 5 179573300 4D31M4D GCTATGCACA TGTGTGTGTGCTGTGTGCATGTTGGTGCTGCGTGCATGT/----TGTGTGCTGTGTGCATGTTGGTGCTGCGTGC---- ATGTATGTTG 3070 het 3070 hom 65 29 42 26 N/A 0 0 35526 CASAVA_Build 5 179604385 2D GTCTCAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 24 1 16 7 A 18 16 35527 CASAVA_Build 5 179609053 1D AGCACACATG C/- CCCCCTCCCG 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 C 6 5 35528 CASAVA_Build 5 179613503 2D GGTCCAAGAG AC/-- ACCCATTCTT 3070 hom 93 het 36 0 29 7 AC 2 1 35529 CASAVA_Build 5 179621993 1D CTCCCCAAAG A/- GGTGTCTCAT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 1 0 35530 CASAVA_Build 5 179649653 2I TTGTAGAGAC --/AG AGATCTCGCT 3070 hom 98 het 39 0 30 9 AG 1 2 35531 CASAVA_Build 5 179653531 3I ATGGGTGCTT ---/CTC CTCATTAGGA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 CTC 1 2 35532 CASAVA_Build 5 179667194 2D ACTGAGGCTC AG/-- AGAGGCAAAA 3070 het 3070 hom 55 22 27 7 AG 3 2 35533 CASAVA_Build 5 179671324 1D GTGAACAGGG A/- ATTTCAGGTC 2965 het 2965 ref 28 19 9 0 A 2 1 35534 CASAVA_Build 5 179680790 1I TAGAAATATA -/T TTTTTTTGTA 2054 het 2054 ref 26 15 5 6 T 7 8 35535 CASAVA_Build 5 179692846 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2211 het 1949 hom 19 5 7 7 T 11 10 35536 CASAVA_Build 5 179699798 5D AGGTTTTTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 182 het 182 ref 25 12 4 11 TTTTG 1 0 35537 CASAVA_Build 5 179704433 1I GCTGGTCCCC -/T TGTTCCACTC 1938 het 1938 ref 23 9 9 5 T 1 2 35538 CASAVA_Build 5 179709485 1D ACAGTGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3049 hom 29 8 11 10 T 13 12 35539 CASAVA_Build 5 179710294 1D CAGAAAGTCA G/- CAAAATGCCA 3070 het 3070 hom 54 25 25 4 G 1 0 35540 CASAVA_Build 5 179751544 3I CATCACCATA ---/ATC ATCCTGATCG 3070 hom 103 het 40 0 30 10 ATC 1 2 35541 CASAVA_Build 5 179760389 1D ATTAGGAGAC A/- AATGCAAGTC 3070 het 3070 hom 43 18 17 9 A 3 2 35542 CASAVA_Build 5 179778778 3D AGGCTAAAGG AGA/--- AGAAGGAGGA 1449 het 1449 ref 10 4 3 3 AGA 2 1 35543 CASAVA_Build 5 179782824 1I TCTAGTAGGG -/T TTTTTTTTTG 2256 het 2256 ref 25 12 6 7 T 9 10 35544 CASAVA_Build 5 179785869 8D TCTTTGATTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2170 het 706 hom 20 4 10 6 T 22 14 35545 CASAVA_Build 5 179786886 1D CTGTTGCTCA T/- TTTTTTTTTT 1302 het 1302 ref 32 20 4 8 T 12 11 35546 CASAVA_Build 5 179790240 4I CAGAAATAAC ----/ACAA ACAAGTGAAT 3070 het 3070 ref 35 16 18 1 ACAA 1 2 35547 CASAVA_Build 5 179793783 1D AGAGGTGGAG T/- TTTGACTGTG 2381 het 2363 hom 13 6 6 1 T 4 3 35548 CASAVA_Build 5 179794118 1I TTCTTCTCGG -/T TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 57 32 20 5 T 4 5 35549 CASAVA_Build 5 179796359 3D GCAGCAGTGA GCG/--- GAACAGGATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 GCG 1 0 35550 CASAVA_Build 5 179801066 1D GATTCTGTCT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 8 7 35551 CASAVA_Build 5 179802670 3D CTGTCAACAC TTG/--- TTAATTTCTG 3070 het 3070 hom 52 19 27 8 TTG 1 0 35552 CASAVA_Build 5 179803829 3I AATTTATCTA ---/TTG TTGTTGTTGC 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 TTG 3 4 35553 CASAVA_Build 5 179859713 1D CTTTTTTTTT C/- CCCCCTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 9 C 6 5 35554 CASAVA_Build 5 179862284 4I23M1I TACAGGTGAT ----TAGGTGCATTGAGTGGTTGTATA-/TAGCTAGGTGCATTGAGTGGTTGTATAT TAGTTTTACT 3070 het 3070 hom 37 25 22 4 N/A 0 0 35555 CASAVA_Build 5 179874863 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1749 het 1749 ref 16 7 6 4 A 11 10 35556 CASAVA_Build 5 179875059 4D AGTGAGAAAA TAGT/---- TAGCTAAGTT 3070 het 3070 ref 37 27 9 3 TAGT 1 0 35557 CASAVA_Build 5 179875789 1D AAATTCAGGA T/- TTTTTTTTTT 638 het 637 ref 21 6 5 10 T 17 16 35558 CASAVA_Build 5 179877615 10D CCCATCTCCC CCTCTCTCCT/---------- CGTCTTGATT 3070 het 3070 ref 46 27 18 4 CCTCTCTCCT 1 0 35559 CASAVA_Build 5 179879373 1D TAATCGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 T 12 11 35560 CASAVA_Build 5 179879440 1D ATCCATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1825 hom 22 6 9 7 T 15 14 35561 CASAVA_Build 5 179882139 4D GCCAGCATCT GTTA/---- GTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 24 10 12 4 GTTA 1 0 35562 CASAVA_Build 5 179883059 1I TTGTCCCTAA -/T TTTCACTGAA 3070 het 3070 ref 34 16 17 1 T 3 4 35563 CASAVA_Build 5 179885527 1I TTTCTTCTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 0 1 35564 CASAVA_Build 5 179886490 1D ACCGTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2411 hom 30 9 12 9 T 17 16 35565 CASAVA_Build 5 179887696 1I TGTAGCCTGA -/T CTATCCATTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 0 1 35566 CASAVA_Build 5 179892946 1I ATATATATAT -/C ATATCACCGT 930 het 930 ref 15 6 3 6 C 0 1 35567 CASAVA_Build 5 179895778 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 9 8 35568 CASAVA_Build 5 179898626 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATGAGC 3070 het 2429 hom 20 6 10 5 A 6 5 35569 CASAVA_Build 5 179898902 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 9 10 35570 CASAVA_Build 5 179901815 11D TGTGCTGCTT AGGTTTTGCTG/----------- AGGTTTTGCT 1752 het 1752 ref 34 18 9 8 AGGTTTTGCTG 2 1 35571 CASAVA_Build 5 179902942 1D TGTGATAACA G/- GCGTGAGCCA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 G 2 1 35572 CASAVA_Build 5 179905638 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 8 10 4 T 9 10 35573 CASAVA_Build 5 179906828 5I TTCCTTACAG -----/TACAT TAAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 TACAT 0 1 35574 CASAVA_Build 5 179911998 2D ATAATCCCAG CA/-- CACTTTGGGA 1675 het 1675 ref 15 7 4 5 CA 2 1 35575 CASAVA_Build 5 179914124 3I AAAAGAACAG ---/TTT TTTTTTTTAA 3070 het 3040 hom 24 7 17 0 T 8 11 35576 CASAVA_Build 5 179914210 1I GGTTTGTAAT -/G TTTTTTTCTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 0 1 35577 CASAVA_Build 5 179916967 13I TACATTGTAA -------------/CCAGCAGTGCACG AGTGATTCAC 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 CCAGCAGTGCACG 0 1 35578 CASAVA_Build 5 179917512 4D CAAGGTTCTT TTTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 20 22 3 TTTG 1 0 35579 CASAVA_Build 5 179918227 2I CTTGTGTTTG --/CT CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 CT 1 2 35580 CASAVA_Build 5 179918411 11D TCAGTATATT TTATTTGTTTG/----------- TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 TTATTTGTTTG 1 0 35581 CASAVA_Build 5 179920571 4I TATCTATCAA ----/TCAG TCAATCAGTC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TCAG 0 1 35582 CASAVA_Build 5 179923007 1D TTTGTTTTTG C/- TTTTTTTTTC 2292 hom 21 het 8 0 8 0 C 1 0 35583 CASAVA_Build 5 179923540 1I GGCCCTGGGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 6 7 35584 CASAVA_Build 5 179931575 3D AGTCACATGA AAT/--- AATCTGTAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 AAT 2 1 35585 CASAVA_Build 5 179933488 5D AAGTTTCACT TGTTC/----- TGTTCTGTTC 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 TGTTC 3 2 35586 CASAVA_Build 5 179935499 1D GATTCTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 17 5 T 12 11 35587 CASAVA_Build 5 179938328 1I TTTACATAAA -/C CTAAATGGTG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 C 1 2 35588 CASAVA_Build 5 179939688 5I CGAGATAACA -----/ATGTT ATATCTACCG 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 ATGTT 0 1 35589 CASAVA_Build 5 179942463 1D CAAGAGCGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2739 hom 24 7 12 6 A 15 14 35590 CASAVA_Build 5 179974312 1D TCTGGACTGG C/- CTCTACCTCC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 C 2 1 35591 CASAVA_Build 5 179982533 2D CGCTGTGCAC CA/-- CCCCCCCCAA 3070 het 76 hom 27 2 13 12 CA 1 0 35592 CASAVA_Build 5 179985438 19D TGGGGGCTGT GGCTGTGCAGGGGACCTGA/------------------- GGCTGGAGCT 1438 het 1438 ref 30 13 6 15 GGCTGTGCAGGGGACCTGA 1 0 35593 CASAVA_Build 5 180008337 1I CAGAGCCACA -/T TCCCAACACA 2285 hom 50 het 22 0 10 12 T 1 2 35594 CASAVA_Build 5 180016160 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2647 het 559 hom 19 2 14 3 A 15 16 35595 CASAVA_Build 5 180026992 6D TTTTGTTTTG TTTTTT/------ TTTTTTTTGA 72 het 72 ref 20 3 2 15 T 14 8 35596 CASAVA_Build 5 180027950 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 757 hom 25 2 13 10 A 13 14 35597 CASAVA_Build 5 180045207 1I TAACTCATTA -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 T 7 8 35598 CASAVA_Build 5 180046930 1D TATTATTGGA T/- TTTTTTTTTT 1791 het 1791 ref 23 13 4 6 T 15 14 35599 CASAVA_Build 5 180055191 4D ATAGAGTGTG CAAA/---- CACACAGTTA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 CAAA 1 0 35600 CASAVA_Build 5 180065578 1D TTCATTCAGG T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 36 28 3 6 T 12 11 35601 CASAVA_Build 5 180096028 2D GAAGACAAAG GT/-- GCCAAGGTGT 3070 het 3070 hom 37 12 18 8 GT 1 0 35602 CASAVA_Build 5 180106422 2D GCTCAATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 13 11 35603 CASAVA_Build 5 180106775 1I TTTTTTTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 149 hom 25 1 19 5 T 9 10 35604 CASAVA_Build 5 180112186 1I GTCCTGGGTC -/G GGGGGATGGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 5 6 35605 CASAVA_Build 5 180113298 1I CCATGCACTG -/C CCCCCCCAGG 3070 hom 66 het 31 0 21 10 C 7 8 35606 CASAVA_Build 5 180154295 3D TGTGTGGTGG TGC/--- TGCCGGAGGT 3070 het 3070 hom 31 11 17 8 TGC 2 1 35607 CASAVA_Build 5 180154444 1I TGCCCCATTT -/C CTTTCTACTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 C 1 2 35608 CASAVA_Build 5 180158449 1I CCAGATCATC -/T TTTTCAAAAT 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 T 4 5 35609 CASAVA_Build 5 180160274 4D GGTCTGTCTT ACTC/---- ACTGGTCAAG 3070 het 3070 hom 55 26 24 5 ACTC 1 0 35610 CASAVA_Build 5 180161727 6I CAGCCTTCAG ------/GGAGAC GGAGCCGGCC 3070 het 3070 ref 40 15 17 8 GGAGAC 0 1 35611 CASAVA_Build 5 180163671 1I GCGCGCACCC -/T GCAGGCCCCT 3070 het 2592 hom 29 9 17 3 T 0 1 35612 CASAVA_Build 5 180164840 27D5M3D TTAGACCAGA TTATCCAGGAGGATAAACAGTCACAAGATTAGGCA/---------------------------ATTAG--- GAGGAACAAT 3040 het 3040 ref 30 23 8 4 N/A 0 0 35613 CASAVA_Build 5 180167996 1D TTCAGAAGTC T/- TCAATTATTA 3070 het 3070 ref 51 27 22 4 T 2 1 35614 CASAVA_Build 5 180172146 1I TCTTTCCAAA -/T TATTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 1 2 35615 CASAVA_Build 5 180177181 1D AAAGTACTTT G/- GGGAAAACCA 3070 het 3070 ref 31 21 9 1 G 4 3 35616 CASAVA_Build 5 180186365 1D AAGGAGAAAA G/- GGAACAGGAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 3 2 35617 CASAVA_Build 5 180200875 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAC 3070 het 46 hom 28 1 21 7 AT 5 4 35618 CASAVA_Build 5 180200927 2D ACATACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 25 het 13 0 10 3 AT 9 8 35619 CASAVA_Build 5 180206222 2I GTTCCTACTC --/CT CTCTCAGAAA 3070 hom 191 het 69 0 62 7 CT 2 3 35620 CASAVA_Build 5 180206983 2I ACCTGCTCCC --/CT GAGTTAGGAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 CT 0 1 35621 CASAVA_Build 5 180214193 1I TTATTTACAA -/G GGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 G 5 6 35622 CASAVA_Build 5 180216934 4D GAGTACTATT TTTG/---- TTTAAGCATT 3070 hom 108 het 38 0 36 3 TTTG 1 0 35623 CASAVA_Build 5 180221222 3D GGCGGGAAAT GGG/--- GGAATCCGGG 2766 hom 30 het 11 0 11 0 G 5 2 35624 CASAVA_Build 5 180223995 1I AGATTAAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 31 1 23 7 T 13 14 35625 CASAVA_Build 5 180225970 1D CATGGACAAA T/- TTAACAGACT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 2 35626 CASAVA_Build 5 180235301 1D AGTCTCTACT A/- AAAAAAATAC 3070 het 470 hom 13 1 11 1 A 8 7 35627 CASAVA_Build 5 180235461 1I AGCAAAACTC -/T GTGCAAAAAA 2678 het 150 hom 33 3 12 18 T 0 1 35628 CASAVA_Build 5 180237311 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 39 0 29 11 T 10 9 35629 CASAVA_Build 5 180239974 1I AGCTGTGGGC -/T TTTTTTATAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 6 7 35630 CASAVA_Build 5 180243421 2D CTTCCAATTA TG/-- TGGTCAATTT 2957 het 2311 hom 18 6 6 6 TG 2 1 35631 CASAVA_Build 5 180246508 4I TTTTTTGTTC ----/GTTT GTTTTGAGAA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 GTTT 1 2 35632 CASAVA_Build 5 180247054 5D TGGCCTATAG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2593 hom 40 13 18 14 T 17 12 35633 CASAVA_Build 5 180249409 1I GCTGTAAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 10 11 35634 CASAVA_Build 5 180255687 1I CTTTCTTTTT -/G TTACCGTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 0 1 35635 CASAVA_Build 5 180257592 2D ACTCATTTCC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 T 11 9 35636 CASAVA_Build 5 180261794 1D GATGTTTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 9 10 4 T 10 9 35637 CASAVA_Build 5 180269856 1I AAGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 A 11 12 35638 CASAVA_Build 5 180272034 6D CAACAGGATG TATATA/------ TATATATATA 3070 het 2300 hom 27 7 15 7 TA 8 5 35639 CASAVA_Build 5 180277215 1I CAGAATAATT -/A TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 0 1 35640 CASAVA_Build 5 180277635 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1319 het 338 hom 5 1 3 1 A 15 16 35641 CASAVA_Build 5 180280028 4I ACTCATATTT ----/TCCA TCCATCACAC 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 TCCA 1 2 35642 CASAVA_Build 5 180281681 1D TTATTTGGAT A/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 1 0 35643 CASAVA_Build 5 180284044 1D TTCCAAACAA C/- AGTACCATCT 3070 het 3070 hom 58 23 29 6 C 1 0 35644 CASAVA_Build 5 180292612 1D AATAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3036 hom 35 13 10 12 A 13 12 35645 CASAVA_Build 5 180293586 1I AAGGACACTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 9 10 35646 CASAVA_Build 5 180297549 1I TTCCCCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 11 12 35647 CASAVA_Build 5 180299950 1D ATCTCAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 A 15 14 35648 CASAVA_Build 5 180381415 1I ATAGAAACAA -/T TTTTTAGAAA 3070 het 3016 hom 27 10 13 4 T 5 6 35649 CASAVA_Build 5 180383272 1D TCCCCACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1750 hom 35 16 13 6 A 18 17 35650 CASAVA_Build 5 180385152 1D ATTCGATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2615 hom 32 11 15 6 A 12 11 35651 CASAVA_Build 5 180402873 2I TGGGTGTGTC --/TA TGTGTGTGTG 1422 het 1422 ref 37 24 5 8 TA 0 1 35652 CASAVA_Build 5 180411361 2D GGAAGAGGAA AG/-- AGTCTCTCTT 2045 het 2045 ref 20 13 6 1 AG 2 1 35653 CASAVA_Build 5 180420551 4I CACCATGCCC ----/AGCT AATTTTAAGT 3070 het 3070 hom 41 17 17 12 AGCT 0 1 35654 CASAVA_Build 5 180435160 1I GAAGGTTGTT -/G GGGGGGGGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 8 9 35655 CASAVA_Build 5 180439220 1D AGACAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 11 10 35656 CASAVA_Build 5 180439806 4D CCCTCTCTCG AAAA/---- AAACAAACAA 3070 hom 51 het 20 0 18 5 A 7 3 35657 CASAVA_Build 5 180440334 1I GATCAGGGGG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 6 7 35658 CASAVA_Build 5 180443562 3D CTCATAATGG AAT/--- ATTATTCAGC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 AAT 1 0 35659 CASAVA_Build 5 180446674 3D CGGTCCTGGG GGA/--- TCAGTGCTAA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 GGA 1 0 35660 CASAVA_Build 5 180447580 2I ACAACACATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 19 0 14 5 A 10 12 35661 CASAVA_Build 5 180465393 1D26M2D AGGGAAAGGG AAAAAAACCAAACTTGCTCTAACCCACCT/-AAAAAACCAAACTTGCTCTAACCCAC-- CTCTCCCTCC 3070 het 3070 ref 41 24 15 8 N/A 0 0 35662 CASAVA_Build 5 180477792 3D AAGTAAATGA AGG/--- AGATGAGCAA 596 het 596 ref 47 35 2 12 AGG 1 0 35663 CASAVA_Build 5 180479225 1D CACAGGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2086 hom 35 8 18 9 T 12 11 35664 CASAVA_Build 5 180528264 2D AACATACACG CA/-- CACACACACA 1775 het 1775 ref 52 39 4 11 CA 7 6 35665 CASAVA_Build 5 180530503 1D AAGCAACACT A/- AGCAAGAACT 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 2 1 35666 CASAVA_Build 5 180536361 1I CCTTTTTTTA -/T TTTAAACAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 3 4 35667 CASAVA_Build 5 180538306 2D TGGAGAGAAC AG/-- AGTTACCTGT 3070 hom 45 het 19 0 13 7 AG 2 1 35668 CASAVA_Build 5 180541659 2I CCCCGCCTCC --/TA TAGGAAAGGG 3070 hom 76 het 28 0 22 6 TA 1 2 35669 CASAVA_Build 5 180543524 1D ATCTTGCAAT G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 6 5 35670 CASAVA_Build 5 180546312 1I CCAGCATTAC -/A AAAAAATTCC 3070 hom 132 het 54 0 45 9 A 6 7 35671 CASAVA_Build 5 180551320 1I GAACTCGCGA -/C CCCTGGTTTA 3070 hom 75 het 27 0 23 4 C 3 4 35672 CASAVA_Build 5 180586484 1D TTTTCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 24 1 18 5 T 13 12 35673 CASAVA_Build 5 180615215 1D CAAATAACAC T/- TCATGAATCT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 T 2 1 35674 CASAVA_Build 5 180635174 1I CTGGATTAAG -/A AAAAAAACAA 1838 het 1838 ref 101 88 5 8 A 7 8 35675 CASAVA_Build 5 180635287 1I22M4D TTAGACTTTG -AAACTGGTCTTTCAAAGTAACCCAGT/AAAACTGGTCTTGCCAAGTAACC---- CAGACAAAAA 3070 het 3070 ref 73 37 32 21 N/A 0 0 35676 CASAVA_Build 5 180636757 3D CAGTAAGCAG ATT/--- ATTAGTTAGG 3070 het 3070 hom 67 25 35 7 ATT 2 1 35677 CASAVA_Build 5 180637441 1D ATTATGCAAG A/- AAAAAAGAAG 3070 het 3070 ref 49 30 15 6 A 7 6 35678 CASAVA_Build 5 180637885 1I TGGGAACCCA -/C CCCTTGCACA 3070 het 3070 ref 45 30 14 1 C 3 4 35679 CASAVA_Build 5 180639093 1I TAAATGTAGA -/T AAAAACATTC 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 0 1 35680 CASAVA_Build 5 180643336 7I CAGTGGTGGA -------/GGTGCAG CCAGGGCAAG 3070 het 3070 hom 73 25 29 19 GGTGCAG 0 1 35681 CASAVA_Build 5 180643369 7I CCTTCTCCTG -------/TGGTCTC CGGTCTCTGG 3070 het 3070 ref 73 22 13 39 TGGTCTC 0 1 35682 CASAVA_Build 5 180720667 1D ATTTTCTCCA C/- CCTGACATAT 2680 het 2680 ref 27 19 6 2 C 3 2 35683 CASAVA_Build 5 180723454 1I CCAAAAGGGC -/A GATAATAGAA 2818 het 2818 ref 17 7 6 4 A 0 1 35684 CASAVA_Build 5 180836861 1I TTCTGATTCC -/T TTTTTTTTCC 2325 het 2325 ref 49 39 5 5 T 8 9 35685 CASAVA_Build 5 180837466 1D TTTGTTAGCA T/- TTTTTTTTTC 1868 het 1868 ref 64 45 5 14 T 10 9 35686 CASAVA_Build 1 3520 2D TGGAGAAAAC AG/-- GGGAATCCCG 3070 het 3070 ref 51 20 18 14 AG 1 0 35687 CASAVA_Build 1 10180 1D AACATATAGG A/- AAAATCAGAG 2086 het 2086 ref 61 42 5 17 A 5 4 35688 CASAVA_Build 1 18455 2I ATGGTGGTTT --/GG TTTTTTTTTT 446 het 446 ref 21 7 2 12 G 0 2 35689 CASAVA_Build 1 46851 1I AAACTGATCC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 A 8 9 35690 CASAVA_Build 1 51153 1I GTCAATCCTA -/G TTTTCAAAAT 1920 het 1342 hom 9 3 4 2 G 0 1 35691 CASAVA_Build 1 52103 2D56M4I AGACACACAT ACACACACACACACACATATCTGTATATACAAATACACGTATAGCTTACATTTTAATT----/--ACACACACACACACATATCTGTATATACAGATACACGTATAGCTTACATTTTAATTCTTC CTTCATTTCA 3070 het 3070 ref 29 19 19 9 N/A 0 0 35692 CASAVA_Build 1 53599 3D TGGCCTTTCC CTA/--- CTAAGTCATT 3070 het 2048 hom 17 6 9 3 CTA 2 1 35693 CASAVA_Build 1 61710 1D AGAATCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1365 het 911 hom 7 3 3 1 T 15 14 35694 CASAVA_Build 1 63111 1D CTCCCCCTTG T/- TAGGTGAGAA 3043 het 3043 ref 22 13 7 2 T 2 1 35695 CASAVA_Build 1 81414 2D TTTAGTTTGC GT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 301 hom 14 1 9 4 GT 1 0 35696 CASAVA_Build 1 96802 2I CTCTCTCTTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 TC 6 7 35697 CASAVA_Build 1 220914 2D CCAGCCACCA GT/-- ATTGTGAACC 2636 het 2636 ref 19 12 6 1 GT 1 0 35698 CASAVA_Build 1 223549 1D CCAAGCTGTG C/- CCCGACCACC 1304 het 1304 ref 20 17 3 0 C 4 3 35699 CASAVA_Build 1 224245 1D AGCCACATCT C/- CCCAGGTCAG 2542 het 2542 ref 95 70 9 16 C 4 3 35700 CASAVA_Build 1 225479 1D GACTCATGTT G/- GGGGCAGCCC 1111 het 1111 ref 97 78 3 17 G 5 4 35701 CASAVA_Build 1 233714 4D TTCTTATCTC AAGT/---- GTCTTAAAAT 3070 het 3070 ref 67 52 10 6 AAGT 1 0 35702 CASAVA_Build 1 235120 1D ACTGTATTCA G/- GGGGAAAAAA 2923 het 2910 hom 19 10 7 2 G 5 4 35703 CASAVA_Build 1 352759 1D CTAGGAGCAA T/- TTTTTTTTTG 2499 hom 15 het 6 0 6 0 T 10 9 35704 CASAVA_Build 1 446960 1D ACTTTTAGAT G/- GTTTTTTTTT 2882 het 91 hom 9 1 7 1 G 2 1 35705 CASAVA_Build 1 515369 3I CATTTCTCAA ---/AAG AAGATGTACA 1399 het 1399 ref 26 21 3 2 AAG 1 2 35706 CASAVA_Build 1 521744 3D ATTCACACTC CTA/--- CACACCCAGA 1244 het 1244 ref 74 70 3 2 CTA 1 0 35707 CASAVA_Build 1 530642 8I CTATCCAACA --------/ACCATCCC ACCCTGGAAG 2148 het 2148 ref 23 10 6 7 ACCATCCC 0 1 35708 CASAVA_Build 1 537497 2I GTGTGACGGG --/GC GTGTGCTGTG 971 het 971 ref 22 17 4 1 GC 0 1 35709 CASAVA_Build 1 557103 1D TTACTACTCC G/- GGAAAAAAAG 3070 hom 48 het 21 0 16 5 G 3 2 35710 CASAVA_Build 1 582333 2D TGTTTTGTAT TG/-- TGTGTGTGTG 1386 het 1386 ref 30 20 3 7 TG 7 6 35711 CASAVA_Build 1 599625 1I AAAAACTGTA -/T TTTTTTTTGT 1887 het 1887 ref 19 12 4 3 T 8 9 35712 CASAVA_Build 1 615336 1I TTCTATTATC -/T GCCCTGTTGG 3070 het 3070 ref 62 36 23 3 T 0 1 35713 CASAVA_Build 1 713662 2D GATGAGAGAC AG/-- AGAGAAGGAG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 AG 3 2 35714 CASAVA_Build 1 727736 4I GTTGGGACAC ----/ACTT ACTCCACTTT 3070 het 3070 ref 52 36 10 6 ACTT 0 1 35715 CASAVA_Build 1 734814 2D GGTCTATCCC CT/-- GAGGTAAGGA 1637 het 1637 ref 44 36 4 5 CT 1 0 35716 CASAVA_Build 1 739926 1I ATTACATGAA -/G GGAGCAGCAG 3070 hom 24 het 11 0 8 4 G 2 3 35717 CASAVA_Build 1 740875 3I GGAAAAAAAA ---/AGG GAGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 40 27 12 1 AGG 0 1 35718 CASAVA_Build 1 743708 2D CTGGAGGCCC CT/-- GTGAGTAGTG 3070 hom 26 het 13 0 9 4 CT 1 0 35719 CASAVA_Build 1 751821 1I CAGAAAACCA -/T CTAAGGAATT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 0 1 35720 CASAVA_Build 1 765120 4I AAGGTGAAAT ----/AAAG AAATTTCAAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AAAG 0 1 35721 CASAVA_Build 1 765653 1D TTGTAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 33 1 19 14 A 15 14 35722 CASAVA_Build 1 768166 2I GCGTCAACCC --/CT CTCTGTGCTC 3070 hom 63 het 24 0 19 5 CT 2 3 35723 CASAVA_Build 1 780560 2I GTATGCACAC --/AT ACGAGCATAT 3070 hom 139 het 62 0 45 39 AT 0 1 35724 CASAVA_Build 1 783277 2I GTTTTTTAAC --/AT ATAGAAATAT 1618 het 1618 ref 19 13 4 2 AT 1 2 35725 CASAVA_Build 1 786239 1D AGAGTGGGGT G/- GGGGGGTTAA 2215 het 2215 ref 36 27 5 5 G 7 6 35726 CASAVA_Build 1 786999 4I GTAATTAATT ----/GATA GATAGTAGAT 3070 het 3070 ref 82 53 17 12 GATA 1 2 35727 CASAVA_Build 1 787240 4D ATAGATGGAT GATA/---- GATGGATGGA 3070 het 3070 ref 73 42 22 9 GATA 1 0 35728 CASAVA_Build 1 804235 4D CTTGTGTGGG TGTT/---- TGTTTATAAA 3070 het 3070 hom 47 15 21 12 TGTT 2 1 35729 CASAVA_Build 1 805958 1I AGTTTGAGAA -/G AAACTGGGTT 2274 het 2274 ref 50 27 11 12 G 0 1 35730 CASAVA_Build 1 806031 1D CTTTTCTTTG T/- TGCTGGGTTT 3070 het 3070 ref 79 55 15 12 T 2 1 35731 CASAVA_Build 1 806206 1D TTCTACATCC T/- TTTTTTACTC 3070 het 3070 ref 66 37 9 20 T 7 6 35732 CASAVA_Build 1 806359 1I GTTTTTGATA -/T TCTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 92 41 27 25 T 1 2 35733 CASAVA_Build 1 807190 1I AAAGACAAAT -/A TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 71 45 21 5 A 0 1 35734 CASAVA_Build 1 808890 1I GTTTCCTGAC -/T TTTTAATAAT 3070 het 3070 ref 50 26 17 10 T 4 5 35735 CASAVA_Build 1 808985 2I GCTTTTTTTC --/AT ATGTTTGTTG 3070 het 1573 hom 28 6 21 1 AT 1 2 35736 CASAVA_Build 1 809567 9D GTTCATTGGT CTATGTGTC/--------- TGTTTTTGTA 1175 het 1175 ref 25 17 4 4 CTATGTGTC 1 0 35737 CASAVA_Build 1 811189 4D TTGTTCTTAA CAGT/---- CAGACCACTC 3070 het 3070 hom 74 15 17 45 CAGT 1 0 35738 CASAVA_Build 1 811207 6I19M1D CCACTCTTTC ------CTAGGGCTGCTGTGGTTTTC/CTACGGCTAGGGCTGATATGGATTT- TGGGGGTCCA 3070 het 3070 ref 70 25 29 30 N/A 0 0 35739 CASAVA_Build 1 813812 4D AGAGGGAAAG GGAA/---- AGAAGGAAGG 2293 het 2293 ref 53 22 13 22 GGAA 1 0 35740 CASAVA_Build 1 817976 1D16M1D7M1D10M2D CTTATGTATT AAAAAAAATCACAAAAACAAATATTCCTTTTTTTCCTG/-TAAAAAATCACATAAA-AAATATT-CTTTTTTTCC-- TGTTTATAGC 1410 het 1410 ref 90 70 4 55 N/A 0 0 35741 CASAVA_Build 1 819638 2D AGACAGGAAG AA/-- TTTTTAAAAT 1763 het 1763 ref 28 22 4 3 A 2 0 35742 CASAVA_Build 1 819918 1D GGGCCAAATA T/- TTTAGACCAA 3070 het 3070 ref 49 31 18 2 T 4 3 35743 CASAVA_Build 1 822161 2D TTGAAATGTC TG/-- CTCCTGTATC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TG 1 0 35744 CASAVA_Build 1 822824 1D GACTCACTGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 8 7 35745 CASAVA_Build 1 836464 1D GGCAGGAGTC T/- TCCTTCCAGC 2505 het 1845 hom 26 10 10 6 T 2 1 35746 CASAVA_Build 1 848555 1D GGAAGCTCTT G/- CCCCACACCA 3070 hom 95 het 36 0 29 8 G 1 0 35747 CASAVA_Build 1 856375 4I GCCGTGACTC ----/CCCT CCCTCCCTCC 3070 het 318 hom 22 1 14 7 CCCT 3 4 35748 CASAVA_Build 1 857857 4D CATGTCTGTG TTTC/---- TTTCAGCCTG 3070 hom 83 het 31 0 23 9 TTTC 2 1 35749 CASAVA_Build 1 865023 18D CGTCTATGCA GCCAGTGGACGCCGACCT/------------------ GCCAGACGCC 1619 het 1619 ref 17 11 6 2 GCCAGTGGACGCCGACCT 1 0 35750 CASAVA_Build 1 870503 1D CCGCTGACTT C/- CAGCAGGTGG 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 C 2 1 35751 CASAVA_Build 1 874290 9I CGCAGCAGCA ---------/ACAGCAAAG ACAGCAAAGA 3070 hom 91 het 42 0 22 20 ACAGCAAAG 1 2 35752 CASAVA_Build 1 875913 3D CACACACACA CAG/--- ATTTACAGAC 3070 hom 202 het 76 0 68 9 CAG 1 0 35753 CASAVA_Build 1 876043 1D2M1D3M2I AGGGCAGGGC ACTGTTC--/-CT-TTCAG AGTGTACAGT 3070 hom 157 het 55 0 48 9 N/A 0 0 35754 CASAVA_Build 1 876681 5I GCTTTATTTC -----/ATTTT AACACGGTGG 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 ATTTT 0 1 35755 CASAVA_Build 1 884754 4I GCCCCGGGGA ----/AGAC AGACCGGGAG 731 hom 8 het 4 0 3 1 AGAC 1 2 35756 CASAVA_Build 1 890910 2D TGCACTGGGA CC/-- CCACACAGCA 3070 het 1611 hom 24 5 13 7 C 4 2 35757 CASAVA_Build 1 894907 2D GTATCCATGC AT/-- ATGTGTGCGT 3070 het 3070 hom 92 38 43 16 AT 2 1 35758 CASAVA_Build 1 897034 1D AACAAACACA G/- GGCCCTCCCC 3070 hom 33 het 13 0 11 3 G 3 2 35759 CASAVA_Build 1 912169 1I ATTACAGGTG -/C CTGACACCAC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 1 2 35760 CASAVA_Build 1 913842 1I AAAAAAAAAA -/G AAGAAAGAAA 3070 hom 40 het 16 0 14 2 G 0 1 35761 CASAVA_Build 1 915415 1D ACTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 1662 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 5 35762 CASAVA_Build 1 918846 1I GCTGGGGGGG -/C CCAAGACCAA 3070 hom 45 het 19 0 12 7 C 2 3 35763 CASAVA_Build 1 927436 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 1946 het 1946 ref 22 5 9 8 T 10 11 35764 CASAVA_Build 1 930673 1I ACCCACTCTC -/A AGTCAGCTTC 3070 hom 93 het 37 0 27 10 A 1 2 35765 CASAVA_Build 1 938285 3I AAAACACAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 111 het 42 0 36 6 AAC 3 4 35766 CASAVA_Build 1 938710 1I CCTCAGGCTT -/A ATAATAGGGC 1638 hom 32 het 14 0 8 6 A 1 2 35767 CASAVA_Build 1 947831 23I CACGGTGTCT -----------------------/TGTAGTCTGACCTGTGGTCTGAC TGTGGTCCAA 3070 hom 69 het 24 0 23 2 TGTAGTCTGACCTGTGGTCTGAC 0 1 35768 CASAVA_Build 1 955966 8D TGAGATCAGC ATGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 423 het 423 ref 69 35 3 40 ATGTGTGT 1 0 35769 CASAVA_Build 1 981522 1D GGAGCACACA C/- TGCTGAGCAC 3070 hom 84 het 32 0 27 6 C 1 0 35770 CASAVA_Build 1 982706 4D ATTAATGATT TTAA/---- AAAAAAAGCC 3070 het 1935 hom 22 7 12 4 TTAA 1 0 35771 CASAVA_Build 1 988905 2D TGCGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 42 14 12 16 TG 10 9 35772 CASAVA_Build 1 1010787 1I GCAAGTCCAA -/G CTGCCGAGAG 2986 hom 48 het 19 0 13 6 G 0 1 35773 CASAVA_Build 1 1057460 2D GGGGCCTCTC AG/-- GGGCAAGGGG 2868 hom 27 het 11 0 10 2 AG 1 0 35774 CASAVA_Build 1 1057538 2I CGCGAGCCCT --/GG GCGTTGGGCA 3070 hom 32 het 14 0 11 3 G 1 3 35775 CASAVA_Build 1 1058533 1D GGAGACGTTG T/- TTTGGGGTGG 3070 hom 58 het 22 0 18 4 T 4 3 35776 CASAVA_Build 1 1087271 4D CCCTGCCCTC CCCA/---- CCCCCAGACC 1956 hom 24 het 9 0 8 1 CCCA 1 0 35777 CASAVA_Build 1 1093554 2I CGCTGTGCCT --/CA CCCCCACCCA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 CA 0 1 35778 CASAVA_Build 1 1207283 3D CTGCCCAGAT GTG/--- GTGGGGGAGA 2890 het 1158 hom 24 6 9 10 GTG 2 1 35779 CASAVA_Build 1 1243891 1I AGACACTGTC -/A AAAAAAAAAA 844 het 844 ref 31 21 2 8 A 15 16 35780 CASAVA_Build 1 1245267 1D CCTGGCTGCT G/- GGGAGGACAG 2281 het 21 hom 26 0 8 18 G 4 3 35781 CASAVA_Build 1 1266534 4D AAACGCACCT CACA/---- CACACATACA 3070 het 3070 ref 72 35 27 16 CA 5 3 35782 CASAVA_Build 1 1266837 4I CCTCATGCAG ----/ACAC ACACATGCAC 3070 hom 180 het 67 0 58 9 AC 2 4 35783 CASAVA_Build 1 1279231 2D AGCCCGGGAC TG/-- GGAGCCGCGC 3070 hom 54 het 22 0 17 5 TG 1 0 35784 CASAVA_Build 1 1291063 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 7 35785 CASAVA_Build 1 1291427 2D GTGAATGGGT GA/-- GAGAATGAAT 3070 het 3070 ref 69 32 26 12 GA 3 2 35786 CASAVA_Build 1 1291671 16D ATGTGAATGA GTGTGATTGAATGAGT/---------------- GTGAATTAGG 3070 hom 120 het 39 0 39 5 GTGTGATTGAATGAGT 1 0 35787 CASAVA_Build 1 1291773 3D29M2D GTGAATTGAT TAGTGAGGATTGGTGAGTGTGAATGTGGGTGAGT/---TGAGGATTGGTGAGTGTGAATGTGGGTGA-- GTGGATGGGT 3070 hom 223 het 55 0 75 8 N/A 0 0 35788 CASAVA_Build 1 1292536 2I GAATTGGTGA --/GT GTGTGAATGT 3070 hom 234 het 90 0 76 14 GT 2 3 35789 CASAVA_Build 1 1293291 2D GACAGTCTCA CT/-- CTGTTGCCCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CT 2 1 35790 CASAVA_Build 1 1304327 1D GGTCTATCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 10 9 35791 CASAVA_Build 1 1309042 1D GGGTGTGGTA G/- CAGGTGCCTG 3070 hom 66 het 28 0 21 9 G 1 0 35792 CASAVA_Build 1 1311163 1I CCAATTCTGA -/G GGGGGGGTCC 3070 hom 52 het 21 0 17 4 G 7 8 35793 CASAVA_Build 1 1319369 1D TTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2529 het 2529 ref 36 15 8 14 A 15 14 35794 CASAVA_Build 1 1378041 1D27M3D GCTCCTTCTC AAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG/-AAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGA--- AAAAAACAGA 3070 hom 55 het 21 0 17 10 N/A 0 0 35795 CASAVA_Build 1 1475308 1D GTGATTCCAG C/- CTCCTCCGGA 2664 het 2664 ref 19 8 7 4 C 2 1 35796 CASAVA_Build 1 1476801 1I TGTACACTCA -/G GATTCCCAGA 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 G 1 2 35797 CASAVA_Build 1 1483970 1I TCCCTGGAGC -/A GGGGGAACTG 3070 het 3070 hom 55 22 24 9 A 0 1 35798 CASAVA_Build 1 1484994 2I TTTTGGAGAC --/AG AGTTTCATTC 3059 het 3059 ref 25 11 8 6 AG 1 2 35799 CASAVA_Build 1 1487505 4D ACTCTCTGCT TTTC/---- TTTCTCTTAC 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 TTTC 2 1 35800 CASAVA_Build 1 1492098 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 17 3 8 6 A 15 14 35801 CASAVA_Build 1 1495538 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 13 8 A 10 9 35802 CASAVA_Build 1 1495812 1D TCTGCAGGGA C/- CCCCCCCACC 3070 het 2322 hom 38 9 23 6 C 8 7 35803 CASAVA_Build 1 1497038 1I AGCTAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3002 het 2312 hom 22 7 10 5 T 11 12 35804 CASAVA_Build 1 1498673 18D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAG 3070 het 986 hom 16 4 11 4 A 27 9 35805 CASAVA_Build 1 1502735 1I TGGGAAGCCA -/C CCCCACCTGC 3070 het 1595 hom 24 6 11 7 C 4 5 35806 CASAVA_Build 1 1510534 4D GCTAACTTTT TTTG/---- TTTGTTTATT 799 het 799 ref 16 10 5 1 TTTG 2 1 35807 CASAVA_Build 1 1516057 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3044 hom 30 het 14 0 9 5 A 13 12 35808 CASAVA_Build 1 1520946 2I AGGGAGAGAC --/AG AGAGAGACAC 2309 het 2309 ref 42 28 8 6 AG 3 4 35809 CASAVA_Build 1 1521140 4I ACAGAGAGAG ----/AGAC AGACAGACAC 3070 hom 39 het 40 0 19 21 AGAC 2 3 35810 CASAVA_Build 1 1521406 3D AGACAGAGAG AGC/--- AGAACAGGGA 3070 het 2918 hom 51 10 17 24 AGC 1 0 35811 CASAVA_Build 1 1521834 2D ACAGAGACAG AC/-- ACAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 52 19 29 6 AC 2 1 35812 CASAVA_Build 1 1536492 2D ACATGTTTGA TC/-- TCTCAGTGTT 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 TC 3 2 35813 CASAVA_Build 1 1540259 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1862 het 29 hom 9 1 6 3 A 13 12 35814 CASAVA_Build 1 1549567 1D GTCCCCTGCA T/- TTGTCACCTT 3070 het 3070 hom 35 13 11 12 T 3 2 35815 CASAVA_Build 1 1568761 4I23M1I GTAGATGTCC ----CAAAGACTTTAGGGAACTGTCTT-/CAGACAAAGATTTTAGGGAACTGTCTTA AACCTTCAGT 2191 het 2191 ref 48 46 5 10 N/A 0 0 35816 CASAVA_Build 1 1573007 3D TCTTGGCCTT TTC/--- TTCCTCCCTC 3070 het 3070 ref 41 23 13 8 TTC 2 1 35817 CASAVA_Build 1 1573140 1D CTCCGTGCTT C/- CCAAGTGCAG 2666 het 2666 ref 46 31 10 6 C 3 2 35818 CASAVA_Build 1 1573533 1I CAAGACACAC -/T CAATGTCTGG 3070 hom 93 het 39 0 30 9 T 0 1 35819 CASAVA_Build 1 1573742 6D AAACATCGCT GCACAC/------ GCCCTTCCGC 3070 het 3070 hom 44 12 24 8 GCACAC 1 0 35820 CASAVA_Build 1 1578399 3I ATGAACATAC ---/TAA TAATGAACCG 1873 het 1873 ref 30 22 4 4 TAA 1 2 35821 CASAVA_Build 1 1578608 3D CACCGAAGAA GCG/--- TTGTTCTAAT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 GCG 1 0 35822 CASAVA_Build 1 1578672 1I CCACTTACTT -/A AAAAAATATG 2426 het 2426 ref 22 13 5 4 A 6 7 35823 CASAVA_Build 1 1584063 1I TGCAAATCTC -/T TAAGTATCAA 3070 hom 51 het 19 0 15 4 T 1 2 35824 CASAVA_Build 1 1584704 21I CAGCCACATT ---------------------/CTCGACGGGGAGGTGGACAAG ACCACCCTGG 3070 hom 36 het 14 0 12 2 CTCGACGGGGAGGTGGACAAG 0 1 35825 CASAVA_Build 1 1588727 5I AAAAATAAAT -----/AAATA AAATAAAATA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AAATA 3 4 35826 CASAVA_Build 1 1596023 2D GGTCTCAAGT GC/-- ATGTGGGGCA 3070 het 2040 hom 18 6 8 5 GC 1 0 35827 CASAVA_Build 1 1596531 1I TTAGGGCCAC -/G AGACACAACC 1330 hom 20 het 8 0 5 3 G 0 1 35828 CASAVA_Build 1 1607320 1I TTTCATTTCA -/T TTTTTAGATG 3070 hom 21 het 16 0 8 8 T 5 6 35829 CASAVA_Build 1 1635699 1D CTGGACACTC A/- AGACAGTTTC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 2 1 35830 CASAVA_Build 1 1637316 1D GCCTTGACCT C/- CCAGGCTCAA 868 het 868 ref 31 25 2 5 C 3 2 35831 CASAVA_Build 1 1637510 1I CTCGTCCAGC -/T GTTCACTGTG 3070 het 1418 hom 41 3 29 9 T 0 1 35832 CASAVA_Build 1 1638367 1I ATAATCATGA -/T TTTTATGTTA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 4 5 35833 CASAVA_Build 1 1638470 3I ATCACAGAAG ---/AGC AGAATTGTAA 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 AGC 0 1 35834 CASAVA_Build 1 1638676 9D CCAATTTTCC TAACACCCG/--------- TAAGAATCTC 3070 het 3070 ref 66 56 9 7 TAACACCCG 1 0 35835 CASAVA_Build 1 1639340 2I GCTTTTAGCT --/AG AGTTTGCTCT 3070 het 121 hom 54 1 32 21 AG 1 2 35836 CASAVA_Build 1 1640407 2D11M1D GCTTTCAGCT AGAGTTTGCTCTCT/--AGTTTGCTCTC- ATAGCCCCTC 3070 het 3070 ref 84 58 11 23 N/A 0 0 35837 CASAVA_Build 1 1641996 3I GCACCCGGAC ---/TTA TTATTATTTT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 TTA 2 3 35838 CASAVA_Build 1 1642497 1D ACACCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 35 1 29 5 A 11 10 35839 CASAVA_Build 1 1643926 3D CACCGAAGAA GCG/--- TTGTTCTAAT 1654 hom 10 het 5 0 4 1 GCG 1 0 35840 CASAVA_Build 1 1644788 15D ACCCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 22 1 13 10 A 35 20 35841 CASAVA_Build 1 1645961 4D ATGCCTTCGC GATG/---- GACGCCCGCA 1039 het 1039 ref 15 7 5 5 GATG 1 0 35842 CASAVA_Build 1 1647406 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 1280 hom 17 het 7 0 3 4 T 8 7 35843 CASAVA_Build 1 1651298 4I AGGCTGAGGT ----/GGGA GGATCACTTG 1533 het 1533 ref 28 14 5 9 GGGA 0 1 35844 CASAVA_Build 1 1654134 4I ATGGACTCCT ----/ATCG ATACTTGCTG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 ATCG 0 1 35845 CASAVA_Build 1 1662391 1D CTCCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1486 hom 13 het 10 0 6 4 T 12 11 35846 CASAVA_Build 1 1665320 4D AAAAGAAAAG AAAA/---- AAAAAAAACA 49 het 49 ref 23 13 2 8 A 12 8 35847 CASAVA_Build 1 1675782 22D AGGTCCTCAT CCCTGGGACCGAAGTCGCCCCA/---------------------- CCCTGGGCCC 1671 het 1671 ref 26 7 9 11 CCCTGGGACCGAAGTCGCCCCA 1 0 35848 CASAVA_Build 1 1679987 2I ACAAAACAAA --/AC ACAGTTTCCT 3070 hom 151 het 59 0 48 11 AC 1 2 35849 CASAVA_Build 1 1693273 1I CACCTGGAAA -/T TTTTTTTTTT 3027 het 254 hom 30 2 14 14 T 15 16 35850 CASAVA_Build 1 1697761 4D AGTTCAAATG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 AAAC 3 2 35851 CASAVA_Build 1 1714364 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3059 hom 19 8 9 2 A 13 14 35852 CASAVA_Build 1 1717051 8I GACTCTGCCT --------/CAAAAAAA CAAAAAAACA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CAAAAAAA 1 2 35853 CASAVA_Build 1 1729942 4D TTTGTTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2509 hom 37 7 22 8 TTTG 5 4 35854 CASAVA_Build 1 1734456 1D ACATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1334 het 1334 ref 41 28 5 8 T 12 11 35855 CASAVA_Build 1 1760992 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 11 12 35856 CASAVA_Build 1 1767309 1I ACTCCCTCAA -/T GGTCTGGCAC 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 T 0 1 35857 CASAVA_Build 1 1769337 2I GAACTAAAAC --/TA TAAAGCATAC 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 TA 1 2 35858 CASAVA_Build 1 1771292 1I TGTTTGAGAT -/G GGAGTCTCGC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 G 2 3 35859 CASAVA_Build 1 1797137 1D TCAACAGTGT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 456 hom 28 1 17 10 C 10 9 35860 CASAVA_Build 1 1802226 1D CTACGAAGAC A/- AGAGTGGGGT 3070 hom 144 het 56 0 45 12 A 2 1 35861 CASAVA_Build 1 1802306 2D TGCCTGAACG GA/-- GAGAGGGAGT 3070 het 3070 hom 34 13 16 7 GA 3 2 35862 CASAVA_Build 1 1802728 1I CATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 973 hom 31 5 22 4 T 9 10 35863 CASAVA_Build 1 1808941 1I GTTTTTACTC -/T TTTTGAGACA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 4 5 35864 CASAVA_Build 1 1843476 4I CTATTGGAAT ----/CTGA CTGGCAGAGG 3070 hom 69 het 26 0 21 5 CTGA 0 1 35865 CASAVA_Build 1 1859141 31D GGATTTACAA CACCAGGTCCACCTCTGGACACAGGTCCACC/------------------------------- CACCTGTGTC 3070 het 3070 ref 31 16 11 12 CACCAGGTCCACCTCTGGACACAGGTCCACC 1 0 35866 CASAVA_Build 1 1859354 2D TGCACTCACA CT/-- CAACCTTACA 3070 het 3070 ref 77 29 32 19 CT 1 0 35867 CASAVA_Build 1 1859793 2I ACTGACAAAC --/AT GCACTCACAC 3070 hom 139 het 60 0 47 13 AT 0 1 35868 CASAVA_Build 1 1867275 1D TTGTGCGTGT G/- GGGGGGGCTC 3070 het 3070 hom 34 15 9 10 G 8 7 35869 CASAVA_Build 1 1870197 10D9M3D11M6D TCCCTCCCTC CTTCCCTTCCTTCCTTCCCTTTCCTTCCTTCCTCTTTCC/----------CCTTCCTTC---TTCCTTCTCTC------ TCCCTTCCTT 3070 het 3070 ref 42 31 10 6 N/A 0 0 35870 CASAVA_Build 1 1870864 1I GGAACTTTCT -/G TAAGTTTTGA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 G 0 1 35871 CASAVA_Build 1 1873165 1I AGGTCAGGAG -/T TTTGAGGCCA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 3 4 35872 CASAVA_Build 1 1874123 1D CTGGCTAATT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 9 8 35873 CASAVA_Build 1 1876065 4I CTAGGCGACA ----/GAGT GAGACCCTGT 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 GAGT 0 1 35874 CASAVA_Build 1 1965556 2D AGAAAGCTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 97 het 46 0 26 21 AC 10 9 35875 CASAVA_Build 1 1966403 4I GCCTGAAACG ----/CCGC CCGCCGGAGG 2646 hom 19 het 8 0 7 1 CCGC 1 2 35876 CASAVA_Build 1 2019410 19I AGGTCAGAGC -------------------/AGGTGACCAGGAGTGACTA AGGTGACCAG 3070 hom 117 het 46 0 38 9 AGGTGACCAGGAGTGACTA 0 1 35877 CASAVA_Build 1 2033991 1D GGTTGGTTGG T/- TTTTTTTTTT 252 het 252 ref 18 6 2 10 T 14 13 35878 CASAVA_Build 1 2039642 1I AATGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1247 hom 18 het 13 0 7 6 T 13 14 35879 CASAVA_Build 1 2040363 1I CTTTCCTCCC -/T TTTATTATTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 3 4 35880 CASAVA_Build 1 2042843 3D TTAGGGTTAT ATC/--- AGTAGTTAGG 914 het 914 ref 70 25 10 35 ATC 1 0 35881 CASAVA_Build 1 2048643 1D TTTGAGTTGC A/- GGCTTGCGAT 3070 hom 25 het 10 0 9 1 A 1 0 35882 CASAVA_Build 1 2062645 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1493 hom 20 het 15 0 8 7 T 18 16 35883 CASAVA_Build 1 2091794 4I AACTGTGGCA ----/AGAT ACACACAACA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AGAT 0 1 35884 CASAVA_Build 1 2156468 1I CAGCCTCCTG -/T GTAGCTGGGA 2297 het 2297 ref 13 7 6 0 T 0 1 35885 CASAVA_Build 1 2173906 1D AAGGGAGCAG C/- CCCTTGCTCA 3070 het 3070 hom 37 11 19 8 C 4 3 35886 CASAVA_Build 1 2185313 1D TGTTTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 12 11 35887 CASAVA_Build 1 2211836 1I AACAGTTGGC -/G GGGTGGGCTG 3070 hom 37 het 28 1 21 6 G 3 4 35888 CASAVA_Build 1 2231237 1I CACAAATGAC -/T TTTTTTTTTT 2961 hom 21 het 9 0 8 1 T 10 11 35889 CASAVA_Build 1 2233477 5I GTGCCCCACC -----/CGTTT CATTTCTGCC 3070 hom 57 het 20 0 18 2 CGTTT 0 1 35890 CASAVA_Build 1 2238243 1I CTCTGCACAG -/C GGGTCTCGAC 3070 hom 58 het 28 0 18 10 C 0 1 35891 CASAVA_Build 1 2243856 1D GCTCCTTTAG A/- AAAAAAAAAA 1256 het 1256 ref 18 8 4 6 A 11 10 35892 CASAVA_Build 1 2285712 4I TTTGATGGGG ----/TTGT TTGTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTGT 1 2 35893 CASAVA_Build 1 2288606 1D TTGCTCTATC A/- AAAAAAAAAA 2175 het 402 hom 19 2 7 10 A 18 17 35894 CASAVA_Build 1 2288756 2I CTGTCTCTAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 11 13 35895 CASAVA_Build 1 2291013 4D CATTTAGAAA TAAT/---- TAATAAAATA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TAAT 2 1 35896 CASAVA_Build 1 2291974 2D TTTTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 15 13 35897 CASAVA_Build 1 2292526 9I AACAACAACC ---------/ACAACCACA ACAACAACAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ACAACCACA 0 1 35898 CASAVA_Build 1 2294059 1D CAGAGCAGCG A/- CCTGGGCAGT 3070 hom 39 het 16 0 12 4 A 1 0 35899 CASAVA_Build 1 2305016 1D CTGGACGCTC A/- GGGGGCCCCT 3070 hom 90 het 32 0 25 7 A 1 0 35900 CASAVA_Build 1 2323805 1I CTGCTCCGTT -/C CCCAGCACGG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 3 4 35901 CASAVA_Build 1 2345598 1D CAACAGAACT A/- AAAAATTCCC 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 A 6 5 35902 CASAVA_Build 1 2352630 2I GCCCAAGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 41 15 13 13 GT 8 9 35903 CASAVA_Build 1 2355284 1I AGTGCAGTCT -/C CCCCGGGCAC 1960 het 1960 ref 24 11 9 4 C 4 5 35904 CASAVA_Build 1 2357120 1D CCCCACACCT G/- GGGGGCTCAG 2934 het 2934 ref 26 9 11 6 G 6 5 35905 CASAVA_Build 1 2360544 1D AGACCTTTGG C/- CCCCCCGAGG 3070 het 2491 hom 23 7 10 6 C 7 6 35906 CASAVA_Build 1 2365836 1I GGGGGAAGTG -/T TTTGAGTGTC 2074 het 2074 ref 25 9 7 9 T 3 4 35907 CASAVA_Build 1 2383171 1I ACTCATCCCC -/A CCCAGGGCCT 2606 het 2606 ref 25 11 11 3 A 0 1 35908 CASAVA_Build 1 2406523 11I AAGGCCAAGT -----------/GCTCTCTGGAC GCTGCCCCAC 3070 hom 92 het 38 0 28 10 GCTCTCTGGAC 0 1 35909 CASAVA_Build 1 2460532 2I10M3I TCTCCTGCGG --CATTTCAGTG---/CCCATCTCAGCGGCA TTGCGCTGAG 3070 het 3070 ref 40 16 15 12 N/A 0 0 35910 CASAVA_Build 1 2470107 1D AGCCAGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 20 3 10 7 A 13 12 35911 CASAVA_Build 1 2520202 1I TAAGAGAGAA -/G GTGCAGGTAA 3070 hom 126 het 49 0 40 9 G 1 2 35912 CASAVA_Build 1 2521836 3D TGTTTCTGGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 27 0 25 3 A 13 10 35913 CASAVA_Build 1 2522314 1I TTGCAAAGTC -/T TCCCCAAATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 35914 CASAVA_Build 1 2542078 1I TAAAATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 28 1 23 4 A 11 12 35915 CASAVA_Build 1 2547237 3I GTGGACAGAG ---/GAA GAAGAGAAGA 3070 hom 87 het 32 0 27 5 GAA 1 2 35916 CASAVA_Build 1 2551120 3D TGTAGTGGAG CCC/--- CCCCCCTGGG 3070 hom 43 het 21 0 15 6 C 9 6 35917 CASAVA_Build 1 2569305 1D ATTATTACTG T/- TTTTTTTTTT 1382 het 1382 ref 37 26 3 8 T 12 11 35918 CASAVA_Build 1 2616332 1D GCACCCTGCA C/- CCCCAGGTGA 3070 het 3070 hom 59 28 17 14 C 5 4 35919 CASAVA_Build 1 2620205 1D TGAGCATCTG A/- CAGCCTGGAG 2095 het 2095 ref 68 53 6 9 A 1 0 35920 CASAVA_Build 1 2688912 2D GTAATCTTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 108 het 44 0 37 8 TC 6 5 35921 CASAVA_Build 1 2701512 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2565 hom 30 het 18 0 11 7 A 15 14 35922 CASAVA_Build 1 2725126 1D ATATGCCATG C/- TCATGAGTCT 3070 hom 193 het 73 0 64 12 C 1 0 35923 CASAVA_Build 1 2747302 6D57M2D3M2D GAGTGTGTGA GTGTGTGAGTGTGAGTGTGTGTGAGTGTATCACTGTGAGTGTGTGTGAGCTAGTGTGTGTGTGACTGAGT/------GAGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTATCAGTGTCTGTGTGTGTGAGCTAGTGTGTGTGTG--TGA-- GTGTGTGTGA 1969 het 840 hom 17 7 7 19 N/A 0 0 35924 CASAVA_Build 1 2779020 1D AACCTGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 34 2 26 6 T 13 12 35925 CASAVA_Build 1 2779480 13D TTTCTTTTCT TTTCTTCTCTTTC/------------- TTTCTTCTCT 2601 hom 18 het 8 0 7 1 TTTCTTCTCTTTC 2 1 35926 CASAVA_Build 1 2874710 1I AGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 276 hom 27 1 18 8 T 9 10 35927 CASAVA_Build 1 2876815 1I TTGGCGTGGG -/A GGGGGGGTGA 3070 hom 77 het 28 0 20 8 A 0 1 35928 CASAVA_Build 1 2877422 1I GAGGCCTGTG -/C CCCCCCACCC 1204 het 1204 ref 26 12 6 8 C 6 7 35929 CASAVA_Build 1 2903931 1D TATTTGATTT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 8 7 35930 CASAVA_Build 1 2904641 2D TCCCTGGACA TG/-- TGCACAGCAT 3070 het 3070 ref 42 23 9 12 TG 2 1 35931 CASAVA_Build 1 2907195 1I CTGTTTTGAA -/G GGGGGAGCTC 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 G 5 6 35932 CASAVA_Build 1 2923995 3D GAGCAGGGAA AGG/--- AGAACGTCCT 3070 het 2338 hom 24 7 11 9 AGG 1 0 35933 CASAVA_Build 1 2926545 1I GTTTCCCTCT -/G GGGGGGGTCC 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 G 7 8 35934 CASAVA_Build 1 2928268 3D GAGGCCAACC AGA/--- AGAAGTACTT 2290 het 2290 ref 23 11 9 4 AGA 2 1 35935 CASAVA_Build 1 2931585 12D AGGTGGGGTG TGGTGTTTTCAT/------------ TGGTGTTGAG 2248 het 2248 ref 18 7 8 3 TGGTGTTTTCAT 1 0 35936 CASAVA_Build 1 2938241 5I AGCCCCCACA -----/CCAAG CCTGGCAGGG 1622 het 1622 ref 26 11 7 8 CCAAG 0 1 35937 CASAVA_Build 1 2939821 1D GCTGCCAGCG C/- CCCCCACAAT 2900 het 1345 hom 23 6 9 8 C 6 5 35938 CASAVA_Build 1 2940603 1I GATCTAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 28 13 10 A 10 11 35939 CASAVA_Build 1 2946560 2I ACGGCATGTT --/TG TGCAGATCCA 3070 het 3070 ref 68 26 27 15 TG 1 2 35940 CASAVA_Build 1 2950690 1D GACCCTTATC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 45 21 19 8 A 8 7 35941 CASAVA_Build 1 2961503 1I TTGTATTTGA -/T TTTCATTTAC 2597 het 2597 ref 23 9 9 5 T 3 4 35942 CASAVA_Build 1 2984463 1D TCTCCTCTGT C/- CTTGCCTCTG 3070 hom 84 het 32 0 26 6 C 2 1 35943 CASAVA_Build 1 2985829 7I ACAGGGATCC -------/TTCGGGG TGCGGTTGCA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 TTCGGGG 0 1 35944 CASAVA_Build 1 2992553 4I GCAAGGTCTC ----/TGTT TGTCTACACA 3070 het 3070 ref 39 15 18 6 TGTT 0 1 35945 CASAVA_Build 1 2998549 2I GCTGCATGCT --/GC TGGTGTTACC 3070 het 3070 ref 30 11 8 11 GC 0 1 35946 CASAVA_Build 1 3001310 4D CCAGGTGTGT CTTC/---- CTTCCTGGTC 2662 het 2662 ref 22 11 8 4 CTTC 2 1 35947 CASAVA_Build 1 3003644 1I AGCTGTGTAC -/A AAAAGTTTTG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 4 5 35948 CASAVA_Build 1 3021050 2I ACACACATGA --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 hom 89 34 36 19 AC 4 5 35949 CASAVA_Build 1 3035606 2I ATCCTGCCTA --/GT GTGTGTGGGT 3070 het 3070 ref 59 28 20 11 GT 3 4 35950 CASAVA_Build 1 3110007 1D TTCTCTCCCC G/- GGGGGGCCAG 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 G 7 6 35951 CASAVA_Build 1 3131584 1D GCTTGGAAGG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 9 8 35952 CASAVA_Build 1 3135856 3I TCTCCTGCAC ---/TAA TAAAGGACAT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 TAA 1 2 35953 CASAVA_Build 1 3149803 1D CTGATTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 23 0 13 11 A 11 10 35954 CASAVA_Build 1 3152160 1I TGAGTTCACA -/T TTTTCTTAAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 4 5 35955 CASAVA_Build 1 3155974 1D ACCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 A 11 10 35956 CASAVA_Build 1 3158808 1D CTCAAATAGA G/- GGGGGATCTT 3070 het 1133 hom 19 4 8 7 G 6 5 35957 CASAVA_Build 1 3163281 5D ACTCCATCTC AAAAT/----- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 AAAAT 1 0 35958 CASAVA_Build 1 3164019 1D ACATTGGCAT A/- AACCTTGCTC 3070 hom 98 het 39 0 33 6 A 3 2 35959 CASAVA_Build 1 3186300 1D CCTCCTCCCA C/- CCCCCCCGGG 860 het 7 hom 12 0 3 9 C 8 7 35960 CASAVA_Build 1 3208078 2D TGGGCAGGAC AG/-- GGGATAGAGA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 AG 1 0 35961 CASAVA_Build 1 3227813 2I TGTGGGTCTC --/TA TGTGAGTGTG 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 TA 0 1 35962 CASAVA_Build 1 3268760 1I GCATGGGACA -/C CCCAGGCGTC 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 C 3 4 35963 CASAVA_Build 1 3272369 2I CACACAAACG --/CA CACACGCATG 3070 het 3070 ref 68 27 20 21 CA 2 3 35964 CASAVA_Build 1 3287320 1I ACAGTGATAT -/G GGGCCTGGAG 3070 het 3070 ref 46 25 11 10 G 3 4 35965 CASAVA_Build 1 3292670 2D TTGAAAAAAA AG/-- AAAAGGATCC 3070 het 3070 ref 26 16 10 1 AG 1 0 35966 CASAVA_Build 1 3293019 1D TTTCTGATTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 9 8 35967 CASAVA_Build 1 3293423 1I GCCTGTCTTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 7 8 35968 CASAVA_Build 1 3296374 2D TGGGGGTGCG CC/-- CCCCCCCCCC 1545 het 666 hom 15 4 4 7 C 16 14 35969 CASAVA_Build 1 3308307 2D CAGTGCACAC AA/-- ATATTCACGC 3070 het 3070 hom 75 27 39 11 A 3 1 35970 CASAVA_Build 1 3308693 1I GGGCCCAGAG -/C CCCCCCACCG 2002 het 1860 hom 25 10 9 6 C 6 7 35971 CASAVA_Build 1 3316409 1D GTGTTTGCAT G/- GGGGGGTGTG 3070 het 2651 hom 48 16 15 17 G 7 6 35972 CASAVA_Build 1 3327174 1D CTTATTTCTT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 9 8 35973 CASAVA_Build 1 3342624 1D AGGTGTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 30 0 23 7 T 12 11 35974 CASAVA_Build 1 3347099 1I AGCTGTAGAC -/A GCTTTTTTAC 3070 hom 65 het 26 0 21 5 A 0 1 35975 CASAVA_Build 1 3348130 1I GTCTTCCTGC -/G GCCGGTTCCT 3070 hom 66 het 23 0 22 1 G 1 2 35976 CASAVA_Build 1 3370576 2D ACATTCCCTC TG/-- TACACAGAGC 3070 het 3070 hom 29 16 12 2 TG 1 0 35977 CASAVA_Build 1 3372019 1D CTTTCCTTCC G/- GGAACCAGCA 3070 hom 30 het 17 0 11 6 G 3 2 35978 CASAVA_Build 1 3384085 1I GGTCTGGTCC -/G GGCCTGGCGC 3070 hom 51 het 20 0 13 7 G 2 3 35979 CASAVA_Build 1 3387276 2I GGCTGGGCCC --/CT CTCAGCTGCT 2619 hom 39 het 15 0 11 4 CT 1 2 35980 CASAVA_Build 1 3393525 4D GTGTGTGGAG GTGT/---- GTGTGTGTGC 2565 het 1820 hom 17 7 7 3 GT 6 4 35981 CASAVA_Build 1 3404678 3D CATTCACAGG ACA/--- ACAGGTCCCC 2651 het 2346 hom 24 10 7 9 ACA 2 1 35982 CASAVA_Build 1 3442418 1D AACTCTCCAA G/- GGGGCATCCC 2882 het 2779 hom 28 10 11 7 G 5 4 35983 CASAVA_Build 1 3482056 7I AGCAAGTCAC -------/GTCTTAT ATCTTACATG 3070 het 644 hom 15 3 12 0 GTCTTAT 0 1 35984 CASAVA_Build 1 3485141 3D TCCGCCTTTC CAA/--- CAATGGCCAA 3070 hom 84 het 32 0 26 10 CAA 2 1 35985 CASAVA_Build 1 3496821 1D AGGAAGGACA C/- CCCCCCAGCA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 C 7 6 35986 CASAVA_Build 1 3504929 1I AAATATTTAT -/C CCCCTCTCCC 3070 het 1792 hom 27 11 13 3 C 4 5 35987 CASAVA_Build 1 3511573 4D CACAGTCACA CACT/---- CACAGTCACA 3070 het 3070 ref 71 37 26 10 CACT 1 0 35988 CASAVA_Build 1 3511790 4D CGTTCACACA CACT/---- CAATCACACT 3070 het 3070 ref 84 44 34 10 CACT 1 0 35989 CASAVA_Build 1 3511920 2D58M6D TTACACACAT ACACACACAATCACACACATACACATTCACACTCACACACAATCACACATATTCTCATACACTCAT/--ACACACAATCACACACATACACATTCACACTCACACACAATCACACATACTCTCATAC------ ACACTCACAT 3070 het 3070 hom 56 29 36 30 N/A 0 0 35990 CASAVA_Build 1 3512090 6D AAGCTCACAA ACTCAC/------ ACACACTCGC 3070 het 3070 ref 66 35 24 14 ACTCAC 1 0 35991 CASAVA_Build 1 3523782 6I TCCCCTGCCA ------/CCGGCT CCCGTGAATG 2614 het 1925 hom 21 6 7 8 CCGGCT 0 1 35992 CASAVA_Build 1 3530061 1D ACATGCGTCT G/- GGCACACCAG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 G 3 2 35993 CASAVA_Build 1 3553373 1D TTAAAACCAG C/- AGAGACCCGA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 C 1 0 35994 CASAVA_Build 1 3593996 2D GCGCAGGGCA AT/-- GAGACCTGCG 3070 het 3070 ref 23 8 11 5 AT 1 0 35995 CASAVA_Build 1 3603571 36D GGGGCCCCTG CGGGGCCCACCTCGCACCCGCGGCCCACGTCGCACC/------------------------------------ CGCGGCCCAC 1421 het 655 hom 17 5 5 11 CGGGGCCCACCTCGCACCCGCGGCCCACGTCGCACC 1 0 35996 CASAVA_Build 1 3618310 2D ATGTGCACAC AT/-- GTTTGTCTTA 1579 het 1579 ref 37 13 7 17 AT 1 0 35997 CASAVA_Build 1 3629995 4D GTTGGCTGAT CTGC/---- CTGCCTGTCC 3070 hom 44 het 17 0 14 4 CTGC 2 1 35998 CASAVA_Build 1 3630548 1I AAGGCAGCAT -/A AAGTTTCTGG 3070 hom 39 het 16 0 11 5 A 2 3 35999 CASAVA_Build 1 3648955 1I AGAAACGACA -/G GGGGCCTGTC 3070 hom 128 het 46 0 40 6 G 4 5 36000 CASAVA_Build 1 3650342 3D AGACTCTTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 21 0 15 6 A 14 11 36001 CASAVA_Build 1 3663010 2D TGAGGGTGAC AA/-- GAGTTAGGAG 3070 hom 98 het 38 0 29 10 A 2 0 36002 CASAVA_Build 1 3672295 2D TCTTTTCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 14 12 36003 CASAVA_Build 1 3691010 1D CCATTTTCCC A/- ACGACTGCTC 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 A 2 1 36004 CASAVA_Build 1 3697317 1I CAGGCAGAAG -/C CTCTGTGCTG 3070 hom 51 het 20 0 11 9 C 1 2 36005 CASAVA_Build 1 3710854 1I TTCCATGTAA -/G GGGGAACTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 G 4 5 36006 CASAVA_Build 1 3714366 5I AAACAAGCAG -----/ATCTC ATAACTCTCT 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 ATCTC 0 1 36007 CASAVA_Build 1 3721515 1I AGCGCCTCCC -/T GGCGGTGCTC 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 0 1 36008 CASAVA_Build 1 3722114 1D CAGCTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 1569 het 1092 hom 24 5 6 13 T 14 13 36009 CASAVA_Build 1 3728639 2D14M16D TTCAAACTCT GAGAGAGAGAGAGACTGACAGACAGACAGAGG/--GAGAGAGAGAGACT---------------- GACAGACAGA 3070 het 3070 hom 38 23 20 10 N/A 0 0 36010 CASAVA_Build 1 3729132 1I CGTCCCCACT -/A TGCCTGCTGA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 0 1 36011 CASAVA_Build 1 3733294 1I TCTACTGGCT -/G GGCAAGGTGG 3070 hom 85 het 32 0 28 4 G 2 3 36012 CASAVA_Build 1 3735277 2I CCACAGGCTT --/AA AGAGTAAGGG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 1 3 36013 CASAVA_Build 1 3740076 1D ATAAAAAAAA C/- ATTGGAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 C 1 0 36014 CASAVA_Build 1 3741589 1I GAAGGCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 10 11 36015 CASAVA_Build 1 3749969 6D AGAGATGGGG TTTTGA/------ CATGTTCCCC 2228 het 1425 hom 11 5 5 1 TTTTGA 1 0 36016 CASAVA_Build 1 3755691 1D GTGACATAAC T/- TTTTTTTTTT 1958 het 63 hom 34 2 7 26 T 19 18 36017 CASAVA_Build 1 3759326 9I TAAGCGGGCC ---------/GGCCAAGGA GGCCAAGGAC 3070 het 2797 hom 34 11 11 12 GGCCAAGGA 1 2 36018 CASAVA_Build 1 3760225 1D AAAGCCCCCC A/- GAACAGGATG 3070 het 3070 hom 31 13 17 5 A 1 0 36019 CASAVA_Build 1 3771498 1D CTTAAGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 36 0 24 12 T 11 10 36020 CASAVA_Build 1 3774975 1I CCACCCCATC -/T GAATGTGGAT 3070 hom 130 het 48 0 42 6 T 0 1 36021 CASAVA_Build 1 3788461 3I GTGAAACAAC ---/AAT ATCATGTTGT 3070 hom 103 het 39 0 33 6 AAT 0 1 36022 CASAVA_Build 1 3788667 1I TTTGTAGAGG -/T TGGGGTTTCA 3070 hom 98 het 37 0 32 5 T 1 2 36023 CASAVA_Build 1 3811600 1D AAACTTTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 20 12 A 15 14 36024 CASAVA_Build 1 3824945 2D CCCACATAAG CT/-- CTCTCTCTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CT 5 4 36025 CASAVA_Build 1 3827605 1I AGCAGTTCTT -/G GCTGTTGTTT 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 G 1 2 36026 CASAVA_Build 1 3828190 1D TTTTCATTGT A/- AGTAAAACAC 3070 het 3070 ref 35 23 9 6 A 2 1 36027 CASAVA_Build 1 3833063 4I ATCCATCCAT ----/CCAC CCACCCATCT 3070 het 3070 ref 46 18 15 13 CCAC 1 2 36028 CASAVA_Build 1 3833396 5D ATCATCTATC TATCT/----- TATCTATCTA 3070 het 3070 ref 46 26 17 4 TATCT 2 1 36029 CASAVA_Build 1 3907566 1D TCCATCCACT C/- CCCCCAAAAA 3070 hom 71 het 29 0 25 4 C 6 5 36030 CASAVA_Build 1 3908034 1D AGGAGGCAGA G/- GGGAGTGCTC 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 G 4 3 36031 CASAVA_Build 1 3909254 1I ATGACTCCAA -/C CCTGTGACAT 3070 het 3070 ref 52 24 17 11 C 2 3 36032 CASAVA_Build 1 3909918 1D AGCACAGGAC T/- TTTTTTGGGG 3070 hom 90 het 34 0 31 5 T 7 6 36033 CASAVA_Build 1 3910825 1D TATCTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 A 12 11 36034 CASAVA_Build 1 3916502 1I AGTTTGGCAG -/A AGGGGTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 2 36035 CASAVA_Build 1 3925219 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 7 A 11 10 36036 CASAVA_Build 1 3925432 1D GACTCAACTC T/- TGGAGGTGGG 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 2 1 36037 CASAVA_Build 1 3934863 2D CATAAGCAGG CA/-- CACACTGATG 3070 hom 196 het 74 0 66 10 CA 3 2 36038 CASAVA_Build 1 3937579 1I CCCTTGAGAT -/A GCATGGGCTG 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 0 1 36039 CASAVA_Build 1 3945445 1I CTCTATCTTT -/A AAAAAAAAAA 2962 hom 18 het 7 0 7 0 A 13 14 36040 CASAVA_Build 1 3948716 1D AAAACAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 52 1 34 17 T 12 11 36041 CASAVA_Build 1 3975380 1D CTTCCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 11 10 36042 CASAVA_Build 1 3989674 1D AATATAAGGC T/- TTTTTTGGAT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 7 6 36043 CASAVA_Build 1 3989775 7D TTAATTTGTC TTTTTTT/------- TTTTGTTTTG 353 het 353 ref 46 20 6 21 T 11 4 36044 CASAVA_Build 1 3991473 1I GATCTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 10 11 36045 CASAVA_Build 1 3995341 3D AAGAAAAAAG AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3037 hom 26 8 15 3 AAT 6 5 36046 CASAVA_Build 1 3995702 1I TTCCCAGCAG -/A AAATCTAGAA 1507 het 1507 ref 24 16 4 4 A 3 4 36047 CASAVA_Build 1 3998557 1I TCATATAGAA -/C CAAAAAGAGC 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 C 1 2 36048 CASAVA_Build 1 4022432 2I CTGTTTCTCT --/CC CTGTCTCTGT 3070 hom 64 het 27 0 22 5 C 1 3 36049 CASAVA_Build 1 4024197 4D CTCACACTAG CTCA/---- CTCACTCACA 3070 het 3070 ref 49 24 20 8 CTCA 3 2 36050 CASAVA_Build 1 4024432 4D ATTCACTCAT ACTC/---- ACACTCATTC 3070 het 1974 hom 50 8 11 31 ACTC 1 0 36051 CASAVA_Build 1 4024705 2D CACTCACACT CA/-- GTCACTCTTA 3070 het 3070 ref 47 20 13 17 CA 1 0 36052 CASAVA_Build 1 4024831 4I37M2I ACTTGCTCAG ----TCACTCACATTCACTCACTCATTTACTCACACACACA--/TCACTCACTCACATTCACTCACTCATTTACTCACACACACACT GTCACACACA 3070 het 3070 ref 70 43 21 24 N/A 0 0 36053 CASAVA_Build 1 4025066 2D CTCATTCACT CA/-- CAGTCACTCA 3070 het 3025 hom 65 9 30 26 CA 2 1 36054 CASAVA_Build 1 4025094 2I CACTCGCACA --/CT CATTCACTCA 3070 het 3034 hom 63 8 18 37 CT 0 1 36055 CASAVA_Build 1 4025233 2I21M4I GCTCATCACT --CACACTCAGTCACTGATTCAT----/CACACACTCAGTCACTGATTCATTCAC TCACTCACTT 3070 het 3070 ref 60 28 26 19 N/A 0 0 36056 CASAVA_Build 1 4025452 1D20M4I21M2I ACTCACACTC AAGTCACTCACTCATTCACTC----ATTCACTCACTCACACTCATT--/-AGTCACTCACTCATTCACTCATTTATTCACTCACTCACACTCATTCA CACACACACA 3070 het 3070 ref 59 29 26 28 N/A 0 0 36057 CASAVA_Build 1 4025544 2I CATACTCATT --/CA CACACACTTG 3070 hom 87 het 53 0 29 24 CA 3 4 36058 CASAVA_Build 1 4025590 2I20M2D CTCACAGTCA --CTCATTCACACACATTTACTCA/CTCTCATTCACACACATTTACT-- CACACACTCA 3070 het 3070 ref 59 21 15 31 N/A 0 0 36059 CASAVA_Build 1 4025679 4D ACTCACACTT ACTC/---- AGTCATTCAC 3070 hom 185 het 75 0 62 16 ACTC 1 0 36060 CASAVA_Build 1 4026490 4D CACGCTCATC CACT/---- CACTCATTCA 3070 het 90 hom 68 2 37 30 CACT 2 1 36061 CASAVA_Build 1 4026679 2D CTCACTCACA CT/-- CAGTCACTCA 3070 het 3070 hom 77 28 34 15 CT 1 0 36062 CASAVA_Build 1 4026767 4D ACTGTTTCAT TCAC/---- TCACTCACTT 3070 het 3070 ref 89 42 33 17 TCAC 3 2 36063 CASAVA_Build 1 4026997 4I ACTCATTTAT ----/TCAC TCACTCACAC 3070 het 3070 ref 86 39 31 16 TCAC 2 3 36064 CASAVA_Build 1 4031777 6I CTGTCCCCAG ------/CTGCTC CTGCTGCTGA 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 CTGCTC 0 1 36065 CASAVA_Build 1 4046996 3I CACATAAGAG ---/GAT CATGGAAAGG 3070 hom 88 het 34 0 27 7 GAT 0 1 36066 CASAVA_Build 1 4056744 1D TTTCTTGATA T/- TTTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 36 16 16 6 T 6 5 36067 CASAVA_Build 1 4078235 17D TATTAAATCC TGCCTGTGTGAGCAAGA/----------------- TGCCCGGATG 3070 het 3070 ref 39 23 13 9 TGCCTGTGTGAGCAAGA 1 0 36068 CASAVA_Build 1 4080450 1D TTAAACCCAG T/- TAAAGGGGGC 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 T 2 1 36069 CASAVA_Build 1 4097903 3I TGTTCCTCTC ---/ATT ATTACCTGCC 3070 hom 65 het 25 0 17 8 ATT 1 2 36070 CASAVA_Build 1 4102309 1D CCCATTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 17 5 T 11 10 36071 CASAVA_Build 1 4111730 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1048 het 1048 ref 15 4 3 8 T 11 12 36072 CASAVA_Build 1 4114593 3D AAAACAAACA AAC/--- AACACCTCCT 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 AAC 2 1 36073 CASAVA_Build 1 4122612 1I GATGAAAAGG -/T TCTCTTTTTC 2881 hom 24 het 12 0 9 3 T 1 2 36074 CASAVA_Build 1 4131827 5D CTAAAGCCGA TTGTT/----- TTGTGCTGCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TTGTT 1 0 36075 CASAVA_Build 1 4134660 1I ATGGAGGCCT -/G GGGGGAGGCT 2438 hom 33 het 13 0 12 1 G 5 6 36076 CASAVA_Build 1 4139316 1I TAAAGCAGAG -/T TTATTAAGGA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 2 3 36077 CASAVA_Build 1 4141217 4I AATGGGTTTT ----/AAAG GACTAAGAAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AAAG 0 1 36078 CASAVA_Build 1 4149379 3I CCACAGCTCA ---/CCT CCTGATGTGC 3070 hom 84 het 32 0 26 6 CCT 1 2 36079 CASAVA_Build 1 4153320 1D TTGTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 2183 het 2183 ref 32 20 7 5 T 16 15 36080 CASAVA_Build 1 4154427 1D GAGGGTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 11 10 36081 CASAVA_Build 1 4158372 1D CAGCAGACAA G/- AAAAGAGCTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 1 0 36082 CASAVA_Build 1 4163480 1D TCAGAAAGAA T/- TTTTTTGTAA 3070 hom 117 het 42 0 38 4 T 7 6 36083 CASAVA_Build 1 4176372 5I TGGGGACCTG -----/GGGCT GGGCTTGGAG 3070 hom 96 het 33 0 31 2 GGGCT 1 2 36084 CASAVA_Build 1 4180360 1I CCCCAGCTCC -/T GGTGCTTTGC 3070 hom 65 het 30 0 22 8 T 0 1 36085 CASAVA_Build 1 4222418 1D GACAGAGTGA G/- GGGGGGGGCT 1718 het 1121 hom 18 5 6 7 G 9 8 36086 CASAVA_Build 1 4227265 1D GTGCTTGGTA T/- TTTTTTTTTT 2720 het 2720 ref 36 19 8 9 T 13 12 36087 CASAVA_Build 1 4258561 1D AGCATGGAGT G/- GGTGAATGAG 3070 het 3070 hom 57 22 20 15 G 3 2 36088 CASAVA_Build 1 4261556 1D CAATGGGGAC A/- GGGGCAGAGG 3070 het 2839 hom 40 12 19 9 A 1 0 36089 CASAVA_Build 1 4263506 1D TCTGGTGCTC T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 79 het 34 0 25 10 T 8 7 36090 CASAVA_Build 1 4264212 1I GGGCAGAGAG -/C TTTCCTTTCC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 0 1 36091 CASAVA_Build 1 4270969 1D GGCTTATGAT A/- ACACTACCTG 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 2 1 36092 CASAVA_Build 1 4280921 3I TCTCAATTGA ---/TCT TCTTTCAAAT 3070 hom 87 het 32 0 27 5 TCT 1 2 36093 CASAVA_Build 1 4281852 4D TCTCTCTCTC TGTT/---- TGTCTACCCT 3070 hom 77 het 30 0 26 6 TGTT 1 0 36094 CASAVA_Build 1 4289863 4D AAAAACCCTT GGGG/---- GGGGGGGGTG 3070 hom 40 het 24 0 15 10 G 12 8 36095 CASAVA_Build 1 4336170 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 12 13 36096 CASAVA_Build 1 4352930 1D TATTAAAATT A/- AAAACTGTGC 3070 het 3070 ref 32 13 15 5 A 5 4 36097 CASAVA_Build 1 4360309 1D CTCGCTGCTC A/- AACCCCTAGG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 3 2 36098 CASAVA_Build 1 4360676 1D ATGGAGTGGG A/- AGGTGGTCTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 2 1 36099 CASAVA_Build 1 4373093 4D TGATTAGCTC ATTT/---- ATTTTATAAC 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 ATTT 2 1 36100 CASAVA_Build 1 4386770 1D TCCAAAGCAT G/- GGCCACTCAT 3070 het 3070 hom 51 23 22 7 G 3 2 36101 CASAVA_Build 1 4386901 4I GACATTGTGT ----/GTGA GTGTGTGTAT 3070 het 3070 hom 66 30 34 2 GTGA 0 1 36102 CASAVA_Build 1 4387090 2D GAATGTGTGT GA/-- GTGTCAGTGT 3070 het 3070 hom 79 35 31 14 GA 1 0 36103 CASAVA_Build 1 4395580 1D TTATTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2148 hom 28 10 10 8 T 13 12 36104 CASAVA_Build 1 4398344 6D TACCTTGAAG GAGCTA/------ GTCCAATGTG 3070 hom 103 het 37 0 33 7 GAGCTA 1 0 36105 CASAVA_Build 1 4415364 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 10 9 36106 CASAVA_Build 1 4419730 1I CATTGTCGAC -/T TTTCTCTTCT 3070 het 3070 ref 36 12 16 8 T 3 4 36107 CASAVA_Build 1 4448380 1D GAGGCAGGGG A/- AAAATAGAGG 3070 hom 61 het 23 0 19 5 A 5 4 36108 CASAVA_Build 1 4484472 2I CACCCTCACA --/CT GTCAACATTC 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 CT 0 1 36109 CASAVA_Build 1 4486661 4D GGCTCCTAGG CTCC/---- CTCCCTGTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CTCC 2 1 36110 CASAVA_Build 1 4495865 5D AGAATGAAGT TGACC/----- TCTGATACCA 3070 hom 90 het 32 0 30 6 TGACC 1 0 36111 CASAVA_Build 1 4498896 6D GTTCAGAAAT AAACTC/------ AAGCGTTTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 AAACTC 1 0 36112 CASAVA_Build 1 4500995 1I TACTGTGGGG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 33 1 26 6 A 0 1 36113 CASAVA_Build 1 4501979 1I CTTAAGTTTG -/T TATAAGAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 1 2 36114 CASAVA_Build 1 4504725 4D ACAGAGACAT AGAC/---- AGAGAGAGAA 3070 hom 106 het 42 0 36 8 AGAC 1 0 36115 CASAVA_Build 1 4506250 1I ATCCATGTTG -/T CCAAGGGTGT 3070 hom 99 het 43 0 33 10 T 0 1 36116 CASAVA_Build 1 4510124 1I TCTGCCATCT -/C CCCCCCTTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 6 7 36117 CASAVA_Build 1 4511428 1I TAGAAACAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 8 9 36118 CASAVA_Build 1 4512562 3D AAGAAACTCT GGA/--- GGAGAAGAGA 3070 het 3070 hom 50 24 23 8 GGA 2 1 36119 CASAVA_Build 1 4513235 4I ATATGAACCT ----/ATCA ATCATCTCTT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 ATCA 1 2 36120 CASAVA_Build 1 4513553 1D GGCTGCTGCC T/- CCGGCCCTAT 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 T 1 0 36121 CASAVA_Build 1 4531573 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1726 hom 27 7 11 9 T 15 14 36122 CASAVA_Build 1 4535416 1I ACCATAGCAG -/C CACCACTGTC 3070 hom 117 het 48 0 39 9 C 1 2 36123 CASAVA_Build 1 4536765 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 13 14 36124 CASAVA_Build 1 4541493 1I AAAGAAGGCT -/G GGGCCTCTGG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 G 3 4 36125 CASAVA_Build 1 4547028 1D GTGTGACTGA C/- CACTTTCGGG 3070 hom 107 het 43 0 33 10 C 2 1 36126 CASAVA_Build 1 4547928 1D GTTTTTGCAA T/- TTGTCTATTG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 3 2 36127 CASAVA_Build 1 4551260 2I AAAAATGTTC --/TG TGTGGGAAAC 3070 hom 107 het 44 0 33 11 TG 2 3 36128 CASAVA_Build 1 4558626 1D GTGTGTCCCA G/- AGGAGACAGG 3070 het 3070 ref 37 18 10 9 G 1 0 36129 CASAVA_Build 1 4574508 11I CGCTCTTCAT -----------/TCCTCTAATGC TCAGATTCAG 3070 het 3070 hom 51 17 26 8 TCCTCTAATGC 0 1 36130 CASAVA_Build 1 4577695 1I ATCCAAAGGT -/G GCCCTCCAGG 3070 hom 66 het 26 0 21 5 G 1 2 36131 CASAVA_Build 1 4580635 1D TCAAAAAAAA T/- AAAATAAAAT 962 het 962 ref 20 9 7 4 T 1 0 36132 CASAVA_Build 1 4583560 1D CAATCTCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 A 12 11 36133 CASAVA_Build 1 4585623 3D CTGGGCCTGC CCA/--- GGTGGATCCA 3070 het 3070 hom 43 13 26 6 CCA 1 0 36134 CASAVA_Build 1 4586258 1D GGAGGAAGTG T/- CCAGAAGAGA 3070 het 2518 hom 26 6 13 8 T 1 0 36135 CASAVA_Build 1 4590831 7D GACATGGACT GCAAAGC/------- GCAAAGCTTG 3070 hom 111 het 46 0 35 13 GCAAAGC 2 1 36136 CASAVA_Build 1 4603646 1I TAGCCAGTGA -/C CTTCGGAGAT 3070 hom 148 het 57 0 50 7 C 1 2 36137 CASAVA_Build 1 4623257 13D GCAGACTGTG GAAAGCACCTCCA/------------- GAAAGCACGG 3070 hom 72 het 26 0 19 8 GAAAGCACCTCCA 1 0 36138 CASAVA_Build 1 4623619 19I AAGTTGTTAG -------------------/CTGGTGTCGGGAGCAGAGA CTGCCCAGAC 3070 hom 114 het 44 0 35 10 CTGGTGTCGGGAGCAGAGA 0 1 36139 CASAVA_Build 1 4628243 2D AGAGCAGTGC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 103 het 40 0 34 9 TG 7 6 36140 CASAVA_Build 1 4637664 1D ATGTGCATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 11 10 36141 CASAVA_Build 1 4645584 1I CCCTGCCCCA -/G GCGAAGGAGA 3070 hom 98 het 39 0 32 7 G 1 2 36142 CASAVA_Build 1 4695583 5D TGTGTGAGGT GTGAG/----- GTGAGCTCCT 3070 het 3070 hom 29 11 17 4 GTGAG 2 1 36143 CASAVA_Build 1 4702843 3D TGGTGATGTT GAC/--- GACTGACCGA 3070 het 3070 hom 50 14 30 6 GAC 2 1 36144 CASAVA_Build 1 4703850 9D CACTGAGAGA GCTCTCCAG/--------- GCTCTCCAGG 1874 het 1874 ref 32 14 6 13 GCTCTCCAG 3 2 36145 CASAVA_Build 1 4707912 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2266 het 2266 ref 30 11 9 10 A 13 14 36146 CASAVA_Build 1 4709953 2I TGCATGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 76 30 27 19 TG 8 9 36147 CASAVA_Build 1 4717875 1D AGAATTTAAT C/- ATGGAAGTGA 3070 het 3052 hom 32 7 18 7 C 1 0 36148 CASAVA_Build 1 4720165 2I GCATGTGTAT --/GA GAGTGTGTGA 3070 hom 174 het 62 0 56 6 GA 1 2 36149 CASAVA_Build 1 4722942 1D TAAAAGGAAA C/- AACCAGGGAT 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 C 1 0 36150 CASAVA_Build 1 4728236 1D13M4I TTTCCTCCAC TGTTTGCCGGATGC----/-GTTTGCCGGATGCTGTT TGTTATTCTG 3070 het 3070 hom 50 25 24 7 N/A 0 0 36151 CASAVA_Build 1 4730620 5D ATGAATCAGA CAAGG/----- CTGATGGTGG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 CAAGG 1 0 36152 CASAVA_Build 1 4743144 1D CATGTGCGCA T/- TACACACACA 3070 het 3070 hom 41 14 21 7 T 2 1 36153 CASAVA_Build 1 4751809 1I CATTGTCCCC -/T CCTCCTCCTC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 0 1 36154 CASAVA_Build 1 4768228 1D GTGTCCCCCC A/- CCCCAAATAT 3070 hom 63 het 22 0 18 4 A 1 0 36155 CASAVA_Build 1 4769223 1D GTATGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 T 12 11 36156 CASAVA_Build 1 4771108 13D GACAGTACAA TTATCGGTGGTTT/------------- CTAGGGGTTG 3070 hom 24 het 15 0 9 6 TTATCGGTGGTTT 1 0 36157 CASAVA_Build 1 4771151 28D GGGAGAGGTA GGCAGAGGATTTAGGGGGCAGTGAAACT/---------------------------- ATTCTGTATA 386 hom 7 het 9 0 3 9 GGCAGAGGATTTAGGGGGCAGTGAAACT 1 0 36158 CASAVA_Build 1 4779294 1D CAAAAGCAAG A/- AAACTGTCAC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 4 3 36159 CASAVA_Build 1 4790643 1D CCTTCTCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 10 9 36160 CASAVA_Build 1 4800830 1I ATTCAATTAT -/C CCCCCACTCT 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 C 5 6 36161 CASAVA_Build 1 4808451 1D AAAGAGACCG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 A 9 8 36162 CASAVA_Build 1 4831568 2D ATGCATACCC CA/-- CACACACTCC 3070 het 3070 ref 66 30 24 13 CA 4 3 36163 CASAVA_Build 1 4834789 1D TTTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3059 het 1757 hom 17 5 8 4 T 11 10 36164 CASAVA_Build 1 4840949 19D TAAACTCCGG ACTAAACCACATCCCTTGA/------------------- ACTTTGAGAT 3070 het 3070 hom 57 29 29 5 ACTAAACCACATCCCTTGA 1 0 36165 CASAVA_Build 1 4853669 2D5M4I ATGCTGAGTG CCCTTAG----/--CTAAGGGCT GGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 N/A 0 0 36166 CASAVA_Build 1 4854175 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 13 14 36167 CASAVA_Build 1 4865374 1I ACCAAAAGAC -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 6 7 36168 CASAVA_Build 1 4880336 1D TGACATCTTA T/- TTTTTGATCT 3070 het 3070 ref 43 26 10 7 T 6 5 36169 CASAVA_Build 1 4885469 2I GTATAATGAC --/TT TTTAAAATTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 3 5 36170 CASAVA_Build 1 4887751 1I AAATCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 17 15 17 T 10 11 36171 CASAVA_Build 1 4910193 1D ATGCAGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 14 12 A 12 11 36172 CASAVA_Build 1 4912660 1I AAGGGAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 14 7 A 11 12 36173 CASAVA_Build 1 4914724 1D AACAAAAATA G/- GGTCATTACA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 G 3 2 36174 CASAVA_Build 1 4935467 1D CTGGAGCCCT C/- CTGGGCGCAT 3070 het 3070 hom 40 10 26 5 C 2 1 36175 CASAVA_Build 1 4945527 1D CCACCATCCA C/- CCCCACATCC 3070 het 3070 hom 46 16 21 13 C 5 4 36176 CASAVA_Build 1 4968863 2D CGTGAGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 71 23 34 14 TG 10 9 36177 CASAVA_Build 1 4972555 1D GCATAAGGAA G/- GGGGGGATCT 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 G 7 6 36178 CASAVA_Build 1 4988700 1I TTCCCCAAAG -/T TTTCTCCCTC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 3 4 36179 CASAVA_Build 1 4994214 2D TCTCTTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 40 5 15 20 A 16 14 36180 CASAVA_Build 1 5018260 1I AGCAGAAAAT -/A AAAAGTACAA 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 A 4 5 36181 CASAVA_Build 1 5018587 1I ATCCTTCAGG -/A AAAATATAAC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 4 5 36182 CASAVA_Build 1 5026272 2D ATAAAGCCTG GT/-- TAATAAAGCT 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 GT 1 0 36183 CASAVA_Build 1 5049601 1D ATTTAACAAC A/- AAAAAGTTAT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 6 5 36184 CASAVA_Build 1 5060624 1D TTGGGAATGG A/- TCCTATATCC 3070 het 3070 hom 46 19 24 4 A 1 0 36185 CASAVA_Build 1 5064142 4I ATAGACTAAA ----/AGAG AACAATCATA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 AG 0 2 36186 CASAVA_Build 1 5067011 11D ATTCATGTTA CATTAGCACTT/----------- CATTAGCACT 3070 het 3070 hom 32 16 16 7 CATTAGCACTT 2 1 36187 CASAVA_Build 1 5067314 1D CAGAAGAAGG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 A 7 6 36188 CASAVA_Build 1 5073140 1I AAGGAAATCC -/A AAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 A 6 7 36189 CASAVA_Build 1 5081928 1D CAGATGCAGG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 A 9 8 36190 CASAVA_Build 1 5082825 1D AGACAACCAC T/- TGATCTCATC 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 2 1 36191 CASAVA_Build 1 5083237 1I TTAATTTTAA -/T TTTTTTTATT 2529 het 2529 ref 26 13 9 4 T 7 8 36192 CASAVA_Build 1 5093847 2D GAAAGTGAGT TC/-- TGTTTTGACA 3070 het 3070 hom 36 15 21 0 TC 1 0 36193 CASAVA_Build 1 5099578 1I CTTGTTTACT -/C CATATCCTCT 3070 het 3070 hom 46 23 23 0 C 1 2 36194 CASAVA_Build 1 5104511 7D TTGGCCTTGG GGGCTCC/------- GGGCTCCTCC 2611 het 2611 ref 25 13 8 7 GGGCTCC 2 1 36195 CASAVA_Build 1 5117178 1D TTCTGTACAC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 39 13 25 1 A 7 6 36196 CASAVA_Build 1 5123237 1I TCCCAGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 T 10 11 36197 CASAVA_Build 1 5123526 1D ACAAGGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 34 1 26 7 T 13 12 36198 CASAVA_Build 1 5123764 2I AACATGTGTC --/AT GATGGTTTGT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 AT 0 1 36199 CASAVA_Build 1 5125489 2I CATGGCCTAG --/GT GTGTTGTGAT 3070 het 3070 hom 37 8 18 11 GT 2 3 36200 CASAVA_Build 1 5126257 1I AAGAAAGCTG -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 A 6 7 36201 CASAVA_Build 1 5141707 1D CCTTTCCATG T/- TTTCTTTATC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 4 3 36202 CASAVA_Build 1 5154458 2D TGTAAAGTAA AT/-- AACCACATGG 3070 hom 126 het 47 0 40 8 AT 1 0 36203 CASAVA_Build 1 5159006 45D GCTTAACATA GCATGGTTAGTGAAAGAGATTGAGGAACAAATTTCCACTGAGTTG/--------------------------------------------- AGAGCGTTCC 3070 het 3070 ref 33 25 19 3 GCATGGTTAGTGAAAGAGATTGAGGAACAAATTTCCACTGAGTTG 1 0 36204 CASAVA_Build 1 5190076 1I16M1D AAACAGAACC -AAAAAATTAAACATTTA/AAAAAAATTAAACATTT- AAAAAAAATT 3070 hom 111 het 36 0 38 4 N/A 0 0 36205 CASAVA_Build 1 5191215 1D TTCCAGCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 683 hom 44 4 26 14 A 14 13 36206 CASAVA_Build 1 5199522 2D GCTTATGTAA CT/-- CTCATACAAC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 CT 2 1 36207 CASAVA_Build 1 5204270 6D TCCCCAGAGC CTCTCG/------ CCACCCCGAA 2795 het 1158 hom 30 6 10 15 CTCTCG 1 0 36208 CASAVA_Build 1 5211956 1D TGGGATGCAT G/- GGGGGAAAGG 3070 het 3070 ref 40 27 10 3 G 6 5 36209 CASAVA_Build 1 5221489 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1789 hom 21 7 12 2 A 11 10 36210 CASAVA_Build 1 5223556 1I TGAATCATGA -/G GGTGGGTCTT 2931 het 2931 ref 28 18 7 3 G 2 3 36211 CASAVA_Build 1 5238806 1I TCCAAAAAAA -/C CCCTGTTAAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 C 3 4 36212 CASAVA_Build 1 5239476 2D TTTTTTTTTT TG/-- AGACAGAGTC 2040 het 657 hom 15 3 8 4 TG 1 0 36213 CASAVA_Build 1 5241680 3D ATTAGTAGTT GTC/--- GTATTTGTGA 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 GTC 1 0 36214 CASAVA_Build 1 5244076 16I AGTTAAAAAA ----------------/GTATTTTCAGGGCTTG GAGTGGTGGC 3070 het 3070 hom 37 18 19 2 GTATTTTCAGGGCTTG 0 1 36215 CASAVA_Build 1 5247816 1I CTTGGCAGTG -/C AGCTGCTGTG 3070 het 3070 ref 43 16 18 9 C 0 1 36216 CASAVA_Build 1 5250033 2D ATGAATGGGT GG/-- GGATGGCTAA 3070 het 3070 hom 57 22 31 4 G 4 2 36217 CASAVA_Build 1 5250120 3D ACCCAACTTG GAA/--- GAAGAAGCAA 3070 het 3070 ref 45 25 14 8 GAA 3 2 36218 CASAVA_Build 1 5250559 1D TGCCTCTTTA T/- AATCTGTTCT 3070 het 3070 hom 53 21 24 10 T 1 0 36219 CASAVA_Build 1 5251814 1I AAAAACGGAG -/C GGGGGGATGC 3070 het 1147 hom 32 4 16 12 C 0 1 36220 CASAVA_Build 1 5264579 1I CTTCTTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 44 1 39 4 A 10 11 36221 CASAVA_Build 1 5274097 3I ATCATCCCTC ---/TGT TGTTTGAGTG 3070 hom 56 het 24 0 18 6 TGT 1 2 36222 CASAVA_Build 1 5277026 1D GTCCCCCCAA T/- CAAAAAAAAA 2083 het 2083 ref 33 22 5 7 T 1 0 36223 CASAVA_Build 1 5278146 15D CAAATCCAAC CCGTTGGATGTACTT/--------------- CCGTTGAAGT 3070 hom 101 het 41 0 33 8 CCGTTGGATGTACTT 1 0 36224 CASAVA_Build 1 5279727 2D AAAAAGAAAC AA/-- AGAAGAAATG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 3 1 36225 CASAVA_Build 1 5281758 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAC 2615 hom 18 het 8 0 7 1 A 9 10 36226 CASAVA_Build 1 5283670 3I GCAAGCTGAC ---/CTT CTTGTATGAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CTT 1 2 36227 CASAVA_Build 1 5286339 3I CAGAGCTGTG ---/GCC GCCGCCTCCT 3070 hom 93 het 37 0 33 4 GCC 2 3 36228 CASAVA_Build 1 5291131 2I TTGGGCAGTG --/AC ATGAAGGAGC 3070 hom 104 het 42 0 31 11 AC 0 1 36229 CASAVA_Build 1 5293115 26D TTTCATAGTT CATGGCTGCACATGGCACAGACGTGC/-------------------------- CATGGCTGTG 3070 hom 72 het 22 0 25 3 CATGGCTGCACATGGCACAGACGTGC 1 0 36230 CASAVA_Build 1 5296205 1D TGCTACCAAA G/- CTTTCTGTCA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 1 0 36231 CASAVA_Build 1 5302236 4D ACGGTAATGC ACTT/---- ACAGAAGGTG 3070 hom 141 het 50 0 46 4 ACTT 1 0 36232 CASAVA_Build 1 5303899 2I CCTCTCTGAG --/TC TCTGTTTTCT 3070 hom 152 het 56 0 51 5 TC 1 2 36233 CASAVA_Build 1 5395689 2D TCTGTCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 34 1 23 10 A 16 14 36234 CASAVA_Build 1 5396874 1D CCAGCATCCC G/- GGGCATCTAT 3070 hom 26 het 28 1 26 3 G 4 3 36235 CASAVA_Build 1 5398645 1D AAGGCCTGGC A/- AAAGCTCTGG 3070 het 3070 hom 41 18 17 7 A 4 3 36236 CASAVA_Build 1 5413866 1I CAAAAGATCC -/G GGGGGGGGGC 2802 het 2802 ref 30 9 10 11 G 9 10 36237 CASAVA_Build 1 5436122 1I AGTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 A 10 11 36238 CASAVA_Build 1 5473046 1I TTAAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 11 12 36239 CASAVA_Build 1 5483520 4D CATCTATCTG TCTA/---- TCTAGGCATC 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 TCTA 2 1 36240 CASAVA_Build 1 5483818 1I GCTGAAACCG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 8 9 36241 CASAVA_Build 1 5486548 1D CTGATGGATG C/- CCCTGCTTTC 3070 hom 77 het 29 0 23 6 C 4 3 36242 CASAVA_Build 1 5486987 1I CCTCACCGTT -/G AGGGGCAAAG 3070 hom 71 het 28 0 23 5 G 0 1 36243 CASAVA_Build 1 5490252 7D3M3D CCCAGAGTGC GGGGCAGGCATGG/-------CCA--- CGTCTGTCAG 3070 het 3070 ref 32 18 12 5 N/A 0 0 36244 CASAVA_Build 1 5500890 2D TTCTGAACTC TG/-- TGTGGAGTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TG 3 2 36245 CASAVA_Build 1 5502309 1I CTAGGCAGTG -/C CCCAGTGGGA 3070 hom 47 het 19 0 16 3 C 3 4 36246 CASAVA_Build 1 5502640 1I AGGCCCTGGG -/C CTGGCCCACG 3070 hom 63 het 28 0 18 10 C 1 2 36247 CASAVA_Build 1 5545299 1I CTAGGCAGTG -/C CCCAGTGGGG 3070 hom 56 het 21 0 16 5 C 3 4 36248 CASAVA_Build 1 5552196 4I TTCAACATTT ----/TTGA TTGATTGATT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 TTGA 2 3 36249 CASAVA_Build 1 5553099 1I CTATTCTCTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 A 8 9 36250 CASAVA_Build 1 5569537 3I GGCTGGGAGT ---/GAG GAGGGTCTTG 3070 hom 113 het 44 0 36 8 GAG 1 2 36251 CASAVA_Build 1 5570274 1D TCCAATCCAG A/- AAAAAATCAG 3070 hom 116 het 41 0 32 9 A 7 6 36252 CASAVA_Build 1 5586230 4D TTCTCTCTCA TCTC/---- TCTCTCATCT 3070 het 3070 ref 54 23 21 10 TC 5 3 36253 CASAVA_Build 1 5586852 4I TTCTCTCATC ----/TCTG TCTCTTTCTG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 TCTG 0 1 36254 CASAVA_Build 1 5593006 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 13 12 36255 CASAVA_Build 1 5600934 2I CTTCTAGTCT --/TA TTTAGTCTAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 TA 0 1 36256 CASAVA_Build 1 5603651 1I GACCCCCCCC -/T GAGTAAGGCA 3070 hom 85 het 34 0 25 9 T 0 1 36257 CASAVA_Build 1 5614880 1I GACTGAGCCT -/A GGGGTGAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 0 1 36258 CASAVA_Build 1 5616208 4I34M4D CACATGCATA ----TGTGTGTGCAGGTGTGTGTCTGTGTCTGTGTGCATGTG/TATCTGTGTGTGCAGGTGTGTGTCTGTGTCTGTGTGCA---- TGTGTCTGTA 3070 het 3070 ref 73 53 40 14 N/A 0 0 36259 CASAVA_Build 1 5622024 36D GTGACCATGC TGTCTTTGGCTACAGTGGCTCTGTTTCCAAGCAGAT/------------------------------------ TTCTCTTATT 1955 het 1955 ref 29 24 8 8 TGTCTTTGGCTACAGTGGCTCTGTTTCCAAGCAGAT 1 0 36260 CASAVA_Build 1 5625463 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2788 hom 22 8 11 4 A 11 10 36261 CASAVA_Build 1 5637961 15D GTGCAGAGCC ATGTGTCTGAGCCAT/--------------- GTGTCTGATA 3070 het 3070 ref 63 39 10 34 ATGTGTCTGAGCCAT 1 0 36262 CASAVA_Build 1 5638122 1D AACTGCACAA C/- GTTTGAGGAT 3070 het 3070 ref 93 54 8 31 C 1 0 36263 CASAVA_Build 1 5638246 1I TTAGAATGAT -/C CATTCTTTGA 3070 het 3070 ref 78 36 36 7 C 1 2 36264 CASAVA_Build 1 5650900 2I GCACTCCAGT --/GG GCTGCCTAGT 3070 het 3063 hom 80 10 29 41 G 1 3 36265 CASAVA_Build 1 5652066 3D CCAGATCATT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 58 12 26 21 TAA 1 0 36266 CASAVA_Build 1 5652710 12D19M5I CATCACCTTG GAGCAGGGGGTTGGGTGGGGGGTGAGGGGGG-----/------------GGGTGGGGGTTGCAGGGGGAGGCA CGCATCCTCT 3070 het 3070 ref 101 22 36 80 N/A 0 0 36267 CASAVA_Build 1 5655849 4D TTTCTCATGG TTTA/---- TTTAACACCA 1243 het 1243 ref 63 41 9 15 TTTA 2 1 36268 CASAVA_Build 1 5656968 1I8M3I21M2I GCATTGTTTC -TTTCTTTT---TTTTTTTTTTTTTTTTGAGGC--/TTTTCTTTTTCCTTTTTTGTTTTTTTTTGAGACAG AGTCTCGCTC 3070 het 3070 ref 96 44 30 38 N/A 0 0 36269 CASAVA_Build 1 5662103 1D GTTGAATCTC A/- AGAGTCAAGA 3070 het 3070 ref 61 33 21 9 A 2 1 36270 CASAVA_Build 1 5671452 2I TGTGTGCACA --/TG TGTGAGTGTG 3070 het 3070 ref 64 31 24 9 TG 2 3 36271 CASAVA_Build 1 5674418 20I CCAAAGTGAT --------------------/GACAACAAAGGTGACTCCAG GCATTGCCAA 3070 het 2637 hom 23 7 12 4 GACAACAAAGGTGACTCCAG 0 1 36272 CASAVA_Build 1 5693402 9D AGGGAAGGAA GGGAAGGAG/--------- GGAAGAGGGA 3070 hom 60 het 23 0 17 7 GGGAAGGAG 1 0 36273 CASAVA_Build 1 5701024 1D TAAAAACAGT C/- CCCCACACCT 3070 hom 84 het 30 0 26 4 C 5 4 36274 CASAVA_Build 1 5701291 2D ACTCCGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 20 0 14 7 A 16 14 36275 CASAVA_Build 1 5715037 4D CTTCTGTAGG CTGT/---- CTGTTTACTC 3070 het 3070 ref 26 17 9 0 CTGT 2 1 36276 CASAVA_Build 1 5720938 1D GTTGGAAGAG A/- AGTCTTATTT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 2 1 36277 CASAVA_Build 1 5722179 9I AAGATGAGAT ---------/GTTCTGAGG TTCCATCCTC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 GTTCTGAGG 0 1 36278 CASAVA_Build 1 5722802 1I GACCTGAGAC -/A AAAAAACCAA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 A 6 7 36279 CASAVA_Build 1 5727113 1D GTGCTGACAC G/- GGGGTAGGCC 1901 het 1901 ref 18 8 6 4 G 5 4 36280 CASAVA_Build 1 5729307 9D GCAGCAAGTG GGCTTCCCA/--------- GGCTTCCCAG 3070 het 3070 hom 37 12 10 17 GGCTTCCCA 3 2 36281 CASAVA_Build 1 5751139 1I CACATTTCAA -/C CCCCAATAAC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 C 4 5 36282 CASAVA_Build 1 5760107 7I TCAGAATAAG -------/ACTTTAA ACTTTAAAGT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 ACTTTAA 1 2 36283 CASAVA_Build 1 5762148 1D AGTTAGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 A 11 10 36284 CASAVA_Build 1 5769041 15D GAGGGGTGAG GTGGTGTTTGCACCT/--------------- GTGAGCAGGT 3070 het 3070 ref 29 17 9 9 GTGGTGTTTGCACCT 1 0 36285 CASAVA_Build 1 5777087 2I TGCACACGTG --/CA CACACACACA 3070 het 684 hom 81 3 62 16 CA 7 8 36286 CASAVA_Build 1 5780227 1D CTCCATCCAG C/- GAAGTCTAGA 3070 hom 128 het 45 0 40 5 C 1 0 36287 CASAVA_Build 1 5783404 5I3M1D TCAATGCATC -----AATG/GGGGGAAT- TACAAGTCAG 3070 hom 99 het 35 0 31 10 N/A 0 0 36288 CASAVA_Build 1 5783538 7D AGCAAATGTC CCCCCCA/------- CCCCCCACCA 2962 het 2962 ref 26 14 8 5 CCCCCCA 2 1 36289 CASAVA_Build 1 5791511 2D ATGCCACTAA AC/-- ACACACGCCA 3070 hom 153 het 55 0 48 7 AC 4 3 36290 CASAVA_Build 1 5796527 1D AGTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 26 1 19 7 T 11 10 36291 CASAVA_Build 1 5802120 1I TGTACAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 546 hom 29 2 17 10 A 13 14 36292 CASAVA_Build 1 5815202 2D TCAAAGAGTT TC/-- TCTCTGGTGA 3070 het 780 hom 31 5 16 11 TC 3 2 36293 CASAVA_Build 1 5820431 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAATAC 970 hom 7 het 3 0 3 0 A 8 7 36294 CASAVA_Build 1 5832913 1D TCCACTGGTT A/- AAAGTAAAAG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 4 3 36295 CASAVA_Build 1 5877981 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAT 2561 hom 21 het 9 0 8 1 A 9 10 36296 CASAVA_Build 1 5890354 3I GGCATTACCG ---/TGA TGGAGTGCCC 3070 hom 84 het 36 0 27 9 TGA 0 1 36297 CASAVA_Build 1 5912078 2D TGTTAACTAA AG/-- AGTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 50 23 22 7 AG 2 1 36298 CASAVA_Build 1 5935749 4D GTTTTTCTGC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 2587 hom 25 9 9 7 TTGT 4 3 36299 CASAVA_Build 1 5951674 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1933 het 182 hom 23 2 7 14 A 15 14 36300 CASAVA_Build 1 5955010 2I GGGGAGCCCA --/TC GATTTCCACA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TC 0 1 36301 CASAVA_Build 1 5972216 1D CTCAGTAAAT G/- GTCACGGAAC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 2 1 36302 CASAVA_Build 1 5973924 1D AAGCTCGCTA C/- CCCCATAGAA 3070 hom 105 het 41 0 35 8 C 5 4 36303 CASAVA_Build 1 5989849 1I GTCACTGCAT -/G GGGGGGGGCT 3070 hom 43 het 17 0 12 5 G 8 9 36304 CASAVA_Build 1 6014372 2D CATCTCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3037 het 61 hom 24 1 10 14 A 16 14 36305 CASAVA_Build 1 6023178 1I TTCCCACTGT -/A AAAAAACCGA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 6 7 36306 CASAVA_Build 1 6067434 6I CTACATTCCA ------/GCTTGG TTGATAGAGC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 GCTTGG 0 1 36307 CASAVA_Build 1 6083280 1I GGCAGCTGAG -/C CCCCCAAAGG 3070 hom 60 het 24 0 17 7 C 5 6 36308 CASAVA_Build 1 6083688 1I CTTTTTTTTT -/A AAACCTACCG 3070 hom 84 het 32 0 27 5 A 3 4 36309 CASAVA_Build 1 6087138 2I GCACAGGGCA --/GG GGGCCAGGGT 2789 hom 35 het 14 0 8 6 G 3 5 36310 CASAVA_Build 1 6106349 1D TGCTGTGATT A/- ACAGGTGTGA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 2 1 36311 CASAVA_Build 1 6125709 1D AGACATTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 26 1 16 9 T 13 12 36312 CASAVA_Build 1 6171590 1D GTGCCACCAC G/- CCCAGCTAAT 3070 het 3070 hom 19 9 8 4 G 1 0 36313 CASAVA_Build 1 6212431 20D TAAAAAAAAT ACACACACACACACACACAC/-------------------- ACACACACAC 3070 het 2303 hom 23 7 13 10 AC 20 10 36314 CASAVA_Build 1 6212770 1D GAACCATCTC T/- TTTTTTTTTG 1890 het 1890 ref 24 13 4 7 T 10 9 36315 CASAVA_Build 1 6219865 1D TATATGTACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 T 10 9 36316 CASAVA_Build 1 6244288 1I CCCCGGGCCT -/G GGGGGGTCCA 999 hom 20 het 9 0 6 3 G 6 7 36317 CASAVA_Build 1 6247511 2D TGCCGGGTAG CC/-- CAGGCATGGG 3070 het 2428 hom 18 7 9 3 C 3 1 36318 CASAVA_Build 1 6248011 6D GCTGTGCTGC CTATGG/------ CCTTGAGAAG 2603 het 2603 ref 28 14 9 6 CTATGG 1 0 36319 CASAVA_Build 1 6248264 2I CTTTCACTCT --/AA GTCTTGTGGC 3070 hom 63 het 27 0 21 6 A 0 2 36320 CASAVA_Build 1 6256289 1I TGCACTCCAG -/T TAACAGCTGA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 1 2 36321 CASAVA_Build 1 6268416 10D GAGGTCAGGA TGCTTCAGGG/---------- TCTCCCAGCA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TGCTTCAGGG 1 0 36322 CASAVA_Build 1 6315476 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 1166 het 1094 hom 10 3 4 3 A 9 10 36323 CASAVA_Build 1 6319415 2I TGGGGCCTTC --/AT GAGTTCAATT 3070 het 3070 hom 36 10 22 4 AT 0 1 36324 CASAVA_Build 1 6325593 2I ATGACCTTGT --/AA GTTTGAGCCA 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 0 2 36325 CASAVA_Build 1 6347671 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2964 hom 24 7 12 7 A 11 10 36326 CASAVA_Build 1 6404494 1D ACTCCACCCC T/- GGTCCCTATT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 1 0 36327 CASAVA_Build 1 6417443 1D TGAAATGAGC A/- GTTTGGTAGG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 1 0 36328 CASAVA_Build 1 6461689 1I CCACATCTGC -/T TTCTCTCCCA 3070 hom 64 het 26 0 20 6 T 2 3 36329 CASAVA_Build 1 6490831 3I GCGGTCACCT ---/GGG GGGGCCCCAC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 G 4 7 36330 CASAVA_Build 1 6499741 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 9 8 36331 CASAVA_Build 1 6506899 2I CCAACAGTTG --/TA TATAAGTGTA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TA 2 3 36332 CASAVA_Build 1 6518830 2D6M2D CATCTCTACT AAAAATGCAA/--AAATGC-- AAAATTAGCC 1765 hom 12 het 5 0 5 1 N/A 0 0 36333 CASAVA_Build 1 6522307 1D AACTTTTGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 105 het 36 0 36 1 T 8 7 36334 CASAVA_Build 1 6527007 12I CATCTCTACA ------------/AAAATAAAAAAT AAAATAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AAAATAAAAAAT 0 1 36335 CASAVA_Build 1 6528358 12I AAGGGCCCCG ------------/CCCATGAGCACA TCCTCTTGCA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CCCATGAGCACA 0 1 36336 CASAVA_Build 1 6532685 1D TCTAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 24 11 T 12 11 36337 CASAVA_Build 1 6536497 4D TCAAAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 6 AAAG 3 2 36338 CASAVA_Build 1 6540690 1I TTAGTTTTTG -/T TTTTTGTTTT 1673 het 1673 ref 34 15 12 7 T 5 6 36339 CASAVA_Build 1 6551182 2D GGAGAGACTC TG/-- TAAGGCGGGA 3070 hom 53 het 21 0 16 5 TG 1 0 36340 CASAVA_Build 1 6553092 1D AACACATCTC A/- AAAAAAAAAA 1572 het 1572 ref 24 12 5 7 A 17 16 36341 CASAVA_Build 1 6553940 1D GAGCTGCTGT C/- CCCCCCAAGG 3070 hom 105 het 38 0 34 5 C 7 6 36342 CASAVA_Build 1 6569547 9D TGTCAGGGAG CCTGCCTTC/--------- CCTGCCTTCC 3070 het 3070 hom 44 14 13 21 CCTGCCTTC 2 1 36343 CASAVA_Build 1 6593227 1I AATCCCAGCT -/A CTCAGGAGGC 3070 het 2128 hom 23 6 12 5 A 0 1 36344 CASAVA_Build 1 6595257 2D TTCTAATTTG AA/-- TTTTCAATTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 7 A 2 0 36345 CASAVA_Build 1 6606153 1D TTCTGCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2960 hom 34 11 17 6 A 11 10 36346 CASAVA_Build 1 6616229 3I TCCCATCATC ---/ATT ATTTTCTCTA 3025 het 3025 ref 28 15 8 5 ATT 1 2 36347 CASAVA_Build 1 6639363 1I CTGTCTCCAC -/A AAAAAAAACT 1612 het 992 hom 29 6 9 14 A 8 9 36348 CASAVA_Build 1 6639379 1D AACTAAAACC A/- AAAAAAAAAA 1947 het 459 hom 25 5 9 11 A 17 16 36349 CASAVA_Build 1 6641300 1I AAAAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 40 0 20 20 A 10 11 36350 CASAVA_Build 1 6644766 7D GCCCAGTTAA TTGTTTT/------- TTGTTTTTTG 2107 hom 5 het 13 0 6 9 TTGTTTT 3 2 36351 CASAVA_Build 1 6645480 3I CCACCCCAGC ---/CAG CAGCAACAAC 3070 hom 54 het 21 0 17 4 CAG 1 2 36352 CASAVA_Build 1 6665934 1I GTGGCAGTCA -/T ACGGCCCATG 3070 hom 156 het 58 0 47 11 T 0 1 36353 CASAVA_Build 1 6673938 3D CACAGAATTC AAG/--- AACAAATGGG 3070 het 3070 hom 43 14 24 6 AAG 1 0 36354 CASAVA_Build 1 6680457 1I ATGCTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 13 14 36355 CASAVA_Build 1 6710019 3I CATCTCAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AAC 3 4 36356 CASAVA_Build 1 6710165 1I AGGGGGTTCA -/T CAGAATCCGC 3070 hom 80 het 35 0 26 9 T 0 1 36357 CASAVA_Build 1 6715973 1D CCGCTTTCTT A/- AAATGTGCCT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 4 3 36358 CASAVA_Build 1 6719610 8I AGAGTGAGAC --------/TCCATCTA AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TCCATCTA 0 1 36359 CASAVA_Build 1 6724759 2D AAAAAAAAAA AT/-- AAAATAAAAA 2948 het 2948 ref 33 12 13 9 AT 1 0 36360 CASAVA_Build 1 6728453 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1864 hom 24 8 10 6 A 13 12 36361 CASAVA_Build 1 6729416 1D TTACACACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 24 1 17 6 T 13 12 36362 CASAVA_Build 1 6730326 2D CGTGGGTGAC AG/-- AGTGATACGC 537 het 537 ref 24 12 2 10 AG 2 1 36363 CASAVA_Build 1 6731338 9D TCCTTCTTCC CCTCCTCCT/--------- CCTCCTCCTC 1528 het 1528 ref 31 10 5 19 CCT 8 5 36364 CASAVA_Build 1 6737981 1D ACTTTCAAGG T/- TTTTTTTTTT 2890 het 1317 hom 25 4 10 11 T 11 10 36365 CASAVA_Build 1 6738503 2D AGGTACAGAC AG/-- ATGCCATCCC 3070 het 3070 hom 44 16 23 6 AG 1 0 36366 CASAVA_Build 1 6740179 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2935 het 299 hom 12 3 7 2 T 11 10 36367 CASAVA_Build 1 6743969 3I GTTAGAAAGA ---/ATC ATCACTGATA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 ATC 1 2 36368 CASAVA_Build 1 6744452 1D TTATAGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 22 0 11 11 T 17 16 36369 CASAVA_Build 1 6745890 1I TTTGAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 10 11 36370 CASAVA_Build 1 6746659 2D ACCATTCTAT TC/-- TCTCTGCTTC 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 TC 3 2 36371 CASAVA_Build 1 6749342 1D ATTTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1868 hom 19 5 8 6 T 11 10 36372 CASAVA_Build 1 6750070 1I ATCTGGTGTC -/T TGTCTCCTTG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 1 2 36373 CASAVA_Build 1 6751641 1I17M1I ACTCCATCTC -AAAAAAAATTAAAAATT-/AAAAAAAAATTAAAAATTA AAAAAAAAAA 2770 het 172 hom 15 2 9 6 N/A 0 0 36374 CASAVA_Build 1 6760594 1D CCTTTACTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 T 10 9 36375 CASAVA_Build 1 6772452 12D TTAGTGTATC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 2499 hom 29 11 14 8 T 24 12 36376 CASAVA_Build 1 6773899 1I TAAAAAAGTG -/T TTTGTTAGAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 3 4 36377 CASAVA_Build 1 6785388 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1653 het 1653 ref 35 23 5 7 T 12 11 36378 CASAVA_Build 1 6801952 1I AAAAATTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 T 9 10 36379 CASAVA_Build 1 6821402 4I CACAGCATCA ----/TGTT TGTTTGTTTC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 TGTT 2 3 36380 CASAVA_Build 1 6839775 1I GAGGCAAGAA -/T TGGAAGTTGA 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 1 2 36381 CASAVA_Build 1 6854231 1I TGGTTAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 9 10 36382 CASAVA_Build 1 6878493 1I GGCAGTGTGG -/T TTTTTTTCGT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 7 8 36383 CASAVA_Build 1 6880121 31I ATTTTTCTCA -------------------------------/TAAGATTAACACTATGAGAAACCATCTACTG TATATACACC 3070 het 3070 ref 44 22 20 6 TAAGATTAACACTATGAGAAACCATCTACTG 0 1 36384 CASAVA_Build 1 6888030 2D TAGTAGAGAC AG/-- GGTTTCACCA 3070 het 1406 hom 18 4 13 1 AG 1 0 36385 CASAVA_Build 1 6888829 14I TCATGTCAAA --------------/ATGCTCCTGGCAAT TGGTACTCCC 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 ATGCTCCTGGCAAT 0 1 36386 CASAVA_Build 1 6899096 1D AGGCTGCTCT C/- CCCCAGCATT 2176 het 2176 ref 30 14 8 8 C 5 4 36387 CASAVA_Build 1 6905053 1I CCAAGCAGCT -/C TCACTTGGGG 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 C 0 1 36388 CASAVA_Build 1 6920443 9I CCACCATCAC ---------/CATCACCAT CATCACCATC 3070 het 3070 ref 78 38 20 20 CATCACCAT 1 2 36389 CASAVA_Build 1 6923071 1D TTGGATGATG C/- CCCCCACACT 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 C 6 5 36390 CASAVA_Build 1 6926520 1I AAAAAAGAAA -/G AAAATACACA 1557 het 1034 hom 22 7 10 5 G 0 1 36391 CASAVA_Build 1 6935665 1D TGTGTGTTTT G/- CTTGTTTCAT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 G 1 0 36392 CASAVA_Build 1 6939192 2D ACAATCTCTT AA/-- AACTGACTCA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 4 2 36393 CASAVA_Build 1 6969816 1I GACTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2672 het 1496 hom 19 4 10 5 T 12 13 36394 CASAVA_Build 1 6977323 1D TTTGAACTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 10 9 36395 CASAVA_Build 1 7015641 1I TTTTTCTTTA -/T TCACTGGAGT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 1 2 36396 CASAVA_Build 1 7016541 12D GTGCCCAGCC TATTCTTATAAA/------------ TATTCTTGAG 3070 het 3070 hom 33 13 17 7 TATTCTTATAAA 1 0 36397 CASAVA_Build 1 7018048 2D ACTCGGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1497 hom 20 5 12 4 A 13 11 36398 CASAVA_Build 1 7020565 1D TTGATCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1112 hom 42 7 26 9 T 14 13 36399 CASAVA_Build 1 7022161 4D TGTCCAAGAG CCTC/---- CCTCATTTTA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 CCTC 2 1 36400 CASAVA_Build 1 7023506 3D TCGAGTAGCT GGG/--- ACCACAGATG 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 G 3 0 36401 CASAVA_Build 1 7026024 2I CTCTGTGTGT --/GA GTGTGTGTGC 3070 hom 110 het 46 0 37 9 GA 0 1 36402 CASAVA_Build 1 7027350 3D GCGACCTTCC GAG/--- GAGGCATCAG 3070 het 3070 hom 29 15 13 2 GAG 2 1 36403 CASAVA_Build 1 7027545 1D CATTTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 26 1 22 3 A 11 10 36404 CASAVA_Build 1 7028682 1I GCCTGGGATT -/C CTCCAGTGGG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 C 1 2 36405 CASAVA_Build 1 7031995 1D TCACCTGTCT C/- CCACCTTCAC 3070 het 3070 hom 57 26 27 5 C 3 2 36406 CASAVA_Build 1 7034918 1I TGTTGTGGTG -/T TTTCGTGTCG 3070 hom 70 het 28 0 22 6 T 3 4 36407 CASAVA_Build 1 7043351 1D GTCCCTTGAC T/- TTTTGCCCCA 3070 het 2354 hom 33 9 16 8 T 5 4 36408 CASAVA_Build 1 7044206 1I GCCTTTTGGA -/G GAGGTCAAGA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 1 2 36409 CASAVA_Build 1 7045312 1D TCGTTTACTG C/- CGTCTGCCTC 3070 hom 42 het 16 0 12 4 C 2 1 36410 CASAVA_Build 1 7048302 3I CAGCTGCACC ---/TTG TTGTTGGAGT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 TTG 2 3 36411 CASAVA_Build 1 7062120 1I GTGATAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 17 8 3 T 10 11 36412 CASAVA_Build 1 7084454 4D TGCACACAGC ACAA/---- ACACATATAC 3070 het 3070 ref 85 40 39 8 ACAA 1 0 36413 CASAVA_Build 1 7085958 4D CTGAGGCACC GTCT/---- GTCTGAGAGG 3070 het 3070 ref 56 29 20 9 GTCT 2 1 36414 CASAVA_Build 1 7086689 2I TATGCATACA --/AC ACACACACAA 3070 hom 166 het 65 0 55 10 AC 4 5 36415 CASAVA_Build 1 7086900 2D29M2I CACAACACAC ATACACACAACTACATACATGCACACAAAAC--/--ACACACAACTACATACATGCACACAAAACAT AAATATTCAA 3070 het 2269 hom 53 10 27 31 N/A 0 0 36416 CASAVA_Build 1 7088587 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2138 hom 30 10 14 7 A 12 11 36417 CASAVA_Build 1 7122971 1I ACATGGCAAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 8 9 36418 CASAVA_Build 1 7125438 3I TACAGCCTGC ---/AGA AGAACTGTGA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 AGA 1 2 36419 CASAVA_Build 1 7145687 1I GAGGCTGGAT -/G GGGCCTCTCT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 G 3 4 36420 CASAVA_Build 1 7157911 1D CGGCTGGCAG T/- TTTAATGCCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 4 3 36421 CASAVA_Build 1 7164423 4I ATCATAAAAA ----/AGAC AGTTTGTCCC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 AGAC 0 1 36422 CASAVA_Build 1 7181804 1D TTTACTGATG C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 63 het 25 0 19 6 C 8 7 36423 CASAVA_Build 1 7184500 1I TCAATTTTTT -/A TGGTGTCCTT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 0 1 36424 CASAVA_Build 1 7186137 1D TTGTGGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 790 hom 37 4 17 16 T 17 16 36425 CASAVA_Build 1 7187457 1D TCAGAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 574 het 22 hom 16 1 5 11 T 12 11 36426 CASAVA_Build 1 7197512 2I CTTTCTTTTT --/TC TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TC 0 1 36427 CASAVA_Build 1 7197809 1I GATTATCCTA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 6 7 36428 CASAVA_Build 1 7199121 1D TGTTTTCATC T/- ATATTTCCTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 0 36429 CASAVA_Build 1 7214894 1I AGTGGCTGAG -/C CAAGGCACCC 3070 hom 36 het 18 0 13 5 C 1 2 36430 CASAVA_Build 1 7214927 1I17M1I TGTGGCTGTG -CTGCACACGGCTGCCCC-/CCTGCACACGGCTGCCCCG GGCTTCTCAG 3070 hom 25 het 18 0 12 9 N/A 0 0 36431 CASAVA_Build 1 7220804 1D GTCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 15 14 36432 CASAVA_Build 1 7224659 1I GGAAAAGAGG -/A GACAAGTTAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 0 1 36433 CASAVA_Build 1 7227826 2D TTTAGCCAAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AT 7 6 36434 CASAVA_Build 1 7240228 2I AGCGAGGGTC --/TG TGTGCGTACT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TG 2 3 36435 CASAVA_Build 1 7240361 1I TAAACAACAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 22 20 7 T 9 10 36436 CASAVA_Build 1 7250914 1D CAGAGGAGAA G/- GGGGGGTCAG 3070 hom 73 het 32 0 25 7 G 7 6 36437 CASAVA_Build 1 7258839 1I ATTCATGATT -/A AAAAAAAAAA 1916 het 1906 hom 13 6 4 3 A 11 12 36438 CASAVA_Build 1 7260422 1I ATACACACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 33 2 27 4 T 11 12 36439 CASAVA_Build 1 7277501 1I GCCTCCAAGG -/C CAAGGCCCTT 3070 hom 131 het 47 0 38 9 C 1 2 36440 CASAVA_Build 1 7280984 1I CCACCCCGCA -/G GGTCTTTTCC 3070 hom 71 het 28 0 22 6 G 2 3 36441 CASAVA_Build 1 7283326 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1210 het 1210 ref 28 15 4 9 A 13 14 36442 CASAVA_Build 1 7286722 3D GGAGGGAGAT GAA/--- GAGTTATTGC 3070 hom 60 het 29 0 20 11 GAA 1 0 36443 CASAVA_Build 1 7287590 1I CCAAAATTAC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 7 8 36444 CASAVA_Build 1 7288042 1D AAGCAAAAAA C/- CCCCCACTAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 C 6 5 36445 CASAVA_Build 1 7289980 1D AGTTCTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 43 0 37 8 T 11 10 36446 CASAVA_Build 1 7290910 1D TTAGTCTTGT G/- GAGAAGTTTA 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 G 2 1 36447 CASAVA_Build 1 7294249 1D GAAAGTTGAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 10 9 36448 CASAVA_Build 1 7295051 4I ACCGTGGCTC ----/TCTT TCTTTCTACA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 TCTT 1 2 36449 CASAVA_Build 1 7300876 11D AAACACAGGG AGGCACTGAGC/----------- AGTGGCAGGT 2845 het 2845 ref 33 16 11 6 AGGCACTGAGC 1 0 36450 CASAVA_Build 1 7311009 1D CCTGTAGTGG T/- TATGCTCCTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 2 1 36451 CASAVA_Build 1 7312585 2D GGCTCTCTCT CC/-- CACAGACCCT 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 C 3 1 36452 CASAVA_Build 1 7321970 2I AACAAAAGAC --/AA AAAGCTAGGT 3070 het 3070 ref 52 29 15 8 A 3 5 36453 CASAVA_Build 1 7336079 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 26 0 17 9 T 11 12 36454 CASAVA_Build 1 7337952 1I GATGGCTTGG -/C CCCGGAGGGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 3 4 36455 CASAVA_Build 1 7338490 1I CTTGGCGTTG -/C CACATCTGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 36456 CASAVA_Build 1 7340335 3D GCTTTTGTTT TTA/--- TTATTATTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTA 3 2 36457 CASAVA_Build 1 7341900 2I TCCTCATCTC --/TG TGCCATGTGC 3070 hom 111 het 41 0 35 6 TG 1 2 36458 CASAVA_Build 1 7345442 1D TAGTAGACTT G/- AATAGACTGA 3070 hom 172 het 64 0 58 6 G 1 0 36459 CASAVA_Build 1 7347095 1D CTTGTGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 551 hom 25 3 16 6 T 14 13 36460 CASAVA_Build 1 7347880 1I GGTGGCTGCG -/C CTGTGGATGG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 C 1 2 36461 CASAVA_Build 1 7349365 1D GGCCCTTGGG T/- CTGCAAGCTG 3070 hom 108 het 40 0 33 7 T 1 0 36462 CASAVA_Build 1 7365185 1I ATGGGGAATT -/G GCAAGCCAAT 3070 hom 72 het 29 0 23 6 G 1 2 36463 CASAVA_Build 1 7371958 4D GCTCCCCCTG CAGC/---- CCTGCTGGGT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 CAGC 1 0 36464 CASAVA_Build 1 7375702 1I TATATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1670 hom 38 5 28 5 A 15 16 36465 CASAVA_Build 1 7388193 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 210 hom 29 1 27 1 T 9 8 36466 CASAVA_Build 1 7388400 1I ATAACACCAC -/A ACCGGGTGGA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 1 2 36467 CASAVA_Build 1 7392185 1I GCAGGCTCCC -/A AAGGGCTTCC 3070 hom 117 het 44 0 38 6 A 2 3 36468 CASAVA_Build 1 7400765 1I CCCTTGGTTT -/C CTCTATTTCA 3070 hom 96 het 33 0 30 3 C 1 2 36469 CASAVA_Build 1 7401860 1I CTGGAATGCA -/G GGGCACGATC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 G 3 4 36470 CASAVA_Build 1 7404472 12I ACAGAGGGGA ------------/CCTATGTCTCCT CCATACCCTC 3070 hom 106 het 42 0 29 13 CCTATGTCTCCT 0 1 36471 CASAVA_Build 1 7426497 1D CTACAGGGGG T/- CCCAGCTGAG 3070 het 3070 hom 32 15 12 6 T 1 0 36472 CASAVA_Build 1 7433529 1I CAGGGCATCT -/G CATCTTACTG 3070 hom 54 het 25 0 18 7 G 0 1 36473 CASAVA_Build 1 7443241 1D GCTGTGACTG C/- CCCCCCCAAC 2298 het 2298 ref 25 13 7 6 C 8 7 36474 CASAVA_Build 1 7448142 1D AAGGAGACCA G/- GGGCATGGGA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 G 4 3 36475 CASAVA_Build 1 7462756 2D GTGTGAGAGC GT/-- GTGTGTGTGT 1257 het 1257 ref 88 67 4 20 GT 7 6 36476 CASAVA_Build 1 7500207 1D ATATATCATC T/- CTTTAATGTT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 1 0 36477 CASAVA_Build 1 7519492 1D CTGAGCTACT C/- CCAGGGATCC 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 C 3 2 36478 CASAVA_Build 1 7521636 1I TGCTTTCCTT -/C CCCTTTCATC 3070 het 3070 ref 35 18 8 9 C 3 4 36479 CASAVA_Build 1 7523374 1I AGTTGAGGGT -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 44 13 25 6 A 6 7 36480 CASAVA_Build 1 7524516 1D CACTGACGTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 7 6 36481 CASAVA_Build 1 7533474 1D TACCACCCGG C/- CCCCTCACCT 1180 het 1147 hom 11 4 5 2 C 5 4 36482 CASAVA_Build 1 7534839 1D GGCCACCACA C/- CCCCCCAGTG 2552 het 2552 ref 34 16 9 9 C 7 6 36483 CASAVA_Build 1 7535349 2D TCCAAACACT CA/-- GGGCTCTGGA 3070 het 3070 ref 30 12 12 8 CA 1 0 36484 CASAVA_Build 1 7535867 16D44M8D AATAAGTGAG TGAATGAATGAGGGAATGAATGAATGAGGGAATGAATGAATGAGTGAATAATTGAGTGAGTGAATGAA/----------------TGAATGAATGAGGGAATGAATGAATGAGTGAATAATTGAGTGAG-------- TGAGTGAATG 3070 het 3070 ref 51 40 19 21 N/A 0 0 36485 CASAVA_Build 1 7536451 1D TCGTGCTCTG C/- AGGGCTATCT 3070 het 3070 ref 53 29 21 3 C 1 0 36486 CASAVA_Build 1 7537456 1I CTTGCTTCAT -/C CCCCCCCAAC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 C 7 8 36487 CASAVA_Build 1 7538262 1D TCCTGGAACA G/- GCAGGAGAAA 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 G 2 1 36488 CASAVA_Build 1 7538417 1I TCATTCATTC -/T ACCTCCTCTG 3070 het 3070 hom 30 11 19 0 T 0 1 36489 CASAVA_Build 1 7629926 1I AGATCCAGAA -/G GGGGGGGGGG 1297 hom 32 het 19 0 6 13 G 10 11 36490 CASAVA_Build 1 7632237 1I CCTACTTTGC -/T TCCAGGATCC 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 1 2 36491 CASAVA_Build 1 7637243 2D ACACAGCTAT AC/-- ACACACACTC 3070 hom 83 het 40 0 28 12 AC 5 4 36492 CASAVA_Build 1 7638126 2D CCACCTATAC AA/-- ACACACACCT 3070 hom 75 het 38 0 25 14 A 3 1 36493 CASAVA_Build 1 7669964 1I AAGGTGTTTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 51 21 21 9 A 8 9 36494 CASAVA_Build 1 7670839 4I TATTTTTAGT ----/ACAG ACAGAGTTTC 3070 het 1131 hom 11 3 8 0 ACAG 1 2 36495 CASAVA_Build 1 7678832 2D TAAGTTTTTG TT/-- TTGTTGTTGC 1132 het 1132 ref 48 21 7 20 T 4 2 36496 CASAVA_Build 1 7679933 2D CTGGGCTATC TA/-- TTTAAGTTTA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 TA 1 0 36497 CASAVA_Build 1 7681298 2D CCCCTTTCCC CT/-- GAGTCAGCCA 3070 het 3070 ref 31 15 11 7 CT 1 0 36498 CASAVA_Build 1 7681449 2I GAAGCACTGT --/GA CAAACTGCCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 GA 0 1 36499 CASAVA_Build 1 7684728 3D CAGGCACTCC AGG/--- AGAAGAACGA 3070 het 2466 hom 27 8 12 7 AGG 1 0 36500 CASAVA_Build 1 7695497 1D GGCACGTCTT A/- ACATGGCAGC 3070 hom 82 het 32 0 29 3 A 2 1 36501 CASAVA_Build 1 7699284 4D TTAGCAAGAC AGTT/---- AGCACCGTCT 3070 het 3070 ref 38 20 11 8 AGTT 1 0 36502 CASAVA_Build 1 7705121 4I CCCTTGGGCC ----/AGTT ATTGTTTGGA 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 AGTT 0 1 36503 CASAVA_Build 1 7708865 1I TGTCAAAGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 T 9 10 36504 CASAVA_Build 1 7709112 3I AGGTTTGTAT ---/TGA TGATACCTAG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 TGA 1 2 36505 CASAVA_Build 1 7713574 6D TCTCTCTCTC TCTATA/------ TATATATATA 3016 hom 23 het 13 0 10 4 TCTATA 1 0 36506 CASAVA_Build 1 7716319 1I CAGTCGTTGC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 8 9 36507 CASAVA_Build 1 7717189 2D TGTTTAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 19 11 A 13 11 36508 CASAVA_Build 1 7721493 1D GTCAAGACCT A/- AAAATAGCTA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 5 4 36509 CASAVA_Build 1 7730554 1D TTTTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 153 hom 25 1 15 9 T 13 12 36510 CASAVA_Build 1 7740194 3D CAGCCGGATC ACT/--- TGAGGTCAGG 3070 het 2092 hom 21 6 9 6 ACT 1 0 36511 CASAVA_Build 1 7744074 1D GCAGTTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2985 hom 31 9 17 5 T 12 11 36512 CASAVA_Build 1 7748901 1I TTTAGAATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 45 0 36 9 T 9 10 36513 CASAVA_Build 1 7750866 1D AAAATTGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 11 10 36514 CASAVA_Build 1 7757002 1D TCAAATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 11 10 36515 CASAVA_Build 1 7759464 1D TGTGCCTCCA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 8 7 36516 CASAVA_Build 1 7761509 4D AGTCCCTGTC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 2878 hom 22 7 13 2 TTGT 5 4 36517 CASAVA_Build 1 7769950 1I TTAGTATATC -/T TTTTTTAATC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 6 7 36518 CASAVA_Build 1 7771793 2I TTAAAATATA --/TG TATATATATA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 TG 0 1 36519 CASAVA_Build 1 7779836 12D AGCTGGAAGG TGTGAGCATGGA/------------ TGTGAGCATG 2447 het 2447 ref 46 24 11 17 TGTGAGCATGGA 2 1 36520 CASAVA_Build 1 7782864 1I AATCACTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 17 7 T 11 12 36521 CASAVA_Build 1 7783489 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAAAA 3070 het 4 hom 17 1 11 5 G 0 1 36522 CASAVA_Build 1 7783741 1I TAAATGGGTC -/T TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 3 4 36523 CASAVA_Build 1 7786959 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1062 het 1062 ref 33 15 3 15 T 15 16 36524 CASAVA_Build 1 7794915 1I ATCGGTACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 9 10 36525 CASAVA_Build 1 7795536 2D CTTTATACTC TT/-- TGCTTGAGAG 3070 het 3070 ref 47 30 15 3 T 3 1 36526 CASAVA_Build 1 7798477 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2339 het 1237 hom 18 5 7 6 A 14 13 36527 CASAVA_Build 1 7804906 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 16 1 9 6 T 15 14 36528 CASAVA_Build 1 7815366 1D TTGGATTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 38 het 27 0 21 6 T 10 9 36529 CASAVA_Build 1 7822983 1I CTTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1711 hom 25 6 12 7 T 11 12 36530 CASAVA_Build 1 7823936 1I GCCTTAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1785 hom 33 7 14 12 T 14 15 36531 CASAVA_Build 1 7830208 4I AAGAAAAGAA ----/TAAT TAATTATAAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TAAT 1 2 36532 CASAVA_Build 1 7830393 1I CTGAGCTGAC -/T TAACAGATGC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 1 2 36533 CASAVA_Build 1 7833967 4D TGGAGAGGAA AAAG/---- AAAGATCGTT 3070 het 3070 ref 53 25 24 5 AAAG 2 1 36534 CASAVA_Build 1 7835150 4D AAGGTGAAAC AAAT/---- AAATCCATTA 3070 het 3070 ref 32 16 15 5 AAAT 2 1 36535 CASAVA_Build 1 7835772 1D CATCCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2454 hom 36 12 15 9 A 16 15 36536 CASAVA_Build 1 7837184 4I AAGAAGAAAG ----/AAAA AAAAGTGGTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 4 8 36537 CASAVA_Build 1 7837502 3D AACTAATAAC AAT/--- AATAATAATA 3070 het 2549 hom 38 9 21 8 AAT 7 6 36538 CASAVA_Build 1 7838857 1I GGGGCACCAG -/C CCTATGGGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 2 3 36539 CASAVA_Build 1 7840123 1D CTACTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 23 9 A 13 12 36540 CASAVA_Build 1 7842037 1I TAACCCCTGA -/G GGGGGTCACA 3070 het 1646 hom 21 5 12 4 G 5 6 36541 CASAVA_Build 1 7842645 1I GATCCTGTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 46 het 41 0 19 22 A 9 10 36542 CASAVA_Build 1 7842661 2I AAATGCATAC --/AT ATATATATAT 1841 het 1679 hom 38 8 7 23 AT 5 6 36543 CASAVA_Build 1 7843310 1I TCAAATGCCT -/G GGCTCAAGCC 3070 hom 30 het 12 0 9 3 G 2 3 36544 CASAVA_Build 1 7849579 3D AACAGTGGCG CCA/--- CCTTGGCTCA 2404 het 1322 hom 16 4 7 5 CCA 1 0 36545 CASAVA_Build 1 7850779 1D GCACATCACC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 9 8 36546 CASAVA_Build 1 7854539 1D GGGCCTCCTC A/- ATTCCCTGAG 2795 het 2795 ref 25 12 7 7 A 2 1 36547 CASAVA_Build 1 7859051 1D ACCCAGCCTG T/- TGCCACCAAT 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 T 2 1 36548 CASAVA_Build 1 7859406 1D ACATATACAG A/- AAAAAAGTCT 2440 het 2440 ref 25 13 8 4 A 7 6 36549 CASAVA_Build 1 7863682 1I AATGAAGGAC -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 A 6 7 36550 CASAVA_Build 1 7864819 1D CCATCTCTAC A/- AACACTTTAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 3 2 36551 CASAVA_Build 1 7868493 1D AAGGGCGAGG C/- CCAGGAGAGG 1318 hom 12 het 5 0 5 0 C 3 2 36552 CASAVA_Build 1 7872772 1I GCCTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 990 het 990 ref 22 6 4 12 A 17 18 36553 CASAVA_Build 1 7873615 1D ATACCCTCCA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 C 9 8 36554 CASAVA_Build 1 7884847 3I ATCTCTGCCC ---/CCT CCGGGTGAGG 3070 hom 92 het 34 0 29 5 CCT 0 1 36555 CASAVA_Build 1 7886322 1I CAGGCATGAG -/C CACCACGTCC 3070 hom 78 het 30 0 24 6 C 1 2 36556 CASAVA_Build 1 7888076 2I ATAGGCGTGA --/GC CGCCGTGCCA 3070 hom 38 het 14 0 12 2 GC 0 1 36557 CASAVA_Build 1 7888989 1I TACAGCCAGA -/G GCCTCTGCCA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 G 1 2 36558 CASAVA_Build 1 7890680 1I7M1I CAGGAATGGT -GCTCATG-/GGCTCATGC CTGTAATCCC 3070 hom 45 het 17 0 16 2 N/A 0 0 36559 CASAVA_Build 1 7894548 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 18 2 13 3 A 17 14 36560 CASAVA_Build 1 7894835 19D AGCCTAAATT TAAAATAGAGCCAAATGGC/------------------- TAAAATAGTT 3070 hom 93 het 31 0 32 3 TAAAATAGAGCCAAATGGC 1 0 36561 CASAVA_Build 1 7895104 3D CCCCCTTTTC TTG/--- TTGTTTTTCT 3070 hom 115 het 43 0 38 5 TTG 2 1 36562 CASAVA_Build 1 7895639 1D TAGCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 30 1 24 5 T 15 14 36563 CASAVA_Build 1 7896235 9I TGTTTTTTTT ---------/TTTTTGTTG TTGTTGTTGT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 TTTTTGTTG 0 1 36564 CASAVA_Build 1 7896380 2I CGAGGGTTTT --/TG TTTTTTTGTT 3070 hom 41 het 19 0 16 3 TG 0 1 36565 CASAVA_Build 1 7909710 1I GTCTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 38 0 35 3 A 11 12 36566 CASAVA_Build 1 7910378 1I GAGATAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 11 12 36567 CASAVA_Build 1 7929156 1D TATGTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 136 hom 34 1 26 7 T 13 12 36568 CASAVA_Build 1 7952131 1I TGCTTATGTT -/C CTGTTAATTT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 C 1 2 36569 CASAVA_Build 1 8042006 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 25 1 17 7 T 12 11 36570 CASAVA_Build 1 8074560 1D GGAAGATAGC T/- TTTTTTTTTT 1815 het 1815 ref 40 29 5 6 T 13 12 36571 CASAVA_Build 1 8076709 1D CGGGCATTTT G/- GGGCAACAAA 3070 hom 128 het 50 0 42 8 G 4 3 36572 CASAVA_Build 1 8094621 1I ATTTAAAAAA -/T CTTAATCGAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 0 1 36573 CASAVA_Build 1 8096233 1I GAAAATGCAC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 124 het 48 0 41 7 T 7 8 36574 CASAVA_Build 1 8097977 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 28 1 23 4 A 15 14 36575 CASAVA_Build 1 8106447 1D GGAGCAATTT G/- GGGAGGTTCA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 4 3 36576 CASAVA_Build 1 8111861 3I GAGGGGAAGC ---/CGG CGGCACATCT 1703 hom 23 het 10 0 7 3 CGG 1 2 36577 CASAVA_Build 1 8115191 2D CATAAGAGTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 5 TA 1 0 36578 CASAVA_Build 1 8115691 2I AAATTAAAAA --/AG TTTTTTTTAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AG 0 1 36579 CASAVA_Build 1 8117914 1I CCCCATATCC -/G GAATCTGGCC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 1 2 36580 CASAVA_Build 1 8122763 1D ACTCAAGAAC G/- GGGAAACTGG 3070 hom 88 het 37 0 26 11 G 4 3 36581 CASAVA_Build 1 8131439 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 311 hom 28 2 17 9 A 15 14 36582 CASAVA_Build 1 8132189 4I TGTGCATCTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TTTC 2 3 36583 CASAVA_Build 1 8140191 3I GATAAAACAA ---/ATG ATAAGTTATT 2349 hom 12 het 8 0 5 3 ATG 0 1 36584 CASAVA_Build 1 8142030 1I TGCTCGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 25 1 21 3 T 12 13 36585 CASAVA_Build 1 8142742 3I GTTTTTGCTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 29 0 23 6 T 13 16 36586 CASAVA_Build 1 8144460 1D CCGTGGTGGT G/- GGGGGGGTGC 3070 hom 100 het 39 0 34 5 G 8 7 36587 CASAVA_Build 1 8145686 1D ACCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 112 hom 35 1 26 8 T 12 11 36588 CASAVA_Build 1 8145848 1I CTATTTTGTT -/A TGCTTTTGAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 0 1 36589 CASAVA_Build 1 8146613 3D GTGATAACTT TAA/--- GTTAATTGAC 3070 hom 117 het 42 0 40 4 TAA 1 0 36590 CASAVA_Build 1 8146803 1D TATAACCTCA C/- CCCCCACCCA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 6 5 36591 CASAVA_Build 1 8166393 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 194 hom 41 3 25 13 T 14 13 36592 CASAVA_Build 1 8166874 2D CTTTTACTGA CT/-- CTGTTGGCAG 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 CT 2 1 36593 CASAVA_Build 1 8168859 1D CACTCTGACC T/- GGGTGACAAA 3070 hom 72 het 27 0 23 5 T 1 0 36594 CASAVA_Build 1 8175391 1D TCATTGGTTC A/- AGTCAGCTAG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 2 1 36595 CASAVA_Build 1 8200714 1I GAGGGGTGTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 9 10 36596 CASAVA_Build 1 8229597 1I TTTTGCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2520 het 2316 hom 36 8 10 18 T 14 15 36597 CASAVA_Build 1 8230767 1D GTCTAGACTG A/- AAATACTGGA 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 4 3 36598 CASAVA_Build 1 8240919 1I ACTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 5 6 36599 CASAVA_Build 1 8244006 28D CTCTCTTTCT TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC/---------------------------- TTCCTTCCTT 3070 hom 38 het 14 0 13 7 TTCC 11 4 36600 CASAVA_Build 1 8258176 1I ACCCTGTCTT -/C AAAAAAAAAA 3070 het 330 hom 23 1 21 1 C 0 1 36601 CASAVA_Build 1 8259947 4I GAGACAAGGT ----/CTCA CTCTGTTATT 3070 hom 76 het 34 0 30 5 CTCA 0 1 36602 CASAVA_Build 1 8268503 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 13 12 36603 CASAVA_Build 1 8275653 1D CCTGGACTTA C/- ATCCTAATTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 0 36604 CASAVA_Build 1 8276517 1D AAGCCAGGAG T/- TTGAGACCAG 3070 het 1037 hom 25 3 16 7 T 3 2 36605 CASAVA_Build 1 8280307 1D TAAAACCAAC T/- TTTTTTTTTT 1749 het 137 hom 33 2 11 20 T 19 18 36606 CASAVA_Build 1 8285704 1I ACTTTTTTTT -/A ATTCTGAAAG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 1 2 36607 CASAVA_Build 1 8296160 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 21 12 T 12 11 36608 CASAVA_Build 1 8306264 5I GTTCGGCTTA -----/TTACT TTAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 TTACT 0 1 36609 CASAVA_Build 1 8357760 1I AGTACGTGCT -/C ATCTCATCTG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 C 0 1 36610 CASAVA_Build 1 8362988 1D GTCAACAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 26 0 18 8 T 17 16 36611 CASAVA_Build 1 8371400 2D AGATTGTCAA AT/-- ATATTCCAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 AT 3 2 36612 CASAVA_Build 1 8373295 1I CTAGTAAATA -/T TTTTAAAACT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 4 5 36613 CASAVA_Build 1 8386081 1D TCATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2857 het 690 hom 26 2 11 13 T 15 14 36614 CASAVA_Build 1 8389455 1I TGAGGATCTT -/A AAAAAACCTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 6 7 36615 CASAVA_Build 1 8420914 1I TTGGGATTAT -/G GGCATGAGCC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 G 2 3 36616 CASAVA_Build 1 8426523 15D ATGGAGGCTT GGCAGCCTCTGCCAA/--------------- GATTTCAGAG 3070 het 3070 ref 32 18 14 10 GGCAGCCTCTGCCAA 1 0 36617 CASAVA_Build 1 8434089 1I AAAAAAGAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 8 9 36618 CASAVA_Build 1 8435171 3D CACAGAAATC AAT/--- AATGTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 20 5 AAT 2 1 36619 CASAVA_Build 1 8436456 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 948 het 948 ref 11 6 2 3 A 9 10 36620 CASAVA_Build 1 8443075 3D TCAATTTTGA AAG/--- AAGGATTTTC 3070 het 3070 ref 36 22 13 2 AAG 2 1 36621 CASAVA_Build 1 8464867 2D ATTGGATTGT AA/-- AAGTGGCCTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 4 2 36622 CASAVA_Build 1 8479148 1I AGTAACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1902 hom 21 8 11 2 A 10 11 36623 CASAVA_Build 1 8487096 1I ATCCACTGGT -/A ACCATGGAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 1 2 36624 CASAVA_Build 1 8493419 4I TTCAGCCACA ----/GCCC GCCCATTCAG 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 GCCC 1 2 36625 CASAVA_Build 1 8506308 12I5M2D ACATACCACA ------------CTCATTA/CAAGAAGTAACTCTAAT-- GAGTTACTTT 3070 het 3070 ref 49 28 19 4 N/A 0 0 36626 CASAVA_Build 1 8508940 1D AAGTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1169 hom 45 11 17 17 T 17 16 36627 CASAVA_Build 1 8511057 1D CTATATCATA T/- TGTATTAATG 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 2 1 36628 CASAVA_Build 1 8515831 1D CTACATTGCC A/- ACCTTGAAAC 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 2 1 36629 CASAVA_Build 1 8518395 1D AAAACTACAC T/- TCTAGGAAGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 2 1 36630 CASAVA_Build 1 8522049 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 T 10 9 36631 CASAVA_Build 1 8538903 1I GTAAATTATC -/A AAAAAAAAAA 1935 het 1935 ref 40 25 5 10 A 12 13 36632 CASAVA_Build 1 8552484 2D GCTGCAATAA GC/-- TATGATGGCA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 GC 1 0 36633 CASAVA_Build 1 8554542 4D CTGCTTTAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 26 10 16 3 AAAG 3 2 36634 CASAVA_Build 1 8556055 1I CACTAGACTC -/T TTTGAGTTCT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 3 4 36635 CASAVA_Build 1 8569448 1D AAAATGTATG T/- TAAGAAAATA 3070 hom 81 het 35 0 28 11 T 2 1 36636 CASAVA_Build 1 8576137 12D CATGACTTTG CTCCTTATTTGC/------------ CTCCTTATTT 3070 het 3070 ref 41 19 9 15 CTCCTTATTTGC 2 1 36637 CASAVA_Build 1 8580432 1D TTTCACTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 12 11 36638 CASAVA_Build 1 8584589 4D AGAAACTTCA CTGT/---- CTGTAGGCTG 2352 het 2352 ref 31 20 7 7 CTGT 2 1 36639 CASAVA_Build 1 8585037 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2001 hom 26 7 11 8 A 13 12 36640 CASAVA_Build 1 8585482 1D TCATCTGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 A 10 9 36641 CASAVA_Build 1 8605426 1D TAAAATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 12 11 36642 CASAVA_Build 1 8618961 1D TGGTTACTTA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 T 8 7 36643 CASAVA_Build 1 8622803 1I CCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 10 17 0 A 9 10 36644 CASAVA_Build 1 8631618 1I ATGCCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 11 12 36645 CASAVA_Build 1 8631949 1D TTTTATTTTT A/- AACAAGTCTG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 3 2 36646 CASAVA_Build 1 8643731 2I TAAGGGGGAC --/AG ACAGTGTTGC 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 AG 0 1 36647 CASAVA_Build 1 8667489 4D CTCATTCATC CATT/---- CATTCATTCA 3070 hom 81 het 40 0 28 15 CATT 6 5 36648 CASAVA_Build 1 8668032 3D39M1I CAAGTATTAA AACAACAAAATACAAATAATCCTAAGAAATCCACAATAAAGA-/---AACAAAATACAAATAATCCTAAGAAATCTACAATAAAGAT TTTATCTATT 3070 het 1969 hom 21 6 12 11 N/A 0 0 36649 CASAVA_Build 1 8677624 4I TCCTAAGGGG ----/GGGA GGGGGGGGAA 1760 het 52 hom 21 1 5 15 GGGA 0 1 36650 CASAVA_Build 1 8677949 1I CCACAAACTG -/T TAAAAATCCC 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 1 2 36651 CASAVA_Build 1 8706677 1I TTTGTTCCAT -/A AGCCCTTCTC 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 A 1 2 36652 CASAVA_Build 1 8708607 1D CAAAATAAGT C/- AAACTCTTCC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 1 0 36653 CASAVA_Build 1 8714239 1I GCTCCAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2625 hom 24 11 8 5 A 11 12 36654 CASAVA_Build 1 8740269 5I AGAACATTGT -----/AGTTG AGTTAAGAGA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 AGTTG 0 1 36655 CASAVA_Build 1 8750329 1D TTTCTTTATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 8 7 36656 CASAVA_Build 1 8757371 4D ATCAAACAAG AATT/---- AATAGTCTAT 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 AATT 1 0 36657 CASAVA_Build 1 8760356 1I ACTTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 1618 het 1468 hom 9 4 5 0 T 7 8 36658 CASAVA_Build 1 8765358 20D TCGAGACCAG CCTGGCCAAAATGGTGAAAT/-------------------- CCTGTCTCTA 2809 het 1803 hom 14 4 9 2 CCTGGCCAAAATGGTGAAAT 1 0 36659 CASAVA_Build 1 8779210 1I GATACTGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 10 11 36660 CASAVA_Build 1 8780023 1D GACTCCGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 27 1 16 10 A 14 13 36661 CASAVA_Build 1 8783174 1I TTCAAATGAT -/A ACTGTAGGAG 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 1 2 36662 CASAVA_Build 1 8787400 1D CACCTCTGAC A/- AAAAGGAAAG 3070 het 3070 hom 46 19 24 4 A 5 4 36663 CASAVA_Build 1 8798910 3D AATTCGCTGT GAA/--- GAAGGCTATT 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 GAA 2 1 36664 CASAVA_Build 1 8801547 1I GAATTATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1541 hom 40 7 23 10 T 14 15 36665 CASAVA_Build 1 8832022 1D CCCCCTCCAA C/- CCCCCCCGGT 3070 hom 39 het 19 0 13 6 C 8 7 36666 CASAVA_Build 1 8839986 2I CCTGCCTGGT --/TA TATCACCACC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TA 1 2 36667 CASAVA_Build 1 8850198 2D TTCAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2000 hom 34 10 19 5 AT 1 0 36668 CASAVA_Build 1 8851495 1I AATTTTTATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 T 10 11 36669 CASAVA_Build 1 8852076 1I CTAAACCAAC -/G GAGTCAGGGA 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 G 1 2 36670 CASAVA_Build 1 8855034 2I GTTCTGGTAC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 32 7 T 9 11 36671 CASAVA_Build 1 8860357 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 2956 het 1717 hom 12 4 8 0 A 10 9 36672 CASAVA_Build 1 8860523 1D AGCAAAACTC A/- AAAAAAAAAA 2726 hom 36 het 19 0 11 8 A 15 14 36673 CASAVA_Build 1 8862739 1I CAGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 38 0 30 8 A 11 12 36674 CASAVA_Build 1 8868950 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 2521 hom 24 7 12 5 CT 2 1 36675 CASAVA_Build 1 8870068 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 58 het 25 0 19 6 T 10 9 36676 CASAVA_Build 1 8874299 1I ACTCTGTCAC -/A AATCTGGGCA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 2 3 36677 CASAVA_Build 1 8879306 11D CCTCTGCTTA TGTTGCCACTC/----------- CCATTCCCTC 3070 het 3070 ref 25 16 7 4 TGTTGCCACTC 1 0 36678 CASAVA_Build 1 8910763 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 7 6 36679 CASAVA_Build 1 8913332 1D CTTTTTTTTT A/- ATCACAGTAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 2 1 36680 CASAVA_Build 1 8914887 18D TAGTGCAGTG GTGCCATCTTGGCTCACT/------------------ GTGCCATCTT 3070 hom 21 het 10 0 7 3 GTGCCATCTTGGCTCACT 2 1 36681 CASAVA_Build 1 8915717 1D TGAACATTCC T/- TTTTTTTTTT 1813 het 1813 ref 36 20 7 10 T 12 11 36682 CASAVA_Build 1 8917090 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1761 hom 30 het 17 0 8 9 T 14 13 36683 CASAVA_Build 1 8918034 8D AGAAATTCTT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3041 het 195 hom 16 1 12 6 A 24 16 36684 CASAVA_Build 1 8920257 1I TCGGCCTCTC -/A AGAGTGCTGA 3070 hom 72 het 26 0 24 4 A 1 2 36685 CASAVA_Build 1 8921746 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 6 7 36686 CASAVA_Build 1 8924181 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 240 hom 31 1 25 5 T 11 12 36687 CASAVA_Build 1 8925243 1D GGGCCTTGTC G/- GGGGGGCAGT 3070 het 1856 hom 27 7 16 4 G 7 6 36688 CASAVA_Build 1 8934473 1I TTAAAAACAA -/T TTTTTTTTTT 1601 het 1601 ref 17 6 4 7 T 11 12 36689 CASAVA_Build 1 8957403 3I TGACCTAGCC ---/AGA AGAAGTGCCT 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 AGA 1 2 36690 CASAVA_Build 1 8987197 1D AATGTCAGCA G/- GGGATCACCC 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 G 4 3 36691 CASAVA_Build 1 8989142 4D GAACAGCCTG CCTC/---- CCTCCACCTC 3070 het 3070 hom 38 14 17 9 CCTC 2 1 36692 CASAVA_Build 1 8990388 1D CGATTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2561 het 680 hom 23 7 8 8 T 15 14 36693 CASAVA_Build 1 8998537 1D ACCTGGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 13 12 T 13 12 36694 CASAVA_Build 1 9000062 1D AAAGGCCCCC T/- ATTCTGCAGA 3070 hom 95 het 36 0 32 5 T 1 0 36695 CASAVA_Build 1 9005327 5D AAGGCTGCAC CACCT/----- CTGTGGCAGG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 CACCT 1 0 36696 CASAVA_Build 1 9006413 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 10 9 36697 CASAVA_Build 1 9010953 6I TTTATGTTTA ------/TCCTGC TCCTGCTCCT 3070 het 3070 ref 34 14 9 11 TCCTGC 2 3 36698 CASAVA_Build 1 9011002 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1632 het 1632 ref 32 11 7 14 T 15 14 36699 CASAVA_Build 1 9015864 5D TTAAAAAAAA AAGTT/----- ATTTATTTAT 2452 het 2452 ref 16 9 6 1 AAGTT 1 0 36700 CASAVA_Build 1 9016041 1D TTATTTTTAC T/- TTTTTTGTAG 2340 het 2340 ref 22 13 7 2 T 7 6 36701 CASAVA_Build 1 9016841 2I GTCCAAAAAG --/TA TATATGACCT 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 TA 2 3 36702 CASAVA_Build 1 9019517 1I AAATAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3031 het 1754 hom 24 10 11 3 A 8 9 36703 CASAVA_Build 1 9026370 1D GCAAAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 17 13 T 13 12 36704 CASAVA_Build 1 9032350 1D CTGTCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 598 hom 29 3 21 5 A 15 14 36705 CASAVA_Build 1 9041412 1D AATCAAAGAG A/- AAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 A 5 4 36706 CASAVA_Build 1 9048590 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2287 hom 24 9 11 5 A 10 9 36707 CASAVA_Build 1 9055040 1I CCCTAGAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 53 het 23 0 17 6 A 8 9 36708 CASAVA_Build 1 9057323 1I ATTTTCCTTT -/C ACACAACATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 0 1 36709 CASAVA_Build 1 9083458 14I CCCCTCGCTT --------------/GAGCCCAGGAGTTC GAGATCTGAC 3070 hom 125 het 44 0 41 3 GAGCCCAGGAGTTC 0 1 36710 CASAVA_Build 1 9091442 1I CACCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 10 11 36711 CASAVA_Build 1 9108614 1D GTATTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 10 11 T 15 14 36712 CASAVA_Build 1 9125126 1I GTTAGGGCTT -/C CTCCCTCCCG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 1 2 36713 CASAVA_Build 1 9125504 1I TAGGCATGAG -/C CACTGTGCTC 3070 hom 79 het 31 0 20 11 C 1 2 36714 CASAVA_Build 1 9129410 2D GGTCTCTACT AA/-- AAACACAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 5 3 36715 CASAVA_Build 1 9129928 1I GTCATTTCCG -/T TTTTTTTTTT 2888 het 2888 ref 35 18 11 6 T 13 14 36716 CASAVA_Build 1 9147242 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2173 hom 23 9 11 4 A 11 10 36717 CASAVA_Build 1 9151155 2D ATAATCTAAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 39 10 17 12 GT 9 8 36718 CASAVA_Build 1 9202094 8D GCCACCACGC TCAGCTAG/-------- TCAGCTAGTT 2810 het 2810 ref 18 9 7 3 TCAGCTAG 2 1 36719 CASAVA_Build 1 9209299 8I TCCATCTCAA --------/AAATAAAT AAATAAATAA 2609 het 2609 ref 33 15 6 12 AAAT 3 5 36720 CASAVA_Build 1 9224993 1D AAAAAAACAT A/- AAAAAAAAAA 1381 het 1381 ref 34 24 3 7 A 11 10 36721 CASAVA_Build 1 9226412 3D CCTGGGAGAG GTT/--- GTAGCCACTG 2581 het 2581 ref 49 23 15 13 GTT 1 0 36722 CASAVA_Build 1 9226514 3I AGGAAGAGGC ---/GTG GGGGGCGGTG 3070 het 2095 hom 37 17 15 5 GTG 0 1 36723 CASAVA_Build 1 9227566 8D CTCTTTGCAC CCCAGGCA/-------- CCCAGGCATG 3070 het 3070 ref 38 14 13 17 CCCAGGCA 2 1 36724 CASAVA_Build 1 9229896 1I GGTGCCGGCT -/G GCAAAGCCCA 3070 hom 67 het 27 0 16 11 G 1 2 36725 CASAVA_Build 1 9230484 4I AAGGTCCCTT ----/TGGG AGCTGGCATT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 TGGG 0 1 36726 CASAVA_Build 1 9248291 1I TCCAGAAATC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 2848 hom 23 8 9 6 T 6 7 36727 CASAVA_Build 1 9249475 2D AGAGCATCTC TT/-- TTTTTTTTTT 1761 het 1761 ref 25 10 5 11 T 14 12 36728 CASAVA_Build 1 9251693 1D CCACTGATTT A/- AAAAAAAAAA 1711 het 1711 ref 24 13 8 3 A 12 11 36729 CASAVA_Build 1 9255994 1I TGCCCAGAGT -/G GGCCAGGGCC 3070 hom 101 het 38 0 30 8 G 2 3 36730 CASAVA_Build 1 9269287 3I AATGCCAGGA ---/GGT GGGTGAGGAG 3070 het 3070 ref 50 30 12 8 GGT 0 1 36731 CASAVA_Build 1 9272075 1D CCTGCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2818 hom 29 9 14 6 T 12 11 36732 CASAVA_Build 1 9273605 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 1488 hom 22 6 10 6 T 9 8 36733 CASAVA_Build 1 9276675 4D TCTAAGTGAC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 77 39 23 17 TG 9 7 36734 CASAVA_Build 1 9276750 4I GTGTGTCTTT ----/GTGA GTGTGTGTCT 3070 het 3070 hom 95 42 38 15 GTGA 0 1 36735 CASAVA_Build 1 9276916 4I ACGTGTCTCT ----/GTGA GTGTCTGTCT 3070 het 3070 hom 66 18 35 13 GTGA 0 1 36736 CASAVA_Build 1 9293807 2D GGATAAAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 1775 het 1340 hom 33 9 10 14 T 18 16 36737 CASAVA_Build 1 9293980 1D TTCTTCCCCC T/- GATGGGTCTC 3070 het 2428 hom 28 6 18 4 T 1 0 36738 CASAVA_Build 1 9301628 13I CTGAGGTCAT -------------/GAGTTCAAGACCA GCCTGGGCAA 3070 het 828 hom 11 2 8 2 GAGTTCAAGACCA 0 1 36739 CASAVA_Build 1 9303535 1D TCTGGCCACG A/- AAGGCTGGCC 2042 het 2042 ref 25 9 9 7 A 3 2 36740 CASAVA_Build 1 9307152 2D CTCGGAGGGC TG/-- TGGGCCCGGG 2306 het 2306 ref 29 10 9 10 TG 2 1 36741 CASAVA_Build 1 9313204 1D CCTGCCAGCT G/- GACCTTGTGA 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 G 2 1 36742 CASAVA_Build 1 9313351 2D TCTTCTGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 T 12 10 36743 CASAVA_Build 1 9318544 1D TCCGAATGTC A/- ATGTGCACAG 3070 het 3070 hom 45 17 21 8 A 2 1 36744 CASAVA_Build 1 9322648 1I CCGACAGCCC -/T TGAACCACCT 1999 het 1999 ref 22 10 7 5 T 1 2 36745 CASAVA_Build 1 9337447 1D ACTGCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1282 hom 17 4 9 4 A 11 10 36746 CASAVA_Build 1 9352988 1D GCATCTGGGA G/- GGGGGTTGTG 3070 het 2664 hom 30 8 20 5 G 6 5 36747 CASAVA_Build 1 9353735 1I TGTCCCCTCC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 2906 hom 28 7 17 4 A 7 8 36748 CASAVA_Build 1 9356583 5D AAGCTGGTCG CTGGT/----- CTGGTCGCAG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 CTGGT 2 1 36749 CASAVA_Build 1 9357181 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 A 7 8 36750 CASAVA_Build 1 9362572 2I AATAAAATTT --/AA AAAAAGAAGA 2115 het 2115 ref 18 10 5 3 A 5 7 36751 CASAVA_Build 1 9368663 2D GCACAGGCCC AA/-- GTCTCCACAC 3070 het 3070 hom 44 16 20 10 A 2 0 36752 CASAVA_Build 1 9379320 1D AAAACAAATT A/- AAAAAAAAAA 2658 het 28 hom 12 1 8 3 A 12 11 36753 CASAVA_Build 1 9389202 8D CCCTCCTGAG ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 69 het 31 0 23 10 AC 12 8 36754 CASAVA_Build 1 9389936 1I TCAAGGCCTC -/T CCCTGACCCC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 1 36755 CASAVA_Build 1 9395756 1D CCCAGCCCAG C/- CCCCCCCGCA 3070 het 1027 hom 19 6 10 3 C 8 7 36756 CASAVA_Build 1 9403545 2D CTGGGTGACC AA/-- AAAAAAAAAA 2492 het 77 hom 25 2 9 14 A 18 16 36757 CASAVA_Build 1 9406691 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 19 8 A 14 12 36758 CASAVA_Build 1 9407712 1I ATCTACCCAT -/A GGGGCATTAT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 A 0 1 36759 CASAVA_Build 1 9425336 3D CTGTGCCAGC TGT/--- TGTTGTTCTA 3070 het 3070 ref 51 28 14 9 TGT 3 2 36760 CASAVA_Build 1 9430686 1D AATCTCAGCA T/- TTTTGGGAGG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 5 4 36761 CASAVA_Build 1 9433279 1I TGGAGCCCAG -/C CCTTGCCCTG 3070 hom 83 het 34 0 24 10 C 2 3 36762 CASAVA_Build 1 9448590 1D CCCCTCCTGG C/- CGATGGTGGG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 C 2 1 36763 CASAVA_Build 1 9449093 1I CAGCCTGACC -/A ACATGGCGAA 3070 hom 105 het 44 0 36 9 A 1 2 36764 CASAVA_Build 1 9449277 1D TGTCTAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 10 9 36765 CASAVA_Build 1 9458793 2D GAGCACAGGT GC/-- CTGCCACCAC 2616 het 2492 hom 15 7 7 1 GC 1 0 36766 CASAVA_Build 1 9468761 1I CAAATATGTG -/T TCAGCTCGGA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 2 36767 CASAVA_Build 1 9470230 1D CTCATTCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1645 hom 24 5 10 10 A 17 16 36768 CASAVA_Build 1 9476080 1I ACTCCATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 10 11 A 15 16 36769 CASAVA_Build 1 9480136 1I CACCCAGGGA -/C CCACAGATTA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 C 2 3 36770 CASAVA_Build 1 9480960 2I GTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 AG 1 2 36771 CASAVA_Build 1 9481856 1I ACTTTTAGTG -/A AAGGCTGTAA 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 A 2 3 36772 CASAVA_Build 1 9484351 1I GATACATTTA -/G GACCCAGAGA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 G 1 2 36773 CASAVA_Build 1 9510367 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 10 11 36774 CASAVA_Build 1 9511382 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2145 hom 24 8 12 4 A 13 12 36775 CASAVA_Build 1 9513629 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1178 het 388 hom 11 1 4 6 A 15 16 36776 CASAVA_Build 1 9521785 1D TTTGTACACC T/- TTTGCACACG 3070 het 3070 ref 35 20 8 7 T 4 3 36777 CASAVA_Build 1 9524806 1I GCTGGAGCAG -/C CTCTGTTGAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 1 2 36778 CASAVA_Build 1 9546903 1D AATATTTAAC T/- TTTTTGTGTG 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 T 6 5 36779 CASAVA_Build 1 9567561 2D GAGGTTTTGC TA/-- TGTTGTCCAG 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 TA 1 0 36780 CASAVA_Build 1 9611040 1I AGGATAGCTC -/A AAACACTCAC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 3 4 36781 CASAVA_Build 1 9619947 3D GGCTGAGGTG GGA/--- GGATTGCTTG 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 GGA 2 1 36782 CASAVA_Build 1 9623145 1I GAATCGCTTG -/A ACCAGGGAGG 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 A 1 2 36783 CASAVA_Build 1 9624243 10I ATCTTCACCA ----------/GCTCATTCCT GCCCTGGAGT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 GCTCATTCCT 0 1 36784 CASAVA_Build 1 9631331 2D ACTAGAAAGG AT/-- ATACTAGTGT 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 AT 2 1 36785 CASAVA_Build 1 9632780 1I GAAAGGAATA -/G GGGCTTGGGT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 G 3 4 36786 CASAVA_Build 1 9633463 1D20M1I CCGCCTGATA CTAATACTTTACCAATGGAGA-/-TAATACTTTACCAATGGAGAT TTTTCCTTTT 3070 hom 72 het 23 0 24 2 N/A 0 0 36787 CASAVA_Build 1 9637126 9I CCAATGGTTG ---------/GAGGCCAGA TGCGAAAGCC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 GAGGCCAGA 0 1 36788 CASAVA_Build 1 9638154 1I CCAAAATAAC -/G GGCCATTCTC 3070 hom 42 het 18 0 14 4 G 2 3 36789 CASAVA_Build 1 9665771 17D CATTGTCTCA AAAAAAAAAAAAAAACC/----------------- AAAAAACCAA 1695 het 76 hom 12 2 7 4 AAAAAAAAAAAAAAACC 1 0 36790 CASAVA_Build 1 9675220 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1593 hom 10 het 4 0 4 1 A 6 7 36791 CASAVA_Build 1 9679371 1D ACCCTGTCCC A/- AAAAAAAAAA 1031 het 1031 ref 29 22 3 5 A 13 12 36792 CASAVA_Build 1 9714693 1I AAAAGGACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 248 hom 22 1 13 8 A 9 10 36793 CASAVA_Build 1 9738444 1I AAATTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1202 hom 36 4 27 5 A 11 12 36794 CASAVA_Build 1 9789599 2I AAGTCTTTTT --/AC ACCTTACTTT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 AC 1 2 36795 CASAVA_Build 1 9794448 1I ACTAATTCTG -/T TAAGTAATAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 1 2 36796 CASAVA_Build 1 9795494 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1254 het 1254 ref 19 11 4 4 A 17 16 36797 CASAVA_Build 1 9797545 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 20 0 10 12 A 13 12 36798 CASAVA_Build 1 9799223 4D AAAAGGTGGG TTTT/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 59 het 29 0 20 9 T 7 3 36799 CASAVA_Build 1 9818590 1I GGGAAAGGCA -/G GGGAGGCAAA 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 G 3 4 36800 CASAVA_Build 1 9825226 2D AAGCAAGCCC AA/-- GACAGAAATG 3070 het 3036 hom 30 11 12 8 A 2 0 36801 CASAVA_Build 1 9838371 2D TAGGAAATGC TT/-- TTTTTTTTTT 2516 het 2012 hom 41 12 7 22 T 18 16 36802 CASAVA_Build 1 9895466 4D TCCCTTCCAT CGGC/---- CGGCCAGCCA 3070 hom 88 het 34 0 25 11 CGGC 2 1 36803 CASAVA_Build 1 9903385 1D CACTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2339 het 2339 ref 23 12 6 5 T 13 12 36804 CASAVA_Build 1 9916566 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 C 1 0 36805 CASAVA_Build 1 9922019 5I TTTTTTTTTC -----/TTTTT TTTTTTTTTT 1708 het 991 hom 15 3 9 3 T 10 15 36806 CASAVA_Build 1 9923823 4D TTTTCTTTCT TTCG/---- TTCGTTCGTT 3070 het 3070 ref 41 15 17 10 TTCG 3 2 36807 CASAVA_Build 1 9934123 4I GTTGTTGTTG ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 hom 89 het 42 0 29 13 TTGT 3 4 36808 CASAVA_Build 1 9949258 1D ACTTAGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 10 9 36809 CASAVA_Build 1 9950316 1I TTTGTTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 A 10 11 36810 CASAVA_Build 1 9957036 1I ATCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2160 het 224 hom 21 1 9 11 T 15 16 36811 CASAVA_Build 1 9963110 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2984 hom 20 het 9 0 7 2 A 9 8 36812 CASAVA_Build 1 9974733 1I TAGGTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 27 1 17 10 T 15 16 36813 CASAVA_Build 1 9976747 13D AAATGTTAGC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 35 3 17 16 T 29 16 36814 CASAVA_Build 1 10018565 1I ATTTTTTGTG -/T TTTTTAGTAG 2821 hom 18 het 7 0 7 0 T 5 6 36815 CASAVA_Build 1 10023947 1D AAAACAAGAC T/- TAACCTCAGC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 2 1 36816 CASAVA_Build 1 10045210 1I TGCCCACCTT -/G GGCTCCCAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 G 2 3 36817 CASAVA_Build 1 10109848 1I TTTGTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 12 13 36818 CASAVA_Build 1 10169512 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 1545 het 1545 ref 57 46 4 9 CA 7 6 36819 CASAVA_Build 1 10216858 1I CTTAAGGAAC -/T TTTTTTTTTT 2950 het 2518 hom 32 10 11 11 T 13 14 36820 CASAVA_Build 1 10239955 1D TAAAAATTCC A/- AAAAAAAAAA 1931 hom 26 het 16 0 9 7 A 15 14 36821 CASAVA_Build 1 10279794 1D CATTCTTGAA T/- TTTTTTTTTT 2083 het 2083 ref 46 23 7 16 T 17 16 36822 CASAVA_Build 1 10369509 1I CGTGCGCTGC -/T TTTCTATCTG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 3 4 36823 CASAVA_Build 1 10424896 1D AAATACAGAT T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2259 hom 28 8 18 2 T 10 9 36824 CASAVA_Build 1 10430611 2I GCAACAGAGT --/GA GACTCCATCT 3070 hom 78 het 28 0 25 3 GA 1 2 36825 CASAVA_Build 1 10433918 1D TTTTAGATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 11 10 36826 CASAVA_Build 1 10436319 1I CCACACAGAC -/T TTTAAGATTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 3 4 36827 CASAVA_Build 1 10436634 1I TCCAGGATTT -/G GGCACCAGAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 2 3 36828 CASAVA_Build 1 10440532 2D ACGAACGCTC TG/-- TGTGTCTAAC 3070 hom 121 het 45 0 41 4 TG 3 2 36829 CASAVA_Build 1 10447738 4D TCTATAAAAC ATTA/---- ATTAATTATT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 ATTA 3 2 36830 CASAVA_Build 1 10450773 1D TTCAGGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 T 13 12 36831 CASAVA_Build 1 10462845 1D CCTCTCAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 25 1 19 5 T 12 11 36832 CASAVA_Build 1 10466405 1I ACCACTACCA -/C CCCTAAACCT 3070 hom 117 het 43 0 36 7 C 3 4 36833 CASAVA_Build 1 10466576 4I ATATGAATGA ----/ATTC ATTATGTATT 3070 hom 126 het 49 0 42 7 ATTC 0 1 36834 CASAVA_Build 1 10466822 1I CAGGCGCCCA -/C CCACCATGGC 3070 hom 44 het 19 0 12 7 C 2 3 36835 CASAVA_Build 1 10482802 2D ATCCCAGCAC TG/-- TGGGAGGCCG 3070 hom 42 het 18 0 13 5 TG 2 1 36836 CASAVA_Build 1 10493730 7D GTGCAGGCAG CAGAGCT/------- GCTGGTTTGT 3070 het 3070 ref 32 14 13 7 CAGAGCT 1 0 36837 CASAVA_Build 1 10495884 1D TAGAATGCTG T/- TTTTCACCCA 3070 het 3070 ref 44 22 14 9 T 5 4 36838 CASAVA_Build 1 10499863 5I CTTCCCTTAA -----/ACTCT GTTCCAAGAA 3070 het 3070 hom 45 14 20 11 ACTCT 0 1 36839 CASAVA_Build 1 10518421 2I GATAGAGAAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 15 12 13 GT 8 9 36840 CASAVA_Build 1 10520580 1I AGAGAAAACT -/G TTTTGTGCAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 36841 CASAVA_Build 1 10522231 2D TTAAGCCCTC AT/-- AGAACCAGTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 AT 1 0 36842 CASAVA_Build 1 10523246 1I CATCTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 19 9 A 10 11 36843 CASAVA_Build 1 10524725 1I ATGTATTAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 205 hom 44 1 39 4 A 9 10 36844 CASAVA_Build 1 10527399 1D TAGATTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 32 0 21 11 T 11 10 36845 CASAVA_Build 1 10539362 1I TTTTGCTTAA -/G GAACTTTAAA 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 G 1 2 36846 CASAVA_Build 1 10546828 2I TTATTCTCTC --/TT TTAATATTGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 4 36847 CASAVA_Build 1 10553972 1D TTTCTGTATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 2685 hom 23 7 14 3 A 9 8 36848 CASAVA_Build 1 10555325 1D ACTATAGGCG C/- CCCCCCCACC 3070 hom 31 het 16 0 12 4 C 8 7 36849 CASAVA_Build 1 10557719 1I TCTCTTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 12 13 36850 CASAVA_Build 1 10559834 3I GGTGGATAAC ---/AGG AGTTCAAGAC 2666 het 2375 hom 25 9 9 7 AGG 0 1 36851 CASAVA_Build 1 10564656 5D CTTTCTCATG ATTAA/----- ATTAAATTTT 3070 het 3070 ref 28 13 14 3 ATTAA 2 1 36852 CASAVA_Build 1 10566312 5I ATATAAACAT -----/AAGTC GAGTAAGAGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAGTC 0 1 36853 CASAVA_Build 1 10574670 4D TCTGAATTTC TTTG/---- TTTGGTTGTC 3070 hom 132 het 51 0 45 8 TTTG 2 1 36854 CASAVA_Build 1 10576394 1I ATATATAATA -/T TTTTTTTTGT 2770 het 2770 ref 14 8 6 0 T 8 9 36855 CASAVA_Build 1 10577474 1I AATCGCAGCC -/A TGTACCCTGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 36856 CASAVA_Build 1 10578507 1I AACGCAAAGA -/G AGATGCCTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 0 1 36857 CASAVA_Build 1 10581524 1I TTTTCCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 10 11 36858 CASAVA_Build 1 10591319 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 12 11 36859 CASAVA_Build 1 10641972 7D GGGGTGTGCT GTCATGG/------- GCAGTCCCGG 2398 het 2398 ref 32 18 9 6 GTCATGG 1 0 36860 CASAVA_Build 1 10644059 4D ACACACACAA ACCC/---- ACACACAGTC 3070 het 3070 ref 72 31 26 17 ACCC 1 0 36861 CASAVA_Build 1 10644707 4I ATCACCTATA ----/ACAC ACACACACGC 3070 het 3070 hom 90 27 46 17 AC 4 6 36862 CASAVA_Build 1 10644828 2D ATGCATTCTC AT/-- ACACTCTCAT 3070 het 3070 hom 70 29 36 6 AT 1 0 36863 CASAVA_Build 1 10663696 2I AGGCGCCTGC --/CA CACCACACTT 1818 het 367 hom 9 2 5 2 CA 1 2 36864 CASAVA_Build 1 10713749 2I GACTCCGTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 11 13 36865 CASAVA_Build 1 10754172 1D AGTGTAAGGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 8 36866 CASAVA_Build 1 10757202 1D CCATCCATAG C/- CCCCCCGATC 3070 hom 83 het 31 0 27 5 C 7 6 36867 CASAVA_Build 1 10767871 4I CCTTATCTTC ----/CTTT CTTTCTTTCT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 CTTT 3 4 36868 CASAVA_Build 1 10774389 4D AAAAGAGGGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 GA 8 6 36869 CASAVA_Build 1 10779633 1D GAGAAGGGAT G/- GGGGGGGGGG 1191 hom 5 het 20 0 6 14 G 11 10 36870 CASAVA_Build 1 10804787 2D CCAACTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 17 15 36871 CASAVA_Build 1 10808046 1D GATAATAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 76 het 30 0 25 5 A 9 8 36872 CASAVA_Build 1 10813496 6D GAATAATAAT AGCAAC/------ AGCAACAGCT 3070 hom 62 het 23 0 19 6 AGCAAC 2 1 36873 CASAVA_Build 1 10814723 2I TTTCTTTCCC --/CT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 17 8 CT 0 1 36874 CASAVA_Build 1 10827514 1I AGCCCAGTAC -/T GTTAAGTAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 0 1 36875 CASAVA_Build 1 10834548 2I ATATTATCTC --/CT CTCTCCTGAG 3070 hom 65 het 25 0 21 4 CT 2 3 36876 CASAVA_Build 1 10835684 1I TCACTAGCCT -/C CCTCCACTGG 3070 hom 131 het 51 0 41 10 C 2 3 36877 CASAVA_Build 1 10850408 1I ATATGAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 10 11 36878 CASAVA_Build 1 10852901 1I AACACCCCTT -/C CTCACTGGGA 3070 het 3070 hom 44 13 19 12 C 1 2 36879 CASAVA_Build 1 10855046 1I ATCACCAGCC -/A ATAACTCCAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 1 2 36880 CASAVA_Build 1 10876549 1I ACATTGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 12 13 36881 CASAVA_Build 1 10880664 2D ATCCTGGCGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 GT 14 13 36882 CASAVA_Build 1 10880976 1D19M1I GGTCAGAGGG CCCCCTCAAGGGCTGTCAGA-/-CCCCTCAAGGGCTGTCAGAC CCCCAGGGCC 3070 hom 69 het 25 0 18 10 N/A 0 0 36883 CASAVA_Build 1 10893102 1I GGGAAGGAGT -/G GGGGGTGGTA 3070 hom 49 het 21 0 17 4 G 5 6 36884 CASAVA_Build 1 10900112 1D7M1D CAAAACCCTG TTTTGTACA/-TCTCTAC- AAAAAATACA 3070 hom 126 het 43 0 40 4 N/A 0 0 36885 CASAVA_Build 1 10900392 4D37M12I AGAAAAAAGA AAGGAAGGAAGGAAGGAAGAAAGAAGGAAAAAGAAAGAAAG------------/----AAGGAAGGAAGGAAGAAAGAAGGAAAAAGAAAGAAAGAAAATTGTCAAC AAAATTGTCA 3070 het 3070 hom 29 17 21 10 N/A 0 0 36886 CASAVA_Build 1 10905979 1I TACAGCGCCA -/T TGTACATTCC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 1 2 36887 CASAVA_Build 1 10913203 1D CCACAAAACA T/- TTTTTTTTTT 448 het 448 ref 34 14 2 18 T 12 11 36888 CASAVA_Build 1 10921782 2D CAAGCACCGA GG/-- GCTTGCGAAT 3070 het 3070 hom 38 16 13 10 G 3 1 36889 CASAVA_Build 1 10925544 1I GGGGTATCCC -/T TCACAGATTC 3070 het 2843 hom 22 7 11 4 T 1 2 36890 CASAVA_Build 1 10926614 2D CAAAACAAAC AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 A 10 8 36891 CASAVA_Build 1 10935367 5D TGTTGGCCAG GCTGA/----- TCTCAAACTC 2946 het 1161 hom 16 4 8 4 GCTGA 1 0 36892 CASAVA_Build 1 10939610 2I GGGAGAAAAC --/AG AGACCAGAAT 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 AG 1 2 36893 CASAVA_Build 1 10945742 1I CTGTCTCTTT -/A AAAAAAACAG 2543 het 1787 hom 20 8 9 3 A 7 8 36894 CASAVA_Build 1 10946382 1D TACCCAGGTC A/- AAAAAAAAAA 2007 het 2007 ref 26 14 5 8 A 11 10 36895 CASAVA_Build 1 10970525 17D ACTTGGGAAG CTGAGGCAGGAGGATCA/----------------- CTTGAGCCTG 2061 het 2061 ref 16 10 5 3 CTGAGGCAGGAGGATCA 1 0 36896 CASAVA_Build 1 10993980 1D GAAGGGGGGG A/- AAGGGAGGGA 3070 hom 31 het 16 0 10 6 A 3 2 36897 CASAVA_Build 1 10996095 2D ACGTTGGACT CA/-- CAGTTACAGT 3070 hom 123 het 47 0 42 8 CA 2 1 36898 CASAVA_Build 1 10997586 1D GTCTCAAAAC A/- AAAAAAAACG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 9 8 36899 CASAVA_Build 1 11000535 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 10 11 36900 CASAVA_Build 1 11000986 7I3M6I GTGCATGCCA -------CTA------/ATCTTTGCTACAGGTG CACCTGGCTA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 N/A 0 0 36901 CASAVA_Build 1 11003311 1I CCAGCACTTT -/G GGAGGCCGAG 3070 hom 30 het 12 0 10 2 G 2 3 36902 CASAVA_Build 1 11004642 1D AATGAAATGA G/- TGTTCATTGC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 G 1 0 36903 CASAVA_Build 1 11007592 5I GCAAGTTACA -----/TGTTT TAAACATTTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TGTTT 0 1 36904 CASAVA_Build 1 11008685 1I TTATTTCTAA -/T TGCCACTTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 2 36905 CASAVA_Build 1 11023034 1I ACTTGCTTGT -/A TCCAGGAGGC 3070 hom 19 het 11 0 7 4 A 0 1 36906 CASAVA_Build 1 11034564 3D GCCCAGGAAT GAA/--- GAAGGACAGC 3070 hom 104 het 37 0 35 5 GAA 2 1 36907 CASAVA_Build 1 11047499 1I AGCGAAACTC -/T CGTCTCAGGA 2806 hom 27 het 13 0 9 4 T 0 1 36908 CASAVA_Build 1 11048315 4D ATATAAAAGT TTAG/---- TGAGTGCTGC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TTAG 1 0 36909 CASAVA_Build 1 11054255 2I ACTTCCCCCC --/CT GTCTGCTCAG 3070 hom 143 het 55 0 43 12 CT 0 1 36910 CASAVA_Build 1 11054511 3D CTCCAACCAC CAA/--- CGAGACAGCT 3070 hom 123 het 45 0 39 8 CAA 1 0 36911 CASAVA_Build 1 11101013 5D CCTGAGTAGC TAGGA/----- TAACAGGCAC 2910 het 70 hom 9 1 7 1 TAGGA 1 0 36912 CASAVA_Build 1 11116148 3I GTGGGTGACA ---/GTT GTTGAGAGTT 3070 hom 129 het 49 0 42 7 GTT 1 2 36913 CASAVA_Build 1 11131573 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 TA 7 8 36914 CASAVA_Build 1 11154675 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1264 het 886 hom 19 10 4 5 A 17 16 36915 CASAVA_Build 1 11160637 1I GCCTTTTCAC -/A TAACACAGGT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 A 0 1 36916 CASAVA_Build 1 11176594 1D CTTTCTGCAA C/- CCCCCCAACC 3070 hom 85 het 33 0 24 10 C 7 6 36917 CASAVA_Build 1 11185560 1I AAACAAAAAC -/A AAAAACAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 5 6 36918 CASAVA_Build 1 11186621 1D AGGCCCAAGC A/- AACTCATGGA 3070 hom 90 het 36 0 29 7 A 3 2 36919 CASAVA_Build 1 11201936 1D ATGGTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 853 het 853 ref 48 35 2 11 A 12 11 36920 CASAVA_Build 1 11203639 1D AAAACAAAAG T/- TAATTTTTTT 3070 het 580 hom 34 3 27 4 T 2 1 36921 CASAVA_Build 1 11205975 1D AAGGGTTGGT A/- TTAAATAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 0 36922 CASAVA_Build 1 11229249 1I TGGTTTGTCT -/G GGCTGGGTGG 3070 hom 106 het 40 0 34 6 G 2 3 36923 CASAVA_Build 1 11233263 1D ACTAGTTCCC T/- TGTGCTTCTC 3070 hom 127 het 49 0 39 10 T 2 1 36924 CASAVA_Build 1 11233805 1I ATGTGATATG -/C CCCCTCCTTC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 C 4 5 36925 CASAVA_Build 1 11237245 1I CAGAGCTCTT -/A TTTCTAATAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 36926 CASAVA_Build 1 11240752 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 24 2 17 5 A 14 15 36927 CASAVA_Build 1 11243364 1I GTGTCCATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 73 het 33 0 26 7 T 9 10 36928 CASAVA_Build 1 11279531 1I CTTTCCTACC -/A AAGGCAGAGG 3070 hom 48 het 39 1 28 10 A 2 3 36929 CASAVA_Build 1 11284300 1D CCAGAGATTT A/- AAAAAAAAAA 1016 het 1016 ref 28 15 3 10 A 15 14 36930 CASAVA_Build 1 11310780 1D TGGGACTACA G/- GTATACACCA 3070 hom 48 het 17 0 13 4 G 2 1 36931 CASAVA_Build 1 11321267 10D CATATGTGTC TGTGTGTGTA/---------- TGTGTGTGTG 3070 hom 153 het 54 0 51 11 TGTGTGTGTA 1 0 36932 CASAVA_Build 1 11323517 2I AGAAACCCCG --/TC TCTACTAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 TC 1 2 36933 CASAVA_Build 1 11326182 2I CAGGTGAAGG --/TA TGTTTGTAGC 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 TA 0 1 36934 CASAVA_Build 1 11328119 1I GGAAGAGGGA -/T CTGAGGAACA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 0 1 36935 CASAVA_Build 1 11330060 1I TAGTGCAGTT -/A AATAATTTGT 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 A 2 3 36936 CASAVA_Build 1 11331716 1D CAAGATTGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2740 hom 28 8 12 8 T 10 9 36937 CASAVA_Build 1 11342115 1I ATGAAATTGC -/A AACAGATGGG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 2 3 36938 CASAVA_Build 1 11342263 1I GTTTCACAGT -/C CTTCCTTTGT 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 C 1 2 36939 CASAVA_Build 1 11347352 1D AGACTCCATT A/- AAAAAAAAAA 657 het 67 hom 7 1 4 2 A 15 14 36940 CASAVA_Build 1 11355594 1I CCTGAAGGCT -/G GGGACAAGCG 3070 het 2662 hom 31 8 12 11 G 3 4 36941 CASAVA_Build 1 11360915 1D CATCCCTGGG A/- GGTAGGGGTC 2678 het 2678 ref 24 16 6 2 A 1 0 36942 CASAVA_Build 1 11365091 1I11M2D TCTTTTTTTC -TTTTCTTTTTCTT/TTTTTCTTTTTC-- TTTTTTTTTT 3070 het 2566 hom 29 13 11 7 N/A 0 0 36943 CASAVA_Build 1 11388097 1D AACTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1905 het 419 hom 21 7 6 8 T 19 18 36944 CASAVA_Build 1 11408307 12D GATCATAGGT TTGTGATTACTG/------------ TTGTCCCTCA 3070 het 3070 ref 34 19 16 3 TTGTGATTACTG 1 0 36945 CASAVA_Build 1 11410598 1D TGTCCTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 41 1 33 8 T 12 11 36946 CASAVA_Build 1 11416624 1D CATGCATTGG C/- CGAGGCCAGG 3070 het 3070 hom 61 27 28 6 C 2 1 36947 CASAVA_Build 1 11423731 2D GGGCAGGGTC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 72 het 43 0 23 20 AT 1 0 36948 CASAVA_Build 1 11427706 1I AGATACATCT -/G GGGGGTTGGC 1987 het 1987 ref 25 10 7 8 G 5 6 36949 CASAVA_Build 1 11428129 1I CAGAGAGTCA -/G GAGACAGAGA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 G 1 2 36950 CASAVA_Build 1 11428396 2I7M4D GACAGAGAGA --CAGAGTCAGAG/CGCAGAGTC---- AGAGACAGAG 2025 het 2025 ref 49 33 8 11 N/A 0 0 36951 CASAVA_Build 1 11430439 1I GCTAAACTCT -/C CCTGCTGCAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 2 3 36952 CASAVA_Build 1 11434546 4I CTGTTCACCC ----/TTCG TTCGGCCTGT 2596 het 2596 ref 31 15 8 8 TTCG 1 2 36953 CASAVA_Build 1 11443025 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 891 hom 22 3 12 7 A 9 10 36954 CASAVA_Build 1 11448681 1D CTTGTCAGTG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 52 het 29 0 22 7 C 10 9 36955 CASAVA_Build 1 11453183 1I CCAGATCATT -/G GGTTTCCAGG 3070 het 3070 ref 32 12 13 7 G 2 3 36956 CASAVA_Build 1 11493254 18I CATTACCATT ------------------/TTCAGTGTTTTTTGTTTC TTTGTATAGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTCAGTGTTTTTTGTTTC 0 1 36957 CASAVA_Build 1 11508189 2D ATTTATTAAC TG/-- TGTGTCTTTA 3070 hom 97 het 34 0 28 6 TG 3 2 36958 CASAVA_Build 1 11516381 12I AGACACGCAT ------------/GCACACACGCAC GCACACACAC 3070 hom 100 het 43 0 33 10 GCACACACGCAC 0 1 36959 CASAVA_Build 1 11523906 4I CTTAGAAACC ----/TCTG TCTGGCTGCA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 TCTG 1 2 36960 CASAVA_Build 1 11527169 1D AAGAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2988 het 709 hom 24 5 10 9 A 14 13 36961 CASAVA_Build 1 11562195 1I CCCCTCTGCA -/G GGCTTCCCAG 2730 het 2730 ref 19 9 8 2 G 2 3 36962 CASAVA_Build 1 11564368 7I AATTACTAGC -------/CCTTAAA CCTTCCCTAG 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 CCTTAAA 0 1 36963 CASAVA_Build 1 11574082 3D CTACCTTGGA TAC/--- TACTAATCTG 3070 het 3070 ref 52 34 14 4 TAC 2 1 36964 CASAVA_Build 1 11579637 5D TTCTTTCTTT CTTTC/----- TTTTTTTTTT 157 het 157 ref 20 7 3 10 CTTTC 1 0 36965 CASAVA_Build 1 11590613 1D AAAAACAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2358 hom 42 15 20 7 T 13 12 36966 CASAVA_Build 1 11596154 1I GTCAGGTTTT -/G GTCTTATTCA 3070 hom 51 het 27 0 23 4 G 1 2 36967 CASAVA_Build 1 11602817 3I CTTCTAGAAC ---/ACT ACTACCATTA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 ACT 1 2 36968 CASAVA_Build 1 11607920 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 352 hom 23 1 18 4 A 9 10 36969 CASAVA_Build 1 11609360 3I TAACATAGAC ---/TAT TATTATTCTT 3070 hom 78 het 32 0 25 7 TAT 2 3 36970 CASAVA_Build 1 11609571 1D ATGGAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 20 1 17 3 T 11 10 36971 CASAVA_Build 1 11617526 1I AGGGAGAGTC -/T TTTGAGATAT 3070 hom 105 het 41 0 33 8 T 3 4 36972 CASAVA_Build 1 11622654 12D ATTTCGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 15 9 A 23 11 36973 CASAVA_Build 1 11623176 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 21 0 17 5 A 11 12 36974 CASAVA_Build 1 11640397 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 9 8 36975 CASAVA_Build 1 11644421 2D TGCTCTGCCC CT/-- GTCTGCTGCT 3070 hom 69 het 30 0 20 10 CT 1 0 36976 CASAVA_Build 1 11648525 2D TTCTAGAGAC AG/-- AGTCTCACTA 3070 hom 50 het 22 0 17 6 AG 2 1 36977 CASAVA_Build 1 11650244 1I CTCCATCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 26 1 19 6 T 10 11 36978 CASAVA_Build 1 11654515 1D GCCTGGGTGA G/- GGGGGGGGCC 3070 hom 75 het 30 0 24 6 G 9 8 36979 CASAVA_Build 1 11655097 1I CACCCGGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 9 10 36980 CASAVA_Build 1 11673574 4D CCGCGTGTGA GTGT/---- GTGTGTGTGT 957 het 957 ref 27 10 4 14 GT 9 7 36981 CASAVA_Build 1 11684742 2I CACATGCTCT --/CA CACACACGCG 3070 hom 167 het 68 0 50 18 CA 3 4 36982 CASAVA_Build 1 11695843 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 A 13 12 36983 CASAVA_Build 1 11714495 4D TTTCACTTTC TTTT/---- GTTTCTCCGT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 4 0 36984 CASAVA_Build 1 11715582 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 9 8 36985 CASAVA_Build 1 11716262 1I GGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2661 hom 24 7 9 8 T 10 11 36986 CASAVA_Build 1 11733609 2D GAGGCCACAG GA/-- GAGAGAGACA 3070 het 3070 ref 43 18 14 12 GA 5 4 36987 CASAVA_Build 1 11735623 1I CCTTATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2264 hom 23 7 10 7 T 11 12 36988 CASAVA_Build 1 11746087 1D ACTCCGGCTC A/- AAAAAAAAAA 1821 het 882 hom 29 9 8 13 A 17 16 36989 CASAVA_Build 1 11748228 1I CCCCGATCCC -/A ACCACCGTCA 3070 hom 72 het 26 0 22 4 A 1 2 36990 CASAVA_Build 1 11755076 1D GCACAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 66 het 25 0 21 4 T 7 6 36991 CASAVA_Build 1 11757775 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 9 8 36992 CASAVA_Build 1 11760290 1D AATCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 28 0 22 6 A 14 13 36993 CASAVA_Build 1 11762065 2D TCTCTGTGCC CT/-- ATTTGCCTAT 3070 het 3070 hom 52 18 23 11 CT 1 0 36994 CASAVA_Build 1 11765563 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1576 het 113 hom 15 2 6 7 A 18 17 36995 CASAVA_Build 1 11768680 1I CCAGGCCAAG -/T TTTTTTTTTT 2831 hom 27 het 13 0 9 4 T 11 12 36996 CASAVA_Build 1 11769922 3I GGAATGGGTG ---/GAA GAAGAGGCCG 3070 hom 69 het 24 0 21 3 GAA 1 2 36997 CASAVA_Build 1 11784568 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 28 0 22 9 A 24 11 36998 CASAVA_Build 1 11809961 1I TGATGAGACT -/G GGGGGGTCAA 3070 hom 83 het 33 0 27 6 G 6 7 36999 CASAVA_Build 1 11837008 1I AATTAAAAGT -/A AAAAAAAAAT 2488 het 2445 hom 15 8 6 1 A 9 10 37000 CASAVA_Build 1 11840208 1I TAAATACATT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 A 7 8 37001 CASAVA_Build 1 11887998 1D TTTGGAAATC T/- TTTTTTTTTT 725 het 725 ref 19 8 4 7 T 17 16 37002 CASAVA_Build 1 11907012 1I TGGGATTACA -/G GCGTGAGCCA 3070 hom 51 het 20 0 14 6 G 1 2 37003 CASAVA_Build 1 11909141 1I AGGAGAGAGA -/G GCAGGCCGGA 1776 hom 13 het 6 0 5 1 G 1 2 37004 CASAVA_Build 1 11920817 2I GGCTGGTCTC --/GA AATCCTGACC 3070 het 3070 hom 20 8 8 4 GA 0 1 37005 CASAVA_Build 1 11928070 1I ATTGGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 11 12 37006 CASAVA_Build 1 11943872 1D TTCAAAAATT A/- AAAAAAAATA 2974 het 2974 ref 29 14 10 6 A 9 8 37007 CASAVA_Build 1 11954658 7D6M3D GCTTTCTCCA AGGTACTTTCTCCAAG/-------GTCCCC--- ACTCAGTTCC 3070 het 3070 ref 23 11 11 6 N/A 0 0 37008 CASAVA_Build 1 11960297 2I CTCTTGTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 11 13 37009 CASAVA_Build 1 11961879 2I AGCTTGAGTG --/AC AGAGTGAGAC 2483 het 2483 ref 23 10 7 6 AC 0 1 37010 CASAVA_Build 1 11969784 2I TGAAGCCCTG --/TC TCTACGAAAA 2810 het 2810 ref 21 10 6 5 TC 1 2 37011 CASAVA_Build 1 11988806 1I AATACACATT -/A AAAGTAAGTA 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 A 3 4 37012 CASAVA_Build 1 11996748 1I TTTTTTTTCT -/C TTTTTTTTTT 2569 het 909 hom 19 5 10 4 C 0 1 37013 CASAVA_Build 1 12032316 1D GTCTCGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 32 0 23 9 A 12 11 37014 CASAVA_Build 1 12043585 1D GTAGTACACA T/- TTTTTTTTTT 1945 het 1945 ref 23 11 5 7 T 15 14 37015 CASAVA_Build 1 12048999 1D GAGTTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1409 hom 28 6 11 12 T 17 16 37016 CASAVA_Build 1 12056688 9I TCTTCAGGAT ---------/TCACTCAGG CCCTGCAGTC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 TCACTCAGG 0 1 37017 CASAVA_Build 1 12100865 1I AGCTATTCTT -/A GTGCCTCAGC 2620 het 651 hom 8 2 6 0 A 0 1 37018 CASAVA_Build 1 12118714 1D GGTCCATTCC T/- TTTTTTTTTT 1641 het 1641 ref 40 27 6 7 T 13 12 37019 CASAVA_Build 1 12133528 4D GTCACAGGTT AGTA/---- AGAAAGATGA 3070 het 3070 ref 56 31 20 7 AGTA 1 0 37020 CASAVA_Build 1 12139916 1I AAATTAAGAA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 50 21 19 10 T 7 8 37021 CASAVA_Build 1 12160978 1D TTCCACTGCC G/- GGCACGGTGC 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 G 3 2 37022 CASAVA_Build 1 12166825 1D TGTTTTGGGG A/- CCTCCTGGGG 1694 het 1694 ref 17 8 5 4 A 1 0 37023 CASAVA_Build 1 12167948 6D GGGAGATTTC CTTTTT/------ CTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 CTTTTT 2 1 37024 CASAVA_Build 1 12169799 1D TTCTCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 30 15 3 12 T 15 14 37025 CASAVA_Build 1 12177334 1I GTCACAGAGG -/A AAGCAGTGAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 2 3 37026 CASAVA_Build 1 12179585 1I CCCTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2058 hom 29 10 13 6 T 10 11 37027 CASAVA_Build 1 12180185 23D TGTGGGGCAG GGAGCATCATCACCCCCATTTTA/----------------------- CAGAGGAGGA 3070 het 3070 ref 33 21 13 5 GGAGCATCATCACCCCCATTTTA 1 0 37028 CASAVA_Build 1 12199571 1D CACAGAACCC A/- AAATTGTGGG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 4 3 37029 CASAVA_Build 1 12285477 3D AAAGAATTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 686 het 686 ref 36 13 3 20 T 19 16 37030 CASAVA_Build 1 12320633 1D CTAATTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 17 14 A 15 14 37031 CASAVA_Build 1 12392104 4D AATATATAAT AAAG/---- AGACTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 21 7 5 AAAG 1 0 37032 CASAVA_Build 1 12405489 1D TTTGAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 2675 het 2675 ref 48 24 7 18 T 17 16 37033 CASAVA_Build 1 12442125 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2638 het 2638 ref 34 20 7 7 T 17 16 37034 CASAVA_Build 1 12504998 2I CCTGGGCGAC --/AG AGAGAGACTC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 AG 3 4 37035 CASAVA_Build 1 12514963 1D GCTTCCTGTA T/- TTTTTTTTTT 2924 het 2924 ref 39 14 13 12 T 14 13 37036 CASAVA_Build 1 12532815 1I ACTTGCTTAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 8 9 37037 CASAVA_Build 1 12533995 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 5 6 37038 CASAVA_Build 1 12540830 1D CAAAAACAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 2896 hom 31 9 17 5 C 1 0 37039 CASAVA_Build 1 12543232 1D TTGGGGTTTT C/- CTTTTTTTTT 2544 het 449 hom 22 7 7 8 C 2 1 37040 CASAVA_Build 1 12548717 2D CTGGCATGGC AG/-- AGCCTGGTTC 3070 het 3070 hom 52 17 28 7 AG 2 1 37041 CASAVA_Build 1 12551914 4I AAAAGGCAGA ----/GAGT GAGTGAGTGG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 GAGT 2 3 37042 CASAVA_Build 1 12561785 3D TCTTGTCTGG CCA/--- CCTTGTTCGT 3070 het 3070 ref 46 27 15 6 CCA 1 0 37043 CASAVA_Build 1 12567573 4I TCTGTGGGTG ----/TCTC TCTGTATGAG 3070 hom 105 het 42 0 34 8 TC 1 3 37044 CASAVA_Build 1 12567819 6D TGTGTATCTC TGTGTG/------ TGTGTGTCTA 3070 het 3070 ref 92 38 28 32 TG 6 3 37045 CASAVA_Build 1 12569432 4D GTCCTGTAAG AGAA/---- AGAAAGCACA 3070 hom 108 het 38 0 35 8 AGAA 2 1 37046 CASAVA_Build 1 12570845 3I CAGCCTCCCC ---/ACA ACAACAACAG 3070 hom 62 het 26 0 18 8 ACA 3 4 37047 CASAVA_Build 1 12571991 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 727 hom 36 5 16 15 T 16 15 37048 CASAVA_Build 1 12580992 1I AAAATAAAAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 8 9 37049 CASAVA_Build 1 12584770 7I CAGAGATCAA -------/AATGACT AATGCCTTGT 3070 het 3070 hom 46 15 18 13 AATGACT 0 1 37050 CASAVA_Build 1 12602363 1I AGACCCCCCC -/A ACCCCCCTAA 2832 het 2446 hom 20 8 10 2 A 1 2 37051 CASAVA_Build 1 12602868 14I TTTTCACCCC --------------/AACTAGCCCACCCT GGTCAGATGC 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 AACTAGCCCACCCT 0 1 37052 CASAVA_Build 1 12616229 1I TGTGTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 16 1 12 3 T 10 11 37053 CASAVA_Build 1 12653116 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 12 11 37054 CASAVA_Build 1 12655826 1D TTAAAGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 12 11 37055 CASAVA_Build 1 12656420 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1954 het 625 hom 10 3 6 1 T 11 10 37056 CASAVA_Build 1 12656593 1D GGTGCTGGAG A/- AATATTGGAA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 3 2 37057 CASAVA_Build 1 12659156 1D ATCAGAGACA T/- TTTTTTTTTT 2009 het 2009 ref 23 12 6 5 T 12 11 37058 CASAVA_Build 1 12660911 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 11 23 10 A 10 11 37059 CASAVA_Build 1 12665647 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAGATA 3070 het 2093 hom 26 5 15 6 A 7 6 37060 CASAVA_Build 1 12665805 2I AAAGGTCCCA --/GT GTGTGAGTGT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 GT 2 3 37061 CASAVA_Build 1 12684766 21I ACAGCAGCAA ---------------------/GAGGAAACTAATACAGACTGG GTGTGGTTGC 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 GAGGAAACTAATACAGACTGG 0 1 37062 CASAVA_Build 1 12691096 12D AATCTTTTTA TAGTTTGTTTAT/------------ TAGTTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 21 14 4 TAGTTTGTTTAT 1 0 37063 CASAVA_Build 1 12752481 9I AAGGTTTTTG ---------/AATGAATCA AGGGGAAAGG 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 AATGAATCA 0 1 37064 CASAVA_Build 1 12755080 1D TCTAGGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2417 hom 30 9 11 10 T 14 13 37065 CASAVA_Build 1 12763884 2D ATGTTTTTAA TG/-- TGTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 6 TG 2 1 37066 CASAVA_Build 1 12764178 1I GCATTCCCTG -/A GGCAACACTT 3070 het 3070 ref 59 34 19 6 A 0 1 37067 CASAVA_Build 1 12765155 1I GTTTTGTTTT -/C CCCAATTTTA 2707 het 2707 ref 35 21 6 8 C 3 4 37068 CASAVA_Build 1 12766314 1D AATAGCCTGA T/- TTTTTCATGC 1313 het 1313 ref 40 34 3 3 T 6 5 37069 CASAVA_Build 1 12768202 5I CCTTCCTCTT -----/ATCTC AACTGCAAGA 2712 het 2712 ref 52 39 7 6 ATCTC 0 1 37070 CASAVA_Build 1 12769406 1D CAGGGAGGGA C/- CCTGAGAAGG 3070 het 3070 hom 58 28 23 7 C 3 2 37071 CASAVA_Build 1 12774541 1I TGGTGTTATT -/C GTGATTCTCC 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 C 0 1 37072 CASAVA_Build 1 12777926 2I CTAAAAGATG --/AA AAAAAAAAAA 1858 het 1858 ref 40 24 6 10 A 10 12 37073 CASAVA_Build 1 12783314 1I GAGAACCCAG -/A AATAAAGCCA 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 A 2 3 37074 CASAVA_Build 1 12793937 1D TACTTTAGAA C/- CCCCGATGAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 C 5 4 37075 CASAVA_Build 1 12794443 1D TGTAATTATG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 9 8 37076 CASAVA_Build 1 12804942 1D CGCCTGGCTA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 7 6 37077 CASAVA_Build 1 12806400 1D TGTTTCTACT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 9 8 37078 CASAVA_Build 1 12808778 1I ACTTTTACAA -/C TGGGAATTAG 2903 het 2903 ref 18 10 6 2 C 0 1 37079 CASAVA_Build 1 12810440 1D CATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2888 het 2888 ref 48 29 9 10 T 11 10 37080 CASAVA_Build 1 12811189 1I GCAGGCTCCG -/C CCCGCAAGCT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 C 3 4 37081 CASAVA_Build 1 12812315 4D TTGAACAGAG AGAC/---- AGAGAGAGCT 2056 het 2056 ref 74 58 5 11 AGAC 1 0 37082 CASAVA_Build 1 12812815 6I CTGTTACCTC ------/CAAGAT GGCCTCCAAG 1671 het 1671 ref 69 59 6 4 CAAGAT 0 1 37083 CASAVA_Build 1 12812958 2I CTTTTTGATT --/AA GATTTTGTTT 2879 het 2879 ref 54 43 7 4 A 0 2 37084 CASAVA_Build 1 12813682 1D3M3I TTGTTCATAT GAGA---/-ATATAT AAAAAAAAGG 1444 het 1444 ref 47 30 4 16 N/A 0 0 37085 CASAVA_Build 1 12814450 1I AATAAAAAAA -/T TCATTCATTC 3070 het 3070 ref 67 52 8 10 T 1 2 37086 CASAVA_Build 1 12814543 1I ATTTGATCTG -/T TTACGACATT 3070 het 3070 ref 63 29 28 6 T 2 3 37087 CASAVA_Build 1 12816140 1D TAACCTCTGT A/- TTGTCCCTTC 3070 het 3070 ref 63 34 15 15 A 1 0 37088 CASAVA_Build 1 12816379 1D TCACGATGCC A/- AAAAATTGAG 2705 het 2705 ref 49 36 6 8 A 6 5 37089 CASAVA_Build 1 12824938 1D6M2D ATATTAGATA GAAAGAAAG/-AAAGAA-- AAAACTTGAA 1692 het 1692 ref 35 32 4 3 N/A 0 0 37090 CASAVA_Build 1 12847922 3I AGCCAAAAAT ---/GAC AAATCCACAT 3070 het 3070 ref 49 33 13 3 GAC 0 1 37091 CASAVA_Build 1 12860277 6I AACACGCTGC ------/ACTAGT ACTAGTCTCT 3070 het 3070 ref 87 40 30 17 ACTAGT 1 2 37092 CASAVA_Build 1 12867401 2D TGAAAGTATC TT/-- TGTTGAGGGA 3070 het 3070 ref 101 75 17 10 T 3 1 37093 CASAVA_Build 1 12867624 6I TGTTACCTCC ------/AAGATT GCCTCCAAGA 3070 het 3070 ref 63 35 23 5 AAGATT 0 1 37094 CASAVA_Build 1 12867768 6D TTTTGATTGA TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 1120 het 1120 ref 74 64 3 12 TTTTGT 2 1 37095 CASAVA_Build 1 12869710 1D TCATGGTTGC T/- GGCAGCCTAC 2536 het 2536 ref 76 67 6 3 T 1 0 37096 CASAVA_Build 1 12871132 1I TCACGATGCC -/A AAAAATTGAG 3070 het 2005 hom 22 6 11 5 A 5 6 37097 CASAVA_Build 1 12871360 4D AACACAAACG AACA/---- AACAAACAAA 1185 het 1185 ref 35 25 4 6 AACA 3 2 37098 CASAVA_Build 1 12909201 1D CAGCACAGCC T/- TTTTTTGTTA 3070 het 3070 ref 36 26 8 2 T 7 6 37099 CASAVA_Build 1 12925495 4D TCTCTCTCCC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 39 25 10 5 TCTT 3 2 37100 CASAVA_Build 1 12930583 1I AATAAAAAAA -/T TCATTCATTC 2358 het 2358 ref 14 8 5 1 T 1 2 37101 CASAVA_Build 1 12961267 7I CTGTGAGTGG -------/AAAACAA AAAACAAAAA 3070 hom 71 het 30 0 22 8 AAAACAA 1 2 37102 CASAVA_Build 1 12962731 1I TCTCCTTATC -/A AAAAACAGGA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 5 6 37103 CASAVA_Build 1 12971344 1D TACTAAAAAA T/- AATAATAATA 2344 het 403 hom 14 1 5 8 T 1 0 37104 CASAVA_Build 1 12972690 3I ATGCCCGGCC ---/ATA ATAATAATAA 1782 het 1531 hom 10 4 4 2 ATA 3 4 37105 CASAVA_Build 1 12974493 1I AAAACAAAAA -/C CAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 C 1 2 37106 CASAVA_Build 1 13042811 3D CCAGCACTTC AGG/--- AGGCCAAGGC 1388 het 1388 ref 9 4 3 2 AGG 2 1 37107 CASAVA_Build 1 13045750 1I AGACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 11 12 37108 CASAVA_Build 1 13101017 1I TTTCAGTAAG -/T TTCTCTGATT 2157 het 2157 ref 51 41 5 5 T 2 3 37109 CASAVA_Build 1 13103404 2D7M5I29M1I CAATTAATTG CACTTTTTT-----AACTGTTTGATTAAGATTTTTTTTTTTCA-/--GTTTTCTTAAAAAACTGTTTGGTTAAGATTTTTTTTTTTGAC ACAGTCTGAC 3070 het 3070 ref 48 35 8 20 N/A 0 0 37110 CASAVA_Build 1 13104906 1D48M1I CCACCAAGAA TTTTTTTTCTTTAAATTGCTGGTTTAATAAAGAGTTGTTTATTTTCAGG-/-TTTTTTTCTTTAAATTCCTGGTTTAATAAGGACTTGTTTATTTTGAGGA GAAAAGGTCC 2902 het 2902 ref 30 31 7 10 N/A 0 0 37111 CASAVA_Build 1 13109285 1I CAAAAGAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 60 22 16 22 T 2 3 37112 CASAVA_Build 1 13110589 4I6M12I AGTGCATAGA ----AGTCCT------------/ACCCAATACTATGACACCATGC TTGAGAAAAG 1616 het 1616 ref 45 38 4 3 N/A 0 0 37113 CASAVA_Build 1 13121975 1D AGTGCGAGGG A/- AAAAAATCCT 3070 hom 36 het 13 0 13 2 A 7 6 37114 CASAVA_Build 1 13141086 1D GATCATAGTG A/- AAATCCATCT 3070 het 3070 ref 35 26 8 1 A 4 3 37115 CASAVA_Build 1 13249375 2I GGATTGCTTG --/TC TCTGCAGGAA 3070 het 2914 hom 19 7 11 1 TC 1 2 37116 CASAVA_Build 1 13249718 11I CTGATCTGTC -----------/CTCAGCCCCCT CTCAGCCTCC 3070 hom 33 het 14 0 10 4 CTCAGCCCCCT 0 1 37117 CASAVA_Build 1 13253194 1D TTGCTGTAAC A/- AAAAAAGGCT 3070 het 2561 hom 25 6 17 3 A 7 6 37118 CASAVA_Build 1 13320319 1D TGCTGTTATG T/- TTTTTTCCCT 3070 het 1588 hom 36 5 28 3 T 7 6 37119 CASAVA_Build 1 13355359 1D TTGTGGGCAT G/- GAGGGAGACT 1792 het 1792 ref 24 17 4 3 G 2 1 37120 CASAVA_Build 1 13385967 1I TCCATTGGAA -/G GTATAATACA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 2 37121 CASAVA_Build 1 13577146 3D ACCCATCACT GAA/--- GAAGGACAAC 3070 het 3070 ref 46 28 17 1 GAA 2 1 37122 CASAVA_Build 1 13652993 1I TATTATGAGA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 575 hom 11 2 9 0 T 7 8 37123 CASAVA_Build 1 13664248 1D GGAATTTGTC T/- TTAATGAACT 3070 het 3070 ref 57 29 22 6 T 3 2 37124 CASAVA_Build 1 13695378 1D TAGCTATTTA T/- TTTTTATTTT 3070 het 2879 hom 19 7 10 2 T 6 5 37125 CASAVA_Build 1 13696668 1D CTTCATATGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 23 10 8 6 A 9 8 37126 CASAVA_Build 1 13703278 1D ACATTTGACC A/- GGGGACACTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 1 0 37127 CASAVA_Build 1 13703919 6D GAAAAAAGAA AAAGAG/------ AAAGAGAAAG 3070 hom 66 het 24 0 23 6 AAAGAG 2 1 37128 CASAVA_Build 1 13704996 23D AGGAGGGGCC CGTCTGGGCTGTGGGAGGGAGCT/----------------------- CGTCTGGGCT 3070 hom 73 het 28 0 15 17 CGTCTGGGCTGTGGGAGGGAGCT 2 1 37129 CASAVA_Build 1 13724414 2D CTAAACCTTT AC/-- AGTGGGTGCT 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 AC 1 0 37130 CASAVA_Build 1 13727546 2D GTCACCTATC TG/-- TGTTCCCGTA 3070 het 3070 ref 49 23 21 7 TG 2 1 37131 CASAVA_Build 1 13727748 3D AGACCTGTTC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 53 17 21 15 TTG 7 6 37132 CASAVA_Build 1 13729150 2D CCAGCCCCTC CT/-- CTCTCTCTCT 3064 het 2485 hom 26 11 10 5 CT 7 6 37133 CASAVA_Build 1 13730626 2I2M1I GATGGGGGTC --GC-/TTGCG CTGTTGCCCA 3070 het 3070 ref 26 12 9 6 N/A 0 0 37134 CASAVA_Build 1 13732055 4D TAAACATAAA TAAG/---- TATCAGTTTT 3070 het 3070 ref 22 12 10 3 TAAG 1 0 37135 CASAVA_Build 1 13748970 1I CTAAATTGAA -/T TTTTTTTTTT 2400 het 2400 ref 32 15 12 5 T 15 16 37136 CASAVA_Build 1 13751884 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2284 het 1207 hom 13 3 7 3 A 13 11 37137 CASAVA_Build 1 13757481 1I ATAAATAAAG -/A AAAAAATAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 6 7 37138 CASAVA_Build 1 13768730 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 30 het 22 0 10 12 A 9 8 37139 CASAVA_Build 1 13771756 1I AAGACATGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 9 10 37140 CASAVA_Build 1 13774948 1I GAAGTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2848 het 2848 ref 33 15 9 9 T 11 12 37141 CASAVA_Build 1 13778506 7D CTATTTTATA ATTTTTT/------- ATTTTTTATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 ATTTTTT 2 1 37142 CASAVA_Build 1 13781601 14D GGACAAGACG TTACCTGGGAGATC/-------------- TTTAGAAATG 3070 hom 129 het 43 0 43 3 TTACCTGGGAGATC 1 0 37143 CASAVA_Build 1 13788063 25I TCATTGAATA -------------------------/GCTACTATTCAATAAATTGAATAGT GCTACTATTC 1994 het 1994 ref 26 12 5 10 GCTACTATTCAATAAATTGAATAGT 0 1 37144 CASAVA_Build 1 13803523 4D CATCTTAATC CTGA/---- CTATCATTCA 3070 het 3070 ref 42 21 16 8 CTGA 1 0 37145 CASAVA_Build 1 13803688 1D GAGCACTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 12 11 37146 CASAVA_Build 1 13810127 1D CACGGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 1868 hom 18 het 7 0 7 0 C 4 3 37147 CASAVA_Build 1 13810324 4D CAAAACAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AAAC 4 3 37148 CASAVA_Build 1 13810468 3D TATGACGGAA TAT/--- TATTCAGCCT 3070 hom 74 het 28 0 26 4 TAT 2 1 37149 CASAVA_Build 1 13811971 13I GATTAACTTC -------------/TCCAATTTCTTAT TAAATCAAGG 3070 hom 93 het 33 0 32 4 TCCAATTTCTTAT 0 1 37150 CASAVA_Build 1 13816241 1D ATCCATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1179 hom 37 5 26 6 T 15 14 37151 CASAVA_Build 1 13816824 2I TTTAAATAAC --/TT TCATTGTTCA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 1 3 37152 CASAVA_Build 1 13817765 4D TCACCCCGAC TCTG/---- TCTGGAGATT 3070 hom 69 het 30 0 21 10 TCTG 2 1 37153 CASAVA_Build 1 13819789 1I TGGAGACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 35 1 30 4 A 10 11 37154 CASAVA_Build 1 13824359 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2606 het 1833 hom 17 5 7 5 T 12 11 37155 CASAVA_Build 1 13829951 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 435 het 435 ref 18 5 3 11 CT 2 1 37156 CASAVA_Build 1 13861683 1D AGGCACCCCA C/- CCCCCCAAAG 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 C 7 6 37157 CASAVA_Build 1 13883406 4D ATCTCAAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 26 17 8 2 AAAT 3 2 37158 CASAVA_Build 1 13904402 1D AACATTTTTT C/- TTAGATATTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 C 1 0 37159 CASAVA_Build 1 13907264 1D CCCTTTAATC T/- TTTTTTTTTT 1418 het 1418 ref 41 25 4 12 T 12 11 37160 CASAVA_Build 1 13910468 10I GTTGCTTTAG ----------/AATACATTAT TATTCTATTG 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 AATACATTAT 0 1 37161 CASAVA_Build 1 13912217 12I GAATTTGCAT ------------/AGAGGTAGAGAC AGAGATTGTA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AGAGGTAGAGAC 0 1 37162 CASAVA_Build 1 13913302 4D GAGAAGAGGG TTGA/---- TTATGTTCAA 3070 het 3070 ref 37 26 11 1 TTGA 1 0 37163 CASAVA_Build 1 13916023 1I TTTAGACACC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 8 9 37164 CASAVA_Build 1 13918868 1D GCTTGTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 10 9 37165 CASAVA_Build 1 13927739 1D GTCCAAAAGG A/- AAAACCAATG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 5 4 37166 CASAVA_Build 1 13942041 3D AATTGTTGAA AAG/--- AAGAAGAAAG 3070 het 3070 ref 35 23 10 4 AAG 3 2 37167 CASAVA_Build 1 13958649 1D AGCAGAATGT C/- TAAGGGCCTG 3070 het 3070 ref 49 29 16 4 C 1 0 37168 CASAVA_Build 1 13959937 1D GCACACTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 13 19 A 15 14 37169 CASAVA_Build 1 13976718 1D CCTCCTCCCA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 178 hom 24 1 11 12 C 11 10 37170 CASAVA_Build 1 13978982 3I GATAAACTAA ---/CTC CTCCTGCAGG 3070 het 3070 hom 54 18 28 8 CTC 1 2 37171 CASAVA_Build 1 13985354 1D GAATTGATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 10 9 37172 CASAVA_Build 1 13989159 2D GGTTCCACAC TT/-- CACCTGGGGA 3070 het 3070 ref 41 22 12 8 T 2 0 37173 CASAVA_Build 1 13989827 3I AACTGCTCCT ---/TGG TGGTGCCATG 3070 het 3070 ref 62 32 22 8 TGG 1 2 37174 CASAVA_Build 1 13997572 2I AGTATAAAAC --/TG TGCTAGCAAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TG 1 2 37175 CASAVA_Build 1 14008060 1D TAAAAATACC A/- TTGCCCAATC 3070 hom 77 het 30 0 26 4 A 1 0 37176 CASAVA_Build 1 14009244 3I CATCTATAAC ---/ATT AGTTAACCTC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 ATT 0 1 37177 CASAVA_Build 1 14009580 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 20 9 T 10 11 37178 CASAVA_Build 1 14011415 1D TAAGCACAGC G/- GGGGGTCTCA 3070 hom 132 het 49 0 41 8 G 6 5 37179 CASAVA_Build 1 14014356 1D GCCTGGACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 10 9 37180 CASAVA_Build 1 14020125 1I TCCAGCCCCA -/T TCAGACATTT 3070 hom 96 het 34 0 30 4 T 1 2 37181 CASAVA_Build 1 14024515 1D CCACAACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 25 0 14 11 T 17 16 37182 CASAVA_Build 1 14024740 1I GTCTCGATCT -/C CTTACCTCGT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 1 2 37183 CASAVA_Build 1 14026485 1D AGGGGACACA G/- GGGACTCTTG 3070 hom 102 het 44 0 35 9 G 4 3 37184 CASAVA_Build 1 14027394 19I TTTAGGGTAA -------------------/GTAAACTTACCTGTTTCTG GGATCACCTG 3070 hom 96 het 31 0 33 2 GTAAACTTACCTGTTTCTG 0 1 37185 CASAVA_Build 1 14035565 1I AAAGTAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 968 hom 31 3 18 10 T 15 16 37186 CASAVA_Build 1 14036358 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1315 het 75 hom 18 1 6 11 T 17 16 37187 CASAVA_Build 1 14036924 1D TTGGCACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 39 1 29 11 T 13 12 37188 CASAVA_Build 1 14037314 1I CTATTTTTTT -/C TACATGATTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 C 0 1 37189 CASAVA_Build 1 14045096 3I TTTCTTTTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 2791 het 2185 hom 29 9 12 8 T 11 14 37190 CASAVA_Build 1 14047556 11D TCAGTTCGTG GGCCAGGCCCA/----------- GGGCCTTGAT 3070 het 3070 ref 33 18 14 5 GGCCAGGCCCA 1 0 37191 CASAVA_Build 1 14050793 1I AACATCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 33 0 25 8 A 10 11 37192 CASAVA_Build 1 14053573 2I ACATAGGTAA --/AC ACATGTCACA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AC 1 2 37193 CASAVA_Build 1 14061980 1I AATTTTTAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1770 hom 17 4 10 3 T 9 10 37194 CASAVA_Build 1 14066984 1D CTACCCCTTT A/- ACCAGCTAAT 3070 het 3070 hom 50 17 23 11 A 2 1 37195 CASAVA_Build 1 14074977 15D CTCAAAAACA AAAAAACAAAAAAAC/--------------- AAAAAACAAA 2178 het 2178 ref 22 18 7 2 AAAAAACAAAAAAAC 1 0 37196 CASAVA_Build 1 14081769 1D TAGAACTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 37 1 30 6 T 13 12 37197 CASAVA_Build 1 14085034 10D GTAAGTTTAC TGTTTCTCAT/---------- CAAGCTTTCA 3070 hom 69 het 24 0 24 4 TGTTTCTCAT 1 0 37198 CASAVA_Build 1 14087797 1I GTGGCTGCCT -/G GGTTTAGTGG 3070 hom 77 het 31 0 21 10 G 2 3 37199 CASAVA_Build 1 14090847 3D TCACCTTGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 40 0 30 10 T 16 13 37200 CASAVA_Build 1 14093484 1D GTGGTCACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 11 10 37201 CASAVA_Build 1 14095074 1I ATTTTCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 42 3 37 2 T 11 12 37202 CASAVA_Build 1 14100125 1D CTAATCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 12 11 37203 CASAVA_Build 1 14130763 2D AATGATTGTC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 117 het 46 0 40 9 AT 1 0 37204 CASAVA_Build 1 14136134 1D TTTTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 23 2 15 6 T 13 12 37205 CASAVA_Build 1 14139366 1D TGTTGGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 32 5 T 12 11 37206 CASAVA_Build 1 14148404 2I GTACTTGGAG --/AC ACAATTTCTG 3070 hom 62 het 24 0 20 4 AC 1 2 37207 CASAVA_Build 1 14148630 1I TAGGGTGAGA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 7 8 37208 CASAVA_Build 1 14151742 1I ATAAACCCCC -/T GATCGCTTTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 0 1 37209 CASAVA_Build 1 14153693 5D CAAAAAAGCA GTGCC/----- GTGCCATGTA 3070 het 3070 ref 43 20 18 7 GTGCC 2 1 37210 CASAVA_Build 1 14167901 2D CTCTACATTC TG/-- TCTCTCCAGT 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 TG 1 0 37211 CASAVA_Build 1 14170685 10D AGGTTTTTTT TTTGTTGTTG/---------- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 53 17 33 10 TTTGTTGTTG 1 0 37212 CASAVA_Build 1 14178181 1D CAGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 987 het 987 ref 26 12 3 12 A 13 12 37213 CASAVA_Build 1 14189574 1I CTGTAGGTAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 7 8 37214 CASAVA_Build 1 14198014 3D AGTGCCACAT GGC/--- ACTTATTCTA 3070 het 2432 hom 18 6 12 2 GGC 1 0 37215 CASAVA_Build 1 14203188 1I TAAACTGCCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 9 10 37216 CASAVA_Build 1 14203777 1D ATTTGTGCAC T/- TTTGTACATA 2720 het 2720 ref 36 26 6 4 T 4 3 37217 CASAVA_Build 1 14203847 3I CTTAATCTCC ---/AGT CTGGCAGTAT 3070 hom 96 het 40 0 32 8 AGT 0 1 37218 CASAVA_Build 1 14204478 1D TGATTTCAGG T/- TTCTACCTTG 3070 het 3070 ref 51 29 19 4 T 3 2 37219 CASAVA_Build 1 14227292 2I TCTGGGAAAC --/TG TACGTAGGTG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TG 0 1 37220 CASAVA_Build 1 14234694 9I TGGGACTACA ---------/GGCATGAGT GGCATGAGTC 1309 het 415 hom 14 3 4 7 GGCATGAGT 1 2 37221 CASAVA_Build 1 14242695 1D TTATTTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 T 10 9 37222 CASAVA_Build 1 14243473 1I CACTGTTCCG -/C CCCCCCACCA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 C 6 7 37223 CASAVA_Build 1 14245478 2D35M4I AGGTACATAC ATATATATATAAATTTATTACCAGAGCAAAGCAAAAC----/--ATATATATAAATTTATTACCAGAGCAAAGCAAAACAAAA CAAAAATAAA 3070 hom 88 het 34 0 30 17 N/A 0 0 37224 CASAVA_Build 1 14246965 1I AAAAGAAAAA -/C AAAAAATAAA 3070 het 1797 hom 28 9 15 4 C 0 1 37225 CASAVA_Build 1 14247478 1D AAAATACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1263 hom 34 9 16 9 T 15 14 37226 CASAVA_Build 1 14260570 1D TTGAATATGA C/- CCCGTAGAAC 3070 het 3070 ref 50 27 19 5 C 4 3 37227 CASAVA_Build 1 14318107 4I TGTCATTGCA ----/AAAC AAACAAACAA 3049 het 3049 ref 32 16 9 7 AAAC 2 3 37228 CASAVA_Build 1 14319006 23I TGTGTACGAT -----------------------/CCAATTTAATCTTCACAGCAGCC CTATTTGGTG 3070 het 3070 ref 35 22 12 3 CCAATTTAATCTTCACAGCAGCC 0 1 37229 CASAVA_Build 1 14323792 1I GCTGGCAATG -/T TTGGTGTGGA 3070 het 3070 hom 34 10 13 11 T 2 3 37230 CASAVA_Build 1 14326188 5D ACTCCATCTC AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 AAACA 3 2 37231 CASAVA_Build 1 14329632 3D76M3I TGGGGTGGAG GGAGGAGATCTGTGAGCCTGTGGATAACATATCTGAACCTTCTGCCATCAAAATAATAATTAGGCTTGTCCTGAGTAAA---/---GGAGATCTGTGAGCCTGTGGATAACATATCTGAACCTCCTGCCATCAAAATAATAATTAGGCTTGTCCTGAGTAAAAGT AGTAGTCCTT 3070 het 3070 hom 30 30 29 4 N/A 0 0 37232 CASAVA_Build 1 14329975 7I CATTAATCAT -------/TAATCAC ATTAATGAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 TAATCAC 0 1 37233 CASAVA_Build 1 14335705 8I CAGGTGCACA --------/GTACCCTG GTACCCTGGA 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 GTACCCTG 1 2 37234 CASAVA_Build 1 14337941 15D AAGGCAGGCA TGGCTCTTCCAACAC/--------------- TAAGAATGGA 3070 het 3070 ref 44 22 20 5 TGGCTCTTCCAACAC 1 0 37235 CASAVA_Build 1 14341044 1I AGAATTGATA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 T 6 7 37236 CASAVA_Build 1 14341191 1D CCTCCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 2127 het 1213 hom 45 16 7 22 T 17 16 37237 CASAVA_Build 1 14354297 1D TCATTACTTG T/- TATTGGTCTG 3070 het 3070 ref 36 22 13 2 T 2 1 37238 CASAVA_Build 1 14365693 4I TGGTACTATT ----/GTAA GTGTTACTAT 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 GTAA 0 1 37239 CASAVA_Build 1 14369811 1I TCTGTAATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 T 9 10 37240 CASAVA_Build 1 14371081 2I GAATGTACCA --/TT CTTATCTGTA 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 0 2 37241 CASAVA_Build 1 14376399 2I GATGAGAAAG --/AA AACATGTTTA 3070 het 3070 hom 51 22 27 2 A 2 4 37242 CASAVA_Build 1 14383001 1D AAGGAGGCTG C/- CCTGGGTCTG 3070 hom 146 het 52 0 48 4 C 3 2 37243 CASAVA_Build 1 14392744 4D GACTAAGGTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 932 hom 43 6 14 23 T 18 14 37244 CASAVA_Build 1 14397108 4I ATCATAGTAA ----/CAGT CAGAGTAGTA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 CAGT 0 1 37245 CASAVA_Build 1 14406052 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2746 het 2710 hom 25 8 10 7 T 11 12 37246 CASAVA_Build 1 14413324 8I TCCGGCTTTC --------/TTTCTTTA TTTGGAGTGT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 TTTCTTTA 0 1 37247 CASAVA_Build 1 14417380 2D TGGAAGTATC AT/-- ATACATTGTG 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 AT 2 1 37248 CASAVA_Build 1 14417987 3I AGGCATTGTA ---/CAT CATTTGCTGT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 CAT 1 2 37249 CASAVA_Build 1 14425945 1D GCATGGACAC A/- AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 A 7 6 37250 CASAVA_Build 1 14430478 1D CTCTATCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1780 hom 24 6 10 8 T 11 10 37251 CASAVA_Build 1 14435197 2D TTTAATGATA TT/-- TTCTTCAGAT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 4 2 37252 CASAVA_Build 1 14445421 1D AATTAAAAAA T/- ATATAGTATT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 1 0 37253 CASAVA_Build 1 14472918 1D GGGAGCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 34 1 26 7 T 12 11 37254 CASAVA_Build 1 14499351 1I AATTTATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 10 37255 CASAVA_Build 1 14511230 1D AGAATACAGG A/- AAAAATAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 5 37256 CASAVA_Build 1 14514969 1I TGTATGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 T 10 11 37257 CASAVA_Build 1 14531946 1D GAAATTAAAA G/- GGTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 G 3 2 37258 CASAVA_Build 1 14537398 1I TCCACTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 68 het 26 0 23 3 A 9 10 37259 CASAVA_Build 1 14537698 1I GGAAGGAAAT -/G TTCCTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 G 0 1 37260 CASAVA_Build 1 14538104 1D AGAGACTCTG A/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 6 5 37261 CASAVA_Build 1 14539181 8I GCTTATAAAA --------/TCACAGAC TCGGGGAACA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 TCACAGAC 0 1 37262 CASAVA_Build 1 14540160 1D AGTAGAGATT G/- GGGGGGGTTT 3070 het 1298 hom 24 7 14 3 G 8 7 37263 CASAVA_Build 1 14540249 1D TGTTGGGATT A/- ACAGGCATGA 2141 hom 18 het 8 0 7 1 A 2 1 37264 CASAVA_Build 1 14544569 3D TTAGCACAGT ATG/--- ATAAAAATAT 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 ATG 1 0 37265 CASAVA_Build 1 14569046 1D ATTACATGCA C/- CAGTGTAAAT 3070 hom 163 het 64 0 55 9 C 2 1 37266 CASAVA_Build 1 14574980 1I CAAAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 C 0 1 37267 CASAVA_Build 1 14576158 8D AGCTACTTAG CCATTCTC/-------- CCATTCTTGT 3070 hom 98 het 34 0 33 2 CCATTCTC 1 0 37268 CASAVA_Build 1 14577397 5D CTTTAAAAGA AAAGT/----- AAACGGGAGG 3070 hom 119 het 45 0 40 6 AAAGT 1 0 37269 CASAVA_Build 1 14578159 2I AGCACCAGTT --/AG AGTCATGAGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AG 1 2 37270 CASAVA_Build 1 14591157 6D CAACAGATTC CTTTAA/------ CTTTAAGGGA 3070 het 3070 hom 57 27 28 5 CTTTAA 2 1 37271 CASAVA_Build 1 14595984 1D GCTCTATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 12 11 37272 CASAVA_Build 1 14596360 1I TTTTGGAGAC -/T TGGAAGTCCA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 T 1 2 37273 CASAVA_Build 1 14601172 2D GAGTCTATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 18 3 9 6 A 12 10 37274 CASAVA_Build 1 14601322 1D TCTATAGGCC A/- AAAAAAAAAA 1428 het 1428 ref 26 16 3 7 A 13 12 37275 CASAVA_Build 1 14603018 2I GTCTCTGCGC --/AG AGAGAGGTCC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 AG 3 4 37276 CASAVA_Build 1 14607628 1D TGGTCAGGTT C/- CTGGTGAGGG 3070 hom 75 het 31 0 24 7 C 2 1 37277 CASAVA_Build 1 14613697 2D TGCACATACC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 36 20 10 7 GT 8 7 37278 CASAVA_Build 1 14626696 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATG 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 TA 4 5 37279 CASAVA_Build 1 14649209 1I TGCTGCCCCC -/T CCGCCTGCAG 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 T 0 1 37280 CASAVA_Build 1 14654139 2I GAGCTTCCCC --/AG AGAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 AG 2 3 37281 CASAVA_Build 1 14665415 1I TTTTATAAGG -/A AAAACAAAAA 3070 hom 7 het 37 1 26 10 A 4 5 37282 CASAVA_Build 1 14672334 1I ACATACTTAT -/A CTAAAGGTTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 0 1 37283 CASAVA_Build 1 14672746 1D ACACAAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 9 8 37284 CASAVA_Build 1 14680508 2I AATTTTCTAG --/AA AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 8 10 37285 CASAVA_Build 1 14682095 4D TTCCGAGACT TAAA/---- TGAATGAATA 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 TAAA 1 0 37286 CASAVA_Build 1 14688898 3D ACATTATTTA AGG/--- AGAATTTTTC 2726 het 2493 hom 15 6 6 4 AGG 1 0 37287 CASAVA_Build 1 14692083 12D GGCTGTTCCC TCTGCCTGGACA/------------ TTCTTCCCTA 3070 hom 98 het 37 0 29 13 TCTGCCTGGACA 1 0 37288 CASAVA_Build 1 14702381 1D CCTGGCTAAC A/- ACGGTGAAAC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 2 1 37289 CASAVA_Build 1 14707063 2I AAAATAAATA --/AT AAAAAAAAAA 3070 het 1792 hom 22 7 10 5 AT 0 1 37290 CASAVA_Build 1 14707142 1I ATTCTTGTGA -/C CCCCCCAGTA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 6 7 37291 CASAVA_Build 1 14709079 5D AGGCCAGTGT TGCTG/----- GGGCAAGTTA 3070 het 3070 hom 43 18 24 3 TGCTG 1 0 37292 CASAVA_Build 1 14710196 1I TGCGGGGGGT -/G GGGAGGGTGG 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 G 3 4 37293 CASAVA_Build 1 14734748 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 10 0 7 3 A 12 11 37294 CASAVA_Build 1 14756998 3I GCCAGTGCAC ---/TAA TAATATTATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TAA 1 2 37295 CASAVA_Build 1 14760987 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 11 12 37296 CASAVA_Build 1 14764475 2I TTAATTAAAC --/AT ATTTTATTCC 3070 het 3070 hom 56 26 27 3 AT 1 2 37297 CASAVA_Build 1 14783733 1I GGAGACAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 32 1 24 7 T 11 12 37298 CASAVA_Build 1 14788415 2D CAAGGCAGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 35 1 26 8 A 14 12 37299 CASAVA_Build 1 14794227 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 26 0 22 4 A 11 10 37300 CASAVA_Build 1 14799185 1D CTTTGGGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 T 10 9 37301 CASAVA_Build 1 14802480 8I TTTTCCTAAC --------/CTGGTAGG CTGTCATGGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 CTGGTAGG 0 1 37302 CASAVA_Build 1 14827062 2D GGATATGGAA CT/-- CTCTCTCTCT 748 het 748 ref 58 41 2 15 CT 10 9 37303 CASAVA_Build 1 14832000 4D CAAAATGCAC TTTA/---- TTTATTTTTT 3070 hom 86 het 34 0 28 6 TTTA 2 1 37304 CASAVA_Build 1 14869460 3D CACCCTAGAG CTT/--- CTGCTACCTT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 CTT 1 0 37305 CASAVA_Build 1 14875507 3I GGCCACTTCA ---/CGT CGTCCCTGAG 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 CGT 1 2 37306 CASAVA_Build 1 14889669 2I ATTAAGTCAA --/AG AGAGGAAGAT 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 AG 2 3 37307 CASAVA_Build 1 14891131 6D CAGTAGTGGT AAAAAA/------ AAAAAATAAA 391 het 391 ref 34 14 6 16 A 12 6 37308 CASAVA_Build 1 14907546 1D TTCTAGATAC G/- GGGGCAATAT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 G 5 4 37309 CASAVA_Build 1 14919048 5D TTAGAGGAAA TGGAG/----- TGGAGTGGAC 3070 het 3070 hom 45 16 23 10 TGGAG 2 1 37310 CASAVA_Build 1 14930262 5D AGTGTCTAAT GAAAA/----- GAAAAGAAGC 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 GAAAA 2 1 37311 CASAVA_Build 1 14935674 1D GATTACAGGC G/- TGAGCCACCA 3070 het 2347 hom 28 8 12 8 G 1 0 37312 CASAVA_Build 1 14942057 1I CTGCACTCAC -/A CAGTGAATAG 3070 het 3070 hom 55 20 23 12 A 0 1 37313 CASAVA_Build 1 14942513 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2823 het 1928 hom 19 6 8 5 A 14 15 37314 CASAVA_Build 1 14949342 1I CAGTATTCAT -/G GGGTGCGGCC 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 G 3 4 37315 CASAVA_Build 1 14957566 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 11 10 37316 CASAVA_Build 1 14957992 1I TTGAATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 35 0 24 11 A 11 12 37317 CASAVA_Build 1 14960974 1D TGGCAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1119 hom 33 4 13 17 T 17 16 37318 CASAVA_Build 1 14961565 13D TCCCAGCACT TTGGGAGGCCGAG/------------- GTGGGAGGAT 3070 hom 36 het 14 0 13 3 TTGGGAGGCCGAG 1 0 37319 CASAVA_Build 1 14971609 3D ATAGATTGAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 235 hom 26 4 12 10 A 14 11 37320 CASAVA_Build 1 14976248 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTGTATT 2832 hom 27 het 11 0 8 3 G 0 1 37321 CASAVA_Build 1 14992407 8I ATTTTCCCAG --------/TGGATGTT GCTCCTTTAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 TGGATGTT 0 1 37322 CASAVA_Build 1 14997594 7D CACTGCAAGC TCCACTT/------- TCCACTTCCC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 TCCACTT 2 1 37323 CASAVA_Build 1 15002265 1I TGCGCAGTGT -/C CTGCTGAGGA 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 C 1 2 37324 CASAVA_Build 1 15003873 2I AGATCAAGAC --/AT GAGCTGTGGT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 AT 0 1 37325 CASAVA_Build 1 15005339 1D CCAGCTCGTT A/- ATGGTTCCAT 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 A 2 1 37326 CASAVA_Build 1 15010336 1D GGTATTTATG T/- GTTTATATAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 1 0 37327 CASAVA_Build 1 15016862 1D TCTAAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 9 21 8 A 13 12 37328 CASAVA_Build 1 15021437 11I CAAAAGCAGG -----------/AGGGAGAAAGT AGGGAGAAAA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 AGGGAGAAAGT 0 1 37329 CASAVA_Build 1 15033892 6D CTAGGGGAAT TATTAG/------ TATTAGTATT 3070 het 3070 ref 34 17 10 10 TATTAG 4 3 37330 CASAVA_Build 1 15035477 13D TCCTCCCTCA CTGCCCCAAGCAG/------------- CTGCCCCTTT 1161 het 1161 ref 30 11 8 14 CTGCCCCAAGCAG 1 0 37331 CASAVA_Build 1 15037116 2D TATTTCTGAC AG/-- TTCTGGAGGC 3070 het 2710 hom 25 7 15 3 AG 1 0 37332 CASAVA_Build 1 15053814 2I TGTACCTGTC --/TA TGCCACCGCA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 TA 0 1 37333 CASAVA_Build 1 15066179 1I TTCGGGCTCG -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 107 het 44 0 30 14 T 6 7 37334 CASAVA_Build 1 15067123 1I19M1D GCATCGCATA -GCATGGCATCACATACGCAC/CGCACAGCATCGCATACGCA- AGCATTGCAT 3070 het 3070 ref 62 43 16 17 N/A 0 0 37335 CASAVA_Build 1 15067161 16D ATACACAGGC ATCACATACGCACGGT/---------------- ATCACATACA 2954 het 2954 ref 43 27 12 24 ATCACATACGCACGGT 1 0 37336 CASAVA_Build 1 15068351 1I GTTCTGAGGA -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 114 het 41 0 36 5 T 6 7 37337 CASAVA_Build 1 15070421 1D AAGAGTCAAG A/- GGGAGGTTTG 3070 hom 135 het 49 0 44 6 A 1 0 37338 CASAVA_Build 1 15089593 1I AATTTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 25 2 20 3 T 10 11 37339 CASAVA_Build 1 15096708 1D TTTCCAAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 41 0 37 5 A 10 9 37340 CASAVA_Build 1 15100513 1I GGAGTTCAGA -/T TTTTATCCAC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 4 5 37341 CASAVA_Build 1 15102008 1I CTGGAGTGCA -/G TGTCATGATC 3070 hom 98 het 38 0 30 8 G 0 1 37342 CASAVA_Build 1 15165066 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1506 het 706 hom 14 4 5 5 T 17 16 37343 CASAVA_Build 1 15203904 1I CATGCCTCAG -/T TTCCTAATCT 3070 het 3070 ref 53 25 24 4 T 2 3 37344 CASAVA_Build 1 15220980 1D AGGTTGGGGA G/- GCCTCATAAT 3070 het 3070 hom 32 13 12 9 G 2 1 37345 CASAVA_Build 1 15225807 1D AATAATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 A 12 11 37346 CASAVA_Build 1 15254195 1I AATGGGAGCC -/A AAACACCTTT 3070 hom 110 het 38 0 34 4 A 3 4 37347 CASAVA_Build 1 15268112 1D CACCTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 800 het 800 ref 48 38 3 8 A 11 10 37348 CASAVA_Build 1 15308695 2D TGTATGGGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 307 hom 48 6 21 29 TG 7 6 37349 CASAVA_Build 1 15308707 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATGTGTA 3070 hom 79 het 47 0 26 24 TGTA 1 0 37350 CASAVA_Build 1 15308837 4D14M2I24M4I TGTGTTTGTA TGTTTGTGTCTGTATGTC--TGTGTATATATGTGTTTGTGTGTA----/----TGTGTCTGTATGTCTGTGTGTATATATGTGTTTGTGTGTATGTG TGTGTATGTG 3070 het 1694 hom 38 16 25 7 N/A 0 0 37351 CASAVA_Build 1 15308949 4D CGTGTATATA TGTG/---- TGTATGTGCA 3070 het 3070 hom 53 23 26 6 TG 3 1 37352 CASAVA_Build 1 15309045 2D TGTTTGTATA TG/-- TGTGTTTGTA 3070 het 45 hom 57 2 24 33 TG 3 2 37353 CASAVA_Build 1 15309081 2D42M2D24M2D TGTGGGTATA TGTGTGTTGTGTATGTATGTGTAGATGGTGTTTGTGTATGTGTGTATATATATATGTGCGTGTGTGTGCCTG/--TGTGTTGTGTATGTATGTGTAGATGGTGTTTGTGTATGTGTG--TATATATATGTGCGTGTGTGTGCC-- TGTGTGTATG 3070 het 3070 hom 64 23 33 64 N/A 0 0 37354 CASAVA_Build 1 15309303 4D TGTTTGTGTG TGTT/---- TGTGTATGTG 3070 hom 162 het 68 0 52 19 TGTT 1 0 37355 CASAVA_Build 1 15309573 2D16M2D TTTGTGTGTG TATGTATGTGTGTGTATTTG/--TGTGTGTATGTGTATT-- TGTGTTTGTG 3070 het 17 hom 30 1 18 18 N/A 0 0 37356 CASAVA_Build 1 15311821 1I GTGCACAAAG -/C CCCCCGCAGG 3070 het 1702 hom 20 5 11 4 C 5 6 37357 CASAVA_Build 1 15312078 1D CAAAGATGAA C/- CCTCTGGTGA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 C 3 2 37358 CASAVA_Build 1 15312773 4I GAGACAGGGT ----/CTCA CTCTGTCAGG 3070 hom 40 het 24 0 18 7 CTCA 0 1 37359 CASAVA_Build 1 15335575 2D ACCTCTCATG CA/-- CACATTTCCA 3070 hom 87 het 33 0 29 6 CA 3 2 37360 CASAVA_Build 1 15336897 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 492 hom 20 2 16 3 A 15 14 37361 CASAVA_Build 1 15346695 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 25 1 18 6 A 11 12 37362 CASAVA_Build 1 15348016 7D TCTCTACAAA AAAATTT/------- AAAATTTAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 AAAATTT 2 1 37363 CASAVA_Build 1 15348397 1D CACACACACA C/- CCCCCCTCAG 3070 hom 67 het 26 0 22 4 C 7 6 37364 CASAVA_Build 1 15357233 1D GAGATAATGT G/- AGTGACTTCA 3070 hom 138 het 57 0 46 11 G 1 0 37365 CASAVA_Build 1 15372760 2D AACTCCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 34 0 27 7 A 13 11 37366 CASAVA_Build 1 15383250 11I CCTCCCGAGT -----------/AGCTGGGACTA CAGGCGTGCG 3017 hom 18 het 10 0 7 5 AGCTGGGACTA 0 1 37367 CASAVA_Build 1 15383942 1D TTTTTGGTTG C/- CCCCAGCTGG 3070 hom 65 het 25 0 22 3 C 5 4 37368 CASAVA_Build 1 15385899 1I GGCAGGCCAG -/C GGGGCAGGGA 3070 hom 81 het 38 0 27 11 C 0 1 37369 CASAVA_Build 1 15390825 1I TCTCTGGGGA -/G GAAATTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 37370 CASAVA_Build 1 15390957 1D AGTAATTGAC T/- TACGTGACCA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 2 1 37371 CASAVA_Build 1 15391333 19I TCTTTCACTT -------------------/AGCGTAAGTACACGGGTGG AGTTTTTAGC 3070 hom 72 het 30 0 23 7 AGCGTAAGTACACGGGTGG 0 1 37372 CASAVA_Build 1 15395478 2D TGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 59 het 52 1 43 10 TG 8 7 37373 CASAVA_Build 1 15403906 1D ACTATGTGCT G/- GGGGTTGGGG 3070 hom 92 het 41 0 31 12 G 5 4 37374 CASAVA_Build 1 15410884 1I GAAGCAATCA -/C TGGTACAAGT 3070 hom 42 het 30 0 13 17 C 0 1 37375 CASAVA_Build 1 15411565 7D ACACTCTCAG CGTCCCA/------- CGTACAAGGC 3070 hom 166 het 63 0 55 9 CGTCCCA 1 0 37376 CASAVA_Build 1 15419460 2D GTGTAACAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 38 1 23 14 A 17 15 37377 CASAVA_Build 1 15422505 2D CAACTGTGCT GA/-- GAGATGGTGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GA 3 2 37378 CASAVA_Build 1 15434054 4I GAAGTCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 AAAC 3 4 37379 CASAVA_Build 1 15443877 1I ATAAATAAAT -/A AAAGAAATAG 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 A 3 4 37380 CASAVA_Build 1 15453592 3I TTGTTCACAG ---/GGT TAAGGTGGGT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 GGT 0 1 37381 CASAVA_Build 1 15454765 1I TCAAGCCTAC -/A GTCAGGGCTC 3070 hom 84 het 31 0 27 4 A 0 1 37382 CASAVA_Build 1 15455057 7D GCTCCCTGGC TGCCTTG/------- TGCAGAAACC 3070 het 3070 ref 24 11 10 6 TGCCTTG 1 0 37383 CASAVA_Build 1 15457836 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2763 hom 18 het 10 0 7 3 T 7 8 37384 CASAVA_Build 1 15466084 2D TTGCTTCCAG TT/-- TTTGGCAATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 5 3 37385 CASAVA_Build 1 15468330 1D CCTAAGGTAG A/- AACTTTGATT 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 A 3 2 37386 CASAVA_Build 1 15470704 19I ATAACTAATC -------------------/GCATGGGAAATAACTAATT GCATGGGAAA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 GCATGGGAAATAACTAATT 0 1 37387 CASAVA_Build 1 15472570 1I CCTCATGACC -/T TTAGCATTTC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 2 3 37388 CASAVA_Build 1 15473695 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 13 12 37389 CASAVA_Build 1 15476018 1D AGCAACTGTT G/- AGTAGTAACA 3070 het 3070 hom 56 23 28 5 G 1 0 37390 CASAVA_Build 1 15477254 4I CCACCAGTGT ----/TTGC TTTTCTGCTC 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 TTGC 0 1 37391 CASAVA_Build 1 15478547 1D GGCTTTGGAG C/- CCCCCCTCCC 3070 het 64 hom 33 1 26 6 C 7 6 37392 CASAVA_Build 1 15502932 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1408 het 1408 ref 31 19 4 8 A 15 14 37393 CASAVA_Build 1 15504034 3D TATCTGCATT GTC/--- GGGGTCCCCC 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 GTC 1 0 37394 CASAVA_Build 1 15554028 1I GCAGTGACTC -/A ACGCCTGTAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 1 2 37395 CASAVA_Build 1 15554962 1D27M1D TAATTTATTC AAAAAAAAGTGTTTTCTTTCCTGATTATA/-AAAAAAAGTGTTTTCTTTCCTGATTAT- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 48 30 15 10 N/A 0 0 37396 CASAVA_Build 1 15580826 1D TTGTGTAGCA T/- TGACAGCTCC 3070 het 3070 ref 49 19 18 12 T 2 1 37397 CASAVA_Build 1 15583081 2D GTACATTCTC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 46 17 21 9 AT 1 0 37398 CASAVA_Build 1 15585933 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2592 het 2592 ref 23 9 9 5 T 11 12 37399 CASAVA_Build 1 15607563 1I GATTTAAAAC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 A 7 8 37400 CASAVA_Build 1 15607817 20D TGCCTCCAGA GCACCCTGGTTTTCGGCCCT/-------------------- GCACGCATCT 3070 het 3070 hom 33 13 19 8 GCACCCTGGTTTTCGGCCCT 1 0 37401 CASAVA_Build 1 15610694 2I GAGGGAACAG --/CC CCTCGTTCCA 3070 het 2597 hom 29 7 11 11 C 2 4 37402 CASAVA_Build 1 15617932 5D CCTGGTTCAG AGCCC/----- AGCGACACCC 3070 het 3070 hom 50 21 27 6 AGCCC 1 0 37403 CASAVA_Build 1 15637234 4I CTCCATCTCC ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 AAAT 4 5 37404 CASAVA_Build 1 15642464 1I GGGGCCAGGG -/C CCTCCTGCCC 3070 hom 133 het 46 0 39 7 C 2 3 37405 CASAVA_Build 1 15655684 1D20M1I AGGAAATGGG AAAAAAAAAATATTTGGACAC-/-AAAAAAAAATATTTGGACACA AGCTCTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 5 N/A 0 0 37406 CASAVA_Build 1 15657445 2D AGCATTTAAC TT/-- TGTTTCCATA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 3 1 37407 CASAVA_Build 1 15658245 1D CCCATAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 18 9 T 15 14 37408 CASAVA_Build 1 15659392 2D TTTTTAAATT GG/-- GGGGGGGGTA 3070 hom 77 het 32 0 24 10 G 10 8 37409 CASAVA_Build 1 15659734 1D CTTAAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 2915 het 267 hom 21 2 12 7 T 15 14 37410 CASAVA_Build 1 15659956 1D AGACAATGTA T/- TTAGTCCTGC 3070 hom 56 het 23 0 17 6 T 3 2 37411 CASAVA_Build 1 15687063 2I GTTGGTCCCC --/CT GTCTTGTAAA 3070 het 1836 hom 25 7 12 6 CT 0 1 37412 CASAVA_Build 1 15697605 2I TTTTAAAAAG --/TC ACATAAAACT 3070 hom 77 het 30 0 26 4 TC 0 1 37413 CASAVA_Build 1 15705377 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1641 het 274 hom 8 2 5 1 A 11 12 37414 CASAVA_Build 1 15707806 3D CTCAAATCAT TTC/--- TTTTCTAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 8 5 TTC 1 0 37415 CASAVA_Build 1 15715564 4D TGCCTCAATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 2344 het 718 hom 13 5 7 1 A 14 10 37416 CASAVA_Build 1 15717610 4I GCAGGTGCAC ----/TGAG TGTGTGCCAT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 TGAG 0 1 37417 CASAVA_Build 1 15718124 1I ACCTGACTAA -/T TTTTTTTTTT 3002 het 2410 hom 20 9 8 4 T 10 11 37418 CASAVA_Build 1 15719065 1D CACTTCAGCC T/- GGGTGACAGA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 1 0 37419 CASAVA_Build 1 15719213 2D CACAGGGATA AG/-- ATGGCACCGT 3070 het 3070 ref 35 15 10 11 AG 1 0 37420 CASAVA_Build 1 15729429 1I GACCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1995 het 1995 ref 21 9 6 6 A 11 12 37421 CASAVA_Build 1 15755303 10D CAGTTGTTGG TTGTTTTGTT/---------- TTGTTTTGTT 3070 het 2147 hom 17 5 9 7 TTGTT 6 4 37422 CASAVA_Build 1 15756658 2I TTGACTTGAC --/AG AGATGTTTAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 AG 1 2 37423 CASAVA_Build 1 15770096 1I GCCAATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 14 14 A 15 16 37424 CASAVA_Build 1 15780635 1D CTAATATGAC T/- TAAGAAACTG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 2 1 37425 CASAVA_Build 1 15780728 1I AAGCTGAGGC -/A GGCGGATCAC 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 0 1 37426 CASAVA_Build 1 15781257 3I AGGCTGAGAC ---/AGG AGAATTGCTT 2814 het 1162 hom 10 3 7 1 AGG 0 1 37427 CASAVA_Build 1 15782212 8D TCAAGCCCCT GAGTACAG/-------- GATAAGTAAA 3070 het 3070 ref 41 29 10 3 GAGTACAG 1 0 37428 CASAVA_Build 1 15785736 19D ACACCACTCC AGCCTCCACTCTGGAGTGG/------------------- AGCCTCCACT 3070 het 2825 hom 26 11 10 8 AGCCTCCACTCTGGAGTGG 1 0 37429 CASAVA_Build 1 15786709 2D GACCCTGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2654 hom 32 12 11 9 T 13 11 37430 CASAVA_Build 1 15818091 2D GAAAGAATTT AA/-- AAAGTTAATC 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 A 5 3 37431 CASAVA_Build 1 15827834 1D ATTTAAATGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 9 8 37432 CASAVA_Build 1 15857837 1I ACACAGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2739 het 2739 ref 32 16 8 8 A 15 16 37433 CASAVA_Build 1 15868636 1D AATGGAGTAT G/- GTGGCCAAGA 3070 het 3070 ref 48 25 15 8 G 2 1 37434 CASAVA_Build 1 15879716 1I ACTTGAACCC -/G GGGGGGGGCG 750 het 750 ref 12 6 3 3 G 8 9 37435 CASAVA_Build 1 15911731 1I CTTATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 692 het 692 ref 43 16 4 23 T 17 18 37436 CASAVA_Build 1 15911841 1I CTCCCCCTGA -/C CCCTGCCTCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 3 4 37437 CASAVA_Build 1 15972823 1D AATAAAACAA T/- TTTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 T 6 5 37438 CASAVA_Build 1 15973351 1I TCTGTATGAT -/G AAAGCACCCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 0 1 37439 CASAVA_Build 1 15977728 1D CTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 28 2 21 5 T 12 11 37440 CASAVA_Build 1 15980968 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 44 het 16 0 14 2 T 6 7 37441 CASAVA_Build 1 15986501 4I AAAAAAAAAA ----/CACT CACCCCCAGG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 CACT 0 1 37442 CASAVA_Build 1 15989893 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2878 hom 27 8 16 3 A 9 10 37443 CASAVA_Build 1 15994630 1I CTGTCCCCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 T 10 11 37444 CASAVA_Build 1 15996152 1D TTGCGTGAGA T/- TTTTTTTTTT 1646 het 1646 ref 33 9 8 16 T 17 16 37445 CASAVA_Build 1 16002168 5D CTTATCTGTC TTTTT/----- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 27 10 9 8 T 13 8 37446 CASAVA_Build 1 16022925 12D TTTTGACTTG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 1931 het 1931 ref 21 12 6 5 T 23 11 37447 CASAVA_Build 1 16044353 1D CCAATTTTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 309 hom 38 6 28 4 T 10 9 37448 CASAVA_Build 1 16044364 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTAAGA 3070 het 33 hom 41 2 31 8 T 7 6 37449 CASAVA_Build 1 16047692 1D AATGTCTGAC T/- TCGGGAGGGT 1998 het 1998 ref 16 8 6 2 T 2 1 37450 CASAVA_Build 1 16048808 3D TGGCGCTGCT CCA/--- CCCCTTACCC 2357 het 2357 ref 34 19 9 6 CCA 1 0 37451 CASAVA_Build 1 16049483 1D ATTTTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 20 4 T 11 10 37452 CASAVA_Build 1 16063250 9D TAGTGGTTGC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 2580 hom 42 14 19 13 T 19 10 37453 CASAVA_Build 1 16069835 3I ACTTCTAGAA ---/AGG AGGAGTATTG 3070 hom 148 het 57 0 50 7 AGG 1 2 37454 CASAVA_Build 1 16074363 5I AAATGATTGT -----/TTTAA TTAAGTTAAG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 TTTAA 0 1 37455 CASAVA_Build 1 16078758 1I AGCAGACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2250 hom 30 10 14 6 T 13 14 37456 CASAVA_Build 1 16081430 1I TGGATTCCCG -/C CCCCCCCAAT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 C 7 8 37457 CASAVA_Build 1 16083822 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 12 11 37458 CASAVA_Build 1 16090989 2I TGGTTTTTTT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 TA 0 1 37459 CASAVA_Build 1 16102715 1I GCCTTGGCCT -/C CCCAAAGTAT 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 C 3 4 37460 CASAVA_Build 1 16114989 1D TTAGCCTTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 9 8 37461 CASAVA_Build 1 16119134 1D TTGACAATGC T/- TTTTTTTTTT 2863 het 2863 ref 19 8 7 4 T 12 11 37462 CASAVA_Build 1 16124640 1D CTTCCAAAAC T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 16 8 8 0 T 7 6 37463 CASAVA_Build 1 16161317 1D AAATAAAATG A/- AATAAAAATT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 3 2 37464 CASAVA_Build 1 16163207 2I CTCTAGAGAG --/AA AAAAAAAAAA 2047 het 2047 ref 30 7 11 12 A 13 15 37465 CASAVA_Build 1 16170326 1D TGTGTGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 11 10 37466 CASAVA_Build 1 16184611 1D TTTTTAATTA T/- TTTTTTTATA 2919 het 2572 hom 16 7 7 2 T 8 7 37467 CASAVA_Build 1 16184671 1I TCCTGGGCTC -/A AAGCAGTCCT 2298 het 2298 ref 24 12 7 5 A 2 3 37468 CASAVA_Build 1 16187055 2D AAAAAAAAAC TG/-- TTCATATTTT 2420 het 2420 ref 20 12 6 2 TG 1 0 37469 CASAVA_Build 1 16201155 4D TGGAATTTCC AGGG/---- AAGGATCCCT 3070 het 3070 ref 40 23 14 4 AGGG 1 0 37470 CASAVA_Build 1 16205730 4D ACCCACCCTG AATA/---- AATAAAGTAA 3070 het 3070 hom 26 11 9 7 AATA 2 1 37471 CASAVA_Build 1 16207890 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAACC 2006 het 2006 ref 24 12 6 8 A 9 8 37472 CASAVA_Build 1 16220179 1D CACGGCAGGT G/- CTTGTTCCTC 2368 het 2368 ref 28 16 9 3 G 1 0 37473 CASAVA_Build 1 16224706 1D GAAGTCGGGG T/- TATAATGAGC 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 T 2 1 37474 CASAVA_Build 1 16234593 4D CAGCTCCTCG CCCT/---- CCCTCTCTGG 2768 het 2768 ref 61 36 9 18 CCCT 2 1 37475 CASAVA_Build 1 16234697 2D GTCACCAAAA CT/-- CTCTGAGTCC 2304 het 2304 ref 48 30 7 12 CT 3 2 37476 CASAVA_Build 1 16235736 1D GGAGGCAGCA G/- TAATGCTCGT 1780 het 1780 ref 30 13 6 12 G 1 0 37477 CASAVA_Build 1 16239748 4I TTCTCCAACA ----/AAGG AAGAGCTTTT 3070 hom 77 het 31 0 23 8 AAGG 0 1 37478 CASAVA_Build 1 16243321 2D TGCTGGACAC AG/-- GGGGACACCT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 AG 1 0 37479 CASAVA_Build 1 16244190 1D AGGCTGGGCT A/- GCAGCCAGTG 2738 het 2738 ref 34 12 11 12 A 1 0 37480 CASAVA_Build 1 16244870 1D TTGGGGGGGG T/- GCTCTGGGTG 1825 het 855 hom 10 3 5 2 T 1 0 37481 CASAVA_Build 1 16245787 3D TGGCCAAAAC CTT/--- CTCAGATCCC 3070 hom 52 het 20 0 15 5 CTT 1 0 37482 CASAVA_Build 1 16248818 1I8M1D GAGAGTCCAA -AAGGCATTC/TATGGCATT- CCCCCAAGGC 2896 hom 44 het 16 0 14 3 N/A 0 0 37483 CASAVA_Build 1 16255415 3D GCCCCGCCCC TCT/--- TCCTGGCTCA 2180 het 2180 ref 21 10 8 4 TCT 1 0 37484 CASAVA_Build 1 16258326 1D CTGTGAGGTG C/- CTCGTGCACA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 C 2 1 37485 CASAVA_Build 1 16258893 1I GTGATCTGGG -/C CCCCCAAGGA 2383 het 476 hom 12 3 8 1 C 5 6 37486 CASAVA_Build 1 16259264 1D TCCATCAGTG C/- CCCCACACCT 2873 hom 24 het 10 0 8 2 C 5 4 37487 CASAVA_Build 1 16260369 1D GTGAGGTGGA G/- GAAGGCACTG 2156 het 2156 ref 33 18 7 9 G 2 1 37488 CASAVA_Build 1 16283604 3D AGGGCAGAAG CCT/--- CCAGGTGGGG 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 CCT 1 0 37489 CASAVA_Build 1 16283898 1D TGTGGTGAAA C/- CCCCCCCCAT 2723 het 1448 hom 16 5 9 2 C 9 8 37490 CASAVA_Build 1 16284376 2D TCCATCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 A 13 11 37491 CASAVA_Build 1 16285720 1D CACCTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1403 hom 25 5 10 10 T 17 16 37492 CASAVA_Build 1 16296262 1D GTGTGTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 11 10 37493 CASAVA_Build 1 16297189 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 12 11 37494 CASAVA_Build 1 16298094 3D GGAGGAGAGG GGA/--- GGAGGGGAAG 1889 het 1889 ref 22 11 8 5 GGA 2 1 37495 CASAVA_Build 1 16298408 7D GCTACTGAGG AGCAGCT/------- AGCCATTAGT 3070 het 3070 ref 35 23 11 5 AGCAGCT 1 0 37496 CASAVA_Build 1 16300088 4I ATCATCTCAA ----/AAAC AAACAAACGA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 AAAC 2 3 37497 CASAVA_Build 1 16333331 3D CATCATTAAT AAC/--- AACAAGAGCA 3070 hom 58 het 23 0 18 5 AAC 2 1 37498 CASAVA_Build 1 16347427 1D GAATGCAGAA C/- CCCCTTCCCT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 C 5 4 37499 CASAVA_Build 1 16352213 1D TTCTGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 21 0 13 8 A 11 10 37500 CASAVA_Build 1 16372961 1I CAGTGTCCTG -/A GGGCAGGGGG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 0 1 37501 CASAVA_Build 1 16377282 2D TTCTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 609 het 222 hom 31 3 5 23 T 20 18 37502 CASAVA_Build 1 16386405 3D CGAGACTCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 711 het 711 ref 16 4 4 8 A 19 16 37503 CASAVA_Build 1 16387648 1I AATGAGACTC -/T TGTCAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 T 1 2 37504 CASAVA_Build 1 16388491 1D AATACAATCT G/- GGGGGAGACA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 G 6 5 37505 CASAVA_Build 1 16390413 14I GGAGGAAGGA --------------/AAGAAGGGAGGAAG GAAGGAAGGA 1374 het 656 hom 8 2 3 3 AAGAAGGGAGGAAG 0 1 37506 CASAVA_Build 1 16390975 4D AAAGCCCTAC CAGG/---- GCAGGGCATG 3070 het 2111 hom 20 9 9 3 CAGG 1 0 37507 CASAVA_Build 1 16396297 1D TCAAGACCAG C/- CTAGCCAACA 3070 het 2827 hom 22 8 11 3 C 2 1 37508 CASAVA_Build 1 16398781 2I CATCGCTCCC --/CT GTTTAAAGCC 3070 het 3070 ref 33 15 8 10 CT 0 1 37509 CASAVA_Build 1 16401958 5D TTTTTTGGCT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 2279 hom 20 6 11 4 TTTTG 3 2 37510 CASAVA_Build 1 16402271 3D GATGGGTGGA GGG/--- TGTTCCACAG 3070 het 2178 hom 41 6 19 19 G 3 0 37511 CASAVA_Build 1 16402305 2D TTCAACAAAA CT/-- CGGCATCAGA 3070 het 2718 hom 40 8 20 12 CT 1 0 37512 CASAVA_Build 1 16403367 2D TGCTGCCATC AG/-- ACAGAGCTGG 3070 het 3070 ref 46 25 13 9 AG 1 0 37513 CASAVA_Build 1 16410684 3D CCCTAGCAGG GAA/--- GAAGTCAGGA 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 GAA 2 1 37514 CASAVA_Build 1 16412137 6I TGGAACACTC ------/ATCCCT ATCCCTATGA 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 ATCCCT 1 2 37515 CASAVA_Build 1 16419102 1I GTTAGATTTT -/C ACAGCTGTGC 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 C 0 1 37516 CASAVA_Build 1 16441605 1I TGGCTTTAGG -/C GATTCTCCAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 C 0 1 37517 CASAVA_Build 1 16446628 1D CTTTCTTCCT C/- CTCCTCCTCC 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 C 2 1 37518 CASAVA_Build 1 16449025 4D GAAATTTCCA CAAT/---- CAGACACAAA 3070 het 3070 ref 32 19 13 0 CAAT 1 0 37519 CASAVA_Build 1 16455618 1I CTCTTGACAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 41 24 9 8 A 7 8 37520 CASAVA_Build 1 16457446 1D TTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 13 12 37521 CASAVA_Build 1 16460787 1D GGTATATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2442 hom 36 10 19 7 T 12 11 37522 CASAVA_Build 1 16464743 1D ACTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1321 het 1321 ref 41 31 3 9 A 11 10 37523 CASAVA_Build 1 16464863 1D AGTCCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1802 hom 31 7 13 11 A 15 14 37524 CASAVA_Build 1 16468919 4D TTCTTTATGT TTTC/---- TTTGTTTTTT 346 het 346 ref 16 8 4 6 TTTC 1 0 37525 CASAVA_Build 1 16473841 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 T 6 7 37526 CASAVA_Build 1 16481303 1D AGACATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3061 het 1257 hom 24 5 9 10 T 14 13 37527 CASAVA_Build 1 16483047 11I TGACTTACGT -----------/TTAATACAGTA TGACTCTGTA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TTAATACAGTA 0 1 37528 CASAVA_Build 1 16488727 1I CCCTCCACTA -/T TCATTCTTTA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 1 2 37529 CASAVA_Build 1 16512258 1D AATTAAAAAC A/- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 25 17 8 1 A 3 2 37530 CASAVA_Build 1 16517516 1I ATAAATAAAG -/T TTGCCAAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 2 3 37531 CASAVA_Build 1 16523210 6D TTATCAACTC AAATGA/------ AAAAGTTATA 3070 het 3070 ref 38 20 17 5 AAATGA 1 0 37532 CASAVA_Build 1 16529441 1I CTGTTTCCAC -/A AAAAAAAATT 2762 het 2762 ref 20 9 7 4 A 8 9 37533 CASAVA_Build 1 16538762 1I TTGCACAGCT -/G GAACAGATTA 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 G 1 2 37534 CASAVA_Build 1 16539259 1D CTCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3032 het 1430 hom 22 6 10 6 A 12 11 37535 CASAVA_Build 1 16542472 1I CAAAAAACAC -/A AAAAAAATTA 2932 het 2932 ref 26 12 7 7 A 7 8 37536 CASAVA_Build 1 16547617 1I CACCTCTACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 A 9 10 37537 CASAVA_Build 1 16548215 1D ATAAAAGGGG A/- AAAGAACCCA 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 A 4 3 37538 CASAVA_Build 1 16549627 1D TGGGCAACAT C/- GGTGAAACCC 1738 het 4 hom 10 0 5 5 C 1 0 37539 CASAVA_Build 1 16554508 1D TATCACTACT A/- AAAAAAAAAA 1818 het 162 hom 5 1 4 0 A 11 10 37540 CASAVA_Build 1 16567566 3D TCTCTCAACG GTT/--- GTTTATGTTT 3070 het 3070 hom 52 21 28 5 GTT 2 1 37541 CASAVA_Build 1 16569308 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2834 het 1522 hom 20 6 10 4 T 14 13 37542 CASAVA_Build 1 16573956 5D TCTTGAGTGT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 1756 het 1756 ref 22 13 5 4 TTTTG 3 2 37543 CASAVA_Build 1 16580483 1I GTAGAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 2225 hom 25 8 11 6 A 7 8 37544 CASAVA_Build 1 16587488 8D ATGCCCAGCC AAATATAT/-------- AAATATATTT 3070 het 3070 ref 28 12 12 9 AAATATAT 2 1 37545 CASAVA_Build 1 16594688 1I ATATCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 10 11 37546 CASAVA_Build 1 16599893 3I TGTAGGGAAG ---/CTT CTTCTGCAAC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 CTT 1 2 37547 CASAVA_Build 1 16600777 2I AAGTTAAGGA --/CT CTCTGCTCCA 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 CT 2 3 37548 CASAVA_Build 1 16601704 1D AGTGGTGCCA T/- CATGGCTCAC 3047 het 3047 ref 24 11 9 4 T 1 0 37549 CASAVA_Build 1 16651484 1D GCCTAGACCC A/- CCATCAGCTG 3070 het 3070 ref 53 28 15 10 A 1 0 37550 CASAVA_Build 1 16667757 2I TGAAGGTGAC --/TG TGGTCACACC 3070 hom 63 het 25 0 20 5 TG 1 2 37551 CASAVA_Build 1 16674302 6D GATCCCTGAA AATGAG/------ ACATTAAGGT 1270 het 1270 ref 13 9 3 5 AATGAG 1 0 37552 CASAVA_Build 1 16691678 1D CTATGGTCTT C/- AAGACAGTTC 3070 het 3070 ref 36 22 9 7 C 1 0 37553 CASAVA_Build 1 16697463 2D AAAACAGAAA TC/-- TCTGTTTTCT 2838 het 2838 ref 19 10 8 2 TC 2 1 37554 CASAVA_Build 1 16697605 6D CGGTCGTCAG GCTTAA/------ GTCTGTGTGA 1218 het 1218 ref 11 8 3 1 GCTTAA 1 0 37555 CASAVA_Build 1 16705148 3D AAGTCAAACA AAC/--- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 64 40 20 4 AAC 1 0 37556 CASAVA_Build 1 16705749 1D CACGAAACTC G/- TGGGGCAGGC 2644 het 2644 ref 43 26 8 11 G 1 0 37557 CASAVA_Build 1 16705958 4I TTGCTAGGGG ----/CTGA CTGTGTTGAG 3070 het 3070 ref 81 30 19 32 CTGA 0 1 37558 CASAVA_Build 1 16706763 1D ATGATCAGGG T/- TTACTTCTGC 3070 het 3070 ref 45 24 10 13 T 3 2 37559 CASAVA_Build 1 16708714 1I ATTTTTTATA -/C TTTATTTTTA 3070 het 2896 hom 41 9 29 3 C 0 1 37560 CASAVA_Build 1 16709161 1I GAGTTCAAGA -/C CAGCCTGACC 3070 het 3070 ref 35 18 8 9 C 1 2 37561 CASAVA_Build 1 16709483 5D TCTGCTATCA ATTTC/----- ATTTCATTTA 1629 het 1629 ref 81 66 5 15 ATTTC 2 1 37562 CASAVA_Build 1 16710240 5I7M5I ATTTTCTTTC -----CTTTTTT-----/TTTTTCTTTTTTATTTC TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 63 30 11 25 N/A 0 0 37563 CASAVA_Build 1 16711775 1I AGATGCACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 70 47 14 9 T 9 10 37564 CASAVA_Build 1 16712764 2I CCCAGAGAAC --/AG TGCCCATCTG 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 AG 0 1 37565 CASAVA_Build 1 16712885 1I AAGAGGTGAC -/T TGGGGGGTAG 3070 het 3070 ref 58 24 16 18 T 1 2 37566 CASAVA_Build 1 16712919 9I ATTTTCACAC ---------/AGGGTGAGA AGGGTGAGAA 2513 het 2513 ref 64 32 7 25 AGGGTGAGA 1 2 37567 CASAVA_Build 1 16713529 1D CACGGGAACT C/- CCTTCGTGGC 3070 het 3070 ref 55 22 10 23 C 3 2 37568 CASAVA_Build 1 16714059 1D ATCTTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 79 30 18 33 T 12 11 37569 CASAVA_Build 1 16714078 1D TTTGATGTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 68 19 24 27 T 9 8 37570 CASAVA_Build 1 16715930 9I CAGGTCATCA ---------/GGCATCAGT GGCATCAGTT 1719 het 1719 ref 75 58 4 13 GGCATCAGT 1 2 37571 CASAVA_Build 1 16717198 1D GATAGATGAA G/- AAAATCAAAG 2159 het 2159 ref 48 34 5 10 G 1 0 37572 CASAVA_Build 1 16719085 3I ATACCCAGGC ---/TGG AGTGCAGCGG 3070 het 3070 hom 32 17 14 1 TGG 0 1 37573 CASAVA_Build 1 16730444 1I GTTTTTTTTT -/C TTAAATGAAC 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 C 0 1 37574 CASAVA_Build 1 16730555 1D AATGTGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 A 11 10 37575 CASAVA_Build 1 16730929 17D7M1D GCAACAAAAA AGCAAAAACAAACAAACAAACAAAC/-----------------AAACCAA- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 49 26 24 7 N/A 0 0 37576 CASAVA_Build 1 16731463 3I CCTGGTCACA ---/ACC ACCAACGTTT 2516 het 2516 ref 44 32 9 3 ACC 1 2 37577 CASAVA_Build 1 16732533 1I TCTCTCAAAA -/T AAATATATAA 3070 het 3070 ref 40 17 12 11 T 0 1 37578 CASAVA_Build 1 16735401 1D ATGAAGGCTC A/- GGGGTCGATC 2217 het 2217 ref 50 30 7 14 A 1 0 37579 CASAVA_Build 1 16737453 2I AGCAGGACAC --/AG AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 46 32 8 6 AG 0 1 37580 CASAVA_Build 1 16737954 1D TCCAAGGGCT G/- GGGATCTTGC 1383 het 1383 ref 54 43 7 4 G 4 3 37581 CASAVA_Build 1 16738358 1D GGAGGGCACC T/- TTTGGACAGA 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 T 4 3 37582 CASAVA_Build 1 16739620 1D TCCTTTTTTT C/- CTCTAGCTAA 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 C 2 1 37583 CASAVA_Build 1 16740072 1I CCTACTTTTC -/A GGTTTCAGCA 3070 het 3070 ref 49 26 13 10 A 0 1 37584 CASAVA_Build 1 16742697 1I ATCGCTGGTG -/A AAAAACATTC 3070 het 3070 hom 80 37 39 4 A 5 6 37585 CASAVA_Build 1 16743299 1I CTGTTCTCAT -/A AAAAATTAGC 3070 het 3070 ref 73 59 10 4 A 5 6 37586 CASAVA_Build 1 16743815 3I AAGCATTGCA ---/CTT CTTCTATGTT 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 CTT 1 2 37587 CASAVA_Build 1 16746723 5D TAGGGACAAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 18 het 20 0 11 11 AAAAC 4 3 37588 CASAVA_Build 1 16748250 1I TATGGTGAAA -/C CCCCTCCTCT 1580 het 1580 ref 12 7 5 0 C 4 5 37589 CASAVA_Build 1 16753922 3D CAGGGCCTGG AGA/--- AGGCCAGGGC 2284 het 586 hom 9 2 7 0 AGA 1 0 37590 CASAVA_Build 1 16757393 1I ACAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 1615 het 1615 ref 31 21 6 4 A 11 12 37591 CASAVA_Build 1 16762477 2D GCTGAAGGAC TG/-- TGGCTTCTCT 3070 het 3070 ref 74 52 13 14 TG 2 1 37592 CASAVA_Build 1 16763375 9D AAGAAAAGGA TAGATCCAT/--------- TAGATCCATT 3070 het 3070 ref 61 32 19 14 TAGATCCAT 2 1 37593 CASAVA_Build 1 16783514 2D GTGAGGAAAC TG/-- AGGGACAGAC 1662 het 1662 ref 53 37 6 13 TG 1 0 37594 CASAVA_Build 1 16783697 3D CTGCTTCTTA TTC/--- TTATTTTTAT 1750 het 1750 ref 22 9 8 5 TTC 1 0 37595 CASAVA_Build 1 16793371 2I TCACTAAGAC --/TT TGGCCTTTTC 3070 het 3070 hom 101 34 63 4 T 1 3 37596 CASAVA_Build 1 16794698 1I CATTTCTGAG -/A AAAAGGAAAT 3070 het 3070 hom 94 26 51 17 A 4 5 37597 CASAVA_Build 1 16795110 1I16M2I AATGCTTTTA -TTTCTTTCTTTTTTTT--/CTTTCTTTCTTTTTTTTTA AATGAAAATA 3070 het 3070 ref 75 39 33 17 N/A 0 0 37598 CASAVA_Build 1 16798430 2I ATATACATAC --/AT ATATATATAC 3070 het 86 hom 67 1 55 11 AT 4 5 37599 CASAVA_Build 1 16798865 1D40M4I ATCTGTGAAT AAAGACAGCTTCAATTCTTTCTTTTCAATCTTTTCAATACT----/-AAGACAGCTTCAATTCTTTCTTTTCAATCTTTTCAATACTTTTA TTTATTTTTC 3070 het 3070 ref 97 59 8 77 N/A 0 0 37600 CASAVA_Build 1 16799230 1D TAATACATAA C/- ATTACATTTT 3070 het 3070 ref 83 48 29 6 C 1 0 37601 CASAVA_Build 1 16802052 4D AACTAGAGCT TTTC/---- TAAGTGTAAC 2532 het 2532 ref 71 55 8 15 TTTC 1 0 37602 CASAVA_Build 1 16806211 5D GAGAAAGAAG AAGAA/----- AAGAAGAAAG 3070 het 3070 ref 60 28 15 22 AAGAA 2 1 37603 CASAVA_Build 1 16809164 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 79 26 34 22 A 13 12 37604 CASAVA_Build 1 16810114 1I GCCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 92 43 13 36 A 13 14 37605 CASAVA_Build 1 16810337 1D CGAGGCAGGT G/- TATCACTTGA 2406 het 2406 ref 79 56 9 14 G 1 0 37606 CASAVA_Build 1 16815785 1I CATCTCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 77 46 13 18 A 14 15 37607 CASAVA_Build 1 16826415 1I CACTTTCCTG -/C CCCGAACCTC 3070 het 3070 ref 85 50 19 16 C 3 4 37608 CASAVA_Build 1 16828270 11D CAAGACGTGA TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1946 het 1946 ref 51 16 7 29 T 21 10 37609 CASAVA_Build 1 16833005 1D TCAGATTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 95 57 22 18 A 11 10 37610 CASAVA_Build 1 16836944 13D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2696 hom 32 10 23 6 A 23 10 37611 CASAVA_Build 1 16838036 1D26M1D CCTGCCTCTT AAAAAAAAAAAAAAATTTAGCTGGGTGC/-AAAAAAAAAAAAAATTTAGCTGGGTG- TGTGGCATGT 3070 het 3070 hom 47 10 40 9 N/A 0 0 37612 CASAVA_Build 1 16840263 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTCAAAA 2596 het 2596 ref 47 23 9 15 T 6 5 37613 CASAVA_Build 1 16842340 4I GGGCATGCAC ----/ACTA ACTAACACAT 1273 het 1273 ref 72 53 4 15 ACTA 1 2 37614 CASAVA_Build 1 16845286 1I CCAGGGGAAA -/T TTTTTTGACA 3070 het 3070 ref 65 38 13 14 T 6 7 37615 CASAVA_Build 1 16846728 1D TGGCTTGGCC G/- GGGAGGTCAG 1496 het 1496 ref 34 25 6 3 G 4 3 37616 CASAVA_Build 1 16848312 1D ATACTGACTG C/- CCGGCAGTGC 3070 het 3070 ref 100 63 15 24 C 3 2 37617 CASAVA_Build 1 16850202 3D TGATATCTAC TAA/--- TAAGATGTTT 3070 het 3070 hom 49 20 25 6 TAA 2 1 37618 CASAVA_Build 1 16858149 1D ACTATAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 11 10 37619 CASAVA_Build 1 16858612 1I CTTATCTTTG -/C TTGGGGCTTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 0 1 37620 CASAVA_Build 1 16873882 9I ATCCAAAGCC ---------/ACTCAACCA ACTGGACAGA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 ACTCAACCA 0 1 37621 CASAVA_Build 1 16877541 2D CCAAACCAAA TG/-- TGTTTTTATA 3070 het 3070 ref 38 29 8 1 TG 2 1 37622 CASAVA_Build 1 16880351 1D GATAAGTTAT G/- GGGGCTTCTG 3070 het 3070 ref 40 22 13 7 G 5 4 37623 CASAVA_Build 1 16883543 13D CCAATACAAG CAAAAAACAAAAA/------------- CAAAAAACAA 1800 het 1800 ref 21 8 5 10 CAAAAAACAAAAA 2 1 37624 CASAVA_Build 1 16896662 1I AAGAAGGGCA -/G GCAGGTAATA 3070 hom 193 het 73 0 61 12 G 1 2 37625 CASAVA_Build 1 16897849 1I TCTAGCTCTT -/A AAAAAGGATG 3070 het 3070 hom 56 12 29 15 A 5 6 37626 CASAVA_Build 1 16901491 1D CCCGGCCACT C/- CTGTGCAAGA 3070 het 2226 hom 25 9 15 2 C 2 1 37627 CASAVA_Build 1 16903490 3D AGAGATCGAC GAG/--- GAGGGGGCCT 3070 het 3070 ref 60 27 15 23 GAG 2 1 37628 CASAVA_Build 1 16904526 2I CAAATTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 32 6 15 11 TC 0 1 37629 CASAVA_Build 1 16908895 3D GTCTCAGGGG CTC/--- CTCCTAGGGC 3070 het 3070 ref 80 40 29 13 CTC 2 1 37630 CASAVA_Build 1 16910914 1D TGAGGCACAG A/- GAGCTAAGAT 3070 het 3070 ref 94 49 29 17 A 1 0 37631 CASAVA_Build 1 16911043 4D TGTCCCTCTG CCTC/---- CCTCCCTCCC 3070 het 3070 ref 94 46 37 13 CCTC 4 3 37632 CASAVA_Build 1 16912052 4I CCCAGGGAAG ----/AAAT AAATGCAGCC 3070 het 3070 ref 71 35 24 12 AAAT 1 2 37633 CASAVA_Build 1 16913821 1I CCTGAGTAGC -/T GGGATTACAG 3070 hom 47 het 20 0 14 6 T 0 1 37634 CASAVA_Build 1 16915416 2D CACCAGGTTC TT/-- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 52 16 10 27 T 7 5 37635 CASAVA_Build 1 16920291 2D TATTTATTTA TT/-- TTTTTTGAGA 3070 het 2734 hom 25 8 12 6 T 8 6 37636 CASAVA_Build 1 16920951 1D AAAATCTGAG T/- TATGATAATC 3070 hom 194 het 78 0 64 15 T 2 1 37637 CASAVA_Build 1 16921445 1D AGCCACTGAC T/- TTTTGCTGTT 2245 het 2245 ref 95 74 7 16 T 5 4 37638 CASAVA_Build 1 16923081 3D CAGGGGAGGA GAT/--- GATAGAATAT 3070 hom 143 het 58 0 45 17 GAT 2 1 37639 CASAVA_Build 1 16926422 1I CCCGGGTTCA -/C ATTCCCGGCC 3070 het 3070 ref 101 54 25 22 C 0 1 37640 CASAVA_Build 1 16928453 1I CCTCTTAGTT -/A ATCACTATTC 3070 het 3070 ref 64 39 13 12 A 1 2 37641 CASAVA_Build 1 16931276 3D GCATACCCTC TTG/--- CTGCTGAAAC 3070 het 3070 hom 76 14 46 18 TTG 1 0 37642 CASAVA_Build 1 16932611 4D TTTTCTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTG 788 het 788 ref 29 9 5 17 T 13 9 37643 CASAVA_Build 1 16938878 2D15M2D CGGATTTTTG AAAAAAAAAACAACATCAA/--AAAAAAAACAACATC-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 20 0 9 11 N/A 0 0 37644 CASAVA_Build 1 16946889 1I AAAAGACAGG -/T TTCCCTGTAC 3070 het 3070 hom 59 18 20 21 T 2 3 37645 CASAVA_Build 1 16947016 1I AGTAAGCCCC -/T AACAAAGATA 3070 het 3070 ref 42 21 10 11 T 0 1 37646 CASAVA_Build 1 16947470 1D ATGGACAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 80 44 25 11 T 11 10 37647 CASAVA_Build 1 16947843 10I GTCTCACTGT ----------/ATCTGGTGGC ATCTTGGTTG 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 ATCTGGTGGC 0 1 37648 CASAVA_Build 1 16952740 2I ACATAATAAT --/GA GAGATTCTTT 3070 het 3070 ref 55 29 23 3 GA 2 3 37649 CASAVA_Build 1 16955053 1D GGCCCCAGAA G/- TATAAAAACG 3070 het 3070 ref 68 44 13 14 G 1 0 37650 CASAVA_Build 1 16958587 4D CGCCCGCCCC CCCG/---- CCCACCTCAC 1650 het 552 hom 16 2 6 9 CCCG 1 0 37651 CASAVA_Build 1 16959832 1D CCCCTCTCCA C/- CCCCACTCGC 3070 het 3070 ref 96 48 25 23 C 5 4 37652 CASAVA_Build 1 16963490 1I TTCCTGTTTA -/T TTGCACCGGG 2708 het 2708 ref 58 36 9 13 T 2 3 37653 CASAVA_Build 1 16973733 1D GCTGTCACAG A/- AAAACCACAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 5 4 37654 CASAVA_Build 1 16976964 5D GAAGGTGGAG GGGAA/----- GGGAAGGGCT 2480 het 2480 ref 84 61 7 20 GGGAA 2 1 37655 CASAVA_Build 1 16977820 4D CTCATGAGAA CTCT/---- CTCTCTATCT 1412 het 1412 ref 32 17 3 12 CT 5 3 37656 CASAVA_Build 1 16981297 4D TGATTATTCT CTTG/---- CTTGCTTGCT 3070 het 3070 hom 43 15 22 8 CTTG 5 4 37657 CASAVA_Build 1 16993581 1I GCGTTAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 64 2 21 41 T 13 14 37658 CASAVA_Build 1 16993593 2I TTTTTTTTTT --/AA TAAATTCTTA 3070 het 497 hom 52 3 22 27 A 0 2 37659 CASAVA_Build 1 16995014 4D TATTTCCTTT AAAA/---- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 52 12 21 19 A 13 9 37660 CASAVA_Build 1 16996267 1I ACTTGACACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2250 hom 26 7 11 8 T 9 10 37661 CASAVA_Build 1 16997107 2I CATCAAACAA --/TG TGAAATGAAC 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 TG 1 2 37662 CASAVA_Build 1 17055431 3D AAGGCCATGT TAA/--- TAATGTCTTG 3070 hom 142 het 56 0 47 11 TAA 2 1 37663 CASAVA_Build 1 17060792 4D CAGGTAGAAA GAAG/---- GACCTTTTTC 1634 het 1634 ref 52 41 5 7 GAAG 1 0 37664 CASAVA_Build 1 17062042 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 962 het 17 hom 15 1 9 5 A 11 12 37665 CASAVA_Build 1 17066029 1I TGCTGAAACC -/T GAAAAGTAGG 3070 het 3070 ref 54 28 15 11 T 0 1 37666 CASAVA_Build 1 17069722 1D CTACAACCAG A/- ACAAAAGGCC 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 A 2 1 37667 CASAVA_Build 1 17070696 1D GATGGACCCC T/- GAGCCTTCAT 3070 het 3070 ref 81 52 15 15 T 1 0 37668 CASAVA_Build 1 17072996 4D GTTTACATGG CTTC/---- CTTGTCTCTT 3070 het 3070 ref 101 55 28 25 CTTC 1 0 37669 CASAVA_Build 1 17073740 16D TTGTGGTAGA GACGAGCTTTCACCAT/---------------- GTTGGCCCGG 1270 het 1270 ref 36 32 3 1 GACGAGCTTTCACCAT 1 0 37670 CASAVA_Build 1 17073867 2I CCCCCGATTT --/TA TTTTTATTAA 2507 het 2507 ref 33 19 8 6 TA 0 1 37671 CASAVA_Build 1 17074927 2D TACGGGAAAC GG/-- AAAGTATTTG 3070 het 3070 ref 59 42 13 4 G 2 0 37672 CASAVA_Build 1 17076927 1I AAAACCAAAA -/C CCTCAAGAGT 3070 het 3070 hom 71 32 36 3 C 2 3 37673 CASAVA_Build 1 17078173 1D GATTTGTATG A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 55 35 15 6 A 7 6 37674 CASAVA_Build 1 17080248 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 27 9 8 A 11 10 37675 CASAVA_Build 1 17080969 1I TGTCAATCAT -/G GGTAAATATT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 G 2 3 37676 CASAVA_Build 1 17084099 1I CTCTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 23 15 11 T 12 13 37677 CASAVA_Build 1 17089449 1I CTCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 793 het 793 ref 36 25 4 7 A 13 14 37678 CASAVA_Build 1 17091111 2I AGGGAGTCCG --/TT CAGTTGACTG 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 0 2 37679 CASAVA_Build 1 17093093 1D GTAATAACTC T/- TGTCTCCCAC 585 het 585 ref 63 50 3 11 T 2 1 37680 CASAVA_Build 1 17095241 1D CTGGAGTTTC T/- AAAAGTAGAC 3070 hom 31 het 44 1 37 8 T 1 0 37681 CASAVA_Build 1 17098178 1D CTCCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 2758 het 2348 hom 36 10 7 22 A 13 12 37682 CASAVA_Build 1 17100040 2D ACTGCAGCCC AT/-- ATGTCTGTCA 3070 het 3070 ref 55 37 10 11 AT 2 1 37683 CASAVA_Build 1 17100951 1I AACTGGTTGC -/A AAAGGCAAAT 1617 het 1617 ref 73 54 6 13 A 3 4 37684 CASAVA_Build 1 17101402 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 23 11 2 A 11 12 37685 CASAVA_Build 1 17102539 4I GAGCAGGGAG ----/ATGT ATGTGTGGTG 3070 het 3070 ref 85 67 9 9 ATGT 1 2 37686 CASAVA_Build 1 17102997 9I CTGTTAAAAA ---------/TTCCTCAGT GAGAGGTCTC 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 TTCCTCAGT 0 1 37687 CASAVA_Build 1 17104887 1D GGCACTCAAT A/- AAATCCTCCT 3070 het 580 hom 49 5 35 10 A 4 3 37688 CASAVA_Build 1 17104997 1I AATAATAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1504 hom 59 6 41 12 T 10 11 37689 CASAVA_Build 1 17105075 8I TTTGTGAGAC --------/CTTATTTT CTTGTTTACT 3070 het 3038 hom 63 12 25 26 CTTATTTT 0 1 37690 CASAVA_Build 1 17105447 1D26M1I TTCTGTTCTT GGTTTTGTTGTGGTGGTGGTTGTTTTG-/-GTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGT TTTTTTAAGA 2844 het 2844 ref 60 56 10 10 N/A 0 0 37691 CASAVA_Build 1 17107351 2D ACGGTGACTC TG/-- TGGTTCCCAC 1803 het 1803 ref 48 31 7 12 TG 2 1 37692 CASAVA_Build 1 17107511 1I AAAAAACATC -/T TGAAGAAACA 3070 het 3070 ref 77 57 18 2 T 1 2 37693 CASAVA_Build 1 17108324 2I TATGTATGTA --/TG TGTGTGTGGG 2659 het 2659 ref 44 20 12 12 TG 4 5 37694 CASAVA_Build 1 17108963 1D TTTAATAATT A/- AAAAAAGCAA 1946 het 1946 ref 15 6 4 6 A 7 6 37695 CASAVA_Build 1 17113822 1D TGGAGTGGGC A/- TTTTGAACGA 3070 hom 80 het 31 0 25 7 A 1 0 37696 CASAVA_Build 1 17114167 1D TCCCCTCCCC A/- AGTCTTTCAG 3070 het 3070 ref 50 29 11 11 A 2 1 37697 CASAVA_Build 1 17128311 1I CGTGTCCTCC -/T GGGAATGTTT 3070 het 3070 ref 75 57 14 4 T 0 1 37698 CASAVA_Build 1 17128526 1D TCCAGGCTTT C/- CTGAGCTCAC 3070 hom 121 het 52 0 42 10 C 2 1 37699 CASAVA_Build 1 17128651 1I CCTGAGGTTG -/A ACCCAGGTGC 1007 het 1007 ref 69 57 3 9 A 1 2 37700 CASAVA_Build 1 17130844 1D AAGTTCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 26 17 9 T 12 11 37701 CASAVA_Build 1 17131006 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1502 het 1073 hom 18 4 7 7 T 16 15 37702 CASAVA_Build 1 17135110 1D GGGCCTGTTA C/- CCCCAGAGCC 3070 het 3070 ref 53 37 12 4 C 5 4 37703 CASAVA_Build 1 17139196 1D GGTCTGAGCT G/- GGGGGTACTG 2562 het 2562 ref 46 28 7 12 G 6 5 37704 CASAVA_Build 1 17143433 1I AGTGCCCCCC -/G TGGGGTTAGG 2153 het 2153 ref 42 22 6 14 G 0 1 37705 CASAVA_Build 1 17150965 1D GGTAAAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 12 11 37706 CASAVA_Build 1 17166142 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 9 37707 CASAVA_Build 1 17174488 24D GGATAGCCCA GACAGAACCTGGCACGGGAGCCCG/------------------------ GACAGAACCT 2513 hom 29 het 30 0 10 21 GACAGAACCTGGCACGGGAGCCCG 2 1 37708 CASAVA_Build 1 17179852 2D TCCATCTCCT GG/-- GGGGGGGGGT 2244 hom 21 het 10 0 7 3 G 11 9 37709 CASAVA_Build 1 17185832 12D TCCCCAGCAC CCCAGGGCTCCT/------------ CCCTCCCTCC 2145 hom 22 het 9 0 6 4 CCCAGGGCTCCT 1 0 37710 CASAVA_Build 1 17189768 1I ACCAGGCTAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 76 hom 28 1 21 6 T 8 9 37711 CASAVA_Build 1 17195954 1I GACCCCAGAT -/G GGGGGGCAAC 3070 hom 51 het 21 0 16 5 G 6 7 37712 CASAVA_Build 1 17206633 1D AAATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1362 het 47 hom 15 0 7 8 T 19 18 37713 CASAVA_Build 1 17208040 1D AGCAAGACTC A/- AAAAAAAAAA 804 het 32 hom 20 1 4 15 A 17 16 37714 CASAVA_Build 1 17250776 1I AAGATAACCC -/G GGGGGAGGGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 5 6 37715 CASAVA_Build 1 17263327 2D CTGAGATAAC GA/-- GCTGCTCTCA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 GA 1 0 37716 CASAVA_Build 1 17263541 1D GAAGACTTTC T/- GGAAGGGCAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 1 0 37717 CASAVA_Build 1 17268734 2D CATGCGTGCA TG/-- TGTGTTTCTG 3070 het 3070 ref 73 45 22 6 TG 3 2 37718 CASAVA_Build 1 17278882 1I TCTGTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 11 12 37719 CASAVA_Build 1 17282127 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 8 37720 CASAVA_Build 1 17296848 4I ACCAGGGGCT ----/GTTA AAGAGCCTGG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 GTTA 0 1 37721 CASAVA_Build 1 17299128 1I TATTGGGGTT -/G GGGGGGGGGC 1999 het 200 hom 24 2 12 10 G 9 10 37722 CASAVA_Build 1 17302745 1I CATGGTCTAA -/C CCCCACAACA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 C 4 5 37723 CASAVA_Build 1 17305896 1I AAGAGAGGGA -/G GGGATAGGTA 3070 hom 51 het 28 0 16 12 G 3 4 37724 CASAVA_Build 1 17311606 1D AGAGGAGTCT G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 69 het 25 0 20 5 G 9 8 37725 CASAVA_Build 1 17327964 1D GTATTTTACA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 9 8 37726 CASAVA_Build 1 17328904 1I CACACAGACT -/A GGGGTGTGCA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 0 1 37727 CASAVA_Build 1 17330450 1D TTCCCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2642 hom 12 het 15 0 8 7 T 17 16 37728 CASAVA_Build 1 17332849 1D GACACACTTC T/- TTTTTTTTTT 1964 hom 26 het 13 0 8 5 T 17 16 37729 CASAVA_Build 1 17339318 1I GATGGGTTAC -/T CTATTAACCC 3070 hom 83 het 33 0 26 7 T 0 1 37730 CASAVA_Build 1 17340695 1D CCACTTTGTG C/- CCCCAAAGAC 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 C 5 4 37731 CASAVA_Build 1 17346133 1D CGGAGAAGGT G/- GGGGGTGGGG 3070 het 3070 hom 33 13 13 8 G 6 5 37732 CASAVA_Build 1 17349764 1D ATTTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 1470 het 1136 hom 8 4 4 0 T 11 10 37733 CASAVA_Build 1 17396700 1I TCCTCACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 31 1 25 5 A 11 12 37734 CASAVA_Build 1 17412266 8I5M12I GGGACGTAAT --------CTCCT------------/TCGGAGTCCTCATTAGGGAAAAGGA ACCAGGCTGG 3070 hom 87 het 30 0 30 1 N/A 0 0 37735 CASAVA_Build 1 17422041 20I GCCCCCAGCA --------------------/CCCATGGCATACAGTGATCC CCCAAATCCT 3070 het 3070 hom 25 8 10 7 CCCATGGCATACAGTGATCC 0 1 37736 CASAVA_Build 1 17423997 1I TGTCCTGGGA -/G GGGGTAGAAG 3070 het 2495 hom 29 7 16 6 G 4 5 37737 CASAVA_Build 1 17431020 4D AAAAAACACG TGTT/---- TGTTTGTTTG 2053 het 2053 ref 18 8 6 4 TGTT 4 3 37738 CASAVA_Build 1 17442403 2D CCCCAAAGGC TT/-- TTTCAGCCCT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 5 3 37739 CASAVA_Build 1 17469902 1I GAATCAGAGT -/C CCCCCCAGGC 3012 het 3012 ref 29 16 8 5 C 6 7 37740 CASAVA_Build 1 17491317 1I ATCAATTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 T 9 10 37741 CASAVA_Build 1 17493865 2D CTCTAAAACA AC/-- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 AC 1 0 37742 CASAVA_Build 1 17495618 1D TGCTGGTTAA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 T 7 6 37743 CASAVA_Build 1 17497491 7D CTGCCTGCAG TTTGCAA/------- AGCTCCAGTT 3070 het 3070 hom 44 21 21 4 TTTGCAA 1 0 37744 CASAVA_Build 1 17502844 9I GTTACCTAAC ---------/TCCTCTGAG TCCTCTGAGA 3070 het 3070 hom 53 18 25 10 TCCTCTGAG 1 2 37745 CASAVA_Build 1 17504402 1I CCCTCGGCCT -/A TCTCTCTTCC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 0 1 37746 CASAVA_Build 1 17507865 2I GCTCTGTGGC --/GT GGCAGAGACT 3070 hom 100 het 36 0 33 3 GT 0 1 37747 CASAVA_Build 1 17508228 2D GTTCTATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 2250 hom 39 het 20 0 13 7 A 14 12 37748 CASAVA_Build 1 17509707 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 9 10 37749 CASAVA_Build 1 17519351 1D TCCCTCTTAT A/- AAGACCTTTG 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 3 2 37750 CASAVA_Build 1 17522330 12D71M4I4M1I GGCAAGAGAC AGGCAGAGAGAGAGGCAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAATTCTATTGTAACCTTATGACAGAAGTGATATTCCAGCACTTTTAC----TTCC-/------------AGGCAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAATTCTATTGTAACCTTGTGACAGAAGTGATATTCCAGCACTTTTACCATTTTCCG TTGGTTAGAA 3070 het 3070 ref 43 28 22 33 N/A 0 0 37751 CASAVA_Build 1 17527039 1I TATTATTGCA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 6 7 37752 CASAVA_Build 1 17527741 1I AAAAAAAAAA -/G ATAAGTTTAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 G 0 1 37753 CASAVA_Build 1 17529626 11D AAGGCCCAAG AGCCCCTAGCA/----------- AGCCACTGGA 3070 het 2964 hom 24 13 10 5 AGCCCCTAGCA 1 0 37754 CASAVA_Build 1 17530712 5D ATCACCATGG TGGCC/----- TGGCCGGGCA 3070 het 2790 hom 30 8 17 5 TGGCC 2 1 37755 CASAVA_Build 1 17534247 2I ATACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 AT 5 6 37756 CASAVA_Build 1 17539873 5D TATTCCAAGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1953 het 840 hom 22 4 7 11 T 17 12 37757 CASAVA_Build 1 17548785 2D AGACTGTATC AA/-- AAAAAAAAAA 2771 het 41 hom 10 1 8 1 A 15 13 37758 CASAVA_Build 1 17583582 1D GCACTTTGAG T/- AGACCAAGAC 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 T 1 0 37759 CASAVA_Build 1 17584279 2I CGATAGTGTT --/TG TGAGTAGTGT 3070 het 3070 hom 52 19 23 10 TG 1 2 37760 CASAVA_Build 1 17584816 3D GAGGATGACA TCG/--- TCGTCCCCAA 3070 het 3070 ref 53 24 18 11 TCG 2 1 37761 CASAVA_Build 1 17585142 1I CAGGGTGGGT -/A AGGGAGAGTT 3070 hom 120 het 43 0 38 5 A 1 2 37762 CASAVA_Build 1 17590285 4D CTGTTTGTTC CGTT/---- TGTTTAAGAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 10 CGTT 1 0 37763 CASAVA_Build 1 17591259 1D GCAACAGCCA G/- GGTGGCATCT 3070 hom 94 het 36 0 25 12 G 3 2 37764 CASAVA_Build 1 17593274 1D TGGCCTCTGA G/- GGGGGAGGGG 3070 hom 59 het 26 0 19 7 G 6 5 37765 CASAVA_Build 1 17594283 1D CTTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 193 hom 29 6 14 9 T 15 14 37766 CASAVA_Build 1 17596064 2I GGAATGCACC --/CA CAGGTGGCTG 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 CA 1 2 37767 CASAVA_Build 1 17598813 2I CTGCAACTTT --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 8 10 37768 CASAVA_Build 1 17599292 1D AAACCAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 157 hom 23 1 17 5 A 15 14 37769 CASAVA_Build 1 17601934 2I AGGGCCAGAA --/GG GGGGGACAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 G 5 7 37770 CASAVA_Build 1 17603293 8I CCTTCCCTCC --------/TCCCTGCA TCCCTGCATC 3070 hom 64 het 31 0 19 12 TCCCTGCA 1 2 37771 CASAVA_Build 1 17604311 4D CAGGAATAAA AAAC/---- AAACAGCCTT 3070 hom 54 het 22 0 17 5 AAAC 2 1 37772 CASAVA_Build 1 17604892 4D CAGCCTGGGT GAAA/---- GAAACTCAGT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 GAAA 2 1 37773 CASAVA_Build 1 17605553 3I GCGCTGGATG ---/CCT CCTCCCATGA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 CCT 1 2 37774 CASAVA_Build 1 17605855 3D CAGTAGACAA TGT/--- TGTTGTTTAT 3070 hom 59 het 24 0 19 5 TGT 3 2 37775 CASAVA_Build 1 17611158 1D CCATGAGCCA C/- CCTGACTGGC 2767 het 2767 ref 26 14 9 3 C 3 2 37776 CASAVA_Build 1 17617119 1I TACTATGCCA -/T TTTTATATAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 4 5 37777 CASAVA_Build 1 17622047 3I TCCAAATTCC ---/CAA CAACAGCCAA 3070 hom 60 het 29 0 20 9 CAA 1 2 37778 CASAVA_Build 1 17627504 2D TCCAACGCCC CT/-- GTTTTAAGGT 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 CT 1 0 37779 CASAVA_Build 1 17641280 1I TTTTTTTTTT -/A TTTTTTTATT 43 het 43 ref 16 3 2 11 A 0 1 37780 CASAVA_Build 1 17649257 1D CTGTCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 2754 het 1186 hom 31 6 12 13 A 17 16 37781 CASAVA_Build 1 17655726 14D CAAGCCACTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 1493 het 1493 ref 17 9 5 5 T 25 11 37782 CASAVA_Build 1 17663835 1I ACAACGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 8 9 37783 CASAVA_Build 1 17669207 7D ATTCCTTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 20 1 15 5 A 17 10 37784 CASAVA_Build 1 17672343 1I CTTTCATTTT -/A ACTGTACGGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 1 2 37785 CASAVA_Build 1 17672746 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 22 0 19 3 T 8 7 37786 CASAVA_Build 1 17673062 4D AATTTTTTTA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TATT 5 4 37787 CASAVA_Build 1 17675431 5D GCTTTTGTCC AGTTT/----- AGTTTAATGG 3070 hom 80 het 32 0 26 8 AGTTT 2 1 37788 CASAVA_Build 1 17675530 4D ATGATGTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 34 1 28 5 T 14 10 37789 CASAVA_Build 1 17676469 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2979 het 115 hom 26 1 9 16 A 20 17 37790 CASAVA_Build 1 17678235 1I GACAGCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 24 1 19 4 T 10 11 37791 CASAVA_Build 1 17686410 1D TGATTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 29 1 23 5 T 13 12 37792 CASAVA_Build 1 17691619 4D TGTTTTGAGT TAGA/---- TAGAAAAAGC 3070 hom 60 het 25 0 21 6 TAGA 2 1 37793 CASAVA_Build 1 17692567 1I AGACTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 24 3 18 3 A 15 16 37794 CASAVA_Build 1 17693299 1D TCTCAGACTG C/- CCAGGCTAGG 3070 hom 99 het 38 0 31 7 C 3 2 37795 CASAVA_Build 1 17711205 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 19 0 14 5 T 11 10 37796 CASAVA_Build 1 17717886 5D ATTCTGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 581 het 581 ref 20 9 5 8 A 23 18 37797 CASAVA_Build 1 17726933 8D TCCTCTTGCT TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 2104 hom 27 het 16 0 10 6 TTTC 4 2 37798 CASAVA_Build 1 17731311 1I AGGCCCTCGG -/C CCTGTCTGCT 3070 hom 62 het 26 0 19 7 C 2 3 37799 CASAVA_Build 1 17750434 1I TGGAGGGACT -/C CCGAGGAGGC 3070 hom 95 het 37 0 31 6 C 2 3 37800 CASAVA_Build 1 17777632 1D AGCCAGGCAT G/- GTGGTGTGTG 3070 hom 86 het 33 0 29 4 G 2 1 37801 CASAVA_Build 1 17782142 1I ACAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 2614 het 161 hom 18 2 12 4 A 14 15 37802 CASAVA_Build 1 17785585 2D CATTCAGCCC AG/-- AGTTTAGGAA 3070 hom 105 het 39 0 33 6 AG 2 1 37803 CASAVA_Build 1 17886138 8I TTGCTGTGAA --------/TGATGAGG TGATGAGGAT 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 TGATGAGG 1 2 37804 CASAVA_Build 1 17894873 3I GGGTCCCCCT ---/CTG CCACCACCCT 3070 hom 55 het 25 0 17 8 CTG 0 1 37805 CASAVA_Build 1 17896585 1I ACTACTTGGG -/C CAGAGCAAAG 3070 hom 84 het 32 0 27 5 C 1 2 37806 CASAVA_Build 1 17897363 3D TCTGGAGTAG CAT/--- GGGGGCAGAA 3070 hom 99 het 34 0 33 2 CAT 1 0 37807 CASAVA_Build 1 17900624 1D AGTTTATCAG T/- TCATGGGCCT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 T 2 1 37808 CASAVA_Build 1 17908755 1I TCCTTTCTGA -/G GGCCATGCAT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 2 3 37809 CASAVA_Build 1 17916272 1I TACTTGCGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 23 0 15 8 T 9 10 37810 CASAVA_Build 1 17919323 10I TAGGTCTTTC ----------/TAGGCCTTTT TAGGCCCTTA 3070 hom 86 het 33 0 26 7 TAGGCCTTTT 0 1 37811 CASAVA_Build 1 17948398 5I TCCAGTCTAA -----/CTCCC CACTAGCATT 3070 het 3070 ref 56 28 20 8 CTCCC 0 1 37812 CASAVA_Build 1 17959804 3D GGCATCCCTC AGA/--- GGAGTGGGTG 3070 het 3070 ref 37 17 15 7 AGA 1 0 37813 CASAVA_Build 1 17962441 2I ACGGGGTAGC --/GT GTGGGGGTGC 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 GT 1 2 37814 CASAVA_Build 1 17968585 1I GGACATTGGG -/A GACCTGCTCT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 0 1 37815 CASAVA_Build 1 17971016 1D TTGTCCTCTT C/- CTGCCTTCTC 3070 het 3070 hom 48 19 26 3 C 2 1 37816 CASAVA_Build 1 17971571 1I TACTGGATCC -/T CTCATAACTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 0 1 37817 CASAVA_Build 1 17974443 3D GCCTGGAACT GGA/--- GGAGGAGGAG 3070 het 1547 hom 29 5 18 9 GGA 5 4 37818 CASAVA_Build 1 17979778 1I GTTGACAGTG -/C CAGTCCTGAA 2245 het 2174 hom 13 5 5 3 C 1 2 37819 CASAVA_Build 1 17982447 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAACTCC 3036 het 3036 ref 33 13 10 10 A 7 6 37820 CASAVA_Build 1 17994653 1D TAGGAGCAAT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 27 13 13 3 A 7 6 37821 CASAVA_Build 1 17997244 30I ATATGGGTCT ------------------------------/GCGAAGCCGTGAAATGTGCAGTGAAACTAA GCGCAGTCAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 GCGAAGCCGTGAAATGTGCAGTGAAACTAA 0 1 37822 CASAVA_Build 1 17998543 1D TCTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 21 28 5 T 11 10 37823 CASAVA_Build 1 18011105 1I TAATTTTTTT -/C ATTTTTTGTA 3070 het 3032 hom 26 7 18 1 C 0 1 37824 CASAVA_Build 1 18020715 1I GACTATTCCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 15 7 T 8 9 37825 CASAVA_Build 1 18021339 1I ATCTTACCCC -/T CTGTGCCTCA 3070 het 3070 ref 56 28 23 5 T 0 1 37826 CASAVA_Build 1 18043719 1D AGAGGCTTGG A/- AAAGGGAGGA 3070 hom 68 het 28 0 21 9 A 4 3 37827 CASAVA_Build 1 18062961 1I TTATTAACTC -/A AATAGAAATG 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 A 2 3 37828 CASAVA_Build 1 18068191 1I CCCAAGGCTG -/A GCTTGCCGGG 3070 hom 79 het 31 0 26 5 A 0 1 37829 CASAVA_Build 1 18068292 1I TTTTCATCTT -/A TGCTTTGTCC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 0 1 37830 CASAVA_Build 1 18068811 1I ATCTTGGACC -/A AACCCCTGGG 3070 hom 78 het 33 0 24 9 A 2 3 37831 CASAVA_Build 1 18068974 2I TATATTCTTT --/CA CACAGTTTCT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 CA 2 3 37832 CASAVA_Build 1 18069267 1I GCTATGCAGG -/T GGCAGCTGTG 3070 hom 72 het 30 0 22 8 T 0 1 37833 CASAVA_Build 1 18069408 1I CCTGTTCCCA -/T CCTCAGCCCT 3070 hom 4 het 20 0 13 7 T 0 1 37834 CASAVA_Build 1 18069449 1D CTGCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2749 het 21 hom 20 1 8 12 T 13 12 37835 CASAVA_Build 1 18070240 1I TTTGATTAAA -/G TCGTTCCAGC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 0 1 37836 CASAVA_Build 1 18077281 1D GGAGGAGGGA G/- GGGGGGGTCT 2595 het 2595 ref 27 14 9 4 G 8 7 37837 CASAVA_Build 1 18081469 1I TTAAAATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 9 10 37838 CASAVA_Build 1 18082314 4D ATCCATCAAA CTGC/---- CTGCCTGAGG 3070 hom 92 het 37 0 26 13 CTGC 2 1 37839 CASAVA_Build 1 18087292 1I AAAATCACCT -/C CAGAAAGCCA 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 1 2 37840 CASAVA_Build 1 18087398 1D GACCTTGGAA C/- AGGTCCTTCT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 C 1 0 37841 CASAVA_Build 1 18101686 9D TATGCCAGAC AGCATTCTA/--------- AGCATTCTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 AGCATTCTA 2 1 37842 CASAVA_Build 1 18141443 3I TTATAATTTC ---/CTT CTTCTGCTGC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 CTT 1 2 37843 CASAVA_Build 1 18145890 1D TCTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 23 0 16 7 T 11 10 37844 CASAVA_Build 1 18148435 1I TTCCAGACAC -/T TGGTGGGGTT 2837 het 2837 ref 29 15 7 7 T 1 2 37845 CASAVA_Build 1 18149544 1D TCTGTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2113 het 444 hom 15 1 5 9 T 15 14 37846 CASAVA_Build 1 18149694 1I CAGCTATCCA -/T TTTTTTTTTT 2592 het 2592 ref 24 8 9 7 T 11 12 37847 CASAVA_Build 1 18156858 1I GAGCTCCTTT -/G GGACAGTTCC 3070 hom 108 het 41 0 35 6 G 2 3 37848 CASAVA_Build 1 18162485 2I TTTTTAGGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 11 13 37849 CASAVA_Build 1 18165685 3I GGGTGGCGTT ---/CTC CTCTGTGCAA 3070 hom 120 het 42 0 39 3 CTC 1 2 37850 CASAVA_Build 1 18200871 2I GCCAAAGACA --/CT CTCTGCCCGG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 CT 2 3 37851 CASAVA_Build 1 18201091 1D AGAGTTAAGG A/- GGGGGGGGGG 3070 het 35 hom 19 1 11 8 A 1 0 37852 CASAVA_Build 1 18206413 1I GAGAAAGAAA -/G AGAAAGAGAA 1536 het 519 hom 14 2 5 8 G 0 1 37853 CASAVA_Build 1 18208069 14D AAGAGAAAGA AGAAAGAAAGAAAG/-------------- AGAAAGAAGG 3070 het 3070 ref 26 11 15 1 AGAAAGAAAGAAAG 1 0 37854 CASAVA_Build 1 18218053 8D TACCTGTAAT CCCAGCTA/-------- CCCAGCTACT 3070 hom 57 het 21 0 18 5 CCCAGCTA 2 1 37855 CASAVA_Build 1 18225569 1D TCCAAGTGGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 T 9 8 37856 CASAVA_Build 1 18231321 1D TGGGGAGGGG A/- AAAAACACCC 3070 het 3070 hom 49 20 23 8 A 6 5 37857 CASAVA_Build 1 18231705 1I CCTTCCTCCC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 12 16 13 T 7 8 37858 CASAVA_Build 1 18241435 2I ATGAGGTCTG --/CT CTCTCAGAGG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 CT 2 3 37859 CASAVA_Build 1 18261510 4I CAGCATGATC ----/AGAT AGATCTCTCA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 AGAT 1 2 37860 CASAVA_Build 1 18268470 13D AACAGTCATA GGCTGGGTGTGGT/------------- GGCTCACGCC 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 GGCTGGGTGTGGT 1 0 37861 CASAVA_Build 1 18274842 1D CTGTCTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 15 14 37862 CASAVA_Build 1 18286808 1I GACCTCTGAG -/A AATAACCCTG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 2 3 37863 CASAVA_Build 1 18296392 4I TGTCCTCTTT ----/TCCC TCCCTCCCTC 3070 hom 53 het 26 0 15 11 TCCC 3 4 37864 CASAVA_Build 1 18300277 3D TTACAGAAGT TCC/--- TCCTTTCTTT 1159 het 1159 ref 26 14 6 6 TCC 2 1 37865 CASAVA_Build 1 18300421 24D CCTTCCCTCT TTCCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTC/------------------------ TTCCTTCCTT 3070 hom 44 het 18 0 14 10 TTCCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTC 1 0 37866 CASAVA_Build 1 18303077 4D TGTGCGCCCC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 67 27 23 18 TG 8 6 37867 CASAVA_Build 1 18318843 2D AATAACGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 13 11 37868 CASAVA_Build 1 18338432 3I GTTCCGGGAG ---/GCA CTGTCTACGT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 GCA 0 1 37869 CASAVA_Build 1 18339016 1D CCCAACTTCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 10 11 8 T 8 7 37870 CASAVA_Build 1 18344861 2D GCTGAGCGTG GA/-- GGTTAGGGAA 2688 het 2688 ref 25 10 7 9 GA 1 0 37871 CASAVA_Build 1 18359628 24D AACTTGTGTG TTTTCTGGTTTAAGTCATAATTTC/------------------------ TTTTCTGGTA 3070 het 3070 ref 34 20 11 6 TTTTCTGGTTTAAGTCATAATTTC 1 0 37872 CASAVA_Build 1 18371659 2D TTGCATGTGC AG/-- AGAGAGAGAG 1169 het 1169 ref 41 33 3 7 AG 7 6 37873 CASAVA_Build 1 18377498 1D TTACCATAAT A/- ACCATGTGAT 3070 het 3070 hom 36 9 19 8 A 2 1 37874 CASAVA_Build 1 18389587 6D GCCAGGTCAT CTGGAG/------ CTGAGAAAGT 3070 hom 108 het 37 0 36 5 CTGGAG 1 0 37875 CASAVA_Build 1 18392809 1D CACAGACTCA C/- CCAGGATTAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 C 3 2 37876 CASAVA_Build 1 18404222 10D ATAAGAAGGG GAGAGAGAGA/---------- GAGAGAGAGA 3070 hom 73 het 36 0 27 10 GA 10 5 37877 CASAVA_Build 1 18435196 4D TGATATGGTT TGGC/---- TATGTCCCCA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 TGGC 1 0 37878 CASAVA_Build 1 18435812 2I AGACGGTGAG --/GA GAGTGGAGTG 3070 hom 148 het 54 0 50 5 GA 1 2 37879 CASAVA_Build 1 18437097 1I GGGGGTGCTC -/A AAACCCCAGA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 3 4 37880 CASAVA_Build 1 18437707 1D AACTCTTGAG A/- GGGGGTGCCA 3070 hom 94 het 36 0 32 4 A 1 0 37881 CASAVA_Build 1 18438156 3D CTGGCCTGAG CTA/--- CTACTGTTGG 3070 hom 61 het 25 0 20 5 CTA 2 1 37882 CASAVA_Build 1 18501259 1D GTGCTCCAGG C/- CCAAGCTCCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 3 2 37883 CASAVA_Build 1 18513380 2I TTTTTTTTTT --/TA AAACAAAGAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TA 0 1 37884 CASAVA_Build 1 18514903 8I GATAGGTGTG --------/GATGGCTA GATGGCTAGA 3070 hom 103 het 47 0 31 16 GATGGCTA 1 2 37885 CASAVA_Build 1 18516330 1D CTGTGGCTAG A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 39 15 14 11 A 7 6 37886 CASAVA_Build 1 18519420 4D TAGCGCAGGA CAGT/---- CAAACATAAT 3070 hom 63 het 26 0 18 8 CAGT 1 0 37887 CASAVA_Build 1 18531580 2D TCTGAGTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 35 1 20 16 T 14 12 37888 CASAVA_Build 1 18548976 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 12 22 13 A 10 11 37889 CASAVA_Build 1 18557128 2D GAGAGAGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 51 13 22 16 GT 9 8 37890 CASAVA_Build 1 18566469 1I GCATATGAGC -/A AAAACTGAGG 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 A 4 5 37891 CASAVA_Build 1 18566855 1D ATCCTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2222 hom 17 7 9 1 T 11 10 37892 CASAVA_Build 1 18567423 2D CATCTCTACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 17 2 11 4 A 12 10 37893 CASAVA_Build 1 18567641 2I CAAGCATCAC --/TT AAGGCCAGGC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 0 2 37894 CASAVA_Build 1 18569676 1I TGATAAATTG -/A AATTTGGTAA 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 A 2 3 37895 CASAVA_Build 1 18590604 1I AATGGGCTAA -/G GGTTTTATTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 2 3 37896 CASAVA_Build 1 18592836 1D ATTGTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2556 hom 28 8 12 8 A 14 13 37897 CASAVA_Build 1 18613845 1I TAGCATTTGG -/C CCCCCCATTT 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 C 6 7 37898 CASAVA_Build 1 18615223 1D GATCAGGAAC T/- TTTTTCCAGC 3070 het 2955 hom 22 7 13 3 T 6 5 37899 CASAVA_Build 1 18623927 1D GTTTAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2366 hom 26 7 12 9 A 13 12 37900 CASAVA_Build 1 18625029 1D GTATTCTTAT A/- AAAATCCTAT 3070 het 3070 hom 35 13 16 7 A 5 4 37901 CASAVA_Build 1 18638062 14D CCACCCACCC ATGCTGGATGAACT/-------------- ACATGAGGGT 3070 het 3070 ref 49 26 21 8 ATGCTGGATGAACT 1 0 37902 CASAVA_Build 1 18638224 2I TTGTGTAAAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 GT 6 7 37903 CASAVA_Build 1 18646739 4I ACATGCACAT ----/ACAC ACACACACGA 3070 het 3070 ref 66 29 22 15 AC 4 6 37904 CASAVA_Build 1 18665467 1I AAAATAATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 17 het 29 1 23 5 T 9 10 37905 CASAVA_Build 1 18670630 1I CACAGAGAAG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 62 20 32 10 T 7 8 37906 CASAVA_Build 1 18673677 12I AAGGTGAGAT ------------/GTGTGGGTGTGC GTGTGGGTGT 3070 hom 104 het 42 0 34 8 GTGTGGGTGTGC 0 1 37907 CASAVA_Build 1 18674435 1D TTTTCATCTC T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 8 7 37908 CASAVA_Build 1 18677364 2I ACTTCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 625 hom 11 het 5 0 4 1 A 16 18 37909 CASAVA_Build 1 18685066 1D TACACACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 36 2 25 9 A 15 14 37910 CASAVA_Build 1 18686904 1I ACTCTATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 32 2 21 9 A 15 16 37911 CASAVA_Build 1 18688872 1D TACCCTAGTC A/- ACAGCCAGTT 3070 hom 140 het 51 0 38 14 A 2 1 37912 CASAVA_Build 1 18701601 1D AAAATTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 34 0 20 14 A 13 12 37913 CASAVA_Build 1 18740797 1D GGATTTATGA C/- CCCCCCCCCA 1444 het 1444 ref 34 20 4 10 C 10 9 37914 CASAVA_Build 1 18753375 1D AACTTAATTT G/- CCAGGTCAGC 3070 het 3070 hom 65 28 30 9 G 1 0 37915 CASAVA_Build 1 18756277 2D AAAGTAGCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 T 12 10 37916 CASAVA_Build 1 18761857 1I GAATAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 10 8 A 13 14 37917 CASAVA_Build 1 18767684 4I AAGGAAAGAA ----/GAAG GAAGAAGGGA 3070 het 3042 hom 25 10 10 5 GAAG 1 2 37918 CASAVA_Build 1 18775869 12D TTCGCTCTCT CTTCAGCCCTCC/------------ CTTCAGCCCT 3070 het 3070 ref 41 23 13 11 CTTCAGCCCTCC 2 1 37919 CASAVA_Build 1 18791376 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 7 6 37920 CASAVA_Build 1 18796075 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 15 7 7 1 A 6 7 37921 CASAVA_Build 1 18894008 1I GACCTCAAAG -/C CCCCCTGAGT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 C 5 6 37922 CASAVA_Build 1 18905731 1D TCCCAACTAA T/- TTTTGTATAT 1418 het 881 hom 13 4 4 5 T 5 4 37923 CASAVA_Build 1 18915589 1I6M2I TTTTTTGTTT -TTTGTT--/GTTTGTTTG TTTTTCACAC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 N/A 0 0 37924 CASAVA_Build 1 18918887 1I TGTCCCAACT -/G GGGTCATATT 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 G 3 4 37925 CASAVA_Build 1 18932242 1D CCCAAGCCCC T/- TAGCACATTC 3070 hom 89 het 37 0 30 8 T 2 1 37926 CASAVA_Build 1 18956145 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1239 hom 19 4 12 3 A 11 10 37927 CASAVA_Build 1 18956222 3D TCTTATTTCT CTG/--- CTATAATGAG 3070 het 3070 ref 24 12 12 0 CTG 1 0 37928 CASAVA_Build 1 18987704 1I GCTATCTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 10 11 37929 CASAVA_Build 1 18992733 1D CCTGGGATGC A/- AAAGAAATGG 3070 het 3070 ref 43 19 16 9 A 4 3 37930 CASAVA_Build 1 18993332 5D ACAAGAGGTC AAATA/----- ACAGGCCCAA 3070 het 3070 ref 47 21 20 8 AAATA 1 0 37931 CASAVA_Build 1 18997191 4I TTCAACCCCC ----/CCCG CCCCCACCTG 1647 het 1333 hom 22 7 7 8 CCCG 0 1 37932 CASAVA_Build 1 19006939 1D GGCTGGCTCA C/- CCCCAAAGGT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 5 4 37933 CASAVA_Build 1 19012419 4I CTCTGTCTCA ----/AAAC AAACAGACAA 3070 het 3070 hom 57 19 27 11 AAAC 1 2 37934 CASAVA_Build 1 19014266 1D TAATTACACC G/- TGTCCACTAG 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 G 1 0 37935 CASAVA_Build 1 19018836 19D CTGAGGGGCT GACCCCACAGCTAAGGGCA/------------------- GAGGCCAATG 3070 het 3070 ref 35 21 17 7 GACCCCACAGCTAAGGGCA 1 0 37936 CASAVA_Build 1 19028630 1D GAGCCCCCCC T/- GCTGTGAGAG 3070 hom 88 het 32 0 30 3 T 1 0 37937 CASAVA_Build 1 19030339 1D AGACAGATAT G/- GTTTGGATCT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 G 2 1 37938 CASAVA_Build 1 19032068 1D GCCCCCACTC T/- TTTTTTTTTT 2521 het 61 hom 22 2 8 12 T 11 10 37939 CASAVA_Build 1 19032627 4D CATTCACTCA TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 57 25 21 11 TTCT 4 3 37940 CASAVA_Build 1 19034219 1D CTTGGCCAAG A/- GGGGGTCCTT 3070 het 3070 ref 55 29 21 5 A 1 0 37941 CASAVA_Build 1 19036611 3I GATTGAATCT ---/AAG AAGAATTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAG 1 2 37942 CASAVA_Build 1 19046484 1I TACTTTGTGA -/T GGCAGGCCTA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 0 1 37943 CASAVA_Build 1 19046635 1D TATTAGCAAA G/- GAGAGTGATG 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 2 1 37944 CASAVA_Build 1 19047645 1D TTAGGAACCT G/- GGCCACACAG 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 G 3 2 37945 CASAVA_Build 1 19054328 1D ACACCCTGGG C/- CAAGCCACAT 3070 het 3070 hom 67 28 32 9 C 2 1 37946 CASAVA_Build 1 19057392 3D TCACTACGAT CAC/--- CACCATCACC 3070 het 3070 ref 79 34 28 20 CAC 2 1 37947 CASAVA_Build 1 19063920 2D CAGGGAGAGC TT/-- TTTTTAGAGT 3070 hom 80 het 32 0 26 6 T 7 5 37948 CASAVA_Build 1 19064274 1D GGCCCTGACG T/- TTATCTAGGA 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 T 3 2 37949 CASAVA_Build 1 19064716 1I ATGGGGCACA -/G GGGGGAGCCC 3040 het 3040 ref 34 15 10 9 G 5 6 37950 CASAVA_Build 1 19065704 9D TAAACTTCTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2792 het 412 hom 22 4 13 8 T 21 12 37951 CASAVA_Build 1 19065820 1I CTGGGATTAC -/A GGCAAGAACC 3070 hom 90 het 38 0 29 9 A 0 1 37952 CASAVA_Build 1 19067291 1D TCCGTCATCC A/- GGGGGGCTGG 3070 hom 72 het 28 0 21 8 A 1 0 37953 CASAVA_Build 1 19071269 1D CCTCCAGCGG C/- CCCCCAACCC 1658 het 1453 hom 34 14 12 8 C 6 5 37954 CASAVA_Build 1 19073799 1I GAGGGATGCT -/G GCCAGCTGTT 3070 hom 76 het 27 0 21 6 G 1 2 37955 CASAVA_Build 1 19079332 1D CTGCAGACCC G/- GGCGTCTGGC 3070 hom 41 het 16 0 12 4 G 3 2 37956 CASAVA_Build 1 19080733 8I AGGTGAGCAG --------/GGTTGCCT GTGAACGTCC 3070 hom 106 het 40 0 31 9 GGTTGCCT 0 1 37957 CASAVA_Build 1 19093947 12D TCTTTCTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTG 3070 het 2194 hom 31 14 14 6 T 21 9 37958 CASAVA_Build 1 19111391 1D AAAATGTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 9 37959 CASAVA_Build 1 19113746 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2152 hom 19 6 11 2 A 9 10 37960 CASAVA_Build 1 19114468 4I GATTGGTAGC ----/ATTT TCTGATTTCC 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 ATTT 0 1 37961 CASAVA_Build 1 19115204 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2551 het 2551 ref 18 10 7 1 A 11 12 37962 CASAVA_Build 1 19170408 1D GCATTAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2308 hom 30 6 15 9 T 11 10 37963 CASAVA_Build 1 19172090 13D ACTATCTCTC TTTTTTATTTTTA/------------- TTTTTTATTT 3070 het 2938 hom 25 9 13 6 TTTTTTATTTTTA 2 1 37964 CASAVA_Build 1 19176570 1I CAGGCTGTAC -/A GGAAGCACGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 0 1 37965 CASAVA_Build 1 19177066 1I CTATTGATAG -/A AATTTGAATT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 A 2 3 37966 CASAVA_Build 1 19187838 4D AAGGAAGGAT GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 hom 75 het 27 0 24 4 GGAA 6 5 37967 CASAVA_Build 1 19189437 1I TTTTTTTTTT -/C AAGACAGAAT 3070 het 343 hom 19 1 15 3 C 0 1 37968 CASAVA_Build 1 19199200 9I GGAGATGGAA ---------/GAGATGGAG GAGATGGAGG 3070 hom 80 het 31 0 27 4 GAGATGGAG 1 2 37969 CASAVA_Build 1 19201740 6I CACCAAAAAA ------/AAAAAC AAAAAACAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AAAAAC 0 1 37970 CASAVA_Build 1 19208273 1I GTTCCACCCC -/T CCCCCACCCT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 T 0 1 37971 CASAVA_Build 1 19210769 4D GCACATACAT ACAC/---- ACACACACAT 3070 hom 157 het 59 0 51 10 AC 6 4 37972 CASAVA_Build 1 19212667 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2809 hom 29 9 16 7 A 11 10 37973 CASAVA_Build 1 19213450 1D ATTTATTTTT A/- AAATGAGGGC 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 4 3 37974 CASAVA_Build 1 19214058 3I GCGAGGCAGA ---/GGT GGTGGAAGGA 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 GGT 1 2 37975 CASAVA_Build 1 19214578 3I AATTTGTGTT ---/TTC TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 TTC 0 1 37976 CASAVA_Build 1 19215626 1D TGCCTATAAT C/- CTAGCTACTC 2798 hom 21 het 11 0 7 4 C 2 1 37977 CASAVA_Build 1 19216433 1I TCCAAGCTAA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 7 8 37978 CASAVA_Build 1 19220214 1D CTACAAAAAA T/- TACCTGGGTG 1914 het 1914 ref 17 11 5 1 T 2 1 37979 CASAVA_Build 1 19224969 1D TGTGTCACAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 9 8 37980 CASAVA_Build 1 19226027 4I TTGAAAACAT ----/AAAG AAAATGGGCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAAG 0 1 37981 CASAVA_Build 1 19226507 1D CAGATAAAGG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 A 8 7 37982 CASAVA_Build 1 19235522 4D CAAAGCCAGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 32 10 16 8 GA 7 5 37983 CASAVA_Build 1 19245193 2I CCTAAGAGCT --/GC TCCGTTTGGC 3070 het 3070 hom 41 11 18 12 GC 0 1 37984 CASAVA_Build 1 19247955 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 21 4 A 11 10 37985 CASAVA_Build 1 19250653 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1524 hom 19 6 13 0 T 13 14 37986 CASAVA_Build 1 19254984 1D ATTCAGCCTC A/- AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 42 16 18 9 A 7 6 37987 CASAVA_Build 1 19255611 1D TTTCAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 11 10 37988 CASAVA_Build 1 19256311 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 14 7 A 13 12 37989 CASAVA_Build 1 19262455 1I ACAGTAAGTT -/C CCCCTCACTG 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 C 4 5 37990 CASAVA_Build 1 19262778 5I ATTCTTACAA -----/CAACT CAACTCTTTT 2343 het 2343 ref 21 8 5 8 CAACT 1 2 37991 CASAVA_Build 1 19280882 1I TCTTCCCTGG -/C CCCCATGTCT 3070 hom 118 het 47 0 37 10 C 4 5 37992 CASAVA_Build 1 19328850 1D GAGGATGATG A/- AAATTAATTA 3070 het 3070 hom 65 27 34 4 A 4 3 37993 CASAVA_Build 1 19339296 1D TCAGGAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 13 12 37994 CASAVA_Build 1 19365982 1I GTCTCAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 10 11 37995 CASAVA_Build 1 19381993 6D TTATATATGT ACATAC/------ ACATACATAT 3070 het 3070 hom 32 13 13 7 ACATAC 2 1 37996 CASAVA_Build 1 19399364 1I AAAAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 A 11 12 37997 CASAVA_Build 1 19403617 1I ATAAAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 het 1489 hom 12 4 8 0 T 0 1 37998 CASAVA_Build 1 19404721 1D GGTGGCGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2701 hom 44 18 10 16 T 15 14 37999 CASAVA_Build 1 19414769 4I ATTTTTTCAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 TTTA 2 3 38000 CASAVA_Build 1 19418072 5I CTTATTAAAA -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 AAAAC 2 3 38001 CASAVA_Build 1 19482915 1D CTGTCCCCCC A/- AAAAAAAAAC 1052 het 1052 ref 24 12 3 11 A 10 9 38002 CASAVA_Build 1 19488604 1D AATACAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 8 38003 CASAVA_Build 1 19491794 1I CTAAAAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 29 het 17 0 12 5 A 8 9 38004 CASAVA_Build 1 19505694 1I CTTTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 27 0 21 6 T 10 11 38005 CASAVA_Build 1 19509526 1D CACCTATAAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 774 hom 21 2 15 6 C 3 2 38006 CASAVA_Build 1 19521967 1I TTAAAGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 853 hom 43 3 34 6 T 14 15 38007 CASAVA_Build 1 19527254 3D ATGGCCTTTG TTT/--- TAATATTTGT 3070 hom 84 het 30 0 27 3 T 4 1 38008 CASAVA_Build 1 19534663 1D TCAAACAAAC A/- AACAACAACA 1081 het 222 hom 32 2 7 23 A 3 2 38009 CASAVA_Build 1 19549693 6I AGTAGCAGTA ------/AAAGTT ATTGTTTTTA 3070 hom 74 het 32 0 24 8 AAAGTT 0 1 38010 CASAVA_Build 1 19550038 4D TGTAAAACAG TTTT/---- TTGTTTCTAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 6 2 38011 CASAVA_Build 1 19555397 7I GAGACGGCAA -------/ACAGGGC ACAGGGCCAA 3070 hom 110 het 43 0 34 9 ACAGGGC 1 2 38012 CASAVA_Build 1 19556345 5I GACTACTGCA -----/ATCTT GACTTATCTT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 ATCTT 0 1 38013 CASAVA_Build 1 19565137 2I AAGATTCCAC --/GA GAGTCTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GA 1 2 38014 CASAVA_Build 1 19586163 13I CGCACTATGG -------------/TAGGCCCTTTACA TAGAGCATAT 3070 hom 99 het 34 0 33 3 TAGGCCCTTTACA 0 1 38015 CASAVA_Build 1 19590153 1I AACTGAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 11 12 38016 CASAVA_Build 1 19590549 5D GGGTGCACTC AGAGG/----- AAACTGCCAC 3070 hom 110 het 42 0 36 8 AGAGG 1 0 38017 CASAVA_Build 1 19591261 20D GAGACTCTGT CTCAAGGTAAAAAAAAAAAA/-------------------- AAAAAAAGAG 3070 hom 49 het 14 0 12 8 CTCAAGGTAAAAAAAAAAAA 1 0 38018 CASAVA_Build 1 19596163 2D CCAAAGACAC TG/-- TAATTTCACA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 1 0 38019 CASAVA_Build 1 19596911 1I TAAGAATGCA -/G GGGGGAAGCC 3070 hom 99 het 38 0 32 6 G 5 6 38020 CASAVA_Build 1 19597300 40D GGTGAGCCAC AGTCATCCTGCCACACCTGCTCAGTCTCCCGATGAGCCAG/---------------------------------------- GCGAGGTGCT 3070 hom 54 het 16 0 18 4 AGTCATCCTGCCACACCTGCTCAGTCTCCCGATGAGCCAG 1 0 38021 CASAVA_Build 1 19600600 1D CTGTCTTTTG C/- CACCTTTTCA 3070 hom 107 het 42 0 34 9 C 2 1 38022 CASAVA_Build 1 19601786 1D AGGGTGGGCC A/- CGGTGTCCTC 3070 hom 115 het 40 0 37 3 A 1 0 38023 CASAVA_Build 1 19602142 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 9 10 38024 CASAVA_Build 1 19612685 12D AAAGTGCTGG GATTATAAGTGT/------------ GAGCCACCAG 3070 hom 69 het 23 0 23 1 GATTATAAGTGT 1 0 38025 CASAVA_Build 1 19621811 12D CCATCTCAAA AACAACAACAAC/------------ AACAACAACA 3070 hom 42 het 14 0 15 2 AAC 10 6 38026 CASAVA_Build 1 19621934 2D GCAAATTAAG AT/-- ATAAGTAAGC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AT 2 1 38027 CASAVA_Build 1 19622133 1I CACCCCGCAA -/G GGGGCCGGAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 4 5 38028 CASAVA_Build 1 19630667 1D CTGGGCGTGG T/- GGCGGGCGCC 2002 hom 12 het 8 0 5 3 T 1 0 38029 CASAVA_Build 1 19630802 14D ACTCCGTCTC AAAAAATAAAAAAT/-------------- AAAAAATAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AAAAAAT 4 2 38030 CASAVA_Build 1 19633632 1I AGAGTAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 17 0 9 8 T 12 13 38031 CASAVA_Build 1 19635753 2D CCCCATAGCT AA/-- GGAGGGACAA 3070 hom 126 het 45 0 42 3 A 2 0 38032 CASAVA_Build 1 19641225 3D TCAATGAGCC TGT/--- TACATTATTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TGT 1 0 38033 CASAVA_Build 1 19643243 1I CGTCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 19 0 14 5 A 11 12 38034 CASAVA_Build 1 19644448 1D TTTGAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 37 1 27 9 T 12 11 38035 CASAVA_Build 1 19646468 4D ATCCAGCTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1451 het 20 hom 11 1 5 5 T 20 16 38036 CASAVA_Build 1 19649282 5D AAAATGTAGT AATAC/----- AATACATGGA 3070 hom 48 het 20 0 17 4 AATAC 2 1 38037 CASAVA_Build 1 19649738 1D GTTCCAGAGA C/- CCAGGTGAAT 3070 hom 111 het 43 0 35 10 C 3 2 38038 CASAVA_Build 1 19650824 5D TAATGTGTCC TCTAA/----- TCTATTTATT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 TCTAA 1 0 38039 CASAVA_Build 1 19652999 3I TTTTACAGAT ---/GAA GAAAATGAGG 3070 hom 102 het 46 0 34 12 GAA 1 2 38040 CASAVA_Build 1 19661378 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 945 hom 10 het 4 0 4 0 A 12 10 38041 CASAVA_Build 1 19670649 10I CTGTTACGTC ----------/GAGAAATGCT GAGAAATGCT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 GAGAAATGCT 1 2 38042 CASAVA_Build 1 19670947 31D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 20 1 12 13 A 43 12 38043 CASAVA_Build 1 19682294 3I GCAATAAATA ---/CTG CTGCTCCTCC 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 CTG 1 2 38044 CASAVA_Build 1 19685576 1I GTTTGAACCC -/G GGGGGCAGAG 3070 hom 47 het 17 0 16 1 G 5 6 38045 CASAVA_Build 1 19686346 2I CGAAACCCCG --/TC TCTACTAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TC 1 2 38046 CASAVA_Build 1 19686498 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAATTA 2063 het 606 hom 8 2 5 1 A 7 8 38047 CASAVA_Build 1 19687305 1I GATGCTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 33 0 27 6 T 10 11 38048 CASAVA_Build 1 19708304 2I AGGAGGTCTC --/AG AGTTATTTTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 1 2 38049 CASAVA_Build 1 19708847 1I ACACAAGCCT -/G GCCAACATAG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 G 1 2 38050 CASAVA_Build 1 19726217 1I ATTTTGGTAT -/A TATAGCATAC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 0 1 38051 CASAVA_Build 1 19729532 15I GCTGATGTCA ---------------/TGATCTTGGACTTTC CAGCCACTGG 3070 hom 117 het 41 0 39 2 TGATCTTGGACTTTC 0 1 38052 CASAVA_Build 1 19731235 2D CATATATGAC TT/-- TTTTTTTTTT 1488 het 631 hom 28 2 6 20 T 14 12 38053 CASAVA_Build 1 19732489 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2046 het 300 hom 20 1 11 8 A 12 14 38054 CASAVA_Build 1 19745983 1I TCTTTGGATA -/T TTGCAAAATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 3 38055 CASAVA_Build 1 19746989 1D TTATCATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 25 2 16 7 A 13 12 38056 CASAVA_Build 1 19750809 1D ACTACATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 18 17 38057 CASAVA_Build 1 19759525 1D AACTCCACCT A/- AAAAAAAAAA 1422 het 1422 ref 28 12 6 10 A 15 14 38058 CASAVA_Build 1 19760396 1D ACAAAAAAAA C/- AAAAGTGACT 3070 hom 4 het 18 1 10 8 C 1 0 38059 CASAVA_Build 1 19763817 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 143 hom 24 1 16 7 T 12 11 38060 CASAVA_Build 1 19768247 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 12 11 38061 CASAVA_Build 1 19772996 1D CTCTGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 43 7 28 8 A 17 16 38062 CASAVA_Build 1 19794464 1D CATTGACAGC T/- TTTTTTTTTT 1238 het 1238 ref 39 22 3 15 T 13 12 38063 CASAVA_Build 1 19807706 1I AAAAATAAAT -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 8 38064 CASAVA_Build 1 19814659 1I AACACTTTCC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 T 7 8 38065 CASAVA_Build 1 19850372 1I GGCCCCAGCG -/C CCTGCGGAGA 3070 hom 84 het 31 0 24 7 C 2 3 38066 CASAVA_Build 1 19856688 1I GAGGCTCCGG -/C CCCACAGGTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 3 4 38067 CASAVA_Build 1 19858871 2D CTGCAAAGCT GA/-- GTTTCAGGAG 3070 hom 80 het 32 0 24 9 GA 1 0 38068 CASAVA_Build 1 19884412 4I TCTCCAGAAA ----/AAAC AAACAAACAG 3070 hom 123 het 49 0 41 8 AAAC 2 3 38069 CASAVA_Build 1 19886036 2D TTTTTCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 31 0 26 7 T 14 12 38070 CASAVA_Build 1 19899622 3D CACAGAAACA TCT/--- TCTCAGAATC 3070 het 2700 hom 24 7 11 6 TCT 2 1 38071 CASAVA_Build 1 19900285 1D GAGTCTCACT C/- TGTTGCCCCG 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 C 1 0 38072 CASAVA_Build 1 19901910 1D AATAGAGAAG C/- CAACATGTCT 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 C 2 1 38073 CASAVA_Build 1 19907346 1D ATTTAGATAA T/- TTCTGTTTCT 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 T 3 2 38074 CASAVA_Build 1 19908370 1I TCCCGGCGGG -/T GGGGGGGGAC 3070 het 150 hom 25 1 14 10 T 0 1 38075 CASAVA_Build 1 19911700 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1794 het 174 hom 16 4 8 4 A 15 16 38076 CASAVA_Build 1 19956524 1D TTGCATTAGG C/- CTATCTGGAA 3070 het 3070 hom 59 27 27 6 C 2 1 38077 CASAVA_Build 1 19964529 8D TTGGCAACCT AGAGGACA/-------- TTGGAGCCAT 3070 het 3070 hom 58 27 33 0 AGAGGACA 1 0 38078 CASAVA_Build 1 19978127 4D CAGTCCAGTG GACA/---- GACAAAGACA 3056 het 3056 ref 33 19 9 6 GACA 2 1 38079 CASAVA_Build 1 20014470 1D CAAAGTGGGC A/- AGGGTCTAGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 1 38080 CASAVA_Build 1 20018587 1D TTTTAATTGC T/- GTACAAATAT 3070 het 3070 hom 34 12 20 3 T 1 0 38081 CASAVA_Build 1 20024759 1I TGTCCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 10 11 38082 CASAVA_Build 1 20028027 1I CTGTTTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2994 hom 42 11 17 14 T 15 16 38083 CASAVA_Build 1 20033669 3D TCCCAGCTAC TCG/--- GGGGGCTGAG 1581 het 1581 ref 8 4 4 0 TCG 1 0 38084 CASAVA_Build 1 20039121 1D TAAATAAATT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 A 9 8 38085 CASAVA_Build 1 20047087 5D TTGACAAAAT ATTTG/----- ATTTAAGTGC 3070 het 3070 ref 40 26 12 4 ATTTG 1 0 38086 CASAVA_Build 1 20051668 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1060 het 1060 ref 21 7 3 11 T 14 12 38087 CASAVA_Build 1 20056745 1I TGTGTGAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 9 10 38088 CASAVA_Build 1 20062334 1I GGAAAGTGAT -/A AAAAAGTGAT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 A 5 6 38089 CASAVA_Build 1 20075895 1D CTAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 10 9 38090 CASAVA_Build 1 20086163 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1968 het 1968 ref 23 10 6 7 T 16 15 38091 CASAVA_Build 1 20086797 1D CACGTCCCCC T/- GAGCCTTCTT 3070 het 3070 hom 51 22 25 4 T 1 0 38092 CASAVA_Build 1 20088371 1I CCTCCCCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 11 14 A 13 14 38093 CASAVA_Build 1 20093603 8D TCTTATTTCT AAGTCAGC/-------- TTTGGGAATA 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 AAGTCAGC 1 0 38094 CASAVA_Build 1 20095451 2D TCTATTCATA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 35 het 16 0 12 5 AT 7 6 38095 CASAVA_Build 1 20127203 2I TTCTGTGATG --/AT ATATGAATGG 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 AT 2 3 38096 CASAVA_Build 1 20127471 1D AGTCTCTCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 13 12 4 T 10 9 38097 CASAVA_Build 1 20128961 2I TTGTGGAATT --/TC TACAACAGCA 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 TC 0 1 38098 CASAVA_Build 1 20129106 1I GTGACATCCA -/T TTTGTCAGAT 3070 het 3070 hom 62 27 29 6 T 3 4 38099 CASAVA_Build 1 20130078 2I CATCACTATC --/TG TTGTTCTGTT 3070 het 3070 hom 59 23 27 9 TG 0 1 38100 CASAVA_Build 1 20132027 10D37M1I CATCACCATT ATCATCATTATCACCATCACCATTATCACCATCATAATCATCATGAA-/----------GCACCATCACCATTATCATCATCATAATCACCATCAAC ATTACCGTAA 959 het 959 ref 37 67 3 2 N/A 0 0 38101 CASAVA_Build 1 20137578 1I TTTATGGCTG -/T GTAGTATTTC 3070 het 3070 hom 40 12 27 1 T 0 1 38102 CASAVA_Build 1 20141777 1I TTTTCTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 A 11 12 38103 CASAVA_Build 1 20142351 1I TCTTTGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 12 13 38104 CASAVA_Build 1 20143196 2D CAATGAGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 10 T 12 10 38105 CASAVA_Build 1 20145533 1I GTACGTGGGA -/G GGGGGTCTGA 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 G 5 6 38106 CASAVA_Build 1 20149749 2I CTTCTCAAAC --/TT TTTTTTTTTT 1753 hom 30 het 15 0 10 5 T 15 17 38107 CASAVA_Build 1 20149921 1D GATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 10 9 38108 CASAVA_Build 1 20165692 5D ATTTGGACAC TTTTA/----- TTTTATTTTA 2436 het 2436 ref 21 8 7 6 TTTTA 3 2 38109 CASAVA_Build 1 20171622 1I ACAAAACATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 2501 hom 32 8 19 5 A 8 9 38110 CASAVA_Build 1 20179856 1D TCTGGGGTGT A/- AGAATCATGG 3070 het 3070 hom 46 18 26 3 A 2 1 38111 CASAVA_Build 1 20181802 2D GTTGTTTTCG TT/-- TTTTTTTTTT 1723 het 493 hom 22 4 7 11 T 16 14 38112 CASAVA_Build 1 20196434 1I AGAAGAGAAA -/T TTAAAGAAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 2 3 38113 CASAVA_Build 1 20216253 1I CCAGGTATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 8 9 38114 CASAVA_Build 1 20220884 2I AAAATAACAC --/TT TGTCAATTAT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 1 3 38115 CASAVA_Build 1 20230778 1D TGGATGTAAA T/- TTGGTGCTCT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 3 2 38116 CASAVA_Build 1 20239159 4D GAATATCATT AAAC/---- AAACAAACAC 3070 het 3070 ref 43 23 15 7 AAAC 3 2 38117 CASAVA_Build 1 20243450 1I TTCCTGTTGT -/G GGGGGGGGTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 G 8 9 38118 CASAVA_Build 1 20248518 1I GAGCTTTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 8 9 38119 CASAVA_Build 1 20249944 9D TAATTAATTC TTTAAGATA/--------- TTAGATTCCC 3070 het 3070 ref 36 20 13 5 TTTAAGATA 1 0 38120 CASAVA_Build 1 20266084 1I AGACCTTGTC -/T TTTTTTTTCT 2241 het 2241 ref 22 11 6 5 T 8 9 38121 CASAVA_Build 1 20277441 1D AGGCAAGGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 9 8 38122 CASAVA_Build 1 20287551 1D CAATTATGGC T/- TTTTTTTTTT 714 het 714 ref 32 22 2 8 T 12 11 38123 CASAVA_Build 1 20294316 2I CCTGTTAGAG --/AA AGACAGTGGA 3070 het 3070 ref 60 26 22 12 A 1 3 38124 CASAVA_Build 1 20297946 1D GGAAGACTGG C/- CCCCCAGGAC 3070 het 2323 hom 26 6 12 10 C 6 5 38125 CASAVA_Build 1 20300117 1I CCCTACCCCA -/C CGGCAAAATC 3070 hom 93 het 44 0 35 9 C 1 2 38126 CASAVA_Build 1 20330993 2D CAATGGGTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 TG 7 6 38127 CASAVA_Build 1 20357098 4D CAAATGGTAG ACTA/---- ACTAAGTACC 3070 hom 133 het 48 0 42 7 ACTA 2 1 38128 CASAVA_Build 1 20359448 1D AAAAGATCAA C/- CCCCCACTCT 3070 hom 135 het 49 0 44 5 C 6 5 38129 CASAVA_Build 1 20386587 1I TCCCCCACCG -/C CCCATCCCTG 3070 hom 86 het 32 0 25 7 C 3 4 38130 CASAVA_Build 1 20393173 1D AAGTCAGTGG C/- TATAGCTTTA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 C 1 0 38131 CASAVA_Build 1 20404149 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1693 het 25 hom 16 1 8 7 A 16 14 38132 CASAVA_Build 1 20412687 1I ATCTTAATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 9 10 38133 CASAVA_Build 1 20413270 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2306 hom 22 6 9 7 A 13 12 38134 CASAVA_Build 1 20414963 11D7M4I2M4D CTCTGCAATG TTATATGAAAACATTCCA----TGCAAC/-----------GATTCCAGATTTG---- CCCAGATTCC 3070 het 3070 hom 46 22 29 5 N/A 0 0 38135 CASAVA_Build 1 20418693 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAACGC 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 A 7 8 38136 CASAVA_Build 1 20418829 3I AGTAATCCTG ---/AGA AGAATTTCTT 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 AGA 1 2 38137 CASAVA_Build 1 20420617 1I ACTCTTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2762 het 2762 ref 37 17 9 11 A 11 12 38138 CASAVA_Build 1 20424907 1I CTTGGCTTCT -/G GGGGAAGCCT 3070 het 2953 hom 30 8 14 8 G 4 5 38139 CASAVA_Build 1 20427552 1D GGAGTGCAAC G/- GCCGCAGGAG 3070 het 2755 hom 32 9 17 6 G 2 1 38140 CASAVA_Build 1 20434734 1I AGAATGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 11 15 10 T 10 11 38141 CASAVA_Build 1 20437630 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 999 hom 7 het 5 0 3 2 A 10 11 38142 CASAVA_Build 1 20451487 1D TCGTGCCCAT C/- CCCCCCCCCC 2511 het 194 hom 24 3 11 10 C 12 11 38143 CASAVA_Build 1 20458181 45D GACTGGGCAG CATGGAAGGGCTCCAGCAGGGCAGTTGGAGGTCGCTGTTGCTGCT/--------------------------------------------- CTTGTTATAG 3070 het 3070 ref 38 31 18 6 CATGGAAGGGCTCCAGCAGGGCAGTTGGAGGTCGCTGTTGCTGCT 1 0 38144 CASAVA_Build 1 20461573 3I TTCTCTTTCC ---/TTT TTTTTTTTTT 365 het 365 ref 15 10 2 3 T 12 15 38145 CASAVA_Build 1 20466978 1I AGCTATCCCT -/C CCCCCTCCCC 1138 hom 10 het 4 0 4 0 C 5 6 38146 CASAVA_Build 1 20467193 1I TGTGAACCCT -/C CCCCCTGCAG 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 C 5 6 38147 CASAVA_Build 1 20474422 2D AAAAAAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 2266 het 2266 ref 21 9 9 3 A 12 10 38148 CASAVA_Build 1 20485721 1D GAAAGAGCCA C/- CCCTAGGCCC 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 C 4 3 38149 CASAVA_Build 1 20486621 1I TGTTCAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 11 13 T 11 12 38150 CASAVA_Build 1 20490568 2I TCTGTGTGAG --/TC TCTGCGTCTC 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 TC 1 2 38151 CASAVA_Build 1 20497077 6D CGGTGGTGGA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2779 het 1911 hom 26 11 8 9 T 22 16 38152 CASAVA_Build 1 20506891 1D TCTGACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 14 13 38153 CASAVA_Build 1 20560678 5I GAAGGCGGCA -----/CACGT CACGTCCTCT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 CACGT 1 2 38154 CASAVA_Build 1 20581548 6D7M3D GTTGGTAGTA ATAGTGATGGTGGTAA/------ATGGTGG--- TGATTGTGGT 2780 het 2780 ref 46 18 22 16 N/A 0 0 38155 CASAVA_Build 1 20608592 1I GGATGGGGAG -/C TTTTTCTGGG 3070 hom 94 het 35 0 31 4 C 0 1 38156 CASAVA_Build 1 20627216 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 26 0 24 3 A 10 9 38157 CASAVA_Build 1 20658621 3I CCTTTCTCAC ---/TCT TCTTCTCTCC 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TCT 2 3 38158 CASAVA_Build 1 20670159 1I TTCTCCCAAT -/G GCTCTCTGAG 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 G 1 2 38159 CASAVA_Build 1 20691505 1D CAGATCTGGG T/- CAGACCTGTG 3070 het 3070 ref 35 14 12 10 T 1 0 38160 CASAVA_Build 1 20702955 1D CCATTCTACA T/- TTTTTTTTTT 1003 het 1003 ref 31 22 3 6 T 15 14 38161 CASAVA_Build 1 20727821 1D TTACCTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 28 3 A 13 12 38162 CASAVA_Build 1 20753457 1I TTCCCTGTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2033 hom 20 6 11 3 A 9 10 38163 CASAVA_Build 1 20759013 1D AATTAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 13 0 11 2 T 12 11 38164 CASAVA_Build 1 20766859 1D CATTATTGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 T 9 8 38165 CASAVA_Build 1 20776658 1D CACACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2564 het 387 hom 28 4 12 13 T 15 14 38166 CASAVA_Build 1 20780488 5D GAAAATTTAG ATGAA/----- ATGAACAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 3 ATGAA 2 1 38167 CASAVA_Build 1 20781936 4D ATTGCCCATC CATA/---- CATATCCTTT 3070 hom 123 het 47 0 41 7 CATA 2 1 38168 CASAVA_Build 1 20782656 1D CGAGGTGGGC G/- GGATCACGAG 2364 hom 23 het 9 0 7 2 G 3 2 38169 CASAVA_Build 1 20785873 1I GTAAAAATAG -/A AAAAAATTAC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 6 7 38170 CASAVA_Build 1 20786020 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 48 het 22 0 16 7 CT 1 2 38171 CASAVA_Build 1 20786193 58D CAGCACTGTG GAGTCAAGGAGTCCTGAAGGCCGGTCCCAGGCCTGGGCAGGGCTGGGTGGGGCAGACT/---------------------------------------------------------- GAGACAGGGC 3070 het 3070 ref 26 25 13 4 GAGTCAAGGAGTCCTGAAGGCCGGTCCCAGGCCTGGGCAGGGCTGGGTGGGGCAGACT 1 0 38172 CASAVA_Build 1 20788177 1D GCTCCTGTTT C/- CCGCTGCTCT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 C 3 2 38173 CASAVA_Build 1 20794431 1D CCTCAAACCA C/- CCCCTGCTGT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 C 5 4 38174 CASAVA_Build 1 20799834 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 473 hom 26 2 14 11 A 16 15 38175 CASAVA_Build 1 20803130 1D TTTTTTGTTT G/- TTTGTTAATT 3070 hom 85 het 32 0 27 5 G 1 0 38176 CASAVA_Build 1 20809123 4D ACTTGACGCA TGGT/---- TGGTTGGTTG 3070 hom 103 het 46 0 35 12 TGGT 4 3 38177 CASAVA_Build 1 20816896 3D TGCCTCAAGC CTT/--- CTGAGTAGCT 3070 hom 27 het 12 0 9 3 CTT 1 0 38178 CASAVA_Build 1 20822735 2I6M1I CATGGCTAAT --TTTGTA-/TGTTTGTAT TTTTTAGTAG 3070 het 348 hom 12 1 11 0 N/A 0 0 38179 CASAVA_Build 1 20829612 1D AATGTTGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 32 0 24 8 A 13 12 38180 CASAVA_Build 1 20837727 2I GTCTCAAAAC --/AA AAAACAAACA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 4 6 38181 CASAVA_Build 1 20843058 2D TAAAGATAAC TA/-- ATAAAATAGA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 TA 1 0 38182 CASAVA_Build 1 20845943 4D TTATTATTTC TTTA/---- TTTATTTACT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TTTA 3 2 38183 CASAVA_Build 1 20846899 2I ACAAATAACC --/AT AATTCTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AT 0 1 38184 CASAVA_Build 1 20850442 3I TTAAGAATGA ---/TTC TTCTTATACT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TTC 1 2 38185 CASAVA_Build 1 20850714 3I57M4I TAGGGAGAAC ---CATCATTTCACAGTTAAAAGAAAGACAGTCCAGTCCTAGGCAAAATTTCATGAAGCC----/CATCATCATTTCACAGTTAAAAGAAAGACAGTCCAGTCCTAGGCAAAATTTCATGAAGCCACTT ACTTAGGATT 3070 hom 87 het 27 0 25 28 N/A 0 0 38186 CASAVA_Build 1 20851895 1I CCTGGGGCCG -/T TTTCTGGCAG 3070 hom 99 het 39 0 32 7 T 3 4 38187 CASAVA_Build 1 20854248 4D CCAACTTTTT TTTG/---- TTTTTTTTTT 2779 hom 24 het 10 0 9 1 TTTG 1 0 38188 CASAVA_Build 1 20857073 1I GCAGAGGCCC -/G GGGTGCTGTT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 G 3 4 38189 CASAVA_Build 1 20883861 1I ACCGTGGGGT -/C CCCGCCAGCC 3070 het 935 hom 27 6 13 8 C 3 4 38190 CASAVA_Build 1 20884210 4I CTGCAGCCCC ----/GACA GACAGATCAC 2844 het 2844 ref 26 14 9 3 GACA 1 2 38191 CASAVA_Build 1 20885400 1I GAGAGGAAAC -/G GGAAGACAGG 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 G 2 3 38192 CASAVA_Build 1 20885582 2D CACACAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 70 het 35 0 23 14 AC 8 7 38193 CASAVA_Build 1 20888743 1D AACAAAGAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 9 8 38194 CASAVA_Build 1 20891422 1D CCTCTATTGC T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 41 27 3 11 T 11 10 38195 CASAVA_Build 1 20893510 1D CAACATATTC A/- GGCCTCTGAC 3070 het 3070 ref 42 25 13 6 A 1 0 38196 CASAVA_Build 1 20896523 1I CTATCTCTAC -/A AAAAAAATTT 3070 hom 72 het 28 0 25 6 A 7 8 38197 CASAVA_Build 1 20902265 8I ATGAATGGAT --------/GAATGGAC GGACGGATGG 3070 het 3070 ref 50 27 15 8 GAATGGAC 0 1 38198 CASAVA_Build 1 20903011 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1898 het 1898 ref 25 12 9 5 A 13 12 38199 CASAVA_Build 1 20905803 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 8 9 38200 CASAVA_Build 1 20906549 1I CATTCACAGG -/A AAAAAAGGAT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 6 7 38201 CASAVA_Build 1 20909179 2D ATGAGACAGC TA/-- TCTCATAGGA 3070 hom 109 het 40 0 37 4 TA 1 0 38202 CASAVA_Build 1 20910185 1I TAAGCCTCAA -/T TTTTCTCTTC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 4 5 38203 CASAVA_Build 1 20927247 1D CATTCACTGG C/- TTCCTGAGCA 2866 het 1194 hom 23 7 8 8 C 1 0 38204 CASAVA_Build 1 20937081 4D TTTTTACAAA GTTT/---- GTTACCACAG 3070 het 3070 hom 39 13 23 4 GTTT 1 0 38205 CASAVA_Build 1 20946581 1I TGTGTAACTT -/A AGACTATAAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 1 2 38206 CASAVA_Build 1 20950378 1D TTTTTTATGA T/- TTTTTTTTTT 1876 het 1876 ref 28 17 5 6 T 12 11 38207 CASAVA_Build 1 20953551 1I GTTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2419 het 2101 hom 25 7 8 10 T 12 13 38208 CASAVA_Build 1 20960622 4I4M2D GTGGGGATCA ----TTAAAT/AGAGTTCA-- GTTTTCAACA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 N/A 0 0 38209 CASAVA_Build 1 20974071 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1955 het 1955 ref 22 12 5 5 A 15 14 38210 CASAVA_Build 1 20977240 6I GACTTATAAA ------/TTTAAT TTTACATTAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TTTAAT 0 1 38211 CASAVA_Build 1 20985177 1D GTCTCCGTAC G/- GGAGACAACT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 G 3 2 38212 CASAVA_Build 1 21002623 4I TATAAAGAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 AAAC 2 3 38213 CASAVA_Build 1 21010930 13D TGAGTATTTA AAAAAAGCAACAT/------------- AAAAAAGCAA 3070 hom 90 het 37 0 31 9 AAAAAAGCAACAT 2 1 38214 CASAVA_Build 1 21018801 4D TCAGGAAAAA TAAC/---- TAATAGGTAC 3070 het 3070 ref 31 16 13 6 TAAC 1 0 38215 CASAVA_Build 1 21024493 1D AGGAGTATGA G/- GTCTGGCCCA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 2 1 38216 CASAVA_Build 1 21034142 1D TTGAACTCAG T/- TAACAGGAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 1 38217 CASAVA_Build 1 21062848 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 54 het 22 0 19 6 AG 8 6 38218 CASAVA_Build 1 21064998 1D TAATTGTTTT C/- TAATAGTTGT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 C 1 0 38219 CASAVA_Build 1 21069173 1I AACACATTAT -/A AAAATCTTCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 4 5 38220 CASAVA_Build 1 21071377 2D TTTTTCACAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 9 T 13 11 38221 CASAVA_Build 1 21072694 1I TAAAATGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 75 hom 27 1 19 7 T 9 10 38222 CASAVA_Build 1 21072803 1D TTTTTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 2850 hom 52 het 26 0 15 11 A 15 14 38223 CASAVA_Build 1 21074204 1I GACTACAGGT -/G GGACTACTAT 3070 hom 129 het 49 0 42 7 G 2 3 38224 CASAVA_Build 1 21075524 1D TTTATTAAGT A/- AAAAAAAAAA 1951 het 1951 ref 28 14 7 7 A 17 16 38225 CASAVA_Build 1 21086732 1D GATAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 42 1 37 4 A 12 11 38226 CASAVA_Build 1 21095040 3I CTGTTATAAT ---/AGG AGATGACAGC 3070 hom 69 het 25 0 24 2 AGG 0 1 38227 CASAVA_Build 1 21111506 1I TCTGAATTAC -/A AAAAAAGTCT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 6 7 38228 CASAVA_Build 1 21131004 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 20 2 16 3 A 13 12 38229 CASAVA_Build 1 21154319 1I TATTTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 902 hom 45 2 27 16 T 11 12 38230 CASAVA_Build 1 21162541 4D CCTGCTGACT TTAG/---- TAATTTTCCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTAG 1 0 38231 CASAVA_Build 1 21176171 1I AATATAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 21 1 17 3 A 10 11 38232 CASAVA_Build 1 21191433 2D TCAACTAGGA AT/-- ATATAACATC 3070 hom 111 het 46 0 38 9 AT 3 2 38233 CASAVA_Build 1 21196998 1D AGGATTATTT A/- AAAAAAAAAA 1291 het 1291 ref 41 24 4 13 A 15 14 38234 CASAVA_Build 1 21213828 1I AATTCTCCTG -/C CCCAGCCTCC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 3 4 38235 CASAVA_Build 1 21243718 1D ACTTCATTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 45 0 34 13 T 11 10 38236 CASAVA_Build 1 21250998 2D ATACATACAC AT/-- GTGTAGGAAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 AT 1 0 38237 CASAVA_Build 1 21253412 8I ACAAACACTG --------/CGGAAGGC CGGAAGGCCG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CGGAAGGC 1 2 38238 CASAVA_Build 1 21259251 1I GGCTGGTCTT -/A AACTTCTAGG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 2 3 38239 CASAVA_Build 1 21265375 1D CTCCTGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 16 0 10 7 A 13 12 38240 CASAVA_Build 1 21309812 1I ACGCCCAGCC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 7 8 38241 CASAVA_Build 1 21336135 4D TTTCCTGTTT TTCC/---- CTTTTTACTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTCC 1 0 38242 CASAVA_Build 1 21336229 1I TTGTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2105 hom 29 8 13 8 T 12 13 38243 CASAVA_Build 1 21344415 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 8 9 38244 CASAVA_Build 1 21350801 1D TGTATTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 11 10 38245 CASAVA_Build 1 21361829 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 8 38246 CASAVA_Build 1 21385325 1D TTTGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1589 het 917 hom 21 5 6 10 T 19 18 38247 CASAVA_Build 1 21448613 1D CCATCTTTAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 9 8 38248 CASAVA_Build 1 21456866 1D GTCCACGTGG C/- CCCCCCCCGC 1917 het 1388 hom 27 12 7 8 C 9 8 38249 CASAVA_Build 1 21475451 1I GAAAGGCCTT -/A ATTCAGCACT 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 A 1 2 38250 CASAVA_Build 1 21509091 1I AGGATGGTCT -/C CGATCTCCTG 1073 het 1073 ref 9 5 3 1 C 1 2 38251 CASAVA_Build 1 21511526 1D CTCAAAAAAA T/- AATTTTAAAA 2886 het 2815 hom 19 7 9 3 T 1 0 38252 CASAVA_Build 1 21519496 1I AGAAATAAGC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 T 5 6 38253 CASAVA_Build 1 21540023 1I TGCACCCTCC -/G GGGCCACCTC 3070 het 1225 hom 23 5 11 7 G 3 4 38254 CASAVA_Build 1 21549041 1D ACAGTTCTAA T/- TAACATTCCC 3070 het 3070 ref 48 18 18 13 T 2 1 38255 CASAVA_Build 1 21560164 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 A 10 11 38256 CASAVA_Build 1 21560604 3I GAATCTGGTT ---/CCA CCAAGATTTT 3070 hom 86 het 35 0 29 6 CCA 1 2 38257 CASAVA_Build 1 21567477 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 21 8 A 13 12 38258 CASAVA_Build 1 21573862 7I TCTGCCTCCT -------/GCCTCCC GCCTCCCGAG 3070 het 2543 hom 16 6 10 0 GCCTCCC 1 2 38259 CASAVA_Build 1 21579114 1I AATATTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 13 14 38260 CASAVA_Build 1 21579199 1D AGCTCCACTC A/- TGGGTTCATG 3070 hom 42 het 16 0 15 3 A 1 0 38261 CASAVA_Build 1 21589870 4I TTAGGAAGGT ----/AAGA AAGAGTCCTT 3070 hom 104 het 40 0 33 7 AAGA 1 2 38262 CASAVA_Build 1 21607894 2D GTCTCTCTCC CT/-- CTCTCTTTCA 3070 hom 72 het 25 0 25 1 CT 4 3 38263 CASAVA_Build 1 21620251 2D AATCTTCACG AC/-- ACAGTTAGGC 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 AC 2 1 38264 CASAVA_Build 1 21622258 1D GGCAGAGAAT G/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 G 1 0 38265 CASAVA_Build 1 21622787 1I TAAAGAAATG -/T AGCTACATTA 3070 het 3070 ref 48 32 9 7 T 0 1 38266 CASAVA_Build 1 21623965 3I GACAAAACTA ---/AAG AAGCAGCCAG 3070 het 3070 ref 49 29 15 5 AAG 1 2 38267 CASAVA_Build 1 21625672 8D TGAAAGAGAA AGACAGAG/-------- AGACAGAGAG 1390 het 1390 ref 57 47 5 10 AGACAGAG 3 2 38268 CASAVA_Build 1 21626431 3D TGCTCCCATC GGT/--- ACCCCAAAGA 2293 hom 12 het 5 0 5 0 GGT 1 0 38269 CASAVA_Build 1 21628746 1I CTGCGTCCTG -/A AAAAAAAACA 2803 hom 24 het 17 0 8 9 A 8 9 38270 CASAVA_Build 1 21629417 8I GGCATGCTGC --------/CACTTGTG CACTTGTGCG 3070 hom 52 het 20 0 15 5 CACTTGTG 1 2 38271 CASAVA_Build 1 21631160 1D GATTCTTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 25 het 27 1 22 4 A 10 9 38272 CASAVA_Build 1 21634099 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 20 5 A 11 10 38273 CASAVA_Build 1 21638570 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 30 0 19 11 A 11 10 38274 CASAVA_Build 1 21649238 1I GCTGGCTGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 8 9 38275 CASAVA_Build 1 21649831 1I CCAGGTGTGG -/A TGAGGCTTCT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 0 1 38276 CASAVA_Build 1 21657446 1D GGGCATGGGC T/- TTTTTTTTTT 2303 het 2189 hom 33 11 6 16 T 17 16 38277 CASAVA_Build 1 21660333 64D CAGAAATAAT TATATGAGAATATTCATAGTTACTTACGCACAGTAGCCAACAAGTAAACCTGTCTCCCGTCAGA/---------------------------------------------------------------- AAAATGGATA 3070 hom 48 het 17 0 17 3 TATATGAGAATATTCATAGTTACTTACGCACAGTAGCCAACAAGTAAACCTGTCTCCCGTCAGA 1 0 38278 CASAVA_Build 1 21661489 1I TGCCTTTAGG -/T TTTTTTGCAG 2873 het 2873 ref 35 23 6 7 T 6 7 38279 CASAVA_Build 1 21662148 4D ACAGTAAAAA TAAT/---- TAGAGAGGAC 3070 het 3070 ref 45 30 12 4 TAAT 1 0 38280 CASAVA_Build 1 21662329 1I CTCAGAGAGG -/C TCTCGACTTC 3070 het 3070 ref 54 30 15 9 C 0 1 38281 CASAVA_Build 1 21662470 1I CACAGGCCAT -/G GGATGCTCCA 3070 het 3070 ref 45 24 14 8 G 2 3 38282 CASAVA_Build 1 21662675 4I AACAACCGAA ----/AAAT AAATAGATAA 3070 het 3070 ref 53 33 15 5 AAAT 1 2 38283 CASAVA_Build 1 21662867 1I AACAATGGGG -/A AAAAAAGCTG 3070 het 3070 ref 63 40 13 10 A 6 7 38284 CASAVA_Build 1 21663153 1I20M2D AAACATAAAA -AAAGTTAAACATAAAGTGACAT/GAAAGTTAAACATAAAGTGAC-- ATGATGCAGC 3070 het 3070 ref 39 38 7 5 N/A 0 0 38285 CASAVA_Build 1 21663367 1I ATCTGGCCAT -/A AAAAAGTTGA 3070 het 3070 ref 42 30 7 7 A 5 6 38286 CASAVA_Build 1 21663775 2D TATTTTCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 70 1 57 14 A 12 10 38287 CASAVA_Build 1 21664211 1I TTTCCTTTTT -/C TCAGAAATGA 3070 het 3070 ref 72 35 26 11 C 0 1 38288 CASAVA_Build 1 21665290 1D TGGCGCTGAC A/- AGAGACAGAC 3070 hom 60 het 23 0 20 4 A 2 1 38289 CASAVA_Build 1 21668020 1I ATGAATGATG -/A TCCTGTCTTC 3070 het 2447 hom 24 6 15 3 A 0 1 38290 CASAVA_Build 1 21669105 2I AGAGTTAACA --/CT CTCTGTTAGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 CT 2 3 38291 CASAVA_Build 1 21670149 4D ACTCACCCTT AGTC/---- AGAATCAGCT 3070 het 3070 hom 40 19 20 3 AGTC 1 0 38292 CASAVA_Build 1 21675181 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 8 9 38293 CASAVA_Build 1 21679955 1D GTGGACTGTT A/- ATGGGTGTAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 2 1 38294 CASAVA_Build 1 21685503 4D GAAGGAAAGC TGGA/---- TGGATACCCA 3070 hom 66 het 28 0 23 7 TGGA 2 1 38295 CASAVA_Build 1 21690885 4D GTTCCAACTC CTGT/---- CTGTCCAACT 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 CTGT 2 1 38296 CASAVA_Build 1 21692012 1D TCTCTGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 12 11 38297 CASAVA_Build 1 21697229 1D CCCGTGGTTA G/- GGGGCCTAGG 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 G 5 4 38298 CASAVA_Build 1 21737826 14D CGGGGGCAGA GCCAGGTCTTGAAT/-------------- GCCAGGTCTT 2965 hom 39 het 17 0 10 9 GCCAGGTCTTGAAT 2 1 38299 CASAVA_Build 1 21739401 2D CTCCCTGCTG CT/-- TCTCTCCTGC 703 het 703 ref 34 17 5 12 CT 1 0 38300 CASAVA_Build 1 21748291 1D TTTTCTGTGA C/- CCCATTCCCT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 C 4 3 38301 CASAVA_Build 1 21748556 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2389 het 1955 hom 23 9 6 8 T 14 13 38302 CASAVA_Build 1 21750632 1D AAAGTAGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 16 8 A 11 10 38303 CASAVA_Build 1 21752156 5I TCAAAAAAAT -----/AAAAA AAAGAGGAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 3 8 38304 CASAVA_Build 1 21752231 1I TTCCTTCCAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 9 10 38305 CASAVA_Build 1 21773613 2I CGGTATGTAT --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 AC 4 5 38306 CASAVA_Build 1 21774371 3D AACAGGACTG ATC/--- ATATTCCTCT 3070 het 3070 ref 38 17 13 9 ATC 1 0 38307 CASAVA_Build 1 21781062 2I CATCATATTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 20 14 1 AT 7 8 38308 CASAVA_Build 1 21784998 1I CCTGTTTATC -/A AGAAGGAAGC 3070 hom 135 het 47 0 43 4 A 1 2 38309 CASAVA_Build 1 21791994 3D GATAAAGGGA CAC/--- CACAGAGACT 3070 hom 66 het 24 0 19 7 CAC 2 1 38310 CASAVA_Build 1 21795481 1D CATGGCGGTC G/- GGGGAGGCAA 2368 het 1602 hom 25 6 10 9 G 5 4 38311 CASAVA_Build 1 21800103 1I TCAGATACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 32 0 18 14 T 14 15 38312 CASAVA_Build 1 21800397 1D GGAGGTGTCT C/- CCCGAGGACC 3070 het 1945 hom 21 6 8 7 C 4 3 38313 CASAVA_Build 1 21802044 1D AGCCCCAGTG C/- CCCCCCCACA 3070 hom 43 het 23 0 13 10 C 8 7 38314 CASAVA_Build 1 21803424 1I GAGAGGGAGC -/A AAAAAAGACA 3070 hom 80 het 33 0 26 7 A 6 7 38315 CASAVA_Build 1 21806632 8D CTTCTGAGAA CTCTATTT/-------- CTTTCCCTCA 3070 hom 155 het 54 0 46 10 CTCTATTT 1 0 38316 CASAVA_Build 1 21814480 1I AAGCCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 10 11 38317 CASAVA_Build 1 21819633 1I CCCAGCACCT -/G TGCATGAGCC 3070 hom 90 het 34 0 28 6 G 0 1 38318 CASAVA_Build 1 21819933 4D AGCACGCACA CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 50 13 19 18 CT 9 7 38319 CASAVA_Build 1 21823924 2D CTATGGGCTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 71 het 31 0 20 14 CT 7 6 38320 CASAVA_Build 1 21830780 7D AAACAAAAAC AAAAACA/------- AAAAACAAAA 3070 het 1784 hom 14 5 9 2 AAAAACA 2 1 38321 CASAVA_Build 1 21831853 3I CAGTGGCTCA ---/GTG CACCTATAGT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 GTG 0 1 38322 CASAVA_Build 1 21836404 1D ATCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 21 0 11 10 T 12 11 38323 CASAVA_Build 1 21842200 3I TCTATTTTCT ---/CCA CCACCAAGTC 3070 hom 69 het 28 0 22 6 CCA 2 3 38324 CASAVA_Build 1 21842637 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1217 het 467 hom 15 5 4 6 A 19 18 38325 CASAVA_Build 1 21847643 2I GAGATAACAC --/AT GTCAGGCGTC 3070 hom 87 het 35 0 28 7 AT 0 1 38326 CASAVA_Build 1 21858022 1I TGAAGAACGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 18 6 T 15 16 38327 CASAVA_Build 1 21863830 1D AGGCTTATTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 19 het 24 1 21 3 T 10 9 38328 CASAVA_Build 1 21876299 1D GAGAGGCCCC A/- AGCCCAGGGT 3070 hom 106 het 37 0 35 2 A 2 1 38329 CASAVA_Build 1 21883760 6D GTTTCAAGTC TTACAT/------ TTAAGTCTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 TTACAT 1 0 38330 CASAVA_Build 1 21885579 1I ATATGTTGAA -/C CATCCTTGCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 2 38331 CASAVA_Build 1 21905060 1I ATTCATTTAA -/T TTAATAGAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 38332 CASAVA_Build 1 21908666 1I TTTATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 13 14 38333 CASAVA_Build 1 21909311 5D GTCAAGAGAG ATTCA/----- ATTCAGTAAA 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 ATTCA 2 1 38334 CASAVA_Build 1 21911517 3D GTAAACATTC AAT/--- AATTGCCCAC 3070 hom 66 het 28 0 23 9 AAT 2 1 38335 CASAVA_Build 1 21916164 1I CAATTAATAC -/A AAAAAATATC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 6 7 38336 CASAVA_Build 1 21916539 4I CCCAACCAAC ----/CAAA CAAACAAACA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 CAAA 3 4 38337 CASAVA_Build 1 21917645 1I GGCCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2684 hom 28 9 7 12 T 12 13 38338 CASAVA_Build 1 21919631 2D TTTAAGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 AG 2 1 38339 CASAVA_Build 1 21931350 2D CACAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 81 het 30 0 26 5 CT 2 1 38340 CASAVA_Build 1 21934464 1I GAGGACTGTT -/A AAACTCAGGA 3070 hom 72 het 26 0 23 3 A 3 4 38341 CASAVA_Build 1 21939019 1I TGAGATGGAG -/T TTTGGTCTTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 3 4 38342 CASAVA_Build 1 21961093 1D TGCCTGTAAT C/- CCCAGCACTT 3070 hom 83 het 35 0 25 10 C 4 3 38343 CASAVA_Build 1 21964695 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2274 het 599 hom 14 2 8 4 A 11 12 38344 CASAVA_Build 1 21969562 1D ATCAAGTGTC T/- TTTTTTTTTT 1237 het 1237 ref 24 5 3 16 T 19 18 38345 CASAVA_Build 1 21970888 1I AATCCCAGCT -/A GTCAGGGGGA 3070 hom 78 het 32 0 25 7 A 0 1 38346 CASAVA_Build 1 21986337 3I AGTAGCACTT ---/AGG ACGGCCGGGC 3070 het 2027 hom 17 5 10 2 AGG 0 1 38347 CASAVA_Build 1 21995360 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTGTATTT 2150 hom 15 het 6 0 5 1 T 4 5 38348 CASAVA_Build 1 22003293 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTCAAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 7 6 38349 CASAVA_Build 1 22055698 1I GGGTTTCACC -/A TGTTGGCCAG 2054 het 1185 hom 10 4 5 1 A 0 1 38350 CASAVA_Build 1 22061910 14I ATCTCAGGAC --------------/TTTGGGAGGCCGAG GTGGGTGGAT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 TTTGGGAGGCCGAG 0 1 38351 CASAVA_Build 1 22069488 1D CATGGTAGTC A/- GAAAGGCCCA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 1 0 38352 CASAVA_Build 1 22080392 13D TCTTTCCCCA CCCAGGGTGGCAG/------------- CCCAGGCCCC 3070 hom 74 het 24 0 21 5 CCCAGGGTGGCAG 1 0 38353 CASAVA_Build 1 22085455 1D TGCAGCCTCT C/- CCCCGGGGCT 3070 hom 59 het 23 0 17 6 C 5 4 38354 CASAVA_Build 1 22094211 1D TGGATGCCAC G/- GGATGGCCCA 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 G 3 2 38355 CASAVA_Build 1 22104342 4D CACACACACC CACA/---- CACACACACA 2862 het 2862 ref 55 26 14 17 CA 9 7 38356 CASAVA_Build 1 22104416 1I CCTTCTAAAA -/T TAGCCACATG 3070 het 3070 ref 52 23 20 9 T 1 2 38357 CASAVA_Build 1 22105811 1I GACTGGGGGG -/T TGGGGGGGGG 1465 het 801 hom 18 6 6 6 T 1 2 38358 CASAVA_Build 1 22113494 1D AATGTTTTGG A/- AAACAGCCAG 3070 hom 96 het 34 0 30 5 A 4 3 38359 CASAVA_Build 1 22114149 9D CCATGATTGG CCTTTGTTA/--------- CCTTTGTTAC 3070 hom 51 het 24 0 14 13 CCTTTGTTA 2 1 38360 CASAVA_Build 1 22114279 7I GCGGGCAGGG -------/TGCCCAC TGCCCCCGTC 3070 hom 29 het 17 0 11 6 TGCCCAC 0 1 38361 CASAVA_Build 1 22122486 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1528 het 1528 ref 12 6 5 3 A 11 10 38362 CASAVA_Build 1 22122874 1I AAGCCCACGG -/T TGGTGTTTAG 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 1 2 38363 CASAVA_Build 1 22126614 1D ACATCCCCCA C/- CCCCCCCACT 3070 hom 80 het 31 0 22 9 C 8 7 38364 CASAVA_Build 1 22131221 10I ACCCAACCTA ----------/AGAGCTTCTG AGAGCTTCTG 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 AGAGCTTCTG 1 2 38365 CASAVA_Build 1 22133681 1D TGATGCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 19 0 12 7 T 13 12 38366 CASAVA_Build 1 22144083 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2304 hom 34 7 15 12 T 15 14 38367 CASAVA_Build 1 22147256 2I ATTGAGCCAC --/TG CACTCTAGCC 2696 het 2696 ref 28 16 8 4 TG 0 1 38368 CASAVA_Build 1 22160982 1I TGGCAGGAGT -/A AAAGGGTAAC 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 A 3 4 38369 CASAVA_Build 1 22164243 2D CAGATTAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1791 hom 22 7 10 5 T 16 14 38370 CASAVA_Build 1 22165290 1I TGGCCTCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2233 hom 22 7 11 4 T 10 11 38371 CASAVA_Build 1 22173027 1I ACTTCCACCT -/C CCATTCAGGA 1754 het 1754 ref 47 28 6 13 C 2 3 38372 CASAVA_Build 1 22173970 4D TCAAGCTGAG CAAA/---- CAAACATGTC 2196 het 2196 ref 36 30 5 2 CAAA 2 1 38373 CASAVA_Build 1 22174121 1D TGTGATTGGA G/- GGGGTTCACT 2615 het 2615 ref 45 25 8 13 G 5 4 38374 CASAVA_Build 1 22181520 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 8 7 38375 CASAVA_Build 1 22181925 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 27 het 16 0 10 7 T 8 7 38376 CASAVA_Build 1 22182435 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 2191 hom 12 het 5 0 5 0 A 11 10 38377 CASAVA_Build 1 22185002 3I AAATACCCTC ---/ATT GTATTATAAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 ATT 0 1 38378 CASAVA_Build 1 22186234 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 13 5 A 11 10 38379 CASAVA_Build 1 22187378 1I TGTTAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 het 3053 hom 19 10 7 2 T 0 1 38380 CASAVA_Build 1 22187976 1D32M4D TCTCAAAAAG AAAAAAAACTCCAAAAATATATATTTTGTTTATATAC/-AAAAAAACCCCAAAAATATATATTTTGTTTAT---- ATACATACAT 1913 het 731 hom 15 5 5 17 N/A 0 0 38381 CASAVA_Build 1 22191061 3D TTAGGCAGGT GTG/--- GTGGTGGGTG 2618 het 2618 ref 17 9 6 2 GTG 3 2 38382 CASAVA_Build 1 22192386 1D AATAAAAATA C/- AAAAAATTAG 1950 het 1950 ref 29 15 5 9 C 1 0 38383 CASAVA_Build 1 22198900 4I TCAAGCTGAG ----/CAAA CAAACATGTC 2237 het 2237 ref 24 16 5 3 CAAA 1 2 38384 CASAVA_Build 1 22201450 1I TATTTTTTGC -/T TTTTTTTTTG 2319 het 2319 ref 39 31 5 3 T 9 10 38385 CASAVA_Build 1 22201629 1D TGCTATGTTG C/- CCAGGCTGGT 2045 het 2045 ref 27 18 5 4 C 3 2 38386 CASAVA_Build 1 22207841 1D GCTGACTCAG A/- AAAAAAAAAA 2905 het 2905 ref 25 10 8 8 A 12 11 38387 CASAVA_Build 1 22209398 1I GCTAAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 9 10 38388 CASAVA_Build 1 22226108 2D GACTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 35 0 23 14 A 14 12 38389 CASAVA_Build 1 22226423 4D TTGATAACTT TCTA/---- TCTATTATTT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TCTA 2 1 38390 CASAVA_Build 1 22227247 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2456 het 2456 ref 19 10 7 2 A 9 10 38391 CASAVA_Build 1 22229215 1I AGACAAAAAT -/A GAGTTTCTAG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 0 1 38392 CASAVA_Build 1 22230019 4D TATTTCCTAC AGAA/---- AGAGTTTCTC 3070 hom 108 het 44 0 35 9 AGAA 1 0 38393 CASAVA_Build 1 22233408 2I CAGATAACTC --/TT TGTTGTAGGG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 1 3 38394 CASAVA_Build 1 22242822 4D ATTTTCAACT TTAA/---- TTAATTTTTA 3070 het 3070 hom 31 9 14 8 TTAA 2 1 38395 CASAVA_Build 1 22243045 1D AGGCTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 11 6 T 12 11 38396 CASAVA_Build 1 22244364 1I GAAATTAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 22 het 32 1 25 6 A 9 10 38397 CASAVA_Build 1 22257566 1I TTATTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 865 hom 28 2 19 7 T 14 15 38398 CASAVA_Build 1 22258092 1D TTTTGTAGAG A/- ATGGGGCCTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 2 1 38399 CASAVA_Build 1 22258649 1D TTTTTTTGAG A/- ATTCTCGCTC 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 2 1 38400 CASAVA_Build 1 22258979 1D CTTTTTCCTT C/- TTTAACTATA 3070 hom 51 het 22 0 18 5 C 1 0 38401 CASAVA_Build 1 22263165 1I TTTTTTTTTT -/C GTTACATTAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 C 0 1 38402 CASAVA_Build 1 22263404 2D TAGAGTCTCG CT/-- CTGTCACTCA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 CT 2 1 38403 CASAVA_Build 1 22265780 1I GAGATGATGA -/T TTCGAGCTGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 2 3 38404 CASAVA_Build 1 22268876 3D TTGTTTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 2983 het 1361 hom 20 5 10 5 TTG 4 3 38405 CASAVA_Build 1 22272901 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 481 hom 27 2 20 5 T 11 10 38406 CASAVA_Build 1 22278220 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2685 het 381 hom 27 3 9 16 T 17 16 38407 CASAVA_Build 1 22279690 1D AAATTTTTAC T/- GTAAATTGAC 3070 het 3070 ref 40 24 15 2 T 1 0 38408 CASAVA_Build 1 22295383 1D AACAAATAGG T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 7 6 38409 CASAVA_Build 1 22298974 23D TATGATACAA AGCTTGTCCAAGAATTCAGAGCT/----------------------- AGCTTGTCCA 3070 hom 60 het 25 0 21 8 AGCTTGTCCAAGAATTCAGAGCT 2 1 38410 CASAVA_Build 1 22301363 2D AGATCCCTTT AC/-- ACAGACTTAT 3070 het 3070 ref 39 24 12 4 AC 2 1 38411 CASAVA_Build 1 22302123 1I6M10I2M3I TCTTGAGGGA -AGCTTG----------CT---/TTACTTGTATATCTAATCTCAA GCTTAGAGAT 3070 het 3070 hom 43 14 25 7 N/A 0 0 38412 CASAVA_Build 1 22302706 2I CTAATGGTAC --/TT TTCCCCGTGG 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 T 2 4 38413 CASAVA_Build 1 22302845 3I TGTCAGTAGA ---/TTG TTATTTTGCC 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 TTG 0 1 38414 CASAVA_Build 1 22311982 3D TCCTGTATGG GGA/--- GGAGGGGTAG 3070 het 3070 hom 38 14 16 10 GGA 2 1 38415 CASAVA_Build 1 22315906 1I CCCTGGATCT -/C CCCATCAGCA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 C 3 4 38416 CASAVA_Build 1 22318204 2D AAGGTGACTC AG/-- GGGCATGACT 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 AG 1 0 38417 CASAVA_Build 1 22318696 1I TTAAGAGTTC -/T TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 T 6 7 38418 CASAVA_Build 1 22320233 2I TGGGAGAGTC --/TG TGGGGCCCTG 2124 het 2124 ref 26 15 7 4 TG 1 2 38419 CASAVA_Build 1 22375353 4I TGGTCCCACC ----/TCTG TCTGTAACAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TCTG 1 2 38420 CASAVA_Build 1 22381634 1I AACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 2218 het 2218 ref 39 15 8 16 A 13 14 38421 CASAVA_Build 1 22397110 1D CCATATGGGG T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 6 5 38422 CASAVA_Build 1 22416573 4D TCTGAGAAGA ATCT/---- ATCTTGCTCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 ATCT 2 1 38423 CASAVA_Build 1 22425536 2I CCAGCCACCT --/GA GTCTTTCGGA 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 GA 0 1 38424 CASAVA_Build 1 22428084 1D AGCTTTGTGA C/- CCCCCCCTAG 1544 het 1544 ref 25 12 4 9 C 8 7 38425 CASAVA_Build 1 22428827 1I CCTCTCTTTC -/A TAACTGAACT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 0 1 38426 CASAVA_Build 1 22436831 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 6 A 11 10 38427 CASAVA_Build 1 22446922 1D TGTCCCCCTT C/- CCCAGCCCCA 3070 het 3070 ref 33 15 11 8 C 4 3 38428 CASAVA_Build 1 22451163 1D GTTGTTGGCT C/- CCCCACACTA 3070 het 2531 hom 27 10 13 4 C 5 4 38429 CASAVA_Build 1 22500858 1I CACCACTGAT -/C ATTAGAGAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 C 0 1 38430 CASAVA_Build 1 22501596 1I11M1I AAATAAAAGG -TTTTTTTTCTC-/TTTTTTTTTCTCT TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 N/A 0 0 38431 CASAVA_Build 1 22515492 2I AGTTTATAAA --/AC ACACAAACTG 3070 hom 84 het 32 0 26 6 AC 2 3 38432 CASAVA_Build 1 22520646 11I ACTCCCATCT -----------/AGTACCCTCCC ACCTGGTACA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 AGTACCCTCCC 0 1 38433 CASAVA_Build 1 22530563 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1611 het 1611 ref 29 17 4 9 A 13 12 38434 CASAVA_Build 1 22554895 2D ATCTGCATCT TA/-- ATCTCTTACT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 TA 1 0 38435 CASAVA_Build 1 22557164 1I ATCAATGGCA -/G GGGCTCCCTG 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 G 3 4 38436 CASAVA_Build 1 22592388 1D TCTAATCCCC G/- AGTGGGGGCG 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 G 1 0 38437 CASAVA_Build 1 22626032 1I AATTCCAAAT -/G AAAAAAAAAA 3070 het 218 hom 37 1 27 9 G 0 1 38438 CASAVA_Build 1 22630817 1I ATGCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 12 13 38439 CASAVA_Build 1 22631062 1D CTTTTCAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 41 0 33 9 A 11 10 38440 CASAVA_Build 1 22632598 4I TTAAGTAGTA ----/TAAG TAATCTAGAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TAAG 0 1 38441 CASAVA_Build 1 22632953 1I TTTAAGCTAG -/T TTTTTTTTTT 709 het 709 ref 35 28 2 6 T 10 11 38442 CASAVA_Build 1 22635271 2D AAATGAAAAC AT/-- ATGTTCACAC 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 AT 2 1 38443 CASAVA_Build 1 22636953 1I CGCCTGTAAT -/C CCAGCACTTT 3070 hom 19 het 18 0 11 7 C 2 3 38444 CASAVA_Build 1 22645331 2I AAAAAAAGAC --/TG AGAAAAACAA 3070 hom 101 het 55 0 42 13 TG 0 1 38445 CASAVA_Build 1 22647881 8D GGTTGTGTTA TTTCTTTT/-------- TTTCTTTTTA 3005 het 3005 ref 33 20 11 2 TTTCTTTT 2 1 38446 CASAVA_Build 1 22656205 1D CCTGTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 38 0 25 14 T 12 11 38447 CASAVA_Build 1 22662087 2D ATTTAGTGAC TG/-- TTAACAGTGT 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 TG 1 0 38448 CASAVA_Build 1 22663937 1D TTCAAGTGCC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 7 6 38449 CASAVA_Build 1 22687425 1D AGTAGGCGAT A/- AGTGCTATGC 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 A 2 1 38450 CASAVA_Build 1 22715560 2I ATCTAGAAAC --/TG AGGATTGAGA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 TG 0 1 38451 CASAVA_Build 1 22742894 8D CAACACCTGC TGACACTT/-------- TGACACTTTG 3070 het 3070 ref 36 15 15 8 TGACACTT 2 1 38452 CASAVA_Build 1 22745798 1I GCCTGATGCT -/G GGGGGTCAGG 1440 het 1440 ref 17 7 6 4 G 5 6 38453 CASAVA_Build 1 22747050 1D TCTCTCCCCC T/- CTCTCCTTCT 2565 het 2565 ref 21 10 6 5 T 1 0 38454 CASAVA_Build 1 22747195 4D TCTCTCTCCA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 33 het 14 0 10 6 TC 9 7 38455 CASAVA_Build 1 22754202 4D TCCTTCTCGT TCTG/---- TCTGTCTGTC 2184 het 2184 ref 18 9 6 3 TCTG 3 2 38456 CASAVA_Build 1 22773352 1D AGCCACCGCG C/- CCGGCCAGGC 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 C 3 2 38457 CASAVA_Build 1 22774331 6D GCACCTGGCC TTATTA/------ TTATTGTTTT 1401 het 1401 ref 11 8 3 3 TTA 3 1 38458 CASAVA_Build 1 22776987 2I24M8D4M6D ATGTGTGTGT --ATGTGTGCGTGAGTGTATGTGTGCGTGAGTGTATGTGTGCGA/GCATGTGTGCGTGAGTGTATGTGTGC--------ATGT------ GTGTATGCAT 2175 het 2175 ref 44 31 6 14 N/A 0 0 38459 CASAVA_Build 1 22777726 2D50M4D TGTATGTGTA TGTGTGTGCATGTGAGTGTATGTATGCATTTGTGCATGAGTGTATGTGTGCCTGTG/--TGTGTGCATGTGAGTGTATGTATGCATTTGTGCATGAGTGTATGTGTGCC---- TGTGTATGTA 3070 het 3070 hom 77 30 32 61 N/A 0 0 38460 CASAVA_Build 1 22778111 1D GCAAGAGTAT G/- TATGCATGTG 3070 het 3070 ref 95 49 32 16 G 1 0 38461 CASAVA_Build 1 22778212 2I TATGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 72 25 19 28 TG 5 6 38462 CASAVA_Build 1 22778290 2I CCTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 96 46 41 9 TG 4 5 38463 CASAVA_Build 1 22781606 1D CTCAGACCTC A/- AGAGACCCAT 3070 hom 87 het 35 0 28 8 A 2 1 38464 CASAVA_Build 1 22785862 4I GTCTGAGGTG ----/GGGT GGGGGGGTGA 1742 hom 24 het 11 0 6 5 GGGT 0 1 38465 CASAVA_Build 1 22788780 1D TTGGACCACA G/- TAGTTTATCT 3070 het 3070 hom 33 16 13 5 G 1 0 38466 CASAVA_Build 1 22789828 3D GCCCATGACT TTG/--- AATTCCACCT 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 TTG 1 0 38467 CASAVA_Build 1 22811761 1I CAGCCTAGGG -/T TGTGGGGCCT 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 T 1 2 38468 CASAVA_Build 1 22817041 1D TTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1145 hom 29 5 18 6 T 13 12 38469 CASAVA_Build 1 22817121 1D ATAGAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1337 hom 22 5 11 6 T 15 14 38470 CASAVA_Build 1 22818882 3I GGGGTGGTGG ---/GAT GATGATGATA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 GAT 3 4 38471 CASAVA_Build 1 22831563 1I TGTGTGACCC -/T GGGCAAGTCT 3070 hom 75 het 34 0 21 13 T 0 1 38472 CASAVA_Build 1 22847121 2D ACTGCCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 19 0 12 7 T 16 14 38473 CASAVA_Build 1 22848893 2D GCACACACAC AT/-- GCACACGCAC 3070 hom 186 het 70 0 61 9 AT 1 0 38474 CASAVA_Build 1 22848973 1I GCATACATAC -/A ACACATATGT 3070 het 3070 hom 63 20 26 17 A 1 2 38475 CASAVA_Build 1 22849013 2D ATATACACAC AT/-- ATGTACACAT 3070 het 2809 hom 68 11 33 26 AT 2 1 38476 CASAVA_Build 1 22849305 2I ATACATGCAC --/AT ATACCCACAC 3070 hom 204 het 77 0 68 9 AT 1 2 38477 CASAVA_Build 1 22850946 12D TTCACCCTAG CCTGGGTCCCTT/------------ CGGGACTATA 3070 het 3070 ref 24 14 10 2 CCTGGGTCCCTT 1 0 38478 CASAVA_Build 1 22854561 1I TCTGGTCCCA -/G GGGAGCCCTC 3070 het 3070 hom 53 20 21 12 G 3 4 38479 CASAVA_Build 1 22873122 1I TTCAGAAATG -/C CCTAATGCTG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 C 2 3 38480 CASAVA_Build 1 22875208 1I CACGCAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 141 hom 22 1 14 7 T 13 14 38481 CASAVA_Build 1 22878268 4D35M4I ACACACATGG ACACACACACACATGCACATACATATACACACATATACT----/----ACACACACATGCACATACATATACACACATATACTCACA CACACCCCCA 3070 hom 215 het 63 0 67 23 N/A 0 0 38482 CASAVA_Build 1 22878463 4D25M8D ACACACAAAT ACTCACACACATATACCCCCACAGAGACACACACATG/----ACACACATATACCCCCACAGAGACA-------- CACACATGCA 3070 hom 96 het 27 0 32 6 N/A 0 0 38483 CASAVA_Build 1 22908345 1I AGGGGGAATC -/T TTCGTTTCTC 3070 het 3070 hom 25 11 9 5 T 2 3 38484 CASAVA_Build 1 22921241 1I ATGCCCAGCA -/T TTTTTTTTTT 2546 het 2546 ref 20 9 9 2 T 10 11 38485 CASAVA_Build 1 22925489 10D TAATAGTTTC TTTTTCTTTT/---------- TTTTTCTTTT 3070 hom 40 het 23 0 14 9 TTTTTCTTTT 2 1 38486 CASAVA_Build 1 22933503 1D GTCAATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 110 hom 32 2 17 13 T 17 16 38487 CASAVA_Build 1 22943254 1D AGTCATATAA C/- CCCCCCACCC 3070 hom 63 het 25 0 20 5 C 7 6 38488 CASAVA_Build 1 22947458 1D TTCTGGGTCC T/- TTTTTTTTTT 2174 het 1369 hom 24 8 7 9 T 13 12 38489 CASAVA_Build 1 22953284 1D CCAAACCAAA C/- CAAAATGGTG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 2 1 38490 CASAVA_Build 1 22958459 1D CTCAACAGTA C/- CTGTTACTCT 3070 hom 126 het 45 0 42 4 C 2 1 38491 CASAVA_Build 1 22967874 3D TGATCATTCT CTC/--- CTCCCGGCCT 3070 hom 102 het 38 0 33 6 CTC 2 1 38492 CASAVA_Build 1 22977356 1D TCTCCCCCCC T/- CAAAAGGTCC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 1 0 38493 CASAVA_Build 1 23002999 1D GTCTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 A 11 10 38494 CASAVA_Build 1 23018897 2D AAATTGATGA TT/-- TTTTTTTTTT 2250 het 67 hom 15 1 6 8 T 14 12 38495 CASAVA_Build 1 23021410 1D TTTTTAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1904 hom 18 5 8 6 A 10 9 38496 CASAVA_Build 1 23022654 1D TCATACAGTT A/- GGAACTGTGT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 A 1 0 38497 CASAVA_Build 1 23024521 1D AGCCTAGATC A/- GGGGGTGAGC 3070 het 3070 hom 47 18 18 12 A 1 0 38498 CASAVA_Build 1 23031978 2I TATAAGTAAC --/AG AGTCATGCAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AG 1 2 38499 CASAVA_Build 1 23038028 8D AAAACAAAAC AAAAAAAG/-------- AAAAAAAGAA 2570 het 2570 ref 25 15 8 3 AAAAAAAG 3 2 38500 CASAVA_Build 1 23046871 1D CTGAACCCTT C/- CCCCCATACA 3070 hom 150 het 52 0 49 3 C 6 5 38501 CASAVA_Build 1 23060543 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCCATCT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 C 6 7 38502 CASAVA_Build 1 23071100 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 27 2 20 5 A 13 14 38503 CASAVA_Build 1 23078290 2I CCACCTCCAC --/CA CACACACACA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 CA 5 6 38504 CASAVA_Build 1 23084305 1I CCCAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 A 10 11 38505 CASAVA_Build 1 23084838 1D ATGGAGAACG T/- TTAGGCATAA 3070 het 3070 ref 56 39 12 5 T 3 2 38506 CASAVA_Build 1 23087874 2D AATAGAAAAC AG/-- GGGCTCAGGG 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 AG 1 0 38507 CASAVA_Build 1 23103373 3I21M1I AACCTGTCTC ---AAAAAAAAAAAAAAATTAATT-/AAAAAAAAAAAAAAAAAATTAATTA AAAAAAAATC 3006 het 1789 hom 16 6 10 5 N/A 0 0 38508 CASAVA_Build 1 23121839 1D GTTAAAGTTA G/- GCCTGGAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 21 4 G 2 1 38509 CASAVA_Build 1 23140717 3I CTGTGGGTGA ---/GAG GAACTGGACC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 GAG 0 1 38510 CASAVA_Build 1 23150398 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 10 11 38511 CASAVA_Build 1 23170586 1I CGGCTCCACC -/A ACCCCCCAAC 2589 het 2589 ref 21 11 8 2 A 1 2 38512 CASAVA_Build 1 23180515 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 23 4 16 3 A 17 16 38513 CASAVA_Build 1 23182424 1D GGCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 10 9 38514 CASAVA_Build 1 23200877 1D GGGTTAAGTT G/- GGGGGGGGAT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 G 9 8 38515 CASAVA_Build 1 23204205 1I ATTATTATTT -/A TTTTTTTTGA 2829 hom 27 het 13 0 9 4 A 0 1 38516 CASAVA_Build 1 23204534 1D GCTGTACCCC G/- ACCACCTTGG 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 G 1 0 38517 CASAVA_Build 1 23208789 1D GGGGAGGGAC T/- GTAGTAATGT 3070 hom 90 het 33 0 30 4 T 1 0 38518 CASAVA_Build 1 23211439 1D CTAAATACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 20 6 A 13 12 38519 CASAVA_Build 1 23221416 1I TTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 hom 53 het 27 0 21 6 G 0 1 38520 CASAVA_Build 1 23224410 1D AGATGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 2973 het 541 hom 23 3 11 9 T 18 17 38521 CASAVA_Build 1 23225476 3I GTCTGTTTGT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 26 2 17 7 TTG 0 1 38522 CASAVA_Build 1 23231587 1I CTTTGTTTTT -/G GGGGGGACGT 3070 het 3070 hom 45 14 20 11 G 6 7 38523 CASAVA_Build 1 23235525 1D TCTTGCCACG C/- CCCCCCCCTC 2669 hom 41 het 18 0 13 5 C 9 8 38524 CASAVA_Build 1 23254383 1I TATCTTCTTA -/T AAGTCAAGTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 0 1 38525 CASAVA_Build 1 23258414 2D TTCTTAACTC TT/-- GAGCTATGTA 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 T 2 0 38526 CASAVA_Build 1 23260741 1D TAAACTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 24 1 16 7 T 15 14 38527 CASAVA_Build 1 23275685 1I AATCATCATT -/C CCCCCTACCA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 C 5 6 38528 CASAVA_Build 1 23283057 2I ATTAGGAAAC --/TT TTTGGATGCA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 3 5 38529 CASAVA_Build 1 23283813 1I GAAGGCTTTT -/C CCCCCCCTAG 3070 hom 102 het 40 0 33 7 C 7 8 38530 CASAVA_Build 1 23288682 1I GAATTCTACC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 28 het 34 1 29 4 T 9 10 38531 CASAVA_Build 1 23288837 4D CACACCTGGC TTTT/---- TTTTTTTTTC 2636 het 1235 hom 15 6 6 3 T 13 9 38532 CASAVA_Build 1 23289222 3I AAGAAAGGTT ---/AGC AGAGTAGAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 7 AGC 0 1 38533 CASAVA_Build 1 23295211 1D AGAAGGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 339 hom 40 3 22 16 A 14 13 38534 CASAVA_Build 1 23298561 1I TTAAAGAAAA -/C CCCAGCTTAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 3 4 38535 CASAVA_Build 1 23307507 2I TGGACAATAC --/AG AGAGACCCAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AG 2 3 38536 CASAVA_Build 1 23315665 1I CTGGACTGTT -/A AAAAAAAAAA 2751 het 2751 ref 30 15 9 6 A 12 13 38537 CASAVA_Build 1 23347450 3D AGCACAACAA AAC/--- AACAACGACC 3070 het 3070 hom 53 21 29 3 AAC 3 2 38538 CASAVA_Build 1 23347964 5D CAGGAGTTCA AGACC/----- AGCCTAGGAA 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 AGACC 1 0 38539 CASAVA_Build 1 23366581 2I CTGCAGGCAG --/TC TCTGGCCTTC 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 TC 1 2 38540 CASAVA_Build 1 23368031 1I CCCTCCGTCC -/T TTTTTTTCCC 1971 het 931 hom 22 4 8 10 T 7 8 38541 CASAVA_Build 1 23370223 1I TATATATGTA -/T TTTTTATATA 3070 het 2213 hom 13 5 7 1 T 5 6 38542 CASAVA_Build 1 23372387 1D GTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 2867 het 1192 hom 11 3 6 2 T 10 9 38543 CASAVA_Build 1 23376154 2D TAAGGATGAT GG/-- GGGGGGGGTC 3070 het 2186 hom 29 7 13 9 G 10 8 38544 CASAVA_Build 1 23379566 1I GAAATCCTGA -/C TTCGAGTGAT 2880 het 2880 ref 23 12 8 3 C 0 1 38545 CASAVA_Build 1 23382586 5D TTGTTTTTGT TTTTG/----- TTTTTTGAGA 827 het 827 ref 35 19 6 12 TTTTG 1 0 38546 CASAVA_Build 1 23384927 1I AATGTGTCCA -/C CTTCAAACAT 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 C 1 2 38547 CASAVA_Build 1 23385252 1D TCAATTTGAC T/- TTTTTTTTTT 2762 het 2762 ref 24 11 6 7 T 11 10 38548 CASAVA_Build 1 23391745 2D CATGATGAAA CC/-- CCGTCTTTAT 1744 het 1744 ref 18 8 8 3 C 4 2 38549 CASAVA_Build 1 23394460 1D TACAAAGTAT G/- GGGGGGGGTG 3017 het 3017 ref 40 20 12 8 G 9 8 38550 CASAVA_Build 1 23398111 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 2752 het 1731 hom 18 4 10 4 T 9 10 38551 CASAVA_Build 1 23411907 2D TGAGTGCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2137 het 1544 hom 28 7 9 12 T 14 12 38552 CASAVA_Build 1 23415554 3D TAATGCAACC GGG/--- ACCCTGACTG 3070 het 3070 hom 43 19 23 2 G 3 0 38553 CASAVA_Build 1 23449436 1I CCTGCAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 29 3 21 5 T 11 12 38554 CASAVA_Build 1 23470016 2I CGGCCCCCCC --/TT TTTTTTTTTT 2831 hom 24 het 12 0 9 3 T 10 12 38555 CASAVA_Build 1 23486978 2D GAAACAAATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TA 7 6 38556 CASAVA_Build 1 23508603 1D TATGAACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 34 1 24 9 T 13 12 38557 CASAVA_Build 1 23531485 1I TATTGATATT -/A AAAAAAAAAA 2748 het 712 hom 24 3 14 7 A 13 14 38558 CASAVA_Build 1 23537081 1D TGCCGAGTGG T/- TACTATGTGC 3070 het 3070 ref 43 27 13 4 T 2 1 38559 CASAVA_Build 1 23585805 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 2719 hom 15 het 6 0 6 0 T 10 9 38560 CASAVA_Build 1 23588568 1I AGATTCCATC -/A AAAAAAAAAA 2873 het 438 hom 18 1 15 2 A 15 16 38561 CASAVA_Build 1 23620584 1D GTTCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 34 0 29 5 A 12 11 38562 CASAVA_Build 1 23626616 1D GCGCGACATC A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 8 7 38563 CASAVA_Build 1 23645520 2D TTTTTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 34 0 18 16 T 17 15 38564 CASAVA_Build 1 23648136 2D GAGATAACAG TC/-- TCTCTCAGAA 3070 hom 120 het 45 0 38 7 TC 4 3 38565 CASAVA_Build 1 23662446 1D GAAATGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 8 T 11 10 38566 CASAVA_Build 1 23667759 2D10M2D GAGACCATCC TTTAGTTGAGATAG/--TAGCCAACAT-- GGTGAAACCC 3070 hom 27 het 12 0 9 3 N/A 0 0 38567 CASAVA_Build 1 23678363 3D GAGGGAAGCA GAG/--- GCAGGAGAGA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 GAG 1 0 38568 CASAVA_Build 1 23685927 1D CTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 34 het 32 1 23 8 T 10 9 38569 CASAVA_Build 1 23690224 1I TCACTCCCTT -/G GGGATTCCAC 3070 hom 114 het 46 0 37 9 G 3 4 38570 CASAVA_Build 1 23690519 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2866 het 107 hom 24 3 10 11 T 16 14 38571 CASAVA_Build 1 23696889 1I TTCCATAGAT -/G GAGCCCATCC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 G 1 2 38572 CASAVA_Build 1 23701823 1I ACTGCAAGTA -/G GAATAATTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 G 1 2 38573 CASAVA_Build 1 23703924 1I GAAGGCCGCA -/G GGTCCTCTGC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 2 3 38574 CASAVA_Build 1 23706187 1I ACACGAGTGA -/T TTTTTTTAGG 3070 hom 65 het 26 0 21 5 T 7 8 38575 CASAVA_Build 1 23713203 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 34 7 A 13 12 38576 CASAVA_Build 1 23721632 3I CAGAGTTTTC ---/CTT CTTAACCATT 3070 hom 87 het 30 0 28 2 CTT 1 2 38577 CASAVA_Build 1 23722235 1I CTAACCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 30 2 16 12 T 15 16 38578 CASAVA_Build 1 23724268 1D GCTGAGGCCA C/- CCCCCCCCTC 2833 hom 4 het 18 1 9 9 C 9 8 38579 CASAVA_Build 1 23739305 1I AGAGGGACAT -/C CCATGCGGGA 3070 hom 66 het 23 0 22 1 C 2 3 38580 CASAVA_Build 1 23748029 1D GGGCGGGAGA G/- GGGACAGGCG 3070 hom 91 het 33 0 25 9 G 4 3 38581 CASAVA_Build 1 23750805 1I AGCAACATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 33 1 24 10 A 12 13 38582 CASAVA_Build 1 23758926 1I CTGGTTCGAG -/C CCACAGCTCC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 2 3 38583 CASAVA_Build 1 23759427 1I TTTTTAAGAG -/C CCCCCCCCCA 2447 het 2126 hom 24 9 7 8 C 9 10 38584 CASAVA_Build 1 23759942 1I AACAGGACAA -/G GGGGGCTCAG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 5 6 38585 CASAVA_Build 1 23761109 6I GATAGTGGGT ------/AGGAGG AGGTTGGGAG 2880 het 4 hom 20 0 10 10 AGG 1 3 38586 CASAVA_Build 1 23761966 1D TGCTCTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 504 hom 21 2 11 8 T 13 12 38587 CASAVA_Build 1 23763633 3D ATGTTTATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 23 4 12 9 T 14 11 38588 CASAVA_Build 1 23770915 1D GATGGACCTC A/- AAAAATATGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 6 5 38589 CASAVA_Build 1 23776414 1D CTTCCAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 21 2 12 7 A 17 16 38590 CASAVA_Build 1 23787909 1I GCATACGCAT -/G TACCAAGATG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 0 1 38591 CASAVA_Build 1 23788109 1D AGGGCCACAT G/- GGGAATCTCT 3070 hom 95 het 34 0 31 3 G 4 3 38592 CASAVA_Build 1 23806048 1I GCGATCCCCC -/T GCCTCAGCCT 3070 hom 67 het 26 0 24 2 T 0 1 38593 CASAVA_Build 1 23824100 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1376 het 56 hom 9 1 5 3 T 15 14 38594 CASAVA_Build 1 23826714 2I TTCCAATTGT --/AC ACACACACAC 3070 hom 34 het 30 1 22 7 AC 8 9 38595 CASAVA_Build 1 23835961 2D ATTAAGGAGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 30 0 23 8 TA 9 8 38596 CASAVA_Build 1 23837288 2I GGAGGGAGAG --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 18 het 17 0 9 8 GA 5 6 38597 CASAVA_Build 1 23852836 1I CTAGGACCAT -/G GGGGGAAGCT 3070 hom 114 het 41 0 37 4 G 5 6 38598 CASAVA_Build 1 23861113 4D GTCCCTCCTA TTCC/---- GTTCGGCATA 3070 het 3070 hom 52 24 21 8 TTCC 1 0 38599 CASAVA_Build 1 23876048 1D AAAAGCAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 28 1 14 16 T 17 16 38600 CASAVA_Build 1 23877624 1I TCCCCCAGGT -/A AAATGGACGT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 3 4 38601 CASAVA_Build 1 23879180 2I AAATGATCAC --/TT TTTTGGCCCA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 4 6 38602 CASAVA_Build 1 23885226 1I GAAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 1303 het 227 hom 7 1 4 2 A 11 12 38603 CASAVA_Build 1 23903140 1I AGTTCACAGT -/A AAAAAAAAAA 2729 het 2408 hom 20 5 8 7 A 13 14 38604 CASAVA_Build 1 23904963 2I AGCGGGGTGT --/GG TGGCAGGTGC 2193 hom 18 het 7 0 7 0 G 0 2 38605 CASAVA_Build 1 23906858 1I AGATGGAAGA -/G CTAGAGCAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 38606 CASAVA_Build 1 23920214 1I CATGGTGAAA -/C CCCCATCTCT 2222 het 2222 ref 15 9 6 0 C 4 5 38607 CASAVA_Build 1 23922069 2I TGAGGGAGTT --/TA GGAAGATAAC 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 TA 0 1 38608 CASAVA_Build 1 23927423 8D TCTTTTTTCT TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 1822 het 1530 hom 18 5 11 4 TTTC 5 3 38609 CASAVA_Build 1 23927847 1D AGATGATTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 16 11 13 T 10 9 38610 CASAVA_Build 1 23930745 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGC 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 AAG 3 4 38611 CASAVA_Build 1 23938938 2D GTGTTTTAAA TC/-- TCTCTAATGC 3070 het 1783 hom 19 4 13 2 TC 3 2 38612 CASAVA_Build 1 23944590 1I CTATTAATGA -/T TTTTTTTTTT 2203 het 2203 ref 39 22 7 10 T 15 16 38613 CASAVA_Build 1 23971923 1I AACTTTTACC -/T TTTTCATTTA 3070 hom 98 het 36 0 32 4 T 4 5 38614 CASAVA_Build 1 23979098 1I AATAGTATCA -/T TTTTCTTCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 4 5 38615 CASAVA_Build 1 23991108 1D GCTCCGTTTA G/- GGGGGGCGTG 2920 hom 45 het 20 0 12 8 G 7 6 38616 CASAVA_Build 1 24002118 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1046 het 1046 ref 30 18 3 9 T 11 12 38617 CASAVA_Build 1 24023025 4D ATGGGGAGTT ACTC/---- ACTGAGGCAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 8 ACTC 1 0 38618 CASAVA_Build 1 24024989 5I AGAGCCTGTC -----/AAAAA CAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 A 0 5 38619 CASAVA_Build 1 24025436 10I GTTTTGTTGG ----------/TTTGTTTTGT TTTGTTTTGT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 TTTGT 2 4 38620 CASAVA_Build 1 24032768 1D GACTCGGTCT A/- AAAAAAAAAA 2403 hom 27 het 12 0 8 4 A 14 13 38621 CASAVA_Build 1 24033854 1I AAGTGCTGGG -/A TTTCAGGCAT 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 A 0 1 38622 CASAVA_Build 1 24042403 1I TGGAAGCTGG -/A AAACTTGGGG 3070 het 3070 ref 42 15 14 13 A 3 4 38623 CASAVA_Build 1 24046420 1I CAGAGATTTC -/T TTTTTTTTTT 2710 het 2710 ref 31 15 10 6 T 13 14 38624 CASAVA_Build 1 24050895 1D GAGAACACAT G/- GGACACAGGA 3070 het 3070 ref 59 35 7 17 G 3 2 38625 CASAVA_Build 1 24072326 1I12M2I TTTTATTTTA -TTTTTTTGAGAC--/TTTTTTTTGAGACAG AGTCTTGCTC 3070 het 2061 hom 17 6 10 1 N/A 0 0 38626 CASAVA_Build 1 24072510 1I ACAGGGTTTC -/A ACCATATTGG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 2 38627 CASAVA_Build 1 24076227 1D GGTATACCTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 27 13 9 6 A 9 8 38628 CASAVA_Build 1 24083155 6I TTTATGTCTT ------/TTTTTG TTTTTGTTTT 3070 hom 57 het 29 0 19 11 TTTTTG 2 3 38629 CASAVA_Build 1 24083882 2D TCAAAAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 29 2 19 8 T 14 12 38630 CASAVA_Build 1 24085974 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 73 het 27 0 24 3 T 8 7 38631 CASAVA_Build 1 24094263 1D ACGCCACTGT G/- CTCCAGCCTG 3070 hom 75 het 26 0 26 1 G 1 0 38632 CASAVA_Build 1 24098470 6I TTCATTCCTG ------/GGCATA GGCTGAACTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GGCATA 0 1 38633 CASAVA_Build 1 24100118 1I TAACTCTTTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 8 38634 CASAVA_Build 1 24101298 12D TTGAGGGCCT CCCGAGTGACAA/------------ TGATCTCCAA 3070 hom 66 het 21 0 20 4 CCCGAGTGACAA 1 0 38635 CASAVA_Build 1 24105197 1I ATAGTTGTGA -/G TTCTGATTCT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 G 0 1 38636 CASAVA_Build 1 24105585 1D TTTCTCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 18 3 13 2 T 11 10 38637 CASAVA_Build 1 24113669 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 17 1 12 4 T 12 11 38638 CASAVA_Build 1 24114650 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 25 1 16 8 A 16 14 38639 CASAVA_Build 1 24115702 4D GCTGGGTGAC AGAG/---- AGAGAACCTT 3070 hom 93 het 34 0 31 6 AG 4 2 38640 CASAVA_Build 1 24116501 1I GGAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 31 1 21 9 A 12 13 38641 CASAVA_Build 1 24124272 1D TCATGATGCG C/- CCCCCCCCCT 3070 hom 4 het 24 1 14 9 C 10 9 38642 CASAVA_Build 1 24125442 7D TTTTCTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 20 0 12 8 T 16 9 38643 CASAVA_Build 1 24136889 2D CTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 22 1 12 9 T 15 13 38644 CASAVA_Build 1 24137876 1D ATTTTACTAC A/- AAAAAAAAAA 831 het 151 hom 18 2 5 11 A 17 16 38645 CASAVA_Build 1 24141763 4I AAAAAAAAAG ----/AAAA AAAAGGAAAT 1615 hom 27 het 13 0 10 3 A 4 8 38646 CASAVA_Build 1 24142161 4D AGAGTGAGAC TCTG/---- TCTGGAAAAA 3070 het 2979 hom 27 8 15 4 TCTG 2 1 38647 CASAVA_Build 1 24142619 1D TTACTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 30 0 17 13 T 13 12 38648 CASAVA_Build 1 24146469 1I TGCCAGGAGA -/T TTTTTTTTTT 2364 het 2364 ref 23 8 8 7 T 15 16 38649 CASAVA_Build 1 24150869 2D TGCCTGACTC AG/-- TGGAAATTCC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 AG 1 0 38650 CASAVA_Build 1 24153435 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 12 11 38651 CASAVA_Build 1 24154598 2D ACAGACCTGC AA/-- AAACATTCAA 3070 hom 102 het 40 0 33 8 A 5 3 38652 CASAVA_Build 1 24155646 1D TTTTCCTAAT G/- ATTTCATTGA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 G 1 0 38653 CASAVA_Build 1 24157905 4D TTTGGCCCAG AATT/---- ATTCACGCTC 3070 het 3070 ref 37 20 11 9 AATT 1 0 38654 CASAVA_Build 1 24160368 3D GAACGGCTTG CTT/--- TTTTGAGTTT 3070 het 3070 hom 40 9 22 10 CTT 1 0 38655 CASAVA_Build 1 24160400 3D GAATAGCCTG TTA/--- TTGAGTCTTG 3070 het 1926 hom 37 5 14 19 TTA 1 0 38656 CASAVA_Build 1 24161068 2I AAAAATAGAC --/TT CATCTCGTGT 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 T 0 2 38657 CASAVA_Build 1 24161117 4D AGTGCAACTT AAAC/---- TAATGATTGT 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 AAAC 1 0 38658 CASAVA_Build 1 24162479 6D GTACATGATA TGAATG/------ TGAAGCATAA 3070 het 3070 hom 40 15 17 10 TGAATG 1 0 38659 CASAVA_Build 1 24162675 2I ATTTCTGATC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 AT 5 6 38660 CASAVA_Build 1 24167605 4I TTTTGTGAAG ----/AGTA AGTGAGTTAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AGTA 0 1 38661 CASAVA_Build 1 24171509 1I TTTTGGTGTC -/T TTTTTTTTTT 1848 het 1105 hom 16 3 6 7 T 10 11 38662 CASAVA_Build 1 24173070 1D TCAGCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 269 hom 35 2 14 19 T 17 16 38663 CASAVA_Build 1 24173490 2D ACCAACTTTC AA/-- AAGAGTCCAC 3070 het 3070 ref 32 22 9 2 A 4 2 38664 CASAVA_Build 1 24175289 2D CTGCAGATTT AG/-- AGAGGTGATT 3070 het 3070 hom 40 19 18 5 AG 3 2 38665 CASAVA_Build 1 24178356 16D CTATTAGAAA TTATGGAAAGAATTAT/---------------- TTATGGAAAG 3070 het 3070 hom 47 18 28 7 TTATGGAAAGAATTAT 2 1 38666 CASAVA_Build 1 24178883 1D TTGGCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 25 1 18 6 A 11 10 38667 CASAVA_Build 1 24196255 1D CTGGCTAACT A/- AAAAAAAAAA 2620 het 2620 ref 19 9 6 4 A 12 11 38668 CASAVA_Build 1 24197688 7I CACAATCATG -------/GCTTACT GCATCCTCTA 3070 hom 53 het 24 0 18 7 GCTTACT 0 1 38669 CASAVA_Build 1 24206652 1D CATCTCCACA C/- ACACAAAAAA 3070 hom 46 het 21 0 15 6 C 1 0 38670 CASAVA_Build 1 24209195 3I AACCCAGACA ---/TCG TCTGAGATTT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 TCG 0 1 38671 CASAVA_Build 1 24214285 2D TGGGAAATAA CT/-- TATCACCCGG 3070 het 3070 ref 27 10 12 5 CT 1 0 38672 CASAVA_Build 1 24214533 1I CATAGGAGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 14 11 11 A 8 9 38673 CASAVA_Build 1 24215542 1D TCCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 23 0 17 6 T 12 11 38674 CASAVA_Build 1 24219198 1D CCAAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 29 1 20 8 T 12 11 38675 CASAVA_Build 1 24226459 1D CATAAACTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 71 het 30 0 24 6 T 9 8 38676 CASAVA_Build 1 24229045 1D CCCTAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 11 10 38677 CASAVA_Build 1 24229900 1D ACTCTTGTTG T/- TCAGGCTGGA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 2 1 38678 CASAVA_Build 1 24232244 1D TTCAGAAGTC T/- TTTTTTTTTT 2292 het 2292 ref 23 11 6 6 T 13 12 38679 CASAVA_Build 1 24233538 1D TGCTAAGAGC T/- TACAATAAGA 3070 hom 154 het 57 0 52 6 T 2 1 38680 CASAVA_Build 1 24233769 2I TTAATTAAAC --/TT TTTTTTTTTT 2786 het 2786 ref 34 16 11 7 T 11 13 38681 CASAVA_Build 1 24235306 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2151 het 200 hom 41 2 11 29 T 16 15 38682 CASAVA_Build 1 24252238 4I TTTATTTATC ----/TATT TATTTTGAGA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TATT 1 2 38683 CASAVA_Build 1 24253023 2D ATCCATGAGA AT/-- TACCCACTCC 3070 hom 51 het 19 0 18 2 AT 1 0 38684 CASAVA_Build 1 24253376 1D CTTTGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 28 4 20 4 A 15 14 38685 CASAVA_Build 1 24253739 1D TAGGCCCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 T 12 11 38686 CASAVA_Build 1 24262097 2D GGGGGACCAG AA/-- ACTCTGCTTG 3070 hom 99 het 34 0 31 3 A 3 1 38687 CASAVA_Build 1 24275585 10D31M1I CTAATGTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTC-/----------TTTTTTCTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCT TGTCGCCCAG 1501 het 1322 hom 16 8 6 2 N/A 0 0 38688 CASAVA_Build 1 24276143 1D AGGTGATCCA C/- CCCCCCTTGG 3070 hom 66 het 24 0 20 7 C 7 6 38689 CASAVA_Build 1 24295856 1I TCTCTCTCCC -/G GGGGGTCCTG 3070 hom 84 het 34 0 27 7 G 5 6 38690 CASAVA_Build 1 24308473 1D GTAAGTACAA C/- ATAAGTATTA 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 C 1 0 38691 CASAVA_Build 1 24309417 2D AGGTGGCAGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 GT 6 5 38692 CASAVA_Build 1 24313808 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 700 het 700 ref 26 19 3 4 A 11 10 38693 CASAVA_Build 1 24324212 3D GGTTGAACTC CTA/--- CTACAGGCCA 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 CTA 2 1 38694 CASAVA_Build 1 24335584 5D ACTGACTTAG GAGGT/----- GATGTTGAAG 3070 het 3070 ref 59 29 20 13 GAGGT 1 0 38695 CASAVA_Build 1 24336594 1D CCTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2738 het 372 hom 26 2 14 10 T 15 14 38696 CASAVA_Build 1 24341090 1D TTTCTTGGGG T/- CCCCCATCTC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 1 0 38697 CASAVA_Build 1 24343266 4I TGAATTGTAA ----/TTGT TTGTTATCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTGT 1 2 38698 CASAVA_Build 1 24350731 1I CGGGAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 10 11 38699 CASAVA_Build 1 24350986 1I AGGCATATTT -/G GGGGGTAACA 3070 het 3070 ref 52 35 13 4 G 5 6 38700 CASAVA_Build 1 24351470 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 8 7 38701 CASAVA_Build 1 24352012 1D GCACAGTGCT A/- AGACAGTCAC 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 A 2 1 38702 CASAVA_Build 1 24353200 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 11 10 38703 CASAVA_Build 1 24354294 2D TGTGTATGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 126 het 52 0 41 11 TG 7 6 38704 CASAVA_Build 1 24368166 1I AGCTGAACAT -/A AAAAAATAGG 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 6 7 38705 CASAVA_Build 1 24372913 1D TTTTTGTAAA G/- ATGGGGTCTC 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 G 1 0 38706 CASAVA_Build 1 24393070 1I TCCAAAGCTT -/C CTTTCTTTAT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 C 1 2 38707 CASAVA_Build 1 24394238 2D CATAAACAAC AT/-- ATATTTTGCA 3070 het 41 hom 29 1 27 2 AT 3 2 38708 CASAVA_Build 1 24395621 1D ACTCAGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 20 1 11 8 A 16 15 38709 CASAVA_Build 1 24401709 1D CACACTCATC T/- TTCAGACTCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 3 2 38710 CASAVA_Build 1 24403026 1I ACCACATGCC -/T TTTTTTTTTT 2149 het 2149 ref 28 8 14 6 T 15 16 38711 CASAVA_Build 1 24406475 1I GACCTCAGAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 11 13 3 T 8 9 38712 CASAVA_Build 1 24406755 1D GATTACAGGC G/- TGAGCCACTG 3070 het 3060 hom 27 9 15 3 G 1 0 38713 CASAVA_Build 1 24409079 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2189 hom 20 6 13 1 A 11 10 38714 CASAVA_Build 1 24410725 2D TCATGGTGAC AT/-- ATTTTCCATA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AT 2 1 38715 CASAVA_Build 1 24412181 1D TGTCCACTGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 9 8 38716 CASAVA_Build 1 24433329 1D TTCTTTCTCA C/- CCCCTTGTGT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 C 5 4 38717 CASAVA_Build 1 24452009 1D AGTCTCCGCG T/- TACAGCCCTC 3070 het 3070 ref 26 14 8 5 T 2 1 38718 CASAVA_Build 1 24462582 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 101 het 38 0 33 5 T 9 8 38719 CASAVA_Build 1 24466578 1I CCTACTTGGG -/A GAACTGTGGA 3070 hom 141 het 55 0 47 8 A 0 1 38720 CASAVA_Build 1 24480004 1D CATGTAAGGC T/- TTTTTCATTC 3070 het 3070 hom 36 19 16 1 T 6 5 38721 CASAVA_Build 1 24489543 1D AACTCTACTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 10 9 38722 CASAVA_Build 1 24491361 1I CTAGGCCTCA -/C AACACAGTGT 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 C 0 1 38723 CASAVA_Build 1 24496844 1D TCCACCCTAA G/- GGAAGGCTTG 3070 het 3070 hom 28 10 16 5 G 3 2 38724 CASAVA_Build 1 24497914 6D AAAGAAAAAA AGAAAG/------ AGAAAGAAAG 710 het 710 ref 32 20 5 7 AGAAAG 2 1 38725 CASAVA_Build 1 24498347 1I GCCTGCTTTT -/G GGTTCCTTCA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 G 2 3 38726 CASAVA_Build 1 24499131 6D ATAAAACCCG TACCTA/------ TACCTATCAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 5 TACCTA 2 1 38727 CASAVA_Build 1 24499459 2I TTCAAATGAC --/AT GTGTTGGAAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 AT 0 1 38728 CASAVA_Build 1 24502183 1D ACCCTTTTTT A/- AAAAAAATTG 2506 het 2506 ref 24 13 7 4 A 8 7 38729 CASAVA_Build 1 24507421 1D TACATTAAGA T/- TGGTTAAGAG 3070 het 3070 hom 46 14 28 4 T 2 1 38730 CASAVA_Build 1 24508345 18D ACAGCTATGG GGCACTTACTTTGTGCCA/------------------ GGCACTATAT 3070 het 3070 ref 44 27 13 7 GGCACTTACTTTGTGCCA 1 0 38731 CASAVA_Build 1 24515423 1D TTAAGGGGGG A/- AAAAAAGGCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 6 38732 CASAVA_Build 1 24524147 1I TGTGTCAGGG -/C CCTCCCTGTG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 C 2 3 38733 CASAVA_Build 1 24538359 1D CAGTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 21 3 10 8 T 12 11 38734 CASAVA_Build 1 24552924 3D GGGCCTAGCC CCT/--- CAAGTCTATC 3070 het 3070 ref 56 21 24 12 CCT 1 0 38735 CASAVA_Build 1 24554976 5D TTCATTTATC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 35 1 23 11 T 17 12 38736 CASAVA_Build 1 24576174 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 15 1 12 2 A 13 14 38737 CASAVA_Build 1 24579026 1I AACTCTGGCA -/G GTAACAATGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 2 38738 CASAVA_Build 1 24581864 1D TTGTGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 11 10 38739 CASAVA_Build 1 24589818 1I TTTAAGGAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 8 9 38740 CASAVA_Build 1 24589971 1I CGACCTCCTC -/A GGTTCAGGTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 0 1 38741 CASAVA_Build 1 24590906 1I AAACCGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 36 1 29 6 A 10 11 38742 CASAVA_Build 1 24591936 2I GAAATGGGGG --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 A 8 10 38743 CASAVA_Build 1 24595060 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 24 0 21 3 A 13 12 38744 CASAVA_Build 1 24604888 2I TTCTGAAGTC --/TA TTATTTTTTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TA 0 1 38745 CASAVA_Build 1 24605194 1D CCTACTTGTT A/- TATTGGCCCT 3070 hom 120 het 50 0 39 11 A 1 0 38746 CASAVA_Build 1 24624397 1D TTTTTTGCGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 8 7 38747 CASAVA_Build 1 24628432 1I AAATTTAAAC -/A TTGGCATTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 38748 CASAVA_Build 1 24637966 1D AGTGTGGTTT A/- AATGCTAGTA 3070 hom 105 het 40 0 33 7 A 3 2 38749 CASAVA_Build 1 24666385 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2490 hom 20 het 8 0 7 1 A 13 12 38750 CASAVA_Build 1 24671086 2D CTTCCTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 2624 het 235 hom 36 4 11 21 T 18 16 38751 CASAVA_Build 1 24672449 1I GTCAGGAGTT -/G TGAGACCATC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 0 1 38752 CASAVA_Build 1 24674300 3I GGTTTTATGA ---/AAT AATAAAATAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AAT 1 2 38753 CASAVA_Build 1 24675834 1I GTCTTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 13 14 38754 CASAVA_Build 1 24677871 1D TAAGTATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 8 T 11 10 38755 CASAVA_Build 1 24692892 1D CCCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2990 het 2137 hom 24 9 8 7 T 13 12 38756 CASAVA_Build 1 24699175 2D TCAACAGGAA AT/-- AGAGTCAAGA 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 AT 1 0 38757 CASAVA_Build 1 24703543 1I CCGCACCCAG -/C CCAAACCTTT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 C 2 3 38758 CASAVA_Build 1 24709291 2I GAGCATTGGC --/TT TTTAACTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 3 5 38759 CASAVA_Build 1 24720981 2D ATTGGTTGCT GG/-- GGGGGGTGGG 3070 het 1612 hom 18 6 9 4 G 8 6 38760 CASAVA_Build 1 24726235 13D3M1I CAGCCTCCAG AGTAACTAGGACTACA-/-------------ACAT GGTGTGTAAT 3070 het 3070 hom 30 15 17 3 N/A 0 0 38761 CASAVA_Build 1 24731112 1D CTTACAAATT A/- AAAAAAAAAG 1099 het 1099 ref 35 28 3 5 A 10 9 38762 CASAVA_Build 1 24736695 1D CCCTGATAGG A/- CCAGGTGTGG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 1 0 38763 CASAVA_Build 1 24741957 1D CACAGGAAAG A/- ATCTCATCTT 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 2 1 38764 CASAVA_Build 1 24745581 1D GACTTTGGAG A/- AAAGTCCGAT 3070 hom 62 het 25 0 22 4 A 4 3 38765 CASAVA_Build 1 24754367 3D TTCCTATAAA AAT/--- ACGTGTTTTC 3070 hom 88 het 34 0 30 5 AAT 1 0 38766 CASAVA_Build 1 24764489 1I ACACTTGTTC -/A TCTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 A 0 1 38767 CASAVA_Build 1 24771245 4I TATTTCTAGA ----/AACC AAGTTCTCTG 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 AACC 0 1 38768 CASAVA_Build 1 24773207 1D CTGAGAGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1814 hom 20 8 10 2 T 12 11 38769 CASAVA_Build 1 24774020 1I ATTACAGGCA -/C CCACCATCAT 3070 het 3070 ref 25 12 13 0 C 2 3 38770 CASAVA_Build 1 24776938 1I GCCGGGGGTC -/G GGGGGTCTTA 3070 het 2871 hom 25 9 11 5 G 5 6 38771 CASAVA_Build 1 24778276 2D AGGGTGGGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2613 het 2613 ref 31 15 7 9 T 13 11 38772 CASAVA_Build 1 24792400 1D TAGCCTCTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3027 hom 19 8 8 5 A 10 9 38773 CASAVA_Build 1 24793979 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 6 7 38774 CASAVA_Build 1 24794117 4D GAGTGGGAGG TTGA/---- TTGACATCTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 7 TTGA 2 1 38775 CASAVA_Build 1 24795034 1D AGCCTCTGGT A/- ACATACTAAG 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 2 1 38776 CASAVA_Build 1 24797366 1D GTGCCCAGCT G/- GGTGAATTGC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 G 3 2 38777 CASAVA_Build 1 24812759 1D TGCCGTGAAC A/- TTATGTACAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 A 1 0 38778 CASAVA_Build 1 24816388 1D TCTTATTATT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 A 1 0 38779 CASAVA_Build 1 24817628 1D CGTCTTTACT A/- AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 20 8 10 2 A 6 5 38780 CASAVA_Build 1 24821638 3I TAAATGTGAT ---/AAA CCGGATATTC 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 A 0 3 38781 CASAVA_Build 1 24827357 1D TCCAAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 A 13 12 38782 CASAVA_Build 1 24829676 1D CATCTTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1873 hom 32 9 13 10 A 15 14 38783 CASAVA_Build 1 24833433 2I AGCCGTGGTG --/GT GTGTGCCTGT 2001 het 605 hom 10 2 5 4 GT 2 3 38784 CASAVA_Build 1 24839656 1I AAAAGCTATG -/A AAAAAAAAAA 2585 het 2030 hom 18 6 8 4 A 13 14 38785 CASAVA_Build 1 24840026 1I CGAGATCCTG -/C CCACTGCACT 1803 het 1803 ref 17 7 4 6 C 2 3 38786 CASAVA_Build 1 24883379 2D TATTCATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 TG 9 8 38787 CASAVA_Build 1 24888497 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 43 1 38 4 T 11 10 38788 CASAVA_Build 1 24895975 3D CCAGGCTAGA GTT/--- CAGTGGCGCA 3070 het 2689 hom 30 7 13 11 GTT 1 0 38789 CASAVA_Build 1 24896103 4I TATTTGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3060 het 3060 ref 20 10 7 3 TTTG 2 3 38790 CASAVA_Build 1 24897952 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1126 hom 19 6 9 4 A 14 15 38791 CASAVA_Build 1 24900394 1I GGTGAAACCC -/T GTCTCTACTA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 0 1 38792 CASAVA_Build 1 24923844 1I ACTGAGGGCT -/G GGGGGAAAGG 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 G 5 6 38793 CASAVA_Build 1 24925510 1I GACTTCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3006 het 2802 hom 19 8 8 3 A 10 11 38794 CASAVA_Build 1 24927524 1I ATACATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1618 hom 28 5 15 8 T 13 14 38795 CASAVA_Build 1 24930657 1I GGTGCAGTGG -/C TCACGCCTGT 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 C 0 1 38796 CASAVA_Build 1 24940694 1D CCATAAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1586 het 1586 ref 37 19 5 13 T 15 14 38797 CASAVA_Build 1 24969802 3D CTCACACCAA TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 TTC 3 2 38798 CASAVA_Build 1 24975867 21D GTAGGGGCCT GTAGTCCCAGCTACTCGGGAG/--------------------- GCTGAGGCAG 3070 het 107 hom 12 1 11 2 GTAGTCCCAGCTACTCGGGAG 1 0 38799 CASAVA_Build 1 24981272 2D ACTACTAACT CA/-- GAGGAGGAAC 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 CA 1 0 38800 CASAVA_Build 1 24999994 2I GTAATCAGGG --/AC ACAAACACTG 2398 hom 12 het 6 0 5 1 AC 1 2 38801 CASAVA_Build 1 25017891 1D GTCTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 144 hom 27 1 20 6 A 13 12 38802 CASAVA_Build 1 25019798 4D TATTATTCAT TCTC/---- TATGAAGGAA 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 TC 2 0 38803 CASAVA_Build 1 25020277 1I AAGAAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 11 12 38804 CASAVA_Build 1 25044234 1D TCTCTACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 36 2 26 8 A 11 10 38805 CASAVA_Build 1 25045140 5D AGTTGAAAAA AATTC/----- AATTCAAAAG 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 AATTC 2 1 38806 CASAVA_Build 1 25045232 2D AATCCAACAC TG/-- TTAGTAAATT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TG 1 0 38807 CASAVA_Build 1 25045980 1I CCATGATGAA -/T TTTTTTTTTT 2505 het 423 hom 20 1 12 7 T 15 16 38808 CASAVA_Build 1 25055029 2D CATCTCCCCT CA/-- CAGTGTTGCA 3070 het 3070 hom 51 17 29 5 CA 2 1 38809 CASAVA_Build 1 25056224 1I GTCCAATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 12 13 38810 CASAVA_Build 1 25056564 1D GGAGCCTTGA G/- GGGGACAGTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 G 5 4 38811 CASAVA_Build 1 25061799 1I GGAGATGGGA -/C CCCCCCAGTG 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 C 6 7 38812 CASAVA_Build 1 25064254 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 952 hom 30 4 24 2 A 12 13 38813 CASAVA_Build 1 25073143 1I CTGTCTTAAG -/A AAAAAAAAAA 1479 het 1479 ref 21 10 7 4 A 15 16 38814 CASAVA_Build 1 25074187 8I ATCCCATTGT --------/CGATGTGA CGATGTGACG 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 CGATGTGA 1 2 38815 CASAVA_Build 1 25079653 12D AATATATATA TAGAATATATAG/------------ AAAAAATATA 2416 het 2416 ref 15 9 6 2 TAGAATATATAG 1 0 38816 CASAVA_Build 1 25082003 1I TTTTGTAGAT -/A TTTTTCATCA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 0 1 38817 CASAVA_Build 1 25086580 2D CAAAATTCAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 41 18 11 14 AC 9 8 38818 CASAVA_Build 1 25093006 4I TTCCAGGGGC ----/TACA TACAAATGGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TACA 1 2 38819 CASAVA_Build 1 25152031 1I AACTCAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2735 hom 24 6 11 7 T 10 11 38820 CASAVA_Build 1 25179162 1D CTCCCCTGAG C/- CCCCCCCTAG 3070 het 2594 hom 23 8 11 4 C 8 7 38821 CASAVA_Build 1 25181246 1D CTCCAAATAT C/- CCCCCCCCAT 3070 het 1943 hom 26 10 11 5 C 9 8 38822 CASAVA_Build 1 25203585 2I TCCACCAAGA --/GT GTGTCATGAA 3070 hom 83 het 33 0 23 10 GT 2 3 38823 CASAVA_Build 1 25212009 1I CATCAAAGTA -/G CCCCTAAGGG 3070 hom 93 het 32 0 29 3 G 0 1 38824 CASAVA_Build 1 25235080 6I CACTACCATA ------/ATCACC ATCACCATCA 3070 hom 185 het 78 0 58 20 ATCACC 2 3 38825 CASAVA_Build 1 25242637 1D AAATTACCAC A/- AAAAAAACTG 3070 hom 86 het 35 0 28 7 A 8 7 38826 CASAVA_Build 1 25243601 1D TATACCCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 76 het 34 0 26 8 T 10 9 38827 CASAVA_Build 1 25253360 4I TCTTTCCTTC ----/CTCT CTCCCTCCCT 938 het 82 hom 7 2 4 1 CT 1 3 38828 CASAVA_Build 1 25264258 2D CCTTCTTGCC CA/-- CAGTGTCCCA 3070 het 3070 ref 42 24 10 8 CA 2 1 38829 CASAVA_Build 1 25266967 12I AGACGGGAGC ------------/CACGGTGGTTTT CACGGTGGTT 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 CACGGTGGTTTT 0 1 38830 CASAVA_Build 1 25269387 2I AGCTCAGCCT --/CA GTTTTTCCAC 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 CA 0 1 38831 CASAVA_Build 1 25270118 2I TTTGCACAGC --/TG TCTCTCCTGC 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 TG 0 1 38832 CASAVA_Build 1 25274222 1D GCTGGCCTTG T/- CATGACAATC 3070 het 3070 hom 36 15 17 6 T 1 0 38833 CASAVA_Build 1 25278470 1D AAGTTTTTAT A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 32 15 16 2 A 7 6 38834 CASAVA_Build 1 25289591 3I AGCGGAGGAG ---/GAC CACAGAGGTT 3070 hom 21 het 17 0 8 9 GAC 0 1 38835 CASAVA_Build 1 25294666 1D CCCAGCACCA C/- CCCCCCACCA 3070 het 3070 hom 45 13 21 11 C 7 6 38836 CASAVA_Build 1 25300492 2D ATATTATTCC CT/-- GTTTCCCTGA 3070 het 3070 hom 38 11 15 13 CT 1 0 38837 CASAVA_Build 1 25310911 36I TGACATGTTT ------------------------------------/ATTGATTTCTCTGGAGCAGTTCATTCATAAAGGCCA ATTGAGCCCC 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 ATTGATTTCTCTGGAGCAGTTCATTCATAAAGGCCA 0 1 38838 CASAVA_Build 1 25312500 1I GGCTGAAGTC -/T TTTTTTTTTT 1395 het 1395 ref 34 17 7 10 T 15 16 38839 CASAVA_Build 1 25321737 1I ATCTCTATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 9 10 38840 CASAVA_Build 1 25346129 1D AGGCTGAGGC A/- GGGAGAATTG 3070 het 2022 hom 14 6 8 0 A 1 0 38841 CASAVA_Build 1 25353350 1D TAAAAGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 13 7 A 12 11 38842 CASAVA_Build 1 25355155 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 A 11 10 38843 CASAVA_Build 1 25356051 2D TTTAATCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2378 hom 17 7 9 1 A 13 11 38844 CASAVA_Build 1 25361013 4D AATAGCTGGA CATT/---- CACATACGAA 3070 het 3070 ref 39 22 15 6 CATT 1 0 38845 CASAVA_Build 1 25362468 1D AAAGCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2471 hom 31 8 15 10 A 11 10 38846 CASAVA_Build 1 25364326 1D GCGAGATAAC A/- ATACATGCTA 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 A 2 1 38847 CASAVA_Build 1 25377161 5D ATGGTGAAAC CTCGT/----- CTCTACTAAA 1828 het 1378 hom 10 3 5 2 CTCGT 1 0 38848 CASAVA_Build 1 25379741 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTATTT 3016 het 1187 hom 12 4 8 0 T 7 6 38849 CASAVA_Build 1 25443138 1I AGATACAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 31 1 26 4 T 12 13 38850 CASAVA_Build 1 25507115 2D GGGAAGTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 31 1 20 11 A 12 10 38851 CASAVA_Build 1 25523947 1D CGTGGTGCAA C/- CCTGTCTCTA 3070 het 1504 hom 14 5 9 0 C 3 2 38852 CASAVA_Build 1 25535453 1D CAAATATACC A/- CAATAATGAA 3070 hom 33 het 15 0 11 4 A 1 0 38853 CASAVA_Build 1 25558586 1I GATGAGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 35 2 23 10 A 14 15 38854 CASAVA_Build 1 25620497 1I AGCATTTTAA -/G GGGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 G 7 8 38855 CASAVA_Build 1 25646296 1I TTCCTACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 56 1 44 11 A 10 11 38856 CASAVA_Build 1 25668174 2D GCCTGCCTTG GC/-- CTCCCAAAGT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 GC 1 0 38857 CASAVA_Build 1 25672269 4D ATAGTTTGAC TCTG/---- TTTATATTAA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 TCTG 1 0 38858 CASAVA_Build 1 25694439 1D TAAAGAAATC A/- AACTTAAATC 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 A 3 2 38859 CASAVA_Build 1 25696459 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 757 hom 24 2 15 7 A 15 16 38860 CASAVA_Build 1 25700910 2D TGCCCTTAAC CT/-- CTCTAGGGTG 3070 hom 104 het 40 0 34 7 CT 3 2 38861 CASAVA_Build 1 25701270 3I CCATCCTGAG ---/CGT CTGACTTTCC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 CGT 0 1 38862 CASAVA_Build 1 25725217 6D GTAATCATTA TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 hom 94 het 35 0 31 4 TTG 8 6 38863 CASAVA_Build 1 25728582 3D12M1D8M4D CATGCATGTT GTGTGTATTGTGGGTCATGTGTATACTG/---TGTATTGTGTGT-ATGAGGGT---- TGTGTGCTGT 2085 het 2085 ref 23 20 10 7 N/A 0 0 38864 CASAVA_Build 1 25731433 1D AGTTTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 38 0 24 14 T 11 10 38865 CASAVA_Build 1 25738338 8D AAAAAAAGTG TATATATA/-------- TATATATATA 3070 hom 31 het 14 0 11 6 TA 11 7 38866 CASAVA_Build 1 25766515 1D ATTTCAGTGA T/- TTTTCCCCCC 3070 hom 67 het 28 0 20 8 T 5 4 38867 CASAVA_Build 1 25767056 2I ATGAGGAAAC --/TG AGGCCTCAAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 TG 0 1 38868 CASAVA_Build 1 25778893 1D CACCACTACA T/- TACCACAGCT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 1 38869 CASAVA_Build 1 25836987 1I CCATCCTTTT -/A TTTTTTTAAC 3070 het 2939 hom 28 8 17 3 A 0 1 38870 CASAVA_Build 1 25860162 1I TGAAATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 11 12 38871 CASAVA_Build 1 25873852 1I GTGACTTCCT -/G GGGCCTGATG 3070 hom 111 het 40 0 34 6 G 3 4 38872 CASAVA_Build 1 25898384 1D ATCTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 1382 het 1382 ref 26 11 7 8 A 16 15 38873 CASAVA_Build 1 25944414 2D TTTTCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 12 10 38874 CASAVA_Build 1 25949302 3D AGCCCATCTT CTC/--- CTCCCTGCGA 3070 hom 81 het 32 0 27 6 CTC 2 1 38875 CASAVA_Build 1 25949518 2D ACCCAGAGAC AA/-- ATAATGATGC 3070 hom 47 het 20 0 12 8 A 3 1 38876 CASAVA_Build 1 25955543 1I CATGTGGGGG -/A AAAAGGAGAA 3070 hom 72 het 28 0 22 6 A 4 5 38877 CASAVA_Build 1 25956579 4D ACTGAGGCAC GGGG/---- GGGGGGGGCA 3070 hom 74 het 28 0 23 7 G 12 8 38878 CASAVA_Build 1 25957636 1D CCTGGCCAAA G/- GGGGGATGAC 3070 hom 83 het 32 0 21 11 G 6 5 38879 CASAVA_Build 1 25961525 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 27 0 19 8 T 12 11 38880 CASAVA_Build 1 25966704 2D19M1I ACACTCCCCT CACACACACACATTACACACT-/--CACACACACATTACACACTC CCCCCCACAC 3070 het 95 hom 35 2 25 12 N/A 0 0 38881 CASAVA_Build 1 25967652 1D CACTCCCCCC A/- CACACAGACC 3070 het 454 hom 24 5 15 5 A 1 0 38882 CASAVA_Build 1 25973902 1D TTAATACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 36 1 27 8 A 12 11 38883 CASAVA_Build 1 25987005 1D AGATTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 1878 het 1878 ref 29 16 4 10 T 15 14 38884 CASAVA_Build 1 25987683 2D TTTTATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 22 6 T 14 12 38885 CASAVA_Build 1 25992660 3I ACCTTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 29 0 18 11 A 15 18 38886 CASAVA_Build 1 25993736 1D CTCAGGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 18 1 13 4 T 15 14 38887 CASAVA_Build 1 25996270 42D GAGAGAGAAA GAGAGAGAGACACACACACATCAGGGGTGTGTGTGTGTGTAG/------------------------------------------ GAGAGAGAGA 1189 het 1172 hom 19 5 4 26 GAGAGAGAGACACACACACATCAGGGGTGTGTGTGTGTGTAG 1 0 38888 CASAVA_Build 1 25998862 1D CCGGCTGCCA G/- CAGAGGAGGA 1652 het 1652 ref 24 11 7 6 G 1 0 38889 CASAVA_Build 1 26000770 1I CCAAAAAAAC -/A AAAAAAACCA 3070 het 2678 hom 24 7 11 6 A 7 8 38890 CASAVA_Build 1 26011549 2I ATACACACAC --/AT ACATACACAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AT 0 1 38891 CASAVA_Build 1 26017025 1D CTCTCTGCCT C/- CCCCCCCATC 3070 hom 40 het 17 0 14 3 C 8 7 38892 CASAVA_Build 1 26021944 2D GGACTTAGAG CT/-- AAGTGTTGGG 3070 hom 76 het 28 0 22 6 CT 1 0 38893 CASAVA_Build 1 26031488 2I CTGTCACTCA --/CT CTCAGCAGCT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 CT 1 2 38894 CASAVA_Build 1 26056326 1D CACATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 2498 het 146 hom 17 1 9 7 T 19 18 38895 CASAVA_Build 1 26064253 2I AAACAAAAAA --/AC ACATTTCTTC 2051 hom 30 het 14 0 9 5 AC 1 2 38896 CASAVA_Build 1 26068647 2D GAGACTCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 28 1 16 12 A 15 13 38897 CASAVA_Build 1 26073261 2I ATGCCCAGAC --/TT TTTTTTTTTT 2632 hom 36 het 15 0 11 4 T 16 18 38898 CASAVA_Build 1 26090410 2D ACTCCATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 32 0 26 7 A 16 14 38899 CASAVA_Build 1 26098386 1I TCTTTATATT -/C CCCATCTATT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 C 3 4 38900 CASAVA_Build 1 26123467 1D CCTTTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 31 3 22 6 A 14 13 38901 CASAVA_Build 1 26124888 1D ACCTCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 1731 het 1731 ref 20 13 4 3 A 15 14 38902 CASAVA_Build 1 26127427 1D CAACATAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 107 het 37 0 35 2 A 11 10 38903 CASAVA_Build 1 26131090 1D GTCTCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 1883 het 1883 ref 21 11 5 5 A 11 10 38904 CASAVA_Build 1 26132466 1I AAGGATTTAC -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 6 7 38905 CASAVA_Build 1 26133801 1I TACAATACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2703 hom 20 7 10 3 T 11 12 38906 CASAVA_Build 1 26134274 1D AGGGTAAATA T/- TTTTTTACCG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 7 6 38907 CASAVA_Build 1 26146656 1D CCCTGTCTTT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 A 8 7 38908 CASAVA_Build 1 26148585 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2682 hom 24 het 9 0 9 0 T 12 13 38909 CASAVA_Build 1 26154830 4D AGGAAGAAGG AGGA/---- AGGAAGGAAG 3070 het 3070 hom 26 10 10 7 AGGA 4 3 38910 CASAVA_Build 1 26156367 2I TTCTTGAAGC --/CT CTGTTTCCTC 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 CT 1 2 38911 CASAVA_Build 1 26165180 1D GGCCATTATT A/- AAAAGTCCAG 3070 het 3070 ref 26 14 8 7 A 5 4 38912 CASAVA_Build 1 26174022 4D CACTTCATTC ATTT/---- AATTATTCAT 3070 het 3070 hom 49 17 27 7 ATTT 1 0 38913 CASAVA_Build 1 26180299 1D ATAATTGTGT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 8 7 38914 CASAVA_Build 1 26191184 1D AACCGTTTGA T/- TTTTTTGAGA 3070 het 2795 hom 31 7 21 3 T 7 6 38915 CASAVA_Build 1 26205054 1D GGCAGCAGAT G/- GGGTGCAGCA 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 G 4 3 38916 CASAVA_Build 1 26213646 2D CTCTAAATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 8 A 16 14 38917 CASAVA_Build 1 26214598 4D AAAAAAAGGT CAAA/---- CAAAGTTACT 3070 hom 81 het 30 0 25 5 CAAA 2 1 38918 CASAVA_Build 1 26221697 1I GCCTCCCAGC -/T TTCCCTAGCC 3070 hom 86 het 37 0 24 13 T 2 3 38919 CASAVA_Build 1 26225376 2I AAGAAAAAAA --/AT TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 19 0 16 3 AT 0 1 38920 CASAVA_Build 1 26231340 1I GGATCCAACT -/A AACCCTTCTC 3070 hom 107 het 41 0 35 6 A 2 3 38921 CASAVA_Build 1 26248054 1I GGCAATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 32 2 21 9 T 12 13 38922 CASAVA_Build 1 26248988 1I GACACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 975 hom 39 4 30 5 T 11 12 38923 CASAVA_Build 1 26271172 1D TTTTTTTTTT G/- TTGTTGTTTT 1292 het 1101 hom 18 5 7 6 G 1 0 38924 CASAVA_Build 1 26278313 1D ACTCATGAGG C/- TTTGCACTCA 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 C 1 0 38925 CASAVA_Build 1 26281971 1D ATTCTTTTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2210 hom 27 7 17 3 T 9 8 38926 CASAVA_Build 1 26297998 1D ACCCTACCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 68 het 26 0 23 3 A 9 8 38927 CASAVA_Build 1 26304794 7I CAAAAAAAAA -------/AAAAAAG AAAGAAAGAA 1675 het 39 hom 13 1 6 6 AAAAAAG 0 1 38928 CASAVA_Build 1 26307812 4I CAGATGGTTC ----/ATTT GTTTCCATTT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 ATTT 0 1 38929 CASAVA_Build 1 26308940 5I AAAAAAAATG -----/ACATA ACATAATAAG 3070 het 3070 hom 42 18 24 0 ACATA 1 2 38930 CASAVA_Build 1 26309455 1I ACCGTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 2733 het 2733 ref 31 15 13 3 T 12 13 38931 CASAVA_Build 1 26312413 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 934 hom 7 het 3 0 3 1 A 9 8 38932 CASAVA_Build 1 26319450 2D22M1D GGTAAATAAT TATGTGATCTGTACCTTTCTTTCAT/--TGTGATCTGTACCTTTCTTTCA- TTTTCTGTCT 3070 het 3070 ref 52 36 29 6 N/A 0 0 38933 CASAVA_Build 1 26321923 2D AAGAGCTAAC AA/-- GAGAAGAGAG 2658 het 2658 ref 19 11 6 3 A 2 0 38934 CASAVA_Build 1 26324612 2I GAGTTTCAAC --/AA AAAAAAAAAA 2897 het 2897 ref 33 14 10 9 A 10 12 38935 CASAVA_Build 1 26351435 3D TTTTTGTTAT TAA/--- TATCTTACTG 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 TAA 1 0 38936 CASAVA_Build 1 26353883 1D TCTGCCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 A 12 11 38937 CASAVA_Build 1 26365417 2I TTGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 15 11 14 GT 6 7 38938 CASAVA_Build 1 26371289 1D CATATAACCC T/- TTTTTTTTTT 1880 het 767 hom 33 6 10 18 T 17 16 38939 CASAVA_Build 1 26371869 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1577 hom 23 het 10 0 7 3 A 17 16 38940 CASAVA_Build 1 26388117 7D ACCCTGGGCA CCAGACT/------- CCAGACTCCA 3046 hom 35 het 21 0 8 14 CCAGACT 3 2 38941 CASAVA_Build 1 26403407 1D CCTAACTGTC T/- GAAAGGCTTG 3070 het 3070 hom 45 17 24 5 T 1 0 38942 CASAVA_Build 1 26409716 2D ACACATCATA AC/-- ACAGTCTCAC 3070 het 3070 ref 57 27 24 7 AC 2 1 38943 CASAVA_Build 1 26411041 1I CTATTGTGTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 7 8 38944 CASAVA_Build 1 26418695 1D CAAAACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 23 0 16 7 T 11 10 38945 CASAVA_Build 1 26425264 1D AAAATACAGG A/- AAAAAAAAAA 1409 het 505 hom 9 1 5 3 A 12 11 38946 CASAVA_Build 1 26441873 4I CATTAGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 95 het 39 0 32 7 TTTG 3 4 38947 CASAVA_Build 1 26442390 10D GTGATGGTGG TCTTGGTTGA/---------- GGGTTGCTGC 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 TCTTGGTTGA 1 0 38948 CASAVA_Build 1 26445058 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 11 12 38949 CASAVA_Build 1 26449244 2D GGTGTAACTC AG/-- AGGTCCCCAA 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 AG 2 1 38950 CASAVA_Build 1 26450336 1I TTGGTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 19 2 11 6 G 0 1 38951 CASAVA_Build 1 26473102 1D TCCTTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 11 10 38952 CASAVA_Build 1 26478036 4D CCTCATGTCC CTAT/---- CTATCTCTGC 3070 hom 79 het 32 0 25 8 CTAT 2 1 38953 CASAVA_Build 1 26485672 1D AGTAACCATG T/- TAAGAGCCAG 3070 het 3070 ref 46 24 19 4 T 2 1 38954 CASAVA_Build 1 26485913 1I AGTAGCTGGG -/A ATTACAGGCA 3070 het 1569 hom 14 4 10 0 A 1 2 38955 CASAVA_Build 1 26486374 3D AAAGCTCTGG CCT/--- CCTCTTCTGA 3070 hom 122 het 45 0 40 6 CCT 2 1 38956 CASAVA_Build 1 26493434 1I GGGGAGATGC -/A GGGGCACCGT 3070 hom 77 het 28 0 24 4 A 0 1 38957 CASAVA_Build 1 26494754 1D CCCAATGTCA C/- CCCCGCAGGT 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 C 5 4 38958 CASAVA_Build 1 26499713 2I TACCCTCAGA --/CT CTTCATCCCT 3070 hom 86 het 32 0 28 4 CT 1 2 38959 CASAVA_Build 1 26504756 1I AAGCTGTCAT -/A GGGAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 0 1 38960 CASAVA_Build 1 26506565 3D TTCCTGCTGT TAA/--- TCATCATCAT 3070 het 2540 hom 28 10 17 3 TAA 1 0 38961 CASAVA_Build 1 26509628 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAGAA 336 hom 15 het 11 0 5 6 G 1 0 38962 CASAVA_Build 1 26509882 1D GCTCATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 25 0 14 11 T 12 11 38963 CASAVA_Build 1 26516623 21D CTTTAAACAA CAAACTCATTTACGGAATATC/--------------------- TGCTATGTTC 3070 het 3070 ref 34 23 12 4 CAAACTCATTTACGGAATATC 1 0 38964 CASAVA_Build 1 26576372 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 26 0 20 6 A 12 11 38965 CASAVA_Build 1 26590123 1D CCTTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 11 4 A 12 11 38966 CASAVA_Build 1 26591819 1I AGGACATGGA -/G GGAGTAGAGA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 G 2 3 38967 CASAVA_Build 1 26595067 3I ATCCTTCCTC ---/GAT GATGGCTGAA 3070 het 3070 ref 43 15 16 12 GAT 1 2 38968 CASAVA_Build 1 26598238 5I ATTGAATGAA -----/TGAAG TGAAGGTCTC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 TGAAG 1 2 38969 CASAVA_Build 1 26603802 1I AAACAAACAG -/A AAATAATTAG 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 A 3 4 38970 CASAVA_Build 1 26614764 23D GCTTTCTGGG CTGGGCACAACATAGAATATGGC/----------------------- CTGGGCACAA 3070 het 3070 ref 30 19 13 7 CTGGGCACAACATAGAATATGGC 1 0 38971 CASAVA_Build 1 26617948 1I TAGTTCTCTC -/A CCGTGACCAT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 A 0 1 38972 CASAVA_Build 1 26620101 1D CAACAACTAC T/- TTTTTTTTTT 1058 het 1058 ref 46 29 5 12 T 13 12 38973 CASAVA_Build 1 26638658 1D GACCTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1243 het 1243 ref 44 35 3 6 A 11 10 38974 CASAVA_Build 1 26642131 6I TATTTCTAAC ------/TTTTTT TTTTTAATAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 5 11 38975 CASAVA_Build 1 26644162 4I CCTGGTTCTC ----/CATT CATCAGCTGT 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 CATT 0 1 38976 CASAVA_Build 1 26656644 2D TGTATTCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2960 het 871 hom 26 5 8 13 A 18 16 38977 CASAVA_Build 1 26667306 1D GAATGTTCAT A/- GGGGGGTCAT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 1 0 38978 CASAVA_Build 1 26686188 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 641 hom 23 3 10 10 A 17 16 38979 CASAVA_Build 1 26698237 4D CTTGGTTCTC CTAT/---- CTCATTCCCT 3070 het 3070 ref 52 23 22 13 CTAT 1 0 38980 CASAVA_Build 1 26763859 4D CCCTGTGCTT TTAA/---- TTGTCATGTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 7 TTAA 1 0 38981 CASAVA_Build 1 26766099 2I TACATATTAA --/CT CTTTTTTTTT 2712 het 386 hom 25 3 10 12 CT 1 2 38982 CASAVA_Build 1 26768248 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1771 hom 29 7 10 12 A 14 12 38983 CASAVA_Build 1 26770098 1I CTACTTGGGA -/G GCTGAGGCAG 1753 het 1753 ref 15 7 6 2 G 1 2 38984 CASAVA_Build 1 26773016 1I ACTGTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2361 hom 25 10 10 5 A 13 14 38985 CASAVA_Build 1 26778148 1D CTATTTAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 9 8 38986 CASAVA_Build 1 26778383 1D TCTGCTTTAC A/- AGGCTCAAGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 1 38987 CASAVA_Build 1 26958136 1D CTCCAGTGTT A/- ACTGTCAGAT 3070 hom 153 het 54 0 50 4 A 2 1 38988 CASAVA_Build 1 27045294 12I ACGTATATAC ------------/ATATATATGTGT ATATATATGT 2818 hom 18 het 9 0 7 2 ATATATATGTGT 1 2 38989 CASAVA_Build 1 27186911 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1816 hom 17 6 10 1 T 13 12 38990 CASAVA_Build 1 27239147 6D GAGCCCAGAG CCCAGA/------ GTGACTGCTC 2868 hom 41 het 15 0 10 5 CCCAGA 1 0 38991 CASAVA_Build 1 27239326 5D GTTTCCCCCC CCCCG/----- GCTCTCTTGC 3070 hom 69 het 26 0 20 6 CCCCG 1 0 38992 CASAVA_Build 1 27250260 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1381 het 1381 ref 33 16 6 11 A 13 14 38993 CASAVA_Build 1 27254359 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATAAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 6 7 38994 CASAVA_Build 1 27255628 8D TTACAAATAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 19 0 14 5 T 22 14 38995 CASAVA_Build 1 27272799 3D ACAAAAAAAC CAA/--- CAACAACAAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 CAA 7 6 38996 CASAVA_Build 1 27277350 1D TCTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1397 het 42 hom 20 1 7 12 T 17 16 38997 CASAVA_Build 1 27278585 4I TGTTGCCTCT ----/TTGA TTGCACACTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TTGA 0 1 38998 CASAVA_Build 1 27286343 1D CAGGCATGCG C/- CCCAGCTAAT 3070 hom 63 het 24 0 19 5 C 4 3 38999 CASAVA_Build 1 27290878 1D CAAAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 1234 het 1234 ref 56 35 4 17 T 13 12 39000 CASAVA_Build 1 27291376 1I TCTACTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 22 0 14 8 A 13 14 39001 CASAVA_Build 1 27292866 1I CTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2723 hom 30 het 18 0 8 10 T 14 15 39002 CASAVA_Build 1 27297685 3D CACTGGGCAC TGG/--- TTAGTGCCGC 3070 hom 63 het 29 0 18 11 TGG 1 0 39003 CASAVA_Build 1 27314511 1D AAGTAGGTGG A/- AAAAAATCTG 3070 hom 99 het 40 0 32 8 A 7 6 39004 CASAVA_Build 1 27327337 2D CCCTGAACCT CA/-- GTTTCTTCCT 3070 hom 105 het 36 0 35 1 CA 1 0 39005 CASAVA_Build 1 27335609 1D GGATAAGACC A/- GGAGTTTTGA 3070 hom 90 het 32 0 30 3 A 1 0 39006 CASAVA_Build 1 27346190 8D TCTCTACTAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 1661 hom 10 het 8 0 4 4 AAAC 6 4 39007 CASAVA_Build 1 27365238 8D AAATAAATAC ATAAATAT/-------- ATAAATACAT 3070 hom 84 het 27 0 29 2 ATAAATAT 1 0 39008 CASAVA_Build 1 27367442 5D CCAAAATATG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 18 0 13 5 A 20 15 39009 CASAVA_Build 1 27375119 1I ATAGGCGTGA -/G CCACCGCGCC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 G 0 1 39010 CASAVA_Build 1 27376038 1I TTGAGAAGTT -/C CCCCTGGGGG 3070 hom 54 het 20 0 17 3 C 4 5 39011 CASAVA_Build 1 27379136 1D ATACTTTCAT A/- GATAGAATTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 1 0 39012 CASAVA_Build 1 27384665 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 36 het 15 0 10 6 A 7 6 39013 CASAVA_Build 1 27410153 3I GTATGTAAAT ---/GAA GACAATCCAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GAA 0 1 39014 CASAVA_Build 1 27411942 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 9 8 39015 CASAVA_Build 1 27425842 1D CTACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 25 1 20 4 A 11 10 39016 CASAVA_Build 1 27437367 1I ATACTTGAAG -/A ATTGTCATGG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 1 2 39017 CASAVA_Build 1 27448345 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 730 hom 35 4 21 10 A 14 15 39018 CASAVA_Build 1 27476114 1I TATGTTTTAT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 0 1 39019 CASAVA_Build 1 27534343 3I GGGGGTGGTT ---/GTA GGGTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 GTA 0 1 39020 CASAVA_Build 1 27555028 1I AGGGCACAGT -/G AGAAGAGCAG 3070 het 3070 ref 54 33 17 4 G 0 1 39021 CASAVA_Build 1 27567728 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTCG 1491 het 615 hom 6 2 4 0 A 6 7 39022 CASAVA_Build 1 27570376 9I AGAACCAAGA ---------/TATTTGGCC ACGCTTGGTG 3070 het 2716 hom 26 7 13 6 TATTTGGCC 0 1 39023 CASAVA_Build 1 27793782 6D CCTGGGCAGC AGAGAG/------ AGAGAGAGCG 3070 het 1777 hom 23 7 10 9 AG 7 4 39024 CASAVA_Build 1 27835142 1D ACCCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 86 hom 20 1 10 9 A 12 11 39025 CASAVA_Build 1 27855050 1D GACCCTGGCC G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 30 het 18 0 13 5 G 8 7 39026 CASAVA_Build 1 27857074 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 23 0 21 2 A 12 11 39027 CASAVA_Build 1 27862348 2I TAACCCTGGT --/GA TGCCTGCCCC 3070 hom 78 het 28 0 21 7 GA 0 1 39028 CASAVA_Build 1 27865726 8I GTGAGTCCCA --------/TTTTTACC TTGCCTTGAC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TTTTTACC 0 1 39029 CASAVA_Build 1 27869552 1D GCCCAACTAA T/- TTTTTTTTTT 1402 het 1402 ref 27 20 5 2 T 17 16 39030 CASAVA_Build 1 27896884 2I ACATATGTAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 120 het 53 0 41 12 AC 7 8 39031 CASAVA_Build 1 27897540 1I AGCAGCTAAT -/G TCAGTCTTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 39032 CASAVA_Build 1 27898269 1D AAAAAACCCT A/- ACCATGGGAA 748 hom 17 het 11 0 7 4 A 2 1 39033 CASAVA_Build 1 27919148 1I26M1I GCAGGGTTTA -CAGCTCTGCACATTTGGCCCTGGTGT-/CCAGCTCTGCACATTTGGCCCTGGTGTC CCTGGCGGCA 3070 hom 60 het 25 0 19 11 N/A 0 0 39034 CASAVA_Build 1 27947667 1I GCAGGCTCCG -/C CCCCCGGGGT 3000 hom 24 het 10 0 9 1 C 5 6 39035 CASAVA_Build 1 27958865 1D CCCTTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 1017 het 1017 ref 35 28 3 4 T 12 11 39036 CASAVA_Build 1 27960360 1D ATGCCTCTTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 9 8 39037 CASAVA_Build 1 27990450 1I TGGCAGGAGG -/C CCTGGAACCA 3070 hom 65 het 26 0 21 5 C 2 3 39038 CASAVA_Build 1 27999106 1I CACCCACCTT -/G GCCTTCCAAA 3070 hom 128 het 45 0 41 4 G 1 2 39039 CASAVA_Build 1 28008377 1D GGTGGTAGTG C/- AGCCGAGATC 588 het 3 hom 4 0 2 2 C 1 0 39040 CASAVA_Build 1 28013537 1I TGAGGCAGAA -/G GATCACTTGA 2292 het 2292 ref 19 10 6 3 G 1 2 39041 CASAVA_Build 1 28023163 1D CCCATCTCCA T/- TTTTTTTTTA 284 het 284 ref 26 21 2 3 T 10 9 39042 CASAVA_Build 1 28029764 1D ACAAACGCTG A/- AAAAAAAAAA 850 het 850 ref 23 13 3 8 A 12 11 39043 CASAVA_Build 1 28042593 1D CATCTCTATT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 8 7 39044 CASAVA_Build 1 28059078 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 40 hom 23 1 13 9 A 10 9 39045 CASAVA_Build 1 28085620 1D GGTGAAATGA G/- GAGGAGCCAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 G 2 1 39046 CASAVA_Build 1 28089707 2D ATGTTAACAA CT/-- CTGCATGTAT 3070 het 3070 ref 42 26 15 2 CT 2 1 39047 CASAVA_Build 1 28095176 4D TACATATATT TTTG/---- TTTATTACTT 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 TTTG 1 0 39048 CASAVA_Build 1 28101115 1D TAAACATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 11 10 39049 CASAVA_Build 1 28102406 3D AACGACTGAA AAG/--- AAGTTAAATG 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 AAG 2 1 39050 CASAVA_Build 1 28111192 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1492 hom 18 4 12 2 A 11 10 39051 CASAVA_Build 1 28118733 1D TCAAGTGATT C/- TCCTGCCTCA 3070 hom 41 het 19 0 18 1 C 1 0 39052 CASAVA_Build 1 28118794 1I CCCAGCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 22 0 14 8 T 10 11 39053 CASAVA_Build 1 28120262 4D TCTCAAAAAC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 hom 47 het 18 0 16 6 ACAA 6 5 39054 CASAVA_Build 1 28121140 1D GCAGTGGCAG A/- ATCTCAGCTC 3070 hom 72 het 25 0 24 3 A 2 1 39055 CASAVA_Build 1 28123136 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 22 0 20 2 A 11 10 39056 CASAVA_Build 1 28124710 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACTC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 AG 2 1 39057 CASAVA_Build 1 28129960 1D CACCACTGTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 8 7 39058 CASAVA_Build 1 28134246 1I AACAGTGCCT -/G GAGAATCCCA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 1 2 39059 CASAVA_Build 1 28139544 9I CCATTTATGA ---------/CGTTCTGTT AATCATCTCA 3070 hom 66 het 24 0 19 5 CGTTCTGTT 0 1 39060 CASAVA_Build 1 28150177 2I CTATGATTTA --/AC ACACAAATGT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 AC 2 3 39061 CASAVA_Build 1 28151266 1I CTCATAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2712 hom 41 10 15 16 T 12 13 39062 CASAVA_Build 1 28192162 1D TAAACCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2663 hom 24 10 10 5 A 11 10 39063 CASAVA_Build 1 28196306 1D CTAACAGGTT G/- TGAGCTCTTT 3070 het 3070 ref 58 30 22 6 G 1 0 39064 CASAVA_Build 1 28213817 2D7M1I CAGAGCAAGA CTCTGTCTC-/--CTGTCTCA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 8 N/A 0 0 39065 CASAVA_Build 1 28225859 1I ACAAGGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1250 hom 26 4 14 8 A 12 13 39066 CASAVA_Build 1 28237185 2I TCTTAGTGAC --/TT TAACCCACCA 3070 het 3070 hom 62 30 29 3 T 1 3 39067 CASAVA_Build 1 28245943 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 34 2 24 8 T 13 14 39068 CASAVA_Build 1 28262087 4D GCGACAGGAA ACTG/---- ACTAACGCTC 3070 het 2573 hom 25 9 9 9 ACTG 1 0 39069 CASAVA_Build 1 28275795 1I GAAAGAAAAG -/A AAAAAAAATG 2295 hom 18 het 8 0 6 2 A 8 9 39070 CASAVA_Build 1 28279254 1I ACAATAAAAC -/A AAATAGAGGC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 3 4 39071 CASAVA_Build 1 28285322 1I TTGTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 T 12 13 39072 CASAVA_Build 1 28293126 1I AACACCTTAC -/A GGAATGCATG 3070 hom 114 het 39 0 38 1 A 0 1 39073 CASAVA_Build 1 28311230 1I GTTAATAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 12 13 39074 CASAVA_Build 1 28311761 2D GGTTTTTAAA AC/-- ACAGATTGCT 1714 het 1714 ref 24 14 6 4 AC 2 1 39075 CASAVA_Build 1 28337403 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 T 12 11 39076 CASAVA_Build 1 28384806 1D AGGAAAAAAA G/- GTTACGAAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 2 1 39077 CASAVA_Build 1 28418869 1I TCCGCCTCCT -/G GGTTCAAGCA 2698 het 2698 ref 24 10 8 6 G 2 3 39078 CASAVA_Build 1 28419114 3I ATGGGTGATA ---/GTG GTGTTGTGGT 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 GTG 1 2 39079 CASAVA_Build 1 28428578 1D TAATTTTAAG A/- AAAAAAAAAT 2661 het 2661 ref 23 12 7 4 A 10 9 39080 CASAVA_Build 1 28432598 4I GTACAGGAAT ----/TACA TACAGGCATG 3070 het 1052 hom 19 5 9 5 TACA 1 2 39081 CASAVA_Build 1 28437353 4D TAGGTGTGAC ACAG/---- ACAAAGTACC 3070 het 3070 ref 52 28 18 8 ACAG 1 0 39082 CASAVA_Build 1 28438455 1I CCATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2096 het 2096 ref 33 21 7 5 A 11 12 39083 CASAVA_Build 1 28446295 1I TTCTCGCGGA -/G GCGGGGCTAG 2487 het 2130 hom 20 7 7 6 G 1 2 39084 CASAVA_Build 1 28463661 1D TGTGTTGCAC T/- TTTCTTGTTC 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 T 4 3 39085 CASAVA_Build 1 28464187 1I ATGGAAGCCC -/T TAGTAGTAGC 3070 het 3070 ref 50 25 15 10 T 1 2 39086 CASAVA_Build 1 28464937 1I CTAGATCTTT -/A ACAGGCCTTG 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 A 1 2 39087 CASAVA_Build 1 28517103 4I TCCTGATGGG ----/ATTA ATTATCTCTC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 ATTA 1 2 39088 CASAVA_Build 1 28520297 2D ACTAATTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 924 hom 33 6 10 19 T 18 16 39089 CASAVA_Build 1 28539402 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 24 16 3 6 A 12 11 39090 CASAVA_Build 1 28551350 1I CTGGGATTAC -/A AGGCGTGAGC 3070 het 2396 hom 18 8 9 1 A 1 2 39091 CASAVA_Build 1 28558187 1D ATTCAGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3010 hom 34 10 19 5 A 12 11 39092 CASAVA_Build 1 28561891 1I CTCAAAAAAA -/T AAATAAATAA 2459 het 2459 ref 20 11 8 1 T 0 1 39093 CASAVA_Build 1 28561996 1D TCTCCTCTCA T/- TCCCCCTTCT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 2 1 39094 CASAVA_Build 1 28563063 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTGT 2137 het 1094 hom 12 3 6 3 T 9 8 39095 CASAVA_Build 1 28565593 4I TCTTTCTTTC ----/TTTT TTTCTTTCTT 1357 het 1357 ref 21 11 5 6 T 3 7 39096 CASAVA_Build 1 28572395 1I TTAAACATAA -/T TTTTTTTTTT 1682 het 1682 ref 24 12 6 6 T 11 12 39097 CASAVA_Build 1 28587288 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 A 8 9 39098 CASAVA_Build 1 28588248 4I ATGAGGAACT ----/CAAA CAACAGCAAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 CAAA 0 1 39099 CASAVA_Build 1 28592254 4D TTTGTCAGTT AAAC/---- AAAATATGGC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AAAC 1 0 39100 CASAVA_Build 1 28594365 1D TGTGATACAT A/- ACGATGCCAG 3070 hom 60 het 26 0 20 6 A 2 1 39101 CASAVA_Build 1 28614372 2D AAAAAAAAAA AG/-- AGAGAGAAAA 3070 het 2205 hom 25 11 11 3 AG 4 3 39102 CASAVA_Build 1 28626139 6D TCATTTTAAT AATACA/------ AATGTAAATA 3070 het 3070 hom 44 19 23 5 AATACA 1 0 39103 CASAVA_Build 1 28632013 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1730 hom 21 5 12 4 T 12 13 39104 CASAVA_Build 1 28637139 1I AGTCAGGAAC -/A GGGGGTGTGG 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 A 0 1 39105 CASAVA_Build 1 28638439 1D TAAAAAAAAA G/- CATAAAGTGT 3070 het 3070 ref 34 22 11 2 G 1 0 39106 CASAVA_Build 1 28641906 1D GCCTGGCAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 T 10 9 39107 CASAVA_Build 1 28644585 1I TTTACCTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 9 10 39108 CASAVA_Build 1 28661750 4I AGGCATGAGC ----/GGTG CACCACGCCT 3070 het 3070 hom 46 15 27 4 GGTG 0 1 39109 CASAVA_Build 1 28669157 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3021 hom 26 7 15 4 A 13 12 39110 CASAVA_Build 1 28680135 1I TTTAGTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 9 10 39111 CASAVA_Build 1 28729257 2D GCACTGGCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2198 hom 34 14 16 4 A 19 17 39112 CASAVA_Build 1 28740713 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3005 het 413 hom 13 3 9 1 A 10 9 39113 CASAVA_Build 1 28757028 4I AGGCAGAGTC ----/TCTG TCTGTCGCCC 3044 het 3044 ref 22 10 8 4 TCTG 1 2 39114 CASAVA_Build 1 28764895 7I CAAATAAAAA -------/AAAAAAG AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 AAAAAAG 1 2 39115 CASAVA_Build 1 28772381 1I CGCCTGCCTC -/G GCCTCCCAAA 2893 hom 18 het 8 0 7 1 G 1 2 39116 CASAVA_Build 1 28774067 1D ATGGGAAACT A/- GTGGCTCGGA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 1 0 39117 CASAVA_Build 1 28777483 4I ATGTGTTGGG ----/ACTT ACTTACTGCT 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 ACTT 1 2 39118 CASAVA_Build 1 28781172 1I TCCTCCGAGC -/G GGAAGAAGCG 2038 het 2038 ref 21 11 7 3 G 2 3 39119 CASAVA_Build 1 28782538 1I2M1I TGAGACGGAG -CT-/TCTC GCTCTGTCGC 2522 hom 25 het 12 0 9 3 N/A 0 0 39120 CASAVA_Build 1 28784195 1I7M1I TGGGATTACA -GCACCTG-/GGCACCTGC CCCCAGGCCC 3070 hom 30 het 11 0 10 1 N/A 0 0 39121 CASAVA_Build 1 28784300 1I GACCTACCTG -/C CTTGGCCTCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 1 2 39122 CASAVA_Build 1 28786411 1D TTTCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 2826 het 1246 hom 24 7 8 9 T 14 13 39123 CASAVA_Build 1 28819914 1I CCCTTTCTCT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 8 9 39124 CASAVA_Build 1 28822070 2D AGCTTGCAGT GA/-- GCCGAGATCA 1794 het 1494 hom 12 4 5 3 GA 1 0 39125 CASAVA_Build 1 28827378 1D GCATGAGAAT G/- GCTTGAACCC 1351 het 1351 ref 8 5 3 0 G 2 1 39126 CASAVA_Build 1 28836098 5D AATACCAGTG TTTCA/----- TTTCACTCAT 3070 het 3070 hom 37 13 18 10 TTTCA 2 1 39127 CASAVA_Build 1 28846973 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 14 3 A 13 12 39128 CASAVA_Build 1 28852210 2D GTATTTTGAG TA/-- TAGAGGCAGG 1944 het 1944 ref 24 12 5 7 TA 2 1 39129 CASAVA_Build 1 28859250 1D AGCTGGGTGT G/- GTGGCGCGTG 2955 het 1188 hom 13 3 8 2 G 2 1 39130 CASAVA_Build 1 28879314 1I ATCCTGTCTC -/T TATCTTTAAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 T 1 2 39131 CASAVA_Build 1 28893465 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1150 hom 14 4 9 1 T 10 11 39132 CASAVA_Build 1 28943197 1I TACAGTATCA -/G CCTAACAGTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 G 0 1 39133 CASAVA_Build 1 28943374 2D AGAATGAGTC AA/-- AGAGATGCAG 3070 het 3070 hom 52 26 26 2 A 3 1 39134 CASAVA_Build 1 28947120 1D CCAGCTACTC G/- GGAGGCTGAG 3070 het 2319 hom 17 6 10 1 G 3 2 39135 CASAVA_Build 1 28948863 1D AGAAAAAAAA G/- GTAGACTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 G 2 1 39136 CASAVA_Build 1 28951396 3I TGTGGTGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 TTG 5 6 39137 CASAVA_Build 1 28956537 1D GTTCTACTTT C/- CAACTCATTT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 C 2 1 39138 CASAVA_Build 1 28956693 1D TTCATGTGAG T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 T 8 7 39139 CASAVA_Build 1 28964533 2I TTAAAAAAAG --/TT TTTTGAGAGA 3070 het 2631 hom 27 9 13 5 T 4 6 39140 CASAVA_Build 1 28965365 8D TAATTTTGTG TGTGTGTA/-------- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 34 20 14 5 TGTGTGTA 2 1 39141 CASAVA_Build 1 28992071 1I TTTACAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 12 13 39142 CASAVA_Build 1 29005527 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 656 het 656 ref 32 23 3 7 A 14 13 39143 CASAVA_Build 1 29028089 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 25 1 19 5 A 15 14 39144 CASAVA_Build 1 29038161 1I GCATACTTTT -/A TCAGATTAGT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 0 1 39145 CASAVA_Build 1 29044578 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1465 het 584 hom 17 2 6 9 A 17 16 39146 CASAVA_Build 1 29044895 1D TTTGTAACAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 111 het 41 0 33 8 A 9 8 39147 CASAVA_Build 1 29045534 2D GCAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 62 het 25 0 19 10 AG 6 5 39148 CASAVA_Build 1 29047344 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 12 11 39149 CASAVA_Build 1 29060935 1D TATGCCCCTC T/- TTCCCTGTGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 3 2 39150 CASAVA_Build 1 29072371 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 2424 het 2424 ref 32 12 8 12 A 13 14 39151 CASAVA_Build 1 29095925 4I GATAAGGAGC ----/AGTG AGCGATGTGA 3070 het 3070 hom 44 12 24 8 AGTG 0 1 39152 CASAVA_Build 1 29099531 10D GGGATATAAG CATGCACCAC/---------- CATGCTAGGC 3070 het 3070 hom 26 13 14 2 CATGCACCAC 1 0 39153 CASAVA_Build 1 29106940 1D AAAATTTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 10 9 39154 CASAVA_Build 1 29111007 1I CAGGCGTGGT -/G GCACATGCCT 3070 hom 81 het 28 0 25 3 G 1 2 39155 CASAVA_Build 1 29114155 11I GTATTTTTGA -----------/CGAGGGAAAAT CGGTCCCCTC 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 CGAGGGAAAAT 0 1 39156 CASAVA_Build 1 29125148 1I CCCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2477 hom 16 6 7 3 A 9 10 39157 CASAVA_Build 1 29125283 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2355 het 1206 hom 20 4 9 7 A 15 14 39158 CASAVA_Build 1 29131507 1I CAGGCATGAG -/C CATCATGCCT 3070 hom 48 het 22 0 14 8 C 1 2 39159 CASAVA_Build 1 29135505 1I CTTGTATCCT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 8 9 39160 CASAVA_Build 1 29143634 11D TCAGATCTGG TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 20 4 11 5 T 23 12 39161 CASAVA_Build 1 29152406 1I GGTTTCTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 8 5 T 10 11 39162 CASAVA_Build 1 29165023 2D GGCTCATGCC TG/-- TAACCCCAGC 3070 het 3070 hom 27 11 11 6 TG 1 0 39163 CASAVA_Build 1 29175817 1I TGTAGCCCTA -/T TTCAGCTAGT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 2 3 39164 CASAVA_Build 1 29176494 1D TATGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 T 17 16 39165 CASAVA_Build 1 29178814 1D CTGTCCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 13 12 39166 CASAVA_Build 1 29215836 1I AATATATTAT -/A AAGTACTACT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 A 2 3 39167 CASAVA_Build 1 29217597 2I GTTTAAACAC --/TT AACATGGTAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 0 2 39168 CASAVA_Build 1 29225184 2D TGGTGAGGTA AG/-- GAGGACATCC 3070 het 3070 ref 53 25 19 9 AG 1 0 39169 CASAVA_Build 1 29236979 17I AAATTTCATA -----------------/TGTTGCTACATATGTAC TGTAGCAACA 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 TGTTGCTACATATGTAC 0 1 39170 CASAVA_Build 1 29250997 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3063 hom 38 10 17 11 A 15 14 39171 CASAVA_Build 1 29270809 2I TCTCTTCAGG --/AC ACAACTCACA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 AC 1 2 39172 CASAVA_Build 1 29283132 1I TGGGTATCTT -/C CTTCTGTGCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 1 2 39173 CASAVA_Build 1 29295933 4I CAGCTGTCAG ----/TCTT TATGAAGCTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TCTT 0 1 39174 CASAVA_Build 1 29309282 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 22 1 15 6 A 13 14 39175 CASAVA_Build 1 29318920 1D GCTTTGTAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 8 7 39176 CASAVA_Build 1 29326311 1I TCTAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 14 0 12 2 A 15 16 39177 CASAVA_Build 1 29332649 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 1602 het 523 hom 7 3 4 0 A 10 9 39178 CASAVA_Build 1 29337234 1D CCTGAGTGAT A/- AAGAAAGACT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 3 2 39179 CASAVA_Build 1 29342869 2I CCAAATCACT --/TC TCTTTTTTTT 2121 hom 48 het 18 0 13 5 TC 1 2 39180 CASAVA_Build 1 29346130 1I AACTGTCTCA -/G GGAAAAAAAA 3070 het 387 hom 21 3 8 10 G 2 3 39181 CASAVA_Build 1 29352022 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 28 1 19 8 A 13 14 39182 CASAVA_Build 1 29358941 1I TTTTATATGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 9 10 39183 CASAVA_Build 1 29360492 1D GCCTATATTT A/- AAAACCAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 5 4 39184 CASAVA_Build 1 29373312 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 29 2 22 5 A 11 10 39185 CASAVA_Build 1 29375589 1D TAAAAACTTT A/- AAAAAAAAAA 2132 het 2132 ref 29 14 8 8 A 14 13 39186 CASAVA_Build 1 29376107 1I TAATATGTGG -/T TAAGTTTTAC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 1 2 39187 CASAVA_Build 1 29377453 11I TTTCAATTAC -----------/TTCTTTTTTTT TTTTTTTTTT 1001 hom 21 het 8 0 8 1 TTCTTTTTTTT 0 1 39188 CASAVA_Build 1 29387748 1I CCTATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2967 het 2967 ref 21 10 7 4 T 10 11 39189 CASAVA_Build 1 29388496 1I GAGATGGGTT -/G GGGGGGGGGT 799 het 799 ref 20 9 3 8 G 9 10 39190 CASAVA_Build 1 29410811 2D AACTTGCCCC CT/-- GATTCCAAAG 3070 hom 140 het 51 0 44 7 CT 1 0 39191 CASAVA_Build 1 29413705 1I AGGTGATCCA -/C CCACCTCGGC 3070 hom 44 het 17 0 14 3 C 2 3 39192 CASAVA_Build 1 29417163 10I GACCTGATCC ----------/CCTCTGGAAG CCTCTGGAAG 3070 het 3070 ref 44 17 16 11 CCTCTGGAAG 1 2 39193 CASAVA_Build 1 29431456 1I AAATATTATC -/A GGGGGTTATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 1 39194 CASAVA_Build 1 29448263 4I GTGTGCACAC ----/ACAT ACACACACGC 3070 het 3070 ref 52 25 16 11 ACAT 0 1 39195 CASAVA_Build 1 29449163 1I TGCCACAAAT -/G CCTTCCACCC 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 G 0 1 39196 CASAVA_Build 1 29456321 4I GAGGAGAGAG ----/AAGT AAGTAGCATG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 AAGT 1 2 39197 CASAVA_Build 1 29457066 1I GGAGCCATAA -/T TTTTTTTTTT 2911 het 2096 hom 26 7 13 6 T 10 11 39198 CASAVA_Build 1 29463273 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2351 het 1530 hom 16 5 5 6 A 12 11 39199 CASAVA_Build 1 29482090 1D GGTTGGGTGT G/- GGGGGATGGC 2083 het 1774 hom 19 6 8 5 G 6 5 39200 CASAVA_Build 1 29495779 1D TGCTACTTTG T/- TTTTTTTTTT 1136 het 1136 ref 19 6 6 7 T 14 13 39201 CASAVA_Build 1 29497362 1D13M2D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAGACAA/-AAAAAAAAAAGAC-- AAAAAAAAAA 3070 het 2312 hom 23 9 13 6 N/A 0 0 39202 CASAVA_Build 1 29503824 2I GAAGGGGCCC --/TA TCAGTGAGGG 3070 hom 87 het 33 0 26 7 TA 0 1 39203 CASAVA_Build 1 29539266 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1021 het 1021 ref 25 12 4 9 T 15 14 39204 CASAVA_Build 1 29552031 1D GATGAGGTCA G/- GGGGGGAGTG 2161 het 2161 ref 31 19 7 5 G 7 6 39205 CASAVA_Build 1 29557365 1D ACAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 398 hom 30 1 25 4 A 10 9 39206 CASAVA_Build 1 29560443 1D CCCTGCTCCA C/- ATCTGCCCTG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 C 1 0 39207 CASAVA_Build 1 29572429 2I TGAGACAGAA --/TC TCTCTCTGCG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TC 3 4 39208 CASAVA_Build 1 29577506 1D ATTTTTGATA G/- GATTTATCTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 G 2 1 39209 CASAVA_Build 1 29585053 5D GCGTTAATGT TAAAA/----- TAAAATAGAG 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 TAAAA 2 1 39210 CASAVA_Build 1 29585650 1D AACTGTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 17 18 8 T 10 9 39211 CASAVA_Build 1 29593870 2I GGGAACCCTG --/TC TATTGAGCAC 537 het 537 ref 28 21 3 4 TC 0 1 39212 CASAVA_Build 1 29594353 4D TCCCTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 674 het 629 hom 16 5 5 6 TC 8 6 39213 CASAVA_Build 1 29606434 3D GGCACTATTA TTC/--- TTCTTCTCAG 3070 hom 105 het 45 0 36 11 TTC 3 2 39214 CASAVA_Build 1 29610395 1D ACTTCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 1547 het 1547 ref 35 21 5 9 T 15 14 39215 CASAVA_Build 1 29621926 1I TGGTTCTTTT -/C TTGATTAGTC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 0 1 39216 CASAVA_Build 1 29628542 1D CTTTCTGGCT G/- GACCCTTTCT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 G 2 1 39217 CASAVA_Build 1 29648626 3D AATCACAAAC AGG/--- AGGACTTGGG 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 AGG 2 1 39218 CASAVA_Build 1 29652511 15D TCAGGAAAGA TTTCCCTGGGAAAGT/--------------- TTTCCCTGGG 3070 het 3070 ref 31 14 9 9 TTTCCCTGGGAAAGT 2 1 39219 CASAVA_Build 1 29661409 1D TCTTCCAGGT C/- CCCCCCCAAC 3070 het 3070 ref 38 21 10 8 C 8 7 39220 CASAVA_Build 1 29663146 2I GGTTTTTTTT --/TG GGCTGTTATA 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 TG 0 1 39221 CASAVA_Build 1 29674245 1I AATCTCATCC -/A AAAACACCCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 5 39222 CASAVA_Build 1 29718011 3D CTTCCTTCTC CTT/--- CTTCTTCTTC 2163 het 930 hom 16 5 7 4 CTT 7 6 39223 CASAVA_Build 1 29746341 1D TGCCTACGTC T/- TGTGCTGATA 3070 het 3070 ref 45 21 19 6 T 2 1 39224 CASAVA_Build 1 29800987 1D TTCCGGGGCA C/- TTTTTGTCTG 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 C 1 0 39225 CASAVA_Build 1 29824229 2I CAGCATACTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 29 0 17 12 A 11 13 39226 CASAVA_Build 1 29838994 2I TCTCTGTCTC --/TG TGTGTGTGTG 2314 het 222 hom 17 1 10 6 TG 8 9 39227 CASAVA_Build 1 29855613 2D ACTAAAAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 775 het 494 hom 22 8 3 11 T 16 14 39228 CASAVA_Build 1 29864911 1D CACTGTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 28 1 20 7 A 11 10 39229 CASAVA_Build 1 29873022 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 20 3 13 4 A 11 12 39230 CASAVA_Build 1 29875774 3D GAGGGCTCTT CTC/--- CTACTGAAGG 3070 het 3070 hom 47 20 24 4 CTC 1 0 39231 CASAVA_Build 1 29876161 1D TCCTCCTCCT C/- CCCCCCCCCC 2362 het 120 hom 23 2 7 14 C 11 10 39232 CASAVA_Build 1 29886965 1I AGACCCTGGG -/T GACAGTGCAG 3070 hom 134 het 49 0 43 6 T 0 1 39233 CASAVA_Build 1 29889024 1D CTGGAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 274 hom 28 1 19 9 A 15 14 39234 CASAVA_Build 1 29897249 1I AACGTTAAGG -/C CAGCCAAGTG 3070 hom 69 het 25 0 22 3 C 1 2 39235 CASAVA_Build 1 29908988 1I CCTCCCAAAA -/G GGGTAAAAAG 3070 hom 109 het 40 0 37 3 G 3 4 39236 CASAVA_Build 1 29919345 1D AGTCATTCAC T/- TCTTTGTTCA 3070 hom 188 het 68 0 58 10 T 2 1 39237 CASAVA_Build 1 29925125 1D CCCCAACCCA C/- CCCAGCCTCG 3070 hom 124 het 45 0 37 8 C 4 3 39238 CASAVA_Build 1 29925505 1I CTGCTGGCCA -/G GGGGCCCTTG 3070 hom 112 het 44 0 34 10 G 4 5 39239 CASAVA_Build 1 29930575 2D CAGGGACTAG AA/-- AAGCAAGAAG 3070 hom 62 het 25 0 22 5 A 4 2 39240 CASAVA_Build 1 29933176 37I AAGCATCTCT -------------------------------------/AGGCATAATCCTTGCCCAAGTCCCTGACCACTTCCTA AGGACAAATT 3070 hom 135 het 45 0 46 6 AGGCATAATCCTTGCCCAAGTCCCTGACCACTTCCTA 0 1 39241 CASAVA_Build 1 29939931 1D GGTCACACAG C/- CTGGTGAGAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 C 2 1 39242 CASAVA_Build 1 29946351 1I CAGGGGAAGT -/C AGCTGCCCTC 3070 hom 122 het 46 0 41 5 C 0 1 39243 CASAVA_Build 1 29951645 4D CTTCTGGAAG CCCC/---- CCCCCCCCCG 1736 het 751 hom 11 3 6 2 C 13 9 39244 CASAVA_Build 1 29989337 2D GGGAGAGACT GG/-- GGAGAGACAG 3070 hom 82 het 30 0 25 6 G 4 2 39245 CASAVA_Build 1 29990272 1D CTGGATTCTC A/- AGAGTCGGGG 3070 hom 55 het 26 0 14 12 A 2 1 39246 CASAVA_Build 1 30055323 1D CAGCAGAGGA G/- GACCCAAGCC 1838 het 1838 ref 23 11 6 7 G 2 1 39247 CASAVA_Build 1 30070628 2D TCTCTCACAC AT/-- AGTCACACAC 3070 het 3070 hom 49 19 21 12 AT 1 0 39248 CASAVA_Build 1 30070677 2D CACACTCATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 57 12 25 20 CA 6 5 39249 CASAVA_Build 1 30071119 2D ACACTCACAT CA/-- CACACACACA 3070 hom 122 het 54 0 40 17 CA 6 5 39250 CASAVA_Build 1 30071308 2I GCACACAATT --/CA CACACACATA 3070 het 3070 ref 87 39 37 11 CA 4 5 39251 CASAVA_Build 1 30076257 12I GAGGTCCTAC ------------/TGTATGCCATGG TGTCTGGTTT 3070 hom 87 het 33 0 27 6 TGTATGCCATGG 0 1 39252 CASAVA_Build 1 30076579 1D GCCACAAATG T/- GAGACATCGG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 1 0 39253 CASAVA_Build 1 30078302 1D TCCATTCAGC A/- GTTTTAATTG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 1 0 39254 CASAVA_Build 1 30080263 8I2M1I ATAATTAATT --------TA-/CTCCTTCCTAG ATTATTTGAA 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 N/A 0 0 39255 CASAVA_Build 1 30085774 2I AATAAATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2824 hom 27 7 13 7 TA 7 8 39256 CASAVA_Build 1 30118689 1I CTGATCCTTT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 6 7 39257 CASAVA_Build 1 30118759 13D TGATTTGAGA ATTCTACCAAATC/------------- ATTCTACCAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 8 ATTCTACCAAATC 1 0 39258 CASAVA_Build 1 30119707 6D ATAATAATAG TAATAA/------ TAATAATAAT 1416 het 1416 ref 23 9 9 7 TAA 5 3 39259 CASAVA_Build 1 30120660 1D AAGTTTTAGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 8 7 39260 CASAVA_Build 1 30120915 2I TCAAGAGTGT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 9 11 39261 CASAVA_Build 1 30123353 4I ATTTTGATTT ----/ACAA ACAGTTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 ACAA 0 1 39262 CASAVA_Build 1 30149648 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 100 het 42 0 34 9 T 10 9 39263 CASAVA_Build 1 30162702 4D TTCCCCTTCC CCTT/---- CCTTCCTTCC 3070 hom 68 het 26 0 23 3 CCTT 4 3 39264 CASAVA_Build 1 30177356 1D TGGCTGTTAC G/- GGGTTGACCG 3070 het 3070 ref 50 27 14 9 G 4 3 39265 CASAVA_Build 1 30183594 4I CACATTGAGC ----/TTCT TTAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 TTCT 0 1 39266 CASAVA_Build 1 30183906 1I CAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 11 12 39267 CASAVA_Build 1 30222249 1D ATACTGACAG T/- TTTTTTTTTT 623 het 623 ref 49 38 3 8 T 12 11 39268 CASAVA_Build 1 30232486 1I GTGAAGGAAC -/A AGCCCTGGTT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 1 2 39269 CASAVA_Build 1 30275618 1D TAGATGCTGT A/- AAAAAAAAAA 1755 het 1755 ref 33 21 4 8 A 12 11 39270 CASAVA_Build 1 30293482 1D GCCTAACGTG T/- TTGGATTCCC 3070 hom 141 het 52 0 48 5 T 3 2 39271 CASAVA_Build 1 30294067 2I CCTGGATTGA --/GG GGGGGGCTTG 3070 hom 132 het 48 0 42 6 G 6 8 39272 CASAVA_Build 1 30300381 4I AGTGGTAAAC ----/AGTT GCGGTAAGCA 3070 hom 96 het 37 0 30 7 AGTT 0 1 39273 CASAVA_Build 1 30309337 3D GATTGGAAAT AAG/--- AAGATTATGG 3070 het 3070 ref 52 31 15 8 AAG 2 1 39274 CASAVA_Build 1 30320686 1D CTCCCCACTT C/- CCAAGCCCAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 3 2 39275 CASAVA_Build 1 30324745 1D AATAAATTTG A/- AAACTTAGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 4 3 39276 CASAVA_Build 1 30325708 23D TGTAAACGTG GTGAGGATGATACCATGGAGGGC/----------------------- GTGAGGATGA 3070 hom 95 het 42 0 30 14 GTGAGGATGATACCATGGAGGGC 2 1 39277 CASAVA_Build 1 30331896 1D CACATGGGGA G/- GGGGGGCTCA 3070 hom 33 het 16 0 10 6 G 7 6 39278 CASAVA_Build 1 30333577 1D AGCCAGGCTT G/- GGGCCTCTGT 3070 hom 81 het 33 0 26 7 G 4 3 39279 CASAVA_Build 1 30333923 1D CACATAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 34 0 24 10 T 15 14 39280 CASAVA_Build 1 30363523 4D AAGCCGACAC AGAT/---- AGACAAATCT 3070 het 3070 ref 38 18 15 7 AGAT 1 0 39281 CASAVA_Build 1 30393020 1D GGGGTGGGGG A/- ATCGCTGAGA 3070 het 3070 ref 47 24 18 6 A 2 1 39282 CASAVA_Build 1 30406570 2I TAATTATTCC --/CT GTTTACAGAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 CT 0 1 39283 CASAVA_Build 1 30409971 1D CGCTTTTACA G/- GTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 48 21 20 10 G 2 1 39284 CASAVA_Build 1 30412522 4I TGTTGGAACT ----/ACTA ACTAAGAATA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 ACTA 1 2 39285 CASAVA_Build 1 30413905 4D ATATATATTA TATC/---- TATCTATCAT 3070 het 3070 hom 38 17 15 7 TATC 3 2 39286 CASAVA_Build 1 30432830 1I GCAGAATGGT -/G GATGGCATCC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 G 1 2 39287 CASAVA_Build 1 30433604 2I ATTGCTCTTC --/CA CAGTTTCTGA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 CA 1 2 39288 CASAVA_Build 1 30447059 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 12 12 T 13 14 39289 CASAVA_Build 1 30505876 1I ACAGGTGAGA -/G GCCACAGGCA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 G 1 2 39290 CASAVA_Build 1 30531625 2D GCTGCAAACC TG/-- TGTCAGCTGT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 TG 2 1 39291 CASAVA_Build 1 30547323 2I CTTGTAATAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 11 39292 CASAVA_Build 1 30552820 1I CACCCAGTCA -/G GGGCCCCATA 3070 hom 63 het 22 0 20 2 G 3 4 39293 CASAVA_Build 1 30563814 1D TCATTAGCAT A/- ATATTTGCAT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 2 1 39294 CASAVA_Build 1 30588575 1I GAGGGCAGAG -/C CACCCAGGTG 3070 hom 78 het 31 0 23 8 C 1 2 39295 CASAVA_Build 1 30590359 2D GATTTATACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 37 0 22 16 A 16 14 39296 CASAVA_Build 1 30597691 16I GTAACAGTTT ----------------/CTCAGGTTCTCCTTGA CTTTGATCAC 3070 hom 120 het 41 0 40 5 CTCAGGTTCTCCTTGA 0 1 39297 CASAVA_Build 1 30598120 4I TTATTCAATC ----/ACTT ATTTATATCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ACTT 0 1 39298 CASAVA_Build 1 30598753 1I GTAATAACAA -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 57 het 23 0 18 5 T 7 8 39299 CASAVA_Build 1 30601128 1D GGTTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 11 10 39300 CASAVA_Build 1 30604622 1D GTAGGGCAGA G/- GGGGAGCAGC 3070 hom 76 het 28 0 26 3 G 5 4 39301 CASAVA_Build 1 30608194 1D CAGGGCCCCT C/- CTCCACACTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 2 1 39302 CASAVA_Build 1 30622437 7D CTGAGCCTCT CTGCCTC/------- CTGCTCCAGG 3070 hom 132 het 47 0 44 4 CTGCCTC 1 0 39303 CASAVA_Build 1 30622997 5D TGCAGAGGGG ACACC/----- AGGGCTGGGG 3070 hom 63 het 24 0 21 4 ACACC 1 0 39304 CASAVA_Build 1 30633245 4D TTTATGGATG GAGT/---- GAGTCGTAGC 3070 hom 84 het 33 0 28 6 GAGT 2 1 39305 CASAVA_Build 1 30638705 1D AGAAGGTCTT A/- AAGGGAATGT 3070 hom 90 het 32 0 31 3 A 3 2 39306 CASAVA_Build 1 30645438 1I GGGATTCTCA -/T TGGAATTATG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 1 2 39307 CASAVA_Build 1 30648480 3D GCAACTAGAT CCA/--- CCACTGTACA 3070 hom 95 het 39 0 29 11 CCA 2 1 39308 CASAVA_Build 1 30651102 3D3M4I5M9D AGAACCTAAG CCACCC----TCCAAACCACAGGG/---CCCTAGTTCCTA--------- GTCATTCTGG 806 hom 15 het 9 0 5 4 N/A 0 0 39309 CASAVA_Build 1 30697188 1D CTTGGCTGGT G/- GGGGGGGGAG 2719 hom 37 het 15 0 10 5 G 9 8 39310 CASAVA_Build 1 30699015 3D GCACAGGAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 593 hom 18 3 10 5 T 14 11 39311 CASAVA_Build 1 30710503 15D ATAATGAGAT TGATGATGATGATGA/--------------- TGATGATGAT 3070 het 3070 ref 26 16 12 3 TGA 9 4 39312 CASAVA_Build 1 30713281 1D CAATTAAGCA C/- CCCCCCCCTT 1423 het 352 hom 22 4 5 13 C 9 8 39313 CASAVA_Build 1 30728041 4I CCCTTGCAGC ----/CTAT CTATCTGTAA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 CTAT 1 2 39314 CASAVA_Build 1 30734225 3D16M6D8M15D TAATGTAATG TTAGTGATGATGATGATAACAATAGTGATGATGGTGATGGCAATAATA/---GTGATGGTGATTATAA------GGATGATG--------------- ATAATGGTGG 1502 het 1502 ref 82 74 6 9 N/A 0 0 39315 CASAVA_Build 1 30793137 1I TGAGACCTGT -/C CGAGGGGTAG 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 C 1 2 39316 CASAVA_Build 1 30794530 1D AATATTGAAT A/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 1 0 39317 CASAVA_Build 1 30802187 1I CACTGAGTTG -/A GCAGGGAAGA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 0 1 39318 CASAVA_Build 1 30803015 1D AAACAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 A 10 9 39319 CASAVA_Build 1 30805337 3D TGTAAAACAC AGA/--- AGAACCCCTA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 AGA 2 1 39320 CASAVA_Build 1 30824897 2I TATAATAATC --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 11 39321 CASAVA_Build 1 30831138 1D TCACTGGGAG A/- GCGCAGACTG 3070 het 2847 hom 25 7 14 4 A 1 0 39322 CASAVA_Build 1 30837519 1D AACCTAAAAG A/- AATGGATAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 A 3 2 39323 CASAVA_Build 1 30839422 1D AAAAAAAAAA T/- TTTAAACAAT 3070 het 54 hom 29 1 24 4 T 4 3 39324 CASAVA_Build 1 30843841 1I CCTGAATCTG -/C CTGGCTCCTC 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 C 1 2 39325 CASAVA_Build 1 30848168 2I CGTCTCTACT --/AA AAAGTTAGCC 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 A 3 5 39326 CASAVA_Build 1 30852078 3I AAGTGCATTG ---/TTT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 T 8 11 39327 CASAVA_Build 1 30879716 5I TGCATATGTG -----/TGTGC TGTGCACACG 3070 het 3070 ref 61 30 27 4 TGTGC 1 2 39328 CASAVA_Build 1 30881710 12I CTGGTGACAT ------------/TGGGGAAAGGAC TGAAAAGAGG 3070 het 3070 hom 53 12 26 15 TGGGGAAAGGAC 0 1 39329 CASAVA_Build 1 30897696 1D CTCCCTTCCA G/- TACATTCCCT 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 G 1 0 39330 CASAVA_Build 1 30906059 3D CGTAGCTCAC TGT/--- TGTTGTAACA 3070 het 3070 ref 47 21 21 7 TGT 3 2 39331 CASAVA_Build 1 30908474 1I TTTGCCCAAA -/G CTGGCACCTT 3070 het 3070 ref 38 15 11 12 G 0 1 39332 CASAVA_Build 1 30912841 1I TAGGGTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 11 14 8 A 15 16 39333 CASAVA_Build 1 30922401 1D TCATTGACAT C/- TTTACTTTAA 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 C 1 0 39334 CASAVA_Build 1 30928333 1D GCCACTGAAG C/- CAATAAGGAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 C 2 1 39335 CASAVA_Build 1 30932091 1I AGGGAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 1893 het 1802 hom 15 7 4 4 A 10 11 39336 CASAVA_Build 1 30937308 4I AATTCTGTCT ----/CTGA CTGTCATTAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 CTGA 0 1 39337 CASAVA_Build 1 30939013 1I ATGGGTTGAT -/G GGGGCAGCCC 3070 hom 96 het 34 0 31 3 G 4 5 39338 CASAVA_Build 1 30943629 1D GAGAGCTGGG T/- TTCACTGCCA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 3 2 39339 CASAVA_Build 1 30946536 9I GCTGCCATCA ---------/GCCCCCAAG GCCTCATCAC 3070 hom 77 het 33 0 25 8 GCCCCCAAG 0 1 39340 CASAVA_Build 1 30948812 1I TGGCTTAATT -/G TCAGACTACA 3070 het 3070 ref 46 29 13 4 G 0 1 39341 CASAVA_Build 1 30949605 4I GAAATAGGCC ----/GTCT GTTTTCCATT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 GTCT 0 1 39342 CASAVA_Build 1 30951770 2I ATAACACATC --/TT TTTTTTTTTT 2262 het 731 hom 17 4 8 5 T 16 18 39343 CASAVA_Build 1 30958139 1D ACAGCACCAT C/- CCCCCCCACC 3070 hom 101 het 42 0 33 9 C 8 7 39344 CASAVA_Build 1 30958682 1I AGGGTTAACT -/A AAAAAAGATG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 6 7 39345 CASAVA_Build 1 30965533 2D TAGCTGTGAC TA/-- TTCGCTGCCA 3070 hom 78 het 30 0 24 6 TA 1 0 39346 CASAVA_Build 1 30967414 13D CAAGCCTGGC CTTGGGCCATTTG/------------- CTTCACTTCT 3070 hom 81 het 28 0 26 4 CTTGGGCCATTTG 1 0 39347 CASAVA_Build 1 30975683 1I TTACCAGCTC -/T TTTTTTCCCT 2354 het 1460 hom 17 4 7 6 T 6 7 39348 CASAVA_Build 1 30980383 1I CGCCTCCTGG -/A AATCGATATG 3070 het 3070 ref 45 23 12 10 A 2 3 39349 CASAVA_Build 1 30997173 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAGG 888 het 888 ref 21 10 4 7 A 8 9 39350 CASAVA_Build 1 31025761 1D CCATCTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 T 11 10 39351 CASAVA_Build 1 31031015 1D CTATGGCTCC G/- GGGGGTACTC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 G 6 5 39352 CASAVA_Build 1 31038033 1I CACTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 T 10 11 39353 CASAVA_Build 1 31067527 3I CTCCACGTAC ---/CCT CCTCACCCCT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 CCT 1 2 39354 CASAVA_Build 1 31094521 2D AATAAGAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 29 0 12 17 T 13 11 39355 CASAVA_Build 1 31129710 1I ACACCACAGA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 C 8 9 39356 CASAVA_Build 1 31130744 1D AACTTGATCC T/- GTTTTAATGA 3070 het 3070 ref 36 21 13 3 T 1 0 39357 CASAVA_Build 1 31139788 2I GTGTGGATGA --/GT GTGTGTGTGA 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 GT 4 5 39358 CASAVA_Build 1 31139927 1I GGATGAATGT -/G GGGGGGTGAG 1506 het 1506 ref 31 10 5 16 G 6 7 39359 CASAVA_Build 1 31140118 2D ATGACTGTGA GT/-- GTGTGGGTGA 1872 het 1872 ref 61 35 8 22 GT 3 2 39360 CASAVA_Build 1 31143516 2I CAGAACAAGA --/AC ACTGAGGCAC 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 AC 1 2 39361 CASAVA_Build 1 31147247 1D AGGTGAATGG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 8 7 39362 CASAVA_Build 1 31155778 2D TCTCAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 699 hom 14 4 9 1 A 17 15 39363 CASAVA_Build 1 31157962 3D GTGGGTGCTC AGT/--- AGCTGTCACC 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 AGT 1 0 39364 CASAVA_Build 1 31168656 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 13 14 39365 CASAVA_Build 1 31194208 18D GAAAAACAAG AAAATTAAAGAAGAACAA/------------------ TTCAACTATC 3070 het 3070 hom 31 15 17 8 AAAATTAAAGAAGAACAA 1 0 39366 CASAVA_Build 1 31227115 2D CACACTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 2558 hom 25 8 11 6 CA 9 8 39367 CASAVA_Build 1 31236505 1I AGAACAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 10 11 39368 CASAVA_Build 1 31242387 1D AAAAAATCAT G/- CAAAACTGAA 3070 het 3070 hom 47 20 24 4 G 1 0 39369 CASAVA_Build 1 31243907 1I CGCCATCTCT -/A AAAAAAAAAG 2558 het 2558 ref 27 13 8 6 A 9 10 39370 CASAVA_Build 1 31246806 1D AGATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 10 10 0 A 12 11 39371 CASAVA_Build 1 31252753 11D AGGGGTGGGG ACACTGATCAA/----------- ACCATCCAAT 3070 het 3070 ref 37 22 16 6 ACACTGATCAA 1 0 39372 CASAVA_Build 1 31253833 1D CAAGATTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 A 12 11 39373 CASAVA_Build 1 31255552 1D CCACTATGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 49 27 14 8 A 10 9 39374 CASAVA_Build 1 31267607 1D CTGCTCATCT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 17 18 6 A 9 8 39375 CASAVA_Build 1 31276144 1D CAGTGTCCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 9 11 A 12 11 39376 CASAVA_Build 1 31276593 2I AACTCTACAC --/AT GTTATATGAA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 AT 0 1 39377 CASAVA_Build 1 31280830 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1615 hom 19 6 8 5 A 12 11 39378 CASAVA_Build 1 31284647 1D CCACGCTAAC A/- AAAAAAAAAT 1251 het 1223 hom 24 9 8 7 A 10 9 39379 CASAVA_Build 1 31288647 1I GAACATTTCC -/T TTTTTTTTTG 3024 het 3024 ref 29 16 9 4 T 9 10 39380 CASAVA_Build 1 31302789 3D GTGAGCCAAT ATC/--- ATCATATCAC 3070 het 3070 ref 22 12 9 3 ATC 2 1 39381 CASAVA_Build 1 31312684 2I GTATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 1843 hom 17 5 9 3 AT 6 7 39382 CASAVA_Build 1 31315334 1I CCTCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1225 hom 27 5 18 4 A 13 14 39383 CASAVA_Build 1 31326512 1I TAATGGAGAC -/T TTTTTTGGCA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 6 7 39384 CASAVA_Build 1 31330256 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2165 hom 27 12 9 6 T 13 12 39385 CASAVA_Build 1 31331231 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2538 het 985 hom 14 4 6 4 A 15 16 39386 CASAVA_Build 1 31337471 4D CATCTCTTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 2273 hom 16 5 8 4 AAAT 5 4 39387 CASAVA_Build 1 31339452 1D GAGATCCAGG A/- AAAAAAAAAA 1291 het 965 hom 11 3 3 5 A 13 12 39388 CASAVA_Build 1 31365254 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2480 het 1485 hom 16 6 7 3 A 14 15 39389 CASAVA_Build 1 31366951 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 21 1 13 7 A 17 16 39390 CASAVA_Build 1 31413313 1D TGATTCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 22 2 13 7 T 12 11 39391 CASAVA_Build 1 31438497 1D TTTATTATTT A/- TTTTTTTATT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 1 0 39392 CASAVA_Build 1 31439789 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTCTTTCC 2432 het 23 hom 24 1 16 8 T 5 4 39393 CASAVA_Build 1 31444000 4D TCCAAATCTC TCAT/---- ATCTGGCCAC 3070 hom 72 het 26 0 24 3 TCAT 1 0 39394 CASAVA_Build 1 31448764 10D6M8D TCCCTCAGAA GGGGTCACAGTCAATGACAGTGCC/----------TTCATG-------- TCCACACGAT 3070 hom 48 het 14 0 16 1 N/A 0 0 39395 CASAVA_Build 1 31453778 1I CTTTCTTCCA -/C CCCCCCGCTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 C 6 7 39396 CASAVA_Build 1 31455873 1D CAGGCACCCA C/- CACCACGCCC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 2 1 39397 CASAVA_Build 1 31457854 2D TTTTTTTTTT TA/-- GGAGACAAGG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TA 1 0 39398 CASAVA_Build 1 31458563 1I TTGAGGATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 9 10 39399 CASAVA_Build 1 31458870 3I TAACAAGTGT ---/TAA TGATGATGCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TAA 0 1 39400 CASAVA_Build 1 31460515 1D GTGGGAGGAG A/- AAAAAATCCA 3070 hom 128 het 47 0 42 5 A 7 6 39401 CASAVA_Build 1 31476197 1I TATATATTTA -/G GGGGGCACAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 5 6 39402 CASAVA_Build 1 31494231 2D CTGGAAGGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 41 2 18 21 T 16 14 39403 CASAVA_Build 1 31496070 1D TTAGATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 11 10 39404 CASAVA_Build 1 31501869 1D GATTTTACTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 9 8 39405 CASAVA_Build 1 31506621 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1149 hom 22 het 13 0 7 6 A 15 14 39406 CASAVA_Build 1 31508439 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 10 11 39407 CASAVA_Build 1 31510565 1D TGTGATTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 85 het 34 0 28 6 T 9 8 39408 CASAVA_Build 1 31511284 2I AAAAACAAAC --/AA AAAAATTTAA 3070 hom 93 het 40 0 31 9 A 5 7 39409 CASAVA_Build 1 31512663 2D TGGGTATTTA AT/-- ATGTGTTCAA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 AT 2 1 39410 CASAVA_Build 1 31513735 2D TTTTTTTTTT GA/-- GACAGGGTCT 3070 hom 41 het 19 0 14 5 GA 2 1 39411 CASAVA_Build 1 31516115 4D ATTCAACAAA TATT/---- TATTAAGTAC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 TATT 2 1 39412 CASAVA_Build 1 31517093 1I TTAATTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 30 1 27 2 T 10 11 39413 CASAVA_Build 1 31519075 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 158 hom 31 1 29 4 A 11 12 39414 CASAVA_Build 1 31520870 5I ACTCTGTCAT -----/CCAGG CTGGAGTGCA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 CCAGG 0 1 39415 CASAVA_Build 1 31524484 1D TACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 8 A 11 10 39416 CASAVA_Build 1 31525993 4I GAAAGTTGAG ----/TATT TATCTGACAG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TATT 0 1 39417 CASAVA_Build 1 31534104 2I GAACAGCCTT --/TC TTTTTTTTTT 1160 hom 20 het 31 0 11 20 TC 0 1 39418 CASAVA_Build 1 31537301 3I AAAGGACGCC ---/AAG AAGAATTAGT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AAG 1 2 39419 CASAVA_Build 1 31540785 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 8 39420 CASAVA_Build 1 31543812 1D TAGAGACCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 35 0 27 8 T 9 8 39421 CASAVA_Build 1 31546368 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 908 het 908 ref 26 14 3 10 A 13 12 39422 CASAVA_Build 1 31550616 1D TCCCTCAGCC T/- TTGGTATGGA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 3 2 39423 CASAVA_Build 1 31557940 1D GTCCCAGCTC T/- TTTTGCTTGC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 5 4 39424 CASAVA_Build 1 31563064 1D TATACTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 484 hom 40 2 35 3 T 12 11 39425 CASAVA_Build 1 31569413 2D AAAGAATGAC TG/-- TATTTCTAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 5 TG 1 0 39426 CASAVA_Build 1 31574788 1D TATAAAGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2957 hom 25 8 15 2 T 10 9 39427 CASAVA_Build 1 31578743 1D GGATCAAGAG A/- TCAGGAGTTC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 1 0 39428 CASAVA_Build 1 31582267 1D CCTGGCCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 25 0 11 14 T 13 12 39429 CASAVA_Build 1 31590583 4D GGCAATGTTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 hom 30 het 18 0 11 8 TGTT 6 5 39430 CASAVA_Build 1 31593453 2D TAAAGGGCCC CT/-- CAGTACCACT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 CT 1 0 39431 CASAVA_Build 1 31594954 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGGTTTTG 3070 hom 66 het 23 0 21 2 G 6 5 39432 CASAVA_Build 1 31618976 3D TTTTACAAGT GAG/--- GAGTCCGAGG 3070 hom 72 het 25 0 24 4 GAG 2 1 39433 CASAVA_Build 1 31681740 1I AAGTGGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 24 0 18 7 T 10 11 39434 CASAVA_Build 1 31683018 1I CCTCAGAGTT -/A AGACGCCTTC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 1 2 39435 CASAVA_Build 1 31683978 2I12M1D CAGAGCGAGA --CTGTCTCAAAAGA/CTCTGTCTCAAAAG- AAAAAAATAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 N/A 0 0 39436 CASAVA_Build 1 31688197 1I GAGGCCTGAT -/A ACCACCCTGC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 39437 CASAVA_Build 1 31691757 1I CATTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 11 12 39438 CASAVA_Build 1 31691937 1D ATTTTTTGGG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 7 39439 CASAVA_Build 1 31692904 2I CCACACAAAC --/AT GTGTACGTTG 3070 hom 150 het 53 0 50 3 AT 0 1 39440 CASAVA_Build 1 31694970 2D ATTAACCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 35 0 15 20 T 14 12 39441 CASAVA_Build 1 31712441 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 314 hom 44 3 25 16 T 15 14 39442 CASAVA_Build 1 31720080 1I CCTCGAGAGA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 27 1 14 12 G 0 1 39443 CASAVA_Build 1 31745710 11D TGCTTCTATG TGGAGTCTGTC/----------- TGCATGGCCG 3070 hom 74 het 26 0 23 5 TGGAGTCTGTC 1 0 39444 CASAVA_Build 1 31746895 1I CGGGACTTCC -/A TCAGTGGCTT 3070 hom 93 het 38 0 30 8 A 0 1 39445 CASAVA_Build 1 31774053 1D GAATACCTGA G/- ATTTGGGCTG 3070 het 3070 hom 33 9 21 4 G 1 0 39446 CASAVA_Build 1 31775842 1I TGAAGTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 T 11 12 39447 CASAVA_Build 1 31783293 1D TTACTCATCT G/- GTACCCTCCC 3070 hom 81 het 32 0 28 6 G 2 1 39448 CASAVA_Build 1 31786407 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1350 het 1350 ref 26 11 4 11 A 13 12 39449 CASAVA_Build 1 31790338 1D ATTGTTAATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 9 8 39450 CASAVA_Build 1 31791792 1D CATCTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 1006 het 1006 ref 33 28 3 2 A 12 11 39451 CASAVA_Build 1 31792074 1I CTTTTCTTGC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 8 9 39452 CASAVA_Build 1 31812468 8D AGCCAACAAG TGCACAAA/-------- TGCAGGCAAA 3070 het 3070 ref 62 37 22 5 TGCACAAA 1 0 39453 CASAVA_Build 1 31826829 1D CACCTCCAGG C/- CCCTCCCAAG 3070 het 2030 hom 28 9 13 6 C 4 3 39454 CASAVA_Build 1 31837655 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 26 het 11 0 9 2 AG 10 9 39455 CASAVA_Build 1 31846657 1I TAATCTGATT -/A AAAATGGGCA 3070 hom 41 het 21 0 15 6 A 4 5 39456 CASAVA_Build 1 31847726 1I CCTTCCATGC -/A ACCCCTTTTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 1 2 39457 CASAVA_Build 1 31850660 1I TATTCAAATA -/C AGGAGTCAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 0 1 39458 CASAVA_Build 1 31851453 1I ATACCAAATG -/T CCACTTAAGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 0 1 39459 CASAVA_Build 1 31855635 1I AATGCGGGGT -/G GGCCAGGGGC 2159 het 2159 ref 21 10 6 5 G 2 3 39460 CASAVA_Build 1 31865506 3I CCTACCCAAT ---/TCC TACAGGCCTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 TCC 0 1 39461 CASAVA_Build 1 31866224 3I CTGCCACCGA ---/GAT GATTTTAAGG 2647 het 2647 ref 37 17 8 12 GAT 1 2 39462 CASAVA_Build 1 31870115 1I CTTGGGTCCT -/C CCCCCAACCT 3070 hom 89 het 35 0 26 9 C 5 6 39463 CASAVA_Build 1 31873139 1D TCCCTGAATG A/- AAAAGACACA 3070 hom 132 het 47 0 42 6 A 5 4 39464 CASAVA_Build 1 31875359 5I GGCCCTGTCA -----/CCTCC CCCACTCAGC 3070 hom 96 het 40 0 30 10 CCTCC 0 1 39465 CASAVA_Build 1 31881517 1I AGCTATACTT -/A AAGAGTATTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 2 3 39466 CASAVA_Build 1 31892665 1I CAGCCATCTT -/A ACAGTGCCGC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 1 2 39467 CASAVA_Build 1 31898272 4I CTCTGGAGTC ----/CCAT CCATCAGCTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 CCAT 1 2 39468 CASAVA_Build 1 31920203 1D ATACAGTTCA C/- CTGGGCTATT 3070 hom 78 het 29 0 26 5 C 2 1 39469 CASAVA_Build 1 31954369 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 68 het 30 0 22 8 T 10 9 39470 CASAVA_Build 1 31960306 1I TGGGGTCAAT -/G GGGGGGTGTG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 G 6 7 39471 CASAVA_Build 1 32016256 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1842 het 1842 ref 13 6 5 2 A 11 12 39472 CASAVA_Build 1 32017277 3D TTGACTTACC AGA/--- AGGACAGGAA 3070 hom 132 het 51 0 42 9 AGA 1 0 39473 CASAVA_Build 1 32032687 3D TTTTTTTCTT TTC/--- TTTTTTTTTT 1286 het 910 hom 18 5 6 7 TTC 1 0 39474 CASAVA_Build 1 32041221 15I CAGGGGTGTG ---------------/GGAAGAAGAGCAACA GGAAGAATAT 3070 hom 84 het 35 0 28 8 GGAAGAAGAGCAACA 0 1 39475 CASAVA_Build 1 32042877 5I AATCCCAGAT -----/AGAAA AGATAAGATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AGAAA 0 1 39476 CASAVA_Build 1 32045647 4D TTTAAATAAC AGAT/---- AGGTCAAAGA 2075 het 2075 ref 11 5 5 2 AGAT 1 0 39477 CASAVA_Build 1 32057462 1D TCTCTGTCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 10 9 39478 CASAVA_Build 1 32060007 1D ATAATGTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 55 22 18 15 T 10 9 39479 CASAVA_Build 1 32060909 1I CTAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 1476 het 1476 ref 32 11 9 12 A 17 18 39480 CASAVA_Build 1 32061994 1I GGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 T 10 11 39481 CASAVA_Build 1 32076053 1D AGAAGGGCAA G/- AAAACCTGCC 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 G 1 0 39482 CASAVA_Build 1 32078250 1D ATCCAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 30 0 13 17 T 11 10 39483 CASAVA_Build 1 32084543 1I ATGAGATTTA -/G GGGGGGACAC 3070 hom 123 het 48 0 40 8 G 6 7 39484 CASAVA_Build 1 32089922 3D ACCCGGCTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 18 0 14 4 T 14 11 39485 CASAVA_Build 1 32118781 1I GAACTGTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 A 10 11 39486 CASAVA_Build 1 32123358 1I CCTATCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1489 hom 30 4 21 5 A 14 15 39487 CASAVA_Build 1 32125819 2D GTAATATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1460 het 618 hom 29 7 5 17 T 18 16 39488 CASAVA_Build 1 32142380 1D CACCTCTGGG C/- CCTTTGAACA 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 C 3 2 39489 CASAVA_Build 1 32144475 1D TTGAACTCCT G/- GGGCTCAAGT 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 G 4 3 39490 CASAVA_Build 1 32146300 86D ACCACCTGGA AAATATATATATATATATATATATTATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------------------------------------------------------- ATATATATAT 3070 het 54 hom 12 1 9 4 AAATATATATATATATATATATATTATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 39491 CASAVA_Build 1 32177582 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAAAG 3070 het 1949 hom 20 6 14 2 AAAG 2 1 39492 CASAVA_Build 1 32224790 1D AAAATTAAGG A/- AAAAAAAAAA 1106 het 1106 ref 25 14 3 8 A 11 10 39493 CASAVA_Build 1 32269030 1D TTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1536 het 1536 ref 39 19 6 14 T 13 12 39494 CASAVA_Build 1 32284375 1D AGGGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1572 het 1572 ref 36 22 4 12 T 12 11 39495 CASAVA_Build 1 32364089 2I TTAATTGAGA --/TT TTATATATAT 3070 het 2777 hom 22 8 9 5 T 2 4 39496 CASAVA_Build 1 32430650 2I TGGGGTGGGG --/GT GTGGGAGGAG 2512 het 2512 ref 27 12 8 7 GT 1 2 39497 CASAVA_Build 1 32469690 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGGTGG 3070 het 3070 hom 20 11 8 3 AAG 3 2 39498 CASAVA_Build 1 32544381 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2179 het 1336 hom 20 7 6 7 T 15 14 39499 CASAVA_Build 1 32558414 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1395 het 1395 ref 25 14 5 6 A 13 14 39500 CASAVA_Build 1 32750341 1D TATATGTAAG T/- TTTTTTTTTA 1406 het 1406 ref 24 17 3 4 T 10 9 39501 CASAVA_Build 1 32758744 1D TGGACTCTAT A/- AACATTTCTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 3 2 39502 CASAVA_Build 1 32881583 1D TTTAGTTTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 29 0 25 4 G 2 1 39503 CASAVA_Build 1 32882001 1I TTTTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 10 11 39504 CASAVA_Build 1 32894535 1I CAGCCGCCGG -/T TTTTTTTTGT 2109 hom 18 het 13 0 7 6 T 8 9 39505 CASAVA_Build 1 32894892 1D CTTTGTACTT C/- CATCGCGTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 C 2 1 39506 CASAVA_Build 1 32897135 2D ATATATAAAC AT/-- ACGTATATAT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 AT 1 0 39507 CASAVA_Build 1 32897727 1I CAGCCTGGGC -/A AAAAAAAAAA 2530 het 338 hom 34 1 15 18 A 11 12 39508 CASAVA_Build 1 32897754 5D CTCCGTCTCA AAAAC/----- AAAACAAAAG 3070 hom 41 het 24 0 14 10 AAAAC 2 1 39509 CASAVA_Build 1 32900000 1I TTTTTTTTTT -/C CACATTCGTT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 C 1 2 39510 CASAVA_Build 1 32911632 1I AATTTTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 0 1 39511 CASAVA_Build 1 32912502 1D GCTCACTGCA G/- CCTCCAATTC 3070 hom 70 het 44 1 42 2 G 1 0 39512 CASAVA_Build 1 32914820 4D AAAAAAAGAA AAAG/---- AAAAGCTGTT 3070 hom 39 het 19 0 13 6 AAAG 1 0 39513 CASAVA_Build 1 32915899 3I ATAGGATTGA ---/GTT GTTGTACACC 3070 hom 148 het 53 0 46 7 GTT 1 2 39514 CASAVA_Build 1 32920633 5I AAATTTAAAA -----/AAATG AAATAAAATC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AAATG 0 1 39515 CASAVA_Build 1 32920950 2I CAGAGCGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 138 hom 21 1 19 1 CT 1 2 39516 CASAVA_Build 1 32929581 1I GACTCCGACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 9 10 39517 CASAVA_Build 1 32929757 2D AAAAAAAAAA GT/-- AGCAAGGCAA 3070 hom 45 het 19 0 17 2 GT 1 0 39518 CASAVA_Build 1 32937917 1D CAAACATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 525 hom 28 4 14 10 T 15 14 39519 CASAVA_Build 1 32960742 1D AAAGGAAAGG A/- AAGGAAGGAA 741 het 281 hom 22 3 6 13 A 3 2 39520 CASAVA_Build 1 32962031 1D CATCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 17 0 11 6 A 11 10 39521 CASAVA_Build 1 32976198 2I CTGTTGCCTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 27 0 20 7 T 9 11 39522 CASAVA_Build 1 33000656 1I ATATATTTAC -/A TTTTTTTTTT 900 het 900 ref 16 9 3 4 A 0 1 39523 CASAVA_Build 1 33016605 1I CTTTCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 10 11 39524 CASAVA_Build 1 33022197 1D CACAAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 2842 het 2842 ref 42 18 8 17 T 15 14 39525 CASAVA_Build 1 33024079 1D GCCCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 499 hom 20 2 15 4 T 18 17 39526 CASAVA_Build 1 33048295 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 34 1 20 13 A 15 16 39527 CASAVA_Build 1 33052080 2I TTTATTTTAT --/TC TCTTAGTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TC 1 2 39528 CASAVA_Build 1 33059200 3I TAAAAGTAAC ---/ATA ATAATGAACA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATA 1 2 39529 CASAVA_Build 1 33061459 2I TGTGATAACC --/TG TGTCTGACAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TG 1 2 39530 CASAVA_Build 1 33067398 1D CCACTGATTC T/- TTAGTACAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 3 2 39531 CASAVA_Build 1 33070468 1D CATACTGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 112 het 42 0 37 5 T 11 10 39532 CASAVA_Build 1 33091456 14I TGGGTGGGTC --------------/ATTTGAGGTCAGGA GTTTGAGACC 3070 hom 66 het 30 0 20 10 ATTTGAGGTCAGGA 0 1 39533 CASAVA_Build 1 33095507 1D TTATTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 41 1 27 13 T 10 9 39534 CASAVA_Build 1 33114179 1I ATTTGGGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 27 0 14 13 T 10 11 39535 CASAVA_Build 1 33118775 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 12 13 39536 CASAVA_Build 1 33141621 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 958 het 958 ref 24 16 3 6 A 15 14 39537 CASAVA_Build 1 33162762 1D CAACTATAGT C/- CAACACTTCT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 C 2 1 39538 CASAVA_Build 1 33174922 1D TACCCCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3011 hom 29 12 13 4 A 17 16 39539 CASAVA_Build 1 33181643 1D CGTCTATACT A/- AAAAAAAAAA 1573 het 1573 ref 39 30 4 5 A 12 11 39540 CASAVA_Build 1 33248163 2D GCATTTGGTC AG/-- TTAAGAAAGG 1304 het 1304 ref 42 35 3 4 AG 1 0 39541 CASAVA_Build 1 33248581 1I GTAATCAAAG -/C CTCCCTGTTC 3070 het 3070 ref 55 28 19 8 C 1 2 39542 CASAVA_Build 1 33248755 4I ATATTGTGTC ----/TCTG TATTTCTACC 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 TCTG 0 1 39543 CASAVA_Build 1 33248811 2D TTTTTCCCTT AC/-- ACTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 AC 2 1 39544 CASAVA_Build 1 33313389 1D TTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2144 het 984 hom 26 7 8 11 T 19 18 39545 CASAVA_Build 1 33329738 1D CTATTTTCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 91 het 37 0 31 6 T 10 9 39546 CASAVA_Build 1 33353596 1I CAGATTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 13 14 39547 CASAVA_Build 1 33353809 1I GGAGAATCGC -/T TGAACCCAGG 3070 hom 68 het 26 0 23 3 T 1 2 39548 CASAVA_Build 1 33382324 10D ATGTTACTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 31 0 24 8 T 20 10 39549 CASAVA_Build 1 33403144 1D CTATATTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 30 1 15 14 T 17 16 39550 CASAVA_Build 1 33407206 1D CCTCCTGGAT C/- CCGGGAGAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 C 3 2 39551 CASAVA_Build 1 33408510 1D CAGTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 22 0 11 11 A 14 13 39552 CASAVA_Build 1 33422230 2I AAATGAAATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 29 9 A 11 13 39553 CASAVA_Build 1 33423957 1I ACATCAGGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 39554 CASAVA_Build 1 33433834 1D CTAAACATAG A/- AAAGGCAGAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 3 39555 CASAVA_Build 1 33436882 1I AAAGTCAATC -/A GTCAATCAAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 0 1 39556 CASAVA_Build 1 33437512 1D TGACAGTAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 8 39557 CASAVA_Build 1 33449125 1D TTAAGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 2252 het 112 hom 12 1 6 5 T 15 14 39558 CASAVA_Build 1 33466049 1D GGAAGGGATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 10 9 39559 CASAVA_Build 1 33478824 4D GCAAAATGTA TTTG/---- TTTGTTTACA 3070 hom 123 het 45 0 40 7 TTTG 2 1 39560 CASAVA_Build 1 33492312 10I CATTTAGTAG ----------/TTATGTGTCT TTCGTCTGTT 3070 hom 49 het 24 0 17 7 TTATGTGTCT 0 1 39561 CASAVA_Build 1 33493672 1D TCCTGGAACC G/- GCTGCCTCCT 3070 hom 66 het 23 0 21 3 G 2 1 39562 CASAVA_Build 1 33500599 2D TTCACACCAT TC/-- TCTCCTGCCT 978 hom 13 het 13 0 4 9 TC 3 2 39563 CASAVA_Build 1 33516120 2D TGTTCCTCCC CT/-- GTCGCCCCTG 3070 het 2481 hom 22 8 10 4 CT 1 0 39564 CASAVA_Build 1 33519258 6D CTCTGTCTCA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 hom 41 het 21 0 14 7 AAC 8 6 39565 CASAVA_Build 1 33534828 2D AGGAGGAGAA AG/-- AGGGGAAAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AG 2 1 39566 CASAVA_Build 1 33535540 3I TTTATCTCTC ---/TAA TGATAAAGAC 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 TAA 0 1 39567 CASAVA_Build 1 33538998 6D CCCCAGACTT GGAGAA/------ GGAAGAAAGT 3020 het 3020 ref 28 14 10 6 GGAGAA 1 0 39568 CASAVA_Build 1 33542681 1I CAGGCAGAAA -/T TTTTTTTTTT 2212 het 1179 hom 31 6 10 15 T 16 17 39569 CASAVA_Build 1 33544186 4I GGGAGCTGTG ----/TTTT TTGTTTTGAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 6 39570 CASAVA_Build 1 33554757 8I GAAGATGAGT --------/TAGGTGCC TAGGTGCCAG 3070 het 3070 hom 23 9 11 4 TAGGTGCC 1 2 39571 CASAVA_Build 1 33566744 4D ATCCTACACT CTAC/---- CTGACTCCCC 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 CTAC 1 0 39572 CASAVA_Build 1 33567679 1D GGTTTAAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 60 23 28 9 A 10 9 39573 CASAVA_Build 1 33569422 1D TGGGTCGAGG A/- ACTAGGAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 2 1 39574 CASAVA_Build 1 33574647 1I ACCAATGAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 9 39575 CASAVA_Build 1 33597390 4D TCAATATTGC TGAA/---- TGAATGAATG 3070 het 3070 ref 48 20 19 14 TGAA 4 3 39576 CASAVA_Build 1 33600948 2D TTCTTGAAAC TT/-- AATCATGTTT 3070 het 3070 ref 53 28 19 7 T 2 0 39577 CASAVA_Build 1 33601273 3D ACCAGGGAAA TAG/--- TCTAACAGAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 TAG 1 0 39578 CASAVA_Build 1 33609530 6D TTGCCACTGA GCACTC/------ CAACTATTAG 3070 het 3070 hom 35 10 21 6 GCACTC 1 0 39579 CASAVA_Build 1 33611309 1I CCTTTTATTC -/T TTTTTTTTGG 2693 het 1152 hom 22 5 10 7 T 8 9 39580 CASAVA_Build 1 33618051 3I GACCAGTCTC ---/CTT CTGCCTCTGG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 CTT 0 1 39581 CASAVA_Build 1 33622092 2D GGAAGGACTC AG/-- GGGGAGCATG 3070 het 3070 ref 44 29 10 7 AG 1 0 39582 CASAVA_Build 1 33628874 2D GGAGTCAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1219 hom 45 8 17 20 T 16 14 39583 CASAVA_Build 1 33629842 1D CTTTGATAGG A/- AAAAAAAAAA 1404 het 1404 ref 30 19 4 7 A 13 12 39584 CASAVA_Build 1 33631913 48I GGCAAGAATA ------------------------------------------------/AACGATGACCTCAGCTGCTGCACAGCTCTTCACTGTTCTCTTAATACC AACTCTACCC 3070 het 3070 ref 58 29 21 13 AACGATGACCTCAGCTGCTGCACAGCTCTTCACTGTTCTCTTAATACC 0 1 39585 CASAVA_Build 1 33633638 8D CTTAAGATAA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 3070 het 1980 hom 18 4 9 6 AAAT 7 5 39586 CASAVA_Build 1 33641024 3I GGGAAAACTC ---/TTT TTTTTTTTGA 2919 het 2919 ref 21 9 9 3 T 8 11 39587 CASAVA_Build 1 33642161 1D TTTCATATGC T/- GTTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 T 1 0 39588 CASAVA_Build 1 33655712 1D AGGAATATTG C/- CAGAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 22 12 7 C 2 1 39589 CASAVA_Build 1 33656566 6D AGTGAGAGAG AGAGAA/------ AGAGGACACA 3070 het 2825 hom 25 10 13 4 AGAGAA 1 0 39590 CASAVA_Build 1 33659316 3D TCAGGAGAAA TGT/--- TGTCTTATCT 3070 het 3070 ref 44 25 15 5 TGT 2 1 39591 CASAVA_Build 1 33662222 2D AGGCGGAGGT GG/-- TGCAGTGATC 3070 het 3070 hom 18 7 8 3 G 2 0 39592 CASAVA_Build 1 33671536 4D TCTCGGTTTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 AT 9 7 39593 CASAVA_Build 1 33674151 25D GAGGTTGTTC ATGAGGGGCGGATCACACGGACAGA/------------------------- ATGAAGTGTG 3070 het 3070 ref 32 18 16 6 ATGAGGGGCGGATCACACGGACAGA 1 0 39594 CASAVA_Build 1 33678873 4I TAGACTCTGT ----/CAAA CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 CAAA 3 4 39595 CASAVA_Build 1 33703182 2D AATAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 25 2 14 10 A 13 11 39596 CASAVA_Build 1 33703769 3D CCGTGCCCAG AAT/--- AATGACAGAG 3070 het 3070 hom 56 26 26 4 AAT 2 1 39597 CASAVA_Build 1 33704188 1D TCACCATTAG T/- CTGCTTCTTC 3070 het 3070 ref 45 23 19 4 T 1 0 39598 CASAVA_Build 1 33714014 2D CGCTTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2357 hom 24 het 10 0 9 2 T 16 14 39599 CASAVA_Build 1 33716543 1I AATTGGATTT -/G GGGGATCTTA 3070 het 316 hom 70 1 61 8 G 4 5 39600 CASAVA_Build 1 33719388 1I CCCCTATATT -/A TTTCTTTTAA 3070 hom 70 het 26 0 22 4 A 0 1 39601 CASAVA_Build 1 33722132 1D AAATATTTCA T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 160 het 60 0 54 7 T 8 7 39602 CASAVA_Build 1 33723772 1I CTTTTGTATA -/T TTTTTTTTTT 3049 hom 34 het 17 0 9 8 T 10 11 39603 CASAVA_Build 1 33727057 1D TCCTGCAGCA G/- GTGCAGGCTG 3070 hom 107 het 43 0 33 10 G 2 1 39604 CASAVA_Build 1 33738585 7D GTTTGAGAGG TCCCAGT/------- TCTTTTCAGT 3070 hom 135 het 48 0 45 7 TCCCAGT 1 0 39605 CASAVA_Build 1 33746008 8D CTGTCTTTTA TCTTTCTT/-------- TCTTTCTTTC 3070 hom 52 het 26 0 18 8 TCTT 6 4 39606 CASAVA_Build 1 33749328 1I CCGTTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2258 het 45 hom 11 1 8 2 A 13 14 39607 CASAVA_Build 1 33752468 1D AATTTACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2385 hom 18 8 9 1 T 11 10 39608 CASAVA_Build 1 33755093 2D AAATCAGATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 12 10 39609 CASAVA_Build 1 33771762 1D CACTGGATAG T/- TTTTTCTTTG 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 T 6 5 39610 CASAVA_Build 1 33778461 2D AAAAAAAAAA AC/-- ACCCCCAATA 3070 het 2032 hom 24 7 11 7 AC 2 1 39611 CASAVA_Build 1 33800409 1D GCCTGGTTCA G/- GCTCTTACCC 3070 hom 101 het 39 0 32 7 G 2 1 39612 CASAVA_Build 1 33802266 3D ACCATCATCT TCA/--- TCATCATCAT 3023 het 3023 ref 57 19 16 24 TCA 6 5 39613 CASAVA_Build 1 33804494 1D CAGGAACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1124 hom 44 4 35 7 A 12 11 39614 CASAVA_Build 1 33810579 3D CATGTCCATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 46 0 40 8 T 15 12 39615 CASAVA_Build 1 33811052 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 11 10 39616 CASAVA_Build 1 33811234 1D TTTCCACTGA G/- GGGGGATCTC 3070 hom 72 het 27 0 25 3 G 6 5 39617 CASAVA_Build 1 33815757 1D CCTTTCGTCT C/- CCCCCCATCC 3070 hom 121 het 45 0 37 8 C 7 6 39618 CASAVA_Build 1 33843000 3D AGCCCTGTGT AGA/--- AGGAGAGTAT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AGA 1 0 39619 CASAVA_Build 1 33850870 1D TTTGTGATGG T/- TTTTTTTTTT 1744 het 387 hom 23 2 5 16 T 17 16 39620 CASAVA_Build 1 33851045 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 4 5 39621 CASAVA_Build 1 33856203 14I CTGTGGGCTA --------------/AGACAGAGAGACAG AGACAGAGAG 3070 hom 90 het 34 0 29 6 AGACAGAGAGACAG 1 2 39622 CASAVA_Build 1 33894284 1D GCTTAGGGAA G/- GGGAAGGGAG 3070 hom 58 het 23 0 19 6 G 4 3 39623 CASAVA_Build 1 33938198 1I CTTTACTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 27 2 21 5 T 11 12 39624 CASAVA_Build 1 33946586 4D CCCCAAAACC AAAT/---- AAATACATGG 3070 hom 135 het 53 0 46 10 AAAT 2 1 39625 CASAVA_Build 1 33948955 9D CCTTCAGAAC ATGGAAACA/--------- TAAGCTGCTC 3070 hom 111 het 39 0 38 6 ATGGAAACA 1 0 39626 CASAVA_Build 1 33954095 1D ATTTCAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 42 1 27 15 T 12 11 39627 CASAVA_Build 1 33962545 1D GAGGGCCTCA G/- GGGAGCACCC 3070 hom 85 het 31 0 27 5 G 4 3 39628 CASAVA_Build 1 34031884 12I ATTGGCAGGA ------------/GTGAGGCTGGTG GTGAGGATGG 3070 hom 85 het 36 0 26 10 GTGAGGCTGGTG 0 1 39629 CASAVA_Build 1 34039178 3D ACAAATGGGC CAA/--- CGAGTATGTC 3070 het 3070 hom 47 24 20 5 CAA 1 0 39630 CASAVA_Build 1 34041962 1D CCTTCCAGTA T/- CCACCTCTAA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 1 0 39631 CASAVA_Build 1 34047470 5I TTACTAAACA -----/AAATC ATATATAGGC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AAATC 0 1 39632 CASAVA_Build 1 34047932 1I AACACCATCA -/T TTTTTTTGCA 1900 het 1900 ref 21 8 4 9 T 7 8 39633 CASAVA_Build 1 34048798 1I CGATATTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 10 11 39634 CASAVA_Build 1 34050846 4I AGTTAGAAAA ----/TCTC TCTGATTTTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TC 1 3 39635 CASAVA_Build 1 34051803 3D TCTGGACATT ATC/--- ATATAATGGG 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 ATC 1 0 39636 CASAVA_Build 1 34061581 2D TCTCCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 43 2 25 16 T 14 12 39637 CASAVA_Build 1 34063342 1I AAGAAGAGAG -/C CCCCCAGTGC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 5 6 39638 CASAVA_Build 1 34065853 1D TTTTATTCAT G/- GGTGTATCCT 3070 hom 141 het 52 0 47 5 G 3 2 39639 CASAVA_Build 1 34075590 1I TTTTTTTTCA -/T TGGAGCACCC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 1 2 39640 CASAVA_Build 1 34075652 2I TAAAAAGAAG --/AT TTTTTTACTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AT 0 1 39641 CASAVA_Build 1 34079830 1I ACCAGAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 10 11 39642 CASAVA_Build 1 34081852 1D TGCCAGCCAG A/- GATCCCAGGG 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 1 0 39643 CASAVA_Build 1 34082476 1I GTGTGTGTGT -/G GGGGGGGCGC 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 G 7 8 39644 CASAVA_Build 1 34088939 1D TTACACTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 55 het 28 0 21 7 T 10 9 39645 CASAVA_Build 1 34100138 3I CTGATCTCCT ---/GTG GAGGGCCCCA 3070 hom 110 het 41 0 33 8 GTG 0 1 39646 CASAVA_Build 1 34106924 4D ACTCCATCTT AACA/---- AACAAACAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 AACA 6 5 39647 CASAVA_Build 1 34119189 10I TTTATGATGC ----------/CCAGTATGTG CCAGGCACTG 3070 het 3070 ref 44 26 15 4 CCAGTATGTG 0 1 39648 CASAVA_Build 1 34123309 1I GAACCAGAGA -/C CCAGAGAGTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 C 2 3 39649 CASAVA_Build 1 34126195 1I AAATGGCCCT -/A ATTCACTATA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 1 2 39650 CASAVA_Build 1 34127844 6D TGAGGCTGAC ATATAT/------ ATATATACTG 3070 het 3070 ref 31 15 17 2 AT 6 3 39651 CASAVA_Build 1 34128241 1D ATAAAAAAAA G/- AGAAAGAAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 1 0 39652 CASAVA_Build 1 34142776 1D GGTGTTATCC A/- CCACTAAATA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 A 1 0 39653 CASAVA_Build 1 34200639 1I GCAAGGTCAG -/C CCCAGGTTCT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 C 3 4 39654 CASAVA_Build 1 34251411 1D TGGAGTTTTC A/- ATCCATCGTT 3070 het 3070 hom 50 19 17 15 A 2 1 39655 CASAVA_Build 1 34254994 4D ATAGATAGAC AGAT/---- AGAATGATTG 3070 het 3070 hom 27 11 14 6 AGAT 1 0 39656 CASAVA_Build 1 34266029 18D AGGCTAGACC TGGGCAGACAGCCCTACA/------------------ TGGGCAGACA 3070 hom 77 het 36 0 20 21 TGGGCAGACAGCCCTACA 2 1 39657 CASAVA_Build 1 34275308 5I TAAAAAATTA -----/AATTT AATTTAATAA 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 AATTT 1 2 39658 CASAVA_Build 1 34278396 1I AAATTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 12 6 A 10 11 39659 CASAVA_Build 1 34281141 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 53 het 22 0 18 4 T 10 9 39660 CASAVA_Build 1 34286320 3D AGGAAGAGAG GTC/--- GTCATGTTCC 3070 het 3070 hom 54 20 23 11 GTC 2 1 39661 CASAVA_Build 1 34292373 3D CACAAATGTC CTT/--- CTTCTCTTCC 3070 het 3070 ref 38 22 15 2 CTT 2 1 39662 CASAVA_Build 1 34314799 4I ATGATTCACA ----/AATT AATTATTTTG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 AATT 1 2 39663 CASAVA_Build 1 34337108 4I TCAACAACAG ----/AAAC AATATCAGAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 AAAC 0 1 39664 CASAVA_Build 1 34340225 1D AAATGTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3010 hom 23 8 10 5 T 12 11 39665 CASAVA_Build 1 34343525 1D AATGTGACAA C/- CAAAATTTCT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 C 2 1 39666 CASAVA_Build 1 34346461 2D AAACCCTAAT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 36 13 17 7 GA 6 5 39667 CASAVA_Build 1 34352483 6D GAGAACTCCT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 2086 het 2086 ref 24 10 6 11 TTG 8 6 39668 CASAVA_Build 1 34361711 1I CAAACTTAAA -/G GGGGGGGGGT 2047 hom 4 het 30 0 12 18 G 9 10 39669 CASAVA_Build 1 34366322 2I GGGGTGTCCT --/TC TCCTCCCACA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 TC 1 2 39670 CASAVA_Build 1 34367192 1D TACATGTGTA C/- CCCCCCCCAC 1261 het 1068 hom 46 11 10 25 C 9 8 39671 CASAVA_Build 1 34378503 3D34M2I CAAACAAACA AACAAAAAAAAACCCAGCGGCAGAAGAAAGCATGGCC--/---AAAAAAAAACCCAGCGGCAGAAGAAAGCATGGCCCT CTGTGAGCTT 3070 het 47 hom 24 2 17 17 N/A 0 0 39672 CASAVA_Build 1 34379883 1D CACATGGAAA G/- GACCTTGACT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 G 2 1 39673 CASAVA_Build 1 34385836 2I AAGTGGGTGC --/AG AGTCAGGGAG 3070 hom 79 het 30 0 25 5 AG 1 2 39674 CASAVA_Build 1 34386795 1I CTCCTTCAGT -/G GGGGCACAGA 3070 hom 110 het 43 0 35 8 G 4 5 39675 CASAVA_Build 1 34405813 24D CTGTGCTCGG GGGCCCTGAGCGAGGCTGTGCTCT/------------------------ GGGCCCTGCA 2408 het 2408 ref 21 15 5 6 GGGCCCTGAGCGAGGCTGTGCTCT 1 0 39676 CASAVA_Build 1 34407306 1I ACATATACTC -/T TAACTTCTCT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 1 2 39677 CASAVA_Build 1 34427165 2D CCTTCCTTCC CT/-- GTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 CT 1 0 39678 CASAVA_Build 1 34461664 1I TGTCTGCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 11 12 39679 CASAVA_Build 1 34470409 1D ATCGGTTCTC A/- CAGAACACTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 0 39680 CASAVA_Build 1 34485257 1I TTTTTTTGGC -/G GGGGGGGCAG 3070 hom 78 het 28 0 23 5 G 7 8 39681 CASAVA_Build 1 34507328 10D CTTGTCATAC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 2336 het 2336 ref 19 7 7 7 AT 11 6 39682 CASAVA_Build 1 34510306 1D CCTGGCTCTC G/- GTCTAACTCT 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 G 2 1 39683 CASAVA_Build 1 34510401 4I ACCATGAACT ----/GATG GATGGAGTAG 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 GATG 1 2 39684 CASAVA_Build 1 34524083 5D TTGTTGAATC AAATT/----- GAATTAAATG 3070 het 3070 hom 44 15 19 14 AAATT 1 0 39685 CASAVA_Build 1 34528611 1D GGTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 715 hom 39 2 27 10 T 12 11 39686 CASAVA_Build 1 34537560 1I GATTTTTTCA -/C CAATTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 C 1 2 39687 CASAVA_Build 1 34545385 1I AGAGTTAAAA -/G ACGACATAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 0 1 39688 CASAVA_Build 1 34551598 1D TCTGTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 26 0 21 6 T 10 9 39689 CASAVA_Build 1 34560767 3D CACATCTAAT AAC/--- AACAGCTAAC 3070 hom 135 het 51 0 46 7 AAC 2 1 39690 CASAVA_Build 1 34569579 1I TTTTCCAACT -/C CCATAATTGG 3070 het 213 hom 68 1 58 9 C 2 3 39691 CASAVA_Build 1 34583836 2I TTAAAAAAAT --/AC AGTCATGAGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AC 0 1 39692 CASAVA_Build 1 34586045 2I CAAGGCCATG --/GC GGGGGGGGGC 53 het 34 hom 24 1 2 21 GC 0 1 39693 CASAVA_Build 1 34593682 2D TCCGTGAAGC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AT 1 0 39694 CASAVA_Build 1 34594455 1I AGGGCAGGAT -/G GGAAGGTAAG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 2 3 39695 CASAVA_Build 1 34627819 1D TCTGTGGACA T/- TTTAAAAGAA 3070 hom 144 het 56 0 48 9 T 4 3 39696 CASAVA_Build 1 34631536 1D CTTGTAAATT A/- AAAAAAAAAT 1278 het 1278 ref 40 35 3 3 A 10 9 39697 CASAVA_Build 1 34633261 1D CTGATGCAAG A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 A 7 6 39698 CASAVA_Build 1 34643036 1D TTAGGCCTTA C/- CTCCCAATAC 3070 het 3070 hom 51 22 24 6 C 2 1 39699 CASAVA_Build 1 34646086 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAGTAAA 3015 het 1498 hom 12 4 8 0 T 4 5 39700 CASAVA_Build 1 34655575 1D TCAGCACAGG C/- TTTAAAATCA 3070 het 3070 ref 58 34 17 7 C 1 0 39701 CASAVA_Build 1 34671990 4D GAAGACCACA AGGC/---- AGAGGGATCA 3070 het 3070 ref 41 25 14 4 AGGC 1 0 39702 CASAVA_Build 1 34673478 1D CACCCAGGCT G/- GGAGTGCAGT 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 G 3 2 39703 CASAVA_Build 1 34681045 1I GCCTGGGACA -/G GGCCTAGCCA 3070 hom 82 het 33 0 26 7 G 2 3 39704 CASAVA_Build 1 34685724 1I ACTCTGAGAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 A 8 9 39705 CASAVA_Build 1 34687595 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3033 hom 37 12 12 13 A 13 14 39706 CASAVA_Build 1 34704023 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1759 hom 17 5 11 2 A 13 12 39707 CASAVA_Build 1 34715132 8D AGAATCTCTT GAACCCCA/-------- AAGGCAAGGT 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 GAACCCCA 1 0 39708 CASAVA_Build 1 34716188 1D CATAATCAGT A/- ATATGTGGAT 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 A 2 1 39709 CASAVA_Build 1 34721577 1D GACCTCAGTT G/- GGGGGTGGAT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 G 6 5 39710 CASAVA_Build 1 34734529 2D AAAAACAGAC AT/-- ATACATTCGT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 AT 2 1 39711 CASAVA_Build 1 34751374 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 T 8 9 39712 CASAVA_Build 1 34769691 2I CTGATGAGCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 A 10 12 39713 CASAVA_Build 1 34771247 1I CTAGGGGCAA -/G GGAGCACTGG 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 G 2 3 39714 CASAVA_Build 1 34776629 1I ATTAGAATTC -/A AAAAAAAAAA 2292 het 2292 ref 24 15 7 2 A 12 13 39715 CASAVA_Build 1 34778796 1D TATTAAAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 9 8 39716 CASAVA_Build 1 34788860 1D GGAATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 25 20 3 A 10 9 39717 CASAVA_Build 1 34850175 4D TCTAGGTCTG CCCA/---- CCAGGGCAGA 3070 het 3070 hom 36 12 18 10 CCCA 1 0 39718 CASAVA_Build 1 34863781 1D GCATGCCCCC A/- GCCACCTCCT 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 A 1 0 39719 CASAVA_Build 1 34927971 4I CTCTCTGTAG ----/CTGA CTGACTACGT 3070 hom 130 het 49 0 43 6 CTGA 1 2 39720 CASAVA_Build 1 34944773 3D GTACATTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 951 het 445 hom 27 6 4 20 T 17 14 39721 CASAVA_Build 1 34975215 2D TGCAGTCGTG CA/-- CACACACACA 1438 het 1438 ref 37 25 4 10 CA 7 6 39722 CASAVA_Build 1 34985396 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 42 0 33 9 A 12 11 39723 CASAVA_Build 1 35013273 2I CCAGTGAGCC --/GA GAGACGTGGA 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 GA 2 3 39724 CASAVA_Build 1 35022395 2D GGAGGTGGTG GA/-- GAGCACAGGC 3070 het 3070 hom 43 15 24 5 GA 2 1 39725 CASAVA_Build 1 35033632 2D GAGCACAGAC AG/-- AGTCAGCATG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 AG 2 1 39726 CASAVA_Build 1 35037491 3D TGAGCCTGCT CTC/--- CTCCTATTCC 3070 het 3070 ref 33 20 12 2 CTC 2 1 39727 CASAVA_Build 1 35048600 1D ATCACGACTA T/- TCATTCAACA 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 T 2 1 39728 CASAVA_Build 1 35049080 1D GCAAAGACAT G/- GAATCAACCT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 G 2 1 39729 CASAVA_Build 1 35051741 1D AAATTGAGGG A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 105 het 40 0 36 6 A 8 7 39730 CASAVA_Build 1 35054666 1I CCAGGAGAAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 7 8 39731 CASAVA_Build 1 35073756 1I GAAATGCAGC -/A AAGGCATTGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 3 39732 CASAVA_Build 1 35073884 1D AAAGAGGCAG A/- AAAATAGCTG 3070 hom 117 het 43 0 40 7 A 5 4 39733 CASAVA_Build 1 35077828 1I AAATTTGATA -/C GTCAGCCCTC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 C 0 1 39734 CASAVA_Build 1 35086109 13I GAGGATCCCT -------------/GGGCTCAGACCCA GGGCCTTGCT 3070 hom 73 het 28 0 19 9 GGGCTCAGACCCA 0 1 39735 CASAVA_Build 1 35086514 2D ATCCCAGAAT CA/-- CACTCCAGGA 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 CA 2 1 39736 CASAVA_Build 1 35088786 3D AACTAGATAA AGG/--- AGGTTTTACT 3070 het 3070 ref 62 33 23 7 AGG 2 1 39737 CASAVA_Build 1 35104973 1I GCCGCCGCCA -/C CCCCCCCAAC 1616 hom 24 het 11 0 7 4 C 7 8 39738 CASAVA_Build 1 35108694 4I GCCTTCTCTC ----/CCTG CCTGCCTGCC 2595 het 2595 ref 45 14 13 18 CCTG 3 4 39739 CASAVA_Build 1 35123161 1D CCACCGTGAC T/- TTACCTCTTG 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 T 3 2 39740 CASAVA_Build 1 35130853 6D4M11D CTACAGGTGC CCACTACTGTGCCTACCTACC/------CTGT----------- AAATTTAATT 3070 het 3070 ref 25 14 10 11 N/A 0 0 39741 CASAVA_Build 1 35137117 1D AACTGTCCCT A/- ACCATTGCCA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 A 2 1 39742 CASAVA_Build 1 35149213 2I ATTATCCACC --/CT CCCCCCCCAC 3070 het 1843 hom 33 12 14 7 CT 0 1 39743 CASAVA_Build 1 35193218 2I ATCCTAGAAC --/CA CCACTAAACA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 CA 0 1 39744 CASAVA_Build 1 35207840 1I GGGGATATCA -/C CCCCAGCTTT 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 C 4 5 39745 CASAVA_Build 1 35209013 1I CATTCTCAAA -/T TAACAAATTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 1 2 39746 CASAVA_Build 1 35239459 1D CTGTCAGGTG T/- TTTTTTTTTT 2042 het 2042 ref 35 18 9 8 T 17 16 39747 CASAVA_Build 1 35310713 1I ATCTTTTGAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 8 9 39748 CASAVA_Build 1 35311439 1D ACACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 308 hom 25 1 13 11 A 17 16 39749 CASAVA_Build 1 35317610 2I GCGTTGGGCG --/GC GGGCGTCCCT 3070 hom 31 het 16 0 8 8 GC 0 1 39750 CASAVA_Build 1 35319137 1D AATAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 27 0 22 5 T 12 11 39751 CASAVA_Build 1 35325620 1D TTGCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 12 11 39752 CASAVA_Build 1 35327819 1D TTTTTTGTTA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 6 39753 CASAVA_Build 1 35329268 1D GCTATTTACC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 8 7 39754 CASAVA_Build 1 35330588 1D ACTCGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 26 1 15 10 T 13 12 39755 CASAVA_Build 1 35330601 1D TTTTTTTTTT G/- TATTTTTAGT 3070 hom 4 het 19 1 15 3 G 1 0 39756 CASAVA_Build 1 35353883 1D CATGAGTGAG T/- TTACTGTAAG 3070 hom 120 het 44 0 41 5 T 3 2 39757 CASAVA_Build 1 35358413 3I TAAGAGGTAA ---/CTT AAGAAAGAAA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 CTT 0 1 39758 CASAVA_Build 1 35374799 1I TCTAGATCTT -/G TAGGATGGAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 0 1 39759 CASAVA_Build 1 35377632 4D TTGCATCTAA ATAG/---- ATGTGAGAGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATAG 1 0 39760 CASAVA_Build 1 35382436 1D TAAGTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 17 8 T 12 11 39761 CASAVA_Build 1 35389858 1D GCTTACTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 11 10 39762 CASAVA_Build 1 35391520 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 44 0 28 16 A 15 14 39763 CASAVA_Build 1 35400953 1D ACCATGTTGG T/- CAGACTGGTT 3070 het 197 hom 19 2 14 3 T 1 0 39764 CASAVA_Build 1 35402964 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2853 hom 27 het 13 0 10 3 A 12 11 39765 CASAVA_Build 1 35405556 11D TAGCTGGGAC TACAGGCATTA/----------- TACAGGCATG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TACAGGCATTA 1 0 39766 CASAVA_Build 1 35421414 5D GTACTAAACC TTTTT/----- TTTTTTTTGA 3070 het 2542 hom 42 9 22 12 T 13 8 39767 CASAVA_Build 1 35499852 18D TCTCCTTCTT CTCCTTCTTCTCCTCCTC/------------------ CTCCTTCTTC 3070 hom 69 het 20 0 23 7 CTCCTTCTTCTCCTCCTC 2 1 39768 CASAVA_Build 1 35507574 11D CAGATTCTTA AGTGCATCTTT/----------- AGTGCATCTT 3070 hom 29 het 12 0 10 3 AGTGCATCTTT 2 1 39769 CASAVA_Build 1 35509549 1D GGAATGCTGG A/- AAAAAAAAAA 1579 het 1579 ref 38 23 4 11 A 13 12 39770 CASAVA_Build 1 35519850 2D CATATAATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AT 9 8 39771 CASAVA_Build 1 35541498 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 558 hom 20 2 13 5 A 8 7 39772 CASAVA_Build 1 35543034 4I ACAAGTAAAC ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTTA 1 2 39773 CASAVA_Build 1 35553266 1D GGTGATGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 22 10 T 14 13 39774 CASAVA_Build 1 35569304 1D AGTCTTTTTT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 8 7 39775 CASAVA_Build 1 35599547 1D AGAGCACTGA T/- TTTTTTTTTT 1543 het 1543 ref 57 43 4 12 T 12 11 39776 CASAVA_Build 1 35643958 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2696 het 2696 ref 29 10 11 8 T 11 10 39777 CASAVA_Build 1 35770830 3D TAAAAGGTAA GAT/--- GAAAATATAC 3070 het 3070 hom 42 17 19 8 GAT 1 0 39778 CASAVA_Build 1 35818241 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 8 7 39779 CASAVA_Build 1 35831226 12D AGGGGGATAG AGAAAGAGAGAA/------------ AGAAAGAGAG 3070 het 3070 ref 30 12 15 7 AGAAAGAGAGAA 1 0 39780 CASAVA_Build 1 35871676 2D TTTTAACCAA AC/-- ACAGTTTTTG 3070 hom 146 het 55 0 48 8 AC 2 1 39781 CASAVA_Build 1 35884829 2D TCACACCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 30 1 20 10 A 15 13 39782 CASAVA_Build 1 35888402 1I AGTGACCATA -/C ATTTTTTGCA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 C 0 1 39783 CASAVA_Build 1 35895002 4I AGCAACCCTC ----/TGTT TGGAGGCATT 3070 hom 123 het 45 0 38 7 TGTT 0 1 39784 CASAVA_Build 1 35902867 1D ATTTTATTTT A/- TTTTTGATTT 2638 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 0 39785 CASAVA_Build 1 35903563 1I ATATTTTTAA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 8 9 39786 CASAVA_Build 1 35909008 1D TGTGTCCCCT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 103 het 41 0 35 6 A 8 7 39787 CASAVA_Build 1 35927106 1I AGGTGAGGCT -/G GGATGGAGTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 2 3 39788 CASAVA_Build 1 35932662 1D GTACATATTT G/- TTACAGCAGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 1 0 39789 CASAVA_Build 1 35938389 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 10 9 39790 CASAVA_Build 1 35942576 9I AGTTAATGCT ---------/GTTTGACCG TGGCTACACC 3070 hom 138 het 49 0 45 4 GTTTGACCG 0 1 39791 CASAVA_Build 1 35948745 4D TGTACCACCA TGAC/---- TGACTAATTT 3070 hom 98 het 39 0 29 11 TGAC 2 1 39792 CASAVA_Build 1 35988189 1I CTTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 33 1 23 9 T 12 13 39793 CASAVA_Build 1 35991593 1D TTTGTTTAAA T/- TACATATACA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 T 2 1 39794 CASAVA_Build 1 36006556 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 13 0 10 4 A 13 12 39795 CASAVA_Build 1 36020846 1D TTTTGAAGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 9 8 39796 CASAVA_Build 1 36035019 1D TCTTATTCGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 8 39797 CASAVA_Build 1 36067220 1I CCCCCCCCCC -/A CACACACACA 1170 het 1170 ref 24 12 6 6 A 0 1 39798 CASAVA_Build 1 36086640 1D TTGTATACAC T/- TTTCATGAAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 4 3 39799 CASAVA_Build 1 36095019 2D AAAAAAAAAA GG/-- GGGGGGGGGG 1094 het 113 hom 22 1 5 17 G 12 10 39800 CASAVA_Build 1 36162421 3D CAAGCAACAT CAG/--- CAGCAGCAGC 3070 het 2930 hom 34 11 13 11 CAG 7 6 39801 CASAVA_Build 1 36171186 1I AACATTTGTT -/A ACATCAAACC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 2 39802 CASAVA_Build 1 36241330 1D ACAGTGGGCA T/- TTTTTTTTTT 1760 het 1760 ref 24 15 5 4 T 13 12 39803 CASAVA_Build 1 36256534 1D GATTATGAAG C/- AAAAAAGGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 0 39804 CASAVA_Build 1 36269670 1I TTCTCCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 25 2 19 4 T 11 12 39805 CASAVA_Build 1 36299190 1I TATAGGAGTC -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 A 6 7 39806 CASAVA_Build 1 36321795 2I GGGGCAGTGA --/CT CACATCTGTA 3070 hom 54 het 19 0 17 2 CT 0 1 39807 CASAVA_Build 1 36329367 1D CAAAAAAAGC A/- AAAAACAACA 3070 het 3070 ref 39 21 11 9 A 6 5 39808 CASAVA_Build 1 36342374 3D AAGAGCAAAA CTC/--- CACCTCAAAA 3070 hom 36 het 13 0 12 2 CTC 1 0 39809 CASAVA_Build 1 36344139 1D TGTCTCACTT A/- AAAAAAAAAA 2912 het 497 hom 22 3 11 8 A 17 16 39810 CASAVA_Build 1 36344905 1I GCAGGGCGCC -/A AAGGAACAGC 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 2 3 39811 CASAVA_Build 1 36348456 1I GCTCTCATTT -/A AAAAAAAAAA 1670 het 1580 hom 21 8 7 6 A 17 18 39812 CASAVA_Build 1 36349742 2D CCCTGAGCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 33 0 18 17 T 14 12 39813 CASAVA_Build 1 36352351 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 7 6 39814 CASAVA_Build 1 36359906 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 11 39815 CASAVA_Build 1 36379352 3D TCAAAAAAAA AAG/--- AAGAATTCTG 3070 hom 60 het 21 0 21 3 AAG 2 1 39816 CASAVA_Build 1 36380390 1D CAGGAGGCCC T/- TTGAACTCAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 3 2 39817 CASAVA_Build 1 36387252 1D AAGAGAGAAG T/- TAAGTGGCAG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 2 1 39818 CASAVA_Build 1 36396331 1D CCTAGGGGCA G/- GGGGGATGTT 3070 hom 77 het 28 0 23 5 G 6 5 39819 CASAVA_Build 1 36405946 3D CCAAGCCTCA CTC/--- CTCTACCTCC 3070 hom 100 het 37 0 31 9 CTC 2 1 39820 CASAVA_Build 1 36408683 1I ACATGGAAAC -/A AATCAGTGCA 3070 hom 147 het 54 0 48 6 A 2 3 39821 CASAVA_Build 1 36437272 1D ATTCATTGTC T/- TTTTTTTTTT 1581 het 1581 ref 34 17 6 11 T 17 16 39822 CASAVA_Build 1 36437997 1I TAGTGTCACC -/A ACTCAACAAG 3070 het 3070 hom 46 13 25 8 A 1 2 39823 CASAVA_Build 1 36444603 1D TTATAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 25 0 14 11 T 13 12 39824 CASAVA_Build 1 36445518 1I GTTGCTATTA -/T TTCAAGAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 2 3 39825 CASAVA_Build 1 36467841 4D TTGTTTGTTC GTTT/---- GTTTGTTTGT 2923 het 2923 ref 20 8 7 5 GTTT 4 3 39826 CASAVA_Build 1 36471144 6I CTCACTGCAA ------/CCTCTG CCTCCCAGAT 3070 hom 86 het 31 0 30 2 CCTCTG 0 1 39827 CASAVA_Build 1 36474442 2D CATGACAGAC TG/-- GGCGCAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 TG 1 0 39828 CASAVA_Build 1 36491354 1D TTCACACAGA T/- TGGGTACTGC 3070 hom 105 het 36 0 35 1 T 2 1 39829 CASAVA_Build 1 36520418 4D TCAGCCACTT TCTC/---- TCTTTTTTTT 1914 het 450 hom 29 4 11 15 TC 3 1 39830 CASAVA_Build 1 36521805 52D TGGAACCCCT GCTGTTTATTTCAGATGAGTATCTAGAATCCTTGTCTTAGATGAATTGATTA/---------------------------------------------------- GCTGTTTATT 3070 hom 39 het 29 0 14 20 GCTGTTTATTTCAGATGAGTATCTAGAATCCTTGTCTTAGATGAATTGATTA 2 1 39831 CASAVA_Build 1 36536172 1I GTCTCTACTG -/A AAAAAAAAAA 1294 het 1294 ref 16 6 7 3 A 14 15 39832 CASAVA_Build 1 36543193 2D TTTGGGTTTC TT/-- TTTTTTTTTC 1927 het 1927 ref 22 12 7 3 T 11 9 39833 CASAVA_Build 1 36545662 2D CTAGGGACTC TT/-- GGGGCAGAAC 3070 het 3070 hom 35 14 14 9 T 2 0 39834 CASAVA_Build 1 36554417 10D TGCTTTTATT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 34 15 10 12 TTTTG 5 3 39835 CASAVA_Build 1 36565377 1I GAGGCCAGAA -/T TTTGCCCACT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 T 3 4 39836 CASAVA_Build 1 36613695 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1097 het 1097 ref 12 7 5 0 A 13 14 39837 CASAVA_Build 1 36629107 6D AATGGCTGAC CAGTGG/------ CAGTTGGGGA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 CAGTGG 1 0 39838 CASAVA_Build 1 36634317 3D GGGCTGAGGC AGG/--- AGAATGGCGT 1351 hom 14 het 8 0 4 4 AGG 1 0 39839 CASAVA_Build 1 36636659 1D TCTGGGCAAC A/- ATGGGGAGAC 3070 hom 47 het 19 0 15 7 A 2 1 39840 CASAVA_Build 1 36637256 1I CAAATTTGGC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 9 39841 CASAVA_Build 1 36637388 2D GTGGTATAAC AA/-- GAGGCCAGAG 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 2 0 39842 CASAVA_Build 1 36645540 1D TACATAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2707 hom 36 13 16 8 T 13 12 39843 CASAVA_Build 1 36646574 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 10 9 39844 CASAVA_Build 1 36662141 1D AACAGAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1829 hom 20 7 10 3 T 11 10 39845 CASAVA_Build 1 36687615 1D TAACTTTCTT A/- TTTTTTTCAT 2387 het 2387 ref 18 12 5 1 A 1 0 39846 CASAVA_Build 1 36693245 1D TAAGCAATGC T/- TTTGCATATG 3070 het 3070 hom 62 26 29 8 T 4 3 39847 CASAVA_Build 1 36720494 1D GAGAGTGGGC G/- GGGGGGGGGC 1569 hom 33 het 22 0 8 14 G 10 9 39848 CASAVA_Build 1 36778712 2I ATTAGTGGCC --/TG TGTCTCATTC 3070 hom 85 het 36 0 29 7 TG 1 2 39849 CASAVA_Build 1 36789971 4I TTTTCCCCTC ----/TGAT TGTTTTTGAT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 TGAT 0 1 39850 CASAVA_Build 1 36797055 1D CACAATGAAT A/- AAAATTTAAT 1768 het 1768 ref 24 11 5 8 A 5 4 39851 CASAVA_Build 1 36799356 2I GACACGTGTG --/CA CACACACATG 3070 hom 113 het 47 0 34 13 CA 4 5 39852 CASAVA_Build 1 36835328 1D ATTAATTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 T 10 9 39853 CASAVA_Build 1 36916708 2I AAAGCCTGAC --/GG GGGTTCTATT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 3 5 39854 CASAVA_Build 1 36922493 1D CATAAATGTC T/- TTCTTTTGAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 3 2 39855 CASAVA_Build 1 36970267 1D TCAGGACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 9 T 11 10 39856 CASAVA_Build 1 36982945 1D TTTGCTTTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 86 het 34 0 30 4 T 9 8 39857 CASAVA_Build 1 36987421 2I TTTTTTTTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 13 15 39858 CASAVA_Build 1 36988692 1D ATGCTATTTT A/- AAAAAATCTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 7 6 39859 CASAVA_Build 1 37056103 1I GCAGGAGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 22 26 2 A 9 10 39860 CASAVA_Build 1 37070267 8D CTCCCTGGCG ACTGCTCT/-------- ACTGCTCTCA 3070 hom 117 het 40 0 39 8 ACTGCTCT 2 1 39861 CASAVA_Build 1 37120215 2D CCTCTGTGTC TG/-- TGTCTTACTA 3070 hom 92 het 40 0 31 11 TG 2 1 39862 CASAVA_Build 1 37125997 2D GAGAGAGAGT GA/-- GAGAGAGAGA 1403 hom 21 het 8 0 8 0 GA 8 7 39863 CASAVA_Build 1 37144844 3D GGACCAGATG GTT/--- GTTGTTGCAA 3070 hom 117 het 42 0 39 4 GTT 3 2 39864 CASAVA_Build 1 37151609 1D CTGTTCTGCG T/- TTATTACTTC 3070 hom 75 het 30 0 25 7 T 3 2 39865 CASAVA_Build 1 37159805 1D CAAATCACAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 10 9 39866 CASAVA_Build 1 37175001 1I TTTAACCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 37 1 26 10 T 11 12 39867 CASAVA_Build 1 37178059 1I ACTACCACTA -/C CCGTTGTCCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 C 2 3 39868 CASAVA_Build 1 37199590 1I CCATCAGAGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 8 9 39869 CASAVA_Build 1 37258948 1I ATAGCATTTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 A 8 9 39870 CASAVA_Build 1 37280050 1D GGATTAAATG A/- GGTAATACAT 3070 het 3070 ref 57 26 22 9 A 1 0 39871 CASAVA_Build 1 37284245 2I TTCCCCAGAC --/AG AGTTAACTGT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 AG 1 2 39872 CASAVA_Build 1 37296595 1D TTCGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3047 het 3047 ref 26 12 8 6 A 13 12 39873 CASAVA_Build 1 37323612 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2225 het 1381 hom 28 10 10 8 T 15 14 39874 CASAVA_Build 1 37325476 1I AAGCTCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 12 13 39875 CASAVA_Build 1 37346580 3D CAAGGCTGGA TGG/--- TGGTGGTTTT 3070 hom 174 het 69 0 56 15 TGG 3 2 39876 CASAVA_Build 1 37352461 1D TCACTGCACA T/- TTCATTCTGG 3070 hom 93 het 43 0 30 13 T 3 2 39877 CASAVA_Build 1 37361067 4I CAATAGCTCC ----/AACT GAGTTTCCAA 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 AACT 0 1 39878 CASAVA_Build 1 37362496 1D TTTAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 12 11 39879 CASAVA_Build 1 37376802 2I CAAGCAAACA --/CG GCTTCTCCTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 CG 0 1 39880 CASAVA_Build 1 37386617 1I TTTCACTTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 9 10 39881 CASAVA_Build 1 37400163 1I TCTTCAGTAT -/A GCCACAGAGT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 0 1 39882 CASAVA_Build 1 37424484 4D AAAAAGAAAA AGAC/---- AGGCTCTCTG 2632 het 2632 ref 18 9 7 3 AGAC 1 0 39883 CASAVA_Build 1 37435989 1D CTTTTGACAC A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 A 8 7 39884 CASAVA_Build 1 37436982 1D ATGCTGAGTG A/- AAAAAAAAAA 2160 het 2160 ref 50 34 7 11 A 11 10 39885 CASAVA_Build 1 37460622 4I CAACCAACAG ----/ACAA ACAAACAAAC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 ACAA 3 4 39886 CASAVA_Build 1 37462879 1I ATAAAGCAAT -/A AAAAAAACAT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 7 8 39887 CASAVA_Build 1 37468576 1D TAAATTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 27 0 20 7 T 11 10 39888 CASAVA_Build 1 37468798 1D TTTTAGGGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 16 15 39889 CASAVA_Build 1 37477430 1I TTCAGTGGGC -/T TACCCTAGAC 3070 hom 138 het 49 0 45 4 T 1 2 39890 CASAVA_Build 1 37485846 1I AGGAAGGGGT -/G GGGGGGGCAT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 G 7 8 39891 CASAVA_Build 1 37486669 1I CAGAGAGGGT -/C CCCCAGGCCT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 C 4 5 39892 CASAVA_Build 1 37489443 1D CCTCCACCCC A/- AATATTTGGC 3070 het 3070 ref 45 19 16 12 A 3 2 39893 CASAVA_Build 1 37491494 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1557 het 595 hom 7 2 4 1 T 7 6 39894 CASAVA_Build 1 37494767 4D TTTGTCTCAT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 2217 hom 38 14 11 15 TC 9 7 39895 CASAVA_Build 1 37496485 4D GACCAGCAAG CAAA/---- CAAACAAACA 2137 het 2137 ref 34 10 12 13 CAAA 3 2 39896 CASAVA_Build 1 37501154 1I TGTGAACAAA -/G GGGGGTCATT 3070 hom 121 het 44 0 41 3 G 5 6 39897 CASAVA_Build 1 37502174 1D AGTAAGTGGA G/- GAGCCCACAT 3070 het 3070 hom 57 26 27 4 G 2 1 39898 CASAVA_Build 1 37506385 1D CCTCTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2702 hom 25 10 11 4 T 11 10 39899 CASAVA_Build 1 37518912 4I AGTAACCATG ----/ATGA ATAGAGCTTT 3070 het 3070 ref 62 27 26 9 ATGA 0 1 39900 CASAVA_Build 1 37523684 4D TCATATAGAG AATT/---- AAATAAATTA 3070 het 3070 ref 33 17 14 6 AATT 1 0 39901 CASAVA_Build 1 37526581 30D TCAGGGGCTT GGACTTCATTCTGTAGACTCTCAGGGGCCC/------------------------------ GGACTTCATT 3070 hom 69 het 34 0 20 21 GGACTTCATTCTGTAGACTCTCAGGGGCCC 2 1 39902 CASAVA_Build 1 37533093 3I AAACAGAGAG ---/AGC AGCAGCAGGA 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 AGC 2 3 39903 CASAVA_Build 1 37536491 2D CAATGAAGGT GG/-- AAGAAGAGTA 3070 het 3070 hom 47 18 20 11 G 2 0 39904 CASAVA_Build 1 37552121 4D TCTCCATCTC TCTT/---- TCTCTCCCTC 1914 hom 34 het 14 0 10 4 TCTT 1 0 39905 CASAVA_Build 1 37559568 1D GGCAAAACCA G/- GGTGCACTTG 3070 het 3070 ref 56 34 17 6 G 3 2 39906 CASAVA_Build 1 37561698 1D GAAGGCACTT G/- GGTTTGTGAC 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 G 3 2 39907 CASAVA_Build 1 37562104 3I AGGATGGAAA ---/TCT TCTTTGCTAT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 TCT 1 2 39908 CASAVA_Build 1 37562197 3I TACTAAAAAG ---/ACA ACAAGTGGTC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 ACA 1 2 39909 CASAVA_Build 1 37566100 2D TGGCTTCAAA TT/-- CCAGTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 20 9 9 T 2 0 39910 CASAVA_Build 1 37569271 1D CATAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 27 1 21 5 T 11 10 39911 CASAVA_Build 1 37574031 3D GAAGGTATAA TAG/--- TAATCTATTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 TAG 1 0 39912 CASAVA_Build 1 37581020 1I TTTAGGGACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 T 8 9 39913 CASAVA_Build 1 37604831 1D TCGAGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 456 het 456 ref 42 33 3 6 A 12 11 39914 CASAVA_Build 1 37624922 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 7 6 39915 CASAVA_Build 1 37638321 2I GGGTCTTGGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 59 20 24 15 TG 7 8 39916 CASAVA_Build 1 37655876 1D ATATGAAAAG A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 A 7 6 39917 CASAVA_Build 1 37656000 2D AAAAAAAGAT AA/-- GAGTAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 2 0 39918 CASAVA_Build 1 37656319 1D GATGCGGAGG T/- TTGCAGTGAG 2690 het 2690 ref 18 8 7 3 T 3 2 39919 CASAVA_Build 1 37660922 4I TCTCGTGAGA ----/ACTC ACTCACTATC 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 ACTC 1 2 39920 CASAVA_Build 1 37661040 2D GAGCCAAACC AT/-- ATCAGTCCTC 3070 het 3070 hom 52 17 26 11 AT 2 1 39921 CASAVA_Build 1 37666473 1I CAATGATGAA -/C CCCCCCATCT 3070 het 1359 hom 16 4 9 3 C 6 7 39922 CASAVA_Build 1 37670592 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAGAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 9 39923 CASAVA_Build 1 37680839 2D TGTCTCTCTC TG/-- TCTCTCCCTC 3070 het 7 hom 32 1 19 15 TG 1 0 39924 CASAVA_Build 1 37680861 8I TCTCTGTGTT --------/TCTGTCTC TCTATTTCTG 3070 het 97 hom 35 2 17 16 TCTGTCTC 0 1 39925 CASAVA_Build 1 37681614 3D ATTAAAATGA GAG/--- GAGAAGAGGT 3070 hom 99 het 37 0 31 6 GAG 2 1 39926 CASAVA_Build 1 37690877 1I GCTGCCAGGC -/T TCAGAAGCTA 3070 hom 82 het 32 0 26 6 T 1 2 39927 CASAVA_Build 1 37706629 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 22 0 19 4 A 10 9 39928 CASAVA_Build 1 37738474 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTGAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CT 1 2 39929 CASAVA_Build 1 37750684 5D TATTCTTCCC ATTTT/----- CCTATAATTT 3070 het 3068 hom 23 7 16 0 ATTTT 1 0 39930 CASAVA_Build 1 37754238 1I TTCCTTGGAA -/T TTTTTACATA 3070 hom 77 het 28 0 24 4 T 5 6 39931 CASAVA_Build 1 37756080 1D TTTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2918 het 860 hom 26 3 9 14 T 15 14 39932 CASAVA_Build 1 37757562 3D CCGTGAAGGT CTG/--- TAGCTTCACT 594 het 594 ref 29 11 3 16 CTG 1 0 39933 CASAVA_Build 1 37761317 2D ATTTGAACTC TT/-- TGAGATCTCT 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 T 3 1 39934 CASAVA_Build 1 37780153 4D AAGATTCATT CTTA/---- CTATCGATCT 3070 het 3070 ref 45 23 22 2 CTTA 1 0 39935 CASAVA_Build 1 37789458 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2649 het 1351 hom 29 4 9 16 A 16 17 39936 CASAVA_Build 1 37793769 1I CAAACCAAAA -/T CAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 34 4 19 11 T 0 1 39937 CASAVA_Build 1 37841851 1D AGTGGGGCAT G/- GGGGCACACA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 G 5 4 39938 CASAVA_Build 1 37842135 4D TTCTGACCTC ATTT/---- ATTTATTAGC 3070 het 3070 hom 58 21 33 7 ATTT 2 1 39939 CASAVA_Build 1 37849937 71D ATAGCTGACC TTATCCCCATACTAGTTATTATCGAAACCATCAGCCTACTCATTCAACCAATAGCCCTGGCCGTACGCCTA/----------------------------------------------------------------------- AGAATCCCTC 3070 hom 90 het 30 0 30 6 TTATCCCCATACTAGTTATTATCGAAACCATCAGCCTACTCATTCAACCAATAGCCCTGGCCGTACGCCTA 1 0 39940 CASAVA_Build 1 37869283 4D GCTGAGAGTC AGAG/---- AGTTCAGGCT 3070 het 3070 hom 45 18 18 10 AG 3 1 39941 CASAVA_Build 1 37870765 1D CCTCTATACC A/- GGGGGTACAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 1 0 39942 CASAVA_Build 1 37877516 1D GATCCTCAGA C/- CCCCCCACTC 3070 hom 95 het 40 0 32 8 C 7 6 39943 CASAVA_Build 1 37878442 1D GGATTAAAAA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 77 het 33 0 26 7 T 8 7 39944 CASAVA_Build 1 37878864 1D AAATTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 24 0 16 8 T 13 12 39945 CASAVA_Build 1 37886967 16I CCTTTTCCTT ----------------/GCTGGGTCGGACTTTG GCTAAGCTGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 GCTGGGTCGGACTTTG 0 1 39946 CASAVA_Build 1 37887018 2D GAGAGAATAA GT/-- GTGTCTATGT 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 GT 3 2 39947 CASAVA_Build 1 37898721 4D CCGTCTTCTA TCTG/---- TCTGTCTTTC 3070 het 3070 ref 35 12 14 12 TCTG 2 1 39948 CASAVA_Build 1 37902580 2D TTAAAAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 1984 het 1478 hom 16 4 6 7 A 13 11 39949 CASAVA_Build 1 37903909 2I AAACTGAAAC --/AG GAGTGGGAGG 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 AG 0 1 39950 CASAVA_Build 1 37918067 1D CCCTGTCTCT A/- ACTAAAAAAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 2 1 39951 CASAVA_Build 1 37931659 1I ATTTATTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 31 het 13 0 11 3 T 8 9 39952 CASAVA_Build 1 37937026 1D TGGGAGTTTG C/- TATATTGTAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 1 0 39953 CASAVA_Build 1 37944038 8D TCTGTTTTTC TGTTTTTT/-------- GGTTTTGTTT 2950 hom 22 het 17 0 12 7 TGTTTTTT 1 0 39954 CASAVA_Build 1 37946571 3D CTCTCTCCTT TTC/--- TTTTTAGAAC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TTC 1 0 39955 CASAVA_Build 1 37970290 1D CGATGTCTGA T/- TTTTCACAAC 3070 hom 102 het 36 0 34 3 T 5 4 39956 CASAVA_Build 1 37977081 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAGGAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 7 6 39957 CASAVA_Build 1 37980018 1I CTGACCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 37 1 22 14 A 14 15 39958 CASAVA_Build 1 37981933 2I TAAATTACAT --/GA GATACTCAGT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 GA 1 2 39959 CASAVA_Build 1 37982162 3I GATAGATATA ---/GAT GATATATAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 GAT 1 2 39960 CASAVA_Build 1 37982923 1I CATCTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 17 1 11 5 A 11 12 39961 CASAVA_Build 1 37983024 4D AATCATGTAT CTGA/---- CAAGGTTTGT 3070 hom 96 het 33 0 33 1 CTGA 1 0 39962 CASAVA_Build 1 37988425 1I AGATTATGGG -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 6 7 39963 CASAVA_Build 1 37988724 5I AAGGATAAGG -----/GAAGT GAAGTGACAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 GAAGT 1 2 39964 CASAVA_Build 1 37992911 1I CAAAGCTGGA -/G GATCACTTGA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 1 2 39965 CASAVA_Build 1 37993609 3D ACACACCCTC CCA/--- CCACCACCAT 3070 hom 120 het 50 0 40 10 CCA 4 3 39966 CASAVA_Build 1 37998055 1I CCCCATTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 33 1 22 10 A 13 14 39967 CASAVA_Build 1 38001922 2D AGAGTCAATT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AG 9 8 39968 CASAVA_Build 1 38007558 1D TCCGTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 12 11 39969 CASAVA_Build 1 38011749 1I CCATCTGTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 345 hom 39 1 31 7 A 9 10 39970 CASAVA_Build 1 38020146 1D TGGTTCACTG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 39971 CASAVA_Build 1 38026238 5D GAGGTTAAAG CAAGC/----- CAAGATTATG 3070 hom 32 het 14 0 10 5 CAAGC 1 0 39972 CASAVA_Build 1 38040115 4D AAACAAAAAC AACA/---- AACAAACAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 10 AACA 4 3 39973 CASAVA_Build 1 38057257 1D GTGTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2957 hom 27 het 14 0 8 6 A 13 12 39974 CASAVA_Build 1 38061701 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 25 1 18 6 A 13 12 39975 CASAVA_Build 1 38074066 1D CCTGAACGTC T/- TTTTTTTTTT 1252 het 1252 ref 40 25 5 10 T 12 11 39976 CASAVA_Build 1 38075205 1D GGAAGGGGGG C/- GGCGGGGAAT 3070 hom 52 het 22 0 18 5 C 1 0 39977 CASAVA_Build 1 38190531 2D TTTAGGGAAT AA/-- GAGGTCTCAG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 2 0 39978 CASAVA_Build 1 38199077 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 9 39979 CASAVA_Build 1 38203619 2D ACTTGCTTTC TT/-- TGTCATAAGA 3070 hom 27 het 18 0 11 7 T 3 1 39980 CASAVA_Build 1 38208824 3D TTCTTCTCAG CAC/--- CACATCACAC 1632 hom 10 het 4 0 4 0 CAC 2 1 39981 CASAVA_Build 1 38209493 4D ACACCTCTAC ACAA/---- ACAAACTAGA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 ACAA 2 1 39982 CASAVA_Build 1 38216596 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 826 het 826 ref 24 15 2 7 A 15 14 39983 CASAVA_Build 1 38218393 1I CTCAAAAAAA -/C CTCACATACG 3070 hom 54 het 19 0 19 1 C 1 2 39984 CASAVA_Build 1 38223719 1D AATCAAAGGA G/- GGCAGGTATC 3070 hom 72 het 28 0 22 6 G 3 2 39985 CASAVA_Build 1 38229336 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 8 9 39986 CASAVA_Build 1 38229793 1D CTGCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1487 het 1487 ref 42 29 4 9 A 15 14 39987 CASAVA_Build 1 38232825 1I TCTGGGTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 49 het 32 1 27 4 T 9 10 39988 CASAVA_Build 1 38245402 1D CCCGGCTAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 15 0 13 2 T 10 9 39989 CASAVA_Build 1 38246535 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 942 hom 10 het 4 0 4 0 A 7 6 39990 CASAVA_Build 1 38315693 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2130 het 2130 ref 37 20 5 12 T 12 11 39991 CASAVA_Build 1 38341770 5I TGACCTCTGA -----/TGCCG TGCTGTTTTT 3070 hom 144 het 53 0 48 5 TGCCG 0 1 39992 CASAVA_Build 1 38345493 4D TGTGTGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 45 0 36 11 TG 8 6 39993 CASAVA_Build 1 38379490 1D CTATTTTCTC T/- CCTGCACTCC 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 T 1 0 39994 CASAVA_Build 1 38393595 1I ACTGACATTT -/C CAATTTCAGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 1 2 39995 CASAVA_Build 1 38401736 1D CCACAAAGCC A/- AAATATCTAC 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 A 4 3 39996 CASAVA_Build 1 38408002 4D ACACACAGAC CACA/---- CACACACACA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CA 11 9 39997 CASAVA_Build 1 38417329 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 45 16 23 7 A 8 7 39998 CASAVA_Build 1 38422409 1I CCCTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 8 8 T 10 11 39999 CASAVA_Build 1 38425131 1D TCTTATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 781 hom 36 5 15 16 T 15 14 40000 CASAVA_Build 1 38430582 1D GGCACTCAAT G/- GGAATTGCTG 3070 het 3070 ref 47 28 16 3 G 3 2 40001 CASAVA_Build 1 38434454 1I CATTCCATGG -/A ATAGTTACTA 3070 het 3070 hom 64 26 29 9 A 1 2 40002 CASAVA_Build 1 38436830 1D ATCTATGTGT A/- TATTTGAGCA 3070 het 3070 ref 60 29 24 8 A 1 0 40003 CASAVA_Build 1 38454432 1D AGGGAGCCGA T/- TTCAAGGAAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 3 2 40004 CASAVA_Build 1 38464237 1D TCCAGGGTCT G/- TGCTCCCAAC 3070 het 3070 ref 52 27 19 8 G 1 0 40005 CASAVA_Build 1 38499970 2I CACCAATATC --/TG TGCAAATTCT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TG 1 2 40006 CASAVA_Build 1 38505861 4D43M4I CTTCCATCCA TCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTAGTTCCTTCTTCCCTCCGTCTCTCCT----/----TCCTTCCTTCCTTCCTTAGTTCCTTCTTCCCTCCGTCTCTCCTTCCC TCCCTCCCTC 3070 het 3070 ref 47 25 12 27 N/A 0 0 40007 CASAVA_Build 1 38506437 2I TAGAAGGGAC --/AT GTGTGTGAAC 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 AT 0 1 40008 CASAVA_Build 1 38538943 4I TTACTGGGGG ----/AGAT AGATAAGACA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 AGAT 1 2 40009 CASAVA_Build 1 38541134 1D AAATAAAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 10 9 40010 CASAVA_Build 1 38542030 2D AGTTTAAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 30 1 23 8 T 14 12 40011 CASAVA_Build 1 38542180 1I CAGTTCTTTT -/A AAAAATAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 5 6 40012 CASAVA_Build 1 38542584 2I TAAAAGACTC --/TT TCTGCAAAAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 1 3 40013 CASAVA_Build 1 38543161 1I AAACTACTAG -/A AAAAAACATA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 6 7 40014 CASAVA_Build 1 38551861 6D TAAAATGCCT TTAGTC/------ TTAAAGACTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TTAGTC 1 0 40015 CASAVA_Build 1 38558671 14D ATGTCTGTGC TCTGATGATTGCTG/-------------- TCTGATGATT 3070 hom 99 het 34 0 34 4 TCTGATGATTGCTG 2 1 40016 CASAVA_Build 1 38565713 1I CTCGGTAACC -/A CCCCCCCATT 3070 hom 97 het 37 0 31 6 A 0 1 40017 CASAVA_Build 1 38568665 1D GCAGGCTTCA T/- TTTTTTTTTT 1979 het 751 hom 34 7 7 21 T 19 18 40018 CASAVA_Build 1 38577189 1I CTTCTCAGTT -/G TTATAAGGGC 3070 hom 157 het 58 0 53 5 G 0 1 40019 CASAVA_Build 1 38580783 17D TTCCTTCCTT CCTTCCTTCTTTCCTTC/----------------- CTTCCTCCCT 3070 het 3070 hom 47 15 22 16 CCTTCCTTCTTTCCTTC 1 0 40020 CASAVA_Build 1 38591266 1I GGAAGGGGGT -/G GGGGAGGTGC 3070 hom 80 het 31 0 26 5 G 4 5 40021 CASAVA_Build 1 38597350 7D ATAAAGATCT GGACTGG/------- TGGAGTCCTT 3070 hom 96 het 36 0 33 6 GGACTGG 1 0 40022 CASAVA_Build 1 38602914 1D ATAAGAAGGC A/- AAAAAATCAC 3070 hom 135 het 52 0 46 7 A 7 6 40023 CASAVA_Build 1 38639236 1I TGTCTGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 29 0 22 7 A 12 13 40024 CASAVA_Build 1 38649949 3I CACATAATAT ---/GCA GCCAACTAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GCA 0 1 40025 CASAVA_Build 1 38653079 1D TTTGGAAATG A/- GTGGAGTTAA 3070 hom 187 het 66 0 63 4 A 1 0 40026 CASAVA_Build 1 38655522 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 83 het 32 0 29 3 T 10 9 40027 CASAVA_Build 1 38659748 4I AGACATGAAA ----/TAAG TAAGAGTTTT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 TAAG 1 2 40028 CASAVA_Build 1 38672597 1D GAGCTCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 12 11 40029 CASAVA_Build 1 38672989 1I CTGGGTCTTA -/G GGGAGGGGGA 3070 hom 116 het 46 0 38 8 G 3 4 40030 CASAVA_Build 1 38678394 1D AATTTTATGA C/- TTTTTTTTCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 40031 CASAVA_Build 1 38680607 1D AGCTGTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 11 10 40032 CASAVA_Build 1 38681597 1D TTTTTCTTTT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 1 0 40033 CASAVA_Build 1 38690741 6D GGTTGTCAAG CCTGAT/------ TCCTGATCCT 3070 het 3070 ref 60 37 19 7 CCTGAT 1 0 40034 CASAVA_Build 1 38696189 1I ATATAACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 835 hom 41 2 31 8 A 13 14 40035 CASAVA_Build 1 38697941 1D CCCTCAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 29 2 22 6 A 11 10 40036 CASAVA_Build 1 38700262 1I CAGGTAGGGA -/C ATTTTGGCTT 3070 hom 135 het 47 0 44 3 C 0 1 40037 CASAVA_Build 1 38701998 4D TTTAAAAGTT TAAA/---- TAATTTTTCC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TAAA 1 0 40038 CASAVA_Build 1 38702347 4D AACAAAAAAG CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 61 het 23 0 20 4 CAAA 5 4 40039 CASAVA_Build 1 38702996 1D TTCGCGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 628 hom 38 2 26 10 T 14 13 40040 CASAVA_Build 1 38703096 3D CAGAAGTAGC AGG/--- AGCTCAGAAA 3070 het 3070 hom 51 24 26 3 AGG 1 0 40041 CASAVA_Build 1 38716192 3I GTACCAGCAC ---/GTT GTTTTACTTC 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 GTT 1 2 40042 CASAVA_Build 1 38720121 4D TCTGCTAATA AATG/---- AATGAATGAA 3070 het 3070 hom 61 20 27 16 AATG 4 3 40043 CASAVA_Build 1 38722325 14D TTGAGTATCT GTTTTTGTTTTTTG/-------------- GTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 51 25 16 11 GTTTTTGTTTTTTG 1 0 40044 CASAVA_Build 1 38726956 1D AGGCTGGAAG A/- CCAAAACCAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 7 A 1 0 40045 CASAVA_Build 1 38732113 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2326 het 1937 hom 21 6 7 8 T 10 11 40046 CASAVA_Build 1 38806301 1I ACATCAAAGG -/T TTTTTTTTTT 1536 het 724 hom 30 6 11 13 T 11 12 40047 CASAVA_Build 1 38806831 3D TGAGGGACTA AGC/--- AGCAGGCAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AGC 2 1 40048 CASAVA_Build 1 38821646 5I CACAATAGCA -----/AAGAC ATGGAATCAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 AAGAC 0 1 40049 CASAVA_Build 1 38823254 16D CTGAATCCAG GCTCTAAAATACACCC/---------------- GCTCTAAAAT 3070 hom 111 het 40 0 36 11 GCTCTAAAATACACCC 2 1 40050 CASAVA_Build 1 38830336 5D ATTTTTTCTC TTCTT/----- TTCAATGTTC 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 TTCTT 1 0 40051 CASAVA_Build 1 38832577 1I AATATTCTTC -/T TCTTTTTTTT 2726 het 2726 ref 28 13 11 4 T 1 2 40052 CASAVA_Build 1 38858843 1I ACCTTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 1711 het 1711 ref 34 12 10 12 A 16 17 40053 CASAVA_Build 1 38861744 5D CTACCCCCCC CCCCA/----- CCCACCATGA 2754 het 146 hom 16 2 9 6 CCCCA 1 0 40054 CASAVA_Build 1 38863854 1I CCCTCTTTAC -/A AACTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 2 3 40055 CASAVA_Build 1 38875896 1I CTCTCTTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 9 10 40056 CASAVA_Build 1 38876316 1D TTTAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 1557 het 1557 ref 38 27 4 8 A 12 11 40057 CASAVA_Build 1 38889043 1I GGAGTTACTG -/T TTCTCAGCTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 2 3 40058 CASAVA_Build 1 38913701 1I CATCAGCCCA -/T TTGGGCAGGT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 2 3 40059 CASAVA_Build 1 38919278 2D GCCCCCTCAA CC/-- CCCCCCCCAT 3070 het 32 hom 15 1 9 5 C 10 8 40060 CASAVA_Build 1 38940947 3D2M1D CCAAAAAGTT ATACAC/---CA- AGATCAAGAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 7 N/A 0 0 40061 CASAVA_Build 1 38944489 1D CCAGGTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 A 11 10 40062 CASAVA_Build 1 38945878 1I AAACAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 A 10 11 40063 CASAVA_Build 1 38971067 1I ACTCCCCTGC -/T TTAAAACCCT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 T 2 3 40064 CASAVA_Build 1 38976357 1D ACACTGTGTC A/- CATCCCACAC 3070 het 3070 ref 53 25 13 19 A 1 0 40065 CASAVA_Build 1 38995784 1D AAGCTGTTTG T/- TCCCTCCTCT 3070 het 3070 ref 64 32 25 9 T 2 1 40066 CASAVA_Build 1 39002278 18D CTCTTAGTCC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 2215 het 357 hom 16 3 6 7 T 28 10 40067 CASAVA_Build 1 39019186 1I TTTCTCATAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 19 8 10 T 8 9 40068 CASAVA_Build 1 39021925 2I GGGGGGTTGG --/GC GGGGGGGAAC 3070 het 330 hom 25 1 10 14 GC 0 1 40069 CASAVA_Build 1 39047528 2D AAACGAGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 913 het 233 hom 36 5 4 27 T 14 12 40070 CASAVA_Build 1 39052955 6D CAACTCGCAG CCGACT/------ CGGCTGAACA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 CCGACT 1 0 40071 CASAVA_Build 1 39053347 4D TAGAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AG 7 5 40072 CASAVA_Build 1 39061369 2I GTTCTTCCTG --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 20 het 29 1 22 6 GA 5 6 40073 CASAVA_Build 1 39084732 1I GTAACAGGGA -/C CCTCTGGGAC 3070 hom 111 het 42 0 36 6 C 2 3 40074 CASAVA_Build 1 39089103 1D TTTTTTTGTT G/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 0 40075 CASAVA_Build 1 39089539 4I CAGACCATTT ----/TAAA TAAATTAATC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 TAAA 1 2 40076 CASAVA_Build 1 39099637 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2584 het 72 hom 17 1 10 6 A 14 15 40077 CASAVA_Build 1 39109838 1I TGCCCAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2755 hom 24 10 9 5 T 15 16 40078 CASAVA_Build 1 39120641 2D ATATATTATT TA/-- TATATATATA 1557 hom 18 het 7 0 7 1 TA 7 6 40079 CASAVA_Build 1 39123712 3D AAATCCTCAG TCT/--- TCTTCTATGA 3070 het 3070 ref 44 25 18 2 TCT 3 2 40080 CASAVA_Build 1 39142742 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 44 het 19 0 16 3 A 10 9 40081 CASAVA_Build 1 39166701 5D GCGCCCGGCC ATGTT/----- TTGTTTTGTT 1793 hom 10 het 4 0 4 0 ATGTT 1 0 40082 CASAVA_Build 1 39172418 4D ACCAGCCTGC CAAT/---- ATGGCAAAAC 2224 het 2224 ref 20 9 8 3 CAAT 1 0 40083 CASAVA_Build 1 39193502 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 1098 het 1016 hom 12 3 5 4 T 10 9 40084 CASAVA_Build 1 39198467 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2853 het 428 hom 13 3 8 2 A 15 12 40085 CASAVA_Build 1 39220376 15D AAACTTAACA TTTGTTTTATCTGAG/--------------- TTTCTTCCTC 2751 het 2751 ref 20 12 9 1 TTTGTTTTATCTGAG 1 0 40086 CASAVA_Build 1 39234730 1D TCCAAAGTGC T/- GGATTACAGG 2596 het 2596 ref 25 12 6 7 T 1 0 40087 CASAVA_Build 1 39235369 1I TCCCACCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 11 12 40088 CASAVA_Build 1 39240130 6I AGAGTTCAGT ------/ATTGTC AACATATTCA 3070 het 3070 ref 56 29 22 5 ATTGTC 0 1 40089 CASAVA_Build 1 39255504 4D ACAGCAAGAC TGTA/---- TGCAGGGCCT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TGTA 1 0 40090 CASAVA_Build 1 39268982 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 12 2 10 2 A 12 11 40091 CASAVA_Build 1 39270861 1D GCAAAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 8 A 12 11 40092 CASAVA_Build 1 39274277 4I CATGATAACA ----/CCTG CCTCGGCCTC 2888 het 1754 hom 16 5 6 5 CCTG 0 1 40093 CASAVA_Build 1 39285996 1I GGAGGGGAAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 7 8 40094 CASAVA_Build 1 39287973 4D CAGCCTAGAA AGAC/---- AGACAGCCTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 6 AGAC 2 1 40095 CASAVA_Build 1 39295117 1D CATGAAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1395 hom 22 4 13 6 A 15 14 40096 CASAVA_Build 1 39295242 3I AAAACATAAT ---/ATC ATTTATAATC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 ATC 0 1 40097 CASAVA_Build 1 39295356 4I AGATCTAAAT ----/AAAC AGACAGATAT 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 AAAC 0 1 40098 CASAVA_Build 1 39302788 1D TTTAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 1185 het 1185 ref 15 8 4 3 A 12 11 40099 CASAVA_Build 1 39305984 1I TTTCCTTTTT -/A TATACATATA 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 A 0 1 40100 CASAVA_Build 1 39312750 1D AGCTGAGGCC T/- TTTTTTTTTT 1841 het 1841 ref 23 12 6 5 T 13 12 40101 CASAVA_Build 1 39327979 1D TTCATTCAAT A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 A 8 7 40102 CASAVA_Build 1 39329249 1D CTGCCAGCCT G/- AAAGCCCTGT 3070 hom 81 het 29 0 26 3 G 1 0 40103 CASAVA_Build 1 39331051 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 51 hom 27 1 18 8 T 10 9 40104 CASAVA_Build 1 39340691 3D ATTAATTGGA GGC/--- GGGGGGGGGG 3070 het 612 hom 24 5 11 8 GGC 1 0 40105 CASAVA_Build 1 39359063 1I GGGTGTCTAT -/C CCCTCAAGCA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 3 4 40106 CASAVA_Build 1 39370622 1D CAAGCATTAC T/- TTTTTGGCTC 3070 hom 116 het 47 0 37 10 T 6 5 40107 CASAVA_Build 1 39372467 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1151 hom 12 het 5 0 5 0 T 12 13 40108 CASAVA_Build 1 39378206 1D GAACTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 34 1 24 9 T 15 14 40109 CASAVA_Build 1 39382916 1I AATTTTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 963 hom 37 4 29 4 T 12 13 40110 CASAVA_Build 1 39387995 5I ATCCCAGCCC -----/GATAT GATATTTAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 GATAT 1 2 40111 CASAVA_Build 1 39391117 1I TAAACAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 34 0 26 8 A 11 12 40112 CASAVA_Build 1 39408033 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1786 het 496 hom 14 2 4 8 T 17 16 40113 CASAVA_Build 1 39420668 1D CACTACCTAG A/- AAATGAAGAC 3070 hom 81 het 28 0 27 1 A 4 3 40114 CASAVA_Build 1 39429459 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2157 het 1190 hom 48 12 10 27 T 19 16 40115 CASAVA_Build 1 39437073 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 CT 2 1 40116 CASAVA_Build 1 39444051 1D TTTGATAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 62 het 26 0 24 2 A 10 9 40117 CASAVA_Build 1 39447896 1D CCATCCTGGG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 9 8 40118 CASAVA_Build 1 39448777 1I TTCCTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 10 11 40119 CASAVA_Build 1 39454414 4D GAAAAAAGAT AAAG/---- AAAATGTAGT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AAAG 1 0 40120 CASAVA_Build 1 39454938 1I AGTGGTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 32 1 21 10 T 11 12 40121 CASAVA_Build 1 39484538 5D GTGACTTCTA AAGTT/----- AAGTTCTCAG 3070 hom 135 het 48 0 46 3 AAGTT 2 1 40122 CASAVA_Build 1 39486862 2I GCCTCTACTC --/AA AAAATTATAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 4 6 40123 CASAVA_Build 1 39495571 1I AGACAGTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 334 hom 22 2 15 5 T 9 10 40124 CASAVA_Build 1 39515413 2D AGAATGAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 36 0 22 18 A 14 12 40125 CASAVA_Build 1 39523760 1I ATTATTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2768 hom 52 14 21 17 T 15 16 40126 CASAVA_Build 1 39538767 1I CCTATCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 43 1 35 7 A 11 12 40127 CASAVA_Build 1 39574926 1D AGTGGTGTGC T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 42 29 4 9 T 12 11 40128 CASAVA_Build 1 39576517 4D GTTTTTTGGG TTGT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 33 0 29 6 TTGT 1 0 40129 CASAVA_Build 1 39601864 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1223 het 1223 ref 26 14 4 8 T 16 15 40130 CASAVA_Build 1 39606236 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1379 het 1379 ref 29 16 4 9 A 17 16 40131 CASAVA_Build 1 39657122 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 777 het 777 ref 22 16 2 5 A 13 12 40132 CASAVA_Build 1 39659124 1D AGAAACCCAA T/- TTTTTTTTTT 1698 het 999 hom 20 7 5 8 T 19 18 40133 CASAVA_Build 1 39670061 1I AACAAGACAC -/A ATCTCTACAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 1 2 40134 CASAVA_Build 1 39683256 3D TATAAGTTTC TGT/--- TGTTATTTGC 3070 het 3070 hom 64 29 33 3 TGT 2 1 40135 CASAVA_Build 1 39711965 2I TGTTGAGAGA --/CT CTTGTTTTCA 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 CT 1 2 40136 CASAVA_Build 1 39716219 1I CTCTTATATC -/T TTTTTTTTTT 2799 het 1152 hom 21 4 9 8 T 14 15 40137 CASAVA_Build 1 39722591 1D TTACTGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 T 12 11 40138 CASAVA_Build 1 39724330 1D AATGTGTATT A/- AAAAAAAAAA 1502 het 1502 ref 47 35 4 8 A 12 11 40139 CASAVA_Build 1 39727478 2I GGATTCCACT --/CA CATGTGGTCT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 CA 1 2 40140 CASAVA_Build 1 39728497 1D CCAAATGTGA T/- TTTTGGGGGC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 5 4 40141 CASAVA_Build 1 39735998 6I TCTGACTCTT ------/CCCTGC CCCTGCCCCT 1346 het 1341 hom 21 9 4 8 CCCTGC 2 3 40142 CASAVA_Build 1 39746510 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 14 2 A 14 13 40143 CASAVA_Build 1 39763297 1D GAAGTGGGAA G/- GGGAGCAGGA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 G 4 3 40144 CASAVA_Build 1 39764318 4I GCACTGTCTG ----/GAGT GAGTCAGCAC 3070 het 2506 hom 33 12 13 8 GAGT 1 2 40145 CASAVA_Build 1 39783135 1I AGTTGTACTC -/T TGATTAGGCA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 1 2 40146 CASAVA_Build 1 39805268 2I TCTCATCAAC --/TA TAAAGGATTT 2559 het 2559 ref 40 23 8 9 TA 1 2 40147 CASAVA_Build 1 39819135 1I TTTGGATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2235 hom 22 5 12 5 T 10 11 40148 CASAVA_Build 1 39831434 1D TTTCTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 2128 het 751 hom 14 2 6 6 T 13 12 40149 CASAVA_Build 1 39835466 1I CCTCACAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1943 hom 30 7 13 10 A 15 16 40150 CASAVA_Build 1 39867173 4I CTGTTTTTTT ----/CTAA CTAACATTTG 3070 hom 75 het 27 0 22 5 CTAA 1 2 40151 CASAVA_Build 1 39892297 5D TTAGTGGAGA AGAGT/----- ATCATGATGG 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 AGAGT 1 0 40152 CASAVA_Build 1 39894334 1D CTTAGTAACA G/- GGCTTCCATT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 G 3 2 40153 CASAVA_Build 1 39901965 9D CCGCCTCCTG GCCATAGCT/--------- GCCATAGCTG 3070 hom 84 het 36 0 28 9 GCCATAGCT 2 1 40154 CASAVA_Build 1 39909129 1D CTACTCTACT C/- CCCCCCCAAC 3070 het 1192 hom 39 8 11 21 C 8 7 40155 CASAVA_Build 1 39911112 1I CATTCCTAGG -/C CCCCCACCTG 1044 het 1044 ref 19 9 5 5 C 5 6 40156 CASAVA_Build 1 39916637 2I GTGATCTGCC --/TG CCTTGGCCTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TG 0 1 40157 CASAVA_Build 1 39917445 8I GAGACCCCAG --------/CTTCTTCT CTTCTTCTCT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 CTTCTTCT 1 2 40158 CASAVA_Build 1 39928117 2D GGTCAGGAGA TT/-- TTTTCTCTCT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 6 4 40159 CASAVA_Build 1 39931101 1I CGGCCTTAGC -/A GGGGGCTGAG 3070 hom 82 het 33 0 25 8 A 0 1 40160 CASAVA_Build 1 39950687 1I AATTTCCTGT -/G GGCTGTCTGA 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 G 2 3 40161 CASAVA_Build 1 39958372 1I TAAAAATGAG -/A AAAAAAAAAA 2849 het 2566 hom 22 6 9 7 A 13 14 40162 CASAVA_Build 1 39967352 12D ATCTTGGCTT CCTAGGGGGCAC/------------ CCTCGTGTCT 3070 het 3070 ref 27 18 11 1 CCTAGGGGGCAC 1 0 40163 CASAVA_Build 1 39970119 4I CATATGTAGC ----/TCAG TCAAAGTGTC 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 TCAG 0 1 40164 CASAVA_Build 1 39989630 1I TTGGTTTTTG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 7 8 40165 CASAVA_Build 1 40006599 4I GGCCACACAC ----/AGAT AGAGGAAGCT 2722 het 2722 ref 36 19 8 9 AGAT 0 1 40166 CASAVA_Build 1 40018201 1D TCACAGTCAA G/- CTGTCAGCTA 3070 het 3070 ref 64 29 27 8 G 1 0 40167 CASAVA_Build 1 40020723 1D ACTTGCTTTG T/- TTTTGTTTTT 606 het 606 ref 25 12 4 9 T 5 4 40168 CASAVA_Build 1 40032982 1I TGGCTGAGGT -/G GCATGTGCCT 3070 hom 69 het 24 0 23 1 G 1 2 40169 CASAVA_Build 1 40034651 2D AATATCCAGA AT/-- ATATATGTTT 3070 het 713 hom 18 4 10 4 AT 4 3 40170 CASAVA_Build 1 40034690 1D TATTTTAAAA C/- CTCATACAAC 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 C 2 1 40171 CASAVA_Build 1 40071156 6D AGCTTCCAAT GACCAC/------ GACCACGTGA 3070 het 3070 ref 44 20 17 8 GACCAC 2 1 40172 CASAVA_Build 1 40072272 1I GGGCTCAAGC -/A ATCATCTCAC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 1 2 40173 CASAVA_Build 1 40077146 2I AAGAGAGGAC --/AA AAAAAATTAC 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 A 6 8 40174 CASAVA_Build 1 40090208 1I TCTATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 1262 het 901 hom 13 4 4 5 A 17 18 40175 CASAVA_Build 1 40091663 3D ATCGCATCTG TTT/--- TTTTTTTTGA 3070 het 2197 hom 22 7 11 4 T 11 8 40176 CASAVA_Build 1 40093181 20D GTTCACTGCA GCCTCAACCTCCCAGGGCTC/-------------------- GAGTCATCCT 3070 het 3070 ref 35 21 14 4 GCCTCAACCTCCCAGGGCTC 1 0 40177 CASAVA_Build 1 40119815 1D TTCATGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 19 9 T 12 11 40178 CASAVA_Build 1 40123832 1D ACTTCACCTC T/- TTTTTTTTTT 1729 het 826 hom 30 8 7 16 T 16 15 40179 CASAVA_Build 1 40128854 2D GATTTCTCCC CT/-- GTCCCCAGAT 3070 het 3070 hom 43 13 26 5 CT 1 0 40180 CASAVA_Build 1 40136347 8D TTTTCCAATT TAGATATA/-------- TACAAATCGA 3070 het 3070 hom 37 13 21 5 TAGATATA 1 0 40181 CASAVA_Build 1 40140949 1D GCTGGCTTAG C/- CCCCGCTTTG 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 C 5 4 40182 CASAVA_Build 1 40156637 1D TCAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2839 hom 24 10 10 4 A 13 12 40183 CASAVA_Build 1 40163694 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 83 hom 38 3 24 11 A 15 14 40184 CASAVA_Build 1 40164421 12D TCAGAGAGCA CAAGTCCCAAGC/------------ CAAGGATTCA 3070 het 3070 ref 50 28 20 9 CAAGTCCCAAGC 1 0 40185 CASAVA_Build 1 40175338 5D AGGTCTAGAA CCCAG/----- CCCAGCCCAG 3070 hom 54 het 28 0 16 15 CCCAG 5 4 40186 CASAVA_Build 1 40181784 1D TTATTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 32 0 26 6 T 13 12 40187 CASAVA_Build 1 40191378 1I CTACTATTAA -/T TTTTTTTTTT 1371 het 1371 ref 23 8 7 8 T 15 16 40188 CASAVA_Build 1 40196203 3D CAAAAAACTT CAG/--- CAGCTAATTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 CAG 2 1 40189 CASAVA_Build 1 40197945 1I GGTGGATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 45 0 32 13 T 11 12 40190 CASAVA_Build 1 40208102 1D TGTAGAAACC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 285 hom 36 1 30 5 T 9 8 40191 CASAVA_Build 1 40210357 1D ACTCTGCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1288 hom 26 7 16 3 A 20 19 40192 CASAVA_Build 1 40225428 1I TTTTTCTACT -/C CCATTCTCCC 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 C 2 3 40193 CASAVA_Build 1 40268683 1D ACCGTGCATG T/- TCTCAGTTTA 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 T 2 1 40194 CASAVA_Build 1 40282134 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1423 het 1423 ref 13 7 3 3 A 10 11 40195 CASAVA_Build 1 40289655 2D TCACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 12 16 14 AC 8 7 40196 CASAVA_Build 1 40292390 4D GTTGAGGGGA GAGT/---- GAGTAAGAGC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 GAGT 2 1 40197 CASAVA_Build 1 40293595 3D CAACTCTAAT ATC/--- ATATCTTAAA 3070 het 3070 ref 36 22 13 2 ATC 1 0 40198 CASAVA_Build 1 40295175 1I GCAAAAAAAA -/G CAGTTTCTGT 3070 het 3070 ref 57 29 23 5 G 0 1 40199 CASAVA_Build 1 40300482 4D GGTTGGGAGA CTCT/---- CTCTTTAATT 3070 het 3070 hom 37 17 15 9 CT 4 2 40200 CASAVA_Build 1 40307086 5D TACTTTTATT TTTTA/----- TTTTATTTTA 2132 het 2132 ref 18 7 6 6 TTTTA 3 2 40201 CASAVA_Build 1 40308662 1I AAAGTTACAC -/T GTTGACACAC 3070 hom 126 het 50 0 41 9 T 0 1 40202 CASAVA_Build 1 40311791 4I GATGATAAGA ----/TGAT TGATAGCACA 3070 het 3070 ref 55 33 20 2 TGAT 1 2 40203 CASAVA_Build 1 40320682 1D TATAGAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 29 3 14 12 A 12 11 40204 CASAVA_Build 1 40329105 1D TATACCCATC A/- ACAACAGAGA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 2 1 40205 CASAVA_Build 1 40330951 4D TCTATAACTC ACTT/---- ACAACTCAAC 3070 het 3070 hom 36 16 16 6 ACTT 1 0 40206 CASAVA_Build 1 40331047 11I CTAACCACTG -----------/GCATGTGAAAA GCATGTGAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 GCATGTGAAAA 0 1 40207 CASAVA_Build 1 40331641 5D46M4I GGAGGGGGCA ATAGGGAGTGATTGCTTAATGGCTATGTGTGTTTTTCTGGGGTGTTGAAAA----/-----GAGTGATTGCTTAATGGCTATGTGTGTTTTTCTGGGGTGTTGAAAAAGAG AGAAGTGTTA 3070 hom 144 het 44 0 48 20 N/A 0 0 40208 CASAVA_Build 1 40332029 1I CTGTAGTCCC -/A GCTACTTGGG 2911 hom 21 het 8 0 8 0 A 0 1 40209 CASAVA_Build 1 40332699 1I TGCTGTGTGG -/C CTAGTTCCTA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 C 1 2 40210 CASAVA_Build 1 40334908 1D TGCAAATATT A/- AAAAAAAAAA 1152 het 1152 ref 28 20 4 4 A 13 12 40211 CASAVA_Build 1 40335089 3I AAGTGAGAGA ---/TGC TGCTGCATCC 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 TGC 2 3 40212 CASAVA_Build 1 40338776 4D TTCAAAAATT TAAC/---- TAAATTATGA 3070 het 3070 ref 30 17 11 4 TAAC 1 0 40213 CASAVA_Build 1 40348155 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 16 0 A 13 12 40214 CASAVA_Build 1 40355665 3I CACAGAAAAT ---/AAC AAGTGTTGGT 2250 het 2250 ref 26 13 6 7 AAC 0 1 40215 CASAVA_Build 1 40368285 1D CTGACTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2616 het 357 hom 27 1 13 14 A 16 15 40216 CASAVA_Build 1 40369458 1I GTGTTTTACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 9 10 40217 CASAVA_Build 1 40369771 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 1114 het 1114 ref 26 10 6 10 C 1 0 40218 CASAVA_Build 1 40382921 1I AATATTCATG -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 6 7 40219 CASAVA_Build 1 40398932 3D AAGCTGAGGC AGG/--- AGAATGTTTG 3070 het 3070 hom 21 11 10 0 AGG 1 0 40220 CASAVA_Build 1 40409270 8D TGATAGTGTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 16 14 11 TTTG 6 4 40221 CASAVA_Build 1 40411774 1D GATCATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 733 hom 30 8 11 11 T 17 16 40222 CASAVA_Build 1 40417806 1D AAGTTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 8 T 14 13 40223 CASAVA_Build 1 40425342 1D CCAGGCTGGA G/- TGCAGTGGCG 2765 het 1703 hom 15 4 8 3 G 1 0 40224 CASAVA_Build 1 40432423 5I GCTGAGTTAA -----/TAACT TAGACTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TAACT 0 1 40225 CASAVA_Build 1 40446953 1I GGCATGTGCC -/T GTAGTCCCAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 0 1 40226 CASAVA_Build 1 40466986 1I GCTCAAGTGA -/T TCTCCCACCT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 1 2 40227 CASAVA_Build 1 40491431 4I GAGTGAGACC ----/CTGT CTGTCTTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 CTGT 1 2 40228 CASAVA_Build 1 40493057 5I ATTCAGTCAT -----/TTTCC TTTATTTATT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 TTTCC 0 1 40229 CASAVA_Build 1 40501117 1D TGAACAACTT A/- ACAACACTAC 3070 hom 117 het 45 0 38 8 A 2 1 40230 CASAVA_Build 1 40505273 2I GCAATCTGCC --/TT TGCCTTGGCC 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 1 3 40231 CASAVA_Build 1 40511961 1I ATAACTACTC -/T TTTTTTTTTT 2908 het 2908 ref 20 9 8 3 T 10 11 40232 CASAVA_Build 1 40522199 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1296 het 1296 ref 26 13 5 8 T 17 16 40233 CASAVA_Build 1 40537114 1D TATTCTAGTG C/- TTTATGTTGA 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 C 1 0 40234 CASAVA_Build 1 40578644 20D TGCAACTGCC TCTTATTTTAACTCCTTGCT/-------------------- TCCAGTTTTG 3070 het 3070 ref 42 23 22 6 TCTTATTTTAACTCCTTGCT 1 0 40235 CASAVA_Build 1 40580570 1I CGTCTTTTGC -/A ATCTGAATAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 1 2 40236 CASAVA_Build 1 40582290 2D CATATTTCTG CC/-- CCCCCCCCCC 2558 het 1051 hom 25 8 9 8 C 12 10 40237 CASAVA_Build 1 40584980 1D TGTTTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 A 11 10 40238 CASAVA_Build 1 40585503 2D GTGTGTGTTT TG/-- TTTTTGTTTT 1233 het 979 hom 12 4 5 3 TG 1 0 40239 CASAVA_Build 1 40595733 1I CAACAACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 956 hom 27 5 12 10 A 13 14 40240 CASAVA_Build 1 40603004 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2359 hom 42 11 14 17 A 14 15 40241 CASAVA_Build 1 40614086 2D GTGACTAGAA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 131 hom 24 2 9 13 C 11 9 40242 CASAVA_Build 1 40617241 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 24 1 15 9 T 15 14 40243 CASAVA_Build 1 40625010 3D TTTTTTTTAA AAC/--- AACAACAACT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AAC 4 3 40244 CASAVA_Build 1 40625604 1I GAATTTTCAA -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 6 7 40245 CASAVA_Build 1 40627569 1D TGCATTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 36 0 29 8 T 10 9 40246 CASAVA_Build 1 40631361 1I AATCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 17 1 12 4 A 13 14 40247 CASAVA_Build 1 40636602 1I AGTACTCCCG -/C CTCAGCCTCC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 1 2 40248 CASAVA_Build 1 40636672 1I ATATTTTAAA -/C AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 C 0 1 40249 CASAVA_Build 1 40637961 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1517 hom 28 5 14 9 A 13 12 40250 CASAVA_Build 1 40638032 1I CATAACCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 9 10 40251 CASAVA_Build 1 40639078 3D AAGATTATTC TGG/--- TGGTGGGATT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TGG 3 2 40252 CASAVA_Build 1 40671572 1I TCCTTGTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 58 19 27 12 T 9 10 40253 CASAVA_Build 1 40679095 1D TAAGCCCATC T/- TTTTTTTTTT 2643 het 1675 hom 26 7 9 10 T 13 12 40254 CASAVA_Build 1 40684199 6I AAATCTTTTG ------/CAATTT TTTAAGTGCT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 CAATTT 0 1 40255 CASAVA_Build 1 40746888 1I CGCATAAGCA -/G CACCCTCCTC 3070 hom 56 het 23 0 17 6 G 0 1 40256 CASAVA_Build 1 40748454 1I TTTTACTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 20 18 11 T 11 12 40257 CASAVA_Build 1 40773852 1I TAGATAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 27 1 23 3 T 10 11 40258 CASAVA_Build 1 40809895 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAGAAAGAA 1867 het 239 hom 14 3 8 5 A 5 3 40259 CASAVA_Build 1 40837258 1D CAATTTTTGC T/- TTTGTTGCCA 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 T 4 3 40260 CASAVA_Build 1 40882321 1I CAAGAAAGGT -/G GGGGGGCTCT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 G 6 7 40261 CASAVA_Build 1 40886078 1I CAGGCTCCCA -/G GAGGAGGCGA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 G 1 2 40262 CASAVA_Build 1 40888262 1D CAAGACTGAG C/- CCCTGATGTT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 C 4 3 40263 CASAVA_Build 1 40900676 4I GGTTCCAGAG ----/CTCC CCCAAGTCCC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 CTCC 0 1 40264 CASAVA_Build 1 40912086 4D CCTGCTGTGC TGTT/---- TATTATCTGT 3070 het 3070 ref 30 16 8 10 TGTT 1 0 40265 CASAVA_Build 1 40921890 4I AGCAGCAGAA ----/AACT AACTAAGATA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 AACT 1 2 40266 CASAVA_Build 1 40925265 1I GTGGCTCCTC -/A AAAAAAAAAA 2651 het 2651 ref 38 16 10 12 A 15 16 40267 CASAVA_Build 1 40925583 1D AATTTAGGCC A/- GGGGCGGTGG 3070 het 3070 hom 28 13 11 5 A 1 0 40268 CASAVA_Build 1 40928626 1D TATAAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 11 23 11 T 11 10 40269 CASAVA_Build 1 40932310 1I ACAGAAACTT -/G GAAGAATCTG 3070 het 3070 hom 48 20 26 2 G 1 2 40270 CASAVA_Build 1 40950816 1D ACTGGAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 11 10 40271 CASAVA_Build 1 40955200 2D GGATAGAAAC AG/-- AAATTTAGGA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 AG 1 0 40272 CASAVA_Build 1 40958777 1D TAAGAAGGAA T/- TTTCCCATTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 7 T 4 3 40273 CASAVA_Build 1 40965638 1I ATGTGCCACC -/G ACAACCAGCT 3070 het 1625 hom 15 5 8 2 G 0 1 40274 CASAVA_Build 1 40966135 3D AATCCTGTCT AGA/--- AGGTTTTCAG 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 AGA 1 0 40275 CASAVA_Build 1 40973421 11D AAGGGGTGGG CCTGAGTGTCT/----------- CCTTATGTCT 3070 het 2524 hom 30 9 14 9 CCTGAGTGTCT 1 0 40276 CASAVA_Build 1 40975593 1I TTAATTCTAC -/T TTTTTTTTTT 2165 het 1978 hom 20 8 7 5 T 13 14 40277 CASAVA_Build 1 40978669 5D ACAAGTAATT AATGA/----- AATGAAATAA 3070 het 3070 hom 46 16 24 9 AATGA 2 1 40278 CASAVA_Build 1 40988847 9D TGAAAGTTTT AAAGCAAAA/--------- AAAGCAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 AAAGCAAAA 2 1 40279 CASAVA_Build 1 41004308 1I GCCCCACAGA -/C CCCCCATCCA 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 C 5 6 40280 CASAVA_Build 1 41009425 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 T 10 9 40281 CASAVA_Build 1 41010668 2D CAGGGAGAAT AG/-- AGAGAGCATT 3070 het 3070 ref 51 29 13 10 AG 4 3 40282 CASAVA_Build 1 41011501 5I CAAAATGACA -----/TGGAG TGGAGTGTCA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 TGGAG 1 2 40283 CASAVA_Build 1 41016775 2D AGTCTCTAGC CT/-- CTCTTTGGAG 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 CT 3 2 40284 CASAVA_Build 1 41017706 11I CCAGCACCTC -----------/TCGTCTGGTGG GTGGCCTAAG 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 TCGTCTGGTGG 0 1 40285 CASAVA_Build 1 41019513 4D TAGTGAGTGC GTCT/---- GTCTCCTCAG 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 GTCT 2 1 40286 CASAVA_Build 1 41037692 1I GTGGGCCATG -/C CCCCCCCCCT 2021 hom 25 het 20 0 8 12 C 9 10 40287 CASAVA_Build 1 41043419 4D AAAATAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 10 AAAC 4 3 40288 CASAVA_Build 1 41043895 1D AAAGGTGGGG A/- GGGGAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 1 0 40289 CASAVA_Build 1 41044959 3I GTAAGGAAAG ---/AGA AGAATTCTTT 3070 hom 98 het 37 0 33 4 AGA 1 2 40290 CASAVA_Build 1 41046222 1I ACTAAAAATC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 8 9 40291 CASAVA_Build 1 41053144 1D AATCTGCTTT C/- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 8 9 C 2 1 40292 CASAVA_Build 1 41054307 1D TCCGTAGAGC T/- TTGTAGCATT 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 T 3 2 40293 CASAVA_Build 1 41071134 1I GACACAGGAG -/C CCCCAAGAAG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 4 5 40294 CASAVA_Build 1 41087329 1D GAAAACAAAC A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 52 23 25 4 A 8 7 40295 CASAVA_Build 1 41087804 1D ATTCTGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 13 12 40296 CASAVA_Build 1 41098438 7I TTCTTTTTTC -------/TTTTTTT TTGAGGAGTC 3070 hom 69 het 25 0 24 2 T 2 9 40297 CASAVA_Build 1 41102760 2I AGACGGAAAA --/TC TCTGCCCAAT 2490 het 1178 hom 17 4 6 7 TC 1 2 40298 CASAVA_Build 1 41112847 1I ATGTGCCTGT -/A AGTCCCAGCT 2650 het 1257 hom 21 5 7 9 A 1 2 40299 CASAVA_Build 1 41112956 1D AGTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2394 het 2256 hom 19 7 7 5 A 12 11 40300 CASAVA_Build 1 41124078 12D CATCTCAAAA AAAAAGAAAAAG/------------ AAAAAGAAAA 1839 het 1839 ref 17 10 6 4 AAAAAG 4 2 40301 CASAVA_Build 1 41124888 2D ATCTCTACAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 103 hom 33 3 13 17 T 11 9 40302 CASAVA_Build 1 41127583 3D TTAAGAAAAC TAT/--- TATTCCATGA 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 TAT 2 1 40303 CASAVA_Build 1 41127803 21I GGGAGAGATA ---------------------/AAGAGTTTTTTTTTCCTGAAC CCCAAAACTT 3070 het 3070 ref 18 9 9 2 AAGAGTTTTTTTTTCCTGAAC 0 1 40304 CASAVA_Build 1 41143345 12D CTAATTTTTA TATTATTATTAT/------------ TATTATTATT 3070 het 2653 hom 20 6 12 3 TAT 9 5 40305 CASAVA_Build 1 41151867 1I GAGCCACAGT -/C CCCTGCTCAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 3 4 40306 CASAVA_Build 1 41152053 1I ATGAAAACAA -/T TTTTTTTGGC 1685 het 1416 hom 10 4 5 1 T 7 8 40307 CASAVA_Build 1 41152344 1I CAAAAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 0 1 40308 CASAVA_Build 1 41194171 12I CTTTCGGTTT ------------/TTGTTGTTGTTG TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 TTG 2 6 40309 CASAVA_Build 1 41195567 8D ATACAGTTTG TTTTTTAT/-------- TTTTTTATTT 1954 het 1954 ref 23 9 9 5 TTTTTTAT 2 1 40310 CASAVA_Build 1 41197016 1D TTTTTTAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 27 2 11 14 A 15 14 40311 CASAVA_Build 1 41199192 1I TGAAACCCCA -/T TCTCTCCCAA 601 het 601 ref 12 5 2 5 T 1 2 40312 CASAVA_Build 1 41203950 1I GAACCCAGCC -/T TTGACCACGC 3070 hom 83 het 34 0 26 8 T 2 3 40313 CASAVA_Build 1 41206671 1I TCCCCCATCA -/C CCCCCCCAAA 3070 hom 68 het 26 0 21 5 C 7 8 40314 CASAVA_Build 1 41210395 13D CTACGTCTCC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 1709 het 1709 ref 23 14 5 8 A 25 12 40315 CASAVA_Build 1 41214680 2D GCACACACAC AT/-- ATGCATTCAT 1789 het 1789 ref 25 15 5 5 AT 2 1 40316 CASAVA_Build 1 41217497 11D AGCAGCCGCC TTCGGGGCAGG/----------- TGTGGGGAGG 2979 het 2730 hom 28 11 12 9 TTCGGGGCAGG 1 0 40317 CASAVA_Build 1 41225874 1D AAGGGCACAG T/- TAACAGTCAT 3070 hom 141 het 52 0 42 10 T 2 1 40318 CASAVA_Build 1 41228883 1I GTCTCGATTT -/A AAAAAAAAAG 1691 het 1691 ref 29 13 9 7 A 9 10 40319 CASAVA_Build 1 41238475 25D TGGTAACTTA TGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTT/------------------------- TGTTTTGTTT 1808 het 638 hom 23 4 4 17 TGTTT 9 4 40320 CASAVA_Build 1 41239269 2D CTTTTCTCCC CT/-- GTCTGAATAA 3070 het 3070 hom 29 10 18 3 CT 1 0 40321 CASAVA_Build 1 41242860 1I GCCCAGCGTT -/C CACATAGTAC 3070 het 3070 hom 52 14 31 7 C 1 2 40322 CASAVA_Build 1 41246566 16D TTAAAATGCC TCCCATCCTGCCACGT/---------------- TCCCAGGGCC 3070 het 3070 ref 35 17 18 6 TCCCATCCTGCCACGT 1 0 40323 CASAVA_Build 1 41249896 1D TAATTCCCAC T/- TTTTTTTTTC 1106 het 1106 ref 40 34 3 3 T 10 9 40324 CASAVA_Build 1 41259188 2I GTGGGAAGAC --/AG GGGATCTGCC 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 AG 0 1 40325 CASAVA_Build 1 41260810 2D TGTGCGGGGA AG/-- AGAGGGGCGC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 AG 3 2 40326 CASAVA_Build 1 41266012 1I CAATAAGATC -/T TTTTTGTAAA 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 T 5 6 40327 CASAVA_Build 1 41271545 1I AGACACTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2846 hom 43 14 18 11 A 13 14 40328 CASAVA_Build 1 41274099 1D CCTTCACCCC T/- CCACCACAGC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 1 0 40329 CASAVA_Build 1 41276971 2I AAAAGATAAG --/TC TCTGAGGGTC 3070 het 3070 hom 39 14 25 0 TC 1 2 40330 CASAVA_Build 1 41279171 5D AACAACAAAA AAAGG/----- AGGGCATTTT 3070 het 3070 ref 35 19 16 2 AAAGG 1 0 40331 CASAVA_Build 1 41279692 6D ATTAGCAACT ATTATA/------ ATTATAACAA 3070 het 3070 hom 43 14 22 10 ATTATA 2 1 40332 CASAVA_Build 1 41282261 3D TGGTTGCTTA TTG/--- TTCTATTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 13 5 TTG 1 0 40333 CASAVA_Build 1 41285832 1I ATGTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 2604 het 844 hom 8 2 6 0 T 9 10 40334 CASAVA_Build 1 41286356 1D AGTCTTCATA G/- GTTTAGTGGC 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 G 2 1 40335 CASAVA_Build 1 41291379 33I GTTTCACCAT ---------------------------------/GTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTTG TGATCTGCCC 3070 hom 38 het 16 0 12 4 GTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTTG 0 1 40336 CASAVA_Build 1 41298268 1D AAAAAGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 11 10 40337 CASAVA_Build 1 41306669 1D GATTAAAGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 9 8 40338 CASAVA_Build 1 41308481 1D AATGATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2689 hom 32 7 17 9 A 12 11 40339 CASAVA_Build 1 41309523 3D CACCTTTACA ATG/--- ATAAGATGTC 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 ATG 1 0 40340 CASAVA_Build 1 41309931 1I CCTAAAAGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 9 10 40341 CASAVA_Build 1 41317607 1D AAACCAGACC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 8 7 40342 CASAVA_Build 1 41320079 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 590 hom 36 3 16 17 A 11 10 40343 CASAVA_Build 1 41325159 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACCCCA 3070 het 1274 hom 39 9 19 11 C 0 1 40344 CASAVA_Build 1 41325779 1I CCTGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 10 11 40345 CASAVA_Build 1 41329298 5D ACTCCGTGTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1240 hom 12 het 8 0 3 6 A 21 16 40346 CASAVA_Build 1 41338827 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1211 het 96 hom 11 1 4 6 T 16 14 40347 CASAVA_Build 1 41340043 2I GTCAACTATC --/AT ATACTTGGAT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 AT 1 2 40348 CASAVA_Build 1 41343219 1D TTAAACAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2203 hom 20 6 9 5 T 13 12 40349 CASAVA_Build 1 41357714 1I AAAACAAAAA -/C AAAAAAAACC 3070 het 2257 hom 29 11 10 8 C 0 1 40350 CASAVA_Build 1 41359448 10D GGACTTAAAA CACTGCCTGG/---------- CATACAGGCA 3070 het 3070 hom 38 16 20 4 CACTGCCTGG 1 0 40351 CASAVA_Build 1 41362778 2I GAGTCTGGAT --/TA TGTTTTACAG 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 TA 0 1 40352 CASAVA_Build 1 41401491 1I17M1I CATCCATGCT -GCACCTGGAGCTGCCCA-/GGCACCTGGAGCTGCCCAC CTTGCGGCAG 3070 hom 64 het 21 0 21 6 N/A 0 0 40353 CASAVA_Build 1 41402712 1I CTTTAATTCA -/G GATTCATTGA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 1 2 40354 CASAVA_Build 1 41404930 1D TATAGAAATG C/- TACTGACTTT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 C 1 0 40355 CASAVA_Build 1 41421843 2I TATGCCTGTC --/AG AGTGTCAGAG 3070 het 3070 ref 47 21 22 4 AG 1 2 40356 CASAVA_Build 1 41426073 3D CCATCTCTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 12 5 A 14 11 40357 CASAVA_Build 1 41427049 2I TATAGTAATA --/AC AGTCAAATTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AC 0 1 40358 CASAVA_Build 1 41448533 1I GTGAAAATGG -/C CACATTGCCC 2988 het 2988 ref 23 14 7 2 C 1 2 40359 CASAVA_Build 1 41452153 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 8 7 40360 CASAVA_Build 1 41467009 1D TGACTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 10 9 A 11 10 40361 CASAVA_Build 1 41468348 1D TGTAGACCAC A/- AGGGAAAATA 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 A 2 1 40362 CASAVA_Build 1 41485588 1D TTCTGAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 45 1 29 16 T 13 12 40363 CASAVA_Build 1 41501104 2D ATATGTGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 AC 9 8 40364 CASAVA_Build 1 41503399 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTGTATT 1471 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 5 40365 CASAVA_Build 1 41512270 33D AGAAAAGTAC ACGATCTATTTTTTGTAACTTTTTTGGGGGGTG/--------------------------------- ACTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 24 18 12 3 ACGATCTATTTTTTGTAACTTTTTTGGGGGGTG 1 0 40366 CASAVA_Build 1 41517261 1I TGACCTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 10 11 40367 CASAVA_Build 1 41519256 1I CTTGCCTTTA -/G CAGTGACAAG 3070 hom 84 het 34 0 26 8 G 0 1 40368 CASAVA_Build 1 41530221 2D ATCTTGAGTG AT/-- ATATATATAT 720 het 720 ref 41 33 3 7 AT 6 5 40369 CASAVA_Build 1 41556041 12I GCTTGGTTGG ------------/AGTGTGCAGCCC ACCTTTAGGG 3070 het 3070 hom 50 24 20 6 AGTGTGCAGCCC 0 1 40370 CASAVA_Build 1 41559515 1D GGTGAGCTGG T/- ATCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 1 0 40371 CASAVA_Build 1 41578431 2D GCAGGACTAC TA/-- TGTTTCCTCC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 TA 1 0 40372 CASAVA_Build 1 41584960 1D TCTGGGTCTG T/- TTTTTTTTTT 2108 het 2108 ref 17 8 6 3 T 12 11 40373 CASAVA_Build 1 41588146 1D ATGTGCCTGA C/- CCCCTCCCCA 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 C 5 4 40374 CASAVA_Build 1 41594018 2D GGTCTCAAGA CT/-- CTGTGAACAT 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 CT 2 1 40375 CASAVA_Build 1 41606942 11I CGTGTGGGGG -----------/AGGGGCCTCCC ACACCCTCCC 1188 hom 18 het 9 0 5 4 AGGGGCCTCCC 0 1 40376 CASAVA_Build 1 41619185 1I ACCTTGGGGA -/C CCCCAGCCTA 3070 hom 86 het 33 0 27 6 C 4 5 40377 CASAVA_Build 1 41626524 6D TGAGGCTGCC GTGCTG/------ CTGCTGCTGG 2890 het 2890 ref 23 11 8 4 GTGCTG 1 0 40378 CASAVA_Build 1 41631237 1D AAGGAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 2936 het 1275 hom 41 10 14 17 T 17 16 40379 CASAVA_Build 1 41644109 8D TGGGGGTGGT GGCTTGGA/-------- GCCCAGACTC 3070 het 3070 ref 45 21 19 6 GGCTTGGA 1 0 40380 CASAVA_Build 1 41649416 2I TTGTAGAGAT --/AG AGTTTCACCA 1673 hom 29 het 20 0 6 14 AG 1 2 40381 CASAVA_Build 1 41652212 1I GCATGTGACA -/T AGCATACAGC 3070 hom 232 het 85 0 77 8 T 0 1 40382 CASAVA_Build 1 41659768 2D TTCAGAAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2464 het 1918 hom 24 7 10 7 T 13 11 40383 CASAVA_Build 1 41662764 2D AGTATGTGTG AT/-- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 ref 70 30 26 16 AT 1 0 40384 CASAVA_Build 1 41663045 9D GACGTATAGC TATGTGTGG/--------- TATGTGTGGT 3070 het 3070 hom 80 26 39 22 TATGTGTGG 3 2 40385 CASAVA_Build 1 41663382 10D GTAGGTGTGG TGTGTGTGTC/---------- TGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 50 20 16 18 TGTGTGTGTC 2 1 40386 CASAVA_Build 1 41663654 1D TGTGCACTTG C/- TGTGTACATA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 1 0 40387 CASAVA_Build 1 41663848 2D TATGCATATG TA/-- TATGTCTGTG 3070 het 3070 hom 69 28 38 4 TA 2 1 40388 CASAVA_Build 1 41670930 2I AAGGTCACAC --/AG AGAGAGGAGC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 AG 3 4 40389 CASAVA_Build 1 41671867 3D GGCCTTCATT TCC/--- TCAACTGTGC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TCC 1 0 40390 CASAVA_Build 1 41673049 1D TTGTCCTGAG C/- CCCCGGCAGG 3070 hom 68 het 28 0 21 8 C 5 4 40391 CASAVA_Build 1 41678770 4D AGTGGACTGA AGCC/---- AATTAGATCC 3070 het 3070 ref 47 27 17 5 AGCC 1 0 40392 CASAVA_Build 1 41681693 1I GGAGGACATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 9 10 40393 CASAVA_Build 1 41687281 4D GGAGCAGCTG GAGA/---- GCCCCGGCTC 1483 het 1483 ref 20 9 5 7 GA 2 0 40394 CASAVA_Build 1 41693426 3I TGATTCTGTT ---/GTA GGGGCTGTCC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 GTA 0 1 40395 CASAVA_Build 1 41699097 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 11 10 40396 CASAVA_Build 1 41700848 1I TATTTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 2931 het 2512 hom 29 8 11 10 T 13 14 40397 CASAVA_Build 1 41705989 21D GTTCATTTGA GAGGTGATTCCAGGAAGCCAC/--------------------- GAGGGATGTG 3070 het 3070 hom 32 12 16 9 GAGGTGATTCCAGGAAGCCAC 1 0 40398 CASAVA_Build 1 41711877 1I TTTGGAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 9 40399 CASAVA_Build 1 41739476 1D TTAAATGGGA C/- CCAATACTTC 3070 hom 148 het 55 0 50 5 C 3 2 40400 CASAVA_Build 1 41744858 5D TGTTTTTTTT TTTTG/----- TTTGTTTCTG 3070 hom 7 het 35 1 29 6 TTTTG 1 0 40401 CASAVA_Build 1 41745143 5D TGCCTGCACG TTTCT/----- TTTTTCTGTT 3070 hom 90 het 31 0 30 1 TTTCT 1 0 40402 CASAVA_Build 1 41763556 1I ATGATAATAA -/T AACAGCAGCA 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 0 1 40403 CASAVA_Build 1 41764250 2D CAACGCCAGC CA/-- GAGTTGCCCT 2437 het 2437 ref 19 9 7 4 CA 1 0 40404 CASAVA_Build 1 41764804 6I CACCCCCACA ------/CTCACC CTCACCCTCA 3070 het 1665 hom 42 9 13 20 CTCACC 2 3 40405 CASAVA_Build 1 41765234 3D TCACACTCAC CTT/--- CACACTCCAC 3070 het 3070 ref 50 20 20 10 CTT 1 0 40406 CASAVA_Build 1 41765303 2D CTCACACACC CT/-- CTTCCTCACA 100 het 100 ref 43 17 2 24 CT 2 1 40407 CASAVA_Build 1 41766310 3I TCCACACCCC ---/CAT CCTCACTTAC 3070 hom 78 het 44 0 30 14 CAT 0 1 40408 CASAVA_Build 1 41768176 1I CACACCAACA -/C CCCCCCACCA 1665 het 1665 ref 29 13 7 9 C 6 7 40409 CASAVA_Build 1 41772200 1D TGGGTCCCCG T/- TCTCTCTCAG 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 2 1 40410 CASAVA_Build 1 41777051 9I CAGGCAGGAA ---------/CCCAGAAGC TGGGTTGAAA 3070 hom 107 het 42 0 31 12 CCCAGAAGC 0 1 40411 CASAVA_Build 1 41777495 1I CAGTTTCCCA -/G GCAGCTCCTG 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 G 1 2 40412 CASAVA_Build 1 41783667 3I TACCACCAAT ---/ACC ACCACCATCG 3070 hom 66 het 41 0 16 25 ACC 2 3 40413 CASAVA_Build 1 41786800 1D TTTGGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 39 0 34 5 T 11 10 40414 CASAVA_Build 1 41789596 1I TAAAATTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 9 10 40415 CASAVA_Build 1 41810688 1I TCGCCCACCC -/T TCTGGGCCCG 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 1 2 40416 CASAVA_Build 1 41845852 1D AAGCTCTTCC T/- TTTTTTTTTC 1488 het 1488 ref 42 31 5 6 T 10 9 40417 CASAVA_Build 1 41849297 2D CTGAAAATCC CA/-- CACTGTGAGA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 CA 2 1 40418 CASAVA_Build 1 41855502 2D CTTTACAGAC TG/-- ATGCATTCAT 3070 het 3070 hom 50 23 24 5 TG 1 0 40419 CASAVA_Build 1 41856139 1I TCTAAGCATC -/T TTTTAGTTCA 3070 het 3070 ref 41 23 9 9 T 4 5 40420 CASAVA_Build 1 41856256 2I TCACTGGTGG --/GT GTGCATTTCC 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 GT 1 2 40421 CASAVA_Build 1 41862163 1I TGCCGATCAG -/A AGTGACGTGT 3070 hom 102 het 38 0 32 6 A 1 2 40422 CASAVA_Build 1 41862271 1D ATTAAAGCAG C/- CCCAGGAGCT 3070 het 3070 hom 48 17 23 9 C 4 3 40423 CASAVA_Build 1 41863495 1D AACAAGAAAG A/- AAAAGGAATA 3070 het 2964 hom 20 9 7 5 A 5 4 40424 CASAVA_Build 1 41875218 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2367 het 607 hom 15 5 6 6 A 20 16 40425 CASAVA_Build 1 41876891 1D GGGGGCTACT A/- GGGGTAGAGG 3070 hom 53 het 19 0 14 5 A 1 0 40426 CASAVA_Build 1 41888822 2D GTTTTCTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 25 1 20 5 T 15 13 40427 CASAVA_Build 1 41891302 1I ACAAAGTGGG -/A AAAAAATGTG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 6 7 40428 CASAVA_Build 1 41892606 1I TCAGGATAGT -/A TGCTTAGGAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 40429 CASAVA_Build 1 41988017 4D TCTGCAAAAC AAAT/---- AAGTTGGACT 3070 hom 99 het 38 0 32 8 AAAT 1 0 40430 CASAVA_Build 1 41993867 2D CACAGCAGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 13 11 40431 CASAVA_Build 1 42007737 1D ATTAAAAGTC T/- TCTAGGAACC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 T 2 1 40432 CASAVA_Build 1 42011769 1D CAGACACCCT C/- CCGGAATCCA 3070 hom 86 het 38 0 27 11 C 3 2 40433 CASAVA_Build 1 42029869 2I GTTGCCTGGG --/AT AATGCTGATA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AT 0 1 40434 CASAVA_Build 1 42045283 1D TTCCTCCCCG C/- CCAGCCCACC 2992 het 2992 ref 30 15 10 6 C 3 2 40435 CASAVA_Build 1 42049356 1D AATGACCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2403 hom 32 9 13 10 T 14 13 40436 CASAVA_Build 1 42051180 1I AGAGCCAAGC -/T GCTTTCTGGA 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 T 0 1 40437 CASAVA_Build 1 42054012 1D TTTTTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 15 10 T 14 13 40438 CASAVA_Build 1 42068541 1D CATAAGTTGG A/- AGTCAGTAAA 3070 het 3070 ref 63 34 26 3 A 2 1 40439 CASAVA_Build 1 42071686 1D TTAGAGAAGG A/- AAAAAACTAA 3070 hom 89 het 33 0 28 6 A 7 6 40440 CASAVA_Build 1 42079674 1I ATTACAAACA -/G GTGCAAAGCC 2701 het 2701 ref 31 15 6 10 G 1 2 40441 CASAVA_Build 1 42083462 11I AAGAGACTAC -----------/ATAACTTATTT AATATGTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 ATAACTTATTT 0 1 40442 CASAVA_Build 1 42086451 3D GCCTCCAGGT ATG/--- ATGATGAAAT 3070 het 3070 ref 45 24 17 7 ATG 3 2 40443 CASAVA_Build 1 42104813 1D ACCCAGGACC A/- AGCCTGCTTG 3070 hom 126 het 45 0 40 6 A 2 1 40444 CASAVA_Build 1 42109666 1D ATTTAAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 13 12 40445 CASAVA_Build 1 42115938 1D GGGTTTCATA G/- GTCAATGGTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 2 1 40446 CASAVA_Build 1 42117317 1I GCAGGCACCT -/A AAGCACTTCT 2297 het 1909 hom 16 5 6 5 A 2 3 40447 CASAVA_Build 1 42142045 1D CTTGCCTCTT A/- AAAGAGTATT 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 A 4 3 40448 CASAVA_Build 1 42142904 4D TACTTGAAAC TTCA/---- TTCATTGTAC 3070 hom 122 het 48 0 40 11 TTCA 2 1 40449 CASAVA_Build 1 42145093 1D CCCCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1390 het 1390 ref 36 19 4 13 T 14 13 40450 CASAVA_Build 1 42153395 1D AGAATCATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 27 0 23 4 A 12 11 40451 CASAVA_Build 1 42158836 3D AACAAGATGG TTT/--- TTTTTTTTTT 448 het 448 ref 42 6 5 32 T 13 10 40452 CASAVA_Build 1 42159970 2D GAGGAGAATC AT/-- AGGCAGCAGT 3070 hom 69 het 24 0 24 1 AT 1 0 40453 CASAVA_Build 1 42186798 1I TATTGAAGCC -/A AAAGAGCCGC 3070 hom 30 het 13 0 10 3 A 3 4 40454 CASAVA_Build 1 42193223 1I AGCTTCCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 36 1 21 14 T 14 15 40455 CASAVA_Build 1 42195488 1D AAAAGTTTTG C/- CAGAATAATC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 C 2 1 40456 CASAVA_Build 1 42223235 1D TCAGAGGACT A/- AAAAAAAAAA 1173 het 1173 ref 33 19 4 10 A 12 11 40457 CASAVA_Build 1 42244826 2D TTCCAAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 29 1 16 12 A 18 16 40458 CASAVA_Build 1 42246080 1I TCATTTGCTT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 144 het 60 0 48 12 A 7 8 40459 CASAVA_Build 1 42250689 3I GAGCCCTTAT ---/AAG AAGAGGAAGA 3070 hom 101 het 39 0 32 8 AAG 1 2 40460 CASAVA_Build 1 42257792 1I TCATTTTCTA -/T TTTTTATTGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 5 6 40461 CASAVA_Build 1 42258752 1I TATGTTGGCA -/C AAAACTGTTC 3070 hom 102 het 44 0 35 9 C 0 1 40462 CASAVA_Build 1 42268839 1D GAGCTGAGCT C/- CCCCATTCCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 5 4 40463 CASAVA_Build 1 42271808 1D GCATTGACTT A/- TCTCTCCAGT 3070 hom 141 het 51 0 48 4 A 1 0 40464 CASAVA_Build 1 42275819 1D TTAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1076 het 1076 ref 50 33 4 13 A 12 11 40465 CASAVA_Build 1 42291405 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3020 het 61 hom 11 1 9 1 A 15 14 40466 CASAVA_Build 1 42299812 1I AATGGAAAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 8 9 40467 CASAVA_Build 1 42304085 4I CACACCCATT ----/TAGA TAGATAGGTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TAGA 1 2 40468 CASAVA_Build 1 42316402 1D CTTATAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 12 11 40469 CASAVA_Build 1 42318140 4D TATTCTATTC TATT/---- TATTTATTTA 2684 het 20 hom 37 1 8 29 TATT 5 4 40470 CASAVA_Build 1 42320960 4D TTTGACACTC TCTT/---- TCTTTTAATT 3070 hom 123 het 44 0 42 5 TCTT 2 1 40471 CASAVA_Build 1 42321489 3D ATTAAATGCA TTG/--- TTATTATTAT 3070 hom 114 het 40 0 39 3 TTG 1 0 40472 CASAVA_Build 1 42334514 12I TCTTAAGTTC ------------/AGCCTTCCACAA AGCCCTAAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 AGCCTTCCACAA 0 1 40473 CASAVA_Build 1 42339303 1I TCAGTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 11 40474 CASAVA_Build 1 42340739 1I CAAAGATGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 413 hom 24 1 15 8 A 9 10 40475 CASAVA_Build 1 42388090 4I GGAGAACAAA ----/ACAG ACAAATTCTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ACAG 0 1 40476 CASAVA_Build 1 42403332 2D GTGGGGTGAT CC/-- TAGGATGAGG 3070 hom 56 het 24 0 21 4 C 2 0 40477 CASAVA_Build 1 42403799 3I TCCCATATTA ---/TTT TTAGCAGCCA 3070 hom 66 het 26 0 16 10 T 2 5 40478 CASAVA_Build 1 42412172 1I GCATCGCTTA -/G GGGGTACTGC 3070 hom 108 het 41 0 35 6 G 4 5 40479 CASAVA_Build 1 42437882 1D CGAAGCACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 11 10 40480 CASAVA_Build 1 42439348 17I TTTATTTTCA -----------------/AACTATCTGTGGCTAGT AGGCAGAAAT 3070 hom 123 het 39 0 42 0 AACTATCTGTGGCTAGT 0 1 40481 CASAVA_Build 1 42440670 1D TGTTTACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 11 10 40482 CASAVA_Build 1 42443281 2D CTAGAGGGAG AA/-- AATGAAAACA 3070 het 3070 hom 55 22 27 8 A 4 2 40483 CASAVA_Build 1 42608308 3I TTAGGAACAC ---/TTG TTGGAGATGA 3070 hom 150 het 53 0 50 3 TTG 1 2 40484 CASAVA_Build 1 42614825 3D ACTTGAGGCC AGG/--- AGTTCAAGAT 3070 het 3070 hom 26 7 13 9 AGG 1 0 40485 CASAVA_Build 1 42627997 1D GCTAGAACCT G/- GGAGGCAAAG 2769 het 2769 ref 21 10 7 5 G 3 2 40486 CASAVA_Build 1 42628072 2D ACGCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAT 1416 het 1416 ref 30 20 5 6 A 11 9 40487 CASAVA_Build 1 42631474 1I ACTTAAATCC -/T TGTCTGAGTG 3070 het 3070 hom 44 12 20 12 T 1 2 40488 CASAVA_Build 1 42633801 2I GGGCATGAGC --/CT CTCTGATTGT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 CT 2 3 40489 CASAVA_Build 1 42635022 3D TAGTAGAATG TCT/--- TCTGTGTAGT 3070 het 3070 ref 50 32 17 1 TCT 2 1 40490 CASAVA_Build 1 42635271 1D AAAGAACAGT A/- AAAGCATCTG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 4 3 40491 CASAVA_Build 1 42635982 4D TCCTGTGTCT AAAA/---- AAAAAATAAA 448 het 448 ref 41 23 4 14 A 10 6 40492 CASAVA_Build 1 42638485 1I AGATATAGCT -/G AAATATAAGG 3070 het 3070 hom 35 9 21 5 G 0 1 40493 CASAVA_Build 1 42641470 3I GCTAGAAAAA ---/TCT TCTCACAAGT 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 TCT 1 2 40494 CASAVA_Build 1 42644948 4I TGTTATGTAA ----/GTAT GTATGTATGT 3070 het 3070 hom 58 19 19 20 GTAT 4 5 40495 CASAVA_Build 1 42645611 1D AACTTGTCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 9 8 40496 CASAVA_Build 1 42651750 2D8M12D TGACAGAGTA AGAGTCTCTCAAAAAAAAAAAA/--AGTCTCTC------------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 9 9 N/A 0 0 40497 CASAVA_Build 1 42653429 2I TAAAAACACT --/CA CAAGAACAAC 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 CA 1 2 40498 CASAVA_Build 1 42654346 3D CACATTTTGC GGG/--- GGGGGGGGCT 3070 het 2620 hom 25 10 12 4 G 11 8 40499 CASAVA_Build 1 42654754 1D TTTAGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 39 3 17 20 A 12 11 40500 CASAVA_Build 1 42664883 4I GATATATTTG ----/AAAT AAATAATAAG 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 AAAT 1 2 40501 CASAVA_Build 1 42672185 1D ATCATGTTAA G/- GTTGGCTATC 3070 het 3070 ref 56 28 21 9 G 2 1 40502 CASAVA_Build 1 42678926 3D TGTCCTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 TTG 5 4 40503 CASAVA_Build 1 42684910 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2569 het 2569 ref 21 9 9 3 A 14 15 40504 CASAVA_Build 1 42686382 4D ATAGCAAAGC AGAT/---- AGATACCCAG 3070 het 3070 ref 44 28 12 5 AGAT 2 1 40505 CASAVA_Build 1 42708551 1I AGGATGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 11 40506 CASAVA_Build 1 42710148 1I ATGGTTTTGC -/T TTTTAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 4 5 40507 CASAVA_Build 1 42712228 1I GATAAAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 10 11 40508 CASAVA_Build 1 42715351 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCTCTAC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 C 6 5 40509 CASAVA_Build 1 42719371 1I CTCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2776 het 2776 ref 26 11 10 5 A 13 14 40510 CASAVA_Build 1 42720790 2D CACACACACT CA/-- CACACACAAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 CA 5 4 40511 CASAVA_Build 1 42721150 1D GGAACATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 A 12 11 40512 CASAVA_Build 1 42722337 7I8M9I ATTAAAAATG -------TTAAATGT---------/TTTATGATTAAACATTAAACAACA ATAAAACAAT 3070 het 3070 hom 22 11 12 2 N/A 0 0 40513 CASAVA_Build 1 42727288 1D TTCTGTCCTA C/- CTCCTATATT 3070 het 3070 hom 52 19 31 3 C 2 1 40514 CASAVA_Build 1 42729248 1D TATATAAAAA T/- GCTACCAGTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 1 0 40515 CASAVA_Build 1 42729765 1I GTTAATGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 148 hom 24 1 14 9 A 13 14 40516 CASAVA_Build 1 42730280 4I CAGGAAAAAA ----/ACTG ACTAACTTCC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 ACTG 0 1 40517 CASAVA_Build 1 42733959 1D AATAAAAAAT A/- AAACAAAATT 3070 het 2148 hom 23 5 15 3 A 4 3 40518 CASAVA_Build 1 42734724 4I ATTACTATAA ----/ATAT ATATATATAT 2358 het 830 hom 13 4 5 4 AT 6 8 40519 CASAVA_Build 1 42739022 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTACAT 3070 het 2445 hom 25 7 14 5 T 7 6 40520 CASAVA_Build 1 42743473 1I TTTCCTAAAG -/A AAATTTCTGC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 3 4 40521 CASAVA_Build 1 42745995 4I TTTTCCAGCA ----/TAGT TAGTTAGGGG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TAGT 1 2 40522 CASAVA_Build 1 42746136 1I AACACTTGTA -/T TTTTACCAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 4 5 40523 CASAVA_Build 1 42754926 1D TCCTCTTCCA T/- TTTTCACCAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 5 4 40524 CASAVA_Build 1 42755900 2I ATGTGGATGT --/TC TGTTTTATCA 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 TC 0 1 40525 CASAVA_Build 1 42758419 1I GTTTGTTTTG -/T TTTTCCTTTT 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 T 4 5 40526 CASAVA_Build 1 42762364 1I TTTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 11 12 40527 CASAVA_Build 1 42769392 4D TTTTAGTAAT AGTG/---- AGTGAGTGAG 3070 het 3070 ref 27 11 11 6 AGTG 3 2 40528 CASAVA_Build 1 42772227 1D AGGCTCCCTC A/- AGCTACTCAG 3070 het 3070 ref 40 18 17 6 A 2 1 40529 CASAVA_Build 1 42778177 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2710 het 746 hom 28 6 9 13 A 15 14 40530 CASAVA_Build 1 42783984 2D GCAGGCAGAT CG/-- CTTGAGCTCA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 CG 1 0 40531 CASAVA_Build 1 42787735 1D CAAATATCGC A/- AGGGCAAGAA 3070 het 3070 ref 46 19 16 12 A 2 1 40532 CASAVA_Build 1 42788363 1I CATTCACACA -/G TTGATCAAGC 3070 het 3070 ref 54 26 20 8 G 0 1 40533 CASAVA_Build 1 42789502 5I TTCTACTGTA -----/CTGTG CTGTGCTCTT 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 CTGTG 1 2 40534 CASAVA_Build 1 42790827 1I GGATTTTCCA -/T TTTTTTAAAT 2512 het 2512 ref 41 22 6 13 T 6 7 40535 CASAVA_Build 1 42791749 1D TTCTCCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2500 hom 23 9 10 4 A 10 9 40536 CASAVA_Build 1 42792256 2D TTTCCCATAG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 TA 6 5 40537 CASAVA_Build 1 42792414 2D AGCCATTTCC AT/-- ATCTCTATTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 AT 2 1 40538 CASAVA_Build 1 42792813 2D3M7D GGGATTACAG ACGTGAGCCACC/--GTG------- ACACCTGACC 3070 het 3070 hom 28 14 20 1 N/A 0 0 40539 CASAVA_Build 1 42822864 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 8 9 40540 CASAVA_Build 1 42827482 2D TCATTGAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 13 10 A 14 12 40541 CASAVA_Build 1 42835016 1D AACAAACAAA C/- AAAAACAGTT 3070 het 3070 ref 44 20 15 10 C 1 0 40542 CASAVA_Build 1 42835320 1I GAGGAAAGAG -/C CTCTGTCCTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 C 1 2 40543 CASAVA_Build 1 42849143 2D GACTATAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 16 14 40544 CASAVA_Build 1 42871019 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2911 hom 29 11 17 2 A 13 12 40545 CASAVA_Build 1 42890239 2I TATGGAAAAC --/TG TGTGGAGTTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 TG 2 3 40546 CASAVA_Build 1 42904981 1I AAGGGAAGAG -/A AACCACCTAA 3070 het 3070 hom 52 21 20 11 A 2 3 40547 CASAVA_Build 1 42907305 1I CCGTCTTTCC -/A AAAAAAAAAA 1795 het 1795 ref 25 8 8 9 A 14 15 40548 CASAVA_Build 1 42925624 1I CTCACTGCAA -/C CTCCGCCTCC 3070 het 1809 hom 21 6 8 7 C 1 2 40549 CASAVA_Build 1 42932669 2D GTGCTATCAG TT/-- TTCTCACTAA 3070 het 3070 hom 39 14 23 3 T 4 2 40550 CASAVA_Build 1 42939794 2I TTGTTTTTTT --/TG TTTTTGTTGG 3070 het 2814 hom 31 9 19 3 TG 0 1 40551 CASAVA_Build 1 42943827 6I4M1I CAGGAATTTG ------ACCT-/AGACCAACCTG GGTAAAATAA 3070 het 3070 ref 41 19 14 9 N/A 0 0 40552 CASAVA_Build 1 42951784 5D TATTGCTATG TTATA/----- TTTTGTTATT 3070 het 3070 ref 48 25 21 3 TTATA 1 0 40553 CASAVA_Build 1 42952808 2I ATTTTTTTTT --/TG TTTTTTTGTC 3070 het 1443 hom 33 9 16 8 TG 0 1 40554 CASAVA_Build 1 42957634 1D GGAGTTTGAG A/- TCAGCCTGAG 3070 het 2288 hom 16 5 10 1 A 1 0 40555 CASAVA_Build 1 42962674 3D TCAAAAAAAG TTA/--- TTATTAGAGA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 TTA 3 2 40556 CASAVA_Build 1 42967224 1D AAACAGTCCC A/- ATTGTGTTTT 3070 het 3070 ref 53 27 25 1 A 2 1 40557 CASAVA_Build 1 42983502 1I ATTACAAGCG -/T GAGCTACTGA 3070 het 3070 hom 45 14 27 4 T 0 1 40558 CASAVA_Build 1 43050900 5D ATTTATTTGA TTAGT/----- TTATCTGGAA 3070 het 3070 ref 42 24 18 0 TTAGT 1 0 40559 CASAVA_Build 1 43052484 1I GGACTACAGG -/C GAGCACCACC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 0 1 40560 CASAVA_Build 1 43052874 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 18 het 7 0 7 1 A 10 9 40561 CASAVA_Build 1 43062447 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2213 het 200 hom 11 1 9 1 A 11 12 40562 CASAVA_Build 1 43062606 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 15 0 12 3 A 13 14 40563 CASAVA_Build 1 43073609 2D TGCAGAAAGG CC/-- CCTGGGCAGA 3070 hom 75 het 31 0 25 7 C 4 2 40564 CASAVA_Build 1 43081971 1I AGCAAGCATG -/T TTTTAGACCA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 4 5 40565 CASAVA_Build 1 43085081 1I CGCGACCCTC -/G GCCCTGGCCC 2601 hom 33 het 15 0 9 6 G 1 2 40566 CASAVA_Build 1 43100114 2D CACACACACA TG/-- CGCGCACACA 3070 hom 104 het 38 0 34 6 TG 1 0 40567 CASAVA_Build 1 43125082 1I GGAAGACGAA -/G GAAGGTGTTT 2436 het 2436 ref 28 12 10 6 G 1 2 40568 CASAVA_Build 1 43128541 1D TAAGATCTAT C/- CTGCTGTACA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 C 2 1 40569 CASAVA_Build 1 43130398 2D TCGATGAGAG AC/-- TTGAGGAAGC 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 AC 1 0 40570 CASAVA_Build 1 43165833 10I CATGCGTGCG ----------/GGTGAGAAAT GGTGAGTATA 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 GGTGAGAAAT 0 1 40571 CASAVA_Build 1 43182887 1I CTCTGAAAGC -/G GTCAGTCAGG 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 G 1 2 40572 CASAVA_Build 1 43184006 4I7M1I CAAAAAAAAA ----AAAAAAC-/AAACAAAAAACA AAAAAACAAA 3070 het 2818 hom 18 9 8 3 N/A 0 0 40573 CASAVA_Build 1 43188106 1I GTTTCCAATT -/G GGGGGTCTCT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 G 5 6 40574 CASAVA_Build 1 43192474 1D AGAAAGCATC T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 T 3 2 40575 CASAVA_Build 1 43205436 2D ATGCCCAGAC AG/-- AGCAGCCGGT 3070 het 3070 hom 36 14 11 11 AG 2 1 40576 CASAVA_Build 1 43208006 1I CAAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2768 het 1991 hom 18 7 9 2 A 13 14 40577 CASAVA_Build 1 43215650 3D CGGCTTTGGT GAG/--- GAGTTCTTAC 2773 hom 21 het 12 0 8 4 GAG 2 1 40578 CASAVA_Build 1 43222662 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 10 9 40579 CASAVA_Build 1 43229653 1I CTAAAATCAT -/G TATAGTTTCC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 G 0 1 40580 CASAVA_Build 1 43229964 1D TTTTTTTTTT A/- AAAGACAGAG 2498 het 129 hom 15 1 9 5 A 4 3 40581 CASAVA_Build 1 43240100 1D CTCTGGACCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 21 16 12 T 10 9 40582 CASAVA_Build 1 43265838 13D TTTTCCTTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1854 hom 23 12 9 5 T 23 10 40583 CASAVA_Build 1 43271410 1I CAAAGCAAGA -/C CCCCCCATTT 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 C 6 7 40584 CASAVA_Build 1 43274063 2I ATTTTTTTAC --/AG AGTCTTTCAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 AG 1 2 40585 CASAVA_Build 1 43280018 1I AAATATGTAT -/G TATATAGGCT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 0 1 40586 CASAVA_Build 1 43351017 2D CATGAGCCAC TG/-- TGCCTGGCCA 3070 het 2398 hom 14 5 9 0 TG 2 1 40587 CASAVA_Build 1 43351878 1D CCTTTGCCCA T/- TTTTTTTTTT 2300 het 1499 hom 23 9 6 8 T 17 16 40588 CASAVA_Build 1 43363684 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1058 het 1058 ref 38 21 4 13 T 17 16 40589 CASAVA_Build 1 43366059 3D TTTCTCCTAT CTA/--- CTCTTTCCTG 3070 het 3070 ref 44 22 15 8 CTA 1 0 40590 CASAVA_Build 1 43366203 4D CTAATTACCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 TTTC 5 4 40591 CASAVA_Build 1 43375728 1D CTAAACATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2920 hom 24 8 12 4 A 11 10 40592 CASAVA_Build 1 43382137 3I TCCTACCTGC ---/CCT CCTCTTTTGG 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 CCT 1 2 40593 CASAVA_Build 1 43385649 4I CATTAAAAAT ----/AAAC AAACTATAAA 3070 het 3070 hom 37 10 23 4 AAAC 1 2 40594 CASAVA_Build 1 43386438 1I CGGTCCCAGC -/A AAAAACTCTT 2010 het 2010 ref 18 7 6 5 A 5 6 40595 CASAVA_Build 1 43399831 2I CGCATCTACT --/CA CAGTTATTAC 3070 het 3070 ref 50 21 17 12 CA 1 2 40596 CASAVA_Build 1 43408207 6I TGAGAATCTA ------/ATGCCT ATGCCTGATG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 ATGCCT 1 2 40597 CASAVA_Build 1 43428966 1I TTTTGTCACA -/T TTTTTTTTTT 2531 het 2531 ref 33 19 10 4 T 10 11 40598 CASAVA_Build 1 43430059 1I TAGGTTGCTC -/T TTTTTTTTTT 2936 het 2936 ref 21 10 9 2 T 11 12 40599 CASAVA_Build 1 43434825 1I GCAGAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 25 17 11 A 10 11 40600 CASAVA_Build 1 43436907 1D GCGGAGAGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 10 9 40601 CASAVA_Build 1 43437843 2D GGTGAACAAA AG/-- AGAGATGGTT 3070 het 3070 hom 45 17 26 4 AG 3 2 40602 CASAVA_Build 1 43447049 3D17M1D CTTAAAGTAT AACAATAATAATAATAAAAGA/---AATAATAATAATAAAAG- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 15 0 13 7 N/A 0 0 40603 CASAVA_Build 1 43449196 1I TTCATAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1247 hom 28 3 22 3 A 13 14 40604 CASAVA_Build 1 43450075 4I TAACTTACTA ----/ACTC TTCTCTTGCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ACTC 0 1 40605 CASAVA_Build 1 43451769 1I TATGGGGGGG -/T GCGGTGGAGC 3070 het 1789 hom 29 8 13 8 T 0 1 40606 CASAVA_Build 1 43453427 1I AGGATTGCAT -/G GGGGGGAAGC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 G 6 7 40607 CASAVA_Build 1 43456866 1I ACCATGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 9 10 40608 CASAVA_Build 1 43459061 1D AAGTTCGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 26 1 19 6 A 12 11 40609 CASAVA_Build 1 43474340 1I AGACCCAAGC -/G GGCCTCCTGC 1628 hom 35 het 14 0 8 6 G 2 3 40610 CASAVA_Build 1 43475172 1I ATCCCCCCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 14 9 A 10 11 40611 CASAVA_Build 1 43483585 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1515 hom 32 7 17 8 A 15 16 40612 CASAVA_Build 1 43487138 1I TATCATAACC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 7 8 40613 CASAVA_Build 1 43493284 1D CCTCTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 2884 het 177 hom 24 3 11 10 T 15 14 40614 CASAVA_Build 1 43501512 1I TTTTATTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 159 hom 14 1 9 4 A 0 1 40615 CASAVA_Build 1 43506904 5I TTAGAAAAGT -----/TTAAA TTATATATGT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TTAAA 0 1 40616 CASAVA_Build 1 43556767 1D GCATTTTATC T/- TTTTTTTTTT 1352 het 1352 ref 31 20 3 8 T 13 12 40617 CASAVA_Build 1 43606962 1D AAACTAAAGA T/- TTTTTTAGGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 6 40618 CASAVA_Build 1 43612537 1D CTTAATAGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 584 hom 37 2 32 3 A 10 9 40619 CASAVA_Build 1 43614525 1D GCTGGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 35 3 14 18 T 15 14 40620 CASAVA_Build 1 43614950 2I TAGAATGGAA --/GT GTATACAGGG 3070 hom 126 het 51 0 42 9 GT 1 2 40621 CASAVA_Build 1 43615829 1D TGGTCAATCG T/- TTTTTTCAAG 3070 hom 148 het 56 0 50 7 T 7 6 40622 CASAVA_Build 1 43651981 4D ACTTGGCATG TTAT/---- TTATTTGTGA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TTAT 2 1 40623 CASAVA_Build 1 43668439 1I CTTGGTTCCC -/T TGAGGCCTGG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 1 2 40624 CASAVA_Build 1 43683750 2D GAACTGCCAT CC/-- CCCCCAATCA 3070 hom 98 het 39 0 32 7 C 7 5 40625 CASAVA_Build 1 43712129 1D ATTTTTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 41 0 24 17 A 15 14 40626 CASAVA_Build 1 43715124 3D TTCTCTCTTT CTG/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2756 hom 26 10 10 7 CTG 1 0 40627 CASAVA_Build 1 43750408 2D ACACGCAGAA AG/-- AGAGAGAAAG 3070 hom 85 het 31 0 29 3 AG 4 3 40628 CASAVA_Build 1 43753944 1D AAATTTCCAA T/- TTTTATTTAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 5 4 40629 CASAVA_Build 1 43756433 1D GTCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1113 het 156 hom 9 1 6 2 T 17 16 40630 CASAVA_Build 1 43770985 1D AAAATCCCTG T/- TTTTTTACTG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 7 6 40631 CASAVA_Build 1 43779954 12D GAGAATAAAG GACAGTTCTTCC/------------ CAAGAAAGGG 3070 het 3070 hom 47 22 26 2 GACAGTTCTTCC 1 0 40632 CASAVA_Build 1 43790374 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 10 9 40633 CASAVA_Build 1 43798433 2I TGCAGCAGGC --/TG TGTGGTGTGT 3070 hom 192 het 72 0 58 14 TG 2 3 40634 CASAVA_Build 1 43810522 2D TCTTCTCTGA GC/-- CCTTGTCAAG 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 GC 1 0 40635 CASAVA_Build 1 43820835 1I ACCTGGCTGC -/G GGGCCACAGC 3070 hom 63 het 24 0 19 5 G 3 4 40636 CASAVA_Build 1 43827682 3I TCTCACCCTC ---/CTT ACCACTACAT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 CTT 0 1 40637 CASAVA_Build 1 43828126 1I AGACCCTATG -/A AAAAAAAAAA 1147 het 1147 ref 25 13 4 8 A 13 14 40638 CASAVA_Build 1 43831452 4D CAAGGCTGTC TGTG/---- TGAGACTCTG 3070 het 3070 hom 51 22 22 11 TG 3 1 40639 CASAVA_Build 1 43834143 1I AGGGGGACTG -/T TTTCATGTGA 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 T 3 4 40640 CASAVA_Build 1 43837992 1I TTGGAATGCT -/G GGGGGGTTAT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 G 6 7 40641 CASAVA_Build 1 43840883 1I CACTGCACGG -/T TGGTCCCTGC 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 T 1 2 40642 CASAVA_Build 1 43853131 1I AATAAAAAAA -/T ACTCTTAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 0 1 40643 CASAVA_Build 1 43871456 2I36M3I CATGTACATG --TATATATGTATGTGTATGTATATATGTGTATTAGAG---/TATATATATGTATGTGTATGTATATATGTGTATTAGAGAAA AAAACTTTCA 3070 het 1542 hom 22 6 7 16 N/A 0 0 40644 CASAVA_Build 1 43878576 1D ATTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 12 11 40645 CASAVA_Build 1 43887249 1D ATTCTGTATA T/- TTTTTTATGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 40646 CASAVA_Build 1 43887440 2I CGCCCCAAGA --/GC GCTGCTCCTA 3070 het 1051 hom 13 3 9 1 GC 1 2 40647 CASAVA_Build 1 43891626 1I AGCAGTAAGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 T 7 8 40648 CASAVA_Build 1 43898550 1D TTTTACTTTC A/- AAAAGGTACT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 5 4 40649 CASAVA_Build 1 43899060 1D ATACATTTAG A/- TTTTTCAGAA 3070 het 3070 hom 43 20 19 5 A 1 0 40650 CASAVA_Build 1 43903256 1D TAATCTTCAG A/- AGAGATTAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 2 1 40651 CASAVA_Build 1 43920167 1D ATTTACATGG T/- TAAGACTGTC 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 2 1 40652 CASAVA_Build 1 43925988 2D GACTATGCCC CT/-- GTTTCACTGA 3070 het 3070 ref 52 26 21 6 CT 1 0 40653 CASAVA_Build 1 43935172 1I TGAACAAGAC -/A AAAAAAGTCC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 6 7 40654 CASAVA_Build 1 43968207 2I AATGTATGAA --/AG AGCCTGTTTT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 AG 1 2 40655 CASAVA_Build 1 43975301 3D GGTTCTAGGC TTG/--- CAGTTGAAGG 3070 het 3070 hom 49 21 21 8 TTG 1 0 40656 CASAVA_Build 1 43975374 1I TTGAAATATC -/A ACACAGTGAC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 1 2 40657 CASAVA_Build 1 43981347 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2324 het 26 hom 17 1 8 8 A 15 14 40658 CASAVA_Build 1 43982102 2D TTCTTTCATT CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 605 hom 32 6 11 15 C 12 10 40659 CASAVA_Build 1 43983707 2I TCTAAATAGA --/CT CTGATAAGTT 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 CT 1 2 40660 CASAVA_Build 1 43987133 1I CAGCAGGCTT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 40661 CASAVA_Build 1 43996264 4D AGCTAAAAAT AAAC/---- AAAGATATGT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 AAAC 1 0 40662 CASAVA_Build 1 43999568 1I TGTAAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 22 14 4 4 T 13 14 40663 CASAVA_Build 1 44004195 1D ACATGGTAAC A/- ATGGAGATAG 3070 hom 69 het 28 0 23 6 A 2 1 40664 CASAVA_Build 1 44006083 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 249 hom 15 1 9 5 A 13 14 40665 CASAVA_Build 1 44012338 4D GAGGCAAAAA AGAC/---- AGAATAGCCA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 AGAC 1 0 40666 CASAVA_Build 1 44020818 2I CTTATTTTCA --/CT CTGTTTCTCC 3070 hom 102 het 41 0 34 7 CT 1 2 40667 CASAVA_Build 1 44021007 1D TGACATGGCC T/- TATGAGGTGG 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 T 2 1 40668 CASAVA_Build 1 44021325 3I GGGCTCAGAT ---/AAG AAATTTTGAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 AAG 0 1 40669 CASAVA_Build 1 44023373 1I GACTAAGACT -/A GGGGGGGTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 0 1 40670 CASAVA_Build 1 44030612 2I TACTTTAAAA --/GT GTGCACAGAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GT 1 2 40671 CASAVA_Build 1 44032700 2D GCAGTGGAAA CT/-- CTGATTTTCT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 CT 2 1 40672 CASAVA_Build 1 44039891 1D ACATTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3033 hom 40 13 20 7 T 15 14 40673 CASAVA_Build 1 44040257 4D GACCCTGTGT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 CAAA 6 5 40674 CASAVA_Build 1 44041632 1D ATCCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 12 10 A 14 13 40675 CASAVA_Build 1 44049142 1D AGGGAGGCCC G/- GATGGCCTCC 3070 hom 26 het 33 0 18 15 G 2 1 40676 CASAVA_Build 1 44049757 1D CCTCACTTCT G/- CAGCTCCTGG 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 G 1 0 40677 CASAVA_Build 1 44050506 1D TCCTGGCTTG A/- AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 A 7 6 40678 CASAVA_Build 1 44051138 2I GTGTGTGCGT --/GC GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 GC 0 1 40679 CASAVA_Build 1 44057748 1D CAGGCCATAT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 7 40680 CASAVA_Build 1 44057912 1I AATGGATTCT -/G GGGGTAAATG 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 G 4 5 40681 CASAVA_Build 1 44075235 1D TGTGGGTTCC T/- TGAGATTGCC 3070 hom 126 het 47 0 42 6 T 2 1 40682 CASAVA_Build 1 44075613 3I AGGCAGAGAG ---/ACC AGGAAACCAT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 ACC 0 1 40683 CASAVA_Build 1 44094078 5I CATTACAGAA -----/CACTT CATAGGCCAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CACTT 0 1 40684 CASAVA_Build 1 44099694 19D TGGTGTGGAG CTGTCAGGACTTGTATAGA/------------------- CTGCATACAA 3070 hom 132 het 43 0 45 3 CTGTCAGGACTTGTATAGA 1 0 40685 CASAVA_Build 1 44102247 1D GATAAGAAAC T/- TGAGTGGGGG 3070 hom 42 het 17 0 14 4 T 2 1 40686 CASAVA_Build 1 44105881 1I CAGCTTGTAA -/G ACAAATCTAC 3070 hom 150 het 57 0 49 8 G 0 1 40687 CASAVA_Build 1 44107890 3D TATTCTTGAC CAA/--- ATGCTCTTGC 3070 hom 157 het 56 0 53 5 CAA 1 0 40688 CASAVA_Build 1 44112737 1D TGTATGAATG T/- TTTTCATAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 5 4 40689 CASAVA_Build 1 44135297 1D AGGTCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 38 0 25 14 T 12 11 40690 CASAVA_Build 1 44164865 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 31 het 29 1 24 4 A 9 10 40691 CASAVA_Build 1 44167571 2I TAATTATTAT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TA 0 1 40692 CASAVA_Build 1 44177580 1D GAGGGAGGGA G/- GGGGAGGGAG 1357 het 32 hom 15 1 5 9 G 5 4 40693 CASAVA_Build 1 44183129 1I ACCCCTAAAA -/C CCCCTTAACT 3070 het 197 hom 37 1 29 7 C 4 5 40694 CASAVA_Build 1 44231703 1D TGTCTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 21 0 14 7 A 12 11 40695 CASAVA_Build 1 44277437 1D CTTTTGACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 T 11 10 40696 CASAVA_Build 1 44284149 9D GCAACACAGA ATCACACAT/--------- ATCACACATA 3070 het 3070 hom 52 22 22 12 ATCACACAT 2 1 40697 CASAVA_Build 1 44304136 1D AGAAGTAATT C/- AATAGAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 C 1 0 40698 CASAVA_Build 1 44310428 1D GGAACCCAGG T/- TTTTTTTTTT 1343 het 1343 ref 26 18 3 5 T 11 10 40699 CASAVA_Build 1 44311467 2D TTCTTCTTCT TC/-- TTTTTTTTTT 267 het 267 ref 27 17 1 9 TC 1 0 40700 CASAVA_Build 1 44329185 2D33M2I ACACACACAC ATGCACACGCACACACACACACACACGCACGCATG--/--GCACACGCACACACACACACACACGCACGCATGCA CACACACACA 3070 het 3070 hom 42 23 20 8 N/A 0 0 40701 CASAVA_Build 1 44329501 1D AAGAGTGGCA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 33 15 18 2 T 8 7 40702 CASAVA_Build 1 44330568 4D GCCATTGCAC TCTA/---- TCTAGCCTGG 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TCTA 2 1 40703 CASAVA_Build 1 44331306 2I AAAGGAGAAT --/TC AAATTCAAGT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 TC 0 1 40704 CASAVA_Build 1 44331506 1D ATAGAGTAAC A/- GGGGGAAAAT 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 A 1 0 40705 CASAVA_Build 1 44332453 1D AGGTTATTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 T 10 9 40706 CASAVA_Build 1 44334071 1I TTTCTTGGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 9 10 40707 CASAVA_Build 1 44335867 1I GAATGAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 9 10 40708 CASAVA_Build 1 44336737 2D TCTTTATTAT TA/-- TTTTTTTTAA 3070 het 2108 hom 15 6 8 1 TA 1 0 40709 CASAVA_Build 1 44350654 13D TTTTCTTTCT TTTTTTTATTTTC/------------- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 32 17 15 4 TTTTTTTATTTTC 1 0 40710 CASAVA_Build 1 44356925 4D AGGCCTGAAG TGGC/---- TGGCTGTCCG 1316 het 565 hom 7 2 5 0 TGGC 2 1 40711 CASAVA_Build 1 44362534 1D TTTTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 11 10 40712 CASAVA_Build 1 44364835 4I GTTCCTGGTG ----/CTTT CTTCCTACCC 3070 het 3070 hom 47 22 24 1 CTTT 0 1 40713 CASAVA_Build 1 44368583 1I GCTAGACTGG -/C CCCCCCGACT 2628 het 2628 ref 23 10 9 4 C 6 7 40714 CASAVA_Build 1 44372777 2D CTGAGCGAGA CT/-- CTATCTCAAA 3070 het 2082 hom 21 5 15 1 CT 2 1 40715 CASAVA_Build 1 44376869 12I AATGCTTCCG ------------/GGGCTTTGTAAA GGCACAAATC 3055 het 3055 ref 32 15 9 8 GGGCTTTGTAAA 0 1 40716 CASAVA_Build 1 44381995 1I GCCAAGATGG -/T GAAACCCTGT 3070 het 371 hom 11 1 10 0 T 0 1 40717 CASAVA_Build 1 44383280 1I ATGTGATGCT -/A ACAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 A 1 2 40718 CASAVA_Build 1 44383663 1I TGACTCACAT -/A AAAAAGTCAT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 A 5 6 40719 CASAVA_Build 1 44392269 1I ATAACCAATG -/T TTTTATAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 4 5 40720 CASAVA_Build 1 44416968 1I CTCTCAGGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 9 10 40721 CASAVA_Build 1 44441007 1D AGTTAATACG T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 7 6 40722 CASAVA_Build 1 44449754 1I CCTGCTGTTT -/A AACCAATTAC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 2 3 40723 CASAVA_Build 1 44455054 3D CAGTGGCTGC AGG/--- AGGAGGCCAG 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 AGG 3 2 40724 CASAVA_Build 1 44468030 1I GGTGCATACA -/C CCTTTGGGCT 3070 hom 87 het 32 0 26 6 C 2 3 40725 CASAVA_Build 1 44503411 4I AAGCGGGAAG ----/GAGA GAGAACAAGT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 GA 2 4 40726 CASAVA_Build 1 44506529 10I CCAACCCATA ----------/GGACTTCACG GGGTGACTGG 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 GGACTTCACG 0 1 40727 CASAVA_Build 1 44526410 4D GAGGACAGAC CAGA/---- CAGTCAGGTT 3070 het 3070 hom 44 17 24 4 CAGA 1 0 40728 CASAVA_Build 1 44554243 1D AGACCCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2243 hom 32 13 15 4 T 16 15 40729 CASAVA_Build 1 44574813 1D GCAAGAAGTT A/- AGATTGATCT 3070 het 3070 ref 55 27 23 7 A 2 1 40730 CASAVA_Build 1 44578294 3D GGTCTCTACT CGA/--- GGCCCTGAAT 3070 het 3070 hom 24 9 11 5 CGA 1 0 40731 CASAVA_Build 1 44586035 1D TGCATGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 118 het 51 0 39 13 A 13 12 40732 CASAVA_Build 1 44602658 1D TGACTCTTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 T 10 9 40733 CASAVA_Build 1 44609191 1D GGTATCCCAG C/- CCCCCATGTC 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 C 6 5 40734 CASAVA_Build 1 44620088 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1376 hom 22 8 9 5 A 14 15 40735 CASAVA_Build 1 44633078 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 19 0 10 9 A 12 11 40736 CASAVA_Build 1 44641294 1I AAAGTGTCCC -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 6 7 40737 CASAVA_Build 1 44654275 3D TTGGGTCAAG CAT/--- CATCTTTCCT 3070 het 3070 ref 54 31 19 4 CAT 2 1 40738 CASAVA_Build 1 44656902 1D GTTTGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 11 10 40739 CASAVA_Build 1 44663655 3D TGGTAAATAC TTG/--- TTGTTAAAGT 3070 het 3070 hom 58 25 29 8 TTG 2 1 40740 CASAVA_Build 1 44672974 1D AGACTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2652 het 1628 hom 21 8 9 4 A 15 14 40741 CASAVA_Build 1 44674686 2I TGTGAGCAAA --/AG AGAGAGAATA 3070 het 2672 hom 35 11 18 6 AG 3 4 40742 CASAVA_Build 1 44697446 1I TTTTGGTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 9 10 40743 CASAVA_Build 1 44700184 9D TTTTTCTTTG TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1528 het 1098 hom 16 7 6 7 T 21 12 40744 CASAVA_Build 1 44705969 1D TAGCATAGCA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 T 7 6 40745 CASAVA_Build 1 44707176 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1179 hom 14 4 10 0 A 10 12 40746 CASAVA_Build 1 44707690 7D GTTCACCTAG AAAGCAC/------- AAATCTCAGA 3070 het 3070 ref 51 27 23 3 AAAGCAC 1 0 40747 CASAVA_Build 1 44708276 1I50M2D CAGAGTCACA -TTTGAAACTATGTCTCTGGCTGCAGAGTAGAGAATGCATTGCAGGGAAACAA/TTTTGAAACTATGTCTCTGGCTGCAGAGTAGAGAATGCATTGCAGGGAAAC-- GAGCAGATGT 3070 het 3070 hom 58 38 39 4 N/A 0 0 40748 CASAVA_Build 1 44724464 4I ATGTTCAGAA ----/AGAG AGAGCATTCG 3070 hom 66 het 26 0 21 5 AG 2 4 40749 CASAVA_Build 1 44738255 19D CAGCTTCTCT CCATCTCTACCACATGACC/------------------- CTGGACCAAG 3070 hom 81 het 28 0 28 5 CCATCTCTACCACATGACC 1 0 40750 CASAVA_Build 1 44751738 1I AGGCCCTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 9 10 40751 CASAVA_Build 1 44762363 1I AAATGTGAAT -/G GGGGGGATGC 1824 het 1824 ref 20 10 7 3 G 6 7 40752 CASAVA_Build 1 44763257 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 A 8 9 40753 CASAVA_Build 1 44768156 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 1097 het 399 hom 5 1 4 0 A 8 9 40754 CASAVA_Build 1 44768314 2D CTCTTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2799 het 864 hom 13 3 7 3 A 13 11 40755 CASAVA_Build 1 44768791 1D TCAAATCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 38 1 29 8 A 16 15 40756 CASAVA_Build 1 44789675 1I TGCCCGGCCA -/T TTTTTTTTGT 2919 het 2779 hom 17 7 7 3 T 8 9 40757 CASAVA_Build 1 44791463 4I CCCACTCTTC ----/ATTA TAATAAGGTT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 ATTA 0 1 40758 CASAVA_Build 1 44794411 5D CTTGTACCTC AGCCT/----- CCCAAGTAGC 3070 hom 105 het 36 0 36 3 AGCCT 1 0 40759 CASAVA_Build 1 44799160 1D CTGCCAGGCC T/- GTACATGCAC 3070 hom 120 het 45 0 40 6 T 1 0 40760 CASAVA_Build 1 44801492 7D CTAGGTCCTC AGGGGCG/------- AGGCTGGGCT 3070 het 3070 ref 33 14 10 11 AGGGGCG 1 0 40761 CASAVA_Build 1 44801552 6D CTGAGCTGAT GCTGAG/------ GCAGGGCCCC 2035 het 2035 ref 27 15 7 9 GCTGAG 1 0 40762 CASAVA_Build 1 44808000 1I GGGCTGCTGA -/G GGGGGAACAA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 G 5 6 40763 CASAVA_Build 1 44813095 3D TGCTGTGGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 66 het 32 0 22 12 TTG 5 4 40764 CASAVA_Build 1 44832349 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 25 1 21 3 A 12 11 40765 CASAVA_Build 1 44834748 6D TTGAACTCGA GAGGCG/------ GAGGTGGCAG 1076 hom 10 het 6 0 4 2 GAGGCG 1 0 40766 CASAVA_Build 1 44851022 1I ATGCTTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 10 11 40767 CASAVA_Build 1 44902712 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1792 het 1792 ref 25 12 6 8 A 17 16 40768 CASAVA_Build 1 44934204 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2457 hom 31 het 24 0 9 15 A 17 16 40769 CASAVA_Build 1 44934221 1D AAAAAAAAAA G/- ACTAGCCCAG 2567 het 35 hom 23 0 10 13 G 1 0 40770 CASAVA_Build 1 44957502 1I AACTAGCTTT -/G TATAGGGCTT 3070 hom 117 het 50 0 38 12 G 0 1 40771 CASAVA_Build 1 44964069 3D CACAAAAACA GGC/--- CGGGCACGGT 3070 het 3070 hom 26 9 17 0 GGC 1 0 40772 CASAVA_Build 1 44964520 1D TGGTTTTTCT C/- CGGTTGTTAC 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 C 2 1 40773 CASAVA_Build 1 44968953 6D AACCACAAAA CAAAAC/------ CAAATTTTCG 3070 het 3070 hom 26 10 14 4 CAAAAC 1 0 40774 CASAVA_Build 1 44969418 1I ATTTGAAGAG -/T AAACCAGAGC 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 T 0 1 40775 CASAVA_Build 1 44969569 2D GTAAAGGAAA AG/-- AGGGGGAAAA 3070 het 3070 ref 52 22 22 11 AG 2 1 40776 CASAVA_Build 1 44977393 1D GGTTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 2695 het 1712 hom 20 6 8 6 A 13 12 40777 CASAVA_Build 1 44989447 4D CTGTATTTTA TTAT/---- TTATTTATTT 3049 het 2325 hom 23 6 7 12 TTAT 6 5 40778 CASAVA_Build 1 44996489 8D CCAAAAACCT ATTAGCTG/-------- ATTAGCTGTC 3070 hom 108 het 42 0 31 12 ATTAGCTG 2 1 40779 CASAVA_Build 1 45001439 3I TAATATGCTT ---/ATA ATAAAGTGTC 3070 het 3070 hom 55 16 31 8 ATA 1 2 40780 CASAVA_Build 1 45002294 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 17 0 10 7 A 11 10 40781 CASAVA_Build 1 45002574 1I ACCTGGGATT -/A ACAGGTGCGT 3070 het 2933 hom 17 7 7 3 A 1 2 40782 CASAVA_Build 1 45003725 4D AATAATAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2202 het 1691 hom 13 4 6 4 AAAG 4 3 40783 CASAVA_Build 1 45009234 1D AATAATCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2069 hom 24 6 14 4 T 11 10 40784 CASAVA_Build 1 45009859 1D GTTAATTTTG T/- TATTTTTAGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 2 1 40785 CASAVA_Build 1 45016639 1I TGCCCAGGCT -/G GAGGGGGCTG 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 G 1 2 40786 CASAVA_Build 1 45018238 3I GCCCAGATAA ---/TGT TGTATTTGTA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 TGT 1 2 40787 CASAVA_Build 1 45021652 2I CTTGGCACAC --/TG AAGTCCAAAT 3070 hom 63 het 27 0 20 7 TG 0 1 40788 CASAVA_Build 1 45048198 3D GCATAGTCAT CTC/--- CTCTGAGACC 3070 het 3070 hom 47 20 22 8 CTC 2 1 40789 CASAVA_Build 1 45053833 4D AGTAAATGAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 TTTA 4 3 40790 CASAVA_Build 1 45053876 1D CACCCAGGCT G/- GAGTGCAGTG 3070 het 1825 hom 30 5 14 11 G 2 1 40791 CASAVA_Build 1 45053991 4I TCACATTCGG ----/CTAA CTAACTTTTT 3070 het 2964 hom 34 11 16 7 CTAA 1 2 40792 CASAVA_Build 1 45056389 6I GAAAAAAAAA ------/AAAAAG AAAAAGAATT 3070 het 2820 hom 39 14 15 10 AAAAAG 1 2 40793 CASAVA_Build 1 45062760 1D TACCATCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 38 1 16 21 T 15 14 40794 CASAVA_Build 1 45068499 2I GGCCTGGAAG --/TA GGCTTCTGGG 3070 hom 96 het 37 0 31 6 TA 0 1 40795 CASAVA_Build 1 45080534 12D TTTTCTCTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 6 T 23 11 40796 CASAVA_Build 1 45091039 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 23 2 12 9 A 17 16 40797 CASAVA_Build 1 45092254 1D GCAGTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2355 hom 42 13 21 8 T 12 11 40798 CASAVA_Build 1 45092849 1I GCATTATGTC -/T TTTTTTTTTT 2569 het 572 hom 29 2 14 13 T 15 16 40799 CASAVA_Build 1 45125179 4I TTAATTCAGC ----/TTGT TTTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 TTGT 0 1 40800 CASAVA_Build 1 45128696 4D AATAAGCACT TAAA/---- TAAAATATTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 4 TAAA 2 1 40801 CASAVA_Build 1 45129337 1I GGTAGATGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 A 8 9 40802 CASAVA_Build 1 45131903 2I ACAGTAGGTG --/CT GTTAAATTTT 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 CT 0 1 40803 CASAVA_Build 1 45153559 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2997 het 1626 hom 15 6 8 1 A 12 11 40804 CASAVA_Build 1 45158298 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2852 hom 30 12 11 7 T 14 13 40805 CASAVA_Build 1 45161914 2I TTCTTCTCTC --/TT CATTTCTTTC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 0 2 40806 CASAVA_Build 1 45174685 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1893 het 7 hom 11 1 7 3 A 16 15 40807 CASAVA_Build 1 45176240 1I TCCTGCCCTC -/T TTAGTATCAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 3 40808 CASAVA_Build 1 45176627 2I GAAAACTTGA --/GC CAGGAGTGAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 GC 0 1 40809 CASAVA_Build 1 45183514 1D CTCTGAGACT A/- AAAAAAAAAA 2606 het 1236 hom 18 5 8 5 A 13 12 40810 CASAVA_Build 1 45183851 1D TCTCTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 27 1 20 6 A 11 10 40811 CASAVA_Build 1 45189189 3D CTCAAGTGAT CCA/--- CCCACCTTGG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 CCA 1 0 40812 CASAVA_Build 1 45189733 1I CACAGCTTAT -/G GTGGTCCATC 3070 hom 138 het 49 0 46 3 G 1 2 40813 CASAVA_Build 1 45191411 1I CCATAAGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1843 hom 41 6 22 13 A 16 17 40814 CASAVA_Build 1 45194748 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 A 9 10 40815 CASAVA_Build 1 45221956 2D CTTGGTGAAA CT/-- CTGTCTCTAC 3070 het 1972 hom 18 5 13 1 CT 2 1 40816 CASAVA_Build 1 45223666 1I TAGCCTTTAC -/A GGGTTTCATT 3070 hom 155 het 64 0 52 12 A 0 1 40817 CASAVA_Build 1 45225265 3D CTATTTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 46 het 30 0 18 12 TTG 7 6 40818 CASAVA_Build 1 45225925 1D TGAGACCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 12 11 40819 CASAVA_Build 1 45232284 1I CCTTTGAAGA -/T TAAGTGCTAT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 T 1 2 40820 CASAVA_Build 1 45233941 3D AAAAGAAAGA TCT/--- TCTGTCATTC 3070 het 3070 ref 53 25 25 4 TCT 2 1 40821 CASAVA_Build 1 45236869 3I ATATATAAAC ---/CTA CTATATACCC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CTA 1 2 40822 CASAVA_Build 1 45237519 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 13 12 40823 CASAVA_Build 1 45239378 1I GAGGTGCACC -/T CTGACTTGGG 3070 het 3070 ref 48 22 14 12 T 0 1 40824 CASAVA_Build 1 45239465 1D GGGGTTCACC A/- CCCAAGGTGC 3070 het 3070 ref 34 12 17 5 A 1 0 40825 CASAVA_Build 1 45239814 3D CTCCCTGATA CTC/--- CTTTTTTTTT 1412 het 1412 ref 20 6 6 9 CTC 1 0 40826 CASAVA_Build 1 45246160 1D GCCCACATCC T/- TCCACCCTCA 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 T 2 1 40827 CASAVA_Build 1 45261764 1I TCCATGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 235 hom 33 2 26 5 T 12 13 40828 CASAVA_Build 1 45265271 1I AGAGTTGTTC -/A AAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 3 4 40829 CASAVA_Build 1 45271860 1D CAGGGCACTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 9 8 40830 CASAVA_Build 1 45277071 1D CCCAGGCTGG T/- CTTGAACTCT 3070 het 1584 hom 19 5 10 4 T 1 0 40831 CASAVA_Build 1 45283320 5D CTCACTGGAG TCTTA/----- TCTTACCATG 3070 hom 84 het 30 0 28 3 TCTTA 2 1 40832 CASAVA_Build 1 45291017 1D GGGTGATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 13 5 A 12 11 40833 CASAVA_Build 1 45291387 1D CGTCTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 21 2 15 4 A 17 16 40834 CASAVA_Build 1 45292923 7D TTTACGTAAT TATTAAA/------- TATTAAATAT 3070 het 1773 hom 17 4 12 2 TATTAAA 2 1 40835 CASAVA_Build 1 45294870 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 693 hom 22 2 15 5 A 13 14 40836 CASAVA_Build 1 45348004 1I ACTTCGTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 860 hom 28 3 18 7 A 13 14 40837 CASAVA_Build 1 45373383 1D GGTAATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1291 hom 37 4 19 14 T 15 14 40838 CASAVA_Build 1 45394716 1D GAAATTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 12 11 40839 CASAVA_Build 1 45394981 1D GTGGGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1751 het 1751 ref 34 14 7 14 A 17 16 40840 CASAVA_Build 1 45488886 4D GTTGAATAAA GGAG/---- GGAGGGAGGG 3070 het 1668 hom 30 8 14 8 GGAG 5 4 40841 CASAVA_Build 1 45510089 6I AAAAAAAAAA ------/TTAATC TTTAAGGCAA 3070 het 3018 hom 24 11 10 3 TTAATC 0 1 40842 CASAVA_Build 1 45511273 1D AGTTCTGGGG A/- AATTTGTTAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 3 2 40843 CASAVA_Build 1 45517525 1D AAGACATCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 A 10 9 40844 CASAVA_Build 1 45519522 1D ACACAGTGTC A/- AAAAAAAAAA 2652 het 1510 hom 23 7 7 9 A 18 17 40845 CASAVA_Build 1 45522029 1I AATTTAGTTA -/T TTGTTTTCTC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 2 3 40846 CASAVA_Build 1 45563272 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 16 0 13 3 T 15 14 40847 CASAVA_Build 1 45563566 4D38M1D AAACTTTTTA AAATAAATAAATATTAGAATATGTGGGAAAATAAAATTAATTA/----AAATAAATATTAGAATATGTGGGAAAATAAAATTAATT- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 24 0 28 10 N/A 0 0 40848 CASAVA_Build 1 45567014 1I AGCGACCACT -/G CAGGTGGGGA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 G 0 1 40849 CASAVA_Build 1 45579946 1D GACTTGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 8 6 T 13 12 40850 CASAVA_Build 1 45587926 1D CCATTCTTCA T/- TTCCTCACAC 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 T 3 2 40851 CASAVA_Build 1 45590097 2D AGGAAGACTT TA/-- TACTCTCATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TA 2 1 40852 CASAVA_Build 1 45598860 1I CTTGGCTAAT -/A AGATTCTGGC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 1 2 40853 CASAVA_Build 1 45632901 1D ATGACTGTTT A/- TCACTGCTCT 3070 het 3070 hom 31 9 9 15 A 1 0 40854 CASAVA_Build 1 45644133 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 2367 het 2367 ref 19 9 6 4 A 9 10 40855 CASAVA_Build 1 45645507 1D CCACAATGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 67 het 28 0 23 6 T 9 8 40856 CASAVA_Build 1 45658665 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 9 8 40857 CASAVA_Build 1 45681385 1I AAAGAGGAGA -/T TTTTCTGTAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 4 5 40858 CASAVA_Build 1 45681693 1I AGCCGAACAT -/G GTGGTGCATG 3070 het 3070 hom 29 10 9 10 G 1 2 40859 CASAVA_Build 1 45683248 1D TTTGTAACTT C/- CCCAATTGCT 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 C 4 3 40860 CASAVA_Build 1 45685838 1I TGCAGTTAAC -/T TTTTTTTTTT 2061 het 2061 ref 30 17 6 7 T 10 11 40861 CASAVA_Build 1 45695565 2D ACATACACAC AT/-- GTGTGGCTGG 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 AT 1 0 40862 CASAVA_Build 1 45705896 2D GCCTTCACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1102 hom 25 5 14 6 T 14 12 40863 CASAVA_Build 1 45712057 1D CAATTAGGGA T/- TTTTTTTTTT 2584 het 2501 hom 35 13 8 14 T 17 16 40864 CASAVA_Build 1 45715936 7I CCAGAAGGAA -------/GCAAACT GCAACCTGTA 3070 hom 100 het 37 0 33 4 GCAAACT 0 1 40865 CASAVA_Build 1 45721007 1D GGGAGGCCAA G/- GGGGGTGGAT 2184 het 902 hom 13 2 7 4 G 6 5 40866 CASAVA_Build 1 45724157 1I AATGTATCTT -/A AAAAAAAAAA 2705 het 2705 ref 25 11 7 7 A 11 12 40867 CASAVA_Build 1 45746023 1I CAGTGTGAAA -/T TAGTCTCACT 3070 hom 135 het 49 0 44 5 T 1 2 40868 CASAVA_Build 1 45748327 2D CAGTGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 51 het 31 0 20 12 CT 2 1 40869 CASAVA_Build 1 45748851 1I GTGCAACTAC -/T GAAAGCCCTA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 0 1 40870 CASAVA_Build 1 45755281 1D ATTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 2056 het 2056 ref 31 14 7 10 A 17 16 40871 CASAVA_Build 1 45757440 3D ATACATTAAA TGT/--- TGTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 TGT 2 1 40872 CASAVA_Build 1 45758465 8D CTCTGTCTCC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 2521 het 1632 hom 20 7 9 4 A 20 12 40873 CASAVA_Build 1 45758565 9D TTCCCTTCAC CATTTGTGA/--------- AGGTGGGTTC 3070 hom 27 het 10 0 10 1 CATTTGTGA 1 0 40874 CASAVA_Build 1 45765951 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1589 hom 30 5 17 8 A 14 15 40875 CASAVA_Build 1 45778773 1I TTCACTGGAG -/A ATGTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 1 2 40876 CASAVA_Build 1 45781126 10D CCGTAGGACT TTGAACTTCG/---------- TTGAACTTCG 3070 het 3070 ref 32 17 12 6 TTGAACTTCG 2 1 40877 CASAVA_Build 1 45783964 2I GCCAACCCTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 CA 5 6 40878 CASAVA_Build 1 45788123 6I GTGCTGGTAA ------/TATCTG TATCTTCCTC 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 TATCTG 0 1 40879 CASAVA_Build 1 45791680 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2169 het 1548 hom 12 5 5 2 A 10 11 40880 CASAVA_Build 1 45799661 11I CCCTCTTCCC -----------/CACCCCTTCCT GGCCCATGCT 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 CACCCCTTCCT 0 1 40881 CASAVA_Build 1 45803900 1I GCACAGCTAA -/T TTTTTGTATT 2380 het 1649 hom 16 4 7 5 T 5 6 40882 CASAVA_Build 1 45811790 1D ACAGGGGGTG C/- TGTTTTGGGA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 C 1 0 40883 CASAVA_Build 1 45817697 1I AGTCCAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 14 15 40884 CASAVA_Build 1 45822592 4D CTGTCGCTGT TCGG/---- GAAGGCCTGG 2953 het 1236 hom 18 6 9 4 TCGG 1 0 40885 CASAVA_Build 1 45828598 1I GGTCAGGAGA -/T CGAGACCATC 3070 hom 54 het 21 0 15 6 T 0 1 40886 CASAVA_Build 1 45832115 1D CCATCTGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2432 hom 27 9 13 6 A 12 11 40887 CASAVA_Build 1 45832423 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAGATA 2793 het 754 hom 11 3 7 1 A 6 7 40888 CASAVA_Build 1 45847759 4I ATTCCTCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 AAAC 3 4 40889 CASAVA_Build 1 45852168 1D TGAGCCAACA T/- TTCACTGTTA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 3 2 40890 CASAVA_Build 1 45852808 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTGAG 3070 het 2634 hom 33 7 19 7 T 8 7 40891 CASAVA_Build 1 45857202 3I CTTAGGCTGC ---/TTT TTTTTTGAGA 3070 het 2892 hom 22 8 12 2 T 6 9 40892 CASAVA_Build 1 45857829 2I AGTAACTCAT --/AC GGTTGCAGGA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 AC 0 1 40893 CASAVA_Build 1 45865550 1D CAGTTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 17 9 1 A 12 11 40894 CASAVA_Build 1 45865640 2D AAATAGAGAA AC/-- AGTTGTGTCT 3070 het 3070 hom 21 7 13 1 AC 1 0 40895 CASAVA_Build 1 45865997 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 AAAC 0 1 40896 CASAVA_Build 1 45868990 1D39M1D AGCCCACAGA TTTTTTTCCCCATTTACAAATGAGGACCTGCTGCATCAACA/-TTTTTTCCCCATTTACAAATGAGGACCTGCTGCATCAAC- AAACTGATTC 3070 het 2999 hom 48 11 23 25 N/A 0 0 40897 CASAVA_Build 1 45869349 1D CAGCCACACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 A 13 12 40898 CASAVA_Build 1 45875239 2D TCCCAGGATT AA/-- AAGAGTAAAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 A 4 2 40899 CASAVA_Build 1 45877466 1D TATTCAATTG T/- TTTTGGAATG 3070 hom 140 het 53 0 46 7 T 5 4 40900 CASAVA_Build 1 45882817 1D GATCACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 12 11 40901 CASAVA_Build 1 45887714 3D AATCTGGAGC TTT/--- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 T 12 9 40902 CASAVA_Build 1 45895104 1D TTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 T 10 9 40903 CASAVA_Build 1 45907107 6I TGGTGGGCGC ------/CTACAG CTACTTGGGA 1367 het 1367 ref 40 32 3 5 CTACAG 0 1 40904 CASAVA_Build 1 45907884 1D TGACCCCCCC T/- CCAACCCCCT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 1 0 40905 CASAVA_Build 1 45908152 3D CAAAACTGAA CTC/--- CTTTTTAGTA 3070 het 3070 hom 49 22 24 4 CTC 1 0 40906 CASAVA_Build 1 45908809 7D TTGACTTCTT AGTTTTA/------- AGTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 40 22 17 3 AGTTTTA 1 0 40907 CASAVA_Build 1 45910798 2D TTTTATACAC AT/-- GTTAACTTTT 3070 het 3070 ref 33 20 12 2 AT 1 0 40908 CASAVA_Build 1 45912333 1D TGAAATTGTC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 28 8 19 1 A 8 7 40909 CASAVA_Build 1 45915870 1D CTAGGAAAAG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 A 7 6 40910 CASAVA_Build 1 45917455 1I TGTCTGACAA -/G GTTTAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 G 1 2 40911 CASAVA_Build 1 45919077 1I TGTTCCCTGC -/A AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 5 6 40912 CASAVA_Build 1 45921317 1D TTCCCATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 13 12 40913 CASAVA_Build 1 45932401 4D AGTTTTAAAA ATAT/---- ATATATATAA 3070 het 3070 ref 18 8 8 3 AT 6 4 40914 CASAVA_Build 1 45936977 10D TTTTTTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTG 3047 het 1007 hom 19 4 8 7 T 19 9 40915 CASAVA_Build 1 45938463 1I GTTAAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 10 11 40916 CASAVA_Build 1 45938661 1D AATGCACAGC A/- ACGATCTCGG 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 A 2 1 40917 CASAVA_Build 1 45953067 1I TTTTTTCCCT -/A AAAAATGTCA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 5 6 40918 CASAVA_Build 1 45955772 1D TCTCCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2903 hom 32 10 14 8 T 11 10 40919 CASAVA_Build 1 45956826 1D CCCAGGAGCA C/- CCCCTCCAAT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 C 5 4 40920 CASAVA_Build 1 45960820 6I TAAAAAAATG ------/AAATAA AAATAAAAAT 2643 het 2643 ref 19 7 6 6 AAATAA 2 3 40921 CASAVA_Build 1 45967799 3D GTATAGTAAT AAC/--- AACAAAATAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 AAC 2 1 40922 CASAVA_Build 1 45968976 1I AAGGCATTAT -/A AATGCTAGCA 3070 het 3070 ref 55 29 24 2 A 2 3 40923 CASAVA_Build 1 45976571 1D TTTAGTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 11 10 40924 CASAVA_Build 1 45982108 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1811 hom 15 6 9 0 A 11 12 40925 CASAVA_Build 1 45989335 2I GTTTTCTGAG --/TC TGCATGACTG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TC 0 1 40926 CASAVA_Build 1 45991509 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2219 hom 32 8 15 10 A 13 12 40927 CASAVA_Build 1 45994666 1I GGTTAGGTGA -/T TTTTTTAGAG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 6 7 40928 CASAVA_Build 1 45995081 3I TCCGCCACTT ---/GCC TATCGAGGGT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 GCC 0 1 40929 CASAVA_Build 1 45997647 3I GACCCCCCTA ---/TTC TTCTTCAAAC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 TTC 2 3 40930 CASAVA_Build 1 45999543 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 10 9 40931 CASAVA_Build 1 46005019 16I CTCAGCCTCC ----------------/CAAGCAGTTGGGACTA CAAGCACATG 2048 het 2048 ref 29 20 7 2 CAAGCAGTTGGGACTA 0 1 40932 CASAVA_Build 1 46009086 1D GAAAGCAGAT G/- GGAAAAATCC 3070 het 3070 hom 50 21 26 4 G 3 2 40933 CASAVA_Build 1 46011608 1I TACTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 2299 het 1922 hom 31 8 11 12 A 15 16 40934 CASAVA_Build 1 46017158 1I TGTGAATGTA -/T TTTGGTTTGA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 3 4 40935 CASAVA_Build 1 46024243 7D TCTTTCTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 276 hom 24 3 11 10 T 18 11 40936 CASAVA_Build 1 46028355 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1103 het 1103 ref 20 11 3 6 T 17 16 40937 CASAVA_Build 1 46028896 2D CACAATGGAG TA/-- TATATATATA 1405 het 1405 ref 21 14 3 4 TA 11 10 40938 CASAVA_Build 1 46029894 1I TTTTTGCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2383 hom 20 7 9 4 T 9 10 40939 CASAVA_Build 1 46060658 1D TTGCAGTAAG A/- AGGGGTGTGA 3070 het 3070 ref 49 27 20 2 A 2 1 40940 CASAVA_Build 1 46061597 2D AGTTATTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3022 het 1329 hom 29 10 11 8 T 16 14 40941 CASAVA_Build 1 46071318 2I TGGCCTTTTG --/AA TGGCGGCTGC 2749 het 2749 ref 32 19 8 5 A 0 2 40942 CASAVA_Build 1 46077072 1D ATCAGGACTG T/- TTGCAATAGT 3070 het 3070 hom 49 17 23 10 T 3 2 40943 CASAVA_Build 1 46084380 1D TCATCACTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 10 9 40944 CASAVA_Build 1 46091077 4I TCCATTGTAT ----/GGTC GGTCACACAT 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 GGTC 1 2 40945 CASAVA_Build 1 46093593 1I GAGAAATGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 9 10 40946 CASAVA_Build 1 46109340 1D GGTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2463 het 2463 ref 32 13 10 9 A 17 16 40947 CASAVA_Build 1 46117190 1I CCCAGCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1117 hom 31 6 17 8 T 12 13 40948 CASAVA_Build 1 46122314 6D GTTGCTGGGA AGAAGG/------ AGAAGGAGGA 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 AGAAGG 2 1 40949 CASAVA_Build 1 46132478 1I GTCTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 1142 het 1142 ref 25 15 3 7 A 15 16 40950 CASAVA_Build 1 46144035 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1241 het 1241 ref 17 11 3 3 A 13 12 40951 CASAVA_Build 1 46145152 2D CATTTCTATC TT/-- TTACATGTAT 3070 het 3014 hom 30 9 17 5 T 4 2 40952 CASAVA_Build 1 46164700 1D CCATATGTCC A/- TACTGCAGAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 A 1 0 40953 CASAVA_Build 1 46166827 1I TCACTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2520 het 1456 hom 21 6 9 10 T 13 14 40954 CASAVA_Build 1 46172165 1I AAATTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 13 14 40955 CASAVA_Build 1 46175302 1D ATGCCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 17 0 11 6 T 14 13 40956 CASAVA_Build 1 46175494 1D CATGGGCAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2319 hom 24 8 11 6 T 10 9 40957 CASAVA_Build 1 46177793 1D AATTTTTCAA T/- TTTTTTTTGG 2988 het 2294 hom 22 6 8 8 T 9 8 40958 CASAVA_Build 1 46191870 1I GAGTGAGGGA -/T TTTTGCCATT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 4 5 40959 CASAVA_Build 1 46206695 1D TGAAGTATAA T/- TTCACAGGGT 3070 het 3070 ref 34 13 13 9 T 3 2 40960 CASAVA_Build 1 46206742 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 T 12 11 40961 CASAVA_Build 1 46214224 1D TTTTTAATCT A/- AAAACTGAAT 1274 het 1274 ref 22 10 4 8 A 5 4 40962 CASAVA_Build 1 46219637 1I GGCTGAGGCT -/A AGGGTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 1 2 40963 CASAVA_Build 1 46223521 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 591 het 591 ref 36 28 2 6 T 12 11 40964 CASAVA_Build 1 46228011 1I CCCTCATCAT -/C TTCCCGCTGG 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 C 0 1 40965 CASAVA_Build 1 46233710 2D AAGGAGCCAT GA/-- GACCAAAGAA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 GA 2 1 40966 CASAVA_Build 1 46257431 2D CTTTAGTGTA CT/-- CTCTACACTG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 CT 3 2 40967 CASAVA_Build 1 46260839 9I CCAGCCCCAT ---------/CCAGTGAAG CCAGTGAAGC 3070 het 3070 ref 55 26 21 8 CCAGTGAAG 1 2 40968 CASAVA_Build 1 46263578 1I ACTTTGCCTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 A 7 8 40969 CASAVA_Build 1 46278177 1I TCTAAGACTT -/C CTGTGTCTGT 3070 hom 55 het 28 0 19 9 C 1 2 40970 CASAVA_Build 1 46278373 1I CCCCAGCCCA -/C CCCCTTCATA 3070 hom 29 het 14 0 10 4 C 4 5 40971 CASAVA_Build 1 46281373 1I CAGTTGAAGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 T 8 9 40972 CASAVA_Build 1 46287424 1I ATCTCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2438 het 2438 ref 33 17 8 8 A 15 16 40973 CASAVA_Build 1 46293414 1D TCACCCAGGC A/- TGGAGTGCAG 1433 hom 12 het 5 0 4 1 A 1 0 40974 CASAVA_Build 1 46294312 1D CCTAATATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 11 10 40975 CASAVA_Build 1 46296139 1D GAAATTCAAG C/- CGGCTGCAGA 3070 het 3070 hom 23 9 10 6 C 2 1 40976 CASAVA_Build 1 46300836 6I TTTGTCTCAA ------/AAAAAC AAAAACAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAAAAC 1 2 40977 CASAVA_Build 1 46313881 1I AACCTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 2534 het 2534 ref 31 13 9 9 A 14 15 40978 CASAVA_Build 1 46317364 1D TCGTAAGGGT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 97 het 38 0 33 5 A 9 8 40979 CASAVA_Build 1 46318148 1D AAGAGGCGGA G/- GTTGCAGTAA 1304 het 1144 hom 10 3 5 3 G 2 1 40980 CASAVA_Build 1 46320257 4D TCATGCAGAT ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 het 2657 hom 29 9 11 10 ATAA 6 5 40981 CASAVA_Build 1 46326575 1D AATAAAAAAA C/- AACAGACATT 2725 het 2725 ref 34 19 9 7 C 1 0 40982 CASAVA_Build 1 46329743 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 853 hom 35 3 26 6 AC 8 9 40983 CASAVA_Build 1 46331078 1D CTGGTCTTCA T/- TTCTCTCTCT 1796 hom 9 het 38 0 7 31 T 3 2 40984 CASAVA_Build 1 46333626 4D ATCCTCAGCA AACT/---- AACTTTGAGA 3070 het 3070 ref 42 21 17 6 AACT 2 1 40985 CASAVA_Build 1 46337127 1I GCTTAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 9 10 40986 CASAVA_Build 1 46348371 1D CCTCATCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2361 hom 32 10 14 8 T 12 11 40987 CASAVA_Build 1 46349996 1D AAAAAAGGGT G/- GGGGGGCATG 3070 het 2509 hom 26 8 12 6 G 7 6 40988 CASAVA_Build 1 46356583 1D CCACCATCAT C/- CCCTCAGCTT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 4 3 40989 CASAVA_Build 1 46368824 1I TGACTAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 57 20 31 6 A 10 11 40990 CASAVA_Build 1 46369346 4D CACAGGAAAC AGAA/---- AGGTTCCCTC 3070 het 3070 ref 24 12 12 3 AGAA 1 0 40991 CASAVA_Build 1 46376750 2D GAGATCCCTG TC/-- TCTACAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 TC 2 1 40992 CASAVA_Build 1 46381701 8I TAGGTTTGAG --------/TGTTTTCT TGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 TGTTTTCT 0 1 40993 CASAVA_Build 1 46383631 1D ATAACTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 5 A 14 13 40994 CASAVA_Build 1 46393713 1D CTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1223 het 1223 ref 32 22 4 6 T 11 10 40995 CASAVA_Build 1 46413190 1I CCCATCCCCC -/A TCCTGACCTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 0 1 40996 CASAVA_Build 1 46422075 1D AGAGGACAGA G/- GTGTTCTAGG 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 G 2 1 40997 CASAVA_Build 1 46445344 1D AGTCCTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1807 het 1807 ref 46 28 4 16 T 13 12 40998 CASAVA_Build 1 46452611 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1987 hom 21 7 9 5 A 11 12 40999 CASAVA_Build 1 46455660 3D AAGGATAAAA TGT/--- TGTAAGAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 TGT 2 1 41000 CASAVA_Build 1 46503434 1I CCTCTAATAA -/T TTTTTTTTTT 2774 het 2774 ref 24 14 7 3 T 10 11 41001 CASAVA_Build 1 46542647 2D CACTAATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 20 2 9 9 T 16 14 41002 CASAVA_Build 1 46544011 4D CTCCGTCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AAAT 5 4 41003 CASAVA_Build 1 46553099 1I GAATGGTAGT -/A AACCAGGAGC 3070 het 3070 ref 47 21 15 11 A 2 3 41004 CASAVA_Build 1 46574088 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 12 6 A 10 9 41005 CASAVA_Build 1 46576685 1I ACACCTAATC -/A ACAGCACTTT 3070 het 3070 ref 23 8 9 6 A 1 2 41006 CASAVA_Build 1 46590711 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 938 het 938 ref 30 19 3 8 A 10 11 41007 CASAVA_Build 1 46593103 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTAGTA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 T 7 6 41008 CASAVA_Build 1 46601245 1I ATTTTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 873 het 873 ref 29 17 4 8 T 13 14 41009 CASAVA_Build 1 46608564 2D TGAGCCAGAC TG/-- TAGGTTAGCA 3070 het 3070 hom 46 19 20 8 TG 1 0 41010 CASAVA_Build 1 46616461 1D ATAGCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1767 het 323 hom 16 2 5 9 T 17 16 41011 CASAVA_Build 1 46637256 1D TCCCACCCTG C/- CCCCTGAATA 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 C 5 4 41012 CASAVA_Build 1 46652604 2I TGGCCAGCAC --/AG GGCAGCAGGG 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 AG 0 1 41013 CASAVA_Build 1 46664582 1I CACATTGGAA -/T TTTTTTTTTT 2860 het 1823 hom 25 7 11 7 T 13 14 41014 CASAVA_Build 1 46671147 1I TGTGTGTGAG -/T GGGGGTGGAA 3070 hom 117 het 48 0 38 10 T 0 1 41015 CASAVA_Build 1 46673308 2I GAGATCAGAC --/TT TATGCTGTGG 3070 hom 125 het 47 0 41 6 T 1 3 41016 CASAVA_Build 1 46677332 5I AAAAGAATGG -----/AAAAA AAAAAAAAAT 3070 het 1207 hom 22 5 10 7 A 9 14 41017 CASAVA_Build 1 46677496 1I CAAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1317 hom 16 7 8 1 A 9 10 41018 CASAVA_Build 1 46682988 1D GGTTTGAATT C/- CTACAAGGAC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 C 2 1 41019 CASAVA_Build 1 46687878 1D GAATGAAGGA G/- TAAGCTGAGC 3070 het 3070 ref 49 25 17 8 G 1 0 41020 CASAVA_Build 1 46697194 1D TGGGTGGTGC T/- CTCAGCCTTC 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 1 0 41021 CASAVA_Build 1 46709709 1D CCTTTCTCCA T/- TTTTTTTTTT 1398 het 1398 ref 29 21 3 5 T 12 11 41022 CASAVA_Build 1 46720140 7I AGATAGCTCC -------/ACGGTTT TCCTGGGATT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 ACGGTTT 0 1 41023 CASAVA_Build 1 46740619 2I TGAGTTATCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 14 12 T 10 12 41024 CASAVA_Build 1 46744317 6I TCATTTCTTT ------/TTTTTA TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 TTTTTA 2 3 41025 CASAVA_Build 1 46755179 1I ACATATAGGC -/A AATAAGTGCA 3070 het 3070 ref 53 34 17 2 A 2 3 41026 CASAVA_Build 1 46760074 1I TTTTTTTTTT -/A AAATTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 3 4 41027 CASAVA_Build 1 46773667 10D ATGTTGACCC TTGAGGGCAT/---------- CTACAGACCA 3070 het 3070 ref 40 23 13 8 TTGAGGGCAT 1 0 41028 CASAVA_Build 1 46780899 2I ACACCACAGA --/CT CTGCTTTCAC 3070 hom 123 het 45 0 39 6 CT 1 2 41029 CASAVA_Build 1 46781863 1D AGCAGAGGAA C/- CCCCGAGCCA 2843 het 2843 ref 31 11 13 8 C 5 4 41030 CASAVA_Build 1 46787409 5I TCAAAAAAAA -----/AAAAG AAAAGAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 21 1 AAAAG 1 2 41031 CASAVA_Build 1 46791279 1D GTCACCTGAG T/- TGGAGCTTCG 3070 hom 75 het 41 0 31 11 T 2 1 41032 CASAVA_Build 1 46795156 12D GGACAATGGG CACTTTAGTGCC/------------ CACTTTAGTC 3070 hom 88 het 34 0 26 9 CACTTTAGTGCC 1 0 41033 CASAVA_Build 1 46819053 1D CACCTGAGGA C/- CCAGTTTCTC 3070 het 3070 ref 52 31 13 8 C 3 2 41034 CASAVA_Build 1 46824924 4D TGCACATCCT GAAA/---- GAAACATGGG 3070 het 3070 hom 38 14 23 3 GAAA 2 1 41035 CASAVA_Build 1 46838219 3D ATTCGGCTTA CTT/--- CTTCTCCTCA 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 CTT 2 1 41036 CASAVA_Build 1 46840927 6I AAGCTCATCA ------/GCTATT GCTATTGTTA 3070 het 2843 hom 20 6 12 3 GCTATT 1 2 41037 CASAVA_Build 1 46843398 14D ATCCTGCGGT CCAACCTGAGGGCC/-------------- CCGATGTATC 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 CCAACCTGAGGGCC 1 0 41038 CASAVA_Build 1 46844600 4I TTTAGAATGC ----/TGGG TGGGATTGGG 3070 het 3070 hom 61 24 29 8 TGGG 1 2 41039 CASAVA_Build 1 46847362 16D CTACAGTGGT CATGGTCTGATGGTCC/---------------- CATGGTCTGA 3070 het 3070 ref 57 26 24 9 CATGGTCTGATGGTCC 2 1 41040 CASAVA_Build 1 46847494 2D CAGTGAAAAT CA/-- CACACACACA 868 het 868 ref 69 53 3 13 CA 9 8 41041 CASAVA_Build 1 46850931 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 324 het 324 ref 25 14 3 11 AAG 1 0 41042 CASAVA_Build 1 46871678 1I TTTTAGATGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 8 9 41043 CASAVA_Build 1 46879630 1I GAGCCACTGT -/G CCCAGCCTCA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 G 0 1 41044 CASAVA_Build 1 46882571 1I TAGACAATGT -/G AACTAACATC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 G 0 1 41045 CASAVA_Build 1 46882825 1I TTCGTGCTTG -/T TTTTTTGCCA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 6 7 41046 CASAVA_Build 1 46883002 4I ACAAAATAAC ----/ATTT ATTAAACAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATTT 0 1 41047 CASAVA_Build 1 46883354 1I TGAGCCTCAG -/C CAAGGGTTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 2 41048 CASAVA_Build 1 46885763 2D ATACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 62 28 20 15 AC 10 9 41049 CASAVA_Build 1 46888716 1D ATGGAAAACA T/- TATGAAGTTT 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 T 2 1 41050 CASAVA_Build 1 46896792 1I TCAAGGACAC -/A AAAGTTCATA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 3 4 41051 CASAVA_Build 1 46897795 1D GAGTGTTCAA T/- CTTAATGTTT 3070 het 3070 hom 57 18 29 10 T 1 0 41052 CASAVA_Build 1 46901887 1D TTTGATGGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2167 hom 19 6 9 4 T 10 9 41053 CASAVA_Build 1 46912999 1I TGTAGAGTTA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 100 het 43 0 32 11 T 7 8 41054 CASAVA_Build 1 46913363 1D TCAAAGCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 T 10 9 41055 CASAVA_Build 1 46915131 1I TCATGTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 10 19 11 A 10 11 41056 CASAVA_Build 1 46921274 1I AAAAAAAAAG -/T CACAAGCTTT 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 T 0 1 41057 CASAVA_Build 1 46939649 1D CCTAATACTC T/- TATCAATTAT 3070 het 3070 hom 59 22 32 5 T 2 1 41058 CASAVA_Build 1 46943136 1D TGATTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 675 het 675 ref 36 12 3 22 T 12 11 41059 CASAVA_Build 1 46943160 1I AACTAATGGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 28 hom 34 1 33 0 T 8 9 41060 CASAVA_Build 1 46951105 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 2226 het 2226 ref 16 8 6 2 A 9 10 41061 CASAVA_Build 1 46951425 1I TCTATGATGG -/T TTTAGCCTAT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 3 4 41062 CASAVA_Build 1 46952264 13D GTTAGGATTC TGGCAGAGAATTG/------------- TGGCATACTG 3070 het 3070 ref 36 21 17 6 TGGCAGAGAATTG 1 0 41063 CASAVA_Build 1 46965652 1D GAGCTGAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 9 8 41064 CASAVA_Build 1 46974871 1D CCTTACTGCT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 41 17 18 7 A 8 7 41065 CASAVA_Build 1 46982124 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 9 10 41066 CASAVA_Build 1 46982524 2I GATCAGTGAC --/AT GTGTATCACA 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 AT 0 1 41067 CASAVA_Build 1 46983974 1D GATCTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1315 hom 37 4 22 11 T 13 12 41068 CASAVA_Build 1 46989892 1I CTAGTCTCAT -/G GGGGATGCCC 3070 hom 122 het 48 0 39 9 G 4 5 41069 CASAVA_Build 1 46991383 2D TGGCTGTCTC TT/-- TTTGTTTTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 5 3 41070 CASAVA_Build 1 47021099 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1317 het 934 hom 12 3 4 5 T 15 16 41071 CASAVA_Build 1 47029816 1D AAGTAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2998 hom 26 9 12 5 A 11 10 41072 CASAVA_Build 1 47052146 3D TAAGCCAATC CCT/--- CCTCCTACCC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 CCT 3 2 41073 CASAVA_Build 1 47052673 2I GCATTTCCCC --/CT CTTTCCTCAG 3070 hom 123 het 46 0 40 6 CT 1 2 41074 CASAVA_Build 1 47053085 4I CAGTGAGCAG ----/AACT AACAGTCAGG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AACT 0 1 41075 CASAVA_Build 1 47053334 2D CTAACCCAGG AT/-- GAAGATGACA 3070 het 3070 ref 55 26 25 4 AT 1 0 41076 CASAVA_Build 1 47075423 1I AAACGTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 46 1 38 7 T 10 11 41077 CASAVA_Build 1 47080182 2D TTGTTGAGGG TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 10 8 41078 CASAVA_Build 1 47084506 1D TCATCTCTCT G/- GGGGCTTGTC 3070 hom 65 het 26 0 22 4 G 5 4 41079 CASAVA_Build 1 47097887 1D CTGCATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 13 12 41080 CASAVA_Build 1 47105228 1D GGCAGGCACG A/- GGTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 A 1 0 41081 CASAVA_Build 1 47109903 1I AATTTTTAAA -/T TTTTTGTAGA 2881 hom 27 het 18 0 9 9 T 5 6 41082 CASAVA_Build 1 47115917 1D GTCAAGGTTG T/- TTTGCTTATG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 4 3 41083 CASAVA_Build 1 47116246 1I GTTTTAGCAT -/C CAATATCATA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 1 2 41084 CASAVA_Build 1 47117571 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 26 het 11 0 9 2 A 9 8 41085 CASAVA_Build 1 47121643 1D AGAGTTTGCT G/- GGGTTTGAAA 1666 het 1666 ref 47 37 4 6 G 4 3 41086 CASAVA_Build 1 47144798 1D TAAGACAGTC T/- GTTATTTGGC 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 T 1 0 41087 CASAVA_Build 1 47154164 1D ATTTCTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 29 1 24 4 T 12 11 41088 CASAVA_Build 1 47154975 3I ATTGGTACCA ---/CTT CTTCTGTGAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 CTT 1 2 41089 CASAVA_Build 1 47155026 1I GGTCCTGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3020 hom 31 7 10 14 T 10 11 41090 CASAVA_Build 1 47183694 1I ACTTTGCTCA -/T AGTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 0 1 41091 CASAVA_Build 1 47186084 1I ATCTCAATCC -/T GACTCAAAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 0 1 41092 CASAVA_Build 1 47186352 1I CTTTCTGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 11 12 41093 CASAVA_Build 1 47187285 1D CTCGTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2303 hom 25 8 13 4 T 11 10 41094 CASAVA_Build 1 47192672 1D AGGAAAGGCA G/- GAAAATAGGT 3070 het 3070 ref 48 26 12 10 G 2 1 41095 CASAVA_Build 1 47233448 1I TGAGCCTCAA -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 6 7 41096 CASAVA_Build 1 47236437 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTAGAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 T 6 5 41097 CASAVA_Build 1 47238015 1D ACTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 12 28 11 T 12 11 41098 CASAVA_Build 1 47254982 3D TAAATTGGAT TTA/--- TTATTTGTGT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 TTA 2 1 41099 CASAVA_Build 1 47277970 1D GTCTTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 10 A 13 12 41100 CASAVA_Build 1 47278275 5D TATATACTAT AGTTA/----- AGTTTAGCAA 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 AGTTA 1 0 41101 CASAVA_Build 1 47280546 1D ATTTTAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 T 13 12 41102 CASAVA_Build 1 47282797 3D ACATACCACC ACT/--- ACATTATTAG 3070 het 3070 ref 43 26 17 1 ACT 1 0 41103 CASAVA_Build 1 47286339 1D CTGTCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2748 hom 33 12 16 5 A 13 12 41104 CASAVA_Build 1 47288151 1I CATTTGGTGG -/A AAAAATATCA 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 A 5 6 41105 CASAVA_Build 1 47298721 3D AAAAAAGATA AAG/--- AAGGGCATTA 3070 het 3070 ref 40 18 13 12 AAG 2 1 41106 CASAVA_Build 1 47307701 2D TTTCAAGCAG CC/-- TGTGGCTCTC 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 C 2 0 41107 CASAVA_Build 1 47320039 1I AAACCCACTT -/G ACCAGCAGGA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 0 1 41108 CASAVA_Build 1 47322834 1I AGAAATTGGG -/A AAAGATGGGC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 3 4 41109 CASAVA_Build 1 47328524 1D TGCCATAAGC A/- AAACAACCTT 1487 het 1487 ref 38 29 4 5 A 4 3 41110 CASAVA_Build 1 47342161 3D AGCCTCAATA TTT/--- TGCTTCTTTA 2777 het 2777 ref 30 22 6 3 T 4 1 41111 CASAVA_Build 1 47343177 1D CTGGGGCTGC T/- TTTTTTTTTG 2928 het 510 hom 23 4 12 8 T 10 9 41112 CASAVA_Build 1 47344178 2D CTATATCTGC GG/-- GGGGGGGAGA 3070 het 2460 hom 27 10 12 6 G 9 7 41113 CASAVA_Build 1 47350774 4D TCACATTGAT AACA/---- AACCTACTAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 AACA 1 0 41114 CASAVA_Build 1 47350976 3I TCTGGGCAAC ---/ACA ACAAGACCCC 2961 het 2961 ref 20 9 8 3 ACA 1 2 41115 CASAVA_Build 1 47355909 1I AGGATGACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 9 10 41116 CASAVA_Build 1 47357653 1D TCTTCATGAT A/- AAAAAACCCT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 7 6 41117 CASAVA_Build 1 47360013 2I GCATATAAAC --/AT GTGTGTATGT 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 AT 0 1 41118 CASAVA_Build 1 47369015 1I GGATATACTG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 T 6 7 41119 CASAVA_Build 1 47393956 1D CAAAGATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 11 10 41120 CASAVA_Build 1 47434022 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 9 10 41121 CASAVA_Build 1 47473798 1I CAGGCCGGGG -/C CCAGCCAGGA 3070 hom 66 het 25 0 17 8 C 2 3 41122 CASAVA_Build 1 47476716 2D CAACAACAGG CT/-- CAGTGAAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 CT 1 0 41123 CASAVA_Build 1 47488121 1D CTCGAAGAAG A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 117 het 43 0 39 5 A 8 7 41124 CASAVA_Build 1 47488628 2D ACTCTTGTAT AA/-- AAGAGTGTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 4 2 41125 CASAVA_Build 1 47510708 1D AAGTATACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 39 3 19 17 T 15 14 41126 CASAVA_Build 1 47535603 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 13 14 41127 CASAVA_Build 1 47551604 1D TAAAAATAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 8 7 41128 CASAVA_Build 1 47580909 2D CTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1423 het 213 hom 19 3 5 11 T 18 16 41129 CASAVA_Build 1 47581619 1I CATTTTGGGA -/G GCCAAGGCGG 1625 hom 22 het 11 0 4 7 G 1 2 41130 CASAVA_Build 1 47586338 1D AAAGGATTGT A/- ATCACTGAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 2 1 41131 CASAVA_Build 1 47590788 1I GGGGAGGGAT -/G AGGGGGTCAC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 G 0 1 41132 CASAVA_Build 1 47599305 2I ATGGGTAAAC --/AT ATATGTAACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AT 2 3 41133 CASAVA_Build 1 47608287 2D CATTCTCCTG TC/-- TCAGCCTTCC 2955 hom 21 het 8 0 8 0 TC 2 1 41134 CASAVA_Build 1 47611073 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 12 11 41135 CASAVA_Build 1 47613626 1I GGTAAGCAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 41136 CASAVA_Build 1 47613757 1I TCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 32 1 26 5 A 10 11 41137 CASAVA_Build 1 47619595 1I AAAGTAAAAG -/C ATCTGCAGAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 0 1 41138 CASAVA_Build 1 47619871 1D ATGACATTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 46 0 38 9 A 10 9 41139 CASAVA_Build 1 47637252 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1409 hom 10 het 15 0 7 8 T 18 14 41140 CASAVA_Build 1 47638901 4D TCCATAGCAA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TTTC 4 3 41141 CASAVA_Build 1 47652164 1D ATGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1553 het 1553 ref 35 18 6 12 A 13 12 41142 CASAVA_Build 1 47658820 3D CGCTTTCAAT TCA/--- TATTTCTTTC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TCA 1 0 41143 CASAVA_Build 1 47661854 13D TGGCTAACAT CATCCTAATCTAC/------------- CATCCTAATC 3070 hom 114 het 43 0 39 7 CATCCTAATCTAC 2 1 41144 CASAVA_Build 1 47662747 2I CCGAATACTC --/CT CTCTCTCCCC 3070 hom 66 het 30 0 22 8 CT 3 4 41145 CASAVA_Build 1 47664252 4I24M1D TTTTAAAGTT ----TTTAATTGTTGAATAAGTAATACAT/TTTATTTAATTGTTGAATAAGTAATACA- TCACTTCACT 3070 het 3070 hom 17 8 13 5 N/A 0 0 41146 CASAVA_Build 1 47673210 2D TCCTGGACCT CA/-- GTTTCCGCTC 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 CA 1 0 41147 CASAVA_Build 1 47678143 1D AATAAAAGCA G/- GGGGGTGGGG 3070 hom 51 het 19 0 16 3 G 6 5 41148 CASAVA_Build 1 47679453 4D AGCTCCTTGC TTTT/---- TTTTTTGTGT 419 het 290 hom 46 4 7 37 T 10 6 41149 CASAVA_Build 1 47679633 1D AATCCCCTCT C/- CCCCCCCCGC 3070 hom 65 het 27 0 18 9 C 9 8 41150 CASAVA_Build 1 47684948 1D TATTTGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 45 3 26 16 A 15 14 41151 CASAVA_Build 1 47718428 16D TTTGCCCTTT GCTCCGTGGGACCAGA/---------------- GCTGATCTTC 3070 hom 102 het 33 0 32 4 GCTCCGTGGGACCAGA 1 0 41152 CASAVA_Build 1 47736279 1I TTCTCTTTGG -/T TTCCTTCTTT 3070 het 2616 hom 23 9 10 4 T 2 3 41153 CASAVA_Build 1 47748187 2I GAGAAGAGAC --/AG GGTAAAGAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AG 0 1 41154 CASAVA_Build 1 47772742 3I CTTTGAGGAG ---/TTT TCTTGTATCT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 1 4 41155 CASAVA_Build 1 47793226 1D TTTTTGCATG A/- AAAAATCTGG 3070 het 3070 hom 54 25 24 5 A 6 5 41156 CASAVA_Build 1 47800194 1D GAATAGCAGC A/- GGGACATCAT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 1 0 41157 CASAVA_Build 1 47804897 2I CCACGACCAC --/TG TATTAGTACA 3070 hom 156 het 58 0 52 6 TG 0 1 41158 CASAVA_Build 1 47821003 1I TGAGGGCTCA -/T TTGCCATATT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 2 3 41159 CASAVA_Build 1 47840310 1D GAAAGGATTA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 26 0 23 3 T 2 1 41160 CASAVA_Build 1 47845419 6D GATAAATTAC AAAAAT/------ AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 AAAAAT 4 3 41161 CASAVA_Build 1 47848867 1D AGTTCATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 11 10 41162 CASAVA_Build 1 47855866 1D CAGAGGCACC A/- GACTTACTTA 3070 het 3070 ref 46 27 15 5 A 1 0 41163 CASAVA_Build 1 47857016 2I GCGAAGAGAG --/AA GAGTTGTGTC 3070 hom 108 het 47 0 37 10 A 0 2 41164 CASAVA_Build 1 47860680 1I CTAGAGAATG -/T TTTTTTGCTA 3070 het 3070 hom 47 19 26 2 T 6 7 41165 CASAVA_Build 1 47866961 13D CTGGGGACAC CTAACTGGGGACA/------------- CACGACGTAA 3070 het 3070 ref 31 16 16 3 CTAACTGGGGACA 1 0 41166 CASAVA_Build 1 47870480 1I ACTCCATGGT -/G GGGGGCTCTC 1592 het 1592 ref 22 10 5 7 G 5 6 41167 CASAVA_Build 1 47889527 2D GTAAATGATT AA/-- AGATCTAATA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 3 1 41168 CASAVA_Build 1 47993932 4I TCCCCCTACC ----/AGTA AGTACCACCT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 AGTA 1 2 41169 CASAVA_Build 1 48050818 3I CATCTCTAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAC 3 4 41170 CASAVA_Build 1 48060844 1I TCTGTAAAAT -/G GGGATGTCTT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 G 3 4 41171 CASAVA_Build 1 48069333 8I TCCTTGGTTG --------/TCGCTGGA CCACGTGTCC 3070 hom 110 het 42 0 33 9 TCGCTGGA 0 1 41172 CASAVA_Build 1 48113014 2I TATATACACG --/CA CACACACACA 2546 het 2546 ref 37 17 11 9 CA 7 8 41173 CASAVA_Build 1 48129291 1I CATAGGGAAC -/T AGTGGCTGAG 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 T 0 1 41174 CASAVA_Build 1 48156953 4D GACGGGGACG GAAA/---- GAAAGGACTC 3070 het 3070 ref 36 19 14 6 GAAA 2 1 41175 CASAVA_Build 1 48163699 1D GAACTGACCT C/- CAAAGAAATG 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 C 2 1 41176 CASAVA_Build 1 48175902 1I AATTTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 2832 het 2832 ref 32 11 10 11 A 11 12 41177 CASAVA_Build 1 48177195 6D TGCATGAGAC AGACAG/------ AGACAGAGAC 3070 hom 105 het 45 0 34 13 AGACAG 4 3 41178 CASAVA_Build 1 48180648 1D GGGGACGATC A/- GGGGAGGCAG 3070 het 3070 ref 57 30 23 6 A 1 0 41179 CASAVA_Build 1 48185195 1D TAAGACTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 15 12 15 T 12 11 41180 CASAVA_Build 1 48186526 4I TGCCAGGGAT ----/GTCC GTCCTTTAGG 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 GTCC 1 2 41181 CASAVA_Build 1 48205596 18D AAGCAAGAAA ACACACACACACACACAC/------------------ ACACACACAC 3070 het 1215 hom 25 5 11 14 AC 18 9 41182 CASAVA_Build 1 48222019 1I AAAAAAGAAA -/G AAAAAAAAAA 481 het 262 hom 36 6 8 22 G 0 1 41183 CASAVA_Build 1 48223122 4I ATGCTGTGTC ----/CCCT CCCTACCAAG 3070 het 3070 ref 57 32 19 6 CCCT 1 2 41184 CASAVA_Build 1 48229868 1D AAAATTATGG T/- TATTTCTGTC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 2 1 41185 CASAVA_Build 1 48233761 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2620 hom 37 10 15 13 GT 9 8 41186 CASAVA_Build 1 48277867 1D ATCCTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1364 hom 40 7 17 16 A 17 16 41187 CASAVA_Build 1 48280873 4D ATCCCTGAAC AGAT/---- AGATCCCTAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AGAT 2 1 41188 CASAVA_Build 1 48282710 4I AGCAGTAGTA ----/TTCT TTGACACTCA 3070 hom 138 het 51 0 44 7 TTCT 0 1 41189 CASAVA_Build 1 48294935 2D AGGGAGGGAC TG/-- TGTCTGATTC 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 TG 2 1 41190 CASAVA_Build 1 48314309 8D ATTGTGGATT TATATATA/-------- TATATATATA 3070 het 31 hom 24 1 13 10 TA 13 9 41191 CASAVA_Build 1 48328635 1I AATATTCTCC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 7 8 41192 CASAVA_Build 1 48337999 1D TTTTTTTAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2056 hom 20 6 11 3 T 9 8 41193 CASAVA_Build 1 48338677 16D CAAAAAAAAA AAAAAACAAAAAAAAC/---------------- AAAAACCCAG 2606 het 2606 ref 25 14 11 4 AAAAAACAAAAAAAAC 1 0 41194 CASAVA_Build 1 48349233 5D TCAGACAAAC AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 30 9 13 11 AAAAT 4 3 41195 CASAVA_Build 1 48351748 1D TTATTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 13 12 41196 CASAVA_Build 1 48352046 1D CTGTTGATTG T/- TTCTTTTGCT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 3 2 41197 CASAVA_Build 1 48352652 2D AGATAGTCTC TT/-- AGGGTGGAGC 3070 het 3070 hom 38 17 19 4 T 2 0 41198 CASAVA_Build 1 48363176 3D ATAAGAAACT TAA/--- TAAGCAGAAA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 TAA 2 1 41199 CASAVA_Build 1 48368307 2D ATATAAAGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AT 8 7 41200 CASAVA_Build 1 48376720 1D AAAGGGTACA C/- CTGGGGGTCC 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 C 2 1 41201 CASAVA_Build 1 48379843 1I TTTCTTCCAC -/A AAAAATAGCA 3070 het 3033 hom 40 11 20 9 A 5 6 41202 CASAVA_Build 1 48382169 1I GAGAGAAAAA -/C GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 C 0 1 41203 CASAVA_Build 1 48385349 1D CAATTGCCAC A/- AAAAGAATGG 2710 het 2710 ref 24 14 7 3 A 5 4 41204 CASAVA_Build 1 48394404 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 2944 het 7 hom 9 0 8 1 A 13 12 41205 CASAVA_Build 1 48410088 1D TCGAGGAGTA T/- CTTTGTGGTG 3070 het 2161 hom 19 5 13 1 T 1 0 41206 CASAVA_Build 1 48419198 1D GCATTTCAAC T/- TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 24 15 3 6 T 13 12 41207 CASAVA_Build 1 48420125 2D TTTCGCACTC CT/-- ATATTAATCT 3070 het 3070 ref 42 17 19 6 CT 1 0 41208 CASAVA_Build 1 48426065 4D GCTCCTCACC CCAG/---- CCAGGAAAGA 3070 het 3070 ref 44 25 19 1 CCAG 2 1 41209 CASAVA_Build 1 48427785 1D CCTATTATCC T/- TTCCTGAACA 3070 het 3070 ref 64 37 22 7 T 3 2 41210 CASAVA_Build 1 48432652 1I AATAGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 33 1 28 4 A 13 14 41211 CASAVA_Build 1 48435850 1D ACCTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 A 11 10 41212 CASAVA_Build 1 48438677 2D AGCTCAAGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 A 15 13 41213 CASAVA_Build 1 48471069 5D AAGTAAAGAA AAGAG/----- AAGAGAAGAG 2026 het 2026 ref 25 10 10 8 AAGAG 3 2 41214 CASAVA_Build 1 48481249 3D AGAAGGGCAT GGC/--- TGAGCTAAGC 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 GGC 1 0 41215 CASAVA_Build 1 48490883 1D AAAGTGTTTC A/- GGGGTAGTGG 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 A 1 0 41216 CASAVA_Build 1 48499726 1D TGGCTAATAA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 8 7 41217 CASAVA_Build 1 48501591 1D GAAATTGGAG T/- TTTTTATGAG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 6 5 41218 CASAVA_Build 1 48516490 1D AAAGATGGGG A/- AAAAAACAGA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 7 6 41219 CASAVA_Build 1 48570003 3D GATATTTCAC AAG/--- AAGATCATCC 3070 het 3070 ref 38 20 15 5 AAG 2 1 41220 CASAVA_Build 1 48573597 1I AATCCTAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 10 11 41221 CASAVA_Build 1 48578884 4D TCTTATTGTC AAAT/---- AAAGTATGAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 AAAT 1 0 41222 CASAVA_Build 1 48600936 4I AAATTCAAAG ----/GAAA GAAAGACTTC 3070 hom 134 het 51 0 45 6 GAAA 1 2 41223 CASAVA_Build 1 48638229 5D TAAAAAAGTG CAAAC/----- ATTGGTTACA 3070 hom 102 het 39 0 35 6 CAAAC 1 0 41224 CASAVA_Build 1 48639272 2D ATCATGAGTT TC/-- TGTCTTTCAG 3070 het 3070 ref 44 24 19 2 TC 1 0 41225 CASAVA_Build 1 48667393 1D CAGGATGGGC A/- AAAAAAAAAA 1298 het 1298 ref 30 19 4 7 A 13 12 41226 CASAVA_Build 1 48672840 2I TGACAAATCT --/GA GAGGAGTGAC 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 GA 1 2 41227 CASAVA_Build 1 48676052 1I TGTAATTTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 8 9 41228 CASAVA_Build 1 48686752 1D TCCCCACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 58 18 19 21 A 15 14 41229 CASAVA_Build 1 48688600 1D AGAGCCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 A 15 14 41230 CASAVA_Build 1 48698977 28D CACAGTCACA AAATATAAAGTCAATATATACCGGTAAG/---------------------------- AATGAAAATT 3070 het 3070 ref 23 13 12 2 AAATATAAAGTCAATATATACCGGTAAG 1 0 41231 CASAVA_Build 1 48718492 1I AATGATCAAT -/A AAAAAAAAAA 1091 het 698 hom 9 3 4 2 A 12 13 41232 CASAVA_Build 1 48729663 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2323 het 438 hom 14 1 6 7 A 15 14 41233 CASAVA_Build 1 48735469 7I ATGCAACTTC -------/TTTTTTT TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 6 13 41234 CASAVA_Build 1 48739132 2I GGCCCCACCC --/CT GTCTCCCTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CT 0 1 41235 CASAVA_Build 1 48741580 1I TTTAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 10 11 41236 CASAVA_Build 1 48746099 1D GGGATGCTCA C/- TACTACTGGA 3070 het 3070 ref 43 19 18 7 C 1 0 41237 CASAVA_Build 1 48751999 4D GCCAGATTTT GGGG/---- GGGGGGGGCT 2248 het 18 hom 14 1 5 8 G 12 8 41238 CASAVA_Build 1 48761986 3I CCAGAGCAAT ---/GAA GTACAGTCAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 GAA 0 1 41239 CASAVA_Build 1 48793449 1D TAAGATTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 42 0 30 12 T 12 11 41240 CASAVA_Build 1 48796194 2D CTTTGAGAAC AG/-- AGACTACCTC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AG 2 1 41241 CASAVA_Build 1 48801917 4I ACAGATAGAT ----/AAAC AGACAGACAA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 AAAC 0 1 41242 CASAVA_Build 1 48811819 1D AATCCTAAAT G/- AATTTGTCCT 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 G 1 0 41243 CASAVA_Build 1 48820509 1D AAAACTCAAT A/- AAAAAGTATG 3070 het 3070 ref 52 25 22 7 A 6 5 41244 CASAVA_Build 1 48844453 1D GTGCTTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 32 1 27 4 T 11 10 41245 CASAVA_Build 1 48867229 1I CTTCTCCCGA -/C CTGGGACTCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 1 2 41246 CASAVA_Build 1 48882043 4D GAAAAGAAGC AGAG/---- CCCGTTTGGG 3070 het 3070 hom 55 23 22 13 AG 2 0 41247 CASAVA_Build 1 48896953 3I TTGGGATAGC ---/GAG GAGAAGAGGA 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 GAG 1 2 41248 CASAVA_Build 1 48897474 1D ATTGACCTAC A/- ACTGTCTCAT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 A 2 1 41249 CASAVA_Build 1 48899102 2I ATCAGAACTC --/TG AGTTCTTTCA 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 TG 0 1 41250 CASAVA_Build 1 48899372 2D CTCGTGGTAT AA/-- AGAGGGAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 4 A 3 1 41251 CASAVA_Build 1 48904033 1D TTTTTCACTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 9 8 41252 CASAVA_Build 1 48906692 5D CTTAGCCTAG ACCAT/----- ACCATCCCTG 3070 het 3070 hom 47 17 18 15 ACCAT 2 1 41253 CASAVA_Build 1 48911247 1D TGTATTGTGA G/- GGCTCAGTAC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 G 3 2 41254 CASAVA_Build 1 48938200 2I AAATATACAT --/TA TATATATATA 2612 hom 21 het 10 0 8 2 TA 6 7 41255 CASAVA_Build 1 48938331 1D AGCCACTGCA C/- CCGGATGTTA 3070 het 1777 hom 24 6 11 7 C 3 2 41256 CASAVA_Build 1 48944121 3D GATTGAACAG TGA/--- TGAACCTATT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 TGA 2 1 41257 CASAVA_Build 1 48949976 32D CCCTCTCTCA CTCCCTCTCTCCCTTCCCTTTCCCCATAATTT/-------------------------------- CTCCCTCTCT 3070 hom 54 het 30 0 12 22 CTCCCTCTCTCCCTTCCCTTTCCCCATAATTT 2 1 41258 CASAVA_Build 1 48953963 2I GGGAAAAAAA --/TG TGTGTTTCCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TG 2 3 41259 CASAVA_Build 1 48959222 1D GAGAGGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 10 9 T 13 12 41260 CASAVA_Build 1 48960761 1I GTTGGGAGAC -/T TTTAAGAAAC 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 3 4 41261 CASAVA_Build 1 48966742 1I TCTGACTTGC -/T TTTTTTTTTT 2333 het 1044 hom 46 4 10 32 T 16 17 41262 CASAVA_Build 1 48980683 1I AAGAAAGAAA -/G AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 G 0 1 41263 CASAVA_Build 1 48983256 1D CTCCCAGGTA G/- GGGGGGTCTC 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 G 7 6 41264 CASAVA_Build 1 49006440 3I CACATGTAAC ---/ATG ATGAGTATGT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 ATG 1 2 41265 CASAVA_Build 1 49019471 2D GGATGCTGAC AG/-- AGTAAACACA 3070 het 3070 hom 50 23 26 1 AG 2 1 41266 CASAVA_Build 1 49024275 1D CCCTAGACTT A/- AAAAAAAAAA 2773 het 2773 ref 41 20 9 12 A 12 11 41267 CASAVA_Build 1 49025091 2D ACAACTGGAT AG/-- CCCCAGTCAG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AG 1 0 41268 CASAVA_Build 1 49028640 1I GGGGGAAAAA -/T ATCTTTTCCT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 0 1 41269 CASAVA_Build 1 49034750 4D AGGCCACTCT CAGA/---- CAGTGTATTG 3070 hom 123 het 44 0 41 4 CAGA 1 0 41270 CASAVA_Build 1 49040676 16D CATCTTATTT ATGTGTCTGGACCCCC/---------------- ATCAGTCTGG 3070 hom 102 het 40 0 33 7 ATGTGTCTGGACCCCC 1 0 41271 CASAVA_Build 1 49045192 2D TGTGCATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 179 het 85 0 60 30 TG 9 8 41272 CASAVA_Build 1 49049965 1D TGTCTTGCCC A/- ACTCTGGTTT 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 2 1 41273 CASAVA_Build 1 49052628 2D CATGGGAAAC AT/-- AGTGATATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 1 0 41274 CASAVA_Build 1 49079200 1D GTAAGCAATG A/- AAAGGCATGA 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 A 4 3 41275 CASAVA_Build 1 49105726 1D GAGGTCTCTC A/- GACAAATTAT 3070 hom 137 het 51 0 44 8 A 1 0 41276 CASAVA_Build 1 49112585 1D CCTGCCCTAT C/- CCCAAGTGTA 3070 hom 126 het 45 0 41 4 C 4 3 41277 CASAVA_Build 1 49117456 1D TGTTCAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 14 13 41278 CASAVA_Build 1 49126949 1I CATTATAAAT -/A ACCAGGGTCA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 1 2 41279 CASAVA_Build 1 49134930 3I GGGAGTAGGT ---/AGG AGGAGAAGCA 3070 hom 109 het 41 0 35 6 AGG 1 2 41280 CASAVA_Build 1 49135037 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 9 10 41281 CASAVA_Build 1 49136911 1D TATGTGCTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 10 9 41282 CASAVA_Build 1 49137681 2I AAGTTAATAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 27 0 15 12 T 13 15 41283 CASAVA_Build 1 49143186 2I GAGACGCTGT --/AC ACAGTCTGCA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AC 1 2 41284 CASAVA_Build 1 49147187 1D CAACCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 914 hom 38 2 29 7 T 12 11 41285 CASAVA_Build 1 49269270 3D AAATAAATCT TGG/--- TGGTCTGTTG 3070 het 3070 ref 29 19 8 3 TGG 2 1 41286 CASAVA_Build 1 49270222 3I AGAAAGGGTA ---/TAT CAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 44 20 19 6 TAT 0 1 41287 CASAVA_Build 1 49316143 1D TATGACTACT A/- AAAAGTATGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 A 5 4 41288 CASAVA_Build 1 49351670 1D CACCAGGCTA T/- TTTTTTTTTT 2422 het 2422 ref 18 10 6 2 T 11 10 41289 CASAVA_Build 1 49356556 1D CTTGTGCTGG T/- TTTCAAAGGG 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 T 4 3 41290 CASAVA_Build 1 49367552 3D TTTGTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 35 11 12 12 TTG 5 4 41291 CASAVA_Build 1 49396622 1I TCTGCACAGC -/A AAAAAAAACT 1439 het 1439 ref 11 8 3 0 A 8 9 41292 CASAVA_Build 1 49432538 1D CTTTCTTGTC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 9 8 41293 CASAVA_Build 1 49456805 1D TCTAGCAAAA G/- TCTTTTGGGT 3070 het 3070 ref 54 23 22 9 G 1 0 41294 CASAVA_Build 1 49468180 1D GGGTGACTCA C/- CCCACCTTAT 3070 het 3070 hom 49 20 24 6 C 4 3 41295 CASAVA_Build 1 49471015 1D GACTTTATGG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 T 7 6 41296 CASAVA_Build 1 49494450 1D CAAATTTTTT A/- AAAAAGATAA 1194 het 1194 ref 32 23 3 6 A 6 5 41297 CASAVA_Build 1 49501516 4D TATACATATG TAAC/---- TAACCTGCAC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TAAC 2 1 41298 CASAVA_Build 1 49510036 1I AATGACTCAG -/A CGTCTTAATG 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 A 0 1 41299 CASAVA_Build 1 49629823 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2058 het 106 hom 19 1 11 7 T 15 14 41300 CASAVA_Build 1 49638655 1D ATTTTAGGAA T/- TTTTTTTCTA 2396 het 2396 ref 21 11 5 5 T 8 7 41301 CASAVA_Build 1 49649963 1I ACCTCTTGAA -/T ATAAACTAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 0 1 41302 CASAVA_Build 1 49714553 21D TTTCAATTGT TTTAAATTCACTGAGACTTGC/--------------------- TTTATGACAG 3070 het 3070 ref 28 23 11 1 TTTAAATTCACTGAGACTTGC 1 0 41303 CASAVA_Build 1 49717139 4D TAATTTTCTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 TTTG 3 2 41304 CASAVA_Build 1 49717549 1D AATATCTAGA T/- TTTTTTTTTT 1322 het 1322 ref 46 29 3 14 T 12 11 41305 CASAVA_Build 1 49720820 1D ATCTACTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 8 8 T 10 9 41306 CASAVA_Build 1 49739124 1I AAGCGGGCTG -/T TTTTTAATTC 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 5 6 41307 CASAVA_Build 1 49739797 1D GTCTTCTCCC T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 44 19 14 11 T 7 6 41308 CASAVA_Build 1 49756773 1I AAAGATTGCT -/A AATTATATAA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 A 2 3 41309 CASAVA_Build 1 49760170 1D AAACTATTAG A/- GGGGGGAATG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 1 0 41310 CASAVA_Build 1 49762884 1D TATGCAGAAC T/- TTTTTTTTTC 1009 het 1009 ref 28 22 3 3 T 10 9 41311 CASAVA_Build 1 49777958 1D TGGCCTTGCC T/- TTTTTTGGTG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 7 6 41312 CASAVA_Build 1 49799047 1D CTTACAAACT A/- GGAGAGACTC 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 A 1 0 41313 CASAVA_Build 1 49805042 4I ATTCTCAGAT ----/CTCA CTCAAGCTGC 2154 het 2154 ref 15 6 5 4 CTCA 1 2 41314 CASAVA_Build 1 49806658 1D TACACAAAAA G/- AATAAAATAC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 G 1 0 41315 CASAVA_Build 1 49824922 4I ACTGACTGAC ----/TGAA TGAATGAATG 3070 het 3070 ref 57 30 21 6 TGAA 4 5 41316 CASAVA_Build 1 49846864 1D TAGAAGGAGC A/- AAGCAGAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 A 3 2 41317 CASAVA_Build 1 49872151 6D TATATTATTG TAATAT/------ ATAATATATG 2194 het 991 hom 8 2 5 1 TAATAT 1 0 41318 CASAVA_Build 1 49880323 3I AGAAAACTAG ---/AAA GGAGCAATTA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 0 3 41319 CASAVA_Build 1 49883663 3D ATCAAAAAAA ATT/--- ATTATGACAA 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 ATT 2 1 41320 CASAVA_Build 1 49910846 1I TATACAAAAC -/A AAAAAATTAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 6 7 41321 CASAVA_Build 1 49944043 2I GAAGGCCTTT --/TC TGCATCTATT 1273 het 1273 ref 43 36 3 4 TC 0 1 41322 CASAVA_Build 1 49973082 3D AAATTTTAAA AAT/--- AATAATAATC 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 AAT 4 3 41323 CASAVA_Build 1 49996972 1I TGTAACTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1867 hom 35 6 23 6 T 13 14 41324 CASAVA_Build 1 49998372 4I TTTTGAAAAT ----/TGTC TGTTCGTATC 3070 het 3070 hom 44 12 21 11 TGTC 0 1 41325 CASAVA_Build 1 50006245 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 1825 het 1825 ref 38 29 4 5 A 12 11 41326 CASAVA_Build 1 50018194 1D TCAAAAGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 15 14 13 A 10 9 41327 CASAVA_Build 1 50038628 1I TCTCATTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 935 hom 14 3 9 2 T 9 10 41328 CASAVA_Build 1 50055983 2D ATATTTTACC CT/-- GTTTAGATAT 3070 het 3070 ref 36 21 12 5 CT 1 0 41329 CASAVA_Build 1 50056630 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 21 4 10 7 T 13 12 41330 CASAVA_Build 1 50081207 2D TTTATAATTC AT/-- ATGTCTGTGG 3070 het 3070 hom 62 27 31 4 AT 2 1 41331 CASAVA_Build 1 50092443 1D CTGACACTTG C/- CCTCATTCAC 3070 hom 46 het 32 0 15 17 C 3 2 41332 CASAVA_Build 1 50094305 1D AATCAGAAAT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 8 7 41333 CASAVA_Build 1 50097227 8I GCGAGCTGAG --------/ACTGCGCC ACTGCACTCC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 ACTGCGCC 0 1 41334 CASAVA_Build 1 50100613 1D TATAGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 A 13 12 41335 CASAVA_Build 1 50111998 1D ATCTTTGGAG A/- AAGGCACAGA 3070 het 3070 ref 31 16 15 1 A 3 2 41336 CASAVA_Build 1 50134201 1D TGAATGGGGT A/- AAAAAAAAAA 2764 het 2072 hom 37 12 14 11 A 16 15 41337 CASAVA_Build 1 50134734 1I GATGAATTTT -/C ACCAAATATT 1929 het 1929 ref 23 12 4 7 C 0 1 41338 CASAVA_Build 1 50184446 5D AAAAATTTAA ACTAC/----- ACCCTGGAAC 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 ACTAC 1 0 41339 CASAVA_Build 1 50237594 1D CTACCACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 767 hom 45 4 21 20 A 16 15 41340 CASAVA_Build 1 50244931 1I TGTAGAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2456 hom 21 6 10 5 A 11 12 41341 CASAVA_Build 1 50246267 1D CCCACACTGG A/- GCACCCAGAT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 1 0 41342 CASAVA_Build 1 50248566 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2243 het 1340 hom 11 4 6 3 A 13 12 41343 CASAVA_Build 1 50265200 2D GCCTAATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 1764 het 1764 ref 33 25 4 4 A 14 12 41344 CASAVA_Build 1 50285568 1I ATTTCCTGTA -/T TTTTGAATCA 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 T 4 5 41345 CASAVA_Build 1 50312084 2I TGCACAAAGA --/CT CTAAGTGCAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 CT 1 2 41346 CASAVA_Build 1 50327190 1I TTGGTTTTAC -/T CAGGCTTGGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 1 41347 CASAVA_Build 1 50339863 1D TTCTCACTGA T/- TTCAACAAAT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 3 2 41348 CASAVA_Build 1 50356763 1D GAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 G 1 0 41349 CASAVA_Build 1 50412748 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 T 13 12 41350 CASAVA_Build 1 50417224 1D TCCATTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1481 het 1481 ref 33 23 4 6 T 12 11 41351 CASAVA_Build 1 50425102 3I CCTCTGATAA ---/AAG AATAGCACGT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 AAG 0 1 41352 CASAVA_Build 1 50433331 4D TTGTTTGTTT GTTA/---- TTCATTTTAG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 GTTA 1 0 41353 CASAVA_Build 1 50540474 1D TTGCTGTTTT G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 76 het 36 0 29 8 G 9 8 41354 CASAVA_Build 1 50549757 1D GAGGTAACAG C/- TTTTTCTCCT 3070 hom 112 het 41 0 35 6 C 1 0 41355 CASAVA_Build 1 50550263 1D TTAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 40 1 31 8 A 11 10 41356 CASAVA_Build 1 50560724 1D CATTAGCCAT G/- GGATGGTGAC 3070 hom 144 het 53 0 47 7 G 3 2 41357 CASAVA_Build 1 50582701 4D TCTTTACGCA TCTT/---- TCTCCCAGAA 2352 het 452 hom 34 5 8 22 TCTT 1 0 41358 CASAVA_Build 1 50591568 5D CTATTATTAA AAATT/----- AAATTATATA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 AAATT 2 1 41359 CASAVA_Build 1 50598273 4I ATTGAAAGAA ----/AAAC AAACAAACAG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AAAC 2 3 41360 CASAVA_Build 1 50604685 4I AATCAAAGTC ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 hom 91 het 37 0 25 12 CCTT 4 5 41361 CASAVA_Build 1 50624035 5D CATGAGGCTT ACATA/----- AAGCGTCTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 5 ACATA 1 0 41362 CASAVA_Build 1 50626639 1D TTTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 2757 het 2757 ref 18 8 7 3 T 17 16 41363 CASAVA_Build 1 50633457 1D TATTTTAAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 41364 CASAVA_Build 1 50648265 1I ATTCAGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 37 1 28 8 A 10 11 41365 CASAVA_Build 1 50656392 2D ACTTGTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 24 0 21 3 T 13 11 41366 CASAVA_Build 1 50658048 1D ACAGCAGTCA C/- AGCACCTCGG 2740 het 2740 ref 30 17 8 5 C 1 0 41367 CASAVA_Build 1 50668237 1D AAAAAATATT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 115 hom 30 3 14 13 G 12 11 41368 CASAVA_Build 1 50686633 1I AATTGAGACC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 81 het 37 0 27 10 T 8 9 41369 CASAVA_Build 1 50687198 1D GGGTCACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 476 hom 27 2 13 12 T 18 17 41370 CASAVA_Build 1 50728170 1I ATTTGTTGGC -/A ACAAAAGGCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 2 41371 CASAVA_Build 1 50776814 2D TAAAAAAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 2571 het 1899 hom 35 11 7 17 A 18 16 41372 CASAVA_Build 1 50812240 1I ATACAAAAAA -/C TTGGCTGGGT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 0 1 41373 CASAVA_Build 1 50815093 1D TTCGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 29 0 21 8 T 14 13 41374 CASAVA_Build 1 50835405 1D TAGCACACAG T/- TGGTGGCTCA 3070 hom 126 het 50 0 42 8 T 2 1 41375 CASAVA_Build 1 50839386 2I AGCTCTTTCA --/TG AAATCTTAGA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TG 0 1 41376 CASAVA_Build 1 50848054 1D TGAATTATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 15 7 A 13 12 41377 CASAVA_Build 1 50852051 1I CTTTTATATT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 7 8 41378 CASAVA_Build 1 50852428 2D TCCAAAACTC TT/-- TTCAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 4 2 41379 CASAVA_Build 1 50852780 3I CAACACATAG ---/TAA TAATATTAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TAA 1 2 41380 CASAVA_Build 1 50866095 1I CAACAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 39 1 33 5 T 11 12 41381 CASAVA_Build 1 50884095 1I CTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1130 hom 23 3 15 5 A 10 11 41382 CASAVA_Build 1 50910280 1I GTGGTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2628 hom 15 het 15 0 8 7 T 14 15 41383 CASAVA_Build 1 50917584 1I AAAAAAGTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 190 hom 27 1 20 6 A 9 10 41384 CASAVA_Build 1 50938505 2I AAAGGGGGCT --/CA GTGTGTAATG 3070 hom 114 het 39 0 39 0 CA 0 1 41385 CASAVA_Build 1 50977672 2I ATGTGTATAC --/AT ATGTGAGTGT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 AT 1 2 41386 CASAVA_Build 1 50978288 1I AATGCACTTA -/T TCAACAGATA 3070 hom 137 het 50 0 44 6 T 1 2 41387 CASAVA_Build 1 50986752 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 19 0 15 4 A 15 13 41388 CASAVA_Build 1 50989234 1I AGTTTAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 11 12 41389 CASAVA_Build 1 50989411 1D ATTTCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 12 11 41390 CASAVA_Build 1 51019565 1D CTTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1452 het 1452 ref 32 24 4 4 A 11 10 41391 CASAVA_Build 1 51076817 4D TATAAATTAA AAAT/---- ATATATATTT 1795 hom 10 het 4 0 4 0 AAAT 1 0 41392 CASAVA_Build 1 51085634 1D AATACCTAAG C/- CAGATGGGTA 3070 hom 66 het 31 0 22 9 C 2 1 41393 CASAVA_Build 1 51089342 1D GCAATTTACA T/- TTTTTTTTTT 1667 het 1667 ref 28 11 6 12 T 19 18 41394 CASAVA_Build 1 51162543 1D GAACAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 12 11 41395 CASAVA_Build 1 51185448 1I CAACCACTAC -/T TTCCCTTAGG 3070 hom 147 het 56 0 48 8 T 2 3 41396 CASAVA_Build 1 51214152 4D ATTGAAACAC TTAT/---- TTAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 7 TTAT 1 0 41397 CASAVA_Build 1 51221433 2D CTATTAAATC AT/-- ATTTATACAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AT 2 1 41398 CASAVA_Build 1 51226549 4I TTTTTTTCAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TTTA 2 3 41399 CASAVA_Build 1 51236496 1I CTATCTGCAG -/A AGAATAAAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 1 2 41400 CASAVA_Build 1 51238257 12I CCATCTTCTA ------------/TGATGTGATTAT TATGCATTGC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 TGATGTGATTAT 0 1 41401 CASAVA_Build 1 51242117 1I CTAAGGAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 9 10 41402 CASAVA_Build 1 51251091 1D ATCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 15 0 11 4 T 13 12 41403 CASAVA_Build 1 51279002 1D GGGAAGCCAG C/- CACTATGTTG 3070 hom 123 het 49 0 41 8 C 2 1 41404 CASAVA_Build 1 51291083 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 10 11 41405 CASAVA_Build 1 51301961 6D TGTATATATA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 2364 hom 61 16 12 38 TG 10 7 41406 CASAVA_Build 1 51347776 1I ATTTCCCCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 296 hom 34 1 26 7 T 9 10 41407 CASAVA_Build 1 51390748 1D TCGTTTACAC T/- TTTTTTTTTT 1913 het 134 hom 22 2 8 12 T 17 16 41408 CASAVA_Build 1 51434924 3I TCTTTTTTCT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 63 het 37 0 20 17 TTC 5 6 41409 CASAVA_Build 1 51446458 1I CCATCGCTAC -/A AAAAAAAAAA 2052 het 2052 ref 31 15 8 8 A 16 17 41410 CASAVA_Build 1 51514712 2D AGAGACTGAG TC/-- TCACTATGTT 3070 hom 89 het 35 0 28 8 TC 2 1 41411 CASAVA_Build 1 51548269 1I AAAGCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 10 11 41412 CASAVA_Build 1 51633784 2I ATACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 AC 8 9 41413 CASAVA_Build 1 51643960 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 1246 het 1246 ref 14 10 3 1 A 13 14 41414 CASAVA_Build 1 51699220 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1257 het 1257 ref 19 10 3 6 A 13 14 41415 CASAVA_Build 1 51727401 1D TAACTAATGT A/- AAAAAAAAAA 1294 het 1294 ref 32 20 3 9 A 12 11 41416 CASAVA_Build 1 51796546 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 19 0 14 5 A 10 11 41417 CASAVA_Build 1 51830298 3D TTCACTCAAC ATA/--- ATAATTGCAT 3070 hom 60 het 23 0 19 4 ATA 2 1 41418 CASAVA_Build 1 51839632 4D AAAGACAGTT TGTC/---- TGTGGTTCTG 3070 het 3070 hom 36 13 19 7 TGTC 1 0 41419 CASAVA_Build 1 51984610 1D CTTCAGTTCC T/- ACTTAAAATT 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 T 1 0 41420 CASAVA_Build 1 51988138 1D CTTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3042 het 2572 hom 23 7 8 9 A 15 14 41421 CASAVA_Build 1 52007462 2I GATTTTCTAA --/CT CTGAGGTCAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 CT 1 2 41422 CASAVA_Build 1 52027099 4D TACAGAACTA TATC/---- TATCTATCTA 3070 het 3070 ref 37 14 17 6 TATC 5 4 41423 CASAVA_Build 1 52039522 1D TTTTATTGGC T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 88 het 40 0 29 13 T 8 7 41424 CASAVA_Build 1 52041735 2D TATCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 31 1 22 9 A 18 16 41425 CASAVA_Build 1 52045311 3D TACATTAAAT TAG/--- TAGACCAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 7 TAG 2 1 41426 CASAVA_Build 1 52061809 13D CCTTTACTTT GTATTAAGGTCAA/------------- GCACTAAAGT 3070 hom 165 het 59 0 55 6 GTATTAAGGTCAA 1 0 41427 CASAVA_Build 1 52078652 3D TTCATCATCA TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 hom 119 het 48 0 40 9 TCT 4 3 41428 CASAVA_Build 1 52115826 1D AAATAAGCTA C/- CTCTGAAGGA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 2 1 41429 CASAVA_Build 1 52118078 1D GGAGGATTGC T/- TTGAGCCTGG 3070 hom 89 het 33 0 28 6 T 3 2 41430 CASAVA_Build 1 52119329 1D AATACTGTTT A/- AAATATCCCA 3070 hom 144 het 54 0 49 6 A 4 3 41431 CASAVA_Build 1 52120527 2I TAGACTGGTC --/AG AGAGTTTCTC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 AG 2 3 41432 CASAVA_Build 1 52122594 4I AGAGGCAGGG ----/TTTC TCCATGTTGT 3070 hom 78 het 28 0 24 4 TTTC 0 1 41433 CASAVA_Build 1 52133353 2I AGGGGAACAC --/CA CACACTGGGG 3070 hom 35 het 13 0 11 2 CA 2 3 41434 CASAVA_Build 1 52136584 1I GAATCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 21 0 18 3 A 12 13 41435 CASAVA_Build 1 52140081 2I ACTTCATCTC --/AA AAAAAAAAGG 3070 hom 41 het 17 0 12 5 A 8 10 41436 CASAVA_Build 1 52145858 1D CCCAAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 975 het 975 ref 27 10 3 14 T 17 16 41437 CASAVA_Build 1 52153952 3D GTTGTTGTTG TTT/--- GTTTGCTTGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 3 0 41438 CASAVA_Build 1 52157232 13D TCCTTTTCTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 23 1 17 5 T 23 10 41439 CASAVA_Build 1 52176782 4D TATGTAAGAA TATT/---- TAACGATATG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 TATT 1 0 41440 CASAVA_Build 1 52185655 1D ACCTTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1120 hom 33 3 19 11 A 15 14 41441 CASAVA_Build 1 52188861 4I TGTCATAGAC ----/AAAG AAAGGGAGGC 3070 hom 150 het 57 0 50 7 AAAG 1 2 41442 CASAVA_Build 1 52203480 2D ATTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 22 0 19 3 A 13 11 41443 CASAVA_Build 1 52207879 1D GTAATAAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 48 0 37 12 T 10 9 41444 CASAVA_Build 1 52211717 1I TCTGATCTCG -/T GAAGCTAAGA 3070 hom 95 het 40 0 32 8 T 0 1 41445 CASAVA_Build 1 52234743 1D TATTAGGGTT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 11 10 41446 CASAVA_Build 1 52248580 3I TTAGCCATGT ---/GTG GTGGTGGACG 2068 hom 18 het 7 0 6 1 GTG 2 3 41447 CASAVA_Build 1 52284460 1I TTCTGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 39 1 25 13 A 11 12 41448 CASAVA_Build 1 52286020 1I ACTAAGTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 9 10 41449 CASAVA_Build 1 52293447 3D GCCGCTCAGC ACA/--- ACACCTCTAC 3070 het 3070 ref 30 11 12 8 ACA 2 1 41450 CASAVA_Build 1 52301198 2I AGCTCACAAC --/AG GGTTCGCCCT 3070 hom 122 het 46 0 39 7 AG 0 1 41451 CASAVA_Build 1 52303325 2D TTTGAAGGAC TG/-- TGGCACTTTG 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 TG 2 1 41452 CASAVA_Build 1 52306263 1I TTTAGAGAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 399 hom 38 1 35 2 A 8 9 41453 CASAVA_Build 1 52310281 1I TTAGCCAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 11 hom 18 0 11 7 T 9 10 41454 CASAVA_Build 1 52314854 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1992 het 1992 ref 22 10 6 6 A 17 16 41455 CASAVA_Build 1 52319472 1I ATCTCACCTT -/A ACTGCAACCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 2 41456 CASAVA_Build 1 52329326 1D AAAGAAGAAC A/- AAAAAATGGT 3070 hom 92 het 35 0 31 4 A 7 6 41457 CASAVA_Build 1 52356814 1I CCAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 527 hom 34 2 25 7 A 11 12 41458 CASAVA_Build 1 52397066 1D TGTTCTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1424 het 1424 ref 25 13 6 6 T 15 14 41459 CASAVA_Build 1 52400198 1D TAGTAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1307 het 1307 ref 35 28 3 5 A 13 12 41460 CASAVA_Build 1 52426490 1I GCAGGAACAG -/A AAACCGTATA 3070 hom 66 het 31 0 22 9 A 3 4 41461 CASAVA_Build 1 52427941 1I CCTTAGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 13 14 41462 CASAVA_Build 1 52428330 4I AAGCCCAGTA ----/TAAC TAACACCCGT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 TAAC 1 2 41463 CASAVA_Build 1 52433937 2D AAATAGACAC AG/-- AGTGTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AG 2 1 41464 CASAVA_Build 1 52435879 3D61M2I AGAAGAAAGT AAGAATTTGTAGTATCACACAAGTCATGGAAGAAGAGTTTCATAAAGGAGGAGGATGTGATCTA--/---AATTTGTAGTATCACACAAGTCATGGAAGAAGAGTTTCATAAAGGAGGAGGATGTGATCTAAT ATAATTGAAT 3070 hom 178 het 45 0 59 5 N/A 0 0 41465 CASAVA_Build 1 52465628 3I AGGCGTTGCC ---/TCT TAAGGAAGTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TCT 0 1 41466 CASAVA_Build 1 52494304 2D TTTCTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 24 het 13 0 9 4 TC 10 9 41467 CASAVA_Build 1 52562513 2D TGTCTCAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 AC 10 9 41468 CASAVA_Build 1 52564792 1D CAGATAGTTA C/- GAGCAAGGCC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 C 1 0 41469 CASAVA_Build 1 52570760 1I TTGAGTTCAA -/T TCAGCAATAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 2 41470 CASAVA_Build 1 52574922 2D CCCAGCTTAA TT/-- AATCTAGGAG 3070 hom 50 het 20 0 17 5 T 2 0 41471 CASAVA_Build 1 52707608 1D TCGATAAGAC T/- TAAGGGCAAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 T 2 1 41472 CASAVA_Build 1 52763626 1D ATGAAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 1118 het 1118 ref 54 38 4 12 T 11 10 41473 CASAVA_Build 1 52766751 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1352 het 1352 ref 18 6 4 8 A 17 16 41474 CASAVA_Build 1 52793457 1I CCCTCCAGAT -/A ACTCTCTTCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 2 41475 CASAVA_Build 1 52796828 1I TAATTTACCG -/C CCCCCCCCCC 2806 het 359 hom 23 4 12 7 C 10 11 41476 CASAVA_Build 1 52816470 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1110 hom 26 7 9 10 A 17 16 41477 CASAVA_Build 1 52830126 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 1976 het 1603 hom 21 10 8 3 A 13 14 41478 CASAVA_Build 1 52841277 2D TGTGCAGGGC AG/-- AGAGAGAGTT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 AG 5 4 41479 CASAVA_Build 1 52846145 1D AGCACTCCCC T/- GACCCCCAGT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 1 0 41480 CASAVA_Build 1 52851722 1D TTGCCATGTT G/- CCTAAGCTGG 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 G 1 0 41481 CASAVA_Build 1 52854247 1D GGAAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 2137 het 1607 hom 28 7 8 13 T 17 16 41482 CASAVA_Build 1 52855036 1I CCGTGCCCAA -/C CTGGGTTCCT 2461 hom 27 het 13 0 8 5 C 1 2 41483 CASAVA_Build 1 52858006 3D GGACTCTGGT AAC/--- AACACTCCAG 3070 het 3070 hom 39 17 16 7 AAC 2 1 41484 CASAVA_Build 1 52861252 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 994 hom 18 3 13 2 A 12 11 41485 CASAVA_Build 1 52883835 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 6 7 41486 CASAVA_Build 1 52894687 2D GAGAACAATC TA/-- TGTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 55 18 31 8 TA 1 0 41487 CASAVA_Build 1 52896305 1D ACTAGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 38 0 28 10 T 13 12 41488 CASAVA_Build 1 52932999 7D GAAAAAATTT AAAAATA/------- AAAAATAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AAAAATA 2 1 41489 CASAVA_Build 1 52939652 2D TTCCCCTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2705 hom 5 het 17 0 9 8 T 16 14 41490 CASAVA_Build 1 52949588 1I AGCCATGAGC -/A AAATACACAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 3 4 41491 CASAVA_Build 1 52953225 1D TATTCAGTTG A/- TGACAGCAAT 3070 hom 81 het 33 0 27 7 A 1 0 41492 CASAVA_Build 1 52956379 1D AACAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 11 10 41493 CASAVA_Build 1 52964187 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 416 het 199 hom 11 3 4 4 A 18 16 41494 CASAVA_Build 1 53075667 2I TCTGTCTCAG --/AA AAAAAAAAAA 2100 hom 24 het 10 0 9 1 A 14 16 41495 CASAVA_Build 1 53075790 1I AGATGGTGCC -/A TTGCACTCCA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 0 1 41496 CASAVA_Build 1 53077060 2D ACATAATTGA TT/-- TTTTTTTCTT 3070 hom 45 het 18 0 16 3 T 9 7 41497 CASAVA_Build 1 53093454 11D GCTCTTGCTG TAGTCTTGTTT/----------- ACCATTCTTT 1399 hom 10 het 4 0 4 1 TAGTCTTGTTT 1 0 41498 CASAVA_Build 1 53094979 1I GGGGTTGACT -/C CCTGATTCTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 2 3 41499 CASAVA_Build 1 53099957 1I AGCGAGACTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 9 10 41500 CASAVA_Build 1 53106332 1I GTTCACGCGA -/T TCCCCTGCCT 1680 hom 10 het 7 0 4 4 T 1 2 41501 CASAVA_Build 1 53112364 14D4M1D ACCCCATCCT GATCACCATCTTGATCAGT/--------------TCAG- CGGCCACCAT 3070 hom 30 het 13 0 11 4 N/A 0 0 41502 CASAVA_Build 1 53112500 2D TCTCTCTCTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TA 6 5 41503 CASAVA_Build 1 53123579 2D TTTTTTGTTT TG/-- TGTTTTGTTT 863 hom 19 het 20 0 8 14 TG 2 1 41504 CASAVA_Build 1 53123938 2D TTTTCCCACA TT/-- GTTAAGATAT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 2 0 41505 CASAVA_Build 1 53140288 1D GATGAAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 27 1 17 9 A 12 11 41506 CASAVA_Build 1 53168580 1I AGTATATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 24 0 15 9 A 14 15 41507 CASAVA_Build 1 53173848 1I AGACTCAGTC -/A AAAAAAAAAA 2579 het 392 hom 19 1 13 5 A 15 16 41508 CASAVA_Build 1 53185021 1D TTATATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 21 2 16 3 A 15 14 41509 CASAVA_Build 1 53192242 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 26 1 21 4 A 11 10 41510 CASAVA_Build 1 53196867 3D GTTTGTTAAT ATG/--- ATGAATTATA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 ATG 2 1 41511 CASAVA_Build 1 53267527 1D TCTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2984 het 922 hom 18 3 10 5 T 15 14 41512 CASAVA_Build 1 53293913 1D CACTGTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 647 hom 36 3 20 13 T 15 14 41513 CASAVA_Build 1 53331172 2I AGAGCGAGAC --/TG TGCCAAGGTG 3070 hom 54 het 21 0 16 5 TG 1 2 41514 CASAVA_Build 1 53331998 3I TGCTCTCACG ---/TCT TCCTCCTCTC 3070 hom 54 het 23 0 15 8 TCT 0 1 41515 CASAVA_Build 1 53344860 1I ACACCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 26 3 11 12 A 15 16 41516 CASAVA_Build 1 53345841 4I GCTTGAGAAG ----/CTCT CTAAGACAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 1 3 41517 CASAVA_Build 1 53357339 1I CACTGCCTGC -/A TTTTGGGTCT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 0 1 41518 CASAVA_Build 1 53365127 2D GCTTATCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 26 7 T 12 10 41519 CASAVA_Build 1 53367446 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1599 hom 12 het 5 0 4 1 A 11 12 41520 CASAVA_Build 1 53370999 1I CCAGCTACTT -/G GGGGGGCTGA 3058 het 3058 ref 20 9 10 1 G 6 7 41521 CASAVA_Build 1 53373225 1D TTCTCACCCA T/- TTTTCAGACC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 5 4 41522 CASAVA_Build 1 53391438 1D TACTGACTAG C/- CTACCAGAAC 3070 het 3070 hom 38 19 19 1 C 2 1 41523 CASAVA_Build 1 53392290 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2471 het 1648 hom 20 9 7 5 T 15 14 41524 CASAVA_Build 1 53398103 3I TATTTTGCAG ---/ATA ATGAGTCCAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ATA 0 1 41525 CASAVA_Build 1 53402642 4I AGAGAAAGAG ----/AAAA AGAAAGAAAG 2644 hom 32 het 14 0 11 3 A 1 5 41526 CASAVA_Build 1 53402724 4D AGGGAGGGAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 2085 hom 31 het 13 0 9 5 GGAA 5 4 41527 CASAVA_Build 1 53405117 4D AAGGACAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 AAAG 3 2 41528 CASAVA_Build 1 53408956 1D TCTCTTAATT A/- AAAAAAAAAA 2401 het 586 hom 28 2 11 15 A 17 16 41529 CASAVA_Build 1 53430105 8D AGAGGCATCT CAGTCAGA/-------- CAGCCAGGGT 3070 hom 63 het 23 0 20 8 CAGTCAGA 1 0 41530 CASAVA_Build 1 53437346 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCGCTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AG 1 2 41531 CASAVA_Build 1 53449861 8D TTTTTCTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 19 5 T 18 10 41532 CASAVA_Build 1 53450328 1I GATATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1818 het 107 hom 14 2 7 5 T 15 16 41533 CASAVA_Build 1 53471476 1D GGTAGCAGTC A/- AGAGTGAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 A 2 1 41534 CASAVA_Build 1 53478862 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 29 1 19 9 A 15 16 41535 CASAVA_Build 1 53497002 1D TAATGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 13 12 41536 CASAVA_Build 1 53504334 2D GTCACTGTGT TG/-- TGAGTGGGAT 3070 hom 141 het 48 0 47 3 TG 2 1 41537 CASAVA_Build 1 53504442 1D TTCTTCCTTT C/- TGCCCTGGCC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 C 1 0 41538 CASAVA_Build 1 53505733 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 23 8 A 11 10 41539 CASAVA_Build 1 53506626 1D TGTGGATTTT G/- TATATGCATG 3070 hom 117 het 43 0 40 5 G 1 0 41540 CASAVA_Build 1 53528370 1D GCAGGCGCCA G/- GGGAGTTTGT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 4 3 41541 CASAVA_Build 1 53539991 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 907 hom 36 3 20 13 A 13 14 41542 CASAVA_Build 1 53548466 6D GAGACGGGCT GGGGCA/------ GGGGCAGGGG 3070 hom 70 het 30 0 20 12 GGGGCA 3 2 41543 CASAVA_Build 1 53557048 1D CATTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 1448 het 1448 ref 34 26 5 4 A 12 11 41544 CASAVA_Build 1 53586744 1D CCCAGGTTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 65 het 28 0 22 8 T 9 8 41545 CASAVA_Build 1 53603235 18I TGTGGAAAGG ------------------/GAGGGAAAAGGGTAACTT GAGGGTTACA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 GAGGGAAAAGGGTAACTT 0 1 41546 CASAVA_Build 1 53604779 1D GCTCTGTTGT C/- CAGGCTGTAG 3070 hom 69 het 25 0 19 7 C 2 1 41547 CASAVA_Build 1 53606313 3D CAGATGCAAC CTT/--- CTTCACGAAA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 CTT 2 1 41548 CASAVA_Build 1 53609417 1I GGCCCAGCCA -/G CGGCTGTGGT 2785 het 2785 ref 23 10 10 3 G 0 1 41549 CASAVA_Build 1 53609881 1I GAAAAAGACA -/C CCCCCCCCAC 1215 het 473 hom 19 1 8 10 C 8 9 41550 CASAVA_Build 1 53615172 1I ATCTCCCTTT -/C CTCCTATCTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 1 2 41551 CASAVA_Build 1 53615337 2I CTTGGGGCAC --/AA AAAGCACTGC 1305 het 1305 ref 24 10 6 8 A 3 5 41552 CASAVA_Build 1 53644407 1I AATCTTCCTG -/C CCTTGGCCTC 3070 het 2151 hom 30 7 12 11 C 2 3 41553 CASAVA_Build 1 53661372 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 10 9 41554 CASAVA_Build 1 53670950 1D TGGAGTAATG A/- AAGAACATGT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 A 3 2 41555 CASAVA_Build 1 53675786 1D TTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 31 2 10 19 T 13 12 41556 CASAVA_Build 1 53691558 1D GTATTTTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 A 10 9 41557 CASAVA_Build 1 53693756 1D TGCTATAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 13 12 41558 CASAVA_Build 1 53703942 1D TTGCACACTT C/- CTGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 C 2 1 41559 CASAVA_Build 1 53732067 1I ATCCTCCCAC -/T TCAGCCTCCC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 T 1 2 41560 CASAVA_Build 1 53732854 3D ACATGGTGAA ACC/--- CCCCCGTCTC 1464 hom 10 het 4 0 4 0 ACC 1 0 41561 CASAVA_Build 1 53735611 10I TCAACACAAC ----------/CTTATGTGTG ATCATAGTTT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 CTTATGTGTG 0 1 41562 CASAVA_Build 1 53739848 3D TCTCAGCAGA GGG/--- GCCTCCCGAG 2149 het 2149 ref 25 11 8 7 G 4 1 41563 CASAVA_Build 1 53746421 1I CTGGGGTAAT -/A ACATGTGCAG 3070 hom 96 het 43 0 28 15 A 1 2 41564 CASAVA_Build 1 53755908 1I GGGGTTGGGT -/G GGGGGGTCTC 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 G 6 7 41565 CASAVA_Build 1 53759535 1D GGTGCGTTCT G/- TGCAGCCGCA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 G 1 0 41566 CASAVA_Build 1 53761250 4I TTTCTTTCTT ----/TTTC TTTTTTTTTT 982 het 28 hom 19 1 7 11 TTTC 0 1 41567 CASAVA_Build 1 53777513 2I29M4D ATTCACACAC --ACACACACACCAAGACCCAGAAACTCCCTCACA/AGACACACACACCAAGACCCAGAAACTCCCT---- CACACACACA 3070 het 1926 hom 45 12 27 17 N/A 0 0 41568 CASAVA_Build 1 53784860 1D AGAGATGGCA G/- GGCTCGTCAA 3070 hom 114 het 44 0 36 8 G 3 2 41569 CASAVA_Build 1 53785210 1D TCCCCTGACT G/- GGTATGGAAG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 G 3 2 41570 CASAVA_Build 1 53789928 1D GGCAGTCCCT C/- CCCGGTGAGG 3070 hom 50 het 21 0 18 3 C 4 3 41571 CASAVA_Build 1 53807748 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAGCCT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 6 7 41572 CASAVA_Build 1 53825236 1D ACTGTTACAC A/- CAGCGCAACA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 1 0 41573 CASAVA_Build 1 53829066 1I TGGGGGATGG -/A TGATGCCATT 2639 het 2639 ref 28 15 9 4 A 0 1 41574 CASAVA_Build 1 53836172 1I CTAGCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 9 10 41575 CASAVA_Build 1 53839324 1D ATACACCTCC A/- AACTCCATTT 3070 hom 136 het 53 0 45 8 A 3 2 41576 CASAVA_Build 1 53843174 8D TATATATATA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 833 hom 15 het 19 0 6 15 TG 10 6 41577 CASAVA_Build 1 53843217 6D ATATATATAT ACACAC/------ ACACACACAC 36 het 3 hom 9 0 1 9 AC 8 5 41578 CASAVA_Build 1 53843304 1I GCTGTTAATC -/T GCCAACCCCC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 0 1 41579 CASAVA_Build 1 53845393 2I TACCTAGGCA --/AG AATTAGAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 AG 0 1 41580 CASAVA_Build 1 53851915 1I TTTTTGGTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 408 hom 38 1 32 5 T 9 10 41581 CASAVA_Build 1 53853058 4I CACACGCACA ----/CACT CACACGCACA 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 CACT 0 1 41582 CASAVA_Build 1 53855519 2I AGGGATGGCC --/AA AACTCACCAC 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 2 4 41583 CASAVA_Build 1 53873809 1D ACAAGATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 17 7 A 11 10 41584 CASAVA_Build 1 53876660 1D GGGCAGGCCT C/- CCCCAGGCCA 1264 het 1264 ref 37 22 7 9 C 5 4 41585 CASAVA_Build 1 53895284 1I AGCGATATCA -/C CAGTCCCCAC 3070 hom 116 het 43 0 38 5 C 1 2 41586 CASAVA_Build 1 53908195 11D GCAGCTTGCA GCCCAGCCAAG/----------- GCCCAGCCAG 3070 het 3070 ref 47 27 16 12 GCCCAGCCAAG 1 0 41587 CASAVA_Build 1 53920053 1I51M1I CAGAGCTGAG -TGCATTCGAGGTTGCTGTGGGTGGGTGGAGCAACTGGGACTGAACCCCCTC-/ATGCATTCGAGGTTGCTGTGGGTGGGTGGAGCAACTGGGACTGAACCCCCTCT TCTCCTCCCC 3070 het 3070 ref 45 29 24 12 N/A 0 0 41588 CASAVA_Build 1 53921433 1I CACTTCTGGC -/A AGACACATTC 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 A 1 2 41589 CASAVA_Build 1 53921609 1D AGAGCCTGAG C/- CCCCCCAACC 3070 hom 84 het 31 0 27 4 C 7 6 41590 CASAVA_Build 1 53922893 10I AAATCAAGAA ----------/CTTTCAGTGG CTCACTAGTG 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 CTTTCAGTGG 0 1 41591 CASAVA_Build 1 53930353 1D CCCCTCAAAC T/- GCCTCCCTTT 3070 het 3070 ref 45 23 21 1 T 1 0 41592 CASAVA_Build 1 53931625 1D GATCCATCTT C/- CCTGCTGCTG 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 C 3 2 41593 CASAVA_Build 1 53933687 3D AAGACTAACC AGA/--- AGAAGGTGAC 3070 het 3070 ref 42 19 19 5 AGA 2 1 41594 CASAVA_Build 1 53934918 1I ATTTCTCTCC -/G TTCCCTCCAC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 G 0 1 41595 CASAVA_Build 1 53937330 5D TTATTTTTAT TTTTA/----- TTTTTTTTTG 897 het 897 ref 17 8 4 9 TTTTA 1 0 41596 CASAVA_Build 1 53941016 4I CACAGAAGAC ----/TCTG TCTGGCCACA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 TCTG 1 2 41597 CASAVA_Build 1 53969146 1D AACTCTCAAG T/- TCACTCTGAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 2 1 41598 CASAVA_Build 1 53971064 1D AATCTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 34 1 29 4 A 13 12 41599 CASAVA_Build 1 53975243 1I CCCCTAAGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 31 het 32 1 21 10 A 9 10 41600 CASAVA_Build 1 53979617 1D AGGTATATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 25 9 6 T 12 11 41601 CASAVA_Build 1 53981879 2D GTCAAGAGCG TC/-- TCTGCCTCCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TC 2 1 41602 CASAVA_Build 1 53982175 2D TGGCAGTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2898 het 47 hom 38 2 16 20 T 20 18 41603 CASAVA_Build 1 53999563 1D TCAACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1732 hom 19 5 11 4 A 12 11 41604 CASAVA_Build 1 54004439 1I GCAAAAACCT -/A AACCTAGCTG 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 A 2 3 41605 CASAVA_Build 1 54014226 1I CTTTTTTTTT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 330 hom 29 2 17 10 A 0 1 41606 CASAVA_Build 1 54015293 1I TTTTGTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 13 14 41607 CASAVA_Build 1 54019125 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 13 12 41608 CASAVA_Build 1 54023220 1D ACTCAATCTC A/- AAAAAAAAAA 759 het 759 ref 31 17 3 11 A 13 12 41609 CASAVA_Build 1 54027159 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1780 het 1780 ref 35 24 4 7 A 11 12 41610 CASAVA_Build 1 54035633 1I ATAGTCTCTC -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 5 6 41611 CASAVA_Build 1 54061894 5D TCCCTAACAC TTTCT/----- TTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 TTTCT 1 0 41612 CASAVA_Build 1 54087737 1D TGAAAGATCA G/- GCACGGGTTT 3070 het 3070 ref 33 14 12 8 G 2 1 41613 CASAVA_Build 1 54092522 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 37 1 28 8 A 11 10 41614 CASAVA_Build 1 54131096 1I ATGGCTTGAG -/C CCAGGAGTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 2 3 41615 CASAVA_Build 1 54162363 2D ATTTAAAAAT AG/-- AGGTATATGA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 AG 2 1 41616 CASAVA_Build 1 54164984 1D ACATTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 920 het 920 ref 30 22 4 6 T 15 14 41617 CASAVA_Build 1 54236393 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 26 1 24 1 A 11 10 41618 CASAVA_Build 1 54238222 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 14 15 41619 CASAVA_Build 1 54243188 3D TACCTCATAG TGT/--- TGTTGTGTGG 3070 hom 162 het 58 0 53 5 TGT 3 2 41620 CASAVA_Build 1 54361316 19D CTTCCAACCC CACCCAGCCTTTGGCCTGG/------------------- CACCCAGCCC 3070 hom 96 het 38 0 30 11 CACCCAGCCTTTGGCCTGG 1 0 41621 CASAVA_Build 1 54364391 1I AGGGCCTCAG -/A AGCCCAGAAC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 2 41622 CASAVA_Build 1 54365030 5D TTTTCTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 27 6 T 22 17 41623 CASAVA_Build 1 54365256 2I TGGTTATGAA --/CC ACTACCATTT 3070 hom 99 het 35 0 34 11 C 0 2 41624 CASAVA_Build 1 54365886 3I TGGTGCCTTA ---/AAT AATAACTTCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAT 1 2 41625 CASAVA_Build 1 54369724 1D TATAAATGCA T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 7 6 41626 CASAVA_Build 1 54373007 2D TGTTTTGTTT TG/-- TTTTTTGAGA 3070 het 1631 hom 19 5 9 5 TG 1 0 41627 CASAVA_Build 1 54377907 1I GACCATTCAT -/G GGGGGGGGCA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 G 8 9 41628 CASAVA_Build 1 54386669 1D TTTGACAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 29 6 9 15 A 12 11 41629 CASAVA_Build 1 54390723 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1351 het 1351 ref 33 14 5 14 A 13 14 41630 CASAVA_Build 1 54392005 1D TGCAGAAATG C/- CCCGGGGACT 3070 het 2581 hom 26 10 11 5 C 4 3 41631 CASAVA_Build 1 54392585 1D TGGAGGTTGA C/- TGGCAGGAAA 3070 het 2845 hom 22 7 10 5 C 1 0 41632 CASAVA_Build 1 54406413 1I CATTTTCCCT -/C CCATTGTTCC 3070 het 3070 hom 47 21 25 1 C 2 3 41633 CASAVA_Build 1 54443247 3D TTTTTCTTTC CTT/--- CTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 CTT 2 1 41634 CASAVA_Build 1 54445167 2D AGCTAATTTT TG/-- TGTGTGTGTG 1810 het 62 hom 11 1 7 3 TG 10 9 41635 CASAVA_Build 1 54449752 1I TCCTAGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 10 11 41636 CASAVA_Build 1 54455192 5I GGATGCATTC -----/ATTTT GTTTCATCCC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 ATTTT 0 1 41637 CASAVA_Build 1 54483538 6D TCCCACTTCA GTCTCC/------ CAGAAAAGGA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 GTCTCC 1 0 41638 CASAVA_Build 1 54488803 1D GGGCGGGAAT G/- GGGGGGGGCA 1114 het 872 hom 18 5 3 10 G 9 8 41639 CASAVA_Build 1 54509875 1D CCTCCCTGAC G/- GCCGAGCTGG 3070 hom 77 het 30 0 21 9 G 2 1 41640 CASAVA_Build 1 54521534 3D CCCATCTCAT AAA/--- AAAAAAAAAA 2089 het 714 hom 17 7 5 5 A 19 16 41641 CASAVA_Build 1 54527343 1I TCACCCCTGT -/A AGTTCCCAGG 3070 het 2256 hom 19 9 9 1 A 1 2 41642 CASAVA_Build 1 54529418 1D TTCTAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 11 10 41643 CASAVA_Build 1 54529750 2I GCACAGTTGC --/CA CACACGGGTT 3070 hom 94 het 36 0 27 9 CA 2 3 41644 CASAVA_Build 1 54532693 1D ATTGGTCATT A/- AAAATGGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 5 4 41645 CASAVA_Build 1 54537764 1D TAGAGGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 33 1 17 16 T 13 12 41646 CASAVA_Build 1 54547169 1I CCTCCCCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 A 11 12 41647 CASAVA_Build 1 54551781 4D CTCCTGGGCT CAAA/---- CAATCTTCCC 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 CAAA 1 0 41648 CASAVA_Build 1 54551964 1I GATGCTACTC -/A AGAGTCAAGA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 1 2 41649 CASAVA_Build 1 54552182 3I TGCCCACCAC ---/CAT ACCTGGCTAA 3070 het 2305 hom 18 7 8 3 CAT 0 1 41650 CASAVA_Build 1 54558745 1D TGCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 1904 hom 21 5 14 2 T 8 7 41651 CASAVA_Build 1 54649740 1I CTCTGTCTTG -/A AAAAAAAAAA 2203 het 2203 ref 20 10 8 2 A 13 14 41652 CASAVA_Build 1 54649990 1D CGTCTCTACT A/- AAAATACAAA 2466 het 963 hom 11 3 6 2 A 5 4 41653 CASAVA_Build 1 54661599 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 17 9 4 A 10 9 41654 CASAVA_Build 1 54663020 1D CTTAATGTAG T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 87 het 34 0 29 6 T 8 7 41655 CASAVA_Build 1 54663107 2I ATATATACAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 10 12 41656 CASAVA_Build 1 54664287 1D TTTCATTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 639 hom 22 3 14 6 T 13 12 41657 CASAVA_Build 1 54667131 5D TGTCTCAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 260 het 109 hom 19 1 4 15 AAAAG 1 0 41658 CASAVA_Build 1 54669452 8D GGGGCAGAGG CTGCAGAA/-------- CACCGCATTT 3070 het 3070 ref 38 21 14 7 CTGCAGAA 1 0 41659 CASAVA_Build 1 54670206 1D CATTTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2117 hom 15 het 8 0 6 2 A 11 10 41660 CASAVA_Build 1 54673983 1D TTTTTCACCT A/- AATAGATCCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 3 2 41661 CASAVA_Build 1 54680685 1D ACTTGACCCC T/- TGTTGACACA 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 T 2 1 41662 CASAVA_Build 1 54680820 1D AGCCTACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 221 hom 29 3 11 15 T 11 10 41663 CASAVA_Build 1 54689794 1D ATTTCAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 12 11 41664 CASAVA_Build 1 54690368 1I TCTGTCTCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1063 hom 26 3 18 5 A 14 15 41665 CASAVA_Build 1 54691779 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1956 hom 28 7 11 10 T 12 11 41666 CASAVA_Build 1 54693759 1I TACACATAAA -/T TTCATGATAT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 2 3 41667 CASAVA_Build 1 54694899 1D GTTTCCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 12 11 41668 CASAVA_Build 1 54696246 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1550 hom 15 het 7 0 6 1 A 13 14 41669 CASAVA_Build 1 54704261 1D TTGTGGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3059 het 2780 hom 22 7 11 4 T 11 10 41670 CASAVA_Build 1 54722610 2D GGTGGAGTGG GA/-- AGTCAAGAAT 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 GA 1 0 41671 CASAVA_Build 1 54727160 1I TATGCTCCAG -/C CCCCTGACTT 1281 het 1281 ref 12 6 4 2 C 4 5 41672 CASAVA_Build 1 54727961 1D AGCCGGGGAG T/- TACCTGGGCA 1268 het 1268 ref 19 7 5 7 T 2 1 41673 CASAVA_Build 1 54731733 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 1099 hom 17 het 14 0 10 4 A 9 10 41674 CASAVA_Build 1 54731994 1D CAGGAAGCCC T/- CCTTGATGCC 3070 hom 135 het 47 0 44 3 T 1 0 41675 CASAVA_Build 1 54746444 1D ATTTTTTTTT G/- TGTGTGTGTG 1493 het 1493 ref 24 7 7 10 G 1 0 41676 CASAVA_Build 1 54750247 2D CTCTCAGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 2413 het 1174 hom 14 3 7 4 T 14 12 41677 CASAVA_Build 1 54752422 2D AGCGAGACTC TG/-- TCTCAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 TG 1 0 41678 CASAVA_Build 1 54755610 1I TGGCACAAAG -/T TGGGTGCAAT 3070 hom 157 het 59 0 53 6 T 1 2 41679 CASAVA_Build 1 54758284 2D AGGCCCTGGT GC/-- GCAGAGCAGT 3070 hom 68 het 30 0 21 9 GC 2 1 41680 CASAVA_Build 1 54767046 1I CTTGGGCACC -/T TGCCAACATG 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 T 1 2 41681 CASAVA_Build 1 54792781 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2105 het 2105 ref 22 8 7 7 T 10 11 41682 CASAVA_Build 1 54808943 1D GTGCCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 2957 het 381 hom 10 1 7 2 T 13 12 41683 CASAVA_Build 1 54810459 3D GACGCCTTTC CTT/--- TCTCTCTCTC 227 het 227 ref 35 17 1 17 CTT 1 0 41684 CASAVA_Build 1 54822547 2D CTCCCTGCAT AG/-- AGAGGCGACT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 AG 3 2 41685 CASAVA_Build 1 54824580 1D GGAGGCCCCC T/- AGACAAGGTG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 1 0 41686 CASAVA_Build 1 54848726 29D AGGAACCAGC CACTCCACATTCAGACCGTCATCCCCAGG/----------------------------- CAGCTGGAGA 3070 het 3070 ref 35 22 14 6 CACTCCACATTCAGACCGTCATCCCCAGG 1 0 41687 CASAVA_Build 1 54851280 1D TGACTCAGAG C/- CCCCAGCGTG 3070 hom 74 het 29 0 22 7 C 5 4 41688 CASAVA_Build 1 54855245 2I GAGATTACAG --/GT GTGAGTCTCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GT 1 2 41689 CASAVA_Build 1 54861108 1D AGCTGTGGAT G/- GGGGAATGAG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 G 5 4 41690 CASAVA_Build 1 54864763 10D CACAACACTG CCAAATGACT/---------- CTCATGTCCC 3070 hom 69 het 24 0 24 1 CCAAATGACT 1 0 41691 CASAVA_Build 1 54878171 3I TTCCCCTGAC ---/GAG GAGGAGGATA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 GAG 2 3 41692 CASAVA_Build 1 54879153 3D CTGAAGCAGC AGA/--- AGGAGACTGG 3070 hom 78 het 30 0 25 7 AGA 1 0 41693 CASAVA_Build 1 54880097 1D TCCACAGCCT C/- CCACAAGGGA 3070 hom 99 het 38 0 33 6 C 3 2 41694 CASAVA_Build 1 54884599 1D TTTCCGGGTC T/- TTTTGGCTGG 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 5 4 41695 CASAVA_Build 1 54895948 1D TATCTTAACC T/- TTTTTTTTTT 1441 het 1441 ref 29 18 5 6 T 13 12 41696 CASAVA_Build 1 54908336 1I TAAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 61 hom 25 1 19 5 A 9 10 41697 CASAVA_Build 1 54911152 1I TAATTAGCAA -/T TTGTTGATAA 3070 hom 77 het 36 0 32 4 T 2 3 41698 CASAVA_Build 1 54913247 1D TAATTCATGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 10 9 41699 CASAVA_Build 1 54920422 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 27 0 13 14 T 17 16 41700 CASAVA_Build 1 54923794 1I CCACTCCCCA -/C CCCCCTAGTA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 5 6 41701 CASAVA_Build 1 54937451 10D24M1I TTTCTTTCTC TTTCTTTCTTTCTTTCTCTCCCTCTCTTTCTTTC-/----------TCTTTCTCTCCCTCTCTTTCTTTCT TCCTTTCTTC 1443 het 1443 ref 7 6 3 3 N/A 0 0 41702 CASAVA_Build 1 54958699 1D GACTGCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1106 hom 34 8 15 11 T 15 14 41703 CASAVA_Build 1 54958755 1D AGATATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 40 2 20 18 T 15 14 41704 CASAVA_Build 1 54965125 4I CCTCAAACTC ----/CTGG CTGGGCTCAA 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 CTGG 1 2 41705 CASAVA_Build 1 54974562 1D TCTCCAACTC T/- TAATTCAACA 3070 hom 111 het 43 0 35 9 T 2 1 41706 CASAVA_Build 1 54984854 1I17M1I TATTTTTATT -AAAAAAATTAAAAAAAA-/AAAAAAAATTAAAAAAAAT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 23 15 10 2 N/A 0 0 41707 CASAVA_Build 1 54989462 2I CAACCTCTGC --/CT CCTGGGCTCA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 CT 0 1 41708 CASAVA_Build 1 54993620 1I TTTAAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 2813 het 1966 hom 15 4 6 5 T 9 10 41709 CASAVA_Build 1 55035547 2D GTGTATACAC AT/-- GTGTGTATAT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 AT 1 0 41710 CASAVA_Build 1 55040646 2D TGACATTAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 26 0 17 9 A 15 13 41711 CASAVA_Build 1 55041868 1D TTATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 11 10 41712 CASAVA_Build 1 55048137 1I GTCCAGCCTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 59 het 23 0 19 4 A 9 10 41713 CASAVA_Build 1 55051934 7D TGAGGCTGGC CCGGCCT/------- CCGGCCTCCG 2746 hom 28 het 14 0 8 6 CCGGCCT 2 1 41714 CASAVA_Build 1 55053720 2D CTCCTTCCAT CC/-- TCTGTGTTTG 3070 hom 96 het 37 0 32 6 C 2 0 41715 CASAVA_Build 1 55055986 1D30M14D TAATCCAGTA TTTTTTTTTTTTTGAAATTATGGTGAGGACATGAGGACCAGATTC/-TTTTTTTTTTTGGAAATTATGGTGAGGACA-------------- TGAGGACCAG 3070 het 359 hom 33 1 33 8 N/A 0 0 41716 CASAVA_Build 1 55057026 1D CTAATTTTTG T/- TATTTTTTGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 1 41717 CASAVA_Build 1 55058370 12D TCTTTCTCTC TCTCTCTTTCTT/------------ TCTTTCTTTC 2420 hom 37 het 14 0 11 3 TCTCTCTTTCTT 1 0 41718 CASAVA_Build 1 55076170 1I GGCATTGAGT -/A TATATCTGTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 0 1 41719 CASAVA_Build 1 55076747 1I CATCTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 33 1 25 7 A 11 12 41720 CASAVA_Build 1 55077197 1I GGCAGGGATT -/G GGGGGGAGTA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 6 7 41721 CASAVA_Build 1 55077392 1D CAGGGAGGAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 63 het 24 0 22 4 A 8 7 41722 CASAVA_Build 1 55083233 3D TTTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 2833 het 12 hom 24 1 16 7 T 23 20 41723 CASAVA_Build 1 55099142 3D CCAGCTACTC GGG/--- GGGCTGAGGC 1015 het 6 hom 8 0 4 5 G 6 3 41724 CASAVA_Build 1 55099256 3D CTCAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3003 het 29 hom 17 1 8 10 A 17 14 41725 CASAVA_Build 1 55104931 1D ACCTGCTCTA C/- CCTACAGCCA 3070 hom 69 het 26 0 23 4 C 3 2 41726 CASAVA_Build 1 55106926 52D AAGAATGGAC ATTAACAGTGATGGTTATGAAGGCAATGTAATAGTTCTAATAAAAGATGGAT/---------------------------------------------------- ATTAACAATG 3070 hom 48 het 17 0 16 7 ATTAACAGTGATGGTTATGAAGGCAATGTAATAGTTCTAATAAAAGATGGAT 1 0 41727 CASAVA_Build 1 55107850 2I ACATACATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 37 het 26 0 13 13 AC 8 9 41728 CASAVA_Build 1 55108479 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 19 6 A 11 10 41729 CASAVA_Build 1 55109084 31D TGTTTGTACC TTCCAAGTCTCTTACAATAAGCACAAATCCT/------------------------------- TTCCAAGTCT 3070 hom 71 het 34 0 23 15 TTCCAAGTCTCTTACAATAAGCACAAATCCT 2 1 41730 CASAVA_Build 1 55112230 1I AGTTTTTAAC -/A AAAAAAACTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 7 8 41731 CASAVA_Build 1 55116454 1I GAAGCCAGGG -/A AAAAAACTGC 3070 hom 81 het 35 0 27 8 A 6 7 41732 CASAVA_Build 1 55116605 1D CGCCTCTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 14 0 9 5 A 12 11 41733 CASAVA_Build 1 55156641 1I TACTTTCAAG -/A AAGTCGTGGT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 2 3 41734 CASAVA_Build 1 55166408 1D TGCCCTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 34 1 16 17 T 12 11 41735 CASAVA_Build 1 55169498 4D CTCAAAAAAC AACA/---- AACAAACAAA 3070 hom 65 het 25 0 22 6 AACA 7 6 41736 CASAVA_Build 1 55171255 3D7M8I AATCTATCTG CATTTTACTA--------/---TAAACTAAACAACAT CAGCATTTAT 3070 hom 135 het 48 0 46 4 N/A 0 0 41737 CASAVA_Build 1 55172300 1I TAGAAAATCC -/T TTCCTTGGAT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 T 2 3 41738 CASAVA_Build 1 55173389 2D CTATGACTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 30 8 A 13 11 41739 CASAVA_Build 1 55173551 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 T 13 11 41740 CASAVA_Build 1 55183203 17D CAAGTAGAGT CTGGCACAAAGTAGGTA/----------------- CCTGGACTGA 3070 het 3070 ref 35 19 15 6 CTGGCACAAAGTAGGTA 1 0 41741 CASAVA_Build 1 55188470 1D GCCTGTGAGT G/- GGGGGGGCTT 3070 hom 52 het 24 0 17 7 G 8 7 41742 CASAVA_Build 1 55189061 1I ATGTCCTCCA -/T TTACCGCAAC 3070 het 3070 ref 53 31 16 6 T 2 3 41743 CASAVA_Build 1 55193176 3I AAGTTGACTT ---/TTG TTTATTGAAG 3070 hom 122 het 45 0 41 4 TTG 0 1 41744 CASAVA_Build 1 55198777 3D TTAATTGGTT TAA/--- TAATAATAAG 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 TAA 4 3 41745 CASAVA_Build 1 55220241 1I CCCATTTACA -/G GGGAGGACAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 3 4 41746 CASAVA_Build 1 55224030 1D GTCCCAGCTT C/- CTGTGTGGCA 3070 hom 81 het 36 0 26 10 C 2 1 41747 CASAVA_Build 1 55249574 1D TATTAGGAGG C/- CCCTTTCACG 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 C 4 3 41748 CASAVA_Build 1 55251322 2I CCTGGTCCAC --/AT GTCATAAGAC 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 AT 0 1 41749 CASAVA_Build 1 55254861 2D TTGTTGTTGT TG/-- TTGTTTGTTT 1223 het 1223 ref 43 8 4 31 TG 1 0 41750 CASAVA_Build 1 55265748 4D ACTCTTGAAG TAAA/---- TAAATAATCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TAAA 2 1 41751 CASAVA_Build 1 55266432 1D TTGCGACCCC G/- CACTCCTACC 1789 hom 12 het 6 0 4 2 G 1 0 41752 CASAVA_Build 1 55269044 6I TCATCTGTGG ------/AAAAAT ACAAATACAA 3070 hom 74 het 28 0 23 5 AAAAAT 0 1 41753 CASAVA_Build 1 55275302 2D TTCCAGCTCC TT/-- TGGGGGCTCC 2674 het 2674 ref 28 16 7 6 T 3 1 41754 CASAVA_Build 1 55282863 1D CTTAAAAAAA C/- GTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 C 1 0 41755 CASAVA_Build 1 55288257 3D CTCCTCACAC ACG/--- ACGAGGAACA 3012 het 3012 ref 33 21 8 6 ACG 2 1 41756 CASAVA_Build 1 55290779 1D CTGGGTTGCA C/- CCCCCCCAGC 3070 hom 66 het 24 0 18 6 C 8 7 41757 CASAVA_Build 1 55293584 1I AGAGAGTGGC -/G GGGGGAAGTT 1437 het 1437 ref 20 7 4 9 G 5 6 41758 CASAVA_Build 1 55295195 1D TAACCTAGGT C/- CCCCCTGGCC 3070 hom 78 het 29 0 24 5 C 6 5 41759 CASAVA_Build 1 55295330 4I GAATAGTTTC ----/CGGT CTATCTCCCC 2713 het 2713 ref 29 12 9 8 CGGT 0 1 41760 CASAVA_Build 1 55303206 4I AAGTATTTGA ----/TGAG TGAGTACTTT 3070 het 3070 ref 50 24 16 12 TGAG 1 2 41761 CASAVA_Build 1 55307002 2D TTGTATGTTC GT/-- GTAACAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 GT 2 1 41762 CASAVA_Build 1 55318053 2D TACTCACACA CT/-- GAGTACTCAC 3070 het 3070 ref 57 32 12 15 CT 1 0 41763 CASAVA_Build 1 55329474 1I AGGAACAGGG -/C CCGCACAGCA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 C 2 3 41764 CASAVA_Build 1 55330448 2I TTATTACACA --/TT GTTACGAACT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 0 2 41765 CASAVA_Build 1 55339000 5D GGCAAGAGAT TAGTC/----- TAAAGTTAAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TAGTC 1 0 41766 CASAVA_Build 1 55344181 1I TTATTTGTTC -/T TCCATTCTGA 3070 hom 174 het 61 0 58 3 T 1 2 41767 CASAVA_Build 1 55363376 2D CACAGAATGC TT/-- TGTCTTGTAG 3070 het 3070 hom 41 17 22 4 T 3 1 41768 CASAVA_Build 1 55386625 2D ATCAATAAAC AT/-- AAAGATAGTG 3070 het 3070 hom 36 19 17 1 AT 1 0 41769 CASAVA_Build 1 55389444 1D CTAAGTATTT A/- AAAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 7 6 41770 CASAVA_Build 1 55413091 1I GGGGTCTCAC -/T ATGTTGCCCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 0 1 41771 CASAVA_Build 1 55416426 1D AAAAGCAAAT A/- AAACTAATTA 3070 het 3070 ref 48 22 20 7 A 4 3 41772 CASAVA_Build 1 55423998 1D ATCTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 34 1 19 14 T 13 12 41773 CASAVA_Build 1 55430413 4D GAGAGTTTAA TATT/---- TATTTAGAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 8 TATT 2 1 41774 CASAVA_Build 1 55433273 5D GATCTTCCTT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 133 het 50 0 39 12 AAAAC 5 4 41775 CASAVA_Build 1 55436415 1D TTAAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 11 10 41776 CASAVA_Build 1 55443783 1I TTCTAGATTT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 7 8 41777 CASAVA_Build 1 55445543 1D TGGAAAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2721 hom 36 11 11 14 A 15 14 41778 CASAVA_Build 1 55456192 4D GGAAGAAAGC AAGT/---- GAGTACTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AAGT 1 0 41779 CASAVA_Build 1 55456926 1I CCAAAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 37 2 30 5 A 10 11 41780 CASAVA_Build 1 55458558 1D TAAAAATACC A/- AAAAAAAATT 3070 het 2202 hom 19 7 12 0 A 9 8 41781 CASAVA_Build 1 55459836 2D TAATCTTCTG TT/-- TTTTTTTTGT 73 het 73 ref 14 7 1 6 T 10 8 41782 CASAVA_Build 1 55473702 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1229 hom 19 3 12 4 A 13 14 41783 CASAVA_Build 1 55476542 1D AAGCCCTTTC T/- TTTTTCAACC 3070 het 3070 hom 44 20 17 7 T 6 5 41784 CASAVA_Build 1 55477536 1I AAAGGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2550 hom 35 het 20 0 12 8 T 13 14 41785 CASAVA_Build 1 55477961 1D AAACAAATGG T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 7 6 41786 CASAVA_Build 1 55503799 1I TCATGCAAGC -/T TGTGTTATCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 1 2 41787 CASAVA_Build 1 55507827 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 9 8 41788 CASAVA_Build 1 55508208 1I ATTTGTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 26 0 15 11 T 11 12 41789 CASAVA_Build 1 55511427 1I CTCCACTGAT -/A ACCTCCCTGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 2 41790 CASAVA_Build 1 55514971 1I AAGTGAAAGT -/C CGTTTTACAC 3070 het 3070 ref 57 28 25 4 C 1 2 41791 CASAVA_Build 1 55516029 2I GCGTTCTCCC --/CT GTCACCAATG 3070 hom 100 het 41 0 32 9 CT 0 1 41792 CASAVA_Build 1 55517637 1D CCGAGTACCC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 8 41793 CASAVA_Build 1 55517712 1D TACTGGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 24 0 16 8 T 13 12 41794 CASAVA_Build 1 55522615 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 4 5 41795 CASAVA_Build 1 55526361 4I TCTCCATTGA ----/CTGT CATGCTGCTT 3070 hom 72 het 29 0 22 7 CTGT 0 1 41796 CASAVA_Build 1 55532184 1D AAAGCCCTTC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 6 41797 CASAVA_Build 1 55558235 5I CTCCAGCTGA -----/TGGGC TGGGCTATGG 3070 hom 150 het 55 0 45 10 TGGGC 1 2 41798 CASAVA_Build 1 55566506 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 819 hom 24 3 11 10 A 17 16 41799 CASAVA_Build 1 55567307 1I AGCTTGCACA -/G GGGGCCTCTT 3070 hom 93 het 33 0 30 3 G 4 5 41800 CASAVA_Build 1 55594864 1D CTCAGAGAGT G/- GAAGTGCTGT 3070 hom 126 het 52 0 42 13 G 2 1 41801 CASAVA_Build 1 55621474 2D GTGTGTGCAC GT/-- GTGTTTGTGA 3070 hom 165 het 64 0 53 12 GT 3 2 41802 CASAVA_Build 1 55625349 3I CTTTTTTCTA ---/TCC TCCTCCTCCT 2707 het 2707 ref 34 16 11 7 TCC 5 6 41803 CASAVA_Build 1 55630797 1D TTTGCTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 33 2 26 6 T 12 11 41804 CASAVA_Build 1 55632055 1I CTAGTAGTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 8 9 41805 CASAVA_Build 1 55641095 3D CATTCTACAT AAG/--- AAGAAAGAGG 3070 het 3070 hom 45 18 25 3 AAG 2 1 41806 CASAVA_Build 1 55648277 1D CTGATCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 279 hom 49 1 38 10 T 11 10 41807 CASAVA_Build 1 55658967 40D TCGGGCAGTG TTCTGGACCAGAAGTCTTTTAGATGACTTCTAATTTGACT/---------------------------------------- TTCTGGACCA 3070 hom 48 het 28 0 17 18 TTCTGGACCAGAAGTCTTTTAGATGACTTCTAATTTGACT 2 1 41808 CASAVA_Build 1 55660862 1I AAAATGCCAT -/C CTGCTGTGGC 3070 hom 57 het 40 1 37 2 C 1 2 41809 CASAVA_Build 1 55673298 4I CCAAGAATAG ----/ACAA ACAGAGAGCC 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 ACAA 0 1 41810 CASAVA_Build 1 55682431 4I CCCAAAGATC ----/CAGG CAGGGAAAGC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 CAGG 1 2 41811 CASAVA_Build 1 55682782 1D CTGACAAGGG A/- AAAGACTTGC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 4 3 41812 CASAVA_Build 1 55684371 1D CTTCATTTGT G/- GTGAGGAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 G 2 1 41813 CASAVA_Build 1 55685326 1D CATCTCTACT A/- AAAATACAAA 3070 het 1333 hom 20 4 13 5 A 5 4 41814 CASAVA_Build 1 55687526 3I CTATGAGGAG ---/AGA AGGTGATGAG 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 AGA 0 1 41815 CASAVA_Build 1 55690030 3I CACATTAGAC ---/ATT ATAGAAGATA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 ATT 0 1 41816 CASAVA_Build 1 55692503 3D GTACTTGGAA AAG/--- AAGAAGTAAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 AAG 3 2 41817 CASAVA_Build 1 55692638 1I TACCAGTCAA -/T TTGTACTTCT 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 T 2 3 41818 CASAVA_Build 1 55700526 1D AAGCATAATT A/- AAAAAAAGTC 3070 het 970 hom 17 2 12 5 A 8 7 41819 CASAVA_Build 1 55701063 4D ACTACCTCTT TAAG/---- TGTTTCTATT 3070 het 3070 hom 32 13 19 1 TAAG 1 0 41820 CASAVA_Build 1 55702688 7I TATCTATGTG -------/TCTCTTC TCTCTTCTCC 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 TCTCTTC 1 2 41821 CASAVA_Build 1 55703419 1D TCTAAGTGTT A/- ACAACAAAGA 3070 het 3070 hom 57 24 25 8 A 2 1 41822 CASAVA_Build 1 55703704 1D TGGCCTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 10 9 41823 CASAVA_Build 1 55706076 1I TGAGAACATG -/A AAAAAAGGAG 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 6 7 41824 CASAVA_Build 1 55709983 1D GGAGGAAACA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 118 het 47 0 40 9 T 7 6 41825 CASAVA_Build 1 55712296 1I GAGAATAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 13 13 T 12 13 41826 CASAVA_Build 1 55721618 11I TGTTGGCCAG -----------/GAGTAATACAT GAGAATTAGA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 GAGTAATACAT 0 1 41827 CASAVA_Build 1 55725571 1I CTTCTCCTAG -/T TACCTGGAGC 3070 hom 92 het 43 0 30 13 T 1 2 41828 CASAVA_Build 1 55731130 2D CCCTCTGTGC CA/-- CAGTTTTCTC 3070 het 3070 ref 46 25 14 9 CA 2 1 41829 CASAVA_Build 1 55739995 2D TTCTCATAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 11 13 T 16 14 41830 CASAVA_Build 1 55755165 1I CTTTAAATTG -/C CCTTTCAATG 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 C 2 3 41831 CASAVA_Build 1 55758349 2D CGAATAAAAC TG/-- TGACATGTTG 3070 het 3070 hom 57 20 27 10 TG 2 1 41832 CASAVA_Build 1 55787949 1D GAGTTTCCTT A/- ACTCTATTTT 3070 het 3070 hom 46 21 22 7 A 2 1 41833 CASAVA_Build 1 55789602 1D GTGTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 A 11 10 41834 CASAVA_Build 1 55789996 5D CACATTTGTT AAATC/----- TAATCTGTCA 3070 het 3070 ref 43 31 11 3 AAATC 1 0 41835 CASAVA_Build 1 55823217 1D GCTCAACCCC T/- TCCCAGTGCT 3070 het 3070 ref 45 22 13 10 T 2 1 41836 CASAVA_Build 1 55824105 1D CTTTTTTTTT C/- TCTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 C 1 0 41837 CASAVA_Build 1 55834948 1D TTAAATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 26 1 18 7 T 15 14 41838 CASAVA_Build 1 55835782 1D CTCTCTTCAA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 87 het 37 0 30 9 T 8 7 41839 CASAVA_Build 1 55839834 3I TGTTTGCACA ---/GAG GAGAGACTAT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 GAG 1 2 41840 CASAVA_Build 1 55841470 2I TAGAGAAAAG --/AA AAGTTTTCCC 1863 het 1863 ref 29 17 4 8 A 2 4 41841 CASAVA_Build 1 55849600 5I AAAAAACAAG -----/ACAAA ACAAAACAAA 3070 het 3070 hom 42 11 17 14 ACAAA 3 4 41842 CASAVA_Build 1 55852220 1D ATTTTGTATC T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 T 7 6 41843 CASAVA_Build 1 55852643 1I TCAAAGACAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 8 9 41844 CASAVA_Build 1 55854725 3I CTCCACAACC ---/TAA TAATGTAGCT 3070 het 3070 ref 58 27 26 5 TAA 1 2 41845 CASAVA_Build 1 55855522 1I ATTTTCAGAA -/G AAAGGGGGGC 3070 hom 96 het 33 0 32 1 G 0 1 41846 CASAVA_Build 1 55881920 15I AAGTCAGATA ---------------/TGATAAAAAGGGGCT TGTGATGAAT 3070 het 3070 hom 53 27 21 5 TGATAAAAAGGGGCT 0 1 41847 CASAVA_Build 1 55882166 1I AACTTTTCAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 A 9 10 41848 CASAVA_Build 1 55895555 1D CCATCATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2154 hom 34 10 14 10 T 12 11 41849 CASAVA_Build 1 55900369 2D ATATATACGG TA/-- TATATATATA 1748 hom 15 het 8 0 6 3 TA 8 7 41850 CASAVA_Build 1 55901446 2I ATATATGGTA --/TG TGTATATATA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 TG 1 2 41851 CASAVA_Build 1 55912705 1I GAAAGGGAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 9 10 41852 CASAVA_Build 1 55917852 1D CCTGCTCTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 T 9 8 41853 CASAVA_Build 1 55917968 1D ATGGGTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 41 1 31 9 T 12 11 41854 CASAVA_Build 1 55926928 1I TAATCATTTC -/A AAAAACCAGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 5 6 41855 CASAVA_Build 1 55937881 1I AATAATTTCA -/G GGGAGGTTAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 G 3 4 41856 CASAVA_Build 1 55939492 1I GAAGATAGAT -/G GGGGTGTTCC 3070 hom 102 het 42 0 34 8 G 4 5 41857 CASAVA_Build 1 55958143 1I CTTGAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 33 1 27 5 A 10 11 41858 CASAVA_Build 1 55959280 11D CCGAGTACCT AGGATTACAGG/----------- AGGATTACAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AGGATTACAGG 2 1 41859 CASAVA_Build 1 55962210 1I ATGGTGGAGA -/T TAAGAGAACC 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 T 1 2 41860 CASAVA_Build 1 55978633 1D GCTTTTGATG T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 T 8 7 41861 CASAVA_Build 1 55986336 1I ATTCAGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 29 2 20 7 T 13 14 41862 CASAVA_Build 1 55988040 1D GTTTTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2634 hom 26 9 11 6 A 12 11 41863 CASAVA_Build 1 55988199 4D TACTATAAGC TGAA/---- TGAACACAAT 3070 het 3070 hom 42 14 21 8 TGAA 2 1 41864 CASAVA_Build 1 55991818 1D CATGTCCTGA C/- AAAATTAGTG 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 C 1 0 41865 CASAVA_Build 1 55994269 1I AGCCCCAGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 10 41866 CASAVA_Build 1 55996190 1I TCTTCTACAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 A 8 9 41867 CASAVA_Build 1 56008580 1I CCACTCTGCC -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 55 21 25 9 T 7 8 41868 CASAVA_Build 1 56017350 2D ATACACACAC AG/-- AGGATTTTCC 2839 het 2278 hom 19 7 9 4 AG 2 1 41869 CASAVA_Build 1 56018645 9I AACCTTCATT ---------/CTTGAAAGG CTTGAAAGGT 3070 het 3070 hom 53 21 24 9 CTTGAAAGG 1 2 41870 CASAVA_Build 1 56031458 3D TGATTTTTCT TAA/--- TAATTATACT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAA 2 1 41871 CASAVA_Build 1 56061484 1D GCCAAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 37 1 27 9 A 11 10 41872 CASAVA_Build 1 56082277 1D GGAGACAAGC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 132 het 55 0 45 11 T 9 8 41873 CASAVA_Build 1 56086580 1I AACGGGGTGT -/G GGGGGGGGTG 2759 het 242 hom 14 1 10 3 G 8 9 41874 CASAVA_Build 1 56174570 2I TTTTGAGGTA --/AC ACAAACATTC 3070 hom 134 het 48 0 45 3 AC 1 2 41875 CASAVA_Build 1 56183585 10I TAAGTCCATT ----------/GTGATCTCAG GCGAAGTAAC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 GTGATCTCAG 0 1 41876 CASAVA_Build 1 56185453 1I AATGCAGTGA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 8 9 41877 CASAVA_Build 1 56195362 2D TACAAATATT TG/-- TGTGAGTACA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TG 3 2 41878 CASAVA_Build 1 56217134 1D CCCAGTTTTT G/- CTACTTTGTA 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 G 1 0 41879 CASAVA_Build 1 56229261 3D ATCAGCAGCA AAC/--- AACAACAAGA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 AAC 3 2 41880 CASAVA_Build 1 56236926 1I TCATGAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 15 14 A 11 12 41881 CASAVA_Build 1 56246415 1I GATGTATTTG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 7 8 41882 CASAVA_Build 1 56247270 3I CTGTCAACTA ---/CAT GTTTGGTAGT 3070 het 3070 ref 49 21 15 13 CAT 0 1 41883 CASAVA_Build 1 56251059 4D ATAAAAATAA AAAT/---- AAATAAATAA 2373 het 2373 ref 17 9 6 2 AAAT 4 3 41884 CASAVA_Build 1 56254479 1I CTCAATATCA -/C CGATCATTAG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 1 2 41885 CASAVA_Build 1 56255473 3I ACTACTATGC ---/TCT TCTTCTTCTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 TCT 3 4 41886 CASAVA_Build 1 56267956 4D CCAGTTCATC TGAG/---- ACTTGCTAAT 3070 het 3070 hom 45 13 26 10 TGAG 1 0 41887 CASAVA_Build 1 56280650 1D ATGGGGTTTC T/- AGGGCCCCAG 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 T 1 0 41888 CASAVA_Build 1 56319096 2I CACCCCACTC --/TA TGCATGCTCA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 TA 0 1 41889 CASAVA_Build 1 56322501 1I CAGGGGGCCC -/T TTGGGGTACT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 2 3 41890 CASAVA_Build 1 56354396 5D TTATCACTTG AAATT/----- TATTCATTCA 3070 het 3070 hom 39 19 19 2 AAATT 1 0 41891 CASAVA_Build 1 56360940 1I GGCTTTTTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 8 9 41892 CASAVA_Build 1 56362042 1I ATGACATTTT -/C TTTTTTATAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 C 0 1 41893 CASAVA_Build 1 56367285 1I ATTTGTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 12 13 41894 CASAVA_Build 1 56377301 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1334 het 881 hom 15 4 3 8 A 18 16 41895 CASAVA_Build 1 56377573 2I ATTTTGAGGC --/TG TTAGGTATTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 TG 0 1 41896 CASAVA_Build 1 56379183 1D CTGATTCCAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 A 9 8 41897 CASAVA_Build 1 56385362 1I CTTATGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 13 14 41898 CASAVA_Build 1 56385794 17D AAAAAATTCA AGTTCTTAGAAATTGAG/----------------- GAGATAATTG 3070 het 3070 ref 40 19 17 6 AGTTCTTAGAAATTGAG 1 0 41899 CASAVA_Build 1 56403533 1I TTTTGAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 11 17 T 14 15 41900 CASAVA_Build 1 56411903 1D GATCCTTGGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 9 8 41901 CASAVA_Build 1 56415146 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATAAA 544 het 544 ref 23 4 7 12 A 6 7 41902 CASAVA_Build 1 56418681 1D GCTTCTGGAA T/- TACAAAAAAG 3070 het 3070 hom 52 25 25 2 T 2 1 41903 CASAVA_Build 1 56430196 1D CCATTGGGGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 45 14 24 8 A 8 7 41904 CASAVA_Build 1 56431823 1I CCCCCCCCCC -/A AAAAAAAGAG 1094 het 1023 hom 13 5 4 4 A 7 8 41905 CASAVA_Build 1 56449761 1I TGCTATCTTG -/A AAAAAGTCTA 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 A 5 6 41906 CASAVA_Build 1 56452729 1I CCTCCCTCCC -/T TACAGTTACA 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 T 1 2 41907 CASAVA_Build 1 56459162 1I CAATAGGAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 A 8 9 41908 CASAVA_Build 1 56463932 1D CTCTGAGCTC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 T 7 6 41909 CASAVA_Build 1 56467896 1I GATTTGGGAA -/G GGGGGGGGTC 2747 het 2747 ref 35 15 9 11 G 8 9 41910 CASAVA_Build 1 56474836 1I ATCGCTTACT -/C CTCAGCCTGT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 C 1 2 41911 CASAVA_Build 1 56485355 1D AATGTGGTTT A/- AAAAAAAAAA 1678 het 1678 ref 23 7 5 12 A 17 16 41912 CASAVA_Build 1 56487214 2D ATGTATCTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 45 3 20 22 A 18 16 41913 CASAVA_Build 1 56487461 1I TCACTTGGGT -/C CTGGAGAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 41914 CASAVA_Build 1 56487633 1D AATTCAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1048 hom 24 4 11 9 T 16 15 41915 CASAVA_Build 1 56487924 1D ATTCCTCACC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 7 41916 CASAVA_Build 1 56494800 1I CCTCACATGC -/A AAAATGAGAG 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 4 5 41917 CASAVA_Build 1 56494939 4D CAATGAGGCC TGAG/---- TGAGACCACA 3070 het 3070 ref 39 21 17 3 TGAG 2 1 41918 CASAVA_Build 1 56495137 1I TTCTACAAGA -/G GAAAACAGAG 3070 het 3070 hom 61 23 27 11 G 1 2 41919 CASAVA_Build 1 56504804 3D TCCACGACTC AAT/--- GATGATTAAG 3070 het 3070 ref 37 17 17 4 AAT 1 0 41920 CASAVA_Build 1 56510734 1D ATCAAAAAGC T/- TATCCACCAC 2429 het 2429 ref 15 8 5 2 T 2 1 41921 CASAVA_Build 1 56514990 5D AGTGTCCACC CATCT/----- CATTTTATAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 CATCT 1 0 41922 CASAVA_Build 1 56535183 1I CTTTGTCTTT -/G TTCATGCTGT 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 G 0 1 41923 CASAVA_Build 1 56570673 2D TCAGCTGGAA AG/-- AGGGGGATAT 3070 hom 73 het 28 0 24 7 AG 2 1 41924 CASAVA_Build 1 56574021 1D ACTTTAAAAG A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 7 6 41925 CASAVA_Build 1 56576470 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 18 11 T 15 14 41926 CASAVA_Build 1 56583756 1D TCAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2790 hom 38 7 19 12 A 12 11 41927 CASAVA_Build 1 56585660 1D GGTAGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 2852 het 2049 hom 27 10 12 5 A 15 14 41928 CASAVA_Build 1 56592599 2I GTTTTACCAC --/AT GTGTTTAGTT 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 AT 0 1 41929 CASAVA_Build 1 56593688 2D CTAGATTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 14 8 T 14 12 41930 CASAVA_Build 1 56594487 1I ATAGAATAAA -/T TAGAGGAACA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 1 2 41931 CASAVA_Build 1 56601255 1D GACAAACACA T/- TTTTCTGTAA 3070 het 3070 hom 42 16 24 4 T 5 4 41932 CASAVA_Build 1 56637453 24D4M5D ACATAATTTG GTATGTTCCAGAACATACCAAGTAGGTTCCAGA/------------------------GGTT----- ACAAGTAGGT 3070 hom 126 het 38 0 43 2 N/A 0 0 41933 CASAVA_Build 1 56638659 2D GTCAGTTAAA CT/-- CTCTGCACTT 3070 hom 141 het 49 0 46 7 CT 3 2 41934 CASAVA_Build 1 56654447 1I ACAATGTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 290 hom 45 1 40 4 T 9 10 41935 CASAVA_Build 1 56657729 10D63M4D TCTTTCTCTC TTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTCTCTCTCTCCT/----------TTTCTTTTCTTTTCTTTTCTCTTCTCTTCTCTTTTCCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTCTCTCTC---- TCCTTCCTTC 3070 hom 69 het 18 0 24 12 N/A 0 0 41936 CASAVA_Build 1 56668612 6D CAAACAGCAG CAGAAT/------ CAGTGTTCTG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 CAGAAT 1 0 41937 CASAVA_Build 1 56674202 1D CATTTGTTTT C/- CCCTCACAAA 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 C 4 3 41938 CASAVA_Build 1 56675880 1I GCCAAGATAA -/T TTCTTAACAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 2 3 41939 CASAVA_Build 1 56683703 4I18M2D CATGCGTGAA ----CTCTCTCCCTTTCTCTCTCA/CTCTCTCTCTCCCTTTCTCTCT-- GTCACACACA 1232 het 1232 ref 29 16 6 8 N/A 0 0 41940 CASAVA_Build 1 56685199 1I GCAGTGATCC -/T TTTTGGGTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 4 5 41941 CASAVA_Build 1 56686579 1D AGTGCAGTAC T/- TTCTTTTACA 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 T 3 2 41942 CASAVA_Build 1 56689965 2I GGTTGGGTAC --/AA AGTCCTCTTC 3070 het 3070 hom 42 17 14 11 A 1 3 41943 CASAVA_Build 1 56707969 1D TACATATACG C/- CATGGAATAC 3070 het 3070 ref 21 9 7 6 C 2 1 41944 CASAVA_Build 1 56708329 1I AAAATAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 35 1 31 3 T 9 10 41945 CASAVA_Build 1 56710284 1I TTTTTATTTG -/C CCCCCTTTAT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 C 5 6 41946 CASAVA_Build 1 56724900 1D AAAAATACAT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 8 7 41947 CASAVA_Build 1 56729465 8D TACAATTTCT CTAATATA/-------- CTATCCAATA 3070 het 3070 ref 36 20 17 5 CTAATATA 1 0 41948 CASAVA_Build 1 56737334 1D GCTCCCCCGT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 85 hom 20 2 10 9 C 11 10 41949 CASAVA_Build 1 56755040 1D TTCCGTTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 12 13 A 17 16 41950 CASAVA_Build 1 56771862 3I CTCCCAGGAT ---/TAC TACTACCAGG 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 TAC 2 3 41951 CASAVA_Build 1 56788973 1D CTCTGCCCAT G/- CCTCCTCCTC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 G 1 0 41952 CASAVA_Build 1 56797685 1D ATATGGTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 10 9 41953 CASAVA_Build 1 56818344 3D CGACTGTGGA ACC/--- ACATCTCCTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 ACC 1 0 41954 CASAVA_Build 1 56824422 1D CATATGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 24 0 16 8 T 11 10 41955 CASAVA_Build 1 56828480 1I AAATTAAGGA -/T TTTTTTTTTT 2240 het 782 hom 24 4 9 11 T 17 18 41956 CASAVA_Build 1 56831325 3D ATATGGGGCC TTA/--- TTATTACTAT 1859 het 65 hom 42 1 19 22 TTA 3 2 41957 CASAVA_Build 1 56831753 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3022 het 350 hom 20 2 7 11 T 15 14 41958 CASAVA_Build 1 56839990 1D AGTCCTGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 44 0 33 11 A 12 11 41959 CASAVA_Build 1 56841871 1D GCTCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1032 hom 36 3 25 8 A 12 11 41960 CASAVA_Build 1 56852514 1D AAGTCTCTGC T/- TAAAACATAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 2 1 41961 CASAVA_Build 1 56859588 1I ACCATGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 33 0 26 7 A 11 12 41962 CASAVA_Build 1 56863258 1I AAACAATAAT -/A TTTTTTAGTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 0 1 41963 CASAVA_Build 1 56865492 2D ACAATACTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 43 0 34 9 T 14 12 41964 CASAVA_Build 1 56868276 1I TAGTAAGATC -/A AGTTCTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 1 2 41965 CASAVA_Build 1 56869831 3I TCTCCTGACC ---/TCG TCGTGATCCA 3070 hom 33 het 13 0 10 3 TCG 1 2 41966 CASAVA_Build 1 56870243 1I TTGACCTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 268 hom 25 1 19 5 T 9 10 41967 CASAVA_Build 1 56871115 1D60M1I TAAAATAATC TTTTTTTTTTAAATTATTTAAAATGTTTTGTTATTTTTCATAGAGAAGGGGTTTCACCGTG-/-TTTTTTTTTAAATTATTTAAAATGTTTTGTTATTTTTCATAGAGAAGGGGTTTCACCGTGT TTGCCCAGGC 3070 hom 57 het 25 0 20 15 N/A 0 0 41968 CASAVA_Build 1 56879843 4D GTGATGAAAA ACTT/---- AATGAATCAT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 ACTT 1 0 41969 CASAVA_Build 1 56882373 4D AATCACTGAA AGAC/---- AGAACAACAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AGAC 1 0 41970 CASAVA_Build 1 56882501 1I11M1I GTCTTTTTTC -TTTTTTTTTGT-/TTTTTTTTTTGTG GGGGGAGGGT 3070 hom 59 het 27 0 19 8 N/A 0 0 41971 CASAVA_Build 1 56891408 1D TGGTTCCAAA T/- AATGAAATTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 1 0 41972 CASAVA_Build 1 56900161 1D ACCACAGGTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 9 8 41973 CASAVA_Build 1 56906673 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 19 1 16 2 A 15 14 41974 CASAVA_Build 1 56914236 2I GTATTAATAA --/CT CTGAGATGTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CT 1 2 41975 CASAVA_Build 1 56923596 1I GAGTTAGTAA -/G AAGATTGATT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 G 0 1 41976 CASAVA_Build 1 56925145 2D CTAAATACTC TT/-- TTTTTTTTTT 2362 hom 24 het 16 0 7 9 T 18 16 41977 CASAVA_Build 1 56933444 2D TATGATATAT TA/-- TATATATATA 1907 hom 24 het 12 0 8 4 TA 10 9 41978 CASAVA_Build 1 56951986 1D TGCATTGTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 9 8 41979 CASAVA_Build 1 57021827 2D TGTCACATAA AG/-- AGGGGGTAAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 AG 2 1 41980 CASAVA_Build 1 57029522 2I AGTCCTTATC --/TT TTTTTTTTTT 2088 het 2088 ref 30 10 12 8 T 14 16 41981 CASAVA_Build 1 57045041 2I ATATTGCTTC --/AA GATACTAAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 0 2 41982 CASAVA_Build 1 57050191 1I TTCCTAACCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 9 10 41983 CASAVA_Build 1 57059632 10D TGGTAGCTGT TAGGGGTGGG/---------- TACTGTTTTG 3070 het 3070 ref 36 26 12 5 TAGGGGTGGG 1 0 41984 CASAVA_Build 1 57086857 1I GTGGGAGGTG -/A AAAGGCATTT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 3 4 41985 CASAVA_Build 1 57089662 2I TGCACACATG --/CA CACACACACA 3070 hom 121 het 47 0 39 8 CA 5 6 41986 CASAVA_Build 1 57093898 1D GCTTCATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 903 hom 40 2 30 8 T 12 11 41987 CASAVA_Build 1 57098023 1I AATATATAAA -/C AAAAAATTAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 0 1 41988 CASAVA_Build 1 57123324 3D ATAGATTGGG AGA/--- AGAACAGAAG 3070 hom 157 het 58 0 53 8 AGA 2 1 41989 CASAVA_Build 1 57138906 5I AAAATATAGC -----/ATGAG ATATTAATCT 3070 hom 114 het 45 0 37 8 ATGAG 0 1 41990 CASAVA_Build 1 57140640 1I AAGATAAATC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 6 7 41991 CASAVA_Build 1 57159472 1D GGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2871 hom 26 9 13 5 T 11 10 41992 CASAVA_Build 1 57163632 3I AGTAATTCAC ---/ATA ATGTTTACAA 3070 het 3070 ref 56 22 22 12 ATA 0 1 41993 CASAVA_Build 1 57172426 1I TGCAGGGTCC -/T TTTTTTTTTT 2828 het 2828 ref 32 12 12 8 T 11 12 41994 CASAVA_Build 1 57177153 1I CTCTTGCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 14 12 A 10 11 41995 CASAVA_Build 1 57180523 4D AAGGCTGTGC TAAG/---- TAAGCATGCA 3070 het 3070 ref 47 26 18 5 TAAG 2 1 41996 CASAVA_Build 1 57190222 21I AGAGAAAAGG ---------------------/GGATGTGTCCAAGGTCACACA GCTAGCAGGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 GGATGTGTCCAAGGTCACACA 0 1 41997 CASAVA_Build 1 57208385 1D CCTGGACCAA C/- CCCTTAAGCC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 C 4 3 41998 CASAVA_Build 1 57241926 1D AAACAGAAAC T/- CTGTACCCAT 3070 het 3070 ref 49 30 18 1 T 1 0 41999 CASAVA_Build 1 57267825 1D TGCCTGCCCA T/- TGAAAGCAGC 2837 het 2837 ref 21 12 7 2 T 2 1 42000 CASAVA_Build 1 57274377 1D AATGCACATA T/- TTTTTTAATG 3030 het 3030 ref 28 17 7 6 T 7 6 42001 CASAVA_Build 1 57281281 1D GAAGTTCCAG A/- AAAAGTTATA 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 A 5 4 42002 CASAVA_Build 1 57296046 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 967 hom 5 het 2 0 2 1 T 5 6 42003 CASAVA_Build 1 57316043 1I TTACCATTAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 8 9 42004 CASAVA_Build 1 57344519 1D CCCCCTAACA C/- CCCCCCCCAT 3070 het 144 hom 30 4 13 13 C 9 8 42005 CASAVA_Build 1 57347848 3I CAACACTGCA ---/ATT ATTATTACCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 ATT 2 3 42006 CASAVA_Build 1 57352522 1D TGAATGTTTC T/- TTTTTATTAG 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 6 5 42007 CASAVA_Build 1 57391891 5D GGGGTTTTTT TTTTG/----- TTTGTTTGTT 3070 het 2934 hom 24 8 15 1 TTTTG 1 0 42008 CASAVA_Build 1 57409770 3D CTTTAAATAA TGT/--- TGTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 22 0 TGT 2 1 42009 CASAVA_Build 1 57417124 1I TAGGTGCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 9 10 42010 CASAVA_Build 1 57423795 1I ACACAAGAAT -/G GGGACAAACC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 G 3 4 42011 CASAVA_Build 1 57426910 3D CAGCATATCT ACA/--- ACACTGCTCT 3070 het 3070 ref 40 22 17 3 ACA 2 1 42012 CASAVA_Build 1 57430590 1D TCAAAAGCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 504 hom 35 3 20 13 A 15 14 42013 CASAVA_Build 1 57436207 1I TAGTGTTAGT -/A AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 43 20 21 2 A 5 6 42014 CASAVA_Build 1 57464935 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1929 het 1878 hom 9 4 5 0 T 1 0 42015 CASAVA_Build 1 57468927 2I17M2I TTGAGGGTAC --ATGTGATATTTTGACAC--/ATATGTGATATTTTGACACAT ATATATATAA 3070 het 3070 ref 43 29 20 2 N/A 0 0 42016 CASAVA_Build 1 57513146 1D CTCAGCCAAA T/- TTTTTTTTTT 2306 het 2306 ref 25 14 7 4 T 17 16 42017 CASAVA_Build 1 57514957 1I TTCACAAAGT -/A ACTATGGAAC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 1 2 42018 CASAVA_Build 1 57559767 4D TCGCATCCAG CTCT/---- CTATCAGACT 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 CT 3 1 42019 CASAVA_Build 1 57560131 5D4M4I AAATGCATGA CTCTTTCCA----/-----TAAAGAAG CAATACCTAC 3070 het 3070 ref 42 25 16 5 N/A 0 0 42020 CASAVA_Build 1 57561308 3I AGTTCTGAGA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 9 12 42021 CASAVA_Build 1 57576134 15D TTCCCTCCCC TCCCCTCCCTTCCCT/--------------- TCCCTTCCCT 3070 het 873 hom 32 9 10 18 TCCCCTCCCTTCCCT 1 0 42022 CASAVA_Build 1 57578925 1D AACATTTATT G/- AGTATCAGTC 3070 het 3070 ref 53 30 20 3 G 1 0 42023 CASAVA_Build 1 57594134 28D ACCTCAATAA ACACACACACACACACACACACACACAC/---------------------------- ACACACACAC 3070 het 2194 hom 21 6 10 9 AC 23 9 42024 CASAVA_Build 1 57600607 3I TATTTATTAC ---/TAT TATTATTCAA 3070 het 3070 hom 54 24 23 7 TAT 2 3 42025 CASAVA_Build 1 57603322 2D ATACGCTATC AT/-- AGACTTTATA 1172 het 495 hom 5 1 3 1 AT 1 0 42026 CASAVA_Build 1 57611274 1D ACGTCTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1993 hom 20 8 11 1 A 13 12 42027 CASAVA_Build 1 57612438 1I TGCATAAATG -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 A 6 7 42028 CASAVA_Build 1 57615542 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAAGAAAAG 2814 het 364 hom 15 4 9 2 AAG 0 1 42029 CASAVA_Build 1 57625253 1D CAGGACTCTC A/- GCAGTGGAAT 3070 het 3070 ref 53 30 18 5 A 1 0 42030 CASAVA_Build 1 57636652 1D TGAAAGATAA G/- GAGGAGTTCA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 2 1 42031 CASAVA_Build 1 57637191 2D GGGTTTTGAA TG/-- TGTGCTCTCC 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 TG 3 2 42032 CASAVA_Build 1 57646557 1D TGGATTTTAG A/- AAAGGCAGCA 3070 het 3070 hom 50 21 23 7 A 4 3 42033 CASAVA_Build 1 57669169 1D GCAGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 574 hom 33 2 24 9 A 14 13 42034 CASAVA_Build 1 57720068 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3048 hom 33 het 17 0 12 6 CT 2 1 42035 CASAVA_Build 1 57723440 18I AAATGTCCTG ------------------/CTTCCAGATCTAACTCCA CTTCCAGAGA 3070 het 3070 ref 58 30 17 11 CTTCCAGATCTAACTCCA 0 1 42036 CASAVA_Build 1 57732514 1I ATTGTTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 T 13 14 42037 CASAVA_Build 1 57732761 1I TTCCTGAAGC -/A AAAAATGCCA 3070 het 3070 ref 53 31 16 6 A 5 6 42038 CASAVA_Build 1 57751408 1D AAATATCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 20 11 T 11 10 42039 CASAVA_Build 1 57763704 1I AAGGAAATTG -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 7 8 42040 CASAVA_Build 1 57767044 1I CTTAAAGATG -/A AAAAGGCCTG 3070 het 388 hom 45 1 38 6 A 4 5 42041 CASAVA_Build 1 57767394 3D TTATTCACAA AGT/--- AGCACAATAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 AGT 1 0 42042 CASAVA_Build 1 57770519 1I ATTCTCAAAG -/T TAAGTATTAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 2 42043 CASAVA_Build 1 57771800 14D TCATAACAGG TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 hom 60 het 23 0 21 6 TA 13 6 42044 CASAVA_Build 1 57771934 2D AGCCAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 13 11 42045 CASAVA_Build 1 57774876 1I TGACATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 10 11 42046 CASAVA_Build 1 57782043 1I CATATTTAGG -/A AATTGTTAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 3 42047 CASAVA_Build 1 57785568 1D TCTGGGTTAA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 8 7 42048 CASAVA_Build 1 57793652 1D TGTCTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 2535 het 425 hom 27 4 10 13 T 17 16 42049 CASAVA_Build 1 57796289 4I GCAACCCAAG ----/TTGC TTGCATGCAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTGC 1 2 42050 CASAVA_Build 1 57808654 2D TAACAAACTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 416 hom 30 1 23 6 AT 9 8 42051 CASAVA_Build 1 57815676 1D GAGGCTTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 29 0 16 14 A 13 12 42052 CASAVA_Build 1 57824738 2D TTCTTTCTCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 TC 9 8 42053 CASAVA_Build 1 57834569 2D TCAGGTGTTA TT/-- TTAATTGTCA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 4 2 42054 CASAVA_Build 1 57834754 1I CATTTATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 749 hom 20 3 11 6 T 11 12 42055 CASAVA_Build 1 57844056 1D ATGATTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 39 2 33 4 T 11 10 42056 CASAVA_Build 1 57844309 1I TATTCAAACT -/G GGTCCTTTCC 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 G 2 3 42057 CASAVA_Build 1 57845325 2D GGGATTACAG GT/-- GTGTGAGCCA 3070 hom 84 het 29 0 29 2 GT 3 2 42058 CASAVA_Build 1 57853961 1I TGAGTCAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 8 9 42059 CASAVA_Build 1 57854662 1I TATTGAATCT -/G TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 G 0 1 42060 CASAVA_Build 1 57866183 3D CCTTGCACTA CTT/--- CCTGGCTACT 3070 het 3070 hom 48 21 23 6 CTT 1 0 42061 CASAVA_Build 1 57866878 1I AAATATCTAA -/C CCTCTTTGGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 2 3 42062 CASAVA_Build 1 57882817 2I GTGTGTATGC --/AT ATATATATAT 3070 het 848 hom 35 2 30 3 AT 5 6 42063 CASAVA_Build 1 57884310 1D GGGAGAAAAG A/- AAAAATAGCA 3070 hom 80 het 33 0 27 6 A 6 5 42064 CASAVA_Build 1 57888725 1I ATAGAGGAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 9 42065 CASAVA_Build 1 57892972 2I AAATAACTAA --/CT CTGTTTCATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CT 1 2 42066 CASAVA_Build 1 57894613 2I CAAAAGTAAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 45 hom 48 1 39 8 TG 8 9 42067 CASAVA_Build 1 57917194 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 15 1 13 1 T 11 10 42068 CASAVA_Build 1 57923221 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 11 10 42069 CASAVA_Build 1 57934622 1I ACTGGGCAGA -/G GGGGAAGTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 4 5 42070 CASAVA_Build 1 57957224 1D CAGTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1130 het 1130 ref 27 21 3 3 A 11 10 42071 CASAVA_Build 1 57970074 2D CAAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 247 het 247 ref 33 17 3 13 AT 1 0 42072 CASAVA_Build 1 57986156 1I AAAGGGACAG -/C AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 C 0 1 42073 CASAVA_Build 1 57987039 3I ATCTTTAGAG ---/TAT TAGGATTCTT 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 TAT 0 1 42074 CASAVA_Build 1 57994298 1D CTTACTCTGC A/- ACTGGCAACT 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 A 2 1 42075 CASAVA_Build 1 57994935 1D TGCAGGCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 12 11 42076 CASAVA_Build 1 58000552 2D GGTAAAAGCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 20 11 8 TG 6 5 42077 CASAVA_Build 1 58004527 1D CAGGCAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1829 hom 38 12 13 13 A 15 14 42078 CASAVA_Build 1 58014553 1D TCCAAATTCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 A 10 9 42079 CASAVA_Build 1 58015650 2I AAATAATTTT --/TC TGTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 TC 0 1 42080 CASAVA_Build 1 58018856 1I AGAAAAAAAA -/G TCCATATTTT 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 G 0 1 42081 CASAVA_Build 1 58019974 1D AGCAATTGAG A/- AAAAAAAAAA 2874 het 1596 hom 28 6 10 12 A 17 16 42082 CASAVA_Build 1 58020426 1I AGGATAATTA -/T TTTCGAGGTA 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 T 3 4 42083 CASAVA_Build 1 58026251 1I ATTAAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 10 11 42084 CASAVA_Build 1 58036128 1I AGAAAACTGT -/A ACAAGCTATA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 1 2 42085 CASAVA_Build 1 58071326 2D ACTGAGACTG AA/-- AAAAAAAAAA 1741 het 1741 ref 46 6 5 39 A 16 14 42086 CASAVA_Build 1 58125623 4I AGGTACTCAC ----/TAAG TGTCTATTAA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 TAAG 0 1 42087 CASAVA_Build 1 58137280 1D AGAATGCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 11 10 42088 CASAVA_Build 1 58140707 1D TACATTAAAG A/- ATTATTACCT 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 2 1 42089 CASAVA_Build 1 58146101 4D CAGAGAGCAT TACA/---- TAAACCTAGA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TACA 1 0 42090 CASAVA_Build 1 58146878 1D CCTCAGGAAA G/- GCCCCTGTCA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 G 2 1 42091 CASAVA_Build 1 58164529 4I7M1D AAACTCTCTG ----AGTTCCAC/AGAAAGTTTTA- TGAGAAAGGC 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 N/A 0 0 42092 CASAVA_Build 1 58185937 1I GCAAAGATCA -/G TGAACTAAGG 3070 het 3070 ref 48 29 13 6 G 0 1 42093 CASAVA_Build 1 58193800 3I GTCATTTTCT ---/AAG GTTTCACTTT 3070 hom 129 het 48 0 42 6 AAG 0 1 42094 CASAVA_Build 1 58200233 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 478 hom 12 3 8 1 A 13 14 42095 CASAVA_Build 1 58202035 1I CATCTGCTCT -/G CCACCAAACT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 G 0 1 42096 CASAVA_Build 1 58206001 4D AAATTGTACT TAAA/---- TAAATTAACA 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 TAAA 2 1 42097 CASAVA_Build 1 58211905 1I AAAACTAGGG -/T TGTTACTCTT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 T 1 2 42098 CASAVA_Build 1 58215969 1I GCTGACGACA -/T TCCCCCGGAC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 1 2 42099 CASAVA_Build 1 58218540 2I GCTCTGACTC --/AA GAGTCATCTC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 0 2 42100 CASAVA_Build 1 58223908 1D CTCAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 48 1 41 7 A 12 11 42101 CASAVA_Build 1 58232023 1D CAGAAGCTGG A/- AATTGGCCTA 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 A 3 2 42102 CASAVA_Build 1 58233160 1D TTTAGTGATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 9 8 42103 CASAVA_Build 1 58236650 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1532 het 971 hom 30 5 7 19 T 19 18 42104 CASAVA_Build 1 58252154 2D TCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 33 3 12 20 T 14 12 42105 CASAVA_Build 1 58261442 1D AAAATCTTAC A/- AAAAATTTAA 2638 het 2638 ref 31 18 8 5 A 6 5 42106 CASAVA_Build 1 58276839 1D AATAAGCTCC T/- TTTTTTACCA 3070 hom 113 het 45 0 39 6 T 7 6 42107 CASAVA_Build 1 58283883 1I GCTAGGAATA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 8 9 42108 CASAVA_Build 1 58284070 1D GTTCCTTCTC T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 18 het 33 1 23 9 T 7 6 42109 CASAVA_Build 1 58288172 1I AATTATTTTG -/A AAAAAACCAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 6 7 42110 CASAVA_Build 1 58293785 1I ATTTTCTTTA -/T TTTGTTGACT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 3 4 42111 CASAVA_Build 1 58294037 15D TCATCTCGGC TCACTGCAACCTCTG/--------------- TCACTGCAAC 3059 het 3059 ref 16 10 7 9 TCACTGCAACCTCTG 2 1 42112 CASAVA_Build 1 58296259 4I TGCACAACAC ----/TCTG TCTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 63 30 28 5 TCTG 0 1 42113 CASAVA_Build 1 58360858 1D TATTTGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 17 9 A 12 11 42114 CASAVA_Build 1 58435666 1I AGAGTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 208 hom 41 2 31 8 T 13 14 42115 CASAVA_Build 1 58453662 2D CATGATAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 17 15 42116 CASAVA_Build 1 58459133 2D ATACATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 694 hom 34 6 12 16 AC 9 8 42117 CASAVA_Build 1 58475303 7I ATTTCCACAA -------/AATCAGT AATAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 AATCAGT 0 1 42118 CASAVA_Build 1 58484392 1I AATTGTTAAC -/A AAAAATGAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 5 6 42119 CASAVA_Build 1 58485527 1D TTCCCCCCCC G/- CCAGGTTAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 G 1 0 42120 CASAVA_Build 1 58487902 1D CAGGACTGAA C/- CCCCCGGAAG 3070 het 3070 ref 31 12 10 11 C 6 5 42121 CASAVA_Build 1 58497605 4I CTGCCTGTAC ----/TTCT TTCTGCCTTC 3070 het 3070 hom 64 28 33 3 TTCT 1 2 42122 CASAVA_Build 1 58506348 3D TCTGCCACTT ATG/--- AGCTATATGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ATG 1 0 42123 CASAVA_Build 1 58522284 1I GGAAAACCCA -/C CCTTTTCTTG 3070 hom 177 het 64 0 59 5 C 2 3 42124 CASAVA_Build 1 58524372 2D TGGCTAGCTA TG/-- TGCAGAAAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TG 2 1 42125 CASAVA_Build 1 58543874 4D GCATGCAAAG AAAT/---- AAAGTTATCA 3070 het 3070 ref 52 25 22 7 AAAT 1 0 42126 CASAVA_Build 1 58549666 3I TCCTAATAAA ---/AAT AATAATACCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AAT 2 3 42127 CASAVA_Build 1 58573867 1I GGGTGGAAAC -/A GGGGGATAAC 3017 het 3017 ref 30 11 9 10 A 0 1 42128 CASAVA_Build 1 58579293 1I CAATTTCTAT -/C CCATACATTC 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 C 2 3 42129 CASAVA_Build 1 58583140 3I ATACTCAAAA ---/TAT TATTATTCTC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 TAT 2 3 42130 CASAVA_Build 1 58592080 1I CTTGTTTAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 9 10 42131 CASAVA_Build 1 58596046 19D ACAAGGATCT AGAGAGACAGGACAGAGAC/------------------- CTGTGAAATC 3070 het 3070 ref 43 26 17 5 AGAGAGACAGGACAGAGAC 1 0 42132 CASAVA_Build 1 58599813 1I TTCTGCAAAC -/T CACAGTTTTG 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 T 0 1 42133 CASAVA_Build 1 58602114 1I GGGAGCCTCA -/G GGGGGAGCCC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 G 5 6 42134 CASAVA_Build 1 58606816 4I GTATTTTTAA ----/TCGT TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 TCGT 0 1 42135 CASAVA_Build 1 58621877 4D TGACACATGA CACT/---- CAATAATATA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 CACT 1 0 42136 CASAVA_Build 1 58635784 1I ATGACTCCTG -/A AAACCAGGTT 3070 het 3070 hom 52 16 20 16 A 3 4 42137 CASAVA_Build 1 58641245 1D CCAGTTCTCA G/- GGGTGGGTCT 3070 het 3070 ref 44 21 16 8 G 4 3 42138 CASAVA_Build 1 58641558 1I TTTTGCAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 13 14 42139 CASAVA_Build 1 58644979 3D TCCCCCCCCC CCA/--- ACTGCCACCA 2716 het 1257 hom 26 8 9 11 CCA 1 0 42140 CASAVA_Build 1 58647432 4I TTCAGGTGAT ----/AATA AAGTGATAAC 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 AATA 0 1 42141 CASAVA_Build 1 58650581 3D36M2I AGAACAGCTG TATTATTCCTGGACTTCTCAGTTATGTAACCCAGTAAGT--/---TATTCCTGGACTTCTCAGTTATGTAACCCAGTAAGTTC TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 50 29 29 9 N/A 0 0 42142 CASAVA_Build 1 58660259 1D AGTAGACGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 12 22 12 A 12 11 42143 CASAVA_Build 1 58663209 1I CAATGTGTGG -/A AGGCAATCCT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 1 2 42144 CASAVA_Build 1 58678176 3I TTTGTAACAG ---/TCC TCCTTGGAAG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 TCC 1 2 42145 CASAVA_Build 1 58680700 9I TCTGCAAACA ---------/CACATCCAC CACATCCACA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 CACATCCAC 1 2 42146 CASAVA_Build 1 58686121 1I CTTAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 0 1 42147 CASAVA_Build 1 58733841 1D TTAAACAAAC A/- AAACTGTATA 3070 het 3070 hom 46 14 30 3 A 4 3 42148 CASAVA_Build 1 58759589 1I TATGTACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 10 11 42149 CASAVA_Build 1 58769977 1D TGGATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 48 0 29 19 T 11 10 42150 CASAVA_Build 1 58771745 1D GGTATTGTTA T/- TACTCTGTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 1 42151 CASAVA_Build 1 58781245 1I AACAAAAAGC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 59 het 33 1 30 2 T 6 7 42152 CASAVA_Build 1 58783770 1D AGCACATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 287 hom 27 1 24 3 A 11 10 42153 CASAVA_Build 1 58787187 2I CCTCACGCCA --/GT GTGCATTCCC 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 GT 1 2 42154 CASAVA_Build 1 58787570 7D TCCCCCCGAG AAAGAGA/------- AAGAGCTGGA 3070 hom 60 het 23 0 20 4 AAAGAGA 1 0 42155 CASAVA_Build 1 58788580 4D CTCATTATCC CATG/---- CAGGGCATCA 3070 hom 132 het 51 0 42 13 CATG 1 0 42156 CASAVA_Build 1 58789479 1D TCCCAATATT A/- ACAGTATTTG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 2 1 42157 CASAVA_Build 1 58810324 1D ACAACCCCCC T/- GTTTACAGTA 3070 het 3070 ref 37 20 9 9 T 1 0 42158 CASAVA_Build 1 58834536 2I ATGGATTTAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 TG 7 8 42159 CASAVA_Build 1 58835063 25D GGTCACTGGG GCAAAATGCAGAGGAACTGGATATC/------------------------- GCAAAATGCA 3070 het 3070 ref 56 30 24 14 GCAAAATGCAGAGGAACTGGATATC 1 0 42160 CASAVA_Build 1 58838186 1D GATTGTCTAA T/- TTTTTTTTTT 2897 het 2897 ref 23 12 9 2 T 13 12 42161 CASAVA_Build 1 58838988 1D AATTAAAGAT G/- TTGATCATTT 2693 het 2693 ref 21 12 6 3 G 1 0 42162 CASAVA_Build 1 58843961 1I AGCACCTGTT -/C CAGTGGAGGT 3070 het 3070 ref 61 29 23 9 C 1 2 42163 CASAVA_Build 1 58847276 2D ATGTATGTGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 49 19 19 12 AC 9 8 42164 CASAVA_Build 1 58853569 1I TTTGACTTAA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 8 9 42165 CASAVA_Build 1 58863299 1I AACTCCTAGG -/A AAAAAAAAAA 1492 het 1492 ref 24 15 5 4 A 15 16 42166 CASAVA_Build 1 58866356 1D CCCAGATCTA T/- ATATTTATAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 1 0 42167 CASAVA_Build 1 58868895 2D TTTTTCCCTT AC/-- ACTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 32 22 10 0 AC 2 1 42168 CASAVA_Build 1 58869368 1I TCTTGGGGTG -/A ATCAGCCTTC 3070 het 3070 ref 77 29 25 23 A 1 2 42169 CASAVA_Build 1 58869529 1I TTTTGCACAA -/G GGGGGTCTCC 3070 het 3070 ref 37 25 9 3 G 5 6 42170 CASAVA_Build 1 58875859 2D TCTCATGACA TT/-- TTTTTTTAAG 3070 het 26 hom 31 2 19 10 T 9 7 42171 CASAVA_Build 1 58876770 1D AGGGCTAATG A/- CAGTGTCCCC 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 1 0 42172 CASAVA_Build 1 58881919 1D AGATTTGCAA G/- AGTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 G 1 0 42173 CASAVA_Build 1 58888079 4I CTGTCCAGAT ----/CTGG CTATTTCACC 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 CTGG 0 1 42174 CASAVA_Build 1 58891074 3D TTTCATTACA ATT/--- ATTGAAGAAC 3070 het 3070 hom 53 16 33 5 ATT 2 1 42175 CASAVA_Build 1 58891783 1I AATCAGGACT -/C CCATTTAGCG 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 C 2 3 42176 CASAVA_Build 1 58892841 2I TCCCACTTAC --/AA AAGGCTTCTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 2 4 42177 CASAVA_Build 1 58893579 1D AAATCAGGCA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 87 het 31 0 29 4 T 7 6 42178 CASAVA_Build 1 58893733 1I GATATTTTTA -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 6 7 42179 CASAVA_Build 1 58895499 1I GCCAAGCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 30 1 22 7 A 13 14 42180 CASAVA_Build 1 58900230 1D GTAAGTTATT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 G 1 0 42181 CASAVA_Build 1 58901589 1I CAATAAGTTT -/C CTTTTATAGA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 1 2 42182 CASAVA_Build 1 58904787 1I TTGCAATCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 9 10 42183 CASAVA_Build 1 58907196 2I CCTGTTTGAC --/AG GGGGAAGCGG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AG 0 1 42184 CASAVA_Build 1 58907480 1D TAACAAGAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 17 7 A 10 9 42185 CASAVA_Build 1 58911473 2D TTTAGAACAC AT/-- GTGTGTCTAA 3070 het 3070 ref 55 29 19 7 AT 1 0 42186 CASAVA_Build 1 58926956 1D ATTTTATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 A 11 10 42187 CASAVA_Build 1 58929465 1D GAGTGAACCT G/- GAAGGCGGAG 3070 het 2382 hom 21 6 10 6 G 2 1 42188 CASAVA_Build 1 58933313 1D CACTAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 6 A 13 12 42189 CASAVA_Build 1 58933571 4D ACTAAGCAAA TACT/---- TAGTTCCCTT 3070 het 3070 hom 49 21 27 4 TACT 1 0 42190 CASAVA_Build 1 58935512 4I TACAGTGAAG ----/AGGC AGATCTGGTG 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 AGGC 0 1 42191 CASAVA_Build 1 58936809 1I24M6I AAAGAGAAAA -GGGGAAAAATGAAACACAATCAGA------/GGGGGAAAAATGAAACACAATCAGAAAAATT AAGATAAATC 3070 het 3070 ref 37 28 11 6 N/A 0 0 42192 CASAVA_Build 1 58947805 2D AAAAAAAAAA AG/-- ATCACTGTAT 3070 het 3070 hom 31 10 16 7 AG 1 0 42193 CASAVA_Build 1 58956285 14I TGGGGTCTGG --------------/TGCATGGTAGGCAC TTAACAAGTA 3070 het 3070 ref 46 23 17 8 TGCATGGTAGGCAC 0 1 42194 CASAVA_Build 1 58967142 3D AATATGTGAT AAC/--- AAATTATTAT 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 AAC 1 0 42195 CASAVA_Build 1 58967473 3D ACATAATTAT ATA/--- ATATGTCATG 1305 het 997 hom 5 2 3 0 ATA 2 1 42196 CASAVA_Build 1 58999244 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAGA 1453 het 5 hom 14 1 9 4 A 8 9 42197 CASAVA_Build 1 59001490 3I4M2D GCACTAAAGG ---TGGTAA/CCCAGGT-- AGCCAGGGCC 3070 hom 78 het 27 0 27 4 N/A 0 0 42198 CASAVA_Build 1 59006824 1I AGAAAAACTT -/G TGTATTTAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 0 1 42199 CASAVA_Build 1 59009909 1D TTGGTTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 597 hom 28 2 18 8 A 15 14 42200 CASAVA_Build 1 59033298 5I TATGGGCATT -----/TCCAC TCCACTCACC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TCCAC 1 2 42201 CASAVA_Build 1 59034153 2D CTGGAGAAAT GG/-- GGGGCTGAGG 3070 hom 144 het 51 0 49 4 G 6 4 42202 CASAVA_Build 1 59043493 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 17 18 3 AC 11 9 42203 CASAVA_Build 1 59043678 1I ACTTAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 11 12 42204 CASAVA_Build 1 59058579 1D TTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2589 hom 34 10 14 10 T 12 11 42205 CASAVA_Build 1 59077067 1I TTAAGAGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 11 12 42206 CASAVA_Build 1 59082263 1I CCATGTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1246 het 1246 ref 23 15 4 4 T 15 16 42207 CASAVA_Build 1 59085673 4D ACCATTGATG ATTT/---- ATTTATGTTT 3070 hom 148 het 54 0 50 6 ATTT 2 1 42208 CASAVA_Build 1 59089277 2I TTTTTTTTTT --/AA AAAGCATCCT 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 3 5 42209 CASAVA_Build 1 59090498 4I AGAAGTTGAC ----/AGTT AGTCTTAGGA 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 AGTT 0 1 42210 CASAVA_Build 1 59092187 2D AATAGGAGAC AT/-- ATTTTAAGAG 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 AT 2 1 42211 CASAVA_Build 1 59092350 1D GGAGCGCTTA G/- GTGGGATGCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 2 1 42212 CASAVA_Build 1 59095771 1I ACTTCAGGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 8 9 42213 CASAVA_Build 1 59107088 1I TTTCTCATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1461 hom 36 4 22 10 T 12 13 42214 CASAVA_Build 1 59107099 1I TTTTTTTTTT -/A TAAACCACAG 3070 het 1743 hom 36 8 22 6 A 0 1 42215 CASAVA_Build 1 59109689 1I CAAAATGGAG -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 54 27 18 9 T 6 7 42216 CASAVA_Build 1 59111159 1D ATCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 751 het 751 ref 25 10 4 11 A 14 13 42217 CASAVA_Build 1 59140287 1D ATCAAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 16 13 A 12 11 42218 CASAVA_Build 1 59144570 1I TCACCCCCAG -/C CCCCCACTGA 3070 het 3070 ref 41 17 12 12 C 5 6 42219 CASAVA_Build 1 59150047 1I ATATTAACCC -/T CCATTTCCTC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 0 1 42220 CASAVA_Build 1 59169171 1I AAATGAAAAT -/G GGGGGGCTCC 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 G 6 7 42221 CASAVA_Build 1 59176418 2D TGTGCTCCAA AG/-- GCCATTTATC 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 AG 1 0 42222 CASAVA_Build 1 59179623 2D TTCCTCCACC AG/-- GACTGTTGTG 3070 het 3070 hom 28 12 10 8 AG 1 0 42223 CASAVA_Build 1 59193840 1D GTGAACTGGT G/- GGGGGGGGCC 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 G 9 8 42224 CASAVA_Build 1 59204704 1D AATCTGCCCC T/- CTCCTTGCCC 3070 het 3070 hom 34 14 20 0 T 1 0 42225 CASAVA_Build 1 59206043 2D CATATATATG TA/-- TATATATGTG 3070 het 2701 hom 25 10 11 5 TA 4 3 42226 CASAVA_Build 1 59208886 1I TGTTTTACTT -/C CCGTCACACA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 2 3 42227 CASAVA_Build 1 59215612 1I TGGTGCCCAA -/T TAATTATTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 42228 CASAVA_Build 1 59219035 1D AATAAAAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 101 het 40 0 34 7 A 9 8 42229 CASAVA_Build 1 59230254 3I GTTATTATAA ---/TTG TTGCTTTAGC 3070 hom 86 het 36 0 28 8 TTG 1 2 42230 CASAVA_Build 1 59236704 1I CTTCAGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 25 2 16 7 T 14 15 42231 CASAVA_Build 1 59237334 5I TTCAGCAAAG -----/AAAAT AGAAGCTATT 3070 hom 72 het 34 0 24 11 AAAAT 0 1 42232 CASAVA_Build 1 59240212 1I TTAAAATCAG -/A ATAGTGGCCA 3070 hom 97 het 37 0 30 7 A 1 2 42233 CASAVA_Build 1 59245666 1I TTCAAATGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 111 hom 47 1 38 8 T 9 10 42234 CASAVA_Build 1 59248603 2D CAGGCGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2135 het 34 hom 22 2 10 10 T 15 13 42235 CASAVA_Build 1 59252940 30I CCACCTATGG ------------------------------/CTCCAGGAGCTCAGATTCATGTGCCCAGGC TGCCATAGCA 3070 hom 98 het 34 0 32 5 CTCCAGGAGCTCAGATTCATGTGCCCAGGC 0 1 42236 CASAVA_Build 1 59254549 5D TTGCAGTACA GGGGT/----- GGGGTGTGAG 3070 hom 126 het 47 0 41 7 GGGGT 2 1 42237 CASAVA_Build 1 59257420 1D TGTCTCCCCA C/- CCCCACCCAC 3070 hom 96 het 43 0 34 9 C 5 4 42238 CASAVA_Build 1 59259193 1I CCATTTGTAT -/C TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 34 0 28 7 C 0 1 42239 CASAVA_Build 1 59303884 29I CTGCCTCTCC -----------------------------/AGCTTGCAGTCTTCCTAGAAGCCAGGCTT ATTTTTCTGT 3070 hom 93 het 29 0 30 2 AGCTTGCAGTCTTCCTAGAAGCCAGGCTT 0 1 42240 CASAVA_Build 1 59306955 1D ATAGTTGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 A 15 14 42241 CASAVA_Build 1 59307110 9D GTGGAGCCCA CTTTGTATC/--------- CTAAAAGTCT 3070 het 3070 hom 36 16 19 3 CTTTGTATC 1 0 42242 CASAVA_Build 1 59308423 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2598 hom 34 11 18 5 T 13 12 42243 CASAVA_Build 1 59311465 1D TAGAGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 27 1 14 12 A 12 11 42244 CASAVA_Build 1 59311477 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAGAAAAG 3070 het 512 hom 27 6 13 9 G 1 0 42245 CASAVA_Build 1 59315976 3D CTGCATTTCT TTC/--- TTCTTCTCCT 3070 het 3070 ref 51 26 19 7 TTC 3 2 42246 CASAVA_Build 1 59335094 1D TAAAAGTGTC A/- AAAGCTACAG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 4 3 42247 CASAVA_Build 1 59346551 1I ATGCTAATGT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 C 9 10 42248 CASAVA_Build 1 59364371 1I CAGGGCCATT -/G GGGGGGGCAC 2784 het 2784 ref 24 13 8 3 G 7 8 42249 CASAVA_Build 1 59375659 1D GGAACACAGA C/- CCCCCCACTT 3070 het 3070 hom 39 11 21 8 C 7 6 42250 CASAVA_Build 1 59381154 1D GTAGTAGATA G/- GTGGGTAATT 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 G 2 1 42251 CASAVA_Build 1 59384299 1I ACACAGCATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 157 hom 37 1 29 7 A 9 10 42252 CASAVA_Build 1 59392528 1D GAGACATGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 126 het 51 0 42 9 T 10 9 42253 CASAVA_Build 1 59393354 1I AGTTGGAGAA -/G GGCTTGTCAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 2 3 42254 CASAVA_Build 1 59394641 1I AATCTATGCC -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 6 7 42255 CASAVA_Build 1 59394814 1I TGCGTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 42256 CASAVA_Build 1 59395550 1I ACAACACACA -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 6 7 42257 CASAVA_Build 1 59398337 2I CACATGGACT --/CA GTTTGCTGGC 3070 hom 111 het 40 0 36 4 CA 0 1 42258 CASAVA_Build 1 59401080 14D GGGCTTTATA GTCAGGCAGATTTC/-------------- AAGTCCTGGC 3070 het 3070 ref 40 22 16 5 GTCAGGCAGATTTC 1 0 42259 CASAVA_Build 1 59403012 4I TGAGCCCAAC ----/TCTT TCTTTCTTTG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TCTT 2 3 42260 CASAVA_Build 1 59403462 1D CAAGTCTTCC T/- TCTAGTAAGC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 2 1 42261 CASAVA_Build 1 59404239 10I CAGGTATTAA ----------/GCCAAGTACT ACTAGTTATT 3070 hom 114 het 40 0 38 4 GCCAAGTACT 0 1 42262 CASAVA_Build 1 59406824 1D AATAAAATGT A/- GATTATCTGT 3070 het 3070 hom 43 21 19 3 A 1 0 42263 CASAVA_Build 1 59407411 4D TTAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAGCCA 3070 hom 62 het 24 0 20 5 AAAG 2 1 42264 CASAVA_Build 1 59408188 2D AAAAGACCGT TA/-- TGTTTACCCA 3070 hom 141 het 49 0 48 3 TA 1 0 42265 CASAVA_Build 1 59412370 2I AGGAGAGAGT --/GA GAAGTTATGA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 GA 1 2 42266 CASAVA_Build 1 59414911 4I ACTCACTGTT ----/TTGA TTACTATAGT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TTGA 0 1 42267 CASAVA_Build 1 59467125 1D CCCACTTTGA T/- AGCTTATTCC 3070 het 3070 hom 30 13 12 7 T 1 0 42268 CASAVA_Build 1 59467508 1D ATTGCAGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 10 9 42269 CASAVA_Build 1 59471750 1D CCATGGTTGT G/- AGGCCTCCCC 3070 het 2995 hom 23 10 10 3 G 1 0 42270 CASAVA_Build 1 59475211 1D CATAACCATC A/- AGCATCAGGA 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 A 2 1 42271 CASAVA_Build 1 59477647 1I TCTAGCGTAA -/T GTTAGCTACA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 0 1 42272 CASAVA_Build 1 59483897 1I TTTTTTTTTT -/A ACCTTAAGTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 1 2 42273 CASAVA_Build 1 59488618 1I GCCCATTCTA -/C CTGATTCTTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 1 2 42274 CASAVA_Build 1 59488722 1D TAATTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 1822 het 1305 hom 30 6 9 15 T 17 16 42275 CASAVA_Build 1 59495562 4D ATGGAGTGAC AGAA/---- AGGAAGAATG 3070 hom 90 het 35 0 31 6 AGAA 1 0 42276 CASAVA_Build 1 59501940 10I2M23I CTATCCCAAT ----------CA-----------------------/GGTTGGGGAGCAGCTGAATAGGTTGCTGTTGATTT GGTAATTTAC 3070 het 3070 hom 46 19 24 5 N/A 0 0 42277 CASAVA_Build 1 59504956 1D GACATTAAAA G/- GTGAAAAAGA 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 G 2 1 42278 CASAVA_Build 1 59509892 1I AAATAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 31 2 25 4 A 10 11 42279 CASAVA_Build 1 59511502 4I TTAGCAAGAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 AAAC 3 4 42280 CASAVA_Build 1 59511888 1D ATACACACAC A/- AAAAAACACT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 7 6 42281 CASAVA_Build 1 59517860 1D ATTAATTACC T/- TTTTTTTTTT 2726 het 1362 hom 35 10 10 16 T 19 18 42282 CASAVA_Build 1 59520559 1D TTGGGATGTG T/- TTTTTTTTTT 1867 het 1867 ref 35 19 6 11 T 17 16 42283 CASAVA_Build 1 59546063 1I AAAATTCCCC -/T TCAAAGACAG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 1 2 42284 CASAVA_Build 1 59553532 1D ATATGTCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 10 9 42285 CASAVA_Build 1 59553939 1D TGCCACAAAA T/- GAGCACTTGA 3070 het 3070 ref 38 25 13 2 T 1 0 42286 CASAVA_Build 1 59567573 1I CACTGTATCT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 8 9 42287 CASAVA_Build 1 59567705 2D TTTGTAAAAA AT/-- GTAATATCTG 3070 het 3070 hom 57 22 30 6 AT 1 0 42288 CASAVA_Build 1 59583978 1I CCAAATGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 12 13 A 11 12 42289 CASAVA_Build 1 59588212 1D GCCTGGGAAC T/- TGTGAAACCA 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 T 2 1 42290 CASAVA_Build 1 59592361 2I TTTTTTTGAG --/AC AGGGTCTTGC 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 AC 0 1 42291 CASAVA_Build 1 59593810 1I GAGCAAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 8 16 13 T 12 13 42292 CASAVA_Build 1 59594182 1D ATGTGCTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 10 9 42293 CASAVA_Build 1 59616809 4D GATCATTTTT GGAA/---- GGATCAAGCA 3070 het 3070 hom 27 13 14 1 GGAA 1 0 42294 CASAVA_Build 1 59635297 1I TTGAGTCTGC -/T TTTTTTTTTT 2064 het 2064 ref 24 8 6 10 T 15 16 42295 CASAVA_Build 1 59689641 1I TTGTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 10 11 42296 CASAVA_Build 1 59692466 1I AGACAAGAAT -/G GGGACATCTG 3070 het 3070 hom 55 26 24 5 G 3 4 42297 CASAVA_Build 1 59709465 1I GGAGTTCTCA -/G GAGATCTGGT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 G 1 2 42298 CASAVA_Build 1 59719332 4I ATTTATAAGT ----/AATA AATAGCTATG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 AATA 1 2 42299 CASAVA_Build 1 59729954 1D TTAGCTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 10 12 T 12 11 42300 CASAVA_Build 1 59731675 4I CAGAACTGAT ----/AAAC AAAATGTGAT 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 AAAC 0 1 42301 CASAVA_Build 1 59736175 1I TTCCAGGCCC -/T TTTTTTGCAC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 6 7 42302 CASAVA_Build 1 59736478 1I AATATGTGTA -/T TTTTACAAAT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 4 5 42303 CASAVA_Build 1 59742643 1I AGTTGTGGAA -/G GTTGGACTTG 3070 het 3070 hom 39 18 14 7 G 1 2 42304 CASAVA_Build 1 59744601 1I CCTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 11 12 42305 CASAVA_Build 1 59754343 10D TTTATCCTTA TTATGCCTTC/---------- TTATGCCTTC 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 TTATGCCTTC 2 1 42306 CASAVA_Build 1 59759296 1I AAATTGGGGG -/T TGGGGGGGGA 3070 hom 31 het 31 0 15 16 T 1 2 42307 CASAVA_Build 1 59771206 5D TACAAAACTC TATTT/----- TATTTCTCTA 2881 het 2881 ref 19 8 7 5 TATTT 2 1 42308 CASAVA_Build 1 59771966 4D CCCGAGCAGC CTAA/---- CTGAGAGGCA 2949 het 2949 ref 17 10 7 3 CTAA 1 0 42309 CASAVA_Build 1 59781660 1D TCTATTTGTC T/- TTTTTGGTCT 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 T 6 5 42310 CASAVA_Build 1 59783929 2I AAGGAGAAAC --/AG AGGAGTGAGA 3070 het 3070 ref 57 26 22 9 AG 1 2 42311 CASAVA_Build 1 59784661 4I TTCCCTATTA ----/TCTT TCTTGCTCTG 3070 het 3054 hom 19 9 7 3 TCTT 1 2 42312 CASAVA_Build 1 59805079 4I AATTTATCCC ----/CTTT CTTGTATTTT 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 CTTT 0 1 42313 CASAVA_Build 1 59819800 6D AGCTTTGGAG GGCTGT/------ GGCTGTGGCT 3070 het 3070 ref 46 22 16 11 GGCTGT 2 1 42314 CASAVA_Build 1 59820943 2I TGGTACATAC --/CT CTGTCATGGT 3070 het 3070 ref 64 30 26 8 CT 1 2 42315 CASAVA_Build 1 59833575 1D TTGTAATGCC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 7 6 42316 CASAVA_Build 1 59834543 1I AAATGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 10 11 42317 CASAVA_Build 1 59837598 1D CTCCTGACCT C/- CCAGTGATCT 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 C 3 2 42318 CASAVA_Build 1 59862387 1D ACTGCATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 11 10 42319 CASAVA_Build 1 59873810 1D ATGCGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 787 hom 44 3 25 16 A 17 16 42320 CASAVA_Build 1 59882878 1D GACAGACACG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 1377 hom 18 5 10 3 C 9 8 42321 CASAVA_Build 1 59888472 1D TAAAATTCTC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 1673 hom 13 4 9 0 T 8 7 42322 CASAVA_Build 1 59901305 1I AAGGATGAGG -/C CAAACAGGAG 3070 hom 157 het 56 0 53 3 C 1 2 42323 CASAVA_Build 1 59908978 1D CATTTGAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 346 hom 31 1 29 1 A 10 9 42324 CASAVA_Build 1 59927012 2D TTTTTTAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 1205 het 293 hom 26 7 5 14 T 16 14 42325 CASAVA_Build 1 59935250 1D AAATTACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 11 10 42326 CASAVA_Build 1 59960428 1I ATTTGTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 500 hom 45 2 34 9 T 13 14 42327 CASAVA_Build 1 59980199 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1514 het 118 hom 16 2 6 9 A 19 18 42328 CASAVA_Build 1 59989528 5D ATCATGTACT TAAAA/----- TAATCAGCAC 3070 hom 138 het 49 0 46 7 TAAAA 1 0 42329 CASAVA_Build 1 60000899 2I ATTAAAGACT --/TC TGTCATTTGA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TC 0 1 42330 CASAVA_Build 1 60002439 1D CTACAATTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 30 0 23 9 A 10 9 42331 CASAVA_Build 1 60006344 2D TGACTGGTCC AA/-- AAGATTGCGT 3070 het 3070 ref 52 26 19 7 A 4 2 42332 CASAVA_Build 1 60022459 1I TATAGCACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 9 10 42333 CASAVA_Build 1 60031822 1I GATAGCAAAA -/G CAGTTCTACC 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 G 0 1 42334 CASAVA_Build 1 60044389 1D GCTATTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 T 11 10 42335 CASAVA_Build 1 60047394 1I GAAGTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 10 11 42336 CASAVA_Build 1 60052298 4I GTATGATCTA ----/TTTC TTTCTTTCTT 2956 het 2758 hom 22 8 7 7 TTTC 3 4 42337 CASAVA_Build 1 60102054 1D TATTATTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 83 het 38 0 29 9 T 10 9 42338 CASAVA_Build 1 60110782 1I ACAAAAATTT -/G TTATAATTAA 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 G 0 1 42339 CASAVA_Build 1 60116639 1D TTGTCACTGA T/- TTTTTTTTTT 2161 het 2161 ref 37 26 5 6 T 12 11 42340 CASAVA_Build 1 60118603 1D ATGAAGGTGG T/- TATACATAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 2 1 42341 CASAVA_Build 1 60125921 2D CTTTAAAATT TC/-- TCTCTTTTGT 3070 het 1586 hom 15 4 9 3 TC 3 2 42342 CASAVA_Build 1 60134565 2D22M2I CATATATAAA ATATATATATATATACACACCAAG--/--ATATATATATATACACACCAAGTA TATATATATA 3070 het 1952 hom 20 7 13 5 N/A 0 0 42343 CASAVA_Build 1 60140483 2I CTGCTAGTCT --/GA GTTTTTACAG 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 GA 0 1 42344 CASAVA_Build 1 60140690 1I TAGTAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2603 hom 26 7 12 7 T 10 11 42345 CASAVA_Build 1 60148731 2D CACTGATGAG TA/-- TACACAGTGA 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 TA 2 1 42346 CASAVA_Build 1 60180046 5I AAAAACATGT -----/ATAGA ATAATGACAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 ATAGA 0 1 42347 CASAVA_Build 1 60181938 1D TCTGAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 1398 het 1398 ref 43 26 4 14 T 12 11 42348 CASAVA_Build 1 60182358 4D CTTAGCCGTT TAAG/---- TATGTATAGA 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 TAAG 1 0 42349 CASAVA_Build 1 60191767 8D AGTGTGTATA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 26 15 7 TG 9 5 42350 CASAVA_Build 1 60192849 1I TTGGTGGGTC -/G GGGGGGGGAT 2496 het 2496 ref 26 13 8 5 G 8 9 42351 CASAVA_Build 1 60196785 8I CTTCTCATTG --------/CCACTTGC CCTTTCCTTC 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 CCACTTGC 0 1 42352 CASAVA_Build 1 60212780 5D TCGGATGGTT TAATG/----- TAAGGTATTG 3070 het 3070 hom 57 26 26 5 TAATG 1 0 42353 CASAVA_Build 1 60213318 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 T 9 8 42354 CASAVA_Build 1 60215769 1I TTCATGACCC -/T TTTTTTTTTT 2407 het 2407 ref 40 17 9 14 T 10 11 42355 CASAVA_Build 1 60215819 4I TATATATATA ----/ATAG ATAGACCAAT 2931 het 2931 ref 30 15 7 8 ATAG 1 2 42356 CASAVA_Build 1 60217466 1D GTCTAGCTCC A/- ACATCACATA 3070 hom 138 het 55 0 47 9 A 2 1 42357 CASAVA_Build 1 60233462 3I TCCATTATCC ---/ACT ATCACAAGTA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 ACT 0 1 42358 CASAVA_Build 1 60239500 3D GCAACAACAA CAG/--- CAACAACAAA 3070 hom 87 het 32 0 28 5 CAG 1 0 42359 CASAVA_Build 1 60244865 3D TTCTGCATCC TCT/--- TCTTCTTCTC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 TCT 4 3 42360 CASAVA_Build 1 60245180 2I TCTTGCATAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 10 12 42361 CASAVA_Build 1 60247931 1I CAGTACTTTA -/T ATTTTGATCC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 0 1 42362 CASAVA_Build 1 60250439 1I CGCTTTGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2735 hom 34 11 14 9 A 10 11 42363 CASAVA_Build 1 60265975 2D GAAGCTTAAA AG/-- AGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 AG 2 1 42364 CASAVA_Build 1 60267101 1D TGTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1388 het 1388 ref 42 29 4 9 T 11 10 42365 CASAVA_Build 1 60280921 1I AAATCCTTAC -/A ACAACAATAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 2 42366 CASAVA_Build 1 60285993 1I TAGCAAGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 808 hom 24 2 19 3 A 12 13 42367 CASAVA_Build 1 60314486 1D CTTCAAAAAT G/- TAAGACAATA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 G 1 0 42368 CASAVA_Build 1 60327808 1I AGTGGCCTAG -/C TGGACTGTGA 3070 hom 132 het 54 0 45 9 C 0 1 42369 CASAVA_Build 1 60341984 2I TTGTTTCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 10 12 42370 CASAVA_Build 1 60353598 5D GTAATTTGAA TACTT/----- TTCTTTAGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 TACTT 1 0 42371 CASAVA_Build 1 60356351 1D ACATAGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 10 9 42372 CASAVA_Build 1 60356870 1D GAGGGAAGAC T/- TTTTTATTCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 5 42373 CASAVA_Build 1 60357299 1D TCAATAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 12 11 42374 CASAVA_Build 1 60357545 1I TGTCTTGGCC -/T CTCAAAGTGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 0 1 42375 CASAVA_Build 1 60359998 1I CCATTTTTCA -/T TCCCATGGAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 2 42376 CASAVA_Build 1 60362043 1I TTCAGCATAT -/A TTTTTTTATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 0 1 42377 CASAVA_Build 1 60363264 2D AAAGAAAAGG TT/-- TTTTTTATAT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 8 6 42378 CASAVA_Build 1 60370340 4D TAGACAAGAT AGTC/---- AGATCAGGAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AGTC 1 0 42379 CASAVA_Build 1 60392969 2D GAAAATGAGC AG/-- AGAGTCTGGT 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 AG 3 2 42380 CASAVA_Build 1 60414803 1I CTGCACTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 A 9 10 42381 CASAVA_Build 1 60431256 1D CATGAAAATA C/- ATGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 C 1 0 42382 CASAVA_Build 1 60437220 1D TTTTTATATA T/- TCTATGGGCA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 2 1 42383 CASAVA_Build 1 60439977 2D TTAACACTGA GT/-- GTGTGTGTGT 1193 het 1193 ref 51 39 3 9 GT 8 7 42384 CASAVA_Build 1 60442353 1D4M1D TAGATGCAAT AAATAG/-AATA- GTCTTCTTTG 3070 het 3070 ref 45 22 17 10 N/A 0 0 42385 CASAVA_Build 1 60446067 2D CAGTTTATCA CC/-- CAATGTGGCT 3070 het 3070 ref 28 9 10 10 C 3 1 42386 CASAVA_Build 1 60460242 2D AACTCCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 10 A 16 14 42387 CASAVA_Build 1 60467640 39D CTCTTTTACT CACTGAAGTCATGAAATACATGAATGAGTGAAATACATA/--------------------------------------- CACTGAAGTC 3070 het 3070 ref 38 26 12 10 CACTGAAGTCATGAAATACATGAATGAGTGAAATACATA 1 0 42388 CASAVA_Build 1 60481442 1D TATTAGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1405 het 1405 ref 22 14 3 5 T 11 10 42389 CASAVA_Build 1 60482370 1I CTGAGTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 10 11 42390 CASAVA_Build 1 60545589 3I TGTATTTAAT ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 ATA 5 6 42391 CASAVA_Build 1 60548548 1D CTACAGTGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 10 9 42392 CASAVA_Build 1 60549438 1D TTAAATACAA C/- AAAAAGATAT 3070 het 3070 ref 25 18 7 1 C 1 0 42393 CASAVA_Build 1 60554569 1I CGAAAACCAA -/G TTGCCTGCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 42394 CASAVA_Build 1 60557352 2D TATACATGCT AG/-- ATATTAAGCC 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 AG 1 0 42395 CASAVA_Build 1 60561342 5I TTCAAAATAG -----/TATTT TATTATTAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TATTT 0 1 42396 CASAVA_Build 1 60569002 1D GCCCTATGTA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 8 7 42397 CASAVA_Build 1 60572174 1I TTGCCAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 13 18 15 T 12 13 42398 CASAVA_Build 1 60588196 5D ACTAGGTCAA AATGT/----- AAATACAATT 3070 het 3070 ref 51 26 22 7 AATGT 1 0 42399 CASAVA_Build 1 60593762 1D AGCCAGGTGT G/- GGAGGCAGTG 3070 het 2351 hom 25 10 12 3 G 3 2 42400 CASAVA_Build 1 60601698 3I TGGTCTTGAA ---/CTC CTGACCTCAA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 CTC 0 1 42401 CASAVA_Build 1 60603409 1D GCTGGGCAAA G/- TACTGTCCAT 3070 hom 105 het 40 0 36 6 G 1 0 42402 CASAVA_Build 1 60604252 1I ACGCTGATAC -/A AAAAAGCATG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 5 6 42403 CASAVA_Build 1 60608564 1D TCCTGTTCTC A/- AAATAAACAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 4 3 42404 CASAVA_Build 1 60614174 1I GAAGGAAGAC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 132 het 45 0 45 0 A 7 8 42405 CASAVA_Build 1 60615423 1I AGAAAATAGC -/A AAAAAAGACA 3070 het 3070 ref 38 23 10 5 A 6 7 42406 CASAVA_Build 1 60621461 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATA 1926 het 1195 hom 8 4 4 0 A 9 8 42407 CASAVA_Build 1 60628479 1D CTACAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 826 hom 38 4 25 9 A 12 11 42408 CASAVA_Build 1 60636775 4D TAAATAAATG AATA/---- GACAAATATA 3070 hom 111 het 39 0 38 4 AATA 1 0 42409 CASAVA_Build 1 60642556 1D TATTTGTGGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 8 42410 CASAVA_Build 1 60650901 1D CAACTCCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 20 10 A 11 10 42411 CASAVA_Build 1 60659400 5D TATAAGGGCA AGGTG/----- AGGTGCCTTA 3070 hom 109 het 40 0 36 7 AGGTG 2 1 42412 CASAVA_Build 1 60665217 1I TAGGGATGTA -/T ATCTTACCTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 42413 CASAVA_Build 1 60698215 1I ATTTACAACC -/A AAAGATTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 3 4 42414 CASAVA_Build 1 60705640 1I AAAAAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 2746 het 117 hom 14 2 12 0 A 13 14 42415 CASAVA_Build 1 60713250 1I TTTATTTTCT -/A AAAATTTTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 4 5 42416 CASAVA_Build 1 60716940 9I ATAAATGATA ---------/GAAAAGATG GAAAAGATGG 3070 het 2260 hom 26 5 14 7 GAAAAGATG 1 2 42417 CASAVA_Build 1 60727657 1D CACCTGTAAT C/- CCAGCTACTT 2976 het 1323 hom 12 4 7 1 C 3 2 42418 CASAVA_Build 1 60737827 1D TTCTGTATAT C/- CATTATATCT 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 C 2 1 42419 CASAVA_Build 1 60742605 1D CTGCTATGAC A/- ACATGGGAAC 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 A 2 1 42420 CASAVA_Build 1 60746010 13I TGTTCTCTAA -------------/AAGTGAACAGACT AAGACAGTGG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 AAGTGAACAGACT 0 1 42421 CASAVA_Build 1 60758398 5D GAGAGAAATC TAATT/----- TAATTTTTTA 2832 het 2832 ref 28 15 9 9 TAATT 2 1 42422 CASAVA_Build 1 60769026 1I CAATTTTTTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 7 8 42423 CASAVA_Build 1 60786682 1D ATTCCAGAGT A/- ATGCAGCTGT 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 A 2 1 42424 CASAVA_Build 1 60792691 1D GGCAAGTCAC A/- AAAAAATATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 6 42425 CASAVA_Build 1 60799634 1D ACTGAACACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 10 9 42426 CASAVA_Build 1 60808597 6D ATTGACTAGG ATGCAA/------ ATGCAATTAC 3070 hom 47 het 22 0 14 11 ATGCAA 2 1 42427 CASAVA_Build 1 60811873 1D CTTCCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 12 11 42428 CASAVA_Build 1 60822356 4D AATTTTTGTC TTCT/---- TTAAGTTCTT 3070 het 3070 hom 26 13 12 4 TTCT 1 0 42429 CASAVA_Build 1 60827935 3I CAAATGTCAC ---/CTT CTCATTGAGG 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 CTT 0 1 42430 CASAVA_Build 1 60828699 20I GAAACCCCGT --------------------/CTCTACTAAAAATACAAAAA GTTAGCCGGA 2422 het 1182 hom 12 3 6 4 CTCTACTAAAAATACAAAAA 0 1 42431 CASAVA_Build 1 60834268 4D TCTCCCCAGG AAAT/---- AAATCCTCAA 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 AAAT 2 1 42432 CASAVA_Build 1 60835833 1D CAGCAACTGC T/- CTCCTACTTT 3070 het 3070 hom 53 23 27 4 T 1 0 42433 CASAVA_Build 1 60884685 4D ATTTTTTAAG AAAT/---- AAATATTCTA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 AAAT 2 1 42434 CASAVA_Build 1 60889458 1D CCACATAGTT A/- AAAAAAAAAA 1343 het 1343 ref 40 29 3 9 A 11 10 42435 CASAVA_Build 1 60905721 1I GTTAGATTGC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 8 9 42436 CASAVA_Build 1 60907923 1D AGACCAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 7 A 10 9 42437 CASAVA_Build 1 60911980 4D TGTGTTTGAG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 90 het 41 0 30 14 TTGT 5 4 42438 CASAVA_Build 1 60917735 5D TAACTGTGTG TGTGT/----- GGGGGGGGTG 3070 het 135 hom 32 3 14 15 TGTGT 1 0 42439 CASAVA_Build 1 60928592 1D AAAGTTGAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 A 10 9 42440 CASAVA_Build 1 60941520 1D CTTTCTCTCT G/- GTAACACAAC 3070 het 3070 hom 41 13 21 8 G 2 1 42441 CASAVA_Build 1 60944253 1I AAGGGCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 T 12 13 42442 CASAVA_Build 1 60958532 1I GATTTTTACC -/T AAATTGATGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 0 1 42443 CASAVA_Build 1 60964484 1D TTTCTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 11 9 T 12 11 42444 CASAVA_Build 1 60966265 4D30M1D TTATGGCAAC ACAAACAAAGACAGTAAGTTAACTTTAAGTTCCAT/----ACAAAGACAGTAAGTTAACTTTAAGTTCCA- TTTATGTGCT 3070 het 3070 ref 40 30 12 7 N/A 0 0 42445 CASAVA_Build 1 60970925 42D TGGTCCCACT ATCTCCATGTAAATTTTGTCCTAGAGACCTCCCAAGACTATC/------------------------------------------ ATCTCCATGT 3070 hom 33 het 35 0 11 27 ATCTCCATGTAAATTTTGTCCTAGAGACCTCCCAAGACTATC 2 1 42446 CASAVA_Build 1 60975990 1D ACATACCACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 17 17 10 A 10 9 42447 CASAVA_Build 1 60979390 1I GGTGCTAGGG -/T AGCCCCAGAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 0 1 42448 CASAVA_Build 1 60982228 1D CCTTCATGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2682 hom 20 8 10 2 T 10 9 42449 CASAVA_Build 1 60992293 1I GGATTGATAC -/A AGTAAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 1 2 42450 CASAVA_Build 1 60993289 1I AACAGTTCCT -/A AAAAACTTCA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 5 6 42451 CASAVA_Build 1 60994136 1I TAGATTTTTT -/A TTCTGTTCCA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 A 0 1 42452 CASAVA_Build 1 60994980 2I ACCAAAAACA --/CT GTTATGCAGT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 CT 0 1 42453 CASAVA_Build 1 61006830 1D ATTCTGTATT G/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 G 1 0 42454 CASAVA_Build 1 61015570 1D TTTCTTCCAG T/- TGATCAAATC 3070 het 1149 hom 16 5 10 1 T 2 1 42455 CASAVA_Build 1 61015692 1D ATTCGTCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2849 hom 20 12 7 1 T 10 9 42456 CASAVA_Build 1 61023417 2D TGCTTTGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2070 hom 33 7 22 5 A 15 13 42457 CASAVA_Build 1 61024142 1D AGGTGCAGCC G/- GGCATGGTGG 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 G 3 2 42458 CASAVA_Build 1 61061109 1I ATAATACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 11 12 42459 CASAVA_Build 1 61097145 1D GTTGTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 586 hom 31 2 23 6 T 11 10 42460 CASAVA_Build 1 61139138 2D TGTAGTTAAA AT/-- ATGTTACGAA 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 AT 2 1 42461 CASAVA_Build 1 61141333 1I CTAGTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 2095 het 2095 ref 44 19 10 15 T 11 12 42462 CASAVA_Build 1 61160374 2D AGAACAGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 24 9 A 16 14 42463 CASAVA_Build 1 61191593 2D GAAGGGAGCT AG/-- AGTGAGCTGG 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 AG 2 1 42464 CASAVA_Build 1 61204137 4D AAAATGGATT TTTC/---- TTTCTATCAC 3070 hom 23 het 24 1 20 4 TTTC 2 1 42465 CASAVA_Build 1 61236660 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 hom 93 het 34 0 30 4 AG 2 1 42466 CASAVA_Build 1 61271020 1D TAGCTTATTC T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 39 23 4 12 T 13 12 42467 CASAVA_Build 1 61271253 1I TGACCAGGTC -/T TGAACTCAGC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 2 42468 CASAVA_Build 1 61345727 5I GTATGAGCCA -----/CTTTC CTTTACTGTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CTTTC 0 1 42469 CASAVA_Build 1 61347754 1I CTTATGAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 44 het 18 0 15 3 T 9 10 42470 CASAVA_Build 1 61348370 1I GAAACTAAGT -/C CAAAGGAGTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 1 2 42471 CASAVA_Build 1 61350385 1D AATAGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 12 11 42472 CASAVA_Build 1 61352012 5I AGGCCATGGT -----/GGAGA GGAGAGAAGA 3070 hom 103 het 39 0 34 5 GGAGA 1 2 42473 CASAVA_Build 1 61354278 1D ATGTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 40 3 24 13 T 15 14 42474 CASAVA_Build 1 61361966 1I AAGGCTACAT -/G GGTTTGGCTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 2 3 42475 CASAVA_Build 1 61379681 1I ACTCAGGGGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 383 hom 41 1 31 9 A 8 9 42476 CASAVA_Build 1 61385093 1D TCTTTCATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 176 hom 59 1 49 9 T 10 9 42477 CASAVA_Build 1 61387318 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 26 1 21 4 T 17 14 42478 CASAVA_Build 1 61407061 2I TTGGTCACAG --/TT TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 T 6 8 42479 CASAVA_Build 1 61409173 2D TCAGTTTCAT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 10 8 42480 CASAVA_Build 1 61410575 1D TGAGTCAGAT A/- ATGTGGATAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 2 1 42481 CASAVA_Build 1 61414554 1I ATTTTTGCCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 8 9 42482 CASAVA_Build 1 61422383 2D GGGAAAAAAA AC/-- CAAAAAAAAA 2104 het 790 hom 20 7 11 2 AC 1 0 42483 CASAVA_Build 1 61430098 1D TAAGTAACTC T/- TAACAGTCTT 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 T 2 1 42484 CASAVA_Build 1 61430229 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 2750 het 2750 ref 24 11 7 6 T 9 8 42485 CASAVA_Build 1 61430332 1I CAGTTCTCCT -/G CCTCAGCCTC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 G 0 1 42486 CASAVA_Build 1 61430806 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 2782 het 1571 hom 14 5 6 3 A 8 7 42487 CASAVA_Build 1 61433324 2I CCTCTTGTTG --/TA TATGTTATTC 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 TA 1 2 42488 CASAVA_Build 1 61443129 1I TAGGTAGAGC -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 6 7 42489 CASAVA_Build 1 61444162 13D TTTGCAGCCC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 24 1 17 9 T 29 16 42490 CASAVA_Build 1 61466951 1I TGTATTTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 9 42491 CASAVA_Build 1 61484865 1D TCCAACTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 10 9 42492 CASAVA_Build 1 61516312 1D TTCCTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 11 10 42493 CASAVA_Build 1 61519498 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 37 0 33 5 A 12 11 42494 CASAVA_Build 1 61539435 4D GTGATATGCT AACA/---- GTCAGTGCTA 3070 hom 104 het 38 0 34 5 AACA 1 0 42495 CASAVA_Build 1 61542928 1D TAAGATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 132 het 53 0 44 9 T 11 10 42496 CASAVA_Build 1 61549671 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 26 0 23 4 A 8 9 42497 CASAVA_Build 1 61558895 5D CAGTGTTGAG TATCT/----- TAAAATTAGC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TATCT 1 0 42498 CASAVA_Build 1 61564800 1I GGAACACTGA -/C CCCCATCAGG 3070 hom 135 het 54 0 45 9 C 4 5 42499 CASAVA_Build 1 61566691 1I TATATATATA -/T TTTTTTTCGA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 7 8 42500 CASAVA_Build 1 61575583 1I CACCTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 10 11 42501 CASAVA_Build 1 61578051 1D CCAAGCTTGA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 102 het 42 0 36 7 T 7 6 42502 CASAVA_Build 1 61597103 1D CCCAACACTT C/- CAGGTGGAGG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 C 2 1 42503 CASAVA_Build 1 61606119 4D TCCAGAAAAC TGTT/---- TGGATTCCTG 3070 het 3070 hom 34 13 16 8 TGTT 1 0 42504 CASAVA_Build 1 61607704 4D GATCATTGAT AGAA/---- AGATAATAGA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 AGAA 1 0 42505 CASAVA_Build 1 61610837 1I CATTGTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 12 13 42506 CASAVA_Build 1 61612063 1I TTTGGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1702 hom 25 5 15 5 A 11 12 42507 CASAVA_Build 1 61615483 6I ACTCCATCTC ------/AATAAA AAAAAAAAGA 2684 het 2684 ref 23 10 7 6 AATAAA 0 1 42508 CASAVA_Build 1 61633549 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 1502 het 1502 ref 44 19 5 20 T 15 14 42509 CASAVA_Build 1 61652227 8D ACTTCACAAA TTGTTTTT/-------- TTGTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TTGTTTTT 2 1 42510 CASAVA_Build 1 61664890 1I CTTGTCTTTT -/G GCACAAAAGG 3070 hom 162 het 57 0 53 4 G 1 2 42511 CASAVA_Build 1 61668916 1I TTGTAGTCTG -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 60 het 33 0 21 12 T 7 8 42512 CASAVA_Build 1 61670480 1D CTTTTCCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 42 1 24 18 T 17 16 42513 CASAVA_Build 1 61670854 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 2152 hom 26 het 20 0 10 10 TA 9 8 42514 CASAVA_Build 1 61676110 13D AGAACCCTAT TCTGTTTGGTGTA/------------- TCTGTCAGTT 3070 hom 126 het 46 0 43 6 TCTGTTTGGTGTA 1 0 42515 CASAVA_Build 1 61687942 1I CACAAAGGTG -/C CCGGGGCCAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 C 2 3 42516 CASAVA_Build 1 61693774 1I CCTTTTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 34 2 23 9 T 13 14 42517 CASAVA_Build 1 61706029 1I ATATGAAAGG -/A AAAAAAAATG 2908 het 2908 ref 26 15 7 4 A 8 9 42518 CASAVA_Build 1 61710555 1I AGTTTGCCCC -/T GTTTGAGGAG 3070 hom 81 het 35 0 25 10 T 0 1 42519 CASAVA_Build 1 61715463 2I AGACACTATG --/TT TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 53 26 19 8 T 6 8 42520 CASAVA_Build 1 61719060 1D GGAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 38 20 12 7 T 1 0 42521 CASAVA_Build 1 61719267 1D CAAATGAAAT A/- AAAAAAAAAA 948 het 948 ref 38 29 4 5 A 11 10 42522 CASAVA_Build 1 61724784 1I TTAGATGCAA -/G GCATTTGCTT 3070 het 3070 hom 45 13 27 5 G 1 2 42523 CASAVA_Build 1 61732542 1I ACCACCACAC -/A AGACTAATAT 3070 hom 99 het 38 0 30 8 A 1 2 42524 CASAVA_Build 1 61738441 1I TTATTTTATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 9 10 42525 CASAVA_Build 1 61740894 1I ATGAGAAGCC -/G GGGGGACAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 5 6 42526 CASAVA_Build 1 61742265 2D TATGCGTATG TA/-- TATATATATG 3070 hom 54 het 21 0 18 4 TA 5 4 42527 CASAVA_Build 1 61747827 1D ACTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 29 2 23 4 A 15 14 42528 CASAVA_Build 1 61749063 1D CCACGGCATT C/- TACTGTTCAA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 C 1 0 42529 CASAVA_Build 1 61761059 3D AGACCCTCTC CTT/--- CATCATCTAT 3070 het 3070 hom 35 14 21 1 CTT 1 0 42530 CASAVA_Build 1 61775682 1I CTGTGGCCTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 7 8 42531 CASAVA_Build 1 61779795 1I TCACTAGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 121 hom 51 1 44 6 T 9 10 42532 CASAVA_Build 1 61782879 1D GATCCTGGAC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 18 8 7 3 T 8 7 42533 CASAVA_Build 1 61788846 1I TAATAAAATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 T 9 10 42534 CASAVA_Build 1 61789511 20I TTTGTTAAAT --------------------/TTCTTTAATTGGATTCTGAA TTCCTTCTCT 3070 hom 36 het 13 0 13 1 TTCTTTAATTGGATTCTGAA 0 1 42535 CASAVA_Build 1 61793100 1D AGATGGAATA T/- TTTGTTATTG 1122 het 268 hom 22 3 5 14 T 4 3 42536 CASAVA_Build 1 61793205 3I CCAGTGACTG ---/CTC CTCCTAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 CTC 1 2 42537 CASAVA_Build 1 61801354 2D AGTTTAGGGT GA/-- CCGCTAGACT 3070 het 3070 ref 54 31 17 8 GA 1 0 42538 CASAVA_Build 1 61802847 1D CAAGCTGGCC A/- AAGGGGTAAG 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 A 3 2 42539 CASAVA_Build 1 61806733 1D TGAGAATACC A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 56 31 21 6 A 8 7 42540 CASAVA_Build 1 61816763 2D GTTTCTCCAC AT/-- CTTTGTGGTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AT 1 0 42541 CASAVA_Build 1 61821430 1D ATGTGTAGTA T/- GCTTGTGAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 0 42542 CASAVA_Build 1 61826652 1D AAGAATGCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 8 42543 CASAVA_Build 1 61832720 5I6M14I AGGGAAGTTG -----CCTGAT--------------/GTTGTAGTGATAAAGTTGGCAGGTC TTATGAGGAT 3070 hom 135 het 46 0 46 2 N/A 0 0 42544 CASAVA_Build 1 61857505 3D AAAAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 172 hom 29 2 13 14 A 16 13 42545 CASAVA_Build 1 61858176 1D CAGAGAGGCT G/- GTGTGGAATG 3070 hom 112 het 43 0 37 6 G 2 1 42546 CASAVA_Build 1 61860566 13I AGTAAGAGAA -------------/CTGACCTACTGTG CTTTCCACCT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 CTGACCTACTGTG 0 1 42547 CASAVA_Build 1 61860715 1I GGCGGGCAGA -/T AACTTGAGCC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 0 1 42548 CASAVA_Build 1 61863841 5D TTCAAGAGAA TTCAG/----- TTATCTAATT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TTCAG 1 0 42549 CASAVA_Build 1 61866101 1I GGAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 26 1 21 4 A 10 11 42550 CASAVA_Build 1 61866519 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAACCC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 C 0 1 42551 CASAVA_Build 1 61873125 1D GACCAGCCTA G/- GCAACGTAGC 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 G 2 1 42552 CASAVA_Build 1 61879682 2I TTCAACTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 30 1 14 15 A 14 16 42553 CASAVA_Build 1 61885718 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAAAC 1910 het 76 hom 32 3 9 20 AC 1 0 42554 CASAVA_Build 1 61886549 1D GAGACCTGGT C/- CTTGCCTCTA 3070 het 3070 hom 56 20 27 9 C 2 1 42555 CASAVA_Build 1 61899987 1I AGTTTTGAAG -/A AAAAAAGTAC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 6 7 42556 CASAVA_Build 1 61901531 7D TGCAAGGAGC TTGCACA/------- GAGAAGGAGC 3070 hom 90 het 33 0 31 5 TTGCACA 1 0 42557 CASAVA_Build 1 61904240 1D GGAGGGAAAG T/- TTGGATTCAA 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 T 3 2 42558 CASAVA_Build 1 61907609 1I GAGCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 A 11 12 42559 CASAVA_Build 1 61912463 1D AGTAAACTCT C/- CAAACAGAAA 3070 het 3070 ref 38 20 18 0 C 2 1 42560 CASAVA_Build 1 61913936 1D AGGTGATCCA C/- CCGCCTCAGC 3070 het 325 hom 18 4 9 6 C 3 2 42561 CASAVA_Build 1 61916550 2D AATTCTTCAT AA/-- AAAAAAAGAC 3070 het 69 hom 34 3 17 14 A 9 7 42562 CASAVA_Build 1 61918182 1D GCTTCAGCCT C/- CCAAGTAGGT 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 C 3 2 42563 CASAVA_Build 1 61922943 3I TCATTATTAT ---/AAC AACAAGTTGA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AAC 1 2 42564 CASAVA_Build 1 61924572 1D TTTACTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 423 hom 34 1 26 7 A 10 9 42565 CASAVA_Build 1 61927625 3I TATTTTATTT ---/TAG TATTATTATT 3070 het 2636 hom 23 8 11 4 TAG 0 1 42566 CASAVA_Build 1 61931138 2D TGCAGATGTT CA/-- CACACTCTAA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 CA 3 2 42567 CASAVA_Build 1 61932398 1D AAGAACGCCC T/- TTTTTTTTTC 1252 het 1252 ref 21 11 3 7 T 10 9 42568 CASAVA_Build 1 61933114 2I AAACCATTAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 TA 6 7 42569 CASAVA_Build 1 61935818 4D CATTAAAATG ACAT/---- ACAATGACCT 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 ACAT 1 0 42570 CASAVA_Build 1 61937000 1D TAAAATGGGA T/- TTTTTTTTTT 2579 het 2579 ref 26 12 8 6 T 11 10 42571 CASAVA_Build 1 61947118 1D TTGCATTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 13 15 A 15 14 42572 CASAVA_Build 1 61955463 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1411 het 1411 ref 14 7 5 2 A 13 12 42573 CASAVA_Build 1 61955824 1I AACAGTGTGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 8 9 42574 CASAVA_Build 1 61959802 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 672 hom 20 5 14 1 A 15 14 42575 CASAVA_Build 1 61965927 2I ACTTCTTCCT --/TC TCTCTCTTTT 2451 het 2451 ref 14 7 6 1 TC 3 4 42576 CASAVA_Build 1 61982813 5D GATAGAACTT ATAAA/----- ATGAGTTCTG 1833 het 1833 ref 31 25 4 7 ATAAA 1 0 42577 CASAVA_Build 1 61984934 5D AAAATTAAGC TCTAT/----- TCTGCATTTA 3070 het 3070 hom 39 17 21 2 TCTAT 1 0 42578 CASAVA_Build 1 61985616 12I TTTTGTGTTC ------------/AGCCAGTAAACT GTACAGCTGT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 AGCCAGTAAACT 0 1 42579 CASAVA_Build 1 61997028 3D TCTCTAGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 26 11 11 7 TTG 4 3 42580 CASAVA_Build 1 62001948 3I GAGACAAGGT ---/TTC TTCTCTCTGT 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 TTC 1 2 42581 CASAVA_Build 1 62003979 4I TCCGTGACTC ----/ACCT ACTGCTAATC 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 ACCT 0 1 42582 CASAVA_Build 1 62004513 3I AGATTTCTGT ---/TGA TGATTCTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 TGA 1 2 42583 CASAVA_Build 1 62007164 1I TGTCTCCAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 8 9 42584 CASAVA_Build 1 62009127 1I GTGTGATTGT -/G GCCATTGTAC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 G 1 2 42585 CASAVA_Build 1 62017307 1I13M3I TATAATGACA -TAATATACATAAA---/TTAATATACATAAATAT TGATAAAAAT 3070 het 371 hom 16 2 11 5 N/A 0 0 42586 CASAVA_Build 1 62018919 1D TGGAGTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 T 11 10 42587 CASAVA_Build 1 62019715 6D TCAATGTTAT GCTTTC/------ TATAACTCAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 GCTTTC 1 0 42588 CASAVA_Build 1 62026357 1I GTGAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 425 hom 36 1 21 14 A 10 11 42589 CASAVA_Build 1 62028368 1D GGAGGCTGAA G/- GGGGAGGATT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 G 5 4 42590 CASAVA_Build 1 62031983 1D ATCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1549 het 1178 hom 20 8 4 8 A 17 16 42591 CASAVA_Build 1 62032197 1D AATCTCGCTC T/- TGTTGCCCAG 2831 het 33 hom 14 1 8 7 T 2 1 42592 CASAVA_Build 1 62045910 1D TTGGCAGAAA G/- AAGCTAGGCA 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 G 1 0 42593 CASAVA_Build 1 62062628 1D CCCGGTCCAC T/- TTTTTTTTTT 1270 het 1270 ref 26 11 3 12 T 13 12 42594 CASAVA_Build 1 62064678 4D AAACAAATAA TGCT/---- TGCTTCTAAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TGCT 2 1 42595 CASAVA_Build 1 62068728 7I ATTTCTGTGA -------/CATTTTT CATTTTTCAC 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 CATTTTT 1 2 42596 CASAVA_Build 1 62081027 15I AGCTATTAAA ---------------/AAAAAAAAGGAAAAG AAAAAAAAGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAAAAAAAGGAAAAG 0 1 42597 CASAVA_Build 1 62082159 1I ACGAGCCAGT -/A ATGGAGACTA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 A 1 2 42598 CASAVA_Build 1 62086201 1D TATTTTGTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 17 hom 50 1 39 10 T 9 8 42599 CASAVA_Build 1 62102474 1D TAACTTCACA T/- TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 T 7 6 42600 CASAVA_Build 1 62105810 4I24M7D AAGTTTACTT ----ATTCATATTTTAAAATCTGTAAAATTTTTTT/AAACATTCATATTTTAAAATCTGTAAAA------- TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 28 1 19 13 N/A 0 0 42601 CASAVA_Build 1 62115519 1I AGTTCATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 458 hom 51 2 40 9 T 12 13 42602 CASAVA_Build 1 62117872 1D GAATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1304 hom 34 5 24 7 T 12 11 42603 CASAVA_Build 1 62119668 1D AAAACAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 33 3 22 8 T 21 20 42604 CASAVA_Build 1 62122243 2D ATAAATGCCA TT/-- TTTTTTTAGT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 9 7 42605 CASAVA_Build 1 62125080 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 12 11 42606 CASAVA_Build 1 62131026 11D ATTGTCAATA TCGCCCACCAG/----------- GGTGGCACGT 3070 hom 135 het 49 0 44 8 TCGCCCACCAG 1 0 42607 CASAVA_Build 1 62131746 1D TTTTAGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 22 3 13 6 T 15 14 42608 CASAVA_Build 1 62135322 3D ACTAGTAAAT AAA/--- AAACGATGAA 3070 hom 69 het 31 0 24 9 A 6 3 42609 CASAVA_Build 1 62136064 1I59M1I TTTATGGAAG -AAGGGGAGAAAAAGACGTTAGAAAGTAACCAGCAAGGGTCTGCCAAGTTGTTTTCCCCT-/AAAGGGGAGAAAAAGACGTTAGAAAGTAACCAGCAAGGGTCTGCCAAGTTGTTTTCCCCTG AATGCTGTGA 3070 hom 178 het 38 0 60 3 N/A 0 0 42610 CASAVA_Build 1 62138017 1I AATGATTGAG -/A AATTGCGATA 3070 het 3070 hom 54 23 28 3 A 2 3 42611 CASAVA_Build 1 62138840 5D CATATGTGGC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTTCT 4 3 42612 CASAVA_Build 1 62140487 1D TCAAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 27 1 18 9 A 13 12 42613 CASAVA_Build 1 62143352 1D TTTGTTGAGT C/- AGGTGTCTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 0 42614 CASAVA_Build 1 62150290 11I TTATATTAAA -----------/AAATCCTTTTG AAATTGGATA 3070 hom 30 het 13 0 11 3 AAATCCTTTTG 0 1 42615 CASAVA_Build 1 62156482 2I TATTTCTCCT --/AG AGTCATTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AG 1 2 42616 CASAVA_Build 1 62160908 7D TCTGACTTCA GTCACAT/------- GTCACAAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 15 11 GTCACAT 1 0 42617 CASAVA_Build 1 62162024 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 A 9 8 42618 CASAVA_Build 1 62167678 3D CCTCATAGTA TTG/--- TTGTGACAAT 3070 het 3070 ref 51 24 25 6 TTG 2 1 42619 CASAVA_Build 1 62170506 2D CATTTAGAAT TA/-- GTTTCCAGGT 3070 het 3070 ref 52 29 19 7 TA 1 0 42620 CASAVA_Build 1 62175493 4D ATCCCCATAG TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 10 5 TTTC 2 1 42621 CASAVA_Build 1 62188091 1D ACATGAACCT G/- GCAGAGGCTG 3065 het 3065 ref 21 9 9 3 G 2 1 42622 CASAVA_Build 1 62201392 12D CAAATTAGCA GGATTTCCACTG/------------ GTAGGTTAAA 3070 het 3070 ref 29 19 10 6 GGATTTCCACTG 1 0 42623 CASAVA_Build 1 62217917 2I GTCTCAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3053 hom 42 het 24 0 14 10 A 14 16 42624 CASAVA_Build 1 62255674 1I ACTCCGCCTC -/A AAAAAAAAAA 1388 het 1004 hom 17 4 8 5 A 15 16 42625 CASAVA_Build 1 62266118 3D TTGAGTTATG GGA/--- GTCTTTACAT 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 GGA 1 0 42626 CASAVA_Build 1 62268707 2I TTTGCTTTGG --/TC TGTCTGTGCC 3070 het 3070 hom 36 16 17 6 TC 0 1 42627 CASAVA_Build 1 62268779 1I43M2D CATGGATTTA -TTTTTAATTGGGGTATAATTTATACTCAGTGCAATAGATTTTATG/TTTTTTAATTGGGGTATAATTTATACTCAGTGCAATAGATTTTA-- TCTTAAGTCT 3070 het 3070 ref 26 18 17 6 N/A 0 0 42628 CASAVA_Build 1 62270574 13I CTCTGACTTC -------------/CTGTCTGTGACCT CTAGGCATTC 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 CTGTCTGTGACCT 0 1 42629 CASAVA_Build 1 62281987 1I GTTTTGGTTT -/G GGGGGGGGCA 1601 het 1601 ref 23 12 6 5 G 8 9 42630 CASAVA_Build 1 62283638 1D TGGTGGATAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 A 9 8 42631 CASAVA_Build 1 62285684 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 1613 hom 17 4 12 1 T 7 8 42632 CASAVA_Build 1 62288990 2D CACCTGAAAC AG/-- AGGGTGGGGA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 AG 2 1 42633 CASAVA_Build 1 62319043 9D AAATATTAAC TTCATAAAG/--------- TTCATCAAGC 2263 het 2263 ref 22 14 6 2 TTCATAAAG 1 0 42634 CASAVA_Build 1 62324489 2D AATTAATGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 15 15 10 TG 7 6 42635 CASAVA_Build 1 62326154 1D TTCTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 9 8 T 15 14 42636 CASAVA_Build 1 62334527 2I ATTTCTACCA --/CT CTGTACATTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 CT 1 2 42637 CASAVA_Build 1 62336855 1I ACCGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 13 14 42638 CASAVA_Build 1 62355767 1D GTGTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 1254 het 1254 ref 28 19 3 6 A 13 12 42639 CASAVA_Build 1 62360045 4I AGAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAATTC 3070 het 2094 hom 21 7 12 2 AAAG 1 2 42640 CASAVA_Build 1 62403586 5I CTTTCCTTTC -----/CTTTT CTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 CTTTT 1 2 42641 CASAVA_Build 1 62405851 11D ATACAAGCAC AAGATTTAAAA/----------- AAGATTAAAA 3070 het 3070 ref 41 24 13 7 AAGATTTAAAA 1 0 42642 CASAVA_Build 1 62408071 1D CTGTACGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 11 10 42643 CASAVA_Build 1 62408380 1D AACTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 2170 het 418 hom 19 3 8 9 T 10 9 42644 CASAVA_Build 1 62409170 1D AGAACCGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 7 T 11 10 42645 CASAVA_Build 1 62410928 3D CCAGAGCCTC AGA/--- AGGTCAGTTT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 AGA 1 0 42646 CASAVA_Build 1 62412230 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2891 hom 20 7 10 4 AAAC 5 4 42647 CASAVA_Build 1 62412590 1D GTGTGGTGGC G/- CATGCCTGTA 3070 het 3064 hom 20 8 9 3 G 1 0 42648 CASAVA_Build 1 62418730 1I ATGTGCTCTC -/A ATATGAGTGA 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 A 1 2 42649 CASAVA_Build 1 62421203 3I GTAAAACATA ---/CTT TTTTTATTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CTT 0 1 42650 CASAVA_Build 1 62423509 1I TAATATCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 10 11 42651 CASAVA_Build 1 62434117 1I TGGCCAACTT -/G GGGAAACCCC 2188 hom 24 het 11 0 8 3 G 3 4 42652 CASAVA_Build 1 62437041 3D TTTAAAGTAA CCT/--- CCTTAAAATA 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 CCT 2 1 42653 CASAVA_Build 1 62441508 4D ACATTTATCA TTTC/---- TTCTTGTTAC 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 TTTC 1 0 42654 CASAVA_Build 1 62443818 1I CAGCCTCCTG -/A AGTAGCTGGT 2702 het 381 hom 13 1 8 4 A 1 2 42655 CASAVA_Build 1 62444630 3I TGAATTCTAA ---/TTT TTTTCTAATC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 4 7 42656 CASAVA_Build 1 62450266 1I GAATAAACTT -/C CTATACTGTT 3021 het 3021 ref 20 9 8 3 C 1 2 42657 CASAVA_Build 1 62463968 2I53M1D ATAAAGGTGA --TTATATATATAGTTTCTCTTTTGACTTAATAATTACATTACAAAATTTCTTTCT/TTTTATATATATAGTTTCTCTTTTGACTTAATAATTACATTACAAAATTTCTTTC- TTTTTTTTGA 3070 hom 27 het 10 0 9 10 N/A 0 0 42658 CASAVA_Build 1 62488976 9D ATTTAGAAAA TAATTAACG/--------- TATTTATGGG 3070 het 3070 ref 42 20 19 8 TAATTAACG 1 0 42659 CASAVA_Build 1 62491837 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 2100 het 1344 hom 11 6 5 0 T 9 8 42660 CASAVA_Build 1 62505575 1I CGTTGAAGCT -/G GGGTGTCCAC 3070 het 3070 hom 44 20 17 7 G 3 4 42661 CASAVA_Build 1 62526950 4D CAGTTGTAGG GAGA/---- GAGGAGGCTG 3070 het 3070 hom 47 21 22 5 GA 3 1 42662 CASAVA_Build 1 62527927 5D TCACATGTGA TTTCT/----- TTCCTTGGTG 3070 het 3070 hom 38 11 24 7 TTTCT 1 0 42663 CASAVA_Build 1 62529008 1D CTGGAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 24 1 13 10 T 15 14 42664 CASAVA_Build 1 62531515 1D ACCCCGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 12 11 42665 CASAVA_Build 1 62532902 1I GATCCCCAGA -/C ACCTGGGTGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 0 1 42666 CASAVA_Build 1 62534211 2D TAAGTATTGA CT/-- CTGTCCTGGG 3070 hom 114 het 39 0 38 2 CT 2 1 42667 CASAVA_Build 1 62535568 4D TATTGCTAGC TAGA/---- TACTGTTGTC 3070 hom 87 het 30 0 30 2 TAGA 1 0 42668 CASAVA_Build 1 62536253 1D CTCTGTTGTT C/- TCTAGGCAGG 2341 het 2341 ref 32 17 6 10 C 1 0 42669 CASAVA_Build 1 62537196 1I ATGTATTATT -/A TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 A 0 1 42670 CASAVA_Build 1 62542702 1I ACCAAATGTC -/A AAAAAAGCCC 3070 het 3070 ref 32 12 15 5 A 6 7 42671 CASAVA_Build 1 62542988 1I CCAACAGCCT -/C CCCTTTCAGG 3070 hom 50 het 21 0 15 6 C 3 4 42672 CASAVA_Build 1 62543569 1D TTGCTTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2395 hom 28 8 16 4 T 10 9 42673 CASAVA_Build 1 62549125 1I GGCAAGCACC -/A ATTATCTCCA 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 A 1 2 42674 CASAVA_Build 1 62549560 1I ACCAATACAA -/C CGGGAATGAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 1 2 42675 CASAVA_Build 1 62551233 2D ATACAGTGGT TC/-- CCCCCCAAAC 3070 het 3070 hom 48 23 23 2 TC 1 0 42676 CASAVA_Build 1 62566309 1D TGATTTGGGC A/- GCTGCAGCGA 3070 het 2164 hom 22 9 13 1 A 1 0 42677 CASAVA_Build 1 62569506 3I TCAAGCTATT ---/CTC CTGCTTCAGC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 CTC 0 1 42678 CASAVA_Build 1 62572401 1I AAAAAAAAGT -/C GGGGGGGGGT 1309 het 829 hom 19 4 5 10 C 0 1 42679 CASAVA_Build 1 62597745 3I TTGCATTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 33 15 10 8 TTG 5 6 42680 CASAVA_Build 1 62606683 1I GTTCCAGACC -/T TTTGTTCTCC 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 3 4 42681 CASAVA_Build 1 62621283 2D CATCATGGTC AG/-- AGAGGGAATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AG 3 2 42682 CASAVA_Build 1 62626881 1D TTCATTGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 34 1 16 17 A 17 16 42683 CASAVA_Build 1 62643865 3D AGTTTTTTTT TTG/--- TTTTTTTTTT 231 het 231 ref 29 20 5 4 TTG 1 0 42684 CASAVA_Build 1 62657498 1D GCTTGAACTT A/- AAAAAAAAAA 1029 het 1029 ref 24 18 3 4 A 11 10 42685 CASAVA_Build 1 62678623 2D53M2I TAAAAGGTTT TATATATATATATATATATATTTGTTTGGTTCAGAAGACTTGACAGTTATAAGAC--/--TATATATATATATATATATTTGTTTGGTTCAGAAGACTTGACAGTTATAAGACAA ATTTTAAACT 3070 hom 69 het 18 0 23 8 N/A 0 0 42686 CASAVA_Build 1 62683894 2I TATATGTGTG --/TA TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 35 0 28 7 TA 0 1 42687 CASAVA_Build 1 62690787 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1104 hom 23 4 17 3 A 13 12 42688 CASAVA_Build 1 62691616 1D CCAGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 12 11 42689 CASAVA_Build 1 62692567 2I TAAGTGATTC --/AT ATGTAACTGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 1 2 42690 CASAVA_Build 1 62696795 1D ATAGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 22 1 12 9 T 15 14 42691 CASAVA_Build 1 62701031 1D TGCAAATGGA T/- TTTTTTTTTT 1236 het 1236 ref 40 33 4 3 T 11 10 42692 CASAVA_Build 1 62701967 1D TGTTAAAGTT A/- AAAAAATGCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 7 6 42693 CASAVA_Build 1 62726961 1I TTCAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 16 1 11 4 A 10 11 42694 CASAVA_Build 1 62732924 1I ATCAGTTGGT -/G GGGGGGGGCA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 8 9 42695 CASAVA_Build 1 62738197 1I AACTGTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 27 1 21 5 A 12 13 42696 CASAVA_Build 1 62741022 1I ACCAACACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 8 9 42697 CASAVA_Build 1 62741498 1D TAATGTAATT A/- ATAAGGTGTA 3070 hom 48 het 26 0 17 9 A 2 1 42698 CASAVA_Build 1 62747047 4D ATAAAGTGGT TTAC/---- TTAAATACTA 3070 hom 96 het 38 0 33 7 TTAC 1 0 42699 CASAVA_Build 1 62751513 2D TAGAGAAAAC GG/-- GGGGGGGGGG 577 het 4 hom 9 0 3 7 G 13 11 42700 CASAVA_Build 1 62770325 2D TTTATGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 hom 151 het 54 0 51 3 AG 2 1 42701 CASAVA_Build 1 62772264 1D CACATCAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 12 11 42702 CASAVA_Build 1 62773320 1D TGCACTCCAG C/- CCGGGTGACA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 3 2 42703 CASAVA_Build 1 62774367 4I ATTTTGTTGT ----/CTAA CTGAGTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 CTAA 0 1 42704 CASAVA_Build 1 62779135 3I ACCTTACAGG ---/AGA AGCAGAGATG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AGA 0 1 42705 CASAVA_Build 1 62797705 1D CTAATTAAGA T/- TTTTTTTTTT 1892 het 1892 ref 32 21 4 7 T 12 11 42706 CASAVA_Build 1 62800000 1D AGATGCTTAA G/- TAGATTATGA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 G 1 0 42707 CASAVA_Build 1 62810892 2D TCTTGCAACT GG/-- GGGAGAGGGG 3070 hom 117 het 40 0 39 1 G 5 3 42708 CASAVA_Build 1 62832626 5I AAATTACTAT -----/AAGAA AAGAATTATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAGAA 1 2 42709 CASAVA_Build 1 62843126 9D CTCATTCCAA GTTAATGTG/--------- GTCTAATAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 6 GTTAATGTG 1 0 42710 CASAVA_Build 1 62845456 1D AGACTGACTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 25 0 25 1 A 9 8 42711 CASAVA_Build 1 62847116 4D GTCAACTAAC TCAT/---- TCATTAATTT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 TCAT 2 1 42712 CASAVA_Build 1 62858072 1I CCAGATAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 38 1 24 13 A 10 11 42713 CASAVA_Build 1 62866250 1D CCTTCAAAGG T/- AAAGTAATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 0 42714 CASAVA_Build 1 62870013 1I AAATATTCTA -/G GTTATAATTT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 G 1 2 42715 CASAVA_Build 1 62878763 4D CCTGGCAACA AAGC/---- AAGACCCCGT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 AAGC 1 0 42716 CASAVA_Build 1 62880373 1I TTACTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 27 1 20 6 T 13 14 42717 CASAVA_Build 1 62881269 10D TTTTAATCCA AGGCCACAAG/---------- AGGTCTTACA 3070 hom 102 het 35 0 34 1 AGGCCACAAG 1 0 42718 CASAVA_Build 1 62889709 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 1 A 14 13 42719 CASAVA_Build 1 62916187 3I GCCAGGAGTT ---/TGA CTCCAGCCTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TGA 0 1 42720 CASAVA_Build 1 62925142 1I GGAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 27 1 20 6 A 10 11 42721 CASAVA_Build 1 62925788 5D CAGGCGAACT CAGAA/----- CAAGCTTCAG 3070 hom 139 het 49 0 42 7 CAGAA 1 0 42722 CASAVA_Build 1 62930050 1D GATATGACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 80 het 31 0 28 3 A 10 9 42723 CASAVA_Build 1 62951183 2I CTTCAGAAAT --/AC AGTGTCATTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AC 0 1 42724 CASAVA_Build 1 62964797 1D20M2I AATTCTTTTC TTTTTCTTTCTTTTCTTTTTT--/-TTTTCTTTCTTTTCTTTTTTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 12 0 11 4 N/A 0 0 42725 CASAVA_Build 1 62965431 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 336 hom 7 het 17 0 3 14 T 11 10 42726 CASAVA_Build 1 62970343 1I TTTTCCTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 9 10 42727 CASAVA_Build 1 62971141 1I ATATTCTCTT -/C AACCAGAACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 0 1 42728 CASAVA_Build 1 62971748 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 8 A 12 11 42729 CASAVA_Build 1 62974761 1D AAAAGAACCA T/- TTTTTTTTTT 2451 het 333 hom 22 1 10 11 T 15 14 42730 CASAVA_Build 1 62988838 1D GCACTCATGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 T 10 9 42731 CASAVA_Build 1 62989210 1I GAAAAGCAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 9 10 42732 CASAVA_Build 1 62996889 1I AAACAGTTGC -/G GGGGTTCCTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 4 5 42733 CASAVA_Build 1 62998735 2I CAACAAAAGT --/AA AGTTTGCTAA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 1 3 42734 CASAVA_Build 1 63000753 1I ACTCCTGAAG -/T TCAGCGAGAC 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 T 1 2 42735 CASAVA_Build 1 63012136 11D TCCCTTAAGA TTCAAGGGCTC/----------- TTCAGTCAGC 3070 het 3070 ref 42 21 17 7 TTCAAGGGCTC 1 0 42736 CASAVA_Build 1 63019881 4D GAGAGAATGT TCTG/---- TCTGAGTGCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 7 TCTG 2 1 42737 CASAVA_Build 1 63020821 1I CTGTGAGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 9 10 42738 CASAVA_Build 1 63032094 10D TAAGTCTCTA TATAAGTCTC/---------- TATATTAACT 3070 het 3070 ref 34 22 8 5 TATAAGTCTC 1 0 42739 CASAVA_Build 1 63033120 1D AAGAAATGAG A/- AGCAGAGATG 3070 het 3070 ref 50 32 17 1 A 2 1 42740 CASAVA_Build 1 63038132 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 1561 het 1453 hom 23 8 9 6 T 13 14 42741 CASAVA_Build 1 63040725 1D TGCAAATATT A/- AAAAAAAAAA 1519 het 1519 ref 25 11 5 9 A 15 14 42742 CASAVA_Build 1 63048299 1D TTAACTTACG A/- CCCAACATTT 3070 het 3070 hom 51 25 26 0 A 1 0 42743 CASAVA_Build 1 63055741 1D AGTAGCTGGG A/- CCACAGGTGC 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 A 1 0 42744 CASAVA_Build 1 63062928 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 758 het 758 ref 23 13 5 5 C 1 0 42745 CASAVA_Build 1 63066067 1I TCTCTCTCCT -/C CCACCCTCCA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 2 3 42746 CASAVA_Build 1 63070453 5I GCTTTCTCTG -----/TTTTA TTTAATTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 TTTTA 0 1 42747 CASAVA_Build 1 63073444 1I AGGCCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 2785 het 1181 hom 20 6 9 5 A 15 16 42748 CASAVA_Build 1 63078168 1I TTTTCATTGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 8 9 42749 CASAVA_Build 1 63082416 1I TTCTGCTTCT -/G ACTGCCTGAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 G 0 1 42750 CASAVA_Build 1 63085491 4I AATAAATAAA ----/AAAC AAACAGAAAC 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 AAAC 1 2 42751 CASAVA_Build 1 63086410 4I TAAGTTCTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 2990 het 2990 ref 40 19 9 12 TTTG 3 4 42752 CASAVA_Build 1 63091010 1D TTTTTACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 36 2 11 23 T 12 11 42753 CASAVA_Build 1 63097959 1D TTTCTGTAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2190 hom 20 7 10 3 T 10 9 42754 CASAVA_Build 1 63104279 1D TTTACGTAAT A/- AGGCACATAA 3070 hom 138 het 52 0 46 6 A 2 1 42755 CASAVA_Build 1 63105116 2D TAGGCAAGAA TC/-- TCTATTTTTT 1758 het 1758 ref 26 16 7 3 TC 2 1 42756 CASAVA_Build 1 63106058 4I CATTTTCCTC ----/TCTT TCTTTTTTAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TCTT 1 2 42757 CASAVA_Build 1 63111408 1D TCTAAAAGTC T/- TGATTTGATT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 2 1 42758 CASAVA_Build 1 63112324 2D AGGCCGAGAC GG/-- GCGGATCACG 1777 hom 12 het 6 0 5 1 G 3 1 42759 CASAVA_Build 1 63139335 1I GTGAGTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 11 12 42760 CASAVA_Build 1 63139475 1I TAAAGCATAG -/T AAAACTCACT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 42761 CASAVA_Build 1 63144520 1D TTGCCTAACA T/- TTTTTTTTTA 2642 het 2642 ref 19 7 7 5 T 10 9 42762 CASAVA_Build 1 63144631 5I AGCTGACGTT -----/AATAA AAGAAGCAGG 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 AATAA 0 1 42763 CASAVA_Build 1 63145457 1D AACATTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 12 11 42764 CASAVA_Build 1 63167995 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 29 1 20 8 A 15 14 42765 CASAVA_Build 1 63168211 1D ACCATTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 37 3 17 17 A 17 16 42766 CASAVA_Build 1 63168343 3D TGTTTTACTT CTA/--- CTGCTGTGTT 3070 hom 69 het 27 0 22 10 CTA 1 0 42767 CASAVA_Build 1 63174755 2D CCCAACTTCA TG/-- TTAGAGGTGA 3070 hom 144 het 55 0 49 6 TG 1 0 42768 CASAVA_Build 1 63176812 1I AATTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 11 12 42769 CASAVA_Build 1 63182492 1I GAATTGACAA -/C AGGTAGCCTA 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 C 0 1 42770 CASAVA_Build 1 63182993 1D AGGAATTAAG T/- TTGCCTGGAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 3 2 42771 CASAVA_Build 1 63188818 2D TAGCCTTTTC AA/-- AAATTACTCT 3070 het 3070 hom 25 8 13 6 A 5 3 42772 CASAVA_Build 1 63203521 1I ATCTTTAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 T 9 10 42773 CASAVA_Build 1 63226116 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAGA 323 het 323 ref 17 10 3 5 A 8 9 42774 CASAVA_Build 1 63227382 1D GATTTATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 8 A 13 12 42775 CASAVA_Build 1 63243204 2D CAGGAGACAG AA/-- ACTCTGATTG 3070 het 3070 ref 58 30 19 10 A 3 1 42776 CASAVA_Build 1 63251565 1I CTGTAATCCC -/A GCACTTTCGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 0 1 42777 CASAVA_Build 1 63252302 3I CAGGCATGAG ---/CTA CTACTGCACC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 CTA 1 2 42778 CASAVA_Build 1 63252541 1D CCCTCAGTGT C/- CCCTTTTAGT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 C 4 3 42779 CASAVA_Build 1 63259748 1D TAAAGTGAGA C/- CCCAGTCCCT 3070 het 2483 hom 22 8 10 4 C 4 3 42780 CASAVA_Build 1 63259959 1D TCCTGTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 11 11 A 13 12 42781 CASAVA_Build 1 63260071 1I CGTTTCCAGA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 T 6 7 42782 CASAVA_Build 1 63260277 3D ATTTCTTAAC ATT/--- ATAAACATCA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 ATT 1 0 42783 CASAVA_Build 1 63262002 1I CTGTGTTTCC -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 37 18 15 4 T 6 7 42784 CASAVA_Build 1 63263867 2I TCTACATAAT --/AA AAAAAAAACA 2984 het 2984 ref 23 12 9 2 A 8 10 42785 CASAVA_Build 1 63266219 1D TTTATATATA C/- ATCTATCCTA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 C 1 0 42786 CASAVA_Build 1 63269004 1D ACACTTGGAA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 7 6 42787 CASAVA_Build 1 63274718 1I CCCTGTACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 11 21 11 T 9 10 42788 CASAVA_Build 1 63275211 1D TATTTTTTTT A/- ATTTTGTTAT 3070 het 2523 hom 18 8 9 2 A 2 1 42789 CASAVA_Build 1 63277444 1I TGAAGTATAC -/G GAAAAATGAT 3070 hom 75 het 27 0 25 5 G 1 2 42790 CASAVA_Build 1 63278097 1I AGAGTGGTGA -/G GTTGGGGTGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 42791 CASAVA_Build 1 63278579 9I GACCAAAATG ---------/AAAGAGCTA AAAGTATAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 5 AAAGAGCTA 0 1 42792 CASAVA_Build 1 63279471 1D GTAAATACCC A/- AAAAGAATTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 5 4 42793 CASAVA_Build 1 63282061 2I GTTTACGAAT --/GC CATGGTAACA 3070 hom 66 het 27 0 20 8 GC 0 1 42794 CASAVA_Build 1 63283135 1I37M1D CTCTGGGAGG -TGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATTGAGACCA/CCGAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGCAGATCGAGACC- TCCTGGCTAA 2877 hom 30 het 11 0 11 0 N/A 0 0 42795 CASAVA_Build 1 63283220 3D ATACAAAAAA AAT/--- TTAGCCGGGC 1049 hom 7 het 4 0 3 1 AAT 1 0 42796 CASAVA_Build 1 63284078 1I ACTGAGAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 8 9 42797 CASAVA_Build 1 63284294 6D TACATATATG TACATA/------ TATATGTATA 2681 hom 24 het 9 0 9 1 TACATA 1 0 42798 CASAVA_Build 1 63285140 8D TTGAAAATAG ACAGCAAA/-------- AAATATGACA 3070 hom 111 het 40 0 38 5 ACAGCAAA 1 0 42799 CASAVA_Build 1 63286049 2D CTAAAGACGT AC/-- ACAGACACCT 3070 hom 81 het 34 0 28 7 AC 2 1 42800 CASAVA_Build 1 63301805 1I AGACATTTTT -/G GTTGTCACCA 3070 hom 163 het 59 0 53 6 G 1 2 42801 CASAVA_Build 1 63309755 1D ATTTTTTTTT A/- AAATCATGGA 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 A 4 3 42802 CASAVA_Build 1 63312023 28I CTCTTCTAAA ----------------------------/GGGGTGCAGTGCTTGCATGAGGTCGGGT GGGGGATAAC 3070 hom 63 het 26 0 18 8 GGGGTGCAGTGCTTGCATGAGGTCGGGT 0 1 42803 CASAVA_Build 1 63312723 7D CTGAAGAGGC CATGGGG/------- TTCACCTCCA 2204 het 2204 ref 30 16 6 10 CATGGGG 1 0 42804 CASAVA_Build 1 63314170 1I ATAAGAATAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 9 11 11 T 8 9 42805 CASAVA_Build 1 63314287 4I CCAGCTAGTG ----/AGAA AGAGAGTCAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 AGAA 0 1 42806 CASAVA_Build 1 63314564 4I TATTTGTAGG ----/GATT GATTTGGTAG 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 GATT 1 2 42807 CASAVA_Build 1 63314917 2D ACATGCACAT AC/-- ACAGAAGACT 3070 het 3070 ref 48 29 16 3 AC 2 1 42808 CASAVA_Build 1 63317066 3D TGTTGGTGTT ATC/--- ATTATTATTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 ATC 1 0 42809 CASAVA_Build 1 63320653 1D ATGCCCCCAA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 7 6 42810 CASAVA_Build 1 63323580 1D ATAGGAACGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 9 8 42811 CASAVA_Build 1 63333567 1D TACATATATA T/- CATTTTTAAT 3070 het 3070 ref 44 20 21 3 T 1 0 42812 CASAVA_Build 1 63338903 1D AACAGAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 30 2 13 16 A 13 12 42813 CASAVA_Build 1 63354068 1I AAAAAAAGTC -/A AAAAAATCCC 3070 het 335 hom 34 2 27 5 A 6 7 42814 CASAVA_Build 1 63380920 1D TAAAGTAAAT G/- AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 28 3 12 13 G 1 0 42815 CASAVA_Build 1 63404641 1I ATTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 9 10 42816 CASAVA_Build 1 63408376 1I AAGTGCAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 9 10 42817 CASAVA_Build 1 63408757 1I TATAGGTGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 9 10 42818 CASAVA_Build 1 63422624 1D TTTTTTTTTT A/- ACCCATCAGA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 2 1 42819 CASAVA_Build 1 63429479 1D ACCATGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 11 10 42820 CASAVA_Build 1 63445267 1D TATTAAGGAG T/- TTTTTTAGTC 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 7 6 42821 CASAVA_Build 1 63463159 1D ATAATTAAGG A/- AAAAAAAAAA 1907 het 1907 ref 19 13 4 2 A 11 10 42822 CASAVA_Build 1 63465378 1I AATATAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 11 12 42823 CASAVA_Build 1 63469204 1I TAACTAGAAG -/T CTGGAGGTTG 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 0 1 42824 CASAVA_Build 1 63483935 1D AATTTCTGCC A/- AAAAAAAAAG 2992 het 2992 ref 24 12 8 4 A 10 9 42825 CASAVA_Build 1 63487905 2D44M1I TTAGGTAAAG AAAAAAAAAAAACATGTAGAATTAAAAATAGTTTAATACTGCAGAC-/--AAAAAAAAACCATGTAGAATTAAAAATAGTTTAATACTGCAGACA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 19 18 4 N/A 0 0 42826 CASAVA_Build 1 63490353 1I GCCTCACTAA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 T 6 7 42827 CASAVA_Build 1 63495017 1I CAGTATTTAC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 T 5 6 42828 CASAVA_Build 1 63522303 1D CTACTAAAAT A/- AAAAAAAATT 2239 het 1491 hom 15 6 6 3 A 9 8 42829 CASAVA_Build 1 63537348 1D TAAATGAATG A/- AAAAAAAAAA 1315 het 1315 ref 44 33 3 9 A 12 11 42830 CASAVA_Build 1 63550280 1D TTCTGTTTAG T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 14 2 T 6 5 42831 CASAVA_Build 1 63575727 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 26 1 11 14 A 11 10 42832 CASAVA_Build 1 63579181 3I CAAAGTCTGG ---/AGC AGCCTGACTG 3070 het 3070 ref 53 27 24 2 AGC 1 2 42833 CASAVA_Build 1 63592976 4I ATAACTTTTT ----/ATAG ATAGAGTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATAG 1 2 42834 CASAVA_Build 1 63602899 1D TTATTAATTC T/- TTTTTTTTTG 1681 het 1681 ref 30 26 4 0 T 10 9 42835 CASAVA_Build 1 63612888 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 12 11 42836 CASAVA_Build 1 63613459 2D AGACTCCATT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 2410 hom 28 8 17 4 A 10 8 42837 CASAVA_Build 1 63617203 1I CTTTGGTTCC -/T TTTTTAGATC 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 T 5 6 42838 CASAVA_Build 1 63624140 3I AAAGTGGGCA ---/TTC TTCTTTTGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTC 1 2 42839 CASAVA_Build 1 63635825 1I ACCCTTCATT -/G GTTATATGAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 2 42840 CASAVA_Build 1 63639275 1D TCAAGCTGCC A/- AAAGGGGCTC 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 4 3 42841 CASAVA_Build 1 63641955 1I ATATCTAGGC -/T GTATAGCATA 3070 hom 163 het 58 0 55 4 T 0 1 42842 CASAVA_Build 1 63646055 1D GCCAGTCTTG T/- TTTAGTTATA 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 T 4 3 42843 CASAVA_Build 1 63655101 1D TTTAAAAAAT A/- ACCTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 2 1 42844 CASAVA_Build 1 63658107 1D CTTCTTTCTC T/- TTTTTTGCCA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 7 6 42845 CASAVA_Build 1 63661284 1I GATAATGCAA -/T TTTTTTTTTT 2618 het 469 hom 34 3 18 13 T 17 18 42846 CASAVA_Build 1 63670518 1I TGGTCATGTG -/T TGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 1 2 42847 CASAVA_Build 1 63676067 5D TTAATTAAAC ATTAT/----- ATTATATATA 3070 het 3070 hom 21 8 11 3 ATTAT 2 1 42848 CASAVA_Build 1 63676435 1I CAGGCTGATA -/T TAAGAAGGTA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 1 2 42849 CASAVA_Build 1 63678782 1I AAATACACTC -/T TAATATTTTA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 1 2 42850 CASAVA_Build 1 63680455 6I GTAGAGAATA ------/ATGTTT ATACTTCTCA 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 ATGTTT 0 1 42851 CASAVA_Build 1 63682838 2D ACATAATAGG AT/-- ATATATATAT 2329 het 1541 hom 10 4 6 1 AT 6 5 42852 CASAVA_Build 1 63683548 4I CCATTTCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 1909 hom 25 5 13 7 AAAC 2 3 42853 CASAVA_Build 1 63683637 1I TAAGCTATTG -/T TTACTACATA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 2 3 42854 CASAVA_Build 1 63683908 1I CACCCAGGCT -/G GAGTGCAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 G 1 2 42855 CASAVA_Build 1 63689792 2I TTAAAATGAA --/TG TATGAGCAGA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TG 0 1 42856 CASAVA_Build 1 63690871 3D21M2I TAAATTTTTC TTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTCTT--/---TTTCTTTTTCTTTTCTTTCTTTC TTTTTTTTTT 1712 het 1712 ref 25 10 6 15 N/A 0 0 42857 CASAVA_Build 1 63690907 3I TTTTTTTTTT ---/TAA AAAAGATCCC 3070 het 292 hom 27 6 12 9 TAA 0 1 42858 CASAVA_Build 1 63694158 1D TGTTTAAGTA T/- TTTAAATCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 4 3 42859 CASAVA_Build 1 63696237 2D AGTTTTTCTC TT/-- GAGGGAGCTA 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 T 2 0 42860 CASAVA_Build 1 63707424 3D ACCTCACTGG GTT/--- GTTAAGAGGA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 GTT 2 1 42861 CASAVA_Build 1 63729268 3D CATACATCCA ATT/--- ATTATTCACT 3070 hom 141 het 50 0 47 3 ATT 3 2 42862 CASAVA_Build 1 63730187 2I TGTATGTATT --/CA CAGTCATAAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 CA 1 2 42863 CASAVA_Build 1 63730999 1I ATTTGGCTAG -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 6 7 42864 CASAVA_Build 1 63736186 2I TCCTTTCCCC --/CT CTTTTTCTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CT 1 2 42865 CASAVA_Build 1 63747137 2I AAACTCTTAT --/AA AAAAGTTAGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 4 6 42866 CASAVA_Build 1 63754277 2I AAGAAATGTG --/GT GTATATATAC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 GT 1 2 42867 CASAVA_Build 1 63758473 4D AGCAACTTTA TCAT/---- TCAATTAATA 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 TCAT 1 0 42868 CASAVA_Build 1 63759685 2D TAGCTATATA TG/-- TGAGATGTTA 3070 het 3070 ref 41 23 13 8 TG 2 1 42869 CASAVA_Build 1 63765700 5I TCTGCCACTT -----/ATAAC ATGTGCATTT 3070 het 69 hom 45 2 25 18 ATAAC 0 1 42870 CASAVA_Build 1 63765787 1I ATAATACAGG -/C ATTATAGATG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 C 0 1 42871 CASAVA_Build 1 63767223 1I TTTTAGAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 10 11 42872 CASAVA_Build 1 63769576 3D TCACTTAACA TGT/--- TGTCCTCCAG 3070 het 3070 hom 45 22 23 0 TGT 2 1 42873 CASAVA_Build 1 63776705 1I TGAAAGGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2121 hom 20 7 12 2 T 9 10 42874 CASAVA_Build 1 63778215 1D ATTATGTTAA G/- GGCAATTGGG 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 G 3 2 42875 CASAVA_Build 1 63789124 1D AGATTCCAAG A/- TTTTTGACCT 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 A 1 0 42876 CASAVA_Build 1 63794873 1D TTCTAGAAGC T/- TTTTTATCTC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 6 5 42877 CASAVA_Build 1 63798220 1D GTGTTAATAA T/- TTTTTTTTTT 1657 het 1657 ref 23 13 5 5 T 13 12 42878 CASAVA_Build 1 63802989 1D ATATGGAACC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 57 het 28 0 20 8 A 8 7 42879 CASAVA_Build 1 63803954 1I AAATTCCATT -/A AAAAATGGGC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 5 6 42880 CASAVA_Build 1 63806962 1D TTTTATATGA T/- TTTTAAAGGT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 5 4 42881 CASAVA_Build 1 63807853 1I GGAAACAGTG -/T TAAGGCGAAA 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 T 1 2 42882 CASAVA_Build 1 63812129 1I GGTGAGGTGT -/G TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 G 0 1 42883 CASAVA_Build 1 63819217 1I GTTTTTTTTT -/A ATTGTGTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 A 1 2 42884 CASAVA_Build 1 63824487 1I TAGGATAGCC -/T TTTTTTTTTT 2793 het 2793 ref 38 14 9 15 T 15 16 42885 CASAVA_Build 1 63829934 4D CATTTTGTGG AGTT/---- AGATAACCTT 3070 het 3070 ref 45 26 17 3 AGTT 1 0 42886 CASAVA_Build 1 63832873 1I ATAGGGGAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 2122 hom 17 7 8 2 T 2 3 42887 CASAVA_Build 1 63840873 4D ACAAGTGAAT TGAA/---- ATGTTGCTCA 3070 het 3070 ref 47 23 21 5 TGAA 1 0 42888 CASAVA_Build 1 63846401 3D TGAATGTACT CAA/--- CTGGCATAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 6 CAA 1 0 42889 CASAVA_Build 1 63850517 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2562 hom 26 9 13 5 A 11 10 42890 CASAVA_Build 1 63853213 1I AGAAACTGAG -/A GCCAGAAAGG 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 0 1 42891 CASAVA_Build 1 63856139 1I GTGTGTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 10 11 42892 CASAVA_Build 1 63862516 1I TGCTAGGAGG -/A GGTTGGAAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 42893 CASAVA_Build 1 63864878 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 10 9 42894 CASAVA_Build 1 63938954 1I TTCATTTTCA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 T 7 8 42895 CASAVA_Build 1 63943131 2D TAAGAAAGGT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 4 TG 1 0 42896 CASAVA_Build 1 63961048 12D AACTAAGGGG ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 3070 hom 51 het 24 0 16 11 AT 14 8 42897 CASAVA_Build 1 63963304 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 11 10 42898 CASAVA_Build 1 63971735 1I TCATCCTCCA -/C GGCAATGAAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 C 0 1 42899 CASAVA_Build 1 63973985 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTGGAG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 7 6 42900 CASAVA_Build 1 63981733 1I TGCCCTATCC -/T TATGGGTCAG 3070 hom 148 het 57 0 50 7 T 1 2 42901 CASAVA_Build 1 63994114 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGGGAAGA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AAG 0 1 42902 CASAVA_Build 1 63994784 1I ATGCCCCCCC -/A CAAAAAAAGT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 0 1 42903 CASAVA_Build 1 63996242 4I TCACACCAGA ----/CAAT CAATAGATCT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CAAT 1 2 42904 CASAVA_Build 1 63997149 1I TATCTACATT -/G CTGTAACATG 2725 hom 17 het 26 0 7 19 G 0 1 42905 CASAVA_Build 1 63997775 1D22M2D CTTTTTTTTT CCCCCCAGAAACCTCAGTGGGTGTT/-CCCCCAGAAACCTCAGTGGGTG-- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 27 7 N/A 0 0 42906 CASAVA_Build 1 64000830 1D19M4D TTAGAAGCCA TTTTTTTTTTTTAAGGCAGCCTCT/-TTTTTATTTTTAAGGCAGC---- CTCTGTCACA 3070 hom 69 het 23 0 22 13 N/A 0 0 42907 CASAVA_Build 1 64001327 3I TTGTTCCCTC ---/CTT CTCTCTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CTT 0 1 42908 CASAVA_Build 1 64002418 5I TCTATTCTCC -----/CTTTA CTTTTGTCAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CTTTA 0 1 42909 CASAVA_Build 1 64003669 1I ATGCCAGTGT -/C CTCCCATAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 1 2 42910 CASAVA_Build 1 64004353 2D CTAGTTTATC CT/-- CTGTTAGTGT 3070 hom 33 het 13 0 12 3 CT 2 1 42911 CASAVA_Build 1 64006678 1D CAATTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 28 1 16 12 T 15 14 42912 CASAVA_Build 1 64018430 1D GAACCATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 T 13 12 42913 CASAVA_Build 1 64031039 1I CTTGCAACTT -/A ACTTAACTTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 42914 CASAVA_Build 1 64088560 1D CCTGCCTTCA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 52 25 25 2 T 7 6 42915 CASAVA_Build 1 64088827 2I CAGGTATGAG --/AT AAACTATCAC 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 AT 0 1 42916 CASAVA_Build 1 64111097 5I CACAATTATC -----/TTCAT TTCATAGACT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 TTCAT 1 2 42917 CASAVA_Build 1 64116754 1D GCTGGAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 24 10 T 13 12 42918 CASAVA_Build 1 64121645 3I TGGACTTTAC ---/TTG TTGTAATCTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TTG 1 2 42919 CASAVA_Build 1 64125485 1I GTTTTGGGAT -/G GGGGGGGTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 7 8 42920 CASAVA_Build 1 64132733 1I ATGCATTCCT -/A CATACATAGA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 1 42921 CASAVA_Build 1 64136576 1I AATTGAAAGT -/A AAAAAAATCG 3070 het 105 hom 37 1 34 2 A 7 8 42922 CASAVA_Build 1 64136649 1D ATAAAGGAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 13 hom 18 1 15 2 T 10 9 42923 CASAVA_Build 1 64139867 1D TTTAATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 38 1 30 9 A 11 10 42924 CASAVA_Build 1 64144540 1D TATGGATTAC A/- GGAGTGATCT 3070 het 3070 ref 57 28 26 4 A 1 0 42925 CASAVA_Build 1 64150384 4D CCATCTTTAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2653 het 1530 hom 36 12 10 14 A 18 14 42926 CASAVA_Build 1 64157271 1I CATATCTTGA -/T GATTTTCTAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 0 1 42927 CASAVA_Build 1 64175762 1D ATTGAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 1366 het 1366 ref 38 26 4 8 T 11 10 42928 CASAVA_Build 1 64197574 3I GATTAGGGGA ---/ACT ACAAGATAAG 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 ACT 0 1 42929 CASAVA_Build 1 64198173 1D TCTTCTGCAG C/- CCATTCCCAG 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 C 3 2 42930 CASAVA_Build 1 64201617 1D ACCTGAGGTC G/- GGAGTTTGAT 3070 het 1128 hom 17 3 13 1 G 3 2 42931 CASAVA_Build 1 64206677 11I GGTTATTACT -----------/ACTATCCAGTA GGATAGTGGA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 ACTATCCAGTA 0 1 42932 CASAVA_Build 1 64206729 1D TCTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2684 hom 28 6 17 5 T 10 9 42933 CASAVA_Build 1 64228757 9I AAGAATTCTG ---------/GATGTTTCT GATTTACATG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 GATGTTTCT 0 1 42934 CASAVA_Build 1 64229360 10D TTTGTTTGTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 TTTTG 5 3 42935 CASAVA_Build 1 64235323 1D ACTGTAAGGT G/- CTTGGAATCT 3070 het 3070 hom 50 13 29 9 G 1 0 42936 CASAVA_Build 1 64235940 1D GCAGGTTATG T/- TAAGACTCAC 3070 het 3070 ref 44 22 22 0 T 2 1 42937 CASAVA_Build 1 64241951 3I GGTTGACTGA ---/CCT CCTTGCACTA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 CCT 1 2 42938 CASAVA_Build 1 64248517 4D CCCATAGCTC TCTT/---- TCTTCTCTGT 3070 het 3070 hom 51 21 26 6 TCTT 2 1 42939 CASAVA_Build 1 64272444 1D TGCTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2787 hom 29 7 10 12 T 15 14 42940 CASAVA_Build 1 64273824 1D TTACGCCAGA G/- TCTCTTTCCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 G 1 0 42941 CASAVA_Build 1 64283592 1D ATTCAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 10 9 42942 CASAVA_Build 1 64296858 2I TCGTGGTGGG --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 11 42943 CASAVA_Build 1 64298260 1D CAAGCGTTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 124 het 47 0 41 8 T 10 9 42944 CASAVA_Build 1 64318099 1D ACAATCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2633 hom 27 7 11 10 T 12 11 42945 CASAVA_Build 1 64321864 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 25 2 17 6 A 16 15 42946 CASAVA_Build 1 64327488 1D CGAACCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2390 hom 23 7 8 8 T 11 10 42947 CASAVA_Build 1 64329264 1D TATCTTTATT G/- TTATCAGCCT 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 G 1 0 42948 CASAVA_Build 1 64334309 4D AGGGTTTGTA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 AAAT 3 2 42949 CASAVA_Build 1 64335180 2D CCAGCATCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 21 24 9 T 13 11 42950 CASAVA_Build 1 64335455 1D45M1D GGAGAATCCA TTTTTTTTTTGTCATTTCCAGGCTTTAGAGGTGACTTGCATTTCTTG/-TTTTTTTTTGTCATTTCCAGGCTTTAGAGGTGACTTGCATTTCTT- GCTAGCAGCC 3070 het 3070 ref 43 32 29 9 N/A 0 0 42951 CASAVA_Build 1 64336318 1D CCCTCAGCCT G/- GATCATGTGC 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 G 2 1 42952 CASAVA_Build 1 64339944 3I AGAGACAGAA ---/ATC ATCACAATGA 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 ATC 1 2 42953 CASAVA_Build 1 64344245 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 8 9 42954 CASAVA_Build 1 64345948 1D ATTGTATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 39 1 31 7 T 11 10 42955 CASAVA_Build 1 64361963 2I GTATGATCTT --/AA AAAGTGATTT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 3 5 42956 CASAVA_Build 1 64366827 11I TGCTAGAGGA -----------/TCCCTCTTTGC TGCCACCACA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TCCCTCTTTGC 0 1 42957 CASAVA_Build 1 64369820 1D GTAAATGATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 55 het 29 0 17 12 T 10 9 42958 CASAVA_Build 1 64379625 2I GGCAGGAGCA --/AG AGAGAGTGAG 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 AG 3 4 42959 CASAVA_Build 1 64387286 1I AATCAGATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 A 9 10 42960 CASAVA_Build 1 64391670 1I ATCCCATTTC -/T TGAGTATTTA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 T 1 2 42961 CASAVA_Build 1 64393750 1D AGACACTGGG C/- CCCTTGTGCT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 C 4 3 42962 CASAVA_Build 1 64397943 1I17M1I TTTTGTTGTG -TTTTTTTACCACGATTT-/TTTTTTTTACCACGATTTA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 46 28 20 6 N/A 0 0 42963 CASAVA_Build 1 64398577 1D ACTGTTTAAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 2491 hom 22 7 13 3 T 8 7 42964 CASAVA_Build 1 64400087 1D AAATGCTAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 10 9 42965 CASAVA_Build 1 64400893 3D GCTGTTCAGG AGA/--- AGAAGTAGAC 3070 hom 126 het 43 0 42 2 AGA 2 1 42966 CASAVA_Build 1 64402311 1D CTGAAATATA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 9 8 42967 CASAVA_Build 1 64414770 1I AATTGAGGCA -/C AAAGTTAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 42968 CASAVA_Build 1 64420873 2D TTAGACAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 30 6 12 12 T 12 10 42969 CASAVA_Build 1 64423783 1D ATGTGGCCTG T/- TGTTGACTGG 3070 hom 96 het 36 0 32 5 T 2 1 42970 CASAVA_Build 1 64430494 7I GTGTAAACAT -------/GGCCATG AATACATGTC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 GGCCATG 0 1 42971 CASAVA_Build 1 64432433 17D CCTTCTAGAC ACCTCTAGACACCTTCT/----------------- AGACACCTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 ACCTCTAGACACCTTCT 1 0 42972 CASAVA_Build 1 64457590 1D TGATTTATTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 T 9 8 42973 CASAVA_Build 1 64485353 29D CCCTTGAAGT CTCAGAAGATAGTTATGTCTTTCTCCTAC/----------------------------- CTCCTCTTAC 3070 het 3070 ref 34 29 14 5 CTCAGAAGATAGTTATGTCTTTCTCCTAC 1 0 42974 CASAVA_Build 1 64486841 1D ATTTTACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 25 3 11 11 T 12 11 42975 CASAVA_Build 1 64495183 1I AATTTACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 10 11 42976 CASAVA_Build 1 64517852 1D AATAATAATT A/- AAAAAAAAAG 2898 het 841 hom 9 2 6 1 A 10 9 42977 CASAVA_Build 1 64526274 3D TGAAAAAAAT AAG/--- AAGGACCATT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 AAG 2 1 42978 CASAVA_Build 1 64534138 1I CAAGATAAGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 A 8 9 42979 CASAVA_Build 1 64534255 1I CCTGACAATT -/G GATCAGGACT 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 G 1 2 42980 CASAVA_Build 1 64540184 1D TTCATAAAAC A/- AAAATGAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 5 4 42981 CASAVA_Build 1 64555021 1D TGCATACATT G/- TAAAATCATT 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 G 1 0 42982 CASAVA_Build 1 64556956 2I AATATTTGGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 10 12 42983 CASAVA_Build 1 64557722 1I AGTGTCAATC -/A CCTACACCAG 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 0 1 42984 CASAVA_Build 1 64558823 1I TAGGTCCCTT -/C CCCCCAACAC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 C 5 6 42985 CASAVA_Build 1 64559495 1D CTTTTCCCCT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 9 8 42986 CASAVA_Build 1 64559553 2D GTTGGGGGGT GG/-- GGGGGGGGGG 2083 hom 21 het 10 0 8 2 G 12 10 42987 CASAVA_Build 1 64562244 1D CATATTATAT A/- TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 A 1 0 42988 CASAVA_Build 1 64562461 1I CTCTATATTC -/A AAATTCAGGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 3 4 42989 CASAVA_Build 1 64568973 4D CAGACTTGTG GTCA/---- GTATTTGAAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 7 GTCA 1 0 42990 CASAVA_Build 1 64569838 1I TCATTTAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 11 8 10 A 9 10 42991 CASAVA_Build 1 64570316 1I TCCAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 26 0 18 8 A 12 13 42992 CASAVA_Build 1 64579901 2D TTGGTAGGAC CA/-- CATAATTCAA 3070 het 3070 hom 62 29 32 2 CA 2 1 42993 CASAVA_Build 1 64587860 9I GTAAATGTGG ---------/GGTGTGTGT GGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 58 22 20 16 GGTGTGTGT 1 2 42994 CASAVA_Build 1 64588649 1I GGCTTGGCTT -/G GCCTCAGAGG 2926 het 401 hom 8 1 6 1 G 1 2 42995 CASAVA_Build 1 64593980 7I AGGCCATCTG -------/GGCGTAT AAGTGCAAGT 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 GGCGTAT 0 1 42996 CASAVA_Build 1 64596135 6D AATTAATTAT AAACCG/------ GTCTTGCATT 3070 het 3070 ref 45 22 21 4 AAACCG 1 0 42997 CASAVA_Build 1 64600225 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAATAA 3023 het 3023 ref 29 20 8 1 A 7 8 42998 CASAVA_Build 1 64601075 2D TAGAGAACAC TG/-- TGAAATGACT 3070 het 3070 hom 24 7 12 5 TG 2 1 42999 CASAVA_Build 1 64606144 12I ATGCGCACTT ------------/TCATGTTCATCC TCACAACACA 3070 het 3070 ref 59 32 19 8 TCATGTTCATCC 0 1 43000 CASAVA_Build 1 64614658 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1121 het 558 hom 21 4 7 10 A 17 18 43001 CASAVA_Build 1 64616352 1I AAATTATAGG -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 45 26 9 10 T 7 8 43002 CASAVA_Build 1 64623755 1D TTTTTATACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 13 10 T 11 10 43003 CASAVA_Build 1 64627228 1I TCAAAACCAG -/T TTTTTTTTGT 2541 het 2541 ref 25 13 7 5 T 8 9 43004 CASAVA_Build 1 64630092 1D GTCACATCTA G/- TAGTCTTTTA 3070 het 3070 hom 33 7 22 7 G 1 0 43005 CASAVA_Build 1 64631714 1D TACAAGTATG A/- AAAAAAAATC 3070 het 334 hom 34 1 30 4 A 9 8 43006 CASAVA_Build 1 64663160 22D CTCCAATGCC CATACTACATTACTTCAGGACT/---------------------- CATGATTAGT 3070 hom 111 het 36 0 38 7 CATACTACATTACTTCAGGACT 1 0 43007 CASAVA_Build 1 64675281 1I TGGAAGAGAG -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 7 8 43008 CASAVA_Build 1 64676084 1D TCTTATCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 824 hom 28 5 11 12 T 13 12 43009 CASAVA_Build 1 64678749 1D AAACCTGAGA C/- CACCCTGTGA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 C 2 1 43010 CASAVA_Build 1 64679417 1D ACATAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1289 hom 33 6 13 15 T 19 18 43011 CASAVA_Build 1 64680872 1D AAAACTTTGG T/- TGTATATCCT 3070 het 3070 hom 48 17 27 5 T 2 1 43012 CASAVA_Build 1 64710466 1I TTCTTCGTCG -/T CGTCGTCCTC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 0 1 43013 CASAVA_Build 1 64719158 1D TCTCTCTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 8 8 T 13 12 43014 CASAVA_Build 1 64722136 1D CTTTTACCTT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 14 het 28 1 13 14 C 11 10 43015 CASAVA_Build 1 64728650 1D TGCACCTCTA G/- GGGGGAGAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 G 6 5 43016 CASAVA_Build 1 64730217 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 10 9 43017 CASAVA_Build 1 64730313 1I CTTTCACTAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 8 9 43018 CASAVA_Build 1 64733963 1D AGAGAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 38 1 27 11 T 13 12 43019 CASAVA_Build 1 64748198 2D TCAGAAAAAC AT/-- ATTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 AT 2 1 43020 CASAVA_Build 1 64760247 5I TTCGACAAAG -----/TTTAA TTTATTTTTC 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 TTTAA 0 1 43021 CASAVA_Build 1 64762103 4I TCTTTTCCAA ----/TGAT TGATTGTGCT 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 TGAT 1 2 43022 CASAVA_Build 1 64762300 1I AAATCTGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 10 11 43023 CASAVA_Build 1 64779657 1D CAGATACAGA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 7 6 43024 CASAVA_Build 1 64786092 1D GAGAAGGGGT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 8 7 43025 CASAVA_Build 1 64791281 2D CTCTGGAAGA AC/-- ACTTAACAAA 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 AC 2 1 43026 CASAVA_Build 1 64794955 3I GCTTTTACTC ---/ATT ATTTCTTTTA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 ATT 1 2 43027 CASAVA_Build 1 64800208 4D CTGAATTGAC AGTT/---- TGTTTTTTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AGTT 1 0 43028 CASAVA_Build 1 64800625 1I TCTTTTTAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 8 9 43029 CASAVA_Build 1 64801671 1I ACATGAAGAA -/T TTGGAAAAGG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 2 3 43030 CASAVA_Build 1 64804751 2D GTTTTCAATT CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 209 hom 27 3 12 12 C 11 9 43031 CASAVA_Build 1 64804886 1D AGTATGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 11 10 43032 CASAVA_Build 1 64808033 1I CAGACCCTTG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 109 het 42 0 37 5 A 7 8 43033 CASAVA_Build 1 64818191 1D GCCAGATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 33 0 26 8 A 12 11 43034 CASAVA_Build 1 64855433 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1802 het 54 hom 26 2 10 14 A 11 10 43035 CASAVA_Build 1 64856352 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 966 hom 34 4 25 5 A 14 15 43036 CASAVA_Build 1 64861743 7D GATCATCCCA GCCTGTG/------- GCCTGTGTGC 3070 hom 87 het 32 0 28 7 GCCTGTG 2 1 43037 CASAVA_Build 1 64870528 6D CTTTTTTCTG AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 185 hom 36 4 18 15 A 22 16 43038 CASAVA_Build 1 64874381 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 471 hom 17 1 10 6 A 15 14 43039 CASAVA_Build 1 64879164 1I ATCACCTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 9 10 43040 CASAVA_Build 1 64879538 4D CTGGGCTTTG AACA/---- CAGTTACCTG 3070 hom 102 het 36 0 35 2 AACA 1 0 43041 CASAVA_Build 1 64885335 1I ATAGCAAACT -/A AAAAAAAAAA 1459 het 1459 ref 33 14 5 14 A 16 17 43042 CASAVA_Build 1 64885432 1I TTGTACAAAG -/T TTTCAAAACC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 4 43043 CASAVA_Build 1 64912357 1D AGGAAGTAGG T/- TTTTTATTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 6 5 43044 CASAVA_Build 1 64950334 1D GTTCCAAGCC A/- GGGGAGAGCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 1 0 43045 CASAVA_Build 1 64950549 1I TCCTAAATTA -/C CATCAGGGTC 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 C 1 2 43046 CASAVA_Build 1 64956534 1D GACCCCCCCC G/- CATCCATGAA 1695 het 1695 ref 29 15 5 9 G 1 0 43047 CASAVA_Build 1 65010157 4I ATAAAAGATG ----/GTTA CAATTCTTAA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 GTTA 0 1 43048 CASAVA_Build 1 65017661 1D ATTTTTAACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 32 0 23 9 T 10 9 43049 CASAVA_Build 1 65017814 1D TACTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 742 hom 22 2 14 6 T 15 14 43050 CASAVA_Build 1 65045919 1D TGTTATAAAT A/- AAGCAAACAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 3 2 43051 CASAVA_Build 1 65047986 1D AAAACTTTTT C/- ATCATCTCAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 C 1 0 43052 CASAVA_Build 1 65067367 1D GTGAATGGTG T/- TAGCACCATT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 2 1 43053 CASAVA_Build 1 65070444 3D CTAAATGCCC TAT/--- TATTTCCACA 3070 hom 108 het 40 0 36 6 TAT 2 1 43054 CASAVA_Build 1 65071212 4D AGCTGCAAAA AGTC/---- AGTCAGTCAA 3070 hom 117 het 41 0 38 6 AGTC 3 2 43055 CASAVA_Build 1 65072140 4I AGTTCTTGAG ----/AATT AATTAACATG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AATT 1 2 43056 CASAVA_Build 1 65073358 1I ACTTACACAC -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 6 7 43057 CASAVA_Build 1 65077672 1I19M2D CCTGGATGGA -GGGGCCTGGGTGGCCTCCTCA/GGGGGCCTGGGTGGCCTCCT-- GGAGCCCTGC 3070 het 3070 ref 34 21 15 6 N/A 0 0 43058 CASAVA_Build 1 65082004 3D TGTGTGGTAA TTT/--- TGCTGAATAA 3070 het 3070 ref 34 20 8 8 T 4 1 43059 CASAVA_Build 1 65082857 13D GACTTAAGAG AAGGCAGGAGATC/------------- AAGACCATCC 2654 het 2654 ref 17 12 7 2 AAGGCAGGAGATC 1 0 43060 CASAVA_Build 1 65084689 1D TAGGGTTCTT G/- GCCAGCGTTG 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 G 2 1 43061 CASAVA_Build 1 65092044 1I CCTGCTACCT -/G GTTCACTTGA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 1 2 43062 CASAVA_Build 1 65095127 1I GCCAATAAGC -/T TGTCCTTCCT 3070 het 3070 hom 46 18 15 13 T 1 2 43063 CASAVA_Build 1 65116818 2D13M30D TCATGACCTT TATATATATAGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATA/--TATATATAGTGTG------------------------------ TATATATATA 3070 het 554 hom 9 2 8 3 N/A 0 0 43064 CASAVA_Build 1 65129414 1I CCAGTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 10 11 43065 CASAVA_Build 1 65136040 3I TGAATTCCTC ---/AGA AAGTGGAAAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AGA 0 1 43066 CASAVA_Build 1 65148187 1I TGTCCAAGAG -/C GTTAATAGGC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 0 1 43067 CASAVA_Build 1 65149357 1I TTCAGGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 506 hom 35 2 24 9 A 11 12 43068 CASAVA_Build 1 65160430 1D AAAAAAAAAA C/- CACAACAACA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 C 2 1 43069 CASAVA_Build 1 65160762 1I TATAAACACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 10 43070 CASAVA_Build 1 65163506 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 15 14 43071 CASAVA_Build 1 65172411 1I GGAGAGATGT -/A AAAGGACCAA 3070 het 3070 hom 61 22 33 6 A 3 4 43072 CASAVA_Build 1 65183129 1D ATAGGAATAA C/- TTTTGTAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 C 1 0 43073 CASAVA_Build 1 65183947 3D TTGACGGACA AAC/--- AAAAATGGGA 3070 het 3070 ref 43 20 19 5 AAC 1 0 43074 CASAVA_Build 1 65184003 1I GTTTGCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 16 12 T 11 12 43075 CASAVA_Build 1 65185024 24D TCAACGAGAT ATTTGCAAACCCATGTTCATAGAA/------------------------ ATATCATTCA 3070 het 3070 ref 37 32 13 6 ATTTGCAAACCCATGTTCATAGAA 1 0 43076 CASAVA_Build 1 65191585 1I TGTGACAGGT -/A CTACACAGTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 43077 CASAVA_Build 1 65197790 2I TACAAACAGG --/TA TATACATGGT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 TA 2 3 43078 CASAVA_Build 1 65201734 1I TAAGTATACT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 A 7 8 43079 CASAVA_Build 1 65293050 5D TGCTACTATA TTGAG/----- TTTTCTTTAC 3070 het 3070 ref 52 25 20 8 TTGAG 1 0 43080 CASAVA_Build 1 65307359 1I ATCTCCCACT -/G AGGGTAAGCT 3070 hom 107 het 47 0 38 9 G 0 1 43081 CASAVA_Build 1 65310513 1D ATCACGCCAC T/- GCAATCCAGC 3070 het 1859 hom 20 7 9 4 T 1 0 43082 CASAVA_Build 1 65317259 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2943 het 1785 hom 24 6 9 9 T 13 14 43083 CASAVA_Build 1 65317602 2I TTGTAGATTC --/TT TTTGCAGTTT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 T 3 5 43084 CASAVA_Build 1 65317783 1I CTCCTAAAGA -/T TGGAATGTTC 3070 hom 150 het 55 0 48 7 T 1 2 43085 CASAVA_Build 1 65319035 4I TAAGTCATCT ----/TTTA TTTATTTATT 2613 het 1775 hom 18 6 8 5 TTTA 3 4 43086 CASAVA_Build 1 65321427 2D CTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 47 11 25 12 CA 10 9 43087 CASAVA_Build 1 65322636 17D AGGCCCCACA TTTCTTTTTTTTCTTTC/----------------- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 9 10 TTTCTTTTTTTTCTTTC 1 0 43088 CASAVA_Build 1 65330568 2D GATTGTAGAA AG/-- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 AG 1 0 43089 CASAVA_Build 1 65332637 1D CAGTTGGTTG T/- TAAGTATGTG 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 T 2 1 43090 CASAVA_Build 1 65338580 1D GACTAGATGC T/- TTTTTTTTTC 2921 het 2921 ref 18 9 7 2 T 10 9 43091 CASAVA_Build 1 65353681 7D TACATTGCCC AGCTACA/------- AGGCTGGTCT 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 AGCTACA 1 0 43092 CASAVA_Build 1 65356024 4D AAAAAGAAAG AAAA/---- AAAAAGAAAA 73 het 73 ref 28 17 3 13 A 9 5 43093 CASAVA_Build 1 65356664 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAAAGA 2394 het 526 hom 35 10 11 14 AC 0 1 43094 CASAVA_Build 1 65356844 12D AAGGTTAATA TTGACAAAGGTC/------------ TTGTTACTGG 3070 het 3070 ref 46 24 17 10 TTGACAAAGGTC 1 0 43095 CASAVA_Build 1 65358343 1I GTCTCAGTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 50 31 14 5 T 9 10 43096 CASAVA_Build 1 65359728 4I AGGTTGACAG ----/TAGA TAGATCATTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 TAGA 1 2 43097 CASAVA_Build 1 65364308 1D CAGAGGACTG C/- CCAAGTTGAC 3070 het 2436 hom 22 7 12 3 C 3 2 43098 CASAVA_Build 1 65364797 2I AACAAACAAA --/AT CAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 AT 0 1 43099 CASAVA_Build 1 65366114 1I CTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 13 13 T 13 14 43100 CASAVA_Build 1 65367561 1D ACAGCAGCAT G/- GGGGCAGCTA 3070 hom 80 het 29 0 26 3 G 5 4 43101 CASAVA_Build 1 65371930 1D ACTTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2537 het 1414 hom 21 5 6 10 A 17 16 43102 CASAVA_Build 1 65376247 3I TCTCATCAGA ---/TCT TCTGCAGAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 TCT 1 2 43103 CASAVA_Build 1 65383528 2I TTTACAAAGT --/AA AGAGGTTAAG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 1 3 43104 CASAVA_Build 1 65388543 4D GTTCTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 2634 het 194 hom 29 4 9 18 TC 7 5 43105 CASAVA_Build 1 65388557 2I TCTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 22 3 10 9 T 12 14 43106 CASAVA_Build 1 65390311 2I GTATGAGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 51 21 21 9 AC 6 7 43107 CASAVA_Build 1 65405395 2D CAGAGAAAGA CT/-- CTCTCAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 CT 3 2 43108 CASAVA_Build 1 65410372 1D ATATATATAT A/- TATTTAAACT 679 het 346 hom 8 1 2 5 A 1 0 43109 CASAVA_Build 1 65415520 6I AGTGACTAAT ------/GACTTG ATGCCACGAG 3070 hom 117 het 42 0 39 4 GACTTG 0 1 43110 CASAVA_Build 1 65416211 1I GATAGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1226 hom 41 3 29 9 A 12 13 43111 CASAVA_Build 1 65424748 1I ACTATATTTT -/A AAGCACTGAG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 2 3 43112 CASAVA_Build 1 65435483 1D TTAGTAACTG T/- TTTTTTTCGT 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 T 8 7 43113 CASAVA_Build 1 65437025 1D TGCCTGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 T 12 11 43114 CASAVA_Build 1 65438311 2I ACCACATGAC --/TT TGCTAGAAGA 3070 het 1672 hom 13 4 7 2 T 1 3 43115 CASAVA_Build 1 65440492 1I CACGGTGAGA -/C CCCCACCTCT 1595 het 1595 ref 15 8 5 2 C 4 5 43116 CASAVA_Build 1 65442081 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 10 9 43117 CASAVA_Build 1 65447263 1D AATATTTTGT G/- GGGGGGGTCT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 G 8 7 43118 CASAVA_Build 1 65449509 7D GAATGAGACA GTAATAT/------- GTAATATGAA 3070 het 3070 hom 33 11 19 5 GTAATAT 2 1 43119 CASAVA_Build 1 65456541 1I GATAAAATGC -/T TTTCCCTTCA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 3 4 43120 CASAVA_Build 1 65473418 1I TATCTTTGTT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 A 7 8 43121 CASAVA_Build 1 65474687 2D TTTGTGAAAC AA/-- GAGTTGACTG 3070 het 3070 hom 48 21 23 5 A 2 0 43122 CASAVA_Build 1 65477926 1D TTCTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 10 43123 CASAVA_Build 1 65485385 2D TATTCATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 40 0 32 8 A 13 11 43124 CASAVA_Build 1 65509458 3D TGATAGAAAT CTA/--- CTACATTTTG 3070 het 3070 hom 36 18 16 3 CTA 2 1 43125 CASAVA_Build 1 65510971 1I TTTTGTTTGT -/G TTGTTTATTT 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 G 0 1 43126 CASAVA_Build 1 65512937 3D ATCTTTTAGA AGC/--- AGCCATAAGT 3070 het 2299 hom 26 6 19 3 AGC 2 1 43127 CASAVA_Build 1 65532978 2D GTTAAATAAA GT/-- GTTATTAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 GT 2 1 43128 CASAVA_Build 1 65533934 11D AAAGTTATGT ATTTCATTCAA/----------- GTTCAAATAT 3070 hom 108 het 35 0 37 0 ATTTCATTCAA 1 0 43129 CASAVA_Build 1 65536312 1D ATCATCCTTT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 73 het 26 0 25 1 A 8 7 43130 CASAVA_Build 1 65539596 1I ATGGGCACTT -/C CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 C 8 9 43131 CASAVA_Build 1 65541836 1D TTCTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 T 12 11 43132 CASAVA_Build 1 65544039 1I TGTTATCATA -/T GTCATAATGA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 43133 CASAVA_Build 1 65545069 1D TTCAAAGTTA C/- AAAGACAATT 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 C 1 0 43134 CASAVA_Build 1 65547211 1D TAGGGATCAT C/- CCTATTCTGG 3070 hom 144 het 53 0 49 5 C 3 2 43135 CASAVA_Build 1 65555197 1D TAAAGGTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 20 11 T 12 11 43136 CASAVA_Build 1 65559695 6I ACGGTCTTGA ------/ACTCTT GACCTCAAGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ACTCTT 0 1 43137 CASAVA_Build 1 65575570 1D TAATTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 16 12 T 11 10 43138 CASAVA_Build 1 65583387 2D GGAAGGTATC AT/-- AGGCCTTCTC 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 AT 1 0 43139 CASAVA_Build 1 65583950 1D TTGAGTGGAA G/- GAGTCTGAAG 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 G 2 1 43140 CASAVA_Build 1 65584659 2D TGATAATCCA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 54 21 26 8 T 10 8 43141 CASAVA_Build 1 65600436 31I GTTGCCTGGG -------------------------------/GCTCAATCTCAACTCTGCTAGTAAATAAATA TTCACTAGCT 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 GCTCAATCTCAACTCTGCTAGTAAATAAATA 0 1 43142 CASAVA_Build 1 65601696 4D AGAGAGAGAG AGAC/---- AGAGAAAGAG 2857 het 2857 ref 37 23 10 5 AGAC 1 0 43143 CASAVA_Build 1 65606857 3D TTCTTCCTCC TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 2046 hom 37 7 17 14 TCT 7 6 43144 CASAVA_Build 1 65676160 1D GGCTCACTGC A/- AACCTTAACC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 3 2 43145 CASAVA_Build 1 65678631 1I TGGTGCTTAC -/T TTTTTTTTTT 2417 het 2417 ref 34 11 9 14 T 13 14 43146 CASAVA_Build 1 65679570 1D TTTAGCAGAA G/- GGGTGGGGAG 2746 het 2746 ref 30 15 7 8 G 4 3 43147 CASAVA_Build 1 65713331 1D TTGAAAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 23 0 15 8 A 11 10 43148 CASAVA_Build 1 65722218 1I CCTTCTCTCC -/T TTTTTTTTTT 1392 het 1392 ref 31 22 3 6 T 10 11 43149 CASAVA_Build 1 65725977 2D AAATTAAAAA AT/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 AT 1 0 43150 CASAVA_Build 1 65735259 4I GTTCATATAC ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 37 het 37 1 24 12 AT 7 9 43151 CASAVA_Build 1 65744026 1D TCACCATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 42 0 30 13 T 14 13 43152 CASAVA_Build 1 65757285 2I TCTTTCTTTC --/TT TCTTTCTTTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 3 43153 CASAVA_Build 1 65761110 1D CCTTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 30 0 26 5 T 12 11 43154 CASAVA_Build 1 65766433 1D AAGTATCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1423 hom 36 4 24 10 A 14 13 43155 CASAVA_Build 1 65769237 2D CCTCTTCAAT AC/-- ATTCTCAAAA 3070 hom 126 het 44 0 41 3 AC 1 0 43156 CASAVA_Build 1 65770139 25D ACAAGTGTGC TAGTATACGAAGTTTCTTTAGAGCG/------------------------- TAAAACCAAT 3070 het 3070 ref 39 31 12 6 TAGTATACGAAGTTTCTTTAGAGCG 1 0 43157 CASAVA_Build 1 65777335 1D60M1D TATTTCCTGG TTTTTTTTTTTTGCCTTTGGGGGGAAATGTTAATTATGCATTTTTTTTAAAACCATTGAAAT/-TTTTTTTTTTTGCCTTTGGGGGGAAATGTTAATTATGCATTTTTTTTAAAACCATTGAAA- TTTTTTTTTG 3070 het 442 hom 30 1 20 21 N/A 0 0 43158 CASAVA_Build 1 65777523 1D TTGTTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 24 1 16 7 T 12 11 43159 CASAVA_Build 1 65821775 1D CAGAAGAGCT A/- TACTTTAAAG 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 A 1 0 43160 CASAVA_Build 1 65826575 1I CTAATTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 10 11 43161 CASAVA_Build 1 65830615 1I GGTATGTCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 43162 CASAVA_Build 1 65830793 1D TAATGTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 17 8 T 11 10 43163 CASAVA_Build 1 65853297 1I AACTGACATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 49 0 38 11 T 9 10 43164 CASAVA_Build 1 65860709 2D TGCCATGATA CT/-- CTCTGTGCTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CT 3 2 43165 CASAVA_Build 1 65864870 1I ATTCATTAAC -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 6 7 43166 CASAVA_Build 1 65869791 1D AATTACCCAC T/- TCTCATTAGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 1 43167 CASAVA_Build 1 65869883 2D CTATAGAGAC AA/-- GAGAGAAACC 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 2 0 43168 CASAVA_Build 1 65875344 5I GTGTAATAGA -----/TTACT TTATAGTTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTACT 0 1 43169 CASAVA_Build 1 65875631 2D TTTTGTACCA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 36 0 27 11 AC 9 8 43170 CASAVA_Build 1 65890358 1D GGTTCAGGAG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 9 8 43171 CASAVA_Build 1 65898777 2I TTTTCTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 165 het 63 0 54 9 T 10 12 43172 CASAVA_Build 1 65899807 1D ATCATATTGT G/- GTTTTGATTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 2 1 43173 CASAVA_Build 1 65899998 2I TACATTTTGA --/AT ATTAACTCCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AT 1 2 43174 CASAVA_Build 1 65900800 1I ATTTTAGCAC -/T TTTTTTATTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 43175 CASAVA_Build 1 65901523 2D TAAGATAATC AT/-- GTGGTTTTTA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 AT 1 0 43176 CASAVA_Build 1 65902210 1I CAACTCTTGG -/T TTCATTGATC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 2 3 43177 CASAVA_Build 1 65903507 2I TATGTAAAAC --/AT ATATATTACA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AT 3 4 43178 CASAVA_Build 1 65908033 1D AACTCCTTAA G/- AGGATATAAC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 G 1 0 43179 CASAVA_Build 1 65909168 1D CTGAGCAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 77 het 45 1 44 1 A 10 9 43180 CASAVA_Build 1 65909480 3D CATTTAAGGA AAT/--- AATAATAACA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AAT 3 2 43181 CASAVA_Build 1 65925938 3I GGGTGAGGAC ---/AGA AGACTTCTAG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AGA 1 2 43182 CASAVA_Build 1 65932772 2I TCCAGGAAAC --/AA GAGATGGAAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 2 43183 CASAVA_Build 1 65933773 1D CTAGCAAAAT A/- AAAAAACAAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 7 6 43184 CASAVA_Build 1 65935062 1I CTCTAAAGTT -/C TGTCTCCTGT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 C 0 1 43185 CASAVA_Build 1 65938504 4D TACTAACCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 31 1 17 13 T 18 14 43186 CASAVA_Build 1 65940078 1I AATTAGTTTT -/A TTTATTCTGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 0 1 43187 CASAVA_Build 1 65946931 5I GATTCTTCAC -----/CCTCT CCTCTCAAAT 2817 hom 31 het 16 0 8 8 CCTCT 1 2 43188 CASAVA_Build 1 65953544 5D AAAAGAGTGT AATTG/----- AATTGTTTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AATTG 2 1 43189 CASAVA_Build 1 65953819 1I TACTCTGTTG -/C CAGCATTTGT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 1 2 43190 CASAVA_Build 1 65961438 1I TGTAGCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 12 13 43191 CASAVA_Build 1 65969587 1D CATGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 21 8 A 11 10 43192 CASAVA_Build 1 65969910 1I ATCCCTGCAC -/T TTTGGGAGGC 3070 hom 59 het 23 0 17 6 T 3 4 43193 CASAVA_Build 1 65973032 1I CATTGTGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 584 hom 35 3 28 4 T 9 10 43194 CASAVA_Build 1 65976289 1D CCTCCAGTTA C/- CCCCCCACCC 3070 hom 71 het 27 0 23 4 C 7 6 43195 CASAVA_Build 1 65977474 5D CCTCTGTTCT GTTCC/----- ATTTGTCTAT 3070 het 265 hom 17 1 13 4 GTTCC 1 0 43196 CASAVA_Build 1 65981798 1D CCAGTGTAGG C/- TGCAGAACAG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 C 1 0 43197 CASAVA_Build 1 65986706 1D TACAACAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 11 10 43198 CASAVA_Build 1 65999312 1D TTTATAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 28 0 17 11 T 15 14 43199 CASAVA_Build 1 66035227 1D GCCTGAAACA T/- TTTTTTTTTT 3057 hom 33 het 14 0 11 3 T 15 14 43200 CASAVA_Build 1 66057771 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTGTTTTT 2372 hom 42 het 18 0 13 5 T 4 5 43201 CASAVA_Build 1 66069935 16D CTTTCCAACT CATTTTATGAAGCCAG/---------------- CATTTTATGA 3070 hom 81 het 35 0 28 9 CATTTTATGAAGCCAG 2 1 43202 CASAVA_Build 1 66086739 4I TTGACATATA ----/TATG TGTCTGTGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TATG 0 1 43203 CASAVA_Build 1 66092724 1D TCTCCCAGCC T/- TTTTTTTTTC 1359 het 1359 ref 32 23 3 6 T 10 9 43204 CASAVA_Build 1 66108067 1D CTATACCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 38 4 21 13 T 16 15 43205 CASAVA_Build 1 66109565 2D AGTTAAGATG TA/-- AACTTTTCCC 3070 hom 120 het 43 0 41 3 TA 1 0 43206 CASAVA_Build 1 66119112 1I TGGGAAGCAG -/T TAATAGAAGA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 1 2 43207 CASAVA_Build 1 66127782 1I GCTAATTGCT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 7 8 43208 CASAVA_Build 1 66134122 2D GTATTACTTA AC/-- ACAGTATTAG 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 AC 2 1 43209 CASAVA_Build 1 66150271 1I AGAAGCAGAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 T 8 9 43210 CASAVA_Build 1 66158019 4D TACCATGTAC AGAG/---- CTCTGCCACA 3070 het 3070 ref 43 30 12 2 AG 2 0 43211 CASAVA_Build 1 66159077 1D TTAGCCATTA T/- TCATGTTCAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 2 1 43212 CASAVA_Build 1 66195694 6I TGGGCTCTCT ------/ATTCTG ATTTGTTTGG 3070 hom 114 het 39 0 39 0 ATTCTG 0 1 43213 CASAVA_Build 1 66203166 13D TAACAGTGGT TATACCCAGTGGA/------------- TATATCTGGG 3070 hom 96 het 32 0 33 1 TATACCCAGTGGA 1 0 43214 CASAVA_Build 1 66203790 2D AATCTTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 7 T 13 11 43215 CASAVA_Build 1 66206768 1I TTGACTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 10 11 43216 CASAVA_Build 1 66210624 1D GGAGAGGATA T/- TTTTTTGTCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 7 6 43217 CASAVA_Build 1 66212081 1D TAGCACTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 38 1 27 10 T 11 10 43218 CASAVA_Build 1 66222083 2D TAATAACGTA AT/-- ATATACTATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AT 3 2 43219 CASAVA_Build 1 66226907 1I CTTTTAAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 9 10 43220 CASAVA_Build 1 66228165 2I AAGTGTCTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 32 0 22 10 T 13 15 43221 CASAVA_Build 1 66232782 1I TGGTAACATT -/C GTATAAAGGG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 C 0 1 43222 CASAVA_Build 1 66237140 1D CTAGTGGGTT A/- AAAAAAAAAA 2872 het 2727 hom 27 9 8 11 A 15 14 43223 CASAVA_Build 1 66240473 2D GTGGTAACTT AC/-- TGTGATTTTA 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 AC 1 0 43224 CASAVA_Build 1 66241621 1D CAATACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 37 0 35 2 A 12 11 43225 CASAVA_Build 1 66243571 1I ATCACTTTTA -/C GCTTCCTGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 0 1 43226 CASAVA_Build 1 66252359 1I TGGCCATTTA -/T GTATCTTCTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 0 1 43227 CASAVA_Build 1 66256110 1D TTTTAAAAAA T/- ATATATATAT 300 het 300 ref 23 11 3 9 T 1 0 43228 CASAVA_Build 1 66257168 3D GAGGATAAAG TAC/--- TACAAGATAT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 TAC 2 1 43229 CASAVA_Build 1 66278138 3D TTGTTATGTA GTT/--- GTATATAGGC 3070 het 3070 ref 45 26 18 4 GTT 1 0 43230 CASAVA_Build 1 66282292 14D GGTCTGTCAA GTATTATACTAAAT/-------------- GTATTATACT 3070 het 3070 ref 29 16 10 11 GTATTATACTAAAT 2 1 43231 CASAVA_Build 1 66290278 3I GGTTTACCAA ---/GGT GGTGGTGGGG 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 GGT 2 3 43232 CASAVA_Build 1 66292681 1I TAACCAAGTT -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 6 7 43233 CASAVA_Build 1 66306377 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1693 hom 15 4 10 1 A 10 11 43234 CASAVA_Build 1 66311287 1D CCTTTAGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 12 11 43235 CASAVA_Build 1 66312979 1I GCTTAAGTTG -/A TTGTTCATAT 3070 hom 105 het 41 0 34 7 A 0 1 43236 CASAVA_Build 1 66328953 6I TATGTGTATA ------/TGTATC TGTATCTGTA 2760 hom 30 het 13 0 10 3 TGTATC 1 2 43237 CASAVA_Build 1 66336134 1D TGCTGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2121 hom 29 7 12 11 T 13 12 43238 CASAVA_Build 1 66345792 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 25 3 11 11 A 11 10 43239 CASAVA_Build 1 66346960 1I CAATGTCACT -/C ACTAATCATC 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 C 0 1 43240 CASAVA_Build 1 66347750 1D AAAACAATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 9 8 43241 CASAVA_Build 1 66354483 1D TATTTCTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 33 0 30 4 T 10 9 43242 CASAVA_Build 1 66357778 2I AATAATATTG --/TC TCTAGCATTC 3070 hom 138 het 51 0 46 5 TC 1 2 43243 CASAVA_Build 1 66399326 1D ATGAAAGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 123 het 57 0 41 16 T 10 9 43244 CASAVA_Build 1 66411049 7D TCATCTTCAC ATTATGT/------- ATTATGTATA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 ATTATGT 2 1 43245 CASAVA_Build 1 66415973 1D GATAATAAAT A/- ATGCAGACTC 3070 hom 105 het 38 0 34 4 A 2 1 43246 CASAVA_Build 1 66417785 1D TATTTGAAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 59 25 25 9 A 9 8 43247 CASAVA_Build 1 66442010 4D TATTCTAGTT ATCC/---- ATTCATCTAA 2409 het 2409 ref 12 6 5 1 ATCC 1 0 43248 CASAVA_Build 1 66460167 1I GTGTATTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 11 12 43249 CASAVA_Build 1 66460178 1I TTTTTTTTTT -/A ATCTCCATGT 3070 hom 34 het 28 1 25 2 A 1 2 43250 CASAVA_Build 1 66464573 2I GGAACAAGAT --/AG AGCAAGGTCC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 AG 1 2 43251 CASAVA_Build 1 66467446 2D GCCCGGCTAA TT/-- TTTTTTGTAT 1935 hom 12 het 7 0 5 2 T 8 6 43252 CASAVA_Build 1 66503969 5I2M1I CTCTGGCATT -----TC-/GTGAATCT GAGTGATGCC 3070 hom 132 het 45 0 45 1 N/A 0 0 43253 CASAVA_Build 1 66510892 1D TCCTTTAGTC T/- TTTTCTCTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 5 4 43254 CASAVA_Build 1 66521833 4I AATTTTTACA ----/ACTT ACTTTTTAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 ACTT 1 2 43255 CASAVA_Build 1 66527976 2D GAGAAAATGT TA/-- TATATATATA 1841 hom 12 het 6 0 5 1 TA 9 8 43256 CASAVA_Build 1 66539462 1I GAGAAGCAGA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 54 het 30 0 19 11 T 7 8 43257 CASAVA_Build 1 66568654 1I TCTCTTTTTT -/A GTACTTCTGC 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 0 1 43258 CASAVA_Build 1 66571739 2D ATGTGTGTGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 51 26 19 7 AC 9 8 43259 CASAVA_Build 1 66574923 1D64M4D GTATTAGTAC TTTTTTTTTAGAATGAAGCATTAGGACTTAGCACTTGAGTAAATGTTTGCTAAGATAGAAATGGAAGAT/-TTTTTTTTAGAATGAAGCATTAGGACTTAGCACTTGAGTAAATGTTTGCTAAGATAGAAATGGA---- AGATGGTCCT 3070 het 3070 ref 45 46 32 8 N/A 0 0 43260 CASAVA_Build 1 66576649 3D TGTGGCAAGC ATT/--- ATTAGTGAGG 3070 het 3070 hom 39 15 23 2 ATT 2 1 43261 CASAVA_Build 1 66590989 1D TGTTCCTTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 T 9 8 43262 CASAVA_Build 1 66603845 1I TCCCTCTCCC -/A AACAAGAATA 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 A 2 3 43263 CASAVA_Build 1 66612693 6I GCATGACCAA ------/TGGGTT TGTATGTCTA 3070 het 3070 hom 47 14 26 7 TGGGTT 0 1 43264 CASAVA_Build 1 66614899 1D ACAAGTAGAA C/- CCTTTTTATT 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 C 3 2 43265 CASAVA_Build 1 66615067 1D TGAGCTTAAA T/- GTTCTCATCA 3070 het 3070 ref 48 27 16 6 T 1 0 43266 CASAVA_Build 1 66616156 6D AACCACTGTT AAACTA/------ AATCTTCTCC 3070 het 3070 ref 41 20 19 4 AAACTA 1 0 43267 CASAVA_Build 1 66619028 1I AATAAAGAAA -/G TGGGAGATCT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 G 0 1 43268 CASAVA_Build 1 66624230 1D ATCTCTTCAT C/- CAGCTGTTTA 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 C 2 1 43269 CASAVA_Build 1 66634294 1I4M8I CTGGCCAGGT -TGTT--------/AAGTTAAGGTCAA GGTGAGAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 N/A 0 0 43270 CASAVA_Build 1 66658900 2I TATTCCTTTG --/GC ACACCTCACA 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 GC 0 1 43271 CASAVA_Build 1 66662771 19D TTCTCGAAAA TCTGCACCCTTGCCTTTCC/------------------- TCTTAGGACA 3070 het 3070 ref 41 29 15 7 TCTGCACCCTTGCCTTTCC 1 0 43272 CASAVA_Build 1 66674161 1D AGAAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 11 10 43273 CASAVA_Build 1 66679686 2I ATACATGCAT --/AC ACATATACAT 3070 het 3070 hom 58 23 24 11 AC 1 2 43274 CASAVA_Build 1 66685463 2D ATGATGAATT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 102 het 43 0 35 11 AC 6 5 43275 CASAVA_Build 1 66685822 2I TTTCAAAGAC --/TT CAGATATTGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 2 43276 CASAVA_Build 1 66687922 1D GGAAGGATGA G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 G 8 7 43277 CASAVA_Build 1 66690176 1I TTTAGTAGTG -/A AAAAAAAAAA 2801 het 1624 hom 22 8 8 6 A 13 14 43278 CASAVA_Build 1 66693336 1D GTTCAAGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 10 9 43279 CASAVA_Build 1 66713487 1D TTGGAGCCTC A/- AAAGTTTCTT 3070 hom 120 het 41 0 41 0 A 4 3 43280 CASAVA_Build 1 66717458 1I GGGTCCCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 20 1 12 7 A 10 11 43281 CASAVA_Build 1 66717667 8D TTCAACCTCA GTACCTGC/-------- GTTCTTTCAT 3070 hom 36 het 14 0 13 2 GTACCTGC 1 0 43282 CASAVA_Build 1 66725221 4I45M2I AACAATAAAT ----AAACAAACAAATTAAAAAAAAAGAACTACCAAACTTCTAAAAGAA--/AAACAAACAAACAAATTAAAAAAAAAGAACTACCAAACTTCTAAAAGAATC TCTAAAATAC 3070 hom 42 het 19 0 15 11 N/A 0 0 43283 CASAVA_Build 1 66725820 3D CGTTATATGC ATA/--- ATAACTCCCA 3070 hom 126 het 45 0 43 3 ATA 2 1 43284 CASAVA_Build 1 66740541 1I TAGTGTTTGG -/C TGGTAACTTA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 C 0 1 43285 CASAVA_Build 1 66751320 1D CCAGAGCAAT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 8 7 43286 CASAVA_Build 1 66774177 1I TTCATATAGC -/A TTTCTTAAAA 3070 hom 105 het 46 0 35 11 A 0 1 43287 CASAVA_Build 1 66947050 1D TTTGAAAAGC A/- AAAAAAATAT 3070 hom 138 het 48 0 46 3 A 8 7 43288 CASAVA_Build 1 66956682 1D TACACTGCAT G/- GGTATAGTGG 3070 hom 120 het 45 0 41 5 G 3 2 43289 CASAVA_Build 1 66966170 1I AAGGGATTGC -/A AAAAAAGCAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 7 43290 CASAVA_Build 1 66966319 1I AGCCTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 9 10 43291 CASAVA_Build 1 66978626 4D ACCTTAATTA ATTG/---- ATTAACACTC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 ATTG 1 0 43292 CASAVA_Build 1 66987424 3I ATTATTTTAA ---/TTG TTTTTGTATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTG 0 1 43293 CASAVA_Build 1 66989043 4D GGAAGCGAAG ACTT/---- ACTTGCTCCT 3070 hom 126 het 45 0 42 4 ACTT 2 1 43294 CASAVA_Build 1 66996388 1D AACAAGCAGC A/- AAAATGGGCT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 5 4 43295 CASAVA_Build 1 67012680 6I AGAACCACTT ------/TACCTA TCTAGATTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TACCTA 0 1 43296 CASAVA_Build 1 67017077 1I AATTTTCACT -/A TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 45 0 36 9 A 0 1 43297 CASAVA_Build 1 67021311 1D GAAACTGAAC A/- ACCTGCTCCT 1915 het 1468 hom 7 3 4 0 A 2 1 43298 CASAVA_Build 1 67024751 1I AAGACTCTTT -/G GGGGAGGTGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 G 4 5 43299 CASAVA_Build 1 67025787 1I TCCTTTATTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 8 9 43300 CASAVA_Build 1 67031333 1I TTGCACTCTT -/A AAAAATTATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 5 6 43301 CASAVA_Build 1 67033973 1D TGAACAGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 25 0 20 6 T 10 9 43302 CASAVA_Build 1 67035636 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 10 11 43303 CASAVA_Build 1 67041127 1D TCCTGGTTGG A/- AAAAAATTGC 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 A 7 6 43304 CASAVA_Build 1 67045068 1I TAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2905 het 95 hom 11 1 9 1 A 9 10 43305 CASAVA_Build 1 67045923 3D AATTATGATT ATG/--- ATATCACTAT 3070 hom 54 het 21 0 19 5 ATG 1 0 43306 CASAVA_Build 1 67056232 1D ATCTTGGCTA G/- TTGTGAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 G 1 0 43307 CASAVA_Build 1 67058520 1D TGCATTTTGC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 A 9 8 43308 CASAVA_Build 1 67059077 1I AAGCATTTTA -/T TTATTTTATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 2 3 43309 CASAVA_Build 1 67060455 1D GACGAGGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 A 12 11 43310 CASAVA_Build 1 67061163 1D CTAGAATTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 2492 hom 15 6 9 0 T 8 7 43311 CASAVA_Build 1 67065062 1I GCTTCTACTA -/T AAATTTATGC 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 T 0 1 43312 CASAVA_Build 1 67081471 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 540 het 6 hom 10 0 3 7 A 13 14 43313 CASAVA_Build 1 67083462 30D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTAAA/------------------------------ AAAAAAAAAA 2075 het 22 hom 15 1 6 11 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTAAA 1 0 43314 CASAVA_Build 1 67210322 3D AGTATGACAG ATA/--- ATACCTTTAC 3070 hom 51 het 20 0 18 4 ATA 2 1 43315 CASAVA_Build 1 67213810 4D AAAAAAAGAA AAAG/---- AAAGGAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 27 7 AAAG 2 1 43316 CASAVA_Build 1 67216481 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGATGTGC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AAAG 1 2 43317 CASAVA_Build 1 67216558 4D AGTTCATTTA TAGG/---- TAGGTATCTC 3070 hom 126 het 45 0 43 5 TAGG 2 1 43318 CASAVA_Build 1 67219359 4I CCATGTGTGT ----/TAGA TAGACATATG 3070 hom 151 het 58 0 51 7 TAGA 1 2 43319 CASAVA_Build 1 67226385 17I ATATTTACAT -----------------/GTGTGCTGATGACCCTA GGGGTGTGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 GTGTGCTGATGACCCTA 0 1 43320 CASAVA_Build 1 67227368 1D TTTGTCTTTT A/- AAAAAAAAAT 1273 het 1273 ref 39 33 3 3 A 10 9 43321 CASAVA_Build 1 67232315 6I CAGCATTCTT ------/GTATTG GTAGATCAAA 3070 hom 135 het 54 0 46 8 GTATTG 0 1 43322 CASAVA_Build 1 67235972 5I TCAAGATCTA -----/AATTT AAGACATAAA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 AATTT 0 1 43323 CASAVA_Build 1 67236385 2I ATAATGGAAA --/AC AGTCTAGTGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AC 0 1 43324 CASAVA_Build 1 67291565 1I CACACACCTT -/A AAAAAAAAAA 2247 het 2247 ref 28 14 10 4 A 11 12 43325 CASAVA_Build 1 67294895 4D GAGGACACAT ACAG/---- ACCGTAGCAA 3070 het 3070 hom 54 23 28 4 ACAG 1 0 43326 CASAVA_Build 1 67308461 2I TAGAAGTTCC --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 8 10 43327 CASAVA_Build 1 67308566 1I TACACAGAAG -/T TTTTTAAAGT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 5 6 43328 CASAVA_Build 1 67310604 1I ATTTATAGAC -/A AAAAAAAAAA 2549 het 2544 hom 29 9 10 11 A 13 14 43329 CASAVA_Build 1 67336019 1I GCAATGGAGT -/A AACCAATTAG 3070 het 3070 hom 51 16 26 9 A 2 3 43330 CASAVA_Build 1 67339282 1I TTGGGTTTCA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 T 7 8 43331 CASAVA_Build 1 67359081 1D TGACTAATAT A/- GGGGGTCAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 1 0 43332 CASAVA_Build 1 67364200 1D TGCCAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 2080 het 536 hom 25 3 9 13 A 19 18 43333 CASAVA_Build 1 67372598 1D CTAAGAAAAA C/- TACTAAGGAA 3070 het 2832 hom 23 7 12 4 C 1 0 43334 CASAVA_Build 1 67391019 2D GATGCGTTAC AT/-- TTATTGATTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 AT 1 0 43335 CASAVA_Build 1 67430241 1D TTGTCAGCCT A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 A 7 6 43336 CASAVA_Build 1 67439401 1I TGTGGCTGGG -/C CCGGTGGCTC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 2 3 43337 CASAVA_Build 1 67450374 1I TCCAAAGCCA -/G CTTCTGTCTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 0 1 43338 CASAVA_Build 1 67452528 1I TATAACTAGC -/T TTTTCAAAGT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 T 4 5 43339 CASAVA_Build 1 67456859 19D ATTAAAAGAG TATATTCCAAAATTAAGAA/------------------- TATATTCCAA 2454 het 2264 hom 24 6 8 14 TATATTCCAAAATTAAGAA 2 1 43340 CASAVA_Build 1 67457201 1I CCCTATCTAG -/A AAAAAAAATA 2270 het 2183 hom 13 6 5 2 A 8 9 43341 CASAVA_Build 1 67468818 3D TTTCCTCCTC TTA/--- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 TTA 1 0 43342 CASAVA_Build 1 67481585 1I CGGATTTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 9 10 43343 CASAVA_Build 1 67511370 2D TTCCTTAACT TC/-- TTTTACCTGA 3070 het 3070 ref 56 26 25 5 TC 1 0 43344 CASAVA_Build 1 67526747 1I GTTGCCAAAA -/G ATATTAACAT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 G 0 1 43345 CASAVA_Build 1 67539275 1D TACATACAGT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 8 7 43346 CASAVA_Build 1 67540143 1D GTAGCTATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 10 9 43347 CASAVA_Build 1 67560943 4I TCATGACAAG ----/AGAA AGAAAGAAGA 3070 hom 77 het 31 0 25 6 AGAA 2 3 43348 CASAVA_Build 1 67568847 1I ATAGCCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 463 hom 21 2 14 5 T 12 13 43349 CASAVA_Build 1 67580237 1D CAAGAGGTGA T/- TTTCCAGTGA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 4 3 43350 CASAVA_Build 1 67616709 4I TACAGCTGCC ----/AAAT AAATCTAATC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAAT 1 2 43351 CASAVA_Build 1 67620753 1D GCTAGAACTC A/- AAACTCCATA 3070 hom 126 het 46 0 43 6 A 4 3 43352 CASAVA_Build 1 67627612 2I TACTTTTAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AC 0 1 43353 CASAVA_Build 1 67638972 1D GGGTCTGGAT G/- GGGACTCCAT 3070 hom 81 het 32 0 25 7 G 4 3 43354 CASAVA_Build 1 67643994 1I CTCTTTTCAA -/G TTCCACAACT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 0 1 43355 CASAVA_Build 1 67652638 1D CCACCACCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 41 0 33 9 A 10 9 43356 CASAVA_Build 1 67657030 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 5 A 12 11 43357 CASAVA_Build 1 67657875 1I GTCACTTACA -/T TTTTAGGTTA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 4 5 43358 CASAVA_Build 1 67662950 1D TATGGGGGGG A/- AAAAATGAGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 6 5 43359 CASAVA_Build 1 67666947 2D GAATTAATTA TT/-- TTCTTTTATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 4 2 43360 CASAVA_Build 1 67688833 1D TATATGAAAT A/- TAAATAAACT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 0 43361 CASAVA_Build 1 67700509 1I AGAGTGTTTA -/C TGTTTCTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 43362 CASAVA_Build 1 67715976 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 17 1 14 2 A 11 10 43363 CASAVA_Build 1 67716759 1I AGACATCGTT -/A ATGTGGGAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 1 2 43364 CASAVA_Build 1 67720318 1D TTTGATTTTG T/- TTTTTTATTT 2385 hom 21 het 9 0 8 1 T 7 6 43365 CASAVA_Build 1 67723386 1D AAACAAACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 36 1 29 6 A 11 10 43366 CASAVA_Build 1 67726792 1I CTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 7 het 16 0 10 6 A 9 10 43367 CASAVA_Build 1 67739774 1D ATCTCAGGTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 86 het 31 0 28 3 T 8 7 43368 CASAVA_Build 1 67745948 1D CATAGTGAGA C/- CCCCCATCGC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 C 6 5 43369 CASAVA_Build 1 67758956 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 14 12 0 T 9 10 43370 CASAVA_Build 1 67765879 3D CTGCCTCAGA GTT/--- GTTGTGTGGC 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 GTT 2 1 43371 CASAVA_Build 1 67779721 1D TAAGCTAGGT A/- AAAAATGAGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 6 5 43372 CASAVA_Build 1 67792866 1I GGGAGGCTGA -/G GGGGGCGGAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 5 6 43373 CASAVA_Build 1 67794957 2D GTTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 46 17 21 10 TG 8 7 43374 CASAVA_Build 1 67801582 1I GTTTATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1221 hom 28 3 22 3 A 10 11 43375 CASAVA_Build 1 67812794 1D TTTATTTTCC T/- GTTTATGTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 1 0 43376 CASAVA_Build 1 67825944 2D CCATTCTCAA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 10 8 43377 CASAVA_Build 1 67829510 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATTGCTT 1914 het 1532 hom 17 7 5 5 AGG 1 0 43378 CASAVA_Build 1 67832104 2D TGACTCCTCC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 AG 7 6 43379 CASAVA_Build 1 67836957 1I TTTCAGAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 10 11 43380 CASAVA_Build 1 67839078 8D GGCTGGTCTC GAACTCTT/-------- GACCTCAGGT 2526 het 2526 ref 21 10 9 3 GAACTCTT 1 0 43381 CASAVA_Build 1 67841706 1D ATCAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 10 9 43382 CASAVA_Build 1 67868084 1I TCTCTTGCAC -/T TTTTTTTTTT 2658 het 2658 ref 41 16 8 17 T 15 16 43383 CASAVA_Build 1 67873361 1I TGCAGTAGCC -/A AAAAAAAAAA 422 het 422 ref 37 28 2 7 A 11 12 43384 CASAVA_Build 1 67883915 1I AGTTGGTTAG -/T TCAAAATGGA 3070 hom 109 het 41 0 35 6 T 1 2 43385 CASAVA_Build 1 67884188 1I TAAAAAAAAA -/T AAAAAAAGAA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 0 1 43386 CASAVA_Build 1 67898245 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 A 8 7 43387 CASAVA_Build 1 67929787 1D TAAGCACATT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 8 7 43388 CASAVA_Build 1 67931042 1I TCAGAATTTA -/T TTTTTCCTGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 5 6 43389 CASAVA_Build 1 67934151 1I AACTACCCTT -/C CCCCCCATAT 3070 hom 26 het 11 0 9 2 C 6 7 43390 CASAVA_Build 1 67944928 4D CTTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 23 0 13 12 T 16 12 43391 CASAVA_Build 1 67957554 4D TCCAAGGACG GTCT/---- GTCTCCCTAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 GTCT 2 1 43392 CASAVA_Build 1 67970768 1D TACTGCAAAG A/- AAGGGGCTCT 3070 het 3070 ref 37 20 11 8 A 3 2 43393 CASAVA_Build 1 67991625 1I CCAAAACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 12 13 43394 CASAVA_Build 1 68004656 1I CAAAGGGGTC -/T TTTCCGCGCT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 3 4 43395 CASAVA_Build 1 68022789 1I AATTTCTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1892 hom 13 4 8 1 A 9 10 43396 CASAVA_Build 1 68023093 3D TTGTATAAAC TTA/--- CTCAAGAGCT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TTA 1 0 43397 CASAVA_Build 1 68023400 1I TGGATTATTA -/T TCACAGCACC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 2 43398 CASAVA_Build 1 68028882 1D AGTTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 32 3 15 14 T 17 16 43399 CASAVA_Build 1 68029451 1I ATTGTGGATA -/C TGATGATGTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 0 1 43400 CASAVA_Build 1 68041495 4D TTTAATTTAA AGTT/---- AGTTGGTTGG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AGTT 2 1 43401 CASAVA_Build 1 68051443 4I GCTCTTGGAC ----/TTCA TTATTTCCCG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 TTCA 0 1 43402 CASAVA_Build 1 68056422 1D CAGACTGGTA G/- GAATTTACTA 3070 hom 99 het 35 0 33 4 G 2 1 43403 CASAVA_Build 1 68058359 1I TTGCTGAATT -/A AAAAAAAAAA 1322 het 16 hom 17 1 5 11 A 15 16 43404 CASAVA_Build 1 68060043 1I AATCAGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1303 hom 44 5 31 8 T 11 12 43405 CASAVA_Build 1 68060338 1I TGATGAGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 26 1 20 5 A 10 11 43406 CASAVA_Build 1 68065970 1I TGCTGGGATT -/C ACAGGCGTGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 0 1 43407 CASAVA_Build 1 68074400 1D32M1D TGGTTTCTTA TTTTTTTTTTTCTTTCTCTAGCCTTCTTTTAACT/-TTTTTTTTTTCTTTCTCTAGCCTTCTTTTAAC- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 31 0 34 4 N/A 0 0 43408 CASAVA_Build 1 68080505 12D GATGGTTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTCAAG 3070 hom 96 het 34 0 33 4 T 18 6 43409 CASAVA_Build 1 68081904 1D CCTGGTTGTT A/- AAAAGAGCCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 4 43410 CASAVA_Build 1 68082441 1D TTTAATGGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 9 8 43411 CASAVA_Build 1 68082705 14I CATTTTCTTC --------------/CTTTCTCTCTTTTT CTTTCTCTCT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 CTTTCTCTCTTTTT 0 1 43412 CASAVA_Build 1 68083935 1D TCAAAACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 17 0 13 4 T 13 12 43413 CASAVA_Build 1 68087555 1D AAAAAAAAAA C/- CCCTGTATAT 3070 het 684 hom 32 2 27 4 C 4 3 43414 CASAVA_Build 1 68099011 1D AAGATTATTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 8 7 43415 CASAVA_Build 1 68109798 2I CCTTTTCCTT --/CA CACACACACA 3070 hom 26 het 47 1 32 14 CA 6 7 43416 CASAVA_Build 1 68112447 4D AGGAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 113 het 51 0 38 14 AAAC 5 4 43417 CASAVA_Build 1 68118055 4I TCCTTCTCTC ----/TTCT TTCTGTCTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTCT 1 2 43418 CASAVA_Build 1 68181167 3D ATTTTGCTTA TTG/--- TTGTATCCCT 3070 hom 105 het 39 0 36 5 TTG 2 1 43419 CASAVA_Build 1 68182606 1D GCTAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 9 43420 CASAVA_Build 1 68196566 1I TCTCTAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 782 hom 21 3 14 4 T 14 15 43421 CASAVA_Build 1 68200991 1I TTGTGAATGC -/T TTGCTCATGA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 T 2 3 43422 CASAVA_Build 1 68201360 1D GAAGTGGATC T/- TTTCCTGCTC 3070 hom 129 het 46 0 44 3 T 4 3 43423 CASAVA_Build 1 68203614 1D GGTTCCTTTT C/- CCCTTCTCCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 4 3 43424 CASAVA_Build 1 68209153 1I TTTTTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 858 hom 31 2 22 7 T 12 13 43425 CASAVA_Build 1 68235312 2I TGTCTAAGTC --/TT TGTGTGATAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 3 43426 CASAVA_Build 1 68235399 1D ATGTTTAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 9 8 43427 CASAVA_Build 1 68237507 1I CAGGAAGGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 7 8 43428 CASAVA_Build 1 68239080 1I GTGTAGCTCC -/T CTCTCTCCCT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 0 1 43429 CASAVA_Build 1 68248815 1I CATTACATCC -/T GTCTACCGAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 0 1 43430 CASAVA_Build 1 68254521 1I GCAGCGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1210 hom 46 3 37 6 T 10 11 43431 CASAVA_Build 1 68259482 1I CTATGTGCTA -/G TGGTGTGCTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 43432 CASAVA_Build 1 68269141 3D TCAAGTTTCA TTC/--- TTCTATGTGT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TTC 2 1 43433 CASAVA_Build 1 68274373 1D AAAAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 2184 het 1917 hom 17 7 8 3 A 12 11 43434 CASAVA_Build 1 68274623 6D TAAAGAATGA AAACAG/------ AAACAGAACC 3070 het 3070 ref 31 16 11 6 AAACAG 2 1 43435 CASAVA_Build 1 68274905 1D GCTAAAATTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 8 7 43436 CASAVA_Build 1 68275297 1D TATGCTGAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 19 21 3 A 10 9 43437 CASAVA_Build 1 68283757 3D CTCCCAATTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1143 hom 22 4 9 10 A 17 14 43438 CASAVA_Build 1 68309451 2D TCTATGAAAC AT/-- AAAATTTGTG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 AT 1 0 43439 CASAVA_Build 1 68314780 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 T 11 10 43440 CASAVA_Build 1 68315760 1D TATGTTTCCA G/- GGGGGATTAT 3070 het 2941 hom 21 8 13 0 G 6 5 43441 CASAVA_Build 1 68324349 1I CATTTATAGA -/T TACAAGTATT 3070 het 3070 hom 74 36 34 4 T 1 2 43442 CASAVA_Build 1 68325415 1I CACTTAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 13 14 43443 CASAVA_Build 1 68328722 2D ATTTGATTCT TC/-- TCTTTTCTTC 2144 het 2144 ref 16 11 5 0 TC 2 1 43444 CASAVA_Build 1 68329621 4D TCTTTTGATC TTTG/---- TTTGTTTGAA 2934 het 2934 ref 16 10 6 0 TTTG 3 2 43445 CASAVA_Build 1 68342465 1I TTTGTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 10 11 43446 CASAVA_Build 1 68342783 3D TCATATGATC CCT/--- CCTAAGCCCA 3070 het 3070 ref 41 24 12 6 CCT 2 1 43447 CASAVA_Build 1 68343733 1D AACCAAGGTG C/- CACCTCATTG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 2 1 43448 CASAVA_Build 1 68344988 20D TGTTTGTCAC TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/-------------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 24 20 13 TG 17 7 43449 CASAVA_Build 1 68345569 1D AATAGCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 12 11 43450 CASAVA_Build 1 68347470 4D CTAACAAGAT AGAG/---- AGATTAAGCC 3070 het 3070 ref 44 21 16 9 AG 3 1 43451 CASAVA_Build 1 68348732 3D TTCAGTGACA TAT/--- TATTATTGCA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TAT 3 2 43452 CASAVA_Build 1 68354044 3D TATGTTTTTC TCT/--- TCTTATAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TCT 2 1 43453 CASAVA_Build 1 68356244 1I AATTGATGAG -/A AAAAAAAAAA 1953 het 1953 ref 23 13 6 4 A 10 11 43454 CASAVA_Build 1 68360837 1D AACTTTCTTA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 6 5 43455 CASAVA_Build 1 68362261 1I CTTAGAAAAC -/T TTTAAGTAGT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 3 4 43456 CASAVA_Build 1 68362818 1D GAGAAACGTT C/- CCTCTATCTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 C 3 2 43457 CASAVA_Build 1 68365839 4D CACGCTCAGT CTGA/---- CTGTGTGTGG 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 CTGA 1 0 43458 CASAVA_Build 1 68367595 4I CTCAAAAACT ----/AAAC AAACAAAACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAC 1 2 43459 CASAVA_Build 1 68375552 1I GACAGGAAGA -/T ACTGGGGACA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 T 0 1 43460 CASAVA_Build 1 68399695 1D GCAACATTGT A/- GAGCAGGGTG 3070 het 3070 ref 78 34 34 10 A 1 0 43461 CASAVA_Build 1 68399966 1I9M7D90M1D TTAGTTCATC -ATTTTTCACTATCTCTTGGTCCCAAATGTATCTGAATGATTACCTTCCGGCATTCTCTGCTATTGCTCGTTGGAGTGCTCTCGATTGTCCCCGTGTTTTGTGGGCTG/TATTTTTCAC-------TGTTCCCAAGTATATCTGAATAATTACCTTCCGGCATTCTCTGCTATTGCTCGTTGGGATGCTCTCGACTGTCCCCGTGTTTTGTGGGCT- GTTGGGAGAG 3070 het 3070 ref 74 74 20 46 N/A 0 0 43462 CASAVA_Build 1 68401482 19D TCTGTACACA CTATAAATCTGTACACTAT/------------------- AAATCTATAG 3070 het 3070 ref 54 36 18 12 CTATAAATCTGTACACTAT 1 0 43463 CASAVA_Build 1 68418297 1D TGCTGAGGGA G/- GGGGAAGTTA 3070 hom 109 het 49 0 41 8 G 5 4 43464 CASAVA_Build 1 68429330 2D ACTCAGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 31 2 20 12 A 18 16 43465 CASAVA_Build 1 68437344 2I TTAGAGAGAG --/AC ACAAGACTTG 3070 het 3070 hom 51 18 28 5 AC 1 2 43466 CASAVA_Build 1 68452642 1D AACTTACTCC T/- TTTTTTTTTT 2822 het 864 hom 26 2 11 13 T 12 11 43467 CASAVA_Build 1 68454928 1I AGACAATAAT -/G GGGGGAGATG 3070 hom 108 het 41 0 35 6 G 5 6 43468 CASAVA_Build 1 68456509 1D AAATGGTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 T 9 8 43469 CASAVA_Build 1 68492601 1I CTTAACCATA -/T TAATATTTTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 1 2 43470 CASAVA_Build 1 68495724 1I TACATATCTT -/G GGGGTACATG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 4 5 43471 CASAVA_Build 1 68497438 1D TTTTATTTTA T/- TTTATTTATT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 4 3 43472 CASAVA_Build 1 68504178 2D ATTGCTTAAT TA/-- TATAAGCTCC 3070 hom 114 het 46 0 39 8 TA 3 2 43473 CASAVA_Build 1 68513575 2D CAACAATGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 30 1 22 8 A 14 12 43474 CASAVA_Build 1 68521260 1I AAGTTTAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 11 12 43475 CASAVA_Build 1 68524431 1I TGATTTATTC -/T TTTTAAAATA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 4 5 43476 CASAVA_Build 1 68539538 1D ATGGATGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 109 het 41 0 36 5 T 10 9 43477 CASAVA_Build 1 68560489 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 8 9 43478 CASAVA_Build 1 68569438 1D AAGGGTTCCA C/- CCACTCCATG 3070 hom 135 het 51 0 46 6 C 3 2 43479 CASAVA_Build 1 68572724 1D AAGGACATGA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 74 het 27 0 24 3 T 8 7 43480 CASAVA_Build 1 68581513 1D GTGAAGATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 12 11 43481 CASAVA_Build 1 68584897 1D AAATATAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 32 0 26 6 A 12 11 43482 CASAVA_Build 1 68592247 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 9 8 43483 CASAVA_Build 1 68594940 1D ACTGTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 31 0 18 14 A 12 11 43484 CASAVA_Build 1 68602507 10I TAAAGGTCTC ----------/AGGAAGACAG AGGAAGACAG 3070 hom 129 het 51 0 41 10 AGGAAGACAG 1 2 43485 CASAVA_Build 1 68609321 5D GTACAGTAAT TAAAA/----- TAAGAAATTC 3070 hom 78 het 29 0 27 4 TAAAA 1 0 43486 CASAVA_Build 1 68630129 2I TCCCAAATCC --/TA TATAAGATGG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TA 2 3 43487 CASAVA_Build 1 68632209 1D GTTACTATCC T/- TGTCAAAACC 3070 hom 119 het 43 0 40 4 T 2 1 43488 CASAVA_Build 1 68663548 1D CAGAATTAGG A/- AATTCCCTTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 A 3 2 43489 CASAVA_Build 1 68673446 22D TTTCTGGTGG CTCTTGTTTCTTTTTCTGGCTT/---------------------- CTCTTGTTTC 3070 hom 68 het 30 0 22 14 CTCTTGTTTCTTTTTCTGGCTT 2 1 43490 CASAVA_Build 1 68697212 3D ACAGGAGAAG AGA/--- AGGAGAAAAG 3070 hom 114 het 41 0 39 3 AGA 1 0 43491 CASAVA_Build 1 68707640 1I TTTCTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 10 11 43492 CASAVA_Build 1 68709327 1D TACCATGAAA T/- TTTTTTTTTT 1372 het 1372 ref 35 15 6 14 T 19 18 43493 CASAVA_Build 1 68719907 1I ATACCCCCCC -/A AAAAATCATC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 5 6 43494 CASAVA_Build 1 68758532 1I TCTTCAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 T 11 12 43495 CASAVA_Build 1 68759004 1D CCTCATTAGT C/- CTCTTACTGT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 C 2 1 43496 CASAVA_Build 1 68765446 1D AGTGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1266 het 720 hom 19 5 7 7 T 19 18 43497 CASAVA_Build 1 68769397 1D ATGTAAAAGC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 72 het 27 0 24 4 A 8 7 43498 CASAVA_Build 1 68771600 1D ATAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1474 hom 33 5 25 3 A 13 12 43499 CASAVA_Build 1 68781920 1D CCTTGTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 T 10 9 43500 CASAVA_Build 1 68786954 3I AAAACAAACA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 AAC 3 4 43501 CASAVA_Build 1 68788383 1D AACAAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 11 10 43502 CASAVA_Build 1 68853486 1D ATTTTATTAG A/- AAAAAAAAAG 980 het 980 ref 39 33 3 3 A 10 9 43503 CASAVA_Build 1 68899632 1I AGCTCCGCCT -/C CTGGGTTCAC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 43504 CASAVA_Build 1 68915479 1D GAATGCTTTC A/- AAAAATTTCA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 6 5 43505 CASAVA_Build 1 68940266 1I CTCATCACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 27 10 8 T 10 11 43506 CASAVA_Build 1 68992920 2I AAGCAGAAAG --/AC AGAAAAAGAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AC 0 1 43507 CASAVA_Build 1 68998287 1I ACTTAAAGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 43508 CASAVA_Build 1 69013941 1I TGAGCGATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 9 10 43509 CASAVA_Build 1 69015884 4D GGTTCAAAAG AAGA/---- AAGGAAGCAA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AAGA 1 0 43510 CASAVA_Build 1 69021425 1D TTCTCAAAGA T/- TTTAGCTTCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 4 3 43511 CASAVA_Build 1 69021532 1D CTTTTCAGTC T/- TTTGAAATCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 4 3 43512 CASAVA_Build 1 69040978 4D CCACAGACAT CTCA/---- CTCACTAAGT 3070 hom 126 het 48 0 43 6 CTCA 2 1 43513 CASAVA_Build 1 69042764 2D AGAGGAGCGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 40 2 26 12 A 14 12 43514 CASAVA_Build 1 69047211 11D AGAAGCTAGC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 25 3 15 11 T 25 14 43515 CASAVA_Build 1 69053039 4D TCTGTGAATA TTTG/---- TTAACAGAAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 TTTG 1 0 43516 CASAVA_Build 1 69062979 1D GTTATGAATT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 7 43517 CASAVA_Build 1 69080409 1I TTTTTGTTGG -/T TTTTTTTTTT 1931 het 1931 ref 21 11 4 6 T 10 11 43518 CASAVA_Build 1 69089395 6D ATTATGTGTG TGTGTA/------ TATATATATA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TGTGTA 1 0 43519 CASAVA_Build 1 69098833 2D TGGATTAAAC AT/-- GTGTATTATA 3070 hom 69 het 31 0 23 8 AT 1 0 43520 CASAVA_Build 1 69103247 21D TATTATAGAT TTTATTTTATTTTGTTTTGAC/--------------------- TCATTAGTGA 3070 hom 96 het 30 0 33 3 TTTATTTTATTTTGTTTTGAC 1 0 43521 CASAVA_Build 1 69136652 4I ACATATATAT ----/GTAC ATACACACAC 3000 het 680 hom 12 2 7 3 GTAC 0 1 43522 CASAVA_Build 1 69179326 1D TACTGGCTTC A/- AAAAAAAAAA 1535 het 1535 ref 44 24 5 15 A 13 12 43523 CASAVA_Build 1 69182699 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 708 hom 32 3 24 5 A 13 14 43524 CASAVA_Build 1 69197474 1D GTTGGAGAGA G/- GCATCTTATT 3070 hom 135 het 48 0 46 3 G 2 1 43525 CASAVA_Build 1 69206891 1D AAGTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1543 hom 26 7 13 6 A 12 11 43526 CASAVA_Build 1 69218611 1I GTCAGACACA -/C CCAGGTTTCA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 C 2 3 43527 CASAVA_Build 1 69250827 1I TGTACTCTAC -/A GTTGTGAAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 0 1 43528 CASAVA_Build 1 69252233 7D TTTTTATACC TTTATTG/------- TTAATTGAAT 3070 het 3070 hom 24 12 13 5 TTTATTG 1 0 43529 CASAVA_Build 1 69288531 1D TAATGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 22 1 14 7 T 13 12 43530 CASAVA_Build 1 69294064 10I GAAAGACTGC ----------/TACATTGTGG TACATTGTGG 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 TACATTGTGG 1 2 43531 CASAVA_Build 1 69296155 1I TCTGGGTATG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 9 43532 CASAVA_Build 1 69297082 1D AAAGAACAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 10 9 43533 CASAVA_Build 1 69343230 2D TTCCTTTACC AA/-- AACAGTTTGC 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 A 4 2 43534 CASAVA_Build 1 69365441 1D AAAATTGGAA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 1094 hom 31 4 17 10 T 2 1 43535 CASAVA_Build 1 69375117 1I CATCACACAT -/A AAAAAAGCAG 3070 hom 72 het 35 0 25 10 A 6 7 43536 CASAVA_Build 1 69385737 1I AAAGCAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 49 1 39 9 T 10 11 43537 CASAVA_Build 1 69390178 1D TAATAATAAT G/- GGTACCCATT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 G 3 2 43538 CASAVA_Build 1 69419788 1I AATTTCCATG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 A 7 8 43539 CASAVA_Build 1 69429892 3I TTGGAAGGTA ---/AAT AATGAGTCCA 3070 het 3070 hom 56 24 24 8 AAT 1 2 43540 CASAVA_Build 1 69449277 1D TTTCTCAATA T/- TTTTTTTTTT 1860 het 1860 ref 25 18 5 2 T 12 11 43541 CASAVA_Build 1 69465394 3D TTCTTACACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 10 T 13 10 43542 CASAVA_Build 1 69465764 1D CTATAATTCT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 A 8 7 43543 CASAVA_Build 1 69474760 1I TCAGAGAATG -/T TAAGTGAGTT 3070 het 3070 hom 52 19 28 5 T 1 2 43544 CASAVA_Build 1 69476721 3I TGGAAGCAAC ---/AGG AGAAGTTGTG 3070 hom 74 het 44 1 36 7 AGG 0 1 43545 CASAVA_Build 1 69476980 3I TTTAAATTTT ---/TTA TTATTATTAT 1696 het 1696 ref 18 5 7 6 TTA 5 6 43546 CASAVA_Build 1 69480266 1I ATATCAGTAA -/T TTTTTTTTTT 2956 het 2956 ref 37 17 9 11 T 11 12 43547 CASAVA_Build 1 69480582 1I ATTTTAACAC -/A AAAACCACAA 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 A 4 5 43548 CASAVA_Build 1 69482851 4I TAAGAGCTAA ----/TTGT TTAAGTCATT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 TTGT 0 1 43549 CASAVA_Build 1 69486547 1I37M2D TACATGACTA -TTTTTATATATAGGAAAGAAAAACTAAATCTGACCCCCT/TTTTTTATATATAGGAAAGAAAAACTAAATCTGACCCC-- GTTTTAACTT 3070 het 3070 ref 39 28 27 3 N/A 0 0 43550 CASAVA_Build 1 69499702 5D TCTTATATCA ATTTG/----- ATTTGAAAGA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 ATTTG 2 1 43551 CASAVA_Build 1 69499812 3D TTCACTCTAG GAA/--- GAAGCACTGT 3070 het 3070 ref 45 24 20 1 GAA 2 1 43552 CASAVA_Build 1 69502924 2I TCTTTTGTTT --/AA AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 8 10 43553 CASAVA_Build 1 69508976 1I TTTTGATATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 673 hom 34 2 30 2 A 9 10 43554 CASAVA_Build 1 69517501 1D ACAGGCCAGT G/- GTCTTTGCCT 3070 hom 99 het 41 0 32 10 G 2 1 43555 CASAVA_Build 1 69519850 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 11 10 43556 CASAVA_Build 1 69522140 1I TGTGGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 10 11 43557 CASAVA_Build 1 69528900 11I ACAGATTGGT -----------/TAGTTAATTGG TACTCTACTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TAGTTAATTGG 0 1 43558 CASAVA_Build 1 69531766 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 23 1 14 8 T 15 16 43559 CASAVA_Build 1 69534905 23D ATGTAGAAAA TTTTAAAATTTTCTACAGTGATT/----------------------- TTGTATCCTG 3070 hom 45 het 18 0 16 5 TTTTAAAATTTTCTACAGTGATT 1 0 43560 CASAVA_Build 1 69537624 1D GTTCAGAATG T/- TTAGATAGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 3 2 43561 CASAVA_Build 1 69542991 4I AAAATTACTC ----/TGTT TGTTATGTTG 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TGTT 1 2 43562 CASAVA_Build 1 69548593 1I TCTTTTCTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 8 9 43563 CASAVA_Build 1 69552188 1I ATATTCCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 16 16 16 T 12 13 43564 CASAVA_Build 1 69560617 1D GGGTGAGTTC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 T 8 7 43565 CASAVA_Build 1 69562815 1D AACTAATGTA T/- TTTTAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 5 4 43566 CASAVA_Build 1 69566906 1I CCTAGGTATC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 7 8 43567 CASAVA_Build 1 69568120 1D TTTTATTTTA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 3 2 43568 CASAVA_Build 1 69586438 4D ACTTTTAGTA AACC/---- AACACTACAA 3070 het 3070 ref 37 18 17 4 AACC 1 0 43569 CASAVA_Build 1 69589325 5D ATATCCAAAC TTTAA/----- TTTAATTAAT 3070 het 3070 hom 36 16 19 4 TTTAA 2 1 43570 CASAVA_Build 1 69625291 1D ACTTTCCTAG A/- AGCATAAGAG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 2 1 43571 CASAVA_Build 1 69630628 3D AGTCTTGCTA GCG/--- GCGGTCTATC 3070 het 3070 ref 30 20 9 2 GCG 2 1 43572 CASAVA_Build 1 69656053 1D TGGAAGAATA T/- TTATTAAGCA 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 T 3 2 43573 CASAVA_Build 1 69657442 1I GAAACACAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 2233 hom 20 6 11 3 A 7 8 43574 CASAVA_Build 1 69657748 1D TTCAAGTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 48 17 23 9 T 10 9 43575 CASAVA_Build 1 69659504 2D TCAAAAAGCC TT/-- TTTTGCTGAA 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 T 6 4 43576 CASAVA_Build 1 69668165 2D TTTCATATTC AA/-- AAAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 A 5 3 43577 CASAVA_Build 1 69668906 1D GAAGGGGATG A/- AAAAAAAAAA 1257 het 1257 ref 34 22 5 7 A 13 12 43578 CASAVA_Build 1 69669499 8D TTTCATAATT TCTGAGGG/-------- TCAGCAGTCT 3070 het 3070 ref 41 18 17 9 TCTGAGGG 1 0 43579 CASAVA_Build 1 69688514 3I ACTAAGTATA ---/AAC AACACATGTA 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 AAC 1 2 43580 CASAVA_Build 1 69695886 1D ATTTTATTTG T/- TTTTACAAAC 3070 het 3070 hom 26 9 16 3 T 5 4 43581 CASAVA_Build 1 69699162 1D AGTATTTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 10 9 43582 CASAVA_Build 1 69703519 37I AGGATCATGT -------------------------------------/CATCTACAAAAAAAGACAATTTGACTTCCTCTCTTCC TATTTGAATG 3070 hom 54 het 14 0 19 0 CATCTACAAAAAAAGACAATTTGACTTCCTCTCTTCC 0 1 43583 CASAVA_Build 1 69712505 3I CATTTTTTTC ---/CTT CTGTGTGGTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CTT 0 1 43584 CASAVA_Build 1 69716182 1D TAAAATGTCC T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 7 6 43585 CASAVA_Build 1 69717297 1I ATCTTAGTTA -/T TTTTTAACAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 5 6 43586 CASAVA_Build 1 69719673 1I TAATTCTATC -/T TGTATTGTAA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 1 2 43587 CASAVA_Build 1 69727028 2D AAGTGAAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 24 0 15 9 A 16 14 43588 CASAVA_Build 1 69738118 1D GAATTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 36 2 24 10 T 15 14 43589 CASAVA_Build 1 69746722 1D AAAAAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 32 1 28 3 A 12 11 43590 CASAVA_Build 1 69748761 1I AATAAATGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 505 hom 32 2 25 5 A 9 10 43591 CASAVA_Build 1 69752475 1D ATGTTCTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 10 9 43592 CASAVA_Build 1 69782537 1D ATATTTATTT A/- AAAATATATT 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 5 4 43593 CASAVA_Build 1 69814340 1I TTGTATCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 35 2 21 12 T 12 13 43594 CASAVA_Build 1 69814499 1I TGACACTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 38 2 29 7 A 12 13 43595 CASAVA_Build 1 69818066 7D GAATAGAAGC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 28 0 17 15 T 19 12 43596 CASAVA_Build 1 69833284 1D AAAATGATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3030 hom 32 8 17 7 T 12 11 43597 CASAVA_Build 1 69839066 1D AAGGATCTCT G/- GTTTCTTTTT 1663 hom 15 het 21 1 15 5 G 2 1 43598 CASAVA_Build 1 69858541 1D ACTATTTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 10 9 43599 CASAVA_Build 1 69861707 1I TGCTATGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 38 1 28 9 A 10 11 43600 CASAVA_Build 1 69864298 4I TTTCTCACTA ----/TGAT TGTAAATGAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TGAT 0 1 43601 CASAVA_Build 1 69874696 4D CCAGGCACAG ACAC/---- ACACACACAC 943 het 164 hom 31 4 2 27 AC 10 8 43602 CASAVA_Build 1 69882512 2D TTCAATTTCC AA/-- GAGAGAGATA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 2 0 43603 CASAVA_Build 1 69883433 1D AAGTAAAATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 9 43604 CASAVA_Build 1 69888999 3I TAAACAAAAT ---/ATA ATGTTGTGCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATA 0 1 43605 CASAVA_Build 1 69890525 5I GAAAACCCTA -----/AAGAT TTCACAAACT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AAGAT 0 1 43606 CASAVA_Build 1 69891555 1I ATTTAAAAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 43607 CASAVA_Build 1 69898035 1I ATAATCAAAA -/G GCACTACATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 2 43608 CASAVA_Build 1 69918935 1D ATTCCATGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 10 9 43609 CASAVA_Build 1 69925938 2I GATGCCTCTC --/TA TTGAGTTTTT 3070 hom 99 het 34 0 33 1 TA 0 1 43610 CASAVA_Build 1 69926917 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 743 hom 32 3 22 7 A 8 9 43611 CASAVA_Build 1 69927729 1I TTTTAAAATA -/T AAAATATCAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 0 1 43612 CASAVA_Build 1 69931894 3I TACTCTAAAT ---/CCA CCAATTTAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CCA 1 2 43613 CASAVA_Build 1 69933010 1D GGTACCCCTA C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 60 het 28 0 21 8 C 9 8 43614 CASAVA_Build 1 69936604 1I CTTAATTTAG -/T TTTCAACCCC 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 3 4 43615 CASAVA_Build 1 69951593 1I TTGGTCTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 9 10 43616 CASAVA_Build 1 69955350 1D ATATACATAC T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 T 8 7 43617 CASAVA_Build 1 69958891 4I TATCCTGGAA ----/ATAC ACTTTCTGTG 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 ATAC 0 1 43618 CASAVA_Build 1 69959728 5D TTGGAATGAA ACAGT/----- GTGTAGTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 ACAGT 1 0 43619 CASAVA_Build 1 69972400 4D TTTTATATTA GTTT/---- GTTTATCTTA 3070 het 3070 hom 35 11 21 4 GTTT 2 1 43620 CASAVA_Build 1 69980722 2D TTATATAATC AT/-- ATATTTTATA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 AT 3 2 43621 CASAVA_Build 1 69984039 5D GTGCAACCTT AAATG/----- AATGACAGGA 3070 het 3070 ref 35 25 8 3 AAATG 1 0 43622 CASAVA_Build 1 69988606 4D TTACTAACAC AAAG/---- AAATGATAAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 AAAG 1 0 43623 CASAVA_Build 1 70018917 1I CTTTTCTAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 8 9 43624 CASAVA_Build 1 70022025 12D TCCCCATCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2152 het 2152 ref 14 6 5 3 A 24 12 43625 CASAVA_Build 1 70027641 2D GAGTTTACCA TG/-- TGACCACTAA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 TG 2 1 43626 CASAVA_Build 1 70067883 4I ATAAGCAATT ----/AATG AAAGTATTTA 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 AATG 0 1 43627 CASAVA_Build 1 70071377 1I ACTCTATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2129 hom 29 9 13 7 A 10 11 43628 CASAVA_Build 1 70076131 1D TAACAATAGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 22 8 9 7 A 9 8 43629 CASAVA_Build 1 70098908 1I AGGTTTTTTT -/C GTTCTAGAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 C 0 1 43630 CASAVA_Build 1 70104999 3I TTAATTCATT ---/TTG AGCACTGAAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TTG 0 1 43631 CASAVA_Build 1 70107194 2I ACATATGTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 AT 8 9 43632 CASAVA_Build 1 70119993 1I TACAAAAAAA -/T AAAACAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 0 1 43633 CASAVA_Build 1 70130116 1D ATGCTGTTGG A/- AAAATGGTGC 3070 het 3070 hom 38 15 16 8 A 5 4 43634 CASAVA_Build 1 70130252 3D ACAAAAAAAG AAA/--- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 53 29 23 1 A 9 6 43635 CASAVA_Build 1 70131528 1I CCAACCTTTT -/A AAAATCAAGG 3070 het 3070 hom 44 12 21 11 A 4 5 43636 CASAVA_Build 1 70132091 1D AAAACCAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 10 9 43637 CASAVA_Build 1 70139731 1I CTTTTCTTAT -/G GGGGAAGTGG 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 G 4 5 43638 CASAVA_Build 1 70140850 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 A 10 9 43639 CASAVA_Build 1 70142842 4D TTTAGTATTT CGAG/---- TAACATAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 15 1 CGAG 1 0 43640 CASAVA_Build 1 70151713 6I CACTAGGTAT ------/TTAATG TTAATGTTTC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 TTAATG 1 2 43641 CASAVA_Build 1 70159470 1D AAACTCCAAG T/- TAAGTCATGC 3070 het 3070 ref 34 23 8 3 T 2 1 43642 CASAVA_Build 1 70168341 4D TTATATGAAT TCTC/---- TCTATCTACC 3070 het 3070 hom 33 13 15 7 TC 3 1 43643 CASAVA_Build 1 70187838 2D AAAGAAAAAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 38 18 16 5 AG 7 6 43644 CASAVA_Build 1 70188254 1I GGCCTCTTTA -/T TTTTTTTTCC 2857 het 2857 ref 34 16 8 10 T 8 9 43645 CASAVA_Build 1 70217204 1D TTTCAGTTAG A/- AAAAAAAAAA 1976 het 1976 ref 34 14 9 12 A 19 18 43646 CASAVA_Build 1 70229427 1D ACCTTTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 287 hom 30 2 22 8 A 15 14 43647 CASAVA_Build 1 70236879 1I GTCAATACTC -/A GGGGAAACTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 0 1 43648 CASAVA_Build 1 70287773 1D TTCTGCTGCA T/- TTATTATTGG 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 T 3 2 43649 CASAVA_Build 1 70296284 1I AGACTCACAA -/T TTTTTTTTTT 1285 het 1244 hom 24 6 5 13 T 17 18 43650 CASAVA_Build 1 70354818 1D ACTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 1463 het 398 hom 9 2 4 3 A 19 18 43651 CASAVA_Build 1 70355954 1I TAATTACATA -/T TTTTTTAAGG 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 6 7 43652 CASAVA_Build 1 70366676 1D TTTGTGCTTA T/- TTTTTTTCCT 2947 het 2947 ref 23 10 7 6 T 8 7 43653 CASAVA_Build 1 70385241 1D AAATTATATC T/- TCAAATATTT 2631 het 2631 ref 26 17 6 3 T 2 1 43654 CASAVA_Build 1 70459119 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 10 9 43655 CASAVA_Build 1 70490862 2I TCAAAAAGAA --/TT TTGTCTATAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 4 43656 CASAVA_Build 1 70521236 4D TAACTTTTCC AAGT/---- AAGTTTCTAC 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 AAGT 2 1 43657 CASAVA_Build 1 70536187 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 15 14 43658 CASAVA_Build 1 70554792 1D CATCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 1742 het 1742 ref 28 13 5 10 A 17 16 43659 CASAVA_Build 1 70555332 1D TTGGACTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 12 11 43660 CASAVA_Build 1 70564929 5I TACATGAATG -----/TTTAT TTTAATGTTG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 TTTAT 0 1 43661 CASAVA_Build 1 70565282 1I TAATACCCCA -/T GTAATAACTG 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 T 0 1 43662 CASAVA_Build 1 70593920 6D CTCTCTCTTT TTTTTG/------ TTTTTTTGTT 375 het 375 ref 48 28 6 14 TTTTTG 1 0 43663 CASAVA_Build 1 70602054 16I CAAATATGAG ----------------/TGACCATGGCCTGTGA GACAGCCCTC 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 TGACCATGGCCTGTGA 0 1 43664 CASAVA_Build 1 70603897 2D CCTGGGTAAC AA/-- GAGTGAAATT 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 A 2 0 43665 CASAVA_Build 1 70608114 1D ACTCCTTCCC A/- GATCTTCTTG 3070 het 3070 ref 28 12 10 7 A 1 0 43666 CASAVA_Build 1 70619110 4D AAAAGATGAT AAAA/---- AGAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 A 5 1 43667 CASAVA_Build 1 70630183 1I GAGCTACAGG -/T ATAAGCCACC 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 T 0 1 43668 CASAVA_Build 1 70635568 4I CGACATGATG ----/AGAT AGATACCATC 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 AGAT 1 2 43669 CASAVA_Build 1 70643537 1D TCATGTCACA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 118 het 46 0 40 7 T 9 8 43670 CASAVA_Build 1 70653095 1I AATAATGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 10 16 T 11 12 43671 CASAVA_Build 1 70657972 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 8 7 43672 CASAVA_Build 1 70668820 1I TATTTATTAA -/T TTTTTTTTTT 2000 het 664 hom 14 2 6 6 T 11 12 43673 CASAVA_Build 1 70700807 1I ATTTCTAAGC -/A GCAAAGCATT 2989 het 2989 ref 23 13 8 2 A 0 1 43674 CASAVA_Build 1 70704979 1I AAACAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 A 10 11 43675 CASAVA_Build 1 70706252 1D CTGGGGGCCT G/- CATCATAGCT 3070 het 2685 hom 31 8 15 9 G 1 0 43676 CASAVA_Build 1 70708177 4I GAATTGCTTG ----/AACC AACCCGGGAG 1644 het 488 hom 6 1 4 1 AACC 1 2 43677 CASAVA_Build 1 70709134 4D CTCCAACTTG AAAA/---- AAAAAAAAAA 2036 het 2036 ref 29 17 5 7 A 18 14 43678 CASAVA_Build 1 70710406 4I AGAGAAGATC ----/CAAA CAAACCCAAT 3070 het 2864 hom 26 8 12 6 CAAA 1 2 43679 CASAVA_Build 1 70711560 1I AACACTGCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 30 12 5 A 9 10 43680 CASAVA_Build 1 70712070 5I TACAAAAATT -----/AACTC AGCATGGCTT 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 AACTC 0 1 43681 CASAVA_Build 1 70721190 1I TGAGACTGTA -/T TCAAAAAAAA 1164 het 1164 ref 11 4 3 4 T 1 2 43682 CASAVA_Build 1 70728981 1I GATGCAATAC -/A ATAACAGTAG 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 1 2 43683 CASAVA_Build 1 70735382 1I ATCTAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 10 11 43684 CASAVA_Build 1 70736112 2I TGGAGAAAAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 9 15 11 TG 7 8 43685 CASAVA_Build 1 70740238 1I CCACTCCATT -/A GTAGTAAGTT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 A 0 1 43686 CASAVA_Build 1 70749678 1I GCATATTTTG -/A AGAACCACAA 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 A 1 2 43687 CASAVA_Build 1 70760880 1I TCTCCCCCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 9 10 43688 CASAVA_Build 1 70761383 1D GCAAAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 98 het 37 0 33 4 T 14 13 43689 CASAVA_Build 1 70764906 3I ATATTTAAAA ---/AAG AACACAATTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAG 0 1 43690 CASAVA_Build 1 70769813 1D TTACGTATTT C/- AGAATTCTTA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 1 0 43691 CASAVA_Build 1 70770925 2D GCCTGAAGTT AC/-- ACAGAGAGCC 3070 het 3070 hom 46 18 23 7 AC 2 1 43692 CASAVA_Build 1 70773322 4D TCTTTCTCTC TCCT/---- TCCTTCCTTC 2528 het 2528 ref 38 16 10 14 TCCT 3 2 43693 CASAVA_Build 1 70774628 2D TTTTCTAAGA AT/-- ATTTTTATTT 3070 het 3070 hom 38 13 19 7 AT 2 1 43694 CASAVA_Build 1 70774899 1I CTTGATATTG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 6 7 43695 CASAVA_Build 1 70775003 4D TTATTCTATG TTCA/---- TTTTCATTTC 3070 het 3070 ref 42 21 19 5 TTCA 1 0 43696 CASAVA_Build 1 70776599 1D GCATGTGTTA T/- TTTTTTGACT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 7 6 43697 CASAVA_Build 1 70777280 1D TTCTAGTTAC T/- TTGATCTAAA 3070 het 3070 hom 50 20 22 9 T 3 2 43698 CASAVA_Build 1 70780255 3I CGACATTGGC ---/TTT TTTTTTTTTT 1595 het 1595 ref 49 12 14 23 T 12 15 43699 CASAVA_Build 1 70788553 1D AGAAAATAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 396 hom 40 1 36 4 T 10 9 43700 CASAVA_Build 1 70789541 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 2658 het 487 hom 10 2 8 1 ATA 6 5 43701 CASAVA_Build 1 70789676 6I AGTTTCTCTA ------/AATAGT AATAGTAACA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 AATAGT 1 2 43702 CASAVA_Build 1 70789847 1D ATAACTATAA T/- AAAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 5 T 1 0 43703 CASAVA_Build 1 70790425 2D TAAAAGTAAA CC/-- CCTCTACTTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 5 C 4 2 43704 CASAVA_Build 1 70812514 1D TGGAAGATTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 10 9 43705 CASAVA_Build 1 70818596 1I TTAAATTCTC -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 7 8 43706 CASAVA_Build 1 70841338 3D TACTTTCTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 38 4 12 23 T 15 12 43707 CASAVA_Build 1 70845999 14D ACAGGAAGGC TGTATTTTCCACTA/-------------- TCTATTGCAG 3070 het 3070 hom 26 15 13 4 TGTATTTTCCACTA 1 0 43708 CASAVA_Build 1 70847935 15I TTCAGCCTAC ---------------/CAAGTAGGTAAGACT ACTGCTGCAC 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 CAAGTAGGTAAGACT 0 1 43709 CASAVA_Build 1 70848187 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTATT 2896 het 2896 ref 22 7 10 5 T 8 7 43710 CASAVA_Build 1 70850518 2D TTTTTTTCTC TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 30 het 16 0 10 6 T 10 8 43711 CASAVA_Build 1 70853125 2I CTCATCATCA --/CT GGTCATTAGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CT 0 1 43712 CASAVA_Build 1 70854284 2D TAAAAAAGAG AA/-- AGACAGCAAG 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 3 1 43713 CASAVA_Build 1 70858252 1I GTTAGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 15 22 12 T 11 12 43714 CASAVA_Build 1 70870570 4D CCAACATTCA TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 hom 84 het 39 0 27 17 TTCT 3 2 43715 CASAVA_Build 1 70871754 1D AGTGTGTAAG A/- AAAATATCTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 4 43716 CASAVA_Build 1 70877380 2I TCAGTGTCAG --/TA TATGAGGCTA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TA 1 2 43717 CASAVA_Build 1 70877805 1I TAAAGTACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 10 11 43718 CASAVA_Build 1 70890620 2D CTATGAGCAA GT/-- GTGTTTATGA 3070 het 3070 ref 40 17 16 8 GT 3 2 43719 CASAVA_Build 1 70901985 1D CCCAGACAAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 4 A 7 6 43720 CASAVA_Build 1 70907381 1D TTTTATATTT G/- TTCCAAGTAG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 G 1 0 43721 CASAVA_Build 1 70913923 1D TCCTTCCAGG A/- TTTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 1 0 43722 CASAVA_Build 1 70944370 1D ATAAGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 13 12 43723 CASAVA_Build 1 70948345 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 14 0 11 3 A 17 16 43724 CASAVA_Build 1 70949861 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 840 hom 38 2 31 5 A 9 10 43725 CASAVA_Build 1 70950520 4D ATACTGTATT AGTC/---- AGGGTTCTCT 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 AGTC 1 0 43726 CASAVA_Build 1 70961106 2D CTGGTGTGAG AT/-- GGTCTCATTT 1682 het 1682 ref 29 21 4 5 AT 1 0 43727 CASAVA_Build 1 70961800 2I ATCCTTGTAG --/TA TATAGTTTGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TA 2 3 43728 CASAVA_Build 1 70972230 1D AACATATTTA T/- TTTTTACATA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 6 5 43729 CASAVA_Build 1 70993850 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2968 hom 25 10 10 6 A 11 10 43730 CASAVA_Build 1 70996659 5D CATTTTTAAT TATCA/----- TATGTAACAG 3070 het 3070 ref 35 21 14 0 TATCA 1 0 43731 CASAVA_Build 1 71003054 3I ACACCTCAGT ---/TAA GTCTTCAGTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TAA 0 1 43732 CASAVA_Build 1 71014220 1D AGACTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 A 13 12 43733 CASAVA_Build 1 71052141 1I GAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 8 9 43734 CASAVA_Build 1 71058153 1D ACTTAGTTGC T/- TTTTTTTTTT 1699 het 1699 ref 56 41 4 13 T 11 10 43735 CASAVA_Build 1 71088910 1D ACCTTTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1303 hom 29 8 10 11 T 13 12 43736 CASAVA_Build 1 71099973 1D TTCCATTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 9 14 A 11 10 43737 CASAVA_Build 1 71144794 1I CTGCAGGAGT -/G GGAAAAAATG 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 G 2 3 43738 CASAVA_Build 1 71176157 1I CACTTTTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 A 9 10 43739 CASAVA_Build 1 71188261 1D TAACAAATCT A/- AAAGAGTAAA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 4 3 43740 CASAVA_Build 1 71190548 4I AAAGATTCAG ----/AATT AATTAAAGTT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 AATT 1 2 43741 CASAVA_Build 1 71193115 1I CATGACCGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 8 9 43742 CASAVA_Build 1 71194650 1D TAAAGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 11 11 T 12 11 43743 CASAVA_Build 1 71199348 1D CTGCTGATCT G/- GGGGCAATAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 G 5 4 43744 CASAVA_Build 1 71208306 1I GTTTGATTCC -/A AAACTCATGC 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 A 3 4 43745 CASAVA_Build 1 71211305 11I ACCAAAAAAG -----------/AGATGGAAACA AGATGGAAAC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 AGATGGAAACA 1 2 43746 CASAVA_Build 1 71213636 1D AAACGATTCC T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 T 8 7 43747 CASAVA_Build 1 71214388 1D GCAGGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 12 11 43748 CASAVA_Build 1 71217772 1I GGGTACAGCT -/G GCACGTTATC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 1 2 43749 CASAVA_Build 1 71218316 1D AAGTAATTGA G/- GGGAGTTGAG 3070 hom 131 het 47 0 42 5 G 4 3 43750 CASAVA_Build 1 71222029 2D GAACAATTAT TG/-- GTATCAAAAA 3070 het 3070 ref 51 29 19 5 TG 1 0 43751 CASAVA_Build 1 71232733 1I TAAACCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 34 1 26 7 T 13 14 43752 CASAVA_Build 1 71239843 1D TCTCCTAGAG T/- TTTCCTGTGA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 4 3 43753 CASAVA_Build 1 71256533 1D CTTCTTTAAA T/- TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 7 6 43754 CASAVA_Build 1 71258536 1I CATAAACATT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 7 8 43755 CASAVA_Build 1 71260595 2I ACACTCTGTA --/AC TGTTCAAAAC 3070 het 3070 hom 67 27 33 7 AC 0 1 43756 CASAVA_Build 1 71263812 4D TTTTATTACT GTAA/---- GTGTTATATA 3070 het 3070 hom 40 19 20 3 GTAA 1 0 43757 CASAVA_Build 1 71265478 15D TCTGTCACCG AGGCTGGAGTGCAGT/--------------- AATGCCATCA 3070 het 3070 ref 41 25 12 6 AGGCTGGAGTGCAGT 1 0 43758 CASAVA_Build 1 71272460 3I TATGTGAGTT ---/ATC ATATTAATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATC 0 1 43759 CASAVA_Build 1 71273292 1D ATCTTGGCTC T/- AAGAAAATTC 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 T 1 0 43760 CASAVA_Build 1 71275270 1I GTTTGTGCTC -/T GGAGAATTGC 3070 hom 99 het 35 0 32 3 T 0 1 43761 CASAVA_Build 1 71294053 1I ATTTTCATTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 9 10 43762 CASAVA_Build 1 71294196 1D TGTCTGATAC T/- CTGGATTAAT 3070 het 3070 ref 47 24 17 7 T 1 0 43763 CASAVA_Build 1 71296828 1I CATAGTGAGA -/C CCTGTCTCTA 3070 het 2329 hom 25 5 12 8 C 2 3 43764 CASAVA_Build 1 71306149 1D TCTACTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2190 hom 27 7 9 11 T 17 16 43765 CASAVA_Build 1 71308552 4I ATCAACAAAC ----/AAAG AATATTCAAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AAAG 0 1 43766 CASAVA_Build 1 71312102 5I CAAAGACATT -----/GGTAA GGTATGTTCT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GGTAA 0 1 43767 CASAVA_Build 1 71313028 3D CAGGATAAGC CAG/--- CAGCAATCTT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 CAG 2 1 43768 CASAVA_Build 1 71340356 3D CTGCAATAAC CTT/--- CTTGCTTTGC 3070 het 3070 ref 57 26 21 13 CTT 2 1 43769 CASAVA_Build 1 71352178 1D TTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 12 11 43770 CASAVA_Build 1 71356219 3I CTTGGCTATC ---/CTT CTCTGAGAAA 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 CTT 0 1 43771 CASAVA_Build 1 71356849 5D GCTATTAAAA TATCT/----- TAGAAGGGGA 3070 het 3070 ref 36 22 13 5 TATCT 1 0 43772 CASAVA_Build 1 71363785 2D TTTTTTTCTT TC/-- AATACTTTGA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 TC 1 0 43773 CASAVA_Build 1 71371189 1D TATCAATAAT A/- AAAAAGTCTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 6 5 43774 CASAVA_Build 1 71376725 1I TTTCTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 15 12 A 10 11 43775 CASAVA_Build 1 71394934 3D CCTGTCTAAT CTA/--- CTGATGAGCC 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 CTA 1 0 43776 CASAVA_Build 1 71406667 1I TTTCTCTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 9 10 43777 CASAVA_Build 1 71423536 1I ATATAAAAAA -/T CATTGATTAG 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 0 1 43778 CASAVA_Build 1 71424317 4I CCACGTTTAA ----/TCAC TCTGTGATCT 3070 het 3070 ref 56 27 24 5 TCAC 0 1 43779 CASAVA_Build 1 71431000 1D AGTTATATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 10 9 43780 CASAVA_Build 1 71436894 13D AGCTACTCAG GAGGCTGAGGCAA/------------- GAGAATCACT 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 GAGGCTGAGGCAA 1 0 43781 CASAVA_Build 1 71462596 1D TGACCTTGAT A/- AAAAAAAAAA 3034 het 3034 ref 26 10 9 7 A 13 12 43782 CASAVA_Build 1 71465497 1I GCCACTATGA -/T AGAGGGTACT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 0 1 43783 CASAVA_Build 1 71491464 1D CACATCATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 25 7 T 11 10 43784 CASAVA_Build 1 71500496 1D TTTTTTTTTT A/- AAATTTAGAG 1394 het 1394 ref 33 21 7 5 A 4 3 43785 CASAVA_Build 1 71519433 1I TAAGGCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 9 11 9 T 14 15 43786 CASAVA_Build 1 71521595 1D GCATCTAGGT G/- GATTCCATGT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 2 1 43787 CASAVA_Build 1 71526542 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1083 het 1083 ref 14 8 4 2 A 13 14 43788 CASAVA_Build 1 71532781 4I TTCCCTTTAG ----/AATA AAGGATAAGG 3070 het 3070 hom 53 19 29 5 AATA 0 1 43789 CASAVA_Build 1 71539226 5D GTAGTCCCAA CTACT/----- CTACTCAGGA 3070 hom 129 het 46 0 43 4 CTACT 2 1 43790 CASAVA_Build 1 71557977 1I ATTGTCAATT -/A AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 6 7 43791 CASAVA_Build 1 71595420 16D ATGGAAATGT AATGTTTACATCAACA/---------------- AAAGACCCAC 3070 hom 66 het 24 0 23 4 AATGTTTACATCAACA 1 0 43792 CASAVA_Build 1 71642861 1I CCATCCTTCC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 113 het 46 0 35 11 T 7 8 43793 CASAVA_Build 1 71651310 2D TATGGACTGT AG/-- AGCTGGATGA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 AG 2 1 43794 CASAVA_Build 1 71655624 1I TGGGATGAGG -/T TTTTACTATA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 4 5 43795 CASAVA_Build 1 71662357 1I GACTTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 11 12 43796 CASAVA_Build 1 71669351 1I TCTTTTTTTT -/A ATGACCTTTT 3070 het 118 hom 17 1 16 0 A 1 2 43797 CASAVA_Build 1 71683016 2I CAAGAAAAAC --/TT TGTCAATCCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 1 3 43798 CASAVA_Build 1 71691088 1D AAAAAAAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 128 hom 47 3 40 4 A 10 9 43799 CASAVA_Build 1 71702690 2I ATCAAATGAC --/AG AGTTATGAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AG 1 2 43800 CASAVA_Build 1 71705992 1D TATTTGAAGC A/- AATTGCTTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 3 2 43801 CASAVA_Build 1 71709934 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 129 het 49 0 43 7 A 9 8 43802 CASAVA_Build 1 71716168 1I TTGGATTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 11 12 43803 CASAVA_Build 1 71723497 1I TTTGGCCTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 95 het 40 0 32 8 T 9 10 43804 CASAVA_Build 1 71726013 1I ATTCATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1048 hom 29 3 23 3 T 10 11 43805 CASAVA_Build 1 71729849 1I AGGGCTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 35 1 25 9 T 13 14 43806 CASAVA_Build 1 71730761 1I TGTTTATTAA -/T TTCACAATCT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 2 3 43807 CASAVA_Build 1 71734864 1D GATTACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 38 1 29 8 T 11 10 43808 CASAVA_Build 1 71751450 1D TCAAAAACTT A/- AAATGTGAGG 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 A 4 3 43809 CASAVA_Build 1 71767308 1D AAATAAAGCA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 9 8 43810 CASAVA_Build 1 71793533 2I TTCATACCAA --/CT CTGATGAATT 3070 hom 108 het 46 0 36 10 CT 1 2 43811 CASAVA_Build 1 71798107 2D TCATTCTGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 10 A 14 12 43812 CASAVA_Build 1 71798701 2D AATTCTCCAT TA/-- TATATATATA 2193 hom 15 het 9 0 6 3 TA 9 8 43813 CASAVA_Build 1 71800699 1I CCATTACCCC -/T GTCACACTCT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 T 0 1 43814 CASAVA_Build 1 71806107 1I TGAGATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 11 12 43815 CASAVA_Build 1 71808263 1I AGCTTCATTT -/C TGCCACTAAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 43816 CASAVA_Build 1 71809139 3I CTTTTATAAC ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TGT 3 4 43817 CASAVA_Build 1 71819970 1I TTATACACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 794 hom 28 6 12 10 T 16 17 43818 CASAVA_Build 1 71825734 1D TGATATGAAA G/- GAGACATTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 2 1 43819 CASAVA_Build 1 71828048 1I AAGTTTAATA -/T CTGGGTTTAG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 43820 CASAVA_Build 1 71840621 4D CGGGTTCACG CCAT/---- CCATTCTCCT 1890 hom 15 het 6 0 6 0 CCAT 2 1 43821 CASAVA_Build 1 71853560 1I CACATTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 29 1 24 4 A 10 11 43822 CASAVA_Build 1 71864128 1I TACCTTATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 9 10 43823 CASAVA_Build 1 71904768 1I ACTGCAGATC -/T TTTATTTCAA 3070 hom 89 het 36 0 30 6 T 3 4 43824 CASAVA_Build 1 71911717 13I AAATTTTAAT -------------/TGTATACACAGGA ACAACTTGGT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 TGTATACACAGGA 0 1 43825 CASAVA_Build 1 71912072 1I ATTAATGATA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 9 10 43826 CASAVA_Build 1 71914665 3D TCATTTCATA TCT/--- TTGCTAAACC 3070 hom 126 het 44 0 43 1 TCT 1 0 43827 CASAVA_Build 1 71916338 10D CAGATACATG ATGACAGATC/---------- ATGACAGATC 3070 hom 90 het 39 0 31 11 ATGACAGATC 2 1 43828 CASAVA_Build 1 71921285 1D CCAAATAAAC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 6 43829 CASAVA_Build 1 71924236 1D72M1D GTTAATGGCC AGATGCTATTTTAAATCCAGTTGTGTTTCTGAGCAAAATCATAGGTAGCCTCAAAGGCATGAGACTCATAGACT/-GATGCTATTTTAAATCCAGTTGTGTTTCTGAGCAAAATCATAGGTAGCCTCAAAGGCATGAGACTCATAGAC- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 33 0 31 21 N/A 0 0 43830 CASAVA_Build 1 71940998 1I AAACTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2208 hom 30 7 18 5 A 16 17 43831 CASAVA_Build 1 71944219 1I AGGCATCATT -/C CCCCAACAAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 4 5 43832 CASAVA_Build 1 71959748 5D ATTGGTACAA AAAAT/----- AAAATAAAAA 3070 hom 105 het 42 0 36 8 AAAAT 2 1 43833 CASAVA_Build 1 71983818 1I GACTAACCTA -/T TTCTTGAGAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 2 3 43834 CASAVA_Build 1 72010713 1D TACATTGTTG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 8 7 43835 CASAVA_Build 1 72012958 1D GTATTTTCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 10 9 43836 CASAVA_Build 1 72026718 1I GTTCACATGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1692 hom 20 6 11 3 A 9 10 43837 CASAVA_Build 1 72055222 1D CTCTTACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 218 hom 43 1 31 12 A 11 10 43838 CASAVA_Build 1 72070077 2D AGACAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 12 25 10 A 12 10 43839 CASAVA_Build 1 72093672 1D ATCCTAGGAG A/- AAAGCAGTTG 3070 hom 99 het 35 0 33 3 A 4 3 43840 CASAVA_Build 1 72094023 1D TGTCATCATG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 8 7 43841 CASAVA_Build 1 72098470 1D CTCATCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 52 2 41 9 A 13 12 43842 CASAVA_Build 1 72120383 1D TCACATTTCT A/- GGCTCCTGAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 1 0 43843 CASAVA_Build 1 72122261 1D CTTATTAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 10 9 43844 CASAVA_Build 1 72136933 1I AACTGCTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 159 hom 16 1 12 3 T 9 10 43845 CASAVA_Build 1 72141323 4I AAAATTCAGT ----/TTTG TTTATCATAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTG 0 1 43846 CASAVA_Build 1 72151077 2D ATGTATGTAC AT/-- GTGTGTGTAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 1 0 43847 CASAVA_Build 1 72156955 1D ATGCTGTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 13 12 43848 CASAVA_Build 1 72164000 1D ATGATTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 11 10 43849 CASAVA_Build 1 72164922 1I ATCAATATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 T 11 12 43850 CASAVA_Build 1 72173796 4D TAAGTGTGTA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 36 14 21 2 GT 11 9 43851 CASAVA_Build 1 72186059 1I AAAAAAAAAA -/G ATATGGAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 G 0 1 43852 CASAVA_Build 1 72203096 1D TAATCACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 A 11 10 43853 CASAVA_Build 1 72207071 1I TGGCAAGTGA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 7 8 43854 CASAVA_Build 1 72226054 1D AATCAAAGGA T/- TTTTTTATAA 2780 het 2780 ref 24 15 6 3 T 7 6 43855 CASAVA_Build 1 72251088 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 759 het 759 ref 21 10 4 7 AC 7 8 43856 CASAVA_Build 1 72252099 1D GTACTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2616 hom 24 7 12 6 A 12 11 43857 CASAVA_Build 1 72253388 2I AGTCACACTA --/AT ATGAGTTAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AT 1 2 43858 CASAVA_Build 1 72258871 1I CAAACAACAG -/A AAAAAGATAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 5 6 43859 CASAVA_Build 1 72268303 1I GTGAAATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 35 1 26 8 A 10 11 43860 CASAVA_Build 1 72284103 1D TAGAAAAAAA T/- ATGTAGTTTC 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 T 1 0 43861 CASAVA_Build 1 72292127 1I AAACGAACAC -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 6 7 43862 CASAVA_Build 1 72292152 1D TTTTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 1169 het 1169 ref 40 15 3 24 A 11 10 43863 CASAVA_Build 1 72302151 1I ACTCAGAGAA -/C CCCCCCTGTA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 C 6 7 43864 CASAVA_Build 1 72320986 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2123 hom 26 8 12 6 A 13 12 43865 CASAVA_Build 1 72331601 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2372 hom 25 7 13 5 A 14 15 43866 CASAVA_Build 1 72344811 1D AGGCTGGGAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 9 8 43867 CASAVA_Build 1 72350322 3D TTGTTAATAT GAA/--- GAAGGCCACA 3070 het 3070 hom 43 21 19 5 GAA 2 1 43868 CASAVA_Build 1 72350484 1I TTTTCTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 29 1 17 11 T 11 12 43869 CASAVA_Build 1 72350962 1I AGGGGGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 9 10 43870 CASAVA_Build 1 72351707 1I GCTTTTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 10 11 43871 CASAVA_Build 1 72353473 2I TGTGGTCTTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TA 5 6 43872 CASAVA_Build 1 72363734 1I GTGGCCAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 A 9 10 43873 CASAVA_Build 1 72372916 2D AGAGGTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 24 2 9 13 T 16 14 43874 CASAVA_Build 1 72374869 1I CTTAGCCAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 2564 hom 28 9 10 9 A 8 9 43875 CASAVA_Build 1 72374917 1D CAATTTGTCC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 39 het 20 0 14 7 A 9 8 43876 CASAVA_Build 1 72377371 1I CTCATGAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 12 43877 CASAVA_Build 1 72380238 1I GCATGATAAT -/A AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 A 6 7 43878 CASAVA_Build 1 72382347 1D TGAGGTAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 10 9 43879 CASAVA_Build 1 72382710 8D3M10D4M43D CTGTTAAAAA CAGATAACAAACTACATATATGCACATAAACTGTAAATGCTATGGGATATGAATTTAATTCAGGACAT/--------AAA----------GCAC------------------------------------------- ATAATTAATA 3070 het 3070 ref 42 48 15 4 N/A 0 0 43880 CASAVA_Build 1 72384289 1I CATGCTGTGT -/G ATTTCTCTCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 43881 CASAVA_Build 1 72402288 1D CAGACAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 12 11 43882 CASAVA_Build 1 72425943 1D ACCTGGTATA T/- TTTTTTAGGT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 7 6 43883 CASAVA_Build 1 72431930 1I AATATATATA -/T TTTTTCATAT 2284 het 2284 ref 16 10 5 1 T 5 6 43884 CASAVA_Build 1 72434938 3I3M3I TTACAAGTGA ---TCA---/GGCTCAGAC AGGATGATCA 3070 het 3070 hom 29 9 18 4 N/A 0 0 43885 CASAVA_Build 1 72444850 1D TATAAGGTGA T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 46 19 20 7 T 7 6 43886 CASAVA_Build 1 72458486 1D TTTTTAAGAT A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 A 7 6 43887 CASAVA_Build 1 72462472 4D TCAACATTTA CTGT/---- CTAAGTTCTA 3070 het 3070 ref 36 17 17 3 CTGT 1 0 43888 CASAVA_Build 1 72477815 3D GGGTAGTGAC ATA/--- ATATTCTGAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 ATA 2 1 43889 CASAVA_Build 1 72479638 8I TGTCCACTAT --------/AGCTATAA AGTTGCTAAC 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 AGCTATAA 0 1 43890 CASAVA_Build 1 72484470 4I TCTTTCCATC ----/AATT ACTTTCCTGA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 AATT 0 1 43891 CASAVA_Build 1 72487460 2D CCTTCCACCA TG/-- TGAGAACACA 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 TG 2 1 43892 CASAVA_Build 1 72488038 3D GTTCCCGGCA AAG/--- AAGAACAGGG 3070 het 3070 hom 46 18 26 3 AAG 2 1 43893 CASAVA_Build 1 72499832 1D TTTATAAAAC T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 T 8 7 43894 CASAVA_Build 1 72502813 4I ACTATAAATG ----/ATTA ATTATATTTT 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 ATTA 1 2 43895 CASAVA_Build 1 72527421 1D AATGACTGGC T/- TTTATATGTA 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 T 4 3 43896 CASAVA_Build 1 72528943 1D TTTTGATAAT G/- TTAAATAAAT 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 G 1 0 43897 CASAVA_Build 1 72532042 1D AGTTCTTTGC T/- TTTAGTGCTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 4 3 43898 CASAVA_Build 1 72535040 3I GAGAAAGGAG ---/AGA AGGATTGTGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AGA 0 1 43899 CASAVA_Build 1 72539389 2D CCATGAATAG TT/-- TTATATATAT 3070 hom 30 het 11 0 11 1 T 4 2 43900 CASAVA_Build 1 72542607 1D GCCCAGCTAG T/- TTTTTTGTGT 1424 hom 12 het 6 0 5 1 T 7 6 43901 CASAVA_Build 1 72545098 3D CCAGTACTGT GTA/--- GAATAGAAGT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 GTA 1 0 43902 CASAVA_Build 1 72545264 3D AGAGGTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TTG 5 4 43903 CASAVA_Build 1 72545486 1D TTTGCTAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 9 8 43904 CASAVA_Build 1 72546448 1D GGGTTTTTCG A/- AAAAAACCTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 7 6 43905 CASAVA_Build 1 72548118 8I ACATTTGGTA --------/TTGTAAGT TTTACATTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TTGTAAGT 0 1 43906 CASAVA_Build 1 72567622 3D44M2D TAATAAGAAT TGATGAGGAATAAGGTTGCTGGAATAAAAGAACATTTAATATAAAACAT/---TGAGGAATAAGGTTGCTGGAATAAAAGAACATTTAATATAAAAC-- ATATTATATA 3070 hom 57 het 15 0 20 3 N/A 0 0 43907 CASAVA_Build 1 72569033 3I GTACTTTATA ---/CTT CTTAGAATAC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 CTT 1 2 43908 CASAVA_Build 1 72588838 2D CTTAAAAAAG GA/-- GAGTTTCATT 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 GA 2 1 43909 CASAVA_Build 1 72600356 1I ATTCCGTACA -/C AAAACTCAGA 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 C 0 1 43910 CASAVA_Build 1 72600763 2D AACTCAGGTC TT/-- TGTTAATGTT 3070 het 3070 hom 37 13 14 12 T 3 1 43911 CASAVA_Build 1 72600813 2D TAATAATTAT TA/-- TGTTTAATAT 3070 het 2811 hom 29 6 15 11 TA 1 0 43912 CASAVA_Build 1 72604142 1D CATTATATAT G/- GAAATCATCT 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 G 2 1 43913 CASAVA_Build 1 72606434 1D TCTTATTTTC T/- TACTACCTTT 3070 het 3070 ref 37 20 11 7 T 2 1 43914 CASAVA_Build 1 72633297 1I GAGTAGTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 9 10 43915 CASAVA_Build 1 72635131 1D TTCCCAACGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 23 1 19 3 T 11 10 43916 CASAVA_Build 1 72637252 1I ACATTAGTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 9 10 43917 CASAVA_Build 1 72656599 1D CAAAACTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 37 0 31 6 A 13 12 43918 CASAVA_Build 1 72656795 5D TTCAAAACTA ATTAT/----- ATTAGTCACC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 ATTAT 1 0 43919 CASAVA_Build 1 72664206 1I GATAGAGTAC -/A AAAATTTTCT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 4 5 43920 CASAVA_Build 1 72671761 3D TTCAGATACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 20 9 A 17 14 43921 CASAVA_Build 1 72673424 3D AAATGGTATA TAT/--- TATTAGGCTT 3070 hom 132 het 50 0 45 6 TAT 2 1 43922 CASAVA_Build 1 72675017 1D GATTATTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 34 1 25 8 T 11 10 43923 CASAVA_Build 1 72696237 1I ATGTTGAGCA -/T TTTTTTCATA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 6 7 43924 CASAVA_Build 1 72698903 1I77M1I TCTTATTAGT -AAAACTCCACAGGAAAAGTACACATGAATCCACAGAGTGAGCCCTATGAAAAACTATGACATACATTAAAAAAAAAA-/AAAAACTCCACAGGAAAAGTACACATGAATCCACAGAGTGAGCCCTATGAAAAACTATGACATACATTAAAAAAAAAAG AATAAATTTG 3070 het 286 hom 34 1 33 26 N/A 0 0 43925 CASAVA_Build 1 72706299 1D TTATAACCAT A/- AAAAAATTTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 7 6 43926 CASAVA_Build 1 72716044 1D CATGGAGCTT A/- TTGTATATTG 3070 hom 93 het 32 0 31 1 A 1 0 43927 CASAVA_Build 1 72729731 3D CTGTCTCATA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 144 het 57 0 49 9 AAC 7 6 43928 CASAVA_Build 1 72730824 4D ATATAATAAA AAAT/---- AAATAAATAA 1935 hom 15 het 6 0 6 0 AAAT 5 4 43929 CASAVA_Build 1 72789529 1I GGAATGATCT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 36 6 G 0 1 43930 CASAVA_Build 1 72793035 1I TTTTTTAAAG -/T TTTTTTACTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 6 7 43931 CASAVA_Build 1 72795156 34D14M21D TGTGTGTGTG TATGTATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------------------------TATATATATATATA--------------------- TTTTTTTTTT 2901 hom 26 het 13 0 9 4 N/A 0 0 43932 CASAVA_Build 1 72815594 3D GTACTTGCTT CTC/--- CTTCTTCTTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CTC 1 0 43933 CASAVA_Build 1 72817076 1D TTTTCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2697 hom 30 11 11 9 T 12 11 43934 CASAVA_Build 1 72820659 1I TTCATTCTGC -/A AAGTTCCTCA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 2 3 43935 CASAVA_Build 1 72823785 1I TAAACAAAGC -/A AAAACACGGC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 4 5 43936 CASAVA_Build 1 72824545 5D TGTCTTGCCT CCAGG/----- CTATCTGCTT 3070 hom 78 het 28 0 27 4 CCAGG 1 0 43937 CASAVA_Build 1 72826552 1D GATTTATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 44 0 37 8 A 11 10 43938 CASAVA_Build 1 72829888 2D GTAAACAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 96 het 40 0 33 9 AC 8 7 43939 CASAVA_Build 1 72841106 19I TCGAAGTTGA -------------------/TGGCTCACTTATTTTTATT TTTAGTCCTA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 TGGCTCACTTATTTTTATT 0 1 43940 CASAVA_Build 1 72842774 4I TAACTTACTC ----/TGTT TGTTCAAAAT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 TGTT 1 2 43941 CASAVA_Build 1 72843800 3I ATTATCAGCT ---/AAG AAGAAGATCA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AAG 2 3 43942 CASAVA_Build 1 72848704 3D GCCTATCTCT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 37 21 8 8 TTC 4 3 43943 CASAVA_Build 1 72849539 14D CCTCACCAAT AGATTAAAATTTGC/-------------- TCTGACTAAG 3070 het 3070 ref 34 19 16 3 AGATTAAAATTTGC 1 0 43944 CASAVA_Build 1 72852699 1I ATTAAAAGAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 8 9 43945 CASAVA_Build 1 72859397 1D ATTATTTATC A/- GTCTTTGGGC 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 A 1 0 43946 CASAVA_Build 1 72861803 1I ACTACGTTTT -/C CCCCAGTACT 3070 hom 107 het 41 0 35 6 C 4 5 43947 CASAVA_Build 1 72862619 1I GATGACCATG -/A ATTTGCTTAT 3070 het 3070 ref 51 30 15 6 A 1 2 43948 CASAVA_Build 1 72864301 3D TCCAAGTCAC ATA/--- ATAATAGTTG 3070 het 3070 hom 39 16 17 8 ATA 3 2 43949 CASAVA_Build 1 72868336 1D CTATATTTTT C/- CCCCTACAAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 4 C 5 4 43950 CASAVA_Build 1 72872741 3I TTTGCTGAAT ---/AAA AAAATGTATG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 4 7 43951 CASAVA_Build 1 72874990 12I TCTCTCTCTC ------------/TCTGTCTCTCTG TCTGTCTCTC 3070 hom 77 het 37 0 22 15 TCTGTCTCTCTG 0 1 43952 CASAVA_Build 1 72883081 4D ATTGTACATA ATTT/---- ATTAGAATAT 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 ATTT 1 0 43953 CASAVA_Build 1 72894644 1I AATACAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 A 9 10 43954 CASAVA_Build 1 72898066 7D2M1D7M2I TATTGGATAT GCCTCTAATATGTATAT--/-------AT-TGGATATTG TACTAAGTAC 3070 het 3070 hom 41 20 20 3 N/A 0 0 43955 CASAVA_Build 1 72907566 3D GTGTGAAAAT ATC/--- ATTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 ATC 1 0 43956 CASAVA_Build 1 72933202 1I TGATAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 10 11 43957 CASAVA_Build 1 72941862 1D TTCAACCAAT A/- ATATTCTCTG 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 A 2 1 43958 CASAVA_Build 1 72942195 1D GCTTTCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 23 9 A 14 13 43959 CASAVA_Build 1 72944725 1I GCTTTCCAAG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 7 8 43960 CASAVA_Build 1 72953981 1D GCCTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 906 hom 25 3 14 9 T 11 10 43961 CASAVA_Build 1 72960047 3D GTGGTTTTTT TTC/--- TTCTTCTTGT 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 TTC 3 2 43962 CASAVA_Build 1 72964373 16D CAAATAGGAG ATATATATATATATAT/---------------- ATATATATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 5 AT 15 7 43963 CASAVA_Build 1 72974465 1I TTGAATTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 10 11 43964 CASAVA_Build 1 72976158 1D TTAGAGACAT G/- TTTTAAATAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 1 0 43965 CASAVA_Build 1 72977792 1I TCATTTGCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 T 9 10 43966 CASAVA_Build 1 72982250 7I TAACTTCAAA -------/GAAGCGG GAAGCTTTAC 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 GAAGCGG 0 1 43967 CASAVA_Build 1 72989126 1I TATGTGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 10 11 43968 CASAVA_Build 1 72989220 1I AGAAATATTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 8 9 43969 CASAVA_Build 1 72990002 3D AAAAAGCAAA ATC/--- ATTATATGAC 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 ATC 1 0 43970 CASAVA_Build 1 72996029 4I AAAATTTTAA ----/TTGT TTCTCAGCAG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 TTGT 0 1 43971 CASAVA_Build 1 73000428 1D GTATCATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 12 11 43972 CASAVA_Build 1 73004412 1D ATAGAAAGAT C/- CTATTCTACA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 C 2 1 43973 CASAVA_Build 1 73013828 1D AAGTTACAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 17 19 7 T 10 9 43974 CASAVA_Build 1 73034625 4I TTATCCATTC ----/ATTT GTCGAAGGCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ATTT 0 1 43975 CASAVA_Build 1 73036555 1I TATGTGTCTT -/G GGAAAAGCCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 2 3 43976 CASAVA_Build 1 73044832 3I TCTCTCTCTA ---/CTT CTTCTTCTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CTT 3 4 43977 CASAVA_Build 1 73059205 4I AAAATATGAC ----/ATTT AAAGTGTGTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 ATTT 0 1 43978 CASAVA_Build 1 73070328 1D ATTATCCAGG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 33 11 13 10 A 8 7 43979 CASAVA_Build 1 73074949 1I CCTTCCACAC -/T TTTTTCCAGA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 T 5 6 43980 CASAVA_Build 1 73075530 2I AGCATATTTA --/TT TTGTTTTGCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 2 4 43981 CASAVA_Build 1 73091751 1D AAACACTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 53 2 46 5 A 11 10 43982 CASAVA_Build 1 73092258 1D TTCCTTTATG T/- TTTTTCATGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 6 5 43983 CASAVA_Build 1 73098523 1D AACAACAATT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 152 het 62 0 49 13 A 8 7 43984 CASAVA_Build 1 73101067 1I GTGAGTATCA -/T TTTTTGCATA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 5 6 43985 CASAVA_Build 1 73101436 3I AATATAAGTT ---/GAG GAATAAATAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 GAG 0 1 43986 CASAVA_Build 1 73106297 1D AATGAAGAAT A/- AGTACTTTCA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 2 1 43987 CASAVA_Build 1 73115728 1I ACCCACTAGC -/A AAAATTTTGC 3070 hom 92 het 36 0 29 7 A 4 5 43988 CASAVA_Build 1 73121876 1D TGTAGAACAG A/- AAAAATTCCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 6 5 43989 CASAVA_Build 1 73134294 1I TCACAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 9 10 43990 CASAVA_Build 1 73135707 1I TTCCAGGACT -/A TTTTTTTATC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 1 43991 CASAVA_Build 1 73135851 14I TATCTTATAC --------------/ATATATGTATATAT ATATATGTAT 3070 hom 24 het 13 0 9 5 ATATATGTATATAT 0 1 43992 CASAVA_Build 1 73143358 2I AATAAAAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 10 12 43993 CASAVA_Build 1 73143456 1D AGTAAAGAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 10 9 43994 CASAVA_Build 1 73145081 1I TTTTCTGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 653 hom 30 4 19 7 A 13 14 43995 CASAVA_Build 1 73146884 1I CAATTTTGTG -/T TTTTATATCT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 4 5 43996 CASAVA_Build 1 73159921 3I TCTGTGAGAG ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 12 43997 CASAVA_Build 1 73164911 1I CTTACGTGTC -/A TTTTTGTCCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 1 43998 CASAVA_Build 1 73171682 1D GAAAACCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 12 11 43999 CASAVA_Build 1 73177341 1I TTGTGCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 34 0 28 6 A 10 11 44000 CASAVA_Build 1 73184477 1I ATAATGAAAG -/T CTTTTATGTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 0 1 44001 CASAVA_Build 1 73194874 1D AAAAGGCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 45 1 37 7 T 12 11 44002 CASAVA_Build 1 73238965 2D AAAAATACAC TT/-- AACTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 7 T 2 0 44003 CASAVA_Build 1 73244056 3I CTTTCTTTCT ---/TTC TTATTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTC 0 1 44004 CASAVA_Build 1 73271885 1I AGTCTTCATA -/T TCCAGGCAGG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 1 2 44005 CASAVA_Build 1 73273654 1D AGTGGGGGTT G/- TGCTTGAGAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 0 44006 CASAVA_Build 1 73274207 4D ATATATATAT ATAA/---- AAAATGATCC 3070 hom 39 het 14 0 14 1 ATAA 1 0 44007 CASAVA_Build 1 73277452 2D TAGTAAACAC TG/-- TTTGAGTGAA 3070 hom 141 het 53 0 48 6 TG 1 0 44008 CASAVA_Build 1 73288813 1D ATCAGGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 82 hom 36 1 26 9 A 10 9 44009 CASAVA_Build 1 73314701 7D TAAAAATACT AGAAGAA/------- AGAAGTGAGT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 AGAAGAA 1 0 44010 CASAVA_Build 1 73317041 1D TTTTTATATA T/- GTGTAATTCC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 0 44011 CASAVA_Build 1 73317270 2D GCCATTCATA TG/-- TGTGTGTATA 3070 hom 68 het 31 0 22 9 TG 4 3 44012 CASAVA_Build 1 73321726 1D ATGCTTGTGA T/- TTTTTTCACA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 7 6 44013 CASAVA_Build 1 73323360 1I ATTCTGTTGA -/T TTTGGGGTGT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 3 4 44014 CASAVA_Build 1 73328729 2D TGTAGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 35 0 28 7 T 14 12 44015 CASAVA_Build 1 73329329 5I TTTGTTTTTC -----/TCTTT TCTTTAAGAT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TCTTT 1 2 44016 CASAVA_Build 1 73330235 1I TTTAGGATCC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 8 9 44017 CASAVA_Build 1 73333183 1D ATGGAACAAA C/- TATGTAAAAC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 C 1 0 44018 CASAVA_Build 1 73335556 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 112 het 44 0 38 6 TG 10 9 44019 CASAVA_Build 1 73346596 1D TAGGCACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 10 9 44020 CASAVA_Build 1 73357932 2D CATAAGGGCT TA/-- TATGGAAGCC 3070 hom 114 het 41 0 39 3 TA 2 1 44021 CASAVA_Build 1 73362076 1D GAGGGTGTGC T/- TTTTTTCAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 7 6 44022 CASAVA_Build 1 73364686 1I TAACTTTATC -/A TTTTTTTCTA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 0 1 44023 CASAVA_Build 1 73367631 1D CCAGAGACTT G/- GAAAAGAAAA 3070 het 358 hom 16 1 13 2 G 2 1 44024 CASAVA_Build 1 73370831 2I AGTGAGGTAG --/GT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 GT 0 1 44025 CASAVA_Build 1 73371167 1I TTAGAGTTCA -/T TTTTTCTTGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 5 6 44026 CASAVA_Build 1 73372255 1D ACTTTATTCA T/- TTTTATATCC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 5 4 44027 CASAVA_Build 1 73375593 2D CCTAATAAAA AT/-- ATGTCTTGAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AT 2 1 44028 CASAVA_Build 1 73376266 4I TATAATAAAC ----/TTAT TTATCATTTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTAT 1 2 44029 CASAVA_Build 1 73377111 5D44M4D CATATAATTC TATAATATAATATATATTATATTGGTATATATATATATAAAATTTCTTTACTC/-----TATAATATATATTATATTGGTATATATATATATAAAATTTCTTT---- ACTCATAGAT 1549 hom 10 het 9 0 4 8 N/A 0 0 44030 CASAVA_Build 1 73377435 1I CCAACATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 28 1 22 5 T 10 11 44031 CASAVA_Build 1 73378809 1D8M1D AGTGGCAACA TGTGCGCATC/-GTGCGCAT- CCTTGTCTTG 3070 hom 69 het 26 0 23 8 N/A 0 0 44032 CASAVA_Build 1 73378989 1I CATAGAAGGG -/A ACGTACCTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 44033 CASAVA_Build 1 73382980 1D TTTTTGATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 35 0 30 5 A 11 10 44034 CASAVA_Build 1 73388158 1I ATTTTACATT -/A AATAATTATT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 2 3 44035 CASAVA_Build 1 73388612 1D AAAATCTAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 39 0 31 8 T 10 9 44036 CASAVA_Build 1 73389918 2I ACTGCTAATA --/AT AAGACACACC 3070 hom 137 het 50 0 45 5 AT 0 1 44037 CASAVA_Build 1 73391136 1D CTGGGACTCA G/- GGGCATCATG 3070 hom 45 het 17 0 13 4 G 4 3 44038 CASAVA_Build 1 73391619 1D TCATTGTCCA T/- TATCACTATC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 2 1 44039 CASAVA_Build 1 73392585 2D ATAAAAAAAC AG/-- AAAGTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AG 1 0 44040 CASAVA_Build 1 73392828 3I ATTATACCTC ---/AAT AAACTAGAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAT 0 1 44041 CASAVA_Build 1 73393400 1I CCTGGTGAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 C 3 4 44042 CASAVA_Build 1 73393948 3D TTCAAAAACT GAA/--- GAAGAAGAGG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 GAA 3 2 44043 CASAVA_Build 1 73395971 1D TCCAAAAAAC A/- AAAAATAAGT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 6 5 44044 CASAVA_Build 1 73397933 4D ACCTAACTCT CTCA/---- CTGTCTCCAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 CTCA 1 0 44045 CASAVA_Build 1 73398231 1I16M1I62M1D TAAATTGACC -AAAAAATGAAAGCCAG-AAAAAAAGAAGAGAAAAAGAAACAAAATAAAAGGACAGGAAAGCAAAGAAATGTGTTGCAGAT/AAAAAAATGAAAGCCAGAAAAAAAAGAAGAGAAAAAGAAACAAAATAAAAGGACAGGAAAGCAAAGAAATGTGTTGCAGA- TTGTCTTTAA 3070 hom 108 het 41 0 37 38 N/A 0 0 44046 CASAVA_Build 1 73399752 4D CTTCCACCAC ATAG/---- ATAAAGAGAT 3070 hom 93 het 33 0 31 4 ATAG 1 0 44047 CASAVA_Build 1 73400674 1D ATTGTGTCTC T/- TAAGTCTAGG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 2 1 44048 CASAVA_Build 1 73404155 1D TCTTAATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 40 0 34 7 T 10 9 44049 CASAVA_Build 1 73404912 4I TGTGTGTATT ----/AGTC AGGGTTCTCC 3070 hom 93 het 38 0 30 8 AGTC 0 1 44050 CASAVA_Build 1 73405782 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 158 het 158 ref 28 4 4 21 GT 7 6 44051 CASAVA_Build 1 73406812 1I AGTGTTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 33 1 25 7 A 10 11 44052 CASAVA_Build 1 73407467 4I TATTAAGAGA ----/TAAT TAAGTAAAGG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TAAT 0 1 44053 CASAVA_Build 1 73408333 3I TTGTGTATAC ---/TAT TATTTGGTAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TAT 1 2 44054 CASAVA_Build 1 73408476 4D TTATTTCAGT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CAAA 4 3 44055 CASAVA_Build 1 73412056 1I TCAAAAAAAA -/T ATGAATATAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 1 44056 CASAVA_Build 1 73414544 1I TAAAGGTGAC -/A AGAGTATTGA 3070 hom 148 het 56 0 50 6 A 1 2 44057 CASAVA_Build 1 73414937 2I AATTCCCACT --/AC ACTTTCAGGT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 AC 1 2 44058 CASAVA_Build 1 73424582 4I AATACTTTTA ----/TCTT TCTTTAATAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TCTT 1 2 44059 CASAVA_Build 1 73433752 1D GTGCGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 11 10 44060 CASAVA_Build 1 73436201 1I AAGTGATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 592 hom 33 2 29 2 A 10 11 44061 CASAVA_Build 1 73437466 3I GCTGAGAAAG ---/AAA AAAAAAAAGC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 11 44062 CASAVA_Build 1 73441255 2I GAAAGATCAC --/AT GTTAGGTCAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AT 0 1 44063 CASAVA_Build 1 73446705 1D CTACCAACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 15 14 44064 CASAVA_Build 1 73450539 2I TGATATGAAG --/GT CTTGGTGCAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 GT 0 1 44065 CASAVA_Build 1 73452322 1D TGATAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1379 het 1379 ref 27 21 3 3 A 13 12 44066 CASAVA_Build 1 73470318 3D CTAATCTGCC CAA/--- CAACAAGGAT 3070 hom 126 het 45 0 43 4 CAA 3 2 44067 CASAVA_Build 1 73474450 2D CACTCATTTC TT/-- TTAAGCAAAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 4 2 44068 CASAVA_Build 1 73479112 1I AGACATTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 59 het 25 0 20 5 A 9 10 44069 CASAVA_Build 1 73490285 1I GTGAGCAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 8 9 44070 CASAVA_Build 1 73494154 1I AGCTGTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 30 1 21 8 A 13 14 44071 CASAVA_Build 1 73497536 1I TATAGCTGAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 9 44072 CASAVA_Build 1 73504203 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 399 hom 40 1 35 4 A 9 10 44073 CASAVA_Build 1 73517310 1I CTTTAGCCAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 9 10 44074 CASAVA_Build 1 73519403 1I AAAATTTCTT -/A ATCAGATTGC 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 1 2 44075 CASAVA_Build 1 73521557 2D TGATCTTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 13 11 44076 CASAVA_Build 1 73528912 1D AAATAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 44 2 33 9 T 13 12 44077 CASAVA_Build 1 73533368 3I ATGCTAAAAG ---/TTA TTATTTTATT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTA 1 2 44078 CASAVA_Build 1 73533695 5D69M1D CAATGATAGT ATGAGATAAGAAAGGAAGAAGATATCTACTCATTTGCAGAAACAGAGGAATGTATTATTTTGCAAACATTCATTC/-----ATAAGAAAGGAAGAAGATATCTACTCATTTGCAGAAACAGAGGAATGTATTATTTTGCAAACATTCATT- ATAAACATGG 3070 hom 211 het 34 0 71 9 N/A 0 0 44079 CASAVA_Build 1 73541181 1I TACAAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 13 14 44080 CASAVA_Build 1 73544671 1D AGCAATAGGC A/- AAAACTATAC 3070 hom 90 het 38 0 31 8 A 5 4 44081 CASAVA_Build 1 73545493 4D GAACCTGAAT CGCA/---- CGCAGTAAAG 3070 hom 135 het 52 0 46 8 CGCA 2 1 44082 CASAVA_Build 1 73545999 1I TAATTATGGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 9 44083 CASAVA_Build 1 73546806 1D GCCCAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 174 hom 35 2 22 12 A 13 12 44084 CASAVA_Build 1 73549159 2I CAAACCAGGC --/AG AGAGACCCAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AG 2 3 44085 CASAVA_Build 1 73550002 3D CCATGTGATT TTC/--- TTATTACATC 3070 hom 105 het 40 0 36 6 TTC 1 0 44086 CASAVA_Build 1 73553542 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 11 10 44087 CASAVA_Build 1 73553842 1D GGCCCAGAGA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 129 hom 45 1 35 9 T 3 2 44088 CASAVA_Build 1 73563337 1D TTTAGGATAG T/- TAAAACTTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 2 1 44089 CASAVA_Build 1 73567458 1D TGTAGGAACA T/- TGTTTGCTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 T 2 1 44090 CASAVA_Build 1 73571072 2I TTTTTCCTTT --/TC TCTGTTATTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TC 1 2 44091 CASAVA_Build 1 73584030 1I CATTTCAATG -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 44092 CASAVA_Build 1 73585463 1D GCTATGTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 647 hom 44 2 31 11 A 13 12 44093 CASAVA_Build 1 73587461 4D GGCGCGCACG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 57 het 30 0 19 11 CA 10 8 44094 CASAVA_Build 1 73591330 1I TTAAGAAATG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 7 8 44095 CASAVA_Build 1 73608450 2D CTTAATATTA CT/-- CTCTTTTGTA 3070 hom 117 het 46 0 40 7 CT 3 2 44096 CASAVA_Build 1 73610655 2I TATGGAATAT --/TA TATATATATA 3007 hom 18 het 7 0 7 0 TA 6 7 44097 CASAVA_Build 1 73612181 1D TTTAATAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 11 10 44098 CASAVA_Build 1 73614708 4I TCTCGTGATG ----/GTGA GTAAGTCTCA 3070 hom 126 het 46 0 41 5 GTGA 0 1 44099 CASAVA_Build 1 73620979 5D TTTAAATCTA ATGTT/----- AGTTTATCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 7 ATGTT 1 0 44100 CASAVA_Build 1 73624282 4D TGCTTATGAA ATCT/---- ATCTGAGAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 ATCT 2 1 44101 CASAVA_Build 1 73624862 1I AAATGTCAAA -/T ATTTTTTTTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 0 1 44102 CASAVA_Build 1 73624987 4I ATACACCTTC ----/ATTA ACTAAGATGT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 ATTA 0 1 44103 CASAVA_Build 1 73626539 2D GGCAAGCGTA TT/-- TTTTTTTCCT 3070 hom 98 het 40 0 31 9 T 9 7 44104 CASAVA_Build 1 73628285 1D30M5D TTTACAAAGA TTTTTTCTCCCATTCTAGGCTCTTTTGTTCTTTTTG/-TTTTTCTCCCATTCTAGGCTCTTTTGTTCT----- TTTTGTTTTA 3070 hom 151 het 43 0 51 5 N/A 0 0 44105 CASAVA_Build 1 73628434 1I TGGCCTCAAG -/T TGATCCTCCT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 1 2 44106 CASAVA_Build 1 73628791 3D CCTCTTCTTC CTT/--- CTTCTTCCTT 83 het 59 hom 29 1 1 29 CTT 3 2 44107 CASAVA_Build 1 73628911 5D TCTTCTTCCT TCTTC/----- TCTTCTTCTT 3070 hom 44 het 17 0 14 3 TCTTC 2 1 44108 CASAVA_Build 1 73628994 3I CGCCTTTTTT ---/TCC TCCTTCTTCT 3070 hom 62 het 24 0 21 3 TCC 1 2 44109 CASAVA_Build 1 73631284 2D27M3D20M1D CAAAAAAAAA ATAATAATAATAAAATAAATTTAAAAAAAAACAATTGCTAAATGAAATGCTGT/--AATAATAATAAAATAAACTTTAAAAAA---AATTGCTAAATGAAATGCTG- TAAGTAAGGA 3070 hom 33 het 14 0 12 12 N/A 0 0 44110 CASAVA_Build 1 73659393 2D TTAGTATTAT GA/-- GATAAATGAT 3070 hom 81 het 31 0 28 7 GA 2 1 44111 CASAVA_Build 1 73663941 2I TAGAGCAGGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 30 1 25 4 A 10 12 44112 CASAVA_Build 1 73665435 1I TCTTTCACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 659 hom 31 2 25 4 A 11 12 44113 CASAVA_Build 1 73666262 1D GAGTATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 30 1 28 2 T 11 10 44114 CASAVA_Build 1 73667336 1D CCTCCCCCAG C/- CCCCCCCCAC 2144 het 52 hom 7 1 5 1 C 9 8 44115 CASAVA_Build 1 73674851 1D ATAAACTGTA G/- TACATCCAGA 3070 hom 131 het 48 0 42 6 G 1 0 44116 CASAVA_Build 1 73683269 1D TTATTTAACG T/- TAAGTGTTCA 3070 hom 138 het 50 0 46 4 T 2 1 44117 CASAVA_Build 1 73707306 1I GCCAAAGTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 8 9 44118 CASAVA_Build 1 73711427 2D AGAAAAACTC TT/-- TTGTTATTGT 3070 hom 135 het 51 0 46 6 T 4 2 44119 CASAVA_Build 1 73717672 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 909 hom 31 2 21 8 TA 7 8 44120 CASAVA_Build 1 73729336 1D TTTTTCAAGG T/- TTTTAGCTTC 1320 het 1320 ref 12 6 4 2 T 5 4 44121 CASAVA_Build 1 73745454 2D TGTATATACG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TA 6 5 44122 CASAVA_Build 1 73750011 1I ATGAGACTAT -/G TCTTATTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 0 1 44123 CASAVA_Build 1 73752296 1D GTTTCATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 28 1 22 5 T 12 11 44124 CASAVA_Build 1 73753835 1I TTTATACTGC -/T TTTTTTCAGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 6 7 44125 CASAVA_Build 1 73754314 1I TCCTATTAAT -/A AATTCAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 3 44126 CASAVA_Build 1 73755439 1I AAAACACAAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 8 44127 CASAVA_Build 1 73755716 1D AGAAATGAGT G/- GCTGCCTTTT 3070 hom 36 het 24 0 13 12 G 2 1 44128 CASAVA_Build 1 73757053 1I AAATTGAAAG -/A AAAAAAATCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 7 8 44129 CASAVA_Build 1 73760533 4D55M4I TAAAAATTTC TTAGTTAATGGAAAAAAAAACTGGCAATAGAAAACAATAAGAAATGACTTAAAAAATAG----/----TTAATGGAAAAAAAAACTGGCAATAGAAAACAATAAGAAATGACTTAAAAAATAGAAGA AAGAGAGAAG 3070 hom 73 het 22 0 24 20 N/A 0 0 44130 CASAVA_Build 1 73761428 1I AAAATACTAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 8 44131 CASAVA_Build 1 73762653 1I CAGGATTTGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 8 9 44132 CASAVA_Build 1 73763449 1D TGGGCAAATA G/- GGGGTATTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 5 4 44133 CASAVA_Build 1 73765361 4D CAAAATCTTG CATT/---- CATTCTCCAG 3070 hom 120 het 41 0 40 1 CATT 2 1 44134 CASAVA_Build 1 73779199 1D TTCTTTAGTG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 48 het 20 0 17 5 A 8 7 44135 CASAVA_Build 1 73780213 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 173 hom 19 1 14 4 T 8 9 44136 CASAVA_Build 1 73787814 34I CAGTCCAAAG ----------------------------------/TCTCATTTGAGACAAGGAAAGTCCCTTCTGCCTA TCAGTCTGTA 3070 hom 63 het 20 0 21 3 TCTCATTTGAGACAAGGAAAGTCCCTTCTGCCTA 0 1 44137 CASAVA_Build 1 73791914 4I TTAGAGAACC ----/CTGA CTAATACAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CTGA 0 1 44138 CASAVA_Build 1 73810201 1I CCCTTGAAAG -/T CATGTCAGAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 1 44139 CASAVA_Build 1 73826539 1D TAAAATTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 10 9 44140 CASAVA_Build 1 73828361 8I TTTATTAAGA --------/AAATAAAG AAATAAAGAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AAATAAAG 1 2 44141 CASAVA_Build 1 73830837 5I ATTGTCTCTC -----/GTTAA GTTGTCTCAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 GTTAA 0 1 44142 CASAVA_Build 1 73831447 1D GTTTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 12 11 44143 CASAVA_Build 1 73839262 1I AGAGGTTCCC -/A AACCTCAATT 3070 hom 65 het 23 0 19 4 A 2 3 44144 CASAVA_Build 1 73840685 1I CCTTAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 28 1 24 3 T 10 11 44145 CASAVA_Build 1 73843665 1I CAATAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 8 9 44146 CASAVA_Build 1 73846246 1D TTAATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 A 12 11 44147 CASAVA_Build 1 73849563 1D AAGCTGTATA T/- TTTTCAGTGA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 5 4 44148 CASAVA_Build 1 73851135 3D TCTGAGCTTG ACA/--- ACAAGTTACC 3070 hom 108 het 43 0 37 7 ACA 2 1 44149 CASAVA_Build 1 73851698 6D AATGGATTGT ATTACA/------ ATCCATTGGA 3070 hom 66 het 23 0 23 4 ATTACA 1 0 44150 CASAVA_Build 1 73852664 1I ACTTCCGCGG -/A AAATGAGTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 44151 CASAVA_Build 1 73854334 2I TTTCTTGATC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 11 44152 CASAVA_Build 1 73858766 1D CAGGAGCTGG T/- TTTTTTGAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 7 6 44153 CASAVA_Build 1 73859768 4I AATAAAATAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAAT 2 3 44154 CASAVA_Build 1 73861403 1I ATAAAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 9 10 44155 CASAVA_Build 1 73863012 1D CCAAAGAATA T/- TTAAAGGCAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 3 2 44156 CASAVA_Build 1 73865214 1I GTGGGATTTA -/C CCCCTGCTGA 3070 hom 103 het 43 0 35 8 C 4 5 44157 CASAVA_Build 1 73888283 2D TATATATGTA AT/-- ATATATACAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 4 3 44158 CASAVA_Build 1 73891631 5I GCATAACATC -----/ATAAA ATAAAAATGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 ATAAA 1 2 44159 CASAVA_Build 1 73891941 1D TTGAACCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 20 11 T 13 12 44160 CASAVA_Build 1 73895889 2D GTTTAGAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 313 hom 44 1 39 5 AC 7 6 44161 CASAVA_Build 1 73903592 1D ATGTGGAACT G/- TAAGTCCAAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 G 1 0 44162 CASAVA_Build 1 73911965 5D TCTCTGGGTC TATTA/----- TATTATGACT 3070 hom 120 het 45 0 41 5 TATTA 2 1 44163 CASAVA_Build 1 73921927 1D TTCTATTGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 9 44164 CASAVA_Build 1 73929391 1D TTTTTCAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 T 11 10 44165 CASAVA_Build 1 73931329 4D AGAGAAGCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3064 hom 27 9 10 10 AAAC 5 4 44166 CASAVA_Build 1 73934492 1I TGTAATAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 10 44167 CASAVA_Build 1 73935499 1D ACTCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 17 7 A 13 12 44168 CASAVA_Build 1 73962759 1D TATGGTTTAA G/- GAGATCTATA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 G 2 1 44169 CASAVA_Build 1 73963214 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 29 het 31 1 25 5 AC 10 9 44170 CASAVA_Build 1 73968523 1D TGGGAAGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 224 hom 43 1 36 6 A 10 9 44171 CASAVA_Build 1 73969322 2D ACTGAAAAAA AG/-- AGAGAGTAAA 3070 hom 27 het 22 0 13 9 AG 4 3 44172 CASAVA_Build 1 73973133 12I AGGGTTTGAT ------------/GTATGAACTGAG GATGGCCATA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 GTATGAACTGAG 0 1 44173 CASAVA_Build 1 73977517 3D GTACAATAAA AAC/--- AACAAAATAT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 AAC 2 1 44174 CASAVA_Build 1 73983359 1I AAGATTAAAC -/A AAAAATTTAA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 A 5 6 44175 CASAVA_Build 1 73990331 1D TATAAAAAAG A/- AATAAGACAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 3 2 44176 CASAVA_Build 1 73994623 1I AACAAAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 C 0 1 44177 CASAVA_Build 1 74000390 1D CTAGCTTTCA G/- GAGAATAATT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 G 2 1 44178 CASAVA_Build 1 74003263 2D TGTGCATGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 CA 7 6 44179 CASAVA_Build 1 74011882 1D AGCAAGACTC A/- AAAAAAAAAA 1542 het 512 hom 14 4 5 6 A 17 16 44180 CASAVA_Build 1 74023304 1I TAAGTGCTGT -/C CCCCAGGCTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 4 5 44181 CASAVA_Build 1 74024053 1I CTCAAAAAAA -/T AAAAAAGAAA 3070 hom 18 het 31 1 19 11 T 0 1 44182 CASAVA_Build 1 74041538 1D CACAGTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 15 14 44183 CASAVA_Build 1 74050786 1I TATTCAAACC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 34 13 11 10 T 8 9 44184 CASAVA_Build 1 74071362 2D AACAGCTGCA TT/-- TTTTGATGTG 3070 hom 102 het 43 0 35 9 T 6 4 44185 CASAVA_Build 1 74085074 1D TTTATAGACC T/- TTGAGTAATA 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 T 3 2 44186 CASAVA_Build 1 74085394 3D CCCCCTACTC CTT/--- CTTCCTCTTC 3070 het 3070 ref 44 23 20 4 CTT 2 1 44187 CASAVA_Build 1 74097008 1D GAATAAACTC T/- TGGATGTTAA 3070 het 2166 hom 25 7 17 1 T 2 1 44188 CASAVA_Build 1 74099315 1D GTGGTGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 A 11 10 44189 CASAVA_Build 1 74100992 1I TAAATTAACA -/T TTTTTTTATG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 7 8 44190 CASAVA_Build 1 74102700 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAGAATC 3070 het 3070 hom 46 23 23 0 A 6 5 44191 CASAVA_Build 1 74110921 1I TCACTGATAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 47 26 13 8 T 8 9 44192 CASAVA_Build 1 74111513 3D ATGGCAAAAT ATC/--- ATCCATATGG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 ATC 2 1 44193 CASAVA_Build 1 74111642 1D CTGATATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1302 hom 27 7 12 8 A 15 14 44194 CASAVA_Build 1 74112087 2I CTTTAAGAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 A 10 12 44195 CASAVA_Build 1 74113045 1I TTTATTAACA -/T TGTATACCTC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 1 2 44196 CASAVA_Build 1 74118221 1I GCTTAGAGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 9 10 44197 CASAVA_Build 1 74129066 4I AATCTAATGG ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 13 16 13 TTTC 4 5 44198 CASAVA_Build 1 74143570 1D TTGCTGTCTC A/- GGGGTGACAG 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 A 1 0 44199 CASAVA_Build 1 74149907 1D ATGTGATTTT G/- GGTGAGAACA 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 G 3 2 44200 CASAVA_Build 1 74151767 1D GAGGGAACCA C/- CCCCCATGAT 3070 hom 130 het 46 0 42 4 C 6 5 44201 CASAVA_Build 1 74163059 1D TAGCACAGTT A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 43 19 23 1 A 7 6 44202 CASAVA_Build 1 74165790 11D AGAATATATT GAGTAAGAATA/----------- GATAAGGCTG 3070 het 3070 ref 28 18 8 5 GAGTAAGAATA 1 0 44203 CASAVA_Build 1 74172070 14D ACATGAACAT ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 het 1079 hom 24 6 11 8 AC 16 9 44204 CASAVA_Build 1 74174007 1D TATTGATTTT A/- ATAAAAATAT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 2 1 44205 CASAVA_Build 1 74191891 1I GATTATCGTC -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 T 6 7 44206 CASAVA_Build 1 74196845 1D GGAAGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 T 11 10 44207 CASAVA_Build 1 74207729 2D TCAAACACTC TT/-- TTATGATATC 3070 het 3070 hom 45 19 22 7 T 4 2 44208 CASAVA_Build 1 74207973 1D ATTCACAAAG A/- GGGGGGATGT 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 A 1 0 44209 CASAVA_Build 1 74210813 1D AAGCATGGGA G/- CACATAAATG 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 G 1 0 44210 CASAVA_Build 1 74212278 1D TGATCTAACC A/- AGGTAAGCCC 3070 hom 166 het 64 0 56 8 A 2 1 44211 CASAVA_Build 1 74212846 1I TGAACAGAGG -/A AAAATATCTG 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 4 5 44212 CASAVA_Build 1 74214446 4I TCTTTTCTTG ----/TTTC TTTCTTTTCA 3070 hom 59 het 31 0 24 7 TTTC 1 2 44213 CASAVA_Build 1 74219241 1I TATAACTACA -/C CAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 C 1 2 44214 CASAVA_Build 1 74223043 1I ATTCCTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 914 hom 35 2 24 9 T 10 11 44215 CASAVA_Build 1 74226527 1I CTGCATATAT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 A 7 8 44216 CASAVA_Build 1 74229241 1I TGAATGGTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 7 8 44217 CASAVA_Build 1 74229633 2D AGATTATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 37 2 18 17 A 12 10 44218 CASAVA_Build 1 74232351 1I AACTATTAAA -/C ACACACACAT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 C 0 1 44219 CASAVA_Build 1 74235497 6D TTTTGAGAAA TTTAAC/------ TTTAAGTCTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 TTTAAC 1 0 44220 CASAVA_Build 1 74240705 1I GCAATAAAGC -/T TTTTTAATCA 3043 het 2432 hom 20 8 7 5 T 5 6 44221 CASAVA_Build 1 74242424 1D TATTTTGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 146 het 58 0 48 10 T 10 9 44222 CASAVA_Build 1 74259966 2I AAAGATGGTA --/AC ACACATTTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AC 2 3 44223 CASAVA_Build 1 74274421 1I AAAAATGCTG -/C CCCCCAAATA 3070 het 3070 ref 40 25 14 1 C 5 6 44224 CASAVA_Build 1 74286956 1D TTTATGTAAA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 44225 CASAVA_Build 1 74297380 5I CCATAGCAGA -----/TATGT TATGTTATTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TATGT 1 2 44226 CASAVA_Build 1 74309252 2D ATATATATCA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 19 0 13 7 AT 6 5 44227 CASAVA_Build 1 74311893 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACAGTT 3070 hom 79 het 32 0 26 6 C 0 1 44228 CASAVA_Build 1 74321737 1I GTATATTTTA -/T TTTTTAAAGG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 5 6 44229 CASAVA_Build 1 74323596 1D ACATGGTGGC A/- AAAAAAAAAA 2458 het 634 hom 33 7 10 16 A 17 16 44230 CASAVA_Build 1 74328599 1I TACAAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 11 44231 CASAVA_Build 1 74330250 12D CTACATATTT CAGCCTTCCTTG/------------ CAGCTGAATG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CAGCCTTCCTTG 1 0 44232 CASAVA_Build 1 74343530 1D TGTGTGTGTA T/- TTTTTTTTTT 1489 het 192 hom 23 3 5 15 T 14 13 44233 CASAVA_Build 1 74376436 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 28 1 22 5 A 12 11 44234 CASAVA_Build 1 74383804 1I ATCTTCTAAA -/C TTTTATGTGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 44235 CASAVA_Build 1 74387316 1I ATAAATTATA -/T TGGTTATAAG 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 1 2 44236 CASAVA_Build 1 74411549 2I AGACTGGGCA --/AC AGAGTGAGAG 3070 hom 36 het 17 0 11 6 AC 0 1 44237 CASAVA_Build 1 74414916 1D TTTCTCAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 342 hom 45 3 38 4 T 10 9 44238 CASAVA_Build 1 74439262 4D TTTGTAACTC TGTA/---- TGAATGTTTA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TGTA 1 0 44239 CASAVA_Build 1 74445958 1D TATGAAAATT A/- ATTGTTTGGT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 2 1 44240 CASAVA_Build 1 74450764 1D AATGGAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1203 hom 46 6 21 20 T 16 15 44241 CASAVA_Build 1 74457495 1D TTTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 9 T 12 11 44242 CASAVA_Build 1 74462100 1D CTCATTGTTT G/- GGTGCCAGCT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 3 2 44243 CASAVA_Build 1 74462190 1D CACCTCTGGA C/- CTGCACAGGA 3070 hom 144 het 50 0 48 2 C 2 1 44244 CASAVA_Build 1 74489104 1D ATCTTTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1498 hom 29 7 12 10 T 16 15 44245 CASAVA_Build 1 74489678 3D TAATTATAAT AAC/--- AATTTCTACT 1972 het 1972 ref 19 10 6 6 AAC 1 0 44246 CASAVA_Build 1 74504180 1I AATGGAAGGG -/A AAAATACACA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 A 4 5 44247 CASAVA_Build 1 74506471 1I ATATTTTCTA -/T TTTAAAATAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 3 4 44248 CASAVA_Build 1 74506860 1D CAAATCAATA T/- TTTATTTGGA 3070 hom 129 het 44 0 44 0 T 4 3 44249 CASAVA_Build 1 74509364 1I TTATTTATTA -/G GTAAGAAGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 2 44250 CASAVA_Build 1 74511273 1I AATAGTTATG -/T TTCCCCCTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 3 44251 CASAVA_Build 1 74516410 4I TTTCTCTCTC ----/TCTT TCTCTTATTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TCTT 0 1 44252 CASAVA_Build 1 74518328 1I AAATCAGGTG -/A ATGATCACAG 3070 hom 98 het 36 0 31 5 A 1 2 44253 CASAVA_Build 1 74520083 3I GATTTGTTTT ---/ATC ATCATATGGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 ATC 1 2 44254 CASAVA_Build 1 74523802 1I AACCACAATG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 7 8 44255 CASAVA_Build 1 74527336 1D GGTTAAACAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 8 7 44256 CASAVA_Build 1 74527757 121D CCATAGGTAG TGTCATTAGTCTTTTAGGTCTGCATGCCTCTCTCTATGACTTTTCCCAATCTTTGTTTTAATCAATAATCTTGTCTCCAGTCTAACATGGGAATTGTGCTCTCTGGCATAAAATGGGCTAC/------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TGAATTACAG 3070 hom 48 het 17 0 17 5 TGTCATTAGTCTTTTAGGTCTGCATGCCTCTCTCTATGACTTTTCCCAATCTTTGTTTTAATCAATAATCTTGTCTCCAGTCTAACATGGGAATTGTGCTCTCTGGCATAAAATGGGCTAC 1 0 44257 CASAVA_Build 1 74528485 1D TCTATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 846 hom 43 4 32 7 T 12 11 44258 CASAVA_Build 1 74533450 1D GTTACTAATT A/- TTTTTTTACT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 1 0 44259 CASAVA_Build 1 74537694 1I CTTGAAAGAC -/T TTTTTTGATA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 6 7 44260 CASAVA_Build 1 74539810 1D TGAAGAATTT C/- AACTTTATAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 C 1 0 44261 CASAVA_Build 1 74552332 22D TATATATATA TATATATATATATATATATATG/---------------------- TATATATATG 1928 het 242 hom 5 2 7 0 TATATATATATATATATATATG 1 0 44262 CASAVA_Build 1 74555129 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1803 hom 18 het 8 0 6 2 T 16 14 44263 CASAVA_Build 1 74597108 1D GATAACTCAC A/- AAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 A 5 4 44264 CASAVA_Build 1 74602203 1I AATAAAAAAA -/T AACCTTAGAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 44265 CASAVA_Build 1 74604223 1D ATCACAATGC T/- TTTTTTTTTT 2842 het 2842 ref 49 34 7 8 T 13 12 44266 CASAVA_Build 1 74609805 2I AAAGATGGGT --/AG AGTTTGGAAG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AG 1 2 44267 CASAVA_Build 1 74617608 2D TACACGCGCG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 32 12 13 9 CA 9 8 44268 CASAVA_Build 1 74633615 2I TGGGGAACTC --/TG TGCCTGCATG 3070 hom 82 het 35 0 26 9 TG 1 2 44269 CASAVA_Build 1 74634560 2D GAAAAATGTA AG/-- AGAGACATTG 3070 het 2619 hom 23 8 9 8 AG 3 2 44270 CASAVA_Build 1 74635474 2I ACATGATGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 AG 5 6 44271 CASAVA_Build 1 74662347 5D CACATTAGAA TAGAT/----- AAGAAAATAG 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 TAGAT 1 0 44272 CASAVA_Build 1 74662869 1I CAGGCACCTG -/A AAATTCCCAC 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 A 3 4 44273 CASAVA_Build 1 74664277 1D CAGTGAATTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 114 het 41 0 39 4 A 9 8 44274 CASAVA_Build 1 74666215 1D GAGTATGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 58 19 23 17 T 12 11 44275 CASAVA_Build 1 74668991 5D ATAAACAATT AACTC/----- AAGTCATTTG 3070 het 3070 ref 47 29 16 4 AACTC 1 0 44276 CASAVA_Build 1 74707851 1D TGTTTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 11 10 44277 CASAVA_Build 1 74711805 1I TAAAAGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 11 12 44278 CASAVA_Build 1 74713277 1D AAAAGGCTAC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 6 44279 CASAVA_Build 1 74758441 2I CCCTTTCCCC --/CT GATTCCACAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CT 0 1 44280 CASAVA_Build 1 74759759 2D ACACACACAC AT/-- GTAAACGCAT 3070 het 3070 ref 45 20 20 6 AT 1 0 44281 CASAVA_Build 1 74761714 1I AAGATTTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 8 9 44282 CASAVA_Build 1 74761785 1D AGACTCACTT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 9 8 44283 CASAVA_Build 1 74762942 7I GAGATACAGC -------/AGCAAAT AGCAAATAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGCAAAT 1 2 44284 CASAVA_Build 1 74768996 1D ACTCAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2579 hom 39 12 19 8 T 16 15 44285 CASAVA_Build 1 74770735 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTCTT 2462 het 209 hom 13 2 7 4 T 8 7 44286 CASAVA_Build 1 74772495 2D AATTTCACTC TT/-- AACTTTCAAG 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 T 2 0 44287 CASAVA_Build 1 74773006 1D TACAGATTTC T/- TTTATATAAG 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 T 4 3 44288 CASAVA_Build 1 74773306 1I GCATGTATGT -/A AAAAATCAGG 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 5 6 44289 CASAVA_Build 1 74779044 1D GCTGTTCCCC T/- TTTAGCCAAG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 4 3 44290 CASAVA_Build 1 74786032 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 18 0 16 4 T 10 9 44291 CASAVA_Build 1 74790687 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 25 1 23 1 A 18 17 44292 CASAVA_Build 1 74797005 2D AAGAACTGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 22 6 A 12 10 44293 CASAVA_Build 1 74801781 1D TGTTCTCTGC T/- TTCTCAGTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 3 2 44294 CASAVA_Build 1 74805451 1D AAAGCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 22 9 A 12 11 44295 CASAVA_Build 1 74806106 1D CACATGACCT G/- AGATTGACTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 1 0 44296 CASAVA_Build 1 74813310 1D TCCTCATTTG T/- TTTTTACTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 6 5 44297 CASAVA_Build 1 74815518 1I TAGTTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 42 2 34 6 A 11 12 44298 CASAVA_Build 1 74816969 8D TCTTTCTTTA CTTCCTTC/-------- CTTCCTTCCT 3070 hom 74 het 30 0 24 11 CTTC 6 4 44299 CASAVA_Build 1 74863201 1I TTGGGTCTTG -/T TATGTTGGCC 3070 hom 120 het 43 0 38 5 T 1 2 44300 CASAVA_Build 1 74871436 1I AAAGGAAAGT -/C ACTCTCCAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 0 1 44301 CASAVA_Build 1 74882356 1D GAAATTAATT A/- GACATATTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 1 0 44302 CASAVA_Build 1 74902009 1I GCTAACACAG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 7 8 44303 CASAVA_Build 1 74903485 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 11 12 44304 CASAVA_Build 1 74913697 1D CCATTCCAAG A/- AAAAAAAAAA 1111 het 1111 ref 34 23 3 8 A 13 12 44305 CASAVA_Build 1 74935932 5D ATTTCAGAGG TTAAT/----- TTAAACACCA 3070 hom 93 het 34 0 30 5 TTAAT 1 0 44306 CASAVA_Build 1 74937240 2D ATGGATAAAC TG/-- TGAAACAGAA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 TG 2 1 44307 CASAVA_Build 1 74938030 5D TATTTTTGAT GTTAA/----- GTTTTTAGAT 3070 hom 33 het 14 0 12 3 GTTAA 1 0 44308 CASAVA_Build 1 74939021 1I CCCGAGTAGC -/T TGGGATTACA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 2 44309 CASAVA_Build 1 74939344 4D CTGGACTCAA CTAG/---- ATTTGTTCCA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTAG 1 0 44310 CASAVA_Build 1 74967407 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 13 12 44311 CASAVA_Build 1 74968229 2D AAGCTGGGTG CT/-- CTCTCTCTCT 1286 het 1286 ref 38 28 3 8 CT 8 7 44312 CASAVA_Build 1 74986092 2I CACACATATG --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 TA 4 5 44313 CASAVA_Build 1 74986155 2D ATACACACAC AT/-- ATACACATAT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 AT 2 1 44314 CASAVA_Build 1 74986415 8I TTGAGTTGTG --------/ACAACTTA ACAACCAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 ACAACTTA 0 1 44315 CASAVA_Build 1 74991201 1D TCTAGAATTG C/- CATAACTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 C 2 1 44316 CASAVA_Build 1 75005599 4D TTGTGTTCTA AAAG/---- AGAGAGGAAA 3070 het 3070 hom 52 23 26 12 AAAG 1 0 44317 CASAVA_Build 1 75010780 1D TGAAATCATT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 69 het 24 0 24 1 A 8 7 44318 CASAVA_Build 1 75021936 4D TAGTAAGAAC TAAG/---- TGTTTGCTAT 3070 het 3070 hom 41 17 18 7 TAAG 1 0 44319 CASAVA_Build 1 75028286 1D CCCCTGCACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 T 10 9 44320 CASAVA_Build 1 75043422 17I GGTCTTTTAA -----------------/TCCCTTCTACTACCATC TCCCATGGCA 3070 het 3070 hom 45 21 23 4 TCCCTTCTACTACCATC 0 1 44321 CASAVA_Build 1 75047769 6D CACGGTTGAC TATGTT/------ TGATTATGAG 3070 het 3070 ref 27 14 10 5 TATGTT 1 0 44322 CASAVA_Build 1 75048802 2D ATAATTATAT AA/-- GTTATATTTG 3070 hom 18 het 7 0 7 1 A 2 0 44323 CASAVA_Build 1 75055226 1D AGATGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 12 11 44324 CASAVA_Build 1 75059642 1I AAATACTAGC -/A AAAATTATAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 4 5 44325 CASAVA_Build 1 75065254 20I TAATAAAGTG --------------------/AAACACACACACACACACAC AAACACACAC 3070 het 3070 ref 42 24 11 9 AAACACACACACACACACAC 0 1 44326 CASAVA_Build 1 75074588 1D CTTGATACCA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 7 6 44327 CASAVA_Build 1 75092513 5D ATGAGGATAT GAAAA/----- GAAAAGTCCC 3070 het 3070 ref 36 15 15 8 GAAAA 2 1 44328 CASAVA_Build 1 75122048 1D AAATAAATGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 A 9 8 44329 CASAVA_Build 1 75131277 1D ACACAGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 11 10 44330 CASAVA_Build 1 75137131 1D TTCATGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 10 9 44331 CASAVA_Build 1 75144314 1I TTAAGACAGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 8 9 44332 CASAVA_Build 1 75172440 2D TAACCAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 12 10 44333 CASAVA_Build 1 75175418 1D CAAAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 31 1 22 8 T 15 14 44334 CASAVA_Build 1 75191609 1D TTTAGAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 11 10 44335 CASAVA_Build 1 75201428 1I AATCAGGCAG -/C CCCCCCTAAG 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 C 6 7 44336 CASAVA_Build 1 75205428 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2183 hom 18 6 9 3 A 9 10 44337 CASAVA_Build 1 75217078 1I AACACCACTT -/A AAAAAAAAAA 1588 het 1588 ref 26 9 6 11 A 13 14 44338 CASAVA_Build 1 75234525 1I TAACAGAGAG -/C CCCCCCCCTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 C 8 9 44339 CASAVA_Build 1 75238476 1I TAACTAAGAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 97 het 39 0 33 6 T 8 9 44340 CASAVA_Build 1 75241730 4I GTACGCAGTG ----/TCTC TCTCCACTTT 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 TC 2 4 44341 CASAVA_Build 1 75244109 1I TTCCTGACAT -/A AAGCTCCTAT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 2 3 44342 CASAVA_Build 1 75262307 1D ACTTACCTCA T/- TTTTTAATTG 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 T 6 5 44343 CASAVA_Build 1 75264935 1I AAGGTGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 A 10 11 44344 CASAVA_Build 1 75265432 3D AAAATCACTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2915 het 2610 hom 25 10 7 8 A 14 11 44345 CASAVA_Build 1 75275044 4I TGCAGGAGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 TTTG 2 3 44346 CASAVA_Build 1 75288703 3I TATATCAAAA ---/CAT CATGTTGCAT 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 CAT 1 2 44347 CASAVA_Build 1 75304198 1I TATCCTTGAG -/A ATAATCCATG 3070 het 2315 hom 25 6 10 9 A 1 2 44348 CASAVA_Build 1 75307303 1D AGACATGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 11 10 44349 CASAVA_Build 1 75312171 1I CTTGTCATAC -/T TTACTTCATA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 2 3 44350 CASAVA_Build 1 75317456 1D CTGCAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 15 12 T 13 12 44351 CASAVA_Build 1 75336886 1I ATTTTTGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1906 hom 17 5 10 2 T 11 12 44352 CASAVA_Build 1 75339864 6I TGAAGACATA ------/AACTTC ATTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 AACTTC 0 1 44353 CASAVA_Build 1 75343250 1D CCAGCACTGG C/- CAACAAAGTG 3070 hom 66 het 27 0 21 6 C 2 1 44354 CASAVA_Build 1 75343494 36D ATATATATAC ATATGTATATATATGTATATATATGTGTATATATAT/------------------------------------ ATATGTATAT 1863 hom 18 het 4 0 7 4 ATATGTATATATATGTATATATATGTGTATATATAT 1 0 44355 CASAVA_Build 1 75345023 3D ACTGCATAAC ATT/--- ATCAAACTTA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 ATT 1 0 44356 CASAVA_Build 1 75362662 4D GCGTAGGTAG ACAC/---- ACACACACAC 2440 het 94 hom 30 2 10 18 AC 9 7 44357 CASAVA_Build 1 75368177 4D AGAGTTGGAT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 TC 8 6 44358 CASAVA_Build 1 75373095 2D GACCTGGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 48 1 19 28 T 12 10 44359 CASAVA_Build 1 75380917 3D TTAACATCCT AAA/--- AACTATATTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 6 A 5 2 44360 CASAVA_Build 1 75382836 1I AAGGGAGGGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 8 9 44361 CASAVA_Build 1 75391798 1I TGATTCTCCT -/G CCTCAGCCTC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 G 0 1 44362 CASAVA_Build 1 75392665 1D AGTTTGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 11 10 44363 CASAVA_Build 1 75400526 1I AGGGGAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 43 2 26 15 T 13 14 44364 CASAVA_Build 1 75400856 1D GAGTTTTTAC A/- AAAATATATC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 5 4 44365 CASAVA_Build 1 75442208 3I CAAAATCCTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 TTG 2 3 44366 CASAVA_Build 1 75451765 2D AAAGAGATAA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 120 het 43 0 37 7 TC 7 6 44367 CASAVA_Build 1 75453535 1D CCCTTATGTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 9 8 44368 CASAVA_Build 1 75460745 1D TTTGAACAGG A/- AAAAAAAAAT 1199 het 1199 ref 57 44 3 10 A 10 9 44369 CASAVA_Build 1 75468527 1D ATGAATTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 24 0 15 9 T 12 11 44370 CASAVA_Build 1 75479358 2I AAATATTCTC --/TT GGTCTTGGAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 0 2 44371 CASAVA_Build 1 75486118 1D TGAAGTAGGG A/- TAAAAGCTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 4 A 1 0 44372 CASAVA_Build 1 75493719 1I TTGCCAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 9 10 44373 CASAVA_Build 1 75497130 1I GCCATTCTGC -/A GATTCTGCCA 3070 hom 51 het 19 0 16 3 A 0 1 44374 CASAVA_Build 1 75516512 3I AAATAAAATA ---/TAT TATTAAGTTA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TAT 1 2 44375 CASAVA_Build 1 75518052 2I TTTATTTCAG --/TA GGTTTTGGGA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TA 0 1 44376 CASAVA_Build 1 75521441 1I TCAGCATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 29 1 26 2 T 10 11 44377 CASAVA_Build 1 75522040 1D CTTTCCCTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 9 44378 CASAVA_Build 1 75538119 1D TTGTCTCTAC T/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 9 1 T 1 0 44379 CASAVA_Build 1 75538402 4D GTATATCTTT GCTA/---- GCTATCACTT 3070 hom 61 het 24 0 21 5 GCTA 2 1 44380 CASAVA_Build 1 75564536 1D TTCTTACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 13 12 44381 CASAVA_Build 1 75565359 2D CTAAGCTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 41 1 32 8 T 13 11 44382 CASAVA_Build 1 75567720 1D CATTTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 37 1 31 5 T 12 11 44383 CASAVA_Build 1 75569240 1D ACTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 40 2 24 14 T 17 16 44384 CASAVA_Build 1 75571745 1D TTTTTTTTTT G/- CACTTTAAAA 3070 het 458 hom 25 2 18 6 G 1 0 44385 CASAVA_Build 1 75574356 1D TAGATTTTCA T/- TTTTTTCTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 7 6 44386 CASAVA_Build 1 75580819 4D TGTCCAACTC CAAA/---- CAAAGCCTGT 3070 hom 120 het 44 0 40 8 CAAA 2 1 44387 CASAVA_Build 1 75738739 1D GTACACCCTT G/- GAAGCCATAT 3070 het 3070 ref 50 27 20 3 G 2 1 44388 CASAVA_Build 1 75742738 1I GTATGTCAAT -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 6 7 44389 CASAVA_Build 1 75747048 1I TTCTTTATGT -/A AAGAAAAGGT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 2 3 44390 CASAVA_Build 1 75760631 1D ACTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 27 0 20 7 A 13 12 44391 CASAVA_Build 1 75765991 1D GCACTGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 33 1 22 10 A 12 11 44392 CASAVA_Build 1 75770694 5I ATAAACTATA -----/ATAAT ATAAGTAGCC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ATAAT 0 1 44393 CASAVA_Build 1 75777865 1D TAAAAACTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 383 hom 30 3 13 14 A 10 9 44394 CASAVA_Build 1 75778335 1I CCAATCTAAA -/C TATAATGTAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 0 1 44395 CASAVA_Build 1 75784098 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1080 hom 29 4 19 6 T 13 12 44396 CASAVA_Build 1 75787414 1D TTTTATTTCC A/- GAGGTTTTGC 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 A 1 0 44397 CASAVA_Build 1 75790746 1D ATATAACGGC A/- AAAAAATATA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 7 6 44398 CASAVA_Build 1 75791173 1I TTTTCCATGC -/T TTTCACCTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 3 4 44399 CASAVA_Build 1 75791267 3I GAAATCAGGA ---/CAC CACCAGTTCA 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 CAC 1 2 44400 CASAVA_Build 1 75793724 1I AAAATTGACT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 8 9 44401 CASAVA_Build 1 75793920 2D CCAATTTGTG TC/-- TCTTATTTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TC 2 1 44402 CASAVA_Build 1 75802721 4I TGCAATCGTT ----/TTTG TTTATTTTTC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TTTG 0 1 44403 CASAVA_Build 1 75806582 1D AACTGGTACC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 A 9 8 44404 CASAVA_Build 1 75812077 1D AGAAAGCCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 A 10 9 44405 CASAVA_Build 1 75814764 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 2982 hom 17 het 8 0 7 1 T 9 8 44406 CASAVA_Build 1 75824814 1D TGGAGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 11 10 44407 CASAVA_Build 1 75825181 1I AGTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 T 10 11 44408 CASAVA_Build 1 75827019 1I TGGTTTTTTT -/A AAAAAGCAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 5 6 44409 CASAVA_Build 1 75827480 2D ATTCCATAAC AT/-- GTGGTAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 AT 1 0 44410 CASAVA_Build 1 75830111 1I CTTTCATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 11 44411 CASAVA_Build 1 75833726 1I CACTACAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 9 10 44412 CASAVA_Build 1 75836911 1D CATGAATGGA G/- CTGGAGGCCA 3070 het 3062 hom 22 8 9 5 G 1 0 44413 CASAVA_Build 1 75837432 1D ACACTTGACA T/- TTTGGATTAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 4 3 44414 CASAVA_Build 1 75839708 8D CTAATGTAAA TGACGGGT/-------- TGATGGGTGC 3070 het 1862 hom 12 4 9 0 TGACGGGT 1 0 44415 CASAVA_Build 1 75841631 1I TATTTGTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 26 10 T 11 12 44416 CASAVA_Build 1 75861302 1D CAGTAACTAT C/- AAACATTTAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 C 1 0 44417 CASAVA_Build 1 75869231 1D ATATTCTTCA G/- GGTCTGAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 G 3 2 44418 CASAVA_Build 1 75870611 1D TAACTCAGAT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 42 16 20 8 A 7 6 44419 CASAVA_Build 1 75887081 10I AAAACTTAAC ----------/ATGTCCTTGG ATTATGAGCA 3070 het 3070 ref 49 24 23 2 ATGTCCTTGG 0 1 44420 CASAVA_Build 1 75898396 1D AGAATTGCTT G/- AACCCAGGAG 3070 het 2556 hom 31 7 20 4 G 1 0 44421 CASAVA_Build 1 75900957 1I GTATGTAATA -/C CCCATCCAGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 3 4 44422 CASAVA_Build 1 75902392 1I CCTTCATGAT -/A AAAAAACCTC 3070 hom 36 het 16 0 12 4 A 6 7 44423 CASAVA_Build 1 75909714 2D TTAGAGAAGC AG/-- AGAGACTCAC 3070 het 3070 hom 35 14 19 4 AG 3 2 44424 CASAVA_Build 1 75910324 1D CCAACTATCC A/- CCCAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 A 1 0 44425 CASAVA_Build 1 75912901 1D GATCCCCCCC A/- ACCTCAGCCT 2184 hom 15 het 10 0 6 4 A 2 1 44426 CASAVA_Build 1 75912999 2D CAGGATCTAG AA/-- AATAGCCTCA 1884 het 1884 ref 14 10 4 0 A 4 2 44427 CASAVA_Build 1 75926758 3D TTTCGAGGTC CTT/--- CTTTATTGGC 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 CTT 2 1 44428 CASAVA_Build 1 75941935 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 9 3 A 13 12 44429 CASAVA_Build 1 75946509 1D CATGGGGAAA C/- CCCATCTCTA 2552 het 2552 ref 19 8 6 5 C 4 3 44430 CASAVA_Build 1 75953057 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 1904 hom 15 het 6 0 6 0 CTC 0 1 44431 CASAVA_Build 1 75963515 1D21M3I TGCTTACGGG AAAAAAAAAAGTAAAAAAAAAA---/-GAAAAAAAAGTAAAAAAAAAACCT CCTGCAGAAT 3070 het 3070 ref 29 18 12 5 N/A 0 0 44432 CASAVA_Build 1 75966818 1D GCTTTATATG T/- TTTGTTTGGA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 4 3 44433 CASAVA_Build 1 75967787 1I TTCTCTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3011 het 2391 hom 22 6 8 8 T 8 9 44434 CASAVA_Build 1 75968020 1I ACCCACCTCT -/G GCCTCCCAAA 3070 het 2725 hom 21 7 9 5 G 1 2 44435 CASAVA_Build 1 75970423 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 11 10 A 11 12 44436 CASAVA_Build 1 75974115 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1832 het 452 hom 11 2 5 4 A 14 15 44437 CASAVA_Build 1 75974726 1D AAATTTGCAA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 8 7 44438 CASAVA_Build 1 75976068 1I GAACCTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 11 12 44439 CASAVA_Build 1 75981192 7I GGAAAGCAGC -------/CTTTTCT ACCTCTTTGC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 CTTTTCT 0 1 44440 CASAVA_Build 1 75981448 2D TCCATTAAGG CT/-- CTCTCTCTCA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 CT 5 4 44441 CASAVA_Build 1 75983804 2I TCAAAATATC --/AT ATATATACTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 AT 3 4 44442 CASAVA_Build 1 75985480 1I CAGCTTATAC -/T TTTTTTTAGT 3070 het 2257 hom 28 6 16 6 T 7 8 44443 CASAVA_Build 1 75987170 2I TAATTTTAAC --/AA AGAGTCAAAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 1 3 44444 CASAVA_Build 1 75989057 2D AGTCTCGCTC TG/-- TTGCTCAGGC 3070 het 2563 hom 35 9 12 14 TG 1 0 44445 CASAVA_Build 1 75992678 1I AGAGATGAGG -/T TTTCACCATC 3070 het 2257 hom 17 5 9 3 T 3 4 44446 CASAVA_Build 1 75996246 1D CATCTGTGAA T/- TCCAGTAATT 3070 het 3070 hom 28 9 12 8 T 2 1 44447 CASAVA_Build 1 76000571 1I GCAGTGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2708 hom 28 11 10 7 A 12 13 44448 CASAVA_Build 1 76004602 2I CCTCTGGATT --/AA AAAAAAAAAA 2650 het 2650 ref 30 16 7 7 A 10 12 44449 CASAVA_Build 1 76011409 1I GACCCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 1146 het 1095 hom 29 6 8 15 A 15 16 44450 CASAVA_Build 1 76014488 1D ATTAAGACAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 58 het 25 0 19 6 T 8 7 44451 CASAVA_Build 1 76017248 1I GATTCGATCA -/C AGTGGAAGAA 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 C 0 1 44452 CASAVA_Build 1 76025634 1I CTAGTTAGTT -/A ACAATTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 1 2 44453 CASAVA_Build 1 76028629 2D AAAAATATTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 11 9 44454 CASAVA_Build 1 76030124 1D CCATACAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 32 1 26 5 A 11 10 44455 CASAVA_Build 1 76032266 37D CATCAGATTA CCTAAGAGTGAGACTTAACCCACTTTTAAATTGTTCT/------------------------------------- CAAAATTAGG 3070 het 3070 ref 33 22 19 2 CCTAAGAGTGAGACTTAACCCACTTTTAAATTGTTCT 1 0 44456 CASAVA_Build 1 76035893 1D28M1I ATCTAATTCA GGGAAAATAATATGTTTAGTATTAAAAGA-/-GGAAAATAATATGTTTAGTATTAAAAGAT GTGGGCTGGG 3070 hom 99 het 31 0 33 5 N/A 0 0 44457 CASAVA_Build 1 76038906 1D AGTGTTAGGG T/- TGATGAAGGA 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 T 2 1 44458 CASAVA_Build 1 76043657 2D CCATTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 35 1 22 12 T 15 13 44459 CASAVA_Build 1 76043828 1I GCTCAGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 168 hom 20 1 14 5 T 12 13 44460 CASAVA_Build 1 76048515 4I TTTGTTTGTC ----/TGTT TGTTTTTGAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TGTT 1 2 44461 CASAVA_Build 1 76051987 3D CACTTACCAT AAG/--- AAGACCTTCA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 AAG 2 1 44462 CASAVA_Build 1 76052720 1I CCTGGGCAAC -/T AGAGTGAGAC 3070 hom 87 het 35 0 28 7 T 0 1 44463 CASAVA_Build 1 76055645 2D GTTAAAATTA CT/-- CTGTCTTTGA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 CT 2 1 44464 CASAVA_Build 1 76056068 1D ATAAGTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 926 hom 44 3 30 12 A 12 11 44465 CASAVA_Build 1 76057026 1D GTATATTCCG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 7 44466 CASAVA_Build 1 76061085 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 9 10 44467 CASAVA_Build 1 76063178 1D TTCAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 25 2 12 12 T 15 14 44468 CASAVA_Build 1 76071046 9D CTAGATATTG ATGGAACGT/--------- ATCTCAAAAT 3070 het 1829 hom 11 4 7 3 ATGGAACGT 1 0 44469 CASAVA_Build 1 76089493 2I ATCTGCCATC --/TT GTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 35 1 21 13 T 0 2 44470 CASAVA_Build 1 76093307 1D TTTGTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 14 10 3 T 11 10 44471 CASAVA_Build 1 76099440 1D TCATCTAACC T/- TTTTTTCAAG 3070 hom 43 het 28 1 24 3 T 7 6 44472 CASAVA_Build 1 76116278 1D TAACTTAAGT A/- AATTTAAATA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 3 2 44473 CASAVA_Build 1 76119509 2I CTTACCAAAC --/AT GTGTTTTCAG 3070 hom 123 het 50 0 42 8 AT 0 1 44474 CASAVA_Build 1 76126883 1I TTCATATTTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 7 8 44475 CASAVA_Build 1 76138742 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2483 het 2261 hom 18 6 9 3 T 9 10 44476 CASAVA_Build 1 76143422 1I GTTGTTGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 9 10 44477 CASAVA_Build 1 76147744 1D CAGAATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1440 hom 28 6 17 5 T 13 12 44478 CASAVA_Build 1 76150946 3D TATATATATA TAT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 21 0 11 10 TAT 1 0 44479 CASAVA_Build 1 76155236 5D AAATGTAATC AGATA/----- AGATATGACA 3070 het 3070 ref 55 27 23 7 AGATA 2 1 44480 CASAVA_Build 1 76156121 1D TCTTTGCTAC T/- TTACTATTTA 3070 het 3070 ref 49 26 21 2 T 3 2 44481 CASAVA_Build 1 76159478 1D CTGAAAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 10 9 44482 CASAVA_Build 1 76168246 1I TTGGCAGAGA -/G GGGGGGGTGA 1859 het 1859 ref 21 9 7 5 G 7 8 44483 CASAVA_Build 1 76173783 1I TTCAGCTGCC -/T TTCAAACTTT 3070 het 3070 ref 43 26 16 1 T 2 3 44484 CASAVA_Build 1 76183984 2D AATAAATAGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 69 het 30 0 23 8 GA 7 6 44485 CASAVA_Build 1 76185718 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 10 9 44486 CASAVA_Build 1 76185832 1I TTGATTGGGA -/G GAAAATATTT 3070 het 3070 ref 48 29 13 6 G 1 2 44487 CASAVA_Build 1 76187400 4I CATATAGCCT ----/GTTC GTTCCTCTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 GTTC 1 2 44488 CASAVA_Build 1 76207171 1D CTATTTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 26 1 19 6 T 13 12 44489 CASAVA_Build 1 76211765 15D CATTGGCCAA AGCAAGCCACTGGCT/--------------- ATGCCTAATT 3070 hom 123 het 44 0 41 9 AGCAAGCCACTGGCT 1 0 44490 CASAVA_Build 1 76217023 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 9 18 11 T 10 11 44491 CASAVA_Build 1 76217243 1I ATATTATGTT -/G CTATAAAGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 0 1 44492 CASAVA_Build 1 76223383 1I GGTGCATGCC -/A GGGGTTGCGG 3070 hom 93 het 34 0 29 5 A 0 1 44493 CASAVA_Build 1 76229723 1D TTACATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 179 hom 29 1 24 5 T 12 11 44494 CASAVA_Build 1 76232462 4D GAACAGAGAC ACAT/---- ACACAGAGAG 3070 het 3070 hom 60 26 33 4 ACAT 1 0 44495 CASAVA_Build 1 76250178 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 27 1 22 4 A 10 11 44496 CASAVA_Build 1 76267611 1D39M1D AATTATGAGG TTTTTTTTTAGAAAATTTCTAATTTTTAGAAAAAAATTAGT/-TTTTTTTTAGAAAATTTCTAATTTTTAGAAAAAAATTAG- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 25 10 16 9 N/A 0 0 44497 CASAVA_Build 1 76277978 5I GAGACTTTTT -----/TTTTC TTTTTTTTTT 3070 het 1413 hom 32 7 16 9 TTTTC 0 1 44498 CASAVA_Build 1 76281665 2I GAAAAAAAAA --/GG GGGGGGGGGA 2032 het 1464 hom 17 4 5 8 G 9 11 44499 CASAVA_Build 1 76286644 2D TGTGTGTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 1416 het 1416 ref 60 39 4 17 TG 8 7 44500 CASAVA_Build 1 76288353 1I TCCCCGCAAG -/C CCCCCACCCA 2566 het 1458 hom 12 5 7 0 C 5 6 44501 CASAVA_Build 1 76299673 1I TCTTGTACTA -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 6 7 44502 CASAVA_Build 1 76304723 5D ACTTATAATT ACTTA/----- TTATTTTTAC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 ACTTA 1 0 44503 CASAVA_Build 1 76305733 1I ATGAAAAACC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 7 8 44504 CASAVA_Build 1 76309025 3D ATTCTGGATT AGA/--- AGAACTGTGC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AGA 2 1 44505 CASAVA_Build 1 76315259 10D CAGTTCCAAC CACCTTTGAG/---------- CACCTTTGAG 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 CACCTTTGAG 2 1 44506 CASAVA_Build 1 76315532 1D AACTATGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 T 12 11 44507 CASAVA_Build 1 76318570 1D GTGTTATTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 9 8 44508 CASAVA_Build 1 76319559 11D CTGGTGAGCT AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 38 0 37 4 A 20 9 44509 CASAVA_Build 1 76323046 3D GCTCCAACTC GTT/--- GTCCTAGACC 3070 het 3070 ref 46 24 18 6 GTT 1 0 44510 CASAVA_Build 1 76330758 1D TTAGAAGCAA T/- TTTTATGGGA 3070 het 3070 ref 58 30 22 7 T 5 4 44511 CASAVA_Build 1 76336881 1D TTCCCCATTT A/- AAAAAATGGG 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 7 6 44512 CASAVA_Build 1 76343488 1D ATTTTGTCAC A/- ATTTGCATGG 3070 hom 114 het 46 0 38 8 A 2 1 44513 CASAVA_Build 1 76345571 1D ACACTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1483 het 1483 ref 42 21 4 17 T 17 16 44514 CASAVA_Build 1 76355885 1I GCTGGACTAG -/C CTCTGAGCCT 3070 hom 163 het 61 0 55 6 C 1 2 44515 CASAVA_Build 1 76358083 16D7M10D ATGATAATAG ATATATGTAATAGATAGATGTAATCCCTGTTTT/----------------GATTCAA---------- ATAGGTTTGG 3070 hom 126 het 38 0 43 3 N/A 0 0 44516 CASAVA_Build 1 76362550 4I GTAGAGAGCT ----/GGAG GTGAAGCTGA 3070 hom 69 het 26 0 22 4 GGAG 0 1 44517 CASAVA_Build 1 76394386 3D TAAGGTTTTC TAA/--- TAATTAGACT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TAA 2 1 44518 CASAVA_Build 1 76399166 3D ACTTCAAATA TCT/--- TCTTCTCTAC 3070 het 3070 ref 21 14 7 1 TCT 3 2 44519 CASAVA_Build 1 76414064 1D GACCATTTGT C/- CTATACTATG 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 C 2 1 44520 CASAVA_Build 1 76419766 1I ATATAACTAT -/A GAATGGAGAG 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 0 1 44521 CASAVA_Build 1 76421115 2D ACCTTCATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 16 12 T 12 10 44522 CASAVA_Build 1 76424968 12D TTTATATTCA TGCTCTGGAAAT/------------ TGTACATGTA 3070 het 3070 ref 35 16 19 2 TGCTCTGGAAAT 1 0 44523 CASAVA_Build 1 76427860 4I AGAGATCAGA ----/AGCC AGCCAGCAAA 3070 het 3070 ref 54 30 18 6 AGCC 1 2 44524 CASAVA_Build 1 76432762 3I TATTTCAAAG ---/TAA TAATAATAAA 3070 het 3070 ref 18 8 7 3 TAA 3 4 44525 CASAVA_Build 1 76434158 1I GAAGGAGTAT -/G GGGTGAGGAA 3070 het 3070 ref 50 22 18 10 G 3 4 44526 CASAVA_Build 1 76435161 6D GTGATGTCTA CTTATT/------ CTTTCACTTG 3070 het 3070 ref 43 24 14 9 CTTATT 1 0 44527 CASAVA_Build 1 76436313 4D GTTGCTGTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 26 10 15 2 TTTG 3 2 44528 CASAVA_Build 1 76436942 3D CTGAAGAAGA TAG/--- TGGTGCTTTT 3070 het 3070 hom 52 19 27 6 TAG 1 0 44529 CASAVA_Build 1 76437302 1I TGGCAGTGTC -/A AGACAAGTTC 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 A 1 2 44530 CASAVA_Build 1 76439329 1I CAGCAGTGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 A 9 10 44531 CASAVA_Build 1 76439925 1I GAAAAAACTG -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 2 3 44532 CASAVA_Build 1 76441796 4I GTGACTTGTG ----/CATT TATTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 CATT 0 1 44533 CASAVA_Build 1 76443536 1D CTTCCAAATG C/- CCTGCTATGT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 C 3 2 44534 CASAVA_Build 1 76444117 3I GGGATGTTAA ---/AGG AGATTAGACC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AGG 0 1 44535 CASAVA_Build 1 76446322 1I68M3I GTGCCCCCCC -CCCCAAAAAATAGTTCACCCAGAACCCATGCTAGTCCTTTCATGCCTCAGGGACTCAGGATCCTGTAA---/TCCCCAAAAAATAGTTCACCCAGAACCCATGCTAGTCCTTTCATGCCTCAGGGACTCAGGATCCTGTAACTC CCCACTTAAA 3070 het 120 hom 30 1 45 12 N/A 0 0 44536 CASAVA_Build 1 76447002 1I TTATTGCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 8 9 44537 CASAVA_Build 1 76460948 4D AAAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 2727 het 2727 ref 19 11 6 5 AAAC 3 2 44538 CASAVA_Build 1 76479687 1D AGCAAGAGAG A/- AAAGTGGGAA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 A 4 3 44539 CASAVA_Build 1 76493304 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 37 0 28 9 T 13 14 44540 CASAVA_Build 1 76495006 1D ATAAAATGAC T/- TTTTTTTTTT 1394 het 1394 ref 34 28 4 2 T 13 12 44541 CASAVA_Build 1 76518257 1I7M3D CTCTCCTGTC -TCTCTCCTGT/TTCTCTTC--- CTTTTCTCTC 3070 hom 96 het 34 0 31 7 N/A 0 0 44542 CASAVA_Build 1 76521322 1I CCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 10 11 44543 CASAVA_Build 1 76522290 16I CCCTGGCTTG ----------------/TTGGAAGATGAGAATC TTGGGATTGG 3070 het 3070 ref 32 20 11 2 TTGGAAGATGAGAATC 0 1 44544 CASAVA_Build 1 76522900 1I TGCTTGAGGA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 8 9 44545 CASAVA_Build 1 76523899 1I TGTTTTCATA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 7 8 44546 CASAVA_Build 1 76530029 1D GGAATTTAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 34 21 13 1 A 9 8 44547 CASAVA_Build 1 76533365 1I CCAGTGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 10 11 44548 CASAVA_Build 1 76538086 1D CCAGAGAAAG T/- TTCATTATGC 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 T 3 2 44549 CASAVA_Build 1 76544835 2D TCAAGGCAAT AG/-- AGTTTTCATG 3070 het 3070 ref 39 26 10 5 AG 2 1 44550 CASAVA_Build 1 76544952 3D TTTTTTTTTT TGG/--- GGGGCGGGGG 3070 hom 43 het 29 0 24 7 TGG 1 0 44551 CASAVA_Build 1 76549561 1D TTTCTTTTTT A/- AAAAAATTAT 1243 het 464 hom 13 1 5 7 A 7 6 44552 CASAVA_Build 1 76565100 1D AAGTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 40 3 22 15 T 17 16 44553 CASAVA_Build 1 76572624 15D CTTCTCCATT TACCTTTTGCTTTTG/--------------- TGGAAATCAC 3070 het 3070 ref 42 25 21 5 TACCTTTTGCTTTTG 1 0 44554 CASAVA_Build 1 76604989 1D CTGGTCTGGC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 7 6 44555 CASAVA_Build 1 76614388 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 669 hom 37 2 30 5 A 7 8 44556 CASAVA_Build 1 76616942 1I TCCCCCCCCC -/A AAAAAAAAAA 2056 het 2056 ref 26 9 11 6 A 11 12 44557 CASAVA_Build 1 76624758 1I CCAGGGTGAA -/C TGAATTGTGA 3070 hom 69 het 31 0 23 8 C 0 1 44558 CASAVA_Build 1 76626163 1D TCTATGACTG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 8 7 44559 CASAVA_Build 1 76629204 2I TTAAAATGCT --/TA TATATATATA 3070 het 332 hom 27 3 13 11 TA 6 7 44560 CASAVA_Build 1 76629220 1D TATATATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 18 2 9 7 T 11 10 44561 CASAVA_Build 1 76633484 1I ACCTAACCAG -/A AATGGAGTCT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 2 3 44562 CASAVA_Build 1 76639176 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 11 12 44563 CASAVA_Build 1 76640312 2I TGAATTTATA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 118 het 45 0 40 5 T 9 11 44564 CASAVA_Build 1 76647029 2I TATCCAAGAC --/TT TTTCTTTTTC 3070 hom 135 het 49 0 45 4 T 3 5 44565 CASAVA_Build 1 76674138 1I TTTTATTTTT -/A TTTTTTAATG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 0 1 44566 CASAVA_Build 1 76675856 3D TTTTTTTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 23 1 17 5 T 14 11 44567 CASAVA_Build 1 76693128 1D73M1D CAGTTTGAAT ATGGAGTCTCTAATTCATTTTTAAGTTCTTGAAAGTTTTCTTGAATTATTTACTTGATAATTTTCTCCTATGTAT/-TGGAGTCTCTAATTCATTTTTAAGTTCTTGAAAGTTTTCTTGAATTATTTACTTGATAATTTTCTCCTATGTA- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 22 15 16 N/A 0 0 44568 CASAVA_Build 1 76700800 1I GCAGCCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 10 11 44569 CASAVA_Build 1 76715502 1D TCATCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 11 10 44570 CASAVA_Build 1 76726621 1D GTGTTGATTG T/- TAAGTTTTCT 3070 hom 38 het 27 0 16 12 T 2 1 44571 CASAVA_Build 1 76737001 1D AACAAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 28 1 21 6 A 12 11 44572 CASAVA_Build 1 76747807 3D TGATTTATAC CAA/--- CGAGATTTGA 3070 het 3070 hom 54 22 30 3 CAA 1 0 44573 CASAVA_Build 1 76751250 4I1M2D ATATCTATTT ----AGG/TTCAA-- TATATTGGGT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 N/A 0 0 44574 CASAVA_Build 1 76771144 1D TGAATAATGC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 120 het 49 0 41 8 T 7 6 44575 CASAVA_Build 1 76771609 4D CCTCATTCCC ACAA/---- ACAAACACCA 3070 het 3070 ref 54 25 20 11 ACAA 2 1 44576 CASAVA_Build 1 76775034 1D TTACATAAAA G/- GGAACAATTC 3070 het 3070 hom 21 8 13 0 G 3 2 44577 CASAVA_Build 1 76777940 1I AATTTGCAAG -/A AAAAAAAAAC 2492 hom 18 het 8 0 7 1 A 9 10 44578 CASAVA_Build 1 76782353 2D TAATTACATT TA/-- TATATATATA 2521 hom 21 het 10 0 8 2 TA 10 9 44579 CASAVA_Build 1 76783931 2D ATGAAGAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2497 het 326 hom 19 3 8 8 T 16 14 44580 CASAVA_Build 1 76791629 1I CCACAAAATG -/A AGGGTTGCTA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 1 2 44581 CASAVA_Build 1 76791950 1D TTTCTCTCTA T/- TTTTACTCGT 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 T 5 4 44582 CASAVA_Build 1 76792157 4D CAGTACTGTT TCTG/---- TCTAATTACA 3070 het 3070 hom 40 14 21 6 TCTG 1 0 44583 CASAVA_Build 1 76792788 3D GGACAGAGGC TCT/--- TCTTTCCCTG 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 TCT 2 1 44584 CASAVA_Build 1 76820011 1D TGTACATATG T/- TACCATCATC 3070 het 3070 hom 38 12 25 1 T 2 1 44585 CASAVA_Build 1 76828222 4I CTGCTCTCGT ----/AATC AATCCATTTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 AATC 1 2 44586 CASAVA_Build 1 76829455 2D TGTGTGCGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 41 16 16 11 TG 9 8 44587 CASAVA_Build 1 76831272 1D TTTGTCCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 T 10 9 44588 CASAVA_Build 1 76833963 2D CATACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 CA 8 7 44589 CASAVA_Build 1 76837012 1D TTCACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 5 A 13 12 44590 CASAVA_Build 1 76837503 1D AGATTTTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 10 9 44591 CASAVA_Build 1 76838702 1D CAAATTTCAA C/- CCCACCCCTA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 C 4 3 44592 CASAVA_Build 1 76854182 2D TCTTCCCTCT GA/-- GAGAGATGGC 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 GA 4 3 44593 CASAVA_Build 1 76857333 1D GACTGTTAAG A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 7 6 44594 CASAVA_Build 1 76860444 1D GAGCCAAAGG C/- CCCCAAAGGA 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 C 5 4 44595 CASAVA_Build 1 76869576 1D AACAGGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1115 hom 33 4 13 17 A 15 14 44596 CASAVA_Build 1 76871106 3I ATCTAGCCTT ---/TAA TAATGTGACA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 TAA 1 2 44597 CASAVA_Build 1 76872076 1D TTTAAAAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 9 8 44598 CASAVA_Build 1 76875291 5D GGGATAAATT GTTTA/----- GTTTAATCAG 3070 het 3070 ref 37 21 15 3 GTTTA 2 1 44599 CASAVA_Build 1 76877451 1I TGAAGCTCTG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 132 het 47 0 44 3 A 7 8 44600 CASAVA_Build 1 76879525 2I CTAGGTAGGC --/AA AAGAAGAGTA 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 A 2 4 44601 CASAVA_Build 1 76881717 11I GCAGCTTAAA -----------/ATTATGTAATC ATTATACCAC 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 ATTATGTAATC 0 1 44602 CASAVA_Build 1 76882336 1D TGCAATTCCT C/- CCCCCCTCTT 3070 hom 90 het 33 0 31 6 C 7 6 44603 CASAVA_Build 1 76886783 1I TGGACAATCA -/G GATTTCTTCC 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 G 1 2 44604 CASAVA_Build 1 76894048 1D CTACAACTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 A 10 9 44605 CASAVA_Build 1 76901093 2D GGCTTGATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 39 2 15 22 T 18 16 44606 CASAVA_Build 1 76904326 1D TTTCCACATG T/- TCAAAAGCCA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 2 1 44607 CASAVA_Build 1 76904744 16D CCATATATAT ATATATATATATACAC/---------------- ATATATATAA 3070 het 247 hom 22 2 16 6 ATATATATATATACAC 1 0 44608 CASAVA_Build 1 76907768 4D34M2D TTGTTTGTTC GTTTGTTTGTTTTTTAATCTTTGGCTTATTGTGCGGGCTT/----GTTTGTTTTTTAATCTTTGGCTTATTGTGAGGGC-- TTTTTTTTTT 3070 hom 144 het 42 0 48 7 N/A 0 0 44609 CASAVA_Build 1 76920046 1I CATTTAAAAT -/G TCTGCAACAC 3070 hom 110 het 45 0 37 8 G 0 1 44610 CASAVA_Build 1 76923687 2D CAGGCCAATT AC/-- ACTCTGATTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 8 AC 2 1 44611 CASAVA_Build 1 76923840 2D TTTCCTGTTA CT/-- CTCTCTCCTC 3070 het 3070 hom 32 10 17 6 CT 4 3 44612 CASAVA_Build 1 76927178 1I TTAATCTTTT -/A GTGACAGAGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 0 1 44613 CASAVA_Build 1 76929951 1I ACACTGCTAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 A 8 9 44614 CASAVA_Build 1 76935535 4I AATATATAAA ----/CTAT CTAGTAATAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CTAT 0 1 44615 CASAVA_Build 1 76936187 2D AGAAGCTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 16 14 44616 CASAVA_Build 1 76936340 2I TTTGGAAAAC --/TG GCATTACATA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 TG 0 1 44617 CASAVA_Build 1 76939378 1I TGTTCTTATG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 31 18 9 5 A 7 8 44618 CASAVA_Build 1 76939481 2D ATGATAACTG TA/-- TATATATATG 3070 hom 45 het 28 0 16 14 TA 5 4 44619 CASAVA_Build 1 76940886 1D TAGGCTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 30 2 20 9 A 12 11 44620 CASAVA_Build 1 76947187 1D TGGTCCTGCC A/- GGGGCAGAGG 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 1 0 44621 CASAVA_Build 1 76949091 1I AGTCAATGAG -/T TTAGTATTAT 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 T 2 3 44622 CASAVA_Build 1 76949178 1D TTTAGAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 11 10 44623 CASAVA_Build 1 76951083 1I AGGTGGAAAA -/T TTTAAATGGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 3 4 44624 CASAVA_Build 1 76953506 1I TAGAAGTGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 T 8 9 44625 CASAVA_Build 1 76956055 11I GACACAAGGA -----------/TACATATGTAT TACATATTCA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TACATATGTAT 0 1 44626 CASAVA_Build 1 76961705 1D GATTTCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 37 0 30 7 T 11 10 44627 CASAVA_Build 1 76971545 1I CCATTGGCCT -/A CGTACCTGTC 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 A 0 1 44628 CASAVA_Build 1 76972168 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2011 hom 21 6 12 3 A 13 12 44629 CASAVA_Build 1 76974596 9D CCTTGAAGAA GTCCTTCAC/--------- GTCCTTTGCA 1472 het 1472 ref 15 13 4 1 GTCCTTCAC 1 0 44630 CASAVA_Build 1 76982595 1D TTTAACTTCT C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 ref 24 9 8 7 C 9 8 44631 CASAVA_Build 1 76988015 7D TCTGTCTCAA AAAAACC/------- AAAAACCAAA 3070 het 3070 hom 25 11 14 3 AAAAACC 2 1 44632 CASAVA_Build 1 76997564 1I CCCCACCCCC -/T GCTTGTACTG 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 0 1 44633 CASAVA_Build 1 76998096 1D TGCAGAAAAA G/- AACAGGTAGG 3070 het 3070 ref 62 28 25 9 G 1 0 44634 CASAVA_Build 1 77008312 2D ATTAGGACTT TA/-- ACTTAAGTAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 7 TA 1 0 44635 CASAVA_Build 1 77008647 1D TATGACAAAA G/- CATGTAAATA 3070 het 3070 hom 55 23 27 5 G 1 0 44636 CASAVA_Build 1 77012651 76D ATTTAACGTA GTATAGAGTATGTAATAGTCTCTCAATACATATTTTTGCATGAATAACAAGAGAATAAAAATAATCTTTCCAAGTT/---------------------------------------------------------------------------- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 34 12 6 GTATAGAGTATGTAATAGTCTCTCAATACATATTTTTGCATGAATAACAAGAGAATAAAAATAATCTTTCCAAGTT 1 0 44637 CASAVA_Build 1 77016542 3D AACAAAAAAT ATC/--- AGCTCACCAC 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 ATC 1 0 44638 CASAVA_Build 1 77023027 1D AATGTAGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1531 hom 36 8 19 9 A 12 11 44639 CASAVA_Build 1 77024287 2D TTTCAACTTT GA/-- GAATGTGCTA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 GA 2 1 44640 CASAVA_Build 1 77032691 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 T 7 8 44641 CASAVA_Build 1 77035374 5D GTATAATAAT AATAA/----- AATAAAATAA 3070 hom 24 het 9 0 8 3 AATAA 3 2 44642 CASAVA_Build 1 77087060 4I3M3D ATTCTTCATA ----TGCCAA/ATAGTCC--- CATATGTTCC 3070 hom 84 het 29 0 29 2 N/A 0 0 44643 CASAVA_Build 1 77098276 1D CAGGCACACA C/- GTCCATACTA 3070 hom 154 het 61 0 52 10 C 1 0 44644 CASAVA_Build 1 77138623 9I CAGGTCACAG ---------/GGGATATGA GGGATATGAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 GGGATATGA 1 2 44645 CASAVA_Build 1 77154183 1D ACTTCCTTGG A/- TAATAATAAT 3070 hom 48 het 20 0 17 6 A 1 0 44646 CASAVA_Build 1 77168635 1I TGCACCTTCA -/C CTCAGTAGGT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 C 1 2 44647 CASAVA_Build 1 77185261 4I TATTAAAACT ----/CAAA CAAACTGTTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CAAA 1 2 44648 CASAVA_Build 1 77212587 1D AAAGTGATCC T/- CCTACCTTTG 3070 hom 87 het 30 0 28 2 T 1 0 44649 CASAVA_Build 1 77212987 1I ATATAAGATA -/T ACAGTCTTAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 0 1 44650 CASAVA_Build 1 77219935 1I ATTTGAGCTC -/T GAGAATGGAC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 0 1 44651 CASAVA_Build 1 77230763 5I GTGGTCCCTC -----/TTTAA TTTAATTTAA 3070 hom 89 het 32 0 30 3 TTTAA 2 3 44652 CASAVA_Build 1 77244417 2D TAGTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 2012 het 315 hom 32 2 14 17 TG 1 0 44653 CASAVA_Build 1 77322951 2D CACACACGTA CT/-- CTCTCTCTCT 1322 het 1322 ref 48 33 3 13 CT 9 8 44654 CASAVA_Build 1 77323679 1I TGCCTTTTTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 T 8 9 44655 CASAVA_Build 1 77335857 1D CACAGTTTTT C/- CTTAATCGTG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 C 2 1 44656 CASAVA_Build 1 77338249 1D TTGAAATGCC T/- TAATATTTCA 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 2 1 44657 CASAVA_Build 1 77358141 23D ACCATTAAAA ATACGTTATCTATCCATTTATCT/----------------------- ATACGTTATC 3070 het 3070 ref 47 22 18 14 ATACGTTATCTATCCATTTATCT 1 0 44658 CASAVA_Build 1 77367680 2D TTAAAAACAC AG/-- AGAGTAATGC 2835 het 2835 ref 15 7 6 3 AG 3 2 44659 CASAVA_Build 1 77375873 5I CTTTTATTTG -----/AATTT TATTTTATTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 AATTT 0 1 44660 CASAVA_Build 1 77393873 2D ATTCAAGCCA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 15 21 8 T 11 9 44661 CASAVA_Build 1 77400123 1D AATTCCCAAC A/- GAAATTTGAC 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 A 1 0 44662 CASAVA_Build 1 77404777 1I AGTCAATAGT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 7 8 44663 CASAVA_Build 1 77407764 3D GTTCATTTTT CTC/--- CTCCTTAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 CTC 2 1 44664 CASAVA_Build 1 77413196 4I TGGATCTTCT ----/TCTG TCTGTCTATC 3070 het 3070 hom 36 16 12 8 TCTG 1 2 44665 CASAVA_Build 1 77415479 2D TTATGGTTCA CT/-- GAGGACAGTC 2136 het 2136 ref 27 15 6 7 CT 1 0 44666 CASAVA_Build 1 77418043 4D ATTTGATGAT ATAG/---- ATAATGTCTG 3070 het 3070 hom 31 15 14 3 ATAG 1 0 44667 CASAVA_Build 1 77418651 4I ATGCATTCCT ----/ATTA ATTAGTTAAA 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 ATTA 1 2 44668 CASAVA_Build 1 77439178 2D AAAATTCCTA AC/-- ACAGTCTCTG 3070 het 3070 hom 37 14 19 6 AC 2 1 44669 CASAVA_Build 1 77441433 3I GATGAAAGAC ---/AAT AATACTAAAC 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 AAT 1 2 44670 CASAVA_Build 1 77445866 1D TTTATAGTTT A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 A 7 6 44671 CASAVA_Build 1 77457993 4D CCTTATTTAT TTTA/---- TTTATTTATT 2271 het 256 hom 12 3 7 2 TTTA 8 7 44672 CASAVA_Build 1 77462723 2D GTGAATGTGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 TC 7 6 44673 CASAVA_Build 1 77468621 2D CAGATTAAAC AG/-- ATGATCAGAC 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 AG 1 0 44674 CASAVA_Build 1 77476971 2I GAACCATGTA --/CT CTCTGCCAGA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 CT 2 3 44675 CASAVA_Build 1 77481554 4I AGGGGTCACT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 43 14 15 14 TTTC 4 5 44676 CASAVA_Build 1 77487564 1I CTAAAAACAA -/T TAACTACAAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 1 2 44677 CASAVA_Build 1 77490693 26D21M11D ACATACTTTG GGGAAAGAACAATCTCTTCAATACATGGGAAAGCTAGATATCCATATGCAGAAAAATA/--------------------------GGGAAAGTTAGATTTCTATCT----------- AAATTAGATT 3070 het 3070 ref 31 39 11 3 N/A 0 0 44678 CASAVA_Build 1 77505613 3D TAACCCCAAA CTT/--- CTTCTGGCCT 3070 hom 79 het 32 0 27 6 CTT 2 1 44679 CASAVA_Build 1 77507624 6I TTCTTTACTC ------/AATAAT AATGTGTAGG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 AAT 1 3 44680 CASAVA_Build 1 77507981 2I GACCTAGAGC --/AA TATTAGAACC 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 A 0 2 44681 CASAVA_Build 1 77508640 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 12 13 44682 CASAVA_Build 1 77511425 4D GAAAGCAAAC AAAA/---- AGACCTTTTG 3070 het 3070 hom 51 24 27 2 A 5 1 44683 CASAVA_Build 1 77516478 5I ACACCTGAGT -----/CACAA CACAATAGCC 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 CACAA 1 2 44684 CASAVA_Build 1 77517179 1D TTGAGCTAGA T/- TTTCTCAGCA 3070 het 3070 ref 53 23 24 6 T 4 3 44685 CASAVA_Build 1 77525510 1D ATAAATGCCT G/- AAGTCATTGG 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 G 1 0 44686 CASAVA_Build 1 77532671 2I CCTAGTGAGA --/CT CTATTTCTAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CT 1 2 44687 CASAVA_Build 1 77533942 4D ACAGAACACA TTCT/---- TTCTATTTTG 3070 het 3070 ref 36 18 13 8 TTCT 2 1 44688 CASAVA_Build 1 77534774 1I GTTGACAAAA -/T AATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 0 1 44689 CASAVA_Build 1 77540227 1D TATCCTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 T 13 12 44690 CASAVA_Build 1 77540489 1D ATTTTAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 A 10 9 44691 CASAVA_Build 1 77549955 1D TTTTTCCCCC T/- GATACTGAAT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 1 0 44692 CASAVA_Build 1 77552685 1D CCAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 12 11 44693 CASAVA_Build 1 77560536 2D TGTAGTCCTT GG/-- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 G 2 0 44694 CASAVA_Build 1 77561263 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3026 hom 30 8 14 8 T 11 10 44695 CASAVA_Build 1 77570676 1I TAAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1820 hom 17 6 9 2 T 11 12 44696 CASAVA_Build 1 77571825 1D TCTCCCCCCC A/- CCATGCTAGT 3070 het 2615 hom 25 12 10 5 A 1 0 44697 CASAVA_Build 1 77573658 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1670 hom 39 7 23 9 T 15 14 44698 CASAVA_Build 1 77577918 1D TAGCAATATC T/- TTTTTTTTTT 1417 het 263 hom 30 2 4 24 T 19 18 44699 CASAVA_Build 1 77579023 1D ATGTTTTTTT A/- AAAAAACTTT 3070 hom 70 het 27 0 24 3 A 7 6 44700 CASAVA_Build 1 77583268 1D TAAATTGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 33 0 26 7 A 13 12 44701 CASAVA_Build 1 77586425 2D ACCGACACTC AT/-- AAAACAGAGT 3070 het 3070 ref 47 24 20 4 AT 1 0 44702 CASAVA_Build 1 77597091 1I CTATCCCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 30 1 24 5 A 10 11 44703 CASAVA_Build 1 77605200 5I AAAGGTTTTT -----/GACTC ATATTAGCCT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 GACTC 0 1 44704 CASAVA_Build 1 77605732 6I AGTAGCTAGG ------/AGCACA CGCATGCACC 2120 hom 15 het 6 0 5 1 AGCACA 0 1 44705 CASAVA_Build 1 77612006 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 A 12 11 44706 CASAVA_Build 1 77613095 1I CCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2929 hom 31 8 16 7 A 13 14 44707 CASAVA_Build 1 77613527 1I TCATCAACCT -/A AAGCAGGAAT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 A 2 3 44708 CASAVA_Build 1 77619740 13D CAGGCCAGCT ATGTACAAGACAC/------------- ATGTACAAGA 3070 het 3070 ref 36 19 13 10 ATGTACAAGACAC 2 1 44709 CASAVA_Build 1 77636804 4D AAGAGAAAAT AGAA/---- AGGGGAAAAG 3070 het 3070 hom 39 19 20 7 AGAA 1 0 44710 CASAVA_Build 1 77645354 2D ATAATGAGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 27 0 21 8 A 16 14 44711 CASAVA_Build 1 77648859 6D AGCCTCTTTG TGTTTT/------ TGTTTTTGTT 3070 hom 48 het 23 0 17 7 TGTTTT 4 3 44712 CASAVA_Build 1 77651317 1D TGCCTTTCTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 40 0 33 8 A 9 8 44713 CASAVA_Build 1 77657325 1D TATCACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 42 0 31 11 A 11 10 44714 CASAVA_Build 1 77657688 1I GAAAGAACAG -/A AAAAATCTGA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 5 6 44715 CASAVA_Build 1 77657957 1D CAAATATGAG A/- AAGAACTTAG 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 3 2 44716 CASAVA_Build 1 77661492 12D AGACTCCGTC TAAAAAAAAAAA/------------ TAAAAAAAAA 3070 het 1949 hom 19 10 9 5 TAAAAAAAAAAA 1 0 44717 CASAVA_Build 1 77666869 1I ATCCAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 23 1 20 2 T 10 11 44718 CASAVA_Build 1 77668404 1D TATGGAGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 12 11 44719 CASAVA_Build 1 77671552 2I AAACATAACA --/TT TTCTCTCTAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 2 4 44720 CASAVA_Build 1 77688825 1I TCACAACAGT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 7 8 44721 CASAVA_Build 1 77693095 1I CTCTCTCAAG -/T TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 52 40 4 8 T 11 12 44722 CASAVA_Build 1 77715180 1I GCTGTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 679 hom 34 2 24 8 A 0 1 44723 CASAVA_Build 1 77726672 2I TCCAGACCAT --/AC ACAGAGTCTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AC 1 2 44724 CASAVA_Build 1 77727178 2I CAATCAAGTC --/CA CACTCAGTAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CA 1 2 44725 CASAVA_Build 1 77736217 2D TACATTAAAC AA/-- GAGATTTTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 A 2 0 44726 CASAVA_Build 1 77738709 1D ACCATCCTTC A/- AAGAATGGAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 3 2 44727 CASAVA_Build 1 77742715 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 8 9 44728 CASAVA_Build 1 77763092 1D ATTACCTAAT C/- CCCATGAAGC 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 C 4 3 44729 CASAVA_Build 1 77767385 4D AAACAAAGAA TAAC/---- TAACCACCCA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 TAAC 2 1 44730 CASAVA_Build 1 77781737 4D69M2I AATGACAGTT TGACTGGACATAATTTAAGTCATAATAATTATTTTTCTACCAAAAGTCAGTAAACATTGCTCTATTTTTTTTT--/----TGGACATAATTTAAGTCATAATAATTATTTTTCTACCAAAAGTCAGTAAACATTGCTCTATTTTTTTTTTC TATTGTTTGT 3070 het 3 hom 41 1 53 15 N/A 0 0 44731 CASAVA_Build 1 77788145 4I TCACCCAGGC ----/TGGA TGGAGTATAG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 TGGA 1 2 44732 CASAVA_Build 1 77796934 3I CTATTGACTC ---/TAT TATTTTCTGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TAT 1 2 44733 CASAVA_Build 1 77797819 4D GTCACCCATG TATT/---- TATTTGTTGC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 TATT 2 1 44734 CASAVA_Build 1 77806570 5D TAAATAAATA AAATG/----- AAATGAATCC 3070 hom 48 het 17 0 17 3 AAATG 2 1 44735 CASAVA_Build 1 77815040 11D TAAAAAAAAA AACAAAAAAAC/----------- AACAAAAAAA 3070 het 17 hom 26 1 25 4 AACAAAAAAAC 1 0 44736 CASAVA_Build 1 77829436 1D TAAATATATG T/- TATGCAGCAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 2 1 44737 CASAVA_Build 1 77838402 1D TATAAGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 32 1 26 5 A 12 11 44738 CASAVA_Build 1 77862763 1I AAAAACCCCT -/A AAAAGACAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 5 44739 CASAVA_Build 1 77942388 1D AACTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2737 het 2737 ref 36 18 7 11 A 15 14 44740 CASAVA_Build 1 77947064 1I GTGTACCAAA -/G AAGTGGTGCC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 G 0 1 44741 CASAVA_Build 1 77947179 1I GGCTGGTCTT -/A AAACTCCTGG 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 3 4 44742 CASAVA_Build 1 78001979 1D AAACAAGAAC A/- AAAAAAAAAG 1360 het 1360 ref 26 20 3 3 A 10 9 44743 CASAVA_Build 1 78048028 1D TGCATAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2529 hom 24 7 11 6 T 16 15 44744 CASAVA_Build 1 78060470 1I TAAAGCTGTT -/A AAAAAAACAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 7 8 44745 CASAVA_Build 1 78080011 5I TTCTGCTTTC -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TTTCT 3 4 44746 CASAVA_Build 1 78082571 2D AGCTATAAAC AT/-- GTTTCCAATA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 AT 1 0 44747 CASAVA_Build 1 78089136 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 29 1 23 5 T 11 10 44748 CASAVA_Build 1 78090153 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 27 2 16 9 C 0 1 44749 CASAVA_Build 1 78095596 1D TGTACTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 30 0 25 5 T 13 12 44750 CASAVA_Build 1 78106198 3D CAGGTTTCCT TAA/--- TGATGATGAT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TAA 1 0 44751 CASAVA_Build 1 78120293 5I CACAATCTGT -----/TACAA TACAACAAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TACAA 1 2 44752 CASAVA_Build 1 78140737 1I TTCTGTTCAT -/A ATTCTGAGAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 44753 CASAVA_Build 1 78143532 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 21 1 12 8 A 11 12 44754 CASAVA_Build 1 78162635 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 332 hom 32 1 22 9 A 11 12 44755 CASAVA_Build 1 78162941 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 7 8 44756 CASAVA_Build 1 78203278 1I ATTAACAAAA -/G GAAGTGGACA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 G 1 2 44757 CASAVA_Build 1 78214810 4I TCTATGACCA ----/GCTG GGCTGGAGTG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 GCTG 0 1 44758 CASAVA_Build 1 78220833 25I GGTGCCTCAT -------------------------/GCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAG GCCGAGGCGG 3070 hom 38 het 17 0 13 4 GCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAG 0 1 44759 CASAVA_Build 1 78232856 1D ACTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 39 1 25 13 T 15 14 44760 CASAVA_Build 1 78239265 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 20 1 16 3 A 10 11 44761 CASAVA_Build 1 78243649 1I TTTTTTTTTT -/C TCTCTCTCTC 3070 hom 69 het 30 0 23 7 C 0 1 44762 CASAVA_Build 1 78251089 4D TCTCAAAAAC ACAA/---- ACAAACAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 ACAA 3 2 44763 CASAVA_Build 1 78256041 1I AATATATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 470 hom 30 2 17 11 T 13 14 44764 CASAVA_Build 1 78256340 1I AAAATGCTTG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 7 8 44765 CASAVA_Build 1 78281580 3D ATCTTCATTA AAG/--- AATAGGGAGT 3070 hom 105 het 39 0 36 6 AAG 1 0 44766 CASAVA_Build 1 78282558 1D TATCCTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 742 hom 25 3 14 8 T 15 14 44767 CASAVA_Build 1 78285101 1D CAGATTAAGT G/- GGGGGGAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 7 6 44768 CASAVA_Build 1 78301777 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 10 11 44769 CASAVA_Build 1 78302938 5D CATCTTTTTA AAAAT/----- GTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 AAAAT 1 0 44770 CASAVA_Build 1 78303805 1I TCACAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 12 13 44771 CASAVA_Build 1 78306474 2D TACCTGTGAC AG/-- AATTTGTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 14 6 AG 1 0 44772 CASAVA_Build 1 78309747 1D TTCTAGAAGG T/- TTTTTTTTTT 2839 het 2839 ref 34 14 10 10 T 11 10 44773 CASAVA_Build 1 78310731 2I TAAGACACTC --/AG AGCTTTTTGG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 AG 1 2 44774 CASAVA_Build 1 78311244 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1932 hom 21 het 8 0 6 2 T 11 10 44775 CASAVA_Build 1 78314213 3D GGCTCTGCTT TCC/--- TCATGTCAGC 3070 het 3070 hom 34 14 14 8 TCC 1 0 44776 CASAVA_Build 1 78319473 1D ATTAGTGTTA T/- TTTCCAACTG 3070 hom 81 het 35 0 28 8 T 4 3 44777 CASAVA_Build 1 78321210 2D TCTGTCTCAT AC/-- ACACACATAT 3070 hom 112 het 44 0 38 6 AC 4 3 44778 CASAVA_Build 1 78321383 1I TCTTATCAGC -/T GTCCTAATTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 0 1 44779 CASAVA_Build 1 78326350 3D TCAGAATGGC TAT/--- TATTATTAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TAT 3 2 44780 CASAVA_Build 1 78337716 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1211 het 1211 ref 26 16 3 7 T 13 12 44781 CASAVA_Build 1 78352136 1I CCCATACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 T 15 16 44782 CASAVA_Build 1 78364329 3D TTTTGAAGAT AAC/--- AATATTTGTG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 AAC 1 0 44783 CASAVA_Build 1 78364823 1D TGGCTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 2811 het 2811 ref 43 20 9 14 A 11 10 44784 CASAVA_Build 1 78366268 2I CCAGCCCTGA --/GT GAACTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 GT 0 1 44785 CASAVA_Build 1 78368241 1D AAATCTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 10 9 44786 CASAVA_Build 1 78369419 4D AATCTATTTT TTTC/---- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 TTTC 1 0 44787 CASAVA_Build 1 78374054 1I CCCATCGTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 8 9 44788 CASAVA_Build 1 78376011 1D TTATCTTTCA C/- CTCTACAGCT 3070 het 3070 ref 46 23 18 7 C 2 1 44789 CASAVA_Build 1 78376276 3I TCTGTAGGCT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 TTC 0 1 44790 CASAVA_Build 1 78377829 2I TAGTATTGAC --/TA TATGCAGATA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 TA 1 2 44791 CASAVA_Build 1 78380868 5I TGTGGGGTGG -----/TATTT GAACACTGGA 1277 het 170 hom 13 2 6 5 TATTT 0 1 44792 CASAVA_Build 1 78388736 2D TTTTGGTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 11 10 T 14 12 44793 CASAVA_Build 1 78390050 1I TTTTGTTAGT -/A AAAAAAAAAA 1565 het 1565 ref 12 8 4 0 A 11 12 44794 CASAVA_Build 1 78391375 5I AAGGCATTTC -----/TAATA TAATAAATAT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 TAATA 1 2 44795 CASAVA_Build 1 78396309 26D GGATATGGTC GTTTGTTTTAGACATCACTTTTACAA/-------------------------- ACCTGAAGTT 3070 het 3070 ref 41 26 19 5 GTTTGTTTTAGACATCACTTTTACAA 1 0 44796 CASAVA_Build 1 78402904 14D3M2I CAGGCACCTG CCACCACACCCAGCTAA--/--------------TAATT TTTTTTGTAT 285 het 285 ref 13 5 2 6 N/A 0 0 44797 CASAVA_Build 1 78419578 2D TTTTCCTCTT AA/-- GTCTTTTTTT 3070 het 1562 hom 35 9 16 10 A 2 0 44798 CASAVA_Build 1 78421210 1D TGAAGTGAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 9 8 44799 CASAVA_Build 1 78421708 1D AATCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 12 11 44800 CASAVA_Build 1 78437965 2I TAACTGCTCT --/AA GTGACCCTAT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 0 2 44801 CASAVA_Build 1 78451205 1I AGACAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 A 10 11 44802 CASAVA_Build 1 78459077 1D TGTGTCCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 10 9 44803 CASAVA_Build 1 78462879 1D CTCTGCAGAC A/- AAGTTTGTCA 3070 het 3070 ref 58 29 25 5 A 3 2 44804 CASAVA_Build 1 78477782 1I AAGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 A 11 12 44805 CASAVA_Build 1 78488203 1I TATTTTCTTG -/A AAAAACAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 5 6 44806 CASAVA_Build 1 78494190 1D AGGAGATCTA T/- TTTTTTTTTC 1519 het 1519 ref 35 30 4 1 T 10 9 44807 CASAVA_Build 1 78503136 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2064 hom 20 8 9 3 T 11 10 44808 CASAVA_Build 1 78513535 1I CTTGGCCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 27 1 19 7 T 12 13 44809 CASAVA_Build 1 78513933 3I AGAAAGACAC ---/CCA CCCCCCCTCA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 CCA 0 1 44810 CASAVA_Build 1 78514615 1I GCAGTTGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 9 10 44811 CASAVA_Build 1 78515467 1D GTAAGACCCA T/- TTTTGGACTT 3070 het 3070 hom 48 16 27 5 T 5 4 44812 CASAVA_Build 1 78517918 2D TTACATACTT TG/-- TAAATATCTG 3068 het 3068 ref 26 14 7 6 TG 1 0 44813 CASAVA_Build 1 78518495 3I TCAGTGCACA ---/ACT GTTGGCTTTG 3070 het 3070 ref 54 27 19 8 ACT 0 1 44814 CASAVA_Build 1 78520350 1I TTATGTGGTT -/G TTTTTTTTCT 3038 het 3038 ref 23 8 8 7 G 0 1 44815 CASAVA_Build 1 78525206 1D CAATGCACAT C/- AACACATCTG 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 C 1 0 44816 CASAVA_Build 1 78541372 1D TGCCATTGCT G/- GGGGAATGGG 3070 hom 90 het 36 0 30 7 G 5 4 44817 CASAVA_Build 1 78541649 5I GACAGTGGGA -----/CAGAG CAGAGGGTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 CAGAG 1 2 44818 CASAVA_Build 1 78556397 1D CATATTAGTT A/- AGTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 2 1 44819 CASAVA_Build 1 78557195 1I TGATGAGGAA -/T AAGAGATGCA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 0 1 44820 CASAVA_Build 1 78558191 11D ACAAAACATT GACAGACACTA/----------- GACCCCTAAG 3070 het 3070 hom 48 23 22 9 GACAGACACTA 1 0 44821 CASAVA_Build 1 78558598 19I TTAGACTTTT -------------------/TCTTCTTTTTTAAGATAGC TCTTCTGCCC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 TCTTCTTTTTTAAGATAGC 0 1 44822 CASAVA_Build 1 78565346 1D CAGCACTTTA T/- CAGATATATA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 1 0 44823 CASAVA_Build 1 78565731 1I TATTTATATA -/C TTTATATATT 2457 het 1465 hom 9 3 5 1 C 0 1 44824 CASAVA_Build 1 78568027 2D TTATTACTTT AG/-- AGAGAGACAG 3070 hom 105 het 41 0 34 7 AG 4 3 44825 CASAVA_Build 1 78569201 1I AGTGTCTTTT -/G GGGGGGGAAA 3070 het 2486 hom 35 7 22 6 G 7 8 44826 CASAVA_Build 1 78572532 3D ATTGAAAAAT GAA/--- GACTCATTTG 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 GAA 1 0 44827 CASAVA_Build 1 78572795 4D ACATATTCAG GAAA/---- GAAAGTTTCA 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 GAAA 2 1 44828 CASAVA_Build 1 78575566 2I ACTTAAAGTG --/TA TATATATATA 3070 het 1829 hom 21 7 7 7 TA 6 7 44829 CASAVA_Build 1 78575630 4D TATATACATT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 TC 8 6 44830 CASAVA_Build 1 78581283 1D AAAAACTGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 20 hom 30 1 26 3 T 10 9 44831 CASAVA_Build 1 78586268 1D TCAAGGTACT A/- AAGATTTCCT 3070 het 3070 ref 30 13 13 6 A 3 2 44832 CASAVA_Build 1 78586590 1D TAAACAGGAA T/- TTTTTAAAAC 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 T 6 5 44833 CASAVA_Build 1 78603267 1D AGCTGGGGGC A/- AAAAATGGTT 3070 hom 118 het 46 0 39 7 A 6 5 44834 CASAVA_Build 1 78630367 1D GCCTATCTTA T/- TAATTTTTTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 2 1 44835 CASAVA_Build 1 78638580 5I TTTTTTGTTT -----/AATTA TAAAAGGAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AATTA 0 1 44836 CASAVA_Build 1 78644469 1I AGGACACCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 921 hom 36 3 23 10 A 9 10 44837 CASAVA_Build 1 78649610 1D GTAAAGAGCA C/- CCCTGCAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 C 4 3 44838 CASAVA_Build 1 78660191 7I CAAGAAGAAT -------/ACAAATA ACTTTTTTTT 3070 het 164 hom 31 2 12 17 ACAAATA 0 1 44839 CASAVA_Build 1 78662301 3I ACTTTTATAA ---/TTG TTGTTTCTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TTG 1 2 44840 CASAVA_Build 1 78666963 2I TATTGTAGGG --/TC TTAAATGCTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TC 0 1 44841 CASAVA_Build 1 78682604 1D AGTGAGAATC T/- TTTTTTTTTT 1199 het 1199 ref 38 28 3 7 T 13 12 44842 CASAVA_Build 1 78700455 1I GAGGATTTAA -/T TTTTTTTTTT 2367 het 2367 ref 42 20 8 14 T 16 17 44843 CASAVA_Build 1 78823264 1D CTCATAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 37 0 29 9 A 10 9 44844 CASAVA_Build 1 78829802 1I CAGGCTGGCT -/G GAGCCATAGG 3070 hom 111 het 47 0 37 10 G 1 2 44845 CASAVA_Build 1 78834181 1I TCTCAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 755 hom 24 3 14 7 A 11 12 44846 CASAVA_Build 1 78839864 4D TAAAACTAAA AATC/---- ATTGATTAAC 3070 het 3070 ref 31 19 12 1 AATC 1 0 44847 CASAVA_Build 1 78842046 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 710 het 710 ref 10 6 3 1 A 1 0 44848 CASAVA_Build 1 78856424 1I TGTCCTTTAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 T 8 9 44849 CASAVA_Build 1 78868581 2I TTTTAATTAC --/AT GAGACCATTC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 AT 0 1 44850 CASAVA_Build 1 78880345 12I GGAGGAAAAA ------------/TGAGATATTCTC TGAGATATTC 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 TGAGATATTCTC 1 2 44851 CASAVA_Build 1 78901159 1I TAGGTAGATG -/T GTTTGGTGGT 3070 het 3070 hom 38 10 18 10 T 0 1 44852 CASAVA_Build 1 78904283 1I AACAGGTCAC -/A AACTCATACT 3070 het 3070 ref 51 25 18 8 A 2 3 44853 CASAVA_Build 1 78904991 1D TATTTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 630 het 630 ref 44 29 2 14 A 11 10 44854 CASAVA_Build 1 78905270 7I AGTTGTATCA -------/GCTTTGG GCTACAATAG 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 GCTTTGG 0 1 44855 CASAVA_Build 1 78913551 4I TTTTTATTGC ----/TGAG TATTATTCCA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 TGAG 0 1 44856 CASAVA_Build 1 78921448 1D GTGTACAATT A/- AGTAGAATCT 3070 het 3070 hom 44 11 29 6 A 2 1 44857 CASAVA_Build 1 78926152 2D TCATATAGGA TT/-- TGGCAGAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 3 1 44858 CASAVA_Build 1 78942041 1I AATTTAGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 T 9 10 44859 CASAVA_Build 1 78945527 3D ATGCAGTAAA AGC/--- AGTTCTGAGA 3068 het 3068 ref 17 8 7 3 AGC 1 0 44860 CASAVA_Build 1 78945892 1D AAAAAACATA G/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 G 1 0 44861 CASAVA_Build 1 78947374 1I CAGAACCATT -/A AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 A 6 7 44862 CASAVA_Build 1 78947833 1I CTACAAAGAC -/A AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 3 4 44863 CASAVA_Build 1 78952615 1D CCTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 12 27 7 T 11 10 44864 CASAVA_Build 1 78957184 1D GGCATTATGT A/- AGGTGAGATA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 2 1 44865 CASAVA_Build 1 78963970 1D AGCCACTGTG C/- CCGGCAAATA 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 C 3 2 44866 CASAVA_Build 1 78964306 1I AATACATCTC -/T AAATGAGATA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 0 1 44867 CASAVA_Build 1 78964817 1D TTAATCATAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 7 6 44868 CASAVA_Build 1 78969043 1D ATAAAGCAAG C/- TTTATTGTGC 3070 het 3070 hom 60 24 29 7 C 1 0 44869 CASAVA_Build 1 78969281 1D TTCTAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 19 15 14 T 12 11 44870 CASAVA_Build 1 78996252 9D GGGCAAAAAA AAAAAGAAT/--------- AAAAAGAATA 3070 het 3070 ref 24 15 10 2 AAAAAGAAT 2 1 44871 CASAVA_Build 1 78997771 1I TATTATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2939 hom 26 7 14 5 T 11 12 44872 CASAVA_Build 1 79009034 1D TTCTTATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2389 hom 28 8 12 9 T 13 12 44873 CASAVA_Build 1 79036750 2I TAATTTCTTC --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AT 7 8 44874 CASAVA_Build 1 79039298 1D GAAGAGAGAT A/- AGCATTTTAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 2 1 44875 CASAVA_Build 1 79040964 3D AAATGACATT ATG/--- ATAAGTTAAA 3070 het 3070 ref 47 23 23 3 ATG 1 0 44876 CASAVA_Build 1 79043966 1I TTTTAAAAAC -/T TTTTTTTCGG 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 7 8 44877 CASAVA_Build 1 79046871 1D TTGTATTTAT C/- AGTGGCTCCG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 C 1 0 44878 CASAVA_Build 1 79047994 1I GAGTTAGGGA -/G GATTCCCTCT 2883 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 2 44879 CASAVA_Build 1 79052733 1I GTCTTTGTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 482 hom 42 2 35 5 T 9 10 44880 CASAVA_Build 1 79054289 3D ATCAACGAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 30 4 12 15 T 14 11 44881 CASAVA_Build 1 79057421 1I AGTTCTATAA -/C TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 30 1 24 5 C 0 1 44882 CASAVA_Build 1 79069113 2I TGTTTTGTAT --/TA TATATATATA 3070 hom 60 het 27 0 21 8 TA 7 8 44883 CASAVA_Build 1 79070532 1D TTAAATCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 T 12 11 44884 CASAVA_Build 1 79079995 1I AAATAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 10 11 44885 CASAVA_Build 1 79089942 1D AGGAAAGCAA G/- TAGCCTCTAG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 G 1 0 44886 CASAVA_Build 1 79091673 2I AAGATGACAA --/AG ATTCCATGAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 AG 0 1 44887 CASAVA_Build 1 79099654 1I ATCTCTCCTA -/T TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 5 6 44888 CASAVA_Build 1 79103547 1I GGTAAACACC -/T TAGGAGCACA 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 T 1 2 44889 CASAVA_Build 1 79103697 1I GTATTGGCAG -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 7 8 44890 CASAVA_Build 1 79104351 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3009 het 3009 ref 25 15 8 2 T 7 8 44891 CASAVA_Build 1 79105489 1I CAGGGCAGAG -/C CCAGAAGGGG 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 C 2 3 44892 CASAVA_Build 1 79108113 1D ACAATCATTT G/- TTATGTTCTT 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 G 1 0 44893 CASAVA_Build 1 79120662 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 A 8 7 44894 CASAVA_Build 1 79125956 2D AAATTGAAAA GG/-- ACTGAATAAA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 G 2 0 44895 CASAVA_Build 1 79152915 1D TAAAAGTTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 T 10 9 44896 CASAVA_Build 1 79173803 2D AAGCAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1413 hom 43 12 19 12 A 13 11 44897 CASAVA_Build 1 79176801 1I GAATTAATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 31 het 28 1 24 3 T 7 8 44898 CASAVA_Build 1 79179835 2D TCAATCCCCC CT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 CT 1 0 44899 CASAVA_Build 1 79180945 1D CTCACACCTG T/- AATCCCAGCA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 T 1 0 44900 CASAVA_Build 1 79182342 2I CAGTAATCTT --/TG TGTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 53 24 24 5 TG 2 3 44901 CASAVA_Build 1 79185870 1I TTTGGTCATA -/T TTTTTTTATG 2230 het 2230 ref 22 14 6 2 T 7 8 44902 CASAVA_Build 1 79204265 2D GGACAGAACC AA/-- AAAAAAAAAA 1696 het 1696 ref 30 11 4 16 A 13 11 44903 CASAVA_Build 1 79205190 1I TAGGAATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 A 10 11 44904 CASAVA_Build 1 79206103 1D TCATTTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 11 10 44905 CASAVA_Build 1 79210024 12D ATTGCAGGAT TTGTTGTTTTTG/------------ TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 18 8 TTGTTGTTTTTG 2 1 44906 CASAVA_Build 1 79211929 2I TAAGATAATC --/AT ATATATATAT 2769 het 2769 ref 12 6 6 0 AT 7 8 44907 CASAVA_Build 1 79214981 4D CATAAAAAAC ACAA/---- ACAATCAAAG 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 ACAA 2 1 44908 CASAVA_Build 1 79216899 1I ATATTTTACC -/A ATACGCACAA 3070 het 3070 ref 46 28 11 7 A 1 2 44909 CASAVA_Build 1 79227749 1D TTTTTATTTT G/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 G 1 0 44910 CASAVA_Build 1 79231844 2D GCAAAAATTC CA/-- TTTTTTTTTT 1155 het 1155 ref 24 13 8 3 CA 1 0 44911 CASAVA_Build 1 79234612 9I ATGTTAAGTC ---------/AGCTAATAT AGCTAATATA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 AGCTAATAT 1 2 44912 CASAVA_Build 1 79236531 1I CATTGCTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1890 hom 36 8 23 5 G 0 1 44913 CASAVA_Build 1 79238234 1I CCAGAAGGCA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 7 8 44914 CASAVA_Build 1 79242541 2D CTAGTACTTT TC/-- TCTCTCTCTC 2258 het 2258 ref 42 30 5 7 TC 9 8 44915 CASAVA_Build 1 79249416 2I TTTCTGGATA --/CT CTTTCTGAGG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 CT 1 2 44916 CASAVA_Build 1 79251260 4I TTTATTTTTC ----/TTTG TTTGGACATT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 TTTG 1 2 44917 CASAVA_Build 1 79267085 1I AGGGTAAGAT -/A TTTTTTTTTT 1201 het 1201 ref 35 11 7 17 A 0 1 44918 CASAVA_Build 1 79282726 1D AAAATGTTTA T/- TTTACATATC 3070 hom 138 het 53 0 47 7 T 4 3 44919 CASAVA_Build 1 79287405 1I GTCCAACCTC -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 7 8 44920 CASAVA_Build 1 79287587 4D ATGAGGATGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 31 1 12 19 T 20 16 44921 CASAVA_Build 1 79291299 1D AACAGAAAGA G/- AAACCAAGAG 3070 het 3070 hom 48 16 23 10 G 1 0 44922 CASAVA_Build 1 79294727 1D ACACCCTAGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 44923 CASAVA_Build 1 79296024 1D ACAGTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 9 A 12 11 44924 CASAVA_Build 1 79300331 1I ACTTCCATTT -/A AAAAATAATA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 5 6 44925 CASAVA_Build 1 79310982 1D TATTTTGAAA T/- TTTTTCTAAC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 6 5 44926 CASAVA_Build 1 79313716 2D ATCAGCGGCC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2514 hom 24 7 12 5 AT 6 5 44927 CASAVA_Build 1 79314472 2I AACTACAGGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 9 11 44928 CASAVA_Build 1 79315577 1D17M1D AAACAATATC TTTTTTTCTCCCCGCAACT/-TTTTTTCTCCCCGCAAC- CCATAGATAA 3070 het 3070 hom 39 21 23 5 N/A 0 0 44929 CASAVA_Build 1 79319862 1D CTTAAATGAA G/- GCATTAAAGC 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 G 2 1 44930 CASAVA_Build 1 79339386 4I AATCAAGATA ----/GAGT GAGACAAGTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 GAGT 0 1 44931 CASAVA_Build 1 79343849 2I CTGATGAGCC --/CG TGTGTGCTGG 3070 het 3070 hom 52 19 30 3 CG 0 1 44932 CASAVA_Build 1 79353800 2D GATATTTAAC AG/-- GGAGTTAGAA 3070 het 3070 ref 50 28 17 6 AG 1 0 44933 CASAVA_Build 1 79355723 1I GATAGCATTG -/C TGTTGTATGT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 C 0 1 44934 CASAVA_Build 1 79356634 1I TTTCCTTACC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 8 9 44935 CASAVA_Build 1 79376144 1D ATTGTGAAGA T/- TTCTTGGACA 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 T 3 2 44936 CASAVA_Build 1 79377623 1I TCCAAAAATA -/T TTTTGCTATT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 4 5 44937 CASAVA_Build 1 79396237 1D ACTTTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 11 10 44938 CASAVA_Build 1 79420071 2D AACATTTCGT AA/-- AGAGGTTATA 3070 het 3070 ref 44 21 20 4 A 3 1 44939 CASAVA_Build 1 79437130 1D CAAAATAATA G/- AAAACCATCT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 G 1 0 44940 CASAVA_Build 1 79461483 3D CAAAAAAAAA AAT/--- AAATAAATAA 190 het 190 ref 31 18 2 12 AAT 1 0 44941 CASAVA_Build 1 79473925 1I GTAAAACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 11 12 44942 CASAVA_Build 1 79482701 1I CATGGAGTTT -/C TCTCTGTAGC 3070 het 2184 hom 30 7 19 4 C 0 1 44943 CASAVA_Build 1 79502154 1I GCCTTACACT -/G AGCATCTCGA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 G 0 1 44944 CASAVA_Build 1 79507642 1I TCAAAATGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 9 10 44945 CASAVA_Build 1 79510861 1I CAACAGAAGT -/G GACTTCAGAA 3070 het 3070 ref 47 27 18 2 G 1 2 44946 CASAVA_Build 1 79536615 1D CATGCTTTTT G/- TTCTAATCCC 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 G 1 0 44947 CASAVA_Build 1 79541211 1D AATCAGGAAA G/- CAAATCAGGT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 G 1 0 44948 CASAVA_Build 1 79547694 1I TGAATGAAAC -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 6 7 44949 CASAVA_Build 1 79557086 1I CTGGATATGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 8 9 44950 CASAVA_Build 1 79559581 2I GAAGAGGAGA --/CC AAAAAAAATG 2298 het 2298 ref 41 32 5 4 C 0 2 44951 CASAVA_Build 1 79565470 1D ATTTTTTTTT A/- AAATGTGTAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 4 3 44952 CASAVA_Build 1 79568691 2D TTTTATTGAC AT/-- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AT 2 1 44953 CASAVA_Build 1 79570108 4D TTCCAGTGTC TGTT/---- TCTTTCCTTC 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 TGTT 1 0 44954 CASAVA_Build 1 79570629 1I ATAATCTGGA -/G GGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 G 2 3 44955 CASAVA_Build 1 79582591 2D ATAAATAAAC TT/-- AAGTTAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 2 0 44956 CASAVA_Build 1 79597288 1D GTTTTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 10 8 T 11 10 44957 CASAVA_Build 1 79603296 1D ATTTCCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 7 T 11 10 44958 CASAVA_Build 1 79616581 2I AAATATATCA --/TT CTTTCTTTAT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 0 2 44959 CASAVA_Build 1 79616887 1D CTTGTGTTGG T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 45 19 20 7 T 7 6 44960 CASAVA_Build 1 79620051 1I TGGATTTTAG -/T TTAATCTATG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 2 3 44961 CASAVA_Build 1 79622961 1I TCATTTTATT -/G GGTTAAAGTC 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 G 2 3 44962 CASAVA_Build 1 79627293 1D TAATTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 T 12 11 44963 CASAVA_Build 1 79630086 3I CACAACCATG ---/AAT AATAATATGT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 AAT 2 3 44964 CASAVA_Build 1 79632627 1I ATTCATAAGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 8 9 44965 CASAVA_Build 1 79633722 6D GAGATATATA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 16 16 4 TG 10 7 44966 CASAVA_Build 1 79634402 3I AAGTCCACCA ---/GAG GAGAACTTTT 2869 het 2869 ref 17 8 6 3 GAG 1 2 44967 CASAVA_Build 1 79634462 1D AAAAAATGAC A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 27 13 9 7 A 8 7 44968 CASAVA_Build 1 79641545 1D GCTAATTAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 T 9 8 44969 CASAVA_Build 1 79646643 2D TCCATTAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 46 18 20 10 AT 7 6 44970 CASAVA_Build 1 79652862 1D CAGAGAGGTT G/- GGGGAGGGGC 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 G 5 4 44971 CASAVA_Build 1 79662447 1D TATTTATTCA T/- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 44 19 24 1 T 7 6 44972 CASAVA_Build 1 79674259 1I CCACTCCCTA -/C TTTCAGAGCT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 C 0 1 44973 CASAVA_Build 1 79696917 1D CATCACCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 T 11 10 44974 CASAVA_Build 1 79698374 2I AGGAGGAGAA --/AG AGAAGAATTG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 AG 1 2 44975 CASAVA_Build 1 79702488 3I ACCCAGTGAG ---/GCA GCAGTCCTTA 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 GCA 1 2 44976 CASAVA_Build 1 79703095 1I CTTAGAAAAC -/T ATTTTTTTTT 2716 het 2716 ref 35 20 11 4 T 0 1 44977 CASAVA_Build 1 79705877 2D TGAGGAAGTA AG/-- AGGTGTGGGA 3070 het 3070 hom 31 12 14 7 AG 2 1 44978 CASAVA_Build 1 79718329 1I AAAAGCAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 9 10 44979 CASAVA_Build 1 79718664 1D TATTGGATAA T/- TTTTTCCCAA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 6 5 44980 CASAVA_Build 1 79719405 1D TAAAATCCCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2789 hom 24 8 12 5 A 10 9 44981 CASAVA_Build 1 79720475 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 10 11 44982 CASAVA_Build 1 79722933 1I CAAACTCTCT -/G GGGGTTATCT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 G 4 5 44983 CASAVA_Build 1 79745337 1I GATCTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 10 11 44984 CASAVA_Build 1 79747377 2D TTGTTGTAAC AT/-- GTATAGAACC 3070 het 3070 ref 41 27 12 4 AT 1 0 44985 CASAVA_Build 1 79758439 1I GGTAGAAGAA -/G AAAAAGAAGA 2342 het 2342 ref 21 9 5 7 G 0 1 44986 CASAVA_Build 1 79763249 2D TTCCAACTAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2000 hom 21 6 11 5 TA 7 6 44987 CASAVA_Build 1 79764206 1D AGGTTCCCTA T/- GGGCTGCTGT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 1 0 44988 CASAVA_Build 1 79765588 2D TATACCAACT TC/-- TTTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 TC 1 0 44989 CASAVA_Build 1 79774616 1D TGCTATTAAA G/- ATACCATTGC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 1 0 44990 CASAVA_Build 1 79776486 2D AGATTTAAAT TC/-- TGTTTCTCAT 3070 het 3070 ref 49 25 18 7 TC 1 0 44991 CASAVA_Build 1 79778485 1I AAACTGACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 9 10 44992 CASAVA_Build 1 79785847 2I TCACTATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 TA 5 6 44993 CASAVA_Build 1 79796134 1D GTGATAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 38 3 22 13 A 13 12 44994 CASAVA_Build 1 79802821 2D TAGGTAGCTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 18 het 25 1 19 5 TA 9 8 44995 CASAVA_Build 1 79805131 1D CATCTACAAC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 26 13 12 2 A 8 7 44996 CASAVA_Build 1 79805999 1I ATAAACTGCT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 30 8 16 6 A 7 8 44997 CASAVA_Build 1 79807296 2D ACGATACTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1644 hom 26 9 16 1 T 14 12 44998 CASAVA_Build 1 79808524 1D GGTAGCCAGT A/- AAGGATGTGT 3070 het 2921 hom 28 11 10 7 A 3 2 44999 CASAVA_Build 1 79812735 1D AACAACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1540 hom 33 11 9 14 A 17 16 45000 CASAVA_Build 1 79820205 2D GTTCTAACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 33 4 13 16 T 12 10 45001 CASAVA_Build 1 79822115 2D TTGAATATGT TG/-- TGTTTCCACT 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 TG 2 1 45002 CASAVA_Build 1 79823066 11D GGATTTAGGC AGTTTTTCTCA/----------- AGTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 46 24 20 9 AGTTTTTCTCA 1 0 45003 CASAVA_Build 1 79823349 18D TTGATCCTTA TTTGATCAAGAGTACTTT/------------------ GTAGTCAGTA 3070 het 3070 ref 47 32 13 9 TTTGATCAAGAGTACTTT 1 0 45004 CASAVA_Build 1 79845368 3D AGGCCATCTC CTT/--- CTTCTTACCT 3070 het 3070 hom 31 14 15 5 CTT 3 2 45005 CASAVA_Build 1 79845542 9D TGAGATGTAA CTTTTTTAC/--------- CTTATTTCAT 3070 het 3070 hom 37 17 20 2 CTTTTTTAC 1 0 45006 CASAVA_Build 1 79846028 2I TCTTAAACTC --/TT GTCTGATTTG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 0 2 45007 CASAVA_Build 1 79848804 1I ATACTGGAAC -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 6 7 45008 CASAVA_Build 1 79848968 1I TATTGAAGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 T 8 9 45009 CASAVA_Build 1 79855118 1I CCTAGTGCTG -/T TTTGTGATAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 3 4 45010 CASAVA_Build 1 79856704 1D CAGCAAAGTG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 43 20 12 12 T 8 7 45011 CASAVA_Build 1 79864058 1D TTTTACAATT A/- AAAAATCAGA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 6 5 45012 CASAVA_Build 1 79865071 1I TCATGTGCTG -/T TTTGTACAGC 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 3 4 45013 CASAVA_Build 1 79874443 4D TAAATTTTTT CTTA/---- CTTAGGAAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 CTTA 2 1 45014 CASAVA_Build 1 79874944 4I GGAAGTTTGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TTTG 3 4 45015 CASAVA_Build 1 79890568 1I TTTTTTGGGG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 8 9 45016 CASAVA_Build 1 79910448 4I AAAAAAAAAG ----/AAAA AAAGAAAGAA 3070 hom 56 het 24 0 19 5 A 3 7 45017 CASAVA_Build 1 79921896 2I ATGAAAATAT --/GC GCAGAGGCTC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 GC 1 2 45018 CASAVA_Build 1 79924619 2D TGAGATAGAA AC/-- AGAGTTGACT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AC 1 0 45019 CASAVA_Build 1 79947106 1D CCTCTTCAAT A/- AAAAGAGGTA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 5 4 45020 CASAVA_Build 1 79947436 4D TTTAATAAAC AAAT/---- GAATACTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 7 AAAT 1 0 45021 CASAVA_Build 1 79955080 1I AAATTCTTTT -/A AAAAAACAAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 45022 CASAVA_Build 1 79956408 1D ATATCAGTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 70 het 28 0 24 4 A 10 9 45023 CASAVA_Build 1 79959577 6D TCAAGAACTT AAAAAA/------ AGAGAAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 7 1 45024 CASAVA_Build 1 79967488 1D TAAGCTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 41 0 35 6 A 13 12 45025 CASAVA_Build 1 79969654 1I CTAACCAATC -/A TCCTCATGCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 0 1 45026 CASAVA_Build 1 79973354 1I TAACTGCTTA -/T TTTTTTTATG 3070 het 393 hom 44 1 36 7 T 7 8 45027 CASAVA_Build 1 79978281 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 T 8 7 45028 CASAVA_Build 1 79982703 4D GTACTCAAAA TAAT/---- TAAGTATCTC 3070 hom 90 het 36 0 31 9 TAAT 1 0 45029 CASAVA_Build 1 79984692 1D TAAAACAATG A/- AATTTGCTGC 3070 hom 144 het 52 0 48 4 A 3 2 45030 CASAVA_Build 1 79990687 1I CCTGCTGAAA -/T TCGTAAGATC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 1 2 45031 CASAVA_Build 1 79997983 1I TAATGCAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 423 hom 24 1 20 3 T 9 10 45032 CASAVA_Build 1 79998433 1D TTTGTGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 13 12 45033 CASAVA_Build 1 80009521 2D ATAAGAAGAC TA/-- TATATATATA 1832 hom 12 het 6 0 5 1 TA 7 6 45034 CASAVA_Build 1 80011476 1I GAAAAAACCC -/T CTTTTTATGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 45035 CASAVA_Build 1 80013224 2I ACTTAATAAA --/AT ATATATATAT 2468 het 477 hom 14 1 9 4 AT 5 6 45036 CASAVA_Build 1 80018317 1I TGTATTTAAT -/A AAAAATAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 5 6 45037 CASAVA_Build 1 80020521 1D AGAAAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 38 1 26 11 T 14 13 45038 CASAVA_Build 1 80033567 5D TTCTGTACCT ATTTA/----- ATTTATTCTT 3070 hom 96 het 37 0 33 8 ATTTA 2 1 45039 CASAVA_Build 1 80036369 1D CGTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 37 1 32 5 A 11 10 45040 CASAVA_Build 1 80040362 1D TGTAATTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 10 9 45041 CASAVA_Build 1 80042706 1I TAAAGATTGG -/A AAAAAAATGT 3070 het 393 hom 43 1 37 5 A 7 8 45042 CASAVA_Build 1 80045514 3I CACCATTAAT ---/GAG CAGCTAGGTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 GAG 0 1 45043 CASAVA_Build 1 80050381 1I ATTCATTCCA -/T TATTAATAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 45044 CASAVA_Build 1 80052684 1D GAGAATTAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 10 9 45045 CASAVA_Build 1 80053714 2D AGATGAAGAC AT/-- ATTAAATTTC 3070 hom 90 het 37 0 31 7 AT 2 1 45046 CASAVA_Build 1 80054418 1I AAAATAAGGG -/T GAAATATTGG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 0 1 45047 CASAVA_Build 1 80054524 1D AAATTAAGCC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 8 7 45048 CASAVA_Build 1 80059160 2D TATTTGAAAT AG/-- AGAGTGGGAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AG 3 2 45049 CASAVA_Build 1 80071712 4I CATGGAATGA ----/TTGT TTAATTCTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TTGT 0 1 45050 CASAVA_Build 1 80080144 3I TAATAACAAC ---/AAT GATGACAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AAT 0 1 45051 CASAVA_Build 1 80080362 3I TCTTCTTTGC ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TGT 3 4 45052 CASAVA_Build 1 80087404 10D CTGAAATTTC TAGTGATTTT/---------- TAATAACAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TAGTGATTTT 1 0 45053 CASAVA_Build 1 80090667 1D TTACCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 32 2 25 5 T 11 10 45054 CASAVA_Build 1 80096966 1I GGCAGCATCC -/A GGGGTGGGAG 3070 hom 104 het 40 0 32 8 A 0 1 45055 CASAVA_Build 1 80110766 2D AGGTGTCCTA TG/-- TTCTAGACTG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TG 1 0 45056 CASAVA_Build 1 80136645 1D TTGGGTTAGA T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 7 6 45057 CASAVA_Build 1 80145487 14D ACTCCGTATC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 57 hom 28 2 18 11 A 28 14 45058 CASAVA_Build 1 80151746 5D ACTCTGATGA TTACT/----- TTAGTTAGCA 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TTACT 1 0 45059 CASAVA_Build 1 80156947 2I AAAGCCAAAC --/AG GGGATGTTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AG 0 1 45060 CASAVA_Build 1 80157425 3D GACAACCATG ATA/--- ATGTTTACTA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 ATA 1 0 45061 CASAVA_Build 1 80157591 1I GGAATGTTTC -/A TAAAGTATTC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 0 1 45062 CASAVA_Build 1 80162233 1D TTTGTGGCAA C/- CCCCCCCATC 3070 hom 100 het 43 0 32 11 C 8 7 45063 CASAVA_Build 1 80188304 11I ATATAGCATC -----------/ATGTCTATTAT ATAGCGGCTA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 ATGTCTATTAT 0 1 45064 CASAVA_Build 1 80194323 2I TTTAAATGTT --/AA AAAAAAAAAA 1773 het 175 hom 47 3 7 37 A 12 14 45065 CASAVA_Build 1 80202077 1D GGAGTTTGAC T/- TTTTTTGACT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 T 7 6 45066 CASAVA_Build 1 80205102 1D TTTATAAAAT A/- TTTTTTTGAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 0 45067 CASAVA_Build 1 80215926 1D TTGAATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 42 1 34 7 T 11 10 45068 CASAVA_Build 1 80216780 1D TTTGCAAAGT A/- ATTGTTGTTT 3070 hom 99 het 41 0 34 8 A 2 1 45069 CASAVA_Build 1 80218974 5D TTAAATTATA ATTAT/----- ATTCTGTACC 3070 hom 105 het 37 0 36 3 ATTAT 1 0 45070 CASAVA_Build 1 80219815 1D TTTTAAAGAG A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 193 het 68 0 64 4 A 8 7 45071 CASAVA_Build 1 80243252 1D CTAGTTTAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 26 0 26 1 A 10 9 45072 CASAVA_Build 1 80265826 1D GTCTGCCATG C/- CCCCCATCCT 3070 hom 95 het 34 0 29 5 C 6 5 45073 CASAVA_Build 1 80272459 1I TGAAGTTGAT -/A AAAAAATATT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 6 7 45074 CASAVA_Build 1 80274179 4I ACATTGTTCA ----/TTGT TTGTGTGTAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTGT 1 2 45075 CASAVA_Build 1 80287588 1D GGAAATGTTA T/- TTTTTCACAG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 6 5 45076 CASAVA_Build 1 80296428 3D AATAAGATAT ATG/--- GACTATTTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 ATG 1 0 45077 CASAVA_Build 1 80297952 5D ATACATTTTG TATGT/----- TACATATACC 3070 hom 114 het 41 0 39 4 TATGT 1 0 45078 CASAVA_Build 1 80304901 1D CAAACAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 11 10 45079 CASAVA_Build 1 80306676 2D GCTTTTCATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TA 6 5 45080 CASAVA_Build 1 80315436 2D TTTGAAAAAC TT/-- ATATTTGTAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 0 45081 CASAVA_Build 1 80317671 1D TTTTATCAGG A/- AATTAATGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 3 2 45082 CASAVA_Build 1 80322818 2I GCTACATTTT --/CA CAGTTTTAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CA 1 2 45083 CASAVA_Build 1 80325284 5D5M4I ACACTGCAAG CCACACTTTA----/-----CTGTAACCC TTTACAAGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 N/A 0 0 45084 CASAVA_Build 1 80328742 1D ATCCATCATT A/- AAAAAACAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 7 6 45085 CASAVA_Build 1 80331398 1D CTGCCATTTA T/- TTTTTTGTTC 3070 hom 106 het 42 0 36 6 T 7 6 45086 CASAVA_Build 1 80332216 2D TGTTGATGTG AT/-- ATGTCTCATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 2 1 45087 CASAVA_Build 1 80360756 1D ACAAGGTTTA T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 67 het 29 0 22 7 T 6 5 45088 CASAVA_Build 1 80368721 2D AAAATGCATT CA/-- CTATTTATTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CA 1 0 45089 CASAVA_Build 1 80378609 5D GAAGAAATGG TAGGC/----- TAGGCCAAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 TAGGC 2 1 45090 CASAVA_Build 1 80380812 2D CAGTAGCCAG CA/-- CCTGATGCCA 3070 hom 87 het 34 0 24 10 CA 1 0 45091 CASAVA_Build 1 80390278 1I AAGTTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 834 hom 28 2 20 6 T 11 12 45092 CASAVA_Build 1 80395100 1D TGTAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 32 2 27 3 A 13 12 45093 CASAVA_Build 1 80419549 1I CTCAATAGAT -/A AAAAAATTTC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 6 7 45094 CASAVA_Build 1 80424503 1D AGCTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1471 het 1471 ref 32 22 4 6 A 12 11 45095 CASAVA_Build 1 80428560 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 12 13 45096 CASAVA_Build 1 80434081 1I AATAACATTG -/C ACTCCTTTCT 3070 hom 202 het 73 0 68 5 C 0 1 45097 CASAVA_Build 1 80437586 5I GAAATTTACT -----/TATAA TATAATCATC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TATAA 1 2 45098 CASAVA_Build 1 80441453 1D CACCTGGTTT C/- CTTTCATCCA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 C 2 1 45099 CASAVA_Build 1 80444642 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2027 het 30 hom 16 1 7 8 T 16 15 45100 CASAVA_Build 1 80446209 2I TTCAGATTTA --/GT GTAGTTGTTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 GT 1 2 45101 CASAVA_Build 1 80456645 1I GATACTTGAT -/A ATAGGTGATT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 1 2 45102 CASAVA_Build 1 80458377 8I ATCTCATACA --------/TTCCCTCT TTCCCTCTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTCCCTCT 1 2 45103 CASAVA_Build 1 80460750 5I CAAAATGTGT -----/GTTCC GTTCCACCTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GTTCC 1 2 45104 CASAVA_Build 1 80462023 1I TTTAATTTTT -/A TTGGTTTTAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 0 1 45105 CASAVA_Build 1 80474525 3I TGAATAATTT ---/TAC TACAATTAAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TAC 1 2 45106 CASAVA_Build 1 80474937 3I GAGAAAGAAA ---/ACT ACTATGAATC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 ACT 1 2 45107 CASAVA_Build 1 80478164 1D TATGTAGCCA G/- TTGCAGAGTC 3070 hom 75 het 29 0 25 5 G 1 0 45108 CASAVA_Build 1 80480182 6D TGAAGAAAAA ATATAT/------ ATATATATAT 1802 hom 27 het 10 0 10 1 AT 11 8 45109 CASAVA_Build 1 80483823 1D GGTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 37 1 24 13 T 13 12 45110 CASAVA_Build 1 80499642 1D CCCATTGTTG C/- CCCCACCCCC 3070 hom 93 het 37 0 30 7 C 5 4 45111 CASAVA_Build 1 80502097 1I TAGCAGAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 405 hom 40 1 32 7 A 9 10 45112 CASAVA_Build 1 80505132 2I CTACTGCGAC --/AG GGAGCAGCAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AG 0 1 45113 CASAVA_Build 1 80508551 1D ATTGAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 33 1 27 5 A 11 10 45114 CASAVA_Build 1 80528419 1I ATCCCATTTA -/T TGAATAAATA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 1 2 45115 CASAVA_Build 1 80532727 1I TGTATGTGGA -/G GGGAGATATG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 G 3 4 45116 CASAVA_Build 1 80549548 1D ATATTGTCTT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 94 het 40 0 32 8 A 9 8 45117 CASAVA_Build 1 80561029 4D AATTTTATAA TCTT/---- TCTAAGAGTT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 TCTT 1 0 45118 CASAVA_Build 1 80564314 3I ACCCTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 10 13 12 A 13 16 45119 CASAVA_Build 1 80566992 2D ATCATAGTCA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 11 9 45120 CASAVA_Build 1 80567103 1D ATTTCCTTTC T/- TTTAGCTTGA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 4 3 45121 CASAVA_Build 1 80568180 1I TTTTGTAGCT -/A TATGCACAAA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 A 0 1 45122 CASAVA_Build 1 80568354 1D AAAAATACAG A/- AAAAAAAATA 2854 het 2069 hom 15 5 7 3 A 9 8 45123 CASAVA_Build 1 80575152 1D GACAAACCTG A/- AAAAAAAAAC 2106 het 2106 ref 21 12 5 4 A 10 9 45124 CASAVA_Build 1 80584374 5D TGATACTCTT TTATC/----- TTATAGAGAG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 TTATC 1 0 45125 CASAVA_Build 1 80599744 4D ATAGATAGAT GATA/---- GATAGATAGA 3070 het 3070 ref 43 20 15 11 GATA 5 4 45126 CASAVA_Build 1 80599814 4I ATAAATAGAT ----/GATA GATAGATAGG 3070 het 3070 ref 47 28 11 8 GATA 2 3 45127 CASAVA_Build 1 80603370 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 13 12 45128 CASAVA_Build 1 80630275 4D AAGTAATGAC TAAA/---- TACGTGAGAG 3070 het 3070 ref 42 23 18 2 TAAA 1 0 45129 CASAVA_Build 1 80631499 1I ACCTACATTT -/A AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 6 7 45130 CASAVA_Build 1 80632411 2D ATATATAAAC AT/-- ATATATATAT 2602 het 2602 ref 24 14 9 1 AT 7 6 45131 CASAVA_Build 1 80642682 4D GAGCAAAGGA AAAT/---- AAACTATTCA 3070 het 3070 ref 49 26 16 9 AAAT 1 0 45132 CASAVA_Build 1 80675069 1D19M1I TATATTAAAT AAAAAAAAAATGCTCAAATT-/-AAAAAAAAATGCTCAAATTA AAAAAAAATC 3070 hom 54 het 21 0 19 5 N/A 0 0 45133 CASAVA_Build 1 80680487 16I TGTGTTTGTC ----------------/TATATATGTATGTGTA TATATATGTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TATATATGTATGTGTA 0 1 45134 CASAVA_Build 1 80684027 1D TGAAGCTGCA T/- TTCTCCCTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 3 2 45135 CASAVA_Build 1 80696685 3I AAATTAACAG ---/TAA TAATGTGCTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TAA 1 2 45136 CASAVA_Build 1 80696970 1D CAAAGTCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 11 10 45137 CASAVA_Build 1 80702406 2D ATTTCAAATG GA/-- CAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 40 0 38 2 GA 1 0 45138 CASAVA_Build 1 80705825 1D TGCAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 675 hom 29 4 21 4 A 12 11 45139 CASAVA_Build 1 80707052 1I TGATGAATGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 842 hom 50 2 42 6 T 9 10 45140 CASAVA_Build 1 80707380 3D AAAATTTTAT ATG/--- ATATGTCCAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 ATG 1 0 45141 CASAVA_Build 1 80711098 8D GACTCCATCT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 806 hom 22 het 14 0 6 9 A 26 18 45142 CASAVA_Build 1 80716971 2I TAATCACTAG --/AT ATAGGTACTT 3070 hom 151 het 58 0 51 7 AT 1 2 45143 CASAVA_Build 1 80721972 2I ATGTGAACTC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 54 18 27 9 AG 5 6 45144 CASAVA_Build 1 80724095 2I TCTGCCTTTC --/AT ATATACACAC 3070 hom 84 het 34 0 28 7 AT 2 3 45145 CASAVA_Build 1 80727456 3I TGCTTATACT ---/GTC GTCACTTTTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GTC 1 2 45146 CASAVA_Build 1 80729246 1I ACATGGAAAA -/T TACCTGAATT 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 1 2 45147 CASAVA_Build 1 80732294 7I GTGGACATAA -------/ACTGTGG TATCTGAAAA 3070 het 3070 hom 22 7 14 1 ACTGTGG 0 1 45148 CASAVA_Build 1 80737956 1I CTCTTTTTTT -/A TAAAAAAAAG 3070 het 2175 hom 21 7 11 3 A 0 1 45149 CASAVA_Build 1 80756193 1I GAAAATAATT -/A ATTTATAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 1 2 45150 CASAVA_Build 1 80757443 4I ATGATCAAGC ----/GGTA AGTAAGTGTC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 GGTA 0 1 45151 CASAVA_Build 1 80983050 2D GCCTTCACTC TG/-- AACTTGTTCT 3070 het 3070 ref 41 19 16 9 TG 1 0 45152 CASAVA_Build 1 80986907 1I CCAAGCTGTG -/C CCCCATTATA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 C 4 5 45153 CASAVA_Build 1 80988027 1I TCTTAACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 T 10 11 45154 CASAVA_Build 1 80989417 6I TATGAGTCTA ------/ACATGC ATGCAAATGG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 ACATGC 0 1 45155 CASAVA_Build 1 80996255 1I ATAAAATATA -/T TTAGATGAAG 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 T 2 3 45156 CASAVA_Build 1 81001824 1D ACAAGTCATG T/- AGAGTAGTTG 3070 het 3070 ref 50 26 22 2 T 1 0 45157 CASAVA_Build 1 81004076 1D TAAATTTGTC T/- TTTTTTACAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 T 7 6 45158 CASAVA_Build 1 81015422 1D AATATTACCG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 11 12 3 A 10 9 45159 CASAVA_Build 1 81019369 1I GCAGGCCTAT -/A TTCAGTATTC 3070 het 3070 hom 33 8 17 8 A 0 1 45160 CASAVA_Build 1 81019572 1D AAAAAAAAAA T/- AATAATTAGG 3070 het 3070 ref 40 17 15 9 T 1 0 45161 CASAVA_Build 1 81040580 1D TCAACTTTGA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 T 8 7 45162 CASAVA_Build 1 81042765 2D ATACAACTTT AA/-- AAAAAAAAAT 2011 het 1272 hom 15 5 9 1 A 11 9 45163 CASAVA_Build 1 81046219 1D GTAAAAAGAC T/- TTTTAATAGG 3070 het 3070 ref 27 17 9 2 T 5 4 45164 CASAVA_Build 1 81046616 1D GAACAATGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 50 22 20 9 T 9 8 45165 CASAVA_Build 1 81053578 4I GCATTATTAT ----/ATTA ATTAAAACAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 ATTA 1 2 45166 CASAVA_Build 1 81061448 2I ATCAAAATGA --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 T 8 10 45167 CASAVA_Build 1 81061505 1D AATCTATTTC T/- TTTTTTTTTC 1378 het 1378 ref 36 21 3 13 T 10 9 45168 CASAVA_Build 1 81062755 1I TTCTTGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 9 23 9 A 10 11 45169 CASAVA_Build 1 81062953 5D TTAAACTTCC CATAA/----- GATAACTATT 3070 het 3070 hom 34 12 19 6 CATAA 1 0 45170 CASAVA_Build 1 81064536 3D AAAATAACCA TAC/--- TACATTAGAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 TAC 2 1 45171 CASAVA_Build 1 81065752 1D TGAACAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 8 A 11 10 45172 CASAVA_Build 1 81070220 5D AATTCTAGAC ATATA/----- ATATAAAAGT 3070 het 3070 hom 29 10 18 2 ATATA 2 1 45173 CASAVA_Build 1 81074121 2D TGCTCTCTCC CT/-- GTCTCCCCAC 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 CT 1 0 45174 CASAVA_Build 1 81078754 1D GATTTGCTTT A/- AAAAAAAAAT 1456 het 1456 ref 29 22 4 4 A 10 9 45175 CASAVA_Build 1 81081792 1I AAAGATAAAT -/A ACCAGATTCT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 A 1 2 45176 CASAVA_Build 1 81082342 4D GACTAATCTT ACTA/---- ACTTAACATT 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 ACTA 1 0 45177 CASAVA_Build 1 81082820 5D TCCTCAACTG TTTAT/----- TTTAAGTTCT 3070 het 3070 ref 18 10 8 1 TTTAT 1 0 45178 CASAVA_Build 1 81083791 3D TCAAAACAAC AAT/--- GAGATATCAA 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 AAT 1 0 45179 CASAVA_Build 1 81084630 3I TTTTATTATG ---/TGT TGTTATTATA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 TGT 1 2 45180 CASAVA_Build 1 81085609 1I GAAACAGAAA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 7 8 45181 CASAVA_Build 1 81089403 1I AGTGATAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 1491 hom 41 7 26 8 G 0 1 45182 CASAVA_Build 1 81089966 2I CAATAATCTC --/TT TGTGTCATAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 3 45183 CASAVA_Build 1 81097872 1D AGGGTGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1055 hom 51 4 35 12 A 15 14 45184 CASAVA_Build 1 81099142 1I GCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 10 11 45185 CASAVA_Build 1 81100234 2D CATCTTAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 29 5 12 12 A 18 16 45186 CASAVA_Build 1 81109578 1D AATACATGTA T/- TTTTTAAATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 5 45187 CASAVA_Build 1 81115957 4D ATTCTATGGG ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 6 AT 7 5 45188 CASAVA_Build 1 81117063 3D GTTTTTTGGG TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 T 12 9 45189 CASAVA_Build 1 81120260 1I TCAAATATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 7 8 45190 CASAVA_Build 1 81121693 1D ATCCAACTCA T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 7 6 45191 CASAVA_Build 1 81122995 4I ACCCCATCTC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 12 16 45192 CASAVA_Build 1 81125021 1I TAAAAGCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 10 11 45193 CASAVA_Build 1 81127405 3D GAGAGATGCT GCA/--- GATCATCACT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 GCA 1 0 45194 CASAVA_Build 1 81127603 1I AGATTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 653 hom 40 4 23 13 T 14 15 45195 CASAVA_Build 1 81128732 1D TTTTATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 103 het 37 0 34 3 A 12 11 45196 CASAVA_Build 1 81129199 1I TTTTAGAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 79 het 37 0 27 10 A 9 10 45197 CASAVA_Build 1 81199705 1D GCCTCAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 13 12 45198 CASAVA_Build 1 81209550 1D TATCCGAGAC A/- AAAAAAAAAA 711 het 711 ref 35 27 3 6 A 12 11 45199 CASAVA_Build 1 81212828 1I GTGGGGGTGA -/C CTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 C 1 2 45200 CASAVA_Build 1 81215659 1D TATATGTAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 35 16 15 5 A 9 8 45201 CASAVA_Build 1 81226564 1D CTTTTGCTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 9 8 45202 CASAVA_Build 1 81230177 1D CACCATATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 970 hom 34 5 20 9 T 15 14 45203 CASAVA_Build 1 81238063 3I ATAACATAAA ---/GCC TGACTTATCA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 GCC 0 1 45204 CASAVA_Build 1 81242095 1D TTAATGGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 10 9 45205 CASAVA_Build 1 81244793 4I AAAGACTTGC ----/GGAA GGAAGATGAA 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 GGAA 1 2 45206 CASAVA_Build 1 81254874 1I ATGTAAGTTT -/C CTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 C 1 2 45207 CASAVA_Build 1 81287334 1D TTCATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 25 0 11 14 T 11 10 45208 CASAVA_Build 1 81303258 5D TTATGTATTT ATTTA/----- TTTTATTGCT 3070 het 3070 hom 26 11 15 1 ATTTA 1 0 45209 CASAVA_Build 1 81305627 17D GTAAAAAAAA AAAAAATATATATATAT/----------------- ATATATATAT 3070 hom 84 het 31 0 29 8 AAAAAATATATATATAT 1 0 45210 CASAVA_Build 1 81307569 2D CAGCTAATTT TA/-- TATATATATA 1331 het 1331 ref 13 8 3 2 TA 8 7 45211 CASAVA_Build 1 81315690 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 74 het 27 0 21 6 A 9 8 45212 CASAVA_Build 1 81323631 1D TATATTATTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 89 het 33 0 30 3 A 10 9 45213 CASAVA_Build 1 81329436 1I CTAACAGACT -/G GGGTTATCAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 3 4 45214 CASAVA_Build 1 81334895 2D GCAAAATAGT AA/-- AAAAAAATAA 390 het 390 ref 40 22 3 15 A 9 7 45215 CASAVA_Build 1 81337676 1I TCTCCCATAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 8 9 45216 CASAVA_Build 1 81344939 1D ATCATATGGG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 9 8 45217 CASAVA_Build 1 81352339 2D GCTGTTTATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 13 11 45218 CASAVA_Build 1 81355704 2D AATGACAAAC TT/-- ATACAATGCT 3070 het 3070 ref 39 20 18 2 T 2 0 45219 CASAVA_Build 1 81359524 3I TATTCGTGCT ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 9 12 45220 CASAVA_Build 1 81368363 1D TCTAATTACT G/- GCTACCCCCT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 G 2 1 45221 CASAVA_Build 1 81375937 1D TGGTTGTACC A/- AAAAAAAAAA 1201 het 1201 ref 32 23 3 6 A 12 11 45222 CASAVA_Build 1 81382210 7D TATAACCTCT TATAACA/------- GTCATTCATG 3070 het 3070 ref 44 24 17 6 TATAACA 1 0 45223 CASAVA_Build 1 81404344 2I AGAAAATGTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 AT 5 6 45224 CASAVA_Build 1 81404754 1D TGAAAGTTAC A/- GGATTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 1 0 45225 CASAVA_Build 1 81405101 1I CTTTTCTACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 T 8 9 45226 CASAVA_Build 1 81405776 1D GCTGCTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 11 10 45227 CASAVA_Build 1 81414609 1I CACTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 10 11 45228 CASAVA_Build 1 81426487 2I TCTTTCTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 36 10 13 13 TG 7 8 45229 CASAVA_Build 1 81438409 1I TGTGAGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 44 1 37 6 T 10 11 45230 CASAVA_Build 1 81459083 11D TTGTGACTCG GCTGGGTGTAT/----------- GCATGCTTGA 1720 het 1720 ref 24 12 6 9 GCTGGGTGTAT 1 0 45231 CASAVA_Build 1 81495774 1D ATTGCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 23 9 A 13 12 45232 CASAVA_Build 1 81496605 1D ATCTCTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 11 10 45233 CASAVA_Build 1 81519008 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 T 7 8 45234 CASAVA_Build 1 81525472 1D81M4I TAATAATAAT AAAAAAAAATTTCTTTAGAAAGTATACTGAGACCTCTGCTCTCCACATCAGTCTTGGGGTTATTAAATGATCATTATTACTA----/-AAAAAAAATTTCTTTAGAAAGTATACTGAGACCTCTGCTCTCCACATCAGTCTTGGGGTTATTAAATGATCATTATTACTATTAC TTAGTATCTA 3070 het 3070 ref 32 26 18 15 N/A 0 0 45235 CASAVA_Build 1 81534098 2D TCCTTGGCCA CT/-- CTCTGTATGC 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 CT 3 2 45236 CASAVA_Build 1 81534770 1D TTGAGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2668 het 2668 ref 26 13 8 5 A 11 10 45237 CASAVA_Build 1 81537085 1D TCTTCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 13 12 45238 CASAVA_Build 1 81540206 3D TGTTAGCTAA CTT/--- CATTCCTTGC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 CTT 1 0 45239 CASAVA_Build 1 81544609 1D GAGGACTCAG C/- TTGAGGAGGT 3070 het 3070 ref 44 24 19 2 C 1 0 45240 CASAVA_Build 1 81546105 2I TCTTTTTGAT --/AC AGAGTCTTCT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AC 0 1 45241 CASAVA_Build 1 81554043 3D CGGCAATTAG TTT/--- TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 11 8 45242 CASAVA_Build 1 81560107 1I CATGCTGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 38 0 31 9 A 11 12 45243 CASAVA_Build 1 81562614 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 20 6 A 11 10 45244 CASAVA_Build 1 81574108 1D TATAGTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 32 1 25 6 A 14 13 45245 CASAVA_Build 1 81575625 1D GGTATCCCCC T/- AGATGCTGCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 1 0 45246 CASAVA_Build 1 81579721 1D AAAACTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 11 10 45247 CASAVA_Build 1 81579985 1I ACCTTTCTAT -/A AAAAACATGT 3070 hom 96 het 44 0 33 11 A 5 6 45248 CASAVA_Build 1 81582582 3D AAATGGCAAA TGT/--- TACAAATCAG 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 TGT 1 0 45249 CASAVA_Build 1 81589877 1D ATTAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 11 10 45250 CASAVA_Build 1 81596377 1I TCAAGCCCCC -/A AGCGTGAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 1 2 45251 CASAVA_Build 1 81600668 1D TGTCTTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 10 9 45252 CASAVA_Build 1 81602787 1D AAAACAGTTC T/- TTTGAATACT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 4 3 45253 CASAVA_Build 1 81604569 1D TTGGCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 A 12 11 45254 CASAVA_Build 1 81605470 5I GCAGTAACTC -----/TTGTT TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 TTGTT 3 4 45255 CASAVA_Build 1 81607376 2D ATAAGAGAAA AT/-- AAATGTTTGT 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 AT 1 0 45256 CASAVA_Build 1 81612350 2I AAATACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 19 20 12 AC 8 9 45257 CASAVA_Build 1 81615506 1D CATTTCTAGT A/- AAAAAACATC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 7 6 45258 CASAVA_Build 1 81616075 3D ATCCTACCTC CTT/--- AACACCACAT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 CTT 1 0 45259 CASAVA_Build 1 81616451 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2328 het 2328 ref 21 13 6 2 A 14 11 45260 CASAVA_Build 1 81623871 1D GGAGAGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 12 11 45261 CASAVA_Build 1 81626724 2I TTTCATTTTT --/TC TCTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 TC 1 2 45262 CASAVA_Build 1 81631630 1D TGCCCCAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3051 hom 29 14 8 7 A 15 14 45263 CASAVA_Build 1 81632092 1D ATTGCCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3063 hom 34 13 14 7 T 15 14 45264 CASAVA_Build 1 81640366 1I AAACAGGTAG -/C CAAATTAGTC 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 C 1 2 45265 CASAVA_Build 1 81641519 5D TTTGTTGTTG TTTGT/----- TTGTTTGTTT 1072 het 1072 ref 24 11 7 8 TTTGT 1 0 45266 CASAVA_Build 1 81646591 1I AGAATGCTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 8 9 45267 CASAVA_Build 1 81646783 5D CCACATTAAT TAAGA/----- TGAGTTCAAC 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 TAAGA 1 0 45268 CASAVA_Build 1 81646978 1D TCTTTACCTG C/- CCAATGCACA 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 C 3 2 45269 CASAVA_Build 1 81647568 2I AACACAAAAA --/AC ACACACATTT 3070 hom 30 het 54 3 46 5 AC 3 4 45270 CASAVA_Build 1 81660461 2D CTCAAACTTC TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 14 13 0 T 10 8 45271 CASAVA_Build 1 81669622 2D TGACAGAATG AA/-- AAGTGATTCC 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 A 4 2 45272 CASAVA_Build 1 81680924 1D TAAAACATGG T/- ACTCGGGAGC 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 1 0 45273 CASAVA_Build 1 81683723 1I AAAGTTGCTA -/T TTTTTGCAAA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 T 5 6 45274 CASAVA_Build 1 81685473 2I TACCATTCCC --/TA AGATGATACT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 TA 0 1 45275 CASAVA_Build 1 81698062 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1998 het 1121 hom 23 8 6 10 TA 6 5 45276 CASAVA_Build 1 81711345 4D AATTAGAGAT AGAG/---- GGAGGGAGGA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AG 2 0 45277 CASAVA_Build 1 81720010 4D GGTTTTCAAA GAGG/---- GTCAGAAAAC 3070 hom 138 het 48 0 46 5 GAGG 1 0 45278 CASAVA_Build 1 81720749 8D ATAGCTATTG ATACTTAA/-------- ATACTTAATT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 ATACTTAA 2 1 45279 CASAVA_Build 1 81726810 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1995 het 1995 ref 26 8 7 11 A 15 14 45280 CASAVA_Build 1 81728294 4I ATGAAGAAAT ----/AAAG ATCTCAATAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 AAAG 0 1 45281 CASAVA_Build 1 81738228 1I TGCTTTCTTG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 7 8 45282 CASAVA_Build 1 81764371 1D GTTTCCTTTT A/- TAGACAATTA 3070 het 3070 hom 47 20 22 6 A 1 0 45283 CASAVA_Build 1 81822145 5D AAGTTATTCT CTTAA/----- CTTGACTTGC 3070 hom 84 het 31 0 29 5 CTTAA 1 0 45284 CASAVA_Build 1 81842021 1I TTTTATGCCC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 9 45285 CASAVA_Build 1 81845831 1D ACACCAAAAA G/- TTCCAAGTTG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 G 1 0 45286 CASAVA_Build 1 81847315 1D GTACAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 745 hom 39 3 28 8 T 15 14 45287 CASAVA_Build 1 81851881 1I GTGAAGAAAA -/G TTCTCCTACT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 45288 CASAVA_Build 1 81856337 1I TTATGTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 754 hom 41 3 31 7 T 10 11 45289 CASAVA_Build 1 81857125 1D CTGGAGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 162 hom 35 1 28 6 T 11 10 45290 CASAVA_Build 1 81858216 1I CCATTTCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 43 het 20 0 15 5 A 9 10 45291 CASAVA_Build 1 81858549 1I ATGCAAATAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 147 het 59 0 49 10 A 8 9 45292 CASAVA_Build 1 81862824 1D CACTGCCCCA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 50 het 22 0 17 6 C 8 7 45293 CASAVA_Build 1 81872786 2D AGCTATCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 43 0 33 10 T 13 11 45294 CASAVA_Build 1 81877519 1I AACTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 5 6 45295 CASAVA_Build 1 81877875 9D ATCAAAAGAA AGCAGTAGT/--------- AACTATATTA 3070 hom 41 het 19 0 14 8 AGCAGTAGT 1 0 45296 CASAVA_Build 1 81888664 1I CCAACATGGT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 8 9 45297 CASAVA_Build 1 81894091 2D ATGGCTCTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 29 9 11 10 TG 6 5 45298 CASAVA_Build 1 81906810 1I ACTTGCTTGG -/T ATTTTGTTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 0 1 45299 CASAVA_Build 1 81907759 4I AAGTATTTAT ----/TAAG TATTTACTGT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TAAG 0 1 45300 CASAVA_Build 1 81909792 1D CTGAAATTCC T/- TTTTTTTTTT 1168 het 1168 ref 22 11 4 7 T 13 12 45301 CASAVA_Build 1 81913846 1I AAATAAACTG -/T TTTTTTTTTT 1405 het 1219 hom 19 6 8 5 T 15 16 45302 CASAVA_Build 1 81921929 2I TATTCCATTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 TG 8 9 45303 CASAVA_Build 1 81929600 1D TGCTTGTTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 C 1 0 45304 CASAVA_Build 1 81930141 2D ATATATATGG GT/-- GTGTGTGTGT 1985 hom 30 het 16 0 10 6 GT 7 6 45305 CASAVA_Build 1 81944504 1I ACAAAAAAAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 7 8 45306 CASAVA_Build 1 81947825 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 A 8 7 45307 CASAVA_Build 1 81953125 1I GCATGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 11 12 45308 CASAVA_Build 1 81956735 1D ATGTAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 12 11 45309 CASAVA_Build 1 81961120 1D TTCCTGGGGG A/- AATGCCTGGT 3070 het 3070 ref 49 26 16 8 A 3 2 45310 CASAVA_Build 1 81962067 1D TTTGGGCAGG T/- TTGCCCTTAA 2243 het 2243 ref 30 16 6 8 T 3 2 45311 CASAVA_Build 1 81966086 2D TGTGAATAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 22 8 9 5 AT 8 7 45312 CASAVA_Build 1 81968710 4I ACAGATAGTG ----/CTTA CTTAGTGCAG 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 CTTA 1 2 45313 CASAVA_Build 1 81969778 1I TTCTATCATC -/T TTTTTTTTTT 2625 het 2625 ref 24 13 7 4 T 10 11 45314 CASAVA_Build 1 81979391 1D AGGGAATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 12 11 45315 CASAVA_Build 1 81984313 2I AAAATATAAC --/TT ATAATGCATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 2 45316 CASAVA_Build 1 81993463 2D AGATTTAAAG AT/-- ATATATATAT 945 het 945 ref 11 6 2 3 AT 6 5 45317 CASAVA_Build 1 81999980 1I GTTTTCTGCT -/A TAGATTTACT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 0 1 45318 CASAVA_Build 1 82009975 1D AAAATCCCCC T/- ATGAGAGTGC 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 T 1 0 45319 CASAVA_Build 1 82017651 1D ATAAAAGAAT A/- AAGATGCTTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 3 2 45320 CASAVA_Build 1 82037199 1D TGTGAATGGT G/- CCCAGATGAG 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 G 1 0 45321 CASAVA_Build 1 82038162 1D ATTTTGCAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 10 9 45322 CASAVA_Build 1 82045779 1D CTGCCTAAGA T/- GCTCTCAAAG 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 1 0 45323 CASAVA_Build 1 82046744 4D GCTTTTCATT TTTG/---- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 19 5 TTTG 1 0 45324 CASAVA_Build 1 82048604 3D TTACATAACA AAT/--- AATCATGTTT 3070 het 3070 ref 47 25 18 5 AAT 2 1 45325 CASAVA_Build 1 82048692 1D ATTAAACTGG T/- TACCATCCAT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 T 2 1 45326 CASAVA_Build 1 82053085 3D GTTCAGGTAA TGT/--- TGTTAATTCA 3070 het 3070 hom 28 11 15 4 TGT 2 1 45327 CASAVA_Build 1 82055237 1D TTTTTGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 14 11 T 11 10 45328 CASAVA_Build 1 82055549 1D TTCCGTCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 12 11 45329 CASAVA_Build 1 82056285 4D GAAATTAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 2386 het 2386 ref 23 13 8 2 AAAT 4 3 45330 CASAVA_Build 1 82059010 1D TGTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 11 10 45331 CASAVA_Build 1 82061643 1I TTCCTTCCCT -/C CCCCCCTCCC 2245 het 1810 hom 16 4 7 5 C 6 7 45332 CASAVA_Build 1 82064711 4I CTAGAATGAC ----/TGTT TGGTACCAGC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 TGTT 0 1 45333 CASAVA_Build 1 82065302 1D TATGAAAAAT A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 6 5 45334 CASAVA_Build 1 82083957 1D ACTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 11 10 45335 CASAVA_Build 1 82088605 2D CCCCCTCCTC CT/-- CTTTTACCCC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 CT 2 1 45336 CASAVA_Build 1 82089113 1D TTGTTACCTC T/- TTACACCTCC 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 3 2 45337 CASAVA_Build 1 82093058 1D AGAAAAGTTC T/- TCTGAGCTCC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 2 1 45338 CASAVA_Build 1 82097430 1D TGTCACTGAG T/- TTTTACCTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 7 T 5 4 45339 CASAVA_Build 1 82102582 4D TGAAGTCAGC ATAT/---- ATATCAGTTG 3070 hom 60 het 30 0 21 11 AT 4 2 45340 CASAVA_Build 1 82102630 15D GACCTATTTC TGATTTAGAAAAAAA/--------------- TTGATTGTAA 3070 het 2942 hom 21 7 9 9 TGATTTAGAAAAAAA 1 0 45341 CASAVA_Build 1 82107979 1D AAATGTATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 18 9 A 10 9 45342 CASAVA_Build 1 82108486 5I GATGATTTGC -----/AAACA AAACAAAACA 3070 hom 69 het 31 0 23 8 AAACA 2 3 45343 CASAVA_Build 1 82114868 1D CAATAAGTAC T/- TGTTTAACTA 3070 het 3070 ref 46 24 21 1 T 2 1 45344 CASAVA_Build 1 82115981 1D TTGCTTTGTT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 37 19 14 4 A 9 8 45345 CASAVA_Build 1 82116629 4D CTTTGTAATA TATT/---- TATTTGGTGA 3070 het 3070 hom 30 13 17 2 TATT 2 1 45346 CASAVA_Build 1 82117786 1D TAACCCAGAA T/- TTAAAAAAAA 2697 het 2697 ref 25 11 9 5 T 3 2 45347 CASAVA_Build 1 82127844 1I CATAACATAG -/A AAGTGGGAGG 3070 het 3070 ref 46 29 10 7 A 2 3 45348 CASAVA_Build 1 82129006 1D AGAGATACAC G/- GCAGTCTTTG 3070 het 3070 ref 48 25 19 5 G 2 1 45349 CASAVA_Build 1 82138809 1D CACTGTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 11 10 45350 CASAVA_Build 1 82140946 1D AGGATAGTCA G/- ACTGTGTCAG 3070 hom 120 het 41 0 41 1 G 1 0 45351 CASAVA_Build 1 82145703 1I CTAATATAGC -/T TGACATGTAT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 1 2 45352 CASAVA_Build 1 82147151 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1708 hom 36 5 19 12 T 14 13 45353 CASAVA_Build 1 82157827 1D AAATGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 11 10 45354 CASAVA_Build 1 82160175 1D AGAAGCAAAT G/- TGCCAAACAC 3070 het 3070 ref 39 16 15 9 G 1 0 45355 CASAVA_Build 1 82174953 4D AAGTGAAAAT AATC/---- AAATAAATTA 3070 het 3070 hom 35 17 16 3 AATC 1 0 45356 CASAVA_Build 1 82177085 5I TAGGACAGTG -----/TCTTC TCTTATCTCT 3070 het 3070 ref 34 20 14 0 TCTTC 0 1 45357 CASAVA_Build 1 82179004 1I AGTATTAGCA -/C ACCCTGATGC 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 C 0 1 45358 CASAVA_Build 1 82179454 1I TTTTGCTTAC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 7 8 45359 CASAVA_Build 1 82184141 2D CCATATTCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 40 11 20 10 TC 10 9 45360 CASAVA_Build 1 82186538 1D ATAAATTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 A 11 10 45361 CASAVA_Build 1 82189933 1I ATAAGACTTT -/A AAAATAACAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 4 5 45362 CASAVA_Build 1 82191009 1D AAAAATTGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 11 12 T 10 9 45363 CASAVA_Build 1 82192486 1I AAAGAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 11 12 45364 CASAVA_Build 1 82193611 1D TGCCACCTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 T 10 9 45365 CASAVA_Build 1 82201442 1I CTTATACTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 8 9 45366 CASAVA_Build 1 82208282 4I CAGATAATTC ----/ACAA ACAAATTATG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 ACAA 1 2 45367 CASAVA_Build 1 82210259 5D ACAAGGATAA TTTGT/----- TTTATTGTTT 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 TTTGT 1 0 45368 CASAVA_Build 1 82211198 1I AAAAAAAAAA -/C AACTTGCTCA 2960 het 14 hom 13 1 9 3 C 0 1 45369 CASAVA_Build 1 82234764 1I TTTTCTGCTG -/A AATATCAATC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 3 45370 CASAVA_Build 1 82243135 1D CTTTCAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 9 A 12 11 45371 CASAVA_Build 1 82251584 2D AAGAATTAGA AT/-- ATATATATAT 2140 hom 16 het 32 0 10 22 AT 9 8 45372 CASAVA_Build 1 82268830 1D TTTCCATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 13 9 A 13 12 45373 CASAVA_Build 1 82273449 1D ACCCTCTCTA C/- CCTTCTTTGG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 3 2 45374 CASAVA_Build 1 82280272 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 TG 5 4 45375 CASAVA_Build 1 82317211 2D TGAAAAAGAC TT/-- TGTGAGGCTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 3 1 45376 CASAVA_Build 1 82317458 2I TATTTAGAGG --/TT TTTTTTTTTT 2752 het 2752 ref 24 12 8 4 T 10 12 45377 CASAVA_Build 1 82321557 1I TATACCAGCA -/G TAGAAACCAA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 G 0 1 45378 CASAVA_Build 1 82322632 3I GGGCTATGTA ---/TTC TTTGTTACTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTC 0 1 45379 CASAVA_Build 1 82329540 1I AATATATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 22 9 6 T 10 11 45380 CASAVA_Build 1 82330596 1D AAAAAAAAAA T/- GTCTCCTAGT 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 T 1 0 45381 CASAVA_Build 1 82337687 1I GTTTTGGCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 151 het 53 0 51 2 T 8 9 45382 CASAVA_Build 1 82344556 1I ATTAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 A 10 11 45383 CASAVA_Build 1 82355193 4I AAAAAATCTG ----/AGTT AGGGATAAAG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 AGTT 0 1 45384 CASAVA_Build 1 82357088 1I ATCCTTCAAC -/A AAAATTTGAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 4 5 45385 CASAVA_Build 1 82358947 1I TCGAAAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 T 9 10 45386 CASAVA_Build 1 82366382 1I TAATATCTAC -/T TTGATATCAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 2 3 45387 CASAVA_Build 1 82367231 1I TCTAAAATGT -/A AAAACATGGA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 4 5 45388 CASAVA_Build 1 82375777 1D TTGGGGGAAC A/- CAAAGGTTCA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 A 1 0 45389 CASAVA_Build 1 82382675 1D TTTCCTACAA T/- AGAAGAAAGC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 1 0 45390 CASAVA_Build 1 82388679 2I AATTTTCATC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 T 9 11 45391 CASAVA_Build 1 82390137 1D CAATCTGGTT A/- GACATGGCCA 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 A 1 0 45392 CASAVA_Build 1 82392496 1D TTTCTATCGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 19 18 9 T 10 9 45393 CASAVA_Build 1 82403995 4D ATAAAGTAGG TATC/---- TATCTATCCA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 TATC 3 2 45394 CASAVA_Build 1 82406343 1D ATGCTGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 10 A 13 12 45395 CASAVA_Build 1 82409467 4D AAGGCATATT TGTA/---- TGTGTGCTTA 3070 het 3070 hom 39 18 18 5 TGTA 1 0 45396 CASAVA_Build 1 82411566 5I TAAACCCAGA -----/GCTGG GCTGGTGCAC 1804 het 1804 ref 31 12 5 14 GCTGG 1 2 45397 CASAVA_Build 1 82419156 2I GAAAAAAAAA --/AT ATATATATAT 2185 het 2185 ref 18 10 5 3 AT 6 7 45398 CASAVA_Build 1 82427724 1I TATACAAAGA -/T TTTTTAAAAG 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 T 5 6 45399 CASAVA_Build 1 82433288 6D AGGTGGAGTT AGAAAG/------ AGAGAGTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 19 2 AGAAAG 1 0 45400 CASAVA_Build 1 82442108 1D AATTTGTCAA T/- TTTTTGTTTC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 6 5 45401 CASAVA_Build 1 82444034 1I GGGCTACCAG -/A AAAAAAGATG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 6 7 45402 CASAVA_Build 1 82456417 15I ATTATACCAA ---------------/TTTAATGTTCTAGAG AAAACATTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TTTAATGTTCTAGAG 0 1 45403 CASAVA_Build 1 82464400 1I TTGTTTTTCC -/T TTTTTGCAAT 3070 het 3070 ref 46 19 24 3 T 5 6 45404 CASAVA_Build 1 82464491 2D AAAAAAAAAA AC/-- CTGGATACAG 3070 hom 13 het 35 1 28 7 AC 1 0 45405 CASAVA_Build 1 82474651 1I TAATCACATG -/T TTTTTGTCTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 5 6 45406 CASAVA_Build 1 82474853 1D TGTTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 het 2938 hom 31 11 14 6 G 1 0 45407 CASAVA_Build 1 82475272 2D CATTTTTTAT TG/-- TGTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 TG 2 1 45408 CASAVA_Build 1 82476229 2I ACTCCTGTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 22 2 10 10 TG 0 1 45409 CASAVA_Build 1 82481847 1D TTTTAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1832 hom 20 6 10 4 A 11 10 45410 CASAVA_Build 1 82483144 1D CTAACATGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 9 8 45411 CASAVA_Build 1 82483238 1D TTAAAATCTT A/- ACTAGTTTTT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 A 2 1 45412 CASAVA_Build 1 82484307 1D GTGCAGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 A 12 11 45413 CASAVA_Build 1 82495253 1D CTTTTTGTGC A/- CATATTGAGA 3070 het 3070 ref 45 21 14 11 A 1 0 45414 CASAVA_Build 1 82499693 2I TAGCAAGTTA --/AC ACTAAAGAAT 3070 hom 65 het 24 0 21 3 AC 1 2 45415 CASAVA_Build 1 82499819 4I GCAAACAAAA ----/AATC AATAATGCAA 3070 hom 30 het 19 0 11 8 AATC 0 1 45416 CASAVA_Build 1 82509946 2D ATTGAAATAT AA/-- CTTTTAGGCT 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 A 2 0 45417 CASAVA_Build 1 82511419 1I ATCGCTTGAA -/C CCGGGAGGCG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 2 3 45418 CASAVA_Build 1 82511993 4I TAAATATAAC ----/AATT AATAAAATCT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AATT 0 1 45419 CASAVA_Build 1 82520430 4D AAAGAGTGTT TGAC/---- TGATGGGGAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 TGAC 1 0 45420 CASAVA_Build 1 82527936 1I CTCCCCTTCT -/C CTTCATCCTG 3070 hom 129 het 50 0 43 7 C 1 2 45421 CASAVA_Build 1 82532005 1I CCTTGTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 21 18 10 A 10 11 45422 CASAVA_Build 1 82544059 1D AACTAGGCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2701 hom 35 7 15 13 T 9 8 45423 CASAVA_Build 1 82544103 4I CATCAGTAGT ----/TAAA TAAAGTTCTC 3070 het 3070 hom 50 12 23 15 TAAA 1 2 45424 CASAVA_Build 1 82545636 2I TTTCAGGCAT --/TG TGTGATGCAC 3070 het 3070 hom 57 27 26 4 TG 2 3 45425 CASAVA_Build 1 82545805 1D ATGGCTGATT C/- CCCCCCACTG 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 C 7 6 45426 CASAVA_Build 1 82550113 1D CAGCTAATGA T/- TTTGTCCATT 3070 het 3070 hom 38 14 20 5 T 4 3 45427 CASAVA_Build 1 82551722 2D ACATTTTGGT TA/-- ATATGTTTTT 3070 het 3070 ref 50 23 21 7 TA 1 0 45428 CASAVA_Build 1 82552381 1D TCCCTCAAAC T/- TTGACCTCCA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 3 2 45429 CASAVA_Build 1 82554631 1I AATATGTGTA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 7 8 45430 CASAVA_Build 1 82562548 1I CGTCTCTACT -/A AAAAATACAA 3051 hom 28 het 12 0 9 3 A 5 6 45431 CASAVA_Build 1 82569344 2D1M6I4M3D CCACCCAAAG AAT------ATTTAAC/--TCGGGTGGTTT--- CTCTCCCATT 3070 hom 90 het 31 0 29 3 N/A 0 0 45432 CASAVA_Build 1 82569434 1I GTGAGTATGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 A 9 10 45433 CASAVA_Build 1 82570885 2D ACTCATCAGC AT/-- ATATACATGG 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 AT 3 2 45434 CASAVA_Build 1 82577314 4D ATATGCATTC CTTT/---- CTACCATTTG 3070 het 3070 ref 26 14 11 2 CTTT 1 0 45435 CASAVA_Build 1 82579066 1I AGATTATTAA -/G TCATTTTTAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 0 1 45436 CASAVA_Build 1 82599646 2D TGAAACTGAT AC/-- ATATATATAT 3070 het 1819 hom 20 5 11 4 AC 1 0 45437 CASAVA_Build 1 82607020 4I CAGAGGAGTG ----/CTGC CTGAATTCCT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 CTGC 0 1 45438 CASAVA_Build 1 82615806 1I TGAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 23 2 17 4 T 13 14 45439 CASAVA_Build 1 82624313 1D TCTTTCTCTC T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 T 7 6 45440 CASAVA_Build 1 82629516 1I TGTGTAGGGC -/A AAAAAAAAAA 2246 het 1410 hom 28 10 6 12 A 14 15 45441 CASAVA_Build 1 82632362 5D TTCTTTTTTC TTAAG/----- TTAAATGCTA 3070 het 3070 ref 42 26 14 7 TTAAG 1 0 45442 CASAVA_Build 1 82637529 1D GTGAGAATCT G/- AGGTCTCCTG 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 G 1 0 45443 CASAVA_Build 1 82637911 1D GCAGCCCTAT A/- AAAAATACAT 3070 het 3070 ref 37 21 16 0 A 6 5 45444 CASAVA_Build 1 82647343 1D CTGTCAGTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2561 hom 24 8 10 6 A 10 9 45445 CASAVA_Build 1 82663482 1D ACAATAAGGT G/- GGGGCATAGC 3070 het 3070 ref 54 23 18 14 G 5 4 45446 CASAVA_Build 1 82669739 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 521 hom 25 8 14 4 A 14 13 45447 CASAVA_Build 1 82673575 1D CTTTCTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 18 19 12 A 15 14 45448 CASAVA_Build 1 82687384 1D TTAATAAGTA T/- TTTTTTAGCA 3070 het 2897 hom 24 6 14 4 T 7 6 45449 CASAVA_Build 1 82688688 2I AAAACAAAAC --/AT GTGTTAAGGC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 AT 0 1 45450 CASAVA_Build 1 82693353 2D ATTGATATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2900 hom 31 9 13 9 A 14 12 45451 CASAVA_Build 1 82701616 2I CAGGAAAGGT --/AG AGAGTCCTTC 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 AG 2 3 45452 CASAVA_Build 1 82705177 1I ACTTCTATAA -/T TTTTTGGTAT 3070 het 934 hom 14 3 10 1 T 5 6 45453 CASAVA_Build 1 82705935 4D ATTATATCAG TTCT/---- TTAATTCGGC 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 TTCT 1 0 45454 CASAVA_Build 1 82709535 1I AAAACCCAAT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 A 0 1 45455 CASAVA_Build 1 82725270 1I AAGAGAAGGG -/A GGGGGGAAAG 3070 het 1868 hom 20 7 11 2 A 0 1 45456 CASAVA_Build 1 82738274 4I AGCACTGTAG ----/ACTA ACTGAGAAGG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 ACTA 0 1 45457 CASAVA_Build 1 82763627 4D ACTATTTTAG ATAA/---- ATATATTTTA 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 ATAA 1 0 45458 CASAVA_Build 1 82764149 1D AAAGGTCCTG T/- GTATGAGTAG 3070 het 3070 ref 36 18 16 5 T 1 0 45459 CASAVA_Build 1 82764475 1D GGGAGGCTGA G/- GGGGGCGGAT 3070 hom 66 het 24 0 22 3 G 6 5 45460 CASAVA_Build 1 82774006 2I TGATGTATAA --/CT GTATATTAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 CT 0 1 45461 CASAVA_Build 1 82774615 1D TTCCTAAATC A/- AACAAAGAAA 3070 het 2068 hom 26 6 9 11 A 3 2 45462 CASAVA_Build 1 82774661 1D GAAGAAACAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 9 8 45463 CASAVA_Build 1 82781118 1D AAAACTACAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2508 hom 29 7 16 6 T 10 9 45464 CASAVA_Build 1 82787203 1I AAGGATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 32 0 25 7 T 10 11 45465 CASAVA_Build 1 82796275 2I GTGTCACACA --/TC TCTCTCTTTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TC 3 4 45466 CASAVA_Build 1 82800767 1D TGCTGAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2889 hom 27 10 12 5 A 16 15 45467 CASAVA_Build 1 82808298 1D ATTGCTCCCA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 141 het 51 0 48 4 T 8 7 45468 CASAVA_Build 1 82811962 12D ATTACAATTC TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 38 0 32 8 TG 14 8 45469 CASAVA_Build 1 82815873 4I TCTTTTAAAT ----/ATTA ATTATTATCT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 ATTA 1 2 45470 CASAVA_Build 1 82817588 1I GGTAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 23 1 19 3 A 13 14 45471 CASAVA_Build 1 82818381 3D GCTGGCATAT TTA/--- TTAGGCTAGT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 TTA 2 1 45472 CASAVA_Build 1 82820500 1I AACAGATTGT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 8 9 45473 CASAVA_Build 1 82866026 2D AGGAATCCAC AT/-- ACTCATAACA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 AT 1 0 45474 CASAVA_Build 1 82887185 1D ATACATAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 A 9 8 45475 CASAVA_Build 1 82888939 1D AAAGAAAAAC A/- AGTGTCAGGA 3070 het 3070 ref 48 22 15 12 A 2 1 45476 CASAVA_Build 1 82900188 2D AGGAGCTAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2070 hom 18 6 7 5 A 12 10 45477 CASAVA_Build 1 82900317 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 7 T 11 10 45478 CASAVA_Build 1 82903208 1D GAAACATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 15 10 A 11 10 45479 CASAVA_Build 1 82903948 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 1261 hom 20 4 15 2 A 15 11 45480 CASAVA_Build 1 82904750 5D CATTCCGCGA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 20 9 AAAAT 3 2 45481 CASAVA_Build 1 82905644 1D CCATGTACTG A/- AAAAGGATGT 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 A 5 4 45482 CASAVA_Build 1 82909263 1D GCTGTATAAT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 7 6 45483 CASAVA_Build 1 82916406 5D AGGGTTACAC ACACA/----- AACAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 20 10 ACACA 1 0 45484 CASAVA_Build 1 82917519 1D TGGAAGGATT C/- TTTGCCCGTA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 C 1 0 45485 CASAVA_Build 1 82919394 1I TTACAACACC -/G GGGCATGTGG 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 G 3 4 45486 CASAVA_Build 1 82922010 1I TAAATATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 T 9 10 45487 CASAVA_Build 1 82922439 58D CTGAATATCT CCACAGATTTAAGAGAATACGAGAGAGCATGAAGGAATGAGAAAAATAAATGAATGCC/---------------------------------------------------------- AATGAACTGG 3070 het 3070 ref 42 43 17 1 CCACAGATTTAAGAGAATACGAGAGAGCATGAAGGAATGAGAAAAATAAATGAATGCC 1 0 45488 CASAVA_Build 1 82922662 2D TTTATTTACC TT/-- TCTCTTAAAT 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 T 3 1 45489 CASAVA_Build 1 82923663 1D ATGTGCAGAC T/- TTTTTCACTA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 6 5 45490 CASAVA_Build 1 82926501 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 12 12 T 14 13 45491 CASAVA_Build 1 82928008 4I CCTAGGAATT ----/TGTC TGTCTGCTGC 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 TGTC 1 2 45492 CASAVA_Build 1 82930342 2D CTTGCCTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 13 11 45493 CASAVA_Build 1 82932493 2D CTAGAAAATA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 11 9 45494 CASAVA_Build 1 82932797 1D AACTACCTGC A/- AAAAACTCTT 3070 het 3070 hom 51 22 24 7 A 6 5 45495 CASAVA_Build 1 82933335 1D TTGACTGGGG A/- AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 9 8 45496 CASAVA_Build 1 82933783 3I CCTGCCTTTT ---/TTA AAAAAAAAAA 778 het 778 ref 27 9 5 13 TTA 0 1 45497 CASAVA_Build 1 82934150 1D CATGTTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 10 9 45498 CASAVA_Build 1 82935382 1I ATTATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 14 15 45499 CASAVA_Build 1 82940085 5I TCATAGGATG -----/CTAGA CTAGACACTG 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 CTAGA 1 2 45500 CASAVA_Build 1 82941137 14I ATGAAAAGCA --------------/AGCAATAGACTGCC AGCCCATAAT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 AGCAATAGACTGCC 0 1 45501 CASAVA_Build 1 82941482 14D AAAATTACCT GGGCATGGTGGCGC/-------------- GGGCGCATAA 3070 het 3070 hom 20 9 9 5 GGGCATGGTGGCGC 1 0 45502 CASAVA_Build 1 82942008 2D AAAATCAGGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 T 11 9 45503 CASAVA_Build 1 82943336 1D TTTTTTTTTT C/- CCATGGGACA 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 C 3 2 45504 CASAVA_Build 1 82946893 1D GGGAACACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 10 9 45505 CASAVA_Build 1 82952409 1D GTAGTGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 24 8 T 11 10 45506 CASAVA_Build 1 82964856 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 CT 1 2 45507 CASAVA_Build 1 82967570 1D CTGAAACACC A/- ACAATAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 A 2 1 45508 CASAVA_Build 1 82970284 1I ATGTCATTAA -/T CCTATTCCTG 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 T 0 1 45509 CASAVA_Build 1 82970476 1D ATTAAATTAT A/- AGGCTTGTTC 3070 het 3070 hom 44 21 21 3 A 2 1 45510 CASAVA_Build 1 82975035 2I TTTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 10 12 45511 CASAVA_Build 1 82976118 2I GTGGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 9 14 12 TG 8 9 45512 CASAVA_Build 1 82977959 1I GTGTATCTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 A 8 9 45513 CASAVA_Build 1 82987680 9D AACATTTCAA TTGCTTATG/--------- TTGCTTATGA 3070 het 3070 ref 43 18 18 10 TTGCTTATG 2 1 45514 CASAVA_Build 1 82997285 2I CCTTCTCCTC --/TT GTTCTTCTTC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 0 2 45515 CASAVA_Build 1 83004477 3I AATAAAATCA ---/AAG GAGGAGAAGG 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 AAG 0 1 45516 CASAVA_Build 1 83051559 3I AGTAATCACT ---/TAA TAATGATAGA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 TAA 1 2 45517 CASAVA_Build 1 83067671 1D TGATAACGTA T/- TTTGTAAAAC 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 T 4 3 45518 CASAVA_Build 1 83072985 2D GAGAAGTGAT AC/-- TACAGAAAGT 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 AC 1 0 45519 CASAVA_Build 1 83078056 1I TACAATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 10 11 45520 CASAVA_Build 1 83078884 1D GTAACCAAAT A/- AAAATATATA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 5 4 45521 CASAVA_Build 1 83079635 1D ATAACTTCCT A/- AAAATGTATC 2503 het 2503 ref 32 15 6 11 A 5 4 45522 CASAVA_Build 1 83080745 1I TCAGGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 10 11 45523 CASAVA_Build 1 83101563 1I TTTTGTGGTT -/A CATAGAGGAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 45524 CASAVA_Build 1 83105045 1D TTTATTTTTA T/- TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 29 15 13 1 T 5 4 45525 CASAVA_Build 1 83107711 1D TTCTTGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 15 14 45526 CASAVA_Build 1 83130222 1D GCTCAGTGTT C/- ACACCTGTAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 C 1 0 45527 CASAVA_Build 1 83143362 2D CTTCGGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 1697 het 326 hom 25 6 6 13 T 18 16 45528 CASAVA_Build 1 83143482 1D TGGTTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 201 hom 40 3 24 13 T 15 14 45529 CASAVA_Build 1 83143846 1D TAATGTATCT G/- AAAGAGAATG 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 G 1 0 45530 CASAVA_Build 1 83156900 1D ACATACAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1920 hom 25 6 12 7 T 10 9 45531 CASAVA_Build 1 83160284 1I TTTTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1011 hom 39 4 29 6 T 11 12 45532 CASAVA_Build 1 83163334 1I CTCTTATATT -/A TCCAGATTTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 0 1 45533 CASAVA_Build 1 83182552 1D ATTAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 11 10 45534 CASAVA_Build 1 83183033 4D AAGCAAAGAC TAAT/---- TGAAAGAAGC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TAAT 1 0 45535 CASAVA_Build 1 83188681 2I ATTCCTAATT --/CA CAGTCTTGAG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 CA 1 2 45536 CASAVA_Build 1 83199864 4I AGACGCACAT ----/GAGA GAATATATAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 GA 1 3 45537 CASAVA_Build 1 83207484 1I GGCCTCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 923 hom 34 3 19 12 T 15 16 45538 CASAVA_Build 1 83218862 4D ACTTAGTTGA AAAC/---- AAACAAGCAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 AAAC 2 1 45539 CASAVA_Build 1 83223368 1I GAGCCCACGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 12 13 45540 CASAVA_Build 1 83223776 1I GAAATTGTTA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 7 8 45541 CASAVA_Build 1 83229436 2I AACTACATAA --/AG AGAAGATGAA 3070 het 3070 hom 52 23 25 4 AG 1 2 45542 CASAVA_Build 1 83243594 2D TCTTCGAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 29 0 16 13 T 16 14 45543 CASAVA_Build 1 83252086 1D GGATTGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 7 A 11 10 45544 CASAVA_Build 1 83257543 52D ATATGTACAC ATACATATGTATATATGTGTGTGTACATATGTATATATGTACACACACATAT/---------------------------------------------------- ATACATATGC 3070 hom 24 het 15 0 9 7 ATACATATGTATATATGTGTGTGTACATATGTATATATGTACACACACATAT 1 0 45545 CASAVA_Build 1 83257866 5D AATTTAAAAA TACTT/----- TACTTTATTA 3070 hom 30 het 21 0 11 11 TACTT 2 1 45546 CASAVA_Build 1 83301545 1I CTGTCTCTAG -/A AAAAAAAAAA 1131 het 1131 ref 39 21 5 13 A 13 14 45547 CASAVA_Build 1 83382408 1I CATGGAAAAC -/A GTCTGGCCAC 3070 het 3070 ref 63 37 17 9 A 0 1 45548 CASAVA_Build 1 83388861 4D GAGTTTTGTC CTTT/---- CTGAGGATCT 1883 het 1883 ref 41 34 5 3 CTTT 1 0 45549 CASAVA_Build 1 83390462 1D AGTGGGTCTC T/- TGGCTATGAT 3070 hom 84 het 33 0 29 6 T 2 1 45550 CASAVA_Build 1 83404466 1D AATAGACTTT A/- TTTTTTAGAG 3070 het 468 hom 13 1 12 0 A 1 0 45551 CASAVA_Build 1 83404792 1I TCTCTCCCCC -/G TAACCCTGGC 3070 het 1749 hom 34 4 25 5 G 0 1 45552 CASAVA_Build 1 83412282 2D GATGGGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 12 0 9 3 T 14 12 45553 CASAVA_Build 1 83415096 2D GCTTTACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 44 3 31 10 T 15 13 45554 CASAVA_Build 1 83419302 2D GAATACTGAT AC/-- AGTGTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AC 1 0 45555 CASAVA_Build 1 83419689 1D TAAAATATAG T/- TTTGATATTT 3070 het 3070 hom 39 21 18 1 T 4 3 45556 CASAVA_Build 1 83428239 1D GAGCAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 36 1 25 11 A 13 12 45557 CASAVA_Build 1 83433755 1I GCCTACTTTA -/T TTTCTTTATA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 3 4 45558 CASAVA_Build 1 83463040 1I AGCTTATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 20 1 14 5 T 11 12 45559 CASAVA_Build 1 83466059 1D AAAAATTGAA T/- ATTAGGCCAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 1 0 45560 CASAVA_Build 1 83482199 1D TCACTATGCA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 898 hom 42 3 33 6 G 1 0 45561 CASAVA_Build 1 83486776 1I TAGTTTTGAA -/T CTTGAAATTT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 0 1 45562 CASAVA_Build 1 83495657 1D TTAAAATACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 10 9 45563 CASAVA_Build 1 83531177 1D AAAAGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 5 A 11 10 45564 CASAVA_Build 1 83538653 4I TCAACCTCCT ----/CAAA CAAAACAATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 CAAA 1 2 45565 CASAVA_Build 1 83538917 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 A 10 11 45566 CASAVA_Build 1 83556873 1D ATCCTCCCAC A/- ATCTGTTTTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 2 1 45567 CASAVA_Build 1 83562034 1I CAGAATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 11 12 45568 CASAVA_Build 1 83565189 1D TTAGCTCACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 28 1 23 4 A 11 10 45569 CASAVA_Build 1 83573035 1I TGTATGAGGA -/G GGGAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 3 4 45570 CASAVA_Build 1 83574723 1I AGTCATTTTG -/C ATAGGTCCTA 1340 het 1340 ref 52 41 3 8 C 0 1 45571 CASAVA_Build 1 83594909 1I ATTAGGTAGA -/T TTTTATGTCT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 4 5 45572 CASAVA_Build 1 83596040 1I GTATTTTGAT -/A AAGAATAGCA 2825 het 2825 ref 38 29 6 3 A 2 3 45573 CASAVA_Build 1 83599098 3D GCTTTCTCTC CTT/--- CTCTTTCATA 3070 het 304 hom 34 2 29 4 CTT 1 0 45574 CASAVA_Build 1 83600690 1D GTGCTATATG A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 8 7 45575 CASAVA_Build 1 83603389 1D GTTTTTTTTT A/- AAAGTGGAAC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 4 3 45576 CASAVA_Build 1 83603470 1I TCAAAAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 10 11 45577 CASAVA_Build 1 83612476 2I GTATGGATAT --/AA AACATCATTG 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 2 4 45578 CASAVA_Build 1 83635851 1D TGATGACTGA T/- TTTTTTTTTA 2252 het 2252 ref 43 32 5 6 T 10 9 45579 CASAVA_Build 1 83637914 2I TTTCACTTGT --/CA CACTATGTGT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 CA 1 2 45580 CASAVA_Build 1 83651224 4D GTCAGCAGGG TTCT/---- TTGTCTAATT 3070 hom 27 het 11 0 10 2 TTCT 1 0 45581 CASAVA_Build 1 83663815 10D GAACACCTTA AATTATTGTC/---------- AATAAAAGCA 2315 het 2315 ref 26 19 5 4 AATTATTGTC 1 0 45582 CASAVA_Build 1 83666114 1D CAGCTGTGCA T/- TTTTTTTGCA 2803 het 2803 ref 60 50 6 4 T 8 7 45583 CASAVA_Build 1 83699542 8I CTCAGCTAAG --------/GGTGTTGT ATATTGAAGA 3070 het 3070 ref 45 28 9 8 GGTGTTGT 0 1 45584 CASAVA_Build 1 83720447 1D CTGATGTCTA T/- GAATGATATT 2838 het 2838 ref 48 37 6 5 T 1 0 45585 CASAVA_Build 1 83720598 2I TTAGCTAGTT --/AA AAAAAAAAAA 1338 het 1338 ref 57 39 3 15 A 12 14 45586 CASAVA_Build 1 83728564 2D CAAACAAGAT AA/-- AAAAAAAAGG 3070 hom 106 het 52 1 45 6 A 10 8 45587 CASAVA_Build 1 83745190 1D CCTGACCTCA G/- GTGATCCACC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 G 2 1 45588 CASAVA_Build 1 83746192 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 49 1 34 14 T 10 11 45589 CASAVA_Build 1 83752123 1I TTCAACACTA -/T TTTTCCAGGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 4 5 45590 CASAVA_Build 1 83759983 2I ATACAAATAT --/AA GAGTTATAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 2 45591 CASAVA_Build 1 83764018 1D ATCCAGGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 32 0 25 8 T 10 9 45592 CASAVA_Build 1 83783788 1D TATACCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 40 1 33 6 A 11 10 45593 CASAVA_Build 1 83795250 1D TGGTATTCAG C/- CCCCCTCTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 6 5 45594 CASAVA_Build 1 83804506 1I TACTCCAAAT -/A AAAAAAAAAA 694 het 694 ref 39 27 3 9 A 14 15 45595 CASAVA_Build 1 83813341 4D CAATGATTTC ACAA/---- ACAGAGAGAC 3070 hom 116 het 44 0 39 6 ACAA 1 0 45596 CASAVA_Build 1 83840298 1I GACTCAAAAC -/A AAAAAACTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 6 7 45597 CASAVA_Build 1 83842512 1D GCCACAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 31 2 22 9 A 15 14 45598 CASAVA_Build 1 83845519 2I GAAAGGACTC --/TT TTTTGGATTC 3070 hom 111 het 48 0 35 13 T 4 6 45599 CASAVA_Build 1 83864901 1I AAGCAAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 790 hom 36 4 24 8 T 12 13 45600 CASAVA_Build 1 83872351 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 12 0 8 4 T 13 12 45601 CASAVA_Build 1 83886571 1D AAAATGATGC A/- GGGAATTCTA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 1 0 45602 CASAVA_Build 1 83899652 2D AGTTCGTCTA TC/-- TCTGTTATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TC 2 1 45603 CASAVA_Build 1 83903369 1D TTTTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 28 1 23 4 T 13 12 45604 CASAVA_Build 1 83906306 1D AGTATTAAAA T/- TTTAAAAGAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 3 45605 CASAVA_Build 1 83910845 1D TTCAACATAC A/- AATTTGGGAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 2 45606 CASAVA_Build 1 83911249 9D TTATTTATTT ATTTATTTA/--------- TTTATTTTGA 3070 hom 22 het 9 0 8 2 ATTTATTTA 1 0 45607 CASAVA_Build 1 83921344 4D CATTGTCGTC AGAG/---- AAAGCATAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 6 AG 2 0 45608 CASAVA_Build 1 83946513 2I AATAGTACTC --/TT GAGCTTCCAC 3070 hom 102 het 36 0 34 2 T 0 2 45609 CASAVA_Build 1 83963266 2D ATGTGCCATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 38 0 29 10 TG 7 6 45610 CASAVA_Build 1 83968440 1I TATTGGTGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 8 9 45611 CASAVA_Build 1 83980631 1I CTTTGGGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 13 14 45612 CASAVA_Build 1 83990023 2D TGGCAAAGAC AG/-- AGAAATAGAA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 AG 2 1 45613 CASAVA_Build 1 83998034 1I TTTGCAGCCA -/T TAAAAACAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 1 2 45614 CASAVA_Build 1 84010632 4D TGTGTCACTG ACTT/---- ACTTCGTGAA 3070 hom 90 het 32 0 31 5 ACTT 2 1 45615 CASAVA_Build 1 84025641 25D CAACAAACAT GTATTAAAAATCTACTATTTAGAAA/------------------------- GTACTGTGTC 3070 hom 69 het 22 0 24 5 GTATTAAAAATCTACTATTTAGAAA 1 0 45616 CASAVA_Build 1 84031953 1D GGAGAGGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 31 3 19 9 T 15 14 45617 CASAVA_Build 1 84069794 1I ATATTAAAAC -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 7 8 45618 CASAVA_Build 1 84082153 1D AGGAATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 11 10 45619 CASAVA_Build 1 84099617 1D ACGCTAACCA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 836 hom 32 9 13 10 C 12 11 45620 CASAVA_Build 1 84120589 1D ACTTTCTGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2699 hom 18 6 10 2 A 10 9 45621 CASAVA_Build 1 84120687 2I TTCTTTACTC --/TG TGTGTTTCTG 3070 het 3070 ref 25 11 13 1 TG 2 3 45622 CASAVA_Build 1 84125043 1D CTCTCTTGGC T/- TTACCTCACA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 3 2 45623 CASAVA_Build 1 84126101 1I TTCAATTCCT -/C CATCTGTAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 C 1 2 45624 CASAVA_Build 1 84128323 14D CGACTGCAGA AGAACTTCAAGGAT/-------------- ATTGGTTTGT 3070 het 3070 ref 47 32 14 3 AGAACTTCAAGGAT 1 0 45625 CASAVA_Build 1 84128980 1D AAGTAGTCAA G/- GATGCAGTAA 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 G 2 1 45626 CASAVA_Build 1 84130106 2I CATGATACCA --/CC CCCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 C 3 5 45627 CASAVA_Build 1 84131813 4I ACATAAAGAC ----/TAAA TAAAGACATT 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 TAAA 1 2 45628 CASAVA_Build 1 84145580 1I ATTGTAGGCT -/A AAGGTAGGTG 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 2 3 45629 CASAVA_Build 1 84152087 10D AGGTTATAGT TTTGTTTGGA/---------- TGACAAGCCT 3070 het 3070 ref 48 27 20 5 TTTGTTTGGA 1 0 45630 CASAVA_Build 1 84169938 5D TAGGTTCCTG TTTAA/----- TTTAAGAGTA 3070 het 3070 hom 44 21 19 7 TTTAA 2 1 45631 CASAVA_Build 1 84173809 1D GTAAGGATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 T 10 9 45632 CASAVA_Build 1 84175477 1D AGTACGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 644 hom 30 4 16 10 T 15 14 45633 CASAVA_Build 1 84184155 1D AATTGGTATA C/- AATTCCCACT 2095 het 2095 ref 16 9 5 3 C 1 0 45634 CASAVA_Build 1 84203387 1D AGTCAATCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 8 45635 CASAVA_Build 1 84204423 1D CATAAATAAT G/- TGGGTACGCC 3070 het 3070 ref 55 27 20 9 G 1 0 45636 CASAVA_Build 1 84205597 7D AACAGTTCTC AAACTTG/------- AATGTGCACA 3070 het 3070 ref 38 21 17 3 AAACTTG 1 0 45637 CASAVA_Build 1 84222362 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 10 11 45638 CASAVA_Build 1 84225909 1D GATTTTTTTT A/- AAACTGCTAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 A 4 3 45639 CASAVA_Build 1 84230714 1D TACTCTAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 20 3 A 10 9 45640 CASAVA_Build 1 84259985 4D GGGGAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 8 AAAG 5 4 45641 CASAVA_Build 1 84284107 1D CAAATATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 T 15 14 45642 CASAVA_Build 1 84284393 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1114 het 1114 ref 23 14 6 3 T 13 12 45643 CASAVA_Build 1 84286570 2I AACTTTTTGA --/CT CTTCTATAGT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 CT 1 2 45644 CASAVA_Build 1 84303673 1I TTTATACACA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 T 7 8 45645 CASAVA_Build 1 84304036 1I TTGGTGGTGA -/T GGTTGTGATT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 0 1 45646 CASAVA_Build 1 84310427 2D AATTTAAAAA AC/-- AGTTTTTTTC 3070 hom 79 het 28 0 26 3 AC 1 0 45647 CASAVA_Build 1 84319888 2D CTTGTCAGTT AA/-- GTTTGTTTTA 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 A 2 0 45648 CASAVA_Build 1 84322845 1I GGGTGAGGGA -/T TTTTGAGGGT 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 T 4 5 45649 CASAVA_Build 1 84337641 4D ATAGTAGTAT GTTA/---- GTTTATATAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 GTTA 1 0 45650 CASAVA_Build 1 84344275 3I TAGAAATAAT ---/AAC AATAACTATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AAC 0 1 45651 CASAVA_Build 1 84346580 3I AACAATAGAC ---/ACT ACTAGGATAT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 ACT 1 2 45652 CASAVA_Build 1 84365883 4I ATTTTTACTG ----/TGTC TGTGAGATAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TGTC 0 1 45653 CASAVA_Build 1 84369616 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 16 0 14 2 A 13 14 45654 CASAVA_Build 1 84370555 1D GAATGGACTC T/- TTTTCTGAGG 3070 het 3070 ref 36 20 11 6 T 5 4 45655 CASAVA_Build 1 84372148 1D GTTCAGTGGA C/- CCTTTGCCTG 3070 het 3070 hom 45 19 26 1 C 3 2 45656 CASAVA_Build 1 84372619 1D GGCCTTCGCT G/- GGGACCCTGC 3070 het 3070 hom 28 15 12 2 G 4 3 45657 CASAVA_Build 1 84372901 2I AAATAGAATC --/AT ATAAAATGTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 AT 1 2 45658 CASAVA_Build 1 84380264 2D TCTATTACTC TT/-- GTCTCTATAT 3070 het 3070 hom 49 24 24 2 T 2 0 45659 CASAVA_Build 1 84384415 1I AATGCTGTTT -/G TGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 G 0 1 45660 CASAVA_Build 1 84386738 3D TGATTTTGAA CTC/--- CTTGAAGGCA 3070 het 3070 hom 36 8 28 0 CTC 1 0 45661 CASAVA_Build 1 84391716 4D GGGGTGTGCC TGTA/---- TTAATGCATT 3070 het 3070 ref 49 25 20 6 TGTA 1 0 45662 CASAVA_Build 1 84396345 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3051 hom 34 10 15 9 T 12 11 45663 CASAVA_Build 1 84414876 1D TTTTTATATG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 A 8 7 45664 CASAVA_Build 1 84421054 1I GCACCTGGGC -/T ATTTTGGTTT 2760 het 2760 ref 29 19 6 4 T 0 1 45665 CASAVA_Build 1 84424498 1D TTGTTTTTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 708 hom 32 2 25 5 T 10 9 45666 CASAVA_Build 1 84426480 8D ATTTAAGAAC TAACAATG/-------- TAACAATGTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 6 TAACAATG 2 1 45667 CASAVA_Build 1 84434184 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 23 1 20 2 A 15 14 45668 CASAVA_Build 1 84438411 1D AGCCACTATG C/- CCTTCCATTT 2104 het 2104 ref 24 15 6 3 C 3 2 45669 CASAVA_Build 1 84438904 1D CATTTAGGTC T/- TTAATCCATT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 3 2 45670 CASAVA_Build 1 84442493 4D TGTAGAAAGT TTTA/---- TTTATTATCA 3070 het 3070 hom 32 13 16 6 TTTA 2 1 45671 CASAVA_Build 1 84443028 1I TTTATTTATA -/C TTCATATAAG 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 C 0 1 45672 CASAVA_Build 1 84446135 1D TCTTCTTATT C/- ATTTTTATTT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 C 1 0 45673 CASAVA_Build 1 84453479 1I AAGTTACTAC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 6 7 45674 CASAVA_Build 1 84459541 1D ATCTCCTGTA T/- TTCTGTGGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 3 2 45675 CASAVA_Build 1 84466002 1D CCAAATCTTG A/- ATTATCAATG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 2 1 45676 CASAVA_Build 1 84466788 1D CAGATTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 36 2 26 8 T 12 11 45677 CASAVA_Build 1 84479497 1I CCAACATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1499 hom 20 4 11 5 T 11 12 45678 CASAVA_Build 1 84481937 2D AAGGTAGAAA AC/-- TTCTAACATC 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 AC 1 0 45679 CASAVA_Build 1 84485742 2I AGAAGCAATA --/GT GTGTGACTTA 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 GT 2 3 45680 CASAVA_Build 1 84487153 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2553 het 2426 hom 23 9 9 5 A 13 14 45681 CASAVA_Build 1 84499704 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 62 het 28 0 22 6 T 10 9 45682 CASAVA_Build 1 84500636 4I ATTTTATAAT ----/AATA AATAAATAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AATA 2 3 45683 CASAVA_Build 1 84502319 4D TTTCTTATGG CTAA/---- CTATTAATTA 3070 het 3070 ref 42 19 17 9 CTAA 1 0 45684 CASAVA_Build 1 84504577 1I AATGTGTGCT -/G GGGCCACATT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 G 3 4 45685 CASAVA_Build 1 84510698 1I CATACATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 9 10 45686 CASAVA_Build 1 84512011 1I CTTTGGCCCA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 7 8 45687 CASAVA_Build 1 84520028 1I TATCATAAGG -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 T 7 8 45688 CASAVA_Build 1 84523471 3I4M27I TATAAAACAT ---TGTT---------------------------/GAATGTTTTTATAAAACATTTATAAAAAAAGATA GACTGAAATG 3070 het 3070 ref 33 22 11 2 N/A 0 0 45689 CASAVA_Build 1 84550420 1D TGAAAAATTG T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 7 45690 CASAVA_Build 1 84554535 1D TTGCCTATGC T/- TTTTGGTGTC 3070 hom 63 het 26 0 20 7 T 5 4 45691 CASAVA_Build 1 84589350 3D TTTGAAATTC TAA/--- TAATAAAAGC 3070 hom 85 het 33 0 29 4 TAA 3 2 45692 CASAVA_Build 1 84598575 3I AAACTGCTTC ---/TCT TCTTCTTGCT 3070 het 3070 hom 48 17 29 2 TCT 2 3 45693 CASAVA_Build 1 84603050 4I ATTCAAAGAA ----/AAAC AATTTCTACT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AAAC 0 1 45694 CASAVA_Build 1 84609684 2I TGCAGATTCC --/CT GTGTTTTCCT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 CT 0 1 45695 CASAVA_Build 1 84618849 1D AGGGCTAAGG A/- AAGGAGGGAA 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 A 3 2 45696 CASAVA_Build 1 84623153 1D AAATTTACTT A/- AACCTTCATT 3070 het 3070 hom 42 19 22 2 A 3 2 45697 CASAVA_Build 1 84647088 4D CCAGCAATTT TATA/---- TATATATATA 3070 het 56 hom 19 1 10 9 TA 10 8 45698 CASAVA_Build 1 84649300 1I GAAAAAAAAC -/A GATAACTATG 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 A 0 1 45699 CASAVA_Build 1 84653779 1D GAATTCCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 11 10 45700 CASAVA_Build 1 84655083 1D ATGAAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2948 hom 19 8 10 3 A 12 11 45701 CASAVA_Build 1 84657045 1D ACATTGAGCA T/- TTTTTCATGT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 6 5 45702 CASAVA_Build 1 84658716 2D TCATTAAGAC AT/-- AGGTCATAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 AT 1 0 45703 CASAVA_Build 1 84659859 1D TACCGATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 A 12 11 45704 CASAVA_Build 1 84669297 1D TAAAACATAA T/- TTTTTTTTTT 1997 het 1912 hom 23 8 6 9 T 14 13 45705 CASAVA_Build 1 84672033 2D GGCAGGACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 117 hom 25 2 12 12 A 15 13 45706 CASAVA_Build 1 84687503 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 9 8 45707 CASAVA_Build 1 84696548 1D TCTTCCTGGA G/- AACTTACTCA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 G 1 0 45708 CASAVA_Build 1 84708157 1I GCCTTACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 13 13 A 12 13 45709 CASAVA_Build 1 84709387 4D TTATAATGGT TTTA/---- TTTGATTATA 3070 het 3070 ref 34 19 15 2 TTTA 1 0 45710 CASAVA_Build 1 84714146 3I TTTAATATAC ---/ATT ATCTTTACTC 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 ATT 0 1 45711 CASAVA_Build 1 84716472 2D TATTTTTTTA CT/-- TTTTGTAGAC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 CT 1 0 45712 CASAVA_Build 1 84730430 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2724 het 2724 ref 32 14 6 12 A 13 12 45713 CASAVA_Build 1 84736830 2D CTAAGATGGG GA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 37 3 14 22 GA 1 0 45714 CASAVA_Build 1 84739775 3D ACTAGTACTT GGG/--- GACTCCATTA 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 G 4 1 45715 CASAVA_Build 1 84743015 1I TTTCAAGGAC -/T TGGACGTGAG 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 T 1 2 45716 CASAVA_Build 1 84758802 1D CATCAATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 10 9 45717 CASAVA_Build 1 84777246 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 T 7 6 45718 CASAVA_Build 1 84785253 1I TTGGGTTGTG -/T TTGAGGATTA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 2 3 45719 CASAVA_Build 1 84786706 2D GTTATAGTTT TA/-- TATATGTTAT 2629 het 2629 ref 17 9 7 1 TA 3 2 45720 CASAVA_Build 1 84788144 1I TAGTTGGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 10 11 45721 CASAVA_Build 1 84815134 1I AAACACATAT -/A CTACCTGTGT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 A 0 1 45722 CASAVA_Build 1 84815778 11D TTATGGTTCC TCCATGTCCCT/----------- TCATGGCTTG 3070 het 3070 ref 41 28 15 3 TCCATGTCCCT 1 0 45723 CASAVA_Build 1 84827863 7D GCCAGACTGT TAAAAGA/------- TAAACAGAAA 3070 het 3070 ref 39 20 20 1 TAAAAGA 1 0 45724 CASAVA_Build 1 84832995 2D CCCAACAAAC AT/-- ATGAAAAGAA 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 AT 2 1 45725 CASAVA_Build 1 84848094 1I TCTTTTTCTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 A 8 9 45726 CASAVA_Build 1 84853978 1D ATAGCAAAAG A/- AAAAAAAAAG 2326 het 2326 ref 15 9 5 1 A 10 9 45727 CASAVA_Build 1 84858189 2I CCCCCGGAAA --/AC ACAACCCAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AC 1 2 45728 CASAVA_Build 1 84866864 2D CCACTAAACA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 12 het 29 1 15 14 TG 9 8 45729 CASAVA_Build 1 84873875 18I GTTCTGTTCC ------------------/CTCTATCTGTACTGTTCA CTCTTCAATA 3070 het 3070 hom 51 19 23 9 CTCTATCTGTACTGTTCA 0 1 45730 CASAVA_Build 1 84879467 1D TTGCTCTTGT C/- CCCCAGGCTG 1413 het 1413 ref 21 17 3 1 C 5 4 45731 CASAVA_Build 1 84881145 4D AATTTCACTT AGAA/---- AGCCCTACAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 10 AGAA 1 0 45732 CASAVA_Build 1 84888982 1D TAAAAGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 30 1 20 9 T 12 11 45733 CASAVA_Build 1 84892145 4I CAAATATTAT ----/CAGA CAGATTAATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CAGA 1 2 45734 CASAVA_Build 1 84893580 1D GTTTTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 T 12 11 45735 CASAVA_Build 1 84897267 1I GTATTCTGCC -/A AAACATGAAA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 3 4 45736 CASAVA_Build 1 84897573 1I TGAAGAACTC -/T TATCAGTAGT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 1 2 45737 CASAVA_Build 1 84905329 1I TTTGGCAACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 18 22 6 T 9 10 45738 CASAVA_Build 1 84905593 1D CCTAGTCTCC A/- AATTCAATTT 3070 het 3070 ref 49 28 17 5 A 3 2 45739 CASAVA_Build 1 84907443 1D AAATACTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 11 10 45740 CASAVA_Build 1 84914952 3I TTGTGAAGCC ---/AGG AGGAAACAAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 AGG 1 2 45741 CASAVA_Build 1 84917436 1D TTAGTCATCA G/- TATTGACTCT 3070 hom 138 het 54 0 47 7 G 1 0 45742 CASAVA_Build 1 84919308 1I CTTGTTGGGC -/A AAAAACTGGT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 5 6 45743 CASAVA_Build 1 84919886 1D ATAGGAGCAT G/- TATTATTCTG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 G 1 0 45744 CASAVA_Build 1 84921254 15D TCCAAATACT TTCCCCCATTACAGA/--------------- TAAGGAAACT 3070 het 3070 ref 29 17 14 2 TTCCCCCATTACAGA 1 0 45745 CASAVA_Build 1 84930031 1D CAACCCCGGG A/- AAGGAATAAG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 3 2 45746 CASAVA_Build 1 84930162 2D ATATTAAAAC AG/-- AAATTTAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 AG 1 0 45747 CASAVA_Build 1 84930830 1I AGGCACTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 8 18 12 T 9 10 45748 CASAVA_Build 1 84938220 1I AGTTTGCTCT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 A 8 9 45749 CASAVA_Build 1 84949802 1I CCTTAGGAAA -/G CTCCTTTCTC 3070 hom 96 het 39 0 32 8 G 0 1 45750 CASAVA_Build 1 84962626 1D TGCTTTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 11 10 45751 CASAVA_Build 1 84969775 3I GGACAGTTAG ---/TTC TTCTTGTTGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTC 1 2 45752 CASAVA_Build 1 84977413 1I GACTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 10 11 45753 CASAVA_Build 1 84978822 4D ACATTCCGAC AGAA/---- AGCCTCTCCT 3070 hom 92 het 34 0 30 7 AGAA 1 0 45754 CASAVA_Build 1 84984766 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 12 11 45755 CASAVA_Build 1 84990929 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1554 het 1554 ref 30 13 7 10 T 11 12 45756 CASAVA_Build 1 84992651 1I CCTCGGTGTG -/A AAAAGGTGAC 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 4 5 45757 CASAVA_Build 1 84993331 2I AGTGAAAGTC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 52 23 19 10 GT 6 7 45758 CASAVA_Build 1 84993848 1I GTGTCTTCCA -/C CCCGCAAACT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 C 3 4 45759 CASAVA_Build 1 84994138 1D AGGTGCACCT C/- CCACTTCCTC 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 C 3 2 45760 CASAVA_Build 1 84999524 3D CAACAACAAT AAC/--- AACAACAATA 3070 hom 136 het 48 0 45 4 AAC 3 2 45761 CASAVA_Build 1 85017976 1I TTTTTTGCGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 61 het 31 0 23 8 T 9 10 45762 CASAVA_Build 1 85025268 1D CCTCAACAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 9 8 45763 CASAVA_Build 1 85027573 1I CTGGAGTGAT -/A ACTCACAAGA 3070 het 3070 hom 58 23 31 4 A 1 2 45764 CASAVA_Build 1 85043548 3I TGTTTTTCAA ---/TAT TATTATTCAC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 TAT 2 3 45765 CASAVA_Build 1 85051541 4I TTTTTACTTT ----/TAAG TAAGTATTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TAAG 1 2 45766 CASAVA_Build 1 85055355 1D ATGCTGAGAA T/- TTTTTTTTTA 1361 het 1361 ref 42 34 3 5 T 10 9 45767 CASAVA_Build 1 85064889 1D GTTTTTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 11 10 45768 CASAVA_Build 1 85070990 2I GTGCACGTTT --/CA CACCCAAAGA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 CA 1 2 45769 CASAVA_Build 1 85072840 1I AGCAAATGTA -/T TTTCATGGGG 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 3 4 45770 CASAVA_Build 1 85090323 2D TGGTGACTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1608 het 736 hom 25 6 6 13 T 18 16 45771 CASAVA_Build 1 85098351 1D TTCACATAAA G/- GGCCCCATCA 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 G 3 2 45772 CASAVA_Build 1 85104397 3I TTCATTGTGG ---/AGA AGAAGTGAAC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 AGA 1 2 45773 CASAVA_Build 1 85116292 1I GGTATTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 11 12 45774 CASAVA_Build 1 85138423 1I ATTGGCTTTG -/C CTAAGGCAGC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 1 2 45775 CASAVA_Build 1 85161797 3I TCCTCATAAT ---/CCC CCCATTTTAT 3070 het 3070 ref 54 25 25 4 C 3 6 45776 CASAVA_Build 1 85163131 1D GACTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 2942 het 1287 hom 21 6 8 7 A 15 14 45777 CASAVA_Build 1 85165476 1D AAGTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2274 hom 25 8 11 7 A 13 12 45778 CASAVA_Build 1 85172589 13D ATGGGTATTT CCATAAAGAGTCC/------------- CCATAGGTTC 3070 hom 120 het 43 0 41 6 CCATAAAGAGTCC 1 0 45779 CASAVA_Build 1 85172846 2D AAATGTAATG CA/-- GAGTCTGCTG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 CA 1 0 45780 CASAVA_Build 1 85191978 3I AAGTAAAAAC ---/TCA AGATTATGAG 2815 het 2815 ref 25 15 7 3 TCA 0 1 45781 CASAVA_Build 1 85194426 2I CTTCATAGGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 A 9 11 45782 CASAVA_Build 1 85199160 3I CGTGGAAAAG ---/AAC AACACTGCAT 3070 het 3070 hom 58 23 30 5 AAC 1 2 45783 CASAVA_Build 1 85203147 1I GGGAGCAGCT -/A AAAAAAACAG 2236 het 2236 ref 24 12 6 6 A 7 8 45784 CASAVA_Build 1 85207984 1I ATGAGCACTT -/A AGTCCGCGGA 3070 het 3070 hom 57 22 31 4 A 1 2 45785 CASAVA_Build 1 85214565 1I GCAGCAAGAT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 8 45786 CASAVA_Build 1 85215402 1I TTATTAGTTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 T 8 9 45787 CASAVA_Build 1 85215635 3I GAAAATAAAT ---/AAC AAAGTGGCAA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 AAC 0 1 45788 CASAVA_Build 1 85215730 1D TAAATGGATG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 9 8 45789 CASAVA_Build 1 85216548 1D TGCCTACTTC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 9 8 45790 CASAVA_Build 1 85216686 4D GAAATAAAGA AAAT/---- AATACAAAAG 3070 hom 60 het 23 0 21 4 AAAT 1 0 45791 CASAVA_Build 1 85218577 1I ATAGAAATAG -/A AAAAAAACCC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 7 8 45792 CASAVA_Build 1 85220223 1D ATGTACCCAC A/- AAAATTAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 5 4 45793 CASAVA_Build 1 85221536 5D GTATTTTTGT TTTTC/----- TTTTCTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 32 7 TTTTC 2 1 45794 CASAVA_Build 1 85222668 1I ACATCAATGC -/T TTTTGCACAA 3070 hom 141 het 53 0 47 6 T 4 5 45795 CASAVA_Build 1 85225472 14D TCTATCTATC TATCTATCTATATA/-------------- TATGGCATAT 3070 het 744 hom 20 3 8 13 TATCTATCTATATA 1 0 45796 CASAVA_Build 1 85225539 2D CATATAGATG TA/-- TATATATATC 2321 het 143 hom 17 2 7 8 TA 5 4 45797 CASAVA_Build 1 85226482 1D ATTTTTTTTT A/- ATTTTAATTT 3005 het 3005 ref 30 20 8 3 A 2 1 45798 CASAVA_Build 1 85228718 1I AATAATAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2621 hom 16 6 8 2 A 8 9 45799 CASAVA_Build 1 85229098 1D CCAATTACTT G/- GGGGGGCTGA 3070 het 2247 hom 16 5 11 0 G 7 6 45800 CASAVA_Build 1 85231024 1I CATTATGTCT -/A AAAAAAACCA 3070 hom 69 het 33 0 25 8 A 7 8 45801 CASAVA_Build 1 85231151 1I GCTGACTGAT -/C CAGGGTGGTG 3070 hom 67 het 26 0 21 5 C 1 2 45802 CASAVA_Build 1 85232626 4D CTGGCTTGTC CTCT/---- CTACTAGGAA 3070 hom 127 het 50 0 42 9 CT 3 1 45803 CASAVA_Build 1 85233534 1D GAGCACATGC T/- GTTGGAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 6 T 1 0 45804 CASAVA_Build 1 85233858 1D TACTTTGAAA G/- CTATAGTCAC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 G 1 0 45805 CASAVA_Build 1 85234665 26D TATATATTTC ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 3070 hom 57 het 22 0 20 5 AT 19 6 45806 CASAVA_Build 1 85238314 1D GTTCCAGCTT G/- CTTGGGAGGC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 G 1 0 45807 CASAVA_Build 1 85248946 1D CAAAGCAAAC A/- AAACCATAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 4 3 45808 CASAVA_Build 1 85252505 4I CTAGTATGAT ----/GTTG GTTGAAAAGG 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 GTTG 1 2 45809 CASAVA_Build 1 85256153 1I TCCCAAAGTG -/C AGGTATTACA 2706 het 2706 ref 30 22 6 2 C 0 1 45810 CASAVA_Build 1 85256230 15D CCCCATAAAA CCACAGCCTCTCACC/--------------- CCAAAACACT 3070 het 3070 ref 35 24 12 3 CCACAGCCTCTCACC 1 0 45811 CASAVA_Build 1 85259998 1D AGTTTCCCCC T/- ATGCTACTTT 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 1 0 45812 CASAVA_Build 1 85270180 1I CGTCTCTGCT -/A AAAAAAAAAT 2472 het 2472 ref 15 7 7 1 A 9 10 45813 CASAVA_Build 1 85284578 2D ATATCTATTT GG/-- GGGGGGGGGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 11 9 45814 CASAVA_Build 1 85296871 1I CTAACTTTTT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 129 het 52 0 44 8 A 7 8 45815 CASAVA_Build 1 85307628 7I CTTAGTAGTT -------/CTCACCA CTTAAAATAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CTCACCA 0 1 45816 CASAVA_Build 1 85308765 1D TGGGGCCTCG T/- TTTTCTCATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 5 4 45817 CASAVA_Build 1 85309143 1D TTTATCATTT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 8 7 45818 CASAVA_Build 1 85316147 1D CCAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 12 11 45819 CASAVA_Build 1 85322745 2D TTGTTGCAAA AT/-- ATATATATAT 1907 het 1907 ref 20 11 4 7 AT 8 7 45820 CASAVA_Build 1 85326396 1D TATATTAGTA C/- CAAATGAACT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 C 2 1 45821 CASAVA_Build 1 85331707 1D TCTTAATTGC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 43 20 22 1 T 7 6 45822 CASAVA_Build 1 85339406 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAG 1508 het 735 hom 8 3 4 1 A 9 10 45823 CASAVA_Build 1 85343110 3D TTATCCATAG TTC/--- TTCTTCACAT 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 TTC 3 2 45824 CASAVA_Build 1 85346294 1I TATATATAAA -/C TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 0 1 45825 CASAVA_Build 1 85350328 1D GTATATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 11 10 45826 CASAVA_Build 1 85362528 1D TTATGGTAAG T/- TGCCTGCAAA 3070 hom 166 het 59 0 55 4 T 2 1 45827 CASAVA_Build 1 85367724 29D TCCTGCTTCT ATTCTATGCCTACACTCGAAGCCCTCCAG/----------------------------- GGACCAGGAA 3070 hom 63 het 22 0 21 5 ATTCTATGCCTACACTCGAAGCCCTCCAG 1 0 45828 CASAVA_Build 1 85371116 1D TGTTTTTCTT C/- CCCCCCCAGA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 C 8 7 45829 CASAVA_Build 1 85382629 1D CAACAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 11 10 45830 CASAVA_Build 1 85383345 2D GCTGGCAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 12 10 45831 CASAVA_Build 1 85385893 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTATGTAT 3070 het 222 hom 31 1 27 3 T 4 5 45832 CASAVA_Build 1 85387694 3D AAACAAAATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 22 7 A 13 10 45833 CASAVA_Build 1 85389132 4I GCAATGTTGG ----/TTCT TTCTAACAGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTCT 1 2 45834 CASAVA_Build 1 85404137 9D AAAACTTTAA TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1348 het 794 hom 19 10 4 7 T 25 16 45835 CASAVA_Build 1 85405485 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 790 het 790 ref 24 13 2 9 A 17 16 45836 CASAVA_Build 1 85421854 1I CCTCCACCCC -/T ATGTGTCCTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 0 1 45837 CASAVA_Build 1 85422903 1I TTATCCCATT -/A ACTTTGGGAG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 1 2 45838 CASAVA_Build 1 85431901 1D TTAAAAGGAA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 9 8 45839 CASAVA_Build 1 85437080 1I CTAAGCCAAA -/G GGGGGGGAGG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 7 8 45840 CASAVA_Build 1 85455054 2D57M4D GAACTTTGTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGAGAAAAGAAAGGAAAAGAAAGAGAGAAAGAAAGAAAGAC/--CAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGAGAAAAGAAAGGAAAAGAAAGAGAGAAAGAAAGAA---- AGAGAAAGAA 3070 het 16 hom 20 1 18 12 N/A 0 0 45841 CASAVA_Build 1 85456405 1D TCTATTCTTT G/- GGGTTTTTGA 3070 hom 71 het 27 0 25 2 G 4 3 45842 CASAVA_Build 1 85456474 1D CTTTGTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 25 1 20 4 T 11 10 45843 CASAVA_Build 1 85462495 1I GTTATGAATA -/T GATTTAAATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 1 45844 CASAVA_Build 1 85494067 16I TAATTGATTT ----------------/TACAGTGGGTTTATGA TATAGGAATC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TACAGTGGGTTTATGA 0 1 45845 CASAVA_Build 1 85499463 1I TAATACAGGC -/G GGGGGGAAAA 3070 hom 34 het 39 1 26 12 G 6 7 45846 CASAVA_Build 1 85521657 1I CCTCACAAAT -/G GATGTATCTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 1 2 45847 CASAVA_Build 1 85523208 2D CTGTAACACC CT/-- CTCTGGGGCT 3070 het 5 hom 29 1 20 8 CT 3 2 45848 CASAVA_Build 1 85526898 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGGTCTCA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 5 6 45849 CASAVA_Build 1 85535824 4I AAGGAGAAAG ----/ACAA ACAAGTCATT 3070 het 3070 hom 20 9 8 3 ACAA 1 2 45850 CASAVA_Build 1 85545927 3D CCTCTCCTCT CTC/--- CTCCTCTGTC 3070 het 1392 hom 25 5 9 12 CTC 3 2 45851 CASAVA_Build 1 85546219 1D AGCTTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 500 hom 29 2 18 9 T 12 11 45852 CASAVA_Build 1 85553452 1D TAGGGTCCTA G/- TTTAATTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 15 3 G 1 0 45853 CASAVA_Build 1 85558139 1I GAGGTTTCTC -/A CTTCCATCTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 45854 CASAVA_Build 1 85563391 5D TGTTTGTCTC TCTTT/----- TCTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 38 19 13 9 TCTTT 2 1 45855 CASAVA_Build 1 85565693 1D TAACATGTAA T/- CTAGTAGTGT 3070 het 3070 ref 46 25 20 3 T 1 0 45856 CASAVA_Build 1 85571302 1I AAATCAGCCC -/G TCTGGACTTG 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 G 0 1 45857 CASAVA_Build 1 85572023 1D TAAAAAGAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 9 8 45858 CASAVA_Build 1 85573042 2D TCTTTATAGC AA/-- AGTGAGAATG 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 A 3 1 45859 CASAVA_Build 1 85580114 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 9 10 45860 CASAVA_Build 1 85583606 1D TCTTACATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 35 1 25 11 T 15 14 45861 CASAVA_Build 1 85585010 3I ATTTCTATGT ---/TAG TAGTTAGCAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TAG 1 2 45862 CASAVA_Build 1 85586044 1I ATAAAAAAAG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 38 16 18 4 A 6 7 45863 CASAVA_Build 1 85588444 1D AATCATGGCC T/- TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 43 14 22 8 T 8 7 45864 CASAVA_Build 1 85591152 1D TTATACTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1107 hom 39 5 15 19 T 11 10 45865 CASAVA_Build 1 85592798 1D GAAAATCTCT C/- CTCAAGTATT 3070 het 3070 ref 34 22 12 0 C 2 1 45866 CASAVA_Build 1 85602824 1D GATTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1711 hom 29 7 13 9 T 12 11 45867 CASAVA_Build 1 85603968 5D CCACACTAGG AAGTA/----- TAGTAGGTAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 9 AAGTA 1 0 45868 CASAVA_Build 1 85608881 1I CAGGTGAAAG -/A AAATGGTGGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 3 4 45869 CASAVA_Build 1 85611253 2D AAAAAACCAC TA/-- TTAGTTTAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 TA 1 0 45870 CASAVA_Build 1 85612237 1D AGAGATACTT G/- GGACCCCAAA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 G 3 2 45871 CASAVA_Build 1 85612975 1D TTTATGAGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 10 9 45872 CASAVA_Build 1 85613354 2I CACAATTCAC --/AG AGTGTTTCTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AG 1 2 45873 CASAVA_Build 1 85614988 2I TCTATTTTTT --/TA GAGTTCCCAA 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 TA 0 1 45874 CASAVA_Build 1 85619624 4I CATTGTTTCT ----/TTTC TTTATTTCAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TTTC 0 1 45875 CASAVA_Build 1 85619991 1D GCAGATACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 11 10 45876 CASAVA_Build 1 85633944 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 36 1 31 6 A 13 12 45877 CASAVA_Build 1 85635308 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 11 10 A 15 14 45878 CASAVA_Build 1 85641516 2I GTGTATATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AC 5 6 45879 CASAVA_Build 1 85643905 1I AAAGTGCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 614 hom 41 3 31 7 A 10 11 45880 CASAVA_Build 1 85646565 2D TCCTTCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2889 hom 42 16 14 13 T 13 11 45881 CASAVA_Build 1 85669764 3D TAAGCTAGAA TCC/--- TCCTCCTTTG 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 TCC 3 2 45882 CASAVA_Build 1 85674502 1D GTGATAATTT A/- AAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 6 5 45883 CASAVA_Build 1 85677439 1D CATTCTGCCA T/- TAATTAGCAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 1 45884 CASAVA_Build 1 85679811 4I ACCCCATCTC ----/AAAA AAAAAAGAAA 3070 hom 71 het 29 0 24 5 A 6 10 45885 CASAVA_Build 1 85696285 1D TAAAGGCAAA G/- GTTTACTTAC 3070 het 1832 hom 26 5 20 1 G 2 1 45886 CASAVA_Build 1 85699494 1I TATTAAACAT -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 6 7 45887 CASAVA_Build 1 85700872 1I ATTTCATTCA -/T TCATTCATTC 3070 hom 49 het 29 0 17 12 T 1 2 45888 CASAVA_Build 1 85721400 1D CAGGAAAACC G/- CTTGAACCTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 1 0 45889 CASAVA_Build 1 85739092 1I AATGTCACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 98 het 43 0 33 10 T 9 10 45890 CASAVA_Build 1 85753288 2D GAGCTAGAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 972 hom 78 11 27 43 AC 8 7 45891 CASAVA_Build 1 85756016 1D TAAGGCTCCC A/- AAGGCAGCCC 3070 het 3070 hom 71 29 30 12 A 3 2 45892 CASAVA_Build 1 85756272 9D AAAGTATCTA ATTGTGCAC/--------- ATGAGAAGCT 2664 het 2664 ref 49 39 10 6 ATTGTGCAC 1 0 45893 CASAVA_Build 1 85756557 2I CAACACAGAC --/TT ATTATTTTAC 3070 het 3070 ref 91 46 35 10 T 0 2 45894 CASAVA_Build 1 85757016 3I CATGTAAGAT ---/AAC AAACTCACAG 3070 het 3070 ref 98 46 42 11 AAC 0 1 45895 CASAVA_Build 1 85758054 7D TTTAAAACAC AAACATT/------- AATTAATATA 3070 het 3070 ref 52 30 16 8 AAACATT 1 0 45896 CASAVA_Build 1 85760870 2I AGTCCACAGA --/GG GGAAAAATAA 3070 het 3070 ref 77 44 24 9 G 2 4 45897 CASAVA_Build 1 85761057 2I CTGTGTCCTT --/TA CCTGCCAAAT 3070 het 3070 ref 90 52 34 4 TA 0 1 45898 CASAVA_Build 1 85762384 6I GAAAAAAAAA ------/AAAAAC CGATGCATCA 3070 het 3070 ref 60 28 12 20 AAAAAC 0 1 45899 CASAVA_Build 1 85762586 1I ATGGAGAGAT -/G GCTCTCAGCT 3070 het 3070 hom 65 13 47 5 G 1 2 45900 CASAVA_Build 1 85763503 2I AGAGTGTGGA --/TG TGCAGCTTAA 3070 het 3070 hom 91 39 45 7 TG 1 2 45901 CASAVA_Build 1 85763839 6D GAATGATATT CACACA/------ CACACACACA 3070 het 3070 hom 96 27 51 23 CA 10 7 45902 CASAVA_Build 1 85764395 2I GGTGACAAAG --/GA GACATGGAAA 3070 het 3070 hom 90 40 47 3 GA 1 2 45903 CASAVA_Build 1 85764544 6D25M1I TAGCTTTCCT TCTCTCTCTAATACTATATGTTTGCAGTGAC-/------TCTAATACTATACGTTTGCAGTGACA AATGATCCCT 3070 het 3070 ref 84 60 34 12 N/A 0 0 45904 CASAVA_Build 1 85765435 2D CTGCTGGAAA CT/-- CTGCCTCACT 3070 het 3070 ref 95 48 42 7 CT 2 1 45905 CASAVA_Build 1 85768347 1D CCAGGGTCTG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 89 65 17 7 A 7 6 45906 CASAVA_Build 1 85771900 1I AGACAAGCTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 76 29 39 8 A 8 9 45907 CASAVA_Build 1 85772713 1I TGAAAAAAAA -/T GTATATATAT 2690 het 2690 ref 68 31 10 27 T 0 1 45908 CASAVA_Build 1 85773243 3D ACCAAAGAAA AAG/--- AAGAAAAGGA 3070 het 3070 ref 72 39 22 13 AAG 2 1 45909 CASAVA_Build 1 85773288 1D TTAGCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 71 34 18 20 T 11 10 45910 CASAVA_Build 1 85775839 4I AATTACAATT ----/AGAC AGGAAGAATA 3070 hom 207 het 91 0 69 22 AGAC 0 1 45911 CASAVA_Build 1 85776679 2D GAATCAGGCT AA/-- GTCTGTACTC 3070 het 3070 ref 74 38 32 4 A 2 0 45912 CASAVA_Build 1 85776900 1D CAAGAGAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 60 18 17 27 A 10 9 45913 CASAVA_Build 1 85778405 1I CTAAAATGAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 A 7 8 45914 CASAVA_Build 1 85784395 1D TGATTTGAAT G/- TGTCTCCAAA 3070 het 3070 hom 45 13 20 12 G 1 0 45915 CASAVA_Build 1 85798078 1D AAAAAGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 936 hom 24 3 12 9 A 12 11 45916 CASAVA_Build 1 85804353 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2449 het 1090 hom 15 5 7 3 A 11 12 45917 CASAVA_Build 1 85809148 1I TGGTGGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 20 19 13 A 11 12 45918 CASAVA_Build 1 85846119 1D GACAATAACC A/- CACCTTCTTC 3070 het 3070 ref 29 16 13 1 A 1 0 45919 CASAVA_Build 1 85856633 1D CTGGGCAAGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 110 het 43 0 33 11 A 9 8 45920 CASAVA_Build 1 85858708 1D CCAGATCTCC T/- ATCGAAATTA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 1 0 45921 CASAVA_Build 1 85860291 1I TAATAGCAAC -/A TTGGGAATAG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 0 1 45922 CASAVA_Build 1 85872383 1D AAGGCACTAA T/- TATACATTAG 3070 hom 140 het 49 0 46 4 T 2 1 45923 CASAVA_Build 1 85876938 1D TCAAAATAAT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 116 het 45 0 38 7 A 8 7 45924 CASAVA_Build 1 85887268 1I TTCCAATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 28 0 19 9 T 12 13 45925 CASAVA_Build 1 85900780 2I ATTCCAAAAA --/AC AGTTTTAATT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AC 0 1 45926 CASAVA_Build 1 85904765 1D TTACAATCTG C/- CAAGAATTTG 3070 het 3070 hom 52 21 28 3 C 2 1 45927 CASAVA_Build 1 85905900 1D ATCATCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 21 7 A 15 14 45928 CASAVA_Build 1 85908414 1I GTAAACCAAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 8 9 45929 CASAVA_Build 1 85912007 29D ATGTTCTCTG AATGTACTTTCCTTTAAGGATGTAACTGT/----------------------------- AATGTACTTT 3070 het 3070 ref 37 25 10 12 AATGTACTTTCCTTTAAGGATGTAACTGT 1 0 45930 CASAVA_Build 1 85916291 2D TAGGAAGTGT TA/-- TCATTCTTAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 TA 1 0 45931 CASAVA_Build 1 85923779 5D ATTATAAAAG GACTT/----- GACTTAATTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 GACTT 2 1 45932 CASAVA_Build 1 85935308 4D ATTTTTCGTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1352 hom 8 het 4 0 3 1 T 15 11 45933 CASAVA_Build 1 85935639 1I TTCTCTTCAA -/G ATTATGAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 0 1 45934 CASAVA_Build 1 85948684 1D TTAAGGTCGG C/- CCTAATCCAA 3070 het 3070 hom 35 10 19 7 C 3 2 45935 CASAVA_Build 1 85950620 1D CCCAGCTAAA T/- TTTTTTTGGT 2364 het 1991 hom 22 6 8 8 T 8 7 45936 CASAVA_Build 1 85951253 4D TTTAACTCGT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 TTTA 3 2 45937 CASAVA_Build 1 85956336 1I TGAAGTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 31 0 24 7 A 10 11 45938 CASAVA_Build 1 85959630 1D TATAAGTAGA T/- CTTTAGGACA 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 T 1 0 45939 CASAVA_Build 1 85962083 4I AAACTAAATG ----/AATA GTCAGTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AATA 0 1 45940 CASAVA_Build 1 85962326 1D AAAAATACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 12 11 45941 CASAVA_Build 1 85976120 1D CAGGCGTGAG C/- CACTGTGCCC 3070 het 923 hom 16 3 11 2 C 2 1 45942 CASAVA_Build 1 85982830 1I TCTGCCAGGG -/T TTTTATCAAA 3070 hom 110 het 39 0 37 2 T 4 5 45943 CASAVA_Build 1 85993808 3I AGACATAAAG ---/ACC AATGAAATAT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 ACC 0 1 45944 CASAVA_Build 1 85995843 1D TAAAAAGGCA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 T 8 7 45945 CASAVA_Build 1 85996558 3D GCAGCAGCCA CTT/--- CTTAATTCAC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 CTT 2 1 45946 CASAVA_Build 1 85997265 1I CCCTCCCCAA -/T TATTTTTCTA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 1 2 45947 CASAVA_Build 1 86003621 3D GATTGTTCTC TGT/--- TTTTTTTTAT 3070 het 146 hom 28 2 14 13 TGT 1 0 45948 CASAVA_Build 1 86006857 1I GTTCTTTTGT -/G GCGGGGGGAG 3070 hom 44 het 21 0 18 3 G 1 2 45949 CASAVA_Build 1 86007272 2D5M3D ACAGAATTCA ATAAATTCAA/--AAAGT--- ACAATTCAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 N/A 0 0 45950 CASAVA_Build 1 86008580 1I CTAAGATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 11 12 45951 CASAVA_Build 1 86014775 3I AAAAAATGAG ---/ATA ATACTATTCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ATA 1 2 45952 CASAVA_Build 1 86020787 3I ATACTATGCA ---/GCC ATAAAAGATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 GCC 0 1 45953 CASAVA_Build 1 86026299 1D GCATGAATGT C/- TTCTTTTGAG 2888 het 2888 ref 16 9 6 1 C 1 0 45954 CASAVA_Build 1 86028750 1D ATCTATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 11 11 T 11 10 45955 CASAVA_Build 1 86028929 6D CACTTTATTT TACGTA/------ TTACCAGTGC 3070 hom 72 het 25 0 25 1 TACGTA 1 0 45956 CASAVA_Build 1 86041859 1D AGGTTTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 11 10 45957 CASAVA_Build 1 86044950 1D TTTGTTCACC A/- AATGTGGTTT 3070 het 3070 ref 53 30 19 5 A 3 2 45958 CASAVA_Build 1 86048347 1D CTGGCTATGA C/- CCCTGCTGAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 C 4 3 45959 CASAVA_Build 1 86050376 1I CTACGCTCTC -/T GTTCTCTGTT 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 T 0 1 45960 CASAVA_Build 1 86076453 1D AGAGACAAGA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 T 8 7 45961 CASAVA_Build 1 86080909 1D TAATCATATT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 8 7 45962 CASAVA_Build 1 86090950 1D AAATTTTCCA C/- ACCATTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 5 C 1 0 45963 CASAVA_Build 1 86092983 1I TAGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2305 het 2305 ref 25 12 8 5 T 12 13 45964 CASAVA_Build 1 86100696 2D AAGAAAATCT AC/-- GTTAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 AC 1 0 45965 CASAVA_Build 1 86105966 6I GAAGACTATA ------/ATAAAT ATAAATTAAG 3070 het 3070 ref 51 30 18 3 ATAAAT 1 2 45966 CASAVA_Build 1 86120862 1D CATTCTACTG T/- TGTTGGATAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 2 1 45967 CASAVA_Build 1 86123469 4D CAGAAAACAC ATTT/---- ATTTATTTAC 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 ATTT 3 2 45968 CASAVA_Build 1 86126308 1I CTTTTCCGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 9 10 45969 CASAVA_Build 1 86131570 1D ATTTTTTAAC A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 7 6 45970 CASAVA_Build 1 86132818 1D CTGGGTCTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 10 9 45971 CASAVA_Build 1 86141340 1I ATGCTTCCTT -/A AAAAAAACCC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 8 45972 CASAVA_Build 1 86145428 1I AAGTAATTTT -/G GGGGGGGTTA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 G 7 8 45973 CASAVA_Build 1 86156401 1I GTGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 11 12 45974 CASAVA_Build 1 86159201 1D CAAGAGGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 A 11 10 45975 CASAVA_Build 1 86174431 1D GGTCTTGGTT A/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 21 18 5 A 1 0 45976 CASAVA_Build 1 86179894 1D AGACATGTAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 297 hom 42 1 32 9 T 8 7 45977 CASAVA_Build 1 86180631 2D CTTGTATTGT GA/-- TTTCCTCTTG 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 GA 1 0 45978 CASAVA_Build 1 86182866 1D GAAGAGACTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 T 10 9 45979 CASAVA_Build 1 86186214 20D AGGCCATTGT ATTTCTTTGAAATACATTCA/-------------------- ATTTCTTTGA 3070 hom 72 het 24 0 25 3 ATTTCTTTGAAATACATTCA 1 0 45980 CASAVA_Build 1 86208785 2D GAAGATGAAC AT/-- AGAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 AT 1 0 45981 CASAVA_Build 1 86210587 1I CAACAGAGTG -/A ACAAACTACA 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 A 1 2 45982 CASAVA_Build 1 86231715 1I GAAGCCAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 104 hom 36 1 31 4 A 10 11 45983 CASAVA_Build 1 86233429 1D ATTTACAGTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 45984 CASAVA_Build 1 86234765 42I TGACCAACAT ------------------------------------------/GGCGAAACCCCGTCTCTGCTAAAAATACAAAAAAATTAGCCG GGCATGGTGG 2867 hom 18 het 7 0 7 0 GGCGAAACCCCGTCTCTGCTAAAAATACAAAAAAATTAGCCG 0 1 45985 CASAVA_Build 1 86236035 3D CTGGCTACAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 6 A 15 12 45986 CASAVA_Build 1 86242067 2I AAATAGAGGA --/AG AGAGAGATCT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 AG 3 4 45987 CASAVA_Build 1 86252894 5I CTCCTTTTCC -----/TCTTT TATTTTCTAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 TCTTT 0 1 45988 CASAVA_Build 1 86319584 1D TAATGTGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 44 1 33 10 T 12 11 45989 CASAVA_Build 1 86327135 4I ATATTCTATC ----/ACTG ACTGACTTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ACTG 1 2 45990 CASAVA_Build 1 86332763 1D GGTGGGAGGT G/- GGAGAGGATC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 3 2 45991 CASAVA_Build 1 86335649 5D TCTCCTTCTT TCTTC/----- TCTTTTCTTT 3070 hom 102 het 36 0 33 5 TCTTC 1 0 45992 CASAVA_Build 1 86336689 1I TAGATTTTTC -/A ATCCTTGGCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 45993 CASAVA_Build 1 86343924 1I GCATTCCTGG -/C CCATGCTCCA 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 C 2 3 45994 CASAVA_Build 1 86347597 1I AGGTGAGAAA -/T TTTTGGAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 4 5 45995 CASAVA_Build 1 86348619 2D TACGTTTTCC TA/-- TGTTCTTACT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 TA 1 0 45996 CASAVA_Build 1 86354212 5D TAAATGATTT ATAAA/----- ATAAAGTATG 3070 het 3070 ref 36 20 12 6 ATAAA 2 1 45997 CASAVA_Build 1 86354431 4D CATTCATCTG TTCA/---- TTCATTCAAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 5 TTCA 3 2 45998 CASAVA_Build 1 86362496 1I GCCTTGGTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 7 8 45999 CASAVA_Build 1 86362647 2D AAGTTTTACA CT/-- CTATTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 6 CT 2 1 46000 CASAVA_Build 1 86372081 1I TCTAAAATTC -/T TTTTTTTGTT 2449 het 2449 ref 10 5 5 0 T 7 8 46001 CASAVA_Build 1 86375264 1I AACTGCAGAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 410 hom 43 1 33 9 A 8 9 46002 CASAVA_Build 1 86377451 1I GAAGGAGAAA -/G GGGGGGGGAG 3070 hom 38 het 25 0 13 12 G 8 9 46003 CASAVA_Build 1 86377974 2D TAAAATTTTC AT/-- ATGTCTTGAT 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 AT 2 1 46004 CASAVA_Build 1 86382997 7D TGGTTCTTCC ATTCATT/------- AAGCTTTTAC 3070 het 3070 ref 44 23 17 9 ATTCATT 1 0 46005 CASAVA_Build 1 86383757 1D GCTACAGACA T/- TATCTTATTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 2 1 46006 CASAVA_Build 1 86386461 6D TTGTTTTTGT TTTTGC/------ TTTCTTGAGA 3070 het 2594 hom 22 8 12 7 TTTTGC 1 0 46007 CASAVA_Build 1 86396026 8D GCAAAAACAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 35 15 15 8 AAAC 7 5 46008 CASAVA_Build 1 86398813 1I ATAGGGGCTC -/A AAAAACAATA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 5 6 46009 CASAVA_Build 1 86421783 1I CAGACAGGTA -/G ATATGTTGGT 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 G 0 1 46010 CASAVA_Build 1 86434946 3D GGAAAATTTG AGT/--- AGGTTGATTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 7 AGT 1 0 46011 CASAVA_Build 1 86440176 1D AATGTGCATA G/- GGGAAAAAGC 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 G 4 3 46012 CASAVA_Build 1 86468191 1D ATGCTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 18 11 T 11 10 46013 CASAVA_Build 1 86487081 1I GTAATCTGCT -/A GATGTGGTTT 3070 het 3070 hom 53 21 21 11 A 0 1 46014 CASAVA_Build 1 86489258 1D AAGACATTTG A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 A 7 6 46015 CASAVA_Build 1 86490561 4I TAAGTGCAAA ----/AGAT CAGCTACGGA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 AGAT 0 1 46016 CASAVA_Build 1 86491415 1I ATAAATTTAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 8 9 46017 CASAVA_Build 1 86494469 1D AACCTGTCCT C/- TATCCATCTC 3070 het 3070 hom 44 19 22 5 C 1 0 46018 CASAVA_Build 1 86500470 5D AATTAATTAA TAAAT/----- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 TAAAT 1 0 46019 CASAVA_Build 1 86500649 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 T 9 10 46020 CASAVA_Build 1 86502198 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 31 19 7 5 T 8 7 46021 CASAVA_Build 1 86505518 1I AGATGTGCAC -/A ACCATGCTTG 3070 hom 78 het 36 0 26 10 A 1 2 46022 CASAVA_Build 1 86510603 1I CATCTGACTG -/A AATGCATCGT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 2 3 46023 CASAVA_Build 1 86511908 3D GGCTGAGTCA GGT/--- GGATTGCCTG 3070 het 3070 hom 30 8 21 3 GGT 1 0 46024 CASAVA_Build 1 86517956 1D TACTTCAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 29 1 22 6 A 15 14 46025 CASAVA_Build 1 86525476 1D TTTTTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 11 10 46026 CASAVA_Build 1 86532744 1I AATTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 12 13 46027 CASAVA_Build 1 86533544 1I GTGCTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 480 hom 29 2 18 9 T 15 16 46028 CASAVA_Build 1 86536606 1I ACCCATCCCC -/T GAAGCATTTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 0 1 46029 CASAVA_Build 1 86547989 1I CTGATGCATA -/G GGGGGGCCTA 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 G 6 7 46030 CASAVA_Build 1 86548826 1I GATGTGTCAT -/G GAATAAAAGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 1 2 46031 CASAVA_Build 1 86550758 1D ATATTGGTGT G/- GTGACTATTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 2 1 46032 CASAVA_Build 1 86554673 1I GTTGGCTTTC -/A AAAGCTTTTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 3 4 46033 CASAVA_Build 1 86564455 1I TTTCTCCCCC -/G GGGCTAAATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 3 4 46034 CASAVA_Build 1 86564876 1I GATTTTTTAG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 8 46035 CASAVA_Build 1 86566109 1D ATAAACGCTT A/- ACGCCACCCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 1 46036 CASAVA_Build 1 86573239 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 258 hom 26 2 24 0 A 9 10 46037 CASAVA_Build 1 86573776 1I TGGAAAACTG -/A AAAAAATTGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 46038 CASAVA_Build 1 86575653 2I AGCTTTGTGA --/AG AGTTCTGAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AG 1 2 46039 CASAVA_Build 1 86581063 1D TCCTTTTTTT C/- CCCACAATTC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 C 4 3 46040 CASAVA_Build 1 86582303 1I TTTCTTTTTT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 7 8 46041 CASAVA_Build 1 86585099 1D CATGGGTAAG A/- CAAATGCATT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 1 0 46042 CASAVA_Build 1 86587509 1D ATTTTATTCC A/- AAATAATTAA 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 A 4 3 46043 CASAVA_Build 1 86593783 2I GGAATTTAAA --/CT CTAAAATTTT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 CT 1 2 46044 CASAVA_Build 1 86594499 5D ATGAATAAAC TAAAA/----- TAAGAATTTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 TAAAA 1 0 46045 CASAVA_Build 1 86597513 2D AAAATCTGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2034 hom 30 11 9 11 A 17 15 46046 CASAVA_Build 1 86604877 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2621 het 2621 ref 19 8 6 5 A 11 12 46047 CASAVA_Build 1 86622743 6D TTTTGAGATG AAAAAT/------ AAAAATACAT 3070 het 3070 ref 28 17 11 2 AAAAAT 2 1 46048 CASAVA_Build 1 86624642 1I GAGGTTTTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 T 8 9 46049 CASAVA_Build 1 86631656 1D TAATTGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1475 hom 31 9 10 12 A 13 12 46050 CASAVA_Build 1 86632683 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2563 hom 19 9 8 2 A 14 15 46051 CASAVA_Build 1 86643816 2D AGAATGTTTA TC/-- TCTTTTCATC 3070 het 3070 hom 55 21 31 6 TC 2 1 46052 CASAVA_Build 1 86644898 1I GTAACAGGAT -/A CCCAACTGTT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 A 0 1 46053 CASAVA_Build 1 86646225 1D TAAATACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 11 10 46054 CASAVA_Build 1 86650309 1I CATCATTGCT -/G GGGGGTAGCC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 G 5 6 46055 CASAVA_Build 1 86654015 1I CAGTGGAGCA -/C CACCATGCCC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 C 1 2 46056 CASAVA_Build 1 86660391 1I TGGAGCTGCC -/A ACACCTCTGG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 1 2 46057 CASAVA_Build 1 86668378 1I AATAATTCAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 6 7 46058 CASAVA_Build 1 86672277 1I GAGTGGGGGT -/G GGGGGATCAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 5 6 46059 CASAVA_Build 1 86674202 1D TTTTAAATGG T/- TAAAAAAAAA 3070 het 731 hom 29 6 12 11 T 2 1 46060 CASAVA_Build 1 86683981 1D TAATATTAAT A/- GTACAGAGCA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 1 0 46061 CASAVA_Build 1 86686153 1I TTGAGTTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 9 10 46062 CASAVA_Build 1 86700981 2I GTGTGTGTGT --/GC GTGTGTATTT 3070 het 3070 hom 32 13 10 9 GC 0 1 46063 CASAVA_Build 1 86709454 2D TATTTTGGAG TC/-- TCTGCAATGC 3070 het 3070 ref 42 27 12 3 TC 2 1 46064 CASAVA_Build 1 86723121 1D CAGATGGGAG A/- AAAGTGATAA 3070 hom 87 het 36 0 29 8 A 4 3 46065 CASAVA_Build 1 86723937 3I AGGGCCAGAA ---/TCT TAGTTATAAC 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 TCT 0 1 46066 CASAVA_Build 1 86729185 1I AAAAAAAAAA -/T AAAAAAAAAT 2476 het 696 hom 19 8 10 2 T 0 1 46067 CASAVA_Build 1 86730242 1I GCCCATCTGG -/T TCTAAAATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 1 2 46068 CASAVA_Build 1 86730704 2D GAAACCTAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 AG 8 7 46069 CASAVA_Build 1 86731434 1I CACAAGGACC -/T TTTGGGGAGT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 3 4 46070 CASAVA_Build 1 86733315 1I AGTTTAAAAA -/T AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 0 1 46071 CASAVA_Build 1 86736720 1D AAATTAATTC T/- GTGTGTGGAA 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 1 0 46072 CASAVA_Build 1 86738390 1D CTAAAATGTA T/- TTTAGACTTC 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 T 4 3 46073 CASAVA_Build 1 86742826 1I GGGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2908 hom 25 9 11 5 T 14 15 46074 CASAVA_Build 1 86757564 1I GTTTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 11 12 46075 CASAVA_Build 1 86759971 1I TGCATCATTT -/A AAAAATCTAT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 A 5 6 46076 CASAVA_Build 1 86764223 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 9 8 46077 CASAVA_Build 1 86766957 1I TTCTTTTGGG -/T ACACACCTAG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 0 1 46078 CASAVA_Build 1 86767825 1D GTGTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 2092 het 274 hom 14 1 6 7 T 13 12 46079 CASAVA_Build 1 86774865 1D ATCTCTAGCA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 T 8 7 46080 CASAVA_Build 1 86790171 1I TTCTAATGAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 8 9 46081 CASAVA_Build 1 86801505 2I ATTGCATTGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 23 10 7 6 AT 6 7 46082 CASAVA_Build 1 86927454 1I AAGATTAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1080 hom 39 4 20 15 T 15 16 46083 CASAVA_Build 1 86930541 4I TCTCTCTCTT ----/TCTC TCTTCTTTCT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TC 1 3 46084 CASAVA_Build 1 87058743 1I AGTATAATAA -/T AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 0 1 46085 CASAVA_Build 1 87060405 1D ACAGACAGCA T/- TTTTAAGATT 3070 hom 94 het 37 0 32 6 T 5 4 46086 CASAVA_Build 1 87062961 1D GGGGGAAAAG A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 51 het 18 0 18 2 A 8 7 46087 CASAVA_Build 1 87072398 2D AAGAACAGAA AG/-- AGCTGGATTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AG 2 1 46088 CASAVA_Build 1 87163824 1I CATCTTATGT -/G GATGGTGGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 2 46089 CASAVA_Build 1 87183845 1D TTTAATTAAT C/- TGCTTTGCAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 1 0 46090 CASAVA_Build 1 87189811 1I CTTTATTGCT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 8 9 46091 CASAVA_Build 1 87198019 5D TTGCAACATA AGTAC/----- AGTACAAGAT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AGTAC 2 1 46092 CASAVA_Build 1 87199102 3D GGGAATGCAA AAT/--- AATAACCTTC 3070 hom 99 het 39 0 33 8 AAT 2 1 46093 CASAVA_Build 1 87199413 1D TCTATTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 20 9 A 13 12 46094 CASAVA_Build 1 87205168 1I AGTGCATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 27 1 23 4 T 12 13 46095 CASAVA_Build 1 87206702 1I TCTCCAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 50 0 41 9 T 10 11 46096 CASAVA_Build 1 87230169 1D TAATCAGAAT G/- GCTTAAATAT 3070 hom 117 het 41 0 38 3 G 2 1 46097 CASAVA_Build 1 87235777 2I GCTAAAGATG --/AA AGAGAATTTG 3070 hom 148 het 52 0 50 2 A 1 3 46098 CASAVA_Build 1 87237965 1D ATTATGCTTT C/- CCCCCCAACT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 7 6 46099 CASAVA_Build 1 87238378 2D TTGACTCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 26 1 24 2 A 13 11 46100 CASAVA_Build 1 87241562 1I GATTCAGGAG -/A AAAAAAATAG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 7 8 46101 CASAVA_Build 1 87241981 1D ATGTACAGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 9 46102 CASAVA_Build 1 87242322 2I GCCACCAAAC --/AT AGCTTCTGAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 AT 0 1 46103 CASAVA_Build 1 87248150 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 1072 hom 7 het 3 0 3 0 A 7 8 46104 CASAVA_Build 1 87255136 1D GGTTATTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 33 0 25 8 T 11 10 46105 CASAVA_Build 1 87256233 2I TTAGGAAAAC --/TG AGGTTTAAGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TG 0 1 46106 CASAVA_Build 1 87263459 3I CTGGAGAAGT ---/AAA GAAGAACAGG 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 0 3 46107 CASAVA_Build 1 87269720 2D CATTCTACTC AG/-- AGTGTGGTCC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AG 2 1 46108 CASAVA_Build 1 87275405 1I CAACTTTTGC -/T TTTATCGTCA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 3 4 46109 CASAVA_Build 1 87285126 3I GGATTATAGG ---/TTC CACCCACCAC 2094 het 2094 ref 26 15 10 1 TTC 0 1 46110 CASAVA_Build 1 87285641 1I TTTCACAAAT -/A TTTTTTCCTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 0 1 46111 CASAVA_Build 1 87292175 12I GTTTAAAAAT ------------/AAAAATAAAGTG AAAAATAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AAAAATAAAGTG 0 1 46112 CASAVA_Build 1 87310771 2D ATGCAATCTT TG/-- TGTGTTTGAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TG 3 2 46113 CASAVA_Build 1 87317404 1I TAAATGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1021 hom 25 3 18 4 T 13 14 46114 CASAVA_Build 1 87325193 3I GTAGATATAA ---/ATT ATTATTATAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 ATT 2 3 46115 CASAVA_Build 1 87329954 1D CTTACAAAAC A/- AATCAAAATG 3070 hom 129 het 47 0 43 6 A 3 2 46116 CASAVA_Build 1 87330655 6D TCCCAATCGC CACATA/------ CACATACACA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 CACATA 2 1 46117 CASAVA_Build 1 87360872 4I ATGGGGACAA ----/ACTC ACTGCAACTT 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 ACTC 0 1 46118 CASAVA_Build 1 87373027 1I CAGCAGCCTC -/G GGAGAGGCGG 2760 het 1671 hom 19 6 9 4 G 2 3 46119 CASAVA_Build 1 87381515 13D ATCAGAGAAC AGAATGGTGCCTT/------------- AGGTTTCTGG 3070 het 3070 hom 40 17 19 10 AGAATGGTGCCTT 1 0 46120 CASAVA_Build 1 87382394 4D AATTTATTGA TTAC/---- TTACCACCTG 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 TTAC 2 1 46121 CASAVA_Build 1 87388331 1D ATGTGACTTC T/- TTTTTTTTTC 1307 het 1307 ref 31 23 3 6 T 10 9 46122 CASAVA_Build 1 87467921 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1677 het 1677 ref 31 20 7 4 T 13 12 46123 CASAVA_Build 1 87469415 1I CTGTACTCTC -/G TCTCTGCAAC 3070 het 3070 ref 42 16 17 9 G 0 1 46124 CASAVA_Build 1 87480420 3D GGATTTTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 20 11 T 14 11 46125 CASAVA_Build 1 87484289 3I AGCCTACCTT ---/GGG ACTAATACAG 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 G 0 3 46126 CASAVA_Build 1 87485424 1I AATAAAATAT -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 6 7 46127 CASAVA_Build 1 87485850 24D3M3D AGCTGCTAAA TTTGTGGTTTAAATAACAAGCTGCTAACTT/------------------------TAA--- GTTATGCAGC 3070 het 3070 ref 48 38 23 5 N/A 0 0 46128 CASAVA_Build 1 87486397 4D ATGGCAGCAG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 GA 7 5 46129 CASAVA_Build 1 87487526 1D TGGTGAGATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 9 8 46130 CASAVA_Build 1 87489981 1I CTCATCTCAG -/A TTAAGTCACT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 A 0 1 46131 CASAVA_Build 1 87490374 1I TGTGAGACCA -/G GTTCTTAGTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 1 2 46132 CASAVA_Build 1 87491561 1I GTTTTAAGCT -/A CATAGTTTAA 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 0 1 46133 CASAVA_Build 1 87495433 2D AAGTTAGACC AA/-- GTGAGACCTC 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 2 0 46134 CASAVA_Build 1 87507066 1D ATTGGCACTT A/- AAACCCAATA 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 A 4 3 46135 CASAVA_Build 1 87515249 1I AAAGTTGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 9 10 46136 CASAVA_Build 1 87526200 1I GGGTTTTTTT -/G TGTGTGTGTT 3070 het 2107 hom 28 8 15 5 G 0 1 46137 CASAVA_Build 1 87526918 2D AAAAAAAAAA AT/-- TCCGATGTTG 2865 het 1237 hom 33 5 10 18 AT 1 0 46138 CASAVA_Build 1 87534716 4I CCCATTTTTG ----/CAAA CAGTGTCTCA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 CAAA 0 1 46139 CASAVA_Build 1 87541141 18D ACAAGCAAAC AAAAAAAACAAGCAAACA/------------------ AAAAATGGCA 3070 hom 63 het 23 0 22 9 AAAAAAAACAAGCAAACA 1 0 46140 CASAVA_Build 1 87545147 1I CCCCACTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 799 hom 41 3 28 10 T 10 11 46141 CASAVA_Build 1 87546309 1D AGAGTTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 9 T 11 10 46142 CASAVA_Build 1 87547759 2I AGTCCCGGCA --/TT TTCCTCTCCC 3070 hom 60 het 25 0 16 9 T 2 4 46143 CASAVA_Build 1 87596962 1I TAAATTTAAA -/T TTTTTTTTTT 1845 het 1845 ref 22 13 6 3 T 13 14 46144 CASAVA_Build 1 87606354 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 7 8 46145 CASAVA_Build 1 87613338 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3032 het 3032 ref 25 9 8 8 T 10 9 46146 CASAVA_Build 1 87621649 1D TCTCTTTTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 375 hom 30 1 24 6 A 9 8 46147 CASAVA_Build 1 87644705 1I ACTATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1160 hom 31 3 16 12 A 15 16 46148 CASAVA_Build 1 87662028 1D ACACTATAGG T/- TTTTTTTTTT 1130 het 1130 ref 31 19 4 8 T 11 10 46149 CASAVA_Build 1 87714017 1I AATTATATAC -/A AAATATAATA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 A 3 4 46150 CASAVA_Build 1 87714143 2I AAAGGAAGAA --/CT CTGTTAGTAG 3070 het 3070 ref 76 39 31 6 CT 1 2 46151 CASAVA_Build 1 87715607 4D AGTTTTTATG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 hom 50 25 24 6 TA 7 5 46152 CASAVA_Build 1 87715768 1I3M1I46M1I AGAAACGAAG -GGA-AAAAAACCTCTTCTTCCAGACACATGTCTAAAATCCTGTTGCCAAG-/AGGAGAAAAAACCTCTTCTTCCAGACACATTTCTAAAAACCTGTTGCCAAGA GGTAAATCAT 3070 het 3070 ref 44 46 15 7 N/A 0 0 46153 CASAVA_Build 1 87716335 1D AGGCAAAAAA T/- AAACATTCTT 1552 het 1552 ref 49 33 5 14 T 1 0 46154 CASAVA_Build 1 87716588 1D GCTGAGATGG A/- AAGAGGTGTC 3070 het 3070 ref 68 40 13 16 A 3 2 46155 CASAVA_Build 1 87716641 1I ACCCTGAGGC -/T TTGTGTTTCG 1095 het 1095 ref 64 49 5 11 T 2 3 46156 CASAVA_Build 1 87716700 4I GCTTCTCTGT ----/CTGA CAAGACTCAC 3070 het 3070 ref 76 47 14 15 CTGA 0 1 46157 CASAVA_Build 1 87728112 1D CTGTTTACTC A/- TATGCATGTA 662 het 662 ref 48 39 2 8 A 1 0 46158 CASAVA_Build 1 87735327 4D CCCAGCTATC TTGT/---- TTGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 58 49 8 1 TTGT 2 1 46159 CASAVA_Build 1 87752815 3I TTGTCAAACA ---/TGT TGTGCTTACT 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 TGT 1 2 46160 CASAVA_Build 1 87755855 3I TGGGGCCGTT ---/TTG TTGTTGCTGC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 TTG 2 3 46161 CASAVA_Build 1 87771353 3I TATGTATATT ---/ACA ACAACAATTG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 ACA 2 3 46162 CASAVA_Build 1 87774087 2I GAATGATAAC --/AT GTGAAGATCT 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 AT 0 1 46163 CASAVA_Build 1 87785742 1I CTTGTGTGTC -/T TATCAAGTAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 1 2 46164 CASAVA_Build 1 87808145 1D AATAGTAAAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 8 46165 CASAVA_Build 1 87835338 1I CCATCTAACC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 36 0 28 8 T 9 10 46166 CASAVA_Build 1 87845369 2I CAGAGTAAGA --/CT CTGTCTTAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 CT 1 2 46167 CASAVA_Build 1 87848694 2I TGTGTGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 14 17 12 TG 7 8 46168 CASAVA_Build 1 87852333 1I AAAAAAAAAA -/G GCAGTGAGAC 3070 het 1378 hom 37 9 19 9 G 1 2 46169 CASAVA_Build 1 87855616 1D TGGGGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 11 10 46170 CASAVA_Build 1 87864575 1I AAAAAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 A 11 12 46171 CASAVA_Build 1 87870976 1I AGTAAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 10 11 46172 CASAVA_Build 1 87887927 1D CTATTTATTC T/- TTTTTTTTCC 2345 het 2345 ref 35 14 8 13 T 9 8 46173 CASAVA_Build 1 87892721 1D ACACTTACAT A/- TAGGATTACA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 1 0 46174 CASAVA_Build 1 87927089 6I AAGAAAACTA ------/TAATGT TAATGTTCAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 TAATGT 1 2 46175 CASAVA_Build 1 87932371 1I CCTCAAAAAG -/A AAATGTAACT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 3 4 46176 CASAVA_Build 1 87933381 1D CCCTGCCCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2268 hom 24 9 13 3 A 11 10 46177 CASAVA_Build 1 87946739 1D GTTATTAACG A/- AAAAAATGAA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 7 6 46178 CASAVA_Build 1 87951330 1I GCAATTTAAG -/A AAAAAACTAG 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 6 7 46179 CASAVA_Build 1 87957143 2I TCTAACGCCT --/CA CACACTTTAG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 CA 2 3 46180 CASAVA_Build 1 87964243 1D GCAGGTGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 49 1 42 6 A 11 10 46181 CASAVA_Build 1 87967894 1D CCAGAGCAAA C/- TTTTTATGCT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 C 1 0 46182 CASAVA_Build 1 87971600 8D TAATAATAAT AAAATAAA/-------- AAAATAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 1 AAAATAAA 2 1 46183 CASAVA_Build 1 87976231 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2916 hom 27 het 11 0 8 3 A 13 14 46184 CASAVA_Build 1 87983304 1D GTACAGTCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 9 8 46185 CASAVA_Build 1 87986518 5D AATATGGGAG GAAAA/----- GAAAAGAAAA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 GAAAA 3 2 46186 CASAVA_Build 1 87988729 1D TTGGCATCTT A/- ATTGGCAGTC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 2 1 46187 CASAVA_Build 1 87990333 3I AATTCAAGGC ---/ATA ATGACTGAGA 3070 hom 101 het 39 0 37 2 ATA 0 1 46188 CASAVA_Build 1 87997568 1D GAAATAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 41 2 31 8 T 13 12 46189 CASAVA_Build 1 88000192 5D TGAGAACTGA ACTTT/----- ACTTTATGAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 2 ACTTT 2 1 46190 CASAVA_Build 1 88002652 2D CAGCAAAGTG GA/-- GAGTGTCCCA 3070 het 3070 hom 37 18 17 3 GA 2 1 46191 CASAVA_Build 1 88029114 1I AATTCCTTGA -/C AAAAGCTTTT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 C 0 1 46192 CASAVA_Build 1 88030894 1I ATGCTCCACA -/T TATGCACATA 3070 hom 138 het 47 0 46 1 T 1 2 46193 CASAVA_Build 1 88038099 7I TAGCTCCCTC -------/CCAGTCG CCTGGCACAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 CCAGTCG 0 1 46194 CASAVA_Build 1 88067966 1D TAAAATAATG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 T 8 7 46195 CASAVA_Build 1 88076179 1I TCTGCAAACA -/T ATTCACTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 0 1 46196 CASAVA_Build 1 88093719 1I TTCAGGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 11 12 46197 CASAVA_Build 1 88095338 1I AAGCTCAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 8 9 46198 CASAVA_Build 1 88118502 2D CCCCCTTTTT TC/-- TCTCTTTCCC 3070 het 2783 hom 28 8 14 6 TC 3 2 46199 CASAVA_Build 1 88123645 2I ATTTATTAGA --/GT TCCCATCAGA 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 GT 0 1 46200 CASAVA_Build 1 88133403 1D AGTGTCAAAA T/- TTTTTTTTTT 1604 het 1039 hom 16 5 6 5 T 17 16 46201 CASAVA_Build 1 88134909 2D TTCATTAATT TA/-- TTTAGTCAGT 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 TA 1 0 46202 CASAVA_Build 1 88174814 1D TCTTCAGACC T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 8 7 46203 CASAVA_Build 1 88180705 1I6M3D2M1D AATCTATTGC -CCAATCCCTTAC/TGGAATC---TA- CACTCAGTGG 3070 hom 117 het 43 0 37 8 N/A 0 0 46204 CASAVA_Build 1 88195645 1I AATGGTACTT -/A ATAGAAAATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 46205 CASAVA_Build 1 88197428 1I TGTAAGGCTG -/T TTTTTTTTTT 1600 het 1600 ref 46 25 6 15 T 11 12 46206 CASAVA_Build 1 88211872 1D GCGCCCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 12 8 A 11 10 46207 CASAVA_Build 1 88212950 1I TTAAAGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 36 1 28 7 T 11 12 46208 CASAVA_Build 1 88221473 1I GAGCTTTAGG -/T TGACTGCGTC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 1 2 46209 CASAVA_Build 1 88223149 1D AGAAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2182 het 2182 ref 35 25 5 6 A 13 12 46210 CASAVA_Build 1 88238001 1D AGTTTCTTCA T/- TTTTTTAGCC 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 T 7 6 46211 CASAVA_Build 1 88243251 1D AAATGGACAG A/- AAAATAGTTA 3070 het 3070 ref 52 27 20 6 A 5 4 46212 CASAVA_Build 1 88255071 1I AAACAGACGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 30 2 24 4 A 10 11 46213 CASAVA_Build 1 88259914 1I TAAATTTTAA -/G GGTCCAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 2 3 46214 CASAVA_Build 1 88267487 1D TGAGAAAACA T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 50 21 28 2 T 7 6 46215 CASAVA_Build 1 88268539 1D GGCACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 A 12 11 46216 CASAVA_Build 1 88284079 2I AATACATGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 TG 5 6 46217 CASAVA_Build 1 88288220 2I GTTATCTATT --/TA TATATATCTA 1924 het 1523 hom 14 5 7 2 TA 3 4 46218 CASAVA_Build 1 88288495 1D TTCTCATTCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 8 7 46219 CASAVA_Build 1 88288620 3D TTTAGAAAAT TTA/--- TTATCTTATT 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 TTA 2 1 46220 CASAVA_Build 1 88289272 1I TATCACAGCA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 T 7 8 46221 CASAVA_Build 1 88290880 1D TTTACCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 25 17 14 T 12 11 46222 CASAVA_Build 1 88301029 1D TTCACTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 21 24 7 T 13 12 46223 CASAVA_Build 1 88323646 1I AGCATGGAAT -/G TTTTTTTCAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 0 1 46224 CASAVA_Build 1 88375677 1D GTTTTCACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 40 1 29 10 A 11 10 46225 CASAVA_Build 1 88380690 2D TTACACCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 38 0 15 23 T 18 16 46226 CASAVA_Build 1 88385605 1I TACAAAGTGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 47 20 19 8 A 8 9 46227 CASAVA_Build 1 88397347 4D GGCAGTGTTA GTTT/---- AAGAAAAATG 2590 het 2590 ref 14 7 6 2 GTTT 1 0 46228 CASAVA_Build 1 88398498 1I GAAGGCTCAG -/A AAGTCTTCTC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 2 3 46229 CASAVA_Build 1 88415338 1D CAAAAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 11 10 46230 CASAVA_Build 1 88416585 2I GGAGGAGTCA --/GT GTGTCTCCTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 GT 2 3 46231 CASAVA_Build 1 88431255 1I CAGAAAGTGG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 46 0 40 6 A 8 9 46232 CASAVA_Build 1 88431989 1D TTTTTAGAAA T/- TTTGCAAACC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 4 3 46233 CASAVA_Build 1 88434837 1D GCTACATTCC T/- TTTCAACAGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 4 3 46234 CASAVA_Build 1 88435993 1D GACAAATCTT A/- AACTTGAGGG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 3 2 46235 CASAVA_Build 1 88445108 2D TGCCCAAGAC TT/-- TATCATTTCA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 T 3 1 46236 CASAVA_Build 1 88470850 1I CCCACCCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 146 hom 29 1 21 7 A 12 13 46237 CASAVA_Build 1 88475493 4D TCGCCCACAG CTCC/---- CTTCTCAAAG 3070 hom 117 het 46 0 39 10 CTCC 1 0 46238 CASAVA_Build 1 88478734 2D TTCAAGTCTA TG/-- TGTAAAGTAT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 TG 2 1 46239 CASAVA_Build 1 88484907 1D AAAGCTTAAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 54 het 19 0 19 1 T 9 8 46240 CASAVA_Build 1 88488217 1I TAGCTTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1272 hom 37 4 27 6 T 13 14 46241 CASAVA_Build 1 88490278 8I TATAATCAAT --------/TATAAAAA TATAAAAATA 2461 hom 15 het 8 0 6 2 TATAAAAA 1 2 46242 CASAVA_Build 1 88503208 1I ATCTTAAATC -/A ATTTTTGAGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 46243 CASAVA_Build 1 88505553 1I TTGCAACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1103 hom 28 3 22 3 A 12 13 46244 CASAVA_Build 1 88510209 3D TCAGAATAGT AAC/--- AATGTATCAC 3070 hom 93 het 36 0 29 8 AAC 1 0 46245 CASAVA_Build 1 88512057 4D CCATTTTGAG AAGC/---- AAGAAAATAT 3070 hom 96 het 37 0 32 7 AAGC 1 0 46246 CASAVA_Build 1 88519808 1D TAATACTAAC A/- AGCCAGTTAT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 2 1 46247 CASAVA_Build 1 88528131 1D CTCCACTGGG A/- AAAAACAGAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 6 5 46248 CASAVA_Build 1 88529929 4D AAAGGAAAGA AAGG/---- AAAGAAAGTT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AAGG 1 0 46249 CASAVA_Build 1 88531218 1D AAATGATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 18 6 A 13 12 46250 CASAVA_Build 1 88531686 1I CTTCGATGTG -/A AGAAAAAAAA 3070 hom 129 het 52 0 44 8 A 1 2 46251 CASAVA_Build 1 88535300 1I GAAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 248 hom 31 3 20 8 A 14 15 46252 CASAVA_Build 1 88541636 1I AAACAGATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 9 46253 CASAVA_Build 1 88546277 1I GTAGGCTTCA -/T TTTTTTTGAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 8 46254 CASAVA_Build 1 88550304 1I TCCTCTGCTC -/T TATGTATAGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 46255 CASAVA_Build 1 88552689 38I TCTGGACCCA --------------------------------------/AACTTGCTTTCCAGTTTTATCTCTCTATTTTGTTTCTT TAATCTGTAC 3070 hom 78 het 24 0 26 2 AACTTGCTTTCCAGTTTTATCTCTCTATTTTGTTTCTT 0 1 46256 CASAVA_Build 1 88553643 1D GTCAAGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 48 0 16 33 T 12 11 46257 CASAVA_Build 1 88556486 9I AAGAATCTTG ---------/ACATATTTA ATATATGCTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 ACATATTTA 0 1 46258 CASAVA_Build 1 88557452 1D ACTAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 55 1 48 7 T 12 11 46259 CASAVA_Build 1 88565492 2D GGGCCACTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 31 1 20 10 A 17 15 46260 CASAVA_Build 1 88568559 1I ATAGAAATGC -/T TTTTCATCTT 3070 hom 126 het 49 0 42 7 T 4 5 46261 CASAVA_Build 1 88570022 1D CTGTGCAAGA G/- ACTCTGCTAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 1 0 46262 CASAVA_Build 1 88576926 4D TTTAAACAAA ATTT/---- ATTATAATAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 ATTT 1 0 46263 CASAVA_Build 1 88596399 6D CTCAGAAAGA GACAAT/------ GAAGTAAAGT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 GACAAT 1 0 46264 CASAVA_Build 1 88607386 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 30 1 24 5 A 13 12 46265 CASAVA_Build 1 88619534 1I AATTTACATT -/A AAAAAACTGG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 6 7 46266 CASAVA_Build 1 88633232 3D7M1D17M1D3M4I11M3D8M11D5M1I3M1D GCTAAAGAAA CCTTAGCTTAGCTGTTGAGCTCCAGTCACATG----GTCATACACTAGTCTAAAAGTATTTTCGCTCATATTAA-ATGT/---TAGTTTA-TAATTAAGCAGAACTGA-ATGTTCTGACAGACAATA---TGCAAGGA-----------ATAAACATG- AAAAACATCT 1807 het 1807 ref 31 25 4 5 N/A 0 0 46267 CASAVA_Build 1 88635550 1I GACTGAAAAA -/T TTACATTTTT 3070 hom 98 het 40 0 32 8 T 2 3 46268 CASAVA_Build 1 88651521 4D TCCAGACACT GAAG/---- GAATGCAGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 GAAG 1 0 46269 CASAVA_Build 1 88659400 1I TGTGCCTGCT -/C CCCCCTTCAT 3070 hom 78 het 31 0 24 7 C 5 6 46270 CASAVA_Build 1 88662963 1D TGATACCATA T/- TCCAGCAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 1 46271 CASAVA_Build 1 88663789 16I TTGGATACCA ----------------/GCTCAGCCATAGTAGG ATATGGCACT 3070 hom 117 het 43 0 39 6 GCTCAGCCATAGTAGG 0 1 46272 CASAVA_Build 1 88670380 1D ATCTACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 986 hom 33 3 20 10 A 15 14 46273 CASAVA_Build 1 88690483 1D TTTACTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1221 hom 43 5 32 6 T 13 12 46274 CASAVA_Build 1 88701505 1I TCCCCATCAC -/T ACAAAAAGGA 3070 hom 71 het 27 0 24 3 T 0 1 46275 CASAVA_Build 1 88706682 4D CCCACCATGT GACA/---- GACAGACACT 3070 hom 87 het 37 0 28 11 GACA 3 2 46276 CASAVA_Build 1 88707038 1I CATTGAACAT -/A ACCTTGTTCA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 1 2 46277 CASAVA_Build 1 88741217 2I CACCAGTTAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 A 10 12 46278 CASAVA_Build 1 88743664 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 11 12 46279 CASAVA_Build 1 88744250 1I GAGCTACTTT -/C AAACACAATT 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 C 0 1 46280 CASAVA_Build 1 88744560 7I ATTGGATTGT -------/AATATAA AATATAAAAC 3070 het 3070 ref 37 26 8 3 AATATAA 1 2 46281 CASAVA_Build 1 88744946 1D TCCATCTAAT A/- AATGAGAAAT 3070 het 3070 ref 61 27 28 8 A 3 2 46282 CASAVA_Build 1 88754595 1I GATTAAAATT -/C CCCCCAACAA 3070 het 2928 hom 26 9 13 4 C 5 6 46283 CASAVA_Build 1 88756368 4D GAGAAGAGAG AGTT/---- AGAACAACTG 3070 het 3070 hom 34 14 18 5 AGTT 1 0 46284 CASAVA_Build 1 88757617 1D GATTCCTAGG T/- TTGCAGAGGA 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 T 3 2 46285 CASAVA_Build 1 88759251 1D GCAAGAACGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 33 0 25 8 A 11 10 46286 CASAVA_Build 1 88769415 1D ACAGACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 31 0 21 11 T 12 11 46287 CASAVA_Build 1 88802403 1D CCCTGTGGGC A/- ACTCGGTTGG 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 2 1 46288 CASAVA_Build 1 88805813 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 740 het 740 ref 30 15 3 13 AG 1 0 46289 CASAVA_Build 1 88806962 1D ACCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2692 het 901 hom 34 8 10 16 A 19 18 46290 CASAVA_Build 1 88818904 3I TTGGTGTAGT ---/AGA AGAACTACTT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AGA 1 2 46291 CASAVA_Build 1 88819005 5D GTGCAGTGCT TGGGG/----- TGGGGTGTTT 3070 hom 96 het 37 0 30 8 TGGGG 2 1 46292 CASAVA_Build 1 88821872 1D ACAACGGGCT G/- GGCATGGTGG 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 G 3 2 46293 CASAVA_Build 1 88826272 1I AACAAACATA -/T TGAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 T 1 2 46294 CASAVA_Build 1 88831317 1D ACTCTATAAG A/- AAAAAATTTC 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 A 7 6 46295 CASAVA_Build 1 88837162 3D ATACTTAGCA GAT/--- GATGGCAGAA 3070 hom 99 het 36 0 32 7 GAT 2 1 46296 CASAVA_Build 1 88849519 8D TTTTTAAATT CACACAAC/-------- CACACAACCA 3070 het 3070 ref 35 17 16 5 CACACAAC 2 1 46297 CASAVA_Build 1 88850670 1I CAAAGAGGGA -/G GGGGCAGACT 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 G 4 5 46298 CASAVA_Build 1 88871285 1D AATCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 775 het 775 ref 47 31 4 12 A 15 14 46299 CASAVA_Build 1 88875072 1I CTGTTCTTAT -/G ATAGTGCATG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 G 0 1 46300 CASAVA_Build 1 88880744 1I TCTTTATCAG -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 6 7 46301 CASAVA_Build 1 88882004 3I AAAATCTCTT ---/GAG GAGATTCCAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 GAG 1 2 46302 CASAVA_Build 1 88882506 1D GGTTGTATGC T/- TATCAATAAT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 2 1 46303 CASAVA_Build 1 88882753 1I ATTAAGATGG -/C AAGACAGAGT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 C 0 1 46304 CASAVA_Build 1 88884696 1D TTTAAAAGTC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 8 7 46305 CASAVA_Build 1 88893397 2I ATTAAACACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 7 10 A 12 14 46306 CASAVA_Build 1 88898768 1I AGTAGCACTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 9 10 46307 CASAVA_Build 1 88904290 1I ATCTCATCTT -/A AATTTCCCAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 2 3 46308 CASAVA_Build 1 88911941 1D CACAGCTAAA T/- TGCTTCAGAA 3070 het 3070 hom 52 22 23 7 T 2 1 46309 CASAVA_Build 1 88917981 1I TCTTTACACC -/T TTTTCCCCCT 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 T 4 5 46310 CASAVA_Build 1 88919822 2I TTATTAACAC --/TG TTTTAACATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TG 0 1 46311 CASAVA_Build 1 88920032 1I AAACTATTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 8 9 46312 CASAVA_Build 1 88921836 1D CAGTACAAGC A/- ACAGTAGTTC 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 A 2 1 46313 CASAVA_Build 1 88926360 1D TACACTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 36 0 27 9 T 12 11 46314 CASAVA_Build 1 88930117 2D AACCACACTC AT/-- AACTGTAATT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 AT 1 0 46315 CASAVA_Build 1 88943809 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 12 11 46316 CASAVA_Build 1 88944320 1I ATTTTTGAAT -/G GGGGTTGCAC 3070 het 3070 hom 22 7 13 2 G 4 5 46317 CASAVA_Build 1 88965035 1I GTTTTGGTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 T 9 10 46318 CASAVA_Build 1 88967477 1D CATTTCCGTC T/- TTTAAATTAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 4 3 46319 CASAVA_Build 1 88973240 2D GCAAATTAAA AT/-- AGTTATTATT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 AT 1 0 46320 CASAVA_Build 1 88973735 1I TCCTGGCCTA -/T TTTTTTTTTA 2522 het 2522 ref 21 12 7 2 T 9 10 46321 CASAVA_Build 1 88976440 4D AGTCATTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 AAAC 3 2 46322 CASAVA_Build 1 88977583 1I TCTCTACCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 908 hom 39 2 30 7 A 9 10 46323 CASAVA_Build 1 88984772 1I AGATAATATG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 7 8 46324 CASAVA_Build 1 88987043 1I TCATCTCCAC -/A AAAAAATTTA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 A 6 7 46325 CASAVA_Build 1 88996645 1I CATATTATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 400 hom 30 1 28 1 T 9 10 46326 CASAVA_Build 1 89011497 1D TCTGTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1808 het 1808 ref 33 22 5 6 T 12 11 46327 CASAVA_Build 1 89017489 1I CAAAGGTAAG -/T TGAAAACTCC 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 1 2 46328 CASAVA_Build 1 89024602 1I AGAACTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 10 11 46329 CASAVA_Build 1 89054414 1I CCCCCAAATT -/A AAAAAAAAGA 2585 het 2585 ref 27 17 6 4 A 8 9 46330 CASAVA_Build 1 89065883 10D CCCTTCCCTC CCCTTCCCTT/---------- CCCTTCCCTT 1849 het 377 hom 9 2 5 2 CCCTT 5 3 46331 CASAVA_Build 1 89082179 4D GTTATTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 2052 hom 23 7 10 6 TTGT 3 2 46332 CASAVA_Build 1 89083522 1D ATTCAATATA T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 44 18 18 9 T 7 6 46333 CASAVA_Build 1 89094716 1I GCAAAATGGG -/A AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 6 7 46334 CASAVA_Build 1 89114347 2I TAAAAGCTGT --/AA ATTAGGCAAG 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 1 3 46335 CASAVA_Build 1 89125086 1D TTTCCTAATT G/- TTTTTTTGCA 3070 het 2550 hom 20 6 12 2 G 1 0 46336 CASAVA_Build 1 89155166 1D TTATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2611 het 2568 hom 20 7 7 6 T 14 13 46337 CASAVA_Build 1 89158347 1I TCTCATGGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 A 9 10 46338 CASAVA_Build 1 89173647 1D GAGAGAGAGA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 G 1 0 46339 CASAVA_Build 1 89174937 1I TGCTCTGAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2273 hom 47 8 23 16 A 9 10 46340 CASAVA_Build 1 89174968 1D CACTACTCTG C/- CCCTTGCTTT 3070 het 2924 hom 50 7 23 20 C 4 3 46341 CASAVA_Build 1 89198327 1I ACCTCAGCCT -/C CCAAGTAGCT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 2 3 46342 CASAVA_Build 1 89198654 1D AGAAGAGACT A/- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 A 4 3 46343 CASAVA_Build 1 89205098 2D TAGGTTTCTC AT/-- AGATTCCTTT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 AT 1 0 46344 CASAVA_Build 1 89207927 1D AAGGAATGCC T/- TTTTTTTTTT 1387 het 1387 ref 29 13 4 12 T 12 11 46345 CASAVA_Build 1 89216380 4D TAATATACAC ATGT/---- ATGTATATGT 3070 het 3070 hom 33 14 15 7 ATGT 2 1 46346 CASAVA_Build 1 89217086 1D CCGGCCTTAA T/- TTTTTTTTTT 1925 het 1925 ref 24 13 6 5 T 13 12 46347 CASAVA_Build 1 89224453 1D AGACTGTATG A/- AAAAAAAAAA 3047 het 1767 hom 19 6 8 5 A 12 11 46348 CASAVA_Build 1 89235435 4I TTAAAGACTA ----/TTAG TTAGATTAAT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 TTAG 1 2 46349 CASAVA_Build 1 89235822 1D TAACCCCTGA G/- GGTCAGCATC 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 G 3 2 46350 CASAVA_Build 1 89239742 1I GATTTCTGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2510 hom 37 8 17 12 T 9 10 46351 CASAVA_Build 1 89248396 2D AATTAACTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 831 hom 25 3 10 12 T 16 14 46352 CASAVA_Build 1 89250814 6D TAAGTACATG TAAATA/------ TAAGCCTTTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TAAATA 1 0 46353 CASAVA_Build 1 89251275 1D TGCCTCATTT A/- TTTTTGTATT 3070 het 2560 hom 20 7 13 0 A 1 0 46354 CASAVA_Build 1 89260324 1D TCTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 32 1 15 16 A 12 11 46355 CASAVA_Build 1 89270600 2I GTTTAAAGTC --/TG TTTTATCAGA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TG 0 1 46356 CASAVA_Build 1 89292918 6D GAGAAAACAG AAAAAC/------ AGAAACCTCA 3070 het 3070 ref 51 26 16 12 AAAAAC 1 0 46357 CASAVA_Build 1 89296006 5I CATAGACACA -----/CTTGT CTTGTCTAGG 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 CTTGT 1 2 46358 CASAVA_Build 1 89300258 1D TGGCCACTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 A 12 11 46359 CASAVA_Build 1 89304097 4D AACTGAGCAC AGAA/---- AGACTTTATT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 AGAA 1 0 46360 CASAVA_Build 1 89316364 3D TAATAAAGAT GAG/--- GAGAAAAGAG 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 GAG 2 1 46361 CASAVA_Build 1 89326194 1D TGTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 240 hom 30 1 23 6 T 12 11 46362 CASAVA_Build 1 89326362 1I TCCATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 39 1 30 8 T 11 12 46363 CASAVA_Build 1 89331533 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 10 9 46364 CASAVA_Build 1 89332400 2D AAAAATGGAA AC/-- ACAACATATT 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 AC 2 1 46365 CASAVA_Build 1 89338890 7D CCACCTCAGC TTGTTGG/------- AGCCTGGCTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 TTGTTGG 1 0 46366 CASAVA_Build 1 89340343 1I AATCTTAGAT -/A ACCATTTGTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 1 2 46367 CASAVA_Build 1 89344419 1I TCAAATGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 11 12 46368 CASAVA_Build 1 89368829 3I TCAGAGGAGC ---/TTT TTCCTTCTGG 813 het 813 ref 48 43 2 5 T 2 5 46369 CASAVA_Build 1 89379480 1D AAGTTGGAAA G/- AAAAAAAAAA 1565 het 1565 ref 48 29 4 15 G 1 0 46370 CASAVA_Build 1 89380490 2I TAGTCTATTT --/AC AGGAGTAGTG 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 AC 0 1 46371 CASAVA_Build 1 89381061 1I CCCTTCTTTC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 8 9 46372 CASAVA_Build 1 89384176 1D CTAAAAAAAA T/- CTACAGGTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 T 1 0 46373 CASAVA_Build 1 89400314 1I TCCCCATTGC -/T TTTTTTTTTT 2170 het 2170 ref 28 11 8 9 T 13 14 46374 CASAVA_Build 1 89401869 1D TCAGTGGTAA C/- CATCCCCCTG 3070 het 2975 hom 19 9 8 2 C 2 1 46375 CASAVA_Build 1 89403779 1I CTCAAAAAAA -/G AAGAAAAAAA 3070 het 638 hom 20 4 8 8 G 0 1 46376 CASAVA_Build 1 89407253 2I7M1I GTTAAAAAAA --AAACAAA-/ACAAACAAAC AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 8 11 4 N/A 0 0 46377 CASAVA_Build 1 89411032 1I CTCATCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 T 12 13 46378 CASAVA_Build 1 89420135 1I TAATAACATT -/C AAGCCAAGAG 3070 het 3005 hom 31 7 19 5 C 0 1 46379 CASAVA_Build 1 89426435 3D AATCATCAAG ATC/--- ATCATCATCA 3070 het 3070 hom 55 17 23 16 ATC 7 6 46380 CASAVA_Build 1 89449865 1I AGTGAACCAG -/T TTTTTTTTTT 1875 het 1038 hom 18 5 7 6 T 14 15 46381 CASAVA_Build 1 89455304 1D GCTTACAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 15 14 6 T 10 9 46382 CASAVA_Build 1 89463019 1I ATTTCTTTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 8 9 46383 CASAVA_Build 1 89492653 3D AAACTATAAA ACT/--- ACTACAAGAA 3070 het 3070 hom 34 17 16 4 ACT 2 1 46384 CASAVA_Build 1 89493938 3D TTTAATAAAT AAG/--- AAAAGCTGGA 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 AAG 1 0 46385 CASAVA_Build 1 89498679 1I TGAGATGCAA -/G GGAAAGCATC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 2 3 46386 CASAVA_Build 1 89509741 1D8M1D GCAAAGAAGG AAAATGCCCA/-AAATGCCC- AAAAAAAATA 3070 het 379 hom 32 3 18 13 N/A 0 0 46387 CASAVA_Build 1 89537226 1D CAATTAATTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 19 15 6 T 7 6 46388 CASAVA_Build 1 89540234 1D GTGAGTGTTA C/- CGTTCTTAAA 3070 het 3070 ref 49 23 18 9 C 2 1 46389 CASAVA_Build 1 89554470 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 13 12 46390 CASAVA_Build 1 89555746 9D ATAGGGTCTG GAGTGGAGC/--------- TCCAGCAAAC 3070 hom 78 het 28 0 26 3 GAGTGGAGC 1 0 46391 CASAVA_Build 1 89555848 1I TCAACAAAAA -/G GACCCGCACA 3070 hom 92 het 35 0 31 4 G 1 2 46392 CASAVA_Build 1 89586170 3D GAGACACAAC AAT/--- GATTCCATTA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 AAT 1 0 46393 CASAVA_Build 1 89593586 2D GAATGGAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 16 14 46394 CASAVA_Build 1 89597443 3D GGAAAGTTAG TAA/--- TAATAATAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 8 TAA 4 3 46395 CASAVA_Build 1 89684060 1I TTTGGTGAGG -/C CATGTTTTCC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 C 1 2 46396 CASAVA_Build 1 89687529 1D TGTTTGAAAC A/- AAAAAATGAT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 7 6 46397 CASAVA_Build 1 89692277 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 AT 8 7 46398 CASAVA_Build 1 89693791 4I TAAATGTGTT ----/ATAA ATAATGGTAT 2873 hom 18 het 7 0 7 0 ATAA 1 2 46399 CASAVA_Build 1 89695915 1I GGCTACTATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 25 1 20 4 A 0 1 46400 CASAVA_Build 1 89696928 1D TGTATATAAT A/- AATATGTGCA 3070 hom 93 het 34 0 32 4 A 3 2 46401 CASAVA_Build 1 89699693 1I TTAAAAAAAA -/C AACAAAGATC 3070 het 153 hom 39 1 32 6 C 0 1 46402 CASAVA_Build 1 89701045 2I TAACATTATA --/AT ATATATATAT 3070 het 35 hom 23 1 22 0 AT 5 6 46403 CASAVA_Build 1 89705447 1I TGCTTGGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 983 hom 26 3 12 11 A 13 14 46404 CASAVA_Build 1 89719541 2D AAGTCACCTC TT/-- GAGTGCTTTG 3070 hom 69 het 25 0 24 3 T 2 0 46405 CASAVA_Build 1 89738102 1D AGGTAGTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 10 9 46406 CASAVA_Build 1 89785381 1D ACCAGGGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 35 0 21 14 T 13 12 46407 CASAVA_Build 1 89828124 1D TAGCCATTAG T/- TTTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 36 16 17 5 T 5 4 46408 CASAVA_Build 1 89838080 1I CCTGGGCAGG -/T TAAGTGTGTG 3070 het 3070 ref 58 28 24 6 T 1 2 46409 CASAVA_Build 1 89865519 4D AAGAATGAGA CTCT/---- CTGTCTGGTT 3070 het 3070 hom 21 10 10 2 CT 3 1 46410 CASAVA_Build 1 89874774 18D CCACACACCT CACCCTTGACCAAGCCTC/------------------ CACCAGCTGA 3070 het 3070 ref 42 26 17 5 CACCCTTGACCAAGCCTC 1 0 46411 CASAVA_Build 1 89875459 3I GGAAGGAACA ---/CCT CCTACCTCAG 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 CCT 1 2 46412 CASAVA_Build 1 89876633 1I TTGTCCCCCG -/C CTTGAGAACA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 C 1 2 46413 CASAVA_Build 1 89876770 1I TAATTTACAC -/A ATCCTCTGGA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 1 2 46414 CASAVA_Build 1 89885179 3I ATTTAATAAC ---/ATG ATAACATTAA 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 ATG 0 1 46415 CASAVA_Build 1 89888644 1I ATTAGGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 11 12 46416 CASAVA_Build 1 89900027 3D GCTTGGACCA GAG/--- GAGTAGTGAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 9 GAG 2 1 46417 CASAVA_Build 1 89904552 6I ACTAGAACTT ------/TAAGTA TAACAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 TAAGTA 0 1 46418 CASAVA_Build 1 89916890 1D TAAATGAGGG T/- TTTTTGACAG 3070 het 2863 hom 28 10 12 7 T 6 5 46419 CASAVA_Build 1 89923466 3I GGGGTTTCAC ---/CTT GTTAGCCAGG 2802 hom 15 het 6 0 6 0 CTT 0 1 46420 CASAVA_Build 1 89923971 2D TACAGGAAAC AG/-- AGAAAAAAAT 3070 het 2501 hom 34 8 20 7 AG 2 1 46421 CASAVA_Build 1 89928725 1D AAATCTTTTA G/- AATAAATAGT 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 G 1 0 46422 CASAVA_Build 1 89939639 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 71 het 71 ref 24 16 2 6 AAG 1 0 46423 CASAVA_Build 1 89945335 2D GGGTGGATCA CT/-- TGAGGTCAGG 1709 hom 23 het 12 0 4 8 CT 1 0 46424 CASAVA_Build 1 89985174 1D GGCCAAGGTA T/- TTTTTTTTTT 2255 het 428 hom 10 2 5 3 T 13 12 46425 CASAVA_Build 1 89992364 1D GCTTTTGCAG A/- GGCTCTTCCC 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 1 0 46426 CASAVA_Build 1 90000891 8I CCTGGGACTG --------/GGAAAAAC GTCTGAAACT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 GGAAAAAC 0 1 46427 CASAVA_Build 1 90004310 2I AAAGATAGTG --/AC ACAGAGTCCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AC 1 2 46428 CASAVA_Build 1 90004536 1I CAGTGTCTTC -/A ATGGTCCTTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 1 2 46429 CASAVA_Build 1 90010083 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1514 hom 27 6 17 4 A 15 14 46430 CASAVA_Build 1 90019057 1D AGCAGGATAG T/- TTTTTTTTTT 1045 het 1045 ref 29 14 4 11 T 15 14 46431 CASAVA_Build 1 90025425 1D ATAAATACTG T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 T 7 6 46432 CASAVA_Build 1 90031881 2I GTGCCTTTAC --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 CA 6 7 46433 CASAVA_Build 1 90042605 1I CCACTCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 21 1 18 2 A 13 14 46434 CASAVA_Build 1 90050408 2I ATATTTATAT --/AG AGAGATATGT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AG 2 3 46435 CASAVA_Build 1 90051524 1D TTCTTGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1378 hom 41 6 17 18 T 15 14 46436 CASAVA_Build 1 90053357 1D TGCTGAGAGG T/- CAAGTAAGGA 3070 het 3070 hom 53 23 29 2 T 1 0 46437 CASAVA_Build 1 90054971 5I CCATATTTAG -----/CCCCT CCCACCAGGG 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 CCCCT 0 1 46438 CASAVA_Build 1 90055656 4I AGTGCTCTAT ----/TAAG TTTTTGTTGA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 TAAG 0 1 46439 CASAVA_Build 1 90057219 2I TACAGTGTGT --/GA GAGTGTCTAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 GA 1 2 46440 CASAVA_Build 1 90073221 2D CTTTCGCCAG CA/-- CTAGGCTGCA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CA 1 0 46441 CASAVA_Build 1 90077920 1I TAGTGCAGAG -/A GGTCATCTCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 0 1 46442 CASAVA_Build 1 90084460 1D ATATGATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2578 hom 43 12 18 13 T 17 16 46443 CASAVA_Build 1 90090145 1D AATAGCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 11 10 46444 CASAVA_Build 1 90096823 1D AATTTTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 11 10 46445 CASAVA_Build 1 90101807 1I GTCTGTGTTA -/G TTTAGTTCTT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 G 0 1 46446 CASAVA_Build 1 90133696 1I TAAAGATGTA -/C CTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 C 1 2 46447 CASAVA_Build 1 90141350 15I TATGTTCTCT ---------------/GAGTGCAAAGGCAGA GAGGGTAGAG 3070 het 3070 hom 66 27 34 5 GAGTGCAAAGGCAGA 0 1 46448 CASAVA_Build 1 90149325 1D ATTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 13 12 46449 CASAVA_Build 1 90149842 1I CCTTGCACAC -/T GTGAGCCAGA 3070 het 3070 hom 60 22 29 9 T 0 1 46450 CASAVA_Build 1 90152658 11I TGCCAGCACA -----------/CTGTCACCTCT CAATGTGACT 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 CTGTCACCTCT 0 1 46451 CASAVA_Build 1 90175573 6D AGAAGTGTTT AATTAC/------ AATTATAGAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AATTAC 1 0 46452 CASAVA_Build 1 90198619 1D GCTAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1971 het 1971 ref 58 42 5 11 T 13 12 46453 CASAVA_Build 1 90225149 1I CTCCCGCCTT -/A AGCTTCCCAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 2 46454 CASAVA_Build 1 90228999 1D AAATTATAAG A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 A 8 7 46455 CASAVA_Build 1 90266507 1I TGAATTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 9 10 46456 CASAVA_Build 1 90267956 4D CAAGGTAATG ATAA/---- ATAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 53 27 18 8 ATAA 2 1 46457 CASAVA_Build 1 90276422 1D GAGTGTGGAC T/- TTTTTTTTTT 1104 het 1104 ref 32 21 3 9 T 11 10 46458 CASAVA_Build 1 90279729 1I TGGCTGGGCC -/A CTGTTTGTGT 3070 hom 132 het 50 0 44 6 A 0 1 46459 CASAVA_Build 1 90303513 3I ATGCTAAAGA ---/AAG AAGACCAATT 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 AAG 1 2 46460 CASAVA_Build 1 90309310 1D TCCTTAATTG T/- TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 T 8 7 46461 CASAVA_Build 1 90309998 1D AACTTTGGAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 8 7 46462 CASAVA_Build 1 90310282 1D TGTTTACTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 12 11 46463 CASAVA_Build 1 90313126 2D TAAAGCCACC CA/-- CAGCTGGAGG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 CA 2 1 46464 CASAVA_Build 1 90313681 1D TTTCATGTAC T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 8 7 46465 CASAVA_Build 1 90313866 2I AAAATCCCTA --/AT ACAATACAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AT 0 1 46466 CASAVA_Build 1 90316948 1D TATTAGTTAT A/- ACAGGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 23 3 A 2 1 46467 CASAVA_Build 1 90317749 1I GTTCAATCTC -/T TTATTTCTTA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 2 3 46468 CASAVA_Build 1 90330290 5D TAGATATGTT TTCTC/----- TTCCTTGTGA 3070 het 3070 ref 35 15 18 4 TTCTC 1 0 46469 CASAVA_Build 1 90334174 1D TGATACGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2410 hom 30 9 18 3 T 13 12 46470 CASAVA_Build 1 90336374 1D AAGTGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1650 hom 15 5 7 3 A 12 11 46471 CASAVA_Build 1 90336707 1D AGATTAAAGA G/- GGAGAACAAG 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 3 2 46472 CASAVA_Build 1 90336999 1I ACAAAAAAAA -/T AATTGAACTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 1 46473 CASAVA_Build 1 90337118 1I TACACAACAG -/A AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 27 8 18 1 A 6 7 46474 CASAVA_Build 1 90337267 5I AACCTCACTT -----/ATAAC AGAAGAAATG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATAAC 0 1 46475 CASAVA_Build 1 90338227 1I GAATTACAAC -/A AACTATAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 2 3 46476 CASAVA_Build 1 90339451 1I GCTGAAGAAT -/A AAGACCTGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 3 46477 CASAVA_Build 1 90347396 1I GCCGGATTTT -/A CCTACTTGAA 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 A 0 1 46478 CASAVA_Build 1 90351048 3D AACTGAAAGT CAA/--- CAACAAGTAC 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 CAA 3 2 46479 CASAVA_Build 1 90365583 1I AACAGGAAAT -/G GGGGGGGGGA 3070 hom 82 het 32 0 25 7 G 9 10 46480 CASAVA_Build 1 90373262 1D AATGGCGTTG T/- TTTTTAAATA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 T 6 5 46481 CASAVA_Build 1 90374314 1D GTCATTCAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 36 0 30 8 T 9 8 46482 CASAVA_Build 1 90380510 1D AAATCTGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 10 9 46483 CASAVA_Build 1 90381222 5D TGTGTAGTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3033 het 901 hom 14 2 8 4 TTTTG 5 4 46484 CASAVA_Build 1 90389649 1I TCTATTTATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 9 10 46485 CASAVA_Build 1 90418887 1D TTCCACTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 12 11 46486 CASAVA_Build 1 90426390 3D ACAAGCAAAC AAA/--- GAAGCAAACA 3070 het 3070 ref 52 25 24 8 A 3 0 46487 CASAVA_Build 1 90428888 1I CTGGGAAGGT -/G GGGGAAATGC 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 G 4 5 46488 CASAVA_Build 1 90432695 1I ATTGGGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3031 hom 24 9 11 4 T 13 14 46489 CASAVA_Build 1 90436307 1D CCTCCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 12 11 46490 CASAVA_Build 1 90440377 1I AATGAACCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 9 10 46491 CASAVA_Build 1 90472005 1I TATTGTCTGT -/A TTTTTCAATT 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 0 1 46492 CASAVA_Build 1 90497629 1D AACAGCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 13 12 46493 CASAVA_Build 1 90510477 9D GGTCTAGCAA GAGTCCCAC/--------- CTACCCCTGA 3070 het 3070 ref 59 32 27 4 GAGTCCCAC 1 0 46494 CASAVA_Build 1 90527190 1D CAAAAAAAAA G/- AAACAAAGAG 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 G 1 0 46495 CASAVA_Build 1 90531557 1D GGGAGACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 14 9 T 11 10 46496 CASAVA_Build 1 90533541 4D AGAAGGAAGG AAGA/---- AAGAAAGAAA 2038 het 2038 ref 58 22 12 25 AAGA 5 4 46497 CASAVA_Build 1 90534713 1I TGGGGGCATG -/T TCAGCCCCAC 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 T 1 2 46498 CASAVA_Build 1 90544854 3I AGGAAAGTTA ---/AAG AAGACTGTTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AAG 1 2 46499 CASAVA_Build 1 90545525 3I GAAGGATTAA ---/TGT TGTTGTTGCG 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 TGT 2 3 46500 CASAVA_Build 1 90545968 1I TTTTAACAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 9 10 46501 CASAVA_Build 1 90550536 1I GAAGAAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 A 9 10 46502 CASAVA_Build 1 90554405 5D TTATAATCCT TTGGG/----- TATACACCCA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 TTGGG 1 0 46503 CASAVA_Build 1 90556500 1I AAATATTCTA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 T 6 7 46504 CASAVA_Build 1 90556882 1I GTATTCAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2091 hom 24 7 13 4 T 13 14 46505 CASAVA_Build 1 90558768 1D ATGTCTAGGC A/- AAGCTAGAAG 3070 het 3070 ref 56 33 20 3 A 3 2 46506 CASAVA_Build 1 90565595 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 6 7 46507 CASAVA_Build 1 90573409 1I TATATATGCA -/C CCACACACAT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 C 2 3 46508 CASAVA_Build 1 90575533 1I GGATTGAAAA -/G CTCTTAAAAG 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 G 0 1 46509 CASAVA_Build 1 90580503 1I GAAAAAAAAA -/T GGTCTGGATC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 0 1 46510 CASAVA_Build 1 90587345 2D ATTTGTGTAA GT/-- GACAAGGAAC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 GT 1 0 46511 CASAVA_Build 1 90594254 3I CAGCAGCCAG ---/GCA GCAGCATACA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 GCA 2 3 46512 CASAVA_Build 1 90596950 1D ATCCAGACTC A/- GGGGGGTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 6 A 1 0 46513 CASAVA_Build 1 90611943 1I CAACTTTTTG -/T AATAGATATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 46514 CASAVA_Build 1 90617413 2I CATGTACATA --/TG TGTGTATACA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TG 2 3 46515 CASAVA_Build 1 90618780 1I CCGAGAAGGG -/C CACAGGCTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 1 2 46516 CASAVA_Build 1 90620247 1I GTGAAATATC -/G GGGGGGATCC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 G 6 7 46517 CASAVA_Build 1 90634581 7I GGCAAATACA -------/AATAGCC AATAAATACA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 AATAGCC 0 1 46518 CASAVA_Build 1 90639580 4I CAGTAGAACC ----/AGAA AGAAACATGG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 AGAA 1 2 46519 CASAVA_Build 1 90641610 2I ACTTTAGCTT --/AA AAAAAAAAGA 3070 hom 116 het 50 0 40 10 A 8 10 46520 CASAVA_Build 1 90668563 1D CAATTTATAA T/- TTTTTTTTAT 1865 het 1865 ref 29 16 5 8 T 9 8 46521 CASAVA_Build 1 90680131 1I GCCCTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1287 het 1287 ref 12 5 5 2 T 15 16 46522 CASAVA_Build 1 90694084 1D CTAGTAGAAA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 27 12 13 5 T 7 6 46523 CASAVA_Build 1 90699092 1I AGTTCTTTCA -/T TTTTTTAGGG 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 T 6 7 46524 CASAVA_Build 1 90707586 1D TTGAATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 33 2 10 21 A 11 10 46525 CASAVA_Build 1 90713762 3D TCTTTTGAAG TCA/--- TCTTTCCACT 3070 het 3070 ref 32 21 11 1 TCA 1 0 46526 CASAVA_Build 1 90717439 2D15M10D GCTATTAAAT AGAGAGTTGTTTTACATATATATATGC/--AGAGTTGTTTTACAT---------- ATATATATAT 1771 het 1430 hom 18 6 7 5 N/A 0 0 46527 CASAVA_Build 1 90719827 24I TTCATAGAGG ------------------------/CCTAATTTTGTGGAAAGTTCTGGA AAACAACAAC 3070 het 3070 ref 21 10 10 2 CCTAATTTTGTGGAAAGTTCTGGA 0 1 46528 CASAVA_Build 1 90721498 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 A 13 12 46529 CASAVA_Build 1 90724944 1I TGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 12 13 46530 CASAVA_Build 1 90735517 1D GAAGGATAGG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 T 8 7 46531 CASAVA_Build 1 90741979 3D TTATTATTTC ATT/--- ATTATCTCTT 3070 het 3070 hom 26 12 13 4 ATT 2 1 46532 CASAVA_Build 1 90744603 1I TTAGGAGAGG -/T GCAGATGAAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 0 1 46533 CASAVA_Build 1 90749992 4I CAGAAATAGG ----/AATT AATTCTAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 AATT 1 2 46534 CASAVA_Build 1 90754569 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 1351 het 1351 ref 41 20 6 15 AC 10 9 46535 CASAVA_Build 1 90779629 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2831 hom 26 8 13 5 A 11 12 46536 CASAVA_Build 1 90798938 1D TGAATAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 11 19 13 A 14 13 46537 CASAVA_Build 1 90810060 1D GTGTGTGTGT G/- GGGGGGGGGT 1297 het 1297 ref 34 10 6 18 G 10 9 46538 CASAVA_Build 1 90816261 1I AAACTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 12 13 46539 CASAVA_Build 1 90828050 1I CAACAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 2316 het 2316 ref 30 18 8 4 A 13 14 46540 CASAVA_Build 1 90846959 1D TTATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 2942 het 1639 hom 21 8 8 5 A 16 15 46541 CASAVA_Build 1 90865828 1D GCTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 47 0 40 8 A 11 10 46542 CASAVA_Build 1 90877240 4I AGGAAGGAAA ----/GAAG GAAGGAAGGA 1841 hom 26 het 11 0 9 2 GAAG 2 3 46543 CASAVA_Build 1 90911714 1I GAGAAAATAG -/A AAATATTGGA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 3 4 46544 CASAVA_Build 1 90929582 1D CCTGTTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 43 2 34 7 A 13 12 46545 CASAVA_Build 1 90940128 1D CATTTCAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 10 9 46546 CASAVA_Build 1 90946970 2D CCACTGAAAA TC/-- TCTGTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TC 2 1 46547 CASAVA_Build 1 90973346 1I GATACTTCTG -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 T 6 7 46548 CASAVA_Build 1 91008983 1I GAGAGTCAGG -/C CCAGGAGCTC 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 C 2 3 46549 CASAVA_Build 1 91013938 5D TACAAAAAAT AATAA/----- AATAAAATAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 AATAA 3 2 46550 CASAVA_Build 1 91030861 1I GTCCAACCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 319 hom 44 1 36 7 T 9 10 46551 CASAVA_Build 1 91033033 1I TTAATGTGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 119 het 49 0 39 10 T 8 9 46552 CASAVA_Build 1 91034561 1I ACTGCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 10 11 46553 CASAVA_Build 1 91040067 1D TTAGTTTTGT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 9 8 46554 CASAVA_Build 1 91040245 3D GTGGTATCTC ATT/--- GTTGTTTAAA 3070 hom 108 het 40 0 35 6 ATT 1 0 46555 CASAVA_Build 1 91041844 1D GTCTAGATTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 10 9 46556 CASAVA_Build 1 91048654 1I ATATTAATTC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 7 8 46557 CASAVA_Build 1 91054571 1D CCATCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 1791 het 1791 ref 46 30 5 11 A 11 10 46558 CASAVA_Build 1 91061053 2D CTCTGACTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 23 1 15 7 A 18 16 46559 CASAVA_Build 1 91107055 1D TAATGTCCTT A/- AAGGGTTCAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 10 A 3 2 46560 CASAVA_Build 1 91107611 1I TTTAATGAGA -/T TTTTTTTTTT 2196 het 2196 ref 22 10 5 7 T 10 11 46561 CASAVA_Build 1 91112469 3D TGATTGTATT ATC/--- ATACATTCTC 3070 het 3070 ref 48 26 16 9 ATC 1 0 46562 CASAVA_Build 1 91126881 1D GGTAAACTGA T/- TTTTCTGTTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 5 4 46563 CASAVA_Build 1 91129302 1I TTGCTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2441 hom 23 5 16 2 T 11 12 46564 CASAVA_Build 1 91133154 1I AATGTTTACA -/G GACTACCCAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 1 2 46565 CASAVA_Build 1 91142454 1I CAGATGGGTT -/A AAAACAATTT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 4 5 46566 CASAVA_Build 1 91145087 1I CAAGAGATGA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 6 7 46567 CASAVA_Build 1 91151161 1D CACTCTGTTG C/- CCCAGTATGG 1459 het 1459 ref 18 7 6 5 C 4 3 46568 CASAVA_Build 1 91165796 2D CAGATAAATG TA/-- TACACATATA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 TA 2 1 46569 CASAVA_Build 1 91171827 4D TAAATAAATA AATG/---- AACAAACCCA 3070 het 6 hom 26 1 24 2 AATG 1 0 46570 CASAVA_Build 1 91174952 1D TTTCAAAAGG A/- AAAAACTATT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 6 5 46571 CASAVA_Build 1 91175506 1I TGTGCTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 11 12 46572 CASAVA_Build 1 91183455 2I TTTAAAAGTC --/TT TAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 1 3 46573 CASAVA_Build 1 91197093 4I GCAAAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 AAAC 2 3 46574 CASAVA_Build 1 91205335 1I CAAATTCCCC -/A AACATGTTCC 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 A 2 3 46575 CASAVA_Build 1 91209377 1I TCATCAACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 11 12 46576 CASAVA_Build 1 91218227 5I TTTGCCTGGG -----/AGAAA AGAACTCTTT 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 AGAAA 0 1 46577 CASAVA_Build 1 91228149 10D AATTGTGTCA CATGCTATAG/---------- CATGGATGAA 3070 het 3070 hom 61 28 30 7 CATGCTATAG 1 0 46578 CASAVA_Build 1 91228649 1D GTGAGCAAAC T/- TACTGCCTGG 3070 het 3070 ref 53 21 21 11 T 2 1 46579 CASAVA_Build 1 91230543 1D ATTTATAACC A/- AAAAAAAAAA 2248 het 2248 ref 42 25 6 11 A 13 12 46580 CASAVA_Build 1 91244940 1I CTTTCTGGAT -/G CCCCCCTCTT 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 G 0 1 46581 CASAVA_Build 1 91250987 1I TGTTATACCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 8 9 46582 CASAVA_Build 1 91252894 1D CTTGAAATAA G/- GGGGGGGAGA 3070 het 3070 ref 30 17 12 3 G 8 7 46583 CASAVA_Build 1 91258961 4I GCGTGGAATT ----/AGTC AGGACTGGAC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AGTC 0 1 46584 CASAVA_Build 1 91267041 21I CAGAGAGAAT ---------------------/CTTTCTCTAATCCCTCTTCCA TCCTTCACAC 3070 hom 90 het 32 0 30 4 CTTTCTCTAATCCCTCTTCCA 0 1 46585 CASAVA_Build 1 91269952 1I TTCAATAGAG -/A AAGGATAGTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 3 46586 CASAVA_Build 1 91292557 1D GGGGTTGGAA G/- GTAAGGGGAG 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 G 2 1 46587 CASAVA_Build 1 91295581 1I CTTCCCACTA -/T GATTTGTAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 0 1 46588 CASAVA_Build 1 91311456 2I TGACAGAAAC --/TG GCAATCATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TG 0 1 46589 CASAVA_Build 1 91317546 2D GCATTACAGA CT/-- CTCTTTGGTT 3070 hom 72 het 26 0 24 3 CT 3 2 46590 CASAVA_Build 1 91318639 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 9 10 46591 CASAVA_Build 1 91324505 1D TGTTTTTGGT A/- AAAGATTATA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 A 4 3 46592 CASAVA_Build 1 91327211 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2051 het 460 hom 13 2 7 4 A 15 16 46593 CASAVA_Build 1 91337208 13I GGCTCCCACT -------------/CTTGCTCCCACTC CTTGTCTGAT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 CTTGCTCCCACTC 0 1 46594 CASAVA_Build 1 91339174 3D CATCATCATG TTA/--- TTATCATCAT 3070 het 3070 hom 47 19 22 7 TTA 2 1 46595 CASAVA_Build 1 91348458 4D CAATACAATA ATAG/---- ATAGAGACTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 ATAG 2 1 46596 CASAVA_Build 1 91348942 1D TAAGTGCCTA C/- ATTAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 C 1 0 46597 CASAVA_Build 1 91364132 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 193 hom 31 1 9 21 T 10 11 46598 CASAVA_Build 1 91369888 1I GCTTATAGAT -/A AAACTCCCAT 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 3 4 46599 CASAVA_Build 1 91375232 1D AGTGGCTCAT G/- CCTGTAATCC 3070 hom 64 het 31 0 27 4 G 1 0 46600 CASAVA_Build 1 91379752 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCTCTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AG 2 1 46601 CASAVA_Build 1 91379920 1D AGTAGAGACA G/- GGTTTTGCCA 3070 het 17 hom 18 1 15 3 G 3 2 46602 CASAVA_Build 1 91399504 1I CCAGGGAGTA -/C CCCCCCGGAC 2340 het 2340 ref 30 18 9 3 C 6 7 46603 CASAVA_Build 1 91400897 3D TTGGTGTTGC TAT/--- TGTTGTTGTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TAT 1 0 46604 CASAVA_Build 1 91404155 3D AGAGAGAGAA AGG/--- AGGGGGTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AGG 2 1 46605 CASAVA_Build 1 91404584 1I TCTAAAAAAA -/T ATCAGGAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 46606 CASAVA_Build 1 91406630 26D CAGTGTTCTT TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/-------------------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 39 het 20 0 14 6 TG 22 9 46607 CASAVA_Build 1 91407453 8D17M6D ACATATACAC ACGTATATACGTGTATACACGTATATACATG/--------ACGTGTATACACATATA------ TGTATATACG 1796 hom 22 het 22 0 13 16 N/A 0 0 46608 CASAVA_Build 1 91407561 2I21M10D37M4D GCATATATAC --ATATACACATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATGTATATATACATATATATACATACATACATAT/ATATATACACATATGTATATATG----------TATATGTATGTATATATACATACATATACATATATAC---- ATACATATAT 3070 het 1528 hom 16 12 11 9 N/A 0 0 46609 CASAVA_Build 1 91418628 2D GAAGTGTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 12 10 46610 CASAVA_Build 1 91418722 1I ATCAAAGCTG -/A AAAAGCTGCA 3070 hom 60 het 21 0 20 1 A 4 5 46611 CASAVA_Build 1 91419402 6I CTGAGGTCAG ------/GAGTTT GAGACCAGCC 3070 hom 36 het 13 0 12 1 GAGTTT 0 1 46612 CASAVA_Build 1 91419603 1I ATTCCATCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 42 0 42 0 A 9 10 46613 CASAVA_Build 1 91421454 4I CCACTGACCG ----/TGTA AAAGCATTCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TGTA 0 1 46614 CASAVA_Build 1 91425259 1I CTCTGGCTGA -/C CTTAACATTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 1 2 46615 CASAVA_Build 1 91428853 2D ATATGAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 23 0 19 5 A 12 10 46616 CASAVA_Build 1 91433940 1D TCTCTCTGAT A/- GAGAAGAGGT 3070 hom 123 het 44 0 39 5 A 1 0 46617 CASAVA_Build 1 91434546 6I GCAAATTTAC ------/CTTCAG CAATCTTATC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 CTTCAG 0 1 46618 CASAVA_Build 1 91436465 1D TGTGGAGGTG A/- AAAAAGTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 A 6 5 46619 CASAVA_Build 1 91443346 1D ACAAAATAAC T/- GGGAGATCTA 3070 het 3070 ref 23 10 11 3 T 1 0 46620 CASAVA_Build 1 91444387 1I AGAGGGTGAA -/G GGGGAAGCTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 4 5 46621 CASAVA_Build 1 91448579 1I TTGCCACAGA -/T TGAATGTATT 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 T 1 2 46622 CASAVA_Build 1 91455080 1I AAAGTACAAT -/A AAAAAAAAAG 1298 hom 10 het 4 0 4 0 A 9 10 46623 CASAVA_Build 1 91455244 1D TAAATAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 14 13 46624 CASAVA_Build 1 91464908 1I TTATCTTCAA -/C CCGACCAATC 3070 hom 53 het 26 0 17 9 C 2 3 46625 CASAVA_Build 1 91465726 1I ACGTGAGCCA -/C CGCGCCTGGC 3070 hom 39 het 14 0 13 1 C 1 2 46626 CASAVA_Build 1 91469394 3I3M4D CTTTGACTGG ---AATGACA/GAAAAT---- TCTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 35 17 19 2 N/A 0 0 46627 CASAVA_Build 1 91470885 1D TATTCTGACC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 8 7 46628 CASAVA_Build 1 91476221 10D TGGAGATAAT TTTGTTTTTG/---------- TTTGTTTTTG 3070 hom 90 het 43 0 29 16 TTTGTTTTTG 3 2 46629 CASAVA_Build 1 91477463 14D TTTTGTAATT TAGGTATTTGTATG/-------------- TAGGTATTTG 3070 hom 57 het 32 0 20 12 TAGGTATTTGTATG 2 1 46630 CASAVA_Build 1 91488538 1I CAACCTCTGC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 9 46631 CASAVA_Build 1 91491485 1D ACACACACAG C/- CCCAGCAGCC 3070 het 3070 hom 35 14 12 10 C 4 3 46632 CASAVA_Build 1 91503662 2I TTTGCGACCC --/CT GACTGGGTAC 3070 hom 102 het 37 0 33 4 CT 0 1 46633 CASAVA_Build 1 91518154 1D TAAAATGTAA T/- TTAAGTATGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 3 2 46634 CASAVA_Build 1 91520898 1I GAAGGAACCT -/A TTGTTTTGAG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 0 1 46635 CASAVA_Build 1 91536657 1I GAAATGAAGG -/A AAAAAATGTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 6 7 46636 CASAVA_Build 1 91540089 5I GGGATCTAAT -----/TAAAC TAAAGAGCTT 1305 hom 7 het 3 0 3 0 TAAAC 0 1 46637 CASAVA_Build 1 91542779 1D AGCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1396 het 14 hom 8 0 4 4 T 17 16 46638 CASAVA_Build 1 91547994 1D TCCATGCATG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 7 6 46639 CASAVA_Build 1 91556211 1D CTTAGCCGAA T/- TTCAAAATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 3 2 46640 CASAVA_Build 1 91559590 4D CTCTGTCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAT 5 4 46641 CASAVA_Build 1 91564919 3I AATAGACTAA ---/ATG ATGAAGCAAT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 ATG 1 2 46642 CASAVA_Build 1 91568832 2D ACAACCAGAC AA/-- AGACATATCA 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 A 3 1 46643 CASAVA_Build 1 91582813 2I ATGACTGTGT --/AG AATTTTAAAT 2911 hom 23 het 13 0 8 5 AG 0 1 46644 CASAVA_Build 1 91582899 1I TCTTTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 T 11 12 46645 CASAVA_Build 1 91594866 1I TAGACTAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 9 10 46646 CASAVA_Build 1 91601487 4D ACAAGAAAAA AAAC/---- AAACAACCCC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AAAC 2 1 46647 CASAVA_Build 1 91614154 4I TCCAAAGAAA ----/AATT AATTATCAAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AATT 1 2 46648 CASAVA_Build 1 91615244 1I AATGCAGGTC -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 8 46649 CASAVA_Build 1 91617815 1I CAGGCAAGTG -/T TAACTAAAAG 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 1 2 46650 CASAVA_Build 1 91619184 1I AGTTACTTTT -/A ATTTTAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 1 2 46651 CASAVA_Build 1 91622077 1D CCTTAAAAAA T/- ATACCATTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 0 46652 CASAVA_Build 1 91622893 1D CACATACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 50 2 28 20 T 15 14 46653 CASAVA_Build 1 91626946 2D TAGATAAACT GG/-- ACTCTATCAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 2 0 46654 CASAVA_Build 1 91633169 2I TTGATATAAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 TA 5 6 46655 CASAVA_Build 1 91641202 1I TACTCCTGTG -/A AAAAAACACC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 6 7 46656 CASAVA_Build 1 91647392 1D AGGAAATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 37 1 32 4 T 11 10 46657 CASAVA_Build 1 91651426 1D AACAATATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 27 1 19 8 A 16 15 46658 CASAVA_Build 1 91662043 1I GTAGTTTTTT -/C TGATTCTGTG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 C 0 1 46659 CASAVA_Build 1 91676476 1D TTCTTTCAGA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 T 8 7 46660 CASAVA_Build 1 91676596 1D TGACAGAGGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 24 15 4 T 8 7 46661 CASAVA_Build 1 91676733 1D GCTGCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 150 hom 29 3 9 19 T 12 11 46662 CASAVA_Build 1 91676880 2I CGTCTTCAGA --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 8 10 46663 CASAVA_Build 1 91676981 1D TTTTAATTCT C/- CTTCTTTTGT 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 C 2 1 46664 CASAVA_Build 1 91691079 1D ACACACACAC A/- CACACACACA 2194 het 2194 ref 29 9 5 15 A 1 0 46665 CASAVA_Build 1 91691207 1I GAATACCAAG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 T 8 9 46666 CASAVA_Build 1 91696752 4I TCCTCAAAGC ----/AACA AACAATTAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AACA 1 2 46667 CASAVA_Build 1 91710334 3I ATGATTGAAA ---/ATG ATGATTTTAT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 ATG 1 2 46668 CASAVA_Build 1 91713839 1D ACCTCAGCCT C/- CCAAGTAGCT 3037 het 956 hom 11 2 7 2 C 3 2 46669 CASAVA_Build 1 91729423 2I CTCTTTAAAC --/TG TGCTACAGGA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 TG 1 2 46670 CASAVA_Build 1 91729903 13D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAG 3070 het 2602 hom 22 10 10 2 A 22 9 46671 CASAVA_Build 1 91740032 2D GCAACAATTC TG/-- TGTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 TG 2 1 46672 CASAVA_Build 1 91745740 7D CTACAGTAAC AATGTAT/------- CTCTTAGTAT 2658 het 2658 ref 27 17 6 4 AATGTAT 1 0 46673 CASAVA_Build 1 91751552 2I CTTATAATTT --/AA AAAAAACTTT 3070 het 318 hom 26 3 18 5 A 6 8 46674 CASAVA_Build 1 91757207 1D CCCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 1218 het 1218 ref 14 9 3 3 A 15 14 46675 CASAVA_Build 1 91760160 3D AAACACAAAA ATT/--- AGTTGGGCAT 3070 het 3070 hom 28 9 10 10 ATT 1 0 46676 CASAVA_Build 1 91763577 2I AGATAATGAA --/GT GTAGGCAAAG 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 GT 1 2 46677 CASAVA_Build 1 91770708 1D17M4D ACTCAAATAC AAATCATTTTCCTGCTGCTGGG/-AATCATTTTCCTGCTGC---- TAAGTCATGC 3070 het 3070 ref 58 53 12 3 N/A 0 0 46678 CASAVA_Build 1 91771026 1I TAATTGCTTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 8 9 46679 CASAVA_Build 1 91792573 1D TCACACTCCA G/- GGGGGGAAAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 5 G 7 6 46680 CASAVA_Build 1 91795849 1D ACTCAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 19 8 A 13 12 46681 CASAVA_Build 1 91796630 3D TTTTTTGCTT TTA/--- TTATTATTGA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 TTA 3 2 46682 CASAVA_Build 1 91802028 1I GGTAAATAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 101 het 43 0 33 10 A 9 10 46683 CASAVA_Build 1 91814382 4D AAAGGAAAAT AAAC/---- AGACTTTAGA 3070 het 3070 ref 40 19 17 7 AAAC 1 0 46684 CASAVA_Build 1 91819860 1I TTATAAAAAG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 7 8 46685 CASAVA_Build 1 91828109 1I AAGGCCGGTG -/A AATTTTTTTT 2478 het 2056 hom 20 9 9 2 A 2 3 46686 CASAVA_Build 1 91834575 1I CGAATATCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 10 11 46687 CASAVA_Build 1 91838611 1D CATGTTGGTT G/- GGCTGGGTTC 3070 het 3070 hom 32 10 15 9 G 3 2 46688 CASAVA_Build 1 91843396 3D TGCCCTTACT GCG/--- GGGGGGGAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 GCG 1 0 46689 CASAVA_Build 1 91847513 1I GAGCCATGTG -/T GTGTGTACAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 0 1 46690 CASAVA_Build 1 91848467 7D CTACATATGT TCTCTAA/------- TCTCTAATAT 3070 hom 111 het 46 0 38 9 TCTCTAA 2 1 46691 CASAVA_Build 1 91850946 3I ATTTCCCCAA ---/GAT GATGACATAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 GAT 1 2 46692 CASAVA_Build 1 91853093 1I ACAGGAAAGA -/T GCTACCTTCT 3070 hom 107 het 39 0 35 4 T 0 1 46693 CASAVA_Build 1 91853807 2I AATTTCTCTC --/TG TATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 TG 0 1 46694 CASAVA_Build 1 91855522 1D TCTGAAGGAG C/- CTGAACTTCA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 C 2 1 46695 CASAVA_Build 1 91859829 1I TCTTCTCTTG -/T CACTGCCATG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 0 1 46696 CASAVA_Build 1 91864353 1D TGTTTTTTAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 T 8 7 46697 CASAVA_Build 1 91867325 4D AAGAAGTAAA ACTC/---- ACTATTTCAG 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 ACTC 1 0 46698 CASAVA_Build 1 91868223 1D CAAGAAATTG A/- AAAAAAAAAA 1106 het 1106 ref 46 20 9 18 A 13 12 46699 CASAVA_Build 1 91868237 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 1620 het 1620 ref 45 20 11 14 A 9 8 46700 CASAVA_Build 1 91868802 1I TAAGATGGCT -/A AAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 4 5 46701 CASAVA_Build 1 91869304 1D GCCTAGGGCT G/- GGGGGATTGG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 6 5 46702 CASAVA_Build 1 91877006 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 19 1 14 4 A 13 14 46703 CASAVA_Build 1 91894732 4I TCAGTCTTAG ----/AATC AATCTAGTCC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 AATC 1 2 46704 CASAVA_Build 1 91895668 2I AGTGAAGAGA --/AC ACAGGAGAAG 3070 hom 94 het 36 0 31 5 AC 1 2 46705 CASAVA_Build 1 91897544 1D TGGCTGCCTC T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 109 het 52 0 32 20 T 8 7 46706 CASAVA_Build 1 91897929 1D GACTTCAAGT G/- TCTCTCCTAG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 1 0 46707 CASAVA_Build 1 91911800 1I TATCTCATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 33 1 23 9 A 11 12 46708 CASAVA_Build 1 91913148 1D ACTATTCCTA T/- GCTAATATCA 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 T 1 0 46709 CASAVA_Build 1 91914635 1I AACAGAACTC -/T TGACTGTCCC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 1 2 46710 CASAVA_Build 1 91917156 1I TAAATCGGTA -/T TTCTTATATT 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 T 2 3 46711 CASAVA_Build 1 91918006 4D CAGTGGTTTG AAGA/---- AAGAGACATT 3070 het 3070 hom 42 18 20 6 AAGA 2 1 46712 CASAVA_Build 1 91924753 6I TTGACAGATT ------/AAGAAA AAGTTTTTTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AAGAAA 0 1 46713 CASAVA_Build 1 91943371 1D GTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2060 het 2060 ref 32 14 7 11 T 17 16 46714 CASAVA_Build 1 91943697 1D CAAATGACTA T/- TCCAATTCAC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 2 1 46715 CASAVA_Build 1 91960646 1D AAACTTTCCC T/- TTTTTTTACT 3070 hom 166 het 63 0 56 7 T 8 7 46716 CASAVA_Build 1 91982723 1I AATCAATGTC -/A AAGAAAACAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 2 3 46717 CASAVA_Build 1 91983163 2D ACGCACGCGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 43 0 31 16 AC 8 7 46718 CASAVA_Build 1 92001079 1D AACACTACCT C/- CCTATCTCTC 3070 het 3070 ref 50 27 20 3 C 3 2 46719 CASAVA_Build 1 92020901 1I CGACCTTTTG -/T TGCTCAGGCC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 1 2 46720 CASAVA_Build 1 92021423 1D TGGTTCAGGT G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 G 2 1 46721 CASAVA_Build 1 92032359 1I CCTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 G 0 1 46722 CASAVA_Build 1 92041685 1I TCTGAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 9 11 T 12 13 46723 CASAVA_Build 1 92064890 2I ATCCACTATT --/AA AAAAAAAAAA 2783 het 278 hom 30 2 18 10 A 14 16 46724 CASAVA_Build 1 92069594 1I AGGTTTACCA -/T TTCCCAGAAA 3070 het 3070 ref 41 32 9 0 T 2 3 46725 CASAVA_Build 1 92070515 1I TAAATTTGCA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 46726 CASAVA_Build 1 92071925 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 13 12 46727 CASAVA_Build 1 92074578 7D AGGAGTACAC TGTAAAA/------- TGTAGCAAAC 3070 hom 54 het 21 0 18 5 TGTAAAA 1 0 46728 CASAVA_Build 1 92075952 5D TCATGAAAAC TTCTA/----- TTCTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 6 TTCTA 1 0 46729 CASAVA_Build 1 92078961 1D GTTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 12 11 46730 CASAVA_Build 1 92080245 1D AGACTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1393 hom 16 4 12 0 A 11 10 46731 CASAVA_Build 1 92084737 1D CCTGAAGACA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 24 16 4 T 8 7 46732 CASAVA_Build 1 92114161 1I GGAAACCAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 9 46733 CASAVA_Build 1 92118066 2D CCTTCCAAGC TG/-- TGTTGATTTA 3070 hom 77 het 29 0 26 3 TG 2 1 46734 CASAVA_Build 1 92129049 1D TCATATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 36 0 30 6 T 12 11 46735 CASAVA_Build 1 92136190 2D TTTTCAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 13 11 46736 CASAVA_Build 1 92136510 4D AAAACAAAAC AAAT/---- AAATAAAAAC 3070 hom 138 het 50 0 47 4 AAAT 2 1 46737 CASAVA_Build 1 92139894 1I CCTGGTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 747 hom 35 5 25 5 A 14 15 46738 CASAVA_Build 1 92145462 4D TATGCCATAA ATAT/---- ATATACCTAC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AT 4 2 46739 CASAVA_Build 1 92148450 11D AAAAAAAAAA TATATATATAT/----------- ATATATATAT 883 hom 10 het 4 0 4 0 TATATATATAT 1 0 46740 CASAVA_Build 1 92151004 1I TTAATATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 324 hom 43 1 38 4 A 10 11 46741 CASAVA_Build 1 92155070 1D CTTTTATACA T/- TTTAGGGAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 4 3 46742 CASAVA_Build 1 92170183 1D CTGGAGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 10 9 46743 CASAVA_Build 1 92171445 1D27M1I CTTTAAAAAA TTTTTTTTTCTTTCTAAATAATAGAGAT-/-TTTTTTTTCTTTCTAAATAATAGAGATG GGGGGGTCGC 3070 hom 66 het 24 0 22 5 N/A 0 0 46744 CASAVA_Build 1 92172097 1D ATCTATCTCC T/- TTTTTTTATC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 8 7 46745 CASAVA_Build 1 92175816 2D AGACCCTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 34 0 24 10 A 13 11 46746 CASAVA_Build 1 92179864 6D AGTCGGAGGT GGAGGC/------ GGAGGCGGAG 3070 hom 41 het 24 0 14 11 GGAGGC 5 4 46747 CASAVA_Build 1 92180196 1I TTGTGAGAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 62 het 25 0 20 5 T 9 10 46748 CASAVA_Build 1 92181253 1I ACCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1624 hom 21 4 12 5 A 11 12 46749 CASAVA_Build 1 92184319 1I AGAGACGGGG -/T TTCACCATGT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 2 3 46750 CASAVA_Build 1 92189184 1D AAAAAAAAAA G/- AGATGGTCCT 3024 hom 61 het 36 0 19 17 G 1 0 46751 CASAVA_Build 1 92190713 1I TAAAGGAGAC -/T TGACAAAGTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 1 2 46752 CASAVA_Build 1 92193951 3D GCAGAGAGTT CAC/--- CACTGAGAAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 CAC 2 1 46753 CASAVA_Build 1 92194453 1D GTTCTTCCTG C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 16 het 32 1 21 10 C 9 8 46754 CASAVA_Build 1 92195638 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 A 13 12 46755 CASAVA_Build 1 92197565 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2956 hom 31 het 31 0 11 20 T 17 16 46756 CASAVA_Build 1 92199774 2I ACTCCATCTC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 AG 7 8 46757 CASAVA_Build 1 92200428 1D GCCATTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 32 1 29 2 T 13 12 46758 CASAVA_Build 1 92218475 9D ACCGCACTCC CACCTGGGT/--------- GACAGAGCAA 3070 hom 78 het 29 0 26 5 CACCTGGGT 1 0 46759 CASAVA_Build 1 92225085 1D CTTTTATAAA T/- TCTTTTTTTT 3070 hom 91 het 35 0 30 5 T 2 1 46760 CASAVA_Build 1 92229998 3I TTAGCCGGGC ---/GTG ATGGCGCCAT 1601 hom 15 het 6 0 5 1 GTG 0 1 46761 CASAVA_Build 1 92247871 5D TTTTTTTATT TTTTA/----- TTTTATTTAT 3070 het 2257 hom 19 8 11 0 TTTTA 2 1 46762 CASAVA_Build 1 92252760 2I GAAGAGTATG --/AC TTTTCTAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AC 0 1 46763 CASAVA_Build 1 92253842 5D AGTTATCTTG ACTTC/----- ACTTATTTTT 3070 het 3070 ref 33 20 11 5 ACTTC 1 0 46764 CASAVA_Build 1 92258403 2D AGAACTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 T 13 11 46765 CASAVA_Build 1 92258733 1I CTATGAGAAA -/T TTTATAATTA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 3 4 46766 CASAVA_Build 1 92263322 1I AACTATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 10 11 46767 CASAVA_Build 1 92265434 1D TATCCACACG T/- TTTTTTTTTT 1727 het 1727 ref 47 31 6 10 T 12 11 46768 CASAVA_Build 1 92272791 1D AAGACGCTTC T/- TTTTTTTTTT 2434 het 750 hom 17 2 13 2 T 17 16 46769 CASAVA_Build 1 92335328 1I TCCACAGAAA -/T TTTCTTCTGT 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 T 3 4 46770 CASAVA_Build 1 92355498 1D GATTATTAAA G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 G 2 1 46771 CASAVA_Build 1 92357048 2I TGTGTGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 TG 8 9 46772 CASAVA_Build 1 92360411 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 19 2 9 8 T 12 11 46773 CASAVA_Build 1 92364652 2I TCCTCAATCC --/GT TCTTCACTCA 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 GT 0 1 46774 CASAVA_Build 1 92372275 8D CACTTCTGTG AAGGAACT/-------- CCACTTGTTT 3070 het 3070 ref 38 25 12 2 AAGGAACT 1 0 46775 CASAVA_Build 1 92377804 2D TTTATTAGAC TT/-- AAATTTAGAA 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 T 2 0 46776 CASAVA_Build 1 92378406 1I TTCTTGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 9 10 46777 CASAVA_Build 1 92384361 1I CTTGACAGCC -/A AAAGAGTTCA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 3 4 46778 CASAVA_Build 1 92388449 1D TGAGCTATAC A/- TACATTTCAG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 1 0 46779 CASAVA_Build 1 92391274 1D ATTAATAGTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 T 8 7 46780 CASAVA_Build 1 92396512 1I ATATACTAAA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 7 8 46781 CASAVA_Build 1 92406461 19D TCTAGATATA AAATGTATATTTTAGATAT/------------------- AAATGTATAT 3070 het 3070 ref 25 13 11 4 AAATGTATATTTTAGATAT 1 0 46782 CASAVA_Build 1 92406546 1D TTTTCTCTTC A/- AAAAATCATA 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 A 6 5 46783 CASAVA_Build 1 92409018 4I ATTTTGAAGA ----/TTGT TTCTTATTTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 TTGT 0 1 46784 CASAVA_Build 1 92412772 1I TAGAGAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 T 10 11 46785 CASAVA_Build 1 92426110 1I CTGCATCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 A 9 10 46786 CASAVA_Build 1 92426420 1D AATAAGGGAG A/- ATTGTTAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 2 1 46787 CASAVA_Build 1 92436746 3D CTAGTTAATA AAG/--- AAGTACAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 AAG 2 1 46788 CASAVA_Build 1 92438904 5I AAAATTACTT -----/AAAAC AATGGGGTTA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 AAAAC 0 1 46789 CASAVA_Build 1 92442676 1D AAGATTGACC A/- AAAAAAAAAA 2817 het 1945 hom 42 14 13 15 A 17 16 46790 CASAVA_Build 1 92442752 1I AAAGAACCAG -/A ACAGCTTGTC 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 A 1 2 46791 CASAVA_Build 1 92445518 3D TTTGTTGAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 17 25 10 T 15 12 46792 CASAVA_Build 1 92448572 1I TTTTTTTTTT -/G ATCTTGCAGT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 G 0 1 46793 CASAVA_Build 1 92453371 2D TGTTTTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 24 1 11 13 T 13 11 46794 CASAVA_Build 1 92453942 52D CTTGCGGCAC TCCAAGCAAGATTAAAAGGTTGGGTTTTGAGGAAGAACCAATAAGGATGCTG/---------------------------------------------------- ATAAATGGCC 3070 het 3070 ref 37 25 23 6 TCCAAGCAAGATTAAAAGGTTGGGTTTTGAGGAAGAACCAATAAGGATGCTG 1 0 46795 CASAVA_Build 1 92454873 1I GCAGAATCTG -/T GCATATAGAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 0 1 46796 CASAVA_Build 1 92460542 2D CATGTATAAC AT/-- ATGTATGCTG 3070 het 3070 hom 34 13 18 6 AT 2 1 46797 CASAVA_Build 1 92468210 3D GTATGGTGCA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 51 29 16 8 TTG 4 3 46798 CASAVA_Build 1 92470296 2D GGTACATGTG CA/-- CAGTGTGCAG 3070 het 2278 hom 15 5 10 1 CA 2 1 46799 CASAVA_Build 1 92477896 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1237 het 1237 ref 28 19 3 8 A 13 12 46800 CASAVA_Build 1 92480589 2I ACTACTACAA --/AC ACAGTCCATA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AC 1 2 46801 CASAVA_Build 1 92482278 2I TGGTATACTT --/AC AGTTATTTTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AC 0 1 46802 CASAVA_Build 1 92485187 2D AAAAGGAAAG AA/-- AAGAAAATTT 3070 het 3070 hom 43 20 20 5 A 4 2 46803 CASAVA_Build 1 92485450 2D ATAAGCAAAC AG/-- AATGAAATAT 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 AG 1 0 46804 CASAVA_Build 1 92488445 2D TCACTTAAAC AA/-- TATAATTTTT 3070 het 3070 hom 51 25 25 4 A 2 0 46805 CASAVA_Build 1 92491342 1I ATGGAAATTG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 9 46806 CASAVA_Build 1 92499086 1I ATCTGCTGCC -/T TTTGTATTAC 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 T 3 4 46807 CASAVA_Build 1 92503479 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACTAG 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 C 0 1 46808 CASAVA_Build 1 92517240 7I TGTCTCTTGC -------/ATTTAGT ATGTCCTAAC 3070 hom 51 het 39 1 32 6 ATTTAGT 0 1 46809 CASAVA_Build 1 92525832 2I GAAGCTAAAA --/AT ATAGTATTAG 2907 het 2907 ref 22 13 7 2 AT 1 2 46810 CASAVA_Build 1 92530385 14I CACTACCCTC --------------/CTAGAGTTTACATT CTAGAGTCCT 3070 het 3070 ref 37 24 10 4 CTAGAGTTTACATT 0 1 46811 CASAVA_Build 1 92538787 1D TTCTGGTTCT A/- AAAAGGCAAG 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 A 5 4 46812 CASAVA_Build 1 92550564 1D ACCGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 32 3 22 8 A 15 14 46813 CASAVA_Build 1 92561006 4I TGGGCAACAC ----/AGTG AGACTTTGTC 2908 hom 15 het 6 0 6 0 AGTG 0 1 46814 CASAVA_Build 1 92565627 3I TAGCTACTTC ---/TGT TCACTTTTGG 1401 het 1401 ref 29 21 3 5 TGT 0 1 46815 CASAVA_Build 1 92581883 7D AGAAACAACA ATTATAT/------- ATTAGAAGGC 3070 het 3070 hom 43 18 22 6 ATTATAT 1 0 46816 CASAVA_Build 1 92587116 6D ACATGCACAT ATAAAG/------ AGAAAGGACG 3070 het 3070 ref 32 18 11 7 ATAAAG 1 0 46817 CASAVA_Build 1 92590594 1D CAGCAGGCTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 23 0 19 6 T 9 8 46818 CASAVA_Build 1 92598148 1D AGTCTGGTAA T/- TTGGTAGTGT 3070 hom 126 het 46 0 43 4 T 3 2 46819 CASAVA_Build 1 92599996 5I CGTAACTGTT -----/TTCTC TTCTGTGGAC 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 TTCTC 0 1 46820 CASAVA_Build 1 92603540 1I GGGAGGTTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 A 7 8 46821 CASAVA_Build 1 92611340 1D TGAGGATGGA T/- TTTTAGAGGG 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 T 5 4 46822 CASAVA_Build 1 92637580 2I CAAAAATAAG --/AT AGCAATAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 AT 0 1 46823 CASAVA_Build 1 92639181 1D AAAGCCTCTA T/- AAAGCCATCA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 1 0 46824 CASAVA_Build 1 92661127 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 2998 hom 24 het 10 0 9 3 A 10 9 46825 CASAVA_Build 1 92675301 1I AATCGATTGA -/T TCCCCCCGCC 3070 het 3036 hom 23 8 13 2 T 1 2 46826 CASAVA_Build 1 92676934 4D ACAGTTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 TTTG 5 4 46827 CASAVA_Build 1 92683875 7D GTAGCTGGGA CTACAGG/------- CTACAGGCAC 3070 hom 36 het 13 0 13 1 CTACAGG 2 1 46828 CASAVA_Build 1 92689321 4I TTTAATGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TTTG 2 3 46829 CASAVA_Build 1 92706108 1D GTCTCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 2831 het 2581 hom 23 8 8 7 A 11 10 46830 CASAVA_Build 1 92709941 3D AATTATATTT TTA/--- TTATATTAAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TTA 2 1 46831 CASAVA_Build 1 92710982 1I TCAAATTAGC -/T GCTGAAAGAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 0 1 46832 CASAVA_Build 1 92720570 1I TTTCGTCCTG -/C CCCCCTCCCT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 5 6 46833 CASAVA_Build 1 92725732 1D AAATTGTTAT G/- GGGGGGGAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 8 7 46834 CASAVA_Build 1 92727240 1D TTGAGACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 32 1 24 7 A 12 11 46835 CASAVA_Build 1 92728573 1D GTTTTTACTA T/- TTTAAGTAAT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 4 3 46836 CASAVA_Build 1 92730716 1D GATGCTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 27 3 T 10 9 46837 CASAVA_Build 1 92744063 1D CAGGTTTTAC T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 7 6 46838 CASAVA_Build 1 92744279 1D ATGCCTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 12 11 46839 CASAVA_Build 1 92751311 1D AAACAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 11 10 46840 CASAVA_Build 1 92752270 2D TTCTATGTGT TA/-- TATATAATGG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TA 4 3 46841 CASAVA_Build 1 92755030 1D CCTTTCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 29 1 20 8 A 13 12 46842 CASAVA_Build 1 92756801 1I GGGATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 35 4 18 13 A 13 14 46843 CASAVA_Build 1 92764213 1D ATTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 196 hom 28 1 20 7 T 9 8 46844 CASAVA_Build 1 92769398 4D GAGTGAAAAG AAAC/---- AAACAAAGCC 3070 hom 24 het 13 0 9 4 AAAC 2 1 46845 CASAVA_Build 1 92770259 1I AATGGAAAGC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 8 9 46846 CASAVA_Build 1 92775488 1I GAGCTATAGC -/T TTTTTGAGCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 5 6 46847 CASAVA_Build 1 92789428 1D CGCCTCTGCC T/- TCCCTAAGTG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 2 1 46848 CASAVA_Build 1 92796483 2I ATTTCAGACT --/CA CATATCCACT 3070 hom 75 het 31 0 24 7 CA 1 2 46849 CASAVA_Build 1 92800832 4D ATTTACTGTT TTTG/---- TTTATGTTTT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 TTTG 1 0 46850 CASAVA_Build 1 92802828 1D CAGATAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 30 3 18 9 T 17 16 46851 CASAVA_Build 1 92810892 1I TGATGGGTTC -/A GGGGGTGTTC 3070 hom 122 het 46 0 41 5 A 0 1 46852 CASAVA_Build 1 92816488 1D CTAAATCCTC T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 8 7 46853 CASAVA_Build 1 92818786 4I AATTTTGTGT ----/TTTC TTTATCTTGC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TTTC 0 1 46854 CASAVA_Build 1 92819839 2I GTTTTTGCTT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 29 2 14 13 TA 0 1 46855 CASAVA_Build 1 92819931 9D TTTATTTAAA TAAAGTATG/--------- TAAAGGAATC 3070 hom 87 het 30 0 30 2 TAAAGTATG 1 0 46856 CASAVA_Build 1 92820960 3D ATAAAATATT ATA/--- ATGATAATCA 3070 hom 102 het 35 0 35 1 ATA 1 0 46857 CASAVA_Build 1 92825534 2D CTTCAGGGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 33 4 17 12 A 18 16 46858 CASAVA_Build 1 92838544 1D CATACAATGT A/- ACTTTGTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 2 1 46859 CASAVA_Build 1 92839732 6D GAACCTTAAG TGAAAT/------ TGAAATAAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 7 TGAAAT 2 1 46860 CASAVA_Build 1 92842534 2D TGTGTTAAAA AC/-- TAAGATATTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AC 1 0 46861 CASAVA_Build 1 92846867 1I AAAGGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1049 hom 49 3 40 8 A 10 11 46862 CASAVA_Build 1 92847541 14I CTCACTTTGT --------------/TGCTCAGGCTGGAG TGCTCAGGCT 3070 hom 48 het 24 0 17 8 TGCTCAGGCTGGAG 1 2 46863 CASAVA_Build 1 92849272 1I ATAAATCCCC -/A CCAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 0 1 46864 CASAVA_Build 1 92853002 15D TATATATATA TATATATATATATAT/--------------- ATATATATAT 2984 hom 15 het 7 0 6 1 TATATATATATATAT 1 0 46865 CASAVA_Build 1 92860278 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 11 12 46866 CASAVA_Build 1 92861227 1I AAAGCTGTGT -/A TTTCATCTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 46867 CASAVA_Build 1 92870197 1D GGTGGATAAG C/- TTTTTGATGT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 1 0 46868 CASAVA_Build 1 92875979 1I CCCAGTTACC -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 7 8 46869 CASAVA_Build 1 92880962 1I AAGTACTTCC -/T TAGTATGAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 2 46870 CASAVA_Build 1 92882067 2D AAAGAAAAAA AG/-- AGAAAGATTC 3070 hom 138 het 50 0 47 4 AG 2 1 46871 CASAVA_Build 1 92888611 2D GTGAATGGAC TT/-- TTTTTCTTAA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 7 5 46872 CASAVA_Build 1 92893486 1D CTTATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 11 10 46873 CASAVA_Build 1 92909178 1D CTCCTATCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 10 9 46874 CASAVA_Build 1 92928496 1D CCAATGATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 278 hom 34 2 15 17 T 15 14 46875 CASAVA_Build 1 92940108 2I AAGATATTAC --/TG TATGTTATTT 802 hom 10 het 12 0 4 8 TG 0 1 46876 CASAVA_Build 1 92940958 1I TCTCAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 20 3 G 0 1 46877 CASAVA_Build 1 92948898 2D AGATTGGGGT TG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 37 het 27 0 16 13 TG 1 0 46878 CASAVA_Build 1 92960190 4I TGTCCCACTA ----/TTTT TTTTAATTAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 4 8 46879 CASAVA_Build 1 92966139 1D24M1I ACCCTGTCTC AAAAAAAAAAAAGTTAAAGATAAAC-/-AAAAAAAAAAAGTTAAAGATAAACA AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 7 N/A 0 0 46880 CASAVA_Build 1 92971552 1I CATTATCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 22 1 11 10 T 14 15 46881 CASAVA_Build 1 92972624 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 10 9 46882 CASAVA_Build 1 92972843 1D AAACTTCTGC T/- TTTTGAAAGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 5 4 46883 CASAVA_Build 1 92975767 1I GTACACACAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 33 hom 45 1 34 10 A 9 10 46884 CASAVA_Build 1 92981936 1D TTTCAATGCC T/- TTTAAAAGAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 4 3 46885 CASAVA_Build 1 92985040 1D ACTCTGGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 23 1 13 9 A 15 14 46886 CASAVA_Build 1 92992678 4D AGCTTGCAGA CAAG/---- ATCTTGGCTA 3070 hom 81 het 31 0 28 6 CAAG 1 0 46887 CASAVA_Build 1 92993217 2I ACATAGGTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 43 5 24 14 TG 0 1 46888 CASAVA_Build 1 92995544 1I TTTGAAGAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 416 hom 32 1 29 2 T 9 10 46889 CASAVA_Build 1 92996717 1I CCTGTCTCAC -/A AAAAAAAAAA 2535 het 825 hom 31 3 15 13 A 16 17 46890 CASAVA_Build 1 92999790 1D TTCCAGTAAG A/- TTTTTTTAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 0 46891 CASAVA_Build 1 93006293 1D ATATAACAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 29 0 21 10 A 10 9 46892 CASAVA_Build 1 93009754 4D TTTTCTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 31 0 22 9 T 16 12 46893 CASAVA_Build 1 93012177 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 20 7 A 13 12 46894 CASAVA_Build 1 93016055 1D TGCCAAAATC T/- TTTTTTTTTT 2842 het 1058 hom 40 9 10 21 T 17 16 46895 CASAVA_Build 1 93018593 1I CACAGCCCAC -/T TTTCTTTGCC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 3 4 46896 CASAVA_Build 1 93021517 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2670 hom 19 het 10 0 7 3 A 13 14 46897 CASAVA_Build 1 93022696 4D CCGAAGCTGC TCCG/---- TCCCTCCACC 2561 hom 28 het 11 0 9 2 TCCG 1 0 46898 CASAVA_Build 1 93025714 1D CTATCTTTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 A 10 9 46899 CASAVA_Build 1 93026123 2I TCTAGAAAAG --/AC AAAATTAATC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AC 0 1 46900 CASAVA_Build 1 93040699 1I CGCCACCATG -/C CTGGCTAATT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 1 2 46901 CASAVA_Build 1 93047013 1D TTCCCTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 606 hom 50 2 35 13 T 13 12 46902 CASAVA_Build 1 93055209 1D TCTATTATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 10 9 46903 CASAVA_Build 1 93080757 1I TCTTGCACTT -/A ACAGTCCCAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 46904 CASAVA_Build 1 93089719 1D TTCTGGTTTT A/- AAATAAATAA 2096 hom 21 het 11 0 8 3 A 4 3 46905 CASAVA_Build 1 93135802 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 10 9 46906 CASAVA_Build 1 93136243 24D GACTCCATCT CAAAAAAAACAAAAAACAAACAAA/------------------------ CAAAAAAAAC 3070 hom 40 het 9 0 11 5 CAAAAAAAACAAAAAACAAACAAA 1 0 46907 CASAVA_Build 1 93138198 4I TTTTTAGAAT ----/TCTG TCTTTGTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCTG 0 1 46908 CASAVA_Build 1 93138457 1I TCATTCTTAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 136 hom 28 1 26 1 T 8 9 46909 CASAVA_Build 1 93139027 1D CTTTTTCATG T/- TTTTTTTTTT 1664 het 1664 ref 45 33 5 8 T 11 10 46910 CASAVA_Build 1 93167760 1D GATTGAGTTT A/- ATCTTTTCTT 3070 hom 102 het 39 0 34 7 A 2 1 46911 CASAVA_Build 1 93178097 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 496 hom 25 2 20 3 A 10 11 46912 CASAVA_Build 1 93179141 33D GAGAGTTCTT TGTATATTCCAGATACTAGTCCTTTGTGAGATA/--------------------------------- TGTGATTTGC 3070 hom 67 het 21 0 22 4 TGTATATTCCAGATACTAGTCCTTTGTGAGATA 1 0 46913 CASAVA_Build 1 93191402 3D AAAAAAAGAA AAG/--- AAGTGCAGAC 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AAG 2 1 46914 CASAVA_Build 1 93204159 1D GAGTTCAGAA T/- AGGTGATGTG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 1 0 46915 CASAVA_Build 1 93219972 1D TGCCCAGCCC A/- AATTTTCTTT 3070 het 1603 hom 12 4 7 1 A 3 2 46916 CASAVA_Build 1 93222546 4D GTCTGCCTGC CTGA/---- CTATCATCTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 8 CTGA 1 0 46917 CASAVA_Build 1 93251924 2I GTGGGAAGAA --/CT CTGTGCTATA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 CT 1 2 46918 CASAVA_Build 1 93258396 1D CAATTTGAGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 8 46919 CASAVA_Build 1 93264607 2D5M2I AGCAGATTTG GTAACTT--/--TACGTCC CTGATAAACC 3070 het 3070 ref 41 20 17 7 N/A 0 0 46920 CASAVA_Build 1 93265149 1I TGCCTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 24 2 15 7 A 13 14 46921 CASAVA_Build 1 93265814 1D GAGGCTCTGT G/- GACAAGAAAG 3070 het 3070 hom 42 20 17 6 G 2 1 46922 CASAVA_Build 1 93268152 1D TAAAGTTCTT A/- GGACAATGCT 3070 het 3070 ref 36 25 10 1 A 1 0 46923 CASAVA_Build 1 93270326 2I AAAAGCAGAA --/AT ATGTTTTTGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 1 2 46924 CASAVA_Build 1 93279582 1D AAATTAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2511 hom 24 7 9 8 T 12 11 46925 CASAVA_Build 1 93279756 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTATT 2158 hom 15 het 7 0 6 1 T 7 8 46926 CASAVA_Build 1 93279983 1I AAGTAATTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 T 9 10 46927 CASAVA_Build 1 93283636 1D TGAAAAAAAG A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 7 46928 CASAVA_Build 1 93289739 1I GAAAAAAAAA -/C ACACAAAGTC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 C 0 1 46929 CASAVA_Build 1 93290953 4D GGTGGAAGAC AGAG/---- AGAGTGGGGA 3070 het 3070 ref 44 22 10 12 AG 4 2 46930 CASAVA_Build 1 93301758 1I CCTGGCTAAC -/A TGGTGAAACT 1413 het 1136 hom 8 3 3 2 A 0 1 46931 CASAVA_Build 1 93305431 1D ACCCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1171 het 1171 ref 24 12 4 9 A 13 12 46932 CASAVA_Build 1 93312133 1D ATTTTTAACA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 T 9 8 46933 CASAVA_Build 1 93312852 1I ATAAACTTCT -/A GAAGAAAACA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 0 1 46934 CASAVA_Build 1 93326087 1D ATATGAATGC T/- TTTGAGAAAG 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 4 3 46935 CASAVA_Build 1 93330913 1D ATTCTTTCAG T/- ATAGTTATAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 1 0 46936 CASAVA_Build 1 93343813 2I GAATGTTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 TG 7 8 46937 CASAVA_Build 1 93344587 1D ATGATTGATT A/- ATTGTTCAGG 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 2 1 46938 CASAVA_Build 1 93344666 2D ACTTAAAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 16 0 11 5 T 16 14 46939 CASAVA_Build 1 93345855 1D TTAATTACCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 10 9 46940 CASAVA_Build 1 93350536 4D AATTTTACAT AAAG/---- AAAAATATTA 3070 het 3070 ref 23 14 8 3 AAAG 1 0 46941 CASAVA_Build 1 93352206 1I TTGTTCTGCT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 8 9 46942 CASAVA_Build 1 93354382 1D TTAAAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 T 11 10 46943 CASAVA_Build 1 93364304 1D ATTTAACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 T 12 11 46944 CASAVA_Build 1 93364627 1D TGGAAGCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 T 12 11 46945 CASAVA_Build 1 93365969 1I TTATTTTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 43 0 33 10 T 9 10 46946 CASAVA_Build 1 93368722 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2890 hom 22 8 10 4 A 12 11 46947 CASAVA_Build 1 93375264 1I TATCTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2863 het 1127 hom 25 6 13 6 A 14 15 46948 CASAVA_Build 1 93375772 2I ATATACACAC --/AT GTGTATATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 0 1 46949 CASAVA_Build 1 93387298 3I CAGAACTTGT ---/GAA GAAGGATTTG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GAA 1 2 46950 CASAVA_Build 1 93397823 1I AGGTCTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 12 13 46951 CASAVA_Build 1 93401299 4D TCAAAGAATT ACTC/---- AAGGATACCC 3052 het 3052 ref 23 15 7 1 ACTC 1 0 46952 CASAVA_Build 1 93407740 1I ATCAACGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 773 hom 31 3 22 6 A 11 12 46953 CASAVA_Build 1 93411432 2D GTATCAAAAC AT/-- CACGCTATAC 3070 het 3070 hom 37 13 20 5 AT 1 0 46954 CASAVA_Build 1 93422751 2D TGGTCTGAAA CT/-- CTCTTCCTTT 3070 het 3070 hom 52 23 27 2 CT 3 2 46955 CASAVA_Build 1 93429234 2D AGCAAGGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 37 3 15 20 T 16 14 46956 CASAVA_Build 1 93434512 4D TCAGATAAAT ACTC/---- ACCAAAGCAA 3070 het 3070 ref 30 16 14 3 ACTC 1 0 46957 CASAVA_Build 1 93439830 5I TTGTTTTGTG -----/TTATA TTTTATTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTATA 0 1 46958 CASAVA_Build 1 93444270 1D AAAACTAACA C/- CCATCAACTT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 C 3 2 46959 CASAVA_Build 1 93446183 1D GACATTTGGA T/- TGTTTCCACT 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 T 2 1 46960 CASAVA_Build 1 93446484 1I TTTTTGTTTG -/T TTTGTTTTTT 1608 het 1608 ref 26 8 11 7 T 3 4 46961 CASAVA_Build 1 93451555 1D ATTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2909 het 2909 ref 35 15 10 11 T 13 12 46962 CASAVA_Build 1 93459435 4I CTCCAGCATC ----/TGTT TGTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 TGTT 1 2 46963 CASAVA_Build 1 93477315 1I67M1D GAGAATTTTT -AAAAATAGGTGATTTAAAATTCCAACTAGATATTTTGCTGATATTTGTCCTTATATAACTTGCAGGCT/AAAAAATAGGTGATTTAAAATTCCAACTAGATATTTTGCTGATATTTGTCCTTATATAACTTGCAGGC- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 37 31 26 1 N/A 0 0 46964 CASAVA_Build 1 93502258 1D GGTGGGAGAC A/- AGAGAGCAAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 2 1 46965 CASAVA_Build 1 93511104 2I CTTGGATAAA --/AG AAGGGGCAGT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 AG 0 1 46966 CASAVA_Build 1 93519914 1I AGTAGATGTC -/A AAAAATGAGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 5 6 46967 CASAVA_Build 1 93530376 11I ATACCCATCG -----------/TACCCATACTA TACCAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 TACCCATACTA 0 1 46968 CASAVA_Build 1 93537540 2D TTGGCCTTAC TT/-- AGTACAGTAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 2 0 46969 CASAVA_Build 1 93552106 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1277 het 1277 ref 20 14 3 3 A 13 12 46970 CASAVA_Build 1 93572882 4I TTGCTATGTT ----/ACTC AGGCTGAAGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 ACTC 0 1 46971 CASAVA_Build 1 93574800 2I TCCAAATTAG --/CT CTGGAGGATG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 CT 1 2 46972 CASAVA_Build 1 93578667 1D TGAAAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 24 10 A 15 14 46973 CASAVA_Build 1 93579851 1D CCAAATGCCT C/- TAATTTGTTT 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 C 1 0 46974 CASAVA_Build 1 93580004 4D TTAAACATTA TTGT/---- TTATGTCATC 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 TTGT 1 0 46975 CASAVA_Build 1 93583267 1I GCTCTAACAC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 6 7 46976 CASAVA_Build 1 93585732 1D TTTATGCAAG T/- TTTTTTTTTA 1615 het 1615 ref 41 31 4 6 T 10 9 46977 CASAVA_Build 1 93591037 5D GGTGTGTGAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2413 het 2114 hom 25 10 7 9 T 21 16 46978 CASAVA_Build 1 93596469 1I TCTGTTGCCA -/G TATGGGGCTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 46979 CASAVA_Build 1 93602928 1I AGGAAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 2578 het 1543 hom 23 8 9 6 T 15 16 46980 CASAVA_Build 1 93605295 7D ACCCTGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 640 hom 18 4 11 7 A 17 10 46981 CASAVA_Build 1 93609480 1I GTGGCGGGTG -/C CTGTAATCCC 3070 hom 41 het 15 0 13 2 C 1 2 46982 CASAVA_Build 1 93609788 1I ATTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2758 het 2597 hom 27 11 8 8 T 11 12 46983 CASAVA_Build 1 93610369 4D AAAAAACAAA AAAC/---- AAACAAAAAA 1173 het 1173 ref 25 13 6 10 AAAC 2 1 46984 CASAVA_Build 1 93619778 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAACTCA 3070 hom 61 het 29 0 23 6 A 7 6 46985 CASAVA_Build 1 93630714 1D TCTAAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 462 hom 31 1 13 20 A 11 10 46986 CASAVA_Build 1 93631440 1D AAAAAAATTT A/- AAAAAAGTAA 2781 het 1830 hom 12 4 7 2 A 7 6 46987 CASAVA_Build 1 93632171 2I GCTTGCTGTT --/AA AAAAAAAAAA 2952 het 2952 ref 26 11 9 6 A 12 14 46988 CASAVA_Build 1 93634171 2D TGTTTTGTTT TG/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 TG 1 0 46989 CASAVA_Build 1 93655501 1D AACAAACATG A/- AAAAGTGTTC 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 5 4 46990 CASAVA_Build 1 93656391 1D AGGAGTTACC T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 7 6 46991 CASAVA_Build 1 93679854 1I GGAATACAAT -/G TAGTCACTGC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 G 0 1 46992 CASAVA_Build 1 93680604 2I CAAGAAACAC --/AT GTGCCTGGGG 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 AT 0 1 46993 CASAVA_Build 1 93696276 1I ATTTTTGCTA -/T TTTTGATTTC 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 T 4 5 46994 CASAVA_Build 1 93720603 1D CTTGTAAGTA C/- TTCATGTGCA 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 C 1 0 46995 CASAVA_Build 1 93723297 1D CCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 1065 het 733 hom 23 7 5 12 A 17 16 46996 CASAVA_Build 1 93724593 1I AGCAGAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 11 16 T 13 14 46997 CASAVA_Build 1 93728313 1D CATAAAATAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 91 het 34 0 31 4 T 8 7 46998 CASAVA_Build 1 93740092 1D TCATTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 1373 het 1373 ref 44 31 4 10 A 11 10 46999 CASAVA_Build 1 93744685 1D AAAGGGGTAC T/- AGTCAGTGAG 3070 het 3070 ref 54 24 19 12 T 1 0 47000 CASAVA_Build 1 93759191 4D CATCTCAATA AACC/---- AACCAACCAA 3070 hom 101 het 38 0 30 10 AACC 9 8 47001 CASAVA_Build 1 93760719 1I CACTTATGAG -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 106 het 40 0 36 4 T 7 8 47002 CASAVA_Build 1 93770066 1D AGGATATGTC A/- AAAAAAAAAT 1343 het 1343 ref 48 40 3 5 A 10 9 47003 CASAVA_Build 1 93771229 1D TGCTAAATAA T/- TATCTTTGAA 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 T 2 1 47004 CASAVA_Build 1 93778990 1D CAATGTATGC T/- TTTTTTTTTT 2933 het 2933 ref 39 13 11 15 T 17 16 47005 CASAVA_Build 1 93803534 7I TCCTATTCAT -------/TCAGTTA ACATGCTTTG 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 TCAGTTA 0 1 47006 CASAVA_Build 1 93807894 1D4M4D GCTGACACTG TTAGAAGGC/-TAGA---- AGGGAGCCGC 3070 het 3070 ref 60 30 22 12 N/A 0 0 47007 CASAVA_Build 1 93814376 2I GATGGCGTGG --/AC ACACTTTATG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 AC 2 3 47008 CASAVA_Build 1 93815419 1I GGCATGGGAC -/G GGTTCCTCTC 3070 het 3070 hom 59 25 24 10 G 2 3 47009 CASAVA_Build 1 93867255 1I GGCAATAAAT -/A AAATTCCTCC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 3 4 47010 CASAVA_Build 1 93901092 1I CCTGTAGTTC -/T TTGTTACTCC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 2 3 47011 CASAVA_Build 1 93902319 1D GCTGGAGTGC A/- ATGGCAGGAT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 2 1 47012 CASAVA_Build 1 93986071 4I CCAACATTAC ----/CTAT CTGCCAGCAG 3070 hom 111 het 41 0 36 5 CTAT 0 1 47013 CASAVA_Build 1 93987292 2I ACAAATAATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 GT 8 9 47014 CASAVA_Build 1 93998753 1D AAATTAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 20 16 5 A 11 10 47015 CASAVA_Build 1 94000443 1I CATGCACATC -/T AACTCATGCT 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 T 0 1 47016 CASAVA_Build 1 94003817 1D TTCTTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 870 het 870 ref 26 19 3 4 T 15 14 47017 CASAVA_Build 1 94005668 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1411 het 1411 ref 26 13 5 8 A 17 16 47018 CASAVA_Build 1 94006129 7I AGAGTTCTGA -------/GCCTCTT GGTTTGTGCT 3070 het 3070 hom 60 26 29 5 GCCTCTT 0 1 47019 CASAVA_Build 1 94036588 1I CAATAGCCAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 8 9 47020 CASAVA_Build 1 94040460 1D ACTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 12 11 47021 CASAVA_Build 1 94043731 1I CCTGCCTTTA -/G GGACCCTCAA 3070 hom 154 het 56 0 51 5 G 2 3 47022 CASAVA_Build 1 94059057 1I ATTACAAATT -/G ACATCTTATC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 G 0 1 47023 CASAVA_Build 1 94060331 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3016 hom 30 11 14 5 T 13 12 47024 CASAVA_Build 1 94073188 3I CACATCTATC ---/ATT GAGGCTACTG 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 ATT 0 1 47025 CASAVA_Build 1 94085071 1I CCCCGTTTTT -/C CGAACCCCGC 2572 hom 18 het 8 0 7 1 C 1 2 47026 CASAVA_Build 1 94090516 1I TAAAAAAGAC -/A GACAATACAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 0 1 47027 CASAVA_Build 1 94091987 8I GACATTTATT --------/TATTTCTC TATCATAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 TATTTCTC 0 1 47028 CASAVA_Build 1 94092780 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2434 hom 22 10 9 3 T 9 8 47029 CASAVA_Build 1 94103095 1D GAGATGAGAG C/- AGAAGTTGAA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 C 1 0 47030 CASAVA_Build 1 94103902 3D CATGAGGATA GAG/--- GATTCAGAGA 3070 het 3070 hom 33 12 14 9 GAG 1 0 47031 CASAVA_Build 1 94105961 4I ACAAAAGTAG ----/TTTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 9 13 47032 CASAVA_Build 1 94107126 6D ACCCCAAAAC TATTAT/------ TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 TAT 2 0 47033 CASAVA_Build 1 94107355 1I TGGCCAACTT -/A AAATTATAGT 3070 het 3070 ref 43 23 11 9 A 3 4 47034 CASAVA_Build 1 94108232 1I ATCTAGGGAG -/A AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 6 7 47035 CASAVA_Build 1 94111767 1D GCTCCCTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2062 hom 26 9 13 5 A 11 10 47036 CASAVA_Build 1 94119698 3D GCCTATCTTC TTT/--- ATCTGAAGTG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 3 0 47037 CASAVA_Build 1 94121984 2I CTCAAAAAAA --/AC AAAAAAACAA 3070 het 1684 hom 32 8 20 4 AC 0 1 47038 CASAVA_Build 1 94124357 1D AAGCTACAGC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 9 8 47039 CASAVA_Build 1 94124826 1I AGCAACTAAG -/T TTTTTTTTTC 2432 het 2212 hom 19 5 8 6 T 9 10 47040 CASAVA_Build 1 94132410 3I CTCAAAACTA ---/AAT AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 AAT 0 1 47041 CASAVA_Build 1 94138153 1I ACATAAAGTG -/C CTGACATTCG 3070 het 3070 ref 50 25 24 1 C 1 2 47042 CASAVA_Build 1 94138514 3I GGAACTGAGG ---/ACA ACTTCTAAGA 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 ACA 0 1 47043 CASAVA_Build 1 94140427 1D GTTCACGCCA T/- TCCTCCTGCC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 2 1 47044 CASAVA_Build 1 94141010 1D TTTTTACTAG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 47 10 31 6 T 8 7 47045 CASAVA_Build 1 94156037 3D ATATTGTACT TAA/--- TGATACCCTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 TAA 1 0 47046 CASAVA_Build 1 94177262 1D CCTGCTTACT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 886 hom 27 2 10 15 C 10 9 47047 CASAVA_Build 1 94216429 4I AAGGAGAAAG ----/GAGA GAGGTCTGAG 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 GA 1 3 47048 CASAVA_Build 1 94219929 1D TGCCCACCAC T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 8 7 47049 CASAVA_Build 1 94225204 5D TTAAAAAGAA TACTT/----- TAATCCACTT 3070 het 3070 hom 35 15 20 1 TACTT 1 0 47050 CASAVA_Build 1 94242399 1D TTCCTGAATT C/- CCAGTGCTAC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 C 3 2 47051 CASAVA_Build 1 94251365 1D GTGTTCTTAT C/- CCCCCGCCTT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 C 6 5 47052 CASAVA_Build 1 94252337 12D AAAGAAGGAA GAAAGAAGGAAG/------------ GATGGAGGGA 3070 het 3070 hom 27 10 12 9 GAAAGAAGGAAG 1 0 47053 CASAVA_Build 1 94267255 1D CAAGCGATGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 24 10 9 7 T 8 7 47054 CASAVA_Build 1 94279658 1D GGAGTTAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 46 2 38 7 A 11 10 47055 CASAVA_Build 1 94281916 1I AAAGCAATCC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 9 47056 CASAVA_Build 1 94283463 1D AATGGTGGGC T/- TTTTTTTTTT 1044 het 1044 ref 33 17 5 11 T 19 18 47057 CASAVA_Build 1 94302082 1D CTGGAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 22 8 A 11 10 47058 CASAVA_Build 1 94305364 5D TATACCTCTT AAAAC/----- AAAAAAGCTA 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 AAAAC 1 0 47059 CASAVA_Build 1 94311593 1D TTACAGGAGG C/- ACTAACATCA 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 C 1 0 47060 CASAVA_Build 1 94311976 1I ATTCTTTATA -/G TACTTTGCAA 3070 het 3070 hom 55 23 25 7 G 0 1 47061 CASAVA_Build 1 94313497 1I TCTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 10 11 47062 CASAVA_Build 1 94316915 1D GAACTTTTGG T/- TGTGTCTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 16 1 T 2 1 47063 CASAVA_Build 1 94318138 1D ATAGAAGACC A/- AAAAAAAAAA 2788 het 2788 ref 37 15 11 12 A 13 12 47064 CASAVA_Build 1 94346931 1D TCTCATGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 22 2 11 9 T 12 11 47065 CASAVA_Build 1 94351821 9D GAGTGAATAA ATGACTGTG/--------- ATCCATTGCA 3070 het 3070 hom 35 15 16 8 ATGACTGTG 1 0 47066 CASAVA_Build 1 94355619 1D AGTCCTCAGG C/- CCCCCCACAG 3070 hom 55 het 26 0 20 7 C 7 6 47067 CASAVA_Build 1 94368817 2D ATCCTGGCTA AC/-- ACACAGTGAA 1193 het 886 hom 8 3 3 2 AC 3 2 47068 CASAVA_Build 1 94380339 1I TAAAACAGGG -/A AAACAGGCAG 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 A 3 4 47069 CASAVA_Build 1 94380699 1D CTTTGTAAAA G/- GTGAAAGAAC 3070 het 3070 ref 26 15 9 4 G 2 1 47070 CASAVA_Build 1 94381395 3D AGTAAGAAAA AAC/--- AAAGTGCACC 3070 het 3070 ref 44 22 21 2 AAC 1 0 47071 CASAVA_Build 1 94394504 1D TATGAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 A 15 14 47072 CASAVA_Build 1 94394818 1D ATGGTGCTAG T/- TTTGAAGGAG 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 T 4 3 47073 CASAVA_Build 1 94416643 3D CTTAAACATC ATT/--- GTCAGGTGTC 3070 het 3070 hom 47 20 23 5 ATT 1 0 47074 CASAVA_Build 1 94420245 1I AAGAATCCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 10 47075 CASAVA_Build 1 94421349 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 31 0 26 6 T 11 10 47076 CASAVA_Build 1 94432722 2D TAGACTGTTC TT/-- TTCTCTCTGT 3070 het 3070 hom 37 15 17 7 T 4 2 47077 CASAVA_Build 1 94440019 1I AATATCACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 9 10 47078 CASAVA_Build 1 94445006 2I CACCACTGCA --/CT CCAGCCCAGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CT 0 1 47079 CASAVA_Build 1 94445258 1I GTTCAAGTGA -/T TTCTCGTGCC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 2 3 47080 CASAVA_Build 1 94445695 2D AGTGTCTTGC CA/-- CACAGATAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 CA 3 2 47081 CASAVA_Build 1 94447957 6D AGTCATATAT ATATAC/------ ATATACATAT 3070 hom 54 het 22 0 19 5 ATATAC 2 1 47082 CASAVA_Build 1 94454083 5I TTATTGAAAC -----/AAATG AAAAGATATT 3070 hom 157 het 60 0 53 7 AAATG 0 1 47083 CASAVA_Build 1 94456005 2D AAAAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 13 11 47084 CASAVA_Build 1 94457404 17I CTTCTTAAAA -----------------/CCCTGCACTTTTAAAAT TCCATGTCAC 3070 hom 89 het 35 0 30 7 CCCTGCACTTTTAAAAT 0 1 47085 CASAVA_Build 1 94459710 1I TATGTATATA -/T TTTATACACA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 3 4 47086 CASAVA_Build 1 94461093 1I ATAAACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 15 4 T 13 14 47087 CASAVA_Build 1 94465273 1D AAACTTTTCA T/- TTAATGAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 3 2 47088 CASAVA_Build 1 94470408 3I ATCTCATGAG ---/ATT ATTGTAGGGA 3070 hom 119 het 42 0 39 3 ATT 1 2 47089 CASAVA_Build 1 94471556 8I CTACCACACT --------/AGCAGTAG AGTGAATTAC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AGCAGTAG 0 1 47090 CASAVA_Build 1 94477831 1D GTGATAGAGA C/- TACCCACCGA 3070 hom 105 het 41 0 35 7 C 1 0 47091 CASAVA_Build 1 94479920 2D ATAAATAAAA AC/-- AGACATACTC 3070 hom 18 het 9 0 7 2 AC 1 0 47092 CASAVA_Build 1 94481381 3D CACCAAAAAA CAG/--- CAGAATATGC 3070 hom 114 het 41 0 39 3 CAG 2 1 47093 CASAVA_Build 1 94482062 3D CAATAAACTT AAC/--- AACTCAGATG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 AAC 2 1 47094 CASAVA_Build 1 94482641 1D GGGCATCTAC A/- AAAAAAACCG 3070 hom 71 het 35 0 25 10 A 8 7 47095 CASAVA_Build 1 94490862 1I TTCTCTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 29 1 21 7 A 11 12 47096 CASAVA_Build 1 94494408 2I AAGGAATGAC --/AT TTTCTGTATT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AT 0 1 47097 CASAVA_Build 1 94501540 1I CTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 28 3 22 3 A 11 12 47098 CASAVA_Build 1 94514102 1D TTTCAACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 11 10 47099 CASAVA_Build 1 94522231 1D CAGAAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1028 hom 26 4 18 4 A 15 14 47100 CASAVA_Build 1 94541372 1D GTACCCAGCC A/- AAAAAAAAGG 1155 het 1155 ref 40 31 3 7 A 9 8 47101 CASAVA_Build 1 94569337 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 21 1 17 3 A 11 10 47102 CASAVA_Build 1 94571995 1D TCTTTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 21 0 14 7 A 15 14 47103 CASAVA_Build 1 94584928 1I GACTCCATCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1099 hom 23 3 17 3 A 14 15 47104 CASAVA_Build 1 94599398 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 11 10 47105 CASAVA_Build 1 94621261 1D AAGTTAATTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 9 8 47106 CASAVA_Build 1 94622610 49D ATTAAAATGA AATAATTATATAATAAAATTAAATAACACATGGCCCATCCTAGGGGCTC/------------------------------------------------- AATAAAGGGT 3070 hom 87 het 29 0 30 3 AATAATTATATAATAAAATTAAATAACACATGGCCCATCCTAGGGGCTC 1 0 47107 CASAVA_Build 1 94623550 1I GCAAGCTGAG -/A AAAAAAGAGG 3070 hom 135 het 52 0 45 7 A 6 7 47108 CASAVA_Build 1 94626543 1D TTCCCTCCAA T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 6 47109 CASAVA_Build 1 94629753 3D AAAGTGCTCA AAT/--- AATGAGTGCT 3070 hom 129 het 50 0 43 9 AAT 2 1 47110 CASAVA_Build 1 94643455 1D ATTATCAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1703 hom 28 8 11 10 T 17 16 47111 CASAVA_Build 1 94644312 1I ACCATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 A 11 12 47112 CASAVA_Build 1 94653812 2D GGATTTTCAG AC/-- ACAATATTCT 3070 hom 126 het 45 0 43 3 AC 2 1 47113 CASAVA_Build 1 94668418 2I CAGATGAGAC --/TT TGGACTGTGG 3070 hom 31 het 15 0 11 4 T 1 3 47114 CASAVA_Build 1 94692085 1I ATTATTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 11 12 47115 CASAVA_Build 1 94707036 1D TTGTATGTAT A/- AGGATTAAAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 2 1 47116 CASAVA_Build 1 94710599 1D GTAGTTAGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 44 2 33 9 T 14 13 47117 CASAVA_Build 1 94715720 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 21 1 16 4 A 10 11 47118 CASAVA_Build 1 94715821 64D5M10D4M8D GCTGATGGTG CATTAGTTGAGTTGTCTCTGTGTGTAAAGAGCAGTACATTAATGTGTTATTTTGGTTCTAGAGACTTGAGTTTTATATCACAAAATTAGAT/----------------------------------------------------------------CTTGA----------ACAA-------- TCAATGGCTT 3070 hom 42 het 17 0 14 5 N/A 0 0 47119 CASAVA_Build 1 94761892 1I TTTACTCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 31 0 24 7 T 9 10 47120 CASAVA_Build 1 94765561 2I CAAAGCCAGA --/CT CTGTCTCACA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CT 1 2 47121 CASAVA_Build 1 94769448 2D TCGTTGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 38 1 18 19 T 16 14 47122 CASAVA_Build 1 94787054 1D AGCACTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 778 hom 38 3 24 11 A 13 12 47123 CASAVA_Build 1 94794921 2I TTCTTCTTTC --/CT CTCTTTGCAC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 CT 2 3 47124 CASAVA_Build 1 94796280 1I GAGCTGGCTC -/T GCTCCTTTAC 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 T 0 1 47125 CASAVA_Build 1 94797690 3I AAAAATTAAA ---/AAT AATAATTGTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AAT 2 3 47126 CASAVA_Build 1 94812997 1D GTCTGTTTTT A/- ATACTGGTAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 2 1 47127 CASAVA_Build 1 94815143 1D AAGAACTTGA T/- TTCTGCCTTA 3070 het 3070 ref 28 18 9 2 T 3 2 47128 CASAVA_Build 1 94815232 1D AGTGAATTTC T/- TTTTTTTTTC 950 het 90 hom 17 1 12 4 T 10 9 47129 CASAVA_Build 1 94816088 1I CAATCCCTAC -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 7 47130 CASAVA_Build 1 94819477 5D AGTGTTTGGT CAGGG/----- CAGGGGGTCT 3070 hom 125 het 44 0 42 3 CAGGG 2 1 47131 CASAVA_Build 1 94825544 1I CTCACTTATC -/T TTTGGCGCTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 3 4 47132 CASAVA_Build 1 94832334 1D GACACACAGC G/- GGGGGGTGAG 3070 het 2343 hom 27 12 9 7 G 7 6 47133 CASAVA_Build 1 94859729 3D TTTATCTGCA GAG/--- GCCCTGCACG 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 GAG 1 0 47134 CASAVA_Build 1 94875894 10D ACATCTGCCC CATCCTAAAG/---------- CATCCTAAAC 3070 het 3070 ref 51 25 24 8 CATCCTAAAG 1 0 47135 CASAVA_Build 1 94891043 3D TCTTATAAAA CTT/--- AATCCGGCTG 3070 het 3070 hom 31 12 13 8 CTT 1 0 47136 CASAVA_Build 1 94903283 5D CAACCAACTC TTTAA/----- TTTGTTAGTG 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 TTTAA 1 0 47137 CASAVA_Build 1 94913216 4I TGGATGGATG ----/GATT AATGAATAAT 3070 het 3070 ref 57 28 21 8 GATT 0 1 47138 CASAVA_Build 1 94918757 1I ACTATCTTAA -/T TTTGGGGGGC 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 3 4 47139 CASAVA_Build 1 94923850 6I ATTTAGAAAA ------/TATACT TATAATTAGA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 TATACT 0 1 47140 CASAVA_Build 1 94926594 1I ATAACTAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 8 9 47141 CASAVA_Build 1 94928950 5D AGGGATGCAA TCTTT/----- TCTTAGAATC 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 TCTTT 1 0 47142 CASAVA_Build 1 94930808 1I GTAATCATGA -/T TTTTTTATAA 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 T 6 7 47143 CASAVA_Build 1 94939830 4D TTACACCGAT TAAC/---- TAAATTTTAC 3070 het 3070 ref 35 17 14 6 TAAC 1 0 47144 CASAVA_Build 1 94964210 3D CACCTCAGAC TCA/--- TCATATCAGA 3070 het 3070 ref 51 23 21 9 TCA 2 1 47145 CASAVA_Build 1 94972257 1I TAAATTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 T 11 12 47146 CASAVA_Build 1 94972786 1I AGCCTGGAAG -/T CCCCCCCTTC 3070 het 2732 hom 26 10 12 4 T 0 1 47147 CASAVA_Build 1 94974618 1D TTTTGCAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 11 10 47148 CASAVA_Build 1 94980121 1D CGTTGACATT G/- GGGAAGAAAC 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 G 4 3 47149 CASAVA_Build 1 94994109 1I GCTGGGGAGA -/T TTTTCTACAG 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 T 4 5 47150 CASAVA_Build 1 95014129 26D ACACACACAC ATATGCACACACACACACACACACAT/-------------------------- ATATATATAT 3070 hom 84 het 24 0 28 3 ATATGCACACACACACACACACACAT 1 0 47151 CASAVA_Build 1 95025488 1I GAAGGAGAAG -/A AAAAAAGACA 3070 het 3070 ref 56 23 24 9 A 6 7 47152 CASAVA_Build 1 95029260 1I AATAAAGTCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 T 7 8 47153 CASAVA_Build 1 95031255 1D TTACAAAAGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 83 het 32 0 29 3 A 9 8 47154 CASAVA_Build 1 95038772 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 662 het 381 hom 18 5 5 8 A 22 18 47155 CASAVA_Build 1 95038942 13I TAGGGCTAAG -------------/CCAAAATAAGAAT CCACTTTCCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CCAAAATAAGAAT 0 1 47156 CASAVA_Build 1 95046276 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 A 7 6 47157 CASAVA_Build 1 95046641 1I GCATTTTAGG -/T TACATTAATC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 1 2 47158 CASAVA_Build 1 95048335 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1711 het 579 hom 16 5 7 5 A 17 16 47159 CASAVA_Build 1 95050842 1D AGAGGGGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 110 het 46 0 35 11 A 12 11 47160 CASAVA_Build 1 95053633 7I3M7I TGTAATCCCC -------AAA-------/AGTATTGAAAGCTGGGC TTGGTGGGAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 6 N/A 0 0 47161 CASAVA_Build 1 95059264 13D AATAACTCTG TCCCAAATGTAAA/------------- TCGTAGTTGG 3070 het 3070 ref 41 23 18 3 TCCCAAATGTAAA 1 0 47162 CASAVA_Build 1 95060693 2I GATGTCCTGA --/CT CTGGTGATGG 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 CT 1 2 47163 CASAVA_Build 1 95067438 1D AAAAAAAAAG A/- AAATCGTTTA 552 het 24 hom 29 1 6 22 A 4 3 47164 CASAVA_Build 1 95072366 10D TTTGGAGAAA TGGCAGGTTC/---------- TAGGACTTGG 3070 het 3070 hom 48 24 22 5 TGGCAGGTTC 1 0 47165 CASAVA_Build 1 95075058 8D CTGTCTCAAC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 8 A 23 15 47166 CASAVA_Build 1 95077450 3I TAAGTATGAT ---/AAG AATTTTAGAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAG 0 1 47167 CASAVA_Build 1 95081690 5I ATCCACTGTC -----/ATCTG ACTGTCTTTC 3070 hom 99 het 34 0 33 1 ATCTG 0 1 47168 CASAVA_Build 1 95084291 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1125 het 1125 ref 18 4 10 4 A 17 18 47169 CASAVA_Build 1 95085584 11D AGCCAGGTCC CAGTTACATAG/----------- CAGTGCTTAT 3070 het 3070 ref 29 14 14 6 CAGTTACATAG 1 0 47170 CASAVA_Build 1 95097559 2I GGTGAGAGCC --/AA AAAGAGAGGG 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 A 3 5 47171 CASAVA_Build 1 95113780 3I ATATGGAGGA ---/CAG GGCCATGCTC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 CAG 0 1 47172 CASAVA_Build 1 95122433 1I GGATCTGAAC -/G GGTGAATGCA 3070 hom 92 het 36 0 28 8 G 2 3 47173 CASAVA_Build 1 95125511 2D TAATTCTAGA TC/-- TCTCTGTTGC 3070 hom 123 het 43 0 41 2 TC 3 2 47174 CASAVA_Build 1 95126882 1I GCCTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 27 0 17 10 T 10 11 47175 CASAVA_Build 1 95133414 1I AATCTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 18 5 T 11 12 47176 CASAVA_Build 1 95134553 4I CCCCCAAACC ----/TAAT TAATAGAGCC 3070 hom 105 het 41 0 34 7 TAAT 1 2 47177 CASAVA_Build 1 95137846 1D AAAAAGAAAA T/- TTTAAAGTCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 4 3 47178 CASAVA_Build 1 95139697 2D ATAAACTACA CC/-- CCCCCCCCAG 3070 hom 57 het 24 0 20 5 C 10 8 47179 CASAVA_Build 1 95142468 2I TTAATAAGAC --/CA CAGACCTCAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CA 1 2 47180 CASAVA_Build 1 95146985 1I AAAATAATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 28 het 12 0 10 2 T 7 8 47181 CASAVA_Build 1 95148615 1I TCCATCTCAA -/G GTATCAAGAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 1 2 47182 CASAVA_Build 1 95159786 1D TGTTGATGGT G/- GGTATTAGCG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 3 2 47183 CASAVA_Build 1 95289377 1D CTTCTCTGTG T/- TAAGTGGCAA 3070 hom 150 het 54 0 49 5 T 2 1 47184 CASAVA_Build 1 95291002 1D CTGCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1016 hom 30 5 14 12 A 17 16 47185 CASAVA_Build 1 95292620 1D GTATAGCTTG C/- AGAACTGTGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 47186 CASAVA_Build 1 95298180 1D AGTAGGGAAA C/- CCCCCCAACC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 C 7 6 47187 CASAVA_Build 1 95305721 2I CTCTTTTATT --/AA GATACATTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 2 47188 CASAVA_Build 1 95317632 7D GTTCTTTTGC CCTTCTG/------- CCTTCTGCCT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 CCTTCTG 3 2 47189 CASAVA_Build 1 95318920 2D CAAAAGGTGC TG/-- TGAAAGGCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TG 2 1 47190 CASAVA_Build 1 95319247 1D TTATGGGTTG C/- CTGGGAGTGT 3070 hom 120 het 47 0 39 9 C 2 1 47191 CASAVA_Build 1 95320566 1I CTCAAAAAAA -/G AAAAAAATAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 0 1 47192 CASAVA_Build 1 95324986 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2599 hom 22 8 11 3 A 12 11 47193 CASAVA_Build 1 95337411 4I CTCTCTACTC ----/AGTT AGAAATGAAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AGTT 0 1 47194 CASAVA_Build 1 95337624 4D AAACTCTATT TTTA/---- TTTATTATAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TTTA 2 1 47195 CASAVA_Build 1 95341130 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 22 1 17 4 T 11 12 47196 CASAVA_Build 1 95347551 1I TTTTCTCTCC -/A AAAACCTGGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 5 47197 CASAVA_Build 1 95349278 4D CACATAAAAT AAAA/---- AAAAAAAAAG 3070 hom 56 het 24 0 22 3 A 13 9 47198 CASAVA_Build 1 95362988 1I GGGCAAAATA -/T TTTTTCTAAA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 5 6 47199 CASAVA_Build 1 95364134 1D CATCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 31 0 23 9 A 12 11 47200 CASAVA_Build 1 95371530 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2205 hom 31 7 19 5 A 10 11 47201 CASAVA_Build 1 95388913 1D TTTTAAAATA T/- TTTTTGTACG 3070 het 3070 ref 26 12 12 3 T 6 5 47202 CASAVA_Build 1 95407780 1D TACTTCATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 10 9 47203 CASAVA_Build 1 95409195 1D CTTTTCTCAT C/- CCCCCCCTTT 3070 het 3070 hom 33 13 10 10 C 8 7 47204 CASAVA_Build 1 95411459 1I GTGATCATTC -/T TTTTTTTTTT 1781 het 1087 hom 19 3 6 11 T 13 14 47205 CASAVA_Build 1 95414101 1D TGTATTTTTT G/- TAGAGAAGGA 3070 het 2470 hom 18 6 12 0 G 1 0 47206 CASAVA_Build 1 95419347 1D AAAACAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 11 10 47207 CASAVA_Build 1 95422497 2D CTTTTCTCAC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 26 hom 33 2 16 15 T 11 9 47208 CASAVA_Build 1 95428241 1D TTGCACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 31 1 11 19 T 14 13 47209 CASAVA_Build 1 95430934 1D CATTTTAAGA T/- TTTTTCAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 6 5 47210 CASAVA_Build 1 95432613 1D AAATGAAAAA C/- GTTTGCTAGA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 C 1 0 47211 CASAVA_Build 1 95437203 1D GTCTCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 43 0 33 10 A 13 12 47212 CASAVA_Build 1 95437932 3D TGACAGACTT TTA/--- ACATAATGCC 3070 het 3070 ref 47 22 17 11 TTA 1 0 47213 CASAVA_Build 1 95444576 1I CATGAATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 9 10 47214 CASAVA_Build 1 95445470 3D GTGATTGTGC TGG/--- TGGTGGTGGG 3070 hom 118 het 44 0 37 7 TGG 4 3 47215 CASAVA_Build 1 95446973 1I ATTTTGTCCG -/A AAATCCATTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 3 4 47216 CASAVA_Build 1 95458594 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1814 het 414 hom 13 3 5 6 A 17 16 47217 CASAVA_Build 1 95459075 1D GTATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1707 hom 25 6 11 8 T 15 14 47218 CASAVA_Build 1 95461979 2I GCTTTTGGCG --/GT GGGGGGGGGG 3070 het 459 hom 24 4 17 3 GT 0 1 47219 CASAVA_Build 1 95464435 5I AAATAAAAAA -----/AGAAT AGAAAAGAAA 3070 hom 114 het 44 0 37 7 AGAAT 0 1 47220 CASAVA_Build 1 95468754 5I TTTTATTTGC -----/TTTTA TTTTATCATT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TTTTA 1 2 47221 CASAVA_Build 1 95476561 1D TTATTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 T 13 12 47222 CASAVA_Build 1 95476765 1I AATTGCAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 47223 CASAVA_Build 1 95487273 1I GAATTCTGGT -/A GGGTCCAGAA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 0 1 47224 CASAVA_Build 1 95487936 2I GCTGGATAAA --/AG AGAAGAAAAG 3070 hom 84 het 35 0 28 7 AG 1 2 47225 CASAVA_Build 1 95491758 1I GGTAATTGGC -/T TTCTAAATTT 3070 het 3070 hom 54 19 30 5 T 2 3 47226 CASAVA_Build 1 95500437 1D CTGCAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1158 hom 23 5 12 6 T 15 14 47227 CASAVA_Build 1 95515634 1D ATACAAAATT A/- GCCAGGTGTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 1 0 47228 CASAVA_Build 1 95515720 1I GGCAGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 17 1 15 1 A 11 12 47229 CASAVA_Build 1 95515902 1I TCCTGCCCAG -/A AAAAAATGTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 6 7 47230 CASAVA_Build 1 95517806 2D ATACTACCAC AG/-- AGAGTTAACC 3070 het 3070 hom 40 14 21 6 AG 3 2 47231 CASAVA_Build 1 95548775 4I AGGCTTTTAA ----/TTAT TGTCAATTAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 TTAT 0 1 47232 CASAVA_Build 1 95553760 1I CTACTGTTCT -/C CCCCCTAGCT 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 C 5 6 47233 CASAVA_Build 1 95557418 1I AAAATGATTC -/T CTTTCTCAGC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 0 1 47234 CASAVA_Build 1 95575212 1I CATCTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 24 5 T 11 12 47235 CASAVA_Build 1 95582185 1D TTCTAAACAA T/- TTTTTTCATC 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 7 6 47236 CASAVA_Build 1 95596709 2I TCTGTCATTC --/TT TTTTTTTTTT 2690 het 1953 hom 23 8 8 7 T 10 12 47237 CASAVA_Build 1 95597078 4D AAAAAAATGA AAGT/---- AAGAATTGCC 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 AAGT 1 0 47238 CASAVA_Build 1 95603805 2I AAAAAAAAAA --/AC AAACAACACA 3070 het 382 hom 42 6 22 14 AC 0 1 47239 CASAVA_Build 1 95604460 1D GTTGAAAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 A 9 8 47240 CASAVA_Build 1 95606202 18D GGAGGATGAA TGGGAACAGGGCACAAAG/------------------ GCATCATGGA 3070 het 3070 ref 40 21 17 6 TGGGAACAGGGCACAAAG 1 0 47241 CASAVA_Build 1 95607372 4I AGTGAGAGAC ----/AGTA AGGATGAAAA 3070 hom 111 het 44 0 36 8 AGTA 0 1 47242 CASAVA_Build 1 95625550 5I ATAAGAAGCC -----/AGGGT GTCTGGAGCA 3070 hom 111 het 41 0 35 6 AGGGT 0 1 47243 CASAVA_Build 1 95634783 4D TAACAGATAA GTGT/---- GTGTGTATGT 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 GT 5 3 47244 CASAVA_Build 1 95647883 1D TCTAATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 44 0 28 16 T 12 11 47245 CASAVA_Build 1 95657209 3I CCCCAGTGTG ---/TCA TCGAGTGTTC 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 TCA 0 1 47246 CASAVA_Build 1 95663623 1I ATAGGTCATG -/A AAAAAAAAAA 1355 het 1355 ref 35 26 3 6 A 10 11 47247 CASAVA_Build 1 95666137 1D TTGCCAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 15 14 T 13 12 47248 CASAVA_Build 1 95676898 4I GTGTGTGTGT ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 GA 5 7 47249 CASAVA_Build 1 95692777 1D GTTTGTATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 10 9 47250 CASAVA_Build 1 95703083 1D GGTAGTTCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 9 8 47251 CASAVA_Build 1 95718551 1D TCTGGTCACC A/- AAGGTTGTCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 2 47252 CASAVA_Build 1 95728736 4D TTCAGAAAAC AGAA/---- AGAAAGCTAG 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 AGAA 2 1 47253 CASAVA_Build 1 95750643 1I CACAATACCA -/T TTTTTTTTTT 2970 het 2970 ref 31 13 8 10 T 13 14 47254 CASAVA_Build 1 95752028 1I GATGCATTTC -/A AAGGAAAGGA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 2 3 47255 CASAVA_Build 1 95768996 1I TTTATTTGTA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 6 7 47256 CASAVA_Build 1 95777979 1D GCATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1424 hom 23 6 12 5 T 12 11 47257 CASAVA_Build 1 95785982 1I ATTTGACATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 9 10 47258 CASAVA_Build 1 95790126 1D CTGGTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 32 3 13 16 T 13 12 47259 CASAVA_Build 1 95795969 5I TCTATGTCAT -----/TCATA TCATAACCAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TCATA 1 2 47260 CASAVA_Build 1 95802819 1I TGAAGAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 30 1 25 4 T 13 14 47261 CASAVA_Build 1 95803169 2D TTTTAAAAAC TG/-- TTTATCTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 TG 1 0 47262 CASAVA_Build 1 95803915 1I AGTGTCTCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 24 0 16 8 T 9 10 47263 CASAVA_Build 1 95820257 22D GAAAAAGGAA AAGGTTGGGGGGTAAGTCATTT/---------------------- AGATGGGGAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 7 AAGGTTGGGGGGTAAGTCATTT 1 0 47264 CASAVA_Build 1 95828140 2I TTTGAAGCAT --/AA AAAAGCATTT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 4 6 47265 CASAVA_Build 1 95828604 2D TGGTTGAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 32 2 15 15 T 15 13 47266 CASAVA_Build 1 95828650 1D CAGTCGGGGG A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 39 10 11 18 A 7 6 47267 CASAVA_Build 1 95835324 1D ATTGCTGGGG T/- CACAAAATAA 3070 het 3070 ref 50 28 16 6 T 1 0 47268 CASAVA_Build 1 95838910 2I TGGTTTATAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 17 13 5 AT 5 6 47269 CASAVA_Build 1 95854817 1D AGATACTGGG A/- AAACAGACAT 3070 hom 105 het 43 0 36 8 A 4 3 47270 CASAVA_Build 1 95910592 1I TTAACCATTA -/T TCATTATGGT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 1 2 47271 CASAVA_Build 1 95922022 1I TCACAAATCC -/T TTTTTCATGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 5 6 47272 CASAVA_Build 1 95922397 1I GTCTAGAACC -/A AAAAAAAAAA 1944 het 1944 ref 20 9 5 6 A 10 11 47273 CASAVA_Build 1 95923796 8D AAAAAAACAA AAAAAAAC/-------- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 20 14 13 AAAAAAAC 1 0 47274 CASAVA_Build 1 95944114 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 7 8 47275 CASAVA_Build 1 95944588 1D CCAGAAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 29 10 A 12 11 47276 CASAVA_Build 1 95953074 2D GCCACAGCTC AA/-- GTGTTCAATA 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 A 2 0 47277 CASAVA_Build 1 95953676 4I GATTCTTGGC ----/TCTT TCTATCGATT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 TCTT 0 1 47278 CASAVA_Build 1 95961346 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 15 13 T 14 15 47279 CASAVA_Build 1 95970989 4I CTATCTATCC ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 het 2804 hom 35 8 15 12 ATCT 3 4 47280 CASAVA_Build 1 95988554 1D TTGTGCTTGA C/- TTTTGCATTT 3070 hom 117 het 46 0 40 7 C 1 0 47281 CASAVA_Build 1 96005050 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1561 het 58 hom 25 1 12 14 A 11 10 47282 CASAVA_Build 1 96007447 3I TTTGTTAAGT ---/TTG TTAAGTAATT 2267 hom 12 het 6 0 5 1 TTG 0 1 47283 CASAVA_Build 1 96024976 3D TGAAGACAAT ACA/--- ACAATTCCTT 3070 het 3070 hom 36 13 22 2 ACA 2 1 47284 CASAVA_Build 1 96030497 1I TCCCCCTCTT -/A AAAGATTGCT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 3 4 47285 CASAVA_Build 1 96031330 1I ATGCTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2625 hom 24 7 13 4 T 10 11 47286 CASAVA_Build 1 96032461 1I GAGAATTTTA -/G GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 G 4 5 47287 CASAVA_Build 1 96034789 3D GAGTGCGTTC TTG/--- TTGGCTTTGA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TTG 2 1 47288 CASAVA_Build 1 96044978 1D TTTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 10 9 47289 CASAVA_Build 1 96047969 3D TTATTTATTG TAT/--- TATTTGTGTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TAT 2 1 47290 CASAVA_Build 1 96050860 1D GGATAACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 6 T 12 11 47291 CASAVA_Build 1 96073271 2D CTATCTTCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 34 4 13 17 T 14 12 47292 CASAVA_Build 1 96076320 1D GCATATCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 12 11 47293 CASAVA_Build 1 96078070 3D GTGCTGGCAC TTG/--- TTGGTGGTGG 3070 het 3070 ref 42 16 19 8 TTG 2 1 47294 CASAVA_Build 1 96079440 2D AAAAATATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 14 12 47295 CASAVA_Build 1 96097411 3D GTTTGTTTGT TTG/--- TTTTTTAGTT 444 het 94 hom 40 2 3 35 TTG 1 0 47296 CASAVA_Build 1 96097731 1D ATGTGTGTGA T/- TTTTTTCCAC 3070 hom 120 het 41 0 41 0 T 7 6 47297 CASAVA_Build 1 96106516 1I TTTATTTAAC -/A AAAAATATGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 5 6 47298 CASAVA_Build 1 96108293 4D CTAGACCTTC CCTG/---- CCTGACCACT 3070 hom 50 het 22 0 17 5 CCTG 2 1 47299 CASAVA_Build 1 96110300 2D AGAAATAGAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TA 9 8 47300 CASAVA_Build 1 96111595 1I GCTTGTTTTT -/A AAATACTGTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 3 4 47301 CASAVA_Build 1 96122097 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2851 hom 28 10 13 7 A 14 13 47302 CASAVA_Build 1 96136724 1D ACAAAAAATC T/- TTCATTTTAA 2762 het 2762 ref 24 13 8 3 T 3 2 47303 CASAVA_Build 1 96139914 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 13 10 T 10 11 47304 CASAVA_Build 1 96158307 1D TTGTATTCAA T/- TTTTTATCTC 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 T 6 5 47305 CASAVA_Build 1 96161500 1D CACACAAAAA C/- ACTTCACATT 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 C 1 0 47306 CASAVA_Build 1 96163862 2D TGCATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1387 hom 32 6 14 13 TA 10 9 47307 CASAVA_Build 1 96169351 1I ACTTTGCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 T 9 10 47308 CASAVA_Build 1 96171096 1I TGGATATTAT -/A AAAACCTGTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 4 5 47309 CASAVA_Build 1 96201836 1D TCATTGGGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 14 15 14 T 10 9 47310 CASAVA_Build 1 96210564 1I ATGTATATTC -/T GTTGATTTGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 0 1 47311 CASAVA_Build 1 96214488 2D15M2I AGAAGAAACC AGAGTGTTGATAAAACT--/--AGTGTTGATAAAACTAA AAAAAAAAAA 2763 het 2763 ref 24 14 9 9 N/A 0 0 47312 CASAVA_Build 1 96216980 1I CCTCACCCCC -/T GATCCAGGCA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 0 1 47313 CASAVA_Build 1 96218810 2D GCAAAGAGAA AG/-- AGTTTTACTT 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 AG 2 1 47314 CASAVA_Build 1 96219066 1I TTTACTTTTT -/C TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 C 0 1 47315 CASAVA_Build 1 96221996 1I AATCATATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 11 18 10 T 9 10 47316 CASAVA_Build 1 96226447 1I ATATTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 630 hom 37 4 20 13 T 14 15 47317 CASAVA_Build 1 96235116 2D TCTAACAAAC TG/-- AGGCTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 TG 1 0 47318 CASAVA_Build 1 96236015 2I TTTCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 31 0 20 11 T 11 13 47319 CASAVA_Build 1 96240481 1D ACTGAAGGCT G/- GGCTATGTTC 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 G 3 2 47320 CASAVA_Build 1 96243094 2D TATCCTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2742 het 2742 ref 24 10 8 6 T 12 10 47321 CASAVA_Build 1 96246489 3D CAGTTTTACA CCT/--- CCTGGGACAG 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 CCT 2 1 47322 CASAVA_Build 1 96248660 12D CTGCTTGTAC TCCATGTACTAT/------------ TTCACTTACC 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 TCCATGTACTAT 1 0 47323 CASAVA_Build 1 96253927 1I ATCTCCTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 9 10 47324 CASAVA_Build 1 96260429 2D AGAATAAAAG AA/-- AGCTCAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 3 1 47325 CASAVA_Build 1 96262272 1I AAGACTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 37 2 28 7 A 13 14 47326 CASAVA_Build 1 96264551 2D ACTCCATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 26 0 16 10 A 12 10 47327 CASAVA_Build 1 96266177 1D TGACATCCCT G/- GGGTGTCACT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 4 3 47328 CASAVA_Build 1 96266625 1D TCCCTCTCAT C/- CATTTGCATC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 2 1 47329 CASAVA_Build 1 96267711 4I GCTAACAGTG ----/AAAT AAATACCAGA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 AAAT 1 2 47330 CASAVA_Build 1 96271183 1D CATCTCTCAA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 7 6 47331 CASAVA_Build 1 96271884 1I CATTAATCAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 47 10 29 8 A 6 7 47332 CASAVA_Build 1 96275593 1I TGGGAAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 16 10 T 14 15 47333 CASAVA_Build 1 96278260 6D TCAGAGCAAA GGTCAT/------ GGTCATGGTC 3070 hom 71 het 31 0 24 8 GGTCAT 3 2 47334 CASAVA_Build 1 96279649 1I TGCTGAATCT -/G CAGTGATTAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 0 1 47335 CASAVA_Build 1 96288376 1I TGTCAGTAGG -/A GGGGCACCTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 47336 CASAVA_Build 1 96296462 2D AATAATGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 22 20 15 T 13 11 47337 CASAVA_Build 1 96296695 1D CACTTCTGGA T/- TTTTTTAGAT 3070 het 3070 ref 52 28 19 6 T 7 6 47338 CASAVA_Build 1 96303099 1I ATCACACTCT -/G GGGACTGTTG 1965 het 361 hom 12 1 5 6 G 3 4 47339 CASAVA_Build 1 96306912 2D ATTTCTGTGT TA/-- TAAGTATAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TA 2 1 47340 CASAVA_Build 1 96334390 1I ACAACTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 11 12 47341 CASAVA_Build 1 96340694 2I CAATTTAAAC --/CT CTGTTTTTCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CT 1 2 47342 CASAVA_Build 1 96344353 3I GATACCATTT ---/TTG TTGTTGTTGA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TTG 3 4 47343 CASAVA_Build 1 96347084 1D TCAGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 11 10 47344 CASAVA_Build 1 96351351 2D GTGAATGTTC AG/-- AGTCTTTACT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 AG 2 1 47345 CASAVA_Build 1 96361021 1D CCTGGAACTG A/- AAAGCCAGCA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 4 3 47346 CASAVA_Build 1 96370758 6D CGCGTGCCGT GGCTCA/------ CGCCTTGTAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 GGCTCA 1 0 47347 CASAVA_Build 1 96371635 1D AAAGGTATCG T/- TTTTTTTTTG 1516 het 103 hom 22 1 11 10 T 10 9 47348 CASAVA_Build 1 96371655 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 249 het 203 hom 17 1 3 13 T 14 13 47349 CASAVA_Build 1 96376733 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1689 het 1689 ref 32 18 5 9 T 17 16 47350 CASAVA_Build 1 96383170 2I TGTAGCACAG --/AT ATATATATAT 3070 het 1198 hom 39 4 27 8 AT 8 9 47351 CASAVA_Build 1 96387965 1D AGGGAAGTAT A/- AATTACAATA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 3 2 47352 CASAVA_Build 1 96414195 1I ATGAGGAATA -/T TGTCTTTTTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 47353 CASAVA_Build 1 96414863 9I TGTACTTTGG ---------/CTCCTGTTT CTTGAGTCAT 3070 hom 81 het 34 0 28 7 CTCCTGTTT 0 1 47354 CASAVA_Build 1 96415452 8I AGGGAGGGAT --------/GGAGGGAG GGAGGGAGGG 3070 hom 36 het 16 0 12 4 GGAG 3 5 47355 CASAVA_Build 1 96419195 1D GTGTTTTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 10 9 47356 CASAVA_Build 1 96435314 1I CTATTCAGGC -/T GCTATCACAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 0 1 47357 CASAVA_Build 1 96469563 2D GGAACAACTC TT/-- ATCCTGGTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 2 0 47358 CASAVA_Build 1 96475597 1I TCAAGACCGT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 8 9 47359 CASAVA_Build 1 96490743 1I TAAATTGGTC -/A AAAAAATCAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 6 7 47360 CASAVA_Build 1 96522962 2D TAAAATAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 15 13 47361 CASAVA_Build 1 96534654 1D TCATGATGTT A/- AGCTGGTTAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 2 1 47362 CASAVA_Build 1 96541365 1D ATGGAAATGC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 8 47363 CASAVA_Build 1 96545403 1D TTTTATCTCA T/- TTTTGGTCAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 4 47364 CASAVA_Build 1 96546114 1I GTCTCTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 5 het 15 0 11 4 A 9 10 47365 CASAVA_Build 1 96550558 3I ATCATATTTT ---/CTC CTCTATTAAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 CTC 1 2 47366 CASAVA_Build 1 96558483 1I GTGATGAAAG -/A AAAAAAACCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 8 47367 CASAVA_Build 1 96558608 4D TCCTTTTTAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 26 0 17 9 A 18 14 47368 CASAVA_Build 1 96559534 4D AATATAAAAC AGAT/---- AGTAACAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AGAT 1 0 47369 CASAVA_Build 1 96563042 3I AAATAGAACT ---/ACC ACCACATGAT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 ACC 1 2 47370 CASAVA_Build 1 96563710 2D ATATTTTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 5 A 12 10 47371 CASAVA_Build 1 96564252 1D ACTTACAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 9 8 47372 CASAVA_Build 1 96567816 1D TTTGTGTGTG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 134 het 51 0 45 6 T 9 8 47373 CASAVA_Build 1 96572087 3D GGCCAGTGGC ATG/--- ATGATCAGAA 3070 hom 129 het 48 0 44 5 ATG 2 1 47374 CASAVA_Build 1 96574230 1D AACAAAAATT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 7 47375 CASAVA_Build 1 96582069 3D TGCATAAATG TCT/--- TCTTTTGAGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TCT 2 1 47376 CASAVA_Build 1 96586513 1D ATTTCATCCA T/- TTTTTATATA 453 het 453 ref 16 8 2 6 T 6 5 47377 CASAVA_Build 1 96588471 1D CAAAAATTAG C/- CAGGCATGGT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 C 2 1 47378 CASAVA_Build 1 96590071 2I TATTTTAATA --/AT ATATATATAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AT 6 7 47379 CASAVA_Build 1 96596972 1I CCATCTCGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 375 hom 31 1 24 6 A 9 10 47380 CASAVA_Build 1 96607576 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 20 1 17 2 A 12 11 47381 CASAVA_Build 1 96608860 4D CTGTACAGCA CCCC/---- CCCCCCCCAC 3070 hom 58 het 34 0 27 7 C 12 8 47382 CASAVA_Build 1 96609244 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 186 hom 21 1 16 8 T 10 9 47383 CASAVA_Build 1 96615606 2D CAATTAAAAC TT/-- CAGGAAATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 2 0 47384 CASAVA_Build 1 96623475 1D ATGCAGAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 9 8 47385 CASAVA_Build 1 96630834 1I ACCCTAAGCA -/G TTAATGCCCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 47386 CASAVA_Build 1 96637445 8I TTTGGTTTGG --------/TTTTTTAC TTTTTTGTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTTTTAC 0 1 47387 CASAVA_Build 1 96643981 1D TATTTTGGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 10 9 47388 CASAVA_Build 1 96670873 2I GCCTTGTGAG --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 11 47389 CASAVA_Build 1 96698133 6D AAAAAAAAAA GAAAAG/------ AAAAAAAAGG 3070 hom 74 het 26 0 24 4 GAAAAG 1 0 47390 CASAVA_Build 1 96700025 1I GAATGTAGAC -/A AAAAAACGAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 6 7 47391 CASAVA_Build 1 96719967 2I AATAGAATAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 9 11 47392 CASAVA_Build 1 96752164 1I AAAGAGGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 34 1 28 5 T 12 13 47393 CASAVA_Build 1 96762444 39D GGATGCTGAT AAAGTTCTGACACAGGGAGTGAGTGATGAGTGGTGTGTA/--------------------------------------- AAAGTTCTGA 3070 hom 59 het 33 0 16 27 AAAGTTCTGACACAGGGAGTGAGTGATGAGTGGTGTGTA 2 1 47394 CASAVA_Build 1 96768434 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 12 11 47395 CASAVA_Build 1 96770686 1I ATTATGGGGT -/G GGGGGGGGCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 8 9 47396 CASAVA_Build 1 96775533 4D CAGTTCAATT TCAA/---- TCAGTATTTC 3070 hom 42 het 16 0 13 4 TCAA 1 0 47397 CASAVA_Build 1 96777745 2I TTCCTTTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TG 5 6 47398 CASAVA_Build 1 96805045 4I AGTAGGTCAT ----/AATC AATCTTCATT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 AATC 1 2 47399 CASAVA_Build 1 96805237 1I AGGGTGCTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 8 47400 CASAVA_Build 1 96808249 1D GTTTTCTGAG A/- AATTGGGAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 3 2 47401 CASAVA_Build 1 96886480 1I TGGAGACCTA -/G GACTTTTAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 2 47402 CASAVA_Build 1 97028414 1D ATTTAGAGCC T/- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 36 27 3 6 T 12 11 47403 CASAVA_Build 1 97029161 1D CATAATTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 28 9 A 11 10 47404 CASAVA_Build 1 97038956 16D ATTATTAACT AATTACTTTAATTCTC/---------------- AATTACTATT 3070 hom 51 het 20 0 17 6 AATTACTTTAATTCTC 1 0 47405 CASAVA_Build 1 97137420 1D CTTCTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 7 T 11 10 47406 CASAVA_Build 1 97177781 1I TCAAATATAG -/T TAAGTACTCA 3070 het 3070 ref 52 28 18 6 T 1 2 47407 CASAVA_Build 1 97211074 1I ATCTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 8 1 A 11 12 47408 CASAVA_Build 1 97235946 2D GTGTGACTGA AT/-- ATATAAGTCC 3070 hom 121 het 44 0 38 7 AT 3 2 47409 CASAVA_Build 1 97237823 1I CCTCAGACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 10 11 47410 CASAVA_Build 1 97267437 1D CTTTCACTTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 8 7 47411 CASAVA_Build 1 97278727 1I GTCAGTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 10 11 47412 CASAVA_Build 1 97296085 1I74M5I CCATCTCATT -GGGGGTTATAATTTCAACGTACAAATTTTGGGAAGACACAAACATTCAGCCTATAAGAATTGGTCAGTATATGA-----/GGGGGGTTATAATTTCAACGTACAAATTTTGGGAAGACACAAACATTCAGCCTATAAGAATTGGTAAGTATATGATTACT TTACAGGGTA 3070 hom 120 het 33 0 40 14 N/A 0 0 47413 CASAVA_Build 1 97309865 1D TTAAGGGTCT G/- GGTCCAAATT 3070 hom 77 het 30 0 26 4 G 3 2 47414 CASAVA_Build 1 97319285 1I AAATTAATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 10 47415 CASAVA_Build 1 97324900 1D ATTGTAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 459 hom 47 2 41 4 A 10 9 47416 CASAVA_Build 1 97330981 3D GACATCTTAG TCT/--- TCTTATTATC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 TCT 2 1 47417 CASAVA_Build 1 97333761 4D TTAAAGCTTC TGTG/---- TGTGTATGTA 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 TG 4 2 47418 CASAVA_Build 1 97348002 1D TTTTTAATAT A/- AAAAATATCT 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 A 6 5 47419 CASAVA_Build 1 97349160 4D TAAAAAAAAT AAAC/---- AAAACCCCCA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 AAAC 1 0 47420 CASAVA_Build 1 97356975 4D TTCAAAAAAC TTGT/---- TTGTTTGTCT 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 TTGT 3 2 47421 CASAVA_Build 1 97362320 1D ATTTCCTAAT G/- GACTTCTTCC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 G 2 1 47422 CASAVA_Build 1 97369643 3D GGATGTGCAC AAG/--- AAGAAGATCA 3070 het 3070 ref 43 20 15 10 AAG 3 2 47423 CASAVA_Build 1 97373122 2D GGTGGGGTCT TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 26 0 21 6 TA 6 5 47424 CASAVA_Build 1 97376773 1I TTTTTCTCGC -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 6 7 47425 CASAVA_Build 1 97398488 1D33M1D GGAATATTTT CCCCTAAGCTCTCCATAATAGAATGTTGGTTATAC/-CCCTAAGCTCTCCATAATAGAATGTTGGTTATA- CATCCTTAAC 3070 hom 84 het 22 0 29 4 N/A 0 0 47426 CASAVA_Build 1 97430236 1I TTGCAACCAT -/A ACACATTACT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 1 2 47427 CASAVA_Build 1 97431939 1D TTTCTTCCTC A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 50 19 29 2 A 8 7 47428 CASAVA_Build 1 97440052 1I CTCAAGCAGC -/T TTTTTTTTTT 2848 het 2848 ref 39 11 13 15 T 15 16 47429 CASAVA_Build 1 97454436 1I GCTTTCGAAT -/G TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 G 0 1 47430 CASAVA_Build 1 97461533 12D ATAGAATTAA ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 het 945 hom 25 4 13 11 AC 15 9 47431 CASAVA_Build 1 97517066 1I TTCGTAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 10 11 47432 CASAVA_Build 1 97532024 1D CCCGGGAGGT G/- GAGGTTGCAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 G 2 1 47433 CASAVA_Build 1 97533504 2I CTAGCAATAC --/AA AAGTCTGTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 4 47434 CASAVA_Build 1 97533585 1I TATAAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 11 12 47435 CASAVA_Build 1 97539881 1I AGACATCTTT -/A AGCTTATGCC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 1 2 47436 CASAVA_Build 1 97540055 1I ATGAAGTCAG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 A 7 8 47437 CASAVA_Build 1 97560379 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATA 1808 het 376 hom 7 1 4 2 A 9 8 47438 CASAVA_Build 1 97573008 1D AGACATTAGA G/- GGGAATTTGT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 G 4 3 47439 CASAVA_Build 1 97590708 1I CTGAAATAGT -/A AAAAAAAAAA 2883 het 2883 ref 40 16 10 14 A 16 17 47440 CASAVA_Build 1 97591897 2D TTCCAGAAAC TG/-- GACTTTTCGG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 TG 1 0 47441 CASAVA_Build 1 97621035 1I GATGGAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 A 8 9 47442 CASAVA_Build 1 97623670 1D26M3D TTTTTTTCTT AAAAAAAAAAAAACAAAATAAAACAATAAC/-AAAAAAAAAAAACAAAATAAAACAAT--- AACAACAACC 2878 het 2878 ref 21 12 12 7 N/A 0 0 47443 CASAVA_Build 1 97627455 3D TTTGTCTTTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 534 hom 31 5 13 16 A 14 11 47444 CASAVA_Build 1 97627575 4I GAAAAATATG ----/ACTA ATTAGTAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 ACTA 0 1 47445 CASAVA_Build 1 97628009 1I CTTATTTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 8 28 4 A 13 14 47446 CASAVA_Build 1 97634224 4D ATAGGAAAAG CTAA/---- CTGATGCCAC 3070 het 3070 hom 40 20 18 4 CTAA 1 0 47447 CASAVA_Build 1 97634379 1I TACAGACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 10 11 47448 CASAVA_Build 1 97634484 1I CTTTGAATGA -/T TTTTTTTGTG 2800 het 2800 ref 25 11 7 7 T 7 8 47449 CASAVA_Build 1 97634568 1D TGTGTGTCAG T/- TTTTTATTAT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 6 5 47450 CASAVA_Build 1 97635082 3D ACTACTCAGT TCC/--- TGTTGGACTG 3070 het 3070 ref 49 26 20 7 TCC 1 0 47451 CASAVA_Build 1 97636090 2D ACATGCTGTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 2893 hom 33 12 14 7 T 11 9 47452 CASAVA_Build 1 97641063 1D CATTACCTGA T/- TTTTTGAATG 3070 het 3070 ref 55 29 22 4 T 6 5 47453 CASAVA_Build 1 97644535 4D ATCAGGAATT TTTA/---- TTTATTTATT 2446 het 991 hom 8 2 5 1 TTTA 5 4 47454 CASAVA_Build 1 97653306 1D AAAGGCAAAC A/- AAACTCTAGG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 4 3 47455 CASAVA_Build 1 97656451 6D TATAAGATGA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 2320 hom 32 10 16 8 T 16 10 47456 CASAVA_Build 1 97658247 1I AGAGCCTGGC -/A AAAAAGGGCC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 5 6 47457 CASAVA_Build 1 97662566 1I AAACATAGAC -/A ACACTGTTCA 3070 het 3070 hom 63 23 31 9 A 1 2 47458 CASAVA_Build 1 97663956 1I CATTAATGCC -/T TTTTTCAGAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 5 6 47459 CASAVA_Build 1 97666924 1I TTAAGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 10 11 47460 CASAVA_Build 1 97673448 2I CCTGTATTAG --/TA TATATATTCT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TA 3 4 47461 CASAVA_Build 1 97678409 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1348 het 1348 ref 27 15 3 9 A 17 16 47462 CASAVA_Build 1 97695337 1D AAAAGACGGG A/- ATAATAAATG 3070 het 3070 ref 54 31 23 0 A 2 1 47463 CASAVA_Build 1 97722030 1D CAGAACTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 39 1 37 1 A 12 11 47464 CASAVA_Build 1 97728626 4I ATAGTATATT ----/GTAA GTGTTATAAT 3070 het 2285 hom 14 5 9 0 GTAA 0 1 47465 CASAVA_Build 1 97738430 1D AACTACAGGC A/- AAATCCAGTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 4 3 47466 CASAVA_Build 1 97738756 3D GTAGATTAAT ATA/--- ATGTGAGATA 3070 het 3070 hom 38 16 20 5 ATA 1 0 47467 CASAVA_Build 1 97750381 1I CTTTGATGCC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 7 8 47468 CASAVA_Build 1 97753730 1I AAAGAAACTA -/T AAGATTAATG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 0 1 47469 CASAVA_Build 1 97759078 2D TTCAATAAAC AT/-- GTGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 AT 1 0 47470 CASAVA_Build 1 97760862 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3011 het 3011 ref 23 11 8 4 A 15 14 47471 CASAVA_Build 1 97767825 3D TCTTTCTCTT TTC/--- TTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 TTC 1 0 47472 CASAVA_Build 1 97771066 1I TTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 2574 het 2574 ref 22 10 9 3 G 0 1 47473 CASAVA_Build 1 97775680 5I AACCCAAAAA -----/ATAAC AGAATGTAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 ATAAC 0 1 47474 CASAVA_Build 1 97777402 1I TGTACTCAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 8 9 47475 CASAVA_Build 1 97778301 1D CCAGTTCCTA C/- AGGTTGAGAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 1 0 47476 CASAVA_Build 1 97780940 4I TGAATGAATG ----/AATT AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 AATT 2 3 47477 CASAVA_Build 1 97781837 5D CTAATGAACT TATCA/----- TATAACAAAC 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 TATCA 1 0 47478 CASAVA_Build 1 97785182 2D ATCATAAACC AG/-- AAACAGTACA 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 AG 1 0 47479 CASAVA_Build 1 97785821 6D TCTCGTTGTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 2412 hom 33 14 15 6 TTG 6 4 47480 CASAVA_Build 1 97792114 3D CTGCTTTAAT TAC/--- TACTATGTTC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TAC 2 1 47481 CASAVA_Build 1 97794476 4D TCCCTTTTTT TTTA/---- TTTTATTTTA 515 het 515 ref 16 9 4 3 TTTA 1 0 47482 CASAVA_Build 1 97806019 1D TGGAGATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 10 9 47483 CASAVA_Build 1 97807099 2D ATAAATCTTT AC/-- AGAGTCAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AC 1 0 47484 CASAVA_Build 1 97824102 1I ATTATGTCTT -/C CCCTCTTTCC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 3 4 47485 CASAVA_Build 1 97856522 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1421 het 1421 ref 21 10 5 6 T 15 14 47486 CASAVA_Build 1 97867827 1I CTCCAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2953 hom 27 8 12 7 A 9 10 47487 CASAVA_Build 1 97948865 1I CACCAGTATG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 8 9 47488 CASAVA_Build 1 97982592 3D TCAGATAAAA AAT/--- AATAATAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 AAT 3 2 47489 CASAVA_Build 1 98000064 6D AAATCAAATA CTACAT/------ GCTATCACTT 3070 het 3070 ref 53 26 22 6 CTACAT 1 0 47490 CASAVA_Build 1 98005635 6D ACTCTGCATG TTCTGT/------ TTCCTCTCTG 3070 het 3070 ref 44 26 14 6 TTCTGT 1 0 47491 CASAVA_Build 1 98011548 1I GGGAAGTGCT -/G GGCAGAGAAG 3070 hom 69 het 25 0 22 3 G 2 3 47492 CASAVA_Build 1 98017447 14D TTTTGCAAAC ACACACACACACAT/-------------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 14 21 9 ACACACACACACAT 1 0 47493 CASAVA_Build 1 98022410 1D ATGCTTTTCC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 7 het 43 3 38 2 T 7 6 47494 CASAVA_Build 1 98035603 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTCAGCA 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 T 6 5 47495 CASAVA_Build 1 98037862 1D TTATCAAAAC T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 8 7 47496 CASAVA_Build 1 98039334 1I AAGCTAGTTA -/G ATCTCGTTCC 3070 het 3070 hom 52 17 27 8 G 0 1 47497 CASAVA_Build 1 98050039 1I TTAAAACTAT -/A AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 6 7 47498 CASAVA_Build 1 98053077 4D AAAGAGAGAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 1182 het 15 hom 19 1 7 11 GAAA 6 5 47499 CASAVA_Build 1 98063778 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGGAGGG 1138 het 687 hom 8 2 5 1 G 7 6 47500 CASAVA_Build 1 98064177 4I AATGTGTGTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 TG 6 8 47501 CASAVA_Build 1 98064560 4D CTCTTTTCAG TTCT/---- TTCTGTCTTT 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 TTCT 2 1 47502 CASAVA_Build 1 98066844 1D TTTTTGAATC A/- AAATTTTATA 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 A 4 3 47503 CASAVA_Build 1 98076996 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1016 hom 14 3 9 2 A 11 10 47504 CASAVA_Build 1 98088739 2D TCAGAATGCC AG/-- AGTGACTGAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 AG 2 1 47505 CASAVA_Build 1 98088912 1D AATTGCCTAC A/- AAAAAACCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 7 6 47506 CASAVA_Build 1 98121979 1I TAGGAATCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 11 12 47507 CASAVA_Build 1 98124106 4D TAAGAGGTCA CCTC/---- TGGAATGGTA 3070 het 3070 ref 50 23 18 11 CCTC 1 0 47508 CASAVA_Build 1 98129572 1I CGCAGAAAAA -/C AAAATTAGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 0 1 47509 CASAVA_Build 1 98147765 1I TGCCCTCAAC -/T TACCCTCCCA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 T 1 2 47510 CASAVA_Build 1 98150344 8I CATGCAAACG --------/AGAACGGC AGAACGGCAG 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 AGAACGGC 1 2 47511 CASAVA_Build 1 98173546 5I TGAGTAAAAC -----/GATAT GATGAGACTG 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 GATAT 0 1 47512 CASAVA_Build 1 98198392 2D AACAAAAGAC TT/-- ATATAGAATA 3070 het 3070 ref 44 21 17 8 T 2 0 47513 CASAVA_Build 1 98210117 1D ACAAGCAAAC A/- AAAAACAGGA 2324 het 2324 ref 30 20 7 4 A 6 5 47514 CASAVA_Build 1 98222414 4D TTGTCTCATA CTGT/---- CTAAGCTGAT 3070 het 3070 ref 33 22 10 3 CTGT 1 0 47515 CASAVA_Build 1 98233846 4I CATTCCCAAG ----/TTGT TTAAACAGAG 3070 het 3070 hom 47 15 29 3 TTGT 0 1 47516 CASAVA_Build 1 98241127 2D CACACAACGC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 46 20 18 9 TA 6 5 47517 CASAVA_Build 1 98242640 2I TATTAAAAAC --/AT AGGAAATATA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 AT 0 1 47518 CASAVA_Build 1 98258831 1I CCCATTCTGC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 7 8 47519 CASAVA_Build 1 98261866 5I CACATAAAAA -----/TACTT TAAGGTATTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TACTT 0 1 47520 CASAVA_Build 1 98262600 2D CAACTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 17 9 T 13 11 47521 CASAVA_Build 1 98263359 8I GTAAATGTAC --------/TTAAGTAT TTAAGTATAG 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 TTAAGTAT 1 2 47522 CASAVA_Build 1 98266977 1I ATTTAGCTAT -/A AAAATATTTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 4 5 47523 CASAVA_Build 1 98310406 1D TATATTTACT C/- CGTGGAAAAA 3070 het 3070 ref 44 26 14 5 C 2 1 47524 CASAVA_Build 1 98313041 1I TATGTAAATT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 7 8 47525 CASAVA_Build 1 98313876 1I TCCTCATCCC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 T 8 9 47526 CASAVA_Build 1 98320793 1D AGTGTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 12 11 47527 CASAVA_Build 1 98328341 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2673 het 1556 hom 15 7 7 1 A 12 11 47528 CASAVA_Build 1 98331737 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2306 het 2306 ref 27 10 10 7 A 12 13 47529 CASAVA_Build 1 98336076 1D ATAGGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2863 hom 36 11 14 11 A 13 12 47530 CASAVA_Build 1 98338060 1D TTTAGTTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 8 7 47531 CASAVA_Build 1 98338171 1I TGTACTGCAG -/A AAAAAAAAAA 2313 het 2313 ref 29 16 6 7 A 10 11 47532 CASAVA_Build 1 98342974 2D ATGGCTTCTA GT/-- CACATTTTAT 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 GT 1 0 47533 CASAVA_Build 1 98346675 1I CAGGAGGGAT -/A GGGGGTAGAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 0 1 47534 CASAVA_Build 1 98364599 1D AAAAAAAAAA C/- AATTTGATAG 3070 het 981 hom 38 8 14 17 C 1 0 47535 CASAVA_Build 1 98376038 4I GAATGCATAA ----/ATAG ATAGATATAG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 ATAG 1 2 47536 CASAVA_Build 1 98384354 1D AGGGTGCAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 306 hom 42 2 32 8 T 3 2 47537 CASAVA_Build 1 98388030 1D TGTATTCAAA T/- TTTTTGCATT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 T 6 5 47538 CASAVA_Build 1 98390452 2I ATAAGCCCTA --/GT GTGTGTTGTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 GT 3 4 47539 CASAVA_Build 1 98395272 1D AAATGTAATA C/- AGGTACTATG 3070 het 3070 hom 35 15 16 6 C 1 0 47540 CASAVA_Build 1 98398266 1D TAATATTATA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 T 8 7 47541 CASAVA_Build 1 98401290 1I GCCATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3031 het 3031 ref 32 10 11 11 T 14 15 47542 CASAVA_Build 1 98404526 1I TTTCTTCTTG -/A AATTCTACCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 3 47543 CASAVA_Build 1 98406879 5I CTATTGACTT -----/TAGAG TAATCTAAAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TAGAG 0 1 47544 CASAVA_Build 1 98419970 1I GCTTTGGTGG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 8 9 47545 CASAVA_Build 1 98421548 8I TCGCGTGTGT --------/GTGTGTGC GTGTGCACAC 3070 hom 51 het 35 1 22 12 GTGTGTGC 0 1 47546 CASAVA_Build 1 98437541 1I GTTATAATAA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 7 8 47547 CASAVA_Build 1 98456285 8D AATTCAAATG ACTGGTGC/-------- ACATAACTGG 3070 het 3070 ref 30 13 13 6 ACTGGTGC 1 0 47548 CASAVA_Build 1 98460232 1I ACCAGCAATC -/T TTCTAGCCAG 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 2 3 47549 CASAVA_Build 1 98467758 2D ATATATGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 2589 het 950 hom 35 13 12 11 GT 7 6 47550 CASAVA_Build 1 98467779 4I TGTATATATA ----/TGTG TGTGTGTGTA 3070 het 1397 hom 35 9 16 10 TG 4 6 47551 CASAVA_Build 1 98473398 1D TGGAAAACAG A/- AAAAAAGTGG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 7 6 47552 CASAVA_Build 1 98479176 4D TATTTAATTC ATTT/---- ATTTATGTAC 3070 het 3070 hom 28 13 14 3 ATTT 2 1 47553 CASAVA_Build 1 98484548 6D ATATTTTTAA TACTTT/------ TACTTTTAAC 3070 het 3070 ref 30 19 10 4 TACTTT 2 1 47554 CASAVA_Build 1 98490382 1D GGGAGGGGTC A/- GGGGTGAAAT 1944 het 1944 ref 36 24 6 7 A 1 0 47555 CASAVA_Build 1 98503347 6D CGCCGGTAGG GTGCTT/------ GTTAGATTGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GTGCTT 1 0 47556 CASAVA_Build 1 98509763 1D CCTAGGTATC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 45 0 35 10 T 10 9 47557 CASAVA_Build 1 98527316 1I TTTTTTTTTT -/G ACCTTCAACT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 G 0 1 47558 CASAVA_Build 1 98539165 1D CCATTCCTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 19 0 18 1 T 9 8 47559 CASAVA_Build 1 98545768 1D AAGTCAGGTT A/- TCAACCCCAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 1 0 47560 CASAVA_Build 1 98550404 1D TCCTTTGGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 335 hom 62 1 54 7 T 10 9 47561 CASAVA_Build 1 98550760 2D TTTAAAAAGA CT/-- CTGAACAGCT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 CT 2 1 47562 CASAVA_Build 1 98552675 2D TTTTGCTAAC TT/-- TAAATATCTA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 3 1 47563 CASAVA_Build 1 98561090 1D CACATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 33 1 30 2 A 11 10 47564 CASAVA_Build 1 98563442 1I CAGGGTGTAG -/A AAAAGGTTGG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 4 5 47565 CASAVA_Build 1 98568996 5D ATGATTTCCC TGACT/----- TAAGTTTCAC 3070 hom 78 het 28 0 26 4 TGACT 1 0 47566 CASAVA_Build 1 98581620 4I GTGTTTTGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 TTTG 2 3 47567 CASAVA_Build 1 98622595 1I GGTGTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 10 11 47568 CASAVA_Build 1 98630740 1D CGTGAGAAAC T/- TTTTTTTTAA 2859 het 2859 ref 20 10 7 3 T 9 8 47569 CASAVA_Build 1 98634258 4I TTTTTCTAAG ----/TATT TATCATTCTA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 TATT 0 1 47570 CASAVA_Build 1 98651395 9D TTTCCTAGTT CTGTGAAGA/--------- CTGTCACTGG 3070 het 3070 ref 47 27 16 7 CTGTGAAGA 1 0 47571 CASAVA_Build 1 98652215 1I TAAATGTCAG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 6 7 47572 CASAVA_Build 1 98664081 4D ATGCTGTCAC TTCT/---- TTAAGTCTTC 3070 het 3070 hom 39 15 22 4 TTCT 1 0 47573 CASAVA_Build 1 98667813 1D GAGAAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 T 11 10 47574 CASAVA_Build 1 98668893 4I CAAATGAATG ----/AATA AACTCTATTC 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 AATA 0 1 47575 CASAVA_Build 1 98670443 1D AAGGATTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 A 15 14 47576 CASAVA_Build 1 98673235 1D CTTATTTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 A 10 9 47577 CASAVA_Build 1 98674502 1I TCAAAGTATG -/T TTTCTCTGGT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 3 4 47578 CASAVA_Build 1 98676149 1I AATTTCTTCC -/T TGAACTCCAT 3070 hom 141 het 54 0 46 8 T 1 2 47579 CASAVA_Build 1 98681893 1D GAAAACAAAA G/- TTTGTTCTTT 3070 het 2943 hom 26 9 13 4 G 1 0 47580 CASAVA_Build 1 98683547 1I AATTATTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 20 13 7 0 T 8 9 47581 CASAVA_Build 1 98703058 1D GAAATTGAGA G/- AGTTTTATTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 1 0 47582 CASAVA_Build 1 98708117 2I TTGAAATGCT --/GA GTTTTTTAAT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 GA 0 1 47583 CASAVA_Build 1 98710475 1I TTACATTACA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 373 hom 44 1 39 4 T 7 8 47584 CASAVA_Build 1 98725279 1D AGGAGTACAA C/- CTTTTCTTGA 3070 het 3070 ref 45 26 18 2 C 2 1 47585 CASAVA_Build 1 98731791 1I GCCAGGGTAA -/G GGGGGGATGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 6 7 47586 CASAVA_Build 1 98737467 1I TCTAAAAAAA -/T ATTCCACTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 47587 CASAVA_Build 1 98748814 1D TGAATGGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 10 9 47588 CASAVA_Build 1 98757044 1D TGAATGAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 27 11 10 A 10 9 47589 CASAVA_Build 1 98763910 2I TGAGAAATAA --/AG AGAGACAGTA 3070 het 1357 hom 22 5 13 4 AG 2 3 47590 CASAVA_Build 1 98769088 5I TACCAAGAAA -----/TATAT TAAAATATAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TATAT 0 1 47591 CASAVA_Build 1 98776068 1I AAGGTCACAG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 T 7 8 47592 CASAVA_Build 1 98787146 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 T 7 8 47593 CASAVA_Build 1 98790731 4D GAATAAAAAA AAAG/---- AAAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 AAAG 2 1 47594 CASAVA_Build 1 98792327 2I ATTATCTAAA --/CT CTCTGATTAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 CT 2 3 47595 CASAVA_Build 1 98796029 1D TGAGAAATGG A/- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 11 16 9 A 4 3 47596 CASAVA_Build 1 98799473 1I TCCCCTAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 9 10 47597 CASAVA_Build 1 98805032 2I CCATTATATT --/TC TGTCATCTCT 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 TC 0 1 47598 CASAVA_Build 1 98807234 1D TACCTTAATA G/- CTAGACTATC 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 G 1 0 47599 CASAVA_Build 1 98810997 1I TACAAGTTGA -/G GATAATTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 7 7 G 1 2 47600 CASAVA_Build 1 98819941 1D TAATGGACAC T/- TTAGGCTGAT 2417 het 2417 ref 14 9 5 0 T 3 2 47601 CASAVA_Build 1 98824553 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 2080 het 578 hom 16 5 8 3 A 17 18 47602 CASAVA_Build 1 98832591 2I TGGTAAATGT --/TA TGTGTGTACT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TA 0 1 47603 CASAVA_Build 1 98842513 2D ATATTAACAC TT/-- GAAGTGAATA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 2 0 47604 CASAVA_Build 1 98846089 1D ACAAACAAAC A/- AACAAACAAA 3070 het 1897 hom 41 9 20 12 A 3 2 47605 CASAVA_Build 1 98855238 8D TTTCTTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 13 12 5 T 16 8 47606 CASAVA_Build 1 98856486 1I AAATGAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 10 11 47607 CASAVA_Build 1 98863173 1I ACCCAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 T 10 11 47608 CASAVA_Build 1 98920220 24D GTTTTCTTTT CTTCCTTTTTTTGTCCTTCTTTTA/------------------------ CTTCCTTTTT 3070 het 3070 ref 38 24 15 6 CTTCCTTTTTTTGTCCTTCTTTTA 1 0 47609 CASAVA_Build 1 98934312 1D TCCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 785 het 785 ref 25 20 3 2 T 12 11 47610 CASAVA_Build 1 98939804 1D AGAGAGTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 951 hom 31 3 24 4 A 13 12 47611 CASAVA_Build 1 98951592 1I GCAATAAGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 9 10 47612 CASAVA_Build 1 98958015 2D CTATATATAT AA/-- AATATATATT 1161 het 1161 ref 13 7 3 3 A 4 2 47613 CASAVA_Build 1 98959243 1I ACCTCAAGTT -/G TGTGTTCCCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 0 1 47614 CASAVA_Build 1 98960933 3D AAGGAAAACA ATG/--- ATGATATTTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 ATG 2 1 47615 CASAVA_Build 1 98961481 4D TCTCTCAATA AAGT/---- TTTAAACGGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AAGT 1 0 47616 CASAVA_Build 1 98961606 1D TTTTATGGCC T/- TTTTTTTGGC 3070 het 2951 hom 25 8 15 2 T 8 7 47617 CASAVA_Build 1 98961935 2I ATCCCGGGAG --/GC GCAGAGGTTG 3070 hom 63 het 27 0 21 6 GC 1 2 47618 CASAVA_Build 1 98962107 1D GTTAGCTGGC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 8 47619 CASAVA_Build 1 98964804 1D TTTAAGGGGA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 8 7 47620 CASAVA_Build 1 98967641 2I CAGGAGCTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 19 0 13 6 T 10 12 47621 CASAVA_Build 1 98968378 1D AACTCTCAAT A/- AACTAGATAT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 A 3 2 47622 CASAVA_Build 1 98971359 3D AGGCCATCAT CTC/--- CTATCACACC 3070 het 3070 hom 53 22 25 8 CTC 1 0 47623 CASAVA_Build 1 98977031 1D CTCAGAGAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 12 23 9 T 10 9 47624 CASAVA_Build 1 98977831 5D AGGAGTTGCC AGATA/----- AGAGTGTGAG 3070 het 3070 hom 40 19 20 5 AGATA 1 0 47625 CASAVA_Build 1 98981236 4D AATAAGCAGG TCTA/---- TCTATGATTA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TCTA 2 1 47626 CASAVA_Build 1 98981511 5D GGTGAAGTAT TTAAA/----- TTAGTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 5 TTAAA 1 0 47627 CASAVA_Build 1 98993639 1I TCTAGATGGA -/T TGGCCCTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 47628 CASAVA_Build 1 98994186 1D CATGATTTCA T/- TTTACATCTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 4 3 47629 CASAVA_Build 1 98997077 2D GTTTGTGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 54 25 16 16 AC 9 8 47630 CASAVA_Build 1 99000210 1D CACTTTTCCA T/- TCTCATAATA 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 T 2 1 47631 CASAVA_Build 1 99001577 3D AAACTACTTT AAA/--- AAAAAAAAAT 1114 het 51 hom 11 1 4 6 A 12 9 47632 CASAVA_Build 1 99002747 1I AACATACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 A 11 12 47633 CASAVA_Build 1 99008202 1I CTTTATAGCT -/A ACGTTTATTT 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 A 1 2 47634 CASAVA_Build 1 99009484 1D AATAGCTGCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 22 10 9 T 8 7 47635 CASAVA_Build 1 99012823 3D TTTTTTCCCC TTA/--- TTATGTGATA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TTA 2 1 47636 CASAVA_Build 1 99013220 1I TCAGCATATG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 8 9 47637 CASAVA_Build 1 99016294 4D ACAATCAGAT AGAG/---- AGAACAACTT 3070 het 3070 hom 52 24 25 4 AG 3 1 47638 CASAVA_Build 1 99021057 1D TGAGTCACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 T 12 11 47639 CASAVA_Build 1 99024545 1I AATGGAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 17 1 15 1 A 10 11 47640 CASAVA_Build 1 99027590 1D GAAACATATG A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 30 18 7 5 A 8 7 47641 CASAVA_Build 1 99041807 1D GATGGGTGTC A/- GGGGCAGTCT 2701 het 2701 ref 17 10 7 0 A 1 0 47642 CASAVA_Build 1 99053231 1D CTTGAAAGTG C/- TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 C 1 0 47643 CASAVA_Build 1 99053667 1I TTTGCAGTAG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 7 8 47644 CASAVA_Build 1 99054530 1D GGCCAATATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 11 22 4 T 9 8 47645 CASAVA_Build 1 99068360 3I AATTGCTGAC ---/TCT TCATCAGAAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 TCT 0 1 47646 CASAVA_Build 1 99068857 17D AAATGAAACA ATATTATTTTCAATACT/----------------- ATCAAAATTA 3070 het 3070 ref 18 12 9 0 ATATTATTTTCAATACT 1 0 47647 CASAVA_Build 1 99080804 1I TGCAAAGCGG -/C TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 0 1 47648 CASAVA_Build 1 99102611 1I GGCAATCCAA -/T TTTTCCAGGA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 T 4 5 47649 CASAVA_Build 1 99106638 1I AGGAAAACAA -/T TACTATCTGG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 1 2 47650 CASAVA_Build 1 99107852 1D CCCTCATTCA T/- ACAATGAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 T 1 0 47651 CASAVA_Build 1 99109880 1D AGTAAAGGGC T/- TTTGATCTTT 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 T 4 3 47652 CASAVA_Build 1 99120565 2D GATCATGAGG AC/-- AGTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 AC 1 0 47653 CASAVA_Build 1 99125527 3I CTCTACAATA ---/TCT TCATCTTCAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TCT 0 1 47654 CASAVA_Build 1 99130689 5D TTTCTAAAAA TAAAG/----- TAATTTCACA 3070 het 3070 hom 38 15 23 3 TAAAG 1 0 47655 CASAVA_Build 1 99134987 1D TCTGTAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2685 hom 28 9 16 3 A 10 9 47656 CASAVA_Build 1 99140512 2I TTATTTTAAG --/AA AATGTTTCCT 3070 hom 135 het 54 0 45 9 A 2 4 47657 CASAVA_Build 1 99158601 1D GAGTCAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 35 3 18 14 A 19 18 47658 CASAVA_Build 1 99160217 1I AACATTCAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 A 8 9 47659 CASAVA_Build 1 99163841 1I AAATGGAAAT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 7 8 47660 CASAVA_Build 1 99169444 7I CTAATCATAA -------/TAAAAGT TAAAATTTCA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 TAAAAGT 0 1 47661 CASAVA_Build 1 99179700 1D GGTTGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 577 hom 38 3 30 5 T 13 12 47662 CASAVA_Build 1 99187413 1I GGAATAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 11 12 47663 CASAVA_Build 1 99188343 1I CCTCATTTAT -/A AAATGGGTAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 3 4 47664 CASAVA_Build 1 99193113 1I CCCAAATGTG -/T TTTGGAATTA 3070 hom 140 het 53 0 47 6 T 3 4 47665 CASAVA_Build 1 99196538 1I CCTTTTCCTC -/T TTTCTTTTTT 3070 hom 88 het 37 0 31 6 T 3 4 47666 CASAVA_Build 1 99207340 3I AAAGTAAAAG ---/TCT TCTTCCTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 TCT 1 2 47667 CASAVA_Build 1 99221233 1D ATAAACTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 11 10 47668 CASAVA_Build 1 99229825 1D AAAGGTTGAG T/- TGAGGTCAGT 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 T 2 1 47669 CASAVA_Build 1 99235472 12D TTACTTTAGA AGCCCAGGCAAT/------------ AGCACTATAC 3070 het 3070 hom 38 16 22 5 AGCCCAGGCAAT 1 0 47670 CASAVA_Build 1 99238715 12I TCCAAGGGGT ------------/TGTTCACGGAGC TGTTCACGGA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 TGTTCACGGAGC 0 1 47671 CASAVA_Build 1 99242415 1I TTCGCACCCA -/C CCCTCACGCG 2036 het 1372 hom 15 3 8 4 C 3 4 47672 CASAVA_Build 1 99248965 1I TGATAGCCAC -/T GATCATTACT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 T 0 1 47673 CASAVA_Build 1 99249276 1D ACTATGAATG C/- TAATCAGCAT 3070 het 3070 hom 52 22 23 9 C 1 0 47674 CASAVA_Build 1 99251962 1D ATACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1806 het 1539 hom 26 11 10 5 A 12 11 47675 CASAVA_Build 1 99260239 1I29M1I CTTGTCAGGG -AAAATCAAAAATGTGTTATGCGCCCTACC-/AAAAATCAAAAATGTGTTATGCGCCCTACCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 16 19 N/A 0 0 47676 CASAVA_Build 1 99262272 1D CGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1209 hom 17 4 8 5 T 14 13 47677 CASAVA_Build 1 99263609 1D AGGCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2298 het 984 hom 12 4 6 2 T 15 14 47678 CASAVA_Build 1 99272300 1I TAAAATTATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 9 10 47679 CASAVA_Build 1 99272640 1D AAAGTTTCCA G/- GAACACACAA 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 G 2 1 47680 CASAVA_Build 1 99272757 2D AAAAATCAAC TT/-- AAAATCAATT 3070 het 3070 hom 52 24 24 4 T 2 0 47681 CASAVA_Build 1 99292078 1D ATCAATTTAG C/- AATTCAATTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 C 1 0 47682 CASAVA_Build 1 99293681 2D GAGCCCAGAT AA/-- AGATACACAT 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 A 3 1 47683 CASAVA_Build 1 99297931 1I CAATTTTTTT -/A ATTCTAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 1 2 47684 CASAVA_Build 1 99298942 1I TCTTGAGGAA -/T TTTCTGTGCT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 3 4 47685 CASAVA_Build 1 99299492 1D CTGAGAAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 10 9 47686 CASAVA_Build 1 99302939 1D GCCAATTTTC A/- AAATTGAGTG 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 A 4 3 47687 CASAVA_Build 1 99307639 1D CAGAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 A 11 10 47688 CASAVA_Build 1 99325044 6I GTAGGAAAGA ------/AAGTCT AAGTTTCTAT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 AAGTCT 0 1 47689 CASAVA_Build 1 99326234 1D AGAGAAAAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 A 9 8 47690 CASAVA_Build 1 99335240 1D TAGCTGGTCA T/- TTTGCACATT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 T 4 3 47691 CASAVA_Build 1 99349468 1D AATCTACAAG T/- TTGAAAACTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 3 2 47692 CASAVA_Build 1 99364442 1D GTGTAGTTTC A/- ATTTTCTGCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 1 47693 CASAVA_Build 1 99368883 1I AGTGTGGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1107 hom 28 3 15 10 T 13 14 47694 CASAVA_Build 1 99376833 1D TGTATTTCTT A/- AATATATTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 2 47695 CASAVA_Build 1 99377832 2D GCCTTATTAC AA/-- AAGAGTCAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 4 2 47696 CASAVA_Build 1 99411584 1I TGCCAAGGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 8 9 47697 CASAVA_Build 1 99412796 1I CTTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 21 12 12 T 9 10 47698 CASAVA_Build 1 99426032 1I ATCAGGGGGT -/G GGGGGGCTAG 1634 het 1634 ref 21 11 5 5 G 6 7 47699 CASAVA_Build 1 99432903 2D AGATGACACA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 AC 7 6 47700 CASAVA_Build 1 99435540 3I CTAAGACTTT ---/AAG AAGACCTCTA 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 AAG 1 2 47701 CASAVA_Build 1 99453844 1D GCCAGAAAGG C/- TTGCAGATTC 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 C 1 0 47702 CASAVA_Build 1 99458031 1D TTCTAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 22 9 T 11 10 47703 CASAVA_Build 1 99472340 1I TTCTTTTCCC -/A GGAAAGTATA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 0 1 47704 CASAVA_Build 1 99481181 1I ATTCCAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 9 10 47705 CASAVA_Build 1 99503347 1D TACGCTTCTG A/- AATTGGATCT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 3 2 47706 CASAVA_Build 1 99525397 4D TTCCATGGTG TATA/---- TATATATACC 3070 hom 108 het 39 0 36 4 TA 6 4 47707 CASAVA_Build 1 99532595 1I ATCCCAGCAC -/T TTTAGGAGGC 3070 het 2552 hom 16 6 10 0 T 3 4 47708 CASAVA_Build 1 99552720 1I ATCCAGGCTT -/G GGGGCTCCCC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 4 5 47709 CASAVA_Build 1 99553424 1I TAGCAAGGTC -/A AAAATTTGTG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 4 5 47710 CASAVA_Build 1 99554533 1D ACCAACTGCT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 8 7 47711 CASAVA_Build 1 99581850 1I ATTAAAAAAA -/G AAAAGGATAA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 G 0 1 47712 CASAVA_Build 1 99590802 1I GTTTTGCCTT -/G GCAATTAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 2 47713 CASAVA_Build 1 99596972 1D CATGTTTTTC T/- TCTACTTCAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 1 47714 CASAVA_Build 1 99602523 2I GTGAGTGTGG --/TC TCTCCCCCTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TC 2 3 47715 CASAVA_Build 1 99611467 1D GGGGGGGGGG A/- GAGAGAGAGA 3070 het 712 hom 25 8 12 6 A 1 0 47716 CASAVA_Build 1 99645702 10D TGATGATTAA CAAAATCTGT/---------- CAAAATCTGT 3070 hom 81 het 26 0 28 2 CAAAATCTGT 2 1 47717 CASAVA_Build 1 99646121 6I ATACATAAAT ------/ATATAG ATATAGATAA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 ATATAG 1 2 47718 CASAVA_Build 1 99663492 7I AAATGACACA -------/CAGATGC CAGATGCCAC 3070 hom 93 het 40 0 31 9 CAGATGC 1 2 47719 CASAVA_Build 1 99668507 2I ATTCAAGTAT --/AC AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AC 0 1 47720 CASAVA_Build 1 99669792 1D TTCAATTTCC T/- GCAATAGTTG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 1 0 47721 CASAVA_Build 1 99683314 3I GAAAATCATC ---/TTT TTATCATTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 5 47722 CASAVA_Build 1 99706240 1D CACAATGCAT G/- GAACATCTAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 2 1 47723 CASAVA_Build 1 99710197 1D TAGCAAAGAG A/- CCCTGATAAA 3070 hom 135 het 51 0 45 9 A 1 0 47724 CASAVA_Build 1 99715144 1I TCTAAAATTA -/T TTTTAGTTTT 3070 hom 51 het 19 0 16 3 T 4 5 47725 CASAVA_Build 1 99715522 1D AGAAAGAAAT A/- AAAGGCATTC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 4 3 47726 CASAVA_Build 1 99717528 11D TGTTCATACT TCCTGTGGTCA/----------- TATGAATAAT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 TCCTGTGGTCA 1 0 47727 CASAVA_Build 1 99719482 2I TTCTTATAAC --/TG TAAAATTACT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TG 0 1 47728 CASAVA_Build 1 99723586 2I ATGATGATTG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 49 0 32 17 A 9 11 47729 CASAVA_Build 1 99725159 1I CTAGGAAGGG -/T TTTTTTTTTT 1483 het 1483 ref 47 17 7 23 T 15 16 47730 CASAVA_Build 1 99728472 2D TTTGTTTTTT TG/-- TTGTTGTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TG 1 0 47731 CASAVA_Build 1 99730482 1I CTTTTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 10 11 47732 CASAVA_Build 1 99741388 1D TTCTTCTTAG A/- AAATTCTTAT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 4 3 47733 CASAVA_Build 1 99745063 1I AATTAGAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 9 10 47734 CASAVA_Build 1 99753837 1D TGAAATGGGG A/- AAAAAATCAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 6 47735 CASAVA_Build 1 99754313 1D GCCCCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 2804 het 324 hom 15 2 8 5 A 11 10 47736 CASAVA_Build 1 99760787 2D CAATCCTGTG AT/-- AACAACATTA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 AT 1 0 47737 CASAVA_Build 1 99777506 4D AACAAATAGA TTAT/---- TTATCCATCT 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 TTAT 2 1 47738 CASAVA_Build 1 99787781 1D CTTCAAACTC T/- TTGCACTTAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 3 2 47739 CASAVA_Build 1 99789997 1I CACAGCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1654 hom 41 4 27 10 A 11 12 47740 CASAVA_Build 1 99803740 2D TTTCACATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 16 0 15 3 TA 8 7 47741 CASAVA_Build 1 99805901 1D TATATACTGT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 28 17 9 3 A 8 7 47742 CASAVA_Build 1 99806343 1I TAGGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 11 12 47743 CASAVA_Build 1 99833162 1D TTGTTTGGGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 14 12 2 T 9 8 47744 CASAVA_Build 1 99833875 3D ATAAGATATC TGT/--- TATTATAACC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TGT 1 0 47745 CASAVA_Build 1 99854825 1D GTATCTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 704 hom 26 4 12 10 A 15 14 47746 CASAVA_Build 1 99894081 14D CACACACGCA CACACACACACATG/-------------- CACACACACA 3070 hom 68 het 33 0 30 7 CACACACACACATG 1 0 47747 CASAVA_Build 1 99898784 1D TGCCTAGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 9 47748 CASAVA_Build 1 99906027 1D TTTGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 29 8 T 14 13 47749 CASAVA_Build 1 99926042 1I GAAGGCCAAG -/A AACCACCAGG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 2 3 47750 CASAVA_Build 1 99957215 1D CAGCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 12 11 47751 CASAVA_Build 1 99970989 1D TTTGAGACAA T/- TTTTTTTTTT 2939 het 953 hom 21 4 10 7 T 17 16 47752 CASAVA_Build 1 99978025 1I TCTCAACACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 38 2 31 5 T 10 11 47753 CASAVA_Build 1 99981150 1I TAAATAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 9 10 47754 CASAVA_Build 1 99996095 1D GCCTGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1234 hom 38 3 28 7 A 13 12 47755 CASAVA_Build 1 99999933 1D CAGAGCTTAT A/- AAAAAAAAAA 1332 het 1332 ref 33 27 3 3 A 11 10 47756 CASAVA_Build 1 100005539 1D TTTTGTTTTG T/- TTTGAGACGG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 4 3 47757 CASAVA_Build 1 100021560 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 32 1 19 12 A 12 13 47758 CASAVA_Build 1 100025770 1I CACTGCGCCT -/G GCCCATGCTC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 1 2 47759 CASAVA_Build 1 100030635 1I ATTCATTTAA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 7 8 47760 CASAVA_Build 1 100036620 2I ATTTTGAGCC --/TA TGTGTGTCTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TA 0 1 47761 CASAVA_Build 1 100045584 8I ATGTGGTTGT --------/TAGCAACA TACAATTCCC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TAGCAACA 0 1 47762 CASAVA_Build 1 100055139 1D AAATGGTGAC A/- GGGGAGGGAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 0 47763 CASAVA_Build 1 100056094 1I AAAACTGGTT -/G GGGGGAAGAA 3070 hom 109 het 43 0 37 6 G 5 6 47764 CASAVA_Build 1 100060488 1I AGAGCCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 10 11 47765 CASAVA_Build 1 100071003 4I ATTAAAAAAT ----/AAAC AAATAATAGA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AAAC 0 1 47766 CASAVA_Build 1 100090060 1I TTTCACACAT -/A ACAATGTGAT 3070 hom 48 het 35 1 27 7 A 1 2 47767 CASAVA_Build 1 100097556 2I CCTTTTTCCC --/CT GTTTGTAGTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CT 0 1 47768 CASAVA_Build 1 100097702 1D GGTTATTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 10 9 47769 CASAVA_Build 1 100109555 3D AGTTAATGTG CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 hom 72 het 30 0 23 7 C 13 10 47770 CASAVA_Build 1 100110679 1D TTTACATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 13 12 47771 CASAVA_Build 1 100113984 1D TTTTTAAAAA T/- ATCTTTGCAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 1 0 47772 CASAVA_Build 1 100120287 14D TCTCAAAAAA AAAAAAAAAAAAAG/-------------- AAAGAAATTT 3070 het 3070 hom 25 13 10 5 AAAAAAAAAAAAAG 1 0 47773 CASAVA_Build 1 100124632 1D CTGTCTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 15 15 A 11 10 47774 CASAVA_Build 1 100127237 2I TTACTTTTCC --/CA CCTGCAAAAT 3070 het 3070 hom 56 22 31 3 CA 0 1 47775 CASAVA_Build 1 100128794 3D AGAAAAAAAA AAT/--- ATATATATAT 2256 het 2256 ref 12 6 6 0 AAT 1 0 47776 CASAVA_Build 1 100130975 5I GGCTAGCTGA -----/TTCTT TTCTTCATGT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 TTCTT 1 2 47777 CASAVA_Build 1 100146355 1D TCCAAGTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1212 hom 37 7 16 14 T 12 11 47778 CASAVA_Build 1 100153698 1I TCAACCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 12 4 T 13 14 47779 CASAVA_Build 1 100162505 5I AACTATACAC -----/TTCTT TTCTGGTGAC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 TTCTT 0 1 47780 CASAVA_Build 1 100163926 1D TTCCAAATCC A/- AAAAGTATTC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 5 4 47781 CASAVA_Build 1 100167201 1I TCACATCTGT -/A ATCCTAGTAC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 1 2 47782 CASAVA_Build 1 100169019 2I AAAAACAGAC --/AA GAGATGCAGA 3047 het 3047 ref 36 22 7 7 A 0 2 47783 CASAVA_Build 1 100169331 4D ATTAAGAATT TATA/---- TATAGAGTAG 3070 het 3070 hom 29 11 17 3 TA 4 2 47784 CASAVA_Build 1 100170129 1I AAGGAAATTA -/T ATTTCAATAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 0 1 47785 CASAVA_Build 1 100204218 2D TCTTGTTTGT TG/-- TCTTTTCATT 3070 het 3070 hom 33 11 17 6 TG 1 0 47786 CASAVA_Build 1 100213095 1D TGCATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2294 het 2294 ref 52 32 6 14 T 13 12 47787 CASAVA_Build 1 100324658 1D AATGATTTGA T/- TTTTTTTTTT 2470 het 2470 ref 31 16 10 6 T 17 16 47788 CASAVA_Build 1 100345202 3D CTGAAGAATG TAT/--- TATTATTAAC 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 TAT 3 2 47789 CASAVA_Build 1 100350128 1D ATTTTTGTTT A/- AAAAAAAAGT 1285 het 1285 ref 34 28 3 3 A 9 8 47790 CASAVA_Build 1 100350242 1I ATTCTGGAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 8 9 47791 CASAVA_Build 1 100353558 1D AATAAGTCTG T/- TTTCAACAAA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 T 4 3 47792 CASAVA_Build 1 100356460 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 278 hom 28 1 23 4 A 12 11 47793 CASAVA_Build 1 100356903 2D CATAATTTAC AG/-- AGTTATAAGT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AG 2 1 47794 CASAVA_Build 1 100361115 1I ATTCAATGGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 9 47795 CASAVA_Build 1 100365628 1D CTTGTTGAAC A/- TATGATTGGA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 1 0 47796 CASAVA_Build 1 100413219 29D TTGAAAGCTC CCTGAGAAGCAGATGCCAGCACCATGCTT/----------------------------- CCTGTAAAGC 3070 hom 75 het 23 0 26 2 CCTGAGAAGCAGATGCCAGCACCATGCTT 1 0 47797 CASAVA_Build 1 100422482 1I TAGTCTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 28 1 20 7 T 11 12 47798 CASAVA_Build 1 100428284 2D TTAAAACAAT AA/-- AAGTGTATTA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 4 2 47799 CASAVA_Build 1 100434679 2D CCCTTCTTCC TG/-- TACAGTACAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TG 1 0 47800 CASAVA_Build 1 100455940 3I AGGATTACAG ---/ATA ATGTGTCTAT 3070 hom 114 het 48 0 38 10 ATA 0 1 47801 CASAVA_Build 1 100456085 5D TGTGTGACTT TAGAC/----- TAGTTACTTA 3070 hom 141 het 51 0 47 7 TAGAC 1 0 47802 CASAVA_Build 1 100457077 2D TGGGTAGAGT GG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 3 het 19 1 14 4 G 11 9 47803 CASAVA_Build 1 100458414 1D TTCTGCAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 12 11 47804 CASAVA_Build 1 100465548 15D TACAGGTAGC ATACAGATAGCCCCA/--------------- ATACAGATAG 3070 hom 69 het 28 0 24 8 ATACAGATAGCCCCA 2 1 47805 CASAVA_Build 1 100474238 1I CCATCCCTCC -/T TTTTTTTTTT 1273 het 1273 ref 39 23 3 13 T 11 12 47806 CASAVA_Build 1 100477699 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 12 11 47807 CASAVA_Build 1 100481405 1D CCTTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2823 het 5 hom 14 1 9 4 A 16 15 47808 CASAVA_Build 1 100490064 9D CAGATTAGTT TTAGTTATA/--------- TTAGTTATAT 3070 het 3070 ref 19 8 9 4 TTAGTTATA 2 1 47809 CASAVA_Build 1 100490905 4D TTTTCATTCC TTTG/---- TTTATTTTAG 3070 hom 123 het 46 0 42 5 TTTG 1 0 47810 CASAVA_Build 1 100495713 1D TGTTTATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 27 5 T 12 11 47811 CASAVA_Build 1 100497435 2D GTTGCCTGTT CA/-- CTCTGATGGT 2960 hom 15 het 6 0 6 0 CA 1 0 47812 CASAVA_Build 1 100499972 1I TAAATGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 11 12 47813 CASAVA_Build 1 100502739 1D AGTAGTAAGG T/- CTTTTTGCCT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 1 0 47814 CASAVA_Build 1 100504408 1I AGGCTCCTGC -/A GCCCCAGGCA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 0 1 47815 CASAVA_Build 1 100508345 3D TAAAACTTTT GAA/--- GAAGGTTTTA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 GAA 2 1 47816 CASAVA_Build 1 100520872 1I TTTTATGCAC -/A AAAATCATTT 3070 hom 123 het 53 0 42 11 A 4 5 47817 CASAVA_Build 1 100534026 1I TGCACTTCAT -/C CTGGGAGGCA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 C 1 2 47818 CASAVA_Build 1 100536536 1I TGGTGTTGAT -/G GGGGTGGTGA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 4 5 47819 CASAVA_Build 1 100573036 2I AGCAAACAAC --/AG GGTTAAATAG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 AG 0 1 47820 CASAVA_Build 1 100607974 1D CTTCTAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2252 het 2252 ref 39 24 6 9 T 15 14 47821 CASAVA_Build 1 100632107 2I GCAAAAAAAA --/AT ATATATATAT 1280 het 1280 ref 14 6 4 4 AT 7 8 47822 CASAVA_Build 1 100635302 2I TGATATAGAC --/AT CATCATGTTC 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 AT 0 1 47823 CASAVA_Build 1 100669987 1D CTCTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 1189 het 1189 ref 33 23 4 6 A 13 12 47824 CASAVA_Build 1 100684793 1D GTATTTTGCA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 9 8 47825 CASAVA_Build 1 100705579 1D ATGCACACAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 49 1 39 10 T 9 8 47826 CASAVA_Build 1 100712754 1I GTGGAGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 525 hom 33 3 21 9 T 12 13 47827 CASAVA_Build 1 100727727 1I ATCACTCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1074 hom 37 4 29 4 T 12 13 47828 CASAVA_Build 1 100729483 2D TCTGGAAGAC TA/-- TGTGCCAGAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TA 1 0 47829 CASAVA_Build 1 100730023 9I GCCAGATACC ---------/TTTTTTTTT TTTTTTTGAG 3070 hom 55 het 23 0 17 6 T 7 16 47830 CASAVA_Build 1 100730985 4D TTAGCCCTGC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 76 het 37 0 24 14 TG 11 9 47831 CASAVA_Build 1 100736068 2D AGTGCCTGGC AG/-- AGTTAGTGCT 3070 het 3070 hom 49 18 23 9 AG 2 1 47832 CASAVA_Build 1 100743463 2I ATGAAGACTC --/TG TGGATGTTTT 3070 hom 150 het 60 0 50 10 TG 1 2 47833 CASAVA_Build 1 100744558 1I AACATTGCGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 8 9 47834 CASAVA_Build 1 100752256 1D AAAATCTCTT G/- GTTATATAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 5 G 2 1 47835 CASAVA_Build 1 100760434 1D AGAGATGCAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 9 8 47836 CASAVA_Build 1 100762676 2I ACGGGAACTC --/TA TGTTTTGGGA 3070 hom 95 het 35 0 32 3 TA 0 1 47837 CASAVA_Build 1 100771710 1I ATACCTACCA -/G GTACCCTTGG 3070 hom 96 het 37 0 31 6 G 1 2 47838 CASAVA_Build 1 100782816 5D AAGGTTTTTG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 9 GTTTT 3 2 47839 CASAVA_Build 1 100786808 9I TGTTATTGTC ---------/ATTGTCATT ATTGTCATTA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 ATTGTCATT 1 2 47840 CASAVA_Build 1 100787724 1D AGGTCTATGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 T 10 9 47841 CASAVA_Build 1 100789505 1D AACATCATGT G/- GTAGGAATGC 3070 het 3070 hom 38 12 25 2 G 2 1 47842 CASAVA_Build 1 100790910 2D TTTTTTTGGG TT/-- TTCTCTCTCT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 T 4 2 47843 CASAVA_Build 1 100792005 1D TAGTTAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1369 hom 28 7 20 1 T 11 10 47844 CASAVA_Build 1 100799317 1I TTTTGGATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 9 10 47845 CASAVA_Build 1 100806139 24D ATGTCTATGC CTATGTCTATGTCTATGTCTATGT/------------------------ CTATGTCTAT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 CTATGT 8 4 47846 CASAVA_Build 1 100807892 1I ATATGTTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 9 10 47847 CASAVA_Build 1 100808091 1I CTTAAAAAAA -/T AATCTGGCTT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 0 1 47848 CASAVA_Build 1 100808561 11D48M1D CATCAAAACT AAAAGAACTAGAAAAGAACTAGAGAACCAAGTGCAAATGAACCCCAATGCTAGCAGAAGA/-----------AAAAGAACTAGAGAACCAAGTGCAAATGAACCCCAATGCTAGCAGAAG- ACAAGGAATA 3070 hom 36 het 20 0 12 22 N/A 0 0 47849 CASAVA_Build 1 100809774 1I TTATGAACAC -/A AAAAAAAGAA 90 het 90 ref 21 2 3 16 A 7 8 47850 CASAVA_Build 1 100810662 2D CTATGCAGTC AT/-- AAAAAATTTA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AT 1 0 47851 CASAVA_Build 1 100811766 1D21M1D AAACAAACAA TTCCCATTAAAAAGTGGGCAAAG/-TCCCATTAAAAAGTGGGCAAA- GATACGAAAA 3070 hom 54 het 18 0 19 4 N/A 0 0 47852 CASAVA_Build 1 100811921 1I CACCAGGCAG -/A ATGGCTATTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 1 2 47853 CASAVA_Build 1 100812289 2D ATCTGTAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 19 12 7 A 13 11 47854 CASAVA_Build 1 100812686 1I ATAAAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 11 12 47855 CASAVA_Build 1 100812771 5I TTTTTGAGTT -----/TTCTC TTCTTTGGGA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTCTC 0 1 47856 CASAVA_Build 1 100813829 13D GAACAGAGGC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1646 hom 34 10 15 11 A 23 10 47857 CASAVA_Build 1 100815031 4D ATCTATGCCA TCTG/---- TCTGTCTGTC 3070 het 3070 ref 50 25 19 8 TCTG 4 3 47858 CASAVA_Build 1 100815115 4D TTTATTCCTC ACAA/---- ACAATCCATT 3070 het 3070 ref 40 22 15 6 ACAA 2 1 47859 CASAVA_Build 1 100815839 1I GTTTATTTCC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 46 22 23 1 T 7 8 47860 CASAVA_Build 1 100816452 1D GCATAAATGC T/- TTTTCACAGA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 5 4 47861 CASAVA_Build 1 100817518 1D ATCCACATGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 A 10 9 47862 CASAVA_Build 1 100817704 1I TCCACGAAAG -/A AAAAAATTTG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 6 7 47863 CASAVA_Build 1 100817779 1I AATGGAAAAA -/C ATTCCACAAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 C 0 1 47864 CASAVA_Build 1 100818110 4I AATTTGAGCC ----/ATTT ATTTAAAGAC 3070 het 3070 hom 58 23 26 9 ATTT 1 2 47865 CASAVA_Build 1 100820023 1I AAAAGTGGTC -/T TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 6 7 47866 CASAVA_Build 1 100820588 1D CAAATAAACA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 8 7 47867 CASAVA_Build 1 100820838 1D TGTAAAAAAA C/- CCTAGACATC 3070 het 3070 hom 44 20 20 7 C 3 2 47868 CASAVA_Build 1 100821435 1D TTTTTGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 36 1 26 9 T 11 10 47869 CASAVA_Build 1 100828039 2D ATATTTCACT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AC 9 8 47870 CASAVA_Build 1 100853580 1D CCACTTTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2706 hom 22 9 9 4 T 10 9 47871 CASAVA_Build 1 100857099 1D TCATTCATGG T/- TTTCTCTGCC 3070 het 3070 hom 44 18 22 7 T 4 3 47872 CASAVA_Build 1 100859166 2D ACTTGTATCC TA/-- TAGTGGTTAA 3070 het 3070 hom 36 13 21 6 TA 2 1 47873 CASAVA_Build 1 100860858 1D CAGAGCAATT C/- TTTTGTTCCA 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 C 1 0 47874 CASAVA_Build 1 100865990 1I AACTAAAAGA -/T GAAGCAACAG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 0 1 47875 CASAVA_Build 1 100869847 1D GTTAGCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 38 2 28 8 A 13 12 47876 CASAVA_Build 1 100886964 1D GATCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2446 hom 43 10 17 16 A 13 12 47877 CASAVA_Build 1 100889695 1I CCAGAAATAC -/A GCTAACAAGG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 1 47878 CASAVA_Build 1 100889776 5D CACACACACA CACAC/----- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 CACAC 1 0 47879 CASAVA_Build 1 100896414 1I TGCAGGAATG -/T TTTTATCTCT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 4 5 47880 CASAVA_Build 1 100899696 2I TAATTATAAA --/CT CTCACGTTAC 3070 hom 102 het 41 0 34 7 CT 1 2 47881 CASAVA_Build 1 100908699 4I TAAAATTGAT ----/AGTA AGTTTATGTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AGTA 0 1 47882 CASAVA_Build 1 100921504 1D TTAAAAGTTT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 9 8 47883 CASAVA_Build 1 100927135 1D GGAGTGGTGG A/- AGTAGGTATC 3070 het 3070 ref 39 17 14 9 A 2 1 47884 CASAVA_Build 1 100934614 1D TGCCTTTTTT G/- CTTCCATATA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 G 1 0 47885 CASAVA_Build 1 100939337 1I CATTAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 10 11 47886 CASAVA_Build 1 100944314 6I CTAGTTTTTG ------/TTCCAC TTCCACTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 TTCCAC 1 2 47887 CASAVA_Build 1 100966860 4D TTAAATGAGA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 2 AT 11 9 47888 CASAVA_Build 1 100967554 1I TTGTTTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 36 0 30 6 T 11 12 47889 CASAVA_Build 1 100979582 4I TCCCAATAAC ----/TAAT TAGATTGATC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAAT 0 1 47890 CASAVA_Build 1 100984965 9I CTCTGCAGCA ---------/GATATCCTT GATATTGTTT 3070 hom 138 het 51 0 46 5 GATATCCTT 0 1 47891 CASAVA_Build 1 100999532 1I AATTTAAAGG -/A AAAAAATTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 7 47892 CASAVA_Build 1 101005660 1I TCTCAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 11 12 47893 CASAVA_Build 1 101013059 2I GAAAATATGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 48 19 19 10 TA 5 6 47894 CASAVA_Build 1 101017793 5I CCATAAAAAA -----/CTTTT CTTTTCATAG 3070 hom 129 het 44 0 43 1 CTTTT 1 2 47895 CASAVA_Build 1 101034630 1D AAAGTGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 9 7 A 12 11 47896 CASAVA_Build 1 101039803 1D GGTTTTTTTT A/- ATTATACTTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 2 1 47897 CASAVA_Build 1 101048370 4D AAAATAAATT TATC/---- TAACATCTGT 3070 het 3070 hom 24 11 13 1 TATC 1 0 47898 CASAVA_Build 1 101051628 2D GAGTTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 26 3 13 12 A 16 14 47899 CASAVA_Build 1 101054287 1D ACACAGTACT G/- GAAGTCCTAG 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 G 2 1 47900 CASAVA_Build 1 101055955 30D24M8D AGAAACTGTG ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCTCACATATACATATATG/------------------------------AGATATATATATATCTCACATATA-------- TATATATCAC 2248 hom 18 het 6 0 7 1 N/A 0 0 47901 CASAVA_Build 1 101061898 1I GAGACACAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 1408 hom 16 3 10 3 A 8 9 47902 CASAVA_Build 1 101066486 1I GGTTGGTGGG -/T TTTTTTTTTT 2800 het 2800 ref 31 13 8 10 T 10 11 47903 CASAVA_Build 1 101066594 1D ATAGGTAAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 8 18 6 T 9 8 47904 CASAVA_Build 1 101068514 2D TTTTCAAGTC TA/-- TGTATACTTT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 TA 1 0 47905 CASAVA_Build 1 101069293 3D ATAATTAAAT GAC/--- GAATAATTAA 3070 het 2925 hom 23 10 10 3 GAC 1 0 47906 CASAVA_Build 1 101074929 2I TTACTTTTTC --/CT CTGTTAAGAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 CT 1 2 47907 CASAVA_Build 1 101077753 1I TAATATTGTC -/T TTTTTTTTTT 2888 het 2888 ref 33 15 10 8 T 13 14 47908 CASAVA_Build 1 101139469 1I CCTTCCTTTG -/T TTTTTGCCTC 2950 het 2950 ref 25 12 8 5 T 5 6 47909 CASAVA_Build 1 101140107 3I1M9D GGAAATTTAT ---AGTTTAAATT/GCCA--------- TATAGTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 6 N/A 0 0 47910 CASAVA_Build 1 101148115 1I TTTCTCCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 9 10 47911 CASAVA_Build 1 101162825 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2443 het 2085 hom 24 10 8 6 A 10 11 47912 CASAVA_Build 1 101164907 16I CTCTGTGCCA ----------------/GGCAGTGAACAACATG GGCAAATAGC 3070 het 3070 ref 32 21 12 1 GGCAGTGAACAACATG 0 1 47913 CASAVA_Build 1 101166602 1I TTAAAAGTAG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 T 7 8 47914 CASAVA_Build 1 101169688 1I TCACTGAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 9 10 47915 CASAVA_Build 1 101179089 1D TCACAAATCC G/- TTGTAACCTG 3070 het 3070 hom 37 11 23 4 G 1 0 47916 CASAVA_Build 1 101191212 1I GATCTGATGA -/T TTTAAAAGTG 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 3 4 47917 CASAVA_Build 1 101201855 2D CACAAACCAC AT/-- GTGGCTAGTG 3070 het 3070 hom 58 28 26 5 AT 1 0 47918 CASAVA_Build 1 101208830 1D TACAAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2947 hom 32 9 19 4 A 13 12 47919 CASAVA_Build 1 101215159 1I TAAGTAGTCA -/T TTAGAAGTTT 3070 het 3070 ref 55 25 23 7 T 2 3 47920 CASAVA_Build 1 101223850 1D CATTTACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 A 11 10 47921 CASAVA_Build 1 101225813 1I TTGTCTGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 12 12 13 T 14 15 47922 CASAVA_Build 1 101231187 4D AAACAATTCA AAGT/---- AAGTGGCAAT 3070 het 3070 ref 58 30 24 4 AAGT 2 1 47923 CASAVA_Build 1 101235512 1I CCTTCCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 10 11 47924 CASAVA_Build 1 101235673 3D CCACGCCCGG CTA/--- ATTTTTTGTA 3070 het 1368 hom 13 3 9 1 CTA 1 0 47925 CASAVA_Build 1 101245899 1D AACAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2835 hom 20 10 8 3 A 12 11 47926 CASAVA_Build 1 101249389 1D AAAACTGTAC A/- AAAATGAATC 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 A 5 4 47927 CASAVA_Build 1 101249887 3I AGAGCAAAAT ---/ATG ATGGAGAAAG 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 ATG 1 2 47928 CASAVA_Build 1 101255513 4D ATTTGGTTAC TGTG/---- TGTAATTAGG 3070 het 3070 hom 50 21 26 5 TG 3 1 47929 CASAVA_Build 1 101270507 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 A 10 11 47930 CASAVA_Build 1 101271840 1D AATATACTTT A/- AAAAAAAAAT 746 het 746 ref 13 4 2 7 A 10 9 47931 CASAVA_Build 1 101280680 15D TCATCTCTGC TGTTTTCTTAATTCA/--------------- TTTTATCTGA 3070 het 3070 ref 53 31 19 7 TGTTTTCTTAATTCA 1 0 47932 CASAVA_Build 1 101281158 4D TTCATTCCTT TCCC/---- TCCCTCCCTT 1532 het 366 hom 13 2 6 5 TCCC 3 2 47933 CASAVA_Build 1 101286485 1I GATACCCCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 13 12 T 9 10 47934 CASAVA_Build 1 101302517 2I CCCAGGACTC --/AG GGGATTCCTG 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 AG 0 1 47935 CASAVA_Build 1 101338191 1I GCATTCTACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 9 10 47936 CASAVA_Build 1 101357041 1I CTTTCAGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 9 10 47937 CASAVA_Build 1 101359294 1I AATTACTGAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 8 9 47938 CASAVA_Build 1 101371874 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTATTTT 3070 het 2437 hom 23 8 10 5 T 5 6 47939 CASAVA_Build 1 101382285 22D ACCCAGCACC TTCTGTTAAGAAGCCAGGATTA/---------------------- TTTATTTGCT 1926 het 1926 ref 16 17 5 3 TTCTGTTAAGAAGCCAGGATTA 1 0 47940 CASAVA_Build 1 101393679 1I CACATGGCGG -/C GGGGAAGGGG 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 C 0 1 47941 CASAVA_Build 1 101410408 14D TCATTTGAGC CCAGGAGTTTGAGA/-------------- CCAGGAGTTT 3070 hom 34 het 19 0 11 9 CCAGGAGTTTGAGA 3 2 47942 CASAVA_Build 1 101413127 1I AAGCTTCTTT -/A ACTCACATGC 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 1 2 47943 CASAVA_Build 1 101413519 4I GTACACACAT ----/ACAC ACATGCAGAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AC 1 3 47944 CASAVA_Build 1 101430158 11I ATTGAATCAT -----------/AGTAGAGTGTG GATGGAAGAA 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 AGTAGAGTGTG 0 1 47945 CASAVA_Build 1 101447282 1D CCGGGGGTTT C/- AGGTTCCAGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 1 0 47946 CASAVA_Build 1 101453288 1I31M1D ACAAAAGTAA -TTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTCG/TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGTC- CCCAGGCTGG 3070 hom 69 het 25 0 25 10 N/A 0 0 47947 CASAVA_Build 1 101462470 3D CATTAGCCAT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 41 23 9 10 TTA 7 6 47948 CASAVA_Build 1 101471225 2D AGTTGAAAGT AA/-- AGAGTCCTCA 3070 het 3070 hom 52 19 25 9 A 3 1 47949 CASAVA_Build 1 101476822 1I TTTGATTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 8 9 47950 CASAVA_Build 1 101480157 2I TGTGTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TG 0 1 47951 CASAVA_Build 1 101496718 76D AGGGCTAGTC TGTCTGTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTT/---------------------------------------------------------------------------- TCTTTCTTTC 3070 hom 66 het 25 0 21 5 TGTCTGTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTT 1 0 47952 CASAVA_Build 1 101502418 1I GATAAAAAAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 74 het 30 0 24 6 A 7 8 47953 CASAVA_Build 1 101527693 1D TTTGGAGATA T/- TCCCCCATAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 2 1 47954 CASAVA_Build 1 101561163 1D TTCTCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 11 10 A 11 10 47955 CASAVA_Build 1 101564695 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 8 9 47956 CASAVA_Build 1 101568699 3I AAATCTTCTG ---/GAA GAAGGTGATG 3070 hom 129 het 47 0 40 7 GAA 1 2 47957 CASAVA_Build 1 101631604 1I AATAATTCAG -/A AAACGCTGAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 3 4 47958 CASAVA_Build 1 101633909 1I TTTTAAGAAG -/A GGACCCAATA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 0 1 47959 CASAVA_Build 1 101634927 1D TTTCAGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 43 0 34 11 A 10 9 47960 CASAVA_Build 1 101636006 9I TTTAGTTGGT ---------/TGTATAGCC TGGAAATTTG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TGTATAGCC 0 1 47961 CASAVA_Build 1 101636159 1D TAATATATGC T/- TTTTTTGGAA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 7 6 47962 CASAVA_Build 1 101636765 1D ATTATGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 12 11 47963 CASAVA_Build 1 101637827 1D TTCATGTAAT A/- AGAGTAAATT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 2 1 47964 CASAVA_Build 1 101640011 2D TTTTAATCCT TA/-- TATATATATG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 5 4 47965 CASAVA_Build 1 101654207 1D TGGCCATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 205 hom 22 1 19 2 A 11 10 47966 CASAVA_Build 1 101668580 1D GATGCCCATA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 7 47967 CASAVA_Build 1 101668695 1D TTTGGCCCCT A/- AAAAGTCATG 3070 hom 81 het 28 0 28 1 A 5 4 47968 CASAVA_Build 1 101677669 1I CTTTTTTTTT -/C CCCCCATGAA 3070 het 387 hom 42 1 32 9 C 5 6 47969 CASAVA_Build 1 101679510 1I CAGGGTGTGC -/T GGGATGAAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 0 1 47970 CASAVA_Build 1 101680043 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 18 0 12 6 T 11 10 47971 CASAVA_Build 1 101700857 1D TGGTACTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 45 2 37 6 A 14 13 47972 CASAVA_Build 1 101702928 1D TGTTGAGTAG A/- GGTCGCTTTT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 1 0 47973 CASAVA_Build 1 101708657 1D AAAACAAAAA C/- AAAAAACAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 47974 CASAVA_Build 1 101711409 1I GTATTATTTA -/C CCATATTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 2 3 47975 CASAVA_Build 1 101725492 1I TGCAGTGGTG -/C AATCTTAGTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 0 1 47976 CASAVA_Build 1 101733104 1I TTGTTTAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 10 47977 CASAVA_Build 1 101733368 1I GCTTCATCCC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 189 hom 28 1 23 4 T 8 9 47978 CASAVA_Build 1 101733840 1I CCCTAAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1381 hom 36 5 21 10 T 11 12 47979 CASAVA_Build 1 101734010 2D TTAAAAAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 29 8 T 12 10 47980 CASAVA_Build 1 101734326 1D CTCTCATCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 T 10 9 47981 CASAVA_Build 1 101760594 2D TGTATTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 13 11 47982 CASAVA_Build 1 101760942 1D CCTTCCTAAC T/- TTTCTCATAG 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 4 3 47983 CASAVA_Build 1 101774360 1D TTTTATTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 629 hom 26 3 16 7 T 15 14 47984 CASAVA_Build 1 101778161 3D CTTTGACTAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 28 2 16 10 T 19 16 47985 CASAVA_Build 1 101778794 5I TTAGTGGATG -----/AATAA TATTAGCCTG 3070 hom 114 het 39 0 35 4 AATAA 0 1 47986 CASAVA_Build 1 101781251 2D GAGTCTGAAT AG/-- AGTGAGGAGA 3070 hom 104 het 45 0 38 7 AG 2 1 47987 CASAVA_Build 1 101782563 3D GTCACCACCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 38 1 31 7 T 13 10 47988 CASAVA_Build 1 101784817 5D AAAACCAACC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 27 2 15 11 A 18 13 47989 CASAVA_Build 1 101795277 1I TTCTACCCCA -/C CCCCCCTTTT 3070 hom 80 het 33 0 22 11 C 6 7 47990 CASAVA_Build 1 101797841 1I TCTCTATGCA -/C CCCCTCCTAG 3070 hom 78 het 34 0 26 8 C 4 5 47991 CASAVA_Build 1 101799054 1I TTCTGTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 10 11 47992 CASAVA_Build 1 101799726 3I TTAGTCTGAC ---/CCA CCATCATCTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 CCA 1 2 47993 CASAVA_Build 1 101802761 4I ATTTAAGCAC ----/TCTA TCTGTTAGAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TCTA 0 1 47994 CASAVA_Build 1 101814194 1D TGAAGCTCTA T/- TGAAGATTGT 3070 hom 91 het 37 0 33 4 T 2 1 47995 CASAVA_Build 1 101821705 1D AGAAGGAGAG A/- GGACCCATGT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 1 0 47996 CASAVA_Build 1 101822775 1D GGATTTCGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 T 11 10 47997 CASAVA_Build 1 101823646 1D ATAAAATACA T/- GACATAAACA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 1 0 47998 CASAVA_Build 1 101827981 2I TTTCCATCAA --/GT GTTTTCTGTG 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 GT 1 2 47999 CASAVA_Build 1 101862539 7D ATAGAAAAGG AAAACAT/------- AGGTAAACTA 3070 het 3070 ref 41 27 12 2 AAAACAT 1 0 48000 CASAVA_Build 1 101867655 1D CACTATTCAC A/- ATAGCAAAGA 1433 hom 7 het 3 0 3 0 A 2 1 48001 CASAVA_Build 1 101868081 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1230 hom 15 3 12 0 A 10 9 48002 CASAVA_Build 1 101869848 7D AAGTTTTTCT GACTCAA/------- GACTCAAGGA 3070 het 3070 hom 28 10 15 6 GACTCAA 2 1 48003 CASAVA_Build 1 101870071 1D AAAGTCTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 12 17 11 T 10 9 48004 CASAVA_Build 1 101953760 1D TTCCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 28 2 18 8 T 12 11 48005 CASAVA_Build 1 101957992 2I CCCTAAATCA --/AT ATGTCTAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 AT 1 2 48006 CASAVA_Build 1 101962113 1I TCTACTAAGA -/T TTTTGAGGGA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 4 5 48007 CASAVA_Build 1 101962339 1I GGCAAGAGAG -/T TTTTTTTTTT 2682 het 2682 ref 31 20 9 2 T 10 11 48008 CASAVA_Build 1 101962438 2D CTATTTCTGT AG/-- AGTTTTACTG 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 AG 2 1 48009 CASAVA_Build 1 101968961 2I TGCTTACCAA --/CT CTCTCTCTCA 3070 hom 82 het 35 0 28 7 CT 4 5 48010 CASAVA_Build 1 101973507 4D ATATATAGGG CTGA/---- CTAAGGAACA 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 CTGA 1 0 48011 CASAVA_Build 1 101973762 1I GTCCAGGTGA -/G GGTATAGCCT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 G 2 3 48012 CASAVA_Build 1 101975273 1I TTCTTAAATT -/A TAAAAAAAAA 2884 het 2884 ref 29 14 9 6 A 0 1 48013 CASAVA_Build 1 101976507 1D TGCAAATTTT A/- AAAAAATTAC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 7 6 48014 CASAVA_Build 1 101979847 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2658 hom 28 11 9 8 T 11 10 48015 CASAVA_Build 1 101985380 1I TTAAAAAGTC -/A AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 6 7 48016 CASAVA_Build 1 101986074 1I TTGACATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 A 9 10 48017 CASAVA_Build 1 101991796 2D TTACGAACAT AC/-- TTATGTGCAC 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 AC 1 0 48018 CASAVA_Build 1 101995397 4D63M6I GAGGTTACAG TATTTAATTATTAAATTAAATTTAAATTTATAGTATTATAATTACAGTATAAGGTTACAGTATTATA------/----TAATTATTAAATTAAATTAAAATTTATAGTATTATAATTACAGTATAAGGTTACAGTATTATAATTATG TATAATAAAT 2961 het 2961 ref 22 23 9 8 N/A 0 0 48019 CASAVA_Build 1 101998530 1I AAGATCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 T 11 12 48020 CASAVA_Build 1 102009860 2D AAAATTAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 13 11 48021 CASAVA_Build 1 102010023 4D TCCTTCATAT TTTG/---- TTTGTTATAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 TTTG 2 1 48022 CASAVA_Build 1 102011988 4D AATGAAGTGA GAGT/---- ATTTTCTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 GAGT 1 0 48023 CASAVA_Build 1 102012655 3I AAATTAGCAT ---/AAG AAGAAATAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 AAG 1 2 48024 CASAVA_Build 1 102035016 1D AAAACAAATA T/- TCTGCCTTCT 3070 het 3070 hom 53 24 24 6 T 2 1 48025 CASAVA_Build 1 102042137 1I ACTTAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 11 12 48026 CASAVA_Build 1 102043375 3I AATGCAAATT ---/ACA ACACCTGATA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 ACA 1 2 48027 CASAVA_Build 1 102046281 2D GTCATAAAAC AT/-- GTGATTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 6 AT 1 0 48028 CASAVA_Build 1 102046509 6D GTGGTCATTA AAGATG/------ AAGATGGAAT 3070 het 3070 ref 22 11 7 6 AAGATG 2 1 48029 CASAVA_Build 1 102052411 1I CCAGCTAAGG -/T TTTTTTTTTT 2456 het 2456 ref 33 13 10 10 T 15 16 48030 CASAVA_Build 1 102053599 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2865 het 918 hom 15 5 9 1 A 15 14 48031 CASAVA_Build 1 102053757 1D TTAAAAACTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 A 9 8 48032 CASAVA_Build 1 102055813 1I CACTAATAGC -/T TCTGGATTTG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 1 2 48033 CASAVA_Build 1 102078618 1I ATTTCAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1111 hom 38 5 18 15 T 15 16 48034 CASAVA_Build 1 102085674 1D TAGGAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 11 10 48035 CASAVA_Build 1 102086653 1I ATCCAGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 11 12 48036 CASAVA_Build 1 102088294 4I CAAACCAAAA ----/TCTC TCTATCACTA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 TC 1 3 48037 CASAVA_Build 1 102089083 3D AAAAAGAGAT AAG/--- AAGGAGGACA 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 AAG 2 1 48038 CASAVA_Build 1 102092310 1D AGACAGATTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 9 8 48039 CASAVA_Build 1 102101138 1D ATGTAATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 15 11 20 T 15 14 48040 CASAVA_Build 1 102104564 1I AATAGATGAT -/A AAAATCCTAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 4 5 48041 CASAVA_Build 1 102111046 1D TAGTTTTAGG A/- AAAAAAGGTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 6 48042 CASAVA_Build 1 102113809 2I ACTTTATAAA --/AG AGTGTCATTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AG 1 2 48043 CASAVA_Build 1 102113917 3I TTGGAGAATG ---/TCA TCAATTCTCA 3070 hom 138 het 53 0 47 7 TCA 1 2 48044 CASAVA_Build 1 102115294 4I ATATCTGACT ----/AGTA ATAAATGATA 3070 hom 138 het 48 0 47 1 AGTA 0 1 48045 CASAVA_Build 1 102120487 1D TATATATATA T/- ATATATAAAG 549 hom 5 het 9 0 2 7 T 1 0 48046 CASAVA_Build 1 102124412 1D CATGGTATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 A 10 9 48047 CASAVA_Build 1 102128499 4D ATGCCTATAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 105 het 41 0 35 8 AC 9 7 48048 CASAVA_Build 1 102130393 1D TCGGTATCAG A/- ATGACTAGAG 3070 het 3070 ref 34 15 15 5 A 2 1 48049 CASAVA_Build 1 102130549 1D GAGCAGCAAC A/- ACTGAAGAGC 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 A 2 1 48050 CASAVA_Build 1 102148661 2I CTAAATAGAC --/TG TAAAGAGTAT 3070 het 2368 hom 26 7 13 6 TG 0 1 48051 CASAVA_Build 1 102154546 2I28M1D ATGTCTCTCC --TTTTTTTTTAATTTTTATTTTTTAAACAG/TTTTTTTTTTTAATTTTTATTTTTTAAACA- ACCTGGAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 17 8 N/A 0 0 48052 CASAVA_Build 1 102155648 1D GCAACCTCTG C/- CTCTCAGGTT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 C 2 1 48053 CASAVA_Build 1 102178913 2I CATTTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 1559 hom 25 7 11 7 TA 5 6 48054 CASAVA_Build 1 102194240 6I GTTTTTTTTT ------/TTTTTA TTTTTTTTAA 3070 het 22 hom 24 2 20 2 TTTTTA 0 1 48055 CASAVA_Build 1 102197488 1I CTCCTTTTTT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 498 hom 28 5 16 7 A 0 1 48056 CASAVA_Build 1 102201670 10I GACTTACAGA ----------/GACTTACAGC GACTTACAGC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 GACTTACAGC 1 2 48057 CASAVA_Build 1 102204906 1D GGCGTTCTCC T/- TTTTCTAGTT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 5 4 48058 CASAVA_Build 1 102205458 2I ACAAAAAAAA --/AC CAAATACCAT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 AC 0 1 48059 CASAVA_Build 1 102229295 1D TTGTAGATTT A/- AACCAGGGTA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 3 2 48060 CASAVA_Build 1 102230770 1D TTTCTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 272 hom 40 1 33 8 T 12 11 48061 CASAVA_Build 1 102235035 5D CTTTCCCTCG TCAGT/----- TGCACTTTCT 3070 het 3070 ref 38 16 12 11 TCAGT 1 0 48062 CASAVA_Build 1 102241207 1D TCATGGTGAC T/- TTTCTTCCTG 3070 het 3070 hom 38 15 17 8 T 4 3 48063 CASAVA_Build 1 102250453 1I GAACTGTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1651 hom 26 5 10 11 T 13 14 48064 CASAVA_Build 1 102252497 3D CCTGTTATGT GCA/--- GCCTAAGGAC 3070 het 3070 hom 40 14 17 11 GCA 1 0 48065 CASAVA_Build 1 102273292 26D AAGCAGAAAT TGAGGTCTCAATAAATCTGTGCCTCA/-------------------------- ATAAAAGACA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 TGAGGTCTCAATAAATCTGTGCCTCA 1 0 48066 CASAVA_Build 1 102273486 1D GGTGGTAAAG A/- AAAGGGATTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 4 3 48067 CASAVA_Build 1 102282321 1D CAGCAAATAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 373 hom 45 2 37 6 A 9 8 48068 CASAVA_Build 1 102286902 1D GAAATTAGGG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 9 8 48069 CASAVA_Build 1 102288379 1D TTAATTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 T 10 9 48070 CASAVA_Build 1 102292035 1D TCCCTCAAGA C/- CCACAGGGGG 3070 het 3070 hom 59 25 22 12 C 3 2 48071 CASAVA_Build 1 102294786 1I CAACACAATG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 66 het 52 1 44 7 A 7 8 48072 CASAVA_Build 1 102303009 1I GAAAACCCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 9 10 48073 CASAVA_Build 1 102306199 1I AATCAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 10 11 48074 CASAVA_Build 1 102317469 1D TGGGATTGCA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 7 6 48075 CASAVA_Build 1 102334731 1D TAAATCTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2186 hom 31 8 10 13 A 15 14 48076 CASAVA_Build 1 102338347 1D TGTTTCCCTA T/- TTGGGGGGAC 3070 het 3070 ref 32 14 15 5 T 3 2 48077 CASAVA_Build 1 102344013 1D TTATATCTTA T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 8 7 48078 CASAVA_Build 1 102353776 1I TATTGGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1497 hom 23 5 11 7 A 10 11 48079 CASAVA_Build 1 102357261 1I GTGGATTATC -/T TTTTTGACTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 5 6 48080 CASAVA_Build 1 102358578 1D GGAGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1144 het 1144 ref 30 8 4 18 T 15 14 48081 CASAVA_Build 1 102358613 2I TAGTGAATAG --/GT GTGTATGCTT 2586 het 2586 ref 32 11 7 14 GT 2 3 48082 CASAVA_Build 1 102366818 1D TGAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 5 A 11 10 48083 CASAVA_Build 1 102369800 1I TCCCCCCATC -/A AAAAAAAAGA 1693 het 1693 ref 23 10 6 7 A 8 9 48084 CASAVA_Build 1 102373089 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 1836 het 407 hom 8 2 5 1 A 13 14 48085 CASAVA_Build 1 102383485 4D TTTTGAGAAG TGTC/---- TGTCTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 TGTC 2 1 48086 CASAVA_Build 1 102387774 1D ATAAACACTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 34 0 27 9 T 9 8 48087 CASAVA_Build 1 102389921 1D ATATGAGTTT A/- GTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 1 0 48088 CASAVA_Build 1 102390134 1D CAGATTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 11 10 48089 CASAVA_Build 1 102390307 4I TATAATCATT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 147 het 57 0 48 9 TC 5 7 48090 CASAVA_Build 1 102391444 4I ATAAAATAAA ----/TTGT TTGATCGAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTGT 0 1 48091 CASAVA_Build 1 102399477 1D CTTACTCTTA G/- GCCCAGTAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 G 2 1 48092 CASAVA_Build 1 102402717 1D TTTGGTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 41 1 35 5 T 12 11 48093 CASAVA_Build 1 102407409 1I CAAAATGAAA -/T TTTTCATGAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 4 5 48094 CASAVA_Build 1 102409724 8D ATAAATATTT TATATATA/-------- TATATATATA 1745 hom 10 het 6 0 4 4 TA 13 9 48095 CASAVA_Build 1 102423683 1I GCCAAAACTT -/A AAACAATGGT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 3 4 48096 CASAVA_Build 1 102431571 1D ATGCCCCTGA C/- CTTAGGCTAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 C 2 1 48097 CASAVA_Build 1 102436174 1D TTAATAAAAA G/- TTTTATTATC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 G 1 0 48098 CASAVA_Build 1 102437479 1D GAGTGAACCC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 9 8 48099 CASAVA_Build 1 102438415 2I CTGAAGTCTT --/AA ACTCATTCCA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 1 3 48100 CASAVA_Build 1 102445635 1D TTACCTTAAG T/- TATGTCCCTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 5 T 2 1 48101 CASAVA_Build 1 102455293 1D AGAATGTCCC T/- TCTTGCCACT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 2 1 48102 CASAVA_Build 1 102459161 1D ATCTAACATT C/- CTGATAGAAA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 C 2 1 48103 CASAVA_Build 1 102463087 4I TAGTAGAAGA ----/TAGT TGGTAAATGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TAGT 0 1 48104 CASAVA_Build 1 102465734 4I ATGTAACATG ----/TCTT TCTTTGTGAT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TCTT 1 2 48105 CASAVA_Build 1 102466169 2I GAAAGTCCTC --/TT CTTTTCAGTG 3070 het 2437 hom 22 7 11 4 T 0 2 48106 CASAVA_Build 1 102471078 2D AGGATTTTTT TC/-- TCTTTTAATT 3070 het 3070 hom 35 10 22 4 TC 2 1 48107 CASAVA_Build 1 102478068 1D AAGTAATTAT A/- AAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 5 4 48108 CASAVA_Build 1 102485583 2I CACCTAGCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1912 hom 18 6 9 3 T 11 13 48109 CASAVA_Build 1 102500871 1I CCAAAGAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 26 11 5 A 9 10 48110 CASAVA_Build 1 102502274 6I CACACACACA ------/CTACAC CTACACACAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CTACAC 1 2 48111 CASAVA_Build 1 102507424 1I ATCTGGTGAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 8 9 48112 CASAVA_Build 1 102517810 1I TTACAAACAG -/A AAAACATTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 4 5 48113 CASAVA_Build 1 102518629 1I TAATATATTA -/C TTTTTAAAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 0 1 48114 CASAVA_Build 1 102523888 1D CAGAGGAGAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 7 48115 CASAVA_Build 1 102525474 2D ACCAATAGAG AC/-- ACACATAGAC 3070 hom 94 het 40 0 32 10 AC 3 2 48116 CASAVA_Build 1 102526202 3D TACAGCAAAA GTG/--- GTACTAAGAG 3070 hom 69 het 27 0 24 5 GTG 1 0 48117 CASAVA_Build 1 102526883 4D GACAAATCAG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 14 10 48118 CASAVA_Build 1 102529007 1I CACCATGCTG -/T TTTTATTACT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 4 5 48119 CASAVA_Build 1 102530692 1I TTAACTTTTC -/T TTTAAGTTCA 3070 hom 62 het 24 0 21 3 T 3 4 48120 CASAVA_Build 1 102531283 1D TGGCTAAACT A/- AACTTACACT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 3 2 48121 CASAVA_Build 1 102531493 4I CTTTGAAAAT ----/TGTC TGTTCATATT 3070 hom 75 het 29 0 26 6 TGTC 0 1 48122 CASAVA_Build 1 102533771 1I ATGAAGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 27 0 20 7 A 10 11 48123 CASAVA_Build 1 102539658 3D TTCTGTGTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 24 10 T 14 11 48124 CASAVA_Build 1 102540643 1D CATAGAGTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 10 9 48125 CASAVA_Build 1 102541275 1I CCCTTTTGTG -/A GTTTTACCTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 48126 CASAVA_Build 1 102542195 2D ACCAGTTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 14 12 48127 CASAVA_Build 1 102543359 2I ATAAAAAAAA --/AC AAAAGAAGTA 3070 hom 82 het 33 0 28 5 AC 0 1 48128 CASAVA_Build 1 102543480 1D GGTACCAAAA T/- TTTTTAATAT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 6 5 48129 CASAVA_Build 1 102553274 1I AACCTAATGA -/C GGTGTGGAAC 3070 hom 141 het 54 0 48 6 C 0 1 48130 CASAVA_Build 1 102554343 1D TTTTCAGCAT A/- TTGGGAAACA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 0 48131 CASAVA_Build 1 102556297 9D CACACACACA CACACACAC/--------- ATTTTGCACC 3070 hom 96 het 34 0 33 3 CACACACAC 1 0 48132 CASAVA_Build 1 102559931 1I ATAGCACATG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 8 9 48133 CASAVA_Build 1 102560285 2D CTAAGTATGG AA/-- AAAAAAAGCA 3070 hom 99 het 40 0 34 7 A 9 7 48134 CASAVA_Build 1 102560476 1I AGATGTTTTT -/A AAAATGACCC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 4 5 48135 CASAVA_Build 1 102560610 4D AACTAGCTGC AGAG/---- AGAGAAAGAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AG 4 2 48136 CASAVA_Build 1 102561018 2I TGTGTGAACT --/AA GAGTGAAAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 0 2 48137 CASAVA_Build 1 102561399 1I AGTAATAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 8 9 48138 CASAVA_Build 1 102562066 1I ACTATTACAG -/A AAATGTAAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 3 4 48139 CASAVA_Build 1 102564095 1I AACATTGGAA -/T TTACATGACT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 3 48140 CASAVA_Build 1 102573275 1I ATACTTTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 48141 CASAVA_Build 1 102575062 6D GTGATATTAT ATAGAA/------ ATAAATACAA 3070 hom 45 het 17 0 16 4 ATAGAA 1 0 48142 CASAVA_Build 1 102582433 1I AAAAATAAAT -/A AAAAAAAAAT 1571 hom 15 het 7 0 6 1 A 9 10 48143 CASAVA_Build 1 102582966 1I CATGTGACCC -/A ATAAAGTCAC 3070 hom 126 het 54 0 42 12 A 1 2 48144 CASAVA_Build 1 102584658 12D GACTACTGTA TTTTCAGGTGTG/------------ TTCTCTAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 4 TTTTCAGGTGTG 1 0 48145 CASAVA_Build 1 102584906 2D GTCCCAGAGC TT/-- TTTTTTTACT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 9 7 48146 CASAVA_Build 1 102585412 1D GGCAATAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 9 48147 CASAVA_Build 1 102589864 12I AAAACAGACT ------------/AATACAATAATA AATTACGATT 3070 hom 72 het 27 0 25 4 AATACAATAATA 0 1 48148 CASAVA_Build 1 102592138 3D ATGAAAATTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 24 7 A 13 10 48149 CASAVA_Build 1 102607126 1I GAATTTGGAC -/T TTTGAGTTAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 3 4 48150 CASAVA_Build 1 102609028 5D AAGAATAAAG AAGTT/----- AAGAAAAATG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAGTT 1 0 48151 CASAVA_Build 1 102609914 8I GCTTGACAAT --------/ATAAATGA ATAAATGATA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 ATAAATGA 1 2 48152 CASAVA_Build 1 102611862 4I ATATATAATA ----/AATT AATCATGACA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AATT 0 1 48153 CASAVA_Build 1 102620260 1I GAGAAGATGC -/T GCCATTGCAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 0 1 48154 CASAVA_Build 1 102626082 2D AAAATCAGCT AA/-- AAAAAAATTG 3070 hom 141 het 52 0 48 6 A 9 7 48155 CASAVA_Build 1 102627829 1D TAGTAAATCA T/- TAAGAAATGA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 2 1 48156 CASAVA_Build 1 102628729 1I AAAATCCTAC -/T TATAACAATG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 1 2 48157 CASAVA_Build 1 102630578 2I ATATATATAT --/AA AATCTCAATA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 2 4 48158 CASAVA_Build 1 102632209 1I ATATGATGTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 7 8 48159 CASAVA_Build 1 102632585 1D TAGAAAAAAA T/- ATCAAGAGCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 0 48160 CASAVA_Build 1 102632747 4I TCATTCTCTG ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 29 0 17 12 A 10 14 48161 CASAVA_Build 1 102634274 29I GATAAGCTGC -----------------------------/CCCCATGGGAGTGATGGACATAAAGGACA CCCTCCACAT 3070 hom 93 het 30 0 32 1 CCCCATGGGAGTGATGGACATAAAGGACA 0 1 48162 CASAVA_Build 1 102637543 1I CTGAAGGGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 9 10 48163 CASAVA_Build 1 102639581 4D TTTTAATGCT TTAC/---- TTAAACATGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TTAC 1 0 48164 CASAVA_Build 1 102639967 1I CATTGCCTTG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 6 7 48165 CASAVA_Build 1 102640452 1I ATTGTTACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 44 hom 30 1 26 14 T 9 10 48166 CASAVA_Build 1 102640992 2D ATTTATAAAC AA/-- AAGAGGTTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 4 2 48167 CASAVA_Build 1 102642942 18I TTAATTAAAT ------------------/GTAATTGCAGAATTAAAA GTAATTGCAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 GTAATTGCAGAATTAAAA 0 1 48168 CASAVA_Build 1 102643135 1D GATGTTGAGC T/- TTTTTTCATG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 6 48169 CASAVA_Build 1 102644168 1I ATAGTAAGTC -/T ATGATTATTA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 0 1 48170 CASAVA_Build 1 102650149 3I AATTGAAAAC ---/CTT CTGGAAAAGA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CTT 0 1 48171 CASAVA_Build 1 102654468 1D AGAAAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 A 12 11 48172 CASAVA_Build 1 102658153 1I ATCAATCTTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 9 48173 CASAVA_Build 1 102659769 1I AAAACATAGA -/C CCCCCCACAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 6 7 48174 CASAVA_Build 1 102660962 1I GTAATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 34 1 21 12 A 11 12 48175 CASAVA_Build 1 102661393 4D TTAGCCATGA CAAT/---- CAGATAAGAA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 CAAT 1 0 48176 CASAVA_Build 1 102664580 1D TATGAACAGA C/- ACTTCACAAA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 1 0 48177 CASAVA_Build 1 102667347 1D GAAACATCAA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 7 48178 CASAVA_Build 1 102668257 1D AAAGAGTGTG A/- TGTTCCCCTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 0 48179 CASAVA_Build 1 102671967 2I TCCATGAAAT --/AA GTCTCAATAA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 0 2 48180 CASAVA_Build 1 102675702 1I TTTGAGACGC -/T GTACAGACAG 3070 het 3070 hom 43 21 21 1 T 0 1 48181 CASAVA_Build 1 102681460 1D AAAAACTTTG A/- AAAAAAATTG 1915 het 1915 ref 15 9 6 0 A 8 7 48182 CASAVA_Build 1 102686368 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 7 48183 CASAVA_Build 1 102686740 2I TTATTTTGTC --/TT TATACTCATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 3 48184 CASAVA_Build 1 102690832 1I TACAGGTGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 98 het 40 0 33 7 T 8 9 48185 CASAVA_Build 1 102694239 1D TTCACCATCT C/- CCCCCTAGAG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 C 6 5 48186 CASAVA_Build 1 102698038 1I CCAGGTATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 10 11 48187 CASAVA_Build 1 102708192 1D TTAGGAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 10 9 48188 CASAVA_Build 1 102710118 2D TATGTCTCAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 21 0 13 10 AT 10 9 48189 CASAVA_Build 1 102714068 1D AAGGAAAAGA C/- TTTTAGTATA 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 C 1 0 48190 CASAVA_Build 1 102723985 1D TTGTGGGGCA C/- CATGACCTAC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 2 1 48191 CASAVA_Build 1 102727974 1D AGGTTATAAC A/- GGGGGGACTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 A 1 0 48192 CASAVA_Build 1 102731374 4D AGTTGAAAAT AAGA/---- AAGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AAGA 3 2 48193 CASAVA_Build 1 102732652 2D CACATATATA TT/-- GTGTGTGTAT 3070 het 3070 hom 37 18 19 0 T 2 0 48194 CASAVA_Build 1 102733937 1D GAGAGTATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 10 het 44 1 16 27 T 9 8 48195 CASAVA_Build 1 102734096 2I TCATGTACTC --/TA TGTTAATTGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TA 0 1 48196 CASAVA_Build 1 102738934 1D CAGTCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 31 1 23 7 T 12 11 48197 CASAVA_Build 1 102742464 1I CCATCCCCCC -/T ACCCCCTACC 3070 hom 67 het 24 0 22 2 T 0 1 48198 CASAVA_Build 1 102746024 1I CAGCAAATGT -/A AAAAATGGAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 5 6 48199 CASAVA_Build 1 102755858 2I TACATCATAT --/TA TATACCAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TA 2 3 48200 CASAVA_Build 1 102761288 1I GAACAACTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 9 10 48201 CASAVA_Build 1 102761903 2I CATGATATCA --/GT GTATAATGTG 3070 het 3070 hom 42 16 15 11 GT 1 2 48202 CASAVA_Build 1 102762946 7I GTGGATGACT -------/TGAAGTC TGAAGTCAGA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 TGAAGTC 1 2 48203 CASAVA_Build 1 102764903 1D AATTGGCATA G/- GTTTGAAAGA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 2 1 48204 CASAVA_Build 1 102765209 1D CTTTATATCA T/- TTTAAGTGCC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 4 3 48205 CASAVA_Build 1 102766273 1D17M1I TGTAGCAATC ACTACTAGGTATACTATA-/-CTACTAGGTATACTATAT GGTTTCCTTA 3070 het 1716 hom 37 6 13 21 N/A 0 0 48206 CASAVA_Build 1 102773821 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2657 het 2657 ref 21 10 7 4 A 11 10 48207 CASAVA_Build 1 102787449 1I TAACAAAGAG -/A AAAATAAATG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 4 5 48208 CASAVA_Build 1 102787543 4D TTCATTACTG AATA/---- AATAAACTAT 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 AATA 2 1 48209 CASAVA_Build 1 102788735 1D CTGTAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 732 hom 41 3 31 7 A 15 14 48210 CASAVA_Build 1 102792967 1I CTATTCCACA -/T TTTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 6 7 48211 CASAVA_Build 1 102801518 1D TACTAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 20 4 A 12 11 48212 CASAVA_Build 1 102805161 2D33M4D ATAAATATAC ATATATATATACATATATATACACACACATATATATGTG/--ATATATATACATATATATACACACACATATATA---- TGTGTGTGTG 3070 het 1303 hom 18 5 14 6 N/A 0 0 48213 CASAVA_Build 1 102809487 1D AAAAATGTTT G/- TAGTGCTATT 3070 het 3070 ref 23 10 8 6 G 1 0 48214 CASAVA_Build 1 102812017 1I GAATTAGGTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 396 hom 45 1 36 8 A 8 9 48215 CASAVA_Build 1 102817593 2D ATATATATAT AA/-- AAAATTAAAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 6 4 48216 CASAVA_Build 1 102817879 1D AAAACATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 16 14 A 13 12 48217 CASAVA_Build 1 102818823 4D AAATGTTTTC TTTG/---- TTTATCATAA 3070 het 3070 hom 48 22 25 3 TTTG 1 0 48218 CASAVA_Build 1 102821109 2I ATAATATAAC --/TG TGTGTGTATA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TG 3 4 48219 CASAVA_Build 1 102821485 2D ACTGTTTTTA TC/-- TCTTACTGTA 2104 het 2104 ref 16 10 5 1 TC 2 1 48220 CASAVA_Build 1 102821555 6I TGTATATATA ------/TATATC TATATATCTA 1471 hom 7 het 5 0 3 2 TATATC 0 1 48221 CASAVA_Build 1 102822637 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 10 11 48222 CASAVA_Build 1 102828213 1D TTTCGCATAG T/- TTTTTTTTTT 1653 het 1653 ref 27 10 5 12 T 12 11 48223 CASAVA_Build 1 102836234 1D GCCCTAGAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 10 9 48224 CASAVA_Build 1 102837906 1I AAACCACTGG -/A AAAAAAAAAA 2837 het 2837 ref 33 16 11 6 A 10 11 48225 CASAVA_Build 1 102850786 2I GAGACATAGA --/CT CACACACAAT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 CT 0 1 48226 CASAVA_Build 1 102854301 1I CCCACTTAAA -/G GACACTGAGT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 G 1 2 48227 CASAVA_Build 1 102855316 1I AATTAAACAT -/C TTGCTTGGGA 3070 hom 86 het 36 0 29 7 C 0 1 48228 CASAVA_Build 1 102855373 1D AAAAAAAAAA T/- ATTTGAAACT 3070 het 3070 ref 28 9 14 5 T 1 0 48229 CASAVA_Build 1 102867479 1I TTTGGCAAGA -/C TTTTTTTATT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 C 0 1 48230 CASAVA_Build 1 102875703 1I GCACCTTTAA -/T TTTTTTTTTG 2870 het 2870 ref 25 12 7 6 T 9 10 48231 CASAVA_Build 1 102882862 1D AAACTACTAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 8 7 48232 CASAVA_Build 1 102886756 1D TACCCCCCCC A/- CACACACACA 3070 het 225 hom 29 1 24 4 A 1 0 48233 CASAVA_Build 1 102887058 1D ACGGGCATGC A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 8 7 48234 CASAVA_Build 1 102896405 1I AACGACTAAT -/A TTTTTTAATG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 0 1 48235 CASAVA_Build 1 102899235 1I ACAAACAAAC -/A AAAAATCTAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 5 6 48236 CASAVA_Build 1 102905012 1I AACTTAGGGG -/A AAAAAATCTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 6 7 48237 CASAVA_Build 1 102910921 1I ATGCATTCAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 8 9 48238 CASAVA_Build 1 102914675 1D GGCAATTTAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 9 8 48239 CASAVA_Build 1 102950948 1I GAAACAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 25 3 15 7 A 13 14 48240 CASAVA_Build 1 102961126 1D TACTTATTGA T/- TTTTTTTTTT 2642 het 2642 ref 48 31 8 9 T 13 12 48241 CASAVA_Build 1 102983274 3I ATCTAGGCCT ---/TGG TGGTTTTGGA 3070 hom 107 het 40 0 36 4 TGG 1 2 48242 CASAVA_Build 1 102991351 1D GTAAAATAAA C/- CTCTTTTCTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 2 1 48243 CASAVA_Build 1 103072458 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 9 10 48244 CASAVA_Build 1 103074881 1I ATCTTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2330 hom 27 9 15 3 A 12 13 48245 CASAVA_Build 1 103082316 3D CTTCAAACAT GAA/--- GGAGAAACAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 GAA 1 0 48246 CASAVA_Build 1 103101617 1I3M1I TGTAGACCCA -GCT-/GGCTG ACTCCGGAGG 3070 het 2954 hom 18 8 9 2 N/A 0 0 48247 CASAVA_Build 1 103111049 1I AACTGAATGC -/T TTTAACAGCA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 3 4 48248 CASAVA_Build 1 103121953 1D CTTATTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 12 11 48249 CASAVA_Build 1 103128661 1D AAATAATAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 10 9 48250 CASAVA_Build 1 103134474 2I CCATAATAAG --/TA TTACTTCTCA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 TA 0 1 48251 CASAVA_Build 1 103136039 1I AGTGGAAATA -/T TTTTTTCATC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 6 7 48252 CASAVA_Build 1 103139674 2I CAAAACAAAG --/AC AATGCCTACG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 AC 0 1 48253 CASAVA_Build 1 103145893 2I GAGATTCATC --/TA TGTTATGCAT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 TA 0 1 48254 CASAVA_Build 1 103152968 1D AAACAATGTT A/- AAAAAAAAAA 2106 het 2057 hom 29 9 8 13 A 13 12 48255 CASAVA_Build 1 103176537 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 9 8 48256 CASAVA_Build 1 103177714 3I TGCACATGGT ---/GAG GAGGCATGCT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 GAG 1 2 48257 CASAVA_Build 1 103184475 1D GTATAATAAA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 2702 hom 23 6 11 7 C 9 8 48258 CASAVA_Build 1 103197570 3I GATTTTGTAA ---/TCT TCTGCACTCT 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 TCT 1 2 48259 CASAVA_Build 1 103198622 2D AGGTCACTGG GT/-- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 GT 5 4 48260 CASAVA_Build 1 103204853 8I ACATACACAC --------/ATACACAG ATACCTAAAC 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 ATACACAG 0 1 48261 CASAVA_Build 1 103212324 4I GGAGGTTGCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 AAAC 3 4 48262 CASAVA_Build 1 103218794 2I CTTGAATACA --/CT CCTTTCTTTT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 CT 0 1 48263 CASAVA_Build 1 103228488 1D ATTTTTTTTT A/- AAATCATGTC 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 4 3 48264 CASAVA_Build 1 103229979 2D ATGCCAGGAA TT/-- TTTTTTTTTT 1870 het 1870 ref 38 15 4 19 T 16 14 48265 CASAVA_Build 1 103257734 1D TTTTTATTCC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 T 8 7 48266 CASAVA_Build 1 103259983 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 T 11 10 48267 CASAVA_Build 1 103267560 4D TGACATATTA ATAG/---- ATATAGTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 ATAG 1 0 48268 CASAVA_Build 1 103269394 1D TCCCCCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2398 hom 44 12 20 14 A 13 12 48269 CASAVA_Build 1 103290292 5D ATGGCCTTGT CTCTA/----- CTCTAAGTAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 5 CTCTA 2 1 48270 CASAVA_Build 1 103303331 4I CTCAACTTTG ----/CTGT GAACCTACAC 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 CTGT 0 1 48271 CASAVA_Build 1 103307350 1I TGGTAGTAGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 22 21 2 A 8 9 48272 CASAVA_Build 1 103309979 3I TAATTAAGTT ---/AAC AACATACAAC 1946 het 1946 ref 20 14 5 1 AAC 1 2 48273 CASAVA_Build 1 103321585 2I ATTTTCCAAC --/AG AGTTACTAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AG 1 2 48274 CASAVA_Build 1 103324216 5D TAAAACATAC ATATA/----- ATATGTTTAT 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 ATATA 1 0 48275 CASAVA_Build 1 103326492 1I CTTCAAAGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 T 9 10 48276 CASAVA_Build 1 103341898 9D TGATTGCACA ACAGATATC/--------- ATGGTAGTCC 3070 het 3070 hom 29 14 16 2 ACAGATATC 1 0 48277 CASAVA_Build 1 103364173 4I TAAGTCAGAC ----/TTTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 9 13 48278 CASAVA_Build 1 103368932 1D TTCCAGCATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 10 9 48279 CASAVA_Build 1 103369260 1D TATGTCTTCA T/- TTTTAGTGGC 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 T 5 4 48280 CASAVA_Build 1 103373600 1D TGATTTTCTG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 T 8 7 48281 CASAVA_Build 1 103373723 1D TAAGAGTAAA G/- TTGGATTAGG 3070 het 3070 hom 48 21 23 5 G 1 0 48282 CASAVA_Build 1 103376953 3D GTTTAAGCAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 13 10 48283 CASAVA_Build 1 103378473 4D ACAGAACTAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 1393 hom 35 8 11 18 A 14 10 48284 CASAVA_Build 1 103380014 1I ATCAGAGTGA -/T TTTTCTGGGT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 4 5 48285 CASAVA_Build 1 103380941 4I TTTTTCTCTT ----/AAAA AAAAAAAAAA 3069 het 3069 ref 20 9 8 3 A 12 16 48286 CASAVA_Build 1 103385153 1I GATTATTTTC -/T TTAGCAGAAT 3070 het 3070 ref 39 16 18 5 T 2 3 48287 CASAVA_Build 1 103386623 3I GGCTGTAATC ---/ACA ACACTTTGAG 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 ACA 1 2 48288 CASAVA_Build 1 103387529 1I TTGGGCATTA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 T 7 8 48289 CASAVA_Build 1 103387779 1D AGTGAAAAAC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 8 7 48290 CASAVA_Build 1 103388540 4I TTTGGTATCT ----/AACA AACATTGTTT 3070 hom 128 het 49 0 43 6 AACA 1 2 48291 CASAVA_Build 1 103388982 1D TCATCTCCAG T/- ACTGTCCTGT 3070 het 3070 ref 54 30 19 5 T 1 0 48292 CASAVA_Build 1 103389710 2D CATGTAGTTT TA/-- TGTTATTAAA 2946 het 2946 ref 27 17 7 4 TA 1 0 48293 CASAVA_Build 1 103389990 5D TGATGTAACT TGAAA/----- TGAACTGTAC 3070 hom 63 het 26 0 19 9 TGAAA 1 0 48294 CASAVA_Build 1 103390204 2I GTCAAAACTC --/AA AAACTTGTAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 3 5 48295 CASAVA_Build 1 103391304 5D TGTGATATAG TTTTT/----- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 13 8 48296 CASAVA_Build 1 103392341 2D AATTTCATCT CA/-- AACTGTAGTC 3070 hom 81 het 32 0 27 7 CA 1 0 48297 CASAVA_Build 1 103393468 1D AAGAAACAAG T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 7 6 48298 CASAVA_Build 1 103394528 5D3M4D TGTCTACTGT TATTGCTATGAG/-----CTA---- CAATAAAATG 3070 het 3070 ref 31 17 19 2 N/A 0 0 48299 CASAVA_Build 1 103395054 1I ATAATATATT -/C CTTCTTTTGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 1 2 48300 CASAVA_Build 1 103398617 2D GAGAGTAGCA AC/-- AGTGGGAAGC 3070 hom 108 het 41 0 36 7 AC 1 0 48301 CASAVA_Build 1 103399196 2I CAGTTTTTTC --/TA TATATTTTCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TA 2 3 48302 CASAVA_Build 1 103400428 2D AAGAGAACTA TT/-- GTGTCACTAA 3070 het 3070 ref 46 29 13 5 T 2 0 48303 CASAVA_Build 1 103403803 1I GTACCTCTGG -/T TAGAATTCAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 1 2 48304 CASAVA_Build 1 103404177 1D TCTCCTTCAG T/- TTTGCTCTGA 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 T 4 3 48305 CASAVA_Build 1 103405089 1D TGTGTGGAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 48306 CASAVA_Build 1 103405673 1D AATACAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 23 8 A 12 11 48307 CASAVA_Build 1 103409319 1I TTACAGGCTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 A 7 8 48308 CASAVA_Build 1 103410409 3D TAATGATCAT ATA/--- ATATTTTCTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATA 2 1 48309 CASAVA_Build 1 103412166 3I AAGAAGATAT ---/AAC TATATAAAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAC 0 1 48310 CASAVA_Build 1 103412458 1D ACTAAAAAAA T/- AATATATACA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 1 0 48311 CASAVA_Build 1 103413035 1D AAAAAAATCC A/- AAAAAAAGAG 723 het 723 ref 25 6 5 14 A 8 7 48312 CASAVA_Build 1 103413048 1I53M1D AAAAAGAGTT -AAAAAAAAACCACCACAATGAGATATTACAACACAAATATTAGATTAGTTAAGA/AAAAAAAAAACCACCACAATGAGATATTACAACACAAATATTAGATTAGTTAAG- AAAAAACTTG 3070 het 662 hom 17 3 12 21 N/A 0 0 48313 CASAVA_Build 1 103414078 1I AAAGAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 8 12 11 A 9 10 48314 CASAVA_Build 1 103415209 3D TAACAGAATA TAT/--- TATTATATGA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 TAT 3 2 48315 CASAVA_Build 1 103418442 1D GTATACATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 10 9 48316 CASAVA_Build 1 103424230 1I AAAGAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 28 2 15 11 A 10 11 48317 CASAVA_Build 1 103439620 1D CAGAAAGATA T/- TTTTTTCTTA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 T 7 6 48318 CASAVA_Build 1 103440017 5D TAAATTGAAA TCTTT/----- TCTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 5 TCTTT 2 1 48319 CASAVA_Build 1 103445761 1D CAGTTCTCTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 8 7 48320 CASAVA_Build 1 103446691 2D AAATACATGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 109 het 40 0 36 7 GT 10 9 48321 CASAVA_Build 1 103446821 5D ATATGCACAC ATATA/----- ATATACATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 ATATA 2 1 48322 CASAVA_Build 1 103451847 1I ACAACAACCG -/T GACTTTTTGA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 0 1 48323 CASAVA_Build 1 103461921 4I ACGGGGATGG ----/GTGA GTGAGTGAGT 3070 hom 101 het 43 0 32 11 GTGA 2 3 48324 CASAVA_Build 1 103464522 1D TTTAGCCCTA T/- TTTTTTCACA 3070 hom 135 het 49 0 46 4 T 7 6 48325 CASAVA_Build 1 103471535 1D AAAAGTATTG C/- AAAAAAATTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 48326 CASAVA_Build 1 103472084 1D TGTTGTAGCA T/- TTTTACTTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 5 4 48327 CASAVA_Build 1 103472627 29I AAGAAAAGTT -----------------------------/CTTAATATAAGTGGTAAAAGTTCTTAATA GATGTGGTAA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 CTTAATATAAGTGGTAAAAGTTCTTAATA 0 1 48328 CASAVA_Build 1 103488081 4D ATTACTCATA AAGT/---- AAGTATTTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AAGT 2 1 48329 CASAVA_Build 1 103508936 1I GTGGCCTCAT -/G TGGGGGGGTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 G 0 1 48330 CASAVA_Build 1 103516542 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1549 het 803 hom 13 4 5 4 T 12 13 48331 CASAVA_Build 1 103521222 1D TCATTTTGCA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 7 6 48332 CASAVA_Build 1 103523371 1D GTTATGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 11 10 48333 CASAVA_Build 1 103523859 1I AAATTAAGTA -/T TTTTTTTAAA 2344 het 2344 ref 21 10 7 4 T 7 8 48334 CASAVA_Build 1 103524083 1D ACCAGGCTAC A/- ATAGCATTAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 2 1 48335 CASAVA_Build 1 103528564 3D TAAGCCTCTT GTC/--- GTTCATCTTC 3070 het 3070 ref 39 20 16 5 GTC 1 0 48336 CASAVA_Build 1 103529705 1I GGGAGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 14 12 A 11 12 48337 CASAVA_Build 1 103530610 1D AATAAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 10 9 48338 CASAVA_Build 1 103530785 1I GGAGAAGTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 T 9 10 48339 CASAVA_Build 1 103530980 3I TCCTTTTGAG ---/AAA AAAAGCCTTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 4 7 48340 CASAVA_Build 1 103531448 2D ATTTATAGCA TC/-- TGAGAAACTT 3070 het 3070 hom 26 8 15 4 TC 1 0 48341 CASAVA_Build 1 103544143 1I ATGCATGGAG -/A AAAAAAAAAA 1237 het 1237 ref 35 22 4 9 A 10 11 48342 CASAVA_Build 1 103545811 4D TAAAATTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 69 het 34 0 24 15 AAAC 5 4 48343 CASAVA_Build 1 103548013 1D AGGGTCACAG T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 7 6 48344 CASAVA_Build 1 103548333 1D TTGTTCTGTA T/- TTTTTTACTA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 7 6 48345 CASAVA_Build 1 103550172 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 10 9 48346 CASAVA_Build 1 103551536 1I GGAAACAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 9 10 48347 CASAVA_Build 1 103553959 1D GAGAGAGATG A/- AAGGAGAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 11 6 A 3 2 48348 CASAVA_Build 1 103556762 1D TCTGATATAG T/- TTTTTTATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 7 6 48349 CASAVA_Build 1 103688455 1I ATTAAATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 13 14 48350 CASAVA_Build 1 103781937 3I ACTTTATTTC ---/TAT TATTATTATA 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 TAT 3 4 48351 CASAVA_Build 1 103783921 3D GAATAATTTA ATT/--- ATTTTTTTTA 2896 het 2896 ref 23 12 8 5 ATT 2 1 48352 CASAVA_Build 1 103787446 1I ATTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 10 11 48353 CASAVA_Build 1 103820913 1I ATGCAAATTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 7 8 48354 CASAVA_Build 1 103835125 1D5M1D GTTTTTGTTT CCTTTGC/-CTTTG- CAGTATGGGA 3070 hom 84 het 32 0 28 9 N/A 0 0 48355 CASAVA_Build 1 103896589 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 26 0 25 1 A 10 11 48356 CASAVA_Build 1 103909804 4D CTGCAAACCC CAGT/---- CAAACTTTGC 3070 het 3070 ref 54 30 20 6 CAGT 1 0 48357 CASAVA_Build 1 103924975 1D AGCATTTTCC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 T 8 7 48358 CASAVA_Build 1 103928760 3D TTAAGAAAAC AGT/--- AGGAAAAGTG 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 AGT 1 0 48359 CASAVA_Build 1 103933820 1I ATAGTTTGAT -/G TTTTTAGGCT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 G 0 1 48360 CASAVA_Build 1 103942200 1D CAATTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 2984 het 1432 hom 24 5 10 9 T 12 11 48361 CASAVA_Build 1 104019074 1I TCAAGTCTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 81 60 14 7 T 9 10 48362 CASAVA_Build 1 104024141 2D TAATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 8 17 9 AT 10 9 48363 CASAVA_Build 1 104135666 1D TGCCTTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 41 0 37 5 T 10 9 48364 CASAVA_Build 1 104150539 8D AAGAAAAAAG ACAAATTA/-------- ACAAATTTAC 3070 het 3070 hom 25 12 11 3 ACAAATTA 1 0 48365 CASAVA_Build 1 104151873 4D AAAAAACAAG AAGA/---- AAGTGGGACA 3070 het 1993 hom 25 7 10 8 AAGA 1 0 48366 CASAVA_Build 1 104172845 1D CTGGATCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 12 11 48367 CASAVA_Build 1 104214549 1D ATCCACGAAA G/- GGACATTTCC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 G 3 2 48368 CASAVA_Build 1 104255925 1I ATAAACTCAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 17 17 10 T 7 8 48369 CASAVA_Build 1 104262867 1D TAAGACCTCC T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 66 het 27 0 22 6 T 8 7 48370 CASAVA_Build 1 104292352 3I ACAGACTAAG ---/TTT TTTGGTTGTC 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 3 6 48371 CASAVA_Build 1 104306896 1D AGAAAGGCAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 30 13 14 4 A 8 7 48372 CASAVA_Build 1 104314409 1D GTAAATCTTC T/- TGTGATTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 T 2 1 48373 CASAVA_Build 1 104326886 2D GTGAAGACAG GA/-- GAGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 GA 5 4 48374 CASAVA_Build 1 104331644 1D AAATGCTAGC A/- AAATCAACCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 4 3 48375 CASAVA_Build 1 104333672 1I TAGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 A 10 11 48376 CASAVA_Build 1 104334711 3I ATCTCAACCA ---/GTT GTTAAGAGAT 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 GTT 1 2 48377 CASAVA_Build 1 104338642 1I GTGGAAAATG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 A 8 9 48378 CASAVA_Build 1 104339368 1D CTATTTTTAA T/- TTTTTGAGGA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 6 5 48379 CASAVA_Build 1 104339473 4D GCCAGCATTA TTTG/---- TTTATTTGTT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 TTTG 1 0 48380 CASAVA_Build 1 104342826 1I TTTATAGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 9 10 48381 CASAVA_Build 1 104343803 5D CCACCTCTTT ATTAG/----- ATAATTATTA 3070 het 3070 ref 35 19 10 8 ATTAG 1 0 48382 CASAVA_Build 1 104345672 8D AAATACTATC TTAAGAAA/-------- TTTAGTTTAG 3070 het 3070 ref 44 25 15 5 TTAAGAAA 1 0 48383 CASAVA_Build 1 104346994 1I CTCACATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 12 13 48384 CASAVA_Build 1 104348148 1I AAATATTCAC -/A AAGTAACCTA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 2 3 48385 CASAVA_Build 1 104349287 2D AAAATAACAC AT/-- AGTCTGTGAC 3070 het 3070 ref 45 24 15 7 AT 1 0 48386 CASAVA_Build 1 104351046 3D TAATGACAAG TGA/--- TGATGATCTT 3070 het 2833 hom 19 7 9 3 TGA 3 2 48387 CASAVA_Build 1 104356373 1D TGTTAAAAAT A/- AAAAAAGTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 6 48388 CASAVA_Build 1 104358400 3D TTTTTTGGTG TCT/--- TCTTCATTTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TCT 2 1 48389 CASAVA_Build 1 104367417 1D TAAAGTTTGA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 2701 hom 27 9 15 4 T 7 6 48390 CASAVA_Build 1 104371371 3D AAAAAAGACT TGA/--- TGATCACAGT 3070 het 3070 hom 45 17 26 4 TGA 2 1 48391 CASAVA_Build 1 104373304 1D TAATGACAAT A/- AAAAAACTGC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 7 6 48392 CASAVA_Build 1 104381986 2I TGTCAACTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 27 2 19 6 T 14 16 48393 CASAVA_Build 1 104388334 2D TGACTGTTTG TC/-- TGTCTGGTAG 3070 het 3070 hom 39 15 18 8 TC 1 0 48394 CASAVA_Build 1 104390741 4D GAAGACAGCA GATG/---- GATGGATCTT 3070 het 3070 hom 47 22 21 7 GATG 2 1 48395 CASAVA_Build 1 104391080 1I ATTTTGTTTC -/T TTTTTAGTTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 5 6 48396 CASAVA_Build 1 104392423 1I GCATTGGGTT -/G GGGGGGTGGC 3070 het 3070 ref 44 19 14 11 G 6 7 48397 CASAVA_Build 1 104392934 1D CTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 10 9 48398 CASAVA_Build 1 104407661 1I CTTCTTAATA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 12 25 1 T 7 8 48399 CASAVA_Build 1 104413873 1D TGTGATGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 37 1 27 10 T 12 11 48400 CASAVA_Build 1 104417028 1D AAAAAAAAAA C/- ACTATCTGTG 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 C 1 0 48401 CASAVA_Build 1 104418290 1D AGAAAAACAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 2931 hom 31 9 16 6 A 8 7 48402 CASAVA_Build 1 104420886 5I GCTTTAATGT -----/TCAAA TCAGATTGTA 3070 het 3070 ref 56 29 26 2 TCAAA 0 1 48403 CASAVA_Build 1 104422251 1I GAGAATGCTT -/A AAATTATATT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 3 4 48404 CASAVA_Build 1 104425735 1D GGTGTTTTAA C/- CCTCATAGCA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 C 3 2 48405 CASAVA_Build 1 104428342 4D CAACAAAAGT GTAC/---- ATACACACAC 3070 het 3070 hom 73 32 33 9 GTAC 1 0 48406 CASAVA_Build 1 104430892 1D ATTAGCCATA T/- TTTTATATAG 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 5 4 48407 CASAVA_Build 1 104431217 1D CTTTCTTGGC T/- TTCCTAGTTT 3070 het 3070 ref 54 28 15 11 T 3 2 48408 CASAVA_Build 1 104432293 1D CAGAGAAAAC T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 8 7 48409 CASAVA_Build 1 104435686 1D AAGACAATAC T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 7 6 48410 CASAVA_Build 1 104436785 1I TAGGTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 12 13 48411 CASAVA_Build 1 104451448 2D CAACAACAAC AA/-- AAAACAAAAA 1256 het 1256 ref 27 15 3 9 A 6 4 48412 CASAVA_Build 1 104463428 1D CATGACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 12 11 48413 CASAVA_Build 1 104476298 1I16M1I TTCTATCGCA -GTTCCAAAGCATGCTG-/GGTTCCAAGCCATGCTGT TGTGCAGGCT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 N/A 0 0 48414 CASAVA_Build 1 104505633 1D AAACTATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 905 hom 35 2 22 11 A 14 13 48415 CASAVA_Build 1 104538149 1I TAGAATTTTA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 7 8 48416 CASAVA_Build 1 104548730 1I ATCCTCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 38 1 25 12 T 12 13 48417 CASAVA_Build 1 104551516 14D GTTGTGAATT TTACTGGGTATGAA/-------------- TTACGTCTCA 3070 het 3070 hom 39 17 21 3 TTACTGGGTATGAA 1 0 48418 CASAVA_Build 1 104551916 4D TATAAATAAT TGAG/---- TATTTTGAAT 2223 het 2223 ref 15 7 5 4 TGAG 1 0 48419 CASAVA_Build 1 104569839 1D TTTGCAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 31 2 19 10 A 13 12 48420 CASAVA_Build 1 104570263 1I CTTCAGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 11 13 A 13 14 48421 CASAVA_Build 1 104575029 1I AAGTCACACA -/T TTTTTTTTTT 1194 het 1194 ref 52 43 3 6 T 10 11 48422 CASAVA_Build 1 104577424 2D ATTTTAACAA TT/-- TTTTTCCTTA 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 7 5 48423 CASAVA_Build 1 104579287 1D TAGAAAAAAA T/- ATGAACACCT 3070 het 3070 ref 22 9 10 4 T 1 0 48424 CASAVA_Build 1 104589574 5D TTTAATACAT ATATC/----- ATATGTACAT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 ATATC 1 0 48425 CASAVA_Build 1 104593873 1I TTCGTAAAAG -/T TTGACAAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 T 2 3 48426 CASAVA_Build 1 104594091 1D TGCTTAGAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 10 9 48427 CASAVA_Build 1 104596423 1I CACAATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 606 hom 36 2 25 9 T 10 11 48428 CASAVA_Build 1 104597373 5D ATTATACTAT TAAAA/----- TAAAATTATT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 TAAAA 2 1 48429 CASAVA_Build 1 104599454 2D TTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 25 1 18 8 T 16 14 48430 CASAVA_Build 1 104599924 1D AGAGTGTATG A/- AAAAGTTTCT 3070 hom 82 het 33 0 28 6 A 5 4 48431 CASAVA_Build 1 104600742 2I TACACTACTC --/TG TGGTGGTTTA 3070 hom 90 het 31 0 29 2 TG 1 2 48432 CASAVA_Build 1 104606490 1D CTTTCCATTG C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 1 0 48433 CASAVA_Build 1 104613857 2I ATATAACTGC --/AG AGTTTGTTTT 3070 het 25 hom 40 1 16 23 AG 1 2 48434 CASAVA_Build 1 104616698 2I TTGTTTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 T 10 12 48435 CASAVA_Build 1 104639096 1D AACTCAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 10 9 48436 CASAVA_Build 1 104643064 1D GCATTGACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 11 10 48437 CASAVA_Build 1 104643172 3D TGCAATAAGT TTA/--- TTATATTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTA 2 1 48438 CASAVA_Build 1 104645519 1D CAGCAGGATA G/- GGCAGCAGGC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 G 3 2 48439 CASAVA_Build 1 104647569 1I TTTCATCAAC -/A CGAGACCTGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 48440 CASAVA_Build 1 104648561 6I TCCTTCCCCA ------/TGATCC TGATCCACCA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 TGATCC 1 2 48441 CASAVA_Build 1 104648845 3I AACGAATATG ---/CAC CACCCAACAC 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 CAC 1 2 48442 CASAVA_Build 1 104649536 1D44M2D AAATGAAATT AAAAAGAAGAAAACAATAAAAACAATTAATATAACAAAAAAGTTGTT/-AAAAGAAGAAAACAATAAAAACAATTAATATAACAAAAAAGTTG-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 8 14 16 N/A 0 0 48443 CASAVA_Build 1 104649954 1D AAGATGTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 11 10 48444 CASAVA_Build 1 104650451 1I GAACCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 11 12 11 A 10 11 48445 CASAVA_Build 1 104653267 2D TTTAGTCAAC AT/-- ATATTTATAG 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 AT 3 2 48446 CASAVA_Build 1 104654629 1I AAATTGTGTG -/T TGGGGCGGGC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 1 2 48447 CASAVA_Build 1 104656392 1I TTTTCTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 11 48448 CASAVA_Build 1 104657689 1I TTCGGACTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 9 10 48449 CASAVA_Build 1 104658999 1I TTGTGTTAAA -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 6 7 48450 CASAVA_Build 1 104660931 5I ACAAGTTATA -----/AAAAT AAAATGTTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAAT 1 2 48451 CASAVA_Build 1 104662987 1D CTCAGACCAT G/- AAGATATTCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 1 0 48452 CASAVA_Build 1 104664491 2D TGGTTGTTTG TA/-- TATCTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TA 2 1 48453 CASAVA_Build 1 104664562 4D TTTCTTGATA TGCT/---- TGAGTTCCTT 3070 hom 72 het 25 0 25 3 TGCT 1 0 48454 CASAVA_Build 1 104665722 2D CTATTGACAT AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 39 het 23 0 14 9 A 10 8 48455 CASAVA_Build 1 104671168 1D TCCAAATCTA T/- TCAGATTTAT 1401 het 1401 ref 27 21 3 3 T 2 1 48456 CASAVA_Build 1 104671847 2D ATTATTTTCC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 10 17 11 T 11 9 48457 CASAVA_Build 1 104682479 5I GTTAGGCGAT -----/GCCCC GCCCTGCTTC 3070 het 3070 ref 52 26 15 11 GCCCC 0 1 48458 CASAVA_Build 1 104687209 2D TTCCTGGAGG TT/-- TTATGGCCAC 3070 het 3070 ref 32 19 13 0 T 4 2 48459 CASAVA_Build 1 104687834 5I CTTTATCCCC -----/TCAAA TCAAATATTA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 TCAAA 1 2 48460 CASAVA_Build 1 104689231 1I TTCAAACTTA -/C TCTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 C 0 1 48461 CASAVA_Build 1 104692615 2D TACGACACAC AT/-- GTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 AT 1 0 48462 CASAVA_Build 1 104695489 1D ACTGCACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 12 11 48463 CASAVA_Build 1 104697703 1I GCCGTCCAAA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 6 7 48464 CASAVA_Build 1 104704599 5I TTCACAAAGT -----/AAATG AAATGGAGTT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 AAATG 1 2 48465 CASAVA_Build 1 104707027 1D GACTGTCTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 A 10 9 48466 CASAVA_Build 1 104709406 4I AAAACAAAAT ----/AAAA GAAATCAAGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 0 4 48467 CASAVA_Build 1 104715195 1D GTTAATAATA T/- ATACACTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 T 1 0 48468 CASAVA_Build 1 104715837 1D TTAACAAATT A/- AAAAAAAAAA 1681 het 1681 ref 52 33 5 14 A 12 11 48469 CASAVA_Build 1 104721194 1D AATAGTTACC A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 49 27 21 1 A 7 6 48470 CASAVA_Build 1 104741533 1I CATCTTCACC -/A GTAGTAGTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 48471 CASAVA_Build 1 104742958 1I CTCAGCTTTC -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 A 6 7 48472 CASAVA_Build 1 104749500 1I CTGATTTATG -/T TTTTGTATTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 5 48473 CASAVA_Build 1 104750364 4D TGTTTCATAC TTTT/---- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 48 0 40 9 T 13 9 48474 CASAVA_Build 1 104750967 1I CTGTGGTGAT -/G GGGGGGGCCT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 G 7 8 48475 CASAVA_Build 1 104751198 3I TTATAAATTA ---/CCC AGTCTAAGGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 3 48476 CASAVA_Build 1 104751846 1D TACAGCTCAT A/- AAAGTTGTGC 3070 hom 120 het 41 0 41 5 A 4 3 48477 CASAVA_Build 1 104759276 13I AGGTTCTGGG -------------/TTTCCTTTGCTGT TTTCCTTTGC 3070 het 3070 hom 35 13 16 8 TTTCCTTTGCTGT 1 2 48478 CASAVA_Build 1 104761790 1D TTTGTATTTG T/- TTTGTTTTGT 3070 hom 62 het 27 0 20 7 T 4 3 48479 CASAVA_Build 1 104766690 1D AAACGCTTTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 90 het 33 0 30 5 T 8 7 48480 CASAVA_Build 1 104772269 1D TTTGTAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 850 hom 41 4 25 12 T 15 14 48481 CASAVA_Build 1 104775432 1I TTAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 68 hom 36 2 29 5 A 9 10 48482 CASAVA_Build 1 104776666 1I AAGTAAAAAA -/C AAAGTAGATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 1 48483 CASAVA_Build 1 104781697 3D AAAACAACAA CAG/--- CAGCAAAGTG 3070 hom 126 het 47 0 38 9 CAG 2 1 48484 CASAVA_Build 1 104783696 11I TTCACTGGAG -----------/CTTACTGTGTC CTCACATAGT 3070 het 3070 hom 45 22 20 3 CTTACTGTGTC 0 1 48485 CASAVA_Build 1 104787202 1D TCTATTTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 5 T 10 9 48486 CASAVA_Build 1 104787476 3D AAAGTAATCA GTT/--- ATTATTAATA 3070 het 3070 ref 20 11 8 3 GTT 1 0 48487 CASAVA_Build 1 104787882 4D TGAGTGGATT TTGA/---- TTGATTGATT 3070 het 3070 ref 47 26 16 7 TTGA 3 2 48488 CASAVA_Build 1 104827146 7I GTAACAATTA -------/TTTCTAT TTTTGTATAC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TTTCTAT 0 1 48489 CASAVA_Build 1 104836388 1I TATCCAGACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 12 13 48490 CASAVA_Build 1 104838298 2D AGAAAAAAAA AT/-- ATGATCATTT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 AT 2 1 48491 CASAVA_Build 1 104842747 1D TCAGTGAACT A/- AAAAAAAAAA 1216 het 1216 ref 26 21 4 1 A 12 11 48492 CASAVA_Build 1 104853015 1I TGCAGAAATG -/A AAACTAGTGA 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 A 3 4 48493 CASAVA_Build 1 104855809 1I TGATTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 10 11 48494 CASAVA_Build 1 104856179 1I GTGAGAGCTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 8 9 48495 CASAVA_Build 1 104858673 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 T 6 5 48496 CASAVA_Build 1 104865045 2I CCTATCTTGT --/TA GCCTCCAAAG 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 TA 0 1 48497 CASAVA_Build 1 104869849 1I ATGCCTCATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 8 9 48498 CASAVA_Build 1 104879920 1D TAAAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 9 8 T 12 11 48499 CASAVA_Build 1 104889025 1D GCTTGTTTTT C/- CTCAGGTTTG 2442 het 2442 ref 17 7 7 3 C 2 1 48500 CASAVA_Build 1 104890407 5D TCTCCCTCAG TAAAT/----- TATTTTAGTA 3070 het 3070 ref 39 20 19 1 TAAAT 1 0 48501 CASAVA_Build 1 104899650 1D ACAAATTGAA C/- CTAATTAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 C 2 1 48502 CASAVA_Build 1 104900454 5D GTAATATAAT ATATA/----- ATATATTTCA 1515 hom 10 het 5 0 4 1 ATATA 2 1 48503 CASAVA_Build 1 104912509 1D AGTCAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 12 11 48504 CASAVA_Build 1 104923994 1D TTGAGGAGGC A/- AAAAAGTGAT 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 A 6 5 48505 CASAVA_Build 1 104931564 1I GAAGATGAGG -/A AAAAAAAAAA 2332 het 1737 hom 26 8 10 8 A 14 15 48506 CASAVA_Build 1 104947949 1D TATTTTAGGC A/- AAAAAAAGTT 3070 het 937 hom 25 4 11 10 A 8 7 48507 CASAVA_Build 1 104947976 5D AGAAATAGAA GAGAT/----- AAGACTTATC 3070 het 1129 hom 21 4 10 8 GAGAT 1 0 48508 CASAVA_Build 1 104950683 1I ATACAAACCA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 98 het 34 0 33 1 T 8 9 48509 CASAVA_Build 1 104950874 1D AAAAATACAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 9 8 48510 CASAVA_Build 1 104951548 1D AATTACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 A 12 11 48511 CASAVA_Build 1 104973427 1D TATGTACCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 16 7 T 12 11 48512 CASAVA_Build 1 104976584 1I AATACATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 10 11 48513 CASAVA_Build 1 104977253 1D TGGATGTTGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 21 14 7 A 9 8 48514 CASAVA_Build 1 104985922 1D TCAGATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3030 hom 38 8 17 14 T 15 14 48515 CASAVA_Build 1 104997423 12D CTTAGTATTG CTGTTGAAAAAT/------------ CAATTGGCTT 3070 hom 90 het 33 0 31 5 CTGTTGAAAAAT 1 0 48516 CASAVA_Build 1 105013114 8D AGATATCATG CTCCTTAA/-------- CTCTTTTATA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 CTCCTTAA 1 0 48517 CASAVA_Build 1 105013877 1D GAGGTGGAGT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 8 7 48518 CASAVA_Build 1 105016998 1D AGACCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 38 0 28 10 A 13 12 48519 CASAVA_Build 1 105023320 1D TATAAATTAT A/- AAAAAATATA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 7 6 48520 CASAVA_Build 1 105026282 3D AATATAAATC GAT/--- GAAATACATT 3070 het 3070 ref 45 25 19 2 GAT 1 0 48521 CASAVA_Build 1 105027013 2D GACACTTAAG AT/-- ATATATATAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 5 4 48522 CASAVA_Build 1 105035747 2D9M3I TTAAAATGCC AAGTCGTGCTA---/--GTCATGCTAATT ATTATCACAT 3070 hom 151 het 49 0 50 6 N/A 0 0 48523 CASAVA_Build 1 105039340 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2543 het 2486 hom 26 11 7 8 A 13 12 48524 CASAVA_Build 1 105043270 1D AGGACCTGTC A/- GGGGGTGGGG 2677 het 1927 hom 25 6 10 11 A 1 0 48525 CASAVA_Build 1 105046878 4I ATACCAAAAC ----/CAGA CAAAGACGCA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 CAGA 0 1 48526 CASAVA_Build 1 105050471 1D TTTTGTTTTA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 T 7 6 48527 CASAVA_Build 1 105051875 1I GGTTTTTTTT -/A ATTTGTTTGT 3070 het 2275 hom 29 11 14 4 A 1 2 48528 CASAVA_Build 1 105057955 1I TTAATTTCTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 7 8 48529 CASAVA_Build 1 105059788 4D TCTTTATTAT TCTA/---- TCTATTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 16 5 TCTA 2 1 48530 CASAVA_Build 1 105060351 3D GTTAATTTTA AAG/--- ATGTAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 AAG 1 0 48531 CASAVA_Build 1 105060679 1I AGATAGAAGG -/A AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 A 6 7 48532 CASAVA_Build 1 105063461 3D ATATACACAC ATT/--- ATTAAAATAA 3070 het 3070 hom 35 10 22 4 ATT 2 1 48533 CASAVA_Build 1 105073795 1D AATTTCTGTC T/- TTTTTGATAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 T 6 5 48534 CASAVA_Build 1 105073888 2I TTGGGTATTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TA 5 6 48535 CASAVA_Build 1 105074912 1D TTAAAAAACA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 7 48536 CASAVA_Build 1 105075696 1I TAGGTATCAC -/T TTTTTTGATT 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 T 6 7 48537 CASAVA_Build 1 105078356 1I TTAGCATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 11 12 48538 CASAVA_Build 1 105078829 1D CAGTGTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 19 8 T 10 9 48539 CASAVA_Build 1 105079468 2D GATTAATTCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 T 13 11 48540 CASAVA_Build 1 105083249 1D TGATATTTCA G/- GTAGTCTTTC 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 G 2 1 48541 CASAVA_Build 1 105084354 1I TTAACAATCA -/C CAGGTATCTC 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 C 1 2 48542 CASAVA_Build 1 105084469 2D CTCTCCTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 37 3 18 16 T 14 12 48543 CASAVA_Build 1 105086580 4I TCCTATGAAC ----/TTTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 T 9 13 48544 CASAVA_Build 1 105090578 2D CCTTGCACTT TG/-- TGTGCCATGT 3070 hom 148 het 53 0 50 5 TG 3 2 48545 CASAVA_Build 1 105091899 1D AAGATTTTCC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 9 8 48546 CASAVA_Build 1 105092377 4I AAATTAAATA ----/TAGT TAAAGAAATC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TAGT 0 1 48547 CASAVA_Build 1 105094855 5I TTCACTCACA -----/CACAG CACAGCAAAG 3070 het 3070 ref 48 21 22 5 CACAG 1 2 48548 CASAVA_Build 1 105098088 1D GGGAGCTGAT A/- CAATTCTTTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 0 48549 CASAVA_Build 1 105106878 1I TCTGGGTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 17 15 12 A 14 15 48550 CASAVA_Build 1 105110122 4I AATAAATAAA ----/TAAT TCTTAAATGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TAAT 0 1 48551 CASAVA_Build 1 105110321 1D TAAATGCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 24 11 T 12 11 48552 CASAVA_Build 1 105130779 4D TGAGAAATGG TTGA/---- TTGTTGTTGA 3070 hom 178 het 62 0 59 5 TTGA 1 0 48553 CASAVA_Build 1 105168389 1D TTTTTTAATA T/- TTTTGTACTA 3070 hom 61 het 25 0 21 4 T 5 4 48554 CASAVA_Build 1 105169742 2D GGTAAAAATC TG/-- TAGTTAATAT 3070 het 3070 ref 56 34 15 7 TG 1 0 48555 CASAVA_Build 1 105172884 1I CTATCAAATT -/G CATTACATGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 0 1 48556 CASAVA_Build 1 105178793 1I AATGAATCCA -/G GAGCTGGTTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 1 2 48557 CASAVA_Build 1 105218168 2I GAGTGCTACT --/TA TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 TA 0 1 48558 CASAVA_Build 1 105218328 30D AACTTACCAT TTTCAAGATATGAAACAGATAACTTCCTCA/------------------------------ TTTCAAGATA 3070 het 3070 ref 43 26 11 19 TTTCAAGATATGAAACAGATAACTTCCTCA 2 1 48559 CASAVA_Build 1 105219676 2I GAATTAATCA --/CT CTGATATAAC 3070 het 2982 hom 16 6 9 1 CT 1 2 48560 CASAVA_Build 1 105219719 5I ATTTATATAT -----/TAATA TAATATAATT 277 het 277 ref 12 9 1 3 TAATA 1 2 48561 CASAVA_Build 1 105219993 2D GAAATTCTAT TA/-- TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 25 14 8 5 TA 1 0 48562 CASAVA_Build 1 105221162 2D TTAGCTGTGA AT/-- ATATATATAC 2431 het 1923 hom 12 6 5 1 AT 5 4 48563 CASAVA_Build 1 105235125 1D ACCCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 2079 het 2079 ref 26 9 6 11 A 13 12 48564 CASAVA_Build 1 105237266 1I AGTTATAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 9 10 48565 CASAVA_Build 1 105242325 1D TTCTGTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 18 7 T 11 10 48566 CASAVA_Build 1 105243170 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 38 0 31 8 T 12 11 48567 CASAVA_Build 1 105248929 10I AAAGCTCCAA ----------/ATTTTCCTAC ATTTTCCTGT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 ATTTTCCTAC 0 1 48568 CASAVA_Build 1 105252025 5D CAGATTTTTA AATTT/----- ATTTCTAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 7 AATTT 1 0 48569 CASAVA_Build 1 105252393 1I ATTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2238 hom 33 10 12 12 T 13 14 48570 CASAVA_Build 1 105254701 1I GGAAAAAAAA -/C AAAACTCAAA 3070 het 1744 hom 21 7 12 2 C 0 1 48571 CASAVA_Build 1 105259544 1D AGGGTCACAG A/- TTTTTTTGTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 1 0 48572 CASAVA_Build 1 105264121 1I CAAAACATCA -/T GGTACTGGTA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 0 1 48573 CASAVA_Build 1 105268674 1I CTTATATATA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 8 48574 CASAVA_Build 1 105269022 1I GTCCTGTGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 9 10 48575 CASAVA_Build 1 105284197 1D TTCTTCTAAA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 8 7 48576 CASAVA_Build 1 105284766 1I GTCTGTGCCC -/T GCCCCCAGAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 0 1 48577 CASAVA_Build 1 105287794 1D AAAAGAAAAC A/- AAAAAACCCC 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 A 7 6 48578 CASAVA_Build 1 105290701 4D TGGTGGTGCA TGCC/---- TGTAATCCCA 3070 hom 40 het 15 0 14 3 TGCC 1 0 48579 CASAVA_Build 1 105290878 12D GCCTAAGGAA ACTACCAGACAC/------------ ATTAAGCATA 3070 hom 32 het 15 0 12 4 ACTACCAGACAC 1 0 48580 CASAVA_Build 1 105293538 12D ATAAAATCAA GCCATAAAATAG/------------ GCCATAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 GCCATAAAATAG 1 0 48581 CASAVA_Build 1 105293746 5D AAGTGAAACT TAAAA/----- TAAATTTTAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 4 TAAAA 1 0 48582 CASAVA_Build 1 105295031 1I55M2D ACCGGGAGGC -GAGGTTGCAGTTAGCCAAAATCGCCCCATTGCACAACAGTGCAAGACTCCGTCTCAA/AGAGGTTGCAGTTAGCCAAAATCGCCCCATTGCACAACAGTGCAAGACTCCCTCTC-- AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 22 0 21 11 N/A 0 0 48583 CASAVA_Build 1 105300415 1I CAATACCATG -/A CAGTTGATTT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 0 1 48584 CASAVA_Build 1 105300567 1I CATGCAACTT -/A AAGCAATGTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 2 3 48585 CASAVA_Build 1 105301817 3I ATATTTCATT ---/ATC ATTATTTTAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 ATC 0 1 48586 CASAVA_Build 1 105304089 1D ACTCAATAGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 34 20 8 6 A 9 8 48587 CASAVA_Build 1 105308350 1D GCCTGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 14 13 48588 CASAVA_Build 1 105309125 1I AGAGAGGAAA -/C ATTTGCTGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 48589 CASAVA_Build 1 105310117 5D TGGATTTTAA TTAAT/----- TTAATATATT 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TTAAT 2 1 48590 CASAVA_Build 1 105311642 2I AAAAATAAAA --/CT CTGTATTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CT 1 2 48591 CASAVA_Build 1 105312632 2D TATTACAATC TT/-- TTATCTTTAT 3070 hom 111 het 44 0 38 7 T 4 2 48592 CASAVA_Build 1 105312990 3D AGAGTTAGTT ATC/--- ATTGAAATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 ATC 1 0 48593 CASAVA_Build 1 105313544 2D GATTGATGCA TT/-- TTTTTTCTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 8 6 48594 CASAVA_Build 1 105314051 1I TAACATTATC -/A GGGGGATAAT 3070 hom 115 het 47 0 38 9 A 0 1 48595 CASAVA_Build 1 105314429 2I TTACATTCTC --/TT TACTCATTTA 3070 hom 95 het 36 0 32 4 T 1 3 48596 CASAVA_Build 1 105316064 2I AATAATAAAG --/AC ACAGAATTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AC 1 2 48597 CASAVA_Build 1 105316301 1I AATAAAATTT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 7 8 48598 CASAVA_Build 1 105317427 1D TGTTTAAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 T 10 9 48599 CASAVA_Build 1 105318558 1D CATTTTATAT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 8 7 48600 CASAVA_Build 1 105325535 1D TTTTTAACTA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 7 6 48601 CASAVA_Build 1 105325693 1I GAAAAAAAAA -/G AATGCTACAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 0 1 48602 CASAVA_Build 1 105336297 1D AGGACTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 11 10 48603 CASAVA_Build 1 105340638 18D AGATATATAC ATATATATATATATATAT/------------------ ATATATATAT 3070 het 8 hom 16 1 12 5 AT 17 8 48604 CASAVA_Build 1 105343693 1D GTAAAATTGT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 28 12 9 8 A 9 8 48605 CASAVA_Build 1 105345983 3D TTCTAGAAAA ATT/--- ATTATCGTCA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 ATT 2 1 48606 CASAVA_Build 1 105352291 1I CATTGATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 T 9 10 48607 CASAVA_Build 1 105355098 1I AAAACAAAAT -/A AAAAAATTGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 7 48608 CASAVA_Build 1 105359211 1D TCCATCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 24 2 14 9 T 17 16 48609 CASAVA_Build 1 105359781 2D ATTTTATATT AC/-- TGTGAGATAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 AC 1 0 48610 CASAVA_Build 1 105370110 1D CATTCACAAG A/- TCCAAGAAAC 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 A 1 0 48611 CASAVA_Build 1 105376589 4I TCAAAACTAA ----/TAGT TAGGCATCTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 TAGT 0 1 48612 CASAVA_Build 1 105377933 2D AGCCAATAAT TA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 TA 1 0 48613 CASAVA_Build 1 105385975 1I AAATAAAACA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 196 hom 41 1 31 9 T 7 8 48614 CASAVA_Build 1 105387685 10D TGAAGAAACT AAGAATAAAA/---------- TTTAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 14 10 5 AAGAATAAAA 1 0 48615 CASAVA_Build 1 105401387 1I ATGAACAACT -/G AGCAAGAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 48616 CASAVA_Build 1 105405854 1D TTTGTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 9 T 11 10 48617 CASAVA_Build 1 105409458 1I TTAAACAATG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 6 7 48618 CASAVA_Build 1 105412375 4I TGGCATATAG ----/TTAC TTACAGCAGC 3070 het 3070 hom 36 8 23 5 TTAC 1 2 48619 CASAVA_Build 1 105419108 2D44M2D ATATATATAT ACACACACACACACATATATATGTATACATATATATGTATATATATAC/--ATACACACACACATATATATGTATACATATATATGTATATATAT-- ACCCAATATA 2873 het 2873 ref 18 14 8 10 N/A 0 0 48620 CASAVA_Build 1 105424007 1D ATCACAAATT A/- AAGTATGTGA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 A 3 2 48621 CASAVA_Build 1 105429030 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TA 6 5 48622 CASAVA_Build 1 105449463 1D TTCTGTTTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 T 9 8 48623 CASAVA_Build 1 105450784 3D ATAGAGAACA TCC/--- TCCTGGACAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TCC 2 1 48624 CASAVA_Build 1 105452282 1D CACTTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 1139 het 1139 ref 32 25 3 4 A 13 12 48625 CASAVA_Build 1 105454547 1D CTCCACTTCA T/- TTTTTGGGGC 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 T 6 5 48626 CASAVA_Build 1 105469978 7D CAGTGACCCA AGGTTGC/------- AACATCAGAT 1297 hom 12 het 5 0 4 1 AGGTTGC 1 0 48627 CASAVA_Build 1 105471384 1D TGTAATCCCA G/- CACTTTGGGA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 1 0 48628 CASAVA_Build 1 105471633 4D CCATCTAAAC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 32 het 17 0 11 7 TA 9 7 48629 CASAVA_Build 1 105472241 1D TTAGCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 11 10 48630 CASAVA_Build 1 105475322 2D ATTTCATAAG TA/-- TTTTAAATAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TA 1 0 48631 CASAVA_Build 1 105477563 2I TAAATCAAAT --/TA TATATATATA 2418 het 463 hom 8 1 7 0 TA 8 9 48632 CASAVA_Build 1 105481052 1I CATCATTTAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 208 hom 40 1 35 4 A 8 9 48633 CASAVA_Build 1 105484390 3I GAATACCTCA ---/CCT CCTTCAAAGA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CCT 1 2 48634 CASAVA_Build 1 105490977 1D AGAATTGGTG A/- AAAAAAAAAA 1830 het 1830 ref 38 25 5 8 A 13 12 48635 CASAVA_Build 1 105491246 1D GTCTTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 32 0 20 12 T 11 10 48636 CASAVA_Build 1 105498460 1D GGATGGTACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 35 0 32 5 A 9 8 48637 CASAVA_Build 1 105500637 1I AAAAGTCTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 396 hom 41 1 36 4 T 9 10 48638 CASAVA_Build 1 105501712 2I TCCTGATATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 44 0 29 15 T 12 14 48639 CASAVA_Build 1 105506077 2D TTCCCACTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 31 7 10 14 T 20 18 48640 CASAVA_Build 1 105506816 1D TCTAGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 26 1 9 17 A 11 10 48641 CASAVA_Build 1 105507226 1D TTTTAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 12 11 48642 CASAVA_Build 1 105509309 1I AAAGACTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 46 0 35 11 T 10 11 48643 CASAVA_Build 1 105510157 1D TAGAATAGGA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 T 8 7 48644 CASAVA_Build 1 105515128 1I GTATTTTTTT -/A AAAAACAAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 5 6 48645 CASAVA_Build 1 105516371 1I GAAAAATAAG -/C TTTTTCTCCC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 0 1 48646 CASAVA_Build 1 105519963 2I ACTGATTTTC --/TT TTTTTTTTTT 1436 het 5 hom 26 0 6 20 T 10 12 48647 CASAVA_Build 1 105521626 1I TTTGAAACAC -/A TATGGAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 48648 CASAVA_Build 1 105524575 1D CTTGCCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 25 0 17 8 A 15 14 48649 CASAVA_Build 1 105525529 6I GAAAAAATAA ------/TAGTTT TAAAGTATAT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 TAGTTT 0 1 48650 CASAVA_Build 1 105527926 1D TGAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 14 5 T 11 10 48651 CASAVA_Build 1 105531784 3I AAATTTTAAC ---/TGA TGAGTATTAA 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 TGA 1 2 48652 CASAVA_Build 1 105535743 2I ACAGTTTTTA --/TT TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 T 7 9 48653 CASAVA_Build 1 105539634 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 12 11 48654 CASAVA_Build 1 105540485 1D AAAATTTATA G/- AAGGAAATGA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 G 1 0 48655 CASAVA_Build 1 105541375 1D CTTATTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 10 9 48656 CASAVA_Build 1 105545326 1I TTGTTATTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 8 9 48657 CASAVA_Build 1 105547876 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1740 het 179 hom 15 3 6 7 A 20 18 48658 CASAVA_Build 1 105553355 1D ATATAATGAT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 47 22 21 5 A 8 7 48659 CASAVA_Build 1 105558042 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 1300 het 1300 ref 17 12 3 2 A 9 10 48660 CASAVA_Build 1 105577728 1D TAGTACTTGC T/- TTTTTTTTTT 1282 het 1282 ref 34 26 4 4 T 11 10 48661 CASAVA_Build 1 105579671 4D5M2D ATTTTTTTTT CAAATTTTTCA/----TATTT-- AATTCACCTA 3070 het 205 hom 27 2 9 18 N/A 0 0 48662 CASAVA_Build 1 105591889 2I TATTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTA 3046 het 3046 ref 25 13 9 3 T 9 11 48663 CASAVA_Build 1 105592157 1D TTTAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 T 11 10 48664 CASAVA_Build 1 105593501 5I TTTCCTTTTC -----/TCTTT TCTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TCTTT 3 4 48665 CASAVA_Build 1 105593836 1I GATTATTAGA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 6 7 48666 CASAVA_Build 1 105595149 1D CTTTTGTGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 9 8 48667 CASAVA_Build 1 105596027 1D GTTGTTTTTG A/- AGTGTTCTTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 2 1 48668 CASAVA_Build 1 105596836 1D TCACTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 14 9 T 12 11 48669 CASAVA_Build 1 105597700 1I35M14D GACATATTGG -AGCTCCATTGTATGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTT/AAGCTCCATTGTATGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTG-------------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 17 21 10 N/A 0 0 48670 CASAVA_Build 1 105597924 1I TTTGTTACTA -/T CCCCTTGAAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 0 1 48671 CASAVA_Build 1 105601325 1D AATAGAAATT G/- GAAAAATATG 3070 het 3070 ref 21 11 7 4 G 2 1 48672 CASAVA_Build 1 105602884 1I TATTACCTTT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 A 6 7 48673 CASAVA_Build 1 105603056 1I ACCATTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 9 10 48674 CASAVA_Build 1 105603243 1I CCCAATCATA -/T TTTTTGAATA 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 5 6 48675 CASAVA_Build 1 105605139 4I GCATTCACTC ----/TATT TACATTTTTC 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 TATT 0 1 48676 CASAVA_Build 1 105625042 1I ATTTTTATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 9 10 48677 CASAVA_Build 1 105639624 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 17 0 11 8 A 11 10 48678 CASAVA_Build 1 105647508 1I GCCAAGAGAA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 T 7 8 48679 CASAVA_Build 1 105647639 3D TATGGCACAC ATA/--- ATATTTACTA 2983 het 2983 ref 24 14 8 2 ATA 2 1 48680 CASAVA_Build 1 105653597 1D ACTGAGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 12 11 48681 CASAVA_Build 1 105653922 1I TCTGCAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 12 13 48682 CASAVA_Build 1 105663993 3D TACATTTTGA CTT/--- CTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 CTT 2 1 48683 CASAVA_Build 1 105664678 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 623 hom 36 4 12 21 T 17 16 48684 CASAVA_Build 1 105664863 1D GCTCCCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 6 T 11 10 48685 CASAVA_Build 1 105670290 5D TTAAATAGAA TACTT/----- TATGAGGAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 5 TACTT 1 0 48686 CASAVA_Build 1 105671318 1I AAGAGAAACA -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 6 7 48687 CASAVA_Build 1 105671715 1D GCAATCATAT C/- CCCCCCTTGT 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 C 7 6 48688 CASAVA_Build 1 105692482 1D GCCATCTATG A/- CAATCCCATA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 1 0 48689 CASAVA_Build 1 105699016 1D ATATTCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 772 hom 33 8 10 16 T 17 16 48690 CASAVA_Build 1 105700621 1I GAAAATATAT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 78 het 27 0 26 1 A 7 8 48691 CASAVA_Build 1 105705736 1I CAGCCTATTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 A 8 9 48692 CASAVA_Build 1 105714470 4D TATATTTAAA CAAT/---- CTATTTTCTT 3070 hom 54 het 20 0 19 4 CAAT 1 0 48693 CASAVA_Build 1 105716024 4I CTAAACTGTT ----/AAGA AAGGTAAATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAGA 0 1 48694 CASAVA_Build 1 105716846 1D AGATAAAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 9 8 48695 CASAVA_Build 1 105724294 1D TGGTCTGAAG A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 1 0 48696 CASAVA_Build 1 105736673 1D TTATGTGTGG C/- TATTGTACAT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 C 1 0 48697 CASAVA_Build 1 105744722 2D GAGTTTTTTT TG/-- TTTGTTTTGT 3070 hom 36 het 28 1 22 6 TG 1 0 48698 CASAVA_Build 1 105748982 1D TTTGCTGGAA G/- GTTGCTCTAG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 G 2 1 48699 CASAVA_Build 1 105750288 1I AATGGTAAGC -/A AATGGTAAGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 2 3 48700 CASAVA_Build 1 105752830 1I GCCAAGAAAA -/G CCTCACATAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 0 1 48701 CASAVA_Build 1 105754632 4D TTTTTGTGAT AGTG/---- AGTGAGTCTC 3070 hom 123 het 45 0 40 6 AGTG 2 1 48702 CASAVA_Build 1 105758019 1D GAGAGTTTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 8 48703 CASAVA_Build 1 105758494 2D TCCCAGAATC TG/-- TGCATTTATC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TG 2 1 48704 CASAVA_Build 1 105762943 1D AGAAGACATC A/- ACAAGGTAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 2 1 48705 CASAVA_Build 1 105764632 2I CTTGAAGACA --/AG TTATTGAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AG 0 1 48706 CASAVA_Build 1 105765476 2D CAATGATTTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 TA 10 9 48707 CASAVA_Build 1 105782735 1I TATGAAAAAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 60 het 37 1 32 4 A 8 9 48708 CASAVA_Build 1 105786573 1I TAACCTGTAT -/A GTGGGCTCTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 0 1 48709 CASAVA_Build 1 105786694 1D TTGTCACCAT A/- AAAGGACTTG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 4 3 48710 CASAVA_Build 1 105796550 1I ACAGAATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 39 1 31 7 A 10 11 48711 CASAVA_Build 1 105796672 1D CAAAGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 12 11 48712 CASAVA_Build 1 105809511 1D CCAGGGTAAC A/- TAGTGAAACA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 1 0 48713 CASAVA_Build 1 105813150 2D GAATTGTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 43 0 31 12 A 13 11 48714 CASAVA_Build 1 105815892 4D AAAAGTCTCT CTTC/---- CTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 7 CTTC 1 0 48715 CASAVA_Build 1 105820704 1I TAATATGTTG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 8 9 48716 CASAVA_Build 1 105821364 4I TTTTTGTTGA ----/CTGT CTTTCTTAAT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 CTGT 0 1 48717 CASAVA_Build 1 105825808 4I TGAAAAAGTT ----/AAAA AAGATAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 6 48718 CASAVA_Build 1 105829157 1D CTACAATTTA C/- TTCTACTATG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 0 48719 CASAVA_Build 1 105830251 1D TGTCTCATGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 9 8 48720 CASAVA_Build 1 105830652 3I GATTTCTAGA ---/CAT ATGGCCATGA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 CAT 0 1 48721 CASAVA_Build 1 105831911 1I ACTGTGACCA -/T TCTAAGTGTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 1 2 48722 CASAVA_Build 1 105834069 2I CTGAGAACAC --/AG AGTGTATGAC 3070 hom 104 het 38 0 33 5 AG 1 2 48723 CASAVA_Build 1 105836484 1D GAACAATTTT A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 65 het 38 1 35 3 A 8 7 48724 CASAVA_Build 1 105838426 1I AAATCAAAAC -/A AAAAAAATGT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 7 8 48725 CASAVA_Build 1 105839487 10D ACCCTGCCTC AAAAAAAACA/---------- AAAGAAAACA 3070 hom 66 het 30 0 31 2 AAAAAAAACA 1 0 48726 CASAVA_Build 1 105839984 1D TTATAATGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2021 hom 23 5 13 5 T 9 8 48727 CASAVA_Build 1 105840224 5D33M3I TTTTCAATGA TTTATTTTATCCACAGTGAATCTCAATATATAATCAAC---/-----TTTATCCACAGTGAATCTCAATATATAATCAACAAT ATTTTAATTG 3070 het 3070 hom 40 12 18 24 N/A 0 0 48728 CASAVA_Build 1 105842657 1I TCCATGAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 9 10 48729 CASAVA_Build 1 105843881 1D CTAATTTATT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 8 7 48730 CASAVA_Build 1 105848453 1D CTAAAAACAC A/- AAAAAATTAG 1402 hom 8 het 7 0 3 4 A 7 6 48731 CASAVA_Build 1 105848784 1I AACTCTCAAC -/A AAATTAGGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 3 4 48732 CASAVA_Build 1 105848902 2D ATCATACCCA CT/-- CTCACGACTT 3070 hom 65 het 33 0 21 14 CT 2 1 48733 CASAVA_Build 1 105848955 1D GAATAGTTAT G/- CAACAGAAAG 3070 het 3070 hom 36 13 17 7 G 1 0 48734 CASAVA_Build 1 105850152 1I AGGACCTCCC -/A AAATATGTAA 3070 hom 53 het 28 0 25 3 A 3 4 48735 CASAVA_Build 1 105850674 1D GCACATTAAA T/- TTATACAATT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 3 2 48736 CASAVA_Build 1 105857676 3D TCTATAGTTA GGT/--- ACACAGTGAG 3070 het 3070 ref 46 22 22 3 GGT 1 0 48737 CASAVA_Build 1 105864712 1I TAAAAATATT -/A AAAAAACAGT 3070 het 390 hom 46 1 38 7 A 6 7 48738 CASAVA_Build 1 105865158 1I AAAATCTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 29 1 17 11 A 13 14 48739 CASAVA_Build 1 105865256 2I AAAACCTGGC --/AA AAAAAAAAAA 1709 het 256 hom 25 4 6 15 A 15 17 48740 CASAVA_Build 1 105872309 2I34M2D AACTAATAGG --ATATATATATATATCCTATTACATATATATATATAC/ATATATATATATATATCCTATTACATATATATATAT-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 21 13 18 N/A 0 0 48741 CASAVA_Build 1 105873859 8D CATTGGTTAA ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 1335 hom 19 4 9 7 AT 12 8 48742 CASAVA_Build 1 105874764 1I CATTAGTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 37 0 36 1 T 9 10 48743 CASAVA_Build 1 105875263 1D TTATTTCTGC A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 7 6 48744 CASAVA_Build 1 105875591 10D TTCTAAAAGT TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 701 hom 25 3 13 10 TG 14 9 48745 CASAVA_Build 1 105875734 1D GTTTTTGCTT A/- ACTGTTCTGG 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 2 1 48746 CASAVA_Build 1 105876887 1D AAGACCAGAA G/- GGTCAATGTC 3070 het 3070 ref 47 27 20 0 G 3 2 48747 CASAVA_Build 1 105877021 2D GGTATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 TA 7 6 48748 CASAVA_Build 1 105877615 1I ACTCTGCTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 8 9 48749 CASAVA_Build 1 105878521 1D GTTTGACAAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 9 8 48750 CASAVA_Build 1 105879310 13I AAGCTGAACA -------------/TTTAAAATAATGT TTTATTTCTG 3070 hom 45 het 18 0 16 6 TTTAAAATAATGT 0 1 48751 CASAVA_Build 1 105881120 1I TCTAAAATAG -/T TTTATCTATT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 3 4 48752 CASAVA_Build 1 105881282 2D CAATGTATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 AT 6 5 48753 CASAVA_Build 1 105882256 4D TTACAAAATT TTAA/---- TTAATTTATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 6 TTAA 2 1 48754 CASAVA_Build 1 105901444 1D AAAAACTCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 9 8 48755 CASAVA_Build 1 105902093 4D GTGTGTGTGT GCGC/---- GCGCGCACAT 1153 hom 30 het 13 0 10 4 GC 5 3 48756 CASAVA_Build 1 105902446 1I TTTTGCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 10 11 48757 CASAVA_Build 1 105904714 1D ATACCACAAG T/- TTAGTGCCTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 2 48758 CASAVA_Build 1 105905503 1I ATAACTGAAG -/T TTTGTATCCT 3070 hom 154 het 52 0 52 0 T 3 4 48759 CASAVA_Build 1 105906746 1I ATTGACACAC -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 7 8 48760 CASAVA_Build 1 105907667 1I63M1D GATTTCTTTC -TGAATGTTTTCTTTTTTCAGTATATACATCTTTCATCTCATTTGTTAGCTTTATTCATAAGTAT/ATGAATGTTTTCTTTTTTCAGTATATACATCTTTCATCTCATTTGTTAGCTTTATTCATAAGTA- TTTTTTTGGA 3070 hom 117 het 31 0 40 13 N/A 0 0 48761 CASAVA_Build 1 105909837 2I CAGGAAATTT --/TC TGTTTTGAGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TC 0 1 48762 CASAVA_Build 1 105911028 2I AAATAGAATT --/AA GTCTAAAATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 0 2 48763 CASAVA_Build 1 105912204 2D AAGATTGTGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AC 9 8 48764 CASAVA_Build 1 105914514 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 1865 hom 15 het 9 0 4 5 A 10 9 48765 CASAVA_Build 1 105917470 14D TGAAACGTGT CATATTCTTTCAGA/-------------- ATCTTGCAAT 3070 hom 84 het 29 0 29 2 CATATTCTTTCAGA 1 0 48766 CASAVA_Build 1 105924156 26D AAAAGTAAAC CACTTTTAAGTGTATGTTAAGTGTAT/-------------------------- ATGCAACCAC 3070 hom 87 het 28 0 30 4 CACTTTTAAGTGTATGTTAAGTGTAT 1 0 48767 CASAVA_Build 1 105924345 4I TGTGGTCAAA ----/CATT CATAAAACAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 CATT 0 1 48768 CASAVA_Build 1 105939413 2D AAAAGAAAAC AT/-- ATATATATAT 2608 hom 21 het 10 0 7 3 AT 7 6 48769 CASAVA_Build 1 105949428 2I GCATGTCTAT --/AC ACACACACAC 2957 hom 20 het 14 0 7 7 AC 6 7 48770 CASAVA_Build 1 105952672 1D TTACATTTAC A/- AAAGGAGATC 3070 hom 104 het 40 0 34 7 A 4 3 48771 CASAVA_Build 1 105955622 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 28 1 24 3 A 11 12 48772 CASAVA_Build 1 105958526 2I ATTCTATAAC --/TA TATATATATA 3070 hom 24 het 16 0 9 7 TA 7 8 48773 CASAVA_Build 1 105970389 1I TCATGTATGA -/T TTTTCTCAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 4 5 48774 CASAVA_Build 1 105974200 2I GAAGACAAAC --/TG GAGTCTACAC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 TG 0 1 48775 CASAVA_Build 1 105979867 2D GCTTGATAGT CA/-- CATAGTTTCA 3070 het 3070 hom 49 18 25 9 CA 2 1 48776 CASAVA_Build 1 105984653 1D CCCCATGGAC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 48 26 17 6 T 8 7 48777 CASAVA_Build 1 105995852 3D TGTATGTATG TTA/--- TTATAAATTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 TTA 2 1 48778 CASAVA_Build 1 105996066 1I AGTGTCCTTT -/A AAAAAATCAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 6 7 48779 CASAVA_Build 1 106006804 1I ATTGAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 9 10 48780 CASAVA_Build 1 106028407 1D AATGTTGACT A/- AAAAACTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 6 5 48781 CASAVA_Build 1 106028535 1D TTTGAGGGGA T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 T 7 6 48782 CASAVA_Build 1 106051404 1D TTTTATTTTG T/- TTTTTTTAGT 2872 het 2872 ref 35 20 8 7 T 8 7 48783 CASAVA_Build 1 106060894 1D ACAATAATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 16 10 T 10 9 48784 CASAVA_Build 1 106065841 1I AGTAGAAGAC -/A AAAATCTGTG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 4 5 48785 CASAVA_Build 1 106075458 1D CTAAAACAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 15 15 9 A 10 9 48786 CASAVA_Build 1 106076133 4I ACCAGGAAAC ----/TATT TATTTTTATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TATT 1 2 48787 CASAVA_Build 1 106088323 1I AAAGAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 2119 het 1306 hom 17 5 8 4 T 10 11 48788 CASAVA_Build 1 106094087 4I CTCACAATTA ----/CTTT CTTTAAGCCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CTTT 1 2 48789 CASAVA_Build 1 106106753 4D TCTACTGTAT TAAA/---- TAAAGAATAT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 TAAA 2 1 48790 CASAVA_Build 1 106109525 1D TTTCCCATAT C/- GGTGACATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 0 48791 CASAVA_Build 1 106114424 6I AGTTGTTTCT ------/AAGGTG AATTGACTAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAGGTG 0 1 48792 CASAVA_Build 1 106125389 1I TACGTTTAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 9 48793 CASAVA_Build 1 106132275 1D TATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 12 11 48794 CASAVA_Build 1 106136609 1I GAAAAAGTTA -/T TTTTTATAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 5 6 48795 CASAVA_Build 1 106148034 1D GTAAATGGTG C/- TGGGAAAACT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 1 0 48796 CASAVA_Build 1 106152634 1I GTAAGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 10 11 48797 CASAVA_Build 1 106152762 1I TGACATGTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 9 48798 CASAVA_Build 1 106191977 1D CTTGCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 24 0 13 12 T 11 10 48799 CASAVA_Build 1 106197405 1D TCATTATTGT A/- AAAAAAAAGG 1244 het 1244 ref 38 29 3 7 A 9 8 48800 CASAVA_Build 1 106199181 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAAAG 3070 het 181 hom 25 2 20 3 G 0 1 48801 CASAVA_Build 1 106200747 1I ATTCCTTTCC -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 7 8 48802 CASAVA_Build 1 106206701 4D TACGAGTGAG CTAA/---- CTGAGTATGA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 CTAA 1 0 48803 CASAVA_Build 1 106209092 1I TCATTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 37 2 33 2 A 10 11 48804 CASAVA_Build 1 106210797 1D AAAACATATT C/- CCCCCCCCTT 3070 hom 93 het 40 0 31 9 C 9 8 48805 CASAVA_Build 1 106234557 1I CATATGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 34 1 27 6 T 10 11 48806 CASAVA_Build 1 106237912 1D GTTTTCATTA T/- TTTTTTGAAC 3070 hom 69 het 25 0 23 3 T 7 6 48807 CASAVA_Build 1 106239293 1D TGTATGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 504 hom 36 2 29 5 T 13 12 48808 CASAVA_Build 1 106345925 1D TTTGCCAGTG A/- AAAAAAAAAT 962 het 962 ref 50 42 3 5 A 10 9 48809 CASAVA_Build 1 106403950 1I ATTTTTATAA -/T TGCTATTTAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 1 2 48810 CASAVA_Build 1 106408849 1D CTTTATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1279 hom 29 5 11 13 T 12 11 48811 CASAVA_Build 1 106433489 1I TCTCCAGCAG -/T TTTTCAATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 5 48812 CASAVA_Build 1 106435960 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 36 2 27 7 T 12 13 48813 CASAVA_Build 1 106445872 5I CACAAATAAT -----/AGTAA AGTACAGTTT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 AGTAA 0 1 48814 CASAVA_Build 1 106450634 1I CTATCTGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 19 20 10 T 9 10 48815 CASAVA_Build 1 106452185 1I CTGTTACTAC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 T 6 7 48816 CASAVA_Build 1 106453867 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 8 9 48817 CASAVA_Build 1 106457228 1D GTTACCTCAG T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 T 8 7 48818 CASAVA_Build 1 106457874 2D CTACCAAGTC AG/-- AGAGGCAGGA 3070 het 2735 hom 22 10 9 4 AG 3 2 48819 CASAVA_Build 1 106459979 1I ATCCAGCCAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 97 hom 15 1 13 1 A 8 9 48820 CASAVA_Build 1 106462422 1D TTAATATATG T/- TCCAAATTTG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 2 1 48821 CASAVA_Build 1 106462513 4D CATAACCAAA TTTC/---- TTTGTCAATT 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 TTTC 1 0 48822 CASAVA_Build 1 106468168 1I GAAAACTAAT -/A CAATAGATAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 48823 CASAVA_Build 1 106472950 4D TATATATTAC TTAA/---- TTAATATAAG 3070 het 3070 hom 26 10 16 1 TTAA 2 1 48824 CASAVA_Build 1 106474765 1D ATGGGTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2964 hom 24 8 13 3 T 13 12 48825 CASAVA_Build 1 106477788 1I GTTGAACTGA -/T TTGGATAATG 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 T 2 3 48826 CASAVA_Build 1 106488915 23I CTTCAACATG -----------------------/AATTTGGGAAAGGGGAGAAACAC AATTCATTCC 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 AATTTGGGAAAGGGGAGAAACAC 0 1 48827 CASAVA_Build 1 106497950 4I GGGGAAGATT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 54 23 15 16 AAAC 3 4 48828 CASAVA_Build 1 106500455 1D ATGCCACAGG A/- AAAAAAAAAT 1234 het 1234 ref 33 29 3 1 A 10 9 48829 CASAVA_Build 1 106518353 1I AGTTTTGTTC -/T TTTTTGCTTA 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 T 5 6 48830 CASAVA_Build 1 106521983 4D GATTTTAAAC CTGA/---- CTATTAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 15 3 CTGA 1 0 48831 CASAVA_Build 1 106522232 1D TATACTAGTT C/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 C 1 0 48832 CASAVA_Build 1 106522582 1D ACCTTCATTT A/- GAGCTCTAAA 3070 het 2668 hom 29 7 17 5 A 1 0 48833 CASAVA_Build 1 106523707 3D TGAGAAATAT TTC/--- TTTATCAGTA 3070 het 3070 ref 37 18 18 3 TTC 1 0 48834 CASAVA_Build 1 106524145 1D TCCTTGTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 10 9 48835 CASAVA_Build 1 106524763 3I AATGCTAAAT ---/AAC AATTATAACA 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 AAC 0 1 48836 CASAVA_Build 1 106527742 2D ACTCCAAATG AC/-- AGGGAACATT 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 AC 1 0 48837 CASAVA_Build 1 106528724 1I ATGCAATAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 9 10 48838 CASAVA_Build 1 106530728 1D GTTCTTTGTG A/- AAGAAGTACT 3070 het 3070 ref 72 34 32 6 A 3 2 48839 CASAVA_Build 1 106531464 1D72M2I TAATGACTTC AAAAAAATATCTAAAGAGATAGTCAACACAACCAAAACTGCTGCATATTTAGTAAACATTTTTAAAAGCATAC--/-AAAAAATATCTAAAGAGATAGTCAACACAACCAAAACTGCTGCATATTTAGTAAACATTTTTAAAAGCATACTA TGTGTCAGAT 3070 het 3070 ref 32 22 19 12 N/A 0 0 48840 CASAVA_Build 1 106531739 1I AATCACAATT -/A CTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 0 1 48841 CASAVA_Build 1 106532388 1D ATCTACACAG A/- AAAAAACATC 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 7 6 48842 CASAVA_Build 1 106532440 1D ATAGTACCTG T/- TTTTTTTTTT 689 het 689 ref 27 9 3 15 T 11 10 48843 CASAVA_Build 1 106533720 3I GAGATAGAAA ---/AAT AATAATATTG 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 AAT 2 3 48844 CASAVA_Build 1 106534577 1D CCTGGGCTGG T/- TTGTGGCTAT 3070 het 3070 ref 44 21 21 2 T 3 2 48845 CASAVA_Build 1 106537554 1D GGCAATGATC A/- CATGCCTCTG 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 A 1 0 48846 CASAVA_Build 1 106538836 1D TCCAGCCAAA C/- CAAATTTTTG 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 C 2 1 48847 CASAVA_Build 1 106539861 4D CAGGAGCAGG TTAT/---- TTAATTTCCA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 TTAT 1 0 48848 CASAVA_Build 1 106542549 2I AAAAAAATTC --/TA TGTCTAGTTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 TA 0 1 48849 CASAVA_Build 1 106542662 1I CTCAGACTAC -/T TAGGTGGGCA 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 T 1 2 48850 CASAVA_Build 1 106542994 2I ATAAAACAGG --/AA AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 7 9 48851 CASAVA_Build 1 106555375 1D AGCTAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 1637 het 1637 ref 45 30 6 10 A 12 11 48852 CASAVA_Build 1 106556424 1I ATTCATGGAC -/A TGTATATTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 0 1 48853 CASAVA_Build 1 106558066 1I ACCCTAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 10 48854 CASAVA_Build 1 106564050 3D CAGCAAGTGA ACT/--- ACAACTACAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 ACT 1 0 48855 CASAVA_Build 1 106567713 1D AGCATTCTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 7 48856 CASAVA_Build 1 106571784 1D CTGATGAGCT C/- CCCAAGTCAG 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 C 4 3 48857 CASAVA_Build 1 106579998 4I GAATGACACA ----/CACT CAGTTTATGG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CACT 0 1 48858 CASAVA_Build 1 106580322 1I TCAAATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 11 12 48859 CASAVA_Build 1 106582641 3D TAAAAATCTG ACA/--- ACATTTCTTG 3070 het 3070 hom 35 14 19 4 ACA 2 1 48860 CASAVA_Build 1 106587326 1D CAGATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1652 hom 28 6 15 7 T 13 12 48861 CASAVA_Build 1 106597604 1I ATAAAATACC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 9 10 48862 CASAVA_Build 1 106610988 2D TTGAGTAAAA CT/-- CTGAGGAGCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 CT 2 1 48863 CASAVA_Build 1 106617300 5D ACATTCACTT GTTAA/----- GTTAATTGTA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 GTTAA 2 1 48864 CASAVA_Build 1 106622381 1I TTCAATATGC -/G GGGATTACAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 3 4 48865 CASAVA_Build 1 106623393 1D AGTAAATAAC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 T 8 7 48866 CASAVA_Build 1 106627526 4I TAATTGAAAC ----/TGTG TGTATGTTCA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TG 1 3 48867 CASAVA_Build 1 106628464 1I GTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 46 hom 31 1 24 6 T 9 10 48868 CASAVA_Build 1 106641618 1I ATAAGTAAAT -/A GGTAGAACTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 0 1 48869 CASAVA_Build 1 106652723 3I AAAAAAAAAC ---/CTG TAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 CTG 0 1 48870 CASAVA_Build 1 106653853 1I TCAATAAAAC -/A AAAAATGTTA 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 A 5 6 48871 CASAVA_Build 1 106654156 1D TTCCCCTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 9 8 48872 CASAVA_Build 1 106654330 1D TGTAGTGGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 10 9 48873 CASAVA_Build 1 106669010 4D ATAGATAGAT GATA/---- GATAGATAGA 428 het 428 ref 33 20 4 9 GATA 3 2 48874 CASAVA_Build 1 106675063 5D ATCTGATTGG TGTAT/----- CTGAAAGTGA 3070 het 3070 ref 30 20 9 2 TGTAT 1 0 48875 CASAVA_Build 1 106677348 1D CTTCTTCCCT G/- GGATGCAAGG 1403 het 1403 ref 29 20 3 7 G 3 2 48876 CASAVA_Build 1 106681498 5D ACTCTTTCAG TTATT/----- TTAAAATATA 3070 het 3070 hom 31 11 19 5 TTATT 1 0 48877 CASAVA_Build 1 106684881 2I GGGTAATGTC --/AA GAGAGAGATG 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 A 0 2 48878 CASAVA_Build 1 106685066 3D GAAAAAAGGT ACA/--- ACAACTAGAA 3070 het 3070 ref 37 20 16 2 ACA 2 1 48879 CASAVA_Build 1 106686278 1D CTATCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 40 0 32 8 A 11 10 48880 CASAVA_Build 1 106688466 1D ATCCACTTGT A/- AAAAATTGAA 3070 het 3070 ref 37 18 18 2 A 6 5 48881 CASAVA_Build 1 106688827 3D TCCCACACAG GAA/--- GAAGAGGAGC 3070 het 3070 hom 53 24 23 7 GAA 2 1 48882 CASAVA_Build 1 106694185 1D AATGAAATAA C/- TTTACATCTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 1 0 48883 CASAVA_Build 1 106710169 1D TCACTATTGA C/- TTTTAAGACA 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 C 1 0 48884 CASAVA_Build 1 106711868 5D TAACTAAAAT GAAAA/----- GAATTGTGGC 3070 het 3070 ref 30 17 11 8 GAAAA 1 0 48885 CASAVA_Build 1 106733429 4D27M8D TTCTTTCTTC TCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCCTCCCTCCTTTCTTT/----TCTTTCTTTCTCTTTCTTTCCTCCCTC-------- CTTTCTTTCT 2085 het 2085 ref 23 13 7 8 N/A 0 0 48886 CASAVA_Build 1 106749607 1D TTACAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 302 hom 29 6 13 10 T 12 11 48887 CASAVA_Build 1 106759464 28I TCAAAGACAA ----------------------------/AAACATATCCACAAACAATGAGAACCAG AAATTAGAAG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 AAACATATCCACAAACAATGAGAACCAG 0 1 48888 CASAVA_Build 1 106766669 1I AAGAAGAACT -/A AAAACCAGTC 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 A 4 5 48889 CASAVA_Build 1 106767160 1D ACCCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 25 0 18 7 A 15 14 48890 CASAVA_Build 1 106767522 1I CCCACTTTCT -/C CACTGTTATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 1 2 48891 CASAVA_Build 1 106770687 1D TCGCAAGGAC A/- AAAAAACCAA 3070 hom 53 het 23 0 18 5 A 7 6 48892 CASAVA_Build 1 106773049 1D GATTTGACAC T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 32 15 17 1 T 7 6 48893 CASAVA_Build 1 106775105 2D TTAATAAACT TA/-- TATATATATA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TA 8 7 48894 CASAVA_Build 1 106780838 3D GATTATTGTA TTC/--- TTTTTACCTG 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 TTC 1 0 48895 CASAVA_Build 1 106782335 1D AAAAATAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 11 10 48896 CASAVA_Build 1 106783910 3D TTCGAAATAA TGT/--- TGTAGCAGGT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 TGT 2 1 48897 CASAVA_Build 1 106793871 3D CCTCCCTGAT TAA/--- GTTAATTCCT 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 TAA 1 0 48898 CASAVA_Build 1 106794121 4D AATTTGGACT CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 het 2839 hom 33 14 11 8 CTTC 4 3 48899 CASAVA_Build 1 106802325 16D TATATATATA CACACATATATATATG/---------------- CACACACACA 3070 het 3070 ref 39 15 20 9 CACACATATATATATG 1 0 48900 CASAVA_Build 1 106807849 1I ATCCAGATCA -/G CTTTATTTCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 G 0 1 48901 CASAVA_Build 1 106818786 1D TTAAGTGAAT A/- AAAAAGTACA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 6 5 48902 CASAVA_Build 1 106824486 3D CCCAGCGGGA GAT/--- GATTGAATCA 2893 het 2893 ref 24 16 7 4 GAT 2 1 48903 CASAVA_Build 1 106824733 1D TTATTAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 12 11 48904 CASAVA_Build 1 106825835 1I TGGCTTAGGC -/A AAATAATTCA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 3 4 48905 CASAVA_Build 1 106830981 1I GTTTAGAGAA -/T TTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 34 16 17 1 T 6 7 48906 CASAVA_Build 1 106843871 9I TGCACACGTA ---------/TGTTTACTG TGGCACTATT 2890 het 2890 ref 18 10 6 2 TGTTTACTG 0 1 48907 CASAVA_Build 1 106855974 1I TCTTTTTTTT -/A TATTTTTTAA 2628 het 2628 ref 25 13 8 4 A 0 1 48908 CASAVA_Build 1 106861083 1I GCCCTGTTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 8 9 48909 CASAVA_Build 1 106863981 2D ATCATAACAC TT/-- ATATCTGACA 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 T 2 0 48910 CASAVA_Build 1 106865586 2I TGTTTTATTG --/AC ACAAATTTAT 3070 het 1773 hom 17 5 8 4 AC 1 2 48911 CASAVA_Build 1 106866383 5D ATAACTATAC ACTAT/----- ACTGACCATA 3070 het 3070 hom 44 19 19 7 ACTAT 1 0 48912 CASAVA_Build 1 106871666 1D CGAGAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 13 12 48913 CASAVA_Build 1 106876576 1D TTGCTTAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 A 10 9 48914 CASAVA_Build 1 106882996 1I AGTATAGACA -/G GGTTTTGCCA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 G 2 3 48915 CASAVA_Build 1 106884423 1D TAAAATGGGG A/- AAAAAATTAA 3070 hom 72 het 28 0 24 5 A 7 6 48916 CASAVA_Build 1 106889418 2D TGAATTTCAC AT/-- GTTTGTTAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 AT 1 0 48917 CASAVA_Build 1 106891712 1D TTACCAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 25 0 20 5 A 11 10 48918 CASAVA_Build 1 106894617 1D TACTAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 36 1 30 5 T 12 11 48919 CASAVA_Build 1 106896042 1D CCTTTGTCGC A/- ATTGTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 2 1 48920 CASAVA_Build 1 106899448 9I GGAGAAGTAA ---------/TGCAGATTT TGCCTTGTAC 3070 hom 143 het 52 0 45 7 TGCAGATTT 0 1 48921 CASAVA_Build 1 106901496 5D GGAGTGTAAA CCACT/----- CTTATCTTAA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 CCACT 1 0 48922 CASAVA_Build 1 106908667 1D TGCTTAGGAG A/- AAAAAAAAAA 1014 het 1014 ref 49 38 3 8 A 11 10 48923 CASAVA_Build 1 106911669 1I ACTTAAAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 341 hom 41 2 32 7 T 9 10 48924 CASAVA_Build 1 106916160 1I TGTTTTTCTT -/C CCTCTATACC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 C 2 3 48925 CASAVA_Build 1 106918538 3D GTTTTAACAA TGG/--- TTTAGGAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TGG 1 0 48926 CASAVA_Build 1 106924081 1I TTTGATGGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 9 10 48927 CASAVA_Build 1 106928084 3D TGATGCTATT TTG/--- TTATTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 TTG 1 0 48928 CASAVA_Build 1 106930512 3I CTGTAACTTC ---/CTT CTTAGCCTGT 3070 hom 141 het 55 0 47 8 CTT 1 2 48929 CASAVA_Build 1 106947831 1I GGTGTCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 11 12 48930 CASAVA_Build 1 106953222 1I AAAGTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 10 11 48931 CASAVA_Build 1 106954031 1I AAGGAGTCTG -/C CTTTTAGTTT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 1 2 48932 CASAVA_Build 1 106979045 4D TCACTCTAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 72 het 33 0 25 9 AAAT 6 5 48933 CASAVA_Build 1 106984577 1I ACGTTAGGTA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 T 7 8 48934 CASAVA_Build 1 106987205 1I GTAGATACTG -/A AAAAATGTGC 3070 hom 5 het 39 1 33 5 A 5 6 48935 CASAVA_Build 1 106999151 1D TCTATATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 35 1 30 4 A 13 12 48936 CASAVA_Build 1 107013363 1I GAATGGGTAT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 7 8 48937 CASAVA_Build 1 107014003 1D AGACCATTAT A/- ATCTCATAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 2 1 48938 CASAVA_Build 1 107016953 1I TTTAATTTTT -/A TAAAAAAATA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 0 1 48939 CASAVA_Build 1 107018760 7I CAATATCGTA -------/GGATCAT TTCTTAGTAT 3070 hom 166 het 61 0 56 5 GGATCAT 0 1 48940 CASAVA_Build 1 107026877 1D CTCCTTATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 64 het 27 0 22 6 T 10 9 48941 CASAVA_Build 1 107027247 1I CCCCCTTTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 8 9 48942 CASAVA_Build 1 107035534 2D ATTCAATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 42 1 32 10 A 13 11 48943 CASAVA_Build 1 107035546 2D AAAAAAAAAA AC/-- TCAACTAAAA 3070 het 79 hom 33 2 25 7 AC 1 0 48944 CASAVA_Build 1 107043943 1I CTGATTTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 54 hom 31 1 23 7 T 9 10 48945 CASAVA_Build 1 107050441 1I AGATTTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 13 14 48946 CASAVA_Build 1 107059811 13D5M2D CATTTTGTAC ATAATGAGAACAGATAGAAC/-------------ATAGA-- ATAATGGAAC 3070 hom 93 het 30 0 32 5 N/A 0 0 48947 CASAVA_Build 1 107061914 4I TCGGCAAGTC ----/ACTT ACGCTCTCTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ACTT 0 1 48948 CASAVA_Build 1 107088182 6D ACTATCACTC AATATT/------ TATAAAACAA 3070 hom 102 het 38 0 35 6 AATATT 1 0 48949 CASAVA_Build 1 107092904 17I TCTTCTCTGC -----------------/AAATATCTTGGCAAATA CCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 46 14 26 8 AAATATCTTGGCAAATA 0 1 48950 CASAVA_Build 1 107126587 1I CACTACAAAA -/G TCATACTTTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 0 1 48951 CASAVA_Build 1 107131644 1D ATAGTCCCTG A/- TTTTTATGGC 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 1 0 48952 CASAVA_Build 1 107137504 2D ACAAATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 2470 hom 27 6 19 2 AC 9 8 48953 CASAVA_Build 1 107138573 1I ATGCTGCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 10 11 48954 CASAVA_Build 1 107144044 2I ATTTACAAAC --/AT TATTTCATTA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AT 0 1 48955 CASAVA_Build 1 107160787 1I AGAATGATGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 9 10 48956 CASAVA_Build 1 107162866 7D CCTTTATATG ACTTAAA/------- ACTTAATCAA 3070 hom 129 het 45 0 43 4 ACTTAAA 1 0 48957 CASAVA_Build 1 107170605 1I ATTAACCAAC -/T CATTAAAATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 48958 CASAVA_Build 1 107188169 1D AATTTGGTTC T/- CTGAAGACAT 3070 het 3070 ref 45 21 15 10 T 1 0 48959 CASAVA_Build 1 107192424 1D AGACTATGTC A/- AAAAAAAAAA 1258 het 186 hom 10 1 5 4 A 19 18 48960 CASAVA_Build 1 107194466 2I CTCCCTCATC --/CT GCAGTTGGCG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 CT 0 1 48961 CASAVA_Build 1 107195881 1I GAACAACATG -/A AAATCTTATT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 3 4 48962 CASAVA_Build 1 107240518 2I GTATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 AC 7 8 48963 CASAVA_Build 1 107245318 1I CTATCTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 27 17 9 A 11 12 48964 CASAVA_Build 1 107246698 1I CTATGTTGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 8 9 48965 CASAVA_Build 1 107249120 1I ATAGAAGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 A 13 14 48966 CASAVA_Build 1 107251130 1D AACGTGATTT C/- CCATTGTCTT 3070 het 3070 ref 39 21 10 9 C 3 2 48967 CASAVA_Build 1 107267160 4I AGAAGCATTT ----/AGTA AGTGTCTTTG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AGTA 0 1 48968 CASAVA_Build 1 107267855 1I AATTTACCAC -/T AATGTAAGAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 0 1 48969 CASAVA_Build 1 107269426 3I ATTTGTAAAT ---/AAC AATCAAATGA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 AAC 0 1 48970 CASAVA_Build 1 107277193 1D AGCTTTTGAA T/- GTGTTTGCTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 1 0 48971 CASAVA_Build 1 107279687 3I TATATCATTC ---/TGT AAATTGTTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TGT 0 1 48972 CASAVA_Build 1 107279942 2D GAAGGGTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 34 0 21 13 A 13 11 48973 CASAVA_Build 1 107282033 1D TTGAAAACAA C/- CTTTGCACTG 3070 hom 108 het 42 0 36 7 C 2 1 48974 CASAVA_Build 1 107284662 1I CAGCAGAGTG -/T TAACAGTGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 2 48975 CASAVA_Build 1 107287095 1I ATTGAAAAAA -/G ATGCATTTTT 3070 hom 151 het 53 0 51 2 G 0 1 48976 CASAVA_Build 1 107305385 12D TCTTAGGAGA AAAGAAAGAGAG/------------ AAAGAAAGAG 3070 hom 75 het 32 0 25 7 AAAGAAAGAGAG 2 1 48977 CASAVA_Build 1 107319415 1I AAGAAATCCC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 8 9 48978 CASAVA_Build 1 107327817 1I AGAAAGCAAA -/G GTGATTTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 2 48979 CASAVA_Build 1 107331200 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 22 8 T 12 13 48980 CASAVA_Build 1 107352542 1D CCAGAAAGTC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 9 8 48981 CASAVA_Build 1 107367268 1D AATATAATTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 2713 hom 19 6 11 2 A 8 7 48982 CASAVA_Build 1 107408559 3I AAAATCTTTT ---/CAG TTAAAATTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CAG 0 1 48983 CASAVA_Build 1 107414986 1D CCTTAACCAA T/- TTACAGCAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 3 2 48984 CASAVA_Build 1 107423851 1I GCCCAGGTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 32 0 28 5 T 8 9 48985 CASAVA_Build 1 107424447 1D TTACTCGCCA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 93 het 36 0 32 6 T 8 7 48986 CASAVA_Build 1 107425013 1I AAAACACAAA -/C TTTTTTGTCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 0 1 48987 CASAVA_Build 1 107429740 1D TCTTTCTTCC A/- AATCAAATCT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 3 2 48988 CASAVA_Build 1 107433326 2D22M1I ATAACTATAG TATATATATATATAGTTATATATA-/--TATATATATATAGTTATATATAG TTAGTTATAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 N/A 0 0 48989 CASAVA_Build 1 107437242 5I GTATACCAAG -----/CATCT TACTTGGGGT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 CATCT 0 1 48990 CASAVA_Build 1 107463362 1I GGATGGAATG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 7 48991 CASAVA_Build 1 107516042 1D TTTTTTCCCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 T 9 8 48992 CASAVA_Build 1 107525696 34I GTTTGTGAGG ----------------------------------/AAGGTGGCTTTTAAACATTTTCCAGAATCCTTTC AAAAAACTGT 3070 hom 117 het 42 0 40 6 AAGGTGGCTTTTAAACATTTTCCAGAATCCTTTC 0 1 48993 CASAVA_Build 1 107530014 1D CCAACTTCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 126 het 50 0 42 8 T 9 8 48994 CASAVA_Build 1 107532207 1I GGCATAGGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 775 hom 49 2 44 3 T 9 10 48995 CASAVA_Build 1 107533965 1D GTCAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3028 het 3 hom 22 1 12 9 A 13 12 48996 CASAVA_Build 1 107543424 1D TTATTACTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 24 0 16 8 T 10 9 48997 CASAVA_Build 1 107543993 1I TGTCATCCTT -/A AAAAAATACA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 6 7 48998 CASAVA_Build 1 107544647 1I GGGAACATTA -/G GGGAACATGT 3070 hom 104 het 42 0 35 7 G 3 4 48999 CASAVA_Build 1 107547720 2D ATATAGTTAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 312 hom 28 1 18 9 TG 8 7 49000 CASAVA_Build 1 107554037 1D TACAGACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 473 hom 34 2 24 8 T 16 15 49001 CASAVA_Build 1 107558936 1I CATGCCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 23 1 17 5 T 12 13 49002 CASAVA_Build 1 107562765 1D ATTTAGAGCT C/- CTTTTAGAAG 3070 hom 108 het 45 0 37 9 C 2 1 49003 CASAVA_Build 1 107594716 1D ATTAAAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 7 hom 24 1 15 9 A 8 7 49004 CASAVA_Build 1 107612632 1D TCTCATCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 752 hom 46 3 30 14 T 15 14 49005 CASAVA_Build 1 107618106 10I TAACTTGACT ----------/AAGTGCTAAG AATTTGAGAA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 AAGTGCTAAG 0 1 49006 CASAVA_Build 1 107624749 1D TTGGCATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 27 1 12 14 T 15 14 49007 CASAVA_Build 1 107636128 1D AACCAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 T 11 10 49008 CASAVA_Build 1 107638034 1I TTATAAGTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 8 9 49009 CASAVA_Build 1 107645486 2D TCCTGGACAA AC/-- ACAGAAAGAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AC 2 1 49010 CASAVA_Build 1 107653165 8D TTTTCCTTTG TTCTCTAC/-------- TTCCAGTCAA 3070 hom 126 het 47 0 42 6 TTCTCTAC 1 0 49011 CASAVA_Build 1 107656613 3I ATTGAATTTC ---/AAG AAGAAGTCAA 3070 hom 148 het 56 0 50 6 AAG 2 3 49012 CASAVA_Build 1 107662604 5I AAAAGTTCTC -----/AACTT AACAAGGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AACTT 0 1 49013 CASAVA_Build 1 107664863 1I AAATGAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 37 0 30 7 T 10 11 49014 CASAVA_Build 1 107667924 1D AGGGAAAGCC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 40 0 33 9 A 9 8 49015 CASAVA_Build 1 107675422 1D AGCCATCTTT A/- AATAGCAACA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 3 2 49016 CASAVA_Build 1 107677782 2I TGAAAACATC --/AT GTGTGTGTGT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AT 0 1 49017 CASAVA_Build 1 107702811 1D TCATTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 1547 het 1547 ref 37 25 4 8 A 11 10 49018 CASAVA_Build 1 107717867 2D TTCAAGAGAC AG/-- GGTCTCACTC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AG 1 0 49019 CASAVA_Build 1 107726248 4I TCTGTTCTCC ----/CTGA TTGCTGGAAG 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 CTGA 0 1 49020 CASAVA_Build 1 107727011 1I AAATAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 11 12 49021 CASAVA_Build 1 107729983 1I AAGAATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 11 11 T 11 12 49022 CASAVA_Build 1 107733566 1I ATTAAGTTAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 7 8 49023 CASAVA_Build 1 107738575 1I ACATGAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 9 10 49024 CASAVA_Build 1 107743265 2I GTATACTATA --/CT GACTATTCAT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 CT 0 1 49025 CASAVA_Build 1 107744797 1I GTGGAATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2315 hom 33 12 18 3 T 14 15 49026 CASAVA_Build 1 107747848 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2083 hom 21 9 10 4 A 16 15 49027 CASAVA_Build 1 107748227 2D CTTCTTAATT TA/-- TATATATATA 2705 hom 21 het 12 0 7 5 TA 9 8 49028 CASAVA_Build 1 107755339 1I CTGTCCCCCA -/C CCCTAACTTA 3070 hom 129 het 47 0 41 6 C 3 4 49029 CASAVA_Build 1 107756247 1I GTCAAGCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 11 12 49030 CASAVA_Build 1 107757255 5D42M1D TTCCTGTGGA TTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTCAT/-----TTTCTTTTCTTTTCTTTTCTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTCA- TTTTTTTTTC 3070 hom 28 het 34 1 32 9 N/A 0 0 49031 CASAVA_Build 1 107769331 1I AAAAGTTGAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 2 3 49032 CASAVA_Build 1 107781090 1D GGCCAATGTA T/- TGGGAGAGCA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 2 1 49033 CASAVA_Build 1 107785186 1D AAAGAAAGAG A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 41 20 18 7 A 7 6 49034 CASAVA_Build 1 107785396 1I AGTTTGGGAG -/A GTAGAAATAG 3070 hom 147 het 52 0 49 3 A 0 1 49035 CASAVA_Build 1 107786770 7D TTTTAGACAG TATATTA/------- TATAAGTGGC 3070 het 3070 ref 45 23 22 2 TATATTA 1 0 49036 CASAVA_Build 1 107786952 11I TTTTTTCATA -----------/TGAAACAGCGT TGAAGCAGCT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 TGAAACAGCGT 0 1 49037 CASAVA_Build 1 107793866 1I CTGCTGGATT -/A AAAAAAAAAA 2367 het 2367 ref 29 14 7 8 A 13 14 49038 CASAVA_Build 1 107812996 1D TAATCCCAGC A/- CTTTGGGAGG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 1 0 49039 CASAVA_Build 1 107821873 1D TTTTTGTAGA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 8 7 49040 CASAVA_Build 1 107826201 10D TTACAACAGC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 25 2 13 11 A 27 17 49041 CASAVA_Build 1 107827844 1D TCCCTTTGAT A/- AATCCCTTAA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 3 2 49042 CASAVA_Build 1 107831324 1D TATAAGAATG A/- CTGCTCTGAA 3070 hom 48 het 19 0 16 5 A 1 0 49043 CASAVA_Build 1 107846586 1D TCTCTATATT C/- CCCCCCTGCA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 C 7 6 49044 CASAVA_Build 1 107848245 1I AATAAACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1403 hom 32 5 26 1 A 11 12 49045 CASAVA_Build 1 107858157 13D AACTTTACCT AGAACTTTACCTA/------------- GATGTATTGA 3070 hom 111 het 39 0 38 3 AGAACTTTACCTA 1 0 49046 CASAVA_Build 1 107864121 1I ATTCCTTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 8 9 49047 CASAVA_Build 1 107881278 1D GAAAACTCTT A/- AGTCAGTGAG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 2 1 49048 CASAVA_Build 1 107881782 1I27M1D ACACGTTAAG -CCCCCAGGTGATTCTGATGTGTTTCAGC/CCCCCCAGGTGATTCTGATGTGTTTCAG- CCACAACTGG 3070 het 3070 ref 37 23 10 16 N/A 0 0 49049 CASAVA_Build 1 107883106 1D TCCCAGAATG A/- AAAAGAGCTC 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 A 5 4 49050 CASAVA_Build 1 107893029 4I CTTGACACAC ----/TGTT TGTCTCCTTC 3070 het 3070 hom 54 21 26 7 TGTT 0 1 49051 CASAVA_Build 1 107893926 1D GTCATGAATC T/- TTTACCTGTT 3070 het 3070 ref 50 26 19 5 T 4 3 49052 CASAVA_Build 1 107914867 1I CTCCGGATTC -/G GGGATCTGAA 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 G 3 4 49053 CASAVA_Build 1 107922633 1I CATCTAACTC -/T TATTATTGGC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 1 2 49054 CASAVA_Build 1 107930285 3D CTTGGCATAG TTT/--- TTTTTTTTTT 2844 het 1039 hom 33 8 8 19 T 18 15 49055 CASAVA_Build 1 107937275 1D AGCCTACAAT G/- GGCCCCTAAC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 G 3 2 49056 CASAVA_Build 1 107944477 1I GATATTGAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 8 9 49057 CASAVA_Build 1 107952814 4I GAGGAGGGAA ----/GGTG GGTGGAGGAG 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 GGTG 1 2 49058 CASAVA_Build 1 107989467 1D ATGGAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 36 0 27 9 T 14 13 49059 CASAVA_Build 1 108008484 4I TCCTGATGCT ----/CTCC CTCCCTCCCC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 CTCC 2 3 49060 CASAVA_Build 1 108015923 1I ATATTTTACC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 9 49061 CASAVA_Build 1 108019555 3D TATAGCTAGT TAG/--- TAGAGAGGCA 3070 het 3070 hom 47 16 27 6 TAG 2 1 49062 CASAVA_Build 1 108025800 2D AATGGAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 33 0 13 20 T 18 16 49063 CASAVA_Build 1 108026856 5I TTATGATAGG -----/AAAAC AAAACAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 AAAAC 1 2 49064 CASAVA_Build 1 108036176 1D CTGAAGTTCT A/- TTCAGACTAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 1 0 49065 CASAVA_Build 1 108044421 1D GCAATAAGCA T/- TTTTTAAAGT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 6 5 49066 CASAVA_Build 1 108046791 1D ATTTCCTATT G/- ACTTTTATAA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 G 1 0 49067 CASAVA_Build 1 108046941 4D CACGTCTTTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 148 het 58 0 50 8 A 16 12 49068 CASAVA_Build 1 108069035 2D CCATTTGTGC AT/-- ATACTCCAGA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AT 2 1 49069 CASAVA_Build 1 108072746 24D ATACGTATAC GTATATGTATATGTATATGTATAT/------------------------ GTATATGTAT 3070 hom 91 het 32 0 29 6 GTATAT 8 4 49070 CASAVA_Build 1 108079777 1D TCCTAGACAC A/- TACACTCTCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 1 0 49071 CASAVA_Build 1 108094159 3I CCTTGAGAAG ---/TGT TGTTCATCCC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TGT 1 2 49072 CASAVA_Build 1 108108469 1I ACTCAAATGC -/T GCCTCTTCAG 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 0 1 49073 CASAVA_Build 1 108111060 1I GCATCCTGTG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 A 6 7 49074 CASAVA_Build 1 108113458 4D ATTTTGTGAC TCTA/---- TCTAAGAAGT 3070 het 3070 hom 39 12 24 6 TCTA 2 1 49075 CASAVA_Build 1 108119068 5I CTTTTTTTTT -----/GTTTG TTTTTTAAGA 2224 het 444 hom 19 5 6 8 GTTTG 0 1 49076 CASAVA_Build 1 108119365 3I GCCTAAATAA ---/CAT CAGTGAAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CAT 0 1 49077 CASAVA_Build 1 108122557 2I TAAAAAAATC --/TG TTTACATATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TG 0 1 49078 CASAVA_Build 1 108135530 1D TGGTGATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 40 0 31 11 A 13 12 49079 CASAVA_Build 1 108140936 1D TGTTATTTGT A/- AAAAAAAAAA 402 het 402 ref 19 11 2 6 A 15 14 49080 CASAVA_Build 1 108141089 4I ATTCAATCAA ----/GTTT GTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 GTTT 2 3 49081 CASAVA_Build 1 108158646 5I ATTACTTACT -----/GTTGA GTTGAGTTCC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 GTTGA 1 2 49082 CASAVA_Build 1 108218747 1D TGACCAGCAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 8 7 49083 CASAVA_Build 1 108221093 1I TCTTGGTTTG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 7 8 49084 CASAVA_Build 1 108223857 1D TATTTTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 11 10 49085 CASAVA_Build 1 108224960 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 45 18 18 9 A 7 8 49086 CASAVA_Build 1 108229404 2I CGCTTTTATT --/TC TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 TC 0 1 49087 CASAVA_Build 1 108235295 1I CCCTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 14 15 49088 CASAVA_Build 1 108236763 1I AATTAGTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 9 10 49089 CASAVA_Build 1 108237197 6D AATTAAAAAT ATACAC/------ AGAGTAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 6 ATACAC 1 0 49090 CASAVA_Build 1 108240013 4I TGAAAATTCT ----/CCTC TTATTGTTAC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 CCTC 0 1 49091 CASAVA_Build 1 108240527 5D CTCTTTCATC AAATT/----- AATCGCACAG 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 AAATT 1 0 49092 CASAVA_Build 1 108240853 1D AAAGACTGGC A/- ATTTTGTTAT 3070 het 2871 hom 24 7 16 2 A 2 1 49093 CASAVA_Build 1 108242249 1I TTATTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 A 10 11 49094 CASAVA_Build 1 108244936 2I TTGTGGTCTC --/TG TGAACTTAAC 3070 het 3070 hom 55 21 31 3 TG 1 2 49095 CASAVA_Build 1 108248984 3D ACATGTAATT ATC/--- ATTATATTCA 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 ATC 1 0 49096 CASAVA_Build 1 108253493 1D AGTAAAAAAA T/- GTTATATGAG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 1 0 49097 CASAVA_Build 1 108253594 1D TAGACAATGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 9 8 49098 CASAVA_Build 1 108253913 2I GGTATCCAGA --/CT CTCTGCCATG 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 CT 2 3 49099 CASAVA_Build 1 108266441 2I TTGTTTTGTG --/TC TCAGTATCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TC 1 2 49100 CASAVA_Build 1 108270724 1I TGCCACCCCT -/C CCCCCATCTC 3070 het 3070 hom 66 22 34 10 C 5 6 49101 CASAVA_Build 1 108285141 1D AGCACAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 23 5 A 11 10 49102 CASAVA_Build 1 108289982 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAGAAAGAA 3070 het 43 hom 32 1 22 10 AG 1 0 49103 CASAVA_Build 1 108291544 1I TCTAAGAGTT -/C CCAAAAGAAC 3070 hom 129 het 52 0 44 8 C 2 3 49104 CASAVA_Build 1 108293454 4D TTTGTTTATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1943 hom 19 9 10 0 TTTG 4 3 49105 CASAVA_Build 1 108294276 1I ACCACAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 A 9 10 49106 CASAVA_Build 1 108295957 1D TCAAAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 17 10 A 11 10 49107 CASAVA_Build 1 108299334 8D AAGCTAAAGA ACAGACAG/-------- ATAGACAGGT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 ACAG 2 0 49108 CASAVA_Build 1 108302775 1I TTTTACTTAT -/A TTTTTTTTAT 2912 het 2912 ref 18 9 7 2 A 0 1 49109 CASAVA_Build 1 108310649 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 28 11 12 7 AAAC 5 4 49110 CASAVA_Build 1 108311272 1D CAGTTTCCAT A/- GATACGAAAT 1637 het 1637 ref 23 5 6 12 A 1 0 49111 CASAVA_Build 1 108311957 1D ATAATGCTTC T/- CAAATATAGT 3070 het 3070 ref 35 20 9 7 T 1 0 49112 CASAVA_Build 1 108312088 2I TAGGTGACTC --/AT GTGAAAGACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 0 1 49113 CASAVA_Build 1 108317137 1I GAAGTGATTC -/A AAAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 39 23 16 0 A 6 7 49114 CASAVA_Build 1 108321648 1D ATTAAACCCT A/- ATTTCTGTGT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 2 1 49115 CASAVA_Build 1 108329127 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 11 12 49116 CASAVA_Build 1 108333738 1I ATGCAGCCGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 9 10 49117 CASAVA_Build 1 108333814 1D ACTAACACAG A/- AACAGGAAAC 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 A 3 2 49118 CASAVA_Build 1 108337567 1D CACCGCGCCC G/- GCCAAAATGA 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 G 2 1 49119 CASAVA_Build 1 108339303 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 12 11 49120 CASAVA_Build 1 108343986 1I GTCTGAAAAA -/G CTCCTCTTTC 3070 hom 140 het 56 0 46 10 G 0 1 49121 CASAVA_Build 1 108355897 1D CTAAAATTAC A/- AAACTAGCAG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 4 3 49122 CASAVA_Build 1 108360509 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 46 het 46 ref 18 7 2 11 AAAG 1 0 49123 CASAVA_Build 1 108365308 11D CCTCATGTAA CTTACTTGTGC/----------- CTTCAGGACC 3070 hom 119 het 52 0 43 13 CTTACTTGTGC 1 0 49124 CASAVA_Build 1 108379768 1I GATCAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 11 12 49125 CASAVA_Build 1 108379943 13D AAAGTACCTG GCACAAAGTACCA/------------- GCACAAAGTA 3070 het 3070 hom 36 13 15 13 GCACAAAGTACCA 2 1 49126 CASAVA_Build 1 108383635 1D ATGCTCTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 T 9 8 49127 CASAVA_Build 1 108384705 1I CATTCACAGG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 7 8 49128 CASAVA_Build 1 108389963 1I ATTACACTCA -/T TGGAACCCGT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 T 1 2 49129 CASAVA_Build 1 108395501 1I CCTACAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 854 hom 38 3 25 10 A 12 13 49130 CASAVA_Build 1 108398287 1I GTTTTTATAG -/T TTTGGATTTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 3 4 49131 CASAVA_Build 1 108400403 1D TTAATACTTA G/- GGGATGAAAT 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 G 4 3 49132 CASAVA_Build 1 108405195 1D TTGTAATTTA C/- TTTAAAATAC 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 C 1 0 49133 CASAVA_Build 1 108405280 1I TCACTAAATA -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 T 6 7 49134 CASAVA_Build 1 108408555 4D TTTAATTAAT TAAG/---- TATGATTGAT 3070 het 3070 ref 42 26 15 2 TAAG 1 0 49135 CASAVA_Build 1 108409017 4I AGCAGTACTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 48 19 14 15 TG 7 9 49136 CASAVA_Build 1 108411698 4D TATGTCACAT ATTA/---- ATTAATATGT 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 ATTA 2 1 49137 CASAVA_Build 1 108413339 2D TGTTGGAAAC AG/-- GGGATAGATA 3070 het 3070 ref 22 11 9 4 AG 1 0 49138 CASAVA_Build 1 108414507 1I ATTTTTAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 31 1 24 6 T 11 12 49139 CASAVA_Build 1 108422775 1D AGTAATTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2063 hom 24 8 8 8 A 14 13 49140 CASAVA_Build 1 108424905 2D CAAGCTCTCA CT/-- CTTTTTACTC 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 CT 2 1 49141 CASAVA_Build 1 108425560 4D GACTGCAAAG TCTA/---- TCTGGTTCAA 3070 het 3070 ref 44 22 21 2 TCTA 1 0 49142 CASAVA_Build 1 108427963 1D TAAGAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 34 0 23 11 A 12 11 49143 CASAVA_Build 1 108430017 23I ACACTTGCCC -----------------------/CACAGTGTGTACTATATCTAGAA CACAGACTAC 3070 het 3070 ref 38 22 10 7 CACAGTGTGTACTATATCTAGAA 0 1 49144 CASAVA_Build 1 108431502 1D CAAAAACATG T/- AGGACAGACA 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 T 1 0 49145 CASAVA_Build 1 108438728 1I AGGAGCTCTT -/G TAAATAATAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 G 0 1 49146 CASAVA_Build 1 108440635 4D GCAGACTAAT AGAC/---- TGATAGACTT 3070 het 3070 hom 44 15 27 3 AGAC 1 0 49147 CASAVA_Build 1 108441036 3D3M2I AGGTGCTTTG GGTCCG--/---CAGTA AGAACTGCAA 3070 het 3070 hom 45 17 26 3 N/A 0 0 49148 CASAVA_Build 1 108442550 1I TGGCAAAAGA -/G GGGGGGAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 G 6 7 49149 CASAVA_Build 1 108444374 2I CACATAGAAC --/TA TATAGCAAGA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 TA 2 3 49150 CASAVA_Build 1 108446946 2D AGAAAGAGAC AA/-- TCTGCCTCCA 3070 het 3070 ref 53 29 20 6 A 2 0 49151 CASAVA_Build 1 108447280 1D CTATCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 12 11 49152 CASAVA_Build 1 108449301 1I TTGTGAACAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 8 9 49153 CASAVA_Build 1 108452015 1D TCCCAGGAAG C/- CCAGGGACCA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 C 3 2 49154 CASAVA_Build 1 108454104 4D ACCACCACCA CACC/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 41 13 22 7 CACC 1 0 49155 CASAVA_Build 1 108458881 1I TAAAGACCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 9 10 49156 CASAVA_Build 1 108459432 1D AGCAAAAAAA T/- AAATCCATTA 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 T 1 0 49157 CASAVA_Build 1 108460659 1D CAGTGTGCAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 14 24 1 T 9 8 49158 CASAVA_Build 1 108467198 5D TTTTTTCTTC TTCTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TTCTT 1 0 49159 CASAVA_Build 1 108467390 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGTGTCAC 3070 hom 78 het 27 0 27 2 G 5 4 49160 CASAVA_Build 1 108471239 1I ATTACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1342 hom 25 5 13 7 T 15 16 49161 CASAVA_Build 1 108472669 2D ATAATAAATC CA/-- GTTACACTCA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 CA 1 0 49162 CASAVA_Build 1 108482692 2I CAATGGAGAC --/AG TGTCACAGTG 3070 hom 129 het 46 0 43 3 AG 0 1 49163 CASAVA_Build 1 108509565 2D4M10I ATTAATGTGT GGGAGT----------/--GACTTAATTATTAA TTAAGTCTCT 2391 het 1993 hom 10 4 5 1 N/A 0 0 49164 CASAVA_Build 1 108525308 4D GAAATTATGA AGAG/---- AGAGAAAGGA 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 AG 4 2 49165 CASAVA_Build 1 108525445 1I ATAATTGTCC -/T TTTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 3 4 49166 CASAVA_Build 1 108526662 2D AGAGCTAAAG CA/-- CAGACTATTC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 CA 2 1 49167 CASAVA_Build 1 108533960 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2540 het 829 hom 14 4 7 3 A 14 13 49168 CASAVA_Build 1 108550199 1D TTCTGTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 9 5 T 12 11 49169 CASAVA_Build 1 108557741 1I TAAAGTGTCT -/A ATTACTCATT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 1 2 49170 CASAVA_Build 1 108559439 9D CATGACTCAG TAATCTATT/--------- TAAGCCTGAA 2594 het 2594 ref 26 16 6 6 TAATCTATT 1 0 49171 CASAVA_Build 1 108560877 3I GAGTGCAGGG ---/AGA AGAAGTTTTA 1718 het 1718 ref 21 14 5 2 AGA 1 2 49172 CASAVA_Build 1 108562516 1I CTTTCACAAA -/C TTCCAGGTAG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 C 0 1 49173 CASAVA_Build 1 108571132 1I TCAGGAAAGA -/G GCCTTGGACA 2164 het 1767 hom 17 6 6 5 G 1 2 49174 CASAVA_Build 1 108669027 3D CTGTTTTGCA GTT/--- GTTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 GTT 2 1 49175 CASAVA_Build 1 108679532 1D AGCAAAGCAA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2484 hom 31 9 11 11 C 10 9 49176 CASAVA_Build 1 108702710 1D CAGTGTTTGG T/- TTTTTTGTCC 3070 hom 45 het 18 0 16 3 T 7 6 49177 CASAVA_Build 1 108717485 3D TATAAGTAAT AAG/--- AAGCATTTTT 3070 het 3070 ref 41 32 7 2 AAG 2 1 49178 CASAVA_Build 1 108717581 1D AGTGCTTAGA T/- TTATTCATTT 3070 het 3070 ref 43 31 10 2 T 3 2 49179 CASAVA_Build 1 108779981 3I CGCAGGACCC ---/CCA CCCCCCGAAA 1304 hom 10 het 4 0 4 0 CCA 0 1 49180 CASAVA_Build 1 108782679 9D GCATTACTCT GATACCAAA/--------- GCCAAAGACA 2120 hom 12 het 6 0 5 1 GATACCAAA 1 0 49181 CASAVA_Build 1 108793562 26D TTAGAACAAC TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 2357 het 785 hom 12 3 6 3 TA 22 9 49182 CASAVA_Build 1 108811502 1I TTGTCCAAGG -/C CTCTTTCCTG 3070 het 3070 ref 52 39 9 4 C 1 2 49183 CASAVA_Build 1 108871709 2D TCTCTCTCTC TA/-- TATATATATA 2647 het 1508 hom 22 5 14 4 TA 7 6 49184 CASAVA_Build 1 108873336 3D TTAAATAGTC ATA/--- ATAACATAAA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 ATA 2 1 49185 CASAVA_Build 1 108875321 1I TATGTATACA -/T ATTACTTTGA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 0 1 49186 CASAVA_Build 1 108894159 8I CTAATACTAG --------/GAAATGCT GATGATTTGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GAAATGCT 0 1 49187 CASAVA_Build 1 108906994 1D ATTTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 1108 het 1108 ref 30 20 3 7 A 12 11 49188 CASAVA_Build 1 108924515 5D AGGCTAATTA ACCCT/----- ACAATGGCCT 3070 hom 135 het 47 0 45 3 ACCCT 1 0 49189 CASAVA_Build 1 108926808 1I CTTAACAGAA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 6 7 49190 CASAVA_Build 1 108939030 1D TAATCTCTTG T/- TTTTTTCCCC 1801 het 1801 ref 31 26 4 1 T 7 6 49191 CASAVA_Build 1 108940322 1D TCTTAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2418 hom 24 8 12 4 T 12 11 49192 CASAVA_Build 1 108947101 1I TGAGGGAGAC -/G GGGGGACATA 3070 het 2766 hom 22 7 11 4 G 5 6 49193 CASAVA_Build 1 108947605 2I TTACAAAGAC --/TG AAACCCAGCC 3070 hom 157 het 55 0 52 3 TG 0 1 49194 CASAVA_Build 1 108956063 1I ATGTATATAG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 A 6 7 49195 CASAVA_Build 1 108959690 1I GAGGCCAAGG -/C GGTAGGATCA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 C 0 1 49196 CASAVA_Build 1 108959757 1I TCATTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 10 11 49197 CASAVA_Build 1 108964483 10D TGAAGCACCA ATTATATACC/---------- ATAAGGCCAG 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 ATTATATACC 1 0 49198 CASAVA_Build 1 108965193 2I GAGAGAAAAC --/AG TGTGCACAAG 3070 hom 132 het 50 0 44 6 AG 0 1 49199 CASAVA_Build 1 108974592 1D18M1D GCGGGGAGGG AATAGCATTAGGAGATAAAC/-ATAGCATTAGGAGATAAA- CTAATGTTAA 3070 het 3070 ref 20 15 8 2 N/A 0 0 49200 CASAVA_Build 1 108976920 1I TTTAGGTACA -/G GAACAGCAGA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 G 1 2 49201 CASAVA_Build 1 108978259 1I GGCAGGAGGG -/A AAAATCTGGT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 4 5 49202 CASAVA_Build 1 108980936 1D CTTGCATTAT G/- TCTTCATGTG 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 G 1 0 49203 CASAVA_Build 1 108982833 2I GCCACTACTC --/AT ATGTTGTCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 1 2 49204 CASAVA_Build 1 108986780 7D AAGGTTATAT GACTAAA/------- GAGAAAGCAC 3070 het 3070 ref 49 25 24 2 GACTAAA 1 0 49205 CASAVA_Build 1 109006075 2D AAAGATTGAC TT/-- ATATTTTGAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 2 0 49206 CASAVA_Build 1 109007507 1I82M1I TAGCTTAGCC -TTGTCATCTCATTTTGTCATTATAACTCATCTTTCCTTCGTACACAAGGTAAGTCCTACTGAGTTATAGACCATGTAACGTC-/TTTGTCATCTCATTTTGTCATTATAACTCATCTTTCCTTCGTACACAAGGTAAGTCCTACTGAGTTATAGACCATGTAACGTCT TTTTAGAGTG 3070 het 143 hom 49 2 48 31 N/A 0 0 49207 CASAVA_Build 1 109007662 1I TTGGAAGTTG -/A CATCCTCTCT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 0 1 49208 CASAVA_Build 1 109008353 3D AGTAGAGACA GGG/--- TTTCACTATG 3070 het 1914 hom 19 5 14 0 G 3 0 49209 CASAVA_Build 1 109010053 1I CCAACAGGAT -/A ATGTGTATAT 3070 het 3070 hom 48 22 20 6 A 1 2 49210 CASAVA_Build 1 109013285 1D AGAAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 8 T 12 11 49211 CASAVA_Build 1 109015922 1I TTATCAAAGA -/C CCACCAAGGC 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 C 2 3 49212 CASAVA_Build 1 109032817 1D GAACCTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 27 5 A 11 10 49213 CASAVA_Build 1 109041684 12D TATTTTTCTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTG 3070 hom 38 het 22 0 16 10 T 21 9 49214 CASAVA_Build 1 109061595 2D TCTCAATTAT TC/-- TCTCTCTCTT 3070 het 2043 hom 28 6 18 4 TC 5 4 49215 CASAVA_Build 1 109062845 1I ATTATTGTAT -/A ATTATGGATA 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 1 2 49216 CASAVA_Build 1 109067124 1I GGAGCCGCCA -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 6 7 49217 CASAVA_Build 1 109079933 1D AGAGAAATTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 9 8 49218 CASAVA_Build 1 109095929 2D AAATCAAGAC TG/-- AATATTGGTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TG 1 0 49219 CASAVA_Build 1 109097474 1D4M2D GCCGAGACAT ATAATTA/-TAAT-- AGACCTCTAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 N/A 0 0 49220 CASAVA_Build 1 109102543 1D AAACTTTTAG C/- CAGTAAAGTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 2 1 49221 CASAVA_Build 1 109106668 3I GTTATTTTAA ---/AAC AACATTATAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AAC 1 2 49222 CASAVA_Build 1 109107895 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 12 11 49223 CASAVA_Build 1 109113241 1I ATAACACATA -/T TTTTAATATT 3070 hom 90 het 35 0 31 9 T 4 5 49224 CASAVA_Build 1 109114640 1D CATCCTAGCC T/- TTTGAGCAGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 4 3 49225 CASAVA_Build 1 109114920 1D GGGAGCTCCT G/- GCTTTTGTAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 2 1 49226 CASAVA_Build 1 109120066 14D TAAATCTCAA ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 hom 69 het 34 0 23 13 AC 16 9 49227 CASAVA_Build 1 109122836 4I ATTCATAATT ----/TATA TAAGTTTTAG 3070 hom 75 het 30 0 26 5 TA 1 3 49228 CASAVA_Build 1 109123868 6I GCTCACTATC ------/ATATTT ATTGAAGGAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 ATATTT 0 1 49229 CASAVA_Build 1 109124976 1I TGCAGTGGCG -/C CGATCTCTGC 3070 hom 30 het 18 0 11 7 C 1 2 49230 CASAVA_Build 1 109128146 4I TGTTTTTCTT ----/ACTG ATTTCTAGAA 3070 hom 94 het 36 0 32 4 ACTG 0 1 49231 CASAVA_Build 1 109128866 1D TAAGGCAAGT C/- CCTTCTGCCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 3 2 49232 CASAVA_Build 1 109129709 1I GAGACATTTT -/C CCCCGTTGTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 4 5 49233 CASAVA_Build 1 109133678 1D TATTTACATC T/- TCAAACTTAG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 2 1 49234 CASAVA_Build 1 109151403 13D ACTCCACCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 16 9 A 24 11 49235 CASAVA_Build 1 109156332 1D AGACCACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 25 1 12 12 T 16 15 49236 CASAVA_Build 1 109160279 1I TTTCTTTGCA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 7 8 49237 CASAVA_Build 1 109169901 1D TCCAAGGCGC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 8 49238 CASAVA_Build 1 109170585 1D ACTATCTTTG A/- AAAAAAGGAT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 7 6 49239 CASAVA_Build 1 109178681 1D TAACTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 26 9 A 13 12 49240 CASAVA_Build 1 109179773 1I GTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 2994 het 518 hom 20 2 9 9 T 15 16 49241 CASAVA_Build 1 109184167 1D ACTTTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 36 0 31 5 A 13 12 49242 CASAVA_Build 1 109188202 2D GAAAAGAGAC TG/-- TGGCTTAGAG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 TG 2 1 49243 CASAVA_Build 1 109188523 2D CTCTCTCTCC AT/-- ATATATATAT 2270 het 2270 ref 18 8 7 5 AT 10 9 49244 CASAVA_Build 1 109194789 1D TTAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 46 19 18 11 G 1 0 49245 CASAVA_Build 1 109195067 1I GGAAAGGGGG -/A AATAGCATAA 3070 het 3070 hom 57 25 25 7 A 2 3 49246 CASAVA_Build 1 109197109 1D GGAATGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 A 11 10 49247 CASAVA_Build 1 109198089 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 9 10 49248 CASAVA_Build 1 109216281 1I ATGTACACAC -/T TTTTTTTTTT 2783 het 2783 ref 34 10 10 14 T 13 14 49249 CASAVA_Build 1 109221660 1D CTCCTGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 29 0 25 4 T 13 12 49250 CASAVA_Build 1 109239574 1I GTATTAGAAC -/A GGGGTTCCCA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 0 1 49251 CASAVA_Build 1 109254529 1I TACCTTACAC -/A AAAAATTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 5 6 49252 CASAVA_Build 1 109260406 2I CCTGTCTCTG --/AA AAAAAAAAAA 1891 het 1872 hom 20 6 6 8 A 12 14 49253 CASAVA_Build 1 109261755 38D ACACACACAC ACATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------- ATATATATAT 3029 hom 21 het 9 0 8 1 ACATATATATATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 49254 CASAVA_Build 1 109266206 4I TTTCTTTCTT ----/AGAC AGCTCTTACA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 AGAC 0 1 49255 CASAVA_Build 1 109266689 3D TCAACAACAA CTT/--- CTTCCACTCC 3070 het 3070 hom 52 21 24 8 CTT 2 1 49256 CASAVA_Build 1 109275165 1D CCACTGCACT C/- CAGCCTGGGT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 C 2 1 49257 CASAVA_Build 1 109295819 1I TAAAGGGTAC -/A AGGGTTTCCT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 A 1 2 49258 CASAVA_Build 1 109296319 1I CTCCCCCCTA -/T TTTTTGGGTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 5 6 49259 CASAVA_Build 1 109300806 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2242 het 1039 hom 18 5 9 4 A 13 14 49260 CASAVA_Build 1 109307062 3D GTGTCCGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 TTG 4 3 49261 CASAVA_Build 1 109309477 5D CCTTTACCCA TTTGT/----- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 TTTGT 2 1 49262 CASAVA_Build 1 109312482 3D TCAACATGAA AGT/--- AAACTAAAGA 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 AGT 1 0 49263 CASAVA_Build 1 109313781 1D GCTCAGGGAG A/- GTGATTTGAG 3070 het 3070 hom 60 24 32 4 A 1 0 49264 CASAVA_Build 1 109318028 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 22 7 A 12 11 49265 CASAVA_Build 1 109319223 2I TCACTACTGG --/GT AAGTATCTAG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 GT 0 1 49266 CASAVA_Build 1 109330846 2I AATGAATATT --/AA AGTTATCCTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 3 49267 CASAVA_Build 1 109366590 2I CTTTTCAAAG --/TC TCCGATTTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TC 1 2 49268 CASAVA_Build 1 109370495 1D CGTGCCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 31 1 23 8 T 13 12 49269 CASAVA_Build 1 109374903 1D CTTTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 203 hom 31 4 18 9 A 17 16 49270 CASAVA_Build 1 109382725 7D TCGGGAGGCT GAGGTAG/------- GAGGATCACT 3070 het 3070 hom 25 8 12 6 GAGGTAG 1 0 49271 CASAVA_Build 1 109391193 3D CAGGAGAAAT GTG/--- GTGAACAGAG 3070 het 3070 hom 52 21 24 12 GTG 2 1 49272 CASAVA_Build 1 109398153 4D24M1D GTCATCACCA CTCCCTAATCTCAAGTACCCAGGGACACA/----CTAATCTCAAGTACCCAGGGACAC- AAACACTGAG 1413 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 49273 CASAVA_Build 1 109402390 3D ACCCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1760 het 787 hom 40 13 7 20 A 19 16 49274 CASAVA_Build 1 109407156 2D ACTTGCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 17 9 T 14 12 49275 CASAVA_Build 1 109409692 1D AAAGGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 11 10 49276 CASAVA_Build 1 109410394 4D AAGAACAATC ACTT/---- ACTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 ACTT 2 1 49277 CASAVA_Build 1 109413348 12D AAGTGTGTGA GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGCGC 3070 het 1944 hom 37 13 19 14 GT 9 3 49278 CASAVA_Build 1 109418925 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1989 het 595 hom 11 2 6 3 A 15 16 49279 CASAVA_Build 1 109424021 6D AGCCGGGCGT GGTGTC/------ GGGCGCCTGT 2510 het 1400 hom 9 3 6 2 GGTGTC 1 0 49280 CASAVA_Build 1 109426228 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 38 0 34 6 A 11 9 49281 CASAVA_Build 1 109455618 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 13 14 49282 CASAVA_Build 1 109474647 2I TTTTTAAAAT --/TA TATATATATA 1167 het 763 hom 8 2 3 3 TA 5 6 49283 CASAVA_Build 1 109482324 1D CCTTAAGATC A/- GGTTGACCAG 3070 hom 100 het 40 0 33 9 A 1 0 49284 CASAVA_Build 1 109507713 1I AATTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1670 hom 30 5 20 5 T 11 12 49285 CASAVA_Build 1 109513296 4D TGAGAATAAC ACTG/---- ACTGTCAAAG 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 ACTG 2 1 49286 CASAVA_Build 1 109539639 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 15 13 49287 CASAVA_Build 1 109540798 1D TACAATCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 898 hom 33 2 22 9 A 13 12 49288 CASAVA_Build 1 109555679 1D GATTTTGTCA T/- GTTGGCCAGG 2526 het 1328 hom 11 3 6 2 T 1 0 49289 CASAVA_Build 1 109562512 1D ACTTCATCTG A/- AAAAAAAAAA 2019 het 1912 hom 18 7 5 6 A 14 13 49290 CASAVA_Build 1 109566526 2D TTTTGCACAC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 AT 1 0 49291 CASAVA_Build 1 109577311 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 12 11 49292 CASAVA_Build 1 109577630 1I TCTTCCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 13 14 49293 CASAVA_Build 1 109581145 1I GGGCCCAACT -/C CTCAGAATAC 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 C 1 2 49294 CASAVA_Build 1 109619682 1I ATTCTCCCCC -/T GTCTTCTCCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 49295 CASAVA_Build 1 109629925 4I CCAACTGAAT ----/GGAC GGACCCCTTC 3070 het 3070 ref 32 14 8 10 GGAC 1 2 49296 CASAVA_Build 1 109632376 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 26 2 15 9 T 11 10 49297 CASAVA_Build 1 109633633 1D CAGTACCAGG A/- AAAAAAAAAA 2904 het 2904 ref 21 11 7 3 A 13 12 49298 CASAVA_Build 1 109634660 2D TTTATGACAC AA/-- AGGATGCCTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 A 3 1 49299 CASAVA_Build 1 109645893 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1256 het 1256 ref 18 11 5 2 A 13 12 49300 CASAVA_Build 1 109656659 1D CACTTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 46 4 22 20 A 15 14 49301 CASAVA_Build 1 109657908 2D AAACAAAAAC AA/-- AAAAGCCCAT 3070 hom 92 het 35 0 30 6 A 6 4 49302 CASAVA_Build 1 109666806 1D CCTGAGCAGC T/- TGGGATTATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 1 49303 CASAVA_Build 1 109668281 1D ATCCCCCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 31 hom 31 1 20 10 T 10 9 49304 CASAVA_Build 1 109674570 1I ATAAAAAAAA -/T CTTGAGACAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 0 1 49305 CASAVA_Build 1 109676183 1D TGAAGATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 32 1 22 9 A 14 13 49306 CASAVA_Build 1 109679761 1D GCTGTCCCCC A/- AGCTCACATT 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 2 1 49307 CASAVA_Build 1 109684292 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1337 hom 39 4 19 16 A 18 17 49308 CASAVA_Build 1 109685100 2I AACCACACAC --/AT GATTACCTGC 3070 hom 127 het 49 0 42 7 AT 0 1 49309 CASAVA_Build 1 109692540 1D GACACTAAAC A/- AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 34 22 4 8 A 13 12 49310 CASAVA_Build 1 109697180 1I ACTGCTAGGC -/A TAACTCTGAG 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 0 1 49311 CASAVA_Build 1 109698228 5D CACAAGAATG ATTAA/----- ATTAAACTGT 2918 het 2918 ref 29 18 9 7 ATTAA 2 1 49312 CASAVA_Build 1 109713220 1D ATCCCAGCAC T/- TTTGGGAGGC 3070 hom 65 het 26 0 21 5 T 4 3 49313 CASAVA_Build 1 109723294 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 9 5 A 12 11 49314 CASAVA_Build 1 109756775 1I TACAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1289 hom 40 7 23 10 A 14 15 49315 CASAVA_Build 1 109798057 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2698 het 2698 ref 21 11 9 1 T 11 10 49316 CASAVA_Build 1 109808477 4D TTATATACAT AGAA/---- AAAGTAGTAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 6 AGAA 1 0 49317 CASAVA_Build 1 109813068 4D TCAAGTACTT AGAA/---- AGGGGGTTGT 3070 het 3070 ref 46 20 21 7 AGAA 1 0 49318 CASAVA_Build 1 109813516 1D TATCTTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2166 hom 23 7 14 2 T 13 12 49319 CASAVA_Build 1 109813710 1D GAAGTATCTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 2727 hom 25 9 13 4 A 8 7 49320 CASAVA_Build 1 109815727 1D CTGAACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 10 10 T 13 12 49321 CASAVA_Build 1 109832419 2D AGGGCTGGAG TC/-- TCTTCTGCCT 3070 het 3070 ref 45 20 20 6 TC 2 1 49322 CASAVA_Build 1 109836842 1D CTTTATATTA T/- TTTTTTTTAA 2232 het 2232 ref 19 9 6 5 T 9 8 49323 CASAVA_Build 1 109841977 5D TTCAATAGTA TGGGG/----- ACAGAATGGG 3070 het 3070 ref 49 20 17 12 TGGGG 1 0 49324 CASAVA_Build 1 109842561 2D GGCACAGAGC AG/-- AGAGGAGGGC 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 AG 3 2 49325 CASAVA_Build 1 109843001 1D GCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 2590 het 2590 ref 30 11 9 10 A 15 14 49326 CASAVA_Build 1 109854886 10D ATTCAAGATG TTAGCTGTTC/---------- TTGAGATGGT 3070 het 3070 ref 39 23 17 5 TTAGCTGTTC 1 0 49327 CASAVA_Build 1 109856722 1D GGTCACCACA C/- GATATGTTCT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 C 1 0 49328 CASAVA_Build 1 109860408 2D TCAACCACTT AA/-- GAGTATTCTT 3070 het 3070 hom 41 12 24 5 A 2 0 49329 CASAVA_Build 1 109860569 2D GCCTAGAGAA AG/-- AGTGTAGCTT 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 AG 2 1 49330 CASAVA_Build 1 109897490 1I GAGAAAACAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 10 49331 CASAVA_Build 1 109908023 1I TAATGTTTAA -/T TTTTTATGCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 6 49332 CASAVA_Build 1 109947282 24D AGTACTGGAA CCTGGGGGGTCTTCTAACTACTGG/------------------------ CCTGTGCTCT 3070 hom 75 het 23 0 25 6 CCTGGGGGGTCTTCTAACTACTGG 1 0 49333 CASAVA_Build 1 109973870 1I CGTGCTGGGT -/G GGGGGTCAGG 3070 hom 59 het 30 0 18 12 G 5 6 49334 CASAVA_Build 1 109976552 1I AGGGTCTTCT -/G GGGGGGGTCT 3070 hom 66 het 24 0 20 4 G 7 8 49335 CASAVA_Build 1 109979825 1I CAAAATATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 493 hom 23 2 12 9 A 12 13 49336 CASAVA_Build 1 109982204 4D CATGTGTTTG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TTTA 6 5 49337 CASAVA_Build 1 109988450 1D TTTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2569 het 11 hom 15 1 8 6 T 15 14 49338 CASAVA_Build 1 109994232 1D CTAGAGGTTA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 8 7 49339 CASAVA_Build 1 110022702 2D CATCCTGGCT TG/-- TACACGGTGA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 TG 1 0 49340 CASAVA_Build 1 110046702 1D GTTCAGTGTA C/- TCTCGTGGTA 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 C 1 0 49341 CASAVA_Build 1 110067711 1D TGAAACATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 960 hom 30 5 10 15 T 17 16 49342 CASAVA_Build 1 110072024 1I GCACTTAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1612 hom 23 4 13 6 T 9 10 49343 CASAVA_Build 1 110080577 1D CAGCCTATGG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 T 7 6 49344 CASAVA_Build 1 110081776 3D TAGAGAAGTA TCC/--- TCTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 58 29 26 6 TCC 1 0 49345 CASAVA_Build 1 110106770 4D CGTCCACTTG TACT/---- TACTTGGCGC 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 TACT 2 1 49346 CASAVA_Build 1 110110891 1D GTAACTTTAG C/- CCCCAACCCT 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 C 5 4 49347 CASAVA_Build 1 110112515 2I CATGGATGAG --/GC GCAGCCTCAA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 GC 1 2 49348 CASAVA_Build 1 110132048 1D AGGGTTGGAG A/- AATGCGTCCA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 3 2 49349 CASAVA_Build 1 110149525 5D TTTTTATAAT ATAAC/----- ATAATCATAG 3070 het 3070 ref 25 15 9 3 ATAAC 1 0 49350 CASAVA_Build 1 110171552 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 27 4 14 9 T 15 14 49351 CASAVA_Build 1 110174817 1D CACCACCACA C/- CTGGATAATT 3070 hom 94 het 35 0 29 9 C 2 1 49352 CASAVA_Build 1 110175859 1D CACCCAGGAA C/- TGACTCAGTG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 C 1 0 49353 CASAVA_Build 1 110178574 1D TAAATCTTAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 7 49354 CASAVA_Build 1 110179705 1I TTTTAATGCC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 53 hom 37 1 31 5 T 7 8 49355 CASAVA_Build 1 110207159 1D ACAAGTAGAC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 9 8 49356 CASAVA_Build 1 110210772 1D AAACTACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 11 10 49357 CASAVA_Build 1 110223320 1D GATTCTTATG T/- TCTCTGTGTT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 2 1 49358 CASAVA_Build 1 110232295 24D GGGCCGCGTT AGGCAGGGCGTCGGGACCCTGGTA/------------------------ AGGCAGGGCG 3070 hom 45 het 31 0 16 17 AGGCAGGGCGTCGGGACCCTGGTA 2 1 49359 CASAVA_Build 1 110244178 1D AAAAAAGAAA T/- TTTTTTTTTG 2876 het 2876 ref 20 10 8 2 T 10 9 49360 CASAVA_Build 1 110266866 6D CTGTTCCTGC CTGTGG/------ CTGTGGCTGT 3070 het 2909 hom 55 14 15 26 CTGTGG 4 3 49361 CASAVA_Build 1 110283370 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 38 0 33 6 A 12 11 49362 CASAVA_Build 1 110287984 1D TTTGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2859 het 1505 hom 25 6 9 10 T 15 14 49363 CASAVA_Build 1 110290486 1D AAAGAAATCT A/- AAGCTAACTT 3070 het 1352 hom 39 6 30 4 A 3 2 49364 CASAVA_Build 1 110290507 1D TTTTTTTAAA G/- CCTTAAAATA 3070 het 337 hom 39 3 31 5 G 1 0 49365 CASAVA_Build 1 110290777 1D CAGCAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 12 11 49366 CASAVA_Build 1 110293859 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 1858 het 1858 ref 13 7 4 2 T 11 10 49367 CASAVA_Build 1 110294028 1D AATTCTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 328 hom 21 1 18 2 T 10 9 49368 CASAVA_Build 1 110295316 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 4 5 49369 CASAVA_Build 1 110295683 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 1298 hom 20 5 14 1 T 6 7 49370 CASAVA_Build 1 110300488 1D AGTATGTGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 27 het 32 1 27 4 T 9 8 49371 CASAVA_Build 1 110306964 3D AAATTTTAAG AAC/--- AACTGAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 AAC 2 1 49372 CASAVA_Build 1 110312785 2D GCAATTCAAT AA/-- AGACAGTCTT 3070 het 3070 ref 49 29 17 4 A 3 1 49373 CASAVA_Build 1 110330470 1D GAGATGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 13 11 T 14 13 49374 CASAVA_Build 1 110352734 1D AGCAAGACCA T/- TTGCCAACTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 3 2 49375 CASAVA_Build 1 110359800 1I TTAGATAAAA -/C TTTTGAGTTT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 C 0 1 49376 CASAVA_Build 1 110423710 3I CTATGCAGGA ---/AGG AGTTCTTCAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 AGG 0 1 49377 CASAVA_Build 1 110427791 2D GGCTGGAGAC AG/-- AGACAAGGAG 3070 het 3070 hom 42 20 17 5 AG 2 1 49378 CASAVA_Build 1 110435230 1I ATGTTTTGTA -/T TTTTTTGTAG 2472 het 2472 ref 29 16 8 5 T 6 7 49379 CASAVA_Build 1 110435468 2D TCATGCACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 AC 9 8 49380 CASAVA_Build 1 110443719 1I AAGAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2384 hom 23 6 16 1 A 11 12 49381 CASAVA_Build 1 110454421 1I TCTATGGATA -/T TTTCTTTTCT 2309 het 82 hom 14 2 9 3 T 3 4 49382 CASAVA_Build 1 110459508 1D TAGGAGTGTA T/- TTGAGGGGCT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 3 2 49383 CASAVA_Build 1 110477490 1I AATAATCCTC -/G GGGGGCAAAC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 G 5 6 49384 CASAVA_Build 1 110482689 1I AATTGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 31 0 25 6 T 10 11 49385 CASAVA_Build 1 110490766 1D AGGAAGGAGT G/- GGGGGGGTAG 3070 hom 104 het 40 0 34 6 G 8 7 49386 CASAVA_Build 1 110517933 11D GAATACCAGA TGAATGGAGCG/----------- TGAATGGAGC 2841 het 2841 ref 32 14 10 13 TGAATGGAGCG 2 1 49387 CASAVA_Build 1 110525938 2D GGAACAATGA GT/-- GTGAAAAGGA 3070 hom 108 het 41 0 35 8 GT 2 1 49388 CASAVA_Build 1 110526767 2I GAATAGGAGC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 AG 5 6 49389 CASAVA_Build 1 110530591 1D AATAATTACC A/- AAAAAAAAAA 133 het 133 ref 32 12 3 17 A 15 14 49390 CASAVA_Build 1 110530607 4I AAAAAAAAAG ----/GAAA GAAAGAGAAG 1522 het 1522 ref 28 7 6 15 GAAA 1 2 49391 CASAVA_Build 1 110530828 2I TCTCTCTCTC --/TT GCTCCCGACT 3070 het 2912 hom 32 10 16 6 T 0 2 49392 CASAVA_Build 1 110531334 21D ATTGAGCAAT GAACAATTCGCTAATCAGGCA/--------------------- GAACAATTCG 3070 het 3070 ref 45 24 11 19 GAACAATTCGCTAATCAGGCA 2 1 49393 CASAVA_Build 1 110562736 1I GTAAGGTCCC -/A GGGGCAAGGG 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 A 0 1 49394 CASAVA_Build 1 110586400 1D TTGGAACAGC G/- GGGGGGGCTA 3070 hom 75 het 28 0 22 6 G 8 7 49395 CASAVA_Build 1 110588534 4I TAATAATAAT ----/AAAA AAATAACAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 3 7 49396 CASAVA_Build 1 110591377 1D GTGCAGGTAC T/- TTTTTTTTTT 776 het 776 ref 37 15 4 18 T 15 14 49397 CASAVA_Build 1 110592594 5D TTGTTTTTGT TTTTG/----- TTTTTTTTTG 1113 het 889 hom 32 9 8 15 TTTTG 1 0 49398 CASAVA_Build 1 110593877 1I GCATTGCTTT -/A AAAAAATTGT 3070 hom 94 het 36 0 32 4 A 6 7 49399 CASAVA_Build 1 110603851 1I GTGGGGCAGG -/A AGCTAGAAGG 3070 het 3070 hom 48 12 23 13 A 1 2 49400 CASAVA_Build 1 110605308 3I TCCGGTATTT ---/AAC AACATTTCAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 AAC 1 2 49401 CASAVA_Build 1 110605736 1I ACGCTTTATA -/G GAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 G 1 2 49402 CASAVA_Build 1 110607492 1D AATTTAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 11 10 49403 CASAVA_Build 1 110607935 1D CTTCCTCTCT A/- AAAAAAAAAC 3034 het 1103 hom 28 8 8 12 A 10 9 49404 CASAVA_Build 1 110611069 5I TTCTCTTGAA -----/GAAGG GCATCCCACT 3057 het 3057 ref 27 14 8 5 GAAGG 0 1 49405 CASAVA_Build 1 110639868 1D GGTTATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1514 hom 23 8 8 7 T 11 10 49406 CASAVA_Build 1 110640487 1I CCTCTCCTCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 8 9 49407 CASAVA_Build 1 110640746 1I TGTTTTACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 9 10 49408 CASAVA_Build 1 110640878 1I CAAAAGCCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 T 8 9 49409 CASAVA_Build 1 110666794 3I CACATAAAGA ---/TCT TCTACTCACA 3070 het 3070 hom 55 18 33 4 TCT 1 2 49410 CASAVA_Build 1 110668330 1I AGAGATGCTG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 55 21 28 6 A 7 8 49411 CASAVA_Build 1 110669341 2I GTATTTTAAC --/TG TATTAGGCAC 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 TG 0 1 49412 CASAVA_Build 1 110675975 1I ATAGGGAGAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 8 9 49413 CASAVA_Build 1 110687685 1I CAAAGGTGAG -/A ATGATATCAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 A 1 2 49414 CASAVA_Build 1 110705901 1D TAAGGGGTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 10 8 T 10 9 49415 CASAVA_Build 1 110706780 9I AAAAAAAAAG ---------/CATTCAGAA CATTCAGAAG 2433 het 2029 hom 23 8 8 7 CATTCAGAA 1 2 49416 CASAVA_Build 1 110712990 1D CATTATTTTA T/- GTGTTAGGCC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 1 0 49417 CASAVA_Build 1 110733916 2I GATGCAGCTG --/GA GACCATTATC 3070 het 3070 hom 52 18 23 11 GA 1 2 49418 CASAVA_Build 1 110736901 2D TATTTTTCTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 14 23 7 AC 7 6 49419 CASAVA_Build 1 110739366 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 19 8 10 2 T 7 8 49420 CASAVA_Build 1 110743936 1D CTGGTTAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1735 hom 19 7 9 3 A 10 9 49421 CASAVA_Build 1 110744896 2I TGAGGCGGGT --/GG GGATCACGAG 1729 het 1119 hom 13 6 6 1 G 2 4 49422 CASAVA_Build 1 110747374 3D AAGGCTGTGA TAG/--- TAGCAGTTGT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 TAG 2 1 49423 CASAVA_Build 1 110761473 1D AGAGATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2983 hom 36 11 19 6 A 13 12 49424 CASAVA_Build 1 110766607 1D CAAAAGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 918 hom 30 4 15 11 T 15 14 49425 CASAVA_Build 1 110775981 1I TAACACACGA -/T TTCCTTTAGA 3070 het 3070 hom 52 18 21 13 T 2 3 49426 CASAVA_Build 1 110777327 1D CAGGATCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 15 7 A 12 11 49427 CASAVA_Build 1 110785217 1I CTCTCGTGCC -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 102 het 39 0 33 6 T 6 7 49428 CASAVA_Build 1 110793615 6I TCTACCTTCT ------/AACCCA AAGTGCTGGG 2954 het 1823 hom 17 7 8 2 AACCCA 0 1 49429 CASAVA_Build 1 110806813 1I AGTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 9 10 49430 CASAVA_Build 1 110807217 16D AAGCACTATA CTGTGCACTCTGCAGT/---------------- CTGGGGTTTC 3070 het 3070 ref 37 21 20 1 CTGTGCACTCTGCAGT 1 0 49431 CASAVA_Build 1 110830281 8I CAGTAGTGGT --------/CAGAGTAG CAGAGTAGGC 3070 het 3070 ref 44 20 18 7 CAGAGTAG 1 2 49432 CASAVA_Build 1 110830872 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 7 8 49433 CASAVA_Build 1 110857703 17D CCTTTCTCCG CATGGGTCGAGGGTCCT/----------------- CATGGGTCGA 3070 hom 50 het 24 0 17 10 CATGGGTCGAGGGTCCT 1 0 49434 CASAVA_Build 1 110885478 3D CTTCATCGCA GCC/--- GTGTTAGTGT 3070 het 3070 ref 60 30 28 3 GCC 1 0 49435 CASAVA_Build 1 110905062 9D TCTTGGGGCC GGATCACAT/--------- GGATCACATG 3070 het 3070 ref 28 13 11 7 GGATCACAT 2 1 49436 CASAVA_Build 1 110906041 1I GAGACTCCCA -/G GATAGGGCTC 3070 hom 47 het 18 0 15 3 G 1 2 49437 CASAVA_Build 1 110907693 1I TCCTTCCTTC -/T TTTTTTTTTG 1386 het 1386 ref 16 7 4 5 T 9 10 49438 CASAVA_Build 1 110910947 3D ACAGTACAAT ATG/--- ATGAAATTAC 3070 het 3070 hom 42 13 23 8 ATG 2 1 49439 CASAVA_Build 1 110911968 1D CCCCTTGGTT C/- CAAAGCTATC 3070 het 3070 ref 39 26 8 6 C 2 1 49440 CASAVA_Build 1 110927515 1D TTAGGTAAGA C/- CCCCCCTGAG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 C 7 6 49441 CASAVA_Build 1 110979687 1D GATGGGAAAG T/- GCTGGTGTTT 3070 hom 120 het 42 0 39 3 T 1 0 49442 CASAVA_Build 1 110988752 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 8 49443 CASAVA_Build 1 110992544 1D ATGTGAAGGT A/- TATGGGGGGG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 1 0 49444 CASAVA_Build 1 111003333 1D50M2I AAAAAAAAAA CACAAAAAACAGTAATAGTTGGCTTGCTAGAAACAAATTTTAGGCTTTCTT--/-ACAAAAAACAGTAATAGTTGGCTTGCTAGAAACAAATTTTAGGCTTTCTTTA TCTGCAGCAC 3070 hom 169 het 49 0 57 13 N/A 0 0 49445 CASAVA_Build 1 111029519 1D ATTACTCCCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 9 8 49446 CASAVA_Build 1 111034410 1I CATTTCATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 8 9 49447 CASAVA_Build 1 111035886 5I CTGAAACTAT -----/AAAAG AAGTCTTTAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AAAAG 0 1 49448 CASAVA_Build 1 111051254 2D GCAGTTCTCA AC/-- ACAGATAGCT 3070 hom 132 het 49 0 45 6 AC 2 1 49449 CASAVA_Build 1 111053556 2I AAATAAAGTA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 AT 6 7 49450 CASAVA_Build 1 111056289 1D TTTTAAAAAA T/- TTTAAGTTGA 3070 het 3070 ref 37 19 12 7 T 4 3 49451 CASAVA_Build 1 111072773 1D CAAGACAGGA G/- AATTGCAACA 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 G 1 0 49452 CASAVA_Build 1 111076080 1D GTTTTCCTTG T/- CATTGTTGTC 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 T 1 0 49453 CASAVA_Build 1 111085166 1I TGTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2291 hom 32 7 10 15 T 12 13 49454 CASAVA_Build 1 111090314 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 275 hom 12 1 8 3 A 16 17 49455 CASAVA_Build 1 111105250 1I ACCCCTCTGA -/C CCCTACCCCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 3 4 49456 CASAVA_Build 1 111109165 10D TGGAAGTGAG GTACAGTAAC/---------- GTACAGTAAC 3070 hom 129 het 45 0 44 2 GTACAGTAAC 2 1 49457 CASAVA_Build 1 111114823 2D TGTTAATACA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 hom 130 het 49 0 43 8 T 10 8 49458 CASAVA_Build 1 111114988 3I AGATCCAATT ---/GGA GGAGTTCATA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 GGA 1 2 49459 CASAVA_Build 1 111115915 1I GAAAGAGCAC -/T TTTTTTTTTT 2175 het 861 hom 24 6 7 11 T 12 13 49460 CASAVA_Build 1 111122262 1D AACAGAGGCT A/- AAAGGGCTGC 3070 hom 99 het 37 0 32 5 A 4 3 49461 CASAVA_Build 1 111124238 4D TTTTGTTTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3053 het 3053 ref 40 22 9 10 AAAC 4 3 49462 CASAVA_Build 1 111129485 2D CGAATTACAA TG/-- TGTGTGTGTG 1800 het 1800 ref 52 40 4 9 TG 7 6 49463 CASAVA_Build 1 111134538 1D GTGCTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 12 11 49464 CASAVA_Build 1 111144265 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 15 11 7 A 10 9 49465 CASAVA_Build 1 111148501 1D CAAGTGCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 578 hom 34 3 16 15 T 15 14 49466 CASAVA_Build 1 111163092 1D TTTAGAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2487 hom 24 6 12 6 T 13 12 49467 CASAVA_Build 1 111194685 1I CTCAATTAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 A 8 9 49468 CASAVA_Build 1 111196351 1I CCTTCAAAGT -/A AAAGCAATTC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 3 4 49469 CASAVA_Build 1 111201288 12D TTTTTTTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTGAGA 2866 het 2866 ref 23 11 9 3 T 18 6 49470 CASAVA_Build 1 111203667 1I AAAGGAGAGA -/G TATCTGGAGA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 G 0 1 49471 CASAVA_Build 1 111204098 5I GTCTCAAAAA -----/AAAAC AAAAAAAAAA 3070 het 794 hom 30 10 13 7 AAAAC 0 1 49472 CASAVA_Build 1 111205372 2D ATATATATAT AC/-- ATACATACAT 1072 het 1072 ref 33 27 3 4 AC 1 0 49473 CASAVA_Build 1 111207748 14D TATTGTTGGT GTATAAGAATGCTA/-------------- GTGATTTTTG 3070 het 3070 ref 45 40 9 0 GTATAAGAATGCTA 1 0 49474 CASAVA_Build 1 111208708 1D GATAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 9 13 A 15 14 49475 CASAVA_Build 1 111209020 1I TAGCTATTTT -/A AGAAAGAACC 3070 het 3070 ref 49 30 12 7 A 1 2 49476 CASAVA_Build 1 111210205 1I CAACACAGGA -/G TACCCAGATT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 G 0 1 49477 CASAVA_Build 1 111223133 1I GTACAAATGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 8 9 49478 CASAVA_Build 1 111223667 2D CTTAGAGACT CA/-- CAGTGCACAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 CA 2 1 49479 CASAVA_Build 1 111228830 6I ATCAGTCCCT ------/TTATAA TTATAAAGTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTATAA 1 2 49480 CASAVA_Build 1 111228997 1D TTTAAATGCA T/- TTTTTTGTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 6 49481 CASAVA_Build 1 111233259 1D GTTAATTTAA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 7 6 49482 CASAVA_Build 1 111238700 1I AATTGGGGGG -/A AAAATTTGTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 4 5 49483 CASAVA_Build 1 111242853 1D TTTTCTACCC A/- AAGTGTTGGG 3070 hom 101 het 38 0 33 6 A 3 2 49484 CASAVA_Build 1 111244053 2I AATAAATAAA --/AC AGTTTATTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AC 0 1 49485 CASAVA_Build 1 111244896 1D GCTCACACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 24 0 13 11 A 15 14 49486 CASAVA_Build 1 111245296 1D TCTCTCTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 8 49487 CASAVA_Build 1 111265411 1I GTTACCAGTG -/A AAGTGCAGAA 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 A 2 3 49488 CASAVA_Build 1 111269559 2D TTAAAATCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 TC 7 6 49489 CASAVA_Build 1 111283115 1I AAATAAAATT -/A AATATCTAGG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 2 3 49490 CASAVA_Build 1 111291421 1I TGTACATAGT -/C CCCAAAAAAA 2160 het 2160 ref 31 12 10 9 C 3 4 49491 CASAVA_Build 1 111302609 5I TTTTAAAATG -----/AGTAA AGTATTGTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AGTAA 0 1 49492 CASAVA_Build 1 111328539 10D AGAGACTGTA CCCTGGACCT/---------- GGGGCAGTTG 3070 hom 120 het 44 0 41 5 CCCTGGACCT 1 0 49493 CASAVA_Build 1 111333144 4I GCGTTGGGGA ----/TATC TACATGCAAA 3070 hom 111 het 39 0 37 3 TATC 0 1 49494 CASAVA_Build 1 111336131 1D TCGAGAAGGG T/- TTTTCCAGTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 5 4 49495 CASAVA_Build 1 111348302 1I TTTGATTAGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 89 het 38 0 30 8 T 8 9 49496 CASAVA_Build 1 111349856 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 575 hom 33 5 20 8 A 15 14 49497 CASAVA_Build 1 111351526 2I19M1I TCCAAATGCA --TTTTTTTTTACAAAAATAG-/TTTTTTTTTTTACAAAAATAGA AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 30 20 15 5 N/A 0 0 49498 CASAVA_Build 1 111362781 1D TCATGTGTCC T/- TTTTTCACAT 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 T 6 5 49499 CASAVA_Build 1 111365749 4D TAAAATAAAC AAAT/---- AAATAAGAAA 3070 het 2435 hom 19 9 9 1 AAAT 2 1 49500 CASAVA_Build 1 111366079 1D AGGAAGAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 1858 hom 24 6 15 4 A 9 8 49501 CASAVA_Build 1 111376150 1I GTTGTTTTGC -/T TATAGCAGGA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 1 2 49502 CASAVA_Build 1 111377390 1I CACTGCCTCC -/T GAAGCCTCCA 3070 hom 97 het 39 0 27 12 T 0 1 49503 CASAVA_Build 1 111381512 1D AAAGTTGAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 A 9 8 49504 CASAVA_Build 1 111384051 2I TCAGTATGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 13 9 A 10 12 49505 CASAVA_Build 1 111385406 1D TCAAAATTAC T/- TTGTTAGATT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 3 2 49506 CASAVA_Build 1 111385987 1I CAGTCTACAG -/T TCATACCACC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 T 1 2 49507 CASAVA_Build 1 111386739 2D TTTACAACAC TA/-- TGTCTTCCAA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 TA 1 0 49508 CASAVA_Build 1 111389442 3I GCTTAGATTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 A 13 16 49509 CASAVA_Build 1 111394621 1D TGTCTGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 251 hom 31 1 25 6 T 11 10 49510 CASAVA_Build 1 111423910 2I TTTAACTAAC --/AA AAATAATAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 3 5 49511 CASAVA_Build 1 111432279 1D GTTCTTCTTC A/- AATATATGGA 3070 het 3070 ref 22 11 9 4 A 3 2 49512 CASAVA_Build 1 111439508 1D AATAGGAATG T/- TTTACACTGT 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 T 4 3 49513 CASAVA_Build 1 111447853 1D GGGTTTCCTT G/- GGGGTATAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 5 4 49514 CASAVA_Build 1 111448969 1I CTTCATTCAA -/C CCCCCCCCAC 3070 het 3070 ref 38 15 10 13 C 8 9 49515 CASAVA_Build 1 111449156 2D TTTTTTGTTT TG/-- TGTGTGTGTT 3070 hom 45 het 36 0 15 21 TG 5 4 49516 CASAVA_Build 1 111451913 5I TCATAACATA -----/TAGTT TAGTCTGCAG 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 TAGTT 0 1 49517 CASAVA_Build 1 111456518 1I ACCAGGATTG -/T TAAGTTTCCT 3070 het 3070 hom 40 14 15 11 T 1 2 49518 CASAVA_Build 1 111459239 1I GCAACCTCCG -/C CCCCCCCGGG 2095 het 1891 hom 17 5 7 5 C 7 8 49519 CASAVA_Build 1 111461705 1D TTGTGGCCAG A/- AAAAAAAAAA 1432 het 1432 ref 29 22 4 4 A 11 10 49520 CASAVA_Build 1 111466531 1D AAGGAGGGAA G/- TAAAGACAGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 G 1 0 49521 CASAVA_Build 1 111469163 1D GAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2344 het 2344 ref 30 15 7 10 A 11 10 49522 CASAVA_Build 1 111470803 2I CTTTTCACAA --/CT CTGCCTTTTT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 CT 1 2 49523 CASAVA_Build 1 111476828 1D TTTCTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1291 hom 32 5 15 13 T 17 16 49524 CASAVA_Build 1 111481920 1I CCATCTGGAA -/T TTAAATAATG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 2 3 49525 CASAVA_Build 1 111496313 1D CACTCATTTG T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 6 T 5 4 49526 CASAVA_Build 1 111496474 1D GAAAAGTGAA G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 5 4 49527 CASAVA_Build 1 111505099 1D GTGATTTGGT A/- AAAAAAAAAA 2371 het 2371 ref 41 19 8 14 A 17 16 49528 CASAVA_Build 1 111521986 5D ACGGGAAAAC AGATT/----- CTCCCCCTGC 3070 het 3070 hom 30 13 14 6 AGATT 1 0 49529 CASAVA_Build 1 111525323 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 2172 het 2172 ref 20 10 8 2 T 10 11 49530 CASAVA_Build 1 111530446 1I ATAAACTACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 80 het 33 0 28 5 A 9 10 49531 CASAVA_Build 1 111541295 9I GGAATATGGG ---------/CAGGACAAA CAGGCCCTGA 3070 het 3070 hom 46 15 14 17 CAGGACAAA 0 1 49532 CASAVA_Build 1 111559615 1I AGTACATCTT -/A ACATGTATTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 1 2 49533 CASAVA_Build 1 111571307 1I TCTCTACAAA -/T TTTTTTTTTT 1856 het 1856 ref 37 17 9 11 T 17 18 49534 CASAVA_Build 1 111574398 1I TCTCAATGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 9 10 49535 CASAVA_Build 1 111580800 1D AATGAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 41 1 28 13 A 13 12 49536 CASAVA_Build 1 111587941 1D CCCTCAACCT C/- CAACACACAA 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 C 2 1 49537 CASAVA_Build 1 111593401 1D ATCCTATTCT G/- TGTGTCACAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 G 1 0 49538 CASAVA_Build 1 111597866 1D ATATTAGAAC T/- AGCTAATGCT 3070 het 3070 ref 42 24 15 4 T 1 0 49539 CASAVA_Build 1 111610569 2D GTTATGTTGA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 10 8 49540 CASAVA_Build 1 111614253 1D GCTAGCCCAG C/- CATTTTGTAA 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 C 2 1 49541 CASAVA_Build 1 111617512 1D CCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2777 het 208 hom 16 1 12 3 A 16 15 49542 CASAVA_Build 1 111618089 1I TCTAGAGGGG -/A AAAAAAGTAA 520 het 520 ref 22 16 2 4 A 6 7 49543 CASAVA_Build 1 111622516 4D ACTGGTATTC TTAA/---- GGAATTTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TTAA 1 0 49544 CASAVA_Build 1 111624812 1D TATTAACTAC T/- CTCTACAGAG 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 1 0 49545 CASAVA_Build 1 111626350 1I AAGTATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2158 hom 34 5 19 10 A 10 11 49546 CASAVA_Build 1 111631857 4D AATTATCTTG TTGT/---- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 56 25 26 7 TTGT 2 1 49547 CASAVA_Build 1 111632671 1D CTGTTTCACT C/- CCCTGTCTCT 3070 het 3070 hom 46 16 22 9 C 4 3 49548 CASAVA_Build 1 111635012 2I TTCATGAAAC --/CT CTCCTCGTCT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 CT 1 2 49549 CASAVA_Build 1 111637186 1I TGTTACTGTG -/A AACATGGAAG 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 2 3 49550 CASAVA_Build 1 111665990 1D GGCTCATTTC T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 36 19 15 5 T 7 6 49551 CASAVA_Build 1 111671973 1I ATTTTTTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 T 9 10 49552 CASAVA_Build 1 111674169 7I TTGTATTGTG -------/TTTTTCA GATCTGTCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTTTTCA 0 1 49553 CASAVA_Build 1 111686041 1I TGTTTTAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 9 10 49554 CASAVA_Build 1 111696253 3I AGATCATAAC ---/ATG ATTTATAGCC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 ATG 0 1 49555 CASAVA_Build 1 111699340 21D ACAGTAGAAC TTCTCTCAAAATTGGAGTCAG/--------------------- TTCTCTCAAA 3070 hom 48 het 34 0 17 19 TTCTCTCAAAATTGGAGTCAG 2 1 49556 CASAVA_Build 1 111722224 1D TTAATGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 11 10 49557 CASAVA_Build 1 111753503 1I TACTATAGCT -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 7 8 49558 CASAVA_Build 1 111754801 2D AGAAAAGGGA AC/-- ACACTTATAC 3070 het 3070 hom 44 19 24 2 AC 3 2 49559 CASAVA_Build 1 111755333 1I ATAAAGAAAA -/T GTGGTATATA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 0 1 49560 CASAVA_Build 1 111796548 1D TCCTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2008 hom 30 het 13 0 8 5 A 12 11 49561 CASAVA_Build 1 111817337 4D ATTATTTTAC AAAT/---- AAATATTTAT 3070 het 2286 hom 21 7 12 5 AAAT 2 1 49562 CASAVA_Build 1 111819321 1D TATCACCACT A/- AAAAATGTTA 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 A 6 5 49563 CASAVA_Build 1 111821746 1D TTCCGCCCTG C/- CCCCCACCCA 2354 het 1424 hom 16 4 7 5 C 6 5 49564 CASAVA_Build 1 111823878 1D GACAAGGGAT A/- GGGGTGGGCA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 1 0 49565 CASAVA_Build 1 111831627 3D TAGAAATGGA AAC/--- AACAAGAAGG 3070 het 3070 hom 46 17 26 4 AAC 2 1 49566 CASAVA_Build 1 111834980 1I GTGAAAAGGG -/A AAACAACCAG 3070 hom 151 het 56 0 49 7 A 3 4 49567 CASAVA_Build 1 111845067 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 34 0 20 14 T 11 10 49568 CASAVA_Build 1 111876218 111D CTGGCTGGGA GGAAAGATTATAGCCCTGTACTCTGCTTCTTTGGCGTGGTTCCTTTCCTAGCTTAAGGTAGTTTTCTCACATGCATGTGCTGACCAGCACTCACTCAGCTGAAGGCTTCGG/--------------------------------------------------------------------------------------------------------------- GGAGACCCTC 3070 het 3070 ref 30 38 11 9 GGAAAGATTATAGCCCTGTACTCTGCTTCTTTGGCGTGGTTCCTTTCCTAGCTTAAGGTAGTTTTCTCACATGCATGTGCTGACCAGCACTCACTCAGCTGAAGGCTTCGG 1 0 49569 CASAVA_Build 1 111886842 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 10 9 49570 CASAVA_Build 1 111887749 24D TGTCTTAAGG AGGAGGAGGAAGAGAAGGAGGAAT/------------------------ AGGAGGAGGA 3070 hom 39 het 27 0 14 15 AGGAGGAGGAAGAGAAGGAGGAAT 2 1 49571 CASAVA_Build 1 111901047 2I CATTTTACAT --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 TA 4 5 49572 CASAVA_Build 1 111902498 1D AATTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1880 het 1375 hom 16 6 7 3 T 13 12 49573 CASAVA_Build 1 111916169 1D CTTGGCACCT C/- CTGCAGCTGA 3070 hom 100 het 40 0 32 8 C 2 1 49574 CASAVA_Build 1 111922652 1D AAAAAACCAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 9 8 49575 CASAVA_Build 1 111925011 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 601 hom 28 2 22 4 A 10 11 49576 CASAVA_Build 1 111927436 4D CTCATGCTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 2973 het 138 hom 31 4 12 15 A 20 16 49577 CASAVA_Build 1 111929631 1I CTTCCAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 124 het 46 0 42 4 A 10 11 49578 CASAVA_Build 1 111938660 2D AAGGAAGGAA GG/-- GGAAGGGGAA 1506 het 1506 ref 28 7 7 14 G 4 2 49579 CASAVA_Build 1 111955110 1D AAGAAACATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 10 9 49580 CASAVA_Build 1 111956565 2D ATATATAAAG TC/-- TGTTGAATAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 TC 1 0 49581 CASAVA_Build 1 111962187 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 640 hom 32 2 23 7 A 13 12 49582 CASAVA_Build 1 111964730 1I TTCCTTTATT -/C CCCCCAGTTA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 C 5 6 49583 CASAVA_Build 1 111971923 1I AATTTCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 11 12 49584 CASAVA_Build 1 111972083 1D TTGAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 A 10 9 49585 CASAVA_Build 1 111976050 1I TTTTGGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 11 12 49586 CASAVA_Build 1 111983238 6I AGTATTTTGG ------/ACTTAT ACTCTTTCTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 ACTTAT 0 1 49587 CASAVA_Build 1 111983712 1I CATTATGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 12 13 49588 CASAVA_Build 1 111989302 2I TTTAGGAAAC --/AA AATATGCAGA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 2 4 49589 CASAVA_Build 1 111999386 3I ACTGAAAAAA ---/AAG AAGAAAAAAA 958 het 952 hom 30 8 4 18 AAG 1 2 49590 CASAVA_Build 1 112011828 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1302 het 1302 ref 21 13 3 6 A 15 14 49591 CASAVA_Build 1 112015613 4D ACTATTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 TTTC 3 2 49592 CASAVA_Build 1 112016245 5I TATATGTCTC -----/TTAAG TTAAGTTGAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TTAAG 1 2 49593 CASAVA_Build 1 112021525 5I ATTGAATTAC -----/TTGTG TTGTGTTAAT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 TTGTG 1 2 49594 CASAVA_Build 1 112022908 1I TTCAGGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2867 hom 31 10 12 9 T 11 12 49595 CASAVA_Build 1 112024944 15D CCAGACTGTT AGAAGGAAAACTAAC/--------------- AGAAGGAAAA 3070 hom 30 het 11 0 10 4 AGAAGGAAAACTAAC 2 1 49596 CASAVA_Build 1 112028876 2I AGATTCAGTG --/CT CTCCCCATAA 2410 het 2410 ref 15 7 5 3 CT 1 2 49597 CASAVA_Build 1 112029580 1D ACAAAAAAAA G/- AAACAACCTC 1731 hom 15 het 9 0 6 3 G 1 0 49598 CASAVA_Build 1 112033679 1I GTTCTTATTA -/T TATGTGTGCC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 1 2 49599 CASAVA_Build 1 112039355 6I GAATTAATAA ------/TAATAT TATACTTTAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAATAT 0 1 49600 CASAVA_Build 1 112052398 1D TACTTTTTAC G/- TTTAACCAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 G 1 0 49601 CASAVA_Build 1 112052991 1I ATAGAACCGA -/T AGTTGTTGGT 3070 het 3070 hom 57 27 25 5 T 0 1 49602 CASAVA_Build 1 112063385 1I ACTGTTCCTT -/A ATCCACCCCC 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 A 1 2 49603 CASAVA_Build 1 112067579 1I GCCCCACTAG -/C CATGCCCAGC 3070 hom 66 het 28 0 20 8 C 1 2 49604 CASAVA_Build 1 112069875 1I CTACGAACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2546 hom 27 8 17 2 T 9 10 49605 CASAVA_Build 1 112078383 1D TCTGCTTAGG C/- AAGGGGCAGA 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 C 1 0 49606 CASAVA_Build 1 112089620 1I ATATATATGG -/T TTTTTTTTGT 2582 het 2582 ref 20 12 6 2 T 8 9 49607 CASAVA_Build 1 112094095 4I CATGAACCTC ----/CCTA CCTAATAAAT 3070 hom 126 het 44 0 41 3 CCTA 1 2 49608 CASAVA_Build 1 112102054 1I AGGCTGGAGT -/G CAGTGGCACA 3070 hom 71 het 27 0 23 4 G 0 1 49609 CASAVA_Build 1 112102178 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 21 het 12 0 8 4 T 5 6 49610 CASAVA_Build 1 112111618 2D TAGTAAAAAC AA/-- ATTTAAATAT 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 A 3 1 49611 CASAVA_Build 1 112113623 1D AAGTTTTATG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 7 6 49612 CASAVA_Build 1 112114954 1D CTCAAGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 19 18 13 T 12 11 49613 CASAVA_Build 1 112138207 1I GGCAGCTGTC -/T GCCCTGAGCA 3070 hom 34 het 36 0 29 7 T 0 1 49614 CASAVA_Build 1 112143360 1I TAAATCATAA -/G AAAGCAAGCA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 0 1 49615 CASAVA_Build 1 112149372 1I CAACAGGGGG -/A AAAAAAAAAG 3013 het 3013 ref 32 18 8 6 A 9 10 49616 CASAVA_Build 1 112158391 4I TATCCTAGGA ----/AAGG GCAGGCTCGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAGG 0 1 49617 CASAVA_Build 1 112166229 1D GCAGTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 28 7 T 12 11 49618 CASAVA_Build 1 112172373 1I GTCTTACAAA -/G GCTTTTGCCT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 G 1 2 49619 CASAVA_Build 1 112172660 1I GGTGTTATCA -/G CTGCTACCTG 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 G 0 1 49620 CASAVA_Build 1 112186271 7I GTGTCAACCA -------/GAAAGGG GAAAGGGGCC 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 GAAAGGG 1 2 49621 CASAVA_Build 1 112207478 1D AGGAAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 864 hom 47 2 33 12 A 13 12 49622 CASAVA_Build 1 112210414 1I TTTTCTTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 19 1 17 1 A 0 1 49623 CASAVA_Build 1 112214867 1I TCAGTGAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 237 hom 60 1 50 9 A 8 9 49624 CASAVA_Build 1 112220514 1I TGCATTTGCC -/A GAGTGCCTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 49625 CASAVA_Build 1 112241542 1D TCCCAGATGT C/- CTTTCAGACA 3070 het 3070 hom 36 11 17 9 C 2 1 49626 CASAVA_Build 1 112257275 1D CTGTATTTTT A/- CTGTACCTTT 3070 het 3070 hom 36 10 24 2 A 1 0 49627 CASAVA_Build 1 112264473 2D CTCACACATT CC/-- TTCAGCATCT 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 C 2 0 49628 CASAVA_Build 1 112274754 1I TGCCACCCCC -/T AACCCCCTTC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 0 1 49629 CASAVA_Build 1 112297653 2D ATTTCCAGGC AA/-- AGTGTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 10 17 11 A 3 1 49630 CASAVA_Build 1 112304188 1D GGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1884 hom 27 9 13 5 A 12 11 49631 CASAVA_Build 1 112323658 1D AGGCCATAAT A/- AAAAAGTAAT 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 A 6 5 49632 CASAVA_Build 1 112345471 1I AAATGTTGAA -/T ATGCAATTGC 3070 hom 154 het 59 0 52 7 T 0 1 49633 CASAVA_Build 1 112364536 2D GGAAGGTCAC GT/-- GTGGGGCTAC 3070 hom 126 het 44 0 39 6 GT 2 1 49634 CASAVA_Build 1 112365873 2D ATAAGGAGGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 669 hom 35 6 15 15 GT 9 8 49635 CASAVA_Build 1 112367443 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2894 hom 28 8 11 9 T 11 12 49636 CASAVA_Build 1 112372436 17I CATTTCTCTG -----------------/TCTGGAATTCCGGTCCT TCCTGGGGAC 3070 hom 117 het 47 0 38 9 TCTGGAATTCCGGTCCT 0 1 49637 CASAVA_Build 1 112375452 1D CCTGTCTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 496 hom 43 2 32 9 A 10 9 49638 CASAVA_Build 1 112383979 1I GCTGCACCTT -/C CTTCATGGCC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 C 1 2 49639 CASAVA_Build 1 112417578 5D TTAGACACTG TTAAA/----- TTAAGTTTGC 3070 het 3070 hom 32 15 17 2 TTAAA 1 0 49640 CASAVA_Build 1 112422960 2D AAAAAAACAA AC/-- ACACACACAC 2532 het 2532 ref 30 16 8 7 AC 10 9 49641 CASAVA_Build 1 112442723 10I GGGACCTGAA ----------/ATGCCATCGT AGTCCTAAAG 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 ATGCCATCGT 0 1 49642 CASAVA_Build 1 112449180 3D ATATATCTCC AGA/--- AGGACATATA 2452 het 2232 hom 10 5 5 0 AGA 1 0 49643 CASAVA_Build 1 112452975 2D TTCTAGTCTT GG/-- CTTTATCTGG 3070 het 3070 hom 44 21 21 4 G 2 0 49644 CASAVA_Build 1 112460719 1D AGGAGATCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 10 9 49645 CASAVA_Build 1 112461137 1I TGGTTTATGA -/T TTTATTTAAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 3 4 49646 CASAVA_Build 1 112464255 1I TACCAACCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 9 10 49647 CASAVA_Build 1 112476855 1D GTCATTTGCA G/- GATGATCAGT 3070 het 3070 ref 57 28 25 4 G 2 1 49648 CASAVA_Build 1 112482257 1D ATGAAGAAGA G/- GGCTCACAAA 3070 het 3070 hom 40 13 25 2 G 3 2 49649 CASAVA_Build 1 112483320 5D ATGCCACAAA CCAGT/----- CATGCAAAAT 3070 het 3070 ref 47 26 19 7 CCAGT 1 0 49650 CASAVA_Build 1 112484120 1D GTATTAAAAC A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 51 33 14 6 A 6 5 49651 CASAVA_Build 1 112491617 1D AGAAAATGAG T/- TTATACCCAC 3070 het 3070 hom 30 7 21 2 T 3 2 49652 CASAVA_Build 1 112516540 1I GAGCAGTTTG -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 6 7 49653 CASAVA_Build 1 112521990 1D AGAACTTAAG T/- TCTGATGGCC 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 2 1 49654 CASAVA_Build 1 112531776 1I AAATTCAGAG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 7 8 49655 CASAVA_Build 1 112540619 1D GATTACTTTA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 45 19 21 6 T 8 7 49656 CASAVA_Build 1 112549170 6I AGGGTGGGAG ------/TGATCC TGATCCGATT 2595 het 2594 ref 12 6 6 0 TGATCC 1 2 49657 CASAVA_Build 1 112554912 1D GATAAAGAAT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 8 7 49658 CASAVA_Build 1 112564932 1D CAATAGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 10 49659 CASAVA_Build 1 112571571 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3063 het 3063 ref 19 8 9 2 A 11 12 49660 CASAVA_Build 1 112597922 4I GAAATCCAAC ----/TTAG TTAGTGATAT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 TTAG 1 2 49661 CASAVA_Build 1 112598700 1D TTGGCAGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 A 10 9 49662 CASAVA_Build 1 112602231 1I TTAGTCCCAA -/T GTCTTCAGTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 0 1 49663 CASAVA_Build 1 112610812 1D ATGCTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3069 hom 31 11 19 1 A 12 11 49664 CASAVA_Build 1 112612032 1D ACCAATATGC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 9 8 49665 CASAVA_Build 1 112646141 1I GTTTTTTGGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 T 7 8 49666 CASAVA_Build 1 112654707 1I TAACCAACTT -/C AGCAAAAGTT 3070 het 3070 hom 53 16 27 10 C 0 1 49667 CASAVA_Build 1 112659393 4I TGTGATTATT ----/ATAA ATAAATAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 ATAA 2 3 49668 CASAVA_Build 1 112698053 4D AATGGGAGAG AACT/---- AACCTCTGGT 3070 het 3070 ref 48 22 22 8 AACT 1 0 49669 CASAVA_Build 1 112698160 1D ATGAGCTCCC A/- ACCACTAAAA 3070 het 3070 ref 61 29 24 9 A 2 1 49670 CASAVA_Build 1 112716717 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2068 het 1668 hom 13 5 7 1 A 12 11 49671 CASAVA_Build 1 112733405 3I AAATGTAATC ---/ATT AATAATTTAA 3070 het 2701 hom 17 6 11 0 ATT 0 1 49672 CASAVA_Build 1 112734905 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1058 hom 31 6 12 13 A 22 21 49673 CASAVA_Build 1 112736994 1D AACACCCTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 9 8 49674 CASAVA_Build 1 112739878 1D CAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2688 het 2688 ref 35 13 15 8 A 11 10 49675 CASAVA_Build 1 112741164 1D GTTTCTTAGG T/- TTGAATTGCG 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 T 3 2 49676 CASAVA_Build 1 112747552 4I TTTCAGTATC ----/TGTT TGAACCAGAC 3070 het 3070 hom 45 12 27 6 TGTT 0 1 49677 CASAVA_Build 1 112749128 17D CCAGGAGGCG GAGGTTGCGGTGAGGCC/----------------- GAGGTTGCGG 2392 hom 23 het 8 0 7 3 GAGGTTGCGGTGAGGCC 1 0 49678 CASAVA_Build 1 112755831 1D GTAATTATGA T/- TTTTTTTTTT 2669 het 995 hom 17 4 7 6 T 15 14 49679 CASAVA_Build 1 112759730 4D GAGACAGAGT CTCA/---- CTCTGTCGCC 2816 het 2816 ref 26 9 9 8 CTCA 1 0 49680 CASAVA_Build 1 112760649 1I AACTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 2576 het 1569 hom 31 7 10 14 T 13 14 49681 CASAVA_Build 1 112762048 1I ATTTGTATCG -/T TTTTTGCTTA 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 5 6 49682 CASAVA_Build 1 112763702 1I ACCAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 10 11 49683 CASAVA_Build 1 112774745 1D TTGCCCAGGC T/- TGGAGTGCAG 1466 het 1466 ref 10 4 4 2 T 2 1 49684 CASAVA_Build 1 112780802 2D TTTAGTACAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 12 10 49685 CASAVA_Build 1 112783365 1I GGTCTTAAAG -/T TATTACTGTC 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 T 1 2 49686 CASAVA_Build 1 112785068 3I TTTTGCTGTC ---/ATT ATTGTTAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 ATT 1 2 49687 CASAVA_Build 1 112790343 2D AAAAAAGTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1273 hom 29 8 13 8 A 15 13 49688 CASAVA_Build 1 112791795 1I CTTCTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 2449 het 2449 ref 28 15 6 7 A 10 11 49689 CASAVA_Build 1 112802470 4D AATATTATAG GTCA/---- GTCAGAATTA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 GTCA 2 1 49690 CASAVA_Build 1 112802821 1D TCAGTATCAT A/- AAAAGGCAGA 3070 het 3070 hom 54 22 27 7 A 5 4 49691 CASAVA_Build 1 112803651 1D ATCAGTGTAT A/- AATCACAATG 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 A 3 2 49692 CASAVA_Build 1 112818458 1D ATCTGACTGA T/- TTTTTTTTGT 2223 het 824 hom 11 2 7 2 T 9 8 49693 CASAVA_Build 1 112821620 1D AAAGAAACAT A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 7 6 49694 CASAVA_Build 1 112827925 1D ACTGAATAAC A/- AAAAAAAAAA 2130 het 2130 ref 16 11 5 0 A 13 12 49695 CASAVA_Build 1 112832583 3D TTAGATTGGC CTT/--- CTTCCTTACC 3070 hom 126 het 46 0 41 7 CTT 2 1 49696 CASAVA_Build 1 112833928 1I ATTCTGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 T 10 11 49697 CASAVA_Build 1 112834273 4D GGAAATAAAG AAAC/---- AAACAAGAGA 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 AAAC 2 1 49698 CASAVA_Build 1 112838086 1D AATCTAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 A 13 12 49699 CASAVA_Build 1 112848254 1D GGCTGGTCAG T/- TGACCACCCA 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 T 2 1 49700 CASAVA_Build 1 112864218 3D GGGCTTGCTA TGT/--- TTCCCAGGCT 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 TGT 1 0 49701 CASAVA_Build 1 112870885 1D ACTCCGTCAC A/- AAAAAAAAAA 2938 het 377 hom 14 2 7 5 A 15 14 49702 CASAVA_Build 1 112873298 4D AGTGTGGCAC TGAG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 61 30 30 4 TGAG 1 0 49703 CASAVA_Build 1 112876126 7D TCTACTGCAG TTTTTGT/------- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 TTTTTGT 2 1 49704 CASAVA_Build 1 112877341 3I GGCTGAAGTC ---/CTT TATGCAGTAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 CTT 0 1 49705 CASAVA_Build 1 112877468 4D GTTATTTTAT TTTA/---- TTTTTTTTTT 92 het 92 ref 33 23 1 9 TTTA 1 0 49706 CASAVA_Build 1 112895763 5D TGTGAAAAAA ACTGT/----- ATGGCCCACA 3070 het 3070 ref 35 19 13 6 ACTGT 1 0 49707 CASAVA_Build 1 112896412 1I TTTTCCCCCC -/T GATCAACATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 49708 CASAVA_Build 1 112897235 1I GTATAGACTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 8 9 49709 CASAVA_Build 1 112898364 1I GTGAATCCTA -/T TGGTAAAATG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 1 2 49710 CASAVA_Build 1 112899366 3D AACAAAACAA AAC/--- AAAAAGACCA 561 het 560 ref 36 4 5 28 AAC 1 0 49711 CASAVA_Build 1 112906025 1I TTTAAAAGGT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 7 8 49712 CASAVA_Build 1 112910158 1I TCTGTCTCAA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 G 1 2 49713 CASAVA_Build 1 112914691 14D ATAAAAGATG TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 het 152 hom 21 1 16 6 TA 13 6 49714 CASAVA_Build 1 112924302 1I TTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 8 9 49715 CASAVA_Build 1 112925544 2D GCTCCCCGTC TT/-- TTTTTTTTTT 2265 het 548 hom 30 9 7 16 T 18 16 49716 CASAVA_Build 1 112947158 1D CCGCGCCCGG C/- CCCTGGCAGA 1885 het 1885 ref 20 11 5 5 C 4 3 49717 CASAVA_Build 1 112951850 1D GATATAAACT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 10 9 49718 CASAVA_Build 1 112957474 1I ATTATGCCAA -/G TCCTTGACAT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 G 0 1 49719 CASAVA_Build 1 112958384 4I AGTTTCTTTA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AAAC 3 4 49720 CASAVA_Build 1 112965434 1D AACTAAACAA T/- TTTTTTTTTT 2865 het 2763 hom 33 11 9 13 T 15 14 49721 CASAVA_Build 1 112983244 1D ACTTCAGAAA C/- TATCAAATAT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 C 1 0 49722 CASAVA_Build 1 112985364 5D AATGATCAAT AAAAA/----- AAAAAATAAA 335 het 335 ref 11 3 2 7 A 11 6 49723 CASAVA_Build 1 112986127 1I TTTGTTGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 9 10 49724 CASAVA_Build 1 112987240 1D CAAATAGACC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 41 20 18 5 A 9 8 49725 CASAVA_Build 1 112990111 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 14 15 14 A 12 11 49726 CASAVA_Build 1 112990882 1D TAGGTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 11 16 20 T 15 14 49727 CASAVA_Build 1 112993109 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1640 het 1640 ref 22 6 6 10 A 13 14 49728 CASAVA_Build 1 112994139 1I GTGGTGCCTC -/T TTTTTTTTTT 2684 het 2684 ref 26 14 9 3 T 11 12 49729 CASAVA_Build 1 112995845 1I TTCCTACTCG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 9 10 49730 CASAVA_Build 1 113003727 5D GTTTCTCTCT CTCTC/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 CTCTC 1 0 49731 CASAVA_Build 1 113007050 3D TGGCCAGATC TGT/--- TGTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 TGT 3 2 49732 CASAVA_Build 1 113020165 3D GATTTGGGGT GGG/--- GGAAAAGGGT 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 G 5 2 49733 CASAVA_Build 1 113040189 1I CGTCTCAATT -/A AAAAAAAATA 2281 het 2281 ref 20 8 9 3 A 8 9 49734 CASAVA_Build 1 113052865 5D TGAAGTTCTC AAGAT/----- AAGGTGATGT 3070 het 3070 ref 46 21 19 7 AAGAT 1 0 49735 CASAVA_Build 1 113095432 1D TTGTGACTTA T/- TTTTTTGGCC 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 7 6 49736 CASAVA_Build 1 113098004 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 480 hom 27 2 15 11 T 13 12 49737 CASAVA_Build 1 113100425 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 393 hom 40 1 37 2 A 9 10 49738 CASAVA_Build 1 113110574 1I CCCTGCCTCC -/A ATTTGCCTTG 3070 het 1820 hom 16 6 9 1 A 1 2 49739 CASAVA_Build 1 113124419 4D CAGGCTGGTT TCTA/---- TCCCCCTCTG 3070 het 3070 ref 30 16 10 6 TCTA 1 0 49740 CASAVA_Build 1 113128098 1D CATTCCATAA T/- TTTTTTTTTT 2750 het 181 hom 17 2 8 7 T 15 14 49741 CASAVA_Build 1 113133628 1D GCATTTCTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 10 9 49742 CASAVA_Build 1 113134024 1I AGGGTGCTAA -/T TGACCTGAGG 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 1 2 49743 CASAVA_Build 1 113146391 1D GTGAGGCAGA G/- GGCCCTGCCC 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 G 3 2 49744 CASAVA_Build 1 113148575 1I ATGTCATACA -/G GGGAGTCCCT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 G 3 4 49745 CASAVA_Build 1 113158428 2D AGCGCCACTC TT/-- TTTTTTTTTT 2293 hom 21 het 14 0 7 7 T 14 12 49746 CASAVA_Build 1 113226809 3I GTCCCAGAGC ---/AGA AGGAAGAGGA 3070 hom 84 het 31 0 27 4 AGA 0 1 49747 CASAVA_Build 1 113231450 1I TATGAAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 34 1 19 14 T 11 12 49748 CASAVA_Build 1 113233242 3D CAGGGCAGTA AAG/--- AAGATTTCTG 3070 hom 99 het 35 0 34 5 AAG 2 1 49749 CASAVA_Build 1 113240681 1D ACTTCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 37 3 20 14 T 13 12 49750 CASAVA_Build 1 113248706 2D GGAGTCTGTT AA/-- GTTAGATCTC 3070 het 3070 hom 24 10 12 5 A 2 0 49751 CASAVA_Build 1 113259919 3I GTATGAGATG ---/GAA GAAGAAGACA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GAA 2 3 49752 CASAVA_Build 1 113260317 1D TGAAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 715 hom 30 4 15 11 T 17 16 49753 CASAVA_Build 1 113267407 11I GAGGTTGCGG -----------/TGAGCCGAGAT TGAGCCATTG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 TGAGCCGAGAT 0 1 49754 CASAVA_Build 1 113280361 7I AATTCTAACT -------/TAGAAAA TAGAGAAGGC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TAGAAAA 0 1 49755 CASAVA_Build 1 113318551 1D CTTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 28 1 17 10 A 17 16 49756 CASAVA_Build 1 113343318 1I GTTATCCTTT -/A GTTTTCGGTA 3070 hom 111 het 43 0 36 7 A 0 1 49757 CASAVA_Build 1 113356643 1D TATAGAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 683 hom 33 4 21 8 T 17 16 49758 CASAVA_Build 1 113361338 1I TGGAGGTTGC -/A AGTGAGCTGA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 1 2 49759 CASAVA_Build 1 113374873 1D GGCAAGAAGA C/- ATTCCAGATA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 1 0 49760 CASAVA_Build 1 113388539 6D CTCCATCTCA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 hom 27 het 12 0 10 3 AAT 8 6 49761 CASAVA_Build 1 113405665 1D TTTTCGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 28 0 18 10 T 13 12 49762 CASAVA_Build 1 113412017 1D TGGGATTACA G/- GTGTGCAGCA 3070 hom 53 het 20 0 18 2 G 2 1 49763 CASAVA_Build 1 113416168 1D CTTCAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 12 11 49764 CASAVA_Build 1 113419358 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 28 1 23 4 A 11 12 49765 CASAVA_Build 1 113428775 4I CAATTAAAAC ----/AAAT AAAATCAGCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AAAT 0 1 49766 CASAVA_Build 1 113429427 4D TTCTTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTTG 3 2 49767 CASAVA_Build 1 113434994 2I AAAAGAAAAC --/AA AAAAAAATTT 2082 hom 12 het 6 0 5 1 A 7 9 49768 CASAVA_Build 1 113436711 4I TTATGCCTTC ----/TTTG TTTAAGGACT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TTTG 0 1 49769 CASAVA_Build 1 113441581 1D ATTTTGTGAA G/- GGTATATACA 3070 hom 69 het 28 0 22 7 G 3 2 49770 CASAVA_Build 1 113442077 1D AAGCTAAGTG A/- AAACAGGGAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 4 3 49771 CASAVA_Build 1 113446407 1D TGTTCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 19 0 13 6 T 11 10 49772 CASAVA_Build 1 113447154 1I GCCCCCCTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 256 hom 43 2 34 7 T 9 10 49773 CASAVA_Build 1 113450373 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 23 5 A 13 11 49774 CASAVA_Build 1 113456247 7D CAAATACTCT GAGGTTC/------- TGGAAGAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GAGGTTC 1 0 49775 CASAVA_Build 1 113459675 1D AATTTGTAAA T/- TTTTTTTTTT 2623 het 156 hom 17 1 9 7 T 17 16 49776 CASAVA_Build 1 113460589 2D ACGGTAATGA CT/-- CTGTTGTTTA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 CT 2 1 49777 CASAVA_Build 1 113472086 4I TTAGGTAAAT ----/AAAG AACTTCACAC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AAAG 0 1 49778 CASAVA_Build 1 113475111 1I CAGTCTCGCT -/C TATTGCCCCG 3070 hom 54 het 23 0 18 6 C 0 1 49779 CASAVA_Build 1 113477670 1I AAAATTAGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 34 0 20 14 T 9 10 49780 CASAVA_Build 1 113489410 1D CTCTAAGGAG T/- TTAGTAAAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 3 2 49781 CASAVA_Build 1 113495817 1I TGGAGGCTCA -/G GCAGGAGAAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 2 49782 CASAVA_Build 1 113496747 8D TTAATTTTAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1680 het 37 hom 10 1 4 5 T 22 14 49783 CASAVA_Build 1 113500755 4D GTTTAAATTG TTTT/---- TTTTTTAATT 3070 hom 69 het 27 0 24 5 T 10 6 49784 CASAVA_Build 1 113507883 1D TTGCTGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 12 11 49785 CASAVA_Build 1 113508467 1D GCCTCACACA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 45 24 18 5 T 9 8 49786 CASAVA_Build 1 113512877 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1910 het 52 hom 16 2 10 4 A 17 18 49787 CASAVA_Build 1 113519825 1D TAAATATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 12 11 49788 CASAVA_Build 1 113521294 1I AAATAAATTT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 49789 CASAVA_Build 1 113529263 2D ATATGGAACC AA/-- AAAAAAAAAA 2205 het 478 hom 29 6 5 19 A 18 16 49790 CASAVA_Build 1 113544703 1D CAGAAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 721 hom 28 2 19 7 T 12 11 49791 CASAVA_Build 1 113546661 4I TGGAAAGAGG ----/ACTA ACTTTCTAGC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ACTA 0 1 49792 CASAVA_Build 1 113554272 1I GAGTGTAGGG -/T AAGCCAGTAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 0 1 49793 CASAVA_Build 1 113558016 1I GGCTGCCTTT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 7 8 49794 CASAVA_Build 1 113559575 1D ATTTTCTAAA C/- TTTTACACTC 3070 hom 93 het 34 0 31 4 C 1 0 49795 CASAVA_Build 1 113561352 1D GCTCTGTCTT C/- CTGCATTTCA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 C 2 1 49796 CASAVA_Build 1 113562072 1I TACTTAGAAG -/T TTCTGGAGGC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 2 3 49797 CASAVA_Build 1 113577317 1D GATGTCACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 10 9 49798 CASAVA_Build 1 113578239 1D CCAGCCTGAG A/- TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 24 1 20 4 A 1 0 49799 CASAVA_Build 1 113582438 1D ATTGCTGGTG T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 8 7 49800 CASAVA_Build 1 113601698 1I AGATAAAGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 9 10 49801 CASAVA_Build 1 113606171 1I GGATTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 740 hom 42 2 33 7 A 10 11 49802 CASAVA_Build 1 113614148 2I CATAAATATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 GT 7 8 49803 CASAVA_Build 1 113624548 1D GTTGCTAGTT A/- ATTTTTCACA 3070 hom 154 het 58 0 52 6 A 2 1 49804 CASAVA_Build 1 113637509 12D CACACACACA CACACACACGCG/------------ CGCGCGCGCA 3070 het 2736 hom 33 17 11 7 CACACACACGCG 1 0 49805 CASAVA_Build 1 113644010 1D AAGATGCCCA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 401 hom 15 1 8 6 C 10 9 49806 CASAVA_Build 1 113645812 1I TAATCTCAAA -/G GGTGGATATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 2 3 49807 CASAVA_Build 1 113656747 7I CCAAACAAAC -------/CTCACCA TAAATAAGGC 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 CTCACCA 0 1 49808 CASAVA_Build 1 113660511 1I CTCTACAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 8 9 49809 CASAVA_Build 1 113665028 5I GGAGATAAAG -----/AACTT AACAAGTAAC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 AACTT 0 1 49810 CASAVA_Build 1 113667237 1D ATAAATGTGG C/- TTTGCCCAGT 3070 het 3070 ref 58 32 22 6 C 1 0 49811 CASAVA_Build 1 113676584 1I GACAGAGTGG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 7 8 49812 CASAVA_Build 1 113684833 1D AATTCATAGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 9 8 49813 CASAVA_Build 1 113697919 1I GTAAGGTTAC -/T GTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 T 0 1 49814 CASAVA_Build 1 113699425 1D TCTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 17 1 13 4 T 11 10 49815 CASAVA_Build 1 113715849 1I TCTGTCTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 9 10 49816 CASAVA_Build 1 113743202 1I70M1I AGCTAACTTC -TGTTCTCAAGTGTTGGTCATTAGAATTATTATTTGGTTCTCTTTTCTTCTGGGTTGGATTTTTTCTCAGC-/ATGTTCTCAAGTGTTGGTCATTAGAATTATTATTTGGTTCTCTTTTCTTCTGGGTTGGATTTTTTCTCAGCT TAGACTGTCA 3070 het 3070 ref 45 32 29 7 N/A 0 0 49817 CASAVA_Build 1 113751718 1D TCAATCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 13 14 T 12 11 49818 CASAVA_Build 1 113753312 1D GGATCTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 13 11 T 11 10 49819 CASAVA_Build 1 113754759 1I TTATTTTATT -/A GGCAGTGTTA 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 A 0 1 49820 CASAVA_Build 1 113763785 1D GAGCAAGACC T/- TGTATTTTTG 3070 het 3070 ref 31 13 13 7 T 2 1 49821 CASAVA_Build 1 113766006 1D ACCACCTTGA T/- TTTTTTTTTT 1760 het 1760 ref 53 42 4 7 T 13 12 49822 CASAVA_Build 1 113780189 2D GAATACAAAC AT/-- GTGCATCTTA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AT 1 0 49823 CASAVA_Build 1 113781745 1D ATCTTTGTAT A/- TATTGAATAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 1 0 49824 CASAVA_Build 1 113793733 1D TGCAAGTGCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 9 8 49825 CASAVA_Build 1 113807548 1I GAGAGGGTGC -/A AACCAGTGAG 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 A 2 3 49826 CASAVA_Build 1 113833315 1I ACACCTTAGG -/C CCCCCCCCGA 2416 het 2416 ref 28 13 6 9 C 8 9 49827 CASAVA_Build 1 113847822 12D GTAAAGGAGG AAGGAAATGAAT/------------ AATCTTCAGA 3070 het 3070 ref 54 36 16 4 AAGGAAATGAAT 1 0 49828 CASAVA_Build 1 113850561 1D CTCATATCCC T/- TTTTTTTTTT 2071 het 2071 ref 31 20 6 5 T 13 12 49829 CASAVA_Build 1 113853507 8D TTTCTTTTTT TTTTTTTG/-------- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TTTTTTTG 1 0 49830 CASAVA_Build 1 113866265 1I TATTTATTTC -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 32 8 19 5 T 6 7 49831 CASAVA_Build 1 113874748 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1681 het 1681 ref 22 10 7 5 A 12 11 49832 CASAVA_Build 1 113875054 2D GAGCAAGCCC CT/-- GTCTCAAAAA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 CT 1 0 49833 CASAVA_Build 1 113886490 5D GACGGTATGG GAGTT/----- GAGTTCATTG 3070 het 3070 ref 59 26 25 9 GAGTT 2 1 49834 CASAVA_Build 1 113889473 2I AATGACCTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 10 22 8 T 10 12 49835 CASAVA_Build 1 113922157 1D GTGATGTTTA T/- TTCTCATGAT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 3 2 49836 CASAVA_Build 1 113923106 1D ATAATCTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 201 hom 47 1 35 11 T 9 8 49837 CASAVA_Build 1 113924478 2D AAAATAAGTC TG/-- TCTTTCACCA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 TG 1 0 49838 CASAVA_Build 1 113926616 1D TAGGTATCAA C/- ATTAATAGGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 0 49839 CASAVA_Build 1 113928673 1D TCAGAAAAAC T/- TTTAAAAATT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 4 3 49840 CASAVA_Build 1 113934546 1D GTATTTGGAA T/- TTTTTTAGAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 7 6 49841 CASAVA_Build 1 113938537 2I TTCAAACATC --/AT ATGTCTTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AT 1 2 49842 CASAVA_Build 1 113939674 2D ATCTATAAAA AG/-- AAATTAAACA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 AG 1 0 49843 CASAVA_Build 1 113940946 1D TGAGTATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 31 1 25 5 A 11 10 49844 CASAVA_Build 1 113944752 1D CCATGCTCAT G/- GGTAGGAAGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 3 2 49845 CASAVA_Build 1 113956625 1I AGGAAAAAAG -/A AATAAAATGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 2 3 49846 CASAVA_Build 1 113956781 1I AAAACCAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 8 9 49847 CASAVA_Build 1 113962311 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 25 3 18 4 A 12 11 49848 CASAVA_Build 1 113966493 1D GAACTATGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 11 hom 30 1 24 5 T 9 8 49849 CASAVA_Build 1 113982890 1I GCTAGGAGAA -/C CCACTGCTCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 2 3 49850 CASAVA_Build 1 113984335 1I ATATCATCTT -/A ACGCCAGTCA 2476 het 2476 ref 22 12 6 4 A 1 2 49851 CASAVA_Build 1 113994416 3I TAATTGTTCT ---/TGG TGGTATTTGT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 TGG 1 2 49852 CASAVA_Build 1 114016607 5D CTAGCACCCC TCTGA/----- TCTGATTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TCTGA 2 1 49853 CASAVA_Build 1 114023855 1D TGAAAAATGA T/- TTTTTTTTTT 1040 het 1040 ref 25 19 4 2 T 15 14 49854 CASAVA_Build 1 114028747 1I TACTTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 18 19 12 A 10 11 49855 CASAVA_Build 1 114030517 4D TTTAAAGATC ATTT/---- ATTTATTTAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 ATTT 3 2 49856 CASAVA_Build 1 114031968 1D CACAGTGAGA C/- CCCCATCTCA 3070 hom 44 het 18 0 15 3 C 5 4 49857 CASAVA_Build 1 114039167 1D CAGAGTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 25 5 A 11 10 49858 CASAVA_Build 1 114041843 1I CCAGGCATTT -/A ACTCAGCTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 49859 CASAVA_Build 1 114046791 1I CGGCTACCAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 8 9 49860 CASAVA_Build 1 114052108 1I ATAAGGGCCC -/A AGAGGCACAT 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 A 1 2 49861 CASAVA_Build 1 114068070 1I AACTCTATAG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 6 7 49862 CASAVA_Build 1 114084960 8D GAGGATACTT GAGGTCAA/-------- GAGTTTGAGA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 GAGGTCAA 1 0 49863 CASAVA_Build 1 114096676 15I CTCCCCAGTA ---------------/GCTGGGACTACAGGC GCCTGCAACC 2526 hom 15 het 6 0 6 0 GCTGGGACTACAGGC 0 1 49864 CASAVA_Build 1 114097572 1D TAGGTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 210 hom 31 1 15 16 T 13 12 49865 CASAVA_Build 1 114100042 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2276 het 1331 hom 12 5 7 0 A 11 10 49866 CASAVA_Build 1 114109013 5D GTGCCTGTTT GAAAA/----- GAAAATTTAA 3070 het 3070 ref 51 30 17 5 GAAAA 2 1 49867 CASAVA_Build 1 114112904 1I CACAGTTAAC -/A AAAACTCTGG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 4 5 49868 CASAVA_Build 1 114127603 1D GGCTGACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 18 11 A 11 10 49869 CASAVA_Build 1 114129174 14D TAATTCTTTG ACTCTTGTAATAAC/-------------- ACATAGTTTA 2747 het 2370 hom 15 7 7 3 ACTCTTGTAATAAC 1 0 49870 CASAVA_Build 1 114129271 1I ACTTAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 10 11 49871 CASAVA_Build 1 114137823 1D CTAAGAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 13 12 49872 CASAVA_Build 1 114141480 4I TCGTATTTAC ----/TAAA TAATTTTTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAAA 0 1 49873 CASAVA_Build 1 114147889 1I GTCCCAGCTC -/T TATTGTTTAC 3070 het 3070 ref 36 19 17 0 T 1 2 49874 CASAVA_Build 1 114173856 1D TGCATACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 A 12 11 49875 CASAVA_Build 1 114176201 3I AGGGATTCTA ---/TTC TTCTTTTATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTC 1 2 49876 CASAVA_Build 1 114180086 1I TATTAATTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 50 het 25 0 16 9 T 9 10 49877 CASAVA_Build 1 114184045 1I CTTAGGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 10 11 49878 CASAVA_Build 1 114201719 1I TTCTTAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 A 10 11 49879 CASAVA_Build 1 114208538 1I CTGTCTCCAG -/A AAAAAAAAAA 2001 het 2001 ref 31 14 6 11 A 13 14 49880 CASAVA_Build 1 114209567 1D TTTCATGGGT A/- AAAATGAACA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 5 4 49881 CASAVA_Build 1 114213544 1D ATAGTCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 T 13 12 49882 CASAVA_Build 1 114216290 4D ACACTGTTTA GAGT/---- GAGTGACATG 3070 het 3070 ref 55 27 21 9 GAGT 2 1 49883 CASAVA_Build 1 114221484 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAACA 1603 het 1603 ref 40 16 6 18 A 8 9 49884 CASAVA_Build 1 114227114 3D TTAATAATAA AAT/--- AATAATAATT 3070 het 3070 hom 23 10 12 2 AAT 4 3 49885 CASAVA_Build 1 114228875 1D TCAAAATATA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 9 8 49886 CASAVA_Build 1 114243879 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 12 26 7 A 9 10 49887 CASAVA_Build 1 114323057 1I TTTCTGTATT -/A ATCATGAGAG 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 A 1 2 49888 CASAVA_Build 1 114339615 1I GCACCAAGAG -/A AAAAGCATCA 3070 het 3070 hom 38 17 14 7 A 4 5 49889 CASAVA_Build 1 114352563 1I TAAAGTTGGA -/G TGCCCTAAAT 3070 het 2141 hom 18 5 8 5 G 0 1 49890 CASAVA_Build 1 114354168 1I TTGTGTCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 7 14 5 T 9 10 49891 CASAVA_Build 1 114389484 1D CTGAAAACAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 9 8 49892 CASAVA_Build 1 114394963 1I GTGCTGTCTA -/T TTGAGTGGAT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 2 3 49893 CASAVA_Build 1 114395236 1D TGGCTGAGCT C/- AGGCGTTTGA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 C 1 0 49894 CASAVA_Build 1 114397250 2I TGAGCAACTA --/AC AGCTCATCTT 3070 hom 99 het 36 0 32 4 AC 0 1 49895 CASAVA_Build 1 114399716 2D CTCAAGAAGA CT/-- CTGTCTTGTT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 CT 2 1 49896 CASAVA_Build 1 114435891 1I TTTCCTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 652 hom 35 2 21 12 T 11 12 49897 CASAVA_Build 1 114448812 4I GATGAGGCCC ----/TCCA TCCATCCATC 3070 het 3070 hom 49 16 22 11 TCCA 4 5 49898 CASAVA_Build 1 114449454 1I CAGCCCTGTT -/C CCCCCCCTGG 3070 het 3070 ref 35 14 10 11 C 7 8 49899 CASAVA_Build 1 114449601 1I AAAAAAGTCA -/C CCCCCCAAAT 2989 hom 36 het 16 0 10 6 C 6 7 49900 CASAVA_Build 1 114453157 1D TGGGAGGGTA G/- GGGGGCTGGA 3070 het 2884 hom 35 12 14 9 G 6 5 49901 CASAVA_Build 1 114455880 3D16M8D8M1I CCGAGAGGAA CCCGGCAGGATGTGCTAAACTGCCGGGTGAGGGGC-/---GTAATAATATCTTACA--------TGGGTTGCT TGCAGGAGGA 402 het 402 ref 35 24 4 12 N/A 0 0 49902 CASAVA_Build 1 114460205 1I ACTTAGAATA -/T TTACCTCCCT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 2 3 49903 CASAVA_Build 1 114479656 9D TGATACTAGT TGAGGATGA/--------- TGAGGATGAT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 TGAGGATGA 2 1 49904 CASAVA_Build 1 114493429 7D GACGTGGCCC ATTAATA/------- ATTAATAATA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 ATTAATA 2 1 49905 CASAVA_Build 1 114515530 36D TGGTATCCAA TGATACCAATGGTACCAATGGTATCATTGGTATCAT/------------------------------------ TGATACCAAT 3070 het 3070 ref 58 40 19 13 TGATACCAATGGTACCAATGGTATCATTGGTATCAT 1 0 49906 CASAVA_Build 1 114535236 1D GGGGTAGGGA G/- GGAAGGCCTC 3070 hom 113 het 46 0 38 8 G 3 2 49907 CASAVA_Build 1 114537822 1D ATTTTTGGTT A/- AAAGTCAAGT 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 A 4 3 49908 CASAVA_Build 1 114545448 1D TTACCACTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 10 9 49909 CASAVA_Build 1 114554513 1D CTGAAAATAT G/- GTTCCTTGAA 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 G 2 1 49910 CASAVA_Build 1 114611557 1I TCTCTCTCTC -/A GGACATGTGT 3070 het 3070 hom 57 22 28 7 A 0 1 49911 CASAVA_Build 1 114627435 1D TAATCAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2696 hom 45 12 25 8 T 17 16 49912 CASAVA_Build 1 114633907 1I GATAGGCACT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 9 10 49913 CASAVA_Build 1 114642044 1D CTCCCTGGCA G/- GGGGCTCAGT 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 G 5 4 49914 CASAVA_Build 1 114642713 1I CTTCATTAGA -/T TTTTCAGAAG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 4 5 49915 CASAVA_Build 1 114643314 1D TCTCTGAAAA C/- AGTGAGAAAT 3070 hom 120 het 41 0 41 1 C 1 0 49916 CASAVA_Build 1 114658318 9I TGGGAATTGT ---------/GGGAGCTAC AATTCAAGAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 GGGAGCTAC 0 1 49917 CASAVA_Build 1 114659508 3D AAGGAACTTA AGG/--- AGGTCAGAGC 3070 hom 27 het 10 0 10 1 AGG 2 1 49918 CASAVA_Build 1 114730834 4I GACATTAGGG ----/GTTA GTTATTTCAT 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 GTTA 1 2 49919 CASAVA_Build 1 114739614 1I TTATCTACAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 7 8 49920 CASAVA_Build 1 114741254 1I TAAAAATGAG -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 6 7 49921 CASAVA_Build 1 114742156 1D TACCAGAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 38 3 28 7 A 12 11 49922 CASAVA_Build 1 114754924 1D CCCTTACTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 A 10 9 49923 CASAVA_Build 1 114758545 1I CTCTACAGAA -/C CTAGGCCCTT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 C 1 2 49924 CASAVA_Build 1 114765497 1D ATCCTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 12 11 49925 CASAVA_Build 1 114766641 1I CTTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 10 11 49926 CASAVA_Build 1 114796225 5I ACACTTCTAA -----/AGAAT AGAATAAATG 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 AGAAT 1 2 49927 CASAVA_Build 1 114803865 2D CCTGAGCAAC AG/-- AGTGAGATCC 3070 het 3070 ref 41 20 17 7 AG 2 1 49928 CASAVA_Build 1 114807754 1D ATCTAGATCT A/- AAAAAAAAAA 2917 het 2379 hom 26 8 11 7 A 15 14 49929 CASAVA_Build 1 114819835 3I TCAAAATAAA ---/AAT AATAAATGTT 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 AAT 1 2 49930 CASAVA_Build 1 114824667 1D GCCCCGCCTT A/- AAAAAAAAAA 1606 het 1606 ref 20 9 8 3 A 15 14 49931 CASAVA_Build 1 114829450 1I AAAAATACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 10 11 49932 CASAVA_Build 1 114845509 1I AGCTGGCAAG -/T TTGGTGCTGG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 2 3 49933 CASAVA_Build 1 114845967 3I TAAATAGCAT ---/ATA ATAAGCATTC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 ATA 1 2 49934 CASAVA_Build 1 114850146 1I AATCATATAA -/C CTAACGGGAT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 C 1 2 49935 CASAVA_Build 1 114856524 1D TTTTTATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 A 13 12 49936 CASAVA_Build 1 114860245 2D CCATCTCTAC AA/-- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 8 6 49937 CASAVA_Build 1 114867924 1D GTCATAATTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 8 7 49938 CASAVA_Build 1 114871456 1D TTATTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 27 0 18 9 T 13 12 49939 CASAVA_Build 1 114872457 1D AATTTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2037 hom 23 6 14 3 A 13 12 49940 CASAVA_Build 1 114901041 1D AGCACTACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2615 hom 22 6 12 4 A 10 9 49941 CASAVA_Build 1 114917484 1D ATGCCCCATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 17 16 8 T 9 8 49942 CASAVA_Build 1 114927980 2I CCGAAACAAA --/AC ACACACACAC 832 het 832 ref 15 8 4 3 AC 8 9 49943 CASAVA_Build 1 114940895 1D AAATAAAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2104 hom 25 10 12 4 T 9 8 49944 CASAVA_Build 1 114955552 1I CAGTTTTAAG -/A AGTCTAGTTC 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 1 2 49945 CASAVA_Build 1 114967874 4D ATTTGTTTGA TTGT/---- TTGTTTTATT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TTGT 2 1 49946 CASAVA_Build 1 114968613 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 9 10 49947 CASAVA_Build 1 114968769 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 19 1 12 6 T 15 14 49948 CASAVA_Build 1 114971727 9D AGTCTGACGC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 8 A 20 11 49949 CASAVA_Build 1 114977164 2D AGAAGATGAC TT/-- GACTAAAGTA 3070 het 3070 hom 37 17 19 5 T 2 0 49950 CASAVA_Build 1 114979525 1I TCAATGAAAC -/A AAAAAACTGC 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 A 6 7 49951 CASAVA_Build 1 114982907 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1880 het 809 hom 16 5 6 5 A 17 16 49952 CASAVA_Build 1 114985405 1D ATCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 464 hom 23 1 13 9 A 17 16 49953 CASAVA_Build 1 114987995 1I TAGCTGACAT -/A ATGCAGATTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 2 49954 CASAVA_Build 1 115004108 1I CTAATTTTTT -/G TATTTTTAGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 49955 CASAVA_Build 1 115006156 5D TACACTCATG ATTAA/----- ATTGACCATC 3070 het 3070 ref 41 20 19 4 ATTAA 1 0 49956 CASAVA_Build 1 115006786 1D GATTCATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 13 12 49957 CASAVA_Build 1 115009083 1D CCAAAAATAC A/- AAAAATTACC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 6 5 49958 CASAVA_Build 1 115015266 1D TTCCCCCACC A/- AAAAAAAAAA 1127 het 1127 ref 34 20 3 12 A 13 12 49959 CASAVA_Build 1 115025671 3I CCTAGGAGAT ---/GGA GGAGGTTGCA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 GGA 1 2 49960 CASAVA_Build 1 115035510 1I CTTTGGAGCC -/T TGGGCAACAT 3070 het 2368 hom 28 6 17 5 T 1 2 49961 CASAVA_Build 1 115039540 1D GTTGCTTGTC A/- AAAAAAAAAA 2766 het 613 hom 33 4 14 15 A 15 14 49962 CASAVA_Build 1 115049273 1D CTGGAATGGT A/- AAAAAACCCC 3070 het 3070 ref 29 19 8 3 A 7 6 49963 CASAVA_Build 1 115067759 3D TTATCAGAGT TTG/--- TTGTTAAGTC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 TTG 2 1 49964 CASAVA_Build 1 115069787 1D TTACTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 239 hom 36 1 28 7 T 11 10 49965 CASAVA_Build 1 115078502 1D GATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2013 het 2013 ref 21 8 6 7 A 11 10 49966 CASAVA_Build 1 115079930 3D CCAAGATAAA AAT/--- AATATTCTCC 3070 het 3070 hom 55 23 26 8 AAT 2 1 49967 CASAVA_Build 1 115088907 1I ACTCAAACCT -/A GGGGGAAAAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 0 1 49968 CASAVA_Build 1 115093440 4D TTAGTATCTT ATTC/---- ATTCGTTATA 3070 het 3070 hom 57 25 26 9 ATTC 2 1 49969 CASAVA_Build 1 115095628 4D AGTTATTTAA TCTC/---- TCTAAGTTTC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 TC 3 1 49970 CASAVA_Build 1 115103620 1I TCAGATGGAG -/T TTCACTCGTG 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 T 2 3 49971 CASAVA_Build 1 115114552 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 7 8 49972 CASAVA_Build 1 115120793 1I TTCACGGATA -/T TTTTTTTTTT 2788 het 1356 hom 21 7 9 5 T 13 14 49973 CASAVA_Build 1 115145650 1D GGGTGTTAGA G/- GTGAGACCCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 2 1 49974 CASAVA_Build 1 115147735 1D ATTAAATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 16 2 A 10 9 49975 CASAVA_Build 1 115161107 3D CATTAATGAG GAT/--- GATGATAATG 3070 het 3070 ref 49 27 20 5 GAT 3 2 49976 CASAVA_Build 1 115163580 3I CATGGTGCTC ---/ATT ATTACATGTT 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 ATT 1 2 49977 CASAVA_Build 1 115169529 1I CCAATAGGCG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 8 9 49978 CASAVA_Build 1 115173284 1I AAGAGATTAA -/T TTTTTTTTTT 3036 het 3036 ref 28 13 8 7 T 13 14 49979 CASAVA_Build 1 115173454 1D ATTTTTGTGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 9 8 49980 CASAVA_Build 1 115180531 1I ACAGTTAACC -/T TTTTTTTTTT 1653 het 861 hom 32 6 6 20 T 17 18 49981 CASAVA_Build 1 115199474 1D CGTGGATTCC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 2768 hom 30 10 14 6 T 9 8 49982 CASAVA_Build 1 115199568 1D TCCCCTCCCG C/- CCCCCCGGGG 3070 hom 30 het 26 0 13 13 C 7 6 49983 CASAVA_Build 1 115211047 1I GTCCAGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 T 13 14 49984 CASAVA_Build 1 115239186 1I GGGAATGTTG -/A AATCCAAAGT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 2 3 49985 CASAVA_Build 1 115252326 1D TCTGGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2446 hom 26 8 11 8 T 15 14 49986 CASAVA_Build 1 115271350 5I ATTAAAAATT -----/AAGTC AAGTAAGGAT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 AAGTC 0 1 49987 CASAVA_Build 1 115272443 1D AGGCAGACAG A/- AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 53 24 26 4 A 7 6 49988 CASAVA_Build 1 115289936 3I AATAATTTTT ---/TTA TTATTATACT 3070 het 3070 hom 24 8 14 3 TTA 2 3 49989 CASAVA_Build 1 115294988 7D TTGAGACAGA GTCTCAC/------- GTCTCACTCT 3070 het 1014 hom 18 5 9 5 GTCTCAC 2 1 49990 CASAVA_Build 1 115298203 3D TAGACATTTG TTC/--- TTATTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 TTC 1 0 49991 CASAVA_Build 1 115320723 6D CTAGAAGCCA AGATAC/------ ATATTCTGAG 3070 het 3070 ref 37 14 15 9 AGATAC 1 0 49992 CASAVA_Build 1 115333559 1D GAAAATAAGA C/- AGTAATGGAG 3070 het 3070 ref 44 19 18 8 C 1 0 49993 CASAVA_Build 1 115338140 1D TTTGTGACCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 14 26 2 T 10 9 49994 CASAVA_Build 1 115349887 2I TGAGACAGAG --/TC TCTCACTCTG 1726 het 1726 ref 25 12 6 7 TC 2 3 49995 CASAVA_Build 1 115350308 1I GGGAAATGCA -/C CAATCCCCAA 2343 het 2343 ref 47 40 5 2 C 1 2 49996 CASAVA_Build 1 115373448 2I CATGTTCCTC --/AG AGAGTCATTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AG 2 3 49997 CASAVA_Build 1 115384646 2D AATTTGGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 33 2 13 18 A 14 12 49998 CASAVA_Build 1 115388232 1I TTTTGCCAAT -/A AAATAGATCA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 3 4 49999 CASAVA_Build 1 115392444 4I TATGTGTGTC ----/TATT TATACAGATA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TATT 0 1 50000 CASAVA_Build 1 115394134 2D CCCAACTTAG AC/-- ACAGTCAGTT 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 AC 2 1 50001 CASAVA_Build 1 115399473 1I GGAAAAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 616 hom 26 2 20 4 T 13 14 50002 CASAVA_Build 1 115399550 1I TTACACACAC -/A AAACACACCT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 3 4 50003 CASAVA_Build 1 115403426 1I CTGTAGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 119 hom 41 1 34 6 A 9 10 50004 CASAVA_Build 1 115410824 1I CTAATGACCA -/T TTTTTTTATT 2846 het 2846 ref 36 19 9 8 T 7 8 50005 CASAVA_Build 1 115417671 8I ACCCACCCAC --------/ACCTCGTG ACCTCGTGAG 3070 het 3070 hom 40 15 13 12 ACCTCGTG 1 2 50006 CASAVA_Build 1 115420172 1D GGTAGATAGT C/- ACATAAAGTA 3070 het 3070 ref 53 23 20 10 C 1 0 50007 CASAVA_Build 1 115432924 4I CTCACCCAGG ----/GGTA GGTACTCTTA 3070 het 3070 hom 34 19 14 1 GGTA 1 2 50008 CASAVA_Build 1 115433169 10I GGAACAGGGA ----------/CCGCCAGGGC CCCAAGTCCT 3070 hom 81 het 28 0 25 3 CCGCCAGGGC 0 1 50009 CASAVA_Build 1 115434897 1I GAAGGCAGGA -/G GCCAAATCAC 3070 hom 141 het 54 0 47 7 G 1 2 50010 CASAVA_Build 1 115439057 2D14M4I TCTTCAATTT TATTTTTTTATTATAA----/--TTTTTTTATTATAATTTT TTTTTTTTTT 1294 het 1294 ref 16 8 4 5 N/A 0 0 50011 CASAVA_Build 1 115439238 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1525 hom 20 4 11 5 T 9 10 50012 CASAVA_Build 1 115441613 2D GCATGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1562 het 1562 ref 16 6 5 5 T 12 10 50013 CASAVA_Build 1 115446954 1I TATGTTTGGC -/T TTAAGTCCTT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 2 3 50014 CASAVA_Build 1 115448970 1I CTCACCCAGC -/T TCTAAAGATC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 1 2 50015 CASAVA_Build 1 115467088 1D AGTGTTTATT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 A 8 7 50016 CASAVA_Build 1 115487075 1D CCATTTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 11 10 50017 CASAVA_Build 1 115498459 1D CCAGCAGGGT A/- AACCCTACCT 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 A 3 2 50018 CASAVA_Build 1 115500516 1D TAAGGGGAAC A/- GAAACAGATC 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 A 1 0 50019 CASAVA_Build 1 115501984 1D GCCACTTTTT G/- TTTTACTTAA 3070 het 3070 ref 45 19 22 4 G 1 0 50020 CASAVA_Build 1 115511386 3D AGCCCATGTT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 78 het 32 0 25 8 AAC 5 4 50021 CASAVA_Build 1 115517332 3I CTTCCATCCT ---/CTC CTCCTCCTCC 3070 het 3070 hom 39 13 13 13 CTC 5 6 50022 CASAVA_Build 1 115519703 1D CCAGTCTTCT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 15 het 34 0 19 16 G 11 10 50023 CASAVA_Build 1 115520440 1D ACTTCTATTA C/- CCCCCCCTCC 3070 hom 95 het 38 0 31 8 C 8 7 50024 CASAVA_Build 1 115546332 3D TTCTGCACAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3032 hom 33 12 16 5 A 15 12 50025 CASAVA_Build 1 115555843 1D AAGCAATAAT A/- AATATTTGTA 3070 het 3070 hom 30 8 20 2 A 3 2 50026 CASAVA_Build 1 115557051 3D TTCTTCTCTC TCT/--- TACCAAGATC 3070 het 3070 ref 53 28 17 8 TCT 1 0 50027 CASAVA_Build 1 115562703 4D GACAGAAAAG AGAA/---- AGAAGCGTAG 3070 het 3070 ref 37 21 14 4 AGAA 2 1 50028 CASAVA_Build 1 115582807 1D CCTCTGAACC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 T 9 8 50029 CASAVA_Build 1 115597511 1D AATGTGGAAC A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 59 23 32 4 A 8 7 50030 CASAVA_Build 1 115608068 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1617 het 1617 ref 30 18 5 7 A 17 16 50031 CASAVA_Build 1 115613263 1D GATAGTGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 T 10 9 50032 CASAVA_Build 1 115614684 2D CACTGAAGCA CT/-- CTCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 65 28 30 7 CT 3 2 50033 CASAVA_Build 1 115615824 1D CTGGCTTTTT A/- TATAAGGGCA 3070 het 3070 hom 45 22 21 3 A 1 0 50034 CASAVA_Build 1 115674875 5D TCGGTGACTT CACTC/----- CAAGCAATGT 3070 hom 101 het 38 0 33 8 CACTC 1 0 50035 CASAVA_Build 1 115677905 2I44M4I TCCCTCCCCC --CTCTCTCTCTTTCTTCATTCCTTCCTTTCTTTTCTTTCTTTCTT----/CTCTCTCTCTCTTTCTTCATTCCTTCCTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTC TCTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 15 11 10 N/A 0 0 50036 CASAVA_Build 1 115679794 1D CAAAGGTCTC T/- TAAGGCTTGC 3070 het 3070 ref 53 31 18 4 T 2 1 50037 CASAVA_Build 1 115689906 13D CTAGCAAATA GCTAACCTAGTCT/------------- GTATCTATAT 3070 het 3070 hom 31 10 20 4 GCTAACCTAGTCT 1 0 50038 CASAVA_Build 1 115735315 5D GGAATGATTA ATGTT/----- ATGTTATTAC 3070 het 3070 hom 49 22 23 6 ATGTT 2 1 50039 CASAVA_Build 1 115736691 1D AAAATACTTT G/- GCATAAAAGC 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 G 2 1 50040 CASAVA_Build 1 115751352 1I GCCCACAGAG -/A AATGGGAGAA 3070 het 29 hom 30 1 24 5 A 2 3 50041 CASAVA_Build 1 115752077 4I CTGGCTGTCA ----/AAAG AAAGCTGCTT 3070 het 3070 ref 57 30 20 7 AAAG 1 2 50042 CASAVA_Build 1 115753155 1I ACCACCAGGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 A 8 9 50043 CASAVA_Build 1 115769989 1D CACCAATTGC T/- CTTGGATTGG 3070 het 3070 hom 58 27 27 4 T 1 0 50044 CASAVA_Build 1 115782433 1I TCACCAGCGA -/T TTTTTTTTTT 2221 het 1878 hom 22 6 8 8 T 13 14 50045 CASAVA_Build 1 115788871 1I ACTCACCTCT -/C AGAGAAACAC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 C 0 1 50046 CASAVA_Build 1 115791853 1D AGAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1589 hom 25 6 11 8 A 13 12 50047 CASAVA_Build 1 115797691 2D TTCCTCATGC AG/-- AGTTTTACTT 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 AG 2 1 50048 CASAVA_Build 1 115806637 1D TTCAGTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 8 12 T 13 12 50049 CASAVA_Build 1 115816995 1I GGGGAAGGTG -/C CCCTCTGGCC 2358 het 2358 ref 36 20 8 8 C 3 4 50050 CASAVA_Build 1 115820340 1I TCCCATGCCT -/A ATTAAAGCAG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 1 2 50051 CASAVA_Build 1 115834084 8D TAAAAAGGAA TGAGCTAT/-------- TGAGCTATCA 3070 hom 89 het 37 0 30 8 TGAGCTAT 2 1 50052 CASAVA_Build 1 115873861 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 2101 het 2101 ref 63 45 6 14 AC 8 7 50053 CASAVA_Build 1 115883049 1D CAATATAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 T 11 10 50054 CASAVA_Build 1 115883229 5D AGTTGCCAAG GGTGA/----- GGCTTATAAG 3070 hom 120 het 43 0 39 5 GGTGA 1 0 50055 CASAVA_Build 1 115884548 2D CCTCTGTAAC TG/-- TGGAATGTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 3 TG 2 1 50056 CASAVA_Build 1 115888714 1I TATATATATT -/A AAAAAATTAG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 6 7 50057 CASAVA_Build 1 115893540 1I CACAGAAGGA -/G GGGGGGCCTG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 6 7 50058 CASAVA_Build 1 115898716 3D TGGGTCTAGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 TTG 7 6 50059 CASAVA_Build 1 115904231 20D2M1I4M1I8M10D ACCAGAAGCC AGAGGACAAGAGACCCCCAGTA-GTGT-GCTACGTAATGACACGCG/--------------------TACGTGTCATTACGTA---------- GCCTGATGCG 3070 hom 114 het 31 0 34 8 N/A 0 0 50060 CASAVA_Build 1 115905814 2I ATGTAATTCT --/CA GTGTCGGAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CA 0 1 50061 CASAVA_Build 1 115906555 1D GGTTCCCTTT C/- CACCTTCAGC 3070 hom 114 het 41 0 36 5 C 2 1 50062 CASAVA_Build 1 115912679 47D TAATAGGAAT GTAACTTGGTATAGCCATAATGGAAAAAATATAGAGGTTTCCTAAAA/----------------------------------------------- GTAACTTGGT 3070 hom 24 het 23 0 9 17 GTAACTTGGTATAGCCATAATGGAAAAAATATAGAGGTTTCCTAAAA 2 1 50063 CASAVA_Build 1 115919200 1D CTTTACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 720 hom 38 2 32 4 T 12 11 50064 CASAVA_Build 1 115926313 4I CGGTCTTGAC ----/TCTT TATCCAATTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TCTT 0 1 50065 CASAVA_Build 1 115926951 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 9 8 50066 CASAVA_Build 1 115931281 5D AATGTACAGG TATCA/----- CAGGTGATGT 3070 hom 102 het 38 0 34 7 TATCA 1 0 50067 CASAVA_Build 1 115931979 3D CCCCAACTCC CTT/--- CTTAAGTTTT 3070 hom 95 het 38 0 30 9 CTT 2 1 50068 CASAVA_Build 1 115932683 1D CTGGAAAAGA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 9 8 50069 CASAVA_Build 1 115945677 1D TGTCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 24 0 15 10 A 14 13 50070 CASAVA_Build 1 115965534 15I TACCCATGAC ---------------/TTACTGATGCCCTGT TCACTTTTCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTACTGATGCCCTGT 0 1 50071 CASAVA_Build 1 115969882 2I CAACTGCTTT --/TA TTTTTTTATT 3070 het 1307 hom 16 3 13 0 TA 0 1 50072 CASAVA_Build 1 115990170 3D CACTGTCATT ATC/--- ATAACATATT 3070 het 3070 ref 51 26 24 2 ATC 1 0 50073 CASAVA_Build 1 115991358 1I TCAGTATGAT -/A AGACAGTTCC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 1 2 50074 CASAVA_Build 1 116006367 1D TAAATCATGG T/- TTTTTTGGTC 3070 het 3070 ref 55 28 22 6 T 7 6 50075 CASAVA_Build 1 116013778 10D CTTCGTTGTC TGTAAGATGT/---------- GCCATGTAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 4 TGTAAGATGT 1 0 50076 CASAVA_Build 1 116019091 2D TGTGTACGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 23 19 10 TG 7 6 50077 CASAVA_Build 1 116022925 1I CATGGTGAGA -/C CCCCGTCCTT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 C 4 5 50078 CASAVA_Build 1 116024905 5D TTCCAGTGGA TAGTT/----- TAGGAGCTCC 3070 het 3070 ref 48 24 18 9 TAGTT 1 0 50079 CASAVA_Build 1 116025513 1I GCAGGGGATA -/G GTTGGAGACC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 1 2 50080 CASAVA_Build 1 116036706 1D TAAAGTGGGG A/- GAAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 1 0 50081 CASAVA_Build 1 116044261 2D TGTCTTACAC AT/-- GTGCTAAAAG 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 AT 1 0 50082 CASAVA_Build 1 116044368 1D CACTTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2989 hom 36 10 18 8 T 13 12 50083 CASAVA_Build 1 116053337 1D ACAAGTTCAA T/- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 51 24 21 6 T 7 6 50084 CASAVA_Build 1 116063420 1I TTACACAAAT -/C CGACAGCAAC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 C 1 2 50085 CASAVA_Build 1 116083208 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 601 hom 20 3 12 6 A 13 12 50086 CASAVA_Build 1 116088127 2D ATAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2217 het 47 hom 14 2 7 5 A 12 10 50087 CASAVA_Build 1 116089521 1D TTCCCCCACT C/- CTGGGCTTGT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 C 2 1 50088 CASAVA_Build 1 116090306 1I CGATACGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 18 10 25 T 11 12 50089 CASAVA_Build 1 116091988 11D GTTCTAAGAG GTTTTTGTTTT/----------- GTAGATTCCT 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 GTTTTTGTTTT 1 0 50090 CASAVA_Build 1 116095816 4D CCTCCATCTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 14 10 50091 CASAVA_Build 1 116097649 1I GACAGAAGCC -/A AAGCACTGGG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 2 3 50092 CASAVA_Build 1 116113000 2D TCTGCTCAGC CT/-- CTGTCTCATT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 CT 2 1 50093 CASAVA_Build 1 116116910 1I CCAGCTACTC -/G GGAGGCTAAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 2 3 50094 CASAVA_Build 1 116123104 1D TTCTCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 13 12 50095 CASAVA_Build 1 116128320 1D GAGGGATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 12 11 50096 CASAVA_Build 1 116132048 1I GATTAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 40 hom 29 1 24 4 A 9 10 50097 CASAVA_Build 1 116134880 1I CTGGATCAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 9 10 50098 CASAVA_Build 1 116151017 1D ATTCTGTACC T/- TTTTTTTTTA 1251 het 1251 ref 43 37 3 3 T 10 9 50099 CASAVA_Build 1 116152776 2D TTCCTTTCTT TC/-- TTTCTTTCTT 110 het 4 hom 11 0 1 10 TC 1 0 50100 CASAVA_Build 1 116159227 4D ATTCATGGTG CAAA/---- CAAACATTGG 3070 het 3070 ref 31 14 15 5 CAAA 2 1 50101 CASAVA_Build 1 116160563 1D CTTAATAATC T/- TTTTTTTTTT 2389 het 1348 hom 36 8 11 17 T 17 16 50102 CASAVA_Build 1 116166271 1D TGGTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 29 0 25 4 A 11 10 50103 CASAVA_Build 1 116166763 1D CTGCTAAATA T/- TTTGTTACAT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 4 3 50104 CASAVA_Build 1 116175831 1D GAAAGGCCTA G/- GGGGGGGCGG 2505 hom 25 het 11 0 6 6 G 8 7 50105 CASAVA_Build 1 116189141 10D ATGATATACA AAAGATAAGC/---------- AAAGATATGA 151 het 151 ref 15 6 3 7 AAAGATAAGC 1 0 50106 CASAVA_Build 1 116198825 1I GTCTGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2479 hom 28 9 14 5 T 11 12 50107 CASAVA_Build 1 116207479 12D3M2D CACTGAGGAC GTCAGGGAGCAGTCAGG/------------CCA-- CTGGGAGCTG 3070 het 3070 hom 45 21 23 2 N/A 0 0 50108 CASAVA_Build 1 116211408 6D TAATCATGTA TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 45 het 29 0 16 14 TC 12 9 50109 CASAVA_Build 1 116211600 3I AAAAAAAAAA ---/AAC ACTTACCAAC 3070 hom 85 het 35 0 29 6 AAC 0 1 50110 CASAVA_Build 1 116218365 2D ACTCCATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 14 12 50111 CASAVA_Build 1 116218715 1D TTTCTTGCTG T/- TTTTATCAGC 3070 hom 151 het 52 0 51 1 T 5 4 50112 CASAVA_Build 1 116221048 1D CTAGGCAAGG T/- TTTGTGAAGC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 4 3 50113 CASAVA_Build 1 116227112 1D GTTTTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 A 15 14 50114 CASAVA_Build 1 116235629 4D GCTGAGCAGC AAAA/---- AAAAAAAAAC 3070 het 489 hom 38 6 18 18 A 13 9 50115 CASAVA_Build 1 116236536 7D CTGAGAAGGA GATAACC/------- GAATACTCCT 3070 het 3070 ref 33 18 13 6 GATAACC 1 0 50116 CASAVA_Build 1 116238733 4D ATAATGATAT AAAG/---- AAAGAAAATT 2747 het 2460 hom 11 5 6 1 AAAG 2 1 50117 CASAVA_Build 1 116239713 3I ACTGCTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 54 het 27 0 19 8 TTG 3 4 50118 CASAVA_Build 1 116244373 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2575 het 2575 ref 26 14 9 3 A 11 10 50119 CASAVA_Build 1 116261086 21D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/--------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 12 6 T 32 11 50120 CASAVA_Build 1 116267059 1I ATCTGCTGCC -/T TTTTTTTTTA 2504 het 2504 ref 27 11 8 8 T 9 10 50121 CASAVA_Build 1 116269999 1D TGACCAGAAA T/- TCAGAAATCT 3070 hom 90 het 36 0 31 7 T 2 1 50122 CASAVA_Build 1 116270312 23D TCCGGGAATC ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA/----------------------- GATGGAGTCT 2297 het 2297 ref 17 8 7 3 ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 1 0 50123 CASAVA_Build 1 116282472 1D ACCAAGCATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 9 50124 CASAVA_Build 1 116284153 1D TTACTGAGAC T/- TTTTGCTTCT 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 T 5 4 50125 CASAVA_Build 1 116285684 3D CACTGGACTC CTA/--- CTGCAAGTGG 3070 het 3070 ref 58 28 22 10 CTA 1 0 50126 CASAVA_Build 1 116309639 12I40M1I GGATGCAGTG ------------ATGCAAGTCAGTAAATGTGGTACACCACATAAACAGAATT-/ATGGTTTAATATATGCAAGTCAGTAAATGTGGTACACCACATAAACAGAATTA AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 32 28 11 10 N/A 0 0 50127 CASAVA_Build 1 116313480 6I ACTGACCAAA ------/TAAAGT TAATTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TAAAGT 0 1 50128 CASAVA_Build 1 116318094 2D AGATACTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 22 0 11 12 A 16 14 50129 CASAVA_Build 1 116319980 1I CCTGCCACGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 T 11 12 50130 CASAVA_Build 1 116333926 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 27 1 20 6 A 13 14 50131 CASAVA_Build 1 116340832 21D TTTTTATATG TTAATCTTGTATCCTTTGATC/--------------------- TTAATCTTGT 2758 het 2758 ref 21 20 7 3 TTAATCTTGTATCCTTTGATC 1 0 50132 CASAVA_Build 1 116342119 1D CTATACCCAG T/- TTTTTTGCAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 7 6 50133 CASAVA_Build 1 116344770 7D TTTTTTTTCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1760 het 253 hom 16 3 6 8 T 23 16 50134 CASAVA_Build 1 116356567 1D CCTTAAAAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 A 8 7 50135 CASAVA_Build 1 116362746 3I3M10D CCTAACCTTG ---TGATCTGCCCCCC/TCTTGA---------- TCAGCCTCTT 3070 het 3070 ref 21 11 10 2 N/A 0 0 50136 CASAVA_Build 1 116366552 1D CACTCTCTCC T/- TTGATTTCAG 3070 het 3070 ref 46 22 17 8 T 3 2 50137 CASAVA_Build 1 116386244 1D TAACATTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 39 1 29 9 A 12 11 50138 CASAVA_Build 1 116390015 1D GGTCAATTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 T 10 9 50139 CASAVA_Build 1 116410650 1D TCATTCCACT C/- CCCGCCTCTG 3070 hom 65 het 29 0 23 6 C 4 3 50140 CASAVA_Build 1 116412123 1I CACCTGGAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 A 8 9 50141 CASAVA_Build 1 116415445 1D GGCCTCAATG A/- AAAACAGCAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 5 4 50142 CASAVA_Build 1 116417865 1I ACACACACAC -/A CCCCCCCCAT 3070 hom 106 het 40 0 34 6 A 0 1 50143 CASAVA_Build 1 116428272 5I AATATTTTTG -----/TTCTT TTCTTTTATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTCTT 1 2 50144 CASAVA_Build 1 116430733 1D GATGTTGAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 49 0 38 11 T 10 9 50145 CASAVA_Build 1 116437839 1I TTCTAGGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 548 hom 34 3 25 6 T 14 15 50146 CASAVA_Build 1 116459562 1D TATTAGCCCC T/- GAAAGACAGA 3070 het 3070 ref 45 29 13 3 T 1 0 50147 CASAVA_Build 1 116465775 2I GTTGAAAGTC --/AT AGTCTGTGGG 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 AT 0 1 50148 CASAVA_Build 1 116469168 1D GATAATTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 12 11 50149 CASAVA_Build 1 116473382 1I TGGGCAGTCA -/G GGGGGCCTCC 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 G 5 6 50150 CASAVA_Build 1 116478246 1D GTAAGTCAAA G/- ATGAAAGTAC 3070 het 3070 ref 49 23 22 6 G 1 0 50151 CASAVA_Build 1 116482673 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 A 10 9 50152 CASAVA_Build 1 116487252 1D AAACTCTTGT A/- AACATTTTGC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 3 2 50153 CASAVA_Build 1 116488271 1I CCTCTTTCTC -/T TTTTTTTTGG 2464 het 2464 ref 23 14 7 2 T 8 9 50154 CASAVA_Build 1 116494370 3I TCCAGGTAGG ---/CCT CCTCATACCC 3070 hom 95 het 35 0 30 5 CCT 1 2 50155 CASAVA_Build 1 116502620 3I AGTAATACTC ---/CTT CTTTCATTTC 3070 het 3070 hom 29 9 19 1 CTT 1 2 50156 CASAVA_Build 1 116504485 1I GTCTCAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3064 hom 25 7 13 5 T 15 16 50157 CASAVA_Build 1 116525579 1D AAACCAGCCT G/- GTCCCAAAGC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 G 2 1 50158 CASAVA_Build 1 116549295 1D AGAAGAGAAG T/- AAAAGGTATT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 1 0 50159 CASAVA_Build 1 116564669 4I AAAAAAAATT ----/TTAA TTAATTAATT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 TTAA 2 3 50160 CASAVA_Build 1 116571523 1I TCCTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 1278 het 1278 ref 40 27 5 8 T 15 16 50161 CASAVA_Build 1 116589658 2I GACAGAAAAC --/TG TGTGGCTTAT 3070 hom 135 het 54 0 41 13 TG 2 3 50162 CASAVA_Build 1 116608106 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1822 hom 25 7 14 4 A 9 10 50163 CASAVA_Build 1 116608590 4D GAAAGAAAAC ACTT/---- ACCACACAGA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 ACTT 1 0 50164 CASAVA_Build 1 116609411 2D GTGAGTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2034 hom 21 8 10 3 A 12 10 50165 CASAVA_Build 1 116629269 1D TCCGGTACTG C/- CAAGCTAGTC 3070 het 3070 hom 42 19 17 7 C 2 1 50166 CASAVA_Build 1 116637422 1I AGGTGAGCGC -/T GCACAGGAGA 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 T 0 1 50167 CASAVA_Build 1 116668314 2I37M2I TGTGTATATG --TATATATGTGTATATATATACATATATGTATATATAT--/TATATATATGTGTATCTATATACTTATATGTATATATATAC ACACACACAC 1588 het 587 hom 6 2 5 4 N/A 0 0 50168 CASAVA_Build 1 116685804 1I TAATTTTATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 A 9 10 50169 CASAVA_Build 1 116703536 1I AGCTACAGCC -/A AAAGAAGAGT 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 A 3 4 50170 CASAVA_Build 1 116705625 2D CATATATAAC TA/-- TTTCTCTGTA 3070 het 3070 ref 48 22 19 9 TA 1 0 50171 CASAVA_Build 1 116709123 1I ACAGGACGGC -/A ACTTCCACAA 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 A 1 2 50172 CASAVA_Build 1 116709400 6I TGGCTTTGCA ------/GTTTTT GTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 GTTTTT 1 2 50173 CASAVA_Build 1 116709983 1I AGATGGTATC -/T TTTTTTTTTT 3022 het 3022 ref 40 20 12 8 T 14 15 50174 CASAVA_Build 1 116726854 2I TATTTGCAAC --/TG TATTAGTTAT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 TG 0 1 50175 CASAVA_Build 1 116738154 1D CTGTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1043 het 1043 ref 34 25 3 6 A 11 10 50176 CASAVA_Build 1 116822626 1D TTATCCCTAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 44 18 21 6 A 8 7 50177 CASAVA_Build 1 116824665 3I ACACAAAGAT ---/AAA AAAAACTCTG 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 A 5 8 50178 CASAVA_Build 1 116825099 8I GCGTGTGTGC --------/GTGTGTAT GTGTGTATGT 3070 het 1277 hom 36 10 9 17 GTGTGTAT 1 2 50179 CASAVA_Build 1 116828908 4D CAATACCAAT TAAC/---- TAACTAACCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TAAC 3 2 50180 CASAVA_Build 1 116836710 1D GCCAATCAAA C/- CCCCCCCCCC 1830 het 647 hom 19 3 8 8 C 11 10 50181 CASAVA_Build 1 116892510 1I GGTCATGACC -/T TTTTGCCTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 5 50182 CASAVA_Build 1 116900514 16I AATGTTAAGT ----------------/GACTTGCTAGTTAAGC AATGAAGCCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 GACTTGCTAGTTAAGC 0 1 50183 CASAVA_Build 1 116906167 1I TTTGCTAAAT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 7 8 50184 CASAVA_Build 1 116916224 4D AACCACCAAC ACAT/---- ACATGGTGCA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 ACAT 2 1 50185 CASAVA_Build 1 116928341 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2236 hom 25 9 14 2 A 12 11 50186 CASAVA_Build 1 116931646 1D CAAAGGCCTT A/- GGGTGATCAA 3070 het 3070 ref 46 21 16 10 A 1 0 50187 CASAVA_Build 1 116946145 1I3M3D ACCCACTGTA -ATTAGA/CATT--- TGGGACCCGC 747 het 747 ref 56 49 3 8 N/A 0 0 50188 CASAVA_Build 1 116948968 1D ACTATCTGAA T/- TCACTCAATC 3070 het 3070 ref 46 37 8 2 T 2 1 50189 CASAVA_Build 1 116949334 1D CATGCAATAA T/- TTTAAACCAA 1891 het 1891 ref 33 25 4 4 T 4 3 50190 CASAVA_Build 1 116950852 2I ATTTAAAAGT --/AG AGAGTCCGTG 2861 het 2861 ref 39 31 6 2 AG 2 3 50191 CASAVA_Build 1 116951467 1D CATGAAGGCT G/- GGGAGCCCAC 3070 hom 81 het 30 0 25 5 G 4 3 50192 CASAVA_Build 1 116955689 2D GGTCCCTTTC CT/-- CTCTCATCAC 675 het 675 ref 38 27 4 9 CT 3 2 50193 CASAVA_Build 1 116962864 4D CACACACAAA TATG/---- GTGACATTTT 1128 het 1128 ref 50 45 3 2 TATG 1 0 50194 CASAVA_Build 1 116963162 1D TTAATTAGGA T/- TTTTTTTTGA 2965 het 2965 ref 50 37 7 6 T 9 8 50195 CASAVA_Build 1 116963584 4I CAATCCAGAC ----/AAAT AAATAACTAC 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 AAAT 1 2 50196 CASAVA_Build 1 116966747 1D49M3D TATTATCTCC TTTTTTTAAATAAGCAAGTATATATTGTTCTAAACTGAAGACAAATGATCATA/-TTTTTTAAGTAAGCAAGTATATATTGTTCTAAACTGAAGATAAATGATC--- ATGAGTAGCA 2410 het 2410 ref 37 55 6 9 N/A 0 0 50197 CASAVA_Build 1 116975370 1D GGCTGAGGCA G/- GAGAATGGCG 2649 hom 15 het 6 0 6 0 G 2 1 50198 CASAVA_Build 1 116990653 4D GTTTTGGCTC ACAA/---- ACAGTCAAGG 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 ACAA 1 0 50199 CASAVA_Build 1 116993639 17D GCAAACAGCA TCTTCCTAAAATCTTCC/----------------- TCTTCCTAAA 3070 het 3070 ref 34 16 9 13 TCTTCCTAAAATCTTCC 2 1 50200 CASAVA_Build 1 117001609 2I TGGATCAAAC --/AT ATGTGTGCTT 2318 het 2318 ref 15 7 5 3 AT 1 2 50201 CASAVA_Build 1 117017708 2D AAAAGAAAAG AA/-- AAGAGGTTGA 3070 het 2589 hom 22 8 13 2 A 4 2 50202 CASAVA_Build 1 117040554 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 11 3 A 12 11 50203 CASAVA_Build 1 117053530 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 CT 2 1 50204 CASAVA_Build 1 117078226 1I TCCAGAGTGG -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 6 7 50205 CASAVA_Build 1 117081966 1D CAGATCATCA T/- TTTTTTTTTT 1290 het 1290 ref 35 25 3 7 T 11 10 50206 CASAVA_Build 1 117095563 1I CTGGGTTGGC -/A GATACTTTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 50207 CASAVA_Build 1 117153358 1D CCTGTCTCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2164 hom 35 9 14 13 A 13 12 50208 CASAVA_Build 1 117174515 5I AAGTCTGGTG -----/AGGGT AGGGTGCACT 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 AGGGT 1 2 50209 CASAVA_Build 1 117178507 3D ATGGGTGGCA AAT/--- AATATCTTCC 3070 het 3070 hom 58 20 33 8 AAT 2 1 50210 CASAVA_Build 1 117216996 1I AAACAATAAC -/A AAAAAAAAAA 1024 het 1024 ref 30 17 4 9 A 11 12 50211 CASAVA_Build 1 117227167 1D GAAAAATGCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 9 8 50212 CASAVA_Build 1 117258899 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 12 11 50213 CASAVA_Build 1 117259002 1D GTTTTTTTTT C/- CTCATAGCTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 C 2 1 50214 CASAVA_Build 1 117280388 3D GCTGTTATTT AAC/--- AATATTACAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAC 1 0 50215 CASAVA_Build 1 117289890 1D GTGAATCAGC T/- TTTTTTTTTT 989 het 989 ref 30 15 3 12 T 17 16 50216 CASAVA_Build 1 117298913 1I GGCCTTAGTC -/T TTCTAACTTA 3070 hom 129 het 51 0 43 8 T 2 3 50217 CASAVA_Build 1 117312429 1I AATTGAATCA -/G TACAATGAAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 G 0 1 50218 CASAVA_Build 1 117313266 2D AGTTTATCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 17 22 17 T 14 12 50219 CASAVA_Build 1 117315344 1I CTTTAGTGTT -/A ATAAGATCAG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 1 2 50220 CASAVA_Build 1 117342849 1I ATGGATAGAT -/A AGATAGATAA 1875 het 1875 ref 28 18 4 6 A 1 2 50221 CASAVA_Build 1 117397175 20I AAGTTAATAG --------------------/TTTGTTGTGACTAAAAATAT TTTTGATGCC 3070 hom 75 het 25 0 26 3 TTTGTTGTGACTAAAAATAT 0 1 50222 CASAVA_Build 1 117397918 1D CACTCACAGG T/- TTATCTGCCC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 3 2 50223 CASAVA_Build 1 117398112 1I AAATTAGCTT -/G ACGTGGTGGC 2663 hom 15 het 7 0 6 1 G 0 1 50224 CASAVA_Build 1 117399826 1I TATGCTTTAT -/A AAAAATACTA 3070 hom 78 het 33 0 27 11 A 5 6 50225 CASAVA_Build 1 117400430 1D TATAAAAGTA C/- TATCTCAGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 0 50226 CASAVA_Build 1 117403850 1I8M2D GAAGTCTTTG -TGCCTGCCTA/TTGCCTGCC-- TCAGAGCCGT 3070 hom 92 het 33 0 28 8 N/A 0 0 50227 CASAVA_Build 1 117408487 1I GTGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 9 10 50228 CASAVA_Build 1 117408654 4D TAGTTTTATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTTG 5 4 50229 CASAVA_Build 1 117409927 3I TTGCATGAAG ---/TTA TTATATTCTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTA 1 2 50230 CASAVA_Build 1 117415774 2D TTCAGCAGAC AA/-- AATATATATT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 4 2 50231 CASAVA_Build 1 117426382 2D TTTTTGAGAC AG/-- GGTCTCGCTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AG 1 0 50232 CASAVA_Build 1 117446461 11D GAGAGTCAAT CCCTGCAGCCA/----------- CCCTGCAGCC 3070 het 3070 hom 36 14 19 12 CCCTGCAGCCA 2 1 50233 CASAVA_Build 1 117451760 1D ATAAGGCTGA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 8 7 50234 CASAVA_Build 1 117454146 2D GAGTTGTACC AG/-- AGTCACAGCA 3070 het 3070 hom 46 20 20 9 AG 2 1 50235 CASAVA_Build 1 117456301 4D AATCAGTGAA TAAC/---- TAACAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 23 22 6 TAAC 2 1 50236 CASAVA_Build 1 117469581 2I ATTTACACAC --/TA TATATATATC 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 TA 4 5 50237 CASAVA_Build 1 117471899 4D ATTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2736 het 1841 hom 25 9 8 8 A 17 13 50238 CASAVA_Build 1 117473418 1I TTGATGTAGT -/C AAGACAGGAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 C 0 1 50239 CASAVA_Build 1 117475092 1I CAGTTAATAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 7 8 50240 CASAVA_Build 1 117479635 3I TTTTGTTTTT ---/TTG TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 53 21 23 9 TTG 0 1 50241 CASAVA_Build 1 117479772 1D TAAGATGTTC T/- TTTTTTTTTT 967 het 967 ref 48 36 3 9 T 11 10 50242 CASAVA_Build 1 117483136 1I ATTTTGCCCA -/C AGCAGGAACT 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 C 0 1 50243 CASAVA_Build 1 117483527 3I CTCAAAGGTT ---/ATC ATCAAAAGTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 ATC 1 2 50244 CASAVA_Build 1 117486219 1I CACAGCAATG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 7 8 50245 CASAVA_Build 1 117518203 2D ATTAATTCTT GC/-- CTATTGCTTA 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 GC 1 0 50246 CASAVA_Build 1 117525399 1D CTGTCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 26 5 11 10 A 15 14 50247 CASAVA_Build 1 117534056 3I GCCCAAGACC ---/AAG AAGGTAGGCT 3070 hom 122 het 46 0 38 8 AAG 1 2 50248 CASAVA_Build 1 117536160 2D GGAGATATAT AG/-- ATATATATAT 1630 het 1630 ref 24 15 5 4 AG 1 0 50249 CASAVA_Build 1 117537723 1I ATGCATCCAA -/C CTTGGAGCAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 1 2 50250 CASAVA_Build 1 117543371 4I TTAAACAGAC ----/TTCT TTAAGTCTAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 TTCT 0 1 50251 CASAVA_Build 1 117548986 12D ACTCCAGCCT GGGCAACAGAGC/------------ GAGACTCTGT 3070 hom 42 het 13 0 14 2 GGGCAACAGAGC 1 0 50252 CASAVA_Build 1 117550294 2D ATTATTATCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 30 0 21 11 T 14 12 50253 CASAVA_Build 1 117550813 2I5M5D AGATATTCAT --ATCTGTTGAT/AAACATG----- GCTGACTATG 3070 hom 198 het 70 0 66 4 N/A 0 0 50254 CASAVA_Build 1 117556488 1D GTAGGAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 21 11 T 12 11 50255 CASAVA_Build 1 117556860 1D TACAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 23 1 11 11 A 15 14 50256 CASAVA_Build 1 117557052 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAGCAGC 2192 het 2192 ref 29 8 10 13 A 6 5 50257 CASAVA_Build 1 117559306 1I ACTAGGCCTC -/G GTTCATCTTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 G 1 2 50258 CASAVA_Build 1 117569743 3D TTCCCAAATA GAG/--- GAGAACTAGG 3070 het 3070 hom 59 24 31 6 GAG 2 1 50259 CASAVA_Build 1 117571496 8D ATATATATAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 1282 het 165 hom 15 1 7 7 AC 14 10 50260 CASAVA_Build 1 117590069 3D GCTTTTTTTT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 30 0 22 9 TAA 1 0 50261 CASAVA_Build 1 117596917 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTATT 2727 hom 18 het 7 0 7 0 T 8 7 50262 CASAVA_Build 1 117597942 1I CTTCTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 26 0 14 12 T 11 12 50263 CASAVA_Build 1 117609959 1D AAACACGGAG A/- AAAAAACATT 3070 hom 138 het 59 0 44 15 A 7 6 50264 CASAVA_Build 1 117612860 2I AGCACCACCC --/AT AGAAAGCTCT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AT 0 1 50265 CASAVA_Build 1 117618027 1D CCATCTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 24 1 8 15 T 14 13 50266 CASAVA_Build 1 117624572 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 26 1 21 4 A 14 15 50267 CASAVA_Build 1 117632586 4D AAGGTTTCTT AAAC/---- AAGATCCCCA 3070 het 3070 hom 43 15 24 6 AAAC 1 0 50268 CASAVA_Build 1 117633012 3D AGAACTCAAA TGT/--- TGTTGATGGA 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 TGT 2 1 50269 CASAVA_Build 1 117637191 10D GGAGAACAGA CAAATAGTCT/---------- TCCCCCCTTG 3070 het 3070 ref 33 22 9 4 CAAATAGTCT 1 0 50270 CASAVA_Build 1 117638585 5I GCAGATGTAA -----/TTAAG TTAAGGATTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTAAG 1 2 50271 CASAVA_Build 1 117669079 1D TTTGGAATCA T/- AAAGCCATAC 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 1 0 50272 CASAVA_Build 1 117672269 1D TCTATTTTAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 48 het 34 0 24 11 A 9 8 50273 CASAVA_Build 1 117676181 1D TTTTGGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 12 11 50274 CASAVA_Build 1 117676377 1I GTGGCTCACG -/C CTGTAGTCCT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 C 1 2 50275 CASAVA_Build 1 117686558 1I19M1D ATGAAGACTC -AAAAAAAAATACTAAATTCA/AAAAAAAAAATACTAAATTC- GCAACTAATC 3070 het 3070 ref 46 29 26 8 N/A 0 0 50276 CASAVA_Build 1 117695221 1D CCCGGCTAAC T/- TTTTTTTTGT 3006 het 919 hom 14 3 8 3 T 9 8 50277 CASAVA_Build 1 117716340 5D GGAGGATAAC AAGTT/----- AAGAGGGGCT 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 AAGTT 1 0 50278 CASAVA_Build 1 117716937 1I TATAATGGCA -/T TTTATAGATG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 3 4 50279 CASAVA_Build 1 117718061 1D CATTAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 11 10 50280 CASAVA_Build 1 117720460 1D AGCATGACTC A/- AGTGAGTTTG 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 2 1 50281 CASAVA_Build 1 117722790 1I TGACTCTAAA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 7 8 50282 CASAVA_Build 1 117727397 1D ATTAATGTGA T/- ATGTTACATT 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 T 1 0 50283 CASAVA_Build 1 117732318 2D CCGGACAGAA AG/-- GAAAGATGTG 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 AG 1 0 50284 CASAVA_Build 1 117741212 1D CCTCTTGGAA C/- CCAGTTAATA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 C 3 2 50285 CASAVA_Build 1 117749421 1D CCAAAAAGAC T/- TAACATTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 2 1 50286 CASAVA_Build 1 117751257 1I GAAATGGTAG -/A AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 5 6 50287 CASAVA_Build 1 117752919 1I GCATCTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 10 11 50288 CASAVA_Build 1 117754769 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 12 11 50289 CASAVA_Build 1 117759810 1D TAGATATTTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 9 8 50290 CASAVA_Build 1 117760268 1D TGGAATTGAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 8 7 50291 CASAVA_Build 1 117763321 1D CATTTTACTC T/- TGAGTGTTAT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 T 2 1 50292 CASAVA_Build 1 117768031 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2242 het 1039 hom 20 6 7 7 T 14 13 50293 CASAVA_Build 1 117782469 1I29M1I AAAGAAAATC -TTTTTGTACAGCTGTAAAATATATTTGTG-/TTTTTTGTACAGCTGTAAAATATATTTGTGT TTTTTAAGCT 3070 het 3070 hom 46 22 24 11 N/A 0 0 50294 CASAVA_Build 1 117788441 1D CAAACATTGC T/- ACAATAGCAT 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 T 1 0 50295 CASAVA_Build 1 117793377 3D TTCAAGAGAC AAG/--- AAGAATAGCA 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 AAG 2 1 50296 CASAVA_Build 1 117797006 1D GAAGAAGATG C/- CATCTCATAG 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 C 2 1 50297 CASAVA_Build 1 117801556 6D TTTTGGCAGC TCATCA/------ TCATTTTATA 3070 het 3070 ref 31 21 10 1 TCA 3 1 50298 CASAVA_Build 1 117818532 1I ATTCCATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 12 13 50299 CASAVA_Build 1 117818957 1D ATATCTATCA C/- CCCTTTTCCT 3070 het 3070 hom 54 25 26 4 C 4 3 50300 CASAVA_Build 1 117832359 1D AGCAAATGGC T/- TTTTTTTTTT 1526 het 1526 ref 44 26 4 14 T 13 12 50301 CASAVA_Build 1 117835661 1I CACCTGATCA -/C CCATTTTCTG 3070 hom 102 het 40 0 33 7 C 2 3 50302 CASAVA_Build 1 117840273 2I AAAAATACTC --/TT TTTTTTCAGA 3070 hom 65 het 42 1 36 5 T 6 8 50303 CASAVA_Build 1 117846354 1D CAAATGTGAC T/- GTATTTAAAG 3070 het 3070 hom 47 15 29 4 T 1 0 50304 CASAVA_Build 1 117850274 1D GAATGAAGAT A/- AGTATGGTCT 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 A 2 1 50305 CASAVA_Build 1 117853277 1D ACATCTGTAC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 8 7 50306 CASAVA_Build 1 117853962 3D AAGAAATGAC AAA/--- AAAAAAAAAT 2882 het 2882 ref 21 11 8 2 A 12 9 50307 CASAVA_Build 1 117858354 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCC 3070 het 951 hom 14 2 12 0 A 5 4 50308 CASAVA_Build 1 117880107 1D GTTTACCTAA T/- TTAAGGGTGA 3070 hom 105 het 41 0 36 8 T 3 2 50309 CASAVA_Build 1 117880801 1I CCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 9 10 50310 CASAVA_Build 1 117883171 1I GCTCACACCT -/A ATAGTCCTAG 3070 het 3070 hom 37 13 20 6 A 1 2 50311 CASAVA_Build 1 117887717 1D TATTAGAACC T/- TTTTTTTTTT 1601 het 1601 ref 47 38 4 6 T 11 10 50312 CASAVA_Build 1 117890649 4D ATTTTTAAGG CTTA/---- CTTATTAATA 3070 het 3070 ref 22 13 9 1 CTTA 2 1 50313 CASAVA_Build 1 117892192 1I CCCCTGCACC -/A AAAAAAAAAA 2889 het 2549 hom 22 7 8 7 A 14 15 50314 CASAVA_Build 1 117893376 1D ATGGCTGTAG C/- CCCAGCTACT 3070 het 1152 hom 14 4 9 2 C 4 3 50315 CASAVA_Build 1 117908310 1I CTGGACTGGC -/A ACCAGGCAGA 3070 het 3070 hom 54 25 24 5 A 1 2 50316 CASAVA_Build 1 117918229 6I GTATCTGTCA ------/TGGCTC TGTCCCATGG 3070 hom 77 het 30 0 24 6 TGGCTC 0 1 50317 CASAVA_Build 1 117928525 2D TACCTGTATA TG/-- TGTGTGTTCA 3070 het 3070 ref 82 45 28 10 TG 4 3 50318 CASAVA_Build 1 117928878 10D TGTGTGCATA TGTGTGCATG/---------- TGTGTGCATG 3070 hom 111 het 50 0 38 18 TGTGTGCATG 2 1 50319 CASAVA_Build 1 117930010 3D GATATTGCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 2808 het 1486 hom 31 12 10 9 T 17 14 50320 CASAVA_Build 1 117940087 4D AATCATTAAT TCTA/---- ATGCTGCTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 6 TCTA 1 0 50321 CASAVA_Build 1 117943035 2I CCTCAATCCC --/CT GTTTCAGTGT 3070 het 3070 hom 47 22 19 6 CT 0 1 50322 CASAVA_Build 1 117944479 1D CTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1581 hom 24 8 11 5 T 10 9 50323 CASAVA_Build 1 117952225 1I AACAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 2344 het 2344 ref 27 9 9 9 A 15 16 50324 CASAVA_Build 1 117956669 4D ATTCAAGTCA AGTC/---- AAAGTGTTTG 3070 het 3070 hom 46 21 21 6 AGTC 1 0 50325 CASAVA_Build 1 117957350 2I CATTTCAAGT --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 TG 4 5 50326 CASAVA_Build 1 117962618 2D AGGAAAAGAG TC/-- TCTCTTCCTC 3070 het 3070 hom 22 9 12 3 TC 3 2 50327 CASAVA_Build 1 117963869 2I TAGGGAGTCC --/CT TTCATTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CT 0 1 50328 CASAVA_Build 1 117970328 1I AGTATTTCTT -/C CTACTTAGAA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 C 1 2 50329 CASAVA_Build 1 117972524 4D AAAACTTGTC ATTT/---- ATGCTCATTG 3070 het 3070 hom 46 20 24 5 ATTT 1 0 50330 CASAVA_Build 1 117975938 1I AATCAGGTGT -/G GGGGGGACCC 3070 hom 63 het 25 0 19 6 G 6 7 50331 CASAVA_Build 1 117976949 4D GAGGTGCTCC CTCT/---- CTCTCTCTAG 3070 hom 86 het 39 0 30 11 CT 6 4 50332 CASAVA_Build 1 117980895 1D ACTTCAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 10 9 50333 CASAVA_Build 1 117984557 1I TGAATTTAAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 7 8 50334 CASAVA_Build 1 117987610 1D CCTCTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 55 2 32 21 T 13 12 50335 CASAVA_Build 1 117994754 1I CTGTTCTGTG -/C CCCCCATGGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 5 6 50336 CASAVA_Build 1 118029431 1I TAGGGTGGTC -/A GGGGGGCCTC 3070 hom 126 het 44 0 41 3 A 0 1 50337 CASAVA_Build 1 118034694 3I TCCAGCTATT ---/GTG GTGGTGGGAG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 GTG 2 3 50338 CASAVA_Build 1 118039343 1D AGCTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 804 het 804 ref 25 14 3 8 T 15 14 50339 CASAVA_Build 1 118074382 2I AAACATTATG --/GT GTATATATAT 3070 hom 87 het 40 0 28 12 GT 1 2 50340 CASAVA_Build 1 118086305 4I GAGAATTGTC ----/TATT TATGTCCTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TATT 0 1 50341 CASAVA_Build 1 118116222 1I ATGATAGAGT -/G GGGCTGAAGC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 3 4 50342 CASAVA_Build 1 118119630 6D ATTCCAGAAC TTAAAA/------ TTAAATTAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 TTAAAA 1 0 50343 CASAVA_Build 1 118123643 1I GGTGAATGGG -/C GAACAAATTG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 C 0 1 50344 CASAVA_Build 1 118131948 1D ACTTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 50 1 41 8 T 12 11 50345 CASAVA_Build 1 118136429 1I TGTTTCCTTT -/G GGGGAAATTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 4 5 50346 CASAVA_Build 1 118171665 1I TCTCTCTCTG -/T TGGCCTTCCT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 2 50347 CASAVA_Build 1 118264043 1D GAGGGAAGGG C/- CAGGAAGGAG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 C 2 1 50348 CASAVA_Build 1 118295655 1D AATGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 772 hom 43 4 21 18 T 17 16 50349 CASAVA_Build 1 118295672 1D TTTTTTTTTT A/- TGTTGACAAC 3070 het 983 hom 44 9 21 14 A 1 0 50350 CASAVA_Build 1 118432827 1I AGGCAATTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 A 9 10 50351 CASAVA_Build 1 118464430 1I TAGTGAGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 62 het 30 0 21 9 A 9 10 50352 CASAVA_Build 1 118508554 4D TACTAAATTT GTCA/---- GTCAGTCTGA 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 GTCA 2 1 50353 CASAVA_Build 1 118525206 5D AGTTAGTATC AATTT/----- AAGACAGATT 3070 het 3070 hom 31 15 15 4 AATTT 1 0 50354 CASAVA_Build 1 118526232 4I AGTGCCCATC ----/AATG AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 49 19 21 9 AATG 3 4 50355 CASAVA_Build 1 118534588 5D TGCCCTGTCT TTGAG/----- TTTTTATTGT 3070 het 3070 hom 48 20 24 7 TTGAG 1 0 50356 CASAVA_Build 1 118541126 2D ACCCATGTAT AC/-- ACACACATAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AC 4 3 50357 CASAVA_Build 1 118541264 8I ATATTTTATT --------/AGCTATTC AGCTATTCAT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 AGCTATTC 1 2 50358 CASAVA_Build 1 118544099 1I GGATTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 12 15 10 T 11 12 50359 CASAVA_Build 1 118550960 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 25 5 A 12 11 50360 CASAVA_Build 1 118552926 1I AGGAAAACAG -/A AAGAGCTGCC 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 2 3 50361 CASAVA_Build 1 118559031 4D CTTAATATAA TACT/---- TACATTAATA 3070 het 3070 hom 37 15 21 3 TACT 1 0 50362 CASAVA_Build 1 118559633 1D AGTAAAATGA G/- GGGTTTGACC 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 G 4 3 50363 CASAVA_Build 1 118560045 1D TTGGTACAAA T/- TTTTTTTTTT 2101 het 665 hom 24 3 8 13 T 17 16 50364 CASAVA_Build 1 118584823 1I TCAAACTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 110 het 45 0 37 8 A 9 10 50365 CASAVA_Build 1 118590939 1I AGTGATTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 9 10 50366 CASAVA_Build 1 118606667 5D AATAATATAA TTCTT/----- TTCTTTCCCT 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 TTCTT 2 1 50367 CASAVA_Build 1 118612458 1D GGAGGAGTCA T/- TTTTTTTTTT 1371 het 1371 ref 52 38 4 10 T 11 10 50368 CASAVA_Build 1 118613883 1D TGAAAACACT C/- CCGTGCTGAT 3070 het 3070 ref 58 30 21 8 C 3 2 50369 CASAVA_Build 1 118617558 1D AAATGATGAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 8 7 50370 CASAVA_Build 1 118633593 1D TTGGAAGCTT A/- ACAATCATGG 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 A 2 1 50371 CASAVA_Build 1 118649318 6D TTCAAAGGCA CAAGCT/------ CAACCTCTTG 3070 het 3070 ref 43 21 20 5 CAAGCT 1 0 50372 CASAVA_Build 1 118655211 1I AAATACTTTC -/T TTTTCTTTTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 4 5 50373 CASAVA_Build 1 118661658 1D TAAGCTAGCT G/- TTTTCTTGAA 3070 het 3070 ref 49 28 19 2 G 1 0 50374 CASAVA_Build 1 118663676 2D ACATATATAT AA/-- AACACATATA 2940 hom 15 het 7 0 6 1 A 4 2 50375 CASAVA_Build 1 118665144 1D CAAAATAAGA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 8 50376 CASAVA_Build 1 118669388 1D TCTTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 492 hom 33 2 17 14 T 11 10 50377 CASAVA_Build 1 118671282 1I TAACAGTAGT -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 A 6 7 50378 CASAVA_Build 1 118679951 1I ACTTTCTCAA -/C CCTCTCAAGC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 C 2 3 50379 CASAVA_Build 1 118684115 3I CTAAACCTTG ---/TGC TGCTTTCTGC 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 TGC 1 2 50380 CASAVA_Build 1 118702293 1D TTATCCAAAA G/- AAAGAGGAGA 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 G 1 0 50381 CASAVA_Build 1 118720390 3D CTCCCTCCTG GCT/--- GCTTTCACAG 2671 het 2671 ref 41 25 10 6 GCT 2 1 50382 CASAVA_Build 1 118724680 25D CTTTTCAGGA TTATTTCTCGTCTTGTGGCAAAGAG/------------------------- AAAAGAGAAC 3070 het 3070 ref 43 28 17 8 TTATTTCTCGTCTTGTGGCAAAGAG 1 0 50383 CASAVA_Build 1 118730661 1D TTGTTTGTTT G/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 29 14 14 2 G 1 0 50384 CASAVA_Build 1 118731362 2D62M4D GAACCCACCA ATATATATATATATACATATACATATATATACACGTATACATACATATACACGTATACATATATATAC/--ATATATATATATACATATACTTATATATACACGTATACATACATATACACGTATACATATAT---- ATACACATAC 3070 het 3070 ref 29 24 8 5 N/A 0 0 50385 CASAVA_Build 1 118734724 1D GTTCCGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1554 hom 30 5 13 13 T 15 14 50386 CASAVA_Build 1 118735177 1D AAAGAAGAAA G/- GGGGGGGGGG 3070 het 1076 hom 24 4 9 11 G 11 10 50387 CASAVA_Build 1 118755602 1D CCAAACAGTG A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 A 7 6 50388 CASAVA_Build 1 118758088 2I CCCATTGGTC --/TA TATGTCTGTT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 TA 1 2 50389 CASAVA_Build 1 118774946 1I TCTATACAGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 8 9 50390 CASAVA_Build 1 118776630 13D GATCACTGGA GTGGAGAGGGCCC/------------- TCTCTGACCT 3070 het 3070 ref 28 16 12 4 GTGGAGAGGGCCC 1 0 50391 CASAVA_Build 1 118779375 1D AAGACAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 T 11 10 50392 CASAVA_Build 1 118785945 1D TCCCTTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1865 hom 32 6 14 12 A 17 16 50393 CASAVA_Build 1 118804479 1I TTTTAAGATT -/G TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 G 0 1 50394 CASAVA_Build 1 118808327 1I AAATAAAACG -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 57 het 25 0 15 10 C 9 10 50395 CASAVA_Build 1 118810197 1I GCAAGACACC -/A AATCAACACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 3 50396 CASAVA_Build 1 118810411 4D TCTCATATTC ATTG/---- ATTGAAAGAC 3070 het 3070 ref 25 14 11 1 ATTG 2 1 50397 CASAVA_Build 1 118847963 5I GATAGGCTTA -----/TTTTG TTTTATTTCA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 TTTTG 0 1 50398 CASAVA_Build 1 118853667 5I TTGTTTTTGT -----/TTTTG TTTTGTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 TTTTG 2 3 50399 CASAVA_Build 1 118854917 1I TACTTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1082 hom 45 3 32 10 T 11 12 50400 CASAVA_Build 1 118861149 1I TTCCTTTCTG -/T TTGTTAGTTT 3070 het 233 hom 35 1 30 4 T 2 3 50401 CASAVA_Build 1 118868911 8D TATTAGAGTA TTTTCAAT/-------- TTTTCAATTC 3070 hom 102 het 39 0 35 6 TTTTCAAT 2 1 50402 CASAVA_Build 1 118869534 2I GCTTTCTTCA --/TT TTTTTTTCTT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 7 9 50403 CASAVA_Build 1 118873072 4D TGCATGTGTT TGTG/---- TATGTATGTG 3070 hom 111 het 40 0 38 7 TG 2 0 50404 CASAVA_Build 1 118874196 1D ACTCAGCAGT A/- AAAAAAAACA 3070 het 399 hom 22 1 18 3 A 9 8 50405 CASAVA_Build 1 118880489 1I ATATTAACTC -/A TTTTTTTACC 3070 hom 111 het 48 0 38 10 A 0 1 50406 CASAVA_Build 1 118881692 6D TTCCAAGCCT AGCCTG/------ TTTTTTTTCC 3070 hom 65 het 28 0 21 7 AGCCTG 1 0 50407 CASAVA_Build 1 118887939 1I GGCTAACTAG -/A AAAAAACAGA 3070 hom 87 het 36 0 30 8 A 6 7 50408 CASAVA_Build 1 118894854 4D AATTAAATGA CATG/---- CTCCTGAATG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CATG 1 0 50409 CASAVA_Build 1 118896880 1D TTGAAAGCTG A/- AAAAGAGAAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 5 4 50410 CASAVA_Build 1 118902506 4D AGATTCCTCT GAGA/---- GAGATTTCAC 3070 hom 132 het 46 0 42 6 GA 4 2 50411 CASAVA_Build 1 118910926 8I35M1I GGAAATGATA --------CAATTACTCTGCACTGGATGAAAATAGGAAATTTG-/CAATTACTCAATTACTCTGCACTGGATGAAAATAGGAAATTTGT TTTTTTTTTA 3070 het 258 hom 30 1 30 8 N/A 0 0 50412 CASAVA_Build 1 118912359 1I AGAATCTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 8 9 50413 CASAVA_Build 1 118923043 3D TACAAAATAT AAA/--- TAAGTGAATT 3070 hom 72 het 26 0 25 4 A 3 0 50414 CASAVA_Build 1 118927231 2I CACATTATAT --/AA AGACTATATG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 1 3 50415 CASAVA_Build 1 118944141 4D ATTTGTTCTC TTTG/---- TTTAGAAAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 5 TTTG 1 0 50416 CASAVA_Build 1 118953311 1D TTTATTTTTT A/- AATGGTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 A 3 2 50417 CASAVA_Build 1 118958240 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 606 hom 26 2 21 3 T 12 13 50418 CASAVA_Build 1 118960003 2I ATATGTATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AC 7 8 50419 CASAVA_Build 1 118963734 1I CTTTTGAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 417 hom 33 1 29 3 T 9 10 50420 CASAVA_Build 1 118965461 1I ATATTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 33 0 21 12 T 13 14 50421 CASAVA_Build 1 118969197 1D TGATATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 11 10 50422 CASAVA_Build 1 118976735 1I TTGTATTTCT -/G TGATATCAGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 50423 CASAVA_Build 1 118978592 1I TTTCTTTGTC -/T TTGTTGGATT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 2 3 50424 CASAVA_Build 1 118990252 1D CCCAAAATAG A/- GCCTCTTCTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 50425 CASAVA_Build 1 119008633 3I TGCTGGAAAA ---/AGT AGGCAATATG 3070 hom 157 het 56 0 52 4 AGT 0 1 50426 CASAVA_Build 1 119008880 3I CACAGCTAAT ---/AAC AGGGTTTCAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AAC 0 1 50427 CASAVA_Build 1 119016474 5D AATATTAAAT AAGAA/----- AAGAGAAAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 6 AAGAA 1 0 50428 CASAVA_Build 1 119017582 1I CCATTCAGTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 8 9 50429 CASAVA_Build 1 119020847 1I AATTAAGGAG -/A AAAAAATAAT 3070 hom 92 het 36 0 31 5 A 6 7 50430 CASAVA_Build 1 119021042 3D CCATGAGACA AGC/--- AGTTGAAAAG 3070 hom 99 het 36 0 32 5 AGC 1 0 50431 CASAVA_Build 1 119037742 2D GCAGATTTGT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 47 het 32 0 22 10 A 11 9 50432 CASAVA_Build 1 119064854 1D AACCAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 2332 het 2332 ref 41 24 6 11 T 15 14 50433 CASAVA_Build 1 119125770 1D CTATCTAACC A/- GTCCCAATGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 1 0 50434 CASAVA_Build 1 119135557 1I GATAAAATCA -/G GAGTTGCAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 1 2 50435 CASAVA_Build 1 119196118 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 1102 het 480 hom 6 3 3 0 A 16 17 50436 CASAVA_Build 1 119256467 1I ACTTTAAGAC -/T TTTTTGAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 5 6 50437 CASAVA_Build 1 119257379 1D CTCAAACTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 12 11 50438 CASAVA_Build 1 119265215 2D CCCAGCTACA GT/-- CAGAAAGCTG 3070 hom 87 het 32 0 27 6 GT 1 0 50439 CASAVA_Build 1 119267077 4I CTTCATCAGA ----/AACT AACTATTTTA 3070 hom 160 het 58 0 54 4 AACT 1 2 50440 CASAVA_Build 1 119270055 1D AAGCCACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 T 11 10 50441 CASAVA_Build 1 119274003 1D TCTTATAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 10 9 50442 CASAVA_Build 1 119277610 2D31M1D CCCCACCCAC AAAAAAAAAAAACTATAAAGTTTTATAACTAGGT/--AAAAAAAAAACTATAAAGTTTTATAACTAGG- TTTACATGTC 3070 het 3070 ref 29 21 9 14 N/A 0 0 50443 CASAVA_Build 1 119323354 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 T 9 10 50444 CASAVA_Build 1 119328641 22D GAGCGCCTGA AATATACTTGCAAGGCCGCAGC/---------------------- AATATACTTG 1659 het 1659 ref 15 5 6 8 AATATACTTGCAAGGCCGCAGC 2 1 50445 CASAVA_Build 1 119337150 2I AGCGAAAAGG --/GT GGGGGGAAGC 2620 het 1799 hom 15 6 7 2 GT 0 1 50446 CASAVA_Build 1 119352801 3D CAAAGGAAAA CTT/--- CTGCGACTTC 3070 het 3070 hom 35 14 13 9 CTT 1 0 50447 CASAVA_Build 1 119355885 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 9 10 50448 CASAVA_Build 1 119357469 1D GACAAGAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 10 9 50449 CASAVA_Build 1 119381469 1D CTTGAGATCA C/- CCCACCCTTC 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 C 4 3 50450 CASAVA_Build 1 119390661 1D ATCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 17 8 3 6 T 15 14 50451 CASAVA_Build 1 119391430 1D TAGGAGAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 10 9 50452 CASAVA_Build 1 119392959 2I CGCCTGTAAT --/CC CATCACTTTG 3070 het 748 hom 21 6 10 5 C 1 3 50453 CASAVA_Build 1 119402555 1D TGCACCCACT A/- AACTCGTCAT 2907 het 2525 hom 13 6 6 1 A 3 2 50454 CASAVA_Build 1 119406613 1I CACAGCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 A 10 11 50455 CASAVA_Build 1 119408343 1I CTGCCCCACT -/G GATCTTGGAC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 G 1 2 50456 CASAVA_Build 1 119411276 1I CATTGTACAC -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 A 6 7 50457 CASAVA_Build 1 119414752 1D GCCAGGCACA G/- GTGGCTCACA 2815 hom 21 het 12 0 7 5 G 2 1 50458 CASAVA_Build 1 119416985 1D GTGTGGTATC T/- GCTTTGAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 1 0 50459 CASAVA_Build 1 119428328 1I CGTCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 10 11 50460 CASAVA_Build 1 119429620 1I CCTTTTTGTC -/T TTTTTTTGCG 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 7 8 50461 CASAVA_Build 1 119434276 1D TTTAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 763 het 763 ref 43 31 4 8 A 12 11 50462 CASAVA_Build 1 119437621 20I GATGAAGTCA --------------------/TACTAGATTATAGTGGGCTC TAAATACAAT 3070 het 3070 hom 32 9 21 3 TACTAGATTATAGTGGGCTC 0 1 50463 CASAVA_Build 1 119440105 1D TAAATTTTTA C/- CATCACATTG 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 C 2 1 50464 CASAVA_Build 1 119448768 2D TAGTGCCATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 23 16 15 A 13 11 50465 CASAVA_Build 1 119470414 1D AGCAGTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 469 hom 36 2 20 14 A 17 16 50466 CASAVA_Build 1 119470626 1D GTAGATACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 35 2 17 17 T 16 15 50467 CASAVA_Build 1 119474290 1D GGTAAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 13 11 A 11 10 50468 CASAVA_Build 1 119480061 7D GGACTACAGG CATATGC/------- CACTAAGCCC 3070 het 3070 ref 30 15 15 4 CATATGC 1 0 50469 CASAVA_Build 1 119486076 1D GGATGAAGGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 A 10 9 50470 CASAVA_Build 1 119490374 2I ATATCTCTGC --/CT CTCTAAAAAT 3070 hom 114 het 44 0 37 7 CT 2 3 50471 CASAVA_Build 1 119493020 1I TTGCCACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 T 11 12 50472 CASAVA_Build 1 119493679 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 het 448 hom 29 3 16 10 AAG 3 2 50473 CASAVA_Build 1 119504927 1D AAGTCTAAGA G/- GGTAATATAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 G 3 2 50474 CASAVA_Build 1 119505462 1I TAAATAGAAG -/A CAAGTCCAGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 50475 CASAVA_Build 1 119506200 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 10 9 50476 CASAVA_Build 1 119511599 1D CAATTTCTCC A/- AAAAAATGCC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 A 7 6 50477 CASAVA_Build 1 119518149 5I GCAGGGGGAG -----/AAACA AAACAAACCA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 AAACA 1 2 50478 CASAVA_Build 1 119520535 1I TAGGCACTGG -/C CCAAGATCTA 3070 hom 69 het 24 0 21 3 C 2 3 50479 CASAVA_Build 1 119522018 2D GGACAGACAC AG/-- AAAGTCAGAG 3070 het 3070 hom 36 18 15 3 AG 1 0 50480 CASAVA_Build 1 119530405 1D TTTGAGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 11 10 50481 CASAVA_Build 1 119534026 3D CCCTGTATGA GAC/--- GTGGGGTAGT 3070 het 3070 ref 51 25 21 7 GAC 1 0 50482 CASAVA_Build 1 119539341 5D AATATAATTC TATTA/----- TATTTAGTAA 1773 het 961 hom 7 2 5 0 TATTA 1 0 50483 CASAVA_Build 1 119551435 1D CAGATGGTTG T/- TTCCCAGCAT 3070 het 3070 hom 45 15 26 5 T 3 2 50484 CASAVA_Build 1 119553014 1D AATATTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 798 hom 35 3 28 4 T 12 11 50485 CASAVA_Build 1 119559968 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 T 11 12 50486 CASAVA_Build 1 119562689 1I CTTTGTGATT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 63 het 30 0 23 7 A 7 8 50487 CASAVA_Build 1 119562826 4I CTTGTTTTAT ----/TTAA TTAATTTTTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTAA 1 2 50488 CASAVA_Build 1 119572288 1I TTCGCTGAGG -/C CCCCCGGTCC 3070 hom 106 het 37 0 33 4 C 5 6 50489 CASAVA_Build 1 119578692 1I TTCAACTTTT -/G GGGGCTCAAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 G 4 5 50490 CASAVA_Build 1 119594907 1D TGTGAATGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 10 9 50491 CASAVA_Build 1 119611103 1D TACAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 10 8 A 11 10 50492 CASAVA_Build 1 119613475 1D GGAAAAAAAA C/- AGACTCAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 C 1 0 50493 CASAVA_Build 1 119614538 2I ATTTAAATAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 24 11 7 6 TA 5 6 50494 CASAVA_Build 1 119615842 1D TACAATAAGG A/- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 4 3 50495 CASAVA_Build 1 119617037 2D ATTTTGTATG CC/-- TGGAGCAGGC 2919 het 2919 ref 22 13 7 2 C 2 0 50496 CASAVA_Build 1 119618039 1I AAGGTGTATT -/A AAAAAAGGTT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 6 7 50497 CASAVA_Build 1 119621519 1D CTTCTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 27 1 17 9 A 16 15 50498 CASAVA_Build 1 119633218 3D TTGGTGTAGC AGA/--- AGAAGTGTGG 3070 het 3070 hom 50 24 23 6 AGA 2 1 50499 CASAVA_Build 1 119637257 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TA 10 9 50500 CASAVA_Build 1 119641899 1D CAAAAACAGC T/- TCTAGAGAGG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 2 1 50501 CASAVA_Build 1 119650908 1I ATCAGTTGAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2159 hom 24 7 10 7 T 8 9 50502 CASAVA_Build 1 119657604 2D CTTCCCCTCG CC/-- CCCCCCCCGA 3070 hom 45 het 28 0 15 13 C 10 8 50503 CASAVA_Build 1 119677222 1I AAAAGGCATG -/A AAAAATGATA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 5 6 50504 CASAVA_Build 1 119682950 1I CTTTACTTAA -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 6 7 50505 CASAVA_Build 1 119692013 1D GTTTCCTGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 10 9 50506 CASAVA_Build 1 119707435 18I GCACCCGCAG ------------------/GCTCAACACGACATGGAA GCTGCCAAGG 3070 het 2017 hom 38 8 17 13 GCTCAACACGACATGGAA 0 1 50507 CASAVA_Build 1 119708209 5D TTCAATAATG CTCCA/----- CTCTACTGGC 3070 het 3070 hom 20 10 10 1 CTCCA 1 0 50508 CASAVA_Build 1 119708414 1I AAAGCAGAAA -/C CTCTGATAAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 1 2 50509 CASAVA_Build 1 119711135 2D AATAAAACCA AT/-- ATCTTTTCAT 3070 het 3070 ref 41 19 18 6 AT 2 1 50510 CASAVA_Build 1 119722197 1I TTATAAAAAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 7 8 50511 CASAVA_Build 1 119738691 4D ATATGTACTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 21 het 12 0 8 4 AT 11 9 50512 CASAVA_Build 1 119750202 2I GAAATAAAAG --/AC ACACTTAGAG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AC 2 3 50513 CASAVA_Build 1 119753032 4I GTCAGACAAC ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 AGAA 3 4 50514 CASAVA_Build 1 119757554 1I GAATGTCTAC -/A ACACAGGAGA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 1 2 50515 CASAVA_Build 1 119777430 1I TCACAAGGAA -/G GGTAGGAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 G 2 3 50516 CASAVA_Build 1 119782993 1D GAATTTTTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 15 15 10 A 10 9 50517 CASAVA_Build 1 119786181 5D34M8D CTACCTACAC CACAACACAACTCTGCCTCTGTTTCTCTCTCTCTTTTTCTTTTTTTT/-----CACAACTCTGCCTCTGTTTCTCTCTCTCTTTTTC-------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 16 10 4 N/A 0 0 50518 CASAVA_Build 1 119788434 1D AGCACCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 12 11 50519 CASAVA_Build 1 119795646 1I AACGGAAGAA -/C CCAGCACTAG 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 C 2 3 50520 CASAVA_Build 1 119796027 1I GATCAATCAT -/G GGGTAAATGG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 3 4 50521 CASAVA_Build 1 119806584 2I GCCATGATGC --/CA CAGTTTCACG 3070 het 3070 hom 55 22 22 11 CA 1 2 50522 CASAVA_Build 1 119812289 1D TCAATACCCG C/- CCCCCCCCCA 2189 het 7 hom 16 0 6 10 C 10 9 50523 CASAVA_Build 1 119822889 1D TTTATACAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 9 8 50524 CASAVA_Build 1 119825401 1I GTGTGAAGCC -/A AAAGCTATTC 3070 hom 144 het 54 0 48 6 A 3 4 50525 CASAVA_Build 1 119828004 2D CAGACTAAGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 AT 6 5 50526 CASAVA_Build 1 119856728 1D ACCATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 21 10 A 11 10 50527 CASAVA_Build 1 119863865 3I TTATGTTATT ---/TTA TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTA 0 1 50528 CASAVA_Build 1 119873264 1D TCATAAATCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 48 0 39 9 T 9 8 50529 CASAVA_Build 1 119876316 27D GGCCTGGGCA AAAGTCCCAGGCTCTCATTAGTATGGG/--------------------------- AAACTTTCCA 3070 hom 69 het 25 0 24 7 AAAGTCCCAGGCTCTCATTAGTATGGG 1 0 50530 CASAVA_Build 1 119876734 3D CTTGAACAAG TGT/--- TGTTTTCAAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TGT 2 1 50531 CASAVA_Build 1 119877681 2D TAATACAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 30 1 26 3 T 13 11 50532 CASAVA_Build 1 119882800 1I GAATTTTCCA -/G TAAGTAAACT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 0 1 50533 CASAVA_Build 1 119883376 2I AAGACAGAGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 223 hom 44 1 32 11 GA 8 9 50534 CASAVA_Build 1 119886197 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTCTTGA 3070 hom 73 het 26 0 25 1 T 8 5 50535 CASAVA_Build 1 119886684 1I ACATTCTAAG -/C ACACCTGACA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 C 0 1 50536 CASAVA_Build 1 119889597 1I GAAAAATAGC -/G GTATCTTGTA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 G 1 2 50537 CASAVA_Build 1 119917723 1I CAGAGTGTGG -/A GGTGGAAGCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 0 1 50538 CASAVA_Build 1 119917955 7I ACAGATGATC -------/AGCACTA ATCACCAGCG 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 AGCACTA 0 1 50539 CASAVA_Build 1 119923462 1I TAAAAGCAAT -/G GCAGCAAAAG 3070 het 480 hom 9 1 8 0 G 1 2 50540 CASAVA_Build 1 119936882 1I GTACCGACAC -/T TTGTAAGGCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 2 3 50541 CASAVA_Build 1 119946977 6I ATACCAGAAA ------/AAAAGC AAAAGCAACG 3070 het 3070 hom 43 12 23 8 AAAAGC 1 2 50542 CASAVA_Build 1 119951457 1D TCTGTTTCCT A/- AACCATTATC 3070 het 3070 ref 31 15 14 4 A 3 2 50543 CASAVA_Build 1 119953681 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 933 hom 34 6 19 9 T 13 12 50544 CASAVA_Build 1 120007656 18D TCTCTCTCTC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 1067 het 1067 ref 24 8 6 10 T 30 12 50545 CASAVA_Build 1 120009530 1D TCCAAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 2810 het 2810 ref 37 15 9 13 T 15 14 50546 CASAVA_Build 1 120012015 5D GCCACACTAC CATAA/----- CATAAGAACC 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 CATAA 2 1 50547 CASAVA_Build 1 120021991 1D CTACATTCAA C/- CCCGATGTAC 3070 het 3070 ref 50 21 22 7 C 4 3 50548 CASAVA_Build 1 120029295 1D CCAGTATGGG T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 8 7 50549 CASAVA_Build 1 120034760 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1222 het 1222 ref 20 10 3 7 T 17 16 50550 CASAVA_Build 1 120043122 2I AATATTTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2829 hom 29 9 11 9 TA 7 8 50551 CASAVA_Build 1 120069121 1D AGTGTGGGTG C/- CTATATGTAG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 C 2 1 50552 CASAVA_Build 1 120070127 4I TGTCTAAAAT ----/AGAG AAAGTGCTCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AG 0 2 50553 CASAVA_Build 1 120077491 1D TTTTGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2506 het 271 hom 26 3 9 14 T 15 14 50554 CASAVA_Build 1 120077665 1D ATTTTTTGTA G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 41 het 15 0 11 4 G 10 9 50555 CASAVA_Build 1 120078718 3D TTGCCATTCT TAA/--- TAATAACAAT 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 TAA 3 2 50556 CASAVA_Build 1 120082214 1D CCATGGGGTG T/- TTTTTTTTTT 2487 het 2487 ref 34 12 11 11 T 11 10 50557 CASAVA_Build 1 120082254 2D CCTAAGTTCT AA/-- GTTCCCTGAG 1644 het 1644 ref 26 9 5 12 A 2 0 50558 CASAVA_Build 1 120090017 2D CTTTAGGAAA CT/-- CTGTAATATT 3070 het 3070 hom 47 18 25 5 CT 2 1 50559 CASAVA_Build 1 120094093 7I GCAGCTACCT -------/TCATATA GGGTTCATAT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TCATATA 0 1 50560 CASAVA_Build 1 120096146 7D TGGAGCAATA TTTTGTT/------- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 51 25 16 14 TTTTGTT 2 1 50561 CASAVA_Build 1 120098774 1D TAATGCTCAT A/- AAAACAGTAG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 5 4 50562 CASAVA_Build 1 120100042 4D AGTGTGTGTG TGTA/---- TATATATATA 3070 hom 83 het 32 0 28 4 TGTA 1 0 50563 CASAVA_Build 1 120106508 2I AGTGGTAACA --/GG GGTCAAATGA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 G 2 4 50564 CASAVA_Build 1 120106595 1D ATTTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 32 1 28 3 A 11 10 50565 CASAVA_Build 1 120109905 3I TGTCTTTCTC ---/CTT CTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 CTT 1 2 50566 CASAVA_Build 1 120133411 5D TTCTATTCTC TTCTT/----- CAGGAACAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 7 TTCTT 1 0 50567 CASAVA_Build 1 120134242 1D ATTCTAGACC T/- GTTCATTGTC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 1 0 50568 CASAVA_Build 1 120141335 4D TTGAGCAGTG CTAA/---- CTGTTTAAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 7 CTAA 1 0 50569 CASAVA_Build 1 120157251 1D AAGTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 7 A 11 10 50570 CASAVA_Build 1 120174374 1I CTTAAATTCA -/T TTTTTTCCTG 2230 het 2230 ref 18 9 6 3 T 6 7 50571 CASAVA_Build 1 120183210 9I TGATTATATG ---------/TGTGAGTCA GAGCACCTAG 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 TGTGAGTCA 0 1 50572 CASAVA_Build 1 120190411 4D AATATTCACA TAAT/---- TATTTAGTAA 1048 het 1048 ref 44 39 4 3 TAAT 1 0 50573 CASAVA_Build 1 120192182 1D GCAGCCTCTT C/- CCCCATCCCC 3070 het 3070 ref 45 32 10 4 C 5 4 50574 CASAVA_Build 1 120193288 2D20M13D TTGCTGCATC ATATATCACTTTATGTTTAACTTTTTTATGTTTAA/--ATGTCACTTTATGTTTAACT------------- TTTTTTTATG 2520 het 2520 ref 42 48 6 10 N/A 0 0 50575 CASAVA_Build 1 120194754 2I CCAAGGAAAC --/TG TGTGCCACTT 3070 het 3070 ref 51 28 13 10 TG 2 3 50576 CASAVA_Build 1 120244028 1D TACCCTTGCC T/- TTTTTAGTGA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 T 6 5 50577 CASAVA_Build 1 120251920 2I TGCCAGGGGT --/GG GGTGTGTGCG 3070 het 3070 ref 43 17 19 7 G 2 4 50578 CASAVA_Build 1 120257916 3I TGTTGAGTTT ---/CTA CTACGTTAGT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 CTA 1 2 50579 CASAVA_Build 1 120271672 1D ATTCAAGGGA T/- TTTTTTTTTT 1751 het 1751 ref 33 21 4 8 T 12 11 50580 CASAVA_Build 1 120284019 5D CCTGTAAGTC AAGTT/----- AAGTTTGGCC 3070 het 3070 hom 47 20 24 7 AAGTT 2 1 50581 CASAVA_Build 1 120298206 1D AGTTTTTGGT G/- CCAAATAGAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 G 1 0 50582 CASAVA_Build 1 120299914 1I TCTTAGAGTC -/A TATTAATCCA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 0 1 50583 CASAVA_Build 1 120317500 5D GAACATCTGC TATGA/----- TATAACAACT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 TATGA 1 0 50584 CASAVA_Build 1 120318112 5D TTGATACAAC AAGTA/----- AAGGAGGATG 3070 het 3070 ref 48 25 22 4 AAGTA 1 0 50585 CASAVA_Build 1 120333802 5I ATTATAAAGT -----/AGGTA AGGTAAAGGA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 AGGTA 1 2 50586 CASAVA_Build 1 120336331 5D GTTTATCACG TTCAA/----- TTCATTCATT 3070 het 3070 ref 37 26 10 3 TTCAA 1 0 50587 CASAVA_Build 1 120347849 1D AGATATGTGT A/- AAAAAAAATT 2843 het 2843 ref 33 21 7 8 A 9 8 50588 CASAVA_Build 1 120348927 1D GGTGTACATA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 T 10 9 50589 CASAVA_Build 1 120350408 3D42M1D TTAATATTTA AGTAGTAGGCATTTTTAACCAAATAAAAAGGCACAAAATATAATTA/---AGTAGGCATTTTTAACCAAATAAAAAGGCACAAAATATAATT- AAATAACATA 3070 het 3070 ref 36 30 12 12 N/A 0 0 50590 CASAVA_Build 1 120353087 5I TAAACAGGAA -----/GGAAT GGAATGGAGC 3070 het 3070 ref 62 40 15 7 GGAAT 1 2 50591 CASAVA_Build 1 120354039 3D CATTTGTTAC TGT/--- TGTTGTTCAC 1848 het 1848 ref 45 35 4 6 TGT 3 2 50592 CASAVA_Build 1 120354860 1D23M4D TCTTCAATGT GGGTGGATCCCACTGTGAGAAAGCTCTT/-GGTGGATTCCACTGTGAGAAAGC---- TCTTTCTTAA 3070 het 3070 ref 64 50 7 15 N/A 0 0 50593 CASAVA_Build 1 120355260 1D AGCTGTAAAG A/- AAGGGAAATA 1811 het 1811 ref 45 37 4 4 A 3 2 50594 CASAVA_Build 1 120358553 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 69 42 14 13 A 12 11 50595 CASAVA_Build 1 120359310 1I AACGAAGGGG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 56 29 24 3 A 7 8 50596 CASAVA_Build 1 120359930 4D TTTTAATTCT GTCA/---- CTCTGTGTAA 3070 het 3070 ref 82 42 31 12 GTCA 1 0 50597 CASAVA_Build 1 120360101 1D CCCTTCTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 52 26 18 8 A 10 9 50598 CASAVA_Build 1 120360275 1D TGTATGTGAA G/- GAAACAAAGA 3070 het 3070 ref 59 36 21 2 G 2 1 50599 CASAVA_Build 1 120361531 1I CTCTGTTCTT -/A ATAACCCTGA 3070 het 3070 ref 83 40 35 8 A 1 2 50600 CASAVA_Build 1 120369153 4I CAGTTTTGTT ----/TTTG TTTTTTTTTA 2928 het 2928 ref 38 18 7 13 TTTG 0 1 50601 CASAVA_Build 1 120370960 4D ATTTTTTCTT ACTC/---- TCTCTCAAGG 3070 het 3070 ref 76 52 12 18 ACTC 1 0 50602 CASAVA_Build 1 120371265 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTGCAT 3070 het 1804 hom 29 5 15 9 T 7 6 50603 CASAVA_Build 1 120372588 1D ATGCACCACG T/- TTTTTTTTCC 2991 het 2991 ref 60 34 8 18 T 9 8 50604 CASAVA_Build 1 120372758 1D TTCTGACTTG A/- AAAAAAAAAT 1368 het 1368 ref 43 32 3 8 A 10 9 50605 CASAVA_Build 1 120373052 1D GAGGCAGAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 63 24 30 10 A 9 8 50606 CASAVA_Build 1 120373161 1I GAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 56 20 30 6 A 9 10 50607 CASAVA_Build 1 120375238 1D AAGTTCCCCC T/- CTCCAAGTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 1 0 50608 CASAVA_Build 1 120375289 2D GTGCAAGATC AG/-- AGAGACGCTA 3070 het 3070 ref 42 27 8 7 AG 3 2 50609 CASAVA_Build 1 120375481 3D ATGGTAATAG TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 ref 83 52 19 12 TAA 4 3 50610 CASAVA_Build 1 120377971 4D TGAAGGATAC ACTA/---- ACTACCTTTT 3070 het 3070 ref 66 39 23 4 ACTA 2 1 50611 CASAVA_Build 1 120378071 1I TCTAATTTTT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 53 35 16 2 A 6 7 50612 CASAVA_Build 1 120378763 4D CTAAAAAATT AATA/---- AATAAAATAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 AATA 2 1 50613 CASAVA_Build 1 120382201 2D TGCAAAAAAA AT/-- TCATCAGTGT 2682 het 2682 ref 56 45 7 7 AT 1 0 50614 CASAVA_Build 1 120383132 2I AATGAAAAAC --/AT AGAAAACAGA 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 AT 0 1 50615 CASAVA_Build 1 120388765 3I ATTATCTGAC ---/ACA ACATATAGCA 2781 het 2781 ref 58 49 6 3 ACA 1 2 50616 CASAVA_Build 1 120390107 3I TAAAAAACAT ---/ATA ATAAGCTTTA 3070 het 3070 ref 53 38 9 6 ATA 1 2 50617 CASAVA_Build 1 120392186 1D TTCTGGGATT A/- ACAGGCATGA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 2 1 50618 CASAVA_Build 1 120394346 1I CAAGATTTAG -/A AAAAAACACA 2848 het 2848 ref 41 33 6 2 A 6 7 50619 CASAVA_Build 1 120396143 1D GAAATGTATC A/- AGTCACAGTT 2518 het 2518 ref 45 33 6 6 A 2 1 50620 CASAVA_Build 1 120399870 1I CCTGACAACC -/A CTTGTTCAAG 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 A 0 1 50621 CASAVA_Build 1 120401814 4D CCATCCACTT CTTA/---- CTTATTCAGA 1605 het 1605 ref 49 42 4 6 CTTA 2 1 50622 CASAVA_Build 1 120402378 2D CGGTGGCTCA CG/-- CCTGTAATCC 2391 het 2285 hom 21 8 5 8 CG 1 0 50623 CASAVA_Build 1 120403303 1D CTACACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 14 17 A 15 14 50624 CASAVA_Build 1 120404190 1I59M2D CCAAAGGATT -AAAAAAATTAACCTATGAAATGAACAATTTTTATATCAACATTGGTAGCAATTTGATGTTA/AAAAAAAATTAACCTATGAAATGAACAATTTTTATATCAACATTGGTAGCAATTTGATGT-- TGTTATATAC 3070 het 3070 ref 56 61 17 5 N/A 0 0 50625 CASAVA_Build 1 120404452 4D TCACTGTAAT GAGA/---- GAGGCATATT 3070 het 3070 ref 48 30 12 6 GA 3 1 50626 CASAVA_Build 1 120404555 2I GTGTGTGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 AT 6 7 50627 CASAVA_Build 1 120407689 4I TTTTAAGACA ----/AAAC AAACAACTTT 3070 het 3070 ref 61 38 16 7 AAAC 1 2 50628 CASAVA_Build 1 120407838 4I AAACAAACAA ----/AAAC AAACACTTTG 3070 het 3070 ref 37 27 7 3 AAAC 1 2 50629 CASAVA_Build 1 120408889 2D CTCTTGGTTC AA/-- AAAAAAAAAA 2845 het 2295 hom 33 10 8 15 A 14 12 50630 CASAVA_Build 1 120408982 1D AAAAAATCTC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 47 30 11 7 A 8 7 50631 CASAVA_Build 1 120409219 2D GTCAAAGTGA CC/-- TTTATAAATT 2718 het 2718 ref 38 22 6 11 C 2 0 50632 CASAVA_Build 1 120410577 1I GGACACAGAG -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 57 32 15 11 T 6 7 50633 CASAVA_Build 1 120410960 1I CCACCACACC -/A AAAAAAAAAG 1705 het 1705 ref 54 39 4 11 A 9 10 50634 CASAVA_Build 1 120411051 4D GATTTTGTTT AAGC/---- AAGAGAAGAA 2349 het 2349 ref 45 37 7 2 AAGC 1 0 50635 CASAVA_Build 1 120412491 1D TATTTCCACT A/- AAGGGTCTGA 3070 het 3070 ref 66 48 11 8 A 3 2 50636 CASAVA_Build 1 120414720 3D ATAGTGAAAA AAC/--- TAATCACAGA 3070 het 3070 ref 100 75 15 12 AAC 1 0 50637 CASAVA_Build 1 120415208 2D ATTGATTGTT GG/-- GGGAGCAAGA 3070 het 3070 ref 50 30 15 5 G 5 3 50638 CASAVA_Build 1 120415343 1D AAAGAAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 67 37 9 21 A 10 9 50639 CASAVA_Build 1 120416992 2D GATAAGCTGT AA/-- AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 55 28 7 23 A 8 6 50640 CASAVA_Build 1 120418669 1D CAATTTTATT G/- ATGTTAAGGA 3070 het 3070 ref 78 60 11 7 G 1 0 50641 CASAVA_Build 1 120421081 2D TCACTGCCCC CT/-- GAGACTCTCT 3070 het 3070 ref 93 75 10 10 CT 1 0 50642 CASAVA_Build 1 120424529 1I ACACCCCCCC -/T CCTCTTGCTC 3070 het 2445 hom 46 10 12 24 T 0 1 50643 CASAVA_Build 1 120427477 1I ACCTACTAAC -/A AACAAAAGTC 2294 het 2294 ref 36 29 5 2 A 2 3 50644 CASAVA_Build 1 120428873 1D AATTAAGTTG T/- TTTTTTATCC 3070 het 3070 hom 58 26 24 9 T 7 6 50645 CASAVA_Build 1 120428948 1D GACTGATTCA G/- GACACAGCAG 3046 het 3046 ref 82 66 7 10 G 2 1 50646 CASAVA_Build 1 120430937 2I AAACAAACAA --/AC AAAAAACAAA 2602 het 2602 ref 68 49 9 10 AC 0 1 50647 CASAVA_Build 1 120440310 1D TCCTATTCCT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2229 hom 26 7 8 11 C 10 9 50648 CASAVA_Build 1 120441469 1D ACCAGGCTGA C/- CCCCCCACCA 3070 hom 35 het 18 0 13 5 C 7 6 50649 CASAVA_Build 1 120448495 2I TCTCTGCAAA --/CT CTCTGTCATC 3070 het 2953 hom 17 8 7 2 CT 2 3 50650 CASAVA_Build 1 120448629 1D TCCTAGCAGA G/- GGCCCAGTCA 521 het 521 ref 34 28 2 5 G 3 2 50651 CASAVA_Build 1 120449885 3I CTGTGTTTTT ---/TTA TTATTATTAT 2908 het 2908 ref 59 49 7 3 TTA 3 4 50652 CASAVA_Build 1 120458339 1I CATGGTAAGA -/C CCCCATCTCT 2069 het 2069 ref 45 33 6 6 C 4 5 50653 CASAVA_Build 1 120467466 2D AAATATGCAC AT/-- AGTTTAAAGA 2835 het 2835 ref 53 44 6 3 AT 1 0 50654 CASAVA_Build 1 120478821 1I GGAATTATTT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 58 28 15 15 G 1 2 50655 CASAVA_Build 1 120483547 1I GATTCCATGT -/C TTTGCTATTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 0 1 50656 CASAVA_Build 1 120488280 1I AGAGAAAAGA -/G GCTGATGTAG 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 G 1 2 50657 CASAVA_Build 1 120489464 1I ATTTTTTGAC -/A AAAAAAAAAT 1952 het 1952 ref 58 33 5 20 A 9 10 50658 CASAVA_Build 1 120493655 2I32M4D TTGAGTAGTG --TTGTAATTCTTTTTGTAGAGATCTTTCACCTCCCTT/TTTTGTAATTCTTCTTGTAGAGATCTTTCACCTC---- GTTATCTATA 3070 het 3070 ref 67 49 15 20 N/A 0 0 50659 CASAVA_Build 1 120495467 1D GATTAGCACA C/- ACACACACAA 2815 het 2815 ref 30 19 6 5 C 1 0 50660 CASAVA_Build 1 120495908 3D14M2D TGTAATAAAA CCCCACCTTTTGAAAGTTA/---TACCTTTTGAAAGT-- TATATTTAAA 3070 het 3070 ref 79 58 10 14 N/A 0 0 50661 CASAVA_Build 1 120551571 1I TTGACCACAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 47 13 27 7 T 9 10 50662 CASAVA_Build 1 120552339 1I AGGTGTATGT -/G GTTGGGAAAG 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 G 1 2 50663 CASAVA_Build 1 120556679 3I CGACACTCTC ---/TAT TATGCTCTTA 1942 het 1942 ref 17 8 6 3 TAT 1 2 50664 CASAVA_Build 1 120565245 1I CATGATCATC -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 6 7 50665 CASAVA_Build 1 120580733 1D CCAGACAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 30 3 18 9 T 14 13 50666 CASAVA_Build 1 120582982 1D TTCAAAAAAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 27 19 7 1 T 8 7 50667 CASAVA_Build 1 120617535 1D TTTTCTCTCT C/- CTTGTTTAGC 1817 het 1817 ref 20 11 4 5 C 2 1 50668 CASAVA_Build 1 120618646 1D GAAGGAGCAT G/- GGGGTGGGGG 2881 het 2881 ref 29 14 9 6 G 5 4 50669 CASAVA_Build 1 120618930 1D CTGTGGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 11 10 50670 CASAVA_Build 1 120628546 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 960 het 663 hom 19 7 4 8 T 17 16 50671 CASAVA_Build 1 120634601 4D TCTGTAAGAG AAGT/---- AAGTCTGGCA 2459 het 2459 ref 29 17 6 9 AAGT 2 1 50672 CASAVA_Build 1 120636519 1I AAGACAGGTC -/A CTTGGTTTCT 3070 het 3070 ref 44 30 10 4 A 0 1 50673 CASAVA_Build 1 120676644 1I TATTTTTTAC -/T TTTTTTTTTA 3017 het 3017 ref 32 19 8 5 T 9 10 50674 CASAVA_Build 1 120705172 1D GTTTGTAATG T/- TTTTTTAGTA 3070 het 3070 hom 20 10 7 3 T 7 6 50675 CASAVA_Build 1 120705257 3D CATAACCACT ATG/--- ATATTTACTG 1386 het 1386 ref 31 26 3 3 ATG 1 0 50676 CASAVA_Build 1 120705733 1D CAATTACATA T/- TTTTTTTTGC 1456 hom 14 het 10 0 5 6 T 9 8 50677 CASAVA_Build 1 120705895 1I GAATTCGGGG -/A AAAAAAAAAT 2198 het 456 hom 10 1 6 3 A 9 10 50678 CASAVA_Build 1 120710534 3I CCTCAATTTC ---/TTT TTCTTGTTTT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 T 2 5 50679 CASAVA_Build 1 120712856 1D ATTTTTAGAG T/- TTTTTTTTTT 2671 het 1279 hom 22 9 6 7 T 13 12 50680 CASAVA_Build 1 120716221 5D ATTTCTGCTT ATTAA/----- ATTGTTTCCA 3070 het 3070 ref 35 16 18 5 ATTAA 1 0 50681 CASAVA_Build 1 120718721 1D TAATGTTTCC T/- ACTAATAAAC 3070 het 3070 ref 64 54 8 2 T 1 0 50682 CASAVA_Build 1 120724887 4D GGTAATAATC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 ATTT 6 5 50683 CASAVA_Build 1 120813182 7D GTCAGGCTCC TTGAAGA/------- GATACTTGAA 3070 het 3070 ref 48 32 13 5 TTGAAGA 1 0 50684 CASAVA_Build 1 120818405 1I GTCAGACATT -/C CCCGATACTA 3070 het 3070 ref 45 28 10 7 C 3 4 50685 CASAVA_Build 1 120819252 1D AAGGTTATGC T/- GCAAATTAGG 2908 het 2908 ref 98 74 7 19 T 1 0 50686 CASAVA_Build 1 120823770 1I TTATGGCCAT -/A ATAGCTGATT 3070 het 3070 ref 74 51 10 13 A 1 2 50687 CASAVA_Build 1 120828414 1I CATATGAGTG -/A AAATAAAAAG 3070 het 3070 ref 56 23 16 17 A 3 4 50688 CASAVA_Build 1 120829136 1I GCCTTCTGCT -/C CTCATCTGTC 3070 het 3070 hom 70 20 34 16 C 1 2 50689 CASAVA_Build 1 120829294 2D GGGAAGGCCT GG/-- GGTAAAATGA 3070 het 3070 hom 59 31 28 2 G 4 2 50690 CASAVA_Build 1 120835040 4I AAATTTCACT ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 93 49 19 25 A 11 15 50691 CASAVA_Build 1 120835400 2I AAGAGATAAC --/AG AAATTCTGGA 1279 het 1279 ref 65 47 3 15 AG 0 1 50692 CASAVA_Build 1 120835516 4D ATGGAAAATA CTGT/---- CTCTGAGAAA 3070 het 3070 hom 63 30 30 3 CTGT 1 0 50693 CASAVA_Build 1 120835679 3I CTTCCTTCCC ---/CCT CCTCCTCCTT 3070 het 3070 hom 84 24 24 36 CCT 3 4 50694 CASAVA_Build 1 120837867 1I TCTTGTGTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2725 hom 31 8 11 12 A 9 10 50695 CASAVA_Build 1 120839222 2I TACTTACATC --/TT TTTTTGTCTT 3070 het 3070 ref 52 40 8 4 T 5 7 50696 CASAVA_Build 1 120842007 2D TGATGGGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 93 55 15 23 A 12 10 50697 CASAVA_Build 1 120842191 1D CTGTTGAGAT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 89 43 28 19 A 8 7 50698 CASAVA_Build 1 120842935 1I TAAGGAAAAA -/T AAAAAGCCAC 3070 het 3070 ref 76 40 11 27 T 0 1 50699 CASAVA_Build 1 120843848 13D AGGTGAAATG AAACGAAATAATT/------------- AAATGAAATG 817 het 817 ref 60 47 2 20 AAACGAAATAATT 1 0 50700 CASAVA_Build 1 120844228 3D CAAATGAAAT GAC/--- GAGATGAAAA 1366 het 1366 ref 51 36 5 10 GAC 1 0 50701 CASAVA_Build 1 120901962 3I TCAAATAAAC ---/AAT AATTGTGAGT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAT 1 2 50702 CASAVA_Build 1 120902390 1D TAATTAAGAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 9 8 50703 CASAVA_Build 1 120942459 6I AATATGTCTT ------/AGAAAC AGAAAAAAAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AGAAAC 0 1 50704 CASAVA_Build 1 120960119 4I ATCTTTCTCT ----/CTTG CTCGCTCTCT 3070 hom 70 het 32 0 27 5 CTTG 0 1 50705 CASAVA_Build 1 120975198 1I AGAAACCTTG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 65 het 24 0 22 2 T 7 8 50706 CASAVA_Build 1 120996534 1D AGTGATAGAA T/- TTTTTTTTTT 2227 het 1314 hom 25 10 7 8 T 19 18 50707 CASAVA_Build 1 121013460 1I TATAATAAAA -/T TTTGGTAGTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 3 4 50708 CASAVA_Build 1 121036486 3D ACTCAACAAT AAC/--- AACAAAACAA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AAC 2 1 50709 CASAVA_Build 1 121049451 1D AACTTAGATG T/- TTTTTTTACC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 8 7 50710 CASAVA_Build 1 121054526 1D ATGTGAAGAT A/- TTTCCTTTTC 3070 het 3070 ref 90 46 17 27 A 1 0 50711 CASAVA_Build 1 121057048 3D26M1D CTGTCTTGTT TTACGATGAAGTTATTTCCCTTACTACGAT/---AGGTGCAGTTATCCCGTTTCCAACGA- AGGCCTCAAA 1235 het 1235 ref 53 49 4 9 N/A 0 0 50712 CASAVA_Build 1 121057730 2I GTTTAGCTTT --/TA TCGGAAGATT 3070 het 3070 ref 70 19 22 32 TA 0 1 50713 CASAVA_Build 1 121058417 1I TTAGGGGACG -/T TTATCCCGTT 2423 het 2423 ref 101 51 10 40 T 2 3 50714 CASAVA_Build 1 121058616 1I ACGCCTCAAA -/G CGGTCCAAAT 3070 het 3070 hom 92 28 40 24 G 0 1 50715 CASAVA_Build 1 121061777 1I TACAAAGAAG -/T TTCTGAGAAT 3070 het 3070 ref 91 74 11 6 T 2 3 50716 CASAVA_Build 1 121070845 3I CAGATTCTGC ---/AGG AGGAGTGTTT 2005 het 2005 ref 18 13 5 0 AGG 1 2 50717 CASAVA_Build 1 121083748 1D5M2D GCAGATGCCA GCAAAAGT/-CAAAA-- AGAGAGTTTC 3070 het 2718 hom 18 6 12 8 N/A 0 0 50718 CASAVA_Build 1 121130682 1I GTGACGTTAT -/C CCGCTTCCAA 2704 het 2704 ref 69 55 7 7 C 2 3 50719 CASAVA_Build 1 121175321 1I AAAGTGCTCC -/A AATATCCACT 2646 het 2646 ref 19 12 6 1 A 2 3 50720 CASAVA_Build 1 121180696 1I CGAAATGTTC -/A AAAGAGGTCC 3070 het 3070 ref 54 39 14 1 A 3 4 50721 CASAVA_Build 1 121181052 1I AGTTCCACCT -/A TCCCTTTGCA 3070 het 2764 hom 19 6 12 1 A 0 1 50722 CASAVA_Build 1 141484798 3D TATCTCAAAA TAT/--- TAAGAGCTAT 3070 het 3070 ref 68 42 21 8 TAT 1 0 50723 CASAVA_Build 1 141488475 3I ATTTTGCACC ---/CAT TGTTGTATAG 3070 het 3070 hom 47 14 27 7 CAT 0 1 50724 CASAVA_Build 1 141488526 1D GAAGTTTAAG A/- TTTTTTTTCA 2552 het 2552 ref 99 70 6 24 A 1 0 50725 CASAVA_Build 1 141489216 5I TTCCAACAAT -----/TGAAC TAAAGTGGTA 3070 het 3070 hom 101 22 67 12 TGAAC 0 1 50726 CASAVA_Build 1 141489558 1I CTCGTCATTT -/A ACATTAGGTG 1454 het 770 hom 6 3 3 2 A 1 2 50727 CASAVA_Build 1 141491085 4D GTTTCTTACA TTTG/---- TTTGTATCTT 3070 het 3070 ref 32 22 8 4 TTTG 2 1 50728 CASAVA_Build 1 141491408 1D ACTTTTGTAT G/- TTTTTTTAGT 688 het 688 ref 70 61 3 6 G 1 0 50729 CASAVA_Build 1 141494238 6I CTCCATTTTG ------/ACTTTA AATTTATAAC 3070 het 3070 hom 98 19 70 9 ACTTTA 0 1 50730 CASAVA_Build 1 141498759 1I CCCTTCATTA -/T TTTTTTTGTA 2946 het 2946 ref 71 38 7 26 T 7 8 50731 CASAVA_Build 1 141499748 1I TGTGGTGTTT -/G GTTTTTTTGT 2006 het 2006 ref 28 22 5 1 G 1 2 50732 CASAVA_Build 1 141500461 3D CAACAAAGCT AGA/--- AGAAGACTGT 1809 het 1809 ref 90 75 5 14 AGA 3 2 50733 CASAVA_Build 1 141501543 1D GTCAAAGAAA G/- GGGTGACAGA 1425 het 1425 ref 73 68 4 1 G 4 3 50734 CASAVA_Build 1 141504074 4I GTATAACAAA ----/CTGT CTCTCAGACC 3070 het 3070 ref 42 20 17 8 CTGT 0 1 50735 CASAVA_Build 1 141504348 1I GACATCTTAA -/C ATCACAATTA 3070 het 3070 hom 71 27 41 3 C 0 1 50736 CASAVA_Build 1 141504489 1I ACAGAAGCTG -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 6 7 50737 CASAVA_Build 1 141507651 2D AAATACAGAC AT/-- GTGGTTAGGG 3070 het 3070 ref 82 54 20 11 AT 1 0 50738 CASAVA_Build 1 141511947 1D18M1I ATGTTTTTTT CATGAAGAAATATAGGCAT-/-ATGAAGAAATATAGGCATA ATTTAAACAC 2856 het 2856 ref 95 89 7 30 N/A 0 0 50739 CASAVA_Build 1 141519284 1I TGGAGCTGTG -/C TTTTGCCAAC 3070 het 3070 ref 56 32 19 5 C 0 1 50740 CASAVA_Build 1 141519550 1I TGTTTGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 66 35 20 11 T 10 11 50741 CASAVA_Build 1 141524631 1I GAATACAAAT -/A AAAATATACT 3070 het 3070 ref 66 23 14 29 A 4 5 50742 CASAVA_Build 1 141526038 3D ACATATAAAC AAT/--- ACTATATTTA 3070 het 3070 ref 90 65 15 16 AAT 1 0 50743 CASAVA_Build 1 141526114 2D GTGTGTTCAT CA/-- CCTCTATTCA 1729 het 1729 ref 89 74 4 12 CA 1 0 50744 CASAVA_Build 1 141528760 2I CTTTGAGAGC --/TT TTTTTTTTTC 2821 het 2821 ref 57 37 8 12 T 9 11 50745 CASAVA_Build 1 141531089 2D AATAACAAAC AG/-- AGAAAGGCTC 946 het 946 ref 48 35 3 11 AG 2 1 50746 CASAVA_Build 1 141533997 1D GGTCTGATCA C/- CCCCAACATT 3070 het 3070 hom 75 15 45 18 C 5 4 50747 CASAVA_Build 1 141534231 1D TTGGAAGAGA T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 97 78 12 8 T 6 5 50748 CASAVA_Build 1 141537518 2I AAAATAATGT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 80 42 15 23 A 9 11 50749 CASAVA_Build 1 141537552 1I ACCAGATAGG -/T GGAAAAAGAA 2138 het 2138 ref 81 52 9 21 T 0 1 50750 CASAVA_Build 1 141540238 1D TCCATCTCAA C/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 88 55 28 7 C 1 0 50751 CASAVA_Build 1 141542329 1D TATAAACACA G/- GAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 95 41 45 9 G 2 1 50752 CASAVA_Build 1 141543710 2D AATATTAAAA AC/-- ATAATGATAA 3070 het 3070 ref 100 59 13 30 AC 1 0 50753 CASAVA_Build 1 141548820 1I GATGTTCTTC -/A AATCCAATGA 3070 het 3070 hom 80 28 43 9 A 2 3 50754 CASAVA_Build 1 141548980 4I GAGAAGCAAG ----/AACA AACAAATTCA 3070 het 3070 hom 76 10 57 9 AACA 1 2 50755 CASAVA_Build 1 141549493 1I GGGACACAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 81 54 20 7 A 7 8 50756 CASAVA_Build 1 141550361 1D TCATGAAAGT G/- GACATACTGC 3070 het 3070 ref 99 58 31 16 G 2 1 50757 CASAVA_Build 1 141551184 1D CAAACTTATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 69 26 26 19 A 10 9 50758 CASAVA_Build 1 141552198 2I ATGATGGACT --/AG AGAGAAAATT 3070 het 3070 ref 92 61 18 13 AG 2 3 50759 CASAVA_Build 1 141554426 6D ACTGTAGTTT TGACTA/------ CCAGGGTTCA 3070 het 3070 ref 71 55 7 16 TGACTA 1 0 50760 CASAVA_Build 1 141554692 1D GGATTATTAG T/- TTTTTTTCTT 2052 het 2052 ref 68 31 7 31 T 8 7 50761 CASAVA_Build 1 141555145 2I TAAAAATACA --/AT AAAAAAAAAT 882 het 882 ref 39 26 3 10 AT 0 1 50762 CASAVA_Build 1 141556738 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 40 3 16 22 T 11 12 50763 CASAVA_Build 1 141558094 1D26M1I CTTTACCAAG AAATCAAGAATCCAAAAATGGAATTAC-/-AATCAAGAATCCAAAAATGGAATTACA AAAATAAATC 3070 het 3070 ref 86 36 15 55 N/A 0 0 50764 CASAVA_Build 1 141558195 8I AACACTAAAA --------/ACTACAAT ACATGGTTAG 3070 het 3070 ref 101 58 22 24 ACTACAAT 0 1 50765 CASAVA_Build 1 141559384 4I ATAGGGAGAT ----/TTGA TTGATTGATG 3070 het 3070 hom 59 19 29 11 TTGA 2 3 50766 CASAVA_Build 1 141562199 3D TAGTGAACTT ATA/--- ATGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 99 70 19 12 ATA 1 0 50767 CASAVA_Build 1 141568074 1D ATCATGACTT A/- AAAAATTTTT 1081 het 1081 ref 75 60 3 12 A 6 5 50768 CASAVA_Build 1 141568157 5D TTGTTTTTCC TTTTT/----- TTTTTTTTGG 3029 het 3029 ref 64 28 8 28 T 13 8 50769 CASAVA_Build 1 141573004 1D ACCCTTTCTT C/- CAGTTGATCG 2630 het 941 hom 8 2 6 0 C 2 1 50770 CASAVA_Build 1 141573639 3D TGCCCCTACT GGG/--- GGGGGGTTCC 3070 het 3070 ref 30 14 14 4 G 9 6 50771 CASAVA_Build 1 141574784 2D CCCCTGGCCA TG/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 97 36 16 45 TG 1 0 50772 CASAVA_Build 1 141576745 1I CTGAGCCTGC -/A GGGGCAGGGG 3070 het 3070 hom 91 19 47 25 A 0 1 50773 CASAVA_Build 1 141576871 2D GGGTGGGGCT CC/-- CCCCCCCGTT 3070 het 600 hom 78 6 24 48 C 9 7 50774 CASAVA_Build 1 141578589 3D GACAAAAAAC AAG/--- AAGAACATTG 3070 het 3070 ref 95 72 12 15 AAG 2 1 50775 CASAVA_Build 1 141580231 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2637 het 2637 ref 92 27 10 58 T 16 15 50776 CASAVA_Build 1 141581600 2D GTTGAGGCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 92 31 44 21 TG 9 8 50777 CASAVA_Build 1 141581815 1D GTGTCTGCAT A/- GCATATTTTT 3070 het 3070 ref 91 33 20 39 A 1 0 50778 CASAVA_Build 1 141581834 4D TTTCTCATAC TTTG/---- TTTGTGTCTT 3070 het 3070 hom 84 23 36 27 TTTG 2 1 50779 CASAVA_Build 1 141582016 3D ATTTGTTTGT TTA/--- TTATTTTTAA 3070 het 3070 ref 50 22 17 12 TTA 2 1 50780 CASAVA_Build 1 141582409 1D TTTGAAATAA T/- TTTTTATAGG 1721 het 1721 ref 85 67 6 13 T 6 5 50781 CASAVA_Build 1 141582703 1I AACCTGTGTC -/A AAAAGGATCA 3070 het 3070 ref 74 46 18 10 A 4 5 50782 CASAVA_Build 1 141582847 1D GATTTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 28 10 12 T 12 11 50783 CASAVA_Build 1 141583182 2D GCTCCTGTGA AC/-- ACATAGGTGT 3070 het 3070 ref 96 54 17 30 AC 2 1 50784 CASAVA_Build 1 141584295 2D43M3D CGGGTCGCAC CACAAGGTTTAATTAACTCGTTTGATTGTTTTTCTGTTTTCTTGGGTT/--CAAGGTTTAATTAACTGATTTAATTGTTTTTCTGTTTTCTTGG--- TTTTTTTTTC 1418 het 1418 ref 79 87 4 32 N/A 0 0 50785 CASAVA_Build 1 141585293 1D TGACCACATA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 69 22 36 13 T 10 9 50786 CASAVA_Build 1 141587816 1I CTAAAAATAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 47 20 18 9 A 7 8 50787 CASAVA_Build 1 141587999 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAATTTCA 868 het 868 ref 36 17 2 17 A 5 6 50788 CASAVA_Build 1 141589985 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 101 34 35 32 T 10 11 50789 CASAVA_Build 1 141591019 3D GCTATTTTGA TCT/--- TCTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 93 77 8 8 TCT 2 1 50790 CASAVA_Build 1 141591819 4I GCTGCCTCAC ----/CTCT CTAAGTCTTC 3070 het 3070 hom 98 39 49 10 CT 1 3 50791 CASAVA_Build 1 141592145 1D12M4D19M12D CAAAGAAAAA TAAGTAAAAAGAGAGTTAGGCTTGGGCTTAATGGAATGTTTTCTGTTT/-AAGTAAAAAGAG----AGGCTTAGGCTTAATGGAA------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 83 48 8 64 N/A 0 0 50792 CASAVA_Build 1 141592691 1D ATTCAATAAT A/- AAAAGCTTAA 3070 het 3070 hom 73 32 35 7 A 5 4 50793 CASAVA_Build 1 141593073 8I TTAGATGACT --------/CCATTTTC CCTGTCTTTC 3070 hom 178 het 73 0 59 14 CCATTTTC 0 1 50794 CASAVA_Build 1 141594496 1D TTAAAAAAAA T/- TCCAAAATCA 3070 het 3070 ref 96 61 13 23 T 2 1 50795 CASAVA_Build 1 141606580 1I AAGTACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 8 9 22 A 10 11 50796 CASAVA_Build 1 141607023 1D TCAGGAAGAG A/- AGGGAGAAAA 3070 het 3070 ref 73 45 8 20 A 2 1 50797 CASAVA_Build 1 141607038 3D AGAAAAGTGA AAC/--- AACAACAATA 3070 het 3070 ref 88 61 9 27 AAC 3 2 50798 CASAVA_Build 1 141611022 1D GCACTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 79 35 15 29 A 12 11 50799 CASAVA_Build 1 141614041 2D GGCCTCACTG AT/-- CAGGTTCCAC 3070 het 3070 ref 101 65 11 27 AT 1 0 50800 CASAVA_Build 1 141614516 1I CTGCTGACCA -/C CCCCCCACTA 2708 het 2708 ref 99 72 8 19 C 6 7 50801 CASAVA_Build 1 141616294 1I TGAACACCCA -/G GTTTTTCCGT 3070 het 3070 ref 75 34 19 22 G 1 2 50802 CASAVA_Build 1 141617480 1D CATACCAGAA G/- ACCAAGCAGC 3070 het 3070 ref 65 39 11 15 G 1 0 50803 CASAVA_Build 1 141619749 1D GGAGTCCAGA C/- CAAGGCTCTG 2411 het 2411 ref 45 27 6 12 C 2 1 50804 CASAVA_Build 1 141621314 14D CCCTGCAAAG CCACAGGTGCAAAA/-------------- CCACAGGTGC 1547 het 1547 ref 81 71 6 14 CCACAGGTGCAAAA 1 0 50805 CASAVA_Build 1 141621928 1D ATCACGAGAA C/- TCACCATCAT 2461 het 2461 ref 49 38 7 4 C 1 0 50806 CASAVA_Build 1 141622160 3D CAGCCGAATC TTA/--- TTATTCTGTC 1943 het 1943 ref 61 49 6 7 TTA 2 1 50807 CASAVA_Build 1 141622253 1I GCCACTATGC -/T TTTTTTTTTA 1947 het 1947 ref 100 52 9 39 T 9 10 50808 CASAVA_Build 1 141622863 1I GGGTCTGCAT -/G ATGGTGGCCT 2861 het 2861 ref 65 48 10 7 G 0 1 50809 CASAVA_Build 1 141628117 4I GTTCTACTTT ----/TCTG TCTGTATTAT 2156 het 2156 ref 95 79 5 11 TCTG 1 2 50810 CASAVA_Build 1 141635588 1D TGTGTGTAAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 58 40 9 9 A 8 7 50811 CASAVA_Build 1 141637180 1D CCCAACACCC T/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 49 28 10 11 T 7 6 50812 CASAVA_Build 1 141638104 4D TGTGGCAAAG TGTT/---- TGGATGCCAA 2154 het 2154 ref 54 43 6 6 TGTT 1 0 50813 CASAVA_Build 1 141638175 1D AACTTTTTTT G/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 21 14 19 G 1 0 50814 CASAVA_Build 1 141640655 3D TCCTTCTAAT CTC/--- CTGAAGCCAT 2670 het 2670 ref 67 58 6 3 CTC 1 0 50815 CASAVA_Build 1 141640736 4D GTATGTTTTG ACTT/---- ACTTAGTTAA 1593 het 1593 ref 49 37 4 10 ACTT 2 1 50816 CASAVA_Build 1 141641469 23D AACACTATAT ATATATATATATATATATATCCA/----------------------- AAATATAATT 3070 het 1249 hom 25 4 19 7 ATATATATATATATATATATCCA 1 0 50817 CASAVA_Build 1 141642099 1D TTTATTTTTC T/- GATAATTCAT 3070 het 3070 ref 28 13 14 1 T 1 0 50818 CASAVA_Build 1 141643371 1I TTGAAAATAC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 47 31 11 5 A 7 8 50819 CASAVA_Build 1 141644900 2D GCAGCAGAAA AG/-- AGTCTCCTTT 333 het 333 ref 50 14 2 34 AG 2 1 50820 CASAVA_Build 1 141644936 4I TAAAGGTTGA ----/TATG TATTTATTGA 2814 het 2814 ref 48 13 6 29 TATG 0 1 50821 CASAVA_Build 1 141645340 1I TGTTAAGACA -/T CAAATGCAAT 2815 het 2815 ref 35 26 7 2 T 0 1 50822 CASAVA_Build 1 141648231 1I TCTATCTAAA -/G GGTCTGGGAA 3070 het 3070 ref 50 31 14 5 G 2 3 50823 CASAVA_Build 1 141649375 2D ACTTTTGTAG AT/-- ATAGTGAATG 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 AT 2 1 50824 CASAVA_Build 1 141649542 1I29M2D ACTTTGTCCC -TTTTTTGTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTGA/TTTTTTTGTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTT-- GATGGAGTCA 3070 het 3070 ref 64 48 15 11 N/A 0 0 50825 CASAVA_Build 1 141651399 1I TATCTTCCAT -/A AAAAAAGCCA 1881 het 1881 ref 53 28 4 21 A 6 7 50826 CASAVA_Build 1 141651826 3D4M3D GTGCTAAAAC ATTATGCTAA/---ATGC--- GTGAATTCTG 1239 het 1239 ref 42 32 3 11 N/A 0 0 50827 CASAVA_Build 1 141654166 1D AGTTAAAAGA T/- TTTTTAGTCC 3070 het 3070 ref 42 30 10 2 T 6 5 50828 CASAVA_Build 1 141655600 1I AAATTTATTT -/A AAAGTCAATG 827 het 827 ref 55 45 2 9 A 3 4 50829 CASAVA_Build 1 141657603 1I CCTCACATTT -/G TCAATGGTAG 3070 het 3070 ref 52 32 16 4 G 0 1 50830 CASAVA_Build 1 141659238 12D ACCTCAGAGG GTGGAAAAAGGC/------------ GTGGAAAAAG 1850 het 1850 ref 45 38 4 9 GTGGAAAAAGGC 2 1 50831 CASAVA_Build 1 141659281 1D18M1D85M4D TTTTACTTTG AAAGAAGAAAATCTCTAGATTTTTGTCTATCTTTAGAACACAATGTACAGAACTCAACTTTCTACTAAAGAGTCAAAGGCTAAATTTTTAGCTAAGAAATTATGCTTCT/-AAGAAGAAAATCTCTAGA-TTTTGTCTATCTTTAGGACACAATGTACAGAACTCAACTTTCTACTAAAGAATCAAAGGATAAATTTTTATCTAAGAAATTATGC---- TTCTTACATG 3070 het 3070 ref 34 50 17 7 N/A 0 0 50832 CASAVA_Build 1 141659748 1D ATGAATACAG A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 101 33 54 15 A 7 6 50833 CASAVA_Build 1 141661397 1I TTAATGCATT -/A TGTGTAAAAT 2100 het 2100 ref 67 53 5 9 A 0 1 50834 CASAVA_Build 1 141662421 1I CTCTTCCTCT -/A AAGCCACTGG 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 2 3 50835 CASAVA_Build 1 141663403 1D TACATGTTGA C/- CCCCTTTGCT 3070 het 3070 ref 101 59 37 6 C 5 4 50836 CASAVA_Build 1 141664424 4I TACAAATTTT ----/ATCA ATCAAATGAG 1941 het 1941 ref 15 8 4 3 ATCA 1 2 50837 CASAVA_Build 1 141664867 1D CATATGGGGA T/- TTTGTTTTAA 1689 het 1689 ref 62 50 6 6 T 4 3 50838 CASAVA_Build 1 141664927 15D AGAGCAAACA AGTCATTTGCATGGG/--------------- TAAGAAACTT 1310 het 1310 ref 50 45 3 11 AGTCATTTGCATGGG 1 0 50839 CASAVA_Build 1 141668734 4D AAGACTATAA AAAT/---- AATTACTTCT 1336 het 1336 ref 42 33 4 8 AAAT 1 0 50840 CASAVA_Build 1 141670877 1D CTCAGGTCTT A/- AGAGTATGTT 3070 het 3070 hom 52 21 21 10 A 2 1 50841 CASAVA_Build 1 141731924 2I TATTTTATAC --/AT ATATATATAT 2544 het 2544 ref 87 47 7 33 AT 6 7 50842 CASAVA_Build 1 141741660 5I AGTAAAATTG -----/TTAAA TTAAATAAGC 749 het 749 ref 85 70 2 14 TTAAA 1 2 50843 CASAVA_Build 1 141741679 2D CAAAATAATT TC/-- TGAGTTAAAA 2423 het 2423 ref 88 70 6 13 TC 1 0 50844 CASAVA_Build 1 141742233 1D AGGTGATCCA C/- CCACCTCAGC 2798 het 2798 ref 93 75 7 12 C 3 2 50845 CASAVA_Build 1 141750001 1D CAGGTTTGTT A/- AATATGTATA 3070 het 3070 hom 73 36 31 10 A 3 2 50846 CASAVA_Build 1 141752240 1I TATGAGCACT -/A AATAGAGTTT 2063 het 2063 ref 46 32 5 9 A 2 3 50847 CASAVA_Build 1 141760740 4I GATTATAGTC ----/CTTA TTTAACTCTT 3070 het 3070 ref 75 59 12 4 CTTA 0 1 50848 CASAVA_Build 1 141760895 2D TAATATTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 69 25 21 26 T 12 10 50849 CASAVA_Build 1 141764860 1D27M3D AGGGAAAAAG TTTTTTTTATTGAATAAAATAATAATTATTG/-TTTTTTTATTGAATAAAATAATAATTA--- TTCATATTAC 3070 het 3070 ref 65 64 8 7 N/A 0 0 50850 CASAVA_Build 1 141766717 4D TTTTGGTCTA AAAC/---- AAACCAGAAA 1220 het 1220 ref 94 81 3 18 AAAC 2 1 50851 CASAVA_Build 1 141772384 4D TACATTGTAG TACA/---- TACATAGTCA 2185 het 2185 ref 96 74 5 18 TACA 2 1 50852 CASAVA_Build 1 141775326 2D TAGTATTTTC AG/-- AGAGTTATGC 2240 het 2240 ref 57 37 5 16 AG 3 2 50853 CASAVA_Build 1 141777871 1I ATTGCATTTG -/A TGTCTTAACA 3070 het 3070 ref 84 72 8 4 A 0 1 50854 CASAVA_Build 1 141781113 1D ATGAATTATC A/- GAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 93 70 13 10 A 1 0 50855 CASAVA_Build 1 141784878 1D CTAAAAGTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 10 22 8 A 9 8 50856 CASAVA_Build 1 141787875 1D GGCCAACAGA C/- CTAAGACTCA 3070 het 3070 ref 81 49 20 14 C 2 1 50857 CASAVA_Build 1 141793458 8D AATTCGAATA TGTGTCCC/-------- TGTGTCCCCA 2827 het 2827 ref 93 48 6 42 TGTGTCCC 2 1 50858 CASAVA_Build 1 141804210 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 88 29 37 22 T 11 10 50859 CASAVA_Build 1 141806541 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 97 27 17 53 A 13 12 50860 CASAVA_Build 1 141818286 1D CAGTAACCTC T/- GCAGACTTAA 1433 het 1433 ref 18 14 4 0 T 1 0 50861 CASAVA_Build 1 141832903 2D AGGAGTCTCA CT/-- CTGTCGCCCA 1458 het 174 hom 36 3 5 28 CT 2 1 50862 CASAVA_Build 1 141833024 7I GCGCGTGCCA -------/CCACACT CCACACTCGC 3070 het 3070 ref 68 46 9 13 CCACACT 1 2 50863 CASAVA_Build 1 141855846 1I AGCAGGAGTT -/A GACAAGCTCG 3070 het 3070 ref 63 35 21 7 A 0 1 50864 CASAVA_Build 1 141857949 7D2M8D5M5D4M38D4M11D TGAGTTTGAG CATAATATTACAGAGGCCATTACAGAGGCCTGGTTTTCTTGCTCCAATTCGAGGTCATTAGGTAAACTCACCAAGATCTTGTAG/-------TT--------CATCA-----GCCT--------------------------------------ACCA----------- AGTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 72 83 21 16 N/A 0 0 50865 CASAVA_Build 1 141858058 1I GTACTGAGAT -/G GGAGTGAAAA 3070 het 3070 ref 81 52 15 14 G 2 3 50866 CASAVA_Build 1 141886243 1D AAAGTGTTCC T/- ATTTCTCCAC 3038 het 3038 ref 78 70 8 0 T 1 0 50867 CASAVA_Build 1 141887096 1I29M1D ATGTGGGCTC -TTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAAGTAGT/TTTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAAGTAG- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 52 32 31 9 N/A 0 0 50868 CASAVA_Build 1 141888553 1I TGATCTTTTC -/A AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 97 70 14 13 A 6 7 50869 CASAVA_Build 1 141902838 1D TTATGCAGCC A/- AAAAACACAT 1018 het 1018 ref 75 62 3 10 A 6 5 50870 CASAVA_Build 1 141903498 1I ACACCTAATG -/T TAAATGACGA 1524 het 1524 ref 16 10 5 1 T 1 2 50871 CASAVA_Build 1 141903571 5I GCACGTTGTG -----/CACAT CATATGTACC 1323 het 1323 ref 35 27 5 3 CACAT 0 1 50872 CASAVA_Build 1 141903636 13D9M1D ACACACACAC AAAAAAAAAACAAACACACACAC/-------------ACACACACA- AAAAAAAAGA 1573 het 1573 ref 71 66 4 44 N/A 0 0 50873 CASAVA_Build 1 141959649 3D GCTTATAAAA AAC/--- AACCACCATT 2527 het 2527 ref 49 32 10 7 AAC 2 1 50874 CASAVA_Build 1 141961256 1I ACTCTCCACA -/C CTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 68 23 38 7 C 1 2 50875 CASAVA_Build 1 141961365 5I CTCTGTGTAG -----/TCTTA CCTTATTTCT 2090 het 2090 ref 63 54 5 4 TCTTA 0 1 50876 CASAVA_Build 1 141961648 1D TTTACAGAAG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 38 24 9 5 A 8 7 50877 CASAVA_Build 1 141963168 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 1757 het 1757 ref 78 52 4 22 A 10 11 50878 CASAVA_Build 1 141965330 2D CTCACATGGA AG/-- AGCTTTTATA 3070 het 3070 ref 57 46 9 4 AG 2 1 50879 CASAVA_Build 1 141966412 1I10M4I AATTAACTGT -GAAATGACTT----/GGAAATGACTTTAAA TAGTTATAGT 3070 het 3070 ref 93 58 33 7 N/A 0 0 50880 CASAVA_Build 1 141966778 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 286 hom 53 3 15 36 A 10 9 50881 CASAVA_Build 1 141974518 2I AGAGAAACTC --/AG AGCTCAAAAC 3070 het 3070 ref 56 38 13 5 AG 1 2 50882 CASAVA_Build 1 141978149 2D AGTCTGGCAG CA/-- TCAGGTAGTC 3070 het 3070 ref 95 59 22 16 CA 1 0 50883 CASAVA_Build 1 141980821 1D13M1I TGTTTGTTTA TTTTTTTTTTAAGA-/-TTTTTTTTTAAGAC AGGTTCTTGC 3070 het 3070 ref 44 23 16 12 N/A 0 0 50884 CASAVA_Build 1 141981359 1I CAAAATTTAG -/C CCTTACATCT 3070 het 3070 ref 53 34 15 4 C 2 3 50885 CASAVA_Build 1 141981781 3I30M1I TATATAATAT ---TTGTTTTTTAAGTAGGTTCCATGTTATGTG-/TTGTTGTTTTGTAAGTAGGTTCCATGTTATGTGT CAGATGTGTC 3070 het 3070 ref 75 63 17 3 N/A 0 0 50886 CASAVA_Build 1 141981953 1D GTTTCTTCCA C/- CTAGTGGCTG 2277 het 2277 ref 59 45 7 8 C 2 1 50887 CASAVA_Build 1 141983130 1D TTTTCTTGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 442 hom 51 5 42 4 T 9 8 50888 CASAVA_Build 1 141984078 1I CATTACCACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 99 75 12 13 T 9 10 50889 CASAVA_Build 1 141986016 1I ATTGATCTTT -/A AAAAAGCAAA 3070 het 3070 ref 89 18 13 58 A 5 6 50890 CASAVA_Build 1 141986046 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTCTGA 552 het 552 ref 74 30 6 42 T 7 6 50891 CASAVA_Build 1 141986676 1D CTAAAAATAG A/- AAAAAAATTT 1896 het 1896 ref 34 24 6 6 A 8 7 50892 CASAVA_Build 1 141986841 2D AGTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 808 het 808 ref 31 16 4 12 A 14 12 50893 CASAVA_Build 1 141988834 5D AATTTTTGTA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1555 hom 56 16 23 21 T 17 12 50894 CASAVA_Build 1 141989653 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 319 het 319 ref 70 49 2 20 CTC 0 1 50895 CASAVA_Build 1 141989689 1I19M2I ATTACGGTCA -CCCCGACCAGGACCAGCTA--/CCCCCGACCAGGCCCAGCTAAT ATTTTTTTGT 2942 het 2942 ref 69 50 9 23 N/A 0 0 50896 CASAVA_Build 1 141991308 2I TCTTCTTTCA --/CT TGAACATATA 2681 het 2681 ref 47 37 6 4 CT 0 1 50897 CASAVA_Build 1 141994488 3D AGATCCCAAG AGC/--- AGTGTTCTGA 1748 het 1748 ref 91 70 4 23 AGC 1 0 50898 CASAVA_Build 1 141996309 1I CTCACCAAAA -/C CCCCACTACT 2094 het 2094 ref 34 24 5 5 C 4 5 50899 CASAVA_Build 1 142003009 1D34M2I AACCTGCATG TTCTGCACATGTACCCCAGAACTTAAAGTATAATT--/-TCTGCACATGTACCCCAGAACTTAAAGTATAATTAA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 91 79 15 49 N/A 0 0 50900 CASAVA_Build 1 142004482 5I AGGAGCTCTT -----/GTAAG GTAGATCTGG 3070 het 3070 hom 93 27 48 18 GTAAG 0 1 50901 CASAVA_Build 1 142004592 5I14M3I TGGGTTGAAA -----TTTCTTTTTCTTTT---/TTTATTTTCTTTTTTTTTTTTA AACCATTTAT 3070 het 3070 ref 99 91 19 21 N/A 0 0 50902 CASAVA_Build 1 142008725 1I GCAAAGATTT -/A AAAAAATTTT 1701 het 1701 ref 43 30 7 6 A 6 7 50903 CASAVA_Build 1 142013951 1D CATACCAGAA G/- ACCAAGCAGC 3070 het 3070 ref 49 27 10 12 G 1 0 50904 CASAVA_Build 1 142015508 2I TTTGGTAGAG --/AC ACAGAGCCAA 3070 het 3070 hom 46 13 28 5 AC 1 2 50905 CASAVA_Build 1 142016100 1D TGTATGGGGA C/- TCCAACCCTA 3070 het 3070 hom 76 36 28 14 C 1 0 50906 CASAVA_Build 1 142016111 13I TCCAACCCTA -------------/TACTTTCCTTCTG TATTTTCCTT 1980 het 1980 ref 77 31 7 39 TACTTTCCTTCTG 0 1 50907 CASAVA_Build 1 142016219 1D GGAGTCCAGA C/- CAAGGCTCTG 3070 het 3070 ref 85 51 13 24 C 2 1 50908 CASAVA_Build 1 142016949 1D GTGTCCATCC T/- TCTGTCAGCC 3070 het 3070 ref 57 41 12 7 T 2 1 50909 CASAVA_Build 1 142018630 3D CAGCCGAATC TTA/--- TTATTCTGTC 2636 het 2636 ref 54 40 11 3 TTA 2 1 50910 CASAVA_Build 1 142018812 1I TGAAGCTATG -/A AAACGCCTTC 2546 het 2546 ref 75 56 10 9 A 3 4 50911 CASAVA_Build 1 142019332 1I GGGTCTGCAT -/G ATGGTGGCCT 3070 het 3070 hom 52 20 19 14 G 0 1 50912 CASAVA_Build 1 142020281 1D CCAAAATTTC T/- TTCATCTTCC 3070 het 3070 ref 94 72 9 15 T 3 2 50913 CASAVA_Build 1 142020806 1I GTGAAGGATC -/T CACCCCCCAA 3070 het 3070 ref 84 51 24 9 T 0 1 50914 CASAVA_Build 1 142024586 4I GTTCTACTTT ----/TCTG TCTGTATTAT 1317 het 1317 ref 90 75 4 11 TCTG 1 2 50915 CASAVA_Build 1 142024979 3D ATCTCATGTC CTT/--- CTCACATTGC 3070 het 3070 ref 67 43 16 11 CTT 1 0 50916 CASAVA_Build 1 142025477 3I TTCTGCTTCT ---/AGG AGGCCTCAGA 3070 het 3070 ref 81 56 11 14 AGG 1 2 50917 CASAVA_Build 1 142030187 3D GCTTAGAACA TCT/--- TCTGCCACAA 1866 het 1866 ref 55 40 5 12 TCT 2 1 50918 CASAVA_Build 1 142032987 3I TAAACTTTTC ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 T 9 12 50919 CASAVA_Build 1 142033786 1D TGTTGGCCAC T/- TACGTGTGTT 2224 het 2224 ref 81 69 6 6 T 2 1 50920 CASAVA_Build 1 142034810 1I CCAGGCTAAT -/A TTTTTTTTTG 1355 het 1355 ref 19 9 3 7 A 0 1 50921 CASAVA_Build 1 142035253 2D ACACTGCCTC AA/-- AAAAAAAAGA 1101 het 1101 ref 68 55 3 14 A 10 8 50922 CASAVA_Build 1 142038599 1D ATTCATTTTT G/- TTCCTCCTTA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 1 0 50923 CASAVA_Build 1 142039711 1I CTAACTATAC -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 90 14 47 30 T 7 8 50924 CASAVA_Build 1 142041478 1I GCTGAGGAGG -/A AATTTTCCTA 1068 het 1068 ref 50 39 3 9 A 2 3 50925 CASAVA_Build 1 142043332 1I AGAGTGTTAG -/A GAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 60 29 25 6 A 0 1 50926 CASAVA_Build 1 142043611 1I ACCCAAAGGT -/C CCATCACCTG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 C 2 3 50927 CASAVA_Build 1 142044351 2D GACGGCATAA CT/-- CTCTGAAAAT 3070 het 3070 ref 52 36 13 9 CT 3 2 50928 CASAVA_Build 1 142044438 1I AAACCTGTTA -/C CCCCCCACCC 3070 het 3070 hom 100 33 60 7 C 6 7 50929 CASAVA_Build 1 142044854 2I CCCAAATATA --/TT TTTTTGATGT 1400 het 1400 ref 35 19 3 13 T 5 7 50930 CASAVA_Build 1 142045306 1D TCTTTGCAGG A/- GATATGGATG 3070 het 3070 hom 85 32 47 6 A 1 0 50931 CASAVA_Build 1 142047981 4D AACAATAAAT TGTC/---- TGCCACGTCT 3070 het 3070 ref 84 62 21 2 TGTC 1 0 50932 CASAVA_Build 1 142048294 3D4M3D GTGCTAAAAC ATTATGCTAA/---ATGC--- ATGAATTCTG 3070 het 3070 ref 75 53 15 18 N/A 0 0 50933 CASAVA_Build 1 142049100 4I TATATAAAAA ----/AAAT AATAAGTACA 990 het 990 ref 81 65 3 14 AAAT 0 1 50934 CASAVA_Build 1 142050385 3D AGTCATTAAA ATT/--- ATTATTTCAG 1754 het 1754 ref 39 32 6 1 ATT 3 2 50935 CASAVA_Build 1 142050779 1I TCTACTTTTT -/G TCCCTATACA 1648 het 1648 ref 42 33 4 5 G 0 1 50936 CASAVA_Build 1 142051915 5D ACTCAATAAA ATAAC/----- ATATCATGAT 3070 het 3070 ref 45 30 14 4 ATAAC 1 0 50937 CASAVA_Build 1 142052483 1D CACAATTTTG A/- AAAAGAAATG 1914 het 1914 ref 85 71 5 12 A 5 4 50938 CASAVA_Build 1 142054068 1I CCTCACATTT -/G TCAATGGTAG 2810 het 2810 ref 22 13 6 3 G 0 1 50939 CASAVA_Build 1 142059707 1D AAAAGAGGAA G/- AAAAAAAGGC 2734 het 2734 ref 38 20 7 11 G 1 0 50940 CASAVA_Build 1 142060885 4I TACAAATTTT ----/ATCA ATCAAATGAG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 ATCA 1 2 50941 CASAVA_Build 1 142060953 1D CCCTTTTTCT G/- TTTCAGTTTT 1432 het 1432 ref 17 10 3 5 G 1 0 50942 CASAVA_Build 1 142061178 1D ATGAACAGCT A/- ATTTTGTGTT 1026 het 1026 ref 67 57 3 9 A 2 1 50943 CASAVA_Build 1 142063538 5I ACGAAAAGAG -----/CAAAA AATGCAAAAG 1442 het 1442 ref 12 7 3 2 CAAAA 0 1 50944 CASAVA_Build 1 142065002 5D ATTCAAAAAT ATACA/----- TAATTAATTA 1329 het 1329 ref 52 45 3 8 ATACA 1 0 50945 CASAVA_Build 1 142068636 2D ATGTGAGAAC AA/-- AGAGAGATAC 3070 het 2127 hom 36 7 25 5 A 3 1 50946 CASAVA_Build 1 142070788 1D ATTTTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 2148 het 87 hom 23 2 11 10 T 17 16 50947 CASAVA_Build 1 142072911 1I AGGAGCTCTC -/T TATATCCCTG 2397 het 2397 ref 94 83 6 6 T 1 2 50948 CASAVA_Build 1 142073263 1D ATCTTTCAGT A/- AAAATCTTCA 2565 het 2565 ref 70 35 6 31 A 5 4 50949 CASAVA_Build 1 142073294 1D TCCTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 74 31 23 22 A 12 11 50950 CASAVA_Build 1 142073386 1D TGTGTCCTTC A/- TTTTTATAAT 716 het 716 ref 65 54 2 9 A 1 0 50951 CASAVA_Build 1 142075834 1D GTATAACAAG C/- CCCAAATTCA 1740 het 1740 ref 63 52 4 7 C 4 3 50952 CASAVA_Build 1 142076644 1D TATGAAGACA G/- AGTAAACATC 3070 het 3070 ref 92 66 15 12 G 1 0 50953 CASAVA_Build 1 142077032 1I TATTGATTTT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 7 8 50954 CASAVA_Build 1 142078012 2D ATTTTAACTC AG/-- AAATTATTTT 2716 het 2716 ref 41 26 7 9 AG 1 0 50955 CASAVA_Build 1 142078028 5I TATTTTGCTT -----/ATTTA ATTTAACAAT 1373 het 1373 ref 36 24 3 9 ATTTA 1 2 50956 CASAVA_Build 1 142079727 1D CACCCTACAG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 54 23 29 3 A 7 6 50957 CASAVA_Build 1 142080166 1D CTGAATTGAA G/- GGGAAAGAGG 3070 het 535 hom 48 3 38 7 G 4 3 50958 CASAVA_Build 1 142080405 5I AAGCCCCATT -----/AAAAG AAAAGGTGAA 3070 het 3070 ref 56 28 20 8 AAAAG 1 2 50959 CASAVA_Build 1 142081153 1D CAGGTGAGGA G/- GGGGGCACTT 865 het 865 ref 78 45 3 30 G 6 5 50960 CASAVA_Build 1 142082944 1D TATCTGGGGG T/- GGGGAGGATA 2682 het 2682 ref 67 19 14 37 T 1 0 50961 CASAVA_Build 1 142083012 1D ACTAATATCT G/- GGGGGGGAGA 3070 het 3070 hom 72 17 38 18 G 8 7 50962 CASAVA_Build 1 142083385 1I CCTATATTTA -/G GGGATAGTGG 3070 het 3070 ref 59 32 12 16 G 3 4 50963 CASAVA_Build 1 142084182 1I AATATCACAA -/G GGGGGTGTAA 3070 het 3070 ref 80 33 39 8 G 5 6 50964 CASAVA_Build 1 142086159 1I GCCAATTATC -/A GGGGGACTAA 3070 het 3070 ref 67 31 27 9 A 0 1 50965 CASAVA_Build 1 142087470 1D ATATATATAT A/- GTATAAAATA 537 het 537 ref 21 6 3 12 A 1 0 50966 CASAVA_Build 1 142087794 1I ACAATATCAC -/A GGGAGGTTAC 3070 het 3070 ref 74 35 23 16 A 0 1 50967 CASAVA_Build 1 142087866 1I CATATTTAGA -/G GGGGGGTGTC 3070 het 3070 ref 96 61 18 17 G 6 7 50968 CASAVA_Build 1 142089636 1D AGTATCCAGA G/- AAGGAGAGAA 1683 het 1683 ref 69 54 5 12 G 1 0 50969 CASAVA_Build 1 142090789 1D TAAAATGTCA C/- GGGGGGTATA 2793 het 2793 ref 58 45 6 7 C 1 0 50970 CASAVA_Build 1 142091017 2D GAACAGGGTG TA/-- CACACCCATG 3070 het 3070 ref 93 76 8 10 TA 1 0 50971 CASAVA_Build 1 142091650 1D TGAAGATTCC A/- AAAGCAATTG 1827 het 1827 ref 52 46 4 2 A 4 3 50972 CASAVA_Build 1 142092288 1D GCACCCAAAA G/- TTGTCTTTCA 1874 het 1874 ref 93 84 5 5 G 1 0 50973 CASAVA_Build 1 142094874 1D TGCATTTGTA G/- CACACCTGGG 2525 het 2525 ref 75 58 7 10 G 1 0 50974 CASAVA_Build 1 142096358 1D GCTTCTGTAA T/- TTTTTTCGAG 1417 het 1417 ref 95 66 5 25 T 7 6 50975 CASAVA_Build 1 142100242 1D ATTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 90 26 9 57 A 13 12 50976 CASAVA_Build 1 142104123 1I AGGAGGCCAA -/C CCTGACCACT 3070 hom 234 het 86 0 71 15 C 2 3 50977 CASAVA_Build 1 142113439 2D GAAATGAAAC AG/-- GGGATATTAC 3070 het 3070 hom 48 10 36 5 AG 1 0 50978 CASAVA_Build 1 142115105 6I ACAATAAGGC ------/TTACCT CATAGTTACC 2838 het 2838 ref 71 52 7 12 TTACCT 0 1 50979 CASAVA_Build 1 142116631 1I AGCGCTGGCG -/A CAGGCGCAGA 2052 het 2052 ref 81 49 6 26 A 0 1 50980 CASAVA_Build 1 142118041 1D CCCCTGCCCT G/- GGCCCCCTGG 2916 het 2916 ref 36 16 13 7 G 3 2 50981 CASAVA_Build 1 142119430 1I GAAAGTGAGG -/C GACTGGGGAA 3070 het 3070 hom 101 20 23 58 C 0 1 50982 CASAVA_Build 1 142122484 1D GAGGAGTCAG A/- ATATGAGTCA 3070 het 3070 ref 50 21 11 19 A 2 1 50983 CASAVA_Build 1 142130638 2I CCACTCAAGC --/GA GAGACTTGAA 3070 het 3070 hom 92 19 55 20 GA 2 3 50984 CASAVA_Build 1 142130746 1I GATTGTGGAC -/T TTTTTCCAGT 3070 het 3070 ref 98 82 11 5 T 5 6 50985 CASAVA_Build 1 142131000 6D TGCCTTTTGA AGTAGG/------ AGTAGGAATA 2994 het 2994 ref 61 38 8 20 AGTAGG 2 1 50986 CASAVA_Build 1 142131363 1I CACTCTTTCA -/T TTACCTTGCA 1165 het 1165 ref 90 84 3 3 T 2 3 50987 CASAVA_Build 1 142185307 1I TTAGTCCCCC -/T GATAATTGGC 3070 het 3070 ref 93 69 12 12 T 0 1 50988 CASAVA_Build 1 142190204 11I TGTGTGAGAC -----------/CAGAGTGAGAA CAGAGATGGC 3070 hom 77 het 77 2 54 21 CAGAGTGAGAA 0 1 50989 CASAVA_Build 1 142192180 1I AATTAAATTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 73 32 35 6 T 8 9 50990 CASAVA_Build 1 142193422 2D CAAAATAATT TC/-- TGAGTTAAAA 2854 het 2854 ref 49 37 6 6 TC 1 0 50991 CASAVA_Build 1 142193524 1I GAAATAAGAT -/A AAAATATTCA 1681 het 1681 ref 44 37 4 3 A 4 5 50992 CASAVA_Build 1 142193582 9I TAAATTTATT ---------/TATTTTATA TATTTTATAT 3070 het 3070 ref 62 39 18 5 TATTTTATA 1 2 50993 CASAVA_Build 1 142194389 1I CAGCTGAATA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 95 57 19 19 T 8 9 50994 CASAVA_Build 1 142195207 1I AGACCAGGCA -/G TGAATGCTAT 3070 hom 117 het 46 0 38 9 G 0 1 50995 CASAVA_Build 1 142197742 4I ATTACGAAGC ----/TTTT TTTTTTTTAG 2049 het 2049 ref 93 71 6 16 T 8 12 50996 CASAVA_Build 1 142198123 5D AATTTTGCTG CTTTT/----- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 100 25 9 74 CTTTT 1 0 50997 CASAVA_Build 1 142202792 12I TGTATCTCTC ------------/TTCATTCTCACA TTTTAAATTG 3070 het 3070 ref 94 58 26 10 TTCATTCTCACA 0 1 50998 CASAVA_Build 1 142204200 1I TGGAATAAAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 61 35 16 10 A 8 9 50999 CASAVA_Build 1 142205187 1D GGAGTTAAAG C/- CAAGTTAACT 3070 het 3070 ref 64 35 17 13 C 2 1 51000 CASAVA_Build 1 142208043 4I AAAAATTAGG ----/TTTT TTGTTTGTTT 1147 het 1147 ref 62 46 3 13 T 2 6 51001 CASAVA_Build 1 142211245 1I CTGGTAATGG -/C CCCCTCACCA 3070 het 3070 ref 74 57 9 8 C 4 5 51002 CASAVA_Build 1 142211552 1D TAGCAGCAAA G/- GGGGTCAACA 3070 het 3070 ref 62 41 19 2 G 5 4 51003 CASAVA_Build 1 142212467 4D TTATAGTCTT TATC/---- TAACTCTTCT 1229 het 1229 ref 85 78 3 15 TATC 1 0 51004 CASAVA_Build 1 142213712 1D AGTTTCACAG T/- TAAATTTTAA 3070 het 3070 ref 74 55 10 10 T 2 1 51005 CASAVA_Build 1 142213841 1I TTGCACCTGA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 63 37 14 12 C 8 9 51006 CASAVA_Build 1 142215737 2I TGCTTTGCTC --/AA GTTAGACTTT 3070 het 3070 ref 93 50 38 5 A 0 2 51007 CASAVA_Build 1 142216959 12D CCTAGTAGCT GAGATTACAGAC/------------ ATGTGCCACC 2882 het 2882 ref 70 60 8 13 GAGATTACAGAC 1 0 51008 CASAVA_Build 1 142219170 1D GTAAATGCAA T/- TTTTTGATAT 3070 het 3070 ref 89 63 15 11 T 6 5 51009 CASAVA_Build 1 142219671 1I TAAAATTGTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 82 51 21 10 A 7 8 51010 CASAVA_Build 1 142221804 115D24M3I ATTTGGCAGG AAGAGAACATATTGTGCATCCCTCACTGAATTCAGTAATAAATAAAAATGTGTACATGTGATTAAAAGAAGGTGAATTGATATGTGTGGTGATAATTTTCAAAGTACGTATGTTAGAGTTAAATATTATTAACATAATT---/-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAGTTAAATATTATTAACATAATTTAA TAATAAGGCA 3070 het 3070 ref 84 149 9 45 N/A 0 0 51011 CASAVA_Build 1 142222857 1I TCTATTAGTA -/T ATTCACAGCA 3047 het 3047 ref 101 86 9 6 T 0 1 51012 CASAVA_Build 1 142225365 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 262 hom 33 3 20 10 A 6 7 51013 CASAVA_Build 1 142225422 1I AGAAAGCAAG -/A AAAAAAAGGA 2006 het 2006 ref 55 37 5 13 A 7 8 51014 CASAVA_Build 1 142226183 3D ATTATCACTG ATA/--- ATGTCCATCT 627 het 627 ref 101 96 2 7 ATA 1 0 51015 CASAVA_Build 1 142227041 2D TAGTATTTTC AG/-- AGAGTTATGC 3070 het 3070 ref 76 44 29 3 AG 3 2 51016 CASAVA_Build 1 142228944 1D ACTTAATTTC T/- TTTTTTCTCC 1292 het 1292 ref 53 48 3 2 T 7 6 51017 CASAVA_Build 1 142229443 1D AGAGACACAT A/- GTAGATTAGT 3070 het 3070 hom 77 31 37 9 A 1 0 51018 CASAVA_Build 1 142230029 1D AAGGAGACTC T/- TTTCTGCTGC 2334 het 2334 ref 57 44 5 8 T 4 3 51019 CASAVA_Build 1 142230834 1D TCTGGGCTCT G/- GGCAACTGTA 1571 het 1571 ref 93 72 5 17 G 3 2 51020 CASAVA_Build 1 142231743 1D TAAACTCAGA T/- TTTTTTTACT 1543 het 1543 ref 59 48 4 8 T 8 7 51021 CASAVA_Build 1 142233440 17D11M5I AAATTATATT TTGGAGATATATATATATATAAAGAGAT-----/-----------------TATATAGTGTTTCCTC TGCCTCTCTT 2430 het 2430 ref 56 66 6 7 N/A 0 0 51022 CASAVA_Build 1 142234262 3D AGATGGCTTC AGG/--- AGATTAGAAG 1734 het 1734 ref 76 70 4 5 AGG 1 0 51023 CASAVA_Build 1 142234376 1D TCTCCTCTCA T/- TTTTTTTTTT 2696 het 2696 ref 41 24 9 9 T 11 10 51024 CASAVA_Build 1 142234973 3I ATAATGGGTG ---/AAA TGTACAAGAG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 0 3 51025 CASAVA_Build 1 142235652 1D AGGACTCAAC A/- GAAAATATAT 570 het 570 ref 49 40 2 7 A 1 0 51026 CASAVA_Build 1 142236173 4I TCTTGGTGCC ----/ATCT ATCTCCACTC 1205 het 1205 ref 82 57 4 21 ATCT 1 2 51027 CASAVA_Build 1 142237270 1I AATCCTGGAA -/G AAAACCTAGG 2756 het 2756 ref 79 61 7 11 G 0 1 51028 CASAVA_Build 1 142239186 2D TTAGAGAAAC AA/-- AGAGAAGTAC 3070 het 3070 hom 61 16 36 11 A 3 1 51029 CASAVA_Build 1 142239562 1D GGCCAACAGA C/- CTAAGACTCA 3070 het 3070 ref 97 74 7 21 C 2 1 51030 CASAVA_Build 1 142241233 1I GAATGAGTCA -/T TTTTTTTTAG 2852 het 2852 ref 44 35 7 2 T 8 9 51031 CASAVA_Build 1 142242780 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 1567 het 1567 ref 37 22 4 13 AC 7 6 51032 CASAVA_Build 1 142243448 1I CCTGGGCCTT -/G GCAAGTCATT 2572 het 2572 ref 95 52 9 34 G 1 2 51033 CASAVA_Build 1 142245858 3I ATTTCTGAGG ---/CCT CCTAGAAGCA 1991 het 1991 ref 101 77 5 19 CCT 1 2 51034 CASAVA_Build 1 142251468 1D CCAAGTGGTC A/- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 87 60 9 19 A 5 4 51035 CASAVA_Build 1 142252006 1I AGGCCACCAT -/C ATGCAGACCC 1333 het 1333 ref 93 78 5 10 C 0 1 51036 CASAVA_Build 1 142252523 1I ATTGAAGGCA -/T TTTCATAGCT 2102 het 2102 ref 49 22 5 22 T 3 4 51037 CASAVA_Build 1 142252607 1I TGCAGGCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 27 17 17 A 10 11 51038 CASAVA_Build 1 142253346 1D TAATTGTAAT C/- CCGAATGTTG 3070 het 3070 ref 86 59 13 15 C 3 2 51039 CASAVA_Build 1 142253530 14D ACTAAGGCAG TGCACCTGTGGTTT/-------------- TGCACCTGTG 2328 het 2328 ref 86 57 11 25 TGCACCTGTGGTTT 1 0 51040 CASAVA_Build 1 142257043 1D GCTGCTTGGT C/- TTCTGGTATG 3070 het 3070 ref 57 39 9 10 C 1 0 51041 CASAVA_Build 1 142259862 2D CCTCTTTCCC CT/-- CTCTGTCTTG 3063 het 3063 ref 100 82 8 11 CT 3 2 51042 CASAVA_Build 1 142260003 1I CCTATTTAGT -/G GGGGGGTGGT 3070 het 3070 ref 81 61 12 8 G 6 7 51043 CASAVA_Build 1 142267429 1D ATTAGAACAC T/- CAGTAATCAT 3070 het 3070 ref 96 69 13 15 T 1 0 51044 CASAVA_Build 1 142267500 3I TGGGGCTTTA ---/TTG TTGTTGTTTC 3070 het 3070 ref 91 55 12 24 TTG 2 3 51045 CASAVA_Build 1 142267607 4D CCTATGGCTG CAAA/---- CAAACAAACA 2887 het 2887 ref 101 80 9 14 CAAA 5 4 51046 CASAVA_Build 1 142267676 1I TTTTTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 98 46 23 29 T 12 13 51047 CASAVA_Build 1 142268010 4I GAACATGCAG ----/GTTT GTTACATAGG 2649 het 2649 ref 64 44 7 13 GTTT 0 1 51048 CASAVA_Build 1 142283325 3D AAGTTCAAGC CAT/--- TCTCCTGCCT 1295 het 1295 ref 98 80 4 14 CAT 1 0 51049 CASAVA_Build 1 142284344 2D TTCATGATTT AA/-- AAAAAAGAAG 3070 het 3070 ref 97 51 32 15 A 8 6 51050 CASAVA_Build 1 142284509 1I TACTATAAAC -/A AACAAAAAAA 2279 het 2279 ref 95 68 7 20 A 2 3 51051 CASAVA_Build 1 142286875 1I AGCCACCGTG -/C CCAGACAATT 3070 hom 129 het 49 0 41 8 C 2 3 51052 CASAVA_Build 1 142292278 2D AAACAAAAGC AT/-- ATATATATAC 797 het 797 ref 62 26 8 28 AT 5 4 51053 CASAVA_Build 1 142300816 11D AAATCCATCT CAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 1832 het 1832 ref 61 39 6 28 CAAAAAAAAAA 1 0 51054 CASAVA_Build 1 142301891 2I ATCCGGCTAA --/TT TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 96 39 30 28 T 7 9 51055 CASAVA_Build 1 142311845 1D CCCGTCTCTA C/- TAAAAATACA 1193 het 1193 ref 42 33 4 5 C 1 0 51056 CASAVA_Build 1 142333355 3D AAGTGGGAAA ATG/--- GGGGGGGGGG 2567 het 2567 ref 81 33 13 37 ATG 1 0 51057 CASAVA_Build 1 142359783 4D GTATAATTAA ACAG/---- AGCAGGTTAT 2244 het 2244 ref 89 75 6 20 ACAG 1 0 51058 CASAVA_Build 1 142364642 1D CTCTTTTTTT G/- TTTTGTCTCT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 G 1 0 51059 CASAVA_Build 1 142365148 1I TGATTTTTTG -/A AGGGTTTTTT 3070 hom 190 het 64 0 64 0 A 1 2 51060 CASAVA_Build 1 142365546 25D GACAGTTTGT TATACTTTCTGTTCTTTTACATTTG/------------------------- CTAAGGAGTG 2046 het 2046 ref 91 93 5 17 TATACTTTCTGTTCTTTTACATTTG 1 0 51061 CASAVA_Build 1 142367076 2D ATTCGTCTAA TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 70 45 9 17 T 10 8 51062 CASAVA_Build 1 142367612 1I AGTTAGGCTA -/C TTGGGGTTCA 3070 het 3070 hom 48 14 32 2 C 0 1 51063 CASAVA_Build 1 142367817 2D CTGTGGTGGG CT/-- CCACCCAGTT 3070 het 3070 ref 42 16 13 15 CT 1 0 51064 CASAVA_Build 1 142369869 4I AAGGACAAAA ----/AAAC AAACACCGCA 3070 het 3070 ref 61 37 24 6 AAAC 1 2 51065 CASAVA_Build 1 142379229 1I AAAATCTTGG -/A AAAAAAACTA 2708 het 2708 ref 79 67 7 5 A 7 8 51066 CASAVA_Build 1 142379407 1I AGAATGGGAG -/A AAAGGTTTGC 3070 het 3070 hom 39 13 25 1 A 3 4 51067 CASAVA_Build 1 142379655 1D ATGGCGATCA T/- TAAAAAGTCA 900 het 105 hom 6 1 2 3 T 2 1 51068 CASAVA_Build 1 142385144 1D ATGATCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 93 48 28 21 A 11 10 51069 CASAVA_Build 1 142448855 1I GCCTTATTTT -/A ATGCTAAAAT 3070 het 3070 ref 59 34 12 13 A 1 2 51070 CASAVA_Build 1 142517553 1D AAGTCTTTGC T/- TATTGTGAAT 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 T 2 1 51071 CASAVA_Build 1 142523781 1I GTAGGGTAGA -/T TTTTTTTTAA 2898 het 2898 ref 31 22 6 3 T 8 9 51072 CASAVA_Build 1 142525449 2I TGCTCCAAAA --/AG AGGAATCAAG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AG 1 2 51073 CASAVA_Build 1 142533316 2D CTTTGTACAG AT/-- AAGTAAACTG 3070 het 3070 ref 49 38 10 2 AT 1 0 51074 CASAVA_Build 1 142538096 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 2250 hom 14 6 7 1 ATA 3 4 51075 CASAVA_Build 1 142541290 1I ATGTGAACTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 29 18 7 4 A 7 8 51076 CASAVA_Build 1 142543395 1D CTTGGAGTCA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 9 8 51077 CASAVA_Build 1 142545290 2I GATTATAGAT --/AA GTTTGAAAAT 3070 het 3070 ref 56 28 24 4 A 0 2 51078 CASAVA_Build 1 142546910 1I ATTTCAGTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 15 8 9 T 8 9 51079 CASAVA_Build 1 142550957 1I AGAATAAAAA -/T TTCTTTATGT 1935 het 1935 ref 17 10 4 3 T 2 3 51080 CASAVA_Build 1 142556280 2D AATTAAACTC TT/-- TAAATTATTA 2297 het 2297 ref 41 31 5 5 T 3 1 51081 CASAVA_Build 1 142630367 4D GTGCTGCCAG ACTT/---- ACTTCTCTTA 3070 het 3070 ref 52 27 21 7 ACTT 2 1 51082 CASAVA_Build 1 142632017 1D GGGTCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 11 14 T 15 14 51083 CASAVA_Build 1 142649670 1D ACGTGAGCGT C/- CTGCTGCCAC 2643 het 1549 hom 11 4 7 0 C 2 1 51084 CASAVA_Build 1 142650347 1D TAGGGTAAAC A/- AAATCAAATA 3070 het 3070 hom 83 40 37 6 A 4 3 51085 CASAVA_Build 1 142665075 1I ACTATGGCTG -/C CCCTATGCTA 1361 het 1361 ref 23 19 3 1 C 3 4 51086 CASAVA_Build 1 142673856 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTCC 2887 het 2123 hom 14 6 6 2 C 0 1 51087 CASAVA_Build 1 142677432 2I AGGGAAAAAG --/CT CTAGGAGCTT 1248 het 1248 ref 30 24 3 3 CT 1 2 51088 CASAVA_Build 1 142678788 1D TGCATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1730 het 1730 ref 29 20 5 4 T 11 10 51089 CASAVA_Build 1 142684117 2I GCAGTAAATC --/AA GAGGGCTGCC 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 0 2 51090 CASAVA_Build 1 142684228 2I GAGGTTATCT --/CA CTGTAAGAGA 3070 hom 38 het 16 0 13 3 CA 0 1 51091 CASAVA_Build 1 142693781 1D AGAGCACTGA G/- GACTGCAAAG 3070 het 3070 ref 67 47 13 7 G 2 1 51092 CASAVA_Build 1 142693849 1D TTCTGGCCCT C/- CTGAAACAGG 1276 het 1276 ref 52 31 3 19 C 2 1 51093 CASAVA_Build 1 142694582 1I TGCTGATTTT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 82 56 14 12 A 7 8 51094 CASAVA_Build 1 142700498 7D GTGGAGCCCT AAGGCTC/------- AAGTGTGCTT 2529 het 2529 ref 42 31 8 6 AAGGCTC 1 0 51095 CASAVA_Build 1 142700583 2D AATGAGGCGG AA/-- AAGGACTAGG 3070 het 3070 ref 60 37 19 7 A 4 2 51096 CASAVA_Build 1 142703174 3I TTTAAAACCA ---/TTT TTTTTTTTAT 2932 het 2932 ref 29 17 8 4 T 8 11 51097 CASAVA_Build 1 142703611 11D CAAAAAAAAA AAAACTTGAGT/----------- GCTTTTCTTT 1555 het 1555 ref 18 14 5 5 AAAACTTGAGT 1 0 51098 CASAVA_Build 1 142705768 3D ATGTTTGGAA TTT/--- TTGCATTTCA 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 T 5 2 51099 CASAVA_Build 1 142708343 3I AGGTAAGAGC ---/ATA ATAGAGAGTG 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 ATA 1 2 51100 CASAVA_Build 1 142718572 5I GCATGCACCA -----/CCTCC CCCCCCCAGC 1296 het 1296 ref 43 28 4 11 CCTCC 0 1 51101 CASAVA_Build 1 142720489 1D TTTTTAATCT G/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 98 66 25 8 G 1 0 51102 CASAVA_Build 1 142721882 9I CTTCCTTTTC ---------/CTCCTTCTT CTTCTTCCTC 3070 het 3070 hom 84 35 35 14 CTCCTTCTT 0 1 51103 CASAVA_Build 1 142722910 4D CAGGGGACTC AGAG/---- GGACCTGACA 3070 het 3070 ref 91 73 14 7 AG 2 0 51104 CASAVA_Build 1 142723015 1I GTTCTTTTTT -/G TTGTTGTTTG 3070 het 3070 ref 57 35 15 7 G 0 1 51105 CASAVA_Build 1 142723177 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2622 hom 19 9 9 2 T 9 10 51106 CASAVA_Build 1 142724530 1D GTGAAAAAAA T/- CTCTTTCCAA 3070 het 3070 ref 101 77 14 11 T 1 0 51107 CASAVA_Build 1 142733994 4D GTACTGTATT TTCA/---- TTCAGTCGGT 3070 het 3070 ref 74 39 29 6 TTCA 2 1 51108 CASAVA_Build 1 142735029 1I TAATAGCTCA -/T TTTTTTAGGT 3070 het 3070 ref 48 34 10 5 T 6 7 51109 CASAVA_Build 1 142736437 1I AAATCTAGTG -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 6 7 51110 CASAVA_Build 1 142736627 2I ACACGTGCAC --/AG AGAGGGGATG 3070 het 3070 ref 50 23 15 12 AG 2 3 51111 CASAVA_Build 1 142739924 1I AAAATGAATC -/G GAACAAACTA 3070 het 3070 hom 64 29 29 6 G 1 2 51112 CASAVA_Build 1 142747716 1D TATACGTTGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 58 29 20 12 T 8 7 51113 CASAVA_Build 1 142749019 1D CCATCTCTGC A/- AAAAAAAAGT 2265 het 2265 ref 27 18 7 3 A 9 8 51114 CASAVA_Build 1 142755263 1I CGCTCACGCT -/G GGAGCTGTAG 2627 het 2627 ref 22 12 6 4 G 2 3 51115 CASAVA_Build 1 142757353 2I AAGGGAAGGT --/CC CCCAGGTCTA 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 C 3 5 51116 CASAVA_Build 1 142762519 1D CCAGTATAGA T/- CCCCCCCAAT 3070 het 3070 ref 70 40 16 15 T 1 0 51117 CASAVA_Build 1 142767949 1D CCTGACTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 28 9 11 A 13 12 51118 CASAVA_Build 1 142772277 1D GAGAATAGAT C/- ATTGATTGCC 3070 het 3070 ref 48 28 15 6 C 1 0 51119 CASAVA_Build 1 142776990 2I ATAGTAGATG --/TA TATGTTATAG 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 TA 1 2 51120 CASAVA_Build 1 142777087 1I TTTAGTCAAG -/A ACCTTCTCCT 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 A 1 2 51121 CASAVA_Build 1 142779457 1D TTTATACACA T/- TTTTTTTAAA 2441 het 2441 ref 27 15 6 6 T 8 7 51122 CASAVA_Build 1 142780015 3I TAAAAATCTC ---/ATT GTTGTCTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 7 ATT 0 1 51123 CASAVA_Build 1 142783341 1D AAAGAGTCAC A/- AAAAACTTTA 3070 het 3070 ref 67 40 26 3 A 6 5 51124 CASAVA_Build 1 142787113 1I GTCATGAAAC -/A ATAGCCCTTT 1778 het 1778 ref 32 28 4 0 A 1 2 51125 CASAVA_Build 1 142805882 1I ACTGAGGTTG -/A AGGACAAGTG 3070 het 3070 ref 42 30 8 4 A 1 2 51126 CASAVA_Build 1 143014508 5I GATTGACAGG -----/TGGGT TGCTTAGTTA 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 TGGGT 0 1 51127 CASAVA_Build 1 143026272 12I AAAAAGTAAG ------------/AAAAAAAAGACA AAAAAAAAGT 3070 het 2660 hom 26 8 17 1 AAAAAAAAGACA 0 1 51128 CASAVA_Build 1 143041474 1I ATATGATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 A 10 11 51129 CASAVA_Build 1 143041632 7D GAATTTGGCT CACAGTG/------- AATTATTCAC 2295 het 2295 ref 52 48 7 0 CACAGTG 1 0 51130 CASAVA_Build 1 143045057 5I TAAAATAGAC -----/TAAAA TAAACTAATC 2122 het 2122 ref 87 74 7 6 TAAAA 0 1 51131 CASAVA_Build 1 143045750 2D ACAATGAAAC TG/-- TTTTCAAAAA 3070 het 2878 hom 18 7 8 3 TG 1 0 51132 CASAVA_Build 1 143045998 5I GAGAAACATG -----/TTAAT TTAATTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 TTAAT 1 2 51133 CASAVA_Build 1 143050451 1D CCACTCATTG A/- AAAAAAAAAT 1034 het 1034 ref 33 23 3 8 A 10 9 51134 CASAVA_Build 1 143174264 1D CCATAGTGGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 A 8 7 51135 CASAVA_Build 1 143177661 1D TAGTGACTGG A/- TCATGGTGGT 1307 het 1307 ref 9 5 3 1 A 1 0 51136 CASAVA_Build 1 143179449 2I TTTTTTTTTT --/TC TTTTTTGAGA 3070 het 282 hom 28 4 14 10 TC 0 1 51137 CASAVA_Build 1 143180290 1D TGAGTGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 11 10 51138 CASAVA_Build 1 143182366 2I ATTCCTCTCA --/GT GTGTGAATAA 1415 hom 7 het 3 0 3 0 GT 2 3 51139 CASAVA_Build 1 143213485 1D GCATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 1408 hom 7 het 3 0 3 0 A 13 12 51140 CASAVA_Build 1 143221726 1D ATATGATTAC A/- AAAAAAAAAA 2629 het 1039 hom 10 4 6 0 A 11 10 51141 CASAVA_Build 1 143229722 2D CTTTGTACAG AT/-- AAGTAAACTG 3070 het 3070 ref 50 27 9 14 AT 1 0 51142 CASAVA_Build 1 143230700 1I CCACTCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 33 15 6 A 10 11 51143 CASAVA_Build 1 143234498 1D TAATAATAAA T/- TTTAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 4 3 51144 CASAVA_Build 1 143235191 3D AAAACCTCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 27 12 7 A 14 11 51145 CASAVA_Build 1 143237179 2D TTGATGAAAC AG/-- AGTCTCTGTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AG 2 1 51146 CASAVA_Build 1 143238757 1I AATTCTTTGA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 67 27 18 22 T 6 7 51147 CASAVA_Build 1 143246231 1I ATGTTCAGGG -/A GGAAAAAAAA 3070 het 209 hom 90 2 78 10 A 0 1 51148 CASAVA_Build 1 143249397 1D GACACCTGGA T/- GACTCCTCTT 3070 het 3070 ref 45 25 12 8 T 1 0 51149 CASAVA_Build 1 143253202 4D AGTGAACTAT ATTA/---- ATTATCTTTG 3070 hom 256 het 92 0 86 11 ATTA 2 1 51150 CASAVA_Build 1 143254535 1I ATATTTATTG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 96 61 25 10 T 7 8 51151 CASAVA_Build 1 143254660 6D ATCTTGCTTC TTAATT/------ TTATTTTTAT 2508 het 2508 ref 33 22 9 6 TTAATT 1 0 51152 CASAVA_Build 1 143255405 4D GCCAAAAACT GACA/---- GACAGTTAGT 3070 het 3070 ref 95 76 16 9 GACA 2 1 51153 CASAVA_Build 1 143255596 1I GGTAGCCCTC -/T TTTTTTAGTT 2367 het 2367 ref 43 27 6 10 T 6 7 51154 CASAVA_Build 1 143257270 1D CCCTAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 92 24 28 42 A 11 10 51155 CASAVA_Build 1 143258101 1D TTTTGGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 737 hom 86 5 72 10 A 11 10 51156 CASAVA_Build 1 143263390 4D AAAAAGAGGA GCTG/---- ACTATCAACA 1832 het 1832 ref 49 44 4 2 GCTG 1 0 51157 CASAVA_Build 1 143269825 1I CCAGGCATTG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 529 hom 19 2 16 1 T 7 8 51158 CASAVA_Build 1 143270131 1D GAAAATGAGC A/- AAAAAAGGTG 3070 het 3070 ref 66 39 23 5 A 7 6 51159 CASAVA_Build 1 143271219 4I CCATTTTTGG ----/AATA AATTTGTGTT 2140 het 2140 ref 17 11 5 1 AATA 0 1 51160 CASAVA_Build 1 143271972 2D CATATGTATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 5 hom 25 1 20 4 AT 7 6 51161 CASAVA_Build 1 143274562 1I AAATAATCTA -/T ACCAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 26 16 1 T 0 1 51162 CASAVA_Build 1 143275423 7I CACAGGATCC -------/TTTGACA TTTTCCATTC 2178 het 1069 hom 15 3 6 6 TTTGACA 0 1 51163 CASAVA_Build 1 143276383 1D TTTTAATGCA T/- TTTTTTTAGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 8 7 51164 CASAVA_Build 1 143281207 20D CTTTATTTAT TGTTTTTTCTTTTGCGGGGG/-------------------- TGCGGGGGGG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 TGTTTTTTCTTTTGCGGGGG 1 0 51165 CASAVA_Build 1 143281594 1I GAAGAGGTGT -/G GGGCAGGTGA 2671 hom 20 het 12 0 7 5 G 3 4 51166 CASAVA_Build 1 143285142 4D TTAAGAGAGT TTAA/---- TTTAGAAGTC 1847 het 1847 ref 14 9 4 1 TTAA 1 0 51167 CASAVA_Build 1 143289661 1D ACTTTTTTTT A/- TTATTATTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 0 51168 CASAVA_Build 1 143290273 1D AAATAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 65 24 29 14 T 12 11 51169 CASAVA_Build 1 143292546 1D GAGTTGTTGG T/- TTTTTGTTTT 249 het 249 ref 29 19 2 8 T 6 5 51170 CASAVA_Build 1 143297050 1D GTGAACACTG T/- TGGGTGTGGT 3070 het 3070 ref 58 36 11 11 T 2 1 51171 CASAVA_Build 1 143297855 1I GACGAGAGTT -/C CCTACTAGCC 3070 hom 93 het 39 0 29 10 C 2 3 51172 CASAVA_Build 1 143298112 4D CTACAAGCTC AGTT/---- AGAGTCTAAA 3070 het 3070 ref 80 49 27 6 AGTT 1 0 51173 CASAVA_Build 1 143300757 1D AGTTTGCCCC T/- GGGCTATCAC 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 T 1 0 51174 CASAVA_Build 1 143302001 1D TGCAGATGAG A/- AAAACAGAAA 3070 het 3070 ref 85 56 15 17 A 5 4 51175 CASAVA_Build 1 143303808 1D AGACAACCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 80 36 29 15 A 12 11 51176 CASAVA_Build 1 143303949 1I TTGTTGTAAG -/C CCTACTGGGT 3070 het 3070 ref 80 58 12 10 C 2 3 51177 CASAVA_Build 1 143304932 1D GTCTCTGCTG C/- ACTCTGTCTA 2918 het 2918 ref 25 15 8 2 C 1 0 51178 CASAVA_Build 1 143305761 24I TGATGGGCAA ------------------------/GCCGGGTGTACCAAGTCCATGATG CACATGAGGC 1190 het 1190 ref 26 18 3 6 GCCGGGTGTACCAAGTCCATGATG 0 1 51179 CASAVA_Build 1 143305898 4I GATTTCCCTG ----/TGTC TATCTGTCTT 3070 het 3070 ref 40 26 7 7 TGTC 0 1 51180 CASAVA_Build 1 143307544 1D TCCTGTTTAA G/- AAATCAATGC 3070 het 3070 ref 93 66 18 13 G 1 0 51181 CASAVA_Build 1 143307625 2D TTTGCATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 9 17 T 13 11 51182 CASAVA_Build 1 143307783 1D CATGCCTGGC T/- TAATTTTCAT 3070 het 3070 ref 72 45 11 18 T 2 1 51183 CASAVA_Build 1 143307809 1D TTGTAGAGAT G/- GGGATTCAAC 3070 het 3070 ref 81 52 12 19 G 4 3 51184 CASAVA_Build 1 143308229 1D GGCTACATAC G/- GGTGTTGGTA 3070 het 3070 ref 39 29 8 2 G 3 2 51185 CASAVA_Build 1 143308925 1I AAAATCTCTT -/A ACAGCTATTA 3070 het 3070 ref 88 61 19 8 A 1 2 51186 CASAVA_Build 1 143309340 9D TATACGTGTA CAGATAGAC/--------- CAGATAGACC 3070 het 3070 ref 89 67 12 16 CAGATAGAC 2 1 51187 CASAVA_Build 1 143312875 3D GTGATATCTC GTT/--- GTTTTAATGT 3070 het 3070 ref 69 44 20 5 GTT 2 1 51188 CASAVA_Build 1 143312988 1I CACCTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 58 27 17 14 G 0 1 51189 CASAVA_Build 1 143313165 1I CTCAACTTAA -/T TTTTTTTTCA 2171 het 2171 ref 32 22 5 5 T 8 9 51190 CASAVA_Build 1 143318082 3D TAGGCTTAAA TTT/--- TTTAATGCAT 3070 het 3070 ref 47 29 16 2 T 6 3 51191 CASAVA_Build 1 143326604 2I TAAACCTCAA --/AG AGAGATGTTT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 AG 2 3 51192 CASAVA_Build 1 143327496 1D AAAAACAAAC A/- AAACAAAAAG 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 A 4 3 51193 CASAVA_Build 1 143328032 1I ATCTGAATAT -/A TGATTTAAAA 1887 het 1887 ref 30 26 4 0 A 0 1 51194 CASAVA_Build 1 143329163 2I AAAGGATGTC --/TT TTTGAAACGG 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 T 3 5 51195 CASAVA_Build 1 143329686 1D TGACCCAAAA C/- CCCAGGCTTA 1280 het 1280 ref 15 10 3 3 C 4 3 51196 CASAVA_Build 1 143329822 1I GGAAACCCAT -/G GGTTTGGAGG 3070 het 3070 hom 100 32 61 7 G 2 3 51197 CASAVA_Build 1 143330010 4D CAATGTTCTT AGTA/---- AGTGTCGGTG 2331 het 2331 ref 82 65 7 11 AGTA 1 0 51198 CASAVA_Build 1 143333319 2I GAATCCTCTC --/TG TACCATATAA 3070 het 3070 ref 20 13 7 0 TG 0 1 51199 CASAVA_Build 1 143386176 1I TTTAGTTCAG -/T TTTTTTTTAT 2892 het 2892 ref 24 13 7 4 T 8 9 51200 CASAVA_Build 1 143386785 1D TATTGCAAAG C/- TTCTTAAATG 3030 het 3030 ref 92 73 7 12 C 1 0 51201 CASAVA_Build 1 143386917 1D CCACAGTCTT A/- TGCACCTAAG 3070 het 3070 ref 101 69 23 9 A 1 0 51202 CASAVA_Build 1 143393893 1D CATAAACCTA C/- CTGAGAGGAT 3070 het 3070 ref 80 63 10 8 C 2 1 51203 CASAVA_Build 1 143396960 1D GCGTGAACCC G/- GGAGGCGGAG 2401 het 1019 hom 19 6 8 5 G 3 2 51204 CASAVA_Build 1 143397087 1D AATCTGAGGT C/- CTCGCAGTGT 1611 het 1611 ref 69 61 5 3 C 2 1 51205 CASAVA_Build 1 143402730 1I AAAAGATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 48 2 35 11 A 11 12 51206 CASAVA_Build 1 143403338 5I GTCACTCTGT -----/TAGAA TAGAATCTTG 2749 het 2749 ref 76 56 6 14 TAGAA 1 2 51207 CASAVA_Build 1 143408433 1D CCATCCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 85 26 17 43 A 12 11 51208 CASAVA_Build 1 143523620 2I GAATCCTCTC --/TG TACCATATAA 3070 het 3070 hom 58 22 34 2 TG 0 1 51209 CASAVA_Build 1 143524482 4D AGAGTAAACA CTAT/---- CTATTAGTTC 1194 het 1194 ref 67 63 3 4 CTAT 2 1 51210 CASAVA_Build 1 143528167 1I TATCAGGGAG -/T TTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 57 35 13 9 T 6 7 51211 CASAVA_Build 1 143542877 1D CTGGTGTTTA G/- GGGCAGGATT 3070 het 3070 hom 42 21 16 5 G 4 3 51212 CASAVA_Build 1 143543081 3I GGCTTCACCA ---/ATC ATCTCATGGC 3070 het 3070 ref 34 25 8 1 ATC 1 2 51213 CASAVA_Build 1 143543532 2D GAGCAAAAAC TT/-- TTAATTTTCA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 4 2 51214 CASAVA_Build 1 143543760 2D GATAAAAAAA AC/-- AAATTGTGTA 3070 het 3070 ref 52 31 12 9 AC 1 0 51215 CASAVA_Build 1 143548228 2I ATACATATAT --/AC ACACATACTT 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 AC 2 3 51216 CASAVA_Build 1 143549243 1I CTTGTAGTTC -/T AGTAAAAGAA 2485 het 2485 ref 41 29 6 6 T 0 1 51217 CASAVA_Build 1 143549486 3D GGTGCCCTGG CCT/--- CCTCCAGGCC 3070 het 3070 ref 72 47 16 9 CCT 2 1 51218 CASAVA_Build 1 143552088 1D ACCAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1576 het 1576 ref 50 20 6 26 A 15 14 51219 CASAVA_Build 1 143553073 1I TCAACAAAAA -/G GACATCCACA 3070 het 3070 ref 94 64 28 2 G 1 2 51220 CASAVA_Build 1 143553760 1D5M1I ATACAGAGAA CACCAC-/-ACCACA AAGATACTCA 1161 het 1161 ref 40 32 4 7 N/A 0 0 51221 CASAVA_Build 1 143560784 1I ACTTAAAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 33 8 2 T 9 10 51222 CASAVA_Build 1 143562429 1D ATAGAACACT G/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 58 18 16 24 G 1 0 51223 CASAVA_Build 1 143563990 2D AGGATGAGCT AA/-- GAGCATGCGC 3070 het 3070 ref 88 51 25 13 A 2 0 51224 CASAVA_Build 1 143564149 2D TCCAAATCAC TT/-- TGTCTCAGCA 3070 het 3070 ref 76 46 23 8 T 3 1 51225 CASAVA_Build 1 143564234 1D AAACAGCCTG T/- TTGTAGGAAG 3070 het 3070 ref 85 53 22 11 T 3 2 51226 CASAVA_Build 1 143564846 1I68M6D TCTGATTTTT -AACCATTTCATATACCTCAAGTTTTTCTTCAAAGCACTTCCTAGGGAATGATTAACACTTAGTGTTTTAAGTAA/AAACCATTTCATATACCTCAAGTTTTTCTTCAAAGCACTTCCTAGGGAATGATTAACACTTAGTGTTTT------ ATGTAGATAA 3070 het 3070 ref 71 92 9 12 N/A 0 0 51227 CASAVA_Build 1 143564950 1I ATATATAACA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 64 39 10 15 T 6 7 51228 CASAVA_Build 1 143566691 1I TCAGTCTCAT -/G GGGGCATTCT 3070 het 3070 ref 72 45 17 11 G 4 5 51229 CASAVA_Build 1 143569496 5I TTCATGGGGG -----/ACTAA ACTCAACATT 3070 het 3070 ref 90 68 17 5 ACTAA 0 1 51230 CASAVA_Build 1 143569589 3D TGGGTTAACA TTG/--- TCTTGCTGGA 3070 het 3070 ref 75 60 8 11 TTG 1 0 51231 CASAVA_Build 1 143570294 5I AGAGGATATT -----/GAGAA GAGAAGGGGG 3070 het 3070 ref 68 36 15 17 GAGAA 1 2 51232 CASAVA_Build 1 143571851 4D TCTCTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 67 28 23 18 TC 8 6 51233 CASAVA_Build 1 143573176 3I ACTTCTCACT ---/CCC CCAACCTCAA 1658 het 1658 ref 72 62 4 6 C 2 5 51234 CASAVA_Build 1 143575218 1I GGAACCCTTC -/T TTTTTCATGT 3070 het 3070 hom 73 28 29 16 T 5 6 51235 CASAVA_Build 1 143576218 1D TTCTCACCTG C/- TGAGGTCTGT 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 C 1 0 51236 CASAVA_Build 1 143591563 1D ATTTAATTGA C/- CTTAGTACCT 3070 het 3070 ref 75 40 30 5 C 2 1 51237 CASAVA_Build 1 143595887 1I ACTTCATATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 76 54 13 9 A 8 9 51238 CASAVA_Build 1 143596341 1I GAGCCACAGA -/C TATTATGCAA 3070 het 3070 hom 68 29 32 7 C 0 1 51239 CASAVA_Build 1 143599405 1I TCCATATGTG -/C CCCCCAGCAT 3070 het 3070 ref 57 33 19 5 C 5 6 51240 CASAVA_Build 1 143600803 1D ATGGGTAAAG A/- AAATGTGGCA 3070 het 3070 ref 99 73 16 10 A 4 3 51241 CASAVA_Build 1 143601222 4D TCATTCCATA TTGT/---- TTGTGTGTAT 442 het 442 ref 52 20 6 28 TTGT 2 1 51242 CASAVA_Build 1 143605495 2I CATCTCGACA --/CT CTGCCACACA 3070 het 3070 ref 61 38 19 4 CT 1 2 51243 CASAVA_Build 1 143619998 1I AAAAAACTAA -/G GAGCTATTTG 3070 het 3070 hom 68 26 29 13 G 1 2 51244 CASAVA_Build 1 143622558 1D GTGGCTGGCG C/- CTGTAGTCCC 3070 het 2841 hom 25 9 13 3 C 2 1 51245 CASAVA_Build 1 143623873 1D GAATATTGGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 79 19 46 15 A 9 8 51246 CASAVA_Build 1 143624287 4I ATGTGTTAAT ----/TTGA TTGTGGCAAT 3070 het 3070 hom 84 38 42 4 TTGA 0 1 51247 CASAVA_Build 1 143625412 1I CAGTGCATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 67 25 30 12 T 8 9 51248 CASAVA_Build 1 143626981 1D TTGCAGAGCA G/- TGTTGCACTA 3070 het 3070 ref 73 48 18 7 G 1 0 51249 CASAVA_Build 1 143627728 1D CTCACATAAG T/- TCTTTGAGAA 3070 het 3070 ref 73 51 17 5 T 2 1 51250 CASAVA_Build 1 143629185 1D CCTCCAGAGC A/- ACAGCTTTAT 3070 het 3070 ref 86 56 17 13 A 2 1 51251 CASAVA_Build 1 143630366 1D AAACATATTA C/- CTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 62 40 19 4 C 2 1 51252 CASAVA_Build 1 143632112 1D GGAAAGAAAG A/- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 A 4 3 51253 CASAVA_Build 1 143635086 1D TTTCCTGGAG T/- TCTGCCAAGT 3070 het 3070 ref 80 54 20 8 T 2 1 51254 CASAVA_Build 1 143635181 14D GTCATGGGCT AGGAAGAAACGGCA/-------------- AGGAAGAAAC 3070 het 3070 hom 78 19 53 11 AGGAAGAAACGGCA 2 1 51255 CASAVA_Build 1 143639470 1D AGAAGGAAAG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 62 30 26 8 A 8 7 51256 CASAVA_Build 1 143641592 1D TAAAAGTTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 70 35 27 8 A 10 9 51257 CASAVA_Build 1 143641763 4D AAAATCAAAT TATC/---- TGAGTGCAAA 3070 het 3070 ref 75 42 26 9 TATC 1 0 51258 CASAVA_Build 1 143643554 11D TCAGCGGGCT TCCGGCTCTGC/----------- GCATGCGAGG 1851 het 1851 ref 30 21 7 5 TCCGGCTCTGC 1 0 51259 CASAVA_Build 1 143646684 1D ATATAAAAAG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 61 26 29 7 A 7 6 51260 CASAVA_Build 1 143647153 3I36M5I ATTGTATACA ---TAGTATATTTCAATTAAAAAGATTAAAAGGAGTAAA-----/TATTAGTATATTTCAATTAAAAAGATTAAAAGGAGTAAATAAAT TAAAACTATG 3070 het 3070 hom 62 15 55 16 N/A 0 0 51261 CASAVA_Build 1 143651678 1D TCCAAAATAC T/- TTTTTGTACC 3070 het 3070 ref 87 43 41 4 T 6 5 51262 CASAVA_Build 1 143654371 1D TTCCCCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 83 28 32 24 T 11 10 51263 CASAVA_Build 1 143654959 6I CCTAGAACTT ------/AATATA TATATAGGAG 3070 het 3070 ref 72 32 30 10 AATATA 0 1 51264 CASAVA_Build 1 143657040 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 19 9 A 11 10 51265 CASAVA_Build 1 143658846 5I TTTATGTATT -----/TACTA TACTATACTT 3070 het 3070 ref 79 35 35 9 TACTA 1 2 51266 CASAVA_Build 1 143660623 1D GTTGTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 59 20 31 11 T 11 10 51267 CASAVA_Build 1 143662112 1D TATTGCAAAG C/- TTCTTAAATG 3070 het 3070 ref 84 51 26 8 C 1 0 51268 CASAVA_Build 1 143664196 3D GCATTCCCAT TTC/--- TATGCAGCCT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 TTC 1 0 51269 CASAVA_Build 1 143668614 1I TTCAAAAGAA -/G GGAATGATAG 3070 het 3070 ref 57 28 24 5 G 2 3 51270 CASAVA_Build 1 143668789 5D ATTTGAGACA TAACT/----- TAAACGCTAA 3070 het 3070 ref 97 72 19 7 TAACT 1 0 51271 CASAVA_Build 1 143669054 1D GTGGTCAATA C/- TTAAAGGAAT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 C 1 0 51272 CASAVA_Build 1 143672200 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAATTAG 1789 hom 10 het 4 0 4 0 A 6 8 51273 CASAVA_Build 1 143672249 1I CAGCTACTCG -/A GAGGCTGAGG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 0 1 51274 CASAVA_Build 1 143676215 1I25M1I AGTACATACG -AATTTTTTGTATGCAGAGTGAATTT-/TATTTTTTTGTATGCAGAGTGAATTTC TTCTCCAGGC 1955 het 1955 ref 48 49 6 12 N/A 0 0 51275 CASAVA_Build 1 143676323 4D CAGAAAGGAC TCTA/---- TCTGTCTTGA 2943 het 2943 ref 76 64 8 7 TCTA 1 0 51276 CASAVA_Build 1 143678636 5D GTCACTCTGT TAGAA/----- TAGAATCTTG 2377 het 2377 ref 34 26 5 6 TAGAA 2 1 51277 CASAVA_Build 1 143682268 6I AGCCTATTTG ------/CAATAC CAATACTGTA 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 CAATAC 1 2 51278 CASAVA_Build 1 143683174 1D ATTCATACAA T/- GGAATACTAC 1413 het 1413 ref 23 17 3 4 T 1 0 51279 CASAVA_Build 1 143684416 1I ACTCCTGTAA -/T TTTTTTTTCA 2690 het 2690 ref 51 35 7 10 T 8 9 51280 CASAVA_Build 1 143688724 1D AAAGGGGTGG A/- AAAAAGACAT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 A 6 5 51281 CASAVA_Build 1 143694778 1D ATCTCTCTGT G/- AATTACTCTA 3070 het 3070 ref 73 44 19 11 G 1 0 51282 CASAVA_Build 1 143698215 1I TCAGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 82 25 39 18 A 13 14 51283 CASAVA_Build 1 143702652 3D GGCCAAGGTG GGA/--- AGATCACTTG 3070 het 3070 ref 77 54 10 15 GGA 1 0 51284 CASAVA_Build 1 143705381 1I AATTTTTTTT -/G TTTTTAATTA 3070 het 3070 hom 64 21 29 14 G 0 1 51285 CASAVA_Build 1 143709967 1D ATGGTAGTAT A/- ATATATATGT 398 het 398 ref 61 40 4 18 A 2 1 51286 CASAVA_Build 1 143720133 1D GACCTCAGGT G/- ATTCGCTCAC 3070 het 3070 ref 82 64 12 8 G 1 0 51287 CASAVA_Build 1 143729142 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1636 hom 69 7 33 29 T 11 10 51288 CASAVA_Build 1 143743291 1D TGCTTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1279 hom 84 20 26 38 T 34 33 51289 CASAVA_Build 1 143748206 1I TAATCTGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 89 40 42 7 A 9 10 51290 CASAVA_Build 1 143751421 1D ACACGCCCCC T/- GAACCACCCT 3070 het 3070 ref 93 46 26 24 T 1 0 51291 CASAVA_Build 1 143755401 3I CGTCTCAAAA ---/AAT AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 80 41 29 10 AAT 0 1 51292 CASAVA_Build 1 143759511 1D TGCATGGCTC G/- GGGGGGTCCT 3070 het 3070 ref 71 39 26 11 G 7 6 51293 CASAVA_Build 1 143762837 1I AGAGATACAA -/C GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 C 0 1 51294 CASAVA_Build 1 143765298 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 529 hom 31 3 10 18 A 15 14 51295 CASAVA_Build 1 143803354 3D AAAGTCATAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2725 hom 61 23 12 27 T 17 14 51296 CASAVA_Build 1 143804075 1I GAAGCTTTTC -/A AAATGACTAA 3070 hom 176 het 72 0 57 15 A 3 4 51297 CASAVA_Build 1 143809805 5D TTTAATTGAC AAGGA/----- AAGAAATTTT 3070 het 3070 ref 95 62 23 13 AAGGA 1 0 51298 CASAVA_Build 1 143818674 2D TTCTGAATAT AA/-- GTTTTGCTTG 3070 het 3070 ref 86 52 22 15 A 2 0 51299 CASAVA_Build 1 143818726 2I TATATTTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 94 62 10 22 TG 6 7 51300 CASAVA_Build 1 143823360 1D TGGTTTTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 90 69 14 7 G 1 0 51301 CASAVA_Build 1 143828510 5D8M1I CTTTTACCTT TTTTAATGGGGTA-/-----CTGAGGTAG AATTTTTTAA 3070 het 3070 ref 97 69 33 10 N/A 0 0 51302 CASAVA_Build 1 143834731 2D GAATTACAAA AC/-- ACTACTCAAA 3070 het 3070 ref 57 42 8 10 AC 2 1 51303 CASAVA_Build 1 143845583 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 375 hom 14 1 8 5 A 14 13 51304 CASAVA_Build 1 143847282 1D GTTGGTGTCC T/- TTGAAGCACA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 T 3 2 51305 CASAVA_Build 1 143850446 1I ATTATTATCC -/G GAAGGGAAGG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 G 1 2 51306 CASAVA_Build 1 143851443 2D ATTTTTTTTT TC/-- CCCCATTGAA 3070 het 3070 ref 68 47 13 9 TC 1 0 51307 CASAVA_Build 1 143853427 1D AATCAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 58 29 17 12 A 12 11 51308 CASAVA_Build 1 143857020 1I ACTCAATCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 51 10 27 14 A 8 9 51309 CASAVA_Build 1 143857341 1I GGATTTCATG -/A GATGATACAT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 A 0 1 51310 CASAVA_Build 1 143864174 3I2M2D TTCAGGGTTA ---AACC/ATTAA-- GCCTCATGGT 3070 het 3070 ref 75 58 12 9 N/A 0 0 51311 CASAVA_Build 1 143865140 2D TTCTTTAAAC TA/-- TGTGCATATT 3070 het 3070 ref 42 30 9 3 TA 1 0 51312 CASAVA_Build 1 143873375 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 565 hom 18 2 10 6 T 6 7 51313 CASAVA_Build 1 143881506 8D TAAGATTCCA GCTTGGGT/-------- GACTGATAAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 GCTTGGGT 1 0 51314 CASAVA_Build 1 143885443 3D GCGGTGACTC CTT/--- CTGATCCACA 3070 het 3070 ref 41 30 9 2 CTT 1 0 51315 CASAVA_Build 1 143886269 1D TCTCCTGACC T/- CATGATCCGC 2085 het 186 hom 9 1 5 3 T 1 0 51316 CASAVA_Build 1 143892192 9I ATATAGTTGC ---------/CTCTTGTAT CTCTTGTATG 3070 het 3070 hom 41 8 24 9 CTCTTGTAT 1 2 51317 CASAVA_Build 1 143892282 2I TAGAAAAGGT --/GG GGGGGGGGGA 3070 het 1746 hom 26 5 12 9 G 9 11 51318 CASAVA_Build 1 143894681 1I CAAGCAACTG -/A AAACTGAGTC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 3 4 51319 CASAVA_Build 1 143899296 1D TGGGTGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2443 hom 55 6 13 36 A 15 14 51320 CASAVA_Build 1 143899522 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAC 2878 het 2878 ref 67 44 8 17 A 10 9 51321 CASAVA_Build 1 143901310 1D TTCTCTTTCT C/- CTTGCTCCTC 3070 het 3070 ref 101 74 18 9 C 2 1 51322 CASAVA_Build 1 143903974 1D TCTGCTGTGT C/- CTGAATCAGT 1735 het 1735 ref 76 64 4 10 C 2 1 51323 CASAVA_Build 1 143906288 4D TATATTTTGT CAAA/---- CAAAAAGAAG 3070 het 3070 ref 100 82 13 6 CAAA 2 1 51324 CASAVA_Build 1 143908394 1I GGAGCAAGAG -/C GGGGGGGGTG 3070 hom 92 het 87 2 50 35 C 0 1 51325 CASAVA_Build 1 143912134 1D AACTTTGCCG T/- TTTTTTTTTT 2481 het 499 hom 75 3 17 56 T 13 12 51326 CASAVA_Build 1 143915801 1I AGAAGGCAAA -/G GGGGAAGCAA 3070 het 3070 ref 78 49 13 16 G 4 5 51327 CASAVA_Build 1 143918921 1D CACACCTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 93 71 15 10 T 10 9 51328 CASAVA_Build 1 143919370 3I CTCTTTTCTT ---/AGA AGCCCACTTG 3070 het 3070 hom 61 10 45 6 AGA 0 1 51329 CASAVA_Build 1 143919546 3I TCTGCGATTA ---/GTT TTTTCACTGT 2343 het 2343 ref 57 41 5 11 GTT 0 1 51330 CASAVA_Build 1 143923334 1I TTATTATTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 57 12 34 11 T 9 10 51331 CASAVA_Build 1 143923879 1D ATTAAGTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 79 47 18 14 T 10 9 51332 CASAVA_Build 1 143925083 2D AATTTATAAA GG/-- TCACTTTGAC 3070 het 3070 ref 95 72 11 12 G 2 0 51333 CASAVA_Build 1 143925314 1I ATTTTGATAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 41 10 25 6 T 8 9 51334 CASAVA_Build 1 143925563 3D CACATTTCTT CTC/--- TGTACTACAG 3070 het 3070 ref 66 33 27 9 CTC 1 0 51335 CASAVA_Build 1 143926564 2D ACTTGCTGGC CT/-- CACTTAGTAC 3070 het 3070 ref 75 37 33 7 CT 1 0 51336 CASAVA_Build 1 143929859 4D73M1I CTTAATATGC CTCTCTCATTACAGTGATATTGAATGTTTTTTCATATCATCAGTGGCGTTTGTATTGCCTTTTTTCCTACTTCTTTT-/----CTCATTACAGTGATATTGAATGTTTTTTCATATCATCAGTGGCGTTTGTATTGCCTTTTTTTCTACTTCTTTTG GTAAATTGTG 2393 het 2393 ref 20 24 5 8 N/A 0 0 51337 CASAVA_Build 1 143930065 2D AGTATATAAC AT/-- AACATCAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 AT 1 0 51338 CASAVA_Build 1 143931664 1I TTGATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3036 het 3036 ref 47 16 16 15 T 11 12 51339 CASAVA_Build 1 143945565 3I GTTTGCTATA ---/TGT TGTGTCAGAT 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 TGT 1 2 51340 CASAVA_Build 1 143946310 1D CATAGGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1415 hom 42 9 15 19 T 13 12 51341 CASAVA_Build 1 143947396 4I AGGATACTAG ----/ATTT ATTTAGTGTT 3070 het 3070 ref 86 52 22 12 ATTT 1 2 51342 CASAVA_Build 1 143948207 5I CTTTTCTTTC -----/CTTTT CTTTCCTTTC 3070 het 2152 hom 25 10 10 5 CTTTT 0 1 51343 CASAVA_Build 1 143952113 2D ACACTGATGA AT/-- TTTTTTTGCA 2302 het 2302 ref 84 72 6 8 AT 1 0 51344 CASAVA_Build 1 143958787 1I GGATAGTGCC -/T GGTATTTAGT 3070 hom 174 het 65 0 57 8 T 0 1 51345 CASAVA_Build 1 143959011 2I AGGCCTAGCG --/TC TCTCTGATCT 3013 het 3013 ref 82 64 8 10 TC 2 3 51346 CASAVA_Build 1 143960807 3I ATAAAAAAAA ---/AAT ATAAAAAAAT 2179 het 2179 ref 50 38 7 5 AAT 0 1 51347 CASAVA_Build 1 143961132 1I CTTAAGAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 28 10 11 T 9 10 51348 CASAVA_Build 1 143961699 1D TAGCTGGGGG A/- AAAAAAAATG 1353 het 1353 ref 52 26 3 24 A 9 8 51349 CASAVA_Build 1 143963686 4I ATATTAAAAC ----/ACTT AGAAGATTTA 1850 het 1850 ref 14 10 4 0 ACTT 0 1 51350 CASAVA_Build 1 143964247 3I TCACTTTCAA ---/GTT GTTGTTTGCT 2116 het 2116 ref 47 34 5 8 GTT 2 3 51351 CASAVA_Build 1 143965122 1D CCTTCACGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2421 hom 70 13 27 30 A 11 10 51352 CASAVA_Build 1 143965275 2I AGTCTGATAT --/AA GTTACTCTGC 3070 het 3070 hom 64 12 45 7 A 0 2 51353 CASAVA_Build 1 143968870 2I GTATGCACAC --/AT GTGTGCACAT 3070 het 3070 ref 44 34 7 3 AT 0 1 51354 CASAVA_Build 1 143972811 2I AAGTTGATAC --/TT AATGAAATTT 3041 het 3041 ref 98 80 7 11 T 0 2 51355 CASAVA_Build 1 143974166 3D TTCCTTTTTT TTC/--- TTTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 66 46 11 9 TTC 1 0 51356 CASAVA_Build 1 143974349 4D TTACACAGAG TGAC/---- AGAATTAAAA 1034 het 1034 ref 70 61 3 11 TGAC 1 0 51357 CASAVA_Build 1 143976007 1D TTTCAGAGTT C/- CAATGCTAGA 2658 het 2658 ref 87 75 6 7 C 2 1 51358 CASAVA_Build 1 143977664 2D TTCAAAAAAC AT/-- GTGCTACAAG 3070 het 3070 ref 99 63 25 13 AT 1 0 51359 CASAVA_Build 1 143978297 5D TAGAGACAGG GTTTC/----- ACTGTGTTAG 1228 het 492 hom 5 1 4 2 GTTTC 1 0 51360 CASAVA_Build 1 143979021 1D TCTATTTCCC T/- TTCTTTACAG 3070 het 3070 ref 86 57 21 9 T 3 2 51361 CASAVA_Build 1 143979417 1D GTGGAATCCA C/- CCACATTGAA 2193 het 2193 ref 100 88 5 10 C 3 2 51362 CASAVA_Build 1 143981184 5I TCATCCCCAG -----/TTCCA CTCCATTCCT 3070 het 3070 ref 90 68 10 12 TTCCA 0 1 51363 CASAVA_Build 1 143986865 1I AGAGCCAGTC -/T TGAGTTCCAA 3070 het 3070 ref 72 56 10 6 T 1 2 51364 CASAVA_Build 1 143992405 4D ATGCAAAGAC AGTG/---- AGCTCTGAGA 2489 het 2489 ref 45 37 7 5 AGTG 1 0 51365 CASAVA_Build 1 143997093 1I ATGTACTTTC -/T TTTTTTTTCT 2650 het 2650 ref 35 26 7 2 T 8 9 51366 CASAVA_Build 1 143998570 1I GACTTCTTCT -/G GGGGGAAAAA 2726 het 2726 ref 63 46 6 11 G 5 6 51367 CASAVA_Build 1 144000693 2D TATTTTCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 96 27 21 48 A 18 16 51368 CASAVA_Build 1 144006776 1I CTGTCTTTTT -/C TCAGAGTATG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 C 0 1 51369 CASAVA_Build 1 144010328 1I GGCAGGAGAA -/T TGGCATGAAC 1810 het 1810 ref 10 5 4 1 T 1 2 51370 CASAVA_Build 1 144013325 4I AAATATTTAT ----/CAAA CAGAGAAGAA 2897 het 2897 ref 55 39 7 9 CAAA 0 1 51371 CASAVA_Build 1 144014298 1I ATACTTTCAC -/A AATGACAGTT 1950 het 1950 ref 23 15 5 3 A 2 3 51372 CASAVA_Build 1 144022191 1D TTTATTGGGG A/- AAAAATTGCT 3070 het 3070 ref 76 63 8 7 A 6 5 51373 CASAVA_Build 1 144079565 6D GGTCACTTTC TCTCTG/------ TCTCTGTCTC 2829 hom 11 het 13 0 7 8 TCTCTG 4 3 51374 CASAVA_Build 1 144081062 1D AGCTGTCTGG C/- TCAATGATCT 3070 het 3070 ref 58 44 10 6 C 1 0 51375 CASAVA_Build 1 144082766 1I CTGGTGTTTA -/G GGGCAGGATT 3070 het 3070 ref 55 27 14 14 G 3 4 51376 CASAVA_Build 1 144082969 3I GGCTTCACCA ---/ATC ATCTCATGGC 1870 het 1870 ref 73 58 5 10 ATC 1 2 51377 CASAVA_Build 1 144087233 2D AAGGTGCCTC TT/-- TGTTGCTTGG 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 3 1 51378 CASAVA_Build 1 144087922 1I TTTGAGAATT -/A CTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 92 29 53 10 A 0 1 51379 CASAVA_Build 1 144088140 5D GGGAAAGGAA TTATT/----- TTATTTGGAT 3070 het 3070 ref 89 37 27 32 TTATT 2 1 51380 CASAVA_Build 1 144088882 1D GGGTCTCTCA G/- GGGCAGGGAG 1690 het 1690 ref 39 30 5 4 G 4 3 51381 CASAVA_Build 1 144089131 1D CTTGTAGTTC T/- AGTAAAAGAA 3070 het 3070 hom 40 11 19 10 T 1 0 51382 CASAVA_Build 1 144089234 1I TGTGCAGAAG -/T CCTCTGCATA 3070 het 3070 ref 56 28 20 8 T 0 1 51383 CASAVA_Build 1 144089374 3I GGTTCCCTGG ---/CCT CCTCCAGGCC 2822 het 2822 ref 25 13 7 5 CCT 1 2 51384 CASAVA_Build 1 144090307 1I TGAAACGCGC -/G CATTAGTACT 3070 het 3070 ref 87 53 23 11 G 0 1 51385 CASAVA_Build 1 144093908 15D GCGCAGGGGC TGCTGCTTCGCCACA/--------------- TGCTGCTTCG 1989 het 1989 ref 63 40 9 22 TGCTGCTTCGCCACA 1 0 51386 CASAVA_Build 1 144096890 1D GCGGCCGTTT G/- GCCGTTGGAG 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 G 2 1 51387 CASAVA_Build 1 144135625 1I AAGAAAACCC -/A AAAAAACAAA 3070 het 2700 hom 25 10 13 2 A 6 7 51388 CASAVA_Build 1 144135755 1D CATGGCAAAA C/- CCTGACTCTA 2685 het 2685 ref 17 8 7 2 C 3 2 51389 CASAVA_Build 1 144136426 1D AAAGAACTAA T/- TTTTTTTTTT 2461 het 2461 ref 33 16 7 10 T 17 16 51390 CASAVA_Build 1 144143386 8D ACTCCAGCCT GAGTGACA/-------- GAGTGAGACT 1677 het 1677 ref 13 7 5 2 GAGTGACA 1 0 51391 CASAVA_Build 1 144146327 1D CCCTATGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 8 A 11 10 51392 CASAVA_Build 1 144153198 1D ATCTTTGCTT A/- AGAGTATACT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 2 1 51393 CASAVA_Build 1 144158655 1D GGGATGGGGG A/- ATGGGAAGTT 3070 het 3070 ref 41 23 9 9 A 2 1 51394 CASAVA_Build 1 144205917 4D AAAAAAAAAG AAAT/---- AAAAAATACA 1128 het 1128 ref 16 9 5 2 AAAT 1 0 51395 CASAVA_Build 1 144212279 2I TGGAGGTCTC --/TA ATATATATTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 TA 0 1 51396 CASAVA_Build 1 144223154 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTGTTTT 3070 het 2986 hom 31 14 12 5 G 0 1 51397 CASAVA_Build 1 144233407 7I GGTGAGATCT -------/CGGCTCA CTGCAACCTC 3070 het 2238 hom 18 7 7 4 CGGCTCA 0 1 51398 CASAVA_Build 1 144276332 3D ATTCTGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1258 het 81 hom 24 1 8 16 A 21 18 51399 CASAVA_Build 1 144276934 1I TGGGTGGCAG -/A GTGAGACCCT 3070 het 2610 hom 18 7 9 2 A 0 1 51400 CASAVA_Build 1 144277255 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAACAA 3070 het 2823 hom 23 7 15 3 A 9 7 51401 CASAVA_Build 1 144279895 1D CTGAGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 12 11 51402 CASAVA_Build 1 144280673 20I TTTTCTGTAT --------------------/AAATATACAGAGACTGTATA ATTTAATAGA 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 AAATATACAGAGACTGTATA 0 1 51403 CASAVA_Build 1 144285632 1D TTGAACAAAT A/- TGCAGCCAAC 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 A 1 0 51404 CASAVA_Build 1 144287918 1I GTCTTTGGGG -/C TACTCTCGGG 2744 hom 30 het 13 0 9 4 C 0 1 51405 CASAVA_Build 1 144303046 3D GATATTATAA AAC/--- AACATCTAAC 3070 hom 90 het 35 0 30 7 AAC 2 1 51406 CASAVA_Build 1 144316255 1I AGAGTAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 34 1 27 6 T 12 13 51407 CASAVA_Build 1 144323891 4I GTGGCAACAT ----/AATG TATGTTTCTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AATG 0 1 51408 CASAVA_Build 1 144331506 1D TGAACACCCA G/- TAATTATATT 3070 het 3070 ref 63 44 16 3 G 1 0 51409 CASAVA_Build 1 144331783 1I GCAGAAGAAA -/T TTTTTTGTAT 2716 het 2716 ref 32 17 6 9 T 6 7 51410 CASAVA_Build 1 144333665 4D AATTAAAAAA AGAT/---- AGAAGTGAGT 3070 het 3070 ref 48 27 17 5 AGAT 1 0 51411 CASAVA_Build 1 144333778 1I TTTGTTTTTT -/G GTTTTTTTTT 2660 het 2660 ref 33 15 7 11 G 1 2 51412 CASAVA_Build 1 144335565 1D TCTCAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 het 2420 hom 25 6 13 7 T 1 0 51413 CASAVA_Build 1 144338370 2I GAAAATGTGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 TA 6 7 51414 CASAVA_Build 1 144349993 1I CCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2281 hom 35 9 15 11 A 13 14 51415 CASAVA_Build 1 144352794 2I CCTCTCGAGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 2820 hom 29 11 10 8 GT 8 9 51416 CASAVA_Build 1 144370858 1I CTAAAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 T 10 11 51417 CASAVA_Build 1 144372631 1D CCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 32 1 24 7 A 13 12 51418 CASAVA_Build 1 144375774 2D ACTGAGTCTC AG/-- AGAAATAAAG 3070 het 3070 hom 37 11 21 7 AG 2 1 51419 CASAVA_Build 1 144380770 2D AATTTATAAC TG/-- AGGGTATTCT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 TG 1 0 51420 CASAVA_Build 1 144383945 1D CTTTCAAGAT A/- ACATTTGATT 3070 hom 51 het 21 0 18 6 A 2 1 51421 CASAVA_Build 1 144389606 8D AGAAATTTGG ACATGAAC/-------- ACATGAACAC 1180 het 1180 ref 16 10 3 6 ACATGAAC 2 1 51422 CASAVA_Build 1 144389962 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 5 T 11 10 51423 CASAVA_Build 1 144397545 1D TTATTAATAA T/- TTTTTTTTTT 681 het 681 ref 18 3 3 12 T 15 14 51424 CASAVA_Build 1 144402609 3D CTTCAGGGAT TTA/--- TTATTATTAT 564 het 564 ref 11 4 3 4 TTA 7 6 51425 CASAVA_Build 1 144406847 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1439 het 892 hom 12 3 6 3 A 17 18 51426 CASAVA_Build 1 144409172 1D CAATTAACTC T/- TTTTTTTTTT 1942 het 1942 ref 39 17 6 16 T 17 16 51427 CASAVA_Build 1 144416926 1D GTCCATTATT A/- ATAATCTCTC 3070 het 3070 hom 34 12 13 12 A 2 1 51428 CASAVA_Build 1 144419093 1I ATCAATAGGG -/A AAATGGTTTA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 3 4 51429 CASAVA_Build 1 144442311 1I GCATGATGGC -/T CACGCCTGTA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 0 1 51430 CASAVA_Build 1 144493456 1I GGAGATAGAG -/A CACGAAAAAC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 0 1 51431 CASAVA_Build 1 144497924 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1207 het 1207 ref 25 18 3 4 A 13 12 51432 CASAVA_Build 1 144534722 1D ATGGATGATT A/- AAAAAAAAAA 1836 het 1836 ref 39 29 4 6 A 11 10 51433 CASAVA_Build 1 144704686 4I TAACTTTATT ----/AGAA AGAAACTATC 3070 het 3070 ref 60 38 20 3 AGAA 1 2 51434 CASAVA_Build 1 144705255 1D GGAGAGACAG T/- TAAGGGCCTT 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 T 2 1 51435 CASAVA_Build 1 144716457 3I AGTCGAGGCT ---/GCA GCAGTGAGCC 1866 het 1866 ref 45 35 6 4 GCA 1 2 51436 CASAVA_Build 1 144731364 1I ACCATTTTTG -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 49 27 15 7 T 6 7 51437 CASAVA_Build 1 144732714 2I AGCTTTAGCA --/CC CATCTCCCAC 2645 het 1913 hom 11 4 6 1 C 1 3 51438 CASAVA_Build 1 144874245 2D AGGCCAGGGT TC/-- AGGAGGATTG 2832 het 2832 ref 32 20 8 4 TC 1 0 51439 CASAVA_Build 1 144927648 1D TTTTTCTTTT C/- TAACCACTTC 1377 het 1377 ref 37 29 3 5 C 1 0 51440 CASAVA_Build 1 144927735 1I TTTTTCCCAC -/T TTTCCAGGCT 3070 het 1117 hom 33 3 21 9 T 3 4 51441 CASAVA_Build 1 144930503 2I GAGCACAGTC --/TT TTCATGATCA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 2 4 51442 CASAVA_Build 1 144933653 1I AAAAGATAAT -/G TAGCTGCATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 0 1 51443 CASAVA_Build 1 144935474 1I CTGGTGTTTA -/G GGGCAGGATT 3070 het 3070 ref 44 28 11 5 G 3 4 51444 CASAVA_Build 1 144938570 1I ATTTTTCTGA -/T TTTTCAGTAG 3070 het 3070 ref 87 36 32 19 T 4 5 51445 CASAVA_Build 1 144940827 2I24M5I ATACATATAT --ACACATACTTATATGGGAAAGGAA-----/ACACACATACTTATATCGGAAAGGAATTATT TTATTTGGAT 2630 het 2630 ref 65 70 6 5 N/A 0 0 51446 CASAVA_Build 1 144941588 1D GGGTCTCTCA G/- GGGCAGGGAG 982 het 982 ref 45 38 3 4 G 4 3 51447 CASAVA_Build 1 144942491 1I CAGGTACCTT -/C CCATGGGCCC 3070 het 3070 ref 66 35 22 9 C 2 3 51448 CASAVA_Build 1 144943352 2D TTATGGAGCA AT/-- AGAGAGGAAC 3070 het 3070 ref 60 39 16 6 AT 1 0 51449 CASAVA_Build 1 144944006 1D AGAAATGGAG A/- ATTTGTTGGA 3070 het 3070 hom 97 35 51 11 A 2 1 51450 CASAVA_Build 1 144944980 3D AAATACTGTG CTT/--- TTTTCCACTG 3070 het 3070 ref 59 38 13 11 CTT 1 0 51451 CASAVA_Build 1 144946235 1I GATAGCTGTA -/C CTGAAAGTGA 2290 het 2290 ref 34 28 5 1 C 1 2 51452 CASAVA_Build 1 144950875 1I ATTGAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1291 het 1291 ref 13 5 3 5 A 10 11 51453 CASAVA_Build 1 144952562 1I AACCAATGAC -/A AAAACCACAT 854 het 854 ref 42 36 2 4 A 4 5 51454 CASAVA_Build 1 144955201 1D TTCCCTGAGA G/- GTTACACGTC 3070 het 3070 ref 71 57 9 5 G 2 1 51455 CASAVA_Build 1 144955601 2D GCAAAAGGAA TC/-- TCTCTTCAGG 3070 het 2143 hom 21 6 12 3 TC 3 2 51456 CASAVA_Build 1 144967226 4I TTTACCTTCC ----/AAGG AAGGACATAA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 AAGG 1 2 51457 CASAVA_Build 1 144971246 1D ATCTTTTACG T/- TTTTTCCAGC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 6 5 51458 CASAVA_Build 1 144974149 2D CTGCTCATGG TC/-- TCTCTTTTTT 3070 hom 109 het 43 0 36 7 TC 3 2 51459 CASAVA_Build 1 144976514 1D AAGTGATAGG T/- TTTTTTATGT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 6 51460 CASAVA_Build 1 144978168 1I AGTGTCACAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 82 het 33 0 28 5 A 9 10 51461 CASAVA_Build 1 144979998 2D TAGCCCAAAC AA/-- GAGAAATTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 0 51462 CASAVA_Build 1 144984032 2D TCACTCATGA CT/-- CTGTAGGCAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 CT 2 1 51463 CASAVA_Build 1 144987670 1I AAACTATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 31 0 29 2 A 11 12 51464 CASAVA_Build 1 144992397 1D GTTCTGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 11 10 51465 CASAVA_Build 1 144993895 1I CTCTCTTCTC -/A GAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 32 2 24 6 A 0 1 51466 CASAVA_Build 1 144996244 1I AAACTTAACC -/A AGGAACATCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 2 51467 CASAVA_Build 1 145003110 1D AAAAGTAGAT A/- AAACCACAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 4 3 51468 CASAVA_Build 1 145016917 1D TTCCTTTACG C/- CCGCTGTAAG 3070 hom 71 het 30 0 21 9 C 3 2 51469 CASAVA_Build 1 145020662 2D GCCCTGAAAC TG/-- TACTTTTTCT 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 TG 1 0 51470 CASAVA_Build 1 145034829 1D GCTCATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 143 hom 26 3 15 9 T 15 14 51471 CASAVA_Build 1 145066491 11I TATCAAGTAA -----------/TCCAAATAATT TATACATATA 3070 het 3070 hom 51 22 29 0 TCCAAATAATT 0 1 51472 CASAVA_Build 1 145067773 1D CAGATTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 14 9 T 13 12 51473 CASAVA_Build 1 145069775 1D CCTGAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 15 14 51474 CASAVA_Build 1 145070530 1D ACATGTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 12 11 51475 CASAVA_Build 1 145071890 1I AAATTATACA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 25 11 9 5 T 6 7 51476 CASAVA_Build 1 145072684 1I CATAGATGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 408 hom 39 1 31 7 T 9 10 51477 CASAVA_Build 1 145073411 1I AGCCATTTCC -/T TGTTGCTGTA 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 T 1 2 51478 CASAVA_Build 1 145087969 2D GCAACCTCTA GT/-- CCAAAATTCC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 GT 1 0 51479 CASAVA_Build 1 145090135 1I AATTGATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2442 hom 24 7 14 3 T 11 12 51480 CASAVA_Build 1 145096025 1D CAGAAGGTGG C/- CTTGGATGGC 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 C 2 1 51481 CASAVA_Build 1 145099592 1I ACTGGAAGCT -/A AAACCTGCTT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 A 3 4 51482 CASAVA_Build 1 145101270 3D CCAATACAAC AAT/--- GATTGCAACA 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 AAT 1 0 51483 CASAVA_Build 1 145118155 2D TTTAAACTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 14 12 51484 CASAVA_Build 1 145118505 1D GGTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 9 51485 CASAVA_Build 1 145120722 1I TTATTTGAGG -/T TTTTCTGTTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 4 5 51486 CASAVA_Build 1 145151111 1I TTTTTTTTTT -/A AAATGAAAAT 3070 hom 118 het 46 0 40 6 A 3 4 51487 CASAVA_Build 1 145155434 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 15 14 51488 CASAVA_Build 1 145156438 1I ACATGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 19 0 13 6 T 12 13 51489 CASAVA_Build 1 145156623 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCACC 1238 het 838 hom 7 4 3 0 G 4 3 51490 CASAVA_Build 1 145157595 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 11 10 51491 CASAVA_Build 1 145158038 5D AGTTAATTGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1899 het 113 hom 17 2 8 7 T 21 16 51492 CASAVA_Build 1 145159147 1D TTAAGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 901 hom 32 9 15 8 A 17 16 51493 CASAVA_Build 1 145159316 12D GCATACCTGG CCAGTAAGTAAT/------------ CCTCAAAACT 3070 hom 93 het 31 0 31 3 CCAGTAAGTAAT 1 0 51494 CASAVA_Build 1 145164324 3D TTTATCTTAC TTT/--- TTTTTTTTTT 1984 het 66 hom 12 2 7 4 T 17 14 51495 CASAVA_Build 1 145175315 1D GGCTGAGCTG C/- CCCCAGCACC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 C 5 4 51496 CASAVA_Build 1 145188192 4I CAGTCTGCTT ----/TCTC TCTCTTCTGA 3070 hom 111 het 40 0 36 4 TC 2 4 51497 CASAVA_Build 1 145194787 1I CAGCCTTTAT -/A ACGTGTCTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 2 51498 CASAVA_Build 1 145199694 1D TTTTTTTTTT A/- ATATATAAAG 3070 het 460 hom 28 3 22 4 A 2 1 51499 CASAVA_Build 1 145201014 1I GGGAGATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 38 1 32 5 A 11 12 51500 CASAVA_Build 1 145216821 1I GCCTGGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 697 hom 23 5 13 5 T 15 16 51501 CASAVA_Build 1 145222847 4D TCTCATTCTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AAAC 3 2 51502 CASAVA_Build 1 145225281 2D CCCATCCCCC CT/-- CTGTTATTCT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CT 2 1 51503 CASAVA_Build 1 145231440 1D TCTCCAGCTC T/- GCCCACTTAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 0 51504 CASAVA_Build 1 145232694 2I GAGTGAAGAC --/AT GTGTTCTTCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 AT 0 1 51505 CASAVA_Build 1 145233209 4D TTAAGCAAAC AAAT/---- AAGTGAACTA 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 AAAT 1 0 51506 CASAVA_Build 1 145233339 1I CCTCCTTGCT -/C TATAAGTTAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 0 1 51507 CASAVA_Build 1 145235277 3D35M1D GGGAGAAAGC CTTCTTTTTTCCCCCTATTCTGTCAACCATGGTCCAGTC/---CTTTTTTCCCCCTATTCTGTCAACCATGGTCCAGT- GTGGGATTTT 3070 hom 199 het 54 0 66 8 N/A 0 0 51508 CASAVA_Build 1 145237016 5I CCCCCTTTTA -----/TTTAT TTATTTTTTT 3070 hom 63 het 22 0 22 2 TTTAT 0 1 51509 CASAVA_Build 1 145237391 3D GAAAATGAAC ACA/--- ACACACTAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 ACA 2 1 51510 CASAVA_Build 1 145238390 6D TAGAAGAAAT ACGTAA/------ AGGTAAACTC 3070 hom 60 het 22 0 20 4 ACGTAA 1 0 51511 CASAVA_Build 1 145238746 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 11 10 51512 CASAVA_Build 1 145239818 6I CAAAGCAATC ------/TATATA TAAAGTACAA 3070 hom 157 het 56 0 53 3 TA 1 4 51513 CASAVA_Build 1 145240039 4I GAGAGACGAA ----/AAAT AAATTCATGC 3070 hom 93 het 40 0 31 9 AAAT 1 2 51514 CASAVA_Build 1 145240648 2D TGCTATTATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 12 10 51515 CASAVA_Build 1 145241404 5D TTTATATGTC AAATT/----- AAACAAATTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAATT 1 0 51516 CASAVA_Build 1 145242674 1D TTAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 35 0 24 13 A 11 10 51517 CASAVA_Build 1 145242838 1D GGTATCTACT C/- AAAGGAAAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 C 1 0 51518 CASAVA_Build 1 145248455 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 811 hom 19 2 15 2 A 10 9 51519 CASAVA_Build 1 145251158 3D AAAGTGTATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 13 10 51520 CASAVA_Build 1 145266399 1D CAAGAATAAG C/- CAGGAAGAGG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 2 1 51521 CASAVA_Build 1 145270180 1I TGCTCATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1851 hom 35 7 21 8 A 14 15 51522 CASAVA_Build 1 145273946 1D CTAATAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 48 1 42 5 T 11 10 51523 CASAVA_Build 1 145274437 3D TTTCCCAAAA AGG/--- AGAATATAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AGG 1 0 51524 CASAVA_Build 1 145277254 2D AAAAAGAAAA AG/-- AAAAAGAAAA 1270 het 36 hom 19 1 14 4 AG 1 0 51525 CASAVA_Build 1 145277355 7I TTTTGCTGCT -------/CTCAGAG CCACACATAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CTCAGAG 0 1 51526 CASAVA_Build 1 145290232 4I AAATTTAAGG ----/ATTA ATTGTTCTTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 ATTA 0 1 51527 CASAVA_Build 1 145290354 1I TACTATATAA -/T TTCCAGAACA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 3 51528 CASAVA_Build 1 145292806 31I TTGAGGCTAG -------------------------------/GAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATAGTGA GACTCATCTC 3070 hom 102 het 33 0 33 4 GAGTTTGAGACCAGCCTGGGTAACATAGTGA 0 1 51529 CASAVA_Build 1 145293893 1D TGTGTGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 37 1 31 7 T 11 10 51530 CASAVA_Build 1 145303131 2D AGGGCTTTGT GA/-- GGCCAAGGCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GA 1 0 51531 CASAVA_Build 1 145311174 1D TGCACAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 38 1 28 9 T 12 11 51532 CASAVA_Build 1 145324557 6D TGGTATCTTA TTTTAG/------ TTTTAATTTG 3070 hom 87 het 31 0 30 3 TTTTAG 1 0 51533 CASAVA_Build 1 145324681 4I TTAAATTTGG ----/TTGT TTGTCTTATA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTGT 1 2 51534 CASAVA_Build 1 145341476 1D CTGGGAGGCA C/- CCCCCAGCAG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 C 6 5 51535 CASAVA_Build 1 145342763 1I CCAGCCACTG -/C AAAAACATGC 3070 hom 39 het 15 0 14 2 C 0 1 51536 CASAVA_Build 1 145354891 1I ATTATAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 34 1 26 7 A 10 11 51537 CASAVA_Build 1 145369712 1D CTCAGGGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 11 10 51538 CASAVA_Build 1 145377296 1I TCTCTAAGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 870 hom 45 2 37 6 A 10 11 51539 CASAVA_Build 1 145377594 2D CTAAAATAAT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 6 A 11 9 51540 CASAVA_Build 1 145390794 1D ATTAGTAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 9 8 51541 CASAVA_Build 1 145396418 2D GTAGTAGGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 12 10 51542 CASAVA_Build 1 145399955 3I AACTTAAAGC ---/ATA ATAATAATAA 3070 hom 36 het 14 0 13 3 ATA 3 4 51543 CASAVA_Build 1 145400135 1D TGCATTGCTG A/- AATCTTCAAC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 3 2 51544 CASAVA_Build 1 145400292 4I AGGATGTGTT ----/AGTC AGTATCATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AGTC 0 1 51545 CASAVA_Build 1 145401259 2D TTTTCTGCTC CT/-- CTCTCTCCTC 3070 hom 105 het 39 0 35 5 CT 4 3 51546 CASAVA_Build 1 145401548 1D TAGGTTGAGT C/- CACGTCTTTG 3070 hom 96 het 35 0 31 6 C 2 1 51547 CASAVA_Build 1 145404064 1D9M1D TAGTTTTTTA TTGTTTTTTGA/-TGTTTTTTG- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 5 N/A 0 0 51548 CASAVA_Build 1 145411418 1D AAACTTCTAA G/- GTTACTCAAC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 G 2 1 51549 CASAVA_Build 1 145415553 3D CCATCCTCAA CTT/--- CTTCTTTTTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTT 3 2 51550 CASAVA_Build 1 145424325 1I TTTACAAACA -/T TAAGAGAGAT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 T 1 2 51551 CASAVA_Build 1 145428314 2D TATTATTAAC TT/-- GGTTCTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 0 51552 CASAVA_Build 1 145429920 12I AACATGCTTG ------------/CTTTTTGTCTTT CAACTCTTGG 3070 hom 108 het 38 0 36 3 CTTTTTGTCTTT 0 1 51553 CASAVA_Build 1 145430803 1I TTAAGTGTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 473 hom 36 2 28 6 A 0 1 51554 CASAVA_Build 1 145435543 1D GGGAACTTTT A/- AAAAATACCA 3070 hom 108 het 41 0 35 6 A 6 5 51555 CASAVA_Build 1 145445098 1D TCCAGGTCTT C/- CTCATCTCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 2 1 51556 CASAVA_Build 1 145453273 2D ATCTAGTCCC CT/-- GTTTACAAAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CT 1 0 51557 CASAVA_Build 1 145455982 1D TACAGTTCTT A/- AAAGATGGTG 3070 het 98 hom 40 1 37 2 A 4 3 51558 CASAVA_Build 1 145459832 2I TTCCTATAAC --/TT AGCCTATGGT 3070 hom 86 het 35 0 28 7 T 0 2 51559 CASAVA_Build 1 145467875 1D CCACTTGAAT C/- CAGGAGGGGG 1093 het 1093 ref 11 4 4 3 C 2 1 51560 CASAVA_Build 1 145470700 2D CCAATAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 38 3 18 17 T 14 12 51561 CASAVA_Build 1 145488515 1D CCAACTCATC T/- TTTTCACTGC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 5 4 51562 CASAVA_Build 1 145497529 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 17 9 T 13 12 51563 CASAVA_Build 1 145505160 11D ACGCTGTCTC AAAAAAAAAGA/----------- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 8 14 6 AAAAAAAAAGA 2 1 51564 CASAVA_Build 1 145506887 1D AGCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 12 11 51565 CASAVA_Build 1 145510496 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 14 1 13 0 A 12 11 51566 CASAVA_Build 1 145511860 2D AGGAGTGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 2391 het 2391 ref 24 11 5 8 CT 2 1 51567 CASAVA_Build 1 145512381 1D CCTTGAAGGG A/- AAAAAAAAAT 1222 het 1222 ref 52 39 3 10 A 10 9 51568 CASAVA_Build 1 145514297 1D TGGATTCTGC A/- AATCTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 3 2 51569 CASAVA_Build 1 145517288 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 33 1 29 3 T 11 10 51570 CASAVA_Build 1 145522812 1D CCTCTGTAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 9 8 51571 CASAVA_Build 1 145525699 1I GGTTTATCTG -/T TTAATTTGAA 2894 het 2894 ref 33 20 8 5 T 2 3 51572 CASAVA_Build 1 145529031 10I CAGGAATCAC ----------/CACTCATCAT CACATGACCT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 CACTCATCAT 0 1 51573 CASAVA_Build 1 145540002 2I GGTAAGACTC --/AT GTGGGTTTAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AT 0 1 51574 CASAVA_Build 1 145548598 1D AGTCTAAACC A/- AAAAAAAAAA 2039 het 2039 ref 33 22 5 7 A 13 12 51575 CASAVA_Build 1 145555197 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 12 13 A 12 11 51576 CASAVA_Build 1 145555955 4D CTGATCTTAC GTAA/---- CCACACAACT 3070 het 3070 hom 60 28 28 6 GTAA 1 0 51577 CASAVA_Build 1 145559704 5I AGAGACTGTT -----/AAAAG GAAGAGGGGA 3070 hom 165 het 58 0 55 3 AAAAG 0 1 51578 CASAVA_Build 1 145559971 2D CCACTGTTTT CA/-- CAGATCAGCT 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 CA 2 1 51579 CASAVA_Build 1 145570241 3I TCTGTCTTAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAC 5 6 51580 CASAVA_Build 1 145571928 1D CAAAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2253 het 2253 ref 35 17 5 14 T 15 14 51581 CASAVA_Build 1 145572284 1I AAATTGTGGT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 A 6 7 51582 CASAVA_Build 1 145572859 2D TGCCTAAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2661 hom 34 9 20 6 T 13 11 51583 CASAVA_Build 1 145574716 1I AACAGAAGTA -/C TACTAATTTA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 C 0 1 51584 CASAVA_Build 1 145598287 3D AAGAAAGAGA AAG/--- AAGAATGAAA 3070 het 3070 ref 48 28 14 7 AAG 2 1 51585 CASAVA_Build 1 145600055 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 13 12 51586 CASAVA_Build 1 145622100 1D TGCTGAAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 32 0 25 8 A 10 9 51587 CASAVA_Build 1 145625185 1I GCTTTATGAT -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 40 20 17 3 A 6 7 51588 CASAVA_Build 1 145626979 1D AATACAAAGC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 28 13 15 1 A 8 7 51589 CASAVA_Build 1 145631787 3I TTCCTGTCAG ---/ATA ATGTTATTTT 3070 het 3070 hom 45 13 23 9 ATA 0 1 51590 CASAVA_Build 1 145648791 2D CCACAAGGCC AT/-- ATTTCAGACT 2701 het 2452 hom 16 7 6 3 AT 2 1 51591 CASAVA_Build 1 145666231 1D AAGTTAAAGT A/- AAAGGAGACT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 4 3 51592 CASAVA_Build 1 145666493 4I GCATGCATAA ----/GTGT GTGTCTATAG 3070 hom 166 het 57 0 56 1 GT 2 4 51593 CASAVA_Build 1 145690677 1I TATAAATGCC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 T 8 9 51594 CASAVA_Build 1 145700996 1I ATGGAAATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 53 19 20 14 A 9 10 51595 CASAVA_Build 1 145709163 1D GGAGTCCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 26 3 A 11 10 51596 CASAVA_Build 1 145756208 1I TAACACAGTG -/T AAACCCCATC 1799 het 489 hom 6 1 5 0 T 0 1 51597 CASAVA_Build 1 145763928 1D GACATTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2590 hom 44 14 17 13 A 17 16 51598 CASAVA_Build 1 145767881 1I GAGGCAGGAG -/A ATGGCGTGAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 1 2 51599 CASAVA_Build 1 145771465 1I ACTAGTGTGA -/T TTTTTGGGGG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 5 6 51600 CASAVA_Build 1 145772878 3I CCCGCCAGAG ---/AAC AACCCCCTTT 3070 hom 34 het 20 0 18 2 AAC 1 2 51601 CASAVA_Build 1 145784560 1D TGAGGCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1166 het 1166 ref 48 34 3 11 T 11 10 51602 CASAVA_Build 1 145815918 1I CCATTCTGCC -/A CTATCTACCT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 0 1 51603 CASAVA_Build 1 145831202 2D ACCTGAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 184 hom 22 1 13 9 T 13 11 51604 CASAVA_Build 1 145833240 1D TGCACAAAAT G/- GATTTAAACT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 2 1 51605 CASAVA_Build 1 145856788 1D TTCCTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 29 2 12 15 T 19 18 51606 CASAVA_Build 1 145857374 2D6M1D14M1I19M2D39M2I TACTTAAAAA AGTAAAAATTTACTTAAAATCTG-TTTGTACTCTCAAAAAAAAAGGGTTAAAGAAAACATGGACTCTATAAAACAATACATGAA--/--TAAAAA-TTATTTAAAATCTGTTTTGTACTCTCAAAAAAAA--GGTTAAAGAAAACATGGACTCTATAAAACAATAGATGAAAC ACAAGATAAT 3070 het 3070 ref 49 61 22 13 N/A 0 0 51607 CASAVA_Build 1 145857821 3D CATGCACCAG GGA/--- AAAAATCTAG 3070 het 3070 ref 85 47 34 6 GGA 1 0 51608 CASAVA_Build 1 145860150 4I AGGGAGTAAC ----/AAAG AAGGAGAAAC 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 AAAG 0 1 51609 CASAVA_Build 1 145860231 1D TTAGTAATAA G/- AAAAATATAA 3070 het 3070 ref 69 37 29 4 G 1 0 51610 CASAVA_Build 1 145860517 1D CTCTCAGAAA T/- ATATGGAGAT 3070 het 3070 ref 48 29 14 8 T 1 0 51611 CASAVA_Build 1 145860764 2D AGAATTGCTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 60 33 17 11 TA 1 0 51612 CASAVA_Build 1 145868528 1D AATGCAATAG T/- TTTTTCATTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 6 5 51613 CASAVA_Build 1 146001745 4I TAACTTTATT ----/AGAA AGAAACTATC 3070 het 447 hom 14 1 13 0 AGAA 1 2 51614 CASAVA_Build 1 146003187 1D TGGTGAAGGG A/- AAAAAATCTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 7 6 51615 CASAVA_Build 1 146028411 1I ACCATTTTTG -/T TTTTTTCATG 3070 het 337 hom 10 1 9 0 T 6 7 51616 CASAVA_Build 1 146071263 2D40M4I ATATATTCTA TTTTTTTTTTTCAACAAAACACATAATCTTGATTTTCATAGC----/--TTTTTTTTTCAACAAAACACATAATCTTGATTTTCATAGCTGTA TGTAGAGTAA 1929 het 1929 ref 9 12 4 4 N/A 0 0 51617 CASAVA_Build 1 146107826 1I CTGAATTTTT -/A TATTACTGAG 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 A 0 1 51618 CASAVA_Build 1 146135932 1I TATCTTGCCA -/T TAAAAACTCC 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 T 1 2 51619 CASAVA_Build 1 146168912 5I TTCATTACAT -----/TATAA TATATTACAA 3070 hom 86 het 31 0 29 2 TATAA 0 1 51620 CASAVA_Build 1 146171339 2D AGGCCAGGGT TC/-- AGGAGGATTG 1882 hom 10 het 4 0 4 0 TC 1 0 51621 CASAVA_Build 1 146171891 1D GAGGCCAGGA G/- TTCAAGACCA 3070 hom 23 het 9 0 8 1 G 1 0 51622 CASAVA_Build 1 146178493 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2139 het 2139 ref 30 15 6 9 T 9 10 51623 CASAVA_Build 1 146179015 2I CTGGAGACTC --/AG GGGAGAGAGT 3070 het 3070 ref 88 43 37 8 AG 0 1 51624 CASAVA_Build 1 146182585 1D TCCTGGACAC A/- ATATAAGCTT 3070 het 3070 ref 63 38 18 8 A 2 1 51625 CASAVA_Build 1 146183420 1D TTCCACCACT A/- AAACCACTGA 3070 het 3070 hom 78 36 35 7 A 4 3 51626 CASAVA_Build 1 146183812 1I TTCCAAACCC -/T TTCCTCCCAA 3070 het 3070 ref 85 33 36 16 T 2 3 51627 CASAVA_Build 1 146193411 1D TTCCTTGAGA T/- GGAGTTTTGC 1129 het 1129 ref 38 15 5 18 T 1 0 51628 CASAVA_Build 1 146197015 2I AACCTTCCTG --/CC CCCCATGTTT 3070 het 3070 hom 100 45 50 5 C 4 6 51629 CASAVA_Build 1 146210063 9D CCTGAACAGC TACTAAGAT/--------- TTGCTGGGAC 3070 het 93 hom 37 1 35 4 TACTAAGAT 1 0 51630 CASAVA_Build 1 146212575 1D AATCAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 9 51631 CASAVA_Build 1 146216615 1I CAAGCCAATG -/T GAAATGGGCA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 0 1 51632 CASAVA_Build 1 146233095 1D ATAAAGCATG T/- TAAAGAATCA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 T 2 1 51633 CASAVA_Build 1 146258098 1D ACATTTTGAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 123 het 42 0 41 2 A 9 8 51634 CASAVA_Build 1 146261371 1I TAAAATAGCC -/A AAAAAAACCT 3070 het 17 hom 17 1 13 3 A 7 8 51635 CASAVA_Build 1 146262019 1D TGAGAATTGT A/- AGGCTGGAGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 2 1 51636 CASAVA_Build 1 146319278 3I TATCATTCCA ---/TGT TTTTCTTTCC 3070 hom 21 het 8 0 8 2 TGT 0 1 51637 CASAVA_Build 1 146386468 1D ACTAGCGTAG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 8 7 51638 CASAVA_Build 1 146387601 1I TGTTCCGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 27 9 16 T 11 12 51639 CASAVA_Build 1 146388077 7D GAATTTGGCT CACAGTG/------- AATTATTCAC 1388 het 1388 ref 24 20 4 1 CACAGTG 1 0 51640 CASAVA_Build 1 146388215 1D TTTTTTTTTT G/- CTGCATATAT 3070 het 2473 hom 41 13 11 17 G 1 0 51641 CASAVA_Build 1 146390716 1I TCTTTATAAT -/A AAAAACCATG 3070 het 3070 ref 58 29 25 4 A 5 6 51642 CASAVA_Build 1 146390810 1D GGGTGGGGGG T/- GGTCACTAAG 2412 het 2412 ref 50 37 7 6 T 1 0 51643 CASAVA_Build 1 146427754 2D GCTTTCAAAC AG/-- GGCCTCAAGT 3070 het 3070 ref 60 32 25 3 AG 1 0 51644 CASAVA_Build 1 146435645 1I AGGCTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1296 het 1296 ref 28 11 3 14 T 10 11 51645 CASAVA_Build 1 146436092 4I TTTTAAAGAC ----/TCAT TAATTTGATT 3070 het 3070 hom 46 8 37 1 TCAT 0 1 51646 CASAVA_Build 1 146460801 1D TACTATTATC T/- AAACGAAGGT 2639 het 1171 hom 18 8 6 5 T 1 0 51647 CASAVA_Build 1 146467324 1D TTCCAAGGCC T/- TGCTCAGTCG 3070 het 3070 ref 65 39 11 15 T 2 1 51648 CASAVA_Build 1 146467412 4D GCCCAGTAGA ACTG/---- ACTGACAGTA 1326 het 1326 ref 49 30 5 20 ACTG 2 1 51649 CASAVA_Build 1 146467471 1I CTGTTAACCG -/T AAAAGTTGGT 1922 het 1922 ref 52 38 7 7 T 0 1 51650 CASAVA_Build 1 146467848 4D TACTGATTGC TCTA/---- TCAATAATGT 1655 het 1655 ref 82 74 4 7 TCTA 1 0 51651 CASAVA_Build 1 146468130 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAATA 1752 het 1752 ref 18 7 4 7 A 8 10 51652 CASAVA_Build 1 146469660 1I CAGAGTGATA -/G GCAAAAGGTT 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 G 1 2 51653 CASAVA_Build 1 146476471 1D GAGTGGGCTC A/- ATAATTTTCC 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 A 2 1 51654 CASAVA_Build 1 146477761 1I ATGGCTAACG -/T TAAGGAAGAG 1861 het 1861 ref 12 6 4 2 T 1 2 51655 CASAVA_Build 1 146543538 1I AAAAATAATA -/C AAACGAACAA 2600 het 2600 ref 15 9 6 0 C 0 1 51656 CASAVA_Build 1 146547378 1I CAAAAAAAAA -/T ATTCTTTGTG 3070 het 3070 hom 81 23 56 2 T 0 1 51657 CASAVA_Build 1 146551169 1I AGCTTGCAGT -/G AGCCGAGATC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 0 1 51658 CASAVA_Build 1 146553779 1D ATTTCAGTAA T/- TTTTTTTTCT 2214 het 2214 ref 21 12 6 4 T 9 8 51659 CASAVA_Build 1 146558318 1D AAGAGTAGAA G/- ATAGGGAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 12 0 G 1 0 51660 CASAVA_Build 1 146575800 1I TTTATGGGAG -/A AAATGGGAGA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 A 3 4 51661 CASAVA_Build 1 146576007 1D ATTCTGACAG T/- TTTTAGGTTA 3070 het 3070 ref 92 59 25 8 T 5 4 51662 CASAVA_Build 1 146578161 5I GTCTATAAAA -----/AAGAT AATATAGTAT 2244 het 2244 ref 28 21 5 2 AAGAT 0 1 51663 CASAVA_Build 1 146578215 1D CTAACAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 27 8 13 A 10 9 51664 CASAVA_Build 1 146580436 1D AGCATTAATA T/- TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 41 30 7 5 T 7 6 51665 CASAVA_Build 1 146581779 1I AATGTATACC -/A TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 30 19 7 4 A 0 1 51666 CASAVA_Build 1 146587529 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAATTA 2094 het 2094 ref 25 18 5 2 A 8 7 51667 CASAVA_Build 1 146587609 1I TTATAGACTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 81 47 21 13 T 8 9 51668 CASAVA_Build 1 146588674 8D AATAATCAAA GCTTTTTT/-------- GCCAGATTGT 3070 het 3070 ref 66 58 11 2 GCTTTTTT 1 0 51669 CASAVA_Build 1 146589991 1I TGAATTTCTC -/T TTTTTTTTTT 2401 het 2401 ref 16 10 6 0 T 11 12 51670 CASAVA_Build 1 146590882 1I TTCTGATATA -/T TTTTTTTTTT 2868 het 347 hom 18 1 9 8 T 13 14 51671 CASAVA_Build 1 146591661 1D CTGTTTTACA C/- CAATAGAAAG 3019 het 3019 ref 43 27 9 7 C 2 1 51672 CASAVA_Build 1 146600677 1D GATTATTTCA C/- CCCCACTGCT 1832 het 1832 ref 16 12 4 0 C 5 4 51673 CASAVA_Build 1 146603638 1I ACAGTGTGTG -/A AAAGGCTTAG 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 A 3 4 51674 CASAVA_Build 1 146615541 2I TACACATATC --/TT TGGTCATTGT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 1 3 51675 CASAVA_Build 1 146712370 4D TATTTATCTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 15 12 7 TTTG 3 2 51676 CASAVA_Build 1 146713540 1D TGTGATCACT C/- CCCACAGCAC 3070 het 3070 ref 62 45 16 1 C 4 3 51677 CASAVA_Build 1 146719087 5D24M1I TTCTGGATTC TCTCTTCTCTTCCACTGATATATATTCCA-/-----TCTCTTCCACTGATATATATTCCAT TTTTTTTTTC 1867 het 1867 ref 39 32 4 14 N/A 0 0 51678 CASAVA_Build 1 146725369 1D AACCACATGC A/- AAAAAAATAA 2432 het 2432 ref 23 11 5 8 A 8 7 51679 CASAVA_Build 1 146725548 1D TCTACTAATG A/- AAAAAAAATT 1345 het 1345 ref 33 30 3 1 A 9 8 51680 CASAVA_Build 1 146726175 1I GGAGGAACTT -/A AAAGTACATA 2367 het 1951 hom 12 4 5 3 A 3 4 51681 CASAVA_Build 1 146778272 4D AAAAAGAGGA GCTG/---- ACTATCAACA 3070 het 3070 ref 95 73 15 7 GCTG 1 0 51682 CASAVA_Build 1 146778907 1D AATGAAAATA T/- TTTTTCCTGA 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 T 6 5 51683 CASAVA_Build 1 146779454 1I TTTCCTTTTA -/T TTTTTGTAAT 3070 het 3070 ref 65 45 15 5 T 5 6 51684 CASAVA_Build 1 146783365 4D CCTTGCTCAC CAAA/---- CAGTTATTGA 3070 het 3070 ref 83 41 38 10 CAAA 1 0 51685 CASAVA_Build 1 146786850 2D CATATGTATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 95 62 23 10 AT 6 5 51686 CASAVA_Build 1 146787438 1D CTCTTCCCCA C/- TGTCAGACAA 3070 het 3070 ref 62 41 15 6 C 1 0 51687 CASAVA_Build 1 146791191 1D ATACAGTGAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 8 7 51688 CASAVA_Build 1 146796188 1I AAAAAAAAAA -/G GTTACTTGTA 3070 het 3070 hom 64 26 20 18 G 1 2 51689 CASAVA_Build 1 146796500 3I TTGATGAACT ---/TAA TAATAGTCCT 3070 het 3070 ref 78 36 28 14 TAA 1 2 51690 CASAVA_Build 1 146799678 4D TTAAGAGAGT TTAA/---- TTTAGAAGTC 1915 het 1915 ref 72 55 7 13 TTAA 1 0 51691 CASAVA_Build 1 146800565 1I TTTAGTTTAG -/T TTTTTTGTGA 3070 het 2974 hom 30 7 8 15 T 6 7 51692 CASAVA_Build 1 146804286 1D AGATGTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 71 29 24 18 T 11 10 51693 CASAVA_Build 1 146804907 1I AAATAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 96 33 37 26 T 10 11 51694 CASAVA_Build 1 146812105 3D CCATCCCCTG AAC/--- TCTGCTCTCT 3070 het 3070 ref 67 45 16 9 AAC 1 0 51695 CASAVA_Build 1 146813533 5D TTTCTTTTAA ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 het 208 hom 18 6 10 2 ATTTT 6 5 51696 CASAVA_Build 1 146814738 1D TCATTTTTTA T/- TTTAACCAAC 3070 het 3070 ref 90 70 10 11 T 4 3 51697 CASAVA_Build 1 146815537 1I CGGATGTCAC -/A AAAAGCATTT 3070 het 3070 hom 91 30 49 12 A 4 5 51698 CASAVA_Build 1 146816191 1D TACAAGAGAC A/- GGGGGGACAT 3070 het 3070 ref 80 60 17 6 A 1 0 51699 CASAVA_Build 1 146816781 4D TTTTTCCAGG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 ref 95 38 37 22 TA 8 6 51700 CASAVA_Build 1 146816972 1D GGTTCTATGA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 85 51 26 10 T 8 7 51701 CASAVA_Build 1 146817883 1D10M1I TTATAAGTAC TCATTAAATCA-/-CACTAAATCAT TTTCATTAGG 3070 het 3070 ref 96 62 24 34 N/A 0 0 51702 CASAVA_Build 1 146819425 3I TTCTTATTTC ---/TTT TGTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 86 36 39 11 T 1 4 51703 CASAVA_Build 1 146819563 1D GTAGCTGGGA T/- TAACAGGCAC 1409 het 1409 ref 64 49 5 10 T 2 1 51704 CASAVA_Build 1 146819793 1I ATTGACTGAT -/A AAACATTTTT 2877 het 2877 ref 33 19 6 8 A 3 4 51705 CASAVA_Build 1 146820037 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAATCAG 1214 het 1214 ref 15 10 3 2 A 6 7 51706 CASAVA_Build 1 146823492 4I GATTTCCCTG ----/TGTC TATCTGTCTT 3070 het 3070 ref 90 55 22 13 TGTC 0 1 51707 CASAVA_Build 1 146824770 1I ATTCTCTAAC -/T TTTTTTTTTC 2314 het 2314 ref 62 45 7 10 T 9 10 51708 CASAVA_Build 1 146825382 1D CATGCCTGGC T/- TAATTTTCAT 3070 het 3070 ref 54 35 8 12 T 2 1 51709 CASAVA_Build 1 146825407 1D TTTGTAGAGA T/- TGGGATTCAA 2736 het 2736 ref 43 33 7 3 T 2 1 51710 CASAVA_Build 1 146826942 9D TATACGTGTA CAGATAGAC/--------- CAGATAGACC 3070 het 3070 ref 93 77 11 14 CAGATAGAC 2 1 51711 CASAVA_Build 1 146830805 1D CTCAACTTAA T/- TTTTTTTTCA 2840 het 2840 ref 37 29 7 2 T 9 8 51712 CASAVA_Build 1 146833875 5I GCGGGGAGAC -----/ACTCT ACTCTGACTC 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 ACTCT 1 2 51713 CASAVA_Build 1 146838597 3I AATGCAATTC ---/TAA TAATAATTCC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TAA 2 3 51714 CASAVA_Build 1 146855579 3D CAAGGAAGAA CTG/--- CTTAATGTAA 1403 het 1403 ref 20 15 3 2 CTG 1 0 51715 CASAVA_Build 1 146862126 1I ATCACACAAC -/A AAAAAGGAGA 1632 het 1632 ref 16 11 4 1 A 5 6 51716 CASAVA_Build 1 146865601 2D GCCTTGAGAA TG/-- GAAATCATGA 2259 het 2259 ref 16 11 5 0 TG 1 0 51717 CASAVA_Build 1 146871155 2I GGAGGGGGGG --/AA AAAAAACAAC 1718 het 1718 ref 22 15 5 2 A 6 8 51718 CASAVA_Build 1 146872957 1I CAGGTGCCAT -/C TCCTGGATAC 2729 hom 15 het 6 0 6 0 C 0 1 51719 CASAVA_Build 1 146888901 1I TTTAAAAAAA -/T AAATATATCA 2373 het 1102 hom 11 4 5 2 T 0 1 51720 CASAVA_Build 1 146898006 1D AGGTAGATAC A/- AAAAAATGGT 3070 het 3070 ref 86 73 9 5 A 7 6 51721 CASAVA_Build 1 146904950 2D ACTTGAGGCC CT/-- CTTTGAAAGC 1173 het 1173 ref 16 12 3 2 CT 2 1 51722 CASAVA_Build 1 146905512 1D AAAAATTAGC T/- GGGCATGGTG 3070 het 2401 hom 15 5 9 1 T 1 0 51723 CASAVA_Build 1 146913666 2D ATAATAATTT AA/-- AGAGTTTAAT 3070 het 2410 hom 19 5 13 2 A 3 1 51724 CASAVA_Build 1 146919994 1I GTCCTTTTTG -/T TTTTTTCAAA 1435 het 1435 ref 12 8 3 1 T 6 7 51725 CASAVA_Build 1 146937066 1I GGGCCTTTGT -/A AAACAATTTG 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 A 3 4 51726 CASAVA_Build 1 146937325 1I TGCTGATAAA -/C AATCATGTCT 3070 het 3070 ref 58 44 13 1 C 0 1 51727 CASAVA_Build 1 146937439 1D GATCCAATTT A/- TTAAAATATT 3070 het 3070 ref 88 61 10 19 A 1 0 51728 CASAVA_Build 1 146939427 1I ATTAATATTT -/C CTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 56 34 12 10 C 1 2 51729 CASAVA_Build 1 146939925 1I GATGATCATG -/C AATTCTCTTT 3070 het 3070 ref 70 50 16 4 C 0 1 51730 CASAVA_Build 1 146940240 3D CACTAACAAA TAT/--- TATTATTATA 1085 het 1085 ref 57 47 5 9 TAT 4 3 51731 CASAVA_Build 1 146943096 1I61M5D AATAGTGGGA -AAAGTGATAAAACCAATGTAAAAATCATAAACATTTTATAAAGAATTTTTGTCATGTAATTTAATA/TAAAGTGATAAAACCAATGTAAAAATCATAAACATTTTATAAAGAATTTTTGTCATGTAATT----- TTTTTCTTTA 1621 het 1621 ref 32 38 4 4 N/A 0 0 51732 CASAVA_Build 1 146946659 4I GAAATTTTTC ----/TCTT TCTTATAGTA 1948 het 1948 ref 39 29 5 5 TCTT 1 2 51733 CASAVA_Build 1 146948470 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 het 1376 hom 20 3 17 0 T 4 5 51734 CASAVA_Build 1 146948849 1D GGCAAAATTT A/- AAACATCCGT 2200 het 2200 ref 70 59 5 6 A 4 3 51735 CASAVA_Build 1 146949214 4D AAATATCAGA AAGT/---- AAGTAGAAAT 3070 het 3070 ref 54 38 11 6 AAGT 2 1 51736 CASAVA_Build 1 147027289 1D GCTTCAGAAA C/- CCCCCGGAAA 1036 hom 12 het 6 0 4 2 C 6 5 51737 CASAVA_Build 1 147034665 5D TTGACAAAAC AAACA/----- AAAAAACATC 3070 het 3070 ref 36 20 8 8 AAACA 1 0 51738 CASAVA_Build 1 147048652 1D CCAAGAAGCT C/- CCCGTCTTCT 2129 hom 12 het 5 0 5 0 C 4 3 51739 CASAVA_Build 1 147056475 2D ATCAGGCTCA GT/-- GTGCTCTATT 3070 hom 101 het 37 0 33 5 GT 2 1 51740 CASAVA_Build 1 147059534 1D TCATCTCTAG A/- AAAAAAAAAA 1442 het 1442 ref 12 5 3 4 A 11 10 51741 CASAVA_Build 1 147061382 1I TAAGAGTGTT -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 43 34 7 2 A 6 7 51742 CASAVA_Build 1 147110722 5I GACCAAATAG -----/AATGT AAGTTAGAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AATGT 0 1 51743 CASAVA_Build 1 147110784 3D TTAAGTTATT AAG/--- AAGATGTGAT 3070 het 3070 ref 61 38 13 13 AAG 2 1 51744 CASAVA_Build 1 147110827 2D TGATACATAC AT/-- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 91 35 25 32 AT 5 4 51745 CASAVA_Build 1 147113096 1D ATGTTAGGGT G/- GAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 89 67 7 16 G 2 1 51746 CASAVA_Build 1 147114201 2D CACATATTTA AT/-- ATGTTATATG 3070 het 3070 ref 99 67 23 12 AT 2 1 51747 CASAVA_Build 1 147115526 10D28M6D TTTCATTTCA TCTCATCTTTTCATCTCATTTCATTTGATCATTTCATCAATTCA/----------TCATTTCATTTCATCTCATCTTTTCATC------ TCATTTCATC 3070 het 3070 ref 80 80 30 48 N/A 0 0 51748 CASAVA_Build 1 147115974 5I TCATCTCATG -----/ATTTC ATTTCATCTC 3070 het 313 hom 63 6 31 26 ATTTC 1 2 51749 CASAVA_Build 1 147118266 2I TTCAGGTGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 94 22 46 26 T 10 12 51750 CASAVA_Build 1 147118914 2D AAATACAGAC TT/-- ACATAAATAG 2225 het 2225 ref 91 79 7 7 T 2 0 51751 CASAVA_Build 1 147119008 2D TGACAACGAA TT/-- TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 96 33 7 57 T 8 6 51752 CASAVA_Build 1 147119187 3D25M1I ATGCACAAAC CTTTTTTTTTTTTTAACCCCATCAGCTG-/---TTTTTTTTTTTAAGCTCATCAGCAGT TTTTAGCATT 3070 het 3070 ref 74 36 20 22 N/A 0 0 51753 CASAVA_Build 1 147122562 2I AGCCAAAGAC --/AA AAAAAGATGT 3070 het 3070 ref 91 59 25 7 A 5 7 51754 CASAVA_Build 1 147122827 1D ACTGATTGGC T/- GGGGGATGAG 1260 het 1260 ref 28 23 3 2 T 1 0 51755 CASAVA_Build 1 147124251 3D ATTCCGCAGA GTT/--- GTTGTGTTTT 2893 het 2893 ref 96 80 7 11 GTT 2 1 51756 CASAVA_Build 1 147124591 1D GCTTTAAAAA G/- AAATAGCGTT 1383 het 1383 ref 18 15 3 3 G 1 0 51757 CASAVA_Build 1 147127796 4D TACAAAAACA AAAC/---- AAACAACTAT 3070 het 3070 ref 96 67 15 18 AAAC 2 1 51758 CASAVA_Build 1 147128718 1I ATAGGCCTTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 7 8 51759 CASAVA_Build 1 147130579 4I AGTGTGGCCT ----/CAAG CAAACCATTT 2195 het 2195 ref 93 74 5 14 CAAG 0 1 51760 CASAVA_Build 1 147132047 1D GTAAACAACA T/- AAGGTGGGGT 3070 het 3070 ref 67 33 28 6 T 1 0 51761 CASAVA_Build 1 147132650 1D AGTGATATGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 98 58 29 11 T 9 8 51762 CASAVA_Build 1 147133113 2D GCGGCAAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 24 8 T 13 11 51763 CASAVA_Build 1 147134267 2I ATATGCTCTC --/TT ATATAATATA 932 het 932 ref 94 78 3 13 T 0 2 51764 CASAVA_Build 1 147135836 9D CTATGCTATT AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3056 het 3056 ref 79 47 10 29 A 20 11 51765 CASAVA_Build 1 147135955 1D TGGAATGATG A/- AAAAAAGATA 3070 hom 214 het 77 0 72 6 A 7 6 51766 CASAVA_Build 1 147140313 1I TAAAAATCAA -/G TATACATTTT 3070 het 3070 ref 84 56 23 5 G 0 1 51767 CASAVA_Build 1 147144536 1D TCTCAGCTCA T/- GCAACCACTG 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 T 1 0 51768 CASAVA_Build 1 147145049 1D ACAAATTTTA T/- TTCTTTAATA 3070 het 3070 ref 66 50 12 4 T 3 2 51769 CASAVA_Build 1 147146210 1D51M1D TTTCTCTATT AAAAAAATTAAAGCGTTATAGGTAGATCAGAATTTACCATTACTAACTCCTCA/-AAAAAATTAAAGCGTTATAGGTATATCAGAATTTACCATTACTAACTCCTC- AGTCCTCCTT 1895 het 1895 ref 70 96 5 18 N/A 0 0 51770 CASAVA_Build 1 147148254 1I TAGATTTGTG -/T GTGTACATAC 3070 het 3070 ref 98 59 31 8 T 0 1 51771 CASAVA_Build 1 147149593 2D TTTCTTTTTA AG/-- AACTCAGTCT 1133 het 1133 ref 49 42 3 4 AG 1 0 51772 CASAVA_Build 1 147164372 1D ACAAAACTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 76 47 16 15 T 10 9 51773 CASAVA_Build 1 147164724 2I GGTAGTTGTA --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 88 64 10 14 T 8 10 51774 CASAVA_Build 1 147166560 2I TCTTTCCCTG --/TT TTGTAGGTTT 2745 het 2745 ref 67 59 6 2 T 2 4 51775 CASAVA_Build 1 147167717 1D TTTTCCATCA T/- TTTTTTTTTT 2524 het 2524 ref 68 33 11 27 T 11 10 51776 CASAVA_Build 1 147174505 2D TCCTAAAAAC AG/-- GGAATTCTCT 3070 het 3070 ref 66 49 7 15 AG 1 0 51777 CASAVA_Build 1 147188185 1D GATTCCTGAC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 90 29 50 13 T 9 8 51778 CASAVA_Build 1 147188689 1D ATACTGGGGT G/- GGGGTGTTCC 3070 het 3070 ref 98 53 32 13 G 5 4 51779 CASAVA_Build 1 147191250 3D TAATGGACTT AAC/--- AGATATATAC 3070 het 3070 ref 69 36 28 11 AAC 1 0 51780 CASAVA_Build 1 147194040 4D TAGAGTAAAT AGAC/---- AGCCAACAGA 2541 het 2541 ref 72 57 6 14 AGAC 1 0 51781 CASAVA_Build 1 147198077 3I GCTCTGCATG ---/GAT GATGTTCCCA 3070 het 771 hom 66 3 48 15 GAT 1 2 51782 CASAVA_Build 1 147200937 1D TCTTAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 63 22 22 19 T 15 14 51783 CASAVA_Build 1 147207370 2I ATTAAATAAC --/AT TATTTATAAA 2609 het 2609 ref 15 7 7 1 AT 0 1 51784 CASAVA_Build 1 147214800 6D AGAGGAAGAG GAGAGA/------ GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 94 55 24 23 GA 10 7 51785 CASAVA_Build 1 147215505 1I AAGACTATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 70 38 11 21 A 13 14 51786 CASAVA_Build 1 147272512 1D TGGCTTTTAC G/- TAAAAAATAC 53 het 53 ref 18 9 1 8 G 1 0 51787 CASAVA_Build 1 147278008 1I GGCTATTTCT -/C CCTATGTTAG 1853 het 1853 ref 14 4 10 0 C 2 3 51788 CASAVA_Build 1 147289657 4D TTGTGAAAAT ACTC/---- AGCGCTAAAA 3070 het 3070 ref 39 28 10 1 ACTC 1 0 51789 CASAVA_Build 1 147292787 1D AGTAAGGATG T/- TTTCCCCTCC 3070 het 3070 ref 53 36 13 4 T 4 3 51790 CASAVA_Build 1 147293136 4D CATTAATGAG ACTA/---- ACTAGTCAAT 1065 het 1065 ref 11 8 3 0 ACTA 2 1 51791 CASAVA_Build 1 147294073 1D GATGTGTTTT C/- CCCTGTTTTT 3070 het 3070 ref 73 42 21 13 C 4 3 51792 CASAVA_Build 1 147294255 1I TTTGATCTTG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 63 36 14 13 T 7 8 51793 CASAVA_Build 1 147295676 1D AGAAAGAAAG A/- AAGGAAGGGA 1008 het 1008 ref 31 12 5 15 A 3 2 51794 CASAVA_Build 1 147295826 4D CAAGAACGTG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 72 39 18 17 AGAA 4 3 51795 CASAVA_Build 1 147295944 1D AAGGAAGGAG A/- AAAAAAGAAG 3070 het 3070 ref 84 40 23 22 A 7 6 51796 CASAVA_Build 1 147296737 1D TCCCTCTTTT C/- TTTTTGGGAT 2838 het 2838 ref 50 40 7 3 C 1 0 51797 CASAVA_Build 1 147297055 1I AAGCAACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 97 36 39 22 T 9 10 51798 CASAVA_Build 1 147298029 3I AGTTCACACA ---/TGT TGTCTCACAC 3070 het 3070 ref 92 71 13 8 TGT 1 2 51799 CASAVA_Build 1 147298186 2I AAACTATAAC --/CG CACAAAAAAA 3070 het 3070 ref 80 46 19 15 CG 0 1 51800 CASAVA_Build 1 147380582 1D TATATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 10 22 8 T 13 12 51801 CASAVA_Build 1 147422217 18I AGTCATTAAA ------------------/AGCTTGTCGTTTCGTGTG TAACAGCCCC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 AGCTTGTCGTTTCGTGTG 0 1 51802 CASAVA_Build 1 147430536 1D AAGAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 1553 het 1553 ref 32 13 10 9 A 17 16 51803 CASAVA_Build 1 147448716 1I TCAATCGCAG -/T TCTGTCATTA 3070 het 3070 ref 36 26 7 3 T 1 2 51804 CASAVA_Build 1 147461471 1I CCGCTTGACA -/T GTGGAAGTCG 1877 het 1877 ref 39 29 7 3 T 0 1 51805 CASAVA_Build 1 147470395 3I TTCCTGTGGA ---/AGC TTTTACCTTG 3070 het 3070 ref 48 27 13 8 AGC 0 1 51806 CASAVA_Build 1 147471326 4I TCCAGTTAAG ----/AACT AACAGGAACT 3070 het 3070 ref 66 45 17 10 AACT 0 1 51807 CASAVA_Build 1 147471940 1I CTTAACAATA -/G GAACTAGCAA 3070 het 3070 ref 50 36 10 10 G 1 2 51808 CASAVA_Build 1 147472894 3D5M7D7M2D TGGCCAGTGG CACTGGCCCATGCCTATAATTCCA/---TGGTC-------ATAATTC-- ACACTTTGGG 1926 het 1926 ref 22 16 5 3 N/A 0 0 51809 CASAVA_Build 1 147475467 7I AGTTAGATGG -------/CGGGAGT GAGGGGGGCA 3070 het 3070 ref 58 31 24 3 CGGGAGT 0 1 51810 CASAVA_Build 1 147477136 5I AAAAAGTAAA -----/ATAAC ATGTCTTAGA 2459 het 2459 ref 49 38 6 5 ATAAC 0 1 51811 CASAVA_Build 1 147479880 1I14M4I TCCTTTTGGC -AAAGGACTTGCTTC----/GAAAGGACTTGCTTCCCTT GTTTGTACAA 3070 het 3070 ref 62 43 14 9 N/A 0 0 51812 CASAVA_Build 1 147480104 3I TATCATTCCA ---/TGT TTTTCTTTCC 2125 het 2125 ref 63 39 10 14 TGT 0 1 51813 CASAVA_Build 1 147480771 1I5M1D GCACTTTGGG -AGGCGA/AAGGCG- ACACAGGAAG 1613 het 1613 ref 42 35 5 4 N/A 0 0 51814 CASAVA_Build 1 147482401 1D CAGCTGGAAG C/- CTGTGCACCC 1968 het 1968 ref 34 22 6 6 C 2 1 51815 CASAVA_Build 1 147483819 4D TGTGGGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2873 het 2873 ref 49 33 10 6 TTTG 3 2 51816 CASAVA_Build 1 147485026 2I ATTCAGAAAA --/CG TGTCAGTTTA 3070 het 3070 ref 72 33 34 5 CG 0 1 51817 CASAVA_Build 1 147487517 1D AGCCAACTTT A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 44 24 17 5 A 7 6 51818 CASAVA_Build 1 147487995 1D TTCATTGCTG A/- AAAATCTGAG 3070 het 3070 ref 57 33 18 7 A 5 4 51819 CASAVA_Build 1 147488625 9I GATTAGCTGT ---------/CATGTATTA CCAAACAGGG 3070 het 3070 ref 49 34 12 4 CATGTATTA 0 1 51820 CASAVA_Build 1 147489144 1D CGTCTGGCTA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 T 8 7 51821 CASAVA_Build 1 147490675 1D TTTAAACTAC A/- AAAAATCAGG 3070 het 3070 ref 70 45 13 13 A 6 5 51822 CASAVA_Build 1 147491033 15D CCTTCGTGGC GCAGCAGCAGGTGGG/--------------- GAAGCAGCAG 1981 het 1981 ref 46 22 7 21 GCAGCAGCAGGTGGG 1 0 51823 CASAVA_Build 1 147491203 1D TGTCTCTCCC T/- TTTTTCCCTC 3070 het 3070 ref 85 45 18 22 T 6 5 51824 CASAVA_Build 1 147491888 2D AAGTTGGAAT TC/-- CCAAGTCAAA 3070 het 3070 ref 91 66 19 7 TC 1 0 51825 CASAVA_Build 1 147492529 1I GAGTTCTCCT -/C TGGAGACCAT 3070 het 3070 ref 55 33 15 7 C 0 1 51826 CASAVA_Build 1 147493018 1D TGTGGAAAAT G/- GCCCTCCTGC 3070 het 3070 ref 82 56 16 14 G 2 1 51827 CASAVA_Build 1 147493302 1I ATTAGTTTTA -/C TGGGGTAATT 3070 het 3070 ref 71 46 22 3 C 0 1 51828 CASAVA_Build 1 147493415 10D CATGGAAGGG GGTGGTGGAT/---------- GGTTTCTGGA 3070 het 3070 ref 55 32 17 8 GGTGGTGGAT 1 0 51829 CASAVA_Build 1 147494138 1I AGAGGAAACT -/G ACTAAGGTTT 3070 het 3070 ref 49 33 14 2 G 0 1 51830 CASAVA_Build 1 147494393 1D GATAGATGAA G/- AAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 61 29 26 6 G 1 0 51831 CASAVA_Build 1 147494600 1I TGAACAGACT -/C CCCTCTTGGC 3070 het 3070 ref 68 51 12 5 C 3 4 51832 CASAVA_Build 1 147498841 2D AGTATTCGTT TC/-- TTTGTATAGG 3070 het 3070 ref 37 25 10 2 TC 1 0 51833 CASAVA_Build 1 147501225 5D AGAAAAGGAT TTGTG/----- TGACTAGTCT 3070 het 3070 ref 75 47 22 7 TTGTG 1 0 51834 CASAVA_Build 1 147503633 1I TCCTTTAGTT -/C TTTGGGTACC 3070 het 3070 hom 59 25 26 8 C 0 1 51835 CASAVA_Build 1 147505219 1I TTATTTTCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 50 12 31 7 T 8 9 51836 CASAVA_Build 1 147515419 1I AGTAGATTGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 T 6 7 51837 CASAVA_Build 1 147518275 2I TAAAATTTAA --/AC ACAGCATTTT 3070 het 3070 ref 41 24 8 9 AC 1 2 51838 CASAVA_Build 1 147522437 2D CAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 AG 1 0 51839 CASAVA_Build 1 147527171 1I ACACACACAC -/A ACACAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 12 7 A 1 2 51840 CASAVA_Build 1 147537880 1I CTTGGGCAGT -/G GGGGATACAG 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 G 4 5 51841 CASAVA_Build 1 147539293 22D CCAAAATTGG GGCTTAGCCAAGGAGAGTTCTT/---------------------- GGCTTTGCCC 3070 het 3070 ref 65 61 10 15 GGCTTAGCCAAGGAGAGTTCTT 1 0 51842 CASAVA_Build 1 147539597 1D ATGGCACTGG A/- AAGGAGTGTC 3070 het 3070 ref 71 44 17 11 A 3 2 51843 CASAVA_Build 1 147540207 1D GAGATCCGTC A/- CCCCCTCCTG 3070 het 3070 ref 52 30 14 10 A 1 0 51844 CASAVA_Build 1 147540345 1I AGAAAAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 9 10 51845 CASAVA_Build 1 147541046 3D CATCCATAAA TCT/--- TCTTCTACCA 3070 het 3070 ref 101 81 17 8 TCT 3 2 51846 CASAVA_Build 1 147542620 1I TCCAGGCAAT -/C CCCACCCTTC 3070 het 3070 ref 46 26 12 8 C 3 4 51847 CASAVA_Build 1 147542721 1I TTGTGTTAGC -/G TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 54 17 30 7 G 0 1 51848 CASAVA_Build 1 147546926 1I CAATTTAGTG -/A AAAAAAAACT 2953 het 2953 ref 84 63 8 13 A 8 9 51849 CASAVA_Build 1 147548558 3I AGATCTGTTG ---/AGT AGTAGGAACA 3070 het 3070 ref 84 60 15 9 AGT 1 2 51850 CASAVA_Build 1 147551868 1D TTTTTACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 16 10 A 10 9 51851 CASAVA_Build 1 147552171 1I TCTGTCTCTC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 62 30 14 18 A 8 9 51852 CASAVA_Build 1 147553673 1I AGTTATTCAC -/A AGCTCAGCCC 3070 het 3070 ref 75 53 11 11 A 1 2 51853 CASAVA_Build 1 147553752 2D GGGGACTGGC CT/-- CTCTGCACGG 1248 het 1248 ref 69 48 4 18 CT 3 2 51854 CASAVA_Build 1 147561447 5I AGTGTCGACT -----/CAAAA CAAAGCTAAC 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 CAAAA 0 1 51855 CASAVA_Build 1 147565143 1D AAGGGCTAAC A/- AAAAAAAAAA 2838 het 386 hom 57 6 8 43 A 13 12 51856 CASAVA_Build 1 147565878 1D CCCCACATAC T/- TGCGCCCTGC 3070 het 3070 ref 83 53 21 9 T 2 1 51857 CASAVA_Build 1 147568599 1I GCAAATTGGG -/A AAAAAAAAAA 2295 het 2295 ref 42 17 8 17 A 11 12 51858 CASAVA_Build 1 147569313 1D AGGCAGAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 78 53 14 13 A 9 8 51859 CASAVA_Build 1 147569555 1D AAACAGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 98 61 15 22 A 11 10 51860 CASAVA_Build 1 147571840 6D GACAAATGGG ACTTAA/------ ACTTAAAAAG 3070 het 3070 ref 72 53 11 14 ACTTAA 2 1 51861 CASAVA_Build 1 147572827 1I CAAAAACTTA -/C ATTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 99 56 27 16 C 0 1 51862 CASAVA_Build 1 147573172 1I TCAGCTTTGA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 92 72 9 11 T 6 7 51863 CASAVA_Build 1 147574189 1I CTACTGCAAA -/C CACCAAGACA 3070 het 3070 ref 95 55 28 12 C 1 2 51864 CASAVA_Build 1 147578926 3I AAAACTTAAT ---/CTC CTCTTCCCGT 3070 het 3070 hom 59 18 31 10 CTC 1 2 51865 CASAVA_Build 1 147583968 2D ATAAAATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 71 23 24 25 A 13 11 51866 CASAVA_Build 1 147586061 4D TATTTTAGCC CTAA/---- CTAACATTAT 3070 het 3070 ref 68 46 18 7 CTAA 2 1 51867 CASAVA_Build 1 147588571 2I TTCTTTCTCT --/CC CTCTCTCTCT 2449 het 2449 ref 54 39 6 9 C 1 3 51868 CASAVA_Build 1 147588778 1D26M1D TGAAGAAAAC AAAAAAAAAGAGAAGAGGCCATTGGTAG/-AAAAAAAAGAGAAGAGGCCATTGGTA- GTATATACTT 3070 het 3070 ref 69 49 26 20 N/A 0 0 51869 CASAVA_Build 1 147590983 4D ATGTACAAAT GAGA/---- GAGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 92 72 9 18 GA 5 3 51870 CASAVA_Build 1 147599636 2I GGACTGAAAC --/AG GGCGCAAGAG 3070 het 3070 ref 53 30 14 9 AG 0 1 51871 CASAVA_Build 1 147608040 1I14M4D TCCTTTAGAG -AAAAAAATGCTAAAAAAC/AAAAAAAATGCTAAA---- AAAACAAAAC 75 het 75 ref 37 33 1 11 N/A 0 0 51872 CASAVA_Build 1 147610556 1I TCAAATAGAG -/A GATTTCTTTC 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 A 0 1 51873 CASAVA_Build 1 147613087 1I TGATTGTTTC -/T TTTCAGAAGG 3070 het 3070 ref 50 37 9 4 T 3 4 51874 CASAVA_Build 1 147613176 1D TATTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2126 het 1838 hom 32 11 8 13 T 13 12 51875 CASAVA_Build 1 147614202 1D TTCTTCCAAA T/- TTTTGTTTCA 3070 het 3070 ref 58 29 26 3 T 5 4 51876 CASAVA_Build 1 147618142 4I ACAATCCCGG ----/AGCC AGCCTCATGG 3070 het 3070 hom 55 21 27 7 AGCC 1 2 51877 CASAVA_Build 1 147619119 1I GGGGAAACCA -/C CCCCCACAAT 2866 het 2866 ref 28 11 8 9 C 5 6 51878 CASAVA_Build 1 147619167 3I TTATGTGGGG ---/ATT ATTATGGGAA 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 ATT 1 2 51879 CASAVA_Build 1 147619284 1I ATCATACCTT -/C CCAAAAGTCC 1399 het 1399 ref 35 29 4 2 C 2 3 51880 CASAVA_Build 1 147625019 2D AATTTTCCCC AA/-- AGAGGACCTG 3070 het 3070 hom 50 24 23 6 A 3 1 51881 CASAVA_Build 1 147628714 2I AATCCAGACT --/CC GCGAGAGGGT 2846 het 2846 ref 41 30 7 4 C 0 2 51882 CASAVA_Build 1 147628922 2D TTCCAGGAAA GG/-- GGGGGGGCAA 3070 het 3070 hom 63 30 24 11 G 9 7 51883 CASAVA_Build 1 147630108 2D GCTCTTTTCA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 10 8 51884 CASAVA_Build 1 147637709 1I ATGTCTAGAG -/T TAAGACTTCG 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 T 1 2 51885 CASAVA_Build 1 147654642 1D GTTTATTAGT A/- GGAAACATTA 1922 hom 15 het 14 0 6 9 A 1 0 51886 CASAVA_Build 1 147655361 1I ATCAGAGGTC -/A AACACTTAAA 1866 het 1866 ref 32 24 4 4 A 2 3 51887 CASAVA_Build 1 147657792 3I CAATAATAAG ---/AAC AACACTGATC 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 AAC 1 2 51888 CASAVA_Build 1 147660508 1I TCTACAAAAA -/G AAAAAACTCT 1776 het 1776 ref 13 6 4 3 G 0 1 51889 CASAVA_Build 1 147667944 1D TCAAAGCAAA T/- TATTCATCAA 3070 het 1343 hom 14 3 11 0 T 2 1 51890 CASAVA_Build 1 147668189 2D TACTAAAAAA AT/-- CATTACAAAC 1320 het 1320 ref 21 15 3 3 AT 1 0 51891 CASAVA_Build 1 147673923 1D CTGTTCAGAG T/- TTTTATTTAT 3070 het 3070 hom 28 12 15 3 T 5 4 51892 CASAVA_Build 1 147692681 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2131 het 1419 hom 8 3 5 0 A 9 8 51893 CASAVA_Build 1 147697340 1I TTTTAAGATT -/A AAAAAAAAAG 1581 het 1581 ref 33 24 5 4 A 9 10 51894 CASAVA_Build 1 147706584 1D GTAAAGATCT G/- GCTCTGGTTG 2860 het 2860 ref 40 31 8 3 G 2 1 51895 CASAVA_Build 1 147785319 2I GTGCAATGAG --/AC AGAGAAGATA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 AC 0 1 51896 CASAVA_Build 1 147838294 1I TTTTATTAGG -/T TTTTGGTTAC 2415 hom 12 het 5 0 5 0 T 4 5 51897 CASAVA_Build 1 147841434 10I AGCAGCATGA ----------/TTTATAGTCC TTTGGGTACC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TTTATAGTCC 0 1 51898 CASAVA_Build 1 147849375 4I GAGCTGAATG ----/AGTT AGTGAGAATC 2085 het 2085 ref 13 7 5 1 AGTT 0 1 51899 CASAVA_Build 1 147849464 1I CAGTTTCATT -/G TTGAGTTTTA 3070 het 28 hom 11 1 8 2 G 0 1 51900 CASAVA_Build 1 147851517 1D TGGAGTGCAG T/- TGGTGCGATC 2809 het 2809 ref 34 24 7 3 T 2 1 51901 CASAVA_Build 1 147868983 1I TTACACTTAC -/T TTTTTTTTGT 2760 het 629 hom 12 2 9 1 T 8 9 51902 CASAVA_Build 1 147869433 5I TCCTTTGGCA -----/AGGAG ACACCCTCAC 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 AGGAG 0 1 51903 CASAVA_Build 1 147875673 1D CATGACGTGA C/- TTTTAAAACG 2303 het 2303 ref 12 6 5 1 C 1 0 51904 CASAVA_Build 1 147914910 11D CTGGCAGCAG AGTTCTAAACA/----------- AAAATTACAC 3070 het 3070 ref 45 27 15 7 AGTTCTAAACA 1 0 51905 CASAVA_Build 1 147916165 1I CAGCACTGTA -/T TTTTTTACCT 2950 het 2950 ref 18 10 7 1 T 6 7 51906 CASAVA_Build 1 147917070 1I GTGTAGTGTT -/A ACAGTTTAGT 3070 het 3070 ref 66 30 29 7 A 1 2 51907 CASAVA_Build 1 147918437 1I TATATTTTTT -/G GGGGGGGGCA 1654 het 1654 ref 21 16 4 1 G 8 9 51908 CASAVA_Build 1 147919752 1I CTCTTGAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 27 hom 19 1 11 7 T 9 10 51909 CASAVA_Build 1 147921599 3D TGGATTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1852 hom 46 16 14 19 T 17 14 51910 CASAVA_Build 1 147921899 1I TAAAAGGATA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 84 63 12 9 T 8 9 51911 CASAVA_Build 1 147923194 3D CTCTTCTCCT CTA/--- TAATACAGGA 3070 het 1841 hom 22 5 14 4 CTA 1 0 51912 CASAVA_Build 1 147924895 22D CCAAAATTGG GGCTTAGCCCAGGAGAGTTCTT/---------------------- GGCTTTGCCC 3070 het 3070 ref 92 85 12 11 GGCTTAGCCCAGGAGAGTTCTT 1 0 51913 CASAVA_Build 1 147925947 1I AGAAAAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 57 24 23 10 A 9 10 51914 CASAVA_Build 1 147926648 3D CATCCATAAA TCT/--- TCTTCTACCA 2178 het 2178 ref 24 11 6 7 TCT 3 2 51915 CASAVA_Build 1 147928131 1D CCTATAAAAA T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 7 6 51916 CASAVA_Build 1 147930664 1I CCACCCAGGT -/G TGGATCAATG 2728 het 2728 ref 43 33 6 4 G 0 1 51917 CASAVA_Build 1 147931177 1D TTCTGAAGTA C/- GCTGTGCTCC 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 C 1 0 51918 CASAVA_Build 1 147935326 2D ACTACGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 28 1 22 5 A 12 10 51919 CASAVA_Build 1 147936533 1D AAACAACTGC A/- AATTTTTTTT 2003 het 68 hom 18 2 10 8 A 3 2 51920 CASAVA_Build 1 147937415 1D TTTTTACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1103 hom 22 5 13 4 A 10 9 51921 CASAVA_Build 1 147937718 1I TCTGTCTCTC -/A AAAAAAATGC 2986 hom 15 het 10 0 6 4 A 7 8 51922 CASAVA_Build 1 147943339 1D TAATTGCCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 10 9 51923 CASAVA_Build 1 147946991 5I AGTGTCGACT -----/CAAAA CAAAGCTAAC 3070 het 3070 hom 23 9 11 6 CAAAA 0 1 51924 CASAVA_Build 1 147947646 3D GAAGTTCAAA TAG/--- TAGAGAGATT 3070 het 3070 ref 31 16 10 7 TAG 2 1 51925 CASAVA_Build 1 147950744 1D GGGGACCTTT A/- CGCGTGTGAG 2609 hom 21 het 15 0 7 8 A 1 0 51926 CASAVA_Build 1 147951412 1D CCTCACATAC T/- TGCGCCCTGC 748 het 748 ref 44 34 2 8 T 2 1 51927 CASAVA_Build 1 147954132 1D GCAAATTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2756 hom 37 9 17 13 A 13 12 51928 CASAVA_Build 1 147955748 1I CAGACGCAAA -/G AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 73 34 33 6 G 0 1 51929 CASAVA_Build 1 147956558 1D TACAGAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 10 9 51930 CASAVA_Build 1 147957368 6I GACAAATGGG ------/ACTTAA ACTTAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 ACTTAA 1 2 51931 CASAVA_Build 1 147958699 1D CTTTGATTTT C/- TTCCTTCTGG 3070 het 3070 hom 42 12 28 2 C 1 0 51932 CASAVA_Build 1 147965011 1D AATGCATGAG C/- CCCCAAAAAC 3070 het 3070 ref 68 27 23 18 C 5 4 51933 CASAVA_Build 1 147965837 1I TTAAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 1834 het 1834 ref 20 10 5 5 A 13 14 51934 CASAVA_Build 1 147969496 2I ATAAAATGAT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 TA 0 1 51935 CASAVA_Build 1 147973163 2I TGGAGGTCTC --/TA TAACAGGGGA 3070 het 3070 ref 66 35 21 10 TA 1 2 51936 CASAVA_Build 1 147975918 1I TCACAAAAGG -/A AAAAATACTA 3070 het 3070 ref 58 34 19 5 A 5 6 51937 CASAVA_Build 1 147976511 4D ATGTACAAAT GAGA/---- GAGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 GA 5 3 51938 CASAVA_Build 1 147976683 2I TAGCTAAGAT --/TA TATGTCTCAG 3070 het 3070 ref 59 29 19 11 TA 1 2 51939 CASAVA_Build 1 147977223 1D CTTCTCCAGA C/- CTGGTCACCA 3070 het 3070 ref 92 54 31 8 C 2 1 51940 CASAVA_Build 1 147987945 5D GAAGTAATTG TGTAA/----- TGTAAAAAAG 2571 het 2571 ref 52 43 6 9 TGTAA 2 1 51941 CASAVA_Build 1 147989616 1I GTTTTTTTGG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 28 17 9 T 0 1 51942 CASAVA_Build 1 147992072 6I TACTTTACTC ------/GCACCA GCACCATGTT 3070 het 3070 ref 75 46 12 17 GCACCA 1 2 51943 CASAVA_Build 1 147993232 1I14M4D TCCTTTAGAG -AAAAAAATGCTAAAAAAC/AAAAAAAATGCTAAA---- AAAACAAAAC 2330 het 2330 ref 53 42 10 10 N/A 0 0 51944 CASAVA_Build 1 147998186 1I AGTGTCTTTA -/T TTTGCTTTAA 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 T 3 4 51945 CASAVA_Build 1 147999404 1D TTCTTCCAAA T/- TTTTGTTTCA 3070 het 3070 ref 47 28 15 4 T 5 4 51946 CASAVA_Build 1 148000088 1D CTTAAAAAAA T/- AAAGTCATAT 1848 het 1848 ref 30 22 4 4 T 1 0 51947 CASAVA_Build 1 148004020 1I GGGGAAACCA -/C CCCCCACAAT 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 C 5 6 51948 CASAVA_Build 1 148008659 4I AATTCTTTTG ----/GAAA GAATCTTTCT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 GAAA 0 1 51949 CASAVA_Build 1 148012244 8I GATAAAAAAA --------/AATAAAAT AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 32 17 8 7 AATAAAAT 0 1 51950 CASAVA_Build 1 148013647 2I TCCAGACTCC --/GA GAGAGGGTTC 3070 het 3070 ref 37 22 9 6 GA 2 3 51951 CASAVA_Build 1 148014940 2D TTCTGAGCCC CT/-- GTTTGACTCA 896 het 498 hom 4 1 2 1 CT 1 0 51952 CASAVA_Build 1 148015378 1I TGAAATTAAA -/G AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 74 37 28 9 G 0 1 51953 CASAVA_Build 1 148016130 1I CCACAGTTTC -/A AAAAAACATT 2117 het 2117 ref 35 20 5 10 A 6 7 51954 CASAVA_Build 1 148043563 2I AATCCCTTGA --/CT CTTTTAGGAG 1333 het 1333 ref 33 28 3 2 CT 1 2 51955 CASAVA_Build 1 148052155 1I TTAACAGAGA -/T TTTTTTTTTT 1736 het 1736 ref 49 35 4 10 T 10 11 51956 CASAVA_Build 1 148052318 1I GAAGCTTAGC -/A AAAAAAATAT 1750 het 1750 ref 45 33 5 7 A 7 8 51957 CASAVA_Build 1 148052795 3D AACAGTAAAT ATC/--- ATAGTGGTTA 2188 het 2188 ref 33 28 5 0 ATC 1 0 51958 CASAVA_Build 1 148134318 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 14 15 51959 CASAVA_Build 1 148157753 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1259 het 1259 ref 24 9 3 12 T 17 16 51960 CASAVA_Build 1 148178561 1I CTTTATTGAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 38 0 30 8 A 8 9 51961 CASAVA_Build 1 148217573 1D TAACACTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 943 hom 36 3 25 9 T 16 15 51962 CASAVA_Build 1 148252975 1D AAAGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 951 het 951 ref 24 9 4 12 A 17 16 51963 CASAVA_Build 1 148254325 1D AAGTAACCAG C/- CTGCTGTACA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 C 2 1 51964 CASAVA_Build 1 148270908 1D AAAATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 11 10 51965 CASAVA_Build 1 148279313 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1333 het 1286 hom 27 7 4 16 T 15 16 51966 CASAVA_Build 1 148293652 1I CTAAATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 25 2 14 9 T 16 17 51967 CASAVA_Build 1 148304467 56D TTATTTTGTT CAAAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCG/-------------------------------------------------------- CAAAATGTTT 3070 hom 51 het 30 1 29 1 CAAAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCG 1 0 51968 CASAVA_Build 1 148311348 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 611 hom 23 2 11 10 A 19 18 51969 CASAVA_Build 1 148340466 1D CTCCACCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 A 13 12 51970 CASAVA_Build 1 148340813 1D ACTAAAAAAT A/- AAAAAAAATT 2960 hom 21 het 8 0 8 0 A 9 8 51971 CASAVA_Build 1 148358864 1D AAAAAATAAT A/- AAATCTGAGA 3070 hom 11 het 30 1 27 2 A 4 3 51972 CASAVA_Build 1 148363463 2D ACCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2684 hom 18 het 17 0 9 8 T 18 16 51973 CASAVA_Build 1 148367052 6D CCCTTGTCTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 18 12 51974 CASAVA_Build 1 148367742 18D TCGTGATCTG CCCACCTCAGACTCCCAA/------------------ AGTGCTGGGA 3070 hom 72 het 21 0 21 6 CCCACCTCAGACTCCCAA 1 0 51975 CASAVA_Build 1 148370457 1D TTTTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 980 het 40 hom 18 1 4 13 A 19 18 51976 CASAVA_Build 1 148378345 1D ATGAACTCTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 135 het 49 0 44 5 T 9 8 51977 CASAVA_Build 1 148384802 4I AGCTGAAAGG ----/TCAT TCTGTCCCTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TCAT 0 1 51978 CASAVA_Build 1 148391404 1I GGTGTGAGCC -/A ACCGTGCCTG 3070 hom 63 het 26 0 20 6 A 1 2 51979 CASAVA_Build 1 148392735 1D ATATGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 48 1 42 5 A 11 10 51980 CASAVA_Build 1 148402219 2I GCAGGAGCGA --/AC ACACACACAC 3070 het 572 hom 44 2 28 14 AC 6 7 51981 CASAVA_Build 1 148421625 1I CCTCAACCCT -/G GGAATCAACA 3070 hom 90 het 31 0 28 3 G 2 3 51982 CASAVA_Build 1 148424626 1D TTTTTGTTTT G/- TTTTTTGTTT 3070 het 61 hom 23 1 16 6 G 1 0 51983 CASAVA_Build 1 148426004 2D GAATTTTCCC CT/-- TTCTCTGGCA 3070 hom 120 het 43 0 39 5 CT 1 0 51984 CASAVA_Build 1 148426109 2I AAAACTCTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 38 0 26 12 A 12 14 51985 CASAVA_Build 1 148426296 1D21M2D CACTAGCTTC TTTTTTTTTTTTCCTTCAGAGACC/-TTTTTTTTTTTCCTTCAGAGA-- CCCCCCCCAA 3070 hom 33 het 23 0 16 10 N/A 0 0 51986 CASAVA_Build 1 148426675 1D CTGCTTGAGA T/- TCCACTGTAT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 2 1 51987 CASAVA_Build 1 148532982 1I GAAGGCTGGC -/T TTGGCGAGAG 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 T 2 3 51988 CASAVA_Build 1 148550270 1D CGTCACTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 22 0 14 8 T 12 11 51989 CASAVA_Build 1 148558050 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 12 0 11 2 A 10 9 51990 CASAVA_Build 1 148560377 1D AAAAAAAGCT A/- AAAAAAAAAA 2599 hom 22 het 12 0 7 6 A 11 10 51991 CASAVA_Build 1 148562703 2I CGGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 53 het 20 0 18 2 CT 1 2 51992 CASAVA_Build 1 148566156 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1715 het 1715 ref 41 31 4 6 T 12 11 51993 CASAVA_Build 1 148582338 5D TGAGAGAGAG AAAAA/----- AAAAAAATAT 740 hom 10 het 14 0 4 11 A 12 7 51994 CASAVA_Build 1 148583864 1D TCAAGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 11 10 51995 CASAVA_Build 1 148584183 2D TGTTGAGTAC AT/-- GTGTATCTTC 3070 hom 98 het 40 0 32 9 AT 1 0 51996 CASAVA_Build 1 148591628 1D AGCTGGGCGT G/- GTAGCGGGCG 3047 hom 21 het 10 0 8 2 G 2 1 51997 CASAVA_Build 1 148594521 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 A 9 10 51998 CASAVA_Build 1 148595545 2I CAAAAAAAAA --/AC AAAAACAAAA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 AC 0 1 51999 CASAVA_Build 1 148596530 1I TGTCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 28 1 14 13 A 12 13 52000 CASAVA_Build 1 148606684 4I TAAATTTAAG ----/TAAC TAACTATTAG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TAAC 1 2 52001 CASAVA_Build 1 148612789 1D TTAAGAAATC T/- TTTTTAAAGA 3070 hom 70 het 31 0 23 8 T 6 5 52002 CASAVA_Build 1 148618219 1I TGTGTCTACT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 42 het 20 0 14 6 A 9 10 52003 CASAVA_Build 1 148621322 4D TTTTTGAGCC CTTT/---- CTTATTAATA 3070 hom 84 het 29 0 29 2 CTTT 1 0 52004 CASAVA_Build 1 148638857 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 791 hom 20 2 10 8 A 15 16 52005 CASAVA_Build 1 148644508 1I AAATTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 164 hom 51 1 44 6 T 9 10 52006 CASAVA_Build 1 148648101 2I TTGAAAACAC --/TA TGTATCAGCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TA 0 1 52007 CASAVA_Build 1 148653764 1I AAATAACATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 70 het 30 0 24 6 A 9 10 52008 CASAVA_Build 1 148656273 1D GTTCAACTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 786 hom 56 2 51 3 T 10 9 52009 CASAVA_Build 1 148656589 1D TCCATGTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 47 0 37 12 A 10 9 52010 CASAVA_Build 1 148661275 2D AAACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 41 het 18 0 13 6 AC 8 7 52011 CASAVA_Build 1 148662893 1D TGAAAACAAA T/- TTTTTTTTTT 2016 het 789 hom 27 4 6 17 T 17 16 52012 CASAVA_Build 1 148670770 2D TAGTAGAGAC AG/-- GGGTTCACCA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AG 1 0 52013 CASAVA_Build 1 148672980 2I TATATATAGT --/TA TATATTATGT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 2 3 52014 CASAVA_Build 1 148675987 2I CCTGGGCAAC --/AA GAGCAAAACT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 0 2 52015 CASAVA_Build 1 148678509 6D AGGAGGCTGA GGCTGC/------ GGCTGCAGTG 3070 hom 90 het 31 0 30 3 GGCTGC 2 1 52016 CASAVA_Build 1 148681227 1D AGATACTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 36 0 22 14 A 16 15 52017 CASAVA_Build 1 148682949 2D ACTAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2961 hom 24 het 9 0 9 0 A 14 12 52018 CASAVA_Build 1 148694020 1D ATCAACTCTC A/- AAAAAATGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 7 6 52019 CASAVA_Build 1 148694730 1D GACATTAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 30 2 19 9 A 15 14 52020 CASAVA_Build 1 148695728 1D AATTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 19 1 14 4 A 13 12 52021 CASAVA_Build 1 148703463 1D CTTTTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 20 1 11 9 T 17 16 52022 CASAVA_Build 1 148716035 1D CAGACGTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 109 het 41 0 33 8 T 10 9 52023 CASAVA_Build 1 148719676 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 11 10 52024 CASAVA_Build 1 148726317 1D GGTCTGGGGG A/- ATAGCGAGGG 3070 hom 84 het 32 0 26 8 A 2 1 52025 CASAVA_Build 1 148727570 7I ATGAGCAACT -------/TTCTCTC TTCTCCCCAC 3070 hom 126 het 45 0 43 3 TTCTCTC 0 1 52026 CASAVA_Build 1 148730162 4D CTCAAAAAAA AAAC/---- AAAAAGAAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 4 AAAC 1 0 52027 CASAVA_Build 1 148734735 4D ACCTTGTGAT CCAC/---- CCACCTCAGC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 CCAC 2 1 52028 CASAVA_Build 1 148738473 1I ATACAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 11 12 52029 CASAVA_Build 1 148741331 1I TTCGTTTTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 50 het 21 0 17 4 T 7 8 52030 CASAVA_Build 1 148751020 2D CATCCATGTA CC/-- CCCCCTGCTG 3070 hom 116 het 46 0 34 14 C 7 5 52031 CASAVA_Build 1 148755347 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 8 8 A 11 10 52032 CASAVA_Build 1 148761345 4D AGACTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 10 5 A 16 12 52033 CASAVA_Build 1 148765647 17I TTTTGATTCT -----------------/GAGTCTTGCTCTGTTGC CCTGCCTCAG 1499 hom 12 het 6 0 3 3 GAGTCTTGCTCTGTTGC 0 1 52034 CASAVA_Build 1 148774316 3I TGTTGACAAA ---/GGG CAGTATTTTT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 G 0 3 52035 CASAVA_Build 1 148777117 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 17 2 13 2 A 13 12 52036 CASAVA_Build 1 148785236 1D CGAGAAAAAA T/- ATGCATGTTA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 1 0 52037 CASAVA_Build 1 148789096 2I TGGAGGGCTC --/TG TGAGGGCCCG 3070 hom 71 het 26 0 23 3 TG 1 2 52038 CASAVA_Build 1 148794715 4I28M4I ATGCACACAG ----ACACATGCCCCCATATGCATACACATGT----/ACACACACATGCCCCCATATGCATACACATGTACAC ACACACATAT 3070 het 3070 ref 73 40 31 13 N/A 0 0 52039 CASAVA_Build 1 148794800 2D CGCATATGCG CA/-- CAGACACATG 3070 het 3070 ref 68 35 23 13 CA 2 1 52040 CASAVA_Build 1 148795947 2I TGTTCCCTCT --/AA GGGCAGAGCT 3070 hom 80 het 30 0 23 7 A 0 2 52041 CASAVA_Build 1 148802805 3I GGGAAAACTC ---/AAG AAGAGGGTGT 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 AAG 1 2 52042 CASAVA_Build 1 148809095 1D ACCTCGGGTG A/- TCTACCCACC 3070 het 3070 ref 46 24 13 9 A 1 0 52043 CASAVA_Build 1 148812018 1D TTAATTTTGT A/- AAAAAAAAAA 2080 het 2080 ref 29 11 6 12 A 17 16 52044 CASAVA_Build 1 148813415 3I AGGTTTTTGA ---/TTT TTTTACTTGG 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 T 4 7 52045 CASAVA_Build 1 148815512 4I AAAGAAAAAC ----/CTAT CTAAGGAATA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 CTAT 0 1 52046 CASAVA_Build 1 148816644 1I CTGCTCTCTT -/A ACAACACTAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 2 52047 CASAVA_Build 1 148830065 1D TTTAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 27 1 19 7 T 13 12 52048 CASAVA_Build 1 148845065 1I AAATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 1950 het 1436 hom 13 4 5 4 T 10 11 52049 CASAVA_Build 1 148850599 1D TAAGAGGAAG A/- AAAATGCAGG 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 A 5 4 52050 CASAVA_Build 1 148852938 1D TGCCTCTGCC A/- AAAAACGCCC 3070 het 3070 ref 51 26 19 7 A 6 5 52051 CASAVA_Build 1 148855999 1I CGGATTCAAG -/C GATTCTCCTG 3070 hom 82 het 32 0 25 7 C 0 1 52052 CASAVA_Build 1 148856879 2I TCAGAGTTAT --/TA AAAAAAAAAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TA 0 1 52053 CASAVA_Build 1 148863344 2D CTGGGGATGC AG/-- AGATTTCTCA 3070 het 3070 hom 37 12 17 10 AG 2 1 52054 CASAVA_Build 1 148879965 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1633 hom 11 het 19 0 8 11 A 19 18 52055 CASAVA_Build 1 148899632 1D GAAACAAGGC A/- AGTGTCCATC 3070 het 3070 ref 42 21 19 3 A 2 1 52056 CASAVA_Build 1 148927502 1D GTTGATGTTC T/- TTTTTCCTAG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 6 5 52057 CASAVA_Build 1 148963417 9D TCAGACTTTT CTTCTGCAG/--------- CTTCTGCAGC 3070 het 3070 ref 38 17 15 10 CTTCTGCAG 2 1 52058 CASAVA_Build 1 148964409 2D TGTTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 het 1703 hom 26 7 12 7 TG 1 0 52059 CASAVA_Build 1 148981276 14D AGAATTGCTT GAACCTTAAAGGCA/-------------- GAGGTTGCGG 3070 het 3070 ref 22 14 8 5 GAACCTTAAAGGCA 1 0 52060 CASAVA_Build 1 149000840 15D TCAAAAAAAC AAGAAAAAAAGAAAA/--------------- AAGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 22 13 8 5 AAGAAAAAAAGAAAA 1 0 52061 CASAVA_Build 1 149004388 1D CCTTTTTACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 13 12 52062 CASAVA_Build 1 149072882 1I ATTTCTAACC -/A AAAAAAAAAA 1126 het 1126 ref 37 26 3 8 A 11 12 52063 CASAVA_Build 1 149101678 1D TTTTTCCATT A/- AAAAAAAAAG 3031 het 3031 ref 25 12 7 6 A 10 9 52064 CASAVA_Build 1 149105376 4D AGCCACCAAG GTCA/---- GTCAGCCTGT 3070 het 3070 hom 31 13 18 1 GTCA 2 1 52065 CASAVA_Build 1 149112406 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1808 hom 18 6 10 2 A 10 11 52066 CASAVA_Build 1 149123240 1D CATGTATCAC A/- AAAAAGTTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 6 5 52067 CASAVA_Build 1 149126068 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2786 het 2279 hom 20 7 9 4 A 13 12 52068 CASAVA_Build 1 149140306 3D GCAAAATGTA TTC/--- TTTGGAAGCT 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 TTC 1 0 52069 CASAVA_Build 1 149144724 1D AGAACCTCTT C/- CAAATCTCAT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 C 2 1 52070 CASAVA_Build 1 149172469 1D CTATTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 1484 het 1484 ref 24 13 6 5 T 17 16 52071 CASAVA_Build 1 149189327 1D AGAGCGAAAC T/- TGTCTCAAAA 3070 het 521 hom 33 3 27 4 T 2 1 52072 CASAVA_Build 1 149214965 1D CCGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1590 het 1253 hom 17 8 5 4 A 15 14 52073 CASAVA_Build 1 149244555 1I TCTTGCCTCC -/A AAAAAAAAAA 943 het 943 ref 12 6 5 1 A 11 12 52074 CASAVA_Build 1 149257091 2I ACTTACCAGC --/AT ATTTAGCATT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 AT 1 2 52075 CASAVA_Build 1 149264259 1I TTCCACTTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 403 hom 34 1 25 8 A 9 10 52076 CASAVA_Build 1 149264846 1D CATTATATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 15 7 T 13 12 52077 CASAVA_Build 1 149271345 1I AATCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 2358 het 480 hom 13 1 8 4 A 13 14 52078 CASAVA_Build 1 149281924 1I AAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2737 het 2496 hom 19 9 7 3 A 11 12 52079 CASAVA_Build 1 149294460 4D AACACTGGAC AAAG/---- AAAGGACATG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 AAAG 2 1 52080 CASAVA_Build 1 149295730 3D AGAAGCCAGT CAG/--- CAGCAGTTCC 3070 het 3070 hom 59 23 26 10 CAG 3 2 52081 CASAVA_Build 1 149306033 1D TCATTGAGAG A/- AAAAAAAAAA 2627 het 2247 hom 24 7 10 7 A 15 14 52082 CASAVA_Build 1 149325771 3D TTGTTCTTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2755 hom 32 10 12 10 T 15 12 52083 CASAVA_Build 1 149328089 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 17 10 A 13 12 52084 CASAVA_Build 1 149331497 14D GAGCCACCGC ACCCAGCCATTTTT/-------------- TTAAAATCAT 1964 het 1964 ref 17 10 5 3 ACCCAGCCATTTTT 1 0 52085 CASAVA_Build 1 149357904 1I GAATTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 544 het 544 ref 15 7 5 3 T 17 18 52086 CASAVA_Build 1 149365523 1I ATTGATAGCC -/A GGGGTGAACA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 A 0 1 52087 CASAVA_Build 1 149365812 4D TTCAAGTAAT AGAA/---- AGTAATTCTG 3070 het 3070 hom 45 17 23 6 AGAA 1 0 52088 CASAVA_Build 1 149366808 1D AAAATTGTCC T/- TTTTTTTTTT 1035 het 1035 ref 15 6 4 5 T 12 11 52089 CASAVA_Build 1 149380099 1I CTCCGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 836 het 836 ref 17 10 4 3 A 13 14 52090 CASAVA_Build 1 149380317 4D TGGGCTTATT GGTG/---- GGTGGTACCA 3070 het 3070 hom 46 22 21 4 GGTG 2 1 52091 CASAVA_Build 1 149381507 1I GTTAGCTTCC -/T TGAGGCTGGG 3070 het 3070 hom 36 15 12 9 T 1 2 52092 CASAVA_Build 1 149387147 1D AGTCAGATCT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 8 7 52093 CASAVA_Build 1 149401204 1I GTTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 10 11 52094 CASAVA_Build 1 149407697 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCTC 3070 het 835 hom 11 2 9 0 G 4 5 52095 CASAVA_Build 1 149430106 1D CAATTTAGGA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 G 2 1 52096 CASAVA_Build 1 149446635 1I AAGATTAATC -/T TTTTTTTTTT 2552 het 940 hom 30 5 12 13 T 15 16 52097 CASAVA_Build 1 149446968 1D TTGCTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 24 1 14 10 T 14 13 52098 CASAVA_Build 1 149456001 21D TTAGTAAATG TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/--------------------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 17 8 T 30 9 52099 CASAVA_Build 1 149476960 3D TGAGTTAATT AGG/--- AGAGCATTCC 3070 het 3070 ref 40 21 17 4 AGG 1 0 52100 CASAVA_Build 1 149479024 3I GCCGGGCCTC ---/CTT CTAACTCTAT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 CTT 0 1 52101 CASAVA_Build 1 149487518 2D AAAAGGAAAA AG/-- CACACAGCAC 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 AG 1 0 52102 CASAVA_Build 1 149488916 1I AACTCACTTT -/A ACTCAGTTAA 3070 het 3070 hom 46 22 18 6 A 1 2 52103 CASAVA_Build 1 149495173 1I TGGCTGGGGC -/G GTGGCTCAGG 3070 het 3004 hom 25 9 13 3 G 1 2 52104 CASAVA_Build 1 149498652 1D CATACTAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 9 13 6 A 9 8 52105 CASAVA_Build 1 149504214 1D CGGGTCCTTT C/- CCCCCCTCGA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 C 7 6 52106 CASAVA_Build 1 149512589 1D ATAAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 A 12 11 52107 CASAVA_Build 1 149516799 2D TTCCACACCC CA/-- CTTTCAACCC 3070 het 3070 ref 46 19 21 6 CA 1 0 52108 CASAVA_Build 1 149523903 34D TTGTCTTGTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG/---------------------------------- TATCACTCTG 3070 het 3070 hom 30 16 17 5 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGG 1 0 52109 CASAVA_Build 1 149571377 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 25 0 18 8 A 12 11 52110 CASAVA_Build 1 149577595 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 1975 het 1571 hom 11 4 7 1 CT 2 1 52111 CASAVA_Build 1 149599224 1I CCCGCCTCGT -/C CCCCCCAAAG 3070 hom 52 het 23 0 18 5 C 6 7 52112 CASAVA_Build 1 149606578 2D GCCAGTGCCC CT/-- GTCTCCTGTC 3070 het 3070 hom 26 11 9 7 CT 1 0 52113 CASAVA_Build 1 149608353 1I GGAAGAGGCG -/C CCCTGTGGAC 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 C 3 4 52114 CASAVA_Build 1 149613397 1D TCATTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 12 6 A 11 10 52115 CASAVA_Build 1 149616507 1D CTCATCTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 13 12 52116 CASAVA_Build 1 149617993 5I ATCTCATTTC -----/ATTTT ATTTTATTTT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 ATTTT 2 3 52117 CASAVA_Build 1 149635994 4D TTCTTTCTTC CTTT/---- CTTTTTCTTT 3070 hom 67 het 25 0 23 4 CTTT 2 1 52118 CASAVA_Build 1 149636607 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 10 9 52119 CASAVA_Build 1 149647945 1D TGGGGGAGGG A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 6 52120 CASAVA_Build 1 149648502 2D TGAGACAGGG TC/-- TCTCTCTGTA 3070 hom 60 het 24 0 19 7 TC 4 3 52121 CASAVA_Build 1 149674599 1I GATACTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 943 hom 24 2 15 7 T 12 13 52122 CASAVA_Build 1 149684715 1D ATTTTTTTTT A/- AACAACATAG 3070 hom 77 het 34 0 26 9 A 3 2 52123 CASAVA_Build 1 149685278 1D ATGTGCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 23 1 18 4 A 14 13 52124 CASAVA_Build 1 149726207 2D TCTGCATGTC TG/-- TGGATGACCA 3070 het 3070 hom 16 7 8 2 TG 2 1 52125 CASAVA_Build 1 149730218 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1647 het 62 hom 14 2 4 8 T 17 16 52126 CASAVA_Build 1 149734481 1D TCATTTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 25 1 17 7 A 11 10 52127 CASAVA_Build 1 149735513 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2046 hom 18 het 8 0 7 1 A 11 10 52128 CASAVA_Build 1 149738542 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2406 hom 25 9 12 4 A 13 12 52129 CASAVA_Build 1 149748396 1I ATCCCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 15 8 A 11 12 52130 CASAVA_Build 1 149753322 1D CCTGGGACCT G/- GGGGAGTGTT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 G 5 4 52131 CASAVA_Build 1 149755643 1D AAAGTGGCAC T/- TTTTTTTTTT 1601 hom 4 het 23 0 7 16 T 17 16 52132 CASAVA_Build 1 149767263 18D CGTACTCAGT GTTTCACCGTGAAACATG/------------------ GTTTCACCGT 2379 het 1716 hom 9 4 5 1 GTTTCACCGTGAAACATG 1 0 52133 CASAVA_Build 1 149767520 1D ATCCAATGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 74 het 31 0 23 9 T 10 9 52134 CASAVA_Build 1 149776128 4D GAAGCCAGTA TATT/---- TATTTATTAG 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 TATT 3 2 52135 CASAVA_Build 1 149776591 1I TGATGGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1182 hom 43 3 32 8 A 12 13 52136 CASAVA_Build 1 149778024 4D AGTAAATGCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2759 het 1190 hom 24 8 8 8 T 20 16 52137 CASAVA_Build 1 149785109 2I TTTTCTTTTT --/TC TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 TC 0 1 52138 CASAVA_Build 1 149786052 1I TCTGTAGCCA -/T TTGCTGCTTA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 2 3 52139 CASAVA_Build 1 149793129 4D GGCTGTCTCC CTTT/---- CTTTCTTTAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 8 CTTT 3 2 52140 CASAVA_Build 1 149796474 8D TTTTTGCTTT AATCATCA/-------- AATGTAACTT 2120 het 2120 ref 24 17 6 1 AATCATCA 1 0 52141 CASAVA_Build 1 149805132 1I CTCTCTCCCT -/C CCCCCTCCCT 3070 hom 62 het 22 0 19 3 C 5 6 52142 CASAVA_Build 1 149853049 5I TTTTTTATAA -----/ATTTT ATTTTAATTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATTTT 1 2 52143 CASAVA_Build 1 149858112 1D ATATATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 12 11 52144 CASAVA_Build 1 149859613 1I CTTTAACTTG -/T TGTTTGTATT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 1 2 52145 CASAVA_Build 1 149865366 1D TGTGATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 755 hom 33 4 14 15 T 12 11 52146 CASAVA_Build 1 149868579 2I ACATATATAC --/GT GTATATATAC 3070 hom 30 het 15 0 11 4 GT 1 2 52147 CASAVA_Build 1 149872658 2D CTCTGCCTCC CA/-- CAGTGCTGGG 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 CA 2 1 52148 CASAVA_Build 1 149872745 1D TCCAGACAAC A/- AGTGATTTGA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 2 1 52149 CASAVA_Build 1 149892028 1D GTTGGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1836 het 1047 hom 25 7 5 13 T 17 16 52150 CASAVA_Build 1 149897960 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 hom 78 het 27 0 26 1 T 6 5 52151 CASAVA_Build 1 149901137 1I AATGTATTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 53 19 22 12 T 7 8 52152 CASAVA_Build 1 149903309 3I AAATAATATA ---/TAT TATTTAATAT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 TAT 1 2 52153 CASAVA_Build 1 149903362 2D AATAATTTAG TC/-- TCAGGTTTTT 2922 het 1245 hom 14 3 7 4 TC 2 1 52154 CASAVA_Build 1 149959452 1I TCCTGCCGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 606 hom 30 2 22 6 A 10 11 52155 CASAVA_Build 1 149966814 3I AGGATTCTCC ---/CTG CAGAGTCTGG 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 CTG 0 1 52156 CASAVA_Build 1 149977872 1D GTTAGGCCAA T/- TTTTTTTTTT 935 het 59 hom 7 1 4 2 T 19 18 52157 CASAVA_Build 1 149983306 1D GAGTTTGAGG T/- TTTTTTTTTT 2638 het 571 hom 25 3 8 15 T 15 14 52158 CASAVA_Build 1 149986591 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 T 11 10 52159 CASAVA_Build 1 149989087 1D CAAACTAGAG C/- CCCAGGAAAG 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 C 4 3 52160 CASAVA_Build 1 149992041 6D TTTTCTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 696 hom 20 4 11 5 T 17 11 52161 CASAVA_Build 1 149996433 2D GCTCAATTTC AG/-- AGAGTTTCGT 3070 hom 134 het 50 0 45 5 AG 3 2 52162 CASAVA_Build 1 150002893 2D CTGTGATGAC TG/-- GATACTGACC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TG 1 0 52163 CASAVA_Build 1 150004809 1D TAGTAGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 15 6 T 15 14 52164 CASAVA_Build 1 150010495 1D TATACACCTT A/- ACAGAGCTAA 3070 het 2729 hom 26 7 16 4 A 2 1 52165 CASAVA_Build 1 150011381 10I TTTTGTATTT ----------/TTGGTAGAGA ACGGGTTTCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTGGTAGAGA 0 1 52166 CASAVA_Build 1 150019358 47D AATTAGCTAA TACTATCTATACAACCAGTCCTCAATTACTTTATATACAACCTCAGT/----------------------------------------------- TACTATCTAT 3070 het 3070 ref 38 34 12 15 TACTATCTATACAACCAGTCCTCAATTACTTTATATACAACCTCAGT 1 0 52167 CASAVA_Build 1 150021551 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 2816 het 2816 ref 23 14 6 3 A 10 11 52168 CASAVA_Build 1 150033850 1D TTTTTACTTT A/- AAAAAAGTAA 2949 het 2949 ref 27 16 9 2 A 7 6 52169 CASAVA_Build 1 150048337 1D TGTCTCTACT A/- AAAATACAAA 2228 het 2228 ref 14 6 7 1 A 5 4 52170 CASAVA_Build 1 150074840 1I CCCCCACCCC -/A AAAAAAGAGG 3070 hom 73 het 34 0 20 14 A 6 7 52171 CASAVA_Build 1 150098667 1I AGATTAGCCA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 1829 hom 22 5 10 7 T 7 8 52172 CASAVA_Build 1 150100456 20D TGTCCACAGC TGGGCACTGGGCACATGGCA/-------------------- TGGGCACTGG 1874 het 1874 ref 34 14 10 17 TGGGCACTGGGCACATGGCA 2 1 52173 CASAVA_Build 1 150100844 4D GCACACACTC ACAT/---- ACACACAAAT 3070 het 3070 hom 68 29 29 13 ACAT 1 0 52174 CASAVA_Build 1 150101631 3I CAAGTCTCTC ---/GTT GTAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 GTT 0 1 52175 CASAVA_Build 1 150114495 1I ATACAAAAAA -/C ATTAGCCATA 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 C 0 1 52176 CASAVA_Build 1 150123788 1I CTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 10 11 52177 CASAVA_Build 1 150127995 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 7 8 52178 CASAVA_Build 1 150132527 2D CCAAAACAAA AG/-- AGAGAGAGAG 2250 het 2250 ref 38 22 7 10 AG 9 8 52179 CASAVA_Build 1 150137009 1I GCGAAATACA -/G GGGTAAGGGA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 G 3 4 52180 CASAVA_Build 1 150144207 2D AGCTTTGGTT AC/-- ACATTTATAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 AC 2 1 52181 CASAVA_Build 1 150160210 1I CTGTCCCCCA -/G GCTGTAGTGC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 G 1 2 52182 CASAVA_Build 1 150161395 1D GATTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2029 hom 26 7 14 6 A 13 12 52183 CASAVA_Build 1 150161495 1D CTTGATAAAC T/- TTTTGCTGCT 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 T 5 4 52184 CASAVA_Build 1 150163854 1D AAAGACCCAT C/- CCCCAAAGAT 3070 het 3070 ref 37 18 12 9 C 5 4 52185 CASAVA_Build 1 150165509 20I GCCAGCTATC --------------------/CCAAGGGGGTTTTATTGGCT CTGTAAGTAA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 CCAAGGGGGTTTTATTGGCT 0 1 52186 CASAVA_Build 1 150166216 2I TGCCTTTGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 12 14 52187 CASAVA_Build 1 150166952 4D AACATTTACT TCTA/---- TCTGTGTGCC 3070 het 3070 hom 44 17 25 3 TCTA 1 0 52188 CASAVA_Build 1 150172823 1D TCTTGTAGCC T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 6 5 52189 CASAVA_Build 1 150176265 4D AGATTATTTC CTTT/---- ATTTTTAAGT 3070 het 2218 hom 18 7 11 1 CTTT 1 0 52190 CASAVA_Build 1 150179343 1I ATTATAACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 848 hom 36 3 25 8 A 10 11 52191 CASAVA_Build 1 150188017 6I TGAAACAGGG ------/TCTTGC TCTTGCTCTG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TCTTGC 1 2 52192 CASAVA_Build 1 150200868 1I GAAACAGGCT -/C CCCTTCCCTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 C 3 4 52193 CASAVA_Build 1 150205016 3D TACATATGGG TTC/--- TTTAGTTGAC 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 TTC 1 0 52194 CASAVA_Build 1 150207363 1D ATGCGGGGCA C/- CCCCCCAGCA 2805 het 2805 ref 33 16 9 9 C 7 6 52195 CASAVA_Build 1 150213254 1I ATGAAGACTA -/G GGGATTGTGT 2012 het 2012 ref 37 17 7 13 G 3 4 52196 CASAVA_Build 1 150215517 1I GTTTACTCAA -/C ATAGAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 C 0 1 52197 CASAVA_Build 1 150220658 1I AGAGTCACTT -/C CTTTAACTAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 C 1 2 52198 CASAVA_Build 1 150224623 1D GGAGTGATAT G/- TGGCTTTTAT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 G 1 0 52199 CASAVA_Build 1 150231982 1I AGGCTGGACA -/G GGCAGCAGTG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 G 2 3 52200 CASAVA_Build 1 150244287 8D ATGAATATGA ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 184 hom 14 2 9 4 AT 13 9 52201 CASAVA_Build 1 150246202 1D GTTAGCACGT G/- GGCTGTTTAT 3070 hom 132 het 47 0 42 5 G 3 2 52202 CASAVA_Build 1 150333904 1D GTAATTTATG A/- AAAAAAAAAA 1795 het 1795 ref 23 10 5 9 A 15 14 52203 CASAVA_Build 1 150381926 1D GAAGGGTAGT G/- GGGGGGGTTG 2909 het 1126 hom 19 4 9 6 G 8 7 52204 CASAVA_Build 1 150390845 1D TTTGAGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 780 hom 42 2 30 10 A 13 12 52205 CASAVA_Build 1 150405372 1I TCCATAGTGT -/G GGAGCGGGCC 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 G 2 3 52206 CASAVA_Build 1 150412636 2I ACATCTTATC --/TT TCATAGAGCT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 1 3 52207 CASAVA_Build 1 150415991 1I TCATTCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 503 hom 41 2 34 5 T 10 11 52208 CASAVA_Build 1 150436952 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 9 10 52209 CASAVA_Build 1 150442037 1I CCAGATCACT -/C CCCCAAAGTG 3070 het 3070 ref 43 27 14 2 C 4 5 52210 CASAVA_Build 1 150443348 1D CCTAATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 37 1 20 17 T 15 14 52211 CASAVA_Build 1 150462353 1D AGTTTAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 40 1 33 7 T 11 10 52212 CASAVA_Build 1 150462476 4D GTTCAGAATT AGTC/---- AGTCATGATT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 AGTC 2 1 52213 CASAVA_Build 1 150463760 6D TCATCTTTGG TATTGT/------ TATTACCTTT 3070 het 3070 ref 46 23 17 11 TATTGT 1 0 52214 CASAVA_Build 1 150464158 2D TGAATTACTC AA/-- GAGGGAGTTG 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 A 2 0 52215 CASAVA_Build 1 150468524 3I ATAATGATGA ---/ATT ATTATCATCT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 ATT 1 2 52216 CASAVA_Build 1 150469412 1I GCCACAGAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 12 25 2 T 9 10 52217 CASAVA_Build 1 150475166 3D TCCTGGAAAT GAA/--- GTCTGCAAAA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 GAA 1 0 52218 CASAVA_Build 1 150476372 4D TTTTATTTTA TTAT/---- TTATTTATTT 1863 het 1528 hom 12 5 6 2 TTAT 3 2 52219 CASAVA_Build 1 150478708 3I AAAGAAAAAT ---/AAC AACAATAACA 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 AAC 1 2 52220 CASAVA_Build 1 150479212 1D TTCTCTCAGC T/- TTTGTTTGTC 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 T 4 3 52221 CASAVA_Build 1 150487535 1I TTTTTATTTT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 8 9 52222 CASAVA_Build 1 150493157 1D ATAAGCCTCC T/- TTTGATCTGG 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 T 4 3 52223 CASAVA_Build 1 150494132 1I GGTCTTATAC -/A TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 0 1 52224 CASAVA_Build 1 150498385 1I GAACTCATCC -/T TTTTTTATGG 1996 het 1303 hom 9 3 5 1 T 6 7 52225 CASAVA_Build 1 150509663 3I ACCGGAGCTG ---/TTC TTCTTCAGCC 3070 hom 33 het 14 0 10 4 TTC 2 3 52226 CASAVA_Build 1 150513583 1D TGGCTGGCAG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 8 7 52227 CASAVA_Build 1 150515334 2D CAGTTGATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 7 8 A 13 11 52228 CASAVA_Build 1 150524317 1I CTTGAGTGAC -/T TTTGGGTAAA 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 3 4 52229 CASAVA_Build 1 150530856 1D CTTCCTCCCC T/- AGCCAAGGGA 1518 het 1518 ref 48 38 4 6 T 1 0 52230 CASAVA_Build 1 150553966 1D GGACAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 12 11 52231 CASAVA_Build 1 150560681 2I AGAAGAAATG --/TT TCTAGAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 1 3 52232 CASAVA_Build 1 150563198 1D AGATTTTGGT A/- TGAGCAAACA 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 A 1 0 52233 CASAVA_Build 1 150569252 3D TGCTTATATC AAT/--- AAAGCTAATT 3070 het 3070 ref 33 17 15 4 AAT 1 0 52234 CASAVA_Build 1 150571269 1D TAGGGGAGGG C/- TCAGAATAGT 3070 het 3070 hom 41 15 21 7 C 1 0 52235 CASAVA_Build 1 150572821 2I TACATTCCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 12 14 52236 CASAVA_Build 1 150575140 1I AGGATATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 10 11 52237 CASAVA_Build 1 150575412 1I GCTATTTTTT -/G TTAGATCTCA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 G 0 1 52238 CASAVA_Build 1 150584665 1D19M3I AACCAGTAGA TTTGATACAGATTTTTTTGT---/-TTGATACAGATTTTTTTGTTTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 33 24 15 5 N/A 0 0 52239 CASAVA_Build 1 150586752 4D AATAAATGGT GATA/---- GATAGATTGG 3070 het 3070 hom 50 14 30 6 GATA 2 1 52240 CASAVA_Build 1 150601631 2D TACAGTTCGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 TG 9 8 52241 CASAVA_Build 1 150602468 1I TGCGTGCTAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 T 8 9 52242 CASAVA_Build 1 150603950 1D TCAGCAGGCA T/- TTTTTTTTTT 2870 het 2766 hom 25 9 8 9 T 13 12 52243 CASAVA_Build 1 150609257 2I AAAATCAGAC --/AA AGAGATTATA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 A 1 3 52244 CASAVA_Build 1 150622771 1D CGTCTGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 T 12 11 52245 CASAVA_Build 1 150625234 1I TATTTGGGTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 T 8 9 52246 CASAVA_Build 1 150630850 2I TAAAAAAAAA --/AG GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 AG 0 1 52247 CASAVA_Build 1 150632204 1I GTCATGGCTT -/G AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 G 0 1 52248 CASAVA_Build 1 150651123 1I ATTCCCCAGG -/T CAAGGCCTCT 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 T 0 1 52249 CASAVA_Build 1 150662279 2D TCCACACATG GC/-- GTTATTTTGG 3070 het 3070 hom 36 18 16 3 GC 1 0 52250 CASAVA_Build 1 150678397 5D TTTTGGTCAT GTTGA/----- GTTAACTGGA 3070 het 3070 ref 44 26 17 2 GTTGA 1 0 52251 CASAVA_Build 1 150705072 5D GTGAGTCCTG ACATA/----- ATTTCACAGT 3070 het 3070 ref 45 24 20 5 ACATA 1 0 52252 CASAVA_Build 1 150725991 1D CATTCAGACT A/- AAGAAGTTGC 3070 het 3070 ref 46 28 14 4 A 3 2 52253 CASAVA_Build 1 150736238 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1291 het 1291 ref 14 4 5 5 A 11 12 52254 CASAVA_Build 1 150738246 1D AGACGAAAAA C/- CATCATTGTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 C 2 1 52255 CASAVA_Build 1 150752243 1D TTCTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 926 het 926 ref 27 12 4 11 T 15 14 52256 CASAVA_Build 1 150755600 1D AGCTGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2046 het 1430 hom 25 7 6 12 T 15 14 52257 CASAVA_Build 1 150756664 1D TGGACCTGCC T/- CCCCACACTA 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 T 1 0 52258 CASAVA_Build 1 150771116 1I TCAAGTTCAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 8 9 52259 CASAVA_Build 1 150771671 2I GCCTCCTGTG --/TT TTTTTTTTTT 2394 het 2394 ref 25 8 11 6 T 13 15 52260 CASAVA_Build 1 150772958 1D GGTTTAAATA T/- TTTTTTTTTC 2778 het 2778 ref 25 13 7 5 T 10 9 52261 CASAVA_Build 1 150773513 1I AAGGTGGCGC -/A CGTTCTGTAC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 0 1 52262 CASAVA_Build 1 150773607 6I AAAGAAGGTT ------/TTGTTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 TTG 4 6 52263 CASAVA_Build 1 150774850 12D2M21D GACCAGGGAA GAGCAGGGCCATCCGTTTCTTCGGAAAAAAAAAAT/------------CC--------------------- CAGAGTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 8 N/A 0 0 52264 CASAVA_Build 1 150778450 19D ACAGGGCAAA CATGGCAGCCATTTTCCTC/------------------- CATGGCAGCC 3070 het 3070 ref 49 26 14 17 CATGGCAGCCATTTTCCTC 2 1 52265 CASAVA_Build 1 150780135 2D CAGAGCCTGC CA/-- CACACAGGGA 3070 het 3070 ref 58 28 24 6 CA 4 3 52266 CASAVA_Build 1 150785556 2I ACACCTGAAC --/TT TGGGCTAGCC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 1 3 52267 CASAVA_Build 1 150786946 2D GGTTTGTGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 AT 6 5 52268 CASAVA_Build 1 150800730 1I AAAGGGGAAT -/G GGAAGAGAGC 3070 het 3070 ref 55 23 22 10 G 2 3 52269 CASAVA_Build 1 150856588 3I GTTAATGGGT ---/GCA GCACACCAAC 3070 het 1408 hom 13 3 9 1 GCA 1 2 52270 CASAVA_Build 1 150856676 1D TTAAAAAAAA T/- AAAGGCCTGA 3070 het 1197 hom 14 3 11 0 T 1 0 52271 CASAVA_Build 1 150857964 1D ACACCAGGCT G/- GGGGGGGGCT 3070 het 2651 hom 39 10 21 8 G 9 8 52272 CASAVA_Build 1 150870724 3D TCAGAGAGAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 5 A 13 10 52273 CASAVA_Build 1 150875220 1I CGAAAATTAG -/A ATTTAGGGCT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 1 2 52274 CASAVA_Build 1 150876164 1I ACCAGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 10 11 52275 CASAVA_Build 1 150881509 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 2825 het 2825 ref 18 12 6 0 A 9 10 52276 CASAVA_Build 1 150882286 1I AGACCACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 10 11 52277 CASAVA_Build 1 150885299 1I TAGGCCTTAT -/G GGGGGGTTGA 3070 het 3070 hom 57 23 28 6 G 6 7 52278 CASAVA_Build 1 150940985 1I TTTTATGTAA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 47 19 18 10 T 7 8 52279 CASAVA_Build 1 150948683 7D ATTGAAAAAT TTTCTGA/------- TGTGCTTTGC 3070 het 3070 ref 39 23 15 2 TTTCTGA 1 0 52280 CASAVA_Build 1 150954537 10D AATAGGGAAA GGAAAGTCTC/---------- TTGAATATGT 371 het 371 ref 29 21 3 7 GGAAAGTCTC 1 0 52281 CASAVA_Build 1 150960122 1D GGTAGTAAGT G/- AGCCATCTCC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 G 1 0 52282 CASAVA_Build 1 150961563 1I AAACCATATC -/T TTGGAAAGGT 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 2 3 52283 CASAVA_Build 1 150970287 1D CAAAGTCTAA G/- ATATTCAGTT 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 G 1 0 52284 CASAVA_Build 1 150972940 1I CTAACCCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 9 10 52285 CASAVA_Build 1 150974404 1I CTTTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 10 11 52286 CASAVA_Build 1 150986163 4D TGTGAACATG TCAA/---- TCAATGTAGG 3070 het 3070 ref 65 30 31 5 TCAA 2 1 52287 CASAVA_Build 1 150987621 1I GAATCATATA -/T TTTTTATCTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 5 6 52288 CASAVA_Build 1 150994334 1I GGATTGTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 T 8 9 52289 CASAVA_Build 1 150995460 1I TTTAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2818 hom 27 8 13 6 A 10 11 52290 CASAVA_Build 1 150996286 1D CTTGGATGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2177 hom 18 7 8 3 T 9 8 52291 CASAVA_Build 1 151038190 1D GGATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 11 10 52292 CASAVA_Build 1 151041140 1D ACAGGAAGGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 A 9 8 52293 CASAVA_Build 1 151067942 1I CCTGCACTTA -/T TTTTTTAATC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 7 52294 CASAVA_Build 1 151078259 1D CGGTGTTTGG T/- TTTTTTGTTC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 7 6 52295 CASAVA_Build 1 151124363 1D AGTCCTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 A 13 12 52296 CASAVA_Build 1 151134822 1I GTGGAAGGGT -/A AATCTGGCCC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 2 3 52297 CASAVA_Build 1 151154443 1D CCTCTCTTTG C/- CCCCCCCACT 3070 het 2790 hom 21 8 9 4 C 8 7 52298 CASAVA_Build 1 151162702 1I ATAACTACTG -/A AAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 6 7 52299 CASAVA_Build 1 151167642 1I GAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1524 hom 20 6 11 3 A 9 10 52300 CASAVA_Build 1 151190250 1I ACTTTTGTGA -/C CCTACTTCTC 3070 het 3070 hom 53 19 23 11 C 2 3 52301 CASAVA_Build 1 151207194 2I ATTAGGAGAC --/AT ACCTAATGCT 2659 het 653 hom 8 2 6 0 AT 0 1 52302 CASAVA_Build 1 151225569 4D ACATGCACTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 2113 hom 57 14 28 18 TC 9 7 52303 CASAVA_Build 1 151226211 1I AGGAAAGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 10 11 52304 CASAVA_Build 1 151226321 1I ACCAAACCCC -/A CAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 0 1 52305 CASAVA_Build 1 151229949 2I CGCAATGCAC --/AT ATGTCTCATA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 AT 1 2 52306 CASAVA_Build 1 151231552 1D TACAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1822 hom 25 5 13 7 A 11 10 52307 CASAVA_Build 1 151231923 2I GAAAATGGTG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 9 11 52308 CASAVA_Build 1 151234727 2I AATGACAAAC --/AG ATTATTAGTT 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 AG 0 1 52309 CASAVA_Build 1 151243476 4I CTCTCTAGCT ----/CAGA CAATGTTATT 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 CAGA 0 1 52310 CASAVA_Build 1 151245598 1D AGACTTTGCT G/- AAGTTGCTTA 2901 het 1055 hom 10 3 6 1 G 1 0 52311 CASAVA_Build 1 151250308 4D ATGCCCAGAG TTGT/---- TTGTTTGTTC 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 TTGT 3 2 52312 CASAVA_Build 1 151251175 1D TCTTTCATGA T/- TTTCCAGGGT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 4 3 52313 CASAVA_Build 1 151261928 1D TCTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1779 het 1779 ref 39 28 4 7 A 11 10 52314 CASAVA_Build 1 151264106 2D ATAAACACAC AA/-- ACACTCACTA 3070 het 3070 ref 56 26 25 6 A 3 1 52315 CASAVA_Build 1 151265353 2D TGTCTTTGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 TA 7 6 52316 CASAVA_Build 1 151267873 4D GCCACATGAC TGTG/---- TATGGATAAA 3070 het 3070 ref 54 29 25 0 TG 2 0 52317 CASAVA_Build 1 151268128 2D51M1D TTGTACAGTG AAAAAAAAAAGCAGCAGGGGGATCTTTACACCTAGCTATTCAATGTAATTTAGA/--AAAAAAAAGCAGCAGGGGGATCTTTACACCTAGCTATTCAATGTAATTTAG- AAAAAACAGC 3070 het 3070 hom 40 17 18 19 N/A 0 0 52318 CASAVA_Build 1 151268959 2D GAATTCAAAC TG/-- AGAGTTGGGT 3070 het 3070 hom 38 17 20 3 TG 1 0 52319 CASAVA_Build 1 151270428 1D ATTCTTGGTA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 T 7 6 52320 CASAVA_Build 1 151271128 1D TTTGTTAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2720 hom 34 7 24 3 T 10 9 52321 CASAVA_Build 1 151278676 1D TTAAAATGAT A/- TAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 1 0 52322 CASAVA_Build 1 151293223 1I CAAGCATATT -/A AAAAAAGCCC 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 6 7 52323 CASAVA_Build 1 151299330 1D AGTAATTAAG A/- AGAATGTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 2 1 52324 CASAVA_Build 1 151306466 1D TCACAGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 A 12 11 52325 CASAVA_Build 1 151317086 1D ATTTTACTAC A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 8 7 52326 CASAVA_Build 1 151317469 1I TTACTTTCTG -/T TTTTTTTATT 3070 het 2868 hom 17 7 8 2 T 7 8 52327 CASAVA_Build 1 151319213 9D11M1D TTATTCACCA AGAAAACCTAGAAAATATAGA/---------AGAAAATATAG- AAGCTATAAA 2901 het 2901 ref 23 15 6 4 N/A 0 0 52328 CASAVA_Build 1 151320926 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1228 hom 29 6 11 12 T 17 15 52329 CASAVA_Build 1 151329141 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2315 het 2315 ref 17 10 6 1 A 12 13 52330 CASAVA_Build 1 151383317 1D CCTCAATGTG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 T 8 7 52331 CASAVA_Build 1 151399294 3D TTCACTTAGC ATA/--- ATATCATCAA 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 ATA 2 1 52332 CASAVA_Build 1 151399704 15D GGTGCTGGAG AGGATGTGGAGAAAT/--------------- AGGAACACTT 1928 het 1928 ref 17 10 5 2 AGGATGTGGAGAAAT 1 0 52333 CASAVA_Build 1 151401725 2I CTTGGTGACC --/AG AGAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 46 19 17 10 AG 3 4 52334 CASAVA_Build 1 151405983 1D GAGGGCAGTT A/- AAAGAACTGT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 4 3 52335 CASAVA_Build 1 151406585 6D AAAAAAAACA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 16 1 AAAAAG 3 2 52336 CASAVA_Build 1 151408665 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 809 het 809 ref 17 7 3 7 A 13 14 52337 CASAVA_Build 1 151427806 1D TGGGGCACCA G/- GCACCACTGG 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 G 2 1 52338 CASAVA_Build 1 151439801 1D GAAAGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3005 het 1463 hom 26 7 10 9 T 17 16 52339 CASAVA_Build 1 151449289 1I TTCTCTATCA -/T TTTGCTCTGC 3070 hom 135 het 52 0 45 7 T 3 4 52340 CASAVA_Build 1 151462643 4D CCTATGTGAG AGTA/---- AGTGACACAG 3070 het 3070 ref 45 23 18 6 AGTA 1 0 52341 CASAVA_Build 1 151487988 2D CATACCTCCT TG/-- GTAGTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 TG 1 0 52342 CASAVA_Build 1 151491027 1D TATAGGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 T 12 11 52343 CASAVA_Build 1 151497106 2D AACAAGGGAC CA/-- CACATATCAG 3070 het 3070 hom 54 21 23 11 CA 3 2 52344 CASAVA_Build 1 151504677 5I CAAATTCACT -----/TAAAA TAATAAAATG 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 TAAAA 0 1 52345 CASAVA_Build 1 151539877 9I TTCAAAACAA ---------/ACGATGTAC ACTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 50 30 17 3 ACGATGTAC 0 1 52346 CASAVA_Build 1 151543708 4I CTACCAGTGG ----/AAGA AACTGGAATA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AAGA 0 1 52347 CASAVA_Build 1 151546087 3D CGCAGAAAAT AAG/--- AGCCACAGAG 3070 hom 98 het 37 0 32 6 AAG 1 0 52348 CASAVA_Build 1 151548102 2D GCTAACACAC AT/-- GTCTTAATCA 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 AT 1 0 52349 CASAVA_Build 1 151560821 5D TAAATATATA TAATT/----- TAAGAAGACA 3070 het 3070 hom 35 15 17 5 TAATT 1 0 52350 CASAVA_Build 1 151560980 1D GATGGAAAAA G/- AGACCATTAT 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 G 1 0 52351 CASAVA_Build 1 151568299 1D ACTTTTAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 T 10 9 52352 CASAVA_Build 1 151570765 1D GAATGATACA G/- AGAAGATTAG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 G 1 0 52353 CASAVA_Build 1 151572054 1I TTAACAACCT -/A ATGTCACAAC 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 1 2 52354 CASAVA_Build 1 151573361 1I AATAACAATC -/A AGCTAAGAAC 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 A 1 2 52355 CASAVA_Build 1 151574282 1I CAACAAAAAC -/A AAAAAAGACA 3070 hom 90 het 33 0 29 4 A 6 7 52356 CASAVA_Build 1 151578875 1D CTTAATGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 10 9 52357 CASAVA_Build 1 151581744 1D CCCAGAGTGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 8 52358 CASAVA_Build 1 151582092 3I TGAGAAGGAT ---/AAG AAGACAGCAG 3070 hom 113 het 42 0 38 4 AAG 1 2 52359 CASAVA_Build 1 151587842 3I CTTCCCAGAG ---/AGA AGAAGAGAGC 3070 hom 81 het 31 0 25 6 AGA 2 3 52360 CASAVA_Build 1 151587993 9D TGAATAAGCC CAGGTAGCT/--------- CCTCCCTGGG 3070 hom 81 het 29 0 27 4 CAGGTAGCT 1 0 52361 CASAVA_Build 1 151627939 1D CCTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2026 het 1571 hom 24 8 6 10 A 19 18 52362 CASAVA_Build 1 151657036 1I CATCACATTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 85 het 34 0 28 6 A 7 8 52363 CASAVA_Build 1 151696874 1D TATTGTTCCT G/- GGGTCTCTGG 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 G 4 3 52364 CASAVA_Build 1 151700538 8I GGAGTGACCC --------/CCCCGCAG CCCCATGGAA 3070 hom 38 het 22 0 13 9 CCCCGCAG 0 1 52365 CASAVA_Build 1 151702621 6I TATAAAGCAA ------/ACACTG ACACTGAAAG 3070 het 3070 ref 30 15 15 0 ACACTG 1 2 52366 CASAVA_Build 1 151715688 1I TGGCTCTTAA -/C CCCTCTGCTA 3070 hom 120 het 44 0 39 5 C 3 4 52367 CASAVA_Build 1 151716644 3D GCAGTGAGCC ATG/--- ATGATCACAC 3070 hom 59 het 23 0 20 5 ATG 2 1 52368 CASAVA_Build 1 151716758 1I TCATATGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 30 1 23 6 A 12 13 52369 CASAVA_Build 1 151717101 1D GCTATAACTC T/- TTTCTCATTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 4 3 52370 CASAVA_Build 1 151720653 1I ATTTTCCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 36 2 30 4 T 10 11 52371 CASAVA_Build 1 151722438 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2873 hom 23 het 11 0 8 3 A 11 10 52372 CASAVA_Build 1 151727737 1D TTTTTAATAC A/- AAAAAAAAAA 1204 het 1204 ref 34 24 5 5 A 12 11 52373 CASAVA_Build 1 151732138 1D ATTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 26 2 15 9 T 13 12 52374 CASAVA_Build 1 151737812 1D CTACAAAATA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 35 0 25 10 T 8 7 52375 CASAVA_Build 1 151737969 1I ATTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 22 3 13 6 A 15 16 52376 CASAVA_Build 1 151744159 4D AAAAAAAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 2676 hom 35 het 13 0 12 3 AG 8 6 52377 CASAVA_Build 1 151761850 2I GAGGAGGAAC --/AA AGAACTCCAG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 1 3 52378 CASAVA_Build 1 151764365 10D AGAAAAAGAA AGAAAGAGAG/---------- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 29 17 12 3 AGAAAGAGAG 1 0 52379 CASAVA_Build 1 151850957 15I GCCTGCTTGG ---------------/GTTGTGAGGTAACCC CCCTGCCTCA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 GTTGTGAGGTAACCC 0 1 52380 CASAVA_Build 1 151860260 1I ATCTACAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 573 hom 26 3 17 6 T 15 16 52381 CASAVA_Build 1 151863742 2D AAAAAAGATG AA/-- AAAGGAAACG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 5 3 52382 CASAVA_Build 1 151872580 3D GCCCCACCCC AAG/--- AAGGAGTAAA 3070 hom 95 het 33 0 30 4 AAG 2 1 52383 CASAVA_Build 1 151872919 1D TTAATAACTA C/- CCCCAAGAGG 3070 hom 69 het 29 0 22 8 C 5 4 52384 CASAVA_Build 1 151875189 1D GCACCGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1012 hom 33 6 15 12 T 17 16 52385 CASAVA_Build 1 151887112 4I ACTCCATCTC ----/AAGA GAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AAGA 0 1 52386 CASAVA_Build 1 151887900 2D TCCTCTGGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 26 0 14 13 T 16 14 52387 CASAVA_Build 1 151892864 2D CCGGCCTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 48 het 23 0 17 7 TG 6 5 52388 CASAVA_Build 1 151894862 2I GTGGTTTTTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 99 het 40 0 32 8 GT 7 8 52389 CASAVA_Build 1 151910428 1I GCTATCGGAG -/T TTTTTTCATT 3070 hom 89 het 34 0 29 5 T 6 7 52390 CASAVA_Build 1 151913261 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGGGTCTC 2071 hom 15 het 6 0 6 0 G 6 7 52391 CASAVA_Build 1 151927139 1D AGCTCCTCTA C/- CCCCCCAATA 3070 hom 43 het 18 0 15 3 C 7 6 52392 CASAVA_Build 1 151927999 1D GGGCGCTCAC G/- GTAGGCTGTG 3070 hom 75 het 29 0 22 7 G 2 1 52393 CASAVA_Build 1 151932544 1I CTCCACACCT -/C CCCTACCCTG 3070 hom 107 het 43 0 32 11 C 3 4 52394 CASAVA_Build 1 151932873 4D TACTGGGAGG AGAA/---- AGAGTCACCT 2819 het 2819 ref 28 13 8 8 AGAA 1 0 52395 CASAVA_Build 1 151937978 1I TTAACCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 33 2 21 10 A 13 14 52396 CASAVA_Build 1 151941987 1I CCTGGTCGAG -/T TTTTTTTTTG 2219 het 241 hom 16 1 7 8 T 9 10 52397 CASAVA_Build 1 151951888 2I12M1I TGCTCCATTT --AAAAAATGAGGT-/TAAAAAATTGAGGTA AGTCTGGTGC 3070 hom 36 het 20 0 13 7 N/A 0 0 52398 CASAVA_Build 1 151957564 2I TTCTCAATAC --/TT TTTTACAACT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 4 6 52399 CASAVA_Build 1 151985668 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2354 hom 18 het 7 0 6 1 T 7 6 52400 CASAVA_Build 1 152025187 16I CCCCAGTAGC ----------------/TGGTACTACAGGCGTG TGCCACCATG 3070 hom 72 het 25 0 22 3 TGGTACTACAGGCGTG 0 1 52401 CASAVA_Build 1 152026005 1I AAGGTTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 9 10 52402 CASAVA_Build 1 152026172 1D CCCAGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 1388 het 172 hom 14 2 6 7 T 17 16 52403 CASAVA_Build 1 152039775 1I GCCACCCCCC -/T CCTCCAGCAG 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 0 1 52404 CASAVA_Build 1 152054556 1D AAAAACAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 11 10 52405 CASAVA_Build 1 152074712 1I ATTGTTAGTA -/C CTTTTTAGCA 3070 het 2301 hom 22 7 10 5 C 1 2 52406 CASAVA_Build 1 152075670 15I TAAAAAAAAA ---------------/AAAAAAAAATCAGCC AGGCATGGTG 2856 hom 21 het 10 0 8 2 AAAAAAAAATCAGCC 0 1 52407 CASAVA_Build 1 152085045 1D TAAACTACCG C/- CCCCCCCCCG 3070 hom 4 het 15 0 11 4 C 10 9 52408 CASAVA_Build 1 152094326 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 477 hom 30 3 22 5 T 12 11 52409 CASAVA_Build 1 152096238 2D ATGCATATGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AT 10 9 52410 CASAVA_Build 1 152102613 1D AAGAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 958 hom 27 3 21 3 A 13 12 52411 CASAVA_Build 1 152108392 1I ACTATATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 5 A 13 14 52412 CASAVA_Build 1 152109064 1I TGTCTCTACA -/T TTTTCCTTTT 3070 het 439 hom 15 1 10 4 T 4 5 52413 CASAVA_Build 1 152111654 1I ACATAATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 30 1 26 3 A 12 13 52414 CASAVA_Build 1 152113367 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 17 4 A 10 11 52415 CASAVA_Build 1 152117263 1D TCCTGCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 611 hom 29 2 18 9 T 13 12 52416 CASAVA_Build 1 152140314 1I ATTCTACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1865 hom 23 4 14 5 A 15 16 52417 CASAVA_Build 1 152151497 4I AGAAACTGAG ----/AATT AATTACTATC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AATT 1 2 52418 CASAVA_Build 1 152178375 1I GCCTCAGACT -/G GGGGGGGGTC 3070 hom 55 het 27 0 16 11 G 8 9 52419 CASAVA_Build 1 152186483 1I CACCTCCTTA -/C CCCGACTCAC 3070 hom 129 het 48 0 42 6 C 3 4 52420 CASAVA_Build 1 152188108 1D CCACCACCCA C/- CCCACCTAGA 3070 hom 78 het 37 0 26 11 C 4 3 52421 CASAVA_Build 1 152194797 1I AAAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 16 9 A 10 11 52422 CASAVA_Build 1 152205725 8D AGCAAAAGAA AAACAAAC/-------- AAACAAACTT 3070 hom 78 het 26 0 27 1 AAAC 4 2 52423 CASAVA_Build 1 152206769 1D AAGAATAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 450 hom 15 1 11 3 A 10 9 52424 CASAVA_Build 1 152224825 2I AGAGGCTAGC --/GG ATCGGATCGG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 G 0 2 52425 CASAVA_Build 1 152225808 1D CTAGAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 A 11 10 52426 CASAVA_Build 1 152230620 2I AGTGCAGGAA --/AG AGACGGGTGT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 AG 1 2 52427 CASAVA_Build 1 152231021 2I GGAAGTAACC --/AA AGTGATACAA 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 A 1 3 52428 CASAVA_Build 1 152249971 12D ACTCCGTCTC AAATAAATAAAT/------------ AAATAAATAA 2699 het 479 hom 8 1 7 3 AAAT 7 4 52429 CASAVA_Build 1 152256492 1D CTCAATTTTC A/- GCTTAACCCA 3070 het 3070 ref 35 22 10 4 A 1 0 52430 CASAVA_Build 1 152270992 1D TGGCTAAATT A/- AAAAAAATTT 2664 het 2664 ref 29 15 7 7 A 8 7 52431 CASAVA_Build 1 152284452 2D TATAATCAAA TG/-- TGTGTCTGAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 TG 3 2 52432 CASAVA_Build 1 152289632 1I CATACTAATT -/C CACAGACTCT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 C 1 2 52433 CASAVA_Build 1 152290318 1D ATTTTCACAA T/- TTTTTTTTTG 2893 het 2667 hom 20 6 6 8 T 10 9 52434 CASAVA_Build 1 152341961 2D AGACATATGG TA/-- TATATATAAG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 TA 5 4 52435 CASAVA_Build 1 152344587 1D AAAATCCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 A 12 11 52436 CASAVA_Build 1 152348652 1I ATCTAATAGA -/T ATTTACAGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 0 1 52437 CASAVA_Build 1 152354016 1D TTTCTATCCA C/- CCCGCTGGCA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 C 4 3 52438 CASAVA_Build 1 152361330 2D CCAAATAACA TG/-- TGAATGGCTG 3070 hom 66 het 28 0 23 7 TG 2 1 52439 CASAVA_Build 1 152366209 1D GTGTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2824 het 1027 hom 19 6 9 4 A 16 15 52440 CASAVA_Build 1 152377358 1D GGAGGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 A 11 10 52441 CASAVA_Build 1 152390571 1I TAGTAGTTGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 7 8 52442 CASAVA_Build 1 152398737 1D CAAACCTGTT A/- AGAGTCAACA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 2 1 52443 CASAVA_Build 1 152459088 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2200 hom 30 8 15 7 T 10 11 52444 CASAVA_Build 1 152462223 1D ACTAGGTGGT A/- AAAATTTTCT 3070 het 3070 ref 40 25 14 2 A 5 4 52445 CASAVA_Build 1 152462624 1D TGGTTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 T 12 11 52446 CASAVA_Build 1 152470389 1D CACACTTGGC T/- TTTTTTTTTT 2517 het 886 hom 26 7 9 10 T 14 13 52447 CASAVA_Build 1 152485175 1D ATTTCAAGGC T/- TTTGTGTTTG 3070 het 3070 hom 43 14 25 4 T 4 3 52448 CASAVA_Build 1 152485264 4D GTTAGCGTGT TCAG/---- TCATTCTTCA 3070 het 3070 ref 47 26 16 7 TCAG 1 0 52449 CASAVA_Build 1 152488979 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAAAT 3070 het 1457 hom 33 8 12 13 G 0 1 52450 CASAVA_Build 1 152489453 1I CACCTGGCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 T 9 10 52451 CASAVA_Build 1 152493744 3D TATCTCAGTT TTG/--- TTGTTTAATT 3070 het 3070 ref 48 27 18 5 TTG 2 1 52452 CASAVA_Build 1 152504890 2I TGAAAATGAC --/AT GTGGTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 AT 0 1 52453 CASAVA_Build 1 152532760 1D AGTTTTCAAG A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 7 6 52454 CASAVA_Build 1 152538311 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2282 hom 16 6 8 2 A 10 9 52455 CASAVA_Build 1 152546058 4D CGAGACCAGC CTGA/---- CTAACATGGT 3070 het 980 hom 10 2 8 0 CTGA 1 0 52456 CASAVA_Build 1 152572437 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2091 het 1987 hom 13 6 5 2 A 10 11 52457 CASAVA_Build 1 152574837 1I TCCCAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2167 hom 15 5 8 2 A 12 13 52458 CASAVA_Build 1 152576848 1I TGTATTAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 9 10 52459 CASAVA_Build 1 152599543 1I TAAAAAGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 9 10 52460 CASAVA_Build 1 152599818 1D TAAATTGTAT C/- CCCCCCAATT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 7 6 52461 CASAVA_Build 1 152600253 6I TTGAGCTGGG ------/CATGGT CATGGTGGTG 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 CATGGT 1 2 52462 CASAVA_Build 1 152618387 1I TCTTTTTTTT -/A TAAATTTCTT 3070 het 2927 hom 19 7 9 3 A 0 1 52463 CASAVA_Build 1 152621165 1I TTTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2174 hom 24 8 11 5 A 11 12 52464 CASAVA_Build 1 152625060 16D ACACACAGGC GTTTTTGTACACAGGT/---------------- AAATACAGGC 3070 het 3070 ref 34 20 14 6 GTTTTTGTACACAGGT 1 0 52465 CASAVA_Build 1 152627648 4I AATTTTCCTG ----/TCTT TGTCTTTGCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TCTT 0 1 52466 CASAVA_Build 1 152632370 1D CTCCACCCCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 94 het 40 0 29 11 T 10 9 52467 CASAVA_Build 1 152634199 2D TATTTGTATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2210 hom 24 8 12 4 TG 13 12 52468 CASAVA_Build 1 152634876 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1832 het 1832 ref 26 14 10 3 T 12 11 52469 CASAVA_Build 1 152638173 1I TGGGAATCTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 8 9 52470 CASAVA_Build 1 152643377 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2262 hom 27 het 11 0 8 3 T 13 12 52471 CASAVA_Build 1 152652046 1D GAACTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 1764 het 1567 hom 23 10 4 9 T 15 14 52472 CASAVA_Build 1 152665621 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 25 0 15 10 A 15 14 52473 CASAVA_Build 1 152676518 1I TTAACTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 13 14 52474 CASAVA_Build 1 152676981 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1680 hom 12 het 7 0 5 2 T 15 14 52475 CASAVA_Build 1 152681889 1D CATTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 32 2 20 10 T 14 13 52476 CASAVA_Build 1 152684850 2I ACTCGGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 13 15 52477 CASAVA_Build 1 152685911 1I TGGTGATGTG -/T TATCTTTCCA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 1 2 52478 CASAVA_Build 1 152699530 1D AGTTACTTTG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 9 8 52479 CASAVA_Build 1 152702256 1D GCATAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 33 1 26 6 T 13 12 52480 CASAVA_Build 1 152708481 1D TTTTTCAGTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 9 8 52481 CASAVA_Build 1 152710130 3D AAAAAAAAAC ACA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 1 ACA 1 0 52482 CASAVA_Build 1 152711231 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 3 A 13 11 52483 CASAVA_Build 1 152722938 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 32 0 29 3 A 11 10 52484 CASAVA_Build 1 152734835 1D AGTACATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 11 10 52485 CASAVA_Build 1 152735853 1D GAATTACATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 41 het 31 1 24 6 A 10 9 52486 CASAVA_Build 1 152737300 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTACCTCAGC 1704 het 446 hom 5 1 4 0 CTC 1 0 52487 CASAVA_Build 1 152744888 1I GATAATACTC -/A ACGGAATTGT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 1 2 52488 CASAVA_Build 1 152746282 2I TGCCTGACAC --/AT GTTTCCTTTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 AT 0 1 52489 CASAVA_Build 1 152751130 1I ACTGTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 536 hom 29 2 20 7 A 12 13 52490 CASAVA_Build 1 152758865 2D TTGGTGCCTC TG/-- TGGAGACACC 3070 hom 67 het 28 0 19 10 TG 2 1 52491 CASAVA_Build 1 152761794 2D TAATTTCAAA CT/-- CTTTCTCTTC 3070 hom 107 het 41 0 36 5 CT 2 1 52492 CASAVA_Build 1 152764498 3D ACATGGGTCA AAG/--- AAGAATTTAT 3070 hom 66 het 26 0 23 5 AAG 2 1 52493 CASAVA_Build 1 152767371 1D TGCCCAGGCT G/- GGAGTGCAGT 3070 hom 37 het 18 0 13 5 G 3 2 52494 CASAVA_Build 1 152767760 3I CTCTACTAAA ---/AAT ACAAAAATTA 3070 hom 34 het 15 0 14 1 AAT 0 1 52495 CASAVA_Build 1 152767874 1I TGAGATTGCA -/C CCACTGCAGG 3070 hom 27 het 13 0 10 4 C 2 3 52496 CASAVA_Build 1 152767916 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 A 9 8 52497 CASAVA_Build 1 152768647 2D TCTGTGTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 34 1 22 11 T 16 14 52498 CASAVA_Build 1 152800839 1I GATTAACTCC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 104 het 39 0 35 4 A 8 9 52499 CASAVA_Build 1 152802258 1D CATGTTTTTT A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 7 6 52500 CASAVA_Build 1 152803242 1I GTGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1308 hom 27 3 22 2 A 11 12 52501 CASAVA_Build 1 152817568 2D TGAAGATGAC AG/-- AGCTAGCCGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 6 AG 2 1 52502 CASAVA_Build 1 152819141 2D GCCGAATCAC TG/-- TGATTTGCTG 3070 het 3070 hom 24 11 10 5 TG 2 1 52503 CASAVA_Build 1 152821576 8I GTGACTCAGA --------/GGGGCATG GGGGCATGGG 3070 hom 75 het 31 0 23 8 GGGGCATG 1 2 52504 CASAVA_Build 1 152823386 2D TTATGTTCAC CT/-- CTTTGCCCTC 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 CT 2 1 52505 CASAVA_Build 1 152829887 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 330 hom 20 1 13 6 A 17 16 52506 CASAVA_Build 1 152830360 1D TTCTTAAGCA G/- AAATCAGAAG 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 G 1 0 52507 CASAVA_Build 1 152835459 2I TCTCCTGTCT --/CA GCCTCCCGAG 3070 het 3070 hom 18 7 9 2 CA 0 1 52508 CASAVA_Build 1 152837799 3I TTTCACTTGT ---/GGA GGAGATGAAG 3070 hom 84 het 34 0 26 8 GGA 1 2 52509 CASAVA_Build 1 152846036 1D AGGAGTGCTT A/- AAAAAAAAAA 1391 het 133 hom 28 3 7 18 A 13 12 52510 CASAVA_Build 1 152846640 1D GTAGGGGGTT C/- CACAAGGGGC 2806 het 2806 ref 33 14 11 8 C 2 1 52511 CASAVA_Build 1 152846823 12D TGGCAAGACT ACACACACACGC/------------ ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 20 18 9 ACACACACACGC 1 0 52512 CASAVA_Build 1 152849379 5I TATTTGTAAT -----/ATCTC TAATAGCCCC 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 ATCTC 0 1 52513 CASAVA_Build 1 152862003 2I TTGCTTTGAT --/CA CAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 50 22 23 5 CA 1 2 52514 CASAVA_Build 1 152862170 2D GCAAAGGACA CT/-- CTGTCCTCAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 CT 2 1 52515 CASAVA_Build 1 152865313 2D CACCTGGGTT TG/-- AGAGATTGTC 2817 het 1956 hom 16 8 7 1 TG 1 0 52516 CASAVA_Build 1 152871657 1I TCTCCCTGTT -/A TTCTATTTCG 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 A 0 1 52517 CASAVA_Build 1 152877560 3I CTTTTTTTTG ---/AGA AGGAGTCTTG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 AGA 0 1 52518 CASAVA_Build 1 152897971 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2672 het 1474 hom 16 4 6 6 T 9 10 52519 CASAVA_Build 1 152899286 4I GTATATTAAG ----/TATT TATTTAATAA 3070 hom 123 het 42 0 42 0 TATT 1 2 52520 CASAVA_Build 1 152964641 1D TTCCTTCCTT C/- CTTCTTTTTT 1502 het 1330 hom 24 7 7 10 C 2 1 52521 CASAVA_Build 1 152974089 1I TAGCAGGTGA -/C CCAGGGGGCT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 C 2 3 52522 CASAVA_Build 1 152984026 1D ACATTAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 785 hom 35 4 20 12 A 16 15 52523 CASAVA_Build 1 152991771 1I CTTATTTATT -/A AAAAAACAAT 3070 hom 123 het 44 0 40 4 A 6 7 52524 CASAVA_Build 1 153000253 1I AAAAAGTAAT -/A AAAAAATCAC 3070 hom 73 het 31 0 25 6 A 6 7 52525 CASAVA_Build 1 153015110 4D GAGTGGGATT GTAA/---- GTAAGAGCTG 3070 het 3070 ref 32 13 15 5 GTAA 2 1 52526 CASAVA_Build 1 153019682 5I TTATTTATAT -----/ATACA ATATGTTTTA 2798 hom 18 het 7 0 7 0 ATACA 0 1 52527 CASAVA_Build 1 153022313 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 11 1 8 2 A 13 12 52528 CASAVA_Build 1 153024060 1D GTGTGTGCTG C/- CCCCAGGCTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 5 4 52529 CASAVA_Build 1 153039989 7I TACAAAAAAT -------/ACAAAGA ACAAAGATTA 3070 hom 66 het 24 0 20 4 ACAAAGA 1 2 52530 CASAVA_Build 1 153040237 1D GAAAGGAGGT G/- GGGGGGAGAG 3070 hom 37 het 20 0 13 7 G 7 6 52531 CASAVA_Build 1 153067329 1I CAGCCCCCAG -/A TAAAATGAGA 3070 hom 94 het 33 0 30 3 A 0 1 52532 CASAVA_Build 1 153078684 11D ACCTGGCTGA CGAAGGTTTGG/----------- CCCAGGCACA 3070 hom 114 het 38 0 37 5 CGAAGGTTTGG 1 0 52533 CASAVA_Build 1 153078863 7D TCTGGGGGCC CTGGCCA/------- CTGGCCACTG 3070 hom 47 het 21 0 14 8 CTGGCCA 2 1 52534 CASAVA_Build 1 153083768 7D ACAATAAGGC TATCGGG/------- TTGGAAGGGC 3070 hom 42 het 16 0 14 2 TATCGGG 1 0 52535 CASAVA_Build 1 153084113 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 9 52536 CASAVA_Build 1 153110976 1I AGGGACAGAG -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 48 27 13 8 C 7 8 52537 CASAVA_Build 1 153115885 3D GGCCACGCAC CAA/--- CAACTCTCAG 3070 het 3070 hom 60 21 26 14 CAA 2 1 52538 CASAVA_Build 1 153129189 1I TCCATCCCCC -/A AGGCTGGAGT 3070 het 2794 hom 24 8 11 5 A 1 2 52539 CASAVA_Build 1 153137369 1D GTTAAGTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 13 12 52540 CASAVA_Build 1 153154973 1D TGGCCAACAT G/- GTGAAACCCC 3070 het 273 hom 11 3 8 0 G 2 1 52541 CASAVA_Build 1 153158094 3D GGCTCATGCC TGT/--- GGTCCCAGCA 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 TGT 1 0 52542 CASAVA_Build 1 153158964 1D TTTATTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1476 hom 25 7 11 7 T 13 12 52543 CASAVA_Build 1 153258869 1I TTTGCCAGAG -/A AAAATCACAT 3070 hom 108 het 42 0 34 8 A 4 5 52544 CASAVA_Build 1 153260667 3I TCTCTAACTT ---/AAC AACCCCCCAA 2240 het 2240 ref 18 10 5 3 AAC 1 2 52545 CASAVA_Build 1 153276152 1D GTGAGCCACC A/- ACGCCCCATC 3070 hom 91 het 35 0 23 13 A 2 1 52546 CASAVA_Build 1 153288518 1I TTGAATTGAA -/T TTTTTTTTTT 2552 het 1939 hom 25 6 10 10 T 15 16 52547 CASAVA_Build 1 153309932 1D GGAAACTGGC T/- TTACTGCTAC 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 3 2 52548 CASAVA_Build 1 153375288 1I GGGGGGGAGA -/G GGGGGCGGGG 1724 hom 31 het 14 0 10 4 G 5 6 52549 CASAVA_Build 1 153396981 4D TTAAACAAGT ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 ATAA 6 5 52550 CASAVA_Build 1 153598490 1D CTTGCTCTGT C/- CCCAGGCTGG 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 C 4 3 52551 CASAVA_Build 1 153620897 1D ATTGGTGTGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 4 hom 58 1 49 8 T 9 8 52552 CASAVA_Build 1 153621482 1I TCTGAATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 426 hom 30 1 26 3 T 9 10 52553 CASAVA_Build 1 153633377 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1174 het 1174 ref 20 14 3 3 A 17 16 52554 CASAVA_Build 1 153652542 5D CTTAGAGAAA ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 ATTTT 4 3 52555 CASAVA_Build 1 153704644 1I ATTATTATTA -/T TTATTTTTTT 3070 het 659 hom 31 2 23 6 T 2 3 52556 CASAVA_Build 1 153741270 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 791 het 791 ref 17 6 4 8 A 17 16 52557 CASAVA_Build 1 153775867 2I TATATATATA --/TG TATATATTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TG 0 1 52558 CASAVA_Build 1 153792337 1D TACAATAACT G/- GAAGATCTGC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 G 2 1 52559 CASAVA_Build 1 153819015 1D CTGGGATTAC A/- AGGTGCCCAC 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 2 1 52560 CASAVA_Build 1 153862447 1I ATCCATCAGG -/A TTATCTGAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 0 1 52561 CASAVA_Build 1 153885040 1D CTCATGCGCC T/- TTTCAGATGC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 4 3 52562 CASAVA_Build 1 153926323 2D GAGACTCCGT CA/-- CACACACACA 3070 hom 54 het 24 0 18 6 CA 10 9 52563 CASAVA_Build 1 153951944 4D CTTAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 2830 hom 31 9 18 5 AG 10 8 52564 CASAVA_Build 1 153955649 1D TCTAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 1576 het 574 hom 31 6 8 17 T 19 18 52565 CASAVA_Build 1 154012965 1D CAGAGAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 48 1 34 14 T 12 11 52566 CASAVA_Build 1 154023513 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTAGTA 1795 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 7 52567 CASAVA_Build 1 154034686 4I TACACATAAC ----/TATT TAATTATCAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TATT 0 1 52568 CASAVA_Build 1 154052203 4D AAATATTACC AACT/---- AACATTCACT 3070 hom 123 het 49 0 42 9 AACT 1 0 52569 CASAVA_Build 1 154055575 6D AAAATTAGCC GGGCAT/------ GGTGGCACGC 1945 het 1945 ref 10 5 4 2 GGGCAT 1 0 52570 CASAVA_Build 1 154073600 4D TCTCTTCCTG TCTT/---- TCTTTCTGCT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TCTT 2 1 52571 CASAVA_Build 1 154074519 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 8 9 52572 CASAVA_Build 1 154094142 1D ACTCTGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 294 hom 28 1 21 7 A 13 12 52573 CASAVA_Build 1 154107307 2D TCCATGTCAC AG/-- GGGCCAGGGA 3070 hom 86 het 34 0 26 8 AG 1 0 52574 CASAVA_Build 1 154110742 1D GGACCAAGCA T/- GGTGGCTCAC 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 T 1 0 52575 CASAVA_Build 1 154124987 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2848 het 2086 hom 21 8 8 6 AAAG 4 3 52576 CASAVA_Build 1 154127725 1I CAACATGGTG -/A AACCCCGTCT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 2 3 52577 CASAVA_Build 1 154136060 1I CTTTGAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 55 18 24 13 A 11 12 52578 CASAVA_Build 1 154147385 1I GAAACCCCCC -/A CATCTTCACC 3070 hom 73 het 27 0 25 2 A 0 1 52579 CASAVA_Build 1 154151558 1I TTTTTGAGAC -/A AGAGTCTCAC 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 A 1 2 52580 CASAVA_Build 1 154156667 2I ATCCTGGCTA --/AC ACAGTGAAAC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AC 1 2 52581 CASAVA_Build 1 154173025 3D GTGTCGTATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 8 8 T 15 12 52582 CASAVA_Build 1 154190543 2I TGCCTAGCTA --/TT TTTTTTTTTT 2950 hom 24 het 17 0 9 8 T 13 15 52583 CASAVA_Build 1 154191003 1D GCGCCCGGCC A/- ATCTACTTCC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 2 1 52584 CASAVA_Build 1 154196898 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAA 3070 het 1834 hom 35 8 16 11 G 0 1 52585 CASAVA_Build 1 154200091 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 2993 het 398 hom 12 1 9 2 T 11 10 52586 CASAVA_Build 1 154204618 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2908 het 144 hom 26 1 13 12 T 17 16 52587 CASAVA_Build 1 154211268 1I CAGAAAGAGA -/G GGGGGGGTAA 1808 het 1808 ref 28 12 9 7 G 7 8 52588 CASAVA_Build 1 154230888 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1997 het 680 hom 12 2 7 3 A 11 12 52589 CASAVA_Build 1 154247935 1D TCTAATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 35 1 23 11 T 12 11 52590 CASAVA_Build 1 154261085 1D CGGGTGCGGT G/- GGCTCATGCC 3070 het 33 hom 19 1 13 5 G 3 2 52591 CASAVA_Build 1 154287336 1I TAGCCATGGT -/C CCCCACCTCT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 C 4 5 52592 CASAVA_Build 1 154295159 2I TAGGCAAAAC --/TG TGGGAGTGAG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 TG 1 2 52593 CASAVA_Build 1 154315638 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2128 hom 25 8 11 6 T 9 10 52594 CASAVA_Build 1 154320749 2D AGGTCGGGGG GT/-- GGTGGGGGCA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 GT 1 0 52595 CASAVA_Build 1 154341819 2I CAGCCATCCC --/CT TACTCTACTT 2798 het 2798 ref 25 15 7 3 CT 0 1 52596 CASAVA_Build 1 154404327 4D TCTTAGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1904 hom 28 8 15 5 TTTG 3 2 52597 CASAVA_Build 1 154419544 1D ATTGCCTGCC T/- TTTTTTTTTT 1657 het 1657 ref 28 14 8 6 T 13 12 52598 CASAVA_Build 1 154425454 15I AGCTTTAAGC ---------------/AGCTGTTTTCAATTA AGCTGTTTCA 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 AGCTGTTTTCAATTA 0 1 52599 CASAVA_Build 1 154453649 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 407 het 4 hom 8 0 3 5 A 12 13 52600 CASAVA_Build 1 154454143 1D TCTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 842 hom 28 6 13 9 A 16 15 52601 CASAVA_Build 1 154458799 1I GAATACATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 10 11 52602 CASAVA_Build 1 154459216 6I ACAGGCGTGA ------/GCCACC GTGTATGGCG 3070 het 2423 hom 22 6 12 4 GCCACC 0 1 52603 CASAVA_Build 1 154465992 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 10 12 T 11 10 52604 CASAVA_Build 1 154466979 2I GGAAGGGCCT --/GA GAGAGTGGAC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 GA 2 3 52605 CASAVA_Build 1 154469116 1D TGATGGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2766 hom 29 8 12 9 T 13 12 52606 CASAVA_Build 1 154470934 1I TTTTTTTCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 8 9 52607 CASAVA_Build 1 154499261 1I ATTGAATAAA -/T TGCCTCTGGG 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 1 2 52608 CASAVA_Build 1 154501660 9D AAAAACTTTG GAAGTAAAA/--------- GACAGCCTAG 2127 het 2127 ref 22 8 8 14 GAAGTAAAA 1 0 52609 CASAVA_Build 1 154506486 2I CCCAATGACC --/TT TTAACACTCA 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 2 4 52610 CASAVA_Build 1 154512143 1I TGAAGTGATC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 9 16 8 T 8 9 52611 CASAVA_Build 1 154512231 1D AATGTGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 10 8 T 15 14 52612 CASAVA_Build 1 154532286 1D ATTTTAAGTG A/- AAAAAAAAAC 1814 het 1814 ref 42 35 4 3 A 10 9 52613 CASAVA_Build 1 154536925 4D TTTGTTTGTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 TTTG 3 2 52614 CASAVA_Build 1 154537983 1D TTGTTTTAGC T/- TTTTTTTTTT 2716 het 2716 ref 29 14 7 8 T 13 12 52615 CASAVA_Build 1 154549072 2I GACCCTATCT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 A 9 11 52616 CASAVA_Build 1 154555531 1I GTGTTTCAGG -/T TTTTTTTTTT 1818 het 1087 hom 16 4 5 7 T 15 16 52617 CASAVA_Build 1 154555695 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1852 het 121 hom 8 1 6 1 T 11 10 52618 CASAVA_Build 1 154559680 4D GAGATCGCGC CATT/---- CATTGCACTC 3070 hom 42 het 16 0 14 2 CATT 2 1 52619 CASAVA_Build 1 154561210 1I GCCCAACTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 6 7 52620 CASAVA_Build 1 154572726 37D AGGATCCACA ACTATTATCAGATTCTCAAAGGGCTGGTGACCCTAAG/------------------------------------- AAATGACCAT 3070 het 3070 hom 23 10 12 11 ACTATTATCAGATTCTCAAAGGGCTGGTGACCCTAAG 1 0 52621 CASAVA_Build 1 154574218 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 50 het 25 0 16 9 A 9 10 52622 CASAVA_Build 1 154574656 2D GAACCTTCTG GA/-- GAGAGAGAAC 3070 het 3070 hom 33 9 15 11 GA 5 4 52623 CASAVA_Build 1 154587521 3D TAATTTACAC AGT/--- GGTGGTATAT 3070 het 3070 ref 42 28 9 6 AGT 1 0 52624 CASAVA_Build 1 154589639 1I TGTGGCCTTG -/A AACTCCTGGG 3070 het 2467 hom 22 7 8 7 A 2 3 52625 CASAVA_Build 1 154595796 9D CAAAAGCACC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTGA 3070 het 2757 hom 26 9 12 7 T 17 8 52626 CASAVA_Build 1 154596508 4D GCCCTCACTC TAAG/---- TGACTGATCA 3070 het 3070 ref 40 18 17 7 TAAG 1 0 52627 CASAVA_Build 1 154599164 1I GGAGTGCAGT -/A GGCACGATCT 2847 het 2455 hom 21 9 7 5 A 0 1 52628 CASAVA_Build 1 154603497 1D AGGCCACTGA G/- GGTCAGAAAG 2258 het 2258 ref 23 13 7 3 G 3 2 52629 CASAVA_Build 1 154606003 1I AATCTCACCC -/T TTTCACTAGT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 3 4 52630 CASAVA_Build 1 154606867 2I CCATCTCGAG --/AA AAAAAAAAAA 2825 hom 39 het 16 0 12 4 A 11 13 52631 CASAVA_Build 1 154610885 1I TGAGAGCAAC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 8 9 52632 CASAVA_Build 1 154611003 1D CAGGATTCCA T/- TTTTTTTTTT 2730 het 411 hom 22 3 10 9 T 17 16 52633 CASAVA_Build 1 154611870 2D CATATGGCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 31 3 12 16 A 16 14 52634 CASAVA_Build 1 154612782 1I ATTTCCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 35 1 24 10 T 15 16 52635 CASAVA_Build 1 154620972 1D TTTCTGGACT C/- CCCCCCCAGA 3070 het 3070 hom 41 18 15 8 C 8 7 52636 CASAVA_Build 1 154621873 1D TTTTTGTTAC A/- GGATATCTTG 3070 het 3070 ref 42 21 12 10 A 1 0 52637 CASAVA_Build 1 154755701 1I GGCTTCTTTC -/T TGACCCTGGA 3070 hom 56 het 21 0 18 3 T 1 2 52638 CASAVA_Build 1 154757214 1D TTAAAGTATG C/- CCTCTAGAAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 3 2 52639 CASAVA_Build 1 154757408 1D GGCAGTTCCT G/- TAAGCTTCTA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 G 1 0 52640 CASAVA_Build 1 154757571 1D TCTCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 30 1 23 7 A 12 11 52641 CASAVA_Build 1 154766469 2D TATATGCACG CA/-- CACACACACA 1245 het 1245 ref 33 22 3 9 CA 6 5 52642 CASAVA_Build 1 154772770 4D GTGTTAAGTG ACAT/---- ACATAAGCCA 3070 hom 75 het 26 0 25 2 ACAT 2 1 52643 CASAVA_Build 1 154804131 1I TCCTCCTGAC -/T TCCTTTAAGA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 2 52644 CASAVA_Build 1 154804806 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 8 7 52645 CASAVA_Build 1 154805316 1I GTACTTCAGG -/A AAAATGACCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 4 5 52646 CASAVA_Build 1 154805644 1D GATTTGCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 34 0 27 7 A 12 11 52647 CASAVA_Build 1 154824563 5D TGTGAGTCAC TTTAT/----- TTTTTTGTTT 3070 hom 48 het 17 0 15 2 TTTAT 1 0 52648 CASAVA_Build 1 154831674 2I ACCACCTAAA --/AC AGTTTCCTCA 3070 hom 122 het 43 0 39 4 AC 0 1 52649 CASAVA_Build 1 154862391 3I GGACCCACGC ---/AGG AGAACCCAGC 3070 hom 78 het 29 0 23 6 AGG 0 1 52650 CASAVA_Build 1 154862993 2I TAGAATGAAC --/AG AGTCTTCAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AG 1 2 52651 CASAVA_Build 1 154870558 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 235 hom 29 2 22 6 A 15 14 52652 CASAVA_Build 1 154873546 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 9 8 52653 CASAVA_Build 1 154873776 1D CTTGAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 16 1 11 4 T 13 12 52654 CASAVA_Build 1 154898191 2I TCCTTCCCAC --/AT GTCTAAACAG 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 AT 0 1 52655 CASAVA_Build 1 154918285 1D GTCAACTGAA C/- TATATAGGAC 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 C 1 0 52656 CASAVA_Build 1 154930007 2D CTCATTCTGC CT/-- CTCTCTGTCT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 CT 4 3 52657 CASAVA_Build 1 154934684 1D TGGGTCTCTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 87 het 36 0 28 9 T 9 8 52658 CASAVA_Build 1 154944294 3D TCACCCAAAA GAT/--- GGTCACCAGG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 GAT 1 0 52659 CASAVA_Build 1 154950953 1D CGCCCAGACT G/- GAGTGCAATG 3070 hom 33 het 13 0 9 4 G 2 1 52660 CASAVA_Build 1 154951506 1D TTTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 10 9 52661 CASAVA_Build 1 154986220 1D CCCACTCCCC A/- AGGGCTTAGT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 A 2 1 52662 CASAVA_Build 1 155008100 1I AGTTTAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1598 hom 37 5 24 8 T 12 13 52663 CASAVA_Build 1 155012885 1I TTTATAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 10 11 52664 CASAVA_Build 1 155015952 3I CATGCCCAGC ---/TAA TTTTTGTATT 2704 hom 18 het 8 0 7 1 TAA 0 1 52665 CASAVA_Build 1 155018856 1D AACACAGATA T/- TTGAGGACTA 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 T 3 2 52666 CASAVA_Build 1 155052387 1D AGATGAGGGA G/- CTGCACCACG 3070 het 3070 ref 46 23 14 9 G 1 0 52667 CASAVA_Build 1 155063607 1I CAAGCAATCC -/T TCCACTTCAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 1 2 52668 CASAVA_Build 1 155071233 1D CCGGGGAGAC G/- GGGGGTTGTA 3070 hom 57 het 25 0 19 7 G 6 5 52669 CASAVA_Build 1 155125784 1I TTAATCATCT -/A AATGTGTCAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 2 3 52670 CASAVA_Build 1 155126197 2I ATGTCATTTC --/CT CTGTGTCCTG 3070 hom 132 het 50 0 43 8 CT 1 2 52671 CASAVA_Build 1 155128135 1I TTGTATGCTC -/T TAAGTAGGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 2 52672 CASAVA_Build 1 155128473 2D TGACGTGTGG GC/-- GCGCGCCTGT 3070 hom 57 het 24 0 20 8 GC 4 3 52673 CASAVA_Build 1 155169199 1I CCCAGGACCA -/T TTTTTTTTTT 1246 het 1246 ref 21 11 5 5 T 11 12 52674 CASAVA_Build 1 155177517 8D CGCCAGACTG CTCGTCTT/-------- CTTCCACAGC 1792 het 1792 ref 26 13 8 7 CTCGTCTT 1 0 52675 CASAVA_Build 1 155183265 10I CAGACCCCTG ----------/CCTATCCCTT CCTTTGCCAA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 CCTATCCCTT 0 1 52676 CASAVA_Build 1 155190797 26D CTGTGTCTCC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------------- AAAAAAAAAA 2733 het 2733 ref 26 11 11 6 A 38 12 52677 CASAVA_Build 1 155191714 1D CTAGTTCTAC T/- TTAATAGTGA 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 T 3 2 52678 CASAVA_Build 1 155196344 5D AAAATAACCC CCCCT/----- CCCCCCCCCC 1513 het 313 hom 10 3 5 2 CCCCT 1 0 52679 CASAVA_Build 1 155204965 1D CTTTCCCACA T/- ACCGATCCTT 3070 het 3070 hom 49 23 22 5 T 1 0 52680 CASAVA_Build 1 155209252 1I AAAAAGTTAA -/C CCCTCTGACT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 3 4 52681 CASAVA_Build 1 155218609 1D TAACTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 1522 het 1522 ref 35 26 4 5 T 12 11 52682 CASAVA_Build 1 155227116 1I ATTACCCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 A 9 10 52683 CASAVA_Build 1 155229020 2D TGTATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 180 hom 40 5 24 11 TG 6 5 52684 CASAVA_Build 1 155229032 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 32 het 36 1 23 13 TA 7 6 52685 CASAVA_Build 1 155231253 22D AACAAATGTA GGTAATACTACCTTTCTCAAAG/---------------------- GGTAATTGCG 3070 het 3070 ref 56 37 20 6 GGTAATACTACCTTTCTCAAAG 1 0 52686 CASAVA_Build 1 155231427 2D TGAGATTATC TT/-- TGACATCTCT 3070 het 3070 ref 44 23 15 8 T 3 1 52687 CASAVA_Build 1 155242901 1I CAAAAGCACC -/G TAATCATAGG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 0 1 52688 CASAVA_Build 1 155246786 1I GAGCCCACAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 46 14 25 7 A 7 8 52689 CASAVA_Build 1 155247014 1I TTGTAGAGAT -/G GGGTCTTGCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 3 4 52690 CASAVA_Build 1 155250118 1I CTACATTTTG -/A AATCTTGACA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 2 3 52691 CASAVA_Build 1 155258078 1D GACTAAATTC A/- AAAGTCTTGC 3070 het 3070 ref 50 23 19 9 A 4 3 52692 CASAVA_Build 1 155260518 1I TAATTGGCAT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 A 7 8 52693 CASAVA_Build 1 155274695 4I CCAAATACTG ----/GAGA GAAAGGAGCA 3070 hom 94 het 37 0 26 11 GA 1 3 52694 CASAVA_Build 1 155288797 6D ACTCCCTTTA TTTCTT/------ TTTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 TTTCTT 3 2 52695 CASAVA_Build 1 155290305 1I GTTTCATTGA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 T 6 7 52696 CASAVA_Build 1 155290441 1D TTGATTTGAG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 T 8 7 52697 CASAVA_Build 1 155293309 1D TATGTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 24 1 11 12 T 17 16 52698 CASAVA_Build 1 155318645 1D GATAGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 11 10 52699 CASAVA_Build 1 155324502 1I TCTAAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 10 11 52700 CASAVA_Build 1 155324878 1D ATTATTGCAG A/- AAAAAATCTT 2479 hom 12 het 5 0 5 0 A 7 6 52701 CASAVA_Build 1 155327042 1D ACAGTGCCAA G/- GTTGAAAAAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 2 1 52702 CASAVA_Build 1 155328438 1D GTCCACTGCA G/- GGGGGGGTGG 3070 het 2388 hom 25 9 11 6 G 8 7 52703 CASAVA_Build 1 155343535 1D AGCAGGAGAC T/- TCACGTTCTC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 2 1 52704 CASAVA_Build 1 155345824 1I TCATTGGTAC -/T TTCCTCATCT 3070 het 3070 hom 56 25 26 5 T 2 3 52705 CASAVA_Build 1 155346213 2D CTTCAAGTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 815 hom 28 6 12 10 T 16 14 52706 CASAVA_Build 1 155354643 1D CAAAGCCGCA G/- GAGGGTAAAA 3070 hom 129 het 46 0 44 3 G 2 1 52707 CASAVA_Build 1 155364685 1D TCTGCAGGAC T/- TTTTTTTTTT 1107 het 1107 ref 39 26 4 10 T 12 11 52708 CASAVA_Build 1 155381856 1D GCTGTCAGTG T/- TAACAGAGCA 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 T 2 1 52709 CASAVA_Build 1 155385283 1I CTTCCCCTGC -/A AATCTAAAGA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 2 3 52710 CASAVA_Build 1 155391663 1D AAACGAGGGG C/- GGGGGAGGGT 1237 het 1237 ref 24 10 3 11 C 1 0 52711 CASAVA_Build 1 155395122 1I GGCCTCCCTG -/C CTACGCCCTG 3070 hom 115 het 42 0 35 7 C 1 2 52712 CASAVA_Build 1 155398786 1I TGGTGTCTTA -/T TGCTACGCAG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 1 2 52713 CASAVA_Build 1 155400497 3I AGGGCGGAAT ---/GGG GGGTTCAGGT 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 G 3 6 52714 CASAVA_Build 1 155400821 11I GGGTCTGGGA -----------/GGCTCATTCAG GGAAAACGTC 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 GGCTCATTCAG 0 1 52715 CASAVA_Build 1 155401673 2D AAAAAATCAG AC/-- ACATGTTCAC 638 het 638 ref 25 8 5 12 AC 2 1 52716 CASAVA_Build 1 155401757 5D TCTCTCTCTC TCTCT/----- TTTTTTTTTC 2917 het 2917 ref 25 13 10 4 TCTCT 1 0 52717 CASAVA_Build 1 155401979 1D TCAAAAACTC A/- AAAACCAGGA 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 A 5 4 52718 CASAVA_Build 1 155404121 1I ACCTGGCCCA -/C CCTAAACTCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 2 3 52719 CASAVA_Build 1 155418568 1D GCTGCAAGAA G/- TAAGACAAAC 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 G 1 0 52720 CASAVA_Build 1 155458765 4D TAAAATTGAA TTAT/---- TTGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 TTAT 1 0 52721 CASAVA_Build 1 155462549 1I AACTCCTTGA -/C CCCCACTAAA 3070 het 3070 ref 56 26 26 4 C 4 5 52722 CASAVA_Build 1 155462829 5I CCAAGACCGA -----/TAATT TAGAGACCCC 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 TAATT 0 1 52723 CASAVA_Build 1 155463309 3I AGTAAAGCAA ---/GTG GGAGGCCCAA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 GTG 0 1 52724 CASAVA_Build 1 155463535 1I TAATTTATAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 T 7 8 52725 CASAVA_Build 1 155465038 1D29M1I AGTGACCTAG TTTATAGGCCTGGAGGAATAAGGAGTAAGA-/-TTATAGACCTGGAGGAAAAAGGAGTAAGAG GGTTGAGGCA 3070 het 3070 ref 35 31 14 4 N/A 0 0 52726 CASAVA_Build 1 155467531 1I TAAAATATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 T 11 12 52727 CASAVA_Build 1 155473797 4I CCACCCATTA ----/TTTG TTTATTTTCT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 TTTG 0 1 52728 CASAVA_Build 1 155539633 1I ATTTATAAAC -/A AAGAAGAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 2 3 52729 CASAVA_Build 1 155541031 1I GGACAAAGAC -/A GGTGGCACCA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 0 1 52730 CASAVA_Build 1 155582114 1I44M1I AGTTGTGTGG -TTTGAGTGAGTTTCTAAATCTTGAGTTCTAATTTGATTGCACTG-/TTTTGAGTGAGTTTCTTAATCTTGAGTTCTAATTTGATTGTACTGT TTTCTGAGAG 3070 hom 72 het 26 0 24 3 N/A 0 0 52731 CASAVA_Build 1 155588075 1D AGCCATTCAA C/- AAGTCTCTAG 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 C 1 0 52732 CASAVA_Build 1 155608030 1I TCTCTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2640 hom 25 het 17 0 9 10 T 10 11 52733 CASAVA_Build 1 155622061 1I GTAATAAAAC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 6 7 52734 CASAVA_Build 1 155629566 1D TCATTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 T 12 11 52735 CASAVA_Build 1 155630042 5D TCTTTTAACT TAAGA/----- TATGAGTAGT 3070 het 3070 ref 34 17 17 4 TAAGA 1 0 52736 CASAVA_Build 1 155642928 1I TATGTTTGCC -/T TTGATCCATT 3070 het 3070 ref 49 28 12 9 T 2 3 52737 CASAVA_Build 1 155648733 4D TCATTTGATC CTTA/---- CTGTCATTAT 3070 het 3070 ref 36 20 12 6 CTTA 1 0 52738 CASAVA_Build 1 155653283 7D2M3I GAACTCCCAG GGTGGGAGT---/-------GTCTC TCTGCCCAGC 3070 het 2803 hom 39 12 15 15 N/A 0 0 52739 CASAVA_Build 1 155674995 4D TTCAGTTGAC TGAA/---- TGAGGCCTCC 3070 het 3070 ref 38 22 13 7 TGAA 1 0 52740 CASAVA_Build 1 155677864 3D ACTCATAATG GCA/--- GCAACTTTCT 3070 het 3070 ref 44 24 11 9 GCA 2 1 52741 CASAVA_Build 1 155680812 5I TTTAATCTTT -----/TAATC TAGACAAAAA 3070 het 3070 ref 38 24 10 4 TAATC 0 1 52742 CASAVA_Build 1 155681112 1I TTGTACAGTT -/A AAGAGTCATA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 A 2 3 52743 CASAVA_Build 1 155681450 2I TTAAAAGGAT --/AC AGTTTTTATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AC 0 1 52744 CASAVA_Build 1 155681625 3D AACTGTGATA GTT/--- GTTATTTAAT 3070 het 3070 ref 30 21 7 3 GTT 2 1 52745 CASAVA_Build 1 155683549 3D TTTGAATAGT CTC/--- CTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 CTC 1 0 52746 CASAVA_Build 1 155683597 4D TTCTTAAGCC AATT/---- AATTAGAGTT 3070 het 3070 hom 40 11 23 7 AATT 2 1 52747 CASAVA_Build 1 155683805 1I CTGCATATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 10 11 52748 CASAVA_Build 1 155683924 4D TTTTTTTCCC CAAA/---- CAAAGACATT 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 CAAA 2 1 52749 CASAVA_Build 1 155684808 1D GAGAAGATCT G/- AAAATTATCC 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 G 1 0 52750 CASAVA_Build 1 155686427 1I TGAAAGGTAT -/G GGGGGGTCTA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 6 7 52751 CASAVA_Build 1 155687221 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 195 hom 25 1 22 2 T 10 9 52752 CASAVA_Build 1 155694154 1I CGTGGTTTTG -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 7 8 52753 CASAVA_Build 1 155700654 9D GTATGTAATA TATGTAATC/--------- ACCTCACTCA 808 het 808 ref 54 50 2 7 TATGTAATC 1 0 52754 CASAVA_Build 1 155704927 1I GCCAGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 27 1 20 6 T 13 14 52755 CASAVA_Build 1 155706865 4I CCCAGGACAG ----/CCTC CCTCCCCACT 3070 het 3070 hom 54 17 21 16 CCTC 1 2 52756 CASAVA_Build 1 155729491 4D CCTAGAAGTG GAAC/---- GAACTGCTGG 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 GAAC 2 1 52757 CASAVA_Build 1 155740307 1I AGGCTACCAA -/C CAGCAAGGGA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 C 1 2 52758 CASAVA_Build 1 155741183 1D GGAGAGGGCT C/- CCCGGAAAAA 3070 hom 83 het 40 0 26 14 C 4 3 52759 CASAVA_Build 1 155797052 1D AATTCTTCAA T/- TTTTTTTTTT 2578 het 328 hom 20 5 7 8 T 15 14 52760 CASAVA_Build 1 155798050 1D CATCTCTGCC A/- TGTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 55 35 13 8 A 1 0 52761 CASAVA_Build 1 155809133 2I GCCTCTGATG --/GA GAGTCAGCTC 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 GA 1 2 52762 CASAVA_Build 1 155817523 5D CAGAAGGATA AAATT/----- AGCCAGCTCT 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 AAATT 1 0 52763 CASAVA_Build 1 155821322 1D AGAAAACTTT A/- AAAAAGTATC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 6 5 52764 CASAVA_Build 1 155836812 3D4M1D AGTCACTGAC AGAAATAT/---AATA- TTTAGTTATT 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 N/A 0 0 52765 CASAVA_Build 1 155837362 1D CTTTTTTCAG T/- TTTTCCATTG 2717 het 2717 ref 42 29 6 8 T 5 4 52766 CASAVA_Build 1 155838639 3D AAAATATAAT CTC/--- CTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 CTC 1 0 52767 CASAVA_Build 1 155839372 1D AATTTATAAC T/- TTTTTTTTTT 2696 het 2696 ref 20 10 7 3 T 12 11 52768 CASAVA_Build 1 155862238 1I TGGCTCTTCT -/G TCACCTTTGT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 0 1 52769 CASAVA_Build 1 155862920 1D ATCTGCAATC T/- TTGGTTTGGA 3070 het 3070 hom 33 8 20 5 T 3 2 52770 CASAVA_Build 1 155864813 2D CTGATTTCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 13 11 52771 CASAVA_Build 1 155870770 1D CTTTGTTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 10 9 52772 CASAVA_Build 1 155872161 1I TCAATAAAAG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 T 7 8 52773 CASAVA_Build 1 155883740 5I ATAATTAAAA -----/AATAT AATTATAATT 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 AATAT 0 1 52774 CASAVA_Build 1 155885079 1D TTTTGATGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 10 9 52775 CASAVA_Build 1 155888260 1D GAAGTCTGGC T/- TTTTGGCTAA 3070 het 3070 hom 52 16 25 11 T 5 4 52776 CASAVA_Build 1 155889286 1D GAAGATTTAT A/- ACATGGAATT 3070 het 3070 ref 42 18 19 6 A 2 1 52777 CASAVA_Build 1 155892875 1D TGCATGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 T 11 10 52778 CASAVA_Build 1 155893973 3D AGACAAACAA TAT/--- TATTAGACAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 TAT 2 1 52779 CASAVA_Build 1 155894803 1D AACTACTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 19 14 10 A 10 9 52780 CASAVA_Build 1 155911747 3D AGGTCTTCAG AGA/--- AGCCCCTCTC 1765 het 1765 ref 27 20 4 5 AGA 1 0 52781 CASAVA_Build 1 155919554 1D ATTGAAATTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 50 23 23 5 A 9 8 52782 CASAVA_Build 1 155922678 1D GCGAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 11 10 52783 CASAVA_Build 1 155935917 1D ATGTAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 1392 het 1392 ref 32 19 5 8 A 15 14 52784 CASAVA_Build 1 155945990 1I CCCAAACCCA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 7 8 52785 CASAVA_Build 1 155973440 1D GGCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 1590 het 1590 ref 29 18 4 7 T 10 9 52786 CASAVA_Build 1 155978647 1D GGTTACCCCA T/- TTTTTTGATA 3070 het 3070 hom 31 10 10 11 T 7 6 52787 CASAVA_Build 1 156006811 2D CCCACAGAAG TC/-- AGGGTTTTAC 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 TC 1 0 52788 CASAVA_Build 1 156021183 1I CCCCTCACAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 8 9 52789 CASAVA_Build 1 156041272 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1604 het 1604 ref 32 15 5 12 T 13 12 52790 CASAVA_Build 1 156045314 1I GACTCTTAGA -/T TTTTTGGCCA 3070 het 3070 ref 54 24 21 9 T 5 6 52791 CASAVA_Build 1 156053678 1D ACCTGACTTC A/- AAAACTCTAA 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 A 5 4 52792 CASAVA_Build 1 156055712 1I TTGTGCATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 10 52793 CASAVA_Build 1 156066771 2D AGAAATTCAT TC/-- TCTCTTCAGT 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 TC 3 2 52794 CASAVA_Build 1 156073791 4D TTGTTTGTTT GTTA/---- GTTAGTGAAC 3070 hom 100 het 41 0 33 12 GTTA 2 1 52795 CASAVA_Build 1 156076133 1I CTGCCTGAAG -/T AAAAGTGTGG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 0 1 52796 CASAVA_Build 1 156085545 1I TTTTTCTGTA -/T TTTTTTTTTT 2461 het 2461 ref 34 13 8 13 T 14 15 52797 CASAVA_Build 1 156088562 1D CTTTATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 43 2 33 8 T 11 10 52798 CASAVA_Build 1 156105531 2I TTATTGCTAC --/AA AGAGTCTGCT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 1 3 52799 CASAVA_Build 1 156109257 2I TCATTGGGAG --/GA ATAACATTAG 3070 het 3070 ref 44 17 14 13 GA 0 1 52800 CASAVA_Build 1 156112398 1I TGCTAAAATT -/G TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 G 0 1 52801 CASAVA_Build 1 156114941 6D GCATATGACC TCTAAT/------ TGTGGTTCCA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TCTAAT 1 0 52802 CASAVA_Build 1 156123767 1I ATCATAACAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 8 9 52803 CASAVA_Build 1 156164669 5D AAAGTGTGTG TATAA/----- TATATGTTTT 3070 het 2109 hom 23 6 15 2 TATAA 1 0 52804 CASAVA_Build 1 156172355 1I GAGCAGATTT -/A AAAAAAAAAA 2152 hom 18 het 13 0 7 6 A 13 14 52805 CASAVA_Build 1 156173404 1D GGAAAATGCC T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 59 18 32 10 T 8 7 52806 CASAVA_Build 1 156181003 1I11M1D TTATGTCACA -TTTTTTTCTTCT/TTTTTTTTCTTC- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 43 21 23 4 N/A 0 0 52807 CASAVA_Build 1 156184201 2I AAGATGTATC --/AG GGGCTTGTGA 3070 het 3070 ref 57 26 27 4 AG 0 1 52808 CASAVA_Build 1 156185000 1D CCTGCCAGAA G/- CACCATACAG 3070 het 3070 ref 49 29 17 3 G 1 0 52809 CASAVA_Build 1 156185870 1D TTCTGTTGAA T/- TTTTTTTTTT 2186 het 570 hom 29 6 8 15 T 17 16 52810 CASAVA_Build 1 156191246 4D TGCACCATAA TAAG/---- TATCTCCTGA 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 TAAG 1 0 52811 CASAVA_Build 1 156191793 1D GCCTAACTCA G/- TGAACAGGAA 3070 het 3070 hom 43 17 24 3 G 1 0 52812 CASAVA_Build 1 156193900 11D TCAACCACCA AGCAAAGAGAG/----------- AGCTACAGAG 3070 het 3070 ref 50 21 22 12 AGCAAAGAGAG 1 0 52813 CASAVA_Build 1 156198083 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 27 1 19 7 A 13 14 52814 CASAVA_Build 1 156240216 2D TCTGACTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 12 11 A 14 12 52815 CASAVA_Build 1 156252718 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 6 A 12 11 52816 CASAVA_Build 1 156254176 1I TATTTTTCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 8 9 52817 CASAVA_Build 1 156254304 1D AGGGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 154 hom 36 1 25 10 A 11 10 52818 CASAVA_Build 1 156265011 1D AAGCCCAGGA G/- GCATTTTCCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 2 1 52819 CASAVA_Build 1 156265626 1I GGTAAGCGCA -/T TTCAGGCATA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 2 3 52820 CASAVA_Build 1 156271450 3D ATTTTTGCCA TTG/--- TTCTGTTTTT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TTG 1 0 52821 CASAVA_Build 1 156279502 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2071 het 137 hom 18 1 11 7 A 17 16 52822 CASAVA_Build 1 156299795 1D TGAGTGGAAT A/- AGACCCCCAT 3070 het 3070 ref 61 34 20 7 A 2 1 52823 CASAVA_Build 1 156302227 1D GATTTCTGCC T/- GTGAGACCCC 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 1 0 52824 CASAVA_Build 1 156305330 1D CGGTGCGAAT C/- AGAGGCTTCC 2316 het 2316 ref 23 14 7 3 C 1 0 52825 CASAVA_Build 1 156309291 4D ATCAGTTAGC AGGA/---- AGGAAGGGGA 3070 hom 61 het 26 0 19 8 AGGA 2 1 52826 CASAVA_Build 1 156333685 1D CAGAAACCAT G/- GGGGAATCCA 3070 het 3070 ref 39 17 16 7 G 5 4 52827 CASAVA_Build 1 156360018 1D AAAACCCCAT C/- TGTACTAAAA 3070 het 2207 hom 18 6 9 4 C 1 0 52828 CASAVA_Build 1 156363669 5I GGAGGGTGAG -----/AGAGA AGAGGAGAGA 3070 het 2823 hom 27 8 19 0 AGAGA 0 1 52829 CASAVA_Build 1 156364958 1I ACCTTTTGGA -/T TTTAAAATAA 3070 hom 82 het 30 0 27 3 T 3 4 52830 CASAVA_Build 1 156365720 1I TTTATTTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 1863 hom 17 5 10 2 A 0 1 52831 CASAVA_Build 1 156366245 1I CATCTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 27 15 11 T 10 11 52832 CASAVA_Build 1 156366740 1D CTTTGCTAAC A/- GGGGTGGTGG 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 1 0 52833 CASAVA_Build 1 156370771 1I TTATCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2839 het 1952 hom 25 8 12 5 T 13 14 52834 CASAVA_Build 1 156399036 1D CATAAAGTGG A/- AAAAAAAAAC 1047 het 1047 ref 46 34 3 9 A 10 9 52835 CASAVA_Build 1 156402972 3D TAGGGCACAT TTC/--- TTCTTTGGTT 3070 het 3070 ref 45 29 15 2 TTC 2 1 52836 CASAVA_Build 1 156404496 1I TAATAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 9 10 52837 CASAVA_Build 1 156423799 1D CCTGCTCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 242 hom 32 3 20 9 T 14 13 52838 CASAVA_Build 1 156424979 3D TTCTGGAGAT AGG/--- CTCTTGCTCT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AGG 1 0 52839 CASAVA_Build 1 156425407 2D GCAGAAAGTG AT/-- ATGTTTATTT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AT 2 1 52840 CASAVA_Build 1 156429733 2I AGGTCCCCCG --/AT ATAGTTATCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AT 1 2 52841 CASAVA_Build 1 156429946 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 40 het 21 0 11 10 T 8 9 52842 CASAVA_Build 1 156437553 4D ACTTTATAAT AATA/---- AATAAATTAA 3070 hom 60 het 21 0 21 4 AATA 2 1 52843 CASAVA_Build 1 156438957 4D TTATCACAGA AAAG/---- AAAGATTGTC 3070 hom 51 het 18 0 18 1 AAAG 2 1 52844 CASAVA_Build 1 156439849 1I CACCAATTAG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 8 9 52845 CASAVA_Build 1 156440384 1D TGAAACCGTT A/- AAGAGCTGTA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 A 3 2 52846 CASAVA_Build 1 156441972 1D GGTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 31 1 23 9 T 11 10 52847 CASAVA_Build 1 156442467 1I CGGTCCTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 9 10 52848 CASAVA_Build 1 156442695 2I ATTGCTCCTC --/TT TTTTTTTTGG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 8 10 52849 CASAVA_Build 1 156445610 1D AGTTCATCAT G/- GCTGTAAGCA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 G 2 1 52850 CASAVA_Build 1 156447930 2D ACCATTTGTC TG/-- TGTCATTTGT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TG 2 1 52851 CASAVA_Build 1 156451740 1I TTTCCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 A 9 10 52852 CASAVA_Build 1 156457789 4D TCTTTTTGTT TGTC/---- TGTGCCCTGC 2778 hom 18 het 7 0 7 0 TGTC 1 0 52853 CASAVA_Build 1 156458465 1D TGGTGTCAAA C/- CCTGTCTTAT 3070 hom 117 het 48 0 39 9 C 3 2 52854 CASAVA_Build 1 156458585 2I TTTTATACAC --/TT AATAATAACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 2 52855 CASAVA_Build 1 156461308 1D GAATTATGTA T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 7 6 52856 CASAVA_Build 1 156461380 1D CTCATATTTA G/- ATTCCCATAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 1 0 52857 CASAVA_Build 1 156462127 4D AAGCTGCTCA TATT/---- TAATGTGTAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TATT 1 0 52858 CASAVA_Build 1 156462449 1I TTAATGTGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 8 52859 CASAVA_Build 1 156463246 3I TTTACTGGAA ---/AAC AACATGGGGC 3070 hom 72 het 30 0 24 7 AAC 1 2 52860 CASAVA_Build 1 156558912 3D AATCCTTGGG TTT/--- TTTAGTCAAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 6 3 52861 CASAVA_Build 1 156611369 1D ACAAGTTAAC A/- AAAAAAAAAA 2818 het 2818 ref 37 23 6 8 A 12 11 52862 CASAVA_Build 1 156621778 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 14 4 T 10 11 52863 CASAVA_Build 1 156642737 1I TAAAACACTA -/G TAACTTACTT 3070 het 3070 ref 53 24 22 7 G 0 1 52864 CASAVA_Build 1 156644676 1I TGTCTTCTAT -/A TTTATACCCT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 A 0 1 52865 CASAVA_Build 1 156646606 1I ATGAGGCCAG -/A AAAACCTTGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 7 A 4 5 52866 CASAVA_Build 1 156702979 1D GTTTTATACA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 T 8 7 52867 CASAVA_Build 1 156705599 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAACAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 8 7 52868 CASAVA_Build 1 156706113 1D TAATTGTGTA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 9 8 52869 CASAVA_Build 1 156707143 5I TTCCACTGGC -----/TAAAA TAAAAGTTCC 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 TAAAA 1 2 52870 CASAVA_Build 1 156724211 1D GAAAAAAAAA T/- TAGATATAAC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 2 1 52871 CASAVA_Build 1 156730042 1D TTTATCTCCC T/- TTTCCAGTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 4 3 52872 CASAVA_Build 1 156731821 3D GGAACCATGA AAG/--- AAGAAGAGTA 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 AAG 3 2 52873 CASAVA_Build 1 156732756 1D ATCAGTTGGC G/- GGCAACAAGT 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 G 3 2 52874 CASAVA_Build 1 156737139 2D ACTCACTATC AT/-- AAAAATAGAC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AT 1 0 52875 CASAVA_Build 1 156752065 1D GAAAGCAAGC A/- AAAAGCCATC 3070 het 3070 ref 62 26 23 13 A 5 4 52876 CASAVA_Build 1 156757029 1I GGCTTGATGA -/C CTACGGTAAA 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 C 1 2 52877 CASAVA_Build 1 156759448 1I GTTAATAGTT -/A AAAAAAGCCA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 6 7 52878 CASAVA_Build 1 156762424 1D TAATTTTTTT C/- TTAGTTTCAC 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 C 1 0 52879 CASAVA_Build 1 156764363 1I AACCAGGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 A 12 13 52880 CASAVA_Build 1 156768530 2D CTAGGATTTT TA/-- TAGTTTGAGG 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 TA 2 1 52881 CASAVA_Build 1 156768919 1I ATTAGAGTAG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 6 7 52882 CASAVA_Build 1 156771154 2I GCTCAAGGAG --/AA AGACACTCCT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 A 1 3 52883 CASAVA_Build 1 156773847 1D CAGGGTTATG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 A 8 7 52884 CASAVA_Build 1 156775900 1D GTCTATATGC G/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 G 1 0 52885 CASAVA_Build 1 156776655 1I AATCTTCAAG -/T TATTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 T 1 2 52886 CASAVA_Build 1 156777772 4I TATATATCTC ----/TCTT TCCTCCTCTT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 TCTT 0 1 52887 CASAVA_Build 1 156786250 1D TTTAAAAAAA T/- ATCTTTGAGT 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 T 1 0 52888 CASAVA_Build 1 156786633 4I8M3I TTCTCCATTC ----CTTTGCAA---/TTGTCATTGTCATTC TAGATATTGT 3070 het 3070 ref 44 22 17 9 N/A 0 0 52889 CASAVA_Build 1 156786735 1I TAAATAAAGT -/G GGGGATATTT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 G 4 5 52890 CASAVA_Build 1 156787536 1D TGGGTGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 10 24 7 T 11 10 52891 CASAVA_Build 1 156791425 1I GTATTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 11 13 T 13 14 52892 CASAVA_Build 1 156811214 7I CTTTCTTTGC -------/ATAGTTT ATAGTTTATA 3070 het 3068 hom 26 8 13 5 ATAGTTT 1 2 52893 CASAVA_Build 1 156813985 2I CAGAAATTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 10 12 52894 CASAVA_Build 1 156819129 4D CTCCAAAGCC AATT/---- AATTCACTGT 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 AATT 2 1 52895 CASAVA_Build 1 156821234 1D GTAAGCTCCC T/- AGGATTTATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 T 1 0 52896 CASAVA_Build 1 156822379 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 496 het 496 ref 26 16 4 6 TA 6 7 52897 CASAVA_Build 1 156839677 1I CAAAAATGTA -/T TGTACTAGGG 3070 het 3070 ref 53 24 17 12 T 1 2 52898 CASAVA_Build 1 156841411 2D AAAATTAGTG TT/-- TAATACTTAG 3070 het 3070 ref 41 26 14 1 T 3 1 52899 CASAVA_Build 1 156844840 1D17M1I TTATTTAACA TTTTTTTCAGCTTCCGAG-/-TTTTTTCAGCTTCCGAGT TCTTATCTTT 3070 het 3070 hom 36 17 23 4 N/A 0 0 52900 CASAVA_Build 1 156848972 2I ATTAATGAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 A 10 12 52901 CASAVA_Build 1 156853459 1D GAATAATAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 A 10 9 52902 CASAVA_Build 1 156860530 1D5M2D ACACCTACAT ACTGCAGG/-GTCCA-- GGTAGAAGTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 N/A 0 0 52903 CASAVA_Build 1 156891993 1I AGAGCCTGGT -/G GAAGGCACAG 3070 het 3070 ref 56 31 19 6 G 1 2 52904 CASAVA_Build 1 156901849 1I GTGTATTTTT -/A AAAGGCAGAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 3 4 52905 CASAVA_Build 1 156903578 1D GATGGTATCC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 A 9 8 52906 CASAVA_Build 1 156909638 1D TTGTTAAAAT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 8 52907 CASAVA_Build 1 156920203 1D55M1D GAATAACTGA TTTTTTTTTGGAAGTAGAGCACAATGAGAAAGATGATAGTTATAATAATGGTTTTTA/-TTTTTTTTGGAAGTAGAGCACAATGAGAAAGATGATAGTTATAATAATGGTTTTT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 23 N/A 0 0 52908 CASAVA_Build 1 156920506 3D GCAATTTAGG GAA/--- GAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 32 3 14 16 GAA 2 1 52909 CASAVA_Build 1 156922771 6D AAAAAATAGT TAAAAG/------ TAAAATTATC 3070 het 3070 ref 29 15 12 5 TAAAAG 1 0 52910 CASAVA_Build 1 156923057 1I TATGTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 A 11 12 52911 CASAVA_Build 1 156925525 2D AAACTCCTGG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 11 9 52912 CASAVA_Build 1 156926803 1I27M1I ACCACATTAG -AAAAAAAAGTGTATAAGAATCATAGTG-/AAAAAAAAAGTGTATAAGAATCATAGTGT TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 35 0 24 13 N/A 0 0 52913 CASAVA_Build 1 156927606 3D AGGACTCAGG AAA/--- AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 11 8 52914 CASAVA_Build 1 156928300 1I ACCTGAAGTG -/A AAAAAAAAAA 2314 het 2314 ref 24 11 7 6 A 11 12 52915 CASAVA_Build 1 156929671 3D CTAAATTTTC AGA/--- AGCTTTACAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 AGA 1 0 52916 CASAVA_Build 1 156935642 2I AATGAGTAAC --/TT AATTAAATTG 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 0 2 52917 CASAVA_Build 1 156940773 4D GTGCACACAT AGAG/---- AGAGATGATG 3070 het 3070 hom 32 10 16 7 AG 4 2 52918 CASAVA_Build 1 156986159 4I GTCAACTGTT ----/ACTC ACATATAATA 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 ACTC 0 1 52919 CASAVA_Build 1 156997102 3D TTAATTCAGA GTC/--- GTCCCTGACT 3070 het 3070 hom 23 9 14 1 GTC 2 1 52920 CASAVA_Build 1 157007086 1D TAAATATCAC A/- AAAAGGAAGG 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 A 5 4 52921 CASAVA_Build 1 157009590 1D TTCTGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 24 0 20 4 T 11 10 52922 CASAVA_Build 1 157044243 1D CCACTTGTTC T/- TGCATCCCTG 3070 het 3070 ref 45 24 18 4 T 2 1 52923 CASAVA_Build 1 157078138 24D GTCATAGTGG ATGACCAGGAAGAATCAGGGAAGA/------------------------ ATCAGGGAAG 3070 hom 90 het 31 0 30 4 ATGACCAGGAAGAATCAGGGAAGA 1 0 52924 CASAVA_Build 1 157131852 1D AAAAACTGTT A/- AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 27 11 7 9 A 17 16 52925 CASAVA_Build 1 157144151 1I TTGAAAAGAT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 7 8 52926 CASAVA_Build 1 157145415 1D AGACACAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 9 8 52927 CASAVA_Build 1 157146002 1I AAGAACCTTC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 6 7 52928 CASAVA_Build 1 157149871 1D AATTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 27 0 23 4 A 11 10 52929 CASAVA_Build 1 157153405 4I GTGGTCAAAA ----/AGAT AGACTTCCTC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AGAT 0 1 52930 CASAVA_Build 1 157154656 1I TTTTTTATTT -/A AAAAAAAAGA 650 het 650 ref 25 15 5 5 A 8 9 52931 CASAVA_Build 1 157188795 1D TATAAGCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 29 0 20 10 A 12 11 52932 CASAVA_Build 1 157195186 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAATA 1583 het 338 hom 8 1 7 0 A 8 9 52933 CASAVA_Build 1 157206275 1I AAACTCCCTT -/A AATACAATAA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 2 3 52934 CASAVA_Build 1 157207134 4I GTGAATAGAG ----/CAAA CAAACACACA 3070 hom 99 het 44 0 38 6 CAAA 1 2 52935 CASAVA_Build 1 157211650 2D CCAATAATAC TG/-- TGTTTGTATT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TG 2 1 52936 CASAVA_Build 1 157213455 1I AAAAATAAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 8 9 52937 CASAVA_Build 1 157214689 14D GTGTCTATAC ATATATATATATAT/-------------- ATATATATAT 3070 hom 72 het 30 0 25 8 AT 13 6 52938 CASAVA_Build 1 157220368 1I TCTTTGAGAG -/T TTTTTGTATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 5 6 52939 CASAVA_Build 1 157226297 1I ATTTCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 A 10 11 52940 CASAVA_Build 1 157247797 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2828 hom 24 het 9 0 8 1 A 15 14 52941 CASAVA_Build 1 157248082 3I AACTTTTATC ---/ATT ATGTGGTATC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATT 0 1 52942 CASAVA_Build 1 157248526 1I ATTTTATTCA -/T TGTTTTCCTA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 T 1 2 52943 CASAVA_Build 1 157250884 3D AATGGGAATA ATT/--- TCTTAGACAT 3070 hom 116 het 43 0 40 3 ATT 1 0 52944 CASAVA_Build 1 157254020 3D TATTTATTTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 36 het 19 0 13 6 TTG 7 6 52945 CASAVA_Build 1 157262609 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2762 hom 19 8 7 4 T 9 10 52946 CASAVA_Build 1 157264519 2D ATGTGACCCT AG/-- ATTATCTATT 3070 hom 87 het 35 0 27 8 AG 1 0 52947 CASAVA_Build 1 157267291 2I GGTGGTGGGT --/GG GGGGGGGCCA 2514 hom 19 het 10 0 7 3 G 7 9 52948 CASAVA_Build 1 157269202 6D CTCTGTGAAT GGATTG/------ GTACAATCTT 3070 hom 126 het 46 0 43 6 GGATTG 1 0 52949 CASAVA_Build 1 157272056 1I CCTAGTGACT -/C CGCAGGTGAG 3070 hom 117 het 46 0 39 7 C 1 2 52950 CASAVA_Build 1 157272170 1D TTATCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 7 T 11 10 52951 CASAVA_Build 1 157278738 2I AAAATAAACA --/AC ACAAAATGAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AC 1 2 52952 CASAVA_Build 1 157279237 1I TCAACACTTA -/T CCCAGCTTGC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 0 1 52953 CASAVA_Build 1 157280049 2D TCTTTCTGAC TT/-- TTTAATTCAA 2854 het 2854 ref 37 28 6 3 T 5 3 52954 CASAVA_Build 1 157283427 4I TGCCCTGATA ----/TCAC CCTCTGTATG 2413 het 2413 ref 49 40 6 7 TCAC 0 1 52955 CASAVA_Build 1 157284208 2I TCTTTCTGAC --/TT TTTAATTCAA 1230 het 1230 ref 24 16 3 5 T 3 5 52956 CASAVA_Build 1 157287525 2D CTTTAACCTC CT/-- CTCTCCACAG 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 CT 3 2 52957 CASAVA_Build 1 157293696 1I AGTTTGGGAC -/A AAAATGTGTC 3070 het 3070 ref 62 36 22 4 A 4 5 52958 CASAVA_Build 1 157306601 3D3M1D TTAGTTACCT GTCTCAG/---TCA- TTAATTTGCC 3070 hom 138 het 50 0 47 4 N/A 0 0 52959 CASAVA_Build 1 157323988 1D GGATAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1509 het 195 hom 21 3 7 11 T 17 16 52960 CASAVA_Build 1 157335421 1D GGTTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 930 hom 50 2 32 17 T 14 13 52961 CASAVA_Build 1 157336270 3D TCAAATAATT CCC/--- CCAACTGGGT 3070 hom 102 het 36 0 35 2 C 5 2 52962 CASAVA_Build 1 157339796 1I CAATTCCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1287 hom 34 3 23 8 T 10 11 52963 CASAVA_Build 1 157355265 1D GGTGTTTGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 9 8 52964 CASAVA_Build 1 157400025 1D CCTGGATAAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 A 8 7 52965 CASAVA_Build 1 157416994 1D AAAATACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2490 hom 28 8 13 7 T 13 12 52966 CASAVA_Build 1 157417450 1D ATTTTTCATC T/- CCAGAGAATA 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 1 0 52967 CASAVA_Build 1 157441629 1D TCTTGGTGCC T/- TTTCCTTCTG 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 T 4 3 52968 CASAVA_Build 1 157457469 1I AAGAGGACAA -/G TCTAACCCCT 3070 hom 126 het 44 0 42 2 G 0 1 52969 CASAVA_Build 1 157459108 1D TGCTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 468 hom 28 1 14 13 T 11 10 52970 CASAVA_Build 1 157467000 1D ACTTAAAAAC A/- AAACTATCAA 3070 het 3070 hom 47 23 22 4 A 4 3 52971 CASAVA_Build 1 157468364 2D TTCTGTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 10 13 T 13 11 52972 CASAVA_Build 1 157470653 1I TTAAGTACTT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 7 8 52973 CASAVA_Build 1 157478120 6D AATATTCCAC TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 54 21 19 16 TG 12 9 52974 CASAVA_Build 1 157485731 1D GAGCGGTCAG A/- AAAAATTCAT 3070 het 3070 ref 45 22 12 12 A 6 5 52975 CASAVA_Build 1 157486354 4D AGCAAGAATC AGAA/---- AGAAAGTCAG 3070 het 3070 ref 43 20 20 5 AGAA 2 1 52976 CASAVA_Build 1 157489640 2I CAATAAAGCA --/AT ATACAGGAGC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 AT 1 2 52977 CASAVA_Build 1 157497675 4I GAACTCCTAC ----/AACT AACTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 23 8 8 AACT 1 2 52978 CASAVA_Build 1 157512665 1D TATTTTATCT G/- GATAAAATCT 3070 het 3070 hom 52 18 29 7 G 2 1 52979 CASAVA_Build 1 157516589 2D TGCATGACAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 97 het 42 0 29 13 TG 7 6 52980 CASAVA_Build 1 157520104 2D CTCTAATATC AA/-- AGAGAGCCTC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 3 1 52981 CASAVA_Build 1 157527287 3I GATGAACTCC ---/CTT CTTCTGCATT 3070 hom 110 het 39 0 36 3 CTT 1 2 52982 CASAVA_Build 1 157539858 1D CTGTATATAC T/- TACAATTAAA 3070 het 3070 hom 41 15 24 3 T 2 1 52983 CASAVA_Build 1 157549616 1D CTCCCAGGTT C/- ACGAGATTCT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 C 1 0 52984 CASAVA_Build 1 157556521 1I TTTTCTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 11 10 T 13 14 52985 CASAVA_Build 1 157557247 1I AATTGTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3023 hom 36 11 10 15 T 14 15 52986 CASAVA_Build 1 157583691 1D CCTGCCAACC A/- AAAAAAGTCC 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 7 6 52987 CASAVA_Build 1 157595871 1D TCTGTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 348 hom 44 1 35 10 A 11 10 52988 CASAVA_Build 1 157597170 10D AAATGAAAAA TACATAAGTG/---------- TAGCTCTTGA 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 TACATAAGTG 1 0 52989 CASAVA_Build 1 157606887 3I TTTTTTCTTC ---/TTT TTTTTTTTGT 2647 het 2647 ref 20 10 9 1 T 8 11 52990 CASAVA_Build 1 157623114 1D TAAGAAACCA T/- TTTTCTGGGG 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 5 4 52991 CASAVA_Build 1 157652337 1I TTATTCCTAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 8 9 52992 CASAVA_Build 1 157669209 1I TATCAAGGAG -/T TTATTACTTT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 2 3 52993 CASAVA_Build 1 157673084 1I TAGCGGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 20 14 15 A 14 15 52994 CASAVA_Build 1 157674103 4I GTACCTGATA ----/CCTG CCTGCATCCT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 CCTG 1 2 52995 CASAVA_Build 1 157687956 4D AGGGAAAGAA AAAC/---- AAAGCAAGCA 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 AAAC 1 0 52996 CASAVA_Build 1 157699894 1D GTCAGCATTT A/- AAAAAAAAAA 1227 het 1227 ref 33 19 3 11 A 12 11 52997 CASAVA_Build 1 157722588 1D AAATATCTAC T/- CTATGAGGGG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 1 0 52998 CASAVA_Build 1 157726679 1I TATTACATAG -/T TTAGTCTTAG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 2 3 52999 CASAVA_Build 1 157727733 1D TCCACCTCCC G/- GATTCAAGCG 3070 het 2670 hom 17 7 8 2 G 2 1 53000 CASAVA_Build 1 157729832 27D2M16D AAGCCACTTC CCTAAAATGACCTGATAGATTAGGCTTTTGTCACCCAAGTGCCAA/---------------------------TT---------------- GGACTACCTA 2562 het 2562 ref 29 31 6 3 N/A 0 0 53001 CASAVA_Build 1 157730287 1I CTTAAGGCGG -/C ACACCTGGAG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 C 0 1 53002 CASAVA_Build 1 157730515 1D TGCTGGCTCC A/- GGCAGCCTGC 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 1 0 53003 CASAVA_Build 1 157733202 4D6M2I AAGGGATGCT GGTCTTATAC--/----TGGTACCA AATAAATTTT 3070 het 3070 ref 33 18 15 5 N/A 0 0 53004 CASAVA_Build 1 157741084 3D CAGTACAAAC ATA/--- ATAATATTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 ATA 3 2 53005 CASAVA_Build 1 157743470 1D TGATCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 854 hom 37 9 11 17 T 13 12 53006 CASAVA_Build 1 157743991 2D TCAAAGAATT AA/-- AATCATGTAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 4 2 53007 CASAVA_Build 1 157745133 1I TCTGTTTAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 8 9 53008 CASAVA_Build 1 157751197 2D TTAGAAAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 32 0 16 17 T 12 10 53009 CASAVA_Build 1 157751832 1I ACCCAAATAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 148 het 51 0 50 1 A 8 9 53010 CASAVA_Build 1 157766859 1D TTCACAGTAC T/- CCGTGTATTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 1 0 53011 CASAVA_Build 1 157767352 2D AATTAATACA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 38 12 19 9 GT 6 5 53012 CASAVA_Build 1 157769202 1D TAAAGACAAC A/- AAAACAATTG 1668 hom 15 het 7 0 6 1 A 5 4 53013 CASAVA_Build 1 157769380 4D AAAAAAAAAT TAAA/---- AAAAAAAAAA 1959 het 11 hom 7 0 5 3 TAAA 1 0 53014 CASAVA_Build 1 157785141 1D CTGGCCAGGG C/- GGATCAGGCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 1 0 53015 CASAVA_Build 1 157793993 1D AGATTATATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 401 hom 41 1 34 6 T 10 9 53016 CASAVA_Build 1 157812292 4D AAAAAAGAAA AAAG/---- AAAGAAATGG 1963 het 1963 ref 25 17 8 0 AAAG 2 1 53017 CASAVA_Build 1 157814728 1D TGCTCATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 14 10 A 13 12 53018 CASAVA_Build 1 157822074 1D TGTTTCTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 13 12 53019 CASAVA_Build 1 157826537 4D TTTGGATATG GTTT/---- GTTTGCCGCC 3070 het 3070 hom 55 16 26 15 GTTT 2 1 53020 CASAVA_Build 1 157834306 2D CCTTTTTTTG TC/-- TCAGCTGTGT 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 TC 2 1 53021 CASAVA_Build 1 157877237 1D CCTTTAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 A 10 9 53022 CASAVA_Build 1 157918805 1D ATTCGTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1802 hom 21 4 14 3 A 12 11 53023 CASAVA_Build 1 157920920 1D CAAATGTGGG T/- TTTTTTCACC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 7 6 53024 CASAVA_Build 1 157921410 1I AGTATCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 980 hom 23 3 15 5 T 10 11 53025 CASAVA_Build 1 157925299 1D CTCTCCAAAT C/- CCTTAAAGCA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 C 3 2 53026 CASAVA_Build 1 157926069 1D TTTGGACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2597 hom 41 17 15 9 T 15 14 53027 CASAVA_Build 1 157958469 1I GATCCATGTC -/T TAAACAATGG 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 T 1 2 53028 CASAVA_Build 1 157961268 9I TGTTACTTGG ---------/AAAACAAAT AGAAGGAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAACAAAT 0 1 53029 CASAVA_Build 1 157968988 1D GATCAAATTC A/- CACATAACAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 6 A 1 0 53030 CASAVA_Build 1 157985879 1D CTCAAGCTTG T/- TTTTTGCATC 3070 het 3070 ref 56 34 15 7 T 6 5 53031 CASAVA_Build 1 157995349 1I CTCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 A 9 10 53032 CASAVA_Build 1 158007703 2D ACCTTGTCTC TG/-- TTATGGTCAT 3070 het 3070 ref 39 20 17 5 TG 1 0 53033 CASAVA_Build 1 158010765 1I AGGAGGTTTT -/G GGGGGATGGG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 G 5 6 53034 CASAVA_Build 1 158015665 15D AGTCTTGTCT CCAGAGGTAGTGCAA/--------------- CCAGAAATCC 3070 het 3070 ref 39 19 16 6 CCAGAGGTAGTGCAA 1 0 53035 CASAVA_Build 1 158027653 1D AACTCATGCC A/- AAAAGGTTTG 3070 hom 144 het 54 0 47 7 A 5 4 53036 CASAVA_Build 1 158059744 1I TCTGCCCCCA -/G GCACAAAGCT 3070 het 2348 hom 29 8 9 12 G 1 2 53037 CASAVA_Build 1 158065260 1I AAAGGAGTCA -/G GGGGGGCACT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 G 6 7 53038 CASAVA_Build 1 158089988 1D ATCTAAAAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 9 8 53039 CASAVA_Build 1 158102117 6I GAGACAGGGA ------/CAGAGG CAGAGGCAGA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 CAGAGG 1 2 53040 CASAVA_Build 1 158104766 2D AGTGAGCGCC CT/-- GTCTCTCAGG 3070 hom 115 het 47 0 37 12 CT 1 0 53041 CASAVA_Build 1 158141262 1I GAAGAGAGTT -/A AGGGCCTTGC 3070 hom 51 het 19 0 15 4 A 1 2 53042 CASAVA_Build 1 158149004 2D GACTTCTGAC CA/-- CACAAAGCCA 3070 hom 63 het 24 0 17 7 CA 3 2 53043 CASAVA_Build 1 158150589 1I CCTCCTCCCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 T 7 8 53044 CASAVA_Build 1 158153812 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 A 11 10 53045 CASAVA_Build 1 158157588 2I CAGAATCATG --/CC CCCCCGCAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 5 7 53046 CASAVA_Build 1 158157900 1I CACCCAAAAA -/C CCCCAGAAGG 3070 hom 84 het 35 0 27 8 C 4 5 53047 CASAVA_Build 1 158163343 1I TCAATAAATG -/T TTCTTGAATG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 2 3 53048 CASAVA_Build 1 158173798 1I GGCCCAAGAG -/C CCCCTCTCTC 3070 hom 67 het 27 0 22 5 C 4 5 53049 CASAVA_Build 1 158194292 1I TGAGAATACC -/A GTTAGATTAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 0 1 53050 CASAVA_Build 1 158205456 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 9 53051 CASAVA_Build 1 158230508 1D TGGCCAGGTG C/- CAGTGGCTCA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 2 1 53052 CASAVA_Build 1 158232670 5D CATAATGTAA TGAAG/----- TATAGTTGTA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TGAAG 1 0 53053 CASAVA_Build 1 158233252 1I CTCCCAGCCT -/G CCTGCAACCA 3070 hom 129 het 50 0 42 8 G 0 1 53054 CASAVA_Build 1 158233695 1D ATTTCAGCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 615 hom 22 2 11 9 T 15 14 53055 CASAVA_Build 1 158240984 1I GTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 26 2 20 4 T 11 12 53056 CASAVA_Build 1 158265204 1D CTGTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 11 10 53057 CASAVA_Build 1 158269913 1I CTACACTTCA -/C ATTTATCCCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 0 1 53058 CASAVA_Build 1 158284642 28I ACGGGCCAAG ----------------------------/GCCCCCCTGAGGGCTGCAGTTTTTATCT GCCTCACAGG 3070 hom 45 het 19 0 14 6 GCCCCCCTGAGGGCTGCAGTTTTTATCT 0 1 53059 CASAVA_Build 1 158284800 1I GTCCCTGCTC -/T CTTCTGGGCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 0 1 53060 CASAVA_Build 1 158291182 1D CTCCAAAGAC T/- GCTGGTTGAG 3070 hom 126 het 46 0 40 6 T 1 0 53061 CASAVA_Build 1 158302593 1D TTGGTGAAAG C/- TCAACCACTC 3070 het 3070 ref 39 20 16 6 C 1 0 53062 CASAVA_Build 1 158304702 1I CCACTCCCCA -/C CCCACCCTCC 3070 hom 45 het 17 0 14 3 C 3 4 53063 CASAVA_Build 1 158352956 1D TGACAGGTGA C/- CCCCCCCCCA 2208 hom 39 het 21 0 10 11 C 10 9 53064 CASAVA_Build 1 158356242 2D CCTTATATCT AA/-- AAAAAAAAAA 1837 het 48 hom 16 1 6 10 A 18 16 53065 CASAVA_Build 1 158365552 1I TGTCTCCAAA -/G GCCTCTTGCT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 1 2 53066 CASAVA_Build 1 158368246 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 995 het 995 ref 25 11 4 10 A 15 16 53067 CASAVA_Build 1 158376033 1I TCACCTGCCA -/C CCTCCTTTCT 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 C 2 3 53068 CASAVA_Build 1 158385970 7D GAGCATGGTC AATACAG/------- AATATGGAAG 3070 het 3070 ref 42 20 20 6 AATACAG 1 0 53069 CASAVA_Build 1 158393503 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 8 7 53070 CASAVA_Build 1 158393643 1D GTGCAGGTTT G/- TTATATAAGT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 1 0 53071 CASAVA_Build 1 158415092 2D CGTCTCAAAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 2513 hom 20 9 10 2 A 11 9 53072 CASAVA_Build 1 158416820 1D AAACAGAAGC T/- TTTTCTCTCC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 5 4 53073 CASAVA_Build 1 158418249 1I CACAAAACAG -/C CCCAGCACTC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 C 3 4 53074 CASAVA_Build 1 158425727 1D CCTCAGTTTA C/- CTGTGCATAG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 C 2 1 53075 CASAVA_Build 1 158425813 1D TCTGTCCTCA C/- CCCCCAAGCT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 6 5 53076 CASAVA_Build 1 158430874 1I14M2I CCACACACAC -CCATCCATACACAC--/ACCATCCATACACACCA CACACACAAC 3070 hom 103 het 61 1 56 16 N/A 0 0 53077 CASAVA_Build 1 158431039 2I CACTCCACAC --/AT GTACACACAC 3070 hom 220 het 80 0 69 11 AT 0 1 53078 CASAVA_Build 1 158437493 7D GTCACTATTC TAACCCA/------- TAACCCATAC 3070 hom 127 het 52 0 42 12 TAACCCA 2 1 53079 CASAVA_Build 1 158445544 4D TGGTTTAGAC ACAT/---- ACAAACACAC 3070 het 3070 hom 40 13 15 16 ACAT 1 0 53080 CASAVA_Build 1 158448634 1I TTTAGGGAAG -/A AATTGGTGTT 3070 het 3070 ref 57 28 20 9 A 2 3 53081 CASAVA_Build 1 158492992 1I AGCCAGGAAG -/A AAAAAAAAAA 1075 het 1075 ref 49 41 4 4 A 11 12 53082 CASAVA_Build 1 158495173 1I CTACAAAAAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 9 53083 CASAVA_Build 1 158503861 4D TTTTTCCTTC CTTT/---- CTCTTTCCCT 2533 het 1566 hom 17 5 8 7 CTTT 1 0 53084 CASAVA_Build 1 158508317 1D AATTTTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 18 14 4 T 14 13 53085 CASAVA_Build 1 158510151 7D TCAAGTGATT CTCCTGC/------- CTCAGCCTCC 3070 het 1541 hom 15 5 9 1 CTCCTGC 1 0 53086 CASAVA_Build 1 158544042 2D GATGCAGCTG CT/-- CTCTGCTGCT 3070 het 3070 ref 55 30 17 10 CT 3 2 53087 CASAVA_Build 1 158544614 1I GCAAAGAGCT -/G AGTTGGGAGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 53088 CASAVA_Build 1 158549834 1D TCATTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 2543 het 434 hom 15 1 7 7 T 13 12 53089 CASAVA_Build 1 158570380 4D TACTTCTATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 TG 10 8 53090 CASAVA_Build 1 158573334 1I CTATACCCTT -/A ACCACCTAAC 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 1 2 53091 CASAVA_Build 1 158590299 1I TATAAATATG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 8 9 53092 CASAVA_Build 1 158593828 1D TTAGGAGGCC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 T 8 7 53093 CASAVA_Build 1 158620678 1D TAGACCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1194 het 1194 ref 27 13 3 11 T 15 14 53094 CASAVA_Build 1 158622999 1I TAATTGAATA -/C CCTTTATTTC 1739 het 1739 ref 21 16 4 1 C 2 3 53095 CASAVA_Build 1 158640079 1D AGTTTTAGGG A/- ACTCCAGTCT 3070 het 3070 ref 47 23 21 4 A 2 1 53096 CASAVA_Build 1 158658970 8I TGAAATGACT --------/CAAGTTCC CAGGTTCCTG 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 CAAGTTCC 0 1 53097 CASAVA_Build 1 158661901 1I CTTCTTGCTC -/T TTTTTTTTTT 2864 hom 37 het 17 0 10 7 T 10 11 53098 CASAVA_Build 1 158664864 1D TGGATCTAGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 32 16 12 4 T 8 7 53099 CASAVA_Build 1 158719596 1D AGAGGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 9 T 12 11 53100 CASAVA_Build 1 158745228 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 10 9 53101 CASAVA_Build 1 158759043 1I GATGGAAACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 367 hom 42 1 38 3 T 9 10 53102 CASAVA_Build 1 158764046 1I CTGGGTCCTT -/C TGTATTGGGC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 0 1 53103 CASAVA_Build 1 158767735 1I ATTTTTTTTT -/G GGGGGGGGGG 1401 het 1155 hom 19 5 10 4 G 10 11 53104 CASAVA_Build 1 158769241 3I AGATCGGGCC ---/ATG ATGACAATGG 2101 hom 18 het 7 0 7 0 ATG 1 2 53105 CASAVA_Build 1 158786437 1I3M1I GCCCAGGCCC -ATC-/AATCT TACAAGTCCC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 N/A 0 0 53106 CASAVA_Build 1 158801619 1D CTGATGGAAG A/- ATTACATAGC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 2 1 53107 CASAVA_Build 1 158805384 1D ATTTGTCCTG T/- TTGGTGAGCA 3070 het 3070 ref 39 22 17 0 T 3 2 53108 CASAVA_Build 1 158823484 5D AAAACAAATT TAAAC/----- TAACTAATAC 3070 het 3070 ref 26 18 8 0 TAAAC 1 0 53109 CASAVA_Build 1 158824247 2I ATCACTAATA --/GG GGTTAATTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 2 4 53110 CASAVA_Build 1 158826734 2D AAAAATAAAC AT/-- AAAATATATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AT 1 0 53111 CASAVA_Build 1 158827597 4D TTAAATTGAC AAAT/---- AATAATTATA 2672 het 1474 hom 9 3 6 0 AAAT 1 0 53112 CASAVA_Build 1 158835144 4D ATATTATAAG AGAT/---- AGGAAAAAAA 3070 het 1761 hom 20 5 10 6 AGAT 1 0 53113 CASAVA_Build 1 158841285 1I ATTAAAAAAA -/T ACTTTTTTCT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 0 1 53114 CASAVA_Build 1 158845166 1I TCATAAGCCC -/A GGGTTTACAA 3070 hom 111 het 46 0 37 9 A 0 1 53115 CASAVA_Build 1 158850806 4I TGGCCAACAT ----/AGTG AGTGAAACCC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AGTG 1 2 53116 CASAVA_Build 1 158850990 2D CCGCATCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 35 2 17 16 A 16 14 53117 CASAVA_Build 1 158851622 6D AAAATGTGGG TAAGTC/------ TAAGTATATA 2582 hom 15 het 12 0 6 7 TAAGTC 1 0 53118 CASAVA_Build 1 158853570 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAATT 2300 het 2300 ref 24 13 8 3 A 9 8 53119 CASAVA_Build 1 158879463 1D TTGGCCCCCC A/- CTTCCCCCTA 3070 hom 82 het 30 0 26 5 A 1 0 53120 CASAVA_Build 1 158896452 1D CACATCCTTG C/- CAACATTTGT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 C 2 1 53121 CASAVA_Build 1 158906297 1D CAGATAAGAG A/- AAAAAATTAC 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 7 6 53122 CASAVA_Build 1 158917417 1D GAACACTGAG C/- CCCCACGAAG 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 C 5 4 53123 CASAVA_Build 1 158918698 1I CTCAGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 2608 het 2608 ref 21 8 10 3 A 12 13 53124 CASAVA_Build 1 158923684 1D TTATCTTGTT C/- TTTTTTCAAG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 C 1 0 53125 CASAVA_Build 1 158940841 2D TTGCAAACTC TT/-- GTGTGTGAAG 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 T 2 0 53126 CASAVA_Build 1 158945535 1D ATTGTTATTA T/- TTTAAGCCAC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 4 3 53127 CASAVA_Build 1 158955030 4I AAACAAAACA ----/AAGC AAACAAAAAA 3070 hom 110 het 41 0 36 5 AAGC 0 1 53128 CASAVA_Build 1 158957356 1I CTGGTTCCTG -/T TTTTCTTTTC 3070 hom 72 het 29 0 23 6 T 4 5 53129 CASAVA_Build 1 158964116 2I AGTGGCACAA --/TC TCGGCTTACT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 TC 1 2 53130 CASAVA_Build 1 158971954 1D TAATTACAAA T/- TTTAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 4 3 53131 CASAVA_Build 1 158973989 1I GTCCCAGCTA -/C CTCAGGAGGC 3070 het 1275 hom 15 4 9 2 C 1 2 53132 CASAVA_Build 1 158974763 1D CAGGCAGAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 A 9 8 53133 CASAVA_Build 1 158976698 1D CCCTCACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 28 0 22 6 A 12 11 53134 CASAVA_Build 1 158984318 1I TTCTTAACTG -/T TTTTTCACCT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 5 6 53135 CASAVA_Build 1 159009018 1I TGAGAGTAAG -/A AAAAAGAAAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 5 6 53136 CASAVA_Build 1 159032804 1I TGGGAGATTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 8 9 53137 CASAVA_Build 1 159036789 4D TCAGTCTCTG CTAT/---- CTATCTTTCC 3070 het 3070 ref 44 18 17 10 CTAT 2 1 53138 CASAVA_Build 1 159045748 12D AATCCTGAAT TTATTATTATTA/------------ TTATTATTAT 2036 het 2036 ref 15 6 5 5 TTA 10 6 53139 CASAVA_Build 1 159048849 1D TATCAGATAA T/- TTGACCGTTT 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 T 3 2 53140 CASAVA_Build 1 159049316 1I CCTGGCCAAC -/A TGGTGAAACT 3070 hom 51 het 18 0 18 5 A 0 1 53141 CASAVA_Build 1 159057388 1D CCAACATGGT G/- AAACCCCGTC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 G 1 0 53142 CASAVA_Build 1 159061238 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 8 7 53143 CASAVA_Build 1 159061622 1D ACCATGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1273 het 1273 ref 29 15 5 9 A 15 14 53144 CASAVA_Build 1 159062325 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 421 hom 15 1 12 2 A 9 10 53145 CASAVA_Build 1 159076486 1D TTTTACTCAA G/- GGGGGAAGAA 2590 het 2590 ref 31 14 7 10 G 6 5 53146 CASAVA_Build 1 159093312 1D ATAGAATAGG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 8 7 53147 CASAVA_Build 1 159094499 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1703 het 1703 ref 14 7 5 2 A 11 10 53148 CASAVA_Build 1 159105566 1I ATTGTGAAAC -/A AAAGGAAGGT 3070 het 3070 ref 46 19 20 7 A 3 4 53149 CASAVA_Build 1 159106413 1D ACAACTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 11 10 53150 CASAVA_Build 1 159106810 2I CATTTTTCTG --/TC TCTATAAATT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 TC 1 2 53151 CASAVA_Build 1 159109349 2I GCAAGGAGTC --/TT TCACTTCCTT 3070 het 3070 hom 49 17 28 4 T 1 3 53152 CASAVA_Build 1 159115133 1D AATGGACTAA T/- TACAACTGGT 3070 hom 59 het 22 0 20 2 T 2 1 53153 CASAVA_Build 1 159116720 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 19 1 14 4 A 13 14 53154 CASAVA_Build 1 159123856 5D GCAGCTTCTC TTTAT/----- TTTATTTTAT 3070 hom 89 het 35 0 30 6 TTTAT 3 2 53155 CASAVA_Build 1 159125765 4D AAATATTCGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1583 het 15 hom 23 1 6 17 T 22 18 53156 CASAVA_Build 1 159136675 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 A 11 10 53157 CASAVA_Build 1 159150170 1I AGGTAGGACA -/C GCAGGCAGCA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 C 0 1 53158 CASAVA_Build 1 159153356 1I GGGATGTGGG -/T TTGACAAACC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 2 3 53159 CASAVA_Build 1 159158091 1D AATCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 16 1 15 0 A 11 10 53160 CASAVA_Build 1 159189637 5D GCAATAACAG AGCCC/----- AGCCCAGCCC 3070 het 3070 hom 35 16 13 8 AGCCC 3 2 53161 CASAVA_Build 1 159192272 4D TCTTTCGTGT TCTC/---- TCTCTCTCTC 672 het 672 ref 25 8 7 10 TC 8 6 53162 CASAVA_Build 1 159192407 1I TGCGTATGGG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 8 9 53163 CASAVA_Build 1 159193104 5D CAAAAAAAAC TCTTT/----- TCTTTTCTGT 2009 het 2009 ref 19 13 5 2 TCTTT 2 1 53164 CASAVA_Build 1 159194790 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCACT 2890 het 374 hom 8 1 7 0 G 4 3 53165 CASAVA_Build 1 159195041 1D TCCATCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 127 hom 31 2 15 14 T 15 14 53166 CASAVA_Build 1 159198668 1I CCATTTCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 11 12 53167 CASAVA_Build 1 159198831 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 15 12 10 C 1 0 53168 CASAVA_Build 1 159208715 2D AGTTCAGAGT AC/-- AGTGTCTAGC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 AC 1 0 53169 CASAVA_Build 1 159217089 1I TTGAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 11 12 53170 CASAVA_Build 1 159220163 1I TTTTTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2205 het 2205 ref 35 11 10 14 T 13 14 53171 CASAVA_Build 1 159234384 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 11 12 53172 CASAVA_Build 1 159235633 1I AGGTATGGGT -/G GGGGTAACAG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 G 4 5 53173 CASAVA_Build 1 159239340 4I TCCTATATCC ----/TTTT TTTTTCTCTT 3070 het 2777 hom 20 8 9 3 T 5 9 53174 CASAVA_Build 1 159260063 4D GTGCCCGGCC TTTA/---- TTTATTTATT 1631 het 1631 ref 10 5 4 3 TTTA 3 2 53175 CASAVA_Build 1 159296684 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2552 het 2287 hom 28 10 9 9 A 13 14 53176 CASAVA_Build 1 159297952 1D AGAATATCTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 A 10 9 53177 CASAVA_Build 1 159304414 2D AGCAATCAGA TC/-- TGTCTGTCCC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TC 1 0 53178 CASAVA_Build 1 159309499 13D CAAAGACGTA GCAGAGATGCGGT/------------- GCTGGGCTGC 2406 het 2406 ref 22 13 6 5 GCAGAGATGCGGT 1 0 53179 CASAVA_Build 1 159311462 2D CCAGGTACAC AT/-- GTTATAAAGT 3070 het 3070 ref 63 29 25 11 AT 1 0 53180 CASAVA_Build 1 159313410 1I GTGTGAGTTG -/C CTCTGCATTC 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 C 1 2 53181 CASAVA_Build 1 159313750 4D TGTCACATAC TATA/---- TATAGCCTCC 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 TA 4 2 53182 CASAVA_Build 1 159376035 1D CTGCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 989 het 989 ref 29 18 3 9 A 12 11 53183 CASAVA_Build 1 159427085 2I CACACATTTT --/CA CACACACACA 3070 het 2244 hom 21 7 9 5 CA 7 8 53184 CASAVA_Build 1 159448140 2I TTACTGTGTA --/TT TTGTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 4 53185 CASAVA_Build 1 159473621 2I CTTTCTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 37 1 23 13 T 13 15 53186 CASAVA_Build 1 159475433 1I CCTGTACATC -/T CCCCTACTCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 1 53187 CASAVA_Build 1 159479896 2D AATTTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 18 1 13 4 T 13 11 53188 CASAVA_Build 1 159481925 1D CCAAATGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 23 9 T 12 11 53189 CASAVA_Build 1 159485830 1D GCATAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 19 0 11 8 T 15 14 53190 CASAVA_Build 1 159504634 1D GACAGACATT G/- GGAAGACAGG 3070 hom 75 het 33 0 25 8 G 3 2 53191 CASAVA_Build 1 159507291 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 319 hom 20 2 12 6 A 15 14 53192 CASAVA_Build 1 159522441 1D GAATGATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 938 hom 27 3 20 4 T 15 14 53193 CASAVA_Build 1 159562620 1D ATCTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 1181 het 1181 ref 28 18 4 7 A 13 12 53194 CASAVA_Build 1 159596443 1D CTCATCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1903 hom 29 9 12 8 T 15 14 53195 CASAVA_Build 1 159596652 4D CTAAGACACA AGAG/---- AGTCAAAATT 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 AG 3 1 53196 CASAVA_Build 1 159606327 4D ATGCACCATA GTTT/---- GTTCAGACCC 3070 het 3070 hom 49 22 23 7 GTTT 1 0 53197 CASAVA_Build 1 159612880 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAA 2149 het 339 hom 22 4 6 12 A 18 17 53198 CASAVA_Build 1 159613873 1I AGACTCTATT -/A AAAAAAAAAA 2858 het 1052 hom 23 7 8 8 A 13 14 53199 CASAVA_Build 1 159618660 1I CTATATAAAC -/A AGTTAATACC 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 1 2 53200 CASAVA_Build 1 159621916 1D TTTTAAACAC T/- TTTTTTTTTT 1456 het 1456 ref 33 21 5 7 T 13 12 53201 CASAVA_Build 1 159623390 1D ATGAACTCTA T/- TTTTTTTTTT 2408 het 2408 ref 25 8 8 9 T 14 13 53202 CASAVA_Build 1 159624767 1I CGGGCGCGGT -/G GCTCAGGCCT 1782 hom 15 het 7 0 5 2 G 1 2 53203 CASAVA_Build 1 159646277 1D ACAAAACAAC A/- TTCACACTAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 1 0 53204 CASAVA_Build 1 159673862 1D TATTAGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 10 T 11 10 53205 CASAVA_Build 1 159696473 1D AGGGGAGGGG A/- AAAAAAGTCC 2196 het 2196 ref 93 62 11 22 A 7 6 53206 CASAVA_Build 1 159728624 1I ATATGCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 860 hom 47 2 33 12 T 11 12 53207 CASAVA_Build 1 159729134 2D GGTGGTCAGC TG/-- TGTGTGTGTG 1339 het 1339 ref 37 26 3 8 TG 8 7 53208 CASAVA_Build 1 159745756 1D TAAGGCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 162 hom 39 1 22 16 T 15 14 53209 CASAVA_Build 1 159756924 1D ACGAGACTTT G/- GGTGGAGACA 3070 het 3070 ref 42 30 10 2 G 3 2 53210 CASAVA_Build 1 159766341 1I CGTTAGCGTT -/A AAAAAAAAAA 2656 het 2656 ref 29 17 9 3 A 11 12 53211 CASAVA_Build 1 159771472 5D TCTCCATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAT 147 het 147 ref 13 9 1 4 A 14 9 53212 CASAVA_Build 1 159778647 2I TTCACTTAGC --/TT AACTTGGGAC 3070 het 3070 ref 56 42 10 4 T 0 2 53213 CASAVA_Build 1 159794940 1D AACATTTAGG A/- AGCTATACAG 3070 het 3070 ref 44 27 11 8 A 2 1 53214 CASAVA_Build 1 159829907 1I GTGAGTACAG -/A GTTGTCTCAG 1284 het 1284 ref 50 40 3 7 A 0 1 53215 CASAVA_Build 1 159832386 1D AATTTCTTTA T/- TTTACTTCCA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 4 3 53216 CASAVA_Build 1 159833951 3I CTATTTGTAC ---/ATA ATATTATTCT 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 ATA 1 2 53217 CASAVA_Build 1 159845444 3I GACTCTGGAG ---/GAT GATGGTATAT 3070 het 1736 hom 17 6 9 2 GAT 1 2 53218 CASAVA_Build 1 159849687 1D AGTCCATAAA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 23 hom 29 1 24 5 C 11 10 53219 CASAVA_Build 1 159856585 4I CATTTGGCAA ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 ATTT 3 4 53220 CASAVA_Build 1 159857982 8I CACGGAAAGC --------/TAATTGTG TAATTGTGTC 3070 het 3070 ref 46 27 10 9 TAATTGTG 1 2 53221 CASAVA_Build 1 159860505 1I TTCTTTTTTT -/C CCCTCTAAAC 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 3 4 53222 CASAVA_Build 1 159861886 1D TGTGACCTTA G/- GGGCAACTTA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 4 3 53223 CASAVA_Build 1 159865983 1I AATGCAGCAG -/T CCTATATCTA 2421 hom 12 het 5 0 5 0 T 0 1 53224 CASAVA_Build 1 159866912 1D AGGAGCCCAA T/- TTTCCCAAGA 2563 het 2563 ref 26 15 6 5 T 4 3 53225 CASAVA_Build 1 159868038 1I TTCAAATCTT -/C TGACCACTAG 3070 het 2914 hom 18 8 9 1 C 0 1 53226 CASAVA_Build 1 159868143 3I TCCACAGGAG ---/CTA CTGACTTTTT 2368 het 2368 ref 19 11 5 3 CTA 0 1 53227 CASAVA_Build 1 159869941 1D CAGTTTCTTA G/- GGGGAGAACA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 G 5 4 53228 CASAVA_Build 1 159881695 1D ATTTTTTTTT C/- CAGTTTGCAG 3070 het 3070 ref 42 28 11 3 C 2 1 53229 CASAVA_Build 1 159883375 1D CAGCATGTTT G/- GCTTAGGACC 3070 het 3070 ref 86 45 29 13 G 2 1 53230 CASAVA_Build 1 159888766 1I AAAGTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1687 hom 18 4 11 3 T 11 12 53231 CASAVA_Build 1 159890573 1I TTCTTATTGA -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 T 6 7 53232 CASAVA_Build 1 159891315 1I TTAATACAGG -/T TTTTTTTGGG 3070 het 1579 hom 51 6 40 5 T 7 8 53233 CASAVA_Build 1 159920109 1I TTCTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 926 hom 42 3 31 8 T 12 13 53234 CASAVA_Build 1 159921196 1I AACCTATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 11 12 53235 CASAVA_Build 1 159935668 1I CCTATGTAAC -/A AACCTGCACT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 2 3 53236 CASAVA_Build 1 159941978 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2132 hom 24 10 10 5 A 15 14 53237 CASAVA_Build 1 159946075 1D GAATAAAGGC A/- AGTGGGGCAC 3070 hom 144 het 54 0 48 6 A 2 1 53238 CASAVA_Build 1 159952385 1D CAAGCACATG A/- AAAGGAAAAC 3070 hom 151 het 57 0 51 7 A 4 3 53239 CASAVA_Build 1 159964636 4D AGGCTGAGGC GGGG/---- GGGGGGGGGG 3070 het 189 hom 21 2 11 8 G 14 10 53240 CASAVA_Build 1 159970440 1I AATGTCTAGG -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 8 53241 CASAVA_Build 1 159974930 2D TTTTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2243 het 938 hom 30 8 6 16 T 16 14 53242 CASAVA_Build 1 159976128 1D TGGCCTTAAC T/- TTTTTTGGAT 2840 het 2840 ref 30 17 8 5 T 7 6 53243 CASAVA_Build 1 159981689 1I CTTTAGCATT -/C TGCACGATCT 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 C 0 1 53244 CASAVA_Build 1 159988661 1D TGGAATTTGA T/- TTTTTTTTTT 1407 het 1407 ref 30 17 3 11 T 15 14 53245 CASAVA_Build 1 159989404 3I ACTCTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 10 13 53246 CASAVA_Build 1 159997716 1D ATCTAGATAT G/- CTTTAAAATA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 G 1 0 53247 CASAVA_Build 1 160001791 2I AGTAATATAC --/AG CCACGAGCAG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AG 0 1 53248 CASAVA_Build 1 160012311 2I TACATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 17 hom 36 1 25 10 TA 7 8 53249 CASAVA_Build 1 160013014 4D GAGAAGTAAA TAAT/---- TAAGTAATAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 5 TAAT 1 0 53250 CASAVA_Build 1 160019219 5I GTTTGACAAA -----/CTACT CTAAATCTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CTACT 0 1 53251 CASAVA_Build 1 160022523 9D CCGAGTACCT GGGATTACA/--------- GGGATTACAG 2915 hom 18 het 11 0 7 4 GGGATTACA 2 1 53252 CASAVA_Build 1 160032501 3I CTTCCATCTC ---/CTT CTTTGTGTGA 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 CTT 1 2 53253 CASAVA_Build 1 160033338 1I TGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2968 hom 28 10 11 7 T 10 11 53254 CASAVA_Build 1 160041093 1D CCCCCCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 11 10 53255 CASAVA_Build 1 160041975 1D AGCAGGCCAA C/- CCACTCAGGA 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 C 3 2 53256 CASAVA_Build 1 160045148 1I TAAATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 2582 het 2582 ref 32 18 7 7 T 11 12 53257 CASAVA_Build 1 160056562 5I AGAAAACAAT -----/ATAAA ATAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 ATAAA 1 2 53258 CASAVA_Build 1 160074037 1I CTTTCTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 13 14 53259 CASAVA_Build 1 160078917 2I GAAACTGTGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 TA 5 6 53260 CASAVA_Build 1 160079704 1D GGGAATTGAC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 126 het 48 0 41 7 T 9 8 53261 CASAVA_Build 1 160084536 1D AAAAAAAAAA C/- CAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 C 2 1 53262 CASAVA_Build 1 160089822 1I CCCTAGAAGG -/T TTGGTAAACT 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 2 3 53263 CASAVA_Build 1 160093136 1D CCCTAAATGC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 9 8 53264 CASAVA_Build 1 160094219 3D ATAAGACAAT AAG/--- AACACAAGGG 3070 het 3070 ref 22 12 8 3 AAG 1 0 53265 CASAVA_Build 1 160099018 2I GGCACTTGAC --/AT ATATAACATC 3070 het 3070 ref 54 25 24 5 AT 2 3 53266 CASAVA_Build 1 160105070 1I ATTTAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 11 12 53267 CASAVA_Build 1 160105494 2I TGATTATTGC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 9 11 53268 CASAVA_Build 1 160106441 1I AATACAGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 9 10 53269 CASAVA_Build 1 160119124 1D TCGATACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 T 12 11 53270 CASAVA_Build 1 160123485 1D AAAATGAAGC T/- TTTTTTTTTT 1568 het 1568 ref 43 30 4 9 T 11 10 53271 CASAVA_Build 1 160123662 1D ATTTTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 2888 het 793 hom 25 8 9 8 T 12 11 53272 CASAVA_Build 1 160136486 1I ACTTAACTTA -/C CATCACTACG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 C 1 2 53273 CASAVA_Build 1 160156709 3D TCTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1530 het 186 hom 17 2 5 10 T 18 15 53274 CASAVA_Build 1 160158410 4D TTGTTTTCCC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 37 15 10 13 TGTT 5 4 53275 CASAVA_Build 1 160161871 6I TAGATACAGT ------/TTTTCA TTAAGTTCCT 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 TTTTCA 0 1 53276 CASAVA_Build 1 160163337 2D CGTTGCAGTC AT/-- TGCTTAGTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 AT 1 0 53277 CASAVA_Build 1 160165042 1D CCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 A 10 9 53278 CASAVA_Build 1 160167995 1I ACCCCAAAAG -/A AACCCATCCC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 2 3 53279 CASAVA_Build 1 160172715 1D TTCTTTTTAA T/- TTTTTTTAAT 2052 het 2052 ref 23 12 8 3 T 8 7 53280 CASAVA_Build 1 160174304 1I AAAAGATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1002 hom 23 4 12 8 A 11 12 53281 CASAVA_Build 1 160193588 1D TGTCAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 13 12 53282 CASAVA_Build 1 160196503 1D TCCCATGGTT A/- AAAAAAAAAA 2982 het 2939 hom 32 10 9 13 A 15 14 53283 CASAVA_Build 1 160198540 1D CATCATCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 11 10 53284 CASAVA_Build 1 160206276 1I TTTGGAACCA -/C CTGGGGACCT 2369 het 2369 ref 29 17 8 4 C 1 2 53285 CASAVA_Build 1 160210057 12I GACCCTGAAG ------------/CTCTTGTGGGTC CTCTCAGTGG 3070 het 2849 hom 32 7 17 8 CTCTTGTGGGTC 0 1 53286 CASAVA_Build 1 160219629 1I CTTCTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 11 12 53287 CASAVA_Build 1 160229380 1I49M1I TTCAGTCTGT -AAAAAAATGCACTCTCTGTGAAGTACAACAAAGCAAAGTGCAATAAGAT-/AAAAAAAATGCACTCTCTGTGAAGTACAACAAAGCAAAGTGCAATAAGATG GGGGCATGCC 3070 het 3070 ref 46 38 29 10 N/A 0 0 53288 CASAVA_Build 1 160231204 1I TGTTTTTGGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 8 9 53289 CASAVA_Build 1 160231659 1I CTCTGGGCCA -/C CCCCTCCTCT 3070 hom 82 het 30 0 28 2 C 4 5 53290 CASAVA_Build 1 160235056 1I GGCTGGGAGT -/A AAGTGAGTCA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 2 3 53291 CASAVA_Build 1 160242897 1I CCTGAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 29 1 23 5 A 10 11 53292 CASAVA_Build 1 160261679 1I TCGCCGTGTT -/G GCCAGGCTGG 3070 hom 50 het 20 0 15 5 G 1 2 53293 CASAVA_Build 1 160266854 8I GGGCAAGAGA --------/GTGCCATT GTGCCATTGT 3070 hom 148 het 62 0 49 13 GTGCCATT 1 2 53294 CASAVA_Build 1 160278576 1I GTGAGTCATT -/C TAGAAAATTA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 0 1 53295 CASAVA_Build 1 160279145 2D CTAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 1992 het 188 hom 15 2 5 10 AT 1 0 53296 CASAVA_Build 1 160312189 1I CCCAGACTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1386 hom 37 3 22 12 T 10 11 53297 CASAVA_Build 1 160318607 1D GCAGTATTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 10 9 53298 CASAVA_Build 1 160326565 1I TATTCCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 11 53299 CASAVA_Build 1 160326784 1I TATCTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 888 hom 25 2 17 6 A 13 14 53300 CASAVA_Build 1 160327456 20D CTGCACAGAG AAATGGAGATTTAAAAATCT/-------------------- CTTGTTTTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 AAATGGAGATTTAAAAATCT 1 0 53301 CASAVA_Build 1 160330137 5D CTGGCTAACT TTTTA/----- TTTTTAGTGG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTTTA 1 0 53302 CASAVA_Build 1 160333540 1I GCTGGGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 39 1 35 3 A 11 12 53303 CASAVA_Build 1 160334690 1I CCGGCTATTG -/T TTTGTATCTT 3070 hom 60 het 23 0 19 4 T 3 4 53304 CASAVA_Build 1 160334910 1D AACGGTGTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 502 hom 30 3 20 7 T 12 11 53305 CASAVA_Build 1 160356494 19D ATGTATATGG TATATACATATGTATATGA/------------------- TATATACACA 3070 hom 84 het 29 0 29 4 TATATACATATGTATATGA 1 0 53306 CASAVA_Build 1 160376775 1D GGGTATACCC A/- ATGTTTAGCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 1 53307 CASAVA_Build 1 160391646 6D ATACATATAT ATATAC/------ ATATACATAT 2353 hom 27 het 15 0 10 6 ATATAC 3 2 53308 CASAVA_Build 1 160439578 1D AAAAAGGCTG T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 122 het 47 0 41 6 T 7 6 53309 CASAVA_Build 1 160449237 1D ACACACCCTG T/- GAACTTTGGC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 1 0 53310 CASAVA_Build 1 160449287 1D GGAGTGAGTG C/- CCCCGGCACA 3070 hom 55 het 34 0 23 12 C 5 4 53311 CASAVA_Build 1 160468948 2D TGTGCTTAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 GT 10 9 53312 CASAVA_Build 1 160471555 1I ATTTTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 10 11 53313 CASAVA_Build 1 160473058 1D AACACTCCAG C/- CCCCCTTTCC 3070 hom 95 het 42 0 30 12 C 6 5 53314 CASAVA_Build 1 160474282 9I TGGAAGTCAT ---------/TTTCAGAGA TTTCAGAGAG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TTTCAGAGA 1 2 53315 CASAVA_Build 1 160486978 1I GGGAAAGCCC -/T CCCTCCATAG 3070 hom 109 het 43 0 34 9 T 0 1 53316 CASAVA_Build 1 160497195 1D AGGGAGATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 9 8 53317 CASAVA_Build 1 160499692 1I AAGCTGGAAA -/G TTTAAGATCA 3070 hom 81 het 36 0 26 10 G 0 1 53318 CASAVA_Build 1 160501978 1I GAACTCATCA -/T TTTTTTTATG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 7 8 53319 CASAVA_Build 1 160504728 1D CCCTGTAGCT C/- CCCCCCCCTA 3070 het 53 hom 18 2 9 8 C 9 8 53320 CASAVA_Build 1 160521012 1I AGTGACTGTG -/C CCCACAGACC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 3 4 53321 CASAVA_Build 1 160527440 1D CTGGACTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1106 hom 31 5 18 8 A 14 13 53322 CASAVA_Build 1 160540990 1I GTTAAATGAA -/T TTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 5 6 53323 CASAVA_Build 1 160541802 1D ATTCCTCCTA T/- TTTTTTTTTT 703 het 703 ref 40 28 3 9 T 12 11 53324 CASAVA_Build 1 160558336 1D AGAGGGAGAA G/- GGGGGACAAG 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 G 6 5 53325 CASAVA_Build 1 160560567 1I GTCTCTGAGC -/A ACAACCCTCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 53326 CASAVA_Build 1 160571450 4D ACCTGAGTTT AAGA/---- CCAGTGCTCA 3070 het 3070 ref 64 33 24 10 AAGA 1 0 53327 CASAVA_Build 1 160575816 2D TGCTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2823 hom 33 10 19 7 A 14 12 53328 CASAVA_Build 1 160582859 1D TGTGAATAAA G/- GAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 G 2 1 53329 CASAVA_Build 1 160587233 1D TCCCTTCCCC G/- CAATTCCTGG 3070 hom 142 het 52 0 45 8 G 1 0 53330 CASAVA_Build 1 160588478 1D CTTCGTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 18 4 9 5 T 11 10 53331 CASAVA_Build 1 160596134 1D TTCTCTACGC G/- GGGGGGGGCT 3070 het 2509 hom 26 8 12 7 G 9 8 53332 CASAVA_Build 1 160597692 1D TGCTAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 16 17 13 A 10 9 53333 CASAVA_Build 1 160598842 8D9M6D TCCAGCCTGG GTGACAGAGTGAGTCTCAAAAAA/--------GTGAGTCTC------ AAAAAAAAAA 1790 het 905 hom 13 5 6 5 N/A 0 0 53334 CASAVA_Build 1 160604853 5D TTTTTACTGC AAAAA/----- AAAAAAAAGA 3070 het 421 hom 26 4 13 10 A 13 8 53335 CASAVA_Build 1 160605885 1I TCTGTTTTCT -/G GACGTAAGCC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 G 1 2 53336 CASAVA_Build 1 160607557 1I CCTGAGTAGC -/T AGGACTACAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 0 1 53337 CASAVA_Build 1 160612881 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 25 1 15 10 A 15 14 53338 CASAVA_Build 1 160613058 1D TAAAAGCTTC A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 26 11 9 7 A 8 7 53339 CASAVA_Build 1 160620825 4D CAGATGTCGA ACAC/---- AAAATGTGGG 3070 het 3070 ref 43 21 15 11 AC 2 0 53340 CASAVA_Build 1 160623743 1I ACTTAGGTAC -/T TTCCTGGGAG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 2 3 53341 CASAVA_Build 1 160625946 1I AACCGCAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 10 11 53342 CASAVA_Build 1 160629796 1I ATAAGATGGC -/A GGTATAAATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 0 1 53343 CASAVA_Build 1 160629875 1D CTTAAATTGG A/- AAAAAAAAAA 1861 het 1861 ref 39 32 4 3 A 12 11 53344 CASAVA_Build 1 160630216 5I TATATAGAAT -----/TAAAA TAAAAGATTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TAAAA 1 2 53345 CASAVA_Build 1 160630985 1I AACAAAAAAA -/T GACAAAATTG 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 0 1 53346 CASAVA_Build 1 160637747 1I AGAAAAAAAA -/T GTCTTAAAAT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 T 0 1 53347 CASAVA_Build 1 160638676 2I CCTGTAATCC --/CT CAGCAGTCTG 2921 het 1272 hom 16 3 9 4 CT 0 1 53348 CASAVA_Build 1 160649270 1I CTTCTTTTTT -/G TTGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 47 15 27 5 G 0 1 53349 CASAVA_Build 1 160649707 1D GGGCTTCCTT G/- CCCTTTTTGC 3070 het 3070 ref 41 23 13 6 G 1 0 53350 CASAVA_Build 1 160655588 1I AAATGATAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 8 9 53351 CASAVA_Build 1 160658461 1D CTTACAGAGG C/- TTGAAGTCTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 C 1 0 53352 CASAVA_Build 1 160659919 1I ATGGAACTAT -/A AAATAAACCC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 3 4 53353 CASAVA_Build 1 160663556 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2236 het 245 hom 17 1 9 7 A 13 14 53354 CASAVA_Build 1 160692051 3I GGTACACACC ---/TGT TGTGATCCCA 2585 het 2585 ref 17 8 7 2 TGT 1 2 53355 CASAVA_Build 1 160693166 1I GAAAACGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2237 hom 22 9 10 3 T 9 10 53356 CASAVA_Build 1 160693739 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 745 hom 11 2 9 0 T 8 7 53357 CASAVA_Build 1 160703242 8D ATAAAAATAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 21 9 10 4 AAAC 6 4 53358 CASAVA_Build 1 160704514 19I CAATATGTAC -------------------/AGAGCAGGCATTCAGCCAT AGAGCAGGCA 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 AGAGCAGGCATTCAGCCAT 0 1 53359 CASAVA_Build 1 160708769 1D TAAGAAGAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 8 7 53360 CASAVA_Build 1 160710072 2I TGATGGTCAC --/AT GTGGCATTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AT 0 1 53361 CASAVA_Build 1 160738341 1D AGTCTCTAGT A/- AAAAAAAAAA 1393 het 1393 ref 23 10 6 7 A 19 18 53362 CASAVA_Build 1 160768815 2I TGCTGGGATT --/AC ACAGGTGTGA 3070 het 2286 hom 24 6 15 3 AC 1 2 53363 CASAVA_Build 1 160772835 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1883 hom 21 het 9 0 8 1 T 15 14 53364 CASAVA_Build 1 160778588 1I AGAAGGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 47 0 34 13 T 13 14 53365 CASAVA_Build 1 160785155 1I CTTTAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1361 hom 25 3 18 4 T 13 14 53366 CASAVA_Build 1 160796136 1I CTCTAGTGTT -/A AGACATTTCT 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 A 1 2 53367 CASAVA_Build 1 160807507 1D TCTGGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1588 het 1588 ref 29 18 5 7 T 17 16 53368 CASAVA_Build 1 160822199 1D TGTGTGCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 25 0 18 7 A 12 11 53369 CASAVA_Build 1 160823438 1I AAATATCGGG -/C CAATAGAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 C 1 2 53370 CASAVA_Build 1 160826446 1I TTTTTGCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 13 14 53371 CASAVA_Build 1 160848667 7D TGCCTCAATT AAAAAGA/------- AAAAAGTATA 3070 het 3070 ref 27 14 11 5 AAAAAGA 1 0 53372 CASAVA_Build 1 160851174 1I CTGATTACTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 9 10 53373 CASAVA_Build 1 160853561 2D CTTTCCTTCT TG/-- TAAGCATGTT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 TG 1 0 53374 CASAVA_Build 1 160855951 1I CTTCTCCCAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 9 53375 CASAVA_Build 1 160871728 1I GGAGCGGCCA -/C CCCCCCATAC 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 C 6 7 53376 CASAVA_Build 1 160881498 1I GAACAGGCAT -/A ACTGCAGGGG 3070 het 3070 ref 60 28 27 5 A 1 2 53377 CASAVA_Build 1 160889522 12D CTGTCTTAAA AAACAAACAAGC/------------ AAACAAACAA 3070 hom 63 het 24 0 21 9 AAACAAACAAGC 1 0 53378 CASAVA_Build 1 160889997 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 27 0 21 6 A 13 12 53379 CASAVA_Build 1 160896421 3I CAGGAACAAC ---/GTT GTTAAGTATT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 GTT 1 2 53380 CASAVA_Build 1 160896802 2I CTCCAATATT --/AA GTCTTGTAGA 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 0 2 53381 CASAVA_Build 1 160907087 1I ATATAAACCC -/A AATACTTTGG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 2 3 53382 CASAVA_Build 1 160911572 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2719 het 1037 hom 16 3 9 4 A 11 12 53383 CASAVA_Build 1 160912581 1D AGTGGACAGT C/- AAGAATGGTG 3070 het 3070 hom 66 29 34 4 C 1 0 53384 CASAVA_Build 1 160914672 1I TAAGTAACTT -/C TTTGAACTTA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 C 0 1 53385 CASAVA_Build 1 160916185 1D AGATTATGTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 9 8 53386 CASAVA_Build 1 160922615 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2015 hom 22 8 9 5 T 10 11 53387 CASAVA_Build 1 160925989 1D GTCTCACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 12 11 53388 CASAVA_Build 1 160935472 7I CCAAGGTTGT -------/TAAATAG CTGCAATGGG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 TAAATAG 0 1 53389 CASAVA_Build 1 160936151 1D AGACTTAGTC T/- ATTATTTCCG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 1 0 53390 CASAVA_Build 1 160950162 1D ATTATCCTAC T/- GGTAGACATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 53391 CASAVA_Build 1 160956565 1I ATTGGAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 10 11 53392 CASAVA_Build 1 160973574 1D TTTGGAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 11 10 53393 CASAVA_Build 1 160983873 1I AAAAAAGAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 441 hom 22 1 20 1 A 9 10 53394 CASAVA_Build 1 160988576 1D AAGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 18 8 A 11 10 53395 CASAVA_Build 1 161000814 1I TTTAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 294 hom 27 4 14 9 G 0 1 53396 CASAVA_Build 1 161003446 1I CTATCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 2561 hom 22 het 23 0 9 14 A 11 12 53397 CASAVA_Build 1 161010475 1I TTTCTTCTAT -/C TTGAGCAACC 3070 hom 123 het 44 0 40 4 C 0 1 53398 CASAVA_Build 1 161013893 2D TGATGTACAC CA/-- GTTTACATAA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 CA 1 0 53399 CASAVA_Build 1 161014195 2I AGGCTGAGGC --/CT AGGAGGATGA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 CT 0 1 53400 CASAVA_Build 1 161017376 1I TGTCATTTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 10 53401 CASAVA_Build 1 161018990 3D CTGCAGCCTA TTC/--- TTCTTTATCC 3070 hom 120 het 47 0 41 8 TTC 2 1 53402 CASAVA_Build 1 161030302 1D CTAAGGGGTA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 293 hom 40 1 31 8 T 8 7 53403 CASAVA_Build 1 161032261 14D AACCTATGTA AGTCTTAGATGAAG/-------------- AGTCTTAGAT 2314 het 2314 ref 25 16 6 5 AGTCTTAGATGAAG 2 1 53404 CASAVA_Build 1 161032436 1D ACTTTCATCA T/- TTTAGGATAC 1640 het 1640 ref 21 14 4 3 T 4 3 53405 CASAVA_Build 1 161033865 1D ACAGGAAAAC T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 60 het 26 0 20 8 T 7 6 53406 CASAVA_Build 1 161035564 1D TTATGTCTTT A/- ATTCAGTCGT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 2 1 53407 CASAVA_Build 1 161053457 1D AGCTCAAACA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 9 8 53408 CASAVA_Build 1 161061061 1D CCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2904 hom 29 9 14 7 A 12 11 53409 CASAVA_Build 1 161067379 2I AAATGAATGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 AT 7 8 53410 CASAVA_Build 1 161072667 2D AATGCTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 902 hom 32 6 10 16 T 18 16 53411 CASAVA_Build 1 161073096 3I TGTGTGTGTA ---/ATC ATCTCTCTGT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 ATC 1 2 53412 CASAVA_Build 1 161099919 1I TCATGAAATT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 9 53413 CASAVA_Build 1 161102898 1I TCATGTTTAT -/G GGCTAGAATC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 2 3 53414 CASAVA_Build 1 161103183 2I TACCACAGAG --/AA GAGACTTTAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 2 53415 CASAVA_Build 1 161108858 1I ATCACATTGG -/A AAAATGTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 4 5 53416 CASAVA_Build 1 161108978 1D CTGTGTATAT A/- AAAAAATCAC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 7 6 53417 CASAVA_Build 1 161111164 1I ACCATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 11 12 53418 CASAVA_Build 1 161112504 1D TCAGCCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 22 9 T 13 12 53419 CASAVA_Build 1 161149521 1D CTTTAGACAT G/- GGTTCCTTTA 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 G 3 2 53420 CASAVA_Build 1 161157267 1I GATAAGGAAA -/T AAAACAATTG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 1 53421 CASAVA_Build 1 161157432 1D TCTATAAACT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 132 het 50 0 44 7 A 10 9 53422 CASAVA_Build 1 161161045 1D TAAGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 34 2 26 8 T 13 12 53423 CASAVA_Build 1 161190056 1D AGAAAACTGG T/- TTTTTTTTTT 1494 het 1494 ref 53 43 4 6 T 11 10 53424 CASAVA_Build 1 161198178 2D CCTTTACTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 38 2 14 22 T 13 11 53425 CASAVA_Build 1 161200516 1D TTTTTGCCTC T/- TTTTAATTGT 3070 het 3070 hom 31 10 18 4 T 5 4 53426 CASAVA_Build 1 161202619 1I CTTTCACTAC -/A AAAAAAATTA 2335 hom 26 het 15 0 8 7 A 7 8 53427 CASAVA_Build 1 161204061 2D GAAGTTTAGC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 11 9 53428 CASAVA_Build 1 161209773 1D TGTTTTTATG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 8 7 53429 CASAVA_Build 1 161265333 1D CAGTGATCTT A/- AAAAAAAAAA 1551 het 1551 ref 41 32 4 5 A 12 11 53430 CASAVA_Build 1 161275097 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 C 1 0 53431 CASAVA_Build 1 161280738 1I AAGATGAACA -/G GATTTAGAAA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 1 2 53432 CASAVA_Build 1 161286629 1I GTAGAGTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 10 11 53433 CASAVA_Build 1 161288248 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTATA 1421 het 249 hom 25 2 13 10 TG 3 4 53434 CASAVA_Build 1 161302245 1I TTCTTTCCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 9 10 53435 CASAVA_Build 1 161308645 2I ATAGGGAACC --/AA AAGAGGAATC 3070 hom 132 het 47 0 44 3 A 2 4 53436 CASAVA_Build 1 161312373 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 31 1 24 7 A 10 9 53437 CASAVA_Build 1 161332215 1I TTTTTTAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 T 9 10 53438 CASAVA_Build 1 161340751 1I ATTGCAGTTG -/T TTTTTTTTTT 1172 het 1172 ref 29 19 3 7 T 10 11 53439 CASAVA_Build 1 161361084 1D TGCTGTTTTG A/- AAAAAGGGAG 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 A 6 5 53440 CASAVA_Build 1 161367297 1I TTTGACGATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 A 9 10 53441 CASAVA_Build 1 161377989 1D GATAATTAAA G/- TAAAGAGGAG 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 G 1 0 53442 CASAVA_Build 1 161384224 1I AAAAAAATAT -/G TATATGCAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 0 1 53443 CASAVA_Build 1 161389382 2I AGAACTAGAC --/AG AGAGATTTAC 3070 het 3070 ref 49 20 20 9 AG 2 3 53444 CASAVA_Build 1 161390244 2I TATTACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 AT 6 7 53445 CASAVA_Build 1 161391366 2D TATAAAACTA TG/-- TATATGTATA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 TG 1 0 53446 CASAVA_Build 1 161394134 5I AAAAGAGATG -----/GTGAA GTGGTTTGTC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 GTGAA 0 1 53447 CASAVA_Build 1 161399454 3D ATGATATTTC GGG/--- GGGGGGGGTG 2417 het 2417 ref 33 13 7 13 G 11 8 53448 CASAVA_Build 1 161399899 1I GCACACAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2075 hom 27 7 14 6 A 9 10 53449 CASAVA_Build 1 161402529 3I GCATAGAAGC ---/AGA AGGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AGA 0 1 53450 CASAVA_Build 1 161402679 2I57M1I AGCACTTATT --TGTTTTTCTCAATGGTCCATTTTTGTTTTTAAAAGTGAGAACTCAAAAATACATGTT-/TCTGTTTTTCTCAATGGTCCATTTTTGTTTTTAAAAGTGAGAACTCAAAAATACATGTTA AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 34 23 19 7 N/A 0 0 53451 CASAVA_Build 1 161403478 1I TTGAAGTAAT -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 7 8 53452 CASAVA_Build 1 161413036 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1854 hom 24 het 11 0 8 3 A 12 13 53453 CASAVA_Build 1 161427405 2D GGATCAATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 AT 7 6 53454 CASAVA_Build 1 161440322 2I AATCTGTAAA --/TG TAAATGCCTA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TG 0 1 53455 CASAVA_Build 1 161444684 2I ATGGCGTGAA --/CC CCCGGGAGGC 1718 hom 10 het 4 0 4 0 C 3 5 53456 CASAVA_Build 1 161446571 1I GCCCAACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 10 11 53457 CASAVA_Build 1 161454959 1I TTTCAATTTA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 2143 hom 28 5 16 7 T 7 8 53458 CASAVA_Build 1 161455544 1I CGAGGTGTAA -/T ATGCATACAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 0 1 53459 CASAVA_Build 1 161456738 2I AAATAATCAC --/AT GTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 AT 0 1 53460 CASAVA_Build 1 161462596 4D5M23D GGCCTCCCAA AGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCAC/----GTGGG----------------------- CCAGCCAGAG 2881 het 787 hom 9 2 9 3 N/A 0 0 53461 CASAVA_Build 1 161466324 4D CTCCAGATAC CTGG/---- CTCATAGTAG 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 CTGG 1 0 53462 CASAVA_Build 1 161466877 8D ACCTTAGTTG TAAGATAC/-------- TAAGCTTTTG 3070 het 3070 hom 37 14 20 7 TAAGATAC 1 0 53463 CASAVA_Build 1 161472794 1D AGTGAATTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 A 10 9 53464 CASAVA_Build 1 161473375 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2473 het 2473 ref 28 10 8 10 A 13 14 53465 CASAVA_Build 1 161476466 1D TTTAGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 T 11 10 53466 CASAVA_Build 1 161476844 1D CATGGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 1081 het 1081 ref 35 27 3 5 A 13 12 53467 CASAVA_Build 1 161481762 1D CCCAGAATTA T/- CTTTTCCCCA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 1 0 53468 CASAVA_Build 1 161483551 3I GGATTGTACT ---/ATG CTCATTACCT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 ATG 0 1 53469 CASAVA_Build 1 161488717 1D TTGAATTTTG A/- AGAGTTCTTT 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 A 2 1 53470 CASAVA_Build 1 161492735 4D CCAATAACAG ACAA/---- ACAGAGAGCC 3070 het 6 hom 15 1 14 1 ACAA 1 0 53471 CASAVA_Build 1 161497085 1D AATAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 31 1 16 14 A 12 11 53472 CASAVA_Build 1 161497515 1I ATTTTGACTT -/A AAACTGGATT 3070 het 3070 hom 68 30 31 7 A 3 4 53473 CASAVA_Build 1 161502552 2I GGATCTGCTC --/CT CTGTTTTTAT 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 CT 1 2 53474 CASAVA_Build 1 161516618 1D GGCACAAATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 38 21 8 9 A 9 8 53475 CASAVA_Build 1 161517041 1D CAAAAAAAGT A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 44 21 23 0 A 8 7 53476 CASAVA_Build 1 161527068 1D AGCTCATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 34 3 14 17 A 17 16 53477 CASAVA_Build 1 161527546 2D CCCACTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1347 hom 27 5 11 11 A 14 12 53478 CASAVA_Build 1 161529278 1I TTTAATGGGG -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 6 7 53479 CASAVA_Build 1 161534522 1D TTTGAACACT A/- ACAATACACA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 2 1 53480 CASAVA_Build 1 161537755 1I AGAATGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 T 10 11 53481 CASAVA_Build 1 161544038 1I TAAGAGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 A 10 11 53482 CASAVA_Build 1 161545488 2D GATAGGCTGG GT/-- GTAGTGGTTC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 GT 2 1 53483 CASAVA_Build 1 161545913 1D TAAGGAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 10 T 11 10 53484 CASAVA_Build 1 161552998 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 13 12 53485 CASAVA_Build 1 161554262 1I CTGAACTGCC -/T TTTTTTTTTT 1359 het 1359 ref 43 31 3 9 T 11 12 53486 CASAVA_Build 1 161560402 1I AGAGGCCATT -/A ATACTGTGCC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 2 53487 CASAVA_Build 1 161560928 1I CTAAAATTCT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 A 7 8 53488 CASAVA_Build 1 161562819 1D TCGTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2326 het 2326 ref 22 15 7 0 A 12 11 53489 CASAVA_Build 1 161587193 1I GCCCATGAAA -/T TGTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 1 2 53490 CASAVA_Build 1 161588508 1D TTTCTTTGTA T/- TTCTCAATTG 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 T 3 2 53491 CASAVA_Build 1 161589674 1I ATAATATATT -/G GGTTGACTAA 3070 het 3070 ref 54 27 18 9 G 2 3 53492 CASAVA_Build 1 161591554 1I AGTAGCAAAC -/T TTTTTGATGT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 5 6 53493 CASAVA_Build 1 161592559 5I ACTCCATAAC -----/TCTTA TCTATTAGTA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 TCTTA 0 1 53494 CASAVA_Build 1 161594339 17D CCCTTCATAA TCTAGACTTTCTCACCT/----------------- TCTAGACTTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 9 TCTAGACTTTCTCACCT 2 1 53495 CASAVA_Build 1 161594466 1D TTTACACGTG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 41 12 19 10 T 7 6 53496 CASAVA_Build 1 161603052 1I ATAGATAGGG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 7 8 53497 CASAVA_Build 1 161616026 1I CGTTTTTCGC -/T TTTTTTTTTT 1480 het 1480 ref 36 16 6 14 T 12 13 53498 CASAVA_Build 1 161627325 1I GAAATTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 34 1 19 14 T 14 15 53499 CASAVA_Build 1 161638695 1D TTGCCTGCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 938 hom 39 3 19 18 T 13 12 53500 CASAVA_Build 1 161694826 1I GACCTCACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 411 hom 37 1 31 5 T 9 10 53501 CASAVA_Build 1 161712571 1I TATTTTTTGA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 6 7 53502 CASAVA_Build 1 161729760 2D AAATATATAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AT 7 6 53503 CASAVA_Build 1 161730129 1I GTGCTAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 806 hom 38 5 26 7 A 15 16 53504 CASAVA_Build 1 161730437 1D AAGTTAAAAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 7 6 53505 CASAVA_Build 1 161732196 4D AGTTCCTGAT AGAC/---- AGTTCTCAAA 3070 het 3070 ref 48 26 19 5 AGAC 1 0 53506 CASAVA_Build 1 161734192 1D AAAACATTTA T/- TAGTATTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 2 1 53507 CASAVA_Build 1 161744778 1I TTGAAGGAAC -/A TGTGAGCAGC 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 A 0 1 53508 CASAVA_Build 1 161753576 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 2684 het 1917 hom 17 8 7 2 T 9 10 53509 CASAVA_Build 1 161764620 4D TCAAAAAGTA AAAC/---- AAACTACCAT 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 AAAC 2 1 53510 CASAVA_Build 1 161766969 1D GTGCATTGAG A/- AACAATATTT 3070 hom 53 het 22 0 18 6 A 3 2 53511 CASAVA_Build 1 161767420 5D TTTTCAAGAA ATAAG/----- ATAAGGGTAG 3070 hom 135 het 47 0 46 2 ATAAG 2 1 53512 CASAVA_Build 1 161777602 2D AATGTCCTGT CA/-- CACACACACA 1546 het 1546 ref 53 35 4 15 CA 9 8 53513 CASAVA_Build 1 161803899 2D ATAATAAAAG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 TA 7 6 53514 CASAVA_Build 1 161806209 1I GTCTGCCACA -/T TTCCTGGAAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 2 3 53515 CASAVA_Build 1 161826790 1I TAATTGGTAG -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 6 7 53516 CASAVA_Build 1 161831314 1I GCCATCAAAA -/G GTGTCAGATC 3070 hom 49 het 19 0 16 3 G 1 2 53517 CASAVA_Build 1 161832716 2D ATCCTGGCTC AA/-- AAGCTCCCCC 1722 het 47 hom 9 1 5 4 A 4 2 53518 CASAVA_Build 1 161839764 2D GCTAGCAAGT TC/-- TCTCTAGACC 3070 hom 90 het 33 0 31 6 TC 3 2 53519 CASAVA_Build 1 161853172 2D ATTATAAGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2880 hom 24 7 12 6 AT 7 6 53520 CASAVA_Build 1 161854446 1D AAAGCAGCCA G/- GCAGAGAGGA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 G 2 1 53521 CASAVA_Build 1 161854891 1I TTATGATGCA -/G GACCAAGCAC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 1 2 53522 CASAVA_Build 1 161869663 1I ATTCCAAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 9 10 53523 CASAVA_Build 1 161919644 1D AATTTAAAAC T/- TTTTGTTCAT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 5 4 53524 CASAVA_Build 1 161921312 1D TCTCTCTTTG T/- TGACAAGGCT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 T 2 1 53525 CASAVA_Build 1 161925336 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1927 het 1927 ref 33 22 6 5 A 11 12 53526 CASAVA_Build 1 161926713 2I TATGTACAAA --/CT CTCTGTGTGT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 CT 2 3 53527 CASAVA_Build 1 161941239 1D TTTCTTTTTT A/- AAAATAGTCG 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 5 4 53528 CASAVA_Build 1 161952624 1I TAGATACTCT -/G GCTAAAGGCT 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 G 1 2 53529 CASAVA_Build 1 161962787 1D TCCTTTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 573 hom 34 3 15 16 A 12 11 53530 CASAVA_Build 1 161962798 2D AAAAAAAAAA AT/-- AAAGAGAGAG 3070 het 303 hom 35 2 14 20 AT 1 0 53531 CASAVA_Build 1 161971342 3I TCTGAGCTTC ---/TTT TTATTTATTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 5 53532 CASAVA_Build 1 161973186 1D TGTTGTAGAC T/- TTTTAAAAGT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 5 4 53533 CASAVA_Build 1 161976825 9I TTTATGTTCC ---------/AGGTCTTAG AGTGAGGGCT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 AGGTCTTAG 0 1 53534 CASAVA_Build 1 161978834 1D GTGAACGTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 9 8 53535 CASAVA_Build 1 161985068 1I AAAAACAATA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 7 8 53536 CASAVA_Build 1 161985679 1D AATACTCGAT A/- ACTGAAACTC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 2 1 53537 CASAVA_Build 1 161996578 1D AAGAAGGGCA T/- TACATAATGG 3070 het 1014 hom 14 3 10 1 T 2 1 53538 CASAVA_Build 1 162000648 1D GATTAAAACA T/- TATTATCACG 3070 het 3070 ref 50 29 17 5 T 2 1 53539 CASAVA_Build 1 162001008 1D ATTCAACAAA T/- AATTTTTGAA 2431 het 2431 ref 21 12 5 4 T 1 0 53540 CASAVA_Build 1 162004070 1I ACTCTGGTGA -/T TTTTTACTGA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 T 5 6 53541 CASAVA_Build 1 162010412 10D ATCTGGGGTT TGTGTGTGTC/---------- TGTGTGTGTC 3070 hom 57 het 22 0 17 7 TGTGTGTGTC 2 1 53542 CASAVA_Build 1 162013706 1I TGAATAACTT -/G TAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 G 0 1 53543 CASAVA_Build 1 162014635 1I AAATTAGCAC -/A AAAAGATATT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 4 5 53544 CASAVA_Build 1 162020751 1I TATATAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2640 hom 34 9 14 11 A 14 15 53545 CASAVA_Build 1 162025102 1I CATCATGACT -/G GAAACTAAGA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 G 1 2 53546 CASAVA_Build 1 162026782 1D TAATTTACAA T/- TTTTTTTCCT 2607 het 2607 ref 31 21 7 3 T 8 7 53547 CASAVA_Build 1 162037883 1I GTCTGGCTAT -/C CAAAACTTTG 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 C 1 2 53548 CASAVA_Build 1 162046640 1D GATAGAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 11 13 T 17 16 53549 CASAVA_Build 1 162072857 1D AAACTGCAGC T/- TTTAGAAGAA 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 T 4 3 53550 CASAVA_Build 1 162101074 1I CTCTACTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 10 11 53551 CASAVA_Build 1 162103354 1I GAAAGAGAAT -/A AAAAAACAGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 7 53552 CASAVA_Build 1 162107663 1D TTCCCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 22 11 A 12 11 53553 CASAVA_Build 1 162125886 1D ATCAACTTGC T/- ACCAGGTGGC 3070 het 3070 hom 59 24 30 5 T 1 0 53554 CASAVA_Build 1 162127110 1D TTTTACTATC T/- TCTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 53 23 27 3 T 2 1 53555 CASAVA_Build 1 162143357 1I AAAAACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 13 14 53556 CASAVA_Build 1 162149656 2I ATGCCAGTAG --/TA TATAGCTCAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 TA 2 3 53557 CASAVA_Build 1 162153751 11D CATGTCTCTC TGACTGCTCAT/----------- TGACTGTCAT 3070 het 3070 ref 40 22 16 9 TGACTGCTCAT 1 0 53558 CASAVA_Build 1 162174529 1I TATTTCTCAC -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 T 6 7 53559 CASAVA_Build 1 162179313 1D AATCTCAGCA C/- TTTGGGAGGG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 C 1 0 53560 CASAVA_Build 1 162188943 11D CCCTGGGACA GAGCACCTGGT/----------- GGGGAAGGGG 3070 het 3070 ref 34 23 9 5 GAGCACCTGGT 1 0 53561 CASAVA_Build 1 162200601 4D TAGTAAATAT TAAA/---- AAAGCAATAT 3070 het 3070 ref 39 20 18 4 TAAA 1 0 53562 CASAVA_Build 1 162231275 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 6 7 53563 CASAVA_Build 1 162247030 1D AACTAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 13 19 13 A 15 14 53564 CASAVA_Build 1 162253480 1D GGACCCAGTG T/- TTCAGGAAGT 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 T 3 2 53565 CASAVA_Build 1 162263045 9D CTGCCTTCTT ATCCTGTTG/--------- ATCCTGTTGA 3070 het 3070 ref 48 28 16 8 ATCCTGTTG 2 1 53566 CASAVA_Build 1 162266264 4D GAATATTATA TGTG/---- TAATGCTGAG 3070 het 3070 ref 33 24 8 1 TG 2 0 53567 CASAVA_Build 1 162268623 1I TTGAAAGGAG -/A GTTTTTTTTA 1215 het 1215 ref 29 9 6 14 A 0 1 53568 CASAVA_Build 1 162286674 1D ATCTTTTTTG T/- TTTTTATGGA 3070 het 3070 hom 36 13 20 4 T 6 5 53569 CASAVA_Build 1 162301467 1I TCGCACCCCC -/A AAGGGCAATA 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 2 3 53570 CASAVA_Build 1 162304816 1I CATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 9 10 53571 CASAVA_Build 1 162305814 1D TGGCCTATAG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 8 7 53572 CASAVA_Build 1 162306425 1D GCTTCTTTAG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 8 7 53573 CASAVA_Build 1 162307081 1D TTTCAAATTG T/- TATGTCATCT 3070 het 3070 ref 49 27 20 3 T 2 1 53574 CASAVA_Build 1 162312705 1D TCTTGTTTAA T/- TTTCTACGCT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 T 4 3 53575 CASAVA_Build 1 162313641 4D ACAGTGTTTT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 21 22 1 AC 9 7 53576 CASAVA_Build 1 162313791 1D TCAAGTCCCC T/- TTTATTAATA 3070 het 3070 hom 51 20 23 9 T 4 3 53577 CASAVA_Build 1 162315307 2I AATGGTCCAA --/TG TTATAGGGAC 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 TG 0 1 53578 CASAVA_Build 1 162318884 1I TTATTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 982 hom 47 3 35 9 T 11 12 53579 CASAVA_Build 1 162321813 3D ATATTTTGTC CTT/--- ATTCAATTAT 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 CTT 1 0 53580 CASAVA_Build 1 162342880 1D TCTGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2489 hom 45 12 22 12 A 14 13 53581 CASAVA_Build 1 162352194 1I ACTGGCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 11 12 53582 CASAVA_Build 1 162365638 4D CTGGGTATAT ACGG/---- AGCCAAAGGA 3070 hom 117 het 42 0 40 3 ACGG 1 0 53583 CASAVA_Build 1 162366841 1D AGAGCCATAT A/- TTTTTGCCCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 0 53584 CASAVA_Build 1 162379898 3I TCCTAGAGCA ---/ATC CAATATTAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATC 0 1 53585 CASAVA_Build 1 162389266 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 13 14 53586 CASAVA_Build 1 162391127 1D AATTGTAATC T/- CAGTTCCTAA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 T 1 0 53587 CASAVA_Build 1 162392540 1I CTGCTTATAC -/A AAATCCTATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 3 4 53588 CASAVA_Build 1 162393270 1I ATAGACTACC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 129 het 49 0 40 9 T 6 7 53589 CASAVA_Build 1 162405323 1I CCTAACAACC -/A AAAAAAGTCC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 6 7 53590 CASAVA_Build 1 162407936 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 18 1 15 2 A 12 11 53591 CASAVA_Build 1 162413749 1D AAACTTTTTA G/- GTCTTGTATT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 G 2 1 53592 CASAVA_Build 1 162420594 1I TATTTTCTCA -/G CATATCTTAT 3070 hom 105 het 45 0 36 9 G 0 1 53593 CASAVA_Build 1 162427540 2D TAAACTTCTC TT/-- GACTTAAGTA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 2 0 53594 CASAVA_Build 1 162433799 1I GAAGTCAAAT -/C CCAAAATAGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 2 3 53595 CASAVA_Build 1 162438047 1I ATTTAGCCAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 8 9 53596 CASAVA_Build 1 162443311 1D TCAGGCCAAA G/- TTATCGACAT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 G 1 0 53597 CASAVA_Build 1 162523111 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2500 het 2500 ref 15 8 7 0 T 11 10 53598 CASAVA_Build 1 162531377 4I TATAGCAAGT ----/AAGA GTTTGGCTGT 3070 het 3070 hom 49 19 29 1 AAGA 0 1 53599 CASAVA_Build 1 162539628 2I AAGTTTGGAG --/AT ATCAAAAGTA 3070 het 3070 hom 52 24 23 5 AT 1 2 53600 CASAVA_Build 1 162547087 1D AGCCAAGTTT G/- ATTAAATAAC 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 G 1 0 53601 CASAVA_Build 1 162559173 21I CTCTAAATTC ---------------------/CCTGCATGTAGCACCGGTTCT TTAAATCTAG 3070 hom 96 het 36 0 33 4 CCTGCATGTAGCACCGGTTCT 0 1 53602 CASAVA_Build 1 162568915 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1126 het 616 hom 17 6 3 9 A 17 16 53603 CASAVA_Build 1 162569123 4D AGTCTTCTAC ATCT/---- ATCCCTGGCA 1895 het 1895 ref 30 22 6 2 ATCT 1 0 53604 CASAVA_Build 1 162580517 1I TCTATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 13 14 53605 CASAVA_Build 1 162583285 1I TGATCTTCTG -/C AGCTGAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 C 0 1 53606 CASAVA_Build 1 162590781 1D ATGAAACCAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 9 8 53607 CASAVA_Build 1 162591908 2D CATACACACA CG/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 CG 1 0 53608 CASAVA_Build 1 162594021 1I TGTTCTGTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 8 9 53609 CASAVA_Build 1 162601193 1D AAAATCCAAA G/- GGGGGGCAGG 3070 het 868 hom 15 3 9 3 G 7 6 53610 CASAVA_Build 1 162617793 3D TAAAAGGCTA TTG/--- TTGGATGGCT 3070 het 3070 ref 37 14 17 8 TTG 2 1 53611 CASAVA_Build 1 162630617 1I AAATAATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 11 12 53612 CASAVA_Build 1 162652034 2D CGAGCTATGC AT/-- ATATATATAT 1754 het 1754 ref 32 22 5 5 AT 7 6 53613 CASAVA_Build 1 162666843 1D GAATCCACCC T/- TTTTTTTTTT 2743 het 1219 hom 16 5 9 2 T 12 11 53614 CASAVA_Build 1 162670926 1D AACATACAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 A 8 7 53615 CASAVA_Build 1 162672459 3I CTGTCTCAAA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 AAT 3 4 53616 CASAVA_Build 1 162674088 19D TCCATTGTCT CTATTTGTTTCTAGAAATA/------------------- CTATTTGTTT 3070 het 3070 ref 28 18 8 9 CTATTTGTTTCTAGAAATA 2 1 53617 CASAVA_Build 1 162714935 3D CTGAGCTCAA AAC/--- AACAATCTTT 3070 het 3070 ref 39 24 12 4 AAC 2 1 53618 CASAVA_Build 1 162718121 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1202 het 1202 ref 28 20 3 6 A 13 12 53619 CASAVA_Build 1 162724298 2D AAGTAATAGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 26 0 18 8 AT 9 8 53620 CASAVA_Build 1 162739623 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 15 2 10 5 A 13 12 53621 CASAVA_Build 1 162740593 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3051 het 3051 ref 24 12 9 3 A 11 12 53622 CASAVA_Build 1 162748017 1D ATATAAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 10 9 53623 CASAVA_Build 1 162750804 3I GCTGTTAGCC ---/AGA AGATTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 AGA 1 2 53624 CASAVA_Build 1 162754402 1D CCTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 1992 het 1709 hom 27 9 6 12 A 17 16 53625 CASAVA_Build 1 162776898 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 992 het 992 ref 15 5 4 6 A 16 15 53626 CASAVA_Build 1 162781583 1D GTAGGCTAAA T/- TTCACATATT 2730 het 2730 ref 28 15 7 7 T 3 2 53627 CASAVA_Build 1 162796414 1D CTCCTTTCTT C/- CCCCCCTACC 2781 het 2781 ref 28 15 10 4 C 7 6 53628 CASAVA_Build 1 162798827 1D TAAACTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 A 15 14 53629 CASAVA_Build 1 162801611 1D TTGCAGGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 10 11 T 14 13 53630 CASAVA_Build 1 162804199 1I CTTTTCCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 38 0 34 4 A 9 10 53631 CASAVA_Build 1 162807455 17D4M14D TATTCAGTTG CTACAGTAACTTAAGGAATGGACTTCAGTTACTGT/-----------------ATGG-------------- TCACTTAGGT 3070 het 3070 ref 33 29 15 5 N/A 0 0 53632 CASAVA_Build 1 162823404 1D GTGTGTCTGA T/- TTTTTTTTTT 748 het 748 ref 45 38 3 4 T 11 10 53633 CASAVA_Build 1 162824230 1I TACAGGATTT -/G GGGGAAAAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 4 5 53634 CASAVA_Build 1 162829510 4I AAAAATAATA ----/AAGT AATAGCCAGA 3070 hom 80 het 33 0 25 8 AAGT 0 1 53635 CASAVA_Build 1 162831962 1D AGGTCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 29 3 19 7 T 13 12 53636 CASAVA_Build 1 162839025 1I GGAAGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1410 hom 33 4 22 7 T 11 12 53637 CASAVA_Build 1 162858152 2D TGGGCCGCAC TG/-- TTGTGAGTGC 3070 het 3070 hom 49 23 19 10 TG 1 0 53638 CASAVA_Build 1 162888735 1D CTGTTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 865 het 865 ref 34 20 3 11 T 14 13 53639 CASAVA_Build 1 162889210 1I GTCTCACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 12 13 53640 CASAVA_Build 1 162890387 1D TTTTTGAAAG A/- TATGGACAAG 3070 het 3070 hom 39 13 23 4 A 1 0 53641 CASAVA_Build 1 162898697 1D GTGAACATTT A/- TTTTTTTTCT 3070 hom 22 het 36 1 33 2 A 1 0 53642 CASAVA_Build 1 162900772 2I GTCCCTCCCA --/TG CAATACATGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TG 0 1 53643 CASAVA_Build 1 162907899 1D TTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1658 het 1658 ref 16 6 5 5 T 13 12 53644 CASAVA_Build 1 162915789 1I CTCCTGCTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1306 hom 44 3 31 10 T 9 10 53645 CASAVA_Build 1 162916971 1D CTGTCATGAT G/- GGAGCGTGCC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 3 2 53646 CASAVA_Build 1 162917697 1D AACAAAAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 18 9 7 A 9 8 53647 CASAVA_Build 1 162928595 1D TGTAGATGTA T/- TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 T 6 5 53648 CASAVA_Build 1 162929005 3D CACTGTAACA CAG/--- CAGATTTAAA 3070 het 3070 hom 48 17 21 14 CAG 2 1 53649 CASAVA_Build 1 162944245 1I GTCTTTTTTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 8 9 53650 CASAVA_Build 1 162993670 7I AGTAAAACTT -------/TCCAAGG TTTATCAACC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TCCAAGG 0 1 53651 CASAVA_Build 1 163002885 1D TTTTATCCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 10 9 53652 CASAVA_Build 1 163003864 1D CCATATATAC T/- TTTTTTTTTT 1234 het 1234 ref 36 28 3 5 T 11 10 53653 CASAVA_Build 1 163025830 1I GAGGCGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2064 hom 26 8 12 6 T 10 11 53654 CASAVA_Build 1 163029633 2D CATTACCCTA CT/-- CTCATTGAAT 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 CT 2 1 53655 CASAVA_Build 1 163040515 3D CTTCACAAAT AGC/--- AGCGCAATTA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 AGC 2 1 53656 CASAVA_Build 1 163041508 2D GCCTAAAACA AC/-- AGTCTTTAGG 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 AC 1 0 53657 CASAVA_Build 1 163047735 7I CAAATTATTA -------/ATATAAG TAGGATAAGA 3070 hom 106 het 41 0 36 5 ATATAAG 0 1 53658 CASAVA_Build 1 163048712 1D TCTACATGTG A/- AAAAATGTAG 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 A 6 5 53659 CASAVA_Build 1 163052689 1D AGTTAACTGA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 27 12 13 3 T 8 7 53660 CASAVA_Build 1 163054674 1D TCTATGGGGG A/- AAAAAAGTCC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 7 6 53661 CASAVA_Build 1 163057192 1I ACCATTTTAC -/T GTCTTGCTTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 0 1 53662 CASAVA_Build 1 163057884 1D CTGTGGTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 A 10 9 53663 CASAVA_Build 1 163059256 5I TTTTTGGGAT -----/ATAAG ATAAGTTTTT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 ATAAG 1 2 53664 CASAVA_Build 1 163061774 1D GTAGCAACAT A/- ACATTGTTGT 3070 het 3070 ref 60 29 26 6 A 2 1 53665 CASAVA_Build 1 163062154 2D CTTGAAACCC AA/-- ATGGGAAGGA 3070 het 3070 hom 36 15 15 9 A 3 1 53666 CASAVA_Build 1 163092338 1I ATATTTTTAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 8 9 53667 CASAVA_Build 1 163107728 6D7M8I CATAGCACAT GTTTAAACAAACA--------/------ATAAGGATTTTTTTT TATACTTGTT 3070 hom 111 het 36 0 38 1 N/A 0 0 53668 CASAVA_Build 1 163111835 45D TACCTATATA TATTTGGTGTATGTGTATATATATATATATATACACACATACACC/--------------------------------------------- AAATGGTTTT 3070 hom 81 het 22 0 28 1 TATTTGGTGTATGTGTATATATATATATATATACACACATACACC 1 0 53669 CASAVA_Build 1 163115088 2I GGTGAACAAA --/TT CATTTATTTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 0 2 53670 CASAVA_Build 1 163124482 4D TGGAATATCA ACTG/---- ACTGTGTAGC 3070 hom 93 het 34 0 31 4 ACTG 2 1 53671 CASAVA_Build 1 163133207 1I GAATTCCAAG -/T GTTAGAGAGC 3070 hom 160 het 61 0 54 7 T 0 1 53672 CASAVA_Build 1 163138089 1I22M2D CATAATATAC -GTTATATATATAATTATATGTGGA/AGTTATATATATAATTATATGTG-- GAGAGAGAGA 3070 hom 21 het 8 0 8 2 N/A 0 0 53673 CASAVA_Build 1 163145497 3D GAATAGTCCA AAG/--- AAGACGGAAT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 AAG 2 1 53674 CASAVA_Build 1 163172216 2I AGTTGGGAAA --/AG AGGTTTCCTT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 AG 1 2 53675 CASAVA_Build 1 163173021 1D AACCAGGGGG A/- AAAAATCTCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 6 5 53676 CASAVA_Build 1 163176772 1D GGAGTGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 39 0 19 20 A 15 14 53677 CASAVA_Build 1 163177125 1I GATGTGCCCA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 7 8 53678 CASAVA_Build 1 163183155 2D TGTTAAGTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 21 0 14 8 AT 10 9 53679 CASAVA_Build 1 163225862 1I TTATTTTGCC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 411 hom 34 1 31 2 T 8 9 53680 CASAVA_Build 1 163231284 1I TGTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 29 1 25 3 A 10 11 53681 CASAVA_Build 1 163238698 1I ACAAACTACT -/A AAAAGCTCAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 4 5 53682 CASAVA_Build 1 163270447 2D GGGAGATATG GA/-- GAGAGAGAGA 1129 het 1129 ref 43 30 3 12 GA 9 8 53683 CASAVA_Build 1 163291021 2I TAACATAAAC --/AT AATTTAACAC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AT 0 1 53684 CASAVA_Build 1 163302724 1D TAAATTGAAC G/- TATTTCCCTG 3070 het 3070 hom 54 20 27 8 G 1 0 53685 CASAVA_Build 1 163303089 1D AGAAAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 11 10 53686 CASAVA_Build 1 163304695 15D TCAAGTCACT TGACTTGTTAGTCAG/--------------- TGACTAACAG 3070 het 3070 ref 28 16 11 4 TGACTTGTTAGTCAG 1 0 53687 CASAVA_Build 1 163314196 1D TCTGAGCATT A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 53 20 23 10 A 7 6 53688 CASAVA_Build 1 163318874 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 894 hom 23 3 17 3 A 13 12 53689 CASAVA_Build 1 163319135 1D ATTGCATCTT G/- GAATTTTAGC 3070 hom 110 het 39 0 36 3 G 2 1 53690 CASAVA_Build 1 163330136 1I AAAAGCAAAC -/A AAAAATTCAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 5 6 53691 CASAVA_Build 1 163331417 1D GGAAAGAACA G/- TAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 1 0 53692 CASAVA_Build 1 163333419 1I ACTGGTCAAT -/A AAGAATTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 2 3 53693 CASAVA_Build 1 163344426 1I CCGAGTAGCT -/G GGACTACAGG 3070 hom 24 het 10 0 9 2 G 2 3 53694 CASAVA_Build 1 163368896 1D AGGAGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 786 hom 51 4 35 12 T 15 14 53695 CASAVA_Build 1 163371084 28I TAAATGCCTG ----------------------------/TGATGCCTATTTTGGGATCACTTGCCCT TAATACATTC 3070 hom 114 het 39 0 39 2 TGATGCCTATTTTGGGATCACTTGCCCT 0 1 53696 CASAVA_Build 1 163371919 1D TGATATTGAA C/- CATCATTGCC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 2 1 53697 CASAVA_Build 1 163375210 1D CTGGCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 28 1 23 5 A 13 12 53698 CASAVA_Build 1 163395898 1I CGCTATCCCT -/C CCCCCAGGCT 2844 het 2030 hom 14 6 7 1 C 5 6 53699 CASAVA_Build 1 163406894 2D TGGAATCCAC AT/-- GTTTGCCAAG 3070 het 3070 ref 45 22 15 9 AT 1 0 53700 CASAVA_Build 1 163409881 1D TTGGTGGTTT A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 A 7 6 53701 CASAVA_Build 1 163417748 2D TGTCAACCAT AA/-- AAAGATACAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 5 3 53702 CASAVA_Build 1 163424357 4I AAAAATAACT ----/GACA AACTGAGGTC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 GACA 0 1 53703 CASAVA_Build 1 163458982 1I ACACTTCAAG -/A AAAAAAAAAA 863 het 863 ref 43 31 2 10 A 10 11 53704 CASAVA_Build 1 163461883 1I GAATGGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 19 8 T 10 11 53705 CASAVA_Build 1 163464094 1I TTTAGATAGC -/A CCTGCTGAAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 0 1 53706 CASAVA_Build 1 163465585 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 7 6 53707 CASAVA_Build 1 163466269 1I CCCAAGGAAA -/C CCCCCCCAGT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 C 7 8 53708 CASAVA_Build 1 163467164 1I TTTTTTTTTT -/A TTATTATTTT 3070 hom 14 het 14 0 11 3 A 0 1 53709 CASAVA_Build 1 163469153 1D CAGTATCTAC A/- AAAAATTTAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 6 5 53710 CASAVA_Build 1 163471025 1D GTATAGGGGG C/- GATGCAGTCG 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 C 1 0 53711 CASAVA_Build 1 163472639 2D AGGAAGCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 20 0 11 9 A 16 14 53712 CASAVA_Build 1 163472714 1D GAGTTCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 26 2 9 15 T 15 14 53713 CASAVA_Build 1 163474081 3D GAAGCACGTT AGA/--- AGAAGTTTTG 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 AGA 2 1 53714 CASAVA_Build 1 163474429 1I ACTGGAGGTT -/A AAAAGCAAGG 3070 hom 126 het 54 0 42 12 A 4 5 53715 CASAVA_Build 1 163474939 2D GAAAAAATCA TG/-- ATGTGATCAT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 TG 1 0 53716 CASAVA_Build 1 163476180 1D CTACTCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 11 10 53717 CASAVA_Build 1 163481400 2D AAGCTAATTA CT/-- CTCCTCAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 CT 2 1 53718 CASAVA_Build 1 163485893 3I CTGAACAATG ---/AGA ACACATGGAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AGA 0 1 53719 CASAVA_Build 1 163493302 1I GGCAGGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 10 11 53720 CASAVA_Build 1 163507672 1D AGGATTTAGG T/- TGGTGGACAG 3070 het 3070 hom 54 18 26 10 T 2 1 53721 CASAVA_Build 1 163513975 4D TAACTTGGCC AAGG/---- AAGGTCACAA 3070 het 3070 ref 44 24 12 9 AAGG 2 1 53722 CASAVA_Build 1 163515332 2D AGAAGATCCA AG/-- AGAGAAACTG 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 AG 3 2 53723 CASAVA_Build 1 163522654 1I TGAAAACAAG -/C CCCTTTCCAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 3 4 53724 CASAVA_Build 1 163525104 1D GATTATTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 203 hom 44 1 38 5 A 13 12 53725 CASAVA_Build 1 163528605 1D ATAAACAAAT A/- ACAACCCAGG 3070 het 3070 ref 50 27 17 7 A 2 1 53726 CASAVA_Build 1 163535976 1D GCTGAGCATG C/- CCCCCAACGA 3070 hom 102 het 37 0 33 5 C 6 5 53727 CASAVA_Build 1 163553113 1D ATAGAAATGC A/- ACTATCCATA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 2 1 53728 CASAVA_Build 1 163559666 1I TTCTCAATAC -/T TTTCACATCT 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 T 3 4 53729 CASAVA_Build 1 163559710 1D GTAAAATACC A/- AAGGCAAAGA 2981 het 2981 ref 33 19 7 9 A 3 2 53730 CASAVA_Build 1 163561323 4D TATATACATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 34 0 22 12 TG 9 7 53731 CASAVA_Build 1 163561887 5D CACTGCCCTG TTGGA/----- GGAAGCAATA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TTGGA 1 0 53732 CASAVA_Build 1 163565288 2D AAGACAGGGC CT/-- CTCTGTTCCC 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 CT 3 2 53733 CASAVA_Build 1 163570510 5D GCCGTTTTGC TTAAA/----- TTAAATTCTT 3070 het 3070 ref 47 24 21 5 TTAAA 2 1 53734 CASAVA_Build 1 163575696 1D CACATGGATG C/- CCCACTGTCC 3070 het 3070 hom 42 15 20 8 C 4 3 53735 CASAVA_Build 1 163583794 85D TTGTTGTCAT TAGAGAAACAGCTCCTGCTCACTCTCTCCAAAAACCTTCCCAGAATTAAAAAGCAACAATCAAGAGGCTTCCCTGAAATTAGTAA/------------------------------------------------------------------------------------- TGGTCTTTTG 3070 het 3070 ref 30 39 9 5 TAGAGAAACAGCTCCTGCTCACTCTCTCCAAAAACCTTCCCAGAATTAAAAAGCAACAATCAAGAGGCTTCCCTGAAATTAGTAA 1 0 53736 CASAVA_Build 1 163585480 1I CCTTAAATGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 48 20 23 5 T 9 10 53737 CASAVA_Build 1 163586400 1D CCTGAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 32 2 14 16 T 11 10 53738 CASAVA_Build 1 163587029 1D TGATTCGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 72 hom 33 3 20 12 T 11 10 53739 CASAVA_Build 1 163595180 1I ATTTATGAAG -/A AATCAGCCAT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 2 3 53740 CASAVA_Build 1 163615984 1I CTCCCACCAG -/T TTTCATGTTT 3070 het 3070 ref 51 25 18 8 T 3 4 53741 CASAVA_Build 1 163620429 1D ATTAAAAAAC A/- AAACAAACAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 4 3 53742 CASAVA_Build 1 163624524 5I GGAGAAGGAC -----/TTATG TTATATTATC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 TTATG 0 1 53743 CASAVA_Build 1 163627695 8D CTCACTCTGT CACCCAGA/-------- ATGGAGTGCA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 CACCCAGA 1 0 53744 CASAVA_Build 1 163636992 1I AGAAAGGTTT -/A TCTTTATTAT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 0 1 53745 CASAVA_Build 1 163637951 2I TTGTTACCAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1869 hom 23 6 11 6 T 12 14 53746 CASAVA_Build 1 163638308 4I TTAGGAAAAG ----/AGTT AGAAAATCAT 3070 hom 117 het 45 0 39 8 AGTT 0 1 53747 CASAVA_Build 1 163638408 2D ATCCTACACA CT/-- CACACATGCT 3070 het 3070 ref 69 32 27 13 CT 1 0 53748 CASAVA_Build 1 163638799 2D CACATGCACA CT/-- CTTACACACA 3070 het 3070 hom 74 33 31 14 CT 2 1 53749 CASAVA_Build 1 163643715 1D AACAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 A 13 12 53750 CASAVA_Build 1 163645811 1I ACAAGGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 T 11 12 53751 CASAVA_Build 1 163685099 2D CTTTTTTTTT TC/-- TTGGCACCAT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 TC 1 0 53752 CASAVA_Build 1 163693394 6I GTGAAGATGT ------/CAATGC CAATGCCAAT 3070 het 3070 ref 53 23 21 9 CAATGC 2 3 53753 CASAVA_Build 1 163693663 1I GAGCTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 12 23 14 T 10 11 53754 CASAVA_Build 1 163695076 1I TGTGGAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 35 1 30 4 A 10 11 53755 CASAVA_Build 1 163695278 1I ATCTGGCCAC -/A AAAAAAATGG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 7 8 53756 CASAVA_Build 1 163702291 3D CACAGCTCTG ATC/--- ATCAGACTTG 3070 hom 105 het 39 0 32 10 ATC 2 1 53757 CASAVA_Build 1 163713364 8I ATATTGCATT --------/TAATCATC TTGTTTCCTT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TAATCATC 0 1 53758 CASAVA_Build 1 163713803 4I TGCCTCCCTC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 hom 30 het 18 0 11 7 ATTT 3 4 53759 CASAVA_Build 1 163718242 2I AAGAAAGGAG --/AA AAAAACCACA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 5 7 53760 CASAVA_Build 1 163738381 1D CAACCAATTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 9 8 53761 CASAVA_Build 1 163741635 6D GAAGTTGCCT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 76 het 76 ref 14 3 2 16 A 24 18 53762 CASAVA_Build 1 163742167 1D GAACTTGATC T/- GTCTCTGTAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 53763 CASAVA_Build 1 163749511 5I ATCTTCAGGT -----/TAAAC TTTTTTATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAAC 0 1 53764 CASAVA_Build 1 163751923 1D GGCCAGCAAA G/- AACCTAGAAG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 G 1 0 53765 CASAVA_Build 1 163752328 1D AAAATATTGA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 8 7 53766 CASAVA_Build 1 163754232 1D TTTTTTTTTG T/- TTTGTTTTTT 3070 hom 36 het 21 0 12 10 T 4 3 53767 CASAVA_Build 1 163754936 1D CCAGTATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 11 10 53768 CASAVA_Build 1 163755177 1D GGATATTAGA C/- CCCTTGTCGG 3070 hom 66 het 28 0 23 7 C 4 3 53769 CASAVA_Build 1 163755296 3D CCCATTTGTC TTA/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 27 10 TTA 1 0 53770 CASAVA_Build 1 163761431 1D TTCTAAATTT C/- CCCAAACACT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 4 3 53771 CASAVA_Build 1 163765423 2I ATATATAAAA --/AT ATATATATAA 2232 hom 18 het 8 0 7 1 AT 4 5 53772 CASAVA_Build 1 163765720 6D TTTTATTTAA TAATAT/------ TATATATTAT 3070 hom 30 het 12 0 11 2 TAATAT 1 0 53773 CASAVA_Build 1 163771387 5D CAGACCCTAA CAGGC/----- CTAGAATCTC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 CAGGC 1 0 53774 CASAVA_Build 1 163772748 1D CTGGAGACAC A/- AAAGTCTTGG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 A 4 3 53775 CASAVA_Build 1 163779582 3I TGTCACCTAA ---/TCT TCTACTACAG 3070 hom 105 het 43 0 33 10 TCT 1 2 53776 CASAVA_Build 1 163781479 4D GTCTTACAGG TAGA/---- TAGATGCTCA 3070 hom 94 het 35 0 30 5 TAGA 2 1 53777 CASAVA_Build 1 163782094 2D CACTGAGAAT AA/-- GACATTGTGA 3070 hom 144 het 54 0 48 8 A 2 0 53778 CASAVA_Build 1 163792249 1I CTATATACAA -/G GGGGGGGAAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 7 8 53779 CASAVA_Build 1 163804540 1I ATAGGAGATG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 100 het 41 0 34 7 A 9 10 53780 CASAVA_Build 1 163805078 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 12 0 11 1 A 11 10 53781 CASAVA_Build 1 163805237 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 16 0 11 6 A 17 12 53782 CASAVA_Build 1 163807285 5D CTCAGGTACA TAACT/----- TAGAGTTTAC 3070 hom 87 het 31 0 28 6 TAACT 1 0 53783 CASAVA_Build 1 163816146 4D GAGAGAAGAA AGGG/---- AGGGAGGGAG 3070 hom 123 het 46 0 39 8 AGGG 4 3 53784 CASAVA_Build 1 163816876 1D TCTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 816 hom 43 4 28 13 A 13 12 53785 CASAVA_Build 1 163821560 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACCTCCC 3070 hom 80 het 36 0 31 5 C 0 1 53786 CASAVA_Build 1 163824820 1I ACCCTCCCCA -/C CCCCCCAAAA 3070 hom 47 het 21 0 14 7 C 6 7 53787 CASAVA_Build 1 163831452 1D GAAATTAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 33 0 22 11 A 12 11 53788 CASAVA_Build 1 163838245 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 13 1 11 1 A 12 11 53789 CASAVA_Build 1 163843539 2D CTGCTAACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 100 het 48 0 32 17 AC 10 9 53790 CASAVA_Build 1 163851458 1D TTGGAAGAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 9 8 53791 CASAVA_Build 1 163856049 1D ACAGTGAGTT A/- AGAGAGTGAG 3070 hom 87 het 33 0 30 5 A 2 1 53792 CASAVA_Build 1 163856273 1I ATACACTGGG -/C CCCAAATATT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 3 4 53793 CASAVA_Build 1 163867548 1I GCAGAGGATG -/A GCGAGCCGGA 3070 hom 33 het 15 0 10 5 A 0 1 53794 CASAVA_Build 1 163873069 2D AAGAAAAAAA AG/-- AGCAGTTGAG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 AG 2 1 53795 CASAVA_Build 1 163877049 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 7 8 53796 CASAVA_Build 1 163883588 1D GAGAGACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 T 13 12 53797 CASAVA_Build 1 163893759 1D CTTGGCAGAA T/- CCAGTTGGTA 3070 het 3070 ref 45 24 14 8 T 1 0 53798 CASAVA_Build 1 163894918 13D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2001 hom 15 7 9 5 A 24 11 53799 CASAVA_Build 1 163895208 1I ATCCTAGCTC -/A ACTACAACTC 3070 het 3070 ref 44 22 9 13 A 1 2 53800 CASAVA_Build 1 163896520 1D GTTTCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 11 10 53801 CASAVA_Build 1 163919165 4D TCTTCCCTCG TTAA/---- TTAATCGACA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 TTAA 2 1 53802 CASAVA_Build 1 163920857 1D CCATCCTTAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 A 9 8 53803 CASAVA_Build 1 163922378 2I GTTTTTTTTT --/AA TTAAAAAAAA 3070 het 565 hom 21 4 15 2 A 0 2 53804 CASAVA_Build 1 163923454 1D GTACTGAAAG A/- AAAAACTATT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 A 6 5 53805 CASAVA_Build 1 163923881 4D AAAGAAAAGA AATT/---- AATTAATTCT 3070 hom 33 het 12 0 11 2 AATT 3 2 53806 CASAVA_Build 1 163951630 1I CTCCACATGG -/T TAACTGAAGG 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 T 1 2 53807 CASAVA_Build 1 163951713 1I TCCAGAGAAG -/A AAAACAGCAA 3070 het 3070 ref 45 21 19 6 A 4 5 53808 CASAVA_Build 1 163952421 8D GGGAAGAGAG GCACAGAT/-------- TTTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 4 GCACAGAT 1 0 53809 CASAVA_Build 1 163952488 4I GTGTATATTG ----/CTTT CTTTTTTACA 2423 het 2423 ref 22 13 6 3 CTTT 1 2 53810 CASAVA_Build 1 163952568 1I AAAAAGGCCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 21 10 8 3 T 8 9 53811 CASAVA_Build 1 163953698 1I AATTGTTGTA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 7 8 53812 CASAVA_Build 1 163975258 1I TCCTAAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 9 10 53813 CASAVA_Build 1 163976047 1D ATACATCGTG T/- GTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 1 0 53814 CASAVA_Build 1 163985156 1I CCATATATGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 6 7 53815 CASAVA_Build 1 163985976 4I ATTAATAAAA ----/TCTT TCTAAGGAAC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 TCTT 0 1 53816 CASAVA_Build 1 163994595 16D TGACACATAC AGCGTAAATGTTCAAT/---------------- AGCATTTTCT 3070 het 3070 ref 40 28 15 1 AGCGTAAATGTTCAAT 1 0 53817 CASAVA_Build 1 164035012 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2732 het 1905 hom 18 5 8 5 A 13 14 53818 CASAVA_Build 1 164046801 1I TTATTTAGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 G 0 1 53819 CASAVA_Build 1 164054510 1I GCTGATTAAC -/T TTTTTATTAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 5 6 53820 CASAVA_Build 1 164055832 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 A 6 5 53821 CASAVA_Build 1 164058723 1D TTTCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 A 12 11 53822 CASAVA_Build 1 164083235 1I CTTATGATGG -/T TGGTGGTATT 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 T 1 2 53823 CASAVA_Build 1 164089218 1D ATATTTGATA T/- TTTTTTTTTT 2734 het 2734 ref 25 14 7 4 T 11 10 53824 CASAVA_Build 1 164099936 1D AGCTTTCCAA G/- TAGCTGGGAT 3070 hom 75 het 30 0 26 6 G 1 0 53825 CASAVA_Build 1 164110900 1D CTGAGTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 28 2 10 17 A 17 16 53826 CASAVA_Build 1 164113140 5D TTAGATAAAC ATTTT/----- GTTTTGAGAT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 ATTTT 1 0 53827 CASAVA_Build 1 164123633 1I CCTTTGATTT -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 8 9 53828 CASAVA_Build 1 164136611 2I GTGTGTGCAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 GT 8 9 53829 CASAVA_Build 1 164148289 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 A 11 12 53830 CASAVA_Build 1 164149527 8D GCGTGTGTAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 2646 het 844 hom 26 3 7 21 AC 12 8 53831 CASAVA_Build 1 164150343 1I TAGAAGTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 T 8 9 53832 CASAVA_Build 1 164154794 1I AATTGGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 A 11 12 53833 CASAVA_Build 1 164162244 1D CTAATAGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 11 10 53834 CASAVA_Build 1 164166569 1D AGACTCTTTT C/- CTTACCCTGG 3070 het 3070 hom 44 17 19 9 C 2 1 53835 CASAVA_Build 1 164174145 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGT 3070 hom 63 het 22 0 20 2 CTC 0 1 53836 CASAVA_Build 1 164174945 1D TCTACTTCTC A/- TCTTATAAGG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 1 0 53837 CASAVA_Build 1 164202940 1D CTGACTTGAT A/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 A 1 0 53838 CASAVA_Build 1 164222881 1I TGTATTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 28 0 17 11 T 11 12 53839 CASAVA_Build 1 164226156 1D AGCTGGTTAC T/- TTTTTTTTTT 2578 het 75 hom 25 2 10 13 T 16 15 53840 CASAVA_Build 1 164229663 1I AGAAAGTCAA -/G TTTCTGTTGT 3070 het 3070 hom 52 26 24 2 G 0 1 53841 CASAVA_Build 1 164237420 1D CTGATAGTTA T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 7 6 53842 CASAVA_Build 1 164246920 4D GTCAAAGGAT TGTC/---- TGTATATTAA 3070 het 3070 hom 26 13 13 2 TGTC 1 0 53843 CASAVA_Build 1 164257037 3D ATTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 9 6 53844 CASAVA_Build 1 164258502 1D GGTTTTACTG A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 61 33 21 8 A 6 5 53845 CASAVA_Build 1 164260283 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2906 het 2906 ref 37 19 8 10 T 17 16 53846 CASAVA_Build 1 164263825 5D TACAGTCCCT TTGAG/----- TTAATTTACT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 TTGAG 1 0 53847 CASAVA_Build 1 164266271 4I TAATAGAAAT ----/AATC AAAGAAAATG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 AATC 0 1 53848 CASAVA_Build 1 164267646 5I AGATGTAAAG -----/TTGAA TATGACATAG 3070 het 3070 hom 28 9 9 10 TTGAA 0 1 53849 CASAVA_Build 1 164270818 4D TGTTTTGGCA TGTG/---- TGTACGCTGA 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 TG 3 1 53850 CASAVA_Build 1 164275337 14I CTCATCCTTT --------------/ACCCAGATGTGTGG ACCTGGGTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ACCCAGATGTGTGG 0 1 53851 CASAVA_Build 1 164279585 1D ATGAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 38 1 30 8 A 12 11 53852 CASAVA_Build 1 164288581 1I TGGTTTTTAA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 7 8 53853 CASAVA_Build 1 164293323 1I TGTATTTAAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 T 7 8 53854 CASAVA_Build 1 164293827 1I TTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 32 1 21 10 T 11 12 53855 CASAVA_Build 1 164296704 2I TTCTCTATAA --/AG AGAATATATA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AG 1 2 53856 CASAVA_Build 1 164299430 4I AAAAAATAAT ----/AATA AATAAAAATA 2710 het 2710 ref 20 13 6 1 AATA 1 2 53857 CASAVA_Build 1 164302827 1I AAGGGCCCAT -/A ATTAAGGGTT 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 A 1 2 53858 CASAVA_Build 1 164305152 5D TCAGAAACTC AAAAG/----- AAACAGAATG 3070 het 3070 ref 50 28 19 4 AAAAG 1 0 53859 CASAVA_Build 1 164316202 3D CCTCAGCTAC CCA/--- CCACCATGTC 3070 het 3070 hom 34 16 12 6 CCA 3 2 53860 CASAVA_Build 1 164364076 4I TCTTTTATTT ----/ATTC ATTCATTCAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 ATTC 2 3 53861 CASAVA_Build 1 164368158 4I CCCCTCTCCC ----/CTAA CTAACCCTCG 3070 het 3070 ref 57 31 22 4 CTAA 1 2 53862 CASAVA_Build 1 164369463 2I GAGCAATCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 12 14 53863 CASAVA_Build 1 164373362 1D AGTCCAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 13 12 53864 CASAVA_Build 1 164385107 12D AAGTATAATT AAACAAACAAAC/------------ AAACAAACAA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 AAAC 7 4 53865 CASAVA_Build 1 164386064 1I CACAGTGGGA -/C CAACGTGCTG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 C 1 2 53866 CASAVA_Build 1 164426566 1I TTATTGGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 83 het 33 0 25 8 A 9 10 53867 CASAVA_Build 1 164435348 1I CTGGGCAAAA -/G GGGGGACTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 5 6 53868 CASAVA_Build 1 164436057 1D ACTTTGACTT A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 8 7 53869 CASAVA_Build 1 164438208 4D ACTGAAAAAC TAAT/---- TACGAAATGT 3070 hom 144 het 52 0 48 7 TAAT 1 0 53870 CASAVA_Build 1 164439090 1D TAGGAGGAAA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 28 3 22 3 T 1 0 53871 CASAVA_Build 1 164440498 1D GCTTCCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1343 hom 40 7 17 16 T 17 16 53872 CASAVA_Build 1 164442610 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 691 hom 32 2 24 6 T 11 12 53873 CASAVA_Build 1 164446416 4D CTCCAAGTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 29 1 12 17 T 20 16 53874 CASAVA_Build 1 164452957 1D CCGTTTATTG A/- ATAGAGTGTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 1 53875 CASAVA_Build 1 164453456 2D TTTTTTGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 32 3 20 9 T 16 14 53876 CASAVA_Build 1 164454012 1I TTTGGATGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 141 hom 27 1 25 1 T 9 10 53877 CASAVA_Build 1 164463403 2D ACAGAGAAAC AG/-- AGAGTCTGCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AG 3 2 53878 CASAVA_Build 1 164463764 2I GTGGTATTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 21 0 14 7 T 10 12 53879 CASAVA_Build 1 164473918 1I GTCTGTTGTT -/A ATTTTCCTGG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 1 2 53880 CASAVA_Build 1 164488625 1D ATTTTGAGTA C/- CCACATAACC 3070 hom 102 het 40 0 35 7 C 3 2 53881 CASAVA_Build 1 164492110 1D GAATTCTTCA G/- CTCCAAGCTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 G 1 0 53882 CASAVA_Build 1 164494504 1D AATGTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 47 1 34 13 T 12 11 53883 CASAVA_Build 1 164501546 1D AGTATAACTG T/- TTTTTTTTTC 1206 het 1206 ref 31 22 3 6 T 10 9 53884 CASAVA_Build 1 164510249 1I ACAATGTTTG -/T TTTTTTGCGA 3070 hom 152 het 60 0 49 11 T 6 7 53885 CASAVA_Build 1 164528507 1I GCATTCAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 11 12 53886 CASAVA_Build 1 164532030 2I AAATGGACAC --/TT TTGATTGAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 2 4 53887 CASAVA_Build 1 164532337 1D GTAGCGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 730 hom 22 10 8 4 T 22 21 53888 CASAVA_Build 1 164538320 1I TTAGCTAACA -/T TTTTTTGGGT 3070 het 3070 ref 46 30 12 4 T 6 7 53889 CASAVA_Build 1 164563132 1D TGAGTTGCTG A/- ATTTAGGAAA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 2 1 53890 CASAVA_Build 1 164564177 5D CAGCCTGGTC AACCA/----- GATTGTAATT 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 AACCA 1 0 53891 CASAVA_Build 1 164574573 10D CAGTTCTCAG ACACAGATTC/---------- ACACAGAGAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 5 ACACAGATTC 1 0 53892 CASAVA_Build 1 164576149 1I GGAGGGGTAT -/G GGTGGGTAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 2 3 53893 CASAVA_Build 1 164576570 4D TGTCTCATTC TTTT/---- TTTAATGGTC 3070 het 3070 hom 39 19 16 5 T 7 3 53894 CASAVA_Build 1 164583648 3D TAACTAATAT ATC/--- GTGCTAGGGC 3070 het 3070 hom 43 21 19 5 ATC 1 0 53895 CASAVA_Build 1 164601912 1D ATGAATACAT A/- ATTACCATGA 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 A 2 1 53896 CASAVA_Build 1 164604176 2D TTTTTATCTC TT/-- TAAGAGGTAG 3070 het 3070 hom 54 22 24 9 T 3 1 53897 CASAVA_Build 1 164609619 1D TTTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 2929 het 2929 ref 30 12 13 5 T 17 16 53898 CASAVA_Build 1 164621932 1I CACACATCTA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 T 6 7 53899 CASAVA_Build 1 164636682 1I TGGATCAGGC -/T TTTTTGTCAT 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 T 5 6 53900 CASAVA_Build 1 164679449 1I ATTGTATTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 9 53901 CASAVA_Build 1 164680368 1I GGATTTTTTT -/A TAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 A 0 1 53902 CASAVA_Build 1 164691294 1I GCATTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 2407 het 2407 ref 25 8 8 9 T 13 14 53903 CASAVA_Build 1 164692040 3D TAGAAATATA AAT/--- ATTAATGTTT 1425 het 1425 ref 9 4 4 1 AAT 1 0 53904 CASAVA_Build 1 164693974 9I CAAGGCCTGA ---------/AGGTTTCCC AGCAGCTCTG 3070 hom 144 het 52 0 48 4 AGGTTTCCC 0 1 53905 CASAVA_Build 1 164697908 4I TTTCAAAAAT ----/CTAA CTGTTTGTTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CTAA 0 1 53906 CASAVA_Build 1 164707527 1I TCCCCTGCCC -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 A 7 8 53907 CASAVA_Build 1 164714534 1I ATTTATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 13 14 53908 CASAVA_Build 1 164715313 3I AAGTCTGAAA ---/AAT AATACGACAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 AAT 1 2 53909 CASAVA_Build 1 164717903 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTATCTAT 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 T 5 4 53910 CASAVA_Build 1 164721821 1I CTCCACTTTG -/C CCAGCCTCAC 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 C 2 3 53911 CASAVA_Build 1 164725632 2D TGAGGTCATT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 61 hom 50 2 23 26 GA 10 9 53912 CASAVA_Build 1 164728601 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 33 2 21 10 A 13 12 53913 CASAVA_Build 1 164741803 2D TCTCTTAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 28 0 22 7 T 13 11 53914 CASAVA_Build 1 164742585 1I TACTGAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 8 9 53915 CASAVA_Build 1 164749269 2D ACACACACAC AT/-- GCACGTGCAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AT 1 0 53916 CASAVA_Build 1 164754358 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1258 het 1258 ref 22 17 4 1 A 13 12 53917 CASAVA_Build 1 164756775 2D ATATTACTTG CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 82 het 32 0 26 6 C 11 9 53918 CASAVA_Build 1 164759406 13D TTTGCTATTG TTGGATTTTTAGT/------------- TTTTTCAAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 6 TTGGATTTTTAGT 1 0 53919 CASAVA_Build 1 164767540 2D TTCTGATAAC TT/-- TGGAGATTGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 3 1 53920 CASAVA_Build 1 164773621 1D AGAGCTTTGA T/- TTTTTGGCCC 3070 hom 94 het 33 0 32 2 T 6 5 53921 CASAVA_Build 1 164778806 1I ACTAAAAATA -/T AAAAATTAGC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 0 1 53922 CASAVA_Build 1 164783849 2D ATCCTGAGAC TT/-- TGCTGAAGTT 3070 het 3070 ref 16 7 8 1 T 3 1 53923 CASAVA_Build 1 164800008 6D CTTGTTAATA TAGAGT/------ TATTCTGCTA 3070 het 3070 ref 38 22 16 0 TAGAGT 1 0 53924 CASAVA_Build 1 164818533 2I AGACTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 11 24 12 A 14 16 53925 CASAVA_Build 1 164843641 1I ATCTACTGGT -/G GCACTGACAG 3070 het 3070 ref 53 31 16 8 G 1 2 53926 CASAVA_Build 1 164861107 2D AAATGTTCTC TT/-- TCTCTCTCCT 3070 het 2630 hom 34 8 23 4 T 3 1 53927 CASAVA_Build 1 164868842 2I CACCCATGGG --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 181 hom 37 1 29 7 A 8 10 53928 CASAVA_Build 1 164872693 1D AGATGCAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 10 9 53929 CASAVA_Build 1 164873512 1D AAATTTGAAT A/- AAATGCATTA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 4 3 53930 CASAVA_Build 1 164877192 1I GAGACGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 10 11 53931 CASAVA_Build 1 164881002 18D CATGTTGGCA AGGATGTGGAGAAAGGGG/------------------ AACTCTTATA 3070 het 3070 ref 43 31 15 4 AGGATGTGGAGAAAGGGG 1 0 53932 CASAVA_Build 1 164884369 2I GAACAGACAC --/CT GAACGCCTGG 3070 hom 147 het 54 0 49 5 CT 0 1 53933 CASAVA_Build 1 164887207 4I CCTCAGGTGA ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 GT 7 9 53934 CASAVA_Build 1 164887586 1I TGAAATTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 9 10 53935 CASAVA_Build 1 164891955 2I AAAGTATAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 A 10 12 53936 CASAVA_Build 1 164895464 1I TTTTTTTTTT -/G TGAGAGAGAG 3070 het 330 hom 27 1 24 2 G 0 1 53937 CASAVA_Build 1 164905873 2I GATAATAGAA --/AT ATAACACTTG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 AT 1 2 53938 CASAVA_Build 1 164913806 1D CACTTATACA T/- TCATCTTCTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 2 1 53939 CASAVA_Build 1 164918796 1D AAAGACCAGG A/- AAAATTTTCT 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 A 5 4 53940 CASAVA_Build 1 164920204 1D GATAACAAAG T/- GTGACTTTGT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 T 1 0 53941 CASAVA_Build 1 164920320 1I ACCTTTACCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 8 9 53942 CASAVA_Build 1 164922908 12D AATAGGCAAT ATGTTTTAAAAC/------------ ATGTTTTAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 ATGTTTTAAAAC 2 1 53943 CASAVA_Build 1 164925192 1I GAAATATCAG -/A AAAAATAATA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 5 6 53944 CASAVA_Build 1 164927879 1I TATGCCCACC -/A AAAAAATGTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 6 7 53945 CASAVA_Build 1 164929386 7D TGCTGACCTG CACTGTT/------- CACTGTTCAC 3070 hom 4 het 31 2 27 6 CACTGTT 2 1 53946 CASAVA_Build 1 164930965 2I GGAATAGTAC --/TT CCTGCTCATA 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 T 0 2 53947 CASAVA_Build 1 164938219 1I GACTAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 2857 het 2857 ref 31 14 8 9 A 13 14 53948 CASAVA_Build 1 164945144 1I ACAACAGGTG -/C TGGAGAGGAT 2569 het 19 hom 14 1 9 4 C 0 1 53949 CASAVA_Build 1 164950852 1D AAATAAATAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 9 53950 CASAVA_Build 1 164951351 1I AAGCAATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 35 1 27 7 A 12 13 53951 CASAVA_Build 1 164952090 3D GCCTTTTGTA AAT/--- AGCTGATTTG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 AAT 1 0 53952 CASAVA_Build 1 164954279 2D AACTGCTTTA CC/-- TGAAATTTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 2 0 53953 CASAVA_Build 1 164958279 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 14 13 53954 CASAVA_Build 1 164964126 1D AAGCAGTTCT C/- CCCACCTCAG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 4 3 53955 CASAVA_Build 1 164967015 1D ATCTAGATGG C/- AAGACAGCTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 0 53956 CASAVA_Build 1 164967798 1I CAAATGCCCA -/G GGAATTCATT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 2 3 53957 CASAVA_Build 1 164969029 1D AGTTTATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 35 3 20 12 A 17 16 53958 CASAVA_Build 1 164970008 3I CAAATAGGAA ---/AAG AAGAAGTCAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAG 2 3 53959 CASAVA_Build 1 164972249 1I AGTTAAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 10 53960 CASAVA_Build 1 164974937 3I GTGGTTGATG ---/GTA GTAGCATCAT 3070 het 3070 ref 53 28 21 4 GTA 1 2 53961 CASAVA_Build 1 164983723 3I TGAAGGCTAC ---/AAG AAGATCAAGG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 AAG 1 2 53962 CASAVA_Build 1 164984102 1D AATACAGATC T/- TTAGCAGAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 3 2 53963 CASAVA_Build 1 164984608 1D AGGCAGTGAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 27 9 10 9 A 9 8 53964 CASAVA_Build 1 164987908 1D AGTCACACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 10 22 7 A 10 9 53965 CASAVA_Build 1 164989404 1D TTTTTTTTTT G/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 G 1 0 53966 CASAVA_Build 1 164992801 10D TCAGTCCTCA GTGACCTTCT/---------- GTACACAGTT 3070 het 3070 ref 49 25 22 6 GTGACCTTCT 1 0 53967 CASAVA_Build 1 164994102 1D ATGGACATGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 A 9 8 53968 CASAVA_Build 1 164998488 2D AAAAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1355 hom 15 4 9 2 A 12 10 53969 CASAVA_Build 1 165004591 1I TCTGAAAGAC -/G TATTTCTGGA 3070 het 3070 hom 43 12 27 4 G 0 1 53970 CASAVA_Build 1 165009034 1D AACAGTAATG A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 8 7 53971 CASAVA_Build 1 165009956 4D AAATAACTAC AAAA/---- AAATACCCAA 3070 het 3070 ref 48 24 22 3 A 7 3 53972 CASAVA_Build 1 165010184 1D ACGGAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 A 11 10 53973 CASAVA_Build 1 165010811 3D ATCTCAAGAA AAC/--- AAAGCAAAAC 2385 het 2385 ref 24 14 5 6 AAC 1 0 53974 CASAVA_Build 1 165031630 1I CTGGGACATT -/G GGTGTTCTCC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 2 3 53975 CASAVA_Build 1 165033120 1D TTCGTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 22 0 13 9 T 12 11 53976 CASAVA_Build 1 165048815 3D AACAGGAAAG TCA/--- TCATCATCAT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 TCA 5 4 53977 CASAVA_Build 1 165056198 1D TTCCCATTGT C/- TTGAATATTA 3070 hom 42 het 15 0 14 1 C 1 0 53978 CASAVA_Build 1 165059588 1D ACTGTGATGC A/- AAAAATTATA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 6 5 53979 CASAVA_Build 1 165059776 4I CGTGAGGTCT ----/AACA GTTAGGACCA 3070 hom 104 het 37 0 33 4 AACA 0 1 53980 CASAVA_Build 1 165063028 1D TTGATGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 11 10 53981 CASAVA_Build 1 165070909 3D AAATACCAGA AGG/--- AGAAGACAGA 3070 het 3070 hom 43 17 24 5 AGG 1 0 53982 CASAVA_Build 1 165088395 3D TTGTTAAAAG TTA/--- TACCAAAAAG 3070 het 3070 hom 47 21 23 4 TTA 1 0 53983 CASAVA_Build 1 165089683 1I TCAGGTACTC -/A ATTGTCCTGT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 1 2 53984 CASAVA_Build 1 165091752 1I CAAACCAAAA -/C AACTATATTC 3070 hom 117 het 48 0 39 9 C 0 1 53985 CASAVA_Build 1 165105491 5I TTTATACTTA -----/ATTTT AAGTATCCAC 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 ATTTT 0 1 53986 CASAVA_Build 1 165118390 1D CGTGAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 2536 het 2536 ref 42 33 6 3 T 11 10 53987 CASAVA_Build 1 165121262 10I CCACAGTTAC ----------/ACATCTAGTA ACATCTAGTA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 ACATCTAGTA 1 2 53988 CASAVA_Build 1 165147520 1I AGGGCATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2955 hom 27 10 9 8 A 13 14 53989 CASAVA_Build 1 165159898 2I TTGGAGGAAC --/AG GGGATTTTTG 3070 hom 90 het 33 0 29 4 AG 0 1 53990 CASAVA_Build 1 165210881 4D CCCCCATCAT TCTC/---- TCTCTCTCTC 851 het 224 hom 19 3 8 8 TC 9 7 53991 CASAVA_Build 1 165213666 1I TACAAAAATT -/A GCCAGGCGTG 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 0 1 53992 CASAVA_Build 1 165213818 1I TCTCAAAAAA -/T AATGGCATTT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 T 0 1 53993 CASAVA_Build 1 165222121 2I CTTGATGGCA --/GT GATGGTTTCA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 GT 0 1 53994 CASAVA_Build 1 165227524 1I AGGAGAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 10 11 53995 CASAVA_Build 1 165229228 3I TATCAGCATC ---/TCT TCTTCCTACT 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 TCT 1 2 53996 CASAVA_Build 1 165240366 1D TGAAGACTGC A/- AAAGCTAAAC 3070 hom 117 het 40 0 40 2 A 4 3 53997 CASAVA_Build 1 165244827 1D CTGACTTAAT A/- TATAATCAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 0 53998 CASAVA_Build 1 165245452 1I TTTCTGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1491 hom 30 6 21 3 T 14 15 53999 CASAVA_Build 1 165248755 2I TGAAGCAGTT --/GG GGGGGTCATA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 G 5 7 54000 CASAVA_Build 1 165259610 1D TCTCCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1620 het 1620 ref 45 35 4 6 A 11 10 54001 CASAVA_Build 1 165267298 1I GAGGCAAGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 A 8 9 54002 CASAVA_Build 1 165267863 4I AAGTTTAAAA ----/ATAG ATAGAGAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ATAG 1 2 54003 CASAVA_Build 1 165272436 1I TGCTTAAAAA -/C AAACAAACCT 3070 het 3070 hom 55 22 28 5 C 0 1 54004 CASAVA_Build 1 165281133 4D AGAAAAAAAA AAAG/---- AAGAAACCGG 2906 het 1874 hom 16 4 8 6 AAAG 1 0 54005 CASAVA_Build 1 165294617 3D AAAAAAGCAA GTT/--- TAGGAATCAC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 GTT 1 0 54006 CASAVA_Build 1 165308012 1D ATCCGTCCTG C/- CCGCTCGAGG 3070 hom 79 het 30 0 26 5 C 3 2 54007 CASAVA_Build 1 165308877 1I ATAGAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 10 11 54008 CASAVA_Build 1 165315346 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1438 het 734 hom 25 7 7 11 A 17 16 54009 CASAVA_Build 1 165322752 2D GTGTAAGTAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 66 het 31 0 22 9 GT 8 7 54010 CASAVA_Build 1 165323119 3D2M1D CTAATTTTCT GTAACT/---AC- TACATTCCCC 3070 het 3070 ref 35 17 17 2 N/A 0 0 54011 CASAVA_Build 1 165352513 1D TTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 855 het 855 ref 39 17 7 15 T 17 16 54012 CASAVA_Build 1 165356691 40D TGTAAATTAC ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 36 het 10 0 13 2 AT 28 8 54013 CASAVA_Build 1 165366032 1D ACTGATTGAG C/- GGGGGAGAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 1 0 54014 CASAVA_Build 1 165370525 1I AAGCTGAGCC -/A GGGGGAAAAG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 0 1 54015 CASAVA_Build 1 165372132 1I GAAGGGAGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 9 hom 39 1 30 8 A 8 9 54016 CASAVA_Build 1 165373626 2D ATCTATTTTG GT/-- GTGTGTGTGA 3070 hom 67 het 27 0 22 5 GT 5 4 54017 CASAVA_Build 1 165378539 3D TTCTTGAGTC AGT/--- AGTTTGTGTC 3070 hom 29 het 12 0 10 2 AGT 2 1 54018 CASAVA_Build 1 165379177 15D GTTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2982 hom 24 het 12 0 9 3 T 26 11 54019 CASAVA_Build 1 165389284 1D ACCGGGCTAA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 6 54020 CASAVA_Build 1 165392981 1D TTGTAGTCAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 369 hom 51 1 45 5 A 8 7 54021 CASAVA_Build 1 165394009 1I TGGGCTATAG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 8 54022 CASAVA_Build 1 165397872 2D GGGCCTGGAT AG/-- AGAGACCCCT 3070 hom 99 het 35 0 33 3 AG 3 2 54023 CASAVA_Build 1 165400062 1I GTTGTGGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 10 11 54024 CASAVA_Build 1 165439436 4D TACAGGCATG AGCC/---- ACAGCGCCTT 3070 hom 54 het 20 0 18 3 AGCC 1 0 54025 CASAVA_Build 1 165441122 1I ACCGCAACAT -/C TGTCTCTCAG 3070 hom 42 het 17 0 14 3 C 0 1 54026 CASAVA_Build 1 165447774 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 693 hom 40 2 24 14 A 14 15 54027 CASAVA_Build 1 165449443 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 19 1 14 4 A 13 12 54028 CASAVA_Build 1 165453194 2I CAATTATAAT --/AG AGTTGCTATT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AG 1 2 54029 CASAVA_Build 1 165465024 1I AGTCACTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 12 13 54030 CASAVA_Build 1 165503088 1D TGTAAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 1409 het 1409 ref 45 29 4 12 A 10 9 54031 CASAVA_Build 1 165634682 1I GGTCCTTCAT -/C TGTGAAATAC 3070 hom 141 het 57 0 48 9 C 0 1 54032 CASAVA_Build 1 165656030 1D AATTCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 623 hom 20 3 10 7 T 18 17 54033 CASAVA_Build 1 165662099 2D CTGGGATATT AA/-- AAAAAAAATG 3070 hom 117 het 41 0 40 2 A 10 8 54034 CASAVA_Build 1 165663268 2I GATTCTCAGA --/CT CTTCGCATAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 CT 1 2 54035 CASAVA_Build 1 165664774 2I CTTCCATCTT --/TA TATATATAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TA 4 5 54036 CASAVA_Build 1 165666493 2I AATAAAGCTT --/AG AGTAAAGCTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AG 1 2 54037 CASAVA_Build 1 165667965 1D GCAGGAATCA G/- GGGGGAGGGC 3070 hom 83 het 32 0 23 9 G 6 5 54038 CASAVA_Build 1 165681409 1D CATCTTCATT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 88 het 34 0 29 5 A 9 8 54039 CASAVA_Build 1 165686773 1D CATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 28 2 14 13 A 16 15 54040 CASAVA_Build 1 165690531 3I ATCACTATTG ---/TTA TTATTATCCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TTA 2 3 54041 CASAVA_Build 1 165697697 1D CGACAGGCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 21 0 21 1 A 10 9 54042 CASAVA_Build 1 165711951 1I TTTCTACATG -/T TTGAAACAGG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 2 3 54043 CASAVA_Build 1 165718871 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 250 het 250 ref 20 16 2 2 TTC 1 0 54044 CASAVA_Build 1 165743417 1I TCTAAATAGG -/C CAGCGTGGTG 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 C 1 2 54045 CASAVA_Build 1 165743697 1D ACCCTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 13 12 54046 CASAVA_Build 1 165749173 4D AACTATAAAA AGAT/---- AGTAAAATTT 3070 het 3070 ref 29 19 8 3 AGAT 1 0 54047 CASAVA_Build 1 165750472 1I ACCGGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 T 11 12 54048 CASAVA_Build 1 165762177 3D AGACAGGAAG AGA/--- AGGATGGTTC 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 AGA 1 0 54049 CASAVA_Build 1 165766522 1D AACACTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 A 11 10 54050 CASAVA_Build 1 165767538 1I ATATATTGTA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 6 7 54051 CASAVA_Build 1 165771382 3D TGAGGATAAA TCT/--- TCTTGCGTGG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 TCT 2 1 54052 CASAVA_Build 1 165784342 1I GTTAAACTCT -/A ATACAAAACC 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 1 2 54053 CASAVA_Build 1 165785252 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 30 2 20 8 T 12 11 54054 CASAVA_Build 1 165788914 1D TCTCAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1739 hom 27 7 13 7 A 15 14 54055 CASAVA_Build 1 165792658 1D4M2I3M1I GGTGGCTCAC GAGCT--GTG-/-AGCTCACTGC AGCCTCAAAA 3070 het 3070 ref 25 16 10 2 N/A 0 0 54056 CASAVA_Build 1 165794742 1D CCTCTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2301 hom 24 8 14 2 A 11 10 54057 CASAVA_Build 1 165795372 1I TATTTGTTTT -/A ACGCTCTCCC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 1 2 54058 CASAVA_Build 1 165803463 1D AAAAGCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 14 11 1 A 11 10 54059 CASAVA_Build 1 165858514 1D CTAGGACAGA T/- TTTTTTTTTT 1974 het 1974 ref 29 10 9 11 T 17 16 54060 CASAVA_Build 1 165859061 1I TTAGATCTCT -/C CCCCCCAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 C 6 7 54061 CASAVA_Build 1 165862150 2D AATTGGGATT TG/-- TGTGTGTGTG 2622 het 2622 ref 22 9 7 6 TG 10 9 54062 CASAVA_Build 1 165864627 4D CTTGTCTAAA AAAT/---- ACAACTAGAA 3070 het 3070 ref 41 17 19 7 AAAT 1 0 54063 CASAVA_Build 1 165865441 3D TTCCTGATTT TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 3070 ref 45 19 17 10 TCC 6 5 54064 CASAVA_Build 1 165868548 3D2M14D3M2D CCCTGCGTCT CACATCCAGTAGGTCACTAAGCCT/---AT--------------TGC-- AGTCCATCAA 3070 hom 120 het 38 0 41 1 N/A 0 0 54065 CASAVA_Build 1 165870241 3I AAGATCAGGG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 11 14 54066 CASAVA_Build 1 165878186 6D AGGGAGAAAG TGTTTA/------ TCTGCACCAC 3070 het 3070 hom 48 20 27 4 TGTTTA 1 0 54067 CASAVA_Build 1 165882367 6D CTTAGAGTTT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 hom 53 het 30 0 19 12 TTTTTC 4 3 54068 CASAVA_Build 1 165884556 1D TACCAGTGAT G/- GGGTGCGGGC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 G 4 3 54069 CASAVA_Build 1 165899270 1D CCTGGGTAAC G/- GCAAGACCCT 3070 hom 108 het 39 0 32 8 G 2 1 54070 CASAVA_Build 1 165901209 4D TAACACAATT TGTC/---- TGTCTACTTA 3070 hom 126 het 47 0 43 6 TGTC 2 1 54071 CASAVA_Build 1 165905849 6D CCTCAGGACA CACACG/------ CACACGCACA 3070 hom 102 het 40 0 33 10 CACACG 2 1 54072 CASAVA_Build 1 165925342 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 700 het 700 ref 18 10 3 5 A 17 16 54073 CASAVA_Build 1 165951736 4D TCTCCGTTAC TGAG/---- TGAGTTCTGG 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 TGAG 2 1 54074 CASAVA_Build 1 165952176 3D CCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1435 het 1435 ref 16 8 4 4 T 19 16 54075 CASAVA_Build 1 165967193 1D GCTATTCGGG A/- AGGCTGAGGC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 2 1 54076 CASAVA_Build 1 165977192 1I CTGCAGTCAC -/T TTTTTTTTTT 1329 het 356 hom 20 2 9 9 T 17 18 54077 CASAVA_Build 1 165995552 2D TCAACTACGC AG/-- AGTGCCCAGC 3070 hom 105 het 40 0 35 8 AG 2 1 54078 CASAVA_Build 1 165996222 1I CGCCACCACA -/C CCAGCTAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 2 3 54079 CASAVA_Build 1 165999001 1I TTGGACACTT -/G GGTCTAATTC 3070 hom 95 het 35 0 31 4 G 2 3 54080 CASAVA_Build 1 166000682 3D AGAAATGAGA TAT/--- TATGCCACAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TAT 2 1 54081 CASAVA_Build 1 166001183 1D CTATTAGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 107 het 46 0 36 11 A 10 9 54082 CASAVA_Build 1 166002849 1I TTAATCTCTG -/C CCCCCTTCCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 5 6 54083 CASAVA_Build 1 166004250 1D ATAATGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 33 0 22 11 T 13 12 54084 CASAVA_Build 1 166013436 4D AAGGAACCAT AGAG/---- AGAGCGTGCT 3070 hom 83 het 31 0 27 4 AG 4 2 54085 CASAVA_Build 1 166014286 1I TTGAAAGCCT -/A AAGTGGGAGG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 2 3 54086 CASAVA_Build 1 166017491 1I ATAAAGCTCT -/A AAAATTGATG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 4 5 54087 CASAVA_Build 1 166028129 4D AGATGGACTT TTTA/---- TTTATGAGAG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TTTA 2 1 54088 CASAVA_Build 1 166035625 1I CTCCATAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 40 1 29 10 T 10 11 54089 CASAVA_Build 1 166038276 1I TCACCTCTCA -/C CCGGCCTCTT 3070 hom 112 het 47 0 36 11 C 2 3 54090 CASAVA_Build 1 166040094 1I CCACACTGAC -/A ACGGCATTTT 3070 hom 157 het 59 0 53 6 A 1 2 54091 CASAVA_Build 1 166042874 8D AGAAGGGAGA GGGAGAGG/-------- GGGAGAGGGG 3070 hom 41 het 22 0 12 15 GGGAGAGG 3 2 54092 CASAVA_Build 1 166048262 1D TGTGCATGCC T/- TAGGGAAAGG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 2 1 54093 CASAVA_Build 1 166063197 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 823 het 311 hom 7 3 3 1 T 17 16 54094 CASAVA_Build 1 166067060 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 128 hom 26 1 21 4 T 10 11 54095 CASAVA_Build 1 166082673 13D CTAAGCTTGA ATATCGGTAGCTC/------------- ATGTGACTTT 3070 hom 114 het 39 0 39 3 ATATCGGTAGCTC 1 0 54096 CASAVA_Build 1 166084920 1D TTGATGTCTT C/- CATAGGATAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 2 1 54097 CASAVA_Build 1 166087677 1D AGAGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 15 0 9 6 A 15 14 54098 CASAVA_Build 1 166088641 1I CTTGTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 606 hom 38 4 24 10 A 12 13 54099 CASAVA_Build 1 166094766 3D CCAGGAAAAA ATG/--- ATAAGAGCCT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 ATG 1 0 54100 CASAVA_Build 1 166111293 1I CAATAAATGC -/T TGTTGAGTCT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 2 54101 CASAVA_Build 1 166126471 1I ATCAGCAGGT -/G GCAAAGCCAG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 1 2 54102 CASAVA_Build 1 166179869 1D CCTGACTAAC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 9 8 54103 CASAVA_Build 1 166276582 1D CTTTTTGGGC T/- TTTTTTTTTT 1640 het 1640 ref 31 18 4 9 T 13 12 54104 CASAVA_Build 1 166353850 4D AAACAGAAAG AAAC/---- AAACAAATAA 2807 het 2807 ref 32 21 8 6 AAAC 2 1 54105 CASAVA_Build 1 166361487 1I TTCCCCCCCC -/T TTTTTTTTTT 2117 het 1302 hom 29 5 9 15 T 13 14 54106 CASAVA_Build 1 166371526 3D TCACTAGGGG AGA/--- AGAAGCCAGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 AGA 2 1 54107 CASAVA_Build 1 166373691 1D TAAACTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 16 14 A 11 10 54108 CASAVA_Build 1 166374622 1I TCTCTTAAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 7 8 54109 CASAVA_Build 1 166379481 3D AAAAAAAAAA AAC/--- AAAACATATA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 AAC 1 0 54110 CASAVA_Build 1 166380804 4I TCTCTCCACT ----/ATTA ATTGTCAGTT 3070 het 3070 ref 64 32 24 8 ATTA 0 1 54111 CASAVA_Build 1 166380955 1I GGGAAAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 13 14 54112 CASAVA_Build 1 166382168 1I AAAAGAGAAG -/A AAAAAAGGAG 3070 het 2148 hom 16 5 11 0 A 6 7 54113 CASAVA_Build 1 166383761 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 1779 het 501 hom 7 2 5 0 A 8 7 54114 CASAVA_Build 1 166385373 1D TATCCAAAAG A/- AAAAAAAAAG 2286 het 2076 hom 16 7 5 4 A 10 9 54115 CASAVA_Build 1 166388709 1I AAACCCGGGA -/G GCGGAGCCTG 2943 hom 30 het 11 0 9 2 G 1 2 54116 CASAVA_Build 1 166400133 5D CTTGCTAGTT ACCTA/----- ACAAGTACTG 3070 het 3070 ref 43 22 19 4 ACCTA 1 0 54117 CASAVA_Build 1 166400867 1I TGGGTGACTG -/A ATGGCATGGG 3070 het 3070 ref 47 19 20 8 A 1 2 54118 CASAVA_Build 1 166406814 2D AGAGAACAAA AG/-- AGAGAGATGA 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 AG 4 3 54119 CASAVA_Build 1 166410156 2I TACCCAAATA --/TC TCTCTAATGT 3070 het 3070 ref 43 29 12 2 TC 2 3 54120 CASAVA_Build 1 166414159 1I ACAGAATTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 T 8 9 54121 CASAVA_Build 1 166415494 4D CTCGTGAGAG AGAC/---- AGACAATTAT 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 AGAC 2 1 54122 CASAVA_Build 1 166421471 1D CTTGTCTATT A/- AAAAAAAAAA 2299 het 1589 hom 14 5 8 1 A 12 11 54123 CASAVA_Build 1 166426451 2D CAAGCATTGT TG/-- TGTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 60 33 23 4 TG 2 1 54124 CASAVA_Build 1 166432392 1D TTAATGTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2679 hom 23 7 12 4 T 13 12 54125 CASAVA_Build 1 166435275 1I TTTACTCCCC -/T GGGACCTGTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 54126 CASAVA_Build 1 166436471 1D TTTGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 12 11 54127 CASAVA_Build 1 166437784 1D AATAATTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2728 hom 26 8 13 5 T 12 11 54128 CASAVA_Build 1 166447113 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 9 6 A 11 12 54129 CASAVA_Build 1 166448378 1D CACAAAAAAA C/- ATGACACCTA 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 C 1 0 54130 CASAVA_Build 1 166450519 1I GAGGAAGAGT -/G GACTCAAAGA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 G 1 2 54131 CASAVA_Build 1 166450794 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1388 het 632 hom 17 5 5 7 T 16 15 54132 CASAVA_Build 1 166452265 1I ATATTGCTGA -/T TTTTTTTTTC 2779 het 2779 ref 38 15 12 11 T 9 10 54133 CASAVA_Build 1 166455561 1I GCCAAGAGGA -/G GGGGCCCATT 1444 het 1444 ref 28 14 5 9 G 4 5 54134 CASAVA_Build 1 166501709 1I AGGGCTTCTG -/C CCTAGGCAAT 3070 hom 107 het 41 0 35 6 C 2 3 54135 CASAVA_Build 1 166523331 1D TTTGAAATGA T/- TTTTTTTTTA 1469 het 1469 ref 41 29 4 8 T 10 9 54136 CASAVA_Build 1 166531156 1D TGGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 18 9 7 2 A 11 10 54137 CASAVA_Build 1 166532731 1D CTCCCGTCTC A/- AAAAAAATAT 3070 hom 39 het 29 0 14 15 A 8 7 54138 CASAVA_Build 1 166537133 1I AAAAGCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 10 11 54139 CASAVA_Build 1 166538558 1I CCCCAAAACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 9 10 54140 CASAVA_Build 1 166541261 1D ACAATCTTAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 7 54141 CASAVA_Build 1 166546160 1I CTCTGCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1790 hom 33 9 16 8 A 13 14 54142 CASAVA_Build 1 166561944 1D TTATTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1529 hom 27 7 10 10 T 14 13 54143 CASAVA_Build 1 166572569 1I31M1D ATTAAGTCTA -TTTTTTTTAAAAGACATATTCAAAACTGGGGA/TTTTTTTTTAAAAGACATATTCAAAACTGGGG- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 20 12 8 8 N/A 0 0 54144 CASAVA_Build 1 166574418 1I ACTGTTCCAA -/C CTCTTCCTGT 3070 het 3070 ref 40 23 9 8 C 1 2 54145 CASAVA_Build 1 166607870 2D AGGCCTGGCA TG/-- TGTATCCACA 3070 het 3070 ref 59 28 21 11 TG 2 1 54146 CASAVA_Build 1 166631016 1D ATCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1409 het 1409 ref 29 17 3 9 T 12 11 54147 CASAVA_Build 1 166637334 1I GTTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 761 het 713 hom 33 13 4 16 G 0 1 54148 CASAVA_Build 1 166676272 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1152 het 1152 ref 29 16 6 8 A 12 11 54149 CASAVA_Build 1 166684951 1D AATCTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 289 hom 29 1 20 9 T 11 10 54150 CASAVA_Build 1 166690582 1I TGAATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 17 17 14 T 10 11 54151 CASAVA_Build 1 166691689 2D GCACAGCTCA TC/-- TCTCTGGCTG 3070 het 3070 hom 33 11 22 1 TC 3 2 54152 CASAVA_Build 1 166697190 1D TTGAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 2784 het 2784 ref 22 12 6 4 T 11 10 54153 CASAVA_Build 1 166702130 1I GGAAGGGGAA -/T TGCTTTTCAT 3070 het 3070 hom 70 28 34 8 T 1 2 54154 CASAVA_Build 1 166709011 1I GTATCTTTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 9 10 54155 CASAVA_Build 1 166710222 1D AGTGCAGCTT G/- GGCCCTTGCT 3070 het 3070 ref 30 17 7 6 G 3 2 54156 CASAVA_Build 1 166712219 4D TCGGGGGTGG GGGT/---- GGGGGGTCGG 1593 hom 6 het 6 0 4 3 GGGT 1 0 54157 CASAVA_Build 1 166729675 1I GGAAGGCTTG -/C CTCTACCTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 1 2 54158 CASAVA_Build 1 166762596 2D ACTTCATGGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 TA 7 6 54159 CASAVA_Build 1 166773269 7D ATTTCGATAT GTACCCA/------- GTACCCAGTA 2809 hom 21 het 11 0 8 3 GTACCCA 2 1 54160 CASAVA_Build 1 166825077 1I CTAGTGTATG -/T TTTTTTATTA 3070 hom 149 het 53 0 50 3 T 6 7 54161 CASAVA_Build 1 166832299 1D GATGGAGTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 7 6 54162 CASAVA_Build 1 166837570 1D GAGAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 51 het 20 0 16 5 T 1 0 54163 CASAVA_Build 1 166840580 1I ACTAGATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 519 hom 45 3 32 10 T 10 11 54164 CASAVA_Build 1 166842863 7D CTCCCTTGAG TTTTGCC/------- TTTTGCCTGT 3070 hom 96 het 33 0 32 4 TTTTGCC 2 1 54165 CASAVA_Build 1 166869385 2I AATTCCTCTG --/CC CTCATGAAGC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 1 3 54166 CASAVA_Build 1 166888095 1D GACAAAAAAG A/- AAAAAAAGGT 2972 het 2972 ref 23 12 7 6 A 8 7 54167 CASAVA_Build 1 166892456 1D AAATACTTGG T/- AAACAGCACA 3070 het 125 hom 54 1 51 2 T 1 0 54168 CASAVA_Build 1 166900186 1D TTTGCAATAG C/- CCAAGACAGG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 3 2 54169 CASAVA_Build 1 166904763 1D TATCTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 11 10 54170 CASAVA_Build 1 166904920 1D TGGAACTGGG T/- AATGGGTAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 0 54171 CASAVA_Build 1 166906926 4I GCTTGGTGAT ----/TGTC TGGGCACAGG 3070 hom 126 het 45 0 39 6 TGTC 0 1 54172 CASAVA_Build 1 166907695 1I AGTCTCTTAC -/A ATATAGCAGC 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 1 2 54173 CASAVA_Build 1 166912955 1I CTCAATGTTT -/A AGATCCTTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 2 54174 CASAVA_Build 1 166923233 7I AATGCATGAC -------/CCTCACT CAAGAGGACT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 CCTCACT 0 1 54175 CASAVA_Build 1 166927766 2D AGCCGGTGAC TT/-- TTTTTGTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 5 54176 CASAVA_Build 1 166927944 4I GCATTTTTCA ----/CTGT CTGATACAGT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 CTGT 0 1 54177 CASAVA_Build 1 166928678 3D ATGCAGAATC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 hom 93 het 41 0 31 11 TGT 5 4 54178 CASAVA_Build 1 166931439 1D AGAACTCCTG A/- GCCACACACA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 0 54179 CASAVA_Build 1 166932372 1I TCCTGTCCCC -/T GGCCCCTTTC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 0 1 54180 CASAVA_Build 1 166946174 1I ATAGAACCAG -/C CAGGTGGAAC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 C 1 2 54181 CASAVA_Build 1 166955658 1D GAAGACATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 11 10 54182 CASAVA_Build 1 166972896 1I GAAGCTGCCA -/T TTTTTTTTTA 2729 het 209 hom 21 1 13 7 T 9 10 54183 CASAVA_Build 1 166975796 2D CTCGGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 28 1 13 14 A 18 16 54184 CASAVA_Build 1 166978281 1I AGAGTAAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 432 hom 28 1 23 4 T 9 10 54185 CASAVA_Build 1 166996920 1D TTTTAAAAAG A/- AAAAAGCTGG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 6 5 54186 CASAVA_Build 1 167058739 1D GTTTTGAAGC A/- AAATTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 4 3 54187 CASAVA_Build 1 167076360 1I CACCATGCCC -/G GGCCCTGAAC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 2 3 54188 CASAVA_Build 1 167086648 1I CAGCATTTAA -/G GGGGGGTCAA 3070 hom 71 het 28 0 22 6 G 6 7 54189 CASAVA_Build 1 167087091 1I GATTGTTACC -/T TAAAAAGGCA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 1 2 54190 CASAVA_Build 1 167093776 1D GACTCCCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 22 0 12 10 A 19 18 54191 CASAVA_Build 1 167096909 1D CATGGGCTGT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 116 hom 33 1 27 5 A 8 7 54192 CASAVA_Build 1 167113948 1D CTGCCAACAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 415 hom 22 1 15 6 T 10 9 54193 CASAVA_Build 1 167130725 3I AGGAGTGTGT ---/GGG GTGGGCGGGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 1 4 54194 CASAVA_Build 1 167132517 1D TTTCACAAAA G/- AGAAAACGGA 3070 het 697 hom 54 2 45 8 G 1 0 54195 CASAVA_Build 1 167135291 1D ATAACCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 30 1 25 4 A 11 10 54196 CASAVA_Build 1 167135551 1D TAGATTATTC A/- AAATATTTGT 3070 hom 123 het 42 0 42 0 A 4 3 54197 CASAVA_Build 1 167139590 1I TTTACTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 339 hom 31 1 21 9 T 11 12 54198 CASAVA_Build 1 167161366 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTTTTTTTAC 163 het 163 ref 13 2 1 10 TTA 1 0 54199 CASAVA_Build 1 167166971 4D ATATATATAT ATAC/---- ACTATATATA 3062 hom 18 het 8 0 7 2 ATAC 1 0 54200 CASAVA_Build 1 167167452 2I AAGACATCTG --/GA GAGAAGCAGC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 GA 2 3 54201 CASAVA_Build 1 167184365 5D CCCTTCGTTA AAATG/----- AAAGAGAACA 3070 het 3070 hom 39 17 21 7 AAATG 1 0 54202 CASAVA_Build 1 167186728 2D CTCCTACAGT AA/-- AAAACTGCCT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 6 4 54203 CASAVA_Build 1 167201933 1I GAATATTTAG -/A TAGCTTTTAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 0 1 54204 CASAVA_Build 1 167216077 7D CATATGCACT CTCTCCC/------- CTCTCCTTGG 3070 het 3070 hom 49 20 27 3 CTCTCCC 1 0 54205 CASAVA_Build 1 167220133 1D TCTAACATTC T/- TTTTTTTTTT 1101 het 1101 ref 53 32 4 18 T 11 10 54206 CASAVA_Build 1 167221798 1I CTCTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 T 10 11 54207 CASAVA_Build 1 167243886 2D TAGTCCAAGG GT/-- CTATTAAAGG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 GT 1 0 54208 CASAVA_Build 1 167244115 3D TATATCTAGA AGG/--- AGGACACTTC 3070 hom 99 het 39 0 32 8 AGG 2 1 54209 CASAVA_Build 1 167245635 4I TTAGTTCAGG ----/AGTC AGTCAGAGAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AGTC 1 2 54210 CASAVA_Build 1 167266036 2I ATTATTACAC --/TT ATATTATTCT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 0 2 54211 CASAVA_Build 1 167286887 3I CCTGAGTTTT ---/CTC CTCCTTTGTG 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 CTC 1 2 54212 CASAVA_Build 1 167289690 1I TATTTACTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 T 8 9 54213 CASAVA_Build 1 167291048 1I AAACTGCCTT -/C CCCATACTCC 3070 hom 71 het 30 0 23 7 C 3 4 54214 CASAVA_Build 1 167295151 1I GAATAGAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 10 11 54215 CASAVA_Build 1 167299267 1D TTTGAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 T 11 10 54216 CASAVA_Build 1 167304997 1D CAACAGCCCC T/- AGCCATCAGC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 1 0 54217 CASAVA_Build 1 167321121 5I CCCCTGAACT -----/TAAAA TAAAAGTTGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TAAAA 1 2 54218 CASAVA_Build 1 167328469 1I ACTGGCATAG -/T ATACAACATC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 0 1 54219 CASAVA_Build 1 167332941 1D GGGGAAGCCC T/- GTGTTTTGGA 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 T 1 0 54220 CASAVA_Build 1 167333252 1I CTTGACTTTT -/C CCATTGGCCA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 C 2 3 54221 CASAVA_Build 1 167343956 1I TTTTGTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 9 10 54222 CASAVA_Build 1 167362210 2I TAAATTATGG --/TA TTTGCATTAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TA 0 1 54223 CASAVA_Build 1 167366261 3I CACAGAAGTA ---/CTT CTTTCTGGCC 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 CTT 1 2 54224 CASAVA_Build 1 167369110 2I AAGATAAAAA --/TC AGCTTTCCAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 TC 0 1 54225 CASAVA_Build 1 167371967 17D CAGCCAGCCA CATATATCGGGCACAGC/----------------- CAGTGCCCGA 3070 het 3070 hom 37 14 19 7 CATATATCGGGCACAGC 1 0 54226 CASAVA_Build 1 167421930 1D TAGAAATGCA C/- CAAACAGATT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 C 2 1 54227 CASAVA_Build 1 167454175 1I AACTACTGGA -/C CCAGGTGCAG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 C 2 3 54228 CASAVA_Build 1 167567679 1I GAAAAAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 10 11 54229 CASAVA_Build 1 167579356 1D ACATTGTCTC T/- TTTTTTTTTT 825 het 825 ref 28 15 4 9 T 15 14 54230 CASAVA_Build 1 167584759 1I GAGTTAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1596 hom 25 4 19 2 A 14 15 54231 CASAVA_Build 1 167621680 1D CTTAGAAGGG A/- AAAAAAAAAT 1130 het 1130 ref 47 33 3 11 A 10 9 54232 CASAVA_Build 1 167626065 3D TGTCAATAAC AAT/--- AATAATAAAG 3070 het 3070 hom 37 18 17 3 AAT 3 2 54233 CASAVA_Build 1 167728547 1D TTCAATCTCA T/- TTTCTACTAA 3070 het 3070 hom 52 17 29 9 T 4 3 54234 CASAVA_Build 1 167734531 2I TAAAGGAAAG --/AT ATTTAATTGA 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 AT 1 2 54235 CASAVA_Build 1 167737240 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 8 7 54236 CASAVA_Build 1 167737866 1I ATACAAAATC -/A AATGTGCAAA 3070 het 979 hom 11 2 9 0 A 2 3 54237 CASAVA_Build 1 167757646 1I CCCTGCCTAA -/T TTTTTTTTAA 1113 het 751 hom 10 3 3 4 T 8 9 54238 CASAVA_Build 1 167772182 1D AAATGAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 T 12 11 54239 CASAVA_Build 1 167785444 2D AATATGTTAT CA/-- CACTCTAGAC 3070 het 3070 ref 29 10 10 9 CA 2 1 54240 CASAVA_Build 1 167785497 1D TAGACAAGAC A/- AAAAAAAAAA 2702 het 2702 ref 23 11 8 5 A 13 12 54241 CASAVA_Build 1 167792182 7I AGGTCTTTTT -------/CTCTGGC TGCATATGAA 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 CTCTGGC 0 1 54242 CASAVA_Build 1 167792886 1I TGTGCCCTGC -/A AAAAGCAGAC 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 A 4 5 54243 CASAVA_Build 1 167798274 1D TTAGCATTGC T/- TTTTTATTCA 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 T 6 5 54244 CASAVA_Build 1 167799718 4D TTCTATTCTC TCTT/---- TCACTTCTCA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 TCTT 1 0 54245 CASAVA_Build 1 167802475 1D GTCAGAGTTG A/- AAATATCTTG 3070 het 3070 hom 36 12 21 4 A 4 3 54246 CASAVA_Build 1 167803246 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2550 hom 20 7 10 3 A 9 10 54247 CASAVA_Build 1 167806573 1I TACTTTCTGA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 2842 hom 24 7 14 3 T 6 7 54248 CASAVA_Build 1 167806901 3I15M4D TGGAACATGT ---AGAAGGAAAGATATTTAAA/AGGAGAAGGAAAGATATT---- TGTGAACCAT 3070 het 3070 ref 40 25 18 2 N/A 0 0 54249 CASAVA_Build 1 167808812 3D TGGAGCATTT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 18 7 TTC 1 0 54250 CASAVA_Build 1 167810116 8D TGTAGTCCTT GGAGTCTC/-------- TGCATCAGAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 7 GGAGTCTC 1 0 54251 CASAVA_Build 1 167817698 4D CACACTAAAT AAAC/---- AGAAGAATAG 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 AAAC 1 0 54252 CASAVA_Build 1 167826446 3I TTTTTATAAC ---/CAT CAAGAGTTCT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 CAT 0 1 54253 CASAVA_Build 1 167835221 1I AAACTTTGGC -/A AAAAAAAAAA 2565 het 2565 ref 27 10 7 10 A 13 14 54254 CASAVA_Build 1 167836091 1I AAACATTCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 16 18 8 A 8 9 54255 CASAVA_Build 1 167837757 1I AATTATTACC -/A ATTATCACTG 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 A 1 2 54256 CASAVA_Build 1 167859049 1I CTGGGCTTTG -/C CTCTATTCAG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 1 2 54257 CASAVA_Build 1 167872080 1D AAGACTTCAT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 A 9 8 54258 CASAVA_Build 1 167907332 1I AAAAATAGGT -/G GGACCAATTC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 2 3 54259 CASAVA_Build 1 167917934 3D TCACCTTAAA CTC/--- CTCCTTCAAA 3070 hom 66 het 26 0 19 8 CTC 2 1 54260 CASAVA_Build 1 167919720 23D TTGCCTGGGT GGCAAGCACCACCTCTCCTGGGG/----------------------- GGCAAGCACC 3070 hom 77 het 39 0 19 24 GGCAAGCACCACCTCTCCTGGGG 2 1 54261 CASAVA_Build 1 167928933 1I CCAAGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2143 hom 41 9 20 12 A 15 16 54262 CASAVA_Build 1 167946097 2I GAATTAACAG --/CT CTCTGTGAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CT 2 3 54263 CASAVA_Build 1 167951392 1D TAAAGTATAA T/- TTAAAAAAAG 3070 hom 42 het 17 0 15 4 T 3 2 54264 CASAVA_Build 1 167952265 4D TCTCCATCCC CAAA/---- CAAATTTAGT 3070 hom 114 het 39 0 39 1 CAAA 2 1 54265 CASAVA_Build 1 167961154 1I TCTCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 13 14 54266 CASAVA_Build 1 167966091 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 8 hom 43 1 33 10 A 10 9 54267 CASAVA_Build 1 167975646 1I TCTTACCAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 9 10 54268 CASAVA_Build 1 167982326 8D TTGTGAAATG GATTCAAA/-------- GATTCAAAGA 3070 hom 102 het 39 0 31 10 GATTCAAA 2 1 54269 CASAVA_Build 1 168000667 1D CAGATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 13 12 54270 CASAVA_Build 1 168001675 2D AATTTTTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 26 12 A 13 11 54271 CASAVA_Build 1 168003176 1I ACAACTGGAT -/A AAAAGGGGGC 3070 hom 74 het 28 0 25 3 A 4 5 54272 CASAVA_Build 1 168004014 1I AAAAAACACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 103 hom 26 1 21 4 T 9 10 54273 CASAVA_Build 1 168005028 4I CACAGTAAAG ----/ATCT ATCTGAGAGA 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 ATCT 1 2 54274 CASAVA_Build 1 168010049 39D TCATGGCTCA CTGCAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCAG/--------------------------------------- CTCAGCCCCC 3070 het 3070 ref 21 11 9 5 CTGCAGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCAG 1 0 54275 CASAVA_Build 1 168010488 1I AATTCAAAAC -/A AAAAAACATA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 6 7 54276 CASAVA_Build 1 168010637 1I AATGTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 A 13 14 54277 CASAVA_Build 1 168011760 2D GATCACAACT CA/-- CTGCAGCTTC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 CA 1 0 54278 CASAVA_Build 1 168023640 1I TGTTACATAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 8 9 54279 CASAVA_Build 1 168031617 1I TGAAAGAGTT -/G CTTCCGCTTG 3070 hom 81 het 34 0 26 8 G 0 1 54280 CASAVA_Build 1 168033828 2D GATGAGTGAC TT/-- AGGTATAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 0 54281 CASAVA_Build 1 168037363 4D CCCTTAATTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 28 1 15 15 A 20 16 54282 CASAVA_Build 1 168038664 3D AAACTCTTAT AAG/--- AAGAGAAGTC 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 AAG 2 1 54283 CASAVA_Build 1 168051970 1D TTCCATGAAC T/- GGGCAACTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 0 54284 CASAVA_Build 1 168053717 1I TTCACACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 11 12 54285 CASAVA_Build 1 168055468 1D TCCCCTATTA C/- CCGACTTTAG 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 C 3 2 54286 CASAVA_Build 1 168061839 1D TTAAAACAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 9 8 54287 CASAVA_Build 1 168070239 1I TGCTTGGCTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 45 19 17 9 T 8 9 54288 CASAVA_Build 1 168081453 5I GCAACTCCTC -----/TTCCA TTCAAGTTTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TTCCA 0 1 54289 CASAVA_Build 1 168093521 3D TGTGTCACTT AAC/--- AATGGGGACA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 AAC 1 0 54290 CASAVA_Build 1 168094519 4D ATGGTATAGA CAGT/---- CAGTCATTTA 3070 het 3070 ref 54 26 22 8 CAGT 2 1 54291 CASAVA_Build 1 168099778 4D TGAAAATAGA AAAT/---- AAATGGGTTG 3070 het 3070 ref 31 16 13 5 AAAT 2 1 54292 CASAVA_Build 1 168100766 1I GAAAGTGTGA -/G GCAAAGCCAG 3070 hom 24 het 17 0 9 8 G 1 2 54293 CASAVA_Build 1 168106521 1D TCTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 13 7 T 11 10 54294 CASAVA_Build 1 168122058 2D CCTGGGAAAC AG/-- AGTGAGACTA 3070 hom 66 het 30 0 23 8 AG 2 1 54295 CASAVA_Build 1 168123093 4I ATGGAGAGTG ----/GTCT GTCTTGCTGT 3070 het 3070 ref 37 22 15 0 GTCT 1 2 54296 CASAVA_Build 1 168125357 1D CTCAATTGCT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 9 8 54297 CASAVA_Build 1 168133138 2I TCCTCACCTC --/TT TGAGTCTTTG 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 1 3 54298 CASAVA_Build 1 168146054 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1357 het 1095 hom 10 4 4 2 A 13 12 54299 CASAVA_Build 1 168157681 1D TATCATTAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 10 9 54300 CASAVA_Build 1 168159757 1I ATTCTCCCCC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 9 54301 CASAVA_Build 1 168160389 2I TTTCTTTAAA --/CT CTCTCATTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 CT 2 3 54302 CASAVA_Build 1 168162446 4D AGTTGTGTGT GTAC/---- ACACACACAC 3070 hom 40 het 32 0 14 18 GTAC 1 0 54303 CASAVA_Build 1 168163869 1I ATCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 112 het 44 0 37 7 T 10 11 54304 CASAVA_Build 1 168168483 1D TAATGTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 17 6 T 11 10 54305 CASAVA_Build 1 168171976 1I TTGTTCCCTT -/G GGAACATTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 G 2 3 54306 CASAVA_Build 1 168177311 1I TTAGATGGCT -/A AAACAGTAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 3 4 54307 CASAVA_Build 1 168177804 2D TGTGTTAACA AC/-- AATGTTATTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AC 1 0 54308 CASAVA_Build 1 168179950 1I GGAGCGGCGA -/G GGTTGTGTGG 3070 hom 84 het 32 0 27 5 G 2 3 54309 CASAVA_Build 1 168180912 1D AGTGGGGGGC G/- GGGGGGGGCT 2936 het 5 hom 13 1 9 3 G 9 8 54310 CASAVA_Build 1 168182020 5D TTAGTGAACT AACTA/----- AAGATAATTT 3070 hom 99 het 39 0 34 8 AACTA 1 0 54311 CASAVA_Build 1 168182137 5D CAAATGTATT AAATC/----- AAACTGGGTA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 AAATC 1 0 54312 CASAVA_Build 1 168189229 4D GTTTGTGTCA ACAG/---- ACAATCTATA 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 ACAG 1 0 54313 CASAVA_Build 1 168193853 1I GCAATCTGGT -/G GTCTCCAACT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 1 2 54314 CASAVA_Build 1 168196630 1I ACTAACTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 9 22 4 A 9 10 54315 CASAVA_Build 1 168199689 1I ATAATAAACA -/T TTTTTATTCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 5 6 54316 CASAVA_Build 1 168199986 4I GAGAACACTT ----/AATA AATGTTAGCC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AATA 0 1 54317 CASAVA_Build 1 168201148 1I TTCCTGGTGT -/A AAAACAGGGG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 4 5 54318 CASAVA_Build 1 168202487 8D GATAACTGGA AAATATTT/-------- TAAAATATGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAATATTT 1 0 54319 CASAVA_Build 1 168204522 4D ACTAAATAAA ATTT/---- ATTTAAGTAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 3 ATTT 2 1 54320 CASAVA_Build 1 168209212 1I TCCTGAAATT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 9 54321 CASAVA_Build 1 168210363 13I TATTTGTGCA -------------/TTCTGAAACTCAT TTTTTTAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 TTCTGAAACTCAT 0 1 54322 CASAVA_Build 1 168211156 1D ACTTTCTAAC A/- AAAAATAAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 6 5 54323 CASAVA_Build 1 168213771 1I CAACATTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 593 hom 55 2 41 12 A 11 12 54324 CASAVA_Build 1 168225089 4D CTTGGTTTGC ATTT/---- ATTTATCTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 3 ATTT 2 1 54325 CASAVA_Build 1 168227111 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 34 1 24 9 A 12 11 54326 CASAVA_Build 1 168236771 2I AGCTAAACAT --/TC TGTTTTTAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TC 0 1 54327 CASAVA_Build 1 168239373 4D GCCTTTTGTC TGTT/---- TGTGCCCTGC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 TGTT 1 0 54328 CASAVA_Build 1 168250244 1D CTTACTTTAT A/- AATATCACCC 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 A 3 2 54329 CASAVA_Build 1 168267776 8D GGATCATCCA TACTCATT/-------- GAAGCAAAAA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TACTCATT 1 0 54330 CASAVA_Build 1 168284066 1I CTTATTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 576 hom 31 2 19 10 T 13 14 54331 CASAVA_Build 1 168301941 2D ATTGCCTACA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 31 het 26 0 16 10 C 11 9 54332 CASAVA_Build 1 168305600 1I GAGGCATGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 406 hom 39 1 32 6 A 9 10 54333 CASAVA_Build 1 168315285 1I TCATGATTTT -/A AAAAAACTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 6 7 54334 CASAVA_Build 1 168324785 1D TGCTACTCTA T/- TTTTTTTTTT 2861 het 2861 ref 21 9 6 6 T 11 10 54335 CASAVA_Build 1 168335269 2D CCTTCCTCTT GG/-- GAACTGTAAG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 G 3 1 54336 CASAVA_Build 1 168340102 3I TTCAGATTTG ---/TTC TTCTTGCCCA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TTC 1 2 54337 CASAVA_Build 1 168342693 1D TGCTATGTGG T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 T 8 7 54338 CASAVA_Build 1 168353175 1D ATGGGTACTA G/- GCTTAATACA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 G 2 1 54339 CASAVA_Build 1 168354560 1D ATATGGAAGC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 48 26 15 9 A 9 8 54340 CASAVA_Build 1 168354717 1I GAATAGAATA -/G AGAGCCCAAA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 G 0 1 54341 CASAVA_Build 1 168355809 2I TCATTTATAA --/GT GAGAACTAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 GT 0 1 54342 CASAVA_Build 1 168357598 4D ACACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 27 10 11 6 AC 11 9 54343 CASAVA_Build 1 168359242 3I TAATATTTGA ---/TGT TGTAAATTGT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 TGT 1 2 54344 CASAVA_Build 1 168359402 1I CTTTTAATCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 8 9 54345 CASAVA_Build 1 168361089 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2159 hom 23 7 14 2 A 10 11 54346 CASAVA_Build 1 168371157 1I GTCTGCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 10 11 54347 CASAVA_Build 1 168376072 1D CCTTAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1918 hom 32 7 18 7 A 13 12 54348 CASAVA_Build 1 168376483 1I TGTGCCTAAG -/A ATGGAATTGT 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 A 1 2 54349 CASAVA_Build 1 168376951 2I CTTTTTCTTT --/AC AGTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 AC 0 1 54350 CASAVA_Build 1 168390129 1D AGAAGGGGGT C/- AACTGCCTCC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 C 1 0 54351 CASAVA_Build 1 168393398 1D AATACTATCC A/- ATGTCTCAGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 A 2 1 54352 CASAVA_Build 1 168402072 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 1826 hom 10 het 4 0 4 0 T 8 9 54353 CASAVA_Build 1 168403897 2I AAAATGGTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 22 16 12 T 10 12 54354 CASAVA_Build 1 168406973 1D CGTTTGCCCA T/- TTTTTTAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 7 6 54355 CASAVA_Build 1 168410889 1I TTTCATTAGG -/T TGAGTGTGTA 3070 het 3056 hom 30 9 11 10 T 1 2 54356 CASAVA_Build 1 168410931 1D GAAATTGTGA G/- TAGGTTATAT 3070 het 1966 hom 28 5 19 4 G 1 0 54357 CASAVA_Build 1 168411039 1I TGTTGATTAG -/A AAGGTGCTCA 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 A 2 3 54358 CASAVA_Build 1 168412055 1D CTGGAGTGCA G/- TGACATGATC 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 G 1 0 54359 CASAVA_Build 1 168414792 1I ATGTTGAGCA -/T TTTTTTCATG 3070 het 2829 hom 28 7 14 7 T 6 7 54360 CASAVA_Build 1 168418904 2I CCTTGAATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1991 hom 29 6 13 10 T 13 15 54361 CASAVA_Build 1 168420212 1I CTTTCCCCTT -/C CACTCCCAAC 3070 hom 93 het 32 0 31 1 C 1 2 54362 CASAVA_Build 1 168430242 1I TGTGGTTTCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 34 12 11 11 T 8 9 54363 CASAVA_Build 1 168434490 2D TTAACTTTAG AT/-- AACCCTATTG 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 AT 1 0 54364 CASAVA_Build 1 168444514 1D TAATAAATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 10 9 54365 CASAVA_Build 1 168445291 2D TTTGAGGATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 T 12 10 54366 CASAVA_Build 1 168448594 1I CATTGACTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 T 9 10 54367 CASAVA_Build 1 168461968 1I TTTATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3022 hom 27 8 15 4 A 10 11 54368 CASAVA_Build 1 168466131 1D CTTTCTCCAT G/- GTCACATTGG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 G 2 1 54369 CASAVA_Build 1 168477215 1D ACCAAGCCAC T/- CTCTACACAG 3070 het 3070 hom 34 12 15 8 T 1 0 54370 CASAVA_Build 1 168480338 1I TGGAGTTGCC -/A GTTTATTTAA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 0 1 54371 CASAVA_Build 1 168482738 1D TCTGTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 11 12 A 13 12 54372 CASAVA_Build 1 168488024 1D TATACATTCA G/- CTATTTATTT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 1 0 54373 CASAVA_Build 1 168498224 1I ACTTTATCTC -/A TATGTCATCC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 0 1 54374 CASAVA_Build 1 168504189 1D GAAATCTTAA C/- CCCCAAGGTG 3070 hom 144 het 54 0 48 6 C 5 4 54375 CASAVA_Build 1 168508333 2D GTTCAAGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 6 T 13 11 54376 CASAVA_Build 1 168512139 1I ATAGTGCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 9 10 54377 CASAVA_Build 1 168514912 1D CTGATGAAAA C/- AAATATGGAA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 C 1 0 54378 CASAVA_Build 1 168537265 3I CCAGGGACTT ---/GGA GGAGAACATC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GGA 1 2 54379 CASAVA_Build 1 168542387 1I AGTTTTGGGA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 2645 hom 28 7 12 9 T 6 7 54380 CASAVA_Build 1 168547265 4D TTGTTTGTTT GTTA/---- GTTTTACAAA 3070 het 3070 ref 49 33 15 3 GTTA 1 0 54381 CASAVA_Build 1 168549005 4D CCAAATCCTC TTAA/---- TTAATCTCCC 3070 het 3070 ref 35 17 12 8 TTAA 2 1 54382 CASAVA_Build 1 168551439 1D TTCCTCTTTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 7 6 54383 CASAVA_Build 1 168567655 25I GGACATGCCT -------------------------/TCTGGAACTGAAACAAGTGATTATA ACTATCAACC 3070 hom 117 het 44 0 40 9 TCTGGAACTGAAACAAGTGATTATA 0 1 54384 CASAVA_Build 1 168569362 2I AAAAGGACTC --/TA TGTGGTGTGA 3070 het 3070 ref 49 23 23 3 TA 0 1 54385 CASAVA_Build 1 168570971 1D GGTTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 G 1 0 54386 CASAVA_Build 1 168591805 1D CTGACTTTGA T/- TTGGGGTGAA 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 T 3 2 54387 CASAVA_Build 1 168595897 15I TGAGAAAAAC ---------------/AGGAAGAGAAAAGAA AGGAAGAGAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 AGGAAGAGAAAAGAA 1 2 54388 CASAVA_Build 1 168596923 4D GCCAATGATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 TTTA 3 2 54389 CASAVA_Build 1 168597917 1D TGAAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 11 10 54390 CASAVA_Build 1 168598154 1I TCTTGAAATA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 6 7 54391 CASAVA_Build 1 168622365 4D TATCATTTCT TTTA/---- TTTATTAATT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 TTTA 2 1 54392 CASAVA_Build 1 168622995 1I GTTGAAAAAA -/T TTACATTCCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 3 54393 CASAVA_Build 1 168623408 2D CTGTTCATAG TT/-- TGTTTTGCTG 3070 het 3070 hom 33 9 21 4 T 3 1 54394 CASAVA_Build 1 168627116 1I TAGTTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 10 11 54395 CASAVA_Build 1 168632020 7D CTGCTGTATC CCTGTCA/------- CCTGTCACCT 3070 het 3070 ref 56 35 20 7 CCTGTCA 2 1 54396 CASAVA_Build 1 168635730 1I TACTAACGGG -/A AAAAAAGGCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 6 7 54397 CASAVA_Build 1 168651949 1I TGGTGCGGGG -/A AAAACGTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 4 5 54398 CASAVA_Build 1 168656503 1D AAATGTATTT C/- TGTATTTGTA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 C 1 0 54399 CASAVA_Build 1 168660424 1I ACATTCTATG -/T GCTTCTCAAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 0 1 54400 CASAVA_Build 1 168661386 3I CAAAAGCAAG ---/AAC AACAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 AAC 1 2 54401 CASAVA_Build 1 168670325 1I AGCCTAGACA -/T TTTATATTTC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 3 4 54402 CASAVA_Build 1 168679007 1I CCTTGGGCAT -/A AAAGGCACCA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 3 4 54403 CASAVA_Build 1 168679424 18D ATTACATATT CACACACACACACACACA/------------------ CACACAAACA 3070 het 1710 hom 32 8 20 8 CA 12 3 54404 CASAVA_Build 1 168691194 3D TATATTTAGG GTA/--- GTTAGCTCTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 GTA 1 0 54405 CASAVA_Build 1 168697261 1D GAGTACACGG T/- TCAGTTATCC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 2 1 54406 CASAVA_Build 1 168707481 1D TGTATTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 37 1 31 5 A 12 11 54407 CASAVA_Build 1 168711407 1I GATAATAAGC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 8 9 54408 CASAVA_Build 1 168711678 1D TATGTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 13 12 54409 CASAVA_Build 1 168712526 1D CATAAAATAG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 6 A 7 6 54410 CASAVA_Build 1 168713044 1D TTAGAATGGC T/- TAAAGGTATT 3070 hom 117 het 47 0 40 9 T 2 1 54411 CASAVA_Build 1 168714369 1I CACTTTGCAT -/C CATTGTCAGA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 C 1 2 54412 CASAVA_Build 1 168714461 5D ACAGAAACTC TTTAG/----- TTTAGTTAGG 3070 het 3070 ref 38 22 14 4 TTTAG 2 1 54413 CASAVA_Build 1 168716508 1D GTTTTGTTCA T/- TTTTTAAATT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 6 5 54414 CASAVA_Build 1 168731789 2I GAACAGTTGA --/CT CTCTGTGGTC 3070 hom 126 het 50 0 41 9 CT 2 3 54415 CASAVA_Build 1 168735087 1I AAATAAATAT -/A AAAATATAGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 4 5 54416 CASAVA_Build 1 168740400 1D TACAGTTTCC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 9 8 54417 CASAVA_Build 1 168743667 1D TGGTTTCAAA G/- AACATCTTTA 3070 het 474 hom 11 1 10 0 G 1 0 54418 CASAVA_Build 1 168744250 1D GAAAATGTAA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 4 T 7 6 54419 CASAVA_Build 1 168745923 5D GGTACTGAAA AGCAG/----- AGACTATCTT 3070 het 3070 ref 34 19 14 4 AGCAG 1 0 54420 CASAVA_Build 1 168753108 1I CTTTGGAATC -/T TTATTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 T 2 3 54421 CASAVA_Build 1 168766959 1I AAGGGGAGAC -/T TAAGAAATCC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 1 2 54422 CASAVA_Build 1 168784114 2I GAATAAACTC --/CT CTCAAAACCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CT 1 2 54423 CASAVA_Build 1 168811216 2D TTTTTTTTTT TA/-- AACCAGTATT 3070 het 403 hom 41 4 19 18 TA 1 0 54424 CASAVA_Build 1 168828735 1I AGGCTGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3052 het 2334 hom 30 8 12 10 A 15 16 54425 CASAVA_Build 1 168828795 1I GGATGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 11 12 54426 CASAVA_Build 1 168830764 1D TATAATGAAC T/- TGGTGAGTTA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 2 1 54427 CASAVA_Build 1 168831774 6I GATATAAAAT ------/GACCAA GACCAAGTAA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 GACCAA 1 2 54428 CASAVA_Build 1 168840551 8D GCCTGTTTCC CACTAATA/-------- CACAGCATAC 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 CACTAATA 1 0 54429 CASAVA_Build 1 168841886 1D TTTCTTAAAC T/- TATTTAATGT 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 T 2 1 54430 CASAVA_Build 1 168847790 1D CAACCCTTGC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 T 9 8 54431 CASAVA_Build 1 168854723 3D TTGAAAACTT AGG/--- AGATTTCGTC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 AGG 1 0 54432 CASAVA_Build 1 168856887 1I ATTAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 10 11 54433 CASAVA_Build 1 168857988 3I TTACTTTTCA ---/TTG TTGTTGTACT 3070 het 3070 hom 51 22 28 4 TTG 2 3 54434 CASAVA_Build 1 168868315 1I CTATCTCTTC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 7 8 54435 CASAVA_Build 1 168870534 3D GCTATTAGCC ATG/--- ATATTAGTCT 3070 het 3070 hom 45 23 20 4 ATG 1 0 54436 CASAVA_Build 1 168880357 1D GGATAATATA T/- TTTTTAATAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 6 5 54437 CASAVA_Build 1 168893628 1D TCAGGTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 725 hom 28 4 15 9 T 11 10 54438 CASAVA_Build 1 168897689 1D ACTCGTACCC T/- TCTTTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 17 11 12 T 2 1 54439 CASAVA_Build 1 168899199 1D AGAGAGAGAA G/- GGGAAAGGGG 3070 hom 63 het 27 0 21 6 G 4 3 54440 CASAVA_Build 1 168912098 1I TCCCCTCTCT -/C TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 C 0 1 54441 CASAVA_Build 1 168917260 3I TTATCTTTGC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 18 24 11 A 11 14 54442 CASAVA_Build 1 168921414 4D GCCTGCTTGA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 36 11 18 9 TTTC 5 4 54443 CASAVA_Build 1 168921652 1I GTGTAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 10 11 54444 CASAVA_Build 1 168925889 1D CTCCTCCCCT C/- CCCCCCCATT 3070 het 3070 ref 35 13 12 11 C 8 7 54445 CASAVA_Build 1 168926457 4D AATTAGACTT TAAG/---- TATTCAAATG 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 TAAG 1 0 54446 CASAVA_Build 1 168931610 1D TGCTTTTTTT C/- CCCCCCTCTC 3070 hom 135 het 48 0 44 4 C 7 6 54447 CASAVA_Build 1 168939362 1D TATAATAGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 10 9 54448 CASAVA_Build 1 168950332 1I ATATGTTTTT -/A CCGTACCTTT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 0 1 54449 CASAVA_Build 1 168959714 1I AGGTCCATCA -/T TATGTGGTGC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 1 2 54450 CASAVA_Build 1 168969989 1D ATTGGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 40 2 18 20 T 19 18 54451 CASAVA_Build 1 168970423 2D CATACATGTA TG/-- TGTGCACACA 3070 het 3070 ref 55 25 23 8 TG 3 2 54452 CASAVA_Build 1 168972524 1I CATGGTAAGG -/T TTTTTCCATC 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 5 6 54453 CASAVA_Build 1 168996193 1D CTTGTTGATC T/- GTGTAATATT 2376 het 2376 ref 17 11 5 1 T 1 0 54454 CASAVA_Build 1 168999090 9D GCAGCAAACC ACCACGGCA/--------- CGTGTATACC 2447 het 1331 hom 8 3 5 0 ACCACGGCA 1 0 54455 CASAVA_Build 1 169001253 1D TGTTTTTATG T/- GGCTCTCATG 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 T 1 0 54456 CASAVA_Build 1 169045113 1D AAGGAAAGAC A/- AAAAGCGGGG 3070 het 3070 hom 30 13 12 6 A 5 4 54457 CASAVA_Build 1 169054074 1D TTAGCCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 12 11 54458 CASAVA_Build 1 169056664 10I AAAGATCCTG ----------/TCTCTACAAA ATACACAGAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 TCTCTACAAA 0 1 54459 CASAVA_Build 1 169059082 8D AATGAGTCAT TCCACCTA/-------- TCCTGGAGTT 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 TCCACCTA 1 0 54460 CASAVA_Build 1 169063848 1I AAAGGGATTC -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 A 6 7 54461 CASAVA_Build 1 169067442 1I CAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1904 hom 28 9 13 6 T 9 10 54462 CASAVA_Build 1 169072981 1I GAATTCAGTA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 6 7 54463 CASAVA_Build 1 169073390 2D TAGTTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2659 hom 36 12 13 12 T 13 11 54464 CASAVA_Build 1 169079000 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2039 hom 28 6 18 4 A 10 9 54465 CASAVA_Build 1 169086101 1D TTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 952 het 952 ref 26 20 3 3 A 11 10 54466 CASAVA_Build 1 169093050 3I TTTTCTACTG ---/CTT CTTCTTCCTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 CTT 2 3 54467 CASAVA_Build 1 169093793 1D TTGAGGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 T 12 11 54468 CASAVA_Build 1 169097478 5I TAAAAAGAAG -----/ATAAA ATAAATGTTT 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 ATAAA 1 2 54469 CASAVA_Build 1 169100091 1I GCAAAGACCT -/C CCCACCTTTG 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 C 3 4 54470 CASAVA_Build 1 169103417 1I ATTTTTAGGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 T 8 9 54471 CASAVA_Build 1 169104694 1I TTCCTAGGTA -/T TTTATTCCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 4 54472 CASAVA_Build 1 169105064 5D GCCCATTCAG TATGA/----- TATGATATGG 3070 het 3070 ref 29 16 9 6 TATGA 2 1 54473 CASAVA_Build 1 169110063 1I CTCCCAGGCT -/G GAATGCAGTG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 G 1 2 54474 CASAVA_Build 1 169111242 1I ATGGTTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 16 3 A 12 13 54475 CASAVA_Build 1 169115880 1I ATGTTGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 11 12 54476 CASAVA_Build 1 169118325 4D TTGTCAGTAC TACA/---- TAGTCATAAA 3070 het 3070 hom 22 8 12 3 TACA 1 0 54477 CASAVA_Build 1 169139719 1D GCCTCCTTAC A/- AGTATATAAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 6 A 2 1 54478 CASAVA_Build 1 169142325 2D ATTATATATA AT/-- ATATATAAAA 2032 het 1958 hom 13 6 5 3 AT 4 3 54479 CASAVA_Build 1 169142666 2D AACAGATGAG TC/-- TGTTGACTCT 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 TC 1 0 54480 CASAVA_Build 1 169160143 1D CTTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 16 12 A 11 10 54481 CASAVA_Build 1 169168141 3I AGTACCTTTA ---/CGG TGGCATTTCC 3035 het 3035 ref 31 20 9 2 CGG 0 1 54482 CASAVA_Build 1 169212126 2I TTTCTTCAGC --/AG ATTTGCTTGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AG 0 1 54483 CASAVA_Build 1 169217509 1I TAGAAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 17 0 15 2 A 12 13 54484 CASAVA_Build 1 169218026 1I ACTATTATTC -/A CAGTAAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 1 54485 CASAVA_Build 1 169221718 1D GGAGAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 112 hom 39 1 33 5 T 11 10 54486 CASAVA_Build 1 169259568 3I TATACATTAC ---/ATT ATTAACTATA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATT 1 2 54487 CASAVA_Build 1 169262045 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 805 het 805 ref 33 16 4 13 T 13 14 54488 CASAVA_Build 1 169272554 1D ATACAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1123 het 1123 ref 33 28 3 4 A 12 11 54489 CASAVA_Build 1 169285453 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1285 het 1285 ref 39 29 3 7 T 12 11 54490 CASAVA_Build 1 169324218 1I ATTTATACAG -/A ATTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 1 2 54491 CASAVA_Build 1 169327357 1I TGACTTCTTT -/C CCCCAACACC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 C 4 5 54492 CASAVA_Build 1 169340831 1I TCAATTTTTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 7 8 54493 CASAVA_Build 1 169348609 1I GGGACTGAGT -/C CTGAGGTATG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 54494 CASAVA_Build 1 169355398 1I CATGCAACAA -/C AAAAACTCAC 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 C 0 1 54495 CASAVA_Build 1 169360236 1I CTTGTTCCCA -/C CCCCACTGTG 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 C 4 5 54496 CASAVA_Build 1 169364067 1I AGGGCAGCAG -/C CCTCATGGCC 3070 hom 108 het 45 0 33 12 C 2 3 54497 CASAVA_Build 1 169367400 1I TTAAGATCAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 8 9 54498 CASAVA_Build 1 169374788 1D TGTAAACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 10 19 9 T 11 10 54499 CASAVA_Build 1 169376208 1D CAGAGAGGGA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 8 7 54500 CASAVA_Build 1 169378051 1I GCACAAGAGT -/C CCTTCCGGAC 3070 hom 99 het 35 0 31 4 C 2 3 54501 CASAVA_Build 1 169395953 1D AGTAATTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 24 9 7 8 T 10 9 54502 CASAVA_Build 1 169397223 5D CAACACACAC ACACA/----- CACACATACA 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 ACACA 1 0 54503 CASAVA_Build 1 169399325 1D TGCAATATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 11 10 54504 CASAVA_Build 1 169399767 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 1927 hom 14 5 8 1 A 9 8 54505 CASAVA_Build 1 169401692 1I GAACACAGGG -/T TTTTTTTTTT 2282 het 2282 ref 24 10 6 8 T 10 11 54506 CASAVA_Build 1 169405471 1I GTATTCAGCA -/T TTTTTAAGAT 3070 hom 85 het 36 0 28 8 T 5 6 54507 CASAVA_Build 1 169406696 1D CCTTGATTCC A/- AACTAACTGC 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 3 2 54508 CASAVA_Build 1 169407236 1D TCTATACCCC T/- ATCTCAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 T 1 0 54509 CASAVA_Build 1 169409927 1D TTCACCATGT G/- GGCCAGGCTG 2228 het 2228 ref 16 7 6 3 G 3 2 54510 CASAVA_Build 1 169417828 1D AATGGTTCAG A/- GGGGGTGACT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 A 1 0 54511 CASAVA_Build 1 169423793 10D TTCAGCTGGA ATTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 ATTTTTTTTT 1 0 54512 CASAVA_Build 1 169424976 1D ACCATGTACA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 54513 CASAVA_Build 1 169425137 1I TTTCTCTCTT -/A AAATTTGGCT 3070 hom 118 het 48 0 40 8 A 3 4 54514 CASAVA_Build 1 169426493 1D ACTAGGCCAA T/- TTTACCCAGA 3070 het 3070 hom 53 23 26 5 T 4 3 54515 CASAVA_Build 1 169426909 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 26 0 22 5 A 12 11 54516 CASAVA_Build 1 169427709 3I GTTGAGGTGG ---/GAA GATCACCTGA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 GAA 0 1 54517 CASAVA_Build 1 169429176 3I CTGTTTCAGT ---/GAC GACTTTCCAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 GAC 1 2 54518 CASAVA_Build 1 169430570 1I GTGAGGCTTA -/T TTTTTAATAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 5 6 54519 CASAVA_Build 1 169431560 1D AGCTACATTT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 94 het 35 0 32 4 A 7 6 54520 CASAVA_Build 1 169432427 1D TGTCCTTAGT G/- TGAGAAAATG 3070 het 3070 hom 49 21 21 8 G 1 0 54521 CASAVA_Build 1 169434013 3I TCACTGATTT ---/ACA ACACAATATG 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 ACA 1 2 54522 CASAVA_Build 1 169434174 1D TGATAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 34 2 20 13 T 15 14 54523 CASAVA_Build 1 169437603 1I GAAGGGGGAA -/C CCCTTATAAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 3 4 54524 CASAVA_Build 1 169444882 1I TGTTGTGGCC -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 7 8 54525 CASAVA_Build 1 169454344 1I GAAAAGAAAG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 7 8 54526 CASAVA_Build 1 169468464 1D ATGCATTCCA T/- TTTTTTTTTT 2343 het 2343 ref 31 16 7 8 T 11 10 54527 CASAVA_Build 1 169471571 1D GAGGCACAAG A/- AAAAAACAAA 2946 het 2946 ref 20 11 7 2 A 7 6 54528 CASAVA_Build 1 169479095 12I GGAACTTAGA ------------/CGATGAGTCAAT CGATGCAGCA 3070 het 3070 ref 53 30 16 7 CGATGAGTCAAT 0 1 54529 CASAVA_Build 1 169480720 1D ACTCAACCAT A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 7 6 54530 CASAVA_Build 1 169482280 21D TTATCTGGTC CAACAATGACAGCATCATCAT/--------------------- CATCATCATT 3070 het 3070 ref 49 29 18 8 CAACAATGACAGCATCATCAT 1 0 54531 CASAVA_Build 1 169485340 2D TCCAGCTGAA TC/-- TCTCTCTGAT 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 TC 4 3 54532 CASAVA_Build 1 169557441 1D AGCTGTACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 T 10 9 54533 CASAVA_Build 1 169578310 24I GAAAATTTTT ------------------------/TCTGTCTTAGAGACAGAGTCTCAC TCCATCACCC 1517 het 1517 ref 23 13 4 7 TCTGTCTTAGAGACAGAGTCTCAC 0 1 54534 CASAVA_Build 1 169589566 2D TAATGCATAC TT/-- TTTTTTTTTT 2676 het 1613 hom 22 6 8 8 T 16 14 54535 CASAVA_Build 1 169592311 1D GATTGTTTTA T/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 T 7 6 54536 CASAVA_Build 1 169594031 1I TAAAGGTATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 8 9 54537 CASAVA_Build 1 169602126 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTTCTC 950 het 950 ref 27 16 4 7 AG 1 2 54538 CASAVA_Build 1 169620344 3D CTCAACATTC TTT/--- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 11 8 54539 CASAVA_Build 1 169622680 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 14 10 A 10 9 54540 CASAVA_Build 1 169625702 1D ATCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1863 hom 19 6 10 3 T 11 10 54541 CASAVA_Build 1 169635500 1I TTTATTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2728 hom 23 8 9 6 A 14 15 54542 CASAVA_Build 1 169635667 2D CCATCTCTAT AA/-- AAAAAAATTA 3070 het 1750 hom 19 5 13 1 A 9 7 54543 CASAVA_Build 1 169638338 17I ACTCTAGGAA -----------------/ACTGAGGCAGGCAGATC ACTTGAGGTT 2535 het 2535 ref 16 8 6 2 ACTGAGGCAGGCAGATC 0 1 54544 CASAVA_Build 1 169651377 3D CATCATACTC AAT/--- GATGAAAAGT 3070 het 3070 hom 52 24 23 7 AAT 1 0 54545 CASAVA_Build 1 169654402 1D TCTATCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 11 10 54546 CASAVA_Build 1 169657129 1I71M4I ATGCATACTG -TTAAGGGTATTTATTAGCTGTGGACCTTGAACAAGTGATTTAACCATCCTGTGCTTCTGGTTTTTTTGTTC----/TTTAAGGGTATTTATTAGCTGTGGACCTTGAACAAGTGATTTAACCATCCTGTGCTTCTGGTTTTTTTGTTCGTTT GTTTGTTTTC 3070 het 81 hom 48 1 47 34 N/A 0 0 54547 CASAVA_Build 1 169657373 1I ACTGATGTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 9 10 54548 CASAVA_Build 1 169657466 1D GGTGAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 19 16 8 A 10 9 54549 CASAVA_Build 1 169664688 6D4M1D CAGGTAACAA TCTGGGACTTG/------ACTT- CAATTGACAT 3070 het 3070 hom 29 13 17 4 N/A 0 0 54550 CASAVA_Build 1 169669216 2D AGACTCCGTC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 21 0 20 6 A 11 9 54551 CASAVA_Build 1 169670771 4D AGACCAAACT TCGC/---- TTTTAGAGCG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 TCGC 1 0 54552 CASAVA_Build 1 169671445 1I ATTTTAACAG -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 7 8 54553 CASAVA_Build 1 169673062 2I CTGGGTAACT --/TA TAAATAAAAG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 TA 1 2 54554 CASAVA_Build 1 169675558 1I AAATATAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 11 11 19 T 15 16 54555 CASAVA_Build 1 169677081 1D TTGTAACAAG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 A 7 6 54556 CASAVA_Build 1 169678893 2D CCTGAACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2304 het 2212 hom 21 8 9 4 T 12 10 54557 CASAVA_Build 1 169684896 1D TAAATTAAAC A/- AAAAAAAAAC 2500 hom 29 het 16 0 9 7 A 10 9 54558 CASAVA_Build 1 169690589 1I GTTCAACTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 T 9 10 54559 CASAVA_Build 1 169691093 2I CTTGTAAGAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 AC 7 8 54560 CASAVA_Build 1 169696468 2D CTGAGTGAGA CT/-- CTGTCTAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 11 8 CT 2 1 54561 CASAVA_Build 1 169698105 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 69 het 24 0 22 2 A 6 7 54562 CASAVA_Build 1 169700395 20D CAGCCTCCTG AGTAGCTGGGACTACAGGTT/-------------------- CACATCACCA 3070 het 3070 hom 26 9 17 1 AGTAGCTGGGACTACAGGTT 1 0 54563 CASAVA_Build 1 169706197 1I GAAGTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2809 hom 31 11 11 9 T 13 14 54564 CASAVA_Build 1 169723782 43D GGCTCATTCC AGCCCCCTCTCTTCTTCTTACCCCCACCCCACCCTCTTTAGTG/------------------------------------------- ATAAAATGTC 3070 het 3070 ref 21 18 10 3 AGCCCCCTCTCTTCTTCTTACCCCCACCCCACCCTCTTTAGTG 1 0 54565 CASAVA_Build 1 169727803 2D TTTTGAAAAC AG/-- AGGACATTGA 2509 het 2509 ref 25 18 6 1 AG 2 1 54566 CASAVA_Build 1 169728850 3I TAATAAAAGA ---/GAG AGAGAAGGAA 1866 het 1866 ref 22 12 4 6 GAG 0 1 54567 CASAVA_Build 1 169742365 2I ACTTAAGGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2079 hom 33 8 13 12 T 14 16 54568 CASAVA_Build 1 169757364 3I CTGAGCTGAG ---/TTC TTCTTCCCCA 3070 hom 85 het 34 0 29 5 TTC 2 3 54569 CASAVA_Build 1 169769206 1I TATGCTATTA -/G AACTGTAATT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 G 0 1 54570 CASAVA_Build 1 169781783 4I AATTTGATTC ----/TTAG TTAGTTATAT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 TTAG 1 2 54571 CASAVA_Build 1 169783397 1D GTTTCCCTTC T/- TTTTTTTTTT 2608 het 1171 hom 31 11 13 7 T 12 11 54572 CASAVA_Build 1 169794142 1I GGCAATGTTT -/G GGGGGGGTCT 3070 het 3070 hom 46 14 25 8 G 7 8 54573 CASAVA_Build 1 169794223 2I TCATGGTAAC --/TG TGTCAAGCAA 3070 het 3070 hom 51 24 25 2 TG 1 2 54574 CASAVA_Build 1 169796164 9I ACAATGGGAT ---------/TTGAGACTA TTGACTCCAG 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 TTGAGACTA 0 1 54575 CASAVA_Build 1 169805037 4I TCACAAAGAG ----/CTTT CTTTAACTAT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 CTTT 1 2 54576 CASAVA_Build 1 169806494 1I CAGTCCATAC -/T TTTCTTCCCA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 3 4 54577 CASAVA_Build 1 169817691 2I CATCCATCTC --/AG AGATGATAGG 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 AG 1 2 54578 CASAVA_Build 1 169817784 4D GTTTATGTTC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 29 12 16 3 TTGT 3 2 54579 CASAVA_Build 1 169819140 1I TTAGGCTAGG -/C CTACGCAGGG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 C 1 2 54580 CASAVA_Build 1 169821216 1D GTGGGGGAAC A/- AAGTCATTAG 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 A 3 2 54581 CASAVA_Build 1 169823507 1I AACATCTAGT -/C CCTTCCGGTA 3070 hom 101 het 37 0 33 4 C 2 3 54582 CASAVA_Build 1 169831170 1I ACATTGTCCC -/T TGAGCTGCCC 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 T 1 2 54583 CASAVA_Build 1 169831423 1D TTTCACAGAT G/- GCTTACCATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 2 1 54584 CASAVA_Build 1 169835930 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2820 hom 19 7 10 2 A 13 14 54585 CASAVA_Build 1 169849310 1I CTGTGATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 10 11 54586 CASAVA_Build 1 169858451 2I CTAGAATGGC --/AG AGTCACCACG 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 AG 1 2 54587 CASAVA_Build 1 169861809 1I TTAACTATTC -/T TTTTTAGATG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 5 6 54588 CASAVA_Build 1 169865378 1D AGCTGGGCAG T/- TCAAATTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 2 1 54589 CASAVA_Build 1 169876973 1I AAACTGCTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 9 10 54590 CASAVA_Build 1 169894479 2I TCACTGCAAG --/CT CCGCCTCCCA 3070 hom 50 het 18 0 15 3 CT 0 1 54591 CASAVA_Build 1 170073156 2I GTTTCATCAC --/AT GTTTCTTTAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AT 0 1 54592 CASAVA_Build 1 170074474 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1251 het 1251 ref 14 8 3 4 A 16 15 54593 CASAVA_Build 1 170076156 2I ATTTTAATAT --/AA GTCTTTTTAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 2 54594 CASAVA_Build 1 170096584 1D GGGAAGAATG A/- AAAAACGACT 3070 hom 99 het 37 0 32 6 A 6 5 54595 CASAVA_Build 1 170106020 2D TTGGGGTAAC AT/-- ATGATTTTTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AT 2 1 54596 CASAVA_Build 1 170116027 2D GATTTTTAAA AT/-- ATATTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 AT 3 2 54597 CASAVA_Build 1 170127111 2I GGCAAGTGCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 31 0 21 10 A 12 14 54598 CASAVA_Build 1 170130571 1D CGTTGTTCAA T/- TTCCCACCTA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 3 2 54599 CASAVA_Build 1 170134467 2I ATATATATAT --/AG ATAGAGAGAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AG 0 1 54600 CASAVA_Build 1 170136715 1I ACTAAAAAAA -/C AAATAGAAAA 1743 hom 14 het 6 0 5 1 C 0 1 54601 CASAVA_Build 1 170138381 1I GGCTTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 42 1 29 12 T 11 12 54602 CASAVA_Build 1 170141634 2I GTCTCAAGAC --/AA AAAAAAAAAA 1568 het 440 hom 29 1 6 22 A 10 12 54603 CASAVA_Build 1 170153044 1I ATTTGCTGCC -/A GGGGGGAATT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 0 1 54604 CASAVA_Build 1 170156869 1D TTTTGTAGGG T/- TTTTTTTTTT 1218 het 1218 ref 22 12 5 5 T 11 10 54605 CASAVA_Build 1 170160660 1D CTTTGCCCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 61 het 26 0 21 5 T 10 9 54606 CASAVA_Build 1 170172632 60I TAAGCAATGA ------------------------------------------------------------/GGTAATGTGGAGACACAAAGTTCAGGCAGCAGGTCTGAGAAGAAAGGCTTGAGAAGGTGG TGAATCATCA 3070 hom 63 het 18 0 22 2 GGTAATGTGGAGACACAAAGTTCAGGCAGCAGGTCTGAGAAGAAAGGCTTGAGAAGGTGG 0 1 54607 CASAVA_Build 1 170173042 1D AGGATTTATG T/- TTTTTTTTTT 1851 het 1851 ref 48 38 4 7 T 11 10 54608 CASAVA_Build 1 170173527 1I CAGAGATGGG -/T TTTCAGCATG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 3 4 54609 CASAVA_Build 1 170195998 2I ACCTGAGGCT --/AG AAGAATGACA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AG 0 1 54610 CASAVA_Build 1 170210585 1D CAACCTTTGG T/- TCTTCTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 2 1 54611 CASAVA_Build 1 170244347 1I AGGTCTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 13 14 54612 CASAVA_Build 1 170250525 1D CACTTTTTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 9 8 54613 CASAVA_Build 1 170252148 1I GATCATGTGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 6 7 54614 CASAVA_Build 1 170259610 1D AACAATGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 30 0 23 7 T 13 12 54615 CASAVA_Build 1 170274700 1D AAGGCTGTAG T/- TTTTTTTTTT 1647 het 1647 ref 33 25 4 4 T 11 10 54616 CASAVA_Build 1 170280772 7I GGAGGTTGTT -------/GAGGCTG GAGGATAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 GAGGCTG 0 1 54617 CASAVA_Build 1 170286225 2I AATAATATAC --/TT TTTAAATAAA 3070 het 2257 hom 26 6 15 5 T 3 5 54618 CASAVA_Build 1 170308846 1D GAGAAATATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 8 7 54619 CASAVA_Build 1 170366222 1D TATAATCCAA G/- TTGTTAATAT 3070 het 3070 hom 22 7 12 4 G 1 0 54620 CASAVA_Build 1 170399996 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1415 het 1415 ref 30 15 5 10 T 15 16 54621 CASAVA_Build 1 170466970 1I CTGGGAGGCA -/C CCCCCAGTAG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 C 5 6 54622 CASAVA_Build 1 170487105 25D GCACCAAGAC TTTTTAGAAATATCCATGATATACT/------------------------- TTTTTATTGC 3070 hom 62 het 22 0 21 6 TTTTTAGAAATATCCATGATATACT 1 0 54623 CASAVA_Build 1 170510503 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTTCAAT 3070 het 138 hom 23 2 13 8 A 2 3 54624 CASAVA_Build 1 170590201 4I TTCCCAAGGC ----/TGCA TGCACCCTGT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 TGCA 1 2 54625 CASAVA_Build 1 170594664 1I TGGTGCAAGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 15 het 39 1 33 5 A 8 9 54626 CASAVA_Build 1 170594889 20D CTCCCACAAA ACACACACACACACACACAC/-------------------- ACACACACAC 3070 het 1291 hom 25 6 15 9 AC 18 8 54627 CASAVA_Build 1 170596256 13I ATTTGTTTAC -------------/TTTTTCCTCCAGG TTTTACTTCC 3070 hom 87 het 29 0 30 1 TTTTTCCTCCAGG 0 1 54628 CASAVA_Build 1 170598255 1I AAAGGTGAAT -/C TTTTCGAGTA 3070 hom 129 het 50 0 42 8 C 0 1 54629 CASAVA_Build 1 170608367 4D TATATTTAAT TAGA/---- TAGATAATGT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 TAGA 2 1 54630 CASAVA_Build 1 170614284 1I TGGCTTCAGG -/C CAGCCCTACA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 C 1 2 54631 CASAVA_Build 1 170628190 4D ATCCAGTGTG TATT/---- TATTTACTTA 3070 hom 123 het 45 0 40 7 TATT 2 1 54632 CASAVA_Build 1 170630937 3D TCAGAAGCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2656 het 1354 hom 32 10 8 15 T 19 16 54633 CASAVA_Build 1 170633515 1D ATAGATTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 T 10 9 54634 CASAVA_Build 1 170635670 1D17M1D CCTCATGCTC TTTTTTTTTGCTGTTGTTA/-TTTTTTTTGCTGTTGTT- AAAAAAAAAA 3070 het 2643 hom 35 12 18 14 N/A 0 0 54635 CASAVA_Build 1 170637986 1D ATTGAGAAGT A/- AAGCATTTCA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 3 2 54636 CASAVA_Build 1 170640115 1D ATTTATTTGG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 7 6 54637 CASAVA_Build 1 170642983 1D ACAGGCACTC A/- ACACTGAGCC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 2 1 54638 CASAVA_Build 1 170647805 2I CACTGCTATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 TG 8 9 54639 CASAVA_Build 1 170650666 2D CCTCATCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 1924 het 77 hom 26 2 7 17 A 18 16 54640 CASAVA_Build 1 170658527 1D CTGCCCTGAA G/- GGTAAGTCAC 3070 het 3070 hom 39 16 14 10 G 3 2 54641 CASAVA_Build 1 170666633 1D TATGACAATA T/- TTCAAACTTT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 3 2 54642 CASAVA_Build 1 170681975 1D ACGAAAGCAG A/- TTATCAGAGG 3070 het 3070 ref 44 20 17 8 A 1 0 54643 CASAVA_Build 1 170698703 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 10 54644 CASAVA_Build 1 170700408 2D AAGAGTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3057 hom 40 12 16 12 T 14 12 54645 CASAVA_Build 1 170705941 2I CCAGCTTATT --/GG GGGGGGGTAT 3070 het 3070 hom 52 24 22 6 G 7 9 54646 CASAVA_Build 1 170706362 1D CCTGCACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 13 12 54647 CASAVA_Build 1 170716252 1D GGAATTTACA T/- TTAGTAGAGG 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 T 3 2 54648 CASAVA_Build 1 170725780 3D TAGCCACAAT ATG/--- ATATGTTTGG 3070 het 3070 ref 48 22 21 8 ATG 1 0 54649 CASAVA_Build 1 170751594 2I GAAAAATCAA --/CT ATCCTTAAAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CT 0 1 54650 CASAVA_Build 1 170816731 1I CAAGCATGGT -/G GCGTGCGCCT 1773 hom 15 het 12 0 6 6 G 1 2 54651 CASAVA_Build 1 170869224 1D TACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 11 10 54652 CASAVA_Build 1 170895405 1D TTTTCAATCC T/- TTTTTTTTTT 881 het 881 ref 33 22 3 8 T 13 12 54653 CASAVA_Build 1 170915686 6D TATTTAAAAA TTTATT/------ TTTATTTACT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TTTATT 2 1 54654 CASAVA_Build 1 170935046 2D AGGATACATA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 96 het 42 0 32 11 AG 6 5 54655 CASAVA_Build 1 170935312 1D AGCTGAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 11 10 54656 CASAVA_Build 1 170936756 1D TTAATCTAGA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 8 7 54657 CASAVA_Build 1 170938909 2I GAGGAAAACC --/AA AGAGTGTGGG 3070 hom 134 het 51 0 45 6 A 1 3 54658 CASAVA_Build 1 170941622 1I TTAAGAACCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 T 9 10 54659 CASAVA_Build 1 170968101 1D TTCCCCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 11 10 54660 CASAVA_Build 1 170985178 1D AAGGTGGCAT C/- CCCCGAGCCC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 C 5 4 54661 CASAVA_Build 1 170990485 1D TTAAAACAGT G/- TATACCTGTG 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 G 1 0 54662 CASAVA_Build 1 170995161 3I AAGAGTAGGA ---/GAT GATGAGGACA 3070 het 830 hom 52 5 19 28 GAT 1 2 54663 CASAVA_Build 1 170995172 2D ATGAGGACAC AG/-- AGTGAGATAC 3070 het 2661 hom 58 11 26 22 AG 2 1 54664 CASAVA_Build 1 171012820 4D GAGCTTATAG TTTT/---- AGAGCTGAAC 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 T 4 0 54665 CASAVA_Build 1 171023191 1D ATATTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 12 11 54666 CASAVA_Build 1 171042241 1D AACTGTTAGA C/- TTTTTTTTTT 3070 het 2485 hom 20 7 12 1 C 1 0 54667 CASAVA_Build 1 171052971 2I GAGAGAGACT --/AA GAGTACCTGA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 0 2 54668 CASAVA_Build 1 171064254 1D CAGCTGCGTG A/- AAAAAAGGAG 3070 hom 86 het 37 0 28 9 A 7 6 54669 CASAVA_Build 1 171067179 4D ATAAAATAAG TAAA/---- TAAACTGTCA 3070 het 3070 ref 39 22 15 5 TAAA 2 1 54670 CASAVA_Build 1 171070582 2I GGGGAAGCAC --/AG AGTCAGTCAG 3070 hom 93 het 36 0 29 7 AG 1 2 54671 CASAVA_Build 1 171086489 1D AACTGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 1240 het 1240 ref 36 28 3 6 A 11 10 54672 CASAVA_Build 1 171088762 3D ATTTGCACTC CCA/--- CCAACAGTGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CCA 2 1 54673 CASAVA_Build 1 171125654 2D AGAGGGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 AG 8 7 54674 CASAVA_Build 1 171129305 1I TGGGCCTGGG -/C CAGGAATAGT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 C 1 2 54675 CASAVA_Build 1 171147677 1D GCCCATGCCT A/- GTAATCTCAA 3070 hom 31 het 19 0 10 9 A 1 0 54676 CASAVA_Build 1 171150636 1D ACTTTTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 12 11 54677 CASAVA_Build 1 171167303 3D ATAGATAGAT AGA/--- TAGATAGATA 2071 het 2071 ref 27 16 5 6 AGA 1 0 54678 CASAVA_Build 1 171173535 1D67M1I AGGCATAGGA TATAGGCTACCACGCCTGGCCTAGATTTATATGCATTATCTTAATCCCAACAATCATCCTATGAAGTA-/-GTGAGCTACCACGCCTGGCCTAGATTTATATGCATTATCTTAATCCCAACAATCATCCTATGAAGTAG GGTACTACTG 3070 het 3070 ref 35 34 12 14 N/A 0 0 54679 CASAVA_Build 1 171202031 1I AGTAGGCACT -/C CCTAAAAATT 3070 hom 84 het 30 0 27 3 C 2 3 54680 CASAVA_Build 1 171204599 7D AGGGTGTTTG TGCTATT/------- TGCTATTATG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TGCTATT 2 1 54681 CASAVA_Build 1 171210899 2I TATTTCATAG --/TA TATATATATA 3070 het 446 hom 28 1 17 10 TA 6 7 54682 CASAVA_Build 1 171211394 11D CCCAGTTTTC TTTTCTTTTTT/----------- TTTTCTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTTTCTTTTTT 2 1 54683 CASAVA_Build 1 171226560 1D TAACCACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 35 1 29 5 A 11 10 54684 CASAVA_Build 1 171229942 1D CAAGTTCAGC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 9 8 54685 CASAVA_Build 1 171239769 1D CTTTTTATTA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 7 T 7 6 54686 CASAVA_Build 1 171251449 1I CCTGAACTAA -/T TTTCCCCTAC 3070 hom 101 het 40 0 34 6 T 3 4 54687 CASAVA_Build 1 171271650 2I GCATTAGGAG --/AA AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 10 54688 CASAVA_Build 1 171296267 1I ATATTGTTCC -/T GCCTCGCTCC 3070 hom 135 het 56 0 44 12 T 0 1 54689 CASAVA_Build 1 171318073 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1317 hom 18 4 12 2 A 17 16 54690 CASAVA_Build 1 171325326 2D TATATATACC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AT 5 4 54691 CASAVA_Build 1 171326650 1D CCATTTGTTT G/- TGTCTTCTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 G 1 0 54692 CASAVA_Build 1 171333588 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAATCA 2051 hom 18 het 8 0 7 1 A 8 7 54693 CASAVA_Build 1 171353957 1I AACAGTATGG -/C ATAGTTAGTG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 0 1 54694 CASAVA_Build 1 171354231 1I ATGAAGACTC -/A AAAAAAAAAA 1767 het 1767 ref 37 20 5 12 A 13 14 54695 CASAVA_Build 1 171357169 1I CTAAAAACAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 435 hom 17 1 12 4 A 9 10 54696 CASAVA_Build 1 171361644 3I ACTGTTGACC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 12 15 54697 CASAVA_Build 1 171396276 1I AGAATGTAAG -/A AAAAACTTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 5 6 54698 CASAVA_Build 1 171454366 1D CCTAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 12 11 54699 CASAVA_Build 1 171462875 1D TATTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1212 hom 25 3 12 10 T 14 13 54700 CASAVA_Build 1 171495087 1I AAAGACCCCA -/C AAAAAACCCC 3070 hom 74 het 33 0 23 10 C 0 1 54701 CASAVA_Build 1 171495973 5I AAAAGAAATT -----/CCAAC CCAACCCAGA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 CCAAC 1 2 54702 CASAVA_Build 1 171497623 1D AAAAAAAAAG C/- CCAAGACCAG 2129 het 2129 ref 20 13 5 2 C 3 2 54703 CASAVA_Build 1 171499483 1D GAGATGTTCC A/- AAAATGGAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 5 4 54704 CASAVA_Build 1 171524622 3D AACCATACTT CTC/--- CTTCTCCTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 CTC 1 0 54705 CASAVA_Build 1 171525712 1D ATTTGAGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 867 hom 35 2 29 5 A 12 11 54706 CASAVA_Build 1 171536724 2I TTTGAGAAAC --/AT GTAATTTACG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AT 0 1 54707 CASAVA_Build 1 171537115 1I AAAAGTTCCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 2935 hom 33 10 18 5 T 8 9 54708 CASAVA_Build 1 171538514 1D CAACTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 11 10 54709 CASAVA_Build 1 171542115 1D AAGATGGGGG T/- AATCATATTA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 1 0 54710 CASAVA_Build 1 171566068 6I TACTAAATAT ------/TATTAA TAATTGACAA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 TATTAA 0 1 54711 CASAVA_Build 1 171569087 1D TGAAGGCCTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 9 8 54712 CASAVA_Build 1 171584292 5I ACATTAAACC -----/CAAAT CAAACATAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CAAAT 0 1 54713 CASAVA_Build 1 171587321 1D AGATTTTTTT A/- AAGCTTCAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 A 3 2 54714 CASAVA_Build 1 171588550 1I TAGCAAGCCT -/G GGGGGTGCTG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 G 5 6 54715 CASAVA_Build 1 171590244 1I TCCTCCCTAA -/T TTATTTTATG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 2 3 54716 CASAVA_Build 1 171593808 1D ATTTTGAGAT G/- GGGGGGGGTA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 G 9 8 54717 CASAVA_Build 1 171595225 4D11M1D AAAAAAAAAA AAAGAAAAGAAAAAAG/----AAAAGAAAAAA- AAAAATTCAA 1817 het 1817 ref 17 12 4 5 N/A 0 0 54718 CASAVA_Build 1 171595492 1I TTCTTAAACC -/A ACTAGCCTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 A 1 2 54719 CASAVA_Build 1 171653284 1I GGCCAGCAAT -/G GAGACTCTGA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 G 1 2 54720 CASAVA_Build 1 171658737 1D TATATGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 36 0 25 11 T 13 12 54721 CASAVA_Build 1 171660902 1D AAAGTTCCCT G/- TGGATTTGAT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 1 0 54722 CASAVA_Build 1 171663716 1D CATTATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 27 0 14 13 T 17 16 54723 CASAVA_Build 1 171673681 2I CAGAACATAA --/AT AAGAAAAATT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 AT 0 1 54724 CASAVA_Build 1 171695771 4I CAGCCAAGGG ----/AAGC AAGCAGTGAG 3070 het 3070 ref 64 25 22 17 AAGC 1 2 54725 CASAVA_Build 1 171786841 1D GTTTATGAGG C/- ACAGTTCTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 C 1 0 54726 CASAVA_Build 1 171815938 2I GGTGTAAAGA --/CT CTCACTGTGG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 CT 1 2 54727 CASAVA_Build 1 171842606 1D TCTCCTCCCC T/- TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 7 6 54728 CASAVA_Build 1 171860255 1D CCTCCGGGGG A/- AAAAAAAAAA 1844 het 1844 ref 31 17 5 10 A 15 14 54729 CASAVA_Build 1 171869252 1D ATAGAAAAAA C/- AATACTAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 C 1 0 54730 CASAVA_Build 1 171903469 1D ACCCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1181 het 1181 ref 36 29 3 4 A 11 10 54731 CASAVA_Build 1 172015717 1I TAGAATTTAT -/C CATCTTGGGA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 C 1 2 54732 CASAVA_Build 1 172030954 1D TCCCAGGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 5 T 14 13 54733 CASAVA_Build 1 172031594 1D ATGATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 11 10 54734 CASAVA_Build 1 172040552 2I CCCCTCAAAC --/TT TAAATTTTAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 1 3 54735 CASAVA_Build 1 172108594 1I CATGGTGAAT -/C CCCATCTCTA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 C 3 4 54736 CASAVA_Build 1 172111885 1I AGTTTGCTCA -/T TTTTTTTTTT 1336 het 1336 ref 42 37 3 2 T 10 11 54737 CASAVA_Build 1 172188124 1D AGCTTTCAGG T/- TTTTTTTTTT 1217 het 1217 ref 21 9 4 8 T 12 11 54738 CASAVA_Build 1 172250127 1D AAACTGTTCT A/- AAAAAAAAAA 1342 het 1342 ref 47 37 3 7 A 11 10 54739 CASAVA_Build 1 172310838 1D TTTATAGTAA T/- TTCTTCAAGA 3070 hom 96 het 40 0 33 8 T 3 2 54740 CASAVA_Build 1 172323366 1I TTTCTATGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 9 10 54741 CASAVA_Build 1 172336093 1I GCTGTTTTAC -/T TTTTTATCTA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 5 6 54742 CASAVA_Build 1 172351667 3I ATGTGAGGAT ---/ACA ACAAGAAGGT 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 ACA 1 2 54743 CASAVA_Build 1 172371458 1D AAGTTGCTCC T/- CCTAAAATTT 3070 het 3070 ref 48 24 19 6 T 1 0 54744 CASAVA_Build 1 172382913 2I CAAAAACCAC --/AT GATTATCTCA 1056 het 1056 ref 21 14 3 4 AT 0 1 54745 CASAVA_Build 1 172389149 1I CAACAATAAC -/A AAAAAAAAAA 2806 het 1411 hom 31 8 10 13 A 15 16 54746 CASAVA_Build 1 172392136 1D GAGACTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1285 het 1285 ref 35 17 4 14 A 16 15 54747 CASAVA_Build 1 172396039 1D CTCCCCCCAA C/- CCCCACCCAC 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 C 5 4 54748 CASAVA_Build 1 172397903 5D GATTTAGATG TTTTC/----- TTTTTACGCT 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 TTTTC 1 0 54749 CASAVA_Build 1 172399530 1I AATAAGACAG -/T TTTTTTTTTT 968 het 968 ref 33 24 3 6 T 11 12 54750 CASAVA_Build 1 172400214 2D TCCGCAAGCG CA/-- CACACACACA 1314 het 1314 ref 41 34 3 7 CA 6 5 54751 CASAVA_Build 1 172405605 1D TAGGACTGTA C/- CCACCACACT 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 C 3 2 54752 CASAVA_Build 1 172410917 4I TGTATATGAC ----/ACAT ACAGACCAGT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 ACAT 0 1 54753 CASAVA_Build 1 172415713 2D TTAAAGTCTC AG/-- AATATATTCC 3070 het 3070 hom 37 17 20 2 AG 1 0 54754 CASAVA_Build 1 172430793 2I ATAACCTGGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 AT 5 6 54755 CASAVA_Build 1 172433167 2I GATCTTAATC --/TA ATGATGGTCA 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 TA 0 1 54756 CASAVA_Build 1 172442680 1I GCTATTTCAC -/T TGGTAGAATT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 1 2 54757 CASAVA_Build 1 172451663 1D GGAAGCAACG T/- TAAGTGTCCA 3070 het 3070 ref 49 22 20 8 T 2 1 54758 CASAVA_Build 1 172455315 2D TGAATTAGAC AT/-- AATGGTTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 4 AT 1 0 54759 CASAVA_Build 1 172457756 1D GCCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 16 15 54760 CASAVA_Build 1 172464780 1D AAATGAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 12 11 54761 CASAVA_Build 1 172476700 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 11 18 13 TG 10 9 54762 CASAVA_Build 1 172481406 1I GAACTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 T 11 12 54763 CASAVA_Build 1 172488511 1D ATGTAACTGG T/- TTCATTGAAA 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 T 3 2 54764 CASAVA_Build 1 172494859 1I CAATATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 11 12 54765 CASAVA_Build 1 172501531 1I TGTACTGGTA -/T TTTTTTTTTG 1926 het 1926 ref 23 13 4 6 T 9 10 54766 CASAVA_Build 1 172512761 1D TTATCATTAA T/- TTTTATATTA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 5 4 54767 CASAVA_Build 1 172521282 1D GTTCTAACCG T/- TTTTTTTTTT 1658 het 1658 ref 24 17 4 3 T 13 12 54768 CASAVA_Build 1 172527030 2I ATTACATTGA --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 8 10 54769 CASAVA_Build 1 172528873 1D AAAATTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 T 11 10 54770 CASAVA_Build 1 172553807 1I TTCAGGACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 16 15 17 T 13 14 54771 CASAVA_Build 1 172555685 1I TCTATTCCCT -/A AATAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 2 3 54772 CASAVA_Build 1 172557750 1I TATTAGACAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 T 7 8 54773 CASAVA_Build 1 172565711 1D GGTCTCCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3041 hom 27 8 16 3 A 13 12 54774 CASAVA_Build 1 172566347 4D CTCTGTCTTT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 23 13 7 4 AAAC 5 4 54775 CASAVA_Build 1 172587554 4D GTGTGTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 TTTG 1 0 54776 CASAVA_Build 1 172596009 1I AAAGTTAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 9 10 54777 CASAVA_Build 1 172598790 2I CCCAGTGCCA --/TT TTTATTGAAT 3070 het 3070 hom 40 14 14 12 T 3 5 54778 CASAVA_Build 1 172606500 4I TATTTATTTA ----/TAGG TATTTTCAAT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 TAGG 0 1 54779 CASAVA_Build 1 172610289 2I CTAGATATCA --/AT ATATATAGGT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 AT 3 4 54780 CASAVA_Build 1 172612121 1D TACCATGATA T/- CAAAACCGGA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 1 0 54781 CASAVA_Build 1 172623308 1D TGGGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1949 hom 23 7 11 6 T 12 11 54782 CASAVA_Build 1 172630711 2D CTGAATTCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 12 10 54783 CASAVA_Build 1 172642439 1I GCTCATGCTT -/G TAATCTCAAT 3070 het 3070 hom 44 14 29 1 G 0 1 54784 CASAVA_Build 1 172644491 1D GCATCTGTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 9 8 54785 CASAVA_Build 1 172649708 1I AGGCCATGAA -/G GGCAGGGATA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 G 2 3 54786 CASAVA_Build 1 172650672 1I TATCAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 A 9 10 54787 CASAVA_Build 1 172659249 1I CTCTAATCTC -/A AAATGAACTG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 A 3 4 54788 CASAVA_Build 1 172660490 1I ACATTTATTC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 2881 hom 28 9 15 4 T 7 8 54789 CASAVA_Build 1 172664740 1I ACAACACAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 9 10 54790 CASAVA_Build 1 172678013 5I TACTAGAGAA -----/TATTG TATCTGATTT 2777 het 2777 ref 22 12 7 3 TATTG 0 1 54791 CASAVA_Build 1 172696002 1D TCCTTTTTTT C/- CTCCTCATTC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 C 2 1 54792 CASAVA_Build 1 172700098 1D ACTTTCACAG A/- AAGCCCATCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 3 2 54793 CASAVA_Build 1 172706534 1I GTCTGACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 10 11 54794 CASAVA_Build 1 172706799 2I GGTATTTAGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 52 26 15 11 A 9 11 54795 CASAVA_Build 1 172724079 1D AGGATAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 15 25 9 T 12 11 54796 CASAVA_Build 1 172735011 5D TTAAAAACAC TTAAA/----- TTAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 TTAAA 2 1 54797 CASAVA_Build 1 172739727 1I ATAGACTCTT -/C TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 C 0 1 54798 CASAVA_Build 1 172741229 1I TGTGAAGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 18 12 T 12 13 54799 CASAVA_Build 1 172743607 4D TTATATTCAC CAAA/---- CAGAGTTATC 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 CAAA 1 0 54800 CASAVA_Build 1 172749560 3I TTATAGTAAC ---/ATT ATCTAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 ATT 0 1 54801 CASAVA_Build 1 172757840 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1772 het 1257 hom 18 7 6 6 A 13 11 54802 CASAVA_Build 1 172760517 38D TGTTGTCTTC TATTAGTTTCATAGTTTTGGGTCTTACTTTTAAGTCTT/-------------------------------------- TAACCCATCT 2794 het 2794 ref 28 27 6 2 TATTAGTTTCATAGTTTTGGGTCTTACTTTTAAGTCTT 1 0 54803 CASAVA_Build 1 172766994 1I GATGGGTTGA -/T TTCATATACC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 2 3 54804 CASAVA_Build 1 172781320 1I TCCCAGGTGA -/G GCAATGCCCC 3070 hom 62 het 25 0 14 11 G 1 2 54805 CASAVA_Build 1 172787519 1I CTATTTTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 A 9 10 54806 CASAVA_Build 1 172787698 2D AAGAAATGAA TC/-- TCAATTCTTT 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 TC 2 1 54807 CASAVA_Build 1 172790783 2I ATGGCTCATC --/TA TGACATTGCA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 TA 0 1 54808 CASAVA_Build 1 172809521 1D TATTGAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 11 10 54809 CASAVA_Build 1 172820600 1D TGTGTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 11 10 54810 CASAVA_Build 1 172871409 1I TAAGGCTCTA -/T TTTTAATTCA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 4 5 54811 CASAVA_Build 1 172890711 1I TTTAAACTCA -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 6 7 54812 CASAVA_Build 1 172890883 7I CTCATCACCC -------/CCAAATA CTTTAGGATG 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 CCAAATA 0 1 54813 CASAVA_Build 1 172920747 3D GTCTCAAAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 AAT 4 3 54814 CASAVA_Build 1 172929843 2I AGTATTATAA --/AT AGAGATGATT 1342 het 1342 ref 31 26 3 2 AT 0 1 54815 CASAVA_Build 1 172933082 1I TTCAGTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 17 12 T 10 11 54816 CASAVA_Build 1 172938219 1D TAAGGCATAT A/- TAATTCCTAC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 1 0 54817 CASAVA_Build 1 172939947 2I TTTAGTAGAG --/AT ATGGGGTTTC 3070 het 1533 hom 21 5 15 1 AT 1 2 54818 CASAVA_Build 1 172941009 1I CTTTCTAAAG -/T TGTCTGCCCG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 1 2 54819 CASAVA_Build 1 172968761 1D TTTAATTCTG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 9 8 54820 CASAVA_Build 1 172978041 13D CACTTTAGGA GGCCAAGGCAGGT/------------- GGATCACTTG 1114 het 1114 ref 10 6 3 3 GGCCAAGGCAGGT 1 0 54821 CASAVA_Build 1 172983633 2D GCATTTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 2157 het 2157 ref 25 11 8 7 T 13 11 54822 CASAVA_Build 1 172986124 1D ATCTGAACTA T/- TTTTTTCAGG 3070 hom 155 het 56 0 51 5 T 7 6 54823 CASAVA_Build 1 173001361 1D GTCCAGCAAA T/- TTTTTTTTTT 1616 het 1616 ref 35 23 6 6 T 15 14 54824 CASAVA_Build 1 173032768 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 12 11 54825 CASAVA_Build 1 173034383 4D ATAATTAATC TATT/---- TATTTAGGCC 3070 het 3070 hom 30 10 18 4 TATT 2 1 54826 CASAVA_Build 1 173040790 1I ACTTCTGATA -/C CCCCCCAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 C 6 7 54827 CASAVA_Build 1 173044420 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3014 het 1383 hom 20 6 9 5 T 12 13 54828 CASAVA_Build 1 173063440 1I AAAGATCCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 122 het 44 0 40 4 T 9 10 54829 CASAVA_Build 1 173076577 1I AATCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1471 het 54 hom 17 2 7 8 A 11 12 54830 CASAVA_Build 1 173087220 22I GTCTCAGTCT ----------------------/TTCCCTCTTTCAGATTATAGTC TTAGAAGCAA 3070 het 3070 ref 43 24 19 2 TTCCCTCTTTCAGATTATAGTC 0 1 54831 CASAVA_Build 1 173088577 1I ATTTGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2413 het 1298 hom 18 6 6 6 A 11 12 54832 CASAVA_Build 1 173088990 1I GGCTGGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2366 hom 29 11 11 7 T 14 15 54833 CASAVA_Build 1 173095244 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 2274 het 2274 ref 16 9 6 1 A 9 10 54834 CASAVA_Build 1 173095612 1I CTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 9 10 54835 CASAVA_Build 1 173101340 1D ATATCAGAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 24 14 0 T 9 8 54836 CASAVA_Build 1 173115159 1I GTGCACAGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2598 hom 20 7 9 4 T 9 10 54837 CASAVA_Build 1 173119682 1I GAAAATTAAG -/C TTCCAGCCAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 0 1 54838 CASAVA_Build 1 173123373 1D GCAAAAACTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 G 10 9 54839 CASAVA_Build 1 173123802 1D ATATCAAAAG A/- AAAAAAAAAT 1295 het 1295 ref 24 21 3 0 A 10 9 54840 CASAVA_Build 1 173127726 1D CCTATCCAAA T/- AATTCCTGTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 1 0 54841 CASAVA_Build 1 173130502 5D TTTTTGTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 15 17 13 TTTGT 5 4 54842 CASAVA_Build 1 173139444 1I GAGTGCGGTA -/G CTAACGCCTG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 0 1 54843 CASAVA_Build 1 173142661 1D GTGCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 11 10 54844 CASAVA_Build 1 173142837 1D CTAATGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 A 11 10 54845 CASAVA_Build 1 173144778 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 9 8 54846 CASAVA_Build 1 173153885 1I AATTTAGAAC -/T TATTATGAAG 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 1 2 54847 CASAVA_Build 1 173153989 2I GGGCTGACCT --/TA GTTTCCTCAG 2800 het 2800 ref 29 16 6 7 TA 0 1 54848 CASAVA_Build 1 173154584 1I GTGAGACCCA -/C CCCCCCCGAT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 C 7 8 54849 CASAVA_Build 1 173161620 1D16M1D TTGTTGTTGG TTTTTTTTTTGTTTTTGT/-TTTTTTTTTGTTTTTG- TTTTTTTTTG 1614 het 1614 ref 25 15 8 2 N/A 0 0 54850 CASAVA_Build 1 173166709 2D TAAAGGAACT TA/-- TACCATGTTC 3070 het 3070 ref 37 22 13 4 TA 2 1 54851 CASAVA_Build 1 173176834 1I TTTTGTAGCT -/C CCATGCCTTT 3070 het 3070 hom 61 27 29 5 C 2 3 54852 CASAVA_Build 1 173177004 4D TACACAGCGT GTTA/---- GTTAGTCTAC 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 GTTA 2 1 54853 CASAVA_Build 1 173192081 1I GTCTCAACCT -/C CCAAGTAGCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 2 3 54854 CASAVA_Build 1 173203690 1D ATTTTTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3021 het 1663 hom 29 8 14 7 A 15 14 54855 CASAVA_Build 1 173211795 13D CTTTACCCTC TGTATGACTGTGA/------------- TGTATGACTG 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 TGTATGACTGTGA 2 1 54856 CASAVA_Build 1 173216670 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 12 13 54857 CASAVA_Build 1 173219042 1D CATCACTCTC T/- TTATAAGTAA 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 T 3 2 54858 CASAVA_Build 1 173227535 3D GATAAGCTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 34 2 19 13 T 19 16 54859 CASAVA_Build 1 173230813 6D GTACACTCTA TAAATG/------ TAAATGTAAT 3070 het 3070 ref 39 23 13 6 TAAATG 2 1 54860 CASAVA_Build 1 173235154 1I AGCTCCACCT -/C CTACGGCGGC 3070 hom 72 het 27 0 21 6 C 1 2 54861 CASAVA_Build 1 173238759 5D AATATTACTT TGAAC/----- TGAAACATTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 TGAAC 1 0 54862 CASAVA_Build 1 173241266 2D GGTGAGGAAC AG/-- GGAGAATTAG 3070 het 3070 hom 48 16 28 4 AG 1 0 54863 CASAVA_Build 1 173252817 1I CCCCCTGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 10 11 54864 CASAVA_Build 1 173274501 1D GACCTCTCAG A/- TATAGACATG 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 A 1 0 54865 CASAVA_Build 1 173294306 1D AATAAAAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 10 11 5 A 10 9 54866 CASAVA_Build 1 173315727 2I CTGTGTGTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 49 22 19 8 GT 8 9 54867 CASAVA_Build 1 173326207 1D ACAGGTCCTG C/- CCCCCGTGTC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 C 6 5 54868 CASAVA_Build 1 173328154 11I CACAAGTGGC -----------/AGACTATTGTG AGACTATTGG 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 AGACTATTGTG 0 1 54869 CASAVA_Build 1 173336460 1D GAAATGCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 19 12 T 11 10 54870 CASAVA_Build 1 173347538 1D GCTTCCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 11 10 54871 CASAVA_Build 1 173350496 3D TAACTTGGAG GAA/--- GAAGAAGTGC 3070 het 3070 ref 53 24 25 5 GAA 3 2 54872 CASAVA_Build 1 173351092 2D5M1D4M5D GCTTCCCTGA GGAGCTGAAACTAGTGC/--AACTG-CACT----- AGTTTCAGCT 3070 het 3070 hom 46 18 23 11 N/A 0 0 54873 CASAVA_Build 1 173352199 5I ACAAATACAG -----/AAGTA AAGTAAAGCA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 AAGTA 1 2 54874 CASAVA_Build 1 173354307 1I TTGGTCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 10 11 54875 CASAVA_Build 1 173358215 52D GTTTGAAGGT TGCTAACAAAGGACTGAAGAAGAGCCAGTGAGTTAGGAAAATCAAGGGAGTA/---------------------------------------------------- TGTAGTCATG 3070 hom 59 het 11 0 19 4 TGCTAACAAAGGACTGAAGAAGAGCCAGTGAGTTAGGAAAATCAAGGGAGTA 1 0 54876 CASAVA_Build 1 173359616 4D AGTATAGAGG GAGT/---- GAGTGCTGGT 3070 hom 84 het 31 0 28 8 GAGT 2 1 54877 CASAVA_Build 1 173360447 8D ATCTCAAAAG CAAACAAA/-------- CAAACAAACA 3070 hom 38 het 15 0 12 6 CAAA 7 5 54878 CASAVA_Build 1 173361864 1I TGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1932 het 390 hom 18 2 9 7 T 15 16 54879 CASAVA_Build 1 173366370 3D GCTCCCACAC AGA/--- AGGAGTTATC 3070 het 3070 hom 47 22 21 5 AGA 1 0 54880 CASAVA_Build 1 173370304 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAACAAA 3070 het 2583 hom 17 7 10 0 A 6 8 54881 CASAVA_Build 1 173370612 1D CTCTTGCCCC T/- GACCAGTCCA 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 T 1 0 54882 CASAVA_Build 1 173375375 1I TTTTACAGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 82 het 33 0 29 5 T 9 10 54883 CASAVA_Build 1 173378230 4I CCTAAAAAAC ----/AAAT AAGTGAAGTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AAAT 0 1 54884 CASAVA_Build 1 173378384 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2724 hom 16 7 8 1 T 11 12 54885 CASAVA_Build 1 173379691 2D CATAGGGGTG TA/-- TGTGAGTGAC 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 TA 1 0 54886 CASAVA_Build 1 173400600 1D GAAAACAATC A/- AATATCTCCT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 3 2 54887 CASAVA_Build 1 173401665 1D ATTGTTCTTG T/- TTTTTAGACA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 6 5 54888 CASAVA_Build 1 173403074 1I ACATTTAAAG -/A AATGAGTTCA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 2 3 54889 CASAVA_Build 1 173404385 1D GATTACCTTA C/- TTTATTGATG 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 C 1 0 54890 CASAVA_Build 1 173406626 20D GCTTCCCGTC ACTAGAAGTATGACATCTAA/-------------------- ACTAGAAGTA 3070 hom 56 het 27 0 16 13 ACTAGAAGTATGACATCTAA 2 1 54891 CASAVA_Build 1 173410562 2I CTGTATATAC --/AT ATATATATAT 1163 het 1163 ref 36 23 5 8 AT 8 9 54892 CASAVA_Build 1 173423502 1D TCTTTCCCTG C/- CCCTACACCA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 C 4 3 54893 CASAVA_Build 1 173425607 6I AAATGAAGCT ------/GAGAGA TTCAAGAACT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 GA 0 3 54894 CASAVA_Build 1 173431087 1I AAATATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 37 2 16 19 T 13 14 54895 CASAVA_Build 1 173431098 3D TTTTTTTTTT TTA/--- AAAAAAGAAG 3070 het 1196 hom 36 9 18 11 TTA 1 0 54896 CASAVA_Build 1 173432019 1I CTTTGTGGTC -/A AAAGAGTCCT 3070 hom 76 het 45 0 39 6 A 3 4 54897 CASAVA_Build 1 173432326 1I AAAGCTTTTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 8 54898 CASAVA_Build 1 173438739 1I GATGGATCCC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 623 hom 31 2 27 2 T 8 9 54899 CASAVA_Build 1 173438984 5I ACATGATGCT -----/ATAAC ATATTTGTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ATAAC 0 1 54900 CASAVA_Build 1 173445766 2D ATATACTGTC TT/-- TATTTTTAAT 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 T 3 1 54901 CASAVA_Build 1 173466977 4D TATACACATA TATG/---- TATGTATACA 1544 hom 18 het 8 0 7 2 TATG 2 1 54902 CASAVA_Build 1 173475919 1I GTCATTATTC -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 A 6 7 54903 CASAVA_Build 1 173478197 1I TAAAGCAGGC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 7 8 54904 CASAVA_Build 1 173485738 1D AAATTACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 22 6 T 12 11 54905 CASAVA_Build 1 173490679 4D CCTTGTGAGA GAGC/---- GAGCGGCAAG 3070 hom 117 het 43 0 40 6 GAGC 2 1 54906 CASAVA_Build 1 173495963 7D TGCCAGTCTG TGTCTTT/------- TAATTGGGCA 3070 hom 33 het 14 0 12 5 TGTCTTT 1 0 54907 CASAVA_Build 1 173498735 1I AGAAAAGCTA -/C AAATATAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 0 1 54908 CASAVA_Build 1 173500802 1D GGGCTATTGA T/- TTTTACCTAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 5 4 54909 CASAVA_Build 1 173501124 1I TATTTTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 53 22 18 13 T 9 10 54910 CASAVA_Build 1 173501808 1D GATTTAAAAC T/- TATGAATTGT 3070 hom 117 het 41 0 40 2 T 2 1 54911 CASAVA_Build 1 173502331 3D AAGGATAGCA AAC/--- AAACAAACAA 1771 hom 30 het 48 0 10 40 AAC 1 0 54912 CASAVA_Build 1 173503640 1D CTGCGTCCAT G/- GGGGAATGCC 3070 hom 147 het 55 0 49 7 G 5 4 54913 CASAVA_Build 1 173504051 1I TGTGTAGGGG -/T TGGGGGGAGG 3070 hom 78 het 36 0 27 10 T 1 2 54914 CASAVA_Build 1 173504097 1D TAAGTGTGAG A/- AAACTAATAA 3070 het 2266 hom 32 7 9 16 A 4 3 54915 CASAVA_Build 1 173510450 13D GCTGGCTGAT TCAGTAATCAGAC/------------- TATTGACAGC 3070 hom 126 het 44 0 43 4 TCAGTAATCAGAC 1 0 54916 CASAVA_Build 1 173515378 2D TGTGTGTATG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 312 hom 48 1 35 12 GT 10 9 54917 CASAVA_Build 1 173538131 1D ACAGTGCAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 10 9 54918 CASAVA_Build 1 173540607 2I ATATGTATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 AC 6 7 54919 CASAVA_Build 1 173578718 1I CTGGCAGTTG -/C CAGCCTGGCC 3070 hom 93 het 36 0 27 9 C 1 2 54920 CASAVA_Build 1 173591142 2D AGCTGATGAG CA/-- ATCCTTGTGG 3070 het 3070 ref 63 35 20 9 CA 1 0 54921 CASAVA_Build 1 173605426 1D GCTAGAGATG C/- CCCCCCGGAT 3070 het 3070 hom 35 12 21 4 C 7 6 54922 CASAVA_Build 1 173609508 1I CCTGCTGAGG -/A AGTGGAAGCT 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 A 1 2 54923 CASAVA_Build 1 173610937 1D TGATTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 12 11 54924 CASAVA_Build 1 173611236 1I AGAGAATAAT -/G GGGGGGGGAG 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 G 8 9 54925 CASAVA_Build 1 173616109 1I GCCTTGATGG -/C CACCTCTGTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 1 2 54926 CASAVA_Build 1 173622413 1D CTGGGTTTCT G/- GCGTGTGTCT 3070 het 3070 ref 47 25 16 8 G 2 1 54927 CASAVA_Build 1 173630814 1I CACCAGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 10 11 54928 CASAVA_Build 1 173635971 1I CTTTCATATC -/A AAAGGCTACT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 3 4 54929 CASAVA_Build 1 173642643 1D AGATTTTCAA G/- GGGGGGGCGT 3070 het 1721 hom 27 7 11 9 G 8 7 54930 CASAVA_Build 1 173649442 1D AAAATGGTGG A/- TAGGAGAAGC 3070 hom 120 het 45 0 39 7 A 1 0 54931 CASAVA_Build 1 173649860 1D CCTGGGTGAT A/- AGAGTAAGAT 2215 het 2215 ref 31 22 6 5 A 2 1 54932 CASAVA_Build 1 173651593 13D AAAATATCAT GATTGGAAGTGAA/------------- GATTGGAAGT 3070 het 3070 ref 44 24 16 12 GATTGGAAGTGAA 2 1 54933 CASAVA_Build 1 173652771 48D CATCTCAAAA AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG/------------------------------------------------ AAAGAAAGAA 1884 het 1659 hom 7 5 4 3 AAAG 16 4 54934 CASAVA_Build 1 173664711 1I CTGAAAAATT -/A GGCACCCCTC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 0 1 54935 CASAVA_Build 1 173687236 6D TAGAAGCCAG CCGCCA/------ GCCTCCAGGC 434 hom 7 het 16 0 2 17 CCGCCA 1 0 54936 CASAVA_Build 1 173691052 1D AATGGCTGTT A/- TTTTATACCA 3070 het 3070 hom 40 15 18 8 A 1 0 54937 CASAVA_Build 1 173692391 1D GCATGAGAGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 75 het 29 0 24 6 T 8 7 54938 CASAVA_Build 1 173697542 2I CCTTATTTCT --/AC AGATTATTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AC 0 1 54939 CASAVA_Build 1 173701533 1I GCCCCGCAAA -/G GGCAAGCCCA 3070 hom 101 het 37 0 31 6 G 2 3 54940 CASAVA_Build 1 173726957 1I GTGGGGGAAC -/A ACACACACTG 3070 hom 94 het 37 0 30 7 A 1 2 54941 CASAVA_Build 1 173727792 1I CACTCATTGT -/G GGCCAAAGGC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 G 2 3 54942 CASAVA_Build 1 173740804 1I GACTGTGTTG -/C GATTCCCGCC 3070 hom 93 het 33 0 30 3 C 0 1 54943 CASAVA_Build 1 173740913 1I AGGCTGCCTC -/G GCTGTGCCCA 3070 hom 81 het 36 0 24 12 G 1 2 54944 CASAVA_Build 1 173741666 1I CAGGCCTGGT -/G GCACATGCCT 3070 hom 99 het 35 0 31 4 G 1 2 54945 CASAVA_Build 1 173746525 5I CATTTATCTT -----/TAAAG TAAAGTATCA 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 TAAAG 1 2 54946 CASAVA_Build 1 173761771 1I CTTTTGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 11 12 54947 CASAVA_Build 1 173776604 1I TCCTAGAGGA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 44 9 31 4 T 6 7 54948 CASAVA_Build 1 173783106 3I GTCTATAACT ---/TCA TCAACCCCTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TCA 1 2 54949 CASAVA_Build 1 173790099 9D CCTACATGGC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 11 8 A 20 11 54950 CASAVA_Build 1 173794034 1D AGTATAATAA T/- AAAAAAAAAA 2381 het 1506 hom 10 4 6 0 T 1 0 54951 CASAVA_Build 1 173854667 2D TTGAGAAGAC TG/-- AGGATTTGGT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 TG 1 0 54952 CASAVA_Build 1 173861727 1D GGAGGGACCC G/- GGGGGGAGGT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 G 7 6 54953 CASAVA_Build 1 173864286 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 5 A 11 10 54954 CASAVA_Build 1 173866575 1I CTCTGCTTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 A 9 10 54955 CASAVA_Build 1 173969704 1I CATAGCCAGG -/C CCCACCAAGG 3070 hom 114 het 45 0 37 8 C 3 4 54956 CASAVA_Build 1 173976198 1I TTTTTTCAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 9 10 54957 CASAVA_Build 1 173989808 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2795 het 1376 hom 15 4 7 4 T 12 11 54958 CASAVA_Build 1 174009361 1D GTAAGAGTAA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 8 7 54959 CASAVA_Build 1 174016418 2I CTCCACAGTA --/AC AGAGTTAGGT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 AC 0 1 54960 CASAVA_Build 1 174039429 1I ATTACCTTCT -/G GGGTTGCAAT 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 G 3 4 54961 CASAVA_Build 1 174040646 1I TGTCCTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 A 12 13 54962 CASAVA_Build 1 174042350 1D TAGCAGAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3018 hom 34 9 20 5 A 10 9 54963 CASAVA_Build 1 174043044 1I CAGAGTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 T 10 11 54964 CASAVA_Build 1 174043554 1D TTTGTCCTAA G/- GCTCCTTGAA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 G 2 1 54965 CASAVA_Build 1 174080697 1I ATGCATGTAT -/A AGAGAATGAA 3070 het 3070 ref 53 29 22 2 A 1 2 54966 CASAVA_Build 1 174119928 1D TGGTCCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 13 14 13 T 13 12 54967 CASAVA_Build 1 174124250 1I ATCACATTTC -/T TTTTTTTTTT 842 het 842 ref 37 31 3 3 T 11 12 54968 CASAVA_Build 1 174132285 1D AGCTATTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1522 hom 22 5 9 10 A 15 14 54969 CASAVA_Build 1 174138462 1I CTGAAATCTC -/T TTTTTTTTTC 1295 het 24 hom 39 1 6 32 T 9 10 54970 CASAVA_Build 1 174147832 1D AATAGGCAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 85 het 37 0 28 10 T 10 9 54971 CASAVA_Build 1 174152482 1D GGTTTTCTAT G/- CATTAAAATA 3070 het 3070 hom 67 24 30 13 G 1 0 54972 CASAVA_Build 1 174156578 1I GATCAATATC -/G GGGGTTTTTC 3070 hom 105 het 44 0 35 9 G 4 5 54973 CASAVA_Build 1 174166748 1I GCCTACTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 817 hom 26 2 17 7 T 14 15 54974 CASAVA_Build 1 174171684 4D GATTTTCATC TTTT/---- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 13 9 54975 CASAVA_Build 1 174175301 1I TCCCATATAC -/T TCACACTCCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 54976 CASAVA_Build 1 174176578 1D ATTCTCACAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 52 hom 27 1 25 2 A 10 9 54977 CASAVA_Build 1 174187642 1D TATGAAAACG T/- TAAGACTAAA 3070 hom 126 het 44 0 43 3 T 2 1 54978 CASAVA_Build 1 174188182 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2230 het 470 hom 18 2 11 6 A 17 16 54979 CASAVA_Build 1 174194135 1D TAACCATTCA G/- GTATAATATC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 2 1 54980 CASAVA_Build 1 174200185 1I TTTACTGGGG -/A AAAAAAAGCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 8 54981 CASAVA_Build 1 174200805 1D CCTTAAGCTC T/- TTTTCATACC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 5 4 54982 CASAVA_Build 1 174211824 9D GTAGAATTAG AAGGTCTCA/--------- AAGGTCTCAA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 AAGGTCTCA 2 1 54983 CASAVA_Build 1 174218901 4D ACCCCATAAA TACT/---- TACAATTATT 3070 hom 105 het 37 0 36 6 TACT 1 0 54984 CASAVA_Build 1 174241511 3I TACATTTGCT ---/GAG GAGAGCTTTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 GAG 1 2 54985 CASAVA_Build 1 174247693 3D ATATATGATA AAC/--- AACTGTGTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 7 AAC 2 1 54986 CASAVA_Build 1 174274577 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 34 0 27 7 A 14 13 54987 CASAVA_Build 1 174275340 1D TGTTTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 12 11 54988 CASAVA_Build 1 174292195 1I AACACAGGGA -/T TTTTTTAATA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 6 7 54989 CASAVA_Build 1 174294613 1I CCTCCTCAGA -/T TCCCATATGT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 1 2 54990 CASAVA_Build 1 174298534 4I TATTCAAATG ----/AATA AATAAACTGT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 AATA 1 2 54991 CASAVA_Build 1 174312306 5D TAATGACCTT ACATC/----- ACATGTAGAG 3070 hom 117 het 40 0 40 1 ACATC 1 0 54992 CASAVA_Build 1 174313673 5I AGCCACAAAG -----/AAAAT AAAATAACTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 AAAAT 1 2 54993 CASAVA_Build 1 174314378 1I AAGCAATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 26 1 22 3 A 11 12 54994 CASAVA_Build 1 174319463 4I TGGAAATAAA ----/AGTT AGAGAATACA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AGTT 0 1 54995 CASAVA_Build 1 174320610 1I AATACCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 28 1 25 2 T 10 11 54996 CASAVA_Build 1 174324013 1D AAAGTATCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 54997 CASAVA_Build 1 174327105 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 222 hom 16 1 11 4 A 13 12 54998 CASAVA_Build 1 174329793 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 12 11 54999 CASAVA_Build 1 174343793 1D CTGGACCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 13 12 55000 CASAVA_Build 1 174357271 4I TTTAAATGTC ----/GTTT GTTTTTTATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 GTTT 1 2 55001 CASAVA_Build 1 174360864 1D GATTATTCGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 10 9 55002 CASAVA_Build 1 174365571 2D TCAATAAGAT AC/-- ATTCAGAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 AC 1 0 55003 CASAVA_Build 1 174368974 12D TGTACACACA TACGTATATACG/------------ TACGTATATG 3070 hom 69 het 26 0 24 8 TACGTATATACG 1 0 55004 CASAVA_Build 1 174369677 2D ATAACAATAT AC/-- ACAGACCAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AC 2 1 55005 CASAVA_Build 1 174371698 1D AAAAAATTAC A/- ATACATATAA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 2 1 55006 CASAVA_Build 1 174381149 6D TGCTCATACA ATGCCT/------ ATGCCTGTAG 3070 hom 111 het 39 0 37 5 ATGCCT 2 1 55007 CASAVA_Build 1 174410320 1D TTTCCTTCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 9 55008 CASAVA_Build 1 174412577 1D AAAAAAAGAG A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 8 7 55009 CASAVA_Build 1 174430683 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 25 0 16 9 A 14 15 55010 CASAVA_Build 1 174444332 3I GGGAATAAAG ---/TGT TGTGAAAATA 3070 hom 45 het 20 0 14 6 TGT 1 2 55011 CASAVA_Build 1 174451314 6D TGTGTTTTGT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 hom 84 het 41 0 27 16 TTG 8 6 55012 CASAVA_Build 1 174460101 1I TTCTCTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 12 13 55013 CASAVA_Build 1 174472939 1D TATGTGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 34 1 22 11 T 13 12 55014 CASAVA_Build 1 174474459 1I TGACCTGTAA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 6 7 55015 CASAVA_Build 1 174491844 1D TTAATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 18 2 13 3 T 14 13 55016 CASAVA_Build 1 174521782 1D TGTAATGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 11 10 T 13 12 55017 CASAVA_Build 1 174576312 1D CTAAAAGTGA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 62 het 29 0 20 10 C 11 10 55018 CASAVA_Build 1 174635309 8D TTCAATTTCT TTCATCAG/-------- TGTTTTATAG 3070 het 2283 hom 23 6 17 1 TTCATCAG 1 0 55019 CASAVA_Build 1 174637929 2I ATAAAAACTC --/TA TGTCTTATCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TA 0 1 55020 CASAVA_Build 1 174659933 1I TTCTATCCAT -/A TTCTGAATTC 3070 hom 98 het 40 0 32 8 A 0 1 55021 CASAVA_Build 1 174660127 1I ACCAATAGAG -/T TTTTTTTTTT 1811 het 1811 ref 48 20 8 20 T 15 16 55022 CASAVA_Build 1 174664598 1D TCTACTCAAC T/- TTTTTTTTTT 1066 het 1066 ref 32 17 3 12 T 15 14 55023 CASAVA_Build 1 174695614 1D GGTAGAGGAT G/- GGGGGGGGTG 1882 het 1882 ref 28 14 7 7 G 9 8 55024 CASAVA_Build 1 174706629 1D GGTCAGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 14 9 T 11 10 55025 CASAVA_Build 1 174722699 1D GGGTGGATTT A/- AAAAAAAAAA 1321 het 1321 ref 27 20 3 4 A 11 10 55026 CASAVA_Build 1 174732740 1D TCCCTCAACC T/- TTTTTTTTTA 1248 het 1248 ref 43 33 3 7 T 10 9 55027 CASAVA_Build 1 174735887 2I TAGAAATATG --/TA TAAGTACATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TA 1 2 55028 CASAVA_Build 1 174752034 1I AGTTTAATTC -/T TTTTTTTTTT 2004 het 2004 ref 41 24 6 11 T 15 16 55029 CASAVA_Build 1 174801561 1D ATTGTTGCAC A/- ATGAGGAGAG 3070 het 3070 hom 43 15 20 9 A 2 1 55030 CASAVA_Build 1 174809723 1D AATAAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 T 11 10 55031 CASAVA_Build 1 174816401 1D ATTGCCAGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 52 24 23 7 T 10 9 55032 CASAVA_Build 1 174820443 1D TTTTTGTTTA T/- TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 42 23 10 10 T 6 5 55033 CASAVA_Build 1 174827242 1D CCCAGAGCTA T/- TTATGCTTTC 3070 het 3070 hom 44 14 26 6 T 3 2 55034 CASAVA_Build 1 174846104 1D AGTTGTGTGT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 54 het 25 0 17 9 G 10 9 55035 CASAVA_Build 1 174855637 1D AACTCATAAT A/- AAACAATTCA 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 A 4 3 55036 CASAVA_Build 1 174862649 1D CTGTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1883 het 999 hom 28 11 8 9 T 19 18 55037 CASAVA_Build 1 174892896 4D AAAAGGTGTC ACAA/---- AAGTTGTGGA 3070 het 3070 hom 35 10 22 4 ACAA 1 0 55038 CASAVA_Build 1 174912491 4D GCATACAACT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 16 19 9 AC 11 9 55039 CASAVA_Build 1 174916191 2I AGCTAAAAAC --/TT TTGAATACAA 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 T 2 4 55040 CASAVA_Build 1 174918408 1I TATTAGCTAT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 6 7 55041 CASAVA_Build 1 174939745 1D TTAATGTGCT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 3070 hom 50 18 22 13 G 8 7 55042 CASAVA_Build 1 174959239 1D GGTGGTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 11 10 55043 CASAVA_Build 1 174961449 4D ACACCCGGTT ACAC/---- ACACACGCAC 3070 het 3070 ref 35 18 14 7 AC 5 3 55044 CASAVA_Build 1 174984831 28I CCAGTATCTA ----------------------------/TCATACACATATTTGACCACATTGGTGG TCATACACAT 3070 hom 87 het 34 0 30 7 TCATACACATATTTGACCACATTGGTGG 0 1 55045 CASAVA_Build 1 175047971 1I TTTTTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 19 18 14 T 10 11 55046 CASAVA_Build 1 175054373 1D ACTGCCCCCC T/- GGTATGAGCC 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 1 0 55047 CASAVA_Build 1 175079924 4D TAGGAAGGCT GTGA/---- GTGAGGCTTG 3070 het 3070 ref 41 23 16 5 GTGA 2 1 55048 CASAVA_Build 1 175081818 3D TGCATTATGG AAC/--- ATCAGTGAGG 3070 het 3070 hom 45 20 21 8 AAC 1 0 55049 CASAVA_Build 1 175082092 1D GAAATGTCAA G/- GGATGATGCC 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 G 3 2 55050 CASAVA_Build 1 175083086 2D AGCTGGGAGA CT/-- CTCTCTACGC 3070 het 3070 ref 52 29 20 3 CT 4 3 55051 CASAVA_Build 1 175083529 3D TGGTTTTTCA TTT/--- TTAATCTGGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 T 5 2 55052 CASAVA_Build 1 175088327 2I GGTTAATGTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 TC 6 7 55053 CASAVA_Build 1 175089405 1D CAGGCTCTTC A/- GGGGGCCTCC 3070 het 3070 hom 45 15 25 7 A 1 0 55054 CASAVA_Build 1 175118307 1D TCTTTTACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 10 9 55055 CASAVA_Build 1 175119616 1D TCTTACTAGC T/- GGACCTGAGA 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 T 1 0 55056 CASAVA_Build 1 175121714 1D AGTTTGCATA T/- GACATTGAAG 3070 het 3070 ref 49 21 20 9 T 1 0 55057 CASAVA_Build 1 175138218 1I AGATTTTCCC -/T TCTTAATAGG 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 T 1 2 55058 CASAVA_Build 1 175173037 6D TATTTCTTCT TTACCA/------ GAAGGAACAG 3070 het 3070 ref 60 28 26 8 TTACCA 1 0 55059 CASAVA_Build 1 175187990 4D AGCCTAGTAT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 18 22 12 TTTC 3 2 55060 CASAVA_Build 1 175195279 1D TCTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 2200 het 1776 hom 22 8 6 9 A 12 11 55061 CASAVA_Build 1 175201402 1D CATTCTCACA T/- TTGAATCAAC 3070 het 3070 hom 54 20 29 5 T 3 2 55062 CASAVA_Build 1 175201686 2D TCTTAACTGT AA/-- TTCCTTCTAG 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 2 0 55063 CASAVA_Build 1 175253902 1I CAGAGACATC -/A GAAAGGAGGC 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 0 1 55064 CASAVA_Build 1 175254855 17D GCAGTGGGGA CAGGTTTGAATAATGGT/----------------- CAGGAGTGTG 3070 het 3070 ref 43 27 21 9 CAGGTTTGAATAATGGT 1 0 55065 CASAVA_Build 1 175280371 1I AACTCTGCTA -/T TTGTTTGTCA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 2 3 55066 CASAVA_Build 1 175281664 1D3M3D CATGTAGCTG CTACAGA/-TAC--- CACATGCTTT 3070 het 3070 ref 43 24 18 2 N/A 0 0 55067 CASAVA_Build 1 175305622 1D AAGGATAAAG A/- AAAAAAAAAA 2204 het 2204 ref 30 22 5 3 A 12 11 55068 CASAVA_Build 1 175306345 7I AGTAATAATG -------/TATCTAT TATGCACTGG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TATCTAT 0 1 55069 CASAVA_Build 1 175322044 1I GAATCCATTT -/A AAAAAACTCC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 6 7 55070 CASAVA_Build 1 175336349 3D TTTTGCCTTC AGG/--- AGTTTAGGAT 3070 het 3070 hom 47 23 21 5 AGG 1 0 55071 CASAVA_Build 1 175379910 1D TGGAACATGA T/- TTTTTTTTTT 1198 het 1198 ref 34 26 4 5 T 15 14 55072 CASAVA_Build 1 175395527 1D ACCCTCCTCA G/- GAAGAGCACT 3070 hom 154 het 55 0 52 3 G 2 1 55073 CASAVA_Build 1 175424586 1I TTATAGAAAA -/T AAACCCACAC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 0 1 55074 CASAVA_Build 1 175425161 1I TCCTGCCTCT -/G GCCAAGCCCC 3070 hom 109 het 49 0 33 16 G 1 2 55075 CASAVA_Build 1 175452428 1I ATTCCTGCAA -/G GCAGGCCTAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 2 55076 CASAVA_Build 1 175452539 1I TGGTTGGTAG -/T TTTTTTTTTT 1677 het 1677 ref 25 11 6 8 T 17 18 55077 CASAVA_Build 1 175473167 1D ATACATTCTC A/- GTGATTGATG 3070 het 3070 ref 52 25 23 4 A 1 0 55078 CASAVA_Build 1 175503012 1I CTAGGCACAC -/G GAACTTGGAA 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 G 1 2 55079 CASAVA_Build 1 175509666 1D TTATAAGAAG C/- CTTTACCTAG 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 C 2 1 55080 CASAVA_Build 1 175541406 1I GGGTGGCAGC -/A GGGGGGTGTG 2549 het 2549 ref 35 12 7 16 A 0 1 55081 CASAVA_Build 1 175550547 1D TTCCAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 1832 het 1832 ref 33 18 4 11 A 13 12 55082 CASAVA_Build 1 175554391 2I TTTTGTAATA --/CT CTGTCTCAAG 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 CT 1 2 55083 CASAVA_Build 1 175562447 2I TATATGTATG --/TA TATATATGTA 2188 het 2188 ref 31 19 7 5 TA 3 4 55084 CASAVA_Build 1 175573630 1I GATGTGTTTG -/T TTATATACGT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 2 3 55085 CASAVA_Build 1 175579578 2D CATAGTCAGT GG/-- GCTGAATTTG 3070 het 3070 ref 49 27 22 0 G 3 1 55086 CASAVA_Build 1 175587515 2I ATGTAGGAGA --/GT GTGTGTAAGG 3070 het 3070 hom 65 23 35 7 GT 3 4 55087 CASAVA_Build 1 175587614 2D GTGAATGAGA GT/-- GTTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 74 32 31 17 GT 2 1 55088 CASAVA_Build 1 175587788 2I GAGTAAATGA --/GT GTATTGTGAG 3070 het 3070 hom 80 39 34 7 GT 1 2 55089 CASAVA_Build 1 175594194 1D TCATGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 13 12 55090 CASAVA_Build 1 175605275 3I TCATACATGG ---/TTC TTATTATTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TTC 0 1 55091 CASAVA_Build 1 175627829 1D TCCAGAGACC T/- TCTCAGCACC 3070 het 3070 hom 58 24 28 6 T 2 1 55092 CASAVA_Build 1 175649757 1I TACCCCCATC -/T TAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 57 29 23 5 T 1 2 55093 CASAVA_Build 1 175650597 2D GCTCTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 19 13 12 TG 8 7 55094 CASAVA_Build 1 175652250 12I ATTCTTCACT ------------/CCTCCCTTCACC CATGTCCTTT 3070 het 3070 ref 59 27 23 9 CCTCCCTTCACC 0 1 55095 CASAVA_Build 1 175658467 2I TGGATTTGTC --/TT TTGTAGTCTG 3070 het 3070 ref 55 29 22 4 T 2 4 55096 CASAVA_Build 1 175664743 1D AAAGTGTAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 18 16 6 A 10 9 55097 CASAVA_Build 1 175683576 4D CTGCCTTCCC TGAG/---- TGATATACCA 3070 het 3070 hom 39 18 15 10 TGAG 1 0 55098 CASAVA_Build 1 175703450 1I TTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1123 het 1123 ref 31 25 3 3 A 10 11 55099 CASAVA_Build 1 175725604 2D AACGTGCACG CA/-- CACACACACA 779 het 779 ref 48 28 3 17 CA 9 8 55100 CASAVA_Build 1 175734558 1I CAAATTACAG -/A AAAAAACTTA 3070 het 3070 ref 52 27 23 2 A 6 7 55101 CASAVA_Build 1 175744716 1I CTCAGCTCTG -/T TTATTTCAGC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 2 3 55102 CASAVA_Build 1 175760677 1D TAAATTCCTG A/- AAACTCAGGA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 A 4 3 55103 CASAVA_Build 1 175764684 1D TCCCCCACAT A/- AATACCAATG 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 3 2 55104 CASAVA_Build 1 175768623 1I TACAGGCTTC -/T GCTTCTGGGG 2503 het 2503 ref 27 15 7 5 T 0 1 55105 CASAVA_Build 1 175772229 1D AGGAAAACAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 31 20 9 3 A 9 8 55106 CASAVA_Build 1 175772292 1D AACAGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 17 13 A 13 12 55107 CASAVA_Build 1 175777506 1D GGAACTTAAA T/- TTTATAAGAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 T 4 3 55108 CASAVA_Build 1 175782405 1I GTGCTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 A 13 14 55109 CASAVA_Build 1 175783710 1D CACAAAAGGC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 9 8 55110 CASAVA_Build 1 175785400 2D ACGATTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 13 11 55111 CASAVA_Build 1 175794455 1I GAACAGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 11 12 55112 CASAVA_Build 1 175798007 2D CATTCTTATA AC/-- ACACTCTCTA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 AC 3 2 55113 CASAVA_Build 1 175808346 1I ATCGTCAAAC -/T TTTTTAAAAT 3070 het 2779 hom 24 7 12 5 T 5 6 55114 CASAVA_Build 1 175817553 3I TATTGGTAGT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 A 13 16 55115 CASAVA_Build 1 175826788 5D TTTAGCAGAT GAGCC/----- CAGGTCCTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 7 GAGCC 1 0 55116 CASAVA_Build 1 175850813 8I CCATAAGCAC --------/TCCCACTA ATAGATGTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TCCCACTA 0 1 55117 CASAVA_Build 1 175859070 2D ACATACGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 20 22 9 AC 8 7 55118 CASAVA_Build 1 175860417 1D TATCAAACAA C/- CATATCTCAT 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 C 2 1 55119 CASAVA_Build 1 175860884 1D GAGGCAAATG A/- AAAAAATAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 A 7 6 55120 CASAVA_Build 1 175879574 1I TCTTCTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 32 1 28 3 A 10 11 55121 CASAVA_Build 1 175881013 13D15M13I AGCACTTTGA CTTGTGTTTATTTGTTCCTTTAAGAAGC-------------/-------------GCTTCTTAAAGGAACAAATAAACACAAG TCAAACACAA 3070 hom 126 het 36 0 40 7 N/A 0 0 55122 CASAVA_Build 1 175883068 5D CCAGCTGGGC CCTTT/----- CCTTGAAGTC 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 CCTTT 1 0 55123 CASAVA_Build 1 175890435 1D CCAGGAAACC T/- TTCCTGACCT 3070 het 3070 ref 31 15 8 8 T 3 2 55124 CASAVA_Build 1 175890822 3D GTGGATGTGT TCC/--- TCCTCTTACT 3070 het 3070 ref 30 20 10 0 TCC 2 1 55125 CASAVA_Build 1 175894227 1I GTCAAATTAT -/C TACATTCAAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 C 0 1 55126 CASAVA_Build 1 175896376 3D CCCCTACTCA CTC/--- CTCCTCCAAA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 CTC 3 2 55127 CASAVA_Build 1 175919920 2D GAAACATGTA TG/-- TGTCATATAT 2076 het 2076 ref 18 10 6 2 TG 2 1 55128 CASAVA_Build 1 175925918 2I TCTTTAATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 10 12 55129 CASAVA_Build 1 175953964 1D GATCAAAACC A/- AAGAGTTTTC 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 3 2 55130 CASAVA_Build 1 175968118 3D CAAACACGTC CTT/--- CTTCTCGTGG 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 CTT 2 1 55131 CASAVA_Build 1 175968838 1D ACAGGAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2427 hom 49 11 20 19 T 15 14 55132 CASAVA_Build 1 175987500 5I AATAGCGAGC -----/AGGTT AGGTTAGGTT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 AGGTT 2 3 55133 CASAVA_Build 1 175991137 1I GTCTCTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 13 14 55134 CASAVA_Build 1 175992321 14D CACAGAATTA AGGGTCATTTAGTG/-------------- AGGGTCATTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 12 AGGGTCATTTAGTG 1 0 55135 CASAVA_Build 1 176005644 4I GGCGTTGGGG ----/GGCA GGCAGCTGCT 3070 het 3070 ref 37 14 10 13 GGCA 1 2 55136 CASAVA_Build 1 176019421 1D ATCTCAAACC A/- AATGTAACAG 3070 het 3070 hom 41 13 21 8 A 3 2 55137 CASAVA_Build 1 176023515 1D AAAAAGGGGG A/- AAAAAGAGGA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 6 5 55138 CASAVA_Build 1 176025653 1D TCACTTCATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 A 10 9 55139 CASAVA_Build 1 176072119 1I13M1I TTAATCATTT -AAAATAATAGAGT-/AAAAATAATAGAGTG GGGAGGGAGA 3070 hom 102 het 37 0 35 5 N/A 0 0 55140 CASAVA_Build 1 176072194 1I12M1I6M1I26M1I AGGAGCTGTG -TAGGTCCTCTCC-TTCCAT-ACTGATTTAATTCATATGCCTTTCAT-/TTAGGTCCTCTCCTTTCCATAACTGATTTAATTCATATGCCTTTCATA AAAAGTAAGT 3070 hom 126 het 36 0 43 6 N/A 0 0 55141 CASAVA_Build 1 176072550 1D TATTCATTAC A/- AAAAAATAAT 2495 het 2495 ref 33 20 8 5 A 7 6 55142 CASAVA_Build 1 176082768 2I ACCCTGGACT --/CC CCCACCGCTC 3070 hom 105 het 38 0 34 4 C 3 5 55143 CASAVA_Build 1 176084339 6D CCATCTCCCT CTCTCC/------ CTCTCCCTCT 3070 het 3070 hom 41 19 18 9 CTCTCC 2 1 55144 CASAVA_Build 1 176092816 1D TTTTTAATTT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 2265 hom 27 7 15 5 G 1 0 55145 CASAVA_Build 1 176095640 1D AGAAAACAAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 54 24 19 11 A 8 7 55146 CASAVA_Build 1 176097062 1D TGTGTTGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 10 9 55147 CASAVA_Build 1 176115867 1I TTTATCCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 45 0 36 9 T 11 12 55148 CASAVA_Build 1 176136374 6I TCGTGTCACT ------/GCATTC GCATTCAAGC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 GCATTC 1 2 55149 CASAVA_Build 1 176143042 1D TTGCAGGGAA C/- CCGTGGGAGT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 C 3 2 55150 CASAVA_Build 1 176156754 1D TTCCACCTGC T/- TACCTATTTA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 2 1 55151 CASAVA_Build 1 176158064 1D CACATAAACA C/- TTGAGACAAC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 C 1 0 55152 CASAVA_Build 1 176163846 18D GAATAAAATC CAAGTATAAGTGGACCCA/------------------ CACAGTTCAA 3070 het 3070 hom 38 18 23 4 CAAGTATAAGTGGACCCA 1 0 55153 CASAVA_Build 1 176169894 1D TTACATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 12 11 T 13 12 55154 CASAVA_Build 1 176171421 1D TTCAGTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2668 hom 31 8 19 4 A 13 12 55155 CASAVA_Build 1 176185910 1D TAAGAAGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 41 1 31 10 A 12 11 55156 CASAVA_Build 1 176209882 1D AAATGCTACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 9 55157 CASAVA_Build 1 176210368 1I TGATCTTAAC -/A GGAACAATTT 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 A 0 1 55158 CASAVA_Build 1 176216529 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 G 1 0 55159 CASAVA_Build 1 176221402 1I CCAGCTACCT -/G GGGGGGCTGA 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 G 6 7 55160 CASAVA_Build 1 176239703 1I AAGAAAGAGG -/A AAAAATAGGA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 5 6 55161 CASAVA_Build 1 176240365 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1802 hom 24 6 13 5 A 11 12 55162 CASAVA_Build 1 176242583 1D GGACAATATA T/- TCTTAATTTA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 2 1 55163 CASAVA_Build 1 176248782 3D GCAAAAGGCA TTT/--- TTTTTTTTGT 3070 het 2745 hom 25 9 10 7 T 11 8 55164 CASAVA_Build 1 176250121 5D TTTCCATTTG GTTGT/----- GTTATCTATG 3070 het 3070 ref 29 15 14 1 GTTGT 1 0 55165 CASAVA_Build 1 176250746 2I GATCATATAG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 T 9 11 55166 CASAVA_Build 1 176286767 1D AAAAGTCTCT G/- CCGCGGTGGG 3070 het 3070 hom 60 22 30 9 G 1 0 55167 CASAVA_Build 1 176318824 1D TTAAGGGGTT G/- GTGAAATCTT 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 G 2 1 55168 CASAVA_Build 1 176324710 7I TAGTCAGTGT -------/TATAGAG TATAATCAGG 3070 hom 93 het 40 0 31 9 TATAGAG 0 1 55169 CASAVA_Build 1 176326982 3D GAAAAAAAGT TCA/--- TCATCATTGG 3070 hom 30 het 12 0 10 2 TCA 3 2 55170 CASAVA_Build 1 176331170 1D AAACCATGCT G/- GTTTTGAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 G 2 1 55171 CASAVA_Build 1 176336120 1D CTATAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1958 het 456 hom 9 1 6 2 A 15 14 55172 CASAVA_Build 1 176337782 1I ACAGATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 45 1 39 5 T 10 11 55173 CASAVA_Build 1 176358597 1D TTACTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 611 hom 26 2 19 5 T 13 12 55174 CASAVA_Build 1 176366780 1D CCACTGCAGT C/- CCAGCCTGGG 3070 hom 50 het 19 0 15 4 C 3 2 55175 CASAVA_Build 1 176367982 1I AAATTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 1802 het 1802 ref 19 8 7 4 T 14 15 55176 CASAVA_Build 1 176390574 3I TAATAGATTC ---/ATA ATAATAATAA 1927 het 1927 ref 16 7 4 5 ATA 5 6 55177 CASAVA_Build 1 176396872 1I CAAATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 33 2 28 3 A 10 11 55178 CASAVA_Build 1 176409672 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAAGTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 0 1 55179 CASAVA_Build 1 176420150 1I ATTTTTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 29 2 24 3 T 11 12 55180 CASAVA_Build 1 176429545 1I AATTTTTTTT -/G GGTGAATATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 2 3 55181 CASAVA_Build 1 176472149 1D TTCCAAAAAT C/- AGAGATTCTG 3070 het 3070 hom 42 20 22 0 C 1 0 55182 CASAVA_Build 1 176487780 1D GTTGGGGTCC A/- AAAACATTGA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 5 4 55183 CASAVA_Build 1 176491550 2D ACAACAAAAC AA/-- GAGATAAATA 3070 het 3070 ref 25 14 8 5 A 2 0 55184 CASAVA_Build 1 176497533 1D AAAGTAGCCT G/- GTGTGGTGGT 3070 het 2370 hom 21 7 10 4 G 2 1 55185 CASAVA_Build 1 176528441 3D TGCTTGCAAG AGA/--- TGAGACCAAG 3070 hom 106 het 39 0 34 7 AGA 1 0 55186 CASAVA_Build 1 176537196 1I GTTGTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1128 het 1128 ref 37 19 3 15 T 11 12 55187 CASAVA_Build 1 176631530 2D TAATGAACAG TA/-- TATATATATA 3070 het 122 hom 19 1 17 1 TA 10 9 55188 CASAVA_Build 1 176664321 2I ATGTTCTCTC --/TA TATATATATA 2954 het 1557 hom 17 4 10 3 TA 5 6 55189 CASAVA_Build 1 176715566 1I TTTTGTTAGC -/A AAAAAAAAAA 1860 het 1860 ref 40 32 4 4 A 11 12 55190 CASAVA_Build 1 176717852 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 A 11 12 55191 CASAVA_Build 1 176768073 4I TGCCTGGGAG ----/CCCA CCCTGACACT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 CCCA 0 1 55192 CASAVA_Build 1 176781184 1I TGAAGGTTGA -/T TTTTGACTAC 3070 hom 115 het 46 0 36 10 T 4 5 55193 CASAVA_Build 1 176785518 1D AATAAGGGGG A/- AAGCCGTCTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 A 3 2 55194 CASAVA_Build 1 176790302 3I ATTTTGGGGG ---/GGT GGGGGGCCTG 3070 hom 61 het 26 0 19 7 GGT 0 1 55195 CASAVA_Build 1 176793706 1I ATTTACCTGA -/T TTTTTTATTA 3070 het 273 hom 22 1 21 0 T 6 7 55196 CASAVA_Build 1 176839141 2I GGTTCACCAC --/TT TAAGAAACTC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 1 3 55197 CASAVA_Build 1 176906678 2I5M1I AGGCATTTGC --ACATG-/CACCATGC CCAGCTAATT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 55198 CASAVA_Build 1 176909843 1I CTCAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 17 1 13 3 A 11 12 55199 CASAVA_Build 1 176910211 1I ACTGTTTTTT -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 1 2 55200 CASAVA_Build 1 176912951 3D AAAAGAAGAA AAC/--- AATCCCATTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAC 1 0 55201 CASAVA_Build 1 176913708 2D AGACTCCATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 16 14 55202 CASAVA_Build 1 176916502 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 11 10 55203 CASAVA_Build 1 176919561 1D CATTTGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 35 1 26 8 A 11 10 55204 CASAVA_Build 1 176924082 1D AGTACTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 10 9 55205 CASAVA_Build 1 176928932 1I ACAATTATCC -/A ATACATACAA 3070 hom 41 het 45 0 13 32 A 1 2 55206 CASAVA_Build 1 176929094 2I AATAATTTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 39 0 30 9 T 11 13 55207 CASAVA_Build 1 176930821 1D TGTTTATTTT A/- TTTTTTTTTA 3070 hom 38 het 15 0 13 2 A 1 0 55208 CASAVA_Build 1 176932457 4D AAACAAAAAT GATA/---- GATAGATTGA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 GATA 2 1 55209 CASAVA_Build 1 176938311 2D GTTGGGTCAT AG/-- AGTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 AG 2 1 55210 CASAVA_Build 1 176938451 1D TTATTTCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 21 0 T 13 12 55211 CASAVA_Build 1 176951880 9D ATATCAAGCC TGTATATGT/--------- TGGTTTATAT 3070 het 3070 ref 51 26 18 12 TGTATATGT 1 0 55212 CASAVA_Build 1 176956323 1D TGGTTAGTTT C/- CCCAGCCCAC 3070 hom 75 het 28 0 24 5 C 4 3 55213 CASAVA_Build 1 176957409 1D ACTAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 19 2 11 7 T 15 14 55214 CASAVA_Build 1 176988076 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1893 het 1893 ref 20 9 6 5 T 13 14 55215 CASAVA_Build 1 176999914 2D CCTGTTTTGG GT/-- GTGTGTATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 GT 4 3 55216 CASAVA_Build 1 177039460 4D CATTTCATTA TTTC/---- TTTCAGAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 TTTC 2 1 55217 CASAVA_Build 1 177039828 1D AATCTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2774 hom 38 13 14 11 T 13 12 55218 CASAVA_Build 1 177073468 6I GCAGCCCACC ------/GAGCAT GAGCCGAAGC 3070 hom 42 het 18 0 14 4 GAGCAT 0 1 55219 CASAVA_Build 1 177091953 28D TTTTCCAGAG AGAGAGAGATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 3070 het 480 hom 12 3 10 3 AGAGAGAGATATATATATATATATATAT 1 0 55220 CASAVA_Build 1 177094900 5I CAACCCAAAC -----/TTTTT TTTTAATTAT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 4 9 55221 CASAVA_Build 1 177099146 2I GGAGACAGAC --/AT ATAAATAAAT 3070 het 3070 ref 55 26 25 4 AT 1 2 55222 CASAVA_Build 1 177107282 4I AACATTTTAC ----/TTAT TAAGTTGCTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TTAT 0 1 55223 CASAVA_Build 1 177120233 3I GATAAGATGT ---/GAA GAAGTGGAGA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 GAA 1 2 55224 CASAVA_Build 1 177127675 1D ATTTTTGAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 10 9 55225 CASAVA_Build 1 177161013 6I AGTCAGAATT ------/GGAAAG GGAAAGATAA 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 GGAAAG 1 2 55226 CASAVA_Build 1 177162300 2I AGGAAATCTC --/TG TGAACCTGGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TG 1 2 55227 CASAVA_Build 1 177162459 1D TCAAGAAGAT A/- ACAGGACATT 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 A 2 1 55228 CASAVA_Build 1 177164611 4I TCTTTGAATT ----/AGAC AGCCTAAGAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 AGAC 0 1 55229 CASAVA_Build 1 177165310 1I CATGTTAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 19 26 10 T 10 11 55230 CASAVA_Build 1 177165655 1D AGTGGTCCTC A/- AACTTTAGAG 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 3 2 55231 CASAVA_Build 1 177168079 3I CACACTAGGG ---/CGC CAAGGCATGC 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 CGC 0 1 55232 CASAVA_Build 1 177175460 22D GAGGATCTTT GATGGGGGATTTTCCCCCTGGG/---------------------- GGTGGGGGAT 3070 het 3070 ref 45 24 21 11 GATGGGGGATTTTCCCCCTGGG 1 0 55233 CASAVA_Build 1 177176768 2I TAGAATTAAC --/AT GTGCAGAGAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 AT 0 1 55234 CASAVA_Build 1 177177804 1I AGCTGGAGGT -/C CCCCCCCCAT 2342 hom 10 het 19 0 7 12 C 8 9 55235 CASAVA_Build 1 177180374 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 9 10 55236 CASAVA_Build 1 177183850 1I TGCCATATTG -/C CTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 C 1 2 55237 CASAVA_Build 1 177188439 1D GCAGGAACCC G/- GGGAGGCGGA 2136 hom 24 het 9 0 7 2 G 4 3 55238 CASAVA_Build 1 177192234 1D CTCTGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 19 1 15 3 A 15 14 55239 CASAVA_Build 1 177192798 1D AGTGCCTGCA C/- CTGGCAAGTA 3070 hom 70 het 26 0 23 3 C 2 1 55240 CASAVA_Build 1 177197060 1I GGGGGTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 11 12 55241 CASAVA_Build 1 177197655 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 TA 5 6 55242 CASAVA_Build 1 177203057 1D GAAATGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2612 hom 37 13 17 7 A 15 14 55243 CASAVA_Build 1 177208029 1D GATGCTTATC T/- TTTAATGAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 4 3 55244 CASAVA_Build 1 177208803 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2568 het 1900 hom 26 8 8 10 A 19 18 55245 CASAVA_Build 1 177217759 1D TACAATAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 10 A 12 11 55246 CASAVA_Build 1 177218039 1D ATATATATAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 A 9 8 55247 CASAVA_Build 1 177220774 1I CATTGCAGAC -/T TTTTTTTATT 2738 het 2738 ref 20 12 8 0 T 7 8 55248 CASAVA_Build 1 177249835 1I AAATAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2344 hom 23 10 12 1 A 15 16 55249 CASAVA_Build 1 177273117 1I GTTTAGTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 9 10 55250 CASAVA_Build 1 177274170 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2292 het 2292 ref 27 9 8 10 A 15 16 55251 CASAVA_Build 1 177286881 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2763 het 1408 hom 16 4 10 2 A 15 14 55252 CASAVA_Build 1 177295859 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTATT 1330 hom 15 het 19 0 5 14 A 1 0 55253 CASAVA_Build 1 177308316 1D TCTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 14 19 14 T 12 11 55254 CASAVA_Build 1 177313757 2D AAAAAAAAAA AC/-- TGCTTGTGAG 2672 het 1854 hom 29 12 9 9 AC 1 0 55255 CASAVA_Build 1 177319104 2I GAACTATCCA --/CT GAGAGAACTG 2778 het 2778 ref 29 13 8 8 CT 0 1 55256 CASAVA_Build 1 177325304 4D ACATTCTTCC AGTT/---- AGTTCTTATT 2926 het 2926 ref 28 17 8 5 AGTT 2 1 55257 CASAVA_Build 1 177328603 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2179 hom 23 8 10 5 A 11 12 55258 CASAVA_Build 1 177331184 4I GGTCCCACCG ----/AGAT AGATAGATAG 3070 het 3070 hom 43 10 24 9 AGAT 2 3 55259 CASAVA_Build 1 177332421 4I ACCCCGTCTC ----/TATT TATTAAACAA 3070 het 2922 hom 24 12 12 0 TATT 1 2 55260 CASAVA_Build 1 177337136 2D GAAGGTATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 712 hom 37 6 16 15 T 14 12 55261 CASAVA_Build 1 177345686 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1868 het 503 hom 15 2 8 5 A 13 12 55262 CASAVA_Build 1 177350289 1I TGTTTATCTA -/C CACAGAGGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 2 55263 CASAVA_Build 1 177351961 12D GCAAAACCTC ATCTCTACTACT/------------ ATGACAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 14 2 ATCTCTACTACT 1 0 55264 CASAVA_Build 1 177354845 3D GCCCATGATT CTC/--- CTCCTCAACT 3070 het 3070 ref 37 23 9 10 CTC 3 2 55265 CASAVA_Build 1 177356783 1D ACTACTACTT A/- ATAGCTAAAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 2 1 55266 CASAVA_Build 1 177396418 1D CTTTTAAAAA T/- ATCTTAGTTA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 1 0 55267 CASAVA_Build 1 177401558 1D CAAGACTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 12 11 55268 CASAVA_Build 1 177409281 11I CCGCCACGCC -----------/CAGCTAACTTT TGTATTTTTG 2767 het 1342 hom 11 4 7 0 CAGCTAACTTT 0 1 55269 CASAVA_Build 1 177412244 1I ATGTACCCAC -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 6 7 55270 CASAVA_Build 1 177421429 1I AGTATGTAAG -/T TTTGAGTTAA 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 T 3 4 55271 CASAVA_Build 1 177437851 1D TAAAGATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 8 12 A 12 11 55272 CASAVA_Build 1 177444429 4D CAGAAGACAA TCTC/---- TCTTAGCCAA 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 TC 3 1 55273 CASAVA_Build 1 177447550 1I ATCCTTCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2449 hom 38 9 12 17 A 15 16 55274 CASAVA_Build 1 177449549 1D AAAAATAACT A/- AAAGAGTCCA 3070 het 2216 hom 29 7 16 8 A 4 3 55275 CASAVA_Build 1 177453951 1D TAACTCCAGA T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 7 6 55276 CASAVA_Build 1 177454809 4I ACTAAACAAG ----/CTTT TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 CTTT 0 1 55277 CASAVA_Build 1 177457552 1D GGATTTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2321 hom 25 10 11 4 A 15 14 55278 CASAVA_Build 1 177466456 2I TTTAATTCTC --/AA AAATCTTGAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 3 5 55279 CASAVA_Build 1 177472945 30D GTATGCATGC ATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------ ATATATATAT 2754 het 12 hom 10 1 8 4 AT 24 9 55280 CASAVA_Build 1 177474768 1D TGGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 T 12 11 55281 CASAVA_Build 1 177489720 1D CACATGAATC T/- TTTTTTTTTT 1464 het 1464 ref 29 20 5 4 T 13 12 55282 CASAVA_Build 1 177492531 3D TTTATTTTAT TTA/--- TTTATTTTTT 65 het 55 hom 9 1 1 7 TTA 1 0 55283 CASAVA_Build 1 177498247 3I ATTAAAATTC ---/CTT CTTATTTATA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CTT 1 2 55284 CASAVA_Build 1 177503409 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 770 het 770 ref 19 11 3 5 A 11 12 55285 CASAVA_Build 1 177511012 1D ATAAATAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2657 hom 24 9 11 5 T 11 10 55286 CASAVA_Build 1 177511558 1I CAAGGTTCAT -/C CATGTTGTAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 1 2 55287 CASAVA_Build 1 177524939 1I TTGACCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 15 19 8 T 9 10 55288 CASAVA_Build 1 177530700 1D AATTTGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3024 het 3024 ref 34 17 9 8 T 11 10 55289 CASAVA_Build 1 177531564 3D GCCCGGCTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2442 het 1448 hom 20 7 8 5 T 17 14 55290 CASAVA_Build 1 177533889 5I CTTGATCTAA -----/CTTAT CTTGAGTGCA 3070 hom 93 het 37 0 30 7 CTTAT 0 1 55291 CASAVA_Build 1 177541173 1D CAGTACTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 T 12 11 55292 CASAVA_Build 1 177543366 1I TGCAGACTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 11 9 A 9 10 55293 CASAVA_Build 1 177545400 1I TGACCATGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 55294 CASAVA_Build 1 177545626 1D ATTGTTATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 10 9 55295 CASAVA_Build 1 177553400 1D TCATCATAGG T/- TTTTTTTTTT 3062 het 2029 hom 24 6 8 10 T 15 14 55296 CASAVA_Build 1 177560767 2I TTCACTGCAT --/TA GCCAGGATGG 3070 hom 27 het 13 0 9 4 TA 0 1 55297 CASAVA_Build 1 177569156 1I TTCCTCTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 32 0 20 12 A 13 14 55298 CASAVA_Build 1 177588009 1D GGAGGATGGC T/- TTTTTTTTTT 1673 het 1673 ref 40 30 4 6 T 13 12 55299 CASAVA_Build 1 177593695 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 10 11 55300 CASAVA_Build 1 177605422 1D AAAAAAAAAA T/- TTAAAATAAT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 3 2 55301 CASAVA_Build 1 177606863 1D AATTAGCTAT A/- TCTGAATGTG 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 1 0 55302 CASAVA_Build 1 177611258 2D AATGTATAAC AT/-- ATAATGTATA 1751 het 1751 ref 10 6 4 2 AT 2 1 55303 CASAVA_Build 1 177615270 1I AAAAATACCT -/G GCCCCAGCTC 3070 het 2088 hom 17 7 10 0 G 1 2 55304 CASAVA_Build 1 177618004 1I GCCCGGCTAA -/T TTCTTTTGTA 2697 het 300 hom 10 1 7 2 T 2 3 55305 CASAVA_Build 1 177626446 4I ATTAGGGCTC ----/TGGT TACAATTTTC 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 TGGT 0 1 55306 CASAVA_Build 1 177626509 2I CCTAGATTCC --/TT TTTTTTTTTC 3059 het 3059 ref 34 15 9 10 T 9 11 55307 CASAVA_Build 1 177637925 1I TCCGTCTCAA -/C AAAAAAAAAA 2225 het 1152 hom 29 8 10 11 C 0 1 55308 CASAVA_Build 1 177641604 1I TATTTTGTAG -/T TTTTTTAGTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 6 7 55309 CASAVA_Build 1 177641935 3D AAAGTTTCTC TTG/--- TTATTAATTT 3070 het 3070 ref 46 25 17 7 TTG 1 0 55310 CASAVA_Build 1 177647096 1D TTAAAATTTG T/- TTTTTTTGTT 2884 het 2884 ref 29 13 11 6 T 8 7 55311 CASAVA_Build 1 177647430 1D ATTAAGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 11 10 55312 CASAVA_Build 1 177647608 1D TCTGATTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 10 9 55313 CASAVA_Build 1 177650728 2D AATAGAATAG AA/-- AAAGGTCAGA 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 A 5 3 55314 CASAVA_Build 1 177657998 14D8M7D TTTGATATAG ATATATCAAATATATAATTTATAACAATA/--------------GAATTTAT------- AATTATAAAC 3070 het 3070 hom 29 15 18 5 N/A 0 0 55315 CASAVA_Build 1 177658957 1I TATAGTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 10 11 55316 CASAVA_Build 1 177659899 4D GGTTTTGTTC GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 GTTT 4 3 55317 CASAVA_Build 1 177663144 2I ATTTTTTGAC --/TG TGAATGGTAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 TG 1 2 55318 CASAVA_Build 1 177664937 1I ACTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 9 10 55319 CASAVA_Build 1 177668003 1D GATGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 11 10 55320 CASAVA_Build 1 177668188 1D CATCCCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 21 9 T 12 11 55321 CASAVA_Build 1 177669738 1I CTACTATTGT -/G GGAGTCTAAG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 G 2 3 55322 CASAVA_Build 1 177673435 7I ATGAACAGAA -------/GACAGAG GACAGAGACA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 GACAGAG 1 2 55323 CASAVA_Build 1 177675628 6D ACCTTGAGGG CACCCA/------ CATGGTTTCT 3070 het 3070 hom 35 15 14 10 CACCCA 1 0 55324 CASAVA_Build 1 177679723 5D CAACAAACCA TTTTC/----- TTTTCTTTAG 3070 het 3070 hom 34 13 19 4 TTTTC 2 1 55325 CASAVA_Build 1 177679812 3D GTTTAGTGAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 10 11 T 17 14 55326 CASAVA_Build 1 177680415 1I AGCCAATAGT -/A ATTAAACATG 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 A 1 2 55327 CASAVA_Build 1 177682676 1I TATATTTTAC -/T TTTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 4 5 55328 CASAVA_Build 1 177683269 1D GATTCTACAG T/- TGGCGCAGAA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 T 2 1 55329 CASAVA_Build 1 177683868 7I CCTCATTAAT -------/TTTTTTA TATTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 TTTTTTA 0 1 55330 CASAVA_Build 1 177684649 2D TTTGAGTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2648 het 2648 ref 33 14 8 12 T 14 12 55331 CASAVA_Build 1 177687095 4D CGTATATTTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2499 hom 28 6 16 7 A 14 10 55332 CASAVA_Build 1 177728964 3I CTGATCTACT ---/ATC AACACCAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 ATC 0 1 55333 CASAVA_Build 1 177730300 1D GTGATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 18 8 T 13 12 55334 CASAVA_Build 1 177735118 4I AGACCACATA ----/TTAT TTTATTCACA 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 TTAT 0 1 55335 CASAVA_Build 1 177738853 1I AACTCCGTGT -/A AAAAAAAAAA 2410 het 2150 hom 23 6 10 7 A 15 16 55336 CASAVA_Build 1 177741069 3I TAATGTTTCT ---/TGG GCTTCTTTCC 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 TGG 0 1 55337 CASAVA_Build 1 177743537 1D CAGCTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 20 23 10 A 11 10 55338 CASAVA_Build 1 177744094 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 26 2 14 11 A 14 12 55339 CASAVA_Build 1 177746208 1I TTTATGAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 13 27 5 T 9 10 55340 CASAVA_Build 1 177755768 1D TGATTCCTCC T/- TTTTATGAGT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 5 4 55341 CASAVA_Build 1 177756702 5D ATTTCTGTAT TTTAA/----- TTTAATTTAA 2976 het 2292 hom 15 6 7 2 TTTAA 4 3 55342 CASAVA_Build 1 177759002 1D ATTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 13 12 55343 CASAVA_Build 1 177761553 2I TGCTTGGACC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 AT 7 8 55344 CASAVA_Build 1 177777474 4I10M3D ATATGCATGA ----TAATATATGCATA/TAATTAATATATGC--- ATAATTTCAC 3070 het 3070 hom 40 16 21 6 N/A 0 0 55345 CASAVA_Build 1 177794005 1I TTCTCCTTCT -/C CTCAACCCCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 C 1 2 55346 CASAVA_Build 1 177794786 1D TAGGTATGCT G/- GGGTGGGGAG 3070 het 3070 ref 39 21 16 4 G 4 3 55347 CASAVA_Build 1 177799087 1D ATACATGAGG A/- AAAAGACAAA 3070 het 3070 ref 56 31 21 7 A 5 4 55348 CASAVA_Build 1 177805087 9I CCCTTCTGAT ---------/CTTTGTTGG CTTAAAGTCT 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 CTTTGTTGG 0 1 55349 CASAVA_Build 1 177812153 7D AGGGCCAAGT AAAAAAG/------- AAAAAAGAAA 3070 hom 96 het 40 0 33 11 AAAAAAG 3 2 55350 CASAVA_Build 1 177836900 2I TCTTTTTAAC --/TG TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 TG 0 1 55351 CASAVA_Build 1 177856653 1I ACTCATTTTC -/A AAAAAAAAAC 2502 het 2502 ref 28 13 9 6 A 9 10 55352 CASAVA_Build 1 177875925 3D TCCTTCCTTC CTT/--- CTTCTTAGTG 3070 het 3070 ref 56 31 20 9 CTT 3 2 55353 CASAVA_Build 1 177879393 1I AGATCAAAAG -/A AATTATCCAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 2 3 55354 CASAVA_Build 1 177884547 1D AAAAAACAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 36 24 9 3 A 8 7 55355 CASAVA_Build 1 177885330 3D CCTTCTAAAA CTT/--- CTTAGTTCTG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 CTT 2 1 55356 CASAVA_Build 1 177893381 5D CTCATAAAAT AAATC/----- TGAATATATT 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 AAATC 1 0 55357 CASAVA_Build 1 177909520 1D GGCAGGTTTG C/- CCTAAGCAGT 3070 het 2121 hom 25 5 19 1 C 3 2 55358 CASAVA_Build 1 177917036 1D ACAAAATGTT G/- TATATATCTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 G 1 0 55359 CASAVA_Build 1 177940027 1D TGGTGGTCTT A/- AAAGTTTGTA 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 A 4 3 55360 CASAVA_Build 1 177942241 4D TCTAAAGTCA AATT/---- AATTATTCTT 3070 het 3070 ref 30 14 16 1 AATT 2 1 55361 CASAVA_Build 1 177945897 1D GTCCCAGGAG A/- AAAAAAAAAA 1260 het 1260 ref 30 24 3 3 A 11 10 55362 CASAVA_Build 1 177948100 1D AGATATTATT C/- CCAGTTGGTG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 3 2 55363 CASAVA_Build 1 177949645 1I TGGTTTATTT -/A CCACAATTAC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 0 1 55364 CASAVA_Build 1 177960930 1D TCCAACCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 15 14 55365 CASAVA_Build 1 177970170 1I CGAATACTCC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2211 hom 31 7 15 9 T 8 9 55366 CASAVA_Build 1 177972089 1D ACTCAGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 A 12 11 55367 CASAVA_Build 1 177974969 1D CATGAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 A 12 11 55368 CASAVA_Build 1 177975295 1D TGTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 T 10 9 55369 CASAVA_Build 1 177982925 2D GAGATGCTTG GA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 34 0 25 9 GA 1 0 55370 CASAVA_Build 1 177985462 1I CTAAATATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 7 55371 CASAVA_Build 1 177990952 1I AGTGGTCAGT -/G GAAGAATAGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 1 2 55372 CASAVA_Build 1 177996852 2D ATGTAGAAAC AT/-- ATTTTACATG 3070 het 3070 ref 50 33 15 2 AT 2 1 55373 CASAVA_Build 1 178026538 2I CCAGCTCAGA --/CT CTGGACAGAC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 CT 1 2 55374 CASAVA_Build 1 178039787 5D CCAGAGCCAC TCTTG/----- TCTTGTCATG 2546 het 1626 hom 12 5 7 0 TCTTG 2 1 55375 CASAVA_Build 1 178054492 1D ACCCCGGAGT C/- CCCCAGCTCG 3070 het 3070 hom 40 19 16 7 C 5 4 55376 CASAVA_Build 1 178055637 1D AGAAGATGGA G/- GACCAATGTC 2933 het 2933 ref 37 10 9 19 G 2 1 55377 CASAVA_Build 1 178055658 1D CTAAAGAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 38 3 20 15 T 15 14 55378 CASAVA_Build 1 178070279 1D AAAAATTCAG A/- AAAAAAAAAT 1297 het 1297 ref 40 32 3 5 A 10 9 55379 CASAVA_Build 1 178077961 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2084 hom 27 8 13 6 A 13 14 55380 CASAVA_Build 1 178080340 1I CTAATCAACT -/A CTATCTCCAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 0 1 55381 CASAVA_Build 1 178097208 5D TCTGACAGCT TATCA/----- TATAACAGGT 3070 het 3070 ref 31 15 14 6 TATCA 1 0 55382 CASAVA_Build 1 178102689 1I ACCTAGAGGG -/T TATCACAGAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 1 2 55383 CASAVA_Build 1 178105047 1D ATAAAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2294 hom 26 9 13 4 A 13 12 55384 CASAVA_Build 1 178112401 1I TCTTGTGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 A 10 11 55385 CASAVA_Build 1 178117783 1D AGCGAAACTT G/- GGTCTTCTCC 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 G 3 2 55386 CASAVA_Build 1 178125411 1D CATTTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 2447 het 2447 ref 29 13 7 9 T 15 14 55387 CASAVA_Build 1 178128106 1I GTGCTGTGCA -/C CTGTAACCCC 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 C 1 2 55388 CASAVA_Build 1 178132238 1D GCCATTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 12 11 55389 CASAVA_Build 1 178136324 2D CCCATCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2069 hom 31 7 9 17 A 14 12 55390 CASAVA_Build 1 178165175 7D CTGCTTTTAC TTTGTAA/------- TTTGTAGTCC 3070 het 3070 ref 37 17 18 4 TTTGTAA 1 0 55391 CASAVA_Build 1 178169743 1D TTAGAATCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 10 9 55392 CASAVA_Build 1 178171437 1I AAGGATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 12 13 55393 CASAVA_Build 1 178182275 5I ATAAGATAAG -----/ATAAA ATAAAATAAA 1915 het 1915 ref 21 10 7 4 ATAAA 3 4 55394 CASAVA_Build 1 178184783 1I TGTATCAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 21 7 9 5 A 9 10 55395 CASAVA_Build 1 178209860 1D TGTTTTGAGA T/- GGAGTCTCGC 3070 het 1734 hom 17 5 10 2 T 1 0 55396 CASAVA_Build 1 178211990 1I TGTAAATCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 9 10 55397 CASAVA_Build 1 178221528 1D ACTGCCCCCC T/- GATCCAATTA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 1 0 55398 CASAVA_Build 1 178233768 1D TCTTTAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2202 hom 30 9 14 7 T 13 12 55399 CASAVA_Build 1 178244205 7I GACTCAACTG -------/TTAGCTA TTAGCTATGA 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 TTAGCTA 1 2 55400 CASAVA_Build 1 178246746 1I GTAAACAGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 23 20 3 T 9 10 55401 CASAVA_Build 1 178280655 1I TGATTATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 11 12 55402 CASAVA_Build 1 178299571 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 9 10 55403 CASAVA_Build 1 178307540 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2564 hom 26 8 12 6 A 10 11 55404 CASAVA_Build 1 178311194 2I AAATTAAAAA --/AC ATTAGCTGGG 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 AC 0 1 55405 CASAVA_Build 1 178313138 4I AGGAGACATT ----/AAAG AAAACCAAAA 3070 het 3070 hom 21 7 12 2 AAAG 0 1 55406 CASAVA_Build 1 178314938 1D43M1I TACTTTATAG AAAAAAAAACTAGCTGGTAAAAACTCAAGATAGAAACTTAACTC-/-AAAAAAAACTAGCTGGTAAAAACTCAAGATAGAAACTTAACTCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 16 18 5 N/A 0 0 55407 CASAVA_Build 1 178326360 8D ACATAGATTG ACATACCT/-------- ACTGTAGAGA 2362 het 2362 ref 14 8 6 0 ACATACCT 1 0 55408 CASAVA_Build 1 178327805 1I TTGCTCTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 10 11 55409 CASAVA_Build 1 178330991 4I CATATCCCAT ----/AGAC AGACAGTTCT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 AGAC 1 2 55410 CASAVA_Build 1 178334089 3D GGGTTTTACT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 TTG 7 6 55411 CASAVA_Build 1 178339328 2D CATTTAAGAT TG/-- TGTGTGTGTG 1047 het 1047 ref 46 33 3 12 TG 7 6 55412 CASAVA_Build 1 178344882 1I TCACTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 882 het 448 hom 20 4 7 9 T 15 16 55413 CASAVA_Build 1 178349327 1I GTTTGGTAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 9 10 55414 CASAVA_Build 1 178356952 1I GTAACTCTAA -/T TTTTTTTTTT 2856 het 328 hom 30 3 10 17 T 16 17 55415 CASAVA_Build 1 178358250 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAATTA 3070 het 2955 hom 24 10 10 4 A 7 8 55416 CASAVA_Build 1 178364615 1I TGAGACTGCT -/G GGTTCAAATT 3070 hom 72 het 33 0 22 11 G 2 3 55417 CASAVA_Build 1 178371003 1I CATCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 22 1 15 6 A 11 12 55418 CASAVA_Build 1 178383151 1I CCTGTCTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 10 11 55419 CASAVA_Build 1 178383824 2I ACAGATACTT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 44 13 17 14 CA 7 8 55420 CASAVA_Build 1 178386015 3I TCCCCAGAAA ---/TCT TCTCTGTGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TCT 1 2 55421 CASAVA_Build 1 178387048 1I CCAGTCCCTA -/G ATTAGTTCCC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 G 0 1 55422 CASAVA_Build 1 178407134 1I GGGGGACTGG -/T TTGCTGGGTG 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 2 3 55423 CASAVA_Build 1 178413641 5D GTTTTGGATA TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 39 22 13 6 TGTTT 3 2 55424 CASAVA_Build 1 178419133 1I AAGAAAGAAA -/C CCAAAAAGAC 3070 het 905 hom 21 4 16 1 C 2 3 55425 CASAVA_Build 1 178420253 7I GTGCAGACCC -------/TACAGCA TACAGCATCC 3070 het 3070 hom 67 25 29 13 TACAGCA 1 2 55426 CASAVA_Build 1 178426421 1D CAGGGAAGCT C/- CCTTGAATTG 3070 het 2576 hom 30 9 15 6 C 3 2 55427 CASAVA_Build 1 178441996 1I TCTAACTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2749 hom 34 10 14 10 T 12 13 55428 CASAVA_Build 1 178446099 9I TGATGAGTTC ---------/CAATTTTCA CAATTTTCAC 3070 het 3070 hom 55 16 29 10 CAATTTTCA 1 2 55429 CASAVA_Build 1 178450159 1D TTGTGTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 32 0 26 6 T 11 10 55430 CASAVA_Build 1 178450774 2I GCGCCCGGCC --/AA TATTGTGTAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 0 2 55431 CASAVA_Build 1 178460661 1I AGAGATCCCT -/G GCAAGGTTCT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 G 1 2 55432 CASAVA_Build 1 178472973 1D TTTACTCGGC G/- GGGGGGGCGG 1593 het 1025 hom 15 5 6 4 G 8 7 55433 CASAVA_Build 1 178478022 2D TGCATGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 1246 het 1246 ref 59 43 4 14 TG 7 6 55434 CASAVA_Build 1 178480673 4D GGGCATGAAG CCCT/---- CCCTGCACAG 3070 hom 90 het 34 0 22 14 CCCT 2 1 55435 CASAVA_Build 1 178481563 1I ATTTTTCCAA -/G TTTAAAAAGC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 0 1 55436 CASAVA_Build 1 178485627 6I TGCTCCCTAC ------/GTGTGA GTGTGTGTGC 3070 hom 92 het 42 0 30 13 GTGTGA 0 1 55437 CASAVA_Build 1 178488742 1D TTGGCTCTCC T/- TTTTTCCAAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 6 5 55438 CASAVA_Build 1 178504899 2D TAGAGTGTGT GG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 25 het 47 1 36 10 G 11 9 55439 CASAVA_Build 1 178511852 1I GGGAAGCTGT -/G GTTTGCTTCT 3070 hom 105 het 39 0 33 6 G 1 2 55440 CASAVA_Build 1 178512104 4D TAAGTTCAAT TAAG/---- TAAGTTCTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TAAG 2 1 55441 CASAVA_Build 1 178512596 1I41M4D TTTAAAAGGG -GGGGGGGCATCCTCCTCTGTGTAGCACTGTTTAAGATCACTGTAA/CGGGGGGGCATCCTCCTCTGTGTAGCACTGTTTAAGATCACT---- GTAAGTTGAC 3070 hom 47 het 20 0 15 13 N/A 0 0 55442 CASAVA_Build 1 178513636 1I AACTTTTTTT -/G GGGGGGGGGC 3070 het 458 hom 28 1 15 12 G 9 10 55443 CASAVA_Build 1 178514101 1D ACTGGCTCTC T/- TCTTTCTTGG 3070 hom 125 het 46 0 41 5 T 2 1 55444 CASAVA_Build 1 178516118 1I GAGAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 11 12 55445 CASAVA_Build 1 178522964 1D TTTGAGACCA C/- CCTGAGGAAC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 C 3 2 55446 CASAVA_Build 1 178531030 1D CATCCTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 24 2 14 8 T 17 16 55447 CASAVA_Build 1 178531274 1D AGATAATGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 113 het 45 0 40 6 T 10 9 55448 CASAVA_Build 1 178537166 5D ACATATTTTG TATGT/----- TATATGTCTT 3070 het 3070 ref 48 25 22 6 TATGT 1 0 55449 CASAVA_Build 1 178553925 1I ATCTCCGCCC -/G CCCCCCCCCA 2735 het 29 hom 16 1 10 5 G 0 1 55450 CASAVA_Build 1 178575302 1D GGTGGAAGGA G/- GGAGGGAGGG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 3 2 55451 CASAVA_Build 1 178579029 1D TATAAAAAAA G/- AGTTTATTCC 3070 het 3070 ref 28 13 14 1 G 1 0 55452 CASAVA_Build 1 178579699 16D GTAAATATAG TTGGCTTTCTTGATTT/---------------- TTGGCATTTT 3070 hom 99 het 33 0 34 1 TTGGCTTTCTTGATTT 1 0 55453 CASAVA_Build 1 178581295 1D TCAAATATTT A/- AAAAAACCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 7 6 55454 CASAVA_Build 1 178585026 1D TTTTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 2465 hom 15 het 8 0 5 3 T 12 11 55455 CASAVA_Build 1 178585338 1D TATAAAAAAA T/- AAATAAAATT 190 het 31 hom 8 1 3 4 T 1 0 55456 CASAVA_Build 1 178586182 3D ATATTTTCTA TTG/--- TTGTTACCGA 3070 hom 93 het 35 0 32 5 TTG 2 1 55457 CASAVA_Build 1 178587039 1D AGATATTACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 16 2 7 7 T 15 14 55458 CASAVA_Build 1 178591631 1D ATTGCTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 13 12 55459 CASAVA_Build 1 178594314 2I ACAGAAACCC --/AA CAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 2 55460 CASAVA_Build 1 178595455 11I TTCAGTGGGG -----------/TCCATCCTGGT TCCTAAGCCT 3070 hom 114 het 44 0 37 7 TCCATCCTGGT 0 1 55461 CASAVA_Build 1 178597229 3D AAATTTTATA GAC/--- ACTTTTTTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 GAC 1 0 55462 CASAVA_Build 1 178598568 1D AGCTAAACAT G/- GAAGGAAGTA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 G 2 1 55463 CASAVA_Build 1 178599444 18D CAATCAGAGT AAGCAGGAGCAGGAGCAG/------------------ GAGCAGGAGC 3070 hom 159 het 54 0 51 9 AAGCAGGAGCAGGAGCAG 1 0 55464 CASAVA_Build 1 178600477 1I CCAGATGATC -/T TTTAAATTCC 1856 hom 17 het 14 0 5 9 T 3 4 55465 CASAVA_Build 1 178610341 10I GTTTTCACAC ----------/CTGACTTTCG CTGACCTGCC 3070 hom 93 het 37 0 32 6 CTGACTTTCG 0 1 55466 CASAVA_Build 1 178611910 3D CTATCAGGGC AAA/--- AATTCTAAAA 3070 hom 138 het 55 0 47 8 A 5 2 55467 CASAVA_Build 1 178616035 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 78 het 34 0 27 8 AAAC 3 2 55468 CASAVA_Build 1 178616373 1I TTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 39 0 29 10 A 10 11 55469 CASAVA_Build 1 178622592 1I TGTTTGTAAC -/T TACTCATTGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 55470 CASAVA_Build 1 178623494 3D TAGGGTGGTA TTG/--- TTGTTGAAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 4 TTG 3 2 55471 CASAVA_Build 1 178623778 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 7 8 55472 CASAVA_Build 1 178623934 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 734 het 6 hom 9 0 4 5 A 17 16 55473 CASAVA_Build 1 178624360 1D CACAGATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 13 12 55474 CASAVA_Build 1 178627283 1D TGAACATATA C/- AAATGACCAA 3070 hom 126 het 46 0 43 4 C 1 0 55475 CASAVA_Build 1 178627652 2D ACACTGAAGG AA/-- AAAAAAGACA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 6 55476 CASAVA_Build 1 178628040 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTATGTATG 3070 hom 89 het 34 0 30 4 TA 0 1 55477 CASAVA_Build 1 178628660 5D CACTTAAAAC AAAAT/----- GTTTTTCTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AAAAT 1 0 55478 CASAVA_Build 1 178635662 1I ACAAGAGTTA -/C TACATAGTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 55479 CASAVA_Build 1 178641038 2I CAAATTGTAT --/TC TGTTAGGAGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TC 0 1 55480 CASAVA_Build 1 178653806 4I AAGTCTAATG ----/TTGA TTCTTTTTAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTGA 0 1 55481 CASAVA_Build 1 178665013 2I CCCTACCCCC --/AG AGCTCCTGGC 3070 hom 75 het 33 0 25 8 AG 1 2 55482 CASAVA_Build 1 178667964 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 492 hom 23 2 13 9 A 15 14 55483 CASAVA_Build 1 178678763 1I CCACTTTTTT -/C TTTTCCTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 0 1 55484 CASAVA_Build 1 178680482 1I GCAATTAAAT -/A AGAGTCCAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 55485 CASAVA_Build 1 178688459 1I GAGAAGATTC -/A AATAGACACA 2962 hom 18 het 7 0 7 0 A 2 3 55486 CASAVA_Build 1 178693244 4D AGTAGGGATC ACTA/---- ACCTACAAGA 3070 hom 108 het 38 0 37 3 ACTA 1 0 55487 CASAVA_Build 1 178703589 1I TCCATTTAGA -/T TGTTTCTAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 2 55488 CASAVA_Build 1 178707243 2I AAACATACCT --/GA GACTGGGGAG 3070 hom 51 het 22 0 16 6 GA 1 2 55489 CASAVA_Build 1 178716038 1I GAGGCATTGC -/A AACAGCCTAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 3 55490 CASAVA_Build 1 178716788 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1633 hom 36 8 18 10 A 11 12 55491 CASAVA_Build 1 178717004 1I TTGTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 18 8 T 12 13 55492 CASAVA_Build 1 178737099 3D ATTGCATCAC ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 ATT 7 6 55493 CASAVA_Build 1 178742399 2D AATTTAAAAA AC/-- ACAGATAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AC 2 1 55494 CASAVA_Build 1 178749957 1D TTTGTGAAAT C/- CTGTATAATG 3070 hom 57 het 25 0 20 7 C 2 1 55495 CASAVA_Build 1 178756868 3I GCAACAACAG ---/CAA CAACAACAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 CAA 3 4 55496 CASAVA_Build 1 178758428 1I ACTGAATCCC -/T ATTGCTTGGC 3070 hom 154 het 57 0 52 5 T 0 1 55497 CASAVA_Build 1 178777029 1D CCAGCCCCTG A/- AAATCTCCCA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 4 3 55498 CASAVA_Build 1 178784602 1D CCTGTAATTC T/- TTTTTTTTTT 2126 het 2126 ref 31 21 5 5 T 12 11 55499 CASAVA_Build 1 178793450 1I AATGTCAATA -/T TTTTCTGGAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 4 5 55500 CASAVA_Build 1 178826180 2D ATCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 14 12 55501 CASAVA_Build 1 178826508 1D AGAAAAGCAC A/- AAAAAAGTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 7 6 55502 CASAVA_Build 1 178834356 1I GACAGCTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 27 1 22 4 A 10 11 55503 CASAVA_Build 1 178840461 1D CCTGTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 31 6 15 11 A 13 12 55504 CASAVA_Build 1 178844735 1I ATTATTAAGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2529 hom 19 6 10 3 T 8 9 55505 CASAVA_Build 1 178866765 6I AGGGGGCTGA ------/GGTGGG GGTGGGAGGA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 GGTGGG 1 2 55506 CASAVA_Build 1 178866858 1I AAGCGAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1175 hom 38 3 25 10 A 11 12 55507 CASAVA_Build 1 178885940 4I AGGAAAGAAG ----/ATAA ATGTATATAG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 ATAA 0 1 55508 CASAVA_Build 1 178895561 3D CAGGCGTGAG CCA/--- CCACGCCCAG 3070 het 2257 hom 21 9 9 3 CCA 2 1 55509 CASAVA_Build 1 178944344 1D TGCAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 1365 het 1365 ref 39 33 3 3 T 11 10 55510 CASAVA_Build 1 178949805 1I TTTAGGTTAT -/C TGTTTTTTCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 55511 CASAVA_Build 1 178950017 3I TCTCATCCTT ---/CTC CTCTAGCATC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 CTC 1 2 55512 CASAVA_Build 1 178961062 1I ATAGTGTGAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 8 9 55513 CASAVA_Build 1 178962465 4I TCTATTAACC ----/CAGA CAGACATCAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CAGA 1 2 55514 CASAVA_Build 1 178966589 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 38 0 27 11 T 11 12 55515 CASAVA_Build 1 178976887 1I TTGTTAAATG -/T TTGGTTGATC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 2 3 55516 CASAVA_Build 1 178989314 1D CCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1792 het 1792 ref 24 14 4 6 A 15 14 55517 CASAVA_Build 1 178998650 1I ATCTTTACAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 7 8 55518 CASAVA_Build 1 179007042 1D TTTGAATTGG T/- TTTTTTTTTA 1383 het 1383 ref 33 27 3 3 T 10 9 55519 CASAVA_Build 1 179009479 1D AGATGGCATG T/- TTTCTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 4 3 55520 CASAVA_Build 1 179011564 1I AGAGTGCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 9 10 55521 CASAVA_Build 1 179011962 4I ATTTTCAATA ----/ATAG ATCACCATGT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 ATAG 0 1 55522 CASAVA_Build 1 179014972 1I TCTTACACTC -/T TATCTCATCA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 1 2 55523 CASAVA_Build 1 179017905 1I CTGTTTTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 T 8 9 55524 CASAVA_Build 1 179023741 1I ACTTAAGAGG -/T ATTTTCTTGA 3070 hom 108 het 44 0 36 8 T 0 1 55525 CASAVA_Build 1 179048794 1D TACTAGTGTC T/- TTTTTCCCCC 3070 het 1639 hom 31 13 12 6 T 6 5 55526 CASAVA_Build 1 179053765 1D GATATAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 12 11 55527 CASAVA_Build 1 179054939 2D TCTTGAACTC TT/-- TGCCTCCAGT 3070 het 3070 ref 40 22 11 9 T 3 1 55528 CASAVA_Build 1 179056766 1D TATTCCTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 11 10 55529 CASAVA_Build 1 179065746 2I GTAATGATAG --/TC TCTGTCTCAT 3070 het 3070 hom 32 16 16 0 TC 1 2 55530 CASAVA_Build 1 179066727 1D ATGCTTGCAT A/- AAGCCTTGAG 3070 hom 131 het 52 0 43 9 A 3 2 55531 CASAVA_Build 1 179069264 1I AATGTAAAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 9 10 55532 CASAVA_Build 1 179081522 9I TTCCAAAGCT ---------/GGGATTGCA GACCTGAGCC 3070 hom 108 het 37 0 35 3 GGGATTGCA 0 1 55533 CASAVA_Build 1 179094827 51I TTCAAACCAG ---------------------------------------------------/TAAATTATTACCAGAAGAGAAAGGTTTTAGGTGAAAAGAAAACCATTCCAT TTCTCTTTTC 3070 hom 78 het 23 0 27 4 TAAATTATTACCAGAAGAGAAAGGTTTTAGGTGAAAAGAAAACCATTCCAT 0 1 55534 CASAVA_Build 1 179102300 1I CACATTGGTC -/A ATGGTGAATA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 A 1 2 55535 CASAVA_Build 1 179102571 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1822 het 64 hom 9 1 6 2 T 13 12 55536 CASAVA_Build 1 179116593 3D TTAAATACCT ACA/--- ACAATATTTT 3070 het 3070 ref 48 22 23 5 ACA 2 1 55537 CASAVA_Build 1 179149916 1D TTTACTTCAA G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 100 het 41 0 30 12 G 10 9 55538 CASAVA_Build 1 179153225 2D GCCCTCTGGT GG/-- GGCAAGCAGA 3070 het 3070 hom 40 12 16 12 G 4 2 55539 CASAVA_Build 1 179164416 3D TCTAGCCAAA TGC/--- TGCTGCTGCT 3070 hom 114 het 47 0 38 9 TGC 4 3 55540 CASAVA_Build 1 179164568 1D CTGGATCCCT G/- GGGGGATGGA 3070 hom 150 het 53 0 49 4 G 6 5 55541 CASAVA_Build 1 179168134 1I CTTTCTCCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 9 10 55542 CASAVA_Build 1 179168523 6D2M8D CTTGCTCTGT ATGGAGTGTAGCAGCA/------TG-------- CTCAGTATGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 N/A 0 0 55543 CASAVA_Build 1 179178794 9I TGGGTTTTTT ---------/GTTTGTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 38 0 31 7 GTTTGTTTG 0 1 55544 CASAVA_Build 1 179181868 1D ATCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 11 10 55545 CASAVA_Build 1 179198264 6D CTTTCTTCCT CTTCCC/------ CTTCCCCTCA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 CTTCCC 2 1 55546 CASAVA_Build 1 179199900 1D13M1D TGATGAGCTT AAAAAAAAAATCACA/-AAAAAAAAATCAC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 10 N/A 0 0 55547 CASAVA_Build 1 179201385 2D CTGGGCTTGC GT/-- GTGTGTTCCA 3070 hom 86 het 33 0 26 8 GT 4 3 55548 CASAVA_Build 1 179206346 2I CATCGTGCAC --/AT GTTTTGAAGT 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 AT 0 1 55549 CASAVA_Build 1 179211156 2I TCAGCTACTT --/AA AAACTCAATT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 3 5 55550 CASAVA_Build 1 179215618 4D CCAGTATGAA AACT/---- AACAGCTTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AACT 1 0 55551 CASAVA_Build 1 179216095 1I ATGGTCAAAA -/C CCCCAAACAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 4 5 55552 CASAVA_Build 1 179220904 1D AAATTTAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 10 9 55553 CASAVA_Build 1 179222084 2D TAATATAGCC AA/-- AATACTGTAA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 4 2 55554 CASAVA_Build 1 179223552 2D AATTTGTAAG TT/-- TTTTTTAAAA 1594 het 45 hom 24 1 10 14 T 8 6 55555 CASAVA_Build 1 179226320 1I TGGTGGGGGG -/A AAAGGGAGAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 3 4 55556 CASAVA_Build 1 179229624 1I AAAGCACGTG -/T TTCAAGGGCT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 2 3 55557 CASAVA_Build 1 179230702 1I26M1D TGCACAACCA -TATGTATCAAGAAATTTAAAAAAAAAT/TTATGTATCAAGAAATTTAAAAAAAAA- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 16 0 19 2 N/A 0 0 55558 CASAVA_Build 1 179232334 1I TTGAAAACAA -/T TTTTTTTTTT 1237 het 1237 ref 46 30 3 13 T 13 14 55559 CASAVA_Build 1 179250153 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 13 7 A 12 11 55560 CASAVA_Build 1 179260774 5D GTAATAACAG CTTCC/----- TTATAGAGTG 3070 hom 205 het 72 0 69 4 CTTCC 1 0 55561 CASAVA_Build 1 179269195 1I GAATCTTCTG -/T TAGGCCTTTC 3070 hom 153 het 56 0 46 10 T 1 2 55562 CASAVA_Build 1 179269964 1I ATTACACTCA -/G GACTCCAGGA 3070 hom 129 het 46 0 42 4 G 1 2 55563 CASAVA_Build 1 179270240 3I TTTATGTTTT ---/TCC TCCTCAACAC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 TCC 1 2 55564 CASAVA_Build 1 179279332 2I AAGTGGTGAC --/AT GTGCTTATAA 3070 hom 147 het 53 0 49 5 AT 0 1 55565 CASAVA_Build 1 179284294 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 9 9 A 13 14 55566 CASAVA_Build 1 179289141 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2907 het 2648 hom 31 11 10 11 A 16 15 55567 CASAVA_Build 1 179290458 1I TGAAAATATT -/A AAAAAAAAAA 1331 het 260 hom 9 2 5 2 A 13 14 55568 CASAVA_Build 1 179292880 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 A 11 10 55569 CASAVA_Build 1 179311772 3D CCCATACACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 575 hom 29 8 9 13 T 17 14 55570 CASAVA_Build 1 179314034 1I CAAACTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 A 10 11 55571 CASAVA_Build 1 179314916 1I CTACTTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2012 hom 20 6 9 5 T 12 13 55572 CASAVA_Build 1 179330472 1D CCTTGGGAGG A/- AAAAACATAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 6 5 55573 CASAVA_Build 1 179341953 2D TCTCTTGATG TC/-- TCTGCCTCTT 3070 het 3070 ref 45 22 16 9 TC 2 1 55574 CASAVA_Build 1 179345669 1D TCTGGTGAGC T/- TGAAGGACTC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 2 1 55575 CASAVA_Build 1 179359668 1I AGGCTGAGGT -/G GGAGGATCAC 3070 het 1515 hom 19 4 13 2 G 2 3 55576 CASAVA_Build 1 179371625 1I CATAAAAACT -/A ACAGCTCAAA 3070 hom 98 het 41 0 29 12 A 1 2 55577 CASAVA_Build 1 179372219 2I ACACACAGAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 13 23 10 AC 5 6 55578 CASAVA_Build 1 179388233 11I TAAGCTAGTG -----------/TAGCAGCTTAA TAGCAGGCAC 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 TAGCAGCTTAA 0 1 55579 CASAVA_Build 1 179393936 1D TAATGCAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1499 hom 38 7 19 12 A 13 12 55580 CASAVA_Build 1 179393953 5D AAAAAAGGAA GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 540 hom 30 4 11 18 GTTTT 4 3 55581 CASAVA_Build 1 179399643 1D18M1D ATCAGTGTTC TTTTTTTTTGTAGATAATCT/-TTTTGTTTGTAGATAATC- TTTTTTTCCC 3070 hom 108 het 39 0 35 6 N/A 0 0 55582 CASAVA_Build 1 179404823 31D TCTACGGCAC TCATTAGTAGCTGTGTTTCTTTTTTCAAATA/------------------------------- TAACCTTTAT 3070 het 3070 ref 30 26 11 5 TCATTAGTAGCTGTGTTTCTTTTTTCAAATA 1 0 55583 CASAVA_Build 1 179409350 2D TTTCTGGGGA AG/-- AGAGGAAGCA 3070 het 3070 hom 42 17 24 3 AG 3 2 55584 CASAVA_Build 1 179445249 2D GCCTCATGGG TC/-- TCTGTTTCTT 3070 hom 99 het 37 0 33 6 TC 2 1 55585 CASAVA_Build 1 179453265 8I TTTCATTTGC --------/GTAGTGGG GTAATCCATT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 GTAGTGGG 0 1 55586 CASAVA_Build 1 179455925 5D AGTCTCTGCC CTCCA/----- CTTCTCTCAC 3070 het 3070 ref 37 22 12 6 CTCCA 1 0 55587 CASAVA_Build 1 179458807 1D CCCTTCCACC T/- TTCAGTAAGG 3070 het 3070 hom 53 17 22 14 T 3 2 55588 CASAVA_Build 1 179471992 3D AGTTATGTAA CCT/--- CCTCTCTGTT 3070 het 3070 ref 43 22 15 10 CCT 2 1 55589 CASAVA_Build 1 179480292 1D CTTCCTAATT C/- CTTGACTACA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 C 2 1 55590 CASAVA_Build 1 179493818 1I TGAATTCTGA -/G GGGGTAGGAG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 4 5 55591 CASAVA_Build 1 179548990 1I TTTGTGTGTG -/T GGGGGGGTGG 3070 het 1530 hom 16 5 8 3 T 0 1 55592 CASAVA_Build 1 179564833 4D TTTCCTCCAG CTTT/---- CTTTGTCTTG 3070 het 3070 ref 51 26 23 2 CTTT 2 1 55593 CASAVA_Build 1 179572690 2I ATATAATGTC --/TT ATATCTATTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 0 2 55594 CASAVA_Build 1 179575427 1I AAACATTTTT -/G GTTCTTGACT 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 G 1 2 55595 CASAVA_Build 1 179584365 1D TGTGTTGGGT G/- GGTGTATTGT 3070 het 3070 ref 52 26 22 5 G 3 2 55596 CASAVA_Build 1 179588669 1I AGAGGAGCAG -/A TGGGCCGGCT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 A 0 1 55597 CASAVA_Build 1 179593388 3D CAAAAGAAAA CCT/--- CCTCCTTGCT 3070 het 3070 ref 39 16 17 8 CCT 3 2 55598 CASAVA_Build 1 179599411 9D CAAGGGTGGT TGACATGGA/--------- CCCTGTCCAT 3070 het 3070 ref 54 28 19 12 TGACATGGA 1 0 55599 CASAVA_Build 1 179610222 1D ATCCCAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 10 9 55600 CASAVA_Build 1 179610365 2I GGGACTGTAG --/GT GTATGTACCA 3070 hom 81 het 37 0 28 10 GT 1 2 55601 CASAVA_Build 1 179612605 1I GGAAACTGGC -/A ACTGGAGTTT 3070 hom 117 het 41 0 38 3 A 1 2 55602 CASAVA_Build 1 179624923 2I CTTACGTAAC --/AT GTGTATTTTC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 AT 0 1 55603 CASAVA_Build 1 179654959 3I GCATGATTTC ---/CAT CATCTTCTCC 3070 hom 92 het 34 0 31 3 CAT 1 2 55604 CASAVA_Build 1 179661255 1D TTTTTGGCTG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 18 7 10 1 A 7 6 55605 CASAVA_Build 1 179662158 1D CCGCTTCCCA T/- CTCAGCCACT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 T 1 0 55606 CASAVA_Build 1 179670154 1I TACTGGCCAA -/T TTTTTTTTTT 2674 het 1065 hom 21 4 9 8 T 14 15 55607 CASAVA_Build 1 179671701 6I TGATGACTCA ------/CAGATT CAGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 30 21 8 1 CAGATT 0 1 55608 CASAVA_Build 1 179672519 4D CATTTTAGTT AGAC/---- AGGAGGAATG 3070 het 3070 ref 43 20 19 6 AGAC 1 0 55609 CASAVA_Build 1 179675190 2D TAGACTCTAC CT/-- TTTTTCTGCT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 CT 1 0 55610 CASAVA_Build 1 179676180 1I CTTCTGGGCA -/G GGGTGGCCCA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 G 3 4 55611 CASAVA_Build 1 179700099 1D TCGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 1129 het 1129 ref 43 32 3 9 T 10 9 55612 CASAVA_Build 1 179702307 5I ACTCTGTCTT -----/AAACA AAACAAAACA 3070 hom 72 het 33 0 24 9 AAACA 2 3 55613 CASAVA_Build 1 179758889 3D ACCTCCAGTC CTT/--- CTTCTCCAAT 3070 het 3070 hom 53 23 22 9 CTT 2 1 55614 CASAVA_Build 1 179762172 1D ATGGTCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 13 14 T 17 16 55615 CASAVA_Build 1 179769372 2D TAGAACTAAC TT/-- GTCAAAATCT 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 T 2 0 55616 CASAVA_Build 1 179771167 1I TTCTGACTTT -/A TAAAAATTCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 0 1 55617 CASAVA_Build 1 179778024 1D ATTCCCCACA T/- TGCTAATTAC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 2 1 55618 CASAVA_Build 1 179778768 1D TAGTCCATTG T/- TTCCTAAACT 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 T 3 2 55619 CASAVA_Build 1 179780160 1I TGAATATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 11 12 55620 CASAVA_Build 1 179783880 9I CCATAACACT ---------/TTTTTTTTC TTTTTTTTCT 3070 hom 23 het 19 0 13 7 TTTTTTTTC 1 2 55621 CASAVA_Build 1 179796041 1I TTTCCATTGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 8 9 55622 CASAVA_Build 1 179800647 1D GAAAGGAATC T/- TTTTTTTTTT 1289 het 1289 ref 41 28 3 11 T 13 12 55623 CASAVA_Build 1 179801656 4D GGTACCTGCG GAGA/---- GAAAGTGTGT 3070 het 3070 hom 37 11 21 9 GA 3 1 55624 CASAVA_Build 1 179820780 1D TCCCCCCCCC T/- GCCTCAAACA 3070 het 3070 hom 41 14 16 12 T 1 0 55625 CASAVA_Build 1 179821805 1I GCAAGGATAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 8 9 55626 CASAVA_Build 1 179847162 1D TAAGTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2941 hom 43 11 14 19 T 13 12 55627 CASAVA_Build 1 179865879 1D GGATGGGAAT G/- GGGGGAGGGT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 G 6 5 55628 CASAVA_Build 1 179867151 1D TGCCTGTATA T/- CATCTGCTAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 7 T 1 0 55629 CASAVA_Build 1 179885139 1I GTGTAGGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 A 11 12 55630 CASAVA_Build 1 179908982 8D TATATGAGTA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 27 20 7 TG 10 6 55631 CASAVA_Build 1 179931977 1D AACATATATC T/- TTTTTTTTTT 1359 het 1359 ref 34 21 4 9 T 13 12 55632 CASAVA_Build 1 179982519 1D AGTACTTGGT C/- CTTTTACTGT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 C 2 1 55633 CASAVA_Build 1 179982914 6I GAGGCAAGAG ------/ATTCCT ATTCCTTCAG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 ATTCCT 1 2 55634 CASAVA_Build 1 179990074 2D ACAAGGGTGC CT/-- GTCACTTACA 3070 het 3070 ref 54 28 24 2 CT 1 0 55635 CASAVA_Build 1 180011423 1D ATGGTTGAGG A/- AAGAAAACAA 3070 het 3070 ref 51 26 16 9 A 3 2 55636 CASAVA_Build 1 180019547 5D GCCAAAGGTA AGCTT/----- AGCTTAGGAA 3070 het 3070 hom 46 22 21 8 AGCTT 2 1 55637 CASAVA_Build 1 180024794 1D TGCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 45 21 17 8 T 8 7 55638 CASAVA_Build 1 180028436 4I TGGGCAATGC ----/CCTA CCTGTTTTTA 3070 het 3070 hom 53 20 29 4 CCTA 0 1 55639 CASAVA_Build 1 180035571 2I GATTAAAAAC --/AG AGTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 AG 1 2 55640 CASAVA_Build 1 180037722 4I AGGTTTGCAT ----/TTAG TTAGTTACCC 3070 het 3070 hom 53 18 25 10 TTAG 1 2 55641 CASAVA_Build 1 180042702 1I GAGGAATTCA -/G GAGGCTTTCA 3070 hom 97 het 36 0 31 5 G 1 2 55642 CASAVA_Build 1 180056352 2I GAATACTTGT --/AA AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 A 7 9 55643 CASAVA_Build 1 180056993 1I TGGAAATAAG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 T 6 7 55644 CASAVA_Build 1 180061253 1D AAGGGAAATT A/- AAATGTATTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 4 3 55645 CASAVA_Build 1 180069764 7D45M1I TAAATGTCTA ATGTTGCATGTAGAGGAACTAAAAAAGTAAAAACTAAACTGAAGATTAATGG-/-------ATGTAGAGGAACTAAAAAAGTAAAAACTAAACTGAAGATTAATGGA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 19 9 8 N/A 0 0 55646 CASAVA_Build 1 180072134 1I GTGCTGGTAT -/G CATAGCTAAG 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 G 0 1 55647 CASAVA_Build 1 180078081 1D TTTTTTGGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 23 10 10 6 T 7 6 55648 CASAVA_Build 1 180078695 1I TGTTCATAAA -/T AAACCATAAA 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 T 0 1 55649 CASAVA_Build 1 180078854 1I ACCTCTGGTA -/T GTCCCTATAC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 0 1 55650 CASAVA_Build 1 180079889 6I TTTCATTAAT ------/TGACTG TGAAAAATAA 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 TGACTG 0 1 55651 CASAVA_Build 1 180082086 1D AAACACACTG T/- TTCTATTTGC 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 T 3 2 55652 CASAVA_Build 1 180087180 1D AGATGGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2540 hom 36 11 21 4 A 16 15 55653 CASAVA_Build 1 180090954 1D AGAATAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2480 hom 25 9 13 3 A 10 9 55654 CASAVA_Build 1 180140923 4D GCCATCGGCA TCTC/---- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 40 20 10 11 TC 6 4 55655 CASAVA_Build 1 180156155 1I ACTCCATCTC -/A AAAAATTAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 5 6 55656 CASAVA_Build 1 180187500 1D CTGTTAGACA T/- TTTCTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 T 4 3 55657 CASAVA_Build 1 180209638 1D CCTGAAACAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 9 8 55658 CASAVA_Build 1 180233479 1D TATTTAGCAG A/- TGTAATCCAG 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 1 0 55659 CASAVA_Build 1 180286203 1D CATACATTAA T/- TTACTTATCT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 3 2 55660 CASAVA_Build 1 180319037 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 A 8 9 55661 CASAVA_Build 1 180319194 2I TTGTCTCAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 43 16 17 11 AT 6 7 55662 CASAVA_Build 1 180321033 4D CCAACGTGGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1531 hom 32 5 17 10 TTTG 3 2 55663 CASAVA_Build 1 180324923 5D CCTCTTCCTC CCTTT/----- CCTTAACATC 3070 het 3070 hom 42 20 20 4 CCTTT 1 0 55664 CASAVA_Build 1 180328829 1D CTACTTCACA G/- GGTTGTTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 3 2 55665 CASAVA_Build 1 180340634 1I AGTCAGCTCT -/A AAGTCTTACT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 2 3 55666 CASAVA_Build 1 180340757 3D TTTTATTTGC CTG/--- CTGATACTCT 3070 het 3070 ref 28 14 9 6 CTG 2 1 55667 CASAVA_Build 1 180346881 1D TGCCAGATCG T/- TAAGTGGAGG 2841 het 2841 ref 40 23 10 7 T 2 1 55668 CASAVA_Build 1 180354070 5I GGCTGACCAG -----/TCTTT TTACTCTGTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 TCTTT 0 1 55669 CASAVA_Build 1 180356078 1D ATGCAGAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 A 9 8 55670 CASAVA_Build 1 180363327 1D AGATTACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 A 11 10 55671 CASAVA_Build 1 180367285 1D ACAAACAAAC A/- AACAAAAAAA 3070 het 2876 hom 21 9 9 3 A 3 2 55672 CASAVA_Build 1 180368844 5D GTGTCTCTTT TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 TTTTC 3 2 55673 CASAVA_Build 1 180369390 1D ATATATAGAC A/- TCTAGAAAAC 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 A 1 0 55674 CASAVA_Build 1 180375765 5D TTTTCTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1483 het 561 hom 20 4 6 10 T 21 16 55675 CASAVA_Build 1 180378287 4D TGGTCCCAAC TGTG/---- TGTGTGCCTC 3070 hom 82 het 30 0 27 7 TG 5 3 55676 CASAVA_Build 1 180392758 1I CCATGGTACA -/T TTTGCTAAAA 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 T 3 4 55677 CASAVA_Build 1 180407730 2I TGTATGAAAC --/AT ATGATGTGCT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AT 1 2 55678 CASAVA_Build 1 180410912 1D GGCCTTATCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 9 8 55679 CASAVA_Build 1 180412243 1I AAAAAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 22 0 13 9 T 10 11 55680 CASAVA_Build 1 180413702 3D GAGTCAGGAG TAC/--- TACTCTTGTC 3070 het 3070 ref 35 18 14 6 TAC 2 1 55681 CASAVA_Build 1 180414123 1D TTTTTTAGTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 9 8 55682 CASAVA_Build 1 180421621 1I CATAGTGGAA -/G GGCACAGGGG 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 G 2 3 55683 CASAVA_Build 1 180424978 1I TCTTCTCAAA -/G GGTTGATACC 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 G 2 3 55684 CASAVA_Build 1 180430323 1D CAAAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2820 hom 23 9 11 4 A 13 12 55685 CASAVA_Build 1 180436891 1D AAATTAAAAA T/- ATTCTCTCCT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 1 0 55686 CASAVA_Build 1 180439390 10I ATCTGGGGAT ----------/TCCCTACACA TCCCTTTGTG 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 TCCCTACACA 0 1 55687 CASAVA_Build 1 180440946 6D CACCTGAACA CTCATG/------ CTATAATTTA 3070 het 3070 hom 31 15 15 4 CTCATG 1 0 55688 CASAVA_Build 1 180450124 1D CAGAACAATA T/- TTTAAGCACA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 4 3 55689 CASAVA_Build 1 180450993 2I TATATCTATC --/TA TATATATATA 1564 het 260 hom 28 3 15 11 TA 6 7 55690 CASAVA_Build 1 180451772 4I CAAGATTTAA ----/TTGG TTGGTTGATA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 TTGG 1 2 55691 CASAVA_Build 1 180453745 1I ATATAATTTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 8 9 55692 CASAVA_Build 1 180463277 5D ACTTCAAGCA ATTTT/----- ATTTTATACT 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 ATTTT 2 1 55693 CASAVA_Build 1 180471273 3D TGCAGAAAAA CCT/--- CCTATTTCCC 3070 het 3070 hom 43 17 19 8 CCT 2 1 55694 CASAVA_Build 1 180475016 3D TCCAGAAAAT TTG/--- TTATTTTCTG 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 TTG 1 0 55695 CASAVA_Build 1 180492963 1D TTTTTCGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 218 hom 34 2 24 9 T 12 11 55696 CASAVA_Build 1 180493872 4D TCAGAATAAT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2888 het 2888 ref 27 10 10 7 TTTC 4 3 55697 CASAVA_Build 1 180493917 24D33M2D CCCTTCCCAC CCCTTCCCTTTTTCTTCCTTCCTTCCCTTCCCTTTTTCTTTCTTCCTTCCTCTTTTCTT/------------------------CCCTTCCCTTTTTCTTTCTTCCTTCCTCTTTTC-- TCTTTCTCTT 2699 het 2261 hom 13 6 7 9 N/A 0 0 55698 CASAVA_Build 1 180496907 1D ATTTACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 T 15 14 55699 CASAVA_Build 1 180500754 1D TATAAAATGA T/- TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 43 34 3 6 T 11 10 55700 CASAVA_Build 1 180516759 1D TTGTTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 19 11 T 12 11 55701 CASAVA_Build 1 180521350 1I AAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2889 hom 26 8 15 3 A 9 10 55702 CASAVA_Build 1 180521701 1D GTGATGCCTG T/- GAATAGCCTC 3070 het 3070 ref 47 21 18 9 T 1 0 55703 CASAVA_Build 1 180521947 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1697 hom 10 het 4 0 4 0 A 12 11 55704 CASAVA_Build 1 180525822 2D TCTTTTCTGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 47 hom 38 2 20 17 TC 9 8 55705 CASAVA_Build 1 180526931 3I AATGGATACA ---/GGG GAAAGGAAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 4 55706 CASAVA_Build 1 180528818 1I AAGTGGCATT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 7 8 55707 CASAVA_Build 1 180529178 7I CAGCCCATCC -------/CAGCCCT CAGTGACCTC 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 CAGCCCT 0 1 55708 CASAVA_Build 1 180529595 2D ACACCCATCT AA/-- AATGCAGATA 3070 het 3070 hom 41 20 20 2 A 4 2 55709 CASAVA_Build 1 180530166 1D CCTTCAAGCC A/- CCTCCAAAGA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 1 0 55710 CASAVA_Build 1 180530873 1D AAGTGCCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 101 het 38 0 34 5 A 10 9 55711 CASAVA_Build 1 180531256 6I AAAAAAGAAA ------/AGAGAG AGAGAGAAGA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 AG 3 6 55712 CASAVA_Build 1 180534073 4D GTATGTGTGA GTGT/---- GTGTGTGTGT 930 het 930 ref 48 23 8 19 GT 7 5 55713 CASAVA_Build 1 180534746 1D CAAAAAATAC A/- AAAAATTAGT 3070 het 2360 hom 15 5 8 2 A 6 5 55714 CASAVA_Build 1 180536970 4D GTAGAATAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 50 18 21 12 AAAG 5 4 55715 CASAVA_Build 1 180539430 1D CAAGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2774 hom 35 9 18 8 A 13 12 55716 CASAVA_Build 1 180556997 1D TCTTAGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 T 12 11 55717 CASAVA_Build 1 180557546 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3052 het 326 hom 16 1 11 4 A 14 15 55718 CASAVA_Build 1 180559946 1I CTACTTCCAG -/C CTGGGCAACA 2224 het 2224 ref 19 9 6 4 C 1 2 55719 CASAVA_Build 1 180565055 1D AAGGGAAAGA C/- CCCCCCGCCC 3070 hom 56 het 22 0 18 4 C 7 6 55720 CASAVA_Build 1 180577954 1I CCAATGGGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 42 25 9 8 A 8 9 55721 CASAVA_Build 1 180580200 1D ATTTGTTTTG T/- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 4 3 55722 CASAVA_Build 1 180580694 1D AGGGGAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 1 0 55723 CASAVA_Build 1 180582621 2D GATATTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 17 11 T 12 10 55724 CASAVA_Build 1 180589265 1I TGCTCCCAGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 7 8 55725 CASAVA_Build 1 180593356 1I AAGTGTTTGG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 54 22 23 9 A 8 9 55726 CASAVA_Build 1 180593707 2I ATGTGCCAGC --/CA CCAGAAGGAG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 CA 0 1 55727 CASAVA_Build 1 180607271 11D TTTCTTTCTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 3070 het 1679 hom 28 9 16 3 T 20 9 55728 CASAVA_Build 1 180609738 1I AACTCTGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 20 0 18 4 A 15 16 55729 CASAVA_Build 1 180618254 6I TTTGTTTCTT ------/AAATGA ATCACTGAGA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AAATGA 0 1 55730 CASAVA_Build 1 180620798 2D TCACCATGAC AT/-- ATGTCACAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AT 2 1 55731 CASAVA_Build 1 180625164 4D TTACAATATA TTTT/---- TTTAGAAGGC 3070 hom 131 het 47 0 42 7 T 7 3 55732 CASAVA_Build 1 180625312 2D CTACAAGACT TG/-- TCAAGTAATT 3070 hom 120 het 48 0 41 8 TG 1 0 55733 CASAVA_Build 1 180625988 3D GTCGGAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 18 9 8 A 12 9 55734 CASAVA_Build 1 180638348 4I TACCACATTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 105 het 45 0 36 9 TTTG 3 4 55735 CASAVA_Build 1 180643804 1D AGTCTCCCCC A/- ACGCCTGTCT 3070 het 3070 ref 42 23 12 8 A 2 1 55736 CASAVA_Build 1 180679537 1D GCTCCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 24 1 17 6 T 12 11 55737 CASAVA_Build 1 180687225 12D ATGACTATTA ATTTGTGAGCTG/------------ ACTGTGCTTA 3070 het 3070 ref 56 33 18 7 ATTTGTGAGCTG 1 0 55738 CASAVA_Build 1 180691350 2D AAAAAGAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 A 11 9 55739 CASAVA_Build 1 180697539 15D AACCAGAAGA TAGGACAGTAGAAAC/--------------- TATTAAATCT 2370 het 2370 ref 21 15 7 2 TAGGACAGTAGAAAC 1 0 55740 CASAVA_Build 1 180704931 1D TGGGCTTCAT A/- AAAAATCAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 6 5 55741 CASAVA_Build 1 180732647 4D ATTCTAGAAC CTTT/---- CTTTACTGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 CTTT 2 1 55742 CASAVA_Build 1 180737025 4I TCTCTTTCTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TCTT 3 4 55743 CASAVA_Build 1 180741141 1I GATTGGTGGT -/G GGGGGTATGT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 5 6 55744 CASAVA_Build 1 180742271 1D ACACTTCCTG C/- TTTATAGTCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 1 0 55745 CASAVA_Build 1 180749841 1D TGGAGAGATA G/- GGTTTCACCA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 G 3 2 55746 CASAVA_Build 1 180752468 3I AAAGAATAAA ---/AAC AAGGAAAATA 3070 hom 75 het 36 0 26 10 AAC 0 1 55747 CASAVA_Build 1 180753205 1I AATTATTATT -/G TTTTTTTAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 0 1 55748 CASAVA_Build 1 180753830 2D CAGAGTTTTG CT/-- CTGTCACCCA 3070 hom 87 het 30 0 29 1 CT 2 1 55749 CASAVA_Build 1 180755011 1D CATCTGGAAA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 8 7 55750 CASAVA_Build 1 180755253 1I TTCTTTTTTT -/C CCCTTGTTTC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 C 3 4 55751 CASAVA_Build 1 180758785 1I14M2I AAACATTTTC -TTTTTTTTAATTAA--/TTTTTTTTTAATTAATT TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 20 0 19 4 N/A 0 0 55752 CASAVA_Build 1 180760050 2D GAAATGAGAG TA/-- TATAAGGAGT 3070 hom 75 het 31 0 26 7 TA 3 2 55753 CASAVA_Build 1 180761619 1D TATTGACCAC G/- GGGAAAAAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 4 3 55754 CASAVA_Build 1 180774286 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 11 19 13 A 14 15 55755 CASAVA_Build 1 180775339 1I TTTTCTGAAA -/C CCAGCCAGAT 3070 het 3070 ref 60 28 24 8 C 2 3 55756 CASAVA_Build 1 180778336 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 9 8 55757 CASAVA_Build 1 180780357 1I GGTATTGAAA -/T TTCCTGCTAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 2 3 55758 CASAVA_Build 1 180782106 1D TTTGTATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 12 11 55759 CASAVA_Build 1 180783142 1I TAAAGGATGT -/A GGGGGAGGTA 3070 hom 87 het 42 0 24 18 A 0 1 55760 CASAVA_Build 1 180783619 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 7 7 A 10 9 55761 CASAVA_Build 1 180786986 2D CACCACGACT CA/-- CAGCCCCATT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 CA 2 1 55762 CASAVA_Build 1 180787496 2D ATATGCATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 157 het 62 0 53 10 AT 6 5 55763 CASAVA_Build 1 180803388 6D TCTAAATATT TAACTC/------ TAAGGAATTA 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 TAACTC 1 0 55764 CASAVA_Build 1 180830022 4I AGAAAGAAAG ----/AAGA AAGAAAGAAA 1907 het 6 hom 21 1 13 7 AAGA 2 3 55765 CASAVA_Build 1 180890469 1I AGAATGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 10 11 55766 CASAVA_Build 1 180891576 3D TTCCATCCTT CTC/--- CTCATCAATG 3070 hom 117 het 48 0 40 9 CTC 2 1 55767 CASAVA_Build 1 180895576 1D AGGGACTCAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 55768 CASAVA_Build 1 180930855 1I GAATCACTGG -/C CTACATCATT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 1 2 55769 CASAVA_Build 1 180978800 1I AAACACCCAC -/A AGGCCTTGGA 3070 het 3070 ref 65 36 28 1 A 1 2 55770 CASAVA_Build 1 180981110 1I CATGAGAACC -/A AACTGTTTTC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 2 3 55771 CASAVA_Build 1 180987386 5D TCTAACCAAC AACTT/----- AAGATCAATG 3070 het 3070 ref 33 22 11 2 AACTT 1 0 55772 CASAVA_Build 1 180989697 1D CTTCAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 26 0 23 5 A 12 11 55773 CASAVA_Build 1 180996635 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 498 hom 25 2 16 7 T 1 0 55774 CASAVA_Build 1 181005409 1D TCATTTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 10 18 T 13 12 55775 CASAVA_Build 1 181011061 1D GTCCCCCCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 7 A 12 11 55776 CASAVA_Build 1 181011896 1D ATAAACAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 12 11 55777 CASAVA_Build 1 181085706 1I TTGCCATATC -/A AAAAAAACTG 3070 hom 40 het 24 0 19 5 A 7 8 55778 CASAVA_Build 1 181148286 1D GTAATATCAA T/- TTTTTTTTTT 1822 het 1822 ref 29 16 4 9 T 13 12 55779 CASAVA_Build 1 181167007 1D ATTCATACAC T/- TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 36 28 3 7 T 11 10 55780 CASAVA_Build 1 181177691 1D TTCACCTCTT A/- AAAAAAAGCA 1916 het 1916 ref 23 15 4 4 A 8 7 55781 CASAVA_Build 1 181232960 1D CCTACTGGCA T/- TTTTATATGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 T 5 4 55782 CASAVA_Build 1 181233460 4I GGGGATTGTG ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 46 11 19 16 TGTT 3 4 55783 CASAVA_Build 1 181234095 5I ATCATTCCAG -----/GCAAA GCAGGTAACC 3070 het 3070 hom 56 19 24 13 GCAAA 0 1 55784 CASAVA_Build 1 181237098 1I CTCAAATGGC -/A TTTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 0 1 55785 CASAVA_Build 1 181241503 1I TATGTGTGCA -/G GTGTCTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 1 2 55786 CASAVA_Build 1 181243660 1I CCAAGATTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 T 9 10 55787 CASAVA_Build 1 181245932 7D CACATCAAGT ACCATAG/------- ACTGGGTGGT 3070 het 3070 hom 34 16 16 5 ACCATAG 1 0 55788 CASAVA_Build 1 181249221 1D AAAACTTTAT G/- AAGATATTAT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 G 1 0 55789 CASAVA_Build 1 181250259 4D AACCACTGAG TCTT/---- TCTTCTCATC 3070 het 3070 hom 38 17 20 3 TCTT 2 1 55790 CASAVA_Build 1 181252064 13D TCTCGATCTC CTGACCTCCTGAT/------------- CTGCCCGTCT 2020 het 2020 ref 14 10 6 2 CTGACCTCCTGAT 1 0 55791 CASAVA_Build 1 181254945 1D CAATTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 11 10 55792 CASAVA_Build 1 181255959 1I GAGTTTCACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 T 8 9 55793 CASAVA_Build 1 181256887 2I ATTCAAAAGA --/CT CTGGAGTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 CT 1 2 55794 CASAVA_Build 1 181260904 1D TAATGAACTT C/- CAGAGAGAAC 3070 het 3070 ref 53 30 17 6 C 2 1 55795 CASAVA_Build 1 181261092 1D AATTGGACTT A/- ACAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 A 2 1 55796 CASAVA_Build 1 181263046 2I CCACCAGCCA --/CT CTTTTCTAAG 3070 het 3070 ref 46 28 13 5 CT 1 2 55797 CASAVA_Build 1 181273104 1I AATTGCTGAG -/T TTAGTTCACT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 T 2 3 55798 CASAVA_Build 1 181274315 3I ATGAAGGGAT ---/CCC AATGATTTCC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 C 0 3 55799 CASAVA_Build 1 181274689 1D TTTAAGCTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2738 hom 23 8 10 5 A 10 9 55800 CASAVA_Build 1 181285222 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1795 hom 30 6 16 8 T 12 11 55801 CASAVA_Build 1 181285584 1D AAACTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 A 12 11 55802 CASAVA_Build 1 181286799 1I TTTCAAATTA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 7 8 55803 CASAVA_Build 1 181289170 2I ATCTGTTTTT --/TG TGTGTGTGTT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 TG 4 5 55804 CASAVA_Build 1 181297126 2I TTGGTTGGTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 T 10 12 55805 CASAVA_Build 1 181299071 4I ATTTCAGAGC ----/TAAG TAATTGACAT 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 TAAG 0 1 55806 CASAVA_Build 1 181307139 1D ATAATAGCAA G/- CATAGTACTG 3070 het 3070 ref 56 33 19 4 G 1 0 55807 CASAVA_Build 1 181307316 1I GTGGTCATTT -/G GGGACATCTG 3070 het 3070 hom 60 24 29 7 G 3 4 55808 CASAVA_Build 1 181322274 4D AGATGCTGGA TTGT/---- TTGTTTGGAG 3070 het 3070 ref 50 21 18 13 TTGT 2 1 55809 CASAVA_Build 1 181328187 1D GTTTAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3064 hom 24 7 12 6 A 12 11 55810 CASAVA_Build 1 181331984 1I CTTAAACTTT -/A ATTTTGATAC 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 A 1 2 55811 CASAVA_Build 1 181332567 1D AGTACAGAAA T/- TTAGGGGAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 T 3 2 55812 CASAVA_Build 1 181339733 2I AGAGAACATT --/TG TGACCTAATT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 TG 1 2 55813 CASAVA_Build 1 181341191 1D CAGTGTAGTC A/- GTAGAAAATG 3070 het 3070 ref 46 31 10 5 A 1 0 55814 CASAVA_Build 1 181341394 1I CCTTGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 A 11 12 55815 CASAVA_Build 1 181343920 1I TTTAGTGCTA -/G AAGAGGGCGT 3070 het 3070 ref 51 28 21 2 G 0 1 55816 CASAVA_Build 1 181346856 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2844 het 2708 hom 33 10 11 12 T 13 14 55817 CASAVA_Build 1 181347548 1I AATCTCAGCA -/C TTTGGGAGGC 3070 het 3070 ref 23 8 9 6 C 0 1 55818 CASAVA_Build 1 181349159 1D TATTCGAATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 8 7 55819 CASAVA_Build 1 181361042 1I CCACATGTGA -/C CAGCAGCTAC 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 C 1 2 55820 CASAVA_Build 1 181362877 3I CAAAAAAATT ---/ATA ATGACAGTAT 3070 het 3070 hom 46 21 24 1 ATA 0 1 55821 CASAVA_Build 1 181364229 3D AATAATAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 686 hom 20 4 13 3 A 15 12 55822 CASAVA_Build 1 181364580 3I TAAAGCAAGG ---/TTA TTAGTATAGT 3070 het 3070 hom 33 8 17 8 TTA 1 2 55823 CASAVA_Build 1 181365006 1D CACCATGCCC G/- GGGTAATTTT 3070 het 2284 hom 15 6 8 1 G 4 3 55824 CASAVA_Build 1 181365321 1D ACTTCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 13 12 55825 CASAVA_Build 1 181365588 1I TTACACTGAT -/A ATGCTGGCAC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 1 2 55826 CASAVA_Build 1 181368051 3D CTCCATTTCA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 1166 hom 16 3 10 5 AAT 9 8 55827 CASAVA_Build 1 181370964 1D ACTAGAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 14 3 T 11 10 55828 CASAVA_Build 1 181372479 1D41M4I CATATTTGTC TTTTTTTTTTTCTTTTGACTAGGCATGAGAGTAGGTATCCAC----/-TTTTTTTTTTCTTTTGACTAGGCATGAGAGTAGGTATCCACATTG ATTGAGGAGG 3070 het 3070 ref 26 26 11 10 N/A 0 0 55829 CASAVA_Build 1 181373247 1I GGGTAGTAAT -/G TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 G 0 1 55830 CASAVA_Build 1 181375883 1D GAAAAGGAGA T/- TAATTTTTGA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 T 2 1 55831 CASAVA_Build 1 181381952 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2028 hom 39 11 22 6 A 17 16 55832 CASAVA_Build 1 181382990 2I TATGATCAAC --/TA TATATAGTGC 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 TA 3 4 55833 CASAVA_Build 1 181401838 4D GAATACGAAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 1947 hom 29 6 13 10 TTTA 5 4 55834 CASAVA_Build 1 181414158 1I AGCCAGGTGG -/T TGAGGCAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 1 2 55835 CASAVA_Build 1 181422339 1D CTGGGGCTCC T/- CCAGAGACGG 2426 het 2426 ref 31 19 6 6 T 1 0 55836 CASAVA_Build 1 181426953 1I AAGTATGATC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 8 9 55837 CASAVA_Build 1 181427617 1I ATTCCATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2745 hom 22 6 10 6 A 10 11 55838 CASAVA_Build 1 181428433 1I TTTAATGTTC -/T TTTTTCTGAG 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 5 6 55839 CASAVA_Build 1 181429270 4D GCTTTATACA TACT/---- TACTGCTGTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 TACT 2 1 55840 CASAVA_Build 1 181429600 8D3M4I3M5D ATGGTCCAGT CTCTTCTCAAA----ATGTTTGT/--------AGAGACCATG----- TACTTCTCTT 3070 het 3070 ref 40 29 14 5 N/A 0 0 55841 CASAVA_Build 1 181430009 1D CTTTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 17 16 55842 CASAVA_Build 1 181431901 1I ATAAAAATGA -/T TTTTTTTTTT 2812 het 2812 ref 19 8 9 2 T 12 13 55843 CASAVA_Build 1 181440214 5D AAACAAACAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1868 hom 20 6 12 2 A 15 10 55844 CASAVA_Build 1 181440405 5I AAATAAAAAT -----/TAAAA TAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 TAAAA 2 3 55845 CASAVA_Build 1 181447069 1D AAGTTTTTGA G/- GTCTATGTGA 3070 het 3070 ref 39 18 14 8 G 2 1 55846 CASAVA_Build 1 181449796 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 15 16 55847 CASAVA_Build 1 181455136 4D TCAAAATAAA AGAC/---- AGAAATAGAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 4 AGAC 1 0 55848 CASAVA_Build 1 181457553 1I GTGAGAGCTT -/G TTTATATAAA 3070 het 2573 hom 26 6 16 4 G 0 1 55849 CASAVA_Build 1 181458345 1D CCTGTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 A 13 12 55850 CASAVA_Build 1 181460816 9I TTCCTGGATG ---------/AGATACTTC AGTAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 AGATACTTC 0 1 55851 CASAVA_Build 1 181478598 1D TTCAGTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 19 14 T 14 13 55852 CASAVA_Build 1 181484040 1D AACATTTTGC A/- TAAAACTCTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 A 1 0 55853 CASAVA_Build 1 181496236 1D TGTTCTCCCC T/- TTAAAGCATC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 3 2 55854 CASAVA_Build 1 181497140 5D CATGGCAGAA TCCGC/----- TTCCATTCTT 3070 het 3070 ref 45 23 14 10 TCCGC 1 0 55855 CASAVA_Build 1 181497682 1D AGAAATGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 49 0 34 16 T 12 11 55856 CASAVA_Build 1 181499574 4D TCAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 AAAC 3 2 55857 CASAVA_Build 1 181500931 4D TAACATAAAC AAAT/---- AGTTAAACCA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AAAT 1 0 55858 CASAVA_Build 1 181507439 1D TACATGCTAC G/- TTTATCCTGG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 G 1 0 55859 CASAVA_Build 1 181511431 4D ATTTCCGTAT TTTA/---- TTTATTTTAT 164 het 97 hom 19 2 2 15 TTTA 2 1 55860 CASAVA_Build 1 181534168 5I GCAACAAACA -----/AGTGG AAATCAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 AGTGG 0 1 55861 CASAVA_Build 1 181541933 1D TCCTGGGAGA C/- CTTAGTCCCC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 C 2 1 55862 CASAVA_Build 1 181543208 1D GGAATGTATA T/- TTTTTTTTTT 3033 het 2497 hom 17 8 7 2 T 11 10 55863 CASAVA_Build 1 181549297 6D GAGTGCAGTG GTGCAA/------ TCTTGGCTCA 3070 het 1482 hom 26 5 16 5 GTGCAA 1 0 55864 CASAVA_Build 1 181569412 1I TCCAGAACTG -/T TAAGATAATA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 1 2 55865 CASAVA_Build 1 181569515 5D ACTTGCACAT AACTC/----- AAGTCATTGC 3070 het 3070 ref 33 19 13 3 AACTC 1 0 55866 CASAVA_Build 1 181573977 20I CTGACAGATC --------------------/TATGATATGTCAGATCTATG ATTAACCGTG 3070 het 3070 ref 31 15 10 8 TATGATATGTCAGATCTATG 0 1 55867 CASAVA_Build 1 181574140 1I GTGTGGGGTT -/G GAGGAGAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 G 1 2 55868 CASAVA_Build 1 181575532 1I TCTGTACTCC -/A AAAATGAAGC 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 A 4 5 55869 CASAVA_Build 1 181577778 1D TTCCTTCCTC A/- CCTTTTTTTT 1931 het 1449 hom 33 12 8 13 A 1 0 55870 CASAVA_Build 1 181580877 3D ATCTTCTCTT CTC/--- CTCCCCCACC 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 CTC 2 1 55871 CASAVA_Build 1 181611766 1I GTCACTCACT -/A AATGCTATTA 3070 het 3070 ref 61 35 19 7 A 2 3 55872 CASAVA_Build 1 181614574 1I GGCCATGGCA -/G GCAGATTGCT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 G 1 2 55873 CASAVA_Build 1 181619260 1D AACTTTTATG C/- TTTGCTTCCC 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 C 1 0 55874 CASAVA_Build 1 181624052 1I TTATTTGGGG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 A 7 8 55875 CASAVA_Build 1 181627290 1I CTCTCATCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 9 10 55876 CASAVA_Build 1 181638661 1D TTGGACTTTA C/- CCCCAAAGCT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 C 5 4 55877 CASAVA_Build 1 181665529 1D AAAAAAAACC T/- TAGAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 T 2 1 55878 CASAVA_Build 1 181670967 1D GGGAGTTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 10 9 55879 CASAVA_Build 1 181682123 1I TAATAAATAG -/T TGTCTCTGCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 1 2 55880 CASAVA_Build 1 181686155 1D GTTGAGCATA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 9 8 55881 CASAVA_Build 1 181755784 1D GTTACCAGGA T/- TTTTTTTTTT 1645 het 1645 ref 34 21 5 8 T 13 12 55882 CASAVA_Build 1 181791474 3I GTTTTTGTAA ---/GAT GATGCTAGGT 3070 hom 102 het 37 0 33 4 GAT 1 2 55883 CASAVA_Build 1 181828888 18I TGTGCATGCA ------------------/AGTCTTAGCACCTCAGAT AGTCTTAGCA 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 AGTCTTAGCACCTCAGAT 0 1 55884 CASAVA_Build 1 181830005 7I CTCTACAGAA -------/AAACACT AAACACTAAA 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 AAACACT 1 2 55885 CASAVA_Build 1 181830551 1D AAGACCCTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 9 8 55886 CASAVA_Build 1 181832500 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1999 hom 28 6 8 15 A 15 14 55887 CASAVA_Build 1 181842551 24D AGGTGTGCCT AGCACTTTGGGAGGCTGTAATCTC/------------------------ AGCACTTTGG 3070 het 3070 ref 29 10 9 14 AGCACTTTGGGAGGCTGTAATCTC 1 0 55888 CASAVA_Build 1 181845478 1I ATAATTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 10 11 55889 CASAVA_Build 1 181846350 1D GGCTTCACTT G/- GGACAGGCTG 3070 het 3070 hom 30 8 15 7 G 3 2 55890 CASAVA_Build 1 181847475 2D CATCTAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2185 het 2006 hom 29 12 9 8 T 17 15 55891 CASAVA_Build 1 181856547 4I GCCAGGAAAA ----/TCTT TCTAAGTATG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TCTT 0 1 55892 CASAVA_Build 1 181875459 1D CCTGTAAGCC A/- AAAAAAAAAA 2860 het 2860 ref 22 8 8 6 A 13 12 55893 CASAVA_Build 1 181899975 5I GTATAATAAT -----/AATAA AATAAAATAA 2000 het 1297 hom 10 3 5 2 AATAA 3 4 55894 CASAVA_Build 1 181903762 8D CTTATATATA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 hom 31 het 20 0 11 10 TG 11 7 55895 CASAVA_Build 1 181922191 1I TGACAATATG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 8 9 55896 CASAVA_Build 1 181926490 1D AGGTACTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 A 12 11 55897 CASAVA_Build 1 181942470 1D GGAGCTGCGG C/- CCCCGTGGGC 3070 hom 53 het 21 0 17 5 C 5 4 55898 CASAVA_Build 1 181951259 1I CTTTTAGGTG -/T TAAGCCTTGT 3070 het 3070 hom 58 25 28 5 T 1 2 55899 CASAVA_Build 1 181964323 4I AGACCTGAAA ----/TTGT TTGTGATTTC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 TTGT 1 2 55900 CASAVA_Build 1 181964943 4D AAAATATATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 28 11 13 7 TG 11 9 55901 CASAVA_Build 1 181970827 1I TGGATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 20 5 T 10 11 55902 CASAVA_Build 1 181972708 1I CCTTCCAAAC -/A CATTTAAAGA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 0 1 55903 CASAVA_Build 1 181979130 11I GTAGCAAAGC -----------/AAGAACTTCGA AACAACTAAG 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 AAGAACTTCGA 0 1 55904 CASAVA_Build 1 181979534 1D GGAATCATAA C/- AAGTGGAAAT 3070 het 3070 hom 50 19 27 6 C 1 0 55905 CASAVA_Build 1 181980073 2D CACAACAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 2746 het 2746 ref 26 11 8 7 T 14 12 55906 CASAVA_Build 1 181981109 2I24M1D TAAAATTTAT --GTCTTCTTTTCTCCTTATGGTTTGT/CAGTCTTCTTTTCTCCTTATGGTTAG- GTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 27 19 20 3 N/A 0 0 55907 CASAVA_Build 1 181986383 3D GTGATCTTTT GGA/--- GGAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 GGA 2 1 55908 CASAVA_Build 1 181989713 1I AGTGGGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 12 13 55909 CASAVA_Build 1 181992779 1D TGGTTTGTTT G/- TTTTTTTTTT 3025 het 3025 ref 51 18 17 16 G 1 0 55910 CASAVA_Build 1 181995808 1I CAAATATTGC -/A ACAAAGTAAG 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 1 2 55911 CASAVA_Build 1 182003715 1I CGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 10 11 55912 CASAVA_Build 1 182009714 1D CTTGGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 124 het 56 0 41 16 A 11 10 55913 CASAVA_Build 1 182010333 2D TCTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1593 het 487 hom 31 5 9 17 T 20 18 55914 CASAVA_Build 1 182025595 1I TTAGGTTGGT -/G CAAATGTAAT 3070 hom 33 het 16 0 9 7 G 0 1 55915 CASAVA_Build 1 182030749 1D AGAGACAATA T/- CTAAGATTTA 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 T 1 0 55916 CASAVA_Build 1 182036804 3I TTTTGAGGAA ---/CCT CCATACTGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CCT 0 1 55917 CASAVA_Build 1 182049955 2D AGTCTCATAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 49 26 15 9 AG 8 7 55918 CASAVA_Build 1 182051031 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1175 het 1175 ref 37 8 4 25 A 14 12 55919 CASAVA_Build 1 182054348 1I TCACACTATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 8 9 55920 CASAVA_Build 1 182063078 1D TTTTGCCTCC T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 8 7 55921 CASAVA_Build 1 182063815 1D CTTTTAAGTT A/- AATCACATTC 3070 het 3070 ref 42 22 20 1 A 3 2 55922 CASAVA_Build 1 182065618 1I ATGTTTCCTC -/A GTGAAATTTA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 0 1 55923 CASAVA_Build 1 182066442 1I AATTCTGGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 9 10 55924 CASAVA_Build 1 182070338 5I ATTCACACTC -----/ATACT ATCATCTCTA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 ATACT 0 1 55925 CASAVA_Build 1 182072973 1D TATGGCATGC T/- GGGAAAGCTT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 1 0 55926 CASAVA_Build 1 182073160 10D CTTAGTTTAT GAAGACCTTG/---------- GACATTTGAG 3070 het 3070 ref 25 14 8 4 GAAGACCTTG 1 0 55927 CASAVA_Build 1 182073351 1I CAAAATTGCA -/C TTGATGTATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 0 1 55928 CASAVA_Build 1 182076745 1D CTTGGTGCTT C/- CCTCCATGTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 C 3 2 55929 CASAVA_Build 1 182078090 1D TTGAAGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 697 hom 48 8 16 24 T 13 12 55930 CASAVA_Build 1 182079579 1I TATTTTCATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 T 9 10 55931 CASAVA_Build 1 182080933 6D CTGACATAAA ACAATT/------ ACAATTCAAC 3070 het 3070 ref 32 17 11 7 ACAATT 2 1 55932 CASAVA_Build 1 182084841 1D ATTTAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 T 10 9 55933 CASAVA_Build 1 182086068 1D ATTTTCCTAA T/- TTTTCCATTC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 5 4 55934 CASAVA_Build 1 182103110 3D GAGGAGAAAA AAG/--- AAGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 AAG 2 1 55935 CASAVA_Build 1 182105962 1D TAGTCCTCTG T/- AAACAGGAAG 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 1 0 55936 CASAVA_Build 1 182171756 1I AACCGCAAGC -/G GGGGCCCATG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 G 4 5 55937 CASAVA_Build 1 182173955 1D GGGACTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 12 11 55938 CASAVA_Build 1 182174039 4I TGATTTTAAG ----/TGAT TGATTCCTGT 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 TGAT 1 2 55939 CASAVA_Build 1 182177665 1I AATATATATA -/T TTTTTTCCAT 2259 het 2259 ref 28 15 5 8 T 6 7 55940 CASAVA_Build 1 182195959 3D GAATTCAAGG ACT/--- ACAACAATGA 2798 het 2798 ref 32 18 9 5 ACT 1 0 55941 CASAVA_Build 1 182197143 2D GGGAGAAAAC AA/-- GAGAACATAA 3070 het 3070 hom 51 22 22 8 A 2 0 55942 CASAVA_Build 1 182201548 6I GCCTCCAAAG ------/AAAATT AATGGCAAAG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 AAAATT 0 1 55943 CASAVA_Build 1 182204937 2I CATATGAGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 11 13 55944 CASAVA_Build 1 182212110 5I ATGTATATAT -----/TATAA TATATCATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TATAA 0 1 55945 CASAVA_Build 1 182214381 1I CTACTCCTGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 10 11 7 A 8 9 55946 CASAVA_Build 1 182239137 1I GGAAGCCAAA -/C CACATGGAGA 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 C 1 2 55947 CASAVA_Build 1 182254033 1D TTTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 A 10 9 55948 CASAVA_Build 1 182270036 1D CCCTATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1097 hom 36 10 18 8 T 15 14 55949 CASAVA_Build 1 182274862 1I CTTATCCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 A 10 11 55950 CASAVA_Build 1 182276450 1D AGTTAATTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 8 11 6 A 10 9 55951 CASAVA_Build 1 182284432 2I GCATTTCCTC --/TT GAGACTCTTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 2 55952 CASAVA_Build 1 182285624 1I TTTCTGTCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 9 10 55953 CASAVA_Build 1 182290827 1D GTAATTTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 10 9 55954 CASAVA_Build 1 182294790 1D TAGAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 1672 het 1672 ref 31 15 6 10 T 16 15 55955 CASAVA_Build 1 182340406 2D CTGGGTATAT AC/-- CCAGTAATGG 3070 hom 58 het 25 0 19 6 AC 1 0 55956 CASAVA_Build 1 182355262 1D CTTACCTCAA C/- CTTGTTTTTG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 2 1 55957 CASAVA_Build 1 182362020 1I TTCTCACCTT -/A AAAAAAAAAA 2098 het 2098 ref 44 28 6 10 A 15 16 55958 CASAVA_Build 1 182404269 1D TCAGATTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 T 11 10 55959 CASAVA_Build 1 182417394 2D GAATGAAAAG GC/-- GCAGACAATA 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 GC 2 1 55960 CASAVA_Build 1 182421150 1I AGTGGAATGG -/A GCGGAACGGA 1317 het 1317 ref 39 20 5 14 A 0 1 55961 CASAVA_Build 1 182422280 2D ACCAAGTCTC AG/-- AGAAATACCA 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 AG 2 1 55962 CASAVA_Build 1 182426041 1I ATGGAAAGGG -/T CAGCCAAATC 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 0 1 55963 CASAVA_Build 1 182434043 1I CTGCGTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 10 11 55964 CASAVA_Build 1 182445557 1D TTCTTCCTTT A/- AACATAAGAT 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 A 3 2 55965 CASAVA_Build 1 182446684 1I TTCGTAAAAA -/C ACGGCATCTC 3070 het 3070 ref 49 22 22 5 C 0 1 55966 CASAVA_Build 1 182462912 1D ACCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 10 9 55967 CASAVA_Build 1 182464145 1D TTGGTAAATA T/- TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 T 6 5 55968 CASAVA_Build 1 182464762 4I CAACGTGCAG ----/GTTA GTTACATATG 3070 het 465 hom 11 1 9 2 GTTA 1 2 55969 CASAVA_Build 1 182474995 1D GAGTCCTCAC A/- AAAAACTGGG 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 A 6 5 55970 CASAVA_Build 1 182496760 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 AAAG 3 2 55971 CASAVA_Build 1 182498283 1I CATAATTGAG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 7 8 55972 CASAVA_Build 1 182502001 1I TGGGAAACCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 25 8 4 A 10 11 55973 CASAVA_Build 1 182507972 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 907 hom 17 3 13 2 A 12 11 55974 CASAVA_Build 1 182526505 1I AGTTGTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 11 12 55975 CASAVA_Build 1 182539768 1D ATCCATGTTG T/- TGCAAATGAC 3070 het 3070 hom 60 27 27 6 T 2 1 55976 CASAVA_Build 1 182549008 1I ATTCTGGATA -/T TAACCCCCTG 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 T 1 2 55977 CASAVA_Build 1 182550460 2I ATTTATTCTG --/CA CAAACATTTA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 CA 1 2 55978 CASAVA_Build 1 182558460 3D AAAAAAAACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 13 9 3 A 13 10 55979 CASAVA_Build 1 182560102 1D TAGCTTGTGA G/- GGGGGGGGCC 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 G 9 8 55980 CASAVA_Build 1 182560641 1I TCTTAAACCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 8 9 55981 CASAVA_Build 1 182564803 1I CGCCACTCTG -/A ACTGTGTTCC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 1 2 55982 CASAVA_Build 1 182584823 4D TCTTTTAACA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2146 hom 31 10 11 12 T 18 14 55983 CASAVA_Build 1 182606583 1D AAATAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 12 11 55984 CASAVA_Build 1 182608373 1D AATTTTATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 9 55985 CASAVA_Build 1 182615901 2I TTTTGAAAAC --/TG TAGTGTAATC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TG 0 1 55986 CASAVA_Build 1 182637536 1D CATTTACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 12 11 55987 CASAVA_Build 1 182696274 3D GGGGTGACTA CCT/--- CTCTTTCTAA 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 CCT 1 0 55988 CASAVA_Build 1 182706636 1D ACTCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2143 hom 24 6 9 9 A 13 12 55989 CASAVA_Build 1 182709224 1D AATGGAAGCT A/- AAAAAAAAAA 931 het 931 ref 44 34 3 7 A 11 10 55990 CASAVA_Build 1 182714732 5D CTTTTGGTTC ATTGT/----- AATGATTGTT 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 ATTGT 1 0 55991 CASAVA_Build 1 182722907 1I GACACTACAG -/A ATTCAGACAT 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 A 1 2 55992 CASAVA_Build 1 182737916 1D AGACTGGGTA T/- TTTTGCAAAC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 T 5 4 55993 CASAVA_Build 1 182740104 1I GTTTTTCTGC -/T GCCAGGACCC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 0 1 55994 CASAVA_Build 1 182746560 2I TTGGTAGAAT --/TC GGGATTACAA 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 TC 0 1 55995 CASAVA_Build 1 182752055 4D GACAAAATTA AAAC/---- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 41 22 19 1 AAAC 2 1 55996 CASAVA_Build 1 182752892 4D CATATTACTC TATT/---- TGTTAGAATA 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 TATT 1 0 55997 CASAVA_Build 1 182753309 10I ACAAGAGTGA ----------/AACCGGTATT AATAGGCAAA 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 AACCGGTATT 0 1 55998 CASAVA_Build 1 182756478 5D ATAATTGTAC TTTAT/----- TTAATTGTAC 3070 het 3070 hom 23 10 13 1 TTTAT 1 0 55999 CASAVA_Build 1 182772096 13I TCCACTGTGC -------------/TCACCACACAGCT TCACCCTGTG 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 TCACCACACAGCT 0 1 56000 CASAVA_Build 1 182773881 2I TCACCAACAC --/TT GATATTTTCT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 0 2 56001 CASAVA_Build 1 182791306 4D ACACATACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 18 15 5 AC 7 5 56002 CASAVA_Build 1 182807657 3D TTCCTTGATG TTC/--- TTCTTAATGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 TTC 2 1 56003 CASAVA_Build 1 182817407 4I ATATCATAGC ----/TTGT TTATTTTAAT 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 TTGT 0 1 56004 CASAVA_Build 1 182828451 3D AATCATAAGC AGA/--- AGAAGGTATG 3070 het 3070 ref 47 22 17 10 AGA 2 1 56005 CASAVA_Build 1 182832643 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGAAAGAA 3070 het 1079 hom 21 6 9 6 AAG 0 1 56006 CASAVA_Build 1 182845076 1I AACTCTTTCT -/G GTATTTCCTG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 G 1 2 56007 CASAVA_Build 1 182908454 4D TTTGTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 114 het 46 0 39 9 TTGT 4 3 56008 CASAVA_Build 1 182999169 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1390 hom 26 8 11 7 A 16 17 56009 CASAVA_Build 1 183010560 2D GTTTTGCCCC CT/-- GATTACTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 CT 1 0 56010 CASAVA_Build 1 183027717 1D TCTAGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 34 1 18 15 T 15 14 56011 CASAVA_Build 1 183100097 2D TCTGACAAAC TA/-- TAACGTACAA 3070 het 3070 ref 58 31 22 5 TA 2 1 56012 CASAVA_Build 1 183104498 1D GATTTTTTTT A/- AAAATATCAG 3070 het 3070 ref 38 19 17 4 A 5 4 56013 CASAVA_Build 1 183108470 1D GTATCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 A 13 12 56014 CASAVA_Build 1 183132427 1I ATTTCTATAG -/T TTCAGGACTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 2 3 56015 CASAVA_Build 1 183140693 1I CAGAGCGAGA -/C TCTGTCTCAA 3070 het 2314 hom 22 8 10 4 C 0 1 56016 CASAVA_Build 1 183142977 1D ATAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 2289 het 2289 ref 29 14 7 8 A 11 10 56017 CASAVA_Build 1 183152249 1D AGCTATGAGC A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 A 8 7 56018 CASAVA_Build 1 183157432 1I AGTATGTAAC -/A ATCAAGGCAA 3070 hom 154 het 63 0 52 11 A 1 2 56019 CASAVA_Build 1 183171546 1I AGAGTTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 30 2 21 7 T 13 14 56020 CASAVA_Build 1 183179361 1I CTTGCTAAGG -/A AATGCAATGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 3 56021 CASAVA_Build 1 183181103 2I AGGCTTTTCA --/CT CTCTGTAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 CT 2 3 56022 CASAVA_Build 1 183204550 4D GAGATGGAAG TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 18 16 10 TTTC 5 4 56023 CASAVA_Build 1 183212856 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 2909 het 2909 ref 22 8 10 4 T 9 10 56024 CASAVA_Build 1 183294984 1I AGTCTGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1075 hom 32 3 23 6 A 12 13 56025 CASAVA_Build 1 183303764 1D GCGCCCGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 20 0 14 6 T 12 11 56026 CASAVA_Build 1 183336299 1I GTTTCTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 22 1 17 4 T 11 12 56027 CASAVA_Build 1 183349192 1D ACTTTGTATG A/- AAAAAAAAAA 1166 het 1166 ref 22 12 3 7 A 12 11 56028 CASAVA_Build 1 183359891 6I CAATAGGCTC ------/ATCTTT ATATCAATAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATCTTT 0 1 56029 CASAVA_Build 1 183365598 1D GCACTGACGT A/- AAGTTTTGTT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 A 3 2 56030 CASAVA_Build 1 183390669 2I TAGGAGGGTC --/TT TTTTACAACT 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 T 4 6 56031 CASAVA_Build 1 183393320 1D AGCCCGCGGG C/- CCGCGGCGGT 2708 hom 35 het 16 0 9 7 C 3 2 56032 CASAVA_Build 1 183404078 11I10M2I TATGTGTCCT -----------TTTTTTATTT--/AAATGATAGACTTTTTTTTTTAA ATTTCAGAAA 3070 hom 111 het 32 0 38 3 N/A 0 0 56033 CASAVA_Build 1 183406916 1D TTCAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 39 0 31 8 A 12 11 56034 CASAVA_Build 1 183420169 1I AACAATGATG -/T GGCTTTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 56035 CASAVA_Build 1 183446776 4I AACTACAAAC ----/CGCT CGCTGCTCAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 CGCT 1 2 56036 CASAVA_Build 1 183501986 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 7 6 56037 CASAVA_Build 1 183528392 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 9 56038 CASAVA_Build 1 183559665 2D GTGTGGTAAC AT/-- ATAGCACAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 4 AT 2 1 56039 CASAVA_Build 1 183566452 2I AGTTCTGACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 10 12 56040 CASAVA_Build 1 183569816 1D TATTTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 22 14 17 T 13 12 56041 CASAVA_Build 1 183580878 4I GTTCTTCCAC ----/ACTT AGTGCTTTCA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 ACTT 0 1 56042 CASAVA_Build 1 183583359 2I ATATATATAT --/TA TATATATATA 1494 hom 12 het 7 0 5 2 TA 8 9 56043 CASAVA_Build 1 183584175 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 10 9 56044 CASAVA_Build 1 183585307 1D GCTGGTGTGT C/- TGCCTAGTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 1 0 56045 CASAVA_Build 1 183630870 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 7 8 56046 CASAVA_Build 1 183635560 1I ACACCTACAT -/C CTCTCACAGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 1 2 56047 CASAVA_Build 1 183643539 1D TGGAGGGGAC A/- AAAACATCCA 3070 hom 147 het 52 0 49 3 A 5 4 56048 CASAVA_Build 1 183676349 1I CTTAGGCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 171 hom 32 1 27 4 A 9 10 56049 CASAVA_Build 1 183698618 4D ACAGAACTTA TTTC/---- TTTATCTAAC 3070 hom 144 het 50 0 48 3 TTTC 1 0 56050 CASAVA_Build 1 183717686 1D TCAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2295 hom 23 6 11 6 T 13 12 56051 CASAVA_Build 1 183742589 1I GCTCTGGCTA -/G GACTTCCAGT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 1 2 56052 CASAVA_Build 1 183750214 1I AAAAAAAAAA -/C AATCTTATCA 3070 hom 62 het 37 1 32 4 C 0 1 56053 CASAVA_Build 1 183767960 1I TCCTCCACCA -/T TTTTCTCTTT 3070 het 3070 hom 52 20 22 10 T 4 5 56054 CASAVA_Build 1 183769787 1I TACAGAGATT -/A CTAGATATTC 3070 het 3070 ref 55 25 22 8 A 0 1 56055 CASAVA_Build 1 183770709 1I CCACGTTGAC -/T TTTTCGAGAA 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 T 4 5 56056 CASAVA_Build 1 183772577 2D CCTCAATAGT TC/-- TCAGTGAGAG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 TC 2 1 56057 CASAVA_Build 1 183775143 1D TCTCCTGTAG C/- CCGTGGGCCT 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 C 3 2 56058 CASAVA_Build 1 183777824 1D GTATACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2924 hom 30 9 10 11 T 15 14 56059 CASAVA_Build 1 183828574 3D AGTAAGAAAA AGC/--- AGCTGGTAAT 3070 het 3070 hom 47 23 22 3 AGC 2 1 56060 CASAVA_Build 1 183892984 1D TTTGTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 T 12 11 56061 CASAVA_Build 1 183923975 8D TCCAAATGCC CACTACAG/-------- CGGTAGCTCC 3070 het 3070 hom 33 18 16 4 CACTACAG 1 0 56062 CASAVA_Build 1 183925728 1D TGGGTGCGGT G/- GCTCACACCT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 G 2 1 56063 CASAVA_Build 1 183930816 1D CCAATGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 12 11 56064 CASAVA_Build 1 183932019 2D ATATATTATC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 11 9 56065 CASAVA_Build 1 183932512 4I TTTATCCCAC ----/CTTT ATACTATACC 3070 het 3070 hom 59 23 32 4 CTTT 0 1 56066 CASAVA_Build 1 183933389 1I TGTATGTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 9 10 56067 CASAVA_Build 1 183950597 4I CTGGAGATGT ----/CTAG CAGTTGATGC 3070 hom 126 het 45 0 40 5 CTAG 0 1 56068 CASAVA_Build 1 183951976 5I AGATGTAGTC -----/TTTAA TTTGAAAGAT 3070 het 3046 hom 29 7 22 0 TTTAA 0 1 56069 CASAVA_Build 1 183952543 1I AGAACCCACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 T 9 10 56070 CASAVA_Build 1 183953358 2D AAAAAGAAAC AG/-- AAGTCATATA 3070 het 3070 hom 44 18 25 3 AG 1 0 56071 CASAVA_Build 1 183955187 2I TTTAAGGAAA --/GT GTAGGGGCTA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 GT 1 2 56072 CASAVA_Build 1 183956178 1D CTCAATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 22 5 A 11 10 56073 CASAVA_Build 1 183958305 12I ACTTAGTGGC ------------/AATAATTTGCCA TATGGCCATA 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 AATAATTTGCCA 0 1 56074 CASAVA_Build 1 183962193 2D TTCACAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 13 11 56075 CASAVA_Build 1 183967893 1D AAAAGAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 39 1 29 10 A 14 13 56076 CASAVA_Build 1 183972144 4I TTACTGTCTT ----/AGTA AGACACTTCA 1334 het 1334 ref 41 36 3 2 AGTA 0 1 56077 CASAVA_Build 1 183978177 1D CCTCCAGGAC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 9 8 56078 CASAVA_Build 1 183982361 1D TTCCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1316 het 1316 ref 46 18 5 24 T 17 16 56079 CASAVA_Build 1 184002767 1D AGAAATCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 A 12 11 56080 CASAVA_Build 1 184030580 1I ACATTGATTT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 A 7 8 56081 CASAVA_Build 1 184047485 1I CCCTTGCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2896 hom 29 10 12 7 A 11 12 56082 CASAVA_Build 1 184047902 1D ATGTTGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 10 9 56083 CASAVA_Build 1 184082888 1I TAGCTTAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 T 10 11 56084 CASAVA_Build 1 184118106 1I GAAATGAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 13 14 56085 CASAVA_Build 1 184130864 1I TTATTTTTTG -/T TTACACATAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 2 3 56086 CASAVA_Build 1 184132174 2I AAAAACTCAC --/AT GTGTACACCC 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 AT 0 1 56087 CASAVA_Build 1 184233566 1I TATTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2447 hom 45 10 14 21 T 13 14 56088 CASAVA_Build 1 184246794 5D TACTGGTTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 750 hom 23 het 22 0 8 19 TTTTG 1 0 56089 CASAVA_Build 1 184247881 1I ATGACACCTG -/A ATCTTTTACA 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 A 1 2 56090 CASAVA_Build 1 184248837 1D CTATGCCACC A/- AAATTTACAG 3070 het 3070 ref 44 27 14 6 A 4 3 56091 CASAVA_Build 1 184255191 1D AGGGATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 11 10 56092 CASAVA_Build 1 184268496 12D GGCCATAAGT AAAAAGAAAAAA/------------ AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 5 AAAAAGAAAAAA 2 1 56093 CASAVA_Build 1 184269363 1I ATTTTTTATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 2910 hom 31 11 12 8 A 8 9 56094 CASAVA_Build 1 184273800 1D GGTACATTTA C/- TTTTGAACTC 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 C 1 0 56095 CASAVA_Build 1 184282229 1D CTCAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 23 7 A 11 10 56096 CASAVA_Build 1 184310142 1I TATAAAAGAC -/A TGCTTTTTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 0 1 56097 CASAVA_Build 1 184343517 2I TTGCTTGGTT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 49 15 21 13 AC 8 9 56098 CASAVA_Build 1 184473542 1I AGGAAACAAG -/A TGCTCAAGCC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 0 1 56099 CASAVA_Build 1 184476684 3I ACCCCACAGT ---/GAG GTGAGCAGCT 3070 hom 154 het 54 0 52 2 GAG 0 1 56100 CASAVA_Build 1 184514072 4D TCTTTCTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 1926 hom 30 het 14 0 11 3 TTTC 3 2 56101 CASAVA_Build 1 184531172 1I TGAAGAGATA -/C TTTTAGTAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 56102 CASAVA_Build 1 184545891 1D CATTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 29 hom 23 1 14 8 G 12 11 56103 CASAVA_Build 1 184575150 3I CTTTAGACTT ---/CTA CTGAGTAGCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CTA 0 1 56104 CASAVA_Build 1 184578089 1I TGTATTTAAG -/A GTTGGTTTCC 3070 hom 32 het 13 0 11 2 A 0 1 56105 CASAVA_Build 1 184593381 1D ACTCTAATCT A/- AAAACAAAGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 5 4 56106 CASAVA_Build 1 184597324 1I AGGGTAAAAA -/G AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 56107 CASAVA_Build 1 184601144 1D AGCCACCGTA C/- CTGGCCAAGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 2 1 56108 CASAVA_Build 1 184613807 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 20 1 18 1 A 12 11 56109 CASAVA_Build 1 184627280 3D ATAAGGTATC AAG/--- AATGGGGGTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAG 1 0 56110 CASAVA_Build 1 184631040 1I TAGTAGAGAC -/A GGGTTTCACT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 A 0 1 56111 CASAVA_Build 1 184635286 2I TTTAGAACAC --/TT TATCAAATTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 1 3 56112 CASAVA_Build 1 184637222 4I CGTCCGTCTT ----/TCTG TCTGTCTGTC 3070 hom 101 het 49 0 37 12 TCTG 2 3 56113 CASAVA_Build 1 184650865 1I GGGGGGAGGG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 7 8 56114 CASAVA_Build 1 184673891 3D TGTTTTTGCA AGG/--- AGTTTTGGGA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AGG 1 0 56115 CASAVA_Build 1 184677963 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 443 het 35 hom 9 1 3 5 A 16 15 56116 CASAVA_Build 1 184678216 3I TGTAAAGGAA ---/AGC AGAGAAGTGA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AGC 0 1 56117 CASAVA_Build 1 184682911 1D TGGCAGATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 11 10 56118 CASAVA_Build 1 184683611 1I ATGTTTGTTT -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 6 7 56119 CASAVA_Build 1 184695677 1D AACAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 A 11 10 56120 CASAVA_Build 1 184701890 1I AACCGAGAAA -/T TTACAAATGC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 2 3 56121 CASAVA_Build 1 184702872 1D CATTTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 35 0 30 5 T 13 12 56122 CASAVA_Build 1 184704460 5I TGCTGAACAT -----/TACTC TATCTGGGAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 TACTC 0 1 56123 CASAVA_Build 1 184706369 5I ATATACTTAG -----/TACCA AAATCTTGAT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TACCA 0 1 56124 CASAVA_Build 1 184717516 1D AGCGAGTTTG A/- AAGATCATTT 3070 hom 101 het 40 0 33 9 A 3 2 56125 CASAVA_Build 1 184720433 8D CTTGTTCAGC TTTTAATT/-------- CATATGCAGT 3070 hom 96 het 33 0 32 4 TTTTAATT 1 0 56126 CASAVA_Build 1 184725660 2D ATTTACACAC AT/-- ATACATATTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AT 2 1 56127 CASAVA_Build 1 184733237 3I TAAAACTGGT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 11 14 56128 CASAVA_Build 1 184741990 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 25 3 16 6 T 12 11 56129 CASAVA_Build 1 184746348 1I TAAGGAGCTC -/T TGTAAGGCAG 3070 hom 39 het 19 0 13 6 T 1 2 56130 CASAVA_Build 1 184748944 13I CACAAGCATG -------------/GTGGTTTCTTGAC TGCAGTAGGA 3070 hom 170 het 64 0 50 14 GTGGTTTCTTGAC 0 1 56131 CASAVA_Build 1 184754048 1D AACACACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 24 0 15 9 A 12 11 56132 CASAVA_Build 1 184806383 1D TTTTTGGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 10 9 56133 CASAVA_Build 1 184807166 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 18 5 T 12 11 56134 CASAVA_Build 1 184810414 4I AGAAAGCATT ----/TCAC TCACTCTTCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TCAC 1 2 56135 CASAVA_Build 1 184817991 4D AAATGAATTA GAAC/---- GAACTCCTTA 3070 hom 90 het 36 0 30 8 GAAC 2 1 56136 CASAVA_Build 1 184828400 1D AAACTGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 126 het 53 0 42 11 A 11 10 56137 CASAVA_Build 1 184832913 1I TACAATGCAT -/A AAAAGCAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 4 5 56138 CASAVA_Build 1 184834664 2D TAATTTCATA GT/-- GTTTCAGATC 3070 hom 75 het 26 0 25 2 GT 2 1 56139 CASAVA_Build 1 184835408 3D GTTCTAATAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 30 0 24 7 T 14 11 56140 CASAVA_Build 1 184836200 1D TCCTCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 11 10 56141 CASAVA_Build 1 184838025 3D ATTGTTTCTC TCT/--- TCTTCTTATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TCT 3 2 56142 CASAVA_Build 1 184849113 4D AAGAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 590 het 100 hom 23 2 5 18 AAAG 1 0 56143 CASAVA_Build 1 184853029 1D TTATATCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 19 2 15 2 T 12 11 56144 CASAVA_Build 1 184854785 8I TTTAATTTAT --------/TACTGACA TACTCAGATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TACTGACA 0 1 56145 CASAVA_Build 1 184857405 1I AATTTTTGGA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 6 7 56146 CASAVA_Build 1 184857624 2D AAATCCTTTT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 101 het 44 0 37 7 AG 9 8 56147 CASAVA_Build 1 184862228 2I CAAATTTTTT --/TA TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 43 0 34 9 TA 0 1 56148 CASAVA_Build 1 184865797 1D TAAAAAAAAA T/- CATAGGCCTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 1 0 56149 CASAVA_Build 1 184866167 2I CCAGAATCAC --/CT CTTATAACAA 3070 hom 151 het 55 0 51 4 CT 1 2 56150 CASAVA_Build 1 184868366 1I GGTTCTGGGG -/C CTTTGCACTG 3070 hom 90 het 32 0 29 3 C 1 2 56151 CASAVA_Build 1 184872181 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 11 12 56152 CASAVA_Build 1 184874910 1I GAGAGATTTT -/G TCACCACCAG 1791 hom 10 het 4 0 4 0 G 0 1 56153 CASAVA_Build 1 184883380 4I AATTTTTATC ----/TTGA TTATTTTTTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTGA 0 1 56154 CASAVA_Build 1 184885143 1D ACCACTTTTT A/- ATGGATCATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 1 56155 CASAVA_Build 1 184890386 1I GAACCCGGGA -/G GTGGAGGTTG 3070 hom 57 het 20 0 19 1 G 1 2 56156 CASAVA_Build 1 184891649 1D AACATGGCCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 9 8 56157 CASAVA_Build 1 184891789 6D GAGGGAAATG GGAAGT/------ GGAAGTGATG 3070 het 3070 ref 58 24 24 11 GGAAGT 2 1 56158 CASAVA_Build 1 184894846 1D GGTGCTTATA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 44 16 19 12 T 7 6 56159 CASAVA_Build 1 184898367 2I TATTTTTAAC --/AA AGAGTCGTTA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 A 1 3 56160 CASAVA_Build 1 184902160 5I TACCTTAATC -----/AAAGT AAAGAACTGT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 AAAGT 0 1 56161 CASAVA_Build 1 184917500 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACCA 3070 het 3070 ref 36 19 10 8 AC 5 4 56162 CASAVA_Build 1 184918244 1D TTGGAAAGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 15 15 2 A 10 9 56163 CASAVA_Build 1 184920245 1D CCAATTCTAG C/- CCCCCCCCAG 3070 het 777 hom 36 9 12 15 C 9 8 56164 CASAVA_Build 1 184923938 5I TCACACAATT -----/ATATC AATAGTGCAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 ATATC 0 1 56165 CASAVA_Build 1 184924502 4I AATAAGACAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 AAAT 3 4 56166 CASAVA_Build 1 184925855 1I TCTGCTTCAC -/A AAACTCACTG 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 A 3 4 56167 CASAVA_Build 1 184935255 1D TGAGCCAAGA T/- GGTGCTACTG 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 T 1 0 56168 CASAVA_Build 1 184941849 1I CCTCACTTTG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 7 8 56169 CASAVA_Build 1 184946993 1I GATTTGAGAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 7 8 56170 CASAVA_Build 1 184948481 1I TGCCCCTACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 9 10 56171 CASAVA_Build 1 184948657 1I GAAAGAACAC -/T GCTGGAATTA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 0 1 56172 CASAVA_Build 1 184963556 2D GTCTTGACTC TT/-- TATCCAATTT 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 T 3 1 56173 CASAVA_Build 1 184964652 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1782 het 1006 hom 13 3 4 6 A 13 12 56174 CASAVA_Build 1 184967034 1I ATAGAATGGA -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 7 8 56175 CASAVA_Build 1 184972208 1I CCCTGGTTAA -/T TTGTTTTTTT 3070 hom 51 het 28 0 18 10 T 2 3 56176 CASAVA_Build 1 184973898 1I GACGCAATAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 8 9 56177 CASAVA_Build 1 184975523 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 11 10 56178 CASAVA_Build 1 184990961 1I ACTCTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 157 hom 35 1 26 8 T 10 11 56179 CASAVA_Build 1 184993596 1D GATTAATGAT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 7 6 56180 CASAVA_Build 1 184995825 1I GATTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 10 11 56181 CASAVA_Build 1 184996017 1D CCTGAGCTTA T/- TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 7 6 56182 CASAVA_Build 1 185008309 1D TTCATATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 14 14 T 12 11 56183 CASAVA_Build 1 185010298 1I TATTTTCCTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 25 7 11 7 T 8 9 56184 CASAVA_Build 1 185010375 2D AAACAAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 1148 het 1148 ref 32 20 5 8 A 24 22 56185 CASAVA_Build 1 185013671 3D AGTGACAGTT CTC/--- CTTGTAGCAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 CTC 1 0 56186 CASAVA_Build 1 185020109 1D TTGTTCTCAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 413 hom 37 1 30 7 A 9 8 56187 CASAVA_Build 1 185020619 4D TCCGCATTGC TTAA/---- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TTAA 1 0 56188 CASAVA_Build 1 185024313 2D TGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 1092 het 1092 ref 47 32 3 12 TG 9 8 56189 CASAVA_Build 1 185030826 1I GCATATCTTC -/T TTGGAGACAT 3070 hom 96 het 39 0 31 8 T 2 3 56190 CASAVA_Build 1 185031345 1I GTAGGAATCA -/T TTTTTTTATT 2528 het 1402 hom 11 5 6 0 T 7 8 56191 CASAVA_Build 1 185034669 1D CATAAACGGG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 111 het 44 0 38 7 A 8 7 56192 CASAVA_Build 1 185035839 1I AATATACCTT -/A GTGTGACTAT 3070 het 3070 ref 50 25 16 9 A 0 1 56193 CASAVA_Build 1 185038620 1D AAACAAAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2703 hom 31 8 20 3 T 10 9 56194 CASAVA_Build 1 185052512 1I CTGGAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 9 10 56195 CASAVA_Build 1 185059727 1D ATAGTAAAAT G/- GACAGGAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 2 1 56196 CASAVA_Build 1 185067710 1D TTAAAACATG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 7 56197 CASAVA_Build 1 185074820 1I CCTCAAAGTT -/A AAAAAAACAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 7 8 56198 CASAVA_Build 1 185077694 1D GAGGGGTTGC G/- GGGAGCTTTT 3070 hom 116 het 47 0 39 9 G 4 3 56199 CASAVA_Build 1 185082900 5D ATTTATAGAC TATTT/----- TATATTAACC 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 TATTT 1 0 56200 CASAVA_Build 1 185086275 4I ACAAGGTAAG ----/AGCT AAGTCTTATA 3070 het 3070 ref 40 26 12 3 AGCT 0 1 56201 CASAVA_Build 1 185092049 2D ATCTTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2199 hom 21 6 12 3 TA 7 6 56202 CASAVA_Build 1 185096181 1I GAGCTGTCTC -/A GCTCAGTGAG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 A 0 1 56203 CASAVA_Build 1 185099796 1I GCTGGGATTA -/T AGGCATGAGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 0 1 56204 CASAVA_Build 1 185100023 28D CATGGGAGTG CAGATTCATCCTTGACACTCTGCTTTCA/---------------------------- TTTCCTTTAG 3055 het 3055 ref 39 39 7 4 CAGATTCATCCTTGACACTCTGCTTTCA 1 0 56205 CASAVA_Build 1 185103264 1I GTTCATTTCT -/G GTATATAGAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 G 1 2 56206 CASAVA_Build 1 185110135 1I CTTCTTTTAG -/A AAGTGTTGGG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 2 3 56207 CASAVA_Build 1 185115600 1D TTATATATAT A/- TTTTTTTATT 1798 hom 10 het 4 0 4 0 A 1 0 56208 CASAVA_Build 1 185120648 1D TCCTGTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 32 1 17 14 A 16 15 56209 CASAVA_Build 1 185124606 1D GAAAATGGTT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 7 56210 CASAVA_Build 1 185125529 3I TTTGTTTAGA ---/CCT CCTCTGTACT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 CCT 1 2 56211 CASAVA_Build 1 185126299 1I TTCAAGTGGG -/T TATTTATGTG 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 T 1 2 56212 CASAVA_Build 1 185127168 1D TTCTGTTGTG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 8 7 56213 CASAVA_Build 1 185130009 2D TATGTTAGAT AA/-- AGTCTATTGA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 3 1 56214 CASAVA_Build 1 185134272 1D AGCAAAAGAA T/- GATCAACACG 3070 het 3070 ref 41 22 12 8 T 1 0 56215 CASAVA_Build 1 185135774 1I TATAACTTTG -/C TTTTTTGGAG 3070 hom 107 het 39 0 35 4 C 0 1 56216 CASAVA_Build 1 185139833 1D CTGAAATGGC T/- TTTAGTTTTT 2928 het 2928 ref 19 13 6 0 T 4 3 56217 CASAVA_Build 1 185150026 1I TATATATATG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 7 8 56218 CASAVA_Build 1 185151930 3D TCGTAAACTT CTC/--- CTCCTCGAAC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CTC 3 2 56219 CASAVA_Build 1 185168050 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 30 1 20 9 T 13 12 56220 CASAVA_Build 1 185168362 13D GGCCTTATTT TCTTCTTTTAAAA/------------- AATTAGGCAT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 TCTTCTTTTAAAA 1 0 56221 CASAVA_Build 1 185171164 2D AGGGTTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 22 1 18 3 T 13 11 56222 CASAVA_Build 1 185173496 1D AAAAAAAAAA T/- AGCCTACTGG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 1 0 56223 CASAVA_Build 1 185182209 1I CCTCTAAGCG -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 5 6 56224 CASAVA_Build 1 185184272 2D AAGATTTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 32 2 25 5 A 14 12 56225 CASAVA_Build 1 185185147 3D30M4D AGAAAGAAAA AAGAAAAAGAAAGAAGAAAGAAAGAAAGGCAATAGAA/---AGAAAGAAAAAAGAAAGAAAGAAAGGCAAT---- AGAAAGAAAA 3070 hom 91 het 22 0 31 4 N/A 0 0 56226 CASAVA_Build 1 185187209 2I CCCAATAGTT --/AA AAAAAAAAGC 3070 hom 74 het 36 0 31 5 A 8 10 56227 CASAVA_Build 1 185188466 1I CTCCTGCCCC -/T GTCCCCTCCT 2298 hom 15 het 8 0 6 2 T 0 1 56228 CASAVA_Build 1 185189248 4D CTGTTGCAAA TAAT/---- TTCTTTCAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TAAT 1 0 56229 CASAVA_Build 1 185189709 1D TCTAGTAAAA G/- ACATATTTTG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 G 1 0 56230 CASAVA_Build 1 185190422 1I ATAGAATCTC -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 6 7 56231 CASAVA_Build 1 185191656 1I GACCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1680 hom 10 het 5 0 4 1 T 13 14 56232 CASAVA_Build 1 185192872 1I GCACCACTGC -/T ACTCCAGCCT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 0 1 56233 CASAVA_Build 1 185194957 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 4 A 10 9 56234 CASAVA_Build 1 185195106 9I AAGGAAATAT ---------/AAACTATCA ATCATCCCCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAACTATCA 0 1 56235 CASAVA_Build 1 185196926 1D ACCAGAAGCT G/- GGGGGGGATT 3070 hom 128 het 48 0 42 7 G 8 7 56236 CASAVA_Build 1 185197262 3D AAAATAAAAT AAC/--- AATAAAAGGA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 AAC 1 0 56237 CASAVA_Build 1 185197874 1I TCAAGTAACC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 9 10 56238 CASAVA_Build 1 185198583 1I GTCACTTTGT -/A GTTATTATTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 0 1 56239 CASAVA_Build 1 185204656 1I AAGACGAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 9 10 56240 CASAVA_Build 1 185205031 4I TTATTTTTAA ----/TTAT TTATGGATGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTAT 1 2 56241 CASAVA_Build 1 185205499 1D GATTTCATTA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 8 7 56242 CASAVA_Build 1 185216526 5D AATTAATATC TTTAA/----- TTTTTGTAAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TTTAA 1 0 56243 CASAVA_Build 1 185217651 3I GCAAGATAAC ---/ATA ATTAAGAAAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 ATA 0 1 56244 CASAVA_Build 1 185237019 2D GCTGGAGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 12 10 T 14 12 56245 CASAVA_Build 1 185239073 1I CTTGTATTTA -/G ATGAATGCGC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 0 1 56246 CASAVA_Build 1 185246761 3I AAGGTTTCTC ---/CTT CTGTGTTTGT 3070 het 3070 hom 64 27 30 7 CTT 0 1 56247 CASAVA_Build 1 185247025 1I TTCTTTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2860 hom 27 12 10 5 T 11 12 56248 CASAVA_Build 1 185249382 1D AAGTCAAGCA T/- TTGGGTTTTC 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 T 3 2 56249 CASAVA_Build 1 185253117 3I TCCCAACAAA ---/AAC AACAAAACCC 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 AAC 1 2 56250 CASAVA_Build 1 185290978 1D TTGCTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 938 hom 43 4 29 11 T 13 12 56251 CASAVA_Build 1 185303428 1D TTTCACATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 12 11 56252 CASAVA_Build 1 185313128 1I ATAGATATAA -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 6 7 56253 CASAVA_Build 1 185342320 4I AGGATCAAGG ----/GGGT GGGTACATGT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 GGGT 1 2 56254 CASAVA_Build 1 185347155 1D GCCCTCAGCA T/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 T 7 6 56255 CASAVA_Build 1 185347895 11D GAAGACAGCG TGGTAATAGTT/----------- TGGAAATAAA 3070 het 3070 ref 51 27 23 3 TGGTAATAGTT 1 0 56256 CASAVA_Build 1 185368135 1I ACAAAGAAGG -/T TATTTTATAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 2 56257 CASAVA_Build 1 185368542 1I TTAACCAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 18 13 T 12 13 56258 CASAVA_Build 1 185405227 1I CTTTTTTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 8 9 56259 CASAVA_Build 1 185405874 1D CCAACATCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 79 het 30 0 27 3 T 10 9 56260 CASAVA_Build 1 185407137 1I AAATTTATTT -/C CCAGGAGTTC 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 C 2 3 56261 CASAVA_Build 1 185408644 1I TTTATCCATA -/T TTTTTCATGG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 5 6 56262 CASAVA_Build 1 185419256 1D CTACAGAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 A 10 9 56263 CASAVA_Build 1 185425544 1D TGCTGAGGTC A/- AAATTGTTCT 3070 het 3070 hom 59 22 29 8 A 4 3 56264 CASAVA_Build 1 185428891 5D GAACTACCAA ACTGT/----- CCCCTGCCTG 2591 het 2591 ref 27 18 8 3 ACTGT 1 0 56265 CASAVA_Build 1 185430963 5I TATAGTAGTG -----/TTTTC TTTTTTATGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TTTTC 0 1 56266 CASAVA_Build 1 185432902 1D GAGTTGTTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 7 6 56267 CASAVA_Build 1 185435189 1I TTTAACAATA -/T TTGTTACTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 2 3 56268 CASAVA_Build 1 185464316 2I CTATAGAGGC --/TT TTTAGTTTAG 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 T 3 5 56269 CASAVA_Build 1 185487501 4I ATTGTTAATT ----/GAAA GAAAGTATAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 GAAA 1 2 56270 CASAVA_Build 1 185511101 4D ATATATATAT ATAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 ATAG 1 0 56271 CASAVA_Build 1 185522204 1I CTATTCAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 9 10 56272 CASAVA_Build 1 185522292 4D TCACTCTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 23 15 6 TTTG 4 3 56273 CASAVA_Build 1 185531597 1D TGCACCACGG T/- TTTGGTAGTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 4 3 56274 CASAVA_Build 1 185531748 5I CAAGTTTGTC -----/TACCA AGATTGGTAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 TACCA 0 1 56275 CASAVA_Build 1 185536752 4I TGGGGAGTTA ----/TTAC TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 TTAC 0 1 56276 CASAVA_Build 1 185538991 1I TTAACTCTAC -/T TCTTAAATGA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 1 2 56277 CASAVA_Build 1 185539415 10D TTTCTTTCTT TCTTTCTTTG/---------- TCTTTCTCTT 78 het 78 ref 18 10 2 8 TCTTTCTTTG 1 0 56278 CASAVA_Build 1 185543103 1D AAGCTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3032 het 1938 hom 34 12 11 11 A 17 16 56279 CASAVA_Build 1 185552739 1D AGAGACCTCA C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 C 8 7 56280 CASAVA_Build 1 185566349 1I CCAAAAAAAA -/T AAAGGAAACA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 0 1 56281 CASAVA_Build 1 185578237 3I GTTGAATTAC ---/TCT TCTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 TCT 2 3 56282 CASAVA_Build 1 185598149 2I GATGCACGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 56 29 20 7 TG 6 7 56283 CASAVA_Build 1 185598742 2I TATATATATA --/TG TATGTGTGTG 2634 het 1523 hom 17 6 6 5 TG 0 1 56284 CASAVA_Build 1 185612418 1D TTTTGTTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 G 1 0 56285 CASAVA_Build 1 185617953 1D GATGGAGAAC A/- AAAAAGCCTC 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 A 6 5 56286 CASAVA_Build 1 185626690 3I GGTTCAGTAT ---/CCC CCCAGTCATT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 C 3 6 56287 CASAVA_Build 1 185628946 1D CTGATATTAG A/- AAATCAATTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 3 56288 CASAVA_Build 1 185630578 1D GATGAAGTAA T/- TTTTTTAGAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 6 56289 CASAVA_Build 1 185639453 5D GACTTTAACA GGCTT/----- GTTACTTCCC 3070 het 3070 ref 51 27 20 8 GGCTT 1 0 56290 CASAVA_Build 1 185656530 1D ACTCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 976 het 976 ref 29 12 6 11 A 19 18 56291 CASAVA_Build 1 185667391 6I ACACACACAC ------/ACTACA TACACACACA 3070 hom 87 het 34 0 29 6 ACTACA 0 1 56292 CASAVA_Build 1 185668033 1D CATTAATCTA C/- CTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 C 2 1 56293 CASAVA_Build 1 185679684 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2288 het 2288 ref 29 13 9 7 A 13 12 56294 CASAVA_Build 1 185684078 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2955 het 1399 hom 25 5 9 11 T 10 11 56295 CASAVA_Build 1 185684684 1D CTCTCATATT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 8 7 56296 CASAVA_Build 1 185686288 1I AAGACTTCAT -/A AATGATTCAT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 2 3 56297 CASAVA_Build 1 185696891 9D GCAACTGAGC CAAATACTG/--------- CAAATACTGC 3070 het 3070 hom 45 17 19 17 CAAATACTG 2 1 56298 CASAVA_Build 1 185697728 1D CTCAGAGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 10 9 56299 CASAVA_Build 1 185699309 4I TTTCAAGGAG ----/AAGA GAGAGATCAA 3070 het 3070 hom 56 20 28 8 AAGA 0 1 56300 CASAVA_Build 1 185699543 1I TCCTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 10 11 56301 CASAVA_Build 1 185705986 1D CAGCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 34 1 22 11 A 12 11 56302 CASAVA_Build 1 185709271 1I TATTTAAGCG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 35 0 29 6 T 9 10 56303 CASAVA_Build 1 185710709 1I TTGTAGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3063 het 3063 ref 32 16 8 8 T 11 12 56304 CASAVA_Build 1 185715747 4D ATTGATTGAT TGAC/---- TAATTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TGAC 1 0 56305 CASAVA_Build 1 185716640 1D CAGCCTTCTG C/- CTTCTGTAGT 3070 hom 104 het 40 0 34 6 C 2 1 56306 CASAVA_Build 1 185722473 24I ACCCTTCACC ------------------------/TTTTTTGATCTAACACATATTTTT GTGTAGGAGG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TTTTTTGATCTAACACATATTTTT 0 1 56307 CASAVA_Build 1 185725372 3D TATAAAGAAG ACA/--- ACATTATTCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ACA 2 1 56308 CASAVA_Build 1 185730267 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 36 1 17 18 T 16 15 56309 CASAVA_Build 1 185736460 2I TTTATTCAGG --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 9 11 56310 CASAVA_Build 1 185739477 1I TACTATGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 10 56311 CASAVA_Build 1 185756204 1D GCAGAAAACA T/- TTTTTTTTTT 2913 het 2913 ref 30 12 8 10 T 15 14 56312 CASAVA_Build 1 185776280 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 9 10 56313 CASAVA_Build 1 185781119 2I ATAAATGCTT --/TA TATATATATA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 TA 8 9 56314 CASAVA_Build 1 185790145 1D CCACAAACAA T/- TTTTTAAGGC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 6 5 56315 CASAVA_Build 1 185799068 8I GGCCCTGACT --------/GTGGGCTC GTGTGTGGAA 3070 hom 69 het 25 0 22 3 GTGGGCTC 0 1 56316 CASAVA_Build 1 185801948 2D AAGGAAGTGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 40 12 22 8 AG 8 7 56317 CASAVA_Build 1 185812130 13I TGCATTTAAA -------------/TTTTCTTTTTCTT TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 TTTTCTTTTTCTT 1 2 56318 CASAVA_Build 1 185815337 1D CATTAAAAAA T/- ACAAAAATTA 3070 het 141 hom 15 1 8 6 T 1 0 56319 CASAVA_Build 1 185815604 1D CTACAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1267 hom 28 4 11 13 T 17 16 56320 CASAVA_Build 1 185820744 1D ATGAGGTAGG A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 7 6 56321 CASAVA_Build 1 185821522 1D63M1D AAGAACCACC TATTCCAAGTTGTCATTCAGATGCTATTTGAATATCTCTGGTAATGAAAGTTTCAATGAGGGGAT/-ATTCCAAGTTGCCATTCAGATGCTATTTGAATATCTCTGGTAATGAAAGTTTCAATGAGGGGA- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 21 7 10 21 N/A 0 0 56322 CASAVA_Build 1 185840731 1I TCTGAAAAAA -/G TGCAGAGAGC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 0 1 56323 CASAVA_Build 1 185847380 1I ATTCAGCCAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 52 26 14 12 A 8 9 56324 CASAVA_Build 1 185855700 1D TTTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1559 hom 33 5 20 8 A 14 13 56325 CASAVA_Build 1 185858929 1I GCCTAAATTA -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 T 7 8 56326 CASAVA_Build 1 185859300 3D AGTTTTAAAC ATT/--- ATTGTCAATC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 ATT 2 1 56327 CASAVA_Build 1 185864801 1D CTTTTAAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 10 9 56328 CASAVA_Build 1 185871733 4D AAAAAACAAG CAAA/---- CAAACAAACA 2647 het 2647 ref 24 14 8 4 CAAA 4 3 56329 CASAVA_Build 1 185873956 1I TCTGGTGGGT -/A AGTATTAATA 3070 het 3070 ref 41 28 11 2 A 1 2 56330 CASAVA_Build 1 185884231 1I ATTAACGTTT -/A AAAAACTAGA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 5 6 56331 CASAVA_Build 1 185885695 5D ACACAAATAT ACAAG/----- ACAAGATAGG 3070 het 3070 ref 38 19 18 7 ACAAG 2 1 56332 CASAVA_Build 1 185887537 1I CCTTTAGGAA -/T ATTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 47 18 27 2 T 0 1 56333 CASAVA_Build 1 185893551 1D ATTTTATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 11 10 56334 CASAVA_Build 1 185902382 1D AATTACAGAT A/- TTTTTTTTTG 1498 het 1498 ref 15 11 4 0 A 1 0 56335 CASAVA_Build 1 185902438 1D TCTTTCCCCC T/- TTTTTTTTAA 2730 het 2439 hom 20 10 6 5 T 9 8 56336 CASAVA_Build 1 185930219 1I GAGCTCCAAG -/T TCTGTGATGG 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 1 2 56337 CASAVA_Build 1 185934643 1I TGATGTTTCT -/A AAACTATACC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 3 4 56338 CASAVA_Build 1 185940624 1D AATTTCAGTC A/- AATATATTTG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 3 2 56339 CASAVA_Build 1 185945321 1I GAATTTACAG -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 6 7 56340 CASAVA_Build 1 185946091 8D CATCTCAAAT ATAAATAC/-------- ATAAATACAT 3070 het 3070 ref 21 9 9 7 ATAAATAC 2 1 56341 CASAVA_Build 1 185948442 1D CTTGCCACAA T/- TTCTAAGAAC 3070 het 3070 ref 50 20 19 11 T 3 2 56342 CASAVA_Build 1 185952471 4D CATCATCATC AATT/---- GTTAGCAACA 3070 het 3070 ref 58 30 26 3 AATT 1 0 56343 CASAVA_Build 1 185957913 2I ACAATATTTT --/AC AGAGTGTAAC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 AC 0 1 56344 CASAVA_Build 1 185962737 4I GTGAGATGAA ----/AATC AAGGTTTGTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AATC 0 1 56345 CASAVA_Build 1 185965450 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 34 0 30 4 A 10 11 56346 CASAVA_Build 1 185969080 2I ATAGACAGAC --/AT ACACATGTAT 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 AT 0 1 56347 CASAVA_Build 1 185974161 4D ATCTATATAT TATC/---- TATCTGCCTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 TATC 2 1 56348 CASAVA_Build 1 185975770 1I TGTTTTATAA -/T TTTTTGAAGT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 5 6 56349 CASAVA_Build 1 185979373 1D CTTTGTGCAC A/- AGGCTTATGA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 2 1 56350 CASAVA_Build 1 185988973 4D TTTTGCAAGA GTAT/---- GTATGCTAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 GTAT 2 1 56351 CASAVA_Build 1 186007538 1I GTGCTGGAGG -/A AAAAAAATAG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 7 8 56352 CASAVA_Build 1 186010632 2I TTTGAAAAAC --/AG AGGATTAATC 3070 hom 53 het 29 0 18 11 AG 1 2 56353 CASAVA_Build 1 186011362 9I CTTGAAAATC ---------/ATGAAATAG ATGAAATAGA 3070 hom 101 het 40 0 33 7 ATGAAATAG 1 2 56354 CASAVA_Build 1 186013392 1D GTATGGAAAG T/- TATTGTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 2 1 56355 CASAVA_Build 1 186014019 1D AAGCAGAGAA T/- GAATGAGAGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 0 56356 CASAVA_Build 1 186015359 1I ACTATCTAGA -/C CATTAAAAGA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 1 2 56357 CASAVA_Build 1 186015589 1I ATCAGATCCA -/C CACAAAATCC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 C 1 2 56358 CASAVA_Build 1 186017299 1D CTCACCGTGG C/- CTCCCAAAGT 3070 het 2230 hom 17 6 10 1 C 2 1 56359 CASAVA_Build 1 186029112 1I TGAGTGTTGT -/G GGGGGGCGTC 3070 hom 59 het 25 0 19 6 G 6 7 56360 CASAVA_Build 1 186029580 1D CTATTTGTAA C/- TTTTTTGGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 1 0 56361 CASAVA_Build 1 186029960 3I ATTTTACTGA ---/TGT TGTTGTTAAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TGT 2 3 56362 CASAVA_Build 1 186034544 3D TCTAAAAAAA ATT/--- ATTATGAATG 3070 hom 99 het 36 0 34 3 ATT 2 1 56363 CASAVA_Build 1 186035367 4D AGTTTTATTT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TA 9 7 56364 CASAVA_Build 1 186037791 1I TCATGAAGAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 9 56365 CASAVA_Build 1 186038170 1D AATGATAGAA T/- TCACTGAGAT 3070 hom 117 het 43 0 39 5 T 2 1 56366 CASAVA_Build 1 186038280 1D GTGCAGCTTT G/- GGCAAAGTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 G 3 2 56367 CASAVA_Build 1 186045318 1D AATGAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 32 1 28 3 A 11 10 56368 CASAVA_Build 1 186047652 1I GCTTTATTAC -/T TTGATAATAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 2 3 56369 CASAVA_Build 1 186049637 1I TTAAAACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 492 hom 39 3 26 10 T 14 15 56370 CASAVA_Build 1 186059099 1D ATAAACCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 10 9 56371 CASAVA_Build 1 186067560 1I ACATTAGTTA -/C AGGATTACTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 0 1 56372 CASAVA_Build 1 186075328 3D CTAGCCTAAA CTC/--- CTGTATAACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTC 1 0 56373 CASAVA_Build 1 186077637 1I GGTATGCAAC -/T TTTTTTATCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 7 56374 CASAVA_Build 1 186079855 1D AGACTTATAA T/- TGTTTATAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 2 1 56375 CASAVA_Build 1 186085325 1I AGAGAAGAGT -/A AAAAATTAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 5 6 56376 CASAVA_Build 1 186088665 3D AATAATAATA ATG/--- ATGACAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 6 ATG 2 1 56377 CASAVA_Build 1 186091763 7I GGTTCCTGCC -------/AATGCCA TGGATTCATT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AATGCCA 0 1 56378 CASAVA_Build 1 186105345 3I TACAGTATAT ---/GCC CTTTTCACAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 GCC 0 1 56379 CASAVA_Build 1 186114714 1D AAAAAAAAAA C/- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 51 27 17 7 C 1 0 56380 CASAVA_Build 1 186123767 1I TTTTATATAT -/A AAAAAACAGT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 6 7 56381 CASAVA_Build 1 186125977 1D AAGAGAGGTG T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 T 7 6 56382 CASAVA_Build 1 186129539 1D TCTGCACATA C/- ATGAGTTGAA 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 C 1 0 56383 CASAVA_Build 1 186133704 5D TTTGACAAAT AAAAC/----- AAACAAAAAG 3070 het 3070 hom 56 27 28 2 AAAAC 1 0 56384 CASAVA_Build 1 186152938 1I TTCATTTTAA -/C CCCCCAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 C 5 6 56385 CASAVA_Build 1 186165755 1D AGATTGCCCC T/- AAGGATCACA 3070 het 3070 hom 34 15 14 6 T 1 0 56386 CASAVA_Build 1 186171921 28I CTCTCTTTCT ----------------------------/TGCCTGCTCCTGCTTTTGCCATGTGATG TGCCTGCTCC 3070 hom 60 het 20 0 20 5 TGCCTGCTCCTGCTTTTGCCATGTGATG 0 1 56387 CASAVA_Build 1 186172695 1I AATCTGGGGG -/A GACCAGAAAA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 0 1 56388 CASAVA_Build 1 186175340 1I AGGAGAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 29 1 22 6 T 12 13 56389 CASAVA_Build 1 186186437 1I ATTTTTCTTG -/C CCCCCCCAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 7 8 56390 CASAVA_Build 1 186195830 1I CATTGCTTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 7 8 56391 CASAVA_Build 1 186216752 6D TTCTGCAGGC TGGGAA/------ TGGGAAGTTC 3070 hom 90 het 30 0 31 1 TGGGAA 2 1 56392 CASAVA_Build 1 186239917 1I TTCTTGAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 10 56393 CASAVA_Build 1 186242096 1D CCTGGGACGT A/- GGCCTTGCCA 3070 hom 108 het 38 0 35 4 A 1 0 56394 CASAVA_Build 1 186253164 1I AAAATAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 40 1 32 7 T 11 12 56395 CASAVA_Build 1 186279673 3I TCATTTTAAT ---/AAA ACTCAAGTTT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 1 4 56396 CASAVA_Build 1 186283760 5I CTCTGAAAAG -----/GCAGA GCTCTGCTTA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 GCAGA 0 1 56397 CASAVA_Build 1 186284964 1I TCTTTGATAG -/T TTTTCCCCCC 3070 hom 157 het 58 0 52 6 T 4 5 56398 CASAVA_Build 1 186286210 4D ACATTCTTAC CAAA/---- CACTTTTACT 3070 hom 84 het 29 0 28 4 CAAA 1 0 56399 CASAVA_Build 1 186286400 5D AATATATAAA TATAT/----- TATATATTTT 2396 hom 15 het 6 0 6 1 TATAT 2 1 56400 CASAVA_Build 1 186289594 2D ATACGTATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 74 het 29 0 25 5 AC 9 8 56401 CASAVA_Build 1 186300498 1I TCTTCATAGG -/T TTTCTAGAAA 3070 hom 74 het 30 0 24 6 T 3 4 56402 CASAVA_Build 1 186306752 1I TGCTGGGAAG -/T TAAAATGCTA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 1 2 56403 CASAVA_Build 1 186308230 1I TGGTTGCATC -/T ATTCAGCCAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 0 1 56404 CASAVA_Build 1 186308936 1D TACCTGAGAG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 92 het 36 0 31 5 A 8 7 56405 CASAVA_Build 1 186325651 1I GAATGAGATT -/A AAAAAAGAAC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 6 7 56406 CASAVA_Build 1 186332865 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 10 8 56407 CASAVA_Build 1 186333132 2I CTTTTGTGGA --/TT TGTTTCAGGT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 1 3 56408 CASAVA_Build 1 186338461 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 37 1 34 2 A 11 10 56409 CASAVA_Build 1 186342134 1D TAAAACAAGC T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 7 56410 CASAVA_Build 1 186352622 1I TAAAAGACCC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 8 9 56411 CASAVA_Build 1 186363664 1I CATGCACGGA -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 T 6 7 56412 CASAVA_Build 1 186363765 1I CTCCATTGCA -/G GCCTGGGGCA 3070 hom 90 het 37 0 28 9 G 1 2 56413 CASAVA_Build 1 186364584 2D GCATGCCATC AG/-- GGGATCTGTC 3070 hom 93 het 36 0 30 9 AG 1 0 56414 CASAVA_Build 1 186364962 1D GTAGGGAAAG A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 6 5 56415 CASAVA_Build 1 186376979 1I ATCCTTGATC -/T TTGCCAGACG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 2 3 56416 CASAVA_Build 1 186379872 4I TGTGTAAAAC ----/AGAA AGAAAGAAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AGAA 2 3 56417 CASAVA_Build 1 186394267 1D TTTAAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 216 hom 35 2 18 15 A 15 14 56418 CASAVA_Build 1 186394695 2I AAATGAACCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 12 14 56419 CASAVA_Build 1 186397049 8D GTTTATAAAT AGATTTTA/-------- AGTAATTAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 6 AGATTTTA 1 0 56420 CASAVA_Build 1 186398415 1D TTGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 9 56421 CASAVA_Build 1 186400109 2D AAAAAAAAGA CT/-- ATAAATCTTA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 CT 1 0 56422 CASAVA_Build 1 186400439 1D CTGATTTTCC A/- AAATTGTCTG 3070 hom 108 het 43 0 37 7 A 4 3 56423 CASAVA_Build 1 186402840 2D AACCAATCTT AA/-- GTTAGGTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 2 0 56424 CASAVA_Build 1 186407281 2I AAATAGAAAC --/AT ATTACTGAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AT 1 2 56425 CASAVA_Build 1 186407396 1D AAGCTCTGGG T/- TTTTTGGGGA 3070 hom 103 het 38 0 34 5 T 6 5 56426 CASAVA_Build 1 186408636 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAAAA 1890 het 317 hom 34 4 10 24 AC 1 0 56427 CASAVA_Build 1 186410387 3D ATGAAAAAAT AGG/--- AGGGAAGATA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 AGG 2 1 56428 CASAVA_Build 1 186413759 4I ATAAAGTATC ----/TGAT TGATTATTTA 3070 hom 98 het 39 0 33 6 TGAT 1 2 56429 CASAVA_Build 1 186420867 1I TTAAAAATCA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 107 het 39 0 36 3 T 7 8 56430 CASAVA_Build 1 186425426 4D AATTTCTGAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 102 het 46 0 35 11 AAAC 5 4 56431 CASAVA_Build 1 186427008 5D AAAGAAAAGC ATTAT/----- ATTATAAGGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 ATTAT 2 1 56432 CASAVA_Build 1 186440786 2I AAGGAGAGAG --/AA AGAGAGAGAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 1 3 56433 CASAVA_Build 1 186451232 1I TTATCTTTTC -/A AAAGACTGAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 3 4 56434 CASAVA_Build 1 186453014 2D GGGATTGGAG AC/-- ACCTAACTGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AC 2 1 56435 CASAVA_Build 1 186454979 1I TAAAATCCAT -/A AAAAAATCTA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 6 7 56436 CASAVA_Build 1 186459259 1D TATTCTTCTA T/- TTTTTTCGTA 3070 hom 96 het 38 0 32 9 T 7 6 56437 CASAVA_Build 1 186470269 1I ATGATATATA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 8 56438 CASAVA_Build 1 186485064 4D ATATATACAC TATA/---- TCTATCTATC 1931 het 358 hom 17 1 6 10 TA 2 0 56439 CASAVA_Build 1 186499510 2I CTTTAGCTAG --/AC ACAGAGCACT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 AC 1 2 56440 CASAVA_Build 1 186509689 4D CATATTTGAT ATTA/---- ATTAATAATT 2321 hom 12 het 5 0 5 0 ATTA 2 1 56441 CASAVA_Build 1 186518957 28I9M8I TTAGACTCAC ----------------------------CTTAGTGAT--------/TAAGGGAATAAGAATTATAATAAATGTTATTTGTGGTTTTCAGTA TTTAGATGAT 3070 hom 48 het 11 0 17 0 N/A 0 0 56442 CASAVA_Build 1 186530251 4D GTATTGTAAC TGAG/---- TAACTTTGGT 3070 het 3070 hom 35 13 16 7 TGAG 1 0 56443 CASAVA_Build 1 186538460 2D ACTAAAAATC TA/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 39 0 22 17 TA 1 0 56444 CASAVA_Build 1 186551658 1D TGTCAGTCTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 21 14 2 T 8 7 56445 CASAVA_Build 1 186554482 1I ATTAATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 11 12 56446 CASAVA_Build 1 186555944 1D TGCTTTACTA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 8 7 56447 CASAVA_Build 1 186556023 1I CAATATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 A 13 14 56448 CASAVA_Build 1 186556859 4D AAGGCTTCCC TATT/---- TATTTAAGTC 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 TATT 2 1 56449 CASAVA_Build 1 186565755 2D TTTTATAATA AC/-- AACAGAATTT 3070 het 3070 ref 28 13 14 4 AC 1 0 56450 CASAVA_Build 1 186583129 1I AAAGTCATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 33 1 26 6 T 12 13 56451 CASAVA_Build 1 186597517 1I GGAAAAAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 9 10 56452 CASAVA_Build 1 186604422 1D AAAATCATTA C/- TTATATGTAT 3070 het 3070 hom 37 18 19 1 C 1 0 56453 CASAVA_Build 1 186605067 17I TTTTACTCGG -----------------/TCTGCCTCAAACCTGTT TCTTCATAGG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 TCTGCCTCAAACCTGTT 0 1 56454 CASAVA_Build 1 186606629 1D CATGTAAACG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 T 8 7 56455 CASAVA_Build 1 186606751 2I AGTATCTAAA --/CT CTCTGATGAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 CT 2 3 56456 CASAVA_Build 1 186608033 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTTTCT 2102 het 2102 ref 16 8 6 2 T 10 8 56457 CASAVA_Build 1 186625856 1I ACTGAGCTGT -/A ACTATATTGG 3070 het 3070 hom 43 14 18 11 A 1 2 56458 CASAVA_Build 1 186631553 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 9 10 56459 CASAVA_Build 1 186636005 3I GACACAAAAA ---/AAG AAAATATGTG 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 AAG 0 1 56460 CASAVA_Build 1 186637927 1I ACCAAAAAAA -/T ATATATAGAT 2368 het 2283 hom 16 7 5 4 T 0 1 56461 CASAVA_Build 1 186638443 2I GGTTAAAAGC --/TA TATAATCACA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TA 2 3 56462 CASAVA_Build 1 186639183 3D TAATATGCAC AAG/--- AACATAGAGA 3070 het 3070 ref 37 21 15 3 AAG 1 0 56463 CASAVA_Build 1 186643560 1I ATTATATAGT -/A AAGTGCAATA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 2 3 56464 CASAVA_Build 1 186649592 2I TATATGTATT --/TA TATGTATATA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 TA 1 2 56465 CASAVA_Build 1 186652266 2D GAAAATAAAC TT/-- TGTCTGCACT 3070 het 3070 hom 40 17 20 5 T 3 1 56466 CASAVA_Build 1 186652887 1D GCTTATGTTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 T 7 6 56467 CASAVA_Build 1 186653662 2D13M5D TCTTGAAATC TGTGAGTAGTCGAACTTTGT/--TGAGTAGTCGAAC----- ACAAAGTGAG 3070 het 3070 ref 29 19 12 5 N/A 0 0 56468 CASAVA_Build 1 186660416 1I TGTGTGTACA -/T ATATACATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 0 1 56469 CASAVA_Build 1 186662283 4I GTATTTTCTG ----/TTGT TTATGACTAA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 TTGT 0 1 56470 CASAVA_Build 1 186662828 1D TATTTGAAGA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 8 7 56471 CASAVA_Build 1 186662961 1D GATTTTTAAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 9 8 56472 CASAVA_Build 1 186663640 1I CTACAGATGC -/A TTGATTTATA 3070 het 3070 ref 47 22 21 5 A 0 1 56473 CASAVA_Build 1 186664197 1I ATAACTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 10 14 8 T 10 11 56474 CASAVA_Build 1 186666137 5I AAAAATTATA -----/ATAAC ATATTAGGTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATAAC 0 1 56475 CASAVA_Build 1 186669644 1I AGAAAATTTG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 7 8 56476 CASAVA_Build 1 186674003 2I TGATTTGCCC --/CT CTCTTCTTCT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 CT 2 3 56477 CASAVA_Build 1 186675635 1I GGGAATTCTT -/A AAAAAAACTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 8 56478 CASAVA_Build 1 186676115 2I TTTTAAAAAG --/AT ATTTTAGGAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 AT 1 2 56479 CASAVA_Build 1 186684315 1I TCTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTA 2035 het 2035 ref 18 6 6 6 T 9 10 56480 CASAVA_Build 1 186685178 1I ATGAGAGTGG -/T TAGCTACAGA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 1 2 56481 CASAVA_Build 1 186688710 1D TCTAGAAGAC T/- TTGAGAGTCA 3070 hom 172 het 60 0 58 2 T 3 2 56482 CASAVA_Build 1 186689694 1I AACAAATAAC -/A AAAAATCACT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 5 6 56483 CASAVA_Build 1 186693471 1I TCCCTGCAAA -/T ATTACAATTG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 0 1 56484 CASAVA_Build 1 186695936 1I AAGTTAACAC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 7 8 56485 CASAVA_Build 1 186696531 1I ATTCTAAGCC -/T TTTTTTTTAC 1437 het 1437 ref 13 8 3 2 T 8 9 56486 CASAVA_Build 1 186699705 6D GAATTTTGTA CCTTAC/------ CACAATCTTT 3070 het 3070 ref 43 25 14 7 CCTTAC 1 0 56487 CASAVA_Build 1 186700198 4I GCAAGGACTC ----/CCTA TGTTGTCCAG 1656 het 1656 ref 20 9 4 7 CCTA 0 1 56488 CASAVA_Build 1 186701852 1I TTCTGTGGAC -/A AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 6 7 56489 CASAVA_Build 1 186702131 1D TATCATGAAC T/- GCAAAATGAT 3070 het 3070 hom 58 25 27 7 T 1 0 56490 CASAVA_Build 1 186705155 1I TTTATGTATT -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 5 6 56491 CASAVA_Build 1 186705559 1I ATTGAATGCT -/A CTTCAATAAC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 0 1 56492 CASAVA_Build 1 186707413 2I AAAAATGCAT --/TC TGTTATATAA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 TC 0 1 56493 CASAVA_Build 1 186708579 2I18M4D AAAAGATTAT --GACTAGATAAAACAAAACAAAT/AAGACTAGATAAAACAAAAC---- AAATCAAAAA 3070 het 3070 ref 32 23 12 4 N/A 0 0 56494 CASAVA_Build 1 186710906 1I TGTAAAAATC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 8 9 56495 CASAVA_Build 1 186711205 4D CCGTAATTCC CTCT/---- CTCTCTCCCT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 CT 5 3 56496 CASAVA_Build 1 186720239 3D CCCCCCCCCC ACA/--- CACACACAAA 274 het 274 ref 22 9 2 13 ACA 1 0 56497 CASAVA_Build 1 186721842 1D TGTTAGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 916 hom 35 7 23 5 T 19 18 56498 CASAVA_Build 1 186729241 3D4M1D8M2I AATATAGATC TATCAAATATAGGGAA--/---CAAA-ATCGTAAATC ACCTAATTTC 3070 het 3070 hom 21 11 12 4 N/A 0 0 56499 CASAVA_Build 1 186729579 3I CATATTTATA ---/TAT TATTATGTAT 1897 het 1897 ref 19 11 6 2 TAT 2 3 56500 CASAVA_Build 1 186731638 8I TTAGCATTTC --------/TTTATTTG TTTTACTGTG 3070 het 3070 hom 52 21 25 6 TTTATTTG 0 1 56501 CASAVA_Build 1 186732711 1D TTTTGATTTC T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 8 7 56502 CASAVA_Build 1 186733824 1D AATGCATTAA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 38 12 20 8 T 7 6 56503 CASAVA_Build 1 186740736 1D GCTGAGGTAT A/- CAGAAAAATT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 A 1 0 56504 CASAVA_Build 1 186741673 1I TCATTTATTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 T 7 8 56505 CASAVA_Build 1 186743281 3D TTATTGAATA AAT/--- AATATCTTTT 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 AAT 2 1 56506 CASAVA_Build 1 186745557 2D ATACGTATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 2122 hom 17 6 10 1 TA 8 7 56507 CASAVA_Build 1 186746902 18I CAACCCCTTA ------------------/TCCTAACCCAGACCCTCT TCCTATTGAT 3070 het 3070 ref 35 18 17 3 TCCTAACCCAGACCCTCT 0 1 56508 CASAVA_Build 1 186747051 3I GTATTGATTA ---/ATT TTTTTTTTTT 340 het 340 ref 31 17 4 10 ATT 0 1 56509 CASAVA_Build 1 186748380 1I GACTCAACAT -/C CAAAAAAAAA 3070 het 1908 hom 42 6 24 12 C 1 2 56510 CASAVA_Build 1 186749958 4D CTGGTATCTG TTGT/---- TTGTTTCCTG 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 TTGT 2 1 56511 CASAVA_Build 1 186753762 1D TTCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 928 hom 15 3 9 3 T 11 10 56512 CASAVA_Build 1 186754184 3D TTTGGGAAAA TAT/--- TAATCACAAC 3070 het 3070 hom 48 19 25 7 TAT 1 0 56513 CASAVA_Build 1 186757801 1I GCTTTTTTTT -/C CCCAAGTCTC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 C 3 4 56514 CASAVA_Build 1 186761016 2I TCACTTTTGG --/TA TATATATATA 2033 het 2033 ref 18 9 6 3 TA 7 8 56515 CASAVA_Build 1 186761124 2D AACATAGATG TA/-- TATATATATA 3070 het 2876 hom 28 10 13 5 TA 6 5 56516 CASAVA_Build 1 186761822 1I GTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2594 hom 29 10 12 7 T 11 12 56517 CASAVA_Build 1 186770335 3D TAAAAAAGAA CTT/--- CTATATGCTC 3070 het 3070 ref 36 18 16 6 CTT 1 0 56518 CASAVA_Build 1 186771809 2D AAACATTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 2638 het 2638 ref 58 20 11 27 TG 1 0 56519 CASAVA_Build 1 186775654 1D GTAGCATTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 10 9 56520 CASAVA_Build 1 186776046 5I TGCACCATAC -----/TTAAA TTAAATGGGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTAAA 1 2 56521 CASAVA_Build 1 186781531 6D AGCAGTTCCT GGCTGG/------ GGCCACAGTC 3070 het 3070 hom 36 15 18 6 GGCTGG 1 0 56522 CASAVA_Build 1 186782285 1D ATTTCACGTC A/- AGTTGAAGTT 3070 het 3070 hom 52 19 29 4 A 2 1 56523 CASAVA_Build 1 186783976 1D TCTTTTCCTA T/- TTTTTCCCTG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 T 6 5 56524 CASAVA_Build 1 186784541 1I TTTTTTTTTT -/G ATTTAAGGTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 G 0 1 56525 CASAVA_Build 1 186788414 1D GCAAATGTTC T/- TAAGTGAGGA 3070 het 3070 ref 41 28 13 0 T 2 1 56526 CASAVA_Build 1 186788862 5D ATTGATCATT CTTTA/----- CTTTATGCAC 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 CTTTA 2 1 56527 CASAVA_Build 1 186790180 11D TTTTTTTTTT CTTTTTTGAGA/----------- CAGAGTCTTC 431 het 431 ref 13 6 3 5 CTTTTTTGAGA 1 0 56528 CASAVA_Build 1 186793444 1I CAAATAAAAC -/T TCCTATATGC 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 1 2 56529 CASAVA_Build 1 186797882 2D ATGAAAATTA AC/-- AGTTATTTCA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 AC 1 0 56530 CASAVA_Build 1 186799017 1I AAAGTGAAGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 6 7 56531 CASAVA_Build 1 186802611 1I ACTTGTTTGG -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 53 23 21 9 A 6 7 56532 CASAVA_Build 1 186803596 1D CCCTGCCCAC A/- AAAAATTGCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 6 5 56533 CASAVA_Build 1 186804380 3I ATGATATGTT ---/AAC AATATATCAT 3070 het 3070 hom 15 7 8 0 AAC 0 1 56534 CASAVA_Build 1 186804657 2D TTTCCTGAGA TG/-- GAGTCTTGCT 3070 het 3070 hom 19 10 9 0 TG 1 0 56535 CASAVA_Build 1 186805198 1D ACAATAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 11 10 56536 CASAVA_Build 1 186805423 2D11M3D ATGGGAAGAC TTAATATTATAAAATG/--AATATTATAAA--- ATGATACTCT 3070 het 3070 hom 34 18 20 1 N/A 0 0 56537 CASAVA_Build 1 186807612 1I ATTTGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 A 10 11 56538 CASAVA_Build 1 186807711 1I43M1I ACCACTCCAC -TTATATACCCCAAAATTTAAAACTATATATTCACAAAAATTTA-/ATTATATACCCCAAAATTTAAAACTATATATTCACAAAAATTTAG TATATGTGAA 3070 het 3070 hom 22 12 26 2 N/A 0 0 56539 CASAVA_Build 1 186808186 1D TTTAAAATAC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 T 9 8 56540 CASAVA_Build 1 186808822 4I ACATAACCAC ----/TTTA TTTAAGAATG 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 TTTA 1 2 56541 CASAVA_Build 1 186809810 2I CTAATACCAC --/TT TATTTTGTGG 3070 het 3070 ref 61 34 20 7 T 1 3 56542 CASAVA_Build 1 186813002 1I ATCCACTGGC -/A AAGGACACCA 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 A 2 3 56543 CASAVA_Build 1 186813654 2D TGACAAATAA TT/-- TTTTTTTTGC 3070 het 36 hom 25 1 16 8 T 10 8 56544 CASAVA_Build 1 186815959 1D CTCAGATTAG C/- CAAATTTGAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 C 2 1 56545 CASAVA_Build 1 186823812 1I AAATTCCTTG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 6 7 56546 CASAVA_Build 1 186825435 1D ACTTCATGTC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 12 10 11 T 8 7 56547 CASAVA_Build 1 186830435 1D ATAAATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 12 11 56548 CASAVA_Build 1 186833495 2D CCACAGAATC AA/-- AGTCAAGAAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 5 A 3 1 56549 CASAVA_Build 1 186834733 1D CCAACATCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 9 8 56550 CASAVA_Build 1 186834995 3D GAAGCTGTAC TTG/--- TTGAGCCCAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 10 TTG 2 1 56551 CASAVA_Build 1 186837315 1D ATTTTGTTAA C/- CTTGAACTCT 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 C 2 1 56552 CASAVA_Build 1 186851563 2I AAAAAATAAC --/AA AAAAAAAATG 2546 het 21 hom 26 1 9 16 A 8 10 56553 CASAVA_Build 1 186854498 3I AATCAATCAT ---/TTC TTGTTGTTAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 TTC 0 1 56554 CASAVA_Build 1 186857126 1I TAAACCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 11 12 56555 CASAVA_Build 1 186860877 1D TAATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 15 14 56556 CASAVA_Build 1 186862166 1D TTTCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 13 12 56557 CASAVA_Build 1 186867365 2I ATTCTGAAGG --/TT GTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 32 6 11 15 T 0 2 56558 CASAVA_Build 1 186869474 1D GAATATAGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 10 9 56559 CASAVA_Build 1 186870253 12I TGATATCGTC ------------/AGTGGTTTTCTT AAAGCCCCCT 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 AGTGGTTTTCTT 0 1 56560 CASAVA_Build 1 186870844 1I CCTGGATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 13 14 56561 CASAVA_Build 1 186871258 1I GGATAGAAGG -/A AAAAAATGAA 1568 het 1568 ref 33 12 6 15 A 6 7 56562 CASAVA_Build 1 186874074 1D CTTCATATAG A/- AAAAATTTGA 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 A 6 5 56563 CASAVA_Build 1 186876083 1D TCAATTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 8 9 T 11 10 56564 CASAVA_Build 1 186876814 4I ATTCATATGA ----/TAGT TAGTTAACTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TAGT 1 2 56565 CASAVA_Build 1 186876980 1D AATCTGACAT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 7 6 56566 CASAVA_Build 1 186883491 1I AAAATGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 793 hom 24 2 14 8 T 15 16 56567 CASAVA_Build 1 186886954 1I GTGAAACACC -/T TTCCTGAGTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 3 56568 CASAVA_Build 1 186889418 1D TTCCAAAAGA A/- AAAAAGTATT 3070 het 1000 hom 35 3 14 18 A 7 6 56569 CASAVA_Build 1 186889765 2D TCAATAATAT AA/-- GTTATAACAT 3070 het 3070 hom 18 9 8 3 A 2 0 56570 CASAVA_Build 1 186890415 4D32M1D ATCAGCACAA AAACAAACAAACAAACAAACAAAAACAACCCAAAACA/----AAACAAACAAACAAACAAAAACAACCCAAAAC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 20 N/A 0 0 56571 CASAVA_Build 1 186894353 1D GCTCCTCTTC A/- CCCTTATCTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 A 1 0 56572 CASAVA_Build 1 186895073 4D TATTTGAACC AACT/---- GAGACATTAG 3070 het 3070 ref 32 18 12 4 AACT 1 0 56573 CASAVA_Build 1 186896723 1D CTGCTTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 12 11 56574 CASAVA_Build 1 186911899 1D TGTTGCATGG T/- GTTAAAGTGT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 1 0 56575 CASAVA_Build 1 186929499 2D GGTTGTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 34 0 20 15 T 14 12 56576 CASAVA_Build 1 186930006 1D TATATTTTGG T/- TAACTATATT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 1 56577 CASAVA_Build 1 186936922 2D GTGTAGTCTC TT/-- TATGATTTCT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 T 3 1 56578 CASAVA_Build 1 186940485 11D AGCCCTTATG GACATAGTTCA/----------- GACAAGTTAT 3070 hom 93 het 32 0 31 4 GACATAGTTCA 1 0 56579 CASAVA_Build 1 186941339 4D TTCTGTTTTG AAAA/---- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 13 9 56580 CASAVA_Build 1 186942881 3I ATGCTGACAA ---/TTT TTTTGCTATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 4 7 56581 CASAVA_Build 1 186959243 1D ACATCCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 30 1 19 11 T 11 10 56582 CASAVA_Build 1 186979708 1D GTTATCTCAA T/- TTTTTTATAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 7 6 56583 CASAVA_Build 1 186984633 1I ACAGAGATCA -/T TCCAAATAAC 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 1 2 56584 CASAVA_Build 1 186994113 1I CATGTATAGT -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 6 7 56585 CASAVA_Build 1 187000402 12D TTTCAAATGT ATATATTTATTA/------------ TTGTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 ATATATTTATTA 1 0 56586 CASAVA_Build 1 187000697 3D TTGGTATGTC TTA/--- TTATAAATTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 TTA 2 1 56587 CASAVA_Build 1 187002807 5D GTTCTCTTGA TAAAT/----- TAATTCATTA 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 TAAAT 1 0 56588 CASAVA_Build 1 187005826 10D AATGTAATGC AAACAAAACA/---------- AAACAAAACA 3070 hom 111 het 43 0 36 9 AAACA 5 3 56589 CASAVA_Build 1 187008411 1D ATCAAAAAGC T/- TGTCCACCAC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 2 1 56590 CASAVA_Build 1 187011042 1I AAGACCAATT -/A AACCTCTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 2 3 56591 CASAVA_Build 1 187011592 1I GGAAAACCAA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 6 7 56592 CASAVA_Build 1 187017358 2D ATTATTTCTT AA/-- GTCTTTTACC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 2 0 56593 CASAVA_Build 1 187022205 1D GCCACCTTAT C/- CTTTAAATAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 C 2 1 56594 CASAVA_Build 1 187024581 4I ATGAGAACTC ----/ACTT ACTATCAGGA 3070 het 3070 hom 48 23 24 1 ACTT 0 1 56595 CASAVA_Build 1 187043372 12I CATTCTAAAA ------------/TAACTTAAAGAT TAACTTAAAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TAACTTAAAGAT 1 2 56596 CASAVA_Build 1 187051193 4D TTGAGATTTG CTAC/---- CTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 42 23 15 6 CTAC 1 0 56597 CASAVA_Build 1 187102995 1D ATAGAGACAG A/- AAAAAAAAAT 1318 het 1318 ref 38 31 3 4 A 10 9 56598 CASAVA_Build 1 187126060 1D TCAAGCTGTG A/- AAAAAAAAAA 1394 het 1394 ref 44 32 4 8 A 15 14 56599 CASAVA_Build 1 187128595 1I CAAAAAATCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 9 10 56600 CASAVA_Build 1 187138459 1D GGGAGTTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2503 hom 28 8 16 4 A 11 10 56601 CASAVA_Build 1 187169814 1I CATGATACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 8 9 56602 CASAVA_Build 1 187176111 1I AACCAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 T 12 13 56603 CASAVA_Build 1 187193105 6I AAACAACCAA ------/TGCTGG TGAGGCTGCA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 TGCTGG 0 1 56604 CASAVA_Build 1 187197903 1I TGGAGACAAA -/G TAGAACAGCC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 0 1 56605 CASAVA_Build 1 187209511 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1785 hom 28 het 16 0 9 8 T 13 14 56606 CASAVA_Build 1 187210260 1I GTGAAGAATG -/T TTCTCTATGA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 2 3 56607 CASAVA_Build 1 187218597 1I AATCATGTGG -/T TTTTTTCATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 56608 CASAVA_Build 1 187219284 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 11 10 56609 CASAVA_Build 1 187226334 1I TGTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 593 hom 45 2 30 13 T 9 10 56610 CASAVA_Build 1 187229760 17D TATAATATAG CTTAATTCTTAATTAGT/----------------- ACGTTGATTC 3070 hom 87 het 30 0 30 2 CTTAATTCTTAATTAGT 1 0 56611 CASAVA_Build 1 187232094 1I ATTTAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 39 1 34 4 T 11 12 56612 CASAVA_Build 1 187241409 1D AAACAAGATG A/- AAAAAATATA 2203 hom 15 het 12 0 6 6 A 7 6 56613 CASAVA_Build 1 187257078 1I TATATAGGAC -/T TTTTTTATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 7 56614 CASAVA_Build 1 187260839 2D ATGTACTCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 72 het 33 0 25 9 AC 6 5 56615 CASAVA_Build 1 187269977 1D TCTCAGAGAG A/- AAAAAAATAC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 8 7 56616 CASAVA_Build 1 187270885 34D TGTAATAATG ACACACACGCACGCGCGCACACACACACACACAC/---------------------------------- ACACACACAC 3070 hom 72 het 24 0 25 6 ACACACACGCACGCGCGCACACACACACACACAC 1 0 56617 CASAVA_Build 1 187271582 1I TGCAAAAAAA -/T AAATAAATAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 0 1 56618 CASAVA_Build 1 187273872 1I TTTATTATTA -/T TTTTTCTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 5 6 56619 CASAVA_Build 1 187279059 1I GCTTAAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 16 het 54 1 43 10 A 9 10 56620 CASAVA_Build 1 187279778 4I TTTTTGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTTG 2 3 56621 CASAVA_Build 1 187282711 1I TGTCAGAGCA -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 56622 CASAVA_Build 1 187285401 1D TATTTCAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 88 het 36 0 30 6 T 10 9 56623 CASAVA_Build 1 187286661 4I TTCTGTAATT ----/TTAG TTATTTATTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTAG 0 1 56624 CASAVA_Build 1 187288222 4I CTCCCAGGCT ----/CAAA CAGTCTACCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CAAA 0 1 56625 CASAVA_Build 1 187289990 1D TATTGTAATT A/- AAAAATTATT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 6 5 56626 CASAVA_Build 1 187292477 2D TATGGAAAAA AC/-- AGTCTTCTCA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 AC 1 0 56627 CASAVA_Build 1 187293453 1D GTAATAATGA T/- TTGTATTCTT 3070 hom 117 het 40 0 40 0 T 3 2 56628 CASAVA_Build 1 187293792 2I GTAATAAAAC --/TG TTTTATAGCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TG 0 1 56629 CASAVA_Build 1 187294685 1I TTTACAAGTT -/A AAAATCTGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 4 5 56630 CASAVA_Build 1 187301154 1I CAGAATTTCA -/T TTTTTTTTTT 1720 het 161 hom 30 2 8 20 T 13 14 56631 CASAVA_Build 1 187305688 2D TATTTTACTT CA/-- GTTTGGCAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CA 1 0 56632 CASAVA_Build 1 187308490 5I ATATTCCTTT -----/ATTGC ATTGCAATTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 ATTGC 1 2 56633 CASAVA_Build 1 187311179 1I GTTGTTAAGA -/C CTCATAAAAT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 C 1 2 56634 CASAVA_Build 1 187312082 5I ACGGTCAGTA -----/TAGTT TAAGTAGGAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TAGTT 0 1 56635 CASAVA_Build 1 187312646 1I TCTGATAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 10 11 56636 CASAVA_Build 1 187326960 1D AGAGACATAG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 7 56637 CASAVA_Build 1 187335523 1I GGGTAATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 24 1 14 9 A 13 14 56638 CASAVA_Build 1 187336442 1I CAAAGAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 10 56639 CASAVA_Build 1 187340529 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 12 11 56640 CASAVA_Build 1 187344414 3D TATATTGCAG GTT/--- GTTTGAGGAT 3070 hom 87 het 35 0 30 7 GTT 2 1 56641 CASAVA_Build 1 187345082 1D GCTGTTTCTG T/- TTTTTGTAAA 3070 hom 89 het 33 0 29 5 T 6 5 56642 CASAVA_Build 1 187348086 1I AATATAATGA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 8 56643 CASAVA_Build 1 187349016 1D CTTTGTGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1133 hom 31 5 18 10 A 15 14 56644 CASAVA_Build 1 187353624 2D CGTGGAATGT TA/-- TGAGTAATCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TA 1 0 56645 CASAVA_Build 1 187359275 17I GAATACTAAC -----------------/AAACAGTAAGTCATATA AAACAGGTCT 3070 hom 132 het 47 0 45 4 AAACAGTAAGTCATATA 0 1 56646 CASAVA_Build 1 187359616 1I CAGGAAGTTG -/A GGAGGAAAGC 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 0 1 56647 CASAVA_Build 1 187369846 1D AAAAGTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 534 hom 22 2 17 4 T 13 12 56648 CASAVA_Build 1 187370753 2I TGGTGAAACC --/CT CTCTCTACTA 3070 hom 128 het 48 0 43 5 CT 3 4 56649 CASAVA_Build 1 187382273 1D TCATATAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 51 0 39 12 A 10 9 56650 CASAVA_Build 1 187387194 1I GTGGTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 818 hom 33 3 26 4 A 11 12 56651 CASAVA_Build 1 187389416 4I TATCAATTTC ----/TAAA TAACCTCTAA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TAAA 0 1 56652 CASAVA_Build 1 187415071 1D TATTAAAAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 12 25 7 T 10 9 56653 CASAVA_Build 1 187418319 1D TTAAAACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 41 1 31 11 T 11 10 56654 CASAVA_Build 1 187430582 1D GCTGCAGATT A/- GGGGTACGAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 0 56655 CASAVA_Build 1 187434325 2I CTCTCTCTCT --/AC ACACACACAC 3070 hom 114 het 46 0 38 8 AC 6 7 56656 CASAVA_Build 1 187440726 3I AGGAATTCTC ---/ATT ATTATTCTCA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 ATT 2 3 56657 CASAVA_Build 1 187442528 7I TTGCCTTTAT -------/ACTACTA ACTACTAACT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 ACTACTA 1 2 56658 CASAVA_Build 1 187444173 1I CTTGTCCATT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 8 9 56659 CASAVA_Build 1 187451329 2I TTCGTGTGTG --/TA TGTGTGTATC 3070 hom 144 het 56 0 49 7 TA 0 1 56660 CASAVA_Build 1 187462484 1D ATAAATACTG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 9 8 56661 CASAVA_Build 1 187462658 2D CAATTGTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 36 0 31 5 A 14 12 56662 CASAVA_Build 1 187466997 1D TATTATACCC T/- TTTTCATAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 5 4 56663 CASAVA_Build 1 187478121 3I CATAAAGAGA ---/AAG AAGAATAAGT 3070 hom 57 het 33 0 21 13 AAG 1 2 56664 CASAVA_Build 1 187478187 29I TCCTCCTAAA -----------------------------/GATTAAGCTCAAAGTAAAAGTGAAGAAAG GATTAAGCTC 3070 hom 63 het 29 0 21 9 GATTAAGCTCAAAGTAAAAGTGAAGAAAG 0 1 56665 CASAVA_Build 1 187482615 1I AAAATACATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 435 hom 27 1 22 4 T 9 10 56666 CASAVA_Build 1 187483820 1I TCTATTTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 61 het 29 0 22 7 A 9 10 56667 CASAVA_Build 1 187484611 1D AGGTTTATGT G/- GACCTACAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 G 2 1 56668 CASAVA_Build 1 187489187 1I GCTGAATATA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 52 het 23 0 18 5 T 7 8 56669 CASAVA_Build 1 187490951 1I GTTTCTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 816 hom 29 2 23 4 T 10 11 56670 CASAVA_Build 1 187493916 4I ATCACTGTGT ----/TTTC TTTATGTTCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TTTC 0 1 56671 CASAVA_Build 1 187496207 1D CTAAAAATAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 378 hom 38 1 34 3 T 10 9 56672 CASAVA_Build 1 187500039 4D ATTTTTTGCA TAAT/---- TAAACACTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 6 TAAT 1 0 56673 CASAVA_Build 1 187501904 6D CAAAAAGCAG GACCAA/------ GATAACCATT 3070 hom 117 het 41 0 40 3 GACCAA 1 0 56674 CASAVA_Build 1 187502477 1I TTACAATGTA -/T AAGTGTTACT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 0 1 56675 CASAVA_Build 1 187504859 1D TAAAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 37 1 27 10 T 11 10 56676 CASAVA_Build 1 187515985 1D TAGTACTTCA T/- TTTTTTTTTT 1917 het 1917 ref 46 31 7 9 T 15 14 56677 CASAVA_Build 1 187524201 1I TAACCCAAGA -/C CACCCCTGCT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 C 1 2 56678 CASAVA_Build 1 187531106 1D ATTGGAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 442 hom 36 2 23 11 A 15 14 56679 CASAVA_Build 1 187533041 1I CTTAGAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1274 hom 42 3 27 12 T 14 15 56680 CASAVA_Build 1 187536478 4D15M2I CAGAAATCTG TCTATCTATCTATCTACAA--/----TCTATCTATCTACAAAC ACACACACTA 2786 hom 30 het 13 0 11 3 N/A 0 0 56681 CASAVA_Build 1 187543750 1I GTTTATTCAG -/T TTATTTACAA 3070 hom 119 het 48 0 40 8 T 2 3 56682 CASAVA_Build 1 187547158 1I ATAAGCGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 44 2 33 9 A 10 11 56683 CASAVA_Build 1 187552141 1I CTCTGTCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 8 21 5 A 10 11 56684 CASAVA_Build 1 187552405 1I GCTATAGACC -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 6 7 56685 CASAVA_Build 1 187554384 1I AAACACTACC -/A AAAAACATAG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 5 6 56686 CASAVA_Build 1 187556406 1I GACATTTTCC -/A AAAAACAATG 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 A 5 6 56687 CASAVA_Build 1 187560759 1I AGACTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 11 12 56688 CASAVA_Build 1 187568033 4D GTATAGATAC ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 ATAG 3 2 56689 CASAVA_Build 1 187580262 3I AGAAATTAAA ---/ATC ATTAAAAATT 2275 het 450 hom 7 1 5 1 ATC 0 1 56690 CASAVA_Build 1 187580841 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1014 hom 17 5 10 3 A 15 14 56691 CASAVA_Build 1 187607721 4D AATCAAAGAC AAAG/---- AAGACTGATT 3070 het 3070 hom 38 12 23 4 AAAG 1 0 56692 CASAVA_Build 1 187618071 5D GAAGCCTAGG CAATT/----- GAGGCTACCG 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 CAATT 1 0 56693 CASAVA_Build 1 187636866 1I AAGGGCCACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 T 9 10 56694 CASAVA_Build 1 187639202 1D AAAAAAAAAA C/- ATTCAATACT 2225 het 2225 ref 29 17 7 6 C 1 0 56695 CASAVA_Build 1 187645847 2I TGTGTGTGTG --/TC TGTGTGTGTG 3070 het 804 hom 34 5 27 2 TC 0 1 56696 CASAVA_Build 1 187655826 1D AGTTTCAGTT A/- TTATTTCAAT 3070 het 3070 hom 43 20 19 6 A 1 0 56697 CASAVA_Build 1 187660299 1D GAGACAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 T 10 9 56698 CASAVA_Build 1 187662805 4I GGTATATGTA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 TG 5 7 56699 CASAVA_Build 1 187667055 3D AGTGGGAGAA TTC/--- TTTTTCACTT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 TTC 1 0 56700 CASAVA_Build 1 187671562 1D AAATTATGAG T/- TTTTTTTTTT 2206 het 2206 ref 37 25 6 6 T 12 11 56701 CASAVA_Build 1 187675617 1I TATAAACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 11 12 56702 CASAVA_Build 1 187676504 1I GCTTCTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 A 11 12 56703 CASAVA_Build 1 187684526 4I ATCTTAATAT ----/TTTA TTTATTAAAT 2131 het 1986 hom 11 6 5 0 TTTA 1 2 56704 CASAVA_Build 1 187693526 1D ATAAACTCAC T/- CAAGCTTATG 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 1 0 56705 CASAVA_Build 1 187702123 1I AGGAAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 19 10 A 10 11 56706 CASAVA_Build 1 187712132 2D TAATTTTTGT AG/-- AGTGTCTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 AG 2 1 56707 CASAVA_Build 1 187725986 2I AAGGAATAAC --/AA GATGTATCAA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 A 0 2 56708 CASAVA_Build 1 187728138 5I TAGACTTTTC -----/ATAAT ATGTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 ATAAT 0 1 56709 CASAVA_Build 1 187729447 3I GATATAACTG ---/TAC TACTATCTGG 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 TAC 1 2 56710 CASAVA_Build 1 187729562 1I AATTATGTTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 7 8 56711 CASAVA_Build 1 187737696 1D GTTGTATGAA C/- AAAATCTCAC 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 C 1 0 56712 CASAVA_Build 1 187743217 1I GTGAGAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 11 12 56713 CASAVA_Build 1 187751835 1D GGAGCACTTT A/- AAAAAAAAAA 3032 het 195 hom 29 4 10 15 A 16 15 56714 CASAVA_Build 1 187755939 1I CTTTATGGGG -/T TTTTCATACC 3070 het 3027 hom 30 7 16 7 T 4 5 56715 CASAVA_Build 1 187769333 4D TATAATAATA TTAC/---- TTAGTGTGAA 3070 het 3070 ref 21 11 10 1 TTAC 1 0 56716 CASAVA_Build 1 187771254 1I ACAGGAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 11 12 56717 CASAVA_Build 1 187772718 4D AGCATTTATT TTTA/---- TTTCTGTAAT 3070 het 3070 hom 29 13 16 1 TTTA 1 0 56718 CASAVA_Build 1 187773118 1I TATAATTTCA -/T TTTTTTTTTT 1908 het 1908 ref 22 9 6 7 T 16 17 56719 CASAVA_Build 1 187777533 2D AGTTACAGTG AA/-- AAGACAACCC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 4 2 56720 CASAVA_Build 1 187789041 1D ATTGCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1886 hom 38 7 15 16 T 15 14 56721 CASAVA_Build 1 187790206 4D AAATGAACAA ACAC/---- ACACTAAGTA 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 AC 4 2 56722 CASAVA_Build 1 187794758 1I CACGTTCCTG -/T TTAGCTGTAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 2 3 56723 CASAVA_Build 1 187796318 1D TGCTGGCACA C/- GTGGCCAGCT 2234 het 2234 ref 18 12 5 1 C 1 0 56724 CASAVA_Build 1 187799860 1I TTAGAAGATT -/A TAGTAATTCA 3070 het 3070 ref 61 29 25 7 A 0 1 56725 CASAVA_Build 1 187811698 1D GCTCCCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 9 T 13 12 56726 CASAVA_Build 1 187812321 1I TGGATTTTTT -/A AAAAATCAAG 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 5 6 56727 CASAVA_Build 1 187813391 1D AGATCTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 10 9 56728 CASAVA_Build 1 187814322 6I TATAGAATAT ------/ATTTAA ATTAGATGCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 ATTTAA 0 1 56729 CASAVA_Build 1 187814494 2I GACATTCTTA --/AT TTGTTCAAGT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 AT 0 1 56730 CASAVA_Build 1 187815585 6D34M2I ATATATATAT ACACACACACACACACACACATAAAAGCATCAATACACAC--/------ACACACACACACACATAAAAGCATCAATACACACAT ATATATATAT 1646 het 1646 ref 14 12 4 8 N/A 0 0 56731 CASAVA_Build 1 187819646 1I TTCAAAGAAG -/C TTTTGTCTCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 0 1 56732 CASAVA_Build 1 187827747 2I TATCATAATT --/TA TATATATATA 2892 het 2892 ref 30 14 8 8 TA 7 8 56733 CASAVA_Build 1 187827806 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1677 het 1677 ref 26 12 6 8 TG 8 7 56734 CASAVA_Build 1 187854706 2I AGCAAAAAAT --/AA GTTTTGCCTG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 0 2 56735 CASAVA_Build 1 187882371 1D TTATAATTTG A/- AAAGGATAAG 3070 het 175 hom 14 1 10 3 A 4 3 56736 CASAVA_Build 1 187882690 2I TGAGGCAGAG --/TC TCGGCCGCCC 598 het 598 ref 16 6 3 7 TC 1 2 56737 CASAVA_Build 1 187885194 1D TTGTAATATA T/- TCTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 T 2 1 56738 CASAVA_Build 1 187887165 1I AAAGATAACT -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 6 7 56739 CASAVA_Build 1 187887357 4I TCACAAACTA ----/AGTC ACAATTTAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 AGTC 0 1 56740 CASAVA_Build 1 187888042 1D ATTTTTATTA T/- TAAAAAAACT 2886 het 2886 ref 17 7 8 3 T 2 1 56741 CASAVA_Build 1 187889542 1I ATTTTTTTTT -/C CTCCTACTTG 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 C 1 2 56742 CASAVA_Build 1 187890613 1I TGTGATGAAA -/T ATTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 14 20 0 T 0 1 56743 CASAVA_Build 1 187894784 1D TTCCTTATAC T/- TATGCCAGCT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 T 2 1 56744 CASAVA_Build 1 187895909 5I36M1D AAGCAAGTGA -----TAAGAAGTATATCTTTACAAATTCATGAGAACAAGTG/TAACTTAAGAAGTATATCTTTACAAATTCATGAGAACAAGT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 28 21 4 N/A 0 0 56745 CASAVA_Build 1 187900056 1I TACCCTCCAA -/T TTTTTTTTAA 3060 het 3060 ref 26 13 7 6 T 8 9 56746 CASAVA_Build 1 187907264 1D AATTTCTGGA C/- CCCCAGTGTT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 C 5 4 56747 CASAVA_Build 1 187908109 4I GTCTTCACTG ----/TTTC TTTCTCTTCC 3070 het 3070 hom 51 17 30 4 TTTC 1 2 56748 CASAVA_Build 1 187909655 2D ACAAAAAAAA GT/-- AAAGTATACT 3070 het 3070 hom 29 12 16 2 GT 1 0 56749 CASAVA_Build 1 187910878 1D CCTATGTAAG A/- GGGGGAAAAC 3070 het 3070 hom 38 11 25 3 A 1 0 56750 CASAVA_Build 1 187911009 1D AAAAAGAGCC A/- AAATATAACC 3070 het 3070 hom 32 12 19 3 A 4 3 56751 CASAVA_Build 1 187911130 1D27M1I TATGTTATAA TTTTTTTTTTTTGCTGTTGGAACAATTG-/-TTTTTTTTTTTGCTGTTGGAACAATTGA AAAATAGATC 3070 het 3070 hom 33 17 21 7 N/A 0 0 56752 CASAVA_Build 1 187912365 1D AATTAGGATG T/- TAAGTAATCT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 2 1 56753 CASAVA_Build 1 187915258 3D CAACAGCAGT ACA/--- ACGAGTTACC 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 ACA 1 0 56754 CASAVA_Build 1 187915856 4I GTTTAGTGTT ----/TTTG TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 TTTG 0 1 56755 CASAVA_Build 1 187916179 2I AAGAATGTTT --/TC TTTTTTTCTT 2639 het 2639 ref 27 16 8 3 TC 0 1 56756 CASAVA_Build 1 187917707 1I ACCCATGAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 8 9 56757 CASAVA_Build 1 187918872 1I AAACTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 11 12 56758 CASAVA_Build 1 187920017 2I TGCTAAAAAC --/AT AACAACAACA 3070 het 2940 hom 20 6 12 2 AT 0 1 56759 CASAVA_Build 1 187921264 1D TGAGGAGAAG T/- TTTGAGACTA 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 T 4 3 56760 CASAVA_Build 1 187921553 2I TTCTTAAAAA --/CT CTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 CT 1 2 56761 CASAVA_Build 1 187925805 4D AATGTTTTCT TAAG/---- TAAGAGAAAT 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 TAAG 2 1 56762 CASAVA_Build 1 187926660 2D AAGCAGAGGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 46 13 19 15 GA 6 5 56763 CASAVA_Build 1 187934540 2D AGATGTGCTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 AT 7 6 56764 CASAVA_Build 1 187935088 7D TTCTTCTTCC CTTCATT/------- CTTCATTCTG 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 CTTCATT 2 1 56765 CASAVA_Build 1 187958440 1I CCCAACTGCC -/T TTGGGCACAT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 2 3 56766 CASAVA_Build 1 187982125 3D ATTAATTATT TTC/--- TTCATTTTAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 TTC 2 1 56767 CASAVA_Build 1 187983613 1I ATTCCTTTTA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 T 7 8 56768 CASAVA_Build 1 187988501 1D TCTCTCTCCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 9 8 56769 CASAVA_Build 1 187990346 5I CTTTTATTCC -----/TAGAG TAGAGATTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TAGAG 1 2 56770 CASAVA_Build 1 188003383 5I AAAACATATC -----/TTAAA TTAACTAAAT 3070 hom 137 het 51 0 46 5 TTAAA 0 1 56771 CASAVA_Build 1 188006733 1D TCATAAAGAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 9 8 56772 CASAVA_Build 1 188007795 1I TTCCATACTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 7 8 56773 CASAVA_Build 1 188023358 5I TTGGTGAATC -----/TACTT TACAAACTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TACTT 0 1 56774 CASAVA_Build 1 188023493 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1608 hom 27 4 10 13 T 12 13 56775 CASAVA_Build 1 188029142 10I ATTCATTTAT ----------/TAATTATGTA TCAAATTATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TAATTATGTA 0 1 56776 CASAVA_Build 1 188030326 1D GTCTCACTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 9 8 56777 CASAVA_Build 1 188031539 1D GTAGCCTGAC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 6 56778 CASAVA_Build 1 188031983 1I ATTAATCTGG -/A TGGTGGTCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 1 56779 CASAVA_Build 1 188036062 1I TTTACATCTT -/A TTTGAAATCC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 56780 CASAVA_Build 1 188036622 1D TACAGATATG A/- AAGTACAATA 3070 hom 157 het 57 0 53 4 A 3 2 56781 CASAVA_Build 1 188037205 3D TAATTATTTG TTC/--- TTCTAATCCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTC 2 1 56782 CASAVA_Build 1 188037477 1I CAAAAATATC -/A ATCAATAATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 1 2 56783 CASAVA_Build 1 188037539 1I AGCCTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2290 hom 26 het 12 0 8 4 A 11 12 56784 CASAVA_Build 1 188039414 21D ATATCTGGGC TGTAATGCACCGTCAGTCACT/--------------------- TGTGGGAACT 3070 hom 90 het 27 0 30 2 TGTAATGCACCGTCAGTCACT 1 0 56785 CASAVA_Build 1 188040944 3D GTAAGAAACA TAT/--- TATTAGAAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TAT 2 1 56786 CASAVA_Build 1 188044618 3D TGAGCTTGTG TCT/--- TCTTTAGTTA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TCT 2 1 56787 CASAVA_Build 1 188046329 1I CTTTTTTCCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 335 hom 24 1 19 4 C 0 1 56788 CASAVA_Build 1 188050650 2D ACTGGATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 18 5 A 15 13 56789 CASAVA_Build 1 188055044 1D CCGGTCCTTC T/- TTTTTTATTA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 7 6 56790 CASAVA_Build 1 188055267 4I CTACTCCTGA ----/TTCT TTCAGGTTTT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 TTCT 0 1 56791 CASAVA_Build 1 188056143 1I TTTTAACAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 8 9 56792 CASAVA_Build 1 188056247 1I CAGAGATTTT -/G TTTGATATTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 56793 CASAVA_Build 1 188056381 2I GCCCTAACAA --/AC ACAGAGGGAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AC 1 2 56794 CASAVA_Build 1 188057111 1I TGTCATCTAA -/T TTTAATTCTA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 3 4 56795 CASAVA_Build 1 188058588 1D AGGAGTATAA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 8 7 56796 CASAVA_Build 1 188065652 1I GACTAAAGAG -/C TTTTGCATAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 0 1 56797 CASAVA_Build 1 188067978 1D TAGAATATAC A/- ACATTACCAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 1 56798 CASAVA_Build 1 188071607 1I GTTAAAAGGG -/C TGTTATCAGA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 0 1 56799 CASAVA_Build 1 188138076 1I TTGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 10 11 56800 CASAVA_Build 1 188181411 1I TCATAAAAAG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 7 8 56801 CASAVA_Build 1 188182393 4D AATAAATAAA TTAT/---- TTATTTATTT 2015 hom 15 het 8 0 6 2 TTAT 3 2 56802 CASAVA_Build 1 188204074 2I ACACACACAC --/AT ATATATACAC 3070 hom 114 het 47 0 38 9 AT 3 4 56803 CASAVA_Build 1 188204415 2I AATCCGCGTA --/TC TCTCTCTTTT 3070 hom 130 het 51 0 44 7 TC 3 4 56804 CASAVA_Build 1 188205588 1I TGATAACTTC -/A CTGTATTATA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 56805 CASAVA_Build 1 188215471 1D ATGTTTAGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 10 9 56806 CASAVA_Build 1 188221865 1I TTTGTTTATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 T 9 10 56807 CASAVA_Build 1 188228080 1D TTGGGGTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 10 9 56808 CASAVA_Build 1 188229576 1I GGTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 11 56809 CASAVA_Build 1 188231077 2D ACTCTAATTC AG/-- ATATTTTTCT 3070 het 2651 hom 23 6 12 5 AG 1 0 56810 CASAVA_Build 1 188234069 2D TTAATTTCTC TG/-- TCTCTTTCTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TG 1 0 56811 CASAVA_Build 1 188242138 1I CTGTTAGGGA -/C CCCGTCCACA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 C 3 4 56812 CASAVA_Build 1 188247510 5D TAAATGTGAT ACACC/----- ACATAAACAG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 ACACC 1 0 56813 CASAVA_Build 1 188249444 12D ATAAAATGAT ATATATATAATG/------------ ATATATATAA 2178 het 2178 ref 14 7 5 4 ATATATATAATG 3 2 56814 CASAVA_Build 1 188249731 2I AACTAGGGAT --/AA AAAAGACTAC 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 A 4 6 56815 CASAVA_Build 1 188252367 1I TCTTACATAA -/G AAAAACAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 0 1 56816 CASAVA_Build 1 188253309 2D TTTATCAAAA CT/-- CATCAAACTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 CT 1 0 56817 CASAVA_Build 1 188256231 1D ACTTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 19 0 11 8 T 15 14 56818 CASAVA_Build 1 188262666 3D TATTGTTTTT TTA/--- TTTTTTTATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TTA 1 0 56819 CASAVA_Build 1 188265334 2I AGAAAAAGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 31 8 T 10 12 56820 CASAVA_Build 1 188265888 1D AATTTAATTA T/- TTTTTTATTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 7 6 56821 CASAVA_Build 1 188267973 7I CTTTTTATTT -------/TGAAGTA ATTTCATTTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TGAAGTA 0 1 56822 CASAVA_Build 1 188268526 1D GAAGACATTA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 7 6 56823 CASAVA_Build 1 188270476 1D TGACACAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 332 hom 36 1 28 7 T 12 11 56824 CASAVA_Build 1 188270685 1I CCACAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 25 1 19 5 A 11 12 56825 CASAVA_Build 1 188274082 1D ATAATTATTT A/- AAATATTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 4 3 56826 CASAVA_Build 1 188274419 1I TTCAAAAACT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 56827 CASAVA_Build 1 188282099 2I TGAAGGAGGG --/GA GAGAGGGGGA 3070 hom 35 het 16 0 11 5 GA 2 3 56828 CASAVA_Build 1 188282544 1I TGTGGAAATG -/A AAAATACTAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 4 5 56829 CASAVA_Build 1 188285138 1I AAGAGAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1144 hom 43 3 32 8 T 10 11 56830 CASAVA_Build 1 188292165 1D AATGGTGCTG C/- CAATGAGCAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 C 2 1 56831 CASAVA_Build 1 188294319 4I GTTACAGAGG ----/AGTC TCTTCTCCTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AGTC 0 1 56832 CASAVA_Build 1 188295676 1I ATATTCACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1347 hom 15 3 10 2 A 9 10 56833 CASAVA_Build 1 188300088 2D CAATAAAGTT TA/-- TATCATAATA 3070 het 3070 hom 38 21 14 3 TA 2 1 56834 CASAVA_Build 1 188302031 2D CCAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 10 8 56835 CASAVA_Build 1 188307065 1D CTCTGATGAT C/- AGCAATATTG 3070 hom 57 het 22 0 20 3 C 1 0 56836 CASAVA_Build 1 188311648 3D TCTTAACAAC TTA/--- TTATGGCATC 2733 het 1811 hom 29 5 9 15 TTA 2 1 56837 CASAVA_Build 1 188313461 1I TCTCAAATAA -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 6 7 56838 CASAVA_Build 1 188314948 4D42M1I AAATGATGAC AGAAAGAGAGAAAGAAGAGAAACAAGAGGGGAAATAGTTATGAACT-/----AGAGAGAAAGAAGAGAAACAAGAGGGGAAATAATTATGAACTA AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 26 11 11 17 N/A 0 0 56839 CASAVA_Build 1 188327607 4I GACAGGAGAG ----/TCTC TCTCCCATCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TC 2 4 56840 CASAVA_Build 1 188343839 5D GGGCCATTAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 31 11 12 10 AAAAC 3 2 56841 CASAVA_Build 1 188353885 2I CCCAAATCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 31 12 7 12 AC 8 9 56842 CASAVA_Build 1 188355884 1I GACATATTTG -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 39 9 26 4 A 6 7 56843 CASAVA_Build 1 188361750 5D AAGGCCTTCC TAACA/----- TAAGTGTGAA 3070 het 3070 hom 41 14 23 9 TAACA 1 0 56844 CASAVA_Build 1 188401103 1D GCAATAAACT A/- AAAAAAAAAA 1608 het 1608 ref 31 23 4 5 A 11 10 56845 CASAVA_Build 1 188450848 1D AGCTATTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 34 2 19 13 A 15 14 56846 CASAVA_Build 1 188464545 1D CGGAATTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 110 het 42 0 37 6 T 9 8 56847 CASAVA_Build 1 188474444 1I TGCTGGGAGT -/G TTAACTCGTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 56848 CASAVA_Build 1 188481850 3I AGCATGTTTT ---/ATA ATCCTTGGGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATA 0 1 56849 CASAVA_Build 1 188482157 2I GGGGTCATTC --/AT GGTTATAAAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 AT 0 1 56850 CASAVA_Build 1 188491513 1I TTTTGAAGGG -/T TTTTTTGGGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 6 7 56851 CASAVA_Build 1 188497188 4I TTATTTACAG ----/ATTA ATTAACAAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATTA 1 2 56852 CASAVA_Build 1 188503292 1D AAAAAATGAT A/- AAAAAGCTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 6 5 56853 CASAVA_Build 1 188508807 1I AAGAGATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 43 2 33 8 T 11 12 56854 CASAVA_Build 1 188523638 5D AAATAATTTA ATTTT/----- ATGTTACATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ATTTT 1 0 56855 CASAVA_Build 1 188531996 1D TAAAAAAAAA C/- ATGGGATGTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 1 0 56856 CASAVA_Build 1 188544943 1D AGTCCACAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 24 0 17 8 A 10 9 56857 CASAVA_Build 1 188562766 1D GTCAAGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 39 2 27 10 A 15 14 56858 CASAVA_Build 1 188577767 1D TATTTCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 194 hom 38 2 24 12 T 11 10 56859 CASAVA_Build 1 188580219 1D TTTTCAGTGC A/- AACATAAGTA 3070 hom 108 het 43 0 37 7 A 3 2 56860 CASAVA_Build 1 188588792 1D AAGCTGGCTT A/- AAAAAAAAAA 1676 het 1676 ref 42 30 4 8 A 12 11 56861 CASAVA_Build 1 188599816 1D TCCTTCTTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 26 het 25 1 23 1 A 10 9 56862 CASAVA_Build 1 188601422 5D ATATTATAAT TAATA/----- TAATACAATA 1848 hom 12 het 5 0 5 1 TAATA 2 1 56863 CASAVA_Build 1 188604249 1D TAGGATGTAA C/- AAAAGCCCAT 3070 hom 69 het 28 0 22 6 C 1 0 56864 CASAVA_Build 1 188605407 1I GCATAGACTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 331 hom 28 1 23 4 A 8 9 56865 CASAVA_Build 1 188617935 1D ACAAAATCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 416 hom 32 1 29 3 A 10 9 56866 CASAVA_Build 1 188619943 5D TTTTCTTCAG GTTTT/----- ATTTTTGAGA 3070 hom 54 het 19 0 19 2 GTTTT 1 0 56867 CASAVA_Build 1 188622004 1D AAAAAAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 10 9 56868 CASAVA_Build 1 188627812 2D TAGCTTGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 12 10 56869 CASAVA_Build 1 188632646 1D TTCAGTACCT A/- AAACATTTCC 3070 hom 78 het 34 0 26 9 A 4 3 56870 CASAVA_Build 1 188643957 9D TATTTATTTA TTTTTTTTT/--------- TTTTTGTATT 729 hom 12 het 6 0 5 1 T 14 5 56871 CASAVA_Build 1 188676897 1I GAGAAGCTAG -/A AAAAAAAAAA 1236 het 1236 ref 40 28 3 9 A 10 11 56872 CASAVA_Build 1 188683053 2D TGTAAAATAG TA/-- TATATATATA 3057 hom 24 het 12 0 9 3 TA 8 7 56873 CASAVA_Build 1 188686941 1I TTAGGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 10 11 56874 CASAVA_Build 1 188712005 1I CCCAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 25 1 17 7 A 14 15 56875 CASAVA_Build 1 188715427 7I ATCCACAATG -------/GCTATTT GCATATTGTG 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 GCTATTT 0 1 56876 CASAVA_Build 1 188723343 2I TAAAAAAAAA --/AG GAAAAAAAAA 2832 het 2832 ref 24 11 9 4 AG 0 1 56877 CASAVA_Build 1 188726875 1D TACAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 A 13 12 56878 CASAVA_Build 1 188736796 1I TTCTAATTTT -/A AAAAAGTAGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 5 6 56879 CASAVA_Build 1 188748144 3D TAACCTAATT TTA/--- TTATTTCCTT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 TTA 2 1 56880 CASAVA_Build 1 188754576 1D ACAATGCTTA G/- TAATGACAAT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 G 1 0 56881 CASAVA_Build 1 188761223 2D GAATTTTCCC CT/-- GTTTGATGTT 3070 het 3070 hom 50 20 27 4 CT 1 0 56882 CASAVA_Build 1 188764001 4D ATCATAATAG TTCA/---- TTCGTTCTTG 3070 het 3070 hom 54 20 28 9 TTCA 1 0 56883 CASAVA_Build 1 188778575 1I TTAACATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 11 12 56884 CASAVA_Build 1 188782738 2D TATTATTTGG AA/-- AAAATATATA 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 A 6 4 56885 CASAVA_Build 1 188788633 5D TCATGAATAC TTATT/----- TTATTTGTGA 3070 het 3070 hom 30 13 14 5 TTATT 2 1 56886 CASAVA_Build 1 188801297 1I CATATACCCC -/T GAACCTAAAA 3070 hom 116 het 47 0 39 8 T 0 1 56887 CASAVA_Build 1 188802159 1D TTCATCTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 10 9 56888 CASAVA_Build 1 188816949 2D TGTATGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 TG 10 9 56889 CASAVA_Build 1 188822408 1I AGTTATTAAA -/C AAAGACTACT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 C 0 1 56890 CASAVA_Build 1 188822979 2D ATAAAACTAC AA/-- AGTCATATTT 3070 het 3070 ref 26 13 13 1 A 3 1 56891 CASAVA_Build 1 188823685 1I ATATTCATTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 8 9 56892 CASAVA_Build 1 188824778 1I GCATCTACAA -/C CACTCCTATG 3070 hom 114 het 43 0 37 6 C 1 2 56893 CASAVA_Build 1 188825665 1D TATTATTCTT G/- GGATAAAATA 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 G 3 2 56894 CASAVA_Build 1 188828264 1D GACGCTTGCC A/- AAAATGACGA 3070 het 3070 ref 68 40 21 7 A 5 4 56895 CASAVA_Build 1 188834719 2D AAAGCTAGAC TT/-- ATATTAATCA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 T 2 0 56896 CASAVA_Build 1 188850269 4I TTTTTTTTTC ----/ACAG ACAGAGTCTC 3070 hom 69 het 30 0 23 7 ACAG 1 2 56897 CASAVA_Build 1 188854943 1I TAGAAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 T 10 11 56898 CASAVA_Build 1 188858300 3D TTAGCAATAC TAA/--- TGTCATTTAT 3070 het 2674 hom 22 8 11 3 TAA 1 0 56899 CASAVA_Build 1 188859886 1D GTGTCCTCTT A/- ACTCAGATTT 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 A 2 1 56900 CASAVA_Build 1 188862892 5I CTTGGACTTG -----/TAGCT TACAGAACAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TAGCT 0 1 56901 CASAVA_Build 1 188865751 1D AATTGGGATG C/- CCTTTATCTC 3070 het 3070 ref 47 28 17 3 C 3 2 56902 CASAVA_Build 1 188868916 2D TTTCTTGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 586 hom 38 11 11 17 T 16 14 56903 CASAVA_Build 1 188874266 1D TAGGTTTTAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 9 8 56904 CASAVA_Build 1 188874987 1D AGGCTGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 33 1 24 9 A 12 11 56905 CASAVA_Build 1 188877916 1I AATCTCTGCA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 8 9 56906 CASAVA_Build 1 188879741 1I GAACAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 27 1 22 4 A 12 13 56907 CASAVA_Build 1 188881166 1D TACAGTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 41 0 31 11 T 11 10 56908 CASAVA_Build 1 188882002 1I TTCTCCTTTT -/G GAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 34 14 16 4 G 1 2 56909 CASAVA_Build 1 188886227 1I AAACTATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 15 5 T 10 11 56910 CASAVA_Build 1 188901962 1I TCTATGGGAG -/T TTTTTTTTTT 2143 het 1045 hom 26 6 7 13 T 16 17 56911 CASAVA_Build 1 188918283 1I GAAGTTATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 9 10 56912 CASAVA_Build 1 188922355 4D AGAAGTACTC TCTT/---- TCCAATATCA 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 TCTT 1 0 56913 CASAVA_Build 1 188925616 11D ACAATCAGAT CTCACATCTCC/----------- TTCATGCCCA 3070 het 3070 ref 40 25 16 2 CTCACATCTCC 1 0 56914 CASAVA_Build 1 188931168 1D AATGTTTAGA T/- TTTTTATAAA 3070 het 3070 hom 20 8 12 0 T 6 5 56915 CASAVA_Build 1 188933098 2D TATCTGATGG TT/-- TTTTATATAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 6 4 56916 CASAVA_Build 1 188946254 1D TATTTACTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 10 9 56917 CASAVA_Build 1 188956330 2D TATCCTTTCA TT/-- TTTTTTTTTG 2753 het 2753 ref 28 17 6 5 T 11 9 56918 CASAVA_Build 1 188958877 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 T 8 9 56919 CASAVA_Build 1 188976270 1D ATGGAAATTT A/- AAAAATGAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 A 6 5 56920 CASAVA_Build 1 188985358 1D CTTCTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 11 10 56921 CASAVA_Build 1 188986508 1D TACAATGTGT A/- AACAGTTTGT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 3 2 56922 CASAVA_Build 1 188998527 1D TTCAAAGACC T/- TTTTAAGCAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 5 4 56923 CASAVA_Build 1 189002182 1D AAAGATCAAC A/- AAAACTTGCT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 5 4 56924 CASAVA_Build 1 189008622 4I GCAGCAGGAA ----/TCTG TCTGTCTTTC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TCTG 1 2 56925 CASAVA_Build 1 189039824 1I AGGGATCTAG -/A AACTAGAAAT 3070 het 981 hom 10 2 8 0 A 2 3 56926 CASAVA_Build 1 189046921 1I TTGAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 28 3 C 0 1 56927 CASAVA_Build 1 189054722 2D TATGAGCAAC TA/-- TATGCCAATA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 TA 2 1 56928 CASAVA_Build 1 189055557 1I TCAAATTATC -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 6 7 56929 CASAVA_Build 1 189060943 1I ATTCTGCAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 A 9 10 56930 CASAVA_Build 1 189064633 1D AGAGCAGCAT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 26 10 11 6 A 8 7 56931 CASAVA_Build 1 189067581 4D ATAAAGTGAT AAAG/---- AATCTACAGA 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 AAAG 1 0 56932 CASAVA_Build 1 189071907 4I TGTGTGTGTG ----/TGTA TATACACACA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TGTA 0 1 56933 CASAVA_Build 1 189080542 2I TATTTGGGGC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 TA 6 7 56934 CASAVA_Build 1 189081577 1D CAAATGAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 9 56935 CASAVA_Build 1 189082289 1I CACCATTTAC -/A AAAAATCAAC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 5 6 56936 CASAVA_Build 1 189085423 1D TGTCATTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2002 hom 38 8 18 13 A 12 11 56937 CASAVA_Build 1 189086067 2D AATCAGGTAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 AT 7 6 56938 CASAVA_Build 1 189086834 2D TAGTATTTTG TC/-- TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 TC 1 0 56939 CASAVA_Build 1 189087034 1I AAACTATTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 8 9 56940 CASAVA_Build 1 189092456 4D CTCCCACTTA TAAG/---- TAAGAACATG 3070 hom 107 het 40 0 35 5 TAAG 2 1 56941 CASAVA_Build 1 189099790 21D GCCAACAATT TTGTTGTTGTTATTGTTGTTG/--------------------- TTGTTGTTGT 3070 het 249 hom 47 5 22 31 TTGTTGTTGTTATTGTTGTTG 2 1 56942 CASAVA_Build 1 189106003 4D CACACTTTAT TTAA/---- TTGTTTTATT 3070 het 3070 ref 25 13 11 3 TTAA 1 0 56943 CASAVA_Build 1 189110792 1I GGAGTCCCAA -/C ATGTAGGAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 56944 CASAVA_Build 1 189115092 3D ATAAATATAT AAG/--- AAGAAGAGAT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 AAG 3 2 56945 CASAVA_Build 1 189118085 1D CTTATAGAAT C/- CCCCCCCCCT 833 het 821 hom 23 7 7 9 C 10 9 56946 CASAVA_Build 1 189121583 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 A 10 9 56947 CASAVA_Build 1 189124135 1D ATATATTTGC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 8 56948 CASAVA_Build 1 189129638 1I CTTCTTGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 49 het 38 1 31 6 A 9 10 56949 CASAVA_Build 1 189136138 4I AAGTGCTGAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AAAC 3 4 56950 CASAVA_Build 1 189136374 1D AGTCATTTTC A/- AAAATACTCT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 5 4 56951 CASAVA_Build 1 189137573 1D AGCTATTCTT A/- ACATCAGGTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 1 56952 CASAVA_Build 1 189143597 1I TTTATGACAT -/A GAAAAGTTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 1 56953 CASAVA_Build 1 189146206 1D TTTATTTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 7 9 A 10 9 56954 CASAVA_Build 1 189153554 1I AAAACTTGAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 A 7 8 56955 CASAVA_Build 1 189158154 2D AAAACACATG CA/-- CACACACACA 2864 het 2864 ref 34 14 9 13 CA 9 8 56956 CASAVA_Build 1 189185888 1D TTTAACGGAG A/- AAAAAATGAT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 7 6 56957 CASAVA_Build 1 189187334 7I CAAATAAAAA -------/TGAGGGT TACCAGGTGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TGAGGGT 0 1 56958 CASAVA_Build 1 189201312 4D GTCTATCTAT CTAC/---- CATCTATCTA 3070 het 3070 hom 46 20 23 7 CTAC 1 0 56959 CASAVA_Build 1 189202362 1I GATCACATTG -/C CCCCCCCACC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 7 8 56960 CASAVA_Build 1 189205013 1D TCGTATGCAA T/- TTTTTTGTGC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 7 6 56961 CASAVA_Build 1 189206015 2I TTCAGATCAC --/AT GTGTAACTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AT 0 1 56962 CASAVA_Build 1 189209118 1D CTATAACCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3006 hom 25 7 15 3 T 10 9 56963 CASAVA_Build 1 189219014 2I TTATGTATAC --/AT ATATATGTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 3 4 56964 CASAVA_Build 1 189222043 1I TAAAGAAAAG -/A GGAGAAAAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 56965 CASAVA_Build 1 189227270 4D ACCGACACTG AAGT/---- AAGTATTATT 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 AAGT 2 1 56966 CASAVA_Build 1 189228422 4D TATAAAAAAT AAAG/---- AAAGGAAGAT 3070 het 3070 ref 42 20 20 3 AAAG 2 1 56967 CASAVA_Build 1 189230552 1I TTAAAAAAAA -/T ATTACTTAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 0 1 56968 CASAVA_Build 1 189230771 1D CAGGAAGACA C/- CCCCCCCCAT 3070 het 94 hom 31 1 22 8 C 9 8 56969 CASAVA_Build 1 189231625 1I GCAATTCCCG -/T TTTTTTCAGA 3018 het 3018 ref 19 10 8 1 T 6 7 56970 CASAVA_Build 1 189237700 1D AAACATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 9 10 A 12 11 56971 CASAVA_Build 1 189238229 3D TAACAATTTT ATC/--- ATATTTCTGT 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 ATC 1 0 56972 CASAVA_Build 1 189243060 1I AGTTCATTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 8 9 56973 CASAVA_Build 1 189243179 4I TGAGAAAAAA ----/ATAG ATAGTATCAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ATAG 1 2 56974 CASAVA_Build 1 189247148 1D ATTTTTTTTC T/- TTTCTTTTCT 3070 het 2341 hom 24 7 11 6 T 4 3 56975 CASAVA_Build 1 189249040 1D GAACTCATCA T/- TTTTTTATGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 56976 CASAVA_Build 1 189250739 18I AGCCATGATC ------------------/GCTATGCCACTGCACTCA GCCTTGGTGA 3070 hom 62 het 24 0 20 5 GCTATGCCACTGCACTCA 0 1 56977 CASAVA_Build 1 189252084 3I AGAATTTAAT ---/CTC CTCATCTTTT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 CTC 1 2 56978 CASAVA_Build 1 189257659 1I GACCTGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 392 hom 36 1 31 4 A 9 10 56979 CASAVA_Build 1 189275214 1I CTATTATTTC -/T TTTTTTTTCA 1710 het 878 hom 12 3 5 4 T 8 9 56980 CASAVA_Build 1 189283079 2I TGTGTAGATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 104 hom 31 2 11 18 TG 8 9 56981 CASAVA_Build 1 189298817 6D AAGTTTTATA TTTATT/------ TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 10 4 TTTATT 2 1 56982 CASAVA_Build 1 189298896 3D GCAGTATGAA TTT/--- ATTATAGCTT 3070 het 3070 hom 22 9 10 5 T 3 0 56983 CASAVA_Build 1 189301975 1D TGTATTTTCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 9 8 56984 CASAVA_Build 1 189304841 2D CCATAAAAAC TG/-- TACCTACAAA 3070 het 3070 ref 46 24 20 4 TG 1 0 56985 CASAVA_Build 1 189307130 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 13 14 10 A 9 8 56986 CASAVA_Build 1 189308608 1D TACACTTCAT A/- AAAATATAAC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 5 4 56987 CASAVA_Build 1 189327496 4D CTTTGTTTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3021 hom 25 9 11 5 TTTG 5 4 56988 CASAVA_Build 1 189332412 1I TTTAAATAAT -/A AAAAAAGGTC 2619 het 2076 hom 13 6 6 1 A 6 7 56989 CASAVA_Build 1 189336688 4D CCTTGATATA ATTT/---- ACTAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 ATTT 1 0 56990 CASAVA_Build 1 189350096 1D CATATGGTCT A/- AAAAGGGGAG 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 A 5 4 56991 CASAVA_Build 1 189351865 1I TAAAAATTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 8 9 56992 CASAVA_Build 1 189353486 1D AAACCTGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 10 9 56993 CASAVA_Build 1 189358212 1D AATTGGATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 A 10 9 56994 CASAVA_Build 1 189367085 1I AATATTTTGC -/A AACTATGCAT 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 2 3 56995 CASAVA_Build 1 189367167 1I GTAACTTTAT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 6 7 56996 CASAVA_Build 1 189367321 2I GGCTATTATT --/AA AAAGTCAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 5 56997 CASAVA_Build 1 189369589 9I AAAAAGAAAT ---------/AAAAAAAGA AAAAAAAGAA 3070 het 2917 hom 28 9 17 2 AAAAAAAGA 1 2 56998 CASAVA_Build 1 189372048 1I AAGTTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 20 1 16 3 A 10 11 56999 CASAVA_Build 1 189372385 2D TATATATCAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 AT 7 6 57000 CASAVA_Build 1 189374519 3D TAATTTATTT AGG/--- AGAACTAGGA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 AGG 1 0 57001 CASAVA_Build 1 189379380 3D GCACAATAAA CCT/--- CCTAGAAGAA 3070 het 3070 hom 46 12 28 7 CCT 2 1 57002 CASAVA_Build 1 189381516 1I CATGGGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 11 12 57003 CASAVA_Build 1 189383789 4I ACACCCTGAT ----/AAAA AGAAGAACTA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 1 5 57004 CASAVA_Build 1 189388759 1D TCATTTTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 A 10 9 57005 CASAVA_Build 1 189389187 4I CTATAGGATC ----/TTTG TTTGCATGAG 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 TTTG 1 2 57006 CASAVA_Build 1 189391936 1D AGGACAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 11 9 A 13 12 57007 CASAVA_Build 1 189392491 1I AGTGTAGAGG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 7 8 57008 CASAVA_Build 1 189393970 2D CAACTATACC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 14 15 9 A 11 9 57009 CASAVA_Build 1 189395083 5I AATAAACATT -----/GGAAA GGAAAGAGCC 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 GGAAA 1 2 57010 CASAVA_Build 1 189399443 3D AGGAAAACAA AAC/--- AAGCAACAAA 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 AAC 1 0 57011 CASAVA_Build 1 189405262 1I TTGTAATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 10 11 57012 CASAVA_Build 1 189405572 2I AATTTAGTTC --/AT ATGTCTATAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AT 1 2 57013 CASAVA_Build 1 189411139 1D GATGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 T 11 10 57014 CASAVA_Build 1 189426924 1I ACATACAAAT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 8 9 57015 CASAVA_Build 1 189428518 2I TAAATTGTAC --/TA TATATATATA 2298 het 2298 ref 29 13 6 10 TA 6 7 57016 CASAVA_Build 1 189446018 1I ATTCAAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 14 11 A 11 12 57017 CASAVA_Build 1 189450687 1D TTTATTTAAG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 38 24 12 3 A 8 7 57018 CASAVA_Build 1 189457428 1I46M3I CATATAAAGA -TTTTTTTTTTACCAATTTTCATTTGTCTCCACCATCATTGTAGAAG---/TTTTTTTTTTTACCAATTTTCATTTGTCTCCACCATCATTGTAGAAGTCT TCTTCATTCT 3070 het 3070 ref 37 32 13 13 N/A 0 0 57019 CASAVA_Build 1 189459195 2I GTCATATTCC --/TA TGTCTCATAG 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 TA 0 1 57020 CASAVA_Build 1 189463151 2I TTGCGGTGAA --/AT ATATGTCATA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 AT 2 3 57021 CASAVA_Build 1 189464542 5I GACAGGAAAA -----/TATAT TATAAAATAT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 TATAT 0 1 57022 CASAVA_Build 1 189476477 10D ATATATATAT ATATATATAA/---------- AACTCCAATT 3070 het 454 hom 19 1 17 4 ATATATATAA 1 0 57023 CASAVA_Build 1 189480436 1D CTGTGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1507 het 1507 ref 16 8 4 4 T 13 12 57024 CASAVA_Build 1 189487139 1D TATTTTAGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 23 9 11 T 9 8 57025 CASAVA_Build 1 189495368 1I CAAATGATTA -/T CACAAACTTA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 0 1 57026 CASAVA_Build 1 189495685 1D AAAAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 27 2 16 9 T 15 14 57027 CASAVA_Build 1 189499354 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 24 7 10 7 T 8 7 57028 CASAVA_Build 1 189502644 1I CAGCTTAAAC -/A AAAACAGACA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 4 5 57029 CASAVA_Build 1 189503274 1I ATAAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 10 11 57030 CASAVA_Build 1 189514381 2I AGATGTTAGG --/TC TAAGTTATCC 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 TC 0 1 57031 CASAVA_Build 1 189527833 1I CCTGCTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2929 hom 27 9 12 6 A 14 15 57032 CASAVA_Build 1 189527919 2I TAAAAAAAAA --/AC AAACACACAA 3070 het 70 hom 29 2 10 17 AC 0 1 57033 CASAVA_Build 1 189532776 1D TAGTAGCAGT G/- GTAGGCCAAT 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 G 2 1 57034 CASAVA_Build 1 189534117 1I TTTCCAACTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 7 8 57035 CASAVA_Build 1 189540079 4I TGTCAAAAAT ----/TTTA TTTGTGTAAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TTTA 0 1 57036 CASAVA_Build 1 189544307 4I AAAAAAAGAT ----/AATC AAAAGATTCT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 AATC 0 1 57037 CASAVA_Build 1 189546001 2D GCCAGTATAT AA/-- AAGAGTAATT 3070 het 3070 hom 45 19 20 8 A 4 2 57038 CASAVA_Build 1 189551487 2I TAGACAAAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 1237 hom 22 5 11 6 AT 7 8 57039 CASAVA_Build 1 189555493 3D AAATTCATAA AAC/--- AACAGCAACA 3070 het 2900 hom 22 8 13 1 AAC 2 1 57040 CASAVA_Build 1 189561276 1I CATTCAGGCC -/A AAAAGACTAC 3070 het 3070 hom 52 16 30 6 A 4 5 57041 CASAVA_Build 1 189561744 3D GGATTTTTTG GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 GTT 5 4 57042 CASAVA_Build 1 189566095 2I CATTGAGCAC --/CA GGTCTCTCTG 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 CA 0 1 57043 CASAVA_Build 1 189568513 5D TTGTGCACAC TATAT/----- TATATTATTA 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 TATAT 2 1 57044 CASAVA_Build 1 189572702 1I TTCTTCTAGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 8 9 57045 CASAVA_Build 1 189574531 3I AGTAAATATG ---/CTA CTTTGTAGCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CTA 0 1 57046 CASAVA_Build 1 189581722 2D AAGTTTCAAG CA/-- CACAGTTTCA 3070 het 3070 hom 44 17 23 6 CA 3 2 57047 CASAVA_Build 1 189582457 1D GAAGAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 678 hom 38 4 16 18 A 13 12 57048 CASAVA_Build 1 189584664 3D CCATTTACAA TGT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 TGT 1 0 57049 CASAVA_Build 1 189584982 1I TCTATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 13 14 57050 CASAVA_Build 1 189586058 3D TAAATAATAA AAC/--- AACAACTTAG 3070 het 3070 hom 30 13 14 5 AAC 3 2 57051 CASAVA_Build 1 189586602 1I ATCTGAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 10 11 57052 CASAVA_Build 1 189589647 1I TTTAGGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 779 hom 29 3 20 6 T 15 16 57053 CASAVA_Build 1 189595493 1D ACATTTCTTT A/- ACTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 2 1 57054 CASAVA_Build 1 189600290 1D TCATACTTTT C/- TTTCCTGCTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 1 0 57055 CASAVA_Build 1 189607109 4D GATATAAAAT TAGA/---- TAGTAGATTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 TAGA 1 0 57056 CASAVA_Build 1 189613118 2D CCACTGGATA AT/-- ATATCCTGCT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AT 3 2 57057 CASAVA_Build 1 189614662 3I GGGAGCTACA ---/CAC CACTGGAGCT 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 CAC 1 2 57058 CASAVA_Build 1 189625142 1D ATAGATAAAT A/- AAAAAAGGAG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 7 6 57059 CASAVA_Build 1 189637469 1D ACAAATTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 29 3 21 5 A 14 13 57060 CASAVA_Build 1 189639198 9I2M1I GAAATGTTCT ---------AT-/GGCATTTCCATC AGTCAATTAA 3070 het 3070 hom 44 17 26 2 N/A 0 0 57061 CASAVA_Build 1 189651341 1D TAAACAGAGT A/- AATTGAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 3 2 57062 CASAVA_Build 1 189651703 1D GCCTAATATA T/- AAAAGTAAGG 3070 hom 96 het 39 0 33 7 T 1 0 57063 CASAVA_Build 1 189655439 1D TCCAGGATGG A/- AAAATCAGTG 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 5 4 57064 CASAVA_Build 1 189657054 1I ATGGCTTGAA -/C CGGGGAGGCA 2413 hom 15 het 6 0 6 0 C 1 2 57065 CASAVA_Build 1 189663980 2D CAACAACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 31 11 13 8 AC 10 9 57066 CASAVA_Build 1 189678468 1I CACATCCATA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 T 7 8 57067 CASAVA_Build 1 189710431 1D CTTCAGCAAA G/- TCTCAGGATA 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 G 1 0 57068 CASAVA_Build 1 189714308 1I TAAATTCATA -/T TATTGATACA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 1 2 57069 CASAVA_Build 1 189724190 4D ACATTTTATG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 43 24 11 11 TTTA 3 2 57070 CASAVA_Build 1 189731436 3I ATAAATGCTC ---/ATT ATTACTATGA 2277 het 2277 ref 18 11 5 2 ATT 1 2 57071 CASAVA_Build 1 189735542 1I AAAATATCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 T 8 9 57072 CASAVA_Build 1 189744450 8I GGTTTTCCGT --------/CCTTTGAA CATGAACTGG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 CCTTTGAA 0 1 57073 CASAVA_Build 1 189746180 1D AGTAGCTTCT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 32 17 11 6 A 8 7 57074 CASAVA_Build 1 189757591 1I ATGACATAAA -/C AAATATTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 C 0 1 57075 CASAVA_Build 1 189761242 1D GGGGTTGGGA G/- GAAGGGAGGA 3070 hom 135 het 52 0 44 8 G 2 1 57076 CASAVA_Build 1 189761975 5I ATGTACTAAA -----/TATTC TATTCTATTC 1577 het 1577 ref 18 10 4 4 TATTC 2 3 57077 CASAVA_Build 1 189767192 1D TAAGAAATAG A/- AAACTGACTA 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 A 4 3 57078 CASAVA_Build 1 189769603 1I TAAACTATCT -/G ACTAATAATT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 G 0 1 57079 CASAVA_Build 1 189770370 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2698 hom 34 11 16 7 A 10 9 57080 CASAVA_Build 1 189775854 4D TTGCTTAAGG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 52 25 18 10 TTGT 4 3 57081 CASAVA_Build 1 189780895 1I TTCCCTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2213 hom 33 8 11 14 A 15 16 57082 CASAVA_Build 1 189786562 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 T 11 10 57083 CASAVA_Build 1 189794950 1D CTATAGTGGA G/- GGATGTGGCA 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 G 3 2 57084 CASAVA_Build 1 189807229 2D AGACAGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 21 7 A 16 14 57085 CASAVA_Build 1 189867236 1I ATGAACCCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 9 10 57086 CASAVA_Build 1 189872758 3D TAATTATTGA TCG/--- TCAATTAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 TCG 1 0 57087 CASAVA_Build 1 189872818 4D TGTATAAACT TAAA/---- TAAATAATCA 2400 het 2400 ref 21 9 5 7 TAAA 2 1 57088 CASAVA_Build 1 189879530 1D AAGTCTTGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 10 9 57089 CASAVA_Build 1 189888368 1I ATTAAAAAAA -/C ATATCTACTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 C 0 1 57090 CASAVA_Build 1 189888525 1I TAAAGAGCAA -/C ACCTGCAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 C 0 1 57091 CASAVA_Build 1 189911681 1I GAAGGGCAAC -/A ACTTAAGATA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 1 2 57092 CASAVA_Build 1 189916755 1D GCTGACCCCC A/- ACAGGCCCTG 2700 het 2700 ref 23 13 7 3 A 2 1 57093 CASAVA_Build 1 189924662 1D GAGGCCCTTT G/- CCCATTTTTT 3070 het 3070 ref 55 24 24 7 G 1 0 57094 CASAVA_Build 1 189925217 3I TACATATCAC ---/AAG ATATTGAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 AAG 0 1 57095 CASAVA_Build 1 189925361 4I AATCACTATA ----/ATCT ATCTATCTAC 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 ATCT 2 3 57096 CASAVA_Build 1 189927334 1D ACCATGGCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 14 20 11 A 10 9 57097 CASAVA_Build 1 189938426 4D TTGTTGGGGA GTTT/---- GTTTGTGTCT 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 GTTT 2 1 57098 CASAVA_Build 1 189941238 4I TAATTGACAT ----/TGTC TGTCATTTCC 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 TGTC 1 2 57099 CASAVA_Build 1 189943160 1I TCAGAAATCC -/A AAAATCAAGA 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 A 4 5 57100 CASAVA_Build 1 189976928 1D GACCAAGAAG T/- ACCTATACTA 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 T 1 0 57101 CASAVA_Build 1 189979400 3D TTGTGGTTCA AAT/--- AATCTATTCC 3070 het 3070 ref 51 30 20 3 AAT 2 1 57102 CASAVA_Build 1 189984611 2D GGGTATATAC AT/-- ATATATTTTG 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 AT 4 3 57103 CASAVA_Build 1 189985851 23D TAATCTAAAA TATAAAAAGCAAACTTCTTTTTT/----------------------- TTAGCAAACA 3070 het 3070 hom 45 21 26 3 TATAAAAAGCAAACTTCTTTTTT 1 0 57104 CASAVA_Build 1 189995810 4I TAAATTAAAA ----/TATT TATTAGAGTA 2180 het 2180 ref 18 11 5 2 TATT 1 2 57105 CASAVA_Build 1 190005601 1I AAGTTAAAGC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 8 9 57106 CASAVA_Build 1 190024766 3D TGCCATGTAA CTG/--- CTGCTACCTG 3070 hom 137 het 49 0 43 6 CTG 2 1 57107 CASAVA_Build 1 190029568 1I TAACATTAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 8 9 57108 CASAVA_Build 1 190030875 1D GTTGGTTAAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 8 7 57109 CASAVA_Build 1 190031844 1D GCTTTTATTT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 24 1 17 6 A 1 0 57110 CASAVA_Build 1 190041744 1D TATTTTATTG T/- TTTTTTTTTT 1941 het 1941 ref 17 7 5 5 T 12 11 57111 CASAVA_Build 1 190044826 1D AAGCAAAATC T/- TTGTCTAGCT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 3 2 57112 CASAVA_Build 1 190053609 1I AATTCCTGAA -/G AGCCAAGAGT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 0 1 57113 CASAVA_Build 1 190056253 1D GGTTATATAT A/- AAAAAACACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 7 6 57114 CASAVA_Build 1 190060551 2D CTATATAGTG TA/-- TATATATATA 1154 het 986 hom 8 3 5 0 TA 9 8 57115 CASAVA_Build 1 190075571 1D TATTAAACCA T/- CTTCAGGCTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 0 57116 CASAVA_Build 1 190075922 2D TCTCTCTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 21 het 32 1 20 12 TG 10 9 57117 CASAVA_Build 1 190085145 2I TACATTTAGA --/CT CTTTAAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CT 1 2 57118 CASAVA_Build 1 190101744 8I ACACGCAAAT --------/GGCAAACA GGCATATGAA 3070 hom 138 het 54 0 47 7 GGCAAACA 0 1 57119 CASAVA_Build 1 190105645 43I TTTAAAAAAA -------------------------------------------/TCCTCTTAAATCCCTAATTACCGGAGTTTAGCCACACCAGGTG GCCAATATTT 3070 hom 30 het 11 0 11 1 TCCTCTTAAATCCCTAATTACCGGAGTTTAGCCACACCAGGTG 0 1 57120 CASAVA_Build 1 190109617 2D TTATGAAGTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 11 9 57121 CASAVA_Build 1 190109782 4D AAAACGCTTT TCTG/---- TCTATTATCT 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 TCTG 1 0 57122 CASAVA_Build 1 190111791 5I AATTACTAAA -----/TTTTC TTTTGTGAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTTTC 0 1 57123 CASAVA_Build 1 190113767 3D32M3I ATTTTTAAAA AGGAGTATATTAAAATGAGCACATATTTTTACTAC---/---AGTATATTAAAATGAGCACATATTTTTACTACATA ATATTTTTAC 3070 hom 102 het 30 0 35 5 N/A 0 0 57124 CASAVA_Build 1 190115784 2D GCTTTATAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 22 1 15 6 A 17 15 57125 CASAVA_Build 1 190116897 5I TTTTGAATCA -----/AATAT AATATATAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AATAT 1 2 57126 CASAVA_Build 1 190118161 4D CTTAAGTAAA AAGT/---- AAGTGAGAGA 3070 hom 127 het 49 0 43 8 AAGT 2 1 57127 CASAVA_Build 1 190127951 1I ATAAGAAATT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 8 57128 CASAVA_Build 1 190130401 8D CAAGTTAACA TATCCACT/-------- TAAGGATTGC 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TATCCACT 1 0 57129 CASAVA_Build 1 190132422 1I TCGATTACCT -/G AACCTGTCCT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 G 0 1 57130 CASAVA_Build 1 190139504 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAG 1827 het 1469 hom 13 5 7 1 A 9 10 57131 CASAVA_Build 1 190139662 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2052 hom 20 6 10 4 A 12 14 57132 CASAVA_Build 1 190140394 2I ATGTATGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 AC 8 9 57133 CASAVA_Build 1 190142640 1I TTTATATGTT -/G CCTATGTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 G 0 1 57134 CASAVA_Build 1 190150127 1D GCATCATATA G/- AAAGTCTTAC 3070 het 3070 hom 22 10 10 3 G 1 0 57135 CASAVA_Build 1 190159702 2D CCCAGAACAC TG/-- TGATCAGGCA 3070 het 3070 hom 32 10 19 4 TG 2 1 57136 CASAVA_Build 1 190160360 8I ATTTGTGGCT --------/AGGTATAG AGGTATAGTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 AGGTATAG 1 2 57137 CASAVA_Build 1 190169972 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAGCAAA 2207 het 2207 ref 37 22 8 7 A 6 5 57138 CASAVA_Build 1 190172168 1D TGGTGCTGGG A/- AAACTAGATA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 4 3 57139 CASAVA_Build 1 190174209 3I36M2D AGTGCATGTG ---TTTTTTTTGGTATAATAATTTATTTTCCTTTGGATATG/TTTTTTTTTTTGGTATAATAATTTATTTTCCTTTGGATA-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 9 15 7 N/A 0 0 57140 CASAVA_Build 1 190174530 1I TTTGCTGGCT -/G CCTATATATC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 0 1 57141 CASAVA_Build 1 190174993 1D AAATAAGGAG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 T 7 6 57142 CASAVA_Build 1 190180408 1D TAAAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 11 10 57143 CASAVA_Build 1 190180563 1D AAACTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1606 hom 23 7 13 3 A 13 12 57144 CASAVA_Build 1 190187243 1D CAGTAGATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 A 9 8 57145 CASAVA_Build 1 190198863 1D TAATAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 10 9 57146 CASAVA_Build 1 190211204 1I ATGATTGTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 11 20 11 A 9 10 57147 CASAVA_Build 1 190214362 1D GGCTTGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1006 hom 29 5 15 10 T 12 11 57148 CASAVA_Build 1 190218855 1D CAGATGCCAA T/- AGTTTGTGCA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 1 0 57149 CASAVA_Build 1 190226569 1I ATTCTACACA -/C AAAATAAAAA 1920 het 1920 ref 27 20 6 1 C 0 1 57150 CASAVA_Build 1 190240563 1I CATTATATTG -/C CCCATAGATT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 3 4 57151 CASAVA_Build 1 190242344 5D AAGCAAATAT AAAAA/----- AAGTTTGATG 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 A 7 2 57152 CASAVA_Build 1 190247367 1D TTTTCTTTTT C/- TTTTTTTCTT 1563 het 1563 ref 18 7 9 2 C 1 0 57153 CASAVA_Build 1 190247603 2D AAAAAGAGTG TC/-- TGTATTATAA 3070 het 3070 ref 17 8 9 1 TC 1 0 57154 CASAVA_Build 1 190251468 1I TTTGAATATG -/T TTTTTTGTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 7 57155 CASAVA_Build 1 190258959 1I AAAGAAAATT -/A AAACTCAGTA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 3 4 57156 CASAVA_Build 1 190270751 4D AAAGAGACTT AATC/---- AACCATGTGA 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 AATC 1 0 57157 CASAVA_Build 1 190272493 1D AGAATGACTA C/- CTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 C 2 1 57158 CASAVA_Build 1 190274694 3D AGGATAGCTC TGT/--- TGTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 8 TGT 2 1 57159 CASAVA_Build 1 190276461 4D ATATAAAAAA AAAT/---- AATTGATTTG 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 AAAT 1 0 57160 CASAVA_Build 1 190278236 1D AAATTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 15 14 57161 CASAVA_Build 1 190281338 1D TGCTTTTGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2211 hom 21 6 8 7 A 10 9 57162 CASAVA_Build 1 190287486 1I AAATAATTAT -/A AAATATGTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 3 4 57163 CASAVA_Build 1 190290430 4D TCTTTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTTG 4 3 57164 CASAVA_Build 1 190293518 1D CATATCCTAC A/- AACTCTGATG 3070 het 3070 hom 27 9 13 6 A 3 2 57165 CASAVA_Build 1 190303448 1I TCTTTTTGTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 8 9 57166 CASAVA_Build 1 190303917 1D AATCTTCCAG T/- TTTTTTTTTT 1885 het 1885 ref 33 21 4 8 T 11 10 57167 CASAVA_Build 1 190307396 5I TAATATATTT -----/TATTG TATTGTAGTC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 TATTG 1 2 57168 CASAVA_Build 1 190308665 1D CCTATTAAGG A/- AAAAAAATAT 1087 het 1087 ref 30 18 5 7 A 8 7 57169 CASAVA_Build 1 190309184 4I GTTGTTATTG ----/TTGT TTGTTTTAAT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 TTGT 1 2 57170 CASAVA_Build 1 190321884 3D TTCATTTTTT TAA/--- TGTTTAATGT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TAA 1 0 57171 CASAVA_Build 1 190338350 1D CTCTCTCATG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 42 15 21 9 A 8 7 57172 CASAVA_Build 1 190342099 3D GCTTCCATGT GAA/--- GAAGGACACA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 GAA 2 1 57173 CASAVA_Build 1 190361079 4I CAACTCTAAT ----/AGAG AGAAAGTTTA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 AG 1 3 57174 CASAVA_Build 1 190361348 6D ATAATTTTTT AACAAG/------ AAGTTCTGCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 6 AACAAG 1 0 57175 CASAVA_Build 1 190367489 3D CTCAAATCAC ATG/--- ATATTTATAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 ATG 1 0 57176 CASAVA_Build 1 190368288 1I GGCAGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 A 10 11 57177 CASAVA_Build 1 190375557 1I AAAAATAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 8 9 57178 CASAVA_Build 1 190384919 3I8M1D TCAAAAAACA ---AAACAAAAC/AACAAACAAAA- AAAAAGACTT 3070 het 1498 hom 12 6 9 1 N/A 0 0 57179 CASAVA_Build 1 190393913 6D TAACTCATGT AATAAC/------ AATAAGAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 6 AATAAC 1 0 57180 CASAVA_Build 1 190394635 1D ATAATTTGGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 9 8 57181 CASAVA_Build 1 190404020 1D ACATTACTTT A/- AAAAAGTTAT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 A 6 5 57182 CASAVA_Build 1 190411079 1D ATATCACTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 10 9 57183 CASAVA_Build 1 190435911 2D CTTTAAATCT CA/-- GTTTGAAAAC 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 CA 1 0 57184 CASAVA_Build 1 190438685 1D CAAAAAAAAA C/- AAACAAAAAC 2433 het 2433 ref 34 18 8 8 C 1 0 57185 CASAVA_Build 1 190458642 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 2632 het 2135 hom 24 10 8 7 TA 7 6 57186 CASAVA_Build 1 190459042 6D GTGTGTGTAT ACACAC/------ ACACACACAC 3027 het 3027 ref 24 13 9 6 AC 11 8 57187 CASAVA_Build 1 190464952 1D AATTTTATTT G/- GAATTTACTT 3070 het 3070 ref 33 22 11 0 G 2 1 57188 CASAVA_Build 1 190466986 1D AAAAAAAAAA G/- AATGCTTACA 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 G 1 0 57189 CASAVA_Build 1 190467687 1I TAAAGTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 30 1 17 12 T 15 16 57190 CASAVA_Build 1 190470675 1I TTATCACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 A 10 11 57191 CASAVA_Build 1 190577519 1D TGCATGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 18 10 T 15 14 57192 CASAVA_Build 1 190617773 1D CAAATAAGAT A/- AAAAGGGTGA 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 5 4 57193 CASAVA_Build 1 190618452 1D TGAAGTAGGT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 49 17 24 9 A 9 8 57194 CASAVA_Build 1 190621970 13D GCACTAACAC AGTGCTACAGCCT/------------- AGTGCACATC 3070 het 3070 ref 41 26 17 6 AGTGCTACAGCCT 1 0 57195 CASAVA_Build 1 190626448 1D ACCCGACTAA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 8 7 57196 CASAVA_Build 1 190637259 4D TTTGTTTCTC TCTT/---- GAAAATTTTC 3070 hom 57 het 21 0 20 2 TCTT 1 0 57197 CASAVA_Build 1 190644144 3D TGCTGTACCC AGA/--- AGAAGACAGA 3070 hom 86 het 34 0 29 5 AGA 3 2 57198 CASAVA_Build 1 190651275 5I AACATCATAA -----/TATAT TAGATTATGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TATAT 0 1 57199 CASAVA_Build 1 190661599 1D GCAAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 13 12 57200 CASAVA_Build 1 190664530 1D AGTACATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2894 hom 28 9 12 9 A 13 12 57201 CASAVA_Build 1 190669287 1D TCATAGAAGT A/- AGAGAGTAGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 1 57202 CASAVA_Build 1 190678973 4D CAGCAATAAA TGAC/---- TGGATAAAGT 3070 het 3070 ref 53 28 19 9 TGAC 1 0 57203 CASAVA_Build 1 190689878 1D GAGACCCTTT G/- GAAAGTATAT 3070 het 3070 hom 51 23 24 5 G 2 1 57204 CASAVA_Build 1 190694490 1I GGGGAATCAT -/A CCTTTGAACA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 0 1 57205 CASAVA_Build 1 190747205 3I TGTTTTCTTC ---/CTT CTTTTATATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CTT 1 2 57206 CASAVA_Build 1 190755686 2D ATTTGCCACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 13 8 T 13 11 57207 CASAVA_Build 1 190761730 1D CAAAGAAAAC A/- GGAATTCTTT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 A 1 0 57208 CASAVA_Build 1 190762272 3D GTTCTTTTTG TCC/--- AGATGCACTT 3070 hom 102 het 35 0 35 3 TCC 1 0 57209 CASAVA_Build 1 190767109 3D AGTAGAAATG AGA/--- AGAAGAATAG 3070 het 3070 ref 27 15 9 5 AGA 3 2 57210 CASAVA_Build 1 190773855 2I TCAACTGAAG --/AT AGATCAAAGA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AT 0 1 57211 CASAVA_Build 1 190778700 1I AAGATGAAGA -/G GAGAAAAGGA 3070 hom 99 het 36 0 32 4 G 1 2 57212 CASAVA_Build 1 190779684 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 272 hom 32 1 24 7 T 17 16 57213 CASAVA_Build 1 190790324 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 16 3 10 3 A 15 14 57214 CASAVA_Build 1 190797086 5D ATATAAACAT AATGA/----- AGAATGCAAT 3070 het 3070 hom 21 9 11 4 AATGA 1 0 57215 CASAVA_Build 1 190797591 1D ATATGAAAAG T/- TTTTGCACAG 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 5 4 57216 CASAVA_Build 1 190798154 2I GGAGGGAAGG --/CA CACAACCAGG 3070 hom 138 het 52 0 45 7 CA 2 3 57217 CASAVA_Build 1 190803104 1I GGAAAAAACA -/T TGGGTAAGAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 2 57218 CASAVA_Build 1 190811378 1I CACTGTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 821 hom 54 2 41 11 T 11 12 57219 CASAVA_Build 1 190823119 1I TCCATCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1129 hom 26 4 18 4 A 13 14 57220 CASAVA_Build 1 190835059 1D AATGTCCTGT G/- GGACCTGAAC 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 G 3 2 57221 CASAVA_Build 1 190836305 1I CACCCACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 23 1 17 5 A 10 11 57222 CASAVA_Build 1 190838313 1I TCCAAAATGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 51 23 21 7 A 8 9 57223 CASAVA_Build 1 190838994 1D CTGGTCTTGC T/- GCTTGCTTAT 3070 het 3070 hom 54 22 23 9 T 1 0 57224 CASAVA_Build 1 190841024 1D TTGCAATGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 12 15 10 T 10 9 57225 CASAVA_Build 1 190847480 3D TAAGTAAATA TTC/--- TTCTGCAATT 3070 het 3070 ref 31 14 17 0 TTC 2 1 57226 CASAVA_Build 1 190851561 1I ATGTGTAGTT -/G TTTTCTCTTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 0 1 57227 CASAVA_Build 1 190852411 1I GCCCAAACTA -/C TTTTTACATT 3070 hom 101 het 42 0 32 10 C 0 1 57228 CASAVA_Build 1 190870391 1D AGAAGGACAG C/- CTTTCAATGG 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 C 2 1 57229 CASAVA_Build 1 190875110 1I GCAGCCCCAA -/C CCATCTGGGT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 C 2 3 57230 CASAVA_Build 1 190876422 66D TGCTTCTTGG TCCTCCTCACTTATAGTAGAGACTTACATAGAAAATGAAGTTGATCAGACCACATTTCTCATATGT/------------------------------------------------------------------ TCTTATCTCC 3070 het 3070 ref 27 28 13 1 TCCTCCTCACTTATAGTAGAGACTTACATAGAAAATGAAGTTGATCAGACCACATTTCTCATATGT 1 0 57231 CASAVA_Build 1 190878076 1I ACATAATTCC -/T TTTTTTTTTT 2466 het 2466 ref 42 14 11 17 T 17 18 57232 CASAVA_Build 1 190879209 2I ATGTATTGTT --/CA ATGTAAAGGT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 CA 0 1 57233 CASAVA_Build 1 190893056 1I TAGTCTAGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 A 9 10 57234 CASAVA_Build 1 190913272 1I GGACGTGCAT -/C CCCAGACCAC 3070 hom 123 het 43 0 39 4 C 3 4 57235 CASAVA_Build 1 190914387 1I ATTAAGTATA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 7 8 57236 CASAVA_Build 1 190914753 1I ACATTCCAAG -/A AAAAAAAATC 619 het 619 ref 52 43 2 7 A 8 9 57237 CASAVA_Build 1 190918104 1I TCATTGCTAA -/G CTTAATGTGT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 G 0 1 57238 CASAVA_Build 1 190951090 2D GGCTCATAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 47 18 18 13 AG 9 8 57239 CASAVA_Build 1 190990797 1D CATGTCACCC A/- AAAAAAAAAA 1699 het 1699 ref 41 27 5 9 A 13 12 57240 CASAVA_Build 1 190993394 1I TAAATGCACC -/T TTATAGAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 22 1 T 2 3 57241 CASAVA_Build 1 190993617 2D TTTTAATAGA CT/-- CTCTCTCTTC 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 CT 5 4 57242 CASAVA_Build 1 190994194 1D GGCAATTATG A/- AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 A 7 6 57243 CASAVA_Build 1 190995401 1D TCCTCTTTGA T/- TTTTTTCATC 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 T 7 6 57244 CASAVA_Build 1 190995681 10I ACAAATACAG ----------/TTTTATATCT TTTTATATCT 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 TTTTATATCT 1 2 57245 CASAVA_Build 1 190996608 4I CAACTCAGCA ----/AGAT AGTTTCCTGA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 AGAT 0 1 57246 CASAVA_Build 1 190996761 4D AGACTCAGAC GTCT/---- AAGATCCCTG 3070 het 3070 hom 46 17 28 2 GTCT 1 0 57247 CASAVA_Build 1 190997547 1D GTCTTTGACC T/- TGAAGACAAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 2 1 57248 CASAVA_Build 1 190997840 1I TTATTCACTC -/T CCTACTCTCC 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 T 0 1 57249 CASAVA_Build 1 191003599 2D TAAATAGAAC AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 A 10 8 57250 CASAVA_Build 1 191032001 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAGGGGG 3070 het 2849 hom 21 9 10 2 A 6 5 57251 CASAVA_Build 1 191046712 2D ATTCTGCATG CT/-- CTCTTTTCTC 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 CT 3 2 57252 CASAVA_Build 1 191046961 2D AAAGTGAAAC AA/-- AGTAATCAAG 3070 het 3070 hom 43 18 20 6 A 3 1 57253 CASAVA_Build 1 191048267 1I TTCTAATCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 35 het 29 1 25 3 A 9 10 57254 CASAVA_Build 1 191056158 1I ATCTGGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 10 11 57255 CASAVA_Build 1 191068620 1D TCAAGGGATT A/- AAAAAAAAAA 1215 het 1215 ref 39 27 4 8 A 12 11 57256 CASAVA_Build 1 191090820 4D TGTGATTTAG TAGT/---- TAATCTATTG 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 TAGT 1 0 57257 CASAVA_Build 1 191090889 1I AAATCTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 18 2 10 6 T 15 16 57258 CASAVA_Build 1 191094136 3D ATGATCAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 2323 het 89 hom 13 1 8 5 A 16 13 57259 CASAVA_Build 1 191095202 1D CCCTATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 29 2 13 14 A 17 16 57260 CASAVA_Build 1 191096735 2D AGGCCTGCTC AA/-- AGAGCTCTGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 3 1 57261 CASAVA_Build 1 191108021 7I TTGCAAGTTG -------/GGCCGTT GGCCGTTGTG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 GGCCGTT 1 2 57262 CASAVA_Build 1 191118090 1D AAATAAAATC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 8 7 57263 CASAVA_Build 1 191119271 1D GTTGCACACT C/- CTTATGCAAA 3070 het 3070 hom 42 14 24 5 C 2 1 57264 CASAVA_Build 1 191127323 12D CTTACTGGGA CCACCCCCTCTG/------------ CCCAGGAATC 3070 het 3070 ref 30 18 11 4 CCACCCCCTCTG 1 0 57265 CASAVA_Build 1 191127705 12D GTGGCCACAG CCCCACCCAGGA/------------ GGGCAGGGTC 2225 hom 39 het 14 0 10 7 CCCCACCCAGGA 1 0 57266 CASAVA_Build 1 191131293 2D GCGCAGACCC AA/-- AGAGTGAGCA 3070 het 3070 ref 29 14 9 8 A 3 1 57267 CASAVA_Build 1 191151886 1D GTCTCCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 12 12 T 12 11 57268 CASAVA_Build 1 191158158 8I CCTGGCACTC --------/TCTCTCTT TCTCTCAAGA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 TCTCTCTT 0 1 57269 CASAVA_Build 1 191158912 1I GTTGACAACA -/C CTCTAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 C 1 2 57270 CASAVA_Build 1 191189820 1D AAGGTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 558 hom 30 4 15 11 A 17 16 57271 CASAVA_Build 1 191212778 1D AAAATCAATA T/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 7 6 57272 CASAVA_Build 1 191213237 1I TGCTAGCACT -/G GGGAGCAGCT 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 G 3 4 57273 CASAVA_Build 1 191214239 1D GTGTGATGTA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 93 het 39 0 32 8 T 8 7 57274 CASAVA_Build 1 191244464 1I AATCAAATAA -/T TTTTTTTTTT 2515 het 1155 hom 23 5 8 10 T 15 16 57275 CASAVA_Build 1 191256659 4D AGTGGGGTAA TTCT/---- TTATTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 15 14 7 TTCT 1 0 57276 CASAVA_Build 1 191258545 1I CTTTGTAGTG -/T ATAAGAGAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 0 1 57277 CASAVA_Build 1 191283743 7D CCTTGGAGTA CAAGTCT/------- CAAGTCTTTA 3070 het 3070 hom 32 15 16 2 CAAGTCT 2 1 57278 CASAVA_Build 1 191301426 1D AAAAGCCAAA T/- TTGAAAAGAG 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 T 3 2 57279 CASAVA_Build 1 191303242 1D CCGGCCCAAA T/- TTTTTTTTTT 614 het 614 ref 23 15 3 6 T 12 11 57280 CASAVA_Build 1 191324137 1I TCATCAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 10 11 57281 CASAVA_Build 1 191347476 1I AGATTATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 T 11 12 57282 CASAVA_Build 1 191357144 1I CCCAGAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1702 hom 26 6 10 10 T 13 14 57283 CASAVA_Build 1 191359424 1I TTTTAGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 13 14 57284 CASAVA_Build 1 191372727 1D10M1I AGCAGGAAAT GGCATAATACA-/-GCATAATACAT TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 28 11 19 1 N/A 0 0 57285 CASAVA_Build 1 191377852 2D TCATTGGAGT GA/-- GAGAGAGAGA 1653 het 1653 ref 58 35 5 18 GA 9 8 57286 CASAVA_Build 1 191380569 1D TTTGGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 2956 het 2640 hom 37 9 8 21 T 17 16 57287 CASAVA_Build 1 191394141 1I TCTGGACAGG -/C ATGGTGGCTC 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 C 0 1 57288 CASAVA_Build 1 191394256 1I CTCTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1735 hom 16 5 9 2 A 11 12 57289 CASAVA_Build 1 191394707 2D TCTGTTGTAT AC/-- AGTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 AC 1 0 57290 CASAVA_Build 1 191419104 1D TCTAAAATGT A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 A 7 6 57291 CASAVA_Build 1 191436844 1D GTGTATTGGC G/- GGGGTGGGTG 3070 het 3070 hom 37 14 12 11 G 5 4 57292 CASAVA_Build 1 191456707 2D CTTTTAGTCA AT/-- ATATATATGG 3070 het 3070 ref 42 24 14 6 AT 5 4 57293 CASAVA_Build 1 191458987 1D GTTCATTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 T 10 9 57294 CASAVA_Build 1 191470661 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 6 7 57295 CASAVA_Build 1 191476457 1D TTTAATGGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 6 T 9 8 57296 CASAVA_Build 1 191495712 1D TAAGTAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 36 1 30 6 A 11 10 57297 CASAVA_Build 1 191497372 1I AATCTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 T 10 11 57298 CASAVA_Build 1 191502379 2D TCCTCTTAAC AG/-- GGTCTTTCAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AG 1 0 57299 CASAVA_Build 1 191507716 1I ATGCAGGCTG -/T TTTTTTGGTT 3070 het 2736 hom 31 9 17 5 T 6 7 57300 CASAVA_Build 1 191518101 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 30 7 8 15 T 14 15 57301 CASAVA_Build 1 191518917 1I CCAGAGATCC -/T ACTTTCAAAC 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 T 0 1 57302 CASAVA_Build 1 191541219 1D CTTTGGATAG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 8 7 57303 CASAVA_Build 1 191543776 1D CTGTCTAGAG T/- TTTGGCTTCT 3070 het 3070 hom 45 16 21 9 T 4 3 57304 CASAVA_Build 1 191546434 1D AATAGGAAAC T/- GCCCAGGCAG 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 1 0 57305 CASAVA_Build 1 191547212 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 T 11 10 57306 CASAVA_Build 1 191550719 1I GAACCTTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 47 13 21 13 A 9 10 57307 CASAVA_Build 1 191552176 2I TTTTCTTCAC --/TT GGCTATTATA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 0 2 57308 CASAVA_Build 1 191557773 1I CATAGAATTA -/C CCCCTGCTTA 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 C 4 5 57309 CASAVA_Build 1 191566679 1I TTTCAAAAAC -/A CAGTACTTCA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 0 1 57310 CASAVA_Build 1 191570715 1I ATACTTAGTA -/T TTTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 6 7 57311 CASAVA_Build 1 191571105 1I ATGTTGAGAG -/T GGGGCAGGGA 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 T 0 1 57312 CASAVA_Build 1 191575634 2I TGAGACAGAG --/TC CTGCTCTGTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 TC 0 1 57313 CASAVA_Build 1 191589057 1I GTGACTTCTT -/C CAGAAAAGGG 3070 het 3070 hom 40 12 14 14 C 1 2 57314 CASAVA_Build 1 191604254 1D GGAGTAGCAC T/- TTCATTTTCT 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 T 3 2 57315 CASAVA_Build 1 191605647 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 2617 het 1503 hom 13 4 7 2 T 9 10 57316 CASAVA_Build 1 191606127 1I GTGGCAGGCA -/C CTGTGGTCCC 2313 hom 18 het 7 0 7 0 C 1 2 57317 CASAVA_Build 1 191617022 4D AAGTCTGAAA ATTG/---- ATTGAGAGGC 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 ATTG 2 1 57318 CASAVA_Build 1 191621996 1D TGCAGACTGG T/- TATCCAACTT 3070 het 3070 hom 31 14 17 0 T 2 1 57319 CASAVA_Build 1 191627802 2D ATAGTTTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 A 16 14 57320 CASAVA_Build 1 191635976 1D ATAGGAAAAC T/- AAAAACAAAT 3070 hom 91 het 34 0 29 5 T 1 0 57321 CASAVA_Build 1 191653345 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1372 het 1372 ref 44 29 3 12 T 12 11 57322 CASAVA_Build 1 191676450 4D5M3I CTGGCTGGGT ATTCTCAAA---/----CCAGAGGC ATACCTTTTA 3070 het 3070 ref 38 19 16 6 N/A 0 0 57323 CASAVA_Build 1 191687128 7D43M4D TCTATCTATC ATCTATTATCTATTATCTGTCTTTAAAAAATCTATCATCTATCATCTGTCTATT/-------ATCTATTATCTGTCTTTAAAAAATCTATCATCTATCATCTGTC---- TAATCTATTA 2321 het 2321 ref 35 32 5 15 N/A 0 0 57324 CASAVA_Build 1 191687825 2D GTAGAATAAC AT/-- AATGTTTTGC 3070 het 3070 hom 37 12 22 4 AT 1 0 57325 CASAVA_Build 1 191688134 3I GTATCCACTA ---/TCT TCGGTTCCCC 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 TCT 0 1 57326 CASAVA_Build 1 191688752 2D AAAACAAAAC AG/-- AAAATGTAAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 AG 1 0 57327 CASAVA_Build 1 191705399 1D CAATCAGAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 46 17 18 11 A 9 8 57328 CASAVA_Build 1 191710847 1D GGTCCATATT G/- GCCAGTGGGT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 G 2 1 57329 CASAVA_Build 1 191713014 1I GGAGATAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 8 9 57330 CASAVA_Build 1 191719334 12D TCATGGGGGT TTATTGTACAGA/------------ TTATTTCATC 3070 hom 75 het 24 0 26 1 TTATTGTACAGA 1 0 57331 CASAVA_Build 1 191732916 5D TTTCCCTTTA TTAAC/----- TTAACTATTC 3070 het 3070 hom 28 10 17 2 TTAAC 2 1 57332 CASAVA_Build 1 191782622 3I CTGTGGATGG ---/TCT TCTTTGACTT 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 TCT 1 2 57333 CASAVA_Build 1 191806253 1D AAAAAAAAAA G/- GAGACTATTG 3070 het 3070 hom 43 18 19 8 G 2 1 57334 CASAVA_Build 1 191826806 2D GTGTGTAAGA GT/-- GTTCATTTGA 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 GT 2 1 57335 CASAVA_Build 1 191835708 1I CCTGACACAA -/T TTTTTCTCCT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 5 6 57336 CASAVA_Build 1 191836700 1I GAGAATAAGG -/A AAAAAAAAAA 1231 het 1231 ref 47 33 3 11 A 11 12 57337 CASAVA_Build 1 191838288 2I GCTCATACTC --/TT TAGTTTGTAG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 1 3 57338 CASAVA_Build 1 191851320 1D GCTTTGGCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 722 hom 32 7 9 17 A 12 11 57339 CASAVA_Build 1 191852241 5D GCTAAGTGTT ATAAC/----- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 31 18 11 5 ATAAC 1 0 57340 CASAVA_Build 1 191862057 1D CTGGGGACAA G/- GGACCTAGGG 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 G 3 2 57341 CASAVA_Build 1 191872888 1D TCTTCTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 23 0 19 5 T 10 9 57342 CASAVA_Build 1 191878137 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 T 10 9 57343 CASAVA_Build 1 191884167 9I CAACTTTACT ---------/GAATTTGTG GAATCTTTAG 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 GAATTTGTG 0 1 57344 CASAVA_Build 1 191885486 1D CTTAATGTCC T/- TCTTAATTTT 3070 het 3070 hom 29 12 16 2 T 2 1 57345 CASAVA_Build 1 191886348 1D CACTTGAAAG A/- AAAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 7 6 57346 CASAVA_Build 1 191887286 3I CTCTTCCTTC ---/TCT TCTTCTCTTC 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 TCT 2 3 57347 CASAVA_Build 1 191888582 1D TTGAACAGAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 T 9 8 57348 CASAVA_Build 1 191889149 3I TTAAGATGAT ---/AAC AACTTAATTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AAC 1 2 57349 CASAVA_Build 1 191889583 1D GGTGGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 T 11 10 57350 CASAVA_Build 1 191893413 1D CCTTAGAGGG T/- TTTATGAGGA 3070 het 3070 ref 44 24 19 2 T 4 3 57351 CASAVA_Build 1 191895729 1I CACAAGGACT -/G GGGGGGTCTC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 G 6 7 57352 CASAVA_Build 1 191901726 4D TTCATGTAAA TGAC/---- TGAGAAGAAC 3070 het 3070 ref 42 26 16 1 TGAC 1 0 57353 CASAVA_Build 1 191902935 1I TGTTTTACTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 7 8 57354 CASAVA_Build 1 191906146 1D TAAACATAGA T/- TTTTCTATTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 5 T 5 4 57355 CASAVA_Build 1 191908322 1I GGGAAATCTT -/A AAAATTCCCG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 A 4 5 57356 CASAVA_Build 1 191917017 1I GAAAGGGATC -/A GGGGCTGCTG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 0 1 57357 CASAVA_Build 1 191928401 1D TATCCGTGCT A/- AGAAACTGTA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 2 1 57358 CASAVA_Build 1 191929528 2I TTTATTCATT --/AC TTGTGATGTC 3070 het 3070 hom 51 18 27 6 AC 0 1 57359 CASAVA_Build 1 191931837 1I GCTGTAATGA -/T TTTTTTTTTT 1400 het 1400 ref 31 20 3 8 T 15 16 57360 CASAVA_Build 1 191933691 1I TGATGGTTTC -/A ATTTACTGGA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 1 2 57361 CASAVA_Build 1 191935643 4D TGGAAAACTC AGAT/---- GGTGAGAAGG 3070 het 3070 ref 46 25 20 1 AGAT 1 0 57362 CASAVA_Build 1 191937158 1I CACGAACCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 9 10 57363 CASAVA_Build 1 191946446 1D GGCACTTAAC A/- GTTTCTGATT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 1 0 57364 CASAVA_Build 1 191947371 2I ATTTAATGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 28 0 19 9 T 12 14 57365 CASAVA_Build 1 191952933 4I CACCCCTCTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 52 het 37 0 18 19 TC 7 9 57366 CASAVA_Build 1 191966304 2I GTATGCACAT --/AC ACATATATGT 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 AC 1 2 57367 CASAVA_Build 1 191967262 4D TAGTAATGGA TATT/---- TATTCTGTAC 3070 het 3070 ref 39 17 19 4 TATT 2 1 57368 CASAVA_Build 1 191969379 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 A 8 7 57369 CASAVA_Build 1 191969645 2D GATTTCTGTC AT/-- GTGTGACAGG 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 AT 1 0 57370 CASAVA_Build 1 191970854 2I AAAGGAATAT --/AA GTTTATCATA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 0 2 57371 CASAVA_Build 1 191971167 1D CCTGGCTAAC T/- TTTTTTTTTT 2987 het 1095 hom 13 4 8 1 T 11 10 57372 CASAVA_Build 1 191972158 2D AATATCACTC TT/-- ATATATTTAT 3070 hom 87 het 37 0 30 9 T 2 0 57373 CASAVA_Build 1 191973098 1I AGGTGGAGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 9 10 57374 CASAVA_Build 1 191976150 1I ATTGCTGTAA -/T TTTTTTATAC 2829 het 2829 ref 24 13 8 3 T 6 7 57375 CASAVA_Build 1 191977823 5I TAGTTATGAG -----/TTTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 47 0 24 23 TTTTC 0 1 57376 CASAVA_Build 1 191979160 1D ACTCTCCCTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 7 6 57377 CASAVA_Build 1 191980043 1D TGAAATATGA T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 T 7 6 57378 CASAVA_Build 1 191980327 2D TTACTTGATA TT/-- TGTTGTGGAA 3070 het 3070 ref 34 18 16 0 T 3 1 57379 CASAVA_Build 1 191981136 1D TTTACATAGC T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 T 7 6 57380 CASAVA_Build 1 191986280 2D AAGAAAATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 A 16 14 57381 CASAVA_Build 1 191990349 1D CTATCCTCAA C/- CTAACTTGTG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 C 2 1 57382 CASAVA_Build 1 191991876 1I AATACTATTC -/A AATAAGAAGT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 2 3 57383 CASAVA_Build 1 191999264 1I AGCTGCCAGG -/A AAAAATAGAT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 5 6 57384 CASAVA_Build 1 192000722 13D GGGGGGGGGG TGGGGGGGGCGGT/------------- GGAGGGGGGA 2982 hom 8 het 12 0 10 3 TGGGGGGGGCGGT 1 0 57385 CASAVA_Build 1 192004518 1D CATTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 9 11 T 15 14 57386 CASAVA_Build 1 192006807 1D GGATTCTTCC A/- CAGAACCTCC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 A 1 0 57387 CASAVA_Build 1 192008835 1D CTTGAAACTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 12 24 3 T 7 6 57388 CASAVA_Build 1 192009302 1I ACATAAATAG -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 96 het 38 0 31 7 A 7 8 57389 CASAVA_Build 1 192010041 1I GTGCACAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 13 14 57390 CASAVA_Build 1 192010201 1D TAGAATTTCA C/- TTCTCTGCTG 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 C 1 0 57391 CASAVA_Build 1 192017843 1D TCAAAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 24 11 7 A 12 11 57392 CASAVA_Build 1 192023068 1I TGGGCGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 10 11 57393 CASAVA_Build 1 192028174 1D ATGCCCTTAG C/- CCCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 21 11 2 C 4 3 57394 CASAVA_Build 1 192032496 1D AACAAACATA G/- GAAAAAAAAA 2711 het 2711 ref 18 10 6 3 G 2 1 57395 CASAVA_Build 1 192034881 1D CTATTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 37 1 13 23 T 17 16 57396 CASAVA_Build 1 192035784 3I AGTCTATGAT ---/TCA TCATTATAAT 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 TCA 1 2 57397 CASAVA_Build 1 192049897 1I CTTGATCTTA -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 6 7 57398 CASAVA_Build 1 192051364 2D ATTTTAGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 12 10 57399 CASAVA_Build 1 192058212 3I ATATAAAATT ---/AGC AGACAGATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGC 0 1 57400 CASAVA_Build 1 192062406 1I TTTTGGTACA -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 T 6 7 57401 CASAVA_Build 1 192064229 2I TACATATATC --/TA TGATATCCAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 TA 0 1 57402 CASAVA_Build 1 192073075 1I AAGTATAACT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 7 8 57403 CASAVA_Build 1 192087606 2D AGTAATTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 24 10 T 16 14 57404 CASAVA_Build 1 192101397 10I ATGTTTTTGT ----------/TCTAGAAGAC TATGTTAATT 3070 het 3070 hom 32 10 10 12 TCTAGAAGAC 0 1 57405 CASAVA_Build 1 192101425 4I GGAAAAGCAA ----/AAAC AAACAAAAAG 3070 hom 57 het 31 0 20 11 AAAC 1 2 57406 CASAVA_Build 1 192102277 1D GTCCTCTTAT A/- AAAAATAGGT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 6 5 57407 CASAVA_Build 1 192104261 2D ACTTTTTTGT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 274 hom 56 6 18 32 TC 8 7 57408 CASAVA_Build 1 192105976 3D TCATTAGGTT GTG/--- GTAAAAATGA 2350 het 2350 ref 25 18 7 1 GTG 1 0 57409 CASAVA_Build 1 192106080 4I TCATTTTCAT ----/TTTA TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TTTA 1 2 57410 CASAVA_Build 1 192106312 1D ATTTCAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 36 3 12 21 T 12 11 57411 CASAVA_Build 1 192107091 1I GATGTGGAGC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 7 8 57412 CASAVA_Build 1 192115344 4D ATGAAAATGA ACAG/---- ACAAATGTGT 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 ACAG 1 0 57413 CASAVA_Build 1 192118958 1I TATTTTTTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 8 9 57414 CASAVA_Build 1 192119856 4D TCCTGGCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 42 het 21 0 15 6 AAAT 5 4 57415 CASAVA_Build 1 192120893 14D TCTGCCTCCA GAGCTGCCATTCAT/-------------- GGCCCCAGGG 1498 het 1498 ref 19 13 6 5 GAGCTGCCATTCAT 1 0 57416 CASAVA_Build 1 192124376 1I GCAGTTGGGG -/A AACTGGTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 2 3 57417 CASAVA_Build 1 192129266 3I TTTCTTCTTA ---/TTC ATCAACAGTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTC 0 1 57418 CASAVA_Build 1 192129444 6D CATAAGACTA CATTCT/------ TATAAAACTA 3070 het 3070 hom 36 15 18 5 CATTCT 1 0 57419 CASAVA_Build 1 192130822 4D CATTTTGCTC CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 43 12 21 12 CT 8 6 57420 CASAVA_Build 1 192133133 2D TTTCAGCAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 36 1 19 16 A 13 11 57421 CASAVA_Build 1 192136351 3I CCTTAAAAGA ---/GAT GATGATATGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GAT 2 3 57422 CASAVA_Build 1 192137107 1I GTTAAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 10 11 57423 CASAVA_Build 1 192138832 1I TTCCTTTTAA -/T TTTAAAGGTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 3 4 57424 CASAVA_Build 1 192168205 1I TGTGGGACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 10 11 57425 CASAVA_Build 1 192182600 2D ACATGGACTC TT/-- AATCAAAATT 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 T 2 0 57426 CASAVA_Build 1 192195584 1I ATTAATTGCT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 9 57427 CASAVA_Build 1 192203604 1I AATCCCAACA -/C CTTGGGAAGC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 2 57428 CASAVA_Build 1 192205183 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 10 8 57429 CASAVA_Build 1 192208781 1D TAGTAATTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 10 9 57430 CASAVA_Build 1 192210347 1D AAAGTGTCAG C/- CTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 C 2 1 57431 CASAVA_Build 1 192210887 1I TGTATTTCCC -/T GATCATTAAG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 0 1 57432 CASAVA_Build 1 192214558 1D CAATTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 11 10 57433 CASAVA_Build 1 192221232 1I CTGAAGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1136 hom 28 6 15 7 T 15 16 57434 CASAVA_Build 1 192221912 1D CAACAACACC A/- AAAGACACCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 A 4 3 57435 CASAVA_Build 1 192225520 5D AAATTCACAA TAATC/----- TAATACTATA 3070 het 3070 ref 25 10 11 6 TAATC 1 0 57436 CASAVA_Build 1 192230311 1I GGTTATTACC -/A AAAAAGTCAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 5 6 57437 CASAVA_Build 1 192256276 1D AAAACCCGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 279 hom 36 2 21 13 T 17 16 57438 CASAVA_Build 1 192264130 3I TTCCTTCTCT ---/TCC TCCTCCTCTT 2809 hom 18 het 7 0 7 0 TCC 2 3 57439 CASAVA_Build 1 192266639 1D TGTCCTCTCC A/- AATCTCATGT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 3 2 57440 CASAVA_Build 1 192278506 1I ATTGAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 759 hom 32 2 25 5 A 10 11 57441 CASAVA_Build 1 192282030 1D CTTTCAGCTC A/- AAAAATAAGG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 6 5 57442 CASAVA_Build 1 192282457 4I ATACTCAACT ----/TGAG TGAGTGTCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TGAG 1 2 57443 CASAVA_Build 1 192284520 7D TTTGTGTACA ATTACAT/------- ATTACATATG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 ATTACAT 2 1 57444 CASAVA_Build 1 192286115 1D AGCCTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 473 hom 31 2 19 10 A 15 14 57445 CASAVA_Build 1 192299298 1D CTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 11 10 57446 CASAVA_Build 1 192299568 2I CGTGTGTGGT --/AG AGATATTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AG 1 2 57447 CASAVA_Build 1 192302099 1D CCCCATACTC T/- TCTGCTATTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 2 1 57448 CASAVA_Build 1 192314314 1D TTGTAACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 15 1 11 3 A 15 14 57449 CASAVA_Build 1 192324260 5D TGTCTATATT ATTTG/----- ATTTAACTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 4 ATTTG 1 0 57450 CASAVA_Build 1 192332007 12D CACACAGCTT CCCACACAGCTG/------------ GTAAAACATT 3070 hom 111 het 39 0 38 6 CCCACACAGCTG 1 0 57451 CASAVA_Build 1 192346814 1I TGTTGAATAA -/G GCTCACTAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 1 2 57452 CASAVA_Build 1 192354436 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2346 het 2346 ref 37 24 5 8 T 12 11 57453 CASAVA_Build 1 192358441 2D CTGCGTTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 1592 het 1592 ref 28 21 4 4 TG 8 7 57454 CASAVA_Build 1 192367933 6D TAGGGTTAAA ACATAT/------ ACTGTTTATA 3070 het 3070 ref 28 18 10 2 ACATAT 1 0 57455 CASAVA_Build 1 192385634 5I TTTTTGTACC -----/TTAAG TTATTTTTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TTAAG 0 1 57456 CASAVA_Build 1 192387733 1I GGTATGTGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 10 57457 CASAVA_Build 1 192426823 4D ATAAAATAAA TAGT/---- TAGTAGGGTT 3070 hom 57 het 23 0 20 6 TAGT 2 1 57458 CASAVA_Build 1 192431847 1D GATAGTGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 11 10 57459 CASAVA_Build 1 192447899 2I GATGCAAAAC --/AG GGAACGGAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AG 0 1 57460 CASAVA_Build 1 192448090 3D CTTAAAATAA AAG/--- AAGTTAAAAA 1540 hom 24 het 27 0 10 18 AAG 2 1 57461 CASAVA_Build 1 192449697 6D GTAGCTAGTC ATAATT/------ ATAATATCAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 ATAATT 1 0 57462 CASAVA_Build 1 192453958 1I GGTTTTTTTT -/G TTGTTGTTTT 3070 het 110 hom 20 1 15 4 G 0 1 57463 CASAVA_Build 1 192455358 1D GAAAGAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 30 2 21 8 A 15 14 57464 CASAVA_Build 1 192460364 1I ACATTAAAAA -/G GTACTGCTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 2 57465 CASAVA_Build 1 192460853 4I TTATAATAAC ----/AATT AAGAAAAAAT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 AATT 0 1 57466 CASAVA_Build 1 192463803 2I CAATGTCAAC --/AT GTGTCCATTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 0 1 57467 CASAVA_Build 1 192465650 2D CCTGCCAAAC AT/-- GTGTTCTTTC 3070 hom 90 het 32 0 31 2 AT 1 0 57468 CASAVA_Build 1 192468463 2I CTAGGTACTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TG 7 8 57469 CASAVA_Build 1 192471809 2D TCATCAATTG AT/-- ATAAAGCAAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AT 2 1 57470 CASAVA_Build 1 192476187 4I CAGAAAAACC ----/TTCT TTCTTTTACT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 TTCT 1 2 57471 CASAVA_Build 1 192476835 2D TTGTATTCTC TT/-- TTAGTTATCA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 T 4 2 57472 CASAVA_Build 1 192483949 2D GACTACCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 13 11 57473 CASAVA_Build 1 192485102 1I CCCCAAAAAA -/C CAGAACAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 2 57474 CASAVA_Build 1 192486299 4D CTCGTGAGAG CTCA/---- CTCACTATCA 3070 hom 105 het 41 0 36 7 CTCA 2 1 57475 CASAVA_Build 1 192493443 1I AAGAAAAGAT -/A ATACACTGAA 3070 hom 120 het 42 0 40 2 A 1 2 57476 CASAVA_Build 1 192496952 1D TAACTACTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 167 hom 32 1 28 3 T 10 9 57477 CASAVA_Build 1 192501116 5D CCTCTGAACC TAAAA/----- TAAAAGTTGG 3070 hom 105 het 37 0 36 2 TAAAA 2 1 57478 CASAVA_Build 1 192504451 1I ATTATTTTTA -/C CTATGGATAC 3070 hom 148 het 50 0 50 0 C 1 2 57479 CASAVA_Build 1 192513773 1D GCACGCATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 18 9 A 13 12 57480 CASAVA_Build 1 192519468 1D TCTGTCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 19 1 16 2 A 12 11 57481 CASAVA_Build 1 192537587 2D CTGTTACTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 7 A 12 10 57482 CASAVA_Build 1 192537739 3D ATTAAGTACT TAA/--- TGAGTTATTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAA 1 0 57483 CASAVA_Build 1 192544292 1I ATTTTTTTTG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 8 9 57484 CASAVA_Build 1 192558053 3D ATTTTAGAAT ATG/--- ATATTAAATG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 ATG 1 0 57485 CASAVA_Build 1 192559635 4I AACCAACAAC ----/AAAT AAAAATGCTC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AAAT 0 1 57486 CASAVA_Build 1 192567560 1D TTTTTCATAC T/- TTTTTTAGTT 3070 hom 66 het 31 0 23 9 T 7 6 57487 CASAVA_Build 1 192568826 1D TTTGAAATGT A/- AAAAAGACAC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 A 6 5 57488 CASAVA_Build 1 192573573 1I CAAATTAGAT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 7 8 57489 CASAVA_Build 1 192575272 1I ACCTGGCAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 7 8 57490 CASAVA_Build 1 192591572 1D TGGTAATTGA T/- TTTTTTTTTT 1359 het 1359 ref 35 19 4 12 T 15 14 57491 CASAVA_Build 1 192596668 4I ATTAATAAAC ----/AAAT AAAGATAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAAT 0 1 57492 CASAVA_Build 1 192605344 4I CTAATCTATC ----/TATT GTTTTCCTTT 3070 hom 157 het 56 0 53 3 TATT 0 1 57493 CASAVA_Build 1 192605612 2D2M8I AAAACTCAAG TCTT--------/--TTAGTGAAAA CTCAAGTCTT 1402 het 1402 ref 36 6 5 26 N/A 0 0 57494 CASAVA_Build 1 192609148 6D CAGATTCAAA CTTATC/------ CAGACCCACA 3070 hom 117 het 40 0 40 1 CTTATC 1 0 57495 CASAVA_Build 1 192614087 1D GAAAATAAGC A/- AAAAAAAAAA 2938 het 2938 ref 30 10 10 10 A 17 16 57496 CASAVA_Build 1 192615577 1I AAACAGCAAT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 7 8 57497 CASAVA_Build 1 192624557 1D AATTTAGTGA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 54 het 23 0 19 5 T 7 6 57498 CASAVA_Build 1 192625134 2D AACTGATTGA TT/-- TTTTTTCTAT 3070 hom 30 het 13 0 11 3 T 8 6 57499 CASAVA_Build 1 192625352 1I TCATTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 827 hom 29 2 23 4 T 11 12 57500 CASAVA_Build 1 192628151 1I GATAAACAAC -/T TTAGTGAAGT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 2 3 57501 CASAVA_Build 1 192629280 1D GAAACATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 845 hom 45 2 31 12 A 14 13 57502 CASAVA_Build 1 192635105 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 1480 hom 10 het 4 0 4 0 AC 7 8 57503 CASAVA_Build 1 192635883 2I CTAATAAACT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 10 12 57504 CASAVA_Build 1 192639865 1I CTACAAAAGC -/A AAGGAAACAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 2 3 57505 CASAVA_Build 1 192646236 2D49M1D TTCTGGAGTT AGAGATAAGATTTGGTGAAATATTTTATTTTCTTCTCTTAGGACACTACAGA/--AGATAAGATTTGGTGAAATATTTTATTTTCTTCTCTTAGGACACTGCAG- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 32 27 17 6 N/A 0 0 57506 CASAVA_Build 1 192648091 3I AGACTCACTC ---/ATT ATCACGAGAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 ATT 0 1 57507 CASAVA_Build 1 192648582 2I ACATTATTAA --/AG AGTGGTTTAT 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 AG 1 2 57508 CASAVA_Build 1 192649981 2D TGCCTAGGGC TG/-- TGTGACCTCT 3070 het 3070 ref 57 26 23 10 TG 3 2 57509 CASAVA_Build 1 192650790 1I AAAAATGTTG -/A AAAAAAATCG 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 7 8 57510 CASAVA_Build 1 192651432 3D AATTGCATCT AGA/--- AGAATACAAT 3070 het 3070 ref 40 21 14 7 AGA 2 1 57511 CASAVA_Build 1 192653317 2I TCTATAAATT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 20 22 5 TA 0 1 57512 CASAVA_Build 1 192663901 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 A 11 10 57513 CASAVA_Build 1 192666063 2I ATATATTCAA --/AT ATATATATAT 753 het 753 ref 13 5 3 5 AT 6 7 57514 CASAVA_Build 1 192686531 1D CACTCTGAAA G/- GCCCCAGTGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 2 1 57515 CASAVA_Build 1 192688928 1D TCGGACTGAC T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 T 6 5 57516 CASAVA_Build 1 192695243 1I ACTTCTATTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 7 8 57517 CASAVA_Build 1 192698888 1I TGGTCTAATC -/T TTTGGAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 3 4 57518 CASAVA_Build 1 192707759 1I AAAAAAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 T 13 14 57519 CASAVA_Build 1 192722471 2I AGTTGAATGG --/AT ATATATATAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AT 7 8 57520 CASAVA_Build 1 192726966 1D ACGTGGAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 A 10 9 57521 CASAVA_Build 1 192729642 2D ATACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AT 7 6 57522 CASAVA_Build 1 192730418 24D ACATATATAC ATATATATATATATATATATATAT/------------------------ ATATATATAT 3070 het 40 hom 17 1 10 6 AT 23 11 57523 CASAVA_Build 1 192730553 3I ATATCAGACA ---/TAT TATATTACTG 3070 het 3070 hom 24 7 13 4 TAT 1 2 57524 CASAVA_Build 1 192733335 1D GAATAATAAT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 47 21 20 7 A 8 7 57525 CASAVA_Build 1 192740369 1I TAAACAACTT -/A AAAGATAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 3 4 57526 CASAVA_Build 1 192742273 1D CTTATAAAAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 2932 hom 22 8 12 2 T 8 7 57527 CASAVA_Build 1 192752483 1I GGGAGAAGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 T 9 10 57528 CASAVA_Build 1 192753448 1I CTGTGTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 10 11 57529 CASAVA_Build 1 192754495 4I GACCAATAGC ----/CTAT CTATCATATC 3070 het 3070 hom 44 21 22 1 CTAT 1 2 57530 CASAVA_Build 1 192761332 1I TAATAAGTTA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 6 7 57531 CASAVA_Build 1 192764351 2I TCTCTGATAC --/AT ATATATATAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 AT 4 5 57532 CASAVA_Build 1 192765856 1I CCTTTTCTAG -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 7 8 57533 CASAVA_Build 1 192787415 4D TCTGTCTATC ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 ATCT 3 2 57534 CASAVA_Build 1 192792754 2D TCCTAAACTC CA/-- GTTTTGTTCC 3070 het 3070 ref 33 14 10 10 CA 1 0 57535 CASAVA_Build 1 192793502 2I ATGGAATATG --/TA TATATATATA 1639 het 1002 hom 8 3 4 1 TA 8 9 57536 CASAVA_Build 1 192805756 4D AATGTACAAC ATAA/---- ATAAAGATTA 1021 het 800 hom 6 3 3 1 ATAA 2 1 57537 CASAVA_Build 1 192807849 4D TCAGAATATT TATC/---- TAACAACAGG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 TATC 1 0 57538 CASAVA_Build 1 192809975 2I GATGATGAAG --/AA AAATGCAGCA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 3 5 57539 CASAVA_Build 1 192818370 1D AGCTACTGAC T/- TTATTACTTG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 3 2 57540 CASAVA_Build 1 192828781 1D ACATATTGGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 T 9 8 57541 CASAVA_Build 1 192830603 3D AACAACAAAG ATA/--- ATGTTAGATA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 ATA 1 0 57542 CASAVA_Build 1 192838823 2D GCCCTAAGGT AA/-- AGAGTCCTAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 A 3 1 57543 CASAVA_Build 1 192843057 1I TTTCATGTGT -/C TTTTGGCTGC 1942 het 1942 ref 12 6 4 2 C 0 1 57544 CASAVA_Build 1 192884612 2D TTAAAATCTG GT/-- GTGATTTCCT 3070 het 3070 hom 38 16 21 2 GT 2 1 57545 CASAVA_Build 1 192888134 2D CTAGTCTATT AA/-- AAGTATATCA 3070 het 3070 hom 42 15 21 7 A 4 2 57546 CASAVA_Build 1 192892105 3D GAAAAATAAA AAT/--- AAACTTATTA 3070 het 2566 hom 32 6 23 4 AAT 1 0 57547 CASAVA_Build 1 192894202 4I AGTTTTTCAC ----/TTTG TTTCTGTTAT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 TTTG 0 1 57548 CASAVA_Build 1 192897410 1D CAGCAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 13 1 10 3 A 11 10 57549 CASAVA_Build 1 192906423 7I GATTAGAAAA -------/TACATTG TACAATAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 TACATTG 0 1 57550 CASAVA_Build 1 192907857 2D AATCTCTTTG TC/-- TCTCTCTAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TC 4 3 57551 CASAVA_Build 1 192913836 2D ACAAACACAC TA/-- TATATATGTA 3070 het 1027 hom 17 5 10 2 TA 4 3 57552 CASAVA_Build 1 192919729 1I ATGACACTCT -/A TTAAGAGAGA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 0 1 57553 CASAVA_Build 1 192924410 2I CACATACATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 TA 6 7 57554 CASAVA_Build 1 192926036 2D CACAAAATTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 32 15 13 5 AC 6 5 57555 CASAVA_Build 1 192927175 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 27 1 20 6 T 12 11 57556 CASAVA_Build 1 192929480 1I ACATTGTATC -/T TGTTATATCC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 1 2 57557 CASAVA_Build 1 192931843 1D GACTTATTCC A/- AAGCCCTGCT 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 A 3 2 57558 CASAVA_Build 1 192941021 1I AAAACGAAAG -/A AATAACTGAA 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 A 2 3 57559 CASAVA_Build 1 192953747 1I ACTTTAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 46 1 38 7 T 11 12 57560 CASAVA_Build 1 192969653 4D AAAATAAAAA AGAT/---- AGAAATTACT 3070 het 3070 ref 37 17 18 3 AGAT 1 0 57561 CASAVA_Build 1 192972860 3D AAAATTGGTT ACA/--- ACGAGTGATT 3070 het 3070 ref 34 21 10 4 ACA 1 0 57562 CASAVA_Build 1 192976472 15D GACAGCTGCC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTCA 3070 het 267 hom 28 1 18 11 T 23 8 57563 CASAVA_Build 1 192978810 2I ATATATATAT --/AA AAGAGTTAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 2 4 57564 CASAVA_Build 1 192978974 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3007 het 142 hom 33 3 12 19 T 14 12 57565 CASAVA_Build 1 192980753 1I CTCAGGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1115 hom 37 5 22 10 G 0 1 57566 CASAVA_Build 1 192982302 1D ATACATGGTC T/- TTTTTTGGTG 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 T 7 6 57567 CASAVA_Build 1 192982421 1D CATTTTCAGA C/- TTTTTTAAAA 3070 het 367 hom 31 1 23 7 C 1 0 57568 CASAVA_Build 1 192983260 2D ATGTTCTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 14 12 57569 CASAVA_Build 1 192984986 1I GGAACATTAG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 A 7 8 57570 CASAVA_Build 1 192986044 1I TGAACATCTC -/T AATTCAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 0 1 57571 CASAVA_Build 1 192989205 1I ATCACAAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 9 10 57572 CASAVA_Build 1 192989870 9D TTTTTATTTT TATTTTTTG/--------- TATTTTTTGT 1598 het 1598 ref 15 7 4 6 TATTTTTTG 2 1 57573 CASAVA_Build 1 192990492 1D GTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 8 7 57574 CASAVA_Build 1 192996231 1I ATTAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2953 hom 24 10 10 4 A 10 11 57575 CASAVA_Build 1 193017310 1I TGTTTTTTTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 7 8 57576 CASAVA_Build 1 193022375 1I GCCTAACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 9 10 57577 CASAVA_Build 1 193024240 3I TTTGTGTCAG ---/TAT TATTAATACA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TAT 1 2 57578 CASAVA_Build 1 193030541 3D TATACCTCTC ATG/--- ATGATAGAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 ATG 2 1 57579 CASAVA_Build 1 193074957 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 92 hom 12 1 11 0 T 7 8 57580 CASAVA_Build 1 193077628 1D AGCATAGATA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 9 8 57581 CASAVA_Build 1 193112770 1I AATGGAATTG -/T TTTTTTTTTT 2042 het 2042 ref 34 16 7 11 T 10 11 57582 CASAVA_Build 1 193115311 1I ATGTTAATAG -/A CAATGTATAT 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 A 0 1 57583 CASAVA_Build 1 193119408 1I GATGATTCAA -/C AAATAATCAC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 C 0 1 57584 CASAVA_Build 1 193120203 1I TTGTAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 25 10 2 A 10 11 57585 CASAVA_Build 1 193120523 4I TAGAAAACTG ----/AAAC AAACAAAGAC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 AAAC 1 2 57586 CASAVA_Build 1 193129058 7D CCACTTTGGA AGAGATT/------- TTGGCATTTT 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 AGAGATT 1 0 57587 CASAVA_Build 1 193129342 1I TTGCTAGATG -/A ACTATATTAC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 1 2 57588 CASAVA_Build 1 193135304 3D TTGCATAAAT AGC/--- AGTAAATGTA 3070 het 3070 hom 53 26 25 4 AGC 1 0 57589 CASAVA_Build 1 193137237 2D TGTAACATTT TA/-- TACTCTGACT 3070 het 3070 hom 53 26 24 4 TA 2 1 57590 CASAVA_Build 1 193137993 1I TTAGAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 9 10 57591 CASAVA_Build 1 193144971 8I ATTACATGTG --------/ATTAAATA CAATTTTGAA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 ATTAAATA 0 1 57592 CASAVA_Build 1 193155599 2D GGGCCATAGA AC/-- ACACAGTAAT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 AC 3 2 57593 CASAVA_Build 1 193165017 1D AATAGTTGTC T/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 4 3 57594 CASAVA_Build 1 193173694 1D ACTGTACTCT C/- CCCCTTTAGA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 C 5 4 57595 CASAVA_Build 1 193177897 5I ACTTTATCCC -----/TTCTA TTCTCTTATT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 TTCTA 0 1 57596 CASAVA_Build 1 193179385 1I AGAAAATCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 9 10 57597 CASAVA_Build 1 193314860 2I CTTTGCTATG --/AC ACACACATGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AC 3 4 57598 CASAVA_Build 1 193324236 2D TTGAGATAAC AG/-- AGTTAGTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 AG 2 1 57599 CASAVA_Build 1 193334269 1I TTTTTTTTTT -/G TTGTTGGTAG 3070 het 123 hom 42 1 41 0 G 0 1 57600 CASAVA_Build 1 193334871 3I TTTCATAGAA ---/CTT CTTGATTTCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CTT 1 2 57601 CASAVA_Build 1 193335678 1D54M1I GGTTTTTTTC TTTTTTTTGTGTGTGGTTACTTTATAGTGTCACTGGTCTGAGTACTTCAGTGTGG-/-TTTTTTTGTGTGTGGTTACTTTATAGTGTCACTGGTCTGAGTACTTCAGTGTGGT TTTTTTTTAG 3070 hom 93 het 37 0 32 17 N/A 0 0 57602 CASAVA_Build 1 193337200 40D TTAGTATGCT GTTAGTGGCAGTAATTAAATTCTGTGTTCTCCATATATCA/---------------------------------------- ATTGTTAAAA 3070 hom 84 het 26 0 29 4 GTTAGTGGCAGTAATTAAATTCTGTGTTCTCCATATATCA 1 0 57603 CASAVA_Build 1 193340500 1D TGAAGGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 10 9 57604 CASAVA_Build 1 193343086 1I CCAGGAGTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 9 57605 CASAVA_Build 1 193343188 1D GAATGTCACC A/- TTGAACACAC 3070 hom 90 het 39 0 31 9 A 1 0 57606 CASAVA_Build 1 193347439 1I AGGAGATATA -/C CTAATGTTAA 1893 het 495 hom 8 3 5 3 C 1 2 57607 CASAVA_Build 1 193348142 3I CAAGATAATA ---/ATG ATATTATTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ATG 0 1 57608 CASAVA_Build 1 193349149 1I AATGAGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1247 hom 37 3 29 5 T 10 11 57609 CASAVA_Build 1 193349590 4D ATTTAGATTT CAAA/---- CACTTTTAGA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CAAA 1 0 57610 CASAVA_Build 1 193351398 2D AGACTCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 26 0 17 10 A 17 15 57611 CASAVA_Build 1 193352070 2I TTGGGCTAAT --/TA TATATATATG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TA 4 5 57612 CASAVA_Build 1 193352582 1D TATATATTAC A/- AAAAAATCAC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 7 6 57613 CASAVA_Build 1 193352706 1I GTAAAAAAAA -/T CTCAGAAACC 3070 hom 65 het 25 0 22 3 T 0 1 57614 CASAVA_Build 1 193353584 1D ATAAATAATG T/- TTTTCCTAGT 3070 hom 81 het 28 0 28 2 T 5 4 57615 CASAVA_Build 1 193354040 3D AAATATAAAT ATC/--- ATCTATAGCA 3070 hom 69 het 26 0 24 5 ATC 2 1 57616 CASAVA_Build 1 193356242 2D TTATTCTATT GA/-- TTCAATTGAC 3070 hom 126 het 49 0 43 8 GA 1 0 57617 CASAVA_Build 1 193356546 4D CTGTAGAAAA AAAT/---- AAACATAGTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AAAT 1 0 57618 CASAVA_Build 1 193357241 2D TATAGAAATG AA/-- AAAAAAAATC 3070 hom 120 het 52 0 41 11 A 10 8 57619 CASAVA_Build 1 193358155 5I TTTTTATAAA -----/TACCT TAACTTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TACCT 0 1 57620 CASAVA_Build 1 193360663 1D GGAACCAATA T/- GAAGATTCAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 0 57621 CASAVA_Build 1 193360778 1D GTGTTGTTTT A/- ATAGCCAAGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 2 1 57622 CASAVA_Build 1 193364093 1I TGCAAGAGAT -/G GGGCTACCAC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 3 4 57623 CASAVA_Build 1 193365893 1I TTTTAGAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 9 10 57624 CASAVA_Build 1 193366622 2D TTTTAGATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 32 0 22 11 T 14 12 57625 CASAVA_Build 1 193367020 2I AATCTGTAAT --/TA TATGTCTTGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TA 1 2 57626 CASAVA_Build 1 193367728 1D TACAGTTATG T/- TTTTTTCAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 6 57627 CASAVA_Build 1 193371494 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 25 1 19 6 T 12 11 57628 CASAVA_Build 1 193373663 1D TAATTAAAGC A/- ACCATTTTCA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 2 1 57629 CASAVA_Build 1 193384261 1I AGCCACAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 8 9 57630 CASAVA_Build 1 193385065 11I CAGTATTATA -----------/ATGTCAACTGT AAAATATTAT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 ATGTCAACTGT 0 1 57631 CASAVA_Build 1 193387022 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 10 9 57632 CASAVA_Build 1 193387492 1I TTAATCTATG -/T TTCATTGGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 3 57633 CASAVA_Build 1 193389444 1D TTTTATGTTC A/- AAAAAACAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 6 57634 CASAVA_Build 1 193394557 1D AAAGGACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 11 10 57635 CASAVA_Build 1 193396605 1D AAAGTGAAAC A/- GGTTTGAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 1 0 57636 CASAVA_Build 1 193403771 1I CATATAAATT -/G CTTTACTTAT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 G 0 1 57637 CASAVA_Build 1 193407105 1I TTATGTTCAC -/A ATGAGTTGCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 57638 CASAVA_Build 1 193446943 1D TTTATTAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 12 25 5 T 10 9 57639 CASAVA_Build 1 193482135 4I TCACACTTGT ----/AATC TCAGCACTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AATC 0 1 57640 CASAVA_Build 1 193502948 3D GCAGAGTATT GAA/--- GAAGTTCCCA 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 GAA 2 1 57641 CASAVA_Build 1 193520316 1I CCTTGAGTAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 7 8 57642 CASAVA_Build 1 193526166 1I AATACAAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 T 8 9 57643 CASAVA_Build 1 193531530 1I CATATGCAGG -/T TTTTTATCAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 5 6 57644 CASAVA_Build 1 193553396 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 26 het 24 1 22 1 T 9 10 57645 CASAVA_Build 1 193559223 1I TGTTTCAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 7 8 57646 CASAVA_Build 1 193565599 1D GGGAGTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 11 10 57647 CASAVA_Build 1 193570034 5I TTCTGTATAC -----/TCTAA TCTATAACAA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 TCTAA 0 1 57648 CASAVA_Build 1 193573899 1D22M1D TGCAATTAGA TTTTTTTAAATCAATGTTTGTATG/-TTTTTTAAATCAATGTTTGTAT- TAACATAAGA 3070 het 3070 ref 27 21 12 6 N/A 0 0 57649 CASAVA_Build 1 193581122 1D CTGATCTTCC T/- ACCTCTCCCT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 1 0 57650 CASAVA_Build 1 193581573 1D AAGCAGAAAG A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 7 6 57651 CASAVA_Build 1 193586564 4D CATCTTTATG TATC/---- TATCAGCTTT 3070 het 3070 ref 31 15 16 0 TATC 2 1 57652 CASAVA_Build 1 193656105 1D CTAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1563 het 1473 hom 12 5 4 4 A 13 12 57653 CASAVA_Build 1 193672098 3I ATTATTGAAG ---/TTA TTATTCTTAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTA 1 2 57654 CASAVA_Build 1 193710058 1D AAAAGTCCTT A/- CTATATATTA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 1 0 57655 CASAVA_Build 1 193710754 3D ACAGAATTAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 798 hom 36 5 18 15 A 14 11 57656 CASAVA_Build 1 193711896 1I AAGCACAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 A 11 12 57657 CASAVA_Build 1 193712563 1I GGTGAGGGAT -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 6 7 57658 CASAVA_Build 1 193719574 1I TCTCCCATGG -/T TTTTTTTTTT 1616 het 766 hom 23 2 10 11 T 17 18 57659 CASAVA_Build 1 193722666 1I ACATTGTGAG -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 7 8 57660 CASAVA_Build 1 193722895 1D TGTATTTCAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 A 9 8 57661 CASAVA_Build 1 193723234 1I ATTTGAATAC -/A ATGTTTACAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 1 2 57662 CASAVA_Build 1 193726731 1I ACATAGAAAG -/T TCTTGGTTGT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 T 1 2 57663 CASAVA_Build 1 193727766 6I GATCGTATGA ------/TTTTTG TTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TTTTTG 0 1 57664 CASAVA_Build 1 193727957 1I TGTAGTTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 8 9 57665 CASAVA_Build 1 193806294 1D TGAAAGATCT A/- AAAAAAAAAA 1207 het 1207 ref 23 14 3 7 A 13 12 57666 CASAVA_Build 1 193856932 2I ATACACATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 AT 7 8 57667 CASAVA_Build 1 193914102 1D TCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 T 15 14 57668 CASAVA_Build 1 194009307 1I GTTAATACAA -/G CTTATAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 G 0 1 57669 CASAVA_Build 1 194010982 1D GATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 T 10 9 57670 CASAVA_Build 1 194016417 1D CCACTACTCA T/- CTTATGAACT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 1 0 57671 CASAVA_Build 1 194017114 1D TCTTTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 34 1 24 9 A 12 11 57672 CASAVA_Build 1 194017126 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAGAAAAA 3070 hom 20 het 30 1 22 7 C 1 0 57673 CASAVA_Build 1 194028517 1I TAGCTCAGGG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 6 7 57674 CASAVA_Build 1 194031896 3D GTGTGAGGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 2708 het 12 hom 25 1 12 13 T 19 16 57675 CASAVA_Build 1 194032157 1D TTCCTACTAG A/- GAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 29 1 22 7 A 1 0 57676 CASAVA_Build 1 194033686 1I CTCACTTGTC -/T TTTATGTCCT 3070 hom 178 het 63 0 59 4 T 3 4 57677 CASAVA_Build 1 194040411 1D AGATATAAGC A/- AATTTTGGAA 3070 hom 117 het 44 0 39 7 A 3 2 57678 CASAVA_Build 1 194058529 2I TTATTTATTC --/AT ATATATATAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AT 5 6 57679 CASAVA_Build 1 194060487 3D CCTTCAGAAA TGT/--- TGTCACCATA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TGT 2 1 57680 CASAVA_Build 1 194061511 3D GATTAAAAAT AAC/--- AAGAACTTTA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AAC 1 0 57681 CASAVA_Build 1 194064582 1I AAAATTCACT -/A AACTGAGAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 2 3 57682 CASAVA_Build 1 194068411 5I TAGATATAAT -----/ATATA ATATATTATA 2776 hom 15 het 6 0 6 0 ATATA 1 2 57683 CASAVA_Build 1 194069589 3I AGATTTGACC ---/TAT TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TAT 0 1 57684 CASAVA_Build 1 194070295 5I AGCTGCATCT -----/CAGAA CTTCTATCCA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CAGAA 0 1 57685 CASAVA_Build 1 194070602 3D CTTGACCAAT ATA/--- ATAATATTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 7 ATA 3 2 57686 CASAVA_Build 1 194073906 1I CTGCACCACA -/T TCTTTGCTTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 1 2 57687 CASAVA_Build 1 194075883 1I AAAACAAAAC -/A AAAAATATAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 5 6 57688 CASAVA_Build 1 194076951 10D48M4D ATATATATAT ATATATACACACACACATATATATACACACACACATAGACACACACATATATATACACATAT/----------ACACACATATATATATACACACACATACACACACACATATATATACAC---- ATATATATAG 3070 het 1233 hom 11 5 11 1 N/A 0 0 57689 CASAVA_Build 1 194077586 4I AGCCCAAAGC ----/AACA AACAACCCAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AACA 1 2 57690 CASAVA_Build 1 194078260 4I CTTTTTATGG ----/CTGA CTAATATACT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 CTGA 0 1 57691 CASAVA_Build 1 194079071 4I ACTTTTCAGT ----/TTAA TTAAGTTCTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTAA 1 2 57692 CASAVA_Build 1 194080051 1D AGTTACCAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 57693 CASAVA_Build 1 194081103 1D TATCTTTTTG T/- TTCTTGTTTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 3 2 57694 CASAVA_Build 1 194085003 1D GAAAGAAAGC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 120 het 47 0 40 9 A 9 8 57695 CASAVA_Build 1 194087891 2I ATATTTCACT --/CA GTTATTTGTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CA 0 1 57696 CASAVA_Build 1 194088867 2D TCTCTGTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 TC 7 6 57697 CASAVA_Build 1 194088968 1I AGTGAGAATA -/C CCCTGTTATC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 3 4 57698 CASAVA_Build 1 194092355 23D CACTGTCCAG GAATCCAATGATCAGCTCATCCA/----------------------- GGATCCATGA 3070 hom 161 het 52 0 53 8 GAATCCAATGATCAGCTCATCCA 1 0 57699 CASAVA_Build 1 194093094 1D GAGCCAGAGG A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 7 6 57700 CASAVA_Build 1 194098713 1D TGGTTACTAC A/- AAAAAAAAAA 1442 het 1442 ref 29 17 5 7 A 15 14 57701 CASAVA_Build 1 194102146 6I CTAACTCAAT ------/AAAAGA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 AAAAGA 0 1 57702 CASAVA_Build 1 194105223 1I AATTTTCAAA -/T AGCATCACAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 0 1 57703 CASAVA_Build 1 194112896 1D ACTAAAAATA C/- AAAAAATCAG 3070 het 904 hom 15 3 11 2 C 1 0 57704 CASAVA_Build 1 194116691 1I ATAAATATCT -/A GCTAGAGATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 57705 CASAVA_Build 1 194117485 1I TTGTTGTCAG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 57706 CASAVA_Build 1 194118264 1D AGCACTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 13 12 57707 CASAVA_Build 1 194118961 1D TAGGATTAAT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 30 10 16 5 A 8 7 57708 CASAVA_Build 1 194124016 1D GGCAGCTGAA T/- TTAAAAAAAA 3070 hom 25 het 31 0 18 13 T 3 2 57709 CASAVA_Build 1 194124958 11D ATAATGAAGG GAAGATGAATA/----------- GAAGATGAAT 3070 hom 135 het 48 0 46 5 GAAGATGAATA 2 1 57710 CASAVA_Build 1 194126276 1I AAGATGAAAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 2898 hom 29 10 17 2 T 6 7 57711 CASAVA_Build 1 194126635 1D CGTTTCCAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 10 9 57712 CASAVA_Build 1 194137801 1D AAATCTGATC G/- TTTTATATAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 G 1 0 57713 CASAVA_Build 1 194139484 2D AAAAAGACCC TT/-- TTTTTTTAAA 2007 het 782 hom 29 2 10 17 T 9 7 57714 CASAVA_Build 1 194141677 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 9 57715 CASAVA_Build 1 194143818 1D TCCAAATAAA T/- TTTTTCCTGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 6 5 57716 CASAVA_Build 1 194143920 2I AATGTAAACT --/AA AGAGTAGTCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 3 57717 CASAVA_Build 1 194185030 6I GTATAAACAC ------/AGATAT AGATATAAAT 3070 hom 12 het 35 0 17 18 AGATAT 1 2 57718 CASAVA_Build 1 194186693 1I AGTGTGGGCA -/T TTTTTATTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 5 6 57719 CASAVA_Build 1 194191098 1I TACCAGTGTT -/A ATCCAGAAGT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 1 2 57720 CASAVA_Build 1 194191337 1I TGTATATTTT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 7 8 57721 CASAVA_Build 1 194200356 11D GAATGAATCT GAGGCAGTTCA/----------- GAGGCAGTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 GAGGCAGTTCA 2 1 57722 CASAVA_Build 1 194200747 4D ATATTTTATC CTAT/---- CTGAGACAAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 2 CTAT 1 0 57723 CASAVA_Build 1 194207459 6I GGGGAATAGA ------/GCAGGG CTGTTCTCCA 3070 hom 75 het 37 0 31 6 GCAGGG 0 1 57724 CASAVA_Build 1 194211854 6D TCACCAGCAT TTGCAA/------ TTGCCTGTCT 3070 het 3070 ref 35 19 15 4 TTGCAA 1 0 57725 CASAVA_Build 1 194212692 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 7 8 57726 CASAVA_Build 1 194221523 1I CATTTATCAC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 7 8 57727 CASAVA_Build 1 194226839 1I TGAAAAACTT -/G GGAGTCCAAT 2797 het 1100 hom 10 4 6 0 G 2 3 57728 CASAVA_Build 1 194243273 1I AAAAAAGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 A 9 10 57729 CASAVA_Build 1 194251250 1I ATTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 27 1 22 4 A 13 14 57730 CASAVA_Build 1 194261286 1D TAATATACTG A/- GTCCTATCCA 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 A 1 0 57731 CASAVA_Build 1 194279941 1D AAAAAACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 41 0 25 16 T 13 12 57732 CASAVA_Build 1 194281916 1I TCTCTGAATG -/A AAAAAACTAT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 6 7 57733 CASAVA_Build 1 194306580 5I GTTTCTGTTG -----/CTTTA CATCCTCATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CTTTA 0 1 57734 CASAVA_Build 1 194321295 1I TTGCTGTTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 2701 hom 21 6 11 4 T 7 8 57735 CASAVA_Build 1 194326348 1D TTTCCACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2757 hom 34 9 18 7 A 12 11 57736 CASAVA_Build 1 194347503 1D GATTAATTTT A/- AAAAAGATCT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 6 5 57737 CASAVA_Build 1 194348666 4I GTAATAAAAG ----/TTAT TTATGTAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 TTAT 1 2 57738 CASAVA_Build 1 194356892 1D ACCTTTTTTT A/- AAATGTTGCA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 4 3 57739 CASAVA_Build 1 194370779 1D CCAACACCTG A/- AAGAGAATTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 3 2 57740 CASAVA_Build 1 194371239 3I AGATTATAAT ---/GAA GAAGAAGAAC 3070 het 3070 ref 55 22 17 16 GAA 3 4 57741 CASAVA_Build 1 194373512 1I TTTTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 10 11 57742 CASAVA_Build 1 194382435 1D GATCTGCCTG C/- CTCGGCCTCC 3070 het 1939 hom 15 6 9 1 C 2 1 57743 CASAVA_Build 1 194411104 24D ATATATTAGC AATATATATTAGCTAATATATATT/------------------------ AGAAACCTGG 3070 hom 93 het 32 0 32 6 AATATATATTAGCTAATATATATT 1 0 57744 CASAVA_Build 1 194415203 1D GCTTTCACTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 7 57745 CASAVA_Build 1 194420954 1D TCAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 120 het 50 0 41 10 A 10 9 57746 CASAVA_Build 1 194430300 1D TAAAGCCTTG T/- TGTGGAAGAG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 2 1 57747 CASAVA_Build 1 194435513 1I AAGAAAAAGG -/A ATACCTAACA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 1 2 57748 CASAVA_Build 1 194436687 2D CAGAAAGGTA AG/-- AGTCTTGTGA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 AG 2 1 57749 CASAVA_Build 1 194445806 3D AAATGACCAC AAA/--- AGTGGAGGTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 4 1 57750 CASAVA_Build 1 194455123 3D TTTCTGACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 235 hom 20 4 12 4 T 17 14 57751 CASAVA_Build 1 194466920 1I ACTGCTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 10 11 57752 CASAVA_Build 1 194492338 1D TCCTTATGAG T/- TTTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 21 10 9 3 T 6 5 57753 CASAVA_Build 1 194511163 1I TACTTTCTGC -/T TGTGTTTGTG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 1 2 57754 CASAVA_Build 1 194529613 1D CTGCACAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 18 15 18 A 14 13 57755 CASAVA_Build 1 194543913 1D TCTTTTCCTC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 T 8 7 57756 CASAVA_Build 1 194556467 1I ACATTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 13 14 57757 CASAVA_Build 1 194556751 2I TAAGCATTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 T 10 12 57758 CASAVA_Build 1 194569921 2D ATATATATAT AG/-- AGAGAGTATA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 AG 4 3 57759 CASAVA_Build 1 194583960 1I CATTAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 14 12 A 13 14 57760 CASAVA_Build 1 194596958 2D CAGACACCAG AC/-- ACACACACAC 1031 het 1031 ref 44 31 4 10 AC 10 9 57761 CASAVA_Build 1 194610998 1I CCTACATTTC -/A GATAGTCATT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 0 1 57762 CASAVA_Build 1 194646464 1D CTCAGTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 896 hom 30 2 18 10 A 15 14 57763 CASAVA_Build 1 194674431 5D TGTCAACATC AGGCT/----- AGTGACTTGT 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 AGGCT 1 0 57764 CASAVA_Build 1 194677179 3D TAAAATCTAC TTT/--- TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 12 9 57765 CASAVA_Build 1 194688479 1D ATAAATAGAT G/- GTATTATAAG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 G 2 1 57766 CASAVA_Build 1 194722465 1D TGGTAGCTCT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 8 57767 CASAVA_Build 1 194759864 1I GCTTTATATG -/A AAAATGTTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 5 57768 CASAVA_Build 1 194776895 1I GTACTGAGAT -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 7 8 57769 CASAVA_Build 1 194779712 4I CATAGCAGCT ----/TTAC TTGTAATAGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTAC 0 1 57770 CASAVA_Build 1 194796453 1D GATGTTTTTT C/- TTCCCCCCTC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 1 0 57771 CASAVA_Build 1 194804534 1D AATAATGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 942 hom 25 3 14 8 T 13 12 57772 CASAVA_Build 1 194805821 17D GAGCTAGAGT AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 34 0 20 18 A 31 14 57773 CASAVA_Build 1 194811487 6I ACACCTGTAC ------/AGCACT TTGGGAGGCT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AGCACT 0 1 57774 CASAVA_Build 1 194811826 4D TGTTAGGTTT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 51 het 26 0 18 9 TA 9 7 57775 CASAVA_Build 1 194813918 48D CAAAATTAGG AAACCTGCAGTCTTACCACACTCCATAGTTAGGAAAAAAAACAATCCC/------------------------------------------------ AAACCTGCAG 3070 hom 57 het 35 0 19 24 AAACCTGCAGTCTTACCACACTCCATAGTTAGGAAAAAAAACAATCCC 1 0 57776 CASAVA_Build 1 194824025 1I AATAGATGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 406 hom 46 1 38 7 A 9 10 57777 CASAVA_Build 1 194824522 12D CAAGGAACAA TAATACATAGAC/------------ TACTAACTGT 3070 hom 87 het 29 0 30 1 TAATACATAGAC 1 0 57778 CASAVA_Build 1 194825018 2I ATAAAAAAAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 739 hom 39 2 31 6 GT 7 8 57779 CASAVA_Build 1 194825580 2D ATTTATGCAT AC/-- AGATTTCTAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AC 1 0 57780 CASAVA_Build 1 194836278 1I TTTAGGCAAC -/A AAAAACTAAT 3070 hom 157 het 57 0 53 4 A 5 6 57781 CASAVA_Build 1 194836418 4I TCACACTGAA ----/TGTT TGACAGATTA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 TGTT 0 1 57782 CASAVA_Build 1 194839500 4I TAGAATGGTC ----/TTAA TTAAATAAAT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TTAA 1 2 57783 CASAVA_Build 1 194866126 1D ATTAAAAGAA C/- ATATAGAGAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 C 1 0 57784 CASAVA_Build 1 194876052 1D AATTTTTACA T/- TTTTTTTTTT 1045 het 1045 ref 36 29 3 4 T 11 10 57785 CASAVA_Build 1 194918748 1I ATGTTTGACT -/A AATATACAAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 2 3 57786 CASAVA_Build 1 194924781 4D AATAGAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 42 18 18 7 AAAG 5 4 57787 CASAVA_Build 1 194934984 1D AGATAATGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 42 27 11 5 T 9 8 57788 CASAVA_Build 1 194944367 1I ATTCCCCATG -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 6 7 57789 CASAVA_Build 1 194945811 2I ACAGACACAC --/AA AGACACACAC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 1 3 57790 CASAVA_Build 1 194946533 1I CTTACCCTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 8 9 57791 CASAVA_Build 1 194957568 2I ACTTCTTGTC --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 8 10 57792 CASAVA_Build 1 194987313 4D AAAGATACAT AGAC/---- AGAATTAAAA 1921 het 1921 ref 19 12 4 4 AGAC 1 0 57793 CASAVA_Build 1 194991608 1D TACAAAAAAA C/- ATCAAGTGTT 3070 het 3070 ref 43 25 17 1 C 1 0 57794 CASAVA_Build 1 194995615 2D ATATCTTTTT TA/-- TTTTTGGTGT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 TA 1 0 57795 CASAVA_Build 1 194996350 1D GTTAAATTTG T/- TTGCTATTCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 3 2 57796 CASAVA_Build 1 194997289 3D CCAGAAAACA ACT/--- TAACACTGTT 1352 het 1352 ref 23 17 3 4 ACT 1 0 57797 CASAVA_Build 1 194998540 1D GAGTTAGGTA T/- TTATTGTTTT 1910 het 1910 ref 15 7 5 3 T 3 2 57798 CASAVA_Build 1 195041384 1I AAAACACACC -/A AAAAAAAAGA 1888 het 1888 ref 21 14 4 3 A 8 9 57799 CASAVA_Build 1 195078757 1D ATTTTTTCTA T/- TTTTTTTTCG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 9 8 57800 CASAVA_Build 1 195080292 1I ATGAAATATC -/T TTTTTTTTTT 2377 het 531 hom 13 2 7 4 T 11 12 57801 CASAVA_Build 1 195082804 1D TAATTCTTTA T/- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 7 6 57802 CASAVA_Build 1 195084518 1D TAGTTTATTT A/- GAGACACAAT 3070 het 3070 ref 45 24 19 4 A 1 0 57803 CASAVA_Build 1 195086632 2D GATTAGCAAC AT/-- GTAAATCACA 3070 het 981 hom 10 2 8 0 AT 1 0 57804 CASAVA_Build 1 195087137 2I TATCTATCAC --/AT GATTTGCTAG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AT 0 1 57805 CASAVA_Build 1 195088017 2I TACTCAAGAG --/TA TATATATATA 1765 het 1765 ref 29 18 4 7 TA 7 8 57806 CASAVA_Build 1 195104355 2I TTTTTTTTTT --/TG ATGGAGTCTT 3070 het 1042 hom 18 3 11 4 TG 0 1 57807 CASAVA_Build 1 195104577 1D AGGTGAACCA C/- CCCCCCCCTT 1408 het 1198 hom 16 7 4 5 C 9 8 57808 CASAVA_Build 1 195105086 12I CCCAGTAATC ------------/CAGTAAGGGCAG CAGTAAGGGC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 CAGTAAGGGCAG 1 2 57809 CASAVA_Build 1 195108083 1D TTTGGTGATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 19 19 7 A 9 8 57810 CASAVA_Build 1 195108203 1I TGGTAGCAAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 354 hom 40 1 34 5 A 7 8 57811 CASAVA_Build 1 195110373 1I ATTCCCCATG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 7 8 57812 CASAVA_Build 1 195115190 1D GATAATTATG T/- TTAAAAGATA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 T 3 2 57813 CASAVA_Build 1 195134906 1I CACGTCAATA -/G GGGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 62 33 24 5 G 3 4 57814 CASAVA_Build 1 195167333 1I AATACCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 A 11 12 57815 CASAVA_Build 1 195171673 1I TTGCATTTGG -/T TTTTTTTTTT 2094 het 2094 ref 24 14 6 4 T 10 11 57816 CASAVA_Build 1 195184037 1I TTTATTTTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 8 9 57817 CASAVA_Build 1 195188162 1I TGCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 9 10 57818 CASAVA_Build 1 195190431 1I ACCTGGAACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 9 10 57819 CASAVA_Build 1 195191471 1I CATGGTGGTG -/C ACTCCTGTAA 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 C 0 1 57820 CASAVA_Build 1 195193099 1I GTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1249 het 1249 ref 30 11 5 14 T 15 16 57821 CASAVA_Build 1 195193208 1D AGCAATTCCC T/- TTTAGTTTCT 3070 het 3070 ref 36 16 14 8 T 4 3 57822 CASAVA_Build 1 195198983 4D GTTTTTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2813 het 2813 ref 25 8 7 10 TTTG 5 4 57823 CASAVA_Build 1 195207483 1I GGCTGAAACA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 7 8 57824 CASAVA_Build 1 195209556 5D TTTTATGACT TATTA/----- TATGAATCTA 3070 het 3070 ref 48 25 21 7 TATTA 1 0 57825 CASAVA_Build 1 195231102 1D TGTAGGCAAA T/- GTCTTTATGA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 1 0 57826 CASAVA_Build 1 195252737 1I TGCCATTGGG -/A ATTGCCTTTC 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 1 2 57827 CASAVA_Build 1 195259581 1D ATGGGGGTGG T/- TTCCCACATG 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 T 3 2 57828 CASAVA_Build 1 195260727 1I TCATGATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 9 10 57829 CASAVA_Build 1 195271358 1I ACTAAACTTT -/G GGTGCCTCAA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 G 2 3 57830 CASAVA_Build 1 195277361 1D TTACAGTATG C/- CCCTCCCTGA 3070 het 3070 hom 48 22 22 5 C 4 3 57831 CASAVA_Build 1 195284577 2D6M3D CAAAGTTAAC TTTTTTCAAGT/--TTTTCA--- ATGAAAAGAA 3070 het 3070 hom 50 20 26 7 N/A 0 0 57832 CASAVA_Build 1 195288717 4D TAAGGCTTCT CTCA/---- CACACATATA 2845 het 2845 ref 21 13 8 1 CTCA 1 0 57833 CASAVA_Build 1 195301749 1I AGCAGCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 10 11 57834 CASAVA_Build 1 195308146 1I TCAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 10 2 A 11 12 57835 CASAVA_Build 1 195309067 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1618 het 360 hom 6 2 4 0 A 13 14 57836 CASAVA_Build 1 195309527 5I GGTTTCATAC -----/CTGGA TGCAGGGATT 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 CTGGA 0 1 57837 CASAVA_Build 1 195311004 1D AATAAGCAAT A/- AAAAAAAAAA 2763 het 2763 ref 29 16 6 7 A 12 11 57838 CASAVA_Build 1 195315297 1I TACCTGCATG -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 6 7 57839 CASAVA_Build 1 195317399 1D TGGGGTCAGA G/- TCCCCACACA 2657 het 2657 ref 30 15 8 8 G 1 0 57840 CASAVA_Build 1 195320185 1I TAAGTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 12 12 15 A 15 16 57841 CASAVA_Build 1 195324760 5D TAAGATAAAA ATAAC/----- AAAACAACAT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 ATAAC 1 0 57842 CASAVA_Build 1 195331521 3I TCAAGTATAT ---/GTA AATATTTTTA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 GTA 0 1 57843 CASAVA_Build 1 195344960 2I AAATAATAAC --/AA ATGTCAACAA 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 A 1 3 57844 CASAVA_Build 1 195349783 12I ACTCTTGGAT ------------/AGTGTCTACTAA AGTTGAAATA 3070 het 3070 ref 51 24 19 9 AGTGTCTACTAA 0 1 57845 CASAVA_Build 1 195355373 2I AGTTTCCATG --/CC TATGGTCATT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 C 0 2 57846 CASAVA_Build 1 195364515 4D TATAAAAATA AAAT/---- AATATAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 AAAT 1 0 57847 CASAVA_Build 1 195370006 1I AAAATAATAA -/T AAAAAAAAAA 2813 het 2813 ref 24 13 8 3 T 0 1 57848 CASAVA_Build 1 195370179 1I AGCAAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 8 9 57849 CASAVA_Build 1 195370773 1D ATGTATAATT A/- AAGAATGACA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 3 2 57850 CASAVA_Build 1 195381599 6D CAATTAGAGA ATATAT/------ ATATATATAT 1953 het 711 hom 8 2 4 2 AT 11 8 57851 CASAVA_Build 1 195386642 1D TCACATCTGT A/- AAGTTTTTAG 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 3 2 57852 CASAVA_Build 1 195391969 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAATCC 3070 het 1826 hom 21 5 12 4 A 7 8 57853 CASAVA_Build 1 195393665 1D TTACACACAC A/- AAAAAAGTGC 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 A 7 6 57854 CASAVA_Build 1 195397366 4I GTGAGACATG ----/AAGT AATACATTAT 3070 het 3070 hom 29 7 15 7 AAGT 0 1 57855 CASAVA_Build 1 195406014 1I GTATCCCAAC -/T AAGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 T 0 1 57856 CASAVA_Build 1 195432704 1I ATAAAATTAT -/C CTTTATTGTA 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 C 1 2 57857 CASAVA_Build 1 195437176 2D AAGCCCTCCT GA/-- GAGAGACCGG 1712 het 764 hom 12 2 6 4 GA 4 3 57858 CASAVA_Build 1 195474785 1D CATCTCTTAC T/- TACTCTTCAG 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 T 2 1 57859 CASAVA_Build 1 195488391 2I TGTTTATATT --/AC ACACACACAC 2104 het 241 hom 7 1 5 1 AC 8 9 57860 CASAVA_Build 1 195507566 1D GTCTATCTCT C/- TAGTCCTTTA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 C 1 0 57861 CASAVA_Build 1 195531737 5I AAAAAAAAAT -----/TTCTC TTAAGACAAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 TTCTC 0 1 57862 CASAVA_Build 1 195535324 1I TGTAAAAAAA -/T GTTCATACAG 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 T 0 1 57863 CASAVA_Build 1 195536778 1D AATGCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 13 9 A 12 11 57864 CASAVA_Build 1 195566546 1D TGTTTTTGCA C/- CCCCCCCCAA 2747 het 2747 ref 20 9 7 4 C 9 8 57865 CASAVA_Build 1 195572195 3D TGAGAAATAA TAT/--- TATTATATCA 3070 het 3070 ref 34 18 14 6 TAT 3 2 57866 CASAVA_Build 1 195583594 2I AAATAATGTT --/AA AAACTATTAG 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 3 5 57867 CASAVA_Build 1 195585994 11D GATATGTTTC CTGTTTATTAA/----------- CTGAGTGAAC 3070 het 3070 ref 31 15 14 6 CTGTTTATTAA 1 0 57868 CASAVA_Build 1 195593233 1I TAAATTACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 9 10 57869 CASAVA_Build 1 195594554 7D CATATTACTG GTCAAAT/------- GTAATCATGT 3070 het 3070 ref 47 28 18 5 GTCAAAT 1 0 57870 CASAVA_Build 1 195598889 1D TCTATTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 T 12 11 57871 CASAVA_Build 1 195600783 1D GACAATCACC T/- TTTTAGGTTT 3070 het 3070 hom 51 19 22 11 T 5 4 57872 CASAVA_Build 1 195605994 1D TAACACAATG A/- AAAAAAACCG 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 8 7 57873 CASAVA_Build 1 195608466 1I CTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 12 13 57874 CASAVA_Build 1 195625466 1I TTACCACAAT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 7 8 57875 CASAVA_Build 1 195658067 1D TAATCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 11 10 57876 CASAVA_Build 1 195673384 2D GGCTCTTTTG AA/-- AAGTCTTTAT 3070 het 3070 ref 33 18 13 5 A 4 2 57877 CASAVA_Build 1 195674510 1I TCTCCTCTAA -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 T 6 7 57878 CASAVA_Build 1 195690027 4D TTTTAAAAAG TTAC/---- TTACTTAAGA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 TTAC 2 1 57879 CASAVA_Build 1 195700228 1D AAGGGAAGTA T/- TTTTTTTTTT 1539 het 1539 ref 48 40 5 3 T 11 10 57880 CASAVA_Build 1 195715370 1D ATAAGAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 39 1 27 12 T 11 10 57881 CASAVA_Build 1 195718126 22D TTTGGCCCTT TTAGGGTTACTCCTTAAACCTC/---------------------- TTTTGTTAGA 3070 hom 117 het 35 0 40 3 TTAGGGTTACTCCTTAAACCTC 1 0 57882 CASAVA_Build 1 195726457 1D AAATAACAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 18 15 8 A 9 8 57883 CASAVA_Build 1 195727678 1D CAACTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 990 hom 28 3 18 7 A 11 10 57884 CASAVA_Build 1 195731981 1I TCCATGCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 26 11 6 A 13 14 57885 CASAVA_Build 1 195732082 1D AATGTTGACA T/- GTGCATTAGC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 1 0 57886 CASAVA_Build 1 195734090 1I ATTAACCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 33 1 27 5 A 10 11 57887 CASAVA_Build 1 195741469 5I ATACAAAAAA -----/TTAAC TTAATTTACA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 TTAAC 0 1 57888 CASAVA_Build 1 195741679 5D CAGTATTGTC AATCT/----- AATCTAAGGT 3070 hom 134 het 49 0 45 4 AATCT 2 1 57889 CASAVA_Build 1 195748925 2D TCAAACCAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 33 2 27 4 A 14 12 57890 CASAVA_Build 1 195749276 1I TGCTGAATCT -/G GGGGGGTCAC 3070 hom 88 het 37 0 30 7 G 6 7 57891 CASAVA_Build 1 195759704 1D ATGGAATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 10 9 57892 CASAVA_Build 1 195764612 1I GACTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 14 1 12 1 A 15 16 57893 CASAVA_Build 1 195772798 1I CGTCTCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 12 7 A 13 14 57894 CASAVA_Build 1 195781318 1I TATATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 11 12 57895 CASAVA_Build 1 195781877 7D AATTATTTCA TGTTCAG/------- TGTTCAGTGT 3070 hom 75 het 30 0 26 6 TGTTCAG 2 1 57896 CASAVA_Build 1 195783584 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 8 7 57897 CASAVA_Build 1 195790429 1I CATCTCTACT -/A AAAAAATACA 3070 het 2583 hom 22 7 13 2 A 6 7 57898 CASAVA_Build 1 195792767 6D ACTTCTACCC AGTTTT/------ AAAGGCAAAT 3070 het 3070 ref 49 25 24 2 AGTTTT 1 0 57899 CASAVA_Build 1 195794082 2D TAAATTATAA AT/-- AGATAAAATT 3070 het 3070 ref 35 20 10 7 AT 1 0 57900 CASAVA_Build 1 195795481 3I AAATTTAATA ---/AGT AGTCTAATTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 AGT 1 2 57901 CASAVA_Build 1 195800276 3D ATTGCACACT TAA/--- TAGACTATAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 6 TAA 1 0 57902 CASAVA_Build 1 195806831 2I CCTCTCAAAC --/AT AAACAAATTC 3070 het 3070 ref 63 30 24 9 AT 0 1 57903 CASAVA_Build 1 195806973 7I GGGCAACCTT -------/TACAAAA TACAAAATAC 3070 het 3070 ref 57 28 21 8 TACAAAA 1 2 57904 CASAVA_Build 1 195806986 2I AAAATACAGA --/AT TCAGATCCAA 1249 het 1249 ref 52 32 5 15 AT 0 1 57905 CASAVA_Build 1 195815294 2D ATGTTAAGAC TT/-- TATAAATTTG 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 T 3 1 57906 CASAVA_Build 1 195818559 4D TCAAAATACA GTTT/---- GTTAGTTTAC 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 GTTT 1 0 57907 CASAVA_Build 1 195832926 1D ATAAATGCAT A/- TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 1 0 57908 CASAVA_Build 1 195836994 4I AAATACCTGT ----/TGAA TGAATGAATA 3070 het 3070 hom 67 29 33 5 TGAA 2 3 57909 CASAVA_Build 1 195837280 1I CCTTTTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 10 11 57910 CASAVA_Build 1 195839942 2D TCCCAATAAA AT/-- ATGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 AT 2 1 57911 CASAVA_Build 1 195842931 1I TCACTCTCTA -/T TAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 57912 CASAVA_Build 1 195846209 1I ATCATTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 7 9 4 A 10 11 57913 CASAVA_Build 1 195849476 6I TGAAGTTAGG ------/CAACTC CCATAATCTT 3070 hom 105 het 45 0 42 3 CAACTC 0 1 57914 CASAVA_Build 1 195868610 11D GAGTGATTGT TCTCAATAACC/----------- AAAGGGAAAC 3070 het 3070 ref 41 26 13 5 TCTCAATAACC 1 0 57915 CASAVA_Build 1 195870729 1D CCTTGGCGAC A/- AGAGTGCAAC 2559 het 2559 ref 27 16 6 5 A 2 1 57916 CASAVA_Build 1 195874627 1I TCAACAGAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 26 hom 40 1 32 7 A 9 10 57917 CASAVA_Build 1 195878733 1D GGCTGCCACA T/- AAAGTACATA 2546 het 2546 ref 29 20 7 2 T 1 0 57918 CASAVA_Build 1 195880380 3D CATTATGTCA CCT/--- GAGAGCTTTG 3070 het 3070 hom 44 15 26 4 CCT 1 0 57919 CASAVA_Build 1 195905864 6D CGATTAACAA ATAGTT/------ ATAGTTCATG 3070 het 3070 ref 36 25 10 2 ATAGTT 2 1 57920 CASAVA_Build 1 195906110 2D TGAGGTAAGC TA/-- TAAAATACAG 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 TA 2 1 57921 CASAVA_Build 1 195926632 1D TAACCTGACC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 11 16 6 A 9 8 57922 CASAVA_Build 1 195931443 1I AATGAAATTA -/T TTTCTGTCTC 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 T 3 4 57923 CASAVA_Build 1 195934357 2D AAAACTCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 A 12 10 57924 CASAVA_Build 1 195941760 4I AATTTCTAAG ----/TCTT TCAGATTGAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TCTT 0 1 57925 CASAVA_Build 1 195954145 1I TTAAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 10 11 A 15 16 57926 CASAVA_Build 1 195956322 1I CAGCCTGATT -/G AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 G 0 1 57927 CASAVA_Build 1 195957288 1I GACATAAATT -/G ACACAAGTAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 G 0 1 57928 CASAVA_Build 1 195973550 2D TCAAAAAAAG AA/-- AAACAAGTAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 A 5 3 57929 CASAVA_Build 1 195973774 3D GTTTTGATTG CCT/--- CCTAATTTCC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 CCT 2 1 57930 CASAVA_Build 1 195979153 1D TTAAAAATGT A/- AAAAACCCTA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 6 5 57931 CASAVA_Build 1 195985474 1I GTACATAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 10 11 57932 CASAVA_Build 1 196012577 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 10 9 57933 CASAVA_Build 1 196031969 1D TTTTGTATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 T 10 9 57934 CASAVA_Build 1 196033744 1D CTTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 14 8 T 12 11 57935 CASAVA_Build 1 196034465 1I ACTTGAGTGC -/T GGCTGCAGAT 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 0 1 57936 CASAVA_Build 1 196041122 2D TTTTATGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 12 10 57937 CASAVA_Build 1 196052778 1D TCGTGATAAC T/- CTTAAATATA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 1 0 57938 CASAVA_Build 1 196064071 1I TTAGTAGAGA -/G GGGGGTTTCA 2710 het 2710 ref 20 11 7 2 G 5 6 57939 CASAVA_Build 1 196072628 1D AGTATAACTT A/- AAAAAAAAAA 2180 het 2180 ref 20 13 6 1 A 13 12 57940 CASAVA_Build 1 196075357 8D ACACACACAC ACACAGAG/-------- AGAGAACAAA 3070 het 163 hom 23 4 13 10 ACACAGAG 1 0 57941 CASAVA_Build 1 196078097 1D CCTGCTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 10 9 57942 CASAVA_Build 1 196090864 1I TACTCTCACT -/C CTCTCAGCCC 3070 hom 138 het 54 0 47 7 C 1 2 57943 CASAVA_Build 1 196092278 4D ACAGTCTGGC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 TTTA 4 3 57944 CASAVA_Build 1 196092699 1I TGAGCAACCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 363 hom 18 1 13 4 T 9 10 57945 CASAVA_Build 1 196122081 1I ATTCTCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 11 12 57946 CASAVA_Build 1 196124666 1I AACAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1001 hom 34 4 21 9 T 14 15 57947 CASAVA_Build 1 196128504 1D ACACCTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 54 2 32 21 T 13 12 57948 CASAVA_Build 1 196136648 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 11 12 57949 CASAVA_Build 1 196140662 1I TATTTTAATG -/A AAAAAAACTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 7 8 57950 CASAVA_Build 1 196148994 2D TGGCGAGAGG TT/-- TTTTTTTTGT 3069 het 17 hom 17 1 10 7 T 10 8 57951 CASAVA_Build 1 196150155 1I AGGGGGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 517 hom 32 2 18 12 T 11 12 57952 CASAVA_Build 1 196161284 1I CCTTTGACTA -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 6 7 57953 CASAVA_Build 1 196170013 1D CAAAGTATTG T/- TTTTTTATTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 7 6 57954 CASAVA_Build 1 196172833 2D ACAAAACAAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AC 1 0 57955 CASAVA_Build 1 196174261 10D GATCTACTTC TTTTATTTTA/---------- TTTTATTTTA 3070 hom 69 het 23 0 23 3 TTTTA 4 2 57956 CASAVA_Build 1 196175606 1I ATTTTTTTTC -/A TTTTTTTTTT 2755 hom 15 het 26 1 19 6 A 0 1 57957 CASAVA_Build 1 196186800 2D ATTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 19 10 A 17 15 57958 CASAVA_Build 1 196203219 1D AGGTTCAGAG A/- AAAAAAGCTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 6 57959 CASAVA_Build 1 196207708 2D CTTCCCCCTC TT/-- GTTTCACTTT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 2 0 57960 CASAVA_Build 1 196208999 1I TCTTTTGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 38 het 43 1 35 7 A 9 10 57961 CASAVA_Build 1 196211807 1D ATATGGATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2245 hom 25 7 14 4 T 10 9 57962 CASAVA_Build 1 196230597 1D TTGAGAAAAG A/- AATGTTGCTA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 3 2 57963 CASAVA_Build 1 196236571 5I CAAATAAACT -----/AAAGG AAACAATGAA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 AAAGG 0 1 57964 CASAVA_Build 1 196237325 4I GGGCAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 AAAC 3 4 57965 CASAVA_Build 1 196237746 9D GATTGATTCT ATTGATTCC/--------- ATCTAACAAT 3070 het 3070 ref 44 28 9 9 ATTGATTCC 1 0 57966 CASAVA_Build 1 196238504 2D AACCTGAAAA AG/-- GGGAAAATCT 3070 het 3070 hom 30 13 16 2 AG 1 0 57967 CASAVA_Build 1 196252862 3D AATCCAGTGT TCC/--- TCCTCCTTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 6 TCC 3 2 57968 CASAVA_Build 1 196253430 1I TAAGGAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 29 2 21 6 T 12 13 57969 CASAVA_Build 1 196256259 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 11 10 57970 CASAVA_Build 1 196261765 1D CCATCTACTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 39 0 35 5 T 9 8 57971 CASAVA_Build 1 196282111 2D TATATATATA TC/-- TCTATATAGT 2968 het 9 hom 15 1 11 3 TC 2 1 57972 CASAVA_Build 1 196296366 1D AAAATAAGAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 7 57973 CASAVA_Build 1 196300720 1D CTTTACGTCA G/- GGAACTAATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 3 2 57974 CASAVA_Build 1 196312911 1I CTTTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 11 57975 CASAVA_Build 1 196336493 1I ATAATTTCTG -/T TTTTTCCCCA 3070 het 27 hom 42 1 39 2 T 5 6 57976 CASAVA_Build 1 196350955 1D TAAATAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 12 11 57977 CASAVA_Build 1 196361978 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 8 7 57978 CASAVA_Build 1 196362257 1I AACTACTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 9 10 57979 CASAVA_Build 1 196405344 1D ACTTACTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 28 1 20 7 T 15 14 57980 CASAVA_Build 1 196412343 2D TAGATTTATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 430 hom 30 1 24 6 AT 8 7 57981 CASAVA_Build 1 196444907 1I ATATATATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 192 hom 33 2 17 14 T 15 16 57982 CASAVA_Build 1 196462623 1D ATTGTAGATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 10 9 57983 CASAVA_Build 1 196522176 1I GAGGTCACAC -/T TTTTTTTTTT 2277 het 2277 ref 36 16 7 13 T 15 16 57984 CASAVA_Build 1 196561709 1D TCACTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1580 het 1580 ref 25 17 4 4 A 12 11 57985 CASAVA_Build 1 196573901 1I CAAGCAACAT -/A TTTTGTTGTT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 0 1 57986 CASAVA_Build 1 196580189 1I CATTTTTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 529 hom 24 2 15 7 A 14 15 57987 CASAVA_Build 1 196657510 4I TTTAGACTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 TTTG 3 4 57988 CASAVA_Build 1 196675878 2D GTATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 45 het 23 0 14 9 AT 10 9 57989 CASAVA_Build 1 196699721 1I TTTAAATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 12 13 57990 CASAVA_Build 1 196719358 1I TGAAAAGCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 10 11 57991 CASAVA_Build 1 196823754 5D TATCTTATTG TTTAC/----- TTTGCTAAAG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TTTAC 1 0 57992 CASAVA_Build 1 196843772 1D AATGGGGTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 37 0 26 11 T 10 9 57993 CASAVA_Build 1 196880799 1I TACCTGGAAG -/A AAACCATCCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 4 57994 CASAVA_Build 1 196975044 2D GGCTGAATAG AT/-- ATTAATAAAA 2888 het 2888 ref 29 19 6 4 AT 2 1 57995 CASAVA_Build 1 196976334 1I ACTTTATCTC -/A AAAAAAAAAG 2838 het 2838 ref 26 16 7 3 A 9 10 57996 CASAVA_Build 1 196990347 4I TAAATTATTA ----/TAAG TAAGTCTAAA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 TAAG 1 2 57997 CASAVA_Build 1 196995397 3I AATCAACTAT ---/ATC ATCTACTTCA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 ATC 1 2 57998 CASAVA_Build 1 197006920 1I ATTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 10 11 57999 CASAVA_Build 1 197007394 2I GGAATAGTAA --/AT TTCATGGGAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AT 0 1 58000 CASAVA_Build 1 197020709 1I TAAGAATGGG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 33 15 17 1 A 6 7 58001 CASAVA_Build 1 197021481 3D AGTTATTAGG CAA/--- TAAGTATTAT 2976 het 2976 ref 37 25 7 6 CAA 1 0 58002 CASAVA_Build 1 197035320 2I TTCTAATAAC --/AG ATATTGAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AG 0 1 58003 CASAVA_Build 1 197037036 1D TGTTGCCCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 51 12 27 12 T 9 8 58004 CASAVA_Build 1 197037328 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 11 12 58005 CASAVA_Build 1 197046305 1I TCTTTATACT -/C CCTTGCGTGA 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 C 2 3 58006 CASAVA_Build 1 197051770 1D TGCTTTTGAC T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 7 6 58007 CASAVA_Build 1 197076547 1I TAATTAAGAC -/T TTTTTTTTTT 1078 het 871 hom 9 3 3 3 T 13 14 58008 CASAVA_Build 1 197077488 2D TACTGCTTCT GA/-- GAGTTTTTAA 3070 het 3070 hom 14 7 7 1 GA 2 1 58009 CASAVA_Build 1 197111988 1D GATAGAATAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 10 9 58010 CASAVA_Build 1 197115389 1I TTTGAATTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 A 9 10 58011 CASAVA_Build 1 197119101 1D ACTAGATTAA C/- CCAAAGGATA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 C 3 2 58012 CASAVA_Build 1 197120926 1I CAGAAGGTGG -/A AGCAACCCAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 1 2 58013 CASAVA_Build 1 197124800 2I14M19D CAGAACATAA --ACACACACATTTGACCTCTGTAAGAAACCTCAG/ACACACACACATTTGA------------------- CAGCTAAGTC 3070 het 3070 ref 32 23 12 2 N/A 0 0 58014 CASAVA_Build 1 197125665 1I AAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 13 9 A 10 11 58015 CASAVA_Build 1 197144757 3I CTATAATTTC ---/AAG AAGAATTATT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAG 1 2 58016 CASAVA_Build 1 197145584 1I AAATGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 41 1 33 7 T 13 14 58017 CASAVA_Build 1 197166401 2D CCATGACCCA AC/-- ACAAATAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 AC 2 1 58018 CASAVA_Build 1 197186090 13I CTGAGGTAAT -------------/CCTGTTCCTATTA CCCAGCCCAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 CCTGTTCCTATTA 0 1 58019 CASAVA_Build 1 197206925 3I CTTGAGTAAC ---/CTT CTTCTCTAGA 3070 het 3070 hom 57 20 31 6 CTT 1 2 58020 CASAVA_Build 1 197223467 1I TGTCTCATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 9 10 58021 CASAVA_Build 1 197227692 1I CCTAAGCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 9 10 58022 CASAVA_Build 1 197235666 7D ATTATTATTA TTATTAT/------- TATTATTATT 2430 het 1098 hom 10 3 5 3 TTATTAT 1 0 58023 CASAVA_Build 1 197244576 1I ACTACTATTA -/T TTTTAAAGCA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 4 5 58024 CASAVA_Build 1 197261320 1D AGAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 752 het 434 hom 6 1 5 1 A 12 11 58025 CASAVA_Build 1 197292039 2D TCATATAGGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 429 hom 24 4 8 12 GT 10 9 58026 CASAVA_Build 1 197309634 1D AGTACATGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 10 9 58027 CASAVA_Build 1 197323788 1I AGAAATCAAT -/A CTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 0 1 58028 CASAVA_Build 1 197344358 15I TTGTTCCTCC ---------------/AAAACTTTCATAATG AATATATTGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AAAACTTTCATAATG 0 1 58029 CASAVA_Build 1 197353202 1I GAAAAATTAC -/T TAACCTTCTA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 1 2 58030 CASAVA_Build 1 197355452 1D ATACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 552 hom 27 2 20 5 A 15 14 58031 CASAVA_Build 1 197367680 1D GAAAGAACAA T/- TGAGTTAAGT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 2 1 58032 CASAVA_Build 1 197373930 4D CATTTTAGAA AGAT/---- AGAGCAAAGG 3070 het 3070 ref 63 32 26 8 AGAT 1 0 58033 CASAVA_Build 1 197374718 2I GGACTAGCAC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 15 17 13 TG 8 9 58034 CASAVA_Build 1 197380512 2I TTTGGAGAAT --/AA GTCAGTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 0 2 58035 CASAVA_Build 1 197383042 17D AACTCTAGTA TTATTCTAAAACGTTCT/----------------- TTATTCTAAA 3070 het 3070 ref 40 18 10 14 TTATTCTAAAACGTTCT 2 1 58036 CASAVA_Build 1 197383412 34D GTATTCTCTA CTAGTAGAGAATACTAGTACTACTATTCTCTACT/---------------------------------- AGCCACTGGG 2477 het 2477 ref 22 23 7 10 CTAGTAGAGAATACTAGTACTACTATTCTCTACT 1 0 58037 CASAVA_Build 1 197385219 1D CTTGCAGAAA G/- GATCCCAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 4 G 2 1 58038 CASAVA_Build 1 197386138 4D TGCAAATAGT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 11 22 6 TG 9 7 58039 CASAVA_Build 1 197386584 1I AATCCTAGGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 A 9 10 58040 CASAVA_Build 1 197387511 1D AGGCCACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 6 A 12 11 58041 CASAVA_Build 1 197406419 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAATA 1793 het 1793 ref 25 8 6 11 A 11 8 58042 CASAVA_Build 1 197410321 12D TCCAGCTCCA CCCCAGCCTCAG/------------ CCCCAGTCCC 3070 het 3070 ref 32 19 14 7 CCCCAGCCTCAG 1 0 58043 CASAVA_Build 1 197455377 1D ATATTTTTGT A/- TCTCATTGAG 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 A 1 0 58044 CASAVA_Build 1 197486704 5D AGAATATAAT ATATA/----- ATATAGAATA 1468 hom 7 het 3 0 3 1 ATATA 2 1 58045 CASAVA_Build 1 197507290 1I TAAAAGAGAG -/A AAACATCTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 3 4 58046 CASAVA_Build 1 197512705 4D AAATGAAAAG CAAA/---- CAAACAAACC 3070 het 3070 hom 36 15 15 8 CAAA 3 2 58047 CASAVA_Build 1 197519355 1I GTACTGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 A 10 11 58048 CASAVA_Build 1 197522239 1I TCTTTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 10 11 58049 CASAVA_Build 1 197532607 1I GTAAAAAAAA -/T CATAATGATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 0 1 58050 CASAVA_Build 1 197548777 2D GCCAAATTTA AT/-- AGTTTACTAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 AT 1 0 58051 CASAVA_Build 1 197553082 1D ACTATAAGGA T/- TTTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 7 6 58052 CASAVA_Build 1 197575718 1I TGTTTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 10 11 58053 CASAVA_Build 1 197580566 2I CAGAGCCAGA --/CT CTGTCTCAAA 2431 het 653 hom 8 2 6 0 CT 1 2 58054 CASAVA_Build 1 197582671 2D GTTGCCACTC TT/-- TCCCCCTGCC 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 T 3 1 58055 CASAVA_Build 1 197596671 4I ATGTATATTA ----/TGTG TGTGTATTAC 2714 het 2714 ref 16 7 6 3 TG 2 4 58056 CASAVA_Build 1 197596731 4D TATATATGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 TG 11 9 58057 CASAVA_Build 1 197598507 1D TAAATTAATG C/- AGAAAGAATA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 C 1 0 58058 CASAVA_Build 1 197605421 1I TTCTTTTGAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 9 58059 CASAVA_Build 1 197609847 9D GCTTAGGTAG ACATTAATA/--------- ACAGAAAGAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 ACATTAATA 1 0 58060 CASAVA_Build 1 197615525 1I CATTGACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 A 10 11 58061 CASAVA_Build 1 197620375 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 21 4 8 11 A 18 16 58062 CASAVA_Build 1 197624034 1D CTGGTGATGC T/- GCCATTTGTT 3070 het 3070 ref 54 29 22 4 T 1 0 58063 CASAVA_Build 1 197629841 1D CAGGAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 T 12 11 58064 CASAVA_Build 1 197630405 1I TTTTTGTGTG -/T ATCTATTTTT 2348 het 153 hom 13 2 8 3 T 0 1 58065 CASAVA_Build 1 197633750 1I TTGCTGAGTT -/A GTCAACACTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 0 1 58066 CASAVA_Build 1 197635838 1D GAAGGAAACG A/- AAAGTTGATG 3070 het 3070 ref 52 27 21 5 A 4 3 58067 CASAVA_Build 1 197639474 1I TTTTTTTTTT -/C TTCTTTTTTT 3070 het 2512 hom 25 8 16 1 C 0 1 58068 CASAVA_Build 1 197639822 1D TTGGTTCTGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 9 8 58069 CASAVA_Build 1 197644670 2D CTTTCCTGGA GG/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 36 1 31 5 G 2 0 58070 CASAVA_Build 1 197648474 1I ACAAATTAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 8 9 58071 CASAVA_Build 1 197649944 1I GCAATAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2937 hom 25 11 9 5 A 14 15 58072 CASAVA_Build 1 197650409 2I ATTTTTGTTC --/CT TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 29 2 15 12 CT 0 1 58073 CASAVA_Build 1 197653691 1D ATGAAAAAAA T/- AAACCTTAAC 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 T 1 0 58074 CASAVA_Build 1 197655094 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2720 hom 24 7 11 6 T 11 10 58075 CASAVA_Build 1 197662115 1D CCATAAAAAA T/- AATGAAATTA 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 T 1 0 58076 CASAVA_Build 1 197664354 1D CACAAAAAAA G/- CTATAGGCCA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 G 1 0 58077 CASAVA_Build 1 197664895 1D TTAAGATTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2926 hom 31 8 19 4 A 10 9 58078 CASAVA_Build 1 197665182 1D AGAATTAATA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 7 6 58079 CASAVA_Build 1 197670650 10D CAGAAAGAAA GCTCAAATGT/---------- GCATGGCAAT 3070 het 3070 hom 33 12 21 4 GCTCAAATGT 1 0 58080 CASAVA_Build 1 197670825 2D AAATATATAC AT/-- ATATATATAT 2723 het 1945 hom 15 6 7 2 AT 6 5 58081 CASAVA_Build 1 197672802 1D GGCCATCACT G/- GGGTGAAGCC 3070 hom 141 het 51 0 47 4 G 4 3 58082 CASAVA_Build 1 197674622 1D AAGGACAAAA G/- CTATATGATC 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 G 1 0 58083 CASAVA_Build 1 197688816 1D ACATCTAAGC A/- AAAGATATAT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 4 3 58084 CASAVA_Build 1 197691753 1I GAATGAGTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 7 8 58085 CASAVA_Build 1 197692112 4D ATAAACAAAC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 87 het 37 0 30 8 TA 8 6 58086 CASAVA_Build 1 197696204 2D CAAAATAAAC TA/-- AAGACAAAAA 1879 het 1879 ref 10 6 4 0 TA 1 0 58087 CASAVA_Build 1 197702109 2I ACGCACACAT --/AC ACACACACAC 3004 het 1944 hom 32 11 12 9 AC 6 7 58088 CASAVA_Build 1 197704266 1D CAACATGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 10 9 58089 CASAVA_Build 1 197704539 1D TTTCTCACAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 23 9 12 2 A 8 7 58090 CASAVA_Build 1 197704962 1D GGTGAATTAC A/- TATTAATCTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 1 0 58091 CASAVA_Build 1 197708063 1D TAGGGAAACC A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 A 8 7 58092 CASAVA_Build 1 197711832 3D AACAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 29 hom 37 2 19 17 A 12 9 58093 CASAVA_Build 1 197716372 1I TTCTTCCCCC -/T ATCCCGTGTC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 T 0 1 58094 CASAVA_Build 1 197721588 1I AAAAAAAGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 8 9 58095 CASAVA_Build 1 197722588 1D TTCTCATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 12 11 58096 CASAVA_Build 1 197723778 1D ATATGTGCAC A/- AAAAAAATCG 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 8 7 58097 CASAVA_Build 1 197733844 3D TCAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 2905 het 2665 hom 20 7 7 8 AAG 5 4 58098 CASAVA_Build 1 197738652 1D TGGCTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 A 11 10 58099 CASAVA_Build 1 197741831 1D CTGTGTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 17 22 11 A 12 11 58100 CASAVA_Build 1 197744840 1I CTGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 304 hom 30 1 26 3 A 9 10 58101 CASAVA_Build 1 197748845 5I TTAATCTTTA -----/TATTT TATTTTATTC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TATTT 1 2 58102 CASAVA_Build 1 197770038 1D TGTCTTTATC A/- AAACTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 4 3 58103 CASAVA_Build 1 197774434 1D CTTTAAGCGG T/- TTTCCGCCCT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 4 3 58104 CASAVA_Build 1 197783242 8I CCAAAGTGAT --------/TCATTGGA TCATTGGATT 3070 het 3070 hom 53 22 23 8 TCATTGGA 1 2 58105 CASAVA_Build 1 197784588 2D ACTGACTTAA AC/-- ACACACACAC 572 het 572 ref 50 39 2 10 AC 9 8 58106 CASAVA_Build 1 197786215 1D CAAATGCCAA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 9 8 58107 CASAVA_Build 1 197794213 2I AATCTAATGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 A 10 12 58108 CASAVA_Build 1 197803636 5D CATATTTTCT AAAGA/----- AAAGAGACAA 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 AAAGA 2 1 58109 CASAVA_Build 1 197804506 1I ATGCACTTAG -/A AAAAAGCAGG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 5 6 58110 CASAVA_Build 1 197806780 4I TGATAATAAC ----/TCTT TCAACTAATT 3070 hom 79 het 32 0 27 5 TCTT 0 1 58111 CASAVA_Build 1 197807041 3D AATATTTTAT AGA/--- ATATGACTCT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 AGA 1 0 58112 CASAVA_Build 1 197811643 3I ACCTACTTGC ---/TGT TGTGATTTGA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 TGT 1 2 58113 CASAVA_Build 1 197813071 1I CCTGTTTTTC -/A AAATTGATTC 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 3 4 58114 CASAVA_Build 1 197819612 1I CATGGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 A 11 12 58115 CASAVA_Build 1 197833349 1D AAGAAAAATG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 51 25 23 4 A 9 8 58116 CASAVA_Build 1 197833520 1I AAGCCACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1029 hom 44 3 35 6 A 12 13 58117 CASAVA_Build 1 197840037 1D TACAATAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 7 A 12 11 58118 CASAVA_Build 1 197845482 5D TGAGTAAGGG GATCT/----- GATCTATACC 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 GATCT 2 1 58119 CASAVA_Build 1 197855771 4I CCATTGTAAA ----/GATG TCAATTCTCT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 GATG 0 1 58120 CASAVA_Build 1 197861176 1I CATCTCAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 A 9 10 58121 CASAVA_Build 1 197861461 1D TTAATGCTAT A/- ACATTATATT 3070 het 2963 hom 24 6 16 2 A 2 1 58122 CASAVA_Build 1 197863454 3I TATACTACCC ---/TTA TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 TTA 0 1 58123 CASAVA_Build 1 197863620 1D CACATAGTTT A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 7 6 58124 CASAVA_Build 1 197863747 1I ATTAAAAAAA -/T ATAGGGAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 0 1 58125 CASAVA_Build 1 197865801 10I AACCATCCAT ----------/GTCCCTCTGC TCCATTCCAT 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 GTCCCTCTGC 0 1 58126 CASAVA_Build 1 197868257 5I ATTGACCAGT -----/TTAGG TTGCACATGA 3070 hom 54 het 23 0 19 5 TTAGG 0 1 58127 CASAVA_Build 1 197873276 1I CATAGAAGAG -/C CCAGATAGCC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 2 3 58128 CASAVA_Build 1 197875794 4I TAGCACTATA ----/AAAG AAATAATATA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AAAG 0 1 58129 CASAVA_Build 1 197897078 5D2M15D CTGGGCAATA TTTGTCCAGTATTCAACAAATA/-----CC--------------- CTGGACAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 9 N/A 0 0 58130 CASAVA_Build 1 197903708 2D TCCAATAGCA TC/-- TGTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 TC 1 0 58131 CASAVA_Build 1 197928087 1D CTACTAAAAA T/- ACAAAAATTA 3070 het 1994 hom 16 5 9 2 T 1 0 58132 CASAVA_Build 1 197943624 5D TTTTGAAAAA CTCAG/----- CTCAGCTACA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 CTCAG 2 1 58133 CASAVA_Build 1 197949657 1I ACCGAACTAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 17 7 8 2 A 8 9 58134 CASAVA_Build 1 197953084 7I TGTACTCAGT -------/CTACCAA CTACCAACCT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 CTACCAA 1 2 58135 CASAVA_Build 1 197956906 2D GCTCCCCCTC CT/-- CTGTTTTAGA 3070 het 3070 ref 39 22 11 8 CT 2 1 58136 CASAVA_Build 1 197958392 2D ACAATGTGAC TG/-- TGTAAAATTT 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 TG 2 1 58137 CASAVA_Build 1 197968962 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2992 het 2789 hom 21 9 11 1 A 10 11 58138 CASAVA_Build 1 197975152 1D AGGCATAGTT A/- AAAAAAAAAA 1859 het 1859 ref 51 40 5 7 A 13 12 58139 CASAVA_Build 1 197991387 1D ATATATATAT A/- TTTTACTAGG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 1 0 58140 CASAVA_Build 1 198003195 1I CAGTCCAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 41 1 34 6 A 10 11 58141 CASAVA_Build 1 198011424 1I TAGGTTGGCT -/A TTGTGATGTG 3070 het 3070 ref 73 40 26 7 A 0 1 58142 CASAVA_Build 1 198016852 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 26 1 19 6 A 10 11 58143 CASAVA_Build 1 198025886 1D AAAATGACAT C/- CAATATATGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 2 1 58144 CASAVA_Build 1 198031329 1I AATGATAAGA -/T GTTCTTCTTT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 0 1 58145 CASAVA_Build 1 198031851 1D TTTTCCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 727 hom 33 3 18 12 A 17 16 58146 CASAVA_Build 1 198038453 2I TCCCCCCACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 41 0 30 11 A 10 12 58147 CASAVA_Build 1 198042228 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 11 10 58148 CASAVA_Build 1 198044893 4I AATTTCCACT ----/TTAA TTATCTTATA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTAA 0 1 58149 CASAVA_Build 1 198061465 1I ATGGAATCAA -/T CTAGATGCCC 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 0 1 58150 CASAVA_Build 1 198062862 1D AAAGTAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 21 1 16 4 T 15 14 58151 CASAVA_Build 1 198065185 1D AAAATAAGGG A/- AAATAGATTA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 4 3 58152 CASAVA_Build 1 198089919 1D GGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTA 1687 het 1687 ref 44 36 4 4 T 10 9 58153 CASAVA_Build 1 198124171 1I TGTCTCTACT -/A AAAAGACAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 4 5 58154 CASAVA_Build 1 198125685 11D TGTAATTATA TTAAAAATTAT/----------- TTAAAAATAA 2640 hom 15 het 6 0 6 1 TTAAAAATTAT 1 0 58155 CASAVA_Build 1 198144579 1D AAACTGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 25 0 19 6 T 13 12 58156 CASAVA_Build 1 198146384 2I GTAATACATA --/GT AAAGGTGGCT 2248 hom 12 het 6 0 5 1 GT 0 1 58157 CASAVA_Build 1 198147333 3I TTTTTAATCC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 26 1 19 6 T 12 15 58158 CASAVA_Build 1 198148946 1I GCAGTGGCGT -/A AGGACACCCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 1 2 58159 CASAVA_Build 1 198154238 2D TATCACAGTG GT/-- GATTTTATTT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 GT 1 0 58160 CASAVA_Build 1 198154832 1I GGACACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 34 2 22 10 A 12 13 58161 CASAVA_Build 1 198170726 1I TTTCTGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 A 13 14 58162 CASAVA_Build 1 198174213 1I CATGGTGAAA -/C CCCCCGTCTC 3070 hom 33 het 15 0 10 5 C 5 6 58163 CASAVA_Build 1 198190953 1D ACTTCCCTAC A/- AAAAAAAAAA 928 het 928 ref 36 29 3 4 A 11 10 58164 CASAVA_Build 1 198211708 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 20 1 11 9 A 16 14 58165 CASAVA_Build 1 198215241 1I TTATTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 1321 het 1321 ref 27 16 4 7 T 10 11 58166 CASAVA_Build 1 198215399 1D GCTCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2253 hom 19 het 10 0 7 3 T 15 14 58167 CASAVA_Build 1 198217276 1D ATTAAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 2137 het 2137 ref 42 31 5 6 T 11 10 58168 CASAVA_Build 1 198219209 4D AAGAAAAGAA AAGT/---- AAGTAAGCTG 3070 hom 80 het 29 0 26 5 AAGT 2 1 58169 CASAVA_Build 1 198220659 1D CTCTTTTCAT A/- GACAACTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 1 0 58170 CASAVA_Build 1 198233689 1I AAAAAAAAAA -/T ATTCTTCAAA 3070 het 1250 hom 34 5 18 11 T 0 1 58171 CASAVA_Build 1 198240031 1D AATATTAGGG T/- TTTTTTTTTT 990 het 990 ref 38 25 4 9 T 12 11 58172 CASAVA_Build 1 198240408 4D TACACACAGA GAGC/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 129 het 50 0 44 7 GAGC 1 0 58173 CASAVA_Build 1 198242938 1I TGATGGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 36 2 24 10 A 13 14 58174 CASAVA_Build 1 198280747 1D AAAAAAAAAA T/- CTGAGGTGTT 3070 het 3070 ref 33 13 10 11 T 1 0 58175 CASAVA_Build 1 198287046 3I AAAAGGAAAC ---/ATT ATGAAGTAAA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 ATT 0 1 58176 CASAVA_Build 1 198290114 1D TTTTCAGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 10 9 58177 CASAVA_Build 1 198305013 1I ATTCATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 28 0 19 9 T 11 12 58178 CASAVA_Build 1 198305631 2I AATATTACAC --/AT GTGTCCATGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 AT 0 1 58179 CASAVA_Build 1 198313479 2I AGAAACAAAA --/AC ACAAACAAAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AC 1 2 58180 CASAVA_Build 1 198314349 3D ACTATTAATT TTC/--- TTCCAATATA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 TTC 2 1 58181 CASAVA_Build 1 198315620 1D GCCTTGTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 30 0 24 7 A 12 11 58182 CASAVA_Build 1 198322898 4D TGACCTTTAT CTGC/---- CTTGTTGCAG 261 het 261 ref 34 17 2 19 CTGC 1 0 58183 CASAVA_Build 1 198328455 2I AGTTAGTCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 10 12 58184 CASAVA_Build 1 198331480 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 2204 hom 15 het 7 0 6 1 T 5 4 58185 CASAVA_Build 1 198335095 1D TCTATAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 31 1 19 12 T 13 12 58186 CASAVA_Build 1 198342928 4D CATTAATTCT ACAA/---- ACAAACAATG 3070 hom 163 het 57 0 55 2 ACAA 3 2 58187 CASAVA_Build 1 198347088 1D TGTAGAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 19 7 21 A 15 14 58188 CASAVA_Build 1 198349939 4I ATCTCAAAAA ----/AACT AAATAATAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AACT 0 1 58189 CASAVA_Build 1 198350053 2D14M3I ATACACACAC ATATATATGATATGAA---/--ATATATGATATGAAAGT AGTTGAAGGA 3070 het 3070 ref 26 23 7 3 N/A 0 0 58190 CASAVA_Build 1 198350788 1I12M4I ATGGATATGC -TTTTTTTGTGGT----/TTTTTTTTGTGGTTTAG TTAGTTAGTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 N/A 0 0 58191 CASAVA_Build 1 198362851 1I TTTTGTAATT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 55 28 18 9 A 7 8 58192 CASAVA_Build 1 198365011 10D ACACACACAT ACATACACAC/---------- ACACACTTCA 3070 het 3070 ref 42 27 15 5 ACATACACAC 1 0 58193 CASAVA_Build 1 198368552 1D CATGGGATCA C/- CTCCAGGAGC 3070 het 3070 ref 43 28 12 3 C 2 1 58194 CASAVA_Build 1 198376783 4D CTCCATCTCT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 AAAC 5 4 58195 CASAVA_Build 1 198382713 1D CCTTGTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 12 11 58196 CASAVA_Build 1 198406847 1I GCATCAAGGC -/A AGGCAGCAGA 3070 het 3070 ref 60 29 22 9 A 1 2 58197 CASAVA_Build 1 198413117 1D AACAAAATGG A/- ATTTTTTTTT 3070 het 770 hom 42 2 33 7 A 2 1 58198 CASAVA_Build 1 198461748 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 22 7 A 14 13 58199 CASAVA_Build 1 198465676 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 23 1 17 5 A 13 12 58200 CASAVA_Build 1 198474920 2D AATCTTTGGT GG/-- TTTTTTTTTT 962 het 10 hom 27 0 11 16 G 2 0 58201 CASAVA_Build 1 198502530 1I AAGTGGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 147 het 54 0 49 5 A 10 11 58202 CASAVA_Build 1 198504412 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1060 het 1060 ref 21 16 3 2 A 11 10 58203 CASAVA_Build 1 198504716 1D GTTTCTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 37 2 24 12 T 12 11 58204 CASAVA_Build 1 198517557 1I AGTGGAAGGA -/G TAAAGCTAGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 0 1 58205 CASAVA_Build 1 198522090 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 19 1 16 2 A 13 12 58206 CASAVA_Build 1 198524661 1D TTGTACCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 10 9 58207 CASAVA_Build 1 198527901 1D ATATATTTTT A/- AAAAATAGAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 6 5 58208 CASAVA_Build 1 198530129 1D CAATATATCT G/- GTTTCTGTAC 3070 hom 157 het 57 0 51 7 G 2 1 58209 CASAVA_Build 1 198533147 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1633 hom 10 het 5 0 4 1 T 7 6 58210 CASAVA_Build 1 198543845 1I GTGTTGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 101 het 37 0 34 3 A 9 10 58211 CASAVA_Build 1 198544324 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 26 2 12 12 T 14 13 58212 CASAVA_Build 1 198549376 2D ACACTTGACC AA/-- AAAAAAAAAA 1613 het 750 hom 37 10 6 21 A 16 14 58213 CASAVA_Build 1 198560746 4D CAAATGGCAA ATTG/---- ATTGATCAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 6 ATTG 2 1 58214 CASAVA_Build 1 198564936 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 973 het 973 ref 45 28 3 14 A 13 14 58215 CASAVA_Build 1 198566325 1D ACCCTTTTCT C/- TTTCCCAAGC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 C 1 0 58216 CASAVA_Build 1 198567401 1I ATGTGTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 478 hom 40 2 31 7 T 9 10 58217 CASAVA_Build 1 198571178 2D GTACCACAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 26 0 20 6 A 16 14 58218 CASAVA_Build 1 198577375 1I ACATAAATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 557 hom 31 2 20 9 A 9 10 58219 CASAVA_Build 1 198577457 2I TGTATCTATC --/TA TATATATGTG 3070 hom 54 het 19 0 17 2 TA 3 4 58220 CASAVA_Build 1 198591944 4D CTCCAGCTGT AAAC/---- AGTCCTTCTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 AAAC 1 0 58221 CASAVA_Build 1 198596912 1D GAACTCTCAG T/- TATTGTAGCA 3070 hom 78 het 31 0 24 7 T 2 1 58222 CASAVA_Build 1 198600228 1D AGATTGTGGT A/- AAAAACAATT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 6 5 58223 CASAVA_Build 1 198614568 2I CCTGCAATCA --/GT GTGTTTTCTT 1593 hom 42 het 18 0 15 3 GT 2 3 58224 CASAVA_Build 1 198620140 4D CAATCTATCA ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 hom 129 het 46 0 44 4 ATCT 4 3 58225 CASAVA_Build 1 198620884 1I TGTTTATATT -/A AAAAAAAAAA 896 het 896 ref 25 11 6 8 A 15 16 58226 CASAVA_Build 1 198622886 2D GGACTATAGC TT/-- TTTTTTTTTT 2077 het 267 hom 33 3 8 23 T 20 18 58227 CASAVA_Build 1 198633931 4D ACTCACAATA TACT/---- TACTATCTTT 3070 het 3070 ref 37 16 18 3 TACT 2 1 58228 CASAVA_Build 1 198636863 3I CAAAAAAATA ---/ATT ATTAAGGGTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ATT 1 2 58229 CASAVA_Build 1 198639486 1I CCATGCTTAT -/A ACTTAATATC 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 1 2 58230 CASAVA_Build 1 198641615 1I TCTGTATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 T 13 14 58231 CASAVA_Build 1 198642446 1D TTTTTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 1645 het 1645 ref 39 30 4 5 T 12 11 58232 CASAVA_Build 1 198650385 18D AATAGATGAG TTCCTGAACAAATAAAAT/------------------ TTCCTGAACA 3070 het 3070 hom 31 12 14 10 TTCCTGAACAAATAAAAT 2 1 58233 CASAVA_Build 1 198655310 1D AAAATCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1678 hom 17 6 9 2 T 11 10 58234 CASAVA_Build 1 198662610 1D ACTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1948 het 66 hom 13 1 6 6 A 17 16 58235 CASAVA_Build 1 198679109 4D CTTTTACGAT TGAG/---- TAACAGTCTT 3070 het 2397 hom 15 5 9 1 TGAG 1 0 58236 CASAVA_Build 1 198680916 1I CATCAGTTGA -/T TGGGCATTTG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 1 2 58237 CASAVA_Build 1 198703027 1D GGAATTAGGG A/- AAAAAAAAAA 2425 het 2425 ref 46 28 6 12 A 13 12 58238 CASAVA_Build 1 198713023 5I AATGGAAAAT -----/ATATC ATACACTACA 2719 het 2719 ref 29 14 6 9 ATATC 0 1 58239 CASAVA_Build 1 198717525 1D GGGCATCTGA T/- TTTTTTTTTT 1772 het 1772 ref 49 40 4 6 T 11 10 58240 CASAVA_Build 1 198718046 1I ATTGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 11 12 58241 CASAVA_Build 1 198718113 5D TCTTTCTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 569 hom 25 5 8 13 T 18 13 58242 CASAVA_Build 1 198719748 1D ACTGTAGGCA G/- GCTGCCCACC 3070 het 3070 ref 31 12 13 7 G 2 1 58243 CASAVA_Build 1 198722031 2D TTTCAATAAC AA/-- AGAGTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 23 20 6 A 3 1 58244 CASAVA_Build 1 198727135 1I AGATAATGGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 8 9 58245 CASAVA_Build 1 198747025 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 27 2 24 1 A 13 12 58246 CASAVA_Build 1 198765025 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAACTGC 3070 het 267 hom 40 1 34 5 A 6 7 58247 CASAVA_Build 1 198767433 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1848 het 411 hom 17 1 7 9 T 18 17 58248 CASAVA_Build 1 198791573 4D ATGGGAAAAT AATC/---- AGTCTAATTC 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 AATC 1 0 58249 CASAVA_Build 1 198797317 1D AAAAGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2287 hom 20 6 11 3 A 14 13 58250 CASAVA_Build 1 198799949 1I GGAGCAGAGG -/T GGCAGTGAGC 3070 het 1804 hom 17 5 7 5 T 0 1 58251 CASAVA_Build 1 198813530 4D TATTGTGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3007 hom 25 8 12 5 TTTG 3 2 58252 CASAVA_Build 1 198815368 1D TTCAAAAAAA T/- ATATATATAT 77 het 77 ref 10 5 1 5 T 1 0 58253 CASAVA_Build 1 198825274 19I ACTAAAAATA -------------------/AATATCACTAGTCAAACTT CTTAAGAGTA 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 AATATCACTAGTCAAACTT 0 1 58254 CASAVA_Build 1 198831025 2I TGCAGTACTC --/AT ATAACACTTA 3070 het 3070 hom 45 15 29 1 AT 1 2 58255 CASAVA_Build 1 198842368 4D GGTAGAAGGC TAAA/---- TAAATAGTTA 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 TAAA 2 1 58256 CASAVA_Build 1 198847752 1I GTCCATGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2440 hom 27 10 12 5 T 11 12 58257 CASAVA_Build 1 198850484 1I TTGGGACCCC -/T TCCACGCTGT 3070 hom 50 het 20 0 16 4 T 1 2 58258 CASAVA_Build 1 198855055 2D GCTACACGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2110 hom 27 6 16 5 T 12 10 58259 CASAVA_Build 1 198857125 1I CTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1438 hom 22 6 9 7 T 10 11 58260 CASAVA_Build 1 198859298 1D TCTAATTTTC T/- TTTTTTTATT 692 het 692 ref 10 5 3 2 T 8 7 58261 CASAVA_Build 1 198860042 1I CATTTTTTTT -/G TATCAGGTCT 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 G 0 1 58262 CASAVA_Build 1 198860159 3D AAGTAATCCC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 2955 hom 21 8 10 3 TAT 7 6 58263 CASAVA_Build 1 198863334 1I AGAAGAGGTT -/A AAAAAAATGC 3070 het 2867 hom 30 8 17 5 A 7 8 58264 CASAVA_Build 1 198873363 1I GGTGGCTCAC -/T TAAGGTCAAG 3070 hom 75 het 32 0 24 8 T 1 2 58265 CASAVA_Build 1 198874383 1D AATTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 10 9 T 13 12 58266 CASAVA_Build 1 198877230 12I GCGTGGTGGC ------------/TCATGCCTGTAA TCCCAGCACT 3070 hom 84 het 27 0 29 0 TCATGCCTGTAA 0 1 58267 CASAVA_Build 1 198879494 1D ATAAGTAGCC T/- ATCTTATTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 0 58268 CASAVA_Build 1 198891124 2D CCCCTTACCC CT/-- GTCTGGATTG 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 CT 1 0 58269 CASAVA_Build 1 198907426 2I CTTCTAAGGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 TG 6 7 58270 CASAVA_Build 1 198907677 4D TAGGAGAGAT TATA/---- TATATAAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 TA 5 3 58271 CASAVA_Build 1 198907953 1I6M3D ACACCCCACC -TGTTAGAGA/ATGCCTG--- GAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 9 9 N/A 0 0 58272 CASAVA_Build 1 198908157 1I6M3D ACACCCCACC -TGTTAGAGA/ATGCCTG--- GAATTTTTTT 2851 het 2851 ref 34 25 8 7 N/A 0 0 58273 CASAVA_Build 1 198915265 2I ATATCTGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 AT 5 6 58274 CASAVA_Build 1 198920387 2I ATGTGTGTGT --/GC GTGTGTGTGT 3070 hom 3 het 25 1 14 10 GC 0 1 58275 CASAVA_Build 1 198920697 1D TCTTTCTAGG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 7 58276 CASAVA_Build 1 198922150 1D TTAATACTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 9 58277 CASAVA_Build 1 198923233 9I AAATTAACCA ---------/GGTGTGGTG GGTGTGGTGG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 GGTGTGGTG 1 2 58278 CASAVA_Build 1 198923883 1I GGTTTTTTTT -/C CCCTTAAAAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 C 3 4 58279 CASAVA_Build 1 198924594 1I AGTTAAGAGC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 2368 hom 30 6 16 8 T 7 8 58280 CASAVA_Build 1 198925657 1D ACTAAAATTT A/- AAAAAAATTA 1738 hom 12 het 6 0 5 1 A 8 7 58281 CASAVA_Build 1 198927202 1D CCTTGTCACT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 10 9 58282 CASAVA_Build 1 198928009 1D TGACAGAAAC A/- GGGGAGGAAC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 A 1 0 58283 CASAVA_Build 1 198928098 2D AACTGATGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 31 2 18 11 A 14 12 58284 CASAVA_Build 1 198936652 1I TTTGCTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 T 10 11 58285 CASAVA_Build 1 198948655 1I CTCACTGCAA -/C CTCTGCCTCC 3070 hom 54 het 22 0 17 5 C 1 2 58286 CASAVA_Build 1 198949678 2I ACTCAAACTA --/AC ACACATGAAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AC 2 3 58287 CASAVA_Build 1 198950684 1I CTGCATTGCT -/G GGTGGAGCTC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 G 2 3 58288 CASAVA_Build 1 198952802 10D ACTGATATAT AAAGCAGACA/---------- AAAATTAGAA 3070 het 3070 ref 36 18 17 3 AAAGCAGACA 1 0 58289 CASAVA_Build 1 198957212 2I CTAATTTTTG --/TA TTTTTCCTAG 3070 hom 64 het 25 0 21 4 TA 0 1 58290 CASAVA_Build 1 198957646 3D TAACAGTATT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 8 TTC 3 2 58291 CASAVA_Build 1 198958634 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 12 11 58292 CASAVA_Build 1 198960370 2D TTTGTTTGGG AA/-- AAGTGTGGTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 4 2 58293 CASAVA_Build 1 198979053 3D TCTTCTCAAC TAT/--- TATTCTCCTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 TAT 2 1 58294 CASAVA_Build 1 198985193 3I TCATTGACTC ---/TTG TTGTTTAGTG 3070 het 3070 hom 51 16 31 4 TTG 1 2 58295 CASAVA_Build 1 199010059 1D TCTGTAATAG A/- AAAAAAAAAA 1293 het 1293 ref 40 30 3 9 A 12 11 58296 CASAVA_Build 1 199024395 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 758 hom 25 2 14 9 T 15 14 58297 CASAVA_Build 1 199025548 4I TGAACATGGA ----/CTCT CTCTCCATTT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 CT 2 4 58298 CASAVA_Build 1 199027718 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2605 hom 23 7 12 4 A 11 12 58299 CASAVA_Build 1 199027879 1I AATAGTAAGA -/T TTAGTACTTC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 2 3 58300 CASAVA_Build 1 199039363 3D TTGTAAAGTT AAG/--- AAGTAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 AAG 2 1 58301 CASAVA_Build 1 199039681 1D TCTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 11 10 58302 CASAVA_Build 1 199048056 1I TAAAGAGAAG -/A GATAGTTTAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 0 1 58303 CASAVA_Build 1 199063428 18I TACCTTATTT ------------------/ATATTATTTTTCTAAATA ATATTATTTT 3004 het 3004 ref 23 12 8 3 ATATTATTTTTCTAAATA 0 1 58304 CASAVA_Build 1 199069319 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 A 10 9 58305 CASAVA_Build 1 199071834 1I ATTTGAATCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 C 0 1 58306 CASAVA_Build 1 199079591 1I CTTATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1468 hom 16 6 9 1 T 10 11 58307 CASAVA_Build 1 199081008 1I TTTTTCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 26 0 16 10 T 11 12 58308 CASAVA_Build 1 199083143 2D AGGGTTTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 32 10 13 9 TG 9 8 58309 CASAVA_Build 1 199094170 1I TATTTGTTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 48 14 31 3 T 8 9 58310 CASAVA_Build 1 199100308 4D ATCTCTAAAA AAAT/---- AAATAAATAG 3070 het 3070 ref 31 14 15 5 AAAT 3 2 58311 CASAVA_Build 1 199106407 3I ACTTGCGCGT ---/ACC ACCGTGCCCG 3070 hom 96 het 34 0 31 3 ACC 1 2 58312 CASAVA_Build 1 199113344 1D TATAAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 14 0 10 4 T 12 11 58313 CASAVA_Build 1 199115361 1I ACTCTGCCTG -/A AAAAAAAAAA 1669 het 817 hom 15 4 7 4 A 13 14 58314 CASAVA_Build 1 199155711 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 2906 het 65 hom 17 1 14 3 TTC 1 0 58315 CASAVA_Build 1 199162447 2D AATCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 14 0 11 5 A 14 12 58316 CASAVA_Build 1 199163082 1D CAAGTCATTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 8 58317 CASAVA_Build 1 199172662 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 24 1 13 10 A 16 15 58318 CASAVA_Build 1 199210417 4D TGCCCACACC AGGA/---- AGGAGATGAG 3070 hom 72 het 27 0 24 5 AGGA 2 1 58319 CASAVA_Build 1 199243123 2D ACACACACAC AG/-- AGACAGAGAC 1617 het 1617 ref 64 25 12 27 AG 2 1 58320 CASAVA_Build 1 199275206 1I GGAAGGGACT -/G GGGGAGGGGG 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 G 4 5 58321 CASAVA_Build 1 199293564 1D CAAAAACATA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 21 6 T 6 5 58322 CASAVA_Build 1 199309100 3D ATTGGGAGGT CTG/--- CTGTGCCTCT 3070 hom 122 het 45 0 39 8 CTG 2 1 58323 CASAVA_Build 1 199310469 2D CCTAACCCCA CT/-- CTCCCAGAGC 3070 hom 122 het 45 0 39 9 CT 2 1 58324 CASAVA_Build 1 199315331 2D TTCTGTGTCC TG/-- ACTGAAAATC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TG 1 0 58325 CASAVA_Build 1 199318085 1I GCCTCAGGTA -/T TTTTTTTTAT 2541 het 2302 hom 17 7 7 3 T 8 9 58326 CASAVA_Build 1 199339168 13D AGCTTGGGCA AAGGCTTTCCTCC/------------- AAGGCTTTCC 2401 het 2401 ref 37 15 10 16 AAGGCTTTCCTCC 2 1 58327 CASAVA_Build 1 199347670 3D CTCTTCCTCT TCC/--- TCCTCCTCCT 508 het 508 ref 12 5 4 3 TCC 4 3 58328 CASAVA_Build 1 199347907 1D ATGACGCACA C/- CCCCCCCCAC 625 het 616 hom 16 3 5 8 C 9 8 58329 CASAVA_Build 1 199360308 1D TTCATGGGGG A/- AAAAAAGCCC 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 A 7 6 58330 CASAVA_Build 1 199361890 1I TTAAAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 T 13 14 58331 CASAVA_Build 1 199364542 6D TATGCTCACT CCCCGA/------ CCCCTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 18 1 CCCCGA 1 0 58332 CASAVA_Build 1 199368307 1I GTTCTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 29 3 19 7 T 12 13 58333 CASAVA_Build 1 199370326 3D CTAATCAGGT GAG/--- GAGGACTTCC 3070 het 3070 hom 28 10 12 8 GAG 2 1 58334 CASAVA_Build 1 199370965 1I AGGTGGTGAT -/A AAGAACCACT 3070 het 3027 hom 29 9 18 2 A 2 3 58335 CASAVA_Build 1 199373016 7D CTTCCAGCCT CAGCCTC/------- CCCTAGGCTC 2041 het 2041 ref 25 11 10 6 CAGCCTC 1 0 58336 CASAVA_Build 1 199394304 2D CCCAGGACAA GC/-- GAATGGGAAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 3 GC 1 0 58337 CASAVA_Build 1 199402118 1D ACTATGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 21 6 T 13 12 58338 CASAVA_Build 1 199405776 1D CCGTTTAAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 9 8 58339 CASAVA_Build 1 199426208 1I GGGCAGTGGC -/T TTATGTATCT 3070 hom 143 het 59 0 45 14 T 2 3 58340 CASAVA_Build 1 199453657 1D CCACATCCAT A/- AAGTGGAGAG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 3 2 58341 CASAVA_Build 1 199454816 1I AAGAAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 38 1 31 6 A 10 11 58342 CASAVA_Build 1 199455732 4D CTTTCTTTTT TCTG/---- TCTGTCTGTC 1567 het 1567 ref 25 13 5 7 TCTG 3 2 58343 CASAVA_Build 1 199455812 1I CTTTCTGTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 8 9 58344 CASAVA_Build 1 199455934 2D TCCCTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 32 het 17 0 8 9 TC 10 9 58345 CASAVA_Build 1 199462080 1I TCTGCACCCC -/T GACCTCCGTG 3070 hom 87 het 34 0 24 10 T 0 1 58346 CASAVA_Build 1 199463183 1D TTATTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 1295 het 940 hom 20 4 6 10 T 13 12 58347 CASAVA_Build 1 199465845 1D GAGAGGCAGT G/- GCTGGACACC 3070 het 3070 hom 53 21 23 10 G 2 1 58348 CASAVA_Build 1 199469316 1D AGCTGGGGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 9 8 58349 CASAVA_Build 1 199469813 1I CTCACTTATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 9 10 58350 CASAVA_Build 1 199476668 1D CTAGAGATTT G/- AAGGTATGTA 3070 het 3070 hom 42 21 16 5 G 1 0 58351 CASAVA_Build 1 199483039 1I AATCAGTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 9 10 58352 CASAVA_Build 1 199518236 1D GTAAATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 32 2 21 9 A 15 14 58353 CASAVA_Build 1 199531639 1D GTTTCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 667 hom 41 5 20 16 A 12 11 58354 CASAVA_Build 1 199542599 1D CTACTTTTTG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 8 7 58355 CASAVA_Build 1 199553238 1D TTTTGGTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 97 het 36 0 32 5 A 10 9 58356 CASAVA_Build 1 199554873 3D TTCTTGTGCT ATC/--- ATCTTGAAGA 3070 hom 126 het 48 0 42 7 ATC 2 1 58357 CASAVA_Build 1 199559174 2D TCTGTCCATG CA/-- CACACAATCC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 CA 4 3 58358 CASAVA_Build 1 199560136 1D CATGGTGCCT G/- GGAAGCCACA 3070 hom 69 het 28 0 21 7 G 3 2 58359 CASAVA_Build 1 199576203 1D ATCTTTTGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 T 10 9 58360 CASAVA_Build 1 199582707 1I ACCAGCCCTG -/C CCCCCCCCAG 1921 het 1921 ref 30 9 8 13 C 8 9 58361 CASAVA_Build 1 199602115 1D TATCCCCCAG C/- CCCCCCCAGC 3070 hom 91 het 37 0 25 12 C 8 7 58362 CASAVA_Build 1 199607799 5D GCTTCTGCTC AGAAG/----- AGAAGTCCAG 3070 hom 146 het 53 0 45 9 AGAAG 2 1 58363 CASAVA_Build 1 199610022 1I AATTCCGATT -/A AAAAAATGTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 6 7 58364 CASAVA_Build 1 199632387 1D TTTTGTGGAA C/- CCTGGGGCTC 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 C 3 2 58365 CASAVA_Build 1 199636263 2D CTTCCAGCTC TG/-- AGATCTCACG 3070 hom 111 het 41 0 36 5 TG 1 0 58366 CASAVA_Build 1 199637508 1I CACTATAATC -/A ACAAGTGGCT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 1 2 58367 CASAVA_Build 1 199651327 1D GATATTAGGA C/- CCCCCCCCTT 3070 het 2744 hom 40 13 15 12 C 9 8 58368 CASAVA_Build 1 199674634 1D CTTTAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 10 9 58369 CASAVA_Build 1 199679285 5D AGTGGGGGCC AGGTG/----- GGGTGGGGTG 3070 hom 94 het 34 0 31 6 AGGTG 1 0 58370 CASAVA_Build 1 199685901 2D CAGACCTGAG CT/-- CTGATCCCAG 3070 hom 63 het 23 0 20 7 CT 2 1 58371 CASAVA_Build 1 199687687 2D AGTTCATCAC AT/-- GTCTTTATTA 3070 hom 78 het 28 0 27 3 AT 1 0 58372 CASAVA_Build 1 199689863 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 2563 hom 33 het 22 0 12 10 A 12 13 58373 CASAVA_Build 1 199700557 1I TGTTTTCCCG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 39 0 22 17 T 8 9 58374 CASAVA_Build 1 199713366 3D CCTTCGAGGT GAG/--- GAGATCATGG 3070 hom 129 het 46 0 44 4 GAG 2 1 58375 CASAVA_Build 1 199723184 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 A 9 8 58376 CASAVA_Build 1 199724263 1D GGTTCCCATG A/- AACTTTGTAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 3 2 58377 CASAVA_Build 1 199741258 3D TTCTCTCCTG CTT/--- CTTCTTCCCC 3070 hom 108 het 38 0 35 6 CTT 3 2 58378 CASAVA_Build 1 199762337 1D CAATAAAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 8 58379 CASAVA_Build 1 199763661 1I CGGAAGGCAG -/A GGTTGCAGTG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 0 1 58380 CASAVA_Build 1 199763938 1I ATAATATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 877 hom 17 2 11 4 A 10 11 58381 CASAVA_Build 1 199765808 3D TACAAAGTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 15 12 58382 CASAVA_Build 1 199766522 1I TCAGTCTGGG -/T TTTACTGTAA 3070 hom 74 het 27 0 23 4 T 3 4 58383 CASAVA_Build 1 199779075 1I TTTCTAATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 27 1 24 2 T 9 10 58384 CASAVA_Build 1 199779252 1D TCCCTCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 13 12 58385 CASAVA_Build 1 199788253 1I TGACATTGGG -/C CTCTGACGCA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 C 1 2 58386 CASAVA_Build 1 199792862 3I AGTTTGGTGT ---/CAA CAAGTTGAAG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 CAA 1 2 58387 CASAVA_Build 1 199808744 1D GAGCCCAGCA G/- CCCAAGGTCA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 G 1 0 58388 CASAVA_Build 1 199809063 2I15M2I TCTCCTGATA --TGTGTGTGTGTATGC--/TGTGTGTGTGTGTATGCGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 52 26 19 13 N/A 0 0 58389 CASAVA_Build 1 199812325 1I GACCCTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2949 het 2949 ref 31 13 10 8 A 11 12 58390 CASAVA_Build 1 199821373 1D TAACAATGAC A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 A 8 7 58391 CASAVA_Build 1 199840881 1I TGGCTTCTGC -/T TTTTTTTTTT 1392 het 1392 ref 39 16 6 17 T 15 16 58392 CASAVA_Build 1 199843765 2I TTTTCTTTTT --/TA TATGTTTTGA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 TA 1 2 58393 CASAVA_Build 1 199881442 15I TGGAATGTGT ---------------/CACAGTGAAAATATA CACAGTGAAA 3070 het 3070 hom 38 9 17 12 CACAGTGAAAATATA 0 1 58394 CASAVA_Build 1 199888387 1I AGCTCTGTGA -/C CCCCCTCTGG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 C 5 6 58395 CASAVA_Build 1 199919306 1D GACAGGAGGT G/- GGGCTCAGGC 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 G 4 3 58396 CASAVA_Build 1 199920830 1I GAAATTCGCA -/C CTGGCCAACA 1248 het 1248 ref 13 9 3 1 C 1 2 58397 CASAVA_Build 1 199937179 2D AAATAAAAAA AG/-- AAAAAGAAAA 1495 het 1296 hom 15 3 7 6 AG 1 0 58398 CASAVA_Build 1 199941632 2D TGCCCCCAGC CA/-- CACTGTAGGA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 CA 2 1 58399 CASAVA_Build 1 199944009 2I TTGGGAGAGA --/CT CTTGCATCTG 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 CT 1 2 58400 CASAVA_Build 1 199945913 2D ATTTTTCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2834 hom 39 12 14 13 A 16 14 58401 CASAVA_Build 1 199961402 1I TCCGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 780 hom 20 3 13 4 A 11 12 58402 CASAVA_Build 1 199977266 1D GAAGGGAAGG A/- ACTGTTCATA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 A 2 1 58403 CASAVA_Build 1 199978624 1I TCCTGCAAAG -/C CCCCTGCCCT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 4 5 58404 CASAVA_Build 1 200002283 1D TTCTATTATC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 8 T 8 7 58405 CASAVA_Build 1 200021034 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2854 het 671 hom 31 5 13 13 T 17 16 58406 CASAVA_Build 1 200032379 1D CACCCAGCCC T/- TATAGCTCCA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 T 2 1 58407 CASAVA_Build 1 200039487 1I TTTGGGGGGT -/G GGGAAGTAGG 3070 hom 116 het 47 0 35 12 G 3 4 58408 CASAVA_Build 1 200049424 1I CCTCATATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 908 hom 27 2 21 4 A 11 12 58409 CASAVA_Build 1 200050121 1I AACCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 31 1 24 6 A 11 12 58410 CASAVA_Build 1 200064224 1D TGTTCTCGCA C/- CCCTTAAATG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 C 4 3 58411 CASAVA_Build 1 200068979 2D CCTGGAATGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 26 0 15 11 T 16 14 58412 CASAVA_Build 1 200069941 1I TCGTTAGAGT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 31 het 18 0 11 7 A 7 8 58413 CASAVA_Build 1 200072375 1D TTTATATAGC T/- TTTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 44 25 19 1 T 4 3 58414 CASAVA_Build 1 200083263 6D GTGAAAAAAA TCTTTT/------ TCTTGCTGTA 3070 het 3070 ref 35 19 14 7 TCTTTT 1 0 58415 CASAVA_Build 1 200092421 3D GTTTCAGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 TTG 5 4 58416 CASAVA_Build 1 200102229 1I TTCAGGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 12 13 58417 CASAVA_Build 1 200104059 1I TCAGTTGGGC -/T TTTTTTTTTT 1883 het 1883 ref 30 12 9 9 T 15 16 58418 CASAVA_Build 1 200106683 5D TGGTCCTGAG TTATT/----- TTATTTTACC 3070 hom 120 het 45 0 40 7 TTATT 2 1 58419 CASAVA_Build 1 200117015 4I CTTTTACCTC ----/ACTT AGACCACCTA 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 ACTT 0 1 58420 CASAVA_Build 1 200120701 2I AGAGTGCTCC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 15 8 10 AT 7 8 58421 CASAVA_Build 1 200128526 1D GAGAGGCCAA G/- GGGGGGGGAT 3070 het 974 hom 21 2 14 5 G 9 8 58422 CASAVA_Build 1 200137718 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 28 1 14 13 T 12 11 58423 CASAVA_Build 1 200142639 4D AAATAAATAA ATAT/---- ATAGACAAGT 3070 hom 97 het 35 0 32 3 AT 3 1 58424 CASAVA_Build 1 200153393 1D TTGGGGAGAT A/- AACAAGTCAC 3070 het 3070 hom 43 13 23 9 A 3 2 58425 CASAVA_Build 1 200157711 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 21 2 A 11 10 58426 CASAVA_Build 1 200184757 1D GCTATAATTA T/- TTATTTACTC 2552 het 2552 ref 17 8 6 4 T 3 2 58427 CASAVA_Build 1 200186414 15D ACTCGTCTCT AAAACAAAACAAAAC/--------------- AAAACAAAAC 3070 hom 27 het 27 0 10 22 AAAAC 7 4 58428 CASAVA_Build 1 200193010 1I AAATATGGTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 8 9 58429 CASAVA_Build 1 200209353 2D TCTCAAAAAC AG/-- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 AG 1 0 58430 CASAVA_Build 1 200210058 5D CATGCTGCCT TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 41 13 14 14 TTTTC 4 3 58431 CASAVA_Build 1 200211292 1D GCCTCGGCCT C/- CCAAAATGCT 2652 het 2652 ref 15 9 6 1 C 3 2 58432 CASAVA_Build 1 200211778 4D GTTTCTTGAA TCTC/---- TATTCTGTCC 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 TC 2 0 58433 CASAVA_Build 1 200217914 4D TGAGTGTGTT AGAC/---- AGGTTACCTG 3070 hom 117 het 43 0 38 8 AGAC 1 0 58434 CASAVA_Build 1 200219064 3I GCCTGGTTTC ---/CTT CTTCTGGACT 3070 hom 36 het 18 0 9 9 CTT 1 2 58435 CASAVA_Build 1 200220365 3D ACCCTGTTTT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 AAC 4 3 58436 CASAVA_Build 1 200220573 12D TATTTCTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 27 1 19 9 T 36 24 58437 CASAVA_Build 1 200221998 8D CAGTTTTTTG TTTTTTAT/-------- TTTTTTATTT 3070 hom 45 het 24 0 16 8 TTTTTTAT 2 1 58438 CASAVA_Build 1 200231259 1D CATAGCGAAA C/- CCTACCTCTA 3070 het 3070 hom 31 8 16 7 C 3 2 58439 CASAVA_Build 1 200232919 1D TGAGGAGCCT G/- GGCTTTATTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 G 3 2 58440 CASAVA_Build 1 200237610 1I ATGGGAAAAC -/A ACTGGGTCAG 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 A 1 2 58441 CASAVA_Build 1 200241793 4D TTTTTCTCTT TCTG/---- TCCTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 TCTG 1 0 58442 CASAVA_Build 1 200252272 1D CTTGTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2884 het 2884 ref 33 13 9 11 A 15 14 58443 CASAVA_Build 1 200254786 2I GAACCAAAGT --/CA CACACACACT 3070 het 3070 ref 52 26 18 8 CA 4 5 58444 CASAVA_Build 1 200260242 1D TCTTTACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 768 hom 15 2 9 4 T 12 11 58445 CASAVA_Build 1 200261028 1D TTTGGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 A 12 11 58446 CASAVA_Build 1 200271796 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2634 het 10 hom 14 1 8 6 T 18 17 58447 CASAVA_Build 1 200272795 1D TATGGAGTAC T/- GTGCTAGATA 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 1 0 58448 CASAVA_Build 1 200279071 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1944 het 1944 ref 26 14 9 3 A 11 12 58449 CASAVA_Build 1 200280570 1I CCTCTTCACT -/G TCCTCCTAAT 3070 hom 93 het 37 0 29 8 G 0 1 58450 CASAVA_Build 1 200289104 1D TTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 1323 het 1323 ref 27 16 8 4 A 16 15 58451 CASAVA_Build 1 200318684 8D TTTGTTTGTG TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 2980 het 2980 ref 24 9 7 8 TGTT 6 4 58452 CASAVA_Build 1 200324013 1D GGCAGCTAGG A/- AGACAGGACA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 2 1 58453 CASAVA_Build 1 200324600 4I CACTTTGGGC ----/TAGA TACTCAGTTA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 TAGA 0 1 58454 CASAVA_Build 1 200326082 1I TTCTTCATGG -/T CTAGGACACA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 0 1 58455 CASAVA_Build 1 200327347 3D GCTCAGGCAA TCC/--- TCCTGCCTCA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TCC 2 1 58456 CASAVA_Build 1 200328391 1I GCTTTTACTC -/T TTACTTAATA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 2 3 58457 CASAVA_Build 1 200329229 4D GTACAGAGAC AGAG/---- GGAGGGAGGC 2011 het 2011 ref 18 11 7 0 AG 2 0 58458 CASAVA_Build 1 200332735 1I ACTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 10 5 T 10 11 58459 CASAVA_Build 1 200336426 1I TCTGTCACCC -/A GGCTGGAATA 3070 hom 63 het 22 0 21 1 A 0 1 58460 CASAVA_Build 1 200350915 1D TTTTTTTTTC G/- CCCCCTGAAA 699 het 699 ref 28 12 5 13 G 1 0 58461 CASAVA_Build 1 200358115 1I TGGGCAACCG -/A AAAAAAAAAA 2742 hom 11 het 14 0 10 4 A 15 16 58462 CASAVA_Build 1 200387277 1I TGGTATTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 9 10 58463 CASAVA_Build 1 200399875 1D GGGCCAGCTA G/- GGACCTCCTG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 3 2 58464 CASAVA_Build 1 200403141 1I CTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2019 hom 21 het 8 0 8 0 T 10 11 58465 CASAVA_Build 1 200405881 1I ACTGGCGGGG -/C CGGGGGGGTG 2613 hom 48 het 23 0 13 10 C 1 2 58466 CASAVA_Build 1 200407423 10D AAACATCTCT GTGCCACCTG/---------- GTGCCACCCA 3070 hom 48 het 18 0 16 5 GTGCCACCTG 1 0 58467 CASAVA_Build 1 200413219 8I CTGAGGACTG --------/GGGCTGGC GGGCTGGCGG 3070 hom 47 het 24 0 17 8 GGGCTGGC 1 2 58468 CASAVA_Build 1 200417159 1D AGGGAAGGGA G/- GTGGGGTCTT 3070 hom 78 het 33 0 25 8 G 2 1 58469 CASAVA_Build 1 200421516 1D CTCAGCCACC A/- CCCAGGGAAG 3070 hom 87 het 35 0 27 10 A 1 0 58470 CASAVA_Build 1 200430928 3D TGGGAAAGCC TGG/--- TGGGGCCTTC 3070 hom 41 het 15 0 13 2 TGG 2 1 58471 CASAVA_Build 1 200433368 1I CTTTCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 883 hom 32 6 13 13 A 13 14 58472 CASAVA_Build 1 200453217 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAACCCC 3070 het 3070 hom 42 21 19 2 A 6 7 58473 CASAVA_Build 1 200456194 4I GGTCTTGAAC ----/AGGA TCCTGACCTC 3070 het 1854 hom 15 4 8 3 AGGA 0 1 58474 CASAVA_Build 1 200456480 2I CTGTGGGGAC --/AG GGGGTTCTGG 3070 hom 120 het 44 0 36 8 AG 0 1 58475 CASAVA_Build 1 200457698 8D AGTAGGAACC ACCAACAT/-------- ACCAACATGA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 ACCAACAT 2 1 58476 CASAVA_Build 1 200458852 1D AACTCTGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 64 het 26 0 22 4 A 9 8 58477 CASAVA_Build 1 200459599 1I ACAGGCCTGT -/G GAAAAGGCAC 1000 hom 11 het 8 0 4 4 G 1 2 58478 CASAVA_Build 1 200461132 1D GATGGCCCAA G/- TGGGGAGTTC 3070 het 2639 hom 24 8 12 4 G 1 0 58479 CASAVA_Build 1 200461462 3D TAGCTTTCAT TCC/--- TCTTTGAAAC 3070 het 3070 ref 43 27 10 7 TCC 1 0 58480 CASAVA_Build 1 200467353 1D TTTTCTCACC T/- TTTAAAGTGG 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 4 3 58481 CASAVA_Build 1 200468423 1I AAAAAATGTT -/A AAAACCTTGT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 4 5 58482 CASAVA_Build 1 200487631 2D GAAAGGGGAA AG/-- AGAGAGAAGA 2579 het 2579 ref 24 9 8 7 AG 4 3 58483 CASAVA_Build 1 200490651 7D CTGTCTCTAC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAG 3070 het 1882 hom 34 11 17 11 A 16 9 58484 CASAVA_Build 1 200528860 4D TGGCTGGCAC ACAG/---- ACAGTGCTCA 3070 het 3070 ref 46 26 15 6 ACAG 2 1 58485 CASAVA_Build 1 200551365 1I GAATGAACAG -/A AAGTGATGAA 3070 het 3070 ref 58 28 26 4 A 2 3 58486 CASAVA_Build 1 200553091 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 10 11 58487 CASAVA_Build 1 200587062 4D CTCAGCTCAC TGCA/---- TGCAACCTCC 3070 hom 125 het 43 0 40 3 TGCA 2 1 58488 CASAVA_Build 1 200588644 6I GTTTCAAAAA ------/AAAAAG AAAAAGAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 AAAAAG 1 2 58489 CASAVA_Build 1 200601188 1I TCTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1097 het 1097 ref 29 20 3 6 A 11 12 58490 CASAVA_Build 1 200609415 1I GATATCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 10 11 58491 CASAVA_Build 1 200626414 1D CACATCCAGC T/- TTTTTTTTTT 2058 het 1493 hom 27 6 7 14 T 17 16 58492 CASAVA_Build 1 200637298 5D TCACAGTATA TTTTG/----- TTTTATTAAT 3070 het 3070 ref 39 24 12 4 TTTTG 1 0 58493 CASAVA_Build 1 200644050 2D AAAATGCCTC AT/-- GTGAGAACCA 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 AT 1 0 58494 CASAVA_Build 1 200654224 1D TTATAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 12 11 58495 CASAVA_Build 1 200663723 1D ATTAAACTAA T/- TTTTTTTTTT 2024 het 1717 hom 16 6 6 4 T 15 14 58496 CASAVA_Build 1 200663803 1I TCAAGTGATT -/C CCCAGCCTTG 3070 hom 74 het 27 0 25 2 C 3 4 58497 CASAVA_Build 1 200666213 1I GAATCTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 T 10 11 58498 CASAVA_Build 1 200689459 1D ATAAAGACAC T/- TTTTTTTTTT 2800 het 2800 ref 35 12 10 13 T 14 13 58499 CASAVA_Build 1 200690957 4D ATATATATAT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 AG 8 6 58500 CASAVA_Build 1 200694154 5D CCATCTAGTA GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 25 17 7 3 GTTTT 3 2 58501 CASAVA_Build 1 200717302 1I ATAAAAAAAA -/T ATTGATGTTA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 0 1 58502 CASAVA_Build 1 200744959 2I GCCAATTCCC --/CT GATTCTTTGT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 CT 0 1 58503 CASAVA_Build 1 200751048 4D AAAATAAAAG TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 TGTT 3 2 58504 CASAVA_Build 1 200753382 1D ATGAGGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2669 hom 31 9 10 12 T 13 12 58505 CASAVA_Build 1 200765057 1D GTTATTATTG A/- AAAAAAAAAA 1437 het 1437 ref 26 15 4 7 A 15 14 58506 CASAVA_Build 1 200776981 1I CTAGTGTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2551 hom 33 10 17 6 T 9 10 58507 CASAVA_Build 1 200782790 2D TTCAGTTCTC AA/-- AGGATTCAGA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 3 1 58508 CASAVA_Build 1 200787279 1I58M1I AATTAAACCA -TTTTTTTTTTAAGGGAGATCCTTGTGATAGTTGGAATTTCTAAAATGCCTCCCCAAAA-/TTTTTTTTTTTAAGGGAGATCCTTGTGATAGTTGGAATTTCTAAAATGCCTCCCCAAAAG GTCCTCACCT 3070 het 3070 ref 34 24 8 20 N/A 0 0 58509 CASAVA_Build 1 200823256 4I ATCCTGAGAC ----/TGTT TGTTTATAGC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 TGTT 1 2 58510 CASAVA_Build 1 200823783 4I AAGGAAAGAA ----/TGTT TGTTTCACCC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 TGTT 1 2 58511 CASAVA_Build 1 200832371 4D AAAAAGAGAA AAAC/---- AAGGAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 18 11 1 AAAC 1 0 58512 CASAVA_Build 1 200838729 2D CCCCACTCTG CC/-- CCCCCACAGC 3070 het 2002 hom 26 7 10 9 C 7 5 58513 CASAVA_Build 1 200843633 1I CTCTGTGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 13 7 T 10 11 58514 CASAVA_Build 1 200860858 20D TATGTGTGTG GTGTGTGTGGTATGTGTGTC/-------------------- GTGTGTGTGG 3070 hom 248 het 97 0 64 53 GTGTGTGTGGTATGTGTGTC 1 0 58515 CASAVA_Build 1 200891878 2D CTTTGGAACG CA/-- CACACACACA 3070 hom 106 het 47 0 36 13 CA 9 8 58516 CASAVA_Build 1 200894427 1D TTTTTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 17 11 T 13 12 58517 CASAVA_Build 1 200910662 22I AATCTCAATG ----------------------/TCTCCTCTTTATGAGAGGTCAC TCATGATCTC 3070 hom 71 het 22 0 22 5 TCTCCTCTTTATGAGAGGTCAC 0 1 58518 CASAVA_Build 1 200914164 1D CAGATTTAGC G/- TCTGTGATTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 0 58519 CASAVA_Build 1 200920098 1I TTTATTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 920 hom 40 3 28 9 T 11 12 58520 CASAVA_Build 1 200944843 1D CTGGCTTCCT G/- GGCGCCCCCA 3070 hom 83 het 31 0 25 6 G 3 2 58521 CASAVA_Build 1 200947128 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 465 het 465 ref 29 23 2 4 T 10 9 58522 CASAVA_Build 1 200947887 3I ACAATGGACT ---/AAG AATGAGACCT 3070 hom 95 het 36 0 30 6 AAG 0 1 58523 CASAVA_Build 1 200951817 8D AAGAAAAAGA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 93 het 35 0 31 8 AAAC 5 3 58524 CASAVA_Build 1 200952541 11I GGAATCTAAG -----------/TATGGGAGCAA CATAATCCAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TATGGGAGCAA 0 1 58525 CASAVA_Build 1 200960226 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 11 12 58526 CASAVA_Build 1 200970104 1D TGGGTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 218 hom 32 2 22 9 A 15 14 58527 CASAVA_Build 1 200975193 1D AATATTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 16 0 10 6 T 12 11 58528 CASAVA_Build 1 200977689 1I TCACTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 30 0 25 5 T 13 14 58529 CASAVA_Build 1 200981868 1I TTTCCATAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 8 9 58530 CASAVA_Build 1 200985363 7I GCCTAGGCCC -------/TAGGCCT TATTTATCTT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 TAGGCCT 0 1 58531 CASAVA_Build 1 200989306 4I CCCTTCAAGT ----/ATGA ATGAACAGAA 3070 hom 77 het 32 0 25 7 ATGA 1 2 58532 CASAVA_Build 1 200992848 1D GCTGGGAGGT G/- GGGGGGGGAT 3070 hom 67 het 28 0 24 4 G 9 8 58533 CASAVA_Build 1 200995958 2D CCAGCTACGT GG/-- GGGGGGCTGA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 G 8 6 58534 CASAVA_Build 1 200998610 5I TCTCCACTTC -----/CTCAA CTCATCATCT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 CTCAA 0 1 58535 CASAVA_Build 1 201000991 2D ATTATAAACT AC/-- ACACTTCTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 8 AC 3 2 58536 CASAVA_Build 1 201010816 1D CATGATGAAA C/- CCCCCATCTC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 6 5 58537 CASAVA_Build 1 201011279 2D CAGTGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 CT 2 1 58538 CASAVA_Build 1 201017759 7D GAATATATAC ACAATAT/------- ACTTATTTTA 3070 hom 117 het 40 0 40 4 ACAATAT 1 0 58539 CASAVA_Build 1 201021235 2I CCTGGTACTA --/CT CTGTGCGGCT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 CT 1 2 58540 CASAVA_Build 1 201021341 5I TCAGACAACA -----/TTTAC TTTACTTTAT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 TTTAC 1 2 58541 CASAVA_Build 1 201021918 1I GACCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 353 het 126 hom 12 1 3 8 T 11 12 58542 CASAVA_Build 1 201031014 4I ATGAATGTAG ----/TCTC TCTTTCTCTC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TC 1 3 58543 CASAVA_Build 1 201031541 1D CCTAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 23 3 T 11 10 58544 CASAVA_Build 1 201035409 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 486 hom 18 2 12 4 A 13 14 58545 CASAVA_Build 1 201037019 1D TTAAATGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 38 1 31 7 A 11 10 58546 CASAVA_Build 1 201037386 17I TTTTATTTAC -----------------/AATTTTATTTAAAATTA AATTTTCATT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AATTTTATTTAAAATTA 0 1 58547 CASAVA_Build 1 201040006 1D AATAAAAGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 10 9 58548 CASAVA_Build 1 201071727 1I TTGAGACCCC -/G GTCCCCTCCC 2304 hom 36 het 15 0 10 5 G 1 2 58549 CASAVA_Build 1 201073086 1I AATCTTTCTC -/A AGAGAAGCCT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 1 2 58550 CASAVA_Build 1 201076480 2D TATTAATTAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 19 0 14 5 T 11 9 58551 CASAVA_Build 1 201077500 1D GGTGGCTCAC G/- GCCTGTAATC 3070 hom 40 het 18 0 12 6 G 2 1 58552 CASAVA_Build 1 201094211 3D CATCCTACGT GGG/--- GGGGGCCTAT 3070 hom 108 het 40 0 36 7 G 8 5 58553 CASAVA_Build 1 201108173 7I CCTCACAGCA -------/GCAGAGG GCAGAGGCCT 3070 hom 88 het 35 0 27 8 GCAGAGG 1 2 58554 CASAVA_Build 1 201118431 4I CCACTCCTAC ----/TTGT TTGTTTATTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TTGT 1 2 58555 CASAVA_Build 1 201119964 6I AGCACCCTTT ------/TAAAAA TAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TAAAAA 1 2 58556 CASAVA_Build 1 201120838 18D ACTCTATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 13 0 12 5 A 27 9 58557 CASAVA_Build 1 201122497 7D TTCTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTGA 3070 hom 46 het 18 0 15 3 T 15 8 58558 CASAVA_Build 1 201128087 3D CCTGGAATAT CTG/--- TTACCCACCC 3070 hom 90 het 34 0 31 6 CTG 1 0 58559 CASAVA_Build 1 201136670 1D GTGGTGTGCA T/- TTTGTAGTCC 3070 hom 29 het 13 0 10 3 T 4 3 58560 CASAVA_Build 1 201139212 1I TGCATTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 28 0 26 2 T 10 11 58561 CASAVA_Build 1 201140121 1D TTTGTATATG A/- TTTTTTTATT 3070 hom 102 het 43 0 35 9 A 1 0 58562 CASAVA_Build 1 201147162 1D AATTTGGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 10 9 58563 CASAVA_Build 1 201147208 4D TATATATGTA TCTC/---- TCTCTCTCTC 1688 hom 30 het 25 0 11 15 TC 11 9 58564 CASAVA_Build 1 201153206 3I ACAAGCAGTT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CTC 0 1 58565 CASAVA_Build 1 201158034 1I AAGAGATAAA -/G GGGGGGCCGG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 G 6 7 58566 CASAVA_Build 1 201159626 4I AAAAAACAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AAAC 2 3 58567 CASAVA_Build 1 201167438 1D TATTTTGCCC A/- ACTTTTATTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 2 1 58568 CASAVA_Build 1 201167630 1D TCTGTTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 62 het 27 0 21 7 A 10 9 58569 CASAVA_Build 1 201176120 2I CCACCACCAC --/AT GAGGCTAATT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 AT 0 1 58570 CASAVA_Build 1 201212163 5I GCATGTGCCA -----/CCACG CCTGGCTAAT 3070 hom 18 het 7 0 7 1 CCACG 0 1 58571 CASAVA_Build 1 201212338 1D TTTGTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 22 8 T 12 11 58572 CASAVA_Build 1 201228379 3I TGTATAAAAC ---/TAT TATAGCATTA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TAT 1 2 58573 CASAVA_Build 1 201229553 1D CCCCGAGTTT C/- TTTTTTTAAT 3070 hom 53 het 24 0 18 6 C 1 0 58574 CASAVA_Build 1 201229986 12D TCTAGTCTAC TTCTTTTATTTT/------------ TTCTTTTATT 3070 hom 27 het 14 0 9 5 TTCTTTTATTTT 2 1 58575 CASAVA_Build 1 201231161 1I AGAGAGTATT -/A ATGAACAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 58576 CASAVA_Build 1 201232244 2I2M10D ATGTGACTTG --TACAATGAAAAC/GCTA---------- TACAAAATAT 3070 hom 93 het 34 0 32 4 N/A 0 0 58577 CASAVA_Build 1 201236324 5I ATTATTTTTG -----/TTTGC TTTGTTTTTA 3070 hom 79 het 30 0 27 3 TTTGC 0 1 58578 CASAVA_Build 1 201239268 1D TAAATAACAA C/- CTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 20 0 17 3 C 2 1 58579 CASAVA_Build 1 201240257 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 19 1 12 6 A 15 14 58580 CASAVA_Build 1 201244205 2D ATTGCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 174 hom 33 3 16 16 T 18 16 58581 CASAVA_Build 1 201247621 1D CAGACTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 21 1 14 6 T 15 14 58582 CASAVA_Build 1 201260238 1D CACATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 48 1 30 17 T 13 12 58583 CASAVA_Build 1 201271251 1I CAATCCCCCA -/C CCCCCACACA 3070 hom 100 het 39 0 26 13 C 5 6 58584 CASAVA_Build 1 201271554 3I50M1D GTTTCTGTGT ---AGCAGAGAGGACAGGGGCAGGAGGTCCTGGACAGTCATCTCAGGGGCATCT/AGCAGCAGAGAGGACAGGGGCAGGAGGTCCTGGACAGTCATCTCAGGGGCATC- TGCCTGGCAG 3070 het 1943 hom 25 7 11 19 N/A 0 0 58585 CASAVA_Build 1 201278528 2D GCTGGAATTA CC/-- CAGGTGTGCG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 3 1 58586 CASAVA_Build 1 201287740 2I CTTCCCTCCC --/CT GTGTCAATGA 2422 het 2422 ref 26 10 7 9 CT 0 1 58587 CASAVA_Build 1 201289864 2I AGGCCCGCTG --/GC CCAGTGCCGG 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 GC 0 1 58588 CASAVA_Build 1 201291720 3D CTAGGCCAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 559 hom 26 4 11 11 T 14 11 58589 CASAVA_Build 1 201298315 3I TGCGAGCTGT ---/GAA GAAGAATGAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 GAA 2 3 58590 CASAVA_Build 1 201304098 1D GTCAGAGAGC A/- GGGTGGACTG 3070 hom 60 het 26 0 19 7 A 1 0 58591 CASAVA_Build 1 201305856 5D AAATGGACTT TTCTC/----- TTTCTTTGAT 3070 hom 117 het 42 0 39 4 TTCTC 1 0 58592 CASAVA_Build 1 201306507 6D GCAGGCTTCC TAATTT/------ TAAGTTTTTG 3070 hom 54 het 21 0 19 4 TAATTT 1 0 58593 CASAVA_Build 1 201306707 1D CACTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 39 1 29 10 T 12 11 58594 CASAVA_Build 1 201309314 7I CTGTCTAGCA -------/CATCATC CATCATCAGC 3070 hom 143 het 54 0 44 10 CATCATC 1 2 58595 CASAVA_Build 1 201310201 4I CTGACTGAAA ----/CATT CATTATGTGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CATT 1 2 58596 CASAVA_Build 1 201316837 1D CAACATTTGA T/- TAATACAGTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 2 1 58597 CASAVA_Build 1 201350782 1D TTCTGTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 42 0 36 6 T 11 10 58598 CASAVA_Build 1 201351432 5D ACACACACAC TTATA/----- TTATGCAAAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TTATA 1 0 58599 CASAVA_Build 1 201369829 1I TGGAGTGTCT -/A AAGAGGGAAG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 2 3 58600 CASAVA_Build 1 201386552 15D TCCTGTCTTC TCTGTCCTCCCCCTA/--------------- TCTGCTGTCT 3070 het 3070 ref 42 24 16 5 TCTGTCCTCCCCCTA 1 0 58601 CASAVA_Build 1 201388333 19D ATGGGATGGT TTTTTCCTGTCCCACGGGA/------------------- TGAGTCAGAA 3070 het 3070 ref 45 29 16 3 TTTTTCCTGTCCCACGGGA 1 0 58602 CASAVA_Build 1 201402464 1D GGGAGGAGCC T/- TGGAGTGTAA 3070 hom 87 het 34 0 26 8 T 2 1 58603 CASAVA_Build 1 201404408 2I CCTCCCGTGA --/CT CTTCAGTGTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 CT 1 2 58604 CASAVA_Build 1 201426094 1I TTTGAAGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 83 het 38 0 31 7 A 9 10 58605 CASAVA_Build 1 201431791 2D TGTTAGCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 33 5 14 14 A 15 13 58606 CASAVA_Build 1 201444238 1D TGAAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 11 10 58607 CASAVA_Build 1 201449949 5D GTGTCCAGCT GGACA/----- CCAGGCCTGC 3070 hom 99 het 35 0 33 3 GGACA 1 0 58608 CASAVA_Build 1 201459072 1D CCCCTGTGAG C/- CCCAGGTAGA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 C 4 3 58609 CASAVA_Build 1 201461168 3I AAGGGGCTTC ---/ATT ATGGGAGACA 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 ATT 0 1 58610 CASAVA_Build 1 201481179 8I TTAAGAGAAT --------/AAAAAGAC AAGCCACAGA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 AAAAAGAC 0 1 58611 CASAVA_Build 1 201489307 1D AAGCTGATAA C/- AACTTAGCTT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 C 1 0 58612 CASAVA_Build 1 201489546 1I TAATATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1210 hom 23 5 13 5 T 13 14 58613 CASAVA_Build 1 201490997 1I TGCTACTCAG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 7 8 58614 CASAVA_Build 1 201506018 1D AGTCCAACCT C/- TTCCCTGTGA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 1 0 58615 CASAVA_Build 1 201512136 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1217 het 114 hom 17 3 6 8 A 18 16 58616 CASAVA_Build 1 201521358 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 9 10 58617 CASAVA_Build 1 201524847 1I GACCCTGCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 36 0 23 13 A 10 11 58618 CASAVA_Build 1 201530417 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 9 10 58619 CASAVA_Build 1 201543868 1D GGTTTTCTGA G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 101 het 40 0 33 7 G 8 7 58620 CASAVA_Build 1 201551887 1I CAACATAGTG -/A AGACGACATC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 1 2 58621 CASAVA_Build 1 201558247 1I TGTGAAATCA -/T TTGCCATTCA 3070 hom 132 het 47 0 44 3 T 2 3 58622 CASAVA_Build 1 201567978 1D AATTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 T 15 14 58623 CASAVA_Build 1 201570077 1I ATCAAGGGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 117 het 45 0 38 7 A 8 9 58624 CASAVA_Build 1 201576219 1I TACAAGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 30 1 25 4 T 10 11 58625 CASAVA_Build 1 201582248 1I GGAGGCAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 50 2 37 11 T 11 12 58626 CASAVA_Build 1 201592410 1I CCTCATTCAT -/A AAATGGGGAC 3070 hom 148 het 56 0 50 6 A 3 4 58627 CASAVA_Build 1 201604297 1I AAGAGCAGGA -/G GGGCCAGGAG 3070 het 3070 hom 39 11 23 5 G 3 4 58628 CASAVA_Build 1 201608870 1D TTATGTGAGC A/- AAAAATACCT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 6 5 58629 CASAVA_Build 1 201629708 1I AAATATAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 11 1 9 1 A 0 1 58630 CASAVA_Build 1 201632815 3D TATTTTTAAG CAA/--- CAACAACAGC 3070 hom 68 het 30 0 22 8 CAA 3 2 58631 CASAVA_Build 1 201635249 1D TCTTTTTTAG T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 T 7 6 58632 CASAVA_Build 1 201641239 8I6M16I GGGCTCCTGC --------TACTGG----------------/AGATGCCTCACTGGTCAGAGCTGTGTCACA AAGCTACTCC 3070 hom 117 het 40 0 39 6 N/A 0 0 58633 CASAVA_Build 1 201643678 2D TTAAATAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 14 9 T 12 10 58634 CASAVA_Build 1 201648988 4I AAGCCCATCA ----/GACT AACAGCAGAT 3070 hom 21 het 8 0 7 1 GACT 0 1 58635 CASAVA_Build 1 201662901 1D AAGATCAATT C/- CCCCCACACT 3070 hom 96 het 34 0 33 3 C 6 5 58636 CASAVA_Build 1 201667501 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1235 het 1235 ref 10 6 3 1 T 13 14 58637 CASAVA_Build 1 201759965 1D AAAATGCATT G/- CTAATTTTTT 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 G 1 0 58638 CASAVA_Build 1 201788568 4D GTAAAGGAGG GTGA/---- GTGTTTGTAA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 GTGA 1 0 58639 CASAVA_Build 1 201796200 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTTTTGT 3070 het 538 hom 25 2 20 3 A 2 3 58640 CASAVA_Build 1 201799624 2D TTTTGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1557 hom 33 9 17 7 T 13 11 58641 CASAVA_Build 1 201800595 2D TTTTCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1409 hom 36 7 17 12 T 16 14 58642 CASAVA_Build 1 201805653 2I TCTCTCTCCC --/CT GAGTCACCAT 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 CT 0 1 58643 CASAVA_Build 1 201811068 1I GCTGGTTCTG -/C CCCCTCACCA 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 C 4 5 58644 CASAVA_Build 1 201812146 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 8 13 A 11 10 58645 CASAVA_Build 1 201815417 4I CCACATTCAC ----/TTTA TTTATTTGTT 3070 hom 42 het 31 1 26 4 TTTA 1 2 58646 CASAVA_Build 1 201818302 1D TTTACATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 38 1 23 15 T 11 10 58647 CASAVA_Build 1 201849006 1I AAAAGGCAAC -/T TTTTTTTTTT 3065 het 3065 ref 40 22 9 9 T 10 11 58648 CASAVA_Build 1 201854593 2I TGAACCAAAC --/TT GCGTTAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 0 2 58649 CASAVA_Build 1 201855418 3D7M6D CTGCTGCTGC TATTGCTGCTGAAACA/---CGCTGCT------ GCTGCTGATA 328 het 328 ref 32 22 2 14 N/A 0 0 58650 CASAVA_Build 1 201860152 5D AAGGGAGAAA GGAAG/----- GGAAGGGAAG 3070 het 2105 hom 26 7 10 11 GGAAG 4 3 58651 CASAVA_Build 1 201881820 1I GAATATTTAC -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 58652 CASAVA_Build 1 201881998 1I AGTAAGGCTC -/A AAGAGATAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 2 3 58653 CASAVA_Build 1 201883188 1I ACTTCTCTCT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 35 het 17 0 13 4 A 8 9 58654 CASAVA_Build 1 201890668 1I AAAGAAAAAG -/A ATATTCATGA 3070 hom 33 het 17 0 12 5 A 1 2 58655 CASAVA_Build 1 201891818 3D CGCCCAGCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 27 1 17 10 T 15 12 58656 CASAVA_Build 1 201902077 3I TTACAATGTT ---/CTC CTCCATCTGG 3070 hom 105 het 38 0 34 4 CTC 1 2 58657 CASAVA_Build 1 201905920 2D TGAGTTCATA CT/-- CTTTTTTATT 2444 hom 39 het 30 0 13 17 CT 2 1 58658 CASAVA_Build 1 201917784 1I GCTTAGCCTC -/A AGAACAAAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 58659 CASAVA_Build 1 201918355 1I GCTCAGGCCT -/C AGCTATCAGT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 C 0 1 58660 CASAVA_Build 1 201921292 2D GCCTAGACTC TT/-- TAGGATGAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 3 1 58661 CASAVA_Build 1 201924225 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 182 hom 25 1 20 4 T 9 10 58662 CASAVA_Build 1 201934201 1D GTTATAGCTT A/- AAACATTTCC 2353 het 2353 ref 24 12 8 4 A 4 3 58663 CASAVA_Build 1 201950495 1I AATACCAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 9 10 58664 CASAVA_Build 1 201955077 6I TCCACCCTCA ------/TTGCCT TTGCCTTTGC 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 TTGCCT 2 3 58665 CASAVA_Build 1 201960342 1I ATTTTGCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 10 11 58666 CASAVA_Build 1 201962177 1D TGAAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 33 2 18 13 T 15 14 58667 CASAVA_Build 1 201964611 1D TCTGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 21 0 15 7 A 11 10 58668 CASAVA_Build 1 201977543 1I TCAATAATTC -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 T 6 7 58669 CASAVA_Build 1 201987141 1D ATATGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 9 13 T 13 12 58670 CASAVA_Build 1 201999609 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1754 hom 29 6 13 10 T 12 13 58671 CASAVA_Build 1 202003714 1D TGTCTCAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 12 11 58672 CASAVA_Build 1 202015012 2I CACTGCTCAT --/TA TATATGCTCA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 TA 2 3 58673 CASAVA_Build 1 202016990 1D GACTACACAT A/- AAATATGCTA 2745 het 2745 ref 16 7 6 3 A 4 3 58674 CASAVA_Build 1 202018985 1I GAGGAAGTGG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 2182 hom 16 5 8 3 A 7 8 58675 CASAVA_Build 1 202022326 1D ATTACCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1966 hom 29 11 14 4 T 13 12 58676 CASAVA_Build 1 202023164 1I ACTCCGTATC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 8 9 58677 CASAVA_Build 1 202025336 2D CTTCTCACAC AT/-- GTCAGACAGC 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 AT 1 0 58678 CASAVA_Build 1 202026056 2I TTAAAAGCCC --/TG TGTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 TG 1 2 58679 CASAVA_Build 1 202028041 2D CCAGCCACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3033 het 2801 hom 32 16 13 3 T 16 14 58680 CASAVA_Build 1 202037569 2D TTGGTTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 33 5 16 12 T 14 12 58681 CASAVA_Build 1 202049723 1D TACATTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 16 9 T 12 11 58682 CASAVA_Build 1 202058839 1D ATGAAAAGTC A/- ATGTTGTAAC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 2 1 58683 CASAVA_Build 1 202063787 5D CCTGCTTCTC TAAAT/----- TAAGTGTAGA 3070 het 3070 hom 42 18 23 2 TAAAT 1 0 58684 CASAVA_Build 1 202073042 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 20 1 17 2 A 14 15 58685 CASAVA_Build 1 202074706 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 34 7 14 13 A 21 20 58686 CASAVA_Build 1 202075924 1I TCCTGACCTC -/A AAGTGATCAG 3070 het 3026 hom 19 7 8 4 A 2 3 58687 CASAVA_Build 1 202078676 1I GCCTTCCGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 928 hom 23 2 14 7 T 11 12 58688 CASAVA_Build 1 202084667 1I TTTCAGTCTT -/A GCTCTGTTGC 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 0 1 58689 CASAVA_Build 1 202096008 5D AAAATCACTT TCAAC/----- TCAACCCCTT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 TCAAC 2 1 58690 CASAVA_Build 1 202097136 3D CAGGACGGCA CTC/--- CTCCTACCAC 2028 het 1207 hom 13 7 5 2 CTC 2 1 58691 CASAVA_Build 1 202099686 4D TTTTCTTTCC TCTG/---- TCTATGTTGA 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 TCTG 1 0 58692 CASAVA_Build 1 202100190 1I CTACCCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 11 12 58693 CASAVA_Build 1 202102719 4D ATATCACTTC TTTT/---- AAGACAGCGG 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 4 0 58694 CASAVA_Build 1 202103839 4I GAGACAGAGT ----/CTCA CTCTGTCGCT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 CTCA 0 1 58695 CASAVA_Build 1 202104565 1I GGATTACAGG -/T GCATGCCACC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 0 1 58696 CASAVA_Build 1 202107849 4D CTTAACTAAA CTAT/---- CTACTCATTC 3070 hom 170 het 62 0 57 6 CTAT 1 0 58697 CASAVA_Build 1 202108050 1I AGCCTGGCAG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 7 8 58698 CASAVA_Build 1 202108693 3D GGTGTCTTTT AAA/--- AAAAAAAATT 3070 het 37 hom 19 2 14 3 A 11 8 58699 CASAVA_Build 1 202110580 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 22 0 21 1 T 9 10 58700 CASAVA_Build 1 202111262 4I ATTCTTCCTT ----/TCTC TCTCTGATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TC 2 4 58701 CASAVA_Build 1 202114475 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 229 hom 46 2 35 9 T 10 11 58702 CASAVA_Build 1 202115007 2I ATTTTTACTC --/TT TATACGCACA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 3 58703 CASAVA_Build 1 202118666 2I GTCTCCAAAA --/AT AAAAAAAAAA 1226 het 178 hom 25 3 8 14 AT 0 1 58704 CASAVA_Build 1 202119090 1D AAATTTAGCT G/- GCTGGGCATG 3070 het 2592 hom 20 7 10 5 G 2 1 58705 CASAVA_Build 1 202122029 2I TACATTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 1894 hom 12 het 12 0 5 7 T 10 12 58706 CASAVA_Build 1 202127624 1D GGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 25 12 11 3 A 9 8 58707 CASAVA_Build 1 202129687 2I GAAATGACAC --/AA ATGATAGAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 3 58708 CASAVA_Build 1 202130636 1I TGAAACAAAC -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 6 7 58709 CASAVA_Build 1 202132286 5D CAAAATACAT AAAGA/----- AAAACCTGAT 3070 het 3070 ref 49 24 20 7 AAAGA 1 0 58710 CASAVA_Build 1 202135074 1D ATTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 16 3 9 4 A 17 16 58711 CASAVA_Build 1 202139343 1I TGATGTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 10 11 58712 CASAVA_Build 1 202141170 1D ATTTATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 11 10 58713 CASAVA_Build 1 202152246 21I TACAGGCGTG ---------------------/AGCCACTGCACCCAGCCCATT ATCTTAGTAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 AGCCACTGCACCCAGCCCATT 0 1 58714 CASAVA_Build 1 202152452 1D AACTATTGAC T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 8 T 7 6 58715 CASAVA_Build 1 202157099 2D TTTTTTTTTT TC/-- TTTTTTTTTT 2809 het 2764 hom 24 10 11 3 TC 1 0 58716 CASAVA_Build 1 202157687 1I TATATATATA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 T 7 8 58717 CASAVA_Build 1 202159512 2D TTAGGTTTCA GG/-- GGTACATGTG 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 G 4 2 58718 CASAVA_Build 1 202168966 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1408 het 496 hom 31 8 7 16 A 19 18 58719 CASAVA_Build 1 202172607 1I GCCAGAGTTG -/T TTTTTTACTG 3070 het 2350 hom 18 6 10 2 T 6 7 58720 CASAVA_Build 1 202179688 1I CAATTTTGAC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 112 het 43 0 38 5 T 6 7 58721 CASAVA_Build 1 202180339 1I TTGGTGAATT -/G GGGGGAGCTT 3070 hom 93 het 42 0 32 10 G 5 6 58722 CASAVA_Build 1 202180499 1D GTAGAAAGTA G/- AATCTTCTGA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 G 1 0 58723 CASAVA_Build 1 202202115 1D ACACACAGAA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 22 8 10 5 T 8 7 58724 CASAVA_Build 1 202202745 2D CTAAAAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 1846 het 430 hom 18 2 7 9 T 16 14 58725 CASAVA_Build 1 202216146 1I AGTAGGGCTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 8 9 58726 CASAVA_Build 1 202225763 1D TGCCTCATAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 7 A 10 9 58727 CASAVA_Build 1 202226909 1D ATCAATCCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 192 hom 25 1 18 7 T 15 14 58728 CASAVA_Build 1 202232234 1D CTAATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 2728 het 950 hom 19 5 9 6 A 15 14 58729 CASAVA_Build 1 202236750 1D ATCCATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 27 1 15 12 A 13 12 58730 CASAVA_Build 1 202238626 2I TAAGCCTGAA --/AG AGAGCCCTCA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 AG 2 3 58731 CASAVA_Build 1 202241439 1I TGCTTCCTGT -/A ACAGCCTGCA 3070 het 2715 hom 25 6 12 7 A 1 2 58732 CASAVA_Build 1 202270478 1I24M1I GAGTTTCGCA -GGGGGGCAGTCTTTTAAAGCAGTT-/GGGGGGGCAGTCTTTTAAAGCAGTTC CCCCATAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 3 N/A 0 0 58733 CASAVA_Build 1 202281828 1I TCCCCAGGGA -/G GGGGCTCAGT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 G 4 5 58734 CASAVA_Build 1 202283191 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 16 1 9 6 A 13 12 58735 CASAVA_Build 1 202290528 1I TCTATTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 12 4 A 11 12 58736 CASAVA_Build 1 202293586 1I GCAACAAAGC -/A AAAAAAAAAA 2014 het 2014 ref 22 14 5 3 A 10 11 58737 CASAVA_Build 1 202296986 4D TCCACTGTAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2829 het 2589 hom 33 9 13 13 TTTG 4 3 58738 CASAVA_Build 1 202300739 4D GACAGTCCTG CCTT/---- CACTTCTTCA 3070 hom 116 het 43 0 37 7 CCTT 1 0 58739 CASAVA_Build 1 202306050 1I CTTCCTGTCT -/C CACTAATTGG 3070 hom 138 het 55 0 46 9 C 1 2 58740 CASAVA_Build 1 202317007 3D CATATTCGTT TTC/--- TTATTTCTGT 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 TTC 1 0 58741 CASAVA_Build 1 202317993 2I GCCAGGTGTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 52 24 15 13 GT 8 9 58742 CASAVA_Build 1 202320550 3I GGGTTTGTTG ---/TTC TTGCTTGAGA 3070 hom 117 het 46 0 37 9 TTC 0 1 58743 CASAVA_Build 1 202322251 1I GAAGGAGTTT -/C ATCATGTTGG 3070 het 995 hom 16 3 12 1 C 0 1 58744 CASAVA_Build 1 202322679 1D TTCTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 192 hom 30 2 19 9 T 13 12 58745 CASAVA_Build 1 202328663 2I GCTTCCTAAC --/TG TGAAATGCCA 3070 hom 135 het 54 0 44 10 TG 1 2 58746 CASAVA_Build 1 202332191 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 het 2865 hom 17 6 10 2 AG 2 1 58747 CASAVA_Build 1 202332616 3D TCTTCTCTTT TTC/--- TTCTTCTTTC 3070 het 3070 ref 35 13 14 11 TTC 3 2 58748 CASAVA_Build 1 202346654 2D ATCCCCATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 A 13 11 58749 CASAVA_Build 1 202348192 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 16 2 13 1 A 13 14 58750 CASAVA_Build 1 202374767 2D GTCATACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 146 het 57 0 49 8 TG 7 6 58751 CASAVA_Build 1 202376716 1I TAGGACTATA -/G GCATGTACCA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 G 1 2 58752 CASAVA_Build 1 202390994 1D CCTTGCCTGA C/- CCCCAGCAAC 3070 hom 107 het 38 0 33 5 C 5 4 58753 CASAVA_Build 1 202393851 1I CTGGATCTCA -/C CCCCCCACGC 3070 hom 44 het 19 0 12 7 C 6 7 58754 CASAVA_Build 1 202396841 1I TTCTTGGACC -/T TTTTTTTGTT 2165 het 2165 ref 30 17 5 8 T 7 8 58755 CASAVA_Build 1 202419828 1D TGCCTTGTTG C/- CCTGGGGACC 2687 het 2687 ref 26 14 8 4 C 3 2 58756 CASAVA_Build 1 202432233 1D TCCCGGTCTC A/- AGAGTTCTCC 2361 het 2361 ref 28 12 9 7 A 2 1 58757 CASAVA_Build 1 202432890 1I AGCAACCAGC -/T TATGAGCAAG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 1 2 58758 CASAVA_Build 1 202433178 1D TGCATCGCAA G/- TGACTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 G 1 0 58759 CASAVA_Build 1 202436051 8D CATATATGTG TATATATA/-------- TATATATATA 1577 het 210 hom 10 2 7 4 TA 10 6 58760 CASAVA_Build 1 202449140 1D CTTCCCATGG C/- CCCAGACTTG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 4 3 58761 CASAVA_Build 1 202476024 1I ATGGCCCAGA -/C CCCCTCAGGA 1737 het 1737 ref 48 41 4 4 C 4 5 58762 CASAVA_Build 1 202528655 6D AGCTGGAAGC TGTTAG/------ TGTTAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 TGTTAG 2 1 58763 CASAVA_Build 1 202538272 15D AAGAAAAGAT CCTCCTTGGGGAAAG/--------------- CCTCCTTGGG 2176 het 2176 ref 26 10 8 11 CCTCCTTGGGGAAAG 2 1 58764 CASAVA_Build 1 202581436 1I CATTTCCCTG -/A AAAGAACAGC 3070 het 3070 hom 32 8 18 6 A 3 4 58765 CASAVA_Build 1 202582166 4I GGGCACCTGA ----/GGAG GGGTGGCCAG 3070 het 1742 hom 38 6 20 12 GGAG 0 1 58766 CASAVA_Build 1 202588126 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2983 het 420 hom 14 4 9 1 A 11 12 58767 CASAVA_Build 1 202608665 1D CCTGAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1269 hom 40 4 28 8 T 16 15 58768 CASAVA_Build 1 202618014 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1275 het 1146 hom 14 5 4 5 A 17 16 58769 CASAVA_Build 1 202625742 2I ACCTCCATGG --/CT CTCCCCCTTT 3070 het 3070 ref 41 26 14 1 CT 1 2 58770 CASAVA_Build 1 202642504 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 28 0 18 10 A 12 13 58771 CASAVA_Build 1 202652463 1D AAACAAAGAG A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 7 6 58772 CASAVA_Build 1 202670957 1I TTTACACTTG -/A AAAATGGGAC 3070 het 3070 hom 55 23 23 9 A 4 5 58773 CASAVA_Build 1 202675783 1I ATAACAGTCT -/C TCTCCCATGC 3070 hom 90 het 35 0 28 7 C 0 1 58774 CASAVA_Build 1 202687398 2D CTCTGTGCCT CA/-- GTTTCTCATC 3070 het 3070 hom 51 18 28 7 CA 1 0 58775 CASAVA_Build 1 202689529 1I TAACATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 25 2 16 8 T 13 14 58776 CASAVA_Build 1 202694843 2D ATAGCTCACT AC/-- ACAGCCCCAA 3070 hom 112 het 39 0 36 5 AC 2 1 58777 CASAVA_Build 1 202698109 3D CCTTCCCTGC TGG/--- TATTTACTGA 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 TGG 1 0 58778 CASAVA_Build 1 202699121 2D TTGCCCCTGC CT/-- CTCTTCCACT 3070 het 3070 hom 43 14 25 4 CT 3 2 58779 CASAVA_Build 1 202700135 1I GAAATCGAGT -/C CAAAACACAG 3070 hom 111 het 46 0 35 11 C 1 2 58780 CASAVA_Build 1 202700949 2I CCCAAATCCC --/CT ACCCCATTCT 3070 het 2332 hom 18 6 10 2 CT 0 1 58781 CASAVA_Build 1 202701395 4I CCTGCAACAC ----/GGAA GGGCTTTCCG 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 GGAA 0 1 58782 CASAVA_Build 1 202707715 2D AAAATATTGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 11 9 58783 CASAVA_Build 1 202715065 4I CCCAGGTTCC ----/CTCT AAGGGCATGG 3070 het 3070 ref 46 18 16 12 CT 0 2 58784 CASAVA_Build 1 202717861 12D ATGAAAAGAC GGGGGGGGGGGG/------------ GGGGGTGCTC 3070 het 765 hom 27 5 16 7 G 17 5 58785 CASAVA_Build 1 202719141 3D ACCCTGACTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2732 het 584 hom 33 8 8 17 A 15 12 58786 CASAVA_Build 1 202719239 2I CCTGATACTC --/TG TGTTTCACAC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 TG 1 2 58787 CASAVA_Build 1 202721194 1D TTATTATTCC T/- TTTTCTCACC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 5 4 58788 CASAVA_Build 1 202725236 1D CTTTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 1017 het 1017 ref 36 25 3 8 A 15 14 58789 CASAVA_Build 1 202734647 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 11 10 58790 CASAVA_Build 1 202737666 1D TGATTTTTTT C/- CAAAGGCAGT 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 C 2 1 58791 CASAVA_Build 1 202753606 1I TCCTCATACA -/T TTTTTTTTTT 2776 het 2776 ref 26 9 6 11 T 10 11 58792 CASAVA_Build 1 202763453 2I TTTTAAACAC --/TT ATGCATTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 0 2 58793 CASAVA_Build 1 202769138 12I CTTTTTTTCT ------------/TCTGAAACAGGG TCTCAGGTTG 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 TCTGAAACAGGG 0 1 58794 CASAVA_Build 1 202769534 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1951 het 1951 ref 33 13 9 11 T 15 16 58795 CASAVA_Build 1 202772798 1D CCATACACTC T/- TTTCCTTTTG 3070 het 3070 ref 44 24 20 0 T 4 3 58796 CASAVA_Build 1 202776036 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1937 het 1572 hom 16 5 6 5 A 10 11 58797 CASAVA_Build 1 202786316 1D TGCTTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3000 hom 37 16 10 11 T 15 14 58798 CASAVA_Build 1 202791678 1D GAAGGCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 11 10 58799 CASAVA_Build 1 202797349 1I AGACCAAGGG -/A AAAAAAAAAA 863 het 863 ref 28 13 5 10 A 15 16 58800 CASAVA_Build 1 202801084 5D TGCAAAAAAA TATCT/----- TTTATAGCCT 3070 het 3070 ref 36 24 11 4 TATCT 1 0 58801 CASAVA_Build 1 202810870 2I TCACACTGCT --/AG AGCAAGGGGT 3070 het 3070 hom 51 24 26 1 AG 1 2 58802 CASAVA_Build 1 202823614 3I CTGCTGTGCC ---/CTT CTTCTCCAGT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 CTT 1 2 58803 CASAVA_Build 1 202825754 1D TCCCCCCATA C/- CCCCCCCCTT 2877 het 282 hom 20 3 7 12 C 9 8 58804 CASAVA_Build 1 202827055 4D AATTATATCT CAAA/---- CAAACGAACA 3070 het 3070 hom 38 10 24 8 CAAA 2 1 58805 CASAVA_Build 1 202842794 1D CAACCTCATT A/- AAATCTGCAT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 A 4 3 58806 CASAVA_Build 1 202861252 1I GAGAATACAT -/A AAATGTCCCT 3070 het 3070 hom 59 28 25 6 A 3 4 58807 CASAVA_Build 1 202862707 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 27 5 T 11 10 58808 CASAVA_Build 1 202862718 1D TTTTTTTTTT G/- CCTAGGGCTG 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 G 1 0 58809 CASAVA_Build 1 202868009 4D AACTTAAACC CAAA/---- CAAACAAAAG 3070 het 3070 ref 37 20 9 10 CAAA 3 2 58810 CASAVA_Build 1 202875209 1D ACAAGTGAGA C/- CCCCGTCTCT 3070 het 3062 hom 26 12 9 6 C 5 4 58811 CASAVA_Build 1 202878282 9I CAGGGTAGGC ---------/AAGGGAGGG AAAAAGGTGC 3070 het 3070 hom 40 14 14 12 AAGGGAGGG 0 1 58812 CASAVA_Build 1 202882907 2D CAAGGAGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 514 hom 36 3 19 14 A 16 14 58813 CASAVA_Build 1 202888190 1I AAGAAGGACC -/T GAGCTAAAGT 3070 hom 42 het 19 0 14 5 T 0 1 58814 CASAVA_Build 1 202893324 1D GCCAGGATCT G/- GGGGAAGGGG 3070 het 3070 ref 31 16 11 6 G 5 4 58815 CASAVA_Build 1 202905494 2I CTCAGCAGTC --/AA AGAGCTGAAA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 1 3 58816 CASAVA_Build 1 202905757 2I ATTTCCACTC --/TT GTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 57 0 34 23 T 0 2 58817 CASAVA_Build 1 202906480 1I AGAAAGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 A 11 12 58818 CASAVA_Build 1 202912128 1I TTCTGAGCTT -/A TGTACTGCTT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 A 0 1 58819 CASAVA_Build 1 202922377 1D GAATGGATGA G/- GTGGAGGCCA 3070 het 3070 ref 48 22 15 11 G 2 1 58820 CASAVA_Build 1 202925772 1D CTCTACTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 10 9 58821 CASAVA_Build 1 202936637 3D TACCCTGATC CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 CTT 5 4 58822 CASAVA_Build 1 202940354 2D CACCCAGGCC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 104 het 41 0 29 12 GT 7 6 58823 CASAVA_Build 1 202943163 1I GGTGTGTTCC -/G GGGGGGTATG 3070 het 3070 hom 36 11 13 12 G 6 7 58824 CASAVA_Build 1 202944284 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2013 het 1215 hom 17 8 5 4 A 15 14 58825 CASAVA_Build 1 202988479 2I TGGGATGGAC --/AG AGAGAGACGG 3070 het 3070 ref 44 20 13 11 AG 3 4 58826 CASAVA_Build 1 202993952 1D AATCAGAATC A/- GGGGTACAGT 3070 het 3070 ref 45 27 13 6 A 1 0 58827 CASAVA_Build 1 203005960 1D ATACCTGACT G/- GGGAGTGGAG 3070 het 3070 ref 56 29 22 6 G 4 3 58828 CASAVA_Build 1 203011940 1I CACCGGGAAA -/G TTTTCTTTAT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 0 1 58829 CASAVA_Build 1 203014728 1I AAAAAAAAGG -/A AAAAAAAATT 685 het 685 ref 13 7 3 3 A 8 9 58830 CASAVA_Build 1 203019829 1D TACAGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 476 hom 38 7 8 23 T 15 14 58831 CASAVA_Build 1 203028229 2D CAGACTCCTG GA/-- GAGAGGAGGC 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 GA 3 2 58832 CASAVA_Build 1 203030902 1D TTTCCCTCCC A/- GGGGGGCGCT 2255 het 2255 ref 25 12 8 5 A 1 0 58833 CASAVA_Build 1 203047530 1D ATCTGGCTGA G/- GAGCTTTTGA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 G 2 1 58834 CASAVA_Build 1 203060241 1I CCTGCATTAT -/G GGGGGGGGCC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 G 8 9 58835 CASAVA_Build 1 203067895 15D GTTCTGTGTG AACACCTGTGTGAAC/--------------- AAGGTGAACC 3070 het 3070 hom 43 22 26 5 AACACCTGTGTGAAC 1 0 58836 CASAVA_Build 1 203078240 2D CTGAAAACTC TT/-- TGTCCCATTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 T 3 1 58837 CASAVA_Build 1 203081952 1I CTGTCTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 A 13 14 58838 CASAVA_Build 1 203093227 1D CCTGCCTGCC T/- AGCAACAGGT 3070 het 3070 hom 36 13 13 10 T 1 0 58839 CASAVA_Build 1 203096745 1I ACCATTTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 9 10 58840 CASAVA_Build 1 203108908 2D3M5D TTCCTTCCAG GCACCTTGCA/--ATC----- TTTGAAAGGC 3070 het 3070 ref 43 20 17 9 N/A 0 0 58841 CASAVA_Build 1 203109428 1D TGGGGGCCTT C/- CATTCTGAGG 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 C 2 1 58842 CASAVA_Build 1 203111417 1D TCCCCTGCCC T/- TTCCCCCCAC 3070 het 2655 hom 26 9 11 6 T 3 2 58843 CASAVA_Build 1 203115069 2D ATGTGTACGT TG/-- TGTCTCATAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 TG 2 1 58844 CASAVA_Build 1 203121141 1D TTTGCCCTGT G/- GGGGGGGAAG 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 G 8 7 58845 CASAVA_Build 1 203126317 1D AGGGAGGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2208 hom 26 10 10 6 T 12 11 58846 CASAVA_Build 1 203135172 1I GCAACACTCA -/G GCATCTCTCT 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 G 1 2 58847 CASAVA_Build 1 203140635 1D TCCTATTCAT C/- CATCCACCCA 3070 het 2995 hom 22 8 11 4 C 2 1 58848 CASAVA_Build 1 203142439 1D CATATATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2407 hom 22 11 10 1 T 13 12 58849 CASAVA_Build 1 203145907 2I ATTAAACCAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TA 5 6 58850 CASAVA_Build 1 203146268 3I TTCTTTGGCA ---/TCT TCTTAGCTCA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 TCT 1 2 58851 CASAVA_Build 1 203146576 1I TTCCAAGAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 9 10 58852 CASAVA_Build 1 203148617 1I CAAAAAAAAA -/T AATAATTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 0 1 58853 CASAVA_Build 1 203148900 3I TAATAAACAT ---/AAC AAAAATGTTC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 AAC 0 1 58854 CASAVA_Build 1 203152474 7I TTTTTGTTTG -------/TTTGTTT TTTGTTTTTT 3070 hom 69 het 34 0 23 11 TTTGTTT 2 3 58855 CASAVA_Build 1 203172799 1I GTGCCTTCTT -/A ACCATTCAGG 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 A 1 2 58856 CASAVA_Build 1 203178412 1D CACAGGGGGG A/- AAAGTGGACC 3070 het 3070 hom 42 19 20 4 A 4 3 58857 CASAVA_Build 1 203194813 1I CCTTCTCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 11 12 58858 CASAVA_Build 1 203220401 1D AAAGCCACTG A/- AAGCATGCAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 3 2 58859 CASAVA_Build 1 203223669 4I ACAGGAGTCC ----/ACAG ACAGTCAGGA 3070 het 3070 ref 52 32 13 7 ACAG 1 2 58860 CASAVA_Build 1 203233784 1D CCTTAATGCC A/- AACTCACATT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 A 3 2 58861 CASAVA_Build 1 203234482 2D CTTTTTCATT AA/-- AAAGTGGGGC 3070 hom 120 het 46 0 39 7 A 5 3 58862 CASAVA_Build 1 203236578 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 26 4 17 6 A 13 11 58863 CASAVA_Build 1 203236772 1D TTCTGACTCT C/- CCCTTTCCTA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 C 4 3 58864 CASAVA_Build 1 203240516 4D TAGACAACCA CAGG/---- CAGTCACTTT 3070 het 3070 ref 55 30 17 13 CAGG 1 0 58865 CASAVA_Build 1 203242716 3D TTAAGGAGGT GGA/--- GGTCAGCTTG 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 GGA 1 0 58866 CASAVA_Build 1 203244346 1D ACTGACCACA C/- CCCCCCTCCC 2680 het 2680 ref 26 9 11 6 C 7 6 58867 CASAVA_Build 1 203246662 1I TCAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2059 het 249 hom 14 3 6 5 A 15 16 58868 CASAVA_Build 1 203246959 1I TCCCCCAGGA -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 92 het 33 0 26 7 C 8 9 58869 CASAVA_Build 1 203258736 3I CTAGAAGTTG ---/TCC TTATTCTCGA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 TCC 0 1 58870 CASAVA_Build 1 203285198 4I TATAGACACA ----/ACAG ACAGATACCC 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 ACAG 1 2 58871 CASAVA_Build 1 203285774 1D TCCAAAGAAC T/- CTGTAAAGTG 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 T 1 0 58872 CASAVA_Build 1 203286378 1I TCTGAGTACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 9 10 58873 CASAVA_Build 1 203294776 1I TGGGGTCCCA -/C CCCAGAGTGG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 C 3 4 58874 CASAVA_Build 1 203295447 1I AGTGTGAAGA -/G GGGAGGGGAA 3070 het 3070 hom 40 19 16 5 G 3 4 58875 CASAVA_Build 1 203295507 2D GAGGGCAGGC AG/-- AGTCAGGGCT 3070 het 3070 hom 43 14 22 9 AG 2 1 58876 CASAVA_Build 1 203296467 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2005 het 1437 hom 11 4 6 2 A 19 18 58877 CASAVA_Build 1 203302664 1I ACACAGCATT -/G GCAGAGGCAC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 G 1 2 58878 CASAVA_Build 1 203308111 4I TTCGTGGGCA ----/TGGG TGACAGAATG 3070 hom 93 het 33 0 28 5 TGGG 0 1 58879 CASAVA_Build 1 203315995 1I CTAAAAAGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 8 9 58880 CASAVA_Build 1 203321485 3I TGCTTCATTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 13 16 58881 CASAVA_Build 1 203323468 2I CTGTTATTTT --/TA TATAAAGAAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TA 2 3 58882 CASAVA_Build 1 203331122 1D ACATTATGAG T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 92 het 36 0 31 8 T 8 7 58883 CASAVA_Build 1 203342331 1D CCTAGGCAAC A/- GAGTGAGACT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 1 0 58884 CASAVA_Build 1 203345326 2D TGGGTGGGGT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 11 9 58885 CASAVA_Build 1 203349443 1I GTGTATTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 C 0 1 58886 CASAVA_Build 1 203359146 5D TGTAATCCCA GCACT/----- TTGGGAGGCC 3070 hom 48 het 19 0 15 4 GCACT 1 0 58887 CASAVA_Build 1 203364269 1I ATTTATTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 10 58888 CASAVA_Build 1 203364913 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 56 het 26 0 19 7 T 9 8 58889 CASAVA_Build 1 203366621 1D CATCCTAGGC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 8 7 58890 CASAVA_Build 1 203369537 1D TGTTTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 8 7 58891 CASAVA_Build 1 203374835 1I GTCTGAGGGG -/T TTTGTCTGTG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 3 4 58892 CASAVA_Build 1 203383667 1I AAGAGCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 504 hom 35 3 22 10 A 11 12 58893 CASAVA_Build 1 203387440 4D TGGTTATAGG CTTT/---- CTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 29 8 CTTT 2 1 58894 CASAVA_Build 1 203388412 1D TTGAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 2060 het 2060 ref 44 32 5 7 T 12 11 58895 CASAVA_Build 1 203389454 2I TAACTTACTT --/TC TTTGTGTGTG 2881 hom 29 het 40 1 22 17 TC 0 1 58896 CASAVA_Build 1 203397683 2I ACACACACAG --/AC ACACACACAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AC 5 6 58897 CASAVA_Build 1 203406782 2I TCATGTAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 31 0 22 9 A 13 15 58898 CASAVA_Build 1 203407710 4D CAGCAGGTTT ATTG/---- ATTGATTGAT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 ATTG 4 3 58899 CASAVA_Build 1 203408216 1D ACGCCCAGCT A/- ATTTTCATTC 3070 hom 47 het 18 0 16 2 A 2 1 58900 CASAVA_Build 1 203417050 1D TTTAACCTAG A/- TATACTCAAG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 1 0 58901 CASAVA_Build 1 203430570 7D CCTCAGCCTC CCAAGTA/------- CCAAGTAGCT 1594 hom 10 het 7 0 4 4 CCAAGTA 2 1 58902 CASAVA_Build 1 203430878 1I ATGCCTGGCC -/A AAAAATATCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 5 6 58903 CASAVA_Build 1 203436098 1I CAATTTTTTG -/T TATTTTTAAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 1 2 58904 CASAVA_Build 1 203446187 5D TTCCAATCTA AAGTT/----- ATTTCCTAAT 3070 hom 126 het 47 0 43 8 AAGTT 1 0 58905 CASAVA_Build 1 203447824 2I GAAGACAGTC --/AT ATCTCCATGG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 AT 1 2 58906 CASAVA_Build 1 203466590 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 36 het 20 0 13 9 T 9 8 58907 CASAVA_Build 1 203479156 1I AAAAACCAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 68 hom 31 1 27 3 A 8 9 58908 CASAVA_Build 1 203494945 1D TTTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 30 1 22 7 T 12 11 58909 CASAVA_Build 1 203495057 2I GGACCCTAAC --/AG GGGTTCTTTG 3070 hom 87 het 32 0 26 6 AG 0 1 58910 CASAVA_Build 1 203497122 1I CACCTGGCTG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 7 8 58911 CASAVA_Build 1 203497430 1I AACCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 774 hom 29 2 23 4 A 13 14 58912 CASAVA_Build 1 203500242 1D GTTAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 T 12 11 58913 CASAVA_Build 1 203502341 2I CCCCGTCTCC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 9 11 58914 CASAVA_Build 1 203505809 1I TCCTTCTGTA -/T TTTTTTGGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 7 58915 CASAVA_Build 1 203510782 3D CAAATAAAAA AAC/--- AAAAAAAAAG 3070 hom 29 het 18 0 14 4 AAC 1 0 58916 CASAVA_Build 1 203513106 4D TAATTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 TTTG 4 3 58917 CASAVA_Build 1 203513939 5D CAGCCAAGTG TGGCC/----- TGGCCTGGCC 3070 hom 93 het 35 0 29 7 TGGCC 3 2 58918 CASAVA_Build 1 203519180 11D AAAAAAAAAG AAGAAGAAAGA/----------- AAGAAAGAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 3 AAGAAGAAAGA 1 0 58919 CASAVA_Build 1 203546600 14D AGGGCTATGT CTTAAGGCTCTACC/-------------- CTTAAGGCTC 3070 het 3070 ref 33 16 12 8 CTTAAGGCTCTACC 2 1 58920 CASAVA_Build 1 203551624 1D CCTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1980 hom 20 6 11 3 A 10 9 58921 CASAVA_Build 1 203556654 2I AACCCACCCC --/CT GTGCCAGAGC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 CT 0 1 58922 CASAVA_Build 1 203569704 4D TTCTTTTTTC TCTT/---- TCTTTCTTCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TCTT 3 2 58923 CASAVA_Build 1 203577111 1D ATCTTATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 36 1 23 13 A 12 11 58924 CASAVA_Build 1 203577409 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 193 hom 25 1 19 5 T 11 10 58925 CASAVA_Build 1 203582353 1I GGGAGGGGTT -/G CAGGGGTAGG 3070 hom 83 het 30 0 27 3 G 0 1 58926 CASAVA_Build 1 203587671 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1515 het 1515 ref 22 12 4 6 A 13 14 58927 CASAVA_Build 1 203596529 2I ATGCTCAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 31 1 24 6 T 11 13 58928 CASAVA_Build 1 203599645 2I TAGCTTCCAC --/AT ATGTTTATTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AT 1 2 58929 CASAVA_Build 1 203604078 1D AACTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 33 1 26 6 A 14 13 58930 CASAVA_Build 1 203629130 1D AATGGCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 11 10 58931 CASAVA_Build 1 203629427 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 13 12 58932 CASAVA_Build 1 203650926 12D GGGGGATAAC CATGGGGAGAAG/------------ CATGAACACG 3070 het 3070 hom 49 22 26 12 CATGGGGAGAAG 1 0 58933 CASAVA_Build 1 203651218 2D GAATAGAAAC AG/-- AGATACAGAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AG 2 1 58934 CASAVA_Build 1 203653584 1D CAGACATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 30 0 15 15 A 15 14 58935 CASAVA_Build 1 203658387 3D AGCCTACTTC TTG/--- TTGTTGTCTT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 TTG 3 2 58936 CASAVA_Build 1 203661664 16D GATGTGATTT TTCCTAGCAATTTTTG/---------------- AAACTATGAT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TTCCTAGCAATTTTTG 1 0 58937 CASAVA_Build 1 203669948 1I TCTTTTTTTT -/C TCTCTCTCTT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 0 1 58938 CASAVA_Build 1 203670100 1I GTAAAAAAAA -/T ATATATATAT 1470 hom 7 het 4 0 3 1 T 0 1 58939 CASAVA_Build 1 203672270 1I GGGATGGCCT -/G GGGGTCCAGA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 4 5 58940 CASAVA_Build 1 203679149 1I AGGGTCCTTT -/G GGGGAATTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 4 5 58941 CASAVA_Build 1 203681347 1I CTCCCTCCAC -/T TTTTCCAGAC 3070 hom 29 het 24 1 19 4 T 4 5 58942 CASAVA_Build 1 203683513 1I CGGGGGAGCG -/C CCTGCCTTCC 3070 hom 47 het 19 0 16 3 C 2 3 58943 CASAVA_Build 1 203708124 4I AAAAATAAAT ----/AAAC AAAAAATAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AAAC 0 1 58944 CASAVA_Build 1 203708215 4D AGGGAGGGAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 hom 74 het 32 0 24 8 GGAA 3 2 58945 CASAVA_Build 1 203710073 3D CTGGTAAGTA TGG/--- TGCAAACCTG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 TGG 1 0 58946 CASAVA_Build 1 203722284 1I AGTTTTTATA -/T AATTGTCATG 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 0 1 58947 CASAVA_Build 1 203722862 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2485 het 1490 hom 12 5 7 0 A 9 8 58948 CASAVA_Build 1 203739059 1I CAGAGCCAGG -/C AGGTTGCTGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 0 1 58949 CASAVA_Build 1 203744031 1D CCCACATCCA G/- GGGGTGGGAG 3070 het 3070 ref 40 20 10 11 G 5 4 58950 CASAVA_Build 1 203747836 7D CTGAACCCTT GGGGGAC/------- ACACAGGCAG 3070 het 3070 ref 26 12 12 3 GGGGGAC 1 0 58951 CASAVA_Build 1 203756451 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 18 1 16 1 A 14 13 58952 CASAVA_Build 1 203768689 14D TGTGTGTGTG TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 het 481 hom 22 2 17 5 TA 15 8 58953 CASAVA_Build 1 203775477 4D ACCAGCCTGG CCAA/---- CCAACATAGA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 CCAA 2 1 58954 CASAVA_Build 1 203780640 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 15 0 9 6 T 9 10 58955 CASAVA_Build 1 203784152 2D AAGTCGAGGG CC/-- CCCCCCCCAG 3070 hom 75 het 36 0 24 14 C 10 8 58956 CASAVA_Build 1 203786657 12I18M3D GCATTCCAGC ------------ATGAGACTGTCCAAAAAAAAG/CTGGCCAACAGAGTGAGACTGTCCAAAAAA--- AAGGAAGGAA 2671 hom 30 het 11 0 9 2 N/A 0 0 58957 CASAVA_Build 1 203786961 1D ATTTCAGGCA T/- TTGTCAGATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 3 2 58958 CASAVA_Build 1 203787765 2D15M2D TATATATTTG TATATATATATATTTCCAT/--TATATATATATTTCC-- ATATATATAT 1004 hom 7 het 10 0 3 7 N/A 0 0 58959 CASAVA_Build 1 203795150 8D TCGACATACA AAAATGAG/-------- AAAATGAGTA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 AAAATGAG 2 1 58960 CASAVA_Build 1 203806177 5I TCTGGAGGGG -----/CCGGC CCGTTCTGGG 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 CCGGC 0 1 58961 CASAVA_Build 1 203809000 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAC 2773 het 2126 hom 14 6 7 1 A 10 9 58962 CASAVA_Build 1 203809315 5I AAGAGATCAC -----/ATATT ATATCATTTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ATATT 0 1 58963 CASAVA_Build 1 203821438 1D TGCACACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 47 1 34 12 T 15 14 58964 CASAVA_Build 1 203824660 2I TGGAGGGTGA --/GG GGGTGTAGGC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 G 3 5 58965 CASAVA_Build 1 203835680 1D GTCCTCCCTA T/- AAAAAGCAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 1 0 58966 CASAVA_Build 1 203839454 2D AGGGAATGTC AA/-- GAGATGCTCT 3070 het 3070 hom 38 10 23 6 A 2 0 58967 CASAVA_Build 1 203848825 1D GCATACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 10 10 A 13 12 58968 CASAVA_Build 1 203861046 1D GCCTACGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 599 hom 40 3 30 7 A 12 11 58969 CASAVA_Build 1 203864623 1I TGAGGACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 23 1 14 8 A 13 14 58970 CASAVA_Build 1 203865499 1D AAAGCTAAAG A/- AAAAAAATCC 2854 het 2854 ref 17 9 6 2 A 8 7 58971 CASAVA_Build 1 203875251 1I TAATTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 1101 het 1101 ref 19 9 4 6 T 15 16 58972 CASAVA_Build 1 203876783 1D GCTAATTTTT G/- TATTTTCAGT 3070 het 1772 hom 18 4 10 4 G 1 0 58973 CASAVA_Build 1 203907608 2D6M4I AACAGGGTGA CTCTGTCT----/--CTGTCTCAAA CAAACAAACA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 N/A 0 0 58974 CASAVA_Build 1 203920307 1I TATTTTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 9 10 58975 CASAVA_Build 1 203920599 1D GGGATATACA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 T 8 7 58976 CASAVA_Build 1 203921544 4I ATACTGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 99 het 46 0 32 14 TTTG 3 4 58977 CASAVA_Build 1 203926638 1I TCTCTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 16 2 10 4 A 14 15 58978 CASAVA_Build 1 203930617 4I ACCAACCAAC ----/CAAA CAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 CAAA 2 3 58979 CASAVA_Build 1 203938811 1D TTCTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 13 12 58980 CASAVA_Build 1 203953147 1I AATTCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2599 hom 23 7 11 5 T 13 14 58981 CASAVA_Build 1 203953837 1D GGTTTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 1008 het 1008 ref 27 15 6 6 A 19 18 58982 CASAVA_Build 1 203953972 10D TTCCTCCCTC TTTTTTCTTT/---------- TTTTTTCTTT 2198 het 2198 ref 19 9 9 2 TTTTTTCTTT 2 1 58983 CASAVA_Build 1 203957785 12D GAAGCCTATA AAAAATTTACTT/------------ TCACATATTC 2346 het 2346 ref 21 13 7 2 AAAAATTTACTT 1 0 58984 CASAVA_Build 1 203969083 3D TTGATGTGAA AGG/--- AGTAGTAGAG 3070 het 3070 hom 48 15 27 8 AGG 1 0 58985 CASAVA_Build 1 203981240 1D TCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 11 10 58986 CASAVA_Build 1 203988546 1D CCATATACGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 18 5 13 0 T 17 16 58987 CASAVA_Build 1 203989927 1D AATTTTCCCC T/- GTGATTTTTA 3070 hom 104 het 38 0 34 4 T 1 0 58988 CASAVA_Build 1 203990522 1D GCTTAGGTGA T/- TTTGTACTAC 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 T 4 3 58989 CASAVA_Build 1 203990902 1D TAATAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 19 17 13 A 11 10 58990 CASAVA_Build 1 203996134 1D CCCCTCCCGC A/- AAAAAAAAAA 3050 het 343 hom 28 2 15 11 A 14 13 58991 CASAVA_Build 1 203998867 5D AAAAAAAAAA AAAAT/----- TTTTGTTTAA 2276 het 477 hom 15 4 9 4 AAAAT 1 0 58992 CASAVA_Build 1 204002338 1D AACAAACAAA C/- AAAAAGGTTG 2115 hom 15 het 13 0 6 8 C 1 0 58993 CASAVA_Build 1 204004289 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 21 3 13 5 T 12 13 58994 CASAVA_Build 1 204005599 1D GATGCCCAGA C/- CCCCTCCTTC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 5 4 58995 CASAVA_Build 1 204009073 1D CTAAACACTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 9 8 58996 CASAVA_Build 1 204011696 1D CAGTCTTTGG A/- AAAAAACCTA 3070 hom 97 het 39 0 34 5 A 7 6 58997 CASAVA_Build 1 204014062 4I TACCTATTTA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 126 het 49 0 41 8 TTTG 3 4 58998 CASAVA_Build 1 204017285 1I TTTGGAAGCT -/G GGGGAAAGGG 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 G 4 5 58999 CASAVA_Build 1 204018235 12D AGTTCGAGAC CAGCCTGGGCAA/------------ CATAGCGAGA 3070 het 2868 hom 26 7 17 4 CAGCCTGGGCAA 1 0 59000 CASAVA_Build 1 204031618 8D GCCCTGCCTT GCCTCACC/-------- GCCTCACCTC 3070 hom 105 het 45 0 34 12 GCCTCACC 2 1 59001 CASAVA_Build 1 204032214 2D CGAGGTTTGC CT/-- CTCTTGTTTT 3070 hom 141 het 52 0 47 5 CT 3 2 59002 CASAVA_Build 1 204032783 1D AAAATGACGC A/- AAGACCACTG 3070 hom 111 het 41 0 36 5 A 3 2 59003 CASAVA_Build 1 204036338 1D CTGCAAAGCA G/- GGGCTGGAGA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 G 4 3 59004 CASAVA_Build 1 204054758 1D CTCCCATGAT C/- CTACTGGGTT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 C 2 1 59005 CASAVA_Build 1 204058819 1D CACGATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 T 12 11 59006 CASAVA_Build 1 204065690 1D TCCCCATTTT G/- TAAGTGGAGA 3070 het 3070 ref 48 26 16 7 G 1 0 59007 CASAVA_Build 1 204086806 1D AGATTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2183 hom 24 8 11 5 A 11 10 59008 CASAVA_Build 1 204089488 1I32M4D TAGAAAAAAA -AATGATTAATTCATGTTCAGTCTTTCATCTCTGACC/CAATGACTAATTCATTTTCAATCTTTCATCTCT---- ATTTGACTCT 1335 het 1335 ref 37 42 3 3 N/A 0 0 59009 CASAVA_Build 1 204103118 1D AACTGTGGTT G/- GGGTAGATAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 G 4 3 59010 CASAVA_Build 1 204112083 2I GTGTGTGTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 AT 7 8 59011 CASAVA_Build 1 204139255 2D GCTATTTATG AC/-- AAACTCACAG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 AC 1 0 59012 CASAVA_Build 1 204151855 4I TAGGTTTTGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 76 het 33 0 25 8 TTTG 2 3 59013 CASAVA_Build 1 204172978 1I CCCGGCAAGA -/C CCCCACAGGT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 C 4 5 59014 CASAVA_Build 1 204173642 1I GACCACTTGC -/A AAAAAAAAAA 1774 het 1774 ref 25 13 6 6 A 11 12 59015 CASAVA_Build 1 204176189 1I GCTCAGGCAG -/A AGACAGTGCC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 1 2 59016 CASAVA_Build 1 204183561 18I TTTTACATAT ------------------/GAGATACCCGAGGCCCCA GAGGGGGCCA 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 GAGATACCCGAGGCCCCA 0 1 59017 CASAVA_Build 1 204244896 1I CCTTTATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 A 10 11 59018 CASAVA_Build 1 204251636 2D GTATGTGAAC AG/-- AGTCTTTCTA 1306 het 1306 ref 43 39 3 1 AG 2 1 59019 CASAVA_Build 1 204258208 1D ATAAGGTGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2612 hom 18 7 8 3 T 9 8 59020 CASAVA_Build 1 204298065 3I AAAGCAGTAT ---/AAC AACTATTTAC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 AAC 1 2 59021 CASAVA_Build 1 204303042 1I GATGGGGGGG -/C GGGGCAAATC 2374 het 415 hom 17 6 7 4 C 0 1 59022 CASAVA_Build 1 204340911 1I TATTTTTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 9 10 59023 CASAVA_Build 1 204351321 1I TTTCTGATTT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 23 12 10 1 A 7 8 59024 CASAVA_Build 1 204374273 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 27 3 17 7 T 15 14 59025 CASAVA_Build 1 204418213 1I AGGCAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 10 11 59026 CASAVA_Build 1 204455752 2I TCTCTACTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 107 het 42 0 35 7 A 10 12 59027 CASAVA_Build 1 204555944 1I GGTAGCTGAT -/A ATAATTATCA 3070 het 3070 ref 36 14 10 12 A 1 2 59028 CASAVA_Build 1 204556641 1D TTCTCGTCCT C/- TTGGAGTTAA 3070 het 3070 ref 31 18 8 6 C 1 0 59029 CASAVA_Build 1 204557650 5I ATCACACATT -----/GAAAA GAAACAGTGT 1975 hom 10 het 4 0 4 0 GAAAA 0 1 59030 CASAVA_Build 1 204565320 1D TCTGTTATTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 24 7 9 T 9 8 59031 CASAVA_Build 1 204574668 3D TACTGCTTTG ATA/--- ATAAGTGTGT 3070 het 3070 ref 46 34 10 6 ATA 2 1 59032 CASAVA_Build 1 204574827 1D TCTGTGTGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 9 8 59033 CASAVA_Build 1 204580245 2D CCTCTGCTTC CT/-- CTTTTGATCT 3070 het 3070 ref 45 24 12 10 CT 2 1 59034 CASAVA_Build 1 204580495 1D CCAGTATAGA C/- CCCCCCCAAT 1258 het 1258 ref 39 34 3 2 C 8 7 59035 CASAVA_Build 1 204590226 1D GAGAATAGAT C/- ATTGATTGCC 2840 het 2840 ref 19 11 6 3 C 1 0 59036 CASAVA_Build 1 204601579 5I GTCACAAAAA -----/ACTTT ACTTTAGAGA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 ACTTT 1 2 59037 CASAVA_Build 1 204625637 1D GCTGTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 78 29 18 31 A 13 12 59038 CASAVA_Build 1 204625960 2D GGAAAGAGGG AA/-- AAAAAAGAGT 3070 het 3070 ref 69 47 20 3 A 8 6 59039 CASAVA_Build 1 204633484 2D AGCCCCCCTT AA/-- AAAAAAAAAG 1816 het 1816 ref 78 22 4 56 A 11 9 59040 CASAVA_Build 1 204634331 1I GGTGTGGGCC -/A CTGCACCCGA 3070 het 3070 ref 48 36 10 2 A 0 1 59041 CASAVA_Build 1 204644635 2D GGGAAGGCCT GG/-- GGTAAAATGA 3070 het 3070 ref 62 28 27 8 G 4 2 59042 CASAVA_Build 1 204649764 4D GACTCTGCCT AAAA/---- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 A 12 8 59043 CASAVA_Build 1 204663752 1D ACCTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 2627 het 2627 ref 29 13 10 6 T 12 11 59044 CASAVA_Build 1 204683771 4I AACTGTGTGC ----/ATTT ATTTATATGC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 ATTT 1 2 59045 CASAVA_Build 1 204687886 1I CAACCTACCC -/A CCTGTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 11 12 11 A 0 1 59046 CASAVA_Build 1 204706048 1I TACTGAACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 9 10 59047 CASAVA_Build 1 204717476 1I GAAGTGTAGC -/A GGGGGGAGAG 2745 het 2745 ref 32 15 11 6 A 0 1 59048 CASAVA_Build 1 204736882 4I TGCAAGGCAG ----/GGAA GGCTCTCAGC 2652 het 1682 hom 18 7 8 3 GGAA 0 1 59049 CASAVA_Build 1 204737117 1I GGTATTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3029 het 3029 ref 39 21 9 9 T 11 12 59050 CASAVA_Build 1 204749683 1D TGTGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 15 11 T 12 11 59051 CASAVA_Build 1 204769722 1I TTTTTCCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 A 10 11 59052 CASAVA_Build 1 204772015 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1357 het 1357 ref 16 8 5 3 A 10 11 59053 CASAVA_Build 1 204785469 1D ATTTTTTGAG T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 T 7 6 59054 CASAVA_Build 1 204789074 1D ACCTTGGCCT C/- TCAAAGTGCT 3070 het 347 hom 23 3 18 2 C 1 0 59055 CASAVA_Build 1 204795463 1I CTGGGGGAAA -/T CCCCCCAAAC 3070 het 2195 hom 36 9 18 9 T 0 1 59056 CASAVA_Build 1 204796932 1D AAGAAAGAAC A/- GAGGGAATGT 3070 het 2031 hom 14 6 8 0 A 1 0 59057 CASAVA_Build 1 204801615 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1433 het 1135 hom 22 9 5 8 T 19 18 59058 CASAVA_Build 1 204811235 1I TTTCATCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 11 12 59059 CASAVA_Build 1 204812147 4D GTGTTACTGC TTCT/---- TTGTGTTTTC 3070 het 3070 hom 51 18 21 12 TTCT 1 0 59060 CASAVA_Build 1 204818021 1I ACAAAAAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 8 9 59061 CASAVA_Build 1 204847619 3D AAAGATGAGG ATA/--- ATGATATGCA 3070 het 3070 hom 35 14 18 6 ATA 1 0 59062 CASAVA_Build 1 204858280 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2037 het 333 hom 10 1 8 1 A 17 16 59063 CASAVA_Build 1 204858510 43D AAAAAAAAAA GTGTGTGTATATAAGTGTGTGTGTATATATATGACATATATGT/------------------------------------------- GTGTGTGTAT 3070 hom 25 het 15 0 8 8 GTGTGTGTATATAAGTGTGTGTGTATATATATGACATATATGT 1 0 59064 CASAVA_Build 1 204870361 11D TTTCTTTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 30 1 24 6 T 23 12 59065 CASAVA_Build 1 204876622 1I AACAGTTTTT -/A AAGGTGACCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 2 3 59066 CASAVA_Build 1 204878843 2D ACCTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1019 het 1019 ref 20 6 4 10 T 20 18 59067 CASAVA_Build 1 204885376 21D TTCTTTTAAG TATCCTAGACTTCCTTTTATT/--------------------- TATCCTAGAC 3070 hom 33 het 18 0 12 11 TATCCTAGACTTCCTTTTATT 2 1 59068 CASAVA_Build 1 204890592 3D CCAGTTCCAT TTA/--- TTATTCTAGA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TTA 2 1 59069 CASAVA_Build 1 204916225 2I GCTGGAGTGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 9 7 10 TA 7 8 59070 CASAVA_Build 1 204935740 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 26 2 C 1 0 59071 CASAVA_Build 1 204967991 1D CTTAGACAGG T/- CAAGATTGAA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 T 1 0 59072 CASAVA_Build 1 204979396 3I CCTTCATGAG ---/TCC TCCTCCCTTC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 TCC 2 3 59073 CASAVA_Build 1 204985479 1I GCAGTGCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 41 2 30 9 A 10 11 59074 CASAVA_Build 1 204987445 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTGAG 3070 hom 39 het 22 0 14 8 A 1 0 59075 CASAVA_Build 1 204993912 2I TCTCCCTCTC --/TT CTTCATTCAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 2 59076 CASAVA_Build 1 204999373 1I TCTTAGAGTC -/T TAAATTTTTG 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 1 2 59077 CASAVA_Build 1 205000196 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 23 0 16 7 G 0 1 59078 CASAVA_Build 1 205019825 2I TCTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 328 hom 26 1 19 6 T 13 15 59079 CASAVA_Build 1 205022384 4D AATGAATGCT GTAA/---- GTGTTTCACA 3070 het 3070 hom 52 18 29 5 GTAA 1 0 59080 CASAVA_Build 1 205028495 1I AATAATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 11 12 59081 CASAVA_Build 1 205037252 8I TCAACTGGTG --------/TAGAATTC TAGAATTCTC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 TAGAATTC 1 2 59082 CASAVA_Build 1 205059549 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 29 2 16 11 A 13 14 59083 CASAVA_Build 1 205070543 2I TCATTATCAG --/TT TTTTATATAT 3070 het 358 hom 17 1 16 0 T 4 6 59084 CASAVA_Build 1 205077608 1I GCTTGAGATC -/A GGGGCTTGAG 3070 hom 115 het 43 0 32 11 A 0 1 59085 CASAVA_Build 1 205084429 5D ACACTTCTTG TAATA/----- TAATATAATA 3070 hom 24 het 10 0 9 2 TAATA 3 2 59086 CASAVA_Build 1 205093220 1D ATCACATCAA G/- TTTTTCTGTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 0 59087 CASAVA_Build 1 205118857 1D TTTAACATTA T/- TTTTTATAAT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 6 5 59088 CASAVA_Build 1 205121335 1I GAGAAAAAAA -/T AGATAAATTG 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 T 0 1 59089 CASAVA_Build 1 205130632 1D CCAGGGTGCA G/- GGAAGGATCG 3070 het 3070 hom 37 14 13 11 G 3 2 59090 CASAVA_Build 1 205139845 1I GGCAGCTCTA -/G GGGTGCAGGC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 G 3 4 59091 CASAVA_Build 1 205142504 1I TCATCCCCAG -/C CCCCCCTAAA 2504 het 2504 ref 22 7 7 8 C 6 7 59092 CASAVA_Build 1 205148960 1I CATCCTCTAG -/A CCAAGCTTAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 0 1 59093 CASAVA_Build 1 205154406 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2634 het 1672 hom 25 7 10 8 T 14 13 59094 CASAVA_Build 1 205160990 1I CAATGAAGAA -/T TTGAGGTAAG 3070 het 3070 ref 56 28 21 7 T 2 3 59095 CASAVA_Build 1 205165890 1D CATTTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 1509 het 1509 ref 24 12 6 6 T 15 14 59096 CASAVA_Build 1 205174815 2D TGTCATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2830 hom 36 10 21 5 AT 7 6 59097 CASAVA_Build 1 205190703 1I ATTAGCCAGG -/T GTGGTGGCAC 3070 het 3070 ref 30 17 7 6 T 0 1 59098 CASAVA_Build 1 205217568 4I TTCCTAACTG ----/TTCA TTCAATTCAT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 TTCA 1 2 59099 CASAVA_Build 1 205292707 2D GTTCAACGAT GA/-- GAGTGGTTGA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 GA 2 1 59100 CASAVA_Build 1 205320199 1I GGAAAGTCTA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 6 7 59101 CASAVA_Build 1 205320671 1D TGTTGTCAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 114 het 46 0 39 10 T 9 8 59102 CASAVA_Build 1 205323326 3D TATAGTGAGA CCC/--- CCCCCCCACC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 C 10 7 59103 CASAVA_Build 1 205326909 20I TGGAGATGAT --------------------/CAATTCACAGGAGTATGTGA CTCTGACTGA 3070 hom 72 het 24 0 25 2 CAATTCACAGGAGTATGTGA 0 1 59104 CASAVA_Build 1 205356335 1I CTGGTTGTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 8 9 59105 CASAVA_Build 1 205361419 5I TTGGTTTTCT -----/TTTGA TTTGAATTTG 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 TTTGA 1 2 59106 CASAVA_Build 1 205365050 2D AATCTTACTT TA/-- TATTACTAAG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 TA 2 1 59107 CASAVA_Build 1 205391773 1D TTGCTGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 753 hom 25 2 14 9 T 15 14 59108 CASAVA_Build 1 205395613 1D TCATGTTCTT A/- TTATTCTGAG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 1 0 59109 CASAVA_Build 1 205400896 4D ATAATCTAGC TGAG/---- TGTTTGTTAC 3070 het 3070 ref 33 17 15 5 TGAG 1 0 59110 CASAVA_Build 1 205424816 1D TTAATTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 51 6 30 15 T 16 15 59111 CASAVA_Build 1 205424832 1D TTTTTTTTTT G/- AGAAATTCTG 3070 het 546 hom 44 7 27 10 G 1 0 59112 CASAVA_Build 1 205438092 2D CAATTAAAAG AC/-- ACAGACTGGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AC 2 1 59113 CASAVA_Build 1 205442266 1D TGTATATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 40 1 26 14 A 12 11 59114 CASAVA_Build 1 205445227 1I TAGAGTAATG -/A AAAGGGAAAG 3070 hom 76 het 32 0 25 7 A 3 4 59115 CASAVA_Build 1 205475535 2D CTCACTAGAC TA/-- TAAGCTCCTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TA 2 1 59116 CASAVA_Build 1 205482495 4D CCTTAAAATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 TTTG 5 4 59117 CASAVA_Build 1 205485891 2D GCTAATACAC AT/-- GTGACCTTAG 3070 hom 144 het 55 0 49 7 AT 1 0 59118 CASAVA_Build 1 205501463 1I44M4D ATATTTAAAT -AATAGGAAAATTGTTTCACAGTTAATATAAATATCAATAGTGCATTAT/AAATAGGAAAATTGTTTCACAGTTAATATAAATATCAATAGTGCA---- TTAGAGAACA 3070 hom 78 het 21 0 27 0 N/A 0 0 59119 CASAVA_Build 1 205524499 1I AGGAATTTGC -/T TTTCGCTTTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 3 4 59120 CASAVA_Build 1 205530370 1D CTCCCTGACA C/- CTGGATCAGC 3070 hom 132 het 47 0 44 3 C 2 1 59121 CASAVA_Build 1 205533989 1I GTAAGACTGA -/T TTTTTTTTTT 1271 het 1271 ref 47 42 3 2 T 10 11 59122 CASAVA_Build 1 205540981 1I38M2D CAGAATTCTG -AAAAAAATAATCTCTCTTTAAAGCAGATGATTCTCTGTGC/AAAAAAAAAAATCTCTCTTTAAAGCAGATGATTCTCTGT-- CTCTGTCTTA 3070 het 13 hom 43 1 36 17 N/A 0 0 59123 CASAVA_Build 1 205544874 1D ATAAGCCCAT A/- AGATGATGGC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 2 1 59124 CASAVA_Build 1 205561108 21I CCTTCCTCCT ---------------------/TAGTTACTTCCCCTCCTTCCC TAGTTATTTC 3070 hom 67 het 27 0 23 4 TAGTTACTTCCCCTCCTTCCC 0 1 59125 CASAVA_Build 1 205565989 4I CTTGCAGAAA ----/TAAT TCTTCAAATG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TAAT 0 1 59126 CASAVA_Build 1 205570009 1I AATCTTTTTT -/C CCCACTAGCT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 C 3 4 59127 CASAVA_Build 1 205570299 1I CTTCATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1520 hom 47 5 31 11 A 14 15 59128 CASAVA_Build 1 205571443 2D TGGCTTGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AC 8 7 59129 CASAVA_Build 1 205574722 2I AAAAGAGAAC --/AA GAGAGAGAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 2 59130 CASAVA_Build 1 205574876 7D AACCTAGTTC TTTACTA/------- TTTACAAGAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTTACTA 1 0 59131 CASAVA_Build 1 205577628 1I TAAGATTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1297 hom 25 3 19 3 A 13 14 59132 CASAVA_Build 1 205579201 3I TTGATTAAGT ---/TAA TAATGTGTAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TAA 1 2 59133 CASAVA_Build 1 205601950 1D TGCTTTGGTT A/- ATGTCCAATG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 2 1 59134 CASAVA_Build 1 205602161 1D TCCATCTCAA C/- CCCCACACAC 3070 hom 119 het 44 0 40 4 C 5 4 59135 CASAVA_Build 1 205607172 2I ATACTTATAA --/AT ATGTTATATG 2389 hom 15 het 7 0 6 1 AT 1 2 59136 CASAVA_Build 1 205610074 1D AATTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 7 A 12 11 59137 CASAVA_Build 1 205625812 4D TCACATCTCT TCTC/---- TCTGTGTTTC 3070 hom 111 het 38 0 36 4 TC 3 1 59138 CASAVA_Build 1 205626303 1I TATTGAGAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 8 9 59139 CASAVA_Build 1 205698246 1D CCAAGCTTCA T/- TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 46 36 3 7 T 13 12 59140 CASAVA_Build 1 205720417 1I TGTTTTTATG -/T CTTTAAGTCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 1 59141 CASAVA_Build 1 205720889 1D TTATAATTTC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 9 8 59142 CASAVA_Build 1 205723524 1I CTGCACACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 28 0 19 9 T 9 10 59143 CASAVA_Build 1 205726537 2D CCTTAACTGC TG/-- TGTTAAGAAC 3070 hom 125 het 45 0 40 7 TG 2 1 59144 CASAVA_Build 1 205729880 1I CCTTATTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 94 het 51 0 37 14 T 9 10 59145 CASAVA_Build 1 205821471 4D ACATGAAGAG ATAA/---- ATAAATATTC 3070 hom 99 het 38 0 34 7 ATAA 2 1 59146 CASAVA_Build 1 205861423 1D CTGCCAGTTA G/- CCCTCCTAGA 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 G 1 0 59147 CASAVA_Build 1 205863251 1D TAATAATAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 9 8 59148 CASAVA_Build 1 205884054 6I GGTAACTGCC ------/AGAAAT TCCTTATTAC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AGAAAT 0 1 59149 CASAVA_Build 1 205884331 1D TCATGTTCCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 9 8 59150 CASAVA_Build 1 205886991 2D CTATTTGTTT AC/-- ACACACGTAC 3070 het 3070 ref 38 17 18 5 AC 4 3 59151 CASAVA_Build 1 205888556 2D AGAAGGAAAC AT/-- GTGTCAAATT 3070 het 3070 ref 37 20 14 6 AT 1 0 59152 CASAVA_Build 1 205891262 4I ATAGGAAGAA ----/ATTC AGTCCTCTGA 3070 het 2353 hom 21 6 14 1 ATTC 0 1 59153 CASAVA_Build 1 205892719 1I TAAACTAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 10 12 T 10 11 59154 CASAVA_Build 1 205898276 2I CTGAGAAGAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 21 0 15 6 A 9 11 59155 CASAVA_Build 1 205909362 18D TTTTCCTCTT ATTTCAGTTTTCTTCGAG/------------------ ATCAAATCTG 2474 het 2474 ref 14 7 6 3 ATTTCAGTTTTCTTCGAG 1 0 59156 CASAVA_Build 1 205913286 2I GCATATAATT --/TA TATATTTGTG 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 TA 2 3 59157 CASAVA_Build 1 205914831 1I GTTTTATTCG -/T TGTTTTTTTT 2812 het 2812 ref 35 15 12 8 T 1 2 59158 CASAVA_Build 1 205915242 3I ACTAGAAATT ---/ATC ATAGGGTGGG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 ATC 0 1 59159 CASAVA_Build 1 205922215 1D GAGGTGGGAG A/- AATCACCTGA 1377 het 1377 ref 9 6 3 0 A 3 2 59160 CASAVA_Build 1 205948109 1D TTGATGAGGT A/- TGTACAGCAC 3070 het 3070 ref 45 22 15 9 A 1 0 59161 CASAVA_Build 1 205956266 7D TGATAAATTA GTACAGT/------- GTACAGTGGA 3070 hom 63 het 25 0 22 4 GTACAGT 2 1 59162 CASAVA_Build 1 205959229 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 878 het 319 hom 9 3 5 2 A 12 11 59163 CASAVA_Build 1 205962781 1I TACAAATATT -/C CTGCCAGTTA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 C 1 2 59164 CASAVA_Build 1 205965485 1I TACAATTAAC -/T TTTTTTTTTT 2908 het 2908 ref 29 11 9 9 T 13 14 59165 CASAVA_Build 1 205966098 1D CTAAAAATAC A/- AAAAGTTAGC 1639 het 492 hom 9 1 4 4 A 5 4 59166 CASAVA_Build 1 205977803 1I ATGAGCTGGA -/G GGCCTCATCA 3070 hom 72 het 32 0 26 6 G 2 3 59167 CASAVA_Build 1 205978823 1I TTATGCTACC -/T ACTGATAACC 3070 het 3070 ref 25 16 7 2 T 0 1 59168 CASAVA_Build 1 205985704 3I TATTTTGATG ---/AAT AATATATGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAT 1 2 59169 CASAVA_Build 1 205994825 1I ACAAAAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 24 1 16 7 T 12 13 59170 CASAVA_Build 1 205999942 1I GTGCAGTGGC -/A ACAATCTCAG 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 1 2 59171 CASAVA_Build 1 206001687 2I TGAAAGAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 16 9 A 12 14 59172 CASAVA_Build 1 206019938 4D GCCGGGAACA CTTC/---- CTTTTCAGAA 3070 het 981 hom 16 2 8 6 CTTC 1 0 59173 CASAVA_Build 1 206021904 2D GATTTTTCTA TT/-- TCAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 T 3 1 59174 CASAVA_Build 1 206042305 1I GCTCTTCAAG -/T TTCTTCCCTG 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 T 2 3 59175 CASAVA_Build 1 206061946 2D GACCTGCGAC AA/-- AGACAGGTTA 3070 het 2458 hom 23 7 10 7 A 3 1 59176 CASAVA_Build 1 206069862 3I GCTGTGTGCT ---/ATC ATCATCATCA 3070 hom 141 het 55 0 47 8 ATC 3 4 59177 CASAVA_Build 1 206072292 11I TTTGGGATAC -----------/GTTTTCATATT GTTTTCATAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 GTTTTCATATT 0 1 59178 CASAVA_Build 1 206077402 1D TTCCTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 1174 het 1174 ref 31 23 3 7 A 11 10 59179 CASAVA_Build 1 206084248 1D CTCACCCCAA G/- GGTTCATCAA 3070 het 3070 hom 52 21 26 6 G 3 2 59180 CASAVA_Build 1 206087665 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2629 het 2629 ref 23 8 10 5 A 11 10 59181 CASAVA_Build 1 206094780 1D GAAAAAAAAA C/- AATCCAACCT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 C 1 0 59182 CASAVA_Build 1 206095085 2I GTAAAGGTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 14 2 T 10 12 59183 CASAVA_Build 1 206095383 3D TTTTTTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 TTG 7 6 59184 CASAVA_Build 1 206115049 1I ACTTGCTTTA -/T GTACATTCTC 3070 hom 81 het 39 0 28 11 T 0 1 59185 CASAVA_Build 1 206119648 1D CTTTTTAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 10 9 59186 CASAVA_Build 1 206119829 1I TCCATATATA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 47 27 18 2 T 7 8 59187 CASAVA_Build 1 206125966 1D TGCTTACAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2457 hom 20 7 9 4 T 10 9 59188 CASAVA_Build 1 206126392 3I TGAGGTGCTC ---/CAA CCTCTTCCCT 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 CAA 0 1 59189 CASAVA_Build 1 206132114 1D CTCAATGAAG C/- TGGTCCTACC 3070 hom 141 het 52 0 47 5 C 1 0 59190 CASAVA_Build 1 206150823 1I CGCTGGCCCC -/G GGGGGGAAGC 2999 het 314 hom 21 1 13 7 G 6 7 59191 CASAVA_Build 1 206155134 1I ACAGAGGAGT -/G AGGTTGGGGC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 0 1 59192 CASAVA_Build 1 206164642 1D GCCCTATTAC T/- ACTCAAATGT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 1 0 59193 CASAVA_Build 1 206165956 4D TTATTCAATA TTAT/---- TTATTTGTTA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TTAT 2 1 59194 CASAVA_Build 1 206167197 3D AAGTGTGCAG AGA/--- AGAAGAAAAG 3070 hom 170 het 64 0 57 7 AGA 3 2 59195 CASAVA_Build 1 206178631 1D GGCATTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 30 3 23 5 T 15 14 59196 CASAVA_Build 1 206181103 1D AAAAATACCA T/- TTTTTTAATA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 6 59197 CASAVA_Build 1 206192209 1D AGATAATTAA T/- TTTTAAATTA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 5 4 59198 CASAVA_Build 1 206192583 1D TATTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 30 0 25 5 T 11 10 59199 CASAVA_Build 1 206193742 2D GTGAGTTTTC AA/-- AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 10 8 59200 CASAVA_Build 1 206195863 6I TTCTGAGTAG ------/TATGAC TGTGTTTGGG 3070 hom 128 het 51 0 41 10 TATGAC 0 1 59201 CASAVA_Build 1 206213490 1I CTTCTTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 40 het 40 1 32 7 T 9 10 59202 CASAVA_Build 1 206213904 2I TAAAATGAAA --/TT TTTTACTATT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 4 6 59203 CASAVA_Build 1 206216098 1D TATATTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 28 0 24 4 A 12 11 59204 CASAVA_Build 1 206234762 1D TTTCAGCCAT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 7 6 59205 CASAVA_Build 1 206237025 1I TTCTTTTTTT -/C TTTTTTTTGG 3070 hom 120 het 49 0 41 8 C 0 1 59206 CASAVA_Build 1 206251721 1I TGCTGTTTAC -/T TTTATTTTCT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 T 3 4 59207 CASAVA_Build 1 206270444 9D GATGGAAGGC CTGTCCTGG/--------- CAAAGTGGAC 3070 het 3070 ref 26 14 12 3 CTGTCCTGG 1 0 59208 CASAVA_Build 1 206271418 4D ATATGTGCAC TGTT/---- TGTTCCAGGA 3070 het 3070 ref 37 15 16 7 TGTT 2 1 59209 CASAVA_Build 1 206273028 1I TTTTGTCCTC -/T TTTTTTTTTT 2032 het 1571 hom 31 7 10 14 T 12 13 59210 CASAVA_Build 1 206296994 1I CTTTGAGTTC -/A AGGAAGATAG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 1 2 59211 CASAVA_Build 1 206315715 1D GAGCTTTTCT C/- TCTATTTATT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 C 1 0 59212 CASAVA_Build 1 206323787 1D TCCTACCCCT C/- CCCTCCCACC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 C 4 3 59213 CASAVA_Build 1 206343023 4I AGGACAATTC ----/CTCT CTCTCTCTGC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 CT 4 6 59214 CASAVA_Build 1 206359834 1I CCACCTGCCT -/C AGCCTCCCAA 3070 hom 50 het 21 0 17 4 C 0 1 59215 CASAVA_Build 1 206367243 2I GTGTGCATGT --/AC ACACACACAT 3070 hom 147 het 55 0 48 7 AC 4 5 59216 CASAVA_Build 1 206387418 1I AACCCCTTTT -/G TTTCATGGTT 3070 hom 99 het 34 0 32 2 G 0 1 59217 CASAVA_Build 1 206388279 3I GTGGAAGAGC ---/AGT AGAATTGGGA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 AGT 0 1 59218 CASAVA_Build 1 206398831 1D CTCCAACAAA T/- GGGTCGCTTT 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 T 1 0 59219 CASAVA_Build 1 206411995 1I GTTTTGCCAT -/A AAAAAAAAAA 2151 hom 36 het 18 0 10 8 A 12 13 59220 CASAVA_Build 1 206415549 1I CTGTGTCCTG -/T GACAGTCTAG 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 0 1 59221 CASAVA_Build 1 206426682 1I TGTTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 2924 hom 27 het 18 0 9 9 T 17 18 59222 CASAVA_Build 1 206430124 1D AGAAAAGGGA T/- TTTTTTTTCA 1218 het 1218 ref 56 44 3 9 T 9 8 59223 CASAVA_Build 1 206433829 1I TGCACAACTG -/A TACTGCAGCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 0 1 59224 CASAVA_Build 1 206434454 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 2156 het 237 hom 34 3 14 17 A 10 9 59225 CASAVA_Build 1 206435938 1D CAAGGGAGGT G/- GGGGGTACAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 G 6 5 59226 CASAVA_Build 1 206439658 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 22 0 18 7 A 11 10 59227 CASAVA_Build 1 206441942 1D AGGGCAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 27 2 17 8 T 17 16 59228 CASAVA_Build 1 206463161 9I TAAAGCAGGA ---------/ACTTTAGAT GAATGCTGAG 3070 hom 87 het 30 0 29 1 ACTTTAGAT 0 1 59229 CASAVA_Build 1 206501468 2I ATTAGGAAAC --/AA AAAAGGAAGT 3070 het 3070 ref 39 25 11 3 A 4 6 59230 CASAVA_Build 1 206517302 1D AGCAAACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 12 11 A 15 14 59231 CASAVA_Build 1 206527383 1D TGGTCAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 10 9 59232 CASAVA_Build 1 206527615 1D CTCATCTCCA T/- TTTTTTTTTT 2072 het 2072 ref 47 24 9 14 T 15 14 59233 CASAVA_Build 1 206544625 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 28 0 20 9 T 10 9 59234 CASAVA_Build 1 206581239 23D TCAAGCCTCT GCCTCTGCTACACAGAAGCATCA/----------------------- GCCTCTGCTA 2453 het 2453 ref 30 17 10 13 GCCTCTGCTACACAGAAGCATCA 2 1 59235 CASAVA_Build 1 206634537 1D GAAAGATGAG T/- TTTCCCTTTG 3070 hom 164 het 65 0 53 12 T 4 3 59236 CASAVA_Build 1 206639502 1I GCATGAACCC -/G GGGGGGCGGA 1761 hom 18 het 7 0 7 5 G 6 7 59237 CASAVA_Build 1 206646518 1D AAAAAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 14 14 A 14 13 59238 CASAVA_Build 1 206672345 1D TTTTTTTTTT G/- AGGACTAAGC 3070 het 2293 hom 29 10 13 6 G 1 0 59239 CASAVA_Build 1 206675898 4D ACCTGTAGGT AGGA/---- AGGAAGCAGT 3070 het 3070 ref 50 23 20 9 AGGA 2 1 59240 CASAVA_Build 1 206676981 1I TTAGAAAGGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 A 8 9 59241 CASAVA_Build 1 206679815 1I TTACCCCTCT -/A CCCCCTCCCA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 0 1 59242 CASAVA_Build 1 206682672 1D ATGTTTTGTA T/- TTTTTTTTGT 2976 het 2976 ref 25 14 7 4 T 9 8 59243 CASAVA_Build 1 206705262 2D CTTACTTTAA AC/-- ACTCATTTTT 2500 het 1121 hom 33 7 10 17 AC 2 1 59244 CASAVA_Build 1 206708894 1I CTAGCAACCT -/A AAAAATGTTT 3070 hom 138 het 51 0 45 6 A 5 6 59245 CASAVA_Build 1 206730541 1I TTTTAAGATT -/G TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 G 0 1 59246 CASAVA_Build 1 206732382 1I CTATTCCGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 11 12 59247 CASAVA_Build 1 206733665 1D TCTCTTTTTT G/- TGTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 12 2 G 1 0 59248 CASAVA_Build 1 206745249 1I TGGGCGTGAG -/C CCACTGTGCC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 C 2 3 59249 CASAVA_Build 1 206746336 1D AATGGCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 15 13 A 12 11 59250 CASAVA_Build 1 206783283 3I GTGGAGGAGG ---/TGA TGATGATGGC 3070 hom 116 het 49 0 35 14 TGA 2 3 59251 CASAVA_Build 1 206787515 1D TAAGATAAAC A/- GTAAATTTAT 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 A 1 0 59252 CASAVA_Build 1 206791519 1I CCATTAACTT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 6 7 59253 CASAVA_Build 1 206803080 2I TACACACGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 399 hom 41 1 35 5 TG 6 7 59254 CASAVA_Build 1 206822927 1I GAAAGCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 10 11 59255 CASAVA_Build 1 206830424 1I TGTCATGATC -/A GCAAAAGGCC 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 A 0 1 59256 CASAVA_Build 1 206832117 1I TCAGAAGTTT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 49 30 14 5 A 6 7 59257 CASAVA_Build 1 206844658 1I TCTAGCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 40 1 31 8 T 10 11 59258 CASAVA_Build 1 206861407 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 6 7 59259 CASAVA_Build 1 206870646 9I TTCCTCTCAG ---------/CCCCATTTC CCCTGTCTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CCCCATTTC 0 1 59260 CASAVA_Build 1 206886689 5I TCCTTCCTTC -----/CTTTT CTTTTCTTCT 3070 hom 29 het 12 0 10 2 CTTTT 1 2 59261 CASAVA_Build 1 206925090 1D AAAAAGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 905 hom 37 3 18 16 T 15 14 59262 CASAVA_Build 1 206936414 1I ATCTAAAGAT -/A AAATTAGGCG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 3 4 59263 CASAVA_Build 1 206987135 1D AATCTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 1312 het 1312 ref 49 24 4 21 T 13 12 59264 CASAVA_Build 1 207023169 2I CAAGGAAAGA --/AG TTTTTTTCTC 3070 hom 123 het 45 0 40 5 AG 0 1 59265 CASAVA_Build 1 207024461 18D TGAAAGGAGA ATATATATATATATATAT/------------------ ATATATATAT 3070 hom 78 het 29 0 27 7 AT 17 8 59266 CASAVA_Build 1 207041583 1D TCAAATGTGA T/- TTTTCTCTCC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 5 4 59267 CASAVA_Build 1 207102866 1D AACAAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 11 10 59268 CASAVA_Build 1 207109650 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 115 hom 19 2 15 3 A 17 16 59269 CASAVA_Build 1 207111293 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 2381 hom 33 het 18 0 12 6 T 8 9 59270 CASAVA_Build 1 207131378 3I CCATTATAAA ---/AAT AATATCATTG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 AAT 1 2 59271 CASAVA_Build 1 207149646 1I AAAAACGAGT -/G GGGGATTTGT 3070 hom 101 het 38 0 33 5 G 4 5 59272 CASAVA_Build 1 207160182 2D AGCATGGCAG GA/-- GAGAGAGATT 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 GA 5 4 59273 CASAVA_Build 1 207165752 1D ACTGCGACCG C/- CCCCCCCGCC 2889 het 2889 ref 29 11 11 7 C 8 7 59274 CASAVA_Build 1 207166310 2I TGCACACAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 AC 6 7 59275 CASAVA_Build 1 207172538 1D ATCCAAGATA C/- ATTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 C 1 0 59276 CASAVA_Build 1 207178377 2I TTTGCAAAAA --/GG GTTCCCATTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 1 3 59277 CASAVA_Build 1 207181595 3D AAATAGTTCA TCT/--- TCTACCTAGA 3070 het 3070 hom 45 21 22 6 TCT 2 1 59278 CASAVA_Build 1 207182173 1D GCATTGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 611 hom 28 3 10 15 A 14 13 59279 CASAVA_Build 1 207182624 1I TCAGGCTCAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 8 9 59280 CASAVA_Build 1 207185437 1I ATGTTCCTGG -/A AAAAATGCAA 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 A 5 6 59281 CASAVA_Build 1 207187029 2D TTTAATGCTT CA/-- GTCATAAGTA 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 CA 1 0 59282 CASAVA_Build 1 207190793 1I CAAGATTGAT -/A AATGATATAC 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 A 2 3 59283 CASAVA_Build 1 207195187 21D AAAACAACAG TTAAGAGATAAATCCACATCA/--------------------- TTAAGTCTAT 3070 het 3070 ref 29 18 15 2 TTAAGAGATAAATCCACATCA 1 0 59284 CASAVA_Build 1 207206789 10D ATTCTGTTTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 1949 het 1762 hom 18 7 9 4 A 24 14 59285 CASAVA_Build 1 207219335 1I CAACAACGTT -/A GCTGTCTTCA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 0 1 59286 CASAVA_Build 1 207221574 1D CTTTTACAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3021 hom 24 7 14 4 T 9 8 59287 CASAVA_Build 1 207226650 3I TTGAGAAAAG ---/TCT GAAGTAGCCA 3009 het 1884 hom 25 8 9 8 TCT 0 1 59288 CASAVA_Build 1 207228128 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1387 het 270 hom 4 1 3 0 T 7 6 59289 CASAVA_Build 1 207228319 1I CTTCTGCTTG -/C GCCACCACAT 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 C 0 1 59290 CASAVA_Build 1 207228716 1D ATTTACCAAT A/- AATTTAAAAT 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 A 3 2 59291 CASAVA_Build 1 207240143 2I AAAGTTAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 10 12 59292 CASAVA_Build 1 207240789 1I ACACTTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 10 11 59293 CASAVA_Build 1 207245127 1I AAAAAAAAAA -/T AATAAGAATG 2399 het 905 hom 24 6 10 8 T 0 1 59294 CASAVA_Build 1 207265769 1I ACAAACATCA -/G TGGTGAAACT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 G 0 1 59295 CASAVA_Build 1 207275789 1D TTATAAGGCC A/- AATCCATGTG 3070 het 3070 hom 45 16 24 6 A 3 2 59296 CASAVA_Build 1 207281550 1D ACAAGGTTAG A/- AAAAAAAAAA 1144 het 1144 ref 21 14 3 4 A 12 11 59297 CASAVA_Build 1 207288031 1D AAATATTGAT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 1 0 59298 CASAVA_Build 1 207288401 1D GGCTGAGGGG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 A 8 7 59299 CASAVA_Build 1 207289076 1D GTCATAGTCA T/- TATAGACACA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 T 2 1 59300 CASAVA_Build 1 207293955 1I TGGAAAACAC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 A 7 8 59301 CASAVA_Build 1 207302096 4I AGCTGCCATC ----/CTTT CTTTCTGGAA 3070 hom 161 het 58 0 54 4 CTTT 1 2 59302 CASAVA_Build 1 207307174 2I CTGTATTTTT --/TC TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 34 0 22 12 TC 0 1 59303 CASAVA_Build 1 207316336 1I GAAAAAATCA -/T TTTTTTAAGC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 6 7 59304 CASAVA_Build 1 207323495 1I GATCAGGAGG -/C CCAGAGATGG 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 C 2 3 59305 CASAVA_Build 1 207324666 21D AATAGCTCTC TCACATGTTGTGAAGCTACCT/--------------------- TCACATGTTG 3070 het 3070 ref 49 23 18 16 TCACATGTTGTGAAGCTACCT 1 0 59306 CASAVA_Build 1 207325850 1I CATTGTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 T 11 12 59307 CASAVA_Build 1 207344262 1I CCTAACTAAT -/C CCCCCCCCGA 3070 het 21 hom 30 1 21 8 C 8 9 59308 CASAVA_Build 1 207352566 1D CAGTCTGCAA C/- AAAATTTTCT 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 C 1 0 59309 CASAVA_Build 1 207366563 3I AGAAAAAAAA ---/AAG GACAATAAAA 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 AAG 0 1 59310 CASAVA_Build 1 207372661 1I GCTTGCTCAA -/T TGATCACGAC 3070 hom 108 het 43 0 38 5 T 1 2 59311 CASAVA_Build 1 207389035 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTAGATAG 3070 het 325 hom 42 1 34 7 G 0 1 59312 CASAVA_Build 1 207391781 1I ATGAGGGTGA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 8 9 59313 CASAVA_Build 1 207392873 1I TTTATAACTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 8 9 59314 CASAVA_Build 1 207404399 1D GCACATAAAG A/- AAACACCTAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 4 3 59315 CASAVA_Build 1 207404642 1D AAAATACAGA T/- TTTGATTTAC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 4 3 59316 CASAVA_Build 1 207415201 1D CAGGGCTCCT A/- AAAAATATGT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 A 6 5 59317 CASAVA_Build 1 207448037 8D TGTCTGGGAG GGCTGGGT/-------- GGCTGGGTGG 3070 hom 71 het 27 0 22 7 GGCTGGGT 3 2 59318 CASAVA_Build 1 207460940 2D TCACACACAT AC/-- ACACACACAC 2986 hom 39 het 16 0 14 2 AC 8 7 59319 CASAVA_Build 1 207472102 2D CTGCGCCCAG AA/-- AAGTCATTTT 2936 hom 36 het 13 0 9 4 A 4 2 59320 CASAVA_Build 1 207474559 2D AAAAAAAGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 21 0 16 5 A 14 12 59321 CASAVA_Build 1 207479008 1I CTGGGAAACA -/T TAATACAATC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 2 59322 CASAVA_Build 1 207482247 1D GAGTTGGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 12 11 59323 CASAVA_Build 1 207492963 1I ATGCCAGGGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 8 9 59324 CASAVA_Build 1 207495892 1I TTATATGATG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 122 hom 31 1 24 6 T 7 8 59325 CASAVA_Build 1 207504915 3D CGGTGGGGAA CCC/--- CCCCCCCCCC 2343 het 15 hom 21 1 8 13 C 15 12 59326 CASAVA_Build 1 207511597 2D AAAATTTATG TA/-- TAGAGTCTGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TA 2 1 59327 CASAVA_Build 1 207536632 4I TTTGCTAAGT ----/ACTG GAACAGAATA 3070 het 3070 hom 58 26 28 4 ACTG 0 1 59328 CASAVA_Build 1 207550585 1D ACTTTTTAAA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 7 6 59329 CASAVA_Build 1 207553463 1I TGTAAAATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 9 10 59330 CASAVA_Build 1 207554883 5I GTAAATATGA -----/ACTAC ACCATCCAAC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 ACTAC 0 1 59331 CASAVA_Build 1 207557051 1I TACATTCTCT -/G TGAAATAGAT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 G 0 1 59332 CASAVA_Build 1 207566499 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 1776 het 826 hom 14 3 6 5 T 12 11 59333 CASAVA_Build 1 207573880 2I TGTGACTCAG --/AA AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 8 10 59334 CASAVA_Build 1 207585219 26D AGGTATCAGA ATTTTCCCTTTCTTTCTCACTGAGGT/-------------------------- ATTGTCCCAG 3070 het 3070 ref 46 26 23 7 ATTTTCCCTTTCTTTCTCACTGAGGT 1 0 59335 CASAVA_Build 1 207591198 2D3M7D GTAGATTTTT GACAAGAAGTAG/--CAA------- AGCTTGGGAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 8 N/A 0 0 59336 CASAVA_Build 1 207591888 1I CACTTAGCAT -/A ATGAATTAAA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 1 2 59337 CASAVA_Build 1 207681635 2D AGTTGTGTGT GC/-- TCCTGTGTTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 7 GC 1 0 59338 CASAVA_Build 1 207683649 1I TACTTATATG -/A ATACAATTAT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 1 2 59339 CASAVA_Build 1 207701873 1D TAACAAACAG A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 7 6 59340 CASAVA_Build 1 207703788 1I CCCCTTCAAG -/A GATGGAGTTC 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 0 1 59341 CASAVA_Build 1 207706310 1I GAGGAATATA -/G TACTTTGGTT 3070 het 3070 hom 49 17 27 5 G 0 1 59342 CASAVA_Build 1 207707866 1I GTAGGGAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 8 9 59343 CASAVA_Build 1 207714002 3I CTGTCTCTAA ---/AAT AATAATTGGC 3070 het 3070 hom 41 20 16 7 AAT 2 3 59344 CASAVA_Build 1 207715295 1I AAAGAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 A 10 11 59345 CASAVA_Build 1 207716022 7I TGTAATTGCA -------/GCTGGCT GCTGGCTGAG 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 GCTGGCT 1 2 59346 CASAVA_Build 1 207722102 1D CAACTTGGAG T/- GAATCTCAGG 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 1 0 59347 CASAVA_Build 1 207728447 4I TTGGCCAGCC ----/AAAG AAAGACAGTA 3070 het 3070 hom 54 25 25 4 AAAG 1 2 59348 CASAVA_Build 1 207729502 1I ACTCTCACCT -/G GTTACTGCGG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 G 1 2 59349 CASAVA_Build 1 207745395 1I CCATCTGCCC -/T TGATGGGCTC 3070 het 3070 ref 48 22 13 13 T 1 2 59350 CASAVA_Build 1 207746878 1I TCTTTCTTCC -/T TTTTTTTTCC 2890 het 2890 ref 41 24 10 7 T 8 9 59351 CASAVA_Build 1 207748619 2I CTTTTTTTGC --/CA CACAGCAGAA 3070 het 3070 ref 60 35 21 4 CA 2 3 59352 CASAVA_Build 1 207762881 1I AACATTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 A 11 12 59353 CASAVA_Build 1 207763116 1D TCAAAGCCAC T/- TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 7 6 59354 CASAVA_Build 1 207768241 1D TACAGCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 13 20 13 A 12 11 59355 CASAVA_Build 1 207796196 1D ATTAAGGCAC A/- AAAGCTCATC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 4 3 59356 CASAVA_Build 1 207797918 1D CTGCTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 11 10 59357 CASAVA_Build 1 207802035 1I TTCTTCTAGA -/C CACCCACATG 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 C 1 2 59358 CASAVA_Build 1 207809202 5I ATCTGGAAAG -----/ACACT ACAAACTGTA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 ACACT 0 1 59359 CASAVA_Build 1 207809853 2D TTTGAATCAC CA/-- CAGTTTTCAA 3070 het 3070 hom 42 17 19 8 CA 2 1 59360 CASAVA_Build 1 207810644 1D CTGGGTGGCT A/- AAATGACAGA 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 4 3 59361 CASAVA_Build 1 207811357 2I GATTACAGGC --/AT ATATACCACC 3070 het 1382 hom 23 5 13 5 AT 2 3 59362 CASAVA_Build 1 207815116 1D GACTTGTCTC T/- TAACATGGAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 1 59363 CASAVA_Build 1 207835523 2I TTGCCTCTGT --/CA CAGGAGAGGG 3070 hom 120 het 48 0 39 9 CA 1 2 59364 CASAVA_Build 1 207847136 1D ACCCTCCCAG A/- AAGGCAGGTC 3070 het 3070 ref 57 28 19 11 A 3 2 59365 CASAVA_Build 1 207849301 1D AAAAGGAGAT G/- GGGGGGCAGT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 G 7 6 59366 CASAVA_Build 1 207858639 1I TGGAAGACAA -/C CACGCATTTG 3070 hom 69 het 28 0 21 7 C 1 2 59367 CASAVA_Build 1 207879593 6D ATATACACAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 22 21 14 AC 9 6 59368 CASAVA_Build 1 207899971 1I AAATCTTGTT -/C ATTACAAGTG 3070 het 3070 ref 74 40 28 6 C 0 1 59369 CASAVA_Build 1 207916023 1D CAGACCGAGA G/- AGGAATGGAG 3070 hom 76 het 30 0 23 7 G 1 0 59370 CASAVA_Build 1 207916338 1D ATTTTGAAAT A/- AAAAAACTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 6 59371 CASAVA_Build 1 207926632 3D ATTATAGAAA TGT/--- TGTAAGCAGT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TGT 2 1 59372 CASAVA_Build 1 207946840 1I TGGGGTCACC -/A AAGAGCTTTT 3070 het 3070 ref 54 29 20 5 A 2 3 59373 CASAVA_Build 1 207947132 1D AAGGTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 13 25 7 A 11 10 59374 CASAVA_Build 1 207947895 1D GAACAACAAG A/- AAAAAAAAAA 2154 het 2154 ref 31 13 9 9 A 12 11 59375 CASAVA_Build 1 207956313 1D AAAAAAAAAA C/- CACCTAGGAA 3070 het 3070 ref 28 17 11 1 C 2 1 59376 CASAVA_Build 1 207981177 4D GTCATTTATC TTGT/---- TTATTATCTG 3070 het 3070 hom 35 15 19 3 TTGT 1 0 59377 CASAVA_Build 1 207986188 2D TATCTCACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 8 9 A 12 10 59378 CASAVA_Build 1 207989020 4D GAAGAAAAAC AAAT/---- AAATGCATGC 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AAAT 2 1 59379 CASAVA_Build 1 207989531 3I ACTGAAACTA ---/CTC CTCCATTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 CTC 1 2 59380 CASAVA_Build 1 207992909 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 28 1 20 7 A 10 11 59381 CASAVA_Build 1 207992919 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 731 hom 25 4 16 5 T 7 8 59382 CASAVA_Build 1 207993391 5I CTCTCTATAA -----/TTACT TTAATTTCCA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TTACT 0 1 59383 CASAVA_Build 1 207994072 2I CTCAAAGTTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 22 17 11 TG 8 9 59384 CASAVA_Build 1 207994274 1I TGACTGCGGA -/G CTTTGTAGAC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 G 0 1 59385 CASAVA_Build 1 207995626 2D AAAGGAGCAA AT/-- CCAGAGTTGG 3070 het 3070 ref 55 28 19 8 AT 1 0 59386 CASAVA_Build 1 208001846 1I GTAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 71 29 34 8 A 9 10 59387 CASAVA_Build 1 208003588 2I GAACAAAGCT --/CA TGGGCTTCTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CA 0 1 59388 CASAVA_Build 1 208009214 1I GTGTGGAACC -/G GAAGATGTGA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 1 2 59389 CASAVA_Build 1 208011279 4D GCATGTGAAG GTGT/---- GTGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 87 38 32 20 GT 5 3 59390 CASAVA_Build 1 208011731 2D GCATGTGAAG GT/-- GTGTGTGTAT 3070 het 3070 ref 62 31 18 13 GT 5 4 59391 CASAVA_Build 1 208024764 2D GTTTCCCGCT GC/-- TGCCCTCATT 3070 hom 78 het 29 0 25 6 GC 1 0 59392 CASAVA_Build 1 208033025 3D GGTTTAAAAA AAG/--- AAAAAAGAGT 3070 het 41 hom 37 2 18 17 AAG 1 0 59393 CASAVA_Build 1 208033545 5D TTGTGTTTAC TTTTA/----- TTTTAGTTTC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TTTTA 2 1 59394 CASAVA_Build 1 208035800 1I TTTGTCAATT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 7 59395 CASAVA_Build 1 208038137 14D TTGTGGTATG GAATGAAGAAGTTT/-------------- GACAACATTC 3070 hom 84 het 26 0 26 6 GAATGAAGAAGTTT 1 0 59396 CASAVA_Build 1 208038877 9D ACTCTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 2639 het 57 hom 17 1 12 4 A 23 14 59397 CASAVA_Build 1 208043850 2I GCAGGGGGAA --/AC ACAGCATACA 3070 hom 138 het 47 0 47 0 AC 1 2 59398 CASAVA_Build 1 208046621 8D AAGTTACTTA GCTTCTTG/-------- GCTTCTTGGT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 GCTTCTTG 2 1 59399 CASAVA_Build 1 208047673 6D ATACAAAAAA ATTTGT/------ ATTTGTATTT 3070 hom 106 het 43 0 36 9 ATTTGT 2 1 59400 CASAVA_Build 1 208049036 2D TTAACGATTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 40 het 26 0 18 9 A 11 9 59401 CASAVA_Build 1 208063747 1D TTTTGAGTTC A/- ATACTAGTGT 3070 hom 144 het 53 0 49 6 A 2 1 59402 CASAVA_Build 1 208065658 7I GGGAGGGAAA -------/AAGAAAG AAGAAGAACA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AAGAAAG 0 1 59403 CASAVA_Build 1 208066681 1I CCCTGCACAC -/T TTGCAAATCC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 2 3 59404 CASAVA_Build 1 208066799 1I ACTTTTCTTA -/T TGTATACAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 59405 CASAVA_Build 1 208067189 5D TAGCGTGTTA TCTTT/----- TCTTTTCTTT 475 het 47 hom 22 1 5 17 TCTTT 3 2 59406 CASAVA_Build 1 208067749 1D AAAGCTCATG C/- CCCCGACTCA 3070 hom 144 het 51 0 47 4 C 5 4 59407 CASAVA_Build 1 208069618 4I CTCCGGGCTA ----/ATTT ATTTTTCTTA 3070 hom 55 het 23 0 19 4 ATTT 1 2 59408 CASAVA_Build 1 208074562 2D AAAGTGATGA CT/-- CTAGGGAACA 3070 hom 132 het 48 0 44 7 CT 2 1 59409 CASAVA_Build 1 208078334 1I43M1I ATTGTGGTCA -TTTTTTTTTAGAAATGCTTTATTGTCATTTCTGAAACACTGTA-/TTTTTTTTTTAGAAATGCTTTATTGTCATTTCTGAAAGACTGTAC TAGAGAATGC 3070 het 351 hom 43 1 51 3 N/A 0 0 59410 CASAVA_Build 1 208082192 2D CATGTAAATG CT/-- CTCAGTCAAC 3070 hom 138 het 49 0 46 4 CT 2 1 59411 CASAVA_Build 1 208083959 4D AGGACAACTC AAAT/---- GAATACAAGG 3070 hom 165 het 61 0 51 12 AAAT 1 0 59412 CASAVA_Build 1 208085832 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 19 0 10 9 T 13 12 59413 CASAVA_Build 1 208094293 2D TTTTCTTTTT GA/-- GAGAGAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 39 9 GA 4 3 59414 CASAVA_Build 1 208098093 2I GGACAGAGTA --/CG CGAGGAGATG 3070 hom 51 het 23 0 17 6 CG 1 2 59415 CASAVA_Build 1 208105339 1D CAGCCTGGAC A/- ACATAGTGAG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 2 1 59416 CASAVA_Build 1 208105448 1I GGAGGATTGC -/T TGAACCTGGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 1 2 59417 CASAVA_Build 1 208113643 1I TCTGGAAGGT -/G GCACATGACA 3070 hom 129 het 48 0 42 6 G 1 2 59418 CASAVA_Build 1 208123477 1I AAAATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 A 12 13 59419 CASAVA_Build 1 208159711 3D GGAAATGCAG AAA/--- TCACCCATCT 3070 hom 21 het 8 0 8 1 A 3 0 59420 CASAVA_Build 1 208160442 2D TTGTGTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 41 0 32 10 T 14 12 59421 CASAVA_Build 1 208160905 1I TTTTCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 13 14 59422 CASAVA_Build 1 208182329 2D TGCAAATTTA CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 7 hom 33 0 15 18 C 13 11 59423 CASAVA_Build 1 208190043 6D AAATAATGCT GTTACA/------ GTTAAGATTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 GTTACA 1 0 59424 CASAVA_Build 1 208196251 4I GAACAAACCC ----/CAAA CAAATAATGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CAAA 1 2 59425 CASAVA_Build 1 208200572 1D CTTGAAGCTA G/- GTTGGCCACC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 G 2 1 59426 CASAVA_Build 1 208222539 2D CTGGATGTTG CA/-- CAGTTTTATT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 CA 2 1 59427 CASAVA_Build 1 208257113 1D TTTCTCTTGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 46 19 24 5 T 8 7 59428 CASAVA_Build 1 208272862 2I AAGTATTCTC --/TA AATTTGTTCA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 TA 0 1 59429 CASAVA_Build 1 208302990 1D TTTTTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 13 12 59430 CASAVA_Build 1 208312978 1D TGCAATCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1251 hom 23 3 15 5 A 17 16 59431 CASAVA_Build 1 208340761 1I GAATTTATTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 426 hom 29 1 26 2 T 8 9 59432 CASAVA_Build 1 208348254 1D GGAAGAAAGA G/- GCAATAAGAG 3070 hom 126 het 47 0 41 6 G 2 1 59433 CASAVA_Build 1 208362574 1D CTCTGTCGCA T/- TTTTTTTTTT 1067 het 1067 ref 33 21 3 9 T 12 11 59434 CASAVA_Build 1 208363196 2D CAATAAATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 341 hom 36 1 32 3 AT 6 5 59435 CASAVA_Build 1 208392841 1D GGTTGTTTGA T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 6 59436 CASAVA_Build 1 208406520 1I GGTGACACAG -/C AAGACCTTGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 0 1 59437 CASAVA_Build 1 208411382 7I ATTGGTCTGG -------/TTGAGTT GTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTGAGTT 0 1 59438 CASAVA_Build 1 208416467 2I AGTTTTTTTT --/TG GGGGGGTGTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TG 0 1 59439 CASAVA_Build 1 208418581 4D CAGAGGGGAC TTTG/---- TTTGCCTTGC 3070 hom 130 het 46 0 43 3 TTTG 2 1 59440 CASAVA_Build 1 208418725 1I TGCAGCAAAA -/G GAAAAACTGG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 G 1 2 59441 CASAVA_Build 1 208431984 1I TGGACCAAGG -/A AAAATATCTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 4 5 59442 CASAVA_Build 1 208442096 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 102 hom 42 1 32 9 A 9 10 59443 CASAVA_Build 1 208447997 2I GTCATTGAAC --/TG TATTCTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TG 0 1 59444 CASAVA_Build 1 208450930 1D TTTCAGTGCA C/- CCCCCCACCA 3070 hom 56 het 23 0 18 5 C 7 6 59445 CASAVA_Build 1 208452842 1I ATAAGACTGG -/A TTGCTCTCTG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 0 1 59446 CASAVA_Build 1 208468670 1D AGTCAAGAAA T/- TTTTTTTTTT 2529 het 324 hom 24 3 8 13 T 17 16 59447 CASAVA_Build 1 208475595 5I GCATAATAGG -----/ATCTC ATATGCTGGA 3070 het 3070 hom 53 20 28 5 ATCTC 0 1 59448 CASAVA_Build 1 208481044 18I TTCATGAGGT ------------------/CATGGTTAGTTACATACC CATGTAACTA 3070 het 3070 ref 46 28 15 4 CATGGTTAGTTACATACC 0 1 59449 CASAVA_Build 1 208490998 1D ACTATAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 772 hom 28 6 12 10 T 16 15 59450 CASAVA_Build 1 208494648 1D TTTGGGGGAG A/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 1 0 59451 CASAVA_Build 1 208495401 5I TCCTTATCTG -----/TTGCT AAGGCCATGG 3070 hom 96 het 34 0 31 3 TTGCT 0 1 59452 CASAVA_Build 1 208505354 1D AACAAGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2366 hom 29 6 11 13 T 12 11 59453 CASAVA_Build 1 208507311 2D TTTTTTTGAA AC/-- AGAGTCTCGC 2388 het 890 hom 14 4 6 4 AC 1 0 59454 CASAVA_Build 1 208509515 1D GTTGAAGACT G/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 G 1 0 59455 CASAVA_Build 1 208512252 2D GTACAGAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 31 0 16 15 A 16 14 59456 CASAVA_Build 1 208526141 1I TCCTAGGAAA -/G TTTCATTCAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 G 0 1 59457 CASAVA_Build 1 208528172 3I TGCTAGAGCA ---/ATT ATTGGAGGAA 3070 hom 132 het 53 0 43 10 ATT 1 2 59458 CASAVA_Build 1 208529602 9D TTCTGGGGGG TGTAATTCC/--------- TGTAATTCCT 2842 het 2842 ref 24 13 7 7 TGTAATTCC 2 1 59459 CASAVA_Build 1 208530494 2D ACCAAGCCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 16 25 12 A 13 11 59460 CASAVA_Build 1 208532058 6I CATTAGGTAA ------/TATAAT TATATTAATT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 TATAAT 0 1 59461 CASAVA_Build 1 208533992 1D TAGTAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 21 6 T 11 10 59462 CASAVA_Build 1 208534935 1I ACTTTTCAAC -/T GCAGAGAGCC 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 0 1 59463 CASAVA_Build 1 208539369 1D TTCAATTACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 T 10 9 59464 CASAVA_Build 1 208551721 2I4M4I CTGTTGTGAT --CAGA----/TGCGGAGGAC ACAGAAAAGG 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 N/A 0 0 59465 CASAVA_Build 1 208556819 1I5M1I GTTATCCGTA -GATAA-/GGATAAC CAATGAATTT 3070 hom 108 het 39 0 35 9 N/A 0 0 59466 CASAVA_Build 1 208562592 2D CAGCCTGGGC TT/-- AATAAGAGCG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 2 0 59467 CASAVA_Build 1 208566563 1I TTTTAAAATT -/A ACACTTTGCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 1 2 59468 CASAVA_Build 1 208571800 8D CATTGAGGAG GTAAGCAA/-------- GTAAGCAAGT 3070 het 3070 hom 41 19 16 9 GTAAGCAA 2 1 59469 CASAVA_Build 1 208573412 1I TAATAAAATG -/A AAAAAACTAA 3070 het 2477 hom 22 7 10 5 A 6 7 59470 CASAVA_Build 1 208573435 6D AGCTCCAAAT GTATGA/------ GTATATGTAC 3070 het 2040 hom 25 5 13 8 GTATGA 1 0 59471 CASAVA_Build 1 208575899 3I TGCCTCACAT ---/AAC AACATGGATG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AAC 1 2 59472 CASAVA_Build 1 208576098 1I CATTCTTTTG -/T TTTTTTGGAG 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 6 7 59473 CASAVA_Build 1 208577818 4I ACAGAGGGGA ----/TCTT TCTATTTTGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TCTT 0 1 59474 CASAVA_Build 1 208578152 1D GCCCCCATTT A/- AAAAAAAAAA 2520 het 1314 hom 19 7 6 7 A 11 10 59475 CASAVA_Build 1 208579397 3I GGTCTGTTTT ---/CTC CTCCTCCTTG 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 CTC 2 3 59476 CASAVA_Build 1 208584860 21D CAAGACGAGT CATCGGAACAAGTCATGCCGG/--------------------- CATCGGAACA 3070 hom 104 het 33 0 29 12 CATCGGAACAAGTCATGCCGG 2 1 59477 CASAVA_Build 1 208593196 1D AGCCACCACG C/- CCGGCCCCTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 C 3 2 59478 CASAVA_Build 1 208593402 4D AAGTCACCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1418 hom 29 12 14 5 T 20 16 59479 CASAVA_Build 1 208596062 1D TGCTTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 2188 het 1089 hom 20 6 7 7 T 15 14 59480 CASAVA_Build 1 208599840 1I GGGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 10 11 59481 CASAVA_Build 1 208614234 1D GAAACCAGTG T/- AATGCTACAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 1 0 59482 CASAVA_Build 1 208615105 2D GTTTTATCAC AT/-- GTGTAGATTC 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AT 1 0 59483 CASAVA_Build 1 208615268 2D ATGTGTATAT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 AC 5 4 59484 CASAVA_Build 1 208615831 1D TTCAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 28 1 17 11 A 15 14 59485 CASAVA_Build 1 208623305 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAGAGCT 3070 hom 56 het 21 0 19 2 A 6 5 59486 CASAVA_Build 1 208625095 1I TATTATATCC -/T TTTTTTCCAC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 6 7 59487 CASAVA_Build 1 208627306 2I AAAGGCTAGA --/AT AGTGTGTAAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 AT 0 1 59488 CASAVA_Build 1 208630447 4I ATAAACATAA ----/AGAT AGATAGGTCT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AGAT 1 2 59489 CASAVA_Build 1 208634971 2I CATATGTATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 TA 5 6 59490 CASAVA_Build 1 208635406 1D CACTGACACC A/- ATCCTTGGAG 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 2 1 59491 CASAVA_Build 1 208637063 1I AATATCCTGG -/T TTATGATATT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 2 3 59492 CASAVA_Build 1 208655635 1I AATTTTTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 T 9 10 59493 CASAVA_Build 1 208658366 1D GAGCTGGAGT G/- GGGGGTGAGC 3070 het 2256 hom 28 8 14 8 G 6 5 59494 CASAVA_Build 1 208658991 2D CAAAGCATGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 4 CT 2 1 59495 CASAVA_Build 1 208664404 1I GTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 9 10 59496 CASAVA_Build 1 208669561 1D AATAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 11 10 59497 CASAVA_Build 1 208673537 1D GTGGGGGTGG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 33 15 10 9 A 8 7 59498 CASAVA_Build 1 208685845 1D TTACAGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 12 11 59499 CASAVA_Build 1 208688774 1I TGGATTTCAG -/C CAGTGAGGGT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 C 1 2 59500 CASAVA_Build 1 208689042 1I AACAAAAATC -/T ATTTAGATGC 3070 het 3070 ref 41 27 11 3 T 0 1 59501 CASAVA_Build 1 208689882 1I CAGAGAGGAA -/G GTGGAGATTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 G 1 2 59502 CASAVA_Build 1 208706737 1I ATTTTAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 11 59503 CASAVA_Build 1 208714993 1I ATTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 9 10 59504 CASAVA_Build 1 208721380 1D TTTCTAACAC T/- TGTGTTTTCT 3070 het 3070 hom 73 33 32 10 T 2 1 59505 CASAVA_Build 1 208723582 4I AGCTATCATC ----/TAAA TAAATAAAGC 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 TAAA 2 3 59506 CASAVA_Build 1 208741992 3D ATTCTTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2247 hom 27 11 12 6 T 15 12 59507 CASAVA_Build 1 208742940 1D ACTGAAGATA T/- TTTTTTTTTT 3065 het 3065 ref 30 11 9 10 T 13 12 59508 CASAVA_Build 1 208748497 1D GAACAGGATG A/- AAAGGCATAT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 4 3 59509 CASAVA_Build 1 208756048 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 9 10 59510 CASAVA_Build 1 208756705 1I TGTTTGGCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 11 12 59511 CASAVA_Build 1 208759660 1D TGCCCAGCAA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 8 7 59512 CASAVA_Build 1 208766335 1D GTGGGTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1117 hom 42 8 17 17 T 11 10 59513 CASAVA_Build 1 208769272 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAACAA 1549 het 1548 ref 27 9 8 10 A 8 7 59514 CASAVA_Build 1 208772741 4D TGGAGAGGGA AAAC/---- AAACATTTAT 3070 het 3070 ref 35 20 14 3 AAAC 2 1 59515 CASAVA_Build 1 208773154 18D ACTGGCACCT GAATTTGGATATGGCCAG/------------------ GAGTGATAAG 3070 het 3070 ref 37 24 15 6 GAATTTGGATATGGCCAG 1 0 59516 CASAVA_Build 1 208776841 1D TCTGCTAAAT G/- TCAGTAGCAT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 G 1 0 59517 CASAVA_Build 1 208780123 1D TTGGTATTTC T/- TTTTCACAAT 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 5 4 59518 CASAVA_Build 1 208781139 14D AAAATATAAG ACAATATATTTTTA/-------------- TTTTATATTA 3070 het 3070 ref 17 11 7 1 ACAATATATTTTTA 1 0 59519 CASAVA_Build 1 208783318 1D GGTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 T 11 10 59520 CASAVA_Build 1 208790892 1I ACCTTGGCCT -/C CCCAAAGCTC 3070 het 2542 hom 27 8 15 4 C 3 4 59521 CASAVA_Build 1 208815408 1D TCCTTTGCCC A/- AACCTCCAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 3 2 59522 CASAVA_Build 1 208817041 1I GTTTAACGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 10 11 59523 CASAVA_Build 1 208820744 1I ATAGTGCTGC -/A AAAAAACATA 1875 het 1875 ref 15 8 5 2 A 6 7 59524 CASAVA_Build 1 208834933 1I TTTCAGATTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 8 9 59525 CASAVA_Build 1 208837424 13D CTAAGATGCC ATCCAGGAGCCAG/------------- GTCCTGGAGT 3070 hom 105 het 36 0 33 5 ATCCAGGAGCCAG 1 0 59526 CASAVA_Build 1 208845956 1I CCTGAGTAGC -/T GGGACTACAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 0 1 59527 CASAVA_Build 1 208847344 4D GATGTTTATG TTGT/---- TTAATTGGAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TTGT 1 0 59528 CASAVA_Build 1 208849379 5D AATTTTAAAA AATGT/----- AATGGTGTGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AATGT 1 0 59529 CASAVA_Build 1 208850337 2D GGGTTGCTTG TT/-- TTTCTCTTGT 3070 hom 106 het 39 0 36 4 T 5 3 59530 CASAVA_Build 1 208850651 1D CTTGAATTAA T/- TTTTTATATG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 6 5 59531 CASAVA_Build 1 208859728 1I GCCACTCTCA -/T TTTTTTGCTG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 6 7 59532 CASAVA_Build 1 208860861 1D TGATTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 30 4 12 14 T 13 12 59533 CASAVA_Build 1 208875148 1I ATGAGTAAGT -/A CCAGACTCGG 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 A 0 1 59534 CASAVA_Build 1 208875893 1I CGTTCTGGAA -/G GGGGGGTGCC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 6 7 59535 CASAVA_Build 1 208883673 1D AGTAGATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 22 7 8 T 13 12 59536 CASAVA_Build 1 208883896 2I GAGAAATTTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 T 9 11 59537 CASAVA_Build 1 208888621 1D AAAGCCCCAC A/- AGCTGATTGA 3070 het 3070 ref 50 27 23 1 A 2 1 59538 CASAVA_Build 1 208896373 1D AGCACACATA C/- CCCCCCCGTC 3070 hom 85 het 35 0 25 10 C 8 7 59539 CASAVA_Build 1 208902327 1I AGCGGTTGTC -/A GGGGTGTCTG 3070 het 3070 hom 51 19 21 11 A 0 1 59540 CASAVA_Build 1 208904680 1D GAGATGGTGG C/- CAAGTGCAGG 3070 het 3070 ref 49 29 18 2 C 2 1 59541 CASAVA_Build 1 208909357 3D TTAGCTGTAG TTA/--- TTATACAGCT 3070 het 3070 hom 51 24 25 6 TTA 2 1 59542 CASAVA_Build 1 208918317 1I TAAATAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 11 12 59543 CASAVA_Build 1 208920327 1D ATGGTGCCAC A/- TATCATGCCC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 1 0 59544 CASAVA_Build 1 208925687 6D CACAGCCCCC AGATGA/------ AGATGACAAG 3070 het 3070 ref 37 21 13 8 AGATGA 2 1 59545 CASAVA_Build 1 208934413 1D AACAGCTGAA G/- GGTGGTGGGA 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 G 3 2 59546 CASAVA_Build 1 208935721 3I CAAGAGAAAT ---/ATC ATGAGGATGA 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 ATC 0 1 59547 CASAVA_Build 1 208949702 6D AGAGAGAGAG AGAGAA/------ AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 40 14 19 8 AGAGAA 1 0 59548 CASAVA_Build 1 208983161 1D GTCCTTTCCT A/- GTAGGTGTCA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 1 0 59549 CASAVA_Build 1 208995309 1I AACAAGCTTA -/G AGATGAAAGG 3070 hom 72 het 32 0 23 9 G 0 1 59550 CASAVA_Build 1 209010138 1D GACACAGGGA G/- GGGGAACATC 3070 het 3070 hom 29 11 16 3 G 5 4 59551 CASAVA_Build 1 209012476 1I GACAAGCCTC -/T TTTTTTTTTT 1057 het 1057 ref 38 20 3 15 T 13 14 59552 CASAVA_Build 1 209013633 1I GGATTCAGCT -/C AGGTATCACC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 C 0 1 59553 CASAVA_Build 1 209032653 1D CAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 A 13 12 59554 CASAVA_Build 1 209037447 1I AGATACCTTT -/G GCCCATCCAG 3070 het 3070 hom 52 18 26 8 G 1 2 59555 CASAVA_Build 1 209046597 1D TTCATCCATG T/- TACTGCATGT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 2 1 59556 CASAVA_Build 1 209064125 2D GTAAATGTGA CC/-- CCCCCTTAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 7 5 59557 CASAVA_Build 1 209071948 4I TTATTTAACT ----/TTAA TTAATTTCAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTAA 1 2 59558 CASAVA_Build 1 209075260 1D GTGAGACCAA G/- TATTAATTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 G 1 0 59559 CASAVA_Build 1 209089331 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1362 het 190 hom 28 2 7 19 T 17 16 59560 CASAVA_Build 1 209100081 1D AGAATCTTTT G/- TGCACATACT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 G 1 0 59561 CASAVA_Build 1 209103940 3D ATTAGGAAAC CTG/--- CTGCTAACTA 3070 hom 132 het 47 0 43 6 CTG 2 1 59562 CASAVA_Build 1 209106880 4D CCATACAATA AATT/---- ATTATTCAGT 3070 hom 108 het 37 0 37 4 AATT 1 0 59563 CASAVA_Build 1 209108393 1I TAATGTATAA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 6 7 59564 CASAVA_Build 1 209115768 1D ACACTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1073 hom 28 4 12 14 A 15 14 59565 CASAVA_Build 1 209135128 1D TTTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 10 9 T 12 11 59566 CASAVA_Build 1 209143079 1D GCCATCTCTC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 T 9 8 59567 CASAVA_Build 1 209154757 3D ACCTAAAGTG GGA/--- GGAGGACTGG 3070 het 3070 ref 49 26 19 6 GGA 3 2 59568 CASAVA_Build 1 209157315 2D AGAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 1020 het 1020 ref 32 22 3 9 AG 8 7 59569 CASAVA_Build 1 209169900 1D CAATAGCTGC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 A 7 6 59570 CASAVA_Build 1 209176801 1D TCCAACTCTG A/- AATCTTACAC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 A 3 2 59571 CASAVA_Build 1 209190336 1I CCTCCCCCCT -/C CCCCCACCCC 1393 hom 10 het 4 0 4 0 C 5 6 59572 CASAVA_Build 1 209192653 1D ACTCTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 15 11 A 13 12 59573 CASAVA_Build 1 209211676 4I AAAATCTAAA ----/AGTC AGGACATTTT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 AGTC 0 1 59574 CASAVA_Build 1 209218007 1I TCTCCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 617 het 617 ref 18 5 4 9 T 17 18 59575 CASAVA_Build 1 209247898 1I AAAAAGGGAA -/C CCTTGAGCAC 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 C 2 3 59576 CASAVA_Build 1 209256785 1D GAGGCAGGAG A/- ATTGCCTGAA 3070 het 1687 hom 14 4 10 0 A 2 1 59577 CASAVA_Build 1 209260911 2I CTTTCATGAT --/AA AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 8 10 59578 CASAVA_Build 1 209262779 1D TCAAAAAGAC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 A 8 7 59579 CASAVA_Build 1 209268654 1D TAAATATGAC T/- AGTTAGGGGA 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 T 1 0 59580 CASAVA_Build 1 209284530 1D AATTAGCAAG A/- AAAAAAAATT 1875 het 1875 ref 12 7 4 1 A 9 8 59581 CASAVA_Build 1 209290955 3D TATTTTTGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 150 hom 38 3 18 17 TTG 7 6 59582 CASAVA_Build 1 209291940 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 10 9 59583 CASAVA_Build 1 209293806 2D ATTAAACACC AA/-- GAGAGAGGAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 A 2 0 59584 CASAVA_Build 1 209303740 1I GTTAATGGGT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 7 8 59585 CASAVA_Build 1 209306971 1I CCTCACGGGG -/A AAGGTTTCAG 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 A 2 3 59586 CASAVA_Build 1 209309230 13D AATCACAGAA CTATAGAACATTC/------------- CTCCCCCACC 2421 het 2421 ref 30 17 8 8 CTATAGAACATTC 1 0 59587 CASAVA_Build 1 209309728 2I ACAACAGTTA --/AT GTTATGCAGT 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 AT 0 1 59588 CASAVA_Build 1 209312672 1D GCAACCACTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 9 8 59589 CASAVA_Build 1 209323999 1D TAATAAAAAG C/- CAGTAGTGCT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 C 2 1 59590 CASAVA_Build 1 209324198 1D TGAACTAAGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 88 het 38 0 30 8 T 7 6 59591 CASAVA_Build 1 209324351 3D CCACCCTACT ACC/--- ACCACCACCA 3070 hom 80 het 29 0 27 3 ACC 4 3 59592 CASAVA_Build 1 209332793 1I AAAAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 11 12 59593 CASAVA_Build 1 209341282 2I AAAAAACCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 54 17 24 13 AC 7 8 59594 CASAVA_Build 1 209349731 1D AGAATGAACC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 A 9 8 59595 CASAVA_Build 1 209352467 3D TTAAATAAAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 18 1 14 4 A 22 19 59596 CASAVA_Build 1 209362101 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2122 het 2122 ref 14 8 5 1 A 11 10 59597 CASAVA_Build 1 209366167 1D CCATCACTAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 7 6 59598 CASAVA_Build 1 209366917 1I CCAACCTCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 A 9 10 59599 CASAVA_Build 1 209371795 1I AGATGCTTCA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 8 9 59600 CASAVA_Build 1 209375959 2I ACATGGACTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 48 18 17 13 TG 6 7 59601 CASAVA_Build 1 209390557 1I AGTACAGGCA -/C GTGGTTACCA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 C 0 1 59602 CASAVA_Build 1 209391836 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3006 het 2390 hom 25 12 8 5 A 13 14 59603 CASAVA_Build 1 209392579 1I GATTGTGCCA -/C TGCACTTCAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 0 1 59604 CASAVA_Build 1 209397540 1D GAATCCATTA G/- GTCCTGGGCT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 2 1 59605 CASAVA_Build 1 209405086 4D TAAGGAACTC AAAA/---- AACTCTACAG 3070 het 3070 hom 30 12 17 2 A 6 2 59606 CASAVA_Build 1 209405933 4I TACAATTGGA ----/TTGT TTGTAACACA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 TTGT 1 2 59607 CASAVA_Build 1 209411147 1D AAAAGAAAAC A/- AAAAAAAAAG 2999 hom 24 het 10 0 9 1 A 10 9 59608 CASAVA_Build 1 209411438 2D ACTCCACCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2228 het 18 hom 11 1 7 4 A 18 16 59609 CASAVA_Build 1 209413466 1D CAAGAAGAAG A/- AAGACTCTGG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 3 2 59610 CASAVA_Build 1 209415784 1I TTGGGAACCA -/C AGTAAATTCA 3070 hom 111 het 48 0 37 11 C 0 1 59611 CASAVA_Build 1 209419147 1D CCATTTAATA G/- AGGTAGAAAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 G 1 0 59612 CASAVA_Build 1 209430572 1I TGTCTCAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 8 9 59613 CASAVA_Build 1 209433426 4D CATTTCCCAT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 18 15 2 TTTC 2 1 59614 CASAVA_Build 1 209438838 1D CTGTTCCTTG A/- AAAGTGAAGC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 A 4 3 59615 CASAVA_Build 1 209448876 1I GAAAATAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 12 12 14 A 9 10 59616 CASAVA_Build 1 209453604 90D TTGCTTGAGC CCAGGAGGTCAAGGCTGTAGTAAACCATGTTCACACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAAAATACAAG/------------------------------------------------------------------------------------------ GATCAAAAAA 2279 het 2279 ref 24 24 5 3 CCAGGAGGTCAAGGCTGTAGTAAACCATGTTCACACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAAAATACAAG 1 0 59617 CASAVA_Build 1 209467713 4D GAAGTCAAAG AGAA/---- AGAAAGAGAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 4 AGAA 2 1 59618 CASAVA_Build 1 209468129 5D GTTTTCAACA AAAGT/----- AAAGTTTGCT 3070 het 3070 hom 31 14 16 2 AAAGT 2 1 59619 CASAVA_Build 1 209473767 1I TGCAACTTTC -/G CCCCCCTGGG 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 G 0 1 59620 CASAVA_Build 1 209481363 1D TTTACCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3001 het 2257 hom 37 13 8 16 T 15 14 59621 CASAVA_Build 1 209486240 4D CAAAAATAAA TAAG/---- TAAATAAATA 1468 het 1468 ref 10 6 4 1 TAAG 1 0 59622 CASAVA_Build 1 209491534 1D TCCCAGCTAC T/- TCAGGAGGCT 3070 het 1445 hom 17 4 11 2 T 2 1 59623 CASAVA_Build 1 209492074 1D CTTTCATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 8 T 11 10 59624 CASAVA_Build 1 209492688 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTAGCTC 817 het 817 ref 28 5 8 15 AG 2 1 59625 CASAVA_Build 1 209495890 1D ATTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 494 hom 15 2 8 5 T 13 12 59626 CASAVA_Build 1 209496706 4I CCAAAAAAAT ----/AAAC AACAGCCTTC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAC 0 1 59627 CASAVA_Build 1 209502788 1I TGGCCACTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 13 14 59628 CASAVA_Build 1 209502836 1D TTTAAACAAC T/- TTTTTTTTTT 1709 het 426 hom 10 1 5 4 T 11 10 59629 CASAVA_Build 1 209503410 2I TTACTCAGAC --/TG TAATTGAATT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 TG 0 1 59630 CASAVA_Build 1 209503786 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 10 9 59631 CASAVA_Build 1 209504484 1I CTGTCTCCAC -/A AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 6 7 59632 CASAVA_Build 1 209510514 1I GACATGGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1114 hom 31 3 24 4 A 12 13 59633 CASAVA_Build 1 209510785 3D TGTCCTCCTT TGC/--- TGCAGGTACT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 TGC 2 1 59634 CASAVA_Build 1 209514059 1D TGCCTTTGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 435 hom 28 1 23 4 T 10 9 59635 CASAVA_Build 1 209514551 6D GTAATTTGGA GTAAGT/------ GTACATAGAT 3070 het 3070 hom 26 9 17 2 GTAAGT 1 0 59636 CASAVA_Build 1 209518017 3D TAGTAAAGAT ATC/--- ATCAAAATTA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 ATC 2 1 59637 CASAVA_Build 1 209519153 1D ACGCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 469 hom 27 3 21 3 A 15 14 59638 CASAVA_Build 1 209526278 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 193 hom 24 2 12 10 T 15 14 59639 CASAVA_Build 1 209530938 1I GTTTGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 T 10 11 59640 CASAVA_Build 1 209536304 1D AGGGGTACTT A/- ACATTCCCTT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 2 1 59641 CASAVA_Build 1 209543591 1D GTGTCTGGAG A/- AAAAAATATT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 7 6 59642 CASAVA_Build 1 209548735 1D GGAGCACAGT G/- TCAGTATCTC 3070 het 2864 hom 22 7 10 5 G 1 0 59643 CASAVA_Build 1 209553971 1D TTCAGCAATG T/- TGATCTCATA 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 T 2 1 59644 CASAVA_Build 1 209557317 1D GACACACAAG A/- AAAAAAGTGT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 7 6 59645 CASAVA_Build 1 209562027 1I ATTAATTTTC -/A AAAAAATGCA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 6 7 59646 CASAVA_Build 1 209589958 4D CCAGTTCTCT GAGA/---- GAAAGGTGGG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 GA 3 1 59647 CASAVA_Build 1 209590087 2I CATTTGTATC --/TT TTATACTGCT 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 T 2 4 59648 CASAVA_Build 1 209602021 2D GGGGTTACTC CT/-- CTCATGATTA 3070 het 3070 hom 33 11 12 12 CT 2 1 59649 CASAVA_Build 1 209622285 1D GTCTATTAGT A/- AAAACAAACT 3070 hom 114 het 40 0 39 3 A 5 4 59650 CASAVA_Build 1 209641227 1D ATTGCCTGTC T/- TTTGGATAAA 3070 het 3070 ref 40 21 10 10 T 4 3 59651 CASAVA_Build 1 209649924 1I AAAAATTAGC -/A CAGGTGTGGT 3070 het 2770 hom 27 8 17 2 A 0 1 59652 CASAVA_Build 1 209650938 1D AGGACTTTTA T/- CTGAATATAT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 1 0 59653 CASAVA_Build 1 209654419 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 40 0 30 10 A 11 10 59654 CASAVA_Build 1 209657982 1I CTTTCAACTT -/A AAAAAAAAAA 3031 het 3031 ref 32 14 11 7 A 11 12 59655 CASAVA_Build 1 209669363 5I TACTCTATAA -----/ATTAT AAACATTTCA 3070 het 3070 ref 56 29 24 3 ATTAT 0 1 59656 CASAVA_Build 1 209671219 1D AATAATGAAT A/- ACTCTGAACT 3070 hom 116 het 43 0 38 5 A 2 1 59657 CASAVA_Build 1 209673603 1D CCCTAAGTCT A/- AAAATGAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 5 4 59658 CASAVA_Build 1 209674770 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 13 12 59659 CASAVA_Build 1 209677571 2I TTTTAGTTAA --/AG AGATAAAACT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AG 1 2 59660 CASAVA_Build 1 209685478 1D AACAATTTTT A/- AAAAAATGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 6 59661 CASAVA_Build 1 209686032 3I TTCAAATATC ---/CAT CACAGATGAA 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 CAT 0 1 59662 CASAVA_Build 1 209693085 4I GAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAAGT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AAAG 1 2 59663 CASAVA_Build 1 209702188 1I AGAGAACACC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 7 8 59664 CASAVA_Build 1 209702633 1D TGAAACTAGA C/- CCCCCCTATC 2444 het 2444 ref 13 7 5 1 C 7 6 59665 CASAVA_Build 1 209703714 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAATAAC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 6 7 59666 CASAVA_Build 1 209722187 1D AACTCCGTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 11 12 10 A 10 9 59667 CASAVA_Build 1 209729299 3D AATGTGGTAT TTC/--- TTTAGTTATG 3070 het 3070 hom 49 19 25 6 TTC 1 0 59668 CASAVA_Build 1 209731922 1I CTGGCCTCAA -/G ATTTTGCCTC 3070 hom 95 het 35 0 28 7 G 0 1 59669 CASAVA_Build 1 209735869 1I TGAGGCCCTC -/A GGGGTGGGGG 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 A 0 1 59670 CASAVA_Build 1 209748164 4I CATGTGTAGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 TTTG 3 4 59671 CASAVA_Build 1 209753061 16D GAGGCTGTTG GACACAGTAAATATAT/---------------- GAAGCGCCTA 3070 het 3070 ref 45 26 16 8 GACACAGTAAATATAT 1 0 59672 CASAVA_Build 1 209778059 1D ACTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 15 1 12 2 A 12 11 59673 CASAVA_Build 1 209782346 2D ACCCCACGTG CA/-- CACACACACA 2251 het 2251 ref 43 24 7 12 CA 10 9 59674 CASAVA_Build 1 209834734 1D ATGTATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 11 10 59675 CASAVA_Build 1 209837746 3D ATAGCCAGGT GTG/--- GTGGTGGATG 3070 het 2142 hom 18 6 11 1 GTG 3 2 59676 CASAVA_Build 1 209839537 3I AGGTTAGTGA ---/AAG AAGTAGGATT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 AAG 1 2 59677 CASAVA_Build 1 209849959 1I CTAAATCAGA -/C CTTCCTGGAC 3070 hom 102 het 39 0 30 9 C 1 2 59678 CASAVA_Build 1 209852824 1D CATGGATTCT A/- CTTCACCCAG 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 A 1 0 59679 CASAVA_Build 1 209867858 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCGCCA 2767 hom 18 het 9 0 7 2 G 2 3 59680 CASAVA_Build 1 209868238 2I AGTTTGTATA --/TG TGTTTGTGTA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 TG 1 2 59681 CASAVA_Build 1 209873751 4I ACGGCAGTCA ----/TCAT TCATTCATTC 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 TCAT 3 4 59682 CASAVA_Build 1 209875355 6D CTTTCTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 145 het 145 ref 29 12 2 16 T 19 13 59683 CASAVA_Build 1 209875862 1I CATACTTTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 8 9 59684 CASAVA_Build 1 209878319 1I GACCCCAGCC -/G AGTGTCCTCT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 G 0 1 59685 CASAVA_Build 1 209882000 1D GTTTTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 2345 het 2345 ref 29 18 7 4 A 13 12 59686 CASAVA_Build 1 209886142 1D AGCCTAAAAA T/- TTTTTAACCG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 6 5 59687 CASAVA_Build 1 209896434 4D TGTATCTTTA TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 2316 hom 16 5 9 2 TATT 6 5 59688 CASAVA_Build 1 209909818 1I TTTCCCTCTG -/C TTTTTAGCTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 59689 CASAVA_Build 1 209916302 2D ACTAAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 1481 het 164 hom 13 4 5 5 A 18 16 59690 CASAVA_Build 1 209917094 2I TGTTGGAAAC --/TT TATTCTTAAT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 1 3 59691 CASAVA_Build 1 209927316 1D GCACCCCCTT A/- GAGTTGTGAG 1801 het 1801 ref 23 16 7 0 A 1 0 59692 CASAVA_Build 1 209935946 4D ACATATATAC ATAT/---- ACACACACAC 80 het 80 ref 16 10 2 5 AT 2 0 59693 CASAVA_Build 1 209974579 1D CACTAAGCTT G/- GGGGCCTTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 5 4 59694 CASAVA_Build 1 209983519 1I CAAAAGAGAA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 59695 CASAVA_Build 1 209997220 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1493 het 1493 ref 32 18 4 10 A 13 12 59696 CASAVA_Build 1 210004138 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2762 hom 45 9 21 15 A 16 17 59697 CASAVA_Build 1 210006981 1I ATTTGTAAGG -/T ATGATTCACC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 0 1 59698 CASAVA_Build 1 210016018 1I ATGTTGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 23 1 15 7 T 10 11 59699 CASAVA_Build 1 210024456 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 26 1 11 14 A 17 16 59700 CASAVA_Build 1 210031084 1I GATTTAATTT -/A TTCCACATTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 59701 CASAVA_Build 1 210042053 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 26 3 15 8 A 15 14 59702 CASAVA_Build 1 210045081 1I CAATGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 11 59703 CASAVA_Build 1 210072013 1D GCAATTCAGC T/- TTCCCACATG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 2 59704 CASAVA_Build 1 210074974 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1381 hom 24 6 14 4 A 13 14 59705 CASAVA_Build 1 210085661 1I CTCAACTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 29 1 21 7 T 10 11 59706 CASAVA_Build 1 210086113 32D TAACACAAGT TATCCACTTGTAAACTGCTGTTTTTTTGGGGC/-------------------------------- TATCCACTTG 3070 hom 63 het 30 0 22 12 TATCCACTTGTAAACTGCTGTTTTTTTGGGGC 1 0 59707 CASAVA_Build 1 210092925 5I AGCCACCACA -----/CCTGG CCACAACTGA 3062 hom 24 het 11 0 8 3 CCTGG 0 1 59708 CASAVA_Build 1 210095751 2I TGGTAAGGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 38 0 26 12 T 12 14 59709 CASAVA_Build 1 210099071 1D TAATGTCATT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 8 7 59710 CASAVA_Build 1 210108005 1I TCTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 0 1 59711 CASAVA_Build 1 210109821 1D44M1I TTTAAAATAG TTTTTTTTTTACAAGTGTGTTACTAAAATAGTTTTTCTTTTTCTC-/-TTTTTTTTTACAAGTGTGTTACTAAAATAGTTTTTCTTTTTCTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 23 0 23 10 N/A 0 0 59712 CASAVA_Build 1 210116884 1I TTATAAATAA -/T TTGTAATTGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 3 59713 CASAVA_Build 1 210118699 4I AAATGTCAGA ----/ATCT TTTTGGAAAC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 ATCT 0 1 59714 CASAVA_Build 1 210129153 1I TCCATCTCCG -/A AAAAAAAAAA 2404 het 2303 hom 26 7 9 10 A 11 12 59715 CASAVA_Build 1 210137575 1D AGACTGGTGG A/- AAAAAACCTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 7 6 59716 CASAVA_Build 1 210140048 1I AGAGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 600 hom 28 3 13 12 A 15 16 59717 CASAVA_Build 1 210143423 30D AATCTTCACT AGGTGTTTCTGGGAAAGGTGTTTCTGGGAA/------------------------------ AGGTGTTTCT 3070 hom 84 het 42 0 28 22 AGGTGTTTCTGGGAA 4 2 59718 CASAVA_Build 1 210145427 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 34 1 22 12 A 11 10 59719 CASAVA_Build 1 210148947 1I CTCTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 11 4 A 10 11 59720 CASAVA_Build 1 210167157 4I GATTATTTTC ----/TTTT GTTTAATTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 0 4 59721 CASAVA_Build 1 210167782 1D TCACTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 18 0 14 4 T 15 14 59722 CASAVA_Build 1 210173094 18I AATGTAAACT ------------------/TCCTACGTGAAGCAAGCC TCCTTGCTTC 3070 hom 135 het 51 0 45 7 TCCTACGTGAAGCAAGCC 0 1 59723 CASAVA_Build 1 210198036 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 11 10 59724 CASAVA_Build 1 210215923 1D ATCCCCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 30 0 21 9 T 11 10 59725 CASAVA_Build 1 210230251 2D CACAGCTGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 23 0 16 8 A 14 12 59726 CASAVA_Build 1 210234852 1I GTAAGCTGTG -/A AATCAACAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 2 3 59727 CASAVA_Build 1 210241030 2D GCAGAATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3044 het 28 hom 28 2 12 15 T 20 18 59728 CASAVA_Build 1 210258469 1I TCTTTTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1373 hom 37 3 22 12 A 12 13 59729 CASAVA_Build 1 210265656 1I CTGTACCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 24 1 14 9 A 15 16 59730 CASAVA_Build 1 210266543 4I TGTAGCCTTA ----/AAGG CTTTTCTAAA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 AAGG 0 1 59731 CASAVA_Build 1 210267799 1I TCGAGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 27 1 22 4 T 10 11 59732 CASAVA_Build 1 210275991 1I AGGGCCGACT -/C CCAATTCTGA 3070 hom 79 het 37 0 24 13 C 2 3 59733 CASAVA_Build 1 210284595 2I TGTGTTACTC --/TT TATATATTTT 3070 hom 61 het 25 0 21 4 T 1 3 59734 CASAVA_Build 1 210289972 4I TGAGACCCTA ----/TATC TAAGAAAACA 3070 hom 96 het 34 0 32 3 TATC 0 1 59735 CASAVA_Build 1 210290686 9I TCTCCTTAGG ---------/AAAGACTCA AGAAGATATT 3070 hom 78 het 27 0 26 2 AAAGACTCA 0 1 59736 CASAVA_Build 1 210297326 2D ATGCTTAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 13 11 59737 CASAVA_Build 1 210308338 1D GTTTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 36 0 23 13 A 15 14 59738 CASAVA_Build 1 210316522 1D TCATGAAATT A/- AAAAGCTATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 5 4 59739 CASAVA_Build 1 210317991 1D AAATCTGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 10 9 59740 CASAVA_Build 1 210326579 1I GGGCTCAACT -/C ATGAGCTCAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 0 1 59741 CASAVA_Build 1 210330445 1I TGTGACTGAG -/A AATAAATAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 2 3 59742 CASAVA_Build 1 210336064 1I TAATCTAGGA -/G GGTTGTATAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 2 3 59743 CASAVA_Build 1 210338210 2D GACTCAGGAC CT/-- CTCTGGTTGG 3070 hom 111 het 45 0 37 10 CT 3 2 59744 CASAVA_Build 1 210348840 2D CTTTGGAAAA CT/-- CTCCTAAAAC 3070 hom 135 het 48 0 46 3 CT 2 1 59745 CASAVA_Build 1 210363062 8D ATTCTTTGCT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 hom 74 het 34 0 23 14 TTTG 6 4 59746 CASAVA_Build 1 210369014 1I TTATTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 103 het 40 0 35 5 A 10 11 59747 CASAVA_Build 1 210387687 1I TGGTTCCTTC -/A CCCTTCCCTG 3070 hom 85 het 34 0 26 8 A 0 1 59748 CASAVA_Build 1 210388820 3D AACAGGTAGA CAC/--- ACAGGGAGAA 3070 hom 41 het 17 0 14 4 CAC 1 0 59749 CASAVA_Build 1 210418452 8D AAACCTTCCT GCTTGCTG/-------- GAATCTGCTT 3070 hom 69 het 28 0 24 8 GCTTGCTG 1 0 59750 CASAVA_Build 1 210421582 12D AAATGCTTGG CAGTGGAATTGC/------------ CATCTACCTT 3070 het 3070 ref 41 25 19 0 CAGTGGAATTGC 1 0 59751 CASAVA_Build 1 210426828 1I GTTCTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 13 15 17 T 10 11 59752 CASAVA_Build 1 210433888 1I TTCAGTTGGG -/T TTTTTTTTTT 2997 het 2793 hom 28 11 9 8 T 13 14 59753 CASAVA_Build 1 210465553 4I GGCACAATTG ----/TGTT TGTTTTAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TGTT 1 2 59754 CASAVA_Build 1 210467410 1D ACTTTGGATG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 2613 hom 34 9 16 9 T 9 8 59755 CASAVA_Build 1 210473082 3D GCCCGGCTGA GAG/--- GAGATTCTTA 3070 het 3070 hom 19 8 11 1 GAG 2 1 59756 CASAVA_Build 1 210483354 1I CTCTCCATTA -/C CTGATATTTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 2 59757 CASAVA_Build 1 210484810 1I AACACATCCT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 8 9 59758 CASAVA_Build 1 210491677 1I AAGGAATCTG -/C CCCCCAGGAA 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 C 5 6 59759 CASAVA_Build 1 210494768 1I TTTTTTATTT -/A TTTTTTTAAC 3070 hom 63 het 27 0 21 6 A 0 1 59760 CASAVA_Build 1 210499877 1D ATAGTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3016 het 1230 hom 27 4 8 15 T 15 14 59761 CASAVA_Build 1 210502171 1D AGCACCTTAT A/- ATTTACAACT 3070 het 3070 ref 47 25 17 6 A 2 1 59762 CASAVA_Build 1 210510372 1D CATCTAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 11 10 59763 CASAVA_Build 1 210512130 1D AAGGCATCAT A/- AAAAAGATCT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 6 5 59764 CASAVA_Build 1 210517291 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 17 9 T 14 13 59765 CASAVA_Build 1 210517641 2D AAATTTTCTC TT/-- TCTTTCCAAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 3 T 3 1 59766 CASAVA_Build 1 210519536 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 2354 het 1921 hom 10 4 6 0 T 9 10 59767 CASAVA_Build 1 210527664 1D GATAGGCATT G/- CCAAGACTTT 3070 het 3070 hom 49 24 22 4 G 1 0 59768 CASAVA_Build 1 210528838 2I TGCTTATGTT --/AC ACTTTGACCA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 AC 1 2 59769 CASAVA_Build 1 210532451 4I GTTGTCTTAT ----/AGTC AGTCACTCCT 3070 het 3070 ref 64 28 24 12 AGTC 1 2 59770 CASAVA_Build 1 210540425 1D TTATTTATTA T/- TTTTGTAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 5 4 59771 CASAVA_Build 1 210546313 3D GGAAAAAAGG AGA/--- AGAATGGAGG 3070 het 763 hom 29 4 11 16 AGA 2 1 59772 CASAVA_Build 1 210557359 32I TATTCTCATA --------------------------------/CTTGTTCACCTTACATTCTAGGTGGTTTAAAT CCCAGCTTCA 3070 hom 108 het 34 0 33 6 CTTGTTCACCTTACATTCTAGGTGGTTTAAAT 0 1 59773 CASAVA_Build 1 210558257 1I GGCATATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 11 59774 CASAVA_Build 1 210582814 1I TGATGCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 10 11 59775 CASAVA_Build 1 210590620 1I CTCTGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 2599 het 2599 ref 21 9 7 5 A 11 12 59776 CASAVA_Build 1 210591080 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 223 hom 30 4 15 11 A 7 8 59777 CASAVA_Build 1 210608576 4I CAGAGTGCCT ----/CAAA CACAGAATTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 CAAA 0 1 59778 CASAVA_Build 1 210611558 4D GTTGCTAAAT TCTA/---- TCTAACATTA 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 TCTA 2 1 59779 CASAVA_Build 1 210613327 7I CACTCAAAAT -------/AGATTAA AGACTCAAAT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 AGATTAA 0 1 59780 CASAVA_Build 1 210617763 2I TCTTTGCTGG --/CA CACAACCAGG 3070 het 3070 ref 52 25 16 11 CA 2 3 59781 CASAVA_Build 1 210622276 1I CCAAAGTGCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 G 2 3 59782 CASAVA_Build 1 210623828 3D TACACAAAGA ATC/--- ATCTTCCCTT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 ATC 2 1 59783 CASAVA_Build 1 210640131 2D CTAAGACAAA CT/-- CTATACTACA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 CT 2 1 59784 CASAVA_Build 1 210653403 1D AGCAAGTTCA T/- TATGAGAAGG 3070 het 3070 ref 54 26 23 6 T 2 1 59785 CASAVA_Build 1 210689000 2I GACCAAACTT --/TC TGATTTGCCT 3070 het 3070 hom 37 18 14 5 TC 0 1 59786 CASAVA_Build 1 210701644 1I GGGACATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 11 12 59787 CASAVA_Build 1 210715627 1D ACTCTTCTTC T/- TTTTTATTTA 2093 het 1938 hom 14 5 6 3 T 6 5 59788 CASAVA_Build 1 210736199 1I GTTGCTCAGA -/C CAAAATCGTA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 C 1 2 59789 CASAVA_Build 1 210807129 1D CTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 28 1 15 13 T 11 10 59790 CASAVA_Build 1 210810094 4D AAAGACCTCC CTAT/---- CTATTATTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 CTAT 2 1 59791 CASAVA_Build 1 210811918 1I ACCTCGTGAT -/C CCGCCCGGCT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 2 3 59792 CASAVA_Build 1 210812388 2D AGGCTGAGGC AG/-- AGAAGGATGG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AG 2 1 59793 CASAVA_Build 1 210813909 1I ATTCATAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 145 hom 27 1 19 7 T 9 10 59794 CASAVA_Build 1 210823548 1I GATCCTGTTG -/A AAAGCTGGCA 3070 hom 110 het 45 0 35 10 A 3 4 59795 CASAVA_Build 1 210824145 1I ATATGTATTT -/A ATGAACAACT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 1 2 59796 CASAVA_Build 1 210828605 6I AACAACCACA ------/ACAACC ACAACAAAAA 3070 het 3067 hom 42 10 27 6 ACAACC 0 1 59797 CASAVA_Build 1 210829768 1I CTTGGTCAAC -/T TTTTTTTTTT 1432 het 1371 hom 28 11 6 11 T 17 18 59798 CASAVA_Build 1 210857912 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 79 het 31 0 25 6 GT 10 9 59799 CASAVA_Build 1 210912215 2D GAGTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 A 12 10 59800 CASAVA_Build 1 210913870 1D ACAAAGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 17 13 T 13 12 59801 CASAVA_Build 1 210914527 2D TTTATTGATG TA/-- TATAGTTTAT 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 TA 3 2 59802 CASAVA_Build 1 210923058 3I TCCATTCTTG ---/CTT CTTTCTTTTT 3070 hom 95 het 37 0 30 7 CTT 1 2 59803 CASAVA_Build 1 210928031 1D GAGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2664 hom 22 9 9 4 A 11 10 59804 CASAVA_Build 1 210938558 1I TTGCTACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 9 10 59805 CASAVA_Build 1 210949785 2D TAACTCACTC TT/-- GTAATTGATT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 2 0 59806 CASAVA_Build 1 210950056 1D ACATGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 29 1 13 15 A 15 14 59807 CASAVA_Build 1 210955389 1D GGAGTGCAGT G/- GTCCGATTTA 1880 hom 12 het 7 0 5 2 G 2 1 59808 CASAVA_Build 1 210958366 3D ATGGGTAATT CTC/--- CTTGTGTATC 3070 hom 90 het 36 0 31 7 CTC 1 0 59809 CASAVA_Build 1 210958883 1I ATTAATAGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 225 hom 30 1 24 6 T 9 10 59810 CASAVA_Build 1 210960517 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 17 0 15 6 A 10 9 59811 CASAVA_Build 1 210964070 4D CCTCGCCTGT ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 hom 57 het 29 0 20 11 ACAA 5 4 59812 CASAVA_Build 1 210967058 1I TTCATCTTGC -/G CAGTTCACCA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 G 0 1 59813 CASAVA_Build 1 210971152 1D CAGAGGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 809 hom 36 5 24 7 A 13 12 59814 CASAVA_Build 1 210985645 4D CTGAGGGAAT TGTC/---- TGGACACAGT 3070 hom 72 het 27 0 24 4 TGTC 1 0 59815 CASAVA_Build 1 210985774 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 7 8 59816 CASAVA_Build 1 210991677 1D AATAAAACCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 8 7 59817 CASAVA_Build 1 210992528 1D AAGAACTTTT A/- AAAAAAGGCA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 7 6 59818 CASAVA_Build 1 210995570 2D AAAAAAACCC CT/-- GTGTCTACCT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 CT 1 0 59819 CASAVA_Build 1 211009012 4I CCCTGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 AAAC 2 3 59820 CASAVA_Build 1 211013306 1I AACAGCAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 10 59821 CASAVA_Build 1 211016669 5D29M1D GGAAAACGGT AAAACAAAACAAAACAAAACAACAACAACAACAAC/-----AAAACAAAACAAAACAACAACAACAACAA- AAAAAAAACC 3070 hom 90 het 30 0 31 9 N/A 0 0 59822 CASAVA_Build 1 211018132 4D GATGCCACTT ACTC/---- AAACAGGGAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 ACTC 1 0 59823 CASAVA_Build 1 211027704 4I CAGAGGAAAT ----/AAAG AAAAGTAGCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAG 0 1 59824 CASAVA_Build 1 211029445 1D CCAAAGTGCT G/- GGATTACAGG 3070 hom 40 het 16 0 12 4 G 3 2 59825 CASAVA_Build 1 211036705 1D TACTTATTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 10 9 59826 CASAVA_Build 1 211045897 4I TGTGCTACAT ----/ACAC ACACACATAC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AC 3 5 59827 CASAVA_Build 1 211059471 1D TTTCTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 12 11 59828 CASAVA_Build 1 211062757 3D ACCTACAAAC CTG/--- GTTTTTGGCC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 CTG 1 0 59829 CASAVA_Build 1 211064496 15D CGAAAAAGAG AGAGAAGAGAAGAGA/--------------- AGAGAAGAGA 3070 hom 30 het 12 0 9 5 AGAGA 6 3 59830 CASAVA_Build 1 211068492 1I ACCCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 710 hom 23 2 10 11 A 12 13 59831 CASAVA_Build 1 211071439 1D CTCTGCCTCT A/- AAAAAAAAAA 2785 het 495 hom 29 6 14 9 A 17 16 59832 CASAVA_Build 1 211075802 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2219 het 1225 hom 16 5 8 3 A 17 16 59833 CASAVA_Build 1 211079583 1D ACCCTATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1191 hom 33 3 24 6 A 15 14 59834 CASAVA_Build 1 211086218 1I ATGCTGCCCC -/T AATCCTGCTT 3070 hom 56 het 21 0 17 4 T 0 1 59835 CASAVA_Build 1 211088888 1I TGTGGAGGAA -/G GGGGCCCAGC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 4 5 59836 CASAVA_Build 1 211100101 2D GTGGGGCATG GT/-- GTGGTGCATG 3070 het 2956 hom 32 7 24 2 GT 2 1 59837 CASAVA_Build 1 211102150 1I ATTCACATAA -/C ATAAAACTAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 C 0 1 59838 CASAVA_Build 1 211105102 1D ACCAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 11 10 59839 CASAVA_Build 1 211106440 2D CTGATTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2343 hom 35 11 18 6 T 15 13 59840 CASAVA_Build 1 211114492 4D TCTTTTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1852 het 1298 hom 23 8 11 4 T 20 16 59841 CASAVA_Build 1 211115107 2D ACCAACTAAA TG/-- TATAGTAGTG 3070 het 3070 ref 36 16 12 10 TG 1 0 59842 CASAVA_Build 1 211118499 5D TCTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1409 het 1228 hom 22 9 5 8 A 21 16 59843 CASAVA_Build 1 211118954 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 11 10 59844 CASAVA_Build 1 211119940 1D TAACATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 T 12 11 59845 CASAVA_Build 1 211122765 1I TTTGGGAGGC -/T GAGGCAGTAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 0 1 59846 CASAVA_Build 1 211128641 3I ATGGTTTTAT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 52 22 14 16 TTG 5 6 59847 CASAVA_Build 1 211138385 4I TCTCCCCAAA ----/TAAT TGTTTTTATT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TAAT 0 1 59848 CASAVA_Build 1 211139942 1I AAGAAAGGCT -/C CTGAAACCTA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 1 2 59849 CASAVA_Build 1 211140670 3D TAAAAAAATT CTG/--- CTGCTGAAGA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 CTG 3 2 59850 CASAVA_Build 1 211140826 1D GCTTATGAGA T/- TTATGGAACA 3070 het 3070 hom 49 20 25 5 T 3 2 59851 CASAVA_Build 1 211141234 2D TGGCTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 1865 het 95 hom 14 2 6 6 T 16 14 59852 CASAVA_Build 1 211143178 1D TCAAGCAATT C/- CCCCTGCCTC 3070 hom 30 het 14 0 8 6 C 5 4 59853 CASAVA_Build 1 211159474 1D TGGCAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 12 11 59854 CASAVA_Build 1 211160591 1D GCTACAGGGG C/- CCCCATCCAT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 C 5 4 59855 CASAVA_Build 1 211163718 4I AAAAAAAGAA ----/AAAG AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 AAAG 0 1 59856 CASAVA_Build 1 211178077 3I TGGCTCTGAG ---/GCT GCTATTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 GCT 1 2 59857 CASAVA_Build 1 211184519 1I GTCCTAGAAC -/A ACAGCAGGAT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 1 2 59858 CASAVA_Build 1 211193201 1I TGCGCGGGGG -/C GGGGTGCATT 3070 hom 77 het 36 0 26 10 C 0 1 59859 CASAVA_Build 1 211216534 2I GAGGCCCTGT --/AA AAAAAAAAAA 2854 het 2854 ref 38 17 13 8 A 12 14 59860 CASAVA_Build 1 211217153 1I ATGCAGGCCA -/G GATTCCTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 G 1 2 59861 CASAVA_Build 1 211219028 3D ACATGAGAAT AAG/--- AAGAAGAGCT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 AAG 3 2 59862 CASAVA_Build 1 211226708 1I ACAATGAGCA -/G GAGTCTACAC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 G 1 2 59863 CASAVA_Build 1 211231126 4I TTATTTCGGA ----/AAGT GATATTTAGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AAGT 0 1 59864 CASAVA_Build 1 211252259 1D TTCTCTCAAG T/- TATCTTCAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 2 1 59865 CASAVA_Build 1 211274416 1D ACAACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 3 A 11 10 59866 CASAVA_Build 1 211288520 1I TGCCACCACG -/C CCGGCTAATT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 C 2 3 59867 CASAVA_Build 1 211292510 1I TTCAGAATAA -/T TTTTTTTTTT 1456 het 1456 ref 24 15 4 5 T 13 14 59868 CASAVA_Build 1 211316583 1D TACAAAGTGG T/- TTTTTTTTTT 1368 het 1368 ref 36 32 3 1 T 11 10 59869 CASAVA_Build 1 211318197 1I CTTAGTATTC -/T TTTTTTTTTT 2357 het 1203 hom 31 8 9 14 T 16 17 59870 CASAVA_Build 1 211331925 1I ATTACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 T 13 14 59871 CASAVA_Build 1 211332490 1D CGAAAAATTA G/- GCCGGGCATG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 2 1 59872 CASAVA_Build 1 211334051 1D AATTTATGCT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 45 19 16 10 C 10 9 59873 CASAVA_Build 1 211361867 1D AATGTCTTCT G/- GGAATAACAA 3070 hom 102 het 38 0 35 5 G 3 2 59874 CASAVA_Build 1 211371416 1D TAATGTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 10 7 T 12 11 59875 CASAVA_Build 1 211376431 1D AGGCAGAAAC A/- AAAAAAAAAC 1649 het 1649 ref 50 40 4 6 A 10 9 59876 CASAVA_Build 1 211394126 6I GGTGGAGTGA ------/CATAAG CACCCCTGGG 2598 het 2598 ref 29 13 9 7 CATAAG 0 1 59877 CASAVA_Build 1 211400644 1D CCATAAAAAA G/- GATGAGTTCA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 G 2 1 59878 CASAVA_Build 1 211423546 1D AAAGGGTATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 43 27 13 4 A 9 8 59879 CASAVA_Build 1 211442359 2D GGTGGATCAC TT/-- TTGAGATCAG 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 T 4 2 59880 CASAVA_Build 1 211454077 5D AGGGGTCAGG GAATT/----- CCCTTTCATA 2555 het 2555 ref 14 8 6 0 GAATT 1 0 59881 CASAVA_Build 1 211460134 1D TTTAAATGTA G/- GGTAAGATAA 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 G 3 2 59882 CASAVA_Build 1 211470899 11D AAGTTAATAT TTTAGTTAATA/----------- TTTAGTTAAT 3070 het 3070 ref 25 17 9 3 TTTAGTTAATA 2 1 59883 CASAVA_Build 1 211472038 12D GGCTCCAAAG GCAACTGAGGAT/------------ GCAACTGAGG 3070 het 3070 ref 43 19 16 14 GCAACTGAGGAT 2 1 59884 CASAVA_Build 1 211483252 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 13 12 59885 CASAVA_Build 1 211486728 1D TATAAAATAC A/- AAAAAAAAAC 1197 het 1197 ref 31 24 3 4 A 10 9 59886 CASAVA_Build 1 211494127 3D CTTGTGAAAT ATC/--- ATAGTTTGAA 3070 het 3070 hom 45 21 22 3 ATC 1 0 59887 CASAVA_Build 1 211499372 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 8 7 59888 CASAVA_Build 1 211501108 1I AAAAGGATGA -/T TTAATATTGG 3070 het 3070 hom 47 22 23 2 T 2 3 59889 CASAVA_Build 1 211505525 4D AGACATAAAT TGTC/---- TGATTGTGAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 9 TGTC 1 0 59890 CASAVA_Build 1 211510560 4D TTGACAACAT AGTG/---- AGACCCCGCC 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 AGTG 1 0 59891 CASAVA_Build 1 211514666 1D TTTGTGGTTG T/- TTTTTTTTTA 655 het 655 ref 45 34 3 8 T 10 9 59892 CASAVA_Build 1 211524414 3I ATGAGGTAGA ---/TGT TGTGGTGAAC 3070 hom 81 het 29 0 26 4 TGT 1 2 59893 CASAVA_Build 1 211524608 1I TGAAGTAGGC -/A AAGAAGATGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 3 59894 CASAVA_Build 1 211525312 1I CTGTCATACT -/G GGGGGGTAGG 3070 hom 114 het 39 0 38 1 G 6 7 59895 CASAVA_Build 1 211527935 5D3M1D AATCTTTCAT AGTAATAGT/-----TAG- AACTGCTAAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 4 N/A 0 0 59896 CASAVA_Build 1 211530497 12I TGCTTCTGAC ------------/TCCACATTGATT TCCAGCCCTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TCCACATTGATT 0 1 59897 CASAVA_Build 1 211532224 5D AATAATAATA AAATT/----- AAATTAAATT 3070 hom 45 het 16 0 16 2 AAATT 3 2 59898 CASAVA_Build 1 211569541 1I ATTCAGTTGA -/T TTTTTTTTTT 2267 het 2267 ref 23 10 9 4 T 13 14 59899 CASAVA_Build 1 211578736 1D TCTTGCAGCA T/- TTTTTTTTTT 2651 het 2651 ref 36 16 10 10 T 17 16 59900 CASAVA_Build 1 211580799 1I ATGTGAGGGC -/A AGGCGGGGCC 3070 het 1921 hom 26 7 12 7 A 1 2 59901 CASAVA_Build 1 211583338 1I GAGCTTAAAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 8 9 59902 CASAVA_Build 1 211642449 2I ACATCCCATT --/TA GAATCCTGAT 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 TA 0 1 59903 CASAVA_Build 1 211650790 1D GTGCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 20 11 T 11 10 59904 CASAVA_Build 1 211669173 1D CTGGAGTGCA G/- TGGCACAGTC 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 G 1 0 59905 CASAVA_Build 1 211672716 1D ATCATTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1085 het 1085 ref 49 31 4 14 T 12 11 59906 CASAVA_Build 1 211688735 2D AATCTGTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 1999 het 1999 ref 35 18 6 12 A 16 14 59907 CASAVA_Build 1 211694114 1I TTGACCACAT -/G GGGGGGGGTC 3070 het 456 hom 19 1 15 3 G 8 9 59908 CASAVA_Build 1 211697458 4I AGCAGGGACA ----/CTGT CTGCCTTTTA 3070 het 3070 ref 64 31 24 9 CTGT 0 1 59909 CASAVA_Build 1 211698344 1I AACGTAACAC -/G TTTTTTTTTA 3070 het 110 hom 57 1 51 5 G 0 1 59910 CASAVA_Build 1 211709667 4D GTCTCTGAAG ACAA/---- ACAAACTTTA 3070 het 3070 ref 40 25 10 6 ACAA 2 1 59911 CASAVA_Build 1 211711055 2D TGGTGATTTT TG/-- TGTGTGTGTA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 TG 5 4 59912 CASAVA_Build 1 211719796 1D TAGGATCTTT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 A 8 7 59913 CASAVA_Build 1 211726499 1D GACAGGCAAA G/- AAAGGTGATG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 G 1 0 59914 CASAVA_Build 1 211727462 1D GCCTGAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3009 hom 24 8 12 4 T 11 10 59915 CASAVA_Build 1 211737343 1D TAACTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 2042 het 2042 ref 41 28 5 8 A 11 10 59916 CASAVA_Build 1 211741071 2I TATTTGAAAC --/AT AAAATGATTC 3070 het 3070 hom 37 14 23 0 AT 0 1 59917 CASAVA_Build 1 211741699 1D AGAGTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2691 hom 29 7 13 9 A 14 13 59918 CASAVA_Build 1 211747516 1I AACCCTCTCA -/T TTTTTTTTTT 2491 het 2491 ref 48 17 16 15 T 17 18 59919 CASAVA_Build 1 211749816 2D GCCATTTTTA TC/-- TCTTTTATTA 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 TC 2 1 59920 CASAVA_Build 1 211751148 1D GAGGAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3060 hom 43 10 19 14 T 13 12 59921 CASAVA_Build 1 211767618 1I TGATGTGTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 T 9 10 59922 CASAVA_Build 1 211768414 1I ACAATTCAAG -/A TGAGATTTGG 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 0 1 59923 CASAVA_Build 1 211780053 1I GGTGGTGGTT -/G CTGAAGGTTG 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 G 0 1 59924 CASAVA_Build 1 211792957 1D ATTACCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 11 10 59925 CASAVA_Build 1 211805193 2D TTATAAATGT AC/-- ACACCTACGC 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 AC 3 2 59926 CASAVA_Build 1 211820729 1I45M1D11M1I ATTGTTAGCA -TTTTTTTTTGCAATGAAGTATTGTTTAATTAAGGTGTAGACATTATTTTTTTAAGAC-/TTTTTTTTTTGCAATGAAGTATTGTTTAATTAAGGTGTAGACATTA-TTTTTTAAGACA AAAATGCTAT 3070 het 3070 hom 37 25 26 4 N/A 0 0 59927 CASAVA_Build 1 211822055 1D ATCAGGGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2513 hom 34 10 12 13 T 15 14 59928 CASAVA_Build 1 211826610 1D GAAGGGCACC A/- ATCCTTCTAA 3070 het 3070 hom 53 22 23 9 A 2 1 59929 CASAVA_Build 1 211833029 2I AGCATTACAA --/AT ACAGTGTTCA 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 AT 0 1 59930 CASAVA_Build 1 211839443 1D CGAGGGGGGG A/- AAAACATTCA 3070 het 2186 hom 27 7 11 9 A 5 4 59931 CASAVA_Build 1 211861555 2D AGGAACTAAC AT/-- GTGTGATGAA 3070 het 3070 hom 39 11 23 6 AT 1 0 59932 CASAVA_Build 1 211865399 1I CTTGGGGCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 T 9 10 59933 CASAVA_Build 1 211871771 1D AAAATATGGG T/- TTTTTGCCCT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 6 5 59934 CASAVA_Build 1 211877536 1D TATAATAATT A/- AAAAAATTAG 2513 het 2513 ref 24 17 6 2 A 7 6 59935 CASAVA_Build 1 211881131 1D TCTTTTACCA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 8 7 59936 CASAVA_Build 1 211895149 4D GCTGGGATTA CAGG/---- CATGTGCCAC 3070 het 3070 hom 22 8 10 5 CAGG 1 0 59937 CASAVA_Build 1 211900641 49D GACAGACTCA TGCCTACAAATTATGGTTCATTTATCCCTTTCTTTACTCTTCATTCTAT/------------------------------------------------- TGCACACCAA 2878 het 2878 ref 30 29 7 8 TGCCTACAAATTATGGTTCATTTATCCCTTTCTTTACTCTTCATTCTAT 1 0 59938 CASAVA_Build 1 211902192 2D GTGTGCCTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 28 0 24 5 A 12 10 59939 CASAVA_Build 1 211904299 6D AACCCAAGTT TAAAAA/------ TAAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 25 10 10 7 TAAAAA 1 0 59940 CASAVA_Build 1 211912375 1I ACTTCTCTTG -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 6 7 59941 CASAVA_Build 1 211915849 1D TCTGAAAGAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 59942 CASAVA_Build 1 211921464 1D AGAAGGTGTT A/- AATATATAGA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 3 2 59943 CASAVA_Build 1 211927401 1D GATGTCCACA C/- CTACTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 C 2 1 59944 CASAVA_Build 1 211936469 17D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1761 hom 20 7 13 3 A 27 10 59945 CASAVA_Build 1 211941213 2D TTTTTGAGGG TT/-- TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 51 24 23 6 T 8 6 59946 CASAVA_Build 1 211942818 4I TGAGGTTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TTTG 3 4 59947 CASAVA_Build 1 211949497 1I TTTTGAAGGG -/T TTTTTTGTGC 3070 het 2288 hom 21 7 8 6 T 6 7 59948 CASAVA_Build 1 211954505 4I TCCTGAGAGC ----/CTGT CCTGATGGCC 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 CTGT 0 1 59949 CASAVA_Build 1 211959523 1D TTCTTAGTTC G/- TTTTTTTTAA 3070 het 84 hom 37 2 18 17 G 1 0 59950 CASAVA_Build 1 211974423 1I AAATTAGGGA -/T TTTTGTCAGT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 4 5 59951 CASAVA_Build 1 211981500 1I AACGTGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 10 11 59952 CASAVA_Build 1 211985194 1I GAAGCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 34 1 24 9 T 11 12 59953 CASAVA_Build 1 211998914 2I TGATAAGGCA --/GT GTGGTAGGGC 3070 het 3070 ref 42 27 13 2 GT 1 2 59954 CASAVA_Build 1 211999191 1I TCATTAGCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1121 hom 34 3 29 2 T 9 10 59955 CASAVA_Build 1 212000922 1D CATGGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 10 9 59956 CASAVA_Build 1 212016896 7I GCTTCTTTCC -------/TTACACG TTATAAACCA 3070 hom 114 het 46 0 37 9 TTACACG 0 1 59957 CASAVA_Build 1 212068356 1I TGAAAACAAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 7 8 59958 CASAVA_Build 1 212100372 1I TAAGAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 10 11 59959 CASAVA_Build 1 212108112 1I CGAATGTGCT -/G AAGTGTACTG 3070 hom 154 het 58 0 52 6 G 0 1 59960 CASAVA_Build 1 212112640 1D CAATTAACAA C/- CCCCGCAATG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 5 4 59961 CASAVA_Build 1 212120751 1D ATCTATATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 31 2 21 9 A 13 12 59962 CASAVA_Build 1 212124380 3D TGGAAGGAAA CAT/--- CATCAGCTCC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 CAT 2 1 59963 CASAVA_Build 1 212139089 1D ATTTTTCTCA T/- TTATAAATGA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 3 2 59964 CASAVA_Build 1 212173838 1D ATAGATTCCT C/- CCCCCACCCC 3070 hom 110 het 40 0 37 3 C 6 5 59965 CASAVA_Build 1 212175456 2I GCAGATACAC --/TT TAATATTTTT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 1 3 59966 CASAVA_Build 1 212176857 11D AATTCCCATG CCCAGGTCTTA/----------- CCCAGAAATT 3070 hom 93 het 38 0 31 8 CCCAGGTCTTA 1 0 59967 CASAVA_Build 1 212188912 1D TCTCAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 19 0 13 7 T 11 10 59968 CASAVA_Build 1 212190299 1I CTTTTTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 A 11 12 59969 CASAVA_Build 1 212204128 4I TGCATATATA ----/TACG TACGTATGTG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 TACG 1 2 59970 CASAVA_Build 1 212210239 1D TAAGAGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 39 0 29 10 A 11 10 59971 CASAVA_Build 1 212211482 1I CACCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 10 11 59972 CASAVA_Build 1 212214188 2I TAAAGAAAAC --/TT TTTTTTTTTA 2999 hom 30 het 20 0 9 11 T 9 11 59973 CASAVA_Build 1 212216362 1I AATTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2880 hom 29 8 9 12 A 13 14 59974 CASAVA_Build 1 212240009 2D CTCTCTCTCT TA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 TA 1 0 59975 CASAVA_Build 1 212240972 1I AATGGTACAA -/C CTGTGATTGC 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 C 1 2 59976 CASAVA_Build 1 212248023 1D TTTTATTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1948 hom 23 6 13 4 T 12 11 59977 CASAVA_Build 1 212248389 1D ACAACAACAA C/- AACAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 C 1 0 59978 CASAVA_Build 1 212253543 1I GAGGGTTTTC -/G GGGTTGCTTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 G 3 4 59979 CASAVA_Build 1 212256304 2D TTTGGAAGAC TT/-- TTATTCGCAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 4 2 59980 CASAVA_Build 1 212370787 1D AGATCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 1361 het 1361 ref 43 29 3 11 T 13 12 59981 CASAVA_Build 1 212375020 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 35 4 23 8 A 17 16 59982 CASAVA_Build 1 212385063 1I TTCAAGAGAG -/T TTTTGAAATC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 4 5 59983 CASAVA_Build 1 212385737 10D TCCTACTAGA GGACTAAATG/---------- GGTTTCATTA 3070 hom 90 het 31 0 30 1 GGACTAAATG 1 0 59984 CASAVA_Build 1 212395711 4D TTTATAAGGC AGCT/---- AGCTGTCTCT 3070 hom 114 het 40 0 39 3 AGCT 2 1 59985 CASAVA_Build 1 212418267 6I ATCTGAAAAC ------/ACAGTT ACAGTTGCTG 3070 hom 137 het 58 0 46 12 ACAGTT 1 2 59986 CASAVA_Build 1 212425108 1I ATACAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 39 2 30 7 T 15 16 59987 CASAVA_Build 1 212428465 1D GAAGTGAGCC A/- AAAAAATACT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 A 7 6 59988 CASAVA_Build 1 212431825 1I CCTGTCTCTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 8 9 59989 CASAVA_Build 1 212432623 2I AAACAGTGAC --/TG TGTTTGGTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TG 1 2 59990 CASAVA_Build 1 212441108 3I AATCAGCAAC ---/CTG CTATTTTCAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CTG 0 1 59991 CASAVA_Build 1 212450205 2D CTATGCATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 24 0 17 7 AT 9 8 59992 CASAVA_Build 1 212463561 1D AATTTTCCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 83 het 36 0 28 8 T 8 7 59993 CASAVA_Build 1 212464286 1D21M1D TTACTAATTA CCCCCCCCAGCCGCCCACAAAGA/-TTCCCCCAGCCGCCCACAAAG- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 31 1 32 2 N/A 0 0 59994 CASAVA_Build 1 212464477 5I GTGCTGTCTT -----/CCCAG CCCAGCTTCA 3070 hom 115 het 44 0 38 6 CCCAG 1 2 59995 CASAVA_Build 1 212466442 1D45M1D CCTGTCTCTC AAAAAAAAACTTACAATCTAAGGTACAAAGAGACACACACATAGTTG/-AAAAAAAACTTACAATCTAAGGTACAAAGAGACACACACATAGTT- GGGGGGGCGG 3070 hom 84 het 30 0 29 18 N/A 0 0 59996 CASAVA_Build 1 212471882 1D CTTTCATTTT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 7 59997 CASAVA_Build 1 212474424 1D TGGTTACTGT G/- GGGGGGGTGC 3070 hom 114 het 45 0 38 9 G 8 7 59998 CASAVA_Build 1 212474946 1I TGCTTTTTTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 9 59999 CASAVA_Build 1 212478473 1I AGAAAAAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 8 9 60000 CASAVA_Build 1 212479906 1I GAACAGTTGA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 6 7 60001 CASAVA_Build 1 212486579 1D TCCCTTTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 19 15 3 T 9 8 60002 CASAVA_Build 1 212488682 1D CCACCACTTT C/- CTCAGAGCCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 2 1 60003 CASAVA_Build 1 212490931 1I AGGCTTTGAG -/A AATATAGAAT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 2 3 60004 CASAVA_Build 1 212498986 3I TGCAAATTTA ---/ATT ATTATTTGAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 ATT 2 3 60005 CASAVA_Build 1 212511190 1D AAATCCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 27 2 18 7 T 15 14 60006 CASAVA_Build 1 212517719 2D GTAACCAAAA AC/-- ACTCCTTTCA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 AC 2 1 60007 CASAVA_Build 1 212520319 2D CCCAAGTGAC TT/-- TTCTAAGATC 3070 het 3070 ref 49 30 18 2 T 4 2 60008 CASAVA_Build 1 212535119 1I AAGTAAAGAT -/A AAAAGTAGCA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 4 5 60009 CASAVA_Build 1 212535364 1I GCTTCATGAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 8 9 60010 CASAVA_Build 1 212537266 1D CCATTCCTTT G/- GGGGTTATTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 5 4 60011 CASAVA_Build 1 212539441 10D TTATATATAT ATATATATAC/---------- ACCATAGAAT 3070 het 618 hom 23 3 19 1 ATATATATAC 1 0 60012 CASAVA_Build 1 212541532 1D GATAAGTCTT C/- AGTATTGAGA 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 C 1 0 60013 CASAVA_Build 1 212545681 1D TATAGCCAGA G/- GGGGGGCTAT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 G 7 6 60014 CASAVA_Build 1 212560675 1D ATTTATTGAA T/- TCTTTTATAA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 T 2 1 60015 CASAVA_Build 1 212561373 2D ATACACACAC AT/-- ATAATTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 AT 2 1 60016 CASAVA_Build 1 212568429 1I TGATTCCTGA -/C CTACCTCATG 3070 het 3070 ref 69 36 25 8 C 1 2 60017 CASAVA_Build 1 212576134 2I CAGCTGGATA --/TT TTTTTGCAGA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 5 7 60018 CASAVA_Build 1 212576999 4D TTATACTTTG GACA/---- GACAGAGTTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 GACA 2 1 60019 CASAVA_Build 1 212580707 1D GTAGGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 34 2 21 11 A 15 14 60020 CASAVA_Build 1 212582106 1I GCTTTTGCCG -/T TAAGTCCCAG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 1 2 60021 CASAVA_Build 1 212587636 1D TTTAGTTTTG T/- GGGGAATTAT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 1 0 60022 CASAVA_Build 1 212597702 1D TCCAAAGGGG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 A 7 6 60023 CASAVA_Build 1 212598713 1I TCATTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 26 0 18 9 T 13 14 60024 CASAVA_Build 1 212602043 1I GGAGAAAAAT -/G GGTCCCACAA 3070 hom 104 het 41 0 34 7 G 2 3 60025 CASAVA_Build 1 212606950 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 762 hom 21 3 9 10 A 17 16 60026 CASAVA_Build 1 212612276 1D GCCTGGAGTT G/- GGCGTCTATG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 G 3 2 60027 CASAVA_Build 1 212633637 1D CCATCAAGTC G/- GGGGGGATTA 3070 hom 117 het 45 0 40 7 G 7 6 60028 CASAVA_Build 1 212640016 3I TCCACTGCTG ---/TTC TTCTACTCTT 3070 hom 75 het 35 0 25 10 TTC 1 2 60029 CASAVA_Build 1 212646445 1D AGATTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1184 het 1184 ref 21 11 4 6 A 12 11 60030 CASAVA_Build 1 212647966 2D CTCTGCTCCT TC/-- TCTCTCTGTC 3070 het 3070 hom 44 14 17 13 TC 4 3 60031 CASAVA_Build 1 212649896 3D TTCATATGTC TGT/--- TGGCCTTCTG 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 TGT 1 0 60032 CASAVA_Build 1 212672700 1D ACCTAAAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 9 8 60033 CASAVA_Build 1 212676369 1I AAATAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 193 hom 23 1 21 1 A 9 10 60034 CASAVA_Build 1 212677215 3D ACAGTGGCAA AAG/--- AATTACTGAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 AAG 1 0 60035 CASAVA_Build 1 212682787 1D CATAGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 36 1 24 12 T 14 13 60036 CASAVA_Build 1 212691125 6D TTTGTTTTTG TTGTTT/------ TTGTTTTTGT 3070 hom 93 het 37 0 31 9 TTGTTT 3 2 60037 CASAVA_Build 1 212695875 1D GCAGGGGACA T/- TATGGGAACT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 1 60038 CASAVA_Build 1 212696086 2I TGGCACAGAC --/TT TAATGCTATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 3 60039 CASAVA_Build 1 212698585 6I CAGGGTACTT ------/CAGTAG CTATTTAAGG 3070 hom 126 het 49 0 39 10 CAGTAG 0 1 60040 CASAVA_Build 1 212698945 1D CTCTGGAATT G/- TCTTTGTTAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 1 0 60041 CASAVA_Build 1 212700143 2I AGGGACACAT --/CA CAGACTTGTT 3070 hom 153 het 58 0 51 7 CA 1 2 60042 CASAVA_Build 1 212701114 2I AAAAATAAAG --/TC TATTAAAAAT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 TC 0 1 60043 CASAVA_Build 1 212701600 2D TGTCTCAACT GG/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 G 2 0 60044 CASAVA_Build 1 212703292 2D AACGAGAAAA AG/-- AGAGCCAGCT 3070 hom 120 het 46 0 40 8 AG 3 2 60045 CASAVA_Build 1 212704148 2D TTCGGTGGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 27 0 13 14 T 13 11 60046 CASAVA_Build 1 212705007 11D AGAAGCCCCC CCCCCCCCCCA/----------- CCCCGCCAAA 3070 hom 92 het 30 0 31 3 CCCCCCCCCCA 1 0 60047 CASAVA_Build 1 212705851 6I TGTCTTATGT ------/TTTAAC TTTATTATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTAAC 0 1 60048 CASAVA_Build 1 212707541 2I ATATACAAAA --/AC ACACAAAGAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AC 2 3 60049 CASAVA_Build 1 212709794 2I GGGGAAAGGC --/GG GGGGGTATGT 3070 hom 24 het 10 0 8 2 G 5 7 60050 CASAVA_Build 1 212710095 1D CCTACAAAAT A/- AAAAATAAAA 3070 hom 66 het 23 0 22 2 A 6 5 60051 CASAVA_Build 1 212710992 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2748 het 9 hom 13 1 10 2 A 14 13 60052 CASAVA_Build 1 212722983 1I TTCCCCCCAT -/C ACTATTTCTG 3070 hom 175 het 63 0 58 6 C 0 1 60053 CASAVA_Build 1 212726888 2I AGTTGACCCC --/CT GTCACCCAGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CT 0 1 60054 CASAVA_Build 1 212727186 19D AAAGGAGAAG GAAAGACAGGAATTAAAGT/------------------- GAAAGACAGG 3070 hom 69 het 29 0 23 10 GAAAGACAGGAATTAAAGT 2 1 60055 CASAVA_Build 1 212727600 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 19 0 12 7 A 13 12 60056 CASAVA_Build 1 212732276 1D CTTAGGAGAT A/- AGATGGCCCC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 2 1 60057 CASAVA_Build 1 212737596 1D GCAAAGGTAC A/- AAACATTTAT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 4 3 60058 CASAVA_Build 1 212739347 4D GAGGGTAGGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 31 10 15 8 AT 8 6 60059 CASAVA_Build 1 212751020 1D AAGTCTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2049 het 2049 ref 31 16 9 6 T 12 11 60060 CASAVA_Build 1 212754550 1D AGCCTGGGGT C/- CCCCCTCGAT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 C 6 5 60061 CASAVA_Build 1 212757362 1D CACCAAGGTT A/- AGATTAACTC 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 A 2 1 60062 CASAVA_Build 1 212789739 1I TGCTTGTGGT -/A AAAACAGCAG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 4 5 60063 CASAVA_Build 1 212790168 2I TCTTTCTATC --/CT CTGTTCCTAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CT 1 2 60064 CASAVA_Build 1 212794569 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 4 5 60065 CASAVA_Build 1 212804852 1I CAATATGGAG -/A AAAAGTGACA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 A 4 5 60066 CASAVA_Build 1 212892599 2D TAGTAGAGAC AG/-- GGGTTTCACC 1992 het 450 hom 6 1 5 0 AG 1 0 60067 CASAVA_Build 1 212893434 1D ATCATAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 36 1 19 16 T 15 14 60068 CASAVA_Build 1 212896789 1D CCAACCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 11 10 60069 CASAVA_Build 1 212898153 2D TTAAAGTGTG AA/-- AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 5 A 7 5 60070 CASAVA_Build 1 212901841 1D ATGCTTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 58 26 18 15 T 11 10 60071 CASAVA_Build 1 212921612 1I CCATCCTGGG -/A AACATAGTGA 3070 hom 92 het 34 0 27 7 A 2 3 60072 CASAVA_Build 1 212923621 1I GTTGCCCTGT -/C CCCGACACCC 3070 het 3070 hom 43 18 21 6 C 3 4 60073 CASAVA_Build 1 212925483 2D CTATAGTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 106 hom 28 1 16 11 AT 8 7 60074 CASAVA_Build 1 212928022 2D CCTTACATTT CA/-- CATCATTTAT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 CA 2 1 60075 CASAVA_Build 1 212940287 1D CATTTTTTTT G/- TTTTGTTTTC 2518 het 1847 hom 22 6 8 8 G 1 0 60076 CASAVA_Build 1 212940333 1D GATTTTAAAC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 9 8 60077 CASAVA_Build 1 212942271 1D GTAAGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 2395 het 2395 ref 34 21 6 7 T 13 12 60078 CASAVA_Build 1 212947258 4D TTCTCGTTAT AGTA/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 AGTA 1 0 60079 CASAVA_Build 1 212959588 1I ACTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 811 hom 36 3 30 3 T 11 12 60080 CASAVA_Build 1 212975271 1D TTACAGTTTT C/- AAAAATAAGC 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 C 1 0 60081 CASAVA_Build 1 212977156 7D TTCAATACTC TCTAGTT/------- TCTAAAACCA 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 TCTAGTT 1 0 60082 CASAVA_Build 1 212978534 1D GTTCGAGTAA C/- TTGACCAGGG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 C 1 0 60083 CASAVA_Build 1 212990187 1I TTTTTAATGT -/G TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 G 0 1 60084 CASAVA_Build 1 212991034 3I GCTGAGCACA ---/TGT TGTTGCATTT 3070 het 3070 hom 58 16 33 9 TGT 1 2 60085 CASAVA_Build 1 212997357 1D AAAGCAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 16 9 T 12 11 60086 CASAVA_Build 1 213003526 1D CTTTAACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 952 hom 47 3 27 18 T 15 14 60087 CASAVA_Build 1 213010026 1I CTACACCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 16 3 A 11 12 60088 CASAVA_Build 1 213018013 1I CTCAAAACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 19 13 13 A 9 10 60089 CASAVA_Build 1 213021111 1I CCCACAAAGG -/C TGTCTAGTCT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 0 1 60090 CASAVA_Build 1 213026268 1I GAAATTATCC -/T TTTTTATGGC 2632 het 2632 ref 19 11 6 2 T 5 6 60091 CASAVA_Build 1 213038188 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 10 9 60092 CASAVA_Build 1 213047483 2D GATTTCAGCA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 T 11 9 60093 CASAVA_Build 1 213050532 2I TCTGAATGCC --/TT TTCTTTTTAT 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 T 2 4 60094 CASAVA_Build 1 213062188 1D TCCTTATCTT G/- TGGAATGGTG 3070 het 3070 hom 29 15 12 3 G 1 0 60095 CASAVA_Build 1 213071210 4D AGACTTCTCC CTAA/---- CTAACTCCAT 3070 hom 88 het 33 0 30 5 CTAA 2 1 60096 CASAVA_Build 1 213071552 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 64 het 28 0 21 9 CT 2 1 60097 CASAVA_Build 1 213081387 2I AGCCAGAGCC --/CA CACACCTAAA 3070 hom 95 het 36 0 31 5 CA 2 3 60098 CASAVA_Build 1 213093339 1I CTTAATTGTC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 7 8 60099 CASAVA_Build 1 213106890 1D AACGCTATGT A/- AAACACCACA 3070 hom 74 het 30 0 22 9 A 4 3 60100 CASAVA_Build 1 213127027 5D TCATTTTTTA TTATT/----- TTATTTTATT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 TTATT 3 2 60101 CASAVA_Build 1 213151754 1D TATATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 36 1 23 12 T 13 12 60102 CASAVA_Build 1 213250979 2I ATTGTATTAA --/AT ATATATATTT 2046 het 2046 ref 12 5 5 2 AT 4 5 60103 CASAVA_Build 1 213256252 13I TAAGAGATAT -------------/AGAGGATGCGATA AGAACACATA 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 AGAGGATGCGATA 0 1 60104 CASAVA_Build 1 213258965 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 9 60105 CASAVA_Build 1 213259916 2I GAGGGACCAC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 TA 6 7 60106 CASAVA_Build 1 213261351 53D GTGTTTCCAG GAGAGGTTGGCATCTGAATCGGTGGGCTGAGTAAGGAAGATCTGCCCTTACCC/----------------------------------------------------- AAGGTGGGCA 2215 het 2215 ref 32 30 5 6 GAGAGGTTGGCATCTGAATCGGTGGGCTGAGTAAGGAAGATCTGCCCTTACCC 1 0 60107 CASAVA_Build 1 213262428 2I AACAAGAGAC --/GT GTGTGTGGCT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 GT 3 4 60108 CASAVA_Build 1 213264928 5D TTTTTTTTTT TTTTA/----- ACTGAGATAA 3070 het 1461 hom 34 9 14 13 TTTTA 1 0 60109 CASAVA_Build 1 213268311 1I AGATTGTGCC -/A ATTGCACTCC 1974 hom 10 het 5 0 4 1 A 1 2 60110 CASAVA_Build 1 213269357 1I TCTATTTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 10 60111 CASAVA_Build 1 213269446 2I TGAATAATAT --/TC TGTTACTTAA 1436 het 1436 ref 13 9 3 1 TC 0 1 60112 CASAVA_Build 1 213271612 4D CTTAAATATT TCAG/---- TCCAAAGATT 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 TCAG 1 0 60113 CASAVA_Build 1 213273171 2D GTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 30 0 21 9 T 14 12 60114 CASAVA_Build 1 213273401 1D TGGTATGTGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 90 het 39 0 30 10 T 8 7 60115 CASAVA_Build 1 213274318 2D GTTGTTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3047 het 3047 ref 31 16 7 9 T 13 11 60116 CASAVA_Build 1 213275895 1D TTTTGAGGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 15 16 1 T 10 9 60117 CASAVA_Build 1 213276100 1I CTCTCATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 11 12 60118 CASAVA_Build 1 213276451 1D AATTTTGTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 31 het 30 1 25 4 T 10 9 60119 CASAVA_Build 1 213284973 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAACAA 1928 hom 12 het 6 0 5 1 A 8 7 60120 CASAVA_Build 1 213285912 2D ACACAGACAC AT/-- AGTATATTGT 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 AT 1 0 60121 CASAVA_Build 1 213299400 1I CTTAATTTGG -/T TAAGTTAGTA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 1 2 60122 CASAVA_Build 1 213305371 1D AAATATTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 10 9 60123 CASAVA_Build 1 213306097 2D GCAGGGCTAG GA/-- GAGGGATAAC 3070 het 3070 ref 30 18 11 2 GA 2 1 60124 CASAVA_Build 1 213306437 1I TTAGACTGCT -/A AAAAAAAATT 3070 het 1719 hom 24 4 18 2 A 8 9 60125 CASAVA_Build 1 213321448 1I ATTAGGAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 9 10 60126 CASAVA_Build 1 213337470 1D TAAAGAAAAA T/- TTTTTTTTGG 2914 het 2914 ref 32 15 10 7 T 9 8 60127 CASAVA_Build 1 213338177 1I GTGGGCAGTA -/T TTCCAGAAGA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 2 3 60128 CASAVA_Build 1 213342677 1I AGGTACACTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 T 8 9 60129 CASAVA_Build 1 213346997 1D TGCCTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 T 13 12 60130 CASAVA_Build 1 213348629 1D GTTGAAGTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2452 hom 19 8 8 4 T 10 9 60131 CASAVA_Build 1 213350725 1D GCCCCCACAC A/- TGCATAGCTT 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 A 1 0 60132 CASAVA_Build 1 213355693 1D CATGCTTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 5 het 27 0 18 9 T 10 9 60133 CASAVA_Build 1 213355768 1D AAAGATAGAC A/- AAGATTAATG 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 A 3 2 60134 CASAVA_Build 1 213358537 1I GGTCGCAAAT -/A AAAAATCTAT 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 A 5 6 60135 CASAVA_Build 1 213363192 1I ATATGGTAAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 8 9 60136 CASAVA_Build 1 213367885 4D CCAGTTTGTT TGTC/---- TATTTATTAA 3070 het 3070 hom 55 23 27 7 TGTC 1 0 60137 CASAVA_Build 1 213374077 1I GGTGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 10 11 60138 CASAVA_Build 1 213392181 1D AGCCGTGTGG C/- CTCTGAGTAG 3070 hom 111 het 40 0 36 4 C 2 1 60139 CASAVA_Build 1 213393531 2D ATAGCGTTGT TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 TA 8 7 60140 CASAVA_Build 1 213395268 1I TGCTTCATAA -/T CTTAATTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 0 1 60141 CASAVA_Build 1 213396916 13D ACTCGCGAGG CTGAGGCAGGAGA/------------- ATCACTTGAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 CTGAGGCAGGAGA 1 0 60142 CASAVA_Build 1 213407301 1D TAACAACGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 675 hom 38 2 28 8 A 12 11 60143 CASAVA_Build 1 213409610 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 16 0 10 6 T 11 12 60144 CASAVA_Build 1 213411887 6D TCTCTCTTTG TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 110 het 43 0 36 9 TC 11 8 60145 CASAVA_Build 1 213415416 1I CTGCCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 692 hom 23 2 18 3 T 10 11 60146 CASAVA_Build 1 213418965 1I GGTTGGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 11 12 60147 CASAVA_Build 1 213425100 1I AATCTGTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 10 60148 CASAVA_Build 1 213431250 1D GCTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 35 3 24 8 A 15 14 60149 CASAVA_Build 1 213433401 1D TTTTAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 46 1 31 15 T 13 12 60150 CASAVA_Build 1 213433970 12D TCTCATAGTA CTTTTTTATTCT/------------ CTTTGCCATC 3070 hom 105 het 40 0 33 9 CTTTTTTATTCT 1 0 60151 CASAVA_Build 1 213435330 1D TCATTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 4 T 11 10 60152 CASAVA_Build 1 213437964 4D GACTTTGTCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 96 het 43 0 32 13 CAAA 5 4 60153 CASAVA_Build 1 213440509 16D TTCAGAAAAC TTTAGGGAGCCATTGA/---------------- AGGATTTTAA 3070 hom 84 het 28 0 29 3 TTTAGGGAGCCATTGA 1 0 60154 CASAVA_Build 1 213444622 1I ATTCAGAGCT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 7 8 60155 CASAVA_Build 1 213450828 1I CTTATCTCTC -/T TTCCTGTTTT 3070 hom 141 het 50 0 47 3 T 2 3 60156 CASAVA_Build 1 213455167 1D GCTGGGGGGA T/- TTTTTTTTTT 1546 het 1546 ref 33 27 4 2 T 11 10 60157 CASAVA_Build 1 213474526 1D ATTCATGTAT A/- AAAAACAAGC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 6 5 60158 CASAVA_Build 1 213479926 1I TTTTTCACCT -/A AAAAAACTTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 7 60159 CASAVA_Build 1 213480008 2D TTCAGGTAAC TT/-- TGTAATATGC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 T 3 1 60160 CASAVA_Build 1 213482632 1I GAAATCAATG -/C TGAGGGGATG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 C 0 1 60161 CASAVA_Build 1 213483058 1D CATTGCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 11 10 60162 CASAVA_Build 1 213483903 3D CTCATTAGCA ATG/--- ATGAGAAAGT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 ATG 2 1 60163 CASAVA_Build 1 213491236 2D TGGTTTCAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 36 1 21 14 A 16 14 60164 CASAVA_Build 1 213493940 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAGCTT 3070 hom 63 het 40 0 26 14 A 7 6 60165 CASAVA_Build 1 213498157 2I TCAATTTCCC --/CT TATTGCACAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CT 0 1 60166 CASAVA_Build 1 213511635 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 35 0 20 15 A 15 16 60167 CASAVA_Build 1 213516937 1I CACATGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 45 2 28 15 T 12 13 60168 CASAVA_Build 1 213554290 4D ACTATTGATA TATG/---- TATGCAACAG 3070 hom 114 het 41 0 39 5 TATG 2 1 60169 CASAVA_Build 1 213554865 1I TAATCATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 270 hom 27 1 23 3 A 13 14 60170 CASAVA_Build 1 213646604 1D TTTTTCTGGC A/- AAAAAAAAAA 1356 het 1356 ref 53 39 4 11 A 12 11 60171 CASAVA_Build 1 213647301 1I CTGGGAGTGA -/G GAGAGATGGG 3070 hom 126 het 50 0 41 9 G 1 2 60172 CASAVA_Build 1 213658403 1D CTATCCTTCC A/- AAAAAAAAAG 1007 het 1007 ref 34 28 3 4 A 10 9 60173 CASAVA_Build 1 213810197 1D CGGTAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 1618 het 1618 ref 33 24 4 5 T 13 12 60174 CASAVA_Build 1 213829087 1I AAATACTTAA -/T TTCTTTTTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 3 60175 CASAVA_Build 1 213862696 2D AAAAAAAAAT AA/-- AACAGTTTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 4 2 60176 CASAVA_Build 1 213906269 2D TAAAATAAAT TA/-- TATGAGTAGC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TA 2 1 60177 CASAVA_Build 1 213916745 1I GCCTCTGTGA -/C CCCCCCAAGC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 C 6 7 60178 CASAVA_Build 1 213920372 1D TAAGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 51 0 37 14 T 12 11 60179 CASAVA_Build 1 213922719 1I TACATGTATC -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 1 2 60180 CASAVA_Build 1 213923769 1D CTTCTTCCCC T/- TTATTGCCAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 3 2 60181 CASAVA_Build 1 213928061 2I AAATTCTTGA --/TT TTACAAGGGC 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 2 4 60182 CASAVA_Build 1 213928160 4I AAGTTTTGGG ----/CAAA AGCAAGAGCA 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 CAAA 0 1 60183 CASAVA_Build 1 213930663 3D CATTCTTCCA GTT/--- GTTTAGGCCA 2026 het 2026 ref 39 13 6 20 GTT 2 1 60184 CASAVA_Build 1 213930698 1I TCATTTTCTC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 56 het 37 0 19 18 T 8 9 60185 CASAVA_Build 1 213931170 2I TTAACCTTAA --/AT ATCCTCATTG 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 AT 1 2 60186 CASAVA_Build 1 213932431 2D TATATATATA TG/-- AATTAGAACT 3070 het 3070 hom 22 12 10 1 TG 1 0 60187 CASAVA_Build 1 213937085 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1944 het 1944 ref 18 10 6 2 T 11 12 60188 CASAVA_Build 1 213937493 1I TTTATTTATA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 8 9 60189 CASAVA_Build 1 213943828 1I TGGGGTATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 9 10 60190 CASAVA_Build 1 213949478 7D GAAAATGAAA TTGAGTT/------- TGATCACAAT 3070 het 3070 ref 35 21 13 3 TTGAGTT 1 0 60191 CASAVA_Build 1 213958709 1I AGGGTACTTC -/A GGGGCAGCCA 3070 hom 138 het 52 0 46 6 A 0 1 60192 CASAVA_Build 1 213960141 1I CCAAGTTCAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 A 8 9 60193 CASAVA_Build 1 213986030 2D CGAATAATGT TG/-- TTTCATTCAA 3070 het 3070 ref 38 21 15 4 TG 1 0 60194 CASAVA_Build 1 213989949 1I ATTATTCAAC -/T TATTTTTCTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 1 2 60195 CASAVA_Build 1 214035965 1I CATATTTATG -/A AAAATAAATG 2746 het 2746 ref 28 14 8 6 A 4 5 60196 CASAVA_Build 1 214036808 9D19M11D GTTCTTGAAG AAAATCAAAATGCTCCTCTTCCTCCCACACCTTCAACAG/---------GTGCTCCTCTTCTTCCCAC----------- ACCTTCTTCT 3070 hom 84 het 25 0 28 3 N/A 0 0 60197 CASAVA_Build 1 214115867 2D ATAATAATCA AT/-- ATATAAATAT 3067 hom 18 het 7 0 7 0 AT 3 2 60198 CASAVA_Build 1 214148115 2I GCTAAGCAAC --/AT GTCTCAATGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 0 1 60199 CASAVA_Build 1 214156307 1D GTGCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 11 10 60200 CASAVA_Build 1 214160058 1I GAGAAAAAAA -/C ATGTACATTT 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 C 0 1 60201 CASAVA_Build 1 214164573 1D ACAGACATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 16 6 T 11 10 60202 CASAVA_Build 1 214169120 1I TTAACAATGT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 8 9 60203 CASAVA_Build 1 214199125 1D TATTATAGAA T/- TTTTTTTAAG 2865 het 2541 hom 19 8 7 4 T 8 7 60204 CASAVA_Build 1 214227906 1D TAATCAGCAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 T 9 8 60205 CASAVA_Build 1 214247567 2D AAAGAAAGAC TT/-- TGGTGTCTGT 3070 het 3070 hom 38 13 19 7 T 3 1 60206 CASAVA_Build 1 214254051 2D GCATGAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 AG 8 7 60207 CASAVA_Build 1 214258777 3I TATTATTATT ---/ATC ATTATCTCTG 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 ATC 0 1 60208 CASAVA_Build 1 214278454 1D TTTTTGAAGA C/- CCCCCCTCCA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 C 7 6 60209 CASAVA_Build 1 214292329 1D AAAACAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2753 het 2753 ref 36 18 12 6 A 15 14 60210 CASAVA_Build 1 214294427 1I GAGAAGCAGC -/A AAAACAACAG 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 A 4 5 60211 CASAVA_Build 1 214297647 1D GCAAGATTCC A/- TCTCAAATTA 2526 het 2526 ref 28 15 9 4 A 1 0 60212 CASAVA_Build 1 214304466 1D CTAGGGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 13 7 T 13 12 60213 CASAVA_Build 1 214315823 1D TTAGTAGATT A/- AAAAAAAAAT 1239 het 1239 ref 42 36 3 4 A 10 9 60214 CASAVA_Build 1 214348370 1I TTCCATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 789 hom 42 2 31 9 T 10 11 60215 CASAVA_Build 1 214390403 1D TGTCAACCTT A/- ACCCATTCTC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 2 1 60216 CASAVA_Build 1 214400573 1D CTCGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 11 10 60217 CASAVA_Build 1 214403612 3I CTTTTATCTC ---/ATT AGTATAATTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ATT 0 1 60218 CASAVA_Build 1 214416408 3D AGAAAAATTG AGA/--- AGAAGGTACA 3070 hom 114 het 40 0 39 3 AGA 2 1 60219 CASAVA_Build 1 214444401 4D TTATAATAAC AAAT/---- AATTTGAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AAAT 1 0 60220 CASAVA_Build 1 214458956 2D TCTCAATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 103 het 45 0 35 10 TG 10 9 60221 CASAVA_Build 1 214471520 1D AAAAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 37 0 25 13 T 12 11 60222 CASAVA_Build 1 214484033 1I ACACTGATGC -/T TCATGTCAAC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 1 2 60223 CASAVA_Build 1 214510676 1D TTCATTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 661 hom 25 2 17 7 T 15 14 60224 CASAVA_Build 1 214520671 3I AGGAAGAATT ---/ACA ACAACATTTC 3070 hom 96 het 40 0 32 8 ACA 2 3 60225 CASAVA_Build 1 214531127 1D GATAAAAGCC A/- AAGGCTTTAT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 A 3 2 60226 CASAVA_Build 1 214534493 1I ACACATTTAG -/T TTTTTTTTTT 652 het 652 ref 31 21 3 7 T 11 12 60227 CASAVA_Build 1 214546173 1D GTTCATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 11 10 60228 CASAVA_Build 1 214608174 1D GTACACTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 13 12 60229 CASAVA_Build 1 214613735 5D TAGTTGTCAT GACTC/----- TAAGTTTTCT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 GACTC 1 0 60230 CASAVA_Build 1 214616451 1D AATCCCTATT C/- TTTCAAATAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 0 60231 CASAVA_Build 1 214629979 2D TGTCAGTTTT AA/-- AAGACAGTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 4 2 60232 CASAVA_Build 1 214638523 6I ACACCCATAC ------/ACACAA ACACACACAC 3070 hom 127 het 47 0 38 9 ACACAA 0 1 60233 CASAVA_Build 1 214639908 1D GCTTCTGAAT A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 135 het 50 0 44 6 A 7 6 60234 CASAVA_Build 1 214651050 1D AGTTCCATTT A/- AAAAAAAAAT 1292 het 1292 ref 66 55 3 10 A 10 9 60235 CASAVA_Build 1 214656791 1I GTAAAGATAA -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 132 het 48 0 44 4 T 7 8 60236 CASAVA_Build 1 214677561 1D CACCAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 27 5 T 11 10 60237 CASAVA_Build 1 214685087 1D TTATCATGAC T/- TTGTAGCTAA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 3 2 60238 CASAVA_Build 1 214708305 6I GTGATTACTC ------/TTCCTT TTCGTTAGGA 3070 hom 107 het 41 0 36 5 TTCCTT 0 1 60239 CASAVA_Build 1 214711783 1I AAAAGTAGAT -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 7 8 60240 CASAVA_Build 1 214713878 1D AGGCAAAAAA G/- GTTGTGCTCA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 G 2 1 60241 CASAVA_Build 1 214720485 1D TCGGCAGTGA T/- TTTTTTGGAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 6 60242 CASAVA_Build 1 214724835 1I TATTTTCACT -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 8 60243 CASAVA_Build 1 214731568 2D AAGTATAATA AT/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AT 1 0 60244 CASAVA_Build 1 214732382 1D CACTTGAACC T/- TGGGAGGAGG 3070 hom 27 het 11 0 10 2 T 2 1 60245 CASAVA_Build 1 214733464 4D GGTGTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TG 8 6 60246 CASAVA_Build 1 214733632 1D GATACAAAGA T/- TGTTGAACGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 1 60247 CASAVA_Build 1 214763468 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1958 het 1958 ref 36 17 6 13 T 15 14 60248 CASAVA_Build 1 214786777 4D GCTATCTCTT TATA/---- TATATATATA 2600 het 2085 hom 14 6 6 3 TA 9 7 60249 CASAVA_Build 1 214787466 4D TCCCAGGTAC AATT/---- AATTGTCCAG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AATT 2 1 60250 CASAVA_Build 1 214794418 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2135 het 1709 hom 18 6 8 4 A 13 11 60251 CASAVA_Build 1 214795501 1D TGCCCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1943 hom 21 8 9 5 A 15 14 60252 CASAVA_Build 1 214799008 1I ATAATTTTTA -/T TACTTTTAGT 3070 het 2350 hom 17 6 8 3 T 1 2 60253 CASAVA_Build 1 214805950 1I ATTCTAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 661 hom 31 2 24 5 T 10 11 60254 CASAVA_Build 1 214816845 1I CAATTCTGAC -/A AAAGGTGAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 3 4 60255 CASAVA_Build 1 214823010 1I GTGTTTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 15 28 11 A 10 11 60256 CASAVA_Build 1 214825478 1D ATATTCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 A 11 10 60257 CASAVA_Build 1 214825987 2I41M2I TGTGGAAGAC --AGAGGGATACTCCGTCTCAAAATAAATAAATTAATTAATAA--/AGAGAGGGATACTCCGTCTCAAAATAAATAAATTAATTAATAAAT AGTTATTTTT 3070 het 751 hom 19 2 11 8 N/A 0 0 60258 CASAVA_Build 1 214826719 2I TTTTTTTGTA --/TT TTTTGTAGAG 3070 hom 56 het 20 0 17 3 T 4 6 60259 CASAVA_Build 1 214832158 2D CATGAAAGTC AG/-- GGAAAGAATG 3070 het 3070 hom 42 17 20 6 AG 1 0 60260 CASAVA_Build 1 214847372 1I TAAATGAGAT -/C CAGGGTGAGC 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 C 1 2 60261 CASAVA_Build 1 214850175 1I AATTCAGTGC -/T TTTTTTTTTT 1517 het 1517 ref 33 11 11 11 T 15 16 60262 CASAVA_Build 1 214854309 1I CCTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 51 0 39 12 T 10 11 60263 CASAVA_Build 1 214856675 4D TCCTCCCTCT TCTC/---- TCTATTATCT 3070 het 3070 ref 31 14 13 7 TC 3 1 60264 CASAVA_Build 1 214857469 1D TGGCCTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2816 hom 44 12 19 13 A 14 13 60265 CASAVA_Build 1 214867784 1D AAGAAGTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 T 10 9 60266 CASAVA_Build 1 214870881 1D AAGAGTGAGA T/- TTTTCATCAG 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 T 5 4 60267 CASAVA_Build 1 214874368 1D TGGGCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 11 10 60268 CASAVA_Build 1 214887456 1D ACTGATACAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 9 8 60269 CASAVA_Build 1 214890570 1D AAGATTAATT A/- AAAAAAAAAA 1459 het 1459 ref 40 32 4 4 A 12 11 60270 CASAVA_Build 1 214900932 1I TCCTGATGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 9 10 60271 CASAVA_Build 1 214902592 2I CAGGGAGAGT --/GG GGGGGGGTTC 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 G 7 9 60272 CASAVA_Build 1 214903611 1D TAAGAAAAAC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 66 het 37 1 36 0 A 8 7 60273 CASAVA_Build 1 214908249 2I GTTGGGCATT --/AA AAGTTTTGTT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 2 4 60274 CASAVA_Build 1 214909860 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 9 9 5 A 10 11 60275 CASAVA_Build 1 214912841 3D CAAAAATAAT AAG/--- AAGATATATT 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 AAG 2 1 60276 CASAVA_Build 1 214921759 4I AAAGAATAAG ----/AATC AATTAAAGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AATC 0 1 60277 CASAVA_Build 1 214925214 1D GAGATTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 10 60278 CASAVA_Build 1 214933682 1D ACAATCATAC T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 T 7 6 60279 CASAVA_Build 1 214940090 1I GCCCCGCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 626 hom 34 3 21 10 T 11 12 60280 CASAVA_Build 1 214941101 1D TGCGGAGTTT G/- GGGGGGGTAT 3070 het 3070 hom 37 10 23 4 G 8 7 60281 CASAVA_Build 1 214944757 1D TAATTTAAAT A/- AAACCCCCTA 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 A 4 3 60282 CASAVA_Build 1 214949660 1I GTGCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 A 11 12 60283 CASAVA_Build 1 214953329 1D TCCTTTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 11 A 16 15 60284 CASAVA_Build 1 214972347 1I GATTTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 23 1 12 10 T 15 16 60285 CASAVA_Build 1 214977373 1I TTGTTGCTAA -/G GGGATTAAAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 3 4 60286 CASAVA_Build 1 214977743 1D AGAAGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 12 11 60287 CASAVA_Build 1 214979230 2D CATTAAAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 A 14 12 60288 CASAVA_Build 1 214980864 2I AAAATGGGAT --/TA TATATATACA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TA 4 5 60289 CASAVA_Build 1 214982842 2I CCTCAAACTT --/AA AAGAGTTTAG 3070 het 3070 hom 47 22 23 2 A 2 4 60290 CASAVA_Build 1 214985536 2D TTTTACCCTC TT/-- GAGTTGAAGG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 2 0 60291 CASAVA_Build 1 214989113 1I TGTCTAAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 T 11 12 60292 CASAVA_Build 1 214990726 1I GTTATTTACC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 91 het 40 0 36 4 T 7 8 60293 CASAVA_Build 1 214991793 2I TATTCAGCTG --/AT ATATATATAT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 AT 5 6 60294 CASAVA_Build 1 214998501 1D GAGTCCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1834 hom 22 5 11 7 T 11 10 60295 CASAVA_Build 1 215000232 1I CAATAAAAAA -/C ATCTCAAATT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 C 0 1 60296 CASAVA_Build 1 215003227 3I GGCCATAACA ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 TGT 3 4 60297 CASAVA_Build 1 215004144 1I TAATTGATTC -/T TTTTTTTTTC 1932 het 1932 ref 37 21 7 9 T 9 10 60298 CASAVA_Build 1 215004536 1I GCCCGGCCCA -/G GGGGGGGACT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 G 7 8 60299 CASAVA_Build 1 215012816 1D CACTAGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 15 14 T 13 12 60300 CASAVA_Build 1 215032804 1I GAGCCATGGA -/G GGGGACTCAT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 G 4 5 60301 CASAVA_Build 1 215043998 1I AAGGCAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 42 0 32 10 A 10 11 60302 CASAVA_Build 1 215050668 2D CAAAAATGGA TG/-- TGTGTGTGTG 2561 hom 21 het 10 0 8 2 TG 9 8 60303 CASAVA_Build 1 215059344 3I TAAAGTTTTC ---/TGT TGTATATCTT 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 TGT 1 2 60304 CASAVA_Build 1 215068774 1I ATATGTCCTC -/T TGCTAGTGGT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 1 2 60305 CASAVA_Build 1 215071761 16D TTCAAATGTG GGGCCTGGTCAGAAAT/---------------- GGGGTGAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 12 3 GGGCCTGGTCAGAAAT 1 0 60306 CASAVA_Build 1 215075119 3D CCAACTGATA ATC/--- AGAGTTGAAT 3070 het 3070 hom 26 12 13 4 ATC 1 0 60307 CASAVA_Build 1 215076641 1I AGCAATCATC -/A AATATCAGCA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 2 3 60308 CASAVA_Build 1 215077069 1I ATATATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2532 hom 19 7 11 1 T 10 11 60309 CASAVA_Build 1 215079708 4I GAATGAAACC ----/AACA TTCATCTCCT 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 AACA 0 1 60310 CASAVA_Build 1 215080491 1I CAAGAACTTT -/C CCTTTACATT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 C 2 3 60311 CASAVA_Build 1 215088364 1I ATTTCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2480 hom 43 8 15 20 T 13 14 60312 CASAVA_Build 1 215094792 1I GGAAGGCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 9 10 60313 CASAVA_Build 1 215095390 1D AGAAAAAAAA T/- ATCTGTGGGT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 1 0 60314 CASAVA_Build 1 215098182 2D GTGGGTGGAT CA/-- CGAGGTCAGG 2325 hom 12 het 10 0 5 5 CA 1 0 60315 CASAVA_Build 1 215098480 3I ACTGAAATCT ---/TTA TTTTCTGATT 3070 het 1457 hom 16 3 13 0 TTA 0 1 60316 CASAVA_Build 1 215103249 1D AATGTAGAAT A/- AAGGGCCAAT 2804 het 2804 ref 25 16 7 2 A 3 2 60317 CASAVA_Build 1 215104111 1D ACAAACATTT G/- GGGGGTTGTT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 G 6 5 60318 CASAVA_Build 1 215104299 3D AACAAGTCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2123 hom 35 14 11 11 A 17 14 60319 CASAVA_Build 1 215104536 1D AATAATACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 10 9 60320 CASAVA_Build 1 215104692 2I GTGGAGTAAC --/TT AGACCAACTT 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 T 0 2 60321 CASAVA_Build 1 215106531 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 11 10 60322 CASAVA_Build 1 215114656 1D TATTGTTCCT G/- GGTGTGTCTG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 G 3 2 60323 CASAVA_Build 1 215116168 1I TCTGATAAGA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 7 8 60324 CASAVA_Build 1 215123828 1I TCAAATCTGG -/C AAGCAAGATA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 C 0 1 60325 CASAVA_Build 1 215127973 1D TGTAATTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 13 9 T 12 11 60326 CASAVA_Build 1 215157124 1D ATAGACTTTC T/- TTTTTTTTTT 2275 het 2275 ref 36 19 8 9 T 17 16 60327 CASAVA_Build 1 215177212 1D GGAAGAGCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 10 9 60328 CASAVA_Build 1 215177883 1D TGCTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 903 hom 28 4 10 15 T 11 10 60329 CASAVA_Build 1 215183020 1D AACTTATTAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 9 8 60330 CASAVA_Build 1 215191856 2I ATATGTTTGC --/AT ATATATATAT 2906 het 2906 ref 29 13 8 8 AT 7 8 60331 CASAVA_Build 1 215198002 5D GTATAGTACG CACCA/----- CCATGTGTCC 3070 hom 160 het 55 0 54 3 CACCA 1 0 60332 CASAVA_Build 1 215198479 1D GGTCTTTCTC T/- GATGATGATT 3070 hom 108 het 39 0 34 5 T 1 0 60333 CASAVA_Build 1 215199309 1D TATTTAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 9 8 60334 CASAVA_Build 1 215200102 1I TCTGTAATGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 10 60335 CASAVA_Build 1 215202017 4D28M1I TTACAGCCAT AAAGAAAGAAAAATTGTCAGTGCTTTCTGCTA-/----AAAGAAAAATTGTCAGTGCTTTCTGCTAT TTTTTTTAAC 3070 hom 129 het 39 0 44 5 N/A 0 0 60336 CASAVA_Build 1 215202524 1D AGTAGGAATC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 8 7 60337 CASAVA_Build 1 215204713 1I GAAGAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 10 11 60338 CASAVA_Build 1 215205126 1I CACATATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 155 hom 41 2 30 9 T 11 12 60339 CASAVA_Build 1 215220875 3D TTTCATATGC TCT/--- TCTCTCATCC 3070 het 3070 hom 59 27 27 6 TCT 2 1 60340 CASAVA_Build 1 215253767 2I CACAGTGCTC --/CA CCTGACTGGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 CA 0 1 60341 CASAVA_Build 1 215265318 1I TTTCTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 A 11 12 60342 CASAVA_Build 1 215269025 1D TGAAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 2895 het 2895 ref 23 11 6 6 A 12 11 60343 CASAVA_Build 1 215275646 1I GGATTCCGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 11 14 13 A 15 16 60344 CASAVA_Build 1 215279844 3D TTCCCAAATT GTA/--- GTATTCTATA 3070 het 3070 ref 54 27 23 7 GTA 2 1 60345 CASAVA_Build 1 215283621 1I ATAATGGGGA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 7 8 60346 CASAVA_Build 1 215286851 1D CCTGTCTCAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 46 16 14 17 A 9 8 60347 CASAVA_Build 1 215293996 1I TTGAGCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 13 14 60348 CASAVA_Build 1 215295717 2D TGAGGCCACC AG/-- AGTCTCCTTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 AG 2 1 60349 CASAVA_Build 1 215300139 1I CAATATACTA -/G GCCATGCATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 2 60350 CASAVA_Build 1 215300783 1D ATAGATAGAT A/- GATAGATAGA 3070 het 1564 hom 31 5 10 17 A 1 0 60351 CASAVA_Build 1 215300955 1D ATGGGTAGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 10 9 60352 CASAVA_Build 1 215307376 4D TCAACTGAAC ATAG/---- ATAGCTGTTG 3070 het 3070 hom 57 18 32 12 ATAG 2 1 60353 CASAVA_Build 1 215307494 1D CTATATGACA C/- CAGTTTGTTC 3070 het 3070 hom 48 16 31 2 C 2 1 60354 CASAVA_Build 1 215312676 1I GGTGTGTGTG -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 6 7 60355 CASAVA_Build 1 215320616 3D9M26D GTTTGTTTGT TTGTTTGTTTTGTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTT/---TTTGTTTTG-------------------------- TTTTTTTGAG 1497 het 1168 hom 11 4 5 4 N/A 0 0 60356 CASAVA_Build 1 215324419 3I TTATTAATCT ---/AAG AATATATCTT 3070 het 3070 ref 38 24 13 1 AAG 0 1 60357 CASAVA_Build 1 215326886 1D ACACAAGACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 132 hom 32 1 26 6 T 10 9 60358 CASAVA_Build 1 215328016 1D GCTGGACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2965 hom 41 10 22 9 A 12 11 60359 CASAVA_Build 1 215339342 1D TGAGCAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 36 0 26 10 A 15 14 60360 CASAVA_Build 1 215341758 1D CAACATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 11 10 60361 CASAVA_Build 1 215353556 21D CTTTTGGGGG CTTGGGAGGGACCATTTTTCA/--------------------- CTTGGGAAGA 3070 het 3070 ref 37 23 17 3 CTTGGGAGGGACCATTTTTCA 1 0 60362 CASAVA_Build 1 215370859 1I TTTTATTGTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 8 9 60363 CASAVA_Build 1 215378776 1I CCATCCATCA -/C TATCCATCTC 3070 hom 105 het 43 0 33 10 C 0 1 60364 CASAVA_Build 1 215387642 3I TAGAGAAAAT ---/CAA CAAAACCATT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 CAA 1 2 60365 CASAVA_Build 1 215392103 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 8 9 60366 CASAVA_Build 1 215413574 1I GAGAACCCAG -/C TTAAGTTGGT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 C 0 1 60367 CASAVA_Build 1 215422920 1D CCTTCAATTT A/- AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 42 14 21 8 A 7 6 60368 CASAVA_Build 1 215427176 1D ACCTCAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 12 11 60369 CASAVA_Build 1 215444257 1I TTGTCAACCC -/T TTTTTTTTTG 2654 het 2654 ref 41 21 10 10 T 9 10 60370 CASAVA_Build 1 215447518 1I ACCATCCACA -/T TAAGATGTGA 3070 het 2047 hom 15 6 9 1 T 1 2 60371 CASAVA_Build 1 215448969 1D TATGTGATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 158 hom 34 3 16 15 A 10 9 60372 CASAVA_Build 1 215450850 3I GCTTATTTCA ---/AGG AGATTTTATT 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 AGG 0 1 60373 CASAVA_Build 1 215456343 1I AAAATACCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 T 9 10 60374 CASAVA_Build 1 215463156 2D GACTTCACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 45 0 32 13 T 13 11 60375 CASAVA_Build 1 215464526 4D GATATAACAT ATTA/---- ATTATTAAAT 2458 het 1492 hom 8 3 5 0 ATTA 2 1 60376 CASAVA_Build 1 215475299 3D ATGGGAGAAA ATC/--- ATCAAGATTC 3070 het 3070 ref 34 21 8 6 ATC 2 1 60377 CASAVA_Build 1 215477507 1I CAGGGGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 11 12 60378 CASAVA_Build 1 215484636 1D AGTTCTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 12 11 60379 CASAVA_Build 1 215486124 2D GGTGTGTGTT GC/-- GTGTGTGTTG 3070 hom 56 het 47 1 34 13 GC 1 0 60380 CASAVA_Build 1 215488672 8I CTTCTTAATT --------/GAATTTCA GAATTTCAGT 3070 het 3070 ref 52 30 14 8 GAATTTCA 1 2 60381 CASAVA_Build 1 215495992 2I ACTTACATTA --/CT CTTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 CT 1 2 60382 CASAVA_Build 1 215496757 1I TTCTGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 10 11 60383 CASAVA_Build 1 215502227 3D CTAGGTGGCC AAA/--- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 11 18 6 A 11 8 60384 CASAVA_Build 1 215508701 1D TTTGCCTAAA G/- GCAATTTATG 3070 het 3070 hom 48 23 23 2 G 2 1 60385 CASAVA_Build 1 215509198 1I ACATAGGATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 8 9 60386 CASAVA_Build 1 215510467 1D CATGAAGCAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 7 6 60387 CASAVA_Build 1 215514211 1I AGTATCTACG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 9 10 60388 CASAVA_Build 1 215517065 2D AGAAAATGTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 AT 8 7 60389 CASAVA_Build 1 215548016 4D ACTCCGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1423 het 259 hom 19 5 6 8 A 18 14 60390 CASAVA_Build 1 215548415 1D TATAGGTGTG C/- TAAATGCAAG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 C 1 0 60391 CASAVA_Build 1 215555477 1D GAGTTTGTAA G/- GCATTGCTTC 3070 het 3070 ref 52 25 18 9 G 2 1 60392 CASAVA_Build 1 215562489 4D ATTTTCACTT GGAC/---- GGACTTGTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 GGAC 2 1 60393 CASAVA_Build 1 215565623 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 A 7 6 60394 CASAVA_Build 1 215573795 5D AGTACAATTA ATTGG/----- CATCGTGCAA 3070 hom 88 het 32 0 30 5 ATTGG 1 0 60395 CASAVA_Build 1 215596809 1I ATCTAGTTAG -/A AAAAATGTTA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 5 6 60396 CASAVA_Build 1 215602989 4I TTGGCATTTT ----/ATTA ATTAATATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 ATTA 1 2 60397 CASAVA_Build 1 215606311 1D CTGAAAAAAA C/- ATTTGCAATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 1 0 60398 CASAVA_Build 1 215607037 2D ACAAGATACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 14 12 60399 CASAVA_Build 1 215662548 6I CATTTACAGA ------/CTTTCT CTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 CTTTCT 0 1 60400 CASAVA_Build 1 215664533 1D CCCACCTGAT A/- AGTGGACCAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 2 1 60401 CASAVA_Build 1 215666525 1D AAACTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 A 11 10 60402 CASAVA_Build 1 215667570 1I AAGAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 9 10 60403 CASAVA_Build 1 215669942 3D AATCATCATC ATA/--- ATAAGTTGTT 3070 het 3070 hom 35 17 16 4 ATA 2 1 60404 CASAVA_Build 1 215670132 1D TACCATTTAC T/- TCTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 2 1 60405 CASAVA_Build 1 215672296 1I AGACTTTGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 8 9 60406 CASAVA_Build 1 215673350 14D TATATATATA TTTATTTATTTATT/-------------- TATTTATTTA 23 het 23 ref 8 3 1 4 TTTATTTATTTATT 1 0 60407 CASAVA_Build 1 215745378 1I TTTAGGAAAG -/A AGGTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 1 2 60408 CASAVA_Build 1 215756193 1D TCCATTTTAA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 T 4 3 60409 CASAVA_Build 1 215767444 1D ATAACATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 17 12 T 16 15 60410 CASAVA_Build 1 215774540 3D ACAGTCTGTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 12 15 A 15 12 60411 CASAVA_Build 1 215779874 1I AAACTTAATG -/A ATATACATCT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 1 2 60412 CASAVA_Build 1 215802970 1D TTTGGACAAG T/- TTGCTAAGTT 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 T 3 2 60413 CASAVA_Build 1 215805722 1D AAACGTATAT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 8 7 60414 CASAVA_Build 1 215824311 9D AAAAAAAAAA TATATATAT/--------- ATATATATAT 671 het 671 ref 7 2 3 2 TATATATAT 1 0 60415 CASAVA_Build 1 215826331 1D ATTTTATACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 10 9 60416 CASAVA_Build 1 215831974 1D TTCGTATATC A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 30 21 8 2 A 8 7 60417 CASAVA_Build 1 215848182 1D GATTTTATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 11 10 60418 CASAVA_Build 1 215851353 5D TATACCACAG CTTCA/----- CTTAAGAAAT 3070 het 3070 ref 32 19 13 1 CTTCA 1 0 60419 CASAVA_Build 1 215856988 8D CAAAGATAAA CAAAATAC/-------- CAAAATACAG 3070 het 3070 ref 48 26 18 6 CAAAATAC 2 1 60420 CASAVA_Build 1 215862212 1D GAATCAACAC A/- AGGGACAGGG 3070 het 3070 hom 46 20 23 4 A 2 1 60421 CASAVA_Build 1 215873366 1I ATAATCTATA -/T TTTTTAGAGC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 5 6 60422 CASAVA_Build 1 215878280 2D TGAAAGAAAT AA/-- GTGTTTTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 2 0 60423 CASAVA_Build 1 215889699 1D TCTTTCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 7 13 9 T 15 14 60424 CASAVA_Build 1 215923411 1I GTTAGAAATA -/T TTTTTTTGTT 2928 het 2928 ref 29 16 8 5 T 7 8 60425 CASAVA_Build 1 215938545 1D ATGCAGTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 37 0 26 11 A 15 14 60426 CASAVA_Build 1 215938560 1D AAAAAAAAAA C/- AAAGAAATTC 3070 het 90 hom 36 4 27 5 C 1 0 60427 CASAVA_Build 1 215976527 8D ATTTAAGTGA AGATCTTG/-------- AGGTAGAAAT 3070 hom 138 het 50 0 47 4 AGATCTTG 1 0 60428 CASAVA_Build 1 215986424 1D TTTAGATGAG T/- TAGAAATAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 2 1 60429 CASAVA_Build 1 215986525 1I AGATTATGTG -/T TTTTTAATGT 3070 hom 157 het 56 0 53 3 T 5 6 60430 CASAVA_Build 1 215988709 4D ACTCTGACTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2494 hom 24 het 12 0 8 4 A 20 16 60431 CASAVA_Build 1 215996289 1I TTTTTTGTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 74 hom 30 2 25 3 T 9 10 60432 CASAVA_Build 1 216011814 3I CAAATGTGCA ---/AGG AGATCAAAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AGG 0 1 60433 CASAVA_Build 1 216020302 2I TCTGAGGTAT --/AA AAATGTATGT 3070 hom 154 het 60 0 52 8 A 3 5 60434 CASAVA_Build 1 216021979 3D AAATAAGTGA TAT/--- TATGTCATGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TAT 2 1 60435 CASAVA_Build 1 216022789 1I TAATTTTAAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 8 9 60436 CASAVA_Build 1 216037217 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 25 2 13 11 T 16 15 60437 CASAVA_Build 1 216062751 1D CTGTTTTCTA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 8 7 60438 CASAVA_Build 1 216065020 2I CAAATGTATT --/TG TATTTATATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TG 0 1 60439 CASAVA_Build 1 216079974 1I AATCTTGTCG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 365 hom 54 1 46 7 A 7 8 60440 CASAVA_Build 1 216090444 1I GAGTACAGCC -/A TCTTCTAGCT 3070 hom 129 het 49 0 41 8 A 0 1 60441 CASAVA_Build 1 216098674 1D GCGACATAGC A/- AGACAACTTC 2526 het 1800 hom 11 4 6 2 A 2 1 60442 CASAVA_Build 1 216112588 1I AAACTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 A 11 12 60443 CASAVA_Build 1 216122291 3D AGTATAACTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 TTG 7 6 60444 CASAVA_Build 1 216131348 1I GGGGTATGGG -/T TTATAAATTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 60445 CASAVA_Build 1 216135754 1D GGAATGAGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 9 8 60446 CASAVA_Build 1 216141254 1I CATTCTTTTT -/A TTTTTTTTTT 2475 het 366 hom 30 3 16 11 A 0 1 60447 CASAVA_Build 1 216141474 23D GCTCAAACTC CTGACCTCAGGTGATCCGCCCAG/----------------------- CTTTGCCTCC 3070 het 3070 ref 33 24 12 5 CTGACCTCAGGTGATCCGCCCAG 1 0 60448 CASAVA_Build 1 216150520 5D GAAAAGACAT CTGAG/----- CTTGAGGGGG 3070 het 3070 ref 42 19 19 8 CTGAG 1 0 60449 CASAVA_Build 1 216162157 2I TTCCAACTTT --/TA TATGTTACCT 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 TA 1 2 60450 CASAVA_Build 1 216164310 3I ATGTTTCTGT ---/CTC CTCATATTTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTC 1 2 60451 CASAVA_Build 1 216167207 1D TCCCCATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 996 hom 39 9 15 15 A 14 13 60452 CASAVA_Build 1 216168773 4I ATGAAGAAAA ----/AATG AATGAATGAC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 AATG 2 3 60453 CASAVA_Build 1 216170781 1I TTTTTAATTT -/A AAAAAACATG 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 6 7 60454 CASAVA_Build 1 216172926 1D TATCTGGCCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 8 7 60455 CASAVA_Build 1 216174646 1D TTTTAAGACA G/- GGACACACAG 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 G 3 2 60456 CASAVA_Build 1 216175076 1I TTCCTTAAAG -/T TTTGTTTTTT 3070 het 221 hom 49 7 25 17 T 3 4 60457 CASAVA_Build 1 216175821 1D TTTTTCATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 13 22 11 T 10 9 60458 CASAVA_Build 1 216179144 1D CATTTTTTCC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 8 7 60459 CASAVA_Build 1 216189927 4D TGTTTATTGT TCAA/---- TCAGAGCACA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TCAA 1 0 60460 CASAVA_Build 1 216192291 1D GAGATGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 A 11 10 60461 CASAVA_Build 1 216193826 1I CTGCAGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 992 hom 30 3 23 4 T 11 12 60462 CASAVA_Build 1 216195151 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 50 22 20 8 A 8 7 60463 CASAVA_Build 1 216211332 2D TTCTTAGTAG TC/-- TCTGATCATT 3070 het 3070 ref 37 19 18 2 TC 2 1 60464 CASAVA_Build 1 216214334 2I GTGTGTGTGT --/GG GTGTGTGTAC 3070 hom 74 het 36 0 24 12 G 1 3 60465 CASAVA_Build 1 216216513 1D GTGTGAGATG A/- GCAAGTGTGA 3070 het 3070 ref 48 23 19 7 A 1 0 60466 CASAVA_Build 1 216219775 38D CCACAGTGTG CTAGGAAGAGTTCTAAGCATTTTACTAATACAAACTTT/-------------------------------------- TAAAACACTA 3070 het 3070 ref 34 26 22 5 CTAGGAAGAGTTCTAAGCATTTTACTAATACAAACTTT 1 0 60467 CASAVA_Build 1 216220768 2D AGACTAGAGT CA/-- CTAAGGGTGA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 CA 1 0 60468 CASAVA_Build 1 216226124 1D TATCTTTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 10 9 60469 CASAVA_Build 1 216230571 2I GTTTGGGAGA --/TC TCGGAGCAGC 3070 het 3070 ref 50 22 18 10 TC 1 2 60470 CASAVA_Build 1 216231429 4D TTAAAATAAT CAAA/---- CAGAGTCATC 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 CAAA 1 0 60471 CASAVA_Build 1 216231665 2D TGCATTAATC AT/-- ACCCATATAT 3070 het 3070 hom 60 23 30 7 AT 1 0 60472 CASAVA_Build 1 216235451 2I GAATACTTTG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 9 11 60473 CASAVA_Build 1 216236438 2D ACTCTGTCTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 17 0 11 7 AT 12 11 60474 CASAVA_Build 1 216236785 12D CTAGATAAGA AATTAAAAAAAC/------------ AATTATTATA 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 AATTAAAAAAAC 1 0 60475 CASAVA_Build 1 216237774 1D AAGCCTATTA T/- CCATTATTTT 3070 het 3070 ref 29 17 9 4 T 1 0 60476 CASAVA_Build 1 216238464 2I ACATATATAT --/AC ACACACACAT 2060 het 334 hom 17 3 11 3 AC 4 5 60477 CASAVA_Build 1 216239007 3D ATTTCGTCGC ATA/--- GTAAATAAAA 2375 het 2375 ref 25 16 6 3 ATA 1 0 60478 CASAVA_Build 1 216239943 4D AAGCATAGAA AAAG/---- ACAGACAAAT 3070 het 3070 ref 35 23 9 6 AAAG 1 0 60479 CASAVA_Build 1 216240990 4D CTCCACTTGA CTGT/---- CTTATAGTCA 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 CTGT 1 0 60480 CASAVA_Build 1 216241673 1D CTAGACTACG T/- TAAGTCCTCT 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 T 2 1 60481 CASAVA_Build 1 216241781 3D TAAACTCTAG GAA/--- GAAGGCAGGC 3070 het 3070 hom 40 12 23 6 GAA 2 1 60482 CASAVA_Build 1 216242827 1I GCCTGGGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 9 17 5 A 9 10 60483 CASAVA_Build 1 216243903 1D GACAAATTGA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 7 6 60484 CASAVA_Build 1 216245800 5I TTTTGTTTTT -----/TGTGG GTTCTTGTTT 3070 het 3070 hom 44 14 24 6 TGTGG 0 1 60485 CASAVA_Build 1 216247257 1I CATGTTTAAC -/A AAAAAAGACC 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 6 7 60486 CASAVA_Build 1 216247629 1I TCTCATGTCT -/C CCCCAAAATG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 C 4 5 60487 CASAVA_Build 1 216247983 5D TGTACAACTC CTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 628 hom 25 3 16 6 CTTTT 1 0 60488 CASAVA_Build 1 216256348 1I AGATGGGGGG -/A AAAAAGGAGG 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 A 5 6 60489 CASAVA_Build 1 216259041 1I GAAATTTTAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 7 8 60490 CASAVA_Build 1 216259356 1I GTTGGCTTAG -/A AAAAAAGATT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 6 7 60491 CASAVA_Build 1 216259673 5I ATTTTGAGAG -----/ATAAA ATAAGTTTAG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 ATAAA 0 1 60492 CASAVA_Build 1 216259970 1D GGTTTTCATC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 T 8 7 60493 CASAVA_Build 1 216264266 2D AAAGAAGAAT AA/-- ACTCTTGTTT 3070 het 3070 hom 43 13 27 6 A 3 1 60494 CASAVA_Build 1 216265827 1I GAAAACAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 9 10 60495 CASAVA_Build 1 216267558 4I TTTTAGTGGC ----/TAAA TAAATAAATT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 TAAA 2 3 60496 CASAVA_Build 1 216269082 1D CCTATTTGTG T/- TTTCAAGATC 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 4 3 60497 CASAVA_Build 1 216273774 1I TCTTGTTTAA -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 T 7 8 60498 CASAVA_Build 1 216278369 1I GTTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 10 11 60499 CASAVA_Build 1 216284528 1I ATGGAAGAGC -/G TCACAGGAGA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 G 0 1 60500 CASAVA_Build 1 216286376 1D TGTTACTGGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 9 8 60501 CASAVA_Build 1 216286460 1D AATGTCTTTG A/- AAACAGAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 4 3 60502 CASAVA_Build 1 216290737 1D AAGAGAAAAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 9 8 60503 CASAVA_Build 1 216301035 6D ACAACACCCA CCCCCC/------ CCCCCCCCAT 3070 het 635 hom 27 5 13 9 C 14 8 60504 CASAVA_Build 1 216307421 1D ATTATATATG A/- AAAAAAGATT 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 A 7 6 60505 CASAVA_Build 1 216310430 10D CCACATGTCA TGGAAGGGAC/---------- CCCGTGGGAG 3070 het 3070 ref 32 20 9 5 TGGAAGGGAC 1 0 60506 CASAVA_Build 1 216318788 1I TGATGGCTTG -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 96 het 41 0 31 10 T 7 8 60507 CASAVA_Build 1 216319073 1I CAGTAAGTGA -/T TTTTCTTAAC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 4 5 60508 CASAVA_Build 1 216342518 1I34M1D TGCTCAGCAC -TTTTTTTTAAAACTAAGTCTCTCTCTTTCTTTCCT/TTTTTTTTTAAAACTAAGTCTCTCTCTTTCTTTCC- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 31 7 N/A 0 0 60509 CASAVA_Build 1 216355107 1I CTTAGCAAAC -/T TTTTTTTTTT 2845 het 602 hom 17 2 11 4 T 15 16 60510 CASAVA_Build 1 216356813 1I ATAATGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 31 1 21 9 T 10 11 60511 CASAVA_Build 1 216357124 1D ATAATTTCTA C/- TGGGCCATTT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 C 1 0 60512 CASAVA_Build 1 216364461 1D TAGCCATAAG A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 7 6 60513 CASAVA_Build 1 216371160 1I AGGTTGTATT -/A AAAAAAAAAA 2440 het 719 hom 23 3 11 9 A 15 16 60514 CASAVA_Build 1 216380545 1D TTATAAGAAA G/- CAGGGAAGGA 3070 het 3070 ref 22 9 10 4 G 1 0 60515 CASAVA_Build 1 216410713 3D AATTTGTATT ATA/--- ATAAGTTTTG 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 ATA 2 1 60516 CASAVA_Build 1 216420532 23I GGGGTGCCAT -----------------------/TTTAATAGCAAAAAGAGGCTAGA TTCTGGTCAC 3070 hom 54 het 19 0 19 3 TTTAATAGCAAAAAGAGGCTAGA 0 1 60517 CASAVA_Build 1 216444077 1I ACATAAAATT -/A AGGCATTCTA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 A 1 2 60518 CASAVA_Build 1 216444283 1I TCTTCCAGAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 7 8 60519 CASAVA_Build 1 216445723 10D AAGAGAGAAG AAAGAAAGAA/---------- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 29 13 16 2 AAAGAAAGAA 2 1 60520 CASAVA_Build 1 216447787 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTG 2624 het 1546 hom 16 6 8 2 T 9 10 60521 CASAVA_Build 1 216455764 2D TGCAAAATGA CT/-- CTCTCTCTCT 1628 het 1628 ref 49 38 4 8 CT 8 7 60522 CASAVA_Build 1 216468527 1D ATTTGGCCTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 A 9 8 60523 CASAVA_Build 1 216525181 1D CTCTGGGCTA G/- ACGACCCCGC 3070 hom 51 het 19 0 14 5 G 1 0 60524 CASAVA_Build 1 216540304 3D ACTCATGCTC GAG/--- GTTCATTTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 7 GAG 1 0 60525 CASAVA_Build 1 216550598 3I TTTAAAGAAC ---/CCT TTTTTTAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 CCT 0 1 60526 CASAVA_Build 1 216569790 1D TAGTGGTCAA T/- TTTTTTTTTT 1354 het 1354 ref 34 26 3 6 T 13 12 60527 CASAVA_Build 1 216573150 1I CACTATCAGG -/A AAAAAAAAAA 1395 het 1395 ref 33 23 3 7 A 10 11 60528 CASAVA_Build 1 216576215 2D TTCAGGCAAA AC/-- ACACACACAC 2414 het 2414 ref 51 33 8 11 AC 10 9 60529 CASAVA_Build 1 216585046 4D GACTTGATTG TCCT/---- TCCTTCAACA 3070 hom 155 het 60 0 49 15 TCCT 2 1 60530 CASAVA_Build 1 216586552 4I TTCGCATCAA ----/AAAC AAACAACAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAAC 1 2 60531 CASAVA_Build 1 216618739 1I ACCCGGCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 21 6 T 10 11 60532 CASAVA_Build 1 216621798 2D GTGTGTAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 1285 het 1285 ref 50 33 3 14 GT 8 7 60533 CASAVA_Build 1 216624089 1D CATTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2285 het 2285 ref 27 13 7 7 A 11 10 60534 CASAVA_Build 1 216661339 1D CAAGAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2720 hom 35 12 20 3 T 15 14 60535 CASAVA_Build 1 216680311 1D AAAAACAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 T 12 11 60536 CASAVA_Build 1 216683675 2D CTTGAATCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 10 14 T 14 12 60537 CASAVA_Build 1 216689422 1D GCCAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 11 10 60538 CASAVA_Build 1 216703625 1D GTCAAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 10 3 T 12 11 60539 CASAVA_Build 1 216737279 4D CAAGATTATA AATG/---- AATGAACTAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 AATG 2 1 60540 CASAVA_Build 1 216745243 1D TATTTATTGA G/- GGTCTGTGAC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 G 3 2 60541 CASAVA_Build 1 216770042 1D AGCTGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3022 hom 26 9 10 7 T 12 11 60542 CASAVA_Build 1 216775985 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 26 het 12 0 9 3 A 7 8 60543 CASAVA_Build 1 216790105 1I TAATACAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 677 hom 36 2 26 8 T 12 13 60544 CASAVA_Build 1 216792468 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 31 het 13 0 10 3 A 9 10 60545 CASAVA_Build 1 216795621 1D TCCATCTGGC T/- TTTTTCTTTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 6 5 60546 CASAVA_Build 1 216814056 1I TACATCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 14 14 11 A 14 15 60547 CASAVA_Build 1 216815552 1D GACTACTTTG T/- GGGGGGGGTT 3070 hom 91 het 34 0 27 7 T 1 0 60548 CASAVA_Build 1 216820192 2I CTGCCTTTGG --/TA TATATATATT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 TA 4 5 60549 CASAVA_Build 1 216827166 2D ATTTCCTAAC AT/-- AACACGGACT 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 AT 1 0 60550 CASAVA_Build 1 216840500 1D GGGCTTATTA C/- TAAGGGCAAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 C 1 0 60551 CASAVA_Build 1 216843738 4I ATACTTATTT ----/AGAA AGATTTTCAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AGAA 0 1 60552 CASAVA_Build 1 216844692 2D ATCGTATCTC AT/-- AAAATTTTAG 3070 het 3070 hom 52 21 26 6 AT 1 0 60553 CASAVA_Build 1 216847950 1I ATTAAAAAAA -/G AAAAAAGACA 3070 het 747 hom 43 3 29 11 G 0 1 60554 CASAVA_Build 1 216851558 1I TTACCAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 206 hom 38 1 28 9 A 9 10 60555 CASAVA_Build 1 216853601 1I CCACAAAACA -/C CTTTGAGAAA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 C 1 2 60556 CASAVA_Build 1 216853719 1D GATGTTTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 372 hom 46 1 43 3 T 10 9 60557 CASAVA_Build 1 216855244 1D GGAAATAAAT G/- GACATACCAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 G 2 1 60558 CASAVA_Build 1 216860132 1D TCCACCCTAC T/- TTTTTGGCAG 3070 hom 181 het 65 0 60 5 T 6 5 60559 CASAVA_Build 1 216866817 1I TTTTAATCAA -/T TTTTTTTTTA 2153 het 2153 ref 24 12 6 6 T 9 10 60560 CASAVA_Build 1 216875902 1I ATCAGACTTG -/A AAATTTAAAA 3070 hom 96 het 33 0 32 1 A 3 4 60561 CASAVA_Build 1 216877846 1I TCTTTAAATA -/T TTATAGCACA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 T 2 3 60562 CASAVA_Build 1 216878551 4D ATTTCAACTC ATAT/---- ATATATATAT 1938 het 1938 ref 19 9 4 6 AT 9 7 60563 CASAVA_Build 1 216880249 1I GATACGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 17 11 A 10 11 60564 CASAVA_Build 1 216881591 1I ACAATTCTCA -/T TTTTGTCTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 4 5 60565 CASAVA_Build 1 216884743 4I CATATATAAA ----/TAAC TAATGCTTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TAAC 0 1 60566 CASAVA_Build 1 216904397 1D GTAACAGAAC T/- TTCAATATCC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 3 2 60567 CASAVA_Build 1 216907801 1D TCATTTAATC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 10 9 60568 CASAVA_Build 1 216908836 1I ACCAAAAACC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 6 7 60569 CASAVA_Build 1 216909913 1I GAGCCACTTG -/T TTTTTTTTTG 2909 hom 19 het 22 0 12 10 T 9 10 60570 CASAVA_Build 1 216911371 3D ATGGTTAAAA AAT/--- AATATCTCCT 3070 hom 102 het 38 0 35 6 AAT 2 1 60571 CASAVA_Build 1 216911898 4D AGAAAAACTC TGTT/---- TGTGCAGATG 3070 hom 84 het 30 0 28 7 TGTT 1 0 60572 CASAVA_Build 1 216912136 6I GAGTAAATTA ------/TAATTT TAATTGCTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TAATTT 0 1 60573 CASAVA_Build 1 216915186 8D GATATCTATC ATCTATCT/-------- ATCTATCTAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 ATCT 11 9 60574 CASAVA_Build 1 216915542 1I TGTTTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2021 hom 44 6 35 3 T 12 13 60575 CASAVA_Build 1 216917535 1D CCTTTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 36 1 18 18 T 16 15 60576 CASAVA_Build 1 216918125 3I AAAACAAAAC ---/AAT AAAGCAATCC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAT 0 1 60577 CASAVA_Build 1 216923761 4I ATCAAAACAA ----/AGAC AGAATATCTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AGAC 0 1 60578 CASAVA_Build 1 216925886 2D GTTTTTTTTT TA/-- TTTTTTTTTA 2611 het 1050 hom 23 6 13 4 TA 1 0 60579 CASAVA_Build 1 216966581 1D AAAAATGTTC T/- ATGAAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 0 60580 CASAVA_Build 1 217063428 2D CAAGTAGCAT TC/-- TCTCTCTCTC 1940 het 1940 ref 65 45 5 15 TC 8 7 60581 CASAVA_Build 1 217107899 1I TTTTATTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 23 1 15 7 A 16 17 60582 CASAVA_Build 1 217119163 1D TAATTGCCAT A/- AAAAAATCAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 6 60583 CASAVA_Build 1 217119936 2I TAATTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 11 13 60584 CASAVA_Build 1 217126466 1D ATTATGGTGC T/- TTTTTTTTTT 1608 het 1608 ref 38 28 5 5 T 11 10 60585 CASAVA_Build 1 217135058 1I TTGAGGAGTA -/T TTTTTTTTTT 869 het 869 ref 36 31 2 3 T 10 11 60586 CASAVA_Build 1 217177928 1I TTTTTTTTTT -/A ATCACTTTGA 3021 het 3021 ref 22 10 8 4 A 1 2 60587 CASAVA_Build 1 217178708 1I AGTTCTTTGC -/T TTGTAGGGCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 3 60588 CASAVA_Build 1 217188438 1I CTATGTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1201 hom 33 3 28 2 T 11 12 60589 CASAVA_Build 1 217190353 1I AAATACTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3026 hom 27 8 12 7 A 12 13 60590 CASAVA_Build 1 217191180 1D ATAACTAACA T/- TAACTCTGCA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 2 1 60591 CASAVA_Build 1 217195835 1D TTTTTTTTTC T/- CAAGTTGTTC 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 T 1 0 60592 CASAVA_Build 1 217196588 1D TAGGTCTAAC A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 1 0 60593 CASAVA_Build 1 217201530 1D ATATCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 112 het 47 0 37 10 A 13 12 60594 CASAVA_Build 1 217210289 1D GGTGTACTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 T 10 9 60595 CASAVA_Build 1 217213781 1D TGTTGAAGGA G/- GAACCTGATT 3070 het 3070 ref 38 17 19 2 G 2 1 60596 CASAVA_Build 1 217226421 1D GAGCATGATG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 A 9 8 60597 CASAVA_Build 1 217229802 1D GGATGGGTTC T/- TTTTTTTTTT 1177 het 1177 ref 41 34 4 3 T 12 11 60598 CASAVA_Build 1 217231860 1D AGCCACCATG C/- CCCCGCCCAT 2760 het 2185 hom 17 5 7 5 C 5 4 60599 CASAVA_Build 1 217237751 16D TAAAGGGCAT TCAGTTCAATTATATA/---------------- TCATTGTTTT 3070 het 3070 ref 41 28 13 2 TCAGTTCAATTATATA 1 0 60600 CASAVA_Build 1 217248656 1D AGTGTTTTAT A/- ACTAATACAC 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 A 2 1 60601 CASAVA_Build 1 217252945 1D CTATACCCTC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 T 8 7 60602 CASAVA_Build 1 217255624 2D ATTCTAAGGT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 A 11 9 60603 CASAVA_Build 1 217256010 1D AATATGGGAG A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 A 7 6 60604 CASAVA_Build 1 217258433 1D GTTCTATATC A/- TGTAAAATTA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 1 0 60605 CASAVA_Build 1 217258637 1D AAATAAAAGC T/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 7 6 60606 CASAVA_Build 1 217258879 1I TGGATTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 10 11 60607 CASAVA_Build 1 217260934 4D TATGAACCAT AGAC/---- AGGAAAAAAA 3070 het 2967 hom 31 9 18 7 AGAC 1 0 60608 CASAVA_Build 1 217266621 1I GTGGAAAGCG -/A AAAAAAAACA 2607 het 2607 ref 40 25 9 6 A 8 9 60609 CASAVA_Build 1 217269585 1I CTTATGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 20 12 A 12 13 60610 CASAVA_Build 1 217270253 1I GAGGTTAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 9 10 60611 CASAVA_Build 1 217278278 4I GCAGAGGGAT ----/GAAA GAAAGTCCTG 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 GAAA 1 2 60612 CASAVA_Build 1 217282839 1D TATGAAATGG T/- TCCCCTTCTA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 2 1 60613 CASAVA_Build 1 217292501 13D CCAAGCACAT ATTTAAAATCAAA/------------- ACAAAACACT 3070 het 3070 ref 44 24 21 6 ATTTAAAATCAAA 1 0 60614 CASAVA_Build 1 217293020 2I GCTCTGTGCT --/AA GTCTTTATAC 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 0 2 60615 CASAVA_Build 1 217294294 2I TAATATATAT --/AC ACACATGTGT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 AC 2 3 60616 CASAVA_Build 1 217299813 1I AGGCAACATC -/T TTTTTTTTTT 2828 het 2828 ref 18 8 8 3 T 11 12 60617 CASAVA_Build 1 217300452 4D TTATTAGAGA GAGT/---- ATGACTACTA 3070 het 3070 ref 51 26 19 7 GAGT 1 0 60618 CASAVA_Build 1 217301628 1I ACTAGTAACT -/A AATTAAATTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 2 3 60619 CASAVA_Build 1 217306962 1I GCTTATGGGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 2038 hom 26 6 15 5 T 7 8 60620 CASAVA_Build 1 217314004 25D7M2D11M2D8M9D7M3D19M4I3M8D4M5I7M1I6M1D GGTGCAGTGC CTCCCTTATGCTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATGTATACATACGTAACTAACCTGCACATTGTACACATGTAC----CCTAAAACTTAAAGT-----ATAATAA-TAATAAT/-------------------------AAGGGAG--GCACTGAAGAA--AAACTTGT---------TAAGTAA---GAAAAATTTGAGCATGTGCTTTTCCT--------CAGTGGGAGATGGGAAGGAATAA- AAAAAATAGA 2171 het 2171 ref 8 17 5 3 N/A 0 0 60621 CASAVA_Build 1 217316981 4I GCTAAAACCC ----/AGAG TAGGATCTCT 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 AG 0 2 60622 CASAVA_Build 1 217327571 1I TGGAAGGCTT -/A AAAGAGTAGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 4 60623 CASAVA_Build 1 217328927 2D GTGCTGGGCT AG/-- AAGGCAGTAG 3070 hom 144 het 51 0 46 7 AG 1 0 60624 CASAVA_Build 1 217345632 1I TTTTGAAGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 8 9 60625 CASAVA_Build 1 217346238 1D TAGTTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 33 1 26 6 T 12 11 60626 CASAVA_Build 1 217346509 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1808 het 1275 hom 25 5 7 13 T 17 16 60627 CASAVA_Build 1 217349428 5I AGACTAACTT -----/AGATG AGATAAGATT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AGATG 0 1 60628 CASAVA_Build 1 217359551 4I AAAGTGAAAT ----/ACAG ACAGATTGGA 3070 hom 90 het 35 0 29 6 ACAG 1 2 60629 CASAVA_Build 1 217360468 2I CAAACTGAAA --/CT CTGTAAGTTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CT 1 2 60630 CASAVA_Build 1 217366429 1I TGTGCCCTAT -/A AAAAATGTCC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 5 6 60631 CASAVA_Build 1 217369820 2D TTCAACATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 AC 9 8 60632 CASAVA_Build 1 217374606 1I GTAGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1025 hom 26 3 19 4 A 10 11 60633 CASAVA_Build 1 217381734 1D GCAAATTATT G/- GGGGGGTTTT 3070 hom 52 het 20 0 18 2 G 7 6 60634 CASAVA_Build 1 217384587 5I AAATCTATAG -----/ATATA ATAGATGAGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATATA 0 1 60635 CASAVA_Build 1 217397893 1D TTATTTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 103 het 43 0 33 11 T 10 9 60636 CASAVA_Build 1 217399339 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 6 A 11 10 60637 CASAVA_Build 1 217399469 1D CTCCTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 39 1 29 10 A 11 10 60638 CASAVA_Build 1 217405617 1D GTAATATGAG A/- AAAAAATAAG 3070 hom 45 het 18 0 16 3 A 7 6 60639 CASAVA_Build 1 217426505 7I GTCTTTTTTA -------/TCTATAT TGGCTACTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TCTATAT 0 1 60640 CASAVA_Build 1 217433024 1I CTTTTTTTTT -/G GGGGGGGGGC 3070 hom 81 het 35 0 24 11 G 9 10 60641 CASAVA_Build 1 217442807 1D TGCCTGGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 11 10 60642 CASAVA_Build 1 217443053 2I TTGTTAACCT --/TA TTTATTTTGT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 TA 0 1 60643 CASAVA_Build 1 217447174 1I CGCGTGTGGA -/T TTTTCTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 5 60644 CASAVA_Build 1 217450472 6I ATGTATTCTA ------/CTTTTT CTTTTAAGTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CTTTTT 0 1 60645 CASAVA_Build 1 217458470 1I TTTTTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1333 hom 42 6 29 7 T 11 12 60646 CASAVA_Build 1 217462140 3I AAGGCAGTGA ---/GAG GAGGAGGAGG 3070 hom 114 het 46 0 38 8 GAG 3 4 60647 CASAVA_Build 1 217490579 1D CTTTATCCAT G/- TCCCTGCAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 0 60648 CASAVA_Build 1 217491515 1D TCCCCACTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 9 8 60649 CASAVA_Build 1 217496400 4D TTTGCTTCTC TCTT/---- TCTTTTCTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 4 TCTT 2 1 60650 CASAVA_Build 1 217497319 8D TCCATACCAG TTTTTGTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 23 1 19 4 TTTTTGTT 1 0 60651 CASAVA_Build 1 217499906 2D TAAACCAACA CT/-- CATAACTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 5 CT 1 0 60652 CASAVA_Build 1 217508606 4I AATAAAAAAC ----/AAAG AAGTCCATAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAAG 0 1 60653 CASAVA_Build 1 217516029 1D AATATAAAAA T/- AATGTTTACT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 0 60654 CASAVA_Build 1 217517878 3I GTTTCCAAGG ---/AGA AGAAGAAGTT 3070 hom 75 het 35 0 26 9 AGA 2 3 60655 CASAVA_Build 1 217528800 8D CTTGTCTTAC ATGTTTTA/-------- AAATTGTACT 3070 hom 117 het 40 0 40 6 ATGTTTTA 1 0 60656 CASAVA_Build 1 217531757 1I TCATATGTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 749 hom 46 2 39 5 A 9 10 60657 CASAVA_Build 1 217534390 2D TTCATGGAGA AC/-- ACAGAGCAAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 7 AC 2 1 60658 CASAVA_Build 1 217541733 2I TTTAACTAAC --/AG AGTTATTTTT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 AG 1 2 60659 CASAVA_Build 1 217553495 1D TTAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 19 10 T 13 12 60660 CASAVA_Build 1 217554913 1D GCATCTGAAT A/- ATAGAATAAT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 A 2 1 60661 CASAVA_Build 1 217572707 1I CAACTAAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 426 hom 30 1 26 3 T 9 10 60662 CASAVA_Build 1 217572788 1D TGATTTTCTG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 70 hom 26 1 19 6 C 12 11 60663 CASAVA_Build 1 217583833 1D CAACCATTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 28 15 4 T 9 8 60664 CASAVA_Build 1 217587278 2D TTCTGAATGT TG/-- ATCAGTGTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TG 1 0 60665 CASAVA_Build 1 217594864 4D GATATTTGAC TATT/---- TAAAGTCAAA 3070 het 3070 hom 38 19 19 2 TATT 1 0 60666 CASAVA_Build 1 217607911 1I GGCTTTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1755 hom 41 4 28 9 T 15 16 60667 CASAVA_Build 1 217616227 1I ACAAATGGTG -/T TTTAAAAACT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 T 3 4 60668 CASAVA_Build 1 217622832 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 8 11 6 T 10 11 60669 CASAVA_Build 1 217640465 1D TCTATCTATC T/- TTTTTTTTTT 2873 het 2873 ref 37 18 7 12 T 14 13 60670 CASAVA_Build 1 217646749 1D TCATAAATAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 A 9 8 60671 CASAVA_Build 1 217668912 4I TGTGTGCATC ----/TGTG TGTGTGTGGT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 TG 4 6 60672 CASAVA_Build 1 217683050 1I TTTCTGCTGG -/A AAAAAAAAAA 1507 het 1507 ref 45 15 9 21 A 13 14 60673 CASAVA_Build 1 217683641 1I TTTTGGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 16 8 A 11 12 60674 CASAVA_Build 1 217694716 7I AAATATGAAA -------/CTATCTG CTGTGTCATG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CTATCTG 0 1 60675 CASAVA_Build 1 217698026 1D AGTATAATAA T/- AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 1 0 60676 CASAVA_Build 1 217704262 2I TTAAATGGTA --/TG TGTTTACTAA 3070 hom 123 het 42 0 42 0 TG 1 2 60677 CASAVA_Build 1 217708811 1I GCTACTGTCT -/G TAGAGTTTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 60678 CASAVA_Build 1 217715678 3D GAAAGAAAGA AAG/--- AAAGAAAAGA 418 het 418 ref 13 3 2 11 AAG 1 0 60679 CASAVA_Build 1 217717460 1D CTGAGCTCTT C/- CCCCATACAG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 5 4 60680 CASAVA_Build 1 217719091 1I ACAAAAGCCT -/G GGGGCCGGGA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 G 4 5 60681 CASAVA_Build 1 217722704 1D ATGCAAATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 33 0 25 9 T 10 9 60682 CASAVA_Build 1 217722864 1I CATATACAAA -/G GATCTGCAAG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 G 1 2 60683 CASAVA_Build 1 217725381 5I AAAATGTCTT -----/TTCTC TTCTCCATTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TTCTC 1 2 60684 CASAVA_Build 1 217729561 2I AAAAGCCTTG --/GA TTCAGTTAAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 GA 0 1 60685 CASAVA_Build 1 217735458 1I TTAAACTATA -/T TTTTATTTGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 4 5 60686 CASAVA_Build 1 217748325 1D AAAAGATACA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 9 8 60687 CASAVA_Build 1 217748802 1I TTCATTCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 35 0 26 9 A 9 10 60688 CASAVA_Build 1 217749261 2D TAATCATGTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 4 het 23 1 14 8 TA 9 8 60689 CASAVA_Build 1 217762298 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 172 hom 33 1 19 13 A 16 15 60690 CASAVA_Build 1 217765631 2D GACAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 57 het 22 0 19 5 CT 2 1 60691 CASAVA_Build 1 217767644 2D AAGCTCAGCA TC/-- TCTGAGTCAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TC 2 1 60692 CASAVA_Build 1 217801453 1I CTAACACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 11 12 60693 CASAVA_Build 1 217802675 1D TCCTTATAAC T/- GTTTCATGCA 3070 hom 132 het 49 0 45 5 T 1 0 60694 CASAVA_Build 1 217802960 1D TGGTTGCTAC A/- AGTTCATTTG 3070 hom 114 het 45 0 39 7 A 2 1 60695 CASAVA_Build 1 217810495 2I AGCCAAATAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 10 12 60696 CASAVA_Build 1 217821812 1D ATGCCAAGGT C/- ACCAAAATTT 3070 hom 102 het 39 0 34 6 C 1 0 60697 CASAVA_Build 1 217823522 1I TTTGGTTTTG -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 6 7 60698 CASAVA_Build 1 217848985 1I TTCAGAGGCC -/G AACAGAGCAG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 G 0 1 60699 CASAVA_Build 1 217852547 4I CAAAAAAACA ----/TCAG TTTTTCAGTA 1957 hom 10 het 4 0 4 0 TCAG 0 1 60700 CASAVA_Build 1 217854744 1D GTGTAGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 34 1 26 7 A 15 14 60701 CASAVA_Build 1 217856751 4D TGGGCAACAT AGAG/---- AGACTTTAAC 3070 hom 108 het 39 0 36 5 AG 3 1 60702 CASAVA_Build 1 217857855 1D ATTATGACAC A/- AAAGGAACTG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 4 3 60703 CASAVA_Build 1 217871446 1I GCCAAAGGAC -/A AAACAGCCAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 3 4 60704 CASAVA_Build 1 217887004 1D GTGTGCTATG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 A 9 8 60705 CASAVA_Build 1 217905639 4I AGACATGGAC ----/ATGG ACAGCCGCAC 3070 het 3070 ref 46 29 15 2 ATGG 0 1 60706 CASAVA_Build 1 217914077 1D TTAAACTCAC G/- TCTGTTCGTC 3070 het 3070 hom 54 25 22 8 G 1 0 60707 CASAVA_Build 1 217914947 2D CAAGCCACCA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 13 17 7 AC 10 9 60708 CASAVA_Build 1 217920492 4D CAAGAAAACA AACT/---- AACATGATGA 3070 het 3070 ref 47 25 17 6 AACT 1 0 60709 CASAVA_Build 1 217923644 1D AAGGACATTC G/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 16 9 G 6 5 60710 CASAVA_Build 1 217945461 1I GTTGCAAACC -/T TCTGGAAAGA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 1 2 60711 CASAVA_Build 1 217959360 2D CAGAAGAAAC AG/-- AGGAAAGAAT 3070 het 3070 hom 32 14 17 3 AG 2 1 60712 CASAVA_Build 1 217970020 4D TTGAGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 120 het 50 0 41 10 TTTG 5 4 60713 CASAVA_Build 1 217974673 1I AAAACTGAAG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 48 28 14 6 A 7 8 60714 CASAVA_Build 1 217975240 1D CTATCTCTAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 7 6 60715 CASAVA_Build 1 217976247 1I TTGTTCACAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 701 hom 33 2 26 5 T 9 10 60716 CASAVA_Build 1 217979229 1D AAATTAATCT C/- CCCCAAATGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 5 4 60717 CASAVA_Build 1 217979732 2I CTGGAAACTC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 AG 8 9 60718 CASAVA_Build 1 217985527 1D ACAGGTGGTG C/- AAATTTCAAT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 C 1 0 60719 CASAVA_Build 1 217986848 1D GATAATTTAC A/- AAAAAAAAAA 2295 het 1832 hom 19 8 5 6 A 13 12 60720 CASAVA_Build 1 217988869 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 3070 het 1063 hom 33 12 14 8 AAAAG 1 0 60721 CASAVA_Build 1 217989346 1I GTGGACCTGT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 8 60722 CASAVA_Build 1 217991744 1D TTATGTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 95 het 40 0 32 9 T 10 9 60723 CASAVA_Build 1 217993024 1I CTAATCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 33 2 25 7 T 10 11 60724 CASAVA_Build 1 217993694 1I CCCAAAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 29 6 A 10 11 60725 CASAVA_Build 1 217993785 1I CTGTTGCTGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 60726 CASAVA_Build 1 217996543 1D ATGCAAATAT C/- CCCAAGAGCT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 4 3 60727 CASAVA_Build 1 217999182 4D AGGAGAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGGA 2561 het 1149 hom 20 5 10 5 AAAG 3 2 60728 CASAVA_Build 1 217999532 1D AAGGGGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 11 10 13 A 11 10 60729 CASAVA_Build 1 218000323 3D GCTGTTTTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 2888 het 632 hom 31 8 10 16 T 17 14 60730 CASAVA_Build 1 218011813 1I TAATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 947 het 164 hom 5 1 3 1 T 11 12 60731 CASAVA_Build 1 218018504 1I GCAGGCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 13 14 60732 CASAVA_Build 1 218026573 3I CTCTAAAAAA ---/TAT ATATATATAT 1989 hom 18 het 11 0 6 5 TAT 0 1 60733 CASAVA_Build 1 218026748 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 10 11 60734 CASAVA_Build 1 218034794 1I GCTCCCTCAA -/C CCCCCGGCCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 5 6 60735 CASAVA_Build 1 218045782 1D CCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 11 10 60736 CASAVA_Build 1 218048500 1D CACATATTTG A/- AAAAAAAAAA 2994 het 2994 ref 39 23 10 6 A 15 14 60737 CASAVA_Build 1 218054331 1D TGTGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 37 1 25 11 A 13 12 60738 CASAVA_Build 1 218057965 3I AAGGAGGAGG ---/AGA AGGAGAAAGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AGA 0 1 60739 CASAVA_Build 1 218066853 1I ATTAAAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2908 hom 20 10 8 2 A 9 10 60740 CASAVA_Build 1 218072397 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAGACG 3070 het 1151 hom 21 5 13 3 A 7 6 60741 CASAVA_Build 1 218077207 1D TATCCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 A 11 10 60742 CASAVA_Build 1 218079294 1D AAGAAATGTT G/- GGGGGGTGGC 3070 hom 54 het 21 0 17 5 G 7 6 60743 CASAVA_Build 1 218093894 2I TCCTTATATC --/AT ATATATATAT 3070 het 598 hom 11 2 8 1 AT 6 7 60744 CASAVA_Build 1 218095355 1I CAATGCAGGC -/T TTTTTTTTGG 1053 hom 7 het 3 0 3 0 T 8 9 60745 CASAVA_Build 1 218103145 2I GCTTGAACCC --/GA GAGGTGGGGG 1881 hom 18 het 8 0 6 2 GA 1 2 60746 CASAVA_Build 1 218137884 2I GGAATTATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 12 14 60747 CASAVA_Build 1 218141306 4I ACTCTTGAAC ----/ATAG ATAGATTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATAG 1 2 60748 CASAVA_Build 1 218141698 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 66 het 23 0 23 1 A 7 8 60749 CASAVA_Build 1 218146902 1I GAGTCAACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 9 10 60750 CASAVA_Build 1 218152691 1I CCCAGCTACT -/C CGGGAGGCTG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 1 2 60751 CASAVA_Build 1 218152820 1I CAAACAAACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 34 het 14 0 11 3 A 9 10 60752 CASAVA_Build 1 218171394 2I TACTAAAACT --/AC ACACACACAC 3070 hom 78 het 36 0 27 9 AC 7 8 60753 CASAVA_Build 1 218192539 1D ATGATTGTGG A/- ATTTGTCTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 1 60754 CASAVA_Build 1 218196409 1D55M1I TACCTATCAC TTATTTAAACTAGAACACTATATAGCATCAAATACTTCAAAACAAGCTAGATACTC-/-TATTTAAACTAGAACACTATATAGAATCAAATACTTCACAACAAGCTAGATACTCT TAGAATTAAG 3070 hom 60 het 21 0 21 20 N/A 0 0 60755 CASAVA_Build 1 218196629 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 14 13 60756 CASAVA_Build 1 218197782 1D ATTCCATCTT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 54 het 37 1 32 4 A 9 8 60757 CASAVA_Build 1 218201442 3I TAAGTATGAT ---/GAA GACACATAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 GAA 0 1 60758 CASAVA_Build 1 218201758 1I CAGAGAAGTG -/A TGGAGCAGGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 0 1 60759 CASAVA_Build 1 218206786 3D TGAATACAAA ATT/--- ATGATTCTGA 3070 hom 141 het 51 0 48 5 ATT 1 0 60760 CASAVA_Build 1 218210386 1I AAAATCGTAA -/G ATAAAGTGAA 3070 hom 103 het 38 0 34 4 G 0 1 60761 CASAVA_Build 1 218218432 2I GAGAAACCTC --/AA GTTTTATAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 2 60762 CASAVA_Build 1 218219956 2I CTTATTTTTT --/AA AAGAGTCTAC 3070 hom 135 het 53 0 46 7 A 2 4 60763 CASAVA_Build 1 218220870 1D AGCTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 704 hom 51 2 37 14 T 12 11 60764 CASAVA_Build 1 218242303 1I GCCTCAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1014 hom 29 3 20 6 A 11 12 60765 CASAVA_Build 1 218245341 1I AAGATGATAT -/A AAACCAAAGT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 3 4 60766 CASAVA_Build 1 218251971 1D ATTGGGTTGG T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 8 7 60767 CASAVA_Build 1 218252202 1I CTTGAGGCTT -/A AAAGTTCATT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 3 4 60768 CASAVA_Build 1 218254293 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 269 hom 29 1 25 3 A 9 10 60769 CASAVA_Build 1 218254754 4D TTCCAATCAC TCTT/---- TATTTCCCCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TCTT 1 0 60770 CASAVA_Build 1 218255488 6D AATAAAAGAT GGAAAG/------ GGAAAGGGAA 3070 hom 72 het 26 0 23 5 GGAAAG 4 3 60771 CASAVA_Build 1 218255760 1D AAGGTAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 14 13 60772 CASAVA_Build 1 218256358 1D TGGGGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 18 1 17 0 A 12 11 60773 CASAVA_Build 1 218258795 3I GATAAACTTT ---/AAA AAAAAAAAAA 2322 hom 24 het 17 0 10 7 A 12 15 60774 CASAVA_Build 1 218260663 1D TTCACTGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 12 11 60775 CASAVA_Build 1 218265394 1D CCCTGACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 37 1 29 7 A 12 11 60776 CASAVA_Build 1 218268769 5D CCTTCTGGCC TTTCA/----- TTTAAGACAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTCA 1 0 60777 CASAVA_Build 1 218272207 2D GCCCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1794 het 76 hom 8 1 5 2 T 16 14 60778 CASAVA_Build 1 218273253 5D TGAGACAGAC GACGG/----- GACGGCAGAA 3070 hom 129 het 47 0 44 7 GACGG 2 1 60779 CASAVA_Build 1 218273845 1I TGCTTTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 33 3 21 9 T 14 15 60780 CASAVA_Build 1 218279486 2D TTAATGCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 1488 het 583 hom 21 4 4 13 T 16 14 60781 CASAVA_Build 1 218283232 2I ATTGGTGAAC --/TT AATTGTATAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 2 60782 CASAVA_Build 1 218297804 1D TTAAAATTAC T/- GTGAAAAACA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 T 1 0 60783 CASAVA_Build 1 218309902 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 23 2 19 2 A 12 11 60784 CASAVA_Build 1 218314469 1I ATCCTATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 331 hom 19 1 12 6 T 11 12 60785 CASAVA_Build 1 218389522 3I TTAGAAAACA ---/TGT TATAACAAGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TGT 0 1 60786 CASAVA_Build 1 218429481 1D TGAATATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 23 3 12 8 T 17 16 60787 CASAVA_Build 1 218531158 4D TCGGTGACAG CTTT/---- CTGTAGACTG 3070 het 3070 hom 52 23 25 5 CTTT 1 0 60788 CASAVA_Build 1 218532939 3D TTTTAAGTTT AGG/--- AGAATATTAT 3070 het 3070 hom 38 16 17 7 AGG 1 0 60789 CASAVA_Build 1 218536087 1D TTTTGTTGTT G/- TTTTTTTTTT 938 het 938 ref 51 15 4 33 G 1 0 60790 CASAVA_Build 1 218539466 1I TATCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 T 12 13 60791 CASAVA_Build 1 218553396 1D CCTATCTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3005 hom 33 11 14 9 A 10 9 60792 CASAVA_Build 1 218561895 1I GTCATGGGCA -/C GGACCTTTGG 3070 hom 120 het 44 0 39 5 C 0 1 60793 CASAVA_Build 1 218567873 3D AAAAGTGGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1231 hom 27 8 9 11 T 17 14 60794 CASAVA_Build 1 218568680 4D CTCTCCCTCC CTCT/---- CTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 43 20 14 10 CT 4 2 60795 CASAVA_Build 1 218570140 6D49M1D ACTACAGCTT GAATAAGAATGAGTAGGAGACAGAGCAGGAATGTGTGTGCCAAGGAAAGCCATTTA/------GAATGAGTAGGAGACAGAGCAGGAATGTGTGTGCCAAGGAAAGCCATTT- AAAAAAATCC 3070 hom 146 het 35 0 49 5 N/A 0 0 60796 CASAVA_Build 1 218583449 2D ACCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2095 het 139 hom 9 2 5 2 T 18 16 60797 CASAVA_Build 1 218587094 1I TCTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 2622 het 2622 ref 38 19 11 8 T 14 15 60798 CASAVA_Build 1 218590540 2I CTTTACACAC --/TG AGAGCTATTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TG 0 1 60799 CASAVA_Build 1 218595466 1I CTGTTACGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 A 9 10 60800 CASAVA_Build 1 218617271 1D CTCCTGCTTC A/- GCCTCCTGAG 3070 het 1764 hom 19 5 11 3 A 1 0 60801 CASAVA_Build 1 218618094 4I GTAGGTGCTC ----/AATA AATATTGAGA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 AATA 1 2 60802 CASAVA_Build 1 218625708 1D TTTTCTTCAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 9 8 60803 CASAVA_Build 1 218637815 1D TATATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2783 hom 27 8 13 6 T 11 10 60804 CASAVA_Build 1 218642116 5D CCTTCTTTGT CCCCC/----- CCCCCCCCCC 3070 het 69 hom 36 1 12 24 C 16 11 60805 CASAVA_Build 1 218654134 1I CTCTGGGCCC -/A AAGAGATCCT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 2 3 60806 CASAVA_Build 1 218670361 1D GTCTTGGATT C/- CTTAGCTGTA 3070 hom 95 het 42 0 31 11 C 2 1 60807 CASAVA_Build 1 218686551 1I TGTAGGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 36 2 25 9 T 12 13 60808 CASAVA_Build 1 218689766 1I GAGGTTAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 777 hom 30 3 22 5 T 9 10 60809 CASAVA_Build 1 218697042 1I GAAGGAGGGT -/G GGGGGTGTGC 3070 hom 94 het 40 0 32 8 G 5 6 60810 CASAVA_Build 1 218705652 1D TTCCAATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 30 1 19 10 T 15 14 60811 CASAVA_Build 1 218713999 5I3M15D TTCTCCATCA -----TGGTCCTCACTAAAAAAC/TCCTGTGG--------------- CTATCCTGTG 3070 hom 123 het 39 0 42 1 N/A 0 0 60812 CASAVA_Build 1 218721591 3I AAAGAAACTT ---/ATC ATCAGAGCGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ATC 1 2 60813 CASAVA_Build 1 218731073 3D AATTTACCAG GCA/--- GCACCAGTTT 3070 hom 75 het 27 0 25 6 GCA 2 1 60814 CASAVA_Build 1 218738204 1D GGGTGGGGGT G/- GGGGGTTGAA 2968 hom 24 het 12 0 8 4 G 6 5 60815 CASAVA_Build 1 218741101 1D AATTAAACAA C/- CTTGCCTCAT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 C 2 1 60816 CASAVA_Build 1 218749685 1D TATTTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 1274 het 1274 ref 40 29 4 7 A 12 11 60817 CASAVA_Build 1 218751589 1I GTGTGCTTAA -/T TTTTGTTAAG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 4 5 60818 CASAVA_Build 1 218753229 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 19 0 14 5 A 12 11 60819 CASAVA_Build 1 218765087 1D CATAACACAA T/- TTTTTCAGTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 6 5 60820 CASAVA_Build 1 218766045 1D GAAGCCACTG T/- GCCAGAATCT 3070 hom 87 het 32 0 29 5 T 1 0 60821 CASAVA_Build 1 218767833 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 92 het 34 0 31 3 A 10 9 60822 CASAVA_Build 1 218770194 1I CCGTGCATTT -/A AAATGGGAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 3 4 60823 CASAVA_Build 1 218770926 1D GTAAAGGGTT G/- GGAAGGGGAT 3070 het 3070 hom 46 18 24 5 G 3 2 60824 CASAVA_Build 1 218772978 1I CCTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 35 0 26 9 A 11 12 60825 CASAVA_Build 1 218773336 1D TTATTACGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 10 9 60826 CASAVA_Build 1 218775986 1D AATTTTATAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 11 13 3 T 9 8 60827 CASAVA_Build 1 218780688 1I GAGTCCTATC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 8 60828 CASAVA_Build 1 218798401 1I TCTCTTATTT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 7 8 60829 CASAVA_Build 1 218799863 6I ACAGTAGAAC ------/CCCCTT ATACTTGGGG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CCCCTT 0 1 60830 CASAVA_Build 1 218816001 2D TCTTTTCAGA CT/-- CTGCTAAAAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 CT 2 1 60831 CASAVA_Build 1 218817238 1D TCTCAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 11 10 60832 CASAVA_Build 1 218822537 1D GTGGGTTACT C/- TGGCAAATTG 3070 het 3070 hom 60 26 30 4 C 1 0 60833 CASAVA_Build 1 218827295 4D TCTCTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 598 hom 17 het 14 0 6 8 TC 11 9 60834 CASAVA_Build 1 218840858 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2813 het 2390 hom 31 9 12 10 T 13 14 60835 CASAVA_Build 1 218845039 2D TCTAAGATAC AT/-- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 58 33 22 4 AT 2 1 60836 CASAVA_Build 1 218856653 1D AACAGTTGTC A/- AAAAGTCAAG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 5 4 60837 CASAVA_Build 1 218904816 2I ACTAAAACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 AC 5 6 60838 CASAVA_Build 1 218907587 1D CATTTCATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1932 hom 23 6 9 9 A 12 11 60839 CASAVA_Build 1 218913917 1D CCAAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1935 hom 29 9 14 6 A 12 11 60840 CASAVA_Build 1 218927060 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 1342 het 1342 ref 31 24 3 4 T 11 12 60841 CASAVA_Build 1 218949933 1I TCAAGGGATG -/C CCCTGCCTCA 3070 het 2111 hom 21 7 9 5 C 3 4 60842 CASAVA_Build 1 218963637 4I GCAGGGAAGG ----/GGCT GGCTTCCAGG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 GGCT 1 2 60843 CASAVA_Build 1 218970740 3D CATTTGGTAG TTT/--- TTCTTCAAAA 3070 het 3070 ref 49 28 21 2 T 5 2 60844 CASAVA_Build 1 218970996 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 115 het 115 ref 33 21 2 13 AAAG 1 0 60845 CASAVA_Build 1 218975218 5I ATATGTATAA -----/GATAT ATGTTTATAT 3070 het 3070 hom 18 7 9 2 GATAT 0 1 60846 CASAVA_Build 1 218980023 2I TTGTTAGGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 10 12 60847 CASAVA_Build 1 218982237 21D TTTCCACAGG CAGAGGAGCTTCTTTCCATGC/--------------------- CAGAGGAGCT 3070 het 3070 ref 39 20 12 12 CAGAGGAGCTTCTTTCCATGC 2 1 60848 CASAVA_Build 1 218989395 1I CCTTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 2602 het 1051 hom 26 11 9 6 C 0 1 60849 CASAVA_Build 1 218998807 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 TA 0 1 60850 CASAVA_Build 1 219006944 1D CCACCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2083 het 2083 ref 18 10 6 2 A 13 12 60851 CASAVA_Build 1 219009706 2D GGCACTTTCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 33 9 15 10 TC 7 6 60852 CASAVA_Build 1 219028763 2I ACTAAGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1409 hom 18 het 31 0 10 21 A 14 16 60853 CASAVA_Build 1 219029428 1D ACAAAAAAAA T/- CTCATAATGT 3070 het 1956 hom 22 7 14 2 T 1 0 60854 CASAVA_Build 1 219032726 1I GAAATAATAC -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 6 7 60855 CASAVA_Build 1 219040384 4I AGATAGTGAA ----/CAAG AAGTCACAGC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 CAAG 0 1 60856 CASAVA_Build 1 219040553 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 8 T 12 11 60857 CASAVA_Build 1 219051591 1I TGATTTATCT -/A AAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 A 4 5 60858 CASAVA_Build 1 219060048 1I CAGATATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 10 11 60859 CASAVA_Build 1 219063469 8D TTCTTTCTTT CTCTCTTC/-------- CTCTCTTCCT 3070 het 3070 hom 25 10 10 7 CTCTCTTC 2 1 60860 CASAVA_Build 1 219066270 3I TTGACAATGC ---/CTT CTTCTTGTTG 3070 hom 86 het 34 0 26 8 CTT 2 3 60861 CASAVA_Build 1 219085722 1I TGGTATTCAA -/C AAAGACAACA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 60862 CASAVA_Build 1 219086760 1I GTGTTAAAAA -/T ATTTTTTTTT 2881 het 2881 ref 27 14 9 4 T 0 1 60863 CASAVA_Build 1 219087522 1I CAGAATTTCA -/T TCTTTTTATG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 60864 CASAVA_Build 1 219089748 1D TTTTTGGAAG A/- ATTTGAATAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 2 1 60865 CASAVA_Build 1 219093693 3D TGGAACAAAT CTC/--- CTACAGCATG 3070 het 3070 hom 50 16 24 12 CTC 1 0 60866 CASAVA_Build 1 219096689 2I GATTATTAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 10 12 60867 CASAVA_Build 1 219098408 1D CCATGAATTT C/- TTTCCTGGGA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 1 0 60868 CASAVA_Build 1 219106254 1D ATTCTGCCAA T/- TTTTTGCTTC 3070 hom 123 het 45 0 42 4 T 6 5 60869 CASAVA_Build 1 219107666 1I AAATCCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2134 hom 32 8 15 9 T 11 12 60870 CASAVA_Build 1 219109978 5I AAAGCCAGAA -----/GTTTT GTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 GTTTT 3 4 60871 CASAVA_Build 1 219111971 1D TACTTCACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 T 10 9 60872 CASAVA_Build 1 219182053 2I ACTTCACGGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 T 9 11 60873 CASAVA_Build 1 219197020 2I TTTAAAAGAT --/AA AAAACAGGGA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 4 6 60874 CASAVA_Build 1 219197898 4D TCACAGTATT TCTC/---- TCTATTAAGG 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 TC 3 1 60875 CASAVA_Build 1 219199971 1I CCTATTGGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 9 10 60876 CASAVA_Build 1 219203844 3I CCTCAAGGAG ---/TTC TTCTTGGTCC 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 TTC 1 2 60877 CASAVA_Build 1 219209123 7I TCCTGAATGG -------/TATTGCC TAGGTTTTCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TATTGCC 0 1 60878 CASAVA_Build 1 219216233 2D GCTTAATGAC AG/-- GGGTATGTTC 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 AG 1 0 60879 CASAVA_Build 1 219234175 1D ATCACAAAAA C/- CAGGAAGGGC 3070 het 3070 ref 40 16 18 7 C 2 1 60880 CASAVA_Build 1 219247904 1D AGCATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 13 12 60881 CASAVA_Build 1 219256104 1I TCTTTTAAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 2915 hom 21 9 8 4 T 8 9 60882 CASAVA_Build 1 219258126 2D TGACTAATTT TG/-- TGTGTGTGTG 1886 het 1886 ref 36 16 7 13 TG 10 9 60883 CASAVA_Build 1 219264859 1D TTATTATTAA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 22 16 6 T 8 7 60884 CASAVA_Build 1 219269322 1D GGATGCATGG A/- AAAGCTTTAC 3070 het 3070 ref 57 25 24 8 A 4 3 60885 CASAVA_Build 1 219274475 2I GATGGGAGAC --/AT AGATTTGGGA 3070 het 3070 ref 54 28 20 6 AT 0 1 60886 CASAVA_Build 1 219289252 1I ATTCTTAAAG -/A AAAGAATTTT 2391 het 822 hom 8 2 6 0 A 3 4 60887 CASAVA_Build 1 219298459 1I CCATCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 36 1 24 11 T 11 12 60888 CASAVA_Build 1 219302051 1I ATAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 A 9 10 60889 CASAVA_Build 1 219305975 1D GTATTGCTAT A/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 A 1 0 60890 CASAVA_Build 1 219311631 1D ATGATCAAAC T/- TTAGCTGTTA 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 T 3 2 60891 CASAVA_Build 1 219317276 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 18 0 13 6 A 12 11 60892 CASAVA_Build 1 219321313 1I TTGGCTGTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 8 9 60893 CASAVA_Build 1 219333180 1I TATAGACTTA -/T TTTTAATAGC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 4 5 60894 CASAVA_Build 1 219340517 1I GTTTTTTATT -/A TAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 A 0 1 60895 CASAVA_Build 1 219341443 2D CGTGTACACG CA/-- CACACACACA 899 het 899 ref 33 18 3 12 CA 10 9 60896 CASAVA_Build 1 219349524 5I TAATCCTTAT -----/CACAA CACAACTCAA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 CACAA 1 2 60897 CASAVA_Build 1 219367837 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 60898 CASAVA_Build 1 219371152 1D AACTTGAGAA G/- CATGTGTATT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 G 1 0 60899 CASAVA_Build 1 219374554 1D CTGTTACATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 31 0 13 19 A 12 11 60900 CASAVA_Build 1 219382534 3D TGCTCTTGTC CTT/--- CTCTGGCTTT 3070 het 3070 ref 42 23 14 7 CTT 1 0 60901 CASAVA_Build 1 219386452 1D GTAGGAGAAC A/- AAAGGGATGG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 4 3 60902 CASAVA_Build 1 219388094 2D AAATAATAAC AG/-- ACAATATTTA 3070 hom 144 het 50 0 49 1 AG 1 0 60903 CASAVA_Build 1 219396888 1D CAAATTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 14 12 T 11 10 60904 CASAVA_Build 1 219409993 1I GAAGGTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 A 10 11 60905 CASAVA_Build 1 219410328 1I AAGTACTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 11 12 60906 CASAVA_Build 1 219427373 2I TTGACTGAAG --/AT AACTGTTTTA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AT 0 1 60907 CASAVA_Build 1 219443829 1I ATTCAATGTT -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 7 8 60908 CASAVA_Build 1 219444427 1D GAAGTGAAGT A/- CTTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 1 0 60909 CASAVA_Build 1 219474843 2D AGAGGCAAAC AG/-- ATTAATTAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 AG 1 0 60910 CASAVA_Build 1 219483619 1I TTACATCACT -/A TTTTAAATAT 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 A 0 1 60911 CASAVA_Build 1 219485384 1I ATTTCTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 11 12 60912 CASAVA_Build 1 219506879 1I GGAGACTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 10 11 60913 CASAVA_Build 1 219509103 1D CTTTTTCTCC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 T 8 7 60914 CASAVA_Build 1 219509479 1I GTCTTTATCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 8 9 60915 CASAVA_Build 1 219510293 1D ATCCTTCTTT A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 A 7 6 60916 CASAVA_Build 1 219518026 7D TATAAATGAG CTCAAGT/------- CTCTCTAAAC 3070 het 3070 ref 51 27 20 5 CTCAAGT 1 0 60917 CASAVA_Build 1 219528908 3I CGCAAATAAA ---/AAC AACAAGTTAA 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 AAC 1 2 60918 CASAVA_Build 1 219529951 2I ACAAACATAT --/AG AGAGTTAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AG 2 3 60919 CASAVA_Build 1 219531704 5I TTAAATTAGG -----/TAATT TAATTTAATA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 TAATT 1 2 60920 CASAVA_Build 1 219538420 1D AACTTTATCA T/- TTCCACCTGG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 3 2 60921 CASAVA_Build 1 219539420 1I TTCTATTTAA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 6 7 60922 CASAVA_Build 1 219540888 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 17 11 4 T 8 9 60923 CASAVA_Build 1 219551020 2I TCTATGGAGA --/TT TTGAGAGCCT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 2 4 60924 CASAVA_Build 1 219551346 1D TACAGATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 9 9 T 13 12 60925 CASAVA_Build 1 219557002 1D GAGAACTGGT G/- AAGTATTATT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 G 1 0 60926 CASAVA_Build 1 219558049 1D CCTATTCACT A/- ATCACGGTAT 3070 het 3070 hom 74 33 37 4 A 2 1 60927 CASAVA_Build 1 219567853 1D GGGAAATTAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 T 9 8 60928 CASAVA_Build 1 219576306 1D TGATCTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 705 hom 31 4 9 19 T 13 12 60929 CASAVA_Build 1 219576733 1I AATCAGACTT -/A ACCTGCCATC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 1 2 60930 CASAVA_Build 1 219579672 1D CTTGCAGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 11 10 60931 CASAVA_Build 1 219586689 1I CATTTATTAA -/T CTCTTAATAT 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 T 0 1 60932 CASAVA_Build 1 219591550 1I GTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3040 het 3040 ref 45 21 13 11 T 11 12 60933 CASAVA_Build 1 219611995 1I ATGTGGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 T 10 11 60934 CASAVA_Build 1 219619603 4D TGTCCTGGTT AATA/---- AATAAAGGAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 4 AATA 2 1 60935 CASAVA_Build 1 219633915 1I ATAATTAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 9 10 60936 CASAVA_Build 1 219639501 1D TGGTAACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3039 hom 26 10 10 7 A 11 10 60937 CASAVA_Build 1 219639854 1D CCAATGGAAA C/- CCCCCAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 6 5 60938 CASAVA_Build 1 219655031 4D ATTTTTATTA AATG/---- AATGAATGAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 AATG 4 3 60939 CASAVA_Build 1 219656249 16D TGGGAAGGAC CTGCAGATCATTAGAT/---------------- CTGCAGATCA 3070 hom 48 het 27 0 15 15 CTGCAGATCATTAGAT 2 1 60940 CASAVA_Build 1 219657536 4D ATAGGAAAAT TAGC/---- TAGGCATAGT 3070 het 3070 hom 23 9 11 5 TAGC 1 0 60941 CASAVA_Build 1 219660565 2I AATACAAACT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 9 11 60942 CASAVA_Build 1 219662300 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 9 3 A 16 14 60943 CASAVA_Build 1 219699679 1D AACAACAGTT A/- AGTACCCTTG 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 2 1 60944 CASAVA_Build 1 219703279 2D TTTATATATA TG/-- TATATATATC 2695 het 1155 hom 11 3 7 1 TG 1 0 60945 CASAVA_Build 1 219725987 1D CCAAAAAACC A/- AAAAAAAAAC 1984 hom 8 het 11 0 6 5 A 10 9 60946 CASAVA_Build 1 219727224 1I ACTATGTAAC -/T TTATTTTTTT 2067 het 2067 ref 33 17 10 6 T 2 3 60947 CASAVA_Build 1 219731312 1I AAAAAGGTTT -/A ATTGACTCAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 1 2 60948 CASAVA_Build 1 219739085 1D GAGAAAATGT C/- TGTATCATCT 3070 het 3070 hom 41 13 23 6 C 1 0 60949 CASAVA_Build 1 219739797 6I TGATCCACCT ------/GCCTCA GCCTCCCAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 GCCTCA 0 1 60950 CASAVA_Build 1 219748888 1D ACAAAATTAG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 A 8 7 60951 CASAVA_Build 1 219750283 1I TGTAATGTGG -/A AGAACAAAGA 3070 hom 52 het 37 0 18 23 A 1 2 60952 CASAVA_Build 1 219753338 1D CACCTTTTTA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 7 T 8 7 60953 CASAVA_Build 1 219761995 1D AGACCCATTT A/- TTAGTGATGG 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 1 0 60954 CASAVA_Build 1 219768657 1D TTATTAGCTA C/- ACAGATCAAC 3070 het 3070 hom 38 16 21 2 C 1 0 60955 CASAVA_Build 1 219776480 2D ATTATATGGC AT/-- AGAGTTGTTG 3070 het 3070 hom 50 22 22 8 AT 1 0 60956 CASAVA_Build 1 219782146 4D AAATTGTGGG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 13 12 T 15 11 60957 CASAVA_Build 1 219809424 1D AAATTGATTT A/- ACATTCAAGG 3070 het 3070 hom 39 11 22 7 A 2 1 60958 CASAVA_Build 1 219813103 1D GTTAGGTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 9 18 5 T 9 8 60959 CASAVA_Build 1 219813269 5D ATGGAGTTAT TGTAC/----- TGTACCCATA 3070 het 3070 ref 47 25 20 4 TGTAC 2 1 60960 CASAVA_Build 1 219815240 1D TATTTGGTTT C/- CCCCCACTAA 3070 het 3070 hom 42 18 23 2 C 6 5 60961 CASAVA_Build 1 219816693 1I GACTGGGTAA -/G CTTTAGGAAA 3070 het 3070 hom 50 24 24 2 G 0 1 60962 CASAVA_Build 1 219822265 1I CTAAATTGTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 7 8 60963 CASAVA_Build 1 219824022 1I GATGTTGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 A 10 11 60964 CASAVA_Build 1 219824458 5I ATCTCAAAAT -----/TTAAA TTAAAGAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 TTAAA 1 2 60965 CASAVA_Build 1 219824607 8I TTTCAAAAAT --------/TGTTCCTG GAATTTAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 TGTTCCTG 0 1 60966 CASAVA_Build 1 219826798 1D GCCAATGAGA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 8 7 60967 CASAVA_Build 1 219829493 1D TCTATATATT A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 44 27 14 4 A 7 6 60968 CASAVA_Build 1 219850808 1D TTGCAAGAAC T/- TTTTGCTACT 2724 het 2724 ref 17 10 6 2 T 5 4 60969 CASAVA_Build 1 219852547 4I TTTAGAATCT ----/TAAA TAACTCCAGG 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 TAAA 0 1 60970 CASAVA_Build 1 219852662 1D CCTCCCTGAC G/- TGAATGAAGC 3070 het 2231 hom 28 7 16 5 G 1 0 60971 CASAVA_Build 1 219853683 1I AGAGCTTAGG -/A AAAAATGTTT 2751 het 2751 ref 32 20 8 4 A 5 6 60972 CASAVA_Build 1 219855231 1I TTGTTAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 10 11 60973 CASAVA_Build 1 219864308 1D ATTCTTTGGG T/- TTTTAGATCC 3070 het 3070 hom 53 25 25 3 T 5 4 60974 CASAVA_Build 1 219878358 1D TTTTTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 11 10 60975 CASAVA_Build 1 219880819 1D TTCAATAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 26 8 4 A 10 9 60976 CASAVA_Build 1 219883223 3I CAAGAAGGAA ---/TTC TTCTTAATGG 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 TTC 1 2 60977 CASAVA_Build 1 219896507 1I AATAAACATC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 7 8 60978 CASAVA_Build 1 219900429 1D TATAAGGAAT A/- TTTTTTTCAG 2411 het 2411 ref 23 8 7 8 A 1 0 60979 CASAVA_Build 1 219902580 4I GATAGGTTTT ----/TATA TTTATTTTAT 2865 het 2865 ref 18 11 7 0 TA 0 2 60980 CASAVA_Build 1 219902900 1I TCCTCAATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 9 10 60981 CASAVA_Build 1 219903759 1D TGGGAATATA T/- TTTTCTCAGA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 T 5 4 60982 CASAVA_Build 1 219904404 1D CTATGGGGGC A/- GGGCTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 1 0 60983 CASAVA_Build 1 219904744 2D CAGTGATTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 T 11 9 60984 CASAVA_Build 1 219906144 10D AATTTTAGTC ATTTTAATGA/---------- ATTTATAGAG 3070 het 3070 ref 26 17 13 3 ATTTTAATGA 1 0 60985 CASAVA_Build 1 219908040 1I TTCAGAGCAG -/C CAAGATCTCT 3070 het 3070 hom 35 16 19 0 C 1 2 60986 CASAVA_Build 1 219914010 2D TTTCAGTTAG GA/-- TAATGGCCTC 3070 het 3070 ref 38 21 16 4 GA 1 0 60987 CASAVA_Build 1 219917250 1D CACTACATGC T/- TTTTTTACTG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 7 6 60988 CASAVA_Build 1 219919224 1I TTTCTATTTG -/T TTTCTATATA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 3 4 60989 CASAVA_Build 1 219919739 1I TCAAAAGGTA -/T TTTTCACTTT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 4 5 60990 CASAVA_Build 1 219921383 3I TGTCTCTAAT ---/CTC CTTTTCTGGA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 CTC 0 1 60991 CASAVA_Build 1 219931289 1I TCAAACACAT -/A ACACAAATTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 1 2 60992 CASAVA_Build 1 219953561 1D GTCATTCTAT A/- AAAACTTAGT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 5 4 60993 CASAVA_Build 1 219957424 2D GAAAAGAAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 2969 hom 40 12 15 15 AG 10 9 60994 CASAVA_Build 1 219957527 1I TCTGAATGCA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 6 7 60995 CASAVA_Build 1 219964309 1D ATAACAAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 10 9 60996 CASAVA_Build 1 219982761 1I AGCTGACCGT -/C CCCGGACAGG 1182 het 1182 ref 15 5 4 6 C 3 4 60997 CASAVA_Build 1 219997526 8I GCTTCAAGTG --------/CTCAGGGA CTAGTACCTG 3070 hom 75 het 26 0 25 1 CTCAGGGA 0 1 60998 CASAVA_Build 1 220008968 2I ATTATGATTT --/TA TATATATATA 1695 het 1695 ref 25 14 5 6 TA 7 8 60999 CASAVA_Build 1 220010800 1I ACCATGTTGC -/A CCAGGCTGGC 3070 het 2042 hom 38 7 20 11 A 0 1 61000 CASAVA_Build 1 220016973 1D TCACACTTCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 119 het 52 0 40 12 T 9 8 61001 CASAVA_Build 1 220025969 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2924 het 1786 hom 22 6 7 9 T 12 11 61002 CASAVA_Build 1 220029962 4I AGGTCACAGC ----/TATT TATTTAATTC 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 TATT 1 2 61003 CASAVA_Build 1 220032162 1I CCTATAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 37 2 25 10 T 13 14 61004 CASAVA_Build 1 220039123 2D GTTAGACATC TT/-- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 3 1 61005 CASAVA_Build 1 220046966 1D TCTTGTTCTC T/- TCCTCCTTGT 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 T 2 1 61006 CASAVA_Build 1 220049723 1D TTTTTATCAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 9 8 61007 CASAVA_Build 1 220052126 5I7M1I CCCTGGGGTG -----TGAGGTG-/TGCCCTGAGGTGC ACACCCCTCT 3070 hom 102 het 42 0 29 17 N/A 0 0 61008 CASAVA_Build 1 220055142 1I AGCAAAACAG -/C CTTATTGCTG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 1 2 61009 CASAVA_Build 1 220085002 4I ATTGGAGAAC ----/TTTG TTTATTTGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTTG 0 1 61010 CASAVA_Build 1 220096176 1D GAATGTGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 8 A 11 10 61011 CASAVA_Build 1 220098115 1D TTTATCCAAG A/- AAAAAAGACA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 7 6 61012 CASAVA_Build 1 220099551 16D TATATATATG TACACACACACACACA/---------------- TACACACACA 3070 het 82 hom 27 2 12 14 TACACACACACACACA 2 1 61013 CASAVA_Build 1 220107755 4I CATAATATAC ----/ACTA ACTATTTTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ACTA 1 2 61014 CASAVA_Build 1 220126058 4I CTAAAGAAAG ----/GAAA GAGAGAGTTC 3070 hom 153 het 60 0 49 11 GAAA 0 1 61015 CASAVA_Build 1 220140642 4D CTTGATAGTG GAGT/---- GAGGAAAGGG 3070 het 3070 ref 36 15 17 4 GAGT 1 0 61016 CASAVA_Build 1 220143684 1I TGGCTCAACC -/T GGGGCTTTTA 3070 het 2519 hom 28 8 15 5 T 0 1 61017 CASAVA_Build 1 220144302 5I CACTTCCTCA -----/TAGCC TAGCCTGAAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TAGCC 1 2 61018 CASAVA_Build 1 220145663 2D CACACAGAGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 1464 hom 43 13 19 12 GA 12 11 61019 CASAVA_Build 1 220146382 1D CTGTCTCCAC A/- AAAAATTTTT 3070 het 2104 hom 25 8 14 3 A 6 5 61020 CASAVA_Build 1 220146829 1D TAGCACCAAG C/- CCGTCATGAG 3070 het 3070 ref 57 29 20 9 C 3 2 61021 CASAVA_Build 1 220153233 20I TGTATAGGTT --------------------/TCTTTATTAAAGATATTATA TCTTTATTAA 3070 het 2548 hom 18 8 7 4 TCTTTATTAAAGATATTATA 0 1 61022 CASAVA_Build 1 220154208 1D AATGAATATT G/- GCTAATGTCA 3070 het 3070 hom 57 22 29 7 G 2 1 61023 CASAVA_Build 1 220162450 1D AGTGAATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 968 hom 31 3 23 5 T 12 11 61024 CASAVA_Build 1 220211620 1I GGAAATTTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 A 9 10 61025 CASAVA_Build 1 220218106 2D AATCAGAGAG GT/-- GTCCCTGCAA 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 GT 2 1 61026 CASAVA_Build 1 220220908 3D TATCTCTACA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 AAT 7 6 61027 CASAVA_Build 1 220272163 7D CCCATCTGAA ATTGACC/------- ACACTGTCTG 3070 het 3070 ref 55 28 22 6 ATTGACC 1 0 61028 CASAVA_Build 1 220313278 1D ACTGTTATTG A/- AAAAAAAAAT 1393 het 1393 ref 46 40 4 2 A 10 9 61029 CASAVA_Build 1 220331037 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1804 het 923 hom 9 3 6 0 A 14 15 61030 CASAVA_Build 1 220334066 1D ACAGTAAGAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 8 7 61031 CASAVA_Build 1 220350270 2D TATATTGTAT TA/-- GTTGTTTTAC 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 TA 1 0 61032 CASAVA_Build 1 220374463 1D ATCCACATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2799 hom 31 10 14 7 A 12 11 61033 CASAVA_Build 1 220374901 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTTTGA 3004 het 3004 ref 22 13 7 2 T 9 8 61034 CASAVA_Build 1 220376190 1D ATAAAAAAAA G/- AATCTTTTCT 2732 het 2526 hom 13 7 6 0 G 1 0 61035 CASAVA_Build 1 220376416 3I AAATAGGCCC ---/AAG AAGAAGGAGA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 AAG 2 3 61036 CASAVA_Build 1 220403591 1D ATGCATGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3068 hom 32 11 14 7 A 13 12 61037 CASAVA_Build 1 220411856 1D AAAGAATTAT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 8 7 61038 CASAVA_Build 1 220420321 1I TGCATACATA -/C CCCCCAAAAC 3070 hom 70 het 33 0 22 11 C 5 6 61039 CASAVA_Build 1 220428765 1I TTTTCTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 20 23 11 A 12 13 61040 CASAVA_Build 1 220448589 5D GTAGATTGCA AAAAT/----- AAAATTTTCT 2925 het 2925 ref 26 18 7 2 AAAAT 2 1 61041 CASAVA_Build 1 220455004 1D TCCAGGCCAA G/- GCAGCAGAGT 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 G 2 1 61042 CASAVA_Build 1 220468225 4D TTTCCCAAAA AGAT/---- AGAATAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 AGAT 1 0 61043 CASAVA_Build 1 220470688 3D ATCCATTCCT CTC/--- CTCTACAATT 3070 het 3070 hom 47 19 22 7 CTC 2 1 61044 CASAVA_Build 1 220479089 1I AGCAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1442 het 1442 ref 27 12 5 10 A 13 14 61045 CASAVA_Build 1 220493216 3I ACTCACAAAC ---/ATT ATTGTGGAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATT 1 2 61046 CASAVA_Build 1 220506438 2I CAGGAAAAAT --/AA AATCACAAAT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 2 4 61047 CASAVA_Build 1 220520157 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2812 het 1661 hom 16 4 9 3 T 12 11 61048 CASAVA_Build 1 220529343 1I GAGCCCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 12 12 A 15 16 61049 CASAVA_Build 1 220530895 1I AAAGATGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 10 11 61050 CASAVA_Build 1 220532151 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2402 het 1067 hom 17 6 7 5 A 15 14 61051 CASAVA_Build 1 220534673 2D AGAAAGATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 15 13 A 14 12 61052 CASAVA_Build 1 220535409 1D CATTATTATT A/- GACCTATCCT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 A 1 0 61053 CASAVA_Build 1 220542792 3D TCCAGTGGGC ACA/--- ACAATAACTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 ACA 2 1 61054 CASAVA_Build 1 220549723 1I ATTTTTTTTT -/C CTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 C 1 2 61055 CASAVA_Build 1 220553577 2I AATATTTCTC --/TT CTTTTTGTGC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 0 2 61056 CASAVA_Build 1 220557573 2I GGGTTTGTTG --/TT TTTTTTTTGT 2999 het 2999 ref 32 17 7 8 T 8 10 61057 CASAVA_Build 1 220559924 2I GAGAACTTGT --/GA GTTAGTATCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GA 0 1 61058 CASAVA_Build 1 220562113 23D AAATGGCACC AATCCTTGGCACTACACTGAATA/----------------------- AATTGTGCTA 3070 het 3070 hom 52 26 27 7 AATCCTTGGCACTACACTGAATA 1 0 61059 CASAVA_Build 1 220569275 1D TGTAAACCTC A/- AATATACAAA 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 A 3 2 61060 CASAVA_Build 1 220578081 1D AGGTGGTAAT G/- TGCGCTCGCC 3070 het 3070 hom 49 18 20 11 G 1 0 61061 CASAVA_Build 1 220586474 3I GAAGGAGCAC ---/TGG TGGGGGGGGG 3070 het 43 hom 39 3 29 7 TGG 1 2 61062 CASAVA_Build 1 220588105 1I GTTTGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 670 hom 34 5 25 4 A 13 14 61063 CASAVA_Build 1 220590722 1D TAAAAATGTC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 7 61064 CASAVA_Build 1 220590891 1I TCAAAAATTT -/C TTTAAACAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 0 1 61065 CASAVA_Build 1 220598239 1I CAACCACTAC -/A GAGAACAGTA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 0 1 61066 CASAVA_Build 1 220600741 1D TTCCTCAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 516 hom 28 3 15 10 A 15 14 61067 CASAVA_Build 1 220602131 1D TGAGAGAAAT A/- AAAACACTAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 5 4 61068 CASAVA_Build 1 220605543 3I TTGTTGAGTC ---/GTT GTTGTTGTTT 3070 het 3070 hom 54 16 29 9 GTT 3 4 61069 CASAVA_Build 1 220609081 1I GATCTGGGGT -/A CCCTCATAGG 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 0 1 61070 CASAVA_Build 1 220611393 1D TCTAATAAGG A/- AAAAGGAATG 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 5 4 61071 CASAVA_Build 1 220622737 1D ATATTGTGGG T/- TTTTTTTATT 3070 het 2574 hom 28 8 18 3 T 8 7 61072 CASAVA_Build 1 220624873 12D TTTTTCTACA TTTCTGGCTCTG/------------ TTTTTCCAGA 3070 het 3070 ref 45 23 15 10 TTTCTGGCTCTG 1 0 61073 CASAVA_Build 1 220649910 1D CGCATCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 40 1 27 12 A 12 11 61074 CASAVA_Build 1 220650216 2D TTCTTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 28 0 24 4 T 16 14 61075 CASAVA_Build 1 220651117 2I GGATGGACCT --/GA GAGATAAAAA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 GA 2 3 61076 CASAVA_Build 1 220651642 1I TTTTCTCCTT -/C CCCCAACCCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 4 5 61077 CASAVA_Build 1 220655825 6D TTTGCTCATA ATTTTT/------ CACAAGCATC 3070 hom 154 het 56 0 51 6 ATTTTT 1 0 61078 CASAVA_Build 1 220668467 3I AATCTGGAGG ---/CAT CATATTATCT 3070 hom 85 het 31 0 29 2 CAT 1 2 61079 CASAVA_Build 1 220671259 1I AATAATTTTT -/A AAAATTAGTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 4 5 61080 CASAVA_Build 1 220690922 1D CCAAAAACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 28 het 25 1 22 2 A 10 9 61081 CASAVA_Build 1 220704419 2D GACTCTGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 594 het 193 hom 15 3 3 9 A 15 13 61082 CASAVA_Build 1 220723440 1D TAGAAAAAAA T/- AAAAATAAAT 3070 hom 18 het 21 0 15 7 T 1 0 61083 CASAVA_Build 1 220732695 1I AGTTAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 2447 hom 12 het 6 0 5 1 A 10 11 61084 CASAVA_Build 1 220733253 1I ATAAAGGAAG -/A AAAAAAAAAC 2296 het 26 hom 9 1 6 2 A 9 10 61085 CASAVA_Build 1 220770690 1D35M2D ATAGAGAATC TTTTTTTTTAAATTTTTTCTTTTCTTGTGTATTTTTTG/-TTTTTTTAAAATTTTTTCTTTTCTTGTGTATTTTT-- TGTTTTTTGA 3070 hom 63 het 22 0 22 8 N/A 0 0 61086 CASAVA_Build 1 220772581 2I ACTTTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 26 2 17 7 A 14 16 61087 CASAVA_Build 1 220772815 1I AGTAAGGGTT -/A AAAAAAACTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 7 8 61088 CASAVA_Build 1 220773330 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 15 1 11 3 A 12 13 61089 CASAVA_Build 1 220782353 2D TTTTTTAGAC AG/-- AGTCTCACTC 3070 hom 74 het 29 0 22 9 AG 2 1 61090 CASAVA_Build 1 220797583 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 10 9 61091 CASAVA_Build 1 220808455 1I AAGATACAGG -/A ATGGCCAATA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 1 2 61092 CASAVA_Build 1 220813955 1I TCTGTTAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 35 1 29 5 A 10 11 61093 CASAVA_Build 1 220823392 1I TGATAAAACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1020 hom 37 3 26 8 A 10 11 61094 CASAVA_Build 1 220825686 1D GGATATAAAC A/- AAAAAAGTAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 7 6 61095 CASAVA_Build 1 220831020 1I AGACCCTGTC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 8 9 61096 CASAVA_Build 1 220832106 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1344 het 1344 ref 41 33 3 6 T 10 9 61097 CASAVA_Build 1 220838352 1D GCTTTAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 36 0 27 11 A 10 9 61098 CASAVA_Build 1 220843594 4D AGGATTGAAG TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 105 het 42 0 36 8 TTAT 3 2 61099 CASAVA_Build 1 220852206 7D ACCTTTGAAG CATAGAA/------- GTTTTATATT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 CATAGAA 1 0 61100 CASAVA_Build 1 220856764 24D TCAACCAGGG CTGGAGAGCATTGTAGCCACTCTT/------------------------ CTGGAGAGCA 3070 hom 92 het 39 0 28 14 CTGGAGAGCATTGTAGCCACTCTT 2 1 61101 CASAVA_Build 1 220866319 12I GAGACCTGAC ------------/CTGTTTTGGATT CTGTATACTA 3070 hom 117 het 39 0 38 2 CTGTTTTGGATT 0 1 61102 CASAVA_Build 1 220883129 4D TTTTTTCAAC TTGT/---- TTGTTTTCAT 3070 het 3070 ref 37 16 16 7 TTGT 2 1 61103 CASAVA_Build 1 220883922 1I GGAAGAAAGG -/C CCGCGCACTG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 C 2 3 61104 CASAVA_Build 1 220891614 1I TTGCCACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 10 11 61105 CASAVA_Build 1 220906667 3I AGGGGGAAAT ---/GGG GGGGGCGACA 3070 hom 101 het 39 0 33 6 G 5 8 61106 CASAVA_Build 1 220907776 4I TAAAATTGTC ----/TTAT TTATTTATGA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 TTAT 2 3 61107 CASAVA_Build 1 220916891 1I AAAAAACCAC -/A AAAAAAAAAC 2573 het 2434 hom 23 13 7 3 A 9 10 61108 CASAVA_Build 1 220930656 4I TATATAATCT ----/TATA TATAATATAT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 TA 2 4 61109 CASAVA_Build 1 220940589 1D GGCGCGGTGG C/- GGGCGCCTTA 1974 het 1513 hom 12 6 5 1 C 1 0 61110 CASAVA_Build 1 220945752 1D TGGAGGCTGA G/- GCAGGAGAAT 2190 het 1420 hom 10 4 5 1 G 2 1 61111 CASAVA_Build 1 220982433 1D TTTTAATTTC A/- GGGGAACTAC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 1 0 61112 CASAVA_Build 1 220982773 1D TGCGACGATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 23 14 5 T 10 9 61113 CASAVA_Build 1 220990771 1D AAAACAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 14 13 61114 CASAVA_Build 1 221000657 4I TCTCATTCAT ----/TCAA TCAGTCATTC 3070 het 3070 ref 47 21 23 3 TCAA 0 1 61115 CASAVA_Build 1 221010047 2I TTAAAAAAAA --/AT GATAGCTATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 0 1 61116 CASAVA_Build 1 221012415 2I31M1D TGTGTCTTCT --TCTCTCTCTCTCTCTTTTCTTTCTTTCCTTCT/TCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTTTCTTTCCTTC- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 7 N/A 0 0 61117 CASAVA_Build 1 221014448 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 13 12 61118 CASAVA_Build 1 221019368 2I AACCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 27 0 14 13 A 14 16 61119 CASAVA_Build 1 221019620 4I GAGTAATAGG ----/AAAC AAACAAAAGG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAAC 1 2 61120 CASAVA_Build 1 221019697 1I TGATTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 16 1 12 3 T 11 12 61121 CASAVA_Build 1 221024766 1D CATTTGTTTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 96 het 35 0 33 4 A 8 7 61122 CASAVA_Build 1 221033954 1I AAACCCAAAC -/T TTTTTTTTTT 2385 het 725 hom 24 5 10 9 T 17 18 61123 CASAVA_Build 1 221037302 6D TCACCTATTC TCCCAA/------ TCTTAAGTGC 3070 hom 99 het 34 0 33 4 TCCCAA 1 0 61124 CASAVA_Build 1 221056837 4D TTTAATCTTA TTTG/---- TTTAAGTAGA 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 TTTG 1 0 61125 CASAVA_Build 1 221060176 1I GTTGATTGTT -/A ACGAGAATGG 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 A 1 2 61126 CASAVA_Build 1 221064395 1D GCCCTTCTGC T/- TTTGCTTATA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 T 4 3 61127 CASAVA_Build 1 221066271 2D CCTTTAAGAC TG/-- TAACCTGATT 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 TG 1 0 61128 CASAVA_Build 1 221069412 1D TCTTTGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1654 hom 24 7 9 9 T 13 12 61129 CASAVA_Build 1 221083529 1D AATGAAGGAT G/- GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 G 9 8 61130 CASAVA_Build 1 221084023 6I TTCTCCAGTC ------/TTTGTT TTTGTATTTT 3070 het 3070 ref 44 24 19 1 TTTGTT 0 1 61131 CASAVA_Build 1 221088376 1D35M1D AGTAAATTAC AAAAAAAGTAAAAATTATAGTAAGTAGTGGCTTTTTA/-AAAAAAGTAAAAATTATAGTAAGTAGTGGCTTTTT- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 23 11 16 1 N/A 0 0 61132 CASAVA_Build 1 221089423 1D TAGACCAAAT C/- TGTATAACAT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 1 0 61133 CASAVA_Build 1 221090388 1I ACTGCTACAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 9 8 5 T 9 10 61134 CASAVA_Build 1 221101899 1D GAAAAATGTG T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 7 6 61135 CASAVA_Build 1 221108308 2D AAAACTCTAC AT/-- ATATATATGT 1537 het 1537 ref 26 14 7 5 AT 5 4 61136 CASAVA_Build 1 221111103 1D CTGTTCTGTT C/- CATTGGTCTA 3070 het 2756 hom 18 6 12 1 C 2 1 61137 CASAVA_Build 1 221131682 1I AAAGTAGGAT -/C GAGACCTGGA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 C 0 1 61138 CASAVA_Build 1 221138514 1I TGTACCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 30 1 22 7 T 13 14 61139 CASAVA_Build 1 221142063 1D TGATCTTTTC A/- AAAAACCAGC 2917 hom 18 het 7 0 7 0 A 6 5 61140 CASAVA_Build 1 221145387 4D TAGAAATGGC TAAT/---- TAAAGAATAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 TAAT 1 0 61141 CASAVA_Build 1 221148318 1D CCCTTAATGT A/- AAAAAAATTT 1692 het 1692 ref 24 14 5 5 A 8 7 61142 CASAVA_Build 1 221153718 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 10 9 61143 CASAVA_Build 1 221153905 1I CATTCTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 A 11 12 61144 CASAVA_Build 1 221171651 2D ACCAGGAATC TT/-- TTTTTTTTTT 1907 het 1344 hom 37 7 7 23 T 16 14 61145 CASAVA_Build 1 221178312 6D TCCACTCCTA TTATAC/------ TTATACTTCC 3070 het 3070 hom 28 10 17 4 TTATAC 2 1 61146 CASAVA_Build 1 221182081 1D AAAAAGTAAG A/- AAAAAAACTC 1885 het 1885 ref 26 19 5 3 A 8 7 61147 CASAVA_Build 1 221184420 4I AATAAAAAGT ----/TTAA TTAACTAGAA 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 TTAA 1 2 61148 CASAVA_Build 1 221191332 1D CTTTTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 803 hom 31 2 25 4 A 12 11 61149 CASAVA_Build 1 221211275 1I CCTGGCCTGT -/A AAATGAAGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 4 61150 CASAVA_Build 1 221217500 1D TTTTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 20 2 12 6 T 14 13 61151 CASAVA_Build 1 221219406 5D TTTTTAAATA AAATT/----- AATTTATAGT 3070 hom 54 het 21 0 19 4 AAATT 1 0 61152 CASAVA_Build 1 221221276 1D CTGAGAGACC A/- AAAGGCAAAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 4 3 61153 CASAVA_Build 1 221247049 3D CCTGGAAGTG TTC/--- TTCTGCATTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TTC 2 1 61154 CASAVA_Build 1 221250457 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 24 1 14 10 A 11 10 61155 CASAVA_Build 1 221252780 1I ATTTTTCTAG -/T TTTTTATTTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 5 6 61156 CASAVA_Build 1 221283594 2I ACTCAGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1418 hom 17 4 9 4 A 10 12 61157 CASAVA_Build 1 221287369 4I GACTTGTATT ----/AGTC AGGGTTCTCC 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 AGTC 0 1 61158 CASAVA_Build 1 221289425 2D GGAAAGACAC TG/-- TGAAGGAGGT 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 TG 2 1 61159 CASAVA_Build 1 221295156 2D TACAGCAAAA GG/-- CTCTTCAAGA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 G 2 0 61160 CASAVA_Build 1 221297891 37D AGAGCACCAG AGAGACTGTTATTATGACTATCTACAGGATAATAACA/------------------------------------- AGAGTTTGGA 3070 hom 54 het 22 0 18 8 AGAGACTGTTATTATGACTATCTACAGGATAATAACA 1 0 61161 CASAVA_Build 1 221302254 1I CAATAATAAT -/G GTTAGAAAGT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 G 1 2 61162 CASAVA_Build 1 221316266 1D AAAAGAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 11 10 61163 CASAVA_Build 1 221324888 1I TGGGGAGGGG -/C CCTCTTTGAG 3070 hom 81 het 37 0 28 9 C 2 3 61164 CASAVA_Build 1 221327142 1D TTTCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 11 10 61165 CASAVA_Build 1 221333395 1D TCCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 11 10 61166 CASAVA_Build 1 221335543 1D TCTCAAAAAA C/- AAAACCAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 1 0 61167 CASAVA_Build 1 221335835 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 6 T 13 11 61168 CASAVA_Build 1 221342173 4I AGGAGACTGG ----/ATAA ATAAATTGTA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 ATAA 1 2 61169 CASAVA_Build 1 221343832 4I69M5D ATTTCTAGAT ----TGTCTTCTGCCAAGGGCAGGAGTTACTATCTCAATTTTATCTAAGTACATATTTATTTTTGTTTTTGTCTGTTT/TCTCTGTCTTCTGCCAAGGGCAGGAGTTACTATCTCAATTTTATCTAAGTACATATTTATTTTTGTTTTTGTC----- TAAGTATTAT 3070 hom 157 het 28 0 53 4 N/A 0 0 61170 CASAVA_Build 1 221348916 9D GCTGGATTTT GAAGAAAAC/--------- GAAGAAAACG 3070 hom 90 het 33 0 30 9 GAAGAAAAC 2 1 61171 CASAVA_Build 1 221349437 1I ACTGCCCCCC -/A AGGAGGCCTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 1 2 61172 CASAVA_Build 1 221362176 1I CAATAATATC -/A AAATATGCAT 3070 het 3070 hom 59 22 29 8 A 3 4 61173 CASAVA_Build 1 221402407 8D AGGTGTTCCC TGGCCTGT/-------- TGGTTGCTGT 3070 het 3070 ref 41 23 12 8 TGGCCTGT 1 0 61174 CASAVA_Build 1 221422851 26I ATGTCGTCAA --------------------------/AAAATCATTATTTTTTAATGATTTTT AAAATCATTA 3070 het 3070 ref 36 19 12 8 AAAATCATTATTTTTTAATGATTTTT 0 1 61175 CASAVA_Build 1 221424152 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 964 hom 33 5 19 9 A 14 15 61176 CASAVA_Build 1 221425208 1I CAAGGGAAAT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 7 8 61177 CASAVA_Build 1 221492685 2I TATAATTGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 10 12 61178 CASAVA_Build 1 221494871 1D TGAACAGTAC A/- TGGAAATGAT 3070 het 3070 ref 40 15 15 11 A 1 0 61179 CASAVA_Build 1 221501391 2I TCTTCCTAGC --/TG TGTGACTGAG 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 TG 2 3 61180 CASAVA_Build 1 221511558 1I GGCCAGGAGG -/T GGCAGTGCCC 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 T 0 1 61181 CASAVA_Build 1 221516873 1D TGCACATGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 9 20 3 A 10 9 61182 CASAVA_Build 1 221517270 1D ATGGATGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 9 5 T 12 11 61183 CASAVA_Build 1 221536016 4D TTGAGCCTGG CTCT/---- CTCTGTGTGG 2981 het 2981 ref 29 14 8 8 CT 4 2 61184 CASAVA_Build 1 221562107 4I AATTGATGAT ----/ATAA ATGAGATTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATAA 0 1 61185 CASAVA_Build 1 221575430 1I CCCCATATCT -/C CTTTTCAGTC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 C 1 2 61186 CASAVA_Build 1 221596380 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1183 het 1183 ref 36 22 3 11 T 12 11 61187 CASAVA_Build 1 221618603 4D TTATATAATC AATT/---- AATTATAATT 3070 hom 21 het 8 0 8 1 AATT 2 1 61188 CASAVA_Build 1 221620750 2I TTTCCTTTCG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 11 13 61189 CASAVA_Build 1 221621601 1D CATCAAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 10 9 61190 CASAVA_Build 1 221649080 2I TTATGCTGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 517 hom 24 2 19 3 A 12 14 61191 CASAVA_Build 1 221652405 2I ATGCACACAA --/AC ACACACACAC 870 het 870 ref 33 13 7 13 AC 6 7 61192 CASAVA_Build 1 221652420 2D CACACACATT GA/-- GAGAGAGAGA 942 het 942 ref 27 13 9 7 GA 9 8 61193 CASAVA_Build 1 221663310 2D GTCCTGGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 47 0 32 18 T 12 10 61194 CASAVA_Build 1 221664472 3I AATCCTATGC ---/AGA AGGTGTTAGT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 AGA 0 1 61195 CASAVA_Build 1 221671634 1D TATGGAAGAG A/- AAAAAAGCAA 3070 hom 87 het 30 0 30 1 A 7 6 61196 CASAVA_Build 1 221673760 1I TAAAAAAAAA -/T AAAAATAATA 2353 het 18 hom 8 1 6 1 T 0 1 61197 CASAVA_Build 1 221708933 1D GTCTCAGAGA C/- CCCTCAGCCA 3070 hom 32 het 38 0 20 18 C 4 3 61198 CASAVA_Build 1 221719554 2D TGCCTGCTTT CC/-- CAAACCCAGA 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 C 3 1 61199 CASAVA_Build 1 221724358 4I AATGAATGAA ----/TGAG TGTCTGAGGA 3070 hom 104 het 45 0 29 16 TGAG 0 1 61200 CASAVA_Build 1 221729010 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1007 hom 27 3 19 5 A 15 14 61201 CASAVA_Build 1 221729989 1D TGACCAATAT C/- ACTATTTGAT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 C 1 0 61202 CASAVA_Build 1 221733112 1D GAATTTTCCA T/- TTAATATTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 3 2 61203 CASAVA_Build 1 221734048 1D AATTCTTGTA T/- TTTTTGTAGA 3070 hom 135 het 48 0 45 3 T 6 5 61204 CASAVA_Build 1 221764282 2I AAAGAAAAAA --/AC AAAAAAAAAC 3070 het 1896 hom 37 11 21 5 AC 0 1 61205 CASAVA_Build 1 221778625 1D AGCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 19 0 10 9 A 15 14 61206 CASAVA_Build 1 221778638 5D AAAAAAAAAA AAGAG/----- AGAGAGAAAG 2226 het 974 hom 19 7 8 5 AAGAG 1 0 61207 CASAVA_Build 1 221781872 1D CAAGATTGAG T/- TCTTGGCTTC 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 2 1 61208 CASAVA_Build 1 221782257 2I TCTATATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 135 hom 37 1 33 3 TA 5 6 61209 CASAVA_Build 1 221788232 1I AAAGAAATCA -/C CTTCACCATC 3070 hom 111 het 42 0 36 6 C 1 2 61210 CASAVA_Build 1 221789270 1I GGACGAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 953 hom 37 3 26 8 A 12 13 61211 CASAVA_Build 1 221867365 1D GAGTAGAAGC T/- TTCCCATGCC 3070 het 3070 ref 46 21 23 2 T 3 2 61212 CASAVA_Build 1 221896621 1D TGGTGTTTTT C/- TGAACAATGG 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 C 1 0 61213 CASAVA_Build 1 221924349 1I ATTGGGAAGT -/G GGGGCTGACT 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 G 4 5 61214 CASAVA_Build 1 221929079 1D TCTTCTGAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2149 hom 21 6 11 4 T 10 9 61215 CASAVA_Build 1 221934775 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 956 het 366 hom 18 2 6 10 T 17 16 61216 CASAVA_Build 1 221936043 12D CTGTCTCAAA AAAAAAAAAAAG/------------ AAAAGAAAAG 3070 het 2527 hom 16 8 11 1 AAAAAAAAAAAG 1 0 61217 CASAVA_Build 1 221939328 1D AAAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 38 0 27 12 A 11 10 61218 CASAVA_Build 1 221944444 4I GCCCCTTTTT ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 14 0 8 6 A 10 14 61219 CASAVA_Build 1 221953459 2I CCCCATCTCT --/AC ACACACACAC 3070 hom 100 het 38 0 31 7 AC 7 8 61220 CASAVA_Build 1 221955182 1D GATGGGCTAG C/- GGGGAAATGG 3070 hom 163 het 57 0 55 3 C 1 0 61221 CASAVA_Build 1 221980435 2I CAAGCAAGAC --/TT TAGTAGTTCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 3 61222 CASAVA_Build 1 221981473 1D TTGTCTCAGG A/- AGGGTGAAAT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 A 2 1 61223 CASAVA_Build 1 221984664 1D ATATTATGAG A/- TTTTTTTTTT 3070 het 1186 hom 31 5 18 8 A 1 0 61224 CASAVA_Build 1 221984731 3D CCCAAGACAA TTC/--- TTCTTCTTCC 3070 het 200 hom 28 2 24 2 TTC 4 3 61225 CASAVA_Build 1 222019987 1I GGAGGGCTCC -/A ACACCAGAGT 2118 het 2118 ref 32 15 8 9 A 1 2 61226 CASAVA_Build 1 222020959 1I AAATGCTACA -/C CCCCCCCTCC 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 C 7 8 61227 CASAVA_Build 1 222030367 5I ATAATCTGAC -----/CATAA CATAACATAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 CATAA 2 3 61228 CASAVA_Build 1 222148210 1D AGAACTGGTC A/- AGCCTCACTC 1735 het 1735 ref 41 33 4 5 A 2 1 61229 CASAVA_Build 1 222167870 1I ATTCATTTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 39 0 28 11 T 8 9 61230 CASAVA_Build 1 222210807 2D ATTTTTTTGT AG/-- AGTGAGGGGT 2918 het 1921 hom 12 5 7 0 AG 2 1 61231 CASAVA_Build 1 222211995 5D AATTTTTTAG TATTT/----- TATTTTATTT 2428 het 1984 hom 9 4 5 2 TATTT 4 3 61232 CASAVA_Build 1 222239414 1D AAAATGAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 664 hom 12 4 8 0 A 10 9 61233 CASAVA_Build 1 222240686 7I GAAGAAATGC -------/TAACTAA TAACTAAAGA 3070 het 1761 hom 15 5 9 1 TAACTAA 1 2 61234 CASAVA_Build 1 222246092 1I CTCAGGTGAT -/A ACACCCGCCT 2595 het 908 hom 11 3 8 0 A 1 2 61235 CASAVA_Build 1 222252167 1D GTGAATGTAT A/- AAGTATATCC 3070 het 3070 ref 48 37 11 1 A 3 2 61236 CASAVA_Build 1 222262521 1D TGTACTCTGG T/- TTTTTAGAAT 3070 het 3070 ref 47 37 9 1 T 6 5 61237 CASAVA_Build 1 222270061 15D GACTTGAATG GAATGGAATGGACTC/--------------- GAATGGAATG 3070 het 3070 ref 64 40 20 11 GAATGGAATGGACTC 1 0 61238 CASAVA_Build 1 222271752 6I AATCTGAAAT ------/CTTTTA CTTTTACCAG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 CTTTTA 1 2 61239 CASAVA_Build 1 222271937 2D GGAATTTTAA CT/-- CTATGTAATT 3070 het 3070 ref 58 44 12 3 CT 2 1 61240 CASAVA_Build 1 222272143 4D ACCACCGACC TTTT/---- TTTTCTCCTC 3070 het 3070 hom 60 17 35 9 T 8 4 61241 CASAVA_Build 1 222278429 1D TAACTGTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 13 7 A 12 11 61242 CASAVA_Build 1 222278457 1D GAGTAACTTA G/- AAAACATTTA 2515 het 2515 ref 33 16 7 12 G 1 0 61243 CASAVA_Build 1 222278789 1I ATCACCACAC -/T TGTCTTCCAC 3070 het 3070 ref 23 16 7 0 T 1 2 61244 CASAVA_Build 1 222285923 6I CATGATATAC ------/CCTTAT CCTGTATTGG 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 CCTTAT 0 1 61245 CASAVA_Build 1 222289208 1D TTTATTTCAT A/- AGATAGCATT 2677 het 2677 ref 19 8 6 5 A 2 1 61246 CASAVA_Build 1 222289255 5I AATCAACAAG -----/TAAAA TAAAATTAAT 2867 hom 18 het 10 0 7 3 TAAAA 1 2 61247 CASAVA_Build 1 222293757 1D TCCAGAAGAG A/- AAAGTCCAGT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 4 3 61248 CASAVA_Build 1 222316677 1D TTGGCTAAAG A/- GTAGCAGGGA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 1 0 61249 CASAVA_Build 1 222319371 3D GTTGTTACTG TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 44 19 16 10 TTA 5 4 61250 CASAVA_Build 1 222319705 6D GCCACATCTC AAAAGA/------ AAAAGAAAAA 2723 het 2723 ref 20 11 6 5 AAAAGA 3 2 61251 CASAVA_Build 1 222319873 6D TCTGTAAGAA ATCTGT/------ AAGATTGCCA 3070 het 3070 ref 31 21 11 2 ATCTGT 1 0 61252 CASAVA_Build 1 222323760 2I CCTGGAAAAC --/AT AATCCAAATT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 AT 0 1 61253 CASAVA_Build 1 222325872 1I GCGTTAGATT -/C ACATAAAGGT 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 C 0 1 61254 CASAVA_Build 1 222326655 6I CTATGAGAAT ------/CTAATG CTCCTACTGA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 CTAATG 0 1 61255 CASAVA_Build 1 222328482 38D ATGAATAAAG AGAAAATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------------------------- AGAAAATAGA 3070 het 2749 hom 23 10 14 6 AGAAAATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 61256 CASAVA_Build 1 222330879 1I CATAACTTCA -/G TAACTGCCTA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 G 0 1 61257 CASAVA_Build 1 222330970 3D TGGGTTCCTT GAG/--- GAGTTCATTC 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 GAG 2 1 61258 CASAVA_Build 1 222332551 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 6 T 20 18 61259 CASAVA_Build 1 222333328 1D CATAGTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 57 22 23 13 A 11 10 61260 CASAVA_Build 1 222356208 1D TCAATAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 22 0 17 6 T 12 11 61261 CASAVA_Build 1 222363349 4I ACCCTGTCTC ----/AAAT AAATAAATAA 3043 hom 21 het 16 0 8 8 AAAT 4 5 61262 CASAVA_Build 1 222364249 2D AAGACCAAAG CA/-- CTAGGGAGAA 3070 het 3070 ref 59 36 20 4 CA 1 0 61263 CASAVA_Build 1 222365025 1D TTTTATTGCT A/- AAAAATGCTA 3070 het 3070 hom 38 14 14 11 A 6 5 61264 CASAVA_Build 1 222366497 1I CAAAGTGTAA -/T AATACAAAGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 0 1 61265 CASAVA_Build 1 222367072 1D TTTGTCTTTT G/- TAACGTTAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 1 0 61266 CASAVA_Build 1 222368778 3I TCTGGGAGAT ---/GAG GAGAAGGGAG 2118 hom 27 het 11 0 10 1 GAG 1 2 61267 CASAVA_Build 1 222372628 1D ATAAAAAGGG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 8 7 61268 CASAVA_Build 1 222377406 1I TTCTCACTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 9 10 61269 CASAVA_Build 1 222378276 2D TCTACTAAAA AC/-- ACAAAAAATT 3070 het 2169 hom 16 6 10 1 AC 2 1 61270 CASAVA_Build 1 222380542 1I ACTTAAATAC -/T TACACTAGCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 2 61271 CASAVA_Build 1 222384775 3I TTATTGATTT ---/TTG TTGTTCTTTT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 TTG 1 2 61272 CASAVA_Build 1 222388154 2D CCTAATTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 21 het 8 0 8 1 AT 9 8 61273 CASAVA_Build 1 222393028 2D AAAACAAAAC AT/-- GTGGATAGTC 3070 hom 56 het 21 0 19 2 AT 1 0 61274 CASAVA_Build 1 222395994 4D ATGTTACCGT ACTG/---- ACTATTGTAG 3070 het 3070 ref 51 33 16 5 ACTG 1 0 61275 CASAVA_Build 1 222396794 1D AACTTCTTGA C/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 28 19 9 0 C 1 0 61276 CASAVA_Build 1 222401953 1I TTGACAATGT -/G GGTCCTGGAC 3070 hom 114 het 47 0 39 8 G 2 3 61277 CASAVA_Build 1 222402152 5D TGTAATTTGC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1060 hom 37 11 10 17 A 19 14 61278 CASAVA_Build 1 222403179 1I10M9I CCTGTTGAAA -TTTACTTACT---------/TTTTACTTATTCCTCATTAC AATGTCCTTC 3070 hom 164 het 51 0 54 4 N/A 0 0 61279 CASAVA_Build 1 222403962 1D AGATGCTGCT A/- GGCTCTGGGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 0 61280 CASAVA_Build 1 222404417 5I GGGAGGCCAA -----/GGCAG GGCAGGCAGA 3070 hom 78 het 27 0 24 3 GGCAG 1 2 61281 CASAVA_Build 1 222406367 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2661 hom 38 12 13 13 A 13 14 61282 CASAVA_Build 1 222411342 1D AAAAAAAAAA T/- TATTATTTTC 201 het 201 ref 24 11 3 10 T 2 1 61283 CASAVA_Build 1 222412497 1I ATCTTGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 10 11 61284 CASAVA_Build 1 222415001 3D AAATAGTTTT AAA/--- GACTATTGGG 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 A 3 0 61285 CASAVA_Build 1 222418089 1D CTTTAAAAAC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 T 7 6 61286 CASAVA_Build 1 222421564 1D AAAAAGAAAG A/- AAAGAAAAGA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 4 3 61287 CASAVA_Build 1 222421699 1I TGTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 736 hom 13 het 10 0 4 6 T 10 11 61288 CASAVA_Build 1 222427921 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 8 7 61289 CASAVA_Build 1 222428228 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 28 0 22 7 T 12 11 61290 CASAVA_Build 1 222429472 1I GTTACATTTC -/T TTTTTTTTTT 2856 het 713 hom 22 2 13 7 T 15 16 61291 CASAVA_Build 1 222434305 1D AACTTTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 8 61292 CASAVA_Build 1 222442281 1D ATAATATAAA T/- TTTTTTTTTT 2962 het 2914 hom 25 10 7 8 T 15 14 61293 CASAVA_Build 1 222451487 4D AAAATGCATT TATG/---- TATTCATTTA 3070 het 3070 hom 52 26 24 6 TATG 1 0 61294 CASAVA_Build 1 222451908 3D GTTCATGTAT TTC/--- TTGTTAGGAA 3070 hom 117 het 44 0 39 6 TTC 1 0 61295 CASAVA_Build 1 222458387 1D TTTAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 30 0 23 8 A 11 10 61296 CASAVA_Build 1 222458879 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 10 9 61297 CASAVA_Build 1 222459958 1D ACACACCCAG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 55 het 22 0 17 5 C 12 11 61298 CASAVA_Build 1 222460961 1D CAGGCATATG C/- CACTGTGAAA 3070 hom 66 het 27 0 21 7 C 2 1 61299 CASAVA_Build 1 222461361 2I AGTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1830 hom 18 het 12 0 7 5 A 15 17 61300 CASAVA_Build 1 222465934 1I GTGCCAGGTC -/A CCAAAGAGCC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 0 1 61301 CASAVA_Build 1 222467744 1I CTCTGTAATT -/C AAAAAAAAAA 127 het 127 ref 18 8 2 8 C 0 1 61302 CASAVA_Build 1 222475472 1D GCCAGCCACC A/- CCCCCCCTAA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 A 1 0 61303 CASAVA_Build 1 222488492 1D TGACAAATAC A/- AAACAGGCCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 4 3 61304 CASAVA_Build 1 222490259 1I CCCTGTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 24 0 21 3 A 12 13 61305 CASAVA_Build 1 222492512 1I GCACCCACCA -/C CACACCTGGC 3070 hom 60 het 23 0 20 5 C 1 2 61306 CASAVA_Build 1 222496182 1I ACCTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2218 het 361 hom 11 2 7 2 A 13 14 61307 CASAVA_Build 1 222503476 2I AGTCATTCAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 8 24 8 T 11 13 61308 CASAVA_Build 1 222519063 3D TCTAGAACGT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 TTA 5 4 61309 CASAVA_Build 1 222522651 2I TATTATTATC --/CA CAGTCTAAAT 3070 het 3070 ref 39 17 19 3 CA 1 2 61310 CASAVA_Build 1 222524073 11I TCTTTCTTTC -----------/TTTTTTCTTTT TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 10 10 9 TTTTTTCTTTT 1 2 61311 CASAVA_Build 1 222530067 1I TCTCTAGCTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 A 8 9 61312 CASAVA_Build 1 222537814 4D CATCTCAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 7 AAAG 5 4 61313 CASAVA_Build 1 222540541 1D TATTTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3001 het 2465 hom 35 13 8 14 T 15 14 61314 CASAVA_Build 1 222554160 1D ATTTAAAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 10 9 61315 CASAVA_Build 1 222560325 4D ATATTTGCCT TTTA/---- TTTCTCACTG 3070 het 3070 ref 37 23 10 5 TTTA 1 0 61316 CASAVA_Build 1 222569383 1D ACTCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 16 0 12 4 T 15 14 61317 CASAVA_Build 1 222570900 3D GGGAGGCTGA AGG/--- AGAAGAATCA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 AGG 1 0 61318 CASAVA_Build 1 222572194 2I CTCTAACAAT --/AA AAGACTCACC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 4 61319 CASAVA_Build 1 222572444 1I ATTTTCCCCC -/T TTTTTTAAAC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 6 7 61320 CASAVA_Build 1 222582795 1I CAGTGAGCAG -/A AAAAAAAAAA 2397 het 123 hom 25 1 9 15 A 15 16 61321 CASAVA_Build 1 222583672 3D TATGAGGAAA GAG/--- GAGGAAGGGG 3070 het 3070 hom 44 18 18 11 GAG 2 1 61322 CASAVA_Build 1 222587889 4I CTTTCACACT ----/TTCA TTCTCCTAAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TTCA 0 1 61323 CASAVA_Build 1 222588385 1D CGTTTGTTAC A/- GGGGTTGTTG 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 A 1 0 61324 CASAVA_Build 1 222592459 1D AACCCTGTAA C/- TATTAAGCAG 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 C 1 0 61325 CASAVA_Build 1 222599690 1I GGGAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 T 10 11 61326 CASAVA_Build 1 222601754 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 11 61327 CASAVA_Build 1 222618561 2D AAAATAAAAC AA/-- GAGGAAAAAA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 A 2 0 61328 CASAVA_Build 1 222622985 1I AAGCAGCTGC -/A ACTTTTTTTT 3070 hom 77 het 38 0 30 8 A 1 2 61329 CASAVA_Build 1 222623236 1I TGTGTGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 586 hom 26 3 15 8 T 14 15 61330 CASAVA_Build 1 222635906 3D ATCTCAAAAA AAT/--- AATAAAAATA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AAT 2 1 61331 CASAVA_Build 1 222636867 5I AGATCTCCCT -----/TTTGA TTTGAGATCT 3070 hom 55 het 23 0 19 4 TTTGA 1 2 61332 CASAVA_Build 1 222638145 4D TAGATTGTAT TTTA/---- TTTATTATTA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 TTTA 2 1 61333 CASAVA_Build 1 222642455 1I TCTTCTCCCC -/T TTCCCTGACT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 3 61334 CASAVA_Build 1 222654616 1I AAATTCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 36 3 27 6 T 12 13 61335 CASAVA_Build 1 222664607 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2399 het 120 hom 14 2 7 5 A 19 18 61336 CASAVA_Build 1 222669142 1I CCCCATCTCC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 8 9 61337 CASAVA_Build 1 222674210 5I GTGCAGGTTC -----/TGTTA TAGCACTCAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TGTTA 0 1 61338 CASAVA_Build 1 222677040 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 28 1 21 6 A 12 13 61339 CASAVA_Build 1 222678379 1I CTACCCTTCA -/C CCCCCCAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 6 7 61340 CASAVA_Build 1 222713517 12D CCTTCTACTG CTTAGATCAAGT/------------ CTTCAGCAGA 3070 hom 114 het 37 0 37 7 CTTAGATCAAGT 1 0 61341 CASAVA_Build 1 222722646 4I ACACAGTATT ----/TCTC TCTATTTATT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TC 1 3 61342 CASAVA_Build 1 222727660 1I TTATCAATAA -/T AATAAGTAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 0 1 61343 CASAVA_Build 1 222743120 2I AAATTTTAGA --/TG TGTGTTTTTC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TG 2 3 61344 CASAVA_Build 1 222750803 4I AACTGAAGCC ----/ATCA TCCTGATTTT 3070 hom 93 het 34 0 29 5 ATCA 0 1 61345 CASAVA_Build 1 222755005 1D AAAAGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 27 2 24 1 A 12 11 61346 CASAVA_Build 1 222772827 1I TTTTGAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3004 het 2241 hom 31 12 11 8 T 13 14 61347 CASAVA_Build 1 222810504 1I TTTTCCTATC -/T TTTTTTTTTT 1903 het 1903 ref 61 35 6 20 T 15 16 61348 CASAVA_Build 1 222820357 1D TGGCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 40 1 25 14 T 13 12 61349 CASAVA_Build 1 222822613 12D GACTCTGTCT CAAACAAACAAG/------------ CAAACAAACA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CAAACAAACAAG 1 0 61350 CASAVA_Build 1 222829768 1D TTCTGTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 11 10 61351 CASAVA_Build 1 222835880 3D AGAATACAAT AAG/--- AAGAGCCCAA 3070 het 3070 ref 52 28 20 6 AAG 2 1 61352 CASAVA_Build 1 222839054 7D TTGGTTGTGA AATAATT/------- TGTAATTTGT 3070 het 3070 ref 59 30 27 8 AATAATT 1 0 61353 CASAVA_Build 1 222840024 1I TGCCCAGGCT -/G GGTTTTGAAC 1875 het 1704 hom 12 5 5 2 G 2 3 61354 CASAVA_Build 1 222842270 1I TGTTTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2991 hom 29 7 11 11 A 11 12 61355 CASAVA_Build 1 222856622 4D GAATATTTCA TGTT/---- TGTTTGAAAA 2765 het 2765 ref 26 18 7 2 TGTT 2 1 61356 CASAVA_Build 1 222857500 1D TGTATTTGTC T/- TTGCATTCAG 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 3 2 61357 CASAVA_Build 1 222881691 4D GCTGGGATTA CAGG/---- CACGTGCCAC 3070 het 1179 hom 13 4 9 0 CAGG 1 0 61358 CASAVA_Build 1 222886443 11D GGAGACACAT TGCGAGGGCAC/----------- TGCCCTGCGT 3070 het 3070 ref 40 26 11 5 TGCGAGGGCAC 1 0 61359 CASAVA_Build 1 222900468 14I TAAGACAGCA --------------/AGACGTAAGACAGT GAGGTTTTCA 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 AGACGTAAGACAGT 0 1 61360 CASAVA_Build 1 222905390 4D AGGGACATGG ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 AC 8 6 61361 CASAVA_Build 1 222909515 1I GGCTGTCTTC -/T TGAAGGAGCT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 1 2 61362 CASAVA_Build 1 222913047 1D CTCTCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 1685 het 1685 ref 37 23 4 10 T 11 10 61363 CASAVA_Build 1 222916764 1D TCTTACTTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 9 8 61364 CASAVA_Build 1 222953308 15I GGGGAGCTGA ---------------/GACTCGGAGGGCTAT GAGGTCACTT 3070 het 3070 hom 52 14 33 6 GACTCGGAGGGCTAT 0 1 61365 CASAVA_Build 1 222956417 1D TCCAGCTCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 41 0 34 8 T 10 9 61366 CASAVA_Build 1 222965650 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 12 13 61367 CASAVA_Build 1 222981209 1I TTCTCTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 12 13 61368 CASAVA_Build 1 222989979 1I TTATTTTTTA -/T TTATTTTTTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 2 3 61369 CASAVA_Build 1 223003387 1D AAAGATTAAA T/- TTATTAGTTT 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 T 3 2 61370 CASAVA_Build 1 223016216 1I CTCATCTTAG -/T TATAAATAAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 1 2 61371 CASAVA_Build 1 223017289 4D CCACAGCCTT GTTC/---- CCTGGCAGGG 3070 het 3070 ref 58 28 24 8 GTTC 1 0 61372 CASAVA_Build 1 223030706 3D ATAAGTCTGC CAT/--- CATCCTCCAC 3070 hom 90 het 32 0 31 3 CAT 2 1 61373 CASAVA_Build 1 223031694 1D ATGCTTATGG C/- CGTTTAGTGG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 C 2 1 61374 CASAVA_Build 1 223035681 1D TTTCTTATGA G/- TTTGTTGTAA 3070 hom 157 het 58 0 53 6 G 1 0 61375 CASAVA_Build 1 223045450 2D ACTCCACTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 25 0 18 8 A 16 14 61376 CASAVA_Build 1 223051714 2D CCAAGACTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 8 10 A 12 10 61377 CASAVA_Build 1 223052846 3I TTTATGACTG ---/ATT ATTATTATTA 2735 het 2735 ref 22 10 8 4 ATT 5 6 61378 CASAVA_Build 1 223054813 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1350 hom 21 5 12 4 A 12 11 61379 CASAVA_Build 1 223084001 1I GAGTATGGAA -/G GTAGCAGTCG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 G 1 2 61380 CASAVA_Build 1 223104526 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2589 het 2589 ref 24 11 8 5 A 13 14 61381 CASAVA_Build 1 223132305 2I TTTACATTAA --/AT ATATATATAT 3055 het 184 hom 20 2 8 10 AT 8 9 61382 CASAVA_Build 1 223158794 2D CTCCGTTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 1001 het 308 hom 27 7 5 15 T 16 14 61383 CASAVA_Build 1 223236944 1D CTTAGCTGTA C/- CCCAGAGGTT 3070 hom 48 het 22 0 17 6 C 4 3 61384 CASAVA_Build 1 223260876 4I GGGGTTGAAG ----/ATAA ATAAGGGATG 3070 hom 39 het 17 0 13 4 ATAA 1 2 61385 CASAVA_Build 1 223267482 1I TGCATGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 10 11 61386 CASAVA_Build 1 223268744 1D TCCTCACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 20 7 T 12 11 61387 CASAVA_Build 1 223273573 1D AATGGAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 29 0 24 6 A 10 9 61388 CASAVA_Build 1 223281293 1D GAATCATGCA T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 78 het 32 0 27 7 T 8 7 61389 CASAVA_Build 1 223282193 1I TGTCAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1364 hom 47 4 35 8 T 10 11 61390 CASAVA_Build 1 223285832 1D ACAGAAAAGG T/- TTTGCTGACC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 4 3 61391 CASAVA_Build 1 223286015 1I AAAACTTTAG -/A CTTCTTCAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 61392 CASAVA_Build 1 223287272 6D TTGTAAATTT GTTTAA/------ GTTCCTTATA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 GTTTAA 1 0 61393 CASAVA_Build 1 223289378 1I CTTTAAAATG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 9 61394 CASAVA_Build 1 223289624 4D TGGGTGTTTG CTCT/---- CTCTGTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 5 CT 4 2 61395 CASAVA_Build 1 223292009 4D TAATATTCTG TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 TGTT 3 2 61396 CASAVA_Build 1 223293740 1D GAATTGCCCC T/- AATATCTTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 0 61397 CASAVA_Build 1 223296064 2D TTAATGCAAA AT/-- ATTTAAATGC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AT 2 1 61398 CASAVA_Build 1 223299291 7D AGCTTTTAAT AATGTAA/------- ATAAGAAGTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AATGTAA 1 0 61399 CASAVA_Build 1 223316392 12D GGGAGGCCGA GGCGGATGGAAT/------------ GCTTGAGCTG 3070 hom 126 het 44 0 40 4 GGCGGATGGAAT 1 0 61400 CASAVA_Build 1 223316470 1I CAAAAAATGC -/A AAAAAAATTA 3070 het 468 hom 15 1 12 8 A 7 8 61401 CASAVA_Build 1 223316876 1D AGCTATGAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 8 61402 CASAVA_Build 1 223317452 1I AAAGATATTT -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 7 8 61403 CASAVA_Build 1 223318227 1D CCTCCTCCCC A/- AAAAAAGATA 3070 hom 92 het 36 0 31 5 A 7 6 61404 CASAVA_Build 1 223318909 1I ATGCAGCATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 8 9 61405 CASAVA_Build 1 223322733 1I TTCTCTTTGA -/G TTGGATTGTC 3070 hom 72 het 25 0 24 1 G 0 1 61406 CASAVA_Build 1 223330315 15I2M9I CTGGCTGGTC ---------------CA---------/TGCAGCCTGGGTCAACAGATGGGAAG GCCTAGGGCC 3070 hom 63 het 24 0 21 4 N/A 0 0 61407 CASAVA_Build 1 223331823 1D TATTTCAAAA T/- TTTTTGGGCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 5 61408 CASAVA_Build 1 223337643 2I TGTAATCAAA --/AC ACATATTTTA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AC 1 2 61409 CASAVA_Build 1 223340634 1I ATTGTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 7 8 61410 CASAVA_Build 1 223352598 1D GGCAGTTGTT A/- AAAAATTCTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 5 61411 CASAVA_Build 1 223379124 1D TTCCAGAAGG T/- TTTCTATTTA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 4 3 61412 CASAVA_Build 1 223385154 1D ATAATAATAA T/- AATAAAATAA 907 hom 13 het 12 0 5 7 T 1 0 61413 CASAVA_Build 1 223405662 1I AGTTGGGGGT -/G GGGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 G 7 8 61414 CASAVA_Build 1 223451189 1D GGATTGGTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 7 61415 CASAVA_Build 1 223537767 1D GACCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 12 11 61416 CASAVA_Build 1 223549162 1I AAAAAAAAAA -/T AGTTGGTAGA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 0 1 61417 CASAVA_Build 1 223551666 1D TTCTTTTACA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 45 25 18 3 T 8 7 61418 CASAVA_Build 1 223577344 1D AATTTCATTC T/- GATTATGGCT 3070 het 3070 hom 45 22 20 4 T 1 0 61419 CASAVA_Build 1 223577775 3D ATACTAGGTT TTG/--- TTGTTGTTTT 2474 het 2474 ref 37 18 11 8 TTG 3 2 61420 CASAVA_Build 1 223581486 1D AATTAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 28 0 16 12 T 15 14 61421 CASAVA_Build 1 223582970 1I AACTTTGGGG -/A AAAAAACAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 6 7 61422 CASAVA_Build 1 223586295 1I AAATTCTCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 62 het 29 0 21 8 T 9 10 61423 CASAVA_Build 1 223588828 1D TCTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 20 19 7 A 10 9 61424 CASAVA_Build 1 223590374 6D7M14D ATATATGCAT ATATACATATATGTATACATACATACT/------ATATATG-------------- TATATATACA 809 het 809 ref 13 11 5 7 N/A 0 0 61425 CASAVA_Build 1 223591923 1I ACTGTCAGGG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 6 7 61426 CASAVA_Build 1 223592322 1I TTATTGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 10 11 61427 CASAVA_Build 1 223593585 3D GCAGTGAGCT GAG/--- ATCGCACCAT 3070 het 1576 hom 14 4 10 0 GAG 1 0 61428 CASAVA_Build 1 223594383 1I GCTATTGAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 9 10 61429 CASAVA_Build 1 223598114 1I TCTGTATCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 8 9 61430 CASAVA_Build 1 223598549 2D AAAACTGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 635 hom 22 4 13 5 T 14 12 61431 CASAVA_Build 1 223611925 11I ATTTTTAAAA -----------/ATATGTGATAT ATATAATTAA 3037 het 3037 ref 15 8 7 1 ATATGTGATAT 0 1 61432 CASAVA_Build 1 223613773 1I CTCCAAATGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 8 9 61433 CASAVA_Build 1 223618930 2I AAAGCTACTC --/TT TTAAAATGTA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 2 4 61434 CASAVA_Build 1 223621136 1I CTCCTCTTTT -/C CCCCGAGAAG 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 C 4 5 61435 CASAVA_Build 1 223623805 4D ATATTGTAGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 63 hom 31 2 15 16 AT 9 7 61436 CASAVA_Build 1 223630076 1I CTATGAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3024 hom 23 9 10 4 T 12 13 61437 CASAVA_Build 1 223631296 1I CTTTAAAGCG -/T TTTTTTTTTT 1874 het 1874 ref 30 14 7 9 T 10 11 61438 CASAVA_Build 1 223649910 1D GAGTGAGACT C/- CCGTCTCAAA 1728 het 634 hom 17 3 8 6 C 3 2 61439 CASAVA_Build 1 223663487 2I TTTAAAGTCA --/AT ATTTGAAGTG 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 AT 1 2 61440 CASAVA_Build 1 223694431 2I CTTCAGAGTC --/TT TTCTCTTCCA 3070 hom 124 het 47 0 41 6 T 2 4 61441 CASAVA_Build 1 223699681 2I AGAGTTAGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 12 14 61442 CASAVA_Build 1 223728844 1D CTAAAGAGGC T/- TGTGAGCACC 3070 hom 66 het 29 0 21 8 T 2 1 61443 CASAVA_Build 1 223731502 4D AAAAAGAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 AG 6 4 61444 CASAVA_Build 1 223732058 1D TATCTGGGAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 100 het 40 0 32 9 A 9 8 61445 CASAVA_Build 1 223739632 4D GTGTTACTCC TCAG/---- TCAGAGGCCT 3070 het 3070 ref 45 20 22 4 TCAG 2 1 61446 CASAVA_Build 1 223745803 1I TTTAATCTTT -/A AAAAAAAAAA 2135 het 2135 ref 21 10 8 3 A 11 12 61447 CASAVA_Build 1 223747179 4I TATGACAGTC ----/ATTT ATTTATCCTT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 ATTT 1 2 61448 CASAVA_Build 1 223747240 2I AGACAAATTT --/AC AGTTAATTCT 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 AC 0 1 61449 CASAVA_Build 1 223751054 4D ATATTTCTCA TTAT/---- TTATTCATGC 3070 het 3070 ref 38 19 13 10 TTAT 2 1 61450 CASAVA_Build 1 223752245 3D TCACAGTAAT AAG/--- AAGATTAACT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AAG 2 1 61451 CASAVA_Build 1 223755198 1I TTAATTTGTA -/T TAACAATAGC 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 1 2 61452 CASAVA_Build 1 223758499 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1121 hom 20 5 13 2 T 9 10 61453 CASAVA_Build 1 223759955 9I AAGACATACT ---------/TAAAGCAGC TAATACACTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TAAAGCAGC 0 1 61454 CASAVA_Build 1 223764020 1I CTTGCAGGAT -/A AAAGTCTAAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 3 4 61455 CASAVA_Build 1 223777234 2I TTTGAGCATT --/TC TGTTACTTCT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 TC 0 1 61456 CASAVA_Build 1 223778989 11D TATACACTCT CATTGTTCCAA/----------- CATTGTTCCA 3070 hom 96 het 45 0 32 16 CATTGTTCCAA 2 1 61457 CASAVA_Build 1 223790170 2D TTATACGGTC AA/-- AGAGTGCAAC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 3 1 61458 CASAVA_Build 1 223790717 1I CAAAAGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 11 12 61459 CASAVA_Build 1 223790926 1D CCTAAGACTG T/- TATTATTTAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 4 T 2 1 61460 CASAVA_Build 1 223792935 1I TATGATTGGG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 7 8 61461 CASAVA_Build 1 223795621 1D TAGCCAGGCG T/- TGGTGGCATG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 2 1 61462 CASAVA_Build 1 223802491 1D GAAAGCCTAC T/- TTTTTTTTTT 2303 het 2303 ref 24 8 8 10 T 11 10 61463 CASAVA_Build 1 223803980 4D GATGATTGGT TATG/---- TATACGCCAG 3070 het 3070 hom 50 25 25 3 TATG 1 0 61464 CASAVA_Build 1 223805273 2I AGAAAATAAA --/AC AGTTGGGCAA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 AC 0 1 61465 CASAVA_Build 1 223809907 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3040 het 1894 hom 18 7 10 1 A 13 14 61466 CASAVA_Build 1 223819768 1D CTCAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 114 hom 37 2 30 6 A 12 11 61467 CASAVA_Build 1 223825080 1D GTGAGGAGTT G/- GGAGACCAGC 2471 het 775 hom 10 2 6 3 G 3 2 61468 CASAVA_Build 1 223830439 1D TACAGAAATG A/- AAAAACTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 6 5 61469 CASAVA_Build 1 223830984 5I GAATTAACAC -----/ATATG ATATAACAGA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 ATATG 0 1 61470 CASAVA_Build 1 223833057 14I CTGTCTATAA --------------/ATATTTCAGAGCCC ATATTTCAGA 3070 het 3070 hom 44 15 23 8 ATATTTCAGAGCCC 0 1 61471 CASAVA_Build 1 223836181 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1552 het 820 hom 16 5 6 5 T 17 16 61472 CASAVA_Build 1 223844346 2D GAGAAACAAC AT/-- ATAAATGATA 3070 het 3070 hom 27 11 16 0 AT 2 1 61473 CASAVA_Build 1 223847157 3I GCAAATACAT ---/ACA ACATTTGCCA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 ACA 1 2 61474 CASAVA_Build 1 223852262 1D TCCACTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 13 12 61475 CASAVA_Build 1 223852866 1D CATTACTGAG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 8 7 61476 CASAVA_Build 1 223853177 1I TGATTCAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 11 13 9 A 12 13 61477 CASAVA_Build 1 223856104 1I TTTGGAAACT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 A 8 9 61478 CASAVA_Build 1 223864486 1D TATGTTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 A 12 11 61479 CASAVA_Build 1 223867991 4D ACAACAAAAA TAAC/---- TAATTATAAA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TAAC 1 0 61480 CASAVA_Build 1 223868387 1I ATTAGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 1347 het 901 hom 18 3 5 10 T 15 16 61481 CASAVA_Build 1 223871899 1D GTACAGTGCT A/- AGTGGACAGT 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 A 2 1 61482 CASAVA_Build 1 223877061 1I ACCTTGGGGG -/T TAGGTTTCAA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 1 2 61483 CASAVA_Build 1 223878962 4D ATCAATCAAC AAAT/---- AAATAAATAA 2802 het 724 hom 15 3 7 5 AAAT 6 5 61484 CASAVA_Build 1 223882226 33D TTTGTCCCCT ACCAACTTATAAACATACACTGTTTTGTCCCCC/--------------------------------- ACCAACTTAT 1902 het 1902 ref 26 20 5 9 ACCAACTTATAAACATACACTGTTTTGTCCCCC 1 0 61485 CASAVA_Build 1 223884563 1I CAGAAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 19 27 6 T 10 11 61486 CASAVA_Build 1 223887686 2D ACTGTCACTC AA/-- AGTCTTTAAC 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 3 1 61487 CASAVA_Build 1 223900550 2D CCCTAAAATT TA/-- TATGTTAATA 1799 het 1799 ref 35 20 6 10 TA 2 1 61488 CASAVA_Build 1 223903723 1D TCTTTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2122 hom 31 6 13 13 A 15 14 61489 CASAVA_Build 1 223928530 1D ATTAATTTAC T/- TTTTTTTTTT 1653 het 1653 ref 32 18 6 9 T 13 12 61490 CASAVA_Build 1 223953082 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1211 het 1211 ref 43 9 8 26 T 17 18 61491 CASAVA_Build 1 224013291 1I ACAGAAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 8 9 61492 CASAVA_Build 1 224020387 1D TCCTGGGCTT A/- AACGATCCTC 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 A 3 2 61493 CASAVA_Build 1 224027582 2I ATTTGCCAAC --/TT AGTAATAATA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 T 0 2 61494 CASAVA_Build 1 224035591 10D TGTCCTTGTG TTTTGGTTAT/---------- TTTTGGTAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 TTTTGGTTAT 1 0 61495 CASAVA_Build 1 224037417 2I CCAACTTTTT --/AA AAGTCTTAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 4 61496 CASAVA_Build 1 224045017 1I TTGGCTTTTT -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 1 2 61497 CASAVA_Build 1 224047406 4D CATTTACTGT ATGA/---- ATGGATGGAG 3070 hom 63 het 22 0 22 1 ATGA 1 0 61498 CASAVA_Build 1 224049726 1D AATCATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 903 hom 32 3 27 2 T 13 12 61499 CASAVA_Build 1 224052825 1I CTGTTGTGGC -/A GGGGGACAAT 3070 hom 60 het 25 0 18 7 A 0 1 61500 CASAVA_Build 1 224054915 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 22 1 20 1 A 11 12 61501 CASAVA_Build 1 224056265 1D AAACAACACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 9 8 61502 CASAVA_Build 1 224063592 1D GGGGCTGGGG A/- TCAACGCTCT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 1 0 61503 CASAVA_Build 1 224065091 1I CGGGCAGAGT -/G GGGGGGGGTC 2190 hom 15 het 8 0 6 2 G 8 9 61504 CASAVA_Build 1 224074106 1I GGCCCCAGGT -/G GCTCTGCTCT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 G 1 2 61505 CASAVA_Build 1 224080890 3D CCCTGGCACA TGG/--- TAGACTGAGT 3070 hom 108 het 40 0 33 7 TGG 1 0 61506 CASAVA_Build 1 224082243 2I CCATTACCCC --/CT GTCTGCCCTG 3070 hom 86 het 35 0 27 8 CT 0 1 61507 CASAVA_Build 1 224085452 2I CTATGAAGAC --/AG AGTGGAGTCA 2114 hom 20 het 10 0 6 4 AG 1 2 61508 CASAVA_Build 1 224097537 2I GAAGGAGGAT --/TC TCTTTGTCTA 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 TC 1 2 61509 CASAVA_Build 1 224108466 10D GGTGATATTC GTGCAGAAAT/---------- GTGAAGAGGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 10 GTGCAGAAAT 1 0 61510 CASAVA_Build 1 224111113 1I GCTCTATGTG -/C CCCCAGTGAG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 4 5 61511 CASAVA_Build 1 224115368 1D TCAGGTTACC A/- AGCACACATG 3070 het 3070 hom 61 24 25 13 A 2 1 61512 CASAVA_Build 1 224116118 2D GGGTCTTCCC CA/-- CAGCTTTGCA 2544 het 1753 hom 30 8 9 14 CA 2 1 61513 CASAVA_Build 1 224134314 3I AGTGCTGCAG ---/AGA AGGAGAGAGG 3070 het 3070 hom 46 17 27 2 AGA 0 1 61514 CASAVA_Build 1 224135459 1D CTGTTTACCT C/- CTACCCTGGA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 C 2 1 61515 CASAVA_Build 1 224145807 3I GTTGCAATGT ---/GAA GGTTTTGGGC 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 GAA 0 1 61516 CASAVA_Build 1 224147189 10I TGAAACTGAA ----------/TTTTTTTGGT TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 TTTTTTTGGT 1 2 61517 CASAVA_Build 1 224148438 4D GTTTATGCTG TTTT/---- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 10 11 10 T 12 8 61518 CASAVA_Build 1 224166395 3I GGGGAGAGAA ---/GAG GAGGCAGCCC 3070 hom 105 het 37 0 33 4 GAG 1 2 61519 CASAVA_Build 1 224182224 1I GTAAGAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 8 9 61520 CASAVA_Build 1 224186304 1D ATCTCCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 30 1 20 9 T 16 15 61521 CASAVA_Build 1 224192167 1I GTCATCTGGG -/A AGGCTGAAGT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 1 2 61522 CASAVA_Build 1 224200095 1D AAGAGTTTTG T/- TTGGGGAAAT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 3 2 61523 CASAVA_Build 1 224202890 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2195 het 1125 hom 26 9 8 10 A 17 16 61524 CASAVA_Build 1 224220907 1I GACATAGATT -/C CTATTGCTCA 3070 het 178 hom 10 1 8 1 C 1 2 61525 CASAVA_Build 1 224228339 1D TGTTTTTGCA C/- TTAATGATTT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 C 1 0 61526 CASAVA_Build 1 224231927 2D AGTGAAAGGT GA/-- GAGAGTCTTC 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 GA 3 2 61527 CASAVA_Build 1 224234622 2D AGACTTTCTC GG/-- GGGGGGGTAC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 G 9 7 61528 CASAVA_Build 1 224245236 3I AAACCACAGA ---/AAG CAACCACCTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAG 0 1 61529 CASAVA_Build 1 224247437 3D TCTACTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1040 hom 40 7 22 11 TTC 1 0 61530 CASAVA_Build 1 224248406 1D TGCTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 1255 het 1050 hom 23 7 4 12 T 15 14 61531 CASAVA_Build 1 224256361 1D CACATCAGTG A/- AAAAAAAAAA 1194 het 1194 ref 44 33 3 9 A 12 11 61532 CASAVA_Build 1 224287483 1I TAAATTGTGG -/T AAAATACATG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 0 1 61533 CASAVA_Build 1 224306834 1I TATCACTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 24 7 A 11 12 61534 CASAVA_Build 1 224307711 1D AAGCAAGAAA G/- GAGCTGATCA 3070 hom 87 het 33 0 29 5 G 2 1 61535 CASAVA_Build 1 224325109 2D AAAGAAAGAA AG/-- AAATACGGAA 3070 hom 81 het 32 0 28 8 AG 1 0 61536 CASAVA_Build 1 224325836 1D TTTCATTCTC A/- AAAAAAAAAA 2864 het 427 hom 25 7 9 9 A 17 16 61537 CASAVA_Build 1 224332147 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 21 1 19 1 G 0 1 61538 CASAVA_Build 1 224334247 3I TACTGAGGAC ---/ACA ACATCACCCA 3070 hom 113 het 46 0 37 9 ACA 1 2 61539 CASAVA_Build 1 224355214 1I GTGGCAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 32 0 23 9 A 12 13 61540 CASAVA_Build 1 224361244 1D ACTCCGCTGC A/- AAAAAAAAAA 2676 hom 18 het 11 0 7 4 A 15 14 61541 CASAVA_Build 1 224374376 1I CAACCTCTGC -/T TCACTGGTTC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 1 2 61542 CASAVA_Build 1 224381934 1I CAAATCCTGC -/A AAAAAAAAAA 2646 het 456 hom 40 4 18 18 A 14 15 61543 CASAVA_Build 1 224381961 2D AAAAAAGAAA AC/-- ACACACACAC 2288 het 908 hom 36 7 13 16 AC 8 7 61544 CASAVA_Build 1 224395811 4I TTTATTTATA ----/AAAT AAATAAAAAT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 AAAT 1 2 61545 CASAVA_Build 1 224398004 4I AACTTTTATT ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTTA 1 2 61546 CASAVA_Build 1 224409742 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2919 het 773 hom 19 3 7 9 A 17 16 61547 CASAVA_Build 1 224414646 4D ACCCCTGACC TCAA/---- TCAAGTGATC 3070 hom 24 het 9 0 8 5 TCAA 2 1 61548 CASAVA_Build 1 224423142 3I CTTACACTAC ---/TAT GTCACAGGTA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TAT 0 1 61549 CASAVA_Build 1 224424041 1D TTTTTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 12 11 61550 CASAVA_Build 1 224425476 1I AAGTAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 17 1 10 6 T 12 13 61551 CASAVA_Build 1 224435784 5D TATAATACTC TACTA/----- TCAGTAACAC 3070 het 3070 ref 36 21 14 3 TACTA 1 0 61552 CASAVA_Build 1 224436552 1D CAGACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1785 het 1785 ref 25 15 5 5 A 13 12 61553 CASAVA_Build 1 224439279 1D ACTCCAGCTC A/- AAAAAAAAAA 850 het 850 ref 30 18 3 9 A 17 16 61554 CASAVA_Build 1 224447216 1I TTTATTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 11 12 61555 CASAVA_Build 1 224454320 3D TAATTTTTTC TTT/--- TTTTCTTTTT 3070 hom 125 het 45 0 39 8 T 7 4 61556 CASAVA_Build 1 224454411 5D TTTTATTTCC TCTTT/----- TCTTTTCTTT 3070 hom 62 het 37 1 31 6 TCTTT 3 2 61557 CASAVA_Build 1 224466075 1I CATCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 1128 het 1128 ref 31 20 3 8 A 13 14 61558 CASAVA_Build 1 224497233 3I ATGATTTTCT ---/TAA TAACATTTCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TAA 1 2 61559 CASAVA_Build 1 224499753 1D TGTCTTTTTT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 10 9 61560 CASAVA_Build 1 224500000 4D TCACTGCAAC CTCT/---- CTCTGCTTCC 3070 hom 66 het 23 0 20 3 CT 4 2 61561 CASAVA_Build 1 224514270 4I GAAAACAGAA ----/AATT AATAGAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AATT 0 1 61562 CASAVA_Build 1 224526346 1I TGAGTCTTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 25 0 17 8 T 8 9 61563 CASAVA_Build 1 224543071 3I TGGAAAAAAA ---/TGT TTAAGTCTAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TGT 0 1 61564 CASAVA_Build 1 224551951 1I AACTTGTAAA -/T TTTTTTACTG 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 6 7 61565 CASAVA_Build 1 224562683 5I CAGGCAGGGT -----/ACTGC ACACGTACGC 3070 hom 102 het 39 0 33 6 ACTGC 0 1 61566 CASAVA_Build 1 224571204 4I ACAAACAAAC ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 AAAT 3 4 61567 CASAVA_Build 1 224592739 1I CCAGTAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 28 0 17 12 T 13 14 61568 CASAVA_Build 1 224598411 3I TGTAATGACA ---/TCC TCCTGCACAG 3070 hom 89 het 32 0 29 4 TCC 1 2 61569 CASAVA_Build 1 224599979 1D CTACAAATAC A/- AAAAACTAGC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 6 5 61570 CASAVA_Build 1 224600583 5I AAAAATAAAT -----/AAATA AAATAAAATA 2491 hom 18 het 12 0 7 5 AAATA 3 4 61571 CASAVA_Build 1 224603856 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 11 12 61572 CASAVA_Build 1 224606814 6D TAAAATCAAA GTTGTG/------ GCCAGGCACA 3070 hom 84 het 30 0 28 6 GTTGTG 1 0 61573 CASAVA_Build 1 224609494 5D CTGGTGCAGC GATGT/----- GATGTGATCA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 GATGT 2 1 61574 CASAVA_Build 1 224617177 2D AGCTTGCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 36 0 23 13 T 16 14 61575 CASAVA_Build 1 224624293 1I AAAGAAAAAG -/A AAAGAAAAAT 2534 het 106 hom 17 2 12 3 A 3 4 61576 CASAVA_Build 1 224626196 1D CGCACAGACT A/- AAAATAAGAG 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 5 4 61577 CASAVA_Build 1 224649448 1I GCTATTATTT -/A AAAAAAAAAA 1130 het 1130 ref 37 29 3 5 A 13 14 61578 CASAVA_Build 1 224652446 3I ACTTTTTACA ---/AAC AACACCAAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAC 1 2 61579 CASAVA_Build 1 224658499 2I TCTAGCAACA --/TC TGTCACAGAG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TC 0 1 61580 CASAVA_Build 1 224685781 1D GCGCCCGGCC A/- AAAAAATATT 3070 hom 41 het 19 0 14 5 A 7 6 61581 CASAVA_Build 1 224702649 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 106 hom 31 1 25 5 A 9 10 61582 CASAVA_Build 1 224711969 1D GCTCTTTTTT C/- CCTCCGTCTA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 C 3 2 61583 CASAVA_Build 1 224732611 1I TGACACCAGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 10 14 9 T 8 9 61584 CASAVA_Build 1 224736212 1D GAAATCTCTA T/- AATTGCCTCC 3070 hom 119 het 49 0 40 10 T 1 0 61585 CASAVA_Build 1 224741349 5D TTCTATTTTC TCTAT/----- TCTATTCTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 6 TCTAT 3 2 61586 CASAVA_Build 1 224767696 1I ATACCAACAT -/G GCATTAAAAA 3070 hom 18 het 15 0 10 6 G 1 2 61587 CASAVA_Build 1 224782560 5D CCAAGGGATG GGGTC/----- GGGGAGTGTC 3070 het 3070 ref 43 23 11 10 GGGTC 1 0 61588 CASAVA_Build 1 224786684 22D AGCTATGTGC CACCAAGGACTCCTAGACTGTG/---------------------- CACTACTGAA 2782 het 2782 ref 32 17 8 8 CACCAAGGACTCCTAGACTGTG 1 0 61589 CASAVA_Build 1 224790331 2I TTCTCTAAAA --/AG CTTTGCTGGA 3070 het 3070 hom 52 22 20 10 AG 0 1 61590 CASAVA_Build 1 224790639 4D11M4I TGGTTATATT CTAACTGCTTTGTTT----/----TTGTTTTGCTTGTCC TTGCATGTCT 2530 het 2530 ref 57 43 8 12 N/A 0 0 61591 CASAVA_Build 1 224834453 1I ATTCAGAAGT -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 6 7 61592 CASAVA_Build 1 224836920 1D ATGCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1348 hom 29 7 12 10 A 15 14 61593 CASAVA_Build 1 224840322 2D GGAGAGAGAG AA/-- AAAGAGCTTG 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 A 5 3 61594 CASAVA_Build 1 224844270 1D GGAATGTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 10 9 61595 CASAVA_Build 1 224844412 1D TGGATCCCTT C/- CCCCCACCAT 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 C 6 5 61596 CASAVA_Build 1 224850588 6I CTGCACAGTG ------/TACTAC TACTACTACT 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 TAC 4 6 61597 CASAVA_Build 1 224854467 1D GCTGAGGATG A/- AAAAAAAAAG 982 het 982 ref 41 30 4 8 A 10 9 61598 CASAVA_Build 1 224860523 3I CGAGGTTCTT ---/GAG GAGGAGGGGA 3070 het 3024 hom 28 11 15 2 GAG 2 3 61599 CASAVA_Build 1 224865036 2I GGGGGGTGAC --/AG AACTTTGACA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 AG 0 1 61600 CASAVA_Build 1 224877195 19I AAGTGCTGGG -------------------/ATTACAGGCGTGAGCCACC ATGCCCAGCC 1834 hom 24 het 9 0 9 0 ATTACAGGCGTGAGCCACC 0 1 61601 CASAVA_Build 1 224877918 1I ACTCTATTAA -/T TTTTTTCATA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 6 7 61602 CASAVA_Build 1 224902787 1I TTTGGAGGAT -/G GGGGTAACAC 3070 hom 123 het 45 0 40 5 G 4 5 61603 CASAVA_Build 1 224944856 3D CTCACTCCTC CTA/--- CGTCAAGCAC 3070 het 3070 hom 37 13 18 8 CTA 1 0 61604 CASAVA_Build 1 224959667 1D CAGCCTGACC A/- ACATGGAGAA 3070 het 2962 hom 21 10 9 2 A 2 1 61605 CASAVA_Build 1 224977191 1D GGCTAGAAAA G/- GTTTGAATAG 2376 het 2376 ref 30 15 8 7 G 2 1 61606 CASAVA_Build 1 224979380 3D TCCCTGTTCC ACA/--- ACATGTACTG 3070 het 3070 hom 53 19 25 12 ACA 2 1 61607 CASAVA_Build 1 224989770 1D GTGTAGAAAG T/- TAAGAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 T 2 1 61608 CASAVA_Build 1 225022642 4D CCTGGGCGAC AGAG/---- AGAGACTCTG 3070 het 2166 hom 15 5 10 2 AG 4 2 61609 CASAVA_Build 1 225024602 1D GCAAGGAGAC A/- AACAGTTTCA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 A 3 2 61610 CASAVA_Build 1 225025892 4I TATCTTCTTT ----/AAAA AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 7 11 61611 CASAVA_Build 1 225030253 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 311 hom 28 1 24 3 A 13 12 61612 CASAVA_Build 1 225037725 2D TGTGAGACAT CA/-- GATTCCTGAG 3070 het 3070 hom 48 14 25 11 CA 1 0 61613 CASAVA_Build 1 225058520 2D AAAAATAAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TA 9 8 61614 CASAVA_Build 1 225069222 1D TCTATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 9 61615 CASAVA_Build 1 225082306 1D AGGCCTTCTT C/- CCCCCCTCCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 7 6 61616 CASAVA_Build 1 225093782 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAACCC 3070 het 262 hom 34 1 29 5 A 8 7 61617 CASAVA_Build 1 225094121 2D CTGCCTGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 22 1 16 5 T 16 14 61618 CASAVA_Build 1 225100759 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2061 het 144 hom 20 2 10 8 A 15 16 61619 CASAVA_Build 1 225102803 1D AATGGCCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 29 1 16 12 A 14 13 61620 CASAVA_Build 1 225105005 2I TGTGTCCTTT --/AA AAAAAAATAG 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 7 9 61621 CASAVA_Build 1 225105640 3D ACCCCTTGGG GCT/--- GCTAAGTCTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GCT 2 1 61622 CASAVA_Build 1 225112612 1I AATAATGTTT -/A TAAAGACTAC 3070 het 15 hom 31 1 28 2 A 0 1 61623 CASAVA_Build 1 225120483 1D TGATTCAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 27 1 21 5 T 12 11 61624 CASAVA_Build 1 225124090 1D AAAACATGCT A/- AGTGAAAGAC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 2 1 61625 CASAVA_Build 1 225163203 1D CCATCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 11 10 61626 CASAVA_Build 1 225170634 1I AGCCTCATGA -/T TTTTTTTTTC 1084 het 1084 ref 53 39 4 10 T 9 10 61627 CASAVA_Build 1 225189387 1D AATGCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 15 11 A 13 12 61628 CASAVA_Build 1 225205083 1I AGTTGCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 918 hom 32 2 23 7 T 10 11 61629 CASAVA_Build 1 225218966 1D TTTCCCTGTC T/- TTTGCGCCCT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 4 3 61630 CASAVA_Build 1 225227128 3I TTTAAAACAA ---/AGC AGCACCACTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AGC 1 2 61631 CASAVA_Build 1 225238208 1D CCCTTGCGTG T/- TTGCACCAGG 2373 hom 28 het 11 0 8 3 T 3 2 61632 CASAVA_Build 1 225238360 1I GGTGTGTGTG -/T GGGGGGGGGA 1722 het 1201 hom 20 5 8 7 T 0 1 61633 CASAVA_Build 1 225241447 1I GATTGTGGGA -/T TTTTATCATC 3070 hom 105 het 37 0 34 3 T 4 5 61634 CASAVA_Build 1 225241869 1I TGGGAAGTGC -/T TTTGGCGCGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 3 4 61635 CASAVA_Build 1 225242113 1D ACTGCCCCAG C/- CCCCGGGAGG 3070 hom 128 het 50 0 41 9 C 5 4 61636 CASAVA_Build 1 225242591 3D CTTGTGGCCC TCT/--- TCTTAAGGGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TCT 2 1 61637 CASAVA_Build 1 225242788 3D AGGAGAACAA CAG/--- CAGCCAGCAT 3070 hom 73 het 28 0 22 10 CAG 2 1 61638 CASAVA_Build 1 225244507 3I GTACAATATT ---/ACA ACGAGAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 ACA 0 1 61639 CASAVA_Build 1 225246125 10D CCTTTGCAAA ATAAGCACCT/---------- ATAAGCAACA 3070 hom 87 het 30 0 30 4 ATAAGCACCT 1 0 61640 CASAVA_Build 1 225249827 2I GTACCATCCC --/CA GAGAGAGGCC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CA 0 1 61641 CASAVA_Build 1 225250801 30D TGTCTGGTTG CCCTGGCCAGAACTTCCAATACTATGTTGA/------------------------------ ATAGGAGTGG 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 CCCTGGCCAGAACTTCCAATACTATGTTGA 1 0 61642 CASAVA_Build 1 225253504 1I ATAGGAACAC -/T TTTTTTTTTT 1481 het 682 hom 9 2 6 1 T 15 16 61643 CASAVA_Build 1 225256645 3I TAATAAAAAG ---/ATA ATTAATAAAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ATA 0 1 61644 CASAVA_Build 1 225263192 1D AAGCAAATGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 T 9 8 61645 CASAVA_Build 1 225265058 3D GGAAGAGGAA GAG/--- GAGAAGTTTG 3070 hom 129 het 45 0 43 3 GAG 2 1 61646 CASAVA_Build 1 225266792 1I CTTAGCCTCA -/C CTTCTCCTTC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 1 2 61647 CASAVA_Build 1 225268895 1I TTAAAAGGCG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 8 9 61648 CASAVA_Build 1 225269747 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 7 8 61649 CASAVA_Build 1 225270013 2I TGGGAAGAAG --/AA GAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 0 2 61650 CASAVA_Build 1 225271782 1D AACAGTAATC A/- GGCATAAATG 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 A 1 0 61651 CASAVA_Build 1 225274009 3I ACGTGAAAAT ---/AAC ATCATCAATC 3070 hom 102 het 41 0 33 8 AAC 0 1 61652 CASAVA_Build 1 225276750 1D GAGTGAGACT C/- CCGTCTCAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 C 3 2 61653 CASAVA_Build 1 225284693 2I TTTTTAACAC --/AT GATTTAAAAT 3070 hom 92 het 37 0 31 6 AT 0 1 61654 CASAVA_Build 1 225289139 4I TTTTAGACAG ----/ACAA ACAAACAGCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ACAA 1 2 61655 CASAVA_Build 1 225294037 1D ATGTTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 2383 het 2383 ref 36 24 5 7 A 11 10 61656 CASAVA_Build 1 225294197 4I TTCTTCTGTC ----/AGAT AGGTTAATGT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AGAT 0 1 61657 CASAVA_Build 1 225297736 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2799 het 60 hom 20 1 9 10 A 19 18 61658 CASAVA_Build 1 225300545 2I TGTGTCCACA --/TG TGAGAGCAAA 3070 het 2972 hom 28 9 11 8 TG 1 2 61659 CASAVA_Build 1 225303594 2I TACAAGATCT --/AC AGAGTTTATA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 AC 0 1 61660 CASAVA_Build 1 225304276 3I CTCTGCATAG ---/AGA AGAACTGTTT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 AGA 1 2 61661 CASAVA_Build 1 225308464 4D TGCAAAAGGC TTTA/---- TTTAGCCCCA 3070 het 3070 ref 45 23 21 4 TTTA 2 1 61662 CASAVA_Build 1 225311690 4I CATTTCATAG ----/TTAT TTAATTTTAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 TTAT 0 1 61663 CASAVA_Build 1 225311840 11D CCCAGGGAAC ACTGAGGTTCT/----------- ACACTATACC 3070 het 3070 ref 43 23 19 2 ACTGAGGTTCT 1 0 61664 CASAVA_Build 1 225313200 2D GAACTACATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 32 6 14 14 A 13 11 61665 CASAVA_Build 1 225320713 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 11 10 61666 CASAVA_Build 1 225324723 1D ATGAATTTTT A/- AAAATTCATA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 5 4 61667 CASAVA_Build 1 225326039 4D GTGAATCCCA CCCC/---- CCCCCCCCCA 3070 het 52 hom 17 1 9 7 C 13 9 61668 CASAVA_Build 1 225334185 1I GGATTTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 T 10 11 61669 CASAVA_Build 1 225334266 2I64M1D ACACAAAATT --TGTGTTTTATATACATCTTATAAACATAGCCTGAAGGTTAACTTTTTACAATGTTTTATAATAAT/TGTGTGTTTTATATACATCTTATAAACATAGCCTGAAGGTTAACTTTTTACAATGTTTTATAATAA- TTCTTGTGTA 3070 het 3070 ref 29 24 19 6 N/A 0 0 61670 CASAVA_Build 1 225335606 1D TGGTAATAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 T 10 9 61671 CASAVA_Build 1 225335781 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 8 9 T 13 11 61672 CASAVA_Build 1 225336590 1D AGCTGGTCTC A/- AGATTCCTGG 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 2 1 61673 CASAVA_Build 1 225337483 2I CATCTCTCTC --/TT CTTGCCTTTT 2851 het 2851 ref 19 8 7 4 T 0 2 61674 CASAVA_Build 1 225337600 1D ACTTTAGTCT A/- AAAAATTTTT 2756 het 2756 ref 22 10 8 4 A 6 5 61675 CASAVA_Build 1 225337868 6D ATTTTCCCTT TTTTGA/------ TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 TTTTGA 1 0 61676 CASAVA_Build 1 225338417 3D ACTCCAATGA CTT/--- CTTACAGATG 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 CTT 2 1 61677 CASAVA_Build 1 225339193 2D TTGGGAGAGT GA/-- GAGAAGAACC 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 GA 3 2 61678 CASAVA_Build 1 225341011 2D TTTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 11 13 T 13 11 61679 CASAVA_Build 1 225341715 5I TTTTGGACTC -----/TTCAT TTCGTTTCAT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 TTCAT 0 1 61680 CASAVA_Build 1 225344344 1I TAACAATTAT -/G TGACCTGCTT 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 G 0 1 61681 CASAVA_Build 1 225345950 1I ATGGACTAAT -/A TGGATGGAGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 61682 CASAVA_Build 1 225349776 1I TATATACACA -/T TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 2 3 61683 CASAVA_Build 1 225351653 6D ATGACCTTCA TATTGC/------ TATTGCTAAA 3070 het 3070 ref 35 24 10 4 TATTGC 2 1 61684 CASAVA_Build 1 225352592 1D CAGTTCTAAG A/- AATTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 26 12 2 A 3 2 61685 CASAVA_Build 1 225357293 1D ACCATTACAT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 8 7 61686 CASAVA_Build 1 225361772 2I TGAGACAGGG --/TC TCTCACTCTG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 TC 2 3 61687 CASAVA_Build 1 225362364 4D ACTTCTAACC AACT/---- AACTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 13 15 6 AACT 2 1 61688 CASAVA_Build 1 225362734 1I GCATTCCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 10 11 61689 CASAVA_Build 1 225363699 1I AAAATGTATC -/T TTTTTTTTTG 2911 het 2636 hom 18 6 7 5 T 9 10 61690 CASAVA_Build 1 225364551 4D GCTATTTCTC TCTT/---- TAAGTCTGTC 3070 het 3070 ref 44 24 18 3 TCTT 1 0 61691 CASAVA_Build 1 225369229 6I TAGGATATTT ------/AACTTA AACTTAAACT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 AACTTA 2 3 61692 CASAVA_Build 1 225369840 3D CCAGGTAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 16 8 A 13 10 61693 CASAVA_Build 1 225370197 3I AGAAAAGAGG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 11 14 61694 CASAVA_Build 1 225384796 4D GTCCTTTCCG TATT/---- TATTATTTTG 3070 het 3070 ref 52 28 16 8 TATT 2 1 61695 CASAVA_Build 1 225385178 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 9 8 61696 CASAVA_Build 1 225385471 1I CTTTAACATC -/A AAAATAGATA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 4 5 61697 CASAVA_Build 1 225386375 2D GAGTGTGAAA CT/-- CTCTCTCATG 3070 het 3070 hom 41 16 17 9 CT 4 3 61698 CASAVA_Build 1 225392003 1D ACAGCAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 126 hom 36 1 19 16 A 11 10 61699 CASAVA_Build 1 225402221 1D CTATACGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 A 13 12 61700 CASAVA_Build 1 225405102 1D TTTACCCCAT A/- AATGTATTCA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 3 2 61701 CASAVA_Build 1 225405194 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1660 het 1660 ref 20 6 9 6 A 11 10 61702 CASAVA_Build 1 225407560 1I CAAAAGTTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 9 10 61703 CASAVA_Build 1 225417836 1I GTTGAGAATC -/T TTTTCATATT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 4 5 61704 CASAVA_Build 1 225418056 1D TCTTATTTGT A/- AAAAAAAAAA 1076 het 1076 ref 12 6 3 3 A 12 11 61705 CASAVA_Build 1 225418876 12I TGTGGTCCCA ------------/GCTACTCAGGAG GCTACTCAGG 3070 hom 69 het 27 0 23 5 GCTACTCAGGAG 1 2 61706 CASAVA_Build 1 225419379 1I AGCATGCAAC -/A AGCACTGAAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 1 2 61707 CASAVA_Build 1 225422257 1I TCTTCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 11 12 61708 CASAVA_Build 1 225423433 1D TTCATTTCTA G/- AATTTCCATT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 G 1 0 61709 CASAVA_Build 1 225424779 1I ACTCATGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 A 12 13 61710 CASAVA_Build 1 225429805 5D TAGTATCCTA TACTT/----- TAACACAGCA 1373 het 1373 ref 13 7 5 4 TACTT 1 0 61711 CASAVA_Build 1 225431408 1I CAATATCCCA -/C AAAAACAACT 1253 het 770 hom 12 3 4 5 C 0 1 61712 CASAVA_Build 1 225431459 1I AAGAAAAAAA -/T AAATATATAT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 0 1 61713 CASAVA_Build 1 225434107 1D AAAAAGTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 23 1 20 2 A 11 10 61714 CASAVA_Build 1 225439477 1I TTACAAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 11 12 61715 CASAVA_Build 1 225440079 1I GTCCATGTCG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 382 hom 37 1 30 6 T 8 9 61716 CASAVA_Build 1 225442739 1D AGAGAGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 11 10 61717 CASAVA_Build 1 225444890 3D GCCTTAAATG ATT/--- ATTTAACTTG 3070 het 3070 ref 44 21 20 5 ATT 2 1 61718 CASAVA_Build 1 225446019 1I ATATTCAACG -/A AAATAGTATT 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 3 4 61719 CASAVA_Build 1 225446294 1I AATTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 29 2 21 6 A 12 13 61720 CASAVA_Build 1 225446640 2I GCATAGTTCT --/CA GAGTGTGGTC 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 CA 0 1 61721 CASAVA_Build 1 225447561 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 1631 het 574 hom 6 2 4 0 T 9 8 61722 CASAVA_Build 1 225449300 1I GAAGATATTG -/T TTTCAGGGAT 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 T 3 4 61723 CASAVA_Build 1 225449823 1D ACTGACCCTA T/- CCTGACAATT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 1 0 61724 CASAVA_Build 1 225450029 3I CTATATTATT ---/ATA ATATCATATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATA 1 2 61725 CASAVA_Build 1 225450428 1D TTTTTTTTTT A/- AAAGAGCTCC 3070 het 2848 hom 38 10 22 6 A 4 3 61726 CASAVA_Build 1 225453084 1D TTTAAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 24 1 19 4 T 13 12 61727 CASAVA_Build 1 225454450 5I AAACAACAGA -----/TTTGT TTTGTGTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TTTGT 1 2 61728 CASAVA_Build 1 225454763 1I5M1I TTAAAAAACA -AACAA-/CAACAAC ACAAAAAAAA 2057 het 534 hom 16 3 8 8 N/A 0 0 61729 CASAVA_Build 1 225455460 1D GAACAAAAAT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 7 6 61730 CASAVA_Build 1 225459849 1D ACAGAAGGAC T/- TAGGGGTATT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 2 1 61731 CASAVA_Build 1 225460679 4I ATTATTGGAC ----/AATT ATTATATTAT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 AATT 0 1 61732 CASAVA_Build 1 225461260 3D TTATTTTATT TTA/--- TTATTATTAT 1952 het 1368 hom 10 3 4 3 TTA 4 3 61733 CASAVA_Build 1 225467696 1D AATAATGTTG C/- CAGATGAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 11 9 C 2 1 61734 CASAVA_Build 1 225468537 1D ATTCAAGTGC A/- AAAAAAAAAA 1324 het 1324 ref 35 27 3 6 A 13 12 61735 CASAVA_Build 1 225475002 1I TTTTGCGCTT -/C CATACCTCTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 C 1 2 61736 CASAVA_Build 1 225480115 1I GGAATACCTC -/T TGATTTCCTT 3070 het 3070 ref 50 22 22 6 T 1 2 61737 CASAVA_Build 1 225482159 1I GGTCCATATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 A 9 10 61738 CASAVA_Build 1 225489237 1D GATTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3013 hom 40 10 18 12 T 15 14 61739 CASAVA_Build 1 225490873 3I ATTATTAAAC ---/CTT CTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 CTT 1 2 61740 CASAVA_Build 1 225491553 2I TGGAACTTGC --/AT ATGAATTCAG 2839 het 2839 ref 24 11 7 6 AT 1 2 61741 CASAVA_Build 1 225492136 1D AGGCCGAGGC G/- GGCGGATCAC 3070 het 912 hom 14 2 8 4 G 3 2 61742 CASAVA_Build 1 225497723 5I GGGCCCAACT -----/TAAGA TAAAAGTTTC 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 TAAGA 0 1 61743 CASAVA_Build 1 225498326 1D CTCACTCACC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 42 16 16 11 A 9 8 61744 CASAVA_Build 1 225498819 1I TTCACATGGT -/G GGGGGGGGGC 2439 het 2274 hom 28 8 8 12 G 9 10 61745 CASAVA_Build 1 225500707 4D GCCTGGGGAA ACTC/---- ACCACCCTGA 2492 het 2492 ref 28 15 9 4 ACTC 1 0 61746 CASAVA_Build 1 225507082 3I CAGCATAATT ---/CAA CAACACATTA 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 CAA 1 2 61747 CASAVA_Build 1 225509771 4D46M1I AGGAAAGGAA AGAGAGAGAGGATTTCTATCTGGAATTGACACAACAGAGAAGAGAAAGAG-/----AGAGAGGATTTCTATCTGGAATTGACACAACAGAGAAGAGAAAGAGA AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 47 40 23 9 N/A 0 0 61748 CASAVA_Build 1 225511812 6I GGGCACAGTG ------/GCTCAC GCCTGTAATC 2638 het 2638 ref 23 14 8 1 GCTCAC 0 1 61749 CASAVA_Build 1 225514880 4D CCATGGTGTC AGAA/---- AGAAAGTGTC 3070 het 3070 ref 42 21 17 7 AGAA 2 1 61750 CASAVA_Build 1 225516534 3I AGAAATACAA ---/ATG ATAATGAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 ATG 0 1 61751 CASAVA_Build 1 225516807 1D AGAAAAAGCA C/- ATTTACCTCC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 1 0 61752 CASAVA_Build 1 225523203 1I AGAGACAGGG -/T TTTGCCATGT 3070 het 2103 hom 15 5 9 1 T 3 4 61753 CASAVA_Build 1 225527130 1I AGAATAATTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 7 8 61754 CASAVA_Build 1 225528182 1D AGAAACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2841 hom 28 12 11 5 A 16 15 61755 CASAVA_Build 1 225529397 3I CAAATGCAAT ---/ACA ACAACTACAA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 ACA 1 2 61756 CASAVA_Build 1 225529859 1D GGAGTGCTGG A/- AAAAAAGACA 3070 het 1186 hom 14 3 10 1 A 7 6 61757 CASAVA_Build 1 225531403 3D AATAAATACT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 611 hom 18 4 10 4 A 17 14 61758 CASAVA_Build 1 225531556 3I GCCAAATGAC ---/CAA CAACAGAGAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 CAA 1 2 61759 CASAVA_Build 1 225540179 1D ATAGGTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 10 9 61760 CASAVA_Build 1 225541336 1I CATTCATGAA -/C AATCTGTCTC 3070 het 3070 ref 59 32 20 7 C 0 1 61761 CASAVA_Build 1 225544768 1I TTTACTGTAC -/T ATTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 0 1 61762 CASAVA_Build 1 225544843 5D ACACAGATAT AATAG/----- AATTTATTTG 3070 het 3070 hom 28 12 12 5 AATAG 1 0 61763 CASAVA_Build 1 225546635 1I AGTGTTAAAG -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 6 7 61764 CASAVA_Build 1 225547845 1D TAAAGTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 A 15 14 61765 CASAVA_Build 1 225549790 1I GCATGAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 A 8 9 61766 CASAVA_Build 1 225551034 1D TCCCCACATC A/- AAAAAAAAAA 1116 het 1116 ref 33 15 4 15 A 19 18 61767 CASAVA_Build 1 225551737 4D TTACTATATG ACCC/---- AGAAATATCA 3070 het 3070 ref 63 31 27 7 ACCC 1 0 61768 CASAVA_Build 1 225552412 2D ATATACAATG TT/-- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 9 7 61769 CASAVA_Build 1 225558730 1I ATTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 10 11 61770 CASAVA_Build 1 225560463 4D TTCTAAGTGG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2062 hom 43 13 13 18 T 18 14 61771 CASAVA_Build 1 225567122 3I CCCCTTTGTG ---/TTC TTGTGATAGT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 TTC 0 1 61772 CASAVA_Build 1 225567960 4D ATTCGGACTG ATTA/---- ATTAATAAAT 3070 het 3070 hom 46 21 23 4 ATTA 2 1 61773 CASAVA_Build 1 225568081 1D CTCGTGTCAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 39 21 18 2 A 9 8 61774 CASAVA_Build 1 225568166 1I TAGGTACAAA -/G TTTATTAAAC 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 G 0 1 61775 CASAVA_Build 1 225568322 4I TATTTTGTAT ----/TAAG TAATATTATC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TAAG 0 1 61776 CASAVA_Build 1 225569567 4D AATATACATA AATG/---- AGGTGTTCTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 AATG 1 0 61777 CASAVA_Build 1 225569903 4I TTTAAGTCTT ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 11 15 61778 CASAVA_Build 1 225574129 6I ATGAAATCTA ------/CATTTG CAACGTCTAC 3070 het 3070 hom 48 19 20 9 CATTTG 0 1 61779 CASAVA_Build 1 225574683 1D15M2D ATGTAGATAC TTTTTTTTTTTTTAACAA/-TTTTTTTTTTTTAAC-- AAGAGTCAAG 3070 het 3070 hom 33 9 21 7 N/A 0 0 61780 CASAVA_Build 1 225576715 9I CTCCCGCCTC ---------/AGCCTCCCA AAATGCTGGG 2927 het 2218 hom 21 9 8 4 AGCCTCCCA 0 1 61781 CASAVA_Build 1 225577934 4D CACTGGCCAC TCTT/---- TCTCAGTCTC 3070 het 3070 hom 47 17 26 5 TCTT 1 0 61782 CASAVA_Build 1 225579422 2I TTAAATACAA --/AG AGAGATTGTC 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 AG 2 3 61783 CASAVA_Build 1 225580850 1I GTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 A 11 12 61784 CASAVA_Build 1 225581025 4I AGTCTCCACC ----/AGAT AGATACAGAG 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 AGAT 1 2 61785 CASAVA_Build 1 225582912 1I AGACTGTTTC -/T GCAATTCTGT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 0 1 61786 CASAVA_Build 1 225599671 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 11 61787 CASAVA_Build 1 225626899 6I TGGGTCTCTT ------/ATAGTC ATAGGAAGGG 3070 hom 74 het 33 0 25 8 ATAGTC 0 1 61788 CASAVA_Build 1 225628555 5I TCATCTTGTG -----/TAGTT TATTCCCACA 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 TAGTT 0 1 61789 CASAVA_Build 1 225631794 1I TGGTTTGACA -/T TAGGGGTCCA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 1 2 61790 CASAVA_Build 1 225633241 1I GAATGAAATG -/A AAAAACCAAT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 5 6 61791 CASAVA_Build 1 225636533 1D AGGGACTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 10 9 A 12 11 61792 CASAVA_Build 1 225637285 1D ACCTTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1399 hom 32 8 12 12 T 13 12 61793 CASAVA_Build 1 225639661 1D CAAGTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 1170 het 1170 ref 33 25 3 5 A 12 11 61794 CASAVA_Build 1 225647277 1I GTAAGACCCG -/C CCCCCCCACC 1490 hom 11 het 6 0 3 3 C 7 8 61795 CASAVA_Build 1 225657788 4I GATACACCAT ----/ATGA GAGGCCACAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 ATGA 0 1 61796 CASAVA_Build 1 225658913 1I AATTACCAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 8 9 61797 CASAVA_Build 1 225664284 1D TGACCATTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 9 8 61798 CASAVA_Build 1 225668425 19D GGGAGAGAAA TGGGGGAACAGCCAGTCAG/------------------- TGGGAAGAGC 3070 hom 78 het 25 0 27 0 TGGGGGAACAGCCAGTCAG 1 0 61799 CASAVA_Build 1 225673217 4I AACCAAACCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 AAAC 3 4 61800 CASAVA_Build 1 225675089 1D CCAGTTTGAG A/- AAAAAAACTA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 8 7 61801 CASAVA_Build 1 225689250 1I AGAACCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2273 het 2273 ref 35 11 13 11 A 15 16 61802 CASAVA_Build 1 225696068 1I AAAGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2104 het 1678 hom 11 5 6 0 A 10 11 61803 CASAVA_Build 1 225704140 2I ACTCTGGCTC --/AA AAAAAAAAAA 1172 het 64 hom 6 1 4 1 A 12 14 61804 CASAVA_Build 1 225706732 1I TCAGAATTCT -/C CCCCCCCCCT 3070 hom 33 het 17 0 10 7 C 9 10 61805 CASAVA_Build 1 225708038 2I GGTATGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 252 hom 20 1 14 5 TG 7 8 61806 CASAVA_Build 1 225723712 2D TTTAACATTT TA/-- TGTTTATTTG 3070 hom 99 het 40 0 34 7 TA 1 0 61807 CASAVA_Build 1 225727401 1I GAAGAAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 45 1 36 8 T 11 12 61808 CASAVA_Build 1 225729158 10I AAAGCTAAGA ----------/AACAGAAAGG AATAGCATCA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 AACAGAAAGG 0 1 61809 CASAVA_Build 1 225733241 1I CTAAAACCAT -/A AAAAACCCTA 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 A 5 6 61810 CASAVA_Build 1 225739527 5I CCTTAAAAAT -----/AAAAG AAATTTTGAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 AAAAG 0 1 61811 CASAVA_Build 1 225750796 1I TTACAGCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2457 hom 19 9 9 1 T 10 11 61812 CASAVA_Build 1 225754880 1D TCTGACTCCT C/- TTTTTGCAGC 3070 het 3070 ref 80 39 25 16 C 1 0 61813 CASAVA_Build 1 225761807 3I GTAAGATCTG ---/GGA GGAGTACCCA 2191 het 2191 ref 32 17 5 10 GGA 1 2 61814 CASAVA_Build 1 225765581 1I ACAAATTGCC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 T 6 7 61815 CASAVA_Build 1 225768074 1D TGTAGGTATT G/- GTTGATATTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 2 1 61816 CASAVA_Build 1 225769037 3I18M1D CACCTAAATA ---AACTTGTACTAACTTCTTA/AACAACTTGTACTAACTTCTT- TAACATGTCT 3070 hom 117 het 35 0 40 7 N/A 0 0 61817 CASAVA_Build 1 225769358 1I AATTCACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 660 hom 35 2 28 5 A 13 14 61818 CASAVA_Build 1 225770208 4D TTTTACTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 253 hom 34 3 18 14 T 20 16 61819 CASAVA_Build 1 225779684 8D AAGAGTTTTA TAATTTTT/-------- TAATTTTTGT 3070 het 3070 hom 31 10 17 7 TAATTTTT 2 1 61820 CASAVA_Build 1 225780388 1D ACCTCCAAAC T/- GTACTTTATA 3070 het 3070 hom 35 17 15 4 T 1 0 61821 CASAVA_Build 1 225789105 1I TTTCCCTTCC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 310 hom 27 1 21 5 T 8 9 61822 CASAVA_Build 1 225797697 2I CCCTGTGCCT --/CC CCCAATGCGC 2126 het 2126 ref 25 11 6 8 C 3 5 61823 CASAVA_Build 1 225798386 3D TACTTGCCTT CCC/--- CCCCCCCGCC 3070 hom 17 het 14 0 9 5 C 10 7 61824 CASAVA_Build 1 225822638 1I GAACAAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 11 12 61825 CASAVA_Build 1 225822729 1D TTGTAATAGG T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 23 12 7 T 2 1 61826 CASAVA_Build 1 225826401 1D11M7I ATACTTTCAA GTGGCAGTTTAT-------/-TAGCAGTTTGTTTAGGGC CCCAGATACT 1481 het 1481 ref 38 36 4 5 N/A 0 0 61827 CASAVA_Build 1 225828016 5I9M16I AACTTTTAAG -----TTCAGGGGT----------------/TAACTTTTAAGTTTGTTACCTATGTAACAA ACATGTGCAG 3070 het 3070 ref 27 15 15 1 N/A 0 0 61828 CASAVA_Build 1 225829269 3D ATGGGGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 33 17 12 7 TTG 6 5 61829 CASAVA_Build 1 225831166 4D TAATTTGAGA TCTT/---- TCTAACTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 8 TCTT 1 0 61830 CASAVA_Build 1 225835249 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1642 het 1642 ref 13 7 4 2 A 15 14 61831 CASAVA_Build 1 225836500 2D TATACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 37 12 19 7 CA 7 6 61832 CASAVA_Build 1 225840103 1I CAGTCCCCCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 9 10 61833 CASAVA_Build 1 225840542 1D ATAAGCAAAT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 7 6 61834 CASAVA_Build 1 225843225 1D GATGTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 5 T 12 11 61835 CASAVA_Build 1 225851032 5D AATGTTAAAA TAAAT/----- TAATAATTCA 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 TAAAT 1 0 61836 CASAVA_Build 1 225852826 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 7 61837 CASAVA_Build 1 225885327 1I CCAGGTTTCT -/C CCCCTTGAAG 3070 hom 83 het 35 0 27 8 C 4 5 61838 CASAVA_Build 1 225896084 1D ATATTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 28 1 20 7 A 13 12 61839 CASAVA_Build 1 225899117 1D CAGTTTAAAG A/- AATACTCCCA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 3 2 61840 CASAVA_Build 1 225900857 1D GTGTATTTTT C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 65 het 27 0 22 5 C 9 8 61841 CASAVA_Build 1 225913967 1D TCATAAAAAC T/- GTATTTTCTA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 1 0 61842 CASAVA_Build 1 225914205 1D CTTGGCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 31 1 19 11 A 13 12 61843 CASAVA_Build 1 225914218 1D AAAAAAAAAA C/- AATATATTCT 3070 het 147 hom 31 3 24 6 C 1 0 61844 CASAVA_Build 1 225915624 3D TGTTTTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 35 12 18 7 TTG 7 6 61845 CASAVA_Build 1 225922498 1D ATCCCTGAAG T/- TTTGGGACAA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 4 3 61846 CASAVA_Build 1 225923213 1I GGCCTTATTT -/C CCAAGTTTCC 3070 het 3000 hom 20 7 11 2 C 2 3 61847 CASAVA_Build 1 225925570 1D TCTACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 8 6 A 13 12 61848 CASAVA_Build 1 225935088 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 21 0 13 8 A 9 10 61849 CASAVA_Build 1 225938700 1D ACTGGAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 26 1 21 4 A 13 12 61850 CASAVA_Build 1 225943194 1D AATTTCACAC A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 A 7 6 61851 CASAVA_Build 1 225943742 1D GGGATGATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1942 hom 26 5 20 1 A 12 11 61852 CASAVA_Build 1 225944194 4I GTGAAAATTT ----/AAAC AAGAAAATGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAAC 0 1 61853 CASAVA_Build 1 225945287 4D AAAAACTTAA AAGT/---- AAGACATGAA 3070 het 2555 hom 23 7 10 6 AAGT 1 0 61854 CASAVA_Build 1 225948305 21D CATTGTACAA AATTGAGGTGCTAGTCAGGAC/--------------------- AATTTGGCAA 3070 het 3070 hom 35 16 20 6 AATTGAGGTGCTAGTCAGGAC 1 0 61855 CASAVA_Build 1 225949352 1I TTCTTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 2833 het 2833 ref 27 11 10 6 T 12 13 61856 CASAVA_Build 1 225957711 12I GGCAAACCAA ------------/ATCCAGCAGCAC ATCAAAAAGC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 ATCCAGCAGCAC 0 1 61857 CASAVA_Build 1 225962681 1D TTTGAAAAGC A/- AACAGAATTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 3 2 61858 CASAVA_Build 1 225962758 1D TTGGAAGGAC A/- AAAGGAGCAA 3070 hom 58 het 23 0 20 4 A 4 3 61859 CASAVA_Build 1 225966654 4D AAATACAAAT AAAC/---- AAAACAATGG 2710 het 2710 ref 23 17 6 3 AAAC 1 0 61860 CASAVA_Build 1 225967659 3D ATACTTAAAA GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 hom 8 het 12 0 9 3 G 13 10 61861 CASAVA_Build 1 225973597 20D CCCAGCGCCT AGGAACCAGACCTGAAACCA/-------------------- AGGAACCAGA 2965 het 2965 ref 28 19 9 8 AGGAACCAGACCTGAAACCA 1 0 61862 CASAVA_Build 1 226007156 2D TGAAACCTGC AG/-- AGTCTCAGAT 3070 het 3070 hom 44 20 23 2 AG 2 1 61863 CASAVA_Build 1 226009552 1D TTTTGAGACA G/- GATCTTACTC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 G 2 1 61864 CASAVA_Build 1 226011382 1I CTTAGTCTCT -/G CTAGGAATTG 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 G 0 1 61865 CASAVA_Build 1 226013125 2I GTTCTCACTG --/CC CTGGCCCCCA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 C 1 3 61866 CASAVA_Build 1 226018930 1D CCGTCTCTAT A/- AAAAAATACA 2569 het 2569 ref 23 10 10 3 A 7 6 61867 CASAVA_Build 1 226019372 3I AAAATAAATA ---/GTT GTTGTTGTTT 3070 het 3070 hom 52 16 24 12 GTT 3 4 61868 CASAVA_Build 1 226022013 2D TGTGCATGTC TT/-- GTGTGTGGAG 3070 het 3070 hom 83 30 46 10 T 2 0 61869 CASAVA_Build 1 226031434 2I TGTCTTTTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 21 0 19 2 A 10 12 61870 CASAVA_Build 1 226036516 4I TTGTTTTCTG ----/CTCT CTTTTTCTTA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 CT 1 3 61871 CASAVA_Build 1 226037803 2I6M4I AATGCAGAAA --ATGGTC----/AGACCGTCTTTT CCACAATGGT 3070 hom 72 het 28 0 24 5 N/A 0 0 61872 CASAVA_Build 1 226039824 1I GTAATTTATT -/A AAAAAAAAAA 2868 het 1930 hom 29 9 13 7 A 15 16 61873 CASAVA_Build 1 226045998 8D ACCCTAACCC TGACCTTA/-------- TGACCTTATG 3070 hom 114 het 49 0 37 16 TGACCTTA 2 1 61874 CASAVA_Build 1 226054286 8D TTTTTCTCCC TCCTTCCT/-------- TCCTTCCTTC 2585 het 2585 ref 37 18 10 9 TCCT 6 4 61875 CASAVA_Build 1 226055200 5I ATGATCCCTT -----/TTGAG TTAAGTTTTC 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 TTGAG 0 1 61876 CASAVA_Build 1 226065158 1D CTGAATCATG A/- AGAAATAGAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 2 1 61877 CASAVA_Build 1 226069599 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1076 hom 37 9 14 14 T 17 16 61878 CASAVA_Build 1 226081983 1D AATTCATTGA T/- TTTTTGAAGG 2567 het 2567 ref 20 11 6 3 T 6 5 61879 CASAVA_Build 1 226083081 1D CAAGGGACCA C/- CCCCCAGGGT 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 C 6 5 61880 CASAVA_Build 1 226087852 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 11 10 61881 CASAVA_Build 1 226088993 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2753 hom 28 het 13 0 8 5 A 12 11 61882 CASAVA_Build 1 226090428 1D TGTTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 10 13 T 12 11 61883 CASAVA_Build 1 226094762 1I TTAAATGGTT -/G GGGGCGGAAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 G 4 5 61884 CASAVA_Build 1 226104310 1I TATATTCTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 0 1 61885 CASAVA_Build 1 226106069 1D GTCTTGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1634 hom 27 7 10 10 T 15 14 61886 CASAVA_Build 1 226111674 6D CTCAAAAAAG AGAAAA/------ AGAAAAAGAA 1734 het 1191 hom 16 4 7 8 AGAAAA 3 2 61887 CASAVA_Build 1 226118861 1I AATCCATCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 441 hom 28 1 21 6 A 9 10 61888 CASAVA_Build 1 226128630 1I TAACAATATT -/A AACCTTAAAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 2 3 61889 CASAVA_Build 1 226170662 2D ACTCAAGCAC AT/-- GTGTGCATGC 3070 het 3070 hom 66 23 35 12 AT 1 0 61890 CASAVA_Build 1 226174759 1D AGGGATGGAG A/- AAATAATAAT 2280 het 1476 hom 12 4 6 2 A 4 3 61891 CASAVA_Build 1 226188198 1I CCTCAGAAAC -/T CCCCCAGCCC 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 T 0 1 61892 CASAVA_Build 1 226211406 1I ATAAGCCACC -/A ATGCCTGGAC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 1 2 61893 CASAVA_Build 1 226212801 18D CACTGGGTTG GTAGCCCTTCTCTCCCGA/------------------ GATGTTCTCT 3070 het 3070 ref 31 18 12 6 GTAGCCCTTCTCTCCCGA 1 0 61894 CASAVA_Build 1 226215551 4I AAAAAAAAAC ----/AGAT AGAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 AGAT 0 1 61895 CASAVA_Build 1 226224683 15D TGCCTGTCGG CGGCCTCTACAGGCC/--------------- CGGCCTCTAC 695 het 695 ref 33 19 3 13 CGGCCTCTACAGGCC 1 0 61896 CASAVA_Build 1 226240180 2D ATATATAAAC AT/-- ATATATATGT 1842 het 1842 ref 14 7 5 2 AT 5 4 61897 CASAVA_Build 1 226240740 1D ATTGCTTGGG C/- CCCAGGGGTT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 C 4 3 61898 CASAVA_Build 1 226241945 4I TTGAAAGAAA ----/AAAG AAAGCCCTGT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 AAAG 1 2 61899 CASAVA_Build 1 226243080 1D AATTAAACCT A/- AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 A 7 6 61900 CASAVA_Build 1 226243661 1I AAAGGCCAGC -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 6 7 61901 CASAVA_Build 1 226243777 1D ATAAAAAAAA T/- GACTAAATGC 3070 het 3070 ref 39 25 11 3 T 1 0 61902 CASAVA_Build 1 226247208 2D GTCCATTGCA GC/-- ATTAATTACG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 GC 1 0 61903 CASAVA_Build 1 226256951 1I TCGTCCCTGC -/A AAAAAAAATT 2727 het 2727 ref 21 9 8 4 A 8 9 61904 CASAVA_Build 1 226265569 2D TTCGGGGACT GA/-- GAGGGGCCAG 3070 het 3070 hom 46 15 20 11 GA 2 1 61905 CASAVA_Build 1 226280248 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1001 het 613 hom 14 5 5 4 T 15 14 61906 CASAVA_Build 1 226280461 1D AAGAAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 11 10 61907 CASAVA_Build 1 226284410 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 A 7 6 61908 CASAVA_Build 1 226300788 1I GTGTGTGCAT -/G TGCACGAGGC 3070 hom 181 het 69 0 61 8 G 0 1 61909 CASAVA_Build 1 226376805 1I ATTAGCATAC -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 36 17 18 4 A 6 7 61910 CASAVA_Build 1 226396469 3D TGTCTCCAGC GGT/--- GGTGGTGTGG 3070 hom 45 het 23 0 16 7 GGT 3 2 61911 CASAVA_Build 1 226421680 2D CTGGGGCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 796 het 229 hom 13 4 2 7 T 18 16 61912 CASAVA_Build 1 226426469 1D AGGAAGTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 20 5 A 11 10 61913 CASAVA_Build 1 226432743 1D TCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2080 hom 24 10 11 3 A 13 12 61914 CASAVA_Build 1 226436517 4D CATTCATTTC TTCA/---- TTCATTCAAC 2981 het 2892 hom 21 8 10 3 TTCA 3 2 61915 CASAVA_Build 1 226439108 1I ATTCTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 25 2 15 8 T 11 12 61916 CASAVA_Build 1 226448626 1I TTTGCTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 T 13 14 61917 CASAVA_Build 1 226449039 1D GGGATCACAC T/- TTTGAGAACC 3070 hom 90 het 36 0 29 9 T 4 3 61918 CASAVA_Build 1 226457166 7D TTTCTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 25 10 T 17 10 61919 CASAVA_Build 1 226469575 1D TGTCCGTGGT G/- GGAAGGATAG 3070 hom 53 het 22 0 18 4 G 3 2 61920 CASAVA_Build 1 226471742 1I GTGTCAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 89 hom 25 1 20 4 A 10 11 61921 CASAVA_Build 1 226488447 1I CATACAGCAA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 6 7 61922 CASAVA_Build 1 226492935 2D TGCACTCACA CG/-- TATGAATGTA 3070 hom 222 het 79 0 74 9 CG 1 0 61923 CASAVA_Build 1 226493048 4D ACACATATAA ACTC/---- ACACACACAC 3070 hom 243 het 84 0 79 5 ACTC 1 0 61924 CASAVA_Build 1 226508913 1D TTATTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 25 11 5 A 11 10 61925 CASAVA_Build 1 226511432 1I GGTGCAGGGA -/G GGCCAGGCCC 3070 hom 82 het 35 0 23 12 G 2 3 61926 CASAVA_Build 1 226528032 1I TGGCCCTGAA -/G GGGAGCGGGG 3070 hom 60 het 23 0 19 4 G 3 4 61927 CASAVA_Build 1 226535936 2I31M1I ACTGATTGGA --TCAGAGCTGTTGGTTATGCAGATGCCAGGGG-/GCTCAGAGCTGTTGGTTATGCAGATGCCAGGGGA CAGCCAGCTC 3070 het 1133 hom 30 4 12 20 N/A 0 0 61928 CASAVA_Build 1 226544122 5D GTGGCGTGGT GTGGC/----- GTGGCGTGTT 2457 het 1096 hom 22 7 9 8 GTGGC 2 1 61929 CASAVA_Build 1 226586682 1I ATCACCTAAT -/C ACCTCCCAAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 C 0 1 61930 CASAVA_Build 1 226602482 9D TACTCTACTC TCTTCTTCT/--------- TCTTCTATTC 3070 het 3070 ref 36 18 17 3 TCT 5 2 61931 CASAVA_Build 1 226603882 1D AGACAGAAAG A/- GAGATAGAGA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 A 1 0 61932 CASAVA_Build 1 226659958 1D GGGCAGCCCT G/- GAGGGGAGGT 3070 het 3070 hom 47 17 23 8 G 2 1 61933 CASAVA_Build 1 226681140 1I GAAGAGCTGG -/T TGTTGAAAAG 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 T 1 2 61934 CASAVA_Build 1 226685263 1I TTAGAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 11 12 61935 CASAVA_Build 1 226686545 1I TGGTATGGCT -/G GGGGGTGGTG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 5 6 61936 CASAVA_Build 1 226690600 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 9 9 11 A 10 11 61937 CASAVA_Build 1 226703161 4D ATTAATTATC ATTA/---- ATTATAAGTA 3070 het 3070 ref 53 25 23 6 ATTA 2 1 61938 CASAVA_Build 1 226707794 1D GTTTCGTTTT C/- GTTTTTCAAT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 C 1 0 61939 CASAVA_Build 1 226722834 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2474 het 1861 hom 23 8 7 8 T 14 13 61940 CASAVA_Build 1 226738316 8I TTTCCTTCCT --------/TCTTTTTC TCTTTTTCTC 3070 het 2827 hom 23 8 11 4 TCTTTTTC 1 2 61941 CASAVA_Build 1 226739694 1D ATTTGTGTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 17 15 13 T 10 9 61942 CASAVA_Build 1 226753357 1D CTTTGTTGCT A/- AAAAATGCTA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 A 6 5 61943 CASAVA_Build 1 226755395 2I TAACATGAGG --/TA TATAGGCTGT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 TA 2 3 61944 CASAVA_Build 1 226768184 1I TGCGGGCGGT -/G GAGGAAATCC 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 G 1 2 61945 CASAVA_Build 1 226791472 1D GCTCGGGGCC T/- TCACAGCCTC 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 T 2 1 61946 CASAVA_Build 1 226807352 13D ATGCCTAGTG TGATCCAGGAGTC/------------- TCTCACATAA 3070 het 3070 ref 29 18 13 4 TGATCCAGGAGTC 1 0 61947 CASAVA_Build 1 226838029 2I CACACGCACG --/CA CACACACACG 3070 het 42 hom 43 1 24 18 CA 4 5 61948 CASAVA_Build 1 226849394 1D CAGGGGGAAA C/- CCAGAAGAGT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 C 3 2 61949 CASAVA_Build 1 226851229 8D TTCCTCTCTC TCTTTCTT/-------- TCTTTCTTTC 2194 het 2194 ref 23 11 6 7 TCTT 6 4 61950 CASAVA_Build 1 226861448 1I CTTACGTTTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 7 8 61951 CASAVA_Build 1 226866621 7I ACTCCTGGGC -------/TCAAGCG ATCGGCCCTC 3070 het 2081 hom 24 9 9 6 TCAAGCG 0 1 61952 CASAVA_Build 1 226884789 3D CTGTTTATTT CAC/--- CTGGGTGTAG 2710 het 2710 ref 19 11 7 1 CAC 1 0 61953 CASAVA_Build 1 226892538 4D AAAGATTTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 10 TTTG 4 3 61954 CASAVA_Build 1 226893456 1D CAGCTTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 13 12 61955 CASAVA_Build 1 226918203 1I TTGTGGTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 T 9 10 61956 CASAVA_Build 1 226919118 18I ATACACACAC ------------------/ATATATATACGTATATAT ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 ATATATATACGTATATAT 0 1 61957 CASAVA_Build 1 226927793 14I GGGGCTGTGG --------------/CCACAGCACCCTCC CCCTGAGCTT 2300 het 2300 ref 39 18 8 13 CCACAGCACCCTCC 0 1 61958 CASAVA_Build 1 226936561 1D ATTAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 12 11 61959 CASAVA_Build 1 226955701 1I ATCACCTAAT -/G GCAGATGCCA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 1 2 61960 CASAVA_Build 1 226958766 4D TGGGAGTTTA TATT/---- TATTTCTGAA 3070 hom 120 het 43 0 38 5 TATT 2 1 61961 CASAVA_Build 1 226965421 5I GCTGATTAAT -----/AAAAG AAAGACATTG 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 AAAAG 0 1 61962 CASAVA_Build 1 226975876 3D ATGCCTTGTG TAT/--- TATTCGTCTC 3070 hom 96 het 33 0 29 4 TAT 2 1 61963 CASAVA_Build 1 226983349 1D CTGCCCTGGC G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 72 het 31 0 20 11 G 9 8 61964 CASAVA_Build 1 226984211 2D GTGTGTGTGT GC/-- GCACGTGTGT 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 GC 2 1 61965 CASAVA_Build 1 226984321 4D TGTGTGTGTG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 89 het 69 0 34 38 GT 10 8 61966 CASAVA_Build 1 226998956 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 9 8 61967 CASAVA_Build 1 227016550 1D TTCACACATG A/- GGGGGACAGC 3070 hom 123 het 46 0 41 6 A 1 0 61968 CASAVA_Build 1 227021371 2D ACCTGCTGGC AG/-- AGAGAAGCCA 3070 het 3070 hom 38 18 15 6 AG 3 2 61969 CASAVA_Build 1 227024730 4I AAGAACCATC ----/TCTT TGTTTCATTT 3070 hom 120 het 41 0 41 0 TCTT 0 1 61970 CASAVA_Build 1 227031365 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- GAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 32 18 11 4 AAAG 1 0 61971 CASAVA_Build 1 227031584 1D TTCCAATGGG A/- AATATACTTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 A 3 2 61972 CASAVA_Build 1 227031837 32D TGTGTGTGTG TGTGTATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------- TATATATATA 3070 hom 8 het 18 1 17 3 TGTGTATATATATATATATATATATATATATA 1 0 61973 CASAVA_Build 1 227035283 1D GACCCTGTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 20 12 3 A 9 8 61974 CASAVA_Build 1 227035975 2D GTAAACAGAA GT/-- GTGTGTGCTG 3070 het 3070 hom 70 24 40 6 GT 4 3 61975 CASAVA_Build 1 227042248 3I GAAATGCATC ---/AGG AGGTGATTTC 3070 het 3070 hom 54 17 30 7 AGG 1 2 61976 CASAVA_Build 1 227042747 5D ACTCTGTCTG AAAAA/----- AAAAAAAATT 107 het 107 ref 15 3 1 12 A 13 8 61977 CASAVA_Build 1 227047784 1I TTTTATATAT -/A TTTTTTTTAA 3070 het 2993 hom 17 9 8 0 A 0 1 61978 CASAVA_Build 1 227050872 3D ATGCCTCATG CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 hom 57 het 20 0 15 5 C 13 10 61979 CASAVA_Build 1 227055342 7D TCTTTAACAC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 25 1 22 5 T 21 14 61980 CASAVA_Build 1 227061625 2D TTCCCACATG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 50 19 20 12 GA 6 5 61981 CASAVA_Build 1 227089041 7D TGTTTTTTAA AAGTTTT/------- AAGTTACAAT 3070 hom 81 het 29 0 27 4 AAGTTTT 1 0 61982 CASAVA_Build 1 227090394 3D ACATCTATTT AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 12 9 61983 CASAVA_Build 1 227097470 1I CATACTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 10 11 61984 CASAVA_Build 1 227097888 2D GTGGTGTATG TA/-- TATATATATA 1342 het 1342 ref 17 10 4 4 TA 10 9 61985 CASAVA_Build 1 227105003 2D TGTCTCTCTC TG/-- TGTGTCTGTC 3070 hom 132 het 48 0 44 7 TG 3 2 61986 CASAVA_Build 1 227115343 1I TTGCCTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 10 61987 CASAVA_Build 1 227117588 1I TATTTTAAGT -/A AATCAAAGTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 A 2 3 61988 CASAVA_Build 1 227117798 2D GGTTAAGTTA CT/-- CTTTCTTACT 3070 het 3070 ref 45 21 19 7 CT 2 1 61989 CASAVA_Build 1 227122349 1I ATGGTTTTTT -/A CTTTGTAATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 0 1 61990 CASAVA_Build 1 227122906 1I GCAGCCTCAT -/G GGGTCAGTCT 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 G 3 4 61991 CASAVA_Build 1 227124851 1D CTGTAATCCC A/- ACTCTGTAAT 3070 het 3070 ref 16 7 7 2 A 2 1 61992 CASAVA_Build 1 227125012 2I TTCAAAATGC --/TA TATTGTTGCT 3070 het 2265 hom 28 7 8 13 TA 1 2 61993 CASAVA_Build 1 227126232 3D AATTTCTCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 10 12 T 14 11 61994 CASAVA_Build 1 227126385 8D AACTGGCTAA ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 137 hom 14 1 10 6 AT 10 6 61995 CASAVA_Build 1 227129054 2I TTCTCACGAG --/TT TAGAATCTTT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 1 3 61996 CASAVA_Build 1 227137372 1D ACATGCACCA C/- CCCCCCCCCG 2499 het 1333 hom 37 6 7 26 C 10 9 61997 CASAVA_Build 1 227139952 3I TGAACGGTGG ---/AGT AGTCAGGGGT 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 AGT 1 2 61998 CASAVA_Build 1 227141317 5D AAGAAACGTT AGAGG/----- AGAGACCGAC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 AGAGG 1 0 61999 CASAVA_Build 1 227141714 7D TGCCCAGTTA TAGCCTG/------- GTCCACCTGT 3070 het 3070 hom 44 16 22 8 TAGCCTG 1 0 62000 CASAVA_Build 1 227155700 1D TACAGTAGGT A/- GCTAGTCATA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 A 1 0 62001 CASAVA_Build 1 227171456 1I TCAGCTCAAT -/A AGCCTCTCTT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 1 2 62002 CASAVA_Build 1 227179307 4I TTATGATGTA ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 50 24 14 12 GT 6 8 62003 CASAVA_Build 1 227186898 1D CTGCTGCTGC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 33 0 23 10 A 9 8 62004 CASAVA_Build 1 227188432 4I CAGGATAAAA ----/CTAT CTATCTTGTG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 CTAT 1 2 62005 CASAVA_Build 1 227215608 2I AAAGACCCAT --/GC CACAAGTTAG 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 GC 0 1 62006 CASAVA_Build 1 227223086 1D TTTTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 T 11 10 62007 CASAVA_Build 1 227251736 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2891 hom 34 13 15 7 A 13 12 62008 CASAVA_Build 1 227255905 1I GGAATCAATT -/A GTCTAAAAAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 0 1 62009 CASAVA_Build 1 227262596 2D TAATTTATTA AT/-- AGTTTCCTAA 3070 het 3070 ref 47 29 17 1 AT 1 0 62010 CASAVA_Build 1 227264010 1I GGAAGGAAGG -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 89 het 33 0 29 4 A 7 8 62011 CASAVA_Build 1 227271342 1D TATAAACTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 10 9 62012 CASAVA_Build 1 227271581 4D22M1I4M1D ATAGATAGAT GATAGATAGAGAAATAGATACATAGA-TGATA/----GATAGAGAAATAGATACATAGACAGAT- GATAGATAGA 3070 het 1310 hom 34 7 16 16 N/A 0 0 62013 CASAVA_Build 1 227273212 1D TTTTAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 T 16 15 62014 CASAVA_Build 1 227277394 2D CATGCCTGTC TG/-- TGTGTAAGTG 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 TG 3 2 62015 CASAVA_Build 1 227280974 14D CCAAAGACTT AGCTGGACAATCAA/-------------- AGCTGGACAA 3070 het 3070 ref 40 17 12 14 AGCTGGACAATCAA 2 1 62016 CASAVA_Build 1 227292674 1I TTGAAATTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 9 10 62017 CASAVA_Build 1 227307884 4I TAAACATGTG ----/GATT GATTGATTAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 GATT 2 3 62018 CASAVA_Build 1 227320595 1D AGCAGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2404 het 2404 ref 21 12 6 3 T 12 11 62019 CASAVA_Build 1 227321938 1D TTTGCTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 A 12 11 62020 CASAVA_Build 1 227324206 3D TTCTATTTTA TTG/--- TTATTGTTAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 TTG 1 0 62021 CASAVA_Build 1 227332344 1D CTCGTGACAG A/- AAAAATGGGA 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 A 6 5 62022 CASAVA_Build 1 227334732 2I GATGAGGCTG --/CC CCACATGAGC 3070 hom 107 het 45 0 35 10 C 2 4 62023 CASAVA_Build 1 227338433 1D TACTCACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 40 0 28 12 A 11 10 62024 CASAVA_Build 1 227351663 12D CCAGAGTATC TCATACACCACA/------------ TCACACACAG 3070 het 3070 hom 89 32 33 32 TCATACACCACA 1 0 62025 CASAVA_Build 1 227353027 4D GGTGACCACC CCCT/---- CCCCGTGCCA 3070 hom 87 het 31 0 25 7 CCCT 1 0 62026 CASAVA_Build 1 227363352 1I GTCCTGCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 494 hom 31 2 22 7 A 16 17 62027 CASAVA_Build 1 227367743 5D TTGTTAGGGG AATTA/----- AATTAGACAA 3070 hom 154 het 57 0 50 9 AATTA 2 1 62028 CASAVA_Build 1 227374566 2D GCTGCTTTCT CA/-- GTGTCTTCTC 3070 hom 87 het 33 0 28 7 CA 1 0 62029 CASAVA_Build 1 227375523 3D ACCCTGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 21 8 A 16 13 62030 CASAVA_Build 1 227382809 4I CACTCACACA ----/CACT CACACTCTCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CACT 0 1 62031 CASAVA_Build 1 227418484 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 11 12 62032 CASAVA_Build 1 227418664 3D ATGCAGTCAC AGA/--- AGAACAAGAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 AGA 2 1 62033 CASAVA_Build 1 227420790 2I TATATAGTCT --/TA TATATATATA 2039 het 1018 hom 8 3 5 0 TA 6 7 62034 CASAVA_Build 1 227421346 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTACT 2068 het 856 hom 26 4 7 15 TCTT 2 1 62035 CASAVA_Build 1 227422646 4I CTACCATCCA ----/CTAT CTATTATCCA 3070 hom 181 het 66 0 60 6 CTAT 1 2 62036 CASAVA_Build 1 227438318 6D TATGTGTGCC TTATTA/------ TTATTATTAT 3070 het 2177 hom 23 6 11 6 TTA 8 6 62037 CASAVA_Build 1 227439124 1I ATACCCAGAG -/T TTTTTTTATT 1298 het 1298 ref 14 5 3 6 T 7 8 62038 CASAVA_Build 1 227440187 1I TCTCACACAC -/T GGGGATGGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 62039 CASAVA_Build 1 227445137 1D TAGAATTAGG A/- AAGTTCATTT 3070 het 3070 ref 42 18 16 10 A 3 2 62040 CASAVA_Build 1 227457571 1D TTACATGCTA G/- GGGGAATTCT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 G 5 4 62041 CASAVA_Build 1 227467839 1I TTCAAGTCTT -/C TACTGAGCAG 3070 hom 96 het 36 0 31 5 C 0 1 62042 CASAVA_Build 1 227472949 1I TCCAAGAGGG -/C CCCGGCAGTT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 C 3 4 62043 CASAVA_Build 1 227508732 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2230 hom 23 7 11 5 T 10 9 62044 CASAVA_Build 1 227508876 1D CCATGCCTGG C/- CCCCCCCAGG 1696 het 1372 hom 9 3 6 0 C 8 7 62045 CASAVA_Build 1 227522277 6I GTAAGAGGGG ------/CATTTC CATTTCCCCC 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 CATTTC 1 2 62046 CASAVA_Build 1 227526800 1I TGTATTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2806 het 2806 ref 37 13 11 13 A 15 16 62047 CASAVA_Build 1 227530850 2I TACAAAAAAA --/AT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AT 0 1 62048 CASAVA_Build 1 227541466 1I AAGAAATGGG -/A AAAAAAAAAA 1880 het 1880 ref 31 19 7 5 A 14 15 62049 CASAVA_Build 1 227568280 1I GTACAGCCTG -/T GGAACTATGA 3070 het 3070 ref 48 27 11 10 T 0 1 62050 CASAVA_Build 1 227569032 1I TACCTGTCAT -/C CCAGCAGTTT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 C 2 3 62051 CASAVA_Build 1 227569748 1D TTAACGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 29 1 20 8 T 11 10 62052 CASAVA_Build 1 227586271 4D GTAAGTGTTG TTTT/---- TTTTTTTAAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 11 7 62053 CASAVA_Build 1 227627479 23D TGGGAGGCTG AGGTGGGTGGATCGCTTGAGGCC/----------------------- AGGAGTTTGA 3070 het 1528 hom 13 5 8 3 AGGTGGGTGGATCGCTTGAGGCC 1 0 62054 CASAVA_Build 1 227647217 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 9 10 62055 CASAVA_Build 1 227651081 3I TCCTGGGGTC ---/TGG ATCGGGACCG 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 TGG 0 1 62056 CASAVA_Build 1 227653269 1I CTAATTTTTG -/T TATTTTTAGT 3070 het 1469 hom 17 3 12 2 T 1 2 62057 CASAVA_Build 1 227653776 1D TCTTGTCTCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 A 9 8 62058 CASAVA_Build 1 227656291 1I TTTTTCTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 9 10 62059 CASAVA_Build 1 227659114 2I GTGTATTGTG --/TA TATATATATA 2904 het 2904 ref 32 16 10 6 TA 6 7 62060 CASAVA_Build 1 227668705 1D CTTCTCTCAG A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 8 7 62061 CASAVA_Build 1 227669367 4I TACTGAGATT ----/TTTA TTTAAGCGAT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 TTTA 1 2 62062 CASAVA_Build 1 227690033 4I AACAAAAATA ----/TTTG TTTGTATGAT 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 TTTG 1 2 62063 CASAVA_Build 1 227706349 2D ATATATACCA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 AT 6 5 62064 CASAVA_Build 1 227709895 1D AGCTCACTTA T/- GTAAAGCCTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 8 T 1 0 62065 CASAVA_Build 1 227725219 3I ATTATAGCAA ---/TTC TTCTTTTTTT 3070 hom 83 het 34 0 28 6 TTC 1 2 62066 CASAVA_Build 1 227729688 5D CCTTGTTGAG AGGAA/----- AGGAAAGGAA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 AGGAA 3 2 62067 CASAVA_Build 1 227730696 1I TTTTTTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 12 13 62068 CASAVA_Build 1 227748542 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1759 het 1390 hom 18 10 5 4 A 17 16 62069 CASAVA_Build 1 227759599 9D CTGACAACCT CACAGGCCC/--------- CACAGGCCCC 3070 het 3070 hom 35 12 20 9 CACAGGCCC 2 1 62070 CASAVA_Build 1 227770080 7D CGTCACTCTT AGAAGAC/------- AGACCAAGGT 3070 het 3070 ref 42 24 15 9 AGAAGAC 1 0 62071 CASAVA_Build 1 227770919 1D TTTTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1951 het 483 hom 10 1 5 4 T 15 14 62072 CASAVA_Build 1 227780669 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 7 4 62073 CASAVA_Build 1 227780932 2D GCCTCCTGGG TT/-- TTCAAGCGAT 1703 hom 15 het 7 0 5 3 T 4 2 62074 CASAVA_Build 1 227787312 1D CTTCTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 660 hom 33 8 10 15 T 19 18 62075 CASAVA_Build 1 227788739 1D AGTGGACTCC A/- ACAGCATACG 3070 hom 105 het 38 0 34 5 A 2 1 62076 CASAVA_Build 1 227789225 1D ATCCTTACTT A/- AAAAGGCCAC 3070 het 3070 hom 28 9 15 5 A 5 4 62077 CASAVA_Build 1 227794657 2D AGGTTCAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 26 0 23 4 A 14 12 62078 CASAVA_Build 1 227801646 1I TGTTATCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 11 12 62079 CASAVA_Build 1 227812180 1I AACAGTGAAT -/A AAACACCCAG 3070 het 3070 ref 37 15 17 5 A 3 4 62080 CASAVA_Build 1 227814817 1I GGAATTACTC -/T TACAATGGGA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 1 2 62081 CASAVA_Build 1 227815359 1I ATCCCAGCAA -/T TTTTTTTCCC 2995 het 2995 ref 33 16 10 7 T 7 8 62082 CASAVA_Build 1 227826977 1D TCTTAAAGAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 9 8 62083 CASAVA_Build 1 227833674 1D GTTTGATCTT C/- TATCCAGACC 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 C 1 0 62084 CASAVA_Build 1 227854570 1D AATAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1265 het 1265 ref 14 7 5 2 A 11 10 62085 CASAVA_Build 1 227862307 1D CATTTAGGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 16 14 7 T 9 8 62086 CASAVA_Build 1 227862590 1D CTGTGTAATA T/- TTTAAGTAAC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 4 3 62087 CASAVA_Build 1 227864875 1D TTTGGGGGAG T/- TTTTTTTTTT 1897 het 1897 ref 23 10 8 5 T 13 12 62088 CASAVA_Build 1 227867971 3D GCCTGGCCTT ATG/--- ATGACTTTTG 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 ATG 2 1 62089 CASAVA_Build 1 227884002 1I ATACAATGTC -/T TTCCAATCCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 2 3 62090 CASAVA_Build 1 227888844 1I GTTCTGGGCA -/T TGGACATGTC 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 1 2 62091 CASAVA_Build 1 227890356 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 2883 het 2883 ref 27 12 8 8 A 13 12 62092 CASAVA_Build 1 227895523 1I ACTGACTTGA -/T TTAGCTATAG 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 2 3 62093 CASAVA_Build 1 227902325 4D GGCCAGACTT AAAC/---- AGGCACCAAA 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 AAAC 1 0 62094 CASAVA_Build 1 227920508 2I TGCAGAAAAG --/GA GTAGGGGGTT 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 GA 0 1 62095 CASAVA_Build 1 227929349 1D TCAATTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1664 hom 24 7 13 4 A 12 11 62096 CASAVA_Build 1 227961048 1D AGCAACCAAA G/- ATCTTGTCTA 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 G 1 0 62097 CASAVA_Build 1 227963807 2D TGAGTTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 19 12 6 T 14 12 62098 CASAVA_Build 1 227970448 3D TTTATTCATT TTA/--- TTTTATTCTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 TTA 1 0 62099 CASAVA_Build 1 227971554 1D CACTTGGACC G/- GGGGGGGTGA 3070 het 3070 hom 40 18 14 8 G 8 7 62100 CASAVA_Build 1 227989221 3D TTCAAGTCTC CTT/--- CTCATCTGGC 3070 het 3070 ref 54 30 17 8 CTT 1 0 62101 CASAVA_Build 1 228004388 1D CCTCAGCAGC G/- CCAGCTCCTA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 1 0 62102 CASAVA_Build 1 228040671 3I AATATGGTCC ---/TTT TTTTTTAAAA 371 het 371 ref 19 9 3 7 T 6 9 62103 CASAVA_Build 1 228041478 3D TTCTACGATA AAC/--- ATATTTTATA 3070 het 3070 hom 31 8 19 6 AAC 1 0 62104 CASAVA_Build 1 228042170 3I CAACTTGGGG ---/GTT GTTGTCACCA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 GTT 1 2 62105 CASAVA_Build 1 228043398 1D AGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 1546 het 1546 ref 10 5 4 1 A 10 9 62106 CASAVA_Build 1 228043581 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2561 het 1933 hom 15 6 8 1 A 15 14 62107 CASAVA_Build 1 228044036 1D ACTTTCTTAG T/- TTAACTTGGC 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 T 3 2 62108 CASAVA_Build 1 228044505 3D GAAGTTTGGA ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 1874 hom 29 5 17 8 ATT 7 6 62109 CASAVA_Build 1 228057844 2I GATGAAAGAA --/TG TGTTTCCAGA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 TG 1 2 62110 CASAVA_Build 1 228084999 1I GATCCATTTG -/C CCCCCCCTCC 3070 hom 97 het 36 0 29 7 C 7 8 62111 CASAVA_Build 1 228174303 2I26M11D CTCACAACCC --CACATATGCATACACGCACACACCCCACCATGTACAT/CACACATACGCATATATGCACATACTCC----------- ACACACAGCC 3070 het 3070 ref 86 84 13 9 N/A 0 0 62112 CASAVA_Build 1 228174363 2I AAACATACAC --/AA ACACCCCATC 3070 het 3070 ref 61 41 13 7 A 1 3 62113 CASAVA_Build 1 228252928 4I ATCTCTACAA ----/AAAG AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAAG 0 1 62114 CASAVA_Build 1 228258512 1I GGGGTGCTTT -/A AAAAAAACCT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 7 8 62115 CASAVA_Build 1 228265679 1D AGTGTCCACC A/- AAAAAAAAAA 1699 het 1699 ref 22 11 6 5 A 17 16 62116 CASAVA_Build 1 228272074 1I TTCTCATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 36 1 30 5 A 10 11 62117 CASAVA_Build 1 228272170 1D CTAGCTATAG T/- TTTTTTAGAG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 T 7 6 62118 CASAVA_Build 1 228283864 1D ATAGCGTGTT A/- ATTTGAAAAC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 2 1 62119 CASAVA_Build 1 228295781 1D TAGATCACAG T/- TGTGTAAAGG 3070 hom 106 het 43 0 35 8 T 2 1 62120 CASAVA_Build 1 228296375 2D TTCGTCCACC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 110 het 45 0 35 12 TG 6 5 62121 CASAVA_Build 1 228303235 6D TGTATGGGAA ATATAC/------ ATGTACACAT 3070 het 3070 ref 63 34 27 2 ATATAC 1 0 62122 CASAVA_Build 1 228306100 1D AGCCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 A 11 10 62123 CASAVA_Build 1 228309151 2I GGAGTGTGTC --/TG TTGCCCAGTG 3070 hom 116 het 48 0 36 12 TG 0 1 62124 CASAVA_Build 1 228311212 4I CAGAGACTAT ----/CCGA CCGACCGCAT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 CCGA 1 2 62125 CASAVA_Build 1 228311315 1D GTCAGAATTG T/- TAAGTCGAGC 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 2 1 62126 CASAVA_Build 1 228313617 22D ACGTGTGCAT ACTAATTTGTGCACACGTGCAC/---------------------- ACTGCAATGT 3070 het 3070 ref 77 46 33 14 ACTAATTTGTGCACACGTGCAC 1 0 62127 CASAVA_Build 1 228322703 10D ATCAGGAACA GCCCTTGGAT/---------- GCCCTTGGAT 2352 het 138 hom 25 1 8 19 GCCCTTGGAT 2 1 62128 CASAVA_Build 1 228322723 4I GCCCTTGGAT ----/CCTG GCCTGCCTTG 3070 het 252 hom 22 1 11 10 CCTG 0 1 62129 CASAVA_Build 1 228328065 2I AGTGAGAAAC --/TG TGTTAAGGTA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 TG 1 2 62130 CASAVA_Build 1 228330048 1D CGGCCGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2701 hom 26 10 13 3 T 11 10 62131 CASAVA_Build 1 228330380 4D AGGCACAGAC TGAA/---- TGGGATGATT 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 TGAA 1 0 62132 CASAVA_Build 1 228334446 3D GCCTTTTTCC TCT/--- TCTTCTTCTC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 TCT 4 3 62133 CASAVA_Build 1 228337491 1D TGTCAATTTT A/- AGATGCATTC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 A 2 1 62134 CASAVA_Build 1 228337771 1I ATTTTCCAGC -/T TTTCTTCATC 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 T 3 4 62135 CASAVA_Build 1 228345090 4I TCTGTTCACC ----/TCCG TAAGTTCGCA 3070 hom 162 het 57 0 54 3 TCCG 0 1 62136 CASAVA_Build 1 228354148 3I GCAAAGTGAA ---/AAG AAGTTTATTA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 AAG 1 2 62137 CASAVA_Build 1 228361286 4D GGACCTAGTG TGTC/---- TGAGCAGTGC 3070 het 3070 ref 36 22 12 6 TGTC 1 0 62138 CASAVA_Build 1 228361700 21D TGCTTTTTCT CTTAAAGTGTTCAGCACTCCC/--------------------- CTGAGTTTAT 3070 het 3070 ref 40 26 17 3 CTTAAAGTGTTCAGCACTCCC 1 0 62139 CASAVA_Build 1 228362809 1I CTCTTCTTCC -/T AGCAGAAGAC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 0 1 62140 CASAVA_Build 1 228370554 2D AAAGTGTCGG GC/-- GCTCAGCTAA 2811 het 2811 ref 27 15 10 2 GC 2 1 62141 CASAVA_Build 1 228383928 1D TTTCGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 987 het 987 ref 24 16 3 5 T 13 12 62142 CASAVA_Build 1 228384563 2D TTTTTGTTTT TG/-- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 38 23 13 4 TG 1 0 62143 CASAVA_Build 1 228386561 1I AAGATCAATC -/T TTTTTTTTTT 2662 het 1222 hom 28 5 12 11 T 15 16 62144 CASAVA_Build 1 228387651 24D GCGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGC/------------------------ GCGTGTGTGT 3070 het 1765 hom 19 8 16 4 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGC 1 0 62145 CASAVA_Build 1 228389869 1I GGCAGCATCT -/G GGGTGGGGCT 2064 het 2064 ref 31 13 8 10 G 3 4 62146 CASAVA_Build 1 228394197 1I GCAGCGTTTG -/T TTTTTATCTG 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 5 6 62147 CASAVA_Build 1 228397699 4D TCAAGTTATT AGAC/---- AGAAGAGTGG 3070 het 3070 hom 37 10 19 12 AGAC 1 0 62148 CASAVA_Build 1 228398217 1I TGGACGTGAG -/T TTTGGGGCTT 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 T 3 4 62149 CASAVA_Build 1 228410282 4D ATTTCTTTTC TTTT/---- TATTTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 T 5 1 62150 CASAVA_Build 1 228411727 15I AGGGTGGCGC ---------------/CCTGATCCACCCCAT CCTGATCCAC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 CCTGATCCACCCCAT 0 1 62151 CASAVA_Build 1 228422651 1D GGTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 37 0 33 5 T 11 10 62152 CASAVA_Build 1 228425714 1I ATCTTACTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 8 9 62153 CASAVA_Build 1 228443033 1I TCTATATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 12 13 62154 CASAVA_Build 1 228452054 1D AAGCCCATGC T/- TTTAAGATTC 3070 hom 75 het 29 0 23 7 T 4 3 62155 CASAVA_Build 1 228454334 1I TGTAGCTGTG -/C CTAGAAGGTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 1 2 62156 CASAVA_Build 1 228467072 4D GCTTCAGAGA AAGT/---- GAGTCTTGCC 3070 het 3070 hom 45 20 25 0 AAGT 1 0 62157 CASAVA_Build 1 228467342 9D CTTCCTTTCC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 11 9 A 21 12 62158 CASAVA_Build 1 228468567 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 48 het 23 0 17 7 AAAC 5 4 62159 CASAVA_Build 1 228478077 3D TATATATACA CAC/--- CACATATACA 679 het 679 ref 36 24 3 9 CAC 2 1 62160 CASAVA_Build 1 228480394 2I TATTTGAAAC --/AA GAGCTTTGGG 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 0 2 62161 CASAVA_Build 1 228485002 10I TTGAGACGGA ----------/GTCTTGCTCT GTCACCTAGG 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 GTCTTGCTCT 0 1 62162 CASAVA_Build 1 228489271 1I AAAGACGTTA -/C CCCCATTTTA 3070 het 3070 hom 41 17 16 8 C 4 5 62163 CASAVA_Build 1 228495064 1I CCCAAACACA -/T TTTTTTCTTT 3041 het 3041 ref 28 15 8 5 T 6 7 62164 CASAVA_Build 1 228497156 4D2M2I CCACACCTGT TATACC--/----CCCA ACATTGCTTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 6 N/A 0 0 62165 CASAVA_Build 1 228498216 4D CAATTATTAT TAAG/---- TATCTTGACA 3070 het 3070 ref 28 18 9 3 TAAG 1 0 62166 CASAVA_Build 1 228503704 1I TCCCAGTCTG -/A AAAAAAATAA 2059 het 2059 ref 19 10 6 3 A 7 8 62167 CASAVA_Build 1 228511259 1I GTCTTGAGCG -/C TGCCACCTGC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 0 1 62168 CASAVA_Build 1 228516113 1D ATTTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 A 11 10 62169 CASAVA_Build 1 228518141 4I TATATTATAG ----/ATGT ATGTATGCAT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 ATGT 1 2 62170 CASAVA_Build 1 228518218 2D GATGCATATC TG/-- TATACATGTG 2755 het 2755 ref 25 14 7 4 TG 1 0 62171 CASAVA_Build 1 228518455 4D24M5D GTTTATGTGT ATACATACATATGTTTATGTGTACACATATATC/----ATACATATGTTTATGTGTACACAT----- TATGTGTATA 3070 het 3070 ref 38 26 7 15 N/A 0 0 62172 CASAVA_Build 1 228526057 1D ATCCCAAAGG C/- CCCCCCTCAC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 C 7 6 62173 CASAVA_Build 1 228534397 3I3M7I10M9I ACACACACCA ---CAC-------ACACACCACA---------/TGCCACCAAAAATACATATCACATACACACTC CACAGCACAC 1794 het 1794 ref 24 16 7 5 N/A 0 0 62174 CASAVA_Build 1 228536975 1I CCCCCAGGGT -/G GGGGGGACAG 3070 het 3070 hom 40 13 14 13 G 6 7 62175 CASAVA_Build 1 228538132 8D13M2I ACAGATACAC AGATACAGACAGACACACACA--/--------ACAGACACGCAGATG CACACACAGG 1722 het 1722 ref 48 38 8 8 N/A 0 0 62176 CASAVA_Build 1 228538178 2D48M20D AGACACACAG ACACATACACTGACACAGACATACACATACACACACAGACACACAGATACACACACAGATGCATACACGG/--ACATACACTGACACAGACATACACATACACACACAGACACACAGATAC-------------------- ACACACAGAT 3070 het 3070 hom 25 19 11 25 N/A 0 0 62177 CASAVA_Build 1 228539208 4I GGGGACACAC ----/AAAG AAATGCCCCG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 AAAG 0 1 62178 CASAVA_Build 1 228542018 3I TGTGGCATAT ---/GTG ACACAAGATG 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 GTG 0 1 62179 CASAVA_Build 1 228544927 4D ACAGCCACTT GAGA/---- GAGTTGTGAA 3070 het 3070 ref 51 24 21 8 GA 3 1 62180 CASAVA_Build 1 228567004 1I AGTTAGCAAT -/G AAAAATAAAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 G 0 1 62181 CASAVA_Build 1 228568738 1D CCTGTTCCTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 8 het 38 1 31 6 T 9 8 62182 CASAVA_Build 1 228570200 18D CTACAAAGAG CATTCTCGCGTCCAATTT/------------------ CATTCTCGCA 3070 hom 72 het 25 0 24 6 CATTCTCGCGTCCAATTT 1 0 62183 CASAVA_Build 1 228571162 2I CCGGGGAAAC --/GT GTGTGTGTAT 3070 hom 118 het 44 0 40 4 GT 4 5 62184 CASAVA_Build 1 228571987 2I TGCTTACTCC --/GA GTGTCTGTGT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 GA 0 1 62185 CASAVA_Build 1 228572783 4I GGAAACATCC ----/TATT TATTTATCAA 3070 hom 111 het 41 0 36 5 TATT 1 2 62186 CASAVA_Build 1 228585298 1D TTCATTGTAA G/- GATGCAGGCT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 G 2 1 62187 CASAVA_Build 1 228593546 1I GGGAGGGAGC -/T TGCTACCAGC 3070 hom 58 het 22 0 18 4 T 1 2 62188 CASAVA_Build 1 228601428 1I AGGTTACTAA -/G GGGGGGGTGG 3070 hom 42 het 17 0 13 4 G 7 8 62189 CASAVA_Build 1 228651707 1D ACAATGCAGG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 38 16 15 8 A 8 7 62190 CASAVA_Build 1 228652551 2D AAGTATACTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 114 het 51 0 39 12 TA 6 5 62191 CASAVA_Build 1 228654972 1D CACTGTTACA C/- CCCCCAGTTC 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 C 6 5 62192 CASAVA_Build 1 228656500 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 8 7 62193 CASAVA_Build 1 228658148 2I TCTCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTG 2604 het 2604 ref 29 14 9 6 T 9 11 62194 CASAVA_Build 1 228667601 1D CAGACTCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 12 10 T 11 10 62195 CASAVA_Build 1 228686793 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 9 10 62196 CASAVA_Build 1 228692570 2I AGAAGGATCT --/GA GAGACAATTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 GA 2 3 62197 CASAVA_Build 1 228753170 1D TTTTCTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 31 2 26 3 T 12 11 62198 CASAVA_Build 1 228755227 2D TTTAAACAAC AG/-- AGAGAGAGAG 1040 het 1040 ref 52 39 4 10 AG 9 8 62199 CASAVA_Build 1 228757878 4D ACGACTACTT GTTA/---- GTTAGAGTCT 3070 hom 135 het 49 0 46 6 GTTA 2 1 62200 CASAVA_Build 1 228763678 2D AAAAGAGAAG AC/-- ACAATAAATG 3070 hom 116 het 43 0 37 6 AC 2 1 62201 CASAVA_Build 1 228769054 4I GAGACAGGCA ----/TGTT ATAACATGCT 3070 het 3070 ref 39 25 10 4 TGTT 0 1 62202 CASAVA_Build 1 228771525 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 63 het 30 0 21 9 TG 8 7 62203 CASAVA_Build 1 228772799 2I TGCCTTTTCA --/CT CTGTTGCTAT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 CT 1 2 62204 CASAVA_Build 1 228773876 1I TATTTCTTTG -/C CAGATGTAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 1 2 62205 CASAVA_Build 1 228777191 2D ATGTGTGTGT TG/-- TGTGTTGTTT 3070 het 3070 hom 73 25 39 11 TG 3 2 62206 CASAVA_Build 1 228778047 2I TGAATTCTAA --/TG GAGAGGCAAG 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 TG 0 1 62207 CASAVA_Build 1 228781470 1I TGACAGAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 8 A 9 10 62208 CASAVA_Build 1 228782349 1D GAAAGTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 47 3 37 7 T 11 10 62209 CASAVA_Build 1 228788248 2I CATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TA 5 6 62210 CASAVA_Build 1 228793570 4D AACTTGCAAA TCTC/---- TCTAAGAAAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 TC 3 1 62211 CASAVA_Build 1 228801110 1I AGGAAATTAC -/A AAGGCTTTAG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 2 3 62212 CASAVA_Build 1 228806974 1D ACAGCCCTCA T/- TTACTTCAGC 3070 hom 39 het 14 0 11 3 T 3 2 62213 CASAVA_Build 1 228813510 12I CCAGGGAAAC ------------/TGCTACATTAAG ATACGTTGGT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 TGCTACATTAAG 0 1 62214 CASAVA_Build 1 228845959 8I TGACATAATG --------/TTTTCTAT TTTTCTAGAT 3070 hom 123 het 43 0 40 4 TTTTCTAT 0 1 62215 CASAVA_Build 1 228849071 1D GGGGAAGATG A/- AAAAAACCAA 3070 hom 128 het 44 0 42 2 A 7 6 62216 CASAVA_Build 1 228854577 3I CAGCACCACC ---/AGG ACCCTCCCAT 3070 hom 87 het 34 0 25 9 AGG 0 1 62217 CASAVA_Build 1 228860473 1D CAGTTTTGTT C/- CCTTGCTGGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 3 2 62218 CASAVA_Build 1 228885919 3D TAAACATTAA TTC/--- TTCTTCTTGT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 TTC 3 2 62219 CASAVA_Build 1 228911806 1D CTGTCTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1316 hom 22 5 9 8 A 17 16 62220 CASAVA_Build 1 228914186 3D GACCACGTAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 30 1 15 15 A 19 16 62221 CASAVA_Build 1 228956779 2I ATATAGAATA --/AT ATATATATAT 3070 hom 42 het 22 0 15 7 AT 5 6 62222 CASAVA_Build 1 228962147 1D GCCACATTTT A/- TCATGGAATA 3070 het 3070 hom 52 22 28 2 A 1 0 62223 CASAVA_Build 1 228963233 29D TCTAAACCAG AACCAGAACCAGCAGAACTACTGCCTCTA/----------------------------- AACCAGAACC 3018 het 3018 ref 32 18 10 11 AACCAGAACCAGCAGAACTACTGCCTCTA 1 0 62224 CASAVA_Build 1 228983596 1D TAGCTCTGCT C/- CCTCGCTCCC 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 C 3 2 62225 CASAVA_Build 1 228986975 2D CTTCCATATG GT/-- GTTAAGCCTG 3070 het 3070 ref 36 18 11 9 GT 2 1 62226 CASAVA_Build 1 228989126 4I AGTGGGTAGA ----/CTAT CTTTTAATTG 3070 het 3070 ref 28 10 8 10 CTAT 0 1 62227 CASAVA_Build 1 228992972 4I CACTCATCTA ----/CTTT CTTTCTCTAT 3070 het 3070 ref 31 14 10 8 CTTT 1 2 62228 CASAVA_Build 1 229014596 1D TTTCTAAGGG T/- TTTTTATGTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 6 5 62229 CASAVA_Build 1 229016294 8D TGAGTTTATA GTTTTCAT/-------- GTTTTCATTA 3070 het 3070 ref 31 19 13 4 GTTTTCAT 2 1 62230 CASAVA_Build 1 229018723 1D CATGACTATA G/- GTTGTCTAGA 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 G 2 1 62231 CASAVA_Build 1 229026624 1D AGGCCCCCTG C/- CCCCCCCTCA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 8 7 62232 CASAVA_Build 1 229031653 1D TCTTCCTGTT C/- TCTTGTTGAT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 C 1 0 62233 CASAVA_Build 1 229032042 1D TTAAAATCCG A/- AAAAAAGGCT 3070 hom 81 het 32 0 27 6 A 7 6 62234 CASAVA_Build 1 229037823 1I CACCTCGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 6 A 11 12 62235 CASAVA_Build 1 229038421 1D CTGCTCTTAA T/- TTTTAAAGTT 3070 hom 94 het 36 0 32 4 T 5 4 62236 CASAVA_Build 1 229038573 15D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAC/--------------- CTCCCAGAAA 3070 hom 84 het 27 0 28 4 AAAAAAAAAAAAAAC 1 0 62237 CASAVA_Build 1 229053954 1D TCCCCACTGG C/- CCCCTCTCCC 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 C 5 4 62238 CASAVA_Build 1 229076420 1I CTAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 24 9 4 A 9 10 62239 CASAVA_Build 1 229077113 1I CCAAGAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 11 12 62240 CASAVA_Build 1 229078436 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1620 hom 27 7 9 11 A 14 13 62241 CASAVA_Build 1 229086397 1I TAGTAATTCC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 35 20 8 7 A 8 9 62242 CASAVA_Build 1 229104573 1D CATGGTGAAA C/- CCCCCCCTCT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 8 7 62243 CASAVA_Build 1 229110363 18I CGTCAGGGAT ------------------/AATTCCTGGCTGCTGTAA AATTCCTGGC 3070 hom 117 het 51 0 39 12 AATTCCTGGCTGCTGTAA 0 1 62244 CASAVA_Build 1 229116759 5D ATTTTCCTTA TTATT/----- TTCTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 23 6 TTATT 1 0 62245 CASAVA_Build 1 229134666 1I TAAAAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2302 hom 32 6 19 7 T 14 15 62246 CASAVA_Build 1 229139054 27I ATTACATCAT ---------------------------/ATTACTATATGCAATACTAAATATGCA ATAGTAAATA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 ATTACTATATGCAATACTAAATATGCA 0 1 62247 CASAVA_Build 1 229151593 1I43M1D TTCTTCCCAA -AGGGAAGCAAGCAGGACAACATGGCTAATAATAGTGGGGTGCAG/CGGGGAAGCAAGCAGGACAACATGGCTAATAATAGTGGGGTGCA- GTCAATGGAA 3070 hom 123 het 31 0 42 9 N/A 0 0 62248 CASAVA_Build 1 229157821 2D TCACAAGGTC AG/-- GAGATCGAGA 2874 hom 21 het 9 0 8 1 AG 1 0 62249 CASAVA_Build 1 229158022 2D CCTGGGCGAC AG/-- AGAGAGACTC 3070 hom 30 het 21 0 13 8 AG 4 3 62250 CASAVA_Build 1 229158835 1I ATAACTGTCT -/G GGTCTTGCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 2 3 62251 CASAVA_Build 1 229160195 22D GCCTCATGAG TAAAATAACTTAAAGTTTAAGT/---------------------- TAAAATAACT 3070 hom 96 het 38 0 33 14 TAAAATAACTTAAAGTTTAAGT 1 0 62252 CASAVA_Build 1 229160409 1D CATCCAAACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 77 het 32 0 26 7 T 10 9 62253 CASAVA_Build 1 229162947 1I TTTGTTTGAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 1085 hom 33 4 20 9 G 0 1 62254 CASAVA_Build 1 229165800 8I TTGAGCCCAG --------/GAGTTTGA GAGTTTGAGA 3070 hom 98 het 40 0 30 10 GAGTTTGA 1 2 62255 CASAVA_Build 1 229169540 3D AATTTAGCAC CTT/--- ATTATACTAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CTT 1 0 62256 CASAVA_Build 1 229169773 1D TCCTATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 11 10 62257 CASAVA_Build 1 229170554 2D CTATGGTGGT GG/-- GGGGGGGGCC 2081 het 1432 hom 22 6 7 10 G 10 8 62258 CASAVA_Build 1 229170585 1I TATTGTGGTT -/A AAAAAAAAAA 2631 het 2410 hom 21 8 8 5 A 10 11 62259 CASAVA_Build 1 229170670 11I32M1I TATGCACACT -----------GACCTCCAGAACTTCTTAATCATTCTTTTTTT-/GATGTGAAACAGACCTCCAGAACTTCTTAATCATTCTTTTTTTA AAAAAAACAA 3070 hom 75 het 25 0 26 4 N/A 0 0 62260 CASAVA_Build 1 229171528 1D CTATCCGAGA G/- GCTGAGGCAG 1638 hom 22 het 10 0 6 4 G 2 1 62261 CASAVA_Build 1 229173559 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 1667 hom 11 het 8 0 5 3 A 7 8 62262 CASAVA_Build 1 229182199 1I TTTCCATCTC -/A AGAGTTAAGG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 1 2 62263 CASAVA_Build 1 229182696 1D CTTATTTCGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 73 het 34 0 30 5 T 10 9 62264 CASAVA_Build 1 229188291 2I TTAAGCAGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 T 13 15 62265 CASAVA_Build 1 229204739 2D GGGCTTAAAC AG/-- AGTGAAAGAA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 AG 2 1 62266 CASAVA_Build 1 229208915 1D GCATTCCCCC T/- GAGAACTGAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 0 62267 CASAVA_Build 1 229210056 1D AACAAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 34 1 27 6 A 13 12 62268 CASAVA_Build 1 229213592 4D GATGGTGTAC AATG/---- AGTGAGTGAT 1325 het 492 hom 24 5 7 13 AATG 1 0 62269 CASAVA_Build 1 229214748 1I CAGCTAATCC -/T TTTTTTTTTT 2379 het 144 hom 15 1 8 6 T 10 11 62270 CASAVA_Build 1 229223779 1D CTTCTTCTCT G/- GAGTGCGCCG 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 G 2 1 62271 CASAVA_Build 1 229225301 3I GGAACCTTAC ---/CCA CCATGCTCCA 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 CCA 1 2 62272 CASAVA_Build 1 229226572 1D AATTTGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 A 13 12 62273 CASAVA_Build 1 229234705 1I AACTGCGCTC -/A AAAAAACCCT 2561 hom 15 het 7 0 6 1 A 6 7 62274 CASAVA_Build 1 229234995 4D CCAAAGAGCT TTTG/---- TTTATGTGAG 3070 het 3070 hom 33 16 17 3 TTTG 1 0 62275 CASAVA_Build 1 229249150 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 27 3 10 14 A 15 14 62276 CASAVA_Build 1 229263214 1D TGGGATGGAT C/- CCCCGATACT 3070 hom 102 het 42 0 32 10 C 5 4 62277 CASAVA_Build 1 229265705 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2462 het 127 hom 20 2 12 7 A 17 16 62278 CASAVA_Build 1 229271994 1I CGCTTCCTGG -/A GGCCAGTGAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 1 62279 CASAVA_Build 1 229274365 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 1309 het 1309 ref 20 9 6 5 A 15 16 62280 CASAVA_Build 1 229277828 1D TTTAATTGTA T/- TTTTTCCAGG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 6 5 62281 CASAVA_Build 1 229300388 1D GCTTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2820 het 1904 hom 11 4 7 0 T 7 6 62282 CASAVA_Build 1 229304302 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2063 het 948 hom 26 8 6 12 A 15 14 62283 CASAVA_Build 1 229315217 1I GGGAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 10 11 62284 CASAVA_Build 1 229318110 1D ATTTATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2770 hom 24 9 9 6 T 13 12 62285 CASAVA_Build 1 229320734 1D CAGCATCTGC A/- AAGCCAAGTA 3070 het 3070 ref 35 13 13 10 A 3 2 62286 CASAVA_Build 1 229322129 3D GCTTAACTGA AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 het 3070 hom 43 13 18 15 AGG 7 6 62287 CASAVA_Build 1 229328834 1D TTGCTTTTTT C/- CCCATGAGTG 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 C 4 3 62288 CASAVA_Build 1 229347074 1D TCAAAAAGTC A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 7 6 62289 CASAVA_Build 1 229347925 1I ATGTGGAAGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 8 9 62290 CASAVA_Build 1 229356816 1D TTTTTGCAAG C/- TTCATTATTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 4 C 1 0 62291 CASAVA_Build 1 229359912 1D TGATTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 535 hom 36 2 29 6 T 13 12 62292 CASAVA_Build 1 229361799 1I CACTAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3064 het 75 hom 23 2 16 5 A 15 16 62293 CASAVA_Build 1 229394572 2D ACTCTCCCTG TC/-- TCTCTCTCTC 2383 het 2383 ref 26 9 7 10 TC 9 8 62294 CASAVA_Build 1 229398945 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2226 hom 30 10 14 6 A 14 13 62295 CASAVA_Build 1 229404699 4D AGGAAGAGAA GGAG/---- GGAGAAGAAT 3070 het 3070 ref 52 30 15 9 GGAG 2 1 62296 CASAVA_Build 1 229425890 1I TCCGTCTCAC -/A AAAAAAAAAA 1532 het 1532 ref 18 5 7 6 A 13 14 62297 CASAVA_Build 1 229462740 2I GTTGGGAAGT --/TA TGTCAATTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TA 0 1 62298 CASAVA_Build 1 229463109 1D AAAATTAAAC A/- AAAAAAAAAA 1044 het 1044 ref 35 29 3 3 A 11 10 62299 CASAVA_Build 1 229490117 6D CGTCTCCAAA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 AAT 5 3 62300 CASAVA_Build 1 229518510 6D AAAACAGTGG CCAGGC/------ GCAGGCGCAG 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 CCAGGC 1 0 62301 CASAVA_Build 1 229526995 4D AAAAGAAAAT AAAC/---- CATGAAGTGA 3070 het 3070 hom 34 13 16 7 AAAC 1 0 62302 CASAVA_Build 1 229543168 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 6 A 11 12 62303 CASAVA_Build 1 229553195 4D TGTTGTTAGC GTCA/---- GTCAGGCATT 3070 het 3070 ref 36 25 10 2 GTCA 2 1 62304 CASAVA_Build 1 229557443 1I TAGAGGATCA -/T TTTCTCTAAA 3070 het 2306 hom 21 6 12 3 T 3 4 62305 CASAVA_Build 1 229560221 1D TAGAAGTTAT A/- ATGATTACAT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 2 1 62306 CASAVA_Build 1 229561881 1I CTTCCTCTGT -/G TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 G 0 1 62307 CASAVA_Build 1 229563824 1D TAGCACAGCC A/- TAACAGGAAC 3070 het 3070 hom 49 22 18 9 A 1 0 62308 CASAVA_Build 1 229566977 1I CACTACACAA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 54 19 31 4 T 7 8 62309 CASAVA_Build 1 229570861 4I TGAAAATCTG ----/ACTT ACTTAGAATA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 ACTT 1 2 62310 CASAVA_Build 1 229577394 4D ATTATGAAGA AAAC/---- AAACAAAGAC 3070 het 3070 ref 37 21 12 7 AAAC 2 1 62311 CASAVA_Build 1 229577677 31D CTCCTGCCTC AGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCTTG/------------------------------- AGCCACCACG 3070 het 2813 hom 19 8 14 3 AGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCTTG 1 0 62312 CASAVA_Build 1 229581159 1I ACAGGGATAC -/A AAAGCTTAGA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 3 4 62313 CASAVA_Build 1 229582427 2I TTGGAAACTT --/GA GTGTGGAACT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 GA 0 1 62314 CASAVA_Build 1 229582834 4I37M4I AAATGATAGG ----TATATATATATTTTAAAAAGACATATAAGGGCATATA----/TGTATATATATATATTTTAAAAAGACATATAAGGGCATATAGATT GTTTCCTTAA 2516 het 2516 ref 26 18 8 10 N/A 0 0 62315 CASAVA_Build 1 229586775 1I CATTACGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 11 12 62316 CASAVA_Build 1 229588487 1I GCCCGGCTGG -/T TTTTTTTTTT 2192 het 2192 ref 22 9 7 6 T 10 11 62317 CASAVA_Build 1 229588923 4D GAAAAGTTAC TTAA/---- TTATTTATAT 3070 het 3070 hom 37 15 20 6 TTAA 1 0 62318 CASAVA_Build 1 229590645 4I ACTGTAAGAA ----/AATT AATTAAGAGG 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 AATT 1 2 62319 CASAVA_Build 1 229593838 5D CCTGCACTGC TTCCT/----- TTATGACGAC 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 TTCCT 1 0 62320 CASAVA_Build 1 229595541 1I AGAAAAGCTG -/A AGAGATCAAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 1 2 62321 CASAVA_Build 1 229597786 2D AGTAAGAGCC AA/-- ACCACTTAGT 3070 het 3070 hom 46 19 25 3 A 3 1 62322 CASAVA_Build 1 229598619 1D24M3D CACTGGCTTC TTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGAGATTGG/-TTTTTTTTTTTTCTTTTTTGAGAT--- GGAGTCTCGC 2491 het 1937 hom 21 10 7 8 N/A 0 0 62323 CASAVA_Build 1 229600013 1I TGCATCAAAA -/C CATGAGGATT 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 C 1 2 62324 CASAVA_Build 1 229600705 1I CATCTTTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 T 8 9 62325 CASAVA_Build 1 229601118 1D CACGGCTACT G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 59 33 22 4 G 5 4 62326 CASAVA_Build 1 229602673 2D AAATAGTAGG TA/-- TATATATATT 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 TA 5 4 62327 CASAVA_Build 1 229603953 4I CATGAAGAGC ----/TAAT TAAATAATTT 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 TAAT 0 1 62328 CASAVA_Build 1 229604694 3D TTTATCAGTG TTT/--- TTCTTTTATG 3070 het 3070 hom 31 11 16 7 T 5 2 62329 CASAVA_Build 1 229605279 1I TATCTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 12 13 62330 CASAVA_Build 1 229611385 1I ATACAAAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 27 9 11 7 A 8 9 62331 CASAVA_Build 1 229612272 1I GTCTAAAATC -/A AGAGAGCAAT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 1 2 62332 CASAVA_Build 1 229615384 3D ATTTCCTATC CTA/--- CTACATCAAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 CTA 2 1 62333 CASAVA_Build 1 229616356 1I AAAGGTGGCA -/G GAAAAGTTGA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 G 1 2 62334 CASAVA_Build 1 229617822 1I CTTCTCTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 A 9 10 62335 CASAVA_Build 1 229619596 4D CCTAACTAAT TAAC/---- TACAGTAATA 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 TAAC 1 0 62336 CASAVA_Build 1 229620466 3D TAAAATCACT ATA/--- ATGTTATGAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 6 ATA 1 0 62337 CASAVA_Build 1 229621954 3D TTCTTAAAAA TTT/--- TATCAATGAA 3070 het 3070 hom 40 15 24 3 T 4 1 62338 CASAVA_Build 1 229631004 4D TCTCGTGAGA ACTC/---- ACTCACTATC 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 ACTC 2 1 62339 CASAVA_Build 1 229659484 1I CTATGTACTT -/A ACAACGAACT 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 A 1 2 62340 CASAVA_Build 1 229688480 1D AATCAGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 11 10 62341 CASAVA_Build 1 229712561 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 834 het 834 ref 13 7 2 4 A 13 14 62342 CASAVA_Build 1 229715245 1I TTGGAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 10 11 62343 CASAVA_Build 1 229743966 4I ATAAGAAAAA ----/TATT TATTTATCCA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TATT 1 2 62344 CASAVA_Build 1 229754677 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAACCC 1797 het 1797 ref 26 18 5 3 A 7 8 62345 CASAVA_Build 1 229754925 1I CATGTGGTAC -/T CAGAGAAATA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 0 1 62346 CASAVA_Build 1 229759353 1D TGATGTCGTT A/- ACATATTAAA 3070 hom 141 het 54 0 47 8 A 2 1 62347 CASAVA_Build 1 229766870 5D GTGTGTGTGT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 38 16 18 4 TTTTG 3 2 62348 CASAVA_Build 1 229774090 4D GACAGGACTT TGTC/---- TGTCTCCTTT 3070 het 3070 hom 37 16 20 4 TGTC 2 1 62349 CASAVA_Build 1 229791498 1D GGAGCCAAGA C/- CCCCGAGGTA 3070 het 3070 hom 52 26 25 2 C 5 4 62350 CASAVA_Build 1 229792714 2D CCCCTTTTTT AA/-- AGAGATAGGA 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 A 3 1 62351 CASAVA_Build 1 229802569 1I CTGACCATGG -/C CTCTTAGTTG 3070 hom 120 het 45 0 37 8 C 1 2 62352 CASAVA_Build 1 229803849 1I TTAATTCCAC -/T TTATCATAAT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 2 3 62353 CASAVA_Build 1 229805737 1I AAATACAAAA -/G AATTAGCCGG 1400 hom 7 het 3 0 3 0 G 0 1 62354 CASAVA_Build 1 229822454 1I TAAATGTGGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 24 het 37 1 31 5 A 9 10 62355 CASAVA_Build 1 229825016 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 11 62356 CASAVA_Build 1 229826676 1I GGCTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 575 hom 28 2 21 5 T 10 11 62357 CASAVA_Build 1 229837291 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 10 11 62358 CASAVA_Build 1 229842857 2D ACCTCCGAAA CT/-- CAGCTTCCAA 3070 het 3070 ref 39 16 15 9 CT 1 0 62359 CASAVA_Build 1 229862562 3I GATAGTTAGC ---/TCT TCTTGTTGAA 2391 het 2391 ref 37 27 7 3 TCT 1 2 62360 CASAVA_Build 1 229881027 4D CGTTGCTCTA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 48 20 19 10 TC 8 6 62361 CASAVA_Build 1 229891025 1D TGAATTCTCC T/- TCCTCCATGA 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 T 2 1 62362 CASAVA_Build 1 229897996 2D CTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 65 22 27 17 GT 6 5 62363 CASAVA_Build 1 229910087 2D TCTTTTTATG AT/-- ATGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 AT 2 1 62364 CASAVA_Build 1 229913393 1D TGATTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 2403 het 2403 ref 56 40 6 11 T 12 11 62365 CASAVA_Build 1 229920806 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2639 het 1823 hom 30 9 8 13 T 17 16 62366 CASAVA_Build 1 229923989 1D CTGTTCAACA T/- TTTTTGGATC 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 6 5 62367 CASAVA_Build 1 229925617 1D GTATTTATTG A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 114 het 41 0 38 4 A 8 7 62368 CASAVA_Build 1 229931196 1I TTCTCCTTAG -/T TATTTATAGA 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 T 1 2 62369 CASAVA_Build 1 229935322 1I TAGAAGCAGT -/G GGTAGTGGTG 369 het 369 ref 63 36 3 25 G 2 3 62370 CASAVA_Build 1 229935470 6I28M6D12M6I GGGTAGAGTT ------GGTGATGGTGGTAGTGGTAGGAGTGGTGGTGATAGTGGTGGTAGGA------/TATAGGAGTGGTGGTGGTTATGGTAGGAGTGGTG------GTGGTTGTAGCAGAGTTG GTGATGGTGG 3070 het 3070 ref 48 55 12 26 N/A 0 0 62371 CASAVA_Build 1 229935723 19D ATTGCAGTAG GAGTGGTGGTAGTGGTAGT/------------------- GAGTGGTGGT 3070 het 3070 ref 63 39 14 26 GAGTGGTGGTAGTGGTAGT 1 0 62372 CASAVA_Build 1 229936851 2D GCATCACGTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 CT 9 8 62373 CASAVA_Build 1 229945155 1I5M2I GGCACATGCC -AGTAG--/AAGTAGCC TCCCAGCTAC 3070 het 3070 ref 27 12 12 4 N/A 0 0 62374 CASAVA_Build 1 229947402 2D GCATTATGCA AT/-- ATGTAATTAA 3070 het 1057 hom 16 3 10 3 AT 2 1 62375 CASAVA_Build 1 229947427 1I TTTTTTAAAT -/A AAAAAAATTT 1749 het 199 hom 14 1 5 8 A 7 8 62376 CASAVA_Build 1 229964305 2I AACGAGTAAC --/TG TGCAAACAGG 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 TG 1 2 62377 CASAVA_Build 1 229968790 1I TGCTGGGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 9 10 62378 CASAVA_Build 1 229970918 4D ATTCCTGAGA CAGT/---- CAGAGTGTAC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 CAGT 1 0 62379 CASAVA_Build 1 229972657 1D CGTAGAAATT A/- ACATTTATTT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 2 1 62380 CASAVA_Build 1 229974340 1D CATCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 2390 het 204 hom 23 1 13 9 T 15 14 62381 CASAVA_Build 1 229983661 3I TATTTTATAA ---/TGT TGTATTTTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TGT 1 2 62382 CASAVA_Build 1 229996619 1D TTTCATTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 37 0 30 8 T 11 10 62383 CASAVA_Build 1 230002240 1D CCCTTCCCTT C/- CCCTTCCCCT 915 hom 18 het 7 0 7 0 C 4 3 62384 CASAVA_Build 1 230011771 1I TTTGGATATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 10 11 62385 CASAVA_Build 1 230015169 3D CATCACTGAG CTC/--- CTGACCAATT 3070 hom 108 het 39 0 37 4 CTC 1 0 62386 CASAVA_Build 1 230025608 2I TAGAAGAAAC --/AT TGATGAAAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AT 0 1 62387 CASAVA_Build 1 230034039 2I AGTTTTTATT --/AA AGAGGCATTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 1 3 62388 CASAVA_Build 1 230052081 1I TGAGTTATTA -/T TACAAGCTCG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 1 2 62389 CASAVA_Build 1 230057088 1D AAAATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 28 0 13 15 T 17 16 62390 CASAVA_Build 1 230061939 1I CCATCACTTT -/G GGGGTTAGGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 4 5 62391 CASAVA_Build 1 230071262 3D TCTAAAAAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 24 0 20 5 A 15 12 62392 CASAVA_Build 1 230073358 1I ATATGTACCC -/A GCATTTTTCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 1 62393 CASAVA_Build 1 230076218 1I TCTTAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 20 1 9 10 T 11 12 62394 CASAVA_Build 1 230081460 1D GTGTTTCCGA T/- TTTTTTTTTT 1289 het 1289 ref 40 27 4 9 T 13 12 62395 CASAVA_Build 1 230083126 2D AAGGCAAGGT GG/-- GGGGGGGGTG 3070 hom 110 het 44 0 37 7 G 10 8 62396 CASAVA_Build 1 230084144 1I AGAGCCAGTG -/A AAATGTTCTC 3070 hom 156 het 59 0 52 7 A 3 4 62397 CASAVA_Build 1 230097994 1I CTGTGCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 11 12 62398 CASAVA_Build 1 230123931 3I AATATGTGAA ---/ATT ATGATTGGAT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 ATT 0 1 62399 CASAVA_Build 1 230142119 1D GCTTATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2145 hom 26 8 9 10 T 11 10 62400 CASAVA_Build 1 230150220 1D ACAGACGTAT A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 27 8 12 8 A 7 6 62401 CASAVA_Build 1 230165623 1D TGCCATTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 11 10 62402 CASAVA_Build 1 230189659 1D CCCTGAAAGA T/- TTTTTTCGCT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 7 6 62403 CASAVA_Build 1 230203485 2I AGTCTCACTC --/TG TCACCCAGGC 3070 het 94 hom 17 1 15 2 TG 0 1 62404 CASAVA_Build 1 230206803 2D ATGAACAAAC AT/-- GTAACAATAC 3070 hom 96 het 34 0 33 4 AT 1 0 62405 CASAVA_Build 1 230208301 1I AAATTCCTGA -/T TTTTGGTTTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 4 5 62406 CASAVA_Build 1 230211827 4I TATATGATGT ----/TTAC TTATATATTT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TTAC 0 1 62407 CASAVA_Build 1 230214530 1D GCTAGCAACA G/- CTATTTGTTT 3070 hom 160 het 61 0 54 7 G 1 0 62408 CASAVA_Build 1 230216379 1D AAAGTACTCA G/- GCATACCAAA 3070 hom 123 het 49 0 42 9 G 2 1 62409 CASAVA_Build 1 230225425 1D TTCAGGTAAA T/- TTTCTTCCTT 3070 het 3070 ref 29 14 8 9 T 4 3 62410 CASAVA_Build 1 230226433 2I TGTATGTGTG --/TA TATATATATA 2999 het 2999 ref 26 15 9 2 TA 7 8 62411 CASAVA_Build 1 230229132 5D TTCTTTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1632 het 28 hom 21 1 7 13 T 22 17 62412 CASAVA_Build 1 230229898 3I TTGATCTGTG ---/GAC GACGCAGTTT 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 GAC 1 2 62413 CASAVA_Build 1 230236067 4D TTGAATGAGT GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 hom 90 het 39 0 30 10 GAAA 3 2 62414 CASAVA_Build 1 230245929 4I TAAACTACAC ----/ACAA ACAGACACAC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 ACAA 0 1 62415 CASAVA_Build 1 230258799 1I AGACTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 1845 het 1845 ref 22 8 7 7 T 10 11 62416 CASAVA_Build 1 230266696 4D TTAGAACACC GACT/---- GACTCTGCCA 3070 het 3070 hom 37 11 18 10 GACT 2 1 62417 CASAVA_Build 1 230267769 2D GGGTTCAGAA TC/-- TCTGTTATCC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 TC 2 1 62418 CASAVA_Build 1 230268033 1D CATAGAAAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 9 8 62419 CASAVA_Build 1 230285222 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 9 8 62420 CASAVA_Build 1 230289384 3D AGAAGAGCAT ATA/--- ATAAATTTAT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 ATA 2 1 62421 CASAVA_Build 1 230289500 1I ATGACTGGAG -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 7 8 62422 CASAVA_Build 1 230290852 1D TATTCCCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 16 11 A 10 9 62423 CASAVA_Build 1 230294947 1I TACCATGGCC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 A 8 9 62424 CASAVA_Build 1 230296207 3I CTTTGGCTTA ---/TCT TAATGCTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TCT 0 1 62425 CASAVA_Build 1 230297989 2D TTCCTGGGAC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 T 11 9 62426 CASAVA_Build 1 230298071 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 10 11 62427 CASAVA_Build 1 230307369 1I TCTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 10 11 62428 CASAVA_Build 1 230316110 1D ATTATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3052 het 3052 ref 26 12 7 7 A 11 10 62429 CASAVA_Build 1 230317879 19D ACTTACCAGA AATGAAAAGGCACATGGTT/------------------- AATGCATTGT 3070 het 3070 ref 36 20 17 2 AATGAAAAGGCACATGGTT 1 0 62430 CASAVA_Build 1 230327577 1D CTTTTTCTAG T/- TCCTTGAGGT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 2 1 62431 CASAVA_Build 1 230330845 4D TTCAGCACTT AGTC/---- AGGCTCTTTA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 AGTC 1 0 62432 CASAVA_Build 1 230332955 1D TTCCATAATC A/- GCTGTTCCCC 3070 het 3070 ref 40 17 19 4 A 1 0 62433 CASAVA_Build 1 230334813 3I GTTGAACACA ---/AGG AGGTTTCTGG 3070 hom 88 het 34 0 29 5 AGG 1 2 62434 CASAVA_Build 1 230336039 2I AAGCTAAACC --/TG GGCGAAGTGG 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 TG 0 1 62435 CASAVA_Build 1 230339884 1I GAACAAACAC -/T TTTTCCTTCT 3070 het 3070 ref 51 29 15 7 T 4 5 62436 CASAVA_Build 1 230344844 2D TTCCCACACT GG/-- GTAACACAGG 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 G 3 1 62437 CASAVA_Build 1 230345445 1I CTGGAAGTAC -/A ATGAAAATGC 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 A 1 2 62438 CASAVA_Build 1 230352905 9D TTTTTTTTTT TTTTTGAGA/--------- CAGAGTCTTT 2192 het 666 hom 10 3 7 1 TTTTTGAGA 1 0 62439 CASAVA_Build 1 230365859 1D GGGGCTGTGT G/- GGGGGTAGGA 3070 hom 54 het 32 0 27 6 G 6 5 62440 CASAVA_Build 1 230366818 1I TTGTTTCCAG -/T TTTTTCTTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 5 6 62441 CASAVA_Build 1 230372511 1D CAGTTCGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 T 11 10 62442 CASAVA_Build 1 230374911 13D GTTAAAAGCG TTCCTAAAACACT/------------- TTCTTATATG 3070 het 3070 ref 35 24 12 6 TTCCTAAAACACT 1 0 62443 CASAVA_Build 1 230397847 2I TTCAGCAGTC --/AT CCTGCCCTAT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 AT 0 1 62444 CASAVA_Build 1 230411052 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAATAC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 8 7 62445 CASAVA_Build 1 230423145 32D CAGCCCTGCC TTCAAGGAGCTTACACACTGTACTAGAACGGT/-------------------------------- TTCCAAAGTA 3070 het 2853 hom 15 7 9 3 TTCAAGGAGCTTACACACTGTACTAGAACGGT 1 0 62446 CASAVA_Build 1 230429121 1D GAGGGCCTGT G/- GGGGGGGGTT 3070 het 66 hom 19 2 10 7 G 9 8 62447 CASAVA_Build 1 230430471 1D GAGAGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1196 het 1196 ref 33 26 3 4 T 12 11 62448 CASAVA_Build 1 230455761 1I CCCAACATTT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 A 7 8 62449 CASAVA_Build 1 230465270 7D6M2I CATCAGGAGG CTCCGGAGGCTCT--/-------GGGTATTC ACACTGATGC 729 het 729 ref 23 22 3 1 N/A 0 0 62450 CASAVA_Build 1 230466848 5I CCTTTTATAC -----/TCAGG CCCCTCTTCT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 TCAGG 0 1 62451 CASAVA_Build 1 230480138 1I TCCCAAAAAA -/C ATTTCCATCC 3070 het 3070 ref 49 24 23 2 C 0 1 62452 CASAVA_Build 1 230483223 1D ACAACTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 11 10 62453 CASAVA_Build 1 230489159 3I AGGCTGAAGC ---/AGG AGGACTGCTT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 AGG 1 2 62454 CASAVA_Build 1 230491073 8I ATGCATATCC --------/TGTAGAAT TAACAACTAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TGTAGAAT 0 1 62455 CASAVA_Build 1 230493327 4I ATATATTCAC ----/TTGT TTATTGCTCT 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 TTGT 0 1 62456 CASAVA_Build 1 230496816 1I GAACGAATCT -/A CATTCCCACC 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 0 1 62457 CASAVA_Build 1 230499054 2D ATGCAGTCAC TG/-- TATGCCATTC 3070 het 3070 ref 57 28 25 7 TG 1 0 62458 CASAVA_Build 1 230517872 1D TACTATCCTC T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 T 7 6 62459 CASAVA_Build 1 230525478 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAACCTT 3070 het 55 hom 11 1 8 2 A 6 7 62460 CASAVA_Build 1 230529593 1D AATGCTCTCT A/- AAAAAAAAGA 1858 het 1858 ref 13 7 4 3 A 9 8 62461 CASAVA_Build 1 230530876 1D TTTGGCTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 9 8 62462 CASAVA_Build 1 230536718 4D CACTGAGCCC TTAA/---- ACTGAGGTCT 3070 het 3070 ref 46 26 16 7 TTAA 1 0 62463 CASAVA_Build 1 230542557 1D AATTCTTCTC A/- AAACCAAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 4 3 62464 CASAVA_Build 1 230549768 1I TTTTGGTTTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 8 9 62465 CASAVA_Build 1 230559763 2D GTTTAACTGG GA/-- AGACGCTATG 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 GA 1 0 62466 CASAVA_Build 1 230560833 1D AATTTAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 T 11 10 62467 CASAVA_Build 1 230571334 2I TGTCTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 2585 hom 26 het 14 0 9 5 TC 8 9 62468 CASAVA_Build 1 230571449 4D13M2D CTGTCCATCC ATCTATACATCTCTCTCTG/----ATACATCTCTCTC-- TCTCTGTCTC 2735 het 2735 ref 66 55 14 15 N/A 0 0 62469 CASAVA_Build 1 230576184 4D AAAAGTTCAT ACTC/---- ACAGGTCCTT 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 ACTC 1 0 62470 CASAVA_Build 1 230592911 2D ATTTAATCTC TT/-- CTCCTGCTGT 3070 het 3070 hom 38 16 22 0 T 2 0 62471 CASAVA_Build 1 230593391 1I AAATAGACAT -/A ACATACAATT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 A 1 2 62472 CASAVA_Build 1 230594781 2D GAAAATGTGT TA/-- TATATATACA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 TA 5 4 62473 CASAVA_Build 1 230597819 2D TAGCAAGTCA AT/-- ATGTTTAGTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 2 1 62474 CASAVA_Build 1 230610658 2I TGAAGGACTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 13 12 T 13 15 62475 CASAVA_Build 1 230616979 2I TGACTCAGTT --/AC ACACCATGAG 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 AC 2 3 62476 CASAVA_Build 1 230688286 1D AATTGCTGCA C/- CATCATCCTC 3070 het 3070 hom 72 36 30 6 C 2 1 62477 CASAVA_Build 1 230704311 1D TCCCTGGAGC T/- TTTTTACTTT 3070 hom 77 het 30 0 24 6 T 6 5 62478 CASAVA_Build 1 230709546 1I CGGTCTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 50 2 34 14 T 13 14 62479 CASAVA_Build 1 230721345 17D TATTGTAACC ACAAAAGTTTCATTTGA/----------------- TATAACTTTG 3070 hom 117 het 38 0 40 2 ACAAAAGTTTCATTTGA 1 0 62480 CASAVA_Build 1 230732597 1I GATTCCCCCG -/C CCCAGCCTCC 3070 hom 50 het 20 0 17 3 C 3 4 62481 CASAVA_Build 1 230733186 5I GGAAAACTAA -----/AAACT AAAGTTAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAACT 0 1 62482 CASAVA_Build 1 230745845 4D ATGTGAAGAC CTTT/---- CTTTATAGGA 3070 hom 102 het 41 0 34 10 CTTT 2 1 62483 CASAVA_Build 1 230746930 1I CTCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 27 1 19 7 A 12 13 62484 CASAVA_Build 1 230786229 3D3M1D GTAACAAAGG CCTCAGA/---CAG- AGGAGCTCTC 3070 hom 71 het 26 0 22 7 N/A 0 0 62485 CASAVA_Build 1 230795179 1I TGTTCACAGG -/A AAAAAAAAAA 2528 het 193 hom 22 1 9 12 A 13 14 62486 CASAVA_Build 1 230801369 1D AATCCTGCGA T/- TTTTTAGCCA 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 T 6 5 62487 CASAVA_Build 1 230801917 1I CAGTGCAGAT -/C CCTGTGTGCC 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 C 2 3 62488 CASAVA_Build 1 230802678 1I AAAACAAGAA -/T TTTAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 3 4 62489 CASAVA_Build 1 230805013 1I CAGAAGGTTA -/T TTTAAGCAGG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 3 4 62490 CASAVA_Build 1 230811370 1I GTGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 11 12 62491 CASAVA_Build 1 230816068 1I GAACAAAATT -/A TATGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 0 1 62492 CASAVA_Build 1 230822263 1I TCCAAATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 10 11 62493 CASAVA_Build 1 230824106 1D ATTTAAAACA T/- TTTTTTTTTT 1694 het 1694 ref 22 12 5 5 T 13 12 62494 CASAVA_Build 1 230834984 1I GTTGGCAGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 8 9 62495 CASAVA_Build 1 230835698 2D GGATTAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 T 12 10 62496 CASAVA_Build 1 230839392 4I GAAATTGTAC ----/TTCT TTATTTCCAG 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TTCT 0 1 62497 CASAVA_Build 1 230841864 4I CTTTTACACA ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 15 11 T 12 16 62498 CASAVA_Build 1 230843817 1I GGCAAGAGCC -/A AAAAAAAAAC 1105 het 1105 ref 45 35 3 7 A 9 10 62499 CASAVA_Build 1 230855711 1D CAACCTCATA C/- TTAGCTTATA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 C 1 0 62500 CASAVA_Build 1 230856704 1I ATCCCTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 10 11 62501 CASAVA_Build 1 230860369 1I GACATGAAGG -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 45 13 24 8 A 7 8 62502 CASAVA_Build 1 230865846 1I AGACCCCCTC -/T CCCCACTTCC 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 0 1 62503 CASAVA_Build 1 230873893 1D TAATGAGTAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 9 8 62504 CASAVA_Build 1 230884890 3D GGTTAAAAAA AAC/--- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 50 26 16 10 AAC 1 0 62505 CASAVA_Build 1 230886144 1I CTGCTCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 10 11 62506 CASAVA_Build 1 230892334 2I AGTATAAGAT --/AA AATAGCTCAT 3070 het 3070 ref 35 14 8 13 A 2 4 62507 CASAVA_Build 1 230897323 1I ACTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1632 hom 30 5 17 8 T 10 11 62508 CASAVA_Build 1 230900055 1I AAAAGAAGAT -/G GGGCTCAGAA 3070 het 3070 ref 31 21 7 3 G 3 4 62509 CASAVA_Build 1 230904907 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 153 hom 30 2 21 7 A 9 10 62510 CASAVA_Build 1 230934548 1I GATTTTTGTA -/T TTTTTTATAG 3070 hom 58 het 23 0 18 5 T 6 7 62511 CASAVA_Build 1 230970602 4D GACTCCGTTT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 60 het 21 0 21 4 CAAA 7 6 62512 CASAVA_Build 1 230987067 1I GCTCTTGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 29 0 23 6 A 9 10 62513 CASAVA_Build 1 230989685 3I ACAGCTATCC ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 hom 76 het 37 0 25 12 A 9 12 62514 CASAVA_Build 1 230991628 5I TCCCATTCTC -----/CTCTT CTAAAGACAC 3070 hom 190 het 68 0 64 4 CTCTT 0 1 62515 CASAVA_Build 1 230995054 13D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAGA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 10 0 11 2 AAAAAAAAAAAGA 2 1 62516 CASAVA_Build 1 230995649 37D AGTGTGGGTG GAGGGTGATCTATCAGCATAGAGGTGCAGTGTGGGTA/------------------------------------- GAGGGTGATC 3070 het 45 hom 68 1 37 45 GAGGGTGATCTATCAGCATAGAGGTGCAGTGTGGGTA 1 0 62517 CASAVA_Build 1 231003083 1D TAATCAGGTC T/- TAGAGGCAGG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 2 1 62518 CASAVA_Build 1 231005726 1D TATCTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 2569 het 645 hom 26 3 9 14 T 17 16 62519 CASAVA_Build 1 231022065 1D AGATTGTCTA T/- TTACTTTCAC 3070 hom 72 het 26 0 25 3 T 3 2 62520 CASAVA_Build 1 231023323 17D CATTAATGGC GTTCTTTTAGTATTTTA/----------------- GTTCTTTTAG 3070 hom 102 het 42 0 35 14 GTTCTTTTAGTATTTTA 2 1 62521 CASAVA_Build 1 231027272 3D26M11D AAAGTATAAT AAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAATAAAATAAAATAAAAT/---AAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAA----------- AAAATAAAAT 3070 hom 42 het 11 0 15 3 N/A 0 0 62522 CASAVA_Build 1 231028347 3I CATTACTCAA ---/GGG GTCAGCCAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 1 4 62523 CASAVA_Build 1 231036561 1I TCAGAAAACG -/T TTTTTTGTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 62524 CASAVA_Build 1 231037843 1I GAGATAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1553 hom 35 4 24 7 T 14 15 62525 CASAVA_Build 1 231038570 1I AGTGACACCA -/G GGGCAATTCA 3070 hom 160 het 61 0 54 7 G 3 4 62526 CASAVA_Build 1 231042037 1I ATGATTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 270 hom 29 1 17 11 A 10 11 62527 CASAVA_Build 1 231049284 1D CTCTTTATTT A/- TTTTGTATTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 0 62528 CASAVA_Build 1 231050203 2D CCTACTCCAT AG/-- TTAGCAAATG 3070 hom 111 het 44 0 37 7 AG 1 0 62529 CASAVA_Build 1 231061331 2D5M10D TCCCTTCCCT GCTCTCCCTTCCCTGCT/--TCTCC---------- CTCCCTTCCC 3070 hom 84 het 27 0 29 4 N/A 0 0 62530 CASAVA_Build 1 231061566 2D TTTTTAACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 31 10 A 12 10 62531 CASAVA_Build 1 231079764 1D TTTAAGGCTG A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 A 7 6 62532 CASAVA_Build 1 231084817 2I TGATGCCCCA --/TC TCTTTCTTCC 3070 hom 132 het 49 0 43 6 TC 1 2 62533 CASAVA_Build 1 231090879 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1543 het 52 hom 11 1 5 5 A 19 18 62534 CASAVA_Build 1 231110600 1I CTTTTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 24 0 19 5 T 10 11 62535 CASAVA_Build 1 231117163 1I AAAGTTGTAT -/G GGATTTTTTG 1401 het 1401 ref 32 21 3 8 G 2 3 62536 CASAVA_Build 1 231117989 2D AACTAAAAAC AT/-- GTGTTGATAT 3070 hom 96 het 42 0 33 10 AT 1 0 62537 CASAVA_Build 1 231144745 1D GACATTTACA T/- TTTTATTTCA 3070 het 2526 hom 17 7 9 1 T 5 4 62538 CASAVA_Build 1 231155979 1I TATAAGAATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 8 9 62539 CASAVA_Build 1 231159762 1D TGATTTTGTA T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 T 7 6 62540 CASAVA_Build 1 231169065 1I TTTAGGACTC -/T TATCTAAGGA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 1 2 62541 CASAVA_Build 1 231198059 1D AATCCAATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 53 hom 29 1 26 2 A 9 8 62542 CASAVA_Build 1 231212434 4I TCCTGTTTAC ----/TTTA TTTATCAGAT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 TTTA 1 2 62543 CASAVA_Build 1 231216336 1I CCATAGTGCT -/A AAAAAAGGGG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 A 6 7 62544 CASAVA_Build 1 231223412 1D GAAAATCATC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 9 8 62545 CASAVA_Build 1 231229489 3I AAAGAAAACC ---/AAG AAGTCCCAAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 AAG 1 2 62546 CASAVA_Build 1 231232182 4D TGTTTTTAAA CTCT/---- CTCATGCTCT 3070 het 3070 hom 35 10 20 8 CT 3 1 62547 CASAVA_Build 1 231234950 1D AAGCCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 45 1 34 10 T 12 11 62548 CASAVA_Build 1 231238413 1I AAATAATGTC -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 7 8 62549 CASAVA_Build 1 231243574 1D TGGCTTAGAG A/- AAAACCACAC 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 A 5 4 62550 CASAVA_Build 1 231252607 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 1762 hom 13 4 8 1 A 8 9 62551 CASAVA_Build 1 231260223 1I AGCAAGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 48 2 31 15 A 12 13 62552 CASAVA_Build 1 231272023 1I AAACACACAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 8 9 62553 CASAVA_Build 1 231272650 2I ATTCTACCAC --/AT GTTTAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 0 1 62554 CASAVA_Build 1 231280216 5I GGAGCATCTA -----/TTTAG TTTAGTTTAC 3070 hom 157 het 57 0 53 4 TTTAG 1 2 62555 CASAVA_Build 1 231291563 1D CAAATTACGG A/- AAAAAGGATT 3070 hom 126 het 49 0 43 7 A 6 5 62556 CASAVA_Build 1 231299711 1D AGGGAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 A 11 10 62557 CASAVA_Build 1 231305352 4I TTCTTCTAGT ----/ATTA ATTGTTTCAT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 ATTA 0 1 62558 CASAVA_Build 1 231307177 2I ATCATGCACA --/CT GTTTTACAAT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 CT 0 1 62559 CASAVA_Build 1 231324897 1I ATTATATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1782 hom 22 5 13 4 T 13 14 62560 CASAVA_Build 1 231325952 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2366 hom 25 9 16 0 A 14 12 62561 CASAVA_Build 1 231342464 28D TGTTCAAGTC AATTGATTTCTTCATATATAATTTACTG/---------------------------- AGACCAATGA 3070 het 3070 ref 28 18 13 6 AATTGATTTCTTCATATATAATTTACTG 1 0 62562 CASAVA_Build 1 231353421 2D CCATCTTGCC AA/-- GAGCAAGGAC 3070 het 3070 ref 49 29 15 5 A 2 0 62563 CASAVA_Build 1 231363023 1I GCCTATGGAA -/G TACAGAGGCC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 G 0 1 62564 CASAVA_Build 1 231365518 1I TTCTAAATAG -/C TTATTGAGAT 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 C 0 1 62565 CASAVA_Build 1 231366998 11D AATATATATC ATATATAGAAA/----------- ATATATAGAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 ATATATAGAAA 2 1 62566 CASAVA_Build 1 231368846 1I GGAAAAAAAA -/C ATTACTACTC 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 C 0 1 62567 CASAVA_Build 1 231396722 1I AGGCTGAAAG -/T TTTATGACTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 3 4 62568 CASAVA_Build 1 231413702 1D CACATTCAGA T/- TTTTTTTTTT 1044 het 1044 ref 30 23 4 3 T 15 14 62569 CASAVA_Build 1 231420791 1I CTAATTTTTT -/G TATTTTTTTT 3070 het 1419 hom 16 4 11 1 G 0 1 62570 CASAVA_Build 1 231432199 1I AAAATTAATG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 7 8 62571 CASAVA_Build 1 231452642 1I CATCAACTAA -/T TTAATATCAG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 2 3 62572 CASAVA_Build 1 231459633 8I ACTTACTAGA --------/TTTTCACT TACTTGGGAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 TTTTCACT 0 1 62573 CASAVA_Build 1 231483356 3I GATCATCATC ---/ATT ATCTATTCAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 ATT 0 1 62574 CASAVA_Build 1 231485391 1I TGCGTATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 31 0 23 8 A 11 12 62575 CASAVA_Build 1 231485502 1D TAGGACTGAG C/- AAATGATATT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 1 0 62576 CASAVA_Build 1 231497206 4D AAATTACAAT GTGA/---- GTAACTGATA 3070 het 3070 hom 42 16 20 8 GTGA 1 0 62577 CASAVA_Build 1 231501716 2I AATTTCTCTC --/TT GAACTATCAA 3070 hom 103 het 42 0 35 7 T 0 2 62578 CASAVA_Build 1 231504338 1D TTTTTATATA T/- TTTTTTCTGG 3070 het 2716 hom 22 7 11 4 T 7 6 62579 CASAVA_Build 1 231506024 1I ATTTTTTTTT -/A ATTATACTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 1 2 62580 CASAVA_Build 1 231518768 1D TTAACTGCAC T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 50 27 15 8 T 8 7 62581 CASAVA_Build 1 231535207 1D TTGTGTTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 39 0 35 5 T 10 9 62582 CASAVA_Build 1 231535366 6I CAGTATTATT ------/TACAAC TACAACTACA 3070 hom 105 het 47 0 36 11 TACAAC 1 2 62583 CASAVA_Build 1 231536965 1I GGAGAAAGGG -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 7 8 62584 CASAVA_Build 1 231539581 1D TGTTGTAGCC A/- AAAAAAATCC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 8 7 62585 CASAVA_Build 1 231542222 1D TCGATTTTCT G/- TAATTAGCAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 G 1 0 62586 CASAVA_Build 1 231550330 1D TAAAGTTCCA T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 7 6 62587 CASAVA_Build 1 231553473 1I TCTATGTAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 8 9 62588 CASAVA_Build 1 231555552 1I CCTCCATTAC -/A AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 6 7 62589 CASAVA_Build 1 231557160 19I AGCAACTCTA -------------------/ATGTCTTGGGGATAATCTG AACTGCGTTG 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 ATGTCTTGGGGATAATCTG 0 1 62590 CASAVA_Build 1 231557608 4D AAAGTAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGCA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AG 6 4 62591 CASAVA_Build 1 231558839 3D TTAATGAGCA ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 ref 36 16 11 11 ATT 7 6 62592 CASAVA_Build 1 231566575 1I TGATGTTTTC -/T CTTAGCTGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 1 62593 CASAVA_Build 1 231571297 2D CTCATTCAGC AA/-- AGTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 44 22 21 2 A 3 1 62594 CASAVA_Build 1 231577095 2I TACAGGCATC --/TA TATAAACACA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 TA 2 3 62595 CASAVA_Build 1 231585607 1I TAAGTAAAGG -/T TCTTAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 T 1 2 62596 CASAVA_Build 1 231586940 1I TAAGGGTAGA -/G GAAATATATA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 1 2 62597 CASAVA_Build 1 231587715 1D TTATTTCAAA T/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 7 6 62598 CASAVA_Build 1 231588613 1I22M1I AAAGCTAAGG -TAGTTTCTCTCTCATCAAAAAG-/TTAGTTTCTCTCTCATCAAAAAGT TCAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 43 23 25 2 N/A 0 0 62599 CASAVA_Build 1 231589141 2I AATAAAACAC --/TA TATTAGCTAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 TA 1 2 62600 CASAVA_Build 1 231594307 1I AATGTGTTTG -/T TTTTCCAAAT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 4 5 62601 CASAVA_Build 1 231594426 1I TGATCACAAA -/T TCCTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 1 2 62602 CASAVA_Build 1 231595259 11D54M4D ACTCTGTGTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAAGGAAGGAGAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAAGAAACAAACAAAG/-----------AAAAAAAAGGAAGGAAGGAAGGAGAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAAGAAACAAAC---- AAAGAAACAA 3070 het 1952 hom 16 16 7 10 N/A 0 0 62603 CASAVA_Build 1 231595871 1D GAGGAAAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 T 10 9 62604 CASAVA_Build 1 231599022 10D AATACTCATA CACATACACT/---------- CACATACACT 3070 het 3070 hom 63 24 28 17 CACATACACT 2 1 62605 CASAVA_Build 1 231610802 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2091 het 1129 hom 15 4 6 5 A 13 12 62606 CASAVA_Build 1 231622255 2I GCCGTTTAGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 24 9 T 11 13 62607 CASAVA_Build 1 231623133 1D ATTTTTTTGA G/- GGGGGGTAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 G 7 6 62608 CASAVA_Build 1 231623311 1D GTTACTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 12 11 62609 CASAVA_Build 1 231631480 4D CAGTTTTGAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 2489 hom 32 8 19 7 AC 9 7 62610 CASAVA_Build 1 231641087 3D GTATGATAAT AAC/--- AAAAATTTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 AAC 1 0 62611 CASAVA_Build 1 231647605 2I GGAAAAAAAA --/AG AGTCTGGAAA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 AG 1 2 62612 CASAVA_Build 1 231647913 1D CCTCCCTCTA G/- GGCAACAGAG 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 G 3 2 62613 CASAVA_Build 1 231649289 3I TGCAAGGACA ---/GAG GGATTCTTGT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 GAG 0 1 62614 CASAVA_Build 1 231650263 1I CTAAGAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 51 hom 53 1 43 9 A 9 10 62615 CASAVA_Build 1 231659712 1D CATTTATTTG T/- TTGTCAGTCT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 3 2 62616 CASAVA_Build 1 231664355 21D AGAGCCAGGA GTGATGCCATCAGAGCCAGAG/--------------------- GATGATGGTG 3070 het 3070 ref 42 24 18 9 GTGATGCCATCAGAGCCAGAG 1 0 62617 CASAVA_Build 1 231671044 1I ATGAAAACAA -/C AGGATGCTAT 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 C 0 1 62618 CASAVA_Build 1 231672616 1D ATGTTGTTGC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 27 8 19 1 A 9 8 62619 CASAVA_Build 1 231678959 1I GAGAGACTGC -/A AAAAAGAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 5 6 62620 CASAVA_Build 1 231689168 9D TGATATCCTC CTTGTTCAG/--------- CTTGTTCAGG 3070 het 3070 ref 42 24 17 4 CTTGTTCAG 2 1 62621 CASAVA_Build 1 231695579 1D TATGGTGAAA C/- CCTGTCTCTA 1894 het 460 hom 6 1 5 0 C 3 2 62622 CASAVA_Build 1 231696947 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 29 0 21 8 T 13 12 62623 CASAVA_Build 1 231698670 1D GTTTCTTTCT C/- GGGGGGTCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 C 1 0 62624 CASAVA_Build 1 231699333 1D AAATGGAAAG A/- AAAAATAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 6 5 62625 CASAVA_Build 1 231707451 1I ATTGTTTTTT -/A AAAATATTTT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 4 5 62626 CASAVA_Build 1 231709869 1I CTCTGCTGAA -/G GTGCCTCCTA 3070 het 3070 hom 50 18 23 9 G 1 2 62627 CASAVA_Build 1 231721898 2I GCCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 2313 hom 11 het 14 0 10 4 T 14 16 62628 CASAVA_Build 1 231725012 1D AACAGTAGAA T/- TGAATTTATA 3070 het 3070 hom 35 11 21 4 T 2 1 62629 CASAVA_Build 1 231729356 2D CAGAGAGAGA CT/-- CTTTCTCTGA 3070 het 1833 hom 23 7 10 6 CT 2 1 62630 CASAVA_Build 1 231729658 1I TACCATACAA -/G ACAGGCAAAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 G 0 1 62631 CASAVA_Build 1 231740402 3D AGAAATTGGA TCC/--- TCACCAGACA 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 TCC 1 0 62632 CASAVA_Build 1 231755249 1I AACACCTTGA -/C CCTGGACTTT 3070 hom 110 het 41 0 36 5 C 2 3 62633 CASAVA_Build 1 231758925 4I GGACTACAGG ----/TGCA TGCATGCCAC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TGCA 1 2 62634 CASAVA_Build 1 231766396 4D TAGGAACAAC TATA/---- TATCAACAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TA 3 1 62635 CASAVA_Build 1 231773154 1D ATTGGCGCCA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 88 het 34 0 29 5 T 8 7 62636 CASAVA_Build 1 231776415 1I TTCTCTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 9 10 62637 CASAVA_Build 1 231783584 1D CAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 10 9 62638 CASAVA_Build 1 231794860 3I2M8D GTGTTAAAGT ---GTAAAGTTAA/TGGGT-------- AGTGTAACTT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 N/A 0 0 62639 CASAVA_Build 1 231796783 36D ATATATATTG TGTATATATATACATAATACATATACATATATATTA/------------------------------------ TGTATATATA 3070 hom 63 het 22 0 22 5 TGTATATATATACATAATACATATACATATATATTA 1 0 62640 CASAVA_Build 1 231836688 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 27 1 19 7 A 15 14 62641 CASAVA_Build 1 231839125 7I AACAGGTGAT -------/TGCAGTG CCCTCTAGGA 3070 hom 135 het 55 0 45 10 TGCAGTG 0 1 62642 CASAVA_Build 1 231840369 1I TGGAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 28 0 21 7 A 11 12 62643 CASAVA_Build 1 231840792 1D AAAAAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 21 0 14 7 A 12 11 62644 CASAVA_Build 1 231844457 4D TTAGGCAAAC AGAG/---- GGAGGGCAGA 3070 hom 130 het 49 0 44 8 AG 2 0 62645 CASAVA_Build 1 231846057 1D TCACTTCTTC T/- TACTTAGTGC 3070 hom 132 het 45 0 42 5 T 2 1 62646 CASAVA_Build 1 231855830 5D AGCTGGTAAA ACATT/----- ACATCTGGGT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 ACATT 1 0 62647 CASAVA_Build 1 231874509 2D AAACTAAGAC TA/-- TAGATATTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TA 2 1 62648 CASAVA_Build 1 231884673 7D CACTTTAAAA ATCAGTT/------- ATCCCAAGGG 3070 het 3070 ref 58 35 19 6 ATCAGTT 1 0 62649 CASAVA_Build 1 231885250 1D AAAAAAGAGA G/- GGGACATTCT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 G 4 3 62650 CASAVA_Build 1 231911227 2D TATTTAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 AG 7 6 62651 CASAVA_Build 1 231914142 2D TGGAATGGAC TG/-- TATTAAACAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 TG 1 0 62652 CASAVA_Build 1 231930658 1D CCCATGTACC T/- AAACATGTCA 3070 het 2550 hom 31 7 18 6 T 1 0 62653 CASAVA_Build 1 231934745 13D AAATATTAGT GGCCATGGCCCAA/------------- GGCACAGTCT 3070 het 3070 ref 25 13 11 8 GGCCATGGCCCAA 1 0 62654 CASAVA_Build 1 231937348 4I TATATGGTCT ----/AAGA AAGGGAGAAC 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AAGA 0 1 62655 CASAVA_Build 1 231937532 5D GCTTTCACTT TACTC/----- TATGGACTCA 3070 het 3070 hom 30 9 20 2 TACTC 1 0 62656 CASAVA_Build 1 231939194 1I AAGCCAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 18 10 A 11 12 62657 CASAVA_Build 1 231939283 2I CTTATTTTGA --/CT CTCTGTCTCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CT 2 3 62658 CASAVA_Build 1 231943921 1I TAAATATTGA -/T TTATAGGAGT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 2 3 62659 CASAVA_Build 1 231950379 1D GAAGATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 11 10 62660 CASAVA_Build 1 231952767 2I25M1I TAGCTCTTTT --AAATGACATCCTAGAAATCACTCTC-/TAAAATGACATCCTAGAAATCACTCTCA AAGCTTCTTA 3070 hom 111 het 34 0 38 5 N/A 0 0 62661 CASAVA_Build 1 231958707 1I AATGTATAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 A 8 9 62662 CASAVA_Build 1 231962153 2D AAAAAAAAAA GT/-- GACTCATAAC 1690 het 1690 ref 45 19 9 18 GT 1 0 62663 CASAVA_Build 1 231964395 1I TTGGTATTAC -/A AAAAAAAAAA 2694 het 2694 ref 32 14 8 10 A 10 11 62664 CASAVA_Build 1 231971965 1D GAAGGTCTCT C/- CCCAGTTAGG 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 4 3 62665 CASAVA_Build 1 231976517 8D TCTAATACAT GTGTAGTG/-------- GTGCCTCATT 3070 het 3070 ref 36 25 11 4 GTGTAGTG 1 0 62666 CASAVA_Build 1 231979845 1D GTTGTTCATA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 8 7 62667 CASAVA_Build 1 231982738 4D TTTGTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 32 9 15 9 TTGT 4 3 62668 CASAVA_Build 1 231987153 1I AATTAGGCTT -/A AATTTAATTT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 2 3 62669 CASAVA_Build 1 231990519 1D GTTTGACTAC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 T 9 8 62670 CASAVA_Build 1 231995495 2I ACAAAAAAAA --/AT AAAATAAAAA 959 het 959 ref 19 12 4 3 AT 0 1 62671 CASAVA_Build 1 231995889 11D AAAACCCCAT AGTCTCAGCCC/----------- AAGAGCTTCT 3070 het 3070 ref 31 21 10 2 AGTCTCAGCCC 1 0 62672 CASAVA_Build 1 232003754 2I ATCCCCCCCA --/CC ACACACACAC 291 het 291 ref 50 23 5 22 C 0 2 62673 CASAVA_Build 1 232018638 1D CCCTCACTGA C/- TTACCCCACC 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 C 1 0 62674 CASAVA_Build 1 232022906 3D TTTTTTCTTG GTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 27 5 GTT 1 0 62675 CASAVA_Build 1 232024760 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 8 9 62676 CASAVA_Build 1 232026114 1I TAAAAGAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 9 10 62677 CASAVA_Build 1 232031911 1D CTGTTGTTGA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 7 6 62678 CASAVA_Build 1 232032439 1D CTGCTAGGTT C/- ATTTGGTCTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 0 62679 CASAVA_Build 1 232034811 2I CAGCCCAGTC --/AG AGATTCTTGG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AG 1 2 62680 CASAVA_Build 1 232035799 1D TTATTATAAT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 45 het 19 0 16 4 A 8 7 62681 CASAVA_Build 1 232040353 1D TATGCTCTAT A/- AATGTCTAGA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 3 2 62682 CASAVA_Build 1 232045184 11I GCCTGATGCA -----------/TAACAGGTACT TAATAGTTGA 3070 hom 120 het 48 0 41 8 TAACAGGTACT 0 1 62683 CASAVA_Build 1 232050861 1D CCCTACTCCC A/- CTTGGCAGTC 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 A 1 0 62684 CASAVA_Build 1 232058471 2I GGTTGACACT --/CA CACCACACTT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 CA 1 2 62685 CASAVA_Build 1 232059101 2D TTTTCTGAGG TA/-- TATACCCAGG 3070 het 3070 ref 49 22 17 11 TA 3 2 62686 CASAVA_Build 1 232062882 6D TTTCTGGGTT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 3070 het 2957 hom 28 9 12 9 TTTTTG 3 2 62687 CASAVA_Build 1 232071495 2I CAAAAGCTTG --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 51 24 21 6 CT 5 6 62688 CASAVA_Build 1 232072078 4I ATATATGGAT ----/AGAC AGATAGATAG 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 AGAC 0 1 62689 CASAVA_Build 1 232082778 1I GTTATGCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 58 26 22 10 T 9 10 62690 CASAVA_Build 1 232085646 2I TGTGTGTGTA --/TG TATATATATA 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 TG 0 1 62691 CASAVA_Build 1 232090200 1D CTTTGGGAAG T/- TTTTTTTTTT 2732 het 1685 hom 35 12 9 14 T 15 14 62692 CASAVA_Build 1 232090450 1D TATGCCCCAA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 T 8 7 62693 CASAVA_Build 1 232093704 1I GCCTAGGGGG -/A AAAAATGATT 1731 het 1731 ref 27 18 5 4 A 5 6 62694 CASAVA_Build 1 232097002 2D AATTACACAC AT/-- GTTTTGAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AT 1 0 62695 CASAVA_Build 1 232102044 1I ATTCCTGCGT -/C CCAGGGATAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 C 2 3 62696 CASAVA_Build 1 232106292 1D ATTTTAATAT A/- AAAAAAGCAG 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 A 7 6 62697 CASAVA_Build 1 232110085 1D TGTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 10 9 62698 CASAVA_Build 1 232110548 1I TGATGGTTAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 8 9 62699 CASAVA_Build 1 232119334 4I TTATTCAGTG ----/ATTC ATTCATTCCT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 ATTC 2 3 62700 CASAVA_Build 1 232120394 1I AAATGCAGGG -/A AAGTTTGGGT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 2 3 62701 CASAVA_Build 1 232131312 1I TTGTCAATTT -/A AAAAATTAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 5 6 62702 CASAVA_Build 1 232132525 3D TTCTTAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 15 12 6 A 12 9 62703 CASAVA_Build 1 232156063 1I CTGCACAGAT -/A ACACGCACAT 3070 het 3070 hom 54 22 29 3 A 1 2 62704 CASAVA_Build 1 232161615 1D GATTTAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 11 10 62705 CASAVA_Build 1 232171430 1I GACATATTTT -/G GGGGGGGGGG 3070 het 3070 ref 38 12 13 13 G 10 11 62706 CASAVA_Build 1 232181146 1D CGCCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 1683 hom 27 8 10 9 C 3 2 62707 CASAVA_Build 1 232192021 1I ATTTTCACTG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 7 8 62708 CASAVA_Build 1 232196823 2I TGTAAATGTC --/AA AGAGTGTGGT 3070 het 3070 hom 48 14 26 8 A 1 3 62709 CASAVA_Build 1 232204093 1D CAGTGGGAAA G/- AAAAGACTTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 G 1 0 62710 CASAVA_Build 1 232206949 1I AAAATAGACT -/C CTGTATTGAG 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 C 1 2 62711 CASAVA_Build 1 232210529 1I CTCATCTATT -/C AGATTCTTCT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 C 0 1 62712 CASAVA_Build 1 232224839 1D ACCTCACAGG T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 7 6 62713 CASAVA_Build 1 232226590 1I CGCTTCTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 11 12 62714 CASAVA_Build 1 232228253 1I ATTTGCCAAA -/G TTGATGTCCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 G 0 1 62715 CASAVA_Build 1 232258629 3D TTTTAAAGAT ATA/--- ATATTAATTA 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 ATA 2 1 62716 CASAVA_Build 1 232263883 1D ATTTGGAAAA T/- TTTTAAGCCA 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 T 5 4 62717 CASAVA_Build 1 232273125 1D TTTCCTGCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 T 9 8 62718 CASAVA_Build 1 232281471 1I TCAAGACAGT -/G GTGCTGCTGG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 G 1 2 62719 CASAVA_Build 1 232312483 3I CTAGAGAATT ---/GAG GAGAAGGTGG 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 GAG 1 2 62720 CASAVA_Build 1 232330632 1D CTTCCAGCTG T/- TTGATGCATG 3070 het 3070 ref 44 23 16 7 T 3 2 62721 CASAVA_Build 1 232333361 1I AAATGAAGAC -/T GCCATTAAGT 2295 het 2295 ref 33 22 5 6 T 0 1 62722 CASAVA_Build 1 232333555 1I TGTTCTATTT -/C TTGCCGTGTA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 C 0 1 62723 CASAVA_Build 1 232383708 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2136 het 780 hom 24 4 9 11 A 17 16 62724 CASAVA_Build 1 232396505 1I AAGTCATTAT -/A TAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 0 1 62725 CASAVA_Build 1 232400978 1I CCTCATTGTG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 8 62726 CASAVA_Build 1 232404282 1D ACTTCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 2738 het 359 hom 28 5 10 14 A 19 18 62727 CASAVA_Build 1 232406079 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 20 1 14 5 A 13 12 62728 CASAVA_Build 1 232406715 2I AAAGCAAAAC --/AA AGATTGACAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 3 62729 CASAVA_Build 1 232427724 1I TTTTGCAAAA -/C CTTTTTGGTT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 1 2 62730 CASAVA_Build 1 232447989 1D GCTTTTCCCC T/- GCTCCATGAT 3070 het 3070 ref 39 19 14 8 T 1 0 62731 CASAVA_Build 1 232455827 1I ATTTGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 11 12 62732 CASAVA_Build 1 232467716 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 T 7 8 62733 CASAVA_Build 1 232470725 2I TCGGCAGGCT --/GA GTCAGGAGAA 2101 hom 15 het 6 0 6 0 GA 0 1 62734 CASAVA_Build 1 232473727 3I GTCATTCTTC ---/ATT ATTTTCAGAT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 ATT 1 2 62735 CASAVA_Build 1 232476007 10D2M6D GCTGGATGGC CTCAGAAGGATGGCTTCA/----------TG------ GAAGGCCTTC 3070 het 3070 ref 33 20 16 3 N/A 0 0 62736 CASAVA_Build 1 232476342 1I GCCACATGCT -/A GGATAGTGTT 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 A 0 1 62737 CASAVA_Build 1 232476954 1I CACACCAAGG -/C CCAGGGCACG 3070 het 3070 hom 53 16 26 11 C 2 3 62738 CASAVA_Build 1 232478132 7D AAAAAAAAAA AATATAT/------- ATATATATAT 2539 het 1866 hom 22 6 7 13 AATATAT 1 0 62739 CASAVA_Build 1 232478162 3D GCACAGAAGA TGC/--- TGCTGCTGCT 3001 het 3001 ref 32 14 7 12 TGC 6 5 62740 CASAVA_Build 1 232481145 4I CTTATGAGGC ----/AGAG AGAGAGAGCA 3070 het 3070 ref 47 22 23 2 AG 4 6 62741 CASAVA_Build 1 232481363 1D AAGGATGTGC G/- CTCCTGACAG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 G 1 0 62742 CASAVA_Build 1 232483455 2I TTGTGTCCCC --/CG CCCCCATGCT 3070 het 2493 hom 35 9 19 7 CG 0 1 62743 CASAVA_Build 1 232496025 4D GAAGAGAGAA AGAG/---- AGACAGACAT 3070 het 3070 hom 49 22 23 7 AG 3 1 62744 CASAVA_Build 1 232506822 5I AAATGTAGTT -----/ATATC ATATATTTAA 3070 hom 60 het 27 0 21 7 ATATC 0 1 62745 CASAVA_Build 1 232529744 2D CACAAGCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 T 13 11 62746 CASAVA_Build 1 232529847 10I CAGGCAATCT ----------/GCCTCCCTCA GCCTCCCTCA 2616 het 2616 ref 22 9 6 7 GCCTCCCTCA 1 2 62747 CASAVA_Build 1 232536706 3D AAAATAAATA GAT/--- GATAAAAAGG 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 GAT 2 1 62748 CASAVA_Build 1 232537040 2D TTAAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1979 hom 33 13 12 11 A 16 14 62749 CASAVA_Build 1 232540447 1D GGTTTACTAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 A 8 7 62750 CASAVA_Build 1 232541116 1D ATACTATCAG A/- CAAAATAGTC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 1 0 62751 CASAVA_Build 1 232548721 2I TAACATACAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AT 4 5 62752 CASAVA_Build 1 232553569 1D TGAAAAAAAA C/- AAAGAGCCAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 C 1 0 62753 CASAVA_Build 1 232569757 2D TCTCTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 546 het 546 ref 26 10 6 10 TC 10 9 62754 CASAVA_Build 1 232593051 4D TCATATAAAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1150 hom 25 9 9 7 T 20 16 62755 CASAVA_Build 1 232600531 1I TTCCTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 1898 het 1898 ref 31 12 7 12 T 15 16 62756 CASAVA_Build 1 232602413 10I AATAATAATA ----------/AAATAAAAAC AAATAAAAAC 1808 het 1247 hom 12 5 4 3 AAATAAAAAC 1 2 62757 CASAVA_Build 1 232615845 5I CTCCATTGCA -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 het 2779 hom 27 6 17 4 AAAAC 3 4 62758 CASAVA_Build 1 232632134 3D TTCTAAAGGT GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 het 122 hom 30 4 10 19 G 13 10 62759 CASAVA_Build 1 232633087 1D GAAACATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 11 10 62760 CASAVA_Build 1 232644433 1D CAGCAAAGGC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 6 A 8 7 62761 CASAVA_Build 1 232646597 3I AGACTCAGCA ---/AAG AAGACCAGAC 3070 het 3070 hom 42 11 25 6 AAG 1 2 62762 CASAVA_Build 1 232647064 1D CTCTTTCCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 14 16 11 A 10 9 62763 CASAVA_Build 1 232647809 3D TTAGGTTAAG TCT/--- TCTTATTACA 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 TCT 2 1 62764 CASAVA_Build 1 232648168 20D CTTTGCATCC TTTTATATATAGGATATATA/-------------------- TAACTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 22 15 4 TTTTATATATAGGATATATA 1 0 62765 CASAVA_Build 1 232648420 4D TAAAAAAATA TTTT/---- TTATATTTCA 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 T 6 2 62766 CASAVA_Build 1 232650167 1I TTTATTACCG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 7 8 62767 CASAVA_Build 1 232652537 3D TTTGCATCCA CTT/--- CTTAACTCTG 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 CTT 2 1 62768 CASAVA_Build 1 232653146 2I CGTATATGTA --/TG TGTGTGATAT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 TG 3 4 62769 CASAVA_Build 1 232655247 1D AGTAAGCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 A 13 12 62770 CASAVA_Build 1 232670519 1D CAGGCAGCTT A/- ATTTTGAAAG 3070 hom 94 het 36 0 32 5 A 2 1 62771 CASAVA_Build 1 232672931 1I TCAACGGTTT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 6 7 62772 CASAVA_Build 1 232673679 1D CTTGAAAAAT G/- TCAGGCAATT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 G 1 0 62773 CASAVA_Build 1 232683314 1I AACATGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 44 1 38 5 A 10 11 62774 CASAVA_Build 1 232689201 2D TCTACAAAAA AG/-- AAAAAGAGCA 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 AG 1 0 62775 CASAVA_Build 1 232691986 1D AGTGTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 19 13 T 12 11 62776 CASAVA_Build 1 232694889 1I GCAGCTTTCT -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 73 het 32 0 23 9 G 3 4 62777 CASAVA_Build 1 232696002 7I AACCCTCTCT -------/TGGGGTC TGGATCGGGA 3070 hom 63 het 22 0 20 2 TGGGGTC 0 1 62778 CASAVA_Build 1 232701922 1I CCTGGTGAAG -/T ACAATCGTTA 3070 hom 162 het 57 0 52 5 T 0 1 62779 CASAVA_Build 1 232704939 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 819 hom 5 het 6 0 5 1 A 15 14 62780 CASAVA_Build 1 232706949 1D CGGATATGTC T/- TTTATTAGCA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 4 3 62781 CASAVA_Build 1 232710438 1I CAGGACAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 18 13 14 A 13 14 62782 CASAVA_Build 1 232712759 1D CATACAAAGT G/- TAATGATGAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 G 1 0 62783 CASAVA_Build 1 232726439 1D TACATCGTAC A/- AAAAAAAAAA 1254 het 1254 ref 30 24 4 2 A 13 12 62784 CASAVA_Build 1 232728650 1D TGGGGTTTCA C/- CCTTTTGGCC 3070 het 3070 hom 21 7 12 2 C 3 2 62785 CASAVA_Build 1 232745530 1I TTTAAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 A 10 11 62786 CASAVA_Build 1 232750962 4I CGCCCAGCCT ----/TAAG TAAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TAAG 1 2 62787 CASAVA_Build 1 232758281 8I ACTGTGGCAT --------/TGTGGCAC TGTGGCACTG 3070 het 3070 ref 48 20 14 14 TGTGGCAC 1 2 62788 CASAVA_Build 1 232758321 4I TGTTTTTTTT ----/TTTG TTTGTTTTTT 2563 het 2563 ref 32 12 9 11 TTTG 1 2 62789 CASAVA_Build 1 232770099 5D ACTCCATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 17 1 12 6 A 21 16 62790 CASAVA_Build 1 232770968 2D TCCTAATCAA CT/-- CTGAGGACTG 3070 hom 105 het 37 0 36 2 CT 2 1 62791 CASAVA_Build 1 232780515 2I ACTTATACCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TC 5 6 62792 CASAVA_Build 1 232780582 2D CCCCACCCCA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 63 het 30 0 22 8 AC 10 9 62793 CASAVA_Build 1 232781636 1D38M1D CAAGTAGTGG AAAGGTGTTTCCAAATCAGGAGTTAGAGGCTAAGACCTAC/-CAGGTGTTTCCAAATCAGGAGTTAGAGGCTAAGACCTA- AGCCTCCCCC 3070 hom 108 het 28 0 35 9 N/A 0 0 62794 CASAVA_Build 1 232781908 1I ACATAAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 34 0 27 7 T 10 11 62795 CASAVA_Build 1 232787141 1D TTCAAATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 36 0 14 22 T 12 11 62796 CASAVA_Build 1 232789967 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 20 1 16 3 A 14 13 62797 CASAVA_Build 1 232796088 2D ACTTTTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 20 0 14 10 A 18 16 62798 CASAVA_Build 1 232796593 1D CTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 9 8 62799 CASAVA_Build 1 232803759 3I TCTGGCGAAA ---/TGT TGTTTCCGGG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TGT 1 2 62800 CASAVA_Build 1 232807541 9I GTCAAATTCC ---------/AGTTATAAT AAAGTGCCTA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 AGTTATAAT 0 1 62801 CASAVA_Build 1 232810628 2D GTCTGACTCA TC/-- TCTGTTATGC 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 TC 2 1 62802 CASAVA_Build 1 232813789 1D GTGTGTGTTA T/- GGTAAATCAC 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 T 1 0 62803 CASAVA_Build 1 232824508 4D CTGTAGATAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 27 1 9 19 T 16 12 62804 CASAVA_Build 1 232850730 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 1740 het 1740 ref 21 11 4 6 A 10 9 62805 CASAVA_Build 1 232867576 12D GCAACCCTGC GTCTCTCTCTAT/------------ GTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 43 28 11 8 GTCTCTCTCTAT 1 0 62806 CASAVA_Build 1 232867800 1I CTCACAACAC -/T TTTCAGGAGG 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 T 3 4 62807 CASAVA_Build 1 232870139 2I CCCCTTGAGT --/GC GCAAGCTCCT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 GC 1 2 62808 CASAVA_Build 1 232873159 1D CTGAATCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 T 11 10 62809 CASAVA_Build 1 232882682 1D CTGTGTGTGT G/- GGGGGGGCAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 G 8 7 62810 CASAVA_Build 1 232882846 4I GGACGGAAGG ----/AGAA AGAAAGAGAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AGAA 1 2 62811 CASAVA_Build 1 232886128 1D GTCCCCTACT C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 76 het 29 0 24 6 C 9 8 62812 CASAVA_Build 1 232887517 5D TCTTTTTAAA AAATT/----- AAATTAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 16 6 AAATT 2 1 62813 CASAVA_Build 1 232888876 1D TTATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 13 12 62814 CASAVA_Build 1 232890869 1D GTTATTAGGG A/- AAATGCAAAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 4 3 62815 CASAVA_Build 1 232894559 1I TTCTTTTTTT -/C TTTTTTTTCT 3070 het 123 hom 24 4 13 7 C 0 1 62816 CASAVA_Build 1 232909800 1D CTACCTCAGA C/- CCCCCGCTCT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 C 6 5 62817 CASAVA_Build 1 232914186 1D TGAATATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 38 1 22 15 T 15 14 62818 CASAVA_Build 1 232917044 1D ATTATCTAAC A/- ATACATATTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 A 2 1 62819 CASAVA_Build 1 232935695 4I TGGAAAGACC ----/ACAG ACAGGCCCTG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 ACAG 1 2 62820 CASAVA_Build 1 232935925 2I GCGCAGTGGA --/GC CACTGGACTA 3070 het 3070 ref 39 22 17 0 GC 0 1 62821 CASAVA_Build 1 232939203 1D AAGATATACA T/- TTTTTTTTTT 1792 hom 8 het 9 0 4 5 T 12 11 62822 CASAVA_Build 1 232947083 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2481 het 892 hom 17 3 7 7 T 15 14 62823 CASAVA_Build 1 232953581 1D CAGTCGGGGG T/- GGGGGGAAAT 3070 hom 31 het 14 0 10 5 T 1 0 62824 CASAVA_Build 1 232960503 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAAAGG 559 het 418 hom 26 4 5 19 AAAC 1 0 62825 CASAVA_Build 1 232975454 4D CTCCAAAGGC CAAA/---- CAAACAAGTA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 CAAA 2 1 62826 CASAVA_Build 1 232981546 1D TGAGCACAGC A/- CCCTTCCTCA 3070 het 3070 ref 97 58 22 18 A 1 0 62827 CASAVA_Build 1 232986896 2D AAGTTCATTT CA/-- CATTGTTTGA 1709 het 1709 ref 84 71 4 11 CA 2 1 62828 CASAVA_Build 1 232987731 1D ATTATGGTAC A/- AAAAAAAAAT 2974 het 2974 ref 59 40 7 13 A 10 9 62829 CASAVA_Build 1 232988009 1D GTTGGTTGTG C/- CCCCCCGCAC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 7 6 62830 CASAVA_Build 1 232990413 1D ATAAGAATTT A/- AAAAAAAAAA 1890 het 1890 ref 23 10 7 6 A 17 16 62831 CASAVA_Build 1 232990975 1D GATTTTAATT A/- AAAAAACAGC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 7 6 62832 CASAVA_Build 1 232995497 2D CTTTCTTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 9 10 T 13 11 62833 CASAVA_Build 1 233000315 1I AAAACAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 15 22 10 A 11 12 62834 CASAVA_Build 1 233004937 2D AGCAAAGGCA CT/-- CTCTAAGAGT 2900 het 2900 ref 65 54 7 5 CT 3 2 62835 CASAVA_Build 1 233019703 5I TTATGACCTC -----/AGTTT ACCAGGTCCT 3070 hom 47 het 18 0 15 3 AGTTT 0 1 62836 CASAVA_Build 1 233020499 1I AGCCCGGTGC -/A AATAAACAGG 2997 hom 26 het 11 0 10 1 A 2 3 62837 CASAVA_Build 1 233044425 1D AAACCTAAGC T/- TTTTTTTTTT 1145 het 1145 ref 29 25 3 3 T 12 11 62838 CASAVA_Build 1 233048714 1D CAGCAGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 13 15 A 15 14 62839 CASAVA_Build 1 233055082 1I TTACATGTGA -/G GGGGGTGGAG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 G 5 6 62840 CASAVA_Build 1 233057816 1I ATTCTCTGTG -/T CATTGCTCAT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 0 1 62841 CASAVA_Build 1 233076316 1D TGTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1032 hom 40 12 20 8 T 19 18 62842 CASAVA_Build 1 233086701 1I AGGAGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 1774 het 1774 ref 43 18 10 15 T 15 16 62843 CASAVA_Build 1 233094612 1D TATAGCTGAT A/- AAAAAAATGC 3070 hom 65 het 30 0 23 8 A 8 7 62844 CASAVA_Build 1 233095570 16D ACATTTTGAG AAAACAGACTGTAAAT/---------------- AATCCCACTT 3070 hom 69 het 27 0 23 8 AAAACAGACTGTAAAT 1 0 62845 CASAVA_Build 1 233104703 4D CAAAAAAATT AAGG/---- AAGTAAATAT 3070 hom 102 het 38 0 35 6 AAGG 1 0 62846 CASAVA_Build 1 233118145 1D ACTATTCAGC A/- AAAAACAGGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 6 5 62847 CASAVA_Build 1 233118259 1D ATTATTTCCC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 10 9 62848 CASAVA_Build 1 233123814 1D CGAGTGGTTC A/- GTGGGACCTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 1 0 62849 CASAVA_Build 1 233127306 4I10M4I CTCATTTCCG ----GGACCGGCCC----/TCCCAGTCTAGCTCTTTT CTTATACAGA 3070 het 3070 ref 34 21 17 1 N/A 0 0 62850 CASAVA_Build 1 233133302 1D TAGCCTTATC T/- TTTTTTTTTT 2720 hom 37 het 18 0 13 5 T 12 11 62851 CASAVA_Build 1 233137945 3I GTCTCAAGAA ---/AAG AAATAAAATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAG 0 1 62852 CASAVA_Build 1 233153912 5D AACCCAAAGA AAGAG/----- AAAAGAAGAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AAGAG 1 0 62853 CASAVA_Build 1 233164618 1I GGGCTTACAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 7 8 62854 CASAVA_Build 1 233166052 1D TGACACAGAA G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 G 5 4 62855 CASAVA_Build 1 233173058 1I ACAGGCTCAG -/A AAAAATTCCC 3070 het 3070 ref 44 19 22 3 A 5 6 62856 CASAVA_Build 1 233177540 1I AAATACCAAC -/T TATGAGTCAC 3070 het 3070 ref 63 31 21 11 T 1 2 62857 CASAVA_Build 1 233192599 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2346 hom 32 12 18 2 A 14 13 62858 CASAVA_Build 1 233204102 2I TAATATGGTG --/TA TATATATATA 3070 het 347 hom 32 1 28 3 TA 6 7 62859 CASAVA_Build 1 233204904 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 31 2 22 7 A 13 12 62860 CASAVA_Build 1 233219332 1D AGTATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 11 10 62861 CASAVA_Build 1 233226247 1I TGCTTGGTGA -/G GGTTCATGGT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 G 2 3 62862 CASAVA_Build 1 233235833 3D ATTCACAATA AAT/--- AATAACACAA 3070 het 2195 hom 17 6 9 3 AAT 2 1 62863 CASAVA_Build 1 233240108 2D GTGTTTAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 12 10 62864 CASAVA_Build 1 233241026 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 2987 hom 25 11 12 3 A 9 8 62865 CASAVA_Build 1 233311223 1D TCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 22 2 14 6 A 15 14 62866 CASAVA_Build 1 233319232 3D TGCTGGGCTT CGG/--- CCACGTTTCC 3070 het 3070 hom 37 13 22 3 CGG 1 0 62867 CASAVA_Build 1 233327932 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTG 2645 het 2645 ref 27 14 10 3 T 9 10 62868 CASAVA_Build 1 233333708 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1777 hom 23 6 16 1 A 15 14 62869 CASAVA_Build 1 233337307 3D GAGATACCAG CAT/--- CATCAACATG 3070 het 3070 ref 33 17 11 8 CAT 2 1 62870 CASAVA_Build 1 233348081 3I CAACAATGCT ---/AAA GAAGATACAC 3070 het 3070 hom 59 27 27 5 A 0 3 62871 CASAVA_Build 1 233359884 8D GACCCAGGAA ATGTCCTG/-------- ATGTCCTGAT 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 ATGTCCTG 2 1 62872 CASAVA_Build 1 233365167 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2365 het 2365 ref 19 11 7 1 T 11 10 62873 CASAVA_Build 1 233374238 2D AAACTAACAC AT/-- AGAGACAGAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 AT 1 0 62874 CASAVA_Build 1 233381973 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 18 11 A 11 10 62875 CASAVA_Build 1 233388442 3I CTAAAAAGGC ---/AGA AGAACATATG 2361 het 2361 ref 34 19 6 9 AGA 1 2 62876 CASAVA_Build 1 233408792 1I ACTTCCTAGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 8 9 62877 CASAVA_Build 1 233413712 4I TTTCTCTTTC ----/TTTT CTTTCTCTTT 2887 het 2887 ref 36 21 11 4 T 0 4 62878 CASAVA_Build 1 233420399 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 10 11 62879 CASAVA_Build 1 233423927 2I11M1D AATACTTGCA --CAACAGAACGAT/TGCAACAGAACGA- TGTTATGTTT 3070 het 3070 hom 42 18 23 6 N/A 0 0 62880 CASAVA_Build 1 233426867 1I AATCAACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 A 10 11 62881 CASAVA_Build 1 233440817 4D TTACTAGAGA TTCT/---- TTCTACCATC 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 TTCT 2 1 62882 CASAVA_Build 1 233444705 4D CCAAAGAAAT AGAC/---- AGATGAGAGG 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 AGAC 1 0 62883 CASAVA_Build 1 233446736 1D ATTAAAACAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 9 8 62884 CASAVA_Build 1 233450130 4D TGAAGAAAAT AAAC/---- AAATAATAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 AAAC 1 0 62885 CASAVA_Build 1 233451344 1I AGATCTAGTA -/T TCATAGAATA 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 1 2 62886 CASAVA_Build 1 233453360 2D CATATATATG TA/-- TATATATATA 1302 het 1302 ref 14 6 5 4 TA 6 5 62887 CASAVA_Build 1 233455007 6D TTTTGTTTTG TTTTGT/------ TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 38 22 13 6 TTTTGT 1 0 62888 CASAVA_Build 1 233462500 1D GCAACATGGC A/- AAAAAAAAAA 2456 het 1101 hom 19 6 8 5 A 12 11 62889 CASAVA_Build 1 233464561 2D GGTAAACAGG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 CA 6 5 62890 CASAVA_Build 1 233472186 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1351 het 1351 ref 15 9 4 3 A 15 14 62891 CASAVA_Build 1 233481158 2D GAGAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2197 hom 30 6 13 11 A 13 11 62892 CASAVA_Build 1 233486788 4I CTGAATAAAC ----/TGTT TGGTTTTACT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 TGTT 0 1 62893 CASAVA_Build 1 233495635 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 10 9 62894 CASAVA_Build 1 233498309 2D ATATATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 AC 9 8 62895 CASAVA_Build 1 233500402 1I8M6D AGACAAAACC -TAAGCTACTTTAGG/ACAAGTTAC------ TTATAAGTAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 5 N/A 0 0 62896 CASAVA_Build 1 233500994 1D AGTTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 1262 het 1262 ref 37 27 4 6 A 11 10 62897 CASAVA_Build 1 233502679 4D TACATATTAA ATAC/---- ATACAATACC 2726 het 2726 ref 18 10 7 1 ATAC 2 1 62898 CASAVA_Build 1 233502760 3I CTATATTAAT ---/TTG TTATTATTAC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 TTG 0 1 62899 CASAVA_Build 1 233510174 5D CATTTTAATA TTATT/----- TTATTTCCAT 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 TTATT 2 1 62900 CASAVA_Build 1 233511414 2D GATTGAACCC AA/-- GAGGCAGAGG 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 A 2 0 62901 CASAVA_Build 1 233519664 1D ATTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1924 het 1924 ref 33 16 5 12 A 16 15 62902 CASAVA_Build 1 233523754 2I TAAGCAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 AT 5 6 62903 CASAVA_Build 1 233526419 1D TATTCTTCTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 9 8 62904 CASAVA_Build 1 233530357 1D TCCGTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 18 4 A 14 13 62905 CASAVA_Build 1 233533875 1I TACAGGTATT -/A TTTTTTTGGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 62906 CASAVA_Build 1 233534337 1D AAAAATACCA T/- CTGAGCACAT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 1 0 62907 CASAVA_Build 1 233540196 1I AATTTAAAAC -/T TTTTTCAACA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 5 6 62908 CASAVA_Build 1 233542915 5D TGCTTCAAGA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 AAAAG 5 4 62909 CASAVA_Build 1 233543276 1D CTAAGTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 12 11 62910 CASAVA_Build 1 233559572 1D CTTTTCCAAT A/- TGAAGAACTG 3070 het 3070 ref 45 18 19 10 A 1 0 62911 CASAVA_Build 1 233562377 1I GTTGTATATA -/T TACCACATTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 1 2 62912 CASAVA_Build 1 233566328 1D ACTCCGACTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 9 8 62913 CASAVA_Build 1 233567198 1I TCTGCTACTT -/A ACAAAGCAAG 3070 het 3070 ref 41 20 20 1 A 1 2 62914 CASAVA_Build 1 233569700 1I TTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 A 13 14 62915 CASAVA_Build 1 233571937 1I AAATTTTCAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 7 8 62916 CASAVA_Build 1 233573489 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 8 9 62917 CASAVA_Build 1 233588274 1D CGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2349 het 2349 ref 33 14 8 11 A 13 12 62918 CASAVA_Build 1 233588726 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 2317 het 1648 hom 19 8 7 6 A 15 14 62919 CASAVA_Build 1 233598381 1I TACTTGCTTC -/A AAACGTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 3 4 62920 CASAVA_Build 1 233599598 2D CGTCTCTACT AA/-- AAAAAAACAC 3070 het 2317 hom 21 8 8 6 A 9 7 62921 CASAVA_Build 1 233605192 3I AAAGAAGAAT ---/AAC AACAAGAGTC 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 AAC 1 2 62922 CASAVA_Build 1 233608334 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 23 9 11 4 T 9 8 62923 CASAVA_Build 1 233610942 4D AGGCTGGTCT CGAA/---- CTCCTGAGGT 3070 het 3070 ref 23 14 9 1 CGAA 1 0 62924 CASAVA_Build 1 233628081 1D TACTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 12 16 T 15 14 62925 CASAVA_Build 1 233637817 1I TGGTTTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 15 17 10 T 10 11 62926 CASAVA_Build 1 233638441 3I TCAAAAAGGT ---/TAC GGTAGCTCTG 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 TAC 0 1 62927 CASAVA_Build 1 233642736 6D ATCCTTTTCA ATTATT/------ ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 24 8 10 6 ATT 6 4 62928 CASAVA_Build 1 233643691 1D CTGTTTCTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 9 8 62929 CASAVA_Build 1 233646480 2D CACACAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 12 10 62930 CASAVA_Build 1 233653334 3D CCTTAGAAAC AAT/--- AACTCTAGGC 3070 het 3070 ref 39 23 12 6 AAT 1 0 62931 CASAVA_Build 1 233664488 6I TTTCTTTTTC ------/TTTTTT TTTTTTTGAG 3070 het 2522 hom 24 8 9 7 T 7 13 62932 CASAVA_Build 1 233665046 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 10 11 62933 CASAVA_Build 1 233676122 1I CTATACATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 T 10 11 62934 CASAVA_Build 1 233679018 4I ATCTGAACAC ----/AGTT AGTTAATATC 3070 het 3070 hom 38 16 22 0 AGTT 1 2 62935 CASAVA_Build 1 233680753 1I ACGAAGAGTT -/A AAAAAACTTG 3070 het 3070 hom 71 28 33 10 A 6 7 62936 CASAVA_Build 1 233681957 1I TGTCGTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3068 hom 23 8 10 5 T 10 11 62937 CASAVA_Build 1 233685073 3I ATTATTATTA ---/TTG TTAAGACAGG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 TTG 0 1 62938 CASAVA_Build 1 233688475 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 744 het 744 ref 27 16 3 10 A 13 12 62939 CASAVA_Build 1 233694270 3D ATTCAACAAT AAC/--- AAAATAATTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AAC 1 0 62940 CASAVA_Build 1 233698664 1I CTGGGATTAC -/A GGCGTGAGCC 3070 het 47 hom 17 1 15 1 A 0 1 62941 CASAVA_Build 1 233712547 1D CTGCTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 10 12 A 12 11 62942 CASAVA_Build 1 233716030 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 A 8 9 62943 CASAVA_Build 1 233718562 8I GCGGAGGTTG --------/CAGTGAGC CAGTGAGCTG 2788 het 824 hom 12 2 6 4 CAGTGAGC 1 2 62944 CASAVA_Build 1 233719399 1D GCATGAGTCC T/- TTATTGCAAT 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 T 3 2 62945 CASAVA_Build 1 233724216 2D AATACTACAC AT/-- GTTAACCAGT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 AT 1 0 62946 CASAVA_Build 1 233725483 1D AAAAAAAAAA T/- AATAATAATA 590 het 590 ref 29 23 4 3 T 1 0 62947 CASAVA_Build 1 233751973 1D TCATGGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 12 11 62948 CASAVA_Build 1 233753694 6I AGGCCACTCA ------/TTAAGT TTAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 TTAAGT 0 1 62949 CASAVA_Build 1 233758660 1I GGAATATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 10 11 62950 CASAVA_Build 1 233762221 2I GTACCAAACC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 AT 7 8 62951 CASAVA_Build 1 233766610 1I CACAGCGAGA -/C CCCCATCTCA 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 C 4 5 62952 CASAVA_Build 1 233767203 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2478 het 2478 ref 24 10 8 6 A 13 12 62953 CASAVA_Build 1 233769401 4I ATGAGGAAAA ----/TAAG TAAGTATTTG 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 TAAG 1 2 62954 CASAVA_Build 1 233773832 1D TGGTTCCCCC G/- CCCCCCTTTC 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 G 1 0 62955 CASAVA_Build 1 233782989 2D GCCAGCACAC AT/-- GTTTTAACTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 AT 1 0 62956 CASAVA_Build 1 233798092 1I TTTTTTTTTT -/A AAACCTATGA 3070 het 3070 hom 42 12 14 16 A 3 4 62957 CASAVA_Build 1 233802110 2I ACAGCTAAAC --/AT AGAAAAGGTA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 AT 0 1 62958 CASAVA_Build 1 233806151 1I GCCGGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1441 hom 16 5 7 4 T 10 11 62959 CASAVA_Build 1 233807602 1D GAACTCGTGA T/- CCACCCGCCC 3070 het 2436 hom 16 6 8 2 T 1 0 62960 CASAVA_Build 1 233814585 3I28M6D GCTACCTGTT ---TCACAGAAAGCATGTGCTACACACATCACAATTG/CGGTCACAGAAAGCATGTGCTACACACATCA------ CAATTGCCCC 3070 het 3070 ref 51 36 26 7 N/A 0 0 62961 CASAVA_Build 1 233816303 2D CCATCTCTCC GT/-- GTGTGTGTGT 1079 het 1079 ref 65 42 3 20 GT 7 6 62962 CASAVA_Build 1 233817843 12I GTGGGTATAA ------------/GTGTAAGTGTAC GTGTGAGTCC 3070 het 2563 hom 32 9 16 7 GTGTAAGTGTAC 0 1 62963 CASAVA_Build 1 233827323 1D GTCCCCCCTA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 C 8 7 62964 CASAVA_Build 1 233835886 3I TGTGGGGGGG ---/GGA TGGGTCTCAC 3070 het 3070 ref 33 12 15 6 GGA 0 1 62965 CASAVA_Build 1 233861499 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2632 hom 31 10 12 9 T 13 12 62966 CASAVA_Build 1 233869483 1D CTTTTTTTTT C/- TGAGACAGAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 C 1 0 62967 CASAVA_Build 1 233877371 1D ATAGTGAAAT A/- AGTGAGATGC 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 A 2 1 62968 CASAVA_Build 1 233882749 1D CATGGTGAAA C/- CCCATCTCTA 3070 het 3070 hom 43 19 17 7 C 4 3 62969 CASAVA_Build 1 233883106 1I CATAGGTAAT -/A AACCCCACAG 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 2 3 62970 CASAVA_Build 1 233889030 1D GCATGAGCTC T/- TTTTTTTTTT 789 het 408 hom 10 4 5 1 T 11 10 62971 CASAVA_Build 1 233893006 1D GTAAGGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 A 13 12 62972 CASAVA_Build 1 233923162 1I ATGGCGTGAG -/C CCGGGAGGTG 3070 hom 42 het 17 0 14 3 C 2 3 62973 CASAVA_Build 1 233933864 1I CACCAGTGTC -/T GTTGTTCCCC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 0 1 62974 CASAVA_Build 1 233962912 2D TCTATCCTTC AA/-- AGAGTTGACA 3070 het 3070 hom 38 15 15 9 A 3 1 62975 CASAVA_Build 1 234021204 2I AAACTGTCTC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 1981 hom 24 7 11 6 A 9 11 62976 CASAVA_Build 1 234126684 2I TGCACCTCTG --/CA CATTCCAGCC 1413 het 1413 ref 22 9 5 8 CA 1 2 62977 CASAVA_Build 1 234126915 1I CTCTCCCTTC -/T TTCCCAAATT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 2 3 62978 CASAVA_Build 1 234150083 2I TGTATTAGGG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 44 17 14 13 TC 7 8 62979 CASAVA_Build 1 234162043 1D CTAATTGCAA G/- GGGTTCACAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 G 4 3 62980 CASAVA_Build 1 234164033 1I TGACTATGTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 21 9 10 2 T 8 9 62981 CASAVA_Build 1 234164367 5D TATATATATA TATTT/----- TTTTTTTTTA 1617 het 68 hom 7 1 4 2 TATTT 1 0 62982 CASAVA_Build 1 234198983 2D GGCACATGGC CT/-- CTTCATGTGG 3070 het 3070 ref 29 11 11 9 CT 2 1 62983 CASAVA_Build 1 234246080 1D CCTACTGAGG A/- AAAAAAAAAA 1012 het 1012 ref 45 28 3 16 A 12 11 62984 CASAVA_Build 1 234272728 1D CTTTTGTAGG C/- TAATGAGTTG 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 C 1 0 62985 CASAVA_Build 1 234274770 3I CCTTGAGATC ---/GAA AAAGGAGATA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 GAA 0 1 62986 CASAVA_Build 1 234290692 1I TAGACTGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1328 hom 21 6 9 6 A 14 15 62987 CASAVA_Build 1 234298308 2I ACACATTAAT --/AA AATGTGCACA 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 2 4 62988 CASAVA_Build 1 234304263 3I CATTTGTTAA ---/AAG AACAGGCCAG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AAG 0 1 62989 CASAVA_Build 1 234309206 4D AAATACACTG TATC/---- TGTGCAGTGC 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 TATC 1 0 62990 CASAVA_Build 1 234312157 1D TGCAATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2878 hom 38 15 11 12 T 13 12 62991 CASAVA_Build 1 234319838 1D ACACATCTTT A/- AAAAAAAAAG 3030 het 1448 hom 11 3 7 1 A 10 9 62992 CASAVA_Build 1 234320461 4I CTGGTCGACA ----/GAGT GAGATTCCGT 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 GAGT 0 1 62993 CASAVA_Build 1 234322822 1D TTTTTGCACA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 9 8 62994 CASAVA_Build 1 234331373 2I AATTCTGTGG --/GT GTGTGTGTGA 3070 hom 165 het 72 0 52 20 GT 4 5 62995 CASAVA_Build 1 234331729 4I TTACGTGGGT ----/GTGA GTGTGTGTGG 3070 hom 151 het 69 0 48 21 GTGA 0 1 62996 CASAVA_Build 1 234333663 4D AGAACAGAAT ATAC/---- ATACAATTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 ATAC 2 1 62997 CASAVA_Build 1 234337841 1I GGGAAGCCGA -/G GGGGGGGCAG 2739 het 2739 ref 22 10 7 5 G 7 8 62998 CASAVA_Build 1 234341861 9D GTGCAGTGCC AACATTGAA/--------- AACACCCAGG 3070 hom 82 het 28 0 24 6 AACATTGAA 1 0 62999 CASAVA_Build 1 234352783 1I GTTTATTTTT -/A TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 1 63000 CASAVA_Build 1 234355407 9I3M2D CACCTCTAGT ---------CTGAT/CCCAGCTACCTG-- GTAGGCTGAT 3070 hom 66 het 24 0 19 5 N/A 0 0 63001 CASAVA_Build 1 234365367 4I GGAGGCTGTT ----/CCTG CCTGCCTTGC 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 CCTG 1 2 63002 CASAVA_Build 1 234371278 4I GAAATCCGAG ----/TTTC TTTCTTCTGT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 TTTC 1 2 63003 CASAVA_Build 1 234374010 1D TTTAAGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 22 1 12 9 T 15 14 63004 CASAVA_Build 1 234374333 5D ATCCTGTCTC AAAAA/----- AACAAACGAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 7 2 63005 CASAVA_Build 1 234379179 2I AAGCCTAATC --/TA GCAGTGCCTG 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 TA 0 1 63006 CASAVA_Build 1 234384217 1I TAACTCCCAC -/T CCTGCGCCCT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 0 1 63007 CASAVA_Build 1 234403685 2I TACAAAATTC --/TG TTTCTGTGGA 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 TG 0 1 63008 CASAVA_Build 1 234403854 1D GGATATTAGG A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 A 7 6 63009 CASAVA_Build 1 234407488 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 47 het 21 0 15 6 T 9 8 63010 CASAVA_Build 1 234411821 4I TTGCTATTTT ----/AACC TTTTTTTTTT 1683 het 269 hom 22 3 10 9 AACC 0 1 63011 CASAVA_Build 1 234424156 1D CTCATCATAA T/- TTTGAGAAGC 3070 het 3070 hom 44 12 25 8 T 4 3 63012 CASAVA_Build 1 234425966 4D GACTTTGTTG TTTC/---- TTTTACTGTG 2673 het 2673 ref 29 20 7 4 TTTC 1 0 63013 CASAVA_Build 1 234431340 3I ACACCAATTA ---/TTC TTATGTTTGG 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 TTC 0 1 63014 CASAVA_Build 1 234435015 1I GCATGATGTC -/T TGTAAGTATG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 T 1 2 63015 CASAVA_Build 1 234436753 9I TGAGACGGTG ---------/AGGCCAGCA AGGCCAGCAG 2503 het 2378 hom 33 7 8 18 AGGCCAGCA 1 2 63016 CASAVA_Build 1 234443482 1D AAAAACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2172 hom 31 9 12 10 A 12 11 63017 CASAVA_Build 1 234443601 6D GCAATGAAAT AGAAAC/------ AGATACAGAG 2424 het 2424 ref 23 12 7 6 AGAAAC 1 0 63018 CASAVA_Build 1 234445658 1D CACCTAATCT G/- TGTATTTTGG 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 G 1 0 63019 CASAVA_Build 1 234445845 4D TCATATACAT ACAG/---- AGATTACAAA 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 ACAG 1 0 63020 CASAVA_Build 1 234448893 12D CTCTATTTCA TCTCCTGCTGAG/------------ TCTCTCTCCT 3070 het 3070 ref 40 24 16 2 TCTCCTGCTGAG 1 0 63021 CASAVA_Build 1 234450646 3I CAATATAAAA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 9 12 63022 CASAVA_Build 1 234451292 2I AGAAAAAGAC --/AT ATTTTATTTC 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 AT 1 2 63023 CASAVA_Build 1 234451695 6I CACATATACT ------/TTAATA TTAATTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 TTAATA 0 1 63024 CASAVA_Build 1 234452449 5I ATATTAATTC -----/AATAA ACTTTCCACT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 AATAA 0 1 63025 CASAVA_Build 1 234461016 4D ACGTCCAACT ATTG/---- ATTATTCCAT 3070 het 3070 hom 29 12 14 5 ATTG 1 0 63026 CASAVA_Build 1 234462560 1I AAAAATGGTC -/T TTTTTTTTTT 2669 het 2669 ref 27 10 8 9 T 10 11 63027 CASAVA_Build 1 234463524 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1060 het 1060 ref 21 13 3 5 A 13 12 63028 CASAVA_Build 1 234471480 5D CAAAACAAAA CAAAT/----- CAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 27 11 16 3 CAAAT 1 0 63029 CASAVA_Build 1 234477850 9I TGTTGTATTA ---------/TCACTTAGG TCTTCTCTGA 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 TCACTTAGG 0 1 63030 CASAVA_Build 1 234478359 1I CTTCTAATGT -/G GAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 G 1 2 63031 CASAVA_Build 1 234480496 34D17M2I AAATTTGACC ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCAAAC--/----------------------------------ATATATATATAGCAAACAT GTGTGTGTGC 579 het 490 hom 12 2 2 9 N/A 0 0 63032 CASAVA_Build 1 234482883 1I TAAGTATAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 T 9 10 63033 CASAVA_Build 1 234485024 2D TTTTTTTCTT TC/-- TTTTTTTTTT 2269 het 2269 ref 25 12 8 5 TC 1 0 63034 CASAVA_Build 1 234486456 1D GGAAGGAGGC G/- GGGGGACCTC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 G 6 5 63035 CASAVA_Build 1 234486645 1I CCAGGTCTTC -/A AACTCTCCAT 2636 het 2636 ref 27 18 7 2 A 2 3 63036 CASAVA_Build 1 234486828 4D TCAGCAGCTA TCTC/---- TCTCTTCCAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 TC 4 2 63037 CASAVA_Build 1 234489619 2D CAAAAACTAA AT/-- ATATATATGC 3070 het 3070 hom 31 12 14 7 AT 5 4 63038 CASAVA_Build 1 234489749 1D ACCTAGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 A 11 10 63039 CASAVA_Build 1 234490007 1D18M1I GAAACCAAAG TTTTTTTTTAAAGATAAAC-/-TTTTTTTTAAAGATAAACA AAATAGACAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 10 N/A 0 0 63040 CASAVA_Build 1 234490776 8I CACTACAAAA --------/AAATAAAT AAATAAACAA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 AAAT 1 3 63041 CASAVA_Build 1 234490938 4D GATGTACATA AATC/---- AATAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 AATC 1 0 63042 CASAVA_Build 1 234494971 3D TTTTTTTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2426 het 245 hom 21 2 5 15 T 14 11 63043 CASAVA_Build 1 234497888 1D CCTCCGGGGG A/- AAAAAAAAAA 1223 het 1223 ref 36 22 3 13 A 13 12 63044 CASAVA_Build 1 234499759 1D TCACATATAA T/- ACCTTTGATA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 1 0 63045 CASAVA_Build 1 234504668 1I AAATTAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 862 hom 32 5 16 11 A 10 11 63046 CASAVA_Build 1 234515014 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 T 10 11 63047 CASAVA_Build 1 234516642 1I TTTCACTTGC -/A AACACTTACA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 2 3 63048 CASAVA_Build 1 234522354 1D CTTATTTATC A/- AAAAAAGGCT 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 A 7 6 63049 CASAVA_Build 1 234539416 2D TTAATCTTCT TC/-- TTTTTTTTTT 2949 het 2949 ref 27 15 9 3 TC 1 0 63050 CASAVA_Build 1 234541828 1I TTCTGGCTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 T 8 9 63051 CASAVA_Build 1 234543940 3I GTATGACATT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 11 14 63052 CASAVA_Build 1 234546383 1I AATTAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 0 1 63053 CASAVA_Build 1 234551344 1D ATGCCCGATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 51 20 22 9 A 9 8 63054 CASAVA_Build 1 234553790 1D GTGTCACTGC A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 43 16 23 5 A 7 6 63055 CASAVA_Build 1 234557980 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 8 9 63056 CASAVA_Build 1 234574161 3I GAAACAAACA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 87 het 30 0 27 3 AAC 3 4 63057 CASAVA_Build 1 234574283 1I GGTATCACAG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 9 63058 CASAVA_Build 1 234595628 2I TCCTCCAAAT --/AC AGTTTTCAGT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 AC 0 1 63059 CASAVA_Build 1 234598364 1D CAGTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 996 het 560 hom 14 6 4 4 T 19 18 63060 CASAVA_Build 1 234613310 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2963 het 613 hom 34 9 12 13 A 18 16 63061 CASAVA_Build 1 234615648 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 17 1 9 7 A 11 10 63062 CASAVA_Build 1 234618931 1I AACATCCCTC -/A AAAAAACTTC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 6 7 63063 CASAVA_Build 1 234623935 1I AAAAAAAAAA -/C CCCTTAAAAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 3 4 63064 CASAVA_Build 1 234644386 1I AATTTTTTTC -/T TTTTTTAAAT 2678 het 2678 ref 25 13 8 4 T 6 7 63065 CASAVA_Build 1 234649411 3D TAATTTTGAC ATT/--- GTGGGGATGA 3070 het 3070 ref 51 31 18 3 ATT 1 0 63066 CASAVA_Build 1 234650958 2I TGCCCTGCCA --/GG GGAGAATGTG 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 G 2 4 63067 CASAVA_Build 1 234655891 1D TATTTTTCTT A/- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 1 0 63068 CASAVA_Build 1 234660537 3D AAACAAAATG TCT/--- TCTTCTCCTA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 TCT 3 2 63069 CASAVA_Build 1 234661039 4D CCCTGTCTTA AAAT/---- AAATAAATAA 1922 het 1922 ref 13 5 5 3 AAAT 5 4 63070 CASAVA_Build 1 234662318 1I CCACCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2058 het 1434 hom 25 6 10 9 A 13 14 63071 CASAVA_Build 1 234663098 1D ATCAATGAAA G/- GCGCATCGCC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 2 1 63072 CASAVA_Build 1 234663814 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 224 hom 23 1 17 5 A 8 9 63073 CASAVA_Build 1 234668042 4I GTTTTCCCTC ----/TTTG TTTGTCTGTC 3070 hom 125 het 47 0 37 10 TTTG 1 2 63074 CASAVA_Build 1 234676478 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 32 0 28 4 A 11 10 63075 CASAVA_Build 1 234681349 1I CCTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 10 11 63076 CASAVA_Build 1 234685719 3D AAATCGCCTG TTC/--- TTTTTTTTTG 1970 het 1970 ref 26 17 6 3 TTC 1 0 63077 CASAVA_Build 1 234688278 2I TCCTGGCCTT --/AA AAAAAACTTA 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 6 8 63078 CASAVA_Build 1 234692987 2I TTACACACAC --/AT ATTTAAAATC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 AT 1 2 63079 CASAVA_Build 1 234709428 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 31 1 25 5 A 10 11 63080 CASAVA_Build 1 234709547 1I CAAGTCCCAG -/C CTTCTACTCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 1 2 63081 CASAVA_Build 1 234709669 1I AAGTTTAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 21 1 15 5 A 11 12 63082 CASAVA_Build 1 234709847 2I GGTGTGCACC --/TG TAGTCCCAGC 3070 hom 39 het 19 0 14 5 TG 0 1 63083 CASAVA_Build 1 234710998 1D ATTTAAAAAG T/- TAAGATTCCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 1 63084 CASAVA_Build 1 234719349 1I CACCCAGCAA -/T TTTTTTTTTT 2066 het 710 hom 22 4 12 6 T 17 18 63085 CASAVA_Build 1 234719861 11I4M2I GGCTTACATG -----------GTCC--/TTAGGGCTGGAGTGCAG TGGGATTTCC 3070 hom 75 het 28 0 25 6 N/A 0 0 63086 CASAVA_Build 1 234726112 1I CATCTAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 11 63087 CASAVA_Build 1 234727595 1I AATAGGGAGA -/C CCCCATCTCT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 4 5 63088 CASAVA_Build 1 234727968 1D AAGAGATCCT C/- CCACCTCAGC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 3 2 63089 CASAVA_Build 1 234731584 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 28 1 24 5 A 16 14 63090 CASAVA_Build 1 234738188 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 1695 hom 10 het 6 0 4 2 T 8 7 63091 CASAVA_Build 1 234740627 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 11 12 63092 CASAVA_Build 1 234741556 1I CCTCTCAACT -/A AAAAATACAA 2448 het 2448 ref 21 11 7 3 A 5 6 63093 CASAVA_Build 1 234742042 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 33 1 13 19 T 14 13 63094 CASAVA_Build 1 234742241 4I TCTCTGTCTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 het 1093 hom 25 4 13 8 TCTT 3 4 63095 CASAVA_Build 1 234743812 2D ATATATAAGA TG/-- TGTGTGTGTA 2205 het 2205 ref 28 17 10 2 TG 5 4 63096 CASAVA_Build 1 234745629 1D AGAAAAATAG T/- TGTAAAAGAG 3070 het 3070 hom 43 20 16 7 T 2 1 63097 CASAVA_Build 1 234746466 5D GGAAGAAAGA GAAAG/----- GAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 GAAAG 2 1 63098 CASAVA_Build 1 234755329 1D ATTAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 24 0 17 7 T 15 14 63099 CASAVA_Build 1 234757613 1D TCAATGTTCC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 9 8 63100 CASAVA_Build 1 234761608 2D AAAGATATTG AC/-- AGTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 28 14 13 2 AC 1 0 63101 CASAVA_Build 1 234762771 7D CCATCTCAAG AAAAACA/------- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 18 9 8 3 AAAAACA 3 2 63102 CASAVA_Build 1 234763561 2D CTGACCCCCA TT/-- TTTTTTTTTT 2701 het 2701 ref 30 11 13 7 T 14 12 63103 CASAVA_Build 1 234765390 2D14M2I ATTACTTTCT CACTTATATTACTAAC--/--CTTATATTACTAACAT TTGTGTTATT 2976 het 2976 ref 26 19 7 5 N/A 0 0 63104 CASAVA_Build 1 234767297 3D CTGGATTCTG AGC/--- AGATTTATGT 3070 het 3070 ref 31 15 15 2 AGC 1 0 63105 CASAVA_Build 1 234767722 1I ATTTCAGTAT -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 A 6 7 63106 CASAVA_Build 1 234769121 4D CTGAGATATA GTTT/---- GTTTGGCTTT 3070 het 3070 ref 37 20 9 9 GTTT 2 1 63107 CASAVA_Build 1 234769437 1I GATCATGAGA -/T TTTTAGACCC 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 T 4 5 63108 CASAVA_Build 1 234769547 2I GTCCCAGAAG --/CT CTTACACCTG 3070 het 3070 ref 34 23 9 2 CT 1 2 63109 CASAVA_Build 1 234770456 1D TTTTGGTGGC G/- GGGGGGGCTC 3070 het 3070 ref 30 13 10 8 G 8 7 63110 CASAVA_Build 1 234771512 3D3M4I TATATGTCAA TATAAA----/---ACAGGTT ATATTTAGAA 3070 het 3070 ref 33 21 11 2 N/A 0 0 63111 CASAVA_Build 1 234773874 1D ACATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2065 het 1715 hom 28 11 7 10 T 12 11 63112 CASAVA_Build 1 234774452 1I TGATTTTAAA -/G GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 G 3 4 63113 CASAVA_Build 1 234774646 1D TTAATTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 11 10 63114 CASAVA_Build 1 234774981 4I GTAATTTGCC ----/CCTT CCTTTTTATA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 CCTT 1 2 63115 CASAVA_Build 1 234775167 1D51M10D ACTTGAGGAC GTGGAGACCCTAAAACTGCTTGCTTGCACTGGCCATCATCTCCCATCAGGGTAGACGGTTTC/-TGGAGACCCTAAAACTGCTTGCTTGCACTGGCCATCATCTCCCATCAGGGT---------- AGGTGGCAGT 3070 het 3070 ref 34 34 22 8 N/A 0 0 63116 CASAVA_Build 1 234775698 1I AAGGTTCCCT -/G GAAGTTGTGG 3070 het 3070 ref 51 23 23 5 G 1 2 63117 CASAVA_Build 1 234776471 4I AATCCGTGTT ----/CCTC CCAGCTGTTC 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 CCTC 0 1 63118 CASAVA_Build 1 234776859 2I TCTTGGCCAG --/CT CTGTTATCAG 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 CT 1 2 63119 CASAVA_Build 1 234776937 4I CACTGCTCCT ----/ATCA ATCAAAAGAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 ATCA 1 2 63120 CASAVA_Build 1 234777275 4I CCGATGGATC ----/TGAA TGAATTTGTA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 TGAA 1 2 63121 CASAVA_Build 1 234777480 4D GAGGCAGAAA AGTC/---- AGTCAGGATC 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 AGTC 2 1 63122 CASAVA_Build 1 234777559 4D41M1I ACCATATTAG GAGTGAGTTTTCCTGCTTTAGGAGAGTCCCCAGCATCGGCGAGGA-/----GAGTTTTCCTGCTTTAGGAGAGTCCCCAGCATCGGCGAGGAG GGGGCAGCAC 3070 het 3070 ref 29 23 14 9 N/A 0 0 63123 CASAVA_Build 1 234777798 2I TCTTGGAAGT --/CA CAGAAGGAAG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 CA 1 2 63124 CASAVA_Build 1 234778698 4D CTGACATCAT TTTC/---- TTTATCGTAA 3070 het 3070 hom 48 17 26 9 TTTC 1 0 63125 CASAVA_Build 1 234781333 1D GCCTAAGACT C/- TATGTTCCAG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 1 0 63126 CASAVA_Build 1 234790258 1D ATTAGGAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2308 hom 25 6 12 7 A 10 9 63127 CASAVA_Build 1 234792685 4I ACAGTGTCTC ----/TCTT TCTATTTCTT 3070 hom 104 het 38 0 35 3 TCTT 0 1 63128 CASAVA_Build 1 234792853 7D AGGAATAACA ATATTAT/------- ATAACAGTGG 3070 het 3070 ref 31 15 12 9 ATATTAT 1 0 63129 CASAVA_Build 1 234796356 3I ATTCGCCTTC ---/AGA AGATGTTTTG 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 AGA 1 2 63130 CASAVA_Build 1 234803460 1D CAAGGAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 T 11 10 63131 CASAVA_Build 1 234807068 4I GAAAATACAC ----/AAAT AAGAGCATAC 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 AAAT 0 1 63132 CASAVA_Build 1 234809859 3D TTAAAAAAAA AAC/--- AACAAGAAAC 3070 het 3070 ref 30 17 11 4 AAC 2 1 63133 CASAVA_Build 1 234811048 1I CCCTCTGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 9 10 63134 CASAVA_Build 1 234816075 1D ACTGGCATAT A/- AGCATGACCA 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 A 2 1 63135 CASAVA_Build 1 234818143 1D GGGCCTTTTG A/- GATTAATAAT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 1 0 63136 CASAVA_Build 1 234819417 1I GACATAAAAC -/A AAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 5 6 63137 CASAVA_Build 1 234821054 6I CACATGAGTT ------/GCAATA GATGAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 GCAATA 0 1 63138 CASAVA_Build 1 234821663 1I AATATCCCAT -/A ACAAAATTCT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 1 2 63139 CASAVA_Build 1 234822561 1D AGAAGGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 23 8 A 11 10 63140 CASAVA_Build 1 234824994 7D CTAATTATTA CTTTTTG/------- CTTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 27 11 12 7 CTTTTTG 2 1 63141 CASAVA_Build 1 234831602 3I CAAACAAACA ---/AAC AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 AAC 0 1 63142 CASAVA_Build 1 234831891 1D CATCTTTACT A/- AAAAAAAAAA 2336 het 2303 hom 25 11 7 7 A 13 12 63143 CASAVA_Build 1 234833802 1D GAGAAAACAA G/- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 G 4 3 63144 CASAVA_Build 1 234838646 1I TAAACCCAGC -/A AGGTTGAGAG 3070 het 3070 hom 41 11 23 7 A 1 2 63145 CASAVA_Build 1 234855497 1D ACGACCAGTC A/- AAAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 5 4 63146 CASAVA_Build 1 234859023 1I AAACTATATA -/T TACTTTTCTG 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 T 1 2 63147 CASAVA_Build 1 234864132 1I GTAGGTATAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 11 21 7 T 8 9 63148 CASAVA_Build 1 234866340 1D CCTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 23 1 16 6 T 13 12 63149 CASAVA_Build 1 234866643 1I CCAGCCTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 9 10 63150 CASAVA_Build 1 234867138 1I AAAAAGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 9 10 63151 CASAVA_Build 1 234867840 9I AAATAAAAAA ---------/GTTAGCAGG GTGTGGTGGC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GTTAGCAGG 0 1 63152 CASAVA_Build 1 234872224 1D AATGCACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 22 0 16 6 A 11 10 63153 CASAVA_Build 1 234885741 1I CTTTTAACTA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 7 8 63154 CASAVA_Build 1 234908201 1D TTTTTTAAAT A/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 1 0 63155 CASAVA_Build 1 234912446 1D CTTAAAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 T 13 12 63156 CASAVA_Build 1 234913871 1D GTTTTATGTG T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 99 het 37 0 32 5 T 7 6 63157 CASAVA_Build 1 234922721 1I AGATTTTCCA -/G GAGTGTGGGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 1 2 63158 CASAVA_Build 1 234926241 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 233 hom 31 2 18 11 A 16 15 63159 CASAVA_Build 1 234936035 1D AGGTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 T 12 11 63160 CASAVA_Build 1 234937583 12D TTCATAGTGC TTTTCTTTTCTT/------------ TTTTCTTTTC 3070 het 918 hom 24 6 9 9 TTTTCTTTTCTT 2 1 63161 CASAVA_Build 1 234937633 2D CTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1244 hom 15 het 8 0 5 3 T 20 18 63162 CASAVA_Build 1 234950843 8D TTCTGACTCT GTAATCCA/-------- GTAGGTAACC 3070 hom 71 het 25 0 22 4 GTAATCCA 1 0 63163 CASAVA_Build 1 234955560 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 8 63164 CASAVA_Build 1 234957109 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 10 9 63165 CASAVA_Build 1 234965307 1D AGCCCATCAA G/- GGGTGGGGGA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 G 4 3 63166 CASAVA_Build 1 234966523 1D GTGGAAGGAT C/- CCCCTCCAGA 3070 hom 100 het 39 0 34 6 C 5 4 63167 CASAVA_Build 1 234967451 1D TGGACACCCC T/- AGACGACCTT 1659 het 1659 ref 35 12 4 21 T 1 0 63168 CASAVA_Build 1 234972209 7I GAAGCTGCAT -------/GGGAACG GGGAACTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 GGGAACG 0 1 63169 CASAVA_Build 1 234982667 14D ATAGAGATGA GGTTTCACTATGTT/-------------- GGCCAGGCTG 1863 hom 15 het 6 0 6 0 GGTTTCACTATGTT 1 0 63170 CASAVA_Build 1 234995957 2I AAGACACTGA --/GT GTTCCCACTG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 GT 1 2 63171 CASAVA_Build 1 235003750 1D CTTGTTTGCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 52 22 17 13 T 9 8 63172 CASAVA_Build 1 235004846 6D GTCGTATAGC GAAACG/------ GAATTAAACA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 GAAACG 1 0 63173 CASAVA_Build 1 235011474 1D CTCTGTCTCT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 9 8 63174 CASAVA_Build 1 235013758 3D AAAAGCAAAG AAC/--- AACAACAAAC 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 AAC 3 2 63175 CASAVA_Build 1 235018187 1D TGTCTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1116 hom 31 9 13 9 A 15 14 63176 CASAVA_Build 1 235023864 3D TTTCCTCCTT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 7 TTC 3 2 63177 CASAVA_Build 1 235026724 5I TAATTAATAA -----/ATAAG ATGTAAACCT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 ATAAG 0 1 63178 CASAVA_Build 1 235026942 1D TGAGTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 A 12 11 63179 CASAVA_Build 1 235029713 1I AAATTCATTG -/T TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 17 7 T 1 2 63180 CASAVA_Build 1 235035466 20I TGCAGTGGTG --------------------/CCACCGTGGCTCACTCTTGC CCACCGTGGC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 CCACCGTGGCTCACTCTTGC 0 1 63181 CASAVA_Build 1 235045616 4I CACAATACAT ----/TCTG TCTTTTATTA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TCTG 0 1 63182 CASAVA_Build 1 235047173 1I ATTTCTGGGC -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 6 7 63183 CASAVA_Build 1 235048260 1D CTAGCGATTA G/- GTAAAACCTC 3070 het 3070 hom 53 17 29 8 G 2 1 63184 CASAVA_Build 1 235052164 1I AATTTTATAG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 7 8 63185 CASAVA_Build 1 235055217 1I ACAGTGTATA -/T TTTTTAAGGC 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 5 6 63186 CASAVA_Build 1 235057199 1D CTCCAGATTG T/- GAGAAAATAC 3070 het 3070 ref 42 23 13 7 T 1 0 63187 CASAVA_Build 1 235069316 4I ATATAAAAAG ----/AAAT AACAAATAGC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAAT 0 1 63188 CASAVA_Build 1 235071571 1I TTGGTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 488 hom 30 2 15 13 T 14 15 63189 CASAVA_Build 1 235074988 1D TTCAGAGTGA C/- CACCGAGGTG 3070 het 3070 ref 38 21 10 8 C 2 1 63190 CASAVA_Build 1 235080538 3D ATTTATTGGC TGA/--- TGAAATGTTA 3070 hom 102 het 40 0 34 8 TGA 2 1 63191 CASAVA_Build 1 235090333 1D GTTTTGTTTT G/- TTTTTTTTTG 3070 het 2040 hom 33 8 21 4 G 1 0 63192 CASAVA_Build 1 235096421 1D TAATAACTCT G/- TAATGGCCTT 3070 het 3070 hom 33 10 18 6 G 1 0 63193 CASAVA_Build 1 235099639 11I TGGTAGAGGT -----------/GAGAGGGAATG GAGAGGGATG 3070 hom 118 het 47 0 38 9 GAGAGGGAATG 0 1 63194 CASAVA_Build 1 235101253 1D TATCACCCAC A/- ACTCTATCCT 3070 hom 79 het 31 0 24 8 A 2 1 63195 CASAVA_Build 1 235101440 1I ATACAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 22 23 8 A 10 11 63196 CASAVA_Build 1 235106636 1I CAGATTAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 384 hom 46 1 39 6 A 9 10 63197 CASAVA_Build 1 235112437 1I CCTCAGCCTC -/A ACAAGTAGCT 3070 het 3070 hom 20 7 10 3 A 1 2 63198 CASAVA_Build 1 235125620 4I CACTCGTAGC ----/TATT TATTCTGCAT 3070 hom 154 het 61 0 52 9 TATT 1 2 63199 CASAVA_Build 1 235128328 1D TTTGTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 105 hom 23 1 11 11 T 13 12 63200 CASAVA_Build 1 235130333 1I CTATGCTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 146 hom 28 1 22 5 A 9 10 63201 CASAVA_Build 1 235131390 1D AACCCAACTT C/- CAGGGAGACT 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 C 2 1 63202 CASAVA_Build 1 235134267 3D ATTAAATCTT GAG/--- GCTGGGTGCC 3070 het 1321 hom 23 4 15 4 GAG 1 0 63203 CASAVA_Build 1 235135452 1D CCCTGTGTCG A/- AAGAGCCAAG 3070 het 3070 ref 60 30 22 10 A 3 2 63204 CASAVA_Build 1 235142786 2D GTGATCTGCC TG/-- CCTCTGCCTC 3070 het 3070 hom 22 11 8 3 TG 1 0 63205 CASAVA_Build 1 235143175 4D GCAAACAAAC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 548 hom 34 7 15 14 AAAT 4 3 63206 CASAVA_Build 1 235143397 1D TACATATGAG T/- GGGTCCAACC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 1 0 63207 CASAVA_Build 1 235153701 1D GTTTCTATAG A/- GCAAGAGCAG 3070 het 3070 ref 40 17 17 7 A 1 0 63208 CASAVA_Build 1 235167865 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2910 het 18 hom 31 1 11 19 T 15 14 63209 CASAVA_Build 1 235180243 8D GCCACTTTTT TTGTTTTA/-------- TTGTTTTATT 3070 hom 27 het 13 0 10 5 TTGTTTTA 3 2 63210 CASAVA_Build 1 235214973 1D TATACTAAAC G/- GGGGGAAAAG 3070 hom 118 het 47 0 39 8 G 6 5 63211 CASAVA_Build 1 235216568 1D ACCTTCTCCA T/- TATTTCTGGC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 1 63212 CASAVA_Build 1 235223617 2I GAAATTATGT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 40 1 29 10 TG 0 1 63213 CASAVA_Build 1 235231115 1I GAAGATGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 123 het 52 0 40 12 T 9 10 63214 CASAVA_Build 1 235233773 14I CTGCTGTGTA --------------/GTTTCTCACCTTTT GTTTCTCACT 3070 hom 94 het 37 0 28 9 GTTTCTCACCTTTT 0 1 63215 CASAVA_Build 1 235240515 1D GGGAAAATGG T/- TTTTTCCTTC 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 6 5 63216 CASAVA_Build 1 235258760 1D CCAATCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2555 het 2168 hom 19 7 7 5 A 13 12 63217 CASAVA_Build 1 235260121 1D CAGGTCCCTG T/- TAGGTGTGTG 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 2 1 63218 CASAVA_Build 1 235264692 1I TTTATATTTT -/G GGGGGGGGTT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 G 8 9 63219 CASAVA_Build 1 235269474 1D AAAAAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1313 hom 22 7 12 3 T 15 14 63220 CASAVA_Build 1 235274109 2D ACTATAAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 35 1 32 5 T 13 11 63221 CASAVA_Build 1 235293357 5D CTTCAGTGTT TACAC/----- TAGAGATTAT 3070 het 3070 ref 25 16 8 5 TACAC 1 0 63222 CASAVA_Build 1 235294636 13D AATACCTGCA GTTTTTTGTTTTT/------------- GTTTTTTGTT 3070 hom 66 het 37 0 23 16 GTTTTTTGTTTTT 2 1 63223 CASAVA_Build 1 235295387 1I TGGTATTTTT -/C TTTAGTAGAG 2876 hom 18 het 8 0 7 1 C 0 1 63224 CASAVA_Build 1 235296506 1I ATTTGCTTTT -/C CCCTAATGGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 3 4 63225 CASAVA_Build 1 235297115 1D TGGATTGTGC T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 8 7 63226 CASAVA_Build 1 235311436 2D CACCCCCCAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 103 het 41 0 34 7 AT 8 7 63227 CASAVA_Build 1 235329030 2D GTGTGAACGG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 39 0 32 9 A 11 9 63228 CASAVA_Build 1 235329767 1I GTAGGCACTA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 8 9 63229 CASAVA_Build 1 235339269 1I GTAAAGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 23 2 17 4 T 10 11 63230 CASAVA_Build 1 235340191 1D AAAATGGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 17 0 13 5 T 10 9 63231 CASAVA_Build 1 235345160 1D GGAAACCACA C/- CCCCCCCCTT 3070 hom 71 het 29 0 23 6 C 9 8 63232 CASAVA_Build 1 235352781 1I TTTCAAATAA -/T TTTCCTTGAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 3 4 63233 CASAVA_Build 1 235355347 1D CTGTTTTGCT A/- AAAAAAAAAA 1656 het 1656 ref 37 23 5 9 A 15 14 63234 CASAVA_Build 1 235382844 1D ACAAAGGTGT A/- AATATCCAGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 3 2 63235 CASAVA_Build 1 235383523 1I ATGTGTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 10 11 63236 CASAVA_Build 1 235383586 1D TTTTTTTTTT A/- ATTTTCCCAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 2 1 63237 CASAVA_Build 1 235391281 1D ATTTTGGGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 9 8 63238 CASAVA_Build 1 235394898 3D CTGTTTATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 31 1 22 9 T 15 12 63239 CASAVA_Build 1 235396424 1I ATTATTTGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 420 hom 35 1 28 6 T 9 10 63240 CASAVA_Build 1 235398638 1D AATGTGTGTG C/- CGGCATAAAG 3070 hom 99 het 43 0 33 10 C 2 1 63241 CASAVA_Build 1 235399466 1I CGTGATCCAT -/C CACCTCGACC 3070 hom 63 het 22 0 21 1 C 1 2 63242 CASAVA_Build 1 235399783 2D ATCTCCTATC TT/-- TTATGATTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 6 T 4 2 63243 CASAVA_Build 1 235403776 2I TCAGGAGATC --/GA GAGACCATCC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 GA 2 3 63244 CASAVA_Build 1 235403987 2D CTCAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 8 63245 CASAVA_Build 1 235406211 1I TATAAAAATA -/T ATATATAAAT 1471 hom 7 het 4 0 3 1 T 0 1 63246 CASAVA_Build 1 235421342 1I ATTTTATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 523 hom 26 2 20 4 T 12 13 63247 CASAVA_Build 1 235428766 1D TTTTCTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 12 11 63248 CASAVA_Build 1 235434431 2I AAAAACAAAA --/AT AAAAAAAAAA 3070 het 2262 hom 31 9 16 6 AT 0 1 63249 CASAVA_Build 1 235439439 1D TGTGTGTGTA T/- TTTTTTTTTT 1062 het 1062 ref 25 9 3 13 T 12 11 63250 CASAVA_Build 1 235440040 3I GCATATATTG ---/TTC TTCTTTTATT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TTC 1 2 63251 CASAVA_Build 1 235440145 1D ACTCTTTTTT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 7 6 63252 CASAVA_Build 1 235440943 1I AGGGACGATG -/T TTTGGGCTGC 3070 het 3070 hom 53 15 28 10 T 3 4 63253 CASAVA_Build 1 235442002 2D TGTTTTTGAC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 T 11 9 63254 CASAVA_Build 1 235447621 6D TGTGAAGTAG TTGTGT/------ TTGTGTCCTG 3070 het 3070 hom 57 21 27 11 TTGTGT 2 1 63255 CASAVA_Build 1 235452336 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2011 het 2011 ref 25 12 7 6 A 13 12 63256 CASAVA_Build 1 235457899 3D CTTTTTTTTT TTA/--- TTTTTGATTT 3070 het 3070 hom 39 11 23 7 TTA 1 0 63257 CASAVA_Build 1 235459046 5D ACCAGCTGTA GCATC/----- GCATCTTCTC 3070 het 3070 hom 41 17 20 6 GCATC 2 1 63258 CASAVA_Build 1 235466262 1I TTATCATTAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 7 8 63259 CASAVA_Build 1 235474739 1I AGACAACGTA -/C CCGCTTGAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 2 3 63260 CASAVA_Build 1 235479357 6D TGGATATGGA TATTAG/------ TATTAGTAAC 3070 hom 88 het 34 0 30 5 TATTAG 2 1 63261 CASAVA_Build 1 235483161 4I TATTATTATA ----/TTAC TTATTATTTC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TTAC 0 1 63262 CASAVA_Build 1 235494623 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 13 12 63263 CASAVA_Build 1 235503478 2I GGTTTTAGGG --/GA GAGAGTGTCT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 GA 2 3 63264 CASAVA_Build 1 235504328 1D AAAAAAGTTT A/- AAAAGTAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 5 4 63265 CASAVA_Build 1 235525813 2D AGATCGAGAC AG/-- AGTGCACCAT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 AG 2 1 63266 CASAVA_Build 1 235537092 2I TTACATGCAC --/CT CTGGTGTATC 3070 hom 172 het 64 0 57 7 CT 1 2 63267 CASAVA_Build 1 235562830 12D GTCTTGAGCT CCTGAGCTCAAA/------------ CAATCCTCCT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 CCTGAGCTCAAA 1 0 63268 CASAVA_Build 1 235571728 1I TGTTTTTGAA -/T TTGCCTCTCT 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 T 2 3 63269 CASAVA_Build 1 235572079 1D AATAACTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 46 1 27 19 T 12 11 63270 CASAVA_Build 1 235575676 4D TCTAACAAAG TCTA/---- TCTATTATTA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 TCTA 2 1 63271 CASAVA_Build 1 235580916 1D AGATGGAGCA T/- TTACCAAAAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 T 3 2 63272 CASAVA_Build 1 235583126 1D AGCAAGCAAA C/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 C 1 0 63273 CASAVA_Build 1 235586229 1I TATCTTCTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 A 9 10 63274 CASAVA_Build 1 235586354 1D TCATAGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 981 hom 30 5 12 13 T 13 12 63275 CASAVA_Build 1 235586974 1D TTCTCTTGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 9 8 63276 CASAVA_Build 1 235593008 1I TAGCTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 32 2 19 11 A 13 14 63277 CASAVA_Build 1 235594629 2I ATATTGTAAC --/AT ATTATATTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 1 2 63278 CASAVA_Build 1 235597030 1D TTTGTTTTTG T/- TTTCGAGATA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 T 4 3 63279 CASAVA_Build 1 235597319 1D CTGGCCCCCC A/- AAAAAAGTGG 3070 hom 42 het 23 0 17 6 A 7 6 63280 CASAVA_Build 1 235597511 1D TGTACTTCTT A/- AGGCACAGGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 1 63281 CASAVA_Build 1 235601036 1I TCCTTAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 11 12 63282 CASAVA_Build 1 235605914 6D TCCTCAATTA TTTATT/------ GTATTTATTA 3070 het 3070 hom 53 25 26 2 TTTATT 1 0 63283 CASAVA_Build 1 235606430 1D GGTAAAGAAT G/- GTAAATGATG 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 G 2 1 63284 CASAVA_Build 1 235612838 2I TTTGTTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 12 14 63285 CASAVA_Build 1 235614821 1I TATTATTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 T 9 10 63286 CASAVA_Build 1 235617865 2I GCAGGCACTG --/TC TCTATCTCTG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 TC 1 2 63287 CASAVA_Build 1 235632154 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2304 hom 31 10 12 9 A 12 13 63288 CASAVA_Build 1 235632675 2I TCATCCCTAC --/AA AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 35 24 9 2 A 7 9 63289 CASAVA_Build 1 235632729 1I11M1D21M4D10M4D CTGAGACTCA -GAGTCTTACTCTATTGGGCAGGCTGGAGTACAGCGGTGAAATCATGGCTCA/GGAGGCTGAAGC-AGGGGGATGGTTTGAGGCCAG----GACATCGAGG---- CTGCAGCCTC 717 het 717 ref 34 44 4 5 N/A 0 0 63290 CASAVA_Build 1 235638859 4D TTTTTGGTAT TAAG/---- ATAAATAATA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TAAG 1 0 63291 CASAVA_Build 1 235644154 1I TTTGTCATTC -/A AGTCTTACTT 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 A 1 2 63292 CASAVA_Build 1 235644915 9D ACAATGTTGG AGAACTCTT/--------- AGAACTCTTT 3070 het 3070 ref 53 25 23 6 AGAACTCTT 2 1 63293 CASAVA_Build 1 235648898 2D CAAAGGAAAA CT/-- CATAGCTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 CT 1 0 63294 CASAVA_Build 1 235653545 1D TCTTAAAACA C/- ATCCATCCAG 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 C 1 0 63295 CASAVA_Build 1 235658681 1D CTGGAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2095 hom 24 5 10 9 A 13 12 63296 CASAVA_Build 1 235662127 1D GACTTTAGGC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 T 7 6 63297 CASAVA_Build 1 235662957 1I TGACTGTGTG -/T TGGGGGGGGG 1931 het 1581 hom 13 6 5 2 T 1 2 63298 CASAVA_Build 1 235663273 3I AGTGCTGATT ---/ATA ATATTTATAA 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 ATA 1 2 63299 CASAVA_Build 1 235666201 1I GAGGGTATTG -/T TACGGGGTGT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 1 2 63300 CASAVA_Build 1 235667953 1I TCTGATCTAC -/A AGATTGAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 2 63301 CASAVA_Build 1 235669755 1D AGAAAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1329 hom 40 3 30 7 A 12 11 63302 CASAVA_Build 1 235670923 1D ACTAATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 11 10 63303 CASAVA_Build 1 235676470 1D AATTGGTAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 6 T 10 9 63304 CASAVA_Build 1 235679682 1I GATTGACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 11 9 T 10 11 63305 CASAVA_Build 1 235680966 2I TTTCTATTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 AT 5 6 63306 CASAVA_Build 1 235686499 1I CTGATTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 14 15 63307 CASAVA_Build 1 235688664 2D AAAAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 A 11 9 63308 CASAVA_Build 1 235698909 1I AGATGTAACA -/T GAGGATATTT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 T 0 1 63309 CASAVA_Build 1 235702607 2I ATATTTTTGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2850 hom 27 10 13 4 A 12 14 63310 CASAVA_Build 1 235703890 4I TGTCATGAAT ----/CATA CATAGCTCCT 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 CATA 1 2 63311 CASAVA_Build 1 235705849 1I TTGAAAAGAC -/A AAAGATTGGT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 3 4 63312 CASAVA_Build 1 235708044 1I TTTCATTATC -/A AAAAACAGGG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 5 6 63313 CASAVA_Build 1 235708714 2D CCTTAAGGGA CC/-- CCCCTACCCT 3070 hom 96 het 36 0 31 6 C 6 4 63314 CASAVA_Build 1 235709441 1D ATTTCTGCCC A/- AAATGATAGC 3070 hom 157 het 54 0 53 1 A 4 3 63315 CASAVA_Build 1 235710516 1D AGTTTGTCTA T/- TTTTTTATAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 7 6 63316 CASAVA_Build 1 235711085 4I ATTTATTTTT ----/CTCA CTCTATTTCT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 CTCA 0 1 63317 CASAVA_Build 1 235712411 1I TATTTCACTT -/A ACATACTCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 2 63318 CASAVA_Build 1 235729600 1D TGTCCACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 343 hom 32 1 30 1 A 10 9 63319 CASAVA_Build 1 235736086 1D CCAACACTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 23 0 14 9 T 13 12 63320 CASAVA_Build 1 235740440 3I GCAATCAAAT ---/AAG AAGTATATCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AAG 1 2 63321 CASAVA_Build 1 235746214 1I TTCTTTCGTA -/T TTTTTTTTTG 1870 het 1870 ref 14 7 5 2 T 9 10 63322 CASAVA_Build 1 235748176 1I TTTTCTATTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 T 9 10 63323 CASAVA_Build 1 235748375 4D TGTCATTCTA CTCT/---- CTATGTCCAT 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 CT 3 1 63324 CASAVA_Build 1 235749848 4D GGGCTGTTTT TGTG/---- TTTGTTTGCA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 TG 2 0 63325 CASAVA_Build 1 235751470 9D TGGTGAAACC CTGTCTCTA/--------- CTAAAATTAT 1877 het 1124 hom 8 3 5 0 CTGTCTCTA 1 0 63326 CASAVA_Build 1 235751649 1I20M1D TCTCAAAAAG -AAAAAAAAAATTAAATACATA/AAAAAAAAAAATTAAATACAT- AAAAAAAATA 3070 het 2748 hom 20 9 12 4 N/A 0 0 63327 CASAVA_Build 1 235752923 7D CTTAAAAAAA AAATGAG/------- TTAAACAATG 3070 het 3070 ref 35 21 14 4 AAATGAG 1 0 63328 CASAVA_Build 1 235757710 9D TCCTATCAGA CTGTAAACG/--------- CTGTCAAGAG 3070 het 3070 ref 45 22 23 2 CTGTAAACG 1 0 63329 CASAVA_Build 1 235768404 1I TTTAAAGAAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 9 10 63330 CASAVA_Build 1 235768704 2D AATAAAAAAA AT/-- TAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 AT 1 0 63331 CASAVA_Build 1 235783680 4I TTATACATTA ----/TTTG TTTGATTTAT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 TTTG 1 2 63332 CASAVA_Build 1 235793399 1D AGAAGAGTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 10 9 63333 CASAVA_Build 1 235793655 1I GGGGGCTTTT -/G GGGGAAATTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 4 5 63334 CASAVA_Build 1 235797037 4I ATAATTAGTG ----/GTAT GTTTGTATGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GTAT 0 1 63335 CASAVA_Build 1 235813400 1I TCCTCATCTG -/A AAAAAATGGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 6 7 63336 CASAVA_Build 1 235818756 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 20 2 A 12 11 63337 CASAVA_Build 1 235818816 1I TCCCCTTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 32 1 25 6 A 10 11 63338 CASAVA_Build 1 235825048 1I AAAAAAAGCT -/A AAAAAAAATC 3070 het 433 hom 26 1 23 2 A 8 9 63339 CASAVA_Build 1 235828886 1D ACAACCTATA C/- CACAGAAATA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 C 2 1 63340 CASAVA_Build 1 235850288 5I TACCACAGAT -----/AAATC AAAATAGGAT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 AAATC 0 1 63341 CASAVA_Build 1 235862182 1D TCCATGGCAC A/- AGCATGTTCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 2 1 63342 CASAVA_Build 1 235862313 14D AAGTGAATTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 40 het 22 0 14 9 T 23 9 63343 CASAVA_Build 1 235862685 1D ATAGTATAAT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 9 8 63344 CASAVA_Build 1 235864665 1I CAAAATACGT -/A AAAATTAAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 5 63345 CASAVA_Build 1 235865936 7D CTGTGTAAAA CTGAAAC/------- CTTTTCTCCA 3070 het 2510 hom 15 7 8 1 CTGAAAC 1 0 63346 CASAVA_Build 1 235869941 2I CACTCCCCAC --/CA CACACACACA 3070 het 417 hom 41 1 26 14 CA 7 8 63347 CASAVA_Build 1 235871905 1I ATATTCATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 9 10 63348 CASAVA_Build 1 235884138 1D AGGAGAAATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 9 8 63349 CASAVA_Build 1 235888228 1D TTATCAGAGT A/- AAAAAGCAAC 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 6 5 63350 CASAVA_Build 1 235892412 1D GAAAGGGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 14 11 T 11 10 63351 CASAVA_Build 1 235913611 1I TCTATCACAA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 37 9 21 7 T 7 8 63352 CASAVA_Build 1 235913850 3I GTGGGTCTTT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 51 het 25 0 16 9 TTC 5 6 63353 CASAVA_Build 1 235914692 2D GATTATCTGA AC/-- ACATATATAT 3070 het 3070 hom 23 8 11 5 AC 2 1 63354 CASAVA_Build 1 235927125 3D CCTGGATCTC CTT/--- CTCAGATACA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 CTT 1 0 63355 CASAVA_Build 1 235928627 2D GTTAAAACTC TT/-- TTAGTCTGGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 4 2 63356 CASAVA_Build 1 235939338 1D GGGGGGATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 37 1 32 5 T 12 11 63357 CASAVA_Build 1 235952819 2D CTGGAATCTA CT/-- CTCAGCAAAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CT 2 1 63358 CASAVA_Build 1 235954261 12D TGTATTCCTG TTTTATATTATC/------------ TGAACCCTCA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 TTTTATATTATC 1 0 63359 CASAVA_Build 1 235954685 9I TAAATGGCTA ---------/CGAGAGGAC CATTTCTGAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CGAGAGGAC 0 1 63360 CASAVA_Build 1 235958912 1D ATTCACATTA T/- CATTTCTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 T 1 0 63361 CASAVA_Build 1 235966951 4D GCCTGGGTGT TCTC/---- TGCAGCTGAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TC 2 0 63362 CASAVA_Build 1 235986033 1D ATAAAGGGGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 9 8 63363 CASAVA_Build 1 235990738 17I GTTGGTACGC -----------------/AATGAATGGAGACATGT AATGAATGGA 3070 het 3070 hom 61 28 24 9 AATGAATGGAGACATGT 1 2 63364 CASAVA_Build 1 235995242 1D AGATACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 13 12 T 12 11 63365 CASAVA_Build 1 235996969 4D CAAAGCACTT TTAA/---- TTGTTTGATC 3070 hom 141 het 54 0 48 7 TTAA 1 0 63366 CASAVA_Build 1 236004905 4I TGCAAAACTC ----/TTTA TAGGGTGTTG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 TTTA 0 1 63367 CASAVA_Build 1 236008321 1I AAGCCAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 23 1 14 8 A 12 13 63368 CASAVA_Build 1 236015644 1I GGATATTTCT -/G AAATGAGAAA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 G 0 1 63369 CASAVA_Build 1 236019383 4D GTTTCCTAGA TAAC/---- TAACTCTGAA 3070 het 3070 hom 36 14 22 1 TAAC 2 1 63370 CASAVA_Build 1 236024251 3I ATCCAAAAGC ---/GGA AGAGGCAAAA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 GGA 0 1 63371 CASAVA_Build 1 236025843 22D31M6D ACATATGCAC GCGTATGTGTGTACATATGTATGTGTGCATATGTGTACATATGTATGTATATGTATATA/----------------------GTGTGCATATGTGTACATATGTATGTATATG------ TGTATATACA 2999 het 2999 ref 20 20 8 1 N/A 0 0 63372 CASAVA_Build 1 236028336 4I ACAGAAAGAC ----/TATT TATGTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 TATT 0 1 63373 CASAVA_Build 1 236033235 4I TGCATTTTTC ----/TTTT TTTTTTTTTT 1041 het 1041 ref 24 13 4 8 T 10 14 63374 CASAVA_Build 1 236035637 1D ACCTAGTGAT A/- TTTTGATAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 0 63375 CASAVA_Build 1 236042818 2D AATGTATAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 T 16 14 63376 CASAVA_Build 1 236046617 3D ATGTAGAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 8 A 13 10 63377 CASAVA_Build 1 236054467 2D TAATAAGAGC TA/-- TATATGACAA 2917 het 2773 hom 14 6 6 2 TA 3 2 63378 CASAVA_Build 1 236061786 4I CATAATGTCT ----/TTGA TTGTTTAATC 3070 het 3070 ref 53 28 23 2 TTGA 0 1 63379 CASAVA_Build 1 236063205 1I ACTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1903 het 799 hom 14 4 8 2 A 12 13 63380 CASAVA_Build 1 236066653 1I CTTAAGCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 11 12 63381 CASAVA_Build 1 236068590 4I CCTCCAGAAC ----/CCCA CCCAGCAGAA 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 CCCA 1 2 63382 CASAVA_Build 1 236069793 1I AGGATAAAAG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 7 8 63383 CASAVA_Build 1 236070636 1D AGAAGAGACT G/- GGGGACAATA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 G 5 4 63384 CASAVA_Build 1 236076774 1D TAAATGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 11 10 63385 CASAVA_Build 1 236077644 1D TGAAATACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 12 11 63386 CASAVA_Build 1 236078042 1D TCCCTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 2560 het 1260 hom 22 7 9 6 T 15 14 63387 CASAVA_Build 1 236083919 2I CCTTCTCCTG --/TC TGTTAGCATC 3070 het 3070 ref 52 25 24 3 TC 0 1 63388 CASAVA_Build 1 236087404 2I TAAAAAAAAA --/AC AACAACTTCA 3070 het 3070 hom 46 14 28 4 AC 0 1 63389 CASAVA_Build 1 236095784 2D ATTTAATGCA CT/-- GTTTTTTCCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 CT 1 0 63390 CASAVA_Build 1 236099173 3I TCCCCCAAAT ---/CTG CTATGTATGA 3070 hom 160 het 60 0 54 6 CTG 0 1 63391 CASAVA_Build 1 236100289 2D GTGTGCGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1583 het 1583 ref 48 37 4 7 GT 6 5 63392 CASAVA_Build 1 236111759 1D CACCCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 37 1 26 10 A 12 11 63393 CASAVA_Build 1 236117812 1I CGTGTGCGAT -/A TATTAGGTTG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 0 1 63394 CASAVA_Build 1 236127373 1D TGGGGTAGAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 9 8 63395 CASAVA_Build 1 236140627 4D GAATCCAAAC TATT/---- TGTTCCACTT 3070 het 3070 ref 38 22 16 3 TATT 1 0 63396 CASAVA_Build 1 236151844 1I TTTGGTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 38 1 33 4 T 10 11 63397 CASAVA_Build 1 236156478 1D TGGTTCATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 28 0 23 5 T 10 9 63398 CASAVA_Build 1 236157225 6D TCTGGAGATG GGGTCA/------ GGGTCACTCA 3070 hom 113 het 41 0 32 10 GGGTCA 2 1 63399 CASAVA_Build 1 236158673 2I35M1D ACTCCATCTG --CCCCCCCCAAAAAAATAATATGTGTATTCTTTCAAT/CTCCCCCCCCCAAAAAATAATATGTGTATTCTTTCAA- TTTTTTCCCC 3070 hom 75 het 24 0 26 13 N/A 0 0 63400 CASAVA_Build 1 236163381 1I AACATTGGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 9 10 63401 CASAVA_Build 1 236167605 1I ATCTGAACCA -/G GAGGCACCGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 63402 CASAVA_Build 1 236171895 2D TTTACAGAGT TG/-- TGTTTGATTA 3070 hom 105 het 42 0 36 8 TG 2 1 63403 CASAVA_Build 1 236188266 2D CTTTTCAGTC TA/-- TGTTAGTTTC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 TA 1 0 63404 CASAVA_Build 1 236188721 1I AGAATCAACA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 6 7 63405 CASAVA_Build 1 236192064 2D CTCTGGTAGT AG/-- ATATTCTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 19 5 AG 1 0 63406 CASAVA_Build 1 236192788 4D GAGGAGTGAG AGTA/---- AGAGAGTCCT 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 AGTA 1 0 63407 CASAVA_Build 1 236195422 1I ATTGATAGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 9 10 63408 CASAVA_Build 1 236206987 1I CACAAAAAAA -/C ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 C 0 1 63409 CASAVA_Build 1 236210981 1I AAAAGCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 11 12 63410 CASAVA_Build 1 236238243 4D TATCAAAGTC TTAA/---- TTAAGTGAAT 3070 het 3070 ref 46 30 10 8 TTAA 2 1 63411 CASAVA_Build 1 236245657 1I CAAGTGATAA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 6 7 63412 CASAVA_Build 1 236248568 1I ACTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2167 het 2167 ref 30 15 7 8 A 15 16 63413 CASAVA_Build 1 236252142 21D GTTATTTTCA AGTCAGGTATTTAAAGTCCTC/--------------------- AGTCAGGTAT 3070 hom 63 het 29 0 22 11 AGTCAGGTATTTAAAGTCCTC 2 1 63414 CASAVA_Build 1 236262918 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 158 het 46 hom 10 1 3 7 A 17 16 63415 CASAVA_Build 1 236262934 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 1828 het 91 hom 17 1 11 8 AC 1 0 63416 CASAVA_Build 1 236274108 3D CAATAGCTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 2615 hom 30 het 18 0 11 8 A 15 12 63417 CASAVA_Build 1 236276808 1I CTCATTGTGG -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 6 7 63418 CASAVA_Build 1 236276924 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3058 hom 18 het 11 0 7 4 T 11 10 63419 CASAVA_Build 1 236281604 1I29M22D21M2D TTGTGGTGTG -TGTGTGTGGTGTATGTGTGTGGTGTATATGTGTGGTATAGATGTGTGGTACATGTGTGGTGTATGTGTGATATG/ATGTGTGCAGTGTATGCGTGTGTTGTATAT----------------------TTGTGTGGTGAATGTGTGGTA-- TATGTTTTGT 3070 het 3070 ref 51 83 20 7 N/A 0 0 63420 CASAVA_Build 1 236283587 1D TGTTATGAAA G/- GACTTCAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 2 1 63421 CASAVA_Build 1 236284464 4D TCTTTCTTTC TTTG/---- TTTGTTTCTT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 TTTG 2 1 63422 CASAVA_Build 1 236297007 1D AGGAAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 670 hom 36 5 16 15 T 17 16 63423 CASAVA_Build 1 236302095 2D TTAAAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 110 het 44 0 37 8 A 12 10 63424 CASAVA_Build 1 236324208 3D GATGTTATTT TGA/--- TAATAAGAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 TGA 1 0 63425 CASAVA_Build 1 236325299 1D GACTTCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 29 0 22 7 A 11 10 63426 CASAVA_Build 1 236327508 1I GCTGCTATAT -/A AAAAACCACC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 6 63427 CASAVA_Build 1 236374457 1I AGCATTGTTT -/A AAGAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 A 2 3 63428 CASAVA_Build 1 236392061 1I ATGGGTCTTG -/T TTTTTAATCC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 5 6 63429 CASAVA_Build 1 236392650 1I CATAAACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 10 11 63430 CASAVA_Build 1 236393644 3I CCCAGATGGG ---/CTT GTTTGTGCCC 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 CTT 0 1 63431 CASAVA_Build 1 236400587 1I GTTTCAAGAT -/A TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 22 25 1 A 0 1 63432 CASAVA_Build 1 236408885 3D AAAACTATGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1438 hom 20 5 8 7 T 15 12 63433 CASAVA_Build 1 236414841 1D TGGATTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 11 10 63434 CASAVA_Build 1 236415668 2D TTTTTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 12 11 T 12 10 63435 CASAVA_Build 1 236429048 1I GATAGGGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1506 hom 23 5 13 5 T 13 14 63436 CASAVA_Build 1 236437901 1D AGGTTTTCTT C/- TAGGGTTTTT 3070 het 462 hom 19 3 15 1 C 1 0 63437 CASAVA_Build 1 236448039 3I TCAATTTACT ---/TTA TTATTATTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTA 2 3 63438 CASAVA_Build 1 236451282 1I TAACCTCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 10 63439 CASAVA_Build 1 236451700 1I35M6I ATTTCAACAC -TATTAGCACCCAATTTCTTGTGATCAGTGCCACAT------/TTATTAGCACCCAATTTCTTGTGATCAGTGCCACATAGACTC AGACACAAAC 3070 hom 183 het 48 0 57 16 N/A 0 0 63440 CASAVA_Build 1 236453970 7I GCAGAATGAG -------/AAAGGAC ATCAGAGATC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AAAGGAC 0 1 63441 CASAVA_Build 1 236457062 1D TGGTTGGCAA C/- ACTCTGACCT 3070 het 3070 ref 56 27 21 8 C 1 0 63442 CASAVA_Build 1 236460263 1I CAACAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 7 8 63443 CASAVA_Build 1 236460532 2I ACAGACAAAC --/TA TAGGTATTCA 3070 hom 109 het 40 0 37 3 TA 1 2 63444 CASAVA_Build 1 236465814 3D AACAGCAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 26 0 20 7 A 13 10 63445 CASAVA_Build 1 236471050 1I GAGAAATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2873 hom 31 12 12 7 A 12 13 63446 CASAVA_Build 1 236478594 1I ATCAATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2781 hom 35 10 14 11 T 11 12 63447 CASAVA_Build 1 236479880 1I AATCTGCCTC -/T GCGTATATGG 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 0 1 63448 CASAVA_Build 1 236483150 1D ATTCCATATA T/- TATTGAACTT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 2 1 63449 CASAVA_Build 1 236483281 1I TAATTTCAAA -/C CCTGAAATCT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 C 2 3 63450 CASAVA_Build 1 236496184 1D GTTTCTTTGT A/- AAAAATTGCA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 6 5 63451 CASAVA_Build 1 236502598 6D TTTTCTTTTC TTTTCT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 18 3 TTTTCT 1 0 63452 CASAVA_Build 1 236504114 1I TGGAAAGCAA -/T TGGAAGACGA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 1 2 63453 CASAVA_Build 1 236512533 1I ATTTGCATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 9 10 63454 CASAVA_Build 1 236512760 1D GTAGATGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 12 11 63455 CASAVA_Build 1 236543366 4I CCTCTCTAAA ----/TATC TAAGCATTTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TATC 0 1 63456 CASAVA_Build 1 236544521 1D TGTGTGTGTC G/- GGGGGGGGGG 3070 het 194 hom 35 5 12 19 G 12 11 63457 CASAVA_Build 1 236546290 13I TTTCCCTCAC -------------/AGATTTATAGTGA AGATTACATA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 AGATTTATAGTGA 0 1 63458 CASAVA_Build 1 236546710 7I TCGGATGTTG -------/CCGCTAT CCGCTATCCA 3070 het 3070 ref 50 21 21 8 CCGCTAT 1 2 63459 CASAVA_Build 1 236551870 20D ACACGTCTGA AGGAGTTTTGAAGGAATAGC/-------------------- AGGATATGAG 3070 het 3070 hom 34 18 19 2 AGGAGTTTTGAAGGAATAGC 1 0 63460 CASAVA_Build 1 236554859 2D ATATATATAT TA/-- TATATATATA 2746 hom 18 het 9 0 7 2 TA 8 7 63461 CASAVA_Build 1 236556186 2D AAACAGTATC TG/-- TGCTGCCAAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 TG 2 1 63462 CASAVA_Build 1 236564457 4I TCAATTGATG ----/AGAA TTCTGCTAGT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 AGAA 0 1 63463 CASAVA_Build 1 236566264 1D ACTTTGTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2964 hom 23 8 13 2 A 10 9 63464 CASAVA_Build 1 236567898 4I TTTTTCTCTG ----/TCTC TCTCTATATG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 TC 2 4 63465 CASAVA_Build 1 236568865 7D2M3I5M2D ATCACCCCAA CCCCAGCAA---CCACTGA/-------AATTTCTCCT-- TTGCTATTCT 3070 het 3070 ref 32 18 14 1 N/A 0 0 63466 CASAVA_Build 1 236570397 2D CTCCTCCCTC TT/-- TAAATTTCTT 3070 het 3070 ref 39 21 17 2 T 3 1 63467 CASAVA_Build 1 236570574 3D GTTTACATGT TTG/--- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 TTG 1 0 63468 CASAVA_Build 1 236572764 1I TGTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 9 10 63469 CASAVA_Build 1 236580218 1I TAAGATACAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 8 9 63470 CASAVA_Build 1 236582192 2D GGATTAGTTT GA/-- GATACCCAGC 3070 hom 114 het 44 0 38 8 GA 2 1 63471 CASAVA_Build 1 236583010 1I TAAGAGTTCC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 43 26 11 6 T 7 8 63472 CASAVA_Build 1 236585986 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 11 10 63473 CASAVA_Build 1 236587599 1D CAGCCCCTGT G/- GGCATACTCC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 G 3 2 63474 CASAVA_Build 1 236589205 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 519 hom 29 3 17 9 T 13 12 63475 CASAVA_Build 1 236591051 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 TA 7 8 63476 CASAVA_Build 1 236591106 12I GAGCTTTGTC ------------/CAATCTAAGGCT CAATTGAATT 3070 het 3070 hom 37 7 22 8 CAATCTAAGGCT 0 1 63477 CASAVA_Build 1 236598172 1I ATATTTTTCT -/C TTTATCTTCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 63478 CASAVA_Build 1 236599316 1D TTCCCCATTC T/- TTTTTTCGCT 3070 het 3070 hom 55 17 30 8 T 7 6 63479 CASAVA_Build 1 236601229 1I GATTTTATTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 8 9 63480 CASAVA_Build 1 236604298 5D ATAAGGAAGA TAAAC/----- TAAATAGTCA 3070 hom 75 het 29 0 25 5 TAAAC 1 0 63481 CASAVA_Build 1 236607834 3D TGTCTCTACT AAA/--- AAAAAAAACA 2377 het 4 hom 25 1 12 13 A 11 8 63482 CASAVA_Build 1 236608330 4I TGGCAGCTTA ----/TTAC TTCTACAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTAC 0 1 63483 CASAVA_Build 1 236616225 2D ATATATACAC AT/-- ATGTGTATAT 3070 hom 84 het 34 0 28 9 AT 2 1 63484 CASAVA_Build 1 236635267 1I TGAAATTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 31 1 27 3 A 10 11 63485 CASAVA_Build 1 236640506 2I TTTTTTTTTT --/TC CTCAGAGTAC 3070 hom 36 het 19 0 14 5 TC 0 1 63486 CASAVA_Build 1 236642578 4I CATGTAAAAT ----/TAAC TAACACCGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TAAC 1 2 63487 CASAVA_Build 1 236643338 1D TTTTTTTTTT C/- CCCACAGTGT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 C 4 3 63488 CASAVA_Build 1 236643457 2D ATACAAAATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 30 0 27 5 TA 8 7 63489 CASAVA_Build 1 236644756 4D AGACTCCCTC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 ACAA 5 4 63490 CASAVA_Build 1 236645273 4D TCCAGCAAAC AAAG/---- AAAAACTGAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 5 AAAG 1 0 63491 CASAVA_Build 1 236645712 9D GAGAGAAAGA AGAGAAGAG/--------- AGAGAAGAGG 3070 hom 32 het 18 0 10 12 AGAGAAGAG 2 1 63492 CASAVA_Build 1 236653366 4I ACAAAAAAAC ----/TAAA TATAGGAAGG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TAAA 0 1 63493 CASAVA_Build 1 236675645 1I TTGACTATTT -/C CCCCCCCAAT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 C 7 8 63494 CASAVA_Build 1 236690018 4I CAAATCTGTC ----/TTGA TTTTCATTCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTGA 0 1 63495 CASAVA_Build 1 236690272 1I CTTAAAGGAG -/A AAAAGTTTTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 4 5 63496 CASAVA_Build 1 236695067 2I GACTATTAAC --/AG AAAATGAGGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AG 0 1 63497 CASAVA_Build 1 236696217 5D GAGACAAAAT AAAAC/----- AAAACATGAA 3070 hom 54 het 20 0 19 4 AAAAC 2 1 63498 CASAVA_Build 1 236696941 1D CTACCCCCAC G/- GGTAATACTA 3070 het 3070 hom 35 16 19 0 G 3 2 63499 CASAVA_Build 1 236697566 4I AACCAGTCTT ----/CTAA CTAATTTAGC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CTAA 1 2 63500 CASAVA_Build 1 236700187 1I TTTGGGGAGA -/T TTTTTTGCAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 63501 CASAVA_Build 1 236702822 1I TGTGGGGAGG -/T TTTTGGAATC 3070 hom 141 het 53 0 46 7 T 4 5 63502 CASAVA_Build 1 236703220 3D GAGAGACAGT GAA/--- GAAGAAGAAG 3070 hom 54 het 40 0 19 21 GAA 5 4 63503 CASAVA_Build 1 236705215 1I ATGTAATATT -/C CAAATGCCTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 1 2 63504 CASAVA_Build 1 236707839 3I CTTTCTACTT ---/ATC ATTATATCAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATC 0 1 63505 CASAVA_Build 1 236715004 2I CACACAGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 549 hom 41 2 29 10 AC 7 8 63506 CASAVA_Build 1 236722629 1D TTCAGATATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 10 9 63507 CASAVA_Build 1 236730809 5D TATTAAATCC GTTAT/----- GTTATTTGAC 3070 het 3070 hom 41 19 18 8 GTTAT 2 1 63508 CASAVA_Build 1 236732753 1D TGCAAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1974 hom 20 5 12 3 A 10 9 63509 CASAVA_Build 1 236736489 1I CTATAAAAAT -/G AACTATTTTC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 G 0 1 63510 CASAVA_Build 1 236736865 1D TTGATCGTTG A/- AAAAGTATAA 2798 het 2798 ref 24 13 7 4 A 5 4 63511 CASAVA_Build 1 236739943 4D ATCTATCATC TATT/---- TATCTCTAAT 861 het 861 ref 40 26 5 12 TATT 1 0 63512 CASAVA_Build 1 236747904 4I TAATAATTCT ----/CAAA AGCATTTGAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CAAA 0 1 63513 CASAVA_Build 1 236752445 1I AGTATGTGCC -/T TTTTTTTTTT 1035 het 1035 ref 25 18 5 2 T 11 12 63514 CASAVA_Build 1 236752833 3I TCCTTCTGTC ---/CTT CTATCTTTCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 CTT 0 1 63515 CASAVA_Build 1 236758598 2D TGTCTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 36 0 25 11 TA 8 7 63516 CASAVA_Build 1 236764430 1I TTGTTTACAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 8 9 63517 CASAVA_Build 1 236766597 4I CAGCTATAAC ----/CTAT CTATCTCTTC 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 CTAT 1 2 63518 CASAVA_Build 1 236774117 3D TATGTGTAAG ATC/--- ATCTTTTTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATC 2 1 63519 CASAVA_Build 1 236782895 6D AGCATTTGAC ATAGTA/------ ATAGTACCAG 3070 het 3070 ref 21 9 8 5 ATAGTA 2 1 63520 CASAVA_Build 1 236787374 1I TTGATTGTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 T 8 9 63521 CASAVA_Build 1 236787561 3D TTTTCCTAAT AAC/--- AAAGCAAATA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 AAC 1 0 63522 CASAVA_Build 1 236788020 1I TATAAAAAAA -/T CATATGGATT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 0 1 63523 CASAVA_Build 1 236788691 22D CAAGCAGACG CATTTCAAGGCTCTGCTGGTAT/---------------------- CATCTCCAAA 3070 het 3070 ref 45 28 20 4 CATTTCAAGGCTCTGCTGGTAT 1 0 63524 CASAVA_Build 1 236789261 8I CAAAAGAGTG --------/TATATATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 TA 5 9 63525 CASAVA_Build 1 236790743 2D AATGAAATGA CT/-- CTAGGATAGC 3070 het 3070 ref 43 23 13 9 CT 2 1 63526 CASAVA_Build 1 236802219 1D ATAAGCCATT A/- AAAATTAAGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 5 4 63527 CASAVA_Build 1 236807962 1I ATTACAATAC -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 5 6 63528 CASAVA_Build 1 236822862 2D GTCGCTTTAT TC/-- TCTCCCTGAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 TC 3 2 63529 CASAVA_Build 1 236839566 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1574 het 877 hom 26 4 6 16 T 14 15 63530 CASAVA_Build 1 236839946 11I CAATGTACCA -----------/TATCCATGATG TATCCATGAT 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 TATCCATGATG 1 2 63531 CASAVA_Build 1 236841074 2I TAGCTTGGAG --/TC TCTTAGTGAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 TC 1 2 63532 CASAVA_Build 1 236841615 1I ATGCAGCTAG -/T TAAGTGGAGT 3070 het 3070 hom 54 16 29 9 T 1 2 63533 CASAVA_Build 1 236844974 2I CCAAGTAAGA --/CT CTGTCTTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 CT 1 2 63534 CASAVA_Build 1 236847123 4D GTAAGTTGAC AAAT/---- GAATCATCAG 3070 het 3070 ref 30 14 12 7 AAAT 1 0 63535 CASAVA_Build 1 236860770 1D TGTGAAGGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 T 10 9 63536 CASAVA_Build 1 236880125 2I TTTTCTTCTC --/TT ATAAAATGAA 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 T 0 2 63537 CASAVA_Build 1 236882366 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1528 het 1528 ref 24 10 8 6 A 10 11 63538 CASAVA_Build 1 236885281 1I TATTAGATAT -/A AGACCCCGAC 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 A 1 2 63539 CASAVA_Build 1 236885765 2I TAGAAAAAAG --/AC AGAGAAAATT 2704 het 2704 ref 25 12 6 7 AC 0 1 63540 CASAVA_Build 1 236891896 1I TTATGCAGAT -/C TTGTGTATAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 C 0 1 63541 CASAVA_Build 1 236893648 1I TGAGGATTAA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 T 6 7 63542 CASAVA_Build 1 236899895 3I TTTCTAGTAA ---/TAT TATTCAACTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TAT 1 2 63543 CASAVA_Build 1 236901821 1I TTCCAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 10 11 63544 CASAVA_Build 1 236907840 5D TTACTTTTGC TTTAT/----- TTTAACTTTA 3070 het 3070 hom 43 21 18 7 TTTAT 1 0 63545 CASAVA_Build 1 236934935 1I ACATTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 A 11 12 63546 CASAVA_Build 1 236960323 1D TTCTACTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 17 10 T 12 11 63547 CASAVA_Build 1 236963113 4I AAATTTTAAT ----/CAAA CAGTTTCAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CAAA 0 1 63548 CASAVA_Build 1 236964212 1D CTTATTGTTG T/- TTTTGTTGAC 3070 hom 104 het 40 0 35 7 T 5 4 63549 CASAVA_Build 1 236964945 1I ATGGTGGGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 10 63550 CASAVA_Build 1 236967516 1D ATTTTAAAAA G/- TTTTTATTTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 1 0 63551 CASAVA_Build 1 236972304 2D CAGAAGCTCT TC/-- TGTTTCTTAA 3070 hom 48 het 20 0 17 4 TC 1 0 63552 CASAVA_Build 1 236972773 3I GAGGTTGGTA ---/TTG TTGTCTCAGG 3070 hom 117 het 47 0 37 10 TTG 1 2 63553 CASAVA_Build 1 236973226 1D TCACCTTTTA T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 63554 CASAVA_Build 1 236973288 3I TTTAAATCCT ---/ATG ATGTCATGCA 3070 hom 66 het 37 0 23 14 ATG 1 2 63555 CASAVA_Build 1 236973844 1D AGTAAGCCTA T/- CCCTTCCTGC 3070 hom 132 het 47 0 45 3 T 1 0 63556 CASAVA_Build 1 236975202 22D AGCTGCGGGT GAGCTGCGGGCGAGCTGCGGGC/---------------------- GAGCTGCGGG 3070 hom 81 het 25 0 26 5 GAGCTGCGGGC 3 1 63557 CASAVA_Build 1 236976282 1I GTTATCCAAA -/G GCCCCTGGAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 1 2 63558 CASAVA_Build 1 236987914 6D TTCTCTTGGC ATTCAT/------ ATTCATCAAG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 ATTCAT 2 1 63559 CASAVA_Build 1 236993722 2I TATTTGGGTC --/TG AGAATTCCAC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TG 0 1 63560 CASAVA_Build 1 236993825 6D AGTAGCTGCG ACTGCA/------ ATAAGGCCCG 1054 het 1054 ref 35 27 3 9 ACTGCA 1 0 63561 CASAVA_Build 1 237008648 5D TTCTGCCACC TATTT/----- TATTTTATTT 3070 hom 78 het 39 0 26 13 TATTT 4 3 63562 CASAVA_Build 1 237016571 1I CATTGGAAGG -/C TGAAGTGGAC 3070 hom 33 het 13 0 11 2 C 0 1 63563 CASAVA_Build 1 237023966 1I AATTAATTAA -/T TTATTTATTT 1550 het 46 hom 31 1 8 22 T 2 3 63564 CASAVA_Build 1 237025681 1I AGCCAACAAA -/T TCAGGATGTG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 1 2 63565 CASAVA_Build 1 237026764 4I GTTCATAGAA ----/AGAC AGCATAAAGA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 AGAC 0 1 63566 CASAVA_Build 1 237030939 1I TCTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 31 0 25 6 A 9 10 63567 CASAVA_Build 1 237044497 6D ATTTCTCCTT TATATC/------ TATAGAATAT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 TATATC 1 0 63568 CASAVA_Build 1 237047188 1D TGTCCAAAGC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 96 het 40 0 33 8 A 9 8 63569 CASAVA_Build 1 237052747 1D AAGGCCATGC A/- CTGTGTTTCT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 A 1 0 63570 CASAVA_Build 1 237062317 4D CCAGGGCTGC TGTT/---- TGTTTGGCGC 3070 hom 63 het 24 0 20 6 TGTT 2 1 63571 CASAVA_Build 1 237064434 1D AAAAAATAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 9 8 63572 CASAVA_Build 1 237066991 2D CAAAATTGTG TA/-- TATATATATA 1999 hom 12 het 6 0 5 1 TA 7 6 63573 CASAVA_Build 1 237083076 1D TTTTGAAGGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 56 het 23 0 18 5 T 9 8 63574 CASAVA_Build 1 237085114 3D GGCAGACAGT GTG/--- GTGATTCCTC 3070 hom 54 het 20 0 19 2 GTG 2 1 63575 CASAVA_Build 1 237103282 1I ATATAATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 38 2 22 14 T 12 13 63576 CASAVA_Build 1 237104888 7D AAGGTGAATG CTTTGAA/------- CTTTTCCCCC 3070 hom 111 het 39 0 38 6 CTTTGAA 1 0 63577 CASAVA_Build 1 237107705 2D GTATATATAG AT/-- ATATATATAT 990 hom 21 het 14 0 8 6 AT 6 5 63578 CASAVA_Build 1 237111924 4D AAAGGAGCTT CTGA/---- CTGTCTTTAA 3070 hom 137 het 48 0 45 3 CTGA 1 0 63579 CASAVA_Build 1 237114046 1I CTCCTTCCCC -/A TCCTATTCTG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 0 1 63580 CASAVA_Build 1 237117595 1I CCTTACTCCA -/T TTCTTTCCAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 3 63581 CASAVA_Build 1 237120813 2D ACTCACAGAT AA/-- AAATACATAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 5 3 63582 CASAVA_Build 1 237131259 2I CAAATTGGAT --/AA AGAGTCAACA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 1 3 63583 CASAVA_Build 1 237140098 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 16 2 10 4 A 16 15 63584 CASAVA_Build 1 237143948 1I AAATATGTGT -/G TGTCCCCGCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 63585 CASAVA_Build 1 237144082 1D GGGGAAACTG A/- AGCAAAGAAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 1 63586 CASAVA_Build 1 237148248 1D ACGTCATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 623 hom 30 3 21 6 A 15 14 63587 CASAVA_Build 1 237151266 1D AGAGGCACTG A/- AAAAACGATG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 6 5 63588 CASAVA_Build 1 237155823 1D CCTAAGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 508 hom 27 2 21 4 A 13 12 63589 CASAVA_Build 1 237160210 2I CTTATTTGGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 499 hom 24 2 13 9 A 14 16 63590 CASAVA_Build 1 237176492 1I AAAAGGTTTT -/A AAAAAACAGA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 6 7 63591 CASAVA_Build 1 237177869 1I GAGGATAAAG -/A AATGAAAAAT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 2 3 63592 CASAVA_Build 1 237191046 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 10 11 63593 CASAVA_Build 1 237193995 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 9 8 63594 CASAVA_Build 1 237203851 2I TGGTACATAG --/GT GTGTCATTGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 GT 2 3 63595 CASAVA_Build 1 237207150 4D TGAAAAAAAA CTGT/---- CTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 CTGT 1 0 63596 CASAVA_Build 1 237210275 1I GCAAGCTAAT -/A ACAGAGACTA 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 A 1 2 63597 CASAVA_Build 1 237210354 2D TTTCTATTGA AT/-- ATATGCCTAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 AT 3 2 63598 CASAVA_Build 1 237217258 4D CTCCTCCCTG CCCC/---- CCCCCCCCCC 3070 hom 19 het 25 0 20 6 C 14 10 63599 CASAVA_Build 1 237219271 1D AGCCCTACCT A/- CCATTGTAGA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 1 0 63600 CASAVA_Build 1 237235488 1D CAATCACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 11 10 63601 CASAVA_Build 1 237239892 3D TCCTTCCTTT TCC/--- TACAATTGAC 3070 het 3070 ref 47 32 13 6 TCC 1 0 63602 CASAVA_Build 1 237245550 1D GTGGACGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 38 0 19 20 A 10 9 63603 CASAVA_Build 1 237254858 2D TCACACAACA GT/-- GTGTGTGGAA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 GT 4 3 63604 CASAVA_Build 1 237261919 2I CATGGTGGCT --/TA CATGCCTGTA 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 TA 0 1 63605 CASAVA_Build 1 237263016 1D TCCTTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 41 1 28 13 T 11 10 63606 CASAVA_Build 1 237263986 1I TAACTACTGG -/A AAAAAATCCA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 6 7 63607 CASAVA_Build 1 237264879 3I ATATATTACA ---/TAT TATAATATTT 1721 het 492 hom 5 1 4 0 TAT 1 2 63608 CASAVA_Build 1 237267133 4D TTCAATTAAT AGAG/---- AGAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 22 8 4 AG 3 1 63609 CASAVA_Build 1 237267291 2I ATCACGTGGC --/AA AAAAAAAAAT 1440 het 1440 ref 14 7 3 4 A 9 11 63610 CASAVA_Build 1 237267998 1D CATAATTTAT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 81 het 32 0 27 7 A 8 7 63611 CASAVA_Build 1 237268418 5D CCTGTAATCC CAGCA/----- TTTTGGGAGG 3070 het 3070 hom 41 18 20 6 CAGCA 1 0 63612 CASAVA_Build 1 237272305 2I AGAATCACTC --/TG TGTGTCTTTT 3070 het 3070 hom 50 25 23 2 TG 2 3 63613 CASAVA_Build 1 237274454 1I CTCCTGAATC -/T TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 T 6 7 63614 CASAVA_Build 1 237277796 1I GAATATGATG -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 A 6 7 63615 CASAVA_Build 1 237277937 1D TATAGGCATT A/- AAAACAGGTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 A 5 4 63616 CASAVA_Build 1 237279427 2I GCTGATCACT --/TC ACCCTAATCT 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 TC 0 1 63617 CASAVA_Build 1 237280445 1D AAGCTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 A 12 11 63618 CASAVA_Build 1 237281371 1D AGAAAACAAT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 8 7 63619 CASAVA_Build 1 237283042 3D ATTAAAAGGA ATG/--- ATTTGTTGCA 3070 het 3070 ref 42 22 16 6 ATG 1 0 63620 CASAVA_Build 1 237283806 2D18M5D TGCATTACAA ACACACACACACACATACACATATA/--ACACACACACACATACAC----- ATATAGCATA 3070 het 3070 hom 41 23 23 6 N/A 0 0 63621 CASAVA_Build 1 237285895 1D GGTAATAAAC T/- TGCCTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 23 15 5 T 2 1 63622 CASAVA_Build 1 237287604 1D AAAATCAGTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 A 9 8 63623 CASAVA_Build 1 237290578 6D CACACACACT CACACA/------ CACACACACA 2025 hom 18 het 7 0 7 4 CA 8 5 63624 CASAVA_Build 1 237297275 1I CATTTTTTTT -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 8 63625 CASAVA_Build 1 237335142 1I TTCATTCTGG -/C CTCCCACATT 1423 het 1423 ref 16 11 3 2 C 1 2 63626 CASAVA_Build 1 237343551 2D TCAGGGTCTC TG/-- TGTATATTCA 3070 het 3070 ref 28 11 14 3 TG 2 1 63627 CASAVA_Build 1 237355721 1D AATCTACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 11 14 A 13 12 63628 CASAVA_Build 1 237357941 3I TAATATAAAC ---/CTT CTGAAAGTTG 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 CTT 0 1 63629 CASAVA_Build 1 237365216 1I TGAAACTGCT -/A ACGGACTGCA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 1 2 63630 CASAVA_Build 1 237372108 6I CTCAAACTCT ------/TCACTG TAGACTCAAG 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 TCACTG 0 1 63631 CASAVA_Build 1 237372327 36D GGGCCTAAAA CTTTTAAAATATTACTGAATAAAGACATGTCCACTG/------------------------------------ CTTTCATAGC 2127 het 2127 ref 17 17 5 1 CTTTTAAAATATTACTGAATAAAGACATGTCCACTG 1 0 63632 CASAVA_Build 1 237375171 5D AATGATGGGT TAGAA/----- TAGAACAGTT 3070 hom 113 het 41 0 38 6 TAGAA 2 1 63633 CASAVA_Build 1 237377070 5D18M1D AAGGAAACTG ACTCCAGTCTCAGGTTGGTGGGAG/-----AGTCTCAGGTTGATGGGA- GGGGGGGCTG 3070 het 3070 ref 29 16 14 4 N/A 0 0 63634 CASAVA_Build 1 237379336 1D TTTTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 T 12 11 63635 CASAVA_Build 1 237381179 1D TTTTTCATTG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 8 7 63636 CASAVA_Build 1 237382334 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 49 19 18 12 AC 8 9 63637 CASAVA_Build 1 237387602 1I CTCTGTGTTT -/C CCCCCCCAGC 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 C 7 8 63638 CASAVA_Build 1 237393530 1I CTGTTAATCT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 8 9 63639 CASAVA_Build 1 237394281 1I CTCCCAAGTA -/T CTGGGATTAC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 0 1 63640 CASAVA_Build 1 237401147 5I ACCTTTAAGA -----/AAGTG AAAATACAAC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 AAGTG 0 1 63641 CASAVA_Build 1 237401524 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 22 1 14 7 A 12 13 63642 CASAVA_Build 1 237406445 1D AACAACAAAT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 8 7 63643 CASAVA_Build 1 237433929 1D CTTATTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 24 22 7 T 11 10 63644 CASAVA_Build 1 237440185 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1853 het 1738 hom 21 4 8 9 T 15 16 63645 CASAVA_Build 1 237465228 1I AATTTTTTTT -/A TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 0 1 63646 CASAVA_Build 1 237467330 4I GAGATTAATA ----/AAGT AAGTAAGTCC 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 AAGT 2 3 63647 CASAVA_Build 1 237478893 1D TTTTAAAACG A/- AAAGTACCTG 3070 het 3070 hom 32 9 19 5 A 4 3 63648 CASAVA_Build 1 237492255 1I TTTTAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 13 14 63649 CASAVA_Build 1 237499524 1D TTAAGAAACC T/- TTTTTTAGAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 T 7 6 63650 CASAVA_Build 1 237508203 3D TAAACAACCA AAG/--- AATAGCTCAA 3070 het 2105 hom 17 5 10 2 AAG 1 0 63651 CASAVA_Build 1 237512674 1D GTCCTTTGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 13 8 T 10 9 63652 CASAVA_Build 1 237522151 1I GGAATGAAAG -/A AAAAAATTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 7 63653 CASAVA_Build 1 237522397 1D ATAAATAGAA T/- TTTTTCTCAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 7 T 6 5 63654 CASAVA_Build 1 237524736 1D AAATATCCCA G/- GCAAAATCCT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 G 2 1 63655 CASAVA_Build 1 237528286 2D TCTGTTTCAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 27 0 20 9 A 11 9 63656 CASAVA_Build 1 237530714 1I GGTGTTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 10 11 63657 CASAVA_Build 1 237532549 2D CTTTATACTT TA/-- TACCTAGCCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TA 2 1 63658 CASAVA_Build 1 237533064 3D ATGTGAAAAA AAT/--- AAATAAATAA 14 het 14 ref 35 28 1 8 AAT 1 0 63659 CASAVA_Build 1 237552586 1D TGTTCTTAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 56 het 23 0 19 5 T 9 8 63660 CASAVA_Build 1 237558252 1I GTCTGTAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 8 9 63661 CASAVA_Build 1 237582026 1I AAAAAGGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 24 1 21 2 A 10 11 63662 CASAVA_Build 1 237603883 5I ATTTAAAAAC -----/AAAAG AAATCAGAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAAAG 0 1 63663 CASAVA_Build 1 237605260 1D GTTGGTTTGC T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 68 het 32 0 25 7 T 8 7 63664 CASAVA_Build 1 237611762 2I TTATTAATTT --/AC ACACACACAC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AC 7 8 63665 CASAVA_Build 1 237626247 2I GCTCAGTGTG --/CA CACATTCGCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 CA 2 3 63666 CASAVA_Build 1 237638713 1I GCTGGCTAGA -/T TTTTTTTTTT 2208 het 2208 ref 33 12 9 12 T 14 15 63667 CASAVA_Build 1 237643020 1I AACAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 10 11 63668 CASAVA_Build 1 237644256 1I TGGCCTACTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 8 9 63669 CASAVA_Build 1 237659707 1D TCGTAGGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1922 hom 27 8 7 12 T 15 14 63670 CASAVA_Build 1 237660598 2D CACATACTAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 2088 hom 34 7 15 12 AT 7 6 63671 CASAVA_Build 1 237665127 2I GTAATCCCAG --/CA CACTTCGGGA 3070 het 491 hom 19 2 10 7 CA 1 2 63672 CASAVA_Build 1 237665381 1D CATAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 2441 het 693 hom 14 4 8 2 A 17 16 63673 CASAVA_Build 1 237672070 1I ATACGTTAGG -/T TTTTTTTTTT 2152 het 2152 ref 27 15 6 6 T 11 12 63674 CASAVA_Build 1 237675866 1D TGGTGTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2618 hom 28 11 14 3 T 13 12 63675 CASAVA_Build 1 237677704 4D TGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 4 AAAC 5 4 63676 CASAVA_Build 1 237688811 2D AAATGGGAGA CC/-- CCCCCCCATC 3070 het 342 hom 31 2 19 11 C 9 7 63677 CASAVA_Build 1 237697829 1I CCTACCCCCC -/T CCCAACGTTA 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 T 0 1 63678 CASAVA_Build 1 237706001 1D TTCTAGTTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 T 10 9 63679 CASAVA_Build 1 237710467 5D GATAGCCCAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 799 het 799 ref 27 12 7 8 T 28 23 63680 CASAVA_Build 1 237719336 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1825 hom 24 9 12 4 A 13 12 63681 CASAVA_Build 1 237742738 1I CTCTTTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 11 12 63682 CASAVA_Build 1 237745219 1D TATTTACCTT A/- AAAAAAGCAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 7 6 63683 CASAVA_Build 1 237755270 1I CCCAAAAAAG -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 6 7 63684 CASAVA_Build 1 237755379 1I TTTTTGTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 T 8 9 63685 CASAVA_Build 1 237757291 1D TAGATTTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 A 10 9 63686 CASAVA_Build 1 237757547 4I ATGTGAAGCT ----/CTAA CTGAGCCCCC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 CTAA 0 1 63687 CASAVA_Build 1 237769447 1D TTTCTCTTTC T/- TTCTCATATT 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 T 3 2 63688 CASAVA_Build 1 237769713 1I AATTTTGGCA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 2975 hom 35 12 17 6 T 7 8 63689 CASAVA_Build 1 237771126 1D GTGAGGACTT A/- ACTGTACTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 2 1 63690 CASAVA_Build 1 237774971 1D ATGCATACAT A/- AGGTAATGAT 3070 het 3070 hom 58 26 25 7 A 2 1 63691 CASAVA_Build 1 237781448 1D TAACTGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 A 12 11 63692 CASAVA_Build 1 237793130 3I AAGGAAAGAG ---/ACC ACCAAGAGAT 3070 hom 116 het 42 0 38 4 ACC 1 2 63693 CASAVA_Build 1 237797229 1I ACCTCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 10 13 16 A 13 14 63694 CASAVA_Build 1 237806196 1D CTCCCTACCC A/- CCCCCATCCC 3070 het 3070 ref 49 29 18 3 A 1 0 63695 CASAVA_Build 1 237816154 7D ATTATATAGG TGTTTTT/------- TGTTTTTTGT 3049 het 2661 hom 16 8 8 2 TGTTTTT 2 1 63696 CASAVA_Build 1 237823414 1I TAAAAAAAAA -/C AAACTCAAAT 3070 hom 120 het 43 0 39 4 C 0 1 63697 CASAVA_Build 1 237829352 2D CTGTTTACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 45 8 11 26 T 16 14 63698 CASAVA_Build 1 237833026 1I TAAGTGGAAT -/C ATACAATATT 3070 hom 153 het 54 0 51 3 C 0 1 63699 CASAVA_Build 1 237834239 1D TGACAATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 11 10 63700 CASAVA_Build 1 237860796 2I CTTCCATAAG --/AC ACACTTCTCA 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 AC 2 3 63701 CASAVA_Build 1 237879408 5D AGAATTGGAA TTCAG/----- GAATTCGAGG 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 TTCAG 1 0 63702 CASAVA_Build 1 237882565 1I CTATGACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 30 18 5 A 10 11 63703 CASAVA_Build 1 237882741 1I CCTATCTCAT -/A AAAGTCGTGA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 A 3 4 63704 CASAVA_Build 1 237886255 1I ATTTTTTTTT -/A AAAAAAAGGG 2693 het 2693 ref 21 10 9 2 A 7 8 63705 CASAVA_Build 1 237900695 1I AGGTGATCTA -/C CCCCCCCCAC 2679 het 2679 ref 22 10 7 5 C 8 9 63706 CASAVA_Build 1 237972016 1D CATGCATACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 244 hom 52 2 42 8 T 11 10 63707 CASAVA_Build 1 237990914 1D CCAAACCACT A/- ATATGTCTGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 2 1 63708 CASAVA_Build 1 237998422 16I AAAATAAACA ----------------/CGTAAGAATTAATTGC TGGTGAAAAT 3070 hom 138 het 47 0 47 0 CGTAAGAATTAATTGC 0 1 63709 CASAVA_Build 1 237998691 1D TAAATGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 15 14 63710 CASAVA_Build 1 237999630 1I CATAGCGAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 75 het 27 0 26 3 C 3 4 63711 CASAVA_Build 1 238011791 1I ATTTATTGAT -/A ATAATCAAGT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 A 1 2 63712 CASAVA_Build 1 238012166 1I GGGACTAGTG -/C TTTCCATTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 0 1 63713 CASAVA_Build 1 238012909 1I TGATTTCTAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 8 63714 CASAVA_Build 1 238016655 2D GGCATGCTGC TG/-- AAGGTGTCAT 611 het 89 hom 37 1 3 35 TG 1 0 63715 CASAVA_Build 1 238017309 14I AGGATGAAGC --------------/CTTGGCTTCATCCT CTTGGCAGTA 3070 hom 102 het 39 0 28 11 CTTGGCTTCATCCT 0 1 63716 CASAVA_Build 1 238030829 1D ATGTAAGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 10 9 63717 CASAVA_Build 1 238034266 1I ATTCATTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 39 1 30 8 T 10 11 63718 CASAVA_Build 1 238039110 1D ACCCGGCTAG T/- TTTTTTGTAT 1009 het 45 hom 5 1 3 1 T 7 6 63719 CASAVA_Build 1 238059328 1I GACTGAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 41 1 34 6 T 11 12 63720 CASAVA_Build 1 238060027 1I ACATCATGGA -/T TTTTCAAATC 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 4 5 63721 CASAVA_Build 1 238076013 1D AACTTACAAC T/- TTTTTTTTTT 1364 het 1364 ref 50 37 3 11 T 12 11 63722 CASAVA_Build 1 238099277 1D ATCCAAGAAT G/- GTTTCCCACT 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 G 2 1 63723 CASAVA_Build 1 238107348 1D CTATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 30 0 25 6 A 11 10 63724 CASAVA_Build 1 238118496 1D24M1D ACTCCAACCT GGGCCAGAGAGTGAGACCCTGTCTCA/-GGCCAGAGAGTGAGACCCTGTCTC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 13 5 N/A 0 0 63725 CASAVA_Build 1 238120271 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1168 hom 25 6 13 6 A 13 12 63726 CASAVA_Build 1 238139345 1I CAGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 10 11 63727 CASAVA_Build 1 238158497 6D TTTGAAGATA TTTAAT/------ TTTAATTTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TTTAAT 2 1 63728 CASAVA_Build 1 238159275 1I GTTTTTGCAG -/T TTTTTCTGCC 3070 hom 122 het 47 0 39 8 T 5 6 63729 CASAVA_Build 1 238161052 1I CAAGCTTCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 8 9 63730 CASAVA_Build 1 238165102 4I AAATGGTTGT ----/TAAA TAAAGTCTCT 2259 hom 21 het 26 0 7 19 TAAA 1 2 63731 CASAVA_Build 1 238168925 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 21 1 15 5 A 12 11 63732 CASAVA_Build 1 238169380 4D ATAAGATGAT GAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 25 5 GAAA 1 0 63733 CASAVA_Build 1 238169795 1I CTCCAGCTGC -/A ACTCCTGTAT 3070 hom 96 het 33 0 31 2 A 1 2 63734 CASAVA_Build 1 238172172 1I TTACTATTTT -/G TTTTGTTTTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 0 1 63735 CASAVA_Build 1 238176309 1D GCAGACGTAA T/- TGAGTTAGGT 2663 het 2663 ref 23 13 6 4 T 2 1 63736 CASAVA_Build 1 238178385 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 1511 het 1511 ref 17 6 6 5 A 10 9 63737 CASAVA_Build 1 238179289 1I CCCACTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3048 het 1738 hom 23 5 9 9 T 10 11 63738 CASAVA_Build 1 238185012 6D CCCCCGCCCC CGCCCG/------ CGTCCTTGTG 3070 hom 43 het 19 0 14 5 CGCCCG 1 0 63739 CASAVA_Build 1 238190857 1I TACTCTTATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 9 10 63740 CASAVA_Build 1 238200905 12D GAAGGGAGAT CCAATGGGCTCC/------------ CCAGAGAAGG 1795 het 1795 ref 47 29 8 14 CCAATGGGCTCC 1 0 63741 CASAVA_Build 1 238202720 1I TCAAAGTTGG -/A AAAAGTATGT 3070 het 2791 hom 37 8 21 8 A 4 5 63742 CASAVA_Build 1 238204737 1I AAAATTAGCC -/G GATGGGTGGC 3070 hom 23 het 11 0 8 3 G 1 2 63743 CASAVA_Build 1 238205341 2I GAAGAAAGAA --/AG AGGAAAGAAA 1948 hom 12 het 10 0 4 6 AG 1 2 63744 CASAVA_Build 1 238211990 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 697 hom 47 2 36 11 A 12 11 63745 CASAVA_Build 1 238212988 4I TAGCCCAACT ----/TGGG GCTCTATTTC 3070 hom 120 het 47 0 39 8 TGGG 0 1 63746 CASAVA_Build 1 238213544 6D GCACGAACAA TGAGTC/------ TGTCATTTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 TGAGTC 1 0 63747 CASAVA_Build 1 238217209 1I AAATTTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 A 11 12 63748 CASAVA_Build 1 238231177 2D CTTCTTGGAT TA/-- TATACTAAGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TA 3 2 63749 CASAVA_Build 1 238236598 1D TATTTTTATT C/- TGTGCTCAGT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 1 0 63750 CASAVA_Build 1 238237905 4D TAAGAGGGAC CAGA/---- CAAAGTTCAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 CAGA 1 0 63751 CASAVA_Build 1 238241693 2I AGGATGACAC --/AT ACGGTCCTCC 3070 het 3070 ref 53 31 17 5 AT 0 1 63752 CASAVA_Build 1 238245072 8D TGTTTGTTTG TTTGTTTC/-------- TTTTGTCTCA 2358 het 2358 ref 34 23 10 3 TTTGTTTC 1 0 63753 CASAVA_Build 1 238245563 1D AATAAAAGAC A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 A 8 7 63754 CASAVA_Build 1 238246123 2D TTATTCACAC AT/-- GTGTTGATGG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 AT 1 0 63755 CASAVA_Build 1 238246910 1I TTTTATGGTC -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 6 7 63756 CASAVA_Build 1 238249537 2D AGTATGTAAA AT/-- ATATATGTTC 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 AT 4 3 63757 CASAVA_Build 1 238252406 2D GCCAACAGTC AT/-- ATAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 AT 2 1 63758 CASAVA_Build 1 238257729 2D TTGCTTAATA AT/-- ATGTCATGAA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 AT 2 1 63759 CASAVA_Build 1 238263012 1I AGGAATCCTT -/A AAAATCAAAT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 A 4 5 63760 CASAVA_Build 1 238268523 1D TCATGGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 T 11 10 63761 CASAVA_Build 1 238268980 1D TTTAACTGAG T/- TGTCCCATCA 3070 het 3070 ref 54 29 22 3 T 2 1 63762 CASAVA_Build 1 238271328 37D6M4D TGGAGGATTG ATATAATCCTCCAAATAAATATAATATATCACATTATATTCCCATAT/-------------------------------------AGTGGC---- AATGTGATAT 3070 het 3070 ref 29 20 17 7 N/A 0 0 63763 CASAVA_Build 1 238275084 3D TTATTTTATT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 TTA 5 4 63764 CASAVA_Build 1 238275650 3D ATGGAATTCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 34 5 13 16 A 15 12 63765 CASAVA_Build 1 238277494 1I CTTTGAAATG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 8 9 63766 CASAVA_Build 1 238279176 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1634 het 1622 hom 17 7 6 4 A 12 11 63767 CASAVA_Build 1 238279899 1I ATAGAGAGAT -/C CCCATCTCTA 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 C 3 4 63768 CASAVA_Build 1 238280172 1D GCAAAGAAAA G/- AAGAATGGGG 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 G 1 0 63769 CASAVA_Build 1 238281136 1I GACAGTGTCT -/A AACTGAAGAA 3070 het 3070 ref 32 10 10 12 A 2 3 63770 CASAVA_Build 1 238281702 2I TTGGTCTCCA --/AT ACTCCTGACC 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 AT 0 1 63771 CASAVA_Build 1 238283152 1I TATTCTTTGC -/T GCTGATTCTT 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 T 0 1 63772 CASAVA_Build 1 238283470 1I TCTGATTCCT -/G GAAGTGTAAC 3070 het 3070 ref 43 18 15 11 G 1 2 63773 CASAVA_Build 1 238284432 1D TGCCATGACT A/- TTTACAAATG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 1 0 63774 CASAVA_Build 1 238287075 1I GAGAGGAGAA -/G CTAATATTTA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 G 0 1 63775 CASAVA_Build 1 238291578 3I AAAAACAGTA ---/AAT AATAAATCCG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 AAT 1 2 63776 CASAVA_Build 1 238291975 1D ATTTAAAAAA T/- ATATAAATTG 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 1 0 63777 CASAVA_Build 1 238293038 1I TCGCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 17 11 T 10 11 63778 CASAVA_Build 1 238295585 1I AGACCTTCTT -/A AAAATGTAGC 3070 het 3070 ref 55 26 20 9 A 4 5 63779 CASAVA_Build 1 238307408 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAC 2840 het 2449 hom 26 9 7 10 A 10 9 63780 CASAVA_Build 1 238315435 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1272 het 1156 hom 15 6 8 1 A 12 13 63781 CASAVA_Build 1 238346478 3D AGGAGTAAAT CAA/--- CAGTGAAATT 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 CAA 1 0 63782 CASAVA_Build 1 238348078 2I AGGGAGGTGG --/CT CTCTTGCATC 3070 het 3070 ref 36 14 10 12 CT 2 3 63783 CASAVA_Build 1 238369194 93D TGCAATTCAC ACTGTGTGTAAAATTCACAATGAGGAGCAGGTTGTGGGGATGATTGGTTCAATTAAAATCCTACTGAATTTGAGGATACCTCTTTAAATATAT/--------------------------------------------------------------------------------------------- ACAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 41 50 12 6 ACTGTGTGTAAAATTCACAATGAGGAGCAGGTTGTGGGGATGATTGGTTCAATTAAAATCCTACTGAATTTGAGGATACCTCTTTAAATATAT 1 0 63784 CASAVA_Build 1 238374678 3I AATTTCCATA ---/AGC AGGTCACAGG 3070 het 3070 ref 56 23 22 11 AGC 0 1 63785 CASAVA_Build 1 238380301 4I AAACAAGACA ----/TCAG TCCATCCCAT 3070 het 3070 hom 52 20 28 4 TCAG 0 1 63786 CASAVA_Build 1 238387901 1I CTCTACTAAA -/G AAAAAAAAAA 1907 het 523 hom 20 7 9 4 G 0 1 63787 CASAVA_Build 1 238392527 4I ATTCTAATAT ----/CTTA CTTACTACTT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 CTTA 1 2 63788 CASAVA_Build 1 238395403 3I CTTTGCTGAA ---/GTT GTCTATTTTG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 GTT 0 1 63789 CASAVA_Build 1 238397267 5I CTGAAGTACA -----/GTGGT GTGATCACAG 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 GTGGT 0 1 63790 CASAVA_Build 1 238400671 4D GGCCTGGCTC TGTT/---- TGGGCCGTCT 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 TGTT 1 0 63791 CASAVA_Build 1 238401817 6I TGGTAGAAAG ------/TTTGTA TTTGTTTTCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TTTGTA 0 1 63792 CASAVA_Build 1 238405524 13I CTCAAGTGAT -------------/CCTCCCATGTTAG CCTCCCAAGT 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 CCTCCCATGTTAG 0 1 63793 CASAVA_Build 1 238405629 3I GTGCTTTATT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 50 16 23 11 TTG 5 6 63794 CASAVA_Build 1 238407665 1I TGACTGCGTG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 A 7 8 63795 CASAVA_Build 1 238409192 1D AATGACCAAC A/- ATGTAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 13 20 2 A 2 1 63796 CASAVA_Build 1 238422764 1I AAAGAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 13 14 63797 CASAVA_Build 1 238424053 5I CTGCACTCCT -----/CTTCC CTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 CTTCC 0 1 63798 CASAVA_Build 1 238424871 2D TATCTCTACA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 T 10 8 63799 CASAVA_Build 1 238429031 4D CCGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 2568 het 2568 ref 18 7 8 3 AAAC 3 2 63800 CASAVA_Build 1 238448486 1I TCTCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1787 hom 22 6 12 4 A 13 14 63801 CASAVA_Build 1 238452429 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 10 11 63802 CASAVA_Build 1 238454356 8D ATAAGTGCGA TGTGGTGC/-------- TGAGAAGAAT 3070 het 2881 hom 13 8 7 0 TGTGGTGC 1 0 63803 CASAVA_Build 1 238457352 1D TCCAAACTCA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 T 9 8 63804 CASAVA_Build 1 238463315 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1806 hom 25 9 10 7 A 15 14 63805 CASAVA_Build 1 238468901 5I GGGGAGTATT -----/GAAAG GAAGGAGGTA 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 GAAAG 0 1 63806 CASAVA_Build 1 238471168 1D TTTAATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1971 hom 28 11 14 3 T 14 13 63807 CASAVA_Build 1 238477426 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 2722 het 2043 hom 19 9 9 1 A 15 14 63808 CASAVA_Build 1 238478296 2D TTTTATGGAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 31 0 27 6 TA 8 7 63809 CASAVA_Build 1 238480893 2I ATTTGGGTCT --/TC TCTCTCATTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TC 3 4 63810 CASAVA_Build 1 238482472 1I GGGCTGGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2470 hom 34 9 18 7 T 12 13 63811 CASAVA_Build 1 238483204 7D TTCATTCATT TTTATTC/------- TTTATTCTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 6 TTTATTC 2 1 63812 CASAVA_Build 1 238491275 1I TAACCAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 T 12 13 63813 CASAVA_Build 1 238496107 2I ATCTTTGTCC --/CT CTTTCTCCCC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CT 1 2 63814 CASAVA_Build 1 238497556 6D CCCTGAACTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 20 10 3 A 16 10 63815 CASAVA_Build 1 238502296 2D TGGTTTTTGC AA/-- AAAGATTCCT 3070 het 3070 ref 52 22 21 10 A 5 3 63816 CASAVA_Build 1 238502958 4D GAATTGTTCC CTTG/---- CTTTAGCCAC 3070 het 3070 ref 52 26 21 8 CTTG 1 0 63817 CASAVA_Build 1 238503611 1D CACACAGGGA G/- GAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 2 1 63818 CASAVA_Build 1 238507361 1I CTGCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2626 het 2626 ref 27 12 8 7 T 13 14 63819 CASAVA_Build 1 238510033 1D CTGAGTTTTC T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 33 21 10 3 T 8 7 63820 CASAVA_Build 1 238511675 2I ACAATATCAC --/TG TCATTTTTTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TG 0 1 63821 CASAVA_Build 1 238521671 2I TTTGTTTTTC --/TT TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 T 8 10 63822 CASAVA_Build 1 238521922 1D CTTGCCCCTG C/- CCCATAAAGG 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 C 4 3 63823 CASAVA_Build 1 238525473 7D ATTTCACTTA GCATTAT/------- GCCCTCCAGG 3070 het 3070 ref 40 24 14 4 GCATTAT 1 0 63824 CASAVA_Build 1 238531094 1D TTTATTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 12 11 63825 CASAVA_Build 1 238531838 2I CATTTGACAG --/TT TTTCCATCTC 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 T 3 5 63826 CASAVA_Build 1 238535525 2I ATTAAATTAT --/TA TAATCTAGTG 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 TA 1 2 63827 CASAVA_Build 1 238535729 3I TCCACTTATA ---/CTT CTTCTTGTCA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 CTT 2 3 63828 CASAVA_Build 1 238535875 2D TGCTTGTAAG TT/-- TTTTTTTTTT 2133 het 2133 ref 39 16 7 16 T 16 14 63829 CASAVA_Build 1 238538589 29D GACCTTTCAG AGTTAAGAGATGATAGTGGCTTGGACCTC/----------------------------- AGTTAAGAGA 3070 hom 66 het 35 0 16 23 AGTTAAGAGATGATAGTGGCTTGGACCTC 2 1 63830 CASAVA_Build 1 238544516 1D TAATAAATGT A/- AAAATTTTGG 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 5 4 63831 CASAVA_Build 1 238552124 1D ACTATGGTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 33 hom 41 2 28 11 A 9 8 63832 CASAVA_Build 1 238553048 4I TTCTTTTTCT ----/TTCC TTCCTTCCTT 3070 hom 82 het 39 0 27 12 TTCC 3 4 63833 CASAVA_Build 1 238555477 10I CTAGTGTCAG ----------/AAATATATTT TTAACTCCAA 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 AAATATATTT 0 1 63834 CASAVA_Build 1 238559725 2I ATTTGAAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 10 12 63835 CASAVA_Build 1 238561049 5I ACAGTATATC -----/TCTTA TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 TCTTA 0 1 63836 CASAVA_Build 1 238562187 1I TACATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 10 11 63837 CASAVA_Build 1 238562300 4I TCAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 AAAG 2 3 63838 CASAVA_Build 1 238564574 3I GAACAAAATA ---/TCT TCTTCTACTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 TCT 2 3 63839 CASAVA_Build 1 238576687 9I GATATTTAGT ---------/CATCTGGGC CCCACAAATT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 CATCTGGGC 0 1 63840 CASAVA_Build 1 238578132 3I TGCCAGTATA ---/TGT TGTTGTTTTT 2686 het 1978 hom 26 9 10 7 TGT 2 3 63841 CASAVA_Build 1 238587874 2D AGATATTAAC TT/-- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 27 14 9 6 T 9 7 63842 CASAVA_Build 1 238598505 1I ATTTGAGATA -/T TTAAAAAATT 3070 het 2571 hom 28 7 18 3 T 2 3 63843 CASAVA_Build 1 238598582 11D TATGTAGTTT CTTTTTTCTTC/----------- CTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 30 17 11 5 CTTTTTTCTTC 1 0 63844 CASAVA_Build 1 238622039 1I CTGTTTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 11 12 63845 CASAVA_Build 1 238622918 1I ACATAGAAAA -/G TATCTCAGAA 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 G 0 1 63846 CASAVA_Build 1 238623095 2D GATAAGTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 20 8 T 12 10 63847 CASAVA_Build 1 238631047 2D CACCCCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 34 1 23 11 A 17 15 63848 CASAVA_Build 1 238635542 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1214 hom 25 5 13 8 A 15 14 63849 CASAVA_Build 1 238640086 2D CATAAATCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 33 2 19 12 A 12 10 63850 CASAVA_Build 1 238640993 3I CCCCATCCTA ---/CTT CTTCTTCTTG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CTT 3 4 63851 CASAVA_Build 1 238641554 1D TGATCTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 31 1 18 12 T 12 11 63852 CASAVA_Build 1 238645456 1I AGTATAATAA -/T AAAAAAAAAA 2810 het 6 hom 29 1 11 17 T 0 1 63853 CASAVA_Build 1 238646683 1D CTCTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2787 hom 29 7 15 7 T 11 10 63854 CASAVA_Build 1 238656233 1I CTTTTCAAGT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 9 63855 CASAVA_Build 1 238675626 2I CATCAAAGGG --/TT TTTTTTTTTT 2689 het 2689 ref 35 15 13 7 T 14 16 63856 CASAVA_Build 1 238678740 1D CAAGACCCTG T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 T 4 3 63857 CASAVA_Build 1 238684113 2I CATGGCGTTT --/TC TCTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 TC 2 3 63858 CASAVA_Build 1 238684206 1D GGCTCATGCC T/- TTAATCCCAG 2880 het 2880 ref 32 17 9 6 T 3 2 63859 CASAVA_Build 1 238685102 14I ACCATCGGAA --------------/AGCTGGTGCATAAT AGTAAAGAGG 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 AGCTGGTGCATAAT 0 1 63860 CASAVA_Build 1 238685209 4D GGGCAGGAGG GTTA/---- GTTACTTCAG 3070 het 3070 ref 36 22 12 9 GTTA 2 1 63861 CASAVA_Build 1 238687002 1I ATGCCAGCAC -/T TGGTACTATG 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 1 2 63862 CASAVA_Build 1 238690646 4I AGCAAGAAAG ----/TAAA TAAAATATTA 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 TAAA 1 2 63863 CASAVA_Build 1 238700762 2D CCTTTTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 2294 het 2294 ref 19 8 6 5 A 12 10 63864 CASAVA_Build 1 238703882 2D GTGCTCAAAG AT/-- AACACAGATC 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 AT 1 0 63865 CASAVA_Build 1 238704639 1I AAAATGGTCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 T 8 9 63866 CASAVA_Build 1 238707138 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 10 9 63867 CASAVA_Build 1 238713994 1I TAAAAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 14 19 14 T 11 12 63868 CASAVA_Build 1 238714459 6D TAGCTATTTA TATGAT/------ ATATGATATA 3070 het 3070 ref 27 13 10 6 TATGAT 1 0 63869 CASAVA_Build 1 238723626 1I TTTCTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 9 10 63870 CASAVA_Build 1 238727253 1D ACATGAGATC T/- TTTGATACAG 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 4 3 63871 CASAVA_Build 1 238727536 1D28M1D CAAAGGGAGT AAAAAAAAAAAATTGAAAGCAGAAAGGAGA/-AAAAAAAAAAATTGAAAGCAGAAAGGAG- AAAAAAAAGT 3022 het 3022 ref 30 20 9 10 N/A 0 0 63872 CASAVA_Build 1 238730840 1I TGAGCTTGAC -/T TAAGTTGTGC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 1 2 63873 CASAVA_Build 1 238743892 1I GAAATAGTCC -/G GGTGCGGTGG 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 G 2 3 63874 CASAVA_Build 1 238744409 2D ATGTACACAC TG/-- GAGTAAGAAC 3070 het 3070 hom 48 20 26 2 TG 1 0 63875 CASAVA_Build 1 238744889 1D AAACAAACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 10 9 63876 CASAVA_Build 1 238745427 1D AAGTATTCTA T/- TATCAGGGAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 2 1 63877 CASAVA_Build 1 238746051 1I CAACCCTGAC -/T TTTTTTTTTT 2516 het 1380 hom 26 5 11 10 T 15 16 63878 CASAVA_Build 1 238748903 2I GACAATACTC --/TT AATGGAAACC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 0 2 63879 CASAVA_Build 1 238749096 5D AAAACAAAAG GCAGT/----- GATGTGTATG 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 GCAGT 1 0 63880 CASAVA_Build 1 238752845 1I ACACCTTCTT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 A 7 8 63881 CASAVA_Build 1 238754972 1D CCTCAGCTAC A/- ATTCCATGTG 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 2 1 63882 CASAVA_Build 1 238761638 5D TTTCTTCTTC TTTTT/----- TTTTTTTTGA 3070 hom 19 het 24 1 18 5 T 13 8 63883 CASAVA_Build 1 238764616 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 22 19 63884 CASAVA_Build 1 238766001 1I AGACTGGTAA -/G GACAAGAGGA 3070 hom 123 het 45 0 40 5 G 1 2 63885 CASAVA_Build 1 238775398 36D ATTAGTTGAC TAATTGTAACTAAAATTGTACAAATTGTACAAATTG/------------------------------------ TACAAAATTG 3070 het 3070 ref 43 34 19 2 TAATTGTAACTAAAATTGTACAAATTGTACAAATTG 1 0 63886 CASAVA_Build 1 238779260 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1253 hom 25 8 13 4 A 14 12 63887 CASAVA_Build 1 238781262 1D TTACCTTGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 9 8 63888 CASAVA_Build 1 238781561 1I TCTAGTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3068 hom 32 8 13 11 T 13 14 63889 CASAVA_Build 1 238782878 1D AGCCTTTCAT C/- CCCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 C 4 3 63890 CASAVA_Build 1 238794431 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2716 het 2488 hom 18 7 7 5 A 14 13 63891 CASAVA_Build 1 238799845 1I TTCACTAAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 7 8 63892 CASAVA_Build 1 238830146 3I TGTGTAAAAC ---/GAG GAGATTACGT 3070 hom 187 het 70 0 63 7 GAG 1 2 63893 CASAVA_Build 1 238830396 12D GTTTTTATTG TTTTCTTTTCTT/------------ TTTTCTTTTC 3070 het 3054 hom 23 12 10 5 TTTTCTTTTCTT 2 1 63894 CASAVA_Build 1 238840998 1I ACCTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 36 1 27 8 A 12 13 63895 CASAVA_Build 1 238848642 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 A 9 10 63896 CASAVA_Build 1 238873762 1D GCACATGCCA C/- CATGCCATGC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 C 2 1 63897 CASAVA_Build 1 238876271 1D GTCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 A 12 11 63898 CASAVA_Build 1 238882148 24I3M36I AGTTGATTTC ------------------------ACA------------------------------------/TGTCTTTAAATGGTTTTCCTGCCTACATCATTTAAAATTACCTCAATTCATGAAAATGCAGGG AGATAGTTAA 2670 het 2670 ref 27 22 6 4 N/A 0 0 63899 CASAVA_Build 1 238890218 1D GTGACCCAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 8 7 63900 CASAVA_Build 1 238908342 1I GAAAAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1861 hom 26 6 11 9 T 14 15 63901 CASAVA_Build 1 238911612 4I AAAGACATGG ----/AATC AATCTAAATA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 AATC 1 2 63902 CASAVA_Build 1 238934227 1D CACATACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 9 10 T 12 11 63903 CASAVA_Build 1 238955627 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTGATG 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 7 6 63904 CASAVA_Build 1 238963413 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1687 het 1687 ref 18 8 5 5 A 12 11 63905 CASAVA_Build 1 238968715 1I GTAAAAAAAT -/A AAAAACATAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 5 6 63906 CASAVA_Build 1 238971943 1I TAGAAAAAAA -/T TTCTGTGACC 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 T 2 3 63907 CASAVA_Build 1 238974555 1I ATCATATCTT -/A AAAAAATTGC 3070 het 2428 hom 19 8 11 0 A 6 7 63908 CASAVA_Build 1 238979185 2D AATTTATTTA TT/-- TTTTGAGACA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 6 4 63909 CASAVA_Build 1 238979237 2D CAATGGTGTG AT/-- ATCTCGGCTG 2115 het 2115 ref 21 11 6 4 AT 2 1 63910 CASAVA_Build 1 238980049 2D TATAAATCAT TG/-- TGTTATTTAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TG 2 1 63911 CASAVA_Build 1 239071515 5D AACCATCATC TAATA/----- TGAGTTTCAT 3070 hom 90 het 31 0 31 2 TAATA 1 0 63912 CASAVA_Build 1 239072553 1D TAAGCATTTT G/- GGGGGGGAAT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 G 8 7 63913 CASAVA_Build 1 239073364 1D GATTTTTGTA T/- TTTTTGTAGG 3070 het 3038 hom 28 8 14 6 T 6 5 63914 CASAVA_Build 1 239073823 1I ATGAACAGGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 8 9 63915 CASAVA_Build 1 239078557 2I TAACGAGAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 11 13 12 T 11 13 63916 CASAVA_Build 1 239149551 1D AGTACAAATG A/- AAAGTCTCTC 3070 hom 120 het 43 0 39 5 A 4 3 63917 CASAVA_Build 1 239150870 1I AATAAATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 36 2 30 4 T 10 11 63918 CASAVA_Build 1 239151255 1D TCTCTTGAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 10 9 63919 CASAVA_Build 1 239164992 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1288 hom 22 4 13 5 T 10 11 63920 CASAVA_Build 1 239170730 2D AAAGAAAAAC AG/-- AAGTGAGTGA 3070 het 3070 hom 50 22 26 4 AG 1 0 63921 CASAVA_Build 1 239182764 1I AAAAGGGGGG -/A AAAAGAGATA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 4 5 63922 CASAVA_Build 1 239184482 1I CATGTAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 9 10 63923 CASAVA_Build 1 239185475 18D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 2592 hom 27 het 7 0 10 0 A 32 14 63924 CASAVA_Build 1 239185864 1D AAACATAGGA G/- GGAATCTGTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 3 2 63925 CASAVA_Build 1 239191257 3I TCTCCTCCTC ---/CTT ATCAGATAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CTT 0 1 63926 CASAVA_Build 1 239198473 1I CTGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 8 8 A 11 12 63927 CASAVA_Build 1 239206717 4D TCTATTATCC ATCT/---- ATCTATCATC 3070 het 3070 ref 38 19 15 7 ATCT 2 1 63928 CASAVA_Build 1 239206792 4I46M4I ACCATCCATC ----ATCTATCTGTCTATCTCTTTATCATCTATCATCCATCTATTATCTT----/ATCTATCTATCTGTCTATCTCTTTATCATCTATCATCCATCTATTATCTTTCTA TCTATCATCC 3070 het 3070 hom 46 27 25 3 N/A 0 0 63929 CASAVA_Build 1 239212112 1I GGGAGGCCAA -/G GTGGGTGGAT 3070 het 1633 hom 16 4 10 2 G 1 2 63930 CASAVA_Build 1 239217638 1D ATTTTTTGGA G/- GATGGGGTCT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 G 2 1 63931 CASAVA_Build 1 239225942 1D ATTTTTATTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 19 16 8 T 10 9 63932 CASAVA_Build 1 239254794 2I TATCAAGAAC --/GA GAGAGTAAGT 2976 het 2976 ref 33 21 7 5 GA 2 3 63933 CASAVA_Build 1 239255621 1D TTCTAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 11 10 63934 CASAVA_Build 1 239256744 1D AGCGGGGTTT G/- GGGCATCCAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 G 4 3 63935 CASAVA_Build 1 239262893 1I ATGCGTTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 8 9 63936 CASAVA_Build 1 239265284 1I ATAAGGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 13 21 15 A 10 11 63937 CASAVA_Build 1 239269489 2D AACTCATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 31 17 10 T 12 10 63938 CASAVA_Build 1 239269747 1I TGTTTGATCT -/A ATGAATCGCC 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 A 1 2 63939 CASAVA_Build 1 239271244 2D TTCAAAATTC AG/-- AGTTTGGTGT 3070 het 3070 hom 27 11 16 0 AG 2 1 63940 CASAVA_Build 1 239272199 1D GGATTATAAT A/- AAGCTAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 3 2 63941 CASAVA_Build 1 239274036 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2909 het 491 hom 24 4 9 12 T 14 13 63942 CASAVA_Build 1 239275930 1D GCATTTAGAC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 45 29 12 5 T 7 6 63943 CASAVA_Build 1 239281391 1I AGCCAACCAA -/T TATAGCAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 1 2 63944 CASAVA_Build 1 239282631 1I CAATTCCCCC -/A CCAAAGTATT 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 A 0 1 63945 CASAVA_Build 1 239285044 1I TAAGGTATAA -/T AAGATAGGAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 0 1 63946 CASAVA_Build 1 239287506 4I CTCTTATTCT ----/TCTG TCTTACTGTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TCTG 0 1 63947 CASAVA_Build 1 239297448 1I AATAATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 26 1 15 10 T 13 14 63948 CASAVA_Build 1 239300676 8D29M3D CATAAAAATA CAACAGCCCAACAGAAGGCCACGTTTGGGTAGCCAGCCGT/--------CAACAGAAGGCCACGTTTGGGTAGCCAGC--- CGTCAAGTGC 3070 het 3070 hom 40 12 17 19 N/A 0 0 63949 CASAVA_Build 1 239301421 2D TGTTTAAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 14 12 63950 CASAVA_Build 1 239303829 1D TCTTCGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 25 4 13 8 T 15 14 63951 CASAVA_Build 1 239313841 13I TTTCAGAAAG -------------/GAGTCTCTTATTA GAGTCTCAGA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 GAGTCTCTTATTA 0 1 63952 CASAVA_Build 1 239322785 1I TAAAAGATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 10 11 63953 CASAVA_Build 1 239323758 1I TGTACACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 10 11 63954 CASAVA_Build 1 239324527 6I CAACAACTCT ------/AAAACC AAAACCAAAA 3070 het 3070 ref 50 28 12 10 AAAACC 1 2 63955 CASAVA_Build 1 239360268 1D AACATAAATT A/- AAAAAAAAAA 1145 het 1145 ref 35 24 3 8 A 12 11 63956 CASAVA_Build 1 239383195 1D TGAGGGCACA G/- CATTTGTGCA 3070 hom 150 het 55 0 50 6 G 1 0 63957 CASAVA_Build 1 239387837 2I CACCTCCCGG --/GT TCACGCCATT 3070 hom 41 het 15 0 14 1 GT 0 1 63958 CASAVA_Build 1 239392146 6I TGGTGATCAG ------/CTCCCC CTTCCAAATA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 CTCCCC 0 1 63959 CASAVA_Build 1 239393507 1I TGAGGGCGGC -/T TACCTGTGAG 3070 het 3070 ref 57 29 24 4 T 1 2 63960 CASAVA_Build 1 239407804 1D AAAGTGGGGA G/- GAAAAGGAGG 3070 het 3070 hom 45 21 20 5 G 2 1 63961 CASAVA_Build 1 239409782 2D TCATACACAC AT/-- GAGGCACTTT 3070 het 3070 hom 55 26 26 3 AT 1 0 63962 CASAVA_Build 1 239412868 1D AACGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 13 12 63963 CASAVA_Build 1 239425690 2D GAATTGGAAG AT/-- AGGTCAGAAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 AT 1 0 63964 CASAVA_Build 1 239427755 1D ATAAAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 29 0 16 13 A 15 14 63965 CASAVA_Build 1 239428554 2I ACAAGAAAAC --/TT GTATCATTTC 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 T 0 2 63966 CASAVA_Build 1 239429039 4D AGTCATCTGA TTAT/---- TTATCTGATT 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 TTAT 2 1 63967 CASAVA_Build 1 239432232 1D AATTCATTTT C/- CCCATCCCCT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 4 3 63968 CASAVA_Build 1 239432719 1I TATTTTTAGG -/T TTTTATGGCT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 T 4 5 63969 CASAVA_Build 1 239453634 1D TAGACATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 192 hom 44 2 29 14 A 13 12 63970 CASAVA_Build 1 239453987 2I CTGGTGACCA --/AT ATATATATAT 2632 hom 20 het 12 0 7 6 AT 7 8 63971 CASAVA_Build 1 239457660 10D AACACAGCAA GACCTTGTGT/---------- CACCTCCAGA 1151 het 1151 ref 31 16 4 15 GACCTTGTGT 1 0 63972 CASAVA_Build 1 239459990 1D TATATTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 11 10 63973 CASAVA_Build 1 239465541 3D7M1D TTTCTTCCTT TCCCTTTTCTC/---CCTTTCT- TCTTTTTTCT 802 het 802 ref 29 16 5 10 N/A 0 0 63974 CASAVA_Build 1 239466766 1D ATAAAAAAAA T/- ATCCATCTGA 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 T 1 0 63975 CASAVA_Build 1 239468455 3D ACCCTCTCTC TCT/--- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 TCT 1 0 63976 CASAVA_Build 1 239471862 1D TCTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 30 1 27 2 T 11 10 63977 CASAVA_Build 1 239475296 1I TCCTGCCGTG -/T TAAGTGTGCT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 1 2 63978 CASAVA_Build 1 239480390 1I TATTGTGGGA -/T TTTTTTTTTT 1338 het 1338 ref 49 31 4 14 T 13 14 63979 CASAVA_Build 1 239491693 1D AATTTTAACC A/- AAAAACCCAT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 6 5 63980 CASAVA_Build 1 239495372 1D CAGAGGAAGG T/- TTTTCTGTAG 3070 het 3070 ref 48 25 15 9 T 5 4 63981 CASAVA_Build 1 239496756 1I TTTTGGATAC -/A AAAAATGTGA 3070 het 3070 hom 41 13 25 3 A 5 6 63982 CASAVA_Build 1 239499990 1D TCACAAAATC T/- TAGTTAATCC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 2 1 63983 CASAVA_Build 1 239503099 1D TAATAATGAA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 10 hom 28 1 12 15 C 11 10 63984 CASAVA_Build 1 239503365 1D ATCTGTTAGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 10 9 63985 CASAVA_Build 1 239521254 1D TCACAGTTAC A/- ATACACATGT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 A 2 1 63986 CASAVA_Build 1 239525208 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1546 het 1546 ref 14 5 6 3 A 11 12 63987 CASAVA_Build 1 239529744 1D TTAGGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 33 0 23 11 A 13 12 63988 CASAVA_Build 1 239536052 2D ATCTCTTTTT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 58 19 22 18 CA 10 9 63989 CASAVA_Build 1 239536581 4D TCACACACAA ATAC/---- ATGTCCACCC 3070 het 3070 hom 72 35 33 6 ATAC 1 0 63990 CASAVA_Build 1 239540288 2I AGGTGTGAGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 64 18 26 20 GT 7 8 63991 CASAVA_Build 1 239575859 1I GAATCACTTG -/A ACCCAGGAGG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 1 2 63992 CASAVA_Build 1 239575961 1D ATAAATACTT A/- AATGTTTCTA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 3 2 63993 CASAVA_Build 1 239576227 1I TTGCCATGGT -/A AAATAAGCTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 3 4 63994 CASAVA_Build 1 239576324 1I AGCCAAGGCC -/A AATGCATATG 3070 hom 141 het 58 0 47 11 A 2 3 63995 CASAVA_Build 1 239578934 3I AGATAAAATG ---/ATA ATAATAATAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATA 3 4 63996 CASAVA_Build 1 239591552 1D GTTTTTTTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 10 9 63997 CASAVA_Build 1 239592703 3I TGATGTCTGT ---/CTC CTCCTAGAAA 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 CTC 1 2 63998 CASAVA_Build 1 239593169 2D TAAGTGACAC AG/-- GGGCAAGTAC 3070 het 3070 hom 45 21 21 5 AG 1 0 63999 CASAVA_Build 1 239595499 3D GATTTCAAAG AGA/--- AGAAGTGACA 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 AGA 2 1 64000 CASAVA_Build 1 239596832 4D TAAGACAAAC AGAG/---- AGGGCTGGGT 3070 het 3070 ref 45 20 20 8 AG 3 1 64001 CASAVA_Build 1 239596906 1D AAAAGATACT G/- GGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 G 3 2 64002 CASAVA_Build 1 239600677 1D GCTTGCACAA C/- GACAAAATCA 3070 het 3070 ref 53 24 23 8 C 1 0 64003 CASAVA_Build 1 239602240 3D CCCACTTCTG TCA/--- TCGTGTCAGA 3070 het 3070 ref 31 18 10 5 TCA 1 0 64004 CASAVA_Build 1 239615054 1D ACCTGACCCC A/- TATTCAATTA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 1 0 64005 CASAVA_Build 1 239641317 1D TCCAGAACAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 40 19 15 7 A 9 8 64006 CASAVA_Build 1 239654924 1I AAAAATATAC -/T TTTAAGTTAT 3070 het 2012 hom 19 5 11 3 T 3 4 64007 CASAVA_Build 1 239665711 1D AGCAATTTAC T/- CTTAAAAAGG 1889 het 1463 hom 11 4 5 2 T 1 0 64008 CASAVA_Build 1 239691553 2I CTGAGTAATT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 A 9 11 64009 CASAVA_Build 1 239694186 1D AACTTAATGA G/- GCTTCTCTCC 3070 het 3070 ref 50 28 19 3 G 2 1 64010 CASAVA_Build 1 239695275 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 24 4 13 8 T 17 16 64011 CASAVA_Build 1 239697756 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 9 10 64012 CASAVA_Build 1 239698819 1D GGTTCTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 11 10 64013 CASAVA_Build 1 239727269 2D CACGTGCGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 48 22 16 10 CA 8 7 64014 CASAVA_Build 1 239750961 4D TATGAAATAT TTTA/---- TTTATCCAGT 3070 het 3070 ref 50 24 22 9 TTTA 2 1 64015 CASAVA_Build 1 239781936 2I TCCTGAGGAA --/GG GGCCAAGTCA 3070 het 3070 hom 51 17 24 10 G 2 4 64016 CASAVA_Build 1 239786967 1I GTAATGTGGC -/T TGGAGAGTAG 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 1 2 64017 CASAVA_Build 1 239789376 1I ATAATTTTTT -/A AAAAGTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 4 5 64018 CASAVA_Build 1 239793451 3D TATTCGCTAA TTT/--- TTTAGTGCTT 3070 het 3070 ref 39 27 10 2 T 6 3 64019 CASAVA_Build 1 239794635 4I CATAAGATGT ----/TCTC TCTCTCTGTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TC 3 5 64020 CASAVA_Build 1 239801122 1D AGGTTTTTGT A/- AAACATAAGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 4 3 64021 CASAVA_Build 1 239804456 2I GATCATATGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 10 12 64022 CASAVA_Build 1 239814532 1D AGAAATAGCG T/- TTAAAAGTTG 3070 het 3070 ref 57 34 20 4 T 3 2 64023 CASAVA_Build 1 239815156 4I TGCATTTCAA ----/AATT AATTAATTAA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 AATT 3 4 64024 CASAVA_Build 1 239815175 1D ATTAATAATT A/- AATTAAATTA 584 het 584 ref 15 6 4 5 A 3 2 64025 CASAVA_Build 1 239824033 1I AAAATGCATT -/A ACGTGTTTTG 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 A 1 2 64026 CASAVA_Build 1 239840888 2I GAGAATATAC --/AT ATGTTTAGTA 3070 het 3070 hom 41 11 20 10 AT 1 2 64027 CASAVA_Build 1 239866881 1I GGGGAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 2931 het 2931 ref 34 14 10 10 A 13 14 64028 CASAVA_Build 1 239877327 2D ATTAATTTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 AT 7 6 64029 CASAVA_Build 1 239885632 5I TTTCTTTTCT -----/TTTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TTTTC 0 1 64030 CASAVA_Build 1 239894509 1D GTAAATCAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 32 0 27 7 T 9 8 64031 CASAVA_Build 1 239910711 18I TTCGGGTCTG ------------------/CAGACTCAGCTGGGCTCT CAGTAGCTTC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 CAGACTCAGCTGGGCTCT 0 1 64032 CASAVA_Build 1 239919232 1D CAGAGTGATC A/- AAAAAACAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 7 6 64033 CASAVA_Build 1 239921537 4I TATAGTACTG ----/GACA GACAGTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 GACA 1 2 64034 CASAVA_Build 1 239931607 7I GATCTGTTCA -------/GTCAAAC TCTAGATGAG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 GTCAAAC 0 1 64035 CASAVA_Build 1 239947546 1D CGCAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 10 9 64036 CASAVA_Build 1 239951951 2D TTCATAAAAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 833 hom 35 7 15 13 TG 9 8 64037 CASAVA_Build 1 239952538 1D TTTCCTAAAT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 18 9 7 4 A 8 7 64038 CASAVA_Build 1 239953720 1D GTAATAAAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 9 8 64039 CASAVA_Build 1 239955974 1I GCTCTCTTTT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3017 hom 21 9 11 1 A 0 1 64040 CASAVA_Build 1 239956330 1D CACCATCTTT A/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 A 7 6 64041 CASAVA_Build 1 239956636 11D ATATGTAAGT AATCAATTTTA/----------- AATCAATTTT 3070 het 3070 ref 20 12 8 4 AATCAATTTTA 2 1 64042 CASAVA_Build 1 239957815 3D AACAAAGAAA AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 49 25 23 3 AAG 3 2 64043 CASAVA_Build 1 239958349 4D CAGAAAAGGG AACA/---- GACAACATCC 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 AACA 1 0 64044 CASAVA_Build 1 239958749 1D TCTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 T 11 10 64045 CASAVA_Build 1 239961270 1D CTCGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 15 14 A 13 12 64046 CASAVA_Build 1 239965271 1I TGTCTTTGTG -/C TTGTTGCTTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 C 0 1 64047 CASAVA_Build 1 239968084 3D AAAGTAATCA CTG/--- CTGCTATTTT 3070 het 3070 hom 48 19 28 2 CTG 2 1 64048 CASAVA_Build 1 239969896 3D CTGCTGTCAC TGT/--- TGTTATCATT 3070 het 3070 ref 39 15 16 9 TGT 2 1 64049 CASAVA_Build 1 239972175 1D TTCTGCTGCA T/- TTCCTCCAGC 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 3 2 64050 CASAVA_Build 1 239979686 1I GCAGGTGCCC -/T TTTTTGGGAA 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 T 5 6 64051 CASAVA_Build 1 239986948 2I AAGCACTATC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 49 27 14 8 AT 5 6 64052 CASAVA_Build 1 239987123 4D ATACATCATT GTAG/---- GTTCTATTTT 3070 het 3070 hom 47 15 27 7 GTAG 1 0 64053 CASAVA_Build 1 239988162 1I ACAACATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 11 12 64054 CASAVA_Build 1 239990399 9D ACAAAATGAA AACACTAAT/--------- AAGAAGCTGG 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 AACACTAAT 1 0 64055 CASAVA_Build 1 239992123 3D TCCACGGGCT GCA/--- GAAGGAATAC 3070 het 3070 hom 30 13 13 8 GCA 1 0 64056 CASAVA_Build 1 239992231 1D GAAAGGAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 10 9 64057 CASAVA_Build 1 239992700 3D GCTTCCTTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 6 A 13 10 64058 CASAVA_Build 1 239995113 1D TCTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 29 1 22 6 A 12 11 64059 CASAVA_Build 1 239996629 1D AACTCAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 541 hom 45 5 30 10 A 17 16 64060 CASAVA_Build 1 239997636 4D CCATCCAAGC CTGA/---- GTCATTTCTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 4 CTGA 1 0 64061 CASAVA_Build 1 240001027 2I GTTTTCAAAC --/TG TGTTCTCAGT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 TG 1 2 64062 CASAVA_Build 1 240005504 1D TAAATTAGAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 8 7 64063 CASAVA_Build 1 240007499 7D CCTGACACCA CGGCCAG/------- CTAATTTTTG 3070 het 1562 hom 20 5 14 2 CGGCCAG 1 0 64064 CASAVA_Build 1 240011529 1D AAAGATAAGT C/- GAAACCTCTC 3070 het 3070 ref 52 31 18 4 C 1 0 64065 CASAVA_Build 1 240014780 2D TTGGGAGGCT GA/-- GGCAAAAGAA 2936 het 1908 hom 15 6 8 1 GA 1 0 64066 CASAVA_Build 1 240021056 1I TATTAAAAGT -/A AAAAAATCTG 3070 hom 43 het 17 0 15 2 A 6 7 64067 CASAVA_Build 1 240039582 1I GATTGTGTTA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 6 7 64068 CASAVA_Build 1 240042278 2I TAGATCACTC --/AG AGTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 14 2 AG 1 2 64069 CASAVA_Build 1 240054668 2D AAGATGGAGG GA/-- GAGGGCAAAA 3070 het 2659 hom 27 10 14 4 GA 2 1 64070 CASAVA_Build 1 240064983 1I AGTACTGAAG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 7 8 64071 CASAVA_Build 1 240068660 3D AAGAAAAAAA AAC/--- AATAGAATAG 3070 het 3070 hom 27 9 11 9 AAC 1 0 64072 CASAVA_Build 1 240071439 2D CCAATCAAAT AA/-- AGAGATGGGG 3070 het 3070 hom 37 14 22 2 A 3 1 64073 CASAVA_Build 1 240072997 2I AAGTTAAAAG --/CA CAGATTCCAC 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 CA 1 2 64074 CASAVA_Build 1 240073771 3I TTGTCCAATT ---/ATG GTATGTATCA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 ATG 0 1 64075 CASAVA_Build 1 240076507 1I TCTCTTTATG -/T CCTCCATGCC 3070 hom 147 het 55 0 49 6 T 0 1 64076 CASAVA_Build 1 240080216 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAACAA 3070 het 5 hom 13 1 11 1 C 0 1 64077 CASAVA_Build 1 240081474 1D TAGAAGTTGT A/- AATGCAGTTG 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 A 3 2 64078 CASAVA_Build 1 240085200 1D AGATTCTCCA C/- TGTCCCCATC 2847 het 2847 ref 16 10 6 0 C 1 0 64079 CASAVA_Build 1 240088302 4D CATCAGCCTG TCTA/---- TCTATGTCTC 3070 het 3070 ref 61 33 24 6 TCTA 2 1 64080 CASAVA_Build 1 240089184 2D CAAAAATTAT GA/-- GAGAGAGGAA 3070 het 3070 ref 21 11 9 4 GA 4 3 64081 CASAVA_Build 1 240090214 1I TATAACTGTA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 64082 CASAVA_Build 1 240091868 1I GTTTTCTTTT -/C ATTTTTCTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 64083 CASAVA_Build 1 240093349 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAGCG 3070 het 1145 hom 41 7 16 18 A 7 8 64084 CASAVA_Build 1 240095580 2D AATTCCTGTC AG/-- AATTTTGTCC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 AG 1 0 64085 CASAVA_Build 1 240097542 1D GGATTATGGC T/- TTTTTTTTTA 1301 het 1301 ref 42 32 3 7 T 10 9 64086 CASAVA_Build 1 240101007 1D CCTTATTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 10 9 64087 CASAVA_Build 1 240107720 1D GATTTGAAAG A/- AAGTCTTAAC 3070 het 3070 hom 33 18 14 1 A 3 2 64088 CASAVA_Build 1 240113667 3I AATATGTATA ---/GTG GTGTTTTTGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 GTG 1 2 64089 CASAVA_Build 1 240118335 4D TGTGATGCCA CTGT/---- CTTGATTCAC 3070 het 3070 hom 54 20 29 5 CTGT 1 0 64090 CASAVA_Build 1 240119654 1D ATAGAATACA T/- TTTGTATATT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 4 3 64091 CASAVA_Build 1 240122428 1D GAATCAGGGT C/- CCTTTTTTTT 1646 het 1646 ref 35 11 11 13 C 3 2 64092 CASAVA_Build 1 240122773 1I AAAATAAAAA -/C AAAACAAAAA 3070 hom 103 het 38 0 35 3 C 0 1 64093 CASAVA_Build 1 240127834 5D GTTGGTCAGG CTGGT/----- CTCGAACTCC 1829 het 1829 ref 15 4 6 8 CTGGT 1 0 64094 CASAVA_Build 1 240132576 1D CTGGAAGAAC G/- AGTTAGGTCC 3070 het 3070 ref 42 18 12 13 G 1 0 64095 CASAVA_Build 1 240138582 3D TTAGCCAGGT GTG/--- GTGGTGGCAG 3070 hom 29 het 15 0 10 5 GTG 3 2 64096 CASAVA_Build 1 240140725 1I GAAGTCTTGT -/C GGGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 C 0 1 64097 CASAVA_Build 1 240146760 1D TTTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 11 10 64098 CASAVA_Build 1 240147101 2I AATTTGAAAC --/AT GTAAGTAAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AT 0 1 64099 CASAVA_Build 1 240152497 2D TAGCTGAGAC TG/-- TAGGGGTGCA 1258 het 1258 ref 15 11 3 3 TG 1 0 64100 CASAVA_Build 1 240152662 4I CCAGGCTGGA ----/TTTT TTTTTTTTTT 2226 het 2226 ref 25 9 12 4 T 14 18 64101 CASAVA_Build 1 240153047 1D ACAAGCCTGA C/- CAACATGGTA 3070 het 2039 hom 13 5 7 1 C 2 1 64102 CASAVA_Build 1 240153862 1I TTTTTTTTTT -/C CTTTGAGACA 1594 het 1594 ref 19 8 6 5 C 1 2 64103 CASAVA_Build 1 240155678 1I TGGCTGCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 11 12 64104 CASAVA_Build 1 240177071 1D GTGACTGGGT A/- GGCTGGGTGA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 A 1 0 64105 CASAVA_Build 1 240180868 1I TCCTTTTTAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 7 8 64106 CASAVA_Build 1 240183434 1D TAAAGCAGCT A/- TTCTCTGGAA 2456 het 2456 ref 23 13 6 4 A 1 0 64107 CASAVA_Build 1 240183947 2I TTTTTTTAGT --/AG AGAGACGGGG 1549 hom 15 het 7 0 5 2 AG 2 3 64108 CASAVA_Build 1 240184961 1I AAACTCCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2764 hom 30 10 14 6 A 13 14 64109 CASAVA_Build 1 240186645 2D GAACGTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 2533 het 433 hom 20 3 10 7 T 14 12 64110 CASAVA_Build 1 240186849 9D TCATGTTGGC CAGGATGGT/--------- CTCAAACTCC 1905 het 1905 ref 14 8 5 1 CAGGATGGT 1 0 64111 CASAVA_Build 1 240187635 4D TATAAAATGA TAAG/---- TAACTGGGAG 2246 het 2246 ref 26 19 5 2 TAAG 1 0 64112 CASAVA_Build 1 240189800 2I TGGGGAGGAA --/AG AGGGCACGGT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 AG 1 2 64113 CASAVA_Build 1 240192918 1D AATGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 19 1 12 6 T 14 13 64114 CASAVA_Build 1 240194097 2I TTTTATTTTT --/TA TTTTTTTTTA 3070 het 201 hom 18 4 9 5 TA 0 1 64115 CASAVA_Build 1 240195369 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 22 1 19 4 A 11 10 64116 CASAVA_Build 1 240205118 1I TCATGATCCA -/C CCCCCCTCAG 3070 het 1422 hom 20 5 10 5 C 6 7 64117 CASAVA_Build 1 240211153 1D TATTCTTCCA T/- CCTTTGCCCT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 1 0 64118 CASAVA_Build 1 240211326 1D TACTAAAAAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 2403 hom 18 6 10 2 A 8 7 64119 CASAVA_Build 1 240217018 1I TGTGAACTAG -/T TTTTTTTTTT 1687 het 933 hom 29 6 7 16 T 15 16 64120 CASAVA_Build 1 240218507 2D TCTCTCTCTC TT/-- TCTTTCTTTC 3070 het 2071 hom 30 7 13 11 T 3 1 64121 CASAVA_Build 1 240220089 1I TCTGTCCTGG -/T TTTTTGGGTC 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 T 5 6 64122 CASAVA_Build 1 240232337 1I CTTTACTAAA -/T TACGGCTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 T 1 2 64123 CASAVA_Build 1 240237636 1D TTCTCCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 33 2 23 9 T 12 11 64124 CASAVA_Build 1 240245764 1I AAAATGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 10 7 T 10 11 64125 CASAVA_Build 1 240249473 1D TCACGCCTGT A/- AAACCCAGCA 3070 het 1414 hom 18 5 12 1 A 4 3 64126 CASAVA_Build 1 240252646 1I TAGCGATTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 8 9 64127 CASAVA_Build 1 240258484 1I GTTTGAGGCA -/G AGTTTTGCTC 2262 het 2262 ref 23 14 5 4 G 0 1 64128 CASAVA_Build 1 240262657 1D ACAGACATTG A/- ATTTCTCACA 3070 hom 68 het 28 0 24 4 A 2 1 64129 CASAVA_Build 1 240262744 1D CAGGCAGATC A/- ACCTGAGGTT 3070 hom 68 het 27 0 24 3 A 2 1 64130 CASAVA_Build 1 240263038 1D ACTTTCAATT A/- AAAAAAAAAA 2595 het 2595 ref 28 10 11 7 A 11 10 64131 CASAVA_Build 1 240264019 4D AAAAACAAAC AAAT/---- AAATAATTTT 996 het 409 hom 9 2 3 6 AAAT 2 1 64132 CASAVA_Build 1 240268193 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 57 hom 26 1 19 6 T 13 12 64133 CASAVA_Build 1 240269058 1D CAACTACTGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 9 8 64134 CASAVA_Build 1 240269139 1I TTTTCAGACT -/G GTTTATTTCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 1 2 64135 CASAVA_Build 1 240271071 1D TTTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 10 9 64136 CASAVA_Build 1 240272471 1I94M3I TTGAACTAGG -AAAAAATCTAAAACCTGAACAGACCAATAACAAGTAACAAAATTAAAGCCTTAATAAAAAAAGTCTGTAGGACCAGACTGAAAAATAGAGGAGG---/AAAAAAATCTAAAACCTGAACAGATCAATAACTATTAACAAAATTAAAGCCTTAATAAGAAAAGTCTGTAGGACCAGACTGAAAACTAGAGAAGGAAA GAACATTTCC 3070 het 3070 ref 55 39 15 64 N/A 0 0 64137 CASAVA_Build 1 240272874 2I ATAAAATTTA --/AT ATATTCTTTT 3070 het 282 hom 30 3 19 8 AT 2 3 64138 CASAVA_Build 1 240274007 1I8M3D GAAAGAGTTT -TAGGGCTCAGA/GTAGGATTC--- AGAAGATAGA 2630 het 2630 ref 34 33 6 2 N/A 0 0 64139 CASAVA_Build 1 240274177 2D TCATGCCTGT TA/-- TGTCTTAGCA 3070 het 3070 ref 80 31 43 9 TA 1 0 64140 CASAVA_Build 1 240283158 1I CCTTCAGGGG -/A AAAAAACAAG 3070 het 1181 hom 41 7 30 4 A 6 7 64141 CASAVA_Build 1 240285079 4D TGTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 AAAC 4 3 64142 CASAVA_Build 1 240291234 1D GAGGGTGGCA C/- CTTTGGGGAT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 C 2 1 64143 CASAVA_Build 1 240295483 1D GGTATTTGCT C/- TTTTTGTGTC 3070 hom 101 het 41 0 34 7 C 1 0 64144 CASAVA_Build 1 240297090 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 2685 het 2685 ref 27 12 9 6 T 10 11 64145 CASAVA_Build 1 240298212 1D AGGTTATTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 322 hom 33 1 30 3 T 10 9 64146 CASAVA_Build 1 240299733 4D CTTGATTCTT TATG/---- TATGTTTATG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TATG 2 1 64147 CASAVA_Build 1 240314223 1I CCAATGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 17 21 12 T 10 11 64148 CASAVA_Build 1 240318859 1D CGCATAGAGA T/- TTTTTCCTTT 3070 het 3070 hom 29 8 18 3 T 6 5 64149 CASAVA_Build 1 240323914 1D GGAAAGCTTT C/- CACAGGCCGA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 C 2 1 64150 CASAVA_Build 1 240326609 1D GTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1776 het 932 hom 13 4 5 4 T 15 14 64151 CASAVA_Build 1 240334070 2I GCTTCGAGAC --/AG AGTCTTGTTC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 AG 1 2 64152 CASAVA_Build 1 240335743 4I CTCTATCATT ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 56 24 24 8 AG 5 7 64153 CASAVA_Build 1 240337429 3I GAGCTCTACT ---/CTC CTTTTTTTCG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 CTC 0 1 64154 CASAVA_Build 1 240340019 5D ATTATTATAT TATTA/----- TATTATCATA 2395 het 544 hom 7 2 5 0 TATTA 2 1 64155 CASAVA_Build 1 240345582 1D CTCAAAATCT A/- AAAAAAAAAA 1831 het 1831 ref 20 7 4 10 A 13 12 64156 CASAVA_Build 1 240345994 1I AATAATGCCA -/G GGGCATTATA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 3 4 64157 CASAVA_Build 1 240347312 1D CCTCCATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 18 2 15 1 T 14 13 64158 CASAVA_Build 1 240347910 2I TGCTCACATT --/TC TGTTTCAGTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 TC 0 1 64159 CASAVA_Build 1 240357489 1D ATGGAAAACC A/- AACATCATAT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 3 2 64160 CASAVA_Build 1 240360812 1I GATCGATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 T 9 10 64161 CASAVA_Build 1 240364326 2I TTTTTTTTTT --/AA AATAAATAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 2 4 64162 CASAVA_Build 1 240370371 1D GAGTTCGAGA C/- CAGCCTGGGT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 C 2 1 64163 CASAVA_Build 1 240370668 1D CATCGTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 8 8 T 12 11 64164 CASAVA_Build 1 240377596 1D CTTGCTGGAA C/- TTGGTATTTT 3070 het 3070 hom 29 10 19 0 C 1 0 64165 CASAVA_Build 1 240378886 4D ATCTGCAAAT AGAG/---- AGAGTTTTAT 2785 het 2785 ref 25 12 7 9 AG 4 2 64166 CASAVA_Build 1 240389100 1I GAACGCAAAT -/C TTTTTTATGC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 C 0 1 64167 CASAVA_Build 1 240390792 2D CCTGAGCAAC AG/-- AGTGAGAATC 3070 het 3070 hom 19 7 12 2 AG 2 1 64168 CASAVA_Build 1 240390931 5D ATATGGGGAC TTATA/----- TTATCTTTTT 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 TTATA 1 0 64169 CASAVA_Build 1 240391394 1D GTGGGAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 10 9 64170 CASAVA_Build 1 240394329 1I GACAAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2430 hom 23 6 12 5 A 13 14 64171 CASAVA_Build 1 240412303 1I AGTGGTTTTG -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 6 7 64172 CASAVA_Build 1 240415373 4D GAATAGTATG TATT/---- CTTTTCATAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 TATT 1 0 64173 CASAVA_Build 1 240416106 3D TATATATATA TAC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 TAC 1 0 64174 CASAVA_Build 1 240419506 2D CATACTATTG AA/-- CAAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 A 2 0 64175 CASAVA_Build 1 240422749 2D ATGCTTGGGG TC/-- TCTCTTCCTG 3070 het 3070 hom 39 14 24 1 TC 3 2 64176 CASAVA_Build 1 240428377 1I ACTGAAATTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 T 9 10 64177 CASAVA_Build 1 240443787 1D CTAGAATGGG T/- TTTTTTTTTT 2184 het 2184 ref 41 28 5 8 T 12 11 64178 CASAVA_Build 1 240465770 4I TTTAGTGTAG ----/TTCT TTCTCGTGTC 3070 het 3070 ref 61 35 19 7 TTCT 1 2 64179 CASAVA_Build 1 240467243 1I ATGAGTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 24 14 13 A 10 11 64180 CASAVA_Build 1 240471486 1D GAAAAATGAC A/- AATAAGGTGG 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 A 3 2 64181 CASAVA_Build 1 240471717 4I TTACTTATTT ----/CTTA CTATTTGCCT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CTTA 0 1 64182 CASAVA_Build 1 240478407 1D ATACCACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 21 1 18 3 A 11 10 64183 CASAVA_Build 1 240501275 1D ATACCAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2721 hom 21 7 10 5 A 10 9 64184 CASAVA_Build 1 240502423 1I AACTGCCATT -/A AAGAAGCCTG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 2 3 64185 CASAVA_Build 1 240507402 1I GGACAGTAAG -/A AAAAAAACGC 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 7 8 64186 CASAVA_Build 1 240516489 1D TTTATACCCC T/- TCTATATCTC 3070 het 2361 hom 22 6 10 6 T 2 1 64187 CASAVA_Build 1 240526130 2D TCTCCTTTTG AA/-- AAGTGTCTGT 3070 het 3070 ref 48 32 13 6 A 4 2 64188 CASAVA_Build 1 240530377 16D GAGGAGGAAG AAGAAAGAAAGAAAGA/---------------- AAGAAAGAAA 2097 het 2097 ref 14 8 6 5 AAGA 7 3 64189 CASAVA_Build 1 240532468 1I CACAGCAAGA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 2 3 64190 CASAVA_Build 1 240532749 3D TGTTTGTTTT TTC/--- TTCTTCTTAA 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 TTC 3 2 64191 CASAVA_Build 1 240536186 1I CTTGGCAGGT -/A AGTAAAGATT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 1 2 64192 CASAVA_Build 1 240536475 1I ATATATATAT -/A TTTTAACATA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 0 1 64193 CASAVA_Build 1 240537276 3D ATGATGACGG TGA/--- TGATGATGGT 3070 hom 50 het 31 0 17 14 TGA 3 2 64194 CASAVA_Build 1 240539248 3D AACAAAACAG AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AAC 6 5 64195 CASAVA_Build 1 240539601 1D ACTTGGCCTA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 26 het 12 0 9 3 T 8 7 64196 CASAVA_Build 1 240539792 1I ATTTATTGAG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 T 7 8 64197 CASAVA_Build 1 240539984 1D ACCAATTTTT C/- TTTTTTCCAG 3070 hom 93 het 39 0 31 11 C 1 0 64198 CASAVA_Build 1 240541852 3D TTCCTCAGAC TCA/--- TCAATGATTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TCA 2 1 64199 CASAVA_Build 1 240542160 1I ACAGGCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 288 hom 30 1 20 9 T 11 12 64200 CASAVA_Build 1 240543732 7I AGAATGTGCT -------/TCATTGG TCATTGATCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TCATTGG 0 1 64201 CASAVA_Build 1 240545574 1I GGAGGATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 T 10 11 64202 CASAVA_Build 1 240548585 1D GATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2473 het 2205 hom 20 9 6 5 T 13 12 64203 CASAVA_Build 1 240556072 1I AGTGCTGTGA -/T TACAGGTGTG 2918 het 2918 ref 24 11 7 6 T 1 2 64204 CASAVA_Build 1 240558219 15D TATATGTATG TATGTTCTACATATA/--------------- TATGTTCTAC 3070 het 3070 ref 31 11 12 11 TATGTTCTACATATA 2 1 64205 CASAVA_Build 1 240561462 1D CTTCTAACAT C/- CCTTGATTCC 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 C 3 2 64206 CASAVA_Build 1 240571482 2I ATAAAAAGTC --/TA TGTGTGAAGG 3070 hom 45 het 21 0 16 5 TA 0 1 64207 CASAVA_Build 1 240572677 1D ACAAAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 23 1 20 2 A 11 10 64208 CASAVA_Build 1 240575973 1I TATATCATAT -/G TTATATCACA 3070 hom 29 het 12 0 10 2 G 0 1 64209 CASAVA_Build 1 240578180 6D GAAAGAGGAA ACAAAG/------ ACAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 32 23 8 6 ACAAAG 2 1 64210 CASAVA_Build 1 240584742 1I AATTTGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1613 hom 27 7 14 6 T 11 12 64211 CASAVA_Build 1 240586091 2D ATTGAAAGTG AT/-- TATTAAATCC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AT 1 0 64212 CASAVA_Build 1 240586985 1D GTTAGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 11 10 64213 CASAVA_Build 1 240598263 1I AAGCAGCCTC -/A ATTGTCTGGG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 2 64214 CASAVA_Build 1 240603899 1I TAATAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 64215 CASAVA_Build 1 240619973 38D TGAGATGAAG TCTCACTTTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCA/-------------------------------------- TCTCACTTTG 1405 hom 10 het 14 0 4 10 TCTCACTTTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCA 2 1 64216 CASAVA_Build 1 240621766 1D TAAAACATAC A/- AAAGGCAGAG 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 4 3 64217 CASAVA_Build 1 240634649 3I CTTTTACTCA ---/CCT CCTGACTCCA 3070 het 3070 ref 60 29 24 7 CCT 1 2 64218 CASAVA_Build 1 240640337 1D TATAATGCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 10 9 64219 CASAVA_Build 1 240648112 4D ATCTGAGAGG ACAA/---- ACAGAGTCAA 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 ACAA 1 0 64220 CASAVA_Build 1 240653924 2I TCCTCACAAC --/AT GTTTCTTCAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 AT 0 1 64221 CASAVA_Build 1 240659869 3I CCAACTCATG ---/CCC CCCCAACACA 2679 het 2679 ref 30 22 7 1 C 4 7 64222 CASAVA_Build 1 240667612 1D TTTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 12 11 64223 CASAVA_Build 1 240668883 1D ACTCTTATCA C/- CCTGTTAATT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 C 3 2 64224 CASAVA_Build 1 240674652 5D AAATAATATA TATAT/----- TATTTGTATA 471 het 297 hom 4 1 2 1 TATAT 1 0 64225 CASAVA_Build 1 240684257 3I ACTCCGTGTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 2278 hom 29 7 13 9 A 14 17 64226 CASAVA_Build 1 240684572 2D ACGAAATCAT AA/-- AAGAGTTTCT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 A 4 2 64227 CASAVA_Build 1 240690767 1D AAGCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 11 10 64228 CASAVA_Build 1 240692536 1I AAGTTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3003 hom 33 13 14 6 A 11 12 64229 CASAVA_Build 1 240693696 1I CTCTTCTATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 9 10 64230 CASAVA_Build 1 240696870 1I CTGGTTACCA -/G GGGCTGAGTG 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 G 3 4 64231 CASAVA_Build 1 240701210 1I ATAATTTTGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 8 9 64232 CASAVA_Build 1 240710408 1D AATAACCATT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 7 A 8 7 64233 CASAVA_Build 1 240717750 1D TAATTTATAA T/- TCTCTATGTA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 2 1 64234 CASAVA_Build 1 240719301 1D ACATTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 9 11 A 11 10 64235 CASAVA_Build 1 240720792 1D GCGCCTTAGG T/- TTTGCATTCC 3070 het 3070 hom 51 18 22 11 T 4 3 64236 CASAVA_Build 1 240726104 2D GCAATGGGGG AA/-- AAAAATCAGA 3070 het 3070 hom 26 8 14 6 A 7 5 64237 CASAVA_Build 1 240741514 1I TCTAATGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 57 25 20 12 A 11 12 64238 CASAVA_Build 1 240742790 5D CTGAATTCTT TTTTA/----- TTTTTTCTTT 3070 het 3012 hom 36 10 23 3 TTTTA 1 0 64239 CASAVA_Build 1 240743352 1I TTGAGGGCAG -/A AGATAGACAG 3070 het 3070 ref 61 32 25 4 A 1 2 64240 CASAVA_Build 1 240751379 2D GGACAGAGCC CA/-- CACACTGCCA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 CA 3 2 64241 CASAVA_Build 1 240751894 1D TCTTGAATTC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 15 18 2 A 8 7 64242 CASAVA_Build 1 240777380 3I TTTCTCTCTT ---/ATC ATCTTTTCAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ATC 1 2 64243 CASAVA_Build 1 240781921 1D TACAAAACCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 8 64244 CASAVA_Build 1 240788383 1I TTTATCAGGA -/T GACATAATAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 0 1 64245 CASAVA_Build 1 240790606 1I TAGCCTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 40 0 30 10 A 12 13 64246 CASAVA_Build 1 240799726 2I TTGCACTCTC --/TA TGTGTCACTA 3070 hom 153 het 56 0 51 5 TA 0 1 64247 CASAVA_Build 1 240803250 1D CATCAAGTCA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 9 8 64248 CASAVA_Build 1 240823339 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 11 10 64249 CASAVA_Build 1 240825883 5I GCTTCTTTAG -----/AAAGC AAAATTTCTG 3070 het 3070 hom 35 9 23 3 AAAGC 0 1 64250 CASAVA_Build 1 240832470 11I CATAAGTGGA -----------/AGGTAACTATC ATGCACATTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AGGTAACTATC 0 1 64251 CASAVA_Build 1 240840096 1D ACACATTAGC A/- CACTTAATTC 3070 het 3070 hom 59 27 29 4 A 1 0 64252 CASAVA_Build 1 240843230 1D TGCTAGAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 46 18 22 7 A 10 9 64253 CASAVA_Build 1 240849763 1D TTCATGTGCC T/- TTTTTTTTTT 2062 het 2062 ref 36 24 5 8 T 13 12 64254 CASAVA_Build 1 240853735 4D GAAGACAGTT CTTA/---- CTTTGGGGGA 3070 het 3070 hom 59 25 28 7 CTTA 1 0 64255 CASAVA_Build 1 240854234 1D TGGAAGTTAC A/- AAAAAAAAAA 2076 het 2076 ref 34 15 10 9 A 11 10 64256 CASAVA_Build 1 240868248 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 1860 hom 12 het 5 0 5 0 A 8 9 64257 CASAVA_Build 1 240876444 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2349 hom 21 8 8 5 A 11 12 64258 CASAVA_Build 1 240886094 8D TATTTGTTAC TTAGACCT/-------- CAAGCCCTTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TTAGACCT 1 0 64259 CASAVA_Build 1 240886959 1I CAAAAATTCA -/G AAGAAAACTC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 0 1 64260 CASAVA_Build 1 240889071 4I CTGTTAGAGA ----/GAGT AAGGATGGAA 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 GAGT 0 1 64261 CASAVA_Build 1 240897647 1I ATGTATATGG -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 T 6 7 64262 CASAVA_Build 1 240904314 1D CATGTTGGCC A/- GGCTGGTCTC 2052 het 1778 hom 13 5 6 2 A 1 0 64263 CASAVA_Build 1 240906463 1I GTTGACAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 9 10 64264 CASAVA_Build 1 240909581 8D GAAGAAAGGA AGGGAGGG/-------- AGGGAGGGAG 3070 het 1729 hom 21 5 14 2 AGGG 4 2 64265 CASAVA_Build 1 240913670 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 482 hom 15 2 11 2 A 12 13 64266 CASAVA_Build 1 240914208 12D TATACATATA ATATATATACAT/------------ ATATATATAC 1531 hom 10 het 6 0 4 2 ATATATATACAT 2 1 64267 CASAVA_Build 1 240914280 8D ATATATATAT ATATATAC/-------- ATACACACAC 907 hom 15 het 9 0 5 11 ATATATAC 1 0 64268 CASAVA_Build 1 240920830 4D GTACCCCTAC AACT/---- AACCCACTAC 3070 hom 120 het 44 0 41 7 AACT 1 0 64269 CASAVA_Build 1 240950726 7D ATGTAAGATG TGCCTTC/------- TGCCTTCTGC 3070 het 3070 ref 40 26 8 7 TGCCTTC 3 2 64270 CASAVA_Build 1 240951135 1D AAAAAGAAAA G/- AAAAAGAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 G 1 0 64271 CASAVA_Build 1 240953776 1D TCATTTTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 10 9 64272 CASAVA_Build 1 240960173 1I CAATTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 A 14 15 64273 CASAVA_Build 1 240975050 1I TGGAAAATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 8 9 64274 CASAVA_Build 1 240977202 4D ACATGCGCAC ACAG/---- AGACACACAC 3070 het 1424 hom 70 8 40 23 ACAG 1 0 64275 CASAVA_Build 1 240977224 2D ACATGCACAC AT/-- GTACACAAGA 3070 het 2286 hom 68 12 24 33 AT 1 0 64276 CASAVA_Build 1 240978418 1D TGAAAAATAG A/- ATTAAAAACT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 1 64277 CASAVA_Build 1 240980940 15D TGCTCTCAAG GGACTTACACTCTAA/--------------- GTAAGAGACA 3070 het 3070 ref 36 23 13 6 GGACTTACACTCTAA 1 0 64278 CASAVA_Build 1 240985936 2D9M22D61M1I TAAAATATAA CTCTCTTTCTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGCCATCAATCCTGTAATCTTATATTAGTCATACCAGAACAGGTTA-/--CTCTTTCTG----------------------TATATATATATATATGGCCATCAATCCTGTAATCTTATATTAGTCATACCAGAACAGGTTAT ATAGGTTATA 3070 hom 132 het 29 0 45 5 N/A 0 0 64279 CASAVA_Build 1 240988631 1I CGTGAACTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 476 hom 33 2 27 4 A 11 12 64280 CASAVA_Build 1 240995350 4D GCAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 7 AAAC 3 2 64281 CASAVA_Build 1 241000776 1I TTGAGCCTTA -/T TATCAATCTT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 1 2 64282 CASAVA_Build 1 241003111 1D TTATTGGTTT A/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 1 0 64283 CASAVA_Build 1 241005238 1I TTTTAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 11 12 64284 CASAVA_Build 1 241007264 1I AAAACTGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 33 0 24 9 T 10 11 64285 CASAVA_Build 1 241013352 1I ATACGCCAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 32 hom 37 1 28 8 T 9 10 64286 CASAVA_Build 1 241015589 4I ATATCAAGAG ----/TTTT TAAAAAGGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 5 64287 CASAVA_Build 1 241025614 4D CCTTTTGTTT CTTG/---- CTTATTTTCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 CTTG 1 0 64288 CASAVA_Build 1 241027436 2I ACCAAACACC --/CA GTCTTTCAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 CA 0 1 64289 CASAVA_Build 1 241032899 1I AAAACACTGA -/T TTTTTTACGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 7 64290 CASAVA_Build 1 241037052 1D CTTAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 48 het 19 0 17 6 A 7 6 64291 CASAVA_Build 1 241070738 1I GGTTAAGACT -/A GAGTAAGAAG 3070 hom 144 het 52 0 48 4 A 0 1 64292 CASAVA_Build 1 241074006 2D CCTCAGGTGA TC/-- TCTGCCCGCC 3070 hom 57 het 22 0 19 4 TC 2 1 64293 CASAVA_Build 1 241074515 1D GATCTTTTTT A/- TAATGGAATT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 1 0 64294 CASAVA_Build 1 241074673 1I AAAGTTGCCT -/G GGGGGGGTTC 3070 het 10 hom 29 1 23 5 G 7 8 64295 CASAVA_Build 1 241078273 2D73M1D CCTATTGATC AGAGAGAGAATTTTTCTATAAAGCAAAATTTGGATCTTTTCATCCCTCATGTATGAAACATCCTATAAATCTGACA/--AGAGAGAATTTTTCTATAAAGCAAAATTTGGATCTTTTCATCCCTCATGTATGAAACATCCTATAAATTTGAC- AAACATAATT 3070 hom 160 het 36 0 54 4 N/A 0 0 64296 CASAVA_Build 1 241080618 1I CTAATTCTGT -/G AAGAATAATG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 0 1 64297 CASAVA_Build 1 241083146 7D GTTTTCTGTC TTTGTTT/------- TTTAACTTCT 3070 hom 93 het 29 0 32 1 TTTGTTT 1 0 64298 CASAVA_Build 1 241084237 3D GTCTGAAGGC TGT/--- TGTTCAGATT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TGT 2 1 64299 CASAVA_Build 1 241089579 1D GTCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 454 hom 20 1 16 3 A 10 9 64300 CASAVA_Build 1 241090350 5I GTTATAGCAG -----/GAAAA GAAAAGTAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 GAAAA 1 2 64301 CASAVA_Build 1 241091164 2D AGAGGTGATT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 77 het 46 1 40 5 A 11 9 64302 CASAVA_Build 1 241091709 1D CCTGCTGGAT A/- ACAGCATCTT 3070 hom 74 het 26 0 25 1 A 2 1 64303 CASAVA_Build 1 241093705 1I CTGGTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 12 15 T 13 14 64304 CASAVA_Build 1 241105375 11D CCTGTCTTTT AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 26 1 16 11 A 27 16 64305 CASAVA_Build 1 241108985 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 964 hom 28 4 12 12 T 17 16 64306 CASAVA_Build 1 241110105 1D TCATGCTTGC T/- TTTTTAATTT 1931 hom 21 het 9 0 8 2 T 6 5 64307 CASAVA_Build 1 241113429 3I AACTGTTTGG ---/TGC TGCTGCTGCT 3070 het 36 hom 50 1 36 13 TGC 5 6 64308 CASAVA_Build 1 241115418 1D CTAAAAGTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3034 hom 21 8 12 1 A 10 9 64309 CASAVA_Build 1 241119121 1I GTCATGAAGA -/C AGAGACCACA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 0 1 64310 CASAVA_Build 1 241119205 10D AGGACACAGT AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 15 2 A 24 14 64311 CASAVA_Build 1 241134333 2I AAAACACAAC --/AT ATCAAAACTT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 AT 1 2 64312 CASAVA_Build 1 241142430 2I TTCTGCATCC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 TA 7 8 64313 CASAVA_Build 1 241147345 1D AAGCAAACAG C/- CCTGAGTTGG 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 C 3 2 64314 CASAVA_Build 1 241155967 2I GCGAAAATAA --/CT CTGAAGACCT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 CT 1 2 64315 CASAVA_Build 1 241176237 1D CCATGGCAAA C/- CCCCACATCA 3070 hom 127 het 46 0 41 5 C 5 4 64316 CASAVA_Build 1 241193829 2D TTTGTGTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 19 9 T 14 12 64317 CASAVA_Build 1 241196751 1D TCCAGAAAAG A/- AAAAACAAAA 3070 hom 101 het 37 0 34 3 A 6 5 64318 CASAVA_Build 1 241199137 1D GCATTCCCCC T/- CCACTCCTTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 1 0 64319 CASAVA_Build 1 241205116 44D CTAGAGCTTG TCTCAATGGATCTAGACCTTCATCGCCCTCTGATCGCCGATCAC/-------------------------------------------- CTCTGAGACC 2654 het 228 hom 7 1 6 2 TCTCAATGGATCTAGACCTTCATCGCCCTCTGATCGCCGATCAC 1 0 64320 CASAVA_Build 1 241206531 3I TATTTAAATC ---/AGT ACTATTCTTA 1316 het 1316 ref 44 33 3 8 AGT 0 1 64321 CASAVA_Build 1 241212110 5D GACCCGTCCG CCCCT/----- CCCCTCCCCT 3070 het 26 hom 27 2 16 9 CCCCT 5 4 64322 CASAVA_Build 1 241214331 1D TTTTGCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 27 1 21 5 A 12 11 64323 CASAVA_Build 1 241238996 1I TTAAGTTTTA -/G GGTACATGTG 2709 hom 15 het 6 0 6 0 G 2 3 64324 CASAVA_Build 1 241241439 1I GAGCTGGGGG -/T GTGGAGGGAC 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 T 0 1 64325 CASAVA_Build 1 241251641 1D CTATTTGGGG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 28 het 19 0 9 10 T 8 7 64326 CASAVA_Build 1 241254372 1I TATTTTCTTC -/T TTTTCCTTAC 3070 het 71 hom 22 1 16 5 T 4 5 64327 CASAVA_Build 1 241255039 1I TACAGTTATC -/A TTGTCATTAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 0 1 64328 CASAVA_Build 1 241274244 1I CTTAGGTCAG -/A AAAAAAAAAG 2716 hom 21 het 11 0 7 4 A 9 10 64329 CASAVA_Build 1 241299234 3D ATTAATGTTG CTC/--- ATCAGTTGAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CTC 1 0 64330 CASAVA_Build 1 241306947 1D TGGGAAACCC T/- GATTTCTAAC 1873 hom 12 het 5 0 5 0 T 1 0 64331 CASAVA_Build 1 241314924 2I AACAATAATC --/TA TGAGTTCATA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TA 0 1 64332 CASAVA_Build 1 241336569 2I ATCAAATCAT --/CA CATTGTACCC 1866 het 1866 ref 39 33 4 2 CA 1 2 64333 CASAVA_Build 1 241338544 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1026 het 1026 ref 26 18 4 4 A 15 14 64334 CASAVA_Build 1 241340585 1I AACTCTATTC -/A AAAATTCGTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 4 5 64335 CASAVA_Build 1 241342759 1I GGGCTCAAGC -/A ATCCTCCTGC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 1 2 64336 CASAVA_Build 1 241343790 5I TATACAGAAT -----/TTTAA TTTGTCAATT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TTTAA 0 1 64337 CASAVA_Build 1 241349186 1I TCTTCTTTTT -/C CTTTTTTTTT 3070 het 723 hom 20 3 15 2 C 1 2 64338 CASAVA_Build 1 241379087 1I TAAAATGTAG -/A AAAGATTCTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 3 4 64339 CASAVA_Build 1 241385284 3D GAGTAAAAGT TTC/--- TTGTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TTC 1 0 64340 CASAVA_Build 1 241386752 1D TGAATTTTTC A/- AAAAAAAAAA 1896 het 1896 ref 32 23 4 5 A 11 10 64341 CASAVA_Build 1 241387310 1I AAATAGAGGT -/A AAAAAGAGAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 5 6 64342 CASAVA_Build 1 241389363 3I TCAAAACTTT ---/TTG CTTTCTTAAC 2580 het 2580 ref 36 27 6 3 TTG 0 1 64343 CASAVA_Build 1 241393718 3I GAAAAAAAAG ---/AAC AAAACATTGA 2832 het 2832 ref 31 20 6 5 AAC 0 1 64344 CASAVA_Build 1 241398919 2D AATTTTAACT TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TA 6 5 64345 CASAVA_Build 1 241399508 2D AAATGGAGAA AG/-- AGAAGAAAAA 3070 het 584 hom 21 2 13 7 AG 2 1 64346 CASAVA_Build 1 241400156 1I ACTAAAAATA -/C AAAAATTAGC 2685 hom 18 het 7 0 7 0 C 0 1 64347 CASAVA_Build 1 241405731 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 30 het 14 0 9 5 T 9 8 64348 CASAVA_Build 1 241406416 4I GATACATCTC ----/TATT TGTGGAGTGA 3070 hom 90 het 36 0 29 7 TATT 0 1 64349 CASAVA_Build 1 241436307 1D TCCGCTTGCC T/- TCAGCCTCCC 3070 hom 39 het 16 0 13 4 T 2 1 64350 CASAVA_Build 1 241442614 2I TTTTCTTTCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 69 het 36 0 24 12 TC 7 8 64351 CASAVA_Build 1 241456121 8D TATATATATC TAGATATA/-------- TATATATCTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TAGATATA 1 0 64352 CASAVA_Build 1 241457192 1I ATCATTGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 983 hom 43 3 28 12 A 12 13 64353 CASAVA_Build 1 241463338 1I ACACAGGTTT -/C AAAATTACAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 0 1 64354 CASAVA_Build 1 241465606 1I CATTAAAACT -/A AAAAAAAAAA 2104 het 2104 ref 33 20 7 6 A 15 16 64355 CASAVA_Build 1 241470559 2D GGTATCTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 1422 het 1119 hom 38 10 5 25 T 16 14 64356 CASAVA_Build 1 241471718 1D CCCTCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 20 1 15 6 A 15 14 64357 CASAVA_Build 1 241474680 1I CACAAAAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 81 hom 27 1 20 6 A 9 10 64358 CASAVA_Build 1 241476550 4D CCACATTAAA AGTT/---- AGAGCCAGAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AGTT 1 0 64359 CASAVA_Build 1 241484451 3D CTGACCTCGC CAA/--- CCGCCTCACA 3070 hom 73 het 28 0 22 6 CAA 1 0 64360 CASAVA_Build 1 241488118 1I TAAACAACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 10 64361 CASAVA_Build 1 241493437 3D GCTAGGTTTA CTT/--- CTTTTATCAG 3070 hom 111 het 39 0 38 3 CTT 2 1 64362 CASAVA_Build 1 241524630 1I TTCCCCCCCC -/A CCCCCACAGC 3070 het 375 hom 36 1 27 8 A 0 1 64363 CASAVA_Build 1 241532273 1D ACTCTGGGGG A/- AAAAATGTCA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 6 5 64364 CASAVA_Build 1 241533998 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 12 11 64365 CASAVA_Build 1 241539795 1D TGTTTGTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 1 0 64366 CASAVA_Build 1 241541008 1I TACCCTCAAG -/A AAAAAACTCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 6 7 64367 CASAVA_Build 1 241541693 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 29 10 A 11 10 64368 CASAVA_Build 1 241561801 3D ACAAACTCGT AGG/--- AGAAGTAGAT 3070 hom 124 het 48 0 40 10 AGG 1 0 64369 CASAVA_Build 1 241565709 4I ACCCCTACCC ----/CACT CACTCCCTCC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 CACT 1 2 64370 CASAVA_Build 1 241574304 1I TATGAGTAAC -/A ATTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 A 1 2 64371 CASAVA_Build 1 241575693 1D GTAAAGGAAT A/- ACTTGTTTAG 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 2 1 64372 CASAVA_Build 1 241598137 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 16 8 A 13 12 64373 CASAVA_Build 1 241601671 1D CTAGCTTGGA G/- AATGAGTCTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 G 1 0 64374 CASAVA_Build 1 241607756 1I CTGCCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 23 1 18 4 T 11 12 64375 CASAVA_Build 1 241627531 2D AGAATAGATG CC/-- GTTGGTTGCT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 C 2 0 64376 CASAVA_Build 1 241678674 1I TTAGACTGTG -/A ACTCCTTAAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 1 2 64377 CASAVA_Build 1 241685562 1I TAATAAATGA -/C CCTAATTCAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 C 2 3 64378 CASAVA_Build 1 241692574 1I TTACATTGTA -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 7 8 64379 CASAVA_Build 1 241773384 1D TTTCCTCTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 96 het 40 0 31 10 T 9 8 64380 CASAVA_Build 1 241795799 4I AAATATGCTT ----/AATA TATAAATATA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AATA 0 1 64381 CASAVA_Build 1 241802834 1D TTTTGATTAC T/- TTTTTTTTTT 1671 het 1671 ref 35 23 5 7 T 15 14 64382 CASAVA_Build 1 241812926 1D AACAGCAGTT A/- AAAAAAAAAA 1428 het 1428 ref 34 21 4 9 A 12 11 64383 CASAVA_Build 1 241813472 11D TCTCAAAAAA AAAAAAAAAAG/----------- AAAAAAAAAA 1879 het 133 hom 19 3 9 8 AAAAAAAAAAG 2 1 64384 CASAVA_Build 1 241841609 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 52 1 38 13 A 11 12 64385 CASAVA_Build 1 241843114 2D ATATATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AC 6 5 64386 CASAVA_Build 1 241848811 3D GGGCAAACAA GAG/--- GAGAAAAAGA 3070 hom 132 het 46 0 45 3 GAG 2 1 64387 CASAVA_Build 1 241850432 9D28M6D AACAAGCCAT ATGTTAGCAATGTATACTTTTTTTTTTCCTGCCAGAGGAGACA/---------ATGTATACTTTTTTTTTTCCTGCCAGAG------ TGTCACACTT 3070 hom 45 het 11 0 16 1 N/A 0 0 64388 CASAVA_Build 1 241860742 1D CTAAAAACTG A/- ACGCCAATTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 2 1 64389 CASAVA_Build 1 241860900 1I AAATAGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1178 hom 47 3 34 10 T 12 13 64390 CASAVA_Build 1 241889396 1I CATTTTTGTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 8 9 64391 CASAVA_Build 1 241898977 10D ACCAAAGACA TTATACTAAT/---------- TTATACTAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTATACTAAT 2 1 64392 CASAVA_Build 1 241924423 1D AATATCTATA T/- TAAGAATCCA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 2 1 64393 CASAVA_Build 1 241948569 1I CTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 10 11 64394 CASAVA_Build 1 241978279 1D AATGGGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 A 11 10 64395 CASAVA_Build 1 241998932 8D ATTCTCCATT CCCTCATC/-------- CCCTCATCTC 3070 hom 114 het 41 0 39 4 CCCTCATC 2 1 64396 CASAVA_Build 1 242001628 4D CAAAAGGTTC AAGT/---- AAGACTAATC 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 AAGT 1 0 64397 CASAVA_Build 1 242013096 4I GGGGTCCCTA ----/GATC GATCGGTTCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 GATC 1 2 64398 CASAVA_Build 1 242021213 1D GTAACCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 25 10 T 12 11 64399 CASAVA_Build 1 242022083 2I AAACAATAAT --/AA AAGTCATTTA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 2 4 64400 CASAVA_Build 1 242022233 1D TTATTCACTT A/- ACTCAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 2 1 64401 CASAVA_Build 1 242056971 1I ATAAGGAAGG -/A AAAAAACTCA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 6 7 64402 CASAVA_Build 1 242071106 1D TTCTTATTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 9 8 64403 CASAVA_Build 1 242081848 4D AACACAGTCC GTCT/---- GAGAGAAAGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 GTCT 1 0 64404 CASAVA_Build 1 242101219 2D TCTCTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TC 11 10 64405 CASAVA_Build 1 242103065 5I TATTGATCTT -----/ATATC ATAGGACTTT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 ATATC 0 1 64406 CASAVA_Build 1 242104909 1I TTGGTATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1758 hom 32 7 18 7 T 13 14 64407 CASAVA_Build 1 242183749 1D CATGAAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 760 hom 27 2 15 10 T 15 14 64408 CASAVA_Build 1 242186420 1D CATTAATGAG C/- CTATGTGAGC 3070 het 3070 hom 74 24 41 9 C 2 1 64409 CASAVA_Build 1 242188290 1I AAAGAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 18 1 15 2 A 11 12 64410 CASAVA_Build 1 242197988 2I AGGGACCAGG --/GT GACTGGACAA 3070 hom 150 het 57 0 49 8 GT 0 1 64411 CASAVA_Build 1 242201675 3D TTTTCTTTCT TTG/--- TTGTTTCTTT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 TTG 2 1 64412 CASAVA_Build 1 242205226 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 692 hom 46 2 34 12 A 11 10 64413 CASAVA_Build 1 242217132 2I AAAATTTCAA --/AG AGTCAAAGGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AG 1 2 64414 CASAVA_Build 1 242227917 1D GGCCATACTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 79 het 29 0 27 2 T 9 8 64415 CASAVA_Build 1 242229405 1D TGGACATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 25 12 T 11 10 64416 CASAVA_Build 1 242229957 8D CTGACTATGA TGATCTGT/-------- TTGGTTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 TGATCTGT 1 0 64417 CASAVA_Build 1 242231046 2I AAAAGTGAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 30 1 24 5 T 12 14 64418 CASAVA_Build 1 242240192 1D TGGCATGTCC A/- ATGCCTGATG 3070 hom 99 het 39 0 32 9 A 2 1 64419 CASAVA_Build 1 242240758 1D GTGCTGCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 44 0 35 9 A 11 10 64420 CASAVA_Build 1 242247822 1I TTTTTTTCAC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 T 7 8 64421 CASAVA_Build 1 242256365 1D TCTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 340 hom 18 1 13 4 A 15 14 64422 CASAVA_Build 1 242261807 1I GTTAAGTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 9 10 64423 CASAVA_Build 1 242267647 1I GTTATAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 71 het 27 0 24 3 A 9 10 64424 CASAVA_Build 1 242274952 5D AGCTGAGTTT CTAAG/----- CTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 33 11 20 3 CTAAG 1 0 64425 CASAVA_Build 1 242280360 1I ATTAGAGTGA -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 83 het 33 0 22 11 C 9 10 64426 CASAVA_Build 1 242286517 4D GGTCGTTCTC TCTT/---- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 24 11 13 1 TCTT 1 0 64427 CASAVA_Build 1 242288204 1I TGCTTGTCTC -/T TAACTTCCAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 T 1 2 64428 CASAVA_Build 1 242289458 1I ACATATAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 37 0 33 4 T 10 11 64429 CASAVA_Build 1 242290285 1D TGAAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 12 11 64430 CASAVA_Build 1 242292997 4D CCACAGAGAG TGAT/---- TGATTGAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 12 8 TGAT 2 1 64431 CASAVA_Build 1 242296102 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2885 het 2748 hom 24 10 8 6 T 14 12 64432 CASAVA_Build 1 242299922 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAGTAC 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 A 7 6 64433 CASAVA_Build 1 242304761 16I AGTAGCCCAG ----------------/GCTGCGAAAGCAACAA GCTGCAAAAC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 GCTGCGAAAGCAACAA 0 1 64434 CASAVA_Build 1 242308204 1D TCAGCTAATT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 109 het 40 0 34 7 A 8 7 64435 CASAVA_Build 1 242312023 1I AAGTCCTCGT -/G CCTTCTTTCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 64436 CASAVA_Build 1 242340591 1I TTTAGAAATC -/A GTTTTTTTTT 3070 hom 119 het 49 0 38 11 A 0 1 64437 CASAVA_Build 1 242340756 1D TCTAAAAAAG A/- AATATTTTCT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 3 2 64438 CASAVA_Build 1 242349709 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2783 het 1520 hom 24 8 11 5 A 17 16 64439 CASAVA_Build 1 242362522 1D TTCCTAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 12 11 64440 CASAVA_Build 1 242377316 3D GATAGGGAAG AGA/--- AGGTCAAGAA 3070 hom 114 het 41 0 39 5 AGA 1 0 64441 CASAVA_Build 1 242386864 1D TCCCTTTCTT C/- CCCCTCCATC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 5 4 64442 CASAVA_Build 1 242400769 1I GATTTGATAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 64443 CASAVA_Build 1 242403082 1I TTTAAAAAAT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 A 7 8 64444 CASAVA_Build 1 242430054 1I AGGAGTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 30 0 19 11 A 11 12 64445 CASAVA_Build 1 242442751 2D GGGTGCAGTG TT/-- TCTAGGGAAG 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 T 3 1 64446 CASAVA_Build 1 242448179 1I ACCCTGCCCT -/C GAAGGAGGAA 3070 hom 117 het 46 0 38 8 C 0 1 64447 CASAVA_Build 1 242449198 1I GTGTTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 142 hom 29 1 25 3 A 10 11 64448 CASAVA_Build 1 242453174 1D CTGATGATGT G/- GGGGCCTCAA 3070 hom 113 het 42 0 35 8 G 5 4 64449 CASAVA_Build 1 242453303 4D CCATTCTCCA TCCT/---- TCCTTGTCTC 3070 hom 144 het 52 0 48 5 TCCT 2 1 64450 CASAVA_Build 1 242455218 2I TGCCCAGCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 10 12 64451 CASAVA_Build 1 242467058 1I ATTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 611 hom 42 4 33 5 T 11 12 64452 CASAVA_Build 1 242473332 4D TCTGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAAT 6 5 64453 CASAVA_Build 1 242477217 5D GAAGCCAAGA AAAAG/----- CCAGCATCTT 3070 hom 126 het 44 0 42 5 AAAAG 1 0 64454 CASAVA_Build 1 242491003 2D GAAAAAATCT TA/-- TAAGCTATAA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 TA 2 1 64455 CASAVA_Build 1 242493401 3D5M4I AGGAAGGGAG GCAGGAAA----/---GGAAAAAGG GAAGGAAGGG 3070 het 378 hom 26 4 17 6 N/A 0 0 64456 CASAVA_Build 1 242493899 2I81M1I TGATCATTTC --GAAATGCAGAGGATAATTTGATGAAATTCAACATTCATTCATGACATAAATGCTTGGCAACCTAGAAGTAGAGGGACACTA-/AATAAATGCAGAGGATAATTTGATGAAATTCAACATTCATTCATGACATAAATGCTTGGCAACCTAGAAGTAGAGGGACACTAC CTAAAACTGA 3070 hom 141 het 25 0 48 7 N/A 0 0 64457 CASAVA_Build 1 242496929 1D GTAAAACAGG A/- AAAAAATGAT 3070 het 30 hom 31 1 23 7 A 7 6 64458 CASAVA_Build 1 242497631 8D CATGTGCACG CACACACA/-------- CACACACACA 2107 het 278 hom 30 5 6 22 CA 13 9 64459 CASAVA_Build 1 242500092 1I AGACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1114 hom 26 3 17 6 A 14 15 64460 CASAVA_Build 1 242512525 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 22 1 13 10 A 16 15 64461 CASAVA_Build 1 242514090 1I ACCTATTCCA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 6 7 64462 CASAVA_Build 1 242517030 12D CTCCCAAAGT GCTGGGATTACA/------------ GGCGTGAGCC 3070 hom 38 het 14 0 11 7 GCTGGGATTACA 1 0 64463 CASAVA_Build 1 242523542 3I ACAGCTAGAT ---/AGG AGGACTAAGT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 AGG 1 2 64464 CASAVA_Build 1 242525255 1I TTCATCTTTC -/T TTTTTATTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 5 6 64465 CASAVA_Build 1 242537344 2I ATAATAACGT --/TA TATATACTTT 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 TA 3 4 64466 CASAVA_Build 1 242550658 1I CTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2551 hom 25 7 15 3 A 10 11 64467 CASAVA_Build 1 242561407 2I GCATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AC 5 6 64468 CASAVA_Build 1 242561417 2D ACACACACAC AT/-- ACATACATAC 1888 het 404 hom 26 4 9 13 AT 1 0 64469 CASAVA_Build 1 242574585 1I AAATTGGTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 17 14 2 A 9 10 64470 CASAVA_Build 1 242584115 1I CATAACATCA -/G AGTCTTGGGA 3070 het 3070 hom 46 14 21 11 G 0 1 64471 CASAVA_Build 1 242588508 1D AGAGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2899 het 2899 ref 28 11 10 8 A 14 13 64472 CASAVA_Build 1 242608778 3D GAGACTTCAG GGA/--- GGATGGAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 GGA 2 1 64473 CASAVA_Build 1 242612142 1D GCCAAGTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 9 12 T 13 12 64474 CASAVA_Build 1 242615671 1I GATCAAGAAT -/A AATGTATGCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 2 3 64475 CASAVA_Build 1 242617437 3I AGAGTGGGTG ---/GAT TAGACATGTG 3070 het 3070 ref 54 29 18 7 GAT 0 1 64476 CASAVA_Build 1 242626722 4D AAAGAGAAAC AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 2746 hom 33 11 16 8 AGAA 5 4 64477 CASAVA_Build 1 242630846 1I TGTTATCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 10 11 64478 CASAVA_Build 1 242635625 1D TTAAGTTATA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 37 12 21 5 T 8 7 64479 CASAVA_Build 1 242639256 1I CTAAACATTG -/A AAAAAAAAAA 2446 het 2446 ref 32 17 6 9 A 10 11 64480 CASAVA_Build 1 242640440 1D TTTTCTTACA T/- TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 7 6 64481 CASAVA_Build 1 242644111 4I CACAATGTCT ----/AATA GTCAACCAAT 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 AATA 0 1 64482 CASAVA_Build 1 242650425 1I AAAGAGCATT -/A GCTCAACAAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 0 1 64483 CASAVA_Build 1 242650956 21D AAATGTGGTG AGGGCCACGAGTTACACTGCC/--------------------- AGGGCCACGA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 AGGGCCACGAGTTACACTGCC 2 1 64484 CASAVA_Build 1 242659915 1D TTTTAAAGCA T/- TAACACACCC 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 2 1 64485 CASAVA_Build 1 242662586 3D TCTTAATTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1365 het 370 hom 17 3 5 9 T 21 18 64486 CASAVA_Build 1 242668524 2I CTGATTACAC --/AT GTTTAAACTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AT 0 1 64487 CASAVA_Build 1 242675574 1I AGGGGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 1828 het 1828 ref 37 22 7 8 A 13 14 64488 CASAVA_Build 1 242676595 4I CTTAGGTTCC ----/TAAT TAAGAAGCTT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 TAAT 0 1 64489 CASAVA_Build 1 242685524 4D CCTTTATGTT TCTC/---- TCTTCTTGGA 3070 het 3070 ref 19 9 7 3 TC 3 1 64490 CASAVA_Build 1 242694887 1I TACTTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1345 hom 24 3 18 3 A 12 13 64491 CASAVA_Build 1 242763815 3I GATTGCTCAC ---/TAA TGTCTTTTTC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TAA 0 1 64492 CASAVA_Build 1 242764556 1I CTTCAATCTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 8 64493 CASAVA_Build 1 242766861 2D GTTCCAGGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 5 T 12 10 64494 CASAVA_Build 1 242768861 16D CACCAGAGGG ACTAGCCAACAGCATC/---------------- ACTAGCCAAC 3070 hom 111 het 40 0 33 10 ACTAGCCAACAGCATC 2 1 64495 CASAVA_Build 1 242773998 12D CAAAATATAC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAGTG 3070 hom 105 het 36 0 36 2 A 19 7 64496 CASAVA_Build 1 242776859 2I AATAGGAAAC --/TT TTTTGAAACC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 6 64497 CASAVA_Build 1 242779349 2I TGTATGTCTA --/TC TATATATATA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TC 0 1 64498 CASAVA_Build 1 242784646 1I TTAAATGGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 9 64499 CASAVA_Build 1 242812836 52D ACAGAATTTG ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 69 het 24 0 23 7 AT 33 7 64500 CASAVA_Build 1 242821949 1D CATACAAGAA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 8 7 64501 CASAVA_Build 1 242822919 2D AGGAAACATC TG/-- AAGTTTTAAA 3070 hom 160 het 59 0 54 6 TG 1 0 64502 CASAVA_Build 1 242830297 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 49 het 37 0 18 19 AG 7 8 64503 CASAVA_Build 1 242848531 2I TATGGAGAAA --/CT CTGTCTCTAC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 CT 1 2 64504 CASAVA_Build 1 242848661 4D GAGATTGCGC CATT/---- CATTGCACTC 3070 hom 75 het 27 0 26 3 CATT 2 1 64505 CASAVA_Build 1 242858448 1I CCCCAAATTT -/C CAGATCTACT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 2 64506 CASAVA_Build 1 242861215 1I TCTCTAAAAT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 8 9 64507 CASAVA_Build 1 242862319 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1188 hom 19 3 14 2 A 16 17 64508 CASAVA_Build 1 242869829 2D TTCTAATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 27 8 T 14 12 64509 CASAVA_Build 1 242870114 3I ATATAAGCTC ---/GTA GTAGTAGGCA 3070 hom 103 het 39 0 35 4 GTA 2 3 64510 CASAVA_Build 1 242870445 1D CCTAAACAGA T/- TTTTTTCTAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 6 64511 CASAVA_Build 1 242877695 2D CTTCAGAAAC TG/-- TTTTAAGCTG 3070 hom 120 het 43 0 41 3 TG 1 0 64512 CASAVA_Build 1 242882777 1I TAGTAGCAAG -/A GGGGAATCCT 3070 het 2899 hom 31 9 16 6 A 0 1 64513 CASAVA_Build 1 242888592 1D AGTTGCCAGT A/- ACTTAAATGG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 1 64514 CASAVA_Build 1 242888958 1D GTCATCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 33 1 14 18 T 15 14 64515 CASAVA_Build 1 242890085 3D TTTTCTTTTT TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 TTG 3 2 64516 CASAVA_Build 1 242893466 1I ACACGGGAAC -/A AAAATCAGGC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 4 5 64517 CASAVA_Build 1 242900574 4D GGACAGAGAG GTAA/---- GTAACTATCT 3070 hom 105 het 40 0 35 7 GTAA 2 1 64518 CASAVA_Build 1 242906010 1I ATACAATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 22 0 12 10 T 10 11 64519 CASAVA_Build 1 242913797 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1800 het 1800 ref 29 15 5 9 T 15 14 64520 CASAVA_Build 1 242914470 1D GATCTTTTTA T/- TTTATGTGGT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 4 3 64521 CASAVA_Build 1 242918630 4I GATGGGAGGG ----/TGGA TGGATGGGTA 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 TGGA 1 2 64522 CASAVA_Build 1 242926811 4I TTTTGGCAGA ----/GGAC GGACGCCTGC 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 GGAC 1 2 64523 CASAVA_Build 1 242934473 1D TGGCACTTGT A/- TTCTATCCCG 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 1 0 64524 CASAVA_Build 1 242943616 1I ATTTCAGTTA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 6 7 64525 CASAVA_Build 1 242944269 4D ATGAAGTCTT ACTC/---- AGCCCTCTCT 3070 het 3070 ref 28 17 11 3 ACTC 1 0 64526 CASAVA_Build 1 242945116 5I AAGGAAAGAA -----/AAGAT AAGATCAGAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 AAGAT 1 2 64527 CASAVA_Build 1 242947055 2D58M4D TGTATGTGTG TATATATATATATATCTATATACACACATATATACATATATATATCAACTTTGGTTTTTCTGTT/--TATATATATATATCTATATACACACATATATACATATATATATCAACTTTGGTTTTTC---- TGTTTGCTTG 3070 het 3070 ref 28 28 16 6 N/A 0 0 64528 CASAVA_Build 1 242947923 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 A 12 11 64529 CASAVA_Build 1 242949114 1I ACTGGGCAGT -/G GGGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 G 7 8 64530 CASAVA_Build 1 242968256 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 1422 hom 10 het 5 0 4 1 A 9 8 64531 CASAVA_Build 1 242976341 1D CTTGAGAAAC A/- ACTCAGAAAC 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 A 2 1 64532 CASAVA_Build 1 242976936 1D GTGGTGAGCC A/- AGATCGCACC 3070 het 824 hom 12 3 8 2 A 2 1 64533 CASAVA_Build 1 242984336 1D TTTCTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 33 0 25 8 T 11 10 64534 CASAVA_Build 1 242985278 5D TTTTTGTGTA TTTAT/----- TTTATTTTAT 3070 het 1578 hom 19 4 13 2 TTTAT 4 3 64535 CASAVA_Build 1 242988478 3D CCTGCTAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 2776 het 594 hom 17 3 7 8 A 14 11 64536 CASAVA_Build 1 243007549 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 10 9 64537 CASAVA_Build 1 243023567 4D TGAGCCACTG CACC/---- CGGCCTATAT 3070 het 3070 ref 26 17 9 1 CACC 1 0 64538 CASAVA_Build 1 243031126 1I TTTATTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 31 0 22 9 A 11 12 64539 CASAVA_Build 1 243033481 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 23 1 19 3 A 17 16 64540 CASAVA_Build 1 243033940 1D AATTTTTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 64 het 28 0 21 8 T 10 9 64541 CASAVA_Build 1 243061641 1I AGGAGTCTCG -/C TTTGTTGCCC 1345 het 1345 ref 21 17 3 2 C 0 1 64542 CASAVA_Build 1 243066889 1D CTTAGTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 21 9 A 13 12 64543 CASAVA_Build 1 243070538 4I GGGGCCAGAC ----/AGGG AGAGGGAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 AGGG 0 1 64544 CASAVA_Build 1 243072116 1I GCTTATTTTT -/G ACAGGTAGAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 G 0 1 64545 CASAVA_Build 1 243072556 3D ACCTAAGAGT ATG/--- ATATGTATGT 3070 het 3070 ref 40 23 13 5 ATG 1 0 64546 CASAVA_Build 1 243073116 5I TCTTGAGCAT -----/AGAAA AGAAGTCAAT 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 AGAAA 0 1 64547 CASAVA_Build 1 243075001 3D CTGTGTATTT TTG/--- TTGTTGTTCT 3070 het 3070 ref 41 23 16 5 TTG 3 2 64548 CASAVA_Build 1 243078838 1D ACTTTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 A 13 12 64549 CASAVA_Build 1 243080399 3D GCTGTGCCCA CAC/--- CCCCCCCCAA 3070 het 503 hom 36 5 15 16 CAC 1 0 64550 CASAVA_Build 1 243085080 4D AATCTTAGGT AGCA/---- AGCAATACAC 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 AGCA 2 1 64551 CASAVA_Build 1 243087915 1D TGCCACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 13 12 64552 CASAVA_Build 1 243123809 1I CAGAATGGAG -/T TAGGGGGCTC 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 1 2 64553 CASAVA_Build 1 243135566 2D ATTTTCCCAC AT/-- GTCTGATTAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AT 1 0 64554 CASAVA_Build 1 243144206 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1249 het 1249 ref 13 9 3 2 A 11 10 64555 CASAVA_Build 1 243166347 1I CATGTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 2226 hom 43 12 22 9 C 0 1 64556 CASAVA_Build 1 243177590 1D TTATACAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 A 10 9 64557 CASAVA_Build 1 243179969 1D TGCTATGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1069 hom 21 4 13 4 T 13 12 64558 CASAVA_Build 1 243186852 1I ATAAATAATG -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 A 6 7 64559 CASAVA_Build 1 243188798 2I CATTTGTTTA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 2167 hom 25 8 12 5 T 9 11 64560 CASAVA_Build 1 243190877 1I TGAACAAGAG -/C CCCCCCCAGG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 C 7 8 64561 CASAVA_Build 1 243192453 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAAAAGTACA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 TA 1 0 64562 CASAVA_Build 1 243196596 1I TATATGTAGA -/T GTATATATGT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 0 1 64563 CASAVA_Build 1 243203152 5D GGCAATATAC TAATA/----- TAATAATATA 3070 het 3070 ref 30 16 13 5 TAATA 2 1 64564 CASAVA_Build 1 243206233 1D TTAAGAAAAC T/- TTTAAGTCTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 4 3 64565 CASAVA_Build 1 243227236 2D ACAAATACTC TT/-- TTTATAGACT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 T 5 3 64566 CASAVA_Build 1 243227896 3I TGTCCATCTC ---/AAA TTCCACTATC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 0 3 64567 CASAVA_Build 1 243232679 1D TTCTGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 1109 het 1109 ref 14 6 3 6 T 15 14 64568 CASAVA_Build 1 243233934 9I CATGTGCCAC ---------/CATTGGTGG CTTCGAGTTT 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 CATTGGTGG 0 1 64569 CASAVA_Build 1 243236230 4D GTGATGAGTG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 35 13 14 11 TTTA 5 4 64570 CASAVA_Build 1 243237700 1I GTCCCTGAGA -/T TAGGTAAGCC 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 1 2 64571 CASAVA_Build 1 243243086 4I ACAAACAAAC ----/AAAA AAACCACAGT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 3 7 64572 CASAVA_Build 1 243247490 1I TCCAACCTAT -/A AATTGTAAAC 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 A 2 3 64573 CASAVA_Build 1 243257197 3D GTTAGACTAC TAT/--- TATTCTAGAG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 TAT 2 1 64574 CASAVA_Build 1 243257796 1D CTCTTGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 33 0 19 14 T 15 14 64575 CASAVA_Build 1 243265322 2I GAATAGAATT --/GA GAGTCTGGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 GA 1 2 64576 CASAVA_Build 1 243265593 7I GGAGTTCAAG -------/ACCAGTC ACCAGCCTGG 3070 hom 63 het 21 0 22 1 ACCAGTC 0 1 64577 CASAVA_Build 1 243265986 1I AATTAAAAAC -/T TTTGTGCTTC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 3 4 64578 CASAVA_Build 1 243269414 3I AAAAAAAAAA ---/GAG AGAGTTTGTG 2611 het 1173 hom 39 9 14 16 GAG 0 1 64579 CASAVA_Build 1 243275670 29D CAGGCCATTA GTCTGACTGGTTGTGGACAGCAGCCATCG/----------------------------- GTCTGACTGG 3070 hom 70 het 27 0 24 10 GTCTGACTGGTTGTGGACAGCAGCCATCG 1 0 64580 CASAVA_Build 1 243278912 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2234 het 917 hom 29 6 10 13 T 17 16 64581 CASAVA_Build 1 243281864 1D AAAGTGGTAC A/- AAGTCAGCGA 3070 het 3070 hom 49 21 23 7 A 3 2 64582 CASAVA_Build 1 243287565 1I TTCAAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 40 2 22 16 T 13 14 64583 CASAVA_Build 1 243290959 1D GCCTTTGCAG A/- AAAAGGTTGC 3070 hom 100 het 37 0 34 3 A 5 4 64584 CASAVA_Build 1 243295191 1D TTGGCCAGGC T/- GGTCTTGAAC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 1 0 64585 CASAVA_Build 1 243297949 1I CCATTACTTC -/T GAGTAGCATC 3070 hom 114 het 41 0 33 8 T 0 1 64586 CASAVA_Build 1 243304672 1I GGCTTTAAAA -/T TTTTTGTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 5 6 64587 CASAVA_Build 1 243306651 2I GTGAAATACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 41 0 30 11 T 11 13 64588 CASAVA_Build 1 243308378 14I TGAGTGGATA --------------/AACAAAAGGTGTGT GTATATGTAC 3070 hom 117 het 43 0 39 5 AACAAAAGGTGTGT 0 1 64589 CASAVA_Build 1 243329755 2I TACAATACAC --/AT GTTTTTGTAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 AT 0 1 64590 CASAVA_Build 1 243342439 13D TGTGTTCATA TGCTTAGAGACAT/------------- TGTGAAAGCA 3070 het 3070 ref 28 17 11 6 TGCTTAGAGACAT 1 0 64591 CASAVA_Build 1 243359029 1I TTGATAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 10 11 64592 CASAVA_Build 1 243370756 1I TGTATGGCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 55 26 19 10 T 8 9 64593 CASAVA_Build 1 243376153 1D ACTCCCCCCC G/- CCACCCCCCA 3070 hom 34 het 20 0 13 7 G 1 0 64594 CASAVA_Build 1 243376602 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 G 0 1 64595 CASAVA_Build 1 243377105 1I GCCTCAGCCT -/C CCAAAGTGTT 3070 het 1751 hom 16 5 11 0 C 2 3 64596 CASAVA_Build 1 243377463 5I AAGTTCCTTT -----/TAAAG TAATCTTTTT 3070 hom 45 het 25 0 16 9 TAAAG 0 1 64597 CASAVA_Build 1 243379264 1D CACATCTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 28 1 19 8 T 13 12 64598 CASAVA_Build 1 243381279 1I TTAAAGGGGG -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 A 7 8 64599 CASAVA_Build 1 243388412 2D CTCTTGTTGG TA/-- AACTGATTGT 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 TA 1 0 64600 CASAVA_Build 1 243394997 1D CTCCATCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 10 9 64601 CASAVA_Build 1 243399530 1I TTTACAAGCA -/T TTTTTTGCAG 3070 het 252 hom 49 1 44 4 T 6 7 64602 CASAVA_Build 1 243402007 4D TCCATCCACC TGTT/---- TGTTTATCCA 3070 het 3070 ref 47 23 19 8 TGTT 2 1 64603 CASAVA_Build 1 243411455 1D AAAAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 25 0 16 9 A 11 10 64604 CASAVA_Build 1 243420010 3I ATGAAATTAA ---/CCT CCTATGAAAC 3070 hom 57 het 22 0 14 8 CCT 1 2 64605 CASAVA_Build 1 243422276 1D TCACAGGAAA G/- AAAAAAAAGG 1824 het 1824 ref 52 40 6 6 G 1 0 64606 CASAVA_Build 1 243422820 1I CAACAGATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 193 hom 48 1 41 6 T 9 10 64607 CASAVA_Build 1 243428382 17D TGCGGTGGCT CACGCCTGTAATCCCAG/----------------- CACTTTGGGG 3070 het 2508 hom 17 7 9 1 CACGCCTGTAATCCCAG 1 0 64608 CASAVA_Build 1 243432197 2I CTTGTGTACC --/CT CTCTACCTTA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 CT 2 3 64609 CASAVA_Build 1 243434304 1D AAGATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 9 5 T 13 12 64610 CASAVA_Build 1 243435640 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3018 hom 29 het 16 0 9 7 T 15 14 64611 CASAVA_Build 1 243440434 1D TATCCTAAGC T/- TTTTTTTTTT 2880 het 181 hom 25 3 7 15 T 17 16 64612 CASAVA_Build 1 243442603 7D GAGCCAAAGC CTGAGCA/------- CTTGGTGTAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 7 CTGAGCA 1 0 64613 CASAVA_Build 1 243444143 1D TACAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 A 11 10 64614 CASAVA_Build 1 243446127 2D TACTTGCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 24 0 16 8 A 12 10 64615 CASAVA_Build 1 243458493 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2364 het 2364 ref 36 27 6 3 A 13 12 64616 CASAVA_Build 1 243472850 1D GCTGGGATTA C/- AGGCATGAGC 3070 het 2520 hom 28 7 18 4 C 1 0 64617 CASAVA_Build 1 243473361 4D ATATACATAC ATAT/---- ATATATATAC 516 het 516 ref 29 11 9 9 AT 6 4 64618 CASAVA_Build 1 243478045 1D GATGCATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 20 13 T 11 10 64619 CASAVA_Build 1 243478897 2D TTGCCTTTTT AG/-- AGAGAGGTTT 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 AG 4 3 64620 CASAVA_Build 1 243490951 4D TTCCTTCCTC TCTG/---- TCTTTCTTTC 2303 het 2303 ref 49 25 14 12 TCTG 1 0 64621 CASAVA_Build 1 243495513 1D AGAGAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1080 hom 24 5 11 8 T 17 16 64622 CASAVA_Build 1 243502417 3D CTTTTTTCTA TTG/--- TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 TTG 1 0 64623 CASAVA_Build 1 243503342 1D GACTTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 7 A 25 24 64624 CASAVA_Build 1 243512741 1D CCGCTCCTTT A/- AAAAAAAAGA 2721 het 2721 ref 23 12 9 3 A 9 8 64625 CASAVA_Build 1 243514308 3D ATACCTGGAG TAT/--- TATTACCAGC 3070 hom 75 het 33 0 26 9 TAT 2 1 64626 CASAVA_Build 1 243517905 1D TGATAGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 A 11 10 64627 CASAVA_Build 1 243518862 1D CAACTGTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 9 8 64628 CASAVA_Build 1 243519627 6I TGGTGATAGG ------/TTCCAA ATTCCCAATT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 TTCCAA 0 1 64629 CASAVA_Build 1 243520101 8D AAACCTTTAT TGAATGAA/-------- TGAATGAATG 3070 het 1660 hom 46 16 12 19 TGAA 8 6 64630 CASAVA_Build 1 243526101 1I ACGTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 58 21 20 17 T 11 12 64631 CASAVA_Build 1 243542100 1I CCCCTTGCTT -/G GTGCCACCTC 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 G 1 2 64632 CASAVA_Build 1 243548811 1I ATTGATGAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 50 25 15 10 A 9 10 64633 CASAVA_Build 1 243568907 1I TTTGCTTTTA -/G GGGTTTTTTT 3070 het 967 hom 32 3 25 4 G 3 4 64634 CASAVA_Build 1 243570283 1D AATGACAAGG A/- AAAAAACTCT 3070 hom 79 het 34 0 27 8 A 7 6 64635 CASAVA_Build 1 243573011 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 20 2 13 5 A 15 16 64636 CASAVA_Build 1 243601958 1I GCGCAGGGGT -/C CCCCAGACCC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 C 4 5 64637 CASAVA_Build 1 243611766 1D TTCTCTGGTT A/- ATGGTCTGTT 3070 hom 135 het 52 0 45 9 A 2 1 64638 CASAVA_Build 1 243616262 5I TAATTGATCT -----/AAAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 11 16 64639 CASAVA_Build 1 243617315 1I GTTTCAAACT -/C CTAAGCTCAG 3070 hom 48 het 18 0 15 3 C 1 2 64640 CASAVA_Build 1 243625044 1D GAGCTAGTTC A/- AAAGTAAGCA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 4 3 64641 CASAVA_Build 1 243627139 1D CACATGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 11 10 64642 CASAVA_Build 1 243631808 8D ACAAACAAAC AAACAAAG/-------- AAACACACAC 2560 het 2560 ref 21 12 7 4 AAACAAAG 1 0 64643 CASAVA_Build 1 243633556 2I GTGTGTCCAC --/AT GTGTGTGTGT 3070 hom 128 het 48 0 41 7 AT 0 1 64644 CASAVA_Build 1 243634135 1I ACAAGACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 T 15 16 64645 CASAVA_Build 1 243637388 2D TTCTCCCATT TC/-- TCTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 18 8 4 TC 3 2 64646 CASAVA_Build 1 243637880 1I GGCGCTGATC -/A ATTCAGTGCG 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 A 1 2 64647 CASAVA_Build 1 243640860 1D AATTTGACTA T/- TTTAGGTACT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 4 3 64648 CASAVA_Build 1 243646919 1D ACAAAAGAAA C/- CAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 C 2 1 64649 CASAVA_Build 1 243647031 1I GCTGTGTCTG -/A AAAAATGGAG 2764 het 2764 ref 26 12 10 4 A 5 6 64650 CASAVA_Build 1 243647227 1D AGGGGAAGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 35 6 T 10 9 64651 CASAVA_Build 1 243647908 1D TTCTTGGGGG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 87 het 40 0 29 12 A 9 8 64652 CASAVA_Build 1 243666102 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1152 het 1152 ref 15 9 5 1 A 15 14 64653 CASAVA_Build 1 243695332 1I GACCAGGGGA -/G GGGGGAAAAG 3070 hom 84 het 36 0 22 14 G 5 6 64654 CASAVA_Build 1 243696111 8D TCGATGGGAA TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 3070 hom 78 het 32 0 25 10 TGTT 7 5 64655 CASAVA_Build 1 243697810 1D ACAGAGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 21 0 16 6 A 11 10 64656 CASAVA_Build 1 243710186 4I CCTGAGCAAC ----/AGAG AAAGACCCTG 3070 hom 105 het 43 0 35 8 AG 0 2 64657 CASAVA_Build 1 243710706 2D TTAAAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 35 0 16 19 A 16 14 64658 CASAVA_Build 1 243711670 3D TACAAATGTT ATC/--- ATTACTGAGT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 ATC 1 0 64659 CASAVA_Build 1 243712204 1I TTTAGTAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 G 4 5 64660 CASAVA_Build 1 243714632 3I TCTCCTTCTC ---/CTT CTTCTTCTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CTT 3 4 64661 CASAVA_Build 1 243741938 1I AAAAGCAGTA -/T TTTAGAGGAG 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 3 4 64662 CASAVA_Build 1 243743134 1D CCAACCTGCA C/- CCCCCCCCAA 2030 hom 18 het 10 0 6 4 C 9 8 64663 CASAVA_Build 1 243745411 1D CCCTGCCCTG C/- CTCAGGTCTT 3070 het 3070 hom 52 19 28 5 C 2 1 64664 CASAVA_Build 1 243749479 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 12 11 64665 CASAVA_Build 1 243752283 1I CAGCATTTTG -/T TTTTGCATAT 3070 het 3070 ref 58 32 25 1 T 4 5 64666 CASAVA_Build 1 243764712 2D TTACCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1225 hom 29 9 11 9 T 14 12 64667 CASAVA_Build 1 243775728 6I TCCTAAGTCA ------/GTCAAC GTTCTTCATG 3070 hom 138 het 49 0 47 3 GTCAAC 0 1 64668 CASAVA_Build 1 243778210 1D GGTTGAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 A 11 10 64669 CASAVA_Build 1 243779713 1I CGATACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1938 hom 33 8 17 8 T 11 12 64670 CASAVA_Build 1 243782353 1I AATCTCATCT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 7 8 64671 CASAVA_Build 1 243784545 22D CTTACCATGG CAGATAAGGCTGAAATTTGTCC/---------------------- CAGATAATTG 3070 het 3070 ref 51 33 18 8 CAGATAAGGCTGAAATTTGTCC 1 0 64672 CASAVA_Build 1 243785933 3D TCGGAGACTT CTC/--- CTTAGCAGGC 3070 het 3070 ref 47 23 17 9 CTC 1 0 64673 CASAVA_Build 1 243786630 4I TCTGGTGTTT ----/TTTG TTGTTGTTGT 1153 hom 20 het 22 0 6 16 TTTG 0 1 64674 CASAVA_Build 1 243789536 1I GCAGGGTTTC -/A ACCATGTTGG 3070 hom 63 het 22 0 20 2 A 1 2 64675 CASAVA_Build 1 243825347 2I TGAGATAATC --/AT GTGGTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 AT 0 1 64676 CASAVA_Build 1 243833071 1D GTACGAAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 A 10 9 64677 CASAVA_Build 1 243835094 1I TTCCTCATCA -/G GGCCGTGTGA 3070 het 3070 ref 60 26 26 8 G 2 3 64678 CASAVA_Build 1 243839725 1I TGCCCCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 A 11 12 64679 CASAVA_Build 1 243852025 1D ATAATTAGGC T/- GCAAAACAGA 3070 het 3070 hom 48 19 24 7 T 1 0 64680 CASAVA_Build 1 243866276 1D TTATAGAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 T 11 10 64681 CASAVA_Build 1 243874022 2I CCACACTCTG --/TA TCTTCTCCTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 TA 0 1 64682 CASAVA_Build 1 243883822 1D TCGTCTCCAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 10 23 6 A 9 8 64683 CASAVA_Build 1 243886048 2D GGAATATAAC AG/-- ATGATCTGCA 3070 het 3070 ref 39 20 13 8 AG 1 0 64684 CASAVA_Build 1 243886156 1D CTAAGGGAAG A/- AGGGGTCGGG 3070 het 3070 hom 43 21 17 5 A 2 1 64685 CASAVA_Build 1 243887067 1D ATGAAAATTT G/- GGGGGCATTT 2251 het 2251 ref 35 27 6 2 G 6 5 64686 CASAVA_Build 1 243888233 4D TTTTAAAAAC TGAT/---- TGTTGAAGTT 3070 het 3070 ref 41 26 14 3 TGAT 1 0 64687 CASAVA_Build 1 243891270 5I TAATCGCCAC -----/AGTTA AGTTACTTGG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AGTTA 1 2 64688 CASAVA_Build 1 243891639 3D TATACACACA CAC/--- CACCAATATA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 CAC 2 1 64689 CASAVA_Build 1 243892254 2I ACACCTAATG --/AT ATATATACAC 3070 het 45 hom 32 1 25 6 AT 3 4 64690 CASAVA_Build 1 243892361 8D CACATACCCG ATATATAT/-------- ATATATATAT 2577 hom 21 het 14 0 8 9 AT 10 6 64691 CASAVA_Build 1 243892667 1D12M10D TATGCATATA TACCCAATGATATATATACACAC/-ACCCAGTGATAT---------- ACACACACAC 1909 het 1909 ref 31 19 6 11 N/A 0 0 64692 CASAVA_Build 1 243892891 1D CACCTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 34 2 30 3 T 13 12 64693 CASAVA_Build 1 243893143 1I61M1D TCAGCTCATC -TTTTCCCCTTCTCTCAGACATGACTTTCCTCTGCTGCTTGTTACCCAGTATCAGAAACCCAT/TTTTTTCCCTTCTCTCAGACATGACTTTCCTCTGCTGCTTGTTACCCAGTATCAGAAACCCA- TTTTTTTTTC 3070 het 735 hom 31 4 26 26 N/A 0 0 64694 CASAVA_Build 1 243893312 3D GTCATTTGTG ATC/--- ATTTTTTTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 6 ATC 1 0 64695 CASAVA_Build 1 243895648 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 8 7 64696 CASAVA_Build 1 243900418 1I CTAGTTATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 9 10 64697 CASAVA_Build 1 243900455 1D TGTCTCATTT A/- AAAAAAAAAG 2888 het 2877 hom 39 7 6 26 A 10 9 64698 CASAVA_Build 1 243900856 6I TACTTTCAAA ------/TCTTGG TACTAGATCT 3070 het 3070 ref 46 29 15 2 TCTTGG 0 1 64699 CASAVA_Build 1 243908795 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 A 12 11 64700 CASAVA_Build 1 243913244 1D GCTTCCTCAG C/- CCTTCAGGAT 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 C 3 2 64701 CASAVA_Build 1 243926525 4D ACAGTTTGCC AACA/---- AACAGTCAGC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AACA 2 1 64702 CASAVA_Build 1 243927872 2D AGGCTGAGAC AA/-- GAGAATTGCT 3070 het 3070 ref 32 22 9 1 A 2 0 64703 CASAVA_Build 1 243929537 5D GTGGATTCAA TTGTC/----- TTGTCTTATT 3070 het 3070 ref 37 22 11 6 TTGTC 2 1 64704 CASAVA_Build 1 243932042 8D AATTATTTAC TTGATTGA/-------- TTGATAGTGA 3070 het 3070 ref 38 18 14 10 TTGA 3 1 64705 CASAVA_Build 1 243966149 1I TGTATTTACA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 T 6 7 64706 CASAVA_Build 1 243966755 3I GTGCTTATAT ---/ATA ATGATTATAT 2271 het 2271 ref 25 17 5 3 ATA 0 1 64707 CASAVA_Build 1 243966996 2D ATACTTGTAA CT/-- CTCTGTTGCC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 CT 3 2 64708 CASAVA_Build 1 243969675 1I AAAGCAAAGT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 7 8 64709 CASAVA_Build 1 243969752 1I ACTAAAGATC -/A AAGGGAGGAA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 2 3 64710 CASAVA_Build 1 243970036 1D ACAATCATAT G/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 46 26 15 6 G 1 0 64711 CASAVA_Build 1 243970658 1I GGGAGGAGGG -/A AGAGGAACAG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 1 2 64712 CASAVA_Build 1 243978823 1D AATTTCAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 A 10 9 64713 CASAVA_Build 1 243985904 4D TTGCTCTCTT TTTC/---- TTTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 TTTC 2 1 64714 CASAVA_Build 1 243986725 1I CTTTTAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1184 hom 30 3 14 13 T 13 14 64715 CASAVA_Build 1 243997153 1D GACCGGGATT A/- AGAGTCCAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 2 1 64716 CASAVA_Build 1 243999767 1I TCTGTGGATG -/T TTTAAGTCTC 3070 het 3070 hom 52 20 24 8 T 3 4 64717 CASAVA_Build 1 244000971 4D CTATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 13 18 12 AC 7 5 64718 CASAVA_Build 1 244002601 1I TAAATACATA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 8 9 64719 CASAVA_Build 1 244003989 5D ACAATGTAGA ACGCT/----- CGATGAAATA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 ACGCT 1 0 64720 CASAVA_Build 1 244008749 5I AAATGGAAAA -----/ATTAG ATTTCATCAA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 ATTAG 0 1 64721 CASAVA_Build 1 244016002 1I GAAGTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 838 het 838 ref 18 5 5 8 T 17 18 64722 CASAVA_Build 1 244016138 1I GGGGTGTGGA -/T CGGGGGGGGG 2769 het 2704 hom 24 8 10 6 T 0 1 64723 CASAVA_Build 1 244028329 7D12M2D ACACACACAC ACATACACACACATACACACC/-------CACACATACACA-- CCCACACACA 2169 het 2169 ref 24 21 8 7 N/A 0 0 64724 CASAVA_Build 1 244029376 29I GTGCTGTTAT -----------------------------/AGTCCCTCCTGCCTACCTTCTACTCTAAG AGTCCCTCTC 3070 het 3070 ref 46 23 18 7 AGTCCCTCCTGCCTACCTTCTACTCTAAG 0 1 64725 CASAVA_Build 1 244040691 15D AACTGCAGAG AAAGACGCACTTTTC/--------------- AAAGAATTCC 3070 hom 94 het 34 0 31 5 AAAGACGCACTTTTC 1 0 64726 CASAVA_Build 1 244042627 2I CAACAGTTCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 33 0 25 8 A 15 17 64727 CASAVA_Build 1 244053283 4D CTCGCTCTCG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 101 het 42 0 33 13 CT 7 5 64728 CASAVA_Build 1 244056775 2D ATCAGATCTC AA/-- GAGAACTCAC 3070 hom 116 het 44 0 39 5 A 2 0 64729 CASAVA_Build 1 244057555 2I CTACTCTATG --/TA ATCTTCCAAG 3070 hom 117 het 47 0 39 8 TA 0 1 64730 CASAVA_Build 1 244059044 2I AGACAATCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 21 0 13 9 T 12 14 64731 CASAVA_Build 1 244062411 2D46M1D GTTTTTTTTG TTTTTTTTTTTTTGAGAGTTGAGGAGAAGACGACACCTGATTATAAGTA/--TTTTTTTTTTGGAGAGTTGAGGAGAAGACGACACCTGATTATAAGT- ATATAGTTTT 3070 hom 48 het 31 0 17 29 N/A 0 0 64732 CASAVA_Build 1 244062985 2I AATATGTGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 27 10 A 16 18 64733 CASAVA_Build 1 244074682 1I CGACCATCAC -/T GGCTCCAACA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 0 1 64734 CASAVA_Build 1 244077637 1D ATTCCCTAGG A/- ATTTGGTATC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 2 1 64735 CASAVA_Build 1 244078203 2I TATTTTTTTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 15 10 12 TG 8 9 64736 CASAVA_Build 1 244078900 1I GACAGATCCT -/G GGAATTAGTA 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 G 2 3 64737 CASAVA_Build 1 244079896 1I GTCTTGATGA -/T CAGAGAGAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 0 1 64738 CASAVA_Build 1 244082244 1D CATTCTCACA C/- CAACCAGTAG 3070 hom 144 het 57 0 49 8 C 2 1 64739 CASAVA_Build 1 244083650 1D AAAAAAGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 10 9 64740 CASAVA_Build 1 244084519 2D GTTATCCTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 109 het 48 0 37 11 TC 8 7 64741 CASAVA_Build 1 244085249 1I TTTAGGGGCT -/G GGGGGGGGAA 3070 hom 44 het 29 0 23 6 G 8 9 64742 CASAVA_Build 1 244087352 22I AATTCCTCTC ----------------------/CCAGATGTCTCCTGAGAGTCTT CCTCTAGCGG 3070 hom 59 het 22 0 19 3 CCAGATGTCTCCTGAGAGTCTT 0 1 64743 CASAVA_Build 1 244087442 34I GTCCTACGTT ----------------------------------/GCATAGGTCTGGTCCTGGATTCTCCCTCTGCTTC GCCCCTTTGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 GCATAGGTCTGGTCCTGGATTCTCCCTCTGCTTC 0 1 64744 CASAVA_Build 1 244090072 6D TGACTGAACT CAGTGC/------ CCCCTTCGTG 3070 hom 123 het 43 0 41 4 CAGTGC 1 0 64745 CASAVA_Build 1 244091797 7D AGGGCTGTGT CTTCTAA/------- CTTCTGTCTG 3070 hom 87 het 34 0 30 6 CTTCTAA 1 0 64746 CASAVA_Build 1 244091929 1I CAATACCGCT -/G GCCAGGGACC 3070 hom 110 het 42 0 36 6 G 1 2 64747 CASAVA_Build 1 244092018 7D AGAGTTGACT GTTTTCC/------- GTTTTCCTAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 GTTTTCC 2 1 64748 CASAVA_Build 1 244092237 5D CAGTACTAAG ATTAT/----- ATTATACTCT 3070 hom 90 het 32 0 31 4 ATTAT 2 1 64749 CASAVA_Build 1 244092427 2D TTTTGAACTC TT/-- TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 8 6 64750 CASAVA_Build 1 244092557 1D ATTAAAGAGG C/- CCGAGATGGA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 C 3 2 64751 CASAVA_Build 1 244094657 4I ACCACTGAAC ----/TGTA TGTACACTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TGTA 1 2 64752 CASAVA_Build 1 244095920 1D AGTGTGAAGG A/- TGACATAAGG 3070 hom 126 het 45 0 41 6 A 1 0 64753 CASAVA_Build 1 244097416 4D CTGGAATTAC TTAG/---- TTAGATCACT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TTAG 2 1 64754 CASAVA_Build 1 244097570 16D GATATGTGCA TGCGCGTGCGTGTGCG/---------------- TGCGCGCGCA 1859 hom 30 het 14 0 7 10 TGCGCGTGCGTGTGCG 1 0 64755 CASAVA_Build 1 244100761 3I TCAGGTTAAA ---/CAT CACACGAATC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 CAT 0 1 64756 CASAVA_Build 1 244110933 1I TTGCCCTGGG -/T TAGGCGGGCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 1 2 64757 CASAVA_Build 1 244121676 4D CAAGAATGAA AAAC/---- AAGCTGAGCT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 AAAC 1 0 64758 CASAVA_Build 1 244123432 1D CATGTAATGG A/- ATACTACTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 2 1 64759 CASAVA_Build 1 244125110 4D AACATGAACT CAAA/---- CAGACAGTCA 3070 hom 138 het 50 0 47 8 CAAA 1 0 64760 CASAVA_Build 1 244126817 3D GGAAGAGCAC AGA/--- AGGAGTGAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AGA 1 0 64761 CASAVA_Build 1 244131577 1I CTCCTCCACC -/A AAAAAGAAGG 3070 hom 138 het 54 0 44 10 A 5 6 64762 CASAVA_Build 1 244138193 1I AAGGTCATTA -/T AAAATGATAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 0 1 64763 CASAVA_Build 1 244143614 1I GAAGAGACAA -/C CTATAAAATG 3070 hom 95 het 35 0 32 3 C 1 2 64764 CASAVA_Build 1 244152535 2I TAATGTCATA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 10 12 64765 CASAVA_Build 1 244158443 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 7 8 64766 CASAVA_Build 1 244160089 1D CTCCTGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 727 hom 47 4 30 13 A 14 13 64767 CASAVA_Build 1 244166693 4D GATGCCATGC ACCT/---- ACCTGTAGGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ACCT 2 1 64768 CASAVA_Build 1 244169557 4I TCTCAGGAAG ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AAAT 4 5 64769 CASAVA_Build 1 244178573 1D CCTGGGCCCC A/- AATAGCCCTT 3070 hom 84 het 34 0 26 8 A 3 2 64770 CASAVA_Build 1 244185184 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 45 het 18 0 16 3 T 9 8 64771 CASAVA_Build 1 244191465 8I TGGAGGCCTA --------/AACAGAAG AATCATCCTT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AACAGAAG 0 1 64772 CASAVA_Build 1 244201372 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 43 0 35 9 A 11 10 64773 CASAVA_Build 1 244216135 1I TTCAAGGAAC -/T TGAGAGAGGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 2 64774 CASAVA_Build 1 244219132 1D AACATCCTGT C/- CCCCTTTCTC 3070 hom 123 het 44 0 42 3 C 5 4 64775 CASAVA_Build 1 244219239 1D TCTTCCTGTG C/- ACTCCCCCAG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 C 1 0 64776 CASAVA_Build 1 244231463 1I GCCACCCTTG -/C CCAAAATCTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 2 3 64777 CASAVA_Build 1 244233906 97D GGAAGCCACA GGGCATGGGAGCAAAACCACATGCTTTGGCTCAGACCTCGATTGGAATTCGGGCACCGCCACTTACTAAGGGGCCTTCTCAAGCCTGTCTCCTATCT/------------------------------------------------------------------------------------------------- GTAAAATGGG 3070 hom 36 het 8 0 12 5 GGGCATGGGAGCAAAACCACATGCTTTGGCTCAGACCTCGATTGGAATTCGGGCACCGCCACTTACTAAGGGGCCTTCTCAAGCCTGTCTCCTATCT 1 0 64778 CASAVA_Build 1 244235956 10I TATTGAAAGG ----------/GCAAGAGGAA GGAGAAAAGG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 GCAAGAGGAA 0 1 64779 CASAVA_Build 1 244236496 3D ACTTATTCTC AGA/--- AGATTTTTTA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 AGA 2 1 64780 CASAVA_Build 1 244237580 1D CCAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 24 2 16 6 A 13 12 64781 CASAVA_Build 1 244239530 1I ATATTAGATT -/C CAAGTTAGAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 1 2 64782 CASAVA_Build 1 244277770 4D TAGCAGAAGG AAAA/---- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 19 8 A 13 9 64783 CASAVA_Build 1 244285111 1D AGAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1583 hom 23 5 12 6 A 11 10 64784 CASAVA_Build 1 244285916 2D TATACCTAAA AG/-- TGGTCATAAT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 AG 1 0 64785 CASAVA_Build 1 244289265 1D TTTACCTAGA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 G 1 0 64786 CASAVA_Build 1 244290234 1D AAAGGTTGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 T 11 10 64787 CASAVA_Build 1 244290779 1D AGTGTACACT A/- ACTGGCTGAC 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 A 2 1 64788 CASAVA_Build 1 244292113 10I ATCATTGACT ----------/TAGTGCAACA TAAAGATCGT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 TAGTGCAACA 0 1 64789 CASAVA_Build 1 244302732 2D TGAGACAGAC TT/-- TTCTTCTGCC 3070 het 3070 hom 50 13 30 9 T 4 2 64790 CASAVA_Build 1 244304291 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1392 het 1392 ref 29 21 3 6 A 12 11 64791 CASAVA_Build 1 244305808 1D GAAAATTTAA T/- TATCTGTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 2 1 64792 CASAVA_Build 1 244307462 1I TTTAAAATTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 A 8 9 64793 CASAVA_Build 1 244320446 4D TTTCTCTCTC TCTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 903 hom 37 7 21 10 TCTT 1 0 64794 CASAVA_Build 1 244337433 36D AAGTGACTGC TCCCCACTGAAGCAAGGAATGGATAGAATAAGTCCT/------------------------------------ TGAAATAAAT 3070 het 3070 ref 34 26 9 5 TCCCCACTGAAGCAAGGAATGGATAGAATAAGTCCT 1 0 64795 CASAVA_Build 1 244339111 1D GAACCACTCT A/- AAATGCAACT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 4 3 64796 CASAVA_Build 1 244344058 2D GGGCTCTGAC AG/-- GGGACAGTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 AG 1 0 64797 CASAVA_Build 1 244345081 3D ACAAATCTGC AGA/--- AGGTCAGCCT 3070 het 3070 ref 38 20 14 7 AGA 1 0 64798 CASAVA_Build 1 244347812 18D AAATTACATA TTCTTTCTGTGACAGAAT/------------------ TTCTTTCTGC 3070 het 3070 ref 31 17 14 3 TTCTTTCTGTGACAGAAT 1 0 64799 CASAVA_Build 1 244348738 3D AGGCACGTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3034 het 2297 hom 33 9 10 14 T 15 12 64800 CASAVA_Build 1 244348931 6D CTAGACGTCA TTTATT/------ TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 18 0 TTTATT 2 1 64801 CASAVA_Build 1 244351159 1D TCTATGAGTA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 T 8 7 64802 CASAVA_Build 1 244361840 1I TATAATGTTT -/A AAATGAGAAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 A 3 4 64803 CASAVA_Build 1 244364732 1D TTCCCCCCCC T/- GCCGCTTTTA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 1 0 64804 CASAVA_Build 1 244368622 1I AGTGCTGGGA -/T TTACAGGCAT 2807 het 465 hom 11 1 6 4 T 2 3 64805 CASAVA_Build 1 244371400 1I ACCTTGACAG -/A ATGGTGCATT 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 A 1 2 64806 CASAVA_Build 1 244377115 1D CCCCGGCAAA C/- CCTAGGGGAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 C 3 2 64807 CASAVA_Build 1 244387572 1I AAGCTTTGTC -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 T 6 7 64808 CASAVA_Build 1 244427532 4I GAAAAACTGT ----/ACCA ACCAAGAGAA 3070 het 3070 ref 57 25 22 10 ACCA 1 2 64809 CASAVA_Build 1 244430181 4I TGTAATAGAG ----/AAGA TAGAGAACAG 1797 het 1797 ref 78 56 6 16 AAGA 0 1 64810 CASAVA_Build 1 244437820 4I ACTGGACAAT ----/AAAG AACCTGGGGA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 AAAG 0 1 64811 CASAVA_Build 1 244439236 4D AGCTTGATAG ATGA/---- ATGGTTAATG 3070 het 3070 ref 49 25 21 4 ATGA 1 0 64812 CASAVA_Build 1 244439508 1D GCATTGGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2902 hom 32 9 14 9 A 13 12 64813 CASAVA_Build 1 244440610 1D ACTCCAGCCT G/- GGCAACAAGG 3070 het 2441 hom 20 8 10 3 G 3 2 64814 CASAVA_Build 1 244465482 4I TAGACAGACA ----/TGTC AAAAGACATG 3070 het 3070 ref 33 20 13 0 TGTC 0 1 64815 CASAVA_Build 1 244473327 2D GATTCAACAC AT/-- AGTGAGCCCT 3070 het 3070 hom 34 12 18 6 AT 1 0 64816 CASAVA_Build 1 244479457 2I TTTTTTTGTA --/TT TTTTTTTTTG 1123 het 1123 ref 25 17 3 5 T 9 11 64817 CASAVA_Build 1 244485698 2D GTCTGGGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 40 6 17 17 T 16 14 64818 CASAVA_Build 1 244491633 1D ATAAGAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 A 10 9 64819 CASAVA_Build 1 244491953 2I ATTCTGCTGC --/TT TTGTTTATTC 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 T 2 4 64820 CASAVA_Build 1 244496361 1I TTGAGTATAG -/A AATGTTTTGG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 2 3 64821 CASAVA_Build 1 244498445 2I CAATATGGTG --/AA ACCCCGTCTC 1675 het 1675 ref 11 6 4 1 A 1 3 64822 CASAVA_Build 1 244499436 1I TTCTGTCAAA -/T TATTATTGTT 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 T 1 2 64823 CASAVA_Build 1 244500054 2D AACTGGACAT TA/-- TAGCCCTACC 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 TA 2 1 64824 CASAVA_Build 1 244512474 1I TATTTGTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 11 12 64825 CASAVA_Build 1 244514346 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1577 het 1577 ref 21 12 4 5 T 14 13 64826 CASAVA_Build 1 244529946 1D ATTAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 1468 het 1468 ref 33 25 4 6 A 13 12 64827 CASAVA_Build 1 244541542 6D CTTGAACACT CACACG/------ CACACGCACA 3070 het 3070 hom 32 11 15 8 CACACG 3 2 64828 CASAVA_Build 1 244556330 1D GCTAGTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 11 10 64829 CASAVA_Build 1 244556533 1I AAAAAAAAAA -/T ACAAAATTTA 2081 hom 21 het 9 0 8 1 T 0 1 64830 CASAVA_Build 1 244561900 1D GCCGACCGGC T/- TATTCCCACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 1 64831 CASAVA_Build 1 244567899 1I TAGAGCTCCT -/A TTTCTCAACA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 0 1 64832 CASAVA_Build 1 244576408 1I TTTATAAAGG -/A AAGACGTTTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 3 64833 CASAVA_Build 1 244578724 1I TAAAAATAAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 8 64834 CASAVA_Build 1 244580595 2I AGATTTACAC --/AT GTTACACCAG 3070 hom 116 het 44 0 36 8 AT 0 1 64835 CASAVA_Build 1 244584576 1D AAACTATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 11 10 64836 CASAVA_Build 1 244586060 1I AGCAGTCACT -/C CCCCAGTACC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 4 5 64837 CASAVA_Build 1 244594148 1D GTTGTAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 248 hom 36 3 13 21 A 17 16 64838 CASAVA_Build 1 244599826 1D AGTATAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 30 0 26 4 A 11 10 64839 CASAVA_Build 1 244604499 2D GAAAGTTGTA AT/-- ATATGCCTCA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 AT 3 2 64840 CASAVA_Build 1 244607096 1D TAATAAAAAA T/- AACTAAATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 0 64841 CASAVA_Build 1 244608566 2I TCTCCCCTTC --/AT ATATATATAT 2957 hom 15 het 10 0 6 4 AT 7 8 64842 CASAVA_Build 1 244616818 1D TTTCTGATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 A 12 11 64843 CASAVA_Build 1 244617807 1I GTCAGTTTCT -/A GGGGACCTCC 3070 het 385 hom 15 1 10 4 A 0 1 64844 CASAVA_Build 1 244627838 1D GTTGAGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 35 3 15 17 A 13 12 64845 CASAVA_Build 1 244644547 2D CACATAAATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 34 16 13 7 CA 7 6 64846 CASAVA_Build 1 244647312 1D AGCAGAAGGA G/- GGGAGGTATC 3070 het 3070 ref 52 29 17 6 G 4 3 64847 CASAVA_Build 1 244652346 1D AATGTTTGCC T/- TTTTTTTTAA 3005 het 3005 ref 27 14 9 4 T 9 8 64848 CASAVA_Build 1 244667992 1D ATCAAATAGA G/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 6 5 64849 CASAVA_Build 1 244672527 3I ACAAAGTAAA ---/AGT AGTAGTTACA 2950 het 2950 ref 25 13 6 6 AGT 2 3 64850 CASAVA_Build 1 244679676 1I CTGACACAGA -/G GAAGTGTCAA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 G 1 2 64851 CASAVA_Build 1 244702008 1D GAAAAAAAAC A/- AAAAAAAGGA 3070 het 4 hom 33 1 22 10 A 8 7 64852 CASAVA_Build 1 244717141 1I GGGAGGCCAA -/G GCGAGTGGAT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 G 1 2 64853 CASAVA_Build 1 244720903 2D ATACTTCCAC AT/-- GTTTTATCTC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 AT 1 0 64854 CASAVA_Build 1 244728751 1I AATGCTTATA -/C CCCCCCAGGC 3070 het 2563 hom 21 7 11 3 C 6 7 64855 CASAVA_Build 1 244729978 7I ATTCTGCACT -------/ACGTACC ACCATCACCA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 ACGTACC 0 1 64856 CASAVA_Build 1 244733912 1D AAGTGATTTC A/- GGTTATAATT 3070 het 14 hom 15 1 12 2 A 1 0 64857 CASAVA_Build 1 244735225 1I CCTCCCTCGC -/A GCTAGGGGTG 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 A 0 1 64858 CASAVA_Build 1 244735497 1I CCTAACTTGG -/T TTCAGCCGAT 3070 het 3070 hom 40 10 23 7 T 2 3 64859 CASAVA_Build 1 244735593 2I CTTAAATCCC --/CA CAGTTACTGC 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 CA 1 2 64860 CASAVA_Build 1 244739748 8I GTCTGGGATT --------/GCGGGGCA GCTGGTGGGG 3070 hom 36 het 15 0 9 6 GCGGGGCA 0 1 64861 CASAVA_Build 1 244776068 3D AGGGAGACTC CTT/--- CTTTACAAAC 3070 het 2786 hom 30 8 16 8 CTT 2 1 64862 CASAVA_Build 1 244776741 1I GACAGGCCCT -/A AAAAACCTGT 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 A 5 6 64863 CASAVA_Build 1 244777591 1D ATTTAATTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2986 hom 50 12 22 16 T 14 13 64864 CASAVA_Build 1 244778440 1D ACGTAGGGAG A/- AAAAGGAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 A 5 4 64865 CASAVA_Build 1 244780415 2D TCCTGAGCTT AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 23 15 5 A 10 8 64866 CASAVA_Build 1 244781560 1I GGTGGGAGGA -/C TGCTTGAGCC 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 C 0 1 64867 CASAVA_Build 1 244783575 2I CCTGGGCGAC --/AG AGTGAGACCC 3070 het 2665 hom 24 8 9 7 AG 1 2 64868 CASAVA_Build 1 244784436 2D AGGATCTGGG TT/-- TTGCAAGGGC 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 4 2 64869 CASAVA_Build 1 244785707 2I CAAACTGTAG --/TA TATATATATA 3070 het 2721 hom 28 9 9 10 TA 5 6 64870 CASAVA_Build 1 244788665 1I ACTTAGCTCA -/T TCTCCATAAT 3070 het 3070 ref 48 29 16 3 T 1 2 64871 CASAVA_Build 1 244788849 1D TCGAAGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 11 10 64872 CASAVA_Build 1 244797279 1I TTTGGCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 11 12 64873 CASAVA_Build 1 244802458 4I GTTTGTTATT ----/TAAA TAGAGATGAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TAAA 0 1 64874 CASAVA_Build 1 244806371 15D GTAAATTTGT TTTGGTTTAATTGTG/--------------- TTAGAGTTAG 3070 hom 39 het 15 0 14 2 TTTGGTTTAATTGTG 1 0 64875 CASAVA_Build 1 244813962 1D ACTGCTGGGC T/- TTAAGCAGTC 3070 hom 123 het 43 0 39 4 T 3 2 64876 CASAVA_Build 1 244820574 1I CTCACTGAGG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 7 8 64877 CASAVA_Build 1 244821402 1I CAAAGGTTAG -/A AAAATGAAGT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 4 5 64878 CASAVA_Build 1 244823245 1D ATATGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 13 12 64879 CASAVA_Build 1 244832823 1I TTTTGTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 29 1 16 12 T 12 13 64880 CASAVA_Build 1 244833271 4D AATCGTTTTC TAAA/---- TAGTCACCTT 3070 hom 99 het 34 0 33 3 TAAA 1 0 64881 CASAVA_Build 1 244837604 1I CTCAGGAGTA -/T ATGTCTTCCG 3070 hom 51 het 21 0 16 5 T 0 1 64882 CASAVA_Build 1 244844438 2D CTGCAATAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 30 2 18 10 T 17 15 64883 CASAVA_Build 1 244849080 1I GAGAAAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 662 hom 25 2 21 2 A 12 13 64884 CASAVA_Build 1 244852671 1D GTGAGGAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 10 9 64885 CASAVA_Build 1 244859325 4I TACCTGGAAA ----/TGTC TTTTACTTTT 3070 hom 92 het 34 0 31 3 TGTC 0 1 64886 CASAVA_Build 1 244860625 1I AGGTTATACC -/T TTTTTTTACT 3070 hom 53 het 22 0 18 6 T 7 8 64887 CASAVA_Build 1 244864338 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 7 8 64888 CASAVA_Build 1 244866161 2D GTTTGGTGAC AG/-- GGGCTTTCAC 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 AG 1 0 64889 CASAVA_Build 1 244879087 1D TGTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 23 1 17 5 T 15 14 64890 CASAVA_Build 1 244882701 1D AGGCCAAGGC G/- GGCGGATCAC 271 het 21 hom 3 0 2 2 G 3 2 64891 CASAVA_Build 1 244884749 1D CTTATCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 41 1 31 9 T 11 10 64892 CASAVA_Build 1 244899001 2D CTCCCAATCC AG/-- AGAGAGGCTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AG 4 3 64893 CASAVA_Build 1 244901916 1D TAGAAAGAAC A/- AAACCGGAGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 4 3 64894 CASAVA_Build 1 244908458 1D GTACAATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 12 6 T 12 11 64895 CASAVA_Build 1 244915690 4I GGCCAGAAGT ----/AGAC AGAGCACACA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AGAC 0 1 64896 CASAVA_Build 1 244919047 1I CAGCGCCTAA -/T TTCTGTTAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 3 64897 CASAVA_Build 1 244921251 1D CCTATATTGT G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 64 het 23 0 22 1 G 5 4 64898 CASAVA_Build 1 244924037 2D ATTGTAAAAC AT/-- GTGTTTGAAC 3070 hom 57 het 21 0 20 2 AT 1 0 64899 CASAVA_Build 1 244939770 1D CAAAAGTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 804 hom 28 2 13 14 A 15 14 64900 CASAVA_Build 1 244957963 6I CCCTGGGGTC ------/GTAGAG GTAGTGGTGC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 GTAGAG 0 1 64901 CASAVA_Build 1 244959335 1I TTAGAGACCT -/C CCCCCTGGGA 1713 het 228 hom 17 2 7 8 C 5 6 64902 CASAVA_Build 1 244977632 2I GGTTGGACTG --/CA CAGTCTAAGC 3070 hom 72 het 29 0 24 6 CA 1 2 64903 CASAVA_Build 1 245006234 4I GGCATCTCTA ----/TATT TATTTATTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 TATT 2 3 64904 CASAVA_Build 1 245007414 5D ACACATTTGT AAAGA/----- AAAGGGACAG 3070 het 3070 hom 36 14 17 9 AAAGA 1 0 64905 CASAVA_Build 1 245012278 2I AGGCGTGCGC --/CA CTGCACCGGC 3070 het 3070 ref 33 11 11 11 CA 0 1 64906 CASAVA_Build 1 245014002 2D AAAAAAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1995 hom 32 11 14 8 A 13 11 64907 CASAVA_Build 1 245017392 1I GCCCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2101 het 2101 ref 19 8 8 3 T 10 11 64908 CASAVA_Build 1 245021754 1I GGGCTCCTGC -/A GGGGCCTCCT 3070 hom 68 het 27 0 19 8 A 0 1 64909 CASAVA_Build 1 245032129 1D ATGTTGTAAG A/- AAAGCTATTT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 4 3 64910 CASAVA_Build 1 245036521 92D GTTAAGCCGT GACCTAATATAAATGATTGCATTTATACGAAAATCACTACAATTAGGCATATCTAATCTATAATGACAAAGGTCCATTTCTTCTGGTGGGAG/-------------------------------------------------------------------------------------------- TGTCAACTGG 3070 hom 57 het 19 0 20 3 GACCTAATATAAATGATTGCATTTATACGAAAATCACTACAATTAGGCATATCTAATCTATAATGACAAAGGTCCATTTCTTCTGGTGGGAG 1 0 64911 CASAVA_Build 1 245044905 5I TGAGCTGGAT -----/GTTAA GTTTAGTGGT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 GTTAA 0 1 64912 CASAVA_Build 1 245050993 1I AGTGAAACTG -/A AAAGGATTTG 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 A 3 4 64913 CASAVA_Build 1 245054437 3I3M4D CCTCTCATTT ---GTTGAGA/CAAGTT---- GGTTGAGAAT 3070 hom 105 het 37 0 36 5 N/A 0 0 64914 CASAVA_Build 1 245056169 1I TCATTCAGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 8 9 64915 CASAVA_Build 1 245057054 2D TAGCCTCTAG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 T 11 9 64916 CASAVA_Build 1 245066460 16I CACAAAAACT ----------------/TGTACACAAATGTGTG TAGCAGTCAT 3070 hom 180 het 65 0 59 6 TGTACACAAATGTGTG 0 1 64917 CASAVA_Build 1 245072793 3I GAGCCAAACA ---/CTG CTGATGAATT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 CTG 1 2 64918 CASAVA_Build 1 245078788 4I CAAACAACAC ----/AAAA AAACCCCCTA 3070 hom 67 het 28 0 21 7 A 3 7 64919 CASAVA_Build 1 245084161 16D GAGGCGGAGC TTGCAGTGAGCCGAGA/---------------- TTGCACCACT 3070 hom 36 het 19 0 14 6 TTGCAGTGAGCCGAGA 1 0 64920 CASAVA_Build 1 245084888 5I TGATCGGCTT -----/TTTAC TTTACATGTT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 TTTAC 1 2 64921 CASAVA_Build 1 245090114 2D GAACCTGGTT GG/-- GGGGGGGGCG 3070 hom 28 het 12 0 8 4 G 10 8 64922 CASAVA_Build 1 245095687 2I TAAAGGTTCT --/AA GAGAAATCTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 0 2 64923 CASAVA_Build 1 245096424 2D TATGTCCATT AA/-- ACTACACTCT 3070 hom 87 het 34 0 30 7 A 3 1 64924 CASAVA_Build 1 245100001 1D CATGAATAAC T/- TTTGAGGGCT 3070 hom 90 het 33 0 31 4 T 4 3 64925 CASAVA_Build 1 245100649 1D ATAAAACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 29 1 16 12 A 17 16 64926 CASAVA_Build 1 245102200 1D TTGTGACTCC A/- CTAACCCAAG 3070 het 3070 ref 47 22 13 12 A 1 0 64927 CASAVA_Build 1 245107475 1I CAAAGTAGAC -/A AAAAATTCAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 6 64928 CASAVA_Build 1 245109765 1I CAACCCCGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 423 hom 30 1 24 5 A 9 10 64929 CASAVA_Build 1 245114250 3D TATTATTAAA CTT/--- CTTTTCTTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 CTT 2 1 64930 CASAVA_Build 1 245119210 2D CTTTTTTCCC CT/-- GATTTCCTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CT 1 0 64931 CASAVA_Build 1 245122736 1I AAAAAAAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 22 6 T 9 10 64932 CASAVA_Build 1 245128547 24D TCTTGACAAA ACACACACACACACACACACACAC/------------------------ ACACACACAC 3070 het 1632 hom 26 7 8 15 AC 21 9 64933 CASAVA_Build 1 245133578 1D GATGGTGAGA C/- CCCCCCCCCT 2283 het 4 hom 13 1 10 2 C 10 9 64934 CASAVA_Build 1 245140710 3I TTTCAGAGAA ---/GAG GAGATTAGAT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 GAG 1 2 64935 CASAVA_Build 1 245154794 3I TAATATAAAG ---/GGT GTGTGCATCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GGT 0 1 64936 CASAVA_Build 1 245166382 1I CAAAATATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 28 1 23 4 A 12 13 64937 CASAVA_Build 1 245167916 2D GTGAATGGTA CC/-- CCCCCCCCAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 10 8 64938 CASAVA_Build 1 245169881 10D ATTCTCAGTC TTATTTTATT/---------- TTATTTTATT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTATT 6 4 64939 CASAVA_Build 1 245170236 1D TATGGTAGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 9 8 64940 CASAVA_Build 1 245171416 1D TTGATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 16 15 64941 CASAVA_Build 1 245177594 2I CACGTTTATT --/CA CACAGTCTCT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CA 2 3 64942 CASAVA_Build 1 245182475 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 27 1 16 10 T 15 14 64943 CASAVA_Build 1 245204360 1D GAGAAAAAAC A/- AGAGAGGCAA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 2 1 64944 CASAVA_Build 1 245208778 3D TGTCGGGGAA ATG/--- ACTTGAAGAA 3070 het 3070 ref 50 29 18 4 ATG 1 0 64945 CASAVA_Build 1 245209653 5D CTCATAATTG TTAGT/----- TTAGAGTATT 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 TTAGT 1 0 64946 CASAVA_Build 1 245210343 1D CCCCTGCCAC T/- TTTTTTTTTT 1290 het 626 hom 24 6 7 12 T 17 16 64947 CASAVA_Build 1 245215535 3I ATTAAAACAA ---/TTT TGTCTTATTA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 1 4 64948 CASAVA_Build 1 245219486 3I ACAGGAAAGA ---/AAG AAGAAGACCA 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 AAG 2 3 64949 CASAVA_Build 1 245220123 2D AGGAAAAGAG AA/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 42 23 18 2 A 3 1 64950 CASAVA_Build 1 245227058 1I GAGGCCGAGG -/T GGAAGGATTG 3070 het 1096 hom 17 4 10 3 T 0 1 64951 CASAVA_Build 1 245243501 2I CAGTCCTCTC --/TG AAAAATGATG 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 TG 0 1 64952 CASAVA_Build 1 245247967 1I ACTGTTTTTT -/A AAAAAATTTA 3070 het 2998 hom 23 9 13 1 A 6 7 64953 CASAVA_Build 1 245277037 1D GCTTTCACAA G/- GTGGCATTGT 3070 het 3070 ref 51 23 19 10 G 2 1 64954 CASAVA_Build 1 245281197 1I AAAAAAACAA -/C AAAAAAAACT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 0 1 64955 CASAVA_Build 1 245281708 2D TCTTTTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 2861 het 2861 ref 39 16 12 12 T 16 14 64956 CASAVA_Build 1 245289075 1I ATTAAAAAAT -/A ACACACCCCA 2500 het 1562 hom 11 4 7 0 A 1 2 64957 CASAVA_Build 1 245292831 1I TAAGGCCACT -/A GTGGGCATCT 3070 het 3070 hom 43 12 25 6 A 0 1 64958 CASAVA_Build 1 245295395 3D CCTCCGAAAA AAG/--- AATGACAAGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AAG 1 0 64959 CASAVA_Build 1 245299369 1I AAGGTCTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 9 10 64960 CASAVA_Build 1 245309843 9I TAAGGTTGTT ---------/CGATGGGTC CGGGAATGTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CGATGGGTC 0 1 64961 CASAVA_Build 1 245311292 2I AAATTATCTC --/TT TTTTTTTCTC 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 7 9 64962 CASAVA_Build 1 245317815 5D CTGTCAGCCA GGAGG/----- GGAGGACCCA 3070 hom 86 het 33 0 23 11 GGAGG 2 1 64963 CASAVA_Build 1 245318918 1D GCCTCAGTTT C/- CCCCACTGTG 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 C 5 4 64964 CASAVA_Build 1 245322923 4D GTCACTAAAG AAAA/---- AAGAACAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 17 2 A 6 2 64965 CASAVA_Build 1 245323225 2D CATTTCTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 20 4 T 12 10 64966 CASAVA_Build 1 245351192 1I6M11D TATGAACTTG -TTGGTTCATATAGAACC/TTTGGTT----------- TGCTATGAAC 3070 het 3070 ref 35 23 15 3 N/A 0 0 64967 CASAVA_Build 1 245355903 2I TAGAAAATGT --/AA AATAGTCCAG 2767 het 2767 ref 15 8 7 0 A 2 4 64968 CASAVA_Build 1 245358546 1I AGGACTTAGA -/T TTTTTTTTTT 2207 het 2207 ref 27 16 5 6 T 11 12 64969 CASAVA_Build 1 245365149 1I ACAGAGACAC -/A AAAAAACCCT 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 A 6 7 64970 CASAVA_Build 1 245372767 1D AGGTATTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 25 5 11 9 T 13 12 64971 CASAVA_Build 1 245373892 2D TCCACATCAC AG/-- AGAGAGATAG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AG 4 3 64972 CASAVA_Build 1 245378730 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 17 1 16 0 A 11 10 64973 CASAVA_Build 1 245381761 9D AAACCAAAAC AACATGCAG/--------- AATTACCGAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 AACATGCAG 1 0 64974 CASAVA_Build 1 245381980 1I CACCCCCCGC -/T TTTTTTTTTT 2213 het 1550 hom 28 6 10 12 T 13 14 64975 CASAVA_Build 1 245382231 1D AAAATAAAAC A/- AAATATAAAT 2387 het 2331 hom 12 5 5 2 A 4 3 64976 CASAVA_Build 1 245384043 2D CATATGTGTG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 150 het 65 0 47 19 AC 8 7 64977 CASAVA_Build 1 245393320 5I CTAGACTAAT -----/AAAGA AAAGAAAAGG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 AAAGA 1 2 64978 CASAVA_Build 1 245399736 1D GGTAAGAGAA G/- AAAAAAAAAT 2006 het 612 hom 11 3 6 2 G 1 0 64979 CASAVA_Build 1 245403202 1D ATACAGGGTG C/- CTTGTGTTTG 3070 het 3070 hom 67 26 34 8 C 2 1 64980 CASAVA_Build 1 245405232 1D CTGTGAATTT G/- AAGGTGGAGG 3070 hom 115 het 43 0 38 5 G 1 0 64981 CASAVA_Build 1 245406021 2D TGTGTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TA 6 5 64982 CASAVA_Build 1 245407119 1I CACGGGATAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 9 64983 CASAVA_Build 1 245407199 5D AGTACACTCC TCTTT/----- TCTTCAGAGG 3070 hom 60 het 32 0 21 14 TCTTT 1 0 64984 CASAVA_Build 1 245409463 1D TGAATGTGTT G/- GTATTTCATA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 G 2 1 64985 CASAVA_Build 1 245411772 1I GGCATTATTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 8 9 64986 CASAVA_Build 1 245416517 6I23M2D CTGCACTCCA ------GCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAA/GCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTC-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 18 9 3 N/A 0 0 64987 CASAVA_Build 1 245417058 2D TGGGGTGAAT AA/-- AAAGAGGGGA 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 A 5 3 64988 CASAVA_Build 1 245417146 3I TGGTGACTAC ---/AAT AATGTGTATT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 AAT 1 2 64989 CASAVA_Build 1 245419599 3I AATTCTGAAA ---/AAT AATAACAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 AAT 1 2 64990 CASAVA_Build 1 245419702 2D TATGTAGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1684 hom 42 8 15 22 A 18 16 64991 CASAVA_Build 1 245421727 27D TCAAAAAAAA AATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT/--------------------------- AAATAAATAA 3070 het 878 hom 15 4 12 2 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT 1 0 64992 CASAVA_Build 1 245421914 1D TCTCAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 A 12 11 64993 CASAVA_Build 1 245422693 1I10M1I TATAAAAAAA -AAAAAAACAA-/CAAAACAACAAC AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 N/A 0 0 64994 CASAVA_Build 1 245425456 3D AAACAAACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 30 13 16 3 AAC 6 5 64995 CASAVA_Build 1 245431303 4I CTGGGATTAC ----/AGGT AGGTGTGAGC 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 AGGT 1 2 64996 CASAVA_Build 1 245434335 3D AGATCTCCTC CTT/--- GTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 49 25 17 9 CTT 1 0 64997 CASAVA_Build 1 245439755 1I ATGCTCTGTG -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 6 7 64998 CASAVA_Build 1 245444061 4D TATATATTTG TCTC/---- TCTGTTTTTC 2899 het 2791 hom 14 6 7 1 TC 3 1 64999 CASAVA_Build 1 245445779 4D GTCTAGTAAC TCTG/---- TCTGGGGTTT 3070 het 3070 ref 32 19 12 3 TCTG 2 1 65000 CASAVA_Build 1 245460639 1D GAATAAGAGA G/- CTGTAAGATG 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 G 1 0 65001 CASAVA_Build 1 245472605 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 31 7 15 9 G 0 1 65002 CASAVA_Build 1 245476388 4I AGAAACAATA ----/AAAC AAACAAATAG 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 AAAC 1 2 65003 CASAVA_Build 1 245477237 1D GCCCTTCCTT G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 G 1 0 65004 CASAVA_Build 1 245478705 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 553 hom 18 4 10 4 T 13 14 65005 CASAVA_Build 1 245482825 1I TGCAGTTCAC -/A AAAAAAGTCA 3070 hom 102 het 45 0 35 10 A 6 7 65006 CASAVA_Build 1 245487592 1I GTCTATAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 13 14 65007 CASAVA_Build 1 245491712 1D TAGTAATGCG T/- TTAGTTGCAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 3 2 65008 CASAVA_Build 1 245491924 4D TTTTTACTTA CTTT/---- CTTTCTGTTT 3070 het 593 hom 31 4 15 12 CTTT 2 1 65009 CASAVA_Build 1 245498167 1D TGCTGAAGAA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 643 hom 29 4 19 7 G 2 1 65010 CASAVA_Build 1 245503591 1I TGTCCTCGCA -/G GGAGAATGAT 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 G 2 3 65011 CASAVA_Build 1 245504186 1D TGATCTGCTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 8 7 65012 CASAVA_Build 1 245508841 4I CACCTCCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 967 hom 35 6 10 19 AAAC 4 5 65013 CASAVA_Build 1 245508873 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 1708 hom 30 5 17 8 A 7 8 65014 CASAVA_Build 1 245512431 1I GGTGCCTGTA -/G TCCCAGCTAC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 0 1 65015 CASAVA_Build 1 245516889 2D GCCTACCCTC TG/-- TTATGGGAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 TG 1 0 65016 CASAVA_Build 1 245527782 3D GTGGGGACTC AAG/--- AGACAGCCTC 3070 het 3070 hom 65 26 31 13 AAG 1 0 65017 CASAVA_Build 1 245534800 1D CCATACCTGA T/- TTGAGATGTT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 T 3 2 65018 CASAVA_Build 1 245541655 22I CAAGGCCCTG ----------------------/GGTGGCCCTGCCCCTGGCTTTT GGTGGTCCCG 3070 hom 66 het 24 0 18 6 GGTGGCCCTGCCCCTGGCTTTT 0 1 65019 CASAVA_Build 1 245542659 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 249 hom 28 2 13 13 A 16 15 65020 CASAVA_Build 1 245544986 4D TTGACTAGTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 959 het 143 hom 20 2 5 13 T 22 18 65021 CASAVA_Build 1 245545987 1I TTAAATGGGG -/A AAAAAATGGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 6 7 65022 CASAVA_Build 1 245548864 1I GCATTATAAT -/A GGGGAAGAAG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 0 1 65023 CASAVA_Build 1 245554455 1I TTAGCTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 921 hom 39 2 19 18 T 13 14 65024 CASAVA_Build 1 245570885 1I GATTGCATAT -/C ATGAGGCTTC 3070 hom 109 het 44 0 34 10 C 0 1 65025 CASAVA_Build 1 245574916 1I CAAAAAAAAA -/G AGAAAAAAAA 3070 het 896 hom 29 3 15 11 G 0 1 65026 CASAVA_Build 1 245587697 8D GTCATCCCTC AGGTTAAA/-------- AGGTCTTCTG 3070 het 3070 ref 38 22 9 8 AGGTTAAA 1 0 65027 CASAVA_Build 1 245589072 1D TCACTGGTGA G/- TTGAGCAATG 3070 hom 81 het 33 0 28 7 G 1 0 65028 CASAVA_Build 1 245592508 1D CTTAGTGGCC G/- GGCGCGGTGG 3070 hom 27 het 16 0 9 7 G 3 2 65029 CASAVA_Build 1 245608420 1I GACTGACAGA -/T TTTGGAGGTG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 3 4 65030 CASAVA_Build 1 245609224 1I CCCGCCTCAG -/C CCCCTGAGTA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 C 4 5 65031 CASAVA_Build 1 245610693 8D TATTTATTTA TTTATTTT/-------- TTATTTCTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 3 TTTATTTT 1 0 65032 CASAVA_Build 1 245612370 2D AAGCAGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 26 0 22 4 T 23 21 65033 CASAVA_Build 1 245616635 1I CTGAGGCTGG -/T TTCAAACTCC 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 2 3 65034 CASAVA_Build 1 245618382 2D ACTCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 584 hom 11 het 8 0 3 5 A 18 16 65035 CASAVA_Build 1 245620316 1I ACAGTCCCAG -/A GGGGAGAGAG 3070 hom 88 het 34 0 25 9 A 0 1 65036 CASAVA_Build 1 245629173 2D AGCGAGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 43 0 32 11 A 13 11 65037 CASAVA_Build 1 245630990 1I ACAGTGGGAG -/A AAAAAATCTT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 6 7 65038 CASAVA_Build 1 245635853 21D AACCAGAGCA CCATGTCACATCATGAGAGCG/--------------------- CCATGTCACA 3070 hom 90 het 31 0 30 12 CCATGTCACATCATGAGAGCG 1 0 65039 CASAVA_Build 1 245638500 1D ACCGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1262 het 1262 ref 41 25 4 12 T 15 14 65040 CASAVA_Build 1 245649085 3D ATATATATAT ATA/--- TATTTTTTTT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 ATA 1 0 65041 CASAVA_Build 1 245650681 1I TTGGTTTTTT -/C CTCTTTTCCC 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 1 2 65042 CASAVA_Build 1 245652068 1D CTTCAGGAGG C/- CAAGATGGGA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 C 2 1 65043 CASAVA_Build 1 245656119 1D GTTTCCTTGG A/- AAAAAACATG 3070 hom 120 het 46 0 40 7 A 7 6 65044 CASAVA_Build 1 245658035 2I TTCCTTCCTC --/TG AGGACAGACT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 TG 0 1 65045 CASAVA_Build 1 245658576 6D CCTGGCTTTT TTTAAA/------ TAAAAAAGAT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TTTAAA 1 0 65046 CASAVA_Build 1 245660357 2D GCACAGTCAG GC/-- ATGACTACAC 3070 hom 69 het 26 0 22 4 GC 1 0 65047 CASAVA_Build 1 245664280 1D CCGGTGGGCT G/- GGGTTTGAGT 3070 hom 92 het 40 0 29 12 G 4 3 65048 CASAVA_Build 1 245676607 1I ATAGAAGCAC -/T TTTTTCTTCT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 T 5 6 65049 CASAVA_Build 1 245677587 1I AACATAAGGT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 7 8 65050 CASAVA_Build 1 245678775 1I TTTTCCTATC -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 107 het 40 0 36 4 T 6 7 65051 CASAVA_Build 1 245684121 2I CACACACACA --/TG CACACACACA 3070 het 593 hom 45 2 40 3 TG 0 1 65052 CASAVA_Build 1 245688956 3D ATGTTGAGGG CTT/--- TTTGTTGTTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 CTT 1 0 65053 CASAVA_Build 1 245690632 2I TGGATCACCT --/AA GTTTGGGAGT 1458 het 1458 ref 19 14 4 1 A 0 2 65054 CASAVA_Build 1 245691196 4D AACAATTGAA AAAC/---- AAACAAATGG 3070 het 3070 ref 35 16 15 8 AAAC 2 1 65055 CASAVA_Build 1 245691365 1D GGTGTGAACT G/- GGGGGGTTCC 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 G 7 6 65056 CASAVA_Build 1 245691741 1D TATGATTCCT G/- GTACAAAACT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 G 2 1 65057 CASAVA_Build 1 245692416 8I GCATAACCAT --------/GAAGTATA GAAGTATAGC 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 GAAGTATA 1 2 65058 CASAVA_Build 1 245692559 1I TCACCTCATA -/G TTATCTGTGC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 G 0 1 65059 CASAVA_Build 1 245692785 1I ATATTTGACC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 52 28 19 5 T 7 8 65060 CASAVA_Build 1 245693021 1D AAGTGGTCAT C/- CCCTGGAGTC 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 C 4 3 65061 CASAVA_Build 1 245694670 2D TGAACATACT AA/-- AATATAAGTT 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 A 4 2 65062 CASAVA_Build 1 245695011 1D GCATATTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 A 12 11 65063 CASAVA_Build 1 245695155 2I7M2I ATAAATATGT --AGTTATT--/ACAGTTATTTG TGATTTAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 15 2 N/A 0 0 65064 CASAVA_Build 1 245695347 3D AATGGGTAAT ATC/--- ATGTAGTTTT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 ATC 1 0 65065 CASAVA_Build 1 245698555 1D AAAGAACATC T/- GTTCCCAGAC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 1 0 65066 CASAVA_Build 1 245700074 3I CCAGCCTGGC ---/CAA CATGGTGAAA 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 CAA 0 1 65067 CASAVA_Build 1 245709569 10D CTCCATCCGA TAGTGTTAGC/---------- TAGTGTTAGC 3070 het 3070 ref 46 22 10 18 TAGTGTTAGC 2 1 65068 CASAVA_Build 1 245719823 1I TTCATAATAA -/C CCAACACCTG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 C 2 3 65069 CASAVA_Build 1 245736297 6D TTCTAGTCAG GGTTAA/------ GGTTAAAGTT 3070 hom 85 het 34 0 28 7 GGTTAA 2 1 65070 CASAVA_Build 1 245736860 1D CGTTTTGCTG A/- ACAAGAAACG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 1 65071 CASAVA_Build 1 245737456 6D ATTTTATTTG CTTTTA/------ TTATACTGTA 1224 het 1224 ref 42 40 3 0 CTTTTA 1 0 65072 CASAVA_Build 1 245744406 4D TACTTAAGTG CTAT/---- CTATTTATCT 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 CTAT 2 1 65073 CASAVA_Build 1 245744662 5D CTTTCCCACT TTATG/----- TTTTGTTTGC 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 TTATG 1 0 65074 CASAVA_Build 1 245746479 1D ATGTTGACTG T/- TTTTTTTTTT 2866 het 429 hom 35 5 11 19 T 19 18 65075 CASAVA_Build 1 245747077 1D TCAAAGCTGC T/- TTTGGTCTTT 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 T 4 3 65076 CASAVA_Build 1 245755338 1I CTGACCAGTC -/A AATCAGCTGT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 A 2 3 65077 CASAVA_Build 1 245762800 2D AAGACTGGGT GG/-- GGGGTGTTCA 3070 hom 100 het 38 0 34 5 G 6 4 65078 CASAVA_Build 1 245771109 1D GCTTTTTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 21 19 7 T 10 9 65079 CASAVA_Build 1 245776062 1I GGAAAGAAAG -/A AAATAAATTT 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 3 4 65080 CASAVA_Build 1 245792751 1D CCCACACTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2477 hom 28 7 12 9 T 10 9 65081 CASAVA_Build 1 245793446 4D AACCAAATGC TTTT/---- TTTGAAAGGC 3070 hom 90 het 31 0 31 2 T 7 3 65082 CASAVA_Build 1 245808883 1D AAATGTGTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 T 9 8 65083 CASAVA_Build 1 245815510 2D ATTAAAAAGT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 42 het 19 0 14 6 A 11 9 65084 CASAVA_Build 1 245817085 1I ACATTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 2708 het 2708 ref 39 19 8 12 T 13 14 65085 CASAVA_Build 1 245819611 1D GTCAGCCAGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 19 23 6 T 10 9 65086 CASAVA_Build 1 245820162 1I AATTTTTGCA -/T TTTTGAGTCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 4 5 65087 CASAVA_Build 1 245827011 1D CTACATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 946 hom 12 2 7 3 T 12 11 65088 CASAVA_Build 1 245831300 1D CTAAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 36 1 30 5 A 11 10 65089 CASAVA_Build 1 245832044 1I AATCTTTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 73 het 29 0 25 4 A 9 10 65090 CASAVA_Build 1 245847715 15I AAGTTCTGTA ---------------/TGTGTGTGTGTTGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TGTGTGTGTGTTGTG 0 1 65091 CASAVA_Build 1 245848465 1I AAGCAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 95 het 34 0 33 1 A 9 10 65092 CASAVA_Build 1 245857105 15I CCTTCCTCCA ---------------/TGATTGTAAGTTTCT TGAGGCCTCC 3070 het 3070 ref 40 27 11 3 TGATTGTAAGTTTCT 0 1 65093 CASAVA_Build 1 245865899 5I TTATTATAGG -----/TGTTA TGTTATTATT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TGTTA 1 2 65094 CASAVA_Build 1 245866547 2D AGGGCCATCT AG/-- AGTCACCTCT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AG 2 1 65095 CASAVA_Build 1 245866798 1D ACCCGGGTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 10 21 7 T 10 9 65096 CASAVA_Build 1 245872728 1I ACCAACATTA -/C TTTGCTTGGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 0 1 65097 CASAVA_Build 1 245875326 2I TCAGAGAAAG --/CT CTGTTATGAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CT 1 2 65098 CASAVA_Build 1 245877371 3I CACTTTGATG ---/TGT TGTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 TGT 1 2 65099 CASAVA_Build 1 245877475 5D ATGAAAGAAC ATGGT/----- TATTTACACA 3070 het 3070 hom 49 24 25 1 ATGGT 1 0 65100 CASAVA_Build 1 245878707 3I GTGGAAAGAC ---/ATG ATATTCAGCT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 ATG 0 1 65101 CASAVA_Build 1 245881939 1I TGTCCAGGTA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 6 7 65102 CASAVA_Build 1 245882314 3I TATTGTACAC ---/AAT AAAATCCATC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 AAT 0 1 65103 CASAVA_Build 1 245882533 14I ATGTCTCTTG --------------/AGCTTTATATTGAC AGAATCATAT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 AGCTTTATATTGAC 0 1 65104 CASAVA_Build 1 245885097 1D ATATATACTC T/- TCATATGTAT 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 T 2 1 65105 CASAVA_Build 1 245885438 4D TATTTAAGGA GTTT/---- GTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 GTTT 2 1 65106 CASAVA_Build 1 245885961 37D GAGACTTCTT CATATACATGTTCAGTAAACACTCATATACCTATGAA/------------------------------------- CATATACATG 3070 het 3070 ref 25 12 9 14 CATATACATGTTCAGTAAACACTCATATACCTATGAA 1 0 65107 CASAVA_Build 1 245886374 2I GCACACATAC --/TT ACAGCCTCCC 3070 het 3070 hom 64 29 31 4 T 0 2 65108 CASAVA_Build 1 245887175 1D TTTAAATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 11 10 65109 CASAVA_Build 1 245888451 4D GGTCTCTTGA ATTT/---- ATTTCTCCTA 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 ATTT 2 1 65110 CASAVA_Build 1 245889316 5I TAGATTGTCT -----/CTTTA CTTTGTGGAT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 CTTTA 0 1 65111 CASAVA_Build 1 245889839 1I CTATTTGGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 9 10 65112 CASAVA_Build 1 245890026 1I TCAAGTTTTT -/A ATCAATGATT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 1 2 65113 CASAVA_Build 1 245890732 1I ATTTGCCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 T 10 11 65114 CASAVA_Build 1 245893037 1D TGAAATGTTA T/- TTTAATGTCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 T 4 3 65115 CASAVA_Build 1 245895646 1I CACTATGCAT -/A TTTTTTACTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 0 1 65116 CASAVA_Build 1 245897981 1D CAAAGTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2741 hom 32 9 13 10 T 15 14 65117 CASAVA_Build 1 245904690 2D GTAGGTAGAT TG/-- TGTGTCTCAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 5 TG 3 2 65118 CASAVA_Build 1 245906414 2D TAAAGGTGAC TT/-- TATTCATTAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 T 3 1 65119 CASAVA_Build 1 245908950 1I GGAAGAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 T 11 12 65120 CASAVA_Build 1 245911025 1I AATAGAAATT -/A AATCATTTGC 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 A 2 3 65121 CASAVA_Build 1 245911271 1D TATTTGGTGG A/- AAAAAAAAAA 1109 het 1109 ref 52 44 3 6 A 11 10 65122 CASAVA_Build 1 245913014 1I ATATTTCTAG -/T TTTTTCTATC 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 5 6 65123 CASAVA_Build 1 245916097 2I TCTCTCTCTC --/TT TCTCTCTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 3 65124 CASAVA_Build 1 245917017 1D TCACAGTGCC A/- ATATGAACCC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 1 65125 CASAVA_Build 1 245943343 1I ACTTCTCATC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 A 8 9 65126 CASAVA_Build 1 245987132 2D AGTCAGAAAC TA/-- TTTATCAGCT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TA 1 0 65127 CASAVA_Build 1 245994782 1D AGTTTGTTCC T/- TTTTTGTTGA 3070 hom 111 het 43 0 37 7 T 6 5 65128 CASAVA_Build 1 245996440 1I CAATGCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 9 10 65129 CASAVA_Build 1 245996962 1I ATCTTTTTTT -/A TAAAAAAAAT 2193 het 2193 ref 17 10 6 1 A 0 1 65130 CASAVA_Build 1 245997767 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 10 11 65131 CASAVA_Build 1 246004502 1D TCTTTAGATT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 94 het 39 0 31 8 A 9 8 65132 CASAVA_Build 1 246010592 1I TCATGCTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 410 hom 30 1 25 4 T 9 10 65133 CASAVA_Build 1 246011094 1D CTATTTTGCT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 8 7 65134 CASAVA_Build 1 246019291 1I ACTTTGCCAA -/C ACCCTCACAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 0 1 65135 CASAVA_Build 1 246019750 1I CTTTTGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 983 hom 30 3 22 5 T 12 13 65136 CASAVA_Build 1 246019988 1D GCTGATACTT G/- GGGTACTCCA 3070 hom 92 het 38 0 29 10 G 4 3 65137 CASAVA_Build 1 246021637 1I GATGAGAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 29 1 26 2 A 9 10 65138 CASAVA_Build 1 246021718 1I TAAGTTTACT -/G GGGGGGGTAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 7 8 65139 CASAVA_Build 1 246030921 2D GGTCTAAAAT TC/-- TCTTTTTTGG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TC 2 1 65140 CASAVA_Build 1 246032789 1D TAATAATAAT A/- AAAAAATTAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 7 6 65141 CASAVA_Build 1 246033994 2D AATTAAAAAC AT/-- AAACTGTATA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AT 1 0 65142 CASAVA_Build 1 246035065 4I TACAGATATC ----/AGTT AGTGCTAAGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGTT 0 1 65143 CASAVA_Build 1 246043050 4I TGTCCATCTA ----/TGTT TGTCAAATAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TGTT 0 1 65144 CASAVA_Build 1 246045165 3D CAGTAGGATA AGG/--- AGAAGGTGCC 3070 hom 108 het 38 0 37 4 AGG 1 0 65145 CASAVA_Build 1 246046789 1I TCTTTCAAGC -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 6 7 65146 CASAVA_Build 1 246047629 1D GTACTTCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 15 7 T 10 9 65147 CASAVA_Build 1 246049324 1D GAGCAGATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 10 9 65148 CASAVA_Build 1 246049611 4I CCTTTTGTGT ----/GTGA GTATTTAGTA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 GTGA 0 1 65149 CASAVA_Build 1 246050225 3D GAGAACTGGC ATT/--- AGTTATTCTT 3070 het 3070 ref 35 23 9 6 ATT 1 0 65150 CASAVA_Build 1 246052404 11I GGGACTTGCA -----------/CTAGTGGCCTC CCAAGGGCTC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 CTAGTGGCCTC 0 1 65151 CASAVA_Build 1 246056234 1I TATTAAAATT -/G TATAGGAATT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 G 0 1 65152 CASAVA_Build 1 246056591 9I AGATAAAATG ---------/AGAAATCAA CATAATCATG 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 AGAAATCAA 0 1 65153 CASAVA_Build 1 246058977 1I GGCAATGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2804 hom 30 10 10 10 T 11 12 65154 CASAVA_Build 1 246063574 4D GGAGACCACT GTGA/---- GTGAGAGGGA 3070 het 3070 ref 62 30 25 11 GTGA 2 1 65155 CASAVA_Build 1 246073284 1D TAACTGAGCA G/- CAATAACATC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 G 1 0 65156 CASAVA_Build 1 246077377 2D AAATACTGAT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 44 0 39 5 TG 1 0 65157 CASAVA_Build 1 246078498 1D GCAATGTCTA C/- CCGTGCCCTC 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 C 3 2 65158 CASAVA_Build 1 246083066 5I TTCAACATGA -----/TTGCT TTGCTTCCTT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 TTGCT 1 2 65159 CASAVA_Build 1 246090351 3I GCAACACTGC ---/ACA ACAACCTGAG 3070 het 3070 hom 63 24 33 9 ACA 1 2 65160 CASAVA_Build 1 246105226 1I GATTTTTAAG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 65161 CASAVA_Build 1 246110415 1D TACAACCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 11 10 65162 CASAVA_Build 1 246114312 1I GACTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 2738 hom 25 het 11 0 9 2 T 10 11 65163 CASAVA_Build 1 246115270 1I AACTATCCTT -/A AGTTTATGGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 2 65164 CASAVA_Build 1 246115416 3D TTATATTCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 15 12 65165 CASAVA_Build 1 246116130 1I CAGTATAGTT -/A AGCTTTCTAC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 1 2 65166 CASAVA_Build 1 246117148 1I GTAGTGTTTC -/T TTTTTGTTTT 3070 hom 78 het 27 0 27 4 T 5 6 65167 CASAVA_Build 1 246117862 1I ACACTTCACC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 70 hom 34 1 30 3 T 7 8 65168 CASAVA_Build 1 246126403 1I CAGAGAGGTG -/A AAGGGGGCAC 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 A 2 3 65169 CASAVA_Build 1 246126764 7D GCAGTGGGAA TTGTGGC/------- TTGTGGCTTT 3070 hom 121 het 45 0 37 8 TTGTGGC 2 1 65170 CASAVA_Build 1 246126870 1D ATGGCCTCCT A/- AAAGTTCTGG 3070 het 3070 ref 46 28 17 1 A 4 3 65171 CASAVA_Build 1 246135993 3I TTTAGCAAAA ---/TGG TTTTCTGCTG 3070 hom 72 het 32 0 24 8 TGG 0 1 65172 CASAVA_Build 1 246136913 2I CTGTTTTCTT --/TC TCTCTCTCTC 1872 het 1872 ref 26 9 11 6 TC 8 9 65173 CASAVA_Build 1 246141784 1I TGATATTACT -/C GTAATATCGC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 0 1 65174 CASAVA_Build 1 246144916 1D AGGGAAACGT G/- GTGTGGGAGG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 G 2 1 65175 CASAVA_Build 1 246145258 1I CCAAACCAAC -/T TTGTGCCTTT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 2 3 65176 CASAVA_Build 1 246146755 1D TTTAAATATA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 T 9 8 65177 CASAVA_Build 1 246146923 1D ATCAAACCGC A/- AACTGCCTGG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 3 2 65178 CASAVA_Build 1 246153920 1I TTAGAGACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 T 11 12 65179 CASAVA_Build 1 246179967 2I TCAATAAGAA --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TG 0 1 65180 CASAVA_Build 1 246180999 1I GATTAAAAAT -/A AAAAAATTAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 6 7 65181 CASAVA_Build 1 246184546 1I ATGTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 9 10 65182 CASAVA_Build 1 246184884 1I TATATATATA -/T TATTTTTACT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 1 2 65183 CASAVA_Build 1 246185642 3I GAGCATTTTT ---/TCA TTTCTTTTGG 1450 hom 7 het 3 0 3 0 TCA 0 1 65184 CASAVA_Build 1 246192363 1D TGGCTGTGTG A/- CACTGATTTA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 1 0 65185 CASAVA_Build 1 246263535 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 43 3 20 20 T 13 12 65186 CASAVA_Build 1 246264976 1I TATCTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 1669 het 1669 ref 37 14 8 15 T 15 16 65187 CASAVA_Build 1 246309188 1D4M1D AGAAATTTTC TGTACT/-GTAC- TTTTTTAATG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 N/A 0 0 65188 CASAVA_Build 1 246416820 6D GGGTGGGGCT TGCTGC/------ TGCTGCTGCT 3070 het 3070 ref 38 17 11 13 TGC 5 3 65189 CASAVA_Build 1 246423049 1D ATCAGGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 A 12 11 65190 CASAVA_Build 1 246423522 3D TAGAAAAAAA CTT/--- CTTTTAATTT 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 CTT 2 1 65191 CASAVA_Build 1 246432210 2D CGGTAATCCC CA/-- GTGTCTCAGT 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 CA 1 0 65192 CASAVA_Build 1 246432691 1D TGGAGACTTT A/- AAAAAAAAAA 2504 het 2504 ref 26 12 6 9 A 13 12 65193 CASAVA_Build 1 246460100 1D CTAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 1241 het 639 hom 9 2 4 3 A 15 14 65194 CASAVA_Build 1 246478314 1D AGTTCCTTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 14 18 8 T 9 8 65195 CASAVA_Build 1 246479075 8D ATTCAACTTC ATATATAT/-------- ATATATATAT 2089 het 742 hom 9 3 5 3 AT 13 9 65196 CASAVA_Build 1 246480855 1D CCTATCATTG A/- AAGTAAAATA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 3 2 65197 CASAVA_Build 1 246488819 1D AAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1948 het 1948 ref 11 6 4 1 A 11 10 65198 CASAVA_Build 1 246501335 2D GTAAGGAGAT AA/-- AATTAACAAG 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 A 4 2 65199 CASAVA_Build 1 246503871 6D TGATTCAAAG CCCTAA/------ CTCCCAGTGA 3070 het 3070 ref 40 23 13 5 CCCTAA 1 0 65200 CASAVA_Build 1 246505661 1I GAGAAGCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2349 hom 35 9 18 8 A 13 14 65201 CASAVA_Build 1 246510765 1D CCACTTATAA G/- TGAGAACATG 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 G 1 0 65202 CASAVA_Build 1 246511551 1D TAATTTATGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 9 8 65203 CASAVA_Build 1 246514869 1D TTGAGTCTTC T/- TATTTATTTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 2 1 65204 CASAVA_Build 1 246516712 2D TTAAAATGAC AT/-- AGAGATACCA 3070 het 3070 ref 19 11 7 1 AT 1 0 65205 CASAVA_Build 1 246523822 1D AAAGTTTGCC T/- TAAAACACCA 3070 het 3070 ref 22 11 8 4 T 2 1 65206 CASAVA_Build 1 246533869 2D CAGGGCGTTC AG/-- AGCTAATATC 2428 het 2428 ref 24 16 8 2 AG 2 1 65207 CASAVA_Build 1 246534063 3D GTAAAAATTG TTA/--- TTATAAAATA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 TTA 2 1 65208 CASAVA_Build 1 246535906 6D TCCTGCCCTA GAGTAG/------ ACAAGGCCTG 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 GAGTAG 1 0 65209 CASAVA_Build 1 246541551 3D51M1D ATGGTGTCTC ATTGTTGTGATTTGCATTTCTCTAATAATCAGTGATAATAAGCTTTTTTACATAT/---GTTGTGATTTGCATTTCTCTAATAATCAGTGATAATAAGCTATTTTACATA- TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 24 22 7 6 N/A 0 0 65210 CASAVA_Build 1 246542525 3I TGTAGTTCTC ---/CTT GAGAGGTCCT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 CTT 0 1 65211 CASAVA_Build 1 246543463 1D GGTTCTGGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 10 9 65212 CASAVA_Build 1 246543763 1D GTTTTGTTAA T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 T 7 6 65213 CASAVA_Build 1 246545490 4D CTCAGAGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 13 22 9 TTTG 3 2 65214 CASAVA_Build 1 246549242 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAGAGGT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 5 6 65215 CASAVA_Build 1 246554752 4D ATTGAAAAAT TACA/---- ATAACAATAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 TACA 1 0 65216 CASAVA_Build 1 246557564 1I TTTCTAATGA -/G AAATTTGACA 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 G 0 1 65217 CASAVA_Build 1 246559670 10D ACAGTCTTGT TGGGGCTTGG/---------- TTAACTTACC 3070 het 3070 ref 37 23 13 4 TGGGGCTTGG 1 0 65218 CASAVA_Build 1 246574810 4I TTCATGAGTA ----/ACTT AATTAAAATT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 ACTT 0 1 65219 CASAVA_Build 1 246578374 3I GTGAAATAAC ---/TTA TTATTAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 TTA 2 3 65220 CASAVA_Build 1 246579972 1D TCCACTCTTC A/- ACTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 A 2 1 65221 CASAVA_Build 1 246598468 1I AAAAGAAAAA -/T TTAGGGAACG 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 2 3 65222 CASAVA_Build 1 246611210 1I TAGGCTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 20 1 9 10 A 10 11 65223 CASAVA_Build 1 246637177 5I TAACTCCATA -----/GTTAT GTTATGATGT 3070 het 3070 hom 46 17 23 7 GTTAT 1 2 65224 CASAVA_Build 1 246641741 1I CACATGGTAA -/G TCTGCAAGTG 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 G 0 1 65225 CASAVA_Build 1 246645817 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 1668 het 1605 hom 16 7 6 3 TA 5 6 65226 CASAVA_Build 1 246649948 1I AATTATACCC -/T TTTTCCATCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 4 5 65227 CASAVA_Build 1 246652263 2I GTTTATTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 11 13 65228 CASAVA_Build 1 246654533 1D TTTTTAATCC A/- CCTATGAAAG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 1 0 65229 CASAVA_Build 1 246662556 2I AGTGGTAAAC --/AA GAGGGAGAAT 2646 het 2646 ref 40 28 7 5 A 0 2 65230 CASAVA_Build 1 246662625 1I CTATGGCTTA -/T TGAGGCTACA 3070 het 3070 ref 47 23 7 17 T 1 2 65231 CASAVA_Build 1 246664179 3I CTCCCTGCTC ---/CTT CTACTCGATC 3070 het 3070 hom 64 14 38 12 CTT 0 1 65232 CASAVA_Build 1 246664294 4I CCCACTTCTA ----/CCTC CCTCCCTTCG 3070 het 3070 hom 66 20 38 8 CCTC 1 2 65233 CASAVA_Build 1 246664411 2D GAAAATCCAC AG/-- AAACAGAATA 3070 het 3070 ref 62 43 9 11 AG 1 0 65234 CASAVA_Build 1 246664533 2I23M1I TGGTGATGGT --TGTATCAACCTAAAGGAAAAAAC-/TGTGTATCAACCTAAAGGAAAAAACT TGAGGCAAAG 3070 het 3070 ref 65 40 14 20 N/A 0 0 65235 CASAVA_Build 1 246665628 4D ATGAGAAAAG GTCT/---- GTCTTCTTGA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 GTCT 2 1 65236 CASAVA_Build 1 246665658 2D TCAAAGATCT TA/-- TATACACTGA 903 het 903 ref 26 7 3 20 TA 3 2 65237 CASAVA_Build 1 246665818 2I ACTTCCTTAG --/AA AAACATTGAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 3 5 65238 CASAVA_Build 1 246666112 3I6M2I GATGCAAGCT ---CTATTT--/CTCCTATTTAA GTCACTGGAT 3070 hom 120 het 42 0 40 4 N/A 0 0 65239 CASAVA_Build 1 246666336 2I TTGAATTCAT --/AG ACTCTCCCTG 3070 hom 151 het 56 0 51 5 AG 0 1 65240 CASAVA_Build 1 246668078 2I AATGTCTGAA --/AT ATATTTCAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 AT 2 3 65241 CASAVA_Build 1 246668782 2I CCTTTCCCTT --/TG TGTGAAGTAA 3070 het 3070 hom 64 27 28 9 TG 2 3 65242 CASAVA_Build 1 246669677 3I CTTAAGCCTC ---/ATT ATTTTCAACT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 ATT 1 2 65243 CASAVA_Build 1 246669847 2I69M1I CTAATTTGTG --GTGTTTAATTCTGGAGGACTTGTTTGGATGAAGGTAATTGGAGCTGTCATATTCCCAGGAATAACTCTA-/GTGTGTTTAATTCTGGAGGACTTGTTTGGATGAAGGTATTTGGAGCTGTCATATTCTCAGGGATAACTCTAG ACCAGTGCTG 3070 hom 51 het 20 0 18 13 N/A 0 0 65244 CASAVA_Build 1 246670240 2D CAAATAACTC AT/-- AAGTGGTCCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AT 1 0 65245 CASAVA_Build 1 246670324 1I AGATCCCTTC -/T TTTTGGGATA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 4 5 65246 CASAVA_Build 1 246670587 2D TTGAGCACTC AA/-- ATTTTACAAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 3 1 65247 CASAVA_Build 1 246671078 2D CAACTTTATC AT/-- ATCTCTTTCG 3070 het 3070 hom 45 14 26 5 AT 2 1 65248 CASAVA_Build 1 246671183 2I TCCCCTGGCT --/TC TCTTTGCCCT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 TC 1 2 65249 CASAVA_Build 1 246672770 4I TCTCAGCATA ----/TTTT TTTTTCTTGC 3070 hom 169 het 62 0 57 5 T 5 9 65250 CASAVA_Build 1 246672837 1D TTGGCTGTTT C/- CCCACCCAAA 456 het 456 ref 25 5 2 19 C 4 3 65251 CASAVA_Build 1 246673342 2I AAATTAAAAC --/AG AATCTAAACT 2269 hom 15 het 9 0 6 3 AG 0 1 65252 CASAVA_Build 1 246673411 1D18M2D CTGATGATAT AAAAAGGATTACTTCCTGAAG/-AAAAGGATTACTTCCTGA-- AGAGTTAAAG 2938 hom 18 het 9 0 6 5 N/A 0 0 65253 CASAVA_Build 1 246673520 4D37M1I AAGTCTAAAT TATATAAGATAACTAAGTTCAACACTAGACAAAGTATTGTG-/----TAATATAACTAAGTTCAACACTAGACAAAGTATTGTGA ACACATGAAC 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 N/A 0 0 65254 CASAVA_Build 1 246673894 4D ATCAATCCAA TAGT/---- TAGTTGGAGA 3070 hom 57 het 32 0 20 15 TAGT 2 1 65255 CASAVA_Build 1 246673936 3I69M2D52M1D ATATAAAATA ---TTCAGGAATTATTGAATAACATTCTAAAGGCTGAAAAAGGGTATGGGTTTTCTGCTTATCTGCAACAGAGGGTATAAGGTATGTGTCCAATGGATTTGTGATGACTAGCAATCATAAGTAATGT/TTCTTCAGGAATTATTGAATCACATTCTAAAGGCTGAAAAAGGGTGTGGGTTTTCTGCTTATCTGTAACAGA--GTATAAGGTATGTGTCCAATGGATTTGTGATGACTAGAAATCATAAGTAATG- TGCCCATTAG 3070 het 1790 hom 24 6 12 62 N/A 0 0 65256 CASAVA_Build 1 246674256 3I CCTCACTTTT ---/TTC TTCTCTACCA 3070 hom 78 het 37 0 27 10 TTC 1 2 65257 CASAVA_Build 1 246674715 2D GGCAGTGGAC AA/-- AGACAGGCCT 3070 het 3070 ref 69 43 17 9 A 3 1 65258 CASAVA_Build 1 246675052 2D TATTGTGTTC CT/-- TTTTCCCAGG 3070 het 1263 hom 49 6 36 10 CT 1 0 65259 CASAVA_Build 1 246675168 2I CTCCCCAAAC --/AA AAGAGGCCAG 3070 het 3070 ref 58 40 16 2 A 2 4 65260 CASAVA_Build 1 246675534 3D ACAATGTATT TAA/--- TAAGAAGTCT 3070 het 3070 ref 46 26 15 7 TAA 2 1 65261 CASAVA_Build 1 246676840 2D ATAGTGCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 31 1 21 9 T 16 14 65262 CASAVA_Build 1 246676960 2D ATGAATGAAA AC/-- AGTTACCATT 3070 het 3070 hom 37 10 21 7 AC 1 0 65263 CASAVA_Build 1 246677285 4D AGGTGGATCT TTCA/---- TAAGTACCTT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 TTCA 1 0 65264 CASAVA_Build 1 246678073 1I54M1I TGCCAAAGAG -AGGCTGTAAGGTGCTTGCTTTAACTAAAAAGGTGAAAGTTCTTGACTTAAGGAG-/AAGGCTGTAAGGTGCTTGCTTTAACTAAAAAGGTGAAAGTTCTTGACTTAAGGAGA AGAGAAACCC 3070 het 287 hom 12 1 12 4 N/A 0 0 65265 CASAVA_Build 1 246679892 3D TCAAACCACA CAT/--- CGTAATGCTA 3070 het 1350 hom 13 3 10 2 CAT 1 0 65266 CASAVA_Build 1 246688026 8D2M3I10M3D2M8I CACTGATAAG TGGTTTAACT---ATTTTAAAATTGGAG--------/--------CTCCAATTTTAAAAT---AGTTAAATCA CTTATGTAAA 3070 het 3070 ref 42 34 17 9 N/A 0 0 65267 CASAVA_Build 1 246688690 1D TAGGATGAAG A/- ATGAACATAG 3070 het 3070 ref 70 45 19 6 A 2 1 65268 CASAVA_Build 1 246689817 2D TTTTATTAAC TG/-- TGGGCTTTTC 3070 het 3070 ref 67 49 13 7 TG 2 1 65269 CASAVA_Build 1 246690408 2D AATTTTCATA AT/-- AGTCTTTTAT 3070 hom 160 het 57 0 54 5 AT 1 0 65270 CASAVA_Build 1 246696535 3D AAGAGTACAA AAG/--- AAGGATTGTG 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 AAG 2 1 65271 CASAVA_Build 1 246697095 2D TATACCCTTT TA/-- GTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 55 30 23 5 TA 1 0 65272 CASAVA_Build 1 246699035 2I TCTATATCTC --/TA TATATCTATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TA 2 3 65273 CASAVA_Build 1 246701863 1I AGTCCCAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 64 23 21 20 T 9 10 65274 CASAVA_Build 1 246705173 4I ACATTTGTTC ----/TAAT TAATATGCAA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 TAAT 1 2 65275 CASAVA_Build 1 246705609 2I TTTATATAAT --/TA TATTTACCTC 2465 hom 12 het 7 0 5 2 TA 1 2 65276 CASAVA_Build 1 246706612 2D ATACTGAATC AG/-- ACATTTTCTG 3070 het 3070 ref 54 34 13 8 AG 1 0 65277 CASAVA_Build 1 246706913 2I CTGGAGTCTT --/TA GAGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 58 32 22 4 TA 0 1 65278 CASAVA_Build 1 246707097 4I GCGGAAAATC ----/TTTG TTTCTCTCCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TTTG 0 1 65279 CASAVA_Build 1 246707700 2I TTTCTGTAAT --/TC TGTGTTCTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 TC 0 1 65280 CASAVA_Build 1 246707766 1D TTGAGACCTG T/- CTCACATACT 3070 het 3070 hom 55 21 28 7 T 1 0 65281 CASAVA_Build 1 246708454 5D CTTCACATAT AAATG/----- AAATTGTGCA 3070 het 3070 hom 44 18 20 7 AAATG 1 0 65282 CASAVA_Build 1 246708687 2I ATTTTAGCTT --/TC TGTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 TC 0 1 65283 CASAVA_Build 1 246708995 2D GCACAAGAAT TC/-- TTTCCTTTTT 3070 het 3070 hom 50 18 24 12 TC 1 0 65284 CASAVA_Build 1 246709182 4I ACTTTGGTGG ----/TATT TATTTATTAC 3070 het 1350 hom 26 7 7 12 TATT 2 3 65285 CASAVA_Build 1 246709419 1D15M24D AGAATTTTTA GTTGGCAAGCTTGTTACCAGAAGTCGAGTTGAGTATAAAT/-TTGGCAAGCTTGTTA------------------------ CCTGTCTGGT 3070 het 3070 ref 29 22 15 1 N/A 0 0 65286 CASAVA_Build 1 246711091 2I AATTATAAAA --/AT ATCTCAGAAT 3070 het 2827 hom 17 8 7 2 AT 1 2 65287 CASAVA_Build 1 246712691 8D9M3D TTTTGAAATT AATGAATAAAAGAAAATACC/--------AAAGAAAAT--- ATTCAACATT 2838 het 2838 ref 38 29 6 3 N/A 0 0 65288 CASAVA_Build 1 246712786 2D CCAAATAAAT TA/-- TTTTTGTATT 3070 hom 42 het 21 0 15 6 TA 1 0 65289 CASAVA_Build 1 246712814 1D CAAAGGTACC A/- AAAAAACCTC 1937 het 1937 ref 28 9 4 17 A 7 6 65290 CASAVA_Build 1 246713077 1I CCCAGGCTGG -/A AGTGCAATAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 1 2 65291 CASAVA_Build 1 246715638 2I TGATTTCTGA --/GG GGGTTACAAA 3070 het 3070 ref 60 36 15 9 G 3 5 65292 CASAVA_Build 1 246725668 2I AACCATGTGA --/TG CTAATTACTC 2450 hom 12 het 5 0 5 0 TG 0 1 65293 CASAVA_Build 1 246727926 1I CCAACAGAAA -/G TAAAGGACAC 3070 hom 80 het 33 0 30 3 G 0 1 65294 CASAVA_Build 1 246728606 2I TAGAGGGCCA --/AT AGATGCAAAG 1460 hom 7 het 3 0 3 0 AT 0 1 65295 CASAVA_Build 1 246731039 2D TCCCACTCTC CT/-- CTCTTTTCAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 CT 3 2 65296 CASAVA_Build 1 246749901 2I ACATGGACAC --/AT ATGTTTATTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 1 2 65297 CASAVA_Build 1 246753597 2I CTGATTTAAT --/TC TCTGTCTCTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TC 1 2 65298 CASAVA_Build 1 246756764 3D TTTTGATGGG TTT/--- TTTTTTTCTT 3070 hom 62 het 26 0 21 6 T 10 7 65299 CASAVA_Build 1 246768818 3I GACACAAGAT ---/GAA GAAGTCCTAG 1902 hom 10 het 4 0 4 0 GAA 1 2 65300 CASAVA_Build 1 246771997 1D AATAAATCTA C/- CCCAAAATTA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 4 3 65301 CASAVA_Build 1 246774014 1I GTTCAAATTG -/T TTCCAGTTCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 3 65302 CASAVA_Build 1 246774400 1D CGAACTTTAC T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 8 7 65303 CASAVA_Build 1 246779323 2I TCTTTGCATC --/TA TTGGTCCTCT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TA 0 1 65304 CASAVA_Build 1 246782263 2I TGAGTAATTA --/CC GTCACATGGT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 C 0 2 65305 CASAVA_Build 1 246783620 1D CTTTAGGATT G/- TTTTTTTCTA 3070 hom 96 het 38 0 33 8 G 1 0 65306 CASAVA_Build 1 246785080 1I TGTCCTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 794 hom 35 3 24 8 T 12 13 65307 CASAVA_Build 1 246788019 4I CTTCACAAAA ----/AAGT ATCATTAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AAGT 0 1 65308 CASAVA_Build 1 246794931 3D CTGTCTCAAA AAG/--- AAGAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 7 AAG 2 1 65309 CASAVA_Build 1 246795257 3D33M4I CCAATGTTGA ATGATATTTTCTTTAATTTCAAAAATAATTAGTAAC----/---ATATTTTCTTTAATTTCAAAAATAATTAGTAACTGTT TGTTCCAGGC 3070 hom 66 het 20 0 22 4 N/A 0 0 65310 CASAVA_Build 1 246795577 1I GGCAGAGATG -/C TTTAAGCAGA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 0 1 65311 CASAVA_Build 1 246796628 6I TAAGCAAGTT ------/TTTAAG TTTGTTTTTC 2936 hom 15 het 6 0 6 0 TTTAAG 0 1 65312 CASAVA_Build 1 246797256 1D CCTGCCAGGC T/- TCAAGTTTGC 1440 hom 7 het 3 0 3 0 T 2 1 65313 CASAVA_Build 1 246798019 1D TTCAAAAGCA G/- TCCTGCCCAC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 G 1 0 65314 CASAVA_Build 1 246798735 1I CTTGAGTCAC -/A AAAAAATCAG 3070 het 2711 hom 23 11 8 4 A 6 7 65315 CASAVA_Build 1 246798960 2D ATAAAAGGAA AG/-- AATTCTTGTG 3070 het 3070 hom 17 8 7 2 AG 1 0 65316 CASAVA_Build 1 246799502 5D ATATTGCACA ATTTC/----- ATTTATATGT 1937 het 1495 hom 7 3 4 0 ATTTC 1 0 65317 CASAVA_Build 1 246800530 4I TTAGGAACAA ----/AAAG AAAACAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AAAG 0 1 65318 CASAVA_Build 1 246800854 2I GGAGAGAAAC --/AA AGATTTTCCG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 1 3 65319 CASAVA_Build 1 246802339 2I TTCCTGAGGT --/CA AAATAATTAT 1955 hom 10 het 4 0 4 0 CA 0 1 65320 CASAVA_Build 1 246804690 2D ATGACTGGCT CA/-- CAGTTTCCCC 2487 hom 15 het 6 0 5 1 CA 2 1 65321 CASAVA_Build 1 246813036 3I TTGGTTACAT ---/TAA TAAGTTCTTT 1817 hom 10 het 4 0 4 0 TAA 1 2 65322 CASAVA_Build 1 246868873 3I AGGGTCAGGT ---/AGA AGAAGATTTG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 AGA 2 3 65323 CASAVA_Build 1 246872011 3D ATTTAGCATT ACG/--- ACGTGTGGTT 3070 het 3070 ref 40 24 13 5 ACG 2 1 65324 CASAVA_Build 1 246873681 2I TTCAGTTTGA --/TG TGTGACAGCA 3070 hom 30 het 23 0 11 12 TG 2 3 65325 CASAVA_Build 1 246873779 1I AGGGTTTCTC -/T TCTCCTTAAG 1438 het 288 hom 10 4 3 3 T 1 2 65326 CASAVA_Build 1 246873833 1I CCTTACAGCC -/T TCTCTTTGGC 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 1 2 65327 CASAVA_Build 1 246873969 2I TGAATGACTC --/AG GGGGTAGCAT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 AG 0 1 65328 CASAVA_Build 1 246874062 2D TTGAGATTTT TC/-- ATTTAATATT 3070 het 3070 ref 40 22 16 4 TC 1 0 65329 CASAVA_Build 1 246874615 4D TAAGGTACTT ATGA/---- AAGATCCACC 3070 het 3070 hom 28 8 18 5 ATGA 1 0 65330 CASAVA_Build 1 246874923 4I TTTATCTGCC ----/TATT TATTTAAATG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 TATT 1 2 65331 CASAVA_Build 1 246875047 1D TGCTTGGCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 10 het 27 1 24 2 A 10 9 65332 CASAVA_Build 1 246875753 1D TAGTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 17 4 A 11 10 65333 CASAVA_Build 1 246875898 4D ATATGAACGG AACA/---- ATCATTTAAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AACA 1 0 65334 CASAVA_Build 1 246876336 2I ATCCTACCTC --/AG AGAAGCTGGG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AG 1 2 65335 CASAVA_Build 1 246876434 2I CTTTTCACTA --/AT AGAGTCCCAC 3005 hom 20 het 9 0 7 2 AT 0 1 65336 CASAVA_Build 1 246877529 2D50M3I AAAAGTGGCA TTTGTCACTTAGGTTAAGTGTTTTTCAGAATTATTTGTCTTACGTGTACTAC---/--TGTCACTTAGGTTAAGTGTTTTTCAGAATTGTTTGTCTTACGTGTACTACAGA AGAATATTGA 3070 het 1349 hom 19 3 13 10 N/A 0 0 65337 CASAVA_Build 1 246877645 2D TGCAATTGGT AG/-- AGAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 28 4 AG 2 1 65338 CASAVA_Build 1 246877803 3I TTGCTTCCCA ---/AAC ATCATCATTG 3070 hom 100 het 40 0 37 3 AAC 0 1 65339 CASAVA_Build 1 246877898 2D ATATTTTATA CC/-- CTCTGTTGCA 3070 het 3070 ref 40 31 8 1 C 3 1 65340 CASAVA_Build 1 246878029 2I ATTGGATACA --/CT CTTCCCTCTG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 CT 1 2 65341 CASAVA_Build 1 246878374 5I TTGAACTTAG -----/TTATC TTATATGATT 3070 hom 81 het 46 0 28 18 TTATC 0 1 65342 CASAVA_Build 1 246878441 2D24M2D TCTTATTCAC CTTTTTTCTCTTTTCCTTCCCTTTAACT/--TTTTTCTCTTTTCCTTCCCTTTAA-- CTCTTCAGGA 3070 het 3070 hom 56 24 28 23 N/A 0 0 65343 CASAVA_Build 1 246878573 2D TTTTAATTTC AG/-- ATAATTCTGC 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 AG 1 0 65344 CASAVA_Build 1 246879381 2D GGCTTCCCCC AA/-- AAAAGACTTA 2991 hom 18 het 8 0 7 1 A 6 4 65345 CASAVA_Build 1 246879704 1I TGAAATCCTT -/A AAAATCCCAG 1495 hom 10 het 4 0 3 1 A 4 5 65346 CASAVA_Build 1 246880833 2D54M3D CACAAAAGAG ATATGACAAAGTTGGAAAGGTATCTGATTTACATAAAACATTATGATGTAGTCATGAAC/--ATGATAAAGTTGGAAAGGTATCTGATTTACATAAAACATTATGATGTAGTCATG--- AAACCAAGGT 2706 het 2706 ref 41 26 7 14 N/A 0 0 65347 CASAVA_Build 1 246881212 1D ACTAGACTCT A/- AGTTCTCACA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 2 1 65348 CASAVA_Build 1 246881503 3D CAAACTACCA ATT/--- ATTAACATAC 3070 het 3070 ref 90 46 28 20 ATT 2 1 65349 CASAVA_Build 1 246881812 3I GCACAAAGTT ---/AAC AATTCAAACA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAC 0 1 65350 CASAVA_Build 1 246882239 3I TACAGTTGAA ---/AAT AATTAGGCTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AAT 1 2 65351 CASAVA_Build 1 246882300 1I GACAGTGTAA -/T TTGTTCTATG 1385 hom 7 het 6 0 3 3 T 2 3 65352 CASAVA_Build 1 246882614 1D CCCTCAGTAC A/- ATTCCACCAC 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 2 1 65353 CASAVA_Build 1 246885006 1D TGAGGTACCT A/- AACAAGGTGG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 3 2 65354 CASAVA_Build 1 246885562 5I GAACTGAAAC -----/AGGGG AGTACAGGCA 269 hom 6 het 8 0 2 6 AGGGG 0 1 65355 CASAVA_Build 1 246885779 3D19M2I4M3I GCAGGCTGTT AAGAAGATAGAGATCCAGTGAC--AAAT---/---AAGATAGAGATCCAGTGACTTAAATAGG AGAGCTTGCA 3070 hom 42 het 10 0 15 3 N/A 0 0 65356 CASAVA_Build 1 246886098 2I GAAATCAATG --/TT TTTCTAAGGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 3 5 65357 CASAVA_Build 1 246886283 4D TACTTCAAGA AGAC/---- AGACCTTTTC 3070 hom 36 het 13 0 11 3 AGAC 2 1 65358 CASAVA_Build 1 246886574 1D AAACTCCAAC A/- AAATTACACC 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 4 3 65359 CASAVA_Build 1 246886661 2I AACTTACCAC --/TT TTACCATTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 2 4 65360 CASAVA_Build 1 246887054 1I AATTTTATAC -/T TTCCCCCCGC 118 het 118 ref 31 20 2 9 T 2 3 65361 CASAVA_Build 1 246887360 1D ACTTTGCCTC A/- AGTTTTTTCC 2290 het 2290 ref 54 44 5 5 A 2 1 65362 CASAVA_Build 1 246887504 2D GTATTCTGTT TC/-- TGTGGATTTT 3070 het 908 hom 17 2 13 2 TC 1 0 65363 CASAVA_Build 1 246888973 5I TTTTTCTGTT -----/GAGAA GAGAACTGTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 GAGAA 1 2 65364 CASAVA_Build 1 246889630 10D CCTGCAAGTT TCTGCTAGTC/---------- TCTGCTAGTC 3070 hom 84 het 29 0 29 3 TCTGCTAGTC 2 1 65365 CASAVA_Build 1 246892750 5I CTTTTAGAAG -----/ATAAC ATAGGATAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ATAAC 0 1 65366 CASAVA_Build 1 246893843 1I ATCAGCTAAA -/C TGACAGTACC 3070 hom 24 het 9 0 8 1 C 0 1 65367 CASAVA_Build 1 246908771 1D TTGGAGGCTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 8 65368 CASAVA_Build 1 246913964 1I CTCAAAAAGG -/A AAAAACAAAA 3070 het 747 hom 37 3 28 6 A 5 6 65369 CASAVA_Build 1 246914784 13D GAGGGAAAAA ATAAGTTGAAAAC/------------- ATTGAACAGT 3070 hom 42 het 14 0 15 2 ATAAGTTGAAAAC 1 0 65370 CASAVA_Build 1 246923705 1D AAGCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 32 0 24 8 A 13 12 65371 CASAVA_Build 1 246924180 1I GTAACAAGCC -/A TTTTTTTTCG 3070 hom 107 het 41 0 36 5 A 0 1 65372 CASAVA_Build 1 246925158 1I TATGCTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 18 0 16 2 G 0 1 65373 CASAVA_Build 1 246934614 7D GATCCTGGGA GGGCAAG/------- GAGCAAGGAG 3070 hom 77 het 28 0 25 4 GGGCAAG 1 0 65374 CASAVA_Build 1 246934743 10D GGTAGCCTTC CACCCATTAG/---------- CACAGAGCTT 3070 hom 63 het 22 0 22 2 CACCCATTAG 1 0 65375 CASAVA_Build 1 246937305 1I TTTTGTTGAC -/A AAAAAATATA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 6 7 65376 CASAVA_Build 1 246938190 3I AGAACTACTG ---/AGA AGATGAACAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AGA 1 2 65377 CASAVA_Build 1 246938790 2D TGAGAAAGCA CT/-- CCGCAGGGTG 3070 hom 81 het 30 0 23 8 CT 1 0 65378 CASAVA_Build 1 246939940 1D TCGTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 1304 het 1304 ref 31 16 4 11 T 15 14 65379 CASAVA_Build 1 246940225 5D ACCTTTCCTT TTTAC/----- TTTTAATGGC 3070 hom 75 het 27 0 26 4 TTTAC 1 0 65380 CASAVA_Build 1 246944489 2D AAAAAAGGAA AC/-- ACACACTAAT 3070 hom 48 het 21 0 17 6 AC 4 3 65381 CASAVA_Build 1 246946851 3I GTGTAAAAAA ---/ATT ATTATTCTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ATT 2 3 65382 CASAVA_Build 1 246964702 1D CATTTCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 11 10 65383 CASAVA_Build 1 246968604 1D ATCAGTTTAC A/- AAAAAGTATT 3070 het 3070 ref 49 21 22 8 A 6 5 65384 CASAVA_Build 1 247039771 1D ATATTGAACA T/- TTTTGCTGCT 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 5 4 65385 CASAVA_Build 1 247041196 1I ACAAAGAACC -/A GGGGGGAGAT 3070 het 1419 hom 23 7 11 5 A 0 1 65386 CASAVA_Build 1 247139005 1D TTTCCATATC T/- TTTTTTTTTT 2152 het 34 hom 11 1 6 4 T 15 14 65387 CASAVA_Build 1 247165101 1I ACGGGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 13 14 65388 CASAVA_Build 1 247169507 1I TCTTCCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 30 1 19 10 T 14 15 65389 CASAVA_Build 1 247197659 1D ACTGAGTCGG C/- CGTGAAGAAG 2815 hom 18 het 7 0 6 1 C 2 1 65390 CASAVA_Build 13 17926058 4D GTAGTAAAAC AAAT/---- AGGCAAATAA 1779 het 1779 ref 26 21 4 7 AAAT 1 0 65391 CASAVA_Build 13 17932088 1D ATGTTCCTCA T/- TTTTGAATGT 1352 het 1352 ref 21 14 3 4 T 5 4 65392 CASAVA_Build 13 17932902 2I TAATTGGTAG --/AT TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 39 26 8 5 AT 0 1 65393 CASAVA_Build 13 17934096 1I19M1I TCCACAGAAA -ATTTTTTAAAAATCTAAAA-/TGTTTTTTAAAAATCTAAAAT TGTATATTGC 3070 het 3070 ref 56 49 10 9 N/A 0 0 65394 CASAVA_Build 13 17934218 1I AATGTCCAAC -/A AAGCTACAGT 1698 het 1698 ref 39 30 4 5 A 2 3 65395 CASAVA_Build 13 17934352 1I CAATTTTTTT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 7 8 65396 CASAVA_Build 13 17938531 1I ATGTTACCAT -/C TTTTATCTAC 1446 het 1446 ref 10 6 3 1 C 0 1 65397 CASAVA_Build 13 17940743 4I GTGTTTCTCT ----/TCAG TATGAACTAT 3070 het 3070 hom 27 10 10 8 TCAG 0 1 65398 CASAVA_Build 13 17949858 3D CAAAATGTAC AAT/--- AAGTGTGGTG 3070 het 3070 ref 45 29 15 2 AAT 1 0 65399 CASAVA_Build 13 17954569 1D AGATTGTAGT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 8 7 65400 CASAVA_Build 13 17955293 1D CTCTTTGAAG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 8 7 65401 CASAVA_Build 13 17962715 1I CTACAAAAAT -/A ACATTGATGA 1790 het 1790 ref 45 39 4 2 A 1 2 65402 CASAVA_Build 13 17996731 4D TGAGACTAAC CAGT/---- CAATTATACA 3070 het 3070 ref 37 22 15 2 CAGT 1 0 65403 CASAVA_Build 13 17997852 1I TTTGACCTTG -/T TTTTTTCTAC 1307 het 1307 ref 45 26 5 14 T 6 7 65404 CASAVA_Build 13 18000846 2I ACACACACAC --/AT ACACACACAC 3070 het 95 hom 55 3 44 8 AT 0 1 65405 CASAVA_Build 13 18001298 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2159 het 1822 hom 18 5 6 7 T 15 14 65406 CASAVA_Build 13 18003498 1I AATAAACATG -/A AAAAAATGCT 2315 het 2315 ref 42 36 5 1 A 6 7 65407 CASAVA_Build 13 18011224 1I TGTTAGATTC -/A TTTTTTTTTT 3024 het 3024 ref 43 13 9 21 A 0 1 65408 CASAVA_Build 13 18018617 1D ATAAAAGTTG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 9 8 65409 CASAVA_Build 13 18047103 2I AATTCCAGCC --/AA GTATCAAGCC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 0 2 65410 CASAVA_Build 13 18055082 4I CTTTCTTTCC ----/TTTA TTTATTTATT 1259 hom 11 het 7 0 5 2 TTTA 2 3 65411 CASAVA_Build 13 18056528 1D TTCCTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 2501 het 58 hom 27 2 9 16 T 17 16 65412 CASAVA_Build 13 18056993 1I TGGACTACCC -/T TTGTGAAAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 2 3 65413 CASAVA_Build 13 18060751 1D TTTCATTGAA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 45 het 24 0 16 8 T 9 8 65414 CASAVA_Build 13 18061473 3D TTTAAATTGA TCT/--- TCTGTGTTAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 TCT 2 1 65415 CASAVA_Build 13 18065451 1I AGTGCTGGGA -/T TTACAGGCGT 2977 het 2977 ref 21 10 8 3 T 2 3 65416 CASAVA_Build 13 18066229 1D ACTATGTGCC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 6 A 8 7 65417 CASAVA_Build 13 18072996 1D TACGGGTCCT G/- GGCCCTGTGC 3070 het 2988 hom 30 9 13 9 G 3 2 65418 CASAVA_Build 13 18083808 1D GGCCGTGGAG A/- AAAAAAAACT 2273 het 2273 ref 49 38 5 6 A 9 8 65419 CASAVA_Build 13 18097580 1I CACTATTGCT -/G GTAGAGTCAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 1 2 65420 CASAVA_Build 13 18099035 6I TTTTGTCTGC ------/TGGGTT TGGGTTTGAA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 TGGGTT 1 2 65421 CASAVA_Build 13 18107372 2D CAGCAGAGGA AC/-- ATAAATTGTG 2844 het 2844 ref 14 7 7 0 AC 1 0 65422 CASAVA_Build 13 18113271 1I AGAAGAGGAA -/T TTTTTTTACT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 65423 CASAVA_Build 13 18121544 1D AAACTCCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 174 hom 25 2 11 12 A 17 16 65424 CASAVA_Build 13 18123442 1I ATAAGGCTGG -/A AAAAAATATA 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 6 7 65425 CASAVA_Build 13 18124142 1D AGCCTTGTAT A/- GAAAGGTAGT 3070 hom 51 het 18 0 17 2 A 1 0 65426 CASAVA_Build 13 18144101 14I TGGTCATAGC --------------/TCAGGAAGGAAGGG TCTTTCAGAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TCAGGAAGGAAGGG 0 1 65427 CASAVA_Build 13 18151878 2D TGAGAGAGAT GA/-- GAGAGAAGCC 1605 het 1605 ref 39 31 4 4 GA 4 3 65428 CASAVA_Build 13 18154214 1D ATGAATTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 25 0 23 2 T 10 9 65429 CASAVA_Build 13 18171926 1D TAGTGGAGAG A/- AAAAAAATTC 1304 het 1304 ref 46 41 3 4 A 8 7 65430 CASAVA_Build 13 18172432 1I TCCTAAAAGA -/C ATTTGCATTT 1822 het 1822 ref 40 32 4 4 C 0 1 65431 CASAVA_Build 13 18195813 1I TTAAAGTGAT -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 53 36 13 4 A 7 8 65432 CASAVA_Build 13 18196781 1I CTCTGTTCCC -/A TGAAGAATCA 2109 het 2109 ref 51 38 5 8 A 0 1 65433 CASAVA_Build 13 18210637 3I CATCTACACT ---/GTA GTACCAGACA 2507 het 2507 ref 64 44 9 11 GTA 1 2 65434 CASAVA_Build 13 18227325 1I CCCCTGAAGC -/A GTGATGCAAG 3070 het 3070 hom 66 25 28 14 A 0 1 65435 CASAVA_Build 13 18228712 3D GACCCACCAA CAT/--- CTCACGCACT 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 CAT 1 0 65436 CASAVA_Build 13 18229151 2I TAAAAACTTC --/AA AGTCTCATTT 3070 het 3070 ref 47 36 7 4 A 1 3 65437 CASAVA_Build 13 18270145 1D CTGTCCATCC T/- TCTGTCAGCC 1936 het 1936 ref 58 42 6 10 T 2 1 65438 CASAVA_Build 13 18272215 2I GATTTTTGCC --/AG AGAGAAGAAC 1365 het 1365 ref 40 33 3 4 AG 2 3 65439 CASAVA_Build 13 18274534 1D CTGACCTTGA C/- CCCCCCAAAT 1311 het 1311 ref 24 21 3 1 C 7 6 65440 CASAVA_Build 13 18275141 2I AAACATATTA --/TT TTCTGTCCCT 1201 het 1201 ref 23 16 3 4 T 2 4 65441 CASAVA_Build 13 18281570 5I CTCACCTGAG -----/TCTGA TCAGTGAGCT 3070 het 3070 ref 51 34 9 8 TCTGA 0 1 65442 CASAVA_Build 13 18281634 1D AGCCACTCAC A/- GACACTGCTG 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 A 1 0 65443 CASAVA_Build 13 18283217 2D CCTCTGAGGC TG/-- AGCCAGGGAC 3070 het 3070 ref 56 36 13 8 TG 1 0 65444 CASAVA_Build 13 18284144 3I AATCTTTTAA ---/ATC ATCATACAAT 2327 het 2327 ref 38 32 5 1 ATC 1 2 65445 CASAVA_Build 13 18290585 4I CGTATTATCC ----/TTGT TTAACTGCTC 1390 het 1390 ref 30 24 3 3 TTGT 0 1 65446 CASAVA_Build 13 18292833 1I ACTTGACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 10 12 A 10 11 65447 CASAVA_Build 13 18292988 3I GATATAATCT ---/TGC TGCTTCAATT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 TGC 1 2 65448 CASAVA_Build 13 18294555 2D GCAGCAGAAA AG/-- AGTCTCCTTT 3070 het 3070 ref 53 37 13 3 AG 2 1 65449 CASAVA_Build 13 18294667 1D TGAGGAGGAA C/- TTTTCCTAAA 3070 het 3070 ref 53 40 8 5 C 1 0 65450 CASAVA_Build 13 18306262 4I TTCCTAACAT ----/ATTC AATCAACTGT 2329 het 2329 ref 44 30 6 8 ATTC 0 1 65451 CASAVA_Build 13 18310983 5D ACTCAATAAA ATAAC/----- ATATCATGAT 3070 het 3070 ref 63 38 15 12 ATAAC 1 0 65452 CASAVA_Build 13 18311763 2D TGCAATAATT TC/-- TGTTTCTTCT 1112 het 1112 ref 37 25 3 10 TC 1 0 65453 CASAVA_Build 13 18329858 4D ATTTTTGTGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2381 het 1668 hom 23 11 8 4 T 19 15 65454 CASAVA_Build 13 18331794 2I AGACTGCCAG --/AA AAAAACAGAG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 5 7 65455 CASAVA_Build 13 18335747 4D GGCATAGCAT AGAG/---- AATTTTTAGG 2037 het 2037 ref 63 55 5 4 AG 2 0 65456 CASAVA_Build 13 18340565 18I CACTCTGTAA ------------------/CCAAAATACCTCGCTCTG TAGATATTTT 2043 het 2043 ref 45 35 5 5 CCAAAATACCTCGCTCTG 0 1 65457 CASAVA_Build 13 18344507 1I ACATTTTAAG -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 104 80 15 9 T 6 7 65458 CASAVA_Build 13 18345250 1I GGCTTATCAA -/T AAAAATTCTC 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 0 1 65459 CASAVA_Build 13 18345461 1D AAAGAGTTTC A/- AAAACTTCTA 3070 het 3070 ref 71 45 19 9 A 5 4 65460 CASAVA_Build 13 18345523 5D CTATAGACTA TATAT/----- TATAACAAAT 3070 het 3070 ref 85 60 17 14 TATAT 1 0 65461 CASAVA_Build 13 18346005 1D AAAAATTGCT A/- AAAAAAAAAA 2334 hom 12 het 18 0 5 13 A 11 10 65462 CASAVA_Build 13 18346269 1D AACTTCAACT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 66 45 16 6 A 8 7 65463 CASAVA_Build 13 18352895 1D AGGTAATGCT A/- TAAAATGTGT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 1 0 65464 CASAVA_Build 13 18352977 1I TTACTTTCAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 9 10 65465 CASAVA_Build 13 18353208 1I TGCTGGGGGC -/T TGGGTACGGT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 1 2 65466 CASAVA_Build 13 18355066 26I TACATATTAT --------------------------/TTGTTGCAAACAAAAATATGTTTTTG TAGGTTGGTG 3070 het 2705 hom 19 6 11 2 TTGTTGCAAACAAAAATATGTTTTTG 0 1 65467 CASAVA_Build 13 18355551 1D GTGCAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 20 1 8 12 T 15 14 65468 CASAVA_Build 13 18359365 1D CAAACTCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 10 9 65469 CASAVA_Build 13 18359775 1D ACTTTTTTTT G/- TTTGTTTTGA 2835 het 2835 ref 21 13 6 2 G 1 0 65470 CASAVA_Build 13 18361342 1D ATAGGCCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 13 12 65471 CASAVA_Build 13 18361668 1I AGACTCTATT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 7 8 65472 CASAVA_Build 13 18376957 2I TCTTTCCCCA --/AT GTCTTTCTGT 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 AT 0 1 65473 CASAVA_Build 13 18379284 3I CCCGCACCTG ---/TTC TTCTTCCTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTC 2 3 65474 CASAVA_Build 13 18379695 1I GCAAGAGTCA -/G GGGGGTAATT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 G 5 6 65475 CASAVA_Build 13 18381370 2D TACCCTCATC TA/-- TGATTTTATT 3070 hom 33 het 14 0 12 3 TA 1 0 65476 CASAVA_Build 13 18381471 4D TTCCATTGAC TGTT/---- TGTATTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TGTT 1 0 65477 CASAVA_Build 13 18381566 1D GTTAACATTT G/- TTTTTTTGTT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 G 1 0 65478 CASAVA_Build 13 18382353 3I TATGTATGTC ---/TTT TTTTTAGGTG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 5 8 65479 CASAVA_Build 13 18393696 4D TCCTGGACTC AAAT/---- GAATATGTAA 2462 het 2462 ref 19 12 6 4 AAAT 1 0 65480 CASAVA_Build 13 18395810 1D TTTAGTTATT G/- TGTTTAGTAA 3070 hom 51 het 22 0 17 6 G 1 0 65481 CASAVA_Build 13 18396013 1D AATCTCAGGC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 57 het 26 0 20 7 A 9 8 65482 CASAVA_Build 13 18406586 1D TTATTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 11 10 65483 CASAVA_Build 13 18410141 1D AGAATATCAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 10 9 65484 CASAVA_Build 13 18413499 4I TCTCTGTGAT ----/TGTA TGTTTTTGTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TGTA 0 1 65485 CASAVA_Build 13 18415281 2I CCTTTTCTTT --/CA CAGTTTTAGG 3070 hom 81 het 31 0 26 5 CA 1 2 65486 CASAVA_Build 13 18418008 1D CCCATGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 11 10 65487 CASAVA_Build 13 18421245 2I CAGTGGACTC --/AG GGGGTGCCCA 3070 hom 69 het 29 0 21 8 AG 0 1 65488 CASAVA_Build 13 18423917 1D CATTGTGGCC G/- GGGCTTGGTG 3070 hom 52 het 21 0 15 6 G 4 3 65489 CASAVA_Build 13 18449507 1I CCCTTTATTT -/C CCCCCCCATC 1941 het 1941 ref 26 15 6 5 C 7 8 65490 CASAVA_Build 13 18451308 3D ATAAAATGGG AAT/--- AATATTAGCA 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 AAT 2 1 65491 CASAVA_Build 13 18461127 1D CAAAGAACTT A/- AAACAAATTT 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 A 4 3 65492 CASAVA_Build 13 18463929 1I CTGTTGCAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 A 7 8 65493 CASAVA_Build 13 18464121 2I GCCCAATGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 10 12 65494 CASAVA_Build 13 18474870 1I CTGATGATAG -/T TTTCTTTTGC 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 3 4 65495 CASAVA_Build 13 18476550 1I TGGTCCTGGG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 8 9 65496 CASAVA_Build 13 18476881 2D GATTCATAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2265 het 1973 hom 17 7 6 4 T 13 11 65497 CASAVA_Build 13 18482125 3I ATCAGAACTT ---/ATC ATGAAAATTA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 ATC 0 1 65498 CASAVA_Build 13 18487045 4I ATACATATAC ----/ACAT ACATACATAC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 ACAT 4 5 65499 CASAVA_Build 13 18488013 4I57M1I ATAATTAAAA ----AGTATCTTTCAATTAGTTTGGAGAACTGAGTGACATTATAAAAAATTAAAAATTTGC-/AGTTAGTATCTTTCAATTAGTTTGGAGAACTGAGTGACATTATAAAAAATTAAAAATTTGCA AGACAAATTT 3070 het 3070 ref 34 23 21 7 N/A 0 0 65500 CASAVA_Build 13 18492008 1D ACGATCTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 11 10 65501 CASAVA_Build 13 18493818 1D GGAAATGCTT A/- AAGCTTGCTT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 3 2 65502 CASAVA_Build 13 18494959 5D GAGAGGAGGG GAGGA/----- GAGGGGAGGG 2175 het 1527 hom 18 7 10 3 GAGGA 1 0 65503 CASAVA_Build 13 18495100 2I TTAAATTGGG --/TC TCTGCTCTCA 3070 het 3070 hom 28 7 18 3 TC 1 2 65504 CASAVA_Build 13 18495352 1D CAGAATCCCC T/- GATAGGATTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 1 0 65505 CASAVA_Build 13 18496877 5I TGGTCAGTTT -----/CTTAA AAGTTCAGTG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 CTTAA 0 1 65506 CASAVA_Build 13 18497381 3D TTTTCACAAC AAT/--- GAGAAAACAA 3070 het 3070 ref 32 19 7 8 AAT 1 0 65507 CASAVA_Build 13 18499130 1D CAACACCTGT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 A 8 7 65508 CASAVA_Build 13 18499358 2I CCATCCCTAC --/AA AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 A 7 9 65509 CASAVA_Build 13 18502347 5I TCTCCTTGGG -----/CACCT CACCTCCATC 3070 het 3070 hom 23 9 8 6 CACCT 1 2 65510 CASAVA_Build 13 18505450 1I CAGCAGCCAG -/T TGTGGCCCTC 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 T 1 2 65511 CASAVA_Build 13 18510418 10I ATGCCTGTAA ----------/TCCCAGCACT TTGGGAGGCC 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 TCCCAGCACT 0 1 65512 CASAVA_Build 13 18512492 1D TTAAAAATCT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 A 8 7 65513 CASAVA_Build 13 18514145 4D GCTGTGTGTG TGTT/---- TGTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 TGTT 2 1 65514 CASAVA_Build 13 18514339 1I ATAGCTGGGG -/A AAACACTCTT 3070 het 3070 hom 38 10 21 7 A 3 4 65515 CASAVA_Build 13 18523060 6D CTCACCCAAA TGTTAT/------ TGAGCCTGAA 3070 hom 89 het 31 0 29 2 TGTTAT 1 0 65516 CASAVA_Build 13 18524897 2D AAAAAAATTT AA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 2 0 65517 CASAVA_Build 13 18532982 1D GCGGGACCTG C/- CCCCCCAGGA 3070 hom 60 het 26 0 19 7 C 7 6 65518 CASAVA_Build 13 18533352 1I CAGCCTGTAA -/G TTCAGGAAGA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 0 1 65519 CASAVA_Build 13 18539032 1I ATCTGGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 30 1 27 2 T 10 11 65520 CASAVA_Build 13 18539871 2I GTGGTGCCAG --/AC AGTGGGAGAA 3070 het 3070 ref 50 31 11 9 AC 0 1 65521 CASAVA_Build 13 18540181 3I CACCACCATT ---/ATC ATCACCAACA 3070 hom 146 het 67 0 50 17 ATC 1 2 65522 CASAVA_Build 13 18540432 2I TCATCATCAC --/TG TCGCCAACAC 2801 hom 56 het 45 0 15 30 TG 0 1 65523 CASAVA_Build 13 18540652 3I37M3D CCAGCATTAT ---CATCATCTCTACCACTATCATCACCACCGGTACCATTATC/CACCATCATCTCAACCACTATCATCACCACCAGCACCATT--- ATCACCAACA 2572 het 2572 ref 92 103 10 7 N/A 0 0 65524 CASAVA_Build 13 18541738 1D CAAAAATTGG A/- AAGGAAACTC 3070 het 3070 hom 80 39 35 9 A 3 2 65525 CASAVA_Build 13 18542071 2I14M1I ATGCAAAGAC --TTGTGGGACCGGAT-/TTTTGTGGGGCTGGATG AGCTGGGAGC 3070 het 3070 ref 105 62 44 14 N/A 0 0 65526 CASAVA_Build 13 18542339 10I CACCTGGACC ----------/CCAGGCTGCT CCAGGCTGTG 3070 het 3070 ref 84 37 30 17 CCAGGCTGCT 0 1 65527 CASAVA_Build 13 18543199 1D GCTGTGCCTG T/- TGAGTGTAAA 3070 het 3070 ref 76 41 25 11 T 2 1 65528 CASAVA_Build 13 18543660 1D CTGCTGCCCA G/- AAGCAGCTCA 3070 het 3070 ref 34 20 10 6 G 1 0 65529 CASAVA_Build 13 18544175 1I12M3I TGGCAAAATG -AAAAAATAAGCG---/AAAAAAATAAGAGAAT AATAATAGCT 3070 het 3070 ref 67 43 24 7 N/A 0 0 65530 CASAVA_Build 13 18544404 1D GTGGCCAATT C/- CCAGATGTCC 3070 het 3070 ref 68 35 24 9 C 3 2 65531 CASAVA_Build 13 18544950 1D CCATGGGACC T/- TTGAGTGGGC 3070 het 3070 hom 62 24 25 13 T 3 2 65532 CASAVA_Build 13 18545188 1I TTTTGACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 9 15 12 A 11 12 65533 CASAVA_Build 13 18545484 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2538 het 2293 hom 18 8 8 2 A 13 12 65534 CASAVA_Build 13 18547093 3I TCATCATCCT ---/CAC CACCATCATC 3070 het 3070 ref 102 53 41 9 CAC 1 2 65535 CASAVA_Build 13 18547683 2I GATTTGTCAC --/GA AATCCACAAA 3070 het 3070 ref 77 51 17 11 GA 0 1 65536 CASAVA_Build 13 18548409 1I CAGCCTGTTT -/C AGGGCCCTTG 3070 het 3070 ref 78 43 23 12 C 0 1 65537 CASAVA_Build 13 18549282 1I GATGAAAATG -/T TATCTGTCTG 3070 het 3070 ref 89 41 37 15 T 1 2 65538 CASAVA_Build 13 18551199 4D TAATAAAAGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 988 hom 29 9 13 9 A 17 13 65539 CASAVA_Build 13 18551334 4I TAAAGAAAAT ----/AGAC AGCCTGCAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 AGAC 0 1 65540 CASAVA_Build 13 18551756 2I AAGCCCCCCC --/AA CAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 0 2 65541 CASAVA_Build 13 18552352 2D TAGTCTTTAT CA/-- GACAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 CA 1 0 65542 CASAVA_Build 13 18552468 1D CTGCAGAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 13 13 6 A 9 8 65543 CASAVA_Build 13 18552995 1D AGAGTGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 13 8 A 13 12 65544 CASAVA_Build 13 18556471 1D ACATTACAGT A/- AAAAACCCGT 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 A 6 5 65545 CASAVA_Build 13 18560348 1I AACACACTTG -/A AACACAAACA 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 A 2 3 65546 CASAVA_Build 13 18561180 2I CACATGTGCT --/AC AGACACACAC 3070 hom 154 het 59 0 50 9 AC 0 1 65547 CASAVA_Build 13 18573056 1I CAGAATATCC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 7 8 65548 CASAVA_Build 13 18584855 1D TATTTTAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 29 2 21 6 A 12 11 65549 CASAVA_Build 13 18584996 4I ATGCATACAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 AC 5 7 65550 CASAVA_Build 13 18585417 1I TGTCTCCCTC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 65551 CASAVA_Build 13 18591160 2I AGAGGGTGAT --/AA GGGGGGGAAG 3070 hom 62 het 23 0 17 6 A 0 2 65552 CASAVA_Build 13 18591632 3I GGGAGGTAAG ---/CAC CAGGAGTGGG 3070 hom 40 het 18 0 12 6 CAC 0 1 65553 CASAVA_Build 13 18591816 2I GGGAAAAGAC --/AG GGGGAAATGT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AG 0 1 65554 CASAVA_Build 13 18592656 1I CTGATTTCTC -/T ATTCTGTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 0 1 65555 CASAVA_Build 13 18593257 2D TAGGGTTCTC TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TA 5 4 65556 CASAVA_Build 13 18594339 3D ATTTTGATTT AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 12 8 3 A 12 9 65557 CASAVA_Build 13 18597108 1D GCTCACCTCA T/- TGTGTGACAA 3070 het 3070 ref 44 16 19 10 T 2 1 65558 CASAVA_Build 13 18597385 1I TTTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 11 12 65559 CASAVA_Build 13 18600193 2I CATGAATGTT --/TC TGCTGTAATT 3070 het 3070 ref 40 23 17 0 TC 0 1 65560 CASAVA_Build 13 18602077 1D29M5D3M12D ATCGTGACAC TTTGTAGCATCCATTTCTGCACACATGATGAGCTCCCAGCTGGCAGAAAC/-TTGTGGCATCCATTTCTGCACACATGATG-----CCA------------ CACATCTAAC 3070 het 3070 ref 40 30 15 5 N/A 0 0 65561 CASAVA_Build 13 18603064 1I ATTCTAGCCC -/T TATTACATAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 1 2 65562 CASAVA_Build 13 18603822 1D TTTCAGTGTG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 31 17 14 2 T 9 8 65563 CASAVA_Build 13 18612400 1I GGGGGTCGGA -/T TTTTTTTTTT 2231 het 2231 ref 26 12 7 7 T 10 11 65564 CASAVA_Build 13 18613070 15D TCTACATCCG CTGCACCTACACCGT/--------------- CTGCACCTAC 3070 het 3070 ref 52 30 17 10 CTGCACCTACACCGT 1 0 65565 CASAVA_Build 13 18613840 2D TATCTCTACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 A 12 10 65566 CASAVA_Build 13 18614178 2I TTTCTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2408 het 2408 ref 25 12 9 4 T 10 12 65567 CASAVA_Build 13 18618564 1D CAACAACACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 17 24 4 A 10 9 65568 CASAVA_Build 13 18621214 3D ACATCGTCTT CTC/--- CTCTGTGTGT 3070 het 3070 ref 57 29 21 8 CTC 2 1 65569 CASAVA_Build 13 18622372 1I AAGTGGGGCA -/C CCCCCCAGGG 2437 het 2437 ref 34 15 9 10 C 6 7 65570 CASAVA_Build 13 18629992 1I CCCTCCTGGG -/C CCATGTTCCC 3070 het 3070 ref 54 32 17 5 C 2 3 65571 CASAVA_Build 13 18641486 1D TAAAATAGGC A/- AAAAAAAAAA 1239 het 254 hom 8 1 5 2 A 17 16 65572 CASAVA_Build 13 18643663 4I GCAATGAAGA ----/AAAC AAACAAATAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AAAC 1 2 65573 CASAVA_Build 13 18663690 1D ACTCTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 12 4 A 15 14 65574 CASAVA_Build 13 18666844 1I TGTTTTCATG -/T TTTTTTTTTT 2400 het 2260 hom 24 8 9 7 T 14 15 65575 CASAVA_Build 13 18669897 1D AAAAATATCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 10 9 65576 CASAVA_Build 13 18671149 3D GCCTGAAAGC AGA/--- AGGCTACTGC 3070 het 3070 hom 43 20 20 7 AGA 1 0 65577 CASAVA_Build 13 18672522 2D ACATTTTTAA AT/-- ATAGTTATGA 1569 het 1569 ref 44 36 4 5 AT 2 1 65578 CASAVA_Build 13 18673653 1D CAAGTTTTAC A/- AAAAAAAAAA 2771 het 2771 ref 25 12 8 5 A 12 11 65579 CASAVA_Build 13 18674547 3I AAAGCTGGGG ---/AGC AGCAGCATCA 2067 het 2067 ref 18 11 5 2 AGC 2 3 65580 CASAVA_Build 13 18675506 1D TGGAAATGAT A/- AAAAGGTATC 1901 het 1901 ref 26 16 5 5 A 5 4 65581 CASAVA_Build 13 18683560 3D AGCAGAGCAC AGA/--- AGATTTTTAA 3070 het 3070 ref 60 45 8 9 AGA 2 1 65582 CASAVA_Build 13 18696794 7D TTACTCTACT TCAAACA/------- TCAAAATACC 3070 het 3070 ref 38 22 15 7 TCAAACA 1 0 65583 CASAVA_Build 13 18698896 1D AGTAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1754 hom 19 6 9 4 T 12 11 65584 CASAVA_Build 13 18699008 11I CTCCTGCCTC -----------/AGCCTCCAACT AGCCTCCAAC 3070 het 88 hom 17 1 14 2 AGCCTCCAACT 1 2 65585 CASAVA_Build 13 18699061 9D GGCTAATTTT GTATTTTTA/--------- GTAGAGATGG 3070 hom 27 het 14 0 10 4 GTATTTTTA 1 0 65586 CASAVA_Build 13 18701576 20D TTTCTTTTTC TTTTTCTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTG 1806 het 826 hom 12 6 5 3 TTTTTCTTTTTTTTTTTTTT 1 0 65587 CASAVA_Build 13 18703711 1I AATGAATACT -/G GGGTCAATGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 3 4 65588 CASAVA_Build 13 18705394 1I CATCTCACAG -/A AAAAATAAAC 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 5 6 65589 CASAVA_Build 13 18708414 1D GACCACATTC T/- GCCATCCACA 3070 het 3070 hom 50 18 23 9 T 1 0 65590 CASAVA_Build 13 18709135 2D TGTGAAAACT AA/-- AAGAGACACC 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 A 4 2 65591 CASAVA_Build 13 18709575 2I GAATCCTCAT --/AC AGTTAGTGGA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AC 0 1 65592 CASAVA_Build 13 18718454 1D TAACACAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 10 9 65593 CASAVA_Build 13 18718666 1I TAAAGGGGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 352 hom 42 1 33 8 A 9 10 65594 CASAVA_Build 13 18718910 1D GCAACACAAT A/- AATATAAGGG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 3 2 65595 CASAVA_Build 13 18726409 1I TCACAGAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 A 12 13 65596 CASAVA_Build 13 18727781 7I GGTGATAGAT -------/TAAAGAC TAAACATTGG 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 TAAAGAC 0 1 65597 CASAVA_Build 13 18728183 3D TTTTGAGAAA GTT/--- GTTATTATTT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 GTT 2 1 65598 CASAVA_Build 13 18729799 3I AGAGGCTCTT ---/ATC ATGTCAGAAC 3070 hom 135 het 50 0 43 7 ATC 0 1 65599 CASAVA_Build 13 18731984 1D TCTCATGGTA T/- TTTTTTAAAA 2695 hom 27 het 11 0 10 1 T 7 6 65600 CASAVA_Build 13 18735176 1I CAGCATCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 653 hom 35 2 29 4 A 11 12 65601 CASAVA_Build 13 18739555 1I TATAAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 21 3 T 10 11 65602 CASAVA_Build 13 18756622 1D ATAAATTAAT C/- TTTTATAGTG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 1 0 65603 CASAVA_Build 13 18758952 2I AAAGGGCATC --/CA CATTGGAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 CA 1 2 65604 CASAVA_Build 13 18762437 1I TTCTCCTGCC -/T TCAGCCTCCC 3070 het 2044 hom 15 6 7 2 T 1 2 65605 CASAVA_Build 13 18762895 1I AACTACCTGA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 7 8 65606 CASAVA_Build 13 18772068 1I TAAGCTACTA -/G ATGTAAAGCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 0 1 65607 CASAVA_Build 13 18774331 1I AAATTAAGGT -/A TGTATATTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 0 1 65608 CASAVA_Build 13 18775502 1I ATAAAAACTT -/A AAAAAAAAGT 2916 het 2916 ref 22 11 10 1 A 8 9 65609 CASAVA_Build 13 18775879 1D TGGGAGGCCA C/- GGAGGGTAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 C 1 0 65610 CASAVA_Build 13 18790460 1D AGAAAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 A 13 12 65611 CASAVA_Build 13 18795003 1D GTTAATTTAC A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 120 het 46 0 41 7 A 7 6 65612 CASAVA_Build 13 18800451 4D CAAACTGTCA TTGT/---- TTGTTTGCAC 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 TTGT 2 1 65613 CASAVA_Build 13 18808383 1D ATGTTCTGAA T/- TTCCTGATTT 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 T 3 2 65614 CASAVA_Build 13 18811755 1D ATCATCCCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 10 9 65615 CASAVA_Build 13 18816340 1I GGATATTAGA -/T TTTTATCCAA 2888 het 2888 ref 21 12 6 3 T 4 5 65616 CASAVA_Build 13 18817272 2D TGGGTGTCAC AG/-- AGAGGAGATC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 AG 3 2 65617 CASAVA_Build 13 18821478 1D TCTTTAGTGA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 69 het 27 0 24 5 T 7 6 65618 CASAVA_Build 13 18821609 2D GTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 18 2 14 2 A 14 12 65619 CASAVA_Build 13 18822898 1I ACAAAATCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 10 11 65620 CASAVA_Build 13 18826400 10D TTCTATACTC AAAGGACTTG/---------- AAAGCAAGTA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AAAGGACTTG 1 0 65621 CASAVA_Build 13 18833049 1D AATAGCATTG T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 115 het 47 0 41 6 T 8 7 65622 CASAVA_Build 13 18835640 1I ACATGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 11 12 65623 CASAVA_Build 13 18846384 1D ATAAGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2166 hom 22 7 12 3 T 11 10 65624 CASAVA_Build 13 18847112 1D TGGATTTTTT C/- TCTTCTTCAG 1580 het 1580 ref 15 10 5 0 C 1 0 65625 CASAVA_Build 13 18848109 1D CCAAAAAAAA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 8 7 65626 CASAVA_Build 13 18849855 3D AAGGAGGATC ACT/--- TCTTCAGCCC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 ACT 1 0 65627 CASAVA_Build 13 18850097 4I TGGGATCTTT ----/CTAA CTGTTTCTCC 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 CTAA 0 1 65628 CASAVA_Build 13 18850520 1D GCACTTGTCA T/- TTAAATGTCA 3070 het 3070 ref 41 29 9 6 T 3 2 65629 CASAVA_Build 13 18851503 4I TTCATCAGCC ----/CAAA CAGAGACTAT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 CAAA 0 1 65630 CASAVA_Build 13 18853728 1I GAGGAATTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 77 hom 24 1 12 11 T 9 10 65631 CASAVA_Build 13 18857261 1D ATTTATGTAG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 53 het 22 0 18 4 T 8 7 65632 CASAVA_Build 13 18857475 23D ATTAAAAGAG AATAAAATAAAATAAAATCTAAC/----------------------- TATTTTTAAA 2882 hom 21 het 7 0 8 5 AATAAAATAAAATAAAATCTAAC 1 0 65633 CASAVA_Build 13 18858253 1I CTTACATTGA -/T TTTATCTGTG 2811 het 2811 ref 30 23 6 1 T 3 4 65634 CASAVA_Build 13 18858647 5D GCCAGGCCAC CGGGA/----- CTGGACTGCC 3070 het 964 hom 25 6 12 9 CGGGA 1 0 65635 CASAVA_Build 13 18859130 4D AAATAGAAAT AAAC/---- AAAACAGGAC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 AAAC 1 0 65636 CASAVA_Build 13 18861894 1I61M15D TTGTTTTGGG -AAAAAAATTCTGATATACAATTAAGAATCGACTATTTGTCCTTGAAACAAGAGAGACTCAGTGTTAAAATGGGCCC/AAAAAAAATTCTGATATACAATTAAGAATCGACTATTTGTCCTTGAAACAAGAGAGACTCAG--------------- TGGAAAATGT 3070 hom 75 het 18 0 26 10 N/A 0 0 65637 CASAVA_Build 13 18862345 1D TTAGATTTTT G/- GTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 2 1 65638 CASAVA_Build 13 18864349 1I ATTTTTAATC -/T TTGTGTTTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 3 65639 CASAVA_Build 13 18866835 1D GGTTCCTCTC T/- TTCCCCGGCT 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 T 3 2 65640 CASAVA_Build 13 18870759 1D ACAGGAGCTG T/- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 54 35 14 5 T 3 2 65641 CASAVA_Build 13 18872774 8I ACCCCATCTC --------/TACAAAAA TACAAAAATT 3070 hom 53 het 20 0 18 4 TACAAAAA 1 2 65642 CASAVA_Build 13 18873420 3D ATCGTCCCTT CTC/--- CTTCTGAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 CTC 1 0 65643 CASAVA_Build 13 18873815 1D44M2D GTCTTTACTC AAAAAAAAGTAATTGCATATTCTTAATTATAAGACAAAGATTTGGTT/-AAAAAAAGTAATTGCATATTCTTAATTATAAGACAAAGATTTGG-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 27 0 29 12 N/A 0 0 65644 CASAVA_Build 13 18876974 1I AGATTCTCGC -/T CTGTCGCCCA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 0 1 65645 CASAVA_Build 13 18877653 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 12 11 65646 CASAVA_Build 13 18879742 1I GCATAAGCTC -/A AGGTGAGACG 2161 hom 12 het 5 0 5 0 A 1 2 65647 CASAVA_Build 13 18879893 1I AATCTGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 10 11 65648 CASAVA_Build 13 18886568 1D TTTTAAGCTT A/- TTTCAAGATT 1822 het 1822 ref 45 36 4 6 A 1 0 65649 CASAVA_Build 13 18888830 1D AAGTGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 12 11 65650 CASAVA_Build 13 18893056 2I TGGTAATCTC --/CT TATTTCAAAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 CT 0 1 65651 CASAVA_Build 13 18894302 1I AAAATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 10 11 65652 CASAVA_Build 13 18894312 1I AAAAAAAAAA -/G GTAGCACCCA 3070 het 4 hom 19 1 14 4 G 1 2 65653 CASAVA_Build 13 18894973 2D AAGATGGAAA GT/-- GTGTGAAGTA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 GT 3 2 65654 CASAVA_Build 13 18897955 5I AGTTGGCCCT -----/GCGAA GTGTGCTGCC 3070 het 617 hom 16 3 10 3 GCGAA 0 1 65655 CASAVA_Build 13 18898067 5I ACCTAACTCT -----/TTCTA TTCTAGTCAG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TTCTA 1 2 65656 CASAVA_Build 13 18904172 1D GAGAAAAAAA T/- ATGCCTCTAA 1729 hom 12 het 5 0 5 0 T 1 0 65657 CASAVA_Build 13 18912569 1D CTTTCTTGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 25 0 19 6 A 10 9 65658 CASAVA_Build 13 18917558 1D TCACACACCC A/- AAAGGCTAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 4 3 65659 CASAVA_Build 13 18918217 1I AAGACATGAT -/G AAAAAAAGTA 1338 het 1338 ref 48 42 3 3 G 0 1 65660 CASAVA_Build 13 18920817 5D TGGTGAGGAT GAAGA/----- GAAAAGGGAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 GAAGA 1 0 65661 CASAVA_Build 13 18925679 10D TTTTATAATC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 AT 13 8 65662 CASAVA_Build 13 18927725 5I ACACCTAAGC -----/TAAGG TAATTGTAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAGG 0 1 65663 CASAVA_Build 13 18927837 1D AGTGATACAT A/- AAAAAATACA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 7 6 65664 CASAVA_Build 13 18929960 1I TAAACCACAC -/T AAAATGCCTT 1537 het 1537 ref 37 29 4 4 T 0 1 65665 CASAVA_Build 13 18934242 1I TCTTCACCTA -/T TTTTTTTTTA 2994 het 2994 ref 32 16 9 7 T 9 10 65666 CASAVA_Build 13 18935285 4D CACCAAACCC AACT/---- AATTTTTGTA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AACT 1 0 65667 CASAVA_Build 13 18952220 1I ACATGACTCA -/T TTTTTTATCA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 6 7 65668 CASAVA_Build 13 18961921 4I GTGTGTGTAG ----/ATAT ATCCTTTAGC 3070 hom 42 het 22 0 15 7 AT 1 3 65669 CASAVA_Build 13 18965207 1D GGCAATTACA C/- TAACAGGAAG 2288 het 2288 ref 28 21 6 1 C 1 0 65670 CASAVA_Build 13 18967360 1D CCTCAAGCAA G/- GGCTCCATCC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 G 3 2 65671 CASAVA_Build 13 18975728 2D TTTGTGTGGA GG/-- TAGTCAGCCC 3070 hom 105 het 38 0 34 5 G 2 0 65672 CASAVA_Build 13 18984724 1I ACAGGAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 35 3 25 7 T 13 14 65673 CASAVA_Build 13 18993494 1I TTTAAGTCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 9 65674 CASAVA_Build 13 18998894 1I ATGTGCATAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 49 het 22 0 17 5 A 8 9 65675 CASAVA_Build 13 19000360 1I CTTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 9 10 65676 CASAVA_Build 13 19015534 2D AGTTTCACTC TT/-- GTCTTCTAGG 1900 het 1900 ref 19 9 6 5 T 2 0 65677 CASAVA_Build 13 19016565 1I GAATGAATGA -/C AGCCAAGTGG 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 0 1 65678 CASAVA_Build 13 19023739 1I AAACAAAAAC -/A AAAATATGAA 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 A 4 5 65679 CASAVA_Build 13 19029062 1D AATTTAATGT C/- AAGCAAGAGG 3070 het 3070 ref 26 18 7 1 C 1 0 65680 CASAVA_Build 13 19034263 1I CCAGCTACTC -/G GGATGCTGAG 1359 het 343 hom 5 1 4 0 G 2 3 65681 CASAVA_Build 13 19039936 5I CTAAATCACT -----/TTAAA TTAGTAATTC 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TTAAA 0 1 65682 CASAVA_Build 13 19041154 1D TGTTTACTTT C/- ATCTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 C 1 0 65683 CASAVA_Build 13 19043691 1I ATTTTACCTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 8 9 65684 CASAVA_Build 13 19044751 1I GCTCTCCACT -/A TGGGACCCTG 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 A 0 1 65685 CASAVA_Build 13 19045076 2I TTATACTGTA --/TT TATTTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 1 3 65686 CASAVA_Build 13 19048672 1I AAGAATGCTT -/G TGATTTTTGC 2479 hom 12 het 5 0 5 0 G 0 1 65687 CASAVA_Build 13 19065409 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 1552 het 59 hom 21 2 15 4 AC 1 0 65688 CASAVA_Build 13 19113800 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 1887 hom 14 5 7 2 T 7 8 65689 CASAVA_Build 13 19122903 4D ACTAGGACCT AATA/---- AATCAGAGAG 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 AATA 1 0 65690 CASAVA_Build 13 19130613 2I AATACCTCAC --/AG GGGGGTGGGT 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 AG 0 1 65691 CASAVA_Build 13 19137639 11D TCTGTCCCGA GCCTGTCCTGG/----------- ACGGCGTCCC 3070 het 2421 hom 30 12 14 6 GCCTGTCCTGG 1 0 65692 CASAVA_Build 13 19142961 1D AATAAATCAC T/- TTTTTTTTTT 2139 het 2073 hom 25 8 8 9 T 15 14 65693 CASAVA_Build 13 19145227 1D11M2D GAACCTATAC GGTTTTTTTTTGTT/-GTTTTTTTTTG-- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 25 1 15 14 N/A 0 0 65694 CASAVA_Build 13 19147704 6D TGCTTGTATG GAGTAA/------ GAAATTCATA 1195 het 1195 ref 35 18 4 14 GAGTAA 1 0 65695 CASAVA_Build 13 19159809 20I CCACATAAAT --------------------/CCCCTATATTAAGTTAACCA CCCAGTCGTG 3070 hom 125 het 45 0 42 4 CCCCTATATTAAGTTAACCA 0 1 65696 CASAVA_Build 13 19161101 2D TGATAAACTC TT/-- AAAAAAAAAA 2749 het 347 hom 28 2 12 14 T 2 0 65697 CASAVA_Build 13 19171462 1I TTTTTCTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 9 10 65698 CASAVA_Build 13 19171838 5D AGCCTGCTAC TTACT/----- TTAAAGTAGT 3070 het 3070 hom 43 15 25 6 TTACT 1 0 65699 CASAVA_Build 13 19173350 1D ACAGCCTTGG C/- CAAAGGTACC 2764 het 2764 ref 22 16 6 0 C 2 1 65700 CASAVA_Build 13 19174247 2D TCCTTGGATG TC/-- TCTCAGCATT 3070 hom 39 het 18 0 14 5 TC 3 2 65701 CASAVA_Build 13 19175042 4I TTATTGAGAT ----/TAAG TAACTACATA 3070 het 3070 ref 51 31 13 7 TAAG 0 1 65702 CASAVA_Build 13 19175189 1D CAAGTTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 11 14 A 13 12 65703 CASAVA_Build 13 19182983 1D AAAAGCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 13 12 65704 CASAVA_Build 13 19186754 1D CCTGCCTCAG C/- CTCAAGGGTA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 C 2 1 65705 CASAVA_Build 13 19190851 1D TTCATAATTG C/- TAAAACCTGG 3070 het 3070 ref 41 27 9 5 C 1 0 65706 CASAVA_Build 13 19191964 4D ATTTTACATA AATT/---- AATTGTTAAA 3070 het 3070 ref 38 18 12 11 AATT 2 1 65707 CASAVA_Build 13 19193173 4I AATACTGAAC ----/ATAA ATAGACATTA 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 ATAA 0 1 65708 CASAVA_Build 13 19197768 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 53 22 26 5 A 8 7 65709 CASAVA_Build 13 19205067 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1934 het 1838 hom 20 6 9 5 A 10 11 65710 CASAVA_Build 13 19209737 1I GGGTTTCTCC -/A CTTTAAATTT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 0 1 65711 CASAVA_Build 13 19215069 3I TTACGAAGAA ---/GAG GAGTGAGGAG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 GAG 1 2 65712 CASAVA_Build 13 19215623 2D TAAATTATGC AA/-- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 A 9 7 65713 CASAVA_Build 13 19221778 1I ACAGTTTATC -/T TTTTTTTTTT 840 het 840 ref 11 3 4 4 T 15 16 65714 CASAVA_Build 13 19222600 2I ACAAACAAAA --/AT ATATATATAT 2409 hom 15 het 8 0 6 2 AT 8 9 65715 CASAVA_Build 13 19222934 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTTTTGCTC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AG 1 2 65716 CASAVA_Build 13 19230524 3I GAAAAGGGAA ---/AAG AATAAACATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAG 0 1 65717 CASAVA_Build 13 19234712 1D AAAAAAAGAT C/- AATCACAACC 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 C 1 0 65718 CASAVA_Build 13 19237837 10D TATCAGTCTT TACAAATAAC/---------- TACAAATAAC 3070 het 3070 ref 38 20 15 5 TACAAATAAC 2 1 65719 CASAVA_Build 13 19242195 2D CGGACAAAAC AT/-- AGTTATGTCC 3070 het 3070 ref 49 32 13 5 AT 1 0 65720 CASAVA_Build 13 19243774 1D TGAGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1798 hom 22 6 8 8 T 11 10 65721 CASAVA_Build 13 19258580 1I GACTCCGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 801 hom 21 2 11 8 A 13 14 65722 CASAVA_Build 13 19262463 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 1729 hom 12 het 5 0 5 0 T 10 9 65723 CASAVA_Build 13 19263040 2D ACCACATCTG TT/-- TTTTTTTTTT 565 het 454 hom 15 4 2 9 T 16 14 65724 CASAVA_Build 13 19267107 6D GGAGAAGGTC AGAGAG/------ AGAGAGAGAC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 AG 7 4 65725 CASAVA_Build 13 19277646 2D TGGCTAATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 54 het 26 0 18 8 TG 10 9 65726 CASAVA_Build 13 19286762 8D AGTCCGTCTC AAAAAAGA/-------- AAAAAAGAAA 3070 hom 27 het 16 0 8 8 AAAAAAGA 3 2 65727 CASAVA_Build 13 19289299 5D CTCAAGTCTC TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TTTGT 3 2 65728 CASAVA_Build 13 19303440 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTGTAG 1860 het 1860 ref 17 9 5 3 T 6 7 65729 CASAVA_Build 13 19306447 1D AAAACAGAAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 1784 hom 19 4 11 4 A 8 7 65730 CASAVA_Build 13 19307135 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 695 hom 35 5 12 18 T 15 14 65731 CASAVA_Build 13 19333990 1D GTCTAGTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 12 11 65732 CASAVA_Build 13 19338141 4I GTTACTTAAA ----/CTCT CTCAGCCTCA 3070 het 3070 ref 36 15 9 12 CT 1 3 65733 CASAVA_Build 13 19339491 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2091 het 923 hom 17 4 5 8 A 16 17 65734 CASAVA_Build 13 19345140 1I ACTCTACCCC -/A AAAAAAAAAT 2712 het 2712 ref 16 9 6 1 A 9 10 65735 CASAVA_Build 13 19349363 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 0 1 65736 CASAVA_Build 13 19360024 1D CTTCAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 1221 het 1221 ref 32 23 3 6 T 15 14 65737 CASAVA_Build 13 19363012 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 2478 het 1765 hom 22 8 8 6 A 15 16 65738 CASAVA_Build 13 19376342 1I TTTTTTTTTT -/G AATCATCTTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 G 0 1 65739 CASAVA_Build 13 19378679 1D TATATATATA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 8 7 65740 CASAVA_Build 13 19382367 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 855 het 855 ref 18 12 3 3 A 12 11 65741 CASAVA_Build 13 19394053 1I GTTACAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 22 6 T 10 11 65742 CASAVA_Build 13 19401787 1D ATGTCTTTTT A/- AAAGTGTTTG 3070 het 3070 ref 35 20 15 0 A 4 3 65743 CASAVA_Build 13 19406908 9D TCTTTCTTTC TTTCTTTTT/--------- TTTTTTTTGA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TTTCTTTTT 1 0 65744 CASAVA_Build 13 19410723 2I AAATAAAATT --/TA ATGGAGGGGG 3070 het 3070 hom 27 8 18 1 TA 0 1 65745 CASAVA_Build 13 19414432 12D TTTAATTTTA GTATGTATTTAT/------------ TATACATATT 3070 hom 51 het 19 0 18 3 GTATGTATTTAT 1 0 65746 CASAVA_Build 13 19420157 1I AAAAAAAAAA -/T GTTACATCAA 3070 hom 44 het 33 0 18 15 T 0 1 65747 CASAVA_Build 13 19422074 1I AGCGAGAGAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 44 het 18 0 15 3 A 7 8 65748 CASAVA_Build 13 19428410 1D GTTTATTCAC T/- TAGCATAATG 3070 het 3070 hom 34 9 21 6 T 2 1 65749 CASAVA_Build 13 19437227 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 16 1 13 2 A 13 12 65750 CASAVA_Build 13 19449774 3I CTGGGACTAC ---/AGG CGTCCGCCAC 3028 hom 21 het 8 0 7 1 AGG 0 1 65751 CASAVA_Build 13 19453995 7I CTGTTCGTGG -------/TTAAGAA TGCATGTCTA 3070 hom 144 het 50 0 48 2 TTAAGAA 0 1 65752 CASAVA_Build 13 19457674 1I AATGGTTGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 47 het 20 0 15 5 T 8 9 65753 CASAVA_Build 13 19464330 1I TCAAAAAAGA -/T TTAAAATTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 2 3 65754 CASAVA_Build 13 19468213 4I CCAATTCCTC ----/TATG TGTGTGTGTG 3070 hom 47 het 41 1 33 7 TATG 0 1 65755 CASAVA_Build 13 19478389 4D AAAAAAAAAA TTTT/---- TTTTTTCCTT 3070 het 21 hom 32 1 22 10 T 10 6 65756 CASAVA_Build 13 19489541 1D AGATTCAAGA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 7 6 65757 CASAVA_Build 13 19491247 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 90 hom 25 1 22 3 A 9 8 65758 CASAVA_Build 13 19492094 2I CTGAAAAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 631 hom 32 2 24 6 A 10 12 65759 CASAVA_Build 13 19502373 1D TCTTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 633 het 633 ref 20 9 2 9 T 15 14 65760 CASAVA_Build 13 19506355 12I TCTTAAGCTT ------------/TTTCTTGAGGTG GTCGTCATAT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TTTCTTGAGGTG 0 1 65761 CASAVA_Build 13 19508409 1I AATAAATCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 65762 CASAVA_Build 13 19520429 1D GCTATATCCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 8 7 65763 CASAVA_Build 13 19521321 1I TCACTTACTG -/T TTTTTTCATG 3070 hom 109 het 42 0 36 6 T 6 7 65764 CASAVA_Build 13 19522651 3D AATTGAAAAA AAT/--- AATAATAGTT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 AAT 3 2 65765 CASAVA_Build 13 19531471 1I ACTGGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 828 hom 44 4 32 8 A 11 12 65766 CASAVA_Build 13 19531835 1D TTTTTTTTTT C/- CCCAATAAAT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 C 4 3 65767 CASAVA_Build 13 19534008 1D CAGGTGTGAG C/- TACCACACCC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 0 65768 CASAVA_Build 13 19541579 2D TGGTAGCTCC CT/-- GTTACCAAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 CT 1 0 65769 CASAVA_Build 13 19550472 4D TAGAAGTAGA ATCT/---- ATCTAATAGC 3070 hom 84 het 31 0 29 4 ATCT 2 1 65770 CASAVA_Build 13 19551532 1I TCTGTGATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 10 65771 CASAVA_Build 13 19554139 1D TTTGTGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 6 T 13 12 65772 CASAVA_Build 13 19562043 1I ATTAGTGTTC -/A AAAACTTACA 3070 hom 81 het 46 0 28 18 A 4 5 65773 CASAVA_Build 13 19577532 4I AGGGCCTGGA ----/GGTC GGTCGGTAAA 3070 het 3070 ref 60 28 23 9 GGTC 1 2 65774 CASAVA_Build 13 19580008 1D GACTTGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 13 20 13 T 12 11 65775 CASAVA_Build 13 19581588 1D CAGCCTAGAT G/- GCTGTGCCAG 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 G 2 1 65776 CASAVA_Build 13 19584224 1I AAAAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 25 0 23 2 A 10 11 65777 CASAVA_Build 13 19587261 6I TAAAGAAAGC ------/AAATTG AAATTGTAGG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AAATTG 1 2 65778 CASAVA_Build 13 19588042 2D CCTGGGCAAC AT/-- AGCGAGATCC 3070 het 1748 hom 22 5 13 4 AT 1 0 65779 CASAVA_Build 13 19593629 2D CTTTGGTGTC AG/-- AGACCAATAC 3070 het 3070 hom 46 19 20 9 AG 2 1 65780 CASAVA_Build 13 19594671 1I GAAAAAAACC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 7 8 65781 CASAVA_Build 13 19595032 5I TTAATTTTTT -----/ATTTA TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 18 1 10 7 ATTTA 0 1 65782 CASAVA_Build 13 19597243 4D TCATCCATTC ATTT/---- GTTACTTCAA 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 ATTT 1 0 65783 CASAVA_Build 13 19602220 2D GTACAGACAT AG/-- AGATACACAC 3070 hom 150 het 55 0 47 10 AG 2 1 65784 CASAVA_Build 13 19602969 4I CATACAGACA ----/CACT CAGATACACT 3070 hom 165 het 61 0 55 6 CACT 0 1 65785 CASAVA_Build 13 19604850 1D GCTCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1659 het 883 hom 16 5 7 4 T 15 14 65786 CASAVA_Build 13 19606315 1I TCCTGCCTCA -/T GCCTCCAGAG 2013 het 1818 hom 11 5 5 1 T 0 1 65787 CASAVA_Build 13 19610747 1D TTAAATGTAC A/- ATGTCCATAT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 A 2 1 65788 CASAVA_Build 13 19613931 2D CACTGTAACT CA/-- CAGTGCTAAG 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 CA 2 1 65789 CASAVA_Build 13 19624457 1I CTCTGGAACG -/C AGTCACAGCC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 0 1 65790 CASAVA_Build 13 19649392 1I CCCAATGTGG -/C CCCCCTCTCG 3070 hom 60 het 24 0 17 7 C 5 6 65791 CASAVA_Build 13 19653639 1I ATATTTGTCC -/T TTTGTGTCTG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 3 4 65792 CASAVA_Build 13 19653903 1D GGCAAATGTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 9 8 65793 CASAVA_Build 13 19654750 2I ACTAGTCTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 51 1 37 13 T 11 13 65794 CASAVA_Build 13 19665574 10D CATTCCTCCA AGGACTGAAG/---------- ATCTGTTCGA 1917 het 1643 hom 15 7 7 1 AGGACTGAAG 1 0 65795 CASAVA_Build 13 19672456 1I AATCAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 34 1 19 14 A 11 12 65796 CASAVA_Build 13 19673547 1I AATTGACTAT -/C TACATTTCCA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 C 0 1 65797 CASAVA_Build 13 19679644 1D TCTTTGTTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 10 9 65798 CASAVA_Build 13 19683919 3I GTCCAGGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 108 het 47 0 36 12 TTG 5 6 65799 CASAVA_Build 13 19704652 1I CTGTCCCTCC -/G GGGGCCGGAT 869 hom 12 het 6 0 4 2 G 4 5 65800 CASAVA_Build 13 19706823 4D GGGAAAGAAA AGAG/---- AGAGAGGTGG 3070 hom 91 het 40 0 29 12 AG 5 3 65801 CASAVA_Build 13 19709029 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2809 hom 24 het 10 0 9 2 T 7 6 65802 CASAVA_Build 13 19709448 22D CCCGTATCTC CATAACATTCTGGTCACAACCA/---------------------- CATAACATTC 3070 hom 108 het 42 0 36 13 CATAACATTCTGGTCACAACCA 2 1 65803 CASAVA_Build 13 19713595 1D GGCTGCAGAG C/- CCCCCCCTCC 3070 hom 18 het 27 1 19 9 C 8 7 65804 CASAVA_Build 13 19718242 13I CAACATTAGT -------------/ACTGGCACCCTGC ACTGGCACCG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 ACTGGCACCCTGC 0 1 65805 CASAVA_Build 13 19719504 3I ATATAAGACG ---/TTT TTTTCCCCTA 3070 hom 108 het 39 0 35 4 T 4 7 65806 CASAVA_Build 13 19722397 3I ACAAATCTTA ---/TTG ATTGATTTCT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TTG 0 1 65807 CASAVA_Build 13 19743197 4D AAAATAACTG TAGC/---- ACAGAGTGAT 3070 hom 84 het 29 0 29 2 TAGC 1 0 65808 CASAVA_Build 13 19750655 1D GTTGCAAAAG A/- AAAAAAAATA 2633 hom 18 het 8 0 7 1 A 9 8 65809 CASAVA_Build 13 19750933 3D AAAAAAAAAG AAC/--- AATAAAAAGT 3070 hom 61 het 24 0 20 7 AAC 1 0 65810 CASAVA_Build 13 19752052 1D CATGCTTCAT A/- ATTATTTTTA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 2 1 65811 CASAVA_Build 13 19752794 2I AAAAAAAAAA --/AT TAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 20 5 AT 0 1 65812 CASAVA_Build 13 19753655 1D AGAATGGATG A/- AAAAAACTAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 7 6 65813 CASAVA_Build 13 19763171 5I CTCCTCCCTG -----/CCTCT CCTCTCCTCT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 CCTCT 2 3 65814 CASAVA_Build 13 19771215 1I CTTACCTCCA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 6 7 65815 CASAVA_Build 13 19784369 1I CGAGGAGTTT -/G GGGGAGATAA 3070 het 3070 hom 65 25 32 8 G 4 5 65816 CASAVA_Build 13 19787633 2D TTTGAAACTC CA/-- ACAATTCATA 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 CA 1 0 65817 CASAVA_Build 13 19800617 1D AAAACCCTTC A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 17 10 7 0 A 7 6 65818 CASAVA_Build 13 19814750 1I GGAGGAGCAC -/T TGTGGGCTGT 3070 hom 76 het 32 0 21 11 T 1 2 65819 CASAVA_Build 13 19816576 1D AAAAAAAGGC G/- GGGGCCAAAG 3070 hom 59 het 27 0 20 7 G 5 4 65820 CASAVA_Build 13 19819884 1D AACATCCAGG A/- AAAATGTGGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 5 4 65821 CASAVA_Build 13 19821031 2D CACTCAAGCT CA/-- CACACACACA 3070 hom 198 het 91 1 74 18 CA 6 5 65822 CASAVA_Build 13 19821318 2I CATCCATGCT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 104 39 39 26 CA 5 6 65823 CASAVA_Build 13 19828760 1I GCTGTCAGCT -/G GGCTACATTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 2 3 65824 CASAVA_Build 13 19830279 1I17M1I TGCATTCCTT -CCCCTCGCACCCCTTAC-/CCCCCTCGCACCCCTTACT CCCTCGCTAC 3070 het 3070 hom 38 12 20 10 N/A 0 0 65825 CASAVA_Build 13 19839026 6D AAAAAAAAAG AAAAGA/------ AAAAGAAAAA 1245 het 1245 ref 14 8 4 4 AAAAGA 4 3 65826 CASAVA_Build 13 19841335 1I AAAATTGGAA -/T TCAGAAAATA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 1 2 65827 CASAVA_Build 13 19841509 1D ACTGAAACTC T/- TTTTTTTTTT 2209 het 2209 ref 42 29 5 9 T 11 10 65828 CASAVA_Build 13 19842893 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 12 13 65829 CASAVA_Build 13 19860333 1I GGGGGAAAAA -/G AGAATGTCAG 3070 het 2096 hom 29 7 16 6 G 0 1 65830 CASAVA_Build 13 19865326 13D CATCACACAC ACCTCACATGCAT/------------- CACACACCAC 729 het 729 ref 59 39 7 23 ACCTCACATGCAT 1 0 65831 CASAVA_Build 13 19893205 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 11 9 65832 CASAVA_Build 13 19899879 1I GTTGCTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 32 1 26 5 A 13 14 65833 CASAVA_Build 13 19909064 2I TCTCGGAAAC --/TG TGGTTCCTCA 3070 hom 54 het 21 0 17 4 TG 1 2 65834 CASAVA_Build 13 19916761 1I GCTTGACATG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 6 7 65835 CASAVA_Build 13 19929008 3I GAAGTCAGAT ---/GAA GAAGGACCAG 3070 hom 115 het 41 0 37 4 GAA 1 2 65836 CASAVA_Build 13 19934310 16D ATAAGGTGGC AGGACGACCTAGTGGG/---------------- AGGACGACCT 3070 hom 33 het 12 0 11 3 AGGACGACCTAGTGGG 2 1 65837 CASAVA_Build 13 19935547 1D TTTTCTCCAG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 7 6 65838 CASAVA_Build 13 19938086 1D GAGCTGGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2544 hom 30 10 16 6 A 15 14 65839 CASAVA_Build 13 19939254 1D GCCCGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 1026 hom 10 het 7 0 4 8 T 13 12 65840 CASAVA_Build 13 19946727 1D AAACCAAGTA T/- TTCAAGGGAC 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 T 3 2 65841 CASAVA_Build 13 19950028 4I TATAATACTA ----/TAAT TACTATAAAT 1960 het 971 hom 7 2 4 1 TAAT 0 1 65842 CASAVA_Build 13 19958233 1D AAGTTTTTGT A/- TTTTCAGTAG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 1 0 65843 CASAVA_Build 13 19959390 2I TCTTTAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 10 12 65844 CASAVA_Build 13 19962784 1I ATGAAACAAT -/C CTCATGGCAG 3070 het 1965 hom 19 5 8 6 C 1 2 65845 CASAVA_Build 13 19963430 1I ATATCAGCTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 A 7 8 65846 CASAVA_Build 13 19968824 5D CCGAGGCAGG CAGAT/----- CAGATCTCTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 CAGAT 2 1 65847 CASAVA_Build 13 19971633 1D TAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 10 9 65848 CASAVA_Build 13 19972564 1D CACAGTTGAA G/- GAACTGGTTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 1 65849 CASAVA_Build 13 19982751 2D CAAGTGAATC TT/-- TTTTTTTTTT 2590 het 47 hom 27 1 11 15 T 18 16 65850 CASAVA_Build 13 19983049 1I GCTCCGTGGC -/A AAAAAAAAAG 2198 het 2198 ref 20 8 7 5 A 9 10 65851 CASAVA_Build 13 19992054 1D AATGTTTTAC A/- CATGATGATG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 1 0 65852 CASAVA_Build 13 20006850 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 7 8 65853 CASAVA_Build 13 20007080 1D GTCAATAAAT A/- AATGAATTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 3 2 65854 CASAVA_Build 13 20007695 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 16 0 11 5 A 10 9 65855 CASAVA_Build 13 20009270 1I CTTTCTTACA -/T TTTTTTATTC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 6 7 65856 CASAVA_Build 13 20010519 1I TTAAAAAAAA -/C AAAATAGAAC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 C 0 1 65857 CASAVA_Build 13 20017263 1I TTAATTTAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 78 hom 22 1 18 3 T 8 9 65858 CASAVA_Build 13 20018446 1D AATCCATCTC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 9 8 65859 CASAVA_Build 13 20020509 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGGATTGCTT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 AGG 1 2 65860 CASAVA_Build 13 20020582 1D GAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTA 2857 het 2231 hom 15 5 7 3 T 10 9 65861 CASAVA_Build 13 20027134 4D AAGTTTTATA ATTT/---- ATTTATTATT 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 ATTT 2 1 65862 CASAVA_Build 13 20029930 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2490 hom 25 11 14 0 A 11 10 65863 CASAVA_Build 13 20030943 1I TAATTTTTGC -/A TTTTTAGTAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 0 1 65864 CASAVA_Build 13 20041396 4D ACCAAAGGAA AAAT/---- AAATTGTATA 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 AAAT 2 1 65865 CASAVA_Build 13 20042178 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 23 0 18 5 A 15 14 65866 CASAVA_Build 13 20042816 8I AGAGACAGAA --------/AATAGATT AATGGTTGCC 3070 hom 102 het 36 0 33 3 AATAGATT 0 1 65867 CASAVA_Build 13 20042959 7I TAAAAACCAC -------/TGAATTA TGCACCTTGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TGAATTA 0 1 65868 CASAVA_Build 13 20043603 2I AAATATTGAC --/TT TTGATTTGAA 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 2 4 65869 CASAVA_Build 13 20044177 1I CTTTGATATC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 7 8 65870 CASAVA_Build 13 20045417 20D TTTTTTTAAA CCAGTGAGAATTTCTGACAG/-------------------- ACAGCTTTGT 3070 het 3070 ref 31 23 14 1 CCAGTGAGAATTTCTGACAG 1 0 65871 CASAVA_Build 13 20047205 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 30 0 21 9 T 11 10 65872 CASAVA_Build 13 20048362 1D GATTATTAGA T/- TTTTTCCTAC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 6 5 65873 CASAVA_Build 13 20055258 1D AGTGTTAAAG A/- TTATAACCAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 1 0 65874 CASAVA_Build 13 20056296 2I CTATTTCTGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 19 0 12 7 A 12 14 65875 CASAVA_Build 13 20058682 1I ACCTTGAGAT -/A CAGGAGAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 65876 CASAVA_Build 13 20059047 1I TTTTTTCCCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 8 9 65877 CASAVA_Build 13 20060136 1D TACTATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 31 1 17 13 T 14 13 65878 CASAVA_Build 13 20067174 1D TTTTGAAAGG T/- AACTGATTTG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 1 0 65879 CASAVA_Build 13 20072859 1D TAAAAAAGTT A/- AAACACAAAT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 4 3 65880 CASAVA_Build 13 20078165 4I GATGTAGGCA ----/TGAT TGATTTTTAT 3070 hom 126 het 45 0 40 5 TGAT 1 2 65881 CASAVA_Build 13 20082244 1I TTGACTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 35 2 22 11 T 12 13 65882 CASAVA_Build 13 20082819 1D AGACAGTACC A/- AAAAAAAAAA 1752 het 1752 ref 44 31 4 10 A 11 10 65883 CASAVA_Build 13 20085553 3D CTAGTATGCT ATA/--- ATAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 52 23 25 6 ATA 2 1 65884 CASAVA_Build 13 20085815 1D GAAATAATCC A/- AATGTGCAAC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 3 2 65885 CASAVA_Build 13 20086091 17I TCTATAAAGA -----------------/CAGAAAGTAGATTAGTG TTTGCCAGGG 3070 hom 84 het 29 0 28 2 CAGAAAGTAGATTAGTG 0 1 65886 CASAVA_Build 13 20091001 1D TTTTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 20 1 16 3 T 12 11 65887 CASAVA_Build 13 20093666 19D CTGCTGAGAT AAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 12 A 31 12 65888 CASAVA_Build 13 20103125 1D ATATTACAGT G/- GTAGTAACCT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 G 2 1 65889 CASAVA_Build 13 20104135 1I TTCAAAAAAT -/A TAGCTGGGCA 3070 het 3039 hom 24 10 10 4 A 0 1 65890 CASAVA_Build 13 20115159 1D AGGAAGCTAC A/- AAAAAAAAAA 2980 het 2980 ref 28 13 7 8 A 15 14 65891 CASAVA_Build 13 20118436 1D CAATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 1505 het 1505 ref 30 13 6 11 T 17 16 65892 CASAVA_Build 13 20125743 1D AGAATGCAGT G/- GGTTTTAACC 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 G 3 2 65893 CASAVA_Build 13 20130391 1I ACACGCCACC -/A ATGCCCAACT 2725 het 709 hom 13 3 8 2 A 1 2 65894 CASAVA_Build 13 20131788 1D CTTTATGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 24 0 20 4 T 13 12 65895 CASAVA_Build 13 20140504 1D TTGAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 T 11 10 65896 CASAVA_Build 13 20141564 1D ATTTTCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1148 hom 24 7 12 5 T 15 14 65897 CASAVA_Build 13 20152948 1I TGGCCTGGAG -/A AACACAAGCA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 A 2 3 65898 CASAVA_Build 13 20158687 6D16M1D TCGGTGGTGT TAAAGATAAAGAAATTGATACAT/------TAAAGAAATTGATACA- TTTTTCTTAT 3070 het 3070 hom 46 19 25 12 N/A 0 0 65899 CASAVA_Build 13 20166327 4D CATCTAGAGA AACT/---- AACAGAGCTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 AACT 1 0 65900 CASAVA_Build 13 20168872 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTCAGAC 3070 het 156 hom 23 1 20 2 T 5 6 65901 CASAVA_Build 13 20173199 9I CACAGTTTTT ---------/TGTTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 1531 hom 39 13 15 11 TGTTTTTTG 0 1 65902 CASAVA_Build 13 20181839 2D CTCTTGTATC TG/-- TTAAAGTTTT 3070 het 3070 hom 52 21 25 8 TG 1 0 65903 CASAVA_Build 13 20183493 3D TCTGGTGAGA GTC/--- GTCCCACGCT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 GTC 2 1 65904 CASAVA_Build 13 20183973 2I2M2I ATGTGGGATA --CA--/GCCAGG GACTGGAAGT 3070 het 3070 hom 40 11 26 3 N/A 0 0 65905 CASAVA_Build 13 20187406 1I CTCTGGGGGT -/G GGGGGGGACA 3070 hom 55 het 22 0 18 4 G 7 8 65906 CASAVA_Build 13 20190878 4D TGGCTACGCT CACA/---- CACACCTGCC 2013 het 2013 ref 28 15 7 9 CA 4 2 65907 CASAVA_Build 13 20203316 1I ACACCTGGCT -/A AATGTTTAAA 3070 het 3070 hom 45 13 21 11 A 2 3 65908 CASAVA_Build 13 20207466 1I CCAAAGCCTG -/C CCCCCCACCA 3070 hom 84 het 30 0 25 5 C 6 7 65909 CASAVA_Build 13 20216953 1D TTTATGATTT G/- GGGGTTTTAC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 5 4 65910 CASAVA_Build 13 20223812 1I ATTTCAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 T 10 11 65911 CASAVA_Build 13 20226402 1I TTGTTGGCAG -/T TTTTTTTTTC 2631 het 130 hom 25 2 10 13 T 9 10 65912 CASAVA_Build 13 20226412 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 34 het 24 0 12 12 T 9 10 65913 CASAVA_Build 13 20227045 1D AAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 28 0 20 9 A 11 10 65914 CASAVA_Build 13 20227257 1D AGCAGGGTAG C/- TTTTCCTAGG 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 C 1 0 65915 CASAVA_Build 13 20231781 1I AATCAACAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 47 het 30 1 27 2 A 8 9 65916 CASAVA_Build 13 20232831 2D TAAAAATAAA AT/-- ATGTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 AT 2 1 65917 CASAVA_Build 13 20233817 1D ATCAAATGAA G/- AACTGAATCC 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 G 1 0 65918 CASAVA_Build 13 20236104 1I GTACTGATAT -/C CCCCCATTTC 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 C 5 6 65919 CASAVA_Build 13 20258423 2I TGCTGGGAGG --/TA TATATATATA 878 het 580 hom 26 6 7 13 TA 7 8 65920 CASAVA_Build 13 20260197 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2481 het 877 hom 29 4 9 16 T 15 14 65921 CASAVA_Build 13 20266481 3D ATCCAAGAAA ATG/--- ATGATACTAT 3070 het 3070 ref 23 15 8 1 ATG 2 1 65922 CASAVA_Build 13 20267058 1I AGTTAACTGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 8 9 65923 CASAVA_Build 13 20268399 1D CTTTGGACTG A/- AAAAAAAAAA 2193 het 2193 ref 32 19 6 8 A 13 12 65924 CASAVA_Build 13 20277091 1I TTGCATTTTG -/T TTTTTTTTTT 2253 het 2016 hom 21 7 10 4 T 11 12 65925 CASAVA_Build 13 20282266 5I TTCTAAGTTC -----/AGTTT AAGTAAGTCT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 AGTTT 0 1 65926 CASAVA_Build 13 20286435 13D TCATATACAT AAAAGTATAACTA/------------- AAAAGTAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 13 12 AAAAGTATAACTA 1 0 65927 CASAVA_Build 13 20290102 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTGTATTT 3070 het 1964 hom 22 5 16 1 T 5 4 65928 CASAVA_Build 13 20293450 1I AAAAATTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 14 15 65929 CASAVA_Build 13 20305835 1I CCAAATGGGG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 6 7 65930 CASAVA_Build 13 20313504 4D TTATTTAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 AAAC 3 2 65931 CASAVA_Build 13 20339878 3I TAAGCCTTAC ---/TAA TAAAAGCACA 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 TAA 1 2 65932 CASAVA_Build 13 20344952 1I CAAATTTATG -/T TAAGACTCAT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 1 2 65933 CASAVA_Build 13 20347133 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 10 11 65934 CASAVA_Build 13 20348404 2D TCCATCTCGG AA/-- AAAAAAAAAA 1485 het 1083 hom 16 6 5 5 A 20 18 65935 CASAVA_Build 13 20357967 1I ACAAAAGTAG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 7 8 65936 CASAVA_Build 13 20358431 1I TTCAAGGATG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 A 8 9 65937 CASAVA_Build 13 20361304 6D ACATGAGACT GTTTAA/------ GTTTAAGTTA 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 GTTTAA 2 1 65938 CASAVA_Build 13 20362012 2D AATGAAAAAC TG/-- TTTTGATGAC 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 TG 1 0 65939 CASAVA_Build 13 20365029 1I AGTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3053 het 3053 ref 26 14 8 4 A 13 14 65940 CASAVA_Build 13 20366988 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2058 het 652 hom 11 3 6 2 A 15 14 65941 CASAVA_Build 13 20372944 3D AGAGATGGGG CTT/--- CACCGTGTTG 3058 het 3058 ref 22 13 9 0 CTT 1 0 65942 CASAVA_Build 13 20375498 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2777 het 305 hom 16 1 11 5 T 15 16 65943 CASAVA_Build 13 20377590 1D CATGTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1336 het 11 hom 7 0 4 3 A 17 16 65944 CASAVA_Build 13 20385771 1D GAAGACGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2302 hom 23 7 15 1 T 11 10 65945 CASAVA_Build 13 20387273 1D GAGTGAGCCA C/- CCGCACCCGG 3070 hom 32 het 12 0 11 1 C 3 2 65946 CASAVA_Build 13 20389465 1I TTCAGTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 9 10 65947 CASAVA_Build 13 20390473 1D GATGTCTACT A/- AAAACACAAA 2455 het 2455 ref 21 8 7 6 A 5 4 65948 CASAVA_Build 13 20392788 2I CAGCAAGTGT --/TA TATAATCCCA 3070 hom 141 het 51 0 43 8 TA 2 3 65949 CASAVA_Build 13 20397350 2I TGTTTTAGTA --/TC TCTGTTTTTG 3070 hom 132 het 46 0 44 2 TC 1 2 65950 CASAVA_Build 13 20409785 1D CTAAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1303 het 1149 hom 18 9 4 5 T 17 16 65951 CASAVA_Build 13 20416633 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 13 14 65952 CASAVA_Build 13 20417143 1I GATAACCAAC -/T TTGGTTAATC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 3 65953 CASAVA_Build 13 20418762 4I GCAGCAGCTG ----/TCAC CCACCTGTTC 3070 hom 111 het 40 0 35 5 TCAC 0 1 65954 CASAVA_Build 13 20424363 1I CTGAGCATGC -/A GGGGGGGGAC 3070 hom 119 het 47 0 39 8 A 0 1 65955 CASAVA_Build 13 20424690 14D TCTGTTGTAT TCTCTCTCTCTCTC/-------------- TCTCTCTCTC 3070 hom 81 het 29 0 28 6 TC 14 7 65956 CASAVA_Build 13 20424908 1D GACAGTTGTG A/- GGCGGGGCTT 3070 hom 36 het 17 0 11 6 A 1 0 65957 CASAVA_Build 13 20431374 7D AACTAAAAAT AAAAAAG/------- AAAAAAGAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 4 AAAAAAG 2 1 65958 CASAVA_Build 13 20431892 6D CAACTACTTG GAGGCT/------ GAGGCAGGAG 3003 hom 27 het 10 0 10 0 GAGGCT 1 0 65959 CASAVA_Build 13 20434404 1I ATCAGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 18 1 13 4 A 12 13 65960 CASAVA_Build 13 20435470 1I TTATAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 9 10 65961 CASAVA_Build 13 20440263 1I CCAGCACTTT -/G GGAGGCTGAG 3070 hom 36 het 15 0 11 4 G 2 3 65962 CASAVA_Build 13 20443578 5D AAATATTGTC AAGTG/----- AAGAAAACAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 AAGTG 1 0 65963 CASAVA_Build 13 20445654 2D TGTTTATCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TG 10 9 65964 CASAVA_Build 13 20458022 1I CTGTCTCTAC -/T AAAAACATAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 0 1 65965 CASAVA_Build 13 20459364 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 8 9 65966 CASAVA_Build 13 20468517 1D TGGTAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 2248 het 2248 ref 43 16 7 20 T 19 18 65967 CASAVA_Build 13 20470517 1D AAAATTAATT A/- ATTAATTAAA 2495 het 2495 ref 16 8 6 2 A 2 1 65968 CASAVA_Build 13 20489765 1D CATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 27 1 20 7 T 13 12 65969 CASAVA_Build 13 20492286 8I CAGTTCACAT --------/AAAATATA AAAATATACC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAAATATA 1 2 65970 CASAVA_Build 13 20498466 1D ACTATGAGTT A/- ACCATTCTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 1 65971 CASAVA_Build 13 20504428 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 3070 hom 94 het 36 0 31 5 AG 2 1 65972 CASAVA_Build 13 20507186 2D CCCGAGAAAC AT/-- AGCAAGACTC 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 AT 1 0 65973 CASAVA_Build 13 20508914 3D TCCGTCTCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 AAC 6 5 65974 CASAVA_Build 13 20515133 1D AAAAAAAAAA C/- CAAAAAACAA 2449 hom 27 het 11 0 8 3 C 2 1 65975 CASAVA_Build 13 20517010 1D TTGGGACTAC A/- AGGTGCACAC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 2 1 65976 CASAVA_Build 13 20517246 2D AAAGTGAGAC TG/-- TGTTGCCACA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 TG 2 1 65977 CASAVA_Build 13 20526874 7I CCGTGTCCCT -------/GAACAGA AGCCAGATCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 GAACAGA 0 1 65978 CASAVA_Build 13 20527448 1D TGTGGACTTT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 8 7 65979 CASAVA_Build 13 20529945 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 10 9 65980 CASAVA_Build 13 20531081 3D GTTGTTACAG AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 A 12 9 65981 CASAVA_Build 13 20534944 3I TCCTCCCCTC ---/CTT CCTCTCTTTC 3070 hom 96 het 34 0 31 3 CTT 0 1 65982 CASAVA_Build 13 20536699 1I TACTAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 9 65983 CASAVA_Build 13 20542620 6I CCATTCTCCT ------/GCCTCA GCCTCAGCCT 1784 hom 21 het 8 0 8 2 GCCTCA 1 2 65984 CASAVA_Build 13 20546396 1I ACAAAAACAA -/C AACAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 C 0 1 65985 CASAVA_Build 13 20559418 1D AATTGCATTT A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 1 0 65986 CASAVA_Build 13 20568180 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 29 2 17 10 A 18 16 65987 CASAVA_Build 13 20569164 32D CCAGCTACTC AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATAACTTGAACCT/-------------------------------- AGGAGGTCAA 3070 hom 124 het 40 0 39 6 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATAACTTGAACCT 1 0 65988 CASAVA_Build 13 20571847 5D GTTTCAAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 hom 48 het 17 0 17 1 AAAAG 4 3 65989 CASAVA_Build 13 20572960 1D GGTAATCAAG A/- AAAAATGAGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 6 5 65990 CASAVA_Build 13 20577940 1I ATTACTGCTG -/T TGTTGTTTCT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 T 1 2 65991 CASAVA_Build 13 20584062 10D TAGCCTGGCC AACATGGTGA/---------- AACCCCATCT 1269 het 822 hom 6 2 3 1 AACATGGTGA 1 0 65992 CASAVA_Build 13 20593544 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 35 1 17 17 T 14 13 65993 CASAVA_Build 13 20596906 3I CCCCCGACAG ---/GCT GCTATTTCTC 2265 hom 22 het 11 0 9 2 GCT 1 2 65994 CASAVA_Build 13 20599764 1D TCTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1869 het 263 hom 18 3 8 7 T 17 16 65995 CASAVA_Build 13 20599940 1D AATTTTAAAA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 7 6 65996 CASAVA_Build 13 20600602 2D51M1D ACCATTAAGA ATATGATGTTAGCTGTAGGCTTTTTGTAGATGTTCTTTATCTAGCAGAGGAAGT/--ATGATGTTAGCTGTAGGCTTTTTGTAGATGTTCTTTATCTAGCGGAGGAAG- TCCTCTTTAT 3070 hom 57 het 22 0 20 11 N/A 0 0 65997 CASAVA_Build 13 20608457 1I AAATCTTCAC -/A ATCCACATTC 3070 hom 24 het 12 0 8 4 A 1 2 65998 CASAVA_Build 13 20627953 2I GATAAAAGCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 12 14 65999 CASAVA_Build 13 20639469 2I TTATTTCCTC --/TT TTCTATCCCT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 2 4 66000 CASAVA_Build 13 20641356 1D CTGCAGGCAC A/- ACAACTTTGT 3070 hom 48 het 19 0 15 5 A 2 1 66001 CASAVA_Build 13 20645315 3I GCTCAAGAAA ---/AAG AAGGAGAAAC 3070 hom 104 het 37 0 33 4 AAG 1 2 66002 CASAVA_Build 13 20645765 1D GGACTCAAAC A/- ATATGTACTC 3070 hom 81 het 35 0 27 11 A 2 1 66003 CASAVA_Build 13 20649529 1I GAGCTCTAAA -/C CCCCCAATAC 3070 hom 123 het 50 0 40 10 C 5 6 66004 CASAVA_Build 13 20651867 2I ATAGTGAGAA --/CT CTCTACAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 CT 2 3 66005 CASAVA_Build 13 20667764 2I TCACTGCAAA --/CT CTGTCTCCCG 2306 hom 14 het 6 0 5 1 CT 1 2 66006 CASAVA_Build 13 20668706 1I TTTTCTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 23 1 18 4 T 11 12 66007 CASAVA_Build 13 20701773 1I GCAAACAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 37 1 31 5 T 10 11 66008 CASAVA_Build 13 20705102 1D CTTTGGAACC A/- AAAATGTATA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 5 4 66009 CASAVA_Build 13 20707938 1I AAACAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 29 1 24 4 A 10 11 66010 CASAVA_Build 13 20709099 3D ATCCCTTAGC AGA/--- AGTAGACTTA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 AGA 1 0 66011 CASAVA_Build 13 20709183 1I GTCTGAATGA -/T TCCTGGTAGC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 1 2 66012 CASAVA_Build 13 20714846 2D TAGCCAGAAA AC/-- ACAGCCCTGC 3070 het 3070 ref 67 42 21 6 AC 2 1 66013 CASAVA_Build 13 20714984 1D CTACAGGCTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 88 56 24 8 T 9 8 66014 CASAVA_Build 13 20718228 5I AGAAATGTTT -----/ATAAC ATAAGACATG 3058 het 3058 ref 39 31 7 1 ATAAC 0 1 66015 CASAVA_Build 13 20736680 1D TAGCATTTAT A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 8 7 66016 CASAVA_Build 13 20747642 1D CCTAGAGTAA C/- TCTCAATTTA 2577 het 2577 ref 23 11 7 5 C 1 0 66017 CASAVA_Build 13 20748018 1D ATAGAAGTGG A/- AAACAACAAT 3070 het 3070 ref 54 45 8 1 A 4 3 66018 CASAVA_Build 13 20749264 1I CCTGTTCTCA -/G GAGTCAACGT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 G 1 2 66019 CASAVA_Build 13 20757691 2D CAGTATGTCC AA/-- GAGAGATTGG 3070 het 3070 ref 45 28 16 2 A 2 0 66020 CASAVA_Build 13 20767189 1D GAGGCAATAT A/- AAAAATAGCA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 A 6 5 66021 CASAVA_Build 13 20767460 3D TTAGCAAAAA AAT/--- GTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 43 21 21 1 AAT 1 0 66022 CASAVA_Build 13 20768361 1I AGATAAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 9 10 66023 CASAVA_Build 13 20772007 4I TTGTAGAAAC ----/TTGT AGTAGGGCTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 TTGT 0 1 66024 CASAVA_Build 13 20772926 2I AACACTGCTT --/TA TATATATATA 2819 het 2819 ref 20 10 7 3 TA 7 8 66025 CASAVA_Build 13 20774402 1D TTGTAAAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 10 9 66026 CASAVA_Build 13 20776554 1I GGAGCTGTGG -/A AACGCACTGC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 2 3 66027 CASAVA_Build 13 20777504 1I AGTAATTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 11 12 66028 CASAVA_Build 13 20782266 4D TCGTCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 34 19 10 9 AAAT 3 2 66029 CASAVA_Build 13 20791623 1D CAGAATTTTC T/- TGAGCCACAG 3070 het 2493 hom 23 9 11 4 T 2 1 66030 CASAVA_Build 13 20792497 3D AGCGGCTGGT GAA/--- GGAGGACCCC 2209 het 2209 ref 27 13 9 5 GAA 1 0 66031 CASAVA_Build 13 20793825 1D TGTGCCCAGC A/- AAAAAAAAAA 2612 het 2612 ref 28 13 8 7 A 11 10 66032 CASAVA_Build 13 20794302 2I CTGCATAGAC --/AT GTGTAGTTGG 3070 hom 76 het 29 0 26 3 AT 0 1 66033 CASAVA_Build 13 20796066 4I ACAAAAGTTT ----/TTAC TAACTAACCA 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 TTAC 0 1 66034 CASAVA_Build 13 20796226 3D GCCCTAGTAT TTA/--- TTGAGTTTCC 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 TTA 1 0 66035 CASAVA_Build 13 20796593 1I GGGAAAAATG -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 T 6 7 66036 CASAVA_Build 13 20797277 1D TTCCCACCAT C/- CACTGTCCCT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 C 2 1 66037 CASAVA_Build 13 20798247 1D CCGGCAGAGA G/- GGGCTGCACA 1897 het 1897 ref 22 14 6 2 G 4 3 66038 CASAVA_Build 13 20798681 6I ATTTCTTAGA ------/TTTTTT TTTTTTTTAA 2644 het 1979 hom 18 5 7 6 T 8 14 66039 CASAVA_Build 13 20805785 2D TCACTAATAT AA/-- GTCATGAGGA 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 A 2 0 66040 CASAVA_Build 13 20812403 4D AGAGTTTGCC CTAA/---- CTGTCATTTT 3070 hom 74 het 30 0 24 7 CTAA 1 0 66041 CASAVA_Build 13 20815417 1I ATTAATAACT -/A ATAATATAAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 1 2 66042 CASAVA_Build 13 20818949 1I ATGCTGCAGG -/T GAAGATGGAG 2744 het 1803 hom 22 9 8 5 T 0 1 66043 CASAVA_Build 13 20821934 1D TCTTTGTTTC T/- ATGAGTTTGT 3070 het 3070 hom 42 19 20 4 T 1 0 66044 CASAVA_Build 13 20825813 1I CAGGGTTCAT -/G CCATTCTCCT 873 het 873 ref 8 4 2 2 G 0 1 66045 CASAVA_Build 13 20827799 3D ATGAGGGGAT TTC/--- TTCTTGGATT 3070 het 3070 ref 41 24 14 4 TTC 2 1 66046 CASAVA_Build 13 20842524 4I TAATTATAAT ----/AATA AATAAAAAAT 1443 het 1443 ref 13 7 3 3 AATA 1 2 66047 CASAVA_Build 13 20843633 4D GTAAATCTTC TAAA/---- TAGAGGGTTG 3070 het 3070 hom 40 16 20 6 TAAA 1 0 66048 CASAVA_Build 13 20850908 7D ATGACATGAC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 18 13 A 17 10 66049 CASAVA_Build 13 20872400 1I TATAAAACTC -/T TAACTTGTAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 1 2 66050 CASAVA_Build 13 20885640 3I CATCTGAAAT ---/ACC ACAGTAAGGA 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 ACC 0 1 66051 CASAVA_Build 13 20894764 3D AAGTGAACTC ATT/--- ATTATTATTT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 ATT 4 3 66052 CASAVA_Build 13 20903623 5I TTCATTACTT -----/AAGTA AATATCTAAA 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 AAGTA 0 1 66053 CASAVA_Build 13 20906917 2D AGAGACATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 13 26 7 T 13 11 66054 CASAVA_Build 13 20919385 1I CCGAGGACTC -/G GTCCCAGTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 1 2 66055 CASAVA_Build 13 20924383 1I ATCTTAATGT -/G GCGACAGAAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 G 1 2 66056 CASAVA_Build 13 20941453 1D GTTTTGTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 44 het 33 1 25 7 T 10 9 66057 CASAVA_Build 13 20947784 5D TCCTTAGATT GGAAA/----- GTTTTTAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 5 GGAAA 1 0 66058 CASAVA_Build 13 20948883 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 9 8 66059 CASAVA_Build 13 20955401 3I ACTTCATGAA ---/GTC TATCCTTAGG 3070 hom 69 het 29 0 24 6 GTC 0 1 66060 CASAVA_Build 13 20957125 9D TTCTCTTTCT TTTCTTTTC/--------- TTTCTTTTCT 2502 het 638 hom 17 2 6 9 TTTCTTTTC 2 1 66061 CASAVA_Build 13 20970961 1D GGAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 A 11 10 66062 CASAVA_Build 13 20974901 3I TGTCTTAGGC ---/AGT AGTTTTCCTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AGT 1 2 66063 CASAVA_Build 13 20983858 3D TTAGCCTCTG ACA/--- ACAATTAATG 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 ACA 2 1 66064 CASAVA_Build 13 20998950 1D CAGCAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 52 1 43 8 A 11 10 66065 CASAVA_Build 13 21002608 1I ATTCTCCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 33 0 26 7 A 12 13 66066 CASAVA_Build 13 21008466 1I TTATTCTCAA -/T TTTAAAACTA 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 T 3 4 66067 CASAVA_Build 13 21009609 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2544 het 995 hom 17 3 8 6 T 17 16 66068 CASAVA_Build 13 21011184 1I CCTAAGTGGT -/G GTGGCTCCTC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 1 2 66069 CASAVA_Build 13 21012444 1I ACATTGTTTC -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 8 9 66070 CASAVA_Build 13 21015946 1I ATGCAAGTAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 69 het 30 0 23 7 A 8 9 66071 CASAVA_Build 13 21017980 3D CTGTAAGATA ACT/--- ACAATTAGCA 3070 het 3070 ref 49 27 22 3 ACT 1 0 66072 CASAVA_Build 13 21021762 1I ATTTATTTGC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 7 8 66073 CASAVA_Build 13 21022922 3D TTGAATCTTT ACA/--- ACAACGCTTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 ACA 2 1 66074 CASAVA_Build 13 21032447 22D TCCATATGCA TATCCAACTGCACTAGTACCAT/---------------------- TATCCAACTG 3070 het 3070 hom 31 12 17 8 TATCCAACTGCACTAGTACCAT 2 1 66075 CASAVA_Build 13 21033830 1D AGTGGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 15 3 10 2 T 15 14 66076 CASAVA_Build 13 21033908 4I CAATGTGCAG ----/GTTA GTTACATATG 3070 het 972 hom 13 2 11 0 GTTA 1 2 66077 CASAVA_Build 13 21034581 1D TTTTGTTTCA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 8 7 66078 CASAVA_Build 13 21038912 1D TTTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 14 13 A 12 11 66079 CASAVA_Build 13 21040500 1I ATATTGCACG -/T TGTACAGAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 1 2 66080 CASAVA_Build 13 21040984 1I AGAAATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 29 1 23 5 T 10 11 66081 CASAVA_Build 13 21054391 1D CTTTAGCACT A/- AATAGCTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 3 2 66082 CASAVA_Build 13 21061926 4D CTCACCCCGT AGTG/---- CACTCTCTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 AGTG 1 0 66083 CASAVA_Build 13 21062027 1D TGCGTCAGGG A/- TAAGAACCTC 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 A 1 0 66084 CASAVA_Build 13 21064657 2I TTTTATGAAG --/AC AGCATCATCC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AC 0 1 66085 CASAVA_Build 13 21073772 1D AGTGGGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 38 1 28 10 A 12 11 66086 CASAVA_Build 13 21095384 1D AAAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 2082 hom 15 het 6 0 6 0 T 1 0 66087 CASAVA_Build 13 21096756 1I TTTATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 10 11 66088 CASAVA_Build 13 21102477 2D TATTACATTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 26 6 A 12 10 66089 CASAVA_Build 13 21110772 1D GCACTGTTTC T/- TTTTAACAGT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 5 4 66090 CASAVA_Build 13 21121146 2I TCTAGCTTAT --/TA TATATATATC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 TA 4 5 66091 CASAVA_Build 13 21126137 1I CAGAGCGAGA -/C TCTGTCTCAA 3070 het 155 hom 21 1 14 6 C 0 1 66092 CASAVA_Build 13 21134497 3I TGCCAGGGCA ---/AGG ACTGCTTCCC 3070 hom 141 het 48 0 45 3 AGG 0 1 66093 CASAVA_Build 13 21141573 1I GGGAGGACCA -/C CTCGCTCTTC 3070 hom 56 het 23 0 15 8 C 1 2 66094 CASAVA_Build 13 21168687 2I CATTAGAAAC --/AT GTGGTGGGTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AT 0 1 66095 CASAVA_Build 13 21177810 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 906 hom 12 2 10 0 A 9 10 66096 CASAVA_Build 13 21177968 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1941 hom 30 9 14 7 A 17 16 66097 CASAVA_Build 13 21184333 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 11 12 66098 CASAVA_Build 13 21184477 3D GAATAAATGT ATA/--- ATATTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 ATA 2 1 66099 CASAVA_Build 13 21185928 1I CAACAACAAC -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 6 7 66100 CASAVA_Build 13 21188162 1D TGTGTGCAGA T/- TTATTGTATG 3070 hom 96 het 38 0 33 9 T 3 2 66101 CASAVA_Build 13 21190090 5D GGCGTCCATG AGGTT/----- AGGTTCTTTG 3070 het 3070 ref 43 23 17 5 AGGTT 2 1 66102 CASAVA_Build 13 21194482 1I TTCTGAGGTG -/T TTTTTTTTTT 2292 het 2292 ref 36 20 8 8 T 10 11 66103 CASAVA_Build 13 21195564 1I TATGATATAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 16 het 21 0 11 10 A 8 9 66104 CASAVA_Build 13 21215282 4I CTCCTTGTCG ----/TCTC TCTAAGTACT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TC 1 3 66105 CASAVA_Build 13 21218267 1D ATATATATTT G/- TGTGTGTGTG 1322 het 1224 hom 30 8 4 20 G 1 0 66106 CASAVA_Build 13 21218366 3D GTTTTCCTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1343 hom 36 9 14 13 T 15 12 66107 CASAVA_Build 13 21219547 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 487 hom 35 8 17 10 T 15 14 66108 CASAVA_Build 13 21219835 1D TGCAAACTGT A/- AACTGTCTTG 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 A 3 2 66109 CASAVA_Build 13 21223615 2I CTATCAAAAA --/AT ATATATGCTC 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 AT 3 4 66110 CASAVA_Build 13 21224410 1I AAGCAAAAAT -/A AAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 A 3 4 66111 CASAVA_Build 13 21230568 1D TGAAGACAGA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 88 het 36 0 28 8 C 10 9 66112 CASAVA_Build 13 21231766 1I ACTCCCAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 8 9 66113 CASAVA_Build 13 21232981 1D ACACACCACA G/- ACCCTGGCTG 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 G 1 0 66114 CASAVA_Build 13 21234279 5D TAATCCTTAC TTCCA/----- TTCCTGAGTA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 TTCCA 1 0 66115 CASAVA_Build 13 21245470 1D TTGGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 29 0 13 16 T 15 14 66116 CASAVA_Build 13 21249726 4I TCAAGGACTA ----/TTTG TTTGTCACTC 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 TTTG 1 2 66117 CASAVA_Build 13 21260187 4I CTATCATATC ----/CTAT CTATCTATCT 3070 hom 81 het 40 0 27 13 CTAT 4 5 66118 CASAVA_Build 13 21260201 3D CTATCTATCT ATC/--- ATCTATCATC 2989 het 2989 ref 42 8 15 19 ATC 2 1 66119 CASAVA_Build 13 21263655 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 1903 hom 18 het 8 0 7 1 A 10 9 66120 CASAVA_Build 13 21265971 2D32M2I TACATATATA ATATATATATTATATATGTGTGTATATATATATG--/--ATATATATTATATATGTGTGTATATATATATGTA TATATATATA 1121 hom 12 het 7 0 5 3 N/A 0 0 66121 CASAVA_Build 13 21266956 1D GCTCAGTGTC G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 72 het 38 0 32 6 G 10 9 66122 CASAVA_Build 13 21270485 1D CTCATCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 13 10 A 11 10 66123 CASAVA_Build 13 21287501 1D CACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 17 0 13 4 A 15 14 66124 CASAVA_Build 13 21291753 3I GCACAAAATT ---/AGG GGGAATAAAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AGG 0 1 66125 CASAVA_Build 13 21292056 7I AAATGTTTTC -------/TGATACT TGGCTTGTTC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TGATACT 0 1 66126 CASAVA_Build 13 21296793 1I TATTTTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 761 hom 38 2 28 8 T 11 12 66127 CASAVA_Build 13 21302151 3D ACACTGTGAT AGG/--- AGCGAAAAGT 3070 hom 123 het 46 0 40 10 AGG 1 0 66128 CASAVA_Build 13 21302803 1I GTTTCTGTTG -/T TGCCATCCTT 3070 hom 107 het 37 0 34 4 T 1 2 66129 CASAVA_Build 13 21321845 1I TATAACTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 9 10 66130 CASAVA_Build 13 21324512 1D TTTCCTTTCA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 8 7 66131 CASAVA_Build 13 21337676 1D GAATATCTTG T/- TTTTTTTTTT 2704 het 1199 hom 19 6 7 8 T 13 12 66132 CASAVA_Build 13 21367978 1I CTCCACCCCC -/T ATTCATGTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 66133 CASAVA_Build 13 21370436 2I TTGTTTTCCC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 AT 5 6 66134 CASAVA_Build 13 21371670 1D CTGGAGTTTG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 A 8 7 66135 CASAVA_Build 13 21377421 1I CTGGAATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 18 11 T 10 11 66136 CASAVA_Build 13 21378004 1I AATGCTGAAC -/A ATTTTTAGAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 1 2 66137 CASAVA_Build 13 21379467 3I ACGTGGAGTT ---/ATC ATCATTTTGG 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 ATC 1 2 66138 CASAVA_Build 13 21384588 2D AAAGAAAAAC TT/-- ATATCATACT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 2 0 66139 CASAVA_Build 13 21389729 1D CATTGGGCTG C/- CTCCTGAGTT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 C 2 1 66140 CASAVA_Build 13 21390245 2D GTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 9 7 66141 CASAVA_Build 13 21391048 4D TCAAACTGCC TGTT/---- TATTTACTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 7 TGTT 1 0 66142 CASAVA_Build 13 21392564 5I TTTGCAATCC -----/CTTAG CTAGACATAA 2138 hom 12 het 5 0 5 0 CTTAG 0 1 66143 CASAVA_Build 13 21402178 1D GTTTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 13 12 66144 CASAVA_Build 13 21419797 1I TACTGATGTT -/A ACTGATGCCT 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 A 1 2 66145 CASAVA_Build 13 21422495 1D TTAATAATGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 9 8 66146 CASAVA_Build 13 21427660 1D GAAAAAGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 10 9 66147 CASAVA_Build 13 21430381 1I CTTATCTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 8 9 66148 CASAVA_Build 13 21438128 4I AATTCCTCAC ----/AAAA AAAGGCCTTT 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 A 3 7 66149 CASAVA_Build 13 21439474 23D AAAAAAAAGA AATTTCAATTTCCCATAGAATTT/----------------------- AATTTCAATT 3070 het 3070 ref 26 14 13 4 AATTTCAATTTCCCATAGAATTT 2 1 66150 CASAVA_Build 13 21445990 3D GCAACAGGCT CCC/--- CCCCCGTGAG 3070 hom 58 het 24 0 18 8 C 8 5 66151 CASAVA_Build 13 21447207 1D TGGAAACCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 45 3 28 14 T 13 12 66152 CASAVA_Build 13 21452169 1D ATATTTATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 10 9 66153 CASAVA_Build 13 21453751 1D AACCACCCCC T/- AACCTATAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 1 0 66154 CASAVA_Build 13 21456553 4I TCAAGTTGCT ----/CTTA CTTCTGGAGA 3070 hom 102 het 37 0 34 4 CTTA 0 1 66155 CASAVA_Build 13 21461728 3D GAAAGGTGTG CTT/--- CTTCTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 23 11 6 CTT 4 3 66156 CASAVA_Build 13 21465002 1D TTTAAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 12 12 T 15 14 66157 CASAVA_Build 13 21466408 2I TTGTTAGGGA --/TT TTTTTGAACC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 5 7 66158 CASAVA_Build 13 21470189 1I ACTGATTTCC -/T TTTTGGATGA 3070 het 3070 hom 60 29 26 5 T 4 5 66159 CASAVA_Build 13 21474614 1D CTATCCCAAC A/- AATTTGACAT 3070 het 3070 hom 47 18 26 4 A 3 2 66160 CASAVA_Build 13 21474847 1I CCGGCTAACA -/G GGCAGCCACT 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 G 2 3 66161 CASAVA_Build 13 21474996 3D TACACCTTGA AAT/--- AATAATATTT 3070 het 3070 ref 44 24 19 3 AAT 3 2 66162 CASAVA_Build 13 21480319 1D AGAAACACTC A/- TGTTCCAGGC 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 A 1 0 66163 CASAVA_Build 13 21497994 1I AGTTCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 A 11 12 66164 CASAVA_Build 13 21498700 1I ATTTTTTTTT -/G GTATTTTTAG 3070 het 1470 hom 13 3 9 1 G 1 2 66165 CASAVA_Build 13 21499537 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 A 9 8 66166 CASAVA_Build 13 21509154 1D CTAAATAATG A/- AGGATGGTAC 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 A 2 1 66167 CASAVA_Build 13 21513751 1I ATAAGAATTA -/G GGTCCTTTAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 2 3 66168 CASAVA_Build 13 21530828 8D AGCCTTCTGA GGCTGATG/-------- GGCTGGGTGT 3070 het 3070 hom 46 20 24 6 GGCTGATG 1 0 66169 CASAVA_Build 13 21538607 1I TATTGAGGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 10 11 66170 CASAVA_Build 13 21539495 1D TTCTTTTTTT A/- TTTTTTCAGA 1471 het 1471 ref 34 25 7 3 A 1 0 66171 CASAVA_Build 13 21540843 1I TTCCATATCC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 8 9 66172 CASAVA_Build 13 21548109 1D TCAAATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2048 hom 27 8 15 4 T 12 11 66173 CASAVA_Build 13 21548964 4D AAGAGTGAGT GAGA/---- GAGAGAGATG 3070 het 3070 ref 47 20 17 12 GA 6 4 66174 CASAVA_Build 13 21549459 3D GTGTGTGTGT GTG/--- GAGGGGGGGA 3070 het 741 hom 34 3 27 4 GTG 1 0 66175 CASAVA_Build 13 21549691 3D TTATTTTACT CTC/--- CTCCCATTCC 3070 het 3070 hom 38 20 16 2 CTC 2 1 66176 CASAVA_Build 13 21550436 1I CTGAGTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 T 11 12 66177 CASAVA_Build 13 21568278 1I GTCCGTGCTT -/G CATTGGTATA 3070 hom 138 het 53 0 46 7 G 0 1 66178 CASAVA_Build 13 21587333 6D CCCAGTGCAA TTGAGT/------ TTGTTTTCAC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 TTGAGT 1 0 66179 CASAVA_Build 13 21588697 1D AGCCCTGTGA T/- TTTTTAACAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 6 5 66180 CASAVA_Build 13 21591212 1D CAAGCAGATG A/- AAAATCTTAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 5 4 66181 CASAVA_Build 13 21596848 3D CCAGGGAGAC ATT/--- GTTGTAATAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATT 1 0 66182 CASAVA_Build 13 21597037 2D TAGGTCTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 32 4 20 9 A 13 11 66183 CASAVA_Build 13 21604798 1I51M1I TGATCAGTTT -ACAAAAAAGACTCTCAAAAATAATGATCAGAAACCGGATGATGGAAAACAG-/AACAAAAAAGACTCTCAAAAATAATGATCAGAAACCGGATGATGGAAAACAGA AAAAAATAGC 3070 hom 84 het 31 0 29 16 N/A 0 0 66184 CASAVA_Build 13 21610638 4D CCCACGTAGC CTAT/---- CTATCACTCA 3070 hom 114 het 41 0 38 4 CTAT 2 1 66185 CASAVA_Build 13 21613109 2D AGGAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 AG 5 4 66186 CASAVA_Build 13 21656765 4I ATCTGTTTCT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 2482 hom 23 6 10 8 TTTG 3 4 66187 CASAVA_Build 13 21660869 1D TGCTACTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 11 10 66188 CASAVA_Build 13 21664695 2I GAATTTACAT --/AG GGCTCATGGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AG 0 1 66189 CASAVA_Build 13 21676118 2D GAGAAGAGTC AG/-- GGGGTGAGCT 3070 het 3070 ref 36 20 11 6 AG 1 0 66190 CASAVA_Build 13 21682614 1D GGTGGTTGAC G/- GGGGCCCCTG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 G 5 4 66191 CASAVA_Build 13 21693478 4I TTCAACAGGT ----/AATG AATGACTCAC 3070 het 3070 ref 58 31 22 5 AATG 1 2 66192 CASAVA_Build 13 21700993 4D TCCTGGCCTC AATT/---- AATTAATCCC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AATT 2 1 66193 CASAVA_Build 13 21707613 1I TTTGAAATTC -/T TTGTGTAATG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 3 66194 CASAVA_Build 13 21709877 2I CCTTGTTCCA --/CT CTCTTTTCCT 3070 hom 125 het 48 0 40 8 CT 2 3 66195 CASAVA_Build 13 21729241 3I GTTTCTGTTG ---/TTC TTCTTTTTCT 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 TTC 1 2 66196 CASAVA_Build 13 21733704 1I GTCCAGGCAG -/A AACAAATTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 3 66197 CASAVA_Build 13 21733848 1I TGGCAATTTG -/T TATCTTCTAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 1 2 66198 CASAVA_Build 13 21734265 1D TCTTGCTTCC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 8 7 66199 CASAVA_Build 13 21746956 1I TTAGCTTTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 9 66200 CASAVA_Build 13 21756643 1I TGTCTCATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 T 9 10 66201 CASAVA_Build 13 21761660 1D AAACATGGGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 9 8 66202 CASAVA_Build 13 21762488 1D CAAAAAAAAA C/- CCAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 C 3 2 66203 CASAVA_Build 13 21764458 7D TCAAAAGGTG ACGCATA/------- ACTGTACAAT 3070 het 3070 ref 40 23 17 4 ACGCATA 1 0 66204 CASAVA_Build 13 21769043 1I GTTTTTCATC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 8 9 66205 CASAVA_Build 13 21769653 10I ATTGTCCACC ----------/AGAAAACAAA ACTTAGTAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 AGAAAACAAA 0 1 66206 CASAVA_Build 13 21770263 1I CCTGGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 1082 het 884 hom 7 3 3 1 T 10 11 66207 CASAVA_Build 13 21771845 1D ATTACACAGA T/- GGGGAAAATT 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 T 1 0 66208 CASAVA_Build 13 21774539 1D GTGAAGGGGG A/- AAAATCCTTC 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 A 5 4 66209 CASAVA_Build 13 21776971 1I AAAAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 977 het 977 ref 31 18 4 9 T 11 12 66210 CASAVA_Build 13 21780799 2I CAACACATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 20 23 7 T 11 13 66211 CASAVA_Build 13 21786333 1I CTTCTTTGTC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 7 8 66212 CASAVA_Build 13 21790292 1I TACTGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 15 19 11 T 10 11 66213 CASAVA_Build 13 21790889 1D TTTCCCACTG C/- CCATACCCTG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 C 3 2 66214 CASAVA_Build 13 21799118 1I TTTTTTTATT -/A TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 0 1 66215 CASAVA_Build 13 21809543 1D TTGTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 33 4 23 6 A 14 13 66216 CASAVA_Build 13 21825024 1D AGTAAAAGGT A/- AAAAAAAAAC 854 het 854 ref 43 36 2 6 A 10 9 66217 CASAVA_Build 13 21861039 1D CCATGAGTTT A/- TGAAAAGTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 0 66218 CASAVA_Build 13 21862316 4D AGGTGCAAGT TCTC/---- TCTCTATCTG 3070 hom 81 het 32 0 28 6 TC 4 2 66219 CASAVA_Build 13 21882088 1D AATAAATGGG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 7 6 66220 CASAVA_Build 13 21884675 1I TTCTCCTTGA -/T TTTTTGAAGG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 5 6 66221 CASAVA_Build 13 21888144 3D CTGAATAAGT CTA/--- TATCTATTAA 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 CTA 1 0 66222 CASAVA_Build 13 21895246 2I AATTCCTCTC --/TT GCACCACCAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 0 2 66223 CASAVA_Build 13 21905224 4I GTCTAAAGTT ----/TTTC TTTCAACAAT 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 TTTC 1 2 66224 CASAVA_Build 13 21912909 2D GTCATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2217 hom 25 8 10 7 TA 8 7 66225 CASAVA_Build 13 21914937 1D CTAGCAGGAG A/- ATCTGTCTTG 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 A 2 1 66226 CASAVA_Build 13 21917480 5I TATTGTAAGA -----/TTTAT TTTATTTACA 3070 het 3070 hom 31 8 21 2 TTTAT 1 2 66227 CASAVA_Build 13 21937498 1I ATATACCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1731 hom 32 8 15 9 T 11 12 66228 CASAVA_Build 13 21948670 3I TCTTTTCTTC ---/TTT ATTAGTCTTG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 0 3 66229 CASAVA_Build 13 21966417 1D TTCAGTGTGA T/- TTTTGTCTCT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 5 4 66230 CASAVA_Build 13 21967815 1D GGGCTCCAAA G/- GGGAGGGGAA 3070 hom 138 het 53 0 47 7 G 4 3 66231 CASAVA_Build 13 21974447 1I AACTCAATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 7 8 66232 CASAVA_Build 13 21975551 10I GTGTATACTG ----------/GTAGGAGCCT GTAGGAGACC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 GTAGGAGCCT 0 1 66233 CASAVA_Build 13 21977162 1I CCAAAGGGGG -/A AAAAAAAGCC 3070 hom 84 het 41 1 38 2 A 7 8 66234 CASAVA_Build 13 21978171 4D57M4I ATTAAAAAAT TAAGTAAGTGAAAACATCATTTCTTTGCTTAAGTATTTAAAAAACCTATTTTTATTCATAC----/----TAAGTGAAAACATCATTTCTTTGCTTAAGTATTTAAAAAACCTATTTTTATTCATACCATT AATTAGTGCA 3070 hom 138 het 36 0 47 10 N/A 0 0 66235 CASAVA_Build 13 21979209 1I CAGTAGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 38 1 31 6 T 14 15 66236 CASAVA_Build 13 22003369 1D GAGAATGGCT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 113 het 43 0 38 6 A 9 8 66237 CASAVA_Build 13 22011638 4D AGTCACTAAC CTCT/---- CTAAGACTAC 3070 hom 66 het 28 0 23 9 CT 3 1 66238 CASAVA_Build 13 22018220 5I CTGTCTATTC -----/TAATT TATCAAATTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TAATT 0 1 66239 CASAVA_Build 13 22018577 4D CTCTTTTTAG ACTT/---- ACTTAGCCAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 ACTT 2 1 66240 CASAVA_Build 13 22022355 3I GCAAAAATGA ---/AGT AGATTTAACG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AGT 0 1 66241 CASAVA_Build 13 22022561 2I AATTATAGTT --/AA GTGGCCATTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 0 2 66242 CASAVA_Build 13 22023432 1I CTCTTTAGAG -/A AAGGTTTTTA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 2 3 66243 CASAVA_Build 13 22030802 2D AAAAAAGAAA AG/-- AGAGGAATTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 8 AG 3 2 66244 CASAVA_Build 13 22037810 17D GCAGCATTAT TCACAATAGCTAATATA/----------------- TGGAATCTAC 3070 hom 90 het 31 0 31 5 TCACAATAGCTAATATA 1 0 66245 CASAVA_Build 13 22042468 10D AGAATGCAAA GTCTGATGTT/---------- GGCAGTGAGG 3070 het 3070 ref 39 22 14 7 GTCTGATGTT 1 0 66246 CASAVA_Build 13 22044314 4D TCATACATTG TTTC/---- TGAGAATGTA 3070 het 3070 ref 36 19 17 2 TTTC 1 0 66247 CASAVA_Build 13 22049556 1I TGACCACATA -/C TTGGAAGTAA 1930 hom 10 het 5 0 4 1 C 0 1 66248 CASAVA_Build 13 22058624 1I GGCCACTCCT -/C CCCCCTAGGG 2693 het 2693 ref 33 12 9 12 C 5 6 66249 CASAVA_Build 13 22063536 1I CATTAGGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 813 hom 31 2 24 5 T 10 11 66250 CASAVA_Build 13 22064125 1I TTAACATTTT -/C CCTCAGAGTG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 C 2 3 66251 CASAVA_Build 13 22071533 2I TAGGGAAAAA --/CT CTCTTTTCTC 2117 het 2117 ref 23 15 6 2 CT 2 3 66252 CASAVA_Build 13 22113123 1I TACTACCTTG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 163 het 59 0 55 4 T 8 9 66253 CASAVA_Build 13 22117638 1D GATAGCCAAC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 8 A 7 6 66254 CASAVA_Build 13 22121628 6D2M1I AACTAGATAA TCATTTAT-/------ATG TATATTCGCT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 N/A 0 0 66255 CASAVA_Build 13 22121862 1I AAAAAAGTTT -/G TGAGTTGTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 0 1 66256 CASAVA_Build 13 22123692 2D TAAGTAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 37 0 29 11 A 12 10 66257 CASAVA_Build 13 22124474 4D ACATATACAA ATAC/---- ATATATATGC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ATAC 1 0 66258 CASAVA_Build 13 22125059 2I TTAATCTTAG --/CA TCATTCAGAC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 CA 0 1 66259 CASAVA_Build 13 22125230 4D AGCTCCTGGG CTCT/---- CTATCAGCTC 3070 hom 99 het 37 0 31 7 CT 3 1 66260 CASAVA_Build 13 22132144 1D ATTGGGACAG T/- TCAGATTAAT 3070 hom 120 het 49 0 41 8 T 2 1 66261 CASAVA_Build 13 22138970 1D CATCTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 25 1 21 3 A 11 10 66262 CASAVA_Build 13 22141862 1I AAATTCATCC -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 7 8 66263 CASAVA_Build 13 22142561 1I AAAATCACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 68 1 58 9 T 10 11 66264 CASAVA_Build 13 22149017 1D ATCCCAGCAC T/- TTTGGGAGGC 3070 hom 54 het 20 0 16 4 T 4 3 66265 CASAVA_Build 13 22149379 3D ATATTTTGAC CTA/--- CTATTAAACG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 CTA 2 1 66266 CASAVA_Build 13 22163028 4D CACGCGCGCG CGCA/---- CACACACACA 3070 hom 96 het 34 0 32 4 CGCA 1 0 66267 CASAVA_Build 13 22196429 1D CCAAGTCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 7 het 22 1 13 8 T 10 9 66268 CASAVA_Build 13 22198304 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 294 hom 31 1 25 5 A 12 11 66269 CASAVA_Build 13 22199701 2D TGGCCATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 26 0 21 6 A 14 12 66270 CASAVA_Build 13 22216675 1D GTTGTTTTTG T/- TTTTTGTTTT 2561 hom 30 het 33 0 11 22 T 6 5 66271 CASAVA_Build 13 22221078 1I GAAGGACATG -/T TTGCTTCCCC 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 2 3 66272 CASAVA_Build 13 22223526 1D GATCCGCCCG C/- CTCGGCCTCC 2165 hom 20 het 9 0 7 2 C 2 1 66273 CASAVA_Build 13 22228167 4D ATTAAATATA TAGT/---- TAAAGTATAT 2707 hom 15 het 7 0 6 1 TAGT 1 0 66274 CASAVA_Build 13 22232278 1I CTACTAAAAA -/T ATGGTAGTGG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 0 1 66275 CASAVA_Build 13 22249749 1I GAGGGGAAAT -/A ATCCAAAGAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 1 2 66276 CASAVA_Build 13 22250470 3D TGGCTAAATA CCT/--- CAAGATCTCC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CCT 1 0 66277 CASAVA_Build 13 22256068 1D ACTGCACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 34 1 21 14 A 13 12 66278 CASAVA_Build 13 22257019 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 21 2 16 3 A 12 11 66279 CASAVA_Build 13 22267038 1I TTTCTCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 31 1 27 3 T 10 11 66280 CASAVA_Build 13 22277496 4I GAGAATAAAC ----/AAAT AAATATATAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAAT 1 2 66281 CASAVA_Build 13 22279789 2I AAAATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 1588 hom 24 4 13 7 TA 8 9 66282 CASAVA_Build 13 22281826 2D ACATCCTGTA AT/-- GATAGAAAAT 3070 hom 36 het 23 0 11 12 AT 1 0 66283 CASAVA_Build 13 22281862 4D TAAGATAATA AACA/---- AACAACCCCA 3070 het 9 hom 27 0 10 18 AACA 2 1 66284 CASAVA_Build 13 22289098 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 34 3 20 11 A 15 14 66285 CASAVA_Build 13 22302945 4I ACCACGTGGA ----/AGAC AGAAAAGTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AGAC 0 1 66286 CASAVA_Build 13 22319914 2I CTTACTGGTT --/TA TGTTTTTCAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TA 0 1 66287 CASAVA_Build 13 22321616 1I AGCTTTCCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 351 hom 26 1 20 5 T 9 10 66288 CASAVA_Build 13 22322824 2D TTTAAAAATC AT/-- ATAAATTTGA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AT 2 1 66289 CASAVA_Build 13 22323573 1D GTTTTTTAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 8 7 66290 CASAVA_Build 13 22330361 5I AAAGCTTTTA -----/TCATT TCATCTTTCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TCATT 0 1 66291 CASAVA_Build 13 22351178 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 688 hom 20 2 13 5 A 11 12 66292 CASAVA_Build 13 22355578 1I AGGTCAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 28 0 12 16 T 14 15 66293 CASAVA_Build 13 22356964 1D CCTTCCCCCC T/- ACAGAAGTTA 3070 het 243 hom 22 1 19 2 T 1 0 66294 CASAVA_Build 13 22358280 1I GAAGTCCCTG -/C GGGGCAGCCA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 0 1 66295 CASAVA_Build 13 22371537 1D TTTTTTCTTT G/- TTTGACTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 G 1 0 66296 CASAVA_Build 13 22380408 2D GACTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1764 het 214 hom 23 4 7 12 A 19 17 66297 CASAVA_Build 13 22387424 11D CATAACTGTA AAGGGACTCTG/----------- ATTAGATTGA 3070 hom 30 het 12 0 11 2 AAGGGACTCTG 1 0 66298 CASAVA_Build 13 22390479 1I ATAAATTACC -/T TACTGGAATA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 1 2 66299 CASAVA_Build 13 22399118 1I CGTGGCACAG -/C CTGGCGGGGT 1352 hom 24 het 10 0 7 3 C 1 2 66300 CASAVA_Build 13 22403485 2D ATATATATAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AG 8 7 66301 CASAVA_Build 13 22406328 3D CGATCACAGA CAT/--- CACACACACC 3070 hom 210 het 74 0 68 8 CAT 1 0 66302 CASAVA_Build 13 22415792 2I CCAGCATCCA --/GC CTCCACATTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 GC 0 1 66303 CASAVA_Build 13 22417546 2I GCCATGGATG --/TA TATAGCCTGT 2917 het 2917 ref 47 27 9 11 TA 2 3 66304 CASAVA_Build 13 22428180 1D GTTTCTTTTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 9 8 66305 CASAVA_Build 13 22433285 1I CTTGCCCCCA -/C CCAGCCCCTT 3070 hom 62 het 27 0 19 8 C 2 3 66306 CASAVA_Build 13 22436734 1D GGCAGCAGGA G/- GATGGATGCA 3070 hom 53 het 25 0 17 9 G 2 1 66307 CASAVA_Build 13 22448116 1D GATTTGGAGA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 347 hom 33 1 29 3 T 9 8 66308 CASAVA_Build 13 22454453 1D AAGAGGCGCC T/- TGAGTTCGGT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 2 1 66309 CASAVA_Build 13 22459596 3I CATCAAAAAT ---/ATG ATAAGTATGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATG 0 1 66310 CASAVA_Build 13 22460728 12I ATGGAAGGAA ------------/GCACAGGCAAAT GTGTGGCAGG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 GCACAGGCAAAT 0 1 66311 CASAVA_Build 13 22465516 4D GTTACCACTG TTAC/---- TTCTTGAGTG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TTAC 1 0 66312 CASAVA_Build 13 22465642 4I ACTAGTTATC ----/TGTT TGTCTAGTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TGTT 0 1 66313 CASAVA_Build 13 22472557 2I AATTATTTTA --/CT GTTTTTTTCC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 CT 0 1 66314 CASAVA_Build 13 22478499 1I GATGATGGAA -/T GTTTTTATAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 0 1 66315 CASAVA_Build 13 22478864 21D4M10D17M2D11M4I18M10I3M2I8M9I17M10I TCTGCTATAA CAATGGGACAAGTGTGGGCTGTGGTTCGTTCACACTGATGATGTGAACTGATGATCAGGAGGAAG----GAGAGTATTTTCACACTG----------ATG--ATGAGGAG---------GAAGGAGAGTATAACGA----------/---------------------TGGT----------AGATGAGGAAAAAACAT--ACAGGAGGGAGAAGTGGGAGGATGTTTATTCAGGAAATAAAATATGAAATGGGGAGGGTTGCTACGTGGAAAACTAGAACCAGACCAGTGAT AGTAACAGAA 3070 het 3070 ref 22 54 17 7 N/A 0 0 66316 CASAVA_Build 13 22479419 2D TGGCAGGACT GA/-- GAGTGGATAA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 GA 2 1 66317 CASAVA_Build 13 22480463 1D TGAAATGGGG T/- TATGTCCCTA 3070 het 115 hom 17 1 15 1 T 2 1 66318 CASAVA_Build 13 22496666 1D AGGTGTTACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 A 10 9 66319 CASAVA_Build 13 22498391 1I GTCTCTAATT -/G GGGGGGGTGA 3070 het 3070 ref 37 13 12 12 G 7 8 66320 CASAVA_Build 13 22506498 33D CTCTCTGACG AGGAAGATTAAATAATGTAAACAATAATAACTT/--------------------------------- AACATAAAGG 3070 het 3070 ref 26 14 15 3 AGGAAGATTAAATAATGTAAACAATAATAACTT 1 0 66321 CASAVA_Build 13 22511955 4I CTAATGAAGC ----/TATT TAATAGTGAT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 TATT 0 1 66322 CASAVA_Build 13 22512267 4I ACTCAAAAAC ----/CACT CACTATGCTT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 CACT 1 2 66323 CASAVA_Build 13 22517445 2D CTACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 AT 6 5 66324 CASAVA_Build 13 22518772 1D TCTGTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 1283 het 1090 hom 14 5 5 4 A 17 16 66325 CASAVA_Build 13 22519153 14I AGATGCCAGC --------------/ACTATTCTTTGTGT ACAGCCTGTG 3070 het 3070 ref 46 21 16 10 ACTATTCTTTGTGT 0 1 66326 CASAVA_Build 13 22521259 1D AATGCCCACC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 129 het 48 0 43 6 A 8 7 66327 CASAVA_Build 13 22523855 2D ACCTGAAAAC TG/-- TGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TG 2 1 66328 CASAVA_Build 13 22543681 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1189 het 1189 ref 15 7 3 6 A 15 14 66329 CASAVA_Build 13 22556686 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1760 het 418 hom 11 3 7 1 A 17 18 66330 CASAVA_Build 13 22558239 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 88 hom 22 1 9 12 T 10 9 66331 CASAVA_Build 13 22559573 1I AACAGCTATT -/A AATTTGCTAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 3 66332 CASAVA_Build 13 22560990 4D AGGACAAAAT AATC/---- AATGCCACAG 3070 het 3070 ref 30 18 9 5 AATC 1 0 66333 CASAVA_Build 13 22564621 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAAGA 3070 het 718 hom 40 7 24 10 AAAAG 1 0 66334 CASAVA_Build 13 22568776 1D GGCTCAAAAA T/- AACTCCAGGC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 1 0 66335 CASAVA_Build 13 22568963 1I ATTGATAAAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 9 10 66336 CASAVA_Build 13 22575047 7D TTTTCTTTTC TTTTCTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 839 hom 29 7 18 4 TTTTCTT 1 0 66337 CASAVA_Build 13 22580981 2I AAGTCCATCC --/TA TATATATTTA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 TA 3 4 66338 CASAVA_Build 13 22582556 1D AATAAAGATC G/- TTTTAAAGGC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 1 0 66339 CASAVA_Build 13 22582857 4I AATTGCCTAG ----/AGAT AGATTTTAAT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AGAT 1 2 66340 CASAVA_Build 13 22589941 2D ACATTTTTTC AG/-- AGTGTGCAAT 3070 hom 120 het 43 0 40 5 AG 2 1 66341 CASAVA_Build 13 22590405 4I GTAAAAGCAT ----/TCAA TCAAAGGAAG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TCAA 1 2 66342 CASAVA_Build 13 22592982 1I GTAGGCACAC -/A AGGGAGTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 A 1 2 66343 CASAVA_Build 13 22603729 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 33 0 25 8 A 16 14 66344 CASAVA_Build 13 22616604 1D AAATCCCAAG A/- ATGATATTAG 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 2 1 66345 CASAVA_Build 13 22616653 1I ATGGACCAAA -/T GTAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 0 1 66346 CASAVA_Build 13 22620164 1I TGTCTGCCTG -/C CAGGGTCTCG 3070 hom 48 het 21 0 15 6 C 1 2 66347 CASAVA_Build 13 22620548 1D TGGCATTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 29 1 22 7 A 11 10 66348 CASAVA_Build 13 22623318 4D GTCATGAGAA CATT/---- CACGACAAAA 3070 hom 132 het 47 0 44 4 CATT 1 0 66349 CASAVA_Build 13 22637839 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 7 8 66350 CASAVA_Build 13 22652482 5D TTTGTTAAAC ACAAT/----- AGAAATGTTA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 ACAAT 1 0 66351 CASAVA_Build 13 22656512 1D AAATTGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 24 1 18 5 T 12 11 66352 CASAVA_Build 13 22659952 8I TATGCTGTCC --------/CATGACCA CATGACCAGG 3070 hom 118 het 45 0 38 7 CATGACCA 1 2 66353 CASAVA_Build 13 22662224 1I GTGTTTAATA -/C ATGAGGGGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 0 1 66354 CASAVA_Build 13 22663716 1I AAGCCCGCCA -/T TTTGAGTTGA 3070 het 3070 hom 59 28 28 3 T 3 4 66355 CASAVA_Build 13 22665667 4I GTGAGGTGGC ----/AGAG AGAGAGATTG 3070 het 3070 hom 46 16 17 13 AG 3 5 66356 CASAVA_Build 13 22667589 1D CTTGTTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 10 11 T 10 9 66357 CASAVA_Build 13 22667818 2I TTAATCTAGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 TG 7 8 66358 CASAVA_Build 13 22668757 1I TTTTATTGGA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 7 8 66359 CASAVA_Build 13 22668899 3I CACCTCTCCA ---/CTC CTCCTCCTTT 3070 hom 141 het 53 0 47 6 CTC 2 3 66360 CASAVA_Build 13 22669880 1D AATATATCTT A/- ATTGAAGCCC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 2 1 66361 CASAVA_Build 13 22671247 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2303 hom 4 het 18 0 8 10 A 15 16 66362 CASAVA_Build 13 22671883 1I TGGCAAACTT -/C AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 C 0 1 66363 CASAVA_Build 13 22672264 1D ACGCTTAAAT A/- AAAAATGTCT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 6 5 66364 CASAVA_Build 13 22673305 1D GGTGCTGATT A/- GGGGACCTAA 3070 het 3070 ref 36 18 12 8 A 1 0 66365 CASAVA_Build 13 22673511 3I TTACGTGGAA ---/GAG GAGGAGGCTC 3070 hom 92 het 34 0 30 4 GAG 2 3 66366 CASAVA_Build 13 22676846 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1037 het 1037 ref 18 9 3 6 T 17 16 66367 CASAVA_Build 13 22683068 1I ACCATGTCCG -/A AAAAAAGTCC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 A 6 7 66368 CASAVA_Build 13 22684532 21I CACACCACAA ---------------------/TTTTTGTTCATATACCTTTTT TTTTCTGGTT 3070 het 3070 ref 35 19 17 3 TTTTTGTTCATATACCTTTTT 0 1 66369 CASAVA_Build 13 22687940 1D GCTGAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 A 13 12 66370 CASAVA_Build 13 22688070 2D CTTACAAGAC TA/-- TGTGCACAAA 3070 het 3070 hom 45 20 24 3 TA 1 0 66371 CASAVA_Build 13 22691891 2D ACAATTATTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2807 hom 21 8 8 5 T 12 10 66372 CASAVA_Build 13 22692142 1I GCCCGGTCAA -/T TTTTTTTTTT 1778 het 861 hom 7 3 4 0 T 10 11 66373 CASAVA_Build 13 22693183 1I TTTAGGATGT -/A GTCAGATTTA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 A 0 1 66374 CASAVA_Build 13 22693846 1D CTCAAAATGG T/- TTAAGGAGGT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 3 2 66375 CASAVA_Build 13 22694516 5D56M4D TTTCTAAAAG TTTGTTTTATTTTTACATTTCTATGTGCAATCCATATTGAATTAATTTTTATGTATGATGTGAGA/-----TTTATTTTTACATTTCTATGTGCAATCCATATTGAATTAATTTTTATGTATGATGT---- GAGATTATGA 3070 het 3070 ref 41 43 21 7 N/A 0 0 66376 CASAVA_Build 13 22700572 1I CAATTCCTAC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 T 7 8 66377 CASAVA_Build 13 22706624 4I TTAAATACAC ----/TATT TAGGAGAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 TATT 0 1 66378 CASAVA_Build 13 22708830 3I AAATAATAAC ---/AAT AATAATAATA 2134 het 2134 ref 14 6 5 3 AAT 5 6 66379 CASAVA_Build 13 22712325 8D TATTAAAACA GACAAAGT/-------- AGATTTCACA 3070 het 3070 ref 45 22 21 7 GACAAAGT 1 0 66380 CASAVA_Build 13 22712850 1I ATTTATAAAT -/A AACCATGGGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 2 3 66381 CASAVA_Build 13 22720677 1D TCTCTACAAC A/- AAAAAAATTA 1834 het 1834 ref 16 6 6 4 A 8 7 66382 CASAVA_Build 13 22721692 1D AAGTAAAGCG A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 30 10 16 5 A 7 6 66383 CASAVA_Build 13 22724053 1D TACAAAACAG A/- ATAATGTTAC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 A 2 1 66384 CASAVA_Build 13 22735302 2D GAGCAGAAAC AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 16 16 7 A 10 8 66385 CASAVA_Build 13 22741039 1I TGAACGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1657 hom 34 5 24 5 A 14 15 66386 CASAVA_Build 13 22745326 4D AACTTAGTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2713 hom 37 9 18 10 T 14 10 66387 CASAVA_Build 13 22747643 1I CCCTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2569 hom 26 8 12 6 A 15 16 66388 CASAVA_Build 13 22749553 1D TGAAGCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 A 11 10 66389 CASAVA_Build 13 22754853 1D TTATCCAGTC T/- GTTACTGATG 3070 het 3070 ref 57 26 24 7 T 1 0 66390 CASAVA_Build 13 22756926 1I TTGGATGGGG -/T TTTCATGTAG 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 3 4 66391 CASAVA_Build 13 22757923 1I CGAAGACCAT -/G GGGAAAAGCA 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 G 3 4 66392 CASAVA_Build 13 22758832 4D TAATAAAATA AAGC/---- AATTATAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 AAGC 1 0 66393 CASAVA_Build 13 22759544 4D CACAAAGAAC TGAA/---- TGAATTCTGC 3070 het 3070 ref 52 26 23 4 TGAA 2 1 66394 CASAVA_Build 13 22761776 2I AATTTAAAAC --/AT TGACATTCAT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AT 0 1 66395 CASAVA_Build 13 22762927 5I TGTCTGAGAT -----/ATATA ATATATTACT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 ATATA 1 2 66396 CASAVA_Build 13 22763483 3D TTCATTTTCC ACA/--- AAGAAGAGGT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 ACA 1 0 66397 CASAVA_Build 13 22764259 8I CATTTCTTTC --------/TTTTTTTT TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 8 16 66398 CASAVA_Build 13 22764797 3D CAGTCATAAT ATC/--- ATCTTGTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 ATC 2 1 66399 CASAVA_Build 13 22768744 1I CGGTCACCCC -/T GGCACTCACC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 0 1 66400 CASAVA_Build 13 22771429 3D GATGGTCATA TCT/--- TCTTCTTCTG 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 TCT 4 3 66401 CASAVA_Build 13 22774032 11D CTCCATCTCA AAAAAAAAAAG/----------- AAAAGAAAAA 3070 het 2761 hom 17 6 8 3 AAAAAAAAAAG 1 0 66402 CASAVA_Build 13 22774810 2I ATTTTTAAAA --/GT GAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 GT 0 1 66403 CASAVA_Build 13 22775330 1I TGAGCATGTC -/T TTTCTTTATA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 3 4 66404 CASAVA_Build 13 22776069 1I AATGTGTTTT -/A AAATATTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 3 4 66405 CASAVA_Build 13 22781299 1I TTATTATTGA -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 6 7 66406 CASAVA_Build 13 22784962 1I GTGACATTTG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 30 0 22 8 A 8 9 66407 CASAVA_Build 13 22785309 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1851 hom 31 7 15 9 T 13 12 66408 CASAVA_Build 13 22789334 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 10 11 66409 CASAVA_Build 13 22794047 1D TGTTTGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 11 10 66410 CASAVA_Build 13 22816318 1I CTAGAGATAC -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 7 8 66411 CASAVA_Build 13 22829892 1D TTTCCTATTG T/- TAACTAGGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 1 66412 CASAVA_Build 13 22831542 4D TAATCACCTT GTAA/---- GTGTTTGAAG 3070 het 3070 hom 37 12 21 6 GTAA 1 0 66413 CASAVA_Build 13 22835567 24D GGTTTCAACA TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAATT/------------------------ CCTGACCTCA 2651 het 2651 ref 16 8 8 4 TGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAATT 1 0 66414 CASAVA_Build 13 22836577 4I CTGCCACCAC ----/GTGG GCCCAGCTAA 3070 het 873 hom 13 2 10 1 GTGG 0 1 66415 CASAVA_Build 13 22838570 4D CCTTGTTACG TAAC/---- TAACTATTTC 3070 het 3070 ref 48 22 23 5 TAAC 2 1 66416 CASAVA_Build 13 22846745 1D AATTTTCTGA C/- CTATCAAGTC 3070 het 3070 ref 39 25 8 6 C 2 1 66417 CASAVA_Build 13 22853927 1D TAAAAACAAG T/- TTTTAAATCC 3070 het 3070 ref 33 18 11 6 T 5 4 66418 CASAVA_Build 13 22860553 2D TTAAAAAATG GT/-- GTGTGTGTAT 1525 het 192 hom 10 1 6 3 GT 5 4 66419 CASAVA_Build 13 22862168 1I ATGGATTTGG -/T TTTTTTTTCT 2118 het 2118 ref 29 17 6 6 T 8 9 66420 CASAVA_Build 13 22863711 2D TCGGGACTCT GC/-- GCCCTTCAAG 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 GC 2 1 66421 CASAVA_Build 13 22863948 2D TCAAACTGAC TG/-- TGACAGGTAC 3070 het 3070 hom 56 19 29 12 TG 2 1 66422 CASAVA_Build 13 22869148 4D TAGGCTTGTT AATA/---- AATATGAAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AATA 2 1 66423 CASAVA_Build 13 22869292 1I TCTCTCTGTT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 157 hom 35 1 31 3 A 7 8 66424 CASAVA_Build 13 22873130 1I CGTATCAAAT -/A AAAAAAGATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 6 7 66425 CASAVA_Build 13 22875103 1I GATCACTAGG -/T CAGGAGTTCG 3070 hom 24 het 14 0 9 6 T 0 1 66426 CASAVA_Build 13 22878668 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 8 7 66427 CASAVA_Build 13 22886676 1I ACTGAATCTC -/T TAATTCCAGT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 2 66428 CASAVA_Build 13 22890652 1I CACCCATTTC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 54 het 32 1 31 0 T 8 9 66429 CASAVA_Build 13 22908531 1D CATCAGAGGT C/- CTGGTTCTCA 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 C 2 1 66430 CASAVA_Build 13 22917415 9I ACGGGGCCAG ---------/GGTCTGGGT ACAAACACGA 3070 het 3070 ref 31 21 10 0 GGTCTGGGT 0 1 66431 CASAVA_Build 13 22919648 2D TAAATTAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 12 10 66432 CASAVA_Build 13 22920440 10I TTCTTCAAGG ----------/AAGCCTCAGC GCTGCTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 AAGCCTCAGC 0 1 66433 CASAVA_Build 13 22927871 1D AAAAAGAATA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 10 9 66434 CASAVA_Build 13 22935014 1I GTAAACTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 10 11 66435 CASAVA_Build 13 22936417 1D CTGAAACCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 T 15 14 66436 CASAVA_Build 13 22941528 1D ACTGCCTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 13 13 A 15 14 66437 CASAVA_Build 13 22949960 3D TCTACTCTGA TCT/--- TCTGTTTCTT 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 TCT 2 1 66438 CASAVA_Build 13 22951875 1D CTGCTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3059 het 3059 ref 31 13 10 8 A 13 12 66439 CASAVA_Build 13 22952259 1I CCTATATAGC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 T 8 9 66440 CASAVA_Build 13 22953882 5D CCCTGCTGAA TTGTG/----- TTGTTGCTCC 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 TTGTG 1 0 66441 CASAVA_Build 13 22954426 1D TCTTAACCCC T/- GGGAGAGACT 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 T 1 0 66442 CASAVA_Build 13 22957176 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 19 3 9 7 A 12 11 66443 CASAVA_Build 13 22963647 1D ATGTATGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2695 hom 33 10 15 8 T 12 11 66444 CASAVA_Build 13 22964915 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTC 918 het 708 hom 13 5 3 5 T 11 9 66445 CASAVA_Build 13 22966329 4D CACACGGTGA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 41 22 14 9 GT 8 6 66446 CASAVA_Build 13 22969560 8D GCCCTACAGT GACTGACG/-------- GTGCACTCTG 3070 het 3070 ref 43 23 16 8 GACTGACG 1 0 66447 CASAVA_Build 13 22974409 5D AGTCATTGAA AAGAT/----- AAAAGTATAA 3070 het 3070 hom 31 11 19 2 AAGAT 1 0 66448 CASAVA_Build 13 22974483 1D CTTTCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2862 het 2862 ref 29 15 9 5 T 12 11 66449 CASAVA_Build 13 22975402 3I TCTTGGTACT ---/TGG TGGAGGATTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TGG 1 2 66450 CASAVA_Build 13 22985426 2D AAAAAAAAAA AC/-- CAAGAATATA 2686 het 382 hom 32 9 9 14 AC 1 0 66451 CASAVA_Build 13 23014302 1D AATTTATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 30 0 18 12 T 17 16 66452 CASAVA_Build 13 23019440 2D GGTGGAGAGA CG/-- CGCAGTCTTC 3070 hom 52 het 25 0 13 12 CG 2 1 66453 CASAVA_Build 13 23021686 2D GTTTGTTATT GA/-- GAGAGAGTGG 3070 hom 118 het 48 0 40 8 GA 4 3 66454 CASAVA_Build 13 23023719 1D ATTTTAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 11 10 66455 CASAVA_Build 13 23027029 1D CCTTGTCTCT G/- GGAAAAAAAA 3070 het 32 hom 34 1 26 7 G 3 2 66456 CASAVA_Build 13 23029605 7D TGTGAAGTGT GTATGTG/------- GTATGTGGTA 3070 hom 158 het 65 0 49 17 GTATGTG 3 2 66457 CASAVA_Build 13 23031758 1I ATTTACATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 9 66458 CASAVA_Build 13 23046289 1D CAAATACAGG A/- CTCTCATGGC 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 1 0 66459 CASAVA_Build 13 23046602 1D TGGGCTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 11 10 66460 CASAVA_Build 13 23050517 3I GACATCGGGA ---/ATG ATAATATTTT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 ATG 0 1 66461 CASAVA_Build 13 23052521 1I TTTTTACCCC -/G ATGACAGTTT 3070 hom 114 het 49 0 39 10 G 0 1 66462 CASAVA_Build 13 23056272 4I TGGTTGCATG ----/AGTA AGTTCTTCAG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 AGTA 0 1 66463 CASAVA_Build 13 23057207 1D GCTGTATTTA T/- AGCATTGGCT 3070 hom 81 het 28 0 28 2 T 1 0 66464 CASAVA_Build 13 23062004 1D TGCTGTAGAG A/- ACATGGGTAG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 2 1 66465 CASAVA_Build 13 23063616 1I AGATACAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 28 0 20 8 A 8 9 66466 CASAVA_Build 13 23065126 1D GTCATAACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 71 het 28 0 24 4 T 10 9 66467 CASAVA_Build 13 23078499 1D TAATTTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 9 8 66468 CASAVA_Build 13 23079256 1I ATAAATAATC -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 6 7 66469 CASAVA_Build 13 23082673 1I TGCCTGCCAT -/C CCTGCAGCCC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 2 3 66470 CASAVA_Build 13 23091360 2I AAATGCTGAC --/AT ATGCTATGAG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AT 1 2 66471 CASAVA_Build 13 23093918 2D CCCTATCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 14 12 66472 CASAVA_Build 13 23094413 1D TGGGCATGGT A/- AACGGGTGCC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 A 3 2 66473 CASAVA_Build 13 23101226 1I CACTTTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 473 hom 25 2 14 9 T 14 15 66474 CASAVA_Build 13 23105669 3D TTACAGCAAA CTC/--- CTCATTTTCT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 CTC 2 1 66475 CASAVA_Build 13 23109180 3D GAAAATTAGA GTT/--- GTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 10 14 GTT 3 2 66476 CASAVA_Build 13 23116971 2D CCCCTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 85 het 36 0 29 8 TA 7 6 66477 CASAVA_Build 13 23137723 2I AAATATTAAC --/AT GTTACCCATG 3070 het 3070 hom 51 24 23 4 AT 0 1 66478 CASAVA_Build 13 23143647 1D CAGATGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 13 7 A 12 11 66479 CASAVA_Build 13 23158399 5D CCAAAACCAA GATGG/----- TGACAAGAGT 3070 het 3070 ref 49 25 20 5 GATGG 1 0 66480 CASAVA_Build 13 23160836 3I CTACAGTATT ---/CAG CACAGCAACA 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 CAG 0 1 66481 CASAVA_Build 13 23179878 1D AAAAAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 17 6 A 14 13 66482 CASAVA_Build 13 23186307 1I TTTTCCCATC -/T TTTTTACAAA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 T 5 6 66483 CASAVA_Build 13 23194803 1D TTGTTCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 38 1 29 9 T 13 12 66484 CASAVA_Build 13 23200457 4I ACAAACAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAAC 3 4 66485 CASAVA_Build 13 23207748 1I TCCCCACCTT -/A AAACAATTCC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 3 4 66486 CASAVA_Build 13 23213632 1D ATGTAGCTAT A/- AAAAAATGAG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 7 6 66487 CASAVA_Build 13 23213834 1I GAGGGAGAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 9 10 66488 CASAVA_Build 13 23233267 1D GAATGCATTC T/- TTTTTTTTTT 1526 het 1526 ref 42 26 5 11 T 15 14 66489 CASAVA_Build 13 23235736 1I CCTGGTTTCA -/T TCAGCTCATA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 1 2 66490 CASAVA_Build 13 23240288 7D AAGGTGAACA CCAGATG/------- CCAGATGTTG 3070 hom 117 het 44 0 39 6 CCAGATG 2 1 66491 CASAVA_Build 13 23244448 1I TTTTTAGCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 9 10 66492 CASAVA_Build 13 23248959 1D GACCTGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 37 1 32 5 A 12 11 66493 CASAVA_Build 13 23257764 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 928 hom 20 2 13 5 A 14 13 66494 CASAVA_Build 13 23258795 4D AAAAAAAAAT AAGG/---- AAAGAGTGAC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AAGG 1 0 66495 CASAVA_Build 13 23261330 9D CGTAAACCAT ATGTCACAG/--------- ATGTTATAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 ATGTCACAG 1 0 66496 CASAVA_Build 13 23262729 1D AGTAGAAGGA G/- GGGGAGGCAA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 G 5 4 66497 CASAVA_Build 13 23276050 1D CTAAACATAG C/- TATGCTTCTT 3070 hom 96 het 39 0 33 7 C 1 0 66498 CASAVA_Build 13 23284623 1I CCTGAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 34 1 23 10 A 10 11 66499 CASAVA_Build 13 23287463 1D CTGATTTTTT G/- TTTTTTTTTG 3070 hom 26 het 27 1 24 2 G 1 0 66500 CASAVA_Build 13 23299310 3I AGACACTGAG ---/AGA AGATTACAGT 3070 hom 93 het 35 0 29 6 AGA 1 2 66501 CASAVA_Build 13 23303525 5I CCCATGGCGG -----/CGGGA GGGGGGGATG 3070 hom 81 het 34 0 25 9 CGGGA 0 1 66502 CASAVA_Build 13 23304912 1D ACCTGAACTG C/- AGCCAAGTTT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 C 1 0 66503 CASAVA_Build 13 23316320 3I ATGCGGGCAG ---/AGA AGAAGGTAAA 3070 hom 127 het 48 0 40 8 AGA 1 2 66504 CASAVA_Build 13 23323840 1I TTTAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 51 0 39 12 T 10 11 66505 CASAVA_Build 13 23332983 6D TGAGAATAAT GATTGG/------ GATCATAGCC 3070 hom 87 het 34 0 28 7 GATTGG 1 0 66506 CASAVA_Build 13 23337171 4D AAAATAAGAA AAAT/---- AAATATTAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AAAT 2 1 66507 CASAVA_Build 13 23339157 10D GGTCAAGATG CCAACACTTC/---------- TCATCATGGT 3070 het 3070 hom 48 19 26 5 CCAACACTTC 1 0 66508 CASAVA_Build 13 23342459 4I AATAAAATAT ----/TAAA TAGTTTAGTA 3070 het 2234 hom 14 5 8 1 TAAA 0 1 66509 CASAVA_Build 13 23344967 6I AAGGATACAT ------/AAAAAC TAAAACTATT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 AAAAAC 0 1 66510 CASAVA_Build 13 23348739 3D GGGGTTTTTG TTC/--- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 TTC 2 1 66511 CASAVA_Build 13 23354801 4I CACTACATAT ----/TTTC TTTATTTGCC 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 TTTC 0 1 66512 CASAVA_Build 13 23366418 2I CCATCAGCCA --/TG TGTGTTGGAG 1853 het 1853 ref 16 7 5 4 TG 2 3 66513 CASAVA_Build 13 23366644 2D GGGGACTGAC TG/-- TCACAATTGA 2943 het 2943 ref 27 15 8 4 TG 1 0 66514 CASAVA_Build 13 23370069 1D ATGTTATATA T/- TTTTTTTACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 7 66515 CASAVA_Build 13 23371794 1I CTTTTCATTT -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 A 6 7 66516 CASAVA_Build 13 23380178 2I TTTATCAGGT --/AG GTGTGAGACA 3070 hom 81 het 29 0 25 5 AG 0 1 66517 CASAVA_Build 13 23380660 4I AACATGTCAA ----/ATTT CAGTTAATCT 2407 het 2407 ref 31 20 5 6 ATTT 0 1 66518 CASAVA_Build 13 23381388 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1280 hom 25 6 10 9 A 17 16 66519 CASAVA_Build 13 23382138 1D TTGCTTTTAG T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 8 7 66520 CASAVA_Build 13 23383560 1I GAGGAGGAGG -/A AGGAAGAAAG 3070 het 655 hom 33 4 18 11 A 1 2 66521 CASAVA_Build 13 23384184 1D TTAAAAACAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 114 het 40 0 39 3 A 9 8 66522 CASAVA_Build 13 23386846 1D ACTGCAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 21 0 17 8 A 10 9 66523 CASAVA_Build 13 23398923 4I GAAAGAGGTG ----/TTTA TTTTTAGCGT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TTTA 0 1 66524 CASAVA_Build 13 23400554 1D TTTCTCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 39 1 24 14 T 15 14 66525 CASAVA_Build 13 23409292 1I GACTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 30 1 25 4 A 10 11 66526 CASAVA_Build 13 23410003 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 11 10 66527 CASAVA_Build 13 23410184 1D AGCAACAGAC A/- AGACATAGAC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 2 1 66528 CASAVA_Build 13 23410804 3I CAGCTCTCTC ---/CTT GTCATCACCC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 CTT 0 1 66529 CASAVA_Build 13 23427512 2I GGACGGTGCT --/GA GAGGGAGGGG 3070 hom 72 het 27 0 23 4 GA 1 2 66530 CASAVA_Build 13 23441639 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 21 0 14 8 A 11 10 66531 CASAVA_Build 13 23451001 13D ACCCAACTAA TTAAAAAAATTTT/------------- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 31 12 15 7 TTAAAAAAATTTT 1 0 66532 CASAVA_Build 13 23455785 1D CTGTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 12 11 66533 CASAVA_Build 13 23468549 1I TCAATTGGGC -/A AAAAAACGAT 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 6 7 66534 CASAVA_Build 13 23468756 3I TGTGCTTGGC ---/TGA TGATTGGCTG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TGA 1 2 66535 CASAVA_Build 13 23469689 1D AGTCCATTTT G/- CATTGCTATA 3070 het 3070 hom 40 17 20 5 G 1 0 66536 CASAVA_Build 13 23471750 1I GTGGATTCTT -/C CTGCCTGAGC 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 C 1 2 66537 CASAVA_Build 13 23484038 3D AATGCTCAGC CTT/--- CTTCTTTAAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 CTT 3 2 66538 CASAVA_Build 13 23487888 1D47M19D GCCCCCCCCC AATTCCTAGGTCCACCGTTTCTGGGGTCTTTCCAGCCAAACCATGCCAAGGTGAGCCTCGGCTGGTG/-ATTCCTAGGTCCACCGTTTCTGGGGTCTTTCCAGCCAAACCATGCCA------------------- ACACGTCATA 3070 het 104 hom 20 1 22 12 N/A 0 0 66539 CASAVA_Build 13 23495535 1D GATTTGGATA C/- TTTGCTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 1 0 66540 CASAVA_Build 13 23496824 1D TTGATGACAT A/- AAAATGTTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 5 4 66541 CASAVA_Build 13 23497073 12D ATTCAAATTC ATATATATATAA/------------ ATATATATAT 3070 hom 21 het 10 0 8 4 ATATATATATAA 3 2 66542 CASAVA_Build 13 23497328 4D TTTTCCTATT TTTG/---- TTTATTTCCT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TTTG 1 0 66543 CASAVA_Build 13 23509690 2D GGGACTACAG GT/-- GTGCACACCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 GT 2 1 66544 CASAVA_Build 13 23510500 2D CCCTCTGTTC TA/-- TGTTTACATT 3070 het 3070 ref 43 19 18 7 TA 1 0 66545 CASAVA_Build 13 23514266 7I GAAAGCGCGG -------/TGTCCTC TGTCCTCTGT 3070 hom 89 het 36 0 28 8 TGTCCTC 1 2 66546 CASAVA_Build 13 23514583 1D TTCTGTTTCC A/- AAGCAAACCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 3 2 66547 CASAVA_Build 13 23517261 3D TATAATTTAT ATC/--- ACTCATTGCC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 ATC 1 0 66548 CASAVA_Build 13 23517614 2I CTAAACAAGC --/TG TAAGATTATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TG 0 1 66549 CASAVA_Build 13 23519089 4D CAGGAGTTTA TTAC/---- TTTATTACTC 3070 hom 84 het 29 0 28 4 TTAC 1 0 66550 CASAVA_Build 13 23520605 4I TCTAGTAAAC ----/TAAG TAATCAAGGA 3070 hom 138 het 48 0 47 1 TAAG 0 1 66551 CASAVA_Build 13 23524199 14D GTTTGGACGC AGGGTTTGGCTTCT/-------------- TACACCAGCA 3070 hom 63 het 22 0 21 3 AGGGTTTGGCTTCT 1 0 66552 CASAVA_Build 13 23526697 1D TTTAAATTAA C/- TTTGACATGT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 C 1 0 66553 CASAVA_Build 13 23529047 1D ATGGAACTTC T/- TTTTTTTTTT 1203 het 1203 ref 42 28 3 12 T 15 14 66554 CASAVA_Build 13 23531106 4D TGTATTGTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 TTTG 1 0 66555 CASAVA_Build 13 23532840 6D AAGGTCTAAT ATCCAA/------ ATCCAGCATC 2888 het 2888 ref 26 19 6 4 ATCCAA 1 0 66556 CASAVA_Build 13 23537131 9I CACAGGCCAC ---------/AGGAGACTA AGGAGCCAGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AGGAGACTA 0 1 66557 CASAVA_Build 13 23537749 4D CTCACAAGAC AGAG/---- AGAGACGTCC 3070 hom 111 het 39 0 38 2 AG 4 2 66558 CASAVA_Build 13 23539475 4D TCCTGAGCTA TATG/---- TATGTACCCT 3070 het 3070 ref 53 24 23 8 TATG 2 1 66559 CASAVA_Build 13 23546284 2I AGATCTGAAA --/CT CTGTCTTCAT 3070 het 3070 ref 62 31 24 7 CT 1 2 66560 CASAVA_Build 13 23546778 1D TAAAGTGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 91 het 48 0 40 8 A 10 9 66561 CASAVA_Build 13 23547068 11I ATTTGCCTTA -----------/TTTGAACACAG TTTGAACAGT 3070 het 3070 hom 53 26 22 5 TTTGAACACAG 0 1 66562 CASAVA_Build 13 23553851 1I GCATAAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 9 66563 CASAVA_Build 13 23556683 1D GGTTTTTCTT A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 102 het 37 0 32 5 A 8 7 66564 CASAVA_Build 13 23558206 5I TTCACTGTGG -----/GAGTA GAGTAGCAGG 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 GAGTA 1 2 66565 CASAVA_Build 13 23562257 1I ACTTCCTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 9 10 66566 CASAVA_Build 13 23572282 1D TAAATAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2574 hom 27 10 14 3 A 12 11 66567 CASAVA_Build 13 23580800 4I TTTCATGGTA ----/GAGG GGGGGGGGGA 3070 hom 65 het 23 0 22 1 GAGG 0 1 66568 CASAVA_Build 13 23584457 8D TGGGTCAGTT TGCTACTC/-------- TGCTCTTGTT 3070 het 3070 ref 45 27 15 6 TGCTACTC 1 0 66569 CASAVA_Build 13 23610455 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AAAAAACAGT 2516 het 1516 hom 23 8 11 4 AAC 0 1 66570 CASAVA_Build 13 23614250 1D TAGGGAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 7 T 12 11 66571 CASAVA_Build 13 23618782 1D TGCACAGCAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 3 2 66572 CASAVA_Build 13 23619916 1D CCCTAGCCCC T/- GGCAGACACC 3070 het 3070 hom 43 14 19 11 T 1 0 66573 CASAVA_Build 13 23620507 1I TGTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 T 9 10 66574 CASAVA_Build 13 23629429 1I CTCCTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 1975 hom 16 7 9 0 T 8 9 66575 CASAVA_Build 13 23631250 1I21M1D AATAAAAAAA -CCCTCAATTTAGACCGTGATAT/CCCCTCAATTTAGACCGTGATA- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 29 0 29 4 N/A 0 0 66576 CASAVA_Build 13 23642779 2I TTGGAACACC --/TG TGTCTCCTGA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 TG 1 2 66577 CASAVA_Build 13 23647371 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 8 9 66578 CASAVA_Build 13 23651737 1I AGATTAAATG -/C CAAGTCCCTA 3070 hom 123 het 52 0 42 10 C 1 2 66579 CASAVA_Build 13 23653990 1I GTGGTGGCTT -/A ACACCTATAA 3070 hom 48 het 18 0 16 8 A 1 2 66580 CASAVA_Build 13 23660484 1D AAAAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 11 10 66581 CASAVA_Build 13 23662544 1I GGCTGTAGTT -/A ACCATGGATG 3070 het 874 hom 11 2 7 2 A 1 2 66582 CASAVA_Build 13 23664324 1I CAAAAGCAGC -/T GTTGTAAACT 3070 hom 65 het 27 0 21 6 T 0 1 66583 CASAVA_Build 13 23671090 1I CTATAAAATC -/T TTTTTTTTTT 1929 het 1690 hom 28 9 6 13 T 15 16 66584 CASAVA_Build 13 23671154 1I TGGTTCATTC -/T TTTGTTCTCT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 3 4 66585 CASAVA_Build 13 23673170 24D GCTAGTCAGT CACACACACACACACACACACACA/------------------------ CACACACACA 3070 het 3070 hom 31 13 13 15 CA 18 6 66586 CASAVA_Build 13 23673548 1I CAATATTGAT -/A TTACTATTAA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 0 1 66587 CASAVA_Build 13 23673590 1D GAGTTCACTC T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 36 het 19 0 13 6 T 8 7 66588 CASAVA_Build 13 23676515 2D TGGTAAATTG TT/-- TTAAAAGCAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 4 2 66589 CASAVA_Build 13 23678426 2D AAGAAGACAC AT/-- GTGGCCACAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 AT 1 0 66590 CASAVA_Build 13 23679700 2I ACCCGGGTTC --/CA GTTTCTCCAC 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 CA 0 1 66591 CASAVA_Build 13 23680715 7I GAAGACTGGT -------/GGGGGTG GGGGACTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 GGGGGTG 0 1 66592 CASAVA_Build 13 23680842 1D TAGGCCAAAA G/- AAATCCCTGA 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 G 1 0 66593 CASAVA_Build 13 23684435 3D CCTGTTTAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 2489 het 511 hom 23 4 9 12 A 17 14 66594 CASAVA_Build 13 23693617 1D GAAAGGTTAA G/- GGGGAGCAGG 3070 het 3070 ref 52 27 16 10 G 5 4 66595 CASAVA_Build 13 23694610 1I TTCCTAATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 9 10 66596 CASAVA_Build 13 23713133 1I TCTTTTTTTG -/T TTTTTTGGAG 3019 het 3019 ref 27 16 8 3 T 6 7 66597 CASAVA_Build 13 23725603 1D TCAGCGTTGA T/- TAACTAGAGG 3070 het 3070 ref 53 26 20 9 T 2 1 66598 CASAVA_Build 13 23726957 1I TGCTTGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 15 9 T 11 12 66599 CASAVA_Build 13 23730374 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2258 het 2258 ref 23 10 7 7 A 13 12 66600 CASAVA_Build 13 23736565 1D ATTCGGTAAC T/- TTTCCTAGCT 3070 het 3070 ref 53 30 21 3 T 4 3 66601 CASAVA_Build 13 23741497 16D TTGTTTAACA TGTATGTATGTATGTG/---------------- TGTATGTATG 3070 het 3070 ref 55 25 20 17 TGTATGTATGTATGTG 2 1 66602 CASAVA_Build 13 23748774 8I AAGATGGTAA --------/AAGAAAGG AAGAAAGGAA 3070 het 3070 ref 46 21 13 12 AAGAAAGG 1 2 66603 CASAVA_Build 13 23760691 17D CGGTGCTGGT GGAATCCTTGGGTAAGA/----------------- GGAATCCTTG 2917 het 2917 ref 42 24 9 14 GGAATCCTTGGGTAAGA 1 0 66604 CASAVA_Build 13 23766753 1D AACAGTGGCT A/- ATGACGTAAA 3070 hom 138 het 52 0 47 7 A 2 1 66605 CASAVA_Build 13 23781419 15D GAACTTAAAG TATTATATATATATA/--------------- TATATATATA 3070 hom 39 het 12 0 13 5 TATTATATATATATA 1 0 66606 CASAVA_Build 13 23782739 1D ACAGTGCAGG A/- AAAAAATAAC 2787 het 2450 hom 14 5 8 1 A 7 6 66607 CASAVA_Build 13 23784505 2I TAATTCAGAT --/AA GAGAGAGAGA 3070 het 2865 hom 30 10 14 6 A 0 2 66608 CASAVA_Build 13 23798188 1D TTTAAAAAAA C/- AATAGAGCAG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 C 1 0 66609 CASAVA_Build 13 23804276 1I AAATTCCACA -/T AATACCATAC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 0 1 66610 CASAVA_Build 13 23805235 12D CCATTTTTAA TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2053 het 1674 hom 24 9 7 9 T 28 16 66611 CASAVA_Build 13 23809392 4I AAAATCCATA ----/TCTT TCTTTATACA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TCTT 1 2 66612 CASAVA_Build 13 23814044 6D TGTGTGTGTG TGTGTA/------ TATATATATA 3070 het 3070 ref 29 12 13 7 TGTGTA 1 0 66613 CASAVA_Build 13 23823545 2D TGAATTTGAC TT/-- TTGTTTTTAG 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 4 2 66614 CASAVA_Build 13 23828743 7D19M5D4M6D25M4D21M2I TCACACACAC AACTCATCACACATGCTCATCACACACCACGCTCACTCCACACACACACCACACATGATCATCACACACTCATCACACACACACATAGCAC--/-------CACACATGATCATCACACA-----CTCA------TCACACACCACACATGTTCATCACA----CATCACACACACACTTATCACAA ACATGCTCAT 1192 het 1192 ref 77 85 3 18 N/A 0 0 66615 CASAVA_Build 13 23836513 1I AGTAGGGCAG -/A AAAAAATGGA 2134 het 2134 ref 45 30 5 10 A 6 7 66616 CASAVA_Build 13 23839348 2I GCCATGGATG --/TA TATAGCCTGT 3070 hom 48 het 21 0 14 7 TA 2 3 66617 CASAVA_Build 13 23839468 1D CTCCAGTCTA G/- GAGAGAGGGA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 G 2 1 66618 CASAVA_Build 13 23848691 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 15 0 12 4 A 9 8 66619 CASAVA_Build 13 23850702 1I ATAAGCAACA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 6 7 66620 CASAVA_Build 13 23851284 3D TTGCAAATAA TAT/--- TATGTTGAAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 6 TAT 2 1 66621 CASAVA_Build 13 23860168 1I AAGTGTGGAC -/A AAACCTCAGA 3070 hom 43 het 19 0 14 5 A 3 4 66622 CASAVA_Build 13 23861140 2I CCAGTCACAA --/AG AGGCCACACA 3070 hom 60 het 26 0 19 7 AG 1 2 66623 CASAVA_Build 13 23873781 2I CACTTAAAAA --/GC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 37 17 19 1 GC 0 1 66624 CASAVA_Build 13 23874885 1I TTTACACATC -/T TTTGTTAGTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 3 4 66625 CASAVA_Build 13 23875902 5I TGGTCTACAA -----/TTACC TTAGCTTAGG 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 TTACC 0 1 66626 CASAVA_Build 13 23881324 5I TTGAAGATAT -----/TTTAA TTTAACTAAA 3070 het 2227 hom 21 5 13 3 TTTAA 1 2 66627 CASAVA_Build 13 23881867 1I TTTGATATAC -/A ATAAACACTG 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 A 1 2 66628 CASAVA_Build 13 23883293 2D GATTTTCACC TA/-- TGTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 TA 1 0 66629 CASAVA_Build 13 23884390 1I GCTGTCTTCT -/G GGTTGGTTGC 3070 het 3070 hom 20 9 8 3 G 2 3 66630 CASAVA_Build 13 23887361 1I GCCCAGGTGA -/T TTTTTTTTAT 2386 het 2386 ref 19 7 6 6 T 8 9 66631 CASAVA_Build 13 23888132 1D TTGCTAAGAG T/- TTTTTTTTTT 2668 het 2668 ref 20 9 6 5 T 13 12 66632 CASAVA_Build 13 23888211 4I GGTTAATTAC ----/ATTG ATTGATTAAG 2347 het 2347 ref 26 15 5 6 ATTG 1 2 66633 CASAVA_Build 13 23888439 2D CATTTCATTT TC/-- TCTATTTTTC 3070 het 3070 ref 30 18 10 5 TC 2 1 66634 CASAVA_Build 13 23890928 1D TTTTGAGATG T/- GTACGTTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 T 1 0 66635 CASAVA_Build 13 23892144 2D CGCCCTGAGC TT/-- TTAAGAGAAT 3070 het 3070 hom 28 8 16 5 T 4 2 66636 CASAVA_Build 13 23893460 1I TTCCTAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2505 hom 21 6 8 7 A 10 11 66637 CASAVA_Build 13 23898502 5I TACATACTTA -----/TAAAG TAGTGTACAC 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 TAAAG 0 1 66638 CASAVA_Build 13 23901027 1D CTTTGATCAA T/- TTTACAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 4 3 66639 CASAVA_Build 13 23901151 1I TTTCATTCTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 8 9 66640 CASAVA_Build 13 23904335 2D AACATTTATC AT/-- GTCTTTGTGT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 AT 1 0 66641 CASAVA_Build 13 23905892 1D GACTTGCCCC A/- AATCACAAAG 3070 het 3070 hom 59 21 29 10 A 3 2 66642 CASAVA_Build 13 23906404 1I ATGATTTATA -/C CCCAGTGTAC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 3 4 66643 CASAVA_Build 13 23908833 3D GATGCTATAT TAC/--- TACTATTGTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 TAC 2 1 66644 CASAVA_Build 13 23909732 1D TACATAGGGC T/- GTAAGAATAT 1969 het 1969 ref 36 25 5 7 T 1 0 66645 CASAVA_Build 13 23911137 6I TGCAGCTAAC ------/ATAAAT ATAAACTTTC 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 ATAAAT 0 1 66646 CASAVA_Build 13 23911633 1D CAAAACACTT A/- ACATATGTAG 3070 het 3070 ref 42 21 11 11 A 2 1 66647 CASAVA_Build 13 23912881 2D TCTTAACCAC TG/-- TGTTTACTGA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 TG 2 1 66648 CASAVA_Build 13 23913498 1D AGACCTAAGA G/- GGTTGTCAGC 3070 het 3070 ref 39 25 13 2 G 3 2 66649 CASAVA_Build 13 23915025 2I CCCTCTAGTT --/CA CAGAGAGCTC 3070 het 2852 hom 29 10 16 3 CA 1 2 66650 CASAVA_Build 13 23915679 2I GCCCTGACAC --/CA CAGTCTCCTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 CA 1 2 66651 CASAVA_Build 13 23919145 3D AAACTCTGCG TCT/--- TCTTACCTGT 3070 het 266 hom 24 1 22 5 TCT 2 1 66652 CASAVA_Build 13 23919432 2I TTTATAACTC --/TT TGGTATTTTC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 1 3 66653 CASAVA_Build 13 23920595 2I ATCAATAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 30 1 21 8 A 10 12 66654 CASAVA_Build 13 23922215 1I CTTTCAGTTC -/A CTGAGGGAGG 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 A 0 1 66655 CASAVA_Build 13 23922611 1I TGGATAAAGA -/C TGGATTTGTC 2468 het 2468 ref 22 12 6 4 C 0 1 66656 CASAVA_Build 13 23923781 6I GCACTGCCAC ------/AGAATA CAGATAGCTG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AGAATA 0 1 66657 CASAVA_Build 13 23925077 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 30 het 27 1 19 7 T 10 9 66658 CASAVA_Build 13 23931898 1D GTGATTAAGC A/- GAATAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 1 0 66659 CASAVA_Build 13 23935015 2I AAGTGAAAAC --/AT AGAGCTCCAA 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 AT 0 1 66660 CASAVA_Build 13 23937592 17I AATACCATGC -----------------/AGCCATAAAAAGGAATG AGACCATGTC 2877 het 2877 ref 34 22 7 5 AGCCATAAAAAGGAATG 0 1 66661 CASAVA_Build 13 23937911 1D CCAGAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 12 11 66662 CASAVA_Build 13 23940145 1I TACCCCTTTG -/A TCTATATTAA 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 A 0 1 66663 CASAVA_Build 13 23942889 1I AAATGAAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 T 2 3 66664 CASAVA_Build 13 23944314 2I TAGCACTTGG --/CC CATGGAGTCT 3053 het 3053 ref 38 29 7 2 C 1 3 66665 CASAVA_Build 13 23944789 1I TTCCAAGCTC -/T TACCACTGCA 1349 het 1349 ref 48 38 3 7 T 1 2 66666 CASAVA_Build 13 23949596 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 2525 het 2393 hom 12 6 6 0 A 9 10 66667 CASAVA_Build 13 23954795 1D ATGTACATTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 62 21 35 7 T 10 9 66668 CASAVA_Build 13 23962398 5D TGTAACTGGT ATTTA/----- GGAACGTGTT 3070 het 3070 ref 50 26 19 5 ATTTA 1 0 66669 CASAVA_Build 13 23962557 1D CGTTTTAAAA T/- TTTTAAATTT 3070 het 3070 ref 34 16 17 2 T 5 4 66670 CASAVA_Build 13 23963088 4D CTTGTTTTAC TTTA/---- TTTATTTTTG 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 TTTA 2 1 66671 CASAVA_Build 13 23964409 1D TAAGGATCCA G/- GGCTTTCTAA 2521 het 2521 ref 25 15 6 4 G 3 2 66672 CASAVA_Build 13 23969224 1I GAAGGCATCC -/T TGGTGGGTGT 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 T 1 2 66673 CASAVA_Build 13 23970886 1I TTTCATTTGT -/G GGGGAAAAAA 3062 het 394 hom 21 3 10 8 G 4 5 66674 CASAVA_Build 13 23972186 2I9M1D GTTTTTTTTT --AAAAGAATTA/TAAAAAGAATT- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 13 9 4 N/A 0 0 66675 CASAVA_Build 13 23973129 4I TCTACTATTT ----/TGTC TATTTCTGTT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TGTC 0 1 66676 CASAVA_Build 13 23974356 1I GAAAATCTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 8 9 66677 CASAVA_Build 13 23977680 1I ACCGCCTAAA -/C CCCCCCAGAA 2190 het 2190 ref 31 16 7 8 C 6 7 66678 CASAVA_Build 13 23980323 1D AACAACACAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 A 9 8 66679 CASAVA_Build 13 23991448 1D AGTTAATACA T/- TACTAAATTC 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 2 1 66680 CASAVA_Build 13 23991804 2D GAATTTAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 44 3 31 10 A 13 11 66681 CASAVA_Build 13 23994004 3I AAAAAACAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 49 19 17 13 AAC 5 6 66682 CASAVA_Build 13 23995179 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 12 11 66683 CASAVA_Build 13 23996633 1I GCCATATCTT -/G CTGCCAGCAT 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 G 0 1 66684 CASAVA_Build 13 23997829 1I CATACCTTCC -/A AAAAAGCACT 3070 het 3070 hom 64 20 36 8 A 5 6 66685 CASAVA_Build 13 24004165 13I ATAGAAAATC -------------/AATGAAAATCAAA AATGAAAATC 3070 het 3070 ref 43 24 14 6 AATGAAAATCAAA 0 1 66686 CASAVA_Build 13 24007370 1I GTCCATGCTC -/T TGACCTTTAA 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 T 1 2 66687 CASAVA_Build 13 24014468 2D AGCAGCGCGA TG/-- AAAACAAAAC 3070 het 1831 hom 24 8 12 4 TG 1 0 66688 CASAVA_Build 13 24014641 8D28M1D ATAATTTCTA TATTATATTAACTTCTGGGCTAAAAATTCTTTGGATA/--------TAACTTCTGGGCTAAAAATTCTTTGGAT- AAAATCTAAT 1896 het 1896 ref 23 23 4 4 N/A 0 0 66689 CASAVA_Build 13 24028954 1I AGTAGTGTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 11 12 66690 CASAVA_Build 13 24031885 1I GTGGGTTCTT -/G GGTCTCACTG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 G 2 3 66691 CASAVA_Build 13 24034290 1I CCTGACAAAA -/G AAATGCACCC 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 G 0 1 66692 CASAVA_Build 13 24037223 3I GCATGGCAGC ---/ACG TGCCTGTGGT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 ACG 0 1 66693 CASAVA_Build 13 24049384 5I AATTTTTAAC -----/TTTTA TTTTAGGTTC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 TTTTA 1 2 66694 CASAVA_Build 13 24055748 1I AAATGGGAGG -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 32 21 7 4 T 7 8 66695 CASAVA_Build 13 24091555 1D TCTGTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2420 het 2420 ref 37 18 8 11 T 15 14 66696 CASAVA_Build 13 24092005 1D CAGGGAAATG T/- TTTTTTCTTG 3070 het 2829 hom 23 8 11 4 T 7 6 66697 CASAVA_Build 13 24096819 2I GCCAGCATCC --/AG AGAGAGAGAA 2777 het 2777 ref 26 12 7 7 AG 4 5 66698 CASAVA_Build 13 24112142 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 2001 hom 15 het 8 0 6 2 A 10 9 66699 CASAVA_Build 13 24115048 1D ATTTGGTGGG A/- AGATACCTCA 3070 hom 99 het 39 0 30 9 A 2 1 66700 CASAVA_Build 13 24120882 1D CACCTGTCAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 C 3 2 66701 CASAVA_Build 13 24129202 6I GCTCATGCCT ------/GTAATC ATAATCCCAG 3070 het 2396 hom 24 8 14 2 GTAATC 0 1 66702 CASAVA_Build 13 24130444 1I AGTGTATGTT -/G GGGGGGAGAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 6 7 66703 CASAVA_Build 13 24133030 4D ACTTACTCTT TCTG/---- TCTGTCTGTT 3070 het 3070 hom 48 20 21 10 TCTG 3 2 66704 CASAVA_Build 13 24147211 2D GTGTTATAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 552 hom 40 5 19 16 T 16 14 66705 CASAVA_Build 13 24149937 1D CCGTCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3067 hom 38 12 13 13 A 12 11 66706 CASAVA_Build 13 24150928 1I TTATTGTGAC -/A AGAGTCTCGC 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 1 2 66707 CASAVA_Build 13 24151712 1I TCTCTCTGAT -/A ATATTGTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 1 2 66708 CASAVA_Build 13 24155278 1I TTGTTTTTAG -/T TAGAGACGGG 1866 het 1778 hom 12 5 5 2 T 1 2 66709 CASAVA_Build 13 24156253 1D AGTCTGAGGT C/- CCATGCATGC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 C 3 2 66710 CASAVA_Build 13 24159602 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 10 9 66711 CASAVA_Build 13 24161230 1I CTGTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 11 12 66712 CASAVA_Build 13 24161866 1D GACCATTTTT G/- CTCCTGAGCC 3070 het 3070 ref 41 20 11 12 G 1 0 66713 CASAVA_Build 13 24163776 1I CTCTCTTACG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 11 12 66714 CASAVA_Build 13 24169853 8I AAAGTGATAG --------/TGATAATT AGCTGGGAGG 3070 hom 68 het 28 0 23 5 TGATAATT 0 1 66715 CASAVA_Build 13 24185790 1D TTATTATAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 9 8 66716 CASAVA_Build 13 24193158 4I CTGTTGATGC ----/CACA CACACACACA 3070 hom 63 het 31 0 21 10 CA 6 8 66717 CASAVA_Build 13 24198694 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAGAAA 2388 het 2388 ref 30 11 10 9 A 7 6 66718 CASAVA_Build 13 24203700 2I AACTACTGAT --/AA AAGGGTCTAT 3070 het 3030 hom 17 8 7 2 A 2 4 66719 CASAVA_Build 13 24212553 2D CCTGTTCTCC AG/-- AGAGGATCTC 3070 hom 121 het 46 0 38 8 AG 3 2 66720 CASAVA_Build 13 24223453 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 9 7 66721 CASAVA_Build 13 24228649 1I TTCTGTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 10 11 66722 CASAVA_Build 13 24229345 12I ACAGAACAGT ------------/CCTTGATTCACA CCTTTCATCC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CCTTGATTCACA 0 1 66723 CASAVA_Build 13 24235269 3D GAGTTTTCAT ACC/--- ACCGTAGACC 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 ACC 2 1 66724 CASAVA_Build 13 24253966 1D TTTTGTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 42 1 33 8 T 12 11 66725 CASAVA_Build 13 24254744 1I AGGCTGAGAT -/G GGGGGGGGGA 3070 het 2976 hom 34 8 11 15 G 9 10 66726 CASAVA_Build 13 24255843 2I TATTTTTATA --/TG TTGATTTTTG 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 TG 0 1 66727 CASAVA_Build 13 24257333 1D TGCGAGCTCC T/- TTTTAAATGT 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 T 5 4 66728 CASAVA_Build 13 24270896 1D CCTGTGGGCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 17 16 7 T 9 8 66729 CASAVA_Build 13 24272323 2I GGAGGAAAAC --/AG TGTCTCTGCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AG 0 1 66730 CASAVA_Build 13 24273951 3D GAATACTTAT TTC/--- TTTCATTTTG 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 TTC 1 0 66731 CASAVA_Build 13 24275177 2D ACAGAGTGAG AC/-- ACCCTGTCTG 3070 hom 102 het 39 0 34 6 AC 2 1 66732 CASAVA_Build 13 24275285 2I TCTTGATAAC --/TT TATTAGCAGC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 1 3 66733 CASAVA_Build 13 24289063 1D TCCTCTAGAG C/- CTTGTCGGGG 3070 het 3070 ref 29 20 8 1 C 2 1 66734 CASAVA_Build 13 24292260 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1271 het 879 hom 22 4 4 15 T 18 16 66735 CASAVA_Build 13 24293495 1D GATACAAATC A/- ACTCCTAACA 3070 het 3070 hom 51 20 25 7 A 2 1 66736 CASAVA_Build 13 24300381 3I GCTCATTCTA ---/CTT CTTCTTCATT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CTT 2 3 66737 CASAVA_Build 13 24304511 4D TCACTGGCTT AAAC/---- AAATTCAACT 3070 het 3070 hom 42 14 24 6 AAAC 1 0 66738 CASAVA_Build 13 24308957 4I AAGCAAAAAC ----/AAAA AAAACCAAAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 4 8 66739 CASAVA_Build 13 24309173 1I GGAAAAAGGC -/A ATTTCATGCA 3070 het 3070 hom 54 20 29 5 A 1 2 66740 CASAVA_Build 13 24310960 9D TCCTAGCCAG AGCAGTCAA/--------- GCAAGAGAAG 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 AGCAGTCAA 1 0 66741 CASAVA_Build 13 24315796 3D TCATATAAGT ATC/--- ATCACAGTCA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 ATC 2 1 66742 CASAVA_Build 13 24319488 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 14 0 10 4 T 14 13 66743 CASAVA_Build 13 24331004 4D ATGTTTTAAA ACAC/---- ACACAGATTT 3070 het 3070 hom 31 14 16 2 AC 4 2 66744 CASAVA_Build 13 24334174 4I GGGAAACGGC ----/CAAA CACTTTCAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 CAAA 0 1 66745 CASAVA_Build 13 24336679 1D CTGAACGTAA C/- CTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 C 2 1 66746 CASAVA_Build 13 24338520 4I ACCATCACCA ----/CTAT CTATTTCCAG 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 CTAT 1 2 66747 CASAVA_Build 13 24338894 2I TTATGTAGAC --/AT ATGTTTTCCC 3070 hom 155 het 56 0 51 5 AT 1 2 66748 CASAVA_Build 13 24340010 4D ATTTCATGCA TTAT/---- TTTAGTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 19 4 TTAT 1 0 66749 CASAVA_Build 13 24345004 8I6M19D2M1D CAGGAAAACT --------TTAGATGAAGGGGGACAGCCATGAACTA/TCCCTCTATTAGAT-------------------CT- AATAGAGGGA 3070 het 3070 ref 40 23 12 12 N/A 0 0 66750 CASAVA_Build 13 24345778 1D TCAAATATTA G/- AACTTATTCC 3070 het 3070 ref 41 23 16 3 G 1 0 66751 CASAVA_Build 13 24345881 1D TCATGTAACT G/- AACCATTAAT 3070 het 3070 ref 48 30 18 0 G 1 0 66752 CASAVA_Build 13 24348983 12D ATTTTTCTCA TTTTATCTGATT/------------ TTTCTCATGC 3070 hom 157 het 56 0 53 3 TTTTATCTGATT 1 0 66753 CASAVA_Build 13 24349476 2I CTTTATATAT --/AC ACATATAAAG 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 AC 1 2 66754 CASAVA_Build 13 24352293 4I ATTGACTCAG ----/TTAA TTCCACATGG 3070 het 2714 hom 24 8 11 5 TTAA 0 1 66755 CASAVA_Build 13 24354632 1I CTCACTGTGG -/T TAACATCAGG 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 T 1 2 66756 CASAVA_Build 13 24355538 1D ATGATTTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 10 9 66757 CASAVA_Build 13 24356233 3D TGTTTAAAAA GTT/--- GTTACAGTAA 3070 hom 87 het 43 0 29 16 GTT 2 1 66758 CASAVA_Build 13 24360717 1D TGCTGACAGT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 8 7 66759 CASAVA_Build 13 24372100 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 A 13 14 66760 CASAVA_Build 13 24374375 1D GGAAAATGCT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 41 0 35 6 A 9 8 66761 CASAVA_Build 13 24379770 6D AAAATATAAA ATACTT/------ AATCTTTGCC 3070 het 3070 hom 32 14 19 1 ATACTT 1 0 66762 CASAVA_Build 13 24385533 1D TTATTCACTT A/- AAAAAAAAAA 1859 het 1859 ref 36 31 4 1 A 11 10 66763 CASAVA_Build 13 24387941 3D CCATCTCGAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 34 17 11 8 AAC 7 6 66764 CASAVA_Build 13 24393489 4D AAACCTCCAG CTTT/---- CTCTTTGTTC 3070 het 3070 hom 34 12 19 6 CTTT 1 0 66765 CASAVA_Build 13 24393765 1D AAGTAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 11 10 66766 CASAVA_Build 13 24397023 2D TCTGCAAAAC AG/-- GGGTGGATAA 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 AG 1 0 66767 CASAVA_Build 13 24405062 2I13M1I CTAATTTTTC --CAGTTTGTATGTA-/CACAGTTTGTATGTAT TAACAATTCT 3070 het 3070 hom 37 15 27 7 N/A 0 0 66768 CASAVA_Build 13 24408116 1I ATGACAGAAC -/A AATGAGGAAG 3070 het 3070 ref 56 42 12 2 A 2 3 66769 CASAVA_Build 13 24411496 24I ATGGTGTTGG ------------------------/GTTTGATCACCCCAACACCAATGT GGCTATTTGT 2955 het 2939 hom 23 8 9 9 GTTTGATCACCCCAACACCAATGT 0 1 66770 CASAVA_Build 13 24421589 2D CATTTCTGTC AT/-- ATGAATGGCA 3070 het 3070 ref 29 20 8 2 AT 2 1 66771 CASAVA_Build 13 24422661 3I CCAAAGAGGA ---/AAT AATAATGATT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AAT 2 3 66772 CASAVA_Build 13 24422866 1I GATTACTTAT -/C CTTCATATTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 2 66773 CASAVA_Build 13 24425658 1D AAGCTTTAAG A/- AAATGCTATT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 4 3 66774 CASAVA_Build 13 24433445 1D GAGAAAAAAA T/- ATGCCTCTAA 1311 het 1311 ref 35 31 3 2 T 1 0 66775 CASAVA_Build 13 24437602 1D CCACTCCCCT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 10 9 66776 CASAVA_Build 13 24446158 1I GCTCAAAAAG -/A AAAAAAGTCT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 6 7 66777 CASAVA_Build 13 24447052 1I CTCATGGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 20 1 15 4 A 10 11 66778 CASAVA_Build 13 24460656 1D TGCTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2944 hom 28 14 10 4 T 13 12 66779 CASAVA_Build 13 24473910 1D AATAAAATGC A/- ATCTTCACTG 757 het 757 ref 39 31 3 5 A 2 1 66780 CASAVA_Build 13 24475182 1I AACTCTGCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 13 14 66781 CASAVA_Build 13 24483165 1I GTTTTTTTTT -/C CCTGTACATA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 C 2 3 66782 CASAVA_Build 13 24488419 1I AATAATAATC -/T TAAACTTTTC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 1 2 66783 CASAVA_Build 13 24498651 2D TGTCTGTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3014 het 3014 ref 42 25 7 10 TC 7 6 66784 CASAVA_Build 13 24498721 1D TCAGTAATAG A/- AGAGCTAAGT 2655 het 2655 ref 47 35 6 7 A 2 1 66785 CASAVA_Build 13 24505173 1I CTGGAGCAGG -/T CCCCTCACAG 3070 hom 126 het 44 0 40 4 T 0 1 66786 CASAVA_Build 13 24506289 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 18 0 14 4 A 13 14 66787 CASAVA_Build 13 24511473 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 239 hom 27 1 19 7 A 13 12 66788 CASAVA_Build 13 24518287 1D TTGGTGAATG A/- AATATATGAG 3070 hom 117 het 45 0 39 7 A 3 2 66789 CASAVA_Build 13 24526116 1D CAAAATACCA C/- CATCATTCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 C 2 1 66790 CASAVA_Build 13 24535270 7D TGAGCCCACC TCAGTTT/------- TCTCTGTGTG 3070 hom 105 het 43 0 34 11 TCAGTTT 1 0 66791 CASAVA_Build 13 24540847 2D ACGCACACGG AC/-- ACACACATGC 3070 het 3070 ref 34 19 9 7 AC 4 3 66792 CASAVA_Build 13 24546719 1D TATATATACA T/- TGTAAAGATG 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 T 2 1 66793 CASAVA_Build 13 24547434 3D AGACTGAGGC AGG/--- AGAATAGCTT 3070 het 1395 hom 16 3 12 2 AGG 1 0 66794 CASAVA_Build 13 24550241 5D AAATCTGTAG CTGAA/----- CTGGTCAATT 3070 het 3070 hom 39 18 19 6 CTGAA 1 0 66795 CASAVA_Build 13 24560429 1D TACTACACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 11 10 66796 CASAVA_Build 13 24568802 1I AAGAGCTATT -/G AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 56 39 7 11 G 0 1 66797 CASAVA_Build 13 24569098 1I TGAATGGAAA -/T GGAGCTCAAT 3070 het 3070 ref 62 36 18 10 T 0 1 66798 CASAVA_Build 13 24571493 2D TGTATGTTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 975 hom 16 4 10 2 AC 6 5 66799 CASAVA_Build 13 24583041 1I ATGTATTTCC -/T TTTATTTATG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 3 4 66800 CASAVA_Build 13 24586322 1I AGGAAAAGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 T 8 9 66801 CASAVA_Build 13 24600029 3D ATGTAAAATC ATT/--- ATGTATCAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 ATT 1 0 66802 CASAVA_Build 13 24608633 1D TTTAGTCCAC T/- TTGAGAGAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 T 3 2 66803 CASAVA_Build 13 24610626 3I AGTCAAAAAT ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 100 het 38 0 34 4 AAC 5 6 66804 CASAVA_Build 13 24613171 1D CCTGTGAGGA C/- CCTCACTCCT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 C 3 2 66805 CASAVA_Build 13 24618011 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1247 het 1247 ref 27 20 4 4 A 13 12 66806 CASAVA_Build 13 24620076 26I ATCCCGCTGA --------------------------/GGGATCATTCCAAAGCCTGTAGTTAC GTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 GGGATCATTCCAAAGCCTGTAGTTAC 0 1 66807 CASAVA_Build 13 24629723 1I CCAAGTACAG -/T TGTCATCTTT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 1 2 66808 CASAVA_Build 13 24632396 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 22 2 14 6 T 15 14 66809 CASAVA_Build 13 24645538 2D TTACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 AC 8 7 66810 CASAVA_Build 13 24661873 1I ATTTTAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 617 hom 48 3 37 8 T 13 14 66811 CASAVA_Build 13 24663467 1D ATTAGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 26 1 18 7 T 14 13 66812 CASAVA_Build 13 24667814 2I TCACTCTGAG --/TT TTTAACCTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 3 5 66813 CASAVA_Build 13 24668377 1I TCGGAGGCCC -/A CGAAGATCGA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 0 1 66814 CASAVA_Build 13 24677199 1D GGAGTTGGAC A/- GGGGGGATGG 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 A 1 0 66815 CASAVA_Build 13 24677970 1I AGGACACTTC -/T TTTCTGTCAG 3070 het 3070 ref 44 21 21 2 T 3 4 66816 CASAVA_Build 13 24679546 1D TCCCCTTCGT C/- CACTGGGCTC 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 C 2 1 66817 CASAVA_Build 13 24680223 1D GTATGTTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 9 8 66818 CASAVA_Build 13 24682542 2I ATTCCACACA --/TT TTAAGTCTTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 2 4 66819 CASAVA_Build 13 24686939 1D ATTTCCACTT C/- AGCCTCTGAT 3070 het 3070 ref 46 29 14 3 C 1 0 66820 CASAVA_Build 13 24692558 1D CCGTCCCCCC T/- CCAAAAAAAA 927 het 927 ref 27 10 8 10 T 1 0 66821 CASAVA_Build 13 24694987 9D GAGGTGGGCA GGTGTGGCT/--------- GCCTGGCATG 2684 het 2684 ref 23 12 8 6 GGTGTGGCT 1 0 66822 CASAVA_Build 13 24710381 2D TGAGACAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 14 12 66823 CASAVA_Build 13 24718556 4D CAAATTTTCT TTAA/---- TTAATCAAAG 3070 hom 105 het 38 0 34 6 TTAA 2 1 66824 CASAVA_Build 13 24723148 1D GTTTTATTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 10 9 66825 CASAVA_Build 13 24724880 1D AGGAAAAGAG T/- TACCTCTGTG 3070 hom 99 het 35 0 34 3 T 2 1 66826 CASAVA_Build 13 24736402 1D CAGAAAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 11 10 66827 CASAVA_Build 13 24753669 1D ATCCCTGAGG A/- AAAAGTGGCC 3070 hom 123 het 47 0 39 8 A 5 4 66828 CASAVA_Build 13 24765171 1I AGGAATCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 31 1 19 11 T 14 15 66829 CASAVA_Build 13 24765656 1I ATTGTCTTGC -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3020 hom 31 11 15 5 A 1 2 66830 CASAVA_Build 13 24770183 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAGGAAGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 5 4 66831 CASAVA_Build 13 24787821 4D CAGAAGCATT TGTC/---- TGTCAGTAAC 3070 hom 135 het 47 0 46 1 TGTC 2 1 66832 CASAVA_Build 13 24788586 1D TCTATATGAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 8 66833 CASAVA_Build 13 24791364 6D TGCTTAACAG TTTATA/------ TTTATACTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 6 TTTATA 2 1 66834 CASAVA_Build 13 24795516 1D TAAAATTAAA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 17 0 15 2 T 2 1 66835 CASAVA_Build 13 24795853 6D GTAACTTGAG TTTAAA/------ TTAAAATAGG 3070 hom 93 het 36 0 32 8 TTTAAA 1 0 66836 CASAVA_Build 13 24804676 4D TAATACACAC AAAA/---- AAATTAATAC 3070 hom 93 het 36 0 32 7 A 7 3 66837 CASAVA_Build 13 24816029 5I AACTATTCTC -----/TGTTA TGGATGGTTA 3070 het 3070 ref 20 8 9 3 TGTTA 0 1 66838 CASAVA_Build 13 24817525 5I AAGTATGTGA -----/TAGAT TAGATCAGGG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TAGAT 1 2 66839 CASAVA_Build 13 24817652 3D CTTTGACCTT TTC/--- TTGCTGGTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 TTC 1 0 66840 CASAVA_Build 13 24817723 1D TGGGGGCGGT G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 68 het 25 0 21 4 G 9 8 66841 CASAVA_Build 13 24822122 1I CACTCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 227 hom 31 1 23 7 A 11 12 66842 CASAVA_Build 13 24833089 1D GCCAGGCCAA T/- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 T 4 3 66843 CASAVA_Build 13 24845499 5D TTAAGCCAAT GTTTG/----- TTAAACTTGG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 GTTTG 1 0 66844 CASAVA_Build 13 24848253 1I TTTACAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 62 het 35 0 29 6 A 9 10 66845 CASAVA_Build 13 24850492 2D GAGTTTTGCA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 11 9 66846 CASAVA_Build 13 24859135 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAACA 1929 het 1906 hom 12 5 5 3 A 8 10 66847 CASAVA_Build 13 24865051 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAC 2805 het 398 hom 16 1 6 9 A 10 9 66848 CASAVA_Build 13 24868123 1D CTGGGACTAC A/- GGTGTGCATC 3070 het 1633 hom 12 4 8 0 A 1 0 66849 CASAVA_Build 13 24871051 1I AATGCATATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 9 10 66850 CASAVA_Build 13 24872119 37I CTTTTTTGAG -------------------------------------/ACAGGATCTTGCTCTTTCAGCCAGGCTGGAGTGCAGT GAAGCCATCA 3070 hom 18 het 5 0 7 0 ACAGGATCTTGCTCTTTCAGCCAGGCTGGAGTGCAGT 0 1 66851 CASAVA_Build 13 24880809 6I CACTAAGCCC ------/TTACCT TAAACTCTTT 3070 het 2976 hom 33 7 23 3 TTACCT 0 1 66852 CASAVA_Build 13 24882149 3I TTTTTGTATG ---/TGA TGTATTCAGA 3070 hom 101 het 39 0 33 6 TGA 0 1 66853 CASAVA_Build 13 24890620 1I ATTTTTTTTT -/A CCAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 A 0 1 66854 CASAVA_Build 13 24891791 1I TTGTTCTCAT -/C AACCGTAATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 66855 CASAVA_Build 13 24900322 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 10 9 66856 CASAVA_Build 13 24901693 1D TTGAATGTTT C/- CCTTTCAAGT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 C 3 2 66857 CASAVA_Build 13 24903286 4I CAGATTTTAT ----/TTTA TTTATTTGTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTTA 1 2 66858 CASAVA_Build 13 24908063 8D GTGTGTGTGT GTGTGTGA/-------- GTGTGTGTGT 1622 het 1109 hom 23 8 10 8 GTGTGTGA 1 0 66859 CASAVA_Build 13 24912046 1D CCCTGTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 25 2 17 8 A 13 12 66860 CASAVA_Build 13 24918690 1I GTACATTGAG -/T TTTTTTGTTC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 6 7 66861 CASAVA_Build 13 24918985 5D AAACCTAGGA TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 TTTTG 5 4 66862 CASAVA_Build 13 24922504 2D TTGAATGGTA TT/-- TTTCTGTCTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 5 3 66863 CASAVA_Build 13 24934636 1I AGCTTCTGTG -/T CTTCAAGATG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 0 1 66864 CASAVA_Build 13 24937697 1I TTATCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 35 2 25 8 T 13 14 66865 CASAVA_Build 13 24946338 1D GCCTTAAAGG A/- AAATTACTTC 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 A 4 3 66866 CASAVA_Build 13 24953342 6D AGGGAGAGGA ACAGGG/------ ACAGGGACAG 3070 het 3070 hom 32 16 13 8 ACAGGG 4 3 66867 CASAVA_Build 13 24972732 1D CAATATATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 10 9 66868 CASAVA_Build 13 24989370 1D TTTTAAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 A 10 9 66869 CASAVA_Build 13 24990684 2I GCTTAATTTC --/TG TGTTTCTGGA 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 TG 1 2 66870 CASAVA_Build 13 25018208 1D ATACACTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 10 9 66871 CASAVA_Build 13 25027793 1I TTTTAGATTC -/A GGGGGTAAAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 0 1 66872 CASAVA_Build 13 25028066 4I CCAGCTCCAT ----/ATGG GCATGTTGCT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 ATGG 0 1 66873 CASAVA_Build 13 25034858 1I TGGGAGGATG -/C CCTAACCTAT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 C 2 3 66874 CASAVA_Build 13 25035548 1I ATTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 11 12 66875 CASAVA_Build 13 25037907 1I TTTTATCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 9 10 66876 CASAVA_Build 13 25045497 1D CTGGTGTTAT A/- ATGCTGCATT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 2 1 66877 CASAVA_Build 13 25055989 1D TGGGTGTAGT A/- ACGTGTAGTG 3070 het 3070 hom 42 20 21 2 A 2 1 66878 CASAVA_Build 13 25059578 1I CCATGGCTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 A 9 10 66879 CASAVA_Build 13 25063722 2D AGCTTATAAC TT/-- TTTTTTTTTT 1191 het 1191 ref 35 16 3 16 T 20 18 66880 CASAVA_Build 13 25064346 1I TTTAATCAGG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 9 66881 CASAVA_Build 13 25080636 1D TTAAGTTCTG T/- TTGTGACAGT 3070 hom 105 het 39 0 35 7 T 3 2 66882 CASAVA_Build 13 25102224 1I TGTCCCCCCC -/A CCACCACCAA 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 A 0 1 66883 CASAVA_Build 13 25104021 1D CCAACATAGC A/- AACCAAGCAG 3070 het 3070 hom 43 14 25 4 A 3 2 66884 CASAVA_Build 13 25104384 2D TTTTTGGGGC TT/-- TTATGGAGGC 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 T 4 2 66885 CASAVA_Build 13 25116129 5I AATTTATTCC -----/TATTT TATTTTATTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TATTT 2 3 66886 CASAVA_Build 13 25126367 2D GTTTTTAGAC AG/-- GGTCTCACTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AG 1 0 66887 CASAVA_Build 13 25128416 1I TAAAGTTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 51 1 41 9 T 9 10 66888 CASAVA_Build 13 25139780 1D GATAAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 11 10 66889 CASAVA_Build 13 25156893 1D GCCACTTCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 35 0 27 9 T 9 8 66890 CASAVA_Build 13 25159638 1I TGATCCCCCA -/C CATCCCAGCA 3070 hom 115 het 47 0 34 13 C 1 2 66891 CASAVA_Build 13 25160243 21D CTTTGGCTGT TTTCGTGCTGTTGTGTGGCTG/--------------------- TTTTGTGCTG 3070 het 3070 ref 51 28 21 9 TTTCGTGCTGTTGTGTGGCTG 1 0 66892 CASAVA_Build 13 25160550 5D TGTCAGGGAG AAGAT/----- AAGACTTCTT 3070 hom 84 het 35 0 29 8 AAGAT 1 0 66893 CASAVA_Build 13 25161025 1D GGCTATGATC T/- TCACTGCCAG 3070 het 3025 hom 27 7 14 6 T 2 1 66894 CASAVA_Build 13 25165810 2I GATCTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 54 het 27 0 18 9 TC 8 9 66895 CASAVA_Build 13 25172042 2I CTGGCTATGT --/GG GGAGGTCTAG 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 G 2 4 66896 CASAVA_Build 13 25183701 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 8 9 66897 CASAVA_Build 13 25185930 20D GGTCCTGGGG AGCTAGCAGCTCCCCAGGGT/-------------------- AGCTAGCAGC 3070 het 2541 hom 37 14 18 13 AGCTAGCAGCTCCCCAGGGT 1 0 66898 CASAVA_Build 13 25186262 4D AAAAGAAAGA AAGG/---- AAGGAAGGAA 3070 het 3070 hom 36 11 15 11 AAGG 6 5 66899 CASAVA_Build 13 25203659 1D ACTTTTGGCC A/- AAGAATGCTT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 3 2 66900 CASAVA_Build 13 25206003 1I CCACAAATAG -/T GTTTAACACC 3070 hom 138 het 55 0 46 9 T 0 1 66901 CASAVA_Build 13 25210487 1I CTCCCCCCCC -/A CCCACACACA 3070 het 111 hom 16 2 13 1 A 0 1 66902 CASAVA_Build 13 25211067 2D TGATGGTAAC TG/-- AACTTATCAG 3070 het 3070 ref 55 30 21 5 TG 1 0 66903 CASAVA_Build 13 25219728 1D GGAGGTGTGC T/- TAAGTAGACC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 2 1 66904 CASAVA_Build 13 25220102 1I ATTGGGTTTT -/A AAAAATTCAT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 5 6 66905 CASAVA_Build 13 25226407 1I TGACGAAGAA -/C GAACTGGCCC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 0 1 66906 CASAVA_Build 13 25227536 1D CTACTGCTTA T/- CAAAACTGTT 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 T 1 0 66907 CASAVA_Build 13 25241835 1I GAAGCAGTGA -/T TTACAGCTGT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 T 2 3 66908 CASAVA_Build 13 25246283 2D AATAGCAAAG AC/-- ATGGAATCAA 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 AC 1 0 66909 CASAVA_Build 13 25249110 1I CTTGCTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 11 12 66910 CASAVA_Build 13 25255199 3I ATATGTACTA ---/TTT TTTATTCTTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 3 6 66911 CASAVA_Build 13 25256329 1I GGTTTAAAAA -/T GGAGTCTTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 0 1 66912 CASAVA_Build 13 25265800 1D AGACTTAGTG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 9 8 66913 CASAVA_Build 13 25270655 1D GATGGCTTTT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 2697 hom 26 6 13 7 A 8 7 66914 CASAVA_Build 13 25272922 1D TAACCCTCAT A/- AAAAGTCTCA 3070 hom 122 het 47 0 39 8 A 5 4 66915 CASAVA_Build 13 25279293 1D CTTTATAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 34 2 12 20 T 13 12 66916 CASAVA_Build 13 25280186 2I CAAGTTGCCT --/TA ATTTAAAGAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TA 0 1 66917 CASAVA_Build 13 25283206 1D CCCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 23 10 A 11 10 66918 CASAVA_Build 13 25289489 2D GGTCTTTTAT GG/-- GGGGGGGGGG 2478 het 71 hom 22 2 10 10 G 12 10 66919 CASAVA_Build 13 25293088 1I TTTGGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1066 het 1066 ref 41 33 3 5 T 11 12 66920 CASAVA_Build 13 25304067 1I ATCCATAGTC -/A AATTTCTTTA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 2 3 66921 CASAVA_Build 13 25305212 1I AATAAACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 10 11 66922 CASAVA_Build 13 25315187 1I TCTACAAGGT -/A AAGAGGCTCT 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 2 3 66923 CASAVA_Build 13 25323994 1D TTTAAAAATG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 6 66924 CASAVA_Build 13 25325536 5D CTAAAAAAAA TATAT/----- ATATATATGT 1049 hom 7 het 4 0 3 1 TATAT 1 0 66925 CASAVA_Build 13 25331702 1D CCTTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 23 9 A 13 12 66926 CASAVA_Build 13 25336411 4D GCATGTGACT GACA/---- GACAAAGCCC 3070 het 3070 ref 58 29 23 6 GACA 2 1 66927 CASAVA_Build 13 25340686 1D ACATTCTGGC T/- TTTCAACTCA 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 4 3 66928 CASAVA_Build 13 25343248 2D TGATTGAGTG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 GT 1 0 66929 CASAVA_Build 13 25383063 1I TCCCTCTCAA -/T TTTTTTTTTT 2997 het 1540 hom 33 7 11 15 T 17 18 66930 CASAVA_Build 13 25393760 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2383 het 388 hom 13 1 7 5 A 17 16 66931 CASAVA_Build 13 25395766 1I TTAGCCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 492 hom 39 2 30 7 T 11 12 66932 CASAVA_Build 13 25396781 1I ACATTTGATT -/G GGGGGGGAAT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 G 7 8 66933 CASAVA_Build 13 25407976 4D ATCACTCCCC AAAT/---- AAATCAAGCA 3070 het 3070 ref 41 24 12 7 AAAT 2 1 66934 CASAVA_Build 13 25417437 1D ATTGATGAGG T/- TCTGGGGGAG 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 T 2 1 66935 CASAVA_Build 13 25418884 4I TTATTGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 TTTG 2 3 66936 CASAVA_Build 13 25424523 1I CTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 41 1 30 10 T 11 12 66937 CASAVA_Build 13 25456736 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 857 hom 41 3 26 13 A 13 12 66938 CASAVA_Build 13 25460679 2D TTAATTGCTA AT/-- ACTGCCTCCC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 AT 1 0 66939 CASAVA_Build 13 25464050 1I TACTTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1004 hom 35 5 21 9 T 15 16 66940 CASAVA_Build 13 25464816 1D AGTTGTATAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 10 9 66941 CASAVA_Build 13 25475499 1I GTCCTTTGTT -/C TTTTTTTTTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 0 1 66942 CASAVA_Build 13 25477081 1I TAGCCTGTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 8 9 66943 CASAVA_Build 13 25484207 2D TAGAAGAAAA CT/-- CGCCTTGATG 3070 hom 72 het 29 0 24 8 CT 1 0 66944 CASAVA_Build 13 25515239 1I TTAAGGTGTA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 9 66945 CASAVA_Build 13 25525561 1D TCAAATAGGG C/- CTAAAGTCTC 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 C 2 1 66946 CASAVA_Build 13 25528371 1I ATTTGGACAT -/A AAAATAAATG 3070 hom 151 het 55 0 51 4 A 4 5 66947 CASAVA_Build 13 25530032 1D TTATTTTTGT G/- GGGATGGGGG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 4 3 66948 CASAVA_Build 13 25533796 1I TATTGAACTT -/C CCAACGTCTG 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 C 2 3 66949 CASAVA_Build 13 25534681 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 33 1 28 5 T 11 10 66950 CASAVA_Build 13 25536550 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2839 het 2839 ref 29 14 9 6 A 10 11 66951 CASAVA_Build 13 25546539 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2892 het 2058 hom 17 5 8 4 A 12 11 66952 CASAVA_Build 13 25547705 6I AAGCCTGATC ------/TTGTAG TTGGTGTGTA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 TTGTAG 0 1 66953 CASAVA_Build 13 25551037 16D CATGCCTGTA ATCCCAGCACTGTGGG/---------------- AGGCCGAGGT 2458 het 2458 ref 20 11 7 2 ATCCCAGCACTGTGGG 1 0 66954 CASAVA_Build 13 25554565 1I AAACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1182 hom 29 3 18 8 A 15 16 66955 CASAVA_Build 13 25557258 1D TAATCAGCTA T/- TTTTCAAAAG 2349 het 1402 hom 12 3 6 3 T 5 4 66956 CASAVA_Build 13 25566132 1D AGACCAAAAA G/- GACCATGTGT 3070 het 3070 hom 50 14 30 6 G 2 1 66957 CASAVA_Build 13 25571162 2I GGAGCAAGGC --/AG AGAGTGAAGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 2 3 66958 CASAVA_Build 13 25572586 1D CAGAGAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 47 0 36 11 A 9 8 66959 CASAVA_Build 13 25573905 1I TATATGCAAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 26 10 8 8 T 8 9 66960 CASAVA_Build 13 25575430 2I TGCCACCAGG --/GC CATAGGTTTC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 GC 0 1 66961 CASAVA_Build 13 25575501 3D TTTTTTGTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 13 10 66962 CASAVA_Build 13 25579694 1D TCTAGTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 11 10 66963 CASAVA_Build 13 25583955 1D TCTTAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 1461 het 1461 ref 37 27 4 6 T 13 12 66964 CASAVA_Build 13 25586745 1I TAAACTTGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 393 hom 41 1 36 4 T 9 10 66965 CASAVA_Build 13 25604268 1D TTAAGAATGC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 7 66966 CASAVA_Build 13 25613564 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2160 het 523 hom 14 3 5 6 A 18 17 66967 CASAVA_Build 13 25631240 1I AAATTTTAAC -/A AAAAAATTGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 7 66968 CASAVA_Build 13 25633946 1I ACGCACTCTT -/C CCCCTTTGCC 3070 hom 134 het 49 0 41 8 C 4 5 66969 CASAVA_Build 13 25642377 1D TGGATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 593 hom 32 2 24 6 A 13 12 66970 CASAVA_Build 13 25642624 2D7M1D TTACTAACTA TCCATGCGTG/--AATGCGT- AAGATGGAGG 3070 hom 126 het 44 0 43 4 N/A 0 0 66971 CASAVA_Build 13 25644415 1D AGCACTATGG A/- AAAAAATACA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 7 6 66972 CASAVA_Build 13 25646634 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 15 1 A 10 12 66973 CASAVA_Build 13 25656040 5I TACTTATTTA -----/TATAT TATATGTAAT 2706 hom 15 het 6 0 6 0 TATAT 1 2 66974 CASAVA_Build 13 25658909 4D ACCTTTCTTC TTCT/---- TTTTTTTTTT 2795 hom 32 het 16 0 9 7 TTCT 1 0 66975 CASAVA_Build 13 25661465 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 8 9 66976 CASAVA_Build 13 25661868 1I CCTTGGAGAT -/A AGAGATTTCA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 1 2 66977 CASAVA_Build 13 25667408 3D GCCTTTGGGG GGC/--- GGCTTATTAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GGC 2 1 66978 CASAVA_Build 13 25668885 1I GGAAAGTATA -/C CAGATAGAGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 1 2 66979 CASAVA_Build 13 25679054 1D CTTCCTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 17 0 11 6 A 12 11 66980 CASAVA_Build 13 25696727 1I TTGGCTTCAT -/A AAAACGACAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 4 5 66981 CASAVA_Build 13 25696986 1I GTTTGAAGAT -/A ATTAAATATG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 1 2 66982 CASAVA_Build 13 25705090 1I TGCCCAGGCT -/G GGGTGCAATG 3070 hom 66 het 26 0 21 5 G 3 4 66983 CASAVA_Build 13 25735281 1I TGTTTTTCGG -/T TTTTTTTTTT 1775 het 1602 hom 22 6 10 6 T 10 11 66984 CASAVA_Build 13 25755013 1D GAAAAAGATA T/- TTCATGCAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 2 66985 CASAVA_Build 13 25766270 1D ATTCTGCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 27 9 T 12 11 66986 CASAVA_Build 13 25769466 4I ACTAAAAAGG ----/TAAC TAACCTTAAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TAAC 1 2 66987 CASAVA_Build 13 25783180 3D CACCAATCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2163 het 335 hom 41 6 11 24 T 17 14 66988 CASAVA_Build 13 25783898 2D CCCAGTAGTC TT/-- TATCTCATTA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 3 1 66989 CASAVA_Build 13 25791821 1D TCCAAATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 31 2 14 16 T 15 14 66990 CASAVA_Build 13 25796391 2I CTCTCCATGT --/GA GAGGCAGAGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 GA 1 2 66991 CASAVA_Build 13 25802771 1D CGTGTTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 34 1 25 8 T 11 10 66992 CASAVA_Build 13 25811120 1I TTTTTATTAG -/A AAAAAAACTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 66993 CASAVA_Build 13 25813976 1D GAAAATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 11 10 66994 CASAVA_Build 13 25825536 1D AATTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 33 1 26 6 T 12 11 66995 CASAVA_Build 13 25831399 14I GATGCAGAGT --------------/TTCAGTTTTACAGA ATGAAAAGAG 3070 hom 96 het 40 0 32 8 TTCAGTTTTACAGA 0 1 66996 CASAVA_Build 13 25848358 5D TTAATACATC AAGTT/----- AAATTAATAA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 AAGTT 1 0 66997 CASAVA_Build 13 25883762 3I ATTTTACATA ---/TAT TATTATTCAC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TAT 2 3 66998 CASAVA_Build 13 25893711 1I AATTTATTTT -/G TCATTGCTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 0 1 66999 CASAVA_Build 13 25906438 2D AATTAAGTGG TT/-- TTATATATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 4 2 67000 CASAVA_Build 13 25908374 1D ACCTAGAACC A/- AAGTCAATGC 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 A 3 2 67001 CASAVA_Build 13 25909515 3D ACAACAGAAT GAA/--- GGACAAAAAC 3070 hom 114 het 41 0 39 4 GAA 1 0 67002 CASAVA_Build 13 25913785 1D AATAAATGGG A/- AAGGGAAGAC 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 3 2 67003 CASAVA_Build 13 25924320 1I AGAAAAAAAA -/C AATAAAGACC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 0 1 67004 CASAVA_Build 13 25926175 1D GGACATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 32 1 26 5 A 13 12 67005 CASAVA_Build 13 25930509 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGCG 3070 hom 104 het 38 0 35 3 TG 4 5 67006 CASAVA_Build 13 25946069 2D CTGCTGACTG CA/-- GCAGGTCAGA 2820 het 2820 ref 37 19 9 9 CA 1 0 67007 CASAVA_Build 13 25951693 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 12 11 67008 CASAVA_Build 13 25954479 1I31M1I GGCGTGGTCG -GTGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTGCCTCCAG-/CGTGCGCCTGTAATCCCAGCTACTGCCTCCAGC CTGAGGCAGG 3017 hom 18 het 7 0 7 0 N/A 0 0 67009 CASAVA_Build 13 25976574 1D TCTAATATGC G/- GGATTCAGAT 3070 hom 129 het 48 0 41 7 G 3 2 67010 CASAVA_Build 13 25988977 13I GAGGTGACTG -------------/AATAGTTGACAGA AAGAACAAAG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 AATAGTTGACAGA 0 1 67011 CASAVA_Build 13 26000551 1I ATTCTGATGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 8 9 67012 CASAVA_Build 13 26006795 1D CCTCATCTGT A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 7 6 67013 CASAVA_Build 13 26013783 1D GGAAGCCCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 81 hom 27 2 11 14 T 10 9 67014 CASAVA_Build 13 26013905 1I CAGGCATGAG -/C CCACTGTGCC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 C 2 3 67015 CASAVA_Build 13 26024792 3I CATGTCAAAA ---/ATG ATGACAGTTA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 ATG 1 2 67016 CASAVA_Build 13 26029110 2D CTTCCTTTCC TT/-- TCCTCCTTTC 1214 het 892 hom 35 8 5 23 T 3 1 67017 CASAVA_Build 13 26043413 5D ATTTATCAAG CTTTT/----- CTTTAATTGA 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 CTTTT 1 0 67018 CASAVA_Build 13 26066962 1D GAGCTCCACA T/- TGTCTGTCTT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 T 2 1 67019 CASAVA_Build 13 26068250 2D TAAGTGATCC TT/-- TTTTTTTTTT 2589 het 745 hom 45 11 7 27 T 18 16 67020 CASAVA_Build 13 26073542 1I TCCTGTGCTC -/A AAGGTTCTAC 3070 hom 141 het 54 0 47 7 A 2 3 67021 CASAVA_Build 13 26080137 4I TCTACTGGGG ----/CCTA CCTAGTACAG 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 CCTA 1 2 67022 CASAVA_Build 13 26087090 3D GTGTTCAGAC TGT/--- TGTTGTAGGT 3070 het 3070 ref 41 20 13 10 TGT 3 2 67023 CASAVA_Build 13 26094912 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1019 het 1019 ref 26 19 3 4 A 13 14 67024 CASAVA_Build 13 26099407 1D TATACTATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 10 9 67025 CASAVA_Build 13 26101515 1D AACCAGGCTG T/- TGGCCACTGC 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 2 1 67026 CASAVA_Build 13 26119343 2D GACGATATAG TT/-- TAAAAAGATC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 3 1 67027 CASAVA_Build 13 26130272 2D GGCTATTGTG TA/-- TACACTCCCA 3070 hom 120 het 41 0 40 1 TA 2 1 67028 CASAVA_Build 13 26150257 4D ATAAGTCTGA TTGT/---- TTTATTTCTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TTGT 1 0 67029 CASAVA_Build 13 26168727 1I GCAATCTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 35 0 29 6 C 0 1 67030 CASAVA_Build 13 26175158 6I TCGTTGTTTG ------/TTTGTT TTTGTTTTTG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TTTGTT 2 3 67031 CASAVA_Build 13 26180707 3D GGTCCTAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 26 7 A 14 11 67032 CASAVA_Build 13 26182510 1D TCAGAGGTGA G/- GGGGGGCAAG 3070 hom 83 het 31 0 23 9 G 7 6 67033 CASAVA_Build 13 26207878 3I TGGAAGCTCT ---/GAG GCCTGTGAAA 3070 hom 138 het 50 0 45 5 GAG 0 1 67034 CASAVA_Build 13 26214386 4D CCCAGAAAAT TGTC/---- TGGGTCAGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TGTC 1 0 67035 CASAVA_Build 13 26216321 5I CTGGGGCTCG -----/CATTC CATTGTGAGC 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 CATTC 0 1 67036 CASAVA_Build 13 26216775 1D AAACAACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 34 1 22 11 T 11 10 67037 CASAVA_Build 13 26227544 1I GGATTAAGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 8 9 67038 CASAVA_Build 13 26230527 1D ACCATCATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 8 A 12 11 67039 CASAVA_Build 13 26234941 3D GTAAAACCTG GGA/--- GGAGTCAAAG 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 GGA 2 1 67040 CASAVA_Build 13 26237455 1I TATTCTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 11 12 67041 CASAVA_Build 13 26237621 1I TTAGTTGGGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 8 9 67042 CASAVA_Build 13 26239504 1D CTCTAGGCCT G/- GGCCCTACAT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 G 3 2 67043 CASAVA_Build 13 26242626 1D CTCTCCCCTC A/- AAATACATCC 3070 het 3070 hom 52 26 21 5 A 4 3 67044 CASAVA_Build 13 26248123 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2523 hom 28 7 16 5 A 10 9 67045 CASAVA_Build 13 26249386 4D TCTCGCGAGA ACTC/---- ACTCACTCTC 3070 het 3070 ref 47 28 14 6 ACTC 3 2 67046 CASAVA_Build 13 26251553 1D ATTCATCTGC A/- AACTAGAAAG 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 3 2 67047 CASAVA_Build 13 26270355 1D AAGTATTTTT C/- CCCCAAACTA 3070 hom 64 het 29 0 22 8 C 5 4 67048 CASAVA_Build 13 26273943 1D GTTTGACATC A/- GGGGTCTCAG 3070 hom 61 het 26 0 17 10 A 1 0 67049 CASAVA_Build 13 26275110 1I CTCATCCCCC -/T CTGGTGGCTC 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 0 1 67050 CASAVA_Build 13 26276446 1I TCTAAGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 30 1 20 9 T 10 11 67051 CASAVA_Build 13 26277453 1I ATCTATAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 665 hom 37 2 29 6 A 10 11 67052 CASAVA_Build 13 26277582 2I TTTTTTTGGG --/GC GGGGGGTAGA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GC 0 1 67053 CASAVA_Build 13 26283932 4I AATAAGGCTG ----/TGTC TGTCTCCAGT 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 TGTC 1 2 67054 CASAVA_Build 13 26288333 31D AGTAGCAACT GGACAACAGCTCTGTTATATTTCTGTCAGTG/------------------------------- GGACAACAGC 3070 het 3070 ref 34 26 13 6 GGACAACAGCTCTGTTATATTTCTGTCAGTG 1 0 67055 CASAVA_Build 13 26296120 1I AGGAGGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 750 hom 33 5 19 9 T 14 15 67056 CASAVA_Build 13 26300275 1D TACAAGTCAC A/- AAAAGACAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 6 A 5 4 67057 CASAVA_Build 13 26302741 1D CCAACACTGC T/- TCTCCCCTGG 3070 hom 102 het 37 0 33 5 T 2 1 67058 CASAVA_Build 13 26306223 3D ACGCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 18 15 67059 CASAVA_Build 13 26307546 1D GAGATAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 37 2 30 5 T 12 11 67060 CASAVA_Build 13 26322467 1I TAAGCTCTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 30 0 19 11 T 9 10 67061 CASAVA_Build 13 26363847 1D AAATAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1281 het 1281 ref 32 21 4 7 A 12 11 67062 CASAVA_Build 13 26377200 1D CACCTACCTA T/- TTTTTTTTTT 1510 het 1510 ref 49 33 4 12 T 12 11 67063 CASAVA_Build 13 26378010 1D TTAAAAATAA T/- TTAGTAGGTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 3 2 67064 CASAVA_Build 13 26381218 9I TGAGGTGACT ---------/TATGTGGAC TATGTCATTA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TATGTGGAC 0 1 67065 CASAVA_Build 13 26384649 2D CTCAACACCA TT/-- TTTGTCTTTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 5 3 67066 CASAVA_Build 13 26384986 4D AGGGCCAAGG CTGT/---- CTGACCCCAA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 CTGT 1 0 67067 CASAVA_Build 13 26386573 2D TATGAAGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 19 16 A 18 16 67068 CASAVA_Build 13 26394071 1D CTAGTCACAC A/- TACCTGGGTG 3070 hom 99 het 43 0 33 10 A 1 0 67069 CASAVA_Build 13 26398269 1D CACATGTACC T/- TTGTACTCAA 3070 hom 129 het 46 0 44 4 T 3 2 67070 CASAVA_Build 13 26399837 13D GAGTTACCAG ATGTGGATCTTTA/------------- AATAACCACG 3070 het 3070 ref 37 20 18 3 ATGTGGATCTTTA 1 0 67071 CASAVA_Build 13 26400577 1D TTTTTTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 12 11 67072 CASAVA_Build 13 26411840 1I TACCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 31 3 15 13 A 14 15 67073 CASAVA_Build 13 26413233 1D TGGAAGGGGT C/- CCACATGGGA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 C 3 2 67074 CASAVA_Build 13 26424061 1D CAATAAAAAG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 8 7 67075 CASAVA_Build 13 26429468 12D CAGGGTGACT GGACAGTCTTCA/------------ GGACAGTCTT 3070 hom 129 het 46 0 41 8 GGACAGTCTTCA 2 1 67076 CASAVA_Build 13 26442618 1I CCAATAGAGT -/C CCAGTTCATA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 C 2 3 67077 CASAVA_Build 13 26442715 1I AGCCAGAGGC -/T CTTGCAACAC 3070 hom 108 het 41 0 34 7 T 0 1 67078 CASAVA_Build 13 26445321 2I GCATGCAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 122 het 51 0 40 11 A 10 12 67079 CASAVA_Build 13 26450493 1D TTTAACGATG A/- AAAAAATCCA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 7 6 67080 CASAVA_Build 13 26450685 3I TCTTTCCCTT ---/CTC CTCATCCTGA 3070 hom 80 het 35 0 27 8 CTC 1 2 67081 CASAVA_Build 13 26455094 8D ACAGTTAAAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 1230 het 222 hom 16 1 7 8 AAAG 4 2 67082 CASAVA_Build 13 26456942 1D AAAAGATGTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 T 8 7 67083 CASAVA_Build 13 26457243 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 10 67084 CASAVA_Build 13 26462968 1D TGTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1085 het 1085 ref 11 4 4 3 T 13 12 67085 CASAVA_Build 13 26484360 2D CACACCAAAC AT/-- GTGTTCACTC 3070 hom 114 het 40 0 38 3 AT 1 0 67086 CASAVA_Build 13 26513842 1D AATCAATGAT A/- AAAAAATTAT 2738 het 2738 ref 26 18 7 1 A 7 6 67087 CASAVA_Build 13 26524171 2D ATATATGGAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 53 het 23 0 17 6 AT 7 6 67088 CASAVA_Build 13 26529500 1D CAGATAACTC T/- TGACGACAGA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 2 1 67089 CASAVA_Build 13 26551347 2I TCGTGCTCCC --/TG TGTGTGGGGC 2124 hom 24 het 11 0 7 4 TG 3 4 67090 CASAVA_Build 13 26565447 1I ATTATACCCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 40 1 33 6 A 10 11 67091 CASAVA_Build 13 26567105 1I AGCAACACAG -/T TAAGACCCCT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 1 2 67092 CASAVA_Build 13 26568275 3D CTTACCTGAC TTA/--- TTATTTCACA 3070 het 3070 hom 46 23 20 7 TTA 2 1 67093 CASAVA_Build 13 26570504 1I CAGAATATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 362 hom 47 1 40 6 A 9 10 67094 CASAVA_Build 13 26571826 1D TTCACAATAA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 8 7 67095 CASAVA_Build 13 26594383 1I ATCAGGGTGG -/T TTCCCCCATA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 2 3 67096 CASAVA_Build 13 26595229 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 15 14 67097 CASAVA_Build 13 26595244 1D AAAAAAAAAA T/- ATTTTACAGA 3070 het 232 hom 25 6 11 9 T 1 0 67098 CASAVA_Build 13 26601301 2D76M3D CCACAATAAG AAAGTGACCTGTAGCTCTTTCCGTGTCACTGAGACAACAGGAATATTATATTAAACCACAGTTAAGTGGAAAGAACAAAGC/--AGTGACCTGTAGCTCTTTCCGTGTCACTGAGACAACAGGAATATTATATTAAACCACAGTTAAGTGGAAAGAACAA--- AGCATCTCTG 3070 hom 199 het 37 0 67 4 N/A 0 0 67099 CASAVA_Build 13 26602699 1D AAAACATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 35 1 23 12 A 15 14 67100 CASAVA_Build 13 26620514 2D TGTATAAAAC TA/-- TATATATATA 3070 het 2344 hom 20 7 7 8 TA 6 5 67101 CASAVA_Build 13 26626209 2D AAATATCCAC AT/-- CTTTCCACTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 6 AT 1 0 67102 CASAVA_Build 13 26626465 2D TTTTTGTAAC CT/-- CTCATGCTAC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 CT 2 1 67103 CASAVA_Build 13 26634037 10D AAAAAAAATA AAAAAAAATT/---------- AAAAAGCCAC 3070 het 2290 hom 21 8 12 1 AAAAAAAATT 1 0 67104 CASAVA_Build 13 26635915 1I TAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAGA 3070 het 146 hom 32 4 15 13 G 0 1 67105 CASAVA_Build 13 26636227 1D TACAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 A 13 12 67106 CASAVA_Build 13 26637193 1D GCTGGTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2367 hom 36 11 19 6 T 14 13 67107 CASAVA_Build 13 26649233 1D CTTCTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 23 3 12 8 A 17 16 67108 CASAVA_Build 13 26653996 2D TTAGGATGTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TA 10 9 67109 CASAVA_Build 13 26670554 1D TAGGAAGGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 10 9 67110 CASAVA_Build 13 26679379 1D GCTTAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 33 0 25 8 A 13 12 67111 CASAVA_Build 13 26685662 1I CGGAACTCTC -/A AAGTCATGTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 2 3 67112 CASAVA_Build 13 26699416 1I AGTAACCACA -/G GGGGGAAACT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 G 5 6 67113 CASAVA_Build 13 26700819 1D ATGTTTAACC T/- TCTGAGAAAC 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 T 2 1 67114 CASAVA_Build 13 26705740 3I TAGTCTGCTA ---/TTG TTGTTAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTG 1 2 67115 CASAVA_Build 13 26713790 2I TCTTTCTCAT --/TC TCTCTCTTGC 3070 hom 96 het 42 0 30 12 TC 3 4 67116 CASAVA_Build 13 26719363 1I AAAAGCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 10 11 67117 CASAVA_Build 13 26732051 1D GTCTGGAAGA C/- CACATTATTT 3070 hom 108 het 40 0 34 6 C 2 1 67118 CASAVA_Build 13 26735602 2I CCCAGCACTC --/TT TATTTAACAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 1 3 67119 CASAVA_Build 13 26765108 4I GTGACAGAGC ----/AAAA AAAAAAAAAA 2244 het 1955 hom 20 6 8 6 A 13 17 67120 CASAVA_Build 13 26773573 1D ATAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGT 2297 het 2297 ref 20 12 6 2 T 9 8 67121 CASAVA_Build 13 26774694 1D GTATTTTTTG T/- TGGGGGGGAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 2 1 67122 CASAVA_Build 13 26779730 1D TAAAAAACAC A/- AAAAAAATTA 2322 het 668 hom 9 2 7 0 A 8 7 67123 CASAVA_Build 13 26786553 1I TTAAAAAAAT -/A TTTTTTTTGT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 0 1 67124 CASAVA_Build 13 26789823 1D TATACAGTAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 A 9 8 67125 CASAVA_Build 13 26799581 2D TTAGTTGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 29 2 14 14 T 18 16 67126 CASAVA_Build 13 26805469 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 1635 hom 33 het 28 0 18 11 A 10 9 67127 CASAVA_Build 13 26814110 3I TGTGAGGAGC ---/AAG TGCTCAGTCT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AAG 0 1 67128 CASAVA_Build 13 26814522 4D AGTTAAACAG TGAA/---- TGAATGAATG 3070 hom 102 het 43 0 35 12 TGAA 4 3 67129 CASAVA_Build 13 26819858 13D TTCTTCTTCT TTCTTCTTCTTCC/------------- TTCTTCTTTC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 TTCTTCTTCTTCC 1 0 67130 CASAVA_Build 13 26819908 1I CTTCCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 511 hom 7 het 11 0 3 8 T 13 14 67131 CASAVA_Build 13 26821238 19I CAAAATAAAA -------------------/TAAAATAAAGACCCCTCAC TAAGATGCAA 3070 hom 60 het 21 0 21 1 TAAAATAAAGACCCCTCAC 0 1 67132 CASAVA_Build 13 26821401 3D TGTCCCTACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 13 9 A 17 14 67133 CASAVA_Build 13 26823756 4D GCCCACATTG ACCA/---- ATAAGGAAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 3 ACCA 1 0 67134 CASAVA_Build 13 26830754 1I GAGTGGGGCT -/G GGGGGTGGAA 3070 hom 87 het 39 0 29 10 G 5 6 67135 CASAVA_Build 13 26831177 1D ATCACCCCTC T/- TTAACCCCCA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 T 3 2 67136 CASAVA_Build 13 26834951 1I GGGAGACCGA -/G GGGGTGGGTG 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 G 4 5 67137 CASAVA_Build 13 26842212 1D GTTCTATTGT A/- AAAAAAAACA 1733 het 1733 ref 23 12 8 4 A 9 8 67138 CASAVA_Build 13 26842390 1D ACAATAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 T 11 10 67139 CASAVA_Build 13 26843817 14D TCCCCACCCA AGAAGGCCTGATTT/-------------- AGCTGTTGCT 1710 het 1710 ref 21 14 6 4 AGAAGGCCTGATTT 1 0 67140 CASAVA_Build 13 26849452 5I GTGCTTTCAG -----/TTCTT TTGAGTGTAT 3070 het 3070 hom 57 21 30 6 TTCTT 0 1 67141 CASAVA_Build 13 26850678 1I CTTTTCACTC -/T TTTTTTTTTT 2939 het 433 hom 18 2 13 3 T 13 14 67142 CASAVA_Build 13 26859812 2I GTGACCCACC --/CT CCCCCCATCT 3019 hom 18 het 33 0 11 22 CT 0 1 67143 CASAVA_Build 13 26860074 2D AGGTTTGTGG AA/-- AAGACACTTG 3070 het 3070 hom 42 17 19 8 A 4 2 67144 CASAVA_Build 13 26874956 2I TATAATAAAC --/AT ATATTAAACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AT 2 3 67145 CASAVA_Build 13 26877252 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 485 hom 26 3 14 9 T 17 16 67146 CASAVA_Build 13 26882136 10D AAAAATATGA TAGAATATTT/---------- TAGAATATTT 3070 hom 63 het 20 0 22 4 TAGAATATTT 2 1 67147 CASAVA_Build 13 26882860 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 10 11 67148 CASAVA_Build 13 26886247 1I AAGATCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 11 12 67149 CASAVA_Build 13 26895228 9I AAAATCCTAG ---------/TTAGTAAAT TTAGTAAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTAGTAAAT 1 2 67150 CASAVA_Build 13 26895986 1D CTCAAAAGTG C/- TTCTCAGGTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 1 0 67151 CASAVA_Build 13 26896075 1D AAACTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1861 het 161 hom 28 3 12 13 T 19 18 67152 CASAVA_Build 13 26905458 1I GAATTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 97 hom 21 1 16 4 T 13 14 67153 CASAVA_Build 13 26905665 1I14M3I AAAAAAAAAC -AAAAAAAAACTTTT---/AAAAAAAAAACTTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 24 0 19 8 N/A 0 0 67154 CASAVA_Build 13 26906668 4I GGAAGGACAC ----/TGTT TGGTCTGCTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 TGTT 0 1 67155 CASAVA_Build 13 26912862 1I TTGGTTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 50 2 34 14 T 13 14 67156 CASAVA_Build 13 26918165 3I CTAGGTATTA ---/GAT GATACTATTA 3070 het 3070 hom 29 8 18 3 GAT 1 2 67157 CASAVA_Build 13 26919871 2I TTTTCCCATC --/AT AGTCTGTCCT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 AT 0 1 67158 CASAVA_Build 13 26920048 1I TCTAGTTTTC -/T GTTAATGAAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 0 1 67159 CASAVA_Build 13 26921136 1I TGAGATCGTG -/C CACCGCACTC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 C 1 2 67160 CASAVA_Build 13 26927669 2D TTAGTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 27 9 T 15 13 67161 CASAVA_Build 13 26931014 3I GTTTTTTTTT ---/ACA ACAACTTTCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 ACA 1 2 67162 CASAVA_Build 13 26932683 2D CAGTGAGGTC TT/-- TGGATTTGCT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 T 3 1 67163 CASAVA_Build 13 26950551 2D GTGGGAGGTA GG/-- GGGACTTTCT 3070 hom 102 het 35 0 35 1 G 5 3 67164 CASAVA_Build 13 26958750 1D TCATGACAGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 41 0 34 8 A 9 8 67165 CASAVA_Build 13 26962250 1D ATGTTAATTT A/- AAAAAATTAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 6 67166 CASAVA_Build 13 26970523 1I TTAATATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 42 1 33 10 T 10 11 67167 CASAVA_Build 13 26983500 1D TGTTTTCTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 9 8 67168 CASAVA_Build 13 26986152 18D CTTAAAGTAT AATAAAAATAAATAAATA/------------------ AATAAAAATA 3070 hom 31 het 11 0 10 2 AATAAAAATAAATAAATA 1 0 67169 CASAVA_Build 13 26994549 1I CATTTTTTTT -/A AATTTAAAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 3 67170 CASAVA_Build 13 26996444 1D AAAGAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 10 9 67171 CASAVA_Build 13 27002533 17I TTCACTTAGT -----------------/CCTCGCAGGACATTTCA ATAATGTCCT 3070 hom 123 het 43 0 41 4 CCTCGCAGGACATTTCA 0 1 67172 CASAVA_Build 13 27011408 2D GGTAAAGTAA AG/-- AAAAACTTCA 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 AG 1 0 67173 CASAVA_Build 13 27024231 1D ATACTGTGTA T/- TTCTCATCTA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 T 3 2 67174 CASAVA_Build 13 27036510 3D ATGTATTTTT TTA/--- TCAATCAACA 3070 het 3070 hom 31 12 18 2 TTA 1 0 67175 CASAVA_Build 13 27045581 2D AGCATTGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1780 hom 30 6 11 13 A 16 14 67176 CASAVA_Build 13 27046580 3I AGAATTCACT ---/AGA AGTTCAACAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 AGA 0 1 67177 CASAVA_Build 13 27054028 1D ACTGGTTAGC T/- TTTTTTAGTA 3070 het 3070 hom 29 12 13 6 T 7 6 67178 CASAVA_Build 13 27055663 2I CCAAAGTGCT --/GG GATTACAGGT 2528 het 2528 ref 19 7 8 4 G 1 3 67179 CASAVA_Build 13 27058140 2D TATATACACT TA/-- TATATATATA 2868 het 2423 hom 15 7 7 1 TA 8 7 67180 CASAVA_Build 13 27066493 3D CCTTTATCAC ATT/--- ATTATAATCA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 ATT 2 1 67181 CASAVA_Build 13 27067623 3I AACAAATGTG ---/TCC TCAACTTTTA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 TCC 0 1 67182 CASAVA_Build 13 27070777 2D ATGAGGAAAC TG/-- AGAGTAAGGC 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 TG 1 0 67183 CASAVA_Build 13 27074675 4I TATGCTGTGG ----/TATA TATATATCAG 3070 het 3070 hom 47 19 26 2 TA 3 5 67184 CASAVA_Build 13 27080187 1D GAACAGAGAT C/- CCACCTGTCT 3070 het 3070 ref 48 29 19 0 C 3 2 67185 CASAVA_Build 13 27095802 4I TTAGATTGTT ----/GTTA GTTTAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 GTTA 0 1 67186 CASAVA_Build 13 27100021 2D GGATGGATAC AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 10 8 67187 CASAVA_Build 13 27104779 1I AATTGCAGCA -/C CCCCCCGCCC 3070 hom 66 het 23 0 22 1 C 6 7 67188 CASAVA_Build 13 27109099 1D AGTTTGTGAT A/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 1 0 67189 CASAVA_Build 13 27119529 3I ATTATTATTA ---/TTG TTTTTATTTT 3070 het 2965 hom 30 8 19 3 TTG 0 1 67190 CASAVA_Build 13 27122070 1D TTACTTCTTA T/- TACCAACCAC 3070 het 3070 ref 46 22 23 3 T 2 1 67191 CASAVA_Build 13 27122707 4I TTTCTGGAAG ----/CTAA CTAAGGCAAA 3070 het 3070 ref 54 24 18 12 CTAA 1 2 67192 CASAVA_Build 13 27124794 1I GATCACTTGA -/G GTCAGGAGTT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 G 1 2 67193 CASAVA_Build 13 27128960 1I TTTTGATAGT -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 99 het 42 0 32 10 A 7 8 67194 CASAVA_Build 13 27133667 4D CATAGACAGT GACA/---- GACAGTGCAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 GACA 2 1 67195 CASAVA_Build 13 27146753 1D TGCAAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 12 11 67196 CASAVA_Build 13 27148863 2D TAAAATGTAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AT 8 7 67197 CASAVA_Build 13 27149045 1D ATTATTGAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 9 8 67198 CASAVA_Build 13 27149985 1I ACTTTAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 846 hom 44 3 28 13 T 13 14 67199 CASAVA_Build 13 27153585 29D ACCTGTATGA GCTGGAAAACCAGTCAGCTAATATAAACT/----------------------------- GTATGATACC 3070 hom 111 het 36 0 38 4 GCTGGAAAACCAGTCAGCTAATATAAACT 1 0 67200 CASAVA_Build 13 27154185 2D AAGATGAAAC AT/-- GTGAAAAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 5 AT 1 0 67201 CASAVA_Build 13 27154452 2I AAAGAAGCCA --/AG ATCACTAAAG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AG 0 1 67202 CASAVA_Build 13 27155591 1D TAAAGTACAG A/- AAGAAAAAAA 3070 hom 157 het 55 0 53 4 A 3 2 67203 CASAVA_Build 13 27158833 1D TGTTTCCAAC A/- AAAAAAACTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 7 67204 CASAVA_Build 13 27163970 1I CAAGATGAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 C 3 4 67205 CASAVA_Build 13 27164145 1I ACCCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 A 10 11 67206 CASAVA_Build 13 27167528 15D TCCGTCTCAA AAAATAAAAAGAAAG/--------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 46 het 18 0 15 4 AAAATAAAAAGAAAG 1 0 67207 CASAVA_Build 13 27173851 1I ACTCCGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 10 11 67208 CASAVA_Build 13 27201326 1I CACAGCTTGG -/A AAAAATGGAT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 5 6 67209 CASAVA_Build 13 27202902 1D CCCATTTCCA T/- TTTGTCCAGT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 4 3 67210 CASAVA_Build 13 27204286 4I GGGACATTTG ----/GGTT GGTTCCAAGT 1400 het 1400 ref 9 6 3 0 GGTT 1 2 67211 CASAVA_Build 13 27206188 2I TACAAACAAT --/AA AAAAAAAAAA 1081 het 1081 ref 18 9 3 6 A 10 12 67212 CASAVA_Build 13 27210528 1D AATGCTATTC T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 8 7 67213 CASAVA_Build 13 27292625 1D AAAAAAAAAA G/- CAAAAAACAA 3070 het 2047 hom 27 9 15 3 G 1 0 67214 CASAVA_Build 13 27293610 1I AAGAAAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2315 hom 26 7 13 6 A 9 10 67215 CASAVA_Build 13 27298655 5D GGAGCTCAGG ATAAA/----- ATAAAGTGTC 3070 het 3070 ref 29 13 12 6 ATAAA 2 1 67216 CASAVA_Build 13 27312081 1D GAATAAGATT C/- ACATCCCTCT 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 C 1 0 67217 CASAVA_Build 13 27329472 1D GGCTGGGGGC G/- GGGGGGGTGG 222 het 17 hom 5 0 1 4 G 8 7 67218 CASAVA_Build 13 27334162 4I CCCCTGAGCT ----/CAAA CAATCTGCCC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CAAA 0 1 67219 CASAVA_Build 13 27336374 1D CAGTTAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 10 9 67220 CASAVA_Build 13 27336677 1D AAAGAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 35 4 16 15 T 13 12 67221 CASAVA_Build 13 27346316 1I TATGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 1700 het 496 hom 7 1 5 1 C 4 5 67222 CASAVA_Build 13 27350957 1I TTTGGCACAA -/G TTTTGATCAC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 0 1 67223 CASAVA_Build 13 27352559 1D AATGATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 18 6 A 13 12 67224 CASAVA_Build 13 27354993 1D GCTTCAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2457 hom 38 9 20 9 T 12 11 67225 CASAVA_Build 13 27355446 3D AGTAACTGAT AGA/--- AGAAGGAGTA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 AGA 2 1 67226 CASAVA_Build 13 27360155 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 A 8 7 67227 CASAVA_Build 13 27361466 1D TTAGTAACAT C/- CCCCCCCCCA 2477 het 2055 hom 25 9 6 11 C 10 9 67228 CASAVA_Build 13 27364689 1D TTGAGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2622 hom 31 9 14 8 T 13 12 67229 CASAVA_Build 13 27365656 2D ATTCACTACT GA/-- GAGTATGGCA 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 GA 2 1 67230 CASAVA_Build 13 27365910 1I AGAATATTCT -/C CCCCCCCATC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 C 7 8 67231 CASAVA_Build 13 27387013 3I GTAATCCCAG ---/TAC TACTTTGGGA 2403 het 2403 ref 17 9 6 2 TAC 1 2 67232 CASAVA_Build 13 27391489 1I TCAATTTTTT -/A AAAAAAAAGA 1843 het 1513 hom 14 4 6 4 A 8 9 67233 CASAVA_Build 13 27417952 9D TAAGGTACTG CTTAAACAC/--------- CTTAAACACC 3070 hom 68 het 26 0 23 5 CTTAAACAC 2 1 67234 CASAVA_Build 13 27420470 2D TTCTCATGTA GT/-- GTGTGTGTGC 2042 hom 21 het 19 0 8 11 GT 5 4 67235 CASAVA_Build 13 27421032 1D CTCCATATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 27 0 15 13 T 13 12 67236 CASAVA_Build 13 27427238 4I ACTTACCCAC ----/CGAA CAGCTTCACA 3070 hom 63 het 22 0 21 1 CGAA 0 1 67237 CASAVA_Build 13 27427755 1I TATTTATGTA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 67238 CASAVA_Build 13 27430194 1I TTATACTCTG -/A AACAAAACCA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 2 3 67239 CASAVA_Build 13 27433835 1D GATTTTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 7 67240 CASAVA_Build 13 27442702 1D TTCACCTCCT A/- ATACAAGCCT 1694 hom 17 het 9 0 7 2 A 2 1 67241 CASAVA_Build 13 27445061 1D CTATCTCTAC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 72 het 33 0 24 9 A 8 7 67242 CASAVA_Build 13 27447308 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 26 1 16 9 A 15 14 67243 CASAVA_Build 13 27460030 24D ATAGATAGAT GATAGATAGATAGATAGATAGATA/------------------------ GATAGATAGA 3070 hom 63 het 29 0 22 11 GATA 10 4 67244 CASAVA_Build 13 27471916 1D AGTTTTTACG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 29 0 16 13 T 11 10 67245 CASAVA_Build 13 27495448 2D TCTTTTCAAA TC/-- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 51 19 25 9 TC 1 0 67246 CASAVA_Build 13 27495940 1I TGTCTATCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 10 11 67247 CASAVA_Build 13 27498729 2D CGGAGGATAA AC/-- ACAGAGCAGA 3070 het 3070 hom 55 26 25 6 AC 2 1 67248 CASAVA_Build 13 27499783 4D CCTCTTTTTC CTTT/---- CTTTTAGTAC 3070 het 3070 ref 37 19 16 5 CTTT 2 1 67249 CASAVA_Build 13 27507082 1I TCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 26 1 18 9 A 11 12 67250 CASAVA_Build 13 27512492 1I GAGGCACCAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 90 het 40 0 30 10 A 7 8 67251 CASAVA_Build 13 27512676 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 8 9 67252 CASAVA_Build 13 27512975 1I CTCTACAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 9 7 5 T 11 12 67253 CASAVA_Build 13 27514644 2I GCAATTTCAG --/AA AAAAAGAAGG 3070 hom 103 het 44 0 35 9 A 5 7 67254 CASAVA_Build 13 27515328 1D GTCCTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 50 1 38 11 T 11 10 67255 CASAVA_Build 13 27516587 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1814 het 439 hom 14 3 6 5 A 15 14 67256 CASAVA_Build 13 27521939 1I CCCAAGTGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 9 10 67257 CASAVA_Build 13 27522976 1D TTTGGTCCTA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 847 hom 37 7 20 10 T 4 3 67258 CASAVA_Build 13 27523384 2I CTTTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTA 2203 het 2203 ref 22 12 6 4 T 9 11 67259 CASAVA_Build 13 27525905 1I ACTTTATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 11 12 67260 CASAVA_Build 13 27526699 3D TCTCTACAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 35 19 10 8 AAC 4 3 67261 CASAVA_Build 13 27533499 4D CGCATTAGGG TTCA/---- TTTTTTGTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TTCA 1 0 67262 CASAVA_Build 13 27535214 1D AATTTATAAA G/- CAATGGTAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 G 1 0 67263 CASAVA_Build 13 27535833 6I TGTTCACTTA ------/GTAAGT CTATGATAAG 3070 hom 87 het 39 0 30 9 GTAAGT 0 1 67264 CASAVA_Build 13 27535876 1D ATGAGACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 13 18 A 12 11 67265 CASAVA_Build 13 27539334 1D TTATTTTGTA T/- TTTTTAGCAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 6 5 67266 CASAVA_Build 13 27544280 2D ATATATATAT AA/-- AAATATATGT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 5 3 67267 CASAVA_Build 13 27545490 1D TCATCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 32 4 14 14 A 17 16 67268 CASAVA_Build 13 27546089 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAGAAAA 3070 het 188 hom 31 4 20 7 G 0 1 67269 CASAVA_Build 13 27549167 2D64M2D AGGAAAAGAA AGAGAGAGAGAGAGAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGAGAA/--AGAGAGAGAGAGAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGAG-- AAAGAAAGAG 3070 het 188 hom 11 2 11 11 N/A 0 0 67270 CASAVA_Build 13 27553434 5D CTTACTTAAT TTCTC/----- TTATCAATGT 3070 het 3070 hom 52 25 24 4 TTCTC 1 0 67271 CASAVA_Build 13 27553982 14D ACTTTGATTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 827 het 386 hom 11 2 3 7 T 28 14 67272 CASAVA_Build 13 27603362 3I AATATTAATT ---/TAG TTTTACCCAC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TAG 0 1 67273 CASAVA_Build 13 27671872 1D TTCCATACCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 T 9 8 67274 CASAVA_Build 13 27689980 1I AAAACTTTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 8 9 67275 CASAVA_Build 13 27694463 1D TTAAATTAGC T/- GAAAATCTAT 3070 het 3070 hom 38 15 22 2 T 1 0 67276 CASAVA_Build 13 27709333 1D GGTAGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 12 11 67277 CASAVA_Build 13 27716897 3D TCTTTTCTTC AGT/--- AGTAGTTTTT 3070 hom 79 het 30 0 26 5 AGT 3 2 67278 CASAVA_Build 13 27720658 1D GGAAAGGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 58 het 29 0 20 9 T 10 9 67279 CASAVA_Build 13 27725736 1D TTTGCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2054 het 2054 ref 41 24 5 12 T 13 12 67280 CASAVA_Build 13 27732834 1I TTAATTGGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 8 9 67281 CASAVA_Build 13 27733528 1I ATACTTATTT -/C TGTTTCATAG 3070 hom 66 het 33 0 23 10 C 0 1 67282 CASAVA_Build 13 27734851 1D TTGAAATAAC A/- AACTGTAGAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 3 2 67283 CASAVA_Build 13 27779795 1I TCGTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 321 hom 35 1 30 4 T 13 14 67284 CASAVA_Build 13 27779955 3D GCCCAGGCTG CTA/--- GAGTGCAGTG 3070 hom 30 het 11 0 10 2 CTA 1 0 67285 CASAVA_Build 13 27782559 1D TCGGCAAGCC T/- TCCTTCTGGG 3070 hom 97 het 37 0 30 7 T 2 1 67286 CASAVA_Build 13 27790105 1I TGAGCTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 8 9 67287 CASAVA_Build 13 27803993 1D GCTGATGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 12 11 67288 CASAVA_Build 13 27832196 1I TGCAGTGAGC -/T GAGATCGTGC 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 T 0 1 67289 CASAVA_Build 13 27847524 2D ACATTTTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 32 1 14 19 T 13 11 67290 CASAVA_Build 13 27860592 1D GTCATTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 45 0 34 11 T 11 10 67291 CASAVA_Build 13 27861051 10D GCCATCAATA GCTGTGTGGT/---------- GCAGTCAGAG 3070 het 3070 ref 42 20 21 6 GCTGTGTGGT 1 0 67292 CASAVA_Build 13 27861284 1D TGCTTAACGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 8 A 13 12 67293 CASAVA_Build 13 27878151 1I TTATGTGTGA -/G TCTTCTTTTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 0 1 67294 CASAVA_Build 13 27879507 1D CATCTACCCC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 55 het 24 0 19 5 T 8 7 67295 CASAVA_Build 13 27893672 1D48M19D GCTGCTGCAC TTTTTTTTTTCCTTACTGGGCCCTTATTAACATTATAATCACAGAGTCAGTTTTGTATCACAGAGTTT/-TTTTTTTTTCCTTACTGGGCCCTTATTAACATTATAGTCACAGAGTCA------------------- GTACCTCCAT 3070 hom 118 het 27 0 38 10 N/A 0 0 67296 CASAVA_Build 13 27893920 2I AAGGAAGAAA --/AT ATATAATTTA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 AT 2 3 67297 CASAVA_Build 13 27894456 1D AAGTTTTTTT C/- CCATGAGTGG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 3 2 67298 CASAVA_Build 13 27897679 1D CCAAATTTAT A/- AATATTATGT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 A 3 2 67299 CASAVA_Build 13 27904042 2D GGAATAATGC TA/-- TAGTTTCATT 3070 hom 129 het 44 0 44 1 TA 2 1 67300 CASAVA_Build 13 27904396 3D GAGCTTAGTT CTC/--- CTCTGTGCCA 3070 hom 108 het 40 0 37 5 CTC 2 1 67301 CASAVA_Build 13 27916979 7D CACAGCATAC TAAAATT/------- TAAAATTTAC 3070 hom 57 het 21 0 19 3 TAAAATT 2 1 67302 CASAVA_Build 13 27919280 1D TATAAAAAAT A/- TATATTTTAT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 1 0 67303 CASAVA_Build 13 27929523 1D TATCCGAACA G/- GGATTTGAAA 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 G 3 2 67304 CASAVA_Build 13 28019948 2I CAGGAATCAC --/AG AGTGTACCCC 3070 hom 96 het 46 0 29 17 AG 1 2 67305 CASAVA_Build 13 28031128 1D AGCAACCTTT C/- CGAAAAGGGC 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 C 2 1 67306 CASAVA_Build 13 28033065 1D TGCTGGAACT G/- GGCTGTAAAC 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 G 3 2 67307 CASAVA_Build 13 28039997 1D GAATAGACTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 10 9 67308 CASAVA_Build 13 28046554 1D GTCACACAGG T/- TGTGACACAG 3070 hom 139 het 57 0 42 16 T 2 1 67309 CASAVA_Build 13 28046682 1D GTATCATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 125 het 52 0 41 12 T 12 11 67310 CASAVA_Build 13 28048827 4I GGAGGTGAGC ----/TAAG TAAGATGTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TAAG 1 2 67311 CASAVA_Build 13 28051557 1I CCAAGGCACC -/A GGGAGAAGAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 0 1 67312 CASAVA_Build 13 28056378 1D CTCGGAACAG C/- CATGCCCGGG 3070 hom 78 het 32 0 21 12 C 2 1 67313 CASAVA_Build 13 28067437 1I TTTGTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2607 hom 22 8 9 5 T 10 11 67314 CASAVA_Build 13 28069042 1I ATAAATGATA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 6 7 67315 CASAVA_Build 13 28087831 1D AACTTTATAG A/- ATACAACCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 2 1 67316 CASAVA_Build 13 28089350 2I CAAACAGCCG --/AC ACACCCTTCT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 AC 2 3 67317 CASAVA_Build 13 28096189 6I GGCTAGGGCT ------/CCACCC CCACAGACCT 3070 hom 93 het 33 0 29 4 CCACCC 0 1 67318 CASAVA_Build 13 28097832 1D AGGTCCAGGT G/- ACTTGGAGGT 3070 hom 120 het 47 0 41 7 G 1 0 67319 CASAVA_Build 13 28098366 3I ACAGTAACAG ---/AGA AGAAGCAATC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AGA 1 2 67320 CASAVA_Build 13 28101631 1D GTTTGTGCTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 9 8 67321 CASAVA_Build 13 28102495 2D AAACGCATCG TC/-- TACACAGCAG 3070 het 3070 ref 56 23 16 17 TC 1 0 67322 CASAVA_Build 13 28102981 1D CCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 2293 het 2293 ref 17 8 8 1 A 10 9 67323 CASAVA_Build 13 28112064 3I GGTAGCTCAA ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 TTG 3 4 67324 CASAVA_Build 13 28115935 1I CATATTGACT -/C CCCCCAAACC 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 C 5 6 67325 CASAVA_Build 13 28116592 7D ACTCCGTCTC AAAACAA/------- AAAACAAAAA 2401 het 2401 ref 19 9 8 5 AAAACAA 3 2 67326 CASAVA_Build 13 28118487 1I CAACAACAAC -/A AACAAAAAAA 3044 het 3044 ref 19 8 10 1 A 2 3 67327 CASAVA_Build 13 28123480 1I AAAGTTAAAT -/C CCATATGGAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 C 2 3 67328 CASAVA_Build 13 28127836 3D CCTCTTCCAG CTT/--- CTTAAGTTCT 3070 het 3070 hom 34 15 16 5 CTT 2 1 67329 CASAVA_Build 13 28130505 2D AGACTCATAA AT/-- ATGTCCTTAG 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 AT 2 1 67330 CASAVA_Build 13 28167559 2D AGTTTGTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 35 0 33 2 T 13 11 67331 CASAVA_Build 13 28171899 1D CAATCATTGA T/- TTTCTTAAAG 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 4 3 67332 CASAVA_Build 13 28176064 1I TAAAATGATT -/A AAAAATAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 5 6 67333 CASAVA_Build 13 28176265 1I GAGAGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 51 1 40 10 A 10 11 67334 CASAVA_Build 13 28179933 1D CATTTTCATC A/- CCCCGAAAAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 1 0 67335 CASAVA_Build 13 28181460 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2550 hom 17 het 10 0 7 3 A 15 14 67336 CASAVA_Build 13 28225662 13D AAAAAGAAAG GAAAGAAAGGAAA/------------- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 33 15 19 4 GAAAGAAAGGAAA 1 0 67337 CASAVA_Build 13 28230049 1I GGTTTGAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 9 10 67338 CASAVA_Build 13 28233272 1D TTAAGTAGAT G/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 G 1 0 67339 CASAVA_Build 13 28239187 1D ACAGAATTCT G/- GGGGGCACCA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 G 6 5 67340 CASAVA_Build 13 28250394 1I GCCCAGGCCT -/G GGACACAAAG 3070 het 1470 hom 24 7 10 7 G 2 3 67341 CASAVA_Build 13 28291177 1D CCAGTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 14 9 A 11 10 67342 CASAVA_Build 13 28291696 5D CGGCTCCCTC TTCTG/----- TTCTGAGCGG 2418 het 2418 ref 17 7 6 4 TTCTG 2 1 67343 CASAVA_Build 13 28294849 1I TTAAATAAGG -/A AGAGTACTCT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 1 2 67344 CASAVA_Build 13 28301668 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 A 11 10 67345 CASAVA_Build 13 28302647 1I GATTGAAATG -/A AAAAAATTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 67346 CASAVA_Build 13 28303293 5I ACTAAAAAAT -----/GTATA GTAAAAGAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GTATA 0 1 67347 CASAVA_Build 13 28303685 3D TGCAGAAGAC AAA/--- GAAGGTCATT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 3 0 67348 CASAVA_Build 13 28304648 1D CTTAGAGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 18 0 14 5 T 10 9 67349 CASAVA_Build 13 28304912 4I GAAAAACAAT ----/AAAA AAAATCAATA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 4 8 67350 CASAVA_Build 13 28307584 1D AAGTATTCAG A/- ATAGGCAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 A 2 1 67351 CASAVA_Build 13 28311140 1I TCAATCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 31 0 18 13 T 11 12 67352 CASAVA_Build 13 28313250 7D GCTTTCAGAA TGTCGAG/------- TGTATTCATA 3070 het 3070 hom 46 20 23 4 TGTCGAG 1 0 67353 CASAVA_Build 13 28316539 2D TTTAAAATGC TG/-- TGTGTGTGTG 1308 het 1308 ref 39 29 3 8 TG 7 6 67354 CASAVA_Build 13 28318666 5I AGGAGAAATT -----/AAATC ATCAGGGCAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAATC 0 1 67355 CASAVA_Build 13 28322289 1I GGTATAAGGT -/G CCTTTGAAGG 3070 hom 86 het 34 0 27 7 G 0 1 67356 CASAVA_Build 13 28323909 1I49M2I TTTCCGCCCC -GGCCCTGTGGGATGTATCTGAGTGGGTAGGAGCACTTGAGCAGGACTTA--/TGGCCCTGTGGGATGTATCTGAGTGGGTAGGAGCACTTGAGCAGGACTTAGC GCGCCCAGCT 3070 hom 111 het 44 0 37 23 N/A 0 0 67357 CASAVA_Build 13 28325569 1D TGGCTGATGA G/- ACAGAAACTA 3070 hom 52 het 26 0 21 5 G 1 0 67358 CASAVA_Build 13 28327065 1D CCTCCTGGGG A/- TGCTCTGGTG 3070 hom 96 het 35 0 32 4 A 1 0 67359 CASAVA_Build 13 28329090 1D ATTTATAGTG T/- TGCTAACACA 3070 hom 90 het 45 0 32 16 T 2 1 67360 CASAVA_Build 13 28417317 2I AGTATTCCAT --/TA TATATATATA 3070 hom 42 het 23 0 14 9 TA 8 9 67361 CASAVA_Build 13 28417437 2I GGAAGGTATC --/TT TTCGATATAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 2 4 67362 CASAVA_Build 13 28431678 1D ACACAAAGTA T/- TAGTGTCAGC 3070 hom 72 het 27 0 22 6 T 2 1 67363 CASAVA_Build 13 28443665 1I ATTAGGACTT -/C CAACAGTAAG 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 C 1 2 67364 CASAVA_Build 13 28466384 1D TTTTTTATGG C/- TGCACAGTAT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 C 1 0 67365 CASAVA_Build 13 28481490 6I TGTATTGTAC ------/ACTATT ACTATTAACT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ACTATT 1 2 67366 CASAVA_Build 13 28481885 1D TTATGTTTTC T/- TTATTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 3 2 67367 CASAVA_Build 13 28485850 1I CTTGAATGAT -/A ACAGACCTTC 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 A 1 2 67368 CASAVA_Build 13 28508974 3I AACCCTTGTC ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 9 12 67369 CASAVA_Build 13 28509566 1I CCTTTCTCTC -/T TGTCTGCCCT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 1 2 67370 CASAVA_Build 13 28515848 1D75M5I CCTGTTTGTC TTTTTTTAACTGCTTTTGTTTTAAAGTCTGTTTCTCTAGACTTTAAACAATAAAGTCTGATTGTTTAAAGTCTGAT-----/-TTTTTTAACTGCTTTTGTTTTAAAGTCTGTTTCTCTAGACTTTAAACAATAAAGTCTGATTGTTTAAAGTCTGATATAAC AGACTTTATA 3070 hom 54 het 19 0 18 16 N/A 0 0 67371 CASAVA_Build 13 28516366 1I65M1I CAAGCTGGCA -TTTTTTTTCTTTAAATATTTAAAGATGCTGTTTTAGTAATTTCTAGCTTGAATGGTTTCTAGTGG-/TTTTTTTTTCTTTAAATATTTAAAGATGCTGTTTTAGTAATTTCTAGCTTGAATGGTTTCTAGTGGA AAAATCTACT 3070 hom 54 het 20 0 19 18 N/A 0 0 67372 CASAVA_Build 13 28518426 1D ATTTTGTTTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 63 het 31 0 24 9 T 8 7 67373 CASAVA_Build 13 28520087 3D TTCACTTAGT ATA/--- ATGTTTTTAA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 ATA 1 0 67374 CASAVA_Build 13 28530343 2I GCCTTTAACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 23 6 T 13 15 67375 CASAVA_Build 13 28530704 1D AGGTTGATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 15 14 67376 CASAVA_Build 13 28533740 2I CAAACTTTGG --/TC TCTGTATCTT 3070 hom 134 het 49 0 44 5 TC 1 2 67377 CASAVA_Build 13 28534055 2I TGAAAGAAAC --/TT TAACTTTTGT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 1 3 67378 CASAVA_Build 13 28540602 2I GGAGAAACAC --/TA TATCTTTAAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TA 1 2 67379 CASAVA_Build 13 28542812 19D ATTTGTTAAA CTGTTTGAAACTTGTCTCT/------------------- CTGTTTGAAA 3070 hom 132 het 56 0 45 15 CTGTTTGAAACTTGTCTCT 2 1 67380 CASAVA_Build 13 28543118 2D TGATTGCTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 20 0 16 5 T 11 9 67381 CASAVA_Build 13 28545665 4D GTTAGTGAAA GGCG/---- GGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 32 0 24 9 GGCG 1 0 67382 CASAVA_Build 13 28545988 24D TTTAACTACA GTGGTTCCCTTGGAGATCTTTCAG/------------------------ GTATGTAGAC 3070 hom 66 het 22 0 23 4 GTGGTTCCCTTGGAGATCTTTCAG 1 0 67383 CASAVA_Build 13 28547420 11I GCAGCTCTGA -----------/AATGCATCAGG ACACACGTTG 3070 hom 114 het 43 0 36 7 AATGCATCAGG 0 1 67384 CASAVA_Build 13 28550269 5I CAGAATATAA -----/TGCCT TGATAAAAAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TGCCT 0 1 67385 CASAVA_Build 13 28553903 10D GTTTGGTTAT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 hom 51 het 23 0 18 6 TTTTG 5 3 67386 CASAVA_Build 13 28556665 1D CCCTCCCCTC T/- CCCCCCCTTC 3070 het 20 hom 21 1 11 9 T 1 0 67387 CASAVA_Build 13 28560196 7D ACTCCGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1970 hom 10 het 4 0 4 1 A 24 17 67388 CASAVA_Build 13 28560429 3D TTTAGAGTGA TCT/--- TCTTGGTATT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TCT 2 1 67389 CASAVA_Build 13 28563640 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 7 8 67390 CASAVA_Build 13 28566367 3I AGAAGTATTC ---/CCT CCTCTTCTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 CCT 1 2 67391 CASAVA_Build 13 28566482 1D TTTGTGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 11 10 67392 CASAVA_Build 13 28567708 1D ACTATGTAAA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 8 7 67393 CASAVA_Build 13 28567859 1I70M1D TCAAGTTCAC -TTTTTTTTTCCTGCCACTGCAAATCTGTTGTAGAGCCCCTTTAGTTAATATTTCATTTTAGTTATTTTGCT/TTTTTTTTTTCCTGCCACTGCAAATCTGTTGTAGAGCCCCTTTAGTTAATATTTCATTTTAGTTATTTTGC- TTTTTAACAC 3070 het 515 hom 24 3 16 26 N/A 0 0 67394 CASAVA_Build 13 28569290 1I AGAGCTTTCA -/T TATATTGTGA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 1 2 67395 CASAVA_Build 13 28570585 6D26M4I AGTCATCTAA ACACACACACACACACACACATGTGCGTGCAT----/------ACACACACACACACATGTGCGTGCATTCAC GCACACACAC 3070 hom 138 het 43 0 46 13 N/A 0 0 67396 CASAVA_Build 13 28571649 1I GCTGCTCTCT -/G TATTCCCACA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 0 1 67397 CASAVA_Build 13 28576571 6D AGCAAATCTT AGAGTC/------ AGAGCTGACT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AGAGTC 1 0 67398 CASAVA_Build 13 28577953 1I AATTTCTGAT -/G GAGGATATCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 1 2 67399 CASAVA_Build 13 28582685 1D TCTTTACAAG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 138 het 54 0 47 7 A 8 7 67400 CASAVA_Build 13 28586294 1D TGATTAAACC T/- TTTTTTTTTT 1543 het 1543 ref 33 23 4 7 T 11 10 67401 CASAVA_Build 13 28587347 5I GTCTGCCAAC -----/AGACT AGACTAGGTG 3070 hom 129 het 52 0 43 9 AGACT 1 2 67402 CASAVA_Build 13 28598769 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 T 11 10 67403 CASAVA_Build 13 28601715 5I TTTTATTGAT -----/ATGTC ATATTTGTTC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 ATGTC 0 1 67404 CASAVA_Build 13 28606536 3I TTATTGTGTT ---/TCA GTTCAAGCTC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 TCA 0 1 67405 CASAVA_Build 13 28610706 4D TTAAAAATTA ATAG/---- ATGGATGACT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 ATAG 1 0 67406 CASAVA_Build 13 28611711 4I TTCACTTTAC ----/TGAG TTAGTCCAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TGAG 0 1 67407 CASAVA_Build 13 28620537 1D TGTGTTGTTG C/- CCCCCCATGT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 7 6 67408 CASAVA_Build 13 28635141 2D CAGTTCTAAC AT/-- GTGTGTGGGC 3070 hom 121 het 45 0 38 9 AT 1 0 67409 CASAVA_Build 13 28639705 1D GATAATCATA T/- TTTTTAAATT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 6 5 67410 CASAVA_Build 13 28643034 1D AAACATCTTT A/- AAAAATGTGG 3070 het 3070 hom 40 20 18 3 A 6 5 67411 CASAVA_Build 13 28647912 1I ATAGGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 T 11 12 67412 CASAVA_Build 13 28661675 1I AAGGGACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 A 11 12 67413 CASAVA_Build 13 28662819 1D GTACTCAGCA T/- TTTTTCCTAA 3070 het 3070 ref 65 29 26 11 T 6 5 67414 CASAVA_Build 13 28668573 1D TTTTCCTCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 10 9 67415 CASAVA_Build 13 28682987 1I AAATGGACTC -/T TGAGAGAGTC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 1 2 67416 CASAVA_Build 13 28684747 5I4M7I TCTCCTTAAG -----TAAT-------/TTGAATAATTTATTAA AACAGCTCAC 3070 het 3070 ref 47 34 9 5 N/A 0 0 67417 CASAVA_Build 13 28685503 1D AGTTGTTTGA T/- AGCATTGTCA 1871 het 1871 ref 37 30 4 3 T 1 0 67418 CASAVA_Build 13 28686318 2D TACTACATTG TT/-- TTTTTTTTTT 2143 het 2143 ref 26 11 6 12 T 13 11 67419 CASAVA_Build 13 28690424 2D TAAAATTGCA AC/-- AGTTATACCT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 AC 1 0 67420 CASAVA_Build 13 28693221 1D AGAGAATTAA G/- CCCTAATGCC 3070 het 3070 hom 56 22 29 5 G 1 0 67421 CASAVA_Build 13 28696924 1I TTCTCTTTTT -/C CCCACAATAT 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 C 3 4 67422 CASAVA_Build 13 28698819 1D TTGAATTACC T/- TTATTTATAC 3070 het 3070 ref 43 26 17 0 T 3 2 67423 CASAVA_Build 13 28700180 2D ATATGTATGC TT/-- TTTCACCCAG 3070 het 3070 ref 49 24 17 11 T 5 3 67424 CASAVA_Build 13 28706866 6I ATAGCATTTA ------/CCCTCT GGTGGTACAC 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 CCCTCT 0 1 67425 CASAVA_Build 13 28715005 1D GATAGTACCA T/- TTGTCATCTT 3070 hom 160 het 56 0 54 3 T 3 2 67426 CASAVA_Build 13 28719033 1D TCACATAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 511 hom 28 2 17 9 A 15 14 67427 CASAVA_Build 13 28734048 1I GAGGAATGGT -/A AAAAAGTTGC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 5 6 67428 CASAVA_Build 13 28756534 3D GAATAAGCTA TTT/--- TTTAAAAAAA 1696 het 21 hom 31 1 9 25 T 6 3 67429 CASAVA_Build 13 28759645 1D GTATGTGTGT G/- GTGTGTGTGT 1765 het 1761 hom 48 7 8 34 G 2 1 67430 CASAVA_Build 13 28767259 1D GGCTGTTGCC T/- TTTTTTTTTT 2384 het 2384 ref 41 22 9 10 T 12 11 67431 CASAVA_Build 13 28776542 1I ATCTCACATG -/A AAAGACACAC 3070 hom 90 het 35 0 29 6 A 3 4 67432 CASAVA_Build 13 28777498 1D TAGTTTTGTG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 8 67433 CASAVA_Build 13 28777632 1I AACTATCAGA -/G AATACTATAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 0 1 67434 CASAVA_Build 13 28791991 2D CAAGAAAGCT AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 13 15 7 A 10 8 67435 CASAVA_Build 13 28797671 3I GGGAGGAAGG ---/AGA AGAAGAAAAG 558 het 488 hom 22 6 3 13 AGA 2 3 67436 CASAVA_Build 13 28797696 6D GGAAGAAGAG GAAGAA/------ GAAGAAGAGG 544 het 478 hom 26 4 6 19 GAA 4 2 67437 CASAVA_Build 13 28799283 6D AAAAATGTAT AAGTAA/------ AAGGATGGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AAGTAA 1 0 67438 CASAVA_Build 13 28800333 1D TCCATATATG A/- AAATACATTT 3070 hom 75 het 29 0 26 5 A 4 3 67439 CASAVA_Build 13 28809329 1D CTGGCATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 28 0 22 6 A 12 11 67440 CASAVA_Build 13 28809341 1D AAAAAAAAAA C/- TCCTGCAACT 3070 het 103 hom 33 4 20 9 C 1 0 67441 CASAVA_Build 13 28810569 1I ATTAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 434 hom 26 1 22 3 A 9 10 67442 CASAVA_Build 13 28815338 4I ATTCCCTCTT ----/TGTC TGTCTTTTGA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TGTC 1 2 67443 CASAVA_Build 13 28815844 1I GTTTGGTTTG -/T TTTTGTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 4 5 67444 CASAVA_Build 13 28816379 1I TGCTGTCAGT -/G GGGTACTGAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 3 4 67445 CASAVA_Build 13 28819571 1I TGGAAGTGTA -/T TGTTTAGTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 2 67446 CASAVA_Build 13 28820551 2I CAAATATATA --/TG TTTCTTATTA 3070 hom 66 het 30 0 23 11 TG 0 1 67447 CASAVA_Build 13 28822624 3D CTCTGACATA CTC/--- CTCTATGACC 3070 hom 135 het 50 0 46 5 CTC 2 1 67448 CASAVA_Build 13 28823916 1D ATTTTGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 217 hom 32 2 24 6 T 17 16 67449 CASAVA_Build 13 28834652 9D CATCTCTACC AAAAATAAA/--------- AAAAATTAAA 2909 hom 25 het 12 0 8 4 AAAAATAAA 1 0 67450 CASAVA_Build 13 28843356 1D ACATTAACCA C/- CCCCCCCCCC 1830 het 43 hom 15 1 4 10 C 11 10 67451 CASAVA_Build 13 28844654 1I CAACACTCTA -/C CCTACACCTG 3070 hom 126 het 47 0 40 7 C 2 3 67452 CASAVA_Build 13 28847421 7I6M1I TTTAAAAAGG -------AGTTTT-/GTCTAATATTTTTG TAATAGGAGT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 N/A 0 0 67453 CASAVA_Build 13 28847664 1D ATATATATAT A/- TATATATATA 201 het 3 hom 4 0 1 3 A 1 0 67454 CASAVA_Build 13 28849097 4I CACAAATGAA ----/AAAT AAACTGGAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAAT 0 1 67455 CASAVA_Build 13 28855894 1I TGCCAAGGGA -/G GGGCAGGCCA 3070 hom 105 het 40 0 34 6 G 3 4 67456 CASAVA_Build 13 28856072 1I AACTTACTCA -/T GCAAAACATA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 0 1 67457 CASAVA_Build 13 28865475 3I TTGAGCACAT ---/CTC CTTGTCGCTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTC 0 1 67458 CASAVA_Build 13 28870629 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 11 10 67459 CASAVA_Build 13 28908957 1D CTTTTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 36 0 21 15 T 15 14 67460 CASAVA_Build 13 28910085 2D ATCTTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 32 1 20 12 A 16 14 67461 CASAVA_Build 13 28913686 8I TTCTTCACCA --------/ATGTGGCC ATGTGGCCAC 3070 hom 102 het 42 0 33 9 ATGTGGCC 1 2 67462 CASAVA_Build 13 28914770 17I CCCAAACCAG -----------------/GAGTTCACATGGTATCC CACAGGGAGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 GAGTTCACATGGTATCC 0 1 67463 CASAVA_Build 13 28921424 10D TTCTTAAGTT ATTAACTAGC/---------- ATGCATTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 ATTAACTAGC 1 0 67464 CASAVA_Build 13 28921802 1I CACCAAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 11 12 67465 CASAVA_Build 13 28925903 1D ATCTCTAAGC A/- GGAGGAGTAG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 1 0 67466 CASAVA_Build 13 28933033 1I TCAACAATCT -/A AAAAAAAAAA 1924 het 1924 ref 31 12 7 12 A 16 17 67467 CASAVA_Build 13 28935737 2I TGCCCTAGGT --/CA CACAGCCACC 3070 hom 96 het 36 0 31 5 CA 2 3 67468 CASAVA_Build 13 28946003 4D ACGTGAGTAG AAAT/---- AAATAATGAA 3070 hom 104 het 37 0 35 2 AAAT 2 1 67469 CASAVA_Build 13 28948506 3I AGGGTTTTCA ---/TTG TTGTTTTATT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TTG 1 2 67470 CASAVA_Build 13 28948709 1I CCACCCATTT -/A AAGTATACAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 3 67471 CASAVA_Build 13 28963350 2I GGTGTGGGTA --/TG TGTTATGTAC 3070 hom 109 het 42 0 30 12 TG 1 2 67472 CASAVA_Build 13 28963848 2I ATTCGTGTGA --/TG TGTGTGTGGT 3070 hom 117 het 46 0 35 11 TG 4 5 67473 CASAVA_Build 13 28973983 4I ACACAGGCAC ----/TGCA TGCTCACTCA 3070 hom 166 het 59 0 56 3 TGCA 0 1 67474 CASAVA_Build 13 28975880 1I TAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1446 hom 42 4 31 7 A 11 12 67475 CASAVA_Build 13 28976531 1D GGGCTTCCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 13 het 25 1 19 5 A 10 9 67476 CASAVA_Build 13 28978221 1D GAGAGAAGTC T/- TGTAGAGACC 3070 hom 58 het 28 0 23 5 T 2 1 67477 CASAVA_Build 13 28978716 4D26M4D AGTTATTAAT AATCTATCTATCTGGCCACGTGTCCTAACCTGTT/----TATCTATCTGGCCACGTGTCCTAACC---- TGTTTCTTTT 3070 hom 141 het 46 0 48 7 N/A 0 0 67478 CASAVA_Build 13 28979819 3D CAGCTGGCAC TCA/--- TCATCAGGTG 3070 hom 90 het 36 0 29 10 TCA 3 2 67479 CASAVA_Build 13 28981145 4D ACTCTGCTCC CTCT/---- AACAGGATAG 3070 hom 84 het 30 0 26 8 CT 2 0 67480 CASAVA_Build 13 29006942 3D AAAGTTTGAG AAA/--- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 11 8 67481 CASAVA_Build 13 29014592 1I AATCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 310 hom 21 1 18 2 A 9 10 67482 CASAVA_Build 13 29014944 1I TATGCAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 35 0 30 5 A 10 11 67483 CASAVA_Build 13 29016931 1D GAGAGGGTGT A/- AAATACAGAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 4 3 67484 CASAVA_Build 13 29043671 1D GACATCTGCC G/- GGGGGTCCTC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 G 6 5 67485 CASAVA_Build 13 29052896 12I TCTAGAGACT ------------/GAACAGTGTTAA GAAGGTGATT 3070 hom 132 het 50 0 45 7 GAACAGTGTTAA 0 1 67486 CASAVA_Build 13 29074404 3D GCTGGGCAGA CAT/--- CAGCCAGGTG 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 CAT 1 0 67487 CASAVA_Build 13 29082709 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2645 het 2645 ref 29 13 8 8 T 11 12 67488 CASAVA_Build 13 29090549 1D TCAACAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 A 11 10 67489 CASAVA_Build 13 29093186 4D GGCTATTACC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2026 het 386 hom 33 6 13 15 A 22 18 67490 CASAVA_Build 13 29095531 2D TTAGAAACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 33 2 13 18 A 12 10 67491 CASAVA_Build 13 29111099 2D AAATCGCTAC AT/-- GTTTGGCCAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 AT 1 0 67492 CASAVA_Build 13 29111790 4I CCATGGCAAC ----/ATTG ATTAAGAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 ATTG 0 1 67493 CASAVA_Build 13 29122963 4I TGGTAAATGA ----/AAGT AAGTGTTTCC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AAGT 1 2 67494 CASAVA_Build 13 29125265 1I CGTGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 47 het 22 0 19 3 C 2 3 67495 CASAVA_Build 13 29135195 1I ATAAACCACG -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 A 6 7 67496 CASAVA_Build 13 29143979 1D CATACTGCAC T/- CAAAGTACTT 1825 het 1825 ref 13 7 5 1 T 1 0 67497 CASAVA_Build 13 29170154 1I ATCATAATTT -/A ATTTCACTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 2 67498 CASAVA_Build 13 29170996 2D TATACCACAC AT/-- ATATATATAT 2481 het 2481 ref 19 9 8 2 AT 8 7 67499 CASAVA_Build 13 29189081 1I AAGATATACA -/C ATCTGAAACA 3070 het 3070 hom 58 27 26 5 C 0 1 67500 CASAVA_Build 13 29196023 1D TAAGCCATTT G/- CAGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 1 0 67501 CASAVA_Build 13 29200455 3D TCTAATACTA AAG/--- AAGAAGAGTA 3070 hom 117 het 43 0 39 5 AAG 3 2 67502 CASAVA_Build 13 29202566 4I GGTCTTTAGC ----/GAAT GAATGAATGA 3070 hom 102 het 48 0 34 14 GAAT 3 4 67503 CASAVA_Build 13 29206202 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 2360 hom 37 het 25 0 17 8 TC 0 1 67504 CASAVA_Build 13 29218989 1I AAAAACAGAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 8 9 67505 CASAVA_Build 13 29220026 1D TCCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1547 het 1384 hom 22 9 7 7 A 15 14 67506 CASAVA_Build 13 29220736 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTTGTA 2540 het 2540 ref 19 9 7 3 T 8 7 67507 CASAVA_Build 13 29220796 4I CTGCTGGGCT ----/CAAA CAATCCTCTT 2989 het 2989 ref 24 16 7 1 CAAA 0 1 67508 CASAVA_Build 13 29223625 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 8 9 67509 CASAVA_Build 13 29224812 1D AGCCTTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 780 hom 32 3 15 14 A 17 16 67510 CASAVA_Build 13 29229332 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2088 hom 14 5 8 1 T 9 10 67511 CASAVA_Build 13 29235687 3D TAAGACTTCT AAC/--- AACAAACCAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 AAC 2 1 67512 CASAVA_Build 13 29238021 4I GTTGACACTT ----/AGTA AGTACAGAAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AGTA 1 2 67513 CASAVA_Build 13 29242961 1I CAAAAGCTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 9 10 67514 CASAVA_Build 13 29244393 5D AAGGTACTAC TATAT/----- TGTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 5 TATAT 1 0 67515 CASAVA_Build 13 29249249 1I GGTAGGGCAT -/A AAGAATCAAC 3070 het 3070 hom 43 13 26 4 A 2 3 67516 CASAVA_Build 13 29256555 1D TGGGATACTC T/- TACTTCACAT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 2 1 67517 CASAVA_Build 13 29258906 1D TAGCATTTAG T/- TATGATGTAG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 2 1 67518 CASAVA_Build 13 29259032 2D AAGAGAGGTC AG/-- AGAGTCCTCT 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 AG 3 2 67519 CASAVA_Build 13 29269733 1I TACATTACCT -/A ACATGCATTT 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 A 1 2 67520 CASAVA_Build 13 29294080 1D GCTCTTTGTT A/- AATTAAATTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 3 2 67521 CASAVA_Build 13 29294910 1I ACTATCCTGT -/G GAAAAACTCA 3070 het 3070 hom 48 19 27 2 G 1 2 67522 CASAVA_Build 13 29307639 6I TCCCAGTGGG ------/AGCCAC TGGCTCCCAC 2134 het 2134 ref 26 11 8 7 AGCCAC 0 1 67523 CASAVA_Build 13 29308489 4I AAAAATAAAT ----/AAAC AAATAAACAA 3070 het 2968 hom 33 9 20 4 AAAC 0 1 67524 CASAVA_Build 13 29312231 1I AACAACATTT -/A ATCTGAAAAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 1 2 67525 CASAVA_Build 13 29312702 1I CAAAAAAAAA -/T CTCAATGAAG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 0 1 67526 CASAVA_Build 13 29314272 13D ATTCTCTTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1411 hom 24 6 13 9 T 24 11 67527 CASAVA_Build 13 29316005 1I CTTGGGGATT -/G TTTTCCCAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 G 0 1 67528 CASAVA_Build 13 29317080 1D ACAATATTTA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 6 67529 CASAVA_Build 13 29322891 1D CTACGAGGGT G/- GGGGGGGGAG 2076 hom 22 het 12 0 6 6 G 9 8 67530 CASAVA_Build 13 29335637 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 18 1 12 5 A 12 10 67531 CASAVA_Build 13 29341114 1D TTTTTAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 190 hom 36 1 24 12 T 12 11 67532 CASAVA_Build 13 29343532 2I TGATTCTCCT --/AC AACTACATGA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 AC 0 1 67533 CASAVA_Build 13 29357510 1D CCTATTTTCT G/- GGGTCTTACT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 G 4 3 67534 CASAVA_Build 13 29365476 4I TAAATACATC ----/TATT TATAAATTAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TATT 0 1 67535 CASAVA_Build 13 29375295 1I ACTATTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 36 1 24 11 T 11 12 67536 CASAVA_Build 13 29376536 1I ATTGGCCAGC -/G GAAGAATTCA 3070 het 3070 ref 42 17 10 15 G 1 2 67537 CASAVA_Build 13 29383064 1D ATTCTCTTCC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 T 8 7 67538 CASAVA_Build 13 29387053 1I TCTATCCTAA -/C GACTTAATCA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 0 1 67539 CASAVA_Build 13 29387715 2D TGAATGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 785 het 785 ref 40 30 3 7 TG 7 6 67540 CASAVA_Build 13 29388509 1D ACTGGGTAAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 8 67541 CASAVA_Build 13 29388712 3I GCTGCCACAT ---/CTC CTCTGCTTAG 3070 hom 65 het 26 0 21 5 CTC 1 2 67542 CASAVA_Build 13 29389849 1I CAGACATAAA -/G GGGGTCAAGT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 G 4 5 67543 CASAVA_Build 13 29401135 2I TTTGTTTTTG --/TT TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 7 9 67544 CASAVA_Build 13 29405451 3I CAAAACAGAT ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 ATA 3 4 67545 CASAVA_Build 13 29412971 1I CTCCCCTACC -/T TTTTCTAGTT 3070 het 3070 ref 33 12 10 11 T 4 5 67546 CASAVA_Build 13 29413580 2D ATTTAGATTT GA/-- GACACTGATA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 GA 2 1 67547 CASAVA_Build 13 29425791 1D TGGGCAGGCA C/- CGGGTACAGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 6 C 2 1 67548 CASAVA_Build 13 29427719 1I AATTAAACAG -/A AAAAAAAAAG 2687 het 2687 ref 18 9 7 2 A 9 10 67549 CASAVA_Build 13 29433256 5D TGAAGGGATG AGTGA/----- AGCTGGATAG 3070 het 3070 hom 38 14 21 5 AGTGA 1 0 67550 CASAVA_Build 13 29447496 1I ATATTTATGT -/G GAGTAAAATA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 2 67551 CASAVA_Build 13 29450030 1D CATAATAACA C/- TGTTAGTAAG 3070 het 3070 hom 44 18 21 7 C 1 0 67552 CASAVA_Build 13 29450357 1D CTTATTGGGG T/- TGATGCAAAT 3070 het 3070 ref 40 28 10 3 T 2 1 67553 CASAVA_Build 13 29466909 1D GTCTTGATAT A/- ATTGGGAATC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 2 1 67554 CASAVA_Build 13 29469650 1D TTTTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 2741 het 2190 hom 21 7 9 5 T 12 11 67555 CASAVA_Build 13 29471690 4I AAGGTTCCTA ----/TTTT TTTTCACTGC 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 T 4 8 67556 CASAVA_Build 13 29484524 1D CAATTACCTT A/- AATTGTTGAT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 3 2 67557 CASAVA_Build 13 29505024 1I CAAGGACAAA -/G ACCTTGTTAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 0 1 67558 CASAVA_Build 13 29509434 3I AAAAAAGTAC ---/TTG TTGTTTATCT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TTG 1 2 67559 CASAVA_Build 13 29509857 1I AAAAGTCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 349 hom 28 1 25 2 T 9 10 67560 CASAVA_Build 13 29510452 1D TTAGCCCATT C/- CCTCCTTTCA 3070 hom 123 het 45 0 40 5 C 3 2 67561 CASAVA_Build 13 29511716 1I ATTTAGAGAA -/T CTCTACATCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 0 1 67562 CASAVA_Build 13 29513949 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 27 0 19 9 A 11 10 67563 CASAVA_Build 13 29516779 2D GCCTCTAGAG CT/-- CTCTTTCCCT 3070 hom 111 het 43 0 36 11 CT 3 2 67564 CASAVA_Build 13 29527326 2I TTGTGTAATA --/TC TCAATTTTCA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TC 1 2 67565 CASAVA_Build 13 29528905 2D AGTCACATGA CT/-- CTAATGATCT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 CT 2 1 67566 CASAVA_Build 13 29529073 4D ATTATTTGAC CTGT/---- CTATTTTACA 3070 het 3070 ref 35 17 18 2 CTGT 1 0 67567 CASAVA_Build 13 29537051 1I TATAGCACTT -/A ACCACCTTCA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 A 1 2 67568 CASAVA_Build 13 29538663 3D GTTAAAGGTC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 11 TGT 5 4 67569 CASAVA_Build 13 29541539 1D AACAGGTCAA T/- TTCCAACCTT 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 3 2 67570 CASAVA_Build 13 29543129 1I GGAGGGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 27 8 T 11 12 67571 CASAVA_Build 13 29553122 4I CAGGAGCTTC ----/TCAT TCATTCATTC 3070 hom 81 het 40 0 28 12 TCAT 3 4 67572 CASAVA_Build 13 29555668 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 28 1 13 14 A 12 11 67573 CASAVA_Build 13 29559454 1I CTCAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 9 67574 CASAVA_Build 13 29562213 14D CTGGGACTCC ACTGTGCATTCTTA/-------------- ACTTACCTTG 3070 hom 60 het 22 0 21 5 ACTGTGCATTCTTA 1 0 67575 CASAVA_Build 13 29567910 2I CTCACTGCAA --/CC CCTCCACCTC 1005 het 1005 ref 10 5 4 1 C 2 4 67576 CASAVA_Build 13 29576166 7D TCAATGCACA AAGTAGG/------- AAGTAGGAAA 3070 het 3070 ref 53 30 22 3 AAGTAGG 2 1 67577 CASAVA_Build 13 29583697 1I TTGTTTCTTG -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 6 7 67578 CASAVA_Build 13 29585691 2D CCTCTCCCCA CC/-- CCCCCCCAAA 3070 hom 71 het 25 0 22 3 C 9 7 67579 CASAVA_Build 13 29588251 1D TTATTCCCCG A/- ATACAATGTA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 A 2 1 67580 CASAVA_Build 13 29602270 1I ATATTTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2870 hom 36 8 20 8 T 11 12 67581 CASAVA_Build 13 29604496 1D TAAAATAGAA G/- GGGAGGAAAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 3 G 4 3 67582 CASAVA_Build 13 29614195 3I CAGTTCTGAG ---/AGA AGGAAAGAAC 2823 het 2823 ref 28 16 8 4 AGA 0 1 67583 CASAVA_Build 13 29617765 3D CTATTTATAT TAA/--- TGTTAGAGTA 3070 het 3070 ref 34 18 15 4 TAA 1 0 67584 CASAVA_Build 13 29636090 1D AGGGCAACTA G/- GAAGGCTATT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 2 1 67585 CASAVA_Build 13 29638048 1I AACAAGATGC -/T GCAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 0 1 67586 CASAVA_Build 13 29641035 1I TTCTCTCCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 10 11 A 9 10 67587 CASAVA_Build 13 29642268 6I CTCAGAAATT ------/AGAAAA AGAAAAACAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 AGAAAA 1 2 67588 CASAVA_Build 13 29648676 1D GGTCTCCCCA T/- TCCGGAGTAG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 2 1 67589 CASAVA_Build 13 29649682 1D TCCTCCTGAG A/- AAGGTTACTG 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 A 3 2 67590 CASAVA_Build 13 29664430 2I TTAGGGCAGG --/AA AAAAAGAGAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 5 7 67591 CASAVA_Build 13 29665592 12D AGAAAGGAGG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2907 het 1282 hom 18 6 10 5 T 24 12 67592 CASAVA_Build 13 29676554 12D TAGTCCTTCA TTTTATCTCAAG/------------ TTAGGGTGGG 3070 het 3070 ref 48 29 23 7 TTTTATCTCAAG 1 0 67593 CASAVA_Build 13 29677770 6D TGTGTGTGTA TGTGAG/------ TGTGAGTGTG 3070 het 3070 ref 57 23 21 17 TGTGAG 2 1 67594 CASAVA_Build 13 29682302 1D AGTTATATGT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 9 8 67595 CASAVA_Build 13 29702086 2D GAAGAGGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 22 1 15 6 T 18 16 67596 CASAVA_Build 13 29709751 1D TCCCAGAGAT A/- ACGTATTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 A 2 1 67597 CASAVA_Build 13 29718991 1I CCATCTCACA -/C CAATTAGAAT 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 C 1 2 67598 CASAVA_Build 13 29726207 2I CACCATGGTT --/TC TCTCTTATGT 3070 het 3070 hom 45 18 17 10 TC 2 3 67599 CASAVA_Build 13 29729318 1D TTTGACCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 12 6 T 12 11 67600 CASAVA_Build 13 29730816 1D AGAAGTTTTA C/- TTTATTACTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 C 1 0 67601 CASAVA_Build 13 29730899 1I AGTATCTCGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 T 8 9 67602 CASAVA_Build 13 29746572 1I ATTTGATCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 9 10 67603 CASAVA_Build 13 29750415 1I TCCAAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 10 11 67604 CASAVA_Build 13 29752364 1I GCCGAACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 12 13 67605 CASAVA_Build 13 29754316 4D AAGTTTTTAA CTGT/---- CTTATTAAAT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 CTGT 1 0 67606 CASAVA_Build 13 29757461 3D TTGTAATAAT CAC/--- CACGTGTCAA 3070 het 3070 ref 37 15 18 6 CAC 2 1 67607 CASAVA_Build 13 29765313 1I TCCAGGAATT -/A AGACTTCCTC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 1 2 67608 CASAVA_Build 13 29768609 8I AATGTGGCAA --------/GACGCTTG TCTGAGGATT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 GACGCTTG 0 1 67609 CASAVA_Build 13 29777957 1D TCTTTATTCT C/- ACCACCTGGC 3070 het 3070 hom 37 17 18 4 C 1 0 67610 CASAVA_Build 13 29778591 1D AGGCTGGCAA G/- GGGGGGGTGG 3070 het 3061 hom 24 11 11 2 G 8 7 67611 CASAVA_Build 13 29780906 1D TGTTCCCCAC G/- GCCAATGTCC 3070 het 3070 hom 31 11 15 6 G 2 1 67612 CASAVA_Build 13 29783244 1I TGGCTGCTCA -/T GTATTGTTTA 3070 het 3070 ref 50 19 19 12 T 0 1 67613 CASAVA_Build 13 29784790 3D AGCAGAAAGT TAA/--- TGATGAAGAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 7 TAA 1 0 67614 CASAVA_Build 13 29795457 1D TGCTTGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2952 hom 41 12 19 11 A 11 10 67615 CASAVA_Build 13 29800151 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2578 het 2578 ref 33 19 8 6 A 10 11 67616 CASAVA_Build 13 29802696 1I AATCTGACCC -/T TCTTCAATCA 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 T 1 2 67617 CASAVA_Build 13 29823802 4D AAAAAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 1104 het 1104 ref 19 7 6 7 AAAG 4 3 67618 CASAVA_Build 13 29824345 1D TTATGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 11 15 A 11 10 67619 CASAVA_Build 13 29826242 1I CAAGAATGGG -/T GGGGCAGGAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 0 1 67620 CASAVA_Build 13 29826389 1D CATTTTGGGA G/- GCTGAGGAGG 2791 het 2791 ref 21 13 7 1 G 2 1 67621 CASAVA_Build 13 29830204 1D GCACAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 10 11 11 A 13 12 67622 CASAVA_Build 13 29851730 1D ATCCATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 48 0 35 13 A 14 13 67623 CASAVA_Build 13 29852492 1I CACCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 1839 hom 15 het 8 0 6 2 A 13 14 67624 CASAVA_Build 13 29866394 5D TTATTTTAGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3021 het 3021 ref 25 12 8 6 T 17 12 67625 CASAVA_Build 13 29869343 1D22M14D CTGTGAACCT GGGTATACAATTATCTGCATGAGTTCCTTTCAATTAT/-GGTATACAATTATCTGCATGAG-------------- TTCCTTTCAA 3070 het 3070 hom 31 9 17 19 N/A 0 0 67626 CASAVA_Build 13 29875021 2I GTGGCACAGA --/CC CATCCCATCC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 1 3 67627 CASAVA_Build 13 29877606 5D CTGGGCTCTC TTGTT/----- TGGTTGAAGT 2743 het 2743 ref 20 14 6 1 TTGTT 1 0 67628 CASAVA_Build 13 29885488 1D TTACAGATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 10 9 67629 CASAVA_Build 13 29895281 4I CATGTGTGTC ----/AGAG AGAGACAGAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AG 2 4 67630 CASAVA_Build 13 29901265 4D ATAAATAAAC AAAT/---- AAAAGTAGCC 3070 hom 36 het 14 0 13 2 AAAT 1 0 67631 CASAVA_Build 13 29908889 2D ACTTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 13 11 67632 CASAVA_Build 13 29912849 1I CCTTTCTACC -/T TTTTTGACCA 3070 hom 63 het 25 0 21 5 T 5 6 67633 CASAVA_Build 13 29922246 4D TCCATCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 AAAC 4 3 67634 CASAVA_Build 13 29922906 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 35 22 3 10 T 10 11 67635 CASAVA_Build 13 29926599 4D AATTTTTAAA ATCT/---- ATCTATATCT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 ATCT 2 1 67636 CASAVA_Build 13 29930026 4I AAATGAACCA ----/CCTT CCATCTTTTG 3070 hom 144 het 51 0 48 3 CCTT 0 1 67637 CASAVA_Build 13 29933036 1D CAATACTAAT A/- AAAAAAATTG 1813 het 1813 ref 31 21 4 7 A 8 7 67638 CASAVA_Build 13 29933091 1D CAGCTGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1246 hom 33 6 19 8 T 15 14 67639 CASAVA_Build 13 29936282 1D ATGGGACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 35 1 23 12 A 12 11 67640 CASAVA_Build 13 29941602 59D CTGTATTTTT TGTTTTTTTTTTTCTAAGACAGGTTATGGCTGTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGCAG/----------------------------------------------------------- TGGCATGATC 2487 hom 18 het 7 0 7 0 TGTTTTTTTTTTTCTAAGACAGGTTATGGCTGTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGCAG 1 0 67641 CASAVA_Build 13 29947183 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1392 het 380 hom 16 3 4 9 T 15 14 67642 CASAVA_Build 13 29947703 20D GGTGGTGGCG CTCACCTGTAGTTCCACCTA/-------------------- CTCACTCAGA 1956 het 1956 ref 24 10 8 9 CTCACCTGTAGTTCCACCTA 1 0 67643 CASAVA_Build 13 29953447 1D GCTACAGCAA C/- AGAAAAAGAG 2640 het 2640 ref 31 15 9 7 C 1 0 67644 CASAVA_Build 13 29955494 1I ATTAACTCCT -/C CCTTTCCCTC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 C 2 3 67645 CASAVA_Build 13 29956903 5D GGAAGAGGAA AGAGG/----- AGAGGAGAGG 3070 hom 51 het 25 0 18 9 AGAGG 4 3 67646 CASAVA_Build 13 29957667 1I TACCTATGAC -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 114 het 43 0 37 6 T 7 8 67647 CASAVA_Build 13 29960622 5I ATCAACTTTC -----/TCTTT TCTTTTCTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TCTTT 2 3 67648 CASAVA_Build 13 29967618 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1407 het 25 hom 17 1 6 10 T 15 14 67649 CASAVA_Build 13 29973123 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 26 6 T 6 5 67650 CASAVA_Build 13 29973707 1D TAAATGCATT A/- AATAGAAATT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 3 2 67651 CASAVA_Build 13 29975297 1D CATAGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 3070 hom 53 het 20 0 18 2 C 4 3 67652 CASAVA_Build 13 29976160 1I AAAATCACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 963 hom 49 4 36 9 T 11 12 67653 CASAVA_Build 13 29977028 1D TGGTAAATAA T/- TACGTTTATC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 2 1 67654 CASAVA_Build 13 29984078 1D CTGATTCTTC T/- TTGTGGGGGC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 3 2 67655 CASAVA_Build 13 29995663 1I TGAAGCCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 593 hom 41 2 35 4 T 10 11 67656 CASAVA_Build 13 29996933 4I TTTATGTCTG ----/TGTA TAACCATCTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TGTA 0 1 67657 CASAVA_Build 13 29997856 1D TTATTAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 32 1 25 6 A 11 10 67658 CASAVA_Build 13 29998675 4I ATTCTTCATC ----/CAAA CAGAGAGATC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 CAAA 0 1 67659 CASAVA_Build 13 30069361 1I GTGTCCTTAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 A 8 9 67660 CASAVA_Build 13 30078604 4D ATAACCAAAC CAAA/---- CATTTTATTG 3070 het 3070 hom 42 17 21 5 CAAA 1 0 67661 CASAVA_Build 13 30082876 1D ACACTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 483 hom 35 3 21 12 A 12 11 67662 CASAVA_Build 13 30083989 1D CAGTAAATGT A/- AAAAAAAAAA 2324 het 2324 ref 32 17 8 7 A 14 13 67663 CASAVA_Build 13 30099661 1D TGTTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 2527 het 2527 ref 28 9 6 13 T 13 12 67664 CASAVA_Build 13 30104107 1D AGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2725 hom 37 12 17 8 T 12 11 67665 CASAVA_Build 13 30105140 1D TTCTCTACCT C/- CCCCCCATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 C 7 6 67666 CASAVA_Build 13 30114426 1D ACTCTAAGGC T/- TATCATAGTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 2 1 67667 CASAVA_Build 13 30116552 1I AAAGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 15 6 T 10 11 67668 CASAVA_Build 13 30118493 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 T 10 9 67669 CASAVA_Build 13 30128466 1D TTTTCATCAA C/- CCAAACAGAA 3070 het 3070 hom 42 18 18 8 C 3 2 67670 CASAVA_Build 13 30131688 3D TGAATGTGTT CTC/--- CTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 52 24 21 8 CTC 1 0 67671 CASAVA_Build 13 30140752 4D ATCCTACAAG GAAA/---- GAAACTTTGA 3070 het 3070 hom 40 19 19 4 GAAA 2 1 67672 CASAVA_Build 13 30142904 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 15 13 11 A 10 9 67673 CASAVA_Build 13 30145733 1I AAATAACTAC -/A ATTTGCTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 1 2 67674 CASAVA_Build 13 30153266 1I TTTTTTTTTT -/A ATTTTTATTT 2892 het 1610 hom 16 5 9 2 A 1 2 67675 CASAVA_Build 13 30174953 1D TCTAAGCAAA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 8 7 67676 CASAVA_Build 13 30187955 1I AGGCAAGTGG -/C CCTTTGACCT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 C 2 3 67677 CASAVA_Build 13 30200597 2I AATGTCTGTG --/TA TATATATATT 2147 het 2147 ref 28 18 9 1 TA 4 5 67678 CASAVA_Build 13 30226383 14I TCTCAAAAAG --------------/AGAGAGAAAGCTGA AGTTCACAGT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 AGAGAGAAAGCTGA 0 1 67679 CASAVA_Build 13 30239641 1I GAGAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 2853 het 2383 hom 30 9 12 9 T 11 12 67680 CASAVA_Build 13 30247601 1I TGATGGATTC -/T ACCTCCTGAT 3070 hom 151 het 57 0 51 6 T 0 1 67681 CASAVA_Build 13 30248908 1D TGTTTTGGCT G/- GGTGGTTGTG 3070 het 3070 hom 42 19 19 6 G 3 2 67682 CASAVA_Build 13 30259985 8D CTCCAGCAGC AGGGAGTA/-------- AGGGCAGAGC 3070 het 3070 ref 34 18 11 9 AGGGAGTA 1 0 67683 CASAVA_Build 13 30263131 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 T 10 9 67684 CASAVA_Build 13 30263290 1D GACCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 11 10 67685 CASAVA_Build 13 30266152 1I GGGGGTTGTC -/A TCCCTTTCTG 3070 hom 100 het 41 0 31 10 A 0 1 67686 CASAVA_Build 13 30280151 14D AAAATAACTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 34 0 31 10 T 26 12 67687 CASAVA_Build 13 30281925 10D TCAGACTAAG GCTTGAGATA/---------- GCACAACCAA 3070 het 3070 ref 55 34 21 3 GCTTGAGATA 1 0 67688 CASAVA_Build 13 30292954 3D GCTGAAGCAA TCC/--- TCCTGCTTCA 2859 het 2859 ref 38 14 10 14 TCC 2 1 67689 CASAVA_Build 13 30296608 2D CCCAAATTGA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 43 18 14 12 CT 6 5 67690 CASAVA_Build 13 30298013 1D AACTCTGCCT C/- CCAAAAAAAA 3070 het 798 hom 39 2 33 5 C 3 2 67691 CASAVA_Build 13 30301026 1D TGGGTTCAAG T/- GATTCTCCTG 3070 het 330 hom 11 1 9 1 T 1 0 67692 CASAVA_Build 13 30314043 1I AGGTGTCCAC -/G GGTCAGATCC 3070 het 2816 hom 18 7 10 1 G 2 3 67693 CASAVA_Build 13 30314681 2D TGTGTATGTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 88 61 19 9 GT 6 5 67694 CASAVA_Build 13 30319656 1I GGAAAGAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 A 15 16 67695 CASAVA_Build 13 30320325 1D TGCTGGGAGG A/- AAAAAAAAAC 1346 het 1346 ref 42 36 3 3 A 10 9 67696 CASAVA_Build 13 30322435 2D AAGTGAAAAC AT/-- GTGGTATTTG 3070 het 3070 ref 44 20 20 7 AT 1 0 67697 CASAVA_Build 13 30333803 3I TTTTAAATGT ---/ACA ATTAAATTAT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 ACA 0 1 67698 CASAVA_Build 13 30362236 1I TTAAACAGAA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 1017 hom 33 4 21 8 T 0 1 67699 CASAVA_Build 13 30365626 1D CTTACTTTTT A/- AGTTATTAAA 3070 hom 78 het 40 0 27 13 A 2 1 67700 CASAVA_Build 13 30371542 1D TTCATTCAAT A/- AAAATAAATA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 5 4 67701 CASAVA_Build 13 30391321 1I TAATTGTGAT -/A AAAAGCCATA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 4 5 67702 CASAVA_Build 13 30405803 4D AAAATGAAAA TACT/---- TAATTAGTGC 3070 het 3070 hom 62 25 31 6 TACT 1 0 67703 CASAVA_Build 13 30409656 1D GGCTTCTTTT A/- CGAGTGGCAT 3070 het 3070 hom 45 20 22 5 A 1 0 67704 CASAVA_Build 13 30427250 3I GGCCACAGTG ---/GAA GAAGAAGAAT 3070 hom 92 het 37 0 29 8 GAA 3 4 67705 CASAVA_Build 13 30433679 1D TCCATTTTCT A/- AAAAAATGTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 7 6 67706 CASAVA_Build 13 30434967 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2369 hom 25 8 15 2 T 11 10 67707 CASAVA_Build 13 30449301 3I TTTATACTAT ---/TCG TCGTCTTCTT 3070 het 3070 hom 62 27 26 9 TCG 1 2 67708 CASAVA_Build 13 30456325 3I CTGTATCTTC ---/TTT GATTTATCAA 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 0 3 67709 CASAVA_Build 13 30459837 1I TCCTGTCCCT -/C CCCCCATGAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 C 5 6 67710 CASAVA_Build 13 30462090 1I ATGAACTCAT -/C CTTTTTTGTG 3070 hom 54 het 20 0 18 3 C 1 2 67711 CASAVA_Build 13 30462484 1D CCCCCCCACC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 24 10 10 5 A 9 8 67712 CASAVA_Build 13 30466780 1D ACTCAGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 24 1 15 8 A 17 16 67713 CASAVA_Build 13 30481080 2D CATCAGCTTA GT/-- GTATAGTAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 GT 2 1 67714 CASAVA_Build 13 30491871 1I AACAATATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 790 hom 37 4 20 13 T 13 14 67715 CASAVA_Build 13 30501786 1D AGGGGCTGGT G/- GGGGGGGGGT 584 het 584 ref 23 11 3 10 G 10 9 67716 CASAVA_Build 13 30502222 1D AATTTTTGAT A/- AAAAATAAAC 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 6 5 67717 CASAVA_Build 13 30504138 13D GGCTTCCACT CCCCCACCCCCCA/------------- CCCCCACCCC 3070 hom 74 het 30 0 23 8 CCCCCACCCCCCA 1 0 67718 CASAVA_Build 13 30507256 1D GAGAGAGAGA G/- AAAAAAAATG 3070 hom 103 het 42 0 34 9 G 1 0 67719 CASAVA_Build 13 30510703 2D TTGCCATAGG AA/-- AAAAAAAAAA 2562 het 1725 hom 38 13 11 15 A 16 14 67720 CASAVA_Build 13 30517974 1D TTCCACCCCA T/- TGCAGATCAA 3070 het 3070 hom 44 15 23 7 T 2 1 67721 CASAVA_Build 13 30523423 1D TTCTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 2910 het 2910 ref 30 11 8 11 T 13 12 67722 CASAVA_Build 13 30549448 4D GAATGCTTAT CTGC/---- CTGCCTGGGT 3070 het 3070 ref 41 20 14 10 CTGC 2 1 67723 CASAVA_Build 13 30567945 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 7 8 67724 CASAVA_Build 13 30577886 1D CAAGGTTCCA T/- TTCTTTCTGC 974 hom 17 het 12 0 6 7 T 3 2 67725 CASAVA_Build 13 30585312 2D AGGGACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 AC 10 9 67726 CASAVA_Build 13 30595028 11D GTTGGGGTGC GGACTTATACT/----------- GGACATGTTA 3070 hom 84 het 29 0 28 3 GGACTTATACT 1 0 67727 CASAVA_Build 13 30608149 1D CAGCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2597 het 2597 ref 38 22 9 7 A 13 12 67728 CASAVA_Build 13 30630066 4D ATACCGTACT TTAC/---- TTTTCAATTC 3070 het 3070 hom 28 9 14 6 TTAC 1 0 67729 CASAVA_Build 13 30631253 2D CTCCAGGTTC CA/-- GTTATTATGA 3070 het 3070 hom 33 14 13 8 CA 1 0 67730 CASAVA_Build 13 30643277 1D AATAGATCTC T/- TGTTTTGGTG 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 T 2 1 67731 CASAVA_Build 13 30650275 2D CTGCTCACTC TT/-- TGGGTCTGCA 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 T 3 1 67732 CASAVA_Build 13 30666092 1I TACACACGCA -/G TAAAAGCAAG 3070 hom 162 het 63 0 54 9 G 0 1 67733 CASAVA_Build 13 30667461 2I ATGTTCCCTC --/TT GTGCTGGCCA 3070 hom 93 het 36 0 30 6 T 0 2 67734 CASAVA_Build 13 30687170 1D GAAATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 672 hom 37 2 24 11 T 14 13 67735 CASAVA_Build 13 30688285 1I AGAATGTTTC -/T TTTATCAACA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 3 4 67736 CASAVA_Build 13 30700357 1I TGCTGTGGCC -/G GTTTCCTGGA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 G 1 2 67737 CASAVA_Build 13 30704558 4D CAGGAGGGTT AGAG/---- AGAGAGGGGA 3070 hom 99 het 39 0 33 7 AG 5 3 67738 CASAVA_Build 13 30709263 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 23 2 19 2 A 13 14 67739 CASAVA_Build 13 30711822 1D CACCTGAGTC T/- TTTTTTTTTT 1464 het 1464 ref 38 15 5 18 T 15 14 67740 CASAVA_Build 13 30712616 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 23 2 13 8 T 13 14 67741 CASAVA_Build 13 30718671 5D AGAACTTTAA AAAGT/----- AAAGTAATTT 3070 het 3070 ref 33 18 11 6 AAAGT 2 1 67742 CASAVA_Build 13 30718805 1I GAGTTATCCC -/T TGACTACTTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 1 2 67743 CASAVA_Build 13 30721556 2D ATCTGTGCAC TT/-- TCTGCCATGT 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 T 3 1 67744 CASAVA_Build 13 30729049 1D CCCAGAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 12 11 67745 CASAVA_Build 13 30733269 1D TGTGCATCAA C/- TTTAATTTCA 3070 het 3070 hom 28 10 14 6 C 1 0 67746 CASAVA_Build 13 30734737 2D TTAAATACAC TT/-- TGGTTTGCTA 3070 het 3070 ref 40 22 12 8 T 3 1 67747 CASAVA_Build 13 30744356 1I CTATTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2351 hom 18 het 17 0 10 7 T 15 16 67748 CASAVA_Build 13 30755735 1I CAGAACTCAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 177 hom 17 1 14 2 T 7 8 67749 CASAVA_Build 13 30761757 1D GTGCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 11 10 67750 CASAVA_Build 13 30764837 1I TTCTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2566 het 483 hom 14 1 7 6 T 10 11 67751 CASAVA_Build 13 30767145 1I GTGGACGTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 373 hom 43 1 34 8 T 9 10 67752 CASAVA_Build 13 30768841 1D TTATGTAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 10 9 67753 CASAVA_Build 13 30791528 16I CTAAGAGTCA ----------------/TAAACTACCAGCCTCC TAAACTCCCA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 TAAACTACCAGCCTCC 0 1 67754 CASAVA_Build 13 30793976 1D TGAATGACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 10 9 67755 CASAVA_Build 13 30803550 7D CTGATTAGTG CCTTCTA/------- CTGATACCGG 3070 hom 72 het 31 0 25 9 CCTTCTA 1 0 67756 CASAVA_Build 13 30806676 9I TAATTGGATA ---------/TGGCAAAAG TGGGATGTAT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 TGGCAAAAG 0 1 67757 CASAVA_Build 13 30809978 1I CATTTACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 825 hom 22 2 14 9 A 11 12 67758 CASAVA_Build 13 30810057 2D GCCAACAAAC AG/-- GGAAGGGAAC 3070 hom 75 het 29 0 26 6 AG 1 0 67759 CASAVA_Build 13 30814819 2I AACCCATCTC --/AT GTGCAGAGAC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AT 0 1 67760 CASAVA_Build 13 30837550 1I GGCCACCCAT -/G GGATCAACTG 3070 hom 86 het 31 0 28 3 G 2 3 67761 CASAVA_Build 13 30842999 17I3M13I4M13I TCATACTTTA -----------------AGT-------------AGAA-------------/AAAATCATTCTGCTTTCAGTTCTTCAATTACCCACAATATATCGTTCTAC TCTCTTGATT 3070 het 3070 ref 35 21 11 9 N/A 0 0 67762 CASAVA_Build 13 30849016 1D CATGTGGGAC T/- TGGTGCTATT 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 T 2 1 67763 CASAVA_Build 13 30849202 1D GAAAACTAGA T/- TTTTTTTGTT 2907 het 2047 hom 15 5 7 3 T 8 7 67764 CASAVA_Build 13 30870851 1I CAATAAGAAA -/C CTGCTGTTAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 2 67765 CASAVA_Build 13 30876278 1I ATATAAAAGG -/T TTTTTGCTTC 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 5 6 67766 CASAVA_Build 13 30876545 4I TAAAACAAAA ----/AATT AATTAAATAT 1375 het 1375 ref 14 8 5 1 AATT 1 2 67767 CASAVA_Build 13 30882674 7I AGGGCCCTGC -------/GGTGTGA GGTGGGAGGT 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 GGTGTGA 0 1 67768 CASAVA_Build 13 30891078 4D ATAATAGCAC AGAA/---- AGAAACTTCA 3070 het 3070 hom 49 22 23 5 AGAA 2 1 67769 CASAVA_Build 13 30891940 2D TCAATTTTAC AT/-- ATGTGTTTCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 AT 2 1 67770 CASAVA_Build 13 30901904 14I ATACGACTGG --------------/CAAATATATTCTCC CAATATATAG 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 CAAATATATTCTCC 0 1 67771 CASAVA_Build 13 30902132 1D TTAATCCACC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 18 9 9 T 8 7 67772 CASAVA_Build 13 30905031 1D GGTTTGTAGG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 43 22 13 9 A 7 6 67773 CASAVA_Build 13 30908569 2D GCAGTTTTCC TA/-- TGATAGAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 20 7 TA 1 0 67774 CASAVA_Build 13 30917581 6D TATACACACA TATATG/------ TATATGTATA 3070 het 3070 ref 36 16 11 12 TATATG 4 3 67775 CASAVA_Build 13 30919056 1I CCTGTCCCCC -/T GAAAGACCCC 3070 het 3070 hom 43 21 21 1 T 0 1 67776 CASAVA_Build 13 30933422 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1049 het 217 hom 22 3 4 15 T 19 18 67777 CASAVA_Build 13 30951040 1I CTAGGTACAA -/G GGGGGTATAG 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 G 5 6 67778 CASAVA_Build 13 30962729 2I TGGCAAACAC --/TA TGCAAAATAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 TA 0 1 67779 CASAVA_Build 13 30962834 1D GGAACATAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 10 9 67780 CASAVA_Build 13 30965866 1D AAAAACTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 12 11 67781 CASAVA_Build 13 30967459 1D GTTTCACGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 13 11 T 15 14 67782 CASAVA_Build 13 30970784 6D CTTACATGGT GACGAC/------ GAGAGAAATG 3070 het 3070 ref 24 11 10 4 GAC 2 0 67783 CASAVA_Build 13 30979200 1I GACACCACGG -/T TTTGCTGTGT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 3 4 67784 CASAVA_Build 13 30996135 1I TTTATTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 10 11 67785 CASAVA_Build 13 31038049 1I AGTATTAATT -/C TATAAAAACT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 C 0 1 67786 CASAVA_Build 13 31039648 1I ACCCAGTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 T 9 10 67787 CASAVA_Build 13 31059547 1I TTTGGAATGG -/A AATGTCTATC 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 2 3 67788 CASAVA_Build 13 31059943 2I AGGCTGCATG --/CA CTGTTCATCT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 CA 0 1 67789 CASAVA_Build 13 31071475 1D AGCCAGAGAA C/- CTGATTTAGC 3070 het 3070 hom 47 24 21 2 C 2 1 67790 CASAVA_Build 13 31074283 2I GAGCAAGAAC --/AG AGGAAAGAAC 3070 hom 71 het 28 0 23 5 AG 1 2 67791 CASAVA_Build 13 31074393 1I AAGGTAAAAC -/T TTATTTACTA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 2 3 67792 CASAVA_Build 13 31076145 1I ACCAATCCCC -/A ATGGATACCA 3070 het 3070 ref 36 24 8 4 A 1 2 67793 CASAVA_Build 13 31077106 2D AGATTCCGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 34 0 19 15 A 16 14 67794 CASAVA_Build 13 31077503 1I55M1I ACAATTGAAC -AAAAAATGTAAAGACACATTAAGACAGATATGGTAACCAGTTGCCTTAAGGGGTT-/AAAAAAATGTAAAGACACATTAAGACAGATATGGTAACCAGTTGCCTTAAGGGGTTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 20 24 N/A 0 0 67795 CASAVA_Build 13 31077695 1D TCATTGCTGT C/- AGCACGGTAG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 C 1 0 67796 CASAVA_Build 13 31080200 2I GCGTGGACCC --/AA AGAGTGATCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 1 3 67797 CASAVA_Build 13 31084080 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 A 16 15 67798 CASAVA_Build 13 31091628 1D GAAAGCAGAG T/- TGCATTTGCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 1 67799 CASAVA_Build 13 31095644 2I TTTTTTTCAC --/AT GACTAACCAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 AT 0 1 67800 CASAVA_Build 13 31100453 4D TAACTAGACA AGAC/---- AGACAAAGGT 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 AGAC 2 1 67801 CASAVA_Build 13 31104033 2I AGATAAAATC --/AA AGTCACTCTT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 1 3 67802 CASAVA_Build 13 31126868 1D TTTTCTCAGT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 9 8 67803 CASAVA_Build 13 31128489 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 10 9 67804 CASAVA_Build 13 31133339 1I AGAATTTGGC -/A GTGAATCCAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 0 1 67805 CASAVA_Build 13 31133639 1D TCTTTTTTTT G/- GGGGGGGGTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 8 G 9 8 67806 CASAVA_Build 13 31149582 1I ACTAAAGAGC -/T TCTGCACAGC 2802 hom 18 het 7 0 7 0 T 1 2 67807 CASAVA_Build 13 31152473 1D AAAAGTATGA G/- GTAGATCTGT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 G 2 1 67808 CASAVA_Build 13 31158776 2D AGCATTCCAG TC/-- TCTGCATCCA 3070 hom 112 het 42 0 33 10 TC 2 1 67809 CASAVA_Build 13 31163120 1I AACGGAAAGC -/A AAAAAAAAAA 1994 het 1994 ref 27 9 8 10 A 15 16 67810 CASAVA_Build 13 31163986 1I AAAAACCCTT -/A TAAAAAATCA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 0 1 67811 CASAVA_Build 13 31176675 3D TACCTCATCA TGT/--- TGTGAGAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TGT 2 1 67812 CASAVA_Build 13 31187496 4D GAACACACCT TAGG/---- TACAATGCTT 3070 het 3070 hom 46 21 20 8 TAGG 1 0 67813 CASAVA_Build 13 31187985 4D ATATTCCTGC CTAA/---- CTATTAGAGT 3070 het 3070 ref 56 33 16 8 CTAA 1 0 67814 CASAVA_Build 13 31195577 3D TATATATACA ATG/--- GGTGCCATGT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 ATG 1 0 67815 CASAVA_Build 13 31198419 1D ATTTTACGTG A/- AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 31 9 19 4 A 7 6 67816 CASAVA_Build 13 31199861 1I ACAGGAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 T 10 11 67817 CASAVA_Build 13 31204527 3I ACATGCTCCA ---/CTT CTTCTACTTG 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 CTT 1 2 67818 CASAVA_Build 13 31211429 3I ACAGAGCAAA ---/TTG TTGTACATGC 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 TTG 1 2 67819 CASAVA_Build 13 31215018 1I TTAAGAGCCC -/A AGAATGGCTT 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 A 1 2 67820 CASAVA_Build 13 31215611 1D TCTCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2253 het 2253 ref 14 7 6 2 A 13 12 67821 CASAVA_Build 13 31216860 1I TTTTTGTTTT -/C TTTTTTCAGT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 C 0 1 67822 CASAVA_Build 13 31228214 16I TCTACTCATC ----------------/CTCCCTAATGACATCA CTAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 45 20 23 3 CTCCCTAATGACATCA 0 1 67823 CASAVA_Build 13 31235748 4D ATGCCATTGA GAAG/---- ATTGAGGTAG 3070 het 3070 ref 39 20 13 7 GAAG 1 0 67824 CASAVA_Build 13 31236549 3D CTTCTTTCTT CTG/--- AATGCTTCAG 3070 het 3070 ref 42 27 15 0 CTG 1 0 67825 CASAVA_Build 13 31237570 1I GTTGAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 16 17 14 T 11 12 67826 CASAVA_Build 13 31238194 1I ATATTTATTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 8 9 67827 CASAVA_Build 13 31244087 1I58M2I TTAGGCATCC -AAAAAAAAACAAAAAACAAATTCCTAAATCAAAATTAAATCTTAATTGCCAGATGAAT--/AAAAAAAAAACAAAAAACAAATTCCTAAATCAAAATTAAATCTTAATTGCCAGATGAATAA GTGTTGCTTA 2495 het 2495 ref 26 13 7 20 N/A 0 0 67828 CASAVA_Build 13 31253694 1I AGGAGGAAAG -/C ATAGTAACAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 C 0 1 67829 CASAVA_Build 13 31255654 5I TGGAGAAAAT -----/AACTC AATAAGAGTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AACTC 0 1 67830 CASAVA_Build 13 31258924 4D ACTGAATGAC AAAT/---- AAGCCTCATT 3070 hom 151 het 57 0 51 7 AAAT 1 0 67831 CASAVA_Build 13 31262955 1I AAGCAGCCCT -/C GGCAGTATCC 3070 het 3070 ref 47 19 19 9 C 0 1 67832 CASAVA_Build 13 31272977 2I GATTGTCTAA --/TT TTTTTTTAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 7 9 67833 CASAVA_Build 13 31289194 1D AAAAGTGTTA T/- TTTTTAGGAC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 6 5 67834 CASAVA_Build 13 31290295 3D AGAACTGATG AAT/--- AATCCATTGG 3070 het 3070 hom 49 23 25 1 AAT 2 1 67835 CASAVA_Build 13 31292532 10D ATATATATAT ATATATATAG/---------- AATGCCACAC 579 het 30 hom 5 1 3 2 ATATATATAG 1 0 67836 CASAVA_Build 13 31296965 1I AGACTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 11 13 T 13 14 67837 CASAVA_Build 13 31298361 1D TTCTGAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 7 14 2 A 12 11 67838 CASAVA_Build 13 31299221 1I ACTGCACCCC -/T TATAGTTGAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 1 2 67839 CASAVA_Build 13 31302987 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 995 het 995 ref 22 10 4 8 T 17 16 67840 CASAVA_Build 13 31328480 2I CGAGACTCCG --/TC TCAGGGAAAA 99 het 99 ref 20 10 1 9 TC 1 2 67841 CASAVA_Build 13 31330756 4I ACAAATGAAC ----/AAAA TGGTTCAGGT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 A 0 4 67842 CASAVA_Build 13 31331073 1D GTTCTTTTTC T/- TTTTATACTA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 5 4 67843 CASAVA_Build 13 31332507 12D AAAAATATGC CTATTTTTTTTA/------------ CATGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 14 23 4 CTATTTTTTTTA 1 0 67844 CASAVA_Build 13 31337428 3I AGGGCAGGCC ---/TCT TCTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 TCT 2 3 67845 CASAVA_Build 13 31344672 1D TTCACCACTT G/- GGGAAGTAAG 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 G 4 3 67846 CASAVA_Build 13 31345528 3D GCTGCAGAGA TAG/--- TAGAGAGGCA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 TAG 2 1 67847 CASAVA_Build 13 31350137 1D TATTTCAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 A 10 9 67848 CASAVA_Build 13 31355540 3D CAAAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 1768 het 1768 ref 21 7 8 8 A 14 11 67849 CASAVA_Build 13 31358228 10D CCCTCTCCCT TGCTCACACA/---------- TGCTCACACA 3070 het 3070 ref 56 25 16 20 TGCTCACACA 2 1 67850 CASAVA_Build 13 31361166 1D GTACATTAAC T/- TTTTATTTCT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 T 5 4 67851 CASAVA_Build 13 31362130 5D TATTCCCTAA ACAAT/----- ACAGTATCAC 2835 het 2835 ref 21 13 7 5 ACAAT 1 0 67852 CASAVA_Build 13 31363429 4D TTTTGCAGAT AGTC/---- AGTCGTCTGC 3070 het 3070 hom 41 20 16 7 AGTC 2 1 67853 CASAVA_Build 13 31366755 1D TATACAGCAT C/- TTTTTAAGCT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 C 1 0 67854 CASAVA_Build 13 31367644 6I TCATCTATAA ------/CAGTGG TTTCACTTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CAGTGG 0 1 67855 CASAVA_Build 13 31372177 1D CCACTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1179 hom 33 7 14 12 T 14 13 67856 CASAVA_Build 13 31374866 1D AACAGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 13 12 67857 CASAVA_Build 13 31375549 1I CCATCCCTCA -/C CCCCATCCCA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 C 4 5 67858 CASAVA_Build 13 31377745 7I CAGGTGTGGT -------/GGCTCAC GACTGTAGTT 3070 het 3070 ref 40 20 19 2 GGCTCAC 0 1 67859 CASAVA_Build 13 31382478 1D CCTCTTAGAC T/- TTTTTTTTTT 1835 het 1835 ref 41 34 4 3 T 11 10 67860 CASAVA_Build 13 31385610 1I GATCAAAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 A 9 10 67861 CASAVA_Build 13 31393094 1D CAGAAGGTTT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 34 14 16 5 A 8 7 67862 CASAVA_Build 13 31396929 2D CCTTTCTGTT TC/-- TGTGTCTCAC 3070 het 3070 hom 50 23 23 5 TC 1 0 67863 CASAVA_Build 13 31397701 1I CTTTTAGTAC -/T TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 4 5 67864 CASAVA_Build 13 31405567 1D ATAAAGACAA T/- TCATTTAGCT 3070 het 3070 hom 46 17 21 9 T 2 1 67865 CASAVA_Build 13 31413657 2I GAATTGTAAC --/AG GGGAAGACTT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 AG 0 1 67866 CASAVA_Build 13 31418658 2D TTCTCTGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 14 13 T 12 10 67867 CASAVA_Build 13 31422331 14I ATTTGGCTGA --------------/GGTTCTATGGTCTT GGGTCCTAAG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 GGTTCTATGGTCTT 0 1 67868 CASAVA_Build 13 31422872 1I AACACAAGTT -/G TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 G 0 1 67869 CASAVA_Build 13 31423893 1I GCATTAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 10 11 67870 CASAVA_Build 13 31431393 1I GAATTACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 10 11 67871 CASAVA_Build 13 31435067 2D ACAATCTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 2546 het 2546 ref 40 15 8 17 T 16 14 67872 CASAVA_Build 13 31439765 9D TAATTTTTCC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2473 het 1336 hom 23 6 7 10 T 19 10 67873 CASAVA_Build 13 31440254 3I AAAGTTTTTG ---/CCC TTAAATCCAA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 C 0 3 67874 CASAVA_Build 13 31446039 1D CAAAGTCAGG A/- AATCGAGACC 3070 hom 57 het 24 0 19 6 A 3 2 67875 CASAVA_Build 13 31446251 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 10 11 67876 CASAVA_Build 13 31446938 6D AGACAAAGTC AAAGAT/------ AAAGCCTACA 3070 het 3070 hom 53 18 22 17 AAAGAT 1 0 67877 CASAVA_Build 13 31446990 4D GAAGAAAAAC AATT/---- AATCATATTC 3070 het 3070 hom 56 18 26 13 AATT 1 0 67878 CASAVA_Build 13 31449053 4D TTAAATTGAC AAAT/---- AAAACTTCTT 3070 het 2071 hom 22 6 12 5 AAAT 1 0 67879 CASAVA_Build 13 31449102 1I ACGTTTATAT -/A AAAAAAATAT 3070 het 1442 hom 16 5 9 2 A 7 8 67880 CASAVA_Build 13 31449720 2I AGTGAGACTC --/TT TGTCTCAAAC 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 T 1 3 67881 CASAVA_Build 13 31449787 1D TCCTTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 7 A 12 11 67882 CASAVA_Build 13 31457770 1D TTATCAGGGG T/- TTCCACTTTT 2393 hom 15 het 10 0 5 5 T 3 2 67883 CASAVA_Build 13 31458586 1D CCAAATCTTA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 8 7 67884 CASAVA_Build 13 31463412 1I GATTAATAGA -/T AATTTATTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 0 1 67885 CASAVA_Build 13 31473366 2I TTACACAATA --/AT ATGTTATTGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AT 1 2 67886 CASAVA_Build 13 31481732 14D ACTTTGTTTG CAATGCATTTTTCC/-------------- CAATGCCTTC 1102 het 391 hom 31 5 7 20 CAATGCATTTTTCC 1 0 67887 CASAVA_Build 13 31485944 2D TCACAGTGAC AG/-- GGGAAGGAAA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 AG 1 0 67888 CASAVA_Build 13 31489223 2D GTCCTAGAAC AT/-- AGGAGTAAGA 3070 hom 96 het 38 0 32 7 AT 1 0 67889 CASAVA_Build 13 31511631 1D TCTCCCACCT C/- CCCCCCCATA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 C 8 7 67890 CASAVA_Build 13 31516104 3I GCCTGAAATG ---/GGA GGAGAAGTGC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 GGA 1 2 67891 CASAVA_Build 13 31519875 1D TCCTGGCTAG T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 63 het 22 0 22 2 T 7 6 67892 CASAVA_Build 13 31521577 4I CATAGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 38 0 27 11 TTTG 3 4 67893 CASAVA_Build 13 31526127 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 7 67894 CASAVA_Build 13 31526562 1I AAACTAGACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 67895 CASAVA_Build 13 31530097 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 24 het 9 0 8 1 A 9 10 67896 CASAVA_Build 13 31531814 1D GGTATTTCAT C/- CCCTCACACC 3070 hom 110 het 40 0 37 4 C 4 3 67897 CASAVA_Build 13 31560809 6I ACACCACCAT ------/AGTAAA AGTTTGATTG 3070 hom 63 het 27 0 21 6 AGTAAA 0 1 67898 CASAVA_Build 13 31567336 1I GATGATTAGA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 6 7 67899 CASAVA_Build 13 31569082 2I AGCAACAACT --/TA TATATATATA 3070 het 414 hom 38 1 30 7 TA 6 7 67900 CASAVA_Build 13 31598407 1I ACTTCAGTAT -/G CCAAAAATGA 3070 hom 107 het 43 0 36 7 G 0 1 67901 CASAVA_Build 13 31608177 4I AAGTTAATTT ----/AAAA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 A 9 13 67902 CASAVA_Build 13 31621604 1D TTTGATTTGT G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 63 het 25 0 21 5 G 9 8 67903 CASAVA_Build 13 31629668 1I AAAGATAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 534 hom 35 2 32 1 A 9 10 67904 CASAVA_Build 13 31633833 1I AAAAAAGAGT -/C TCATTCGGAG 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 0 1 67905 CASAVA_Build 13 31637213 1I GCTGGGCACA -/T TGTTCATTCT 3070 het 3070 hom 56 23 30 3 T 1 2 67906 CASAVA_Build 13 31638234 1D GATCCCAGCT G/- CCTGGGAGGG 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 G 1 0 67907 CASAVA_Build 13 31643003 1D GGTATTTATG T/- AAGTCATTTA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 1 0 67908 CASAVA_Build 13 31645732 1D CTTTCAACTC T/- TCTGAAATTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 2 1 67909 CASAVA_Build 13 31664405 1I TTTTAATGAC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 7 8 67910 CASAVA_Build 13 31667046 2I TTCCCAAGAA --/AG AGCTTATGTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AG 1 2 67911 CASAVA_Build 13 31667402 4D TATGCATAAA AGTT/---- AGAGCAAATG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AGTT 1 0 67912 CASAVA_Build 13 31674354 1D CTAATTAAAC T/- GATGTTTTAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 1 0 67913 CASAVA_Build 13 31675077 2I CAGAGTGAGA --/CT CAGTCTCAAA 852 hom 18 het 18 0 5 13 CT 0 1 67914 CASAVA_Build 13 31675860 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 10 12 67915 CASAVA_Build 13 31676456 5D ATTGTTTTAC AGATG/----- AGATGAGAAA 3070 hom 126 het 46 0 43 4 AGATG 2 1 67916 CASAVA_Build 13 31708485 4D ATACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 36 11 18 10 AC 11 9 67917 CASAVA_Build 13 31710438 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 9 8 67918 CASAVA_Build 13 31719097 1D GGAAACCGGA G/- GGTGGGGAGA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 G 3 2 67919 CASAVA_Build 13 31728995 1D AAATCTGAAA T/- GCTCCAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 1 0 67920 CASAVA_Build 13 31729780 1D CATATTTAGG C/- ATTCCAAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 C 1 0 67921 CASAVA_Build 13 31732539 5I CCTTTATTCC -----/TATCT TAACAGAAAG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TATCT 0 1 67922 CASAVA_Build 13 31735001 1D GCACATATTT G/- GGGAATTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 G 4 3 67923 CASAVA_Build 13 31740624 16D AAGCTAGTTT AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAATATATA 1445 het 325 hom 16 2 6 8 A 20 4 67924 CASAVA_Build 13 31749800 1I TGTAAAGTTA -/C TGGTTTGGGG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 C 0 1 67925 CASAVA_Build 13 31759782 1I AAACATTATG -/T TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 T 6 7 67926 CASAVA_Build 13 31781130 1D TTGGAATACA T/- TTTTTTTTTT 2158 het 2119 hom 32 8 7 17 T 15 14 67927 CASAVA_Build 13 31783212 1D ACAGGCTTAG T/- TTGGGTTGGC 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 3 2 67928 CASAVA_Build 13 31789452 4D TTTTGAAAAC AAGT/---- GAGTGGAATA 3070 het 3070 ref 46 26 14 8 AAGT 1 0 67929 CASAVA_Build 13 31815847 1D CCACCTAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 A 10 9 67930 CASAVA_Build 13 31821460 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 10 11 67931 CASAVA_Build 13 31839717 9I GAGGTGGGCA ---------/GATGGCTTG TACTCAGGAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 GATGGCTTG 0 1 67932 CASAVA_Build 13 31859190 1I TCCACCTTTG -/C CTTCATTGTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 1 2 67933 CASAVA_Build 13 31860804 1I ATGCATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1205 hom 38 5 20 13 T 13 14 67934 CASAVA_Build 13 31864727 2D ACTGCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 26 3 13 10 A 18 16 67935 CASAVA_Build 13 31869707 1D AACAAAACCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 51 0 40 12 T 9 8 67936 CASAVA_Build 13 31874641 3D13M1D CAATGGCACT TTGATAAGTAGCAATGC/---AAAACTTTTCCTG- CCCCCCACCA 3070 hom 75 het 27 0 26 3 N/A 0 0 67937 CASAVA_Build 13 31883462 3D AGGCCAAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 43 1 25 17 T 19 16 67938 CASAVA_Build 13 31884779 2D CAACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 751 het 751 ref 27 18 2 8 A 18 16 67939 CASAVA_Build 13 31894333 1I TATTGACAAC -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 6 7 67940 CASAVA_Build 13 31924195 13D TTTCTTTTTC TTTTTCTTTTTTT/------------- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 25 14 12 2 TTTTTCTTTTTTT 1 0 67941 CASAVA_Build 13 31954652 1D GACCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2319 het 1806 hom 22 6 9 7 T 15 14 67942 CASAVA_Build 13 31956297 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 A 6 7 67943 CASAVA_Build 13 31960003 1D ATTTATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 11 10 67944 CASAVA_Build 13 31967236 1D CCTATCCCAG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 7 67945 CASAVA_Build 13 31968343 1I CTATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 13 14 67946 CASAVA_Build 13 31973569 1I AATAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1164 hom 31 4 24 3 T 10 11 67947 CASAVA_Build 13 31979081 2D TCACTCTGAC AG/-- AGAGAGGGCA 3070 het 3070 ref 38 19 16 6 AG 4 3 67948 CASAVA_Build 13 31987813 2D TTCCTCATAA TC/-- TGTTTCTCCC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TC 1 0 67949 CASAVA_Build 13 32001795 1D TCCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 774 hom 29 3 20 6 T 11 10 67950 CASAVA_Build 13 32024866 1D ATTAAGAAGT G/- GGGCATTTAG 3070 het 3070 hom 40 21 18 2 G 4 3 67951 CASAVA_Build 13 32035386 1D AGATTCACCA T/- TTTCCTCTCC 3070 het 3070 hom 46 17 28 3 T 4 3 67952 CASAVA_Build 13 32038798 2D GCCTGTCATC TA/-- TAAAGTAACT 3070 het 3070 hom 58 22 25 12 TA 2 1 67953 CASAVA_Build 13 32061380 1D GGCAGCCCTT A/- AGATATCCTG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 2 1 67954 CASAVA_Build 13 32061934 6I GTATTTACTT ------/TTTAAG TTTAAGAAGC 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 TTTAAG 1 2 67955 CASAVA_Build 13 32062039 1I CTAACCATTT -/C CCCCCATTAC 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 C 5 6 67956 CASAVA_Build 13 32064611 14D CCAGGCTGGT CTCGAACTCCTGGC/-------------- CTCAGGTGAT 1717 het 560 hom 10 4 5 4 CTCGAACTCCTGGC 1 0 67957 CASAVA_Build 13 32064687 1D AGCCACTGCG C/- CCTGGCCTAA 3070 het 3070 ref 26 13 13 1 C 3 2 67958 CASAVA_Build 13 32066414 2I GCAGGGAGAC --/TA TGTGTGGCAA 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 TA 0 1 67959 CASAVA_Build 13 32070320 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 1746 het 1083 hom 7 3 4 0 CTC 0 1 67960 CASAVA_Build 13 32074187 4D AATGCATTCA AAAC/---- AATGTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 11 12 AAAC 1 0 67961 CASAVA_Build 13 32077925 3D AATAGTTAGC TCT/--- TCTTGTTGAA 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 TCT 2 1 67962 CASAVA_Build 13 32082038 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 12 11 67963 CASAVA_Build 13 32087586 3D AGTGAAATGT ATA/--- CCTATCATAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 ATA 1 0 67964 CASAVA_Build 13 32090655 1I TACTGTGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 A 10 11 67965 CASAVA_Build 13 32091313 1D GTACCCTGTT G/- GGGGGAGAGT 3070 hom 123 het 45 0 40 6 G 6 5 67966 CASAVA_Build 13 32093810 1D GTTAATTACA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 23 9 10 T 9 8 67967 CASAVA_Build 13 32095634 6I CCTCCTTGCT ------/TTAAAG TTAAACTATA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 TTAAAG 0 1 67968 CASAVA_Build 13 32099151 1I TATCTAGCAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 8 9 67969 CASAVA_Build 13 32100916 1D CACTGTTATA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 22 9 6 T 7 6 67970 CASAVA_Build 13 32101002 1D CGATGTCAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 9 8 67971 CASAVA_Build 13 32102927 1I TCTTCCTTAC -/T TTTTTTTTTT 2016 het 1941 hom 38 10 10 18 T 15 16 67972 CASAVA_Build 13 32109356 8I TAATGGCTAA --------/ATAAGGGT TGATTTCATT 924 het 924 ref 23 13 2 8 ATAAGGGT 0 1 67973 CASAVA_Build 13 32110796 2I ATGCTGAGAG --/AA AGTATCTAGT 3070 het 3070 ref 54 27 19 8 A 1 3 67974 CASAVA_Build 13 32118507 9D CATGGCTGTG TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2714 het 2714 ref 42 22 12 13 T 23 14 67975 CASAVA_Build 13 32131074 1D GAGACTGGTT A/- AAAATTAGGG 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 A 5 4 67976 CASAVA_Build 13 32132622 1I TGAATTCCCA -/G GGGGAGACCT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 G 4 5 67977 CASAVA_Build 13 32136993 1D GTCTCAAAAA G/- GGAAAAAGAA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 G 3 2 67978 CASAVA_Build 13 32138738 2D ACATATCCAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 A 11 9 67979 CASAVA_Build 13 32142269 1D AGACACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 7 T 12 11 67980 CASAVA_Build 13 32144453 1I CCTCACCCTT -/G GGGAGATTAA 3070 hom 132 het 46 0 43 3 G 3 4 67981 CASAVA_Build 13 32146098 1I GACTACAGGC -/G TGTGCCACCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 0 1 67982 CASAVA_Build 13 32151137 1D TCATAGGGGG A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 8 7 67983 CASAVA_Build 13 32158956 1I GCTTGTTTTT -/C CTCACCAATT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 2 67984 CASAVA_Build 13 32160326 1I ACAGATAAAG -/A AAAAAATCCC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 6 7 67985 CASAVA_Build 13 32163256 1I CATTCATCTT -/C CTCCCAGAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 67986 CASAVA_Build 13 32165034 5D ATGGTCACTT TTTTA/----- TTTTATTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 TTTTA 2 1 67987 CASAVA_Build 13 32166983 1D GATTCTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 12 11 67988 CASAVA_Build 13 32170187 1D CCCTAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 37 0 28 9 T 12 11 67989 CASAVA_Build 13 32180224 1D GCATAAACTG C/- CCCCTTAGTC 3070 hom 123 het 47 0 41 8 C 5 4 67990 CASAVA_Build 13 32195558 6D TCAAGGAAAA AACTTG/------ AACTTGAAGG 3070 het 3070 ref 34 21 13 2 AACTTG 2 1 67991 CASAVA_Build 13 32195681 3I ATTCTTAAAA ---/TTG TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 TTG 0 1 67992 CASAVA_Build 13 32198287 2D AGATAAACTT AA/-- AAAAAAAAAA 2184 het 2184 ref 23 12 6 5 A 16 14 67993 CASAVA_Build 13 32202200 1D TCTTCTAAGG T/- TTTTTATGGT 3070 het 3070 hom 25 9 13 4 T 6 5 67994 CASAVA_Build 13 32206368 2D TCCACCATGT TG/-- GCCTGGCTGG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TG 1 0 67995 CASAVA_Build 13 32209232 1D TCAAAATTTT G/- GGTCAAATCT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 G 3 2 67996 CASAVA_Build 13 32209337 1D TTATATTCTT C/- CCAGAGTTTT 3070 hom 144 het 52 0 48 5 C 3 2 67997 CASAVA_Build 13 32212824 1D CAGCTCAAGA T/- TTTTTTTTTT 1456 het 1456 ref 41 26 4 11 T 12 11 67998 CASAVA_Build 13 32213189 1I AAAGTCCCTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 0 1 67999 CASAVA_Build 13 32215460 1D6M1D CCTTACCCAC GGAAGTAG/-GAAGTA- GAGGTAATAA 3070 hom 154 het 54 0 52 3 N/A 0 0 68000 CASAVA_Build 13 32217305 1D TTCTAGCTAA G/- GAATAGTAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 2 1 68001 CASAVA_Build 13 32220603 1I GCTCTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 2532 het 2532 ref 42 16 10 16 T 15 16 68002 CASAVA_Build 13 32221632 5D AATTTTAACA TAATT/----- TAATAATTAC 3070 het 3070 hom 29 11 18 0 TAATT 1 0 68003 CASAVA_Build 13 32224202 7D AATTGGTGGA GTGTAAG/------- GTGTAATCAT 3070 het 3070 hom 30 14 16 2 GTGTAAG 1 0 68004 CASAVA_Build 13 32226722 1D ACCCTCTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 49 21 23 5 T 9 8 68005 CASAVA_Build 13 32229641 1I GGCAAAACAC -/T TTTCATTTTG 3070 het 3070 ref 61 34 22 5 T 3 4 68006 CASAVA_Build 13 32236201 2I ATATTCTAAC --/AG GGGAAGGCAG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 AG 0 1 68007 CASAVA_Build 13 32240109 5D TTCAAAACAT ATAAA/----- ATAAAGGAAG 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 ATAAA 2 1 68008 CASAVA_Build 13 32242242 1D TAAATTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 T 10 9 68009 CASAVA_Build 13 32243227 1D CACACTACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 T 10 9 68010 CASAVA_Build 13 32243666 1I AATTACATCA -/G TGGCTCGACT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 G 0 1 68011 CASAVA_Build 13 32260118 1D TGTTTTGATT C/- CTATTTATTA 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 C 2 1 68012 CASAVA_Build 13 32274749 1I GTGCAGGTCT -/G GGGAAGTGGT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 G 3 4 68013 CASAVA_Build 13 32275510 12D AGCAAAAACA AAAAACAACAAC/------------ AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 30 15 14 4 AAAAACAACAAC 1 0 68014 CASAVA_Build 13 32338936 1D TTGTCTCTGG A/- AAAAAAAAAG 978 het 978 ref 25 14 3 8 A 10 9 68015 CASAVA_Build 13 32344482 1D CTGTCTCTTG A/- AAAAAAAAAA 811 het 811 ref 40 33 3 6 A 11 10 68016 CASAVA_Build 13 32384582 1D TTGAAATAAA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 7 6 68017 CASAVA_Build 13 32384985 2D ATATATAGTA AT/-- ATATGTTATA 2256 het 1427 hom 10 4 5 1 AT 3 2 68018 CASAVA_Build 13 32387259 1D CTGTCCTCAT G/- GACCTAATCA 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 G 2 1 68019 CASAVA_Build 13 32390404 1D TGTTTCTCCC T/- TTATGCTGCG 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 T 3 2 68020 CASAVA_Build 13 32395587 12D CACTGAACTC CAGCTTTGATGA/------------ CAGAGTGAGA 3070 het 2312 hom 22 7 13 4 CAGCTTTGATGA 1 0 68021 CASAVA_Build 13 32399735 2I ACGTAATTGA --/TT TTTTTTTTTT 2774 het 2774 ref 26 13 9 4 T 10 12 68022 CASAVA_Build 13 32400258 1D CATAGAAGCA G/- GGGGAGCAAA 3070 het 3070 hom 35 17 18 0 G 5 4 68023 CASAVA_Build 13 32407270 1D GTGTATAGGG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 T 9 8 68024 CASAVA_Build 13 32413477 14D AGCCAATCTT CTGCAATTTCCCAC/-------------- CTTTGGGCAA 3070 hom 123 het 39 0 42 1 CTGCAATTTCCCAC 1 0 68025 CASAVA_Build 13 32423525 1I AATTCACTGT -/A ACACTAAGCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 68026 CASAVA_Build 13 32443312 15D GGCCAGTAGG AAACCGTTGCTAGGA/--------------- AAAGATTGCT 3070 hom 148 het 53 0 50 7 AAACCGTTGCTAGGA 1 0 68027 CASAVA_Build 13 32447410 6I AACATATCTT ------/TTTTTA TTTTTATTTT 3070 hom 62 het 23 0 20 3 TTTTTA 2 3 68028 CASAVA_Build 13 32448553 1I ATTACAAAGA -/T TTAAAAGCAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 3 68029 CASAVA_Build 13 32449577 2I13M4I TGTGTGTATC --TGTGTTTCTGTGA----/TGTGTGTTTCTGTGAGTGT GTGTGTGTGT 3070 hom 71 het 42 0 22 28 N/A 0 0 68030 CASAVA_Build 13 32449705 2D GTGCGTGTAT GC/-- GCGTGTGTGT 3070 het 180 hom 39 2 26 11 GC 2 1 68031 CASAVA_Build 13 32452085 4D TACACTTCTA AGAC/---- AGTTGCTAAA 3070 het 3070 ref 50 24 20 8 AGAC 1 0 68032 CASAVA_Build 13 32452422 2D GAGCAGTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 179 hom 54 3 24 29 T 11 9 68033 CASAVA_Build 13 32461351 1D TTTTACTTCC T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 8 7 68034 CASAVA_Build 13 32466511 1D37M4D TTTTTATCAA GGTTTTTGAAAAATGATTTTAAGAAGCCATTGGAATCATTTT/-GTTTTTGAAAAATGATTTTAAGAAGCCATTGGAATCA---- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 40 2 32 18 N/A 0 0 68035 CASAVA_Build 13 32471744 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 hom 75 het 31 0 26 12 CTC 0 1 68036 CASAVA_Build 13 32473175 1I TGTTCACATT -/C ATGATTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 0 1 68037 CASAVA_Build 13 32474361 2D CAAGCAGCTC TA/-- TGTTATACAT 3070 hom 126 het 46 0 43 6 TA 1 0 68038 CASAVA_Build 13 32475122 12I GCTCAGTACT ------------/ATGCCTGGCACA GAGCAGATGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ATGCCTGGCACA 0 1 68039 CASAVA_Build 13 32477416 1D GCTGCAACAG T/- TGTAGGACAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 2 1 68040 CASAVA_Build 13 32484626 10I TTAAGTATTC ----------/TTCTTTTTCT TTCTTTTTCT 3070 hom 45 het 31 0 16 16 TTCTTTTTCT 1 2 68041 CASAVA_Build 13 32487835 1D CTAATCAAAG A/- TAGAGTGCTG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 1 0 68042 CASAVA_Build 13 32491245 1I GAATGCTCCA -/T TTTGCTGATG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 3 4 68043 CASAVA_Build 13 32491938 2I GAGGAGGGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 92 het 38 0 32 7 AG 6 7 68044 CASAVA_Build 13 32492686 4I CACATCGAAC ----/ACAT ACATCCCAAA 3070 hom 114 het 41 0 38 4 ACAT 1 2 68045 CASAVA_Build 13 32501139 3I TGCCTCTAGA ---/GAG GAGAACTGGG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 GAG 1 2 68046 CASAVA_Build 13 32502909 1I ATTATGCAGG -/A AATTAAACAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 2 3 68047 CASAVA_Build 13 32519981 1D TAGAGAAACC T/- TTTAATATCT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 4 3 68048 CASAVA_Build 13 32528777 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 1660 hom 14 het 7 0 6 1 A 17 14 68049 CASAVA_Build 13 32529929 5D AACTCCCTAA CTGAC/----- CTGACGTAGT 3070 hom 153 het 53 0 50 4 CTGAC 2 1 68050 CASAVA_Build 13 32535914 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 22 3 13 6 A 14 15 68051 CASAVA_Build 13 32549420 3I CAAAACAGAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 47 18 15 14 AAC 5 6 68052 CASAVA_Build 13 32552546 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 914 het 914 ref 36 20 3 14 T 12 11 68053 CASAVA_Build 13 32575056 1D GAAATTTAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 9 8 68054 CASAVA_Build 13 32584845 1I TGTTACTGAG -/A AAAAAAAACC 2560 het 2560 ref 30 12 10 8 A 8 9 68055 CASAVA_Build 13 32596855 1I CTCTAAGATT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 68056 CASAVA_Build 13 32597793 1I GCTTCAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 164 hom 34 1 30 3 A 9 10 68057 CASAVA_Build 13 32598059 13I ACATGTCTTG -------------/TTCAAATTAAATA TTCAAATTAA 3070 het 3070 ref 43 23 10 10 TTCAAATTAAATA 1 2 68058 CASAVA_Build 13 32599017 2I AAGTTCTAAC --/AT ATGCTTCTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AT 1 2 68059 CASAVA_Build 13 32600144 8D AGACAGATGT AGATGGAG/-------- AGATGGAGAG 3070 hom 93 het 36 0 32 6 AGATGGAG 2 1 68060 CASAVA_Build 13 32603573 1D AATCATATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 42 1 38 4 T 11 10 68061 CASAVA_Build 13 32605791 2I ATACTAAAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 32 1 15 16 A 14 16 68062 CASAVA_Build 13 32606110 1I TAACAATGAA -/T TAGTTTGTGA 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 T 1 2 68063 CASAVA_Build 13 32606354 3D GGCCATATTG GAA/--- GAAGAAGAAT 3070 het 2891 hom 34 9 16 9 GAA 4 3 68064 CASAVA_Build 13 32608300 1D TGCAGTCAAA G/- TGCTTGTTCA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 G 1 0 68065 CASAVA_Build 13 32611886 2I CTCCTATTCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 17 2 T 9 11 68066 CASAVA_Build 13 32616505 1D CTATGATGTC T/- TTGAAGTCTT 3070 het 3070 hom 59 24 26 9 T 3 2 68067 CASAVA_Build 13 32617672 1D CTTTTTATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 10 9 68068 CASAVA_Build 13 32623273 1I GAATTACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 A 9 10 68069 CASAVA_Build 13 32624554 1D TCAGTCATAC A/- AAAAAAAAAA 2018 het 2018 ref 58 39 7 13 A 15 14 68070 CASAVA_Build 13 32634894 1D ACTATCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 11 10 68071 CASAVA_Build 13 32640118 1D TTTACAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 29 1 26 2 T 11 10 68072 CASAVA_Build 13 32642187 1D TAATGGGTAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 9 8 68073 CASAVA_Build 13 32654056 1D AGATTTCCCT G/- TTTTCCCACA 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 G 1 0 68074 CASAVA_Build 13 32655849 1I GGAGGAACTT -/G GGAGAAGGAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 2 3 68075 CASAVA_Build 13 32666145 1D TTTCAGGTTG T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 7 6 68076 CASAVA_Build 13 32670206 2I ACTTAGGAGG --/CT GAGGCAGGAG 1217 het 732 hom 7 2 3 2 CT 0 1 68077 CASAVA_Build 13 32673182 4D AAATAAAAAT AAAC/---- AAATAAATAA 1811 het 816 hom 10 3 6 1 AAAC 1 0 68078 CASAVA_Build 13 32680226 1I AAATCCTTTT -/A AAAAAACCTC 3070 hom 63 het 28 0 20 8 A 6 7 68079 CASAVA_Build 13 32690451 1D AGTCAGACCC T/- TTGTTTTGGG 3070 het 3070 ref 55 25 20 10 T 3 2 68080 CASAVA_Build 13 32691951 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 25 1 18 6 A 13 14 68081 CASAVA_Build 13 32696526 4I GTAACAAATA ----/GCTC GCTCCCAAGT 3070 het 3070 ref 61 27 27 7 GCTC 1 2 68082 CASAVA_Build 13 32700578 1I ATTTACAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 T 10 11 68083 CASAVA_Build 13 32705905 1I CCTCTGGGGC -/T TTAGGGTTGC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 2 3 68084 CASAVA_Build 13 32719625 1I TGCCCTCTCA -/T TTTTTTGGAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 7 68085 CASAVA_Build 13 32749189 2I GCTTCTGAAA --/AG AAAAAAAAAG 3070 het 105 hom 21 2 10 9 AG 0 1 68086 CASAVA_Build 13 32759738 6I CGGCAGAAGC ------/GTGGAT TCGAATGGAG 3070 het 3070 ref 51 21 21 9 GTGGAT 0 1 68087 CASAVA_Build 13 32763136 1D TTAGATTGGC T/- TGTTACATGT 3070 het 3070 ref 59 27 25 7 T 2 1 68088 CASAVA_Build 13 32774025 1I GTTTCTTTTT -/C TTAGAAAGAC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 0 1 68089 CASAVA_Build 13 32779098 1D AAAAAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 30 0 23 7 A 11 10 68090 CASAVA_Build 13 32808116 16D TCATTCATTC ATTCATTCATTCATTA/---------------- ATTCATTCAC 3070 hom 105 het 41 0 34 11 ATTCATTCATTCATTA 1 0 68091 CASAVA_Build 13 32809487 4D AAGACACAGC TTAA/---- TTAAGACATT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TTAA 2 1 68092 CASAVA_Build 13 32812592 1I AAGAAATTTG -/A AAATGTTTCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 3 4 68093 CASAVA_Build 13 32823084 3D CTTCACAACT ACA/--- ACAACAACAA 3070 hom 96 het 36 0 32 6 ACA 5 4 68094 CASAVA_Build 13 32825962 4I CCAGACATTG ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 108 het 46 0 37 9 TGTT 3 4 68095 CASAVA_Build 13 32831273 11D CCTTCCACAC TGTGGAAGCGT/----------- TGTTTTTCGC 3070 hom 33 het 9 0 11 4 TGTGGAAGCGT 1 0 68096 CASAVA_Build 13 32833471 5D AGAATATAAT ATATA/----- ATACATGTAA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 ATATA 1 0 68097 CASAVA_Build 13 32837234 2I CCTTCCACAC --/TG ATGTGAGATG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 TG 0 1 68098 CASAVA_Build 13 33018788 1I GTCGTATTAA -/T TTTTTTTTTT 1563 het 1563 ref 27 17 5 5 T 13 14 68099 CASAVA_Build 13 33055994 1I GCCTATAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 10 11 68100 CASAVA_Build 13 33129421 1I ACAAACAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 8 9 68101 CASAVA_Build 13 33132321 1I TTTTTACTGA -/T TTTGTACTTG 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 3 4 68102 CASAVA_Build 13 33156749 4I CCACTGCATA ----/TTAG TTAGGGCAAA 2559 het 2559 ref 20 14 6 0 TTAG 1 2 68103 CASAVA_Build 13 33156877 1D GCTTTCTTCC A/- AAAAAAAATA 2157 het 2157 ref 22 11 7 4 A 9 8 68104 CASAVA_Build 13 33156938 1D ATTGGCAACC T/- TTTTTTTTTT 1643 het 1643 ref 21 7 6 9 T 12 11 68105 CASAVA_Build 13 33158039 4D TAGTAAACAA ACAC/---- ACACAATCAA 3070 het 3070 hom 57 25 28 6 AC 4 2 68106 CASAVA_Build 13 33159031 1I TACCTCCTGG -/A ACCCAGCTGC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 1 2 68107 CASAVA_Build 13 33165420 1D TTTATTTATT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 8 7 68108 CASAVA_Build 13 33170020 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 699 het 699 ref 13 4 2 7 A 12 13 68109 CASAVA_Build 13 33194416 4D TAATTAGACC TGTA/---- AATGGCTCTT 3070 het 3070 ref 41 24 13 7 TGTA 1 0 68110 CASAVA_Build 13 33199080 1I CAGAACTAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 9 10 68111 CASAVA_Build 13 33202115 1I GAGTATCTAA -/G GTGCTCCATA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 1 2 68112 CASAVA_Build 13 33211300 1D GATGAATCTC T/- GTATTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 1 0 68113 CASAVA_Build 13 33215998 1D AGGGAGAGAT A/- AGAGATGTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 2 1 68114 CASAVA_Build 13 33218195 9D TGATATGAAA CAGCAGCAG/--------- CAGCAGCAGC 3070 het 3070 hom 52 21 27 8 CAG 6 3 68115 CASAVA_Build 13 33235430 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 8 68116 CASAVA_Build 13 33242377 1D TATCCTGTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 8 68117 CASAVA_Build 13 33244091 2D TATGTATGTG TA/-- TATGTATCTA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TA 2 1 68118 CASAVA_Build 13 33246807 1I CGAGGTCAGG -/A GATCGAGACC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 0 1 68119 CASAVA_Build 13 33253464 1I CATGCCACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 34 0 30 7 T 9 10 68120 CASAVA_Build 13 33254729 2I TTGTTAAGAC --/TT ATATACAGGG 3070 hom 116 het 43 0 38 5 T 0 2 68121 CASAVA_Build 13 33258265 1D ATAGATCAAT G/- GGACAGAACA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 G 3 2 68122 CASAVA_Build 13 33259751 1D TTTAGAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 43 0 37 8 T 11 10 68123 CASAVA_Build 13 33261027 2I TATTATCCTC --/TA TGAGTCTCAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TA 0 1 68124 CASAVA_Build 13 33261773 1D TTTCCCTTAA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 7 6 68125 CASAVA_Build 13 33263279 2D AGAGGTGGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 12 10 68126 CASAVA_Build 13 33263565 1I AACTGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 10 11 68127 CASAVA_Build 13 33266177 6D TACACAGTCT TATTTA/------ TAGGTATTTA 3070 hom 117 het 41 0 37 5 TATTTA 1 0 68128 CASAVA_Build 13 33269457 3D TCCACAAAAG CAA/--- CAACAACAAC 2435 het 2435 ref 21 8 9 5 CAA 7 6 68129 CASAVA_Build 13 33269961 1I AATTGCATCT -/G GGTAGAGGAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 2 3 68130 CASAVA_Build 13 33270610 2D TTGTTTATTT TA/-- TTTTTTTTGA 3070 hom 42 het 22 0 19 5 TA 1 0 68131 CASAVA_Build 13 33272595 1I GAATGATCTT -/A ATAAAAGGTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 1 2 68132 CASAVA_Build 13 33275448 1D TTCAACCCTA T/- TTGTCACCTC 3070 hom 72 het 33 0 23 12 T 3 2 68133 CASAVA_Build 13 33276363 4I ACAAACAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 AAAC 3 4 68134 CASAVA_Build 13 33281260 1D TGTACATACC T/- CATAGAATTA 3070 hom 114 het 45 0 39 8 T 1 0 68135 CASAVA_Build 13 33312735 1D TTTTGTGTGT G/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 1 0 68136 CASAVA_Build 13 33312853 1I AAACAAAAAA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 7 8 68137 CASAVA_Build 13 33315343 1I TTTGCTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 28 1 21 6 T 11 12 68138 CASAVA_Build 13 33317514 2I TCTATATCTC --/TA TCTCTACCTT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 TA 0 1 68139 CASAVA_Build 13 33318883 2D GAGTGCTTTA GC/-- CCATGATGAT 3070 hom 105 het 39 0 34 5 GC 1 0 68140 CASAVA_Build 13 33322603 1I ATGAAGATGA -/T TTTTTAAATT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 5 6 68141 CASAVA_Build 13 33327080 2I24M4I GTCAAAACTT --AAGTCATCCTGATTTCCCCATAAT----/AAAAGTCATCCTGATTTCCCCATAATGCTA GCTCTAATCA 3070 hom 120 het 36 0 39 6 N/A 0 0 68142 CASAVA_Build 13 33329727 6I TGGGGCTAAC ------/ATTAAA ATTAAAATTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATTAAA 1 2 68143 CASAVA_Build 13 33332371 1D77M1D TGTGTTGCAC TTTTTTTTTTTTCTTTTGAGAAGGAAAAAAGCCAGGAGAGAAACTTGAAGTAGCAAAATGGGGACTCAGGAAAACCAAG/-TTTTTTTTTTTCTTTTGAGAAGGAAAAAAGCCAGGAGAGAAACTTGAAGTAGCAAAATGGGGACTCAGGAAAACCAA- GGAAGGAGGA 3070 het 1002 hom 38 4 29 38 N/A 0 0 68144 CASAVA_Build 13 33335416 5D TCAGGCAGTT AAGAA/----- AAGACTGTTT 3070 hom 166 het 57 0 56 2 AAGAA 1 0 68145 CASAVA_Build 13 33337620 3I AAGAAAAGAG ---/TAA TAACAGGACT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TAA 1 2 68146 CASAVA_Build 13 33340572 1I AGAGGCTACT -/A AACTTTGCAC 3070 hom 114 het 46 0 37 9 A 2 3 68147 CASAVA_Build 13 33341532 1I ACTGTGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 37 2 27 8 T 11 12 68148 CASAVA_Build 13 33358187 2D GACATTCAAG GA/-- GAGTCTTCTC 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 GA 2 1 68149 CASAVA_Build 13 33391188 2I TTTATTCTAT --/AG AGAGTAATTG 3070 hom 101 het 36 0 34 2 AG 2 3 68150 CASAVA_Build 13 33399167 4I AATATTTTGA ----/TAAT TAATAGATTA 1908 het 1908 ref 31 19 4 8 TAAT 1 2 68151 CASAVA_Build 13 33424587 1I AAAAGTTCAA -/T TTTATTAGAC 3070 hom 103 het 40 0 35 5 T 3 4 68152 CASAVA_Build 13 33432818 4I AATGACAAAT ----/AGAC AGCCCTGGGA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AGAC 0 1 68153 CASAVA_Build 13 33435320 3I TAAAATATTA ---/TAT TAAGTAAATT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TAT 0 1 68154 CASAVA_Build 13 33437129 1D CAGAAGTTGG A/- AAAGTTGGAA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 4 3 68155 CASAVA_Build 13 33439945 1D TCTTAAACTT G/- GTTTAAACAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 G 2 1 68156 CASAVA_Build 13 33444095 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 8 7 68157 CASAVA_Build 13 33450604 1D CCCCGAGACT C/- CCTCATGGTT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 C 3 2 68158 CASAVA_Build 13 33462832 3I ATAATAAATT ---/AAA AAAAAACAAA 2879 het 772 hom 12 4 6 2 A 6 9 68159 CASAVA_Build 13 33463219 3I TAAAATTGAA ---/AAG AAACACATTC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 AAG 0 1 68160 CASAVA_Build 13 33475551 1D TCCTGCTTTG T/- TGAATTATTG 3070 hom 126 het 47 0 42 6 T 2 1 68161 CASAVA_Build 13 33477452 1I ACTCAGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 10 11 68162 CASAVA_Build 13 33481856 1D CATAATGAAG C/- CTCCATAGAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 C 2 1 68163 CASAVA_Build 13 33486629 1D AGATGTCCAG A/- AAACGTTTAA 3070 het 3070 ref 45 26 17 3 A 4 3 68164 CASAVA_Build 13 33489660 1D CTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTCC 1323 het 1323 ref 34 25 4 6 T 9 8 68165 CASAVA_Build 13 33499996 1I ATGTAACTCC -/T TTTTCTCTCA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 4 5 68166 CASAVA_Build 13 33500255 2D ATGGAAAAAC TG/-- TGTCATTTTT 3070 het 3070 ref 33 21 11 3 TG 2 1 68167 CASAVA_Build 13 33500625 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1656 het 846 hom 9 2 5 2 T 11 12 68168 CASAVA_Build 13 33501103 1I TAAGATAAAT -/A AAAAAAATAT 3070 het 2943 hom 23 6 10 7 A 7 8 68169 CASAVA_Build 13 33501905 4I AAGTGGAAAT ----/AGTG AGCAGGACAG 3070 hom 125 het 50 0 41 9 AGTG 0 1 68170 CASAVA_Build 13 33510901 2D GTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 134 hom 33 1 20 13 T 13 11 68171 CASAVA_Build 13 33510913 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTGTTCTGAA 3070 het 98 hom 31 2 24 7 TG 1 0 68172 CASAVA_Build 13 33511755 2I TCTCCTCCTC --/TT CTTCTTCTTC 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 T 0 2 68173 CASAVA_Build 13 33519459 1D TCAGGAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 T 13 12 68174 CASAVA_Build 13 33520371 3D GGCCAAGGTC AGG/--- AGATCAAGAA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 AGG 1 0 68175 CASAVA_Build 13 33521048 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 170 hom 32 3 15 14 A 16 15 68176 CASAVA_Build 13 33527867 1D TAAAAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 8 A 11 10 68177 CASAVA_Build 13 33533272 1I AAGGTTAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 9 10 68178 CASAVA_Build 13 33543316 20I ACTCTCTGGT --------------------/GGTTTGTTTGCAATCTCTAG GGTTCCCTGC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 GGTTTGTTTGCAATCTCTAG 0 1 68179 CASAVA_Build 13 33550885 2D TGGGTGTGAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 76 32 27 18 TG 8 7 68180 CASAVA_Build 13 33574722 1I AGAAGAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 10 11 68181 CASAVA_Build 13 33608098 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAACTA 3070 hom 19 het 47 1 41 5 A 7 8 68182 CASAVA_Build 13 33622839 2I AGCTAAATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 11 13 68183 CASAVA_Build 13 33628614 2D GAACTCTAAG CT/-- CTTTCTCCAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 CT 2 1 68184 CASAVA_Build 13 33629497 2D AAATGTCATT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 42 12 19 11 AG 6 5 68185 CASAVA_Build 13 33634027 2I AGCTGAATAA --/GT GTCTAAAGGA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 GT 1 2 68186 CASAVA_Build 13 33648847 1I ACGGCAGACT -/C CACTTGGCTG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 C 1 2 68187 CASAVA_Build 13 33650678 1D59M1I TATGCCCCCC TATCCCAACACATCCACAGAAAAGAAGTTTTCCACAGCCTCACTGGCCATTTTAATTAAA-/-ATCCCAACACATCCACAGAAAAGAAGTTTTCCACAGCCTCACTGGCCATTTTAATTAAAG GTAAAATACA 3070 het 3070 hom 29 26 26 4 N/A 0 0 68188 CASAVA_Build 13 33656464 1I AAAGAATAAC -/A AGAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 51 27 16 8 A 1 2 68189 CASAVA_Build 13 33662537 1D TATTTTTATG T/- GGGGATTTGA 3070 het 3070 ref 38 18 15 7 T 1 0 68190 CASAVA_Build 13 33681745 2I ACACAGCCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 TC 7 8 68191 CASAVA_Build 13 33692430 1D AAAGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 13 12 68192 CASAVA_Build 13 33696897 4I GGTAATCAGG ----/AGCT AGCTCAGTGT 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 AGCT 1 2 68193 CASAVA_Build 13 33704308 1I CTGATGGTAG -/T TTCTTTTGCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 2 3 68194 CASAVA_Build 13 33708626 1I GCTTATTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 10 68195 CASAVA_Build 13 33712036 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 30 2 24 4 T 12 11 68196 CASAVA_Build 13 33722684 1D CACACTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 691 hom 32 4 17 11 T 17 16 68197 CASAVA_Build 13 33731126 2D GCTGCAAGAT GA/-- GAAAGAAGTG 3070 hom 99 het 36 0 32 6 GA 2 1 68198 CASAVA_Build 13 33735553 1D ACTAAAAAAA T/- ATACAAAAAA 1378 hom 12 het 6 0 5 1 T 1 0 68199 CASAVA_Build 13 33744402 2D GTTTTTTTTC AT/-- ATGTTTGTTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AT 2 1 68200 CASAVA_Build 13 33746509 1I ACGATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1178 het 1178 ref 36 18 6 12 T 11 12 68201 CASAVA_Build 13 33746676 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1051 het 1051 ref 34 22 4 8 T 13 14 68202 CASAVA_Build 13 33747090 1I GAACCTGAGA -/T TTTTTTTTTT 919 het 919 ref 30 14 3 13 T 13 14 68203 CASAVA_Build 13 33747885 2D AGCACAGTAT GA/-- GAGTGTGGAG 3070 het 3070 ref 49 23 18 10 GA 2 1 68204 CASAVA_Build 13 33755744 2I TATTTGTCTG --/AA AAAGACTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 3 5 68205 CASAVA_Build 13 33757056 1D ATCAAACAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 51 het 26 0 18 8 A 9 8 68206 CASAVA_Build 13 33777638 1I TAGACAAGAG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 6 7 68207 CASAVA_Build 13 33782580 2I CCACTCTGTT --/AG AGTTTGAAAA 3070 het 3070 hom 56 15 34 7 AG 1 2 68208 CASAVA_Build 13 33785285 2I ATGGACACAG --/AT ATATATATCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AT 4 5 68209 CASAVA_Build 13 33789466 1I ATTTGGAAAT -/G GCGAAGGTCA 3070 het 1843 hom 20 5 10 5 G 1 2 68210 CASAVA_Build 13 33798153 4D AAGCTTGAGA CTAT/---- CTGTCTACTT 3070 hom 151 het 54 0 51 5 CTAT 1 0 68211 CASAVA_Build 13 33824736 2I TCATATATTT --/TA TATATATATA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TA 8 9 68212 CASAVA_Build 13 33825068 1D GTCAGGGCTG C/- CCCCTTTAGA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 C 5 4 68213 CASAVA_Build 13 33830248 1I TGCAGGCCCC -/A ACCCAGACCT 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 A 1 2 68214 CASAVA_Build 13 33835217 1I CTGTTAAATC -/T TTGCAGACAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 3 68215 CASAVA_Build 13 33835304 5D GCAAAGAGTC ACCCT/----- ACCCTCGACA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 ACCCT 2 1 68216 CASAVA_Build 13 33835471 3D AAACGCCAGG CTC/--- CTGCTTGAGG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 CTC 1 0 68217 CASAVA_Build 13 33842844 2I TCCCTTTAGA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 247 hom 20 1 16 3 TC 7 8 68218 CASAVA_Build 13 33845606 1D GAAATAAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 2489 hom 23 6 12 5 A 8 7 68219 CASAVA_Build 13 33846904 3D AAAAAAAAAA AAG/--- ATTAAATGAG 3070 het 829 hom 35 8 12 17 AAG 1 0 68220 CASAVA_Build 13 33855976 15I AGTGTGGCTT ---------------/GGTGATACACAGGCA GAAATAGCAC 3070 hom 63 het 24 0 22 3 GGTGATACACAGGCA 0 1 68221 CASAVA_Build 13 33861668 1I TTCTCTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 423 hom 35 1 27 7 T 9 10 68222 CASAVA_Build 13 33874346 1D10M1D TATCTACCAC AAAAAATTGAGA/-AAAAATTGAG- AAAAAATGGC 3070 hom 81 het 27 0 28 1 N/A 0 0 68223 CASAVA_Build 13 33875095 1D GTTTAACATT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 6 68224 CASAVA_Build 13 33875829 1D ACAAAAAAAA G/- ATCAGTATTT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 G 1 0 68225 CASAVA_Build 13 33881235 1I AGCCCCCCCC -/A CGCCCAGTCT 3070 hom 78 het 33 0 25 8 A 0 1 68226 CASAVA_Build 13 33886719 1D CGGGGCCCAC T/- TTATCCCCCG 3070 het 3070 hom 41 22 18 1 T 3 2 68227 CASAVA_Build 13 33907622 1D AGGACATGAA G/- GGTCCTGGGG 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 G 3 2 68228 CASAVA_Build 13 33929818 2D CTCAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 14 12 68229 CASAVA_Build 13 33946968 1D AGGTCATGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 9 8 68230 CASAVA_Build 13 33961564 1D ACCCATCTCC A/- GAACTTTTCC 3070 hom 102 het 40 0 35 7 A 1 0 68231 CASAVA_Build 13 33962442 2D TGTTATCTTG TT/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 123 het 48 0 42 8 T 10 8 68232 CASAVA_Build 13 33978352 11D GAAGGAAGGA GGGAGGGAGGG/----------- AGGGAGGGAG 1068 hom 7 het 3 0 3 0 GGGAGGGAGGG 1 0 68233 CASAVA_Build 13 34004870 1D AGATTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 A 12 11 68234 CASAVA_Build 13 34007763 9I TTGCAAAAAA ---------/ATAAAAAAC ATAAAAAACA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 ATAAAAAAC 1 2 68235 CASAVA_Build 13 34011073 1D CCCCCTTGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 10 9 68236 CASAVA_Build 13 34011221 1D AAAAAAACTG T/- TAAGTGTGAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 2 1 68237 CASAVA_Build 13 34011412 1D TTTTCAACTT A/- AAAGTTCATT 3070 het 2129 hom 17 6 8 3 A 4 3 68238 CASAVA_Build 13 34011523 4I AGTTGCTTCA ----/ATAG ATTATCCCTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 ATAG 0 1 68239 CASAVA_Build 13 34013850 1D GGTTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 835 hom 22 3 13 6 A 17 16 68240 CASAVA_Build 13 34015539 1D TTATTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 A 10 9 68241 CASAVA_Build 13 34023250 1D CCTTGCCAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 27 het 14 0 9 5 A 10 9 68242 CASAVA_Build 13 34025163 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 24 0 21 3 A 12 11 68243 CASAVA_Build 13 34027324 1I AGATTATATG -/T TCTTCTTTGT 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 T 1 2 68244 CASAVA_Build 13 34029449 1D TGGTGTAGGA G/- GCAGAGGAGC 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 G 2 1 68245 CASAVA_Build 13 34042611 3D ATATTTTAAT TAA/--- TAATCAAGGA 3070 hom 57 het 20 0 20 3 TAA 2 1 68246 CASAVA_Build 13 34049482 1I CACTGTCTCC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 89 het 39 0 30 9 A 8 9 68247 CASAVA_Build 13 34050631 2D GTCAAAAACT CA/-- CACTTTCAAA 3070 het 3070 ref 53 29 21 3 CA 2 1 68248 CASAVA_Build 13 34054842 1D ATTTCCCTCT C/- CCTTTCTCCC 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 C 3 2 68249 CASAVA_Build 13 34065388 2D ATTCTCTCAA AC/-- ACTTTAGCAT 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 AC 2 1 68250 CASAVA_Build 13 34065540 1D TTATTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2401 hom 42 12 15 16 T 15 14 68251 CASAVA_Build 13 34078451 3I1M2D TAATCCCTAT ---AAT/TGCA-- ATGGTACTTG 3070 hom 105 het 40 0 35 6 N/A 0 0 68252 CASAVA_Build 13 34095151 1D CACCAAATTC T/- TTTTTTTTTT 1497 het 120 hom 13 1 6 6 T 19 18 68253 CASAVA_Build 13 34097953 1D ATTTACTTTC T/- TTTTTTTTTC 805 het 805 ref 53 42 3 8 T 10 9 68254 CASAVA_Build 13 34108901 1I CATGTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 12 13 68255 CASAVA_Build 13 34110616 2I AACAAATCAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 104 het 44 0 35 9 A 9 11 68256 CASAVA_Build 13 34117756 4I TTCTGAAAAC ----/AGAT AGACATTTAT 3070 het 3070 ref 59 30 26 3 AGAT 0 1 68257 CASAVA_Build 13 34120537 4I CAAGTTGGTA ----/ACTG ACTATGTCTA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 ACTG 0 1 68258 CASAVA_Build 13 34123848 1D AAGCATTCGG T/- TTTTTGTATT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 6 5 68259 CASAVA_Build 13 34126650 1I GGTCCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 10 11 68260 CASAVA_Build 13 34130147 1I CTGTGTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 11 12 68261 CASAVA_Build 13 34135310 1D CACCCCCCCC G/- CCCCCCGACA 1653 het 1198 hom 16 4 5 7 G 1 0 68262 CASAVA_Build 13 34142303 4D TTATTAATAA TACT/---- TAATAATACT 2359 het 2358 ref 14 7 6 1 TACT 1 0 68263 CASAVA_Build 13 34149414 1D CCTTGGGCCC A/- TATTAATTTG 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 1 0 68264 CASAVA_Build 13 34161063 2D AATTGTTGCT AA/-- GTTATCTAAT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 2 0 68265 CASAVA_Build 13 34175235 1I AAATAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 13 14 68266 CASAVA_Build 13 34179008 2D AAAAAGAATC AT/-- AGACAAATAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AT 1 0 68267 CASAVA_Build 13 34182593 1I TATGTGGAGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 53 22 26 5 A 7 8 68268 CASAVA_Build 13 34186900 1I CATTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 A 10 11 68269 CASAVA_Build 13 34190287 1I ATTAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 10 11 68270 CASAVA_Build 13 34191124 5D GTAGGTAGGA TTTAT/----- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 TTTAT 2 1 68271 CASAVA_Build 13 34193359 1D TCATGCACAG T/- TTTTTCATAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 6 5 68272 CASAVA_Build 13 34196320 1I ACTCTACTGA -/T TTTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 T 6 7 68273 CASAVA_Build 13 34197003 1D GCTCCGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 35 2 24 9 A 15 14 68274 CASAVA_Build 13 34197089 1I GTAAACAAAC -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 A 7 8 68275 CASAVA_Build 13 34207545 1D TGTTAACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 A 13 12 68276 CASAVA_Build 13 34211206 1I CAAGCTGTAC -/T TGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 24 1 T 1 2 68277 CASAVA_Build 13 34212136 11D CTTCAGCCAA AGAAACATAGT/----------- AGGTCGGTTC 3070 het 3070 ref 36 16 16 8 AGAAACATAGT 1 0 68278 CASAVA_Build 13 34215529 1I TTCCTAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 263 hom 33 1 23 9 T 10 11 68279 CASAVA_Build 13 34216967 1I ATGCTCATTC -/A GGGGCATTGT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 0 1 68280 CASAVA_Build 13 34217573 5D TTTCCACCTG TTTAC/----- TTTAAGTTTA 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 TTTAC 1 0 68281 CASAVA_Build 13 34218472 4D TGTCTTTGAG GTCT/---- GTTTTTCTTT 2391 het 2391 ref 17 11 5 2 GTCT 1 0 68282 CASAVA_Build 13 34229683 7I6M13I CTTTCTCCTG -------GATACA-------------/ACTTGTTCACACAAGTACTCCTAGAT TATTAATATC 3070 hom 114 het 34 0 34 6 N/A 0 0 68283 CASAVA_Build 13 34248324 1D ATGAAATTGC T/- TTTTTTTTTT 994 het 994 ref 38 26 4 8 T 12 11 68284 CASAVA_Build 13 34260479 1I GCCAACCTAG -/T TTATAGGCAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 3 68285 CASAVA_Build 13 34264266 8D TGGCAGAAGG GCAGCAGA/-------- GCAGCAGAGC 3070 het 3070 ref 46 17 14 17 GCAGCAGA 2 1 68286 CASAVA_Build 13 34265371 1D AGGGGTCATG A/- AGCCCTGGCA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 A 2 1 68287 CASAVA_Build 13 34266930 1D TGGTTTGGCT G/- TGTCCCCACC 3070 het 3070 ref 38 15 18 5 G 1 0 68288 CASAVA_Build 13 34268384 5D AGAATGGTAC ATCCA/----- GTGATAGCTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 7 ATCCA 1 0 68289 CASAVA_Build 13 34271401 2I GCTGACTCTC --/TT TTCGGACTCA 3070 het 1884 hom 23 4 10 9 T 2 4 68290 CASAVA_Build 13 34275481 1D TATTGCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 19 1 15 3 A 13 12 68291 CASAVA_Build 13 34275557 1I AAACTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 T 10 11 68292 CASAVA_Build 13 34277801 1D TCTTAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 11 10 68293 CASAVA_Build 13 34279995 1D TTTGGTTTAA T/- AGGTAGGTAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 T 1 0 68294 CASAVA_Build 13 34289285 1I CACTTACCAG -/A AAAAAAAAAA 2782 het 2782 ref 43 19 9 15 A 12 13 68295 CASAVA_Build 13 34293342 1I TTATCTTAAT -/G GCCAACAATG 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 G 1 2 68296 CASAVA_Build 13 34293884 4D ACAATAAATC AAAT/---- AAATAACAGT 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 AAAT 2 1 68297 CASAVA_Build 13 34301104 1I TGAGCTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 T 10 11 68298 CASAVA_Build 13 34319771 1D GTTGTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 47 1 42 4 T 12 11 68299 CASAVA_Build 13 34325966 2D GTAATGTATT AC/-- ACAGTATTTG 3070 hom 55 het 26 0 18 9 AC 2 1 68300 CASAVA_Build 13 34330792 2D TTTTTAGTAA AC/-- ACAGAGTTTC 2730 het 2730 ref 19 10 7 3 AC 2 1 68301 CASAVA_Build 13 34395015 2D AGCAATGAAG TC/-- TCTCTCTGGA 3070 hom 111 het 42 0 38 9 TC 4 3 68302 CASAVA_Build 13 34413496 2I TTTTTGTCTC --/TT GTATCTGTGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 2 68303 CASAVA_Build 13 34423340 2D ATGATATAAC AT/-- GTGGCAACAA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 AT 1 0 68304 CASAVA_Build 13 34431934 3D AGTCAGAGAT ATC/--- ATAATGTCAT 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 ATC 1 0 68305 CASAVA_Build 13 34449961 1D TTTAAAGTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 10 9 68306 CASAVA_Build 13 34451949 3D CATACAGATA TTC/--- TTCTGTGTTT 3070 het 3070 ref 28 11 11 9 TTC 2 1 68307 CASAVA_Build 13 34471946 1I AGGTAACTTG -/C ATAAGGTTAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 C 0 1 68308 CASAVA_Build 13 34477354 1D ACAGGGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 26 13 14 T 15 14 68309 CASAVA_Build 13 34479220 1D GTAGATGTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 68310 CASAVA_Build 13 34488431 3I ACATGTTAAA ---/ATG ATGAGGATAA 3070 hom 120 het 50 0 41 9 ATG 1 2 68311 CASAVA_Build 13 34496309 1D AAGGATGTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 T 9 8 68312 CASAVA_Build 13 34511405 1I CTCAGAACTG -/T TTTTCTATCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 4 5 68313 CASAVA_Build 13 34519955 31I TATTTGAGGA -------------------------------/ACAGATTAATTTTAAAATCATAATGGGTAAT TATCTTTTAT 3070 hom 39 het 12 0 14 1 ACAGATTAATTTTAAAATCATAATGGGTAAT 0 1 68314 CASAVA_Build 13 34522243 4D TATTTACTTA TAAC/---- TAACCTTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 12 2 TAAC 2 1 68315 CASAVA_Build 13 34532852 1D ATTAAAAAGC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 9 8 68316 CASAVA_Build 13 34542703 1I AGGTATTCAC -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 6 7 68317 CASAVA_Build 13 34566795 3D AGTGAAATCA ATT/--- ATTTCTGCTA 3070 het 3070 ref 45 35 7 5 ATT 2 1 68318 CASAVA_Build 13 34570805 1I7M1I7M1D TTCTCTTAAG -TTTTCTA-AGTAGTAC/TTTTTCTATAGTAGTA- CCCCTTTATT 2837 het 2837 ref 32 29 6 0 N/A 0 0 68319 CASAVA_Build 13 34576869 1D ATGAGAGGCC T/- TTTTATTAAT 1445 het 1445 ref 51 44 4 3 T 5 4 68320 CASAVA_Build 13 34581733 4D GAGATCAAAA TATT/---- TATAAGCAGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 TATT 1 0 68321 CASAVA_Build 13 34603000 2D GAAAATAGAA AT/-- ATATATATCT 3070 het 3070 ref 32 20 8 14 AT 5 4 68322 CASAVA_Build 13 34627169 4D TGGGAGACTT AGGC/---- AGGAGGATCA 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 AGGC 1 0 68323 CASAVA_Build 13 34645260 1I TTTTATGTTT -/A AAAATATTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 4 5 68324 CASAVA_Build 13 34657490 1I ATGGAACAGC -/A ACTTTTGGAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 2 68325 CASAVA_Build 13 34673145 4I GTTCTTATTA ----/CTTT CTATTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CTTT 0 1 68326 CASAVA_Build 13 34700512 1D AGTAATTCTC T/- TTTTTTTTTT 1173 het 1173 ref 36 25 3 8 T 13 12 68327 CASAVA_Build 13 34721517 3D TGTTAAGAGC TTA/--- TTATTCAGAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 TTA 2 1 68328 CASAVA_Build 13 34736748 1D ATCAATAAAT G/- GTGATACATC 3070 het 3070 ref 64 34 26 5 G 2 1 68329 CASAVA_Build 13 34748143 1D ATAATAATTT A/- AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 A 7 6 68330 CASAVA_Build 13 34797008 4D GTGTGGAATC CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 46 18 17 12 CAAA 4 3 68331 CASAVA_Build 13 34801956 15I AAATTGTGTC ---------------/TCAATAAACCAGACT TTAAAAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TCAATAAACCAGACT 0 1 68332 CASAVA_Build 13 34813042 3I CTGATTCTAA ---/AAT AATATGGAAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 AAT 1 2 68333 CASAVA_Build 13 34829319 7I AGTTTTGATA -------/AAATATT CTTTCCACAT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 AAATATT 0 1 68334 CASAVA_Build 13 34830855 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 964 hom 10 2 7 1 A 11 12 68335 CASAVA_Build 13 34831078 2I ATTACAAAGA --/CT CTCTGGGCTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 CT 2 3 68336 CASAVA_Build 13 34831647 1I CTATTCTACC -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 53 28 15 10 A 7 8 68337 CASAVA_Build 13 34835129 1D GAATATTCTC A/- TGCAGTCTAT 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 A 1 0 68338 CASAVA_Build 13 34838843 1D GGTATTCAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 10 9 68339 CASAVA_Build 13 34839692 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2563 hom 33 9 15 9 T 12 11 68340 CASAVA_Build 13 34841262 3I CGGTTTCATG ---/CTT CTGCAGATGG 3070 het 3070 ref 34 11 8 15 CTT 0 1 68341 CASAVA_Build 13 34843048 1I CAGTTGGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 10 11 68342 CASAVA_Build 13 34845694 3I ATACAAAAAT ---/TGC TAGCCGGGCA 3070 het 1782 hom 20 6 9 5 TGC 0 1 68343 CASAVA_Build 13 34846341 1I GATTTCAGTA -/T TTTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 6 7 68344 CASAVA_Build 13 34851848 1I TCAGGATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1230 hom 37 3 29 5 T 13 14 68345 CASAVA_Build 13 34852362 3I4M1D CAGGTGAATC ---ACCTG/AAGACCT- AGGTCAGGAG 2705 het 2705 ref 17 10 6 1 N/A 0 0 68346 CASAVA_Build 13 34861083 1D GAAACCCCTA C/- CTATATTTCT 3070 het 3070 hom 22 10 11 3 C 2 1 68347 CASAVA_Build 13 34864622 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 12 11 68348 CASAVA_Build 13 34872158 3D TAAAACAGTT GTA/--- GTAACATCAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 GTA 2 1 68349 CASAVA_Build 13 34876159 2D ACTGGCCATC AG/-- AGAAATGCAA 2421 het 2421 ref 17 9 5 3 AG 2 1 68350 CASAVA_Build 13 34878435 1D CAGCCAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 31 4 22 7 T 14 13 68351 CASAVA_Build 13 34879077 1I TGTTTATGGG -/T TTTTTTTTTC 1195 het 1195 ref 22 9 5 8 T 9 10 68352 CASAVA_Build 13 34880816 1I CAACCCAATT -/A AAAAATGGGA 3070 hom 121 het 47 0 41 6 A 5 6 68353 CASAVA_Build 13 34886373 1D ACAGTTACTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 8 7 68354 CASAVA_Build 13 34894234 1I TGTTTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 17 10 G 0 1 68355 CASAVA_Build 13 34894251 4D TTTTAGATTC TTCG/---- TTCTTTCACA 680 het 364 hom 25 2 3 21 TTCG 1 0 68356 CASAVA_Build 13 34919628 2I TACAGAGCTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 TA 7 8 68357 CASAVA_Build 13 34937961 1I AATGCAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 T 12 13 68358 CASAVA_Build 13 34940239 4I CCTGAAAATG ----/ATTA ATTTACACCC 3070 hom 33 het 14 0 10 4 ATTA 0 1 68359 CASAVA_Build 13 34962887 1I TACTGTATGT -/A ACCTTCATCT 3070 hom 144 het 51 0 48 3 A 1 2 68360 CASAVA_Build 13 34972782 1D CTTGAGCATT C/- ATTATTTTTG 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 C 1 0 68361 CASAVA_Build 13 34987887 1D TAGTAACTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 35 0 23 12 T 12 11 68362 CASAVA_Build 13 34990927 2D GGTCAGAGAG AA/-- TGTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 A 2 0 68363 CASAVA_Build 13 34993074 1I TTCATTGAGG -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 6 7 68364 CASAVA_Build 13 35001256 1I GATTCACAAT -/A ACCCTTTGAG 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 A 1 2 68365 CASAVA_Build 13 35009603 1D TAATGAGAAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 8 7 68366 CASAVA_Build 13 35010620 1I ACATAACAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 57 26 23 8 A 9 10 68367 CASAVA_Build 13 35014290 1D TGTTTTGACA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 36 hom 20 1 13 6 C 10 9 68368 CASAVA_Build 13 35018195 4I TTAAACAAAC ----/AAAT ATATATGGAG 3070 het 3070 hom 56 21 26 9 AAAT 0 1 68369 CASAVA_Build 13 35024559 1I AAGATTAAAC -/T TAAGATATTA 3070 het 3070 hom 52 18 25 9 T 1 2 68370 CASAVA_Build 13 35032258 21D CCCCATTTTA CAGAGATGAGGTAGAGAGTAG/--------------------- CTAAATAACT 2013 het 2013 ref 30 27 6 4 CAGAGATGAGGTAGAGAGTAG 1 0 68371 CASAVA_Build 13 35033076 1D TGATCTTTGG T/- TCCCTACTGC 3070 het 3070 hom 54 23 22 9 T 2 1 68372 CASAVA_Build 13 35036014 1D AATAGCATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 T 10 9 68373 CASAVA_Build 13 35038499 4D CACCATCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 AAAT 5 4 68374 CASAVA_Build 13 35043886 1I TAATAAAATA -/T TTTTAATTCA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 4 5 68375 CASAVA_Build 13 35046895 1D TGCCAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2502 hom 30 7 19 4 T 15 14 68376 CASAVA_Build 13 35056642 1I ATTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2803 het 2740 hom 23 9 8 7 T 13 14 68377 CASAVA_Build 13 35057114 1D CCTTTCTCAC A/- AATGAGGCAC 1337 het 1337 ref 22 16 4 2 A 3 2 68378 CASAVA_Build 13 35057552 3I CTATTGCTAA ---/TCT TCTCTCCTTG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TCT 1 2 68379 CASAVA_Build 13 35073317 1D GCATCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 15 14 68380 CASAVA_Build 13 35078058 1D TTTATCAAGT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 A 8 7 68381 CASAVA_Build 13 35079896 1D CATTTAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 91 het 36 0 31 5 A 10 9 68382 CASAVA_Build 13 35080962 1I AGGCACTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 8 9 68383 CASAVA_Build 13 35082633 1D ATCTATATCC A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 A 8 7 68384 CASAVA_Build 13 35090669 8I GTTATGTTTC --------/ACTGAAGA GCTGTGAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ACTGAAGA 0 1 68385 CASAVA_Build 13 35092703 1D TAAGTACTTT G/- CCTTTTTACC 3070 het 3070 hom 52 22 26 5 G 1 0 68386 CASAVA_Build 13 35093870 1D TTCCTTCCTC T/- TGTGATCATC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 2 1 68387 CASAVA_Build 13 35102198 5D CAAAATAAAA TAAAT/----- TAAATAAATT 2951 het 2298 hom 18 8 10 0 TAAAT 2 1 68388 CASAVA_Build 13 35122052 6D AAAAAAGTGT ACTGGG/------ ACTGGGATTA 3070 hom 93 het 36 0 31 7 ACTGGG 2 1 68389 CASAVA_Build 13 35124099 1I TTGAACAATA -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 T 6 7 68390 CASAVA_Build 13 35138297 1I GCATTTGCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 256 hom 24 1 21 2 T 9 10 68391 CASAVA_Build 13 35148087 3I TGGGAAACTT ---/CTC CTCCTCTCTT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 CTC 2 3 68392 CASAVA_Build 13 35151308 4D ATACACATAA ATAT/---- ATACATATAT 3070 het 3070 hom 28 13 14 3 AT 3 1 68393 CASAVA_Build 13 35155223 1I ATCTGGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 31 1 19 11 T 11 12 68394 CASAVA_Build 13 35155626 1D ATGAAGGCCG C/- CCCCATCATT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 5 4 68395 CASAVA_Build 13 35160154 2D GAGCTCTTGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 69 het 33 0 23 11 GA 10 9 68396 CASAVA_Build 13 35170628 27D CCACTCCAAT TCACCTCCACTGCTAGCTCACTCCATC/--------------------------- TCACCTCCAC 3070 hom 63 het 34 0 19 23 TCACCTCCACTGCTAGCTCACTCCATC 2 1 68397 CASAVA_Build 13 35171381 1I TGTTTTTCTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 8 9 68398 CASAVA_Build 13 35175008 1I AAACTACTTG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 82 het 35 0 28 7 A 8 9 68399 CASAVA_Build 13 35178473 1I GCAGGCCACA -/G GCCTTGGATC 3070 hom 51 het 21 0 15 6 G 1 2 68400 CASAVA_Build 13 35183931 1D CCGGCCAAGA C/- CCCAAGAGAA 3070 hom 96 het 40 0 31 9 C 4 3 68401 CASAVA_Build 13 35194254 1I30M1I CTTGGAAAGG -AAAAAAAAATACACACAACAACAACAACAA-/AAAAAAAAAATACACACAACAACAACAACAAC AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 10 N/A 0 0 68402 CASAVA_Build 13 35201303 3I CCAAGTTCTG ---/TGA TGACTTAGTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 TGA 1 2 68403 CASAVA_Build 13 35204647 1D GTGTATGGGT G/- GGAATTTACA 3070 het 3070 hom 48 24 22 3 G 3 2 68404 CASAVA_Build 13 35209938 1I AACAACAACG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 A 9 10 68405 CASAVA_Build 13 35210240 1D CTGTATTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 38 0 32 7 T 9 8 68406 CASAVA_Build 13 35235124 1I15M2D CACACATACA -CCCCTACACACACACAT/CCCCCTACACACACAC-- ACCTATACCT 3070 hom 129 het 42 0 41 11 N/A 0 0 68407 CASAVA_Build 13 35238909 4I CCTTCCTCCC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TCTT 2 3 68408 CASAVA_Build 13 35277443 1D CACTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 843 het 843 ref 46 31 3 12 T 10 9 68409 CASAVA_Build 13 35311939 1D TTTTGTTTGA T/- TTTTGACCCA 3070 hom 117 het 40 0 40 1 T 5 4 68410 CASAVA_Build 13 35360681 1I AGTCCCTGGG -/T TACAGCATTT 3070 hom 114 het 40 0 37 3 T 1 2 68411 CASAVA_Build 13 35363018 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 28 1 22 5 T 10 11 68412 CASAVA_Build 13 35364598 2D ATCATCTTTA AC/-- ACACATAACT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 AC 3 2 68413 CASAVA_Build 13 35366691 1I CCTAGAGGCA -/G GGGTGTAAGA 3070 hom 120 het 47 0 36 11 G 3 4 68414 CASAVA_Build 13 35367882 1I ATACTATAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 270 hom 32 1 26 5 A 9 10 68415 CASAVA_Build 13 35368075 1D TTTTTTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 T 11 10 68416 CASAVA_Build 13 35368729 1I TGATATATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 10 11 68417 CASAVA_Build 13 35379979 1I AAAAAACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 20 2 14 4 A 15 16 68418 CASAVA_Build 13 35409273 1I TGTCCGGCTA -/T TTTTTTTTTT 1858 het 1458 hom 10 5 5 0 T 11 12 68419 CASAVA_Build 13 35429177 1D GTGGTCACTA T/- TTTGAAAAGT 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 T 4 3 68420 CASAVA_Build 13 35449255 2D TTTTCGTGTA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 TG 5 4 68421 CASAVA_Build 13 35449730 1D TAATGGGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 10 9 68422 CASAVA_Build 13 35462934 1I CAACGTGGGG -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 A 1 2 68423 CASAVA_Build 13 35466246 1D TGCAGCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 506 hom 35 2 22 12 A 15 14 68424 CASAVA_Build 13 35468077 1I TTATTATTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 T 8 9 68425 CASAVA_Build 13 35469190 1I TTTAATGATG -/C TTTGAGTTGA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 C 0 1 68426 CASAVA_Build 13 35471396 1D TGTCTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 A 12 11 68427 CASAVA_Build 13 35473088 1I GCATAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2729 hom 32 7 11 14 T 15 16 68428 CASAVA_Build 13 35493381 2D TAAAAATAAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 46 het 27 0 16 12 A 11 9 68429 CASAVA_Build 13 35503463 1D ATCAACCACA C/- ACACACAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 C 1 0 68430 CASAVA_Build 13 35525764 2I TAGTATCACG --/AT ATATATATAT 2861 het 1524 hom 15 4 7 4 AT 7 8 68431 CASAVA_Build 13 35538849 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 651 hom 15 2 12 1 A 7 8 68432 CASAVA_Build 13 35540702 2D GAGAACAGTC TT/-- TTTTTTTTTA 3063 het 3063 ref 29 15 9 7 T 11 9 68433 CASAVA_Build 13 35542782 1I TTTAACTTAA -/T TTTTTTTTCT 2508 het 1678 hom 14 4 7 3 T 8 9 68434 CASAVA_Build 13 35552248 1I GGAGTTATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 A 9 10 68435 CASAVA_Build 13 35565103 1I AAGACAAGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 A 9 10 68436 CASAVA_Build 13 35567894 3D ATATGGCCAT AGC/--- AGTCATAAGA 3070 het 3070 ref 25 12 11 3 AGC 1 0 68437 CASAVA_Build 13 35569203 2I AGGCTACAGT --/TC TACAGGTTAA 3070 het 3070 hom 42 12 25 5 TC 0 1 68438 CASAVA_Build 13 35573812 1D ATCTCTGCCT G/- CTCCCTGGTG 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 G 1 0 68439 CASAVA_Build 13 35574327 1D TAGTCTAATC T/- TTTTTTTTTT 2554 het 2554 ref 31 12 10 10 T 17 16 68440 CASAVA_Build 13 35574396 1D TTTTTTTAAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 29 13 10 8 A 8 7 68441 CASAVA_Build 13 35575774 1I GTTCCTATTT -/A AAAATTGGAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 4 5 68442 CASAVA_Build 13 35577420 4D AATTTAAAAT AGTG/---- AGTCCCTTTG 3070 het 3070 ref 35 17 14 7 AGTG 1 0 68443 CASAVA_Build 13 35579239 6I TCTTTTGAGC ------/TTTATG TTTATAACAG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TTTATG 0 1 68444 CASAVA_Build 13 35587466 5I AATTTATCTT -----/AAAAA AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 3 8 68445 CASAVA_Build 13 35588537 1I ACTTAAAATG -/A GTTCCCTGGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 0 1 68446 CASAVA_Build 13 35590223 2I ACATTTTCTC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 9 11 68447 CASAVA_Build 13 35592812 2I ACAAGTTAAT --/AA AAAAACCCTA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 5 7 68448 CASAVA_Build 13 35592913 17D5M2D GATGAAAATT ATGTGAAAATTATATGAAAAACTG/-----------------AAAAC-- TATGAGAAGA 3070 het 3070 ref 43 30 18 6 N/A 0 0 68449 CASAVA_Build 13 35614096 1D ATAAAGAAGG A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 A 7 6 68450 CASAVA_Build 13 35615696 1I AGGCCCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 19 1 15 3 A 11 12 68451 CASAVA_Build 13 35623065 1D GAAAGGGTGA G/- GGGGGTTAGG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 G 6 5 68452 CASAVA_Build 13 35626707 5D CTACAAAAGC AAACA/----- AAACAAAACC 3070 het 3070 ref 54 22 16 23 AAACA 2 1 68453 CASAVA_Build 13 35628592 2I TGGAGAGTAT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 GA 7 8 68454 CASAVA_Build 13 35633711 2D TACAGTATTT GG/-- GGGGGGGGGT 2900 het 10 hom 13 1 8 4 G 11 9 68455 CASAVA_Build 13 35645139 17D CCATCTTGTT ATTTCAGGTACACGGGC/----------------- ATGTCTAGGC 3070 het 3070 hom 45 20 24 6 ATTTCAGGTACACGGGC 1 0 68456 CASAVA_Build 13 35645438 3D AAAGTGGCTG AGA/--- AGATCTCTTT 3070 het 3070 ref 55 27 26 5 AGA 2 1 68457 CASAVA_Build 13 35656402 3D TACTAGTGAA AAG/--- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 AAG 1 0 68458 CASAVA_Build 13 35676092 3D TTTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 151 hom 32 3 14 15 T 17 14 68459 CASAVA_Build 13 35682144 4D GACCAAGTAT GTTA/---- GTTTATTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 25 2 GTTA 1 0 68460 CASAVA_Build 13 35688304 1D GCTTTTAAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 17 14 10 A 10 9 68461 CASAVA_Build 13 35691352 4D AATATGGATG TGTA/---- TGTACCTACC 3070 het 3070 hom 30 11 14 7 TGTA 2 1 68462 CASAVA_Build 13 35691922 3D TTCTCATGAT AAG/--- AGTGAGTGAG 3070 het 3070 hom 57 25 25 8 AAG 1 0 68463 CASAVA_Build 13 35694967 8I AAGATACTGT --------/AATAGCAA GTAAGTATGC 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 AATAGCAA 0 1 68464 CASAVA_Build 13 35697332 1I ATCCTAGAAG -/A AAACCTAGGA 3070 het 100 hom 24 1 15 8 A 3 4 68465 CASAVA_Build 13 35699647 2D4M2D AAATAAATAA ATAAATAA/--AAGT-- AAGCTCTATA 3070 het 3070 ref 38 19 11 10 N/A 0 0 68466 CASAVA_Build 13 35703290 1D TTATAAATGG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 A 9 8 68467 CASAVA_Build 13 35704771 91D CACTTGTACT AAGAATACAAAAAAAGATGAGCCGAGATTGCGCCACTGCAGTCCGCAGTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAA/------------------------------------------------------------------------------------------- AAGAATACAA 3037 het 3037 ref 22 17 7 10 AAGAATACAAAAAAAGATGAGCCGAGATTGCGCCACTGCAGTCCGCAGTCCGGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAA 1 0 68468 CASAVA_Build 13 35705364 3D4M4D CTCAGCAGAG ACTTCAGTGTC/---TTAG---- CACCCCAACA 3070 het 3070 ref 44 28 17 0 N/A 0 0 68469 CASAVA_Build 13 35705661 10I AATCTACTAT ----------/TTTAAATATG TTTAAAGAAC 3070 het 3003 hom 31 7 20 4 TTTAAATATG 0 1 68470 CASAVA_Build 13 35709118 5D CTAGATTACT TAACA/----- TTAGATTACA 3070 het 3070 ref 36 19 11 10 TAACA 1 0 68471 CASAVA_Build 13 35709207 6D ATTATTATTG TATTAT/------ TATTATTATT 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 TAT 6 4 68472 CASAVA_Build 13 35711386 3D TAAAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 132 hom 40 3 20 17 A 13 10 68473 CASAVA_Build 13 35711970 2I TTTTACTTTC --/CA CAGTTTCAGT 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 CA 1 2 68474 CASAVA_Build 13 35713520 4I TGCCATCATG ----/TCGC TCACAATTAT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TCGC 0 1 68475 CASAVA_Build 13 35713876 1D ATATATTACT G/- GAATTGTTGG 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 G 2 1 68476 CASAVA_Build 13 35717626 2I TTGTAGAGAC --/AG AGTCTTGCCA 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 AG 1 2 68477 CASAVA_Build 13 35719654 1D TTAAAAGAAG T/- TTGGAAGAAG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 3 2 68478 CASAVA_Build 13 35721040 1I CATGTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 10 11 68479 CASAVA_Build 13 35721880 4D GGGATATTAT TAAG/---- TAAGTCCTAG 3070 het 3070 hom 56 28 27 1 TAAG 2 1 68480 CASAVA_Build 13 35722089 4I AGAAAATAGA ----/ATTC ATTCATTCAT 3070 het 3070 hom 58 11 26 21 ATTC 4 5 68481 CASAVA_Build 13 35723515 3I GTGAAAATCT ---/TTA TTAACATTTA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 TTA 1 2 68482 CASAVA_Build 13 35723692 1D TTTTAACCTT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 8 7 68483 CASAVA_Build 13 35725498 25D TTTTCTGAGA TGGAGTCTTGCTCTATCAGCCAGGC/------------------------- TGGAGTGCAG 661 het 661 ref 17 7 2 14 TGGAGTCTTGCTCTATCAGCCAGGC 1 0 68484 CASAVA_Build 13 35725558 2I TCACTGCAAC --/CT CTCTGCCTTC 2812 het 421 hom 9 1 6 2 CT 2 3 68485 CASAVA_Build 13 35726093 11I TAGGAAATAG -----------/TTTTGTAAGCA TTTTGTGTTA 3070 het 3070 ref 46 28 12 6 TTTTGTAAGCA 0 1 68486 CASAVA_Build 13 35728689 1I CATGTGGGAA -/T TATTACAATT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 1 2 68487 CASAVA_Build 13 35729260 1D AGGGGAGGTA C/- CCGGTGTTAT 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 C 3 2 68488 CASAVA_Build 13 35729643 1I GAGATCGAGA -/C CATCCTGGCC 3070 hom 35 het 15 0 12 3 C 1 2 68489 CASAVA_Build 13 35730224 1I CAGAATTTGA -/C CCCTAGTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 C 3 4 68490 CASAVA_Build 13 35730887 1I CCAGCACCCC -/T GGGGGCTGCT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 0 1 68491 CASAVA_Build 13 35734434 1I GCCTGACCAA -/C TCTCACATAA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 C 0 1 68492 CASAVA_Build 13 35735345 4I AAAAAAGGGT ----/TAGA TAGAGGTCAG 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 TAGA 1 2 68493 CASAVA_Build 13 35744358 1D TCCATGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 16 6 A 12 11 68494 CASAVA_Build 13 35754264 4D TTCATAAGTA TGTC/---- TGTACAGATT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TGTC 1 0 68495 CASAVA_Build 13 35789667 1I TCCGTGCCCC -/T ACCCCTTATT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 T 0 1 68496 CASAVA_Build 13 35827978 1I AAGTAATGGC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 85 het 31 0 28 3 A 8 9 68497 CASAVA_Build 13 35834930 1D TGGAGGATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 18 11 T 12 11 68498 CASAVA_Build 13 35838942 1D TTTATTTAAA C/- CGGCATGAGG 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 C 2 1 68499 CASAVA_Build 13 35861447 2D AGGTTTTATC AT/-- GTGGAAGAAG 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 AT 1 0 68500 CASAVA_Build 13 35870570 1I TTGTTTGATT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 7 8 68501 CASAVA_Build 13 35871246 5D GTACTCAGCT ATAAA/----- GAATATATAT 3070 hom 111 het 39 0 38 3 ATAAA 1 0 68502 CASAVA_Build 13 35872357 1D ATTCCTCTAG T/- TTTTTTTTTT 2052 het 483 hom 33 4 12 17 T 19 18 68503 CASAVA_Build 13 35875417 1I AAAGGAAACT -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 7 8 68504 CASAVA_Build 13 35875808 1D TAAAAAAAAA T/- ATTCTGTGTT 2787 het 2787 ref 21 12 7 2 T 1 0 68505 CASAVA_Build 13 35896067 1D ATTGGACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 12 6 A 11 10 68506 CASAVA_Build 13 35901320 1D TTTTTAAGTT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 31 13 14 5 A 9 8 68507 CASAVA_Build 13 35902903 43D CAGAAATGCT CCTTTCATTCACCTTTCGAAGCAGAGCATTTGGTCCCCGTTGG/------------------------------------------- CCTCTGACTC 1898 het 1898 ref 44 42 6 5 CCTTTCATTCACCTTTCGAAGCAGAGCATTTGGTCCCCGTTGG 1 0 68508 CASAVA_Build 13 35906971 2I GTGCCCCCCC --/CG CCCCGCGCCA 2193 het 11 hom 24 1 9 14 CG 0 1 68509 CASAVA_Build 13 35915257 12D AGTAAAGGAA GGAAGGGACAGC/------------ GTAGACAGAT 3070 het 3070 hom 48 22 24 4 GGAAGGGACAGC 1 0 68510 CASAVA_Build 13 35995060 1D TTTTTTTTTT G/- GCTATTATGA 3070 het 672 hom 35 2 30 3 G 2 1 68511 CASAVA_Build 13 36001980 1I CCGAGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 10 11 68512 CASAVA_Build 13 36016197 5I TGGCTTTTCC -----/CTTTG CTTTGCTTTG 3070 het 3070 ref 50 19 16 15 CTTTG 2 3 68513 CASAVA_Build 13 36028641 3D ATTTGAAAAC ATA/--- ATATTTGTTC 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 ATA 2 1 68514 CASAVA_Build 13 36029513 2D AAAATATCAC AT/-- GTTCCCTCAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 AT 1 0 68515 CASAVA_Build 13 36030288 1D CCTTTGGGTC T/- GTACTCTTTC 3070 het 3070 ref 50 23 20 8 T 1 0 68516 CASAVA_Build 13 36040850 1D ATCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2871 hom 49 het 24 0 14 12 A 15 14 68517 CASAVA_Build 13 36041598 1D AGTACTAGCA T/- AAGGATAGAC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 1 0 68518 CASAVA_Build 13 36052602 9D AATTACTGGT GGGCCAATG/--------- GGGAGGGCAA 3070 het 3070 hom 25 10 14 3 GGGCCAATG 1 0 68519 CASAVA_Build 13 36058987 1D GTCTCTCCAA C/- CTCTAAAATT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 C 2 1 68520 CASAVA_Build 13 36070380 2D GGTGGCAGAC AA/-- GAGAGAAAAG 3070 hom 84 het 30 0 27 4 A 2 0 68521 CASAVA_Build 13 36084749 1I TATCCCCTTA -/G GGATGCTTAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 G 2 3 68522 CASAVA_Build 13 36092930 4I GTGGGTATCA ----/TTCT TTTGTTAATT 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 TTCT 0 1 68523 CASAVA_Build 13 36095530 1D TCCAGTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 13 9 T 13 12 68524 CASAVA_Build 13 36095975 1I TCCTGAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 12 13 68525 CASAVA_Build 13 36103059 1I CTTAAAAATT -/A AAAAAATTGA 2572 het 2572 ref 25 18 6 1 A 6 7 68526 CASAVA_Build 13 36105246 2I ATGAGACCTG --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 61 het 42 1 30 11 GA 8 9 68527 CASAVA_Build 13 36110193 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 10 11 68528 CASAVA_Build 13 36116527 2D CCTCCCACCT CC/-- CCTGGGAGAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 4 2 68529 CASAVA_Build 13 36122511 33D TGCCTTTTTC ATTGTGCTGACATTTGAATTGACAGGGCAAAAA/--------------------------------- AATGGTAGGG 3070 het 3070 ref 38 25 20 4 ATTGTGCTGACATTTGAATTGACAGGGCAAAAA 1 0 68530 CASAVA_Build 13 36129864 1I AATAAAAGAG -/T AACTATACAA 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 T 0 1 68531 CASAVA_Build 13 36133703 2D ACTATTAAAC AT/-- AAAATTAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 AT 1 0 68532 CASAVA_Build 13 36146443 1D CCCAGACTCT C/- CCCCGAGATC 2126 hom 29 het 18 0 9 9 C 5 4 68533 CASAVA_Build 13 36169610 1I GATGAAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 9 10 68534 CASAVA_Build 13 36172119 3I GAAGGGTGTT ---/GAG GAGAGTCTTC 3070 hom 126 het 45 0 42 3 GAG 1 2 68535 CASAVA_Build 13 36175903 4D TTCTACTATT CTTA/---- CACACCGTGC 1931 het 1931 ref 25 18 5 4 CTTA 1 0 68536 CASAVA_Build 13 36207468 6I AAGTGGAGGG ------/AGTAGC AGGTACCAGA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 AGTAGC 0 1 68537 CASAVA_Build 13 36221536 1D CATACTTTTC T/- TATGTAGAAC 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 2 1 68538 CASAVA_Build 13 36231764 1I TGACAGAGAT -/C AAACTCGCTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 0 1 68539 CASAVA_Build 13 36237846 4D CAGTGCAGTT TGTC/---- TGCATTATCC 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 TGTC 1 0 68540 CASAVA_Build 13 36251693 1D AAGGTGACTA G/- GGGTCTGAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 G 4 3 68541 CASAVA_Build 13 36275033 1D ACATGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 7 A 15 14 68542 CASAVA_Build 13 36275525 1I GAACACTTGA -/T TTTTTTTTAA 2838 het 1962 hom 18 6 9 3 T 8 9 68543 CASAVA_Build 13 36288377 2I AAGGTGACTT --/AC GACTTCTTAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AC 0 1 68544 CASAVA_Build 13 36298040 2D GGTTGGGCAT TG/-- TGGTTCATGC 3070 het 3070 ref 36 20 10 7 TG 2 1 68545 CASAVA_Build 13 36299918 1D ATCTACATGG T/- TTTTTATCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 5 68546 CASAVA_Build 13 36307194 8D AGATGAGTTT TTGCCATG/-------- TTGCCCAGGT 3070 het 3070 ref 31 19 8 6 TTGCCATG 1 0 68547 CASAVA_Build 13 36307934 1D CTCACTATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 11 10 68548 CASAVA_Build 13 36316492 1D GCTTATAGGT A/- ATAGAGTTTC 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 A 2 1 68549 CASAVA_Build 13 36317043 3D CCGAAGCCAA GTT/--- ATTATAATAG 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 GTT 1 0 68550 CASAVA_Build 13 36317238 4D TGAATATATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 246 het 246 ref 23 10 3 10 TG 7 5 68551 CASAVA_Build 13 36317637 6D AGCAGACCGA AATGTT/------ ACTACAGTGT 3070 het 3070 hom 41 18 20 5 AATGTT 1 0 68552 CASAVA_Build 13 36320378 1D TTAAACTGTA G/- GGGTTTCACT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 G 4 3 68553 CASAVA_Build 13 36321413 2D GCTTGCTTAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 39 11 17 11 TC 10 9 68554 CASAVA_Build 13 36329354 2I ACACCTGTTA --/CT GTTGCAATCA 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 CT 0 1 68555 CASAVA_Build 13 36334626 2I GGCCGTGCCC --/AG AGGTTACCCT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 AG 1 2 68556 CASAVA_Build 13 36341967 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 A 12 11 68557 CASAVA_Build 13 36368904 4I TTTTTGTGTA ----/TTTC TTTTTTCTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTTC 0 1 68558 CASAVA_Build 13 36375248 1D GGGCTCTTTC T/- TTTTTTTTCT 2049 het 333 hom 25 3 13 9 T 9 8 68559 CASAVA_Build 13 36388695 1I GGGTTCAGTG -/A AAAAAATGTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 6 7 68560 CASAVA_Build 13 36390128 2D CATGATTAGT AA/-- AGATAGTGTA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 3 1 68561 CASAVA_Build 13 36404933 5I AAAAAATAAT -----/AAAAC AAAACCAGTA 3070 hom 56 het 22 0 19 3 AAAAC 1 2 68562 CASAVA_Build 13 36412779 1D TCACTGTGAT G/- GGGGCAGCCT 3070 hom 146 het 54 0 46 8 G 5 4 68563 CASAVA_Build 13 36413957 1I GCTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 21 2 13 6 A 15 16 68564 CASAVA_Build 13 36415381 1D CAAATAAAAT A/- AAGGCAAAGT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 A 3 2 68565 CASAVA_Build 13 36416837 1D TCTTTCAGAC T/- TTTTTTTTTT 2416 het 875 hom 24 4 7 13 T 17 16 68566 CASAVA_Build 13 36418069 1D ACAAATTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 15 10 T 10 9 68567 CASAVA_Build 13 36422726 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 76 het 29 0 25 5 T 10 9 68568 CASAVA_Build 13 36426201 1I ACCTTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 29 1 20 8 A 10 11 68569 CASAVA_Build 13 36426401 3D TATAATTTTA TCT/--- TCTTCTTTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 5 TCT 3 2 68570 CASAVA_Build 13 36435636 1I AGTTCTGGAG -/C CAATAGCTGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 2 68571 CASAVA_Build 13 36441480 2I GGCTCCTAAG --/TC TGTATTTGGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TC 0 1 68572 CASAVA_Build 13 36441554 1D CATTAATATA T/- TTTAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 4 3 68573 CASAVA_Build 13 36444657 4I ATATAATCGA ----/AGAC AGCATTTATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AGAC 0 1 68574 CASAVA_Build 13 36448888 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 11 12 68575 CASAVA_Build 13 36456671 2D TTGGATTACA CT/-- GTCTTAAATC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CT 1 0 68576 CASAVA_Build 13 36462742 2I TGAATCTCAC --/AT GTCTGTTTAG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 AT 0 1 68577 CASAVA_Build 13 36462892 1D CTACTAAGTT G/- CTCAAATTGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 1 0 68578 CASAVA_Build 13 36463782 1D AGGCTTTGGT G/- GTCATGTCAC 3070 het 3070 hom 54 19 27 9 G 2 1 68579 CASAVA_Build 13 36488567 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 13 1 10 4 A 15 14 68580 CASAVA_Build 13 36493174 1I ACACAAATGG -/T TAAGCTGTAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 2 68581 CASAVA_Build 13 36508467 1I AACTGGAGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 32 3 22 7 G 0 1 68582 CASAVA_Build 13 36514814 2D TCACTGGTAA CT/-- CTGACAAATG 3070 hom 120 het 43 0 40 5 CT 2 1 68583 CASAVA_Build 13 36516443 1D AGCAAGGATC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 8 7 68584 CASAVA_Build 13 36521092 1D TCAAAATGAA C/- CAAAGGCTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 C 2 1 68585 CASAVA_Build 13 36523771 1I GCTATTAAGA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 44 1 37 6 G 1 2 68586 CASAVA_Build 13 36524680 1D TAAAGACTTA C/- AACATAAAAC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 1 0 68587 CASAVA_Build 13 36532274 5I TTGTAAGGTC -----/TGTTT TGTTTTGTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TGTTT 3 4 68588 CASAVA_Build 13 36540950 1D CACAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 12 11 68589 CASAVA_Build 13 36545772 2I CTGAAGAAAC --/GT AGACTTTCCC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 GT 0 1 68590 CASAVA_Build 13 36552753 1D AGATTTCTTA C/- AGTATGCAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 1 0 68591 CASAVA_Build 13 36557891 1I GTATGCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1284 hom 36 4 24 8 T 11 12 68592 CASAVA_Build 13 36560518 8I GGATTTGGGA --------/AAACACAG AATCTGTAAG 3070 hom 193 het 69 0 65 6 AAACACAG 0 1 68593 CASAVA_Build 13 36573988 1D ACGTATACTC T/- TTTTTTTTTT 2862 het 519 hom 33 6 9 18 T 13 12 68594 CASAVA_Build 13 36574844 2I CTGACCAAAC --/AT GTGGCAATTT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 AT 0 1 68595 CASAVA_Build 13 36580206 1I CCTATTTGCA -/G GGCATGAGTG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 G 2 3 68596 CASAVA_Build 13 36587429 1I TCACCCCTGA -/G GAAAGGAGAG 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 G 1 2 68597 CASAVA_Build 13 36629792 2I CCCGCTTATA --/AG TGTGACCATG 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 AG 0 1 68598 CASAVA_Build 13 36635390 1I CTAGAGCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 9 10 68599 CASAVA_Build 13 36644197 1D GGCGGGGGGA G/- GGGGGTCCTT 2579 hom 33 het 12 0 9 3 G 6 5 68600 CASAVA_Build 13 36649637 3D ACTTCCCCCA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 47 18 25 4 AAC 7 6 68601 CASAVA_Build 13 36651614 13I TCTGTGCCCA -------------/TCAGTGTGGGCAG TGTAACCATC 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 TCAGTGTGGGCAG 0 1 68602 CASAVA_Build 13 36656538 1I ACTAAAAAAA -/T AATAGATGCT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 T 0 1 68603 CASAVA_Build 13 36665303 1I TCTTGCCAAC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 49 17 19 13 T 7 8 68604 CASAVA_Build 13 36666081 5D TGAATTCTTG TTCTT/----- TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 TTCTT 3 2 68605 CASAVA_Build 13 36691032 1D TCTGTATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 32 1 25 6 T 12 11 68606 CASAVA_Build 13 36693202 2D CATCCACCAA CT/-- TGACATACAT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 CT 1 0 68607 CASAVA_Build 13 36693569 4I TTCTTTTTTC ----/TTAG TTATGGTGGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TTAG 0 1 68608 CASAVA_Build 13 36701206 1D TAGATTTGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 10 9 68609 CASAVA_Build 13 36703090 1I AGAGAAAAAG -/A AAAAAACATT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 6 7 68610 CASAVA_Build 13 36703250 1D GTAAACTTCA C/- CTGGAAGAGA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 C 2 1 68611 CASAVA_Build 13 36706408 1D TAAAAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2736 hom 29 9 15 5 A 14 13 68612 CASAVA_Build 13 36707588 1I AAAATATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 35 1 30 4 A 11 12 68613 CASAVA_Build 13 36713143 3I ATAATAATAA ---/TAC TAATAACATG 3070 hom 78 het 32 0 24 8 TAC 0 1 68614 CASAVA_Build 13 36714026 1I GACTATTTCC -/A AAAGGTTTGG 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 A 3 4 68615 CASAVA_Build 13 36717979 2I TGATATTTCT --/AA GTCTCATTCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 0 2 68616 CASAVA_Build 13 36720074 1D TCTCTCCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 20 0 18 4 A 10 9 68617 CASAVA_Build 13 36740612 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 33 1 20 13 A 16 15 68618 CASAVA_Build 13 36749719 1I GCCCTCCCCC -/T GGGCCCCACA 3070 hom 114 het 45 0 37 8 T 0 1 68619 CASAVA_Build 13 36753542 1I AATGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 11 12 68620 CASAVA_Build 13 36753698 4I AATGCCTCTA ----/GTTT GTTTGTTCTT 3070 hom 73 het 32 0 25 7 GTTT 1 2 68621 CASAVA_Build 13 36754645 3D GGATCCAGTG TGC/--- TGCTTGTATC 3070 hom 92 het 35 0 31 5 TGC 2 1 68622 CASAVA_Build 13 36760775 3D GCCATATAGC TCT/--- TCGTCTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 19 7 TCT 1 0 68623 CASAVA_Build 13 36775164 1D TTTTCTGCCC T/- GAAAAATATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 68624 CASAVA_Build 13 36777314 1I TCATATTCTA -/G CTAGCAAGTA 3070 hom 84 het 35 0 25 10 G 0 1 68625 CASAVA_Build 13 36784590 1D ACAAATTTGG A/- AACCTTTCCC 3070 hom 71 het 33 0 25 8 A 3 2 68626 CASAVA_Build 13 36786172 2D GCCTTTTATG GT/-- GTAACAAACT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 GT 2 1 68627 CASAVA_Build 13 36802347 1D TTTCATTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2769 hom 27 7 12 8 T 10 9 68628 CASAVA_Build 13 36812455 1D TCAGTTTTTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 8 68629 CASAVA_Build 13 36825161 2D TGGAGACCAC TT/-- AAAATCTACT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 2 0 68630 CASAVA_Build 13 36834954 1D GAAAGGACTC T/- TTTTTTTTTT 1257 het 1257 ref 38 34 3 3 T 11 10 68631 CASAVA_Build 13 36844931 1D AATATTTAAT G/- TTTTTTTTAC 3070 hom 105 het 40 0 35 6 G 1 0 68632 CASAVA_Build 13 36845258 4I AGTTGTGTTT ----/TCTC TCTCTTTTCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TC 2 4 68633 CASAVA_Build 13 36852827 1D ACCAGTAAAA G/- CAAGAATGAA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 G 1 0 68634 CASAVA_Build 13 36853779 1I TCTGAAGAAA -/T TGTCTGCATA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 1 2 68635 CASAVA_Build 13 36862449 1D ATTTGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 31 3 18 10 T 18 17 68636 CASAVA_Build 13 36866034 38D AATCCAGAGC AGGCCCTAACTCTCTTCAATGCTATGAAGGCTGAGAGA/-------------------------------------- GACGAAGAAA 3070 het 3070 ref 28 21 11 3 AGGCCCTAACTCTCTTCAATGCTATGAAGGCTGAGAGA 1 0 68637 CASAVA_Build 13 36869035 1D TTTATATCCA G/- CCAATTTAAA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 G 1 0 68638 CASAVA_Build 13 36869450 1D TGGAAAACAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 9 8 68639 CASAVA_Build 13 36870003 1D AAATCAATAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 9 8 68640 CASAVA_Build 13 36888693 1I CACTTGTAAA -/C AAAAAGAAAT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 C 0 1 68641 CASAVA_Build 13 36899600 3I ATGAAACTGA ---/AAC AAAGAAAACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAC 0 1 68642 CASAVA_Build 13 36906429 1I GAAACACACC -/A TAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 0 1 68643 CASAVA_Build 13 36906509 1D CATTAATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 24 1 21 3 A 12 11 68644 CASAVA_Build 13 36908533 1D CACATATACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 453 hom 19 2 8 9 A 10 9 68645 CASAVA_Build 13 36910673 1D CTAAATGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 125 het 50 0 42 8 T 10 9 68646 CASAVA_Build 13 36911793 4D TTTAATCAAA TTAT/---- TTATTTTTTG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TTAT 2 1 68647 CASAVA_Build 13 36912580 4D TTTCAAACAG TTCA/---- TTGTTAGTGA 3070 het 3070 ref 33 20 13 2 TTCA 1 0 68648 CASAVA_Build 13 36912667 2D TTCTAACAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 15 13 68649 CASAVA_Build 13 36913120 1I GACTTCCAGT -/G GCTATATTGA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 2 68650 CASAVA_Build 13 36913940 1D GTCTTTTCTC T/- TTTTTTCTTA 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 7 6 68651 CASAVA_Build 13 36913985 1D TGTTTATCTT A/- AAAAAATACA 3070 hom 33 het 19 0 12 8 A 7 6 68652 CASAVA_Build 13 36916125 1D ATAGTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 T 12 11 68653 CASAVA_Build 13 36918061 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1560 hom 24 6 10 8 A 13 12 68654 CASAVA_Build 13 36922708 1D TAGTAAATAG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 7 6 68655 CASAVA_Build 13 36931996 3I CATGTAGATT ---/CAC TAGTTTTTAT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 CAC 0 1 68656 CASAVA_Build 13 36932905 1D GTATTGTGTT A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 A 7 6 68657 CASAVA_Build 13 36933779 3I TTGTTGAGTT ---/GTA GTTCTTTTTT 1586 het 1560 hom 16 6 6 4 GTA 0 1 68658 CASAVA_Build 13 36935387 4I TCCATTGGTC ----/TATA TGTATGTCTG 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 TA 0 2 68659 CASAVA_Build 13 36937288 1D TCTGGTTTTA T/- TTTTTTGAAG 3070 het 3070 ref 51 28 21 3 T 7 6 68660 CASAVA_Build 13 36938176 1I TTTTTTCTAT -/A TTTTATATAT 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 A 0 1 68661 CASAVA_Build 13 36940285 1D AATTATAATA G/- ATTTCCAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 1 0 68662 CASAVA_Build 13 36941093 1I CACCAAATTA -/G TACCCCAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 G 0 1 68663 CASAVA_Build 13 36958850 1I CCCAAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 18 11 A 12 13 68664 CASAVA_Build 13 36966821 1D CATGTTCCCC T/- TAATGTCTGT 3070 het 3070 ref 60 30 21 9 T 2 1 68665 CASAVA_Build 13 36968326 1D TCGGGCCCCC A/- AAGTGCTGGG 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 3 2 68666 CASAVA_Build 13 36969833 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3002 hom 23 10 9 4 A 9 10 68667 CASAVA_Build 13 36987622 1I TGAAACAGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 8 9 68668 CASAVA_Build 13 36987715 1D AGAAATAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 9 8 68669 CASAVA_Build 13 36987787 1D TCATCAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 11 10 68670 CASAVA_Build 13 36989517 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 11 10 68671 CASAVA_Build 13 36990334 1I ACTCCATCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 91 het 38 0 30 8 A 9 10 68672 CASAVA_Build 13 36993576 1D CCTACTGTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 30 0 26 6 T 8 7 68673 CASAVA_Build 13 36995009 1D CTATAACCGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 27 1 22 4 T 12 11 68674 CASAVA_Build 13 36998670 1I TCATCCCTGA -/C CCCCTTGCAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 C 4 5 68675 CASAVA_Build 13 37002779 1I AATAACAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 8 9 68676 CASAVA_Build 13 37002985 2I CTCCGCAAGT --/AA AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 A 7 9 68677 CASAVA_Build 13 37004245 1I ATTTTTAGGC -/A AAAAAAAAAA 2888 het 2888 ref 32 17 9 6 A 10 11 68678 CASAVA_Build 13 37004568 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3064 het 1308 hom 23 4 9 10 A 15 16 68679 CASAVA_Build 13 37006536 1I TCATTTCTCA -/T TTATGTCTGA 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 T 2 3 68680 CASAVA_Build 13 37011542 1I CATTCTCTTG -/C CCAGAATGAC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 C 2 3 68681 CASAVA_Build 13 37016981 1D TGTCTGTAAA G/- GATCTTATTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 G 2 1 68682 CASAVA_Build 13 37040147 1I GGACTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 A 10 11 68683 CASAVA_Build 13 37040823 1I TTTTGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 10 11 68684 CASAVA_Build 13 37041326 1D GGATGTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 T 12 11 68685 CASAVA_Build 13 37046062 2I CAGGAGAGAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 20 12 11 TG 6 7 68686 CASAVA_Build 13 37048736 2D TGGGAATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 50 26 15 10 TA 6 5 68687 CASAVA_Build 13 37050134 2D TTCATTACTC AG/-- AGATTTAAAA 3070 het 977 hom 22 3 14 6 AG 2 1 68688 CASAVA_Build 13 37050158 1D TATATAATAA T/- TAATCCAAAG 3070 het 672 hom 25 2 13 11 T 2 1 68689 CASAVA_Build 13 37064419 1I AAAAATCAGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 25 hom 30 1 16 13 T 8 9 68690 CASAVA_Build 13 37066663 1D AAACAAGAGT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 8 7 68691 CASAVA_Build 13 37066901 1I AGAGCAACTG -/T TCAGCTGAAA 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 T 1 2 68692 CASAVA_Build 13 37067185 1I AAAGTAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 31 1 21 9 T 13 14 68693 CASAVA_Build 13 37069123 2I TCAGGAAGAA --/AT ATCTGAGTTC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AT 1 2 68694 CASAVA_Build 13 37083493 4I ATCAAGAAAA ----/AAAT AAATCAGTAC 3070 hom 105 het 42 0 34 8 AAAT 1 2 68695 CASAVA_Build 13 37083641 1D TCAGCTACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 T 10 9 68696 CASAVA_Build 13 37092469 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 28 1 20 7 TC 0 1 68697 CASAVA_Build 13 37096785 1D TTTAGAAAAA T/- TTATTCCCCA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 3 2 68698 CASAVA_Build 13 37100611 1I CTTGTTAAAA -/G TCAAGATAGG 3070 hom 126 het 47 0 42 5 G 0 1 68699 CASAVA_Build 13 37102958 1D AGCAGCTATG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 A 8 7 68700 CASAVA_Build 13 37114868 1I TGATTCTTTC -/T TTTTTCTTTT 1986 het 75 hom 29 2 16 11 T 5 6 68701 CASAVA_Build 13 37120685 1D ATTAATGGTT A/- AAAAAAAAAA 1312 het 1312 ref 34 26 4 5 A 12 11 68702 CASAVA_Build 13 37121144 1D TGAGTAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 12 11 68703 CASAVA_Build 13 37122958 1I TGTGCAGGGA -/C CTTTGTTAGG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 1 2 68704 CASAVA_Build 13 37134447 1D18M2I ACTCTGCCTT AAAAAAAAAAAATTATGTT--/-AAAAAAAAAAATTATGTTAA TTCTTTAAGA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 N/A 0 0 68705 CASAVA_Build 13 37136717 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 418 hom 37 1 28 8 A 9 10 68706 CASAVA_Build 13 37139078 1I CTTCTCACCT -/A AACAGCCCTA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 2 3 68707 CASAVA_Build 13 37145608 1D ATATTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 26 0 19 7 T 13 12 68708 CASAVA_Build 13 37149061 2I AATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TA 6 7 68709 CASAVA_Build 13 37150273 17D GCTTAGAGGA AATATACAGCTCTGAAT/----------------- GCTTTATCAA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 AATATACAGCTCTGAAT 1 0 68710 CASAVA_Build 13 37159092 1D ATTAAAGTTC T/- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 3 2 68711 CASAVA_Build 13 37165215 3I CTGTATGTTA ---/AGG AGGTTACATA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 AGG 1 2 68712 CASAVA_Build 13 37169054 1I CTGAAACATC -/T TTTTTTTTTT 1052 het 1052 ref 31 13 8 10 T 17 18 68713 CASAVA_Build 13 37172090 2I AAATAAAGCA --/TG TGTGTGTGGG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 TG 4 5 68714 CASAVA_Build 13 37178096 2D GATGAGTTCC TA/-- TTGGTCTTTC 3070 hom 98 het 35 0 33 2 TA 1 0 68715 CASAVA_Build 13 37186909 9I CTATTCAGTC ---------/AGTCTTCCT AGTTCAGATT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 AGTCTTCCT 0 1 68716 CASAVA_Build 13 37200346 1D TGTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 A 10 9 68717 CASAVA_Build 13 37201575 1D CTCAAAAATT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 38 21 11 7 A 8 7 68718 CASAVA_Build 13 37202609 2D ATTAACTGTC TT/-- TTCTGTAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 4 2 68719 CASAVA_Build 13 37211642 3D AAGCATGAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 25 4 11 10 T 19 16 68720 CASAVA_Build 13 37218595 1D GGAGGCACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 12 11 68721 CASAVA_Build 13 37219650 1I CAGGCATGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 A 9 10 68722 CASAVA_Build 13 37222287 1I AATATATTCC -/T TTTGTTAGTA 3070 hom 66 het 32 0 23 9 T 3 4 68723 CASAVA_Build 13 37225114 2D TTTCTCCCTC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 CA 7 6 68724 CASAVA_Build 13 37229231 4I ATACATTAAA ----/AAAC AAATATGCAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAAC 0 1 68725 CASAVA_Build 13 37236613 4I TACAATAATT ----/TATC TGTAGATGAT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 TATC 0 1 68726 CASAVA_Build 13 37238113 1I AGATGAATCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 8 9 68727 CASAVA_Build 13 37240658 1D GAGGAGAAAG A/- AAAAGGACTT 3070 hom 114 het 44 0 39 7 A 5 4 68728 CASAVA_Build 13 37247113 3I TATGGTTAAT ---/GAA GAAATTCAAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 GAA 1 2 68729 CASAVA_Build 13 37247942 1D TGTTATCTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 20 16 7 T 10 9 68730 CASAVA_Build 13 37252511 1D ATTTTGTTCA G/- TTGGATATTG 3070 hom 111 het 45 0 38 8 G 1 0 68731 CASAVA_Build 13 37254060 1I GCTTGCTTGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 9 68732 CASAVA_Build 13 37266344 1D TAATTGGTGG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 7 68733 CASAVA_Build 13 37267338 1I GTTATAAAAT -/A AATTCATCAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 3 68734 CASAVA_Build 13 37271071 1D GGAGGTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 25 2 12 11 T 16 15 68735 CASAVA_Build 13 37271819 1I AAAGCCCTGA -/C CTTTTGACTC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 C 1 2 68736 CASAVA_Build 13 37281605 1D GGGTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 20 23 2 T 13 12 68737 CASAVA_Build 13 37317421 1D CCAAAAGAAG T/- TAATAAAGCT 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 2 1 68738 CASAVA_Build 13 37318785 1I AGAGAGGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 9 10 68739 CASAVA_Build 13 37338603 10I ACTTAATTTG ----------/CTAAATAGTT CTAAATAGTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 CTAAATAGTT 1 2 68740 CASAVA_Build 13 37338984 1D TATTTTTTGT G/- GGGGGGGGCG 3070 hom 6 het 22 1 15 7 G 9 8 68741 CASAVA_Build 13 37339633 1D GCATCTTAAA G/- GGGGTTATTA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 G 5 4 68742 CASAVA_Build 13 37340429 1I GATCTTATTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 8 9 68743 CASAVA_Build 13 37340772 1I AGTCTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2659 hom 29 7 17 5 T 11 12 68744 CASAVA_Build 13 37343436 1I TTTTTATCTT -/C TCCTACCCAC 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 C 0 1 68745 CASAVA_Build 13 37347316 2D GAACTTCCAC AT/-- GACTTGGTTT 3070 het 3070 hom 49 21 20 9 AT 1 0 68746 CASAVA_Build 13 37354512 1I AAACACATGA -/T TTTTTTTACT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 7 8 68747 CASAVA_Build 13 37358861 1D GTTTCCTTTT G/- TATTCTGATC 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 G 1 0 68748 CASAVA_Build 13 37363457 1D AGCTATGAGG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 14 15 8 T 8 7 68749 CASAVA_Build 13 37378750 1D GAAGGAAGCA C/- CCTGGTTTAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 C 3 2 68750 CASAVA_Build 13 37387750 4D TCCTTTTTCA TCAT/---- TCATTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 6 TCAT 2 1 68751 CASAVA_Build 13 37390374 1D CACTTTTATG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 8 7 68752 CASAVA_Build 13 37390647 1D GCTTTACCTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 53 29 20 4 T 9 8 68753 CASAVA_Build 13 37392386 1D TTTTCTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 12 13 12 T 11 10 68754 CASAVA_Build 13 37393232 4D TACATGTGAT ACAC/---- ACACACACAC 2060 het 71 hom 15 1 7 7 AC 11 9 68755 CASAVA_Build 13 37393845 1D TTCTAGCTAC G/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 G 1 0 68756 CASAVA_Build 13 37397155 1D CAAGTGAAAT A/- AGATTTCTTA 3070 het 3070 hom 48 17 25 7 A 2 1 68757 CASAVA_Build 13 37398512 1I AAAGAAATAA -/T ATTTGTAAAA 3070 hom 87 het 32 0 28 4 T 0 1 68758 CASAVA_Build 13 37408683 3D AGCAGAACAA TTC/--- TTCTGAGAAG 3070 het 3070 hom 45 16 26 5 TTC 2 1 68759 CASAVA_Build 13 37412023 3D AATAACACTT TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 ref 36 16 16 5 TAA 5 4 68760 CASAVA_Build 13 37413287 11I CACTAGAAAG -----------/AAAGAAAGAAA AAAGAAAGAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AAAGAAAGAAA 1 2 68761 CASAVA_Build 13 37414069 4D TTTTATCAAA TTCT/---- TTCAGAGAAG 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 TTCT 1 0 68762 CASAVA_Build 13 37414523 12I CTCTCTTCCT ------------/TCCTTCCTTCCC TCCTTCCTTC 3070 hom 85 het 39 0 24 15 TCCTTCCTTCCC 0 1 68763 CASAVA_Build 13 37415931 1I CCTTATCTTA -/G TATTTGTCCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 0 1 68764 CASAVA_Build 13 37417322 1D GCTTAGAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 35 0 17 21 T 10 9 68765 CASAVA_Build 13 37417643 1D TTTATAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 50 1 39 10 A 11 10 68766 CASAVA_Build 13 37420584 6D GTATAATTGT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 1075 hom 30 7 19 10 TTG 6 4 68767 CASAVA_Build 13 37421654 2D GAGAGGACAG GA/-- GAGAGAAGAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 GA 4 3 68768 CASAVA_Build 13 37430930 3I CTGTAACCTC ---/TAA TAATGCCATT 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 TAA 1 2 68769 CASAVA_Build 13 37432131 4I CTCATGGTTA ----/CATT CAGCTTAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 CATT 0 1 68770 CASAVA_Build 13 37439746 2D TGTGATTACA CC/-- CCCCCCCCGA 3070 hom 39 het 22 0 14 8 C 10 8 68771 CASAVA_Build 13 37440044 2D TATCTGTAAC CT/-- CTCACTCCAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 CT 2 1 68772 CASAVA_Build 13 37440507 1D TTTTTACTTG T/- TTTTTTTATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 8 7 68773 CASAVA_Build 13 37441056 1I CAGAGTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 10 11 68774 CASAVA_Build 13 37447116 4D CAGAATGATT AATG/---- AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 8 AATG 4 3 68775 CASAVA_Build 13 37448511 1D TGTTTGGGGC T/- TGTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 25 12 8 7 T 2 1 68776 CASAVA_Build 13 37452345 4D AACTTTTTGT TTTG/---- TTTTTTTTAC 3070 het 240 hom 30 2 16 14 TTTG 1 0 68777 CASAVA_Build 13 37452626 4I GAACATATGC ----/TTAA TTATTCTCCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTAA 0 1 68778 CASAVA_Build 13 37456011 1D TCCTCTTCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 35 0 31 4 T 10 9 68779 CASAVA_Build 13 37458047 1I AAGAAACTTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 68780 CASAVA_Build 13 37460422 1D TGCTCTTGAA T/- TTTTTTTTTT 2721 het 1997 hom 28 12 11 5 T 13 12 68781 CASAVA_Build 13 37464498 5I CTTCCTTTTT -----/CTTTC CTTTCCATAG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 CTTTC 1 2 68782 CASAVA_Build 13 37464798 6I GTACACAATT ------/ATTCTC AATCTCCACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATTCTC 0 1 68783 CASAVA_Build 13 37467674 1I TGTTTGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 13 14 68784 CASAVA_Build 13 37474433 5D AATTCTCTTC TAGTT/----- ATTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 25 16 9 2 TAGTT 1 0 68785 CASAVA_Build 13 37474830 1I GTTTCTTTTG -/T TTAATTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 T 2 3 68786 CASAVA_Build 13 37482953 1D CTTTAAGCTA T/- TTTTTTAGTC 3070 het 3070 hom 30 10 19 2 T 7 6 68787 CASAVA_Build 13 37484679 3I AAGAAACAGT ---/TTA TTATTGATTA 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 TTA 1 2 68788 CASAVA_Build 13 37486596 1D TTTGTATGGC T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 68789 CASAVA_Build 13 37497045 1I TGATAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 8 9 68790 CASAVA_Build 13 37499219 3D CTCTCTCTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 222 hom 38 3 12 24 TTC 1 0 68791 CASAVA_Build 13 37499935 1D CATTTTAGGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 8 7 68792 CASAVA_Build 13 37500192 4I TTCTTTTTCA ----/GATT GATCACTGTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 GATT 0 1 68793 CASAVA_Build 13 37507980 4D ACACACACAT ACAC/---- ACACACTCAA 3070 hom 42 het 19 0 14 5 AC 5 3 68794 CASAVA_Build 13 37508032 4I CGTATATATT ----/ACAC ACACACACAG 3070 hom 33 het 16 0 11 5 AC 4 6 68795 CASAVA_Build 13 37513634 1I AGAAAAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 9 10 68796 CASAVA_Build 13 37520089 2D CCACAGACAG TA/-- TATTACACAG 3070 hom 108 het 38 0 37 6 TA 2 1 68797 CASAVA_Build 13 37520205 4I CAACACCAGA ----/ATAT ATATATATTC 3070 het 3070 hom 45 12 24 9 AT 4 6 68798 CASAVA_Build 13 37524542 5D AACAGTAACA TAAAG/----- TAAGAGATAT 2601 het 2601 ref 20 12 6 4 TAAAG 1 0 68799 CASAVA_Build 13 37526311 1I CTCTCCCTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 A 8 9 68800 CASAVA_Build 13 37529645 6I ATATCAACTC ------/AAAAAT AAAAAGTATA 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 AAAAAT 0 1 68801 CASAVA_Build 13 37531067 1D GTAATTAAAG A/- TATGTTAAAG 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 1 0 68802 CASAVA_Build 13 37531182 1D ACCTGCACAA T/- TATATGTTTT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 T 2 1 68803 CASAVA_Build 13 37533008 1I GCCCGGCCAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 2658 hom 25 9 12 4 T 6 7 68804 CASAVA_Build 13 37533595 1D TGTCATCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 330 hom 47 1 32 14 A 13 12 68805 CASAVA_Build 13 37535765 3I AGTTTGCGTT ---/ACC ACCACATTAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 ACC 1 2 68806 CASAVA_Build 13 37537034 3D TTTCATATCC TCT/--- TTTGATTTAA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 TCT 1 0 68807 CASAVA_Build 13 37543916 1I GTGTGATGGC -/A GGGTGCCTGT 3070 het 2214 hom 30 10 14 6 A 0 1 68808 CASAVA_Build 13 37544558 1I AAATAATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 10 11 68809 CASAVA_Build 13 37574279 1I TTTATTCTGG -/A AAAAAACCCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 6 7 68810 CASAVA_Build 13 37581659 1D TTTACAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 27 8 A 11 10 68811 CASAVA_Build 13 37590506 4I TATATATGCA ----/TGTG TGTGTATGTG 3070 hom 75 het 26 0 26 1 TG 2 4 68812 CASAVA_Build 13 37593599 1D TAGTGTGACT G/- GGTGGGTATC 3070 hom 95 het 35 0 31 4 G 3 2 68813 CASAVA_Build 13 37595107 1D TTTTCACTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 411 hom 40 1 31 8 T 9 8 68814 CASAVA_Build 13 37601292 1D GTTTGTTTTT G/- TTTTGTTTTG 2208 het 2142 hom 50 11 12 27 G 1 0 68815 CASAVA_Build 13 37608283 1I CCTAATATTG -/C CCCCCCCAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 7 8 68816 CASAVA_Build 13 37629144 1D AGTTATTATT A/- AAAAACAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 5 68817 CASAVA_Build 13 37636021 4D TAACTTATGA AATT/---- AATAACCAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 AATT 1 0 68818 CASAVA_Build 13 37636910 3D TTAAATAATA TCT/--- TCTTAACATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TCT 2 1 68819 CASAVA_Build 13 37638380 1D TCATCAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 29 0 23 6 A 12 11 68820 CASAVA_Build 13 37646997 3D TTATTTTTAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 25 16 9 2 AAT 4 3 68821 CASAVA_Build 13 37653419 1D CATTATGATT G/- TGAACAAATT 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 G 1 0 68822 CASAVA_Build 13 37658185 1D AATTGTCTAT A/- TTTTTACCTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 1 0 68823 CASAVA_Build 13 37667559 1D AGTCTGTTAG T/- CATTGGGACT 3070 het 3070 ref 41 24 15 3 T 1 0 68824 CASAVA_Build 13 37685426 1I CAGTGATTTG -/C CAGGGGCTCT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 C 1 2 68825 CASAVA_Build 13 37687640 1D GATGCAATTT C/- CCCCCAGTTG 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 C 6 5 68826 CASAVA_Build 13 37693922 5D AAATTTTTTA AAAAG/----- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 31 20 11 1 AAAAG 2 1 68827 CASAVA_Build 13 37706685 1I TATGATCAAG -/T TAAGCTTCAT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 1 2 68828 CASAVA_Build 13 37707636 1I GCATGATACT -/G GTACAAAAAG 3070 hom 81 het 35 0 27 8 G 1 2 68829 CASAVA_Build 13 37709753 7I AAAAAAAAAA -------/AAAACCG GTTCACACTG 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 AAAACCG 0 1 68830 CASAVA_Build 13 37710268 4I TGTACACTTT ----/ACTA ACTAACTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 ACTA 1 2 68831 CASAVA_Build 13 37710537 3I AATTTGAATC ---/ATT ATTATTTCAT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 ATT 2 3 68832 CASAVA_Build 13 37711828 1D ATCAAAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 15 14 68833 CASAVA_Build 13 37712314 8D AATTTAAAAA AAAAAAAG/-------- AAAAAAAAAA 2734 het 2734 ref 27 15 9 4 AAAAAAAG 1 0 68834 CASAVA_Build 13 37715253 5I GGCTGTGGAG -----/AACTT AACACTCTCA 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 AACTT 0 1 68835 CASAVA_Build 13 37717961 2I GTCTTGCTAA --/GT GTGCTGGCCA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 GT 1 2 68836 CASAVA_Build 13 37718894 4D ATAATGCCAC CAAA/---- CAGACATCAC 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 CAAA 1 0 68837 CASAVA_Build 13 37723912 1I TTCCGAAGTC -/T ATAAGACCAG 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 0 1 68838 CASAVA_Build 13 37724344 1D GAGTTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 41 1 26 14 A 13 12 68839 CASAVA_Build 13 37725912 1D TTCCCAAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 38 18 14 6 A 9 8 68840 CASAVA_Build 13 37735383 3I AGAGCAGGGA ---/AAG AAGGGGATAT 3070 het 3070 hom 57 22 29 6 AAG 1 2 68841 CASAVA_Build 13 37750769 1D ATTGATTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 10 9 68842 CASAVA_Build 13 37775108 6D TTTTCAACTG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2998 het 750 hom 30 8 8 15 T 21 15 68843 CASAVA_Build 13 37785414 2I AACATATATA --/TT CTTATAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 1 T 0 2 68844 CASAVA_Build 13 37799495 1I AATGTTTCAG -/A AAAGGTAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 3 4 68845 CASAVA_Build 13 37805362 5I TGCAATAACA -----/TAGAT TAATCATCAC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TAGAT 0 1 68846 CASAVA_Build 13 37809537 1D CTGGTTGAAG T/- TTTTTTTTTT 2943 hom 30 het 18 0 11 7 T 19 18 68847 CASAVA_Build 13 37811148 1D TGTATTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 38 3 15 20 T 17 16 68848 CASAVA_Build 13 37812133 1I GCTAATTTTT -/G TATTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 G 0 1 68849 CASAVA_Build 13 37813800 6D TAAAAAATAT GATTAA/------ GAGAAGTAGA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 GATTAA 1 0 68850 CASAVA_Build 13 37816503 1D TAGGGAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 12 11 68851 CASAVA_Build 13 37817295 11I TGAGAACTAT -----------/TTTTGCCAAAG TTTTGCCAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 8 TTTTGCCAAAG 1 2 68852 CASAVA_Build 13 37818267 1I AGGGAGAAAA -/G CATGTTATCT 3070 hom 172 het 61 0 58 3 G 0 1 68853 CASAVA_Build 13 37818691 1D GTAAATGTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 9 68854 CASAVA_Build 13 37829651 2I TAATACAGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 29 3 T 10 12 68855 CASAVA_Build 13 37830208 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 17 0 14 4 A 1 0 68856 CASAVA_Build 13 37830546 1I ATTTAGCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1386 hom 42 3 29 10 T 11 12 68857 CASAVA_Build 13 37836710 1I AAAAAAATTT -/A TAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 17 0 14 3 A 0 1 68858 CASAVA_Build 13 37849049 1I ACAGAAAGAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 8 9 68859 CASAVA_Build 13 37851901 1I ATTTTTAAAG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 24 het 31 1 24 6 T 8 9 68860 CASAVA_Build 13 37856887 1I AAAAGCATTG -/A AATGTGTATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 3 68861 CASAVA_Build 13 37897913 1I ACAAATAAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 22 0 20 6 T 8 9 68862 CASAVA_Build 13 37917403 9D CTTGCCATCT CTTAGTTCA/--------- CTTCCTGACA 3070 hom 102 het 36 0 33 5 CTTAGTTCA 1 0 68863 CASAVA_Build 13 37938549 5I ATCTTGAAGA -----/AATAC AGTGCCACTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AATAC 0 1 68864 CASAVA_Build 13 37939389 1I CTGTCAGCTT -/G GGTATTACTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 2 3 68865 CASAVA_Build 13 37960463 1I TCATGGCAAA -/G AACTGGCACC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 68866 CASAVA_Build 13 37962287 1I TGATGTTTTT -/C TGGGATTATG 3070 hom 123 het 49 0 41 8 C 0 1 68867 CASAVA_Build 13 37968737 6D AAAGATTATG CCAGTT/------ CCGAGTCTTA 3070 het 3070 hom 44 20 20 7 CCAGTT 1 0 68868 CASAVA_Build 13 37971611 23D TGGTCTTGAA TGCCTGGGTTCAAGCAATCCTCC/----------------------- TGCCTTGGCC 3070 het 3070 ref 27 13 11 6 TGCCTGGGTTCAAGCAATCCTCC 1 0 68869 CASAVA_Build 13 37973690 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1888 het 653 hom 28 6 10 12 A 19 18 68870 CASAVA_Build 13 37976783 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 A 12 11 68871 CASAVA_Build 13 37993523 1D GTGCAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1707 hom 27 7 10 10 A 13 12 68872 CASAVA_Build 13 37993719 1D ATAAACTTTT A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 A 7 6 68873 CASAVA_Build 13 37997532 2D CACTCCCTGC CT/-- CTCTGCCAGC 3070 het 3070 hom 36 12 21 4 CT 3 2 68874 CASAVA_Build 13 38013265 14D ACCCTGTTTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 16 1 14 3 A 25 11 68875 CASAVA_Build 13 38013976 1I ACTCTCATTC -/T TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 4 68876 CASAVA_Build 13 38014663 1I GCTTCTGGGA -/G GATTTAAATT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 G 1 2 68877 CASAVA_Build 13 38022523 1I GGGGTGGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 11 12 68878 CASAVA_Build 13 38022968 1I TGGCTAAAGG -/T TTGCTAATTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 68879 CASAVA_Build 13 38029467 1D AATACAAACA C/- TGATCAATTA 3070 het 3070 ref 58 28 21 12 C 1 0 68880 CASAVA_Build 13 38031087 1I AATAGGGAGG -/A AAAAGTAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 4 5 68881 CASAVA_Build 13 38043525 1I CACAGATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 A 11 12 68882 CASAVA_Build 13 38043700 1D ACCAAAAAAA G/- GCCTGAATAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 G 2 1 68883 CASAVA_Build 13 38054457 1I AAATATTGAA -/G GCATAGTGCC 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 G 1 2 68884 CASAVA_Build 13 38060081 1I TTGTAAGGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 8 9 68885 CASAVA_Build 13 38066077 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2197 hom 27 9 15 3 T 11 10 68886 CASAVA_Build 13 38081357 2I TGACTGTATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 TA 7 8 68887 CASAVA_Build 13 38082573 1I ACCTCTTATA -/G GTCCCAACTC 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 G 1 2 68888 CASAVA_Build 13 38099356 1I TGCTATTCAA -/C TTGGCTCTGG 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 C 0 1 68889 CASAVA_Build 13 38114837 1I GTTTTTGGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 8 9 68890 CASAVA_Build 13 38115652 1I AAAAAAAAGG -/A GGGGGTGGGG 1830 het 228 hom 27 2 8 17 A 0 1 68891 CASAVA_Build 13 38116798 37D TGGGCATGGT GGCAGGTACCTGTAGTCCCAGTTTCTCGGGAGGCTAA/------------------------------------- GGCAGGAGAA 1352 het 1352 ref 12 12 3 0 GGCAGGTACCTGTAGTCCCAGTTTCTCGGGAGGCTAA 1 0 68892 CASAVA_Build 13 38128063 1D GCCAAAAAGA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 103 het 39 0 36 3 C 8 7 68893 CASAVA_Build 13 38153704 1D AAAATAGTAA C/- AGGCACAAGA 3070 hom 148 het 53 0 50 4 C 1 0 68894 CASAVA_Build 13 38181927 8D CTAATGACTT TACCCTTA/-------- AACTGCTTAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 TACCCTTA 1 0 68895 CASAVA_Build 13 38187068 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 12 11 68896 CASAVA_Build 13 38188276 1D ACGAGCCCCT A/- AAAAACCTAG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 6 5 68897 CASAVA_Build 13 38190799 1I CTTTCACTAC -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 32 18 7 7 A 6 7 68898 CASAVA_Build 13 38200837 1D GTGTGAACCA C/- CCGTACCTGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 3 2 68899 CASAVA_Build 13 38203068 1I TTTCTGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 500 hom 37 3 25 9 T 12 13 68900 CASAVA_Build 13 38205452 1D GAGCCAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1139 hom 30 4 18 8 T 13 12 68901 CASAVA_Build 13 38209005 1D AAACCGTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 36 0 31 8 T 10 9 68902 CASAVA_Build 13 38212232 1I GAACTTTTCA -/T TGTGTTTTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 2 68903 CASAVA_Build 13 38222600 1I AGAGTTCATT -/C TTTTTTATGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 0 1 68904 CASAVA_Build 13 38234583 1I CTCTCCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 45 1 27 17 T 11 12 68905 CASAVA_Build 13 38244839 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 13 12 68906 CASAVA_Build 13 38251550 1I AAAGAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 11 12 68907 CASAVA_Build 13 38266118 1D CATGCTAGTA C/- GAAAGAAATG 3070 het 3070 hom 46 18 26 2 C 1 0 68908 CASAVA_Build 13 38267464 1D TTCCAACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 T 11 10 68909 CASAVA_Build 13 38269279 1I TTTGAAAGCA -/C TGGTATTAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 C 0 1 68910 CASAVA_Build 13 38303751 1I TTAACTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 29 1 24 4 T 14 15 68911 CASAVA_Build 13 38309446 1D TGAGAGAGTG T/- TTGTATGATT 3070 het 3070 ref 41 21 13 8 T 3 2 68912 CASAVA_Build 13 38328106 5D TTTGTTAAAC ATTTG/----- ATTTCATTTT 3070 het 3070 ref 37 16 18 4 ATTTG 1 0 68913 CASAVA_Build 13 38335695 1I GTTATAAAAC -/A AAAAAAATGA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 A 7 8 68914 CASAVA_Build 13 38345764 4I GCATCAATCT ----/AATA AATCCATTAG 3070 het 3070 hom 53 24 26 3 AATA 0 1 68915 CASAVA_Build 13 38347309 1I TTTTTAACAA -/G GGACATTTCA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 G 2 3 68916 CASAVA_Build 13 38348584 1I ATTTATTAGT -/A AAAAAAAAAA 2287 het 2287 ref 30 14 7 9 A 14 15 68917 CASAVA_Build 13 38358540 1D GAGAGATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 12 11 68918 CASAVA_Build 13 38369137 4D TTACATTTAT TTAC/---- TTACTTATCT 2511 het 2511 ref 13 7 6 2 TTAC 2 1 68919 CASAVA_Build 13 38370413 1I TTTTTCCCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 9 10 68920 CASAVA_Build 13 38375104 1I CTATAAATAT -/G GGGGAAATCT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 G 4 5 68921 CASAVA_Build 13 38385890 2I CCTGTTTATT --/TC CAGCTTGAGA 3070 hom 65 het 28 0 22 6 TC 0 1 68922 CASAVA_Build 13 38386285 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 8 9 68923 CASAVA_Build 13 38387857 5D TTTTCTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTGTT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 T 12 7 68924 CASAVA_Build 13 38388540 1I GAAGAAAACA -/T TTTTTTAATA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 7 68925 CASAVA_Build 13 38408484 5D6M1D ACTATACTAA GCTCTGCAGATA/-----GCAGAT- AAACAGACAA 3070 hom 69 het 29 0 24 11 N/A 0 0 68926 CASAVA_Build 13 38410002 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 6 7 68927 CASAVA_Build 13 38410248 2D ACCTAAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 19 1 17 2 A 12 10 68928 CASAVA_Build 13 38410325 1D TGGCTAATCT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 9 8 68929 CASAVA_Build 13 38411518 2D ATGTGAGAAC AT/-- AGGGAAAAAG 3070 hom 89 het 32 0 29 4 AT 1 0 68930 CASAVA_Build 13 38415687 1D ACAAGACTGT G/- GTAGTGATAG 3070 hom 72 het 26 0 25 3 G 2 1 68931 CASAVA_Build 13 38417081 3D TTTTTTAAAT GTG/--- GTACTTCACC 3070 hom 114 het 39 0 39 4 GTG 1 0 68932 CASAVA_Build 13 38417283 1D GTAGATCTGG A/- AAAAAGTACT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 5 68933 CASAVA_Build 13 38420096 2D GGAGGCCCAT CA/-- CCCCATTCCC 3070 hom 98 het 36 0 30 8 CA 1 0 68934 CASAVA_Build 13 38425522 1I ATGGATAAAT -/G GGGAGTCATA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 3 4 68935 CASAVA_Build 13 38428519 12D AAACTCTATA ATATATAGTTAT/------------ ATATATAGTT 1514 hom 10 het 5 0 4 1 ATATATAGTTAT 2 1 68936 CASAVA_Build 13 38429702 1D CAGCTGGGCA T/- TTGGAACATG 3070 hom 132 het 48 0 44 4 T 3 2 68937 CASAVA_Build 13 38434372 1I TCATTTGAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 136 hom 36 1 29 8 A 8 9 68938 CASAVA_Build 13 38437021 1D ATCACTGAAA C/- CAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 2 1 68939 CASAVA_Build 13 38469716 1D GAGGTCAGAC T/- TTTTTTTTTC 1347 het 1347 ref 44 38 3 3 T 10 9 68940 CASAVA_Build 13 38506336 1D AAAACAGCCT A/- AAAAAAAAAA 1852 het 1852 ref 52 40 5 7 A 12 11 68941 CASAVA_Build 13 38527843 1I TTGTTTTTTC -/T TTTTCTTTTT 3070 het 323 hom 25 2 23 0 T 4 5 68942 CASAVA_Build 13 38568310 13I TATGATTTGA -------------/AACTAAACAAACT GTACTTCAGT 3070 hom 126 het 45 0 42 5 AACTAAACAAACT 0 1 68943 CASAVA_Build 13 38569565 4D GTTAGCTGTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TC 9 7 68944 CASAVA_Build 13 38571696 3D ACCTTTTTTT TTC/--- TTCTTATTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 4 TTC 2 1 68945 CASAVA_Build 13 38572666 3D AATAGAATGC TTG/--- TTATTTTTAT 3070 hom 135 het 49 0 46 4 TTG 1 0 68946 CASAVA_Build 13 38574079 3I ACTAATAAAT ---/AAG AAGAGATAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAG 1 2 68947 CASAVA_Build 13 38579095 1D TTTACATGAC T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 120 het 47 0 40 8 T 6 5 68948 CASAVA_Build 13 38580210 2I GTTTTCCTTT --/TC TCTCTTTGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TC 2 3 68949 CASAVA_Build 13 38581619 1I TTTAAAAAAG -/T TACATTCTTA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 1 2 68950 CASAVA_Build 13 38585753 4D ATTTTATTTA TTTG/---- TTTGTTTATG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTTG 2 1 68951 CASAVA_Build 13 38586269 2I TTAGCTCTTT --/TC TCTAATGCTC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TC 1 2 68952 CASAVA_Build 13 38587646 2I AATTTTAGTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 25 0 20 5 TG 0 1 68953 CASAVA_Build 13 38589436 1D TAATCTTGAA T/- TTTAATTTGA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 4 3 68954 CASAVA_Build 13 38592618 1D GCTGCCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 14 13 68955 CASAVA_Build 13 38592798 1I TATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 944 hom 22 2 18 2 T 9 10 68956 CASAVA_Build 13 38596153 1I GGACTATTTG -/T TTTTTTTAGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 8 68957 CASAVA_Build 13 38599543 1D AAGTATGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 10 9 68958 CASAVA_Build 13 38605593 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 1305 het 1305 ref 38 16 5 17 C 1 0 68959 CASAVA_Build 13 38607702 1D ACAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 65 het 23 0 21 2 A 9 8 68960 CASAVA_Build 13 38630896 1I CCCCTGGGCC -/T TTCATTCCTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 2 3 68961 CASAVA_Build 13 38654964 1D CAATACATAC A/- GGGGGAATCT 3070 hom 116 het 44 0 38 7 A 1 0 68962 CASAVA_Build 13 38656483 5I AATAGGGAGG -----/AGAGA AGAGTGTGAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AGAGA 0 1 68963 CASAVA_Build 13 38658227 1D ATGGGATTGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 157 het 56 0 53 4 T 8 7 68964 CASAVA_Build 13 38664243 1I CGCTTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 1958 het 321 hom 13 1 6 6 T 15 16 68965 CASAVA_Build 13 38669446 1D CACTGTGTTA C/- AAAAGCAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 C 1 0 68966 CASAVA_Build 13 38684246 3I CAGTTTTGTC ---/TCA TCATTCATTG 3070 hom 93 het 37 0 32 7 TCA 1 2 68967 CASAVA_Build 13 38731339 3I TCCCATAACA ---/TGT TGTAGCCCTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TGT 1 2 68968 CASAVA_Build 13 38731893 3D AGAATGCATC TAT/--- TTGTGAAGAG 3070 hom 6 het 37 1 11 26 TAT 1 0 68969 CASAVA_Build 13 38734082 1I GGAAAAAGAG -/A AAAAAGAAAT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 5 6 68970 CASAVA_Build 13 38739608 7I ATGTCTATTG -------/TCCTTAA TCCTTAATTC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 TCCTTAA 1 2 68971 CASAVA_Build 13 38743550 1D AATTAAGAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 T 10 9 68972 CASAVA_Build 13 38743752 1D GTCCTGGAGG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 9 8 68973 CASAVA_Build 13 38745005 2I AAAGAAAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AG 5 6 68974 CASAVA_Build 13 38747798 4D TTGTTGTGTT AGAC/---- AGAAGTTTTA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 AGAC 1 0 68975 CASAVA_Build 13 38757672 1D ATCTCTTTTC T/- CTTGTAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 0 68976 CASAVA_Build 13 38762360 1I AAGATGATCC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 9 10 68977 CASAVA_Build 13 38769700 1D TTGCCTTTTG C/- CCTGACTGTA 3070 hom 123 het 47 0 40 8 C 3 2 68978 CASAVA_Build 13 38771236 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TA 5 6 68979 CASAVA_Build 13 38824959 2D GGAAAACATT TA/-- TATATATATA 993 hom 12 het 8 0 5 3 TA 6 5 68980 CASAVA_Build 13 38830734 4D AACGGAGTAA ACAG/---- ACAGCCTACA 3070 hom 54 het 21 0 19 4 ACAG 2 1 68981 CASAVA_Build 13 38844526 1I GATTTTTTTC -/A AAGTATGCTC 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 2 3 68982 CASAVA_Build 13 38862298 1D ACATATTTTT A/- AAAAAGTAGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 6 5 68983 CASAVA_Build 13 38863853 30D ATAAGATTGC TGATATGCACCATCAATACGGTGGTACAGG/------------------------------ TGGCCAACTC 3070 het 3070 ref 28 21 13 3 TGATATGCACCATCAATACGGTGGTACAGG 1 0 68984 CASAVA_Build 13 38868775 2I TCTCCAAAAA --/AT ACAAAAATTA 3070 het 3070 ref 44 19 14 12 AT 0 1 68985 CASAVA_Build 13 38869299 1D AAGTAAATTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 10 9 68986 CASAVA_Build 13 38870044 2D AGTCAGACTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 53 23 18 13 TG 10 9 68987 CASAVA_Build 13 38877334 1I TGGACGGTCT -/A AATTTATAAA 3070 het 3070 hom 52 18 28 6 A 2 3 68988 CASAVA_Build 13 38878754 2I TTGATAAAAC --/TT ATTAAAATTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 2 68989 CASAVA_Build 13 38885603 1D AATTGGGGGT A/- GGGGGGGTGG 2468 het 21 hom 29 0 11 18 A 1 0 68990 CASAVA_Build 13 38885723 2D AACCGACTAG TT/-- TTTTTTTTTT 327 het 327 ref 34 6 2 26 T 16 14 68991 CASAVA_Build 13 38887638 1D AAAAATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 38 2 24 14 A 13 12 68992 CASAVA_Build 13 38888115 1D ATCACCCCTA G/- ATTCTCTGTC 3070 hom 175 het 63 0 59 4 G 1 0 68993 CASAVA_Build 13 38888502 1I TTAATATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 40 1 31 8 A 12 13 68994 CASAVA_Build 13 38890520 7D TTTTTTGGTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1421 hom 30 8 12 10 T 19 12 68995 CASAVA_Build 13 38893242 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 8 9 68996 CASAVA_Build 13 38893899 1I GAGAGGATGG -/A AAAAGGCTGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 4 5 68997 CASAVA_Build 13 38898362 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 842 hom 22 4 12 6 T 13 12 68998 CASAVA_Build 13 38901400 1I GATTTCTCTA -/T TTTTTCCTTG 3070 het 3070 ref 44 25 12 7 T 5 6 68999 CASAVA_Build 13 38913637 1I AGAATTTCTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 A 8 9 69000 CASAVA_Build 13 38918825 1D GTAAACCATA T/- TGCCCAAAGT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 2 1 69001 CASAVA_Build 13 38923304 4I TGAGATCCAT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TTTG 2 3 69002 CASAVA_Build 13 38924243 1I CATCAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 32 5 A 11 12 69003 CASAVA_Build 13 38926153 5D CCCCTAGGCA AATGC/----- AATTGATTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 7 AATGC 1 0 69004 CASAVA_Build 13 38932205 2D CAAAATTTAA TT/-- AATGCCTTGA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 2 0 69005 CASAVA_Build 13 38933971 3D CCATTGGAAT TTC/--- TTCTTCTCTA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 TTC 3 2 69006 CASAVA_Build 13 38940618 1D GCAGTTCCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 3 A 10 9 69007 CASAVA_Build 13 38941021 1D CAAATGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 40 1 29 10 A 13 12 69008 CASAVA_Build 13 38967741 1D CATACTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 31 1 19 11 T 13 12 69009 CASAVA_Build 13 38971388 1I CAATGAGCTG -/C TTTTTCTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 0 1 69010 CASAVA_Build 13 38971704 1I CCTATACGCC -/A ACCCTTTCAG 3070 hom 159 het 57 0 50 7 A 1 2 69011 CASAVA_Build 13 38974601 1D ACAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2571 het 12 hom 23 1 12 11 A 15 14 69012 CASAVA_Build 13 38983604 2D TTAAATTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3003 hom 41 15 16 11 A 16 14 69013 CASAVA_Build 13 38991381 1D CTCAAAAAAT A/- AAAATAAAAA 314 het 201 hom 30 3 6 22 A 5 4 69014 CASAVA_Build 13 38996482 1I TAAGGCCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 948 hom 37 4 25 8 A 12 13 69015 CASAVA_Build 13 38998004 1I TAATTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 32 10 T 10 11 69016 CASAVA_Build 13 39010126 6D TCTTTCTTTC TTTCTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 13 0 11 2 TTTCTT 1 0 69017 CASAVA_Build 13 39015775 5I TACCAAACTC -----/CTCTT CTCAGCTCAG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 CTCTT 0 1 69018 CASAVA_Build 13 39024018 1D AAACAGGGAC A/- AAAGTAATAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 4 3 69019 CASAVA_Build 13 39035475 5I CCCTCTGTGA -----/CAGTC CAGTCCATGC 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 CAGTC 1 2 69020 CASAVA_Build 13 39036263 1I GAGCATTTTA -/T TTTTTGTTCA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 5 6 69021 CASAVA_Build 13 39037350 9D45M1D GAGAAAAAGC AGTTGAATTAGTTGAATTACAGTATATTTCATCATAGAATGATAGTGTACCCTTA/---------AGTTGAATTACAGTATATTTCATCATAGAATGATAGTGTACCCTT- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 32 0 17 36 N/A 0 0 69022 CASAVA_Build 13 39053735 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 22 0 14 9 T 12 11 69023 CASAVA_Build 13 39059295 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 34 0 29 5 A 12 11 69024 CASAVA_Build 13 39067844 1D GGTTGTGATG A/- AAGGCATGGT 3070 hom 93 het 39 0 31 9 A 3 2 69025 CASAVA_Build 13 39068793 1D GGCATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 36 0 27 9 A 13 12 69026 CASAVA_Build 13 39079150 2D ACCCTCCCCT GA/-- GAGGGACCCA 3070 hom 60 het 23 0 19 5 GA 2 1 69027 CASAVA_Build 13 39082317 1D TATATAGATT A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 107 het 40 0 36 5 A 8 7 69028 CASAVA_Build 13 39092035 1I ACTTAAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 9 10 69029 CASAVA_Build 13 39093176 1I TAATACAATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 9 69030 CASAVA_Build 13 39100180 1D TAACTGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 618 hom 28 3 11 14 T 15 14 69031 CASAVA_Build 13 39106674 2D AAATATGTAG AC/-- ACATACTTTA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 AC 2 1 69032 CASAVA_Build 13 39109669 4D TAGCCTGCTA ACTT/---- ACTTGTTCTT 3070 het 3070 ref 34 21 7 7 ACTT 2 1 69033 CASAVA_Build 13 39114556 8D CTTCTTAAGG GCACCTTA/-------- TGTTTATAAT 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 GCACCTTA 1 0 69034 CASAVA_Build 13 39116192 1D AGCCAAAAAG T/- TTTTTGAAAC 3070 het 3070 ref 20 10 7 5 T 6 5 69035 CASAVA_Build 13 39121810 4D CATAAAAACA TACT/---- TAAGTAAGCA 2464 het 2464 ref 23 13 6 5 TACT 1 0 69036 CASAVA_Build 13 39123092 1D TTGGAATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 12 11 69037 CASAVA_Build 13 39123104 1D TTTTTTTTTT A/- AAACATAAGG 3070 hom 23 het 29 1 20 12 A 4 3 69038 CASAVA_Build 13 39124104 3D AGTCACACAA CTT/--- CTTTTGCAAG 3070 het 3070 hom 25 8 13 7 CTT 2 1 69039 CASAVA_Build 13 39125827 1D TAAATTTGTA T/- TTTTTATTAC 2770 het 2428 hom 15 6 7 4 T 6 5 69040 CASAVA_Build 13 39125891 2I AACAGCTTTA --/TT TTTTTTTTTT 1168 het 1168 ref 13 7 4 2 T 12 14 69041 CASAVA_Build 13 39127083 1I AGAAAAAAAG -/C CAATGATGTT 2252 het 2252 ref 26 14 7 5 C 1 2 69042 CASAVA_Build 13 39129668 1I ACTTCATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 9 19 12 T 10 11 69043 CASAVA_Build 13 39131182 1D TGCATAAAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 360 hom 54 1 46 7 T 10 9 69044 CASAVA_Build 13 39135233 2I AATAATAAAC --/AT ATGCATTTAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AT 1 2 69045 CASAVA_Build 13 39138715 17D TTTTACATCC ACTGATCTTGACATTCT/----------------- TTTATTTTGA 3070 het 3070 ref 33 22 12 3 ACTGATCTTGACATTCT 1 0 69046 CASAVA_Build 13 39140240 15D CTTTTACATT ACGATTCATGTATCC/--------------- ACACCTTATC 3070 het 3070 ref 27 16 13 3 ACGATTCATGTATCC 1 0 69047 CASAVA_Build 13 39140925 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1343 het 300 hom 9 2 6 1 A 15 16 69048 CASAVA_Build 13 39141163 2D ACGATATAGT AC/-- ACAGTTCCAT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 AC 2 1 69049 CASAVA_Build 13 39152282 4D TTTTAGTAAT CAAA/---- CATTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 6 CAAA 1 0 69050 CASAVA_Build 13 39155885 1I TTTATGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1100 hom 30 4 17 9 A 11 12 69051 CASAVA_Build 13 39158009 3I CCCTTTTCTG ---/TAC TAGTATGTCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TAC 0 1 69052 CASAVA_Build 13 39162237 1D GAGAAAAAAA T/- CTATTAAATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 1 0 69053 CASAVA_Build 13 39164114 4I TTAGAAACAT ----/AAAG AAAAGGTTAT 3070 hom 87 het 34 0 33 1 AAAG 0 1 69054 CASAVA_Build 13 39168309 4I TTTTTATTGA ----/TTGT TTGCATGTAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TTGT 0 1 69055 CASAVA_Build 13 39170317 1D ACTCCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 7 A 11 10 69056 CASAVA_Build 13 39178750 1I CTACACATTT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 7 8 69057 CASAVA_Build 13 39182982 1D GGTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 11 10 69058 CASAVA_Build 13 39183646 27D CTCTGCCCCT TCTAAGAACAGTGGGACCTTTGGAAGG/--------------------------- TTATTTAATC 3070 hom 63 het 20 0 21 6 TCTAAGAACAGTGGGACCTTTGGAAGG 1 0 69059 CASAVA_Build 13 39186362 1I TTTTTGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 941 hom 29 2 21 6 T 11 12 69060 CASAVA_Build 13 39189626 1I TCATTTTTTC -/A AATTCTTTTT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 2 3 69061 CASAVA_Build 13 39191289 1D AACTTTTACA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 9 8 69062 CASAVA_Build 13 39197824 2D TTATAACTTC TA/-- TATATGAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TA 3 2 69063 CASAVA_Build 13 39200609 1D TATGGACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2931 hom 38 10 18 11 T 13 12 69064 CASAVA_Build 13 39207556 4I CATTGCCCTG ----/CTTT CTAATATTTG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 CTTT 0 1 69065 CASAVA_Build 13 39223365 1I GTCCCGATAA -/T TTTTTTTTTT 1511 het 1511 ref 40 30 5 5 T 13 14 69066 CASAVA_Build 13 39224285 1D TCTTGTCAGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 9 8 69067 CASAVA_Build 13 39227844 1I AGCAGGGAAT -/G GAAGGCAGAA 3070 het 3070 hom 57 23 29 5 G 1 2 69068 CASAVA_Build 13 39236465 1D ACTTGGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 16 13 5 T 10 9 69069 CASAVA_Build 13 39237291 1D TTTGTTCCTT A/- AAAAAGAGTC 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 A 6 5 69070 CASAVA_Build 13 39240257 2D TTTAACACAC AT/-- GTCTGTCTAT 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 AT 1 0 69071 CASAVA_Build 13 39241271 1D CAGAATGTCT G/- GAGCTTTTCT 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 G 2 1 69072 CASAVA_Build 13 39247411 5D GTGACTCAAA TAAGT/----- TAAGACAGGT 3070 het 3070 hom 59 24 30 7 TAAGT 1 0 69073 CASAVA_Build 13 39251391 1I TTTCAGTAAG -/T ATTAGCAATG 3070 hom 144 het 59 0 49 10 T 0 1 69074 CASAVA_Build 13 39269928 1D AAATTACTGG T/- TTATATGTCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 3 2 69075 CASAVA_Build 13 39274787 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 897 het 897 ref 23 13 3 7 A 13 14 69076 CASAVA_Build 13 39276719 1I TTCCTTATAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 7 8 69077 CASAVA_Build 13 39291018 3D CTCAAATTAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 38 1 30 7 A 19 16 69078 CASAVA_Build 13 39297747 1D ACCAGGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 10 T 11 10 69079 CASAVA_Build 13 39297931 1D GCAAGTAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 13 12 69080 CASAVA_Build 13 39299275 9D GATACAAACC CTGAAATAA/--------- CTAAAATAAT 3070 het 3070 ref 28 15 13 3 CTGAAATAA 1 0 69081 CASAVA_Build 13 39308122 4D TTTTTTACCA ATTT/---- ATTTGTGGAG 3070 het 3070 hom 41 14 22 6 ATTT 2 1 69082 CASAVA_Build 13 39314606 1I AAGCATTCAC -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 T 7 8 69083 CASAVA_Build 13 39323833 1D TCCAACTTCC A/- ACTATGTGGT 1691 het 1691 ref 22 16 4 2 A 2 1 69084 CASAVA_Build 13 39328501 1I GTTTTGTTTG -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 7 8 69085 CASAVA_Build 13 39328604 5I GTGAACACTT -----/ATCTG TATTGTATTG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 ATCTG 0 1 69086 CASAVA_Build 13 39330399 1D TAAAAGGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 A 10 9 69087 CASAVA_Build 13 39334196 1D AATTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 38 0 21 18 T 15 14 69088 CASAVA_Build 13 39353735 1I CATGCCATGG -/A AGGTGAGAGC 3070 het 89 hom 68 1 59 8 A 1 2 69089 CASAVA_Build 13 39355859 1I CTAAGTTTAC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 9 69090 CASAVA_Build 13 39365360 2I GTGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 47 15 21 11 GT 8 9 69091 CASAVA_Build 13 39367594 1D AGATGTACTT A/- AGAGTTTTCA 3070 hom 169 het 62 0 57 5 A 2 1 69092 CASAVA_Build 13 39371157 1D AAGAATACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 10 9 69093 CASAVA_Build 13 39378491 2D TATACGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 14 23 6 TG 9 8 69094 CASAVA_Build 13 39388991 1I GTCCAAAAAA -/G AATACATTTT 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 G 0 1 69095 CASAVA_Build 13 39389726 4D ACATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 811 het 811 ref 32 17 7 10 AC 8 6 69096 CASAVA_Build 13 39390819 1D ATCCTCTGGG C/- CTTGGTGAAC 3070 het 3070 ref 68 31 28 9 C 2 1 69097 CASAVA_Build 13 39396834 1I CTTACGCATC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 8 9 69098 CASAVA_Build 13 39405174 1I AAGTACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 10 11 69099 CASAVA_Build 13 39425381 11I AGGGCCCAGG -----------/CAGGGCCCAGA CAGGGGCACA 3070 het 2643 hom 27 9 12 6 CAGGGCCCAGA 0 1 69100 CASAVA_Build 13 39428092 5D ATTCTAGATT GAAAA/----- GAAAATTTAA 3070 het 3070 hom 49 21 25 4 GAAAA 2 1 69101 CASAVA_Build 13 39433580 1I AAAAGTTTTA -/G CTGAAACGTG 3070 het 3070 hom 42 11 12 19 G 0 1 69102 CASAVA_Build 13 39433612 3D CTGTCTTCCC TGA/--- TGTCAATCAG 3070 het 2708 hom 50 6 33 12 TGA 1 0 69103 CASAVA_Build 13 39436808 1D TATGAATTTG C/- TGGTATAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 9 6 C 1 0 69104 CASAVA_Build 13 39440140 1D TCCTTCTTGC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 8 7 69105 CASAVA_Build 13 39443536 1I TTTATGTATT -/A AAGTGGTCAT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 A 2 3 69106 CASAVA_Build 13 39447639 3D TTGAAGCAAA TAC/--- TACAAGAGGA 3070 hom 150 het 51 0 50 2 TAC 2 1 69107 CASAVA_Build 13 39449102 2I CTTCAACTCC --/AA AATAAAAATG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 4 69108 CASAVA_Build 13 39456131 5D CTATCCAAAA GAAAG/----- GAAATGATTA 3070 het 3070 hom 53 22 28 6 GAAAG 1 0 69109 CASAVA_Build 13 39481508 1D GGTCCTGGGC T/- TTTTTTCGTG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 7 6 69110 CASAVA_Build 13 39498020 1D CTTTTTATTT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 8 7 69111 CASAVA_Build 13 39498943 3D CTACAAGAGG TGT/--- TGTCCTGTAG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 TGT 2 1 69112 CASAVA_Build 13 39512510 1D AAAAGCAAAT G/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 G 1 0 69113 CASAVA_Build 13 39518461 1D AATTCAGTGA T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 T 7 6 69114 CASAVA_Build 13 39521335 3I ATAATATATT ---/ATA TTACACGCTC 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 ATA 0 1 69115 CASAVA_Build 13 39523209 2D CAAAATTCAT TC/-- TCTTTCTCCT 3070 het 3070 ref 53 32 19 2 TC 2 1 69116 CASAVA_Build 13 39532311 1D AAATAACAAC A/- AAAAAAATAC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 A 8 7 69117 CASAVA_Build 13 39545485 1D TGTGTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 19 10 T 12 11 69118 CASAVA_Build 13 39546279 1D AGACTCCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 5 A 13 12 69119 CASAVA_Build 13 39559722 6D CTGACATGAG TGTGCA/------ TGTGCACATT 3070 hom 121 het 42 0 39 5 TGTGCA 2 1 69120 CASAVA_Build 13 39561192 1D GGGAGAAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 27 6 A 10 9 69121 CASAVA_Build 13 39568020 2I TAATCCCTTC --/TG TGTGGCACTT 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 TG 2 3 69122 CASAVA_Build 13 39573612 3D AGAGACTCAA GCT/--- GCTATCAGGG 3070 hom 150 het 53 0 50 4 GCT 2 1 69123 CASAVA_Build 13 39582951 3I CAGAATGGAC ---/AAT AATGAAGAAT 3070 hom 150 het 55 0 50 5 AAT 1 2 69124 CASAVA_Build 13 39586480 10I10M4I ATATGCCCCC ----------TATCTATTTT----/TAGATAGGGGTATGTATTCTATAC ACGTGTAGAT 3070 het 3070 ref 45 23 23 7 N/A 0 0 69125 CASAVA_Build 13 39590219 2I TCACTGATAC --/AT AACAAAAAAG 3070 hom 108 het 42 0 35 7 AT 0 1 69126 CASAVA_Build 13 39593288 7D CTATTCTTGC TTTCGGT/------- TCAGTAGTCG 3070 hom 148 het 52 0 50 3 TTTCGGT 1 0 69127 CASAVA_Build 13 39600742 1I ATGGATGTTT -/G GGCCACACAG 3070 het 3070 ref 55 29 24 2 G 2 3 69128 CASAVA_Build 13 39602126 1I ACCTGTGCTT -/C CTGTGACCTG 3070 hom 72 het 29 0 24 6 C 1 2 69129 CASAVA_Build 13 39607405 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 11 10 69130 CASAVA_Build 13 39612032 7D GGGAAATCAA GCAGTGT/------- GCAGTGTGCA 3070 hom 78 het 32 0 26 9 GCAGTGT 3 2 69131 CASAVA_Build 13 39612829 9D CTTGTACAGT ATAGACAGG/--------- ACCTAGATAT 3070 het 3070 hom 49 21 25 8 ATAGACAGG 1 0 69132 CASAVA_Build 13 39614811 4I TTTCTCTCTC ----/TCTG TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 TCTG 0 1 69133 CASAVA_Build 13 39616723 14D GAGAAATGCT GGGAAGGGGAGACA/-------------- GGAAGATAAA 3070 hom 99 het 34 0 33 3 GGGAAGGGGAGACA 1 0 69134 CASAVA_Build 13 39630593 1I AGGGTTCTGA -/G CATGAGTGGT 3070 hom 108 het 44 0 36 8 G 0 1 69135 CASAVA_Build 13 39643825 4D TGGCTTATCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 126 het 47 0 40 8 T 18 14 69136 CASAVA_Build 13 39677496 1D CCCACTCAAT A/- AGAACATTGA 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 A 2 1 69137 CASAVA_Build 13 39693325 2D CTTTTCAAAT AC/-- AGAGTGCGTG 3070 het 3070 ref 36 21 13 5 AC 1 0 69138 CASAVA_Build 13 39698694 1I AATTCATTCC -/A AAAAATGCAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 5 6 69139 CASAVA_Build 13 39701927 1I TGGTCAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 26 3 17 6 A 11 12 69140 CASAVA_Build 13 39709324 2I TTTTACCCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 10 12 69141 CASAVA_Build 13 39715160 1I ACCGGGGAGG -/A GGGGGGCGCG 3070 het 2336 hom 28 11 11 6 A 0 1 69142 CASAVA_Build 13 39715513 3I AGGTAACCCC ---/ACA ACAAGAAAGG 3070 hom 114 het 44 0 37 7 ACA 1 2 69143 CASAVA_Build 13 39724403 2D ACGAACAAAC AA/-- AAAAATCTTA 3070 het 3070 ref 29 12 13 6 A 7 5 69144 CASAVA_Build 13 39728536 1D GTGAATACAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 8 7 69145 CASAVA_Build 13 39747049 4I AGCCAGCAGA ----/CTGG CTACCTGTCT 2885 het 2885 ref 41 15 11 15 CTGG 0 1 69146 CASAVA_Build 13 39747261 1D CCCAGGGTGA C/- CCCCCAAACC 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 C 6 5 69147 CASAVA_Build 13 39748794 2D CCCAGCGCGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3015 hom 41 8 18 15 AC 10 9 69148 CASAVA_Build 13 39755083 5I TTGCATCCTT -----/CAATC CAATCAAGTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 CAATC 1 2 69149 CASAVA_Build 13 39762704 4D TACATATGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 157 het 64 0 52 13 TG 8 6 69150 CASAVA_Build 13 39763112 2I TATGTCATAG --/AC ACACCCACAC 3070 hom 175 het 64 0 58 6 AC 2 3 69151 CASAVA_Build 13 39766204 1I TAGTGCCCAC -/A GCACAGATAT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 0 1 69152 CASAVA_Build 13 39770608 1I TCAAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 772 hom 34 2 20 12 A 14 15 69153 CASAVA_Build 13 39770924 1D TTTATAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 27 1 17 9 T 13 12 69154 CASAVA_Build 13 39774865 3I GATGCTTTTA ---/TTT TATCAATAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 4 69155 CASAVA_Build 13 39777353 2I CTCCAAAAAT --/TC TTTGTCAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TC 0 1 69156 CASAVA_Build 13 39781898 1D GGGGATGGAG A/- AAAAAAGACT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 7 6 69157 CASAVA_Build 13 39783921 1I CTTTCCTCCT -/C CCCCATAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 C 4 5 69158 CASAVA_Build 13 39793317 1D AGTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2437 het 1506 hom 21 8 9 4 A 18 17 69159 CASAVA_Build 13 39807616 1D TCCATTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 11 10 69160 CASAVA_Build 13 39815783 1D GGATTGACCC A/- AATTCCCACC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 3 2 69161 CASAVA_Build 13 39835616 4D AGATGGATGG TTCT/---- TCTTGAGGCA 3070 het 3070 hom 61 24 31 7 TTCT 1 0 69162 CASAVA_Build 13 39841022 4D AAAAACAAAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2354 hom 30 13 10 9 A 23 19 69163 CASAVA_Build 13 39841317 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 9 69164 CASAVA_Build 13 39842757 2D ATTAACAACT AG/-- AGTCTTCTAG 3070 het 3070 hom 47 18 26 4 AG 2 1 69165 CASAVA_Build 13 39853070 1I AATTCAAAGA -/C CCCCCCCACA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 C 7 8 69166 CASAVA_Build 13 39869978 1D GGCAATTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 754 hom 34 2 23 9 A 15 14 69167 CASAVA_Build 13 39884527 1I TTTACCCCCC -/T AGCACTAATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 0 1 69168 CASAVA_Build 13 39890669 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 1171 het 1171 ref 27 21 3 4 A 12 11 69169 CASAVA_Build 13 39893412 2D ACCCAAGGAG AT/-- ATATATATAT 1013 het 1013 ref 27 13 3 11 AT 8 7 69170 CASAVA_Build 13 39895917 1I TGCACAGGTT -/A ACATGAAATG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 69171 CASAVA_Build 13 39903971 1D TTAAAAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 38 2 24 12 A 15 14 69172 CASAVA_Build 13 39909855 1D CCCTTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1391 het 1391 ref 35 25 5 7 A 11 10 69173 CASAVA_Build 13 39910444 1I TTTCCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 42 0 35 7 T 10 11 69174 CASAVA_Build 13 39919960 26D GCTTGAATTT CTTTTTCCATCTTTATCGTTTCACAA/-------------------------- ATAGAAGATT 3070 hom 108 het 32 0 35 4 CTTTTTCCATCTTTATCGTTTCACAA 1 0 69175 CASAVA_Build 13 39931203 16D GAAAAAAGAA AGGGAGAGAGGGAGGG/---------------- AGGGAGAGAG 3070 hom 69 het 33 0 23 12 AGGGAGAGAGGGAGGG 2 1 69176 CASAVA_Build 13 39963960 1D GTCACTGAGA C/- AGAAGCCTGT 3070 hom 90 het 32 0 26 6 C 1 0 69177 CASAVA_Build 13 39971274 1I GTCTTCTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 9 10 69178 CASAVA_Build 13 39971333 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 17 0 14 3 A 10 11 69179 CASAVA_Build 13 39996367 1I TATTGTCAAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 7 8 69180 CASAVA_Build 13 39999926 1I GCACAGGAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 8 9 69181 CASAVA_Build 13 40014234 1D AAACAGTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 11 10 69182 CASAVA_Build 13 40019635 1D AGTACCCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2526 hom 25 8 13 4 A 10 9 69183 CASAVA_Build 13 40030546 1D GCATTTAATC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 9 8 69184 CASAVA_Build 13 40036420 1D TTTAGACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 A 12 11 69185 CASAVA_Build 13 40038517 1I TTGACTTTCA -/T TTTTTTTTTT 2138 het 803 hom 27 6 9 12 T 16 17 69186 CASAVA_Build 13 40042360 4D GGCAAGAAAA TTGC/---- TTGAACTCGG 3070 het 484 hom 14 2 10 2 TTGC 1 0 69187 CASAVA_Build 13 40060944 2D CAAGTGATTT AA/-- AAGTGTCACT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 A 4 2 69188 CASAVA_Build 13 40069331 1D ATATCTAGTC T/- TTCCTTATAC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 3 2 69189 CASAVA_Build 13 40071268 1D TATAAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 34 0 28 7 A 12 11 69190 CASAVA_Build 13 40080171 1D CATTCGGTCC A/- ACATCCATAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 2 1 69191 CASAVA_Build 13 40095258 1I AATGGGAATG -/T TTTAAAAAAA 3070 het 223 hom 28 1 23 4 T 3 4 69192 CASAVA_Build 13 40107339 1I TTCATTAACC -/A AAAAAAATTT 3070 het 99 hom 39 1 32 6 A 7 8 69193 CASAVA_Build 13 40122288 4D CTTTTTAGAC TATA/---- TATATAGAGT 3070 hom 93 het 34 0 31 5 TA 5 3 69194 CASAVA_Build 13 40123236 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTGTTTT 2277 hom 10 het 12 0 8 4 T 6 5 69195 CASAVA_Build 13 40123667 3D TACCAAATAA CTT/--- CAAGAGAGGA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CTT 1 0 69196 CASAVA_Build 13 40126638 1D ACTCTGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 18 1 13 4 A 15 14 69197 CASAVA_Build 13 40143216 1I CCTGATACGA -/T TATTTGCTAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 1 2 69198 CASAVA_Build 13 40148740 8D AAAAAAAAAA AGAAGAAG/-------- AAGAAGAAGA 3070 hom 21 het 19 1 17 5 AGAAGAAG 1 0 69199 CASAVA_Build 13 40155386 1D CAGAAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 11 10 69200 CASAVA_Build 13 40161415 1I TGATTGGAAA -/C TATAACCATA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 0 1 69201 CASAVA_Build 13 40163435 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 919 hom 27 2 22 3 A 11 10 69202 CASAVA_Build 13 40165089 1I ACTCCGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 13 8 A 13 14 69203 CASAVA_Build 13 40172983 1D ACACTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1300 hom 42 8 13 21 T 19 18 69204 CASAVA_Build 13 40178125 5I TTGTTGTTGT -----/TTTAA TTTGAGATGG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 TTTAA 0 1 69205 CASAVA_Build 13 40179880 3I GTTTAATTAG ---/ATC CCATTTGTCA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 ATC 0 1 69206 CASAVA_Build 13 40187984 1D CTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 30 3 14 13 T 17 16 69207 CASAVA_Build 13 40232768 1D CATTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1818 het 1818 ref 36 14 6 16 T 17 16 69208 CASAVA_Build 13 40244468 1I ACCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2205 het 26 hom 12 1 5 6 A 12 13 69209 CASAVA_Build 13 40315339 1D CCTTCTTGAT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 8 7 69210 CASAVA_Build 13 40323224 1D AAATCAGTAT A/- GGGGTGAATT 3070 hom 114 het 39 0 39 1 A 1 0 69211 CASAVA_Build 13 40326680 1D GGAGCTAATA T/- TTTAAAATGC 2393 het 2393 ref 30 14 8 8 T 4 3 69212 CASAVA_Build 13 40328841 2D AAAAATAAAC TT/-- AAGGTATCAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 0 69213 CASAVA_Build 13 40335115 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTAAGT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 T 7 6 69214 CASAVA_Build 13 40335269 1D TGCTACCTTA T/- CTTCAACCCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 1 0 69215 CASAVA_Build 13 40335543 8D AAATTCAAAA ACCAAACT/-------- ACCAAACTTA 3070 hom 63 het 23 0 22 3 ACCAAACT 2 1 69216 CASAVA_Build 13 40335860 1I AGTGTATCCT -/C CCCCCCAGGT 3070 hom 47 het 35 1 31 3 C 6 7 69217 CASAVA_Build 13 40336384 1D CAATAGCTAG A/- AAAAATAGAA 3070 hom 93 het 39 0 32 11 A 6 5 69218 CASAVA_Build 13 40336472 1D CCAATAAGAT A/- AAAAAAACTC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 7 69219 CASAVA_Build 13 40336762 4D CAATGTGCAG GTTA/---- GTTACATATG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 GTTA 2 1 69220 CASAVA_Build 13 40342889 3I TTAAAATTTG ---/AGA AGAAGTTTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AGA 1 2 69221 CASAVA_Build 13 40343622 4I TGCTTTTTGG ----/TTTC TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 21 0 15 6 TTTC 0 1 69222 CASAVA_Build 13 40345700 1I CCAAGCTCTT -/A ACACGAGTGG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 1 2 69223 CASAVA_Build 13 40346564 1I CAAGCAGTTA -/G GTCAGGGGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 2 69224 CASAVA_Build 13 40351837 52D ATACACAAAG GCACTCCTTTCTACCATATGCCCATCCTCGTCTACCCCAGTATATCGCTGCT/---------------------------------------------------- CCCTCAGGGG 3070 hom 36 het 12 0 13 2 GCACTCCTTTCTACCATATGCCCATCCTCGTCTACCCCAGTATATCGCTGCT 1 0 69225 CASAVA_Build 13 40352224 1D TAACCACGGT G/- GGGGGTTCTA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 6 5 69226 CASAVA_Build 13 40368346 1D CTCCCCCAGC A/- AAAAAAAAAA 2168 het 1702 hom 31 6 13 14 A 17 16 69227 CASAVA_Build 13 40389514 4I CCCATTACAG ----/TAGT TACCTTGTTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TAGT 0 1 69228 CASAVA_Build 13 40390673 1I TCATAAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 36 1 24 11 T 13 14 69229 CASAVA_Build 13 40391918 3I CCGTCTCAAA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 30 het 15 0 10 5 AAT 5 6 69230 CASAVA_Build 13 40393332 1I TCTAGTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 30 2 26 2 A 11 12 69231 CASAVA_Build 13 40399176 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2143 hom 20 het 8 0 7 1 A 11 10 69232 CASAVA_Build 13 40412436 3I AAATTTCTGC ---/AGA AGATCAGTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AGA 1 2 69233 CASAVA_Build 13 40412523 12D GATTTAACTG AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 26 1 21 7 A 32 20 69234 CASAVA_Build 13 40424505 1I TTGGTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 11 12 69235 CASAVA_Build 13 40433289 2D AGACATTACT TC/-- TGTCATAATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TC 1 0 69236 CASAVA_Build 13 40436653 1I ACCCCCCGAC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 64 het 26 0 23 3 T 7 8 69237 CASAVA_Build 13 40442015 1I AATTTTTAAA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 6 7 69238 CASAVA_Build 13 40444087 1D GTTTTTTTTT G/- GGGGGGGGTA 3070 hom 89 het 42 0 34 8 G 9 8 69239 CASAVA_Build 13 40446332 1D AATAAAGCTG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 8 7 69240 CASAVA_Build 13 40455091 1D GAAACAGCAC T/- TGACCACGTC 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 2 1 69241 CASAVA_Build 13 40458155 1D ACCAGATAAT A/- AAAAAATCTT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 7 6 69242 CASAVA_Build 13 40458790 4I AGGACTTCAC ----/TCTG TCTGGCAAGC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TCTG 1 2 69243 CASAVA_Build 13 40459737 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAGAAAGA 3070 het 481 hom 27 3 20 4 G 0 1 69244 CASAVA_Build 13 40461763 1D CATTTTACAC T/- AACATCCATA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 1 0 69245 CASAVA_Build 13 40471505 1D AAAAGATAGT A/- AAAATATATT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 5 4 69246 CASAVA_Build 13 40472606 1I GATCCGCTTG -/C CTCGGCCTCC 3070 hom 56 het 22 0 18 4 C 1 2 69247 CASAVA_Build 13 40513397 1D TGGTTTCATC A/- AAAAAAAAAA 1099 het 937 hom 36 10 3 23 A 19 18 69248 CASAVA_Build 13 40535611 1I AGGATTTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 T 9 10 69249 CASAVA_Build 13 40538922 4D ATCTTTATGC ATGT/---- ATCTTTTTAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 ATGT 1 0 69250 CASAVA_Build 13 40558059 3D TGACTGACCT GGG/--- TGACAGAGCC 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 G 3 0 69251 CASAVA_Build 13 40564993 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 285 hom 13 1 12 0 A 11 10 69252 CASAVA_Build 13 40567360 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2889 het 2889 ref 29 18 7 6 T 11 10 69253 CASAVA_Build 13 40571532 2D TTTTTTTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TA 9 8 69254 CASAVA_Build 13 40590506 4D TTTCTTTATT TTTA/---- TTTATTTATT 1651 hom 12 het 7 0 5 2 TTTA 4 3 69255 CASAVA_Build 13 40615960 1D AGGAGGGGCT C/- AAAAAACCTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 1 0 69256 CASAVA_Build 13 40659956 1I AGATATGGAG -/A GAATAATATG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 69257 CASAVA_Build 13 40680376 1I CTATTATGGG -/T CTTTTGTAGT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 T 0 1 69258 CASAVA_Build 13 40683721 1D TACCTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 24 0 14 10 T 15 14 69259 CASAVA_Build 13 40687245 1D TGCGTAACAT A/- GCAAGACCCC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 1 0 69260 CASAVA_Build 13 40690417 18D CACCCAGCTA ATTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 14 1 10 4 ATTTTTTTTTTTTTTTTT 1 0 69261 CASAVA_Build 13 40691251 32D ACATGGTGAA ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC/-------------------------------- CAGGCGTGGT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 1 0 69262 CASAVA_Build 13 40693967 3I TGTCACTACT ---/ACC AGAAAAACAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 ACC 0 1 69263 CASAVA_Build 13 40700308 1D AGGGAATCAC T/- TTATTATGTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 3 2 69264 CASAVA_Build 13 40700774 2D GTAATAAACT AA/-- AAAAAGCCCA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 7 5 69265 CASAVA_Build 13 40702863 1I ATGGTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2171 hom 10 het 19 0 12 7 T 13 14 69266 CASAVA_Build 13 40704469 2D ACTAAAAAAC AA/-- AGTGACAGAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 3 1 69267 CASAVA_Build 13 40707991 2I ACACACACAC --/AT AGAAACACAC 3070 het 416 hom 46 2 40 4 AT 0 1 69268 CASAVA_Build 13 40716357 4D CTTAACTCAA CTTT/---- CTTTCTTTCA 3070 hom 120 het 49 0 41 10 CTTT 3 2 69269 CASAVA_Build 13 40717386 1I TTCATATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 33 2 22 9 T 11 12 69270 CASAVA_Build 13 40718186 1D GCCCGAACAC T/- TTACTCATTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 3 2 69271 CASAVA_Build 13 40721236 2D TGTGCTTATC TA/-- TGAGTTCCTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TA 1 0 69272 CASAVA_Build 13 40724445 4I ATATTATTTT ----/ATAA ATAAAGTTAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 ATAA 1 2 69273 CASAVA_Build 13 40730712 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 476 hom 23 2 13 8 A 12 11 69274 CASAVA_Build 13 40732579 1D AAGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 377 hom 41 1 33 7 T 10 9 69275 CASAVA_Build 13 40733077 1I CACAGTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 211 hom 44 1 29 14 A 9 10 69276 CASAVA_Build 13 40733507 9D CAGAAAGAAC ATAATTCTT/--------- CAAATGTATG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 ATAATTCTT 1 0 69277 CASAVA_Build 13 40734781 1I GTGTTCTAAG -/A AAAACTCTAA 3070 hom 151 het 54 0 51 3 A 4 5 69278 CASAVA_Build 13 40737812 4D CTGCCCAAAC AAAG/---- AAGAGGTTAC 3070 hom 91 het 38 0 31 9 AAAG 1 0 69279 CASAVA_Build 13 40740000 1I GAAACTGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 22 1 18 3 A 11 12 69280 CASAVA_Build 13 40742885 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 18 0 11 7 T 9 10 69281 CASAVA_Build 13 40770520 5I9M22I4M8I TAAGTTAGCA -----CTATTACGA----------------------AGTT--------/TACATTTATTCTGATAGGTCTGAATATTGTTTAAATAGTTTTTTTTTC ACACTCTCAT 3070 hom 87 het 22 0 30 2 N/A 0 0 69282 CASAVA_Build 13 40774546 1I AGAGAGACCT -/C TTGTTCTCAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 0 1 69283 CASAVA_Build 13 40790342 1D TGCTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 1723 het 1723 ref 34 18 6 10 T 17 16 69284 CASAVA_Build 13 40793906 4D ATGGAATTCT CTTA/---- CTTACTTATG 3070 hom 120 het 47 0 41 7 CTTA 3 2 69285 CASAVA_Build 13 40797423 3D AAACCATAAA ATT/--- GTGTCACTCA 3070 hom 54 het 21 0 19 4 ATT 1 0 69286 CASAVA_Build 13 40802163 1D TAGTGGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 47 2 32 13 T 11 10 69287 CASAVA_Build 13 40804934 4D AATTTTTAGT TGAC/---- TGACTTGTGA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 TGAC 2 1 69288 CASAVA_Build 13 40807043 1D TTTAAGGTCA C/- CCCCCCCACT 3070 hom 134 het 50 0 43 8 C 8 7 69289 CASAVA_Build 13 40807362 5I GATATCAGAG -----/AAGAT AAGAGACATT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 AAGAT 0 1 69290 CASAVA_Build 13 40807996 1D CATACATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 23 12 T 13 12 69291 CASAVA_Build 13 40808307 1I TTAAAAAAAA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 0 1 69292 CASAVA_Build 13 40810071 1I TACCCAGTTA -/G GAAAAAAACA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 1 2 69293 CASAVA_Build 13 40821623 1I TGGTCCTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 551 hom 38 2 27 9 T 9 10 69294 CASAVA_Build 13 40823914 1D AGAAAAATGT G/- GGGCCATAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 G 4 3 69295 CASAVA_Build 13 40829516 3I TTCTAATAAT ---/TTC TTCTGCATTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TTC 1 2 69296 CASAVA_Build 13 40831228 1D ATTGTTTTTT A/- AAATCCCATT 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 4 3 69297 CASAVA_Build 13 40838949 4D CTTAAGAAAT TGGC/---- TGTATGGATT 3070 hom 72 het 27 0 25 4 TGGC 1 0 69298 CASAVA_Build 13 40845221 3D CGTAAAGCAA AAT/--- AATAATAATT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAT 4 3 69299 CASAVA_Build 13 40850051 3D ATAAAATAAA CAT/--- CATAGACCTG 3070 hom 123 het 42 0 42 0 CAT 2 1 69300 CASAVA_Build 13 40851015 4D AAAGAATCAT TCAC/---- TCAGTCTGTA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 TCAC 1 0 69301 CASAVA_Build 13 40855941 2D CCAAGTGTGT GG/-- GGGGGGGGAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 G 10 8 69302 CASAVA_Build 13 40873993 1D CATCATCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 37 1 31 5 A 15 14 69303 CASAVA_Build 13 40875355 4I CCCGTCAGGC ----/TGCA TGCACTTGGC 3070 hom 83 het 33 0 23 10 TGCA 1 2 69304 CASAVA_Build 13 40877774 4D CCGAATAAAC TGAA/---- TGAGCTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 8 TGAA 1 0 69305 CASAVA_Build 13 40883630 1D TTTGAAATAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 391 hom 43 1 36 6 T 10 9 69306 CASAVA_Build 13 40884532 3I AGGAGTGAAC ---/TGT TGTTGATATA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 TGT 1 2 69307 CASAVA_Build 13 40894602 1I TGCGTTCCAA -/C CCCTGTCGGA 3070 hom 44 het 16 0 15 1 C 3 4 69308 CASAVA_Build 13 40897047 2I ATCTGAAAAC --/TT TTTATTAGCC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 3 5 69309 CASAVA_Build 13 40937690 2I CCCAGAGATG --/CC TACTAGCTCA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 C 0 2 69310 CASAVA_Build 13 40950412 21I TACAGCACAC ---------------------/TGATGGGTCTTGACTCCTTAT CCAATTTGCC 1567 het 1567 ref 17 11 4 2 TGATGGGTCTTGACTCCTTAT 0 1 69311 CASAVA_Build 13 40953655 1D TATCAAATGA C/- TTTTCAACAT 2452 het 2452 ref 43 27 7 10 C 1 0 69312 CASAVA_Build 13 40956121 2D TAGGTTTTGG TA/-- TGTTATGTTT 2955 het 2955 ref 16 9 6 1 TA 1 0 69313 CASAVA_Build 13 40956759 1I CTCCTTCTGG -/T TTTTTTTTTG 2570 het 2570 ref 29 16 7 6 T 9 10 69314 CASAVA_Build 13 40956955 1I TACTATTTTG -/T TTTTTTTTTT 2938 het 2938 ref 21 9 8 4 T 10 11 69315 CASAVA_Build 13 40958262 3D AGACTTTCTT CTC/--- CTCTTTCTAT 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 CTC 2 1 69316 CASAVA_Build 13 40960787 5I TTGTAGGAGC -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 TTTCT 2 3 69317 CASAVA_Build 13 40967756 1I TTTCTCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 10 11 69318 CASAVA_Build 13 40968196 1D CCGTCCCTAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 2552 hom 27 9 11 7 A 8 7 69319 CASAVA_Build 13 40970441 3I ACCTGAAACC ---/TCT TCTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 TCT 1 2 69320 CASAVA_Build 13 40973065 1D AATAAAAGTA T/- GTATTAACAG 3070 het 3070 ref 56 30 19 7 T 1 0 69321 CASAVA_Build 13 40996682 1D ACAAGCTGTT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 7 6 69322 CASAVA_Build 13 40997744 6D ACTGTCTCAG AAAACA/------ AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 5 AAAACA 3 2 69323 CASAVA_Build 13 41001069 1D CCAATTCAAC A/- AAAACACTGA 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 A 5 4 69324 CASAVA_Build 13 41001155 5I GCAAAGTTTC -----/AATTA AATTATTAGC 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 AATTA 1 2 69325 CASAVA_Build 13 41005261 1I ATGAACAATG -/A AAAAAAAAAA 1966 het 1966 ref 22 10 5 7 A 10 11 69326 CASAVA_Build 13 41016703 2I CCCACCAGAG --/GT GTGAGATATA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 GT 1 2 69327 CASAVA_Build 13 41022731 6D CCCAGGAGAG GGAAGA/------ GGATGAAAGG 3070 hom 93 het 33 0 28 6 GGAAGA 1 0 69328 CASAVA_Build 13 41026120 1D ATTCTAACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 32 2 19 11 T 15 14 69329 CASAVA_Build 13 41029163 1D AGATTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 22 0 18 5 A 13 12 69330 CASAVA_Build 13 41041782 1D TAGGCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3054 het 3054 ref 41 20 10 11 T 17 16 69331 CASAVA_Build 13 41061582 8D AGTTTCCCCT CCAGGGCA/-------- CCTGCTCTGT 3070 het 3070 ref 33 20 13 5 CCAGGGCA 1 0 69332 CASAVA_Build 13 41064864 1D TGTTAATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2882 hom 42 10 19 14 A 17 16 69333 CASAVA_Build 13 41069973 9D TCCAGTTGTT CAGGCCCCA/--------- CACTGAGGAG 3070 het 3070 ref 42 26 12 6 CAGGCCCCA 1 0 69334 CASAVA_Build 13 41070964 1D GCTTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 19 7 T 13 12 69335 CASAVA_Build 13 41158643 1I CTTTTGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 T 10 11 69336 CASAVA_Build 13 41210029 1D TTAAAAAAAA G/- AAAAAAGAAG 2432 het 2432 ref 35 16 12 7 G 1 0 69337 CASAVA_Build 13 41219814 1I TCTTGTGCCA -/G TTTTCAAAGG 2822 het 2147 hom 12 5 6 1 G 0 1 69338 CASAVA_Build 13 41222607 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2615 het 1413 hom 28 6 12 10 A 10 11 69339 CASAVA_Build 13 41223805 1I GGATATTTGA -/T TTTAAGAGGG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 3 4 69340 CASAVA_Build 13 41234021 2D TATTTCAAAG TT/-- TTCACTTAGA 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 T 4 2 69341 CASAVA_Build 13 41244609 1I AACAAAAAAA -/C AAATCAGCAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 C 0 1 69342 CASAVA_Build 13 41256725 1I GCTTGAGCCT -/G GGAGGTTGAG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 G 2 3 69343 CASAVA_Build 13 41272769 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3028 het 1426 hom 15 5 8 2 A 11 10 69344 CASAVA_Build 13 41309618 1I TTAATAAAAC -/T TTTTCAGCAT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 4 5 69345 CASAVA_Build 13 41341024 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1460 het 183 hom 16 4 6 7 A 19 18 69346 CASAVA_Build 13 41356716 1I ATGGTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 11 12 69347 CASAVA_Build 13 41385537 4D TGCATTTTAT ACAG/---- ACAGACACAG 3070 het 3070 ref 46 27 15 5 ACAG 2 1 69348 CASAVA_Build 13 41422369 4D AATGTGTTAG CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 47 21 19 8 CAAA 4 3 69349 CASAVA_Build 13 41426322 1D CTATACAACC T/- TTTTTTTTTT 1832 het 1832 ref 47 36 5 6 T 13 12 69350 CASAVA_Build 13 41451722 1D TTTACATTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 9 8 69351 CASAVA_Build 13 41459411 1D TTTTTTAAAA T/- TTTTTTTTCC 2534 het 2534 ref 15 7 6 2 T 9 8 69352 CASAVA_Build 13 41467245 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2633 het 22 hom 24 1 8 15 T 17 16 69353 CASAVA_Build 13 41470231 1I ATTAATATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 9 10 69354 CASAVA_Build 13 41473341 4D CTTTTGGCTT TTTG/---- TTTGTTATTA 3070 het 3070 hom 31 12 17 4 TTTG 2 1 69355 CASAVA_Build 13 41476357 26D ACACTTGTCT CAAACAAACAAACAAACCAACAAACA/-------------------------- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 42 23 20 5 CAAACAAACAAACAAACCAACAAACA 1 0 69356 CASAVA_Build 13 41482596 1I GGCCCCCCCC -/G CCCCACCCCG 1351 hom 14 het 7 0 4 3 G 0 1 69357 CASAVA_Build 13 41520550 1I11M1I ATCCTAGGGA -CCCAGACCGTA-/CCCCAGACCGTAG AGGGAGTGGA 3070 hom 50 het 18 0 14 5 N/A 0 0 69358 CASAVA_Build 13 41532302 2D TCGGCCTCCC AA/-- AGTGTTGGGA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 3 1 69359 CASAVA_Build 13 41549417 1D TTTTCCTGAT G/- TGGTTTAGAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 1 0 69360 CASAVA_Build 13 41557059 1I TGTTCTTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 702 hom 30 2 23 5 A 13 14 69361 CASAVA_Build 13 41562057 1I CTCAGATTAC -/A AAAAAATTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 6 7 69362 CASAVA_Build 13 41564537 8D AAATATTATT CAGCCATG/-------- CAGCCATGAA 3070 hom 63 het 27 0 22 7 CAGCCATG 2 1 69363 CASAVA_Build 13 41579023 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 57 het 20 0 19 2 A 8 7 69364 CASAVA_Build 13 41581788 14D GCGTGCGTGC CTGTGCGTGCGTGT/-------------- GTGTGCGTGT 3070 hom 98 het 39 0 32 9 CTGTGCGTGCGTGT 1 0 69365 CASAVA_Build 13 41586581 2D6M3D TATTATCTGT GCCAGGAACTC/--TAGTAA--- TGGTAAGCGC 3070 hom 105 het 38 0 36 4 N/A 0 0 69366 CASAVA_Build 13 41595682 1I AATACAATGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 899 hom 40 2 33 5 A 9 10 69367 CASAVA_Build 13 41596446 6I TAGATTTAAA ------/TTATAT TAATTTGACT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TTATAT 0 1 69368 CASAVA_Build 13 41600777 4I CATGATTCAC ----/GAGA GAGAGAGAGT 3070 hom 139 het 55 0 45 10 GA 4 6 69369 CASAVA_Build 13 41607114 1D CTCTGTCTCT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 57 het 22 0 21 1 A 8 7 69370 CASAVA_Build 13 41607499 2I ACTGAGCATC --/AT GTGGTGCATG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AT 0 1 69371 CASAVA_Build 13 41610501 2D GTGTGCATGT GA/-- GAGGGGGTGA 3070 hom 135 het 50 0 45 7 GA 2 1 69372 CASAVA_Build 13 41628146 1D ACTACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 11 10 69373 CASAVA_Build 13 41648716 8D TGAAAGAGTA ACATAACC/-------- ACTTGTGGAA 2841 het 450 hom 35 3 11 23 ACATAACC 1 0 69374 CASAVA_Build 13 41649399 1I TGTTTTGTAC -/T TTATAAAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 3 69375 CASAVA_Build 13 41678778 1D AGGGAGACTC T/- TATTTCCCTG 3070 hom 108 het 40 0 36 7 T 2 1 69376 CASAVA_Build 13 41697031 2D TGGGAAAAGG AA/-- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 34 0 27 8 A 10 8 69377 CASAVA_Build 13 41700383 3D TGGCACTTAT AAG/--- AAGAAGTTTC 3070 hom 69 het 30 0 24 7 AAG 3 2 69378 CASAVA_Build 13 41703436 1I GTTGCAGTGA -/G CTGAGATCAC 3070 hom 93 het 35 0 32 7 G 0 1 69379 CASAVA_Build 13 41705109 1I TGAAAAAAAA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 7 8 69380 CASAVA_Build 13 41705221 1D GAGCCATGAT C/- ATGCTACTGC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 1 0 69381 CASAVA_Build 13 41706282 3I ACTTAATTTT ---/ATA ATAAGATTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ATA 1 2 69382 CASAVA_Build 13 41709537 1D GAAGTGGGGG A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 7 6 69383 CASAVA_Build 13 41719986 4I TTAAGGATAT ----/AAAG AAAGAAAAAG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AAAG 1 2 69384 CASAVA_Build 13 41746468 1D AAAACAGCCT G/- GAAAGATCCA 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 G 2 1 69385 CASAVA_Build 13 41746617 1D ACCAGGAGTT C/- AAGACCAGCC 2939 het 1986 hom 23 5 8 10 C 1 0 69386 CASAVA_Build 13 41751418 2I CACACACACA --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 254 hom 39 6 13 20 CT 6 7 69387 CASAVA_Build 13 41759763 1I TTGAGGTAAA -/T TTACCTTTAA 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 T 2 3 69388 CASAVA_Build 13 41767721 1I TCCTTTTCAA -/G GCAGACAGCA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 1 2 69389 CASAVA_Build 13 41770025 5I TTTATTCGTA -----/TTTAC TTTGCTTTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTTAC 0 1 69390 CASAVA_Build 13 41791845 4I GATTTTTGGC ----/CTTT CTTTCCTGTT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 CTTT 1 2 69391 CASAVA_Build 13 41795754 1I AGCTGCTGGG -/T TTTTTTTTTT 2698 het 2698 ref 27 11 8 8 T 13 14 69392 CASAVA_Build 13 41795965 4D TCCTGCGTTG ACAC/---- ACACACCATT 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 AC 5 3 69393 CASAVA_Build 13 41796362 4D ATTTGTATCT TAGC/---- TAGGACAGAG 3070 het 3070 ref 35 16 15 7 TAGC 1 0 69394 CASAVA_Build 13 41796869 3D TGTATTTTCA TCT/--- TCTTGAAACA 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 TCT 2 1 69395 CASAVA_Build 13 41801775 23D AGTGGTAATG AATGCCCAGGTCTGGCAGGCTCC/----------------------- AATGCCCAAG 3070 het 3070 ref 49 39 11 10 AATGCCCAGGTCTGGCAGGCTCC 1 0 69396 CASAVA_Build 13 41805516 5D TATTAAAAAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 3 A 17 12 69397 CASAVA_Build 13 41808419 1I TTAAACTGAG -/C AAACATTTCC 3070 het 3070 ref 58 27 16 15 C 0 1 69398 CASAVA_Build 13 41823065 1I TTTGTTATAG -/C CCCCCAGAGG 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 C 5 6 69399 CASAVA_Build 13 41826770 15D CTGAGGCTCT GTGGGCAGAGCCCAC/--------------- GTGGGCAGTC 3070 het 3070 hom 51 23 21 13 GTGGGCAGAGCCCAC 1 0 69400 CASAVA_Build 13 41834117 1I ACATAATATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 A 9 10 69401 CASAVA_Build 13 41840041 1D GCATGGGTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 246 hom 32 2 15 15 G 10 9 69402 CASAVA_Build 13 41840975 1I AATCCTTAAA -/T TATGATTAAA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 1 2 69403 CASAVA_Build 13 41844932 1I TCTCATTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 30 4 16 10 T 14 15 69404 CASAVA_Build 13 41845698 1D GTGGTAAAGT G/- GGTTAAATAC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 G 3 2 69405 CASAVA_Build 13 41860443 2I AATAGCAGTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 9 11 69406 CASAVA_Build 13 41862498 1I GTATCTTTAC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 100 het 43 0 38 5 T 8 9 69407 CASAVA_Build 13 41864113 4D ATCTGCTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 TTTG 3 2 69408 CASAVA_Build 13 41865484 3D GAAACTTTGT CAG/--- CAGCGGGTTG 3070 hom 75 het 31 0 25 9 CAG 2 1 69409 CASAVA_Build 13 41871284 1I CCTACAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 11 12 69410 CASAVA_Build 13 41877902 5D CCCGGGTTCT GGTCA/----- GATATGCATT 3070 het 3070 ref 35 20 14 3 GGTCA 1 0 69411 CASAVA_Build 13 41896889 1D ATAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 A 10 9 69412 CASAVA_Build 13 41918057 1D GCCATGTAAG A/- TGTGTCTCTT 2782 het 2782 ref 30 18 9 3 A 1 0 69413 CASAVA_Build 13 41926062 1I TTATTCTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 T 10 11 69414 CASAVA_Build 13 41926429 1I AAGAGGATCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 T 8 9 69415 CASAVA_Build 13 41927844 1D TTAAGACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 23 4 15 4 T 13 12 69416 CASAVA_Build 13 41942878 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 A 8 7 69417 CASAVA_Build 13 41942959 1D CTTTATTCAG A/- AAAAATATAG 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 A 6 5 69418 CASAVA_Build 13 41943686 2D AATCATGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 64 het 33 0 21 12 AC 9 8 69419 CASAVA_Build 13 41950305 1D GAAGTCACCT A/- AACAATAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 A 3 2 69420 CASAVA_Build 13 41950705 4D ATGGGGAAGA AGAC/---- AGACTGGGTC 3070 hom 87 het 33 0 28 6 AGAC 2 1 69421 CASAVA_Build 13 41951162 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 9 13 T 13 12 69422 CASAVA_Build 13 41953259 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3022 het 1993 hom 29 8 9 12 A 13 14 69423 CASAVA_Build 13 41960299 7D AACAAATGTG TACTGAA/------- TGTCCCCCAA 3070 hom 81 het 27 0 28 3 TACTGAA 1 0 69424 CASAVA_Build 13 41977812 1D CGGTATTCTT C/- CCCATTGCTT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 C 4 3 69425 CASAVA_Build 13 41986067 1I GGTCAACATG -/A TAAGTAAATG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 0 1 69426 CASAVA_Build 13 41987796 1I CAACAACAAC -/A AACAAAAAAA 3070 het 1171 hom 17 3 13 1 A 2 3 69427 CASAVA_Build 13 41994655 1I AGTAATCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 10 69428 CASAVA_Build 13 41997860 1I TGAATATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 11 12 69429 CASAVA_Build 13 41999365 1I AGGCAGAGTG -/A AAAACGGGTT 3070 het 3070 hom 41 17 15 9 A 4 5 69430 CASAVA_Build 13 42000480 1I CTAGAAACTG -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 A 7 8 69431 CASAVA_Build 13 42003364 1I CCCATCTTCC -/T TAAGGAGGTA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 1 2 69432 CASAVA_Build 13 42009149 2D TCTTTTTCCC AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 10 8 69433 CASAVA_Build 13 42009417 1D TAACAGAACG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 8 7 69434 CASAVA_Build 13 42012598 1I TTGGCAAGAG -/C TGAGAGCTTG 3070 het 3070 ref 70 33 30 7 C 0 1 69435 CASAVA_Build 13 42031337 5D TATTATACTT AAAAC/----- AACCCCATAA 3070 het 3070 ref 45 22 22 3 AAAAC 1 0 69436 CASAVA_Build 13 42037366 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTCTT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 A 1 0 69437 CASAVA_Build 13 42067082 1D GAAGTTGAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 3 2 69438 CASAVA_Build 13 42069312 7I ACCTTGAGGT -------/ACATGTC TATAGACAGT 3070 hom 144 het 52 0 48 5 ACATGTC 0 1 69439 CASAVA_Build 13 42081859 2I GTGTGGACAT --/AC ACCGCAGGCT 3070 hom 99 het 39 0 31 8 AC 1 2 69440 CASAVA_Build 13 42083311 1I CAGTGACTCT -/G GGGGGGAAGC 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 G 6 7 69441 CASAVA_Build 13 42084739 2I TGGCACCCCC --/GT GTGTGTTCTT 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 GT 3 4 69442 CASAVA_Build 13 42084839 1I TCCCTGTGTG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 41 9 21 11 T 7 8 69443 CASAVA_Build 13 42094943 25I TTGTGTGTGC -------------------------/GTGTGTGTGTGTGGTGTGTGTCTGT GTGTGTGTGT 3070 hom 81 het 40 0 27 16 GTGTGTGTGTGTGGTGTGTGTCTGT 0 1 69444 CASAVA_Build 13 42100302 2D GACAGGTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 16 14 69445 CASAVA_Build 13 42109574 1D TTTTAAAGTT C/- TGTTACTTGA 3070 hom 105 het 41 0 36 7 C 1 0 69446 CASAVA_Build 13 42119476 1I AAATAACAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 215 hom 17 1 12 4 T 8 9 69447 CASAVA_Build 13 42119768 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 229 hom 22 3 15 4 T 12 13 69448 CASAVA_Build 13 42129911 2I GGGGTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 29 3 17 9 TG 0 1 69449 CASAVA_Build 13 42141483 1I CAAAATATGC -/A AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 6 7 69450 CASAVA_Build 13 42150891 1I GACTAAATTA -/C ATTTTAACGC 3070 het 3070 hom 52 15 30 7 C 0 1 69451 CASAVA_Build 13 42155986 1I CCACCCCTCC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 7 8 69452 CASAVA_Build 13 42157027 1I CATTAAAGTA -/C CGTCTTCTGT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 C 1 2 69453 CASAVA_Build 13 42159398 1I ATGCTAAATT -/A AAAAAAAAAA 2379 het 2379 ref 24 15 5 4 A 11 12 69454 CASAVA_Build 13 42164148 1D ATTTAGAATT G/- TTTTTTTTCT 2247 het 2247 ref 23 12 8 3 G 1 0 69455 CASAVA_Build 13 42168146 1D AATGCTGTTT G/- TTTCTTTCAA 3070 het 3070 hom 40 14 24 3 G 1 0 69456 CASAVA_Build 13 42173044 2D AAATAAAAAC AG/-- AAAAATGTAG 3070 het 3070 hom 31 12 18 2 AG 1 0 69457 CASAVA_Build 13 42184145 1D TCATTTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 10 9 69458 CASAVA_Build 13 42185198 13I GCATCTGACA -------------/CATTGCAGGTGCT CAATGGATAT 3070 hom 96 het 32 0 33 3 CATTGCAGGTGCT 0 1 69459 CASAVA_Build 13 42193965 1D CTAGCCCTTG A/- AAAAAAACTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 8 7 69460 CASAVA_Build 13 42197839 1I ATTCTGCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 154 het 53 0 51 2 A 9 10 69461 CASAVA_Build 13 42199444 1D54M1D GTTTTTGTTC TTTTTTTCCCCCCAGCAAAGAAATTGCTACTATACATTTTTAGAAACCAGGTCAAT/-TTTTTTCCCCCCAGCAAAGAAATTGCTACTATACATTTTTAGAAACCAGGTCAA- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 25 22 N/A 0 0 69462 CASAVA_Build 13 42201046 3I CTTGGCCCAG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 11 14 69463 CASAVA_Build 13 42208253 1D TAATTTTGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 8 69464 CASAVA_Build 13 42215780 1I TCCAGGGGTT -/G AGGCAGGGAT 3070 hom 109 het 44 0 33 11 G 0 1 69465 CASAVA_Build 13 42227682 3D CAATAACTGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 63 30 15 20 TTG 7 6 69466 CASAVA_Build 13 42234625 1I CAGAAAGGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 8 9 69467 CASAVA_Build 13 42246575 8I GTAGATGTCT --------/ATTAGATC ATTAGATCCA 3070 het 2480 hom 13 5 8 0 ATTAGATC 1 2 69468 CASAVA_Build 13 42255043 1D AAAAATCATA T/- TTTTAAGGAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 T 5 4 69469 CASAVA_Build 13 42258486 3D ACCACATTAC TCA/--- TCCATCTATC 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 TCA 1 0 69470 CASAVA_Build 13 42262465 1D TATCTTAGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 10 9 69471 CASAVA_Build 13 42270116 1D AGACTGTATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 9 8 69472 CASAVA_Build 13 42278987 1I AGATCAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 10 14 T 13 14 69473 CASAVA_Build 13 42310558 2I GGGGAAAAAA --/AG AAAAAGCAAC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AG 0 1 69474 CASAVA_Build 13 42311545 1I AAAACAGACA -/C TGGCCACATG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 0 1 69475 CASAVA_Build 13 42318084 16I TTCTTTCTCA ----------------/TGTTCCCCGTCATGTT TGTTCCCCGT 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 TGTTCCCCGTCATGTT 1 2 69476 CASAVA_Build 13 42320085 1I CTGGTCACCC -/A GCCAGCAAAA 3070 hom 150 het 54 0 49 5 A 0 1 69477 CASAVA_Build 13 42331425 1I AATAATAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 25 1 22 2 A 10 11 69478 CASAVA_Build 13 42339692 2I AATAAACCTC --/TT GGGCCCTAAA 3070 hom 126 het 49 0 41 8 T 0 2 69479 CASAVA_Build 13 42350169 3D CAGGGAAAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 34 4 15 15 T 19 16 69480 CASAVA_Build 13 42360242 1I CCCCCAAAGC -/T TTTCAAAACC 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 3 4 69481 CASAVA_Build 13 42365042 2D GAAAACCCAG GA/-- GAGAGTACAG 3070 hom 110 het 39 0 37 2 GA 3 2 69482 CASAVA_Build 13 42370781 6I AGTATGGAAA ------/TAAACT TAAAGAATGA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 TAAACT 0 1 69483 CASAVA_Build 13 42372563 11D CAATTAACAC AGTTGTACAGA/----------- AGATACCCAA 3070 het 3070 ref 37 23 14 2 AGTTGTACAGA 1 0 69484 CASAVA_Build 13 42375346 2D10M3I ATACTATGAC ATGTTACTTTAA---/--GTTACTTTAAAAT AATTTTTAAG 3070 het 3070 ref 33 22 12 0 N/A 0 0 69485 CASAVA_Build 13 42378418 1D ACAACAGACA G/- GTGTGTGTAA 3070 het 3070 ref 54 29 18 7 G 2 1 69486 CASAVA_Build 13 42381233 6I CCATCTCAAA ------/AATAAT AATAATAACA 2116 het 2116 ref 14 8 5 1 AAT 2 4 69487 CASAVA_Build 13 42381736 1D ATTCCACCAT A/- AAAAGAAGGA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 5 4 69488 CASAVA_Build 13 42404264 2D AGGTGGGGTC TT/-- GCTGTGTTGC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 T 2 0 69489 CASAVA_Build 13 42406766 1I GGTTGTGGTT -/G GGGGGGACGT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 6 7 69490 CASAVA_Build 13 42407005 4D TCCAAATAAT GAGA/---- GAAAGAAGAA 3070 hom 105 het 36 0 35 4 GA 3 1 69491 CASAVA_Build 13 42409197 1I AGACCACTGC -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 7 8 69492 CASAVA_Build 13 42409359 1I CGTTGTTGCT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 8 9 69493 CASAVA_Build 13 42411569 2D AATGAGAGAC AT/-- GTGATATTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 6 AT 1 0 69494 CASAVA_Build 13 42419448 1I CAAAAAAAAA -/G GTACTTAGTA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 G 1 2 69495 CASAVA_Build 13 42430929 1I CAATGCAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 8 9 69496 CASAVA_Build 13 42432160 1I AAAGCATACA -/G AAGGATGTAC 3070 hom 132 het 50 0 44 9 G 0 1 69497 CASAVA_Build 13 42443755 1I AGAGGGAGGG -/A AAAAAACCCC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 6 7 69498 CASAVA_Build 13 42454929 1D AAGCAAGCCA T/- AAAAAATTTC 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 1 0 69499 CASAVA_Build 13 42455847 1D TCTGTCACTC A/- AAAAGCCATG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 5 4 69500 CASAVA_Build 13 42458541 5I GCTAGCTTAA -----/GAACC GAGACTGGTA 3070 het 2046 hom 23 5 16 2 GAACC 0 1 69501 CASAVA_Build 13 42459715 1I TTTTTTGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 10 11 69502 CASAVA_Build 13 42460987 8D AAATAGGTGG TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 3070 hom 36 het 18 0 13 6 TTTA 6 4 69503 CASAVA_Build 13 42484699 1I TCTCATCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 23 2 12 9 T 11 12 69504 CASAVA_Build 13 42498812 4D AATGTTTGTC AATG/---- AGTTAAAGAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 4 AATG 1 0 69505 CASAVA_Build 13 42501670 1D TTTTGGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 10 69506 CASAVA_Build 13 42502135 3D GAATTAAAAA AAG/--- AATAAGATAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 8 AAG 1 0 69507 CASAVA_Build 13 42506165 2I ACTTCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 1456 het 1392 hom 20 7 8 5 A 16 18 69508 CASAVA_Build 13 42506755 1I CCAGCCGAGA -/T TTGTCCTTTT 1989 hom 15 het 7 0 5 2 T 2 3 69509 CASAVA_Build 13 42512175 1I GAGAGAAAAA -/G GAAATATATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 2 69510 CASAVA_Build 13 42521126 2D AAAAAGCCTC AT/-- ATGGCATCCA 3070 hom 99 het 36 0 32 4 AT 2 1 69511 CASAVA_Build 13 42523540 1D CAGTGTGTAG T/- CTTTTATCCC 3070 hom 80 het 31 0 27 7 T 1 0 69512 CASAVA_Build 13 42525815 9D TGCAGCTATT GTAAAAGGG/--------- GTTGAGTTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 GTAAAAGGG 1 0 69513 CASAVA_Build 13 42526010 3D GACAGTTTGA CCT/--- CCTCTTTACC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CCT 2 1 69514 CASAVA_Build 13 42531302 1I CTTTTTGTTG -/T TTTTTAAAGG 3070 hom 61 het 22 0 20 2 T 5 6 69515 CASAVA_Build 13 42535794 4I TCTATTTGGT ----/TGTC TGTCTTTTTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TGTC 1 2 69516 CASAVA_Build 13 42538386 1D AGAATAGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 34 4 T 10 9 69517 CASAVA_Build 13 42543010 1D GCTTGCTACC T/- TAGAGCCAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 2 1 69518 CASAVA_Build 13 42545625 4I CCTGAGGGCA ----/AAAG TGACAGGTAC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AAAG 0 1 69519 CASAVA_Build 13 42546098 1D ATCCTTCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 10 9 69520 CASAVA_Build 13 42548139 4D TATTTCTCTC TCTA/---- TCTCTCTTTA 3070 het 3070 hom 32 10 16 8 TCTA 1 0 69521 CASAVA_Build 13 42553582 1I ACATTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 36 2 25 9 T 11 12 69522 CASAVA_Build 13 42554320 1D TCAGTAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 11 10 69523 CASAVA_Build 13 42558045 3I GATTAAAGTC ---/ATT ATATATGATA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 ATT 0 1 69524 CASAVA_Build 13 42562846 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 22 1 10 11 T 16 14 69525 CASAVA_Build 13 42563827 6D TTATTTGCTG TTCTTT/------ TTCTAATTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 6 TTCTTT 1 0 69526 CASAVA_Build 13 42564638 2D ACACACACAC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 64 het 29 0 22 7 AT 1 0 69527 CASAVA_Build 13 42578935 1D ATGTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 29 0 19 11 A 13 12 69528 CASAVA_Build 13 42582000 2D TATAATAAAA AG/-- AAATTTTAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AG 1 0 69529 CASAVA_Build 13 42607574 14D GCATGGAGGA AAAGGTAATTATAG/-------------- AACACTTTGA 3070 het 3070 hom 29 12 15 6 AAAGGTAATTATAG 1 0 69530 CASAVA_Build 13 42610761 1D AAGGTCAATG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 57 24 24 10 T 9 8 69531 CASAVA_Build 13 42618816 1I TGTAAATCGT -/G GAAAAAGATG 3070 het 3070 hom 50 13 33 4 G 1 2 69532 CASAVA_Build 13 42636240 1I GCCCAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1384 hom 22 5 14 3 T 10 11 69533 CASAVA_Build 13 42638380 1I ATTTGGCTCT -/C TGTCTTAAAG 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 C 0 1 69534 CASAVA_Build 13 42638716 2D GTTTCATGTG AT/-- GCTCATGTAA 3070 het 3070 ref 50 23 24 4 AT 1 0 69535 CASAVA_Build 13 42640551 1D CATCTCTAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 10 9 69536 CASAVA_Build 13 42647071 1I TGACAGGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 625 hom 36 2 23 11 T 9 10 69537 CASAVA_Build 13 42648435 2D ATGTCCTAAC AT/-- GTGTTCTATC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AT 1 0 69538 CASAVA_Build 13 42648676 1D GCATTTACTC T/- TATGTATTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 1 69539 CASAVA_Build 13 42654600 1I GCATGTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1117 hom 37 4 25 8 T 12 13 69540 CASAVA_Build 13 42654684 1D TGTGCACTTG A/- AAAAAATGTG 3070 hom 99 het 37 0 34 8 A 7 6 69541 CASAVA_Build 13 42673548 3D AGAATGTAAT AAG/--- AAGCATTTCA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 AAG 2 1 69542 CASAVA_Build 13 42674132 24I ACCCCAATCT ------------------------/CGGGGTCTCAGTCCCCCATATAGC CCATGTTTCA 3070 het 3070 ref 65 39 18 8 CGGGGTCTCAGTCCCCCATATAGC 0 1 69543 CASAVA_Build 13 42675885 1D CCTCTGCCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 57 20 25 12 T 10 9 69544 CASAVA_Build 13 42684323 1I GCCCAGCTAC -/T TTTTTTTTTT 637 het 637 ref 10 3 4 3 T 15 16 69545 CASAVA_Build 13 42704720 6I CTGCTTCTGG ------/TATAGT TATAGTCTGG 3070 het 3070 hom 54 20 30 4 TATAGT 1 2 69546 CASAVA_Build 13 42706049 2D GGGGAATTGC AA/-- AGAGTATTTA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 3 1 69547 CASAVA_Build 13 42721303 1D TAAAAATGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 412 hom 43 2 34 8 A 10 9 69548 CASAVA_Build 13 42725938 3I ACTAGGGTAA ---/TCT TCTGCTTCTG 3070 hom 94 het 35 0 32 3 TCT 1 2 69549 CASAVA_Build 13 42748968 1D TTTTCTCCTT G/- GGGAAAAAAA 3070 hom 106 het 40 0 35 5 G 4 3 69550 CASAVA_Build 13 42755227 1I TCAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 11 12 69551 CASAVA_Build 13 42764760 1D GACAAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 35 1 29 5 A 11 10 69552 CASAVA_Build 13 42774247 1D TATAAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 26 0 17 11 A 13 12 69553 CASAVA_Build 13 42777109 1I ACTCCTCTGC -/T GTTATGCTGA 3070 hom 111 het 46 0 37 9 T 0 1 69554 CASAVA_Build 13 42777406 4I ATCACCACTG ----/AAGC ATCAATCTTC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AAGC 0 1 69555 CASAVA_Build 13 42778974 2D CACACACACG CA/-- CACACACAGT 3070 hom 93 het 45 0 31 18 CA 5 4 69556 CASAVA_Build 13 42780285 1D CACCCTCCAC A/- CTTTGCCCTC 3070 hom 65 het 25 0 18 7 A 1 0 69557 CASAVA_Build 13 42781976 3I GTTCATTAAA ---/ATG ATTTGTTTTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATG 0 1 69558 CASAVA_Build 13 42782267 4I TGAACCCGGG ----/AGGC AGAGGTTGCA 2074 hom 12 het 5 0 5 1 AGGC 0 1 69559 CASAVA_Build 13 42783500 2D GGTAATAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 10 T 12 10 69560 CASAVA_Build 13 42788766 1D AGCAATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 14 13 69561 CASAVA_Build 13 42788911 1D AGATTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 211 hom 39 1 28 10 A 13 12 69562 CASAVA_Build 13 42804170 1I GAGATATGTT -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 51 21 23 7 A 7 8 69563 CASAVA_Build 13 42807905 1I GAAGGATACC -/A AAAAAAAAAA 1870 het 1870 ref 29 13 10 6 A 15 16 69564 CASAVA_Build 13 42819008 1D AGAAGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 36 2 30 5 T 11 10 69565 CASAVA_Build 13 42832322 1D ATGCCAACTT A/- ACATTGATCC 3070 hom 153 het 61 0 51 10 A 2 1 69566 CASAVA_Build 13 42832848 2I TATGAATGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 580 hom 27 2 13 12 A 14 16 69567 CASAVA_Build 13 42836838 1I TGAATTAAAG -/C ATCCATTCAG 3070 hom 93 het 37 0 30 7 C 0 1 69568 CASAVA_Build 13 42841168 1I TTGCCCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 48 1 33 14 T 10 11 69569 CASAVA_Build 13 42843045 1D CCTGTCCCCA C/- CCCCTCCTGC 3070 hom 34 het 24 0 19 5 C 5 4 69570 CASAVA_Build 13 42862477 3D TGGCTGTGTC TAA/--- TAATAACTTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TAA 3 2 69571 CASAVA_Build 13 42864242 1D TCAGAATCTC A/- GTTTAAATTT 3070 hom 114 het 47 0 39 9 A 1 0 69572 CASAVA_Build 13 42903177 1D AAATGAACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 A 10 9 69573 CASAVA_Build 13 42913948 1D TCTCCTTCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 29 0 20 9 T 12 11 69574 CASAVA_Build 13 42926978 3D ATTGAAACCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2572 hom 28 13 9 7 T 17 14 69575 CASAVA_Build 13 42929121 4I GCCTCTCCTC ----/TGTT TGTTCTCTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TGTT 1 2 69576 CASAVA_Build 13 42935021 1I TCTGGCAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 9 10 69577 CASAVA_Build 13 42938298 1I ATATTGTCTA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 7 8 69578 CASAVA_Build 13 42940118 1I CACAGATATA -/T AGGTTTATTC 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 0 1 69579 CASAVA_Build 13 42940321 1I CATAAATTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 9 10 69580 CASAVA_Build 13 42943946 10D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 1176 het 1176 ref 14 5 4 6 A 20 10 69581 CASAVA_Build 13 42949189 1I CTAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 10 11 69582 CASAVA_Build 13 42951468 1D GTGAAAAAAA C/- AACTACTACT 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 C 1 0 69583 CASAVA_Build 13 42968316 1I58M2D AGTTAACTGA -TTTTTTTCTATAATGTGAGTGCTTTTAGTATCCTAAGAAATAGTTATCATCTTTTGACTT/TTTTTTTTCTATAATGTGAGTGCTTTTAGTATCCTAAGAAATAGTTATCATCTTTTGAC-- TTTCTAGAAA 3070 het 3070 ref 37 33 22 3 N/A 0 0 69584 CASAVA_Build 13 42979123 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAACC 3070 het 2348 hom 16 6 9 1 A 9 8 69585 CASAVA_Build 13 42986999 4D GGAGAAAAGC AGCT/---- AGCTGCCAGA 3070 hom 135 het 49 0 44 6 AGCT 2 1 69586 CASAVA_Build 13 43001998 3I CTGTCTCTAG ---/GCC GCCCCAATTA 3070 het 3070 hom 57 22 24 11 GCC 1 2 69587 CASAVA_Build 13 43006287 2D CCAACCACAA AC/-- ACACTTTAGA 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 AC 3 2 69588 CASAVA_Build 13 43008690 1D AGTTTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 11 10 69589 CASAVA_Build 13 43010965 1D TTTCCTCCCC G/- CCCCTGCCCT 3070 hom 91 het 36 0 30 6 G 1 0 69590 CASAVA_Build 13 43013185 1D TACTTATAGA C/- CATTTATCAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 C 2 1 69591 CASAVA_Build 13 43025830 3D GAGAACTGAC TGT/--- TGTTGTTCTC 3070 het 3070 hom 43 18 24 3 TGT 3 2 69592 CASAVA_Build 13 43027252 1I AGTAAATTAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 8 9 69593 CASAVA_Build 13 43028370 1D ACTTGCCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 41 0 28 13 T 13 12 69594 CASAVA_Build 13 43033335 2D CTTATCATCA CC/-- CCACTAACTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 4 2 69595 CASAVA_Build 13 43049265 1D GATAAAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 40 0 33 7 T 11 10 69596 CASAVA_Build 13 43050122 1D GAAACTATAT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 8 7 69597 CASAVA_Build 13 43055960 1D TAAACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 11 12 T 14 13 69598 CASAVA_Build 13 43060088 1I TGCATTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 28 1 24 3 A 11 12 69599 CASAVA_Build 13 43061773 7I CCAAGTAGCC -------/TATACTT AGACTATAGG 3070 hom 102 het 35 0 34 2 TATACTT 0 1 69600 CASAVA_Build 13 43062755 1I CTAAAAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 39 het 15 0 14 3 A 8 9 69601 CASAVA_Build 13 43066413 1D ATCCCTTCTT A/- AAAAACTGTT 3070 hom 154 het 61 0 52 11 A 6 5 69602 CASAVA_Build 13 43070942 1I AAAGTAAAAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 8 9 69603 CASAVA_Build 13 43082886 3D TTTCCCATAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 32 0 20 12 T 14 11 69604 CASAVA_Build 13 43084648 1I AAAGGTCCGA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 8 9 69605 CASAVA_Build 13 43085008 3I ACTTCATCAT ---/ATC ATCAACAAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 ATC 1 2 69606 CASAVA_Build 13 43088588 1D TCCTCCCGCC T/- CAGCCTCCCA 2247 het 102 hom 11 3 5 3 T 1 0 69607 CASAVA_Build 13 43097885 1I TTTGCTAATA -/C TTTGCTAAGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 0 1 69608 CASAVA_Build 13 43103070 2I TGTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 TG 8 9 69609 CASAVA_Build 13 43106135 6D CAACACCTAC TTACTA/------ TTAATATCAC 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 TTACTA 1 0 69610 CASAVA_Build 13 43109660 1I TAAACATCCA -/G GGGGAGGCCA 3070 het 3070 hom 54 21 24 9 G 4 5 69611 CASAVA_Build 13 43110541 1D GTGTCTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 T 11 10 69612 CASAVA_Build 13 43111249 1D AGACCAGCCT G/- GCCAACAGGG 3070 het 1256 hom 14 4 9 1 G 2 1 69613 CASAVA_Build 13 43113007 2D TACACACATG CA/-- CACACACACG 3070 het 2158 hom 44 10 14 20 CA 5 4 69614 CASAVA_Build 13 43117877 3I GAAAATAGTT ---/CTC CTTCTCAGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CTC 0 1 69615 CASAVA_Build 13 43121931 1I AGTCCCTTGG -/C CCTCCTAGCG 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 C 2 3 69616 CASAVA_Build 13 43122800 1I CATGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 3 4 69617 CASAVA_Build 13 43125746 2D TTGTATGTGC AA/-- AAGACAGTAA 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 A 4 2 69618 CASAVA_Build 13 43125900 3D CCATACCTAC TCT/--- TCTTAGCAAG 3070 hom 98 het 37 0 31 9 TCT 2 1 69619 CASAVA_Build 13 43130904 1D ACCATCACCT G/- TGAATTCTTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 G 1 0 69620 CASAVA_Build 13 43134131 1D AACAGATTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 8 69621 CASAVA_Build 13 43159135 1D TCACAAAAAA G/- TATATATACA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 G 1 0 69622 CASAVA_Build 13 43160331 1D TGGTATCATT A/- ACGGGAGGTT 3070 hom 138 het 52 0 46 7 A 2 1 69623 CASAVA_Build 13 43166364 1D AACTTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 37 2 26 9 A 13 12 69624 CASAVA_Build 13 43168932 1I ATTCCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 989 hom 39 4 27 8 T 15 16 69625 CASAVA_Build 13 43178849 2D ATCAAGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 22 0 15 8 A 12 10 69626 CASAVA_Build 13 43183008 1I AAGAAATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2577 hom 30 8 14 8 T 10 11 69627 CASAVA_Build 13 43190359 1D AATAATGTCC T/- TTGTAGCAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 3 2 69628 CASAVA_Build 13 43192239 2D TATAAATTAC AT/-- GTTATTATTG 3070 hom 148 het 51 0 50 2 AT 1 0 69629 CASAVA_Build 13 43210870 1I TTTTGTTCCC -/A AAACTCTGAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 3 4 69630 CASAVA_Build 13 43215049 4D CGTGTGTAAA ATAG/---- ACTGGGAACA 3070 hom 132 het 50 0 44 7 ATAG 1 0 69631 CASAVA_Build 13 43225117 5I TGCCTCAGCC -----/AGAAA TTCTGAGTAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AGAAA 0 1 69632 CASAVA_Build 13 43230605 3D TTCACAGACA GAG/--- GAGGGACAAG 3070 hom 120 het 48 0 38 11 GAG 2 1 69633 CASAVA_Build 13 43239098 1D TGTCTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 34 1 27 6 A 13 12 69634 CASAVA_Build 13 43239473 3D ACTGTTCAAT GAC/--- ATTTTTAGTT 3070 hom 117 het 45 0 38 9 GAC 1 0 69635 CASAVA_Build 13 43265564 1D CTCTGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 1309 het 34 hom 13 1 7 5 A 17 16 69636 CASAVA_Build 13 43280390 1D CCATTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 40 1 29 10 T 12 11 69637 CASAVA_Build 13 43285871 19I GGTATTAGTG -------------------/GCACAACTGGGTGCGAGAT GCAGGAAGGA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 GCACAACTGGGTGCGAGAT 0 1 69638 CASAVA_Build 13 43290918 1I TCACAAGGAC -/A AAAAAAACCA 2698 het 973 hom 8 2 6 0 A 7 8 69639 CASAVA_Build 13 43292101 1I AAACCTGAAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 8 9 69640 CASAVA_Build 13 43304266 1D TTTATCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 24 2 13 9 A 17 16 69641 CASAVA_Build 13 43309789 2D AATTCTTATA AC/-- ACCTTATGAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AC 2 1 69642 CASAVA_Build 13 43314220 1I TATTTTTCAC -/T TATGGTTAGC 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 1 2 69643 CASAVA_Build 13 43315961 1D TGTTATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 30 1 23 6 T 11 10 69644 CASAVA_Build 13 43326293 1D GACTGAGACC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 10 9 69645 CASAVA_Build 13 43332368 3D AATAAACACA ATT/--- ATTTTATAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATT 2 1 69646 CASAVA_Build 13 43340194 4I CACAACAAAT ----/TCAA TCACGGAACA 3070 hom 160 het 62 0 54 8 TCAA 0 1 69647 CASAVA_Build 13 43355717 1I AGATTATAAT -/A CTAAAATCTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 0 1 69648 CASAVA_Build 13 43364319 1D GTAGGCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 43 1 30 12 A 12 11 69649 CASAVA_Build 13 43368852 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 6 5 69650 CASAVA_Build 13 43369930 2D TATGTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3025 hom 36 het 14 0 13 1 TG 7 6 69651 CASAVA_Build 13 43371978 1I TGTGAAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 41 1 35 6 A 10 11 69652 CASAVA_Build 13 43373934 1I GAGATGGGGC -/T TTTTTTTTTT 2585 het 679 hom 31 4 17 10 T 15 16 69653 CASAVA_Build 13 43375722 1D ACTTTACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1033 hom 35 5 14 17 A 17 16 69654 CASAVA_Build 13 43377695 1I AAGCTTTAAC -/T ACTAGCATCA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 0 1 69655 CASAVA_Build 13 43382907 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 1997 hom 27 het 15 0 7 8 T 9 8 69656 CASAVA_Build 13 43385026 5I GTCACAAAAT -----/GTAAA GTAAGGGAAG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 GTAAA 0 1 69657 CASAVA_Build 13 43402593 1D TGCATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 1431 het 1431 ref 49 32 4 13 A 13 12 69658 CASAVA_Build 13 43449852 2I ACTCCCTCCC --/TG TCTCTCTCTC 1513 hom 10 het 5 0 4 1 TG 0 1 69659 CASAVA_Build 13 43461369 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 9 8 69660 CASAVA_Build 13 43482936 1D AATTTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 12 11 69661 CASAVA_Build 13 43493045 6D ACAATCATAA TATAAT/------ TATATCAATA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TATAAT 1 0 69662 CASAVA_Build 13 43503778 1D AGCAATCTGA G/- GGTTCCAGGT 3070 hom 85 het 33 0 27 6 G 3 2 69663 CASAVA_Build 13 43515618 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 76 het 29 0 25 4 T 7 8 69664 CASAVA_Build 13 43528383 4D TACTTGAACC AGTT/---- AGTTGCCTAA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 AGTT 2 1 69665 CASAVA_Build 13 43529865 2D AAGCAAACAT AA/-- AAAGCAAACA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 5 3 69666 CASAVA_Build 13 43538315 1D TTCTTTCTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 13 25 10 C 1 0 69667 CASAVA_Build 13 43542419 1I CGGGTTCAGG -/T TGATTCTCCT 1417 het 1417 ref 10 6 3 1 T 1 2 69668 CASAVA_Build 13 43549995 3D TAACTATCTT CTA/--- CTGCTGGTCA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 CTA 1 0 69669 CASAVA_Build 13 43550316 1D ATTTCATTCA C/- TCAACTATAA 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 C 1 0 69670 CASAVA_Build 13 43550916 2D TAAAGAAAAA AC/-- ACAGTTTTAG 3070 het 3070 ref 39 25 13 2 AC 2 1 69671 CASAVA_Build 13 43559365 4D GTTGTCAGGA CAAT/---- CAAACATCTT 3070 het 3070 ref 42 25 16 5 CAAT 1 0 69672 CASAVA_Build 13 43563819 3D ATATATTTGG TTC/--- TTCTTAGAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 8 TTC 2 1 69673 CASAVA_Build 13 43575076 1I ATATTATCCA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 6 7 69674 CASAVA_Build 13 43575231 1I TGAACTCTCC -/A ACAGTTTATA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 1 2 69675 CASAVA_Build 13 43588761 2I CCAGGTTCTG --/GC TTTTCCTGCT 3070 hom 132 het 52 0 43 9 GC 0 1 69676 CASAVA_Build 13 43592380 5D AGGAAAAACA CCTTT/----- CCTTTCCTTT 3070 hom 65 het 31 0 22 10 CCTTT 5 4 69677 CASAVA_Build 13 43594966 1I TATTACTGAG -/A AGGAATAGTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 2 69678 CASAVA_Build 13 43599354 1I CAGATTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 8 9 69679 CASAVA_Build 13 43615731 11D AGAGAGATGG GAGCTGATAGA/----------- CCAGAGGAGA 1186 het 1186 ref 45 38 7 4 GAGCTGATAGA 1 0 69680 CASAVA_Build 13 43619361 1D CCTTGCAAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 8 7 69681 CASAVA_Build 13 43625453 8D TCAAGTCAGG TGTAGCTC/-------- TGTAGCTCTT 3070 hom 79 het 36 0 26 14 TGTAGCTC 2 1 69682 CASAVA_Build 13 43688378 1I GTTTCAGTAT -/G GAAGTTAAGG 3070 hom 147 het 54 0 49 5 G 1 2 69683 CASAVA_Build 13 43694765 1I GTGGCACATG -/T TATGTTCAGC 3070 het 3070 ref 62 28 27 7 T 1 2 69684 CASAVA_Build 13 43695141 1I CAAGGTTTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 8 9 69685 CASAVA_Build 13 43705092 3I GCCGCACAGA ---/GCT GCTTGGTGTT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 GCT 1 2 69686 CASAVA_Build 13 43718284 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 25 1 17 8 A 14 13 69687 CASAVA_Build 13 43721350 5D AAATAAATGT AAACA/----- AAACAAAACA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 AAACA 4 3 69688 CASAVA_Build 13 43732180 1I TTAAAAGTCA -/T TTTTAAGAAC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 4 5 69689 CASAVA_Build 13 43748206 1D CCTGGTAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 10 9 69690 CASAVA_Build 13 43758942 1I CACATCTTTG -/T TAGAATGGCT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 1 2 69691 CASAVA_Build 13 43759010 4I CAGTGTTCAC ----/CTGT CTGTCTCTCC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 CTGT 1 2 69692 CASAVA_Build 13 43767587 1I ATTTGACTGT -/G GTCACAAAGC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 1 2 69693 CASAVA_Build 13 43775427 1D TGGTGTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 36 1 23 13 A 12 11 69694 CASAVA_Build 13 43778153 4I ACTCAGGTGC ----/CTGT CTGCTCAGTG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 CTGT 0 1 69695 CASAVA_Build 13 43779972 1D GCTATTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 239 hom 28 3 20 5 T 15 14 69696 CASAVA_Build 13 43788188 1I CCAGAAACAT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 95 het 37 0 32 5 A 6 7 69697 CASAVA_Build 13 43798099 2I CCCAGAAGTT --/TA TATATATATA 3070 het 648 hom 19 2 13 4 TA 8 9 69698 CASAVA_Build 13 43799838 1D TGACAGAAAT A/- ATGAAATCAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 2 1 69699 CASAVA_Build 13 43803280 1I CCAGGGCAGA -/C CCCGCCCCTT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 C 3 4 69700 CASAVA_Build 13 43803430 1D AGAAGCTGTC T/- TTATTAGGAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 T 3 2 69701 CASAVA_Build 13 43804328 1I CTAAGTCTCC -/G GGGGGGGTCT 2605 het 2605 ref 31 17 10 4 G 7 8 69702 CASAVA_Build 13 43808701 1I CTTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 0 1 69703 CASAVA_Build 13 43816956 1D TGCCTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2644 hom 32 12 12 8 T 13 12 69704 CASAVA_Build 13 43820553 1I GAAAGTAGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 8 9 69705 CASAVA_Build 13 43834778 4D GTCAGACGAG TTGA/---- TTGTTTCCAG 3070 het 3070 ref 51 26 20 8 TTGA 1 0 69706 CASAVA_Build 13 43836516 1I AATTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 10 11 69707 CASAVA_Build 13 43838208 1D ACATAACTAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 18 17 8 A 10 9 69708 CASAVA_Build 13 43860276 1D GTTTTTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 26 1 18 7 T 13 12 69709 CASAVA_Build 13 43860415 4D60M4I TGGGTTTTTT TGTGTGTGTGTTTGTTTCCATGTATGTGTATTTGTGAATGTGTATGTGTTAGTGTGTTCATGAA----/----TGTGTGTTTGTTTCCATGTATGTGTATTTGTGAATGTGTATGTGTTAGTGTGTTCATGAATGTG TGTGTATGTA 3070 het 43 hom 44 1 49 27 N/A 0 0 69710 CASAVA_Build 13 43865171 2D GGCCAAGGGA AG/-- AGAGTTTCAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 4 AG 3 2 69711 CASAVA_Build 13 43870612 2D CTGTTTGAAT TA/-- GGGGCTTCTT 3070 het 3070 hom 39 13 21 6 TA 1 0 69712 CASAVA_Build 13 43887467 2I CCTGGGCAAC --/AG AGGACGACTC 3070 hom 83 het 30 0 28 2 AG 1 2 69713 CASAVA_Build 13 43890566 17D TTTTGTGAAG AAATTATTTTTTGGAGC/----------------- AAATGCACTG 3070 het 3070 ref 34 19 15 5 AAATTATTTTTTGGAGC 1 0 69714 CASAVA_Build 13 43891390 1D AACCCAGTCA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 35 11 16 9 T 8 7 69715 CASAVA_Build 13 43892398 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 13 12 69716 CASAVA_Build 13 43896601 1D ATTTCTGTGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 A 10 9 69717 CASAVA_Build 13 43903300 2D ACAGTGCACG CA/-- CACACACACA 1962 het 1962 ref 43 28 5 12 CA 9 8 69718 CASAVA_Build 13 43904700 1I CATTTCAACA -/G GGATGCCCGT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 2 3 69719 CASAVA_Build 13 43917465 1I GAACAACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 12 13 69720 CASAVA_Build 13 43922263 1D GTTGAAAAAC A/- AATAAGAGTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 3 2 69721 CASAVA_Build 13 43925430 3I CTTAATATAA ---/CTT CTTTTTTGCA 3070 hom 111 het 50 0 38 12 CTT 1 2 69722 CASAVA_Build 13 43926987 3D CTGCACTCTT ATC/--- ATAACAGATG 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 ATC 1 0 69723 CASAVA_Build 13 43945742 2D GCAGTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 49 het 23 0 17 6 TG 10 9 69724 CASAVA_Build 13 43947602 1D AAACAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 15 14 69725 CASAVA_Build 13 43952254 1D TAAATTGAAT G/- TATAAGATGT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 G 1 0 69726 CASAVA_Build 13 43960188 1I ATCAAGACTC -/T TGTCTCAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 1 2 69727 CASAVA_Build 13 43970436 4D TCTGCCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 160 hom 26 3 12 12 AAAC 5 4 69728 CASAVA_Build 13 43984794 4I AAAAGCAATC ----/TCTT TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 TCTT 0 1 69729 CASAVA_Build 13 44065698 9D ACTTTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 2619 het 2619 ref 28 14 6 10 A 24 15 69730 CASAVA_Build 13 44125994 2I AAGTATATCT --/TA TATATATATG 1950 het 1950 ref 10 5 4 1 TA 4 5 69731 CASAVA_Build 13 44135907 1I AAAATTGATG -/T CTACTACACC 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 0 1 69732 CASAVA_Build 13 44151039 6I GTGCTGAGAG ------/TTCATC TTCATTCACT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TTCATC 0 1 69733 CASAVA_Build 13 44214053 1D CTAAAAATAT A/- AAAAAAAAAT 1858 het 1858 ref 11 5 5 1 A 10 9 69734 CASAVA_Build 13 44220605 1D TTCATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 11 10 69735 CASAVA_Build 13 44223656 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 1101 het 1101 ref 37 25 3 9 A 13 14 69736 CASAVA_Build 13 44224667 1I GTGTGTGTGT -/G TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 G 0 1 69737 CASAVA_Build 13 44237315 1I GCTTTGCTGA -/G GCATTTTGAG 3070 hom 135 het 48 0 46 2 G 1 2 69738 CASAVA_Build 13 44239376 1D AACTACCCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 38 0 25 13 T 10 9 69739 CASAVA_Build 13 44241405 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 9 10 69740 CASAVA_Build 13 44257536 1I TAAATATCGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 A 12 13 69741 CASAVA_Build 13 44267195 1D GGCTCATGCC T/- TTTTGTAGGG 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 T 5 4 69742 CASAVA_Build 13 44272193 1I CTACAACAAA -/T TTTTTTTTTT 1513 het 1513 ref 32 14 5 13 T 15 16 69743 CASAVA_Build 13 44274075 2D CATTAGACTA AG/-- CACTTTTCAT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 AG 1 0 69744 CASAVA_Build 13 44279378 1D GTGGGTAGGA T/- TGACTTCTGG 3070 het 2678 hom 21 8 10 5 T 2 1 69745 CASAVA_Build 13 44294442 3I TCTCCCGCCC ---/CCT CCTCCTCCTC 2080 het 2080 ref 24 5 6 13 CCT 4 5 69746 CASAVA_Build 13 44299473 8D CATCTCTACT AAAAATAC/-------- AAAAATTAGC 3070 het 2329 hom 15 5 9 5 AAAAATAC 1 0 69747 CASAVA_Build 13 44345017 1I TCGGCTCCCA -/G GGGCCACCTC 3070 hom 70 het 30 0 20 10 G 3 4 69748 CASAVA_Build 13 44358895 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 15 4 A 15 16 69749 CASAVA_Build 13 44365395 1D GAGTCTGGAA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 111 het 42 0 35 7 T 8 7 69750 CASAVA_Build 13 44372672 4I35M1I AACTTTCTAT ----TTTAAGTGACTGTTATTTGGGATCTTTTTTAAAAA-/TTTGTTTAAGTGACTGTTATTTGGGATCTTTTTTAAAAAG ATGCCCTTGT 3070 hom 159 het 42 0 52 5 N/A 0 0 69751 CASAVA_Build 13 44377704 9D GAGGTACTTG AACACACAA/--------- CAGCAAGTTC 3070 het 3070 ref 47 23 22 7 AACACACAA 1 0 69752 CASAVA_Build 13 44389180 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAATT 2693 het 2693 ref 23 14 7 2 A 8 9 69753 CASAVA_Build 13 44394245 1D CCACACACAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 9 8 69754 CASAVA_Build 13 44407090 1D GTAAGAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 A 14 13 69755 CASAVA_Build 13 44412021 1D CCCATAAGCC T/- ATAAAATGTG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 1 0 69756 CASAVA_Build 13 44428417 2I ATATGAAAAC --/AG GGGGATAGAT 3070 hom 92 het 33 0 30 3 AG 0 1 69757 CASAVA_Build 13 44440095 2D ACCTTCTGCC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 35 0 25 10 T 11 9 69758 CASAVA_Build 13 44444047 1D CCTGGATTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 11 20 15 T 10 9 69759 CASAVA_Build 13 44449217 1D CACACTCCTT C/- AACTTCTAAG 3070 het 3070 hom 51 17 27 8 C 1 0 69760 CASAVA_Build 13 44468625 1D GGGAACGGGA T/- TTTTTTTTTT 2542 het 775 hom 26 5 9 12 T 15 14 69761 CASAVA_Build 13 44478168 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2545 hom 30 10 14 6 A 13 12 69762 CASAVA_Build 13 44505569 5I CATGCTACTT -----/AGAAG AGATGATTTT 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 AGAAG 0 1 69763 CASAVA_Build 13 44516139 1D GCTCCTACCT C/- CTCCCTTGCT 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 C 2 1 69764 CASAVA_Build 13 44551880 4I TTACTAACAT ----/CTTG CTTGTTTCAA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 CTTG 1 2 69765 CASAVA_Build 13 44553460 1D TAGAGACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 A 13 12 69766 CASAVA_Build 13 44554811 1I CTCAGGTAGA -/G GGGGGCCCTT 3070 het 3070 hom 40 16 14 10 G 5 6 69767 CASAVA_Build 13 44595770 1D ATCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1526 het 1526 ref 21 14 4 3 A 13 12 69768 CASAVA_Build 13 44625147 1I TCCTCGTAAA -/T TTTTTTTTTT 1094 het 1094 ref 20 5 5 10 T 17 18 69769 CASAVA_Build 13 44691302 1I GACTATCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 11 12 69770 CASAVA_Build 13 44737394 1D ACACCATTTC A/- AAAAAAAAAA 1034 het 1034 ref 22 14 4 6 A 15 14 69771 CASAVA_Build 13 44789394 1D GAGTCACAGG A/- CGAGCTAGGA 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 1 0 69772 CASAVA_Build 13 44790413 11I AGAATTGCTT -----------/GAAGGTCAAGG GAAGGTCAAG 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 GAAGGTCAAGG 1 2 69773 CASAVA_Build 13 44792581 1I ATGTAATAAC -/A AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 6 7 69774 CASAVA_Build 13 44793334 4I ACAAAATAAT ----/GCGG GGGGGGGGGG 44 het 44 ref 24 5 2 17 GCGG 0 1 69775 CASAVA_Build 13 44800055 1D GTTTGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2395 hom 27 9 9 9 A 12 11 69776 CASAVA_Build 13 44802007 1D AGGGCAGTAA C/- CACAAGCCAG 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 C 2 1 69777 CASAVA_Build 13 44804169 3I ACCGCGTCAG ---/CCT CCTCCCAAAG 2743 het 2743 ref 29 12 10 7 CCT 1 2 69778 CASAVA_Build 13 44808941 4D ACCAGGGAGT TTAA/---- TTAACATTCA 3070 het 3070 hom 36 11 19 9 TTAA 2 1 69779 CASAVA_Build 13 44903610 1D4M1I CCTCTGCTTC ACAGG-/-CAGGA TTCAAGCAAT 912 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 69780 CASAVA_Build 13 44903685 2D21M1I TGCCTGGCTA GTTTTTTGTATTTTTATTAGAGA-/--ATTTTGTATTTTCAGTAGAGAC TGGGTTTCAC 2854 hom 15 het 6 0 6 0 N/A 0 0 69781 CASAVA_Build 13 44904845 1D ATAGGACACT A/- AAAAAAAAAA 602 het 602 ref 32 25 4 3 A 12 11 69782 CASAVA_Build 13 44914123 1D ATATTTGTTT C/- CTTTTGGGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 2 1 69783 CASAVA_Build 13 44914387 1D ATGGAAGAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 9 8 69784 CASAVA_Build 13 44921577 1I TATGAGGCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 9 69785 CASAVA_Build 13 44928568 1D CTCAGACCAC A/- CCTGTAGCAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 0 69786 CASAVA_Build 13 44930234 1D GATTTCTTTC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 7 6 69787 CASAVA_Build 13 44931392 2D AAACAGCCTC TA/-- TACTCTCTGT 3070 hom 109 het 42 0 37 6 TA 2 1 69788 CASAVA_Build 13 44940823 1D AAAGCTTGAG A/- ATTTATTGTA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 2 1 69789 CASAVA_Build 13 45043508 1I CCTCCAACCA -/T TTTTTTTTTT 1266 het 1266 ref 34 25 3 6 T 11 12 69790 CASAVA_Build 13 45051194 1D AAAGGTCAGA T/- CTCAAATCTC 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 1 0 69791 CASAVA_Build 13 45061207 5D TCTGTACCTG CTATC/----- CTTCCCCAAC 3070 het 3070 ref 37 17 14 8 CTATC 1 0 69792 CASAVA_Build 13 45070521 1D GCACCCTGAA G/- GTTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 G 2 1 69793 CASAVA_Build 13 45101806 1D AAGCACTTTT A/- ATGGCTCCAT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 2 1 69794 CASAVA_Build 13 45133127 1I GATGAATGAC -/A AAAACAGTGG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 4 5 69795 CASAVA_Build 13 45142699 1D GTGGGCATCA T/- TTTTTTTTTT 3044 het 3044 ref 37 18 9 10 T 17 16 69796 CASAVA_Build 13 45151630 1D CTGGCCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2809 hom 29 9 11 9 T 12 11 69797 CASAVA_Build 13 45173686 2I AGTATGAAAC --/AT GTGGTGGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 0 1 69798 CASAVA_Build 13 45208217 2D CTCTGTCTCG AA/-- AAAAAAAAAA 1466 het 1373 hom 16 9 4 4 A 16 14 69799 CASAVA_Build 13 45243438 2I CTTCACAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 606 hom 33 3 26 4 AG 8 9 69800 CASAVA_Build 13 45244429 1I CCCTGTGTGG -/C CTCTCATGGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 1 2 69801 CASAVA_Build 13 45245564 2I CAATTGCTCC --/AG AGAGCTATCT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 AG 2 3 69802 CASAVA_Build 13 45252406 1D GGACTAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 27 1 16 10 T 13 12 69803 CASAVA_Build 13 45254932 5D TAGCCCAGTC CCCAG/----- CCCTGCGGTG 3070 het 3070 hom 35 16 15 7 CCCAG 1 0 69804 CASAVA_Build 13 45257588 4D TGCCAGAGTT TCTA/---- TCTATCTCCC 3070 het 3070 ref 53 20 22 14 TCTA 2 1 69805 CASAVA_Build 13 45264790 2I CACTGTGTCT --/GG GGCCATGAAG 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 G 2 4 69806 CASAVA_Build 13 45267089 1I CACTAGGACC -/T TTTTTTTTTT 2657 het 2657 ref 34 16 8 10 T 13 14 69807 CASAVA_Build 13 45268079 2D TCTCAAAAAC AT/-- GTTGAATTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 AT 1 0 69808 CASAVA_Build 13 45268398 2D AATGGAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 AG 6 5 69809 CASAVA_Build 13 45280851 3I GTGCATACTT ---/TTC TTATCTACCA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTC 0 1 69810 CASAVA_Build 13 45281470 1I GCTAGACATG -/T TTTTTGTGTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 5 6 69811 CASAVA_Build 13 45289781 1D GAAAGATGTG A/- AGGATGCTGG 3070 hom 97 het 38 0 33 5 A 2 1 69812 CASAVA_Build 13 45294801 2I TTGAAAATGA --/AC ACTTATTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 10 0 AC 1 2 69813 CASAVA_Build 13 45295084 4I TCGTCCCAAG ----/GTCT GTCCTTGCAC 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 GTCT 0 1 69814 CASAVA_Build 13 45302969 2D AGTACTAACC AA/-- AAAAAGGCAG 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 A 7 5 69815 CASAVA_Build 13 45311362 1D TCTCCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 12 11 69816 CASAVA_Build 13 45312607 1I TTAGGTAGTT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 A 6 7 69817 CASAVA_Build 13 45317406 1I GTGCGTGTGT -/G TAAAAACGCT 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 G 0 1 69818 CASAVA_Build 13 45328740 2I TAGGCAAGGA --/GG GATAGCTGAA 3070 het 3070 hom 53 17 31 5 G 1 3 69819 CASAVA_Build 13 45329630 1D AAATCATATA G/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 G 1 0 69820 CASAVA_Build 13 45330575 1I TGGTTCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 9 16 T 13 14 69821 CASAVA_Build 13 45335570 4I CACATTGCAA ----/AGAG AGAGAGATGG 3070 het 3070 ref 57 28 24 5 AG 3 5 69822 CASAVA_Build 13 45337845 1I GGGTTTGCGG -/A GGAGAAAGAG 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 A 0 1 69823 CASAVA_Build 13 45358257 4D ACACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 32 10 11 14 AC 9 7 69824 CASAVA_Build 13 45363493 1I GACAAAAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 9 10 69825 CASAVA_Build 13 45363584 12D CCCACAGCAC AGAGGAGCAGAA/------------ TGTGGAATTT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AGAGGAGCAGAA 1 0 69826 CASAVA_Build 13 45365325 6D ACATAACAGG TTATTA/------ TTCAGTTCAA 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 TTA 2 0 69827 CASAVA_Build 13 45369495 1I CTAAGGGCAG -/C GGGGGACAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 0 1 69828 CASAVA_Build 13 45376496 14I5M4I GATGCGATAT --------------CAGAT----/TAAGGTTAAGATGACAGATAAAA GCGTGGCCCC 3070 hom 117 het 38 0 40 6 N/A 0 0 69829 CASAVA_Build 13 45381276 1D TTATCATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 33 1 23 9 A 12 11 69830 CASAVA_Build 13 45381539 1I ATAAAACCTG -/T TGCCGAGTCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 1 2 69831 CASAVA_Build 13 45383398 12D TGTAGGGCCA CTTGAGCAGTCT/------------ CTTGAGTGCA 3070 hom 98 het 34 0 28 11 CTTGAGCAGTCT 1 0 69832 CASAVA_Build 13 45385725 5D TATCTTTTCA TTATT/----- TTATTTTATT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 TTATT 3 2 69833 CASAVA_Build 13 45390789 1D CTAAAGGAAA C/- TTTTTCGCAT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 C 1 0 69834 CASAVA_Build 13 45394821 1I CAAAAAAATC -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 40 19 19 3 A 6 7 69835 CASAVA_Build 13 45407170 1I GTAAATGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 10 11 69836 CASAVA_Build 13 45408956 1D AATCACCGGA G/- GGAGATAGAA 3070 het 3070 ref 45 29 14 2 G 3 2 69837 CASAVA_Build 13 45409200 1I ATAAAAAAAC -/A GGGAGGTTTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 0 1 69838 CASAVA_Build 13 45411552 1I TAGTGGAGTT -/G GGGGTTTCAC 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 G 4 5 69839 CASAVA_Build 13 45421349 1D GAAAAAGAAC A/- AAAAAACTAA 3070 hom 84 het 30 0 27 3 A 7 6 69840 CASAVA_Build 13 45426610 4D ATTAATGAAT AAAG/---- AAAGTTTATT 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 AAAG 2 1 69841 CASAVA_Build 13 45446992 1D CTGAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 651 het 651 ref 38 26 3 9 T 13 12 69842 CASAVA_Build 13 45448063 1I TTTATCTGTG -/T ATAGGGTCAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 69843 CASAVA_Build 13 45449874 1I CTATGTCATC -/A AACAGTCTAA 3070 het 3070 ref 57 29 24 4 A 2 3 69844 CASAVA_Build 13 45459676 1I TCATACATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 10 11 69845 CASAVA_Build 13 45461941 3I ATCATTAAGC ---/ACA ACATCTGAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ACA 1 2 69846 CASAVA_Build 13 45467161 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACGCCA 3070 het 359 hom 33 2 25 6 C 0 1 69847 CASAVA_Build 13 45471967 2D TTTTTAAATA AG/-- ACTCAAAAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AG 1 0 69848 CASAVA_Build 13 45473886 34D ACTAAAGGCT TTACTGATAGAATGTCAATCACCAAAAACATTTA/---------------------------------- TTACTGATAG 3070 hom 72 het 30 0 25 14 TTACTGATAGAATGTCAATCACCAAAAACATTTA 2 1 69849 CASAVA_Build 13 45475046 2I TGGTACATTT --/TA TGTTTTTTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TA 0 1 69850 CASAVA_Build 13 45480456 1D GTTATACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 481 hom 27 2 21 5 A 13 12 69851 CASAVA_Build 13 45481745 1I TTTTAGTTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 8 9 69852 CASAVA_Build 13 45489644 1D TATTTTTTGC T/- TTGCAAAATA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 3 2 69853 CASAVA_Build 13 45490327 1I AATGCTGCAG -/A ACGGCCATTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 1 2 69854 CASAVA_Build 13 45493658 1I ATTTGGCTGC -/T TTAAAACACA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 2 3 69855 CASAVA_Build 13 45494854 1D GAGTTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3043 het 3043 ref 37 22 7 8 T 15 14 69856 CASAVA_Build 13 45495036 2D CCCAAATGTC TG/-- TGTCTTAGGA 3070 het 3070 ref 50 23 20 8 TG 2 1 69857 CASAVA_Build 13 45496366 2I TGATAACTTC --/AA AGGCTATAAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 3 69858 CASAVA_Build 13 45496865 1D TCCAACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 44 1 29 14 T 12 11 69859 CASAVA_Build 13 45502321 1I ACACTCAGAC -/A TAATAAAAAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 0 1 69860 CASAVA_Build 13 45505645 4D AAAATCATAC AACT/---- AATAAAATCA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 AACT 1 0 69861 CASAVA_Build 13 45508287 1D CCGTGTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1699 hom 38 6 28 5 A 15 14 69862 CASAVA_Build 13 45509806 2D CCACCGTATT AA/-- GTCTGATTCA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 2 0 69863 CASAVA_Build 13 45510320 2I TCACGTCCAC --/AT GTTATCATTT 3070 hom 144 het 56 0 49 7 AT 0 1 69864 CASAVA_Build 13 45518804 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 8 9 69865 CASAVA_Build 13 45519753 5D ACTGAAAGCT AAGAG/----- AAGTGGAGCT 3070 hom 93 het 34 0 32 5 AAGAG 1 0 69866 CASAVA_Build 13 45519849 1D AATAAGTAAA T/- GTATCACAAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 1 0 69867 CASAVA_Build 13 45520036 1D AAACAGGCAC A/- ACCATCCCAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 1 69868 CASAVA_Build 13 45521440 2I CAACAATAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 87 hom 37 1 29 7 AC 5 6 69869 CASAVA_Build 13 45522965 2D TTAAAAAGAC TG/-- TGCACAGAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TG 2 1 69870 CASAVA_Build 13 45530103 1I CCCACGTGCT -/A GAATAAAGTG 3070 hom 141 het 56 0 48 8 A 0 1 69871 CASAVA_Build 13 45538277 2I GTGTAATTCC --/AT ATGTTTCCAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 AT 1 2 69872 CASAVA_Build 13 45538981 4D ACACCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1502 het 527 hom 15 5 5 7 A 20 16 69873 CASAVA_Build 13 45539326 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 258 hom 24 2 16 6 A 8 7 69874 CASAVA_Build 13 45546371 1I TTTTTATCCT -/C CCACAATTAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 C 2 3 69875 CASAVA_Build 13 45546561 3D TGAGTGCATA TTT/--- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 10 7 69876 CASAVA_Build 13 45548533 1I TACAATGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 11 12 69877 CASAVA_Build 13 45549833 1I ACAGATGAAT -/G GATAAAGAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 69878 CASAVA_Build 13 45561287 1I AATAGACTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 10 69879 CASAVA_Build 13 45561983 1D GAACCGTGAG C/- AATAAATTTC 3070 hom 69 het 29 0 23 7 C 1 0 69880 CASAVA_Build 13 45565775 1D CTATTTTTGG A/- AAAAAAGTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 6 69881 CASAVA_Build 13 45567458 1D TATCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 41 0 29 12 A 13 12 69882 CASAVA_Build 13 45573852 1D GTCACTTTAC A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 101 het 41 0 33 8 A 8 7 69883 CASAVA_Build 13 45579512 1D TTGTAACTGT C/- CTTTCATGTT 3070 hom 105 het 43 0 34 9 C 2 1 69884 CASAVA_Build 13 45581176 1I39M1D TCTATTTGAA -TTTTTTTTTAGAGTTTACTTTTCACTGCTGCATTTCCCAT/TTTTTTTTTTAGAGTTTACTTTTCACTGCTGCATTTCCCA- TTTTTCATAC 3070 hom 135 het 40 0 46 6 N/A 0 0 69885 CASAVA_Build 13 45587511 3I AGAATACATA ---/CTT TTTCAAGTGT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 CTT 0 1 69886 CASAVA_Build 13 45596385 1I GGTATTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 45 2 35 8 A 11 12 69887 CASAVA_Build 13 45602725 1D TATTGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 39 1 24 15 T 13 12 69888 CASAVA_Build 13 45604138 2D TCTCTGAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 25 0 17 8 T 16 14 69889 CASAVA_Build 13 45629394 2I GCATGTATAC --/AT ATATATATAT 1681 het 1681 ref 13 8 4 1 AT 5 6 69890 CASAVA_Build 13 45645729 1D ATTAGTTGTG T/- TGTATACTAT 3070 hom 169 het 66 0 57 9 T 2 1 69891 CASAVA_Build 13 45650061 1I TAATTTGTTT -/A ATAAAAGCAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 69892 CASAVA_Build 13 45668442 3D GATGCAAATG AGA/--- AGAAGTTTAA 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 AGA 2 1 69893 CASAVA_Build 13 45686217 1D TCTATTTCTG T/- TGTATGGTTT 3070 het 3070 hom 43 17 23 4 T 2 1 69894 CASAVA_Build 13 45698130 1I TTCCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 15 10 T 10 11 69895 CASAVA_Build 13 45714898 1D AGTGTTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 12 11 69896 CASAVA_Build 13 45721044 6D TCAGTCTCAA TAAATT/------ TAAAAGGATT 3070 het 3070 hom 20 9 9 4 TAAATT 1 0 69897 CASAVA_Build 13 45729620 1I CAACTCTTGT -/G GGGATCACAT 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 G 3 4 69898 CASAVA_Build 13 45735308 4D AAATTTTTGA ATTT/---- ATTTTATTTT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 ATTT 2 1 69899 CASAVA_Build 13 45749364 2D ATAGCATTGC AG/-- AGTCATCAGT 3070 het 3070 hom 40 18 19 5 AG 2 1 69900 CASAVA_Build 13 45753504 1D TTTTCAGACA G/- GTCTCGCTCT 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 G 2 1 69901 CASAVA_Build 13 45760538 3D TGTATTCTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2728 hom 29 9 14 6 T 14 11 69902 CASAVA_Build 13 45795919 1D CACACAACTC T/- TTTTTTTTTT 1662 het 1662 ref 34 12 6 16 T 17 16 69903 CASAVA_Build 13 45835483 1I ATTTCAACTT -/A AAAGAATTAA 3070 het 399 hom 41 1 35 5 A 3 4 69904 CASAVA_Build 13 45873133 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1284 hom 24 6 11 8 A 17 16 69905 CASAVA_Build 13 45877861 1D AACCTGCCCC T/- AAATTTGCAT 3070 hom 125 het 45 0 42 5 T 1 0 69906 CASAVA_Build 13 45878845 6I GTGAACCTGG ------/GAGGCA GAGCTTGCAG 2495 hom 15 het 6 0 6 0 GAGGCA 0 1 69907 CASAVA_Build 13 45897630 5D33M3D TACATGCTTA TTACTTTGTCTTCTCAGAATTTTGTTATATATTTCAGCTTA/-----TTGTCTTCTCAGAATTTTGTTATATATTTCAGC--- TTAACTGCTT 3070 hom 27 het 10 0 10 4 N/A 0 0 69908 CASAVA_Build 13 45899082 1I GGTTGTGAGG -/C CCTCCCCAAC 3070 hom 38 het 15 0 13 2 C 2 3 69909 CASAVA_Build 13 45899538 1I ATATACCTAA -/T TAATAATTAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 1 2 69910 CASAVA_Build 13 45904041 3D6M1I AAATTAGTAT AGCAGAATA-/---AGAATAG TTTTTAAGAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 N/A 0 0 69911 CASAVA_Build 13 45915039 1D TCAAGCTGCA T/- TTTTCCTTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 5 4 69912 CASAVA_Build 13 45943173 4D AGCAATTCTT AAAC/---- AACATTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAAC 1 0 69913 CASAVA_Build 13 45968655 1D TGATAAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 21 1 12 8 T 17 16 69914 CASAVA_Build 13 45979843 1D TCTGCAAACA G/- GGACAATTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 G 3 2 69915 CASAVA_Build 13 45980241 4D GTGGTCTGGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 27 0 15 13 T 16 12 69916 CASAVA_Build 13 45980639 1I TTATTATTGC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 8 9 69917 CASAVA_Build 13 45987006 1D29M2D TTACCTTATC TTTTTTTTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTTTA/-TTTTTTTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTT-- AATTTATTTT 3070 hom 36 het 12 0 13 1 N/A 0 0 69918 CASAVA_Build 13 45990458 1D CTTTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 33 0 26 8 T 12 11 69919 CASAVA_Build 13 45998809 7D CCTCTCAATA GGTGTTT/------- GGTGTTTATT 3070 hom 110 het 39 0 36 7 GGTGTTT 2 1 69920 CASAVA_Build 13 46000440 3I CACTAATATA ---/ATT ATTAAGAAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATT 1 2 69921 CASAVA_Build 13 46000947 4I AAATAAATAA ----/AAAG AAAGAAGGAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AAAG 1 2 69922 CASAVA_Build 13 46002922 2I TTAAGAACTC --/AG AGCTGTATTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AG 1 2 69923 CASAVA_Build 13 46041211 1I TTTATTTTCC -/T TTATTTCGAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 2 3 69924 CASAVA_Build 13 46054301 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 117 het 117 ref 15 9 2 5 AAG 1 0 69925 CASAVA_Build 13 46054628 1I ACATATTGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 G 0 1 69926 CASAVA_Build 13 46055901 1D AATTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 121 hom 24 1 13 10 T 14 13 69927 CASAVA_Build 13 46057107 2D AACTACTTTC AT/-- ACAACTAAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AT 1 0 69928 CASAVA_Build 13 46066380 1D AATCTCAGTG A/- AAAAAAAAAA 1936 het 1936 ref 38 23 6 9 A 15 14 69929 CASAVA_Build 13 46067075 4D CAGGCTATAT AAAG/---- AAAGTCTCAT 3070 het 3070 hom 31 14 16 2 AAAG 2 1 69930 CASAVA_Build 13 46069942 1I AAATAAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 150 hom 40 1 36 3 T 10 11 69931 CASAVA_Build 13 46072297 1I TGCTGGGATT -/A ACAGGCGTGA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 1 2 69932 CASAVA_Build 13 46085523 1D ACCCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 21 1 17 4 A 12 11 69933 CASAVA_Build 13 46086249 1D GTTACCTTTC T/- TTTTTTGTGG 3070 hom 126 het 44 0 42 2 T 7 6 69934 CASAVA_Build 13 46094339 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCAAGGC 3070 hom 18 het 30 1 23 6 C 6 5 69935 CASAVA_Build 13 46099609 1D GATAAAAAAA T/- CGAGAAGTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 1 0 69936 CASAVA_Build 13 46104338 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 42 1 22 19 A 12 11 69937 CASAVA_Build 13 46104350 1D AAAAAAAAAA C/- AAACCTAAAT 3070 het 298 hom 32 7 18 7 C 1 0 69938 CASAVA_Build 13 46117299 1D CAGACTGATA C/- ACTAATTAGT 3070 hom 120 het 42 0 40 3 C 1 0 69939 CASAVA_Build 13 46117822 3D AACTAGTCTT CTG/--- CTCTCAGGTT 3070 hom 123 het 46 0 42 6 CTG 1 0 69940 CASAVA_Build 13 46119931 1D GGTAGTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 38 2 18 18 T 17 16 69941 CASAVA_Build 13 46122706 1D GTTTTTTTTT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 7 6 69942 CASAVA_Build 13 46129300 1D TTCAATTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 10 9 69943 CASAVA_Build 13 46139675 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGGAGGG 686 het 39 hom 8 1 3 4 G 7 6 69944 CASAVA_Build 13 46142791 2I CACTGCCCAT --/CC CCCCCCCCAA 3070 hom 49 het 21 0 16 5 C 8 10 69945 CASAVA_Build 13 46145639 1D TATCAATTGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 8 69946 CASAVA_Build 13 46147134 1D AAAATGTTAC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 9 8 69947 CASAVA_Build 13 46156383 2I TCTACTCCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 43 1 34 8 T 10 12 69948 CASAVA_Build 13 46158708 4I GCTTTGGGGA ----/AGAG AGATTCAAAT 3070 hom 87 het 33 0 27 6 AG 1 3 69949 CASAVA_Build 13 46162208 1I TGACTCCAGG -/A AAAAAAACCT 3070 het 426 hom 30 1 26 3 A 7 8 69950 CASAVA_Build 13 46166066 4I GGAGAGCTGT ----/TTCC TTAAGTTCAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TTCC 0 1 69951 CASAVA_Build 13 46170012 10D TTTGCCTAAT GAAAAAAAGA/---------- GACATTTTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 GAAAAAAAGA 1 0 69952 CASAVA_Build 13 46170623 1I CATTTGAGTG -/A ATTCTGGATG 3070 hom 157 het 57 0 53 4 A 1 2 69953 CASAVA_Build 13 46174341 4I CCTTGAGAAG ----/TTAT TTATAAGTGT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TTAT 1 2 69954 CASAVA_Build 13 46177377 1I ACTTTGTATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 416 hom 42 1 27 14 T 9 10 69955 CASAVA_Build 13 46177682 1I ATTCTGTAGA -/T TTTTTTTACC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 T 7 8 69956 CASAVA_Build 13 46178899 2I TAAAAGTTGT --/AA AAAAATTTGC 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 5 7 69957 CASAVA_Build 13 46207289 2D TTTTTAAAGA GT/-- GTAAATTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 6 GT 2 1 69958 CASAVA_Build 13 46215871 1D AGAAAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 10 69959 CASAVA_Build 13 46221744 1D ATAAATACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2473 hom 26 8 17 2 T 10 9 69960 CASAVA_Build 13 46230030 1I GAAAGAAAGG -/A AAGGAAGAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 2 3 69961 CASAVA_Build 13 46230156 2I CCCCCCCCAC --/AA AAAAAAAAAA 2629 het 2328 hom 31 10 12 9 A 10 12 69962 CASAVA_Build 13 46231094 1I TGTGCTTTTT -/G AATGCTGGTT 3070 hom 159 het 58 0 53 5 G 0 1 69963 CASAVA_Build 13 46231752 4I TTTCTCTGAG ----/AAAT AAAAAAAGGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAT 0 1 69964 CASAVA_Build 13 46231972 14D GACTGTCTCC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 1822 het 1822 ref 25 10 7 11 A 28 14 69965 CASAVA_Build 13 46248066 2I TAACAAACTT --/GA GAGATTTTCA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 GA 2 3 69966 CASAVA_Build 13 46249071 1I TATTTTAGTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 8 9 69967 CASAVA_Build 13 46251129 1I AGAAGTTGCA -/T TTTTTTACCC 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 6 7 69968 CASAVA_Build 13 46255689 4I CTTTTATATA ----/TCTT TCTATTTTCG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TCTT 0 1 69969 CASAVA_Build 13 46266300 1D CTCCAAAAAA C/- AACAACAACA 2985 het 334 hom 26 3 15 8 C 1 0 69970 CASAVA_Build 13 46269661 11D GAGGGTTTCC GTGTCACTTAT/----------- GTAGAAACTA 3070 hom 96 het 33 0 32 5 GTGTCACTTAT 1 0 69971 CASAVA_Build 13 46275748 1D AAAACACTTA C/- TAATGTTTAC 3070 hom 93 het 36 0 26 10 C 1 0 69972 CASAVA_Build 13 46301989 1D ACCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1563 het 1563 ref 23 7 8 8 A 15 14 69973 CASAVA_Build 13 46302281 3I ACTTGTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 TTG 5 6 69974 CASAVA_Build 13 46306904 1I CAATCTCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 11 12 69975 CASAVA_Build 13 46308327 1D TATCTTTTTT A/- AAAAATCTAA 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 A 6 5 69976 CASAVA_Build 13 46337081 1D TGTAAAGAGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 62 het 28 0 24 4 T 9 8 69977 CASAVA_Build 13 46337578 4I AACAGAAAAG ----/AAGT AATATAAGAG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 AAGT 0 1 69978 CASAVA_Build 13 46344467 1D GCATGGTTTA T/- TTGACCACTC 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 3 2 69979 CASAVA_Build 13 46344614 4D CTAGCTTCTC TTTA/---- TTCTAGAGTT 3070 het 3070 ref 42 24 15 5 TTTA 1 0 69980 CASAVA_Build 13 46345289 1D TTTTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2776 hom 35 8 13 14 T 12 11 69981 CASAVA_Build 13 46345384 1D TGATTACATA G/- ACACCACTTT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 G 1 0 69982 CASAVA_Build 13 46352147 1I TATCAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 126 het 53 0 40 13 A 9 10 69983 CASAVA_Build 13 46352986 1I AATAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 9 10 69984 CASAVA_Build 13 46354366 2I CAGGGAAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 38 1 27 10 A 10 12 69985 CASAVA_Build 13 46358482 5I GCAAGTCAGT -----/AAATG AAATAGTTCA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AAATG 0 1 69986 CASAVA_Build 13 46360223 1I AGAACAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 11 12 69987 CASAVA_Build 13 46360607 1D TGAAGTGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 35 2 13 20 A 12 11 69988 CASAVA_Build 13 46372933 1I TCTTAGAAAT -/A ATACAGTGCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 69989 CASAVA_Build 13 46373113 1I ATTCACTGAG -/T TTTGACAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 3 4 69990 CASAVA_Build 13 46375278 2I GGAGTTGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 10 12 69991 CASAVA_Build 13 46380795 1D AGTCTGTTAC A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 129 het 54 0 44 11 A 7 6 69992 CASAVA_Build 13 46383103 1D TTTGGCTGTT G/- GAGTTTTATC 3070 het 3070 hom 36 11 12 16 G 2 1 69993 CASAVA_Build 13 46384321 2D AATTGCTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 31 3 16 12 T 16 14 69994 CASAVA_Build 13 46385264 1D TGCTATCCCT G/- CCCCCCCCCA 1651 hom 10 het 4 0 4 0 G 1 0 69995 CASAVA_Build 13 46388696 1I GGTCAGTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 11 12 69996 CASAVA_Build 13 46392910 1D ACTCTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 2201 het 968 hom 16 6 6 4 T 13 12 69997 CASAVA_Build 13 46398270 1I GTAAGAGGAT -/A GGGGGTGATG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 0 1 69998 CASAVA_Build 13 46399456 1I GAAGAAAGAA -/G GTAGTGAATA 3070 hom 154 het 56 0 52 4 G 1 2 69999 CASAVA_Build 13 46401658 1D AGGGGTACTT C/- ACATGTGTGA 3070 hom 163 het 63 0 52 11 C 1 0 70000 CASAVA_Build 13 46406919 1D CCCAGATGAC A/- TTTCTATGCT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 A 1 0 70001 CASAVA_Build 13 46409687 1I ACAAAATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 27 2 21 4 T 10 11 70002 CASAVA_Build 13 46430707 1I TAGTTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 24 10 T 10 11 70003 CASAVA_Build 13 46434236 1D GCCCGAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 978 hom 40 5 19 16 A 17 16 70004 CASAVA_Build 13 46472532 1I GAGTAATCGA -/T TTTTTTTTTT 1442 het 1442 ref 40 22 5 13 T 13 14 70005 CASAVA_Build 13 46495614 3D TGGAGATCCT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 117 het 51 0 39 16 AAC 6 5 70006 CASAVA_Build 13 46501242 22D AAGTAATTTC ATATATATATATATATATATAT/---------------------- ATATATATAT 3070 hom 24 het 11 0 9 6 AT 19 8 70007 CASAVA_Build 13 46504952 9I ATACAACTCA ---------/ATTTCACTC ATTTTAAAAC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 ATTTCACTC 0 1 70008 CASAVA_Build 13 46506128 1D TTCAGGTGCC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 9 8 70009 CASAVA_Build 13 46514170 1I ACTCTTTACC -/T TTTTTTTTTT 2335 het 2335 ref 23 10 7 6 T 12 13 70010 CASAVA_Build 13 46514441 1I TTTACCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 11 10 T 11 12 70011 CASAVA_Build 13 46521014 1D ATATAATCAC T/- TTTTTTTTTT 1413 het 1413 ref 45 27 5 13 T 17 16 70012 CASAVA_Build 13 46526805 1D TCTTGACTGG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 8 7 70013 CASAVA_Build 13 46532447 10I GTTTTTCACC ----------/ATTGAGGATA ATATTTGCCT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 ATTGAGGATA 0 1 70014 CASAVA_Build 13 46532874 4I AAATCGAGGC ----/TTCT TTCTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 TTCT 1 2 70015 CASAVA_Build 13 46533244 6I TTTGATCCAT ------/TGGTTG TGGTTGTAGA 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 TGGTTG 1 2 70016 CASAVA_Build 13 46536153 4D TAGTTTTCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 25 4 11 11 T 14 10 70017 CASAVA_Build 13 46536895 3D TACCATTGCA GTT/--- GTTGTCAGAC 3070 het 3070 hom 41 16 17 10 GTT 2 1 70018 CASAVA_Build 13 46544731 1I ATGTGAGTAA -/T TTTTTTTTTA 2722 het 2722 ref 19 12 6 1 T 9 10 70019 CASAVA_Build 13 46546369 8D TGACTCATTG GCATCCCA/-------- GAAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 41 17 21 6 GCATCCCA 1 0 70020 CASAVA_Build 13 46548286 1I TAAAAAAAAA -/C ACTACCTACT 2863 het 2368 hom 21 9 6 6 C 0 1 70021 CASAVA_Build 13 46548728 1D ATTCAACATT C/- CTTTATGTTA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 C 2 1 70022 CASAVA_Build 13 46552493 6I CCGGGAGGCG ------/GAGGTT GAGGTTGCAG 2272 hom 12 het 7 0 5 3 GAGGTT 1 2 70023 CASAVA_Build 13 46553228 1D GGGAAGATGC T/- GGATATCTCC 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 T 1 0 70024 CASAVA_Build 13 46570286 17D TCAACCCTCA CCTCCCTCTCAACCTCC/----------------- CCTCCCTCTC 3070 het 3070 ref 34 16 10 16 CCTCCCTCTCAACCTCC 2 1 70025 CASAVA_Build 13 46585159 1I TGCTGATGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 366 hom 51 1 46 4 A 9 10 70026 CASAVA_Build 13 46589041 1D TGAATGAACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 9 8 70027 CASAVA_Build 13 46590062 8D TACTTAATTC AAAATAGT/-------- AAAGTAAATT 3070 hom 123 het 47 0 41 8 AAAATAGT 1 0 70028 CASAVA_Build 13 46597545 2D TGAGGGAAAC AG/-- AGGCACAGAG 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 AG 2 1 70029 CASAVA_Build 13 46599687 1I GAACCTCTGC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 T 7 8 70030 CASAVA_Build 13 46599998 2D AAGCCAAGGT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 11 9 70031 CASAVA_Build 13 46617336 1D ATTATAGGCA C/- CCCCCCACCA 727 het 727 ref 12 6 3 3 C 7 6 70032 CASAVA_Build 13 46620631 3I ATTTGTTAAC ---/TTT TTTAAAAAAA 386 het 386 ref 22 15 3 4 T 3 6 70033 CASAVA_Build 13 46622633 1D CAGCCCTACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 9 8 70034 CASAVA_Build 13 46631383 1D ATAAAAAAAA T/- AACTTGAGTT 3070 het 3070 ref 49 25 21 4 T 1 0 70035 CASAVA_Build 13 46631662 1D TGTTTGTATC A/- AAAAAAAAAA 1256 het 1256 ref 26 16 3 8 A 13 12 70036 CASAVA_Build 13 46643285 9D TGTTGGGAAA CAGAAGTGG/--------- ATGAGTAGAG 1438 het 1438 ref 45 24 9 15 CAGAAGTGG 1 0 70037 CASAVA_Build 13 46670651 4D TTGTAACGAT TAAA/---- TAGTTATTTG 3070 het 3070 ref 30 20 10 2 TAAA 1 0 70038 CASAVA_Build 13 46672360 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1856 hom 29 7 13 9 A 12 11 70039 CASAVA_Build 13 46672905 4D TATTAAAGAT TATC/---- TAAATCCTTA 3070 het 3070 hom 43 20 20 5 TATC 1 0 70040 CASAVA_Build 13 46676763 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 A 13 14 70041 CASAVA_Build 13 46697591 2D CCATTTGCTT GG/-- TAGATCTTCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 2 0 70042 CASAVA_Build 13 46702713 1I AAATGTGGCC -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 7 8 70043 CASAVA_Build 13 46731633 22D GTGGTTCAAT GCAACAGAGTAGAGGGTGGGGG/---------------------- GCAACAGAGT 3070 hom 99 het 43 0 33 14 GCAACAGAGTAGAGGGTGGGGG 2 1 70044 CASAVA_Build 13 46738242 6I TTTTGTAGTT ------/TTACTA TTAGTAGAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTACTA 0 1 70045 CASAVA_Build 13 46743795 1I CAAATGACAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 8 9 70046 CASAVA_Build 13 46746883 13D TGTGCATCTC ACATCTAAAACAT/------------- ACCTTCACAG 3070 het 3070 hom 52 23 26 9 ACATCTAAAACAT 1 0 70047 CASAVA_Build 13 46753973 4I AAATGTAGAC ----/TATT TAGGTATAGT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 TATT 0 1 70048 CASAVA_Build 13 46754549 1I AGAGACTGAT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 7 8 70049 CASAVA_Build 13 46758512 2D36M4D TGTGTGTATA TGTGTGTGTGTGTATATATATATATGTATGTGTGTGTTTGTG/--TGTGTGTGTGTATATATATATATGTATGTGTGTGTT---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 49 29 27 10 N/A 0 0 70050 CASAVA_Build 13 46759092 4D GAAAATTACC CAAA/---- CAAACTTTCC 3070 het 3070 hom 53 23 24 10 CAAA 2 1 70051 CASAVA_Build 13 46759185 4I CTGGCAGCCT ----/TGTG TGTGTATTTG 3070 het 3070 ref 53 28 22 3 TG 2 4 70052 CASAVA_Build 13 46764074 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 2809 het 2137 hom 26 8 12 6 A 12 14 70053 CASAVA_Build 13 46765032 4I GGGTAACTAG ----/AACT AACTAACACA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 AACT 1 2 70054 CASAVA_Build 13 46767754 1I GCTTCATGTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 8 9 70055 CASAVA_Build 13 46774749 1I TATTTTTAAT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 7 8 70056 CASAVA_Build 13 46775063 4D TGTGCTGCTA TGTT/---- TGTTTAACAT 3070 hom 108 het 44 0 37 9 TGTT 2 1 70057 CASAVA_Build 13 46779974 1D AGGAAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 12 6 A 12 11 70058 CASAVA_Build 13 46783267 1D ATAGTCTACC A/- AAAAAGGAAA 49 het 49 ref 37 18 2 17 A 6 5 70059 CASAVA_Build 13 46791124 12D TTTTCTCTTT CCTTTTCCCTCC/------------ CCTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 38 19 15 7 CCTTTTCCCTCC 2 1 70060 CASAVA_Build 13 46796987 1D CAACCTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 26 4 17 6 A 15 14 70061 CASAVA_Build 13 46807307 1I TATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 468 hom 28 2 17 9 T 13 14 70062 CASAVA_Build 13 46814950 1I GAACATAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 25 1 21 3 A 10 11 70063 CASAVA_Build 13 46815624 1D AATAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 2474 het 2474 ref 36 23 6 7 T 13 12 70064 CASAVA_Build 13 46817354 4D TATATATACG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 29 het 23 0 19 7 TA 9 7 70065 CASAVA_Build 13 46837440 1D CTGTTGTTGT G/- GGTGCTGTGT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 3 2 70066 CASAVA_Build 13 46837672 12D CCCTTTTATC TTATTTATTTAT/------------ TTATTTATTT 1841 hom 21 het 15 0 8 10 TTAT 10 7 70067 CASAVA_Build 13 46843147 2D ACAACCCACA GG/-- GAATGGGAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 3 1 70068 CASAVA_Build 13 46846584 1D TCCGCCCCCT G/- GGGGTTCACG 1048 hom 7 het 3 0 3 0 G 5 4 70069 CASAVA_Build 13 46863746 1I CAACTCTACC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 8 9 70070 CASAVA_Build 13 46870550 2I GCTAGAACTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 10 12 70071 CASAVA_Build 13 46872773 5I GTTTTGTCTA -----/TATTT TATTTTATTG 3070 hom 87 het 35 0 30 6 TATTT 1 2 70072 CASAVA_Build 13 46878014 1I ATGACACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1335 hom 38 4 23 11 T 13 14 70073 CASAVA_Build 13 46878442 1D TCTTTTGTCA T/- TTTTTCCACT 3070 hom 57 het 21 0 20 3 T 6 5 70074 CASAVA_Build 13 46883835 1I AAAAGAACTC -/A AGAGTGAGGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 1 2 70075 CASAVA_Build 13 46888033 1I GAAATAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 919 hom 28 3 16 9 A 14 15 70076 CASAVA_Build 13 46891877 1I GGAATGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 11 70077 CASAVA_Build 13 46898812 1D GCCTTGGGGG A/- AAAAATAGAC 3070 hom 91 het 33 0 31 2 A 6 5 70078 CASAVA_Build 13 46899227 1D ATTCTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 33 1 24 8 T 15 14 70079 CASAVA_Build 13 46902718 1I CAAAAATAGC -/A AAAATGAGGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 4 5 70080 CASAVA_Build 13 46905556 3D CCTCTTGTCC CAT/--- CATTTCTTTA 3070 hom 123 het 46 0 39 7 CAT 2 1 70081 CASAVA_Build 13 46910611 2D GTTTTATCAC AT/-- GTTTTGAATC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AT 1 0 70082 CASAVA_Build 13 46913173 2D GCCTCCTAAA TT/-- TTGCTGGACT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 T 4 2 70083 CASAVA_Build 13 46918144 4D ACTGGTATAT ATAC/---- ATACATACAT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 ATAC 4 3 70084 CASAVA_Build 13 46930298 1D TGTAGTCTCA G/- CTACTCGGGA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 1 0 70085 CASAVA_Build 13 46938840 1I AAAACTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 22 2 15 5 A 12 13 70086 CASAVA_Build 13 46939068 1I AATAAACTAG -/A AAATCTAGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 4 70087 CASAVA_Build 13 46943721 1D AATAGACAGT C/- CATCCTCACA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 C 2 1 70088 CASAVA_Build 13 46944085 1I CCTCAATTTC -/T TTTTTAGGAC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 5 6 70089 CASAVA_Build 13 46952598 2D CATACATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 54 0 40 15 T 13 11 70090 CASAVA_Build 13 46952724 1D CTACTAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 31 2 18 13 T 15 14 70091 CASAVA_Build 13 46961974 1D TTCTCACCAC A/- AAAAAAGGTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 7 6 70092 CASAVA_Build 13 46964881 3D CAGCCTGTGA CTT/--- TTTTTTTAAC 3070 hom 93 het 34 0 31 6 CTT 1 0 70093 CASAVA_Build 13 46967739 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2432 het 138 hom 9 1 7 1 T 15 14 70094 CASAVA_Build 13 46986583 1D ATACAAGCAA C/- CCATCCTCCA 3070 hom 123 het 49 0 41 8 C 3 2 70095 CASAVA_Build 13 46989803 6D ATTTTACTTG ACTTAA/------ ACTTACATTG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 ACTTAA 1 0 70096 CASAVA_Build 13 46990080 2D GGGAATTTAC AA/-- AGACAATTGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 1 70097 CASAVA_Build 13 46990433 1I AGGACCTGAT -/A ATTCTTGAGG 3070 hom 65 het 24 0 22 2 A 1 2 70098 CASAVA_Build 13 46994704 9I GAGAACTAAG ---------/TTTTATACC TTTTATACCA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 TTTTATACC 1 2 70099 CASAVA_Build 13 47007950 1D TCAGAACCAG A/- AAAAAAACTA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 8 7 70100 CASAVA_Build 13 47033664 2D TTGTATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 T 14 12 70101 CASAVA_Build 13 47036158 1D GCAGGAGTTG T/- TTTTTTTTTT 1108 het 1108 ref 39 26 4 10 T 11 10 70102 CASAVA_Build 13 47042148 1D GAACTTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 11 10 70103 CASAVA_Build 13 47090914 2I ATGGCATGGC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 42 16 13 13 AG 7 8 70104 CASAVA_Build 13 47103638 2D TTCCTCTTGA CT/-- CTGAATACCA 3070 het 3070 ref 44 20 21 3 CT 2 1 70105 CASAVA_Build 13 47103699 2D AGTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2309 het 261 hom 23 2 8 14 T 12 10 70106 CASAVA_Build 13 47107707 3I TAGAATAATA ---/AAG AAGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 AAG 1 2 70107 CASAVA_Build 13 47114769 3D CATCATTTGC GTT/--- GTTATTTGCA 3070 het 3070 ref 35 18 16 3 GTT 2 1 70108 CASAVA_Build 13 47116400 2D ATACAGTCTC TA/-- TATAACTTTA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 TA 3 2 70109 CASAVA_Build 13 47122972 4I CACTCATTGG ----/GTAT TCAAGATGGT 3070 het 3070 ref 53 23 24 6 GTAT 0 1 70110 CASAVA_Build 13 47143084 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 8 9 70111 CASAVA_Build 13 47143249 13D TCAGCATGAG CCAAGTTGTAGAA/------------- CCAGAAATGC 1868 het 1868 ref 22 15 4 5 CCAAGTTGTAGAA 1 0 70112 CASAVA_Build 13 47144368 1D AAAGACTGCT A/- AAAAAATTTC 3070 het 3070 hom 42 18 20 6 A 7 6 70113 CASAVA_Build 13 47145134 1D AAAAAATAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 10 9 70114 CASAVA_Build 13 47146192 1D TATTTAAGAT G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 9 7 G 5 4 70115 CASAVA_Build 13 47162352 2D GAGGTAACTT TA/-- GGTTAGGTCA 3070 het 3070 hom 56 24 26 9 TA 1 0 70116 CASAVA_Build 13 47163694 1D TTTCACCCCC A/- CACAGTGTCT 3070 het 3070 ref 43 23 19 1 A 1 0 70117 CASAVA_Build 13 47166190 2D CACGCCCCCC CT/-- CTCTCATTCT 1436 het 1436 ref 25 12 6 7 CT 3 2 70118 CASAVA_Build 13 47170583 1I GAAATTAACA -/T TATTTTCTCA 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 T 1 2 70119 CASAVA_Build 13 47171676 1D CTTCCAATAT C/- CATTATGCCT 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 C 2 1 70120 CASAVA_Build 13 47175580 1I89M6D ATTAACAGTT -GGGGGGAAAGGACTGTTGCCCTCTATATTCTTTTTTTACCTTTCATTCAAGCACTATGATAATGATAGGGACTTATTTAAAAAAAAAAAAGAAAC/GGGGGGGAAAGGACTGTTGCCCTCTATATTCTTTTTTTACCTTTCATTCAAGAACTATGATAATGATAGGGACTTATTTAAAAAAAAAAA------ AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 29 23 17 7 N/A 0 0 70121 CASAVA_Build 13 47175690 4D AAGAAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 1204 het 1204 ref 20 9 5 8 AAAG 4 3 70122 CASAVA_Build 13 47177820 2D TAAATTAACT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 TG 1 0 70123 CASAVA_Build 13 47180969 1I GAAACACTTC -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 T 6 7 70124 CASAVA_Build 13 47183637 1D GTTATAATAT A/- AAAGTCTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 A 4 3 70125 CASAVA_Build 13 47190610 1D52M2D TGCACAAAAC AAAAGGGGATCAGGGACTTCTGAGCAATAAAGAGACTTAAGAGACTCAACATGAA/-AAAGGGGACCAGGGACTTCTGAGCAATAAAGAGACTTAAGAGACTCAACATG-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 24 17 15 N/A 0 0 70126 CASAVA_Build 13 47195232 1I ATTCTGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 10 11 70127 CASAVA_Build 13 47200379 1D TGGACCTTTC T/- TAATACCAGG 3070 het 3070 ref 33 17 14 4 T 2 1 70128 CASAVA_Build 13 47205982 2I TTATAATTTT --/AA AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 7 9 70129 CASAVA_Build 13 47215293 1I ATCAAAAATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 A 8 9 70130 CASAVA_Build 13 47217074 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAATACA 2152 het 69 hom 8 1 6 1 A 7 6 70131 CASAVA_Build 13 47221868 1D ACAGAATATT A/- AATCAACCAT 3070 het 3070 hom 42 15 17 11 A 3 2 70132 CASAVA_Build 13 47230019 1I GGGTTCAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 A 10 11 70133 CASAVA_Build 13 47230478 2I AAGTGACCAC --/AT GTGACCTCCA 3070 het 3070 ref 58 27 23 8 AT 0 1 70134 CASAVA_Build 13 47233376 1I CATAGTCAAG -/A AAAAAGAGTT 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 A 5 6 70135 CASAVA_Build 13 47234969 1I CACTGGCTGA -/C CCAAGTAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 C 2 3 70136 CASAVA_Build 13 47242585 1D AAACATCTCC T/- GGACTTGTTG 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 1 0 70137 CASAVA_Build 13 47261266 1D GCCATTACTG A/- AAACTGTATG 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 A 4 3 70138 CASAVA_Build 13 47263181 1D ATGGCTGAAT G/- GGGCCAACTT 2062 het 2062 ref 21 11 7 3 G 4 3 70139 CASAVA_Build 13 47281362 1D CCAGAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 15 12 A 11 10 70140 CASAVA_Build 13 47286184 1D GGAAAGATCA C/- TGCTTTCAAT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 C 1 0 70141 CASAVA_Build 13 47288738 1D ATTAAACTGC A/- AAACCATGGT 3070 het 3070 ref 52 30 19 5 A 4 3 70142 CASAVA_Build 13 47314421 1I TGTACATGGT -/A AAAAAAAAAA 2634 het 2634 ref 34 20 10 4 A 13 14 70143 CASAVA_Build 13 47319061 1I GTAACTGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 43 1 35 7 T 9 10 70144 CASAVA_Build 13 47319403 1D AGTGTCCTAT G/- GAGCCACTTG 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 G 2 1 70145 CASAVA_Build 13 47320116 1D AGTCCTTTAA C/- CCTCATGCCC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 3 2 70146 CASAVA_Build 13 47320396 1D TGGTTCCACA T/- TTTTTGCAAT 3070 hom 85 het 35 0 28 8 T 6 5 70147 CASAVA_Build 13 47326058 3D CAAATTTTAA GAT/--- AATAAATTAG 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 GAT 1 0 70148 CASAVA_Build 13 47329792 1I TTCTTTGACC -/T TACCCTGAGC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 1 2 70149 CASAVA_Build 13 47333050 1I AAATTAGCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 A 9 10 70150 CASAVA_Build 13 47337846 1I GCATTGCCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 8 10 7 T 9 10 70151 CASAVA_Build 13 47340002 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 31 0 21 10 T 15 16 70152 CASAVA_Build 13 47362078 1I AAAAAAAAAA -/T AATGGTGATG 3070 het 395 hom 29 1 27 1 T 0 1 70153 CASAVA_Build 13 47378007 1D ACCCCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 37 1 27 9 A 13 12 70154 CASAVA_Build 13 47378162 1I ATTAGAATGA -/T TTATTGTATC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 2 3 70155 CASAVA_Build 13 47379436 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 8 7 70156 CASAVA_Build 13 47390643 14I GACAAAGAAA --------------/TTTTAAAAAATTTT AAAGAATTTT 3070 het 45 hom 15 1 15 0 TTTTAAAAAATTTT 0 1 70157 CASAVA_Build 13 47391743 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGCGCCC 3070 hom 29 het 12 0 10 2 C 1 2 70158 CASAVA_Build 13 47396685 1I CATTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3035 hom 33 het 17 0 11 6 A 12 13 70159 CASAVA_Build 13 47402905 1D AAAGCAAAGC T/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 26 1 23 3 T 1 0 70160 CASAVA_Build 13 47406301 1I AAAAGACATT -/A AGGGTGCATT 3070 hom 87 het 33 0 27 6 A 1 2 70161 CASAVA_Build 13 47408055 1D ACATACACTT C/- CACAAATGCC 3070 hom 69 het 25 0 23 3 C 2 1 70162 CASAVA_Build 13 47411263 1D CACCGTGTTA G/- GCCAGGATGG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 2 1 70163 CASAVA_Build 13 47412781 1I ACAAGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 654 hom 30 2 21 7 T 9 10 70164 CASAVA_Build 13 47414472 1D23M1I TGTCCCTACC AAAAAAAAAACAAAAATCAAAAAC-/-AAAAAAAAACAAAAATCAAAAACA AAAAAAAAAC 3070 hom 135 het 40 0 45 6 N/A 0 0 70165 CASAVA_Build 13 47431640 3D GGGAGCGGGG GGA/--- GGAGGAGGAG 3070 het 90 hom 14 2 9 3 GGA 10 9 70166 CASAVA_Build 13 47433662 1D CCTCAAACTA T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 8 7 70167 CASAVA_Build 13 47435190 4D CCCTGGTTTT AGTC/---- AGTCAGGGAG 3070 hom 111 het 43 0 34 10 AGTC 2 1 70168 CASAVA_Build 13 47435794 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 28 0 27 1 A 11 10 70169 CASAVA_Build 13 47437631 1D CCCCTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 228 hom 37 2 23 12 A 13 12 70170 CASAVA_Build 13 47438855 1I TTCTTTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 13 14 70171 CASAVA_Build 13 47439823 1D CTAAAAACAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 8 7 70172 CASAVA_Build 13 47443736 8D AGGACAATAG AGAAAACC/-------- AGTAAAACTG 3070 hom 38 het 14 0 13 2 AGAAAACC 1 0 70173 CASAVA_Build 13 47446225 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 18 1 15 3 A 11 10 70174 CASAVA_Build 13 47447734 3I AAAAATTAAA ---/AAG AAGAAGAATC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AAG 2 3 70175 CASAVA_Build 13 47454637 1I AAAATTAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 10 70176 CASAVA_Build 13 47454849 1I TTGACAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 12 13 70177 CASAVA_Build 13 47455524 5I GAATATAGAC -----/AAATT AAATCTACAG 3070 hom 102 het 41 0 31 10 AAATT 0 1 70178 CASAVA_Build 13 47455626 4D TTCTTTTCCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 24 1 14 9 T 18 14 70179 CASAVA_Build 13 47456504 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 8 7 70180 CASAVA_Build 13 47457081 1D CCAGAAAAAT A/- AAAGTAGTAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 4 3 70181 CASAVA_Build 13 47461689 1D ACCATTTCTT A/- AAAGTAAACT 3070 hom 90 het 36 0 29 8 A 4 3 70182 CASAVA_Build 13 47467450 4I ATAGGTCACC ----/ATTA ATTAACAAAA 3070 hom 86 het 33 0 29 4 ATTA 1 2 70183 CASAVA_Build 13 47468024 3D GCTATTAAGG CTT/--- CTGTTATCAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CTT 1 0 70184 CASAVA_Build 13 47471349 1D TAAAGAACAC T/- TTGGGGACAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 3 2 70185 CASAVA_Build 13 47471847 1D CGTCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 15 14 70186 CASAVA_Build 13 47473209 1D GGGCACCCAG A/- AAAATGTCAC 3070 hom 49 het 20 0 12 8 A 5 4 70187 CASAVA_Build 13 47474934 1I TATGAAAAGG -/A TAATTTAAAT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 0 1 70188 CASAVA_Build 13 47475985 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 17 3 A 14 12 70189 CASAVA_Build 13 47476192 1D CTCTCACCAC T/- TTTATTCAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 4 3 70190 CASAVA_Build 13 47480061 4I TAAAACTTAA ----/ATTT ATTAAAATGG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 ATTT 0 1 70191 CASAVA_Build 13 47487542 4I TAAGGGGAGT ----/AAGC AAGTCCTCTC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 AAGC 0 1 70192 CASAVA_Build 13 47490205 2D AACCATGCTC TT/-- CACAACTGGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 2 0 70193 CASAVA_Build 13 47491304 1D GGAGTGATCT C/- GGCTCACTGC 3070 het 2454 hom 16 6 10 1 C 1 0 70194 CASAVA_Build 13 47529797 3D CTCCATTCCC TCT/--- TCTTCTCCCT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TCT 3 2 70195 CASAVA_Build 13 47540969 1D TTACATGAGA G/- GTGCATAAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 G 2 1 70196 CASAVA_Build 13 47557308 13D GCCCAGCTAA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 2868 hom 21 het 8 0 7 3 T 23 10 70197 CASAVA_Build 13 47561326 1D TTCTTTTTTG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 8 7 70198 CASAVA_Build 13 47580795 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3059 hom 24 het 29 0 15 14 T 16 14 70199 CASAVA_Build 13 47588259 1D AATGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 24 1 11 12 T 15 14 70200 CASAVA_Build 13 47594824 1I CCAGCCTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 12 13 70201 CASAVA_Build 13 47597157 1D CACACACCCA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 32 1 26 5 T 2 1 70202 CASAVA_Build 13 47597893 2D AACCAGAAAG GT/-- GGGTCACCCT 3070 hom 91 het 36 0 30 6 GT 1 0 70203 CASAVA_Build 13 47600679 1D GGGAGAACTA T/- TAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 1 70204 CASAVA_Build 13 47602870 2I CTCATGGGGT --/TC TCTATCTGGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TC 1 2 70205 CASAVA_Build 13 47604338 14I CCAAAGATTC --------------/AAATATAAAAAATG AAATAATTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 AAATATAAAAAATG 0 1 70206 CASAVA_Build 13 47611226 1I TCCCCAACCT -/C CCCCTATCCC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 C 4 5 70207 CASAVA_Build 13 47618694 1D TATACCACAG T/- TTTTTTATCC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 6 70208 CASAVA_Build 13 47622990 6I ACGAGGTCAG ------/GAGTTC GAGACCAGCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 GAGTTC 0 1 70209 CASAVA_Build 13 47623703 1I TTTCTAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 28 1 24 3 T 10 11 70210 CASAVA_Build 13 47626116 10D TTTTCCTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 8 T 21 11 70211 CASAVA_Build 13 47636228 1D ACTGTATATC T/- TTTTTGTATA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 6 5 70212 CASAVA_Build 13 47641766 1D CAACAGTAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 10 9 70213 CASAVA_Build 13 47669720 1I AGCACCTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2692 hom 33 12 12 9 A 14 15 70214 CASAVA_Build 13 47744805 3D TTTTTTGAAA TTC/--- TTCTAGGATT 3070 het 3070 ref 26 15 10 4 TTC 2 1 70215 CASAVA_Build 13 47768669 1I TTTAAAATCA -/G TGCATTTAGA 3070 hom 66 het 31 0 21 10 G 0 1 70216 CASAVA_Build 13 47770462 5D CTCACATTTT TTAGA/----- TTAAACAGAA 3070 het 3070 hom 47 22 24 5 TTAGA 1 0 70217 CASAVA_Build 13 47786917 1I CAGCCTGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 A 11 12 70218 CASAVA_Build 13 47796568 1D TGAGTTCAAT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 38 2 27 9 A 1 0 70219 CASAVA_Build 13 47797828 1D TTTTAGTGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 10 9 70220 CASAVA_Build 13 47801095 1D CAGTGAAGTA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 13 het 29 1 24 4 T 7 6 70221 CASAVA_Build 13 47802522 1D AAATGAAGAG T/- TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 48 20 19 9 T 7 6 70222 CASAVA_Build 13 47805921 1D CTGCCACAAC T/- TTTTTTTTTT 1702 het 1702 ref 50 37 5 8 T 13 12 70223 CASAVA_Build 13 47812727 2I AGAGAGAGAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 9 11 70224 CASAVA_Build 13 47818679 1I TGCTTTAGAG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 95 het 35 0 32 3 T 7 8 70225 CASAVA_Build 13 47834453 1D ATCCAGGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 10 9 70226 CASAVA_Build 13 47854042 3D TCCACGTGTT CTC/--- ATTGTTCATT 3070 hom 96 het 33 0 31 3 CTC 1 0 70227 CASAVA_Build 13 47858502 1I CTGTATGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 724 hom 41 2 31 8 T 10 11 70228 CASAVA_Build 13 47864888 4D GACTGATAGT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 84 het 41 0 28 16 TC 8 6 70229 CASAVA_Build 13 47867231 1I ACTGGTGATA -/T CCAGGCAAAC 3070 hom 50 het 21 0 15 6 T 0 1 70230 CASAVA_Build 13 47876580 1D AAAAGAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 25 0 20 6 A 10 9 70231 CASAVA_Build 13 47878236 2I TAAATAACTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 45 0 36 9 TG 7 8 70232 CASAVA_Build 13 47894930 1D GACCTTGTCT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 A 10 9 70233 CASAVA_Build 13 47896741 1I CTTCCTTATC -/T TTTTTTTCCG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 7 8 70234 CASAVA_Build 13 47897831 1D CTCTTAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 A 10 9 70235 CASAVA_Build 13 47903280 1D ACAAACTAAC A/- AAAAATAACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 5 70236 CASAVA_Build 13 47905820 2I CAAAAATGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 46 0 34 12 T 13 15 70237 CASAVA_Build 13 47917126 2D TAAATAGTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 13 11 70238 CASAVA_Build 13 47921756 1D AAAATTAGCT G/- GGCACCATGG 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 G 3 2 70239 CASAVA_Build 13 47930431 2I TCTGAGTGTG --/TA TATATATGGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TA 3 4 70240 CASAVA_Build 13 47947491 5D AGGTGTCAGT TGGGC/----- TGGGCCTGCA 3070 hom 90 het 33 0 30 6 TGGGC 2 1 70241 CASAVA_Build 13 48068192 1D CAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1409 het 1409 ref 23 16 3 6 T 13 12 70242 CASAVA_Build 13 48076407 1I TTTTCAAAAA -/T TTTTAATTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 4 5 70243 CASAVA_Build 13 48157398 14D CACTTTTAAA CACTCACGAGAACT/-------------- CACTCACGAG 3070 het 3070 ref 35 16 12 12 CACTCACGAGAACT 2 1 70244 CASAVA_Build 13 48185037 1D AGCCTCAGAA G/- GGGTAGCTGC 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 G 4 3 70245 CASAVA_Build 13 48196437 1D ACTCATCAAG T/- TAACCAAGGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 2 1 70246 CASAVA_Build 13 48207188 1I AGGGTTGGGG -/A TAGAAATGGC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 1 70247 CASAVA_Build 13 48218242 1D ATCCAACAAC T/- TAGAAAGAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 T 2 1 70248 CASAVA_Build 13 48224232 1I TTCTAATTGT -/G GGTTTTGCCA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 G 2 3 70249 CASAVA_Build 13 48232514 1I TTGTGCTGCA -/G GGGGGGGGCC 2643 het 2643 ref 39 18 14 7 G 8 9 70250 CASAVA_Build 13 48259040 18D ATAGTTTATT AAAAAGTTATTTGGCGGC/------------------ CGGGCATGGT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 AAAAAGTTATTTGGCGGC 1 0 70251 CASAVA_Build 13 48289968 1I TTGATTAAAT -/A ACAAATTTAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 2 70252 CASAVA_Build 13 48297252 1I ATGGTTTAGC -/A ACAACACAGA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 1 2 70253 CASAVA_Build 13 48299784 2I GAGGGGACAC --/AG AGCCAAACCA 3070 het 3070 hom 54 22 22 10 AG 1 2 70254 CASAVA_Build 13 48301277 1D TGAGTGTTGT A/- GGGGGGGAGA 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 A 1 0 70255 CASAVA_Build 13 48310214 1I TCACTGGATG -/A AAAGAAGGAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 3 4 70256 CASAVA_Build 13 48315532 1D GCTCTGTCTG C/- CCCTCTGTGG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 C 4 3 70257 CASAVA_Build 13 48354914 1I GTTTAGCGCA -/T TTTTATATGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 4 5 70258 CASAVA_Build 13 48357683 1D TTCAGGAGCA G/- TACTCATGCA 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 G 1 0 70259 CASAVA_Build 13 48363849 1I AAATAGCAGG -/C CCATGATGAC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 2 3 70260 CASAVA_Build 13 48368217 1D CGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 16 7 A 11 10 70261 CASAVA_Build 13 48384248 1D TTGTAAGGCA T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 T 7 6 70262 CASAVA_Build 13 48387923 1I CGACTTCCCC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 A 7 8 70263 CASAVA_Build 13 48391158 11I GGCGGGAAGG -----------/AGAAGAAACTA AGAAGAAACT 3070 het 79 hom 38 4 29 5 AGAAGAAACTA 0 1 70264 CASAVA_Build 13 48393999 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 7 8 70265 CASAVA_Build 13 48411275 1D ATTTATATAC A/- AAAACCATTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 5 4 70266 CASAVA_Build 13 48411457 1D AGAAAAAGGA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 82 het 30 0 28 3 T 7 6 70267 CASAVA_Build 13 48416249 1D TCTAAAAAAA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 8 7 70268 CASAVA_Build 13 48420690 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 481 hom 13 1 9 3 A 10 11 70269 CASAVA_Build 13 48421555 1D CTTCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 26 1 17 8 A 12 11 70270 CASAVA_Build 13 48432771 1D ATTACTCTAC T/- TTTAAAAAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 4 3 70271 CASAVA_Build 13 48434524 1I AACAGATAAG -/A AAAAACGTAC 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 5 6 70272 CASAVA_Build 13 48444597 1I CAGTTTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2215 hom 32 8 16 8 A 15 16 70273 CASAVA_Build 13 48453618 1D CAATGCAGCC T/- TTTTTTTTTT 1450 het 1450 ref 45 29 5 11 T 13 12 70274 CASAVA_Build 13 48453969 1D CAGAAATGCT G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 G 5 4 70275 CASAVA_Build 13 48480601 3I AGATGGAAGT ---/GTC GTGCACAAGC 3070 hom 153 het 54 0 51 3 GTC 0 1 70276 CASAVA_Build 13 48481075 8I TTTCTTCATT --------/TATTAACA TATTAGTGTG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 TATTAACA 0 1 70277 CASAVA_Build 13 48483378 1D GATGTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 32 0 24 8 T 11 10 70278 CASAVA_Build 13 48517928 1D ATGACAGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 31 1 11 19 T 19 18 70279 CASAVA_Build 13 48519284 1D AGTGCCATTA T/- TTTTTTTTTT 1973 het 1973 ref 31 9 8 14 T 13 12 70280 CASAVA_Build 13 48521841 5D CTCTCTTCTC TTCTT/----- TTCTTTTCTT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 TTCTT 3 2 70281 CASAVA_Build 13 48543865 1I GATTATTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 951 hom 24 2 18 4 T 12 13 70282 CASAVA_Build 13 48544998 1I AGAGTATTTT -/G GGTGGAGTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 2 3 70283 CASAVA_Build 13 48554106 1D AATCAGTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 23 1 13 9 T 15 14 70284 CASAVA_Build 13 48576632 9D CTGCACTCCA GCCCAGGTG/--------- GCCCAGGTGA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 GCCCAGGTG 2 1 70285 CASAVA_Build 13 48585457 1I CCGTCACCCC -/T GTTTAGTAGT 3070 hom 58 het 26 0 19 7 T 0 1 70286 CASAVA_Build 13 48587321 1D TGAGGGATGA G/- GGGGGGGGGG 3070 het 544 hom 30 4 15 11 G 11 10 70287 CASAVA_Build 13 48639128 1I ACTCCACTCC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 8 9 70288 CASAVA_Build 13 48657271 3D TATTGGACTT GAG/--- GATCTTTAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 GAG 1 0 70289 CASAVA_Build 13 48658406 2D AAACCTTATA CT/-- CTCATACATG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 CT 2 1 70290 CASAVA_Build 13 48661323 2I TTTGGGAAAC --/AG AGTCTCACTC 3070 hom 44 het 25 0 17 8 AG 1 2 70291 CASAVA_Build 13 48678475 5I TATATAGCTT -----/CTTAA CTTATTTATG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 CTTAA 0 1 70292 CASAVA_Build 13 48709088 1D TTGCTATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 19 1 14 4 T 15 14 70293 CASAVA_Build 13 48723983 2D AAGGTTATGA CT/-- CTCATTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 CT 2 1 70294 CASAVA_Build 13 48728215 1I TCCTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 24 1 14 9 A 0 1 70295 CASAVA_Build 13 48728269 1D ATCTTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 13 12 70296 CASAVA_Build 13 48736858 1D GTCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 32 0 20 13 A 15 14 70297 CASAVA_Build 13 48743390 1D AAAAAAGTGG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 106 het 43 0 34 9 A 9 8 70298 CASAVA_Build 13 48743743 1D GAGTTGCCTC T/- TTTTTTTTTT 1154 het 1154 ref 35 18 5 13 T 15 14 70299 CASAVA_Build 13 48755319 5D ACTTGGACAT ATAAC/----- ATATAATTAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 ATAAC 1 0 70300 CASAVA_Build 13 48763482 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 353 hom 23 1 18 4 T 8 9 70301 CASAVA_Build 13 48769162 2I CCTGGTTCTC --/TT TGATGCGGAG 3070 hom 101 het 41 0 31 10 T 1 3 70302 CASAVA_Build 13 48779135 1I TTGCAATCTG -/A AAAAAATTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 70303 CASAVA_Build 13 48832498 1D ATAAAGTGGG T/- TTTCCATTAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 3 70304 CASAVA_Build 13 48842054 3D GTGATGGAAC TGT/--- TGTTCTTCAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TGT 2 1 70305 CASAVA_Build 13 48858082 1I CATGCTGGTG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 7 8 70306 CASAVA_Build 13 48870096 6D TAGTTACTGT TATTGA/------ TATTAAGACA 3070 het 3070 hom 39 17 22 4 TATTGA 1 0 70307 CASAVA_Build 13 48872099 1I GTCAACAGTC -/T TAAAAAAAAA 3070 het 2009 hom 24 6 13 5 T 1 2 70308 CASAVA_Build 13 48872905 4D AACAATAGAC AGAA/---- AGAGATAACT 3070 het 3070 hom 34 12 18 7 AGAA 1 0 70309 CASAVA_Build 13 48873701 2I TCACAGCTCC --/CT CTTTTACTTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CT 1 2 70310 CASAVA_Build 13 48879282 1I AAGAAAAAAT -/G TAAATGATGT 3070 hom 147 het 55 0 49 6 G 0 1 70311 CASAVA_Build 13 48881588 4D TGTTTGCTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 12 17 17 A 16 12 70312 CASAVA_Build 13 48882019 1D AGACCAGCCT G/- GGCAACATAG 3070 het 3070 ref 29 9 9 11 G 3 2 70313 CASAVA_Build 13 48884503 3D TTTGCCATTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 40 2 25 14 A 13 10 70314 CASAVA_Build 13 48886113 1I GCAACAAAAC -/A AGAGACTCTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 1 2 70315 CASAVA_Build 13 48887660 2D TCTGTCTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2462 hom 17 7 7 4 A 12 10 70316 CASAVA_Build 13 48889746 1I TAACAGAAGC -/A AAATAACGGA 814 het 814 ref 32 15 3 14 A 3 4 70317 CASAVA_Build 13 48889843 1I CTATCAGGGG -/A AAGACTGAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 2 3 70318 CASAVA_Build 13 48953574 1I TGTTAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 A 11 12 70319 CASAVA_Build 13 48966808 4D GGCTGCTAGG GTCT/---- GTCTGCTCAC 3070 hom 67 het 28 0 22 7 GTCT 2 1 70320 CASAVA_Build 13 48996428 1I CAAACCCAAG -/A AAAAAAAAAA 514 het 514 ref 35 24 3 8 A 11 12 70321 CASAVA_Build 13 49007703 4D TGGGAATGTT AGAC/---- AGAGTGGAAG 2560 het 2560 ref 33 24 6 7 AGAC 1 0 70322 CASAVA_Build 13 49010896 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 2847 hom 30 8 16 6 AC 7 8 70323 CASAVA_Build 13 49016611 8D TGTCTCAAAG AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 2632 hom 17 6 9 5 AAAC 7 5 70324 CASAVA_Build 13 49020088 3D CCACTCCTGG TTA/--- TTTTTTGTAG 3070 het 1568 hom 19 5 9 5 TTA 1 0 70325 CASAVA_Build 13 49020731 2D AAATATGGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 TA 6 5 70326 CASAVA_Build 13 49032750 1D TCTGGCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2196 hom 39 11 13 15 T 15 14 70327 CASAVA_Build 13 49049671 1D TAAATTGCTG T/- TATGTACTGG 3070 hom 108 het 45 0 35 11 T 2 1 70328 CASAVA_Build 13 49051762 1D CTTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 39 2 29 8 A 15 14 70329 CASAVA_Build 13 49054962 1D ACCTATTTTT C/- CCCTATGAAG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 4 3 70330 CASAVA_Build 13 49056406 1I CTTGCAAAAA -/T TCTCTTTAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 70331 CASAVA_Build 13 49058878 1I GCCAATGATT -/A AAAAAAAAAA 1376 het 1376 ref 36 15 5 16 A 15 16 70332 CASAVA_Build 13 49060058 2I AGAGGTTGTA --/GT GTGAGCCAAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 GT 1 2 70333 CASAVA_Build 13 49075899 2I GAGTAGAGTT --/AA AAAAAAAAAG 956 het 43 hom 29 1 9 19 A 9 11 70334 CASAVA_Build 13 49088624 1D TTTTCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 34 0 25 9 T 12 11 70335 CASAVA_Build 13 49090439 1I TCTTCCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 32 1 27 4 T 10 11 70336 CASAVA_Build 13 49116440 1D TGTGCCCACT C/- CCTCTGTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 C 3 2 70337 CASAVA_Build 13 49117303 1I CAAGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1669 hom 26 11 10 5 T 10 11 70338 CASAVA_Build 13 49122110 3I TTTAGGTATC ---/ATT ATCTGGGTGG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 ATT 0 1 70339 CASAVA_Build 13 49137251 1D TGACCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3002 het 684 hom 28 5 15 8 T 17 16 70340 CASAVA_Build 13 49137853 1D TCAACAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 42 2 20 20 T 15 14 70341 CASAVA_Build 13 49139024 1D AGACTCTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 22 0 19 4 A 10 9 70342 CASAVA_Build 13 49141872 3D TTGCAATAAA CCT/--- CCTCCAACAT 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 CCT 2 1 70343 CASAVA_Build 13 49146755 1D GTCAGGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 25 2 14 10 A 11 10 70344 CASAVA_Build 13 49148016 1I GTTGTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 484 hom 39 2 29 8 T 13 14 70345 CASAVA_Build 13 49148393 1I GAATCTTGAG -/T CCCCCCTCCC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 0 1 70346 CASAVA_Build 13 49150160 1D CAGCGTGGAA G/- GGGACCCAAG 2351 hom 22 het 11 0 8 3 G 4 3 70347 CASAVA_Build 13 49152033 2I TATATATATA --/TG TTAGTCAATA 3070 het 285 hom 27 1 19 7 TG 0 1 70348 CASAVA_Build 13 49154358 4D CTACCAGGAT CAAA/---- CAGTCACACG 3070 hom 114 het 43 0 39 7 CAAA 1 0 70349 CASAVA_Build 13 49155682 11D AAACAAACAA ACAAAAAAAAC/----------- AAAAACAAAA 3070 hom 78 het 26 0 27 3 ACAAAAAAAAC 1 0 70350 CASAVA_Build 13 49176150 6I ACCTGACTAC ------/AATGCT AATTTTTAAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 AATGCT 0 1 70351 CASAVA_Build 13 49178893 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 20 9 T 11 10 70352 CASAVA_Build 13 49179714 1D TTTTCCTCTA C/- CCCCCACGAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 C 6 5 70353 CASAVA_Build 13 49180136 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2623 hom 13 het 17 0 7 10 T 15 14 70354 CASAVA_Build 13 49182030 1D AAACTTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 9 5 A 11 10 70355 CASAVA_Build 13 49188145 1I CAGAAAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 9 10 70356 CASAVA_Build 13 49189578 2I GAAAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 1264 hom 8 het 13 0 8 5 A 16 18 70357 CASAVA_Build 13 49191107 5I TATGTAGATA -----/AAGAT AAGATTACAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAGAT 1 2 70358 CASAVA_Build 13 49195220 1D CACTACCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 908 hom 32 2 23 7 T 13 12 70359 CASAVA_Build 13 49197650 1D TGTAAAAAAA C/- AATAACACAT 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 C 1 0 70360 CASAVA_Build 13 49204825 1D TTCAGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 12 11 70361 CASAVA_Build 13 49214503 1I TAGTAGGACC -/A AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 5 6 70362 CASAVA_Build 13 49216365 2D TGTGAAAAAG AA/-- AAAAAGTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 20 2 A 7 5 70363 CASAVA_Build 13 49217575 5D TGGCTCACTG CAGCC/----- CCTGCCTCCA 2028 het 2028 ref 15 8 7 1 CAGCC 1 0 70364 CASAVA_Build 13 49229399 1D GCTAGAGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 12 11 70365 CASAVA_Build 13 49230891 2I ATATAAATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 105 het 44 0 35 9 AC 5 6 70366 CASAVA_Build 13 49232060 2D ACAGACTTAG AC/-- AATGTTCCTC 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 AC 1 0 70367 CASAVA_Build 13 49260855 3D CCAGACCCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 653 het 653 ref 26 7 7 12 T 21 18 70368 CASAVA_Build 13 49266462 1D CACCTCTACT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 8 7 70369 CASAVA_Build 13 49270027 1D CCCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 762 hom 23 2 15 6 A 13 12 70370 CASAVA_Build 13 49272898 1I CCCATAGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 A 10 11 70371 CASAVA_Build 13 49284453 1D GAATTCAAAG T/- TTTAAGGAGA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 4 3 70372 CASAVA_Build 13 49298308 1D GATAGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 11 10 70373 CASAVA_Build 13 49320781 9D GTGGCACACG CCTGTGGCC/--------- CCATGTGGCC 3070 hom 99 het 34 0 31 6 CCTGTGGCC 1 0 70374 CASAVA_Build 13 49323243 4D AAGAAAACAT AAAA/---- AAGCAATATT 3070 hom 117 het 44 0 40 6 A 6 2 70375 CASAVA_Build 13 49324183 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 2625 het 1022 hom 12 3 7 2 T 9 8 70376 CASAVA_Build 13 49324685 1D AGAAAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 2528 hom 27 het 12 0 10 2 A 11 10 70377 CASAVA_Build 13 49334740 4D GCTTATGCTA CTTC/---- CTTGTTCAAA 3070 hom 120 het 44 0 39 6 CTTC 1 0 70378 CASAVA_Build 13 49349039 1I CCCCATCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 9 10 70379 CASAVA_Build 13 49349857 1D CTGGTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 35 0 29 6 A 11 10 70380 CASAVA_Build 13 49350652 1D CGTCATGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 820 hom 45 3 31 11 T 23 22 70381 CASAVA_Build 13 49357136 1D AAGAAAAAAA C/- CAAACAATCC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 2 1 70382 CASAVA_Build 13 49368869 4I AGGCAATTCT ----/CCTG CCTGCCTCAG 3070 hom 68 het 27 0 21 6 CCTG 1 2 70383 CASAVA_Build 13 49369660 1I CTGAAAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1204 hom 47 7 27 13 T 14 15 70384 CASAVA_Build 13 49394965 1I AAAAAAAAAA -/C ATTTTATAGA 3070 het 149 hom 44 1 39 4 C 0 1 70385 CASAVA_Build 13 49411679 1I TTCTTTAATG -/T TTTTTTATGC 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 6 7 70386 CASAVA_Build 13 49416054 1I CTATAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 21 5 T 10 11 70387 CASAVA_Build 13 49422509 4I TTAGAGAAGC ----/CATT CAAATTTCAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 CATT 0 1 70388 CASAVA_Build 13 49434694 1I TCTCTACTTT -/A AAAAAAAAAA 928 het 928 ref 24 13 5 6 A 15 16 70389 CASAVA_Build 13 49434859 1I CTTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 920 hom 33 2 21 10 A 11 12 70390 CASAVA_Build 13 49446296 1D TTTCTCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 23 12 T 12 11 70391 CASAVA_Build 13 49465816 1I ATTCGGGGGC -/G GGGGGGGGCA 2592 hom 21 het 10 0 8 2 G 8 9 70392 CASAVA_Build 13 49469930 1I CTGTGTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 41 1 28 12 T 10 11 70393 CASAVA_Build 13 49471217 39D GGGTTTCTCA CTCCCTTTTCCTTGTCACCCTATGTGGGCGTCTGGGCCG/--------------------------------------- CTCCCTTTTC 3070 hom 36 het 16 0 12 7 CTCCCTTTTCCTTGTCACCCTATGTGGGCGTCTGGGCCG 1 0 70394 CASAVA_Build 13 49474518 2D AGAGCAAGAC TG/-- TCTCAAAAAA 3070 het 156 hom 19 1 17 1 TG 1 0 70395 CASAVA_Build 13 49481254 4D TTTAAAAAAT ACTC/---- ACGTAAAATA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 ACTC 1 0 70396 CASAVA_Build 13 49500354 1D GGTTTTGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 32 2 21 9 A 15 14 70397 CASAVA_Build 13 49511680 3D CCACAATTTT ACA/--- ACAGCTCAGC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ACA 2 1 70398 CASAVA_Build 13 49531569 1D ATCTTCCAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 77 het 35 0 26 9 A 9 8 70399 CASAVA_Build 13 49548546 1I AAATGTGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 26 1 21 4 T 13 14 70400 CASAVA_Build 13 49566237 1D CTAATAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 42 0 35 7 T 12 11 70401 CASAVA_Build 13 49595208 1I TGTAAGCGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 402 hom 32 1 21 10 T 9 10 70402 CASAVA_Build 13 49641586 1I CCTTTCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 11 12 70403 CASAVA_Build 13 49645751 1I ATTTGAGGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 9 10 70404 CASAVA_Build 13 49650398 2D AAAAAAAATT AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 2545 hom 24 11 11 2 A 10 8 70405 CASAVA_Build 13 49659459 1D CCCAATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 T 11 10 70406 CASAVA_Build 13 49664447 1D AGAGACACTT C/- CCAGGCTCTT 3070 het 3070 ref 38 16 17 6 C 3 2 70407 CASAVA_Build 13 49665085 1I ATTCAGATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 9 10 70408 CASAVA_Build 13 49667043 1D TTTAAAAGTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 9 8 70409 CASAVA_Build 13 49692758 1D AAGATTGCTT A/- GAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 1 0 70410 CASAVA_Build 13 49709873 2D AAACATAGTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 AT 6 5 70411 CASAVA_Build 13 49723379 3D CTCTCAAGGG CAT/--- CTTATAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 CAT 1 0 70412 CASAVA_Build 13 49727345 1I TTTTTTATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 13 33 4 T 9 10 70413 CASAVA_Build 13 49736420 1D CCACCACACC T/- GGCTAATTTT 1636 het 370 hom 9 1 5 3 T 1 0 70414 CASAVA_Build 13 49747051 1D CTGAAGGTGG T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 51 19 25 8 T 8 7 70415 CASAVA_Build 13 49753810 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 T 10 9 70416 CASAVA_Build 13 49754619 3I AGTGTCACTC ---/ATT ATCCTCACTT 3070 hom 159 het 57 0 52 5 ATT 0 1 70417 CASAVA_Build 13 49760495 1D CCAACATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 23 2 T 13 12 70418 CASAVA_Build 13 49765011 1D TCAATGCTTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 8 7 70419 CASAVA_Build 13 49775720 7I GATAATAAGA -------/AAATGCT AAATGCTATG 3070 het 3070 hom 25 7 16 2 AAATGCT 1 2 70420 CASAVA_Build 13 49787204 9D TAGAACCCCT ACCAATAGA/--------- ACCAAGCACC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 ACCAATAGA 1 0 70421 CASAVA_Build 13 49787702 1I AGTAAGATTG -/T ATGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 0 1 70422 CASAVA_Build 13 49789294 1D CTTTGAAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 59 hom 24 1 12 11 A 10 9 70423 CASAVA_Build 13 49790326 4D AAATTAACTC ACTT/---- ACTATTAATT 3070 het 3070 ref 28 14 14 2 ACTT 1 0 70424 CASAVA_Build 13 49790980 1D CCTCCTGCTT C/- CTGGGTTGGG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 C 2 1 70425 CASAVA_Build 13 49793058 1I CAGGGTGCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 T 8 9 70426 CASAVA_Build 13 49794157 1D TTGCTGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 A 11 10 70427 CASAVA_Build 13 49795187 5D TGAATTTTAG AATTA/----- AATTCTCAAT 3070 het 3070 ref 34 19 14 5 AATTA 1 0 70428 CASAVA_Build 13 49797524 1D GTCAGGAGTT A/- AAAGACCAGC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 4 3 70429 CASAVA_Build 13 49799638 4D GGTTAGTATT AGAC/---- AGACAGTGAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 AGAC 2 1 70430 CASAVA_Build 13 49800314 2I GACATAGTCC --/TT TTTATGCCTC 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 T 3 5 70431 CASAVA_Build 13 49802822 2I GTTACATGTG --/TA TATATATATA 2203 het 2203 ref 36 23 8 5 TA 5 6 70432 CASAVA_Build 13 49805835 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1657 het 432 hom 14 1 6 7 A 15 14 70433 CASAVA_Build 13 49811170 12D CTCTTCCTTG CTCTCTTCCTTT/------------ CTCCCAACTT 3070 het 3070 hom 35 18 20 3 CTCTCTTCCTTT 1 0 70434 CASAVA_Build 13 49811437 1D GACTTGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 12 11 70435 CASAVA_Build 13 49821836 1D TGTGGAACAA G/- AAGGCTGACT 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 G 1 0 70436 CASAVA_Build 13 49824679 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 2535 het 2535 ref 23 7 9 7 A 9 10 70437 CASAVA_Build 13 49828429 1I GCATCGTGGG -/T TTTTTCCCCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 5 6 70438 CASAVA_Build 13 49831387 1D ACTTTTTTTT A/- AAGGCCCAGT 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 A 3 2 70439 CASAVA_Build 13 49835505 1D CCATCTTAAA T/- TTTTTAGCAA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 T 6 5 70440 CASAVA_Build 13 49838651 1D TAATGGCTAA C/- AGGGTACAGA 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 C 1 0 70441 CASAVA_Build 13 49848421 10D CTTTTCTTTC TTTCTTTTCT/---------- TTTCTTTTCT 3070 hom 72 het 30 0 25 9 TTTCT 5 3 70442 CASAVA_Build 13 49850423 2I16M1D ACTGCAATTT --TCTGTTTTTTCTTTTCT/TCTCTGTTTTTTCTTTTC- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 30 3 26 6 N/A 0 0 70443 CASAVA_Build 13 49854229 11D TATATTGAAC AGAAGTGCTTT/----------- ATAAGGTCTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AGAAGTGCTTT 1 0 70444 CASAVA_Build 13 49856816 1D GTTGGTTCCC A/- AAAAAACTCA 3070 hom 86 het 35 0 28 7 A 7 6 70445 CASAVA_Build 13 49871378 1I TCTGTATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 492 hom 35 3 15 17 A 14 15 70446 CASAVA_Build 13 49878167 2D TCTTCCCCCC CT/-- CTTTCACTCC 3056 het 3056 ref 33 19 9 5 CT 2 1 70447 CASAVA_Build 13 49881600 2D GAAGAAAGTC TG/-- TGAAGTTTCT 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 TG 2 1 70448 CASAVA_Build 13 49898295 1D ATTTGTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 806 hom 29 5 16 8 A 16 15 70449 CASAVA_Build 13 49899135 1D TAGGTTAAGC A/- ATGTTCAATA 3070 het 3070 ref 40 18 15 9 A 2 1 70450 CASAVA_Build 13 49917771 1D AGCTAGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 30 0 19 12 T 14 13 70451 CASAVA_Build 13 49920049 1I CACTGATAGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 8 9 70452 CASAVA_Build 13 49921614 1D ACCTCCCTCT A/- ATCTAAACCC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 2 1 70453 CASAVA_Build 13 49943299 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTCCAA 3070 hom 49 het 21 0 17 4 T 6 7 70454 CASAVA_Build 13 49947188 3D TTTGAAAATA AAT/--- AACAACTTTC 3070 hom 42 het 15 0 13 3 AAT 1 0 70455 CASAVA_Build 13 49962535 2I CTTCTTCCCC --/CT GTTATTTATT 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 CT 0 1 70456 CASAVA_Build 13 49964164 1I AATGCAAATG -/T GACAATGACG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 0 1 70457 CASAVA_Build 13 49968414 6I TGTGTATGTG ------/TATATA TATATATATA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 TA 6 9 70458 CASAVA_Build 13 49975319 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCCTCCC 2898 het 292 hom 10 2 8 0 C 7 6 70459 CASAVA_Build 13 49983169 1D GAGGCACAGA C/- CCCACCATCA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 C 4 3 70460 CASAVA_Build 13 49983484 1I ATTGTGAGAC -/T TTAACCTTGT 3070 hom 97 het 39 0 31 8 T 2 3 70461 CASAVA_Build 13 49984587 3D CTCCAATTCT CTC/--- CTCCTCAGTT 3070 het 3070 ref 46 27 17 4 CTC 3 2 70462 CASAVA_Build 13 49986113 1I AACAGAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 15 12 T 10 11 70463 CASAVA_Build 13 49986454 1D TGCATTCCAT G/- GCATCATGTC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 G 2 1 70464 CASAVA_Build 13 49986522 4I AAAGAAAGAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 het 2966 hom 30 9 16 5 AGAA 2 3 70465 CASAVA_Build 13 49988633 1D GAATAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 11 10 70466 CASAVA_Build 13 49999575 19D CGGGGATACA CTGAAATTCTCTGGCCTTG/------------------- CTGAGCTGGG 3070 het 3070 ref 30 14 16 4 CTGAAATTCTCTGGCCTTG 1 0 70467 CASAVA_Build 13 50003976 1I AAAATGTAAC -/A GGCAAAGTTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 0 1 70468 CASAVA_Build 13 50013299 1D TAGAAGAACT G/- GGGCTAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 G 4 3 70469 CASAVA_Build 13 50013798 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 14 13 70470 CASAVA_Build 13 50015599 5I GAAATCCTCC -----/TAAGT TATTTTTAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TAAGT 0 1 70471 CASAVA_Build 13 50020189 1I TCCACGTTAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 A 8 9 70472 CASAVA_Build 13 50024300 1D AATTTTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 A 11 10 70473 CASAVA_Build 13 50041680 1I AATATTTTTC -/A ACTGCAAAGT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 1 2 70474 CASAVA_Build 13 50046214 4D CCTGTGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 67 32 30 8 TG 8 6 70475 CASAVA_Build 13 50046863 2D AACACCACAC AG/-- GGACACGCTA 3070 het 3070 hom 47 21 24 3 AG 1 0 70476 CASAVA_Build 13 50047288 1I CTGGGGCCTG -/T TGGGGCCTCC 3070 hom 71 het 27 0 23 4 T 1 2 70477 CASAVA_Build 13 50049288 1D ATTCATAGTA T/- TTTTTTTTTT 2194 het 2194 ref 35 11 7 17 T 15 14 70478 CASAVA_Build 13 50063672 1D ATAAATACAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 9 8 70479 CASAVA_Build 13 50068795 3D CTTTTTGGGA CTC/--- CTAACTTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 25 4 CTC 1 0 70480 CASAVA_Build 13 50071603 43D AGAGCTCAAT GTTTTCAGTCTTTTGATAATTAGAGATGGAGTCTAGCAGGGAA/------------------------------------------- AGGTCATTTC 3070 het 3070 ref 37 32 12 5 GTTTTCAGTCTTTTGATAATTAGAGATGGAGTCTAGCAGGGAA 1 0 70481 CASAVA_Build 13 50071949 5D GCATGTGTGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2554 hom 29 9 18 4 T 16 11 70482 CASAVA_Build 13 50076869 1D GCAGACTGCC T/- TCTCATTTCC 3070 hom 121 het 48 0 40 9 T 2 1 70483 CASAVA_Build 13 50077219 1I AAAAAAAAAA -/T CTTAAATTTA 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 T 0 1 70484 CASAVA_Build 13 50086758 1D TCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2683 hom 34 10 18 6 A 11 10 70485 CASAVA_Build 13 50104223 1I CCATCTAGAT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 7 8 70486 CASAVA_Build 13 50128074 1D ATTGGGATGC T/- TGTAAACATT 3070 het 3070 ref 45 20 17 9 T 2 1 70487 CASAVA_Build 13 50129382 1I CAAAATAACA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 8 9 70488 CASAVA_Build 13 50133715 3I TAAAATAAAA ---/TTT TTTTATAAAC 688 het 688 ref 8 3 3 2 T 4 7 70489 CASAVA_Build 13 50146442 1I AGAGGCCCAG -/T TTTTTTTTTT 828 het 828 ref 47 28 3 16 T 13 14 70490 CASAVA_Build 13 50170312 1I TAGCTCTTGG -/T GGGGGGGGAG 3070 het 2128 hom 33 9 16 8 T 0 1 70491 CASAVA_Build 13 50178553 1D GCCCGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 948 het 948 ref 25 16 3 6 T 15 14 70492 CASAVA_Build 13 50199461 1D GGTCTAGGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 7 T 9 8 70493 CASAVA_Build 13 50219092 2D TGTGGAACGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AC 8 7 70494 CASAVA_Build 13 50254912 1D CTGTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 2751 het 2751 ref 38 17 9 13 A 16 15 70495 CASAVA_Build 13 50262620 1I AGGAGACCCC -/G CGCTGCTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 G 0 1 70496 CASAVA_Build 13 50264899 1I AAGGCCTCCC -/T TTACCCAATC 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 2 3 70497 CASAVA_Build 13 50265001 1I TTTGCTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 T 13 14 70498 CASAVA_Build 13 50266439 1D GTAAAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3033 hom 41 15 18 9 T 13 12 70499 CASAVA_Build 13 50268216 1I ATATAATATT -/C CCCCCCTTAT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 C 6 7 70500 CASAVA_Build 13 50269943 3I TCATTCACTT ---/AAC AAGTATAGAG 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 AAC 0 1 70501 CASAVA_Build 13 50285018 3I AGAATGACAG ---/AAA AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 7 10 70502 CASAVA_Build 13 50288063 1D ATATTCTTGA G/- GGGGGGCTGC 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 G 7 6 70503 CASAVA_Build 13 50290039 5D GAGAGCATCT CAAGA/----- CAAGAGAAGG 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 CAAGA 2 1 70504 CASAVA_Build 13 50293870 1I TGGGTAAGGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 9 10 70505 CASAVA_Build 13 50294632 1D ACTGTTGTTG A/- AAAAAAAAAA 2552 het 2552 ref 31 13 8 10 A 12 11 70506 CASAVA_Build 13 50306292 1D CTAAAACACA C/- AAAAAAAATG 2206 het 2206 ref 15 9 5 2 C 1 0 70507 CASAVA_Build 13 50306569 2D AAACATATGC AA/-- AAAAAAAAAA 2877 het 2877 ref 17 10 6 1 A 12 10 70508 CASAVA_Build 13 50308511 1I GAAAGAGAGA -/G AAAAGGAAAG 3070 het 2991 hom 26 9 12 5 G 0 1 70509 CASAVA_Build 13 50322106 4D TTACATAAAA ATAT/---- ATATATTTTA 3070 het 2917 hom 29 8 19 3 AT 5 3 70510 CASAVA_Build 13 50329260 3D TAAAGGAACA TGT/--- TGTAACCCAA 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 TGT 2 1 70511 CASAVA_Build 13 50330440 1D AACAAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 13 12 70512 CASAVA_Build 13 50334019 1D GGGAACAACA C/- ACATTAGGGC 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 C 1 0 70513 CASAVA_Build 13 50337895 1D GTGAGACTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1242 hom 24 7 13 4 A 17 16 70514 CASAVA_Build 13 50350791 1I ACATTTATTC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 8 9 70515 CASAVA_Build 13 50353794 1I ATTCAAGGAT -/A ATTTTTCTCA 3070 hom 75 het 32 0 24 8 A 1 2 70516 CASAVA_Build 13 50368727 1I ACTTTACAGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 7 8 70517 CASAVA_Build 13 50373711 1D ATTGAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 10 6 A 11 10 70518 CASAVA_Build 13 50374389 1D AGCTCAGCAA G/- GGGTGTCTAA 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 G 4 3 70519 CASAVA_Build 13 50379727 2D ACACCAATCA CT/-- GTGTCAAACT 3070 het 3070 ref 43 22 17 6 CT 1 0 70520 CASAVA_Build 13 50381030 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTGAC 1874 het 1874 ref 22 12 5 5 T 8 7 70521 CASAVA_Build 13 50398293 2D GAAATCTCAA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 T 10 8 70522 CASAVA_Build 13 50413118 1I CAGTGACTTA -/G GGAGAGTTTA 3070 het 3070 hom 54 16 30 8 G 2 3 70523 CASAVA_Build 13 50451656 1D TGATGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 20 9 A 13 12 70524 CASAVA_Build 13 50451951 1I ATAAAACAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 9 10 70525 CASAVA_Build 13 50452695 2D TTCCTATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 574 hom 31 4 10 19 A 14 12 70526 CASAVA_Build 13 50467849 1I TTTTTTTTTT -/C CACTATTAGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 1 2 70527 CASAVA_Build 13 50469158 1I GGTATTTTGG -/A AGTAAGCTCA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 1 2 70528 CASAVA_Build 13 50471586 1D AAAAAAAAAA C/- AAACCTCTGC 2803 het 1581 hom 31 8 17 7 C 1 0 70529 CASAVA_Build 13 50502643 1D GAGCGATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 35 1 16 18 A 16 15 70530 CASAVA_Build 13 50506911 1I AAGTGTTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 97 het 45 0 38 7 T 9 10 70531 CASAVA_Build 13 50511498 1D AGGAGTTGAG T/- TTTTTTTGGT 1674 hom 24 het 12 0 8 4 T 8 7 70532 CASAVA_Build 13 50511554 4I CGTTTGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 34 het 15 0 11 5 TTTG 3 4 70533 CASAVA_Build 13 50534695 1D CATTTAAGGC T/- GATTTTGGTA 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 T 1 0 70534 CASAVA_Build 13 50536361 1I ATGGTGTGTT -/A AACTATCACA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 2 3 70535 CASAVA_Build 13 50536882 1D ATTTGAAGTC T/- GCTGCTAGTT 3070 het 3070 ref 46 23 21 3 T 1 0 70536 CASAVA_Build 13 50539340 1I TCAGGAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 21 0 18 3 A 10 11 70537 CASAVA_Build 13 50539541 2D AAATGGTTTA AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 626 hom 22 4 17 1 A 12 10 70538 CASAVA_Build 13 50567450 3I CTGTTGTTGC ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 TGT 3 4 70539 CASAVA_Build 13 50576912 1D CTATTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1986 hom 44 8 23 13 A 15 14 70540 CASAVA_Build 13 50584027 1I CTGCGGTAAT -/G GGACCTCACA 3070 hom 63 het 27 0 17 10 G 2 3 70541 CASAVA_Build 13 50585704 2D AAGTGTATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 151 hom 33 4 16 13 TG 13 12 70542 CASAVA_Build 13 50602804 2I GGAAAGAATC --/AA AGACCTTATC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 1 3 70543 CASAVA_Build 13 50607790 1D ACCCTGTCCC A/- AAAAAAAAAA 2576 het 2296 hom 19 6 8 5 A 12 11 70544 CASAVA_Build 13 50614733 1D ATTTCTGCTT A/- AAAAAAAAAA 2919 het 1807 hom 20 9 9 2 A 13 12 70545 CASAVA_Build 13 50614778 1I CCTTTTTTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1220 hom 13 3 7 3 A 9 10 70546 CASAVA_Build 13 50616481 1I GTCTTAAAAC -/T TTTCTTTTGA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 3 4 70547 CASAVA_Build 13 50617276 1D AATTTTTTTT C/- CTTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 19 10 8 1 C 2 1 70548 CASAVA_Build 13 50617861 10D CTCAAAAGAA TATAACCATT/---------- TATGTATCAC 3070 het 3070 ref 30 23 8 2 TATAACCATT 1 0 70549 CASAVA_Build 13 50618330 3I GGCACCCAAA ---/TTT ATTAACCTAT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 0 3 70550 CASAVA_Build 13 50626557 8D GGGCTGTTTA AATTATAC/-------- AATTATACAG 3070 hom 87 het 36 0 28 11 AATTATAC 2 1 70551 CASAVA_Build 13 50631939 3I CATATGTAAG ---/TTC ACAGTGTATT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 TTC 0 1 70552 CASAVA_Build 13 50633292 4D AAGACTTTCC TATT/---- TAGTTTTCAA 1802 het 966 hom 11 2 5 5 TATT 1 0 70553 CASAVA_Build 13 50639216 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2980 hom 21 9 10 2 A 10 11 70554 CASAVA_Build 13 50641013 3D CTCTCTCTCT TCC/--- TCCTTCTCTC 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 TCC 2 1 70555 CASAVA_Build 13 50641560 1I GGTAGAAAAG -/A AAAAACCCAT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 5 6 70556 CASAVA_Build 13 50642787 1I14M1D GTCACGGGCT -GGGAAGGCAGCCTTC/GGGGAAGGCAGCCTT- CCCTTGGTGT 2764 hom 30 het 11 0 10 1 N/A 0 0 70557 CASAVA_Build 13 50655881 2I AATTTCCAAA --/GG AAGTATCACA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 G 0 2 70558 CASAVA_Build 13 50656393 2D TCAAAAATGC AT/-- AGTTACTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 AT 1 0 70559 CASAVA_Build 13 50671194 1I CTGTTTACAC -/T TTTTCTGTAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 4 5 70560 CASAVA_Build 13 50676565 1D GCTGGTTGTT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 45 het 22 0 15 7 A 8 7 70561 CASAVA_Build 13 50678786 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 826 hom 27 3 17 7 A 12 11 70562 CASAVA_Build 13 50689314 1I ATAGCATTAG -/T TTACATTGTA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 T 2 3 70563 CASAVA_Build 13 50695333 1D TAGCCCTGCC T/- TTTTTTTTTT 2361 het 2361 ref 35 15 10 10 T 13 12 70564 CASAVA_Build 13 50695967 2I CAACTTTAAC --/TG AAGATTATTG 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 TG 0 1 70565 CASAVA_Build 13 50702213 2I AATATTGAAT --/TA TATATATATA 2435 het 2435 ref 16 6 6 4 TA 7 8 70566 CASAVA_Build 13 50704442 4I GATTGAATAC ----/TTAT TTATTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 TTAT 1 2 70567 CASAVA_Build 13 50707736 1D AGAATTAACT A/- GTCCTATTTG 3070 het 3070 ref 26 16 9 2 A 1 0 70568 CASAVA_Build 13 50714397 1D CACATAATGT G/- GTTTAGAGAG 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 G 2 1 70569 CASAVA_Build 13 50727887 1I GTATGCCCAG -/T CCAGATGTAG 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 0 1 70570 CASAVA_Build 13 50733703 20I AACTATGATT --------------------/CCATAGTGAACATAGATCTG ACAGGCAGAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 CCATAGTGAACATAGATCTG 0 1 70571 CASAVA_Build 13 50734503 1I AAATTACCCC -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 70572 CASAVA_Build 13 50753541 1I ACTCTTAGCT -/G GGGGGGTGGT 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 G 6 7 70573 CASAVA_Build 13 50755092 2I ATATGGTCTC --/TT TTGCAGCTAC 3070 hom 104 het 38 0 35 3 T 2 4 70574 CASAVA_Build 13 50760359 1I ACCTTTGCTC -/T CAAATTCAGT 3070 het 3070 hom 51 24 23 4 T 0 1 70575 CASAVA_Build 13 50771949 3D AGGATTTGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 2001 het 2001 ref 35 17 9 10 A 19 16 70576 CASAVA_Build 13 50773525 11D5M2I2M7I GTCAGTCAGT TTTCCTTGCTATAAAG--GA-------/-----------GAAAGCTGACTAAATT ATCCTTGAAG 3070 het 3070 ref 54 32 21 5 N/A 0 0 70577 CASAVA_Build 13 50775337 1I ATGAGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 11 12 70578 CASAVA_Build 13 50790168 2D TGCTTCATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 A 14 12 70579 CASAVA_Build 13 50820094 1I GTGCCATCGT -/C CCCCCCCCCC 1326 het 1326 ref 33 18 4 11 C 10 11 70580 CASAVA_Build 13 50837529 1I AAGTAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 10 11 70581 CASAVA_Build 13 50845340 1D TGGTGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1818 het 1818 ref 37 26 5 6 T 13 12 70582 CASAVA_Build 13 50861037 1D TTTGACCCAC A/- ATAAACCATT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 A 2 1 70583 CASAVA_Build 13 50870084 1D TTTCAAATGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 A 10 9 70584 CASAVA_Build 13 50877075 3D CACATTGTAA TCT/--- TCTACTTTCA 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 TCT 2 1 70585 CASAVA_Build 13 50887791 2D TCCATTAAAC CT/-- CTTTCTTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 CT 2 1 70586 CASAVA_Build 13 50892382 2D CAGTAGTCAC AT/-- ATATAATTTC 2726 het 2726 ref 21 13 6 2 AT 3 2 70587 CASAVA_Build 13 50904586 4D GTTTACCACA ATTT/---- ATTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 9 ATTT 1 0 70588 CASAVA_Build 13 50906897 1D TTTTGCACTG T/- TTTGTTGCTG 3070 hom 111 het 40 0 38 4 T 4 3 70589 CASAVA_Build 13 50916887 1D ACTCTATCCC A/- AAAAAAAAAA 1504 het 1504 ref 18 13 4 2 A 11 10 70590 CASAVA_Build 13 50965417 1D TATGAGTTCC T/- TTACCCAAAA 3070 het 3070 ref 55 31 20 4 T 3 2 70591 CASAVA_Build 13 50969140 2D TACAATAGAC TT/-- TTCTCAGCCT 3070 het 3070 hom 61 25 30 6 T 4 2 70592 CASAVA_Build 13 50980388 1I TCTGTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2700 hom 27 9 10 8 A 10 11 70593 CASAVA_Build 13 51047563 1D ACACCGTATC A/- AAAAAAAAAA 1122 het 1122 ref 19 9 3 8 A 13 12 70594 CASAVA_Build 13 51048091 1D TCTGTACCTG A/- AAAAAAAAAA 1689 het 1689 ref 18 9 5 4 A 16 15 70595 CASAVA_Build 13 51049629 1D GACTCTTTTA G/- GAGCTAACAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 G 2 1 70596 CASAVA_Build 13 51091571 1D CACTATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 280 hom 27 2 13 12 A 13 12 70597 CASAVA_Build 13 51094991 10D AACTTTACAC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3022 het 1701 hom 29 8 11 10 T 22 12 70598 CASAVA_Build 13 51128191 1D TATCTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1581 het 1581 ref 38 22 4 12 T 17 16 70599 CASAVA_Build 13 51162335 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTATT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 0 1 70600 CASAVA_Build 13 51198386 1D CACACTTGAT A/- ATATATCCTG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 2 1 70601 CASAVA_Build 13 51210176 4D ACAAATGTAT GAGA/---- GAAACTTCCC 3070 het 3070 hom 36 14 20 5 GA 3 1 70602 CASAVA_Build 13 51229595 2I AGAAAAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 2776 het 2776 ref 29 13 8 8 A 11 13 70603 CASAVA_Build 13 51231957 13D AACGGTTGTT TTAACCCAAATCA/------------- TTACCAGAGT 3070 het 3070 hom 33 15 17 7 TTAACCCAAATCA 1 0 70604 CASAVA_Build 13 51266930 1D AAAATAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 798 hom 33 2 23 8 T 14 13 70605 CASAVA_Build 13 51278090 1D TTAACTGGAG T/- CAGCTGAGCT 3070 het 3070 hom 58 22 24 13 T 1 0 70606 CASAVA_Build 13 51280013 2I CCTACCCACA --/CT CTCTGTACCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CT 2 3 70607 CASAVA_Build 13 51282457 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 19 0 12 7 T 11 12 70608 CASAVA_Build 13 51318663 3I TTTATGTATT ---/GAC TATACTATAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 GAC 0 1 70609 CASAVA_Build 13 51332877 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 97 hom 15 1 10 5 TA 7 5 70610 CASAVA_Build 13 51342668 3I CTACTCCCTC ---/CTT AAGTCCCGAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CTT 0 1 70611 CASAVA_Build 13 51351497 1I CTCATGTTCC -/T TTTTCTTGAA 3070 hom 114 het 39 0 38 1 T 4 5 70612 CASAVA_Build 13 51352634 1D ATACAGGGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 10 9 70613 CASAVA_Build 13 51371686 7D ATCAGAAGAC TTAAGTA/------- TTAAGACGGC 3070 hom 84 het 34 0 29 7 TTAAGTA 1 0 70614 CASAVA_Build 13 51380401 2D ATTTGAAGGC AG/-- ACTCAACCCT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AG 1 0 70615 CASAVA_Build 13 51402265 1D TATTTGCCTT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 42 het 31 0 20 11 C 10 9 70616 CASAVA_Build 13 51403437 1D AGTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1596 het 426 hom 28 4 6 18 A 17 16 70617 CASAVA_Build 13 51411798 1I TGAGTGAATC -/T TTAGCTATAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 2 3 70618 CASAVA_Build 13 51413984 2I TTCACTACCA --/AC ACACTTAGGA 3070 hom 144 het 53 0 47 6 AC 2 3 70619 CASAVA_Build 13 51417215 4I TGAGCGGTGG ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 hom 120 het 49 0 40 9 CCTT 3 4 70620 CASAVA_Build 13 51441001 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1034 het 599 hom 26 10 3 13 T 16 14 70621 CASAVA_Build 13 51444549 5I CTTCCCACAC -----/TCAAT TCTGCATTTC 3070 hom 84 het 36 0 28 8 TCAAT 0 1 70622 CASAVA_Build 13 51455800 1I TACAAGAGAG -/C TCTGGCTGGC 3070 hom 63 het 22 0 20 2 C 0 1 70623 CASAVA_Build 13 51464269 1D TAAGAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 13 13 A 15 14 70624 CASAVA_Build 13 51473934 1D ATCCTTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 33 0 26 8 T 11 10 70625 CASAVA_Build 13 51475764 2I TTCAACTGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 36 1 22 13 A 12 14 70626 CASAVA_Build 13 51481021 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 93 het 37 0 31 7 T 9 8 70627 CASAVA_Build 13 51493317 3D AATATCTGAT AAC/--- AATCAAAATC 3070 hom 111 het 40 0 36 6 AAC 1 0 70628 CASAVA_Build 13 51494836 1D AATAAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 999 hom 31 4 13 14 T 17 16 70629 CASAVA_Build 13 51514608 1D CCACACTTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 10 9 70630 CASAVA_Build 13 51518868 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 14 8 A 13 14 70631 CASAVA_Build 13 51521804 1D CTGATGAACT A/- AAAAAAAAAA 1334 het 1334 ref 16 12 3 1 A 15 14 70632 CASAVA_Build 13 51538151 1D TAGGTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 11 10 70633 CASAVA_Build 13 51541076 1D CCACTGCACT C/- CAGCCTGGGC 1346 hom 15 het 10 0 5 5 C 2 1 70634 CASAVA_Build 13 51541108 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 10 9 70635 CASAVA_Build 13 51550730 2I AATAAAACTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 34 1 26 7 T 11 13 70636 CASAVA_Build 13 51564562 1I TCTTTCTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 31 1 25 5 A 10 11 70637 CASAVA_Build 13 51570570 1I AAATGGTTCT -/C TAATTTAACC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 0 1 70638 CASAVA_Build 13 51574950 5D CAAGTTTTTA TTTTG/----- TTTTAATTCT 3070 hom 102 het 36 0 34 5 TTTTG 1 0 70639 CASAVA_Build 13 51578317 1D GGGATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 31 2 24 5 A 14 13 70640 CASAVA_Build 13 51579402 4I CTGTTTCTAT ----/ACTA ACTGAGTGGT 3070 hom 79 het 34 0 21 13 ACTA 0 1 70641 CASAVA_Build 13 51582803 2D TAGAAATTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AC 9 8 70642 CASAVA_Build 13 51599492 3I GAAATTTGAA ---/CTT CTTAACTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CTT 1 2 70643 CASAVA_Build 13 51613896 1I CTCTAACTAC -/T TTATTCCTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 5 T 2 3 70644 CASAVA_Build 13 51616052 1I AAATTCTTAC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 7 8 70645 CASAVA_Build 13 51622799 12I ATCAACTTAC ------------/CTATCACAAGTG CTTATAATCT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 CTATCACAAGTG 0 1 70646 CASAVA_Build 13 51627836 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTATTT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AG 2 1 70647 CASAVA_Build 13 51637990 1D TTCTTATTAC A/- AAAAAAAAAA 950 het 950 ref 39 28 3 8 A 11 10 70648 CASAVA_Build 13 51660863 9D TTTAACCTAC ATGCCATTT/--------- AACACAATGC 3070 hom 71 het 26 0 23 4 ATGCCATTT 1 0 70649 CASAVA_Build 13 51732852 1I GACAAATATA -/C CTGGAGGGTT 3070 hom 23 het 9 0 8 1 C 1 2 70650 CASAVA_Build 13 51757784 4D ATTCCCTTTA TTTC/---- TTTATCTTCT 3070 het 3070 ref 44 31 10 4 TTTC 1 0 70651 CASAVA_Build 13 51772941 1I GGTTGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 12 13 70652 CASAVA_Build 13 51777238 4D ATCTACTGTA TATG/---- TATACATATA 3070 het 1808 hom 35 6 28 2 TATG 1 0 70653 CASAVA_Build 13 51789659 2D GCCAGCCTGG TC/-- TCGAACTCCT 3070 het 3070 hom 46 20 20 8 TC 2 1 70654 CASAVA_Build 13 51844003 1D AACCATCTAG T/- CTCCCCAAGG 3070 hom 66 het 27 0 20 7 T 1 0 70655 CASAVA_Build 13 51850930 1D GGAAAGCTGC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 9 8 70656 CASAVA_Build 13 51852467 1I CACCCGTCCT -/C CCCACTGCCC 3070 hom 78 het 28 0 24 4 C 3 4 70657 CASAVA_Build 13 51857837 1I GAGAAAAAAC -/A AAAAAAATCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 7 8 70658 CASAVA_Build 13 51890424 1I TTAAAAAAAT -/A AAAAAGAGGC 3070 hom 57 het 23 0 18 5 A 5 6 70659 CASAVA_Build 13 51919922 1I TATGAAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1523 hom 39 7 21 11 T 15 16 70660 CASAVA_Build 13 51949196 1D TGGAATAAGG A/- AAAAAATGTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 7 6 70661 CASAVA_Build 13 51973954 1D AGCAGCAGCC A/- AAAAAAAAAA 1908 het 1908 ref 27 17 6 5 A 12 11 70662 CASAVA_Build 13 51979533 1I TTTATGTATA -/T ATACTTTAGC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 0 1 70663 CASAVA_Build 13 52029076 2D TCTTGAACTT TA/-- TACTTGATAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 TA 2 1 70664 CASAVA_Build 13 52051048 2D TATTCCCTAA AT/-- ATATATATAT 2446 het 2203 hom 13 6 5 2 AT 8 7 70665 CASAVA_Build 13 52084083 1I AAGCAATTAA -/T AAATTACATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 70666 CASAVA_Build 13 52093888 1D CCTTATCTGC A/- AAATGGAGAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 4 3 70667 CASAVA_Build 13 52094995 3I TAAATGGCAG ---/TAT TTTTTTTTTT 2788 het 2788 ref 49 36 8 5 TAT 0 1 70668 CASAVA_Build 13 52117755 1I GGGTGCCTAT -/A AGTCCCAGCT 2098 hom 18 het 7 0 6 1 A 1 2 70669 CASAVA_Build 13 52119777 1D GGATGGTCTC G/- ATCTCCTGAC 3070 hom 27 het 11 0 9 3 G 1 0 70670 CASAVA_Build 13 52120145 1D TATTGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2670 het 567 hom 25 2 9 14 T 15 14 70671 CASAVA_Build 13 52120978 2D TTTTTTTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 11 T 15 13 70672 CASAVA_Build 13 52125523 2D GCTGAAAGGA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 7 het 26 0 11 15 T 10 8 70673 CASAVA_Build 13 52125987 1I AGAAAAGAGG -/A AAACCTGTTT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 A 3 4 70674 CASAVA_Build 13 52137649 4I TGTGAATCAG ----/TAGT TAGTTGCTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TAGT 1 2 70675 CASAVA_Build 13 52143458 3I ATATTTTTAA ---/AAG AAGAATTTTA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AAG 1 2 70676 CASAVA_Build 13 52149840 11D74M1I CCAGTTATTC TGTTAACCCGTTGTCTACTTGTTGCATACTGCTTGTTGTTGCATTTTCTAACAATGGAAACAGTCTTTGCCGACATGAGTATCTA-/-----------TGTCTACTTGTTGCATACTGCTTGTTGTTGCATTTTCTAACAATGGAAACAGTCTTTGCCGACATGAGTATCTAT GTAGTTATTT 3070 hom 214 het 37 0 72 8 N/A 0 0 70677 CASAVA_Build 13 52150818 1D TTTTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 26 0 17 9 T 15 14 70678 CASAVA_Build 13 52150924 1I AAGCAGTCCT -/C CTACCCCAAC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 C 1 2 70679 CASAVA_Build 13 52151720 1I GGCATCCTTT -/A AAAAAATTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 7 70680 CASAVA_Build 13 52154525 1D TTGTAGAGGT G/- GGGGTGTCTC 3070 hom 98 het 35 0 32 3 G 5 4 70681 CASAVA_Build 13 52156557 1D CTATTTTTTT G/- TTCTACATTT 3070 het 412 hom 19 1 16 2 G 1 0 70682 CASAVA_Build 13 52157045 1D TTGTTGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 27 0 19 8 T 13 12 70683 CASAVA_Build 13 52159515 1I ATAATAATCA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 8 9 70684 CASAVA_Build 13 52162095 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 32 0 17 15 A 8 9 70685 CASAVA_Build 13 52162547 2I TTTGGTTCTC --/TT AGTGCTGTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 0 2 70686 CASAVA_Build 13 52165255 2I TAGCATTTTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 TA 7 8 70687 CASAVA_Build 13 52170741 1I GCTAATTTTT -/A AAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 3 4 70688 CASAVA_Build 13 52173657 1I CTTGGGTATT -/A TAGTGACGTT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 0 1 70689 CASAVA_Build 13 52176598 6I TTTATGTAAA ------/TATAGT TATATAAACA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 TATAGT 0 1 70690 CASAVA_Build 13 52177040 8I CATCTCTACT --------/AAAAATAC AAAAAATTAG 3070 hom 33 het 13 0 11 2 AAAAATAC 0 1 70691 CASAVA_Build 13 52180324 1D TTCAACACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 31 0 19 12 T 12 11 70692 CASAVA_Build 13 52183985 2I AATGAAACTG --/TA TACCTATTAA 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 TA 1 2 70693 CASAVA_Build 13 52184084 1D CTGCTGTCTG C/- TAGTCTTCCA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 C 1 0 70694 CASAVA_Build 13 52184326 1D CTCCAGCCTA G/- CTGTGAACCC 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 G 1 0 70695 CASAVA_Build 13 52207506 1D AGGTTCTGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 T 9 8 70696 CASAVA_Build 13 52213447 1I GTACATGTAA -/T TTTTAAAGGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 4 5 70697 CASAVA_Build 13 52218435 21I CGTATGACTC ---------------------/CTAAAATTAGTGTCTTTTAGG ACCATCTTCC 3070 het 3070 ref 36 19 9 10 CTAAAATTAGTGTCTTTTAGG 0 1 70698 CASAVA_Build 13 52219121 1I AATTAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1418 hom 29 5 15 9 T 10 11 70699 CASAVA_Build 13 52225643 1I CTAAAAATAC -/A AAAATAAGCT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 4 5 70700 CASAVA_Build 13 52264206 1D ACAAGTCCAT G/- GGGGAGAACT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 5 4 70701 CASAVA_Build 13 52265299 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 395 hom 32 1 22 10 A 9 10 70702 CASAVA_Build 13 52274252 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 37 4 26 7 T 12 11 70703 CASAVA_Build 13 52280374 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 24 1 19 4 A 13 12 70704 CASAVA_Build 13 52292436 1I TCATAGTAAG -/T GGGTGAGTAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 0 1 70705 CASAVA_Build 13 52296307 1I ATTTATTTGA -/T TTTTTTAGTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 6 7 70706 CASAVA_Build 13 52308044 3D AAATAACCAT AAA/--- AATAGCCAAC 3070 het 3070 ref 34 21 10 6 A 5 2 70707 CASAVA_Build 13 52329721 5D GCTTTGCTTT GCCTC/----- GCCTCAGGAG 3070 hom 66 het 26 0 20 6 GCCTC 2 1 70708 CASAVA_Build 13 52348751 1I GAATAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2377 het 2377 ref 24 10 8 6 A 10 11 70709 CASAVA_Build 13 52356612 2D GGAAGAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 39 1 25 14 A 16 14 70710 CASAVA_Build 13 52372118 2D GGGGTGAGAC AG/-- GGGTACTTTA 3070 het 3070 hom 34 16 14 6 AG 1 0 70711 CASAVA_Build 13 52377332 2D TTCTTCTCTC TG/-- TATTACTTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TG 1 0 70712 CASAVA_Build 13 52387433 1D GCCTCCAGAA G/- GAATGTGGTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 2 1 70713 CASAVA_Build 13 52388688 2D GCTCAAAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 1813 het 20 hom 25 1 9 16 T 20 18 70714 CASAVA_Build 13 52401341 2D TGAAAAAAGC AG/-- AGAGGGCTGG 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 AG 3 2 70715 CASAVA_Build 13 52408448 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2616 hom 30 10 11 9 A 12 11 70716 CASAVA_Build 13 52418449 1D GGGCTAGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 23 22 6 A 11 10 70717 CASAVA_Build 13 52419073 1D38M8D AAATGAAACA TTTAAAAAAAAAGAAATTTGGCTGCCTAGAGCACTAGAGCAGTAGAC/-TTAAAAAAAAAGAAATTTGGCTGCCTAGAGCACTAGAG-------- CAGTAGACCA 3070 het 277 hom 36 2 47 4 N/A 0 0 70718 CASAVA_Build 13 52428638 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1374 het 1374 ref 35 30 3 2 T 10 9 70719 CASAVA_Build 13 52446183 6D5M11D CTCTCCCTCC CCTAGTCTCCTATGGTACCTAC/------CTCCT----------- AATCTCTACC 3070 het 3070 ref 61 40 26 8 N/A 0 0 70720 CASAVA_Build 13 52460965 1I TATAACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 10 11 70721 CASAVA_Build 13 52461548 1I ATTTTGCCTG -/T TTTTTTTTTT 1355 het 1355 ref 52 34 4 14 T 14 15 70722 CASAVA_Build 13 52487108 2D GCCCAAGAGA TG/-- TGTTATAGAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 TG 2 1 70723 CASAVA_Build 13 52489844 3I GACCACACTT ---/CTC CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 CTC 0 1 70724 CASAVA_Build 13 52504861 1I CACACACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 10 11 70725 CASAVA_Build 13 52507457 1I TTTAATCTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 9 10 70726 CASAVA_Build 13 52545670 1I GAGACCCCCC -/T GGGCCTCCAG 3070 hom 104 het 38 0 34 4 T 0 1 70727 CASAVA_Build 13 52548439 2D AAAGCAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 1455 het 861 hom 35 8 4 23 T 16 14 70728 CASAVA_Build 13 52549229 1D TAGTTAGGGG C/- CCCTATTAAT 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 C 4 3 70729 CASAVA_Build 13 52556833 6D AATTCATTCA CTTTTT/------ CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 CTTTTT 2 1 70730 CASAVA_Build 13 52579278 1D ATGCTGACTA C/- AATTTTTTGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 1 0 70731 CASAVA_Build 13 52580394 10D TGGCATGGTC ACTCATGGAA/---------- AGATTTGTCT 3070 hom 99 het 32 0 33 2 ACTCATGGAA 1 0 70732 CASAVA_Build 13 52584714 1D TGGAGATGAA T/- TTTGATAGGT 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 T 4 3 70733 CASAVA_Build 13 52591770 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2972 het 2972 ref 27 16 7 4 A 10 11 70734 CASAVA_Build 13 52601007 1D CTTATTTGTT A/- GTAGCCATGT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 1 0 70735 CASAVA_Build 13 52648323 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 703 hom 24 2 14 8 A 12 11 70736 CASAVA_Build 13 52657780 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACAAAA 3070 het 34 hom 30 2 23 5 C 0 1 70737 CASAVA_Build 13 52658121 2I TCCCAACCAC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 9 11 70738 CASAVA_Build 13 52660265 1D AGTTGGCACT G/- AGTTTTTTTC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 1 0 70739 CASAVA_Build 13 52668382 9D GTTTTGATAA TATTTTTAT/--------- TATTTTTATT 3070 hom 87 het 32 0 30 5 TATTTTTAT 2 1 70740 CASAVA_Build 13 52669240 3I AGACAGTATT ---/CTG CATTAGGGTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTG 0 1 70741 CASAVA_Build 13 52684610 6D GTAATAACTT AATAAG/------ TATTTATTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 AATAAG 1 0 70742 CASAVA_Build 13 52705847 1I CTCCAACCAA -/G GGGGAATACC 3070 hom 80 het 32 0 26 6 G 4 5 70743 CASAVA_Build 13 52713329 1D CTTATATTTG C/- CCAGACTTTC 3070 hom 156 het 58 0 52 6 C 3 2 70744 CASAVA_Build 13 52730610 1D GTAGATGTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 9 70745 CASAVA_Build 13 52747549 1I GAAACACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 30 1 23 6 A 11 12 70746 CASAVA_Build 13 52752085 1D CTTATCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 140 het 54 0 46 9 T 11 10 70747 CASAVA_Build 13 52755044 1D TCAGAACCCC T/- GGCTACTCTC 3070 hom 117 het 45 0 35 11 T 1 0 70748 CASAVA_Build 13 52768633 1D TCTTTTTTTT G/- TTTTGTTTTC 3070 het 338 hom 28 2 21 5 G 1 0 70749 CASAVA_Build 13 52786580 1I CTCTGCAAAT -/G GGAAGAGCTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 2 3 70750 CASAVA_Build 13 52791665 6I TATAATGAGT ------/CTGTTG CTTTGATGAC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 CTGTTG 0 1 70751 CASAVA_Build 13 52799636 1I AAAACCACCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 28 hom 35 2 26 7 T 9 10 70752 CASAVA_Build 13 52809336 2D ACAGAAATCA TC/-- TCTCTCCTCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TC 4 3 70753 CASAVA_Build 13 52823062 1I TAAAATATAT -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 0 1 70754 CASAVA_Build 13 52824354 1I AATTTAGGGG -/A AAAAACACCT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 5 6 70755 CASAVA_Build 13 52824759 18D ACCCAGATAT ACATATACATATACATAC/------------------ ACATATACAT 3070 hom 51 het 26 0 18 10 ACATATACATATACATAC 2 1 70756 CASAVA_Build 13 52826086 1D GCTGCTGAAG A/- AAAAAATCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 6 70757 CASAVA_Build 13 52836279 1D TTTGCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 12 11 70758 CASAVA_Build 13 52849304 3D ACTGGGACAG AGA/--- AGATGTGTAA 3070 hom 120 het 44 0 41 5 AGA 2 1 70759 CASAVA_Build 13 52858601 2I TGAAAGGCAG --/CC AACACTTTAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 2 70760 CASAVA_Build 13 52863298 1I ACAAGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 11 70761 CASAVA_Build 13 52875633 1I GCATAATAAG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 70762 CASAVA_Build 13 52877665 1D TCTTCATGAA G/- AGCTGTTTCA 3070 hom 109 het 41 0 33 8 G 1 0 70763 CASAVA_Build 13 52882982 1I AATTTTATGA -/C TTCATGAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 0 1 70764 CASAVA_Build 13 52901172 15D CCCTGACAAG CAGAAGCAGCTTTCC/--------------- CAGATACTTA 3070 hom 91 het 34 0 28 9 CAGAAGCAGCTTTCC 1 0 70765 CASAVA_Build 13 52923546 3D TGTAGAAGAC TTT/--- TTTACTTTAT 3070 hom 126 het 43 0 43 0 T 6 3 70766 CASAVA_Build 13 52951113 1I ATGTAATCTC -/A AACCAACCGT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 2 3 70767 CASAVA_Build 13 52969209 1I TGTTTTCTAC -/T GAATACATAT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 0 1 70768 CASAVA_Build 13 52969755 4D TATATGCTCT TAGA/---- TTATCTTTAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 TAGA 1 0 70769 CASAVA_Build 13 52969980 17D GCAGATACTG TTCTTTCATACATTTCA/----------------- TTCTTTCATA 3070 het 3070 hom 28 12 14 4 TTCTTTCATACATTTCA 2 1 70770 CASAVA_Build 13 52970522 2D ACTAGAAGAC TA/-- TGAGGGGTTT 3070 het 3070 ref 40 23 13 5 TA 1 0 70771 CASAVA_Build 13 52972986 1D TTCACCTCAA T/- TTTTTTTTTT 2867 het 2867 ref 24 13 8 3 T 11 10 70772 CASAVA_Build 13 52979206 3I4M1I TTATTTTAGC ---CTCA-/AAAATCAC ATGTAACCTA 3070 het 3070 hom 27 9 16 4 N/A 0 0 70773 CASAVA_Build 13 52980591 2D CCTGTGGAGC AG/-- AGCCAGGTCA 3070 het 3070 ref 38 18 18 4 AG 2 1 70774 CASAVA_Build 13 52996578 1I TAGGTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 566 hom 31 2 22 7 T 11 12 70775 CASAVA_Build 13 52997160 12I TAGAGTCAAC ------------/GCCTGCTGAGCA GAACTCACTG 3070 hom 102 het 34 0 34 1 GCCTGCTGAGCA 0 1 70776 CASAVA_Build 13 53034544 1D AAAACATTTT G/- TTTACTTAAG 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 G 1 0 70777 CASAVA_Build 13 53042820 1I TGCAAATTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 9 10 70778 CASAVA_Build 13 53059526 1D AAGTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 12 11 70779 CASAVA_Build 13 53065134 1D TTCTACTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 13 12 70780 CASAVA_Build 13 53066834 1I TAGATTTTAT -/A TAATATCTCA 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 A 0 1 70781 CASAVA_Build 13 53079189 1I ATTTCCTGTT -/A AAAAATCTCT 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 5 6 70782 CASAVA_Build 13 53084564 5D CAGCTCTGTA CCTCC/----- CATAGCTATT 3070 het 3070 ref 39 25 13 5 CCTCC 1 0 70783 CASAVA_Build 13 53093595 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1779 hom 16 7 9 0 A 11 12 70784 CASAVA_Build 13 53098475 3D TAGAAATATT AGG/--- AGATTGTGCC 3070 het 3070 ref 34 17 10 9 AGG 1 0 70785 CASAVA_Build 13 53122347 1I AGAATGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 20 0 8 12 A 11 12 70786 CASAVA_Build 13 53125437 7I TTTGAGGATC -------/TAATTAT AGACTGTTAT 2797 het 2797 ref 25 17 6 2 TAATTAT 0 1 70787 CASAVA_Build 13 53147733 1I ATTCAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 A 10 11 70788 CASAVA_Build 13 53150644 1D ACAAGCAAAC A/- AAACACTCTA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 4 3 70789 CASAVA_Build 13 53153943 2D GCATTGGATG CA/-- ATCAAGCCTA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 CA 1 0 70790 CASAVA_Build 13 53157369 2D AATTTTCCCT AA/-- GTTTGAATAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 A 2 0 70791 CASAVA_Build 13 53162309 4I CTAAAAACAT ----/GAAA GAAAGACATT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 GAAA 1 2 70792 CASAVA_Build 13 53170482 1D AGAAATTTAG A/- AAAACAATCC 3070 het 3070 ref 33 20 13 0 A 5 4 70793 CASAVA_Build 13 53185427 1D ACAAATGTAT A/- TATTAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 A 1 0 70794 CASAVA_Build 13 53205133 1I CATATACATG -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 6 7 70795 CASAVA_Build 13 53206507 1D TCACACCAGA G/- GTTTTGTAGA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 G 2 1 70796 CASAVA_Build 13 53207180 2I TAGAAAAGTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 10 12 70797 CASAVA_Build 13 53207721 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 9 A 12 11 70798 CASAVA_Build 13 53217949 1I TGTATCTGTG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 1601 hom 33 5 20 8 T 8 9 70799 CASAVA_Build 13 53218560 2D ATTGTTACTC TT/-- TTAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 4 2 70800 CASAVA_Build 13 53220346 2I GTAGTCAAAC --/AG AATTCAAAAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AG 0 1 70801 CASAVA_Build 13 53225286 1D CTAAAATAAG T/- TTTCTTTTAG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 4 3 70802 CASAVA_Build 13 53235216 2D ATGCGGAGAA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 68 het 25 0 22 3 C 11 9 70803 CASAVA_Build 13 53250853 2D TAGAAAGGTA TG/-- TGCATATGCA 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 TG 2 1 70804 CASAVA_Build 13 53252878 1D TTCAAGTGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 A 10 9 70805 CASAVA_Build 13 53254741 2I GAAGAGTTTT --/AC AGTTTCTGGT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 AC 0 1 70806 CASAVA_Build 13 53255809 3D AGAGCATAAT AAC/--- TGCAGTAGCA 2522 het 2522 ref 36 15 12 9 AAC 1 0 70807 CASAVA_Build 13 53257683 1D TAGCTAAATC T/- TTTTTCACAG 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 T 6 5 70808 CASAVA_Build 13 53273098 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 12 11 70809 CASAVA_Build 13 53277202 1D AATGCAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 11 10 70810 CASAVA_Build 13 53279049 1D GGTATTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 11 10 70811 CASAVA_Build 13 53281822 1D AGAACATATA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 114 het 44 0 38 7 T 8 7 70812 CASAVA_Build 13 53282899 1D ATGTGGTGCC T/- TTTTATAATA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 5 4 70813 CASAVA_Build 13 53286881 3I AATTAAAAAG ---/ATA ATAATAACAT 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 ATA 2 3 70814 CASAVA_Build 13 53297254 1I TTGGATCAGT -/A ACGAGGCCCA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 A 1 2 70815 CASAVA_Build 13 53315240 16D TGTCCTTCAT ATATAAGTTAATACAA/---------------- ATATAAGTTA 3070 het 3070 hom 37 15 15 11 ATATAAGTTAATACAA 2 1 70816 CASAVA_Build 13 53318756 1I AATAAAATGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 6 7 70817 CASAVA_Build 13 53337150 1D TGCATGTTCT A/- TTAGACTCTA 2817 het 2062 hom 18 5 6 7 A 1 0 70818 CASAVA_Build 13 53339876 14I ACCTTTCCTT --------------/GGTGCTTCTGTGCA GGGTTTGGGT 3070 hom 99 het 35 0 33 4 GGTGCTTCTGTGCA 0 1 70819 CASAVA_Build 13 53342421 3D ATTTTTCATG CTA/--- CTATTATACA 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 CTA 2 1 70820 CASAVA_Build 13 53346750 4D GTTTAGGCAT CAAA/---- CAAAGAATAT 3070 het 3070 hom 54 22 28 7 CAAA 2 1 70821 CASAVA_Build 13 53353591 1I AGAAAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2233 hom 34 8 16 10 A 15 16 70822 CASAVA_Build 13 53360369 1I TTTTATTCTT -/A AAATAAGCTA 3070 het 2606 hom 32 6 21 5 A 3 4 70823 CASAVA_Build 13 53378869 1I TCCCAGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 502 hom 24 2 17 5 A 13 14 70824 CASAVA_Build 13 53389498 2I TTCAATATCT --/AC ACAGTTTGTG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AC 1 2 70825 CASAVA_Build 13 53399310 1D ATGGACCACA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 53 33 12 9 T 8 7 70826 CASAVA_Build 13 53400157 6D ACTTGAATTA TTTCAG/------ TTTAAGAGAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 TTTCAG 1 0 70827 CASAVA_Build 13 53402128 1D ACTGACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 935 hom 36 9 16 11 T 14 13 70828 CASAVA_Build 13 53410159 2D AAAATGATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1094 het 1094 ref 17 8 3 6 T 20 18 70829 CASAVA_Build 13 53413518 1D ACTTGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 12 11 70830 CASAVA_Build 13 53429418 2I ATAACTTATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 16 16 12 TG 6 7 70831 CASAVA_Build 13 53434555 2D TTATATACCA TT/-- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 T 9 7 70832 CASAVA_Build 13 53439174 1D GGGAGGGGCC A/- GGGGCAAAAT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 1 0 70833 CASAVA_Build 13 53450926 1I TATTGAAATT -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 6 7 70834 CASAVA_Build 13 53452053 2I TGTGAGAGGT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 20 9 10 TA 8 9 70835 CASAVA_Build 13 53470050 1I GTTTTTCAGG -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 6 7 70836 CASAVA_Build 13 53480567 5D TTTATCAGCC TAATT/----- TATTTTACTT 3070 het 3070 ref 35 21 12 5 TAATT 1 0 70837 CASAVA_Build 13 53490031 4D AGGAAGGGAT GGAG/---- GGAGGGAGGG 643 hom 13 het 11 0 4 7 GGAG 4 3 70838 CASAVA_Build 13 53491076 1D CAGTCACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 47 0 39 8 T 12 11 70839 CASAVA_Build 13 53522441 1D GTTTCTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 31 1 26 6 A 11 10 70840 CASAVA_Build 13 53532863 1D GAGAGTAAAA G/- GGGGAATTTT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 G 5 4 70841 CASAVA_Build 13 53547468 1I AATTCATTTT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 A 7 8 70842 CASAVA_Build 13 53556774 2I ACTCCAGTAG --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 11 70843 CASAVA_Build 13 53562108 1D GTGAGATGGA T/- TTTTTTTTTT 2434 het 2434 ref 48 29 8 11 T 15 14 70844 CASAVA_Build 13 53570666 1D TCTGTTAGTC A/- AAGTTAATTC 2904 het 2904 ref 29 17 8 4 A 3 2 70845 CASAVA_Build 13 53579680 1I TTATCAAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 8 9 70846 CASAVA_Build 13 53584210 1D CAAATAAAAC A/- AAAAAAGTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 7 A 7 6 70847 CASAVA_Build 13 53587972 1I TAAAACAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 877 hom 44 5 28 11 T 13 14 70848 CASAVA_Build 13 53589506 1I TGGTGTAATT -/G GGGGGAAAGG 3070 hom 70 het 32 0 24 10 G 5 6 70849 CASAVA_Build 13 53590022 1I ACCTCTTTCC -/T TAGATGAACT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 2 70850 CASAVA_Build 13 53591899 1D GTGTTATAGT G/- GAAAATTAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 G 2 1 70851 CASAVA_Build 13 53592143 1D CAAATTTTTT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 9 8 70852 CASAVA_Build 13 53594536 4I TACATTTTTA ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 10 14 70853 CASAVA_Build 13 53594880 1D CTACATAAGA T/- AGTATATCTA 3070 hom 108 het 38 0 36 3 T 1 0 70854 CASAVA_Build 13 53595459 2D CCAAAAAGTA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 78 het 32 0 27 7 GT 6 5 70855 CASAVA_Build 13 53596204 7I GTTAATTGCT -------/GATATTA GTTATTAGTT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 GATATTA 0 1 70856 CASAVA_Build 13 53603431 1I TATGTTGCTA -/C TTGGCTGTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 0 1 70857 CASAVA_Build 13 53616690 4D TACATGTGTC TATA/---- TATGCACATA 3070 hom 105 het 41 0 36 9 TA 3 1 70858 CASAVA_Build 13 53617488 1D CTGGATTCTC T/- CCTTCGTCCC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 1 0 70859 CASAVA_Build 13 53619487 1D CCTACTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 12 11 70860 CASAVA_Build 13 53635517 3D AGTGTGAAAA ATC/--- AGCAGGATTT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 ATC 1 0 70861 CASAVA_Build 13 53641179 3I ATGATAATAA ---/TTC TTCTTATTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTC 1 2 70862 CASAVA_Build 13 53642069 5I TTGCATACTT -----/CTCTC CTCGAGAATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CTCTC 0 1 70863 CASAVA_Build 13 53659698 4D AAAGAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2202 het 2202 ref 28 11 10 8 AAAG 5 4 70864 CASAVA_Build 13 53699649 3D TCATAAATGT TTA/--- TTTTTTTCAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TTA 1 0 70865 CASAVA_Build 13 53727932 1D ATTTTTCATT A/- TGCAAAAAGT 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 A 1 0 70866 CASAVA_Build 13 53729928 4D TGTTTTCTCC TGTT/---- TGTTTATTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 TGTT 2 1 70867 CASAVA_Build 13 53731265 1D TTGAGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 659 hom 36 2 20 15 T 17 16 70868 CASAVA_Build 13 53733123 1I CAATAAAAAA -/G AAAGGACAGC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 G 0 1 70869 CASAVA_Build 13 53745381 1D TAGAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 13 12 70870 CASAVA_Build 13 53766771 4D GACTCCTTTA TAAG/---- TAAGTCCCAG 3070 het 3070 hom 36 16 19 3 TAAG 2 1 70871 CASAVA_Build 13 53768791 4D CCAAGACCAC ATAG/---- ATAGTGACTA 3070 het 3070 ref 59 28 25 6 ATAG 2 1 70872 CASAVA_Build 13 53772064 4I AAAGAATAAA ----/CAAG CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 CAAG 0 1 70873 CASAVA_Build 13 53774899 1D AATACTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 12 11 15 T 13 12 70874 CASAVA_Build 13 53779540 4D GAAATGAGAT AGAC/---- AGCAACACAA 3070 het 3070 hom 25 8 13 5 AGAC 1 0 70875 CASAVA_Build 13 53788378 1I CAGCCCCTCT -/C CCCCCGCTGG 2300 het 935 hom 20 5 11 4 C 5 6 70876 CASAVA_Build 13 53792209 1D AATATAAAGG T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 6 70877 CASAVA_Build 13 53793739 6I TGATAGTAGA ------/GCTAAG GCAGCTCCTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 GCTAAG 0 1 70878 CASAVA_Build 13 53795267 4D AAGAAGAGAT TGTC/---- TGTTGTGTCA 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 TGTC 1 0 70879 CASAVA_Build 13 53796342 1I TTGGTTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 T 10 11 70880 CASAVA_Build 13 53801880 1D TAGTAGAGAT A/- AAAAAACACT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 7 6 70881 CASAVA_Build 13 53805812 1D ATGGCTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 11 10 70882 CASAVA_Build 13 53806235 4I GAGACTCACA ----/GAGT GATTACCCAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GAGT 0 1 70883 CASAVA_Build 13 53820197 1D AGACATAGAT A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 A 7 6 70884 CASAVA_Build 13 53820707 1I AAAAAAAAAC -/A AAACAAAACT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 3 4 70885 CASAVA_Build 13 53821141 1D AAATTAAATG T/- TCCAGAGGCA 3070 het 3070 ref 46 24 17 7 T 2 1 70886 CASAVA_Build 13 53826109 1I CTGTTTCTTA -/T TTTTTTTTTT 1771 het 1771 ref 22 7 6 9 T 11 12 70887 CASAVA_Build 13 53830450 1I ATAGGAGGGT -/G GGGGCAGAGA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 G 4 5 70888 CASAVA_Build 13 53842488 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 10 11 70889 CASAVA_Build 13 53844724 2I CTTTTCTTTT --/TA TATATATATA 1364 het 944 hom 13 4 4 5 TA 7 8 70890 CASAVA_Build 13 53847239 1D ATGAATAGAA T/- TTACCCAACC 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 T 3 2 70891 CASAVA_Build 13 53852174 1D TTGCTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2747 hom 34 11 19 4 T 12 11 70892 CASAVA_Build 13 53864418 1D CAAATATAGA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 8 7 70893 CASAVA_Build 13 53870545 16I TGCAAGCCCA ----------------/CACAAAGTTTCGTTTT TTTGTGTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 CACAAAGTTTCGTTTT 0 1 70894 CASAVA_Build 13 53897316 4D TACCAAACTC AATA/---- AATAATATTC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AATA 2 1 70895 CASAVA_Build 13 53899024 3D CTGGGACTAC AGG/--- TGCCCGCCAC 2650 het 320 hom 9 2 6 1 AGG 1 0 70896 CASAVA_Build 13 53905455 2D TAGAAGAATC CT/-- CTCTCAGAAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 CT 3 2 70897 CASAVA_Build 13 53908110 1D ATAAATTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2807 hom 42 14 17 11 A 16 15 70898 CASAVA_Build 13 53909913 4D TTGAAAGATA ATAC/---- ATAGATACAG 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 ATAC 1 0 70899 CASAVA_Build 13 53910860 2D TTTAAGGAAG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 TA 7 6 70900 CASAVA_Build 13 53912312 3I TTTTCTTTTG ---/TTC TTCTTCGTTT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 TTC 2 3 70901 CASAVA_Build 13 53918303 1I ATTTTGCATC -/A CTTATTAGAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 0 1 70902 CASAVA_Build 13 53920295 5I ATCTCCTCTG -----/TACTT TACAAAGATT 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 TACTT 0 1 70903 CASAVA_Build 13 53923993 4I ATGAGAAGTT ----/ACTC ACTATCACAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 ACTC 0 1 70904 CASAVA_Build 13 53925899 2D AGCCCTCCAA CT/-- CTCTAGGAAT 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 CT 3 2 70905 CASAVA_Build 13 53927957 1I ATAATCTGTA -/C AACAAAACCC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 C 0 1 70906 CASAVA_Build 13 53930685 1I AATTTTATTC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 7 8 70907 CASAVA_Build 13 53931068 1D GTATTGTGCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 9 8 70908 CASAVA_Build 13 53932703 1I AAACTTCAAG -/T TTTCTGAAAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 3 4 70909 CASAVA_Build 13 53938821 1I AAATTTCTGA -/T TTTTTTTTTG 2384 het 2384 ref 22 11 5 6 T 9 10 70910 CASAVA_Build 13 53940976 5D ATTTTCATGA TTATG/----- TTATGTTATA 3070 het 3070 hom 29 11 16 3 TTATG 2 1 70911 CASAVA_Build 13 53947146 1D AGTCCAGGCC T/- GTGAAACTTC 3070 het 3070 hom 35 17 13 5 T 1 0 70912 CASAVA_Build 13 53952686 1I GCCAAAAGCC -/A AAATTAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 13 2 A 3 4 70913 CASAVA_Build 13 53965470 1I GAAAAAAAAC -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 A 6 7 70914 CASAVA_Build 13 53965762 1I CAAATATTTG -/T TTGACAATAA 3070 het 3070 hom 44 14 26 4 T 2 3 70915 CASAVA_Build 13 53967786 1I TTTTCAAAAG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 7 8 70916 CASAVA_Build 13 53970625 1I GTCACAGGCA -/C TCAATACCAG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 C 0 1 70917 CASAVA_Build 13 53971588 1D AAAAGAATAC A/- AAAATGGGAT 3070 het 3070 hom 49 24 20 5 A 5 4 70918 CASAVA_Build 13 53978170 2D AGGGAAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 A 12 10 70919 CASAVA_Build 13 53987777 3D AAAATCTATA AGG/--- TACTCAAACA 3070 hom 117 het 41 0 40 2 AGG 1 0 70920 CASAVA_Build 13 53990831 2I TACAGTCAGA --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 10 70921 CASAVA_Build 13 53993291 1I TAAATTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1592 hom 32 6 16 10 A 16 17 70922 CASAVA_Build 13 53995711 4D ATAAATGTAT CTGC/---- CTATTTCCAT 3070 hom 151 het 53 0 51 2 CTGC 1 0 70923 CASAVA_Build 13 53998883 1D GAGTAAATGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3 hom 40 1 36 3 A 9 8 70924 CASAVA_Build 13 54000665 1D TAATAAAAAA T/- ATTCCAAGTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 1 0 70925 CASAVA_Build 13 54003754 3D TTAAAATTAA AAT/--- AATTTTAATT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 AAT 2 1 70926 CASAVA_Build 13 54017156 2I CTTTAATAAA --/CT CTCAATAATT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 CT 1 2 70927 CASAVA_Build 13 54021157 1D CCACATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 42 1 33 8 A 12 11 70928 CASAVA_Build 13 54021870 1D CCATCAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 10 9 70929 CASAVA_Build 13 54023204 2I ATAGGAAATT --/TA TATATATATA 2559 hom 15 het 9 0 6 3 TA 8 9 70930 CASAVA_Build 13 54061021 3D ACATTCTAAG TAA/--- TAAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 6 TAA 2 1 70931 CASAVA_Build 13 54062154 1I TTTTTCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 10 14 16 T 13 14 70932 CASAVA_Build 13 54063015 3D GAGTTAAAAA ATT/--- ATTATGTGAA 3070 het 3070 hom 36 16 15 7 ATT 2 1 70933 CASAVA_Build 13 54071928 1D TGATTACATT A/- AAAAATGAGA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 6 5 70934 CASAVA_Build 13 54076180 2I TGAAGTCTCG --/CT CTGTCACCTA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 CT 1 2 70935 CASAVA_Build 13 54084859 6I TGAGAAATAA ------/TTAAAT TTAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 TTAAAT 0 1 70936 CASAVA_Build 13 54092044 1I CTAAATTCCC -/T TATGATTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 1 2 70937 CASAVA_Build 13 54117070 2D ATATTTCCTC TT/-- TTGAAAACTT 3070 het 3070 ref 26 15 10 5 T 4 2 70938 CASAVA_Build 13 54129576 1D TCCCCAAACC T/- TTTAATTCAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 4 3 70939 CASAVA_Build 13 54133391 3D TGATATGTAG TAT/--- TATTGTGAAC 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 TAT 2 1 70940 CASAVA_Build 13 54143437 2I TTTTCTATTA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 22 7 11 5 T 9 11 70941 CASAVA_Build 13 54145312 1I ATCTAAAATA -/T AACTTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 0 1 70942 CASAVA_Build 13 54146859 1I AATAAGAAAT -/A AATGTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 2 3 70943 CASAVA_Build 13 54153713 1D GACAATTTTA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 7 6 70944 CASAVA_Build 13 54163486 5I CATATGTTGT -----/TGAAA TAATATCATC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TGAAA 0 1 70945 CASAVA_Build 13 54170190 1I CTGAAGATGA -/T TGATTACCCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 70946 CASAVA_Build 13 54172505 1D CACCACTTCC T/- GTTGAAAGGC 3029 het 3029 ref 22 10 8 4 T 1 0 70947 CASAVA_Build 13 54175551 3D CCAGATAATC CAA/--- CAACAAGACT 3070 het 3070 hom 46 21 17 9 CAA 3 2 70948 CASAVA_Build 13 54183786 1D TATATTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2679 hom 35 9 17 9 T 12 11 70949 CASAVA_Build 13 54189929 3D2M9D GATCCCTTTT CCATTATGTAATGC/---TT--------- CTTTAATCTT 404 het 404 ref 18 4 3 11 N/A 0 0 70950 CASAVA_Build 13 54196382 1D TTCTGTGTAC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 T 8 7 70951 CASAVA_Build 13 54201335 1I TGCTGATAAC -/A TGGTATCTTC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 0 1 70952 CASAVA_Build 13 54203182 1I TTTGTTTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 11 12 70953 CASAVA_Build 13 54206282 1I TATTTCCACC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 25 7 18 0 A 7 8 70954 CASAVA_Build 13 54206375 1D TAATATTTAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 2460 hom 15 6 9 0 A 8 7 70955 CASAVA_Build 13 54208013 1I CACAGGAAAA -/G CTTTCTATTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 70956 CASAVA_Build 13 54214423 2I TACTAAAAGC --/AA AGAGCTTCAT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 1 3 70957 CASAVA_Build 13 54218855 1I ATTCCACTTC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 27 8 19 0 T 7 8 70958 CASAVA_Build 13 54219005 1I ATTCTAAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 T 9 10 70959 CASAVA_Build 13 54222281 1I AATCTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 575 het 575 ref 36 24 2 10 A 13 14 70960 CASAVA_Build 13 54243353 1D CTTTGTAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 48 0 36 12 T 10 9 70961 CASAVA_Build 13 54243853 1I CTAATATATA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 T 6 7 70962 CASAVA_Build 13 54253862 1I GACAGCTGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2822 hom 31 8 17 6 T 9 10 70963 CASAVA_Build 13 54270078 4D ATATTATAAA TTTG/---- TTTATTTGTG 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 TTTG 1 0 70964 CASAVA_Build 13 54277087 1I CTTTTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 T 13 14 70965 CASAVA_Build 13 54285866 2I TTTTAACTCT --/CA GAGATGAGTG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 CA 0 1 70966 CASAVA_Build 13 54293781 3I CATTGTAATT ---/GTG GTGTATAAAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 GTG 1 2 70967 CASAVA_Build 13 54298708 1D CTCAAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 29 1 19 10 A 12 11 70968 CASAVA_Build 13 54304072 1I GCAACCCGTG -/T CCATTAACAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 0 1 70969 CASAVA_Build 13 54306212 1D GTGTGTGGGT G/- GGGGGGTGTA 3070 hom 24 het 21 0 10 11 G 7 6 70970 CASAVA_Build 13 54313665 1D TGATTAAAAT G/- ATCATAAAGA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 G 1 0 70971 CASAVA_Build 13 54314218 2D ATAACTTTCT TA/-- TGTCTTCAAA 3070 het 3070 hom 46 20 23 4 TA 1 0 70972 CASAVA_Build 13 54342110 1I TTATTTAGTG -/T TTTTTTTTAA 2634 het 2634 ref 25 15 6 4 T 8 9 70973 CASAVA_Build 13 54343415 1D AATTTTGAAT C/- TAAATTATGG 3070 het 3070 hom 43 14 27 4 C 1 0 70974 CASAVA_Build 13 54346424 4I TTTGTTTCTC ----/TATT TGTTTGTTTT 2940 het 2940 ref 26 14 7 5 TATT 0 1 70975 CASAVA_Build 13 54351523 3D TTATAAAAAC ATT/--- ATATTAGTGG 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 ATT 1 0 70976 CASAVA_Build 13 54356743 1D CACCAAATGC T/- TTTTTTTTTT 2423 het 2423 ref 26 15 6 5 T 13 12 70977 CASAVA_Build 13 54361268 6D ACATACATAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 AC 12 9 70978 CASAVA_Build 13 54365426 1D TTTCTGTCAG T/- CTTCTTACAA 3070 het 3070 hom 43 22 19 2 T 1 0 70979 CASAVA_Build 13 54371386 3I TGGAACTGTG ---/AGA AGTATTAATA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 AGA 0 1 70980 CASAVA_Build 13 54375840 1D AAGAAAATTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 T 10 9 70981 CASAVA_Build 13 54380821 2D AACCCCTCTC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 61 het 28 0 20 9 A 11 9 70982 CASAVA_Build 13 54381095 1D TGAACCTTAC A/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 7 6 70983 CASAVA_Build 13 54381331 1I TCTACCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 29 0 21 8 T 11 12 70984 CASAVA_Build 13 54383187 1D ATAGCAAGAT A/- AGTTCATAAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 2 1 70985 CASAVA_Build 13 54397121 1D TTCTTTATGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 10 9 70986 CASAVA_Build 13 54398391 8I AAATGACCCA --------/AATAGGCC AATCCGTAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 AATAGGCC 0 1 70987 CASAVA_Build 13 54414595 1D TACCCCTAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 59 het 25 0 20 6 A 9 8 70988 CASAVA_Build 13 54415556 4D TTAAACTGTT AGTG/---- AGATTTATTA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AGTG 1 0 70989 CASAVA_Build 13 54416451 4I TTAATTCTTT ----/CTAA CTTTTTGACT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTAA 0 1 70990 CASAVA_Build 13 54418686 5I AAATTCTGGT -----/CTTGG CTTAGAATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CTTGG 0 1 70991 CASAVA_Build 13 54428310 1I TCTGATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 10 11 70992 CASAVA_Build 13 54428831 1I GTTTATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 11 12 70993 CASAVA_Build 13 54430187 1I TTGTTGCAAG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 6 7 70994 CASAVA_Build 13 54431694 4D GTACTGTCAC TGTT/---- TGCTTTATGT 3070 het 3070 ref 51 29 20 10 TGTT 1 0 70995 CASAVA_Build 13 54431797 2D TGTCGCCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 14 12 70996 CASAVA_Build 13 54435616 4I TAAAATATAG ----/CAAA CAGTTATTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 CAAA 0 1 70997 CASAVA_Build 13 54441572 1I AAACTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 12 13 70998 CASAVA_Build 13 54444720 4D AAAAACTAAT AAAG/---- AAATCTATCA 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 AAAG 1 0 70999 CASAVA_Build 13 54450335 4I TTTTTTTTTC ----/TGTT TGTTTGTTTT 3070 het 479 hom 37 7 12 18 TGTT 2 3 71000 CASAVA_Build 13 54450517 1I TGTAGAGACA -/G GGGTCTCATT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 G 3 4 71001 CASAVA_Build 13 54454084 1D AGTGTGCGTT C/- CTACCATTAT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 C 2 1 71002 CASAVA_Build 13 54456756 1I CATTACTTTT -/A AATTGATCTG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 2 3 71003 CASAVA_Build 13 54458811 1I TTTGTAACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 9 10 71004 CASAVA_Build 13 54472673 1I TGTACATACC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 T 7 8 71005 CASAVA_Build 13 54474402 3D AGAGGCTGAG AGA/--- AGATTTATAT 3070 het 3070 hom 29 10 16 5 AGA 2 1 71006 CASAVA_Build 13 54475298 2D TAATTGTAAC AT/-- GTTCTTATTA 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 AT 1 0 71007 CASAVA_Build 13 54487271 1D GGCTAATTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 25 9 8 T 10 9 71008 CASAVA_Build 13 54490044 10I TGGAGATTAC ----------/TTAAAGTGGT TTTGACCAGA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 TTAAAGTGGT 0 1 71009 CASAVA_Build 13 54490337 3I ATAACTTAAA ---/GAC GACAGAATTT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 GAC 1 2 71010 CASAVA_Build 13 54493350 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2437 hom 28 9 10 9 TG 7 8 71011 CASAVA_Build 13 54495259 5I ATTATTTGTT -----/GTATA GTATAGGTTT 3070 het 3070 hom 38 19 18 1 GTATA 1 2 71012 CASAVA_Build 13 54510736 1D CTAGAGGAAA T/- TCCCACATCA 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 T 2 1 71013 CASAVA_Build 13 54516595 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1156 het 1156 ref 29 20 3 6 A 13 12 71014 CASAVA_Build 13 54523343 1I GAAGTTACTC -/A GGAATGGAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 71015 CASAVA_Build 13 54544243 1I ACCATTTTTT -/A ATCTCTTAAT 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 A 1 2 71016 CASAVA_Build 13 54550232 1I TCTGAAAAAA -/T AAATCTGAAA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 T 0 1 71017 CASAVA_Build 13 54562230 3I GTTTACACTT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 het 2286 hom 23 6 12 5 CTC 0 1 71018 CASAVA_Build 13 54568213 2D ATGTTAAAAA CT/-- CTAATGGCAC 3070 het 2332 hom 32 6 13 14 CT 2 1 71019 CASAVA_Build 13 54571323 4D ATGAAATAAA CTGT/---- CTTTGTTTGC 3070 het 3070 hom 32 9 19 7 CTGT 1 0 71020 CASAVA_Build 13 54580245 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAGAAAAA 3070 het 2931 hom 30 13 12 5 G 0 1 71021 CASAVA_Build 13 54580959 1D GACATTTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 10 9 71022 CASAVA_Build 13 54582989 4D ATAAATATGA TAAT/---- TAATAAATAA 1696 het 1696 ref 9 5 4 0 TAAT 2 1 71023 CASAVA_Build 13 54593610 1I TTTTATAATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 A 8 9 71024 CASAVA_Build 13 54603047 1I TTGATTGAGC -/A GTTTGATAGG 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 0 1 71025 CASAVA_Build 13 54605034 4I GCAGAAGCTC ----/GTTA GTTTAATTAG 3070 het 3070 hom 17 7 8 2 GTTA 0 1 71026 CASAVA_Build 13 54607639 6D GAAGGAGATA GAGATT/------ ATCTTTTATT 3070 het 3070 hom 32 11 20 5 GAGATT 1 0 71027 CASAVA_Build 13 54612678 1I CATCTATATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 9 10 71028 CASAVA_Build 13 54615982 1I ACTCTTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 A 10 11 71029 CASAVA_Build 13 54619436 1I AAAATGTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 T 9 10 71030 CASAVA_Build 13 54630886 3D TGCTCTTATT ATA/--- TGTCACACAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 5 ATA 1 0 71031 CASAVA_Build 13 54631294 6D AAAGAATCTG AGATAT/------ ATATATATAT 3070 het 2936 hom 22 9 11 4 AGATAT 1 0 71032 CASAVA_Build 13 54632837 1D TGACAAATGT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 9 8 71033 CASAVA_Build 13 54635059 1I GTGATTTTGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 A 8 9 71034 CASAVA_Build 13 54645865 2D GAATTGACTC TA/-- TATTACTGCT 3070 het 3070 ref 44 26 18 1 TA 2 1 71035 CASAVA_Build 13 54647391 1D TAAATTTGAT G/- GTTTGAGTTA 3070 het 3070 ref 37 22 15 0 G 2 1 71036 CASAVA_Build 13 54650329 2D AGGGCATATC AG/-- AGACCCTTCC 3070 het 3070 ref 35 17 11 8 AG 2 1 71037 CASAVA_Build 13 54652733 1I TTTGTCAATT -/A ATACCTCACT 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 A 1 2 71038 CASAVA_Build 13 54653565 3I TCTAAAGCAA ---/TAC TACTCTTGAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 TAC 1 2 71039 CASAVA_Build 13 54653912 11D AAAAGAAAAT ATAATGATTCG/----------- ATAATCATTC 3070 het 3070 hom 29 15 14 5 ATAATGATTCG 1 0 71040 CASAVA_Build 13 54655193 6D ATTTTAGGAT AAGATA/------ AAGATTTTGA 2396 het 2396 ref 22 13 6 3 AAGATA 1 0 71041 CASAVA_Build 13 54657025 5I TATACATACA -----/TATAT TATATAAATA 3070 het 2786 hom 17 6 11 0 TATAT 1 2 71042 CASAVA_Build 13 54661064 1D TCTAATTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1559 hom 29 9 13 7 A 17 16 71043 CASAVA_Build 13 54664076 1I ACAATGATAT -/A AACAGATAAA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 A 2 3 71044 CASAVA_Build 13 54674759 1D TTCTTCCTGA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 T 3 2 71045 CASAVA_Build 13 54677997 4I GAGGAAGTCC ----/ATTT ATTCTTGTTT 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 ATTT 0 1 71046 CASAVA_Build 13 54679368 1D CTCAAGGGGG T/- AAAAACAGAA 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 T 1 0 71047 CASAVA_Build 13 54682155 1I TGATGGCATC -/A AGTGAGACTA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 A 1 2 71048 CASAVA_Build 13 54684524 2I GAAAAATCAC --/AA AGATATAATT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 3 71049 CASAVA_Build 13 54685168 3I GTCTCTCTCC ---/TCG TCTTTTTATA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 TCG 0 1 71050 CASAVA_Build 13 54690865 2D GAGACTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 21 1 12 8 T 13 11 71051 CASAVA_Build 13 54692578 3D AATGTAATCT CTC/--- TTTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 CTC 1 0 71052 CASAVA_Build 13 54693423 1I ATACATAAAT -/G GTATATGGGT 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 G 1 2 71053 CASAVA_Build 13 54696568 5D ACTCTCTCTC TCTCT/----- TTTTTTTTTT 1574 het 520 hom 18 3 6 10 TCTCT 1 0 71054 CASAVA_Build 13 54696876 3D AATATGGTAA TCT/--- TCTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 TCT 2 1 71055 CASAVA_Build 13 54697080 1D TAATATTGCA T/- TTTTTACAAA 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 T 6 5 71056 CASAVA_Build 13 54700215 16D AAATACCTAT AGAATACGAGGTATTC/---------------- AGCGACCACG 3070 het 3070 hom 40 22 22 3 AGAATACGAGGTATTC 1 0 71057 CASAVA_Build 13 54701105 1I GAAACATTAA -/C CCAATTGTAG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 C 2 3 71058 CASAVA_Build 13 54707205 1D GATGGTAAAC A/- AAAAAAAAAA 1965 het 1965 ref 24 13 8 3 A 13 12 71059 CASAVA_Build 13 54709953 3D GTTTGAAATA GTT/--- GTTTTCCAAG 3070 het 3070 ref 38 23 11 6 GTT 2 1 71060 CASAVA_Build 13 54710080 2I AGAAACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 AC 6 7 71061 CASAVA_Build 13 54711439 1D CCTTTTGTTA T/- TTATATTAAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 3 2 71062 CASAVA_Build 13 54713802 1I14M3I CACTTGAAGG -TTTTTTTTTTCATT---/TTTTTTTTTTTCATTTGA TGATGAATAA 3070 het 3070 ref 35 15 15 11 N/A 0 0 71063 CASAVA_Build 13 54716159 2D TTTTCATAAG TA/-- GAGAAAGAGG 3070 het 3070 ref 31 15 13 6 TA 1 0 71064 CASAVA_Build 13 54726804 1D TGGGGAGAAG A/- AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 A 7 6 71065 CASAVA_Build 13 54730231 1I TTAATCCACA -/T TTTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 5 6 71066 CASAVA_Build 13 54730767 1D ATGTTCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 11 10 71067 CASAVA_Build 13 54731246 2I ATACAGATGT --/AG GATACAGATG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 AG 0 1 71068 CASAVA_Build 13 54733181 1D AGTTTAAAGC A/- GATCCGATTT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 1 0 71069 CASAVA_Build 13 54733899 3I TGGCACCCTG ---/ATC ATCTTGGATT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 ATC 1 2 71070 CASAVA_Build 13 54735402 1I ACGTTTGCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 9 10 71071 CASAVA_Build 13 54736763 2D AAAAGGGTTT AG/-- ATCTATCCCT 3070 hom 57 het 31 0 20 11 AG 1 0 71072 CASAVA_Build 13 54741951 1D CAGGATCACA T/- TTTTTGTAAG 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 6 5 71073 CASAVA_Build 13 54744009 1D TTTAAATGAA T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 8 7 71074 CASAVA_Build 13 54751916 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2085 hom 23 6 13 4 A 11 10 71075 CASAVA_Build 13 54754030 2D TGCACACGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 777 hom 38 4 21 14 CA 8 7 71076 CASAVA_Build 13 54754059 1I GAAAATAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 1043 hom 37 4 15 18 A 8 9 71077 CASAVA_Build 13 54754398 1I AATGACTGGC -/A TTTTAAATAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 0 1 71078 CASAVA_Build 13 54759207 1D GTTGTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 12 11 71079 CASAVA_Build 13 54760846 1I GGTCTAAGAC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 7 8 71080 CASAVA_Build 13 54763310 1I AACGATTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 9 10 71081 CASAVA_Build 13 54769309 1I TTGATTCTGC -/T TTTTACCTGC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 4 5 71082 CASAVA_Build 13 54769840 1I ATTGCATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 12 13 71083 CASAVA_Build 13 54770312 2I ACAAGGCCAG --/AC ACAGACTGTC 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 AC 1 2 71084 CASAVA_Build 13 54772571 1I AATTCACCTA -/T TTTTTTTTTT 2916 het 2916 ref 33 22 8 3 T 10 11 71085 CASAVA_Build 13 54778437 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAACC 3070 het 198 hom 39 1 34 6 A 9 8 71086 CASAVA_Build 13 54779781 1I TAATATACTG -/T TAAGTGACCA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 1 2 71087 CASAVA_Build 13 54789699 1I TAAAATGAGT -/G GGTTTTAGAT 3070 hom 52 het 39 1 34 4 G 2 3 71088 CASAVA_Build 13 54790034 1D ACTTTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 T 12 11 71089 CASAVA_Build 13 54792380 2I TTTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 19 3 11 5 T 10 12 71090 CASAVA_Build 13 54793279 1D TGCATATTAG C/- CCCTTTGTCA 3070 hom 18 het 10 0 7 3 C 4 3 71091 CASAVA_Build 13 54796134 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 22 0 11 11 A 17 16 71092 CASAVA_Build 13 54796956 3I CCCTCAACAT ---/GTG GGGATTATGG 2022 het 2022 ref 24 12 5 7 GTG 0 1 71093 CASAVA_Build 13 54802681 1I AGGCTGGTGG -/T TGTTAGAGTC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 1 2 71094 CASAVA_Build 13 54804126 4D GTACAGAGAT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 ATAG 3 2 71095 CASAVA_Build 13 54804462 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAATTAC 2395 het 626 hom 11 2 5 4 A 6 7 71096 CASAVA_Build 13 54804632 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2374 hom 31 7 17 7 A 11 12 71097 CASAVA_Build 13 54805288 1D TAGTTTGGAT A/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 1 0 71098 CASAVA_Build 13 54805595 8D CTGCAGAACG ATAAGCCA/-------- ATTAAACCTC 2740 het 2740 ref 32 19 7 6 ATAAGCCA 1 0 71099 CASAVA_Build 13 54810295 1D AATACTACTG A/- ATTTTGCATG 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 2 1 71100 CASAVA_Build 13 54810807 1I GATGTAGCAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 8 9 71101 CASAVA_Build 13 54811872 5D CTTATTAAGA CTTGT/----- CTTGTGCTCT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 CTTGT 2 1 71102 CASAVA_Build 13 54813354 1I TATGGGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 932 hom 32 3 23 6 T 14 15 71103 CASAVA_Build 13 54819427 1D GTTTCACATA T/- TTATCTTGTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 3 2 71104 CASAVA_Build 13 54820771 1I GTGTAGTTCA -/T TGTTAATGTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 1 2 71105 CASAVA_Build 13 54829542 1I TCAGTTTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 98 het 39 0 33 6 A 9 10 71106 CASAVA_Build 13 54829604 11D CATGTGCTAT CTTTACAGGGA/----------- CTTTACAGGG 3070 hom 114 het 51 0 39 13 CTTTACAGGGA 3 2 71107 CASAVA_Build 13 54833116 5I TCTGAGACAG -----/TTATA TTATCAGTAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTATA 0 1 71108 CASAVA_Build 13 54834085 4I AAATGTAGCT ----/TAAA TAGATATGAC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TAAA 0 1 71109 CASAVA_Build 13 54834549 3I TCTTCAAAAT ---/CTC CTTCACAAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CTC 0 1 71110 CASAVA_Build 13 54835827 1D CATCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 34 2 28 5 A 13 12 71111 CASAVA_Build 13 54837201 1I TAAAAAAAAA -/G GATCATGAGG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 G 1 2 71112 CASAVA_Build 13 54843716 1I ATTGAATGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 654 hom 32 2 22 8 A 9 10 71113 CASAVA_Build 13 54855204 15I CTTAAAATTC ---------------/AACAACAAAGAAACA AACAACTCTA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 AACAACAAAGAAACA 0 1 71114 CASAVA_Build 13 54859885 1D GAAGGAGAAG A/- AAAATAAAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 5 4 71115 CASAVA_Build 13 54865272 1I TTTTTCCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 31 1 23 7 T 10 11 71116 CASAVA_Build 13 54865683 1D TCTACACAAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 8 71117 CASAVA_Build 13 54867994 1D TCTCAATCAG A/- AAATATATTG 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 4 3 71118 CASAVA_Build 13 54868716 2D TAAAAAAAAT AA/-- GTCTAGCTTA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 2 0 71119 CASAVA_Build 13 54870461 1I TACTAATAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 8 9 71120 CASAVA_Build 13 54871906 1D AAAATATCTT C/- CAAAGTGGCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 2 1 71121 CASAVA_Build 13 54874174 1I AGGTCTGAAG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 8 71122 CASAVA_Build 13 54879317 1I TATTTGAAAA -/C CCCTTTTCTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 3 4 71123 CASAVA_Build 13 54886593 1D AAATATGGAG T/- TAAAACTAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 2 1 71124 CASAVA_Build 13 54898341 5I AAACAAACTT -----/TAAAG TAAGAGCAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TAAAG 0 1 71125 CASAVA_Build 13 54906661 1I ACTGAAGAAG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 7 8 71126 CASAVA_Build 13 54912398 1D TTCTTTATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 10 9 71127 CASAVA_Build 13 54913671 4D GTGTCAGGGA CTAT/---- CTGTCATTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 CTAT 1 0 71128 CASAVA_Build 13 54925676 1I TACTACAGTG -/A AAAAAACCCC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 6 7 71129 CASAVA_Build 13 54926887 1I CCGTGTGGTA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 6 7 71130 CASAVA_Build 13 54930960 1D ATAACTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 10 9 71131 CASAVA_Build 13 54935356 4I ATTTTAGAAA ----/TTTC TCTCTCCACC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TTTC 0 1 71132 CASAVA_Build 13 54935605 1I GAGTAGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3017 het 3017 ref 28 14 10 4 T 11 12 71133 CASAVA_Build 13 54941849 2I AAATAAAGTA --/AT ATATATATAT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 AT 5 6 71134 CASAVA_Build 13 54954231 1I AATCTGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 10 11 71135 CASAVA_Build 13 54966311 1I TATCACCAGG -/T TACCCTAATT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 1 2 71136 CASAVA_Build 13 54968661 1D TCAGAAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 663 hom 33 2 19 12 T 11 10 71137 CASAVA_Build 13 54974440 1I CAAATATGCC -/T TTTTTTGTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 6 7 71138 CASAVA_Build 13 54982771 2D TCAAGTAAAC AT/-- GTGTAAATCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AT 1 0 71139 CASAVA_Build 13 54989419 1D AACCTAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 25 10 A 11 10 71140 CASAVA_Build 13 54989618 1I TCAACCCTTG -/C CCCCCTCCCC 3070 hom 75 het 33 0 25 8 C 5 6 71141 CASAVA_Build 13 54990334 1I CAGAAGTCAC -/A ACTTCCTAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 1 2 71142 CASAVA_Build 13 54994896 2D AGTTTCTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 54 0 39 15 A 13 11 71143 CASAVA_Build 13 54999394 2D GTAAATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AT 9 8 71144 CASAVA_Build 13 55016471 1D TTCTAAGTAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 A 9 8 71145 CASAVA_Build 13 55024350 1I GAATATATTA -/T TTTTTCAGCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 5 6 71146 CASAVA_Build 13 55024685 3I TTTAAATTTA ---/ATC ATCTTATAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ATC 1 2 71147 CASAVA_Build 13 55031534 2I TCCTCCCCGC --/AA AAAAAAACAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 7 9 71148 CASAVA_Build 13 55032066 1I TGTAAAAAAA -/C ACATGTTAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 C 0 1 71149 CASAVA_Build 13 55034791 1I AAGGACTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 40 1 35 4 T 11 12 71150 CASAVA_Build 13 55035891 6D TTCCTGTTCT TAGAAA/------ TAGAAATTTG 3070 hom 96 het 35 0 32 4 TAGAAA 2 1 71151 CASAVA_Build 13 55045217 2D GTGTCAACAG CA/-- CACTGATGGA 3070 het 3070 ref 35 16 15 6 CA 2 1 71152 CASAVA_Build 13 55049098 123D CATGGCCTTT GTGCTCTAGCTTATGCACAGAGGTCAAGATCCCTTCCCCAACTCTCCACACTGCTGCAGCCACTGCTGCCTCTGAAAGCCAAAGCAAGCAAACCTTAAATCTGAGAGTCTGGGTATGTAAACA/--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- GTAACCACAT 3070 hom 41 het 14 0 13 7 GTGCTCTAGCTTATGCACAGAGGTCAAGATCCCTTCCCCAACTCTCCACACTGCTGCAGCCACTGCTGCCTCTGAAAGCCAAAGCAAGCAAACCTTAAATCTGAGAGTCTGGGTATGTAAACA 1 0 71153 CASAVA_Build 13 55055969 1D AGGCAGGAGT G/- GGGGGTCGCA 1394 hom 12 het 7 0 4 3 G 6 5 71154 CASAVA_Build 13 55056910 5D TTTAAAACTT ATCTC/----- ATATTTATGA 3070 hom 96 het 33 0 33 3 ATCTC 1 0 71155 CASAVA_Build 13 55057232 3I GTATGAAAAT ---/AAG AAGCACTTGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAG 1 2 71156 CASAVA_Build 13 55057411 4I GGAAGGAAGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 2822 hom 27 het 13 0 9 4 AAGG 3 4 71157 CASAVA_Build 13 55057836 2D TACATCAGGC TT/-- TTTTTTTTGG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 10 8 71158 CASAVA_Build 13 55058027 5D CAAGTGGGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTTTG 3 2 71159 CASAVA_Build 13 55066906 1D AATGTTTATT C/- CAAACACATA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 C 2 1 71160 CASAVA_Build 13 55070657 5D CTCTAGTACT TTAAA/----- TTACTTTGCA 3070 het 3070 ref 44 25 16 8 TTAAA 1 0 71161 CASAVA_Build 13 55076293 1D ATATGAAAAG C/- TTTAATATTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 1 0 71162 CASAVA_Build 13 55086165 1D CATATTGCAT A/- AAGAGACATG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 3 2 71163 CASAVA_Build 13 55093224 1D CATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 29 1 18 10 A 13 12 71164 CASAVA_Build 13 55099185 1I AAAAATGAAA -/T TCCCCCCCCC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 T 1 2 71165 CASAVA_Build 13 55103428 5D TTAATCCATC TTAAG/----- TTAATTTTTT 3070 hom 96 het 33 0 33 1 TTAAG 1 0 71166 CASAVA_Build 13 55104699 2I TCTGCCCACA --/TT TTTTTTTCCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 7 9 71167 CASAVA_Build 13 55105501 1I TCCTATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 13 14 71168 CASAVA_Build 13 55112986 2D TATATTTCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 36 het 14 0 12 3 AC 8 7 71169 CASAVA_Build 13 55124659 1D TTTGTTCATT A/- ACCATGTTAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 2 1 71170 CASAVA_Build 13 55136607 1D ATTCTTGCAT G/- CCTTCCTTGT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 G 1 0 71171 CASAVA_Build 13 55140272 10D ATTAGACAAG AATCCAAAAT/---------- AATCAGATTT 3070 hom 90 het 31 0 31 4 AATCCAAAAT 1 0 71172 CASAVA_Build 13 55148543 1I AAGCAGAGCG -/C AGAGCTCTGG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 0 1 71173 CASAVA_Build 13 55157166 5D ATGTGTTTTC TTATT/----- TTATTAGTAT 3070 hom 108 het 37 0 37 2 TTATT 2 1 71174 CASAVA_Build 13 55160234 1D CTTTTCTTCT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 18 het 10 0 7 4 A 9 8 71175 CASAVA_Build 13 55163142 2D ACATAAACAC TT/-- ATATATTTTA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 2 0 71176 CASAVA_Build 13 55176520 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 886 hom 10 het 5 0 3 2 TA 6 5 71177 CASAVA_Build 13 55180865 1D TGCACATGTG T/- AGGGGTGCCT 3070 het 3070 ref 32 22 8 2 T 1 0 71178 CASAVA_Build 13 55181454 1I CCCTTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 26 1 14 11 A 12 13 71179 CASAVA_Build 13 55182217 1D TGTAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 615 hom 34 3 25 7 A 13 12 71180 CASAVA_Build 13 55183543 1I AAATATATAT -/A TTTTGACTAT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 0 1 71181 CASAVA_Build 13 55184074 2D TTGGTTTATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 43 1 25 17 T 16 14 71182 CASAVA_Build 13 55187063 1I CCACGGGCAA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 71183 CASAVA_Build 13 55189468 1D CTCTAGGTTA T/- TTTTTTATGC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 7 6 71184 CASAVA_Build 13 55190444 1I ATTTATGCAA -/T ATTTTTTTTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 0 1 71185 CASAVA_Build 13 55193892 4D AAATATAAAC TATT/---- CATTATAGAA 3070 het 3070 hom 23 10 10 4 TATT 1 0 71186 CASAVA_Build 13 55193958 4I TGTGTAACTA ----/TAAC TAAAATACAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TAAC 0 1 71187 CASAVA_Build 13 55195795 2D GAAATTCTTT TG/-- TGTTTTTGGC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TG 2 1 71188 CASAVA_Build 13 55198485 2D CATGAGGGAA AT/-- ATATATATAT 1242 het 1242 ref 41 28 3 10 AT 8 7 71189 CASAVA_Build 13 55199936 1I CATAAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 22 1 15 6 T 12 13 71190 CASAVA_Build 13 55204055 1D CTCTGGAGAA C/- CCTGAGTAAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 3 2 71191 CASAVA_Build 13 55204885 1I TCTGCAGTGG -/A GTGGGGGGGG 1499 het 816 hom 21 4 8 9 A 0 1 71192 CASAVA_Build 13 55205183 1I TTCTAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 11 12 71193 CASAVA_Build 13 55214384 2I ATGAAATAAA --/AC ACAGCTTTAT 3070 hom 74 het 29 0 24 5 AC 1 2 71194 CASAVA_Build 13 55215671 14D ATACATAATA ATTATATATATTAT/-------------- ATTATATATT 3070 hom 24 het 8 0 9 1 ATTATATATATTAT 1 0 71195 CASAVA_Build 13 55215859 5I ATTTGTAATG -----/TTATT TTATCTTCTA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TTATT 0 1 71196 CASAVA_Build 13 55219826 4D AAGTGAACAC AGAG/---- AGAGATAAAT 3070 hom 82 het 33 0 27 7 AG 4 2 71197 CASAVA_Build 13 55222432 1D TTTGCTAATG C/- TTCCCCCCCT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 C 1 0 71198 CASAVA_Build 13 55224320 4I ATTTTTCCAC ----/TTCT TTCTATTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 TTCT 1 2 71199 CASAVA_Build 13 55227307 1I AACACTGAGA -/C TAGACCCTCC 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 C 0 1 71200 CASAVA_Build 13 55244962 1D TACTGAGCAT A/- ACTGAACATC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 2 1 71201 CASAVA_Build 13 55245310 1I TATTTGAAAT -/G AGGGTGATCG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 G 0 1 71202 CASAVA_Build 13 55272047 1D TTAAAAATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 10 9 71203 CASAVA_Build 13 55276934 5D AATAATTGTA TTTAC/----- TTTACTGTCA 3070 het 3070 hom 30 11 19 1 TTTAC 2 1 71204 CASAVA_Build 13 55279810 1D GGTGATTAAC A/- TTCAGCTCCT 3070 hom 81 het 32 0 27 6 A 1 0 71205 CASAVA_Build 13 55280836 2D CTGTCATCCC CA/-- AATAGCTGCG 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 CA 1 0 71206 CASAVA_Build 13 55288220 1D GCCCGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 2584 het 383 hom 15 2 8 5 T 15 14 71207 CASAVA_Build 13 55289700 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 44 3 17 24 A 12 10 71208 CASAVA_Build 13 55290758 2I ACAAGTTTTA --/CG CAGAGTGTTA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 CG 0 1 71209 CASAVA_Build 13 55296202 1I AAAAAAAAAA -/G AAACCATATT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 G 0 1 71210 CASAVA_Build 13 55303239 25D AAAAATTATA TATATATGTATATACACATAATGTT/------------------------- TATATATATA 1816 het 1816 ref 19 13 5 4 TATATATGTATATACACATAATGTT 1 0 71211 CASAVA_Build 13 55305393 1I AGAAAATATA -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 6 7 71212 CASAVA_Build 13 55308053 1D GTGAATGAGT C/- TCATGAGATC 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 C 1 0 71213 CASAVA_Build 13 55318592 1I TTGTAAAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 345 hom 34 1 30 3 T 9 10 71214 CASAVA_Build 13 55326845 4D AAGAAAGAAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 1709 het 77 hom 16 1 7 11 AGAA 4 3 71215 CASAVA_Build 13 55326860 12D GAAAGAAAGA AAGGGAGGAAAG/------------ AAGAAAGAAA 865 het 865 ref 19 6 7 8 AAGGGAGGAAAG 1 0 71216 CASAVA_Build 13 55330088 1I CAATGAACAT -/G GGAGTGTGGA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 G 2 3 71217 CASAVA_Build 13 55354174 5D ACAAATAAAT GTTAA/----- GTTATGTTTG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 GTTAA 1 0 71218 CASAVA_Build 13 55356653 1D AAATTTTCTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 T 9 8 71219 CASAVA_Build 13 55357798 1I GTTTTATGAA -/T TGAGCCTCTT 3070 hom 86 het 34 0 28 6 T 1 2 71220 CASAVA_Build 13 55365195 1D CAAGAAAAAG A/- AAAAAATGCA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 7 6 71221 CASAVA_Build 13 55367251 2D ATCTGCCAAT GG/-- GAACTCTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 G 3 1 71222 CASAVA_Build 13 55367725 4D AAAAAATGAA AAAC/---- AAACAATTCT 3070 het 3070 ref 28 16 9 6 AAAC 2 1 71223 CASAVA_Build 13 55370511 1I AAAATATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 10 11 71224 CASAVA_Build 13 55371555 1I GTCACTGGGA -/T TTTTTTTGCG 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 7 8 71225 CASAVA_Build 13 55373307 1I TCAGCAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 9 10 71226 CASAVA_Build 13 55375805 1D TGTTTACCTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 53 17 26 10 T 9 8 71227 CASAVA_Build 13 55377003 1I CAGAAATTTG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 6 7 71228 CASAVA_Build 13 55386183 1D TCAGTAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 33 hom 29 1 12 18 A 10 9 71229 CASAVA_Build 13 55391142 1D GGTAATTGCA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 T 8 7 71230 CASAVA_Build 13 55392356 1D AATCGGATAA T/- TTATAAGAAA 3070 het 3070 ref 26 12 13 1 T 3 2 71231 CASAVA_Build 13 55403472 1I AGTCATTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 29 3 21 5 A 15 16 71232 CASAVA_Build 13 55404434 3D TACTAAGATT TTC/--- TTCTCCAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 10 TTC 2 1 71233 CASAVA_Build 13 55406797 2D ACTGTAGTGA AC/-- AAGGCATTTT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 AC 1 0 71234 CASAVA_Build 13 55418609 1I AAAATTAGGA -/T TTTTTTGCTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 6 7 71235 CASAVA_Build 13 55425757 1D CTCGGAGTGT G/- GGGGGATAAG 2763 het 2763 ref 15 8 6 1 G 6 5 71236 CASAVA_Build 13 55430103 1D GATGGATTCA T/- CTCCTTGTTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 1 0 71237 CASAVA_Build 13 55430514 4D GAGGTTGCTT TTTG/---- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 25 5 TTTG 2 1 71238 CASAVA_Build 13 55434473 3I TGAAGCAAAC ---/AAA GAAAACCAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 3 71239 CASAVA_Build 13 55435803 1D ATCAACCCGG C/- CCCCCCACCA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 C 7 6 71240 CASAVA_Build 13 55438038 1D AGAAAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2578 hom 22 9 9 4 A 15 14 71241 CASAVA_Build 13 55439720 1I AAACTCTTAG -/A AAACAGGCTG 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 A 3 4 71242 CASAVA_Build 13 55446441 1I CTTATTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 456 hom 23 1 16 6 A 13 14 71243 CASAVA_Build 13 55449694 1I GTGTCCCCCC -/T AGTCCAGACG 3070 hom 71 het 28 0 25 3 T 0 1 71244 CASAVA_Build 13 55456374 4I TAAAAATAAG ----/AATA AATAAATAAA 1822 het 1721 hom 11 5 4 2 AATA 3 4 71245 CASAVA_Build 13 55457994 4I AGTATTCCTG ----/AATA AATATACAGA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 AATA 1 2 71246 CASAVA_Build 13 55467958 4I TATTGGTGGC ----/TCTA TCTATAACAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TCTA 1 2 71247 CASAVA_Build 13 55470928 1I TAATTTATTG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 54 24 27 3 A 8 9 71248 CASAVA_Build 13 55472398 1D CCTTGTCAAC A/- AAACATTGCC 3070 het 3070 hom 54 20 29 5 A 4 3 71249 CASAVA_Build 13 55478444 1D GAGAAGGAGG A/- AAAAATTATG 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 A 6 5 71250 CASAVA_Build 13 55485537 1I TACTAGTTTT -/G GAAAAAGAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 1 2 71251 CASAVA_Build 13 55492259 3I3M6I3M2I CATGAGGACC ---TGC------TTA--/CCATGCTGGGTTTTACT GTGCTGGGTT 3070 het 3070 ref 44 25 17 5 N/A 0 0 71252 CASAVA_Build 13 55492342 2D TTCTTCCCAC AT/-- GTGTAGGGTA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 AT 1 0 71253 CASAVA_Build 13 55492439 1D TCAATGCATC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 42 22 19 2 T 7 6 71254 CASAVA_Build 13 55498950 1D GATACAATGC T/- TTTTTTTTTT 2832 het 569 hom 24 3 10 11 T 15 14 71255 CASAVA_Build 13 55505427 1D AATTCCATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 7 T 9 8 71256 CASAVA_Build 13 55506726 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1775 het 1775 ref 40 27 4 9 T 15 14 71257 CASAVA_Build 13 55520810 1D TTTTGAAAGG C/- CTTTACAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 2 1 71258 CASAVA_Build 13 55524715 4D AACTTGACTC TGTT/---- TGAGACTTAC 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 TGTT 1 0 71259 CASAVA_Build 13 55527111 3D TGTGTGTGTA TAT/--- TATTATGTGC 3070 het 3070 ref 46 26 17 5 TAT 3 2 71260 CASAVA_Build 13 55535803 1I CACTTTGAGA -/G GCTAAGGCAG 3070 hom 69 het 25 0 22 3 G 1 2 71261 CASAVA_Build 13 55537267 1D TTGGAATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 A 12 11 71262 CASAVA_Build 13 55543693 7D CTCCTAAGAG CTAAGTA/------- CTGCTTTGGC 3070 het 3070 ref 49 28 18 7 CTAAGTA 1 0 71263 CASAVA_Build 13 55544256 1D AAAAAAATGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 36 0 28 9 T 10 9 71264 CASAVA_Build 13 55566779 1I ATTTTTATGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 T 8 9 71265 CASAVA_Build 13 55568442 2I ATTAGGACTC --/TT TTAATGATTA 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 T 2 4 71266 CASAVA_Build 13 55580300 1I TCTTCTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 18 1 17 0 T 11 12 71267 CASAVA_Build 13 55595947 1I ACTATTATTA -/T GTAGGGCAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 71268 CASAVA_Build 13 55604728 1D ATACTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1883 hom 32 7 10 15 T 17 16 71269 CASAVA_Build 13 55617660 1I TTTTATTCAC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 9 71270 CASAVA_Build 13 55632193 1D ATAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 A 12 11 71271 CASAVA_Build 13 55639917 1I TAGATAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 10 11 71272 CASAVA_Build 13 55646039 1D CAAAAATATG T/- TAACATTGGA 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 2 1 71273 CASAVA_Build 13 55656862 1I AATTCAGGAG -/T TTTTTTTTTT 2257 het 2257 ref 21 9 7 5 T 13 14 71274 CASAVA_Build 13 55663030 1I AAATTAACTG -/A AAAAAAATCC 3070 het 2889 hom 21 6 12 3 A 7 8 71275 CASAVA_Build 13 55664270 1I ATGTTTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 45 2 36 7 T 11 12 71276 CASAVA_Build 13 55667627 1D GTACTTTTAA T/- TTTTTATTGA 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 T 6 5 71277 CASAVA_Build 13 55670962 1I AGAATTTAGC -/A GACATGATTT 3070 het 3070 hom 52 17 30 5 A 0 1 71278 CASAVA_Build 13 55685571 1D AAACATCAGA T/- TTTTTTTTTT 1890 het 1890 ref 35 21 6 8 T 16 15 71279 CASAVA_Build 13 55693198 1D AATTTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 T 13 12 71280 CASAVA_Build 13 55698753 1D AAATATCCAC A/- AAAACCCTCA 3070 het 3070 hom 52 21 30 2 A 5 4 71281 CASAVA_Build 13 55706878 1I CAAACACTGC -/T TATGTGTCAT 3070 het 3070 ref 39 21 18 0 T 1 2 71282 CASAVA_Build 13 55723288 1D ACTAGAAGAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 9 8 71283 CASAVA_Build 13 55723490 1I TATTAATTAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 8 9 71284 CASAVA_Build 13 55724249 1I CAAACACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 10 11 71285 CASAVA_Build 13 55728940 1I GAAGCTGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 A 10 11 71286 CASAVA_Build 13 55731016 1I TCATCTTTTG -/C CTTCTGAATC 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 C 1 2 71287 CASAVA_Build 13 55731750 1I TATGCTGCTA -/G AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 G 0 1 71288 CASAVA_Build 13 55732977 3D AAGGAAGAAT GAG/--- GAGGACTGTC 3070 het 3070 hom 49 25 21 5 GAG 2 1 71289 CASAVA_Build 13 55733353 1I CATAAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 A 11 12 71290 CASAVA_Build 13 55736237 15I TATTTTCAAG ---------------/CATCTGTAGCCACTC CACTCCTCCT 3070 het 3070 hom 45 18 21 7 CATCTGTAGCCACTC 0 1 71291 CASAVA_Build 13 55737075 1I TTACCTTCCA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 7 8 71292 CASAVA_Build 13 55738193 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAATAG 2917 het 2522 hom 18 7 8 3 A 8 7 71293 CASAVA_Build 13 55738826 1I TTAGTTGCCA -/T TAGGGAGTTG 3070 het 3070 ref 49 27 21 1 T 1 2 71294 CASAVA_Build 13 55739053 7D ATTCTGCTCC TTGGTTT/------- TTGGTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 18 12 5 TTGGTTT 2 1 71295 CASAVA_Build 13 55813203 1D TCATGGTACT G/- TTAGAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 G 1 0 71296 CASAVA_Build 13 55816516 1I CAAACATATG -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 A 6 7 71297 CASAVA_Build 13 55828110 1D TAAGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2324 het 2324 ref 40 27 6 7 T 13 12 71298 CASAVA_Build 13 55836092 1I ATCAACAAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 9 10 71299 CASAVA_Build 13 55839386 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 332 hom 26 1 23 2 A 12 11 71300 CASAVA_Build 13 55839596 1I AGAAATCGAT -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 A 6 7 71301 CASAVA_Build 13 55848518 1D TGCCAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 2454 het 2454 ref 30 13 7 11 A 15 14 71302 CASAVA_Build 13 55852416 1I TTGCAGTGAG -/C CGAGATCATG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 1 2 71303 CASAVA_Build 13 55862459 1D ATTGTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 12 11 71304 CASAVA_Build 13 55864090 1I AGTAATGGAG -/A ACATTATCAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 71305 CASAVA_Build 13 55871984 2D AAAAATAGAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 GA 8 7 71306 CASAVA_Build 13 55885964 3D GGAAATAATG CTC/--- CTGCTTATGT 3070 het 3070 ref 53 25 26 4 CTC 1 0 71307 CASAVA_Build 13 55891461 1I GGGGTTTCAC -/T TGTGTTGGCC 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 T 1 2 71308 CASAVA_Build 13 55924618 2I ACATTATTCC --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 8 10 71309 CASAVA_Build 13 55933005 3D CAAAAAAAAA TCT/--- ATCTATCTAT 394 het 394 ref 34 21 4 9 TCT 1 0 71310 CASAVA_Build 13 55933083 2I AGAAAGAAAA --/AG AGAGGGAGAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AG 2 3 71311 CASAVA_Build 13 55933461 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- GAGGCTTTTT 3070 het 1065 hom 27 10 13 5 AAAAG 1 0 71312 CASAVA_Build 13 55934168 1I GGGGCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 10 11 71313 CASAVA_Build 13 55934889 1D AGGCATAAGA G/- GGCTGGCTCC 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 G 3 2 71314 CASAVA_Build 13 55934982 1D TATTTTGTTA T/- TGGAGAGCCC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 2 1 71315 CASAVA_Build 13 55935074 2I TGGAAAAGTA --/CT GAGTCAAGGC 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 CT 0 1 71316 CASAVA_Build 13 55940012 2D AAATGTAAGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 37 hom 40 2 20 19 T 11 9 71317 CASAVA_Build 13 55943288 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2915 het 1254 hom 18 6 8 4 A 16 14 71318 CASAVA_Build 13 55945927 1D ATAACTTCTA T/- TTTTTTTTTC 1357 het 1357 ref 45 34 3 8 T 10 9 71319 CASAVA_Build 13 55952947 1D TATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1387 hom 29 6 14 9 T 15 14 71320 CASAVA_Build 13 55958536 1D CAAGGGGTAA T/- TTTCAGCTGA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 T 4 3 71321 CASAVA_Build 13 55963288 4D ATAAACAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 AAAC 4 3 71322 CASAVA_Build 13 55965268 1I GAACACCTCA -/G CCTGGGCCTC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 0 1 71323 CASAVA_Build 13 55968890 3D TTATCATTAT GAA/--- GTATTGTGCA 3070 het 3070 ref 39 25 13 1 GAA 1 0 71324 CASAVA_Build 13 55972514 2D CATTTTAGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 T 14 12 71325 CASAVA_Build 13 55973439 4I GGAGCGTCCC ----/TTTG TTTGTTGTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 TTTG 1 2 71326 CASAVA_Build 13 55976176 1I TGCTGCTTAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 7 8 71327 CASAVA_Build 13 55981490 1D ACAGGGCTGG A/- AAAATCTCCA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 5 4 71328 CASAVA_Build 13 55988092 2I TTTGTGCTTC --/CT CTCTCTGCCA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 CT 3 4 71329 CASAVA_Build 13 55988267 6D CCAGAAATAC CTCTAG/------ CTCTAGCAAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 CTCTAG 2 1 71330 CASAVA_Build 13 55988440 1I CACACCATAG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 0 1 71331 CASAVA_Build 13 55990453 3I7M1I AGGACTTGCA ---TGTAAAC-/TATTTTATTCT GGAGAATAAA 3070 het 3070 ref 36 22 13 3 N/A 0 0 71332 CASAVA_Build 13 55990926 1D AAATGGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 12 11 71333 CASAVA_Build 13 55993229 1D TCTAAACAGC A/- AAGCATTCAG 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 A 3 2 71334 CASAVA_Build 13 56001044 1I GTTACCAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 11 12 71335 CASAVA_Build 13 56002542 6D TGCAGATCAC AAGTAA/------ AATATTTGAT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 AAGTAA 1 0 71336 CASAVA_Build 13 56002873 1I TTCAATTCAG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 8 9 71337 CASAVA_Build 13 56004441 7I TACTTTATAA -------/TCTGCTG TCTGTTGTTA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TCTGCTG 0 1 71338 CASAVA_Build 13 56005237 1D ATTATAGGAT A/- AAAATACTAT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 5 4 71339 CASAVA_Build 13 56005587 6I TATTGTAATA ------/ACTTAT ACTTATAACA 3070 hom 63 het 32 0 22 10 ACTTAT 1 2 71340 CASAVA_Build 13 56009138 1D CAAAACACAC T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 8 7 71341 CASAVA_Build 13 56009307 1D CATTGCTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 15 9 T 10 9 71342 CASAVA_Build 13 56014189 2I GAAATACTTA --/AT ATAAGTACAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AT 1 2 71343 CASAVA_Build 13 56014785 6D CTCAGAAACA TTAGTT/------ TTAAAGAGGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTAGTT 1 0 71344 CASAVA_Build 13 56022704 1I ACTAGAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 10 71345 CASAVA_Build 13 56036787 1D CACTCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 11 10 71346 CASAVA_Build 13 56078095 1D TCAAATATTC T/- TTTAAGACTA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 T 4 3 71347 CASAVA_Build 13 56100279 1D TACCAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 660 hom 28 3 11 14 A 15 14 71348 CASAVA_Build 13 56137409 24D GAGTTGACAG TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 29 0 19 12 T 40 16 71349 CASAVA_Build 13 56139157 1I TCTTCAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 18 15 5 T 13 14 71350 CASAVA_Build 13 56140937 2D AGTCAGAACA AG/-- AGAGGAATAC 3070 hom 87 het 33 0 30 5 AG 3 2 71351 CASAVA_Build 13 56152980 2D TTTTTGTAAC TT/-- ATTTTTAATT 3070 hom 27 het 16 0 10 8 T 2 0 71352 CASAVA_Build 13 56159850 2I TCCTGGTGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 28 0 18 10 A 12 14 71353 CASAVA_Build 13 56160539 2I CACAAACAAT --/TC TCACTCTTTC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TC 1 2 71354 CASAVA_Build 13 56164910 1D TATATTTTTT G/- TTTTGTAACC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 1 0 71355 CASAVA_Build 13 56173012 1D ATCTTTTGGC T/- TTTGGTTTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 T 4 3 71356 CASAVA_Build 13 56175420 2I ATAGGACATA --/AT ATGAGAGATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AT 1 2 71357 CASAVA_Build 13 56187430 4D ACACACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 AC 9 7 71358 CASAVA_Build 13 56207325 4D ATTTATACAT AGAG/---- ATAGTAATAA 3070 hom 96 het 36 0 31 7 AG 2 0 71359 CASAVA_Build 13 56226015 1D ACGGGATGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 9 8 71360 CASAVA_Build 13 56229360 1D TGAGAGAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 35 het 28 1 24 3 A 9 8 71361 CASAVA_Build 13 56255194 3D CAAAGTTAGC AGG/--- AGAAGGAAAT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AGG 1 0 71362 CASAVA_Build 13 56263551 4D GATCTCTAGA ACAG/---- TTTTTATTCT 3070 het 3070 ref 28 19 8 2 ACAG 1 0 71363 CASAVA_Build 13 56265465 2D CTAAAAGGTT TG/-- TGTGTGTGTG 1353 het 1353 ref 41 31 3 7 TG 10 9 71364 CASAVA_Build 13 56274882 1I CTGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 10 71365 CASAVA_Build 13 56291826 30D GTATTCTGTG ATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------ ATATATATAT 3070 hom 69 het 23 0 23 5 AT 23 8 71366 CASAVA_Build 13 56302205 1D ATTTTCTCCA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 879 hom 18 5 10 3 C 9 8 71367 CASAVA_Build 13 56311205 3I ATCTTTTAAT ---/ATC ATATGGTTGC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATC 0 1 71368 CASAVA_Build 13 56338652 1I TTCTCAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 21 1 18 2 A 10 11 71369 CASAVA_Build 13 56344298 1D AAAAGAAGAA T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 2 1 71370 CASAVA_Build 13 56346431 12D TTCCTTCAGT ATACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 10 25 9 ATACACACACAC 1 0 71371 CASAVA_Build 13 56360879 2I AAATAAACAC --/TT TTTTCAGTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 4 6 71372 CASAVA_Build 13 56371291 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAG 1440 het 940 hom 16 5 7 4 A 9 10 71373 CASAVA_Build 13 56388987 12D GTTGGTTGGA GAACCTTCACAG/------------ GAAAGCAAGT 3070 het 3070 hom 32 12 17 5 GAACCTTCACAG 1 0 71374 CASAVA_Build 13 56389306 18D GAATGAAAGT AGCACCTCCTTTACTGGA/------------------ AATAAGAGCA 3070 het 3070 ref 38 23 14 5 AGCACCTCCTTTACTGGA 1 0 71375 CASAVA_Build 13 56392371 1D TTCTGTCCCT G/- TGAAGGGAAG 3070 het 3070 hom 54 19 24 13 G 1 0 71376 CASAVA_Build 13 56392886 1D GGGGAAGTGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 9 8 71377 CASAVA_Build 13 56395356 1D AAACAACCAG A/- ACTCACTCAC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 2 1 71378 CASAVA_Build 13 56396862 1D ACAAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 1396 het 1396 ref 33 20 6 7 A 15 14 71379 CASAVA_Build 13 56458706 3I TGCTAAAAAT ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 38 18 15 5 AAC 3 4 71380 CASAVA_Build 13 56461369 1I AATATTTAGC -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 6 7 71381 CASAVA_Build 13 56462208 3D TCTACAAAAT CTA/--- CTAAAATATT 3070 het 2795 hom 15 7 8 1 CTA 2 1 71382 CASAVA_Build 13 56470572 1I TTATAACTTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 8 9 71383 CASAVA_Build 13 56470916 1D TTAAAGTGAA T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 T 7 6 71384 CASAVA_Build 13 56475383 1D TTTTTCCCCC T/- GATCAGCTCA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 1 0 71385 CASAVA_Build 13 56478964 2D GTTGAGACTC TT/-- TATCATGAAC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 3 1 71386 CASAVA_Build 13 56480268 2D CAGTGCATGA AT/-- ATATATATAA 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 AT 5 4 71387 CASAVA_Build 13 56486326 3D TTTTTCTGTC CTA/--- CTGGATATTC 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 CTA 1 0 71388 CASAVA_Build 13 56486637 4D GTCTTTGTGT AATC/---- AATCCCCTCT 3070 het 3070 ref 48 27 19 6 AATC 2 1 71389 CASAVA_Build 13 56489951 1D TCTTTCGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 10 9 71390 CASAVA_Build 13 56490047 1D TCATGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 12 11 71391 CASAVA_Build 13 56490932 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2839 het 2839 ref 29 11 7 13 T 15 14 71392 CASAVA_Build 13 56493034 8D TACCCTAACC CCAGTCTG/-------- CCAGTCTGCA 3070 het 3070 ref 50 25 21 6 CCAGTCTG 2 1 71393 CASAVA_Build 13 56493624 1I GAAATGTGAG -/T CCCAAGCCAG 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 T 0 1 71394 CASAVA_Build 13 56495429 1I TCACACACAC -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 A 6 7 71395 CASAVA_Build 13 56500132 2D GTTTAAGCTT TA/-- AGATCATCAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 TA 1 0 71396 CASAVA_Build 13 56500557 1D TATATTTTAT A/- TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 A 1 0 71397 CASAVA_Build 13 56501255 1I TCCTTTTTTT -/A ATTCTTATTG 3070 het 3070 ref 52 27 24 1 A 1 2 71398 CASAVA_Build 13 56502268 1I TGTGTAAACG -/T TAAGTATGTA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 1 2 71399 CASAVA_Build 13 56505075 2D AAATGGAGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1762 hom 28 4 19 6 AT 6 5 71400 CASAVA_Build 13 56506590 2I56M1D AAATTTGCCT --GTCTCTGTCAATTGCCCACAGTGAAAAGTTATTGAATATTTTAAAATCAATTGAAAT/GCGTCTCTGTCAATTGCCCACAGTGAAAAGTTATTGAATATTTTAAAATCAATTGAAA- TTTAATTTCA 3070 het 3070 ref 40 34 25 5 N/A 0 0 71401 CASAVA_Build 13 56507477 1I CTGAATTATT -/A TGTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 0 1 71402 CASAVA_Build 13 56523287 1I AATCCAGGAG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 8 9 71403 CASAVA_Build 13 56534626 4I TGTTTGAGGC ----/TTAA TTGAGTGCTT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 TTAA 0 1 71404 CASAVA_Build 13 56537613 1D TTTTATGTCA T/- TCAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 T 2 1 71405 CASAVA_Build 13 56537733 3D TTTGCAAAAT ATG/--- ATGATATTTA 3070 het 3070 hom 27 10 16 3 ATG 2 1 71406 CASAVA_Build 13 56540011 1D AAAAATTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 11 10 71407 CASAVA_Build 13 56540109 4D AGTTAAAAAT AGAC/---- AGAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 AGAC 1 0 71408 CASAVA_Build 13 56546777 1D CTCTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2540 het 2307 hom 24 10 8 6 A 18 17 71409 CASAVA_Build 13 56550563 12D TCTCTCTCTC TCTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2022 het 351 hom 14 4 8 2 TCTTTTTTTTTT 1 0 71410 CASAVA_Build 13 56551126 1I CACAAATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 A 10 11 71411 CASAVA_Build 13 56551691 2I TACTTGACAA --/AG AGATTAATAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 AG 1 2 71412 CASAVA_Build 13 56557755 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1376 hom 12 4 8 0 A 13 12 71413 CASAVA_Build 13 56558045 4D CCTTTTAATA TATT/---- TAGTTTACAT 3070 het 3070 ref 39 21 17 2 TATT 1 0 71414 CASAVA_Build 13 56571841 2D CAAGTAACAC AT/-- GTGTTAGATC 3070 het 3070 ref 30 19 10 3 AT 1 0 71415 CASAVA_Build 13 56571899 1I TTGTTTTTCT -/A AAAAAAAACC 2446 het 2446 ref 32 21 6 5 A 8 9 71416 CASAVA_Build 13 56574317 1D CTCAGAGTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 A 10 9 71417 CASAVA_Build 13 56575009 1D TCACAGATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 7 12 3 A 13 12 71418 CASAVA_Build 13 56584212 1D TATTTGTCCA T/- TTTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 5 4 71419 CASAVA_Build 13 56588050 1D ATGGGATTTC T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 T 8 7 71420 CASAVA_Build 13 56590843 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 26 2 19 5 A 13 14 71421 CASAVA_Build 13 56593463 1D ATCTATAGAT G/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 G 1 0 71422 CASAVA_Build 13 56597640 2I TTACAATATA --/AT GTTAGTATAT 3070 het 958 hom 18 2 16 0 AT 0 1 71423 CASAVA_Build 13 56669120 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 12 11 71424 CASAVA_Build 13 56693521 4I GGAGTTCGAG ----/ACCA ACCAGCCTGG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 ACCA 1 2 71425 CASAVA_Build 13 56694267 1D GGAAGGACAT A/- AATAAAAGCT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 3 2 71426 CASAVA_Build 13 56711869 22D CCTATGTATT TTTTAAATTTTAAATTCGAGCC/---------------------- TATATTTTTA 3070 het 3070 ref 26 13 11 6 TTTTAAATTTTAAATTCGAGCC 1 0 71427 CASAVA_Build 13 56713055 1I TCTCCTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 11 12 71428 CASAVA_Build 13 56727256 1D AATAATTAAC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 8 7 71429 CASAVA_Build 13 56733398 1I TATTTGGTCC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 T 6 7 71430 CASAVA_Build 13 56743874 1I AATCATCATT -/A CTCAGTAAAC 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 A 0 1 71431 CASAVA_Build 13 56744277 1I AAAGCAAAAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 7 8 71432 CASAVA_Build 13 56764840 1I AAGATATCAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 A 8 9 71433 CASAVA_Build 13 56784266 4D ACACACACAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 39 11 17 14 AT 7 5 71434 CASAVA_Build 13 56788659 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAAAAA 921 het 921 ref 17 12 2 3 A 10 11 71435 CASAVA_Build 13 56790585 4I TTTCAGAAAA ----/AGAG AGGAGACATA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 AG 1 3 71436 CASAVA_Build 13 56790750 1D AATAGATATT A/- AAAAATAGTA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 6 5 71437 CASAVA_Build 13 56791603 2D AAAATTGCTA AG/-- AGAGTAAATT 3070 het 3070 ref 32 17 12 5 AG 3 2 71438 CASAVA_Build 13 56792288 12I CAAAAGCTAG ------------/TCTAGTAGCTCA TCCAATAATT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TCTAGTAGCTCA 0 1 71439 CASAVA_Build 13 56799759 5D ATACTAAACA ATTGT/----- ATTGTATTGC 3070 het 3070 hom 48 22 24 3 ATTGT 2 1 71440 CASAVA_Build 13 56809586 1D CCATGTCTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 10 9 71441 CASAVA_Build 13 56816139 1I CACACCAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 9 10 71442 CASAVA_Build 13 56827787 1I GTACATATTC -/T TTTTTTTTCT 2430 het 2430 ref 21 12 5 4 T 8 9 71443 CASAVA_Build 13 56836172 2D GTCAATTTTT AA/-- AAAGTCATTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 A 5 3 71444 CASAVA_Build 13 56839072 5D CTTCAGAATG ATAAA/----- ATTAAATGGC 3070 het 3070 hom 29 14 14 3 ATAAA 1 0 71445 CASAVA_Build 13 56840328 3D AGGTTACAAC AAG/--- AAGAATTGTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 5 AAG 2 1 71446 CASAVA_Build 13 56848622 2D GCTATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 TG 7 6 71447 CASAVA_Build 13 56868159 2I CTTTTGCTTA --/AC ACAGTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 AC 1 2 71448 CASAVA_Build 13 56882966 2D GACAGCGATT GA/-- GGTGGAAATT 3070 het 3070 ref 46 28 17 2 GA 1 0 71449 CASAVA_Build 13 56886338 3D ATTGGATCAT ATC/--- ATGTTAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 7 ATC 1 0 71450 CASAVA_Build 13 56886887 2I TATCCCATAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 AT 6 7 71451 CASAVA_Build 13 56887301 5D CAATTTAATT AGAAG/----- AGAAGAACTC 3070 het 3070 ref 49 22 25 5 AGAAG 2 1 71452 CASAVA_Build 13 56892575 4D TTCACTTATT TGAG/---- TAATTATGTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 TGAG 1 0 71453 CASAVA_Build 13 56897540 5I TCATGAAAGA -----/CATAC CATATCTTAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CATAC 0 1 71454 CASAVA_Build 13 56916267 1I CTACCTTTAG -/A AATTTTTTAA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 2 3 71455 CASAVA_Build 13 56953128 1I GGTGAAGAGA -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 6 7 71456 CASAVA_Build 13 56958344 1I7M2I AAGAAAAAAA -AAATAAA--/TAAATAAAAT TAAATAAAAC 1743 hom 10 het 4 0 4 0 N/A 0 0 71457 CASAVA_Build 13 56960255 1D TTCTTAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 49 2 32 15 T 13 12 71458 CASAVA_Build 13 56961913 4D TTATAAGCAA TCTT/---- TCTTTTACTT 2715 het 2715 ref 30 17 8 5 TCTT 2 1 71459 CASAVA_Build 13 56968804 4D TTAAATAGAG AGAA/---- AGTAATTTCT 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 AGAA 1 0 71460 CASAVA_Build 13 56978671 23D ATTCACTTAT CAATTTCAGAATTTCAGTTTGCC/----------------------- CAATTTCAGA 3070 hom 117 het 44 0 39 10 CAATTTCAGAATTTCAGTTTGCC 1 0 71461 CASAVA_Build 13 56985388 1D AAAGGAATAT A/- ATTGCTCCTT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 2 1 71462 CASAVA_Build 13 56998170 2I TAAGCACTAA --/AC ACATGGGTGA 3070 hom 108 het 46 0 35 11 AC 1 2 71463 CASAVA_Build 13 57005229 2D CCAGTCCTTT CA/-- GACTGGTCTC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 CA 1 0 71464 CASAVA_Build 13 57009825 3I AAGTATTTGC ---/TTA TTATACCTTA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TTA 1 2 71465 CASAVA_Build 13 57018177 4I CTCCTCTTTC ----/TTGA TTGTTTTTCT 3070 hom 120 het 42 0 38 4 TTGA 0 1 71466 CASAVA_Build 13 57023909 4I AATTAAAAAC ----/AATT AACCTGGCAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AATT 0 1 71467 CASAVA_Build 13 57047101 4I GATTATAGTC ----/AGTT AGTTTCATTT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 AGTT 1 2 71468 CASAVA_Build 13 57050143 1D TTGTTGGTAA T/- TTTTTTTATT 2784 het 2784 ref 26 16 6 4 T 8 7 71469 CASAVA_Build 13 57064284 3D GATCCTGTTC TAT/--- TATTCTATCT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 TAT 2 1 71470 CASAVA_Build 13 57101028 2D TGTGGTGGTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 GT 8 7 71471 CASAVA_Build 13 57103923 1D GAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAT 3047 het 358 hom 32 1 14 18 A 10 9 71472 CASAVA_Build 13 57116662 1I TATTTCTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 9 10 71473 CASAVA_Build 13 57127347 1I AAGGTGACAG -/C TTGAAAGAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 0 1 71474 CASAVA_Build 13 57128004 1I CAGTAATTGT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 7 8 71475 CASAVA_Build 13 57128215 1D TCTTTGTTTG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 A 8 7 71476 CASAVA_Build 13 57134710 4D ACCTACTTCC ACAA/---- ACAGAGAGCT 3070 het 3070 ref 42 21 19 3 ACAA 1 0 71477 CASAVA_Build 13 57139905 2D CCTGTTCTAT TA/-- TATATATACC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TA 5 4 71478 CASAVA_Build 13 57151496 1D GACTGAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 32 0 22 10 A 12 11 71479 CASAVA_Build 13 57152275 2I TTATATCTAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AT 7 8 71480 CASAVA_Build 13 57158226 1I CTCATCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 30 1 21 8 A 10 11 71481 CASAVA_Build 13 57173675 1I AGACACCCAT -/G ATTTTGCTTT 3070 hom 65 het 24 0 22 2 G 0 1 71482 CASAVA_Build 13 57195403 1I ATTTCTTCCT -/A AAAAATTTCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 5 6 71483 CASAVA_Build 13 57197436 1I GTGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 274 hom 29 1 19 9 A 11 12 71484 CASAVA_Build 13 57204123 3D CTCTAAAAAA TAT/--- TATGGCACAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAT 2 1 71485 CASAVA_Build 13 57208380 1I GTGGAACGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 584 hom 49 3 32 14 A 13 14 71486 CASAVA_Build 13 57210219 1D GAATTAAAAG A/- AAAAAATATT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 6 71487 CASAVA_Build 13 57217924 1D TGCTCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 36 0 28 8 T 11 10 71488 CASAVA_Build 13 57223754 1I GGCAACCAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 8 9 71489 CASAVA_Build 13 57229127 3I AATTAACATT ---/CTC TGTCTTTTGC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 CTC 0 1 71490 CASAVA_Build 13 57233815 1D ATGCAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 A 11 10 71491 CASAVA_Build 13 57239465 1I GTAAAAAAAA -/G AAACAAAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 71492 CASAVA_Build 13 57243561 1I ATTGATAACT -/A TAACCTGTAT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 0 1 71493 CASAVA_Build 13 57249263 5D TGTCATTGTC TTGTT/----- TTGTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TTGTT 2 1 71494 CASAVA_Build 13 57252284 1D ATTTTGCTCT A/- AAAAACATTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 6 5 71495 CASAVA_Build 13 57257447 1I CTTCTTTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 64 hom 36 1 31 4 T 9 10 71496 CASAVA_Build 13 57260627 2D ATGTGTAAAT AC/-- ACACATATAT 3070 hom 75 het 27 0 26 4 AC 3 2 71497 CASAVA_Build 13 57263857 4D CAAGCATGAC TAAT/---- TAAAACACTA 3070 hom 99 het 35 0 34 3 TAAT 1 0 71498 CASAVA_Build 13 57276896 1I ATCCATTAGC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 135 het 54 0 45 9 A 8 9 71499 CASAVA_Build 13 57277451 2I TTGGTCAACA --/CT CTCCTCTACA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 CT 1 2 71500 CASAVA_Build 13 57284387 1D TATGTGGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 14 13 71501 CASAVA_Build 13 57296227 2D GTGGCAGGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 97 het 42 0 31 11 AG 6 5 71502 CASAVA_Build 13 57307774 1D ATATTTTCAT C/- CCGATTTTAT 3070 hom 119 het 41 0 38 3 C 3 2 71503 CASAVA_Build 13 57318513 2D AACTTTTATG CT/-- CTGTTTTCCT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 CT 2 1 71504 CASAVA_Build 13 57319341 1D GATGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 12 11 71505 CASAVA_Build 13 57320583 1D AATTTTTTTC A/- AAAAAAATGT 1404 het 1404 ref 28 20 3 5 A 8 7 71506 CASAVA_Build 13 57320725 1D TGGTAGTTAA C/- TTGTGGGGAT 2007 het 2007 ref 44 37 5 2 C 1 0 71507 CASAVA_Build 13 57339306 3D TAGAATTTCT AAC/--- AGGCATTCCT 3070 hom 102 het 35 0 35 1 AAC 1 0 71508 CASAVA_Build 13 57350532 4I ATCCTAAGGG ----/TACC ATATCATGAG 3070 hom 83 het 34 0 27 7 TACC 0 1 71509 CASAVA_Build 13 57376540 3I CAAAGATTTC ---/ATG ATGATGATAC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 ATG 2 3 71510 CASAVA_Build 13 57378980 1D TCATCAATTC T/- TTATGAAGCA 3070 hom 99 het 40 0 34 7 T 3 2 71511 CASAVA_Build 13 57384457 1I ATGAAAGACC -/A AGGAACATAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 2 71512 CASAVA_Build 13 57385866 1D GGCTTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 34 2 29 3 A 13 12 71513 CASAVA_Build 13 57389991 1D GGTTATACAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 10 9 71514 CASAVA_Build 13 57396272 1D GTCTTACACT G/- ATTAAGTTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 1 0 71515 CASAVA_Build 13 57397211 1I AAGTGATTAG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 71516 CASAVA_Build 13 57410390 1D AAAAAAAAAA G/- GTTCACTAAA 3070 hom 99 het 36 0 31 6 G 2 1 71517 CASAVA_Build 13 57418320 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 153 hom 29 1 21 7 T 11 12 71518 CASAVA_Build 13 57420823 2I AAAATTTTTC --/TT TCTCTCTTTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 1 3 71519 CASAVA_Build 13 57426271 3I TTTTAAATAG ---/TAA TAATAATAGC 3070 hom 85 het 33 0 29 4 TAA 2 3 71520 CASAVA_Build 13 57436926 1D TGATAAATAA G/- GGGTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 G 4 3 71521 CASAVA_Build 13 57438804 2D TCAACACACA CT/-- CTCTTTTTGT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 CT 3 2 71522 CASAVA_Build 13 57441910 1D TGTATGTTGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 31 0 26 6 A 9 8 71523 CASAVA_Build 13 57447177 1I ACTCAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 31 1 19 11 A 10 11 71524 CASAVA_Build 13 57448874 2I TATGTATTTG --/TA TATATATATA 3070 het 927 hom 38 2 26 10 TA 6 7 71525 CASAVA_Build 13 57450047 4D AGCAGGAGAG AGAT/---- AGATTGGAGG 3070 hom 96 het 36 0 31 6 AGAT 2 1 71526 CASAVA_Build 13 57450473 1I AGAGGTAGCA -/T TTTTTTTTTA 446 hom 12 het 28 0 3 25 T 9 10 71527 CASAVA_Build 13 57452218 3D TATAATTTTG ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 ATT 5 4 71528 CASAVA_Build 13 57455730 1I CAAAGATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 11 12 71529 CASAVA_Build 13 57455926 1D17M1I19M2D TAGGTGGACT AAAAAAAAGAGAGAAGGC-AAAAAAAGGGAAAGGAAACAA/-AAAAAAAGAGAGAAGGCAAAAAAAAGGGAAAGGAAAC-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 22 0 24 4 N/A 0 0 71530 CASAVA_Build 13 57462876 2D CATAAAATAC TG/-- TGTTATATGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TG 2 1 71531 CASAVA_Build 13 57467509 1I TAATATATTC -/A ATTCAATGCT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 1 2 71532 CASAVA_Build 13 57468669 1D TCTGCAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 61 het 34 0 26 9 T 10 9 71533 CASAVA_Build 13 57477679 1D TCAGATAAGT A/- AATCAATACT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 3 2 71534 CASAVA_Build 13 57479695 1D ATGAAAAAAA G/- AAAAAGAAAA 612 het 612 ref 34 17 5 12 G 1 0 71535 CASAVA_Build 13 57481489 1I ATTAAAAGTG -/A AAAAAATCAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 6 7 71536 CASAVA_Build 13 57489942 1I GCTTTTTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 10 het 17 1 16 0 T 9 10 71537 CASAVA_Build 13 57500509 1D TTGAGCTCTT C/- CCCTAGGATT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 C 4 3 71538 CASAVA_Build 13 57501244 1I AGTGATCTTC -/T TTTTTTATTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 6 7 71539 CASAVA_Build 13 57505814 1D AAATTGAAAG C/- AAAATAATAA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 C 1 0 71540 CASAVA_Build 13 57507761 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 30 0 21 9 T 14 13 71541 CASAVA_Build 13 57510796 1I AGGGCTCACC -/A AAAACATAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 4 5 71542 CASAVA_Build 13 57512683 4D TATTCTATAC AAAT/---- AAATAAAAGG 3070 hom 144 het 51 0 48 3 AAAT 2 1 71543 CASAVA_Build 13 57517319 1D GTCTGCATGG T/- TGGATGAAAA 3070 het 10 hom 34 1 22 11 T 2 1 71544 CASAVA_Build 13 57518891 1I CATCAAAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 71545 CASAVA_Build 13 57522344 1I GTACAATCAT -/A AATTCACCAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 3 71546 CASAVA_Build 13 57539780 1D AAATGTGCTC T/- TTTTTATCCT 3070 hom 151 het 55 0 51 5 T 6 5 71547 CASAVA_Build 13 57540127 1I CTTATAGTAA -/T AGATAATGAT 3070 hom 56 het 52 1 46 5 T 0 1 71548 CASAVA_Build 13 57545455 1I TGTAGCACCT -/C CCCCCCTCTC 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 C 6 7 71549 CASAVA_Build 13 57547849 1D TAAATGTAAA T/- ATTCTTGTGT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 1 0 71550 CASAVA_Build 13 57548708 1D AGAAAAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 41 15 19 7 A 9 8 71551 CASAVA_Build 13 57552650 4D GCATATACTT TATC/---- TTATATTCAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TATC 1 0 71552 CASAVA_Build 13 57560762 1D CATATGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 39 0 29 11 A 12 11 71553 CASAVA_Build 13 57579068 1D TATTCCTTTA T/- TTCCTGAATT 3070 het 2594 hom 17 6 8 3 T 3 2 71554 CASAVA_Build 13 57586070 1D TCTGTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 942 hom 29 2 23 4 T 11 10 71555 CASAVA_Build 13 57599390 1D TCCACAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 11 10 71556 CASAVA_Build 13 57602847 1D GATCATGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 662 hom 26 5 11 10 T 19 18 71557 CASAVA_Build 13 57608885 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2046 het 1465 hom 18 4 8 6 A 15 14 71558 CASAVA_Build 13 57635582 1I CCATATGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 104 hom 24 1 18 5 A 10 11 71559 CASAVA_Build 13 57643101 1D ATTTGGGTGG T/- TTTTTTGTGG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 7 6 71560 CASAVA_Build 13 57653372 1I TCCAAATTGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 8 9 71561 CASAVA_Build 13 57670695 1I TTGGCTGTGT -/C CCCATTCAAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 C 3 4 71562 CASAVA_Build 13 57678050 2I TTTTAGGAAA --/CT TAGTTAAATC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 0 1 71563 CASAVA_Build 13 57685684 1I AAGCATTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 701 hom 41 2 28 11 T 10 11 71564 CASAVA_Build 13 57705361 2D CAACATTTAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 78 het 39 0 27 12 AC 8 7 71565 CASAVA_Build 13 57709799 1D TAAATGTTTA C/- CTCTTTGACT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 C 2 1 71566 CASAVA_Build 13 57729273 1D TTGTTTTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 10 9 71567 CASAVA_Build 13 57731422 1D TTACTTTTTG T/- TTTTTTTCCT 2694 het 2694 ref 21 9 7 5 T 8 7 71568 CASAVA_Build 13 57739004 8D CTTTCTTTCG TTCTTTCA/-------- TTCTTTCATT 3070 het 2238 hom 37 11 20 7 TTCTTTCA 2 1 71569 CASAVA_Build 13 57753299 2I TGAGAAAATT --/AA AGTTTGCACA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 3 71570 CASAVA_Build 13 57755764 3D TATGTTAGAC ATA/--- ATAATTATTA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 ATA 2 1 71571 CASAVA_Build 13 57761312 1I CTTCCCTGCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 16 16 13 T 8 9 71572 CASAVA_Build 13 57764608 1I TTTTCTGGGG -/A AAAAATTCAA 2324 het 2324 ref 31 14 7 10 A 5 6 71573 CASAVA_Build 13 57769216 1D GTGCAAAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 A 10 9 71574 CASAVA_Build 13 57789627 1I ATGTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 1463 het 1463 ref 34 15 7 12 A 17 18 71575 CASAVA_Build 13 57795783 19D ATAGAACTAT TTTTAAAATATTTAAAATA/------------------- TTTTAAAATA 3070 het 3070 ref 34 16 12 9 TTTTAAAATATTTAAAATA 1 0 71576 CASAVA_Build 13 57796324 10I TAACTCTTAG ----------/ATTATATTAC ATTGTCTTAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 ATTATATTAC 0 1 71577 CASAVA_Build 13 57805772 5I CTTTATAATT -----/TAATA TAATTTATCT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 TAATA 0 1 71578 CASAVA_Build 13 57817589 1D AACAACCATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 10 9 71579 CASAVA_Build 13 57844450 2I CTTGTTTCAC --/AT GTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 AT 0 1 71580 CASAVA_Build 13 57850175 1D CTGAAACATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 10 9 71581 CASAVA_Build 13 57850639 4D ATGGATGGGT AAAC/---- ATTTAAATTC 3070 het 3070 hom 35 14 18 5 AAAC 1 0 71582 CASAVA_Build 13 57852126 5D TGTGTTGCTT AAATA/----- AAATCAAAAG 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 AAATA 1 0 71583 CASAVA_Build 13 57858149 2I TGGATTTATA --/AG TTATATCAGT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 AG 0 1 71584 CASAVA_Build 13 57882826 2I ATACAAACAC --/AT ATGTGTACAC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 AT 1 2 71585 CASAVA_Build 13 57886521 3D AGAGACTGCT TGC/--- TAAACTTGAT 3070 het 3070 ref 41 19 20 3 TGC 1 0 71586 CASAVA_Build 13 57891021 2D TAGGCCTTGA AT/-- ATGTCTGCTA 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 AT 2 1 71587 CASAVA_Build 13 57907888 1I TTTCTGCATT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 7 8 71588 CASAVA_Build 13 57912102 14I TATCTTATAG --------------/AAACTTTTGAAAAT AAAAGGGCCC 3070 het 3070 hom 26 11 13 4 AAACTTTTGAAAAT 0 1 71589 CASAVA_Build 13 57918749 1I TAGATGATAT -/A AAAATGGTCT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 4 5 71590 CASAVA_Build 13 57923766 1D ACTAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 T 12 11 71591 CASAVA_Build 13 57933241 1D TGCTGTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 A 12 11 71592 CASAVA_Build 13 57936373 1D AAGGCAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 10 9 71593 CASAVA_Build 13 57940135 3D CTTTTTTGCA TCT/--- TCTTTAGAAA 3070 het 3070 ref 35 17 18 1 TCT 2 1 71594 CASAVA_Build 13 57944156 1I GGCCACTGAA -/T TTGTGGACAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 T 2 3 71595 CASAVA_Build 13 57944472 2D GGATGCATGT AA/-- AAAAAAAAAA 1933 het 1933 ref 25 9 9 7 A 13 11 71596 CASAVA_Build 13 57951852 4I TGTTTTCTCC ----/CTCT ATTTGCCATT 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 CT 0 2 71597 CASAVA_Build 13 57952048 1I TATGGTATAG -/T TTTTCTTACT 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 T 4 5 71598 CASAVA_Build 13 57959436 1D GGAAAGAGGC T/- TAAACAACTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 2 1 71599 CASAVA_Build 13 57961905 1D ACTTTTTGAC A/- TTTAAAATTC 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 A 1 0 71600 CASAVA_Build 13 57967326 16I CTTTTGATGG ----------------/CTTAGAAAAGTCGAAA CTTATACTTC 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 CTTAGAAAAGTCGAAA 0 1 71601 CASAVA_Build 13 57968945 3I TGTTAAACTT ---/GGG TTTGAAAGAC 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 G 0 3 71602 CASAVA_Build 13 57969625 1D TGCAATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 12 11 71603 CASAVA_Build 13 57973822 4I ACAAGACATG ----/TACA TATTTTGACC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 TACA 0 1 71604 CASAVA_Build 13 57975014 2I ATGTTTACTC --/AG GGGATATTTG 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 AG 0 1 71605 CASAVA_Build 13 57981549 2I GAGAAACTCT --/CA CAGACCAGAG 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 CA 1 2 71606 CASAVA_Build 13 57989876 3D TTAAGGTCAT TGA/--- TGAAGGTGGG 3070 hom 102 het 39 0 34 8 TGA 2 1 71607 CASAVA_Build 13 57992776 1D17M3D TGCCTAGTTC TTTTTTTTTTTCTTTTTTTTA/-TTTTTTTTTTCTTTTTT--- TTATTATTAT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 N/A 0 0 71608 CASAVA_Build 13 57996636 1D ATTTTACACC A/- AAAGCAATGG 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 A 4 3 71609 CASAVA_Build 13 57999761 1D CAGCCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 24 0 17 7 A 15 14 71610 CASAVA_Build 13 58002570 2I TAGGATGATG --/TC TCTCCTCCAC 3070 het 3070 ref 31 17 7 7 TC 2 3 71611 CASAVA_Build 13 58003535 1D TAGTTGATTT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 A 8 7 71612 CASAVA_Build 13 58006188 1D AATGATTTAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 31 17 14 1 T 8 7 71613 CASAVA_Build 13 58009056 1D CAGCCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 45 1 32 12 T 11 10 71614 CASAVA_Build 13 58011702 3D TTAAAGTTTA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 66 het 37 0 22 17 AAC 7 6 71615 CASAVA_Build 13 58012319 1D CAAGTATATC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 8 71616 CASAVA_Build 13 58012507 4D TTTCTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 TC 9 7 71617 CASAVA_Build 13 58013129 1D ATCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 28 1 20 7 T 15 14 71618 CASAVA_Build 13 58016593 1D AATGTGTCCT C/- CTTTGTTCTG 3070 het 3070 hom 42 17 21 5 C 2 1 71619 CASAVA_Build 13 58019405 1D TTTTTTTTTT C/- AGCTTTCAAG 3070 het 520 hom 41 5 28 9 C 1 0 71620 CASAVA_Build 13 58021315 2I ATATTATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2842 hom 34 12 18 4 TG 6 7 71621 CASAVA_Build 13 58026134 4D CACAGATGTG TGTA/---- TGTATGTATA 3070 het 3070 hom 32 12 17 6 TGTA 3 2 71622 CASAVA_Build 13 58026260 1I ACAAAAAAAA -/C CTTTAGTTTT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 C 1 2 71623 CASAVA_Build 13 58027930 1I ACATGAATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 366 hom 37 1 31 5 T 9 10 71624 CASAVA_Build 13 58032557 1I CATAGCAAAG -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 A 7 8 71625 CASAVA_Build 13 58038746 2D TCTACATTTC TA/-- TAATTTTATT 3070 het 3070 hom 54 22 27 7 TA 2 1 71626 CASAVA_Build 13 58045072 2D65M1D TTATAAATAC ATATATGTTATACTTCTGAAATTATGTCATGGTTTTTGGATGTCTCCTTCTGTTTTTATTTGTTTGCT/--ATATGTTATACTTCTGAAATTATGTCATGGTTTTTGGATGTCTCCTTCTGTTTTTATTTGTTTGC- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 50 34 27 14 N/A 0 0 71627 CASAVA_Build 13 58049902 1I CTTGACCTTT -/C CCTCTCAACA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 2 3 71628 CASAVA_Build 13 58050453 2D CATTCTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1840 het 35 hom 29 1 7 21 T 18 16 71629 CASAVA_Build 13 58052118 1I AGAATAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2081 hom 30 6 13 11 A 11 12 71630 CASAVA_Build 13 58052416 2D ATATACAGAC AT/-- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 AT 5 4 71631 CASAVA_Build 13 58064468 1I GGCTTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 9 10 71632 CASAVA_Build 13 58071739 1D AGTTCAATAG A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 8 7 71633 CASAVA_Build 13 58076521 5D TAATTTTATT GTTTA/----- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 16 1 GTTTA 1 0 71634 CASAVA_Build 13 58092919 1I CACTCAAGAT -/A AAATGCTATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 3 4 71635 CASAVA_Build 13 58102782 2D GCTATAACTC TT/-- GTTTCTTCTT 3070 hom 123 het 47 0 41 7 T 2 0 71636 CASAVA_Build 13 58112837 1D GAGGGAGTGT G/- TCTTGCTCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 1 0 71637 CASAVA_Build 13 58136466 1I TTGACATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 T 11 12 71638 CASAVA_Build 13 58143356 1D ACTTGTCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 T 10 9 71639 CASAVA_Build 13 58151301 2D TGCACAACAC TG/-- TTTATATATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TG 1 0 71640 CASAVA_Build 13 58152247 1I GCAATGCTGT -/G GGGGTCCATC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 4 5 71641 CASAVA_Build 13 58161830 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 918 hom 30 4 18 8 A 12 13 71642 CASAVA_Build 13 58167261 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 28 het 28 ref 24 18 1 5 AAAG 1 0 71643 CASAVA_Build 13 58174575 1D GGGAGGCTGA G/- GGCAGGCAGA 3070 hom 51 het 19 0 16 5 G 3 2 71644 CASAVA_Build 13 58180543 1I CTGTCTGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 35 0 26 9 A 10 11 71645 CASAVA_Build 13 58187798 1I GAGTAAAGCA -/T TTTATAGAGA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 3 4 71646 CASAVA_Build 13 58194059 2D AAGATATGTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 214 hom 29 1 21 7 AT 10 9 71647 CASAVA_Build 13 58194632 3I TTATGCAAAA ---/TGT TGTTTTATAG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 TGT 1 2 71648 CASAVA_Build 13 58196133 3D TTATGCAAAA TGT/--- TGTTTCATAC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TGT 2 1 71649 CASAVA_Build 13 58200753 4I TCCTAAATGC ----/TCTT TCTTTGTCAG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TCTT 1 2 71650 CASAVA_Build 13 58203136 11I ATAAATAAAA -----------/TATAAACACAT TATATACCAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TATAAACACAT 0 1 71651 CASAVA_Build 13 58203930 1I TAATAATACA -/T TGTTAATAAG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 1 2 71652 CASAVA_Build 13 58206676 1I TTGTAAGCCA -/C CCATGCTATG 3070 hom 108 het 41 0 35 6 C 2 3 71653 CASAVA_Build 13 58207049 2I ACACACAAAC --/AT ATATATATAT 1404 hom 13 het 27 0 5 22 AT 6 7 71654 CASAVA_Build 13 58208972 3D CACCTGTAAA GTT/--- GTTCAAACAG 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 GTT 2 1 71655 CASAVA_Build 13 58216411 1I AAGTATTCAT -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 6 7 71656 CASAVA_Build 13 58221286 3I TTGAAAGTTT ---/GGA AATCCCTCTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 GGA 0 1 71657 CASAVA_Build 13 58232381 1D GTATTTAGTT G/- AAAAGTAGGG 3070 het 3070 ref 43 21 19 5 G 1 0 71658 CASAVA_Build 13 58236260 3D GGAGACAAAG GCA/--- GCTGAGACAA 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 GCA 1 0 71659 CASAVA_Build 13 58237702 3D TACAGTTGTG TTC/--- TTATCATCTC 3070 het 3070 ref 29 17 9 4 TTC 1 0 71660 CASAVA_Build 13 58243806 1D69M8D GCATTATCTT AAAAAAAAAAAAGTCATCCCTATCATGCAGTGATTATTGATAAGCTGACAAAGGAATAAAAACAGTAAAACACTAACC/-AAAAACAAAAAGTCATCCCTATCATGCAGTGATTATTGATAAGCTGACAAAGGAATAAAAACGGTAAAA-------- CACCTGCAGC 3070 het 3070 hom 38 30 38 5 N/A 0 0 71661 CASAVA_Build 13 58244233 1I ATATGGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 11 12 71662 CASAVA_Build 13 58245012 1D CCCTGTCTCT A/- TTAAAAATAC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 1 0 71663 CASAVA_Build 13 58252617 1I TTGCAATGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2979 hom 23 7 11 5 T 9 10 71664 CASAVA_Build 13 58253607 8D TCTTTCTTTC TTTCTTTT/-------- TTTTTTTTTC 1917 het 1917 ref 20 11 5 5 TTTCTTTT 1 0 71665 CASAVA_Build 13 58254837 1I AAAACAAAGC -/A AAAAAAATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 7 8 71666 CASAVA_Build 13 58254890 2D AAATATACTA TT/-- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 26 7 11 9 T 9 7 71667 CASAVA_Build 13 58255972 2I TGACAGCAAA --/CT CTCTCATCTT 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 CT 2 3 71668 CASAVA_Build 13 58256653 3I ATATGTTTCT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TTG 2 3 71669 CASAVA_Build 13 58256713 1I TCCCTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 17 0 9 8 T 13 14 71670 CASAVA_Build 13 58270088 2I TACCTATAAC --/AT GTGAGTATTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AT 0 1 71671 CASAVA_Build 13 58270260 5D AACAAGAGAT TGAAA/----- TGATGTGAGA 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 TGAAA 1 0 71672 CASAVA_Build 13 58272343 1I GAGATAACTC -/A AAAAAAGAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 6 7 71673 CASAVA_Build 13 58274011 24D GGAGGTAGGG AAGAAAGTAGGGAGGGAGGGAGGA/------------------------ AAGAAAGGAA 3070 het 3070 ref 44 32 17 11 AAGAAAGTAGGGAGGGAGGGAGGA 1 0 71674 CASAVA_Build 13 58274319 1I TCAATCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 10 11 71675 CASAVA_Build 13 58276371 1D AAAGCTTATT A/- AGAATCTAGC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 1 71676 CASAVA_Build 13 58283178 3I ACAAGACTTA ---/TTT ATTATTATTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 0 3 71677 CASAVA_Build 13 58283428 3D GGAATGCTGG TTT/--- TTGTCTCCAC 3070 hom 96 het 38 0 32 9 T 5 2 71678 CASAVA_Build 13 58289219 4D AATTGCACAG TCTT/---- TCTATCTCTC 3070 het 3070 ref 37 17 17 6 TCTT 1 0 71679 CASAVA_Build 13 58293234 4I CTCCTTTGAT ----/TTAG TTAGATGTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 TTAG 1 2 71680 CASAVA_Build 13 58297824 6I TAATGGGAAC ------/TTACAG TTAATGCCTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TTACAG 0 1 71681 CASAVA_Build 13 58298551 1I CTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 8 9 71682 CASAVA_Build 13 58299381 1I AGCCTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 10 11 71683 CASAVA_Build 13 58316251 1D AGAAGGAAAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 83 het 30 0 28 3 A 9 8 71684 CASAVA_Build 13 58323654 4I ATTTTACAAG ----/AAAC AAACAACGTA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 AAAC 1 2 71685 CASAVA_Build 13 58329737 2I GGAGGTTGGG --/GT GGACCAGGAG 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 GT 0 1 71686 CASAVA_Build 13 58333021 1I AGTGCAAGGG -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 7 8 71687 CASAVA_Build 13 58337051 5D TAAAACTATT AAAAG/----- AAACCATTAT 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 AAAAG 1 0 71688 CASAVA_Build 13 58337306 1D57M2D ACTCTGTAGG AAAAAAAAAATCTGTTAAACCTATTACAAATGGGCAAAAGCTATGAATAGACATTTCTCA/-AAAAAAAAATCTGTTAAACCTATTACAAATGGGCAAAAGGTATGAATAGACATTTCT-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 28 15 11 N/A 0 0 71689 CASAVA_Build 13 58337677 1D GAAAGGAAAT A/- AAGCATATTG 3070 het 3070 hom 46 22 19 5 A 3 2 71690 CASAVA_Build 13 58338977 4D TATTTGTGTG TATA/---- TATATACACA 1631 het 1631 ref 20 10 4 8 TA 5 3 71691 CASAVA_Build 13 58340790 4I TCAAAAAAAT ----/AAAC AAACCCTTAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AAAC 1 2 71692 CASAVA_Build 13 58341663 1I AAAAATATTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 60 27 23 10 A 8 9 71693 CASAVA_Build 13 58344138 1D AATGACTACT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 A 8 7 71694 CASAVA_Build 13 58345402 3I TTTCGGCTAA ---/TCT TCTTCTTGGA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TCT 2 3 71695 CASAVA_Build 13 58351075 5D GTTAGGCCAA ATATT/----- ATATTAAGTA 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 ATATT 2 1 71696 CASAVA_Build 13 58357741 6D CAAGTCTTCA ACTAAC/------ TTTTCTTTGT 3070 het 3070 hom 48 19 26 4 ACTAAC 1 0 71697 CASAVA_Build 13 58358121 4D ATTTATACTC AAAG/---- AAAGATTAAC 3070 het 3070 ref 38 23 14 2 AAAG 2 1 71698 CASAVA_Build 13 58358712 1D CAAAAAAAAA C/- CCCAGCTAGA 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 C 4 3 71699 CASAVA_Build 13 58359090 1I GCAACTATTG -/T TTTGTTATAA 3070 het 3070 hom 56 23 29 4 T 3 4 71700 CASAVA_Build 13 58359598 1I GTTATTTATC -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 6 7 71701 CASAVA_Build 13 58361886 1D TGCAATTTTG C/- CCGGTGGTTG 2504 het 2504 ref 17 8 7 2 C 3 2 71702 CASAVA_Build 13 58363112 1D GAAATAAATG T/- TAAAAGTATC 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 T 2 1 71703 CASAVA_Build 13 58364550 1I TCAGAAAACT -/C CCCTCTCTCA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 3 4 71704 CASAVA_Build 13 58366858 1I AGAGAATGAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 8 9 71705 CASAVA_Build 13 58367247 3I TCTGGTGCAA ---/AAG AAGAAAGGAC 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 AAG 1 2 71706 CASAVA_Build 13 58369226 1D ATCACTTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 10 9 71707 CASAVA_Build 13 58370465 1I TTTTCTATTT -/G TTTTTGATAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 G 0 1 71708 CASAVA_Build 13 58372599 5D ACAAGTGTGA ATTGT/----- ATTCTAAGTG 3070 het 3070 hom 39 18 20 5 ATTGT 1 0 71709 CASAVA_Build 13 58374255 2D GCATTGGTTC TT/-- TTTTTGTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 7 5 71710 CASAVA_Build 13 58386344 2D TGTTTCACTC AG/-- GGGATATCAT 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 AG 1 0 71711 CASAVA_Build 13 58388534 1I TTATCTTAGA -/C CCCCCCATTT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 C 6 7 71712 CASAVA_Build 13 58389755 1D ACCATCATTT A/- AAAAAAAAAA 1147 het 1147 ref 38 29 3 6 A 11 10 71713 CASAVA_Build 13 58391390 2I TATTTATTTA --/TT TTTTTTTTTG 3015 het 3015 ref 23 9 12 2 T 9 11 71714 CASAVA_Build 13 58395469 4D GTAGGCACAC TATT/---- TATTCTGTCT 3070 het 3070 hom 42 15 19 10 TATT 2 1 71715 CASAVA_Build 13 58399976 5D CCGTCTTTTC TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 12 16 4 TTTGT 4 3 71716 CASAVA_Build 13 58400531 2D GTGTGGAATC AA/-- AGAGTTGTAG 3070 het 3070 ref 44 24 19 2 A 3 1 71717 CASAVA_Build 13 58406209 1I TATATATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 10 11 71718 CASAVA_Build 13 58408640 4D3M9D CTGGCAGGTT TTAAACTGTCTTTGGC/----ACT--------- TTGAAGGTTT 3070 het 3070 ref 35 20 18 4 N/A 0 0 71719 CASAVA_Build 13 58409712 4I TCATTCACTT ----/ACTC ATTAAGTAAT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 ACTC 0 1 71720 CASAVA_Build 13 58412814 1D TAAAAGATCA T/- TTAAATGACT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 T 3 2 71721 CASAVA_Build 13 58419527 1I TCAAGTGGTA -/T TTTTTTTTTT 2891 het 2891 ref 42 18 11 13 T 13 14 71722 CASAVA_Build 13 58425346 8D CTCTAAGTCC CTTTATTT/-------- CTTTATTTCT 3070 het 3070 hom 29 12 14 7 CTTTATTT 2 1 71723 CASAVA_Build 13 58429161 1D TACAGTTTGA T/- TTTTTAAATA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 T 6 5 71724 CASAVA_Build 13 58440410 4D GAGAAACAGC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 511 hom 56 10 22 26 TG 10 8 71725 CASAVA_Build 13 58442791 1I GGATGGAATG -/T ATTGGTTGGC 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 T 0 1 71726 CASAVA_Build 13 58463184 1D TCCCCCCTTA T/- TCTGAGGGAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 1 71727 CASAVA_Build 13 58473423 1I TTTTGATTAG -/A AGGTGAAGAC 3070 het 3070 hom 53 25 22 6 A 1 2 71728 CASAVA_Build 13 58492268 1I ATGGAATATT -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 A 7 8 71729 CASAVA_Build 13 58492450 4D TGATATTTGA AGGT/---- AGGGCCTATG 3070 het 3070 hom 26 11 13 4 AGGT 1 0 71730 CASAVA_Build 13 58520740 1D AAGAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 648 hom 31 5 15 12 A 13 12 71731 CASAVA_Build 13 58527835 3D CTCTGTACGT ATG/--- ATAATTATCT 3070 het 3070 ref 23 12 10 4 ATG 1 0 71732 CASAVA_Build 13 58529176 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 T 8 7 71733 CASAVA_Build 13 58529769 4D ATGGTTTAAC AGAT/---- AGATAGTATA 3070 het 3070 hom 45 21 22 4 AGAT 2 1 71734 CASAVA_Build 13 58530865 4I CTCTCTTTCT ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 hom 51 17 17 17 CA 7 9 71735 CASAVA_Build 13 58531742 2D AAGTTTAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 13 11 71736 CASAVA_Build 13 58535734 1D AGAAAGGACC A/- GGTGGAAAAG 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 1 0 71737 CASAVA_Build 13 58539964 1D GTCTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 10 11 A 11 10 71738 CASAVA_Build 13 58542266 3I AAAGAACCTT ---/ATC ATCATAAGGT 3070 het 3070 ref 45 27 14 4 ATC 1 2 71739 CASAVA_Build 13 58544063 4D GTAGAAAGTA AGTC/---- AGTCATTAGA 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 AGTC 2 1 71740 CASAVA_Build 13 58547865 1I CATCCAGGCA -/T TTCCATACAT 3070 het 3070 ref 39 23 16 0 T 2 3 71741 CASAVA_Build 13 58555720 5D AATGCCAAAT ATCTG/----- AACTGACATA 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 ATCTG 1 0 71742 CASAVA_Build 13 58558726 1D TCTACTTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 A 10 9 71743 CASAVA_Build 13 58559147 3D TTATTGAAGA AAG/--- AAGAAGTATT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 AAG 3 2 71744 CASAVA_Build 13 58566805 1D TTTTTACCAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 9 8 71745 CASAVA_Build 13 58572633 2I CTTGTTATAC --/TT ATAATTAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 0 2 71746 CASAVA_Build 13 58573721 4I ATTGAAAATA ----/AATT AATTTTCAGT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 AATT 1 2 71747 CASAVA_Build 13 58573894 1I TCCATTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 10 11 71748 CASAVA_Build 13 58579917 1I GGGGTGGGAG -/C CCCCCACACA 3070 het 1871 hom 23 8 11 4 C 5 6 71749 CASAVA_Build 13 58581298 2D TTCCAGTTAT AG/-- AAACACTATC 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 AG 1 0 71750 CASAVA_Build 13 58582685 4I ATGTGTATGT ----/AACA AACATTTATG 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 AACA 1 2 71751 CASAVA_Build 13 58584988 3D CCACTATGGG AGA/--- AGATTAAGTG 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 AGA 2 1 71752 CASAVA_Build 13 58607831 7I GGCACATAAG -------/CCCCCTA CCTTACTCAG 3070 het 3070 ref 54 30 17 7 CCCCCTA 0 1 71753 CASAVA_Build 13 58617926 1I ATGGACTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 71754 CASAVA_Build 13 58619704 1I CATAAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 11 12 71755 CASAVA_Build 13 58633526 1D GGCTCTGGCA G/- GGGGGAAGGA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 6 5 71756 CASAVA_Build 13 58647628 1D TAATTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 820 hom 47 3 37 9 A 11 10 71757 CASAVA_Build 13 58648374 3D TTTGGTTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 28 0 15 13 T 15 12 71758 CASAVA_Build 13 58655685 3D CAAATCAGAC CTT/--- CTAATACCTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CTT 1 0 71759 CASAVA_Build 13 58656625 1D AAACTTTATC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 8 71760 CASAVA_Build 13 58658953 1I ATTATTTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 263 hom 30 2 23 5 A 11 12 71761 CASAVA_Build 13 58663132 1I TTACAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 35 1 28 6 T 11 12 71762 CASAVA_Build 13 58669912 1D CATATATCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 42 0 34 8 A 10 9 71763 CASAVA_Build 13 58675135 1I TTGTTCTCCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 857 hom 39 3 27 9 A 9 10 71764 CASAVA_Build 13 58681744 1I TATACTGGGC -/G GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 G 7 8 71765 CASAVA_Build 13 58682526 2I AGAAAAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 36 het 19 0 13 6 AT 6 7 71766 CASAVA_Build 13 58684516 1I CTCAGGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 37 1 31 5 T 10 11 71767 CASAVA_Build 13 58689636 4D AGAAAAGAAC AAAT/---- AAGACAATAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 AAAT 1 0 71768 CASAVA_Build 13 58691138 1D TCATTGGGAC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 8 7 71769 CASAVA_Build 13 58698478 1D ACCAAAAATT G/- GGGAAGTAAT 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 G 4 3 71770 CASAVA_Build 13 58705074 16D AGGGGAAAGA AGGGAGGGAGAGAGGG/---------------- AGGGAGGGAG 556 het 556 ref 35 17 5 17 AGGGAGGGAGAGAGGG 2 1 71771 CASAVA_Build 13 58710738 1I CCTGAGTAGA -/C AAATTTTCTA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 C 0 1 71772 CASAVA_Build 13 58723609 1I GATTGCACTG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 48 het 25 0 17 8 T 7 8 71773 CASAVA_Build 13 58747106 1D TCTTCACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 17 11 A 14 13 71774 CASAVA_Build 13 58841051 2D TGATCACTCT TC/-- TCTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 TC 2 1 71775 CASAVA_Build 13 58892095 12D TTCAACATGA GATTTGGGTGGG/------------ GACACAAAGC 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 GATTTGGGTGGG 1 0 71776 CASAVA_Build 13 58894008 3I TTTCTCCTGA ---/CTT CTTGTCAGGA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 CTT 1 2 71777 CASAVA_Build 13 58923545 1I TTTTTTCCCC -/T AATCATGACT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 0 1 71778 CASAVA_Build 13 58923752 1D AAAAAGGGGG A/- GGGAGATTTT 2257 het 1165 hom 33 13 11 10 A 1 0 71779 CASAVA_Build 13 58927350 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 7 8 71780 CASAVA_Build 13 58928692 1D CAGAAAATTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 9 8 71781 CASAVA_Build 13 58931828 1I GGTAAAACAG -/T TGTCTGCAAG 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 1 2 71782 CASAVA_Build 13 58936384 2I TCTCAAAAAA --/AT AATAAAATAA 3070 hom 37 het 21 0 14 7 AT 0 1 71783 CASAVA_Build 13 58937800 1I AGTATAATAT -/A GAAAAAGTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 0 1 71784 CASAVA_Build 13 58946264 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 15 2 11 2 A 14 12 71785 CASAVA_Build 13 58971857 1D CATCAAGGCC T/- TTCCTTGATC 3070 hom 116 het 49 0 38 11 T 3 2 71786 CASAVA_Build 13 58982111 1I TGGGCGGATC -/A ACGAGGTCAA 2147 het 2147 ref 13 7 5 1 A 1 2 71787 CASAVA_Build 13 58982335 3D TCAAAAAAAA TAT/--- ATATATATAT 611 hom 4 het 11 0 5 6 TAT 1 0 71788 CASAVA_Build 13 58987111 1I ACACCTCACT -/A AATCACTATA 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 A 2 3 71789 CASAVA_Build 13 58994024 1D ATATCAAGCT A/- AAAAAATCTC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 7 6 71790 CASAVA_Build 13 59007295 1D CAGCACAACC T/- TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 43 27 5 11 T 12 11 71791 CASAVA_Build 13 59053641 1D TTTCTACCAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 9 8 71792 CASAVA_Build 13 59056463 1D TTTTGTTTTT G/- TTTTTTGCAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 G 1 0 71793 CASAVA_Build 13 59059892 1I ATAATCTGTG -/A AAAAAAGGCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 6 7 71794 CASAVA_Build 13 59065683 1I ATGAAGGCAG -/A AGTAAAGATG 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 1 2 71795 CASAVA_Build 13 59067512 3I CTTCAAACTA ---/TAC TACAAGGCTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TAC 1 2 71796 CASAVA_Build 13 59068897 4D45M4D AAAGTATAAT AAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGCCATCAGATTTCATGAGAACTC/----AAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGCCATCAGATTTCATGAGA---- ACTCACTATT 3070 hom 42 het 17 0 14 7 N/A 0 0 71797 CASAVA_Build 13 59069641 2D TTATTGACAT AA/-- GTTTATTTAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 2 0 71798 CASAVA_Build 13 59069797 3D GTGGAGAGAA GAG/--- GGCAGGCTAG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 GAG 1 0 71799 CASAVA_Build 13 59070971 1D AAGAAGATAT A/- AAAAAAGAAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 7 6 71800 CASAVA_Build 13 59072718 1I GTACCAGACC -/T TGCTATATTG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 1 2 71801 CASAVA_Build 13 59073451 5D TCCCAAACCA CTCTG/----- CTCTGGGTCA 3070 hom 129 het 46 0 41 6 CTCTG 2 1 71802 CASAVA_Build 13 59074467 7I TGACAATGAG -------/AGTTTGC AGTTTTTCAG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AGTTTGC 0 1 71803 CASAVA_Build 13 59074777 1I AGTCAACAGG -/T TATAAAAGGG 3070 hom 120 het 47 0 39 8 T 1 2 71804 CASAVA_Build 13 59074984 1I GATTTGATTC -/A AAGAGAGGCT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 2 3 71805 CASAVA_Build 13 59076317 1D48M5I AATGGAAAAA GATATTCTACACTATCAGAAGCAAAAAGTGGGCAGGAGTCACTATACTT-----/-ATATTCTACACTATCAGAAGCAAAAAGTGGGCAGGAGTCACTATACTTATATC AGATAAAACA 3070 hom 57 het 17 0 20 13 N/A 0 0 71806 CASAVA_Build 13 59078392 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 9 8 71807 CASAVA_Build 13 59079122 3I TCTTCTTCAT ---/TGC TGCTATTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TGC 1 2 71808 CASAVA_Build 13 59079601 4D TTCACTTGCC CTAA/---- CTGTCCTTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CTAA 1 0 71809 CASAVA_Build 13 59079989 4D10M1D ACAGGAGTCC GAGTGAGAAGTAACT/----GAGAAGTAAC- GTTATTATTT 3070 hom 120 het 44 0 41 10 N/A 0 0 71810 CASAVA_Build 13 59081306 4I TTAAAGAAAC ----/TATT TATATGACTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TATT 0 1 71811 CASAVA_Build 13 59083299 1I TATAAAAAAA -/T AAGTAAAAAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 0 1 71812 CASAVA_Build 13 59083358 2D ACTAACTTTA AT/-- ATGTCTTAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 AT 2 1 71813 CASAVA_Build 13 59083460 24I38M4I AACACATTTT ------------------------AAAATTTTTTAACATATTTAAAAATTTTTAAATCGTGG----/AAAATTTTTTTTAACACAATTAAAAAAATTTTTTAACATATTTAAAAATTTTTAAATCGTGGCTTA CTTAGACATT 3070 hom 27 het 17 0 10 19 N/A 0 0 71814 CASAVA_Build 13 59083749 1D TTTTTCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 38 1 33 4 T 11 10 71815 CASAVA_Build 13 59084704 1D GGCGAAGGGG A/- AAGCAAGACA 3070 hom 93 het 32 0 30 2 A 3 2 71816 CASAVA_Build 13 59086355 2I GGTGCTCTGT --/GA GTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 GA 0 1 71817 CASAVA_Build 13 59087221 3I ATCTCAAATA ---/AAC AACAACAATA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAC 2 3 71818 CASAVA_Build 13 59093118 1I GAATTTGAGA -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 8 9 71819 CASAVA_Build 13 59099784 1D TGCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 11 10 71820 CASAVA_Build 13 59117627 1I ACTTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2065 hom 34 8 14 12 T 15 16 71821 CASAVA_Build 13 59122593 2D ATATATAGAC AG/-- ACACACACAC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AG 1 0 71822 CASAVA_Build 13 59126552 1D CTGTTCATAG T/- TGTCATAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 2 1 71823 CASAVA_Build 13 59132322 1I TTGAAGTGTG -/C CTGTTCTTCT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 C 1 2 71824 CASAVA_Build 13 59136769 2I20M1I ATCTACCAAT --AAAAGTATCTCCAAATGATC-/AAAAAAGTATCTCCAAATGATCT GTTCCTTGAG 3070 het 3070 hom 45 22 25 5 N/A 0 0 71825 CASAVA_Build 13 59144529 2I TAGAACTCTG --/TA GTGTCCTAAA 3070 het 3070 ref 48 24 11 13 TA 0 1 71826 CASAVA_Build 13 59185762 11I ATTTGAGGAA -----------/GGGGAGCTGTT GGGGAGCTAT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 GGGGAGCTGTT 0 1 71827 CASAVA_Build 13 59188315 2I TCCAAGAAAC --/TT TTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 2 4 71828 CASAVA_Build 13 59189989 1I CAAACCAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 A 9 10 71829 CASAVA_Build 13 59196036 1D GCATGAGCCA C/- CGCACCCAGC 2376 het 2001 hom 14 5 6 3 C 2 1 71830 CASAVA_Build 13 59204395 1I GAGTCTATCT -/A ATATTCTTCT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 1 2 71831 CASAVA_Build 13 59209445 3D AGAAAAAATA AAC/--- AACGCCATTA 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 AAC 2 1 71832 CASAVA_Build 13 59213300 6D AAGAAAATGA ATGAGT/------ ATAAGGGCTG 3070 het 3070 hom 33 10 21 5 ATGAGT 1 0 71833 CASAVA_Build 13 59214714 14D16M3D AAGAAAAGAA AGAAAAGGAAAGAGAAAAGAAAAGAAAGAAAAG/--------------AAAAGAAAAGAAAGAA--- AAGAAAAGAG 2779 het 2779 ref 27 13 11 13 N/A 0 0 71834 CASAVA_Build 13 59214859 9I AAAAGAAAGA ---------/AAAGAAAGG AAAGAAAGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAAGAAAGG 0 1 71835 CASAVA_Build 13 59216658 1I TTGTGTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 10 11 71836 CASAVA_Build 13 59229463 1D ATATAATGGT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 9 8 71837 CASAVA_Build 13 59231988 3D GGCTGAGGCA AGG/--- AGAATTGCTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 AGG 1 0 71838 CASAVA_Build 13 59234598 3I AAGGTGTGAA ---/AAC AAAGAGGCAG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 AAC 0 1 71839 CASAVA_Build 13 59235432 2I CACATATATG --/TA TATATACATG 3070 het 3070 ref 40 26 11 3 TA 3 4 71840 CASAVA_Build 13 59237844 1I ACTACTGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 9 10 71841 CASAVA_Build 13 59238924 1D CTAGGCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2280 hom 30 9 12 11 A 13 12 71842 CASAVA_Build 13 59245896 24D36M1D CACTTACCAT TTTGCCAAAATGCCAGTTAAGGTATTTCTAACTGCACTGGCAAATGTGGGAGATTAAAACA/------------------------TTTCTAACTGCACTGGCAAATGTGGGAGATTAAAAC- AGATGACAGA 3070 het 3070 ref 35 24 17 14 N/A 0 0 71843 CASAVA_Build 13 59246145 3D ACCTCAAGGC AAT/--- AATATAAGGA 3070 het 3070 hom 22 8 10 5 AAT 2 1 71844 CASAVA_Build 13 59247871 1I AGAACGTATA -/G GTTTATCTTC 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 G 1 2 71845 CASAVA_Build 13 59272161 3I ACTTCTTTTT ---/GAA GAAGTTTCTA 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 GAA 1 2 71846 CASAVA_Build 13 59279355 7I ACTAAGGACC -------/ATTCAGA ATCATCATCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATTCAGA 0 1 71847 CASAVA_Build 13 59283062 4I TTGCTTGCTA ----/TTAC AAAAAATTTT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TTAC 0 1 71848 CASAVA_Build 13 59291900 1I TAGAAGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 A 13 14 71849 CASAVA_Build 13 59292165 4I AAATGTTAAC ----/AAGT AAGTATTATT 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 AAGT 1 2 71850 CASAVA_Build 13 59297172 4I ACACATTTAT ----/TTTA TTTATTTATT 2755 het 2755 ref 16 8 7 1 TTTA 2 3 71851 CASAVA_Build 13 59306062 5I AAAAGCAAAC -----/AAAAT AAAATTTTAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AAAAT 1 2 71852 CASAVA_Build 13 59306157 5D TTCTTTATGC ATTAG/----- ATTATTAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 ATTAG 1 0 71853 CASAVA_Build 13 59306589 1I ATATCTAAAA -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 7 8 71854 CASAVA_Build 13 59312953 1I TCTCAGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 10 11 71855 CASAVA_Build 13 59313097 3I TTAAATTATT ---/CCC CCAATACCTT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 C 2 5 71856 CASAVA_Build 13 59316241 1D CCCAGAACTT A/- AAAAAAAAAA 2430 het 2321 hom 27 11 6 10 A 15 14 71857 CASAVA_Build 13 59317183 1D TTTCCTTTTT C/- CTTTTTTTTC 3070 het 1408 hom 31 8 18 5 C 2 1 71858 CASAVA_Build 13 59320443 1I AAGTCAAATC -/T TTTTTTTTTT 1884 het 188 hom 15 1 7 7 T 17 18 71859 CASAVA_Build 13 59342301 1D GTCTGGCAAC T/- TTTTTTTTTT 1672 het 1672 ref 40 30 4 6 T 13 12 71860 CASAVA_Build 13 59347664 1I AGATTGTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 10 11 71861 CASAVA_Build 13 59361012 1I TTACAGGGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 7 8 71862 CASAVA_Build 13 59362649 1I TTCCTAAGCA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 6 7 71863 CASAVA_Build 13 59372026 1D AACTCACAAG T/- TATTAGCAGC 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 2 1 71864 CASAVA_Build 13 59376781 1I ATGCGTCCCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 9 10 71865 CASAVA_Build 13 59391076 2D CTTCAAGAAA AT/-- ACAAAAAAAA 3070 het 951 hom 38 11 17 12 AT 1 0 71866 CASAVA_Build 13 59393410 1I AGAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 12 13 71867 CASAVA_Build 13 59396632 1D TTTATACTTT A/- AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 7 6 71868 CASAVA_Build 13 59401597 1D TACTGTTAAC A/- CTGCTATCAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 1 0 71869 CASAVA_Build 13 59406839 2I GAAACCTAAG --/CA CAGAGAATAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 CA 1 2 71870 CASAVA_Build 13 59413990 1I GAAGGATGGC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 89 het 35 0 33 2 A 8 9 71871 CASAVA_Build 13 59416349 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 A 11 10 71872 CASAVA_Build 13 59417756 1D TTGCTGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 A 13 12 71873 CASAVA_Build 13 59422273 5D AATATAATAT TTTAA/----- TTTATTTATA 3070 het 3070 ref 36 21 14 3 TTTAA 1 0 71874 CASAVA_Build 13 59426460 1I AAGGCACTCA -/T TTTTTCCTTT 3070 het 3070 hom 57 20 28 9 T 5 6 71875 CASAVA_Build 13 59432812 1I AATTATTAGC -/A AAAAACAAGT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 5 6 71876 CASAVA_Build 13 59437675 3D CCAATCTGGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 38 2 28 9 A 17 14 71877 CASAVA_Build 13 59448597 3I ATGGCTGATG ---/ACT ACTACCATGC 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 ACT 1 2 71878 CASAVA_Build 13 59459953 1I AGAAAGGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 11 12 71879 CASAVA_Build 13 59461518 1D TTTTTAAGAA T/- TTTTTTAAGA 3070 het 1722 hom 14 4 9 4 T 7 6 71880 CASAVA_Build 13 59464982 1D AAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 1915 het 1915 ref 25 13 5 7 A 17 16 71881 CASAVA_Build 13 59479532 1I TTTCACTTTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 7 8 71882 CASAVA_Build 13 59501193 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 13 4 A 10 11 71883 CASAVA_Build 13 59501297 1D TTGCTCAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 10 9 A 11 10 71884 CASAVA_Build 13 59511011 1I CTATAAATGC -/T TGATATCAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 71885 CASAVA_Build 13 59511446 1I TTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 11 12 71886 CASAVA_Build 13 59513242 26D AGCCTGTAAT ATATATTTTTAAATGAACCTGGACAA/-------------------------- ATATATTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 12 5 ATATATTTTTAAATGAACCTGGACAA 1 0 71887 CASAVA_Build 13 59522947 6I GGCAACAGAC ------/TATACA AGAAACAACG 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TATACA 0 1 71888 CASAVA_Build 13 59541080 1D GTGCTGCAAT G/- AACATGTGCG 3070 hom 99 het 38 0 34 6 G 1 0 71889 CASAVA_Build 13 59548841 1D CTGAAAGAAG A/- AAAAAAGACT 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 A 7 6 71890 CASAVA_Build 13 59550527 2D AGGCAAGAAC AA/-- AAAAAGACTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 7 5 71891 CASAVA_Build 13 59551186 1D GATGCACGAG C/- CAATATGCTC 3070 het 3070 hom 28 10 14 5 C 2 1 71892 CASAVA_Build 13 59558736 2D AAATAGAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 35 2 14 19 A 13 11 71893 CASAVA_Build 13 59560363 1I GTTCATCTCT -/A ACTAAGTATT 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 A 1 2 71894 CASAVA_Build 13 59567177 2I GCATGTTAGT --/TG TGTCACAATA 3070 het 3070 hom 45 23 20 2 TG 1 2 71895 CASAVA_Build 13 59573657 1I TTGCGATTTC -/T TTTTTTTTTT 2128 het 2128 ref 31 12 10 9 T 14 15 71896 CASAVA_Build 13 59574581 4D TTTGCTAAAT AAAG/---- AAGATGTCAG 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 AAAG 1 0 71897 CASAVA_Build 13 59586325 1I AAAATGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 10 11 71898 CASAVA_Build 13 59586408 1I ACAGATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 11 12 71899 CASAVA_Build 13 59588566 6I ATGTTTGTTT ------/AAAACA AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 46 16 14 16 AAAACA 2 3 71900 CASAVA_Build 13 59597975 1I TCCAGAGAAG -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 49 27 14 8 A 6 7 71901 CASAVA_Build 13 59609075 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 1 A 14 11 71902 CASAVA_Build 13 59612972 3I ATCTAATAAA ---/TAT TATGTGCACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAT 1 2 71903 CASAVA_Build 13 59613475 3I ACAATTAGGC ---/CAA CAACATGTGT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 CAA 1 2 71904 CASAVA_Build 13 59615048 1D ATGCCCCACA T/- TTTTTTTTTC 2293 het 1896 hom 27 11 9 7 T 10 9 71905 CASAVA_Build 13 59618183 3I TTAATACTAC ---/TTT TTATTACACC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 2 5 71906 CASAVA_Build 13 59620078 10D AGTTAGGAAG CTATTGCAAT/---------- CTATTGCAAT 3070 hom 156 het 56 0 48 18 CTATTGCAAT 2 1 71907 CASAVA_Build 13 59623302 5D AATAACTGAG AACTT/----- AACACTATAG 3070 het 3070 hom 60 27 29 4 AACTT 1 0 71908 CASAVA_Build 13 59624962 4I TTCACTACTG ----/ATAA ATACTTACTA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 ATAA 0 1 71909 CASAVA_Build 13 59656757 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAAAATT 1049 het 1049 ref 22 17 3 2 A 9 8 71910 CASAVA_Build 13 59657334 1I ATTGTGGTAC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 8 9 71911 CASAVA_Build 13 59665747 1I TAGGTGATGC -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 6 7 71912 CASAVA_Build 13 59678132 1D TGCAGGCCTG T/- CTAGCTCAAA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 1 0 71913 CASAVA_Build 13 59679289 2I AGAAAAACAA --/TT TTTTTTTTTT 2617 het 2617 ref 30 14 10 6 T 13 15 71914 CASAVA_Build 13 59680100 1I ACTACAGATC -/A AATGTCTCTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 2 3 71915 CASAVA_Build 13 59680904 10D AAAAAAAGAA ACACACCCAC/---------- ACACACCCAC 3070 het 3070 ref 43 22 12 14 ACACACCCAC 2 1 71916 CASAVA_Build 13 59684047 1D TCTTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 14 9 A 11 10 71917 CASAVA_Build 13 59684919 1D GAGAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 11 21 17 A 13 12 71918 CASAVA_Build 13 59685720 1D TCATTGACAT A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 7 6 71919 CASAVA_Build 13 59690415 6D GATGTTTTTC TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 321 hom 33 5 14 14 TG 21 18 71920 CASAVA_Build 13 59700475 1D TTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1928 het 739 hom 28 8 7 15 T 19 18 71921 CASAVA_Build 13 59707914 1D AACACTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 8 T 11 10 71922 CASAVA_Build 13 59727363 1D AGTAGTAGTC T/- TTGGTATGAA 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 T 3 2 71923 CASAVA_Build 13 59729031 2I TGGTTTTTAG --/TA TATACAAATC 3070 het 3070 hom 35 9 19 7 TA 2 3 71924 CASAVA_Build 13 59733092 1D TTTGTTGTGG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 8 7 71925 CASAVA_Build 13 59736755 3I TAATTAATTT ---/AGG AGGAAGACGG 3070 hom 93 het 37 0 30 7 AGG 1 2 71926 CASAVA_Build 13 59737245 1I TCTCAATACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 128 het 47 0 43 4 T 8 9 71927 CASAVA_Build 13 59737817 2D ACCCACCACT GA/-- GTTTCCACAT 3070 hom 141 het 49 0 48 3 GA 1 0 71928 CASAVA_Build 13 59746586 36I29M1I ACTATGGCAT ------------------------------------TAATGGCCTCTGCAAATGGCCTTCTCTGC-/TATTAGACTGTCTGCTCATTTATAACCTTTACTGCCTAATGGCCTCTGCAAATGGCCTTCTCTGCG AGTCCTTTTA 3070 hom 102 het 24 0 35 4 N/A 0 0 71929 CASAVA_Build 13 59749953 1D GATTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 27 1 19 7 A 13 12 71930 CASAVA_Build 13 59769607 3D TTCTGTCACC TTG/--- TTGTTTTTGC 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 TTG 2 1 71931 CASAVA_Build 13 59771550 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 11 12 71932 CASAVA_Build 13 59772052 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 A 8 9 71933 CASAVA_Build 13 59777325 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 10 11 71934 CASAVA_Build 13 59780759 5I CTTTGTAGGA -----/AATTT AATTTAAATA 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 AATTT 1 2 71935 CASAVA_Build 13 59781476 1D TTTCTCCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 5 A 10 9 71936 CASAVA_Build 13 59788119 1I GACATTGGGG -/A TTGCAGTTCA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 0 1 71937 CASAVA_Build 13 59790275 1D ATATTAACTG T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 6 71938 CASAVA_Build 13 59790367 1D CTGCCAGTAC T/- TTTTTTGCAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 6 71939 CASAVA_Build 13 59791076 5I CCTGAATTAG -----/ATAAC ATAATTGAGG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 ATAAC 0 1 71940 CASAVA_Build 13 59791215 1D CTTAAAAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 8 71941 CASAVA_Build 13 59791445 1I GGAGCAGAAG -/A CGAGGAAATC 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 0 1 71942 CASAVA_Build 13 59791847 3I TTAATTGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 TTG 5 6 71943 CASAVA_Build 13 59793414 2I GTGAAAGAGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 460 hom 37 4 23 10 GA 8 9 71944 CASAVA_Build 13 59801155 1D ATTGTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 A 13 12 71945 CASAVA_Build 13 59806339 1D GCAACCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 43 2 21 20 T 17 16 71946 CASAVA_Build 13 59807352 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 9 8 71947 CASAVA_Build 13 59822252 1D CCTCTATTTT G/- GGGGAAGTGT 3070 het 3070 hom 46 23 21 3 G 5 4 71948 CASAVA_Build 13 59826883 1I GAAAATGATG -/T TTTTGTGAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 4 5 71949 CASAVA_Build 13 59831219 1D CTACAAAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 82 het 31 0 27 4 A 8 7 71950 CASAVA_Build 13 59833410 2D CCTGCAAGAA AG/-- AGGGTCCTGT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AG 2 1 71951 CASAVA_Build 13 59842290 1D GATCCAGGTG C/- CCTTTACCCA 3070 het 3070 hom 26 10 15 2 C 3 2 71952 CASAVA_Build 13 59849204 1D TGTCTCGAGG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 8 7 71953 CASAVA_Build 13 59849944 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2054 hom 26 9 8 9 A 15 14 71954 CASAVA_Build 13 59867296 1D AAGGCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 20 23 10 T 11 10 71955 CASAVA_Build 13 59876372 1D TTGGCTAAGG A/- AAAAACAAGG 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 A 6 5 71956 CASAVA_Build 13 59888421 1I TCTAATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 10 11 71957 CASAVA_Build 13 59892516 1D ATTTTATCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 T 10 9 71958 CASAVA_Build 13 59893329 1I GGTAATTAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 9 10 71959 CASAVA_Build 13 59894891 4I GAATTTAAAT ----/AAAG AAGAAATGTC 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 AAAG 0 1 71960 CASAVA_Build 13 59899493 3I ATTTTTGTTC ---/TGT TGTTTTACAC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 TGT 1 2 71961 CASAVA_Build 13 59900770 4I TTAAGGTGAA ----/TAGT AAGTGATTTT 3070 het 3070 hom 54 21 24 9 TAGT 0 1 71962 CASAVA_Build 13 59909151 3I GTCTGTGTGA ---/GTT GCTGAAGTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GTT 0 1 71963 CASAVA_Build 13 59914507 4D AGGGATTTTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 328 hom 30 4 9 18 TG 10 8 71964 CASAVA_Build 13 59916475 1D ATTCAAAAGC T/- GTCATTTGAT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 1 0 71965 CASAVA_Build 13 59924951 1D CTGTTCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 20 7 T 14 13 71966 CASAVA_Build 13 59925623 6I AACACTTTCC ------/TTTAGA TTTAATCAGT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 TTTAGA 0 1 71967 CASAVA_Build 13 59928746 1I GAAATTGGTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 8 9 71968 CASAVA_Build 13 59947021 1I TGTCAGAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 11 71969 CASAVA_Build 13 59950158 1I GGTTAAGAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 9 10 71970 CASAVA_Build 13 59956254 2I TGGGAGAGGG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 25 8 5 T 9 11 71971 CASAVA_Build 13 59964442 14D GACTTTTCAG GTAATTTTGTTCTA/-------------- GTATATTAAC 3070 het 3070 ref 33 18 15 2 GTAATTTTGTTCTA 1 0 71972 CASAVA_Build 13 59981446 1D GTACTAGTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 10 9 71973 CASAVA_Build 13 59989321 1I TTGTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 2938 het 2938 ref 38 17 9 12 T 11 12 71974 CASAVA_Build 13 59992969 1D TGCTCAGTGG T/- TAGGACTGGA 3070 hom 105 het 41 0 35 7 T 2 1 71975 CASAVA_Build 13 59995141 5I AGGCACATTA -----/TTTTG TTTTTTCACT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 TTTTG 0 1 71976 CASAVA_Build 13 59996642 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 11 10 71977 CASAVA_Build 13 59999972 1I ACATAAACTC -/T TTTTTTATAG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 6 7 71978 CASAVA_Build 13 60000577 3D GGAGTAAAAG ATA/--- ATAATCATCT 3070 het 3070 ref 35 14 16 7 ATA 2 1 71979 CASAVA_Build 13 60002583 1D TTTTAAATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2315 hom 30 7 17 6 T 10 9 71980 CASAVA_Build 13 60006698 1I TTTTTTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 10 11 71981 CASAVA_Build 13 60016579 1D ATATCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 815 hom 29 2 21 6 A 16 15 71982 CASAVA_Build 13 60032064 2I AAATGGAAAC --/TG TGAGGTGATG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TG 1 2 71983 CASAVA_Build 13 60044956 1I AATGTTGAAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 8 9 71984 CASAVA_Build 13 60047330 3D AATTAAAAAC AGA/--- AGAAGGAAGG 3070 hom 114 het 41 0 35 6 AGA 2 1 71985 CASAVA_Build 13 60047637 1I AACAGAGGAA -/G GCCCATGGCA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 1 2 71986 CASAVA_Build 13 60050302 1D TTTCGTAAGG C/- TAGTTCTTTA 3070 hom 60 het 27 0 21 7 C 1 0 71987 CASAVA_Build 13 60056891 2D TGCTTGCCTA TT/-- TATAAAAGGG 3070 het 3070 ref 33 17 12 7 T 3 1 71988 CASAVA_Build 13 60057055 6I TTAATGCTAT ------/TTTTAA TCCCCCAACA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 TTTTAA 0 1 71989 CASAVA_Build 13 60057778 1I ACCAAAACCC -/T TAAATTCAGT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 1 2 71990 CASAVA_Build 13 60057854 2D GATCCGAGAC TG/-- TGGGGAGAAG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 TG 2 1 71991 CASAVA_Build 13 60057948 1D TTTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3023 hom 27 10 16 1 A 11 10 71992 CASAVA_Build 13 60060455 1D AAATCATGAC A/- TTTTAAATGA 3070 het 699 hom 23 5 16 2 A 1 0 71993 CASAVA_Build 13 60067469 2D CGCCCACCCC CT/-- GACAGGCCCC 2366 het 1788 hom 11 5 5 1 CT 1 0 71994 CASAVA_Build 13 60069700 1I TAAAAGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 39 1 19 19 A 10 11 71995 CASAVA_Build 13 60070749 2D CCAAGAAATC AG/-- AGATGACACA 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 AG 2 1 71996 CASAVA_Build 13 60075765 2D CTTGCGCCAA GC/-- ACACTTCTTG 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 GC 1 0 71997 CASAVA_Build 13 60076313 2I AAATAGACAC --/TG TGGACTACTA 3070 hom 102 het 40 0 33 7 TG 1 2 71998 CASAVA_Build 13 60077544 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 A 8 9 71999 CASAVA_Build 13 60078911 3D TTATTTTTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 1858 het 277 hom 16 4 5 8 T 19 16 72000 CASAVA_Build 13 60089800 2I TCTGCCTCTC --/TT TTGTTACTTC 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 T 2 4 72001 CASAVA_Build 13 60093553 1I GGCTGTCTGG -/A AAAAAAAAAA 1415 het 1415 ref 33 14 4 15 A 13 14 72002 CASAVA_Build 13 60093708 1I TCAGGGGCAT -/G GGTTTCCAGG 3070 hom 116 het 45 0 38 7 G 2 3 72003 CASAVA_Build 13 60098848 1D CTGAGGCACC T/- TTTTAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 27 11 T 5 4 72004 CASAVA_Build 13 60101140 1I TGCCAGTGTT -/A ACGATTAGCC 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 1 2 72005 CASAVA_Build 13 60104330 1I TATATATTGA -/T TTTTATACCT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 4 5 72006 CASAVA_Build 13 60104374 2I TGGTTATAAC --/GT GTGTGTGTGT 2309 het 2309 ref 29 14 6 9 GT 8 9 72007 CASAVA_Build 13 60104612 1I TTATTGGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 14 14 T 13 14 72008 CASAVA_Build 13 60106966 5I GACTTTTGAT -----/AATTC AATTATAACA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AATTC 0 1 72009 CASAVA_Build 13 60107985 3D TTTACATGTT TGA/--- TGGCCACTTG 3070 het 3070 hom 27 11 13 5 TGA 1 0 72010 CASAVA_Build 13 60114446 8I CTAACAGCAG --------/AAACAGCA AAACAGCATG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAACAGCA 1 2 72011 CASAVA_Build 13 60123257 1D CACCAGCATC T/- TTAAAGAGCT 3070 het 3070 ref 51 28 16 7 T 3 2 72012 CASAVA_Build 13 60127012 6D GGGATACTTT ATCTTC/------ TTCTTCTTCT 2456 het 550 hom 22 2 8 14 ATCTTC 1 0 72013 CASAVA_Build 13 60132664 4D CAAACTCTGA TATT/---- CTTTCTCTTG 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 TATT 1 0 72014 CASAVA_Build 13 60132761 3I GTCATTTATG ---/TTC TTCTCTAAAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 TTC 1 2 72015 CASAVA_Build 13 60134807 2D ATCACCCCAA AT/-- GCACAGATTA 3070 het 3070 ref 44 22 21 1 AT 1 0 72016 CASAVA_Build 13 60137915 1D CATGATTACA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 22 13 1 T 9 8 72017 CASAVA_Build 13 60143384 1D AGGTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 1645 het 1645 ref 24 8 5 11 A 11 10 72018 CASAVA_Build 13 60152957 4D AATTATAGTG TTTT/---- TTTTTTTTTC 3070 het 638 hom 26 3 9 14 T 13 9 72019 CASAVA_Build 13 60153061 1I AGAAAAAGTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 T 8 9 72020 CASAVA_Build 13 60153831 2D ATACGTATAT AC/-- ACACACGTAT 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 AC 4 3 72021 CASAVA_Build 13 60154512 1I AATCTCTAAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 8 9 72022 CASAVA_Build 13 60155664 1D CAGGTAGATT C/- GGGGTCTGTA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 1 0 72023 CASAVA_Build 13 60160795 1I ATGTTGAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 80 het 31 0 28 3 T 9 10 72024 CASAVA_Build 13 60161159 1D AGTATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2727 hom 30 7 10 14 T 15 14 72025 CASAVA_Build 13 60163657 4I GGTATGACTT ----/AGAA AGAAGTTTCA 3070 hom 71 het 35 0 33 2 AGAA 1 2 72026 CASAVA_Build 13 60168513 2I AGCAGTATCT --/TA GAGTCCCACA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TA 0 1 72027 CASAVA_Build 13 60175401 1I ATTTCATTCA -/T GTTTTATGGC 3070 het 2739 hom 31 11 19 1 T 0 1 72028 CASAVA_Build 13 60175714 1D TATTAGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 900 hom 39 2 31 6 T 13 12 72029 CASAVA_Build 13 60176158 1I TGTGTGGTCC -/A AAGCACAGAG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 A 2 3 72030 CASAVA_Build 13 60176544 4I GTCTTGATGC ----/TCTG TCTAATACTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCTG 0 1 72031 CASAVA_Build 13 60176723 4I TGTAATGATC ----/TTCT TTGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 TTCT 0 1 72032 CASAVA_Build 13 60179354 1D GATTTTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 11 10 72033 CASAVA_Build 13 60181263 3D ATGGAAAGTT AGG/--- AGAAGGAATT 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 AGG 1 0 72034 CASAVA_Build 13 60190151 1I AATGGACTAA -/T ATAGGAGGAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 72035 CASAVA_Build 13 60192330 2I TTCAGAAGAC --/TA TGTGGGTCAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TA 0 1 72036 CASAVA_Build 13 60193007 3D GGAAGGAAAT AGC/--- AGCCATTAGA 3070 het 3070 ref 54 28 18 8 AGC 2 1 72037 CASAVA_Build 13 60193996 3I AAAAAAAAAC ---/AAA AAAACAAAAA 3070 hom 11 het 22 0 15 7 A 4 7 72038 CASAVA_Build 13 60196311 4D AAAGTAAGAC AAAG/---- AAATCATCCA 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 AAAG 1 0 72039 CASAVA_Build 13 60200071 3D CCAGCCACTT CTC/--- CTCTCTACTG 3070 het 3070 hom 37 16 13 9 CTC 2 1 72040 CASAVA_Build 13 60201825 3D GAATTCTGAT GTC/--- GTTATGTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 5 GTC 1 0 72041 CASAVA_Build 13 60204082 2I CAGAGGGAGG --/GA GAGAGAAGAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 GA 3 4 72042 CASAVA_Build 13 60211572 3D CTCTATAAAC TCT/--- TCTTTGTTAT 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 TCT 2 1 72043 CASAVA_Build 13 60219233 1I ATAACTAATG -/T TTATAAAGGG 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 2 3 72044 CASAVA_Build 13 60225603 2I CAAAAAAAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 24 5 11 8 AC 0 1 72045 CASAVA_Build 13 60232789 1I GAAAAATTAG -/T TTTGGTGGTT 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 T 3 4 72046 CASAVA_Build 13 60234477 4D GATTCAGTTT GTGA/---- GTATTTTGTT 3070 het 3070 hom 49 23 24 6 GTGA 1 0 72047 CASAVA_Build 13 60240268 1I GCCACTTCAC -/T TTTTTTTTTT 2340 het 2340 ref 27 13 7 7 T 10 11 72048 CASAVA_Build 13 60243211 4I TTCACTGACC ----/TATT TATTATTTCA 3070 het 3070 hom 48 20 19 9 TATT 1 2 72049 CASAVA_Build 13 60243381 4D AACAAAGTAA CTTG/---- CTTCAAATTT 3070 het 3070 ref 49 23 20 8 CTTG 1 0 72050 CASAVA_Build 13 60246192 1D GTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2611 het 2611 ref 38 13 9 16 T 13 12 72051 CASAVA_Build 13 60246241 1D TTGTTCTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 T 9 8 72052 CASAVA_Build 13 60246326 1I TACCACTATA -/C ACTTTCCTCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 C 0 1 72053 CASAVA_Build 13 60247532 3I CTTTTTATGA ---/TGC TAATGTAACT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 TGC 0 1 72054 CASAVA_Build 13 60253574 1D TGGTTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2536 hom 30 8 12 11 T 15 14 72055 CASAVA_Build 13 60253975 4I CTCAATAATC ----/TTTG TTTATGTCCA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 TTTG 0 1 72056 CASAVA_Build 13 60254325 1I AGATGAAAGG -/C ATGTTGGCCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 C 0 1 72057 CASAVA_Build 13 60255855 2D ATACACATAC AT/-- ATATATATAT 2969 het 2969 ref 25 12 9 4 AT 8 7 72058 CASAVA_Build 13 60259991 2I GGAGTTTTGA --/TT TTTTTTTTTT 2187 het 2187 ref 24 9 9 6 T 13 15 72059 CASAVA_Build 13 60269045 2I TGGCCCTCAC --/AG AGACACACCC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 AG 1 2 72060 CASAVA_Build 13 60269779 1I AACTGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 10 11 72061 CASAVA_Build 13 60284350 3D TTTTGCAGCA AAC/--- AACAGGATCT 3070 het 3070 ref 37 19 13 9 AAC 2 1 72062 CASAVA_Build 13 60285849 1D ATCTCCAACC A/- AATGTTTCCC 3070 het 3070 hom 55 20 25 12 A 3 2 72063 CASAVA_Build 13 60289597 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTATT 1601 het 1601 ref 17 10 6 1 T 8 7 72064 CASAVA_Build 13 60295175 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 543 hom 19 5 8 6 A 17 16 72065 CASAVA_Build 13 60296042 1D CCTGAAGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 T 10 9 72066 CASAVA_Build 13 60309019 10D TTCCCATCGC ATATTATGGG/---------- TTAAACATAG 3070 het 3070 ref 45 24 15 7 ATATTATGGG 1 0 72067 CASAVA_Build 13 60310602 1I GAACTAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 10 11 72068 CASAVA_Build 13 60316556 1D TTTCTGGCAG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 9 8 72069 CASAVA_Build 13 60317157 9I TAACATCACT ---------/TTGTGTATG GTTTTCTAAA 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 TTGTGTATG 0 1 72070 CASAVA_Build 13 60318657 3I ACAGCAGAAA ---/TCT TCTCCATTGG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 TCT 1 2 72071 CASAVA_Build 13 60328367 3D ATTTTAGTTA TTC/--- TTTTATAATT 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 TTC 1 0 72072 CASAVA_Build 13 60329747 2D GTCCTTCCTC TT/-- TTAAGTTGCT 3070 het 3070 ref 63 31 28 6 T 4 2 72073 CASAVA_Build 13 60333044 2D GCATTATAAC AT/-- AATTTTTTAG 3070 het 3070 ref 40 17 18 6 AT 1 0 72074 CASAVA_Build 13 60333888 2D CTTACCCATA GG/-- TCTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 G 2 0 72075 CASAVA_Build 13 60338999 3I TAATATTCTC ---/TGA TGGTTATTTG 2797 het 2797 ref 25 17 7 1 TGA 0 1 72076 CASAVA_Build 13 60341245 1I AGTTCTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 14 15 72077 CASAVA_Build 13 60346842 1I CAGTAGTGGC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 7 8 72078 CASAVA_Build 13 60350430 2D AAAATGTTCC TG/-- TCTTTCCCCA 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 TG 1 0 72079 CASAVA_Build 13 60367367 3D AAAAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAGA 2652 het 798 hom 17 6 11 1 A 11 8 72080 CASAVA_Build 13 60370080 1I TCTGTCATCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 A 9 10 72081 CASAVA_Build 13 60372574 1D GCTGCAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 11 10 72082 CASAVA_Build 13 60386014 6I TGGAAGATAA ------/CAACAG CAGCAACAAC 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 CAACAG 0 1 72083 CASAVA_Build 13 60388714 1D GCCTATACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 A 10 9 72084 CASAVA_Build 13 60392440 4I AACAATAAAA ----/GTAT GTATTCTATT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 GTAT 1 2 72085 CASAVA_Build 13 60393704 1I CCATATTTGG -/A AAATGTTATG 3070 het 3070 ref 57 31 21 5 A 3 4 72086 CASAVA_Build 13 60396087 4D AAATAAATCA TAGT/---- TAGTAAAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAGT 2 1 72087 CASAVA_Build 13 60419852 1D CTGAAGACTT C/- CCCCCCCGCT 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 C 8 7 72088 CASAVA_Build 13 60420877 2D AAAACAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2547 hom 29 10 12 10 A 16 14 72089 CASAVA_Build 13 60422716 1I AAAGAGCAGT -/G CAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 G 0 1 72090 CASAVA_Build 13 60424182 2I TTAACTTGCT --/AG AGTTTGATCA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AG 1 2 72091 CASAVA_Build 13 60430475 6D CCACTCTGCT GCTAGG/------ GCTAGGGCTA 3070 het 3070 ref 35 14 10 13 GCTAGG 3 2 72092 CASAVA_Build 13 60431293 4D ATATAAACAC ACTT/---- AAGTAAGAGT 3070 het 3070 ref 46 28 13 6 ACTT 1 0 72093 CASAVA_Build 13 60437454 1I ATGAAATTTA -/C AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 C 0 1 72094 CASAVA_Build 13 60440731 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 T 11 10 72095 CASAVA_Build 13 60441429 1D TCATCTCACA G/- GAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 G 2 1 72096 CASAVA_Build 13 60442325 4D TTAAACTAAC AGAG/---- AGAAATTGTG 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 AG 3 1 72097 CASAVA_Build 13 60451190 2D GCATATATAT AA/-- GTTTTCTACT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 2 0 72098 CASAVA_Build 13 60460108 1I AACCAGTTTA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 T 6 7 72099 CASAVA_Build 13 60467162 4D TATATATATA TATG/---- TATATATATA 366 het 166 hom 4 1 3 1 TATG 1 0 72100 CASAVA_Build 13 60472352 1I TGTGCTGAGG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 7 8 72101 CASAVA_Build 13 60479913 1I CATAAGCAAC -/A AGGAGCTGAA 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 A 1 2 72102 CASAVA_Build 13 60485288 5D TTTAGTCGTC TTTTT/----- TTTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 20 8 T 8 3 72103 CASAVA_Build 13 60485962 4I CTTCCTACAT ----/TCCC TCTCTATTCC 3070 het 3070 hom 51 23 20 8 TCCC 0 1 72104 CASAVA_Build 13 60488082 4D TTGCTTAGAG CTAA/---- CTAACTTTTT 3070 het 3070 ref 45 27 13 8 CTAA 2 1 72105 CASAVA_Build 13 60488327 1D TTATTTCTCA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 T 9 8 72106 CASAVA_Build 13 60492769 1D TAGTTACATG A/- AAAAAAATAA 1952 hom 17 het 28 0 5 26 A 8 7 72107 CASAVA_Build 13 60495274 1D CAATATTTTT A/- ACAAGTAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 1 72108 CASAVA_Build 13 60495556 2D CCTGGGTGAC AG/-- AGAGAGAGAC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AG 5 4 72109 CASAVA_Build 13 60500432 1I AAAGGAATAG -/T AGAGTGCAGG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 T 0 1 72110 CASAVA_Build 13 60505476 1I ATTTATAAGT -/G GGAGCGGAAT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 G 2 3 72111 CASAVA_Build 13 60506566 1I TTTTCATTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 T 9 10 72112 CASAVA_Build 13 60509779 5D AGCCCATGAG TAATT/----- TAAAAGTATA 3070 het 3070 ref 23 12 11 1 TAATT 1 0 72113 CASAVA_Build 13 60510695 4D AGAAATGAAG AACA/---- AACAACAGGG 3070 het 3070 ref 37 20 15 5 AACA 2 1 72114 CASAVA_Build 13 60511605 1D GAAATGTTGG A/- AATTTGTCGA 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 A 3 2 72115 CASAVA_Build 13 60517129 5D GCAACAGAAG GTAAA/----- TAAAGGTAAT 3070 het 3070 hom 38 13 21 9 GTAAA 1 0 72116 CASAVA_Build 13 60517729 9I AAATAGATCA ---------/TGTCCTTTT AAGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 TGTCCTTTT 0 1 72117 CASAVA_Build 13 60518407 1D AGGAATACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 T 12 11 72118 CASAVA_Build 13 60519490 1D CTAGATATTC T/- TTATGACTTT 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 T 3 2 72119 CASAVA_Build 13 60520076 4I TTGAAAATGT ----/GTAA GTAAGTACAA 3070 het 3070 hom 43 15 16 12 GTAA 1 2 72120 CASAVA_Build 13 60521050 1D TAACTTAAAT G/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 G 1 0 72121 CASAVA_Build 13 60521428 4I TTTTTATATC ----/TGTT TGTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 TGTT 1 2 72122 CASAVA_Build 13 60522086 1D GAGAAGACAC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 29 1 15 15 A 1 0 72123 CASAVA_Build 13 60522778 1D CAGTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 2878 het 2878 ref 46 30 7 10 A 12 11 72124 CASAVA_Build 13 60525908 5I AGATTAATTG -----/AAATA AAATATGTTT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 AAATA 1 2 72125 CASAVA_Build 13 60534494 5D TGGAATATCT TTTCA/----- TTTATTTGTG 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 TTTCA 1 0 72126 CASAVA_Build 13 60534658 3I CTGCCAAGTA ---/CAG TATTAAAAGT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 CAG 0 1 72127 CASAVA_Build 13 60534826 55I TTTCACTTAA -------------------------------------------------------/AGTCCCAATCTCCAAGAACCTATAGGTGATGGTAAGTAAAGATTTACTATAATTT CTCCCCATCT 3070 het 3070 ref 32 17 11 8 AGTCCCAATCTCCAAGAACCTATAGGTGATGGTAAGTAAAGATTTACTATAATTT 0 1 72128 CASAVA_Build 13 60535563 3D TTATTCACAT TTA/--- TTTTAATGTA 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 TTA 1 0 72129 CASAVA_Build 13 60535624 12D AATCTAATAT TGTGTCTGTGTG/------------ TGTGTCTGTG 2726 het 2726 ref 30 21 8 4 TGTGTCTGTGTG 1 0 72130 CASAVA_Build 13 60536295 3D CAAAACTGAT CTC/--- CTGGAAACTC 3070 het 3070 ref 57 30 23 4 CTC 1 0 72131 CASAVA_Build 13 60536588 1I TTGTTCATAG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 T 6 7 72132 CASAVA_Build 13 60537576 3I TTCCAGAAGT ---/ATC ATTCTTTAAC 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 ATC 0 1 72133 CASAVA_Build 13 60537916 1I TCAGGGTTTT -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 6 7 72134 CASAVA_Build 13 60538310 1I TGAGAAATGG -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 A 6 7 72135 CASAVA_Build 13 60539960 1I AAGTATATCC -/A AAAAAGACAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 5 6 72136 CASAVA_Build 13 60541178 4D GGAGATTTCT TAGG/---- TAGGCTCTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 3 TAGG 2 1 72137 CASAVA_Build 13 60545386 4D GTGAACAAAC AAAG/---- AAGCTTAGGG 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 AAAG 1 0 72138 CASAVA_Build 13 60548245 1I AGCCCCTACC -/A TCATAGTCCC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 0 1 72139 CASAVA_Build 13 60553539 1D AACACAGGTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 11 24 5 T 9 8 72140 CASAVA_Build 13 60554777 1I ACTATTATAA -/T TTTAAATTAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 3 4 72141 CASAVA_Build 13 60555022 3D TAACAAAGAT ATC/--- ATAAGACAAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 ATC 1 0 72142 CASAVA_Build 13 60555589 2D AAATAGTGAC AG/-- ATGTTATTTA 3070 het 3070 hom 34 11 18 7 AG 1 0 72143 CASAVA_Build 13 60555725 1I TGTTAATAAT -/A GGGGTAAATG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 72144 CASAVA_Build 13 60557196 1D TTTGTGAGGA C/- ATTTTAATTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 C 1 0 72145 CASAVA_Build 13 60563723 4I TTCCTCCACA ----/ACTC ACTATTCCAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 ACTC 0 1 72146 CASAVA_Build 13 60569071 1I CATTGGCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1289 hom 38 3 32 3 T 10 11 72147 CASAVA_Build 13 60572339 1D CTGGATGCTC A/- AGGCAGAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 2 1 72148 CASAVA_Build 13 60574281 5D AGGGAATATG CTTAA/----- CTTATTAGAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 5 CTTAA 1 0 72149 CASAVA_Build 13 60577851 4D TAGATTTACC TGTT/---- TGTTTACCTC 3070 hom 87 het 36 0 30 7 TGTT 2 1 72150 CASAVA_Build 13 60578936 1D GTTACTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 11 10 72151 CASAVA_Build 13 60584712 4I TGGAAATACT ----/GATA AATAGAAAAC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 GATA 0 1 72152 CASAVA_Build 13 60586395 1D TTAAAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 37 2 17 18 T 13 12 72153 CASAVA_Build 13 60588283 1D TCCTGTCAAC A/- AAATTTGGGG 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 A 4 3 72154 CASAVA_Build 13 60594726 1D CTGCAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 17 6 A 11 10 72155 CASAVA_Build 13 60596930 1I TCAGGGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1254 hom 31 3 18 10 T 15 16 72156 CASAVA_Build 13 60600052 1D TCACTCCTAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 39 het 35 0 12 23 T 9 8 72157 CASAVA_Build 13 60600615 5D AGATATGCTC TTTAT/----- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 4 TTTAT 2 1 72158 CASAVA_Build 13 60602209 5D AGCTATTTTT GTTTA/----- GTTGAGTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 21 4 GTTTA 1 0 72159 CASAVA_Build 13 60606663 1D ATATATAAGG T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 T 7 6 72160 CASAVA_Build 13 60612565 3I TCATTCCTTG ---/ATT ATATTTTCAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 ATT 0 1 72161 CASAVA_Build 13 60614260 2I ATGAATAAAC --/AT ATTAGATGTG 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 AT 1 2 72162 CASAVA_Build 13 60614330 2I CTACTTTAAT --/AG AGATTGTTTA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 AG 1 2 72163 CASAVA_Build 13 60620100 19I CCTCTTACTG -------------------/AATTATAGATAACATTAAA AAGTGCCATA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 AATTATAGATAACATTAAA 0 1 72164 CASAVA_Build 13 60639082 5D TAATAATGAC TAAAT/----- TACATTTCAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 6 TAAAT 1 0 72165 CASAVA_Build 13 60640146 2I GTAGAATGTA --/CT CTTTTTTTTT 3070 het 2956 hom 28 9 16 3 CT 1 2 72166 CASAVA_Build 13 60645351 4D GTAATGAGGC ATTT/---- ATTTATTATT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 ATTT 2 1 72167 CASAVA_Build 13 60650819 3D CATACAATTA TAT/--- TATAATAGAA 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 TAT 2 1 72168 CASAVA_Build 13 60661979 18D56M3D TCTAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTTATTCATTCTTTGCCTATTTCTGTTAACTTTTTTTTTTACCATGTTAAAAGTGATT/------------------AGTTATTCATTCTTTGCCTATTTCTGTTAACTTTTTTTTTTACCATGTTAAAAGTG--- ATTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 14 14 20 N/A 0 0 72169 CASAVA_Build 13 60666021 4D AGACATTGGA ATTG/---- ATTATGTGTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 6 ATTG 1 0 72170 CASAVA_Build 13 60667268 1D CATGAGGCAT A/- AAATGAGATG 3070 het 3070 hom 33 9 22 4 A 4 3 72171 CASAVA_Build 13 60669279 2I ACTCAATATT --/TG TGTGTGTGTG 2989 het 2989 ref 36 11 12 13 TG 8 9 72172 CASAVA_Build 13 60671236 1D TTATAATTTA T/- TTTTAAAATG 2655 het 2655 ref 21 12 6 3 T 5 4 72173 CASAVA_Build 13 60675185 4D AAATTCCTTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 15 22 13 A 16 12 72174 CASAVA_Build 13 60684484 3I AACCATAAAC ---/ATT ATAATTCTAA 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 ATT 0 1 72175 CASAVA_Build 13 60694659 1I TCCTAATATC -/G GGGGGGGGGG 1560 het 580 hom 36 5 9 22 G 10 11 72176 CASAVA_Build 13 60696767 1I AGGGGGGTGG -/C ACCCTCCACC 2967 hom 42 het 19 0 13 6 C 0 1 72177 CASAVA_Build 13 60697796 1D ATATCACTGT G/- GGGTGTACTG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 G 4 3 72178 CASAVA_Build 13 60701918 1D AATATCACAA G/- GGGGGTGTAC 3070 het 3070 ref 34 19 9 7 G 6 5 72179 CASAVA_Build 13 60709238 4I AACCTGTAGT ----/TAGA TAGAAAGAAT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 TAGA 1 2 72180 CASAVA_Build 13 60709615 2D AAATTTTCTC AG/-- AGAGTGGGAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 6 AG 3 2 72181 CASAVA_Build 13 60710071 1I GGAAAGAACT -/G TCATGATCCA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 G 0 1 72182 CASAVA_Build 13 60710630 1D TGTAGGATAG A/- AAAATTACAC 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 5 4 72183 CASAVA_Build 13 60712685 1D GTCACAGGAG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 35 19 16 1 A 8 7 72184 CASAVA_Build 13 60713675 4D GTAATAAGCT TACA/---- TAAATTATTA 3070 het 3070 ref 31 20 11 0 TACA 1 0 72185 CASAVA_Build 13 60713909 3I CACTATGATT ---/AAG AAGAAGTAAG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AAG 2 3 72186 CASAVA_Build 13 60714279 1I TCAGGTAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 10 11 72187 CASAVA_Build 13 60715816 1I GATATATAGT -/A AAAATATTAA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 A 4 5 72188 CASAVA_Build 13 60717861 13D ATTCTTCTGC ATATGACTAGCCA/------------- GTTATCCCAG 3070 het 3070 ref 34 22 16 3 ATATGACTAGCCA 1 0 72189 CASAVA_Build 13 60718426 1I GATTCATAGA -/T TTTTGTCTCT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 4 5 72190 CASAVA_Build 13 60720230 1I TCTCCCCTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 2394 hom 22 7 8 7 T 8 9 72191 CASAVA_Build 13 60721483 2D AATAATATTC AT/-- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 ref 45 23 20 8 AT 1 0 72192 CASAVA_Build 13 60722083 4D TCCAAATTCT ATCA/---- GTCAGAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 ATCA 1 0 72193 CASAVA_Build 13 60724983 1D ATAAGATCTT A/- AAGGATGGGC 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 A 3 2 72194 CASAVA_Build 13 60730250 1I TGTAATTTCA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 45 20 18 7 T 8 9 72195 CASAVA_Build 13 60730948 1D TGTTTTTCAC T/- TTATAAATGT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 3 2 72196 CASAVA_Build 13 60733355 1I GATTTTCCTG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 T 7 8 72197 CASAVA_Build 13 60753170 4I TTGTGTGTGT ----/TTTA TTGTTTGTTT 2002 het 2002 ref 23 12 7 4 TTTA 0 1 72198 CASAVA_Build 13 60758710 1I CACAGAGAAT -/A AGGTGAATTC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 1 2 72199 CASAVA_Build 13 60761782 1D TATTTAAAAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 A 8 7 72200 CASAVA_Build 13 60767572 4D GTAGCATGCT AGAC/---- AGACACAACA 3070 het 3070 hom 40 18 20 6 AGAC 2 1 72201 CASAVA_Build 13 60774807 1I AACCCCCCCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 9 10 72202 CASAVA_Build 13 60775250 1D CCTTCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 11 10 72203 CASAVA_Build 13 60777080 1D GTAAAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 757 hom 25 3 18 5 A 15 14 72204 CASAVA_Build 13 60777960 1I ATTTGTTCTA -/C CACATAGCAA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 C 1 2 72205 CASAVA_Build 13 60779456 1I TTTGTTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 11 15 T 13 14 72206 CASAVA_Build 13 60781465 5D TAAGTTTATT TAAAA/----- TAAAATATAT 3070 het 2951 hom 26 8 16 4 TAAAA 2 1 72207 CASAVA_Build 13 60781793 2D GAAACAGTAC AG/-- TTATGCCAGC 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 AG 1 0 72208 CASAVA_Build 13 60782481 1D CAGCTATAAG T/- TTTATAAGTA 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 T 4 3 72209 CASAVA_Build 13 60789732 4D TAAAGAAAAT TTTG/---- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 TTTG 1 0 72210 CASAVA_Build 13 60789886 1D AAATTTTAGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 7 6 72211 CASAVA_Build 13 60790075 3I GATTTAAAGA ---/ATG ATATTTTCAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 ATG 0 1 72212 CASAVA_Build 13 60792261 4D ATCCCTGGAA TGAT/---- GTGCATTGTG 3070 het 3070 hom 27 8 19 3 TGAT 1 0 72213 CASAVA_Build 13 60806656 4D GTCAACTGCT CTTA/---- CTTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 CTTA 1 0 72214 CASAVA_Build 13 60806957 4D GCCACTGCAC TCCA/---- TCCAGCCTGG 2729 hom 13 het 13 0 8 5 TCCA 2 1 72215 CASAVA_Build 13 60808207 2D26M1D GTAAAATCTC TGTAATTCATTATATTAAATAGTATAATA/--TAATTCATTATATTAAATAGTATAAT- AAAATTATGC 3070 het 3070 ref 38 21 20 4 N/A 0 0 72216 CASAVA_Build 13 60811135 9D TGACAGCCTG CTGGCAGCC/--------- CTGGCAGCCC 1743 het 1743 ref 22 13 4 5 CTGGCAGCC 2 1 72217 CASAVA_Build 13 60814940 1I CACACATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 31 1 16 14 A 14 15 72218 CASAVA_Build 13 60826987 1I GGAGGAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 9 10 72219 CASAVA_Build 13 60833921 1I TCCAAATGAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 8 9 72220 CASAVA_Build 13 60841644 1I GGGAGGCCAA -/G GCAGGCAGAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 2 72221 CASAVA_Build 13 60843456 11I ATTGTGTCAG -----------/GCATTATATTT GCATCATTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GCATTATATTT 0 1 72222 CASAVA_Build 13 60845236 1I ATAATTTACA -/T TGTATCCCAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 2 72223 CASAVA_Build 13 60848397 1I TTTTTAAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 9 10 72224 CASAVA_Build 13 60852888 1I AACAGAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 A 9 10 72225 CASAVA_Build 13 60857022 5I ATAGAGAAAT -----/AGCTG CCCAGTTTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AGCTG 0 1 72226 CASAVA_Build 13 60858445 2I ATACAAAAAC --/AT ATTTTTCATA 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 AT 1 2 72227 CASAVA_Build 13 60859415 1I TTTGAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 13 14 72228 CASAVA_Build 13 60861311 1D ATTGCCAGGC T/- TTATAAATAT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 3 2 72229 CASAVA_Build 13 60865768 1D ACAATGACTT G/- TTTGCTGCTA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 G 1 0 72230 CASAVA_Build 13 60866014 3D TCATGAATAT TTA/--- CACTTTATTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 TTA 1 0 72231 CASAVA_Build 13 60876593 1D AGCTACAGGT C/- GGGGGTAGAT 3070 het 3070 ref 38 19 13 8 C 1 0 72232 CASAVA_Build 13 60879933 1D AGAAATAACT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 9 8 72233 CASAVA_Build 13 60883136 1I ATGTCCAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 653 hom 21 4 14 3 T 15 16 72234 CASAVA_Build 13 60891026 1D GAGGCTGAGG T/- GGGCGGATGG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 1 0 72235 CASAVA_Build 13 60892883 1I CCTGATGACT -/A CTTTTTTATG 3070 hom 90 het 39 0 34 5 A 0 1 72236 CASAVA_Build 13 60895016 1D GTGCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 39 1 35 3 A 13 12 72237 CASAVA_Build 13 60904528 1I CTAGAGAGAG -/A AAAAAACTAA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 6 7 72238 CASAVA_Build 13 60914314 1D AACCATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 11 10 72239 CASAVA_Build 13 60914972 2I ATTAGCAGAC --/TT AATATTTTCA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 0 2 72240 CASAVA_Build 13 60927728 1D CAGCCTATGT G/- TGTCCTTAAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 1 0 72241 CASAVA_Build 13 60936505 1I TTTTCTTCTT -/C TCTTTTTTAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 C 0 1 72242 CASAVA_Build 13 61082689 1I TTAGAACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 25 18 10 T 11 12 72243 CASAVA_Build 13 61160360 1I ATTCCTGAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 9 10 72244 CASAVA_Build 13 61254544 1I TCTTTCTGTC -/T TTTCAATAGC 3070 hom 141 het 59 0 48 11 T 3 4 72245 CASAVA_Build 13 61398374 1D AGGTTTTTGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 8 72246 CASAVA_Build 13 61402032 1D AATACTCTGT A/- AAATCCAAGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 3 72247 CASAVA_Build 13 61411673 41I CATCTCTCAC -----------------------------------------/TCTGCTTCTACCCTCCCCACTTCTGGAGTTCCAAGTGTCTA TTATTTTCAT 3070 hom 71 het 29 0 23 8 TCTGCTTCTACCCTCCCCACTTCTGGAGTTCCAAGTGTCTA 0 1 72248 CASAVA_Build 13 61416777 4D CACGATTGTC ATAT/---- TTATTAATAT 3070 hom 18 het 8 0 7 2 AT 2 0 72249 CASAVA_Build 13 61418906 2I ATCAGTACTC --/TT TTTGTTTTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 3 5 72250 CASAVA_Build 13 61420289 1D ACTAATAAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 9 8 72251 CASAVA_Build 13 61535408 2D GGTAGAATCA AT/-- ATTGTGAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 6 AT 2 1 72252 CASAVA_Build 13 61538885 1I GTCAGTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 10 11 72253 CASAVA_Build 13 61542217 1D ACTACATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 A 12 11 72254 CASAVA_Build 13 61545034 1D TATATTCATA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 33 17 9 8 T 7 6 72255 CASAVA_Build 13 61551529 1D TCTACAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 199 hom 44 2 24 18 A 13 12 72256 CASAVA_Build 13 61552624 1D TGGGGGGCGA T/- TTCCCCCATG 3070 het 3070 hom 44 21 16 8 T 3 2 72257 CASAVA_Build 13 61558743 4I TAGTATAGTC ----/TGAG TATTTCTAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TGAG 0 1 72258 CASAVA_Build 13 61586332 1I ACTCCATATG -/A AAAATGGTTA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 4 5 72259 CASAVA_Build 13 61589251 2I ATTGCTGGTT --/TC CTTTACCATC 3070 het 2944 hom 24 6 14 4 TC 0 1 72260 CASAVA_Build 13 61591458 2D GTCATAAGTA AC/-- ACATATGTTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 9 AC 2 1 72261 CASAVA_Build 13 61598110 2D TTATATATAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2068 hom 17 7 9 1 AT 7 6 72262 CASAVA_Build 13 61606465 4I AGTATTTAAA ----/AATT AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AATT 2 3 72263 CASAVA_Build 13 61635714 3I CAATGCAGAA ---/AAG AAAGAAGCCA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 AAG 0 1 72264 CASAVA_Build 13 61648443 2D GTGGTTTCAT GA/-- AAAAGCTAGA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 GA 1 0 72265 CASAVA_Build 13 61656038 3D TCTAATATTT TTC/--- TTCTGCTGCA 3070 het 3070 hom 39 15 19 8 TTC 2 1 72266 CASAVA_Build 13 61657820 1D TTCACAAGTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 T 9 8 72267 CASAVA_Build 13 61659945 1D ACTACAGAGG T/- TTTTTTTTTT 2562 het 786 hom 23 2 10 11 T 17 16 72268 CASAVA_Build 13 61667353 1D TAGATTATCA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 8 7 72269 CASAVA_Build 13 61670074 8D AACAAAAATT AGCTGGGC/-------- ATGGTGGTGT 3070 het 3070 hom 22 10 12 1 AGCTGGGC 1 0 72270 CASAVA_Build 13 61670225 1I ACTCCGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 10 11 72271 CASAVA_Build 13 61670390 2D CTCTTGTTAT TC/-- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 TC 4 3 72272 CASAVA_Build 13 61671150 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 1279 het 200 hom 7 1 3 3 T 8 9 72273 CASAVA_Build 13 61673662 1I AATAAAAACC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 7 8 72274 CASAVA_Build 13 61677080 1I TAAAGAGTAT -/A TAAATAAATC 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 A 0 1 72275 CASAVA_Build 13 61677326 7I GAGATGGGAG -------/GTAAATC TTAAATCTTT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 GTAAATC 0 1 72276 CASAVA_Build 13 61677479 6I TAGGGAGGGT ------/AAGGAA AAGTAATTTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 AAGGAA 0 1 72277 CASAVA_Build 13 61677594 2D GGTCGATTTC TA/-- TGTTTGTCCA 3070 het 3070 ref 40 23 12 6 TA 1 0 72278 CASAVA_Build 13 61678368 1I ATTCTGTTGG -/T AGTCATTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 T 0 1 72279 CASAVA_Build 13 61680516 1D ACCCAAAAAT A/- ATTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 A 2 1 72280 CASAVA_Build 13 61681425 1I GTTGGAGATA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 T 8 9 72281 CASAVA_Build 13 61682444 2I TATATTTCTT --/TC TGTTTTTCAT 3070 het 2061 hom 23 6 9 8 TC 0 1 72282 CASAVA_Build 13 61682492 3D ATTAGTAGTC ATT/--- AATCATTATA 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 ATT 1 0 72283 CASAVA_Build 13 61683448 3I CCCTACAGTT ---/ATG TTTTATGATT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 ATG 0 1 72284 CASAVA_Build 13 61683515 1D ATCTGATAAA C/- TAATCAGAAA 3070 het 3070 hom 39 20 19 2 C 1 0 72285 CASAVA_Build 13 61684836 4I TCAGAATAGA ----/TTCT TTCTTTCTTT 3070 het 2652 hom 27 11 10 6 TTCT 2 3 72286 CASAVA_Build 13 61690108 1D TCAAAAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 A 10 9 72287 CASAVA_Build 13 61691695 2I AAGGACACTG --/AT TTAAACCTGG 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 AT 0 1 72288 CASAVA_Build 13 61693502 4I CATTTCTAAC ----/AAGT GAGTGAATGA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 AAGT 0 1 72289 CASAVA_Build 13 61696088 1I CTCTGTTTTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 T 7 8 72290 CASAVA_Build 13 61696702 3D AATGACTAAT AAG/--- AAGTTTTAAA 3070 het 3070 hom 45 22 20 4 AAG 2 1 72291 CASAVA_Build 13 61699267 1D TTTTATAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 12 11 72292 CASAVA_Build 13 61700220 2I AAAGATCTGT --/TA TATATATATA 2805 het 2805 ref 32 20 8 4 TA 7 8 72293 CASAVA_Build 13 61706800 1D GGAAGAAGAG C/- TATATGTTAC 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 C 1 0 72294 CASAVA_Build 13 61724987 1I ATGTACCACA -/T TTTTTTTTTT 2753 het 1028 hom 30 4 11 15 T 14 15 72295 CASAVA_Build 13 61740939 1I TAACTCCCTT -/A ATTTCTGGCG 3070 het 3070 hom 47 13 28 6 A 1 2 72296 CASAVA_Build 13 61762068 1D AGTGTGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 11 10 72297 CASAVA_Build 13 61778056 3I GTGAAAGTGA ---/AAG AAGTGTTTCG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAG 1 2 72298 CASAVA_Build 13 61783917 1D TATTGGAGTT G/- GCATTTGGTA 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 G 2 1 72299 CASAVA_Build 13 61784033 1I CAGCACTTGA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 C 8 9 72300 CASAVA_Build 13 61785056 1D CCCCATTGAC A/- AAAAACACAT 3070 het 3070 hom 35 15 14 7 A 6 5 72301 CASAVA_Build 13 61787186 3D GTGTCACAGA CTT/--- CTTCTTCTTC 1387 het 1387 ref 37 10 10 17 CTT 7 6 72302 CASAVA_Build 13 61791937 2I TAACATGCAC --/AT GTCTTGTGAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AT 0 1 72303 CASAVA_Build 13 61792905 1I ATTTTTGAAA -/G GTCTGTGTGA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 G 1 2 72304 CASAVA_Build 13 61796114 1D TATAGTATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 10 9 72305 CASAVA_Build 13 61802831 1I TTCATTCTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 16 18 4 T 9 10 72306 CASAVA_Build 13 61809489 4I TGGCTGAGTC ----/TGTT TGTCCAGAAA 3070 het 3070 hom 47 16 28 3 TGTT 0 1 72307 CASAVA_Build 13 61811821 1D CTGATTATTG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 9 8 72308 CASAVA_Build 13 61814062 2D AGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2044 hom 35 11 21 3 TA 7 6 72309 CASAVA_Build 13 61814508 2I CACACACACG --/CA CACGCACACA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 CA 1 2 72310 CASAVA_Build 13 61821681 1I GCTTGGAATT -/C CAGCTAGCCA 2884 het 2884 ref 38 19 10 9 C 1 2 72311 CASAVA_Build 13 61822541 4I TGAAGTTTTC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 TTAT 4 5 72312 CASAVA_Build 13 61824857 2D TGAAAGTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1026 het 553 hom 26 7 5 14 T 18 16 72313 CASAVA_Build 13 61828540 1D TATCTTGTAG A/- AAACAAAAAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 4 3 72314 CASAVA_Build 13 61829875 1I TCACCCCCCC -/A CCCCGCCCCC 1939 hom 11 het 11 0 7 4 A 0 1 72315 CASAVA_Build 13 61847159 4I ATACAAACTC ----/ATAA ATAAAGATAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ATAA 1 2 72316 CASAVA_Build 13 61853257 3D AGAAACAAGA AGC/--- AGACGATGTG 3070 het 3070 ref 51 27 22 3 AGC 1 0 72317 CASAVA_Build 13 61855007 1I TAAAGTCATC -/T TTTTCACCTT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 4 5 72318 CASAVA_Build 13 61858178 1D TCAAAAAAAA G/- AAAAAAATTC 3070 het 466 hom 25 2 19 4 G 1 0 72319 CASAVA_Build 13 61860055 2D CATTTTCTCA CT/-- CTCACATCGA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 CT 2 1 72320 CASAVA_Build 13 61860283 1I CAGTGAGGAA -/G AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 G 0 1 72321 CASAVA_Build 13 61860739 1D TAAAGCAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 11 10 72322 CASAVA_Build 13 61865377 1I ATAAACAGAA -/T TTTTTTCCTC 2910 het 2910 ref 23 12 6 5 T 6 7 72323 CASAVA_Build 13 61867551 1I TAGTCACACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 9 10 72324 CASAVA_Build 13 61868766 2D AACTTGATCT CA/-- GTGTTCTACA 3070 het 3070 ref 33 14 14 6 CA 1 0 72325 CASAVA_Build 13 61872654 2D GTGAGTACTA TT/-- CTTGTAGTGG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 2 0 72326 CASAVA_Build 13 61877772 1I TAAAAACAAA -/C ACAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 C 0 1 72327 CASAVA_Build 13 61880179 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 9 7 72328 CASAVA_Build 13 61888596 2I AAACTTAGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2889 hom 24 9 11 4 TA 7 8 72329 CASAVA_Build 13 61893473 13D TTGTAGTTAA AACCTCTGGTGAT/------------- AACCTTGAAA 3070 het 3070 ref 32 19 15 1 AACCTCTGGTGAT 1 0 72330 CASAVA_Build 13 61898784 1I AGAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 A 10 11 72331 CASAVA_Build 13 61911801 2D AAGGAGTATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 26 11 9 7 CA 10 9 72332 CASAVA_Build 13 61919101 1D CATAATATAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 9 72333 CASAVA_Build 13 61930920 1D CTTTTAGTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 10 9 72334 CASAVA_Build 13 61948047 4D ATAAATTTAA AAAT/---- AAATGAATGG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AAAT 2 1 72335 CASAVA_Build 13 61952389 2D AGATAGAGAA AG/-- AGAGCAAAAG 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 AG 3 2 72336 CASAVA_Build 13 61957161 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 A 12 11 72337 CASAVA_Build 13 61970081 1I ATGCTCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3026 hom 32 10 12 10 T 14 15 72338 CASAVA_Build 13 61985725 1D TGGGAGTGAC A/- ATACTCATTA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 2 1 72339 CASAVA_Build 13 61989306 1D TCTTAGATCA T/- TTTTTGTAGT 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 T 6 5 72340 CASAVA_Build 13 61989744 1I GCAGAGTGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 72341 CASAVA_Build 13 61989981 1I AATCTCATTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 8 9 72342 CASAVA_Build 13 61990721 4D AAGCGGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 TTTG 5 4 72343 CASAVA_Build 13 61991688 4I AGTGAACAGT ----/TAAA TAGTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TAAA 0 1 72344 CASAVA_Build 13 61998620 3I CCAGTTTTGC ---/AGA AGTAGTTCAG 3070 hom 141 het 55 0 48 7 AGA 0 1 72345 CASAVA_Build 13 61999697 2D AAATAATAAC TT/-- AAATTTAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 2 0 72346 CASAVA_Build 13 62001626 4D TAGGCGTTAT TAAA/---- TAACGCCTGA 3070 het 2231 hom 19 5 12 2 TAAA 1 0 72347 CASAVA_Build 13 62001698 2D ATTTGTTAAC AA/-- AGAGAATGTT 1602 het 492 hom 6 1 4 1 A 3 1 72348 CASAVA_Build 13 62007738 1D TAAGTGTATA C/- TAATGCCATT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 C 1 0 72349 CASAVA_Build 13 62034136 1I TGTGTCTTAC -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 6 7 72350 CASAVA_Build 13 62034195 1D TTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 10 9 72351 CASAVA_Build 13 62036097 4D CTTGTTAGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 9 TTTG 3 2 72352 CASAVA_Build 13 62039868 1I AACCCATTGC -/A AAAAAATAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 6 7 72353 CASAVA_Build 13 62042077 1I ATTTCAAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 8 9 72354 CASAVA_Build 13 62043012 5D AAAGCCAGCA AGTTC/----- AGTTCTAGAC 3070 hom 81 het 32 0 28 6 AGTTC 2 1 72355 CASAVA_Build 13 62043137 1D AGAGTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 16 13 T 13 12 72356 CASAVA_Build 13 62046518 4D GTTTTACTGC ATGA/---- ATGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 5 ATGA 2 1 72357 CASAVA_Build 13 62051892 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 32 2 22 9 A 16 14 72358 CASAVA_Build 13 62064177 2I TTGTGGGCAC --/TG TCTCTTAGTC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 TG 0 1 72359 CASAVA_Build 13 62075080 1I TGCAAGCTCC -/G CCTCCTGGGT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 0 1 72360 CASAVA_Build 13 62084223 9D GAACTGGGTA CCTCAATTG/--------- CAAATGCAGA 3070 het 3070 ref 32 19 12 6 CCTCAATTG 1 0 72361 CASAVA_Build 13 62093580 1D GGTATATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 37 1 32 4 A 13 12 72362 CASAVA_Build 13 62109302 1D GAGCAGCGGG A/- GGTGTTACAC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 1 0 72363 CASAVA_Build 13 62122426 6D ATGATATTTT GTCATA/------ GTAGCCTTAG 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 GTCATA 1 0 72364 CASAVA_Build 13 62125373 4I CCCAGGGATT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TTTG 3 4 72365 CASAVA_Build 13 62127605 1D CTCACATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 9 A 12 11 72366 CASAVA_Build 13 62130462 1I TCCACACGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 33 1 25 7 T 10 11 72367 CASAVA_Build 13 62132312 8I ACTTAATGTG --------/AATTAAGT GAGGCATTCT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 AATTAAGT 0 1 72368 CASAVA_Build 13 62137540 1I TTAACTTTAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 8 9 72369 CASAVA_Build 13 62141202 5D TTAACTAATA TAAAG/----- TAGAGCCTAG 3070 het 3070 hom 47 21 26 1 TAAAG 1 0 72370 CASAVA_Build 13 62142394 1I TTTGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 13 14 72371 CASAVA_Build 13 62146937 1D TGCCCTTTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 T 9 8 72372 CASAVA_Build 13 62158061 4I TCCAAATAGT ----/CAAA CACATTTTAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 CAAA 0 1 72373 CASAVA_Build 13 62161111 6I TATAAATTTT ------/ATATAA CACAAAATTA 2305 het 2305 ref 34 26 5 3 ATATAA 0 1 72374 CASAVA_Build 13 62161517 7I TCAGTTTGTT -------/CAAAAAG CTAGTTATGC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 CAAAAAG 0 1 72375 CASAVA_Build 13 62163609 2D TGTATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 1962 het 1962 ref 17 12 5 0 TG 7 6 72376 CASAVA_Build 13 62164461 6D ACAACCACAT TCACTC/------ TCACTCTTTT 3070 hom 89 het 34 0 30 7 TCACTC 2 1 72377 CASAVA_Build 13 62195678 10I CTCTGGTGAA ----------/TCTTGACTAG TCTATGCACA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 TCTTGACTAG 0 1 72378 CASAVA_Build 13 62220251 1D TCTTAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 11 10 72379 CASAVA_Build 13 62231428 2D ACACAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 A 12 10 72380 CASAVA_Build 13 62239129 1I TTCTTCAAGT -/A AACCTATTAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 2 3 72381 CASAVA_Build 13 62245532 3I AAAAGAATTT ---/ACA ACATTTTTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ACA 1 2 72382 CASAVA_Build 13 62252815 2I AAAAAAAAAA --/AT AATAACAAAA 3070 hom 59 het 29 0 25 4 AT 0 1 72383 CASAVA_Build 13 62264096 1D AATCTTATGA C/- CTCCGGAATA 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 C 2 1 72384 CASAVA_Build 13 62265871 1I TGGTCAGTGA -/C AACCCCACCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 72385 CASAVA_Build 13 62266320 1D CAGCTATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 12 11 72386 CASAVA_Build 13 62268332 1I TGACCTTTTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 8 9 72387 CASAVA_Build 13 62269288 1D CCAAGAAGAA G/- GGGTGAGTCT 3070 het 2181 hom 19 5 12 2 G 4 3 72388 CASAVA_Build 13 62269975 2D GAAGTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 62 het 22 0 21 4 TG 8 7 72389 CASAVA_Build 13 62271017 10D CAGCTCCACA GAGCCAGGAG/---------- GAGCCAGGAG 3070 hom 72 het 31 0 21 11 GAGCCAGGAG 3 2 72390 CASAVA_Build 13 62272988 1I ATTTACACAC -/A AAAAAAATGC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 7 8 72391 CASAVA_Build 13 62279889 1D TTGTTATGTG T/- TAGTCATTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 2 1 72392 CASAVA_Build 13 62281042 4D GATTATATAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 69 het 28 0 24 7 AT 8 6 72393 CASAVA_Build 13 62283397 2D TTAGTCATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 38 0 18 20 T 17 15 72394 CASAVA_Build 13 62283492 1I CATTTAAGTC -/T TTATTCCATC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 3 72395 CASAVA_Build 13 62284380 1I CAGTAACTAC -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 7 8 72396 CASAVA_Build 13 62284464 1I AACACTGATG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 7 8 72397 CASAVA_Build 13 62287093 1D TAGTTTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 41 0 30 11 T 12 11 72398 CASAVA_Build 13 62287294 1I TTTTTGATAA -/G GATAGTTCGG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 1 2 72399 CASAVA_Build 13 62295512 1D TTCAATTAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 9 72400 CASAVA_Build 13 62297487 1I GCTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 35 1 32 2 A 10 11 72401 CASAVA_Build 13 62298705 4D AATGTGATTT AAAA/---- AAAAAAAACA 3070 hom 27 het 25 0 9 16 A 12 8 72402 CASAVA_Build 13 62299369 1I CAAATCTTAC -/A ACCCATTGTG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 1 2 72403 CASAVA_Build 13 62303743 4D TGTGTGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 879 hom 29 het 29 0 11 19 TG 10 8 72404 CASAVA_Build 13 62313875 5I AGAAGTTATT -----/TTTAA TTTCTTTATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTTAA 0 1 72405 CASAVA_Build 13 62325386 1I TATTTCTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 9 10 72406 CASAVA_Build 13 62326231 1D AGAATTTTGC T/- TCTGCAAGGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 2 1 72407 CASAVA_Build 13 62339405 1I CAAGAAAATG -/A CCTTGATTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 0 1 72408 CASAVA_Build 13 62353616 1I TCCAAATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 13 14 72409 CASAVA_Build 13 62357615 1I ATATCTAAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 8 9 72410 CASAVA_Build 13 62360508 2I GACATATAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 A 12 14 72411 CASAVA_Build 13 62361594 1I AAAAGTAAAG -/A AAAAAATAGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 6 7 72412 CASAVA_Build 13 62361933 4D TGGAAGTATA AGAT/---- AGATACACAC 3070 hom 57 het 21 0 19 4 AGAT 2 1 72413 CASAVA_Build 13 62363367 1D AGCAGACACA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 8 7 72414 CASAVA_Build 13 62368032 2I ATTTTTATTT --/TA TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 23 12 11 0 TA 0 1 72415 CASAVA_Build 13 62368755 1I TTTTTGCTTT -/A CGATAACACA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 0 1 72416 CASAVA_Build 13 62372885 1I TGCTTAATAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 8 9 72417 CASAVA_Build 13 62373933 1I ACTGAATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2892 hom 37 8 14 15 A 12 13 72418 CASAVA_Build 13 62373986 17I TCTAAGCAAC -----------------/AAGATGACATCTAAGCA AACGATGAAC 3070 het 3070 ref 41 15 14 14 AAGATGACATCTAAGCA 0 1 72419 CASAVA_Build 13 62376484 4D TAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGATAA 3070 het 3070 ref 42 15 21 10 AG 5 3 72420 CASAVA_Build 13 62378534 2D GGAAAAACTG CA/-- CACTGGATGG 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 CA 2 1 72421 CASAVA_Build 13 62383505 1D AACCTAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 28 1 13 14 A 12 11 72422 CASAVA_Build 13 62384389 1D GCTATAATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 T 9 8 72423 CASAVA_Build 13 62396755 1I CAGTGAGTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 9 10 72424 CASAVA_Build 13 62399510 3I AAATGGAAAG ---/AAC AACTAGAAAG 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 AAC 1 2 72425 CASAVA_Build 13 62401384 1I CCAATTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 10 11 72426 CASAVA_Build 13 62402228 1D AGGCAGAAAT A/- AAAAAAAAAT 2743 het 2743 ref 29 19 6 4 A 10 9 72427 CASAVA_Build 13 62405025 1D GCCTTAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 14 0 T 11 10 72428 CASAVA_Build 13 62407002 1I TTACTTGCCT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 6 7 72429 CASAVA_Build 13 62412881 6I AAAGATACAC ------/AAACTT AAAGACATCA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 AAACTT 0 1 72430 CASAVA_Build 13 62425271 2D AATAAATAGT AC/-- ACACTGAGTG 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 AC 3 2 72431 CASAVA_Build 13 62425626 3I TCCATTGCAA ---/CTC CTCCTCCTCT 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 CTC 3 4 72432 CASAVA_Build 13 62436694 2I TTGGGGCCCC --/CA CACAGATTCC 3070 hom 78 het 32 0 25 7 CA 2 3 72433 CASAVA_Build 13 62448683 1D ATCCCCTTTT C/- CAAATACATA 3070 het 2609 hom 19 6 12 1 C 2 1 72434 CASAVA_Build 13 62450176 1I AACCAGATTA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 2297 hom 18 6 11 1 T 6 7 72435 CASAVA_Build 13 62451412 1D CATAATCATC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 T 10 9 72436 CASAVA_Build 13 62454803 1D TTCAATTTCT A/- AAAAAAAAAT 2510 het 2510 ref 18 10 6 2 A 10 9 72437 CASAVA_Build 13 62467661 1I TATTTTCCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 872 hom 33 2 29 2 T 9 10 72438 CASAVA_Build 13 62470402 1D AGACAGGAAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 9 8 72439 CASAVA_Build 13 62474151 2I TTGGTCTGGG --/AA AACCACACCC 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 A 2 4 72440 CASAVA_Build 13 62497157 1I TCTGAACTGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 8 9 72441 CASAVA_Build 13 62498266 1I TAGGACATTT -/A AAAAATATGT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 5 6 72442 CASAVA_Build 13 62500833 2D12M1I TTTCTTAATA TTTTTTAAATTGTA-/--TTTTAAATTGTAG TTAGTATCAT 3070 het 3070 ref 45 28 22 5 N/A 0 0 72443 CASAVA_Build 13 62500941 5D TGTAAACTTG GTTGT/----- AATGACTGCA 3070 het 3070 ref 48 33 12 9 GTTGT 1 0 72444 CASAVA_Build 13 62501388 29D TGGAGCACTG AAAACCACCATTTCACAATTCCACTTGTA/----------------------------- AGGGATCTAC 3070 het 3070 ref 70 47 30 9 AAAACCACCATTTCACAATTCCACTTGTA 1 0 72445 CASAVA_Build 13 62501745 2D AACCTCCACA TG/-- TTTTCCCACT 3070 het 3070 ref 68 36 26 9 TG 1 0 72446 CASAVA_Build 13 62502181 1I ATTAGTCAAA -/T TTTAATAACA 1114 het 1114 ref 34 31 3 0 T 3 4 72447 CASAVA_Build 13 62502867 1D AAGTGTTTGG A/- AAAAAATACT 2644 het 2644 ref 35 26 7 2 A 7 6 72448 CASAVA_Build 13 62503047 4I TGTGGAATAT ----/ATGG ATAGATTGAT 3070 het 3070 ref 57 27 19 14 ATGG 0 1 72449 CASAVA_Build 13 62503085 4D14M4D30M1D GTATATATAG AGAAAGAGACAGAGAGAGAGCAAGAGAGAAAATGACAGAGAGACAGAAAAACA/----AGAGACAGAGTGTG----AGAGAGACAATGACAGAGAGAAAGAAAAAC- AAAAAGTCTA 3070 het 3070 ref 54 47 8 42 N/A 0 0 72450 CASAVA_Build 13 62503208 4I TGTACATTAC ----/TATT TGTTTCCTTC 3070 het 3070 hom 68 27 32 10 TATT 0 1 72451 CASAVA_Build 13 62503285 1I ATTTTAACAA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 84 58 18 9 T 6 7 72452 CASAVA_Build 13 62503412 1I ATCTTTGTTG -/A AAACTTCTAG 3070 het 3070 ref 70 34 18 20 A 3 4 72453 CASAVA_Build 13 62503662 22I4M53I TATTAAGCCA ----------------------TAGG-----------------------------------------------------/ATTAATAAAAATAAAATCAGAGTAGGAGTATTTGAACAAATAAGCTATAAGGTGGAAAGTAAAGGAGTTAAGGAATTGA TTATCCCCAA 3070 het 3070 ref 66 53 9 8 N/A 0 0 72454 CASAVA_Build 13 62503772 1I AAGGCCCATG -/C CTTTATTTCT 3070 het 3070 hom 84 26 50 8 C 1 2 72455 CASAVA_Build 13 62504686 4D TAATCTCTTT CTTC/---- CTCTATAATT 3070 het 3070 ref 98 63 21 21 CTTC 1 0 72456 CASAVA_Build 13 62504981 1D19M2I TTTGTTTCCA TTTTTTGGGGGGTATATAAC--/-GTTTTGGGGGGTATATAACAA AGTCTAAAAT 3070 het 3070 ref 101 51 61 8 N/A 0 0 72457 CASAVA_Build 13 62505867 3D TATGCCTATG TCT/--- TCTTCTAAAA 3070 het 3070 hom 97 30 49 20 TCT 3 2 72458 CASAVA_Build 13 62506095 2D TGACTCTCAA AT/-- ATATTGAATT 3070 het 3070 hom 83 29 33 26 AT 3 2 72459 CASAVA_Build 13 62506286 4D GCATTTCTGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 95 26 20 58 A 16 12 72460 CASAVA_Build 13 62506900 1I TAAGGAGGGG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 2806 hom 58 10 24 24 A 7 8 72461 CASAVA_Build 13 62506914 2I AAAGGAAAAA --/TT CTGCTTCTTA 1056 het 1056 ref 60 14 4 42 T 0 2 72462 CASAVA_Build 13 62506964 1I TTATTACTGA -/T TTATGTTTAA 3070 het 3070 ref 98 31 16 51 T 2 3 72463 CASAVA_Build 13 62507363 1I26M1I10M3I CTAAATTAAC -AAATATTATTTTTAAGCTATAAAAAT-AGGTAAAATG---/AAAATATTATTTTTAAGAAATAAAAATAAGGTAAAATGATA ATGTAATAAG 3070 het 3070 ref 73 45 15 33 N/A 0 0 72464 CASAVA_Build 13 62507440 3I52M11D CTTTTATACA ---AACAATAATGAGCATAGCTGAATGCGCTGGTTCTCTGAATCCATGATAAAAATAATAGATTTT/AACAACAATAATGAGCATAGCTGAATGTGCTGATTCTCTGAATCCATGATAAAAA----------- TATCTTATCC 3070 het 3070 ref 74 90 18 25 N/A 0 0 72465 CASAVA_Build 13 62507638 2D TAATTGAAGG CT/-- CTCAAATTCA 3070 het 3070 hom 93 28 59 6 CT 2 1 72466 CASAVA_Build 13 62507727 2I55M1I32M1I AAAAAATAAC --GTGGTTTGGGGATTCACTTGTGGTTGTAATGGATAAATTAAAATATCAAAGCTAG-TTTCTTCTCATTCAGAGTTGCAAACATTAAAA-/CTGGGGTTTGGGGATTCACTTGTGGTTGTAATAGATAAATTAAAATATCAAAGCTAGTTTTTTTCTCATTCAGAGTTGCAAATATTAAAAT AACCAAAAGA 3070 het 3070 hom 68 42 60 47 N/A 0 0 72467 CASAVA_Build 13 62507991 1I GTAAAAAATC -/T GATTGTGGTT 3070 het 3070 hom 91 23 63 5 T 0 1 72468 CASAVA_Build 13 62508072 1I TGATGTAAAG -/T TATTGGTTCA 3070 het 3070 ref 97 73 15 9 T 1 2 72469 CASAVA_Build 13 62508524 1I GTACAGCTTT -/A ACTAGAAACT 3070 het 3070 hom 97 38 53 19 A 1 2 72470 CASAVA_Build 13 62508653 5D AATTTAACAT ATCTC/----- ATATTATTAC 3070 het 3070 hom 100 45 44 16 ATCTC 1 0 72471 CASAVA_Build 13 62509388 3D TATTCTTTAA AAC/--- AATAAAATTT 3070 het 3070 ref 90 70 14 6 AAC 1 0 72472 CASAVA_Build 13 62512322 1D CACACACTCA G/- ACTTGTGAGC 3070 het 3070 ref 93 49 12 32 G 1 0 72473 CASAVA_Build 13 62512469 1I AAATTTTAAG -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 ref 53 29 19 12 A 6 7 72474 CASAVA_Build 13 62512552 4I TAAAAAATCA ----/TCGT TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 68 30 31 7 TCGT 0 1 72475 CASAVA_Build 13 62512928 2I TAAGTTTCAT --/TG TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 88 35 46 7 TG 0 1 72476 CASAVA_Build 13 62513832 1D34M3I AGGTAAGAAT GTGTTTCTGGTCTTAAGGCTGGCAACACCAGCACC---/-TGTTTTCTGTCTTAAGGCTGGCAACACCAGCACCACT AAGTGAGGCC 3070 het 3070 ref 53 42 20 33 N/A 0 0 72477 CASAVA_Build 13 62513975 30D TATGACTACG ACTATGACTATGACTATGACTATGACTACA/------------------------------ ACTAATCATA 3070 het 3070 ref 99 55 70 28 ACTATGACTATGACTATGACTATGACTACA 1 0 72478 CASAVA_Build 13 62514582 2I AAAATAAAAA --/AC ATGCTGATAG 3070 het 3070 hom 83 22 57 4 AC 0 1 72479 CASAVA_Build 13 62514680 4D AAAGAGATAT AAGA/---- AAATGAACTT 3070 het 3070 ref 66 35 25 30 AAGA 1 0 72480 CASAVA_Build 13 62515374 5I15M2D GGAGCTAATG -----TCTGGCTTTGCAGTTAA/TCTGATCTGGCTTTGCAGTT-- GAGATATTCA 3070 het 3070 hom 83 34 41 26 N/A 0 0 72481 CASAVA_Build 13 62515401 1I GAGATATTCA -/T TATAAATATC 2582 het 2582 ref 95 34 7 54 T 1 2 72482 CASAVA_Build 13 62516246 1I6M3I AATACTTGGT -AAATGG---/AAAATGGATA ATATCAACCT 3070 het 3070 hom 95 32 54 15 N/A 0 0 72483 CASAVA_Build 13 62516362 1I TTAACCACTG -/A GCTAACTTGT 3070 het 3070 hom 100 20 64 16 A 0 1 72484 CASAVA_Build 13 62517421 1I CGTTACTAAA -/G AAACAAAATG 3070 het 3070 hom 88 28 56 4 G 0 1 72485 CASAVA_Build 13 62517538 1D ACTCCCACCA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 83 24 44 15 T 8 7 72486 CASAVA_Build 13 62518841 1I TGGATCAATG -/T GAAGATATGA 3070 het 3070 ref 102 49 26 27 T 0 1 72487 CASAVA_Build 13 62520621 3D GATGTAAATA ATG/--- ATGATTTTGA 2686 het 2686 ref 62 32 7 26 ATG 2 1 72488 CASAVA_Build 13 62520967 18D TCCTCAGTGT ATGGTCCAGAATTCCACA/------------------ AGGTGGCTCT 3070 het 3070 ref 99 47 59 18 ATGGTCCAGAATTCCACA 1 0 72489 CASAVA_Build 13 62521207 1D GATAATACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 92 18 38 38 A 11 10 72490 CASAVA_Build 13 62521451 5D CTGCATCTCC TAAAA/----- TAAAACTTCT 3070 het 3070 hom 96 21 69 11 TAAAA 2 1 72491 CASAVA_Build 13 62522017 1I AAATATGTAC -/A AGTTTTATTT 2185 het 2185 ref 45 32 5 8 A 1 2 72492 CASAVA_Build 13 62523087 9D ATGTTACTTG TAGTGGAAT/--------- GACTAGTTAA 3070 het 3070 ref 80 36 34 21 TAGTGGAAT 1 0 72493 CASAVA_Build 13 62523311 1D43M1I AATAAAAACC AAAATGGGAAGGAAAATTAGAGGAGTGCATGATAAATGAAAACT-/-AAATTGGAAGGAAAATTAGAGGAGTGCATGATAAATGAAAAGTA ATGAGTCAAT 3070 het 3070 ref 99 97 14 26 N/A 0 0 72494 CASAVA_Build 13 62523561 1D CAGTAATTGG A/- AAAAAAAATC 1598 het 1598 ref 100 83 8 10 A 9 8 72495 CASAVA_Build 13 62524380 5D TTTATCTTTG GTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 76 28 36 12 GTTTT 1 0 72496 CASAVA_Build 13 62525410 4I10M1D TTCACATGAT ----AGATTCAAACA/TAGGAGATTCAGAC- TTTTCTTCAA 3070 het 3070 ref 95 69 24 16 N/A 0 0 72497 CASAVA_Build 13 62526489 1D TCTTGCTCTG T/- CACCCAGGCT 3070 hom 45 het 29 0 18 13 T 1 0 72498 CASAVA_Build 13 62526594 1D TTGGACTACA G/- GGGCGCGCCA 1402 het 1402 ref 18 13 3 2 G 4 3 72499 CASAVA_Build 13 62526779 1D AAGGAATCTC T/- TATTCGTTTT 3070 het 3070 hom 86 27 54 6 T 2 1 72500 CASAVA_Build 13 62526995 2I TTTAAAGGAA --/AG AGAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 98 39 28 31 AG 1 2 72501 CASAVA_Build 13 62527146 1D ATATAGGAGT G/- TTGTCACAAG 3070 het 3070 ref 78 34 34 15 G 1 0 72502 CASAVA_Build 13 62527318 1I TCTCTCAGGG -/C CCATTGTAGC 707 het 707 ref 65 32 3 30 C 2 3 72503 CASAVA_Build 13 62527359 19D3M3D TTATACCAAT ATTCGTATATAAATGTATATAACGT/-------------------GAA--- ATATAAATGA 3070 het 3070 ref 57 50 18 16 N/A 0 0 72504 CASAVA_Build 13 62527621 9D TACTTTCACT TAAGAAAAA/--------- TAAAATGTCA 3070 het 3070 ref 97 66 27 19 TAAGAAAAA 1 0 72505 CASAVA_Build 13 62528276 4D TTGAAAGCTG TTTA/---- TTTATTTGTT 3070 het 3070 ref 97 32 25 47 TTTA 2 1 72506 CASAVA_Build 13 62528986 2D TAAGGTCTTT TA/-- TGTTATTTTA 3070 het 3070 ref 85 48 32 13 TA 1 0 72507 CASAVA_Build 13 62529794 55D2M14D TTTGCCTTAA TGTTTATTCTACTGGTAATAGCCTATGTAGAATAAGATTCTTGTGATTAGTACTCACATGAGATATTTCTG/-------------------------------------------------------AC-------------- TTATTTTACT 248 het 248 ref 54 62 2 21 N/A 0 0 72508 CASAVA_Build 13 62529901 4D25M1I CATTAGAAAG GTTTTTTTTTAAAAAAGCATAAATTTGGA-/----TTTTTTTAAATAGCGTAAATTTGGAT ATTTTTTTAT 2360 het 2360 ref 50 36 6 17 N/A 0 0 72509 CASAVA_Build 13 62530096 1D31M1I CAACTGGTAA TTTTTTTTTTCTTAGAGGGAATTTTTAAGGCA-/-TGTTTTTTTCTTAGAGGGAATTTTTAAGGCAT TTTTACCATT 3070 het 3070 ref 52 38 13 19 N/A 0 0 72510 CASAVA_Build 13 62530182 2I TCAATAATTT --/TA TGTTGTGCTT 3070 het 3070 hom 80 31 38 15 TA 0 1 72511 CASAVA_Build 13 62530307 1D AGGATTGGCG T/- TTTTTGAACA 3070 het 3070 hom 89 29 54 8 T 6 5 72512 CASAVA_Build 13 62530414 1I GTTTCCCCAG -/A AAACTCTGTA 3070 het 3070 hom 87 31 46 11 A 3 4 72513 CASAVA_Build 13 62530515 1D CTGCTTCATT C/- TTTCCTTGCT 2937 het 2937 ref 80 55 7 21 C 1 0 72514 CASAVA_Build 13 62530688 6I64M3I ATACATGATC ------TTTTGTAATAAGGTGTGCATTTTTGTGCACTCAGGAGATCATTCCCTGTGGGGTCTTGTCTCTA---/TTTCGTTTTTGTTAACAAGTGGGCATTTTTGTGCACTCAGGAGATCATTCCCTGTGGGGTCTCGTCTCTAAAC AACTGAACTT 3070 het 3070 ref 77 39 37 38 N/A 0 0 72515 CASAVA_Build 13 62530977 1D TGCATTTGTG T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 83 34 35 15 T 7 6 72516 CASAVA_Build 13 62531062 7D49M8D CCTATGTCTC TAATATTTGTTTAGTCTTTAAATATATCGTATTTTTTTGCGTATAGAAATTCAAAACCAAATTC/-------TGTTTAGACTTTAAATATGTCGTAACTTTTTGCATATAGAAATTCAAAA-------- ATATGACAAG 3070 het 3070 ref 38 48 21 13 N/A 0 0 72517 CASAVA_Build 13 62531499 1I AGGAGGTAAT -/A AAATGTGAAC 3070 het 3070 hom 74 20 49 9 A 3 4 72518 CASAVA_Build 13 62531646 3I TATTTATAAT ---/TTA TATTTATAAT 3070 het 3070 hom 48 13 24 12 TTA 0 1 72519 CASAVA_Build 13 62531880 2D40M1D17M2D TATATCAAAC AGTATTAATCTAAGCATATATTTGAAAAAAGGAGATAACAAATTTTTCTTTTACAAAGTAAC/--TATTAATCTAAGCATATATTTGAAAAAAGGAGATAACAAA-TTTTCTCTTATAAAGTA-- AAATTGTTTC 3070 het 3070 ref 99 73 37 33 N/A 0 0 72520 CASAVA_Build 13 62532066 3I TATAATTTTA ---/AGG AGTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 85 33 46 6 AGG 0 1 72521 CASAVA_Build 13 62532179 2D ATTCAATGCG AT/-- ATAGAGTAAA 3070 het 3070 ref 102 46 42 17 AT 2 1 72522 CASAVA_Build 13 62532550 1I AAAAGGAATA -/T TTAGCACATC 3070 het 3070 hom 105 22 58 26 T 2 3 72523 CASAVA_Build 13 62532805 2D ACATAATCAT AA/-- GTTTAATTTT 2820 het 2820 ref 97 49 7 41 A 2 0 72524 CASAVA_Build 13 62533259 1D GTCAACCTAA T/- ATATGCTTAT 3070 het 3070 ref 78 53 16 9 T 1 0 72525 CASAVA_Build 13 62533860 1D TATTTATTAC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 101 31 48 23 T 7 6 72526 CASAVA_Build 13 62533935 4D TGTGTTTATC TAAT/---- TGAGACAAAA 3070 het 3070 ref 85 43 35 11 TAAT 1 0 72527 CASAVA_Build 13 62534046 2D AATGCAATGC AT/-- ATGTCCTCAG 3070 het 3070 ref 67 40 19 15 AT 2 1 72528 CASAVA_Build 13 62534290 6I CAACTCCACT ------/TCCCTA TCCCCAACAC 3070 het 3070 ref 60 36 12 12 TCCCTA 0 1 72529 CASAVA_Build 13 62534351 1I43M2D GTTTCTAGAT -AGTTATTTTCGTGCTGATAAGAGTGCCAACTCTGTAAGGACTCTG/AAGTTATTTTTGTGCTGATAAGAATGCCAGCTCTGTAAGGACTC-- TGTCATTTCT 3070 het 3070 ref 73 66 17 16 N/A 0 0 72530 CASAVA_Build 13 62534465 2D TAATATATGT AC/-- AGTTGAAATA 3070 het 3070 ref 79 56 18 7 AC 1 0 72531 CASAVA_Build 13 62535292 1D AGGACTCTCC T/- TAACAATGAG 3070 het 3070 ref 100 55 39 10 T 2 1 72532 CASAVA_Build 13 62536900 6D CAAAAACCTA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 hom 52 het 22 0 17 5 AAAAAC 3 2 72533 CASAVA_Build 13 62537154 16D9M2D12M2I TGTAAGCTGT TTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTAATTTATGTTGTC--/----------------TTTTGTTTT--ATTTCTGTTGCCCA TGTTACCATA 2244 het 2244 ref 34 41 5 9 N/A 0 0 72534 CASAVA_Build 13 62537607 2D ACTTTGGTCA AC/-- AAATATTTAA 3070 het 3070 ref 36 25 11 3 AC 1 0 72535 CASAVA_Build 13 62537771 7D60M1D TTCCAAAAAT ATTATTAATTAATTATTTTATGTGTTTCATTCATTCATATTGAGTAATGACAGTATGCAATTTCTCCT/-------ATTAATTATTTTATGTGTTTTATTCATTCATATTGAGTAATGACCGTATGCAATTTCTCC- ACTAAGAACA 3070 het 3070 ref 48 38 17 52 N/A 0 0 72536 CASAVA_Build 13 62538296 1D AAAGTAAACA T/- TAAAAGACTA 3070 het 3070 hom 88 34 51 5 T 2 1 72537 CASAVA_Build 13 62538384 4D TTTAGTAAAC TTCT/---- CTCTAACTTG 3070 het 3070 ref 56 29 23 6 TTCT 1 0 72538 CASAVA_Build 13 62538460 1I63M2I AAATTAGAAG -AAAAACCCCACAGAGAATGAAAGAGAATTTATAATCTGGGAAAGTTATTTGAATTCTAAAAAC--/AAAAAATCCCACAGAGAATGAAAGAGAATTCATAATCTGGGAAAGTTATTTGAATTCTAAAAACAA AAAAAATTGC 3070 het 3070 ref 59 42 43 24 N/A 0 0 72539 CASAVA_Build 13 62538722 4I GAAGCTTACT ----/AATA AATATCAAGC 3070 het 3070 ref 92 45 21 27 AATA 1 2 72540 CASAVA_Build 13 62538752 4I ATTTTCATCA ----/ATAG GTAGTTTTAT 3070 het 3070 ref 86 44 19 27 ATAG 0 1 72541 CASAVA_Build 13 62538942 1I AGTGGGAGAG -/A AAAAAACGGT 3070 het 3070 ref 46 29 16 1 A 6 7 72542 CASAVA_Build 13 62539419 1D14M2D68M4D TTTCATGTAT CACATATTATATAATGAAACAGTTAAAATGGATTAGTATGAGGGCATTCATACAGAGCGAAGGTTATTCATTACCAAAGCCAGGATGTG/-ACATATTATGTAAT--AAAAGTCAAAATGGATTAGTATGAGGGCATTCATATAGAGCAAAGGTTATTAATTACTAAAGCAAGGA---- TGTATTATGT 1308 het 1308 ref 47 52 3 28 N/A 0 0 72543 CASAVA_Build 13 62539598 5D GAATTAGCTG AAGTT/----- AATACTCATA 3070 het 3070 ref 55 26 27 8 AAGTT 1 0 72544 CASAVA_Build 13 62539658 2D ATATTTGATG TA/-- TCTACTTTCA 3070 het 3070 ref 72 54 8 12 TA 1 0 72545 CASAVA_Build 13 62539827 8D132M2I CAAACAAAGA AAACAAGTGCATTTAATCAAAACAGTTGCAAGGCATACAGTTTTAAAGAATAATAATCCAATAATAAAGTATTAAGAAGTAAAATGTAAGGTGACTATTATTTCTATATACACTTATGAAAATTATGAAATATTTAAAAA--/--------GCATTTAATAAAAACAGTTGCAAGGCATACAATTGTAAAGAATAATAATCCAATAATAAAGTATTGTGAAGTAAAATGTAAGGTGACTATTATTTCTATATACACTTATAAAAATCATGAAATATTAAAAAAAG TAATCAGTAT 3070 het 3070 ref 45 46 15 100 N/A 0 0 72546 CASAVA_Build 13 62540106 2D AAAGAAAAAT AG/-- CTTTTTCACA 3070 het 3070 ref 48 25 17 11 AG 1 0 72547 CASAVA_Build 13 62540629 4I TCAAGAGATC ----/TGCT TGTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 71 33 27 13 TGCT 0 1 72548 CASAVA_Build 13 62540952 3D TGTATTTCAT TGG/--- TCAAAGCAGT 3070 het 3070 ref 59 29 21 12 TGG 1 0 72549 CASAVA_Build 13 62541034 3D CATTATTGAC ATT/--- ATTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 84 41 41 2 ATT 2 1 72550 CASAVA_Build 13 62541696 1D13M2I TAGAAGAAAA TATTTAACACAACT--/-ATTTAACACAACTAC GTTATAAATT 3070 het 3070 ref 53 35 14 5 N/A 0 0 72551 CASAVA_Build 13 62541735 2D AGGTGAAGAG AC/-- ATAAAAAGAA 2896 het 2896 ref 41 24 6 13 AC 1 0 72552 CASAVA_Build 13 62542096 8D AAACCATTTC AAATACGG/-------- AAATACAGGA 3070 het 3070 hom 89 27 53 30 AAATACGG 1 0 72553 CASAVA_Build 13 62542467 1D7M1D TTCAAGTATT ATATAGTCT/-GACAGTC- TTTTTCTGGT 3070 het 3070 hom 98 44 48 25 N/A 0 0 72554 CASAVA_Build 13 62543104 4D TTGGTTCTGA ATTT/---- ATTTGTAAAC 3070 het 3070 hom 87 31 44 26 ATTT 2 1 72555 CASAVA_Build 13 62543187 3D TAATAATTTA CTC/--- TTTTGGGTTT 3070 het 3070 hom 98 26 66 13 CTC 1 0 72556 CASAVA_Build 13 62543302 1D CAATATTTTT G/- CCCTTCTCAT 3070 het 3070 hom 88 37 43 13 G 1 0 72557 CASAVA_Build 13 62543546 4D TGTAACTTTC CTCT/---- CTATGATTTC 3070 het 3070 ref 85 38 44 6 CT 3 1 72558 CASAVA_Build 13 62543697 1D CGACAGTGAT A/- TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 69 37 23 9 A 1 0 72559 CASAVA_Build 13 62543765 1I ATGGGTACTC -/A CAATATTTGT 3070 het 3070 ref 58 28 24 7 A 0 1 72560 CASAVA_Build 13 62543920 11D CTCACTATGA GCTCCGTCAAG/----------- GCTAAGATGC 3070 het 3070 ref 56 44 12 13 GCTCCGTCAAG 1 0 72561 CASAVA_Build 13 62544571 2D CCCAGGCACA AC/-- AGTTTTGGGA 3070 het 3070 hom 83 35 41 9 AC 1 0 72562 CASAVA_Build 13 62545093 1I ATAGTATGCA -/T TTTTTCCATT 3070 het 3070 ref 64 50 8 6 T 5 6 72563 CASAVA_Build 13 62545158 14I15M1D AACTTGCATC --------------TCCTATAAAATAATGT/TGTCAAGTGTATTTTTCTATAAAATAATG- TTAGTGTCTT 3070 het 3070 ref 62 38 24 14 N/A 0 0 72564 CASAVA_Build 13 62545374 1I43M4D TATATGTATT -AAAAATCTTAAAAGGAAAGCTATTTAATCTGTAGCATGGATGAATAT/AAAAAATCTTCAACGGAAAGCTGTTTAACCTGTAACATGGATGA---- TTATTTGACA 3070 het 3070 ref 70 42 40 12 N/A 0 0 72565 CASAVA_Build 13 62545634 4I ATTAAATATA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 76 27 39 20 AAAT 2 3 72566 CASAVA_Build 13 62545879 1I CCAATTATTC -/T ATCATGGCCA 3070 het 3070 hom 93 33 44 16 T 0 1 72567 CASAVA_Build 13 62546113 4D TATTGAAATT CTAC/---- AGACAAGCAA 3070 het 3070 hom 89 39 42 24 CTAC 1 0 72568 CASAVA_Build 13 62546857 1D TCTAAAAAAA T/- TCCAAAAGCT 3070 het 3070 hom 85 24 58 11 T 2 1 72569 CASAVA_Build 13 62558290 1I TCTAGGTTGC -/G TGTTTCTTAC 3070 hom 123 het 43 0 42 1 G 0 1 72570 CASAVA_Build 13 62562585 16D CCGTAGTTTA CACAGTGGATCATTCC/---------------- CACTTTGTCC 3070 hom 123 het 42 0 42 4 CACAGTGGATCATTCC 1 0 72571 CASAVA_Build 13 62563574 1I AAAAAAATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 422 hom 40 1 32 7 T 9 10 72572 CASAVA_Build 13 62564933 1I TTCAATTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 428 hom 30 1 24 5 T 9 10 72573 CASAVA_Build 13 62574188 1D CAGAATATTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 123 het 46 0 42 6 T 9 8 72574 CASAVA_Build 13 62578626 1I CCTTGAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 706 hom 38 4 24 10 A 13 14 72575 CASAVA_Build 13 62582440 2I CATTTATTGC --/CT CTCAGTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CT 1 2 72576 CASAVA_Build 13 62584602 1I CACATTCTAA -/T TTTATGAATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 4 72577 CASAVA_Build 13 62584771 4I GCAACATAAC ----/TTTA TTTGTTATTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTTA 0 1 72578 CASAVA_Build 13 62588619 5D TGCTGACAAT AGAGG/----- AGGCAAATTT 3070 hom 90 het 32 0 29 3 AGAGG 1 0 72579 CASAVA_Build 13 62591200 1I ACAACTACTG -/T TAATACATTG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 1 2 72580 CASAVA_Build 13 62598490 32I TTTCCTTGCA --------------------------------/AATGCATTGGTCTTGTCTCTACTTCTAAGGTT ATATTGATAG 3070 hom 111 het 38 0 38 2 AATGCATTGGTCTTGTCTCTACTTCTAAGGTT 0 1 72581 CASAVA_Build 13 62611250 1D AATGAGGTTG A/- AATTCTTTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 2 72582 CASAVA_Build 13 62624298 3I CATAATAAAC ---/ATT ATGTTAAATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATT 0 1 72583 CASAVA_Build 13 62624847 1I TATTTATAAT -/A AAAAAACTAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 6 7 72584 CASAVA_Build 13 62630140 1I TTTGGATCAT -/G GGGGTGGATC 3070 hom 102 het 38 0 32 6 G 4 5 72585 CASAVA_Build 13 62632076 1I AAATTAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 72586 CASAVA_Build 13 62636417 2I TATATAATAA --/AT ATATATATAT 412 hom 7 het 10 0 2 8 AT 7 8 72587 CASAVA_Build 13 62649835 1I AATGCGATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 25 1 21 3 A 10 11 72588 CASAVA_Build 13 62652505 4I TCCCTCCCTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 hom 87 het 44 0 29 15 TCTT 2 3 72589 CASAVA_Build 13 62657354 1D CTTTATTTGG A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 8 7 72590 CASAVA_Build 13 62659313 1I TGGATATCGC -/A AAAAAAAAAA 1980 het 838 hom 24 5 7 12 A 17 18 72591 CASAVA_Build 13 62663867 1I ACTTGGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1510 hom 34 5 24 5 A 15 16 72592 CASAVA_Build 13 62671577 1D AAAATTATTA T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 6 72593 CASAVA_Build 13 62673037 2D ATAAATAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 16 14 72594 CASAVA_Build 13 62674165 1D AAGTTGTAGC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 7 6 72595 CASAVA_Build 13 62676779 4D CAATTTCAAA ACTT/---- ACTTAAAGTA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 ACTT 2 1 72596 CASAVA_Build 13 62679170 1D CATTTATCAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 9 8 72597 CASAVA_Build 13 62685363 1D CCATCATATC T/- CCTGTGACCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 1 0 72598 CASAVA_Build 13 62702176 1I ATTTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 10 11 72599 CASAVA_Build 13 62702275 1I ATCTTTTTTT -/C TTTTATATAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 0 1 72600 CASAVA_Build 13 62716621 1I CCTAGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 11 12 72601 CASAVA_Build 13 62717093 2I TGATAAAAGT --/AG AGTTTGATTT 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 AG 1 2 72602 CASAVA_Build 13 62720205 2I GCACACTAAA --/AC ACACACATGC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AC 3 4 72603 CASAVA_Build 13 62729559 1I GAGACAAAAA -/G GGTTAGTCTA 3070 het 3070 hom 39 14 24 1 G 2 3 72604 CASAVA_Build 13 62732188 8D ACTGGGTTAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 24 3 19 2 T 23 15 72605 CASAVA_Build 13 62732360 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 461 hom 14 2 9 3 T 8 7 72606 CASAVA_Build 13 62733802 1I CATTTCAAAA -/T GTAAATAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 T 0 1 72607 CASAVA_Build 13 62740247 2I TGTCACAGCA --/AT ATGCCACTGA 1926 het 1926 ref 18 7 5 7 AT 1 2 72608 CASAVA_Build 13 62740290 2D AGTATTCCAT TA/-- TATATATATA 2784 het 2784 ref 24 11 8 7 TA 6 5 72609 CASAVA_Build 13 62752313 1D GGGGAAACCA C/- CCCCCATTAT 3070 hom 126 het 47 0 39 8 C 6 5 72610 CASAVA_Build 13 62756812 9D GGAATATTGG TCTGTAGTT/--------- TCCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 25 11 7 TCTGTAGTT 1 0 72611 CASAVA_Build 13 62758093 4D TTTCTTTTGG TTCT/---- TTTTCTTTAT 3070 het 3070 hom 28 12 16 0 TTCT 1 0 72612 CASAVA_Build 13 62777381 2I AGACTCTGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1919 hom 23 6 11 6 A 14 16 72613 CASAVA_Build 13 62781933 1D AAGGAGGGGG A/- AAAACATATA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 5 4 72614 CASAVA_Build 13 62782170 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2576 het 1528 hom 12 4 7 1 A 11 10 72615 CASAVA_Build 13 62784239 1I GGGCCTGTGC -/T GGTGGTAGAC 3070 hom 126 het 50 0 39 11 T 0 1 72616 CASAVA_Build 13 62799802 1D CATCATTGTG T/- TATTTTACTC 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 T 2 1 72617 CASAVA_Build 13 62829286 1I ACTACCTCTA -/C TATTACTACG 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 C 0 1 72618 CASAVA_Build 13 62829770 2D CCCTAAAAGT AA/-- AAGAGTAGGA 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 A 4 2 72619 CASAVA_Build 13 62851329 1I AAGGAGAGGC -/A AAAAAAAAAA 2899 het 2338 hom 16 6 7 3 A 11 12 72620 CASAVA_Build 13 62852195 2I TTGTAGACTC --/TT TAGGATTTTC 1449 het 1449 ref 22 14 4 4 T 1 3 72621 CASAVA_Build 13 62852953 1I TAAATACATA -/T TTTTTAGAGA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 5 6 72622 CASAVA_Build 13 62855623 1I TTTATTTAAC -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 T 6 7 72623 CASAVA_Build 13 62859723 1I TTCTTTCCTC -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 5 6 72624 CASAVA_Build 13 62866056 1I TTCATTTAAG -/C ATTTGGGATT 3070 het 1413 hom 39 5 20 14 C 0 1 72625 CASAVA_Build 13 62866075 4D TATTGAAAAC AAAT/---- CAAATTTTAA 3070 het 133 hom 29 1 14 15 AAAT 1 0 72626 CASAVA_Build 13 62869477 10D TTGATTTTTG CTTGGTGATT/---------- TTTTTAAGTT 3070 het 3070 hom 27 10 17 1 CTTGGTGATT 1 0 72627 CASAVA_Build 13 62870000 1D CAAAGTTTCT G/- TGAAATATCT 3070 het 3070 ref 43 24 17 3 G 1 0 72628 CASAVA_Build 13 62877032 3I TTTCAGTTGT ---/CAA CAAGTTCCTC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 CAA 1 2 72629 CASAVA_Build 13 62884023 1I ACAGATTATA -/T TTTTTGTAGG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 5 6 72630 CASAVA_Build 13 62887626 1D ATGCATTAAC A/- AAAAATAAGA 3070 hom 154 het 56 0 52 5 A 6 5 72631 CASAVA_Build 13 62892176 3D TGTTGTTAAA AAT/--- AATATTATAT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 AAT 2 1 72632 CASAVA_Build 13 62892314 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 29 1 24 4 T 11 10 72633 CASAVA_Build 13 62899454 9D TTTCCCCCAC CCTAATAAG/--------- CCTAATAAGC 3070 hom 63 het 24 0 22 5 CCTAATAAG 2 1 72634 CASAVA_Build 13 62899890 1D TTAAGAGATT A/- AAGTAAGACA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 3 2 72635 CASAVA_Build 13 62900328 1D TTTTCAAATA T/- TTGTTAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 24 5 T 3 2 72636 CASAVA_Build 13 62900818 1I AAATTTACTG -/T TTTTTCCTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 5 6 72637 CASAVA_Build 13 62904795 3D CTTAATACAG TTT/--- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 11 8 72638 CASAVA_Build 13 62905363 1I GAAGCAGACA -/C AAAAAAGCCC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 0 1 72639 CASAVA_Build 13 62910503 1D GAGAGAGATA G/- GGGAATGGCC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 4 3 72640 CASAVA_Build 13 62922393 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1366 het 1366 ref 13 7 4 2 T 15 14 72641 CASAVA_Build 13 62923130 1D TCTAAATATA C/- CACGTTATGC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 C 2 1 72642 CASAVA_Build 13 62923503 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 940 hom 7 het 3 0 3 0 A 11 10 72643 CASAVA_Build 13 62934099 9I TGATAAAATA ---------/TCCTGTCCC GCACCCTCAA 3070 hom 90 het 30 0 30 1 TCCTGTCCC 0 1 72644 CASAVA_Build 13 62934451 1D TAATAACAAT G/- CACATAATTG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 G 1 0 72645 CASAVA_Build 13 62938298 2D56M2D AAGAAAAAAG AAAAAAAAAAAATGCCAACCCAAAATAAAATACCTGACAAAGCTGTCCTTAAGAAATAAG/--AAAAAAAAAATGCCAACCCAAAATAAAATACCTGACAAAGCTGTCCTTAAGAAATA-- AGAGAGAGAT 3070 hom 84 het 31 0 29 21 N/A 0 0 72646 CASAVA_Build 13 62938721 1D GAGACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2104 hom 27 het 17 0 9 8 A 15 14 72647 CASAVA_Build 13 62938764 1D TTTCATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 21 1 14 6 A 11 10 72648 CASAVA_Build 13 62939137 3D GTATTCATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 22 1 12 10 A 17 14 72649 CASAVA_Build 13 62942910 3D AATTTGGAGA TAT/--- TATTGTTATT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 TAT 2 1 72650 CASAVA_Build 13 62943114 1D TATATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 33 4 14 15 T 17 16 72651 CASAVA_Build 13 62949519 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1767 het 1257 hom 21 5 5 11 A 17 18 72652 CASAVA_Build 13 62955157 4I GGCTATTGAC ----/TCAA TCAATTCTAG 3070 hom 21 het 13 0 8 5 TCAA 1 2 72653 CASAVA_Build 13 62956634 6D AATAAACTCC TATATA/------ TATATATATA 2298 hom 12 het 6 0 5 1 TA 12 9 72654 CASAVA_Build 13 62964933 3D TATTTTTATT TTA/--- TTATTTTGTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTA 2 1 72655 CASAVA_Build 13 62966724 1I AGCAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 908 hom 40 2 25 13 A 11 12 72656 CASAVA_Build 13 62968883 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 46 het 21 0 16 5 A 9 10 72657 CASAVA_Build 13 62971330 1I TAATGCAATA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 8 9 72658 CASAVA_Build 13 62973329 2I AGAAACTTAA --/TT TTTTTTAAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 6 8 72659 CASAVA_Build 13 62980088 1I AAAAAGGTAA -/G AGACTATATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 72660 CASAVA_Build 13 62983328 4I TTTCATTCAA ----/AAAG AAAGACAAAG 3070 hom 73 het 27 0 25 2 AAAG 1 2 72661 CASAVA_Build 13 62984620 1I CCTGTGACAG -/A AGGCGTCTAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 1 2 72662 CASAVA_Build 13 62988502 1I AAGATAATTT -/G GGGGTGAGCC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 4 5 72663 CASAVA_Build 13 62989176 22D36M11I TTAATAATAT TTTAAATAATATTTTAATATTATTTAAATAATATTTTAACTTAGAAATACAGTTGATT-----------/----------------------TTTAAATAATATTTTCACTTAGAAATACAGTTGATTCTTGAACAATG CTGAGGTTAG 3070 hom 60 het 25 0 21 16 N/A 0 0 72664 CASAVA_Build 13 62996374 3D3M7I CATTCTCTTA CCTTAA-------/---TAAGGTGTTC TCCCATTTGG 3070 hom 102 het 38 0 35 5 N/A 0 0 72665 CASAVA_Build 13 63005351 1D TTTCCAGATA T/- TTAAAAGGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 2 72666 CASAVA_Build 13 63006496 12D TTGAAGGAAA GGACAAAGTTCT/------------ GGACAAAGTT 1284 hom 12 het 6 0 5 2 GGACAAAGTTCT 2 1 72667 CASAVA_Build 13 63016691 4D GGGATTATGG GCAT/---- GCACCTCCAC 3070 hom 63 het 22 0 22 1 GCAT 1 0 72668 CASAVA_Build 13 63019634 5I32M1I TAGCTTAAGA -----TAATTTCAGAATTTATATTATTTAAATATTTG-/TAAGTTAATTTCAGAATTTATATTATTTAAATATTTGT TTTTTTTACA 3070 hom 78 het 20 0 27 3 N/A 0 0 72669 CASAVA_Build 13 63029838 1I GGCTCCTAGG -/C AGAAAGGACT 3070 hom 63 het 38 1 34 3 C 0 1 72670 CASAVA_Build 13 63030152 1I GAGATCTCAT -/G GTTTTATAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 2 72671 CASAVA_Build 13 63040533 1I TTGTTACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 25 1 21 3 T 10 11 72672 CASAVA_Build 13 63045172 18D TGTACAGTTC AGGGATATTAAATACATG/------------------ AGGGTTGTCT 3070 het 3070 ref 31 18 15 1 AGGGATATTAAATACATG 1 0 72673 CASAVA_Build 13 63049535 2I TGGAGAAAAC --/AG AGCCATTCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AG 1 2 72674 CASAVA_Build 13 63054836 1D ACTTTGATGC T/- TGCTTTCTTG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 1 72675 CASAVA_Build 13 63057163 1D AACTAAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 28 0 19 9 A 11 10 72676 CASAVA_Build 13 63063031 1I CACGCAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 9 10 72677 CASAVA_Build 13 63117414 1D TGTATTAGAA T/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 6 5 72678 CASAVA_Build 13 63155255 4D GTATATATGG GCCA/---- TATTTTCTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 GCCA 1 0 72679 CASAVA_Build 13 63163461 2D ATATATATAT AC/-- ACACATATTT 3070 het 1943 hom 32 9 22 1 AC 3 2 72680 CASAVA_Build 13 63164108 5I ACAACTATGT -----/TAAAA TAAATATGTC 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 TAAAA 0 1 72681 CASAVA_Build 13 63167671 5D TAATCCATTA TTACC/----- TTTCCTGTAT 3070 het 3070 ref 31 14 10 10 TTACC 1 0 72682 CASAVA_Build 13 63168211 1D TGATACAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 11 10 72683 CASAVA_Build 13 63183784 4D AAATTTGAAT TTAA/---- TATTGAACAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 TTAA 1 0 72684 CASAVA_Build 13 63186611 1I ACTCCGTCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 9 10 72685 CASAVA_Build 13 63186986 2I ATTTTTAAAA --/AG GGATTATTCT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 AG 0 1 72686 CASAVA_Build 13 63241406 4D TCAAGCTCTG TTTT/---- CCCTGAACAC 3070 hom 33 het 12 0 12 2 T 4 0 72687 CASAVA_Build 13 63262249 1D AAAATATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 946 hom 15 3 8 4 A 15 14 72688 CASAVA_Build 13 63269080 1D ACAACAAGGT C/- CCACTACTTC 2305 het 2305 ref 46 38 5 3 C 3 2 72689 CASAVA_Build 13 63350948 5I CTTTTCATTC -----/AAAAT AAAATAGTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AAAAT 1 2 72690 CASAVA_Build 13 63353779 1I AATGCCTATC -/T TTTTTTTTTT 1572 het 1572 ref 41 26 5 10 T 14 15 72691 CASAVA_Build 13 63354682 1I TATTTGAGCC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 10 72692 CASAVA_Build 13 63365575 2D AAACCTGCAC AT/-- GTCCCCCTGA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 AT 1 0 72693 CASAVA_Build 13 63373031 1I TTTAAGCTAA -/T TATCTAGTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 72694 CASAVA_Build 13 63382481 1D TATGTTCATA C/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 1 0 72695 CASAVA_Build 13 63386569 1D CTAAATTCTA T/- TTTTCCACTT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 5 4 72696 CASAVA_Build 13 63391592 1I GAGTTCAGCT -/C CTGTGGTGTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 C 1 2 72697 CASAVA_Build 13 63400706 1I AGAAATCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 32 1 23 8 A 10 11 72698 CASAVA_Build 13 63404779 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 1375 hom 26 5 13 9 AC 6 7 72699 CASAVA_Build 13 63440971 1D CAAAGCATAC A/- AAAACATAAA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 5 4 72700 CASAVA_Build 13 63441416 4D AGCAAAGAAC ATAA/---- ATAGACAACT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 ATAA 1 0 72701 CASAVA_Build 13 63448939 7D3M5D GTGTACACTG ATGTGTACACTCATG/-------GAC----- TGTATTACTT 3070 hom 99 het 31 0 34 2 N/A 0 0 72702 CASAVA_Build 13 63449119 4I CATCACAATA ----/TCTC TCTCTGAGAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TC 2 4 72703 CASAVA_Build 13 63460871 1D AAAAGTAGAG A/- AGATGATTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 2 1 72704 CASAVA_Build 13 63475607 1I ACTCTGCTTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 401 hom 26 1 19 7 A 7 8 72705 CASAVA_Build 13 63475695 4I GTAACTATAG ----/TCTC TCTGTCTCTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TC 1 3 72706 CASAVA_Build 13 63481715 3D TTAGTTCAGC ATA/--- ATGATACCCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATA 1 0 72707 CASAVA_Build 13 63485008 1D ATCCAAGGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 3 T 10 9 72708 CASAVA_Build 13 63485878 4I CTTTCATAAC ----/ATAA ATAAATTCTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 ATAA 1 2 72709 CASAVA_Build 13 63488357 1I TACAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 10 72710 CASAVA_Build 13 63513285 3I77M1I ACCTAATGAG ---CTTACAAAATGTAAGAAACTTACAGCCAATAGTATTAAGGGCTTTCCATGTGCCAAAAATTGGGTTCAGTTACTTGC-/CTTCTTACAAAATGTAAGAAACTTACAGCCAATAGTATTAAGGGCTTTCCATGTGCCAAAAATTGGGTTCAGTTACTTGCT TTTATTGTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 21 N/A 0 0 72711 CASAVA_Build 13 63540142 2D CTTGTCAAAA AG/-- AGAGAAATAC 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 AG 3 2 72712 CASAVA_Build 13 63547836 1I TGCAGCTGGT -/A AGTCCTGATG 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 1 2 72713 CASAVA_Build 13 63557118 3I ACTTTGTTCG ---/TCT TCTTCAATAT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 TCT 1 2 72714 CASAVA_Build 13 63570684 1I AAAATAAGTA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 7 8 72715 CASAVA_Build 13 63570992 1D TTGTTGATCT C/- CCCTTCTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 C 4 3 72716 CASAVA_Build 13 63574181 4I AAATAAAAAC ----/TATT TAACCAAATT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 TATT 0 1 72717 CASAVA_Build 13 63578225 1I ACATACTATA -/T TTTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 T 5 6 72718 CASAVA_Build 13 63582241 1D CAGGAAAGCA T/- GTGCGAAACT 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 T 1 0 72719 CASAVA_Build 13 63583254 2I CTCATTTGAG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 8 10 72720 CASAVA_Build 13 63584298 2D GCCTCAAGGC AA/-- ACTTTGGTTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 A 3 1 72721 CASAVA_Build 13 63586217 1I AAGAAAAAAA -/T ATATTGAGAA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 T 0 1 72722 CASAVA_Build 13 63598824 4D TACAAAGCAG AAGA/---- AAGAAATTTC 3070 het 3070 hom 38 16 20 5 AAGA 2 1 72723 CASAVA_Build 13 63600559 1I AATATATAAA -/G GAAATTAAAA 2362 het 1932 hom 12 5 5 2 G 1 2 72724 CASAVA_Build 13 63602088 1D16M2D ATATTTCTAG AAAAAAAATTCTGTGCTGA/-AAAAAAATTCTGTGCT-- GTCTGTTCCA 3070 het 3070 ref 28 19 12 3 N/A 0 0 72725 CASAVA_Build 13 63605196 1I CCAATCCCAG -/A AGAAAGATAT 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 A 1 2 72726 CASAVA_Build 13 63606538 1D GGATTTCCAG T/- TTTTTCCGCT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 6 5 72727 CASAVA_Build 13 63609198 3D ATACAAAATG TAC/--- AAAATAAACA 3070 het 3070 ref 26 18 8 2 TAC 1 0 72728 CASAVA_Build 13 63614762 2I TGAAAAGGGA --/AC ACTTTTACAC 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 AC 1 2 72729 CASAVA_Build 13 63622519 4D CTGTCTTGCT GTTA/---- GTTTGATTAT 3070 het 3070 ref 44 26 15 5 GTTA 1 0 72730 CASAVA_Build 13 63625354 1D TAAGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 998 hom 22 6 10 7 T 13 12 72731 CASAVA_Build 13 63627482 1I ACAATTAGTT -/G GTGAAAAATG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 72732 CASAVA_Build 13 63627576 2I TATTTGAGTA --/AC ACAATTTTAT 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 AC 1 2 72733 CASAVA_Build 13 63627651 1D TACTTATATG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 9 8 72734 CASAVA_Build 13 63629849 10D TTTATACTTC ATTACTCCAT/---------- ATTACTCCAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 8 ATTACTCCAT 2 1 72735 CASAVA_Build 13 63637156 3I TCTAATTTTG ---/TTC TTATTTCAAG 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 TTC 0 1 72736 CASAVA_Build 13 63637887 2D TTCTGATATA TG/-- TATATATTTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TG 1 0 72737 CASAVA_Build 13 63641929 1I CTATGTTTAC -/T TATTGAATGG 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 1 2 72738 CASAVA_Build 13 63642552 1I TTAGACATCT -/A AAGGAGTGGG 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 2 3 72739 CASAVA_Build 13 63645459 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 CA 8 7 72740 CASAVA_Build 13 63650488 2D TAGAACAATC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 CA 6 5 72741 CASAVA_Build 13 63650999 1D GAAGAGCAAT G/- GTTTGACTCA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 G 2 1 72742 CASAVA_Build 13 63653648 2I TAAAAGTAAC --/TG TGAAAGAATT 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 TG 1 2 72743 CASAVA_Build 13 63660202 1D ACTTGGGATA T/- TTTTTTAGGC 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 T 7 6 72744 CASAVA_Build 13 63661997 10D ATATACACAT ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 het 2600 hom 20 9 12 1 AC 15 10 72745 CASAVA_Build 13 63664125 3I GTTCTCTCTA ---/TTC TTGTATATTT 3070 het 3070 ref 37 22 9 6 TTC 0 1 72746 CASAVA_Build 13 63664286 1D AGATTTCAGT A/- GCTGAGAATA 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 A 1 0 72747 CASAVA_Build 13 63669125 5D AAAAAGCAAG GTATC/----- GTATATTTCA 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 GTATC 1 0 72748 CASAVA_Build 13 63669774 1I TTTTTATCAG -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 6 7 72749 CASAVA_Build 13 63670701 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 7 6 72750 CASAVA_Build 13 63673064 4D TAAATAATCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 AAAT 3 2 72751 CASAVA_Build 13 63674036 2D GAGTTACACG TA/-- TATTTGGAAT 3070 het 3070 ref 40 19 18 5 TA 2 1 72752 CASAVA_Build 13 63677463 5D TTGCCTTATA GTTTT/----- ATTATTATAT 3070 het 3070 ref 41 24 15 4 GTTTT 1 0 72753 CASAVA_Build 13 63691270 1I GATCTTTTTA -/T TTGTTAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 2 3 72754 CASAVA_Build 13 63697821 1D TCTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1321 het 1321 ref 33 16 4 14 T 17 16 72755 CASAVA_Build 13 63698382 1I ATTCTCACAG -/A AACAGAAATA 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 A 2 3 72756 CASAVA_Build 13 63701880 1I AGCATGTTGT -/A AAAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 6 7 72757 CASAVA_Build 13 63702812 1I AGTTAATTTG -/A ATAACTGTTA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 1 2 72758 CASAVA_Build 13 63705033 2D AGGAAATAAA AG/-- AGGATACAAA 3070 het 2078 hom 24 5 17 2 AG 2 1 72759 CASAVA_Build 13 63705657 1I TTGCCCATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 8 9 72760 CASAVA_Build 13 63706328 1I GATATTACAA -/T TATTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 T 1 2 72761 CASAVA_Build 13 63706538 1D GCTCAGTAGC A/- AAAAAACAGG 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 7 6 72762 CASAVA_Build 13 63707180 1I TATATGTGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 31 14 6 T 9 10 72763 CASAVA_Build 13 63737727 1I CAATTAATGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 A 9 10 72764 CASAVA_Build 13 63741554 1I AAGATAATAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 9 10 72765 CASAVA_Build 13 63746031 1D GATTCATTAG T/- TTTTTTTTTT 2430 het 2430 ref 22 14 6 2 T 11 10 72766 CASAVA_Build 13 63746493 1I TAAGAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 9 10 72767 CASAVA_Build 13 63752136 1D TTTATTTGGC A/- AAAAAAAATC 3040 het 3040 ref 26 18 7 1 A 9 8 72768 CASAVA_Build 13 63753638 13D TCAAGAATGT ACAAGGAACTTAA/------------- ACAAATTAAC 3070 het 3070 ref 31 18 12 4 ACAAGGAACTTAA 1 0 72769 CASAVA_Build 13 63755629 4I AAGGAAGGAT ----/GGAA GGAAGGAAGG 1361 het 651 hom 12 4 6 2 GGAA 3 4 72770 CASAVA_Build 13 63757010 1D ATGCTGGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 107 het 40 0 36 4 A 10 9 72771 CASAVA_Build 13 63764706 1I TGTTTCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 35 0 23 12 T 10 11 72772 CASAVA_Build 13 63766800 2D GAATGGCTTA GC/-- CACTTTGGAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 GC 1 0 72773 CASAVA_Build 13 63775877 2I GACATATTTG --/AT ATATATATAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 5 6 72774 CASAVA_Build 13 63776079 1I TTTTTCTAAA -/T GTAAAATTAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 0 1 72775 CASAVA_Build 13 63787651 2I CTTCTTTCTT --/AA AAGTTTCAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 4 72776 CASAVA_Build 13 63804152 2D AATTAATAAC TT/-- GCTAAATTTC 3070 hom 78 het 33 0 27 7 T 2 0 72777 CASAVA_Build 13 63811422 2I AATAGCACTC --/AT ATGCTGATAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 1 2 72778 CASAVA_Build 13 63819345 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 23 1 12 11 A 15 14 72779 CASAVA_Build 13 63827222 4D GAAGGAAACA ACAG/---- ACAATGAGGT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 ACAG 1 0 72780 CASAVA_Build 13 63827746 7I TAACTATGAA -------/TACTCAT TGAGTGCTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TACTCAT 0 1 72781 CASAVA_Build 13 63829108 1I CATTTTATTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 8 9 72782 CASAVA_Build 13 63831428 2D GGCAGAAAAT AA/-- AATATTTATC 3070 hom 99 het 38 0 34 6 A 4 2 72783 CASAVA_Build 13 63846443 1I AAACTTTCCC -/A CATTTTTCTA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 0 1 72784 CASAVA_Build 13 63847543 1D AAGGATTGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 8 72785 CASAVA_Build 13 63858667 1I GCATCCAAAC -/T ATATCATTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 0 1 72786 CASAVA_Build 13 63861456 4I TGTGCAAAAA ----/AATC ACCACTTTCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AATC 0 1 72787 CASAVA_Build 13 63864554 1I TGTTAACCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 403 hom 37 1 32 4 A 9 10 72788 CASAVA_Build 13 63867705 1D ATGTAAATAT A/- TATTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 A 1 0 72789 CASAVA_Build 13 63871287 1I CAACATGGGA -/G CCCCACAAAG 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 G 0 1 72790 CASAVA_Build 13 63872561 1I TTTATAATTC -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 T 7 8 72791 CASAVA_Build 13 63890565 1I AGAAAATTGG -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 6 7 72792 CASAVA_Build 13 63897171 1D ACCTTTTGAC T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 T 7 6 72793 CASAVA_Build 13 63901550 1I GGTAAAAAAA -/T GCCAAGCTCT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 0 1 72794 CASAVA_Build 13 63922093 1I GTATCGATAC -/A AAAAAGCAAC 3070 het 3070 hom 56 19 27 10 A 5 6 72795 CASAVA_Build 13 63934674 1I ATGGACAAAA -/G ACAGGGAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 G 0 1 72796 CASAVA_Build 13 63947160 2D GAAAGCCCTC AT/-- AAAAATAATG 3070 het 3070 ref 50 25 18 8 AT 1 0 72797 CASAVA_Build 13 63952582 1D GGATGATAAG A/- GCAGAGTGAA 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 A 1 0 72798 CASAVA_Build 13 63953340 1I ATCCTTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 624 hom 45 2 36 7 T 11 12 72799 CASAVA_Build 13 63953501 2I CTTCATCAAT --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 AC 4 5 72800 CASAVA_Build 13 63960763 4I TATTTTATAT ----/ACAG ACAAACATAT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 ACAG 0 1 72801 CASAVA_Build 13 63971451 1I TGGAAGATAT -/G GGGGGGGATG 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 G 7 8 72802 CASAVA_Build 13 63972395 1D AAGAACCACA G/- GGAGGTGTGA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 G 3 2 72803 CASAVA_Build 13 63973980 5I TGGGGGGGGC -----/TTATA TTATATTATT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTATA 1 2 72804 CASAVA_Build 13 63981640 2D GCTTTTTTTC AT/-- ATGTTTGTTG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AT 2 1 72805 CASAVA_Build 13 63981825 4D GTCTGTTAAT TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 TTTG 2 1 72806 CASAVA_Build 13 63991025 1I CTTTTCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2969 hom 28 8 10 10 T 13 14 72807 CASAVA_Build 13 64015343 4I GAGGAGGGAG ----/TTTC TTTCATCTCA 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 TTTC 1 2 72808 CASAVA_Build 13 64025819 2I ACTATGATGA --/AG AGAAAGACCT 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 AG 1 2 72809 CASAVA_Build 13 64027756 1I ACAATTCCCC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 T 7 8 72810 CASAVA_Build 13 64041119 1D GATTTTTTCC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 T 8 7 72811 CASAVA_Build 13 64042417 1D TAAGTATTTT G/- GTTTCTCAAA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 G 2 1 72812 CASAVA_Build 13 64045381 1I TTTATTTCAA -/G GATGGGCGAC 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 G 1 2 72813 CASAVA_Build 13 64048128 3I GTCAGGAGTT ---/TGA GGCCAGCCTG 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 TGA 0 1 72814 CASAVA_Build 13 64048325 1D ATCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 9 11 A 12 11 72815 CASAVA_Build 13 64050270 1I ACATGTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 10 11 72816 CASAVA_Build 13 64050722 1D AAAAAAAAAA C/- CCTCACTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 C 3 2 72817 CASAVA_Build 13 64077871 1I TTTAGTAGAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 C 0 1 72818 CASAVA_Build 13 64080271 1D GGAGTGTTGT G/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 G 1 0 72819 CASAVA_Build 13 64083028 2I TGTGTGTATA --/TG TGTGTGTATA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 TG 3 4 72820 CASAVA_Build 13 64083117 1I TATTATGAAT -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 A 6 7 72821 CASAVA_Build 13 64084195 1D GAAAGGTGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 9 19 8 A 10 9 72822 CASAVA_Build 13 64091322 1D AAGCATGGTT G/- GGGGAGGACT 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 G 5 4 72823 CASAVA_Build 13 64100544 1D TGTTTTGTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 T 9 8 72824 CASAVA_Build 13 64129853 1I TGCAAGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 11 72825 CASAVA_Build 13 64133381 6D AAGGATTTGC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 29 1 19 9 A 20 14 72826 CASAVA_Build 13 64140561 1D AGTTTCAAAG T/- TTTCGCACTG 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 4 3 72827 CASAVA_Build 13 64142316 1I TAAATGAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 9 10 72828 CASAVA_Build 13 64143764 1D AGCTTTCCCT G/- TGTTAGCCAG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 1 0 72829 CASAVA_Build 13 64145390 10D ATTATTTTGC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 1571 hom 31 9 16 9 T 22 12 72830 CASAVA_Build 13 64147357 1D GTATATTTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 8 7 72831 CASAVA_Build 13 64150582 4I TAACATGGTG ----/GGTA GTAGTATACA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 GGTA 0 1 72832 CASAVA_Build 13 64162062 4I TTCTTTGTTT ----/AAAG AAAGAAACTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAAG 1 2 72833 CASAVA_Build 13 64166160 2D TGACATTCCC CT/-- GTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 9 6 CT 1 0 72834 CASAVA_Build 13 64176746 3I ACATGTTCTG ---/CTA CTACTTGAGA 3070 hom 76 het 30 0 24 6 CTA 1 2 72835 CASAVA_Build 13 64180883 1I GTTTATGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 37 1 25 11 T 11 12 72836 CASAVA_Build 13 64181269 1I AAGGATTGAG -/A AAAAAGACAG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 A 5 6 72837 CASAVA_Build 13 64182264 3I GAAATTCAAA ---/TAT TATAACAATC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAT 1 2 72838 CASAVA_Build 13 64184752 2I ATTAGACAAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 9 11 72839 CASAVA_Build 13 64186013 4D ATTATTATTA TTAT/---- TTTTTTTTTT 1883 het 1518 hom 13 7 6 1 TTAT 1 0 72840 CASAVA_Build 13 64186861 1I CAGCAAATTG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 6 7 72841 CASAVA_Build 13 64196492 2I AGACACACAA --/AG AGAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 AG 4 5 72842 CASAVA_Build 13 64196761 1I AGCTATTTGG -/A AAAAAAAAAA 1539 het 1539 ref 22 11 4 7 A 11 12 72843 CASAVA_Build 13 64197556 24D TGTCTATGTC TATACATGCATATGTACATGTATG/------------------------ TATGCATGCA 3070 het 3070 ref 41 27 13 4 TATACATGCATATGTACATGTATG 1 0 72844 CASAVA_Build 13 64201213 6I ACTCTGTCTC ------/AAAAAG AAAAAGAAAA 2943 het 2943 ref 34 21 8 5 AAAAAG 1 2 72845 CASAVA_Build 13 64202250 1D TAAAGTATTT A/- AATTATGTAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 3 2 72846 CASAVA_Build 13 64202795 2D AAATGTGTTT TA/-- TCTTATGACT 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 TA 1 0 72847 CASAVA_Build 13 64202935 1D CTTCTCAAAA G/- AATACATTTA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 G 1 0 72848 CASAVA_Build 13 64203391 1D ATGCAGTCAT A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 7 6 72849 CASAVA_Build 13 64203710 6I ATCCTAGAAC ------/TTAAAA TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TTAAAA 1 2 72850 CASAVA_Build 13 64203895 3D74M1D ACTGTGTATT ATAATGACAGTCTCATATACTTAGAGAAATTGCAATCTGTTTGCTTATAAGTATTATAATTGCTTGATAAACCAAATG/---ATGACAGTCTCATATACTTAGAGAAATTGCAATCTGTTTGCTTATAAGTATTATAATTGCTTGATAAACCAAAT- GAGCTTTGGC 3070 het 3070 ref 31 29 14 10 N/A 0 0 72851 CASAVA_Build 13 64206506 2I ATCTTGGTCA --/CT CTGATAATTG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 CT 1 2 72852 CASAVA_Build 13 64211759 1D GTTCAATCTT A/- TATTGAGTAC 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 A 1 0 72853 CASAVA_Build 13 64212066 2D TAAAAGGACA TT/-- TTTTTTTTAG 2580 het 2580 ref 26 16 6 6 T 10 8 72854 CASAVA_Build 13 64214413 1D ATCAGCCACC T/- TTTTTTTTTT 2152 het 1319 hom 17 4 6 7 T 13 12 72855 CASAVA_Build 13 64219397 1D TCCCAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 12 11 72856 CASAVA_Build 13 64222617 1D GAAATGAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 9 8 72857 CASAVA_Build 13 64226561 4I AATAACATAT ----/TAAA TAAATTAGTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TAAA 1 2 72858 CASAVA_Build 13 64228325 3I CTTAGCTTTT ---/ACA ACAATAGTGA 3070 het 3070 hom 54 16 33 5 ACA 1 2 72859 CASAVA_Build 13 64230811 1I AGCTTATTTT -/C CTCTTGTGTA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 C 1 2 72860 CASAVA_Build 13 64233166 1D TGTAGTATTA T/- TTTATGAGTC 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 T 4 3 72861 CASAVA_Build 13 64256211 1D CAGCACATGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 22 het 31 1 22 8 A 10 9 72862 CASAVA_Build 13 64259371 2I CATAGGTGAC --/AA GAGCACTAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 2 72863 CASAVA_Build 13 64260345 1I TTTATTTTTT -/A TTTTTTGGAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 0 1 72864 CASAVA_Build 13 64263005 1I TCATTTATTT -/C GCAAGTGCAG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 0 1 72865 CASAVA_Build 13 64266412 26I GGGATATATG --------------------------/TAAGTATATACTTACAGATATATGCA TACCTTTATC 3070 hom 99 het 37 0 34 6 TAAGTATATACTTACAGATATATGCA 0 1 72866 CASAVA_Build 13 64278771 3D ACATTAAATA TAT/--- TATTATTTAA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 TAT 3 2 72867 CASAVA_Build 13 64281234 1I GCATCGTGTG -/C CTGGAAAAGC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 1 2 72868 CASAVA_Build 13 64293002 2D AATAGATCTA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 350 hom 55 1 45 9 AG 7 6 72869 CASAVA_Build 13 64304802 6D AAAAAACTAC TTTAAA/------ TTTAATATGG 2100 hom 12 het 6 0 5 2 TTTAAA 1 0 72870 CASAVA_Build 13 64306674 5I TAATAAAACA -----/AATAT AATATAATAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AATAT 1 2 72871 CASAVA_Build 13 64315014 1I ATGATTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 35 1 29 5 A 11 12 72872 CASAVA_Build 13 64323490 1I AATTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 A 13 14 72873 CASAVA_Build 13 64346482 1I CATGGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 36 1 25 10 A 10 11 72874 CASAVA_Build 13 64350695 2D CTACTCTCAG TT/-- TTATATATAT 2552 hom 24 het 12 0 9 3 T 4 2 72875 CASAVA_Build 13 64351030 2D ACAAAACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AC 8 7 72876 CASAVA_Build 13 64352847 1I ACACAGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 29 2 19 8 T 13 14 72877 CASAVA_Build 13 64353687 1D ATAATTTAAA T/- TAGAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 2 1 72878 CASAVA_Build 13 64354627 1D TAGGTACATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 298 hom 39 1 25 13 T 10 9 72879 CASAVA_Build 13 64357921 1I TCAAATCTTT -/C CAAAACTTTC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 1 2 72880 CASAVA_Build 13 64388702 1D CATACCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 30 1 24 5 T 11 10 72881 CASAVA_Build 13 64390236 1I AAAACATTAT -/G AAAAAAATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 72882 CASAVA_Build 13 64392770 1I AGAAATCAAT -/G GGGGGGGGTT 3070 hom 71 het 32 0 22 10 G 8 9 72883 CASAVA_Build 13 64403488 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 1222 het 555 hom 22 4 10 10 A 16 18 72884 CASAVA_Build 13 64416515 1I TGGGCAACAG -/A AAAAGATCCT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 4 5 72885 CASAVA_Build 13 64426693 2D GCTAATTGCT GG/-- TGGATAGATA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 G 2 0 72886 CASAVA_Build 13 64431910 1D CTTCAGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 11 10 72887 CASAVA_Build 13 64433343 1I ATGTTTAAAA -/C AACAAGATAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 0 1 72888 CASAVA_Build 13 64435688 1D TGGTAACATG A/- AAAAAACAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 7 A 7 6 72889 CASAVA_Build 13 64439592 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 7 8 72890 CASAVA_Build 13 64442379 3D TTTTTACCTT GTC/--- AGTTTGTGAG 3070 hom 75 het 29 0 25 6 GTC 1 0 72891 CASAVA_Build 13 64453235 1I CCCATTTACA -/T TGAAGGTTAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 1 2 72892 CASAVA_Build 13 64457126 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 2421 hom 21 het 9 0 8 1 A 9 10 72893 CASAVA_Build 13 64462390 2D TAGATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 40 0 30 10 TG 7 6 72894 CASAVA_Build 13 64464126 1D GCATGTGCCT G/- TAGTCCCAGC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 G 1 0 72895 CASAVA_Build 13 64466120 1D ATCTCATGCA T/- TTTGGTTTCA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 T 4 3 72896 CASAVA_Build 13 64477500 1I TATGTAACTA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 7 8 72897 CASAVA_Build 13 64484869 1D CATACACTGA C/- CCTATTCAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 3 2 72898 CASAVA_Build 13 64486081 1I ATCCTCTGTA -/T TTTTTGCCCC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 5 6 72899 CASAVA_Build 13 64496392 1D CTTCCTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 9 72900 CASAVA_Build 13 64497257 2I GCACATAATA --/AT ATATAAATAT 2804 hom 24 het 11 0 9 2 AT 2 3 72901 CASAVA_Build 13 64499185 1I TTTGAGTTGA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 6 7 72902 CASAVA_Build 13 64507920 1D GAACTGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 26 0 20 7 A 12 11 72903 CASAVA_Build 13 64516810 1D TCTAAAAAAA T/- AAAATAAAAT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 1 0 72904 CASAVA_Build 13 64544541 1D AACATAAGAG A/- AAAACCTAGG 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 5 4 72905 CASAVA_Build 13 64569704 1D TGTAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 41 0 38 3 A 12 11 72906 CASAVA_Build 13 64610015 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 138 hom 27 1 23 3 A 13 14 72907 CASAVA_Build 13 64623840 1I CAAGAAAAAA -/T AATGTCTAAA 3070 hom 178 het 62 0 60 2 T 0 1 72908 CASAVA_Build 13 64632213 2I ATTAATCCAC --/AT GTTACAGTAA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 AT 0 1 72909 CASAVA_Build 13 64632423 2D AATAACTCTC TT/-- CTCACTTTCC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 2 0 72910 CASAVA_Build 13 64685547 1I AAGCCAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 33 1 23 9 A 12 13 72911 CASAVA_Build 13 64707138 1D TACTTGTGCC T/- TTTTTTTTTT 1407 het 1407 ref 49 38 4 8 T 11 10 72912 CASAVA_Build 13 64725698 1D CAGCACTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 36 2 24 10 T 15 14 72913 CASAVA_Build 13 64738024 4I TTGGGTAATG ----/AGAA AGAACCTTTG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AGAA 1 2 72914 CASAVA_Build 13 64771259 1D AATTTACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 11 10 72915 CASAVA_Build 13 64818078 4I TAGCACAACA ----/AAAT AAATAATCAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AAAT 1 2 72916 CASAVA_Build 13 64829555 1D TTTATGTCAG A/- AAAAAAAAAA 2073 het 2073 ref 43 31 5 7 A 13 12 72917 CASAVA_Build 13 64839360 2D AGGAGGCAAA TG/-- TGTGTGTGTG 470 het 470 ref 47 36 3 8 TG 8 7 72918 CASAVA_Build 13 64846109 1I TGATCTACCC -/A CCTCAGCCTC 3070 hom 116 het 42 0 39 3 A 0 1 72919 CASAVA_Build 13 64856954 2I TTATTTTGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 10 12 72920 CASAVA_Build 13 64867571 1D ACTAATTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 25 hom 37 1 32 4 T 10 9 72921 CASAVA_Build 13 64881227 1D GTAATAAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 10 9 72922 CASAVA_Build 13 64882341 1I ATGGGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 497 hom 27 2 23 2 A 11 12 72923 CASAVA_Build 13 64895407 1D ATGTTCCTTA T/- TTTTTTTTTT 2661 hom 42 het 21 0 14 7 T 17 16 72924 CASAVA_Build 13 64907364 1D ATAATTAATG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 21 10 0 T 9 8 72925 CASAVA_Build 13 64924715 1D TATAGTTATT A/- AAAAAAGTTT 2183 het 994 hom 9 3 5 1 A 7 6 72926 CASAVA_Build 13 64929404 4I9M5D21M2D TCTAAAACAA ----TAATAAAACTATAGTATAGTGAATACTTAGGTAACAT/TAGTTAATAAAAC-----TATAGTGAATACTTAGGTAAC-- AGTCATTTAT 2878 het 2878 ref 33 30 6 9 N/A 0 0 72927 CASAVA_Build 13 64933537 1I TCAACTTTGA -/T TGTACTTACG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 1 2 72928 CASAVA_Build 13 64933589 1I ATTTTTCCTG -/A AAAAAAAAAA 2553 het 1454 hom 31 7 10 14 A 15 16 72929 CASAVA_Build 13 64940226 1D GTTTGGGTTT A/- AAAAGAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 5 4 72930 CASAVA_Build 13 64942491 10D CACTTCAATG TAACAGAACC/---------- CCAGAAATGA 3070 hom 66 het 27 0 23 10 TAACAGAACC 1 0 72931 CASAVA_Build 13 64943751 1I AAAGAAGAAG -/A AAAGGAAATT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 3 4 72932 CASAVA_Build 13 64946082 1D ACCAGAGAAT A/- AAATGAAGGG 3070 hom 78 het 31 0 27 6 A 4 3 72933 CASAVA_Build 13 64951843 10I ATTTTTTAAT ----------/AAGTGTCAGG GATCTTCGAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 AAGTGTCAGG 0 1 72934 CASAVA_Build 13 64953522 2D TGCTATTTAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 27 het 26 1 24 1 TC 6 5 72935 CASAVA_Build 13 64953534 2D TCTCTCTCTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 31 het 30 1 25 5 TA 6 5 72936 CASAVA_Build 13 64955435 22D GTGCAAAAGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 27 2 14 15 T 39 17 72937 CASAVA_Build 13 64955982 1D AACTTTAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 38 0 28 11 T 10 9 72938 CASAVA_Build 13 64957129 1I AATTTTCTTG -/A AAAAAATTCA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 6 7 72939 CASAVA_Build 13 64964644 1I AAAACGAAAC -/A AAAAACTATA 3070 hom 63 het 30 0 22 8 A 5 6 72940 CASAVA_Build 13 64965756 2D TCTCAAACTT AA/-- AATAAAAGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 4 2 72941 CASAVA_Build 13 64967124 2I TGTTTTTCAC --/AT GACATAAAAT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 AT 0 1 72942 CASAVA_Build 13 64973868 1D AATCACATGG A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 7 6 72943 CASAVA_Build 13 64989709 1I CTGTTCAATT -/A AAAAAAAAAT 2690 het 2690 ref 24 14 7 3 A 9 10 72944 CASAVA_Build 13 65004426 1D TCGGTGCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 16 10 A 11 10 72945 CASAVA_Build 13 65013468 4I AAAAACAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 2425 het 2425 ref 27 14 10 3 AAAC 3 4 72946 CASAVA_Build 13 65018660 1D ATCTCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 A 11 10 72947 CASAVA_Build 13 65018807 1I CATTCATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 10 11 72948 CASAVA_Build 13 65038841 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 2585 hom 24 9 14 2 A 11 9 72949 CASAVA_Build 13 65043015 4D TTTTAAGGAT TAAG/---- TGAGTTAACA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 TAAG 1 0 72950 CASAVA_Build 13 65046839 1D TAGTAAGGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 10 9 72951 CASAVA_Build 13 65052283 2D TGAGAAAACT TA/-- TATATATATA 950 het 950 ref 9 4 4 1 TA 7 6 72952 CASAVA_Build 13 65056919 1D TAACAACAGC A/- AAAAAAAAAA 1355 het 1355 ref 22 12 5 5 A 17 16 72953 CASAVA_Build 13 65060736 1I GACACATACA -/C CCCCCCCAAG 2859 het 983 hom 9 2 6 1 C 7 8 72954 CASAVA_Build 13 65069462 3D ATAGATAGAT AGA/--- TAGATAGATA 347 het 347 ref 25 7 2 16 AGA 1 0 72955 CASAVA_Build 13 65071242 2I GAAAAGTTTG --/AA AGACAATGAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 1 3 72956 CASAVA_Build 13 65071792 1I CAGAAAGTAT -/A TGTTATAAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 0 1 72957 CASAVA_Build 13 65072762 2D TAAAGTATTT TA/-- TATATATATA 2256 hom 12 het 5 0 5 0 TA 9 8 72958 CASAVA_Build 13 65073335 1I ACAGGGTTTT -/G GCTCTGTCTC 2612 het 2612 ref 22 13 7 2 G 1 2 72959 CASAVA_Build 13 65078694 2D AAAATTCACC TA/-- TATATATATA 2066 hom 18 het 9 0 7 2 TA 6 5 72960 CASAVA_Build 13 65080075 1I AGCCTTCCCA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 6 7 72961 CASAVA_Build 13 65088673 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 9 9 8 TG 9 8 72962 CASAVA_Build 13 65097824 3D AATATGTAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 7 T 14 11 72963 CASAVA_Build 13 65098884 3D TCAGAATCTC CTT/--- CTGGAGAAAT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 CTT 1 0 72964 CASAVA_Build 13 65102129 1I CATTATCATC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 7 8 72965 CASAVA_Build 13 65104185 1D TCAACAACAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 C 1 0 72966 CASAVA_Build 13 65123283 1D CCAGAAGACC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 9 8 72967 CASAVA_Build 13 65147164 2I CCTTTCTGTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 25 0 17 8 TG 0 1 72968 CASAVA_Build 13 65147268 17D CAGCAGAGGC TGCAGAACAGCAAATAT/----------------- TGCAGAACAG 3070 het 3070 ref 23 12 10 4 TGCAGAACAGCAAATAT 2 1 72969 CASAVA_Build 13 65156961 1D GTTCCTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 T 11 10 72970 CASAVA_Build 13 65159772 1I CATGAATGTG -/T GTTGGATTTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 0 1 72971 CASAVA_Build 13 65163770 1I AATAATGCAG -/C TATTTATATC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 0 1 72972 CASAVA_Build 13 65169188 1D ATGGGAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 11 10 72973 CASAVA_Build 13 65170177 4D TATAATATTC AATA/---- AATATACCAT 2436 het 2436 ref 15 10 5 1 AATA 2 1 72974 CASAVA_Build 13 65177530 6D TATTTTATTA TTATAC/------ TTTAAGTTTT 3070 het 2563 hom 23 8 12 3 TTATAC 1 0 72975 CASAVA_Build 13 65182318 1D CATCATATTA T/- TTTTTTTTTT 2125 het 2125 ref 26 14 5 7 T 11 10 72976 CASAVA_Build 13 65186115 1D ATAGCAGCAC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 T 8 7 72977 CASAVA_Build 13 65187014 1I CTAAGTTGTG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 8 9 72978 CASAVA_Build 13 65190075 1I TTATTCATTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 8 9 72979 CASAVA_Build 13 65198475 3D GTATTGAACA CAT/--- CATCTGATTG 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 CAT 2 1 72980 CASAVA_Build 13 65205945 1D AAGAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2386 hom 24 10 9 6 A 12 11 72981 CASAVA_Build 13 65217574 1D GGCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 T 11 10 72982 CASAVA_Build 13 65222681 1D TAATGTGAGA T/- TTTTTTTTTT 1970 het 1970 ref 36 22 6 8 T 15 14 72983 CASAVA_Build 13 65231871 1D CCAAACAGAT A/- AAAACCCAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 5 4 72984 CASAVA_Build 13 65234908 1I TGAGAAAGAA -/C TCGGACAAGA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 C 0 1 72985 CASAVA_Build 13 65239839 1I ATCTTTGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2944 hom 33 8 14 11 A 17 18 72986 CASAVA_Build 13 65248592 1I CATTAGTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 134 hom 48 1 42 5 T 9 10 72987 CASAVA_Build 13 65249293 2D TGATAACCAC AT/-- GTTTACTTTC 2858 het 2858 ref 23 16 7 0 AT 1 0 72988 CASAVA_Build 13 65262155 4I CAATCAACTG ----/GTCA GTCAGTTAGT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 GTCA 1 2 72989 CASAVA_Build 13 65262838 4D TTCTAAAACT TTAA/---- TTCTTTATTT 3070 het 1447 hom 19 5 11 3 TTAA 1 0 72990 CASAVA_Build 13 65265625 4D AACATTAAAA TAAT/---- TAATGCTACT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 TAAT 2 1 72991 CASAVA_Build 13 65266011 2I AAATAAAAAC --/TT ATAAAATTTT 3070 hom 42 het 23 0 15 8 T 0 2 72992 CASAVA_Build 13 65268923 1D AAAAGGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 11 11 T 15 14 72993 CASAVA_Build 13 65276172 1D CATGTGAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 10 9 72994 CASAVA_Build 13 65278396 5D TTTCTACCAC TAGTA/----- TAGGCAGAGA 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 TAGTA 1 0 72995 CASAVA_Build 13 65279522 1I AAAAATTAAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 8 9 72996 CASAVA_Build 13 65280920 2D CGTGCTGGTT TA/-- TATATATATG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TA 5 4 72997 CASAVA_Build 13 65293498 4D ACTCAAAAAT AGAG/---- AGGCATGGTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 AG 3 1 72998 CASAVA_Build 13 65300507 1D AAAACTACTA T/- TTTTTTTTTT 1079 het 1079 ref 34 23 3 8 T 11 10 72999 CASAVA_Build 13 65300570 4D TACCCTTTCT GTTA/---- GTTCTTAAAA 3070 het 3070 hom 38 9 25 6 GTTA 1 0 73000 CASAVA_Build 13 65308224 1D AGCCATGCTT C/- CATTACTTGA 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 C 2 1 73001 CASAVA_Build 13 65308506 1I ATTTTGCTCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 T 7 8 73002 CASAVA_Build 13 65310149 1D TTTTAGAGTA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 8 7 73003 CASAVA_Build 13 65339219 1I TTTAATACAA -/T TGGGGGGGTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 2 73004 CASAVA_Build 13 65341921 2I AAAAAGATAG --/AA AAGAGAGTTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 2 4 73005 CASAVA_Build 13 65343674 1D CCTTATTTGG A/- AATAAAATCG 3070 hom 175 het 65 0 59 6 A 3 2 73006 CASAVA_Build 13 65347051 3I AGGCCTACAC ---/TGT TACTCTGTGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TGT 0 1 73007 CASAVA_Build 13 65350685 3D TCTTCCACTG TCT/--- TCTTATTTTT 3070 hom 42 het 19 0 14 7 TCT 2 1 73008 CASAVA_Build 13 65350824 4D ACTTGAAAGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1157 hom 7 het 22 0 6 17 A 15 11 73009 CASAVA_Build 13 65353896 1D TGATGAGAGA C/- CCCCCACACC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 C 6 5 73010 CASAVA_Build 13 65355256 14D TATATATATA TATATATATATATG/-------------- TGTGTGTGTA 3070 hom 42 het 14 0 15 0 TATATATATATATG 1 0 73011 CASAVA_Build 13 65358716 4D TTAGCAAAAA AGAG/---- AGAGAATTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AG 4 2 73012 CASAVA_Build 13 65361190 1I AGGCAATCTG -/A AAAAAAGGAT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 6 7 73013 CASAVA_Build 13 65362354 2D TTAGGATAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 141 het 55 0 48 8 AC 8 7 73014 CASAVA_Build 13 65374378 1D CTTTTTTAAG T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 84 het 36 0 28 9 T 8 7 73015 CASAVA_Build 13 65380255 1D GTTTCAAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 73016 CASAVA_Build 13 65384499 1D AAATTTCTCC A/- TCTTCTATTC 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 1 0 73017 CASAVA_Build 13 65385983 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 508 hom 34 5 24 5 A 7 8 73018 CASAVA_Build 13 65385993 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 179 hom 40 2 34 4 A 8 9 73019 CASAVA_Build 13 65397318 2I CTAATGTTTT --/TC TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 37 22 14 2 TC 0 1 73020 CASAVA_Build 13 65404945 2I AACCAGACTG --/TT TTTTCCGTGC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 4 6 73021 CASAVA_Build 13 65407282 2I GAAAGAAGAA --/AG AGAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 AG 3 4 73022 CASAVA_Build 13 65421020 5D ACTTGTTCTT TTCTC/----- TTCTCAAACA 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 TTCTC 2 1 73023 CASAVA_Build 13 65430935 2I ATAAAAGTTT --/TA GTCGGTTCTT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 TA 0 1 73024 CASAVA_Build 13 65434250 1I TCTGTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 1174 het 1174 ref 26 10 7 9 T 15 16 73025 CASAVA_Build 13 65435224 1D AGCACCCCAT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 1218 hom 18 5 9 4 C 10 9 73026 CASAVA_Build 13 65435747 5D TGTAGTCTTC TGAGA/----- TAAGATTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 20 4 TGAGA 1 0 73027 CASAVA_Build 13 65439146 3I GTTCTCCAGG ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 A 9 12 73028 CASAVA_Build 13 65440023 1I AAATTATTCC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 A 7 8 73029 CASAVA_Build 13 65442996 2D CAAGGGTACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2768 hom 29 8 14 7 A 12 10 73030 CASAVA_Build 13 65449169 10I CATGAAAATG ----------/GACTAACACA GTAAATTGGT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 GACTAACACA 0 1 73031 CASAVA_Build 13 65454010 1I TATCTTTATT -/C TGAATAATTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 C 0 1 73032 CASAVA_Build 13 65460805 4I CATATGTGAC ----/ATGT ATGTATGTGT 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 ATGT 2 3 73033 CASAVA_Build 13 65462346 2D TTGTTTGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 13 11 73034 CASAVA_Build 13 65464670 3I GTTTTTAAGT ---/ATA ATTTGGTGGG 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 ATA 0 1 73035 CASAVA_Build 13 65488268 1D TTTAACTCTT A/- TTTTTTCTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 1 0 73036 CASAVA_Build 13 65503914 2I TGAGCCACAC --/AT GTGAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 AT 0 1 73037 CASAVA_Build 13 65506934 1D CACTGTTGGT G/- GGGACTGTAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 4 3 73038 CASAVA_Build 13 65521554 12D29M2D ATACTCATCA AATTTTTTGTACAATTTTTTGTATCAAAAAAGAAAAATTTTTG/------------AATTTTTTGTATCAAAAAAGAAAAATTTT-- TGATACAGTC 3070 hom 84 het 24 0 29 7 N/A 0 0 73039 CASAVA_Build 13 65523128 1I AAGAGTTGCC -/A AGGTGATGAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 1 2 73040 CASAVA_Build 13 65538966 1I TCTGCTCATG -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 8 73041 CASAVA_Build 13 65542008 25D2M3D ACAAACTGCA GGGATGCAGTTTGTTTATTCTCCACTCAAT/-------------------------TC--- AAGGAAAATT 3070 hom 95 het 30 0 29 6 N/A 0 0 73042 CASAVA_Build 13 65542371 2I GAGTCACAAT --/TG TGTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 1 2 73043 CASAVA_Build 13 65544102 1D ATCAAGAGAT A/- ACTTGTTATG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 2 1 73044 CASAVA_Build 13 65544699 4D TATTTTTATC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 42 hom 25 1 15 10 AT 10 8 73045 CASAVA_Build 13 65554664 4D TAAGTTATCC TTAT/---- TTGTTTCCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TTAT 1 0 73046 CASAVA_Build 13 65558452 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1833 het 300 hom 8 1 6 1 A 13 14 73047 CASAVA_Build 13 65560855 4I GTTATTGTCC ----/CTGT CTAACTCCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CTGT 0 1 73048 CASAVA_Build 13 65563698 1I GCCAATTTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 10 73049 CASAVA_Build 13 65568244 4D ACAATAAAAT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 GA 8 6 73050 CASAVA_Build 13 65570826 1I TAGAAGACTA -/C CTATGGAAAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 1 2 73051 CASAVA_Build 13 65572062 1I TGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 16 1 10 5 A 10 11 73052 CASAVA_Build 13 65573862 6D CCCATAGCCA TCAATC/------ TCAATGCCAC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TCAATC 1 0 73053 CASAVA_Build 13 65585563 1D TCCTGCAGTA T/- TGGGGGGGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 1 73054 CASAVA_Build 13 65585849 1I CTATTACTTT -/A TTTATTACAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 1 73055 CASAVA_Build 13 65587598 2D GCACCTAGAT GA/-- GATGCTAACA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 GA 2 1 73056 CASAVA_Build 13 65600219 1I TATAGAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 32 1 23 8 T 10 11 73057 CASAVA_Build 13 65603656 2I2M32I AGTCAAATAT --GC--------------------------------/TAGCAATTTCATTTGGTCTCACATAAGTATCTATAT AGACATACAT 3070 hom 57 het 18 0 20 0 N/A 0 0 73058 CASAVA_Build 13 65604745 1I GGAGGGCCTT -/A AAATTAATAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 3 4 73059 CASAVA_Build 13 65605728 1I CTAAATGTGA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 87 het 35 0 31 4 T 7 8 73060 CASAVA_Build 13 65606762 3I AAAAAATTTA ---/TAT TATATTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TAT 1 2 73061 CASAVA_Build 13 65607637 1D AAAAAAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 11 10 73062 CASAVA_Build 13 65609549 1I TGAAAGAAGC -/A AAAAGAACTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 4 5 73063 CASAVA_Build 13 65612142 4I GTTGTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 126 het 53 0 43 10 TTTG 2 3 73064 CASAVA_Build 13 65621808 1D AAGATGGATT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 8 7 73065 CASAVA_Build 13 65623737 2D CCACTGAAAC TT/-- TAGCTCTCTC 3070 het 3070 ref 42 21 17 6 T 3 1 73066 CASAVA_Build 13 65633373 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCCGGCTT 3070 het 348 hom 29 1 24 4 C 5 6 73067 CASAVA_Build 13 65635175 2I ATACCAAAAA --/AC AGTTAATAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AC 0 1 73068 CASAVA_Build 13 65639335 2I TTGCTAAAAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 42 0 25 17 A 9 11 73069 CASAVA_Build 13 65639936 4I TATAATTTTC ----/TTCA TTCATTTTGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTCA 1 2 73070 CASAVA_Build 13 65641388 1I TGGTAACTAA -/G AAAATAATAT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 G 0 1 73071 CASAVA_Build 13 65641860 15D ATATATATAT TAAAAATTAGATATA/--------------- TGAAAATTAG 3070 hom 36 het 13 0 13 2 TAAAAATTAGATATA 1 0 73072 CASAVA_Build 13 65642063 4D ATAAAAGCTA TATT/---- TATTTAGATA 2642 hom 15 het 6 0 6 0 TATT 2 1 73073 CASAVA_Build 13 65644630 1I ATTTGTGTTC -/A AAAAAATTGT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 6 7 73074 CASAVA_Build 13 65647653 2D ACAATAATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 15 8 T 16 14 73075 CASAVA_Build 13 65648896 5I TGACCTAATT -----/AAGGA AAGTTTGAAT 3070 hom 85 het 34 0 26 8 AAGGA 0 1 73076 CASAVA_Build 13 65662083 8D AAGACAGCAC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 32 1 22 11 A 22 14 73077 CASAVA_Build 13 65662938 2I CAAAGTGATA --/CT TTGAAATGAT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 CT 0 1 73078 CASAVA_Build 13 65665770 1I TGAGAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 492 hom 32 3 25 4 A 12 13 73079 CASAVA_Build 13 65670475 2I ATATAATCTC --/AT ATTCATGCAC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AT 1 2 73080 CASAVA_Build 13 65670737 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAAGA 3070 het 6 hom 33 1 26 7 AAAG 2 1 73081 CASAVA_Build 13 65682004 3D TTTTTTTTTT TTA/--- AAAAAAATTG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TTA 1 0 73082 CASAVA_Build 13 65683928 1D ATCTCCTGTC T/- CTTCTTCTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 1 0 73083 CASAVA_Build 13 65693619 2I ATGGAAAATG --/AA AAGAGATGAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 2 4 73084 CASAVA_Build 13 65693988 3D TTAAAAGAGT AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 12 9 73085 CASAVA_Build 13 65697997 1D TTTTTTTTTT G/- TGTGTGATGA 3070 hom 19 het 33 1 27 5 G 1 0 73086 CASAVA_Build 13 65716115 2D TATTATTAAA CT/-- CTTTCTATAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CT 2 1 73087 CASAVA_Build 13 65733691 1D AATACTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 809 hom 31 3 20 8 A 15 14 73088 CASAVA_Build 13 65742745 1I AAATGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 31 0 23 8 A 10 11 73089 CASAVA_Build 13 65744350 1I AAGATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 808 het 808 ref 37 22 3 12 A 15 16 73090 CASAVA_Build 13 65746850 1D GAAAAAAAAA T/- GTTTGTTTTT 3070 hom 88 het 33 0 30 4 T 1 0 73091 CASAVA_Build 13 65750495 1D ATCTTTATCA G/- AAGTGTGAAA 3070 hom 118 het 45 0 38 7 G 1 0 73092 CASAVA_Build 13 65753042 1I CTGTCCTTGA -/C ATAGTTTGCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 0 1 73093 CASAVA_Build 13 65761954 4D ATAAATATAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 TTTG 4 3 73094 CASAVA_Build 13 65763402 1D TAAATTTCTA T/- GTAAGTAGGA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 0 73095 CASAVA_Build 13 65769776 4I TGGTTATTAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 AAAC 3 4 73096 CASAVA_Build 13 65773256 1D CAATGAAGCA T/- TTTTAGACTC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 5 4 73097 CASAVA_Build 13 65784744 1D ATCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 37 1 21 15 A 16 15 73098 CASAVA_Build 13 65794187 1I TTGGATGCAT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 G 8 9 73099 CASAVA_Build 13 65802773 1I AAACTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 2636 het 2579 hom 24 8 8 8 A 11 12 73100 CASAVA_Build 13 65809732 8D GTACTTGTTA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 1087 hom 42 6 19 20 AAAC 6 4 73101 CASAVA_Build 13 65811016 1I GGTAGAAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 89 het 42 0 30 12 A 9 10 73102 CASAVA_Build 13 65811360 3D TAGTAATGAG AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 AAC 4 3 73103 CASAVA_Build 13 65813883 1D CTGTACTAAC A/- GGCACAGGAC 3070 hom 108 het 44 0 36 9 A 1 0 73104 CASAVA_Build 13 65820535 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 608 hom 29 6 13 10 T 14 13 73105 CASAVA_Build 13 65826521 1D AGGTGATTTA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 8 7 73106 CASAVA_Build 13 65830082 1I GAAAGCGCAC -/A AGAATTTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 2 73107 CASAVA_Build 13 65855171 4I AAAACAAACA ----/AACT AAAACAAACA 3070 hom 98 het 44 0 39 5 AACT 0 1 73108 CASAVA_Build 13 65856965 1D TCCCAGATAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2608 hom 22 8 9 5 T 9 8 73109 CASAVA_Build 13 65859960 3D ATTTTTGACC AGG/--- AGCTTCTCAA 3070 het 3070 hom 33 13 20 0 AGG 1 0 73110 CASAVA_Build 13 65868716 4D CGAAATAGAT AGAC/---- AGACAGATAG 3070 het 3070 hom 59 22 35 5 AGAC 2 1 73111 CASAVA_Build 13 65873485 1D GTTTTATGAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 9 8 73112 CASAVA_Build 13 65873905 1D GTACCTCCTG C/- CCAACTACTC 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 C 3 2 73113 CASAVA_Build 13 65875229 1I AGGAACTGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 A 9 10 73114 CASAVA_Build 13 65878064 1I TTATGTATAA -/G GGGACTGATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 3 4 73115 CASAVA_Build 13 65881702 4I TCTTTATCCC ----/TAGG TAGGTGTTCC 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 TAGG 1 2 73116 CASAVA_Build 13 65887878 1I AAAATAAGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 7 8 73117 CASAVA_Build 13 65890972 1D AGATAGACCG C/- TAGCCAGACT 3070 hom 27 het 12 0 10 5 C 1 0 73118 CASAVA_Build 13 65891353 1D TCACGCTGAT A/- CCAAAACTTG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 1 0 73119 CASAVA_Build 13 65895500 1I GAGACACAGC -/A AAAAAAAAAA 1711 het 1578 hom 16 4 5 7 A 13 14 73120 CASAVA_Build 13 65897693 1D TCAGAAAACG A/- AAAAAAAAAA 1441 het 1441 ref 39 31 4 4 A 13 12 73121 CASAVA_Build 13 65914800 1D CAGTTTGTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 31 het 22 0 20 2 T 9 8 73122 CASAVA_Build 13 65916624 1I CTAATAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 T 10 11 73123 CASAVA_Build 13 65920975 4I TGTTTCAGGA ----/AATT AATTAAGTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AATT 1 2 73124 CASAVA_Build 13 65944513 8D GACCAGCCTG GGCAACTT/-------- GGCAAAACCT 3070 hom 69 het 26 0 22 9 GGCAACTT 1 0 73125 CASAVA_Build 13 65948444 1D ATTACATTTT A/- AAAAAATCAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 7 6 73126 CASAVA_Build 13 65958587 1D TAGACCCTGT C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 57 het 23 0 18 6 C 9 8 73127 CASAVA_Build 13 65970353 1D CTCGGCTCAC T/- TGAAAGCTCC 1440 hom 10 het 5 0 4 1 T 2 1 73128 CASAVA_Build 13 65974782 5I GAAATAGCAG -----/TTAAC TTAATGAAGA 3070 hom 126 het 44 0 40 4 TTAAC 0 1 73129 CASAVA_Build 13 65979353 2D TCAACTTCTC TT/-- ATAAGGAAAG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 2 0 73130 CASAVA_Build 13 66003243 1I AAAAAATCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 9 10 73131 CASAVA_Build 13 66008971 1I AAAGCAGATA -/T GACACCAGTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 0 1 73132 CASAVA_Build 13 66010891 1D TCAAGTATCT G/- GGTACTTTGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 3 2 73133 CASAVA_Build 13 66012004 1D CTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 18 1 12 6 T 18 17 73134 CASAVA_Build 13 66027553 1I CATTCTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 986 hom 40 4 28 8 A 13 14 73135 CASAVA_Build 13 66036483 5D TTTTTTTATA GAGAT/----- GAGGTCTTAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 GAGAT 1 0 73136 CASAVA_Build 13 66036999 1D TAATGTAGGG T/- TTTTTTTTTT 2380 het 2380 ref 49 37 6 6 T 12 11 73137 CASAVA_Build 13 66060941 4I GGTTCTAATG ----/CAGA CAGTGTGTTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 CAGA 0 1 73138 CASAVA_Build 13 66063596 1D GTAACTATCT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 10 9 73139 CASAVA_Build 13 66066071 1D ATATATAAAG T/- TTTTTTATAG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 7 6 73140 CASAVA_Build 13 66074751 1I AAAAATTTTT -/A AAAAGTAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 4 5 73141 CASAVA_Build 13 66085897 1I AAAAGAGCTC -/T AATTAATTTG 3070 hom 71 het 25 0 23 2 T 0 1 73142 CASAVA_Build 13 66086198 4I CTTAGCACAC ----/AATT AAAGCAACCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AATT 0 1 73143 CASAVA_Build 13 66088534 1D CTATCAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 23 10 T 13 12 73144 CASAVA_Build 13 66097097 4I GTAAAAAAAT ----/AGAG AGCCTAATGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AG 1 3 73145 CASAVA_Build 13 66097795 1D TATAGTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1168 hom 38 6 15 17 T 17 16 73146 CASAVA_Build 13 66098879 3I GATTTACATA ---/TTT AACATTATTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 0 3 73147 CASAVA_Build 13 66102840 1D GATTTAATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 9 73148 CASAVA_Build 13 66109891 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 7 6 73149 CASAVA_Build 13 66116475 1D GCAAAATGTT A/- AATCGTAGGG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 3 2 73150 CASAVA_Build 13 66121761 3D AGATACAAAA CTT/--- ACTGGTAATA 3070 het 3070 ref 34 23 9 3 CTT 1 0 73151 CASAVA_Build 13 66127009 6D GCTCAGGTAA TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 3070 hom 97 het 46 0 33 15 TTTTTG 4 3 73152 CASAVA_Build 13 66128263 1D AAGGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 2236 het 2236 ref 45 33 6 7 A 13 12 73153 CASAVA_Build 13 66132496 4D AATCACTGCA CTGT/---- CTGAGTAATG 3070 het 3070 hom 45 20 22 5 CTGT 1 0 73154 CASAVA_Build 13 66134175 2D TTTGTGAGTA TG/-- TGTGTGTGTG 2973 het 1178 hom 24 5 12 7 TG 10 9 73155 CASAVA_Build 13 66146558 1D GTATTGTGTT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 8 7 73156 CASAVA_Build 13 66155986 1I AGTTAAGCCC -/T TTTTTTCACA 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 T 6 7 73157 CASAVA_Build 13 66172057 1D GTTAGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 11 10 73158 CASAVA_Build 13 66172306 2I AATCAAAGTG --/CT CTCCTTCATG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 CT 1 2 73159 CASAVA_Build 13 66175369 1I ATTTATCCAT -/A ATGCTAGTTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 73160 CASAVA_Build 13 66176045 1I ATTAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3040 hom 26 8 10 8 A 9 10 73161 CASAVA_Build 13 66183671 1D AAAAATAAAG A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 38 17 19 3 A 7 6 73162 CASAVA_Build 13 66209335 4I ATTTGTTCTC ----/TCTT TATTTCTATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TCTT 0 1 73163 CASAVA_Build 13 66219140 1I CATTTTATTC -/A AAAAAAACTG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 7 8 73164 CASAVA_Build 13 66233317 1I AACTTGCTGG -/T TTTGCGGCTT 3070 hom 74 het 28 0 23 5 T 3 4 73165 CASAVA_Build 13 66246553 5D GGGGAAATGA TGGAG/----- TCACTTCTTT 3070 het 3070 ref 42 22 18 5 TGGAG 1 0 73166 CASAVA_Build 13 66254020 4I ATCTCGGGCT ----/CAAA CAATCAAAAG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 CAAA 0 1 73167 CASAVA_Build 13 66268776 4I AGAATATAGG ----/TTCA TTCACTGTAG 3070 hom 138 het 51 0 46 5 TTCA 1 2 73168 CASAVA_Build 13 66270951 1D CTGTTCCTCG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 79 het 51 1 44 6 T 10 9 73169 CASAVA_Build 13 66278649 3D TACCTTTGTC ATT/--- GTTGTTATGG 3070 het 3070 ref 62 35 19 9 ATT 1 0 73170 CASAVA_Build 13 66281915 1I AGTACTTGGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 8 9 73171 CASAVA_Build 13 66288990 1I TAAAACAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2669 hom 27 7 12 8 T 10 11 73172 CASAVA_Build 13 66299502 1I GCAAAAAAAA -/G AAAAAAGAAA 3070 het 458 hom 29 4 20 5 G 0 1 73173 CASAVA_Build 13 66302090 1I TTGTTCCAAC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 7 8 73174 CASAVA_Build 13 66304029 3I GTAATAAAAA ---/CTT CTGTGGAAAA 3070 hom 126 het 46 0 41 5 CTT 0 1 73175 CASAVA_Build 13 66312598 3D ATAATTTGAC AAG/--- AGAATTATAC 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 AAG 1 0 73176 CASAVA_Build 13 66315489 2D GCACATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 117 het 52 0 40 12 AC 9 8 73177 CASAVA_Build 13 66318254 1I AGATAATGCA -/G GGGGGAAAAA 347 het 347 ref 32 12 4 16 G 5 6 73178 CASAVA_Build 13 66325889 1D TTTTTTTTTT C/- AGGAGACAGG 2798 het 2798 ref 25 12 9 4 C 1 0 73179 CASAVA_Build 13 66339150 1I AGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 12 12 T 15 16 73180 CASAVA_Build 13 66343564 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAATC 2192 het 1152 hom 13 4 6 3 A 8 9 73181 CASAVA_Build 13 66344170 1I TTAACATGTC -/T GTCTACTACT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 0 1 73182 CASAVA_Build 13 66349182 1I TACCAAATTG -/A AAAAAAAATG 1145 het 1145 ref 18 11 3 4 A 8 9 73183 CASAVA_Build 13 66349518 1D GGTTTAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 6 T 12 11 73184 CASAVA_Build 13 66377838 1D TCTGAACCTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 A 9 8 73185 CASAVA_Build 13 66380887 1I ATGTACCTTC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 7 8 73186 CASAVA_Build 13 66382506 1I TGAAATTAAT -/A GATAAGATAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 0 1 73187 CASAVA_Build 13 66382670 1I AAAAAATCTT -/A ACAAATTTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 1 2 73188 CASAVA_Build 13 66396769 2D ATAATCAGTC TT/-- ATACATATTT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 T 2 0 73189 CASAVA_Build 13 66397470 1I ATTTTTGGCT -/C TACCGTATCT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 0 1 73190 CASAVA_Build 13 66397753 4D ATTTTGTACA TTCT/---- TTCTTTATTC 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 TTCT 2 1 73191 CASAVA_Build 13 66400992 1D ATAACGAGGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 9 8 73192 CASAVA_Build 13 66412895 1I38M1I TTAAAGAAGT -AAAAATGTCAAAAAAGAGGAAAAATAGCAAAATACAGG-/AAAAAATGTCAAAAAAGAGGAAAAATAGCAAAATACAGGA AAAAAATTTC 3070 hom 147 het 45 0 49 7 N/A 0 0 73193 CASAVA_Build 13 66415138 2I AACCTGAGGC --/TT TTTACTTAAC 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 T 3 5 73194 CASAVA_Build 13 66417339 4I CTGCCTAAAA ----/AGGC AGGCAACATT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 AGGC 1 2 73195 CASAVA_Build 13 66420668 1I AGTGATACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 10 11 73196 CASAVA_Build 13 66423098 1D GCTTATAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 10 9 73197 CASAVA_Build 13 66425213 1D TTCTATAGTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 9 8 73198 CASAVA_Build 13 66434544 4D GTCATGTGTC ACTT/---- AATGAGGGTG 3070 het 3070 ref 43 21 21 5 ACTT 1 0 73199 CASAVA_Build 13 66450948 2D TATGTATATA TG/-- TGTGTATATA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 TG 3 2 73200 CASAVA_Build 13 66459827 1I GATATTCCAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 30 het 30 1 25 4 T 7 8 73201 CASAVA_Build 13 66463633 3D CTCCAGTTAC ATA/--- ATATTTTTGA 3070 het 3070 ref 26 14 11 4 ATA 2 1 73202 CASAVA_Build 13 66472631 1D AAAATAAAAT A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 8 7 73203 CASAVA_Build 13 66474655 1D ACAATTAATC A/- AGAGTCTAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 2 1 73204 CASAVA_Build 13 66477240 7D TTCTATTAAA AACTATC/------- AGTAGAGGAG 3070 het 3070 ref 35 21 12 4 AACTATC 1 0 73205 CASAVA_Build 13 66477375 1I TGATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 11 12 73206 CASAVA_Build 13 66479242 1D TTATTCTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 10 9 73207 CASAVA_Build 13 66485856 1D TGATGGATAA C/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 C 1 0 73208 CASAVA_Build 13 66513964 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2332 het 59 hom 21 1 9 11 A 17 16 73209 CASAVA_Build 13 66527774 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 23 0 15 8 A 11 12 73210 CASAVA_Build 13 66528499 2D TCTTTTTGTA TC/-- TCTGTGTTTA 3070 het 3070 hom 42 18 20 7 TC 2 1 73211 CASAVA_Build 13 66533513 4D TCTGTCTGTC TGTT/---- TGTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 41 18 22 2 TGTT 1 0 73212 CASAVA_Build 13 66535664 1I TTTCCAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 30 0 23 7 A 12 13 73213 CASAVA_Build 13 66538808 1D TCATACAGAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 8 7 73214 CASAVA_Build 13 66539738 1I TTTTAAATAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 7 8 73215 CASAVA_Build 13 66544863 1D TAATATACTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 28 0 24 5 A 9 8 73216 CASAVA_Build 13 66558555 3D AAACTTGGCA CTT/--- CTTTTAAAGT 3070 het 3070 ref 48 22 17 12 CTT 2 1 73217 CASAVA_Build 13 66560233 1D ATTTCATAGA T/- TTTTTTTTTT 2152 het 2152 ref 23 8 7 8 T 15 14 73218 CASAVA_Build 13 66565052 1D GAATTGCAGC T/- TTTAATGGCG 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 4 3 73219 CASAVA_Build 13 66566799 1D ATTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 8 T 13 12 73220 CASAVA_Build 13 66573891 3I ATCTTCAATT ---/AAG AAACCAATTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAG 0 1 73221 CASAVA_Build 13 66601760 2D ATAAATATAC AT/-- ATATATATAT 2365 het 2365 ref 24 13 6 5 AT 6 5 73222 CASAVA_Build 13 66604832 1D ACATAGCATT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 8 7 73223 CASAVA_Build 13 66617734 1I TAGACTATAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 A 7 8 73224 CASAVA_Build 13 66623327 1I CTCCTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 9 10 73225 CASAVA_Build 13 66632710 1D TCAAAGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1673 hom 22 6 13 3 T 12 11 73226 CASAVA_Build 13 66662591 5I TAAGAGGAAA -----/TATTT TATTTTGTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TATTT 1 2 73227 CASAVA_Build 13 66664139 1D CCTATTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 37 0 26 11 A 11 10 73228 CASAVA_Build 13 66666502 1D AACTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 37 1 33 3 T 11 10 73229 CASAVA_Build 13 66689406 1I TTTAATGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1055 hom 42 4 32 6 A 11 12 73230 CASAVA_Build 13 66692404 1I TGTAAAATTA -/T GTAATATGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 1 73231 CASAVA_Build 13 66718670 2D TTTGGAATTT TA/-- TATATATATA 2630 het 1288 hom 14 4 6 5 TA 8 7 73232 CASAVA_Build 13 66735758 1D CCCTCAGCCT C/- CCCCCCCCTA 3070 hom 8 het 34 1 22 11 C 9 8 73233 CASAVA_Build 13 66737401 1I ACTTACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1750 hom 36 4 30 2 A 11 12 73234 CASAVA_Build 13 66751688 1D GCCCATGCAC T/- TCCAATTCCT 3070 hom 105 het 38 0 35 4 T 2 1 73235 CASAVA_Build 13 66755257 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 26 0 21 5 T 11 10 73236 CASAVA_Build 13 66771091 3I GAAATAACTT ---/ATC ATTGTTGATT 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 ATC 0 1 73237 CASAVA_Build 13 66775311 1D AATTTCTACA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 T 8 7 73238 CASAVA_Build 13 66780483 1I TCTCAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 A 10 11 73239 CASAVA_Build 13 66793825 1D ATTTAGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 T 12 11 73240 CASAVA_Build 13 66795585 1I ATTTTCTTTT -/A AAAATCAATG 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 A 4 5 73241 CASAVA_Build 13 66798289 1I AGGAAAGTCA -/G GTGTTTGTGA 3070 het 3070 ref 58 28 22 8 G 1 2 73242 CASAVA_Build 13 66803155 1D ATCAGTCCCC T/- TATTTTGGTA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 2 1 73243 CASAVA_Build 13 66807546 2D ATATGTGATG GT/-- TAATATTGAG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 GT 1 0 73244 CASAVA_Build 13 66808296 3D AAATCAAAAT AAA/--- GAAAATATTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 3 0 73245 CASAVA_Build 13 66811244 2I TAGGCTTGTG --/TT TTAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 2 4 73246 CASAVA_Build 13 66814572 7I TGTCTCTCTC -------/TGATTTT CTAAATTTCC 3070 hom 52 het 25 0 20 5 TGATTTT 0 1 73247 CASAVA_Build 13 66814661 1I TAACCTGATT -/G GGTAGGGAGG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 G 2 3 73248 CASAVA_Build 13 66821404 2D AACGTGGAAA AT/-- TGAGCCCCAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 1 0 73249 CASAVA_Build 13 66822308 5D GATGGGGTTG TTTGT/----- TTTTTTTCTT 3070 hom 33 het 15 0 12 4 TTTGT 1 0 73250 CASAVA_Build 13 66831468 2I ATTTATTCTT --/TC TCTGTCTCTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TC 1 2 73251 CASAVA_Build 13 66840112 4D ATAAATCAAT TAAG/---- TACTATTTTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TAAG 1 0 73252 CASAVA_Build 13 66843850 5D TGTGAGAGGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1827 het 133 hom 31 3 6 22 T 16 11 73253 CASAVA_Build 13 66846921 1I TTTAAAGGTT -/A AAAAAATATG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 6 7 73254 CASAVA_Build 13 66848544 52D CTCTAAGCCT GCTATCACTGAAATGTACTACTTTGACTTTGTAAAATTAGCCAGTCCTGACA/---------------------------------------------------- GCTATCACTG 3070 hom 51 het 51 0 17 42 GCTATCACTGAAATGTACTACTTTGACTTTGTAAAATTAGCCAGTCCTGACA 2 1 73255 CASAVA_Build 13 66850440 10D TTTTATAATT TTTTTATATC/---------- TTTTTATATC 3070 hom 78 het 32 0 27 7 TTTTTATATC 2 1 73256 CASAVA_Build 13 66852824 1I CCGTATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 34 1 25 8 A 11 12 73257 CASAVA_Build 13 66853448 2I GGCCCCCTCC --/CT GTTTCAAGTT 3070 het 3070 hom 35 16 15 6 CT 0 1 73258 CASAVA_Build 13 66855813 1D ATCAGCCGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 T 11 10 73259 CASAVA_Build 13 66856922 1D CTCTTATTTC T/- TATGTTGGGG 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 T 2 1 73260 CASAVA_Build 13 66860596 1I TGAAAAAGGT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 8 9 73261 CASAVA_Build 13 66864407 4D TACTATGAAT TCTC/---- TCTAATATTA 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 TC 3 1 73262 CASAVA_Build 13 66875444 1I ACTCTGAGGA -/G GACGACAAGC 3070 hom 63 het 23 0 19 4 G 1 2 73263 CASAVA_Build 13 66882585 1I GCAGCAAAAT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 7 8 73264 CASAVA_Build 13 66883709 1D TATAGAAAGT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 8 73265 CASAVA_Build 13 66892683 5I TACAGCTATC -----/TAATA TGACAACATG 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 TAATA 0 1 73266 CASAVA_Build 13 66896722 2D ATGTATCAAT TA/-- TATATATATA 2416 het 69 hom 7 1 5 1 TA 9 8 73267 CASAVA_Build 13 66897047 1D ACCTCTCTGA C/- AGGCAAGAAG 3070 het 3070 ref 46 20 19 8 C 1 0 73268 CASAVA_Build 13 66899662 4D ATTCTTTATC TATT/---- TATGTGTTAA 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 TATT 1 0 73269 CASAVA_Build 13 66903821 1D TATATATATA T/- AAAATCAATC 1422 het 233 hom 14 2 4 8 T 1 0 73270 CASAVA_Build 13 66905573 1D TTATATATAT A/- TTTTTTACTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 1 0 73271 CASAVA_Build 13 66906159 1I TTTCAAGGGA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 6 7 73272 CASAVA_Build 13 66910506 1I TTAAAAAGCA -/T TTTTTCTTAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 5 6 73273 CASAVA_Build 13 66918079 4D11M1D ACTGCAAACA CATGCTCAAACTATCA/----CTCAAACTATC- AAAAATGCAG 3070 het 3070 ref 44 34 17 5 N/A 0 0 73274 CASAVA_Build 13 66922306 1D TATTTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1274 hom 21 5 8 9 A 14 13 73275 CASAVA_Build 13 66924482 2D AGATGGGTGA TT/-- TTTCTGCATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 5 3 73276 CASAVA_Build 13 66930119 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 9 10 73277 CASAVA_Build 13 66930645 1I AAATCCTGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 18 0 T 9 10 73278 CASAVA_Build 13 66932593 1I AATTCTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2049 hom 22 9 11 2 A 12 13 73279 CASAVA_Build 13 66933416 6I AAAGGATTGG ------/TCTTTA TCCTCTCAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCTTTA 0 1 73280 CASAVA_Build 13 66938856 2D TGAAATGCAC AG/-- AGTTTTATAG 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 AG 2 1 73281 CASAVA_Build 13 66941472 1I TTGGCTAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 18 21 10 T 9 10 73282 CASAVA_Build 13 66941885 1I ATTCATTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 9 10 73283 CASAVA_Build 13 66946381 12D TCATGCCGAC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 het 2690 hom 32 12 13 11 A 24 12 73284 CASAVA_Build 13 66961391 1I CTTTCTTGGC -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 6 7 73285 CASAVA_Build 13 66984033 1D TACAAAACAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 A 8 7 73286 CASAVA_Build 13 66988620 4D CATATTTGTG TGTA/---- TGTATTTATA 3070 het 3070 ref 40 19 17 8 TGTA 2 1 73287 CASAVA_Build 13 66991721 1D GCTGCATTGT G/- TCCATGTCAT 3070 het 3070 hom 54 26 25 4 G 1 0 73288 CASAVA_Build 13 66992372 1D TTTCAGAGGA T/- GTATCAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 19 8 T 1 0 73289 CASAVA_Build 13 66993227 3D GTGAGAGCTA GTT/--- GTTAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 GTT 2 1 73290 CASAVA_Build 13 66995605 1I TTGAATTATG -/T TTTCCATATC 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 3 4 73291 CASAVA_Build 13 66999743 4I AGTTGATTGA ----/CTCT CTATCTTATG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CT 1 3 73292 CASAVA_Build 13 67006120 1I GAGCATTTAA -/C CGAAGTCCAG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 C 1 2 73293 CASAVA_Build 13 67011914 1I CAAACCTTCA -/C ATGTACCCTC 3070 het 3070 ref 66 35 26 5 C 0 1 73294 CASAVA_Build 13 67015023 2I ATAAGGAGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2663 hom 27 9 13 5 A 10 12 73295 CASAVA_Build 13 67016346 1D TAGGACACTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 9 8 73296 CASAVA_Build 13 67017962 1I ACCTTGACTC -/A AAAAAAAAAA 1938 het 1938 ref 34 12 8 14 A 13 14 73297 CASAVA_Build 13 67020990 1I TAACATAATC -/A AAACTATTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 3 4 73298 CASAVA_Build 13 67030438 59D CTAATTCACA GAAAAAGATTAAGAGAATCAGGATTCATTAAAAAGAAGGTAATGTAGCAAAATTTATCT/----------------------------------------------------------- ATTTATACAT 3070 het 3070 ref 27 30 9 1 GAAAAAGATTAAGAGAATCAGGATTCATTAAAAAGAAGGTAATGTAGCAAAATTTATCT 1 0 73299 CASAVA_Build 13 67030760 1I TATAATTTTT -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 6 7 73300 CASAVA_Build 13 67038341 1I TTGTATGCTT -/C CCCTTTCAAA 1820 het 1820 ref 17 11 4 2 C 3 4 73301 CASAVA_Build 13 67039939 1I TTGAAAATTC -/T TTTGTGTAAT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 3 4 73302 CASAVA_Build 13 67042298 1D AATATCCAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2975 hom 33 8 17 8 T 10 9 73303 CASAVA_Build 13 67043592 1I CTCCAAAATT -/A AATCTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 2 3 73304 CASAVA_Build 13 67044189 2I TCATGTTTTT --/CA CAGATCTTTG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 CA 1 2 73305 CASAVA_Build 13 67046166 1I TGGGAAATTG -/A AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 36 13 23 0 A 6 7 73306 CASAVA_Build 13 67051435 1D TCTGTCTTGA T/- TTTTGACATG 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 T 5 4 73307 CASAVA_Build 13 67053873 1D ACAATTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2806 hom 20 7 10 3 A 12 11 73308 CASAVA_Build 13 67075754 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1368 hom 25 7 12 7 T 15 14 73309 CASAVA_Build 13 67081628 1I ACATAAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 10 11 73310 CASAVA_Build 13 67087634 4D TTCCATAGTG TCTA/---- TCTATTAATT 3070 hom 75 het 27 0 26 4 TCTA 2 1 73311 CASAVA_Build 13 67089015 11I GCAGAACCCA -----------/TGCATATGAAC TGTAGATCCA 3070 hom 87 het 30 0 30 2 TGCATATGAAC 0 1 73312 CASAVA_Build 13 67091496 2I TTCTCTTTGT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 TC 7 8 73313 CASAVA_Build 13 67092995 1I ATCCAATAGC -/T TTTTTTTTTT 2283 het 2283 ref 27 8 10 9 T 13 14 73314 CASAVA_Build 13 67096105 1D CTGTAAGAAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 8 7 73315 CASAVA_Build 13 67098859 1D TTTTAAATAT A/- AAAAATCAAG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 A 6 5 73316 CASAVA_Build 13 67128957 27D CAGTAATTGG AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC/--------------------------- AGCAGCAGCA 3070 het 1126 hom 28 7 9 21 AGC 15 6 73317 CASAVA_Build 13 67132160 1I GAAATATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 T 10 11 73318 CASAVA_Build 13 67144794 2D TTAAAAATTG TA/-- TATATATATA 1902 het 1902 ref 30 14 4 12 TA 9 8 73319 CASAVA_Build 13 67166637 1I CCGTTATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1356 hom 29 4 19 6 A 15 16 73320 CASAVA_Build 13 67277196 4D TTGCCACTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 50 22 14 14 TTTG 5 4 73321 CASAVA_Build 13 67300520 1I AAATTGTTAA -/G ATAGGTTAAG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 G 0 1 73322 CASAVA_Build 13 67309217 1I TTTGCTAAGC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 7 8 73323 CASAVA_Build 13 67324167 1I TCTCTCGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 10 11 T 12 13 73324 CASAVA_Build 13 67346343 1I GACCAGTGAC -/A AGTCTGTGAC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 1 2 73325 CASAVA_Build 13 67360741 1D TGCAGTCATG A/- GTGTGTCTCT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 A 1 0 73326 CASAVA_Build 13 67365540 1D TAGCACCCCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 T 8 7 73327 CASAVA_Build 13 67367059 1I AGACCAGTGG -/A AAAAGATGGC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 4 5 73328 CASAVA_Build 13 67372242 1I AATTTCATAT -/G GAACCAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 1 2 73329 CASAVA_Build 13 67381381 1D CGTCTCTCCT A/- AAAAAGAGAA 2565 hom 21 het 8 0 8 0 A 6 5 73330 CASAVA_Build 13 67396746 1D CACCAAACTC A/- TATGACATGC 3070 hom 123 het 48 0 42 8 A 1 0 73331 CASAVA_Build 13 67399189 3I TGTGGTTTCC ---/ACA ACACTACATA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 ACA 1 2 73332 CASAVA_Build 13 67437220 1D CACTCCCTCC T/- TTTTTTTTCA 953 het 953 ref 43 28 3 12 T 9 8 73333 CASAVA_Build 13 67439960 1I GGGGAGACAT -/G GTGGGAGATA 3070 het 3070 ref 52 26 23 3 G 1 2 73334 CASAVA_Build 13 67452588 4D AATGACAGAC CAGT/---- CAGTGTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 CAGT 2 1 73335 CASAVA_Build 13 67452898 1I AATATTCTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 T 9 10 73336 CASAVA_Build 13 67453610 4D GGTAGGTTCC TTTG/---- TTTGGTCACT 3070 het 3070 ref 39 20 16 5 TTTG 2 1 73337 CASAVA_Build 13 67458481 1D TTAATTTTTC A/- AGTATAAGGG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 2 1 73338 CASAVA_Build 13 67478346 4D GAAATTTCTG GAAA/---- GATAGACCTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 GAAA 1 0 73339 CASAVA_Build 13 67491161 1D AATATATACC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 49 24 22 3 T 9 8 73340 CASAVA_Build 13 67495127 1I AAAATGTAAC -/T TAAATTATGG 3070 het 3070 ref 47 29 13 5 T 1 2 73341 CASAVA_Build 13 67499058 1I ATTTGATCTG -/T TTTTTGTCCA 3070 het 2516 hom 28 7 17 4 T 5 6 73342 CASAVA_Build 13 67508829 3D AAAAGCACTT CTC/--- CTTTCATTCT 3070 het 3070 ref 46 22 20 6 CTC 1 0 73343 CASAVA_Build 13 67518593 12I TTATTTTTAC ------------/TTTCAAAGACAT CGTGATGAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 TTTCAAAGACAT 0 1 73344 CASAVA_Build 13 67519199 4D ATGATCTAGA ACCT/---- AGTAGTTTCA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 ACCT 1 0 73345 CASAVA_Build 13 67523715 1I TTCCATGCTT -/C TTTATTCAGT 3070 het 3070 ref 63 34 26 3 C 0 1 73346 CASAVA_Build 13 67532909 6D TGAAGGAAAA TAATAT/------ TAATAAGGTA 3070 het 3070 ref 28 18 10 3 TAATAT 1 0 73347 CASAVA_Build 13 67535191 1I AGAGCTGTAA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 T 7 8 73348 CASAVA_Build 13 67540302 1I CAGATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2029 het 2029 ref 20 8 7 5 T 11 12 73349 CASAVA_Build 13 67546211 1D CTTCTAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 11 10 73350 CASAVA_Build 13 67569750 1I GAAAGACAAG -/A AAAGATTCTC 3070 het 3070 ref 60 32 21 7 A 3 4 73351 CASAVA_Build 13 67605944 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 12 24 2 A 10 9 73352 CASAVA_Build 13 67625589 1D TGAAATAATG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 C 10 9 73353 CASAVA_Build 13 67626688 2I TATAGAAGAC --/TG TGTACAATCT 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 TG 1 2 73354 CASAVA_Build 13 67639196 2D ATACAGATGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 2594 hom 31 7 14 10 AT 6 5 73355 CASAVA_Build 13 67647701 9D AAATACAACT TTTTTTAAA/--------- TTTAGAAATC 3070 het 3070 ref 32 19 10 5 TTTTTTAAA 1 0 73356 CASAVA_Build 13 67654666 1D TATATTATTT A/- ACAACTCCCA 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 A 2 1 73357 CASAVA_Build 13 67658639 1I AGATTTCTGA -/T TTTTTATCCT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 5 6 73358 CASAVA_Build 13 67660553 1I AATGTCTGAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 8 9 73359 CASAVA_Build 13 67660831 2I TATATTTCTC --/TT TGTTTGACTT 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 T 1 3 73360 CASAVA_Build 13 67686269 13I AAAAAAAAGA -------------/CTTTGAAAATAAC CTCTGAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CTTTGAAAATAAC 0 1 73361 CASAVA_Build 13 67696466 1I AGTCCAAAGT -/C ATATCTGAGA 2816 het 2816 ref 25 13 7 5 C 0 1 73362 CASAVA_Build 13 67707661 1I ATACATTGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 187 hom 22 1 15 6 T 8 9 73363 CASAVA_Build 13 67711387 1D TGTTTTTTTT A/- ATCTTCTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 2 1 73364 CASAVA_Build 13 67727641 1I CAATTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 10 11 73365 CASAVA_Build 13 67742492 6D TTAGTTGGGC CTGATT/------ CTGATTATGT 3070 hom 181 het 62 0 61 2 CTGATT 2 1 73366 CASAVA_Build 13 67747557 6D TTCCTTTGTC TTAGTA/------ TATGTTATCA 3070 het 3070 ref 43 24 18 4 TTAGTA 1 0 73367 CASAVA_Build 13 67757579 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2039 het 2039 ref 31 8 11 12 T 17 16 73368 CASAVA_Build 13 67772397 1I AACAGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 A 10 11 73369 CASAVA_Build 13 67772692 1I CCACTACTGA -/T TTAAAAAAAA 2410 het 1275 hom 34 6 9 19 T 2 3 73370 CASAVA_Build 13 67791441 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 A 10 11 73371 CASAVA_Build 13 67798776 2D TAGAATATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 14 12 73372 CASAVA_Build 13 67805035 1D TAATGGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 6 T 13 12 73373 CASAVA_Build 13 67817957 1D AAAACATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 11 10 73374 CASAVA_Build 13 67818566 2I AGTTGAAGAG --/AT ATATATATAG 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 AT 4 5 73375 CASAVA_Build 13 67819649 1D CGTTATGAGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 20 hom 27 1 12 14 T 9 8 73376 CASAVA_Build 13 67838173 3D TTTTTGGCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 1161 het 1006 hom 37 13 3 21 T 21 18 73377 CASAVA_Build 13 67839264 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2464 het 1944 hom 17 8 6 3 A 10 11 73378 CASAVA_Build 13 67841174 2I AGAAATAAAC --/TT GATCTACCAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 0 2 73379 CASAVA_Build 13 67844670 4I TTGATTTATG ----/GATT ATTATTAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 GATT 0 1 73380 CASAVA_Build 13 67845338 1I AATAGTTGCC -/A ACATAGAAAG 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 1 2 73381 CASAVA_Build 13 67847065 2I TGTGCATGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 13 17 13 TG 8 9 73382 CASAVA_Build 13 67851295 4D TCTATCTATT TATC/---- TATCTATCTA 3070 het 3070 ref 42 17 16 12 TATC 5 4 73383 CASAVA_Build 13 67855113 1I CATCTTTGGA -/T TATGAAGAAT 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 T 1 2 73384 CASAVA_Build 13 67857695 1I TTTTACTGTA -/C CTTTTCTGTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 C 1 2 73385 CASAVA_Build 13 67861876 3D TTTTGTGTGT GAG/--- GAGAACACTT 3070 het 3070 hom 43 21 20 4 GAG 2 1 73386 CASAVA_Build 13 67865147 1D GTAGAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 A 13 12 73387 CASAVA_Build 13 67867760 2D TGCGAATGCT TC/-- CCTGGGGATA 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 TC 1 0 73388 CASAVA_Build 13 67868742 1I GTATATTAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 9 10 73389 CASAVA_Build 13 67880284 2D AACACTTGAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 AT 7 6 73390 CASAVA_Build 13 67884903 6I GTATTATTGA ------/TTATCT TTATTATTTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 TTATCT 0 1 73391 CASAVA_Build 13 67893478 1I GAAATATCAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 9 10 73392 CASAVA_Build 13 67897984 1D TCCTTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 33 0 29 5 T 11 10 73393 CASAVA_Build 13 67910738 1D CCATGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 750 het 750 ref 22 15 3 5 A 12 11 73394 CASAVA_Build 13 67912865 1I ATTTAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 36 1 28 7 A 11 12 73395 CASAVA_Build 13 67914796 2I GTATAGAAAC --/AT ATGATTTATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AT 1 2 73396 CASAVA_Build 13 67929575 6I ATTTTACTTT ------/ATTTTC ATTTTCAGTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ATTTTC 1 2 73397 CASAVA_Build 13 67953315 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 331 hom 31 1 23 7 A 9 10 73398 CASAVA_Build 13 67960903 1I TTAAATTTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 10 73399 CASAVA_Build 13 67962114 1D AAACTTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 36 2 24 10 A 15 14 73400 CASAVA_Build 13 67980686 4I CTTTGTGATT ----/TTAA TTTTCATTTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TTAA 0 1 73401 CASAVA_Build 13 67988536 1D TTCAAATTTT A/- AAAAATAAAT 3070 hom 87 het 30 0 30 1 A 6 5 73402 CASAVA_Build 13 67989825 1D12M2I TTCCTGTTTG TTTTTTTTTTTCG--/-ATTTTTTTTTCGTT TTTTTTTTTA 3070 hom 41 het 30 1 26 6 N/A 0 0 73403 CASAVA_Build 13 67993039 3D21M1I TGCCAGGCTC TTTTTTTTTTTTGTTTATTTATTT-/---TTTTTTTTTGTTTATTTATTTA TTTTTTTTAT 3070 hom 45 het 21 0 16 6 N/A 0 0 73404 CASAVA_Build 13 67993856 4D AACTCTTTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AAAC 5 4 73405 CASAVA_Build 13 67995880 2D CAGTGTGCAA AG/-- AGACCTATCT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 AG 2 1 73406 CASAVA_Build 13 67998791 3I CCTATCAACC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 18 9 A 11 14 73407 CASAVA_Build 13 68018305 1D TGGAACTATT A/- GCTCTAGAAA 3070 het 3070 ref 31 14 15 3 A 1 0 73408 CASAVA_Build 13 68022350 3I AGTACATGAT ---/GAA GAAGAACAAT 3070 hom 162 het 60 0 53 7 GAA 2 3 73409 CASAVA_Build 13 68036671 1I TTTTTTTCTT -/C TGGTGAGCAT 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 C 0 1 73410 CASAVA_Build 13 68039780 1D TGAACCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 14 12 T 12 11 73411 CASAVA_Build 13 68047860 2D AGGAGTCAAG TT/-- TTTCTCATCA 3070 hom 126 het 44 0 42 4 T 5 3 73412 CASAVA_Build 13 68056175 1I CGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTC 1047 het 123 hom 7 2 5 0 T 9 10 73413 CASAVA_Build 13 68056842 1D TTGAGATAGG T/- TTCCCATAAT 2534 het 2534 ref 17 10 6 2 T 3 2 73414 CASAVA_Build 13 68057215 1D AGGAACATAT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 8 7 73415 CASAVA_Build 13 68058662 4I TTTTAAACAT ----/AATC AATAAAAACA 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 AATC 0 1 73416 CASAVA_Build 13 68061499 1D TGAATAGACA T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 7 6 73417 CASAVA_Build 13 68070473 1D GTGGGCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 34 1 26 8 A 12 11 73418 CASAVA_Build 13 68070512 4I CTCTCTGTCT ----/ACAC ACACACGCGC 1617 het 1617 ref 28 5 5 18 AC 3 5 73419 CASAVA_Build 13 68071840 4D TCGCACCACT GCAC/---- TCCAGCCTGG 2634 het 1484 hom 9 3 6 0 GCAC 1 0 73420 CASAVA_Build 13 68074874 2D CTGTATATAC AT/-- ATATACACAC 2750 het 95 hom 22 2 11 10 AT 3 2 73421 CASAVA_Build 13 68082738 2D GCATGTGAAA AC/-- ACAATAATTA 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 AC 2 1 73422 CASAVA_Build 13 68086809 6D TTTAGTTTGC TAAATT/------ TATTAGAGTT 3070 het 3070 hom 26 11 15 4 TAAATT 1 0 73423 CASAVA_Build 13 68087179 3D GAAAGAAGGA CTT/--- CGAATAAAGA 3070 het 3070 hom 46 19 21 7 CTT 1 0 73424 CASAVA_Build 13 68104791 2I ATATATTTAC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TA 5 6 73425 CASAVA_Build 13 68107948 1D TTACATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1471 hom 37 6 13 18 T 17 16 73426 CASAVA_Build 13 68115364 1I TTCCTAAGAG -/C AGTATCAGTG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 0 1 73427 CASAVA_Build 13 68118149 1D TAAGTTATCT C/- TATGCCTACA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 1 0 73428 CASAVA_Build 13 68118771 1D CATCAAAGAC A/- AATAAATTAA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 3 2 73429 CASAVA_Build 13 68119219 1D ATTTCCCACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 10 9 73430 CASAVA_Build 13 68120653 1I ACACTCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 10 11 73431 CASAVA_Build 13 68121152 1D TTTTACACAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 8 7 73432 CASAVA_Build 13 68122883 3D AAACTTTTAA AAT/--- AATTATTATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAT 2 1 73433 CASAVA_Build 13 68124409 28I TGCAATATCT ----------------------------/CTGAGGTATGACTGTATTCCCACATCTG TTTAAGCTAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 CTGAGGTATGACTGTATTCCCACATCTG 0 1 73434 CASAVA_Build 13 68125728 2D AAGGAAACAT TA/-- TATATATATA 3070 het 106 hom 26 1 16 9 TA 8 7 73435 CASAVA_Build 13 68127532 1D TTTAGAAACA G/- ATACAGCCTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 G 1 0 73436 CASAVA_Build 13 68129387 1D ACAAGCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 45 0 40 6 A 11 10 73437 CASAVA_Build 13 68132075 1I AGATCCTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 10 73438 CASAVA_Build 13 68133874 1D TGCATGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 10 9 73439 CASAVA_Build 13 68134780 9I ATTGGCTTTC ---------/ATTCCTAAT ATTAAATGTA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 ATTCCTAAT 0 1 73440 CASAVA_Build 13 68138859 1D TGCAAATATT A/- AAAAAAAAAA 2429 het 2429 ref 33 21 6 6 A 13 12 73441 CASAVA_Build 13 68141950 1I ACAGATTGTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 102 het 40 0 33 7 A 8 9 73442 CASAVA_Build 13 68147655 1D CTTCATATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 479 hom 48 2 41 5 A 10 9 73443 CASAVA_Build 13 68149963 1D CATACTAGCA T/- TAACAGACTC 3070 hom 99 het 47 0 34 14 T 2 1 73444 CASAVA_Build 13 68181147 1I TACAGTTTTT -/C CCCACAAGGA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 C 3 4 73445 CASAVA_Build 13 68189694 2I GTTTGAATCA --/TT TTATATATAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 4 73446 CASAVA_Build 13 68194772 4I TTTTAGCAGA ----/CAGT CAGCCAAAGT 3070 hom 108 het 46 0 36 10 CAGT 0 1 73447 CASAVA_Build 13 68219019 1D CCCTTTCCTT C/- TTTGACTTGA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 C 1 0 73448 CASAVA_Build 13 68242410 1D AACTACATGA C/- TCTATACATT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 C 1 0 73449 CASAVA_Build 13 68248244 1D CAATTTTTTC G/- TTTTTTTTAA 3070 het 2464 hom 19 8 10 1 G 1 0 73450 CASAVA_Build 13 68257618 24D AAATGTGTAC CTTCTTGTTATTGGACAGAGTAGT/------------------------ CTATATAGAT 3070 het 3070 ref 25 11 9 7 CTTCTTGTTATTGGACAGAGTAGT 1 0 73451 CASAVA_Build 13 68259492 1I TTCACTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 10 11 73452 CASAVA_Build 13 68271712 1I AATACTGTAG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 7 8 73453 CASAVA_Build 13 68273618 1I TGTAGTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 11 12 73454 CASAVA_Build 13 68273737 3D TAAGGATATA TAT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 143 hom 26 2 11 13 TAT 1 0 73455 CASAVA_Build 13 68287557 1D TTTAAAATAT A/- ATCTTATAAC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 2 1 73456 CASAVA_Build 13 68298809 1I CGCATGAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 9 10 73457 CASAVA_Build 13 68299109 1D TAAAACTGGA C/- CCCTTTCTTA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 C 4 3 73458 CASAVA_Build 13 68300087 1D ATGAAAAAAA G/- CTCAATATCA 3070 het 3070 ref 56 30 20 7 G 1 0 73459 CASAVA_Build 13 68304315 1D GTTGATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 25 10 8 T 12 11 73460 CASAVA_Build 13 68311854 4D TTCCATATTT TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 TA 8 6 73461 CASAVA_Build 13 68312202 1I ATATTAGTCA -/T TTTTAGTGAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 4 5 73462 CASAVA_Build 13 68314545 4D TTACATTTTA ACTT/---- ACTTATTTAT 3070 hom 87 het 34 0 30 7 ACTT 2 1 73463 CASAVA_Build 13 68323922 1I AGACACAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 9 10 73464 CASAVA_Build 13 68327980 1I ATGAAAAATT -/A ACAGAAATAA 3070 het 3070 ref 29 20 7 2 A 1 2 73465 CASAVA_Build 13 68328697 3D ATGAAATTGT GAA/--- GAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 29 18 5 GAA 3 2 73466 CASAVA_Build 13 68336244 1D TCAGGGTCCT C/- CAAGGGTTAA 3070 hom 138 het 51 0 44 7 C 2 1 73467 CASAVA_Build 13 68339419 1D GCAGGTGGAA T/- TTTTTTTTTT 918 het 918 ref 35 15 4 16 T 17 16 73468 CASAVA_Build 13 68346084 1I CCCTTTTCTG -/T TTCAGTTACA 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 T 2 3 73469 CASAVA_Build 13 68351776 1D AATATAAATA C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 C 8 7 73470 CASAVA_Build 13 68352558 1D AAAACTTTTT A/- TATATTGCTG 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 A 1 0 73471 CASAVA_Build 13 68353427 4D GAGAAAACTC AGTT/---- AGTATATTTG 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 AGTT 1 0 73472 CASAVA_Build 13 68355907 1D TTAGCAATGA T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 2 1 73473 CASAVA_Build 13 68358105 1D TATTTTTGTC T/- TCTGCCTGTT 3070 het 3070 ref 37 22 9 7 T 2 1 73474 CASAVA_Build 13 68363688 1D GGAAAGGAAA G/- TGGAGGATAA 2850 het 2850 ref 16 8 8 0 G 1 0 73475 CASAVA_Build 13 68364527 1I CTAAATTCTG -/C CCCCCCCCTT 1856 het 1856 ref 31 11 8 12 C 8 9 73476 CASAVA_Build 13 68365337 4D TAGGGTACAC TTTT/---- TTTTCTTTAC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 8 4 73477 CASAVA_Build 13 68365414 4I CTTCCTCTTT ----/TCTC TCTGTCTCTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TC 1 3 73478 CASAVA_Build 13 68369590 5D CTGGGAAGAC TAGAA/----- TAGCAATGCA 3070 het 3070 hom 37 14 20 5 TAGAA 1 0 73479 CASAVA_Build 13 68370565 8I TAGTTCACAT --------/CTGTTCCC CTGTTCCCCT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 CTGTTCCC 1 2 73480 CASAVA_Build 13 68372524 1I ATGCTTATCT -/A AAATGCCTTC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 3 4 73481 CASAVA_Build 13 68378207 1D GTCACCCCCC T/- TTTTTTTTTG 1622 het 1622 ref 37 23 4 10 T 10 9 73482 CASAVA_Build 13 68383079 1D GAGTCTTGCT C/- TGTCGCCCAG 935 het 800 hom 13 2 3 8 C 1 0 73483 CASAVA_Build 13 68388581 1I AACAAATTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 T 9 10 73484 CASAVA_Build 13 68392400 1I TGCAAAATAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 8 9 73485 CASAVA_Build 13 68393863 1I ATTAGAATTT -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 53 24 26 3 A 6 7 73486 CASAVA_Build 13 68398519 1I GAATAATAGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 8 9 73487 CASAVA_Build 13 68402275 2D AAGATTACTT AA/-- AAGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 A 4 2 73488 CASAVA_Build 13 68413502 1D AGTTATAATT G/- ACAGAATTAT 3070 het 3070 ref 44 23 19 3 G 1 0 73489 CASAVA_Build 13 68415000 4D GATTATCTTC ATAA/---- ATAAATAATA 3070 het 3070 hom 36 10 22 5 ATAA 3 2 73490 CASAVA_Build 13 68417664 4D ATGACAAAAT AAAC/---- AAGGAATAAT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 AAAC 1 0 73491 CASAVA_Build 13 68418572 1D GGAAAAAAAA T/- GTAACATGCC 3070 het 3070 hom 45 15 27 6 T 1 0 73492 CASAVA_Build 13 68420333 1I GTAACTGAAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 T 8 9 73493 CASAVA_Build 13 68423718 1I ATTTTTCCAC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 A 7 8 73494 CASAVA_Build 13 68425926 4I AGTTAAAACA ----/TAGT TAGTACTGAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TAGT 1 2 73495 CASAVA_Build 13 68426085 2I GACCTGTAAT --/CC CCCCCCATGT 3070 het 1607 hom 28 5 19 4 C 6 8 73496 CASAVA_Build 13 68426749 1D TCACAGTGCT A/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 1 0 73497 CASAVA_Build 13 68428249 1I GGGCCTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 10 11 73498 CASAVA_Build 13 68430537 1D GTATTTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 10 9 73499 CASAVA_Build 13 68434706 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 8 9 73500 CASAVA_Build 13 68435258 4I GTAGTTAATT ----/ATCA AAAAAGATGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 ATCA 0 1 73501 CASAVA_Build 13 68439518 13D TTTTCCTTCT ATGCATAGGCTGC/------------- ATAGAAGCCT 3070 hom 72 het 28 0 23 7 ATGCATAGGCTGC 1 0 73502 CASAVA_Build 13 68441640 14D CCGTCCCATA TAAGTAATTCTATT/-------------- TAAATAATTT 3070 hom 99 het 31 0 33 3 TAAGTAATTCTATT 1 0 73503 CASAVA_Build 13 68446123 1I AGATGAAAGT -/A ACAAAAAATA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 1 2 73504 CASAVA_Build 13 68458510 3I ATGAGATGCT ---/ATA ATAATGAGCT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 ATA 1 2 73505 CASAVA_Build 13 68462453 1D TGACAAGATT A/- AAAAAAAAAA 723 het 723 ref 21 13 2 7 A 15 14 73506 CASAVA_Build 13 68475553 1I AGCCACAAAC -/A AAAAAATGAG 3070 hom 96 het 46 0 33 13 A 6 7 73507 CASAVA_Build 13 68485889 4D AACATCTTAC GTAA/---- GTGTTTTTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 5 GTAA 1 0 73508 CASAVA_Build 13 68507723 1I TCCTAATTTG -/A AGTTTTTCTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 2 73509 CASAVA_Build 13 68520367 1D TAAATATGTA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 7 6 73510 CASAVA_Build 13 68530579 1D GTGATATGGC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 9 8 73511 CASAVA_Build 13 68534848 1D AGACACACAC A/- ACATATAGCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 1 73512 CASAVA_Build 13 68541854 1D TGTGTACCTC A/- AATGATTAAG 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 3 2 73513 CASAVA_Build 13 68545812 1D TCTTCTTGAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 9 8 73514 CASAVA_Build 13 68546332 1I ACATTATTGA -/C CTCTAAAAGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 1 2 73515 CASAVA_Build 13 68548034 2I CTGCTATTTC --/AG AGTTTGATCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 AG 1 2 73516 CASAVA_Build 13 68551108 3D TCAACAATAT CAA/--- CAATATGAAG 3070 hom 66 het 24 0 23 2 CAA 2 1 73517 CASAVA_Build 13 68555178 3D TTATGAACTT TAA/--- TAATAACTTC 2179 het 2179 ref 23 15 5 4 TAA 3 2 73518 CASAVA_Build 13 68555381 1I ACATGCCATT -/A AATGAAAGAC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 2 3 73519 CASAVA_Build 13 68556564 2D GCACTCATAC AT/-- ATGTTTACAT 3070 hom 172 het 60 0 58 3 AT 2 1 73520 CASAVA_Build 13 68557974 3D ACTCGTAGAC ATA/--- ATATTTACAT 3070 hom 217 het 78 0 73 6 ATA 2 1 73521 CASAVA_Build 13 68558577 1I TATTTATATA -/C ACATGTTATA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 C 0 1 73522 CASAVA_Build 13 68559679 1D AGTTGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 11 10 73523 CASAVA_Build 13 68560764 1I GCATCCTTAT -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 7 8 73524 CASAVA_Build 13 68566675 1I TAGCTTGATG -/A AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 5 6 73525 CASAVA_Build 13 68567495 10I AGAAGAATGC ----------/GTATCACAAA ATTTGTTTAT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 GTATCACAAA 0 1 73526 CASAVA_Build 13 68572966 1I GTGAATATAA -/T ACAAGGGCTA 3070 het 3070 ref 56 25 25 6 T 0 1 73527 CASAVA_Build 13 68575481 6I TTATAAGGAC ------/CCTTAT CATTGGATTT 3070 het 3070 hom 45 20 18 7 CCTTAT 0 1 73528 CASAVA_Build 13 68576079 4I TTTTTTTTTT ----/AAAA AAAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 5 9 73529 CASAVA_Build 13 68577474 4I CTACAAAAGG ----/GTGA GTAAGTATAT 3070 het 3070 hom 32 9 22 1 GTGA 0 1 73530 CASAVA_Build 13 68578804 1I TTTATAAAAC -/A AGAGCACCAG 3070 het 3070 hom 53 24 28 1 A 1 2 73531 CASAVA_Build 13 68580564 2I AAAATAGGAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 AT 7 8 73532 CASAVA_Build 13 68580771 1D AACCACAAAT A/- AAAAAACCTA 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 A 7 6 73533 CASAVA_Build 13 68582561 1I TTTTCTAAGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 7 8 73534 CASAVA_Build 13 68583307 4D GATCTGACGG TTCA/---- CTTTGAGAAC 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 TTCA 1 0 73535 CASAVA_Build 13 68585031 13D TCTAGTCATT GTTCATGCTCACC/------------- GTGCTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 25 13 3 GTTCATGCTCACC 1 0 73536 CASAVA_Build 13 68586525 1D CCACGGTGTT C/- TCATGATAGT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 C 1 0 73537 CASAVA_Build 13 68587853 1I TTCTAATATT -/C ACTAAGTTTG 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 C 0 1 73538 CASAVA_Build 13 68588944 2D ATACAAAATA AC/-- ACAGTTTTTC 3070 het 3070 ref 58 27 24 7 AC 2 1 73539 CASAVA_Build 13 68593495 1I ACAACATCAA -/C AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 C 0 1 73540 CASAVA_Build 13 68595758 1I GGCCATCATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 A 8 9 73541 CASAVA_Build 13 68602185 1I TATTTGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 36 1 32 3 A 10 11 73542 CASAVA_Build 13 68603224 28I ATAAGTAATG ----------------------------/ATTATCTTAGATAACTTAGACAATCTAA GTTATCTAAG 3070 hom 102 het 34 0 35 6 ATTATCTTAGATAACTTAGACAATCTAA 0 1 73543 CASAVA_Build 13 68607027 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAATG 2581 het 1325 hom 32 9 13 10 G 0 1 73544 CASAVA_Build 13 68609234 16D ACTTACTCTA AGCCAATACTGATGGG/---------------- TTTTCTACTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 7 AGCCAATACTGATGGG 1 0 73545 CASAVA_Build 13 68616321 1I AATTTTTAAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3067 hom 21 8 11 2 A 7 8 73546 CASAVA_Build 13 68617420 1D AGAGCTAGAC A/- AAGAGTTCTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 3 2 73547 CASAVA_Build 13 68621875 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1690 het 1690 ref 41 16 9 16 A 17 18 73548 CASAVA_Build 13 68623904 1I AGTGCCAAAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 2578 hom 18 7 7 4 T 8 9 73549 CASAVA_Build 13 68627718 7D ATCACTGATT TAATGCA/------- TAATGCATAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 7 TAATGCA 2 1 73550 CASAVA_Build 13 68629396 2D TAAACACTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 48 hom 20 2 10 8 AT 7 6 73551 CASAVA_Build 13 68633156 4I GAACAAAGAG ----/TAAA TAAACCCCAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAAA 1 2 73552 CASAVA_Build 13 68638009 1I ACAGAAAAAC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 8 73553 CASAVA_Build 13 68638370 19D CAATTCAGGA TGAGTGCAAGAATCCACAG/------------------- TGAGGATCAA 3070 het 3070 hom 42 17 26 8 TGAGTGCAAGAATCCACAG 1 0 73554 CASAVA_Build 13 68642179 8I AAGTACTCGG --------/GATATTTT GATATTTTGA 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 GATATTTT 1 2 73555 CASAVA_Build 13 68643643 1D ACCAATTAAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 A 8 7 73556 CASAVA_Build 13 68648556 2D TTAAAACAAA AT/-- ATGTTTATAC 3022 het 3018 hom 17 8 7 2 AT 2 1 73557 CASAVA_Build 13 68648712 1I AATATCTAAC -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 6 7 73558 CASAVA_Build 13 68656912 1I CAAGAGAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 33 1 18 14 T 13 14 73559 CASAVA_Build 13 68658697 4I TATATATATG ----/TGTA TGTATGTATG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TGTA 3 4 73560 CASAVA_Build 13 68659549 1I TACAGTTTTT -/G TTTTTCTCAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 G 0 1 73561 CASAVA_Build 13 68661373 1D TAAAATCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 11 10 73562 CASAVA_Build 13 68661866 1I TTTACTTTCC -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 6 7 73563 CASAVA_Build 13 68669772 1I AAAGTTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 339 hom 35 1 31 3 T 10 11 73564 CASAVA_Build 13 68675541 1I CTTTACAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 73565 CASAVA_Build 13 68675868 2I TATATATATT --/TA TATATATATA 1632 het 1632 ref 13 7 4 2 TA 5 6 73566 CASAVA_Build 13 68681116 1D TAGTCACAAT G/- GCAATTATAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 2 1 73567 CASAVA_Build 13 68684447 2D GGTTGGTAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 33 0 29 4 T 12 10 73568 CASAVA_Build 13 68684855 1I TGGTGTTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 326 hom 50 1 43 6 T 9 10 73569 CASAVA_Build 13 68689737 1I TGATAAACCA -/T TTTTTCCTAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 5 6 73570 CASAVA_Build 13 68700992 2D TATTTGGTTT TA/-- TGTTTCTGCA 3070 hom 120 het 43 0 41 4 TA 1 0 73571 CASAVA_Build 13 68703456 2I TCTATTTTTT --/CC TTTTTCAATC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 C 0 2 73572 CASAVA_Build 13 68707942 1I TATGGGTGTC -/T TGGGAATTTC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 1 2 73573 CASAVA_Build 13 68712887 1I GTGAGAAAAA -/T AAATGGACAT 3070 het 385 hom 30 1 25 4 T 0 1 73574 CASAVA_Build 13 68712980 1D GGAGCCTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 9 8 73575 CASAVA_Build 13 68714772 1D AGGTCCTTGA G/- TGATGTTTAC 3070 hom 87 het 32 0 28 4 G 1 0 73576 CASAVA_Build 13 68715361 2I CTTCCCACTC --/TG TATACTCTTG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 TG 0 1 73577 CASAVA_Build 13 68716454 1I AGTCAGTCTT -/G GTAAGTGAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 1 2 73578 CASAVA_Build 13 68723522 1D TAACTAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 27 0 21 6 T 12 11 73579 CASAVA_Build 13 68726790 4I CATGAAAATT ----/TATA TATATATATA 2620 hom 21 het 9 0 8 1 TA 7 9 73580 CASAVA_Build 13 68727602 1I AAGAACACAA -/C ATAACTAGAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 0 1 73581 CASAVA_Build 13 68778696 4D TCTTTTAAAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 75 het 35 0 25 13 AC 11 9 73582 CASAVA_Build 13 68779395 16D TTTTTATTTC ATGAGTTACTCATGAA/---------------- ATGAGTTAAC 3070 hom 87 het 29 0 30 4 ATGAGTTACTCATGAA 1 0 73583 CASAVA_Build 13 68815538 1I ATTGGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 34 2 24 8 T 10 11 73584 CASAVA_Build 13 68819241 1I TTTGGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1100 hom 35 3 26 6 T 10 11 73585 CASAVA_Build 13 68825984 1D TGTTGCAGTT A/- AAAGGAATGC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 4 3 73586 CASAVA_Build 13 68827925 4D AATTGTACAT TAAC/---- TATGACTCTC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 TAAC 1 0 73587 CASAVA_Build 13 68836489 1D TGATAAAATG T/- TTTTTATTAA 3070 hom 87 het 35 0 28 7 T 6 5 73588 CASAVA_Build 13 68844918 4D ATACCACTAA TTGT/---- TTGAATTGTT 3070 hom 102 het 36 0 35 5 TTGT 1 0 73589 CASAVA_Build 13 68848449 1D GTTGACCCAG C/- AATCCCATTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 0 73590 CASAVA_Build 13 68857231 1D TACTAATAAA T/- TAATGGAAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 2 1 73591 CASAVA_Build 13 68859912 1D GTCTGCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1109 het 1109 ref 33 22 3 8 A 13 12 73592 CASAVA_Build 13 68860196 1D CACTCTTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 135 het 56 0 44 12 T 10 9 73593 CASAVA_Build 13 68873114 5D ACAAACAAAC AAAAA/----- AACAAAACAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 2 73594 CASAVA_Build 13 68874769 4I TTCTGTAGTG ----/CTTT CTTTAATTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CTTT 1 2 73595 CASAVA_Build 13 68875033 1I GGGGAGTGAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 8 9 73596 CASAVA_Build 13 68887525 1D GACAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 319 hom 26 1 18 7 A 11 10 73597 CASAVA_Build 13 68901763 1D GACAATTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 30 1 22 7 A 13 12 73598 CASAVA_Build 13 68912689 1I CATTTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 10 11 73599 CASAVA_Build 13 68915885 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 9 10 73600 CASAVA_Build 13 68922133 1D TTAGAACAAT G/- AAGTTGATTG 3070 hom 126 het 46 0 43 4 G 1 0 73601 CASAVA_Build 13 68950347 1D TGGCTGCATA G/- TATTCCATCG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 1 0 73602 CASAVA_Build 13 68957978 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 15 1 13 1 A 12 11 73603 CASAVA_Build 13 68982199 1D TCCAATTAAA C/- CCTCTTTTTC 3070 hom 65 het 26 0 22 4 C 3 2 73604 CASAVA_Build 13 68987093 2D TCAAAACTCC AT/-- ATGTTTCTCT 3070 hom 89 het 35 0 30 5 AT 2 1 73605 CASAVA_Build 13 68992533 3D TTCTTTTATA TAT/--- TGTTTCTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TAT 1 0 73606 CASAVA_Build 13 68998795 5D TGGAGAATGT ATATG/----- ATATAACTAC 3070 hom 151 het 54 0 51 6 ATATG 1 0 73607 CASAVA_Build 13 69005196 1D TGAAATCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 12 11 73608 CASAVA_Build 13 69006024 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 8 73609 CASAVA_Build 13 69006815 1I CAGCAGAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 8 9 73610 CASAVA_Build 13 69021381 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 7 8 73611 CASAVA_Build 13 69031054 4D ATGTTTTTCT ATAC/---- ATACATACAT 3070 hom 89 het 36 0 27 10 ATAC 4 3 73612 CASAVA_Build 13 69048854 1D ACACACTGAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 7 73613 CASAVA_Build 13 69049833 1I AGTCTCTACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 10 73614 CASAVA_Build 13 69051182 1D GAAGGCATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 10 9 73615 CASAVA_Build 13 69080779 4D TTTATACTAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 38 het 17 0 13 4 TTTA 5 4 73616 CASAVA_Build 13 69083480 2I CCTTGAAAAC --/TG TGATTTATCC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 TG 1 2 73617 CASAVA_Build 13 69085111 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 55 25 18 12 A 7 8 73618 CASAVA_Build 13 69088190 1I TCATTCAACT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 7 8 73619 CASAVA_Build 13 69100657 2I ACCAATTTTG --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 10 24 9 A 8 10 73620 CASAVA_Build 13 69103566 2D ACAAATACTC TT/-- AATATAGCAC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 T 2 0 73621 CASAVA_Build 13 69104622 6I ACCTATACTC ------/ATACAT ATACTCATAA 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 ATACAT 0 1 73622 CASAVA_Build 13 69105344 1I TCAAATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 961 hom 25 3 17 5 A 13 14 73623 CASAVA_Build 13 69112561 1I TACTTGAAGG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 7 8 73624 CASAVA_Build 13 69112807 4I CGTAAAAATT ----/TAAG AAAGAAAGCC 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 TAAG 0 1 73625 CASAVA_Build 13 69117522 1D TTGGAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 937 het 937 ref 26 19 3 4 T 15 14 73626 CASAVA_Build 13 69117665 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2703 hom 22 9 9 4 T 17 16 73627 CASAVA_Build 13 69126430 2I TAGTCAACAC --/TT TAAAGATAAA 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 1 3 73628 CASAVA_Build 13 69129753 1D TGAGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2234 hom 30 12 10 8 T 17 16 73629 CASAVA_Build 13 69134668 1D ACTACTTTTT C/- CCCCTAAAGG 3070 het 3070 hom 44 16 25 5 C 5 4 73630 CASAVA_Build 13 69136524 1D ATGGAATTTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 19 11 7 1 A 9 8 73631 CASAVA_Build 13 69145268 2I GTATCAAAAT --/AG AGTCAAGATC 3070 het 3070 ref 33 14 16 3 AG 1 2 73632 CASAVA_Build 13 69150721 2D CATTTCTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2085 hom 24 6 14 5 T 14 12 73633 CASAVA_Build 13 69156024 1I AAGCTTTTAC -/A AAAAACTCTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 5 6 73634 CASAVA_Build 13 69163957 4I AAATATAAAA ----/TATC TATCTATATA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 TATC 1 2 73635 CASAVA_Build 13 69165192 4D TTGCCTACTT ATAA/---- ATAGATTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 ATAA 1 0 73636 CASAVA_Build 13 69177106 1I ACTTAGTTGC -/A ACAATAGTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 2 73637 CASAVA_Build 13 69181772 1I23M3I TAATAACATT -GAGTTACATTAAAAAATAAAGTC---/GGAGTTACATTAAAAAATAAAGTCCTT ATTATTTTTG 3070 het 2683 hom 30 8 17 11 N/A 0 0 73638 CASAVA_Build 13 69182023 4D AGTACAAATA ACTT/---- TAAAGTGAAT 3070 het 3070 hom 25 13 12 2 ACTT 1 0 73639 CASAVA_Build 13 69184394 1D TCACACCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 34 1 27 7 T 13 12 73640 CASAVA_Build 13 69187652 4D GGCAGTTTTA TTAT/---- TTATTTTTTT 3070 het 44 hom 28 2 15 14 TTAT 2 1 73641 CASAVA_Build 13 69189892 3D TCAGTCTATT AGC/--- AGCATTTTTA 3070 het 3070 hom 37 19 17 2 AGC 2 1 73642 CASAVA_Build 13 69190546 1D ATATTCTAGG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 9 8 73643 CASAVA_Build 13 69204790 1D GTTTGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 14 12 T 12 11 73644 CASAVA_Build 13 69227859 1D GATTATCTTG C/- CTCAGTCAGA 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 C 2 1 73645 CASAVA_Build 13 69265632 1I ATCATGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 10 11 73646 CASAVA_Build 13 69271227 1D TTGCATAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2218 hom 25 8 15 2 A 13 12 73647 CASAVA_Build 13 69287849 1D AAAATTTTTT A/- AAAAAGCCGT 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 A 6 5 73648 CASAVA_Build 13 69289558 1D CCTTTTTCAT A/- AATGAGCACC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 3 2 73649 CASAVA_Build 13 69298123 1D TTACTTACAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 A 9 8 73650 CASAVA_Build 13 69315416 1I AAAAAAATAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 A 8 9 73651 CASAVA_Build 13 69317396 4D TAATAAAGTC TGCT/---- TGCTTATTAC 3070 hom 95 het 33 0 31 4 TGCT 2 1 73652 CASAVA_Build 13 69319001 3D TACATAAATT ATG/--- ATGCTAAAGG 3070 hom 135 het 47 0 46 1 ATG 2 1 73653 CASAVA_Build 13 69319538 1D CTGCATTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 6 A 23 22 73654 CASAVA_Build 13 69321862 1D AGAAAATCAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 A 9 8 73655 CASAVA_Build 13 69323217 1I21M3I36M1D10M4I TTAGTAGTCA -CAACTGAAAAACATACATATA---TACTTTTATTTTTTATGCTTTTATAGGTAGCTGTCTCTTTTTTAAGT----/CCAACTGAAAAACATACATATATACTACTTTTATTTTTTATGCTTTTATAGGTAGCTGTCT-TTTTTTAAGTACTA ACTGTGTTTA 3070 hom 63 het 27 0 22 12 N/A 0 0 73656 CASAVA_Build 13 69331392 1D CATTTTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 T 15 14 73657 CASAVA_Build 13 69332882 4I AATTCTATTT ----/AAGA AAGATGAACA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 AAGA 1 2 73658 CASAVA_Build 13 69334832 14I AAATGAGGTA --------------/ATATGGGTGAGGCC TTAATGCAAT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 ATATGGGTGAGGCC 0 1 73659 CASAVA_Build 13 69335521 34I GAATTAAAAC ----------------------------------/AAAAGAGGATCCTAGAAGAAGACTAGGCACCAGT AAAATATTAA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 AAAAGAGGATCCTAGAAGAAGACTAGGCACCAGT 0 1 73660 CASAVA_Build 13 69335616 1D18M1D AGTGTATATG AAAAAAAAACATAAGAAATA/-AAAAAAAACATAAGAAAT- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 40 18 23 6 N/A 0 0 73661 CASAVA_Build 13 69339080 2I AAATTATCAC --/AT GTTTAATCAT 3070 het 3070 hom 51 19 29 3 AT 0 1 73662 CASAVA_Build 13 69340152 3D CAAAAAACAA AAT/--- AATAAGTTTT 3070 het 2097 hom 17 6 9 4 AAT 2 1 73663 CASAVA_Build 13 69347987 1I AATCCTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 10 11 73664 CASAVA_Build 13 69348785 2D ACACTCACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 13 18 8 AC 6 5 73665 CASAVA_Build 13 69349170 1I AACTCTGTCC -/A AAAAAAAAAA 2877 het 2877 ref 22 13 7 2 A 11 12 73666 CASAVA_Build 13 69349607 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 9 10 73667 CASAVA_Build 13 69353880 3I CTTAACTCCA ---/ATT ATTACATATT 3070 het 3070 ref 54 26 18 10 ATT 1 2 73668 CASAVA_Build 13 69354151 4I ATCACATTTT ----/ATAG ATAAAGAGAT 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 ATAG 0 1 73669 CASAVA_Build 13 69357558 1D GTAGGTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 12 11 73670 CASAVA_Build 13 69358512 1D TTTGCACCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 10 9 73671 CASAVA_Build 13 69361177 2I TGCATAGGTC --/AT ATATATATAT 2582 het 2582 ref 25 12 6 7 AT 8 9 73672 CASAVA_Build 13 69362372 1D AACAATTTCC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 41 25 11 6 A 7 6 73673 CASAVA_Build 13 69371112 1D GGAATTTGGT C/- AGCTGCAATT 3070 het 3070 hom 35 9 14 13 C 1 0 73674 CASAVA_Build 13 69375641 6D CCCTTTCTTC GTTCTA/------ GTTCTCTAGA 3070 hom 55 het 23 0 19 5 GTTCTA 1 0 73675 CASAVA_Build 13 69376298 5D TAATAATAGA AAAAT/----- AAAATGCATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAAT 2 1 73676 CASAVA_Build 13 69383702 1D TATCATCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 32 1 23 8 A 15 14 73677 CASAVA_Build 13 69392269 4D ATAGATAAAA TTTG/---- TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 20 13 5 TTTG 2 1 73678 CASAVA_Build 13 69397816 4I AATAAACTCT ----/AACA AACATTTGAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 AACA 1 2 73679 CASAVA_Build 13 69401267 1I AGAATCATAA -/G GCTGCAAAGA 3070 het 2955 hom 27 7 16 4 G 1 2 73680 CASAVA_Build 13 69405134 9D AAACAAAAAC AGAGGAAGA/--------- AGAGAAATTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 AGAGGAAGA 1 0 73681 CASAVA_Build 13 69405949 1D AATACTTGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 9 8 73682 CASAVA_Build 13 69406053 2D GGAATTCGAC TT/-- AATATTATGG 3070 het 3070 ref 37 17 18 5 T 2 0 73683 CASAVA_Build 13 69406866 1D CCCATCTACC T/- TGAATTTCAT 3070 het 3070 ref 42 19 17 7 T 2 1 73684 CASAVA_Build 13 69407102 22D TGTGTATATA TATATATATATATATATATATG/---------------------- TATATATATA 2541 het 2049 hom 15 5 7 4 TATATATATATATATATATATG 1 0 73685 CASAVA_Build 13 69408142 3D AAGAAAGTTT ATG/--- ATATCACACA 3070 het 3070 ref 41 21 19 2 ATG 1 0 73686 CASAVA_Build 13 69414596 1D TTCTCCTTTT C/- ATCATGAATA 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 C 1 0 73687 CASAVA_Build 13 69415380 1I TCATTTAATT -/C TTTTTATAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 C 0 1 73688 CASAVA_Build 13 69418627 2D GAGGATTGTG AT/-- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 AT 1 0 73689 CASAVA_Build 13 69425413 3I CAGGCTACTC ---/ATG ATTTGATGTA 3070 het 3070 hom 45 16 18 11 ATG 0 1 73690 CASAVA_Build 13 69430586 7D TTTCAAAGAT TATAAAC/------- TATAATCATT 3070 het 3070 ref 39 22 15 5 TATAAAC 1 0 73691 CASAVA_Build 13 69430872 1D CCTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3010 hom 34 9 17 8 A 12 11 73692 CASAVA_Build 13 69431691 1I ACTACTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 516 hom 40 2 16 22 A 12 13 73693 CASAVA_Build 13 69432427 1D GAAATGCTGT A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 A 6 5 73694 CASAVA_Build 13 69432809 12D20M4D TCTCTACAAA TACAATTAATACTACAATTAATACTTGTATATTGAG/------------TACAATTAATACTTGTATAT---- TAACATTCAA 3070 het 3070 hom 40 12 31 9 N/A 0 0 73695 CASAVA_Build 13 69433962 4I TCTATTATGT ----/TTTG TTTATTTGCC 3070 het 3070 hom 22 9 8 5 TTTG 0 1 73696 CASAVA_Build 13 69434916 8D CAAGGCTATA GTAGCCTC/-------- ATAATATGAG 3070 het 3070 ref 38 20 16 4 GTAGCCTC 1 0 73697 CASAVA_Build 13 69435345 1I GCATGCACAA -/G CCACCTCACC 3070 het 3070 hom 53 18 28 7 G 0 1 73698 CASAVA_Build 13 69436011 1I GGCAAAAAAT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 7 8 73699 CASAVA_Build 13 69436190 1I TTGTTTGTTT -/G TTTTAAAAAT 303 het 303 ref 36 23 4 11 G 0 1 73700 CASAVA_Build 13 69440460 13D TGTAAATAGA ACTGATATATTTG/------------- CTAAGAAACA 3070 het 973 hom 17 2 11 4 ACTGATATATTTG 1 0 73701 CASAVA_Build 13 69440676 1D GTTGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 12 11 73702 CASAVA_Build 13 69440934 1D GCCACATTTT C/- TTAATCGAGC 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 C 1 0 73703 CASAVA_Build 13 69441190 1D TTTTAGGAGA T/- TTTTTTTCAT 2996 het 2721 hom 19 7 7 5 T 8 7 73704 CASAVA_Build 13 69442075 1I TTAAACTTTT -/G TAAGTTCCAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 0 1 73705 CASAVA_Build 13 69448490 3D TAAACAAAAA AGT/--- AGAATGTATT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 AGT 1 0 73706 CASAVA_Build 13 69450622 4D GGTCAGAATA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2371 het 634 hom 19 6 7 6 T 16 12 73707 CASAVA_Build 13 69456043 8I CTGATTTTTG --------/ACAAAGGC ACAAAGATCC 3070 hom 111 het 40 0 38 3 ACAAAGGC 0 1 73708 CASAVA_Build 13 69458005 2D AGTATTCCAC TG/-- TGTGTGTGTG 2666 hom 21 het 9 0 8 1 TG 6 5 73709 CASAVA_Build 13 69476657 1I GCCATCCCCC -/T TGACTAGTCC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 1 2 73710 CASAVA_Build 13 69484501 6D TATTTTTCAC TTTTAA/------ TTTTATTAAG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TTTTAA 1 0 73711 CASAVA_Build 13 69485035 2I GATTCTGTAT --/AA AAAAAAAATA 1932 het 1932 ref 14 8 4 2 A 8 10 73712 CASAVA_Build 13 69486694 4I TGAAAATGAT ----/AAGA AAGTGCAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AAGA 0 1 73713 CASAVA_Build 13 69487129 1I GCAAACATGC -/A AAAAATTATT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 5 6 73714 CASAVA_Build 13 69490185 2I GAACTAGCGC --/AA AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 8 10 73715 CASAVA_Build 13 69491499 1I TAAGCTATAA -/G AAGTTAATGA 3070 het 3070 hom 43 18 22 7 G 0 1 73716 CASAVA_Build 13 69494733 3D TGTTTTTAAA TTT/--- TTACTATTTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 T 5 2 73717 CASAVA_Build 13 69494944 1D GCCTTTTTTT A/- ATGCCTTAAT 3070 het 3070 hom 53 19 27 8 A 2 1 73718 CASAVA_Build 13 69499522 1I GTGAATGTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 55 25 21 9 T 7 8 73719 CASAVA_Build 13 69503249 1D CCTGCCAACC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 28 9 19 0 A 9 8 73720 CASAVA_Build 13 69511375 1D CTAATTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 G 1 0 73721 CASAVA_Build 13 69514094 4D TGCTTATTTC TTTG/---- TTTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 62 28 27 7 TTTG 2 1 73722 CASAVA_Build 13 69519533 2D GAAATCTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 26 9 12 6 TG 10 9 73723 CASAVA_Build 13 69524078 1D TATAGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 2987 het 2987 ref 26 13 9 4 T 11 10 73724 CASAVA_Build 13 69526957 1D TGATCAAGCA T/- TAAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 2 1 73725 CASAVA_Build 13 69527157 3I AAGACGTAAT ---/AAC AGAAATCTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAC 0 1 73726 CASAVA_Build 13 69529131 4D CAAAAATATC AAAA/---- AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 A 10 6 73727 CASAVA_Build 13 69532985 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 10 11 73728 CASAVA_Build 13 69533474 1D CTGAATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 12 11 73729 CASAVA_Build 13 69545691 1I AAAGTGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 25 1 17 7 A 11 12 73730 CASAVA_Build 13 69547894 2I ATACACACAC --/AT ATATATATAT 2898 hom 24 het 10 0 9 1 AT 6 7 73731 CASAVA_Build 13 69548521 2I AAGGATAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 45 4 32 9 T 14 16 73732 CASAVA_Build 13 69568780 1I AAGTTAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 11 73733 CASAVA_Build 13 69570021 2D TTCCTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 32 0 17 15 T 12 10 73734 CASAVA_Build 13 69573403 3D CAATATTGTC CTT/--- CAACTAGCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CTT 1 0 73735 CASAVA_Build 13 69587161 2D TCTTTCTAAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 GT 10 9 73736 CASAVA_Build 13 69589990 1D ATATTGTTGT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 79 het 31 0 27 4 A 8 7 73737 CASAVA_Build 13 69590969 1D AGATATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 41 0 31 10 T 14 13 73738 CASAVA_Build 13 69592049 1I AATATTTCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 9 10 73739 CASAVA_Build 13 69597068 1D AATTTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 30 1 22 7 T 13 12 73740 CASAVA_Build 13 69599802 1D AAAACAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 33 0 32 1 T 11 10 73741 CASAVA_Build 13 69599885 2I CATTAATCAT --/AA GTTATTAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 2 73742 CASAVA_Build 13 69604992 1I CTAAAGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 718 hom 36 2 27 7 T 11 12 73743 CASAVA_Build 13 69607776 1D TTCTTACATT C/- CTTTCCCTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 C 2 1 73744 CASAVA_Build 13 69610457 2D72M2I GATTTAAATT AAAAAAAAAAAAAGTTAACTTTCATTACCAAGCTGCGAAAATCTAAATTTTAAATGTTAATTTTTTATCAAATT--/--AAAAAAAAAAAGTTAACTTTCATTACCAAGCTGCGAAAATCTAAATTTTAAATGTTAATTTTTTATCAAATTTG TGTTAATTTT 3070 hom 84 het 29 0 29 18 N/A 0 0 73745 CASAVA_Build 13 69612667 2I ACACACACAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 36 0 27 9 A 13 15 73746 CASAVA_Build 13 69614848 1D CAACTTTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 10 9 73747 CASAVA_Build 13 69624481 2D ACTCTGTACC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TG 6 5 73748 CASAVA_Build 13 69629638 1D3M5D CTCACATGAC TAAGATATC/-AAG----- CAGAGATTTG 3070 hom 111 het 42 0 38 8 N/A 0 0 73749 CASAVA_Build 13 69631313 2D CCACTTCCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TC 10 9 73750 CASAVA_Build 13 69632310 4D TTTTTGTGAG CACT/---- CAGTCTGTTG 3070 hom 33 het 16 0 12 4 CACT 1 0 73751 CASAVA_Build 13 69633907 1I AAAAAAAATG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 8 9 73752 CASAVA_Build 13 69635167 1D ATTCTCTCCC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 87 het 34 0 28 7 T 8 7 73753 CASAVA_Build 13 69639784 1I CCTAAAACTT -/A AAAGTATAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 3 4 73754 CASAVA_Build 13 69650809 1D TAACAGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 13 12 73755 CASAVA_Build 13 69653060 2I TGAAATATAT --/AG AGTTAACAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AG 1 2 73756 CASAVA_Build 13 69658772 1I TTTCTATACA -/T TTTTTCACGC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 5 6 73757 CASAVA_Build 13 69661110 2D AGTGTATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 42 het 21 0 15 7 TG 7 6 73758 CASAVA_Build 13 69661159 2D GTACCTATAT AC/-- ACACACACAC 2277 hom 21 het 12 0 7 5 AC 10 9 73759 CASAVA_Build 13 69669463 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 11 10 73760 CASAVA_Build 13 69679761 1D AAGTTAGCAG C/- TAACCAGTTG 3070 hom 117 het 43 0 39 5 C 1 0 73761 CASAVA_Build 13 69687591 4I TAGACACCCA ----/AAAT AAATAAAATC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 AAAT 1 2 73762 CASAVA_Build 13 69688534 4D ATGAATGTGG TATA/---- TATAACCTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TA 4 2 73763 CASAVA_Build 13 69688767 2D TATGCACAAA CT/-- CATGAACATT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 CT 1 0 73764 CASAVA_Build 13 69693711 1I CTATTTTGTT -/G GGAAGGGTTG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 2 3 73765 CASAVA_Build 13 69695075 1I TAACAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 10 11 73766 CASAVA_Build 13 69696511 2I4M1D ACACCCAAAA --TCATC/TGTGAT- AGAACACAGA 3070 hom 141 het 51 0 47 6 N/A 0 0 73767 CASAVA_Build 13 69698543 1D ATAAAATATT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 73768 CASAVA_Build 13 69699198 1D GTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 10 9 73769 CASAVA_Build 13 69701947 1D TATGAAACAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 7 73770 CASAVA_Build 13 69718354 2D AAATAAATCA CT/-- GTTTATTCTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 CT 1 0 73771 CASAVA_Build 13 69728411 1I TCAGGGAGGC -/T TTTTTAGGCT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 5 6 73772 CASAVA_Build 13 69729049 1D TCAGTCCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 778 hom 32 2 24 6 A 13 12 73773 CASAVA_Build 13 69730377 5D CACAAAAAAT AAGTG/----- AAGTGATGTA 3070 hom 99 het 34 0 34 2 AAGTG 2 1 73774 CASAVA_Build 13 69732786 1I TCTCACTAAT -/G GGCAATGGAG 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 G 2 3 73775 CASAVA_Build 13 69738102 1D TCTTTGATAT A/- AAAAACAGGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 6 5 73776 CASAVA_Build 13 69754870 12I AGTCCCTTTA ------------/GCCACCTTACCT GCCTAAATAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 GCCACCTTACCT 0 1 73777 CASAVA_Build 13 69770681 5I TTTAAAAAAA -----/AAATT AAAATAAAAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AAATT 0 1 73778 CASAVA_Build 13 69774213 1I ATGAAACAGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 384 hom 50 1 40 9 A 8 9 73779 CASAVA_Build 13 69780494 8I TCACCTATTT --------/TTTAGTCA TTTAGTCATC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 TTTAGTCA 1 2 73780 CASAVA_Build 13 69782629 1D TAATTTTTTT G/- GCGCTTCTCC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 G 2 1 73781 CASAVA_Build 13 69784751 5I CAAAACATCA -----/TATTT TATTTCAGAA 3070 hom 124 het 44 0 42 2 TATTT 1 2 73782 CASAVA_Build 13 69785506 1D TTAGCTGTCA C/- CCTATTATTT 3070 hom 132 het 51 0 45 7 C 3 2 73783 CASAVA_Build 13 69786774 1I GGTTGTGATG -/T AATAGTTCAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 73784 CASAVA_Build 13 69787966 3I TATTCTAAGT ---/TAA TGATGTGTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TAA 0 1 73785 CASAVA_Build 13 69791246 20D ACACACACAC ATATATATATATATATATAT/-------------------- ATATATATAT 3070 hom 66 het 28 0 23 7 AT 16 6 73786 CASAVA_Build 13 69793803 1D CTGTATGTTC T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 T 8 7 73787 CASAVA_Build 13 69796488 3I AATAAAAAAA ---/AAT ACACCTAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AAT 0 1 73788 CASAVA_Build 13 69796915 2D CAGCTTCACA AT/-- CTATTTCCAG 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 AT 1 0 73789 CASAVA_Build 13 69798228 3D GTCACCCAGG TAT/--- TAAGGCCGGA 3070 het 3070 ref 52 26 23 4 TAT 1 0 73790 CASAVA_Build 13 69799609 2D GAATTTTACA AT/-- AGTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 43 23 16 6 AT 1 0 73791 CASAVA_Build 13 69806427 6D TAATTTCATT AATATA/------ AATATAAGAG 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 AATATA 2 1 73792 CASAVA_Build 13 69807017 2D ATTAGAAAAT AC/-- AGAGATTTAC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 AC 1 0 73793 CASAVA_Build 13 69811068 1D AAAGCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 10 7 A 11 10 73794 CASAVA_Build 13 69814706 1I TCTGTAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 A 9 10 73795 CASAVA_Build 13 69814829 3I GTCAATGTCT ---/AGC AGAATATTTC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AGC 0 1 73796 CASAVA_Build 13 69815051 1D TGGAAGACAT A/- GGGGAAAAAC 3070 het 3070 ref 60 28 25 10 A 1 0 73797 CASAVA_Build 13 69816582 3I CAACAACTGG ---/CAC CACTTCTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 CAC 1 2 73798 CASAVA_Build 13 69825991 1I TGTCAAAGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 9 10 73799 CASAVA_Build 13 69832655 1D GGGTATCTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 9 8 73800 CASAVA_Build 13 69837504 1D TTGAAATTAC A/- AAAAAATAAA 2426 het 2426 ref 26 16 5 7 A 7 6 73801 CASAVA_Build 13 69837679 1I TTATGGCTCA -/C TGTAACTTTG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 C 0 1 73802 CASAVA_Build 13 69843211 1I TACTGCCCTC -/T GCTTGATAGT 3070 het 3070 hom 57 21 29 7 T 0 1 73803 CASAVA_Build 13 69855898 1I TAATTTTTTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 7 8 73804 CASAVA_Build 13 69864983 1D TAAACTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 11 10 73805 CASAVA_Build 13 69874654 1D TTAAAAAACA T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 7 6 73806 CASAVA_Build 13 69879643 2D ACATATATAT TA/-- TATATATATA 2139 het 1479 hom 16 5 7 4 TA 8 7 73807 CASAVA_Build 13 69892686 1I AATGCATTTA -/T AATTTAAACA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 0 1 73808 CASAVA_Build 13 69892796 3D AATATTGAAA TAC/--- TTCTTAAAAC 3070 het 3070 ref 38 22 13 6 TAC 1 0 73809 CASAVA_Build 13 69895385 1I GCTAAGAGCC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 7 8 73810 CASAVA_Build 13 69895567 2D GTGATTTGTA TG/-- TCTGTCCATA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 TG 1 0 73811 CASAVA_Build 13 69898927 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2593 hom 25 9 12 5 A 11 10 73812 CASAVA_Build 13 69922797 2D CACACTCGCT CA/-- CACACACACA 3070 hom 118 het 44 0 38 7 CA 6 5 73813 CASAVA_Build 13 69922910 1I GAGTACCCAG -/A AAAAAACAAG 3070 hom 126 het 51 0 43 9 A 6 7 73814 CASAVA_Build 13 69926610 2I GTCAAGAACA --/GT ATTGGGTCTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 GT 0 1 73815 CASAVA_Build 13 69930884 1I AAGATTAGAG -/A AAAAAAGAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 73816 CASAVA_Build 13 69931860 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 25 1 23 1 A 11 10 73817 CASAVA_Build 13 69936182 3I TGGTAAAATA ---/TGC TTCTATTTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TGC 0 1 73818 CASAVA_Build 13 69936745 1D TTATTTTTCC A/- GTAGAAATAT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 1 0 73819 CASAVA_Build 13 69937680 2I GTATATATAC --/GT ATATATATGT 3070 het 52 hom 27 1 20 6 GT 0 1 73820 CASAVA_Build 13 69938134 1D TATATTGATT A/- ATTTCCTCAC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 2 1 73821 CASAVA_Build 13 69938577 2I AAGTCCCAGA --/GT GTGAGTTGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 GT 1 2 73822 CASAVA_Build 13 69939618 28D CCTTTGTTGA ATGCATAGTTTATACATGAGAAATTGTC/---------------------------- ATTGCGGAAC 3070 hom 69 het 26 0 24 6 ATGCATAGTTTATACATGAGAAATTGTC 1 0 73823 CASAVA_Build 13 69940382 2D ATTTTGATAT TA/-- TGTTTATTTA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TA 1 0 73824 CASAVA_Build 13 69952236 1I ATGCTAAACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 10 73825 CASAVA_Build 13 69958756 2D TAATATACAC AT/-- GTGTGTATGT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 AT 1 0 73826 CASAVA_Build 13 69985130 4I AGATAGATAC ----/ATAG ATAGATAGAT 3070 hom 75 het 36 0 26 10 ATAG 2 3 73827 CASAVA_Build 13 69986401 1D TTCTTTTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 35 0 27 8 A 11 10 73828 CASAVA_Build 13 69991274 2D CCTATTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 42 0 40 4 T 12 10 73829 CASAVA_Build 13 69991583 1I GTGAAATGAT -/A AGAGTGTAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 1 2 73830 CASAVA_Build 13 69992884 1D AGTTAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 11 10 73831 CASAVA_Build 13 69994264 1D TGTTTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 11 0 9 2 A 11 10 73832 CASAVA_Build 13 70000153 2I CCACAAAAAA --/AC CAAAAAAATG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AC 0 1 73833 CASAVA_Build 13 70003233 1D TATAAGCAAG T/- TACCATAATT 3070 hom 132 het 52 0 45 8 T 2 1 73834 CASAVA_Build 13 70037847 13D GAACTTGGAT TTAACATATACAA/------------- TTAACCTCTT 3070 hom 114 het 38 0 39 2 TTAACATATACAA 1 0 73835 CASAVA_Build 13 70038018 4I TTTTAATAAG ----/TAAT TATATTGCAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TAAT 0 1 73836 CASAVA_Build 13 70069222 1D TGAGTATTTC T/- TTTTGACGCT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 5 4 73837 CASAVA_Build 13 70069684 1D CCCCCTCCAA C/- CCCCCACCAA 3070 hom 97 het 39 0 31 8 C 6 5 73838 CASAVA_Build 13 70072042 1D AGGTTTATAT C/- TTATGATTAA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 C 1 0 73839 CASAVA_Build 13 70077992 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 19 1 11 7 A 13 12 73840 CASAVA_Build 13 70089002 1D TGGTATGAAC A/- TTTCTTATGA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 A 1 0 73841 CASAVA_Build 13 70089568 1I ATGATTTATG -/T TTTTTGTGTT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 5 6 73842 CASAVA_Build 13 70114034 1D ACTTTAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 26 5 A 10 9 73843 CASAVA_Build 13 70123176 1D GACAAGATTT C/- CTTTTTTCAA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 C 2 1 73844 CASAVA_Build 13 70125095 1I CAATTAAACG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 44 het 20 0 15 5 T 6 7 73845 CASAVA_Build 13 70127895 1I TGTTTTCGTA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 157 het 58 0 53 5 T 7 8 73846 CASAVA_Build 13 70131684 1I GAATTACTAG -/A AAAAAATGTA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 6 7 73847 CASAVA_Build 13 70132275 1I ATGTGAATAA -/T TTTTTATTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 5 6 73848 CASAVA_Build 13 70140909 1D TTAGTAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 957 hom 44 4 25 15 A 15 14 73849 CASAVA_Build 13 70146699 1D AAATATCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 28 0 17 11 T 13 12 73850 CASAVA_Build 13 70150487 4D ATATGTGATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 11 13 9 TTTG 3 2 73851 CASAVA_Build 13 70157506 1I AGTCTCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 10 11 73852 CASAVA_Build 13 70159987 1D AAAGGCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 34 1 27 6 A 13 12 73853 CASAVA_Build 13 70162676 6I TAACTTGGGG ------/CTTAAT CTTAATTTGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CTTAAT 1 2 73854 CASAVA_Build 13 70172809 98D AAATATGGAT TTATAATACAATGTGGGTAGATGTAAAAATATTTGGGCTGAGTGAAAATAATCCAGTAAAAAAAGACACATATTGTGTTATTCAGTTAATATGAAAAA/-------------------------------------------------------------------------------------------------- TCCAGATTAG 1879 het 1879 ref 27 35 5 7 TTATAATACAATGTGGGTAGATGTAAAAATATTTGGGCTGAGTGAAAATAATCCAGTAAAAAAAGACACATATTGTGTTATTCAGTTAATATGAAAAA 1 0 73855 CASAVA_Build 13 70183156 2I GAAAATTGAG --/AT ATTTTATAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AT 1 2 73856 CASAVA_Build 13 70183708 1I TGTAAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 22 1 18 3 T 10 11 73857 CASAVA_Build 13 70193990 1I ACAAGCCCTG -/T TTCAGGTATT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 2 3 73858 CASAVA_Build 13 70213918 5I TTAGATGTAT -----/ATATA ATATATCTGG 1021 het 1021 ref 17 11 3 3 ATATA 1 2 73859 CASAVA_Build 13 70214535 30D GGACATATGC ATGTTGATGGACCTGTTCATACACATATAA/------------------------------ GTGTTGATGG 3070 het 3070 ref 73 63 22 6 ATGTTGATGGACCTGTTCATACACATATAA 1 0 73860 CASAVA_Build 13 70225743 11I ATTGCACTTG -----------/ATAATTTAAAA AATTACTCTC 3070 hom 72 het 26 0 25 2 ATAATTTAAAA 0 1 73861 CASAVA_Build 13 70232897 1I GGGGCTGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2308 hom 38 9 13 16 A 10 11 73862 CASAVA_Build 13 70234729 1D GGTTTTTGAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 85 het 36 0 29 8 A 9 8 73863 CASAVA_Build 13 70236988 1I TTATTACACA -/T TTTTTCAACT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 5 6 73864 CASAVA_Build 13 70238401 1I TCAATGACTG -/T TTTCTTCATG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 3 4 73865 CASAVA_Build 13 70244968 2I GTTCATTATC --/AT ATGACAGGAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AT 1 2 73866 CASAVA_Build 13 70246584 1I ATCTTCAAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 73867 CASAVA_Build 13 70246936 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 A 8 9 73868 CASAVA_Build 13 70248099 1I AAACTACTTT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 6 7 73869 CASAVA_Build 13 70248759 1I AGTAACTATG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 A 7 8 73870 CASAVA_Build 13 70259757 5D TGCCAGATTG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 35 4 19 13 A 15 10 73871 CASAVA_Build 13 70260674 1I TCTATCATAC -/A AAAGCTGTTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 3 4 73872 CASAVA_Build 13 70261141 2I AAATAATGTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 AT 6 7 73873 CASAVA_Build 13 70266825 1I TTAATGTTTT -/G TGTTGTCATT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 0 1 73874 CASAVA_Build 13 70268958 1D AGTTCATTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 10 9 73875 CASAVA_Build 13 70273869 1D ACTTGCCATT A/- CAGGTAAAAG 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 A 1 0 73876 CASAVA_Build 13 70276142 1I CATCCTTACT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 G 0 1 73877 CASAVA_Build 13 70276220 1D TAGTAGTCCC A/- AGCTATTCGG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 2 1 73878 CASAVA_Build 13 70284593 7I ATATTAGGTT -------/GCAGAGG GCAGAGGGTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 GCAGAGG 1 2 73879 CASAVA_Build 13 70291603 1D ATCCCAGAAA G/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 G 1 0 73880 CASAVA_Build 13 70297555 1D TCCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 T 11 10 73881 CASAVA_Build 13 70301922 1D AACGTTGTCC T/- AGATACATTA 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 T 1 0 73882 CASAVA_Build 13 70309620 2D TCTTTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 34 1 21 13 T 12 10 73883 CASAVA_Build 13 70311980 4I CAGGGAGCTA ----/TGAC TAAGTCTGGG 3070 hom 102 het 40 0 34 6 TGAC 0 1 73884 CASAVA_Build 13 70321801 1I AACTCAGGGG -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 6 7 73885 CASAVA_Build 13 70382231 1I ACCATCCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 9 10 73886 CASAVA_Build 13 70388983 3I AATATGAAGC ---/TAA TAATGCAAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TAA 1 2 73887 CASAVA_Build 13 70392832 1D ATTTCAAAAA T/- AAAAAAGCTA 3070 het 349 hom 30 1 29 0 T 1 0 73888 CASAVA_Build 13 70399612 1I AAAACTATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 8 9 73889 CASAVA_Build 13 70414483 1I TATAAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 A 10 11 73890 CASAVA_Build 13 70426338 1I ACTCCGTGGG -/A AAAAAAAAAA 1792 het 1792 ref 20 8 5 7 A 13 14 73891 CASAVA_Build 13 70428817 2I ATGGACTGAC --/AT TGAGGATGTA 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 AT 0 1 73892 CASAVA_Build 13 70430773 2D ATGCAAGAAG TA/-- TATATATATA 1864 het 843 hom 15 5 7 3 TA 9 8 73893 CASAVA_Build 13 70436543 3D CTCCAATAGT TTC/--- TTATTTTACC 3070 het 3070 ref 45 26 16 4 TTC 1 0 73894 CASAVA_Build 13 70441864 1I GACATTTGCC -/A AAAAAAAAAA 2616 het 2616 ref 36 13 8 15 A 14 15 73895 CASAVA_Build 13 70444311 5I ATAATAAATA -----/GATTC TTGAATATTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GATTC 0 1 73896 CASAVA_Build 13 70445806 1D ATGAAAGTTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 68 het 37 1 34 2 A 10 9 73897 CASAVA_Build 13 70447646 1I ATATTTTCTA -/C CTCTTTCACA 3070 hom 160 het 58 0 54 4 C 1 2 73898 CASAVA_Build 13 70452388 1D TCTCTGGCTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 14 26 3 A 9 8 73899 CASAVA_Build 13 70453047 1D GAATACTCAC T/- TATGTCTCCC 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 T 2 1 73900 CASAVA_Build 13 70467211 1I AAAAGCAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 11 12 73901 CASAVA_Build 13 70472039 1I CCAGAACTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 8 9 73902 CASAVA_Build 13 70472221 1I GCTGTGACAT -/A AAATGATGCA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 3 4 73903 CASAVA_Build 13 70472914 4D ACTCTGTCCT CAAA/---- CAACTATTTA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 CAAA 1 0 73904 CASAVA_Build 13 70475754 2D AAAGACTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 29 1 16 12 T 16 14 73905 CASAVA_Build 13 70481659 1I ATTAACAGAG -/A AAAAAACGAA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 6 7 73906 CASAVA_Build 13 70485263 1D TGTACCTTTA T/- TCCAGTTCAT 3070 het 3070 hom 26 8 16 3 T 2 1 73907 CASAVA_Build 13 70496502 3D TGGCACATTT GAA/--- GAAGGTTCTT 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 GAA 2 1 73908 CASAVA_Build 13 70502070 1I TCAAATTCTG -/C CCCTCCAGAG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 C 3 4 73909 CASAVA_Build 13 70518089 1D AATGTGACTG A/- AAGTTTTCAT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 A 3 2 73910 CASAVA_Build 13 70527639 2I TGTGAATTTC --/TT TTTTATTATA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 4 6 73911 CASAVA_Build 13 70531769 2I TTCTATTCTC --/TA TTTTATTTGT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 TA 0 1 73912 CASAVA_Build 13 70536337 4I TACCACTTGA ----/GACT GGGTAATTAA 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 GACT 0 1 73913 CASAVA_Build 13 70536740 6D GAATCAGAAT AGCTGA/------ GGTAATACTA 3070 het 3070 ref 34 20 12 6 AGCTGA 1 0 73914 CASAVA_Build 13 70539188 2I CTTAGATGGA --/AG GTTACTAACT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 AG 0 1 73915 CASAVA_Build 13 70542996 1D AAACTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 881 hom 24 7 9 8 T 17 16 73916 CASAVA_Build 13 70553722 4D ATGAATAAAT AAAC/---- AAACACACAA 3070 het 3070 hom 44 23 19 2 AAAC 2 1 73917 CASAVA_Build 13 70558600 1I TGAGTTAATG -/T TTGTATATGG 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 2 3 73918 CASAVA_Build 13 70559988 2D GGAGAACTTT TA/-- TGTCTAGCTA 3070 het 2855 hom 25 8 13 4 TA 1 0 73919 CASAVA_Build 13 70564454 1I ACAATAAATA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 7 8 73920 CASAVA_Build 13 70564703 1I ATTTATTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 218 hom 24 1 16 7 A 9 10 73921 CASAVA_Build 13 70575545 1I TTCTTACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 T 13 14 73922 CASAVA_Build 13 70588524 2I TAGAAAACTC --/TT AGATATTAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 2 73923 CASAVA_Build 13 70593314 1I AGTTTAAGGG -/A ATCTCTGCCT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 1 2 73924 CASAVA_Build 13 70624181 1D CCAACAAATT G/- TTCTTTCCTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 G 1 0 73925 CASAVA_Build 13 70629184 2D TGAGGGAAGA CT/-- CAGTGGCATA 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 CT 1 0 73926 CASAVA_Build 13 70640042 1D GCTATAATTT C/- AATTAATCAT 3070 hom 63 het 28 0 22 10 C 1 0 73927 CASAVA_Build 13 70640151 1I AAGTTGACTT -/C CCTAAAATAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 C 2 3 73928 CASAVA_Build 13 70664594 3D ACTTCTAAAT ATC/--- ATGATTTCCA 3070 het 3070 hom 42 17 20 7 ATC 1 0 73929 CASAVA_Build 13 70716307 1D GCAAGAAAAA G/- AAAACAGGAA 3070 het 373 hom 34 1 28 5 G 1 0 73930 CASAVA_Build 13 70739945 1D AAAAGGAGGT G/- GGGGGGTGCA 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 G 7 6 73931 CASAVA_Build 13 70741023 1I TGTTTTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 A 11 12 73932 CASAVA_Build 13 70747642 1D TTTTCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 A 13 12 73933 CASAVA_Build 13 70750467 2I GAGAGAGAGG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 GA 6 7 73934 CASAVA_Build 13 70760428 1I CGATTTTCTC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 7 8 73935 CASAVA_Build 13 70760989 1D TTCTTCATTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 31 0 30 2 T 9 8 73936 CASAVA_Build 13 70766981 20D TTCATGTGCA TGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/-------------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 14 10 13 TG 18 8 73937 CASAVA_Build 13 70768138 3D CACACTTTCA AAC/--- AACAAGATCT 3070 het 3070 ref 42 26 14 4 AAC 2 1 73938 CASAVA_Build 13 70773710 1I TGATTCAAAG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 7 8 73939 CASAVA_Build 13 70786050 6I AAGTATACAA ------/AAGGAT ATAGATCCCA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 AAGGAT 0 1 73940 CASAVA_Build 13 70789770 1I TCCTTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 671 hom 45 7 16 22 A 11 12 73941 CASAVA_Build 13 70792422 1D ATTCAAAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 19 11 6 T 10 9 73942 CASAVA_Build 13 70804839 1I GTATTACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 794 hom 42 4 29 9 T 10 11 73943 CASAVA_Build 13 70807719 1D CAAATGCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 147 het 57 0 49 8 T 10 9 73944 CASAVA_Build 13 70811852 1I TATAAAAAAA -/T AGCATAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 1 73945 CASAVA_Build 13 70815738 1D TCTTTTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 22 0 14 8 T 13 12 73946 CASAVA_Build 13 70825226 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 17 0 15 2 A 11 10 73947 CASAVA_Build 13 70836894 1D GATCTCTGAT A/- ATGGCTTTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 2 1 73948 CASAVA_Build 13 70838621 1D TACTATATAT G/- TTTTTATGTC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 G 1 0 73949 CASAVA_Build 13 70845369 1I AAGAGATTTT -/G CTTAATATGT 3070 hom 48 het 24 0 16 8 G 0 1 73950 CASAVA_Build 13 70854902 2D AAAATAACTC AG/-- TGTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AG 1 0 73951 CASAVA_Build 13 70868336 1D TCAGGAATCT C/- AAGTAACCTC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 C 1 0 73952 CASAVA_Build 13 70869966 1I CACTTTCATT -/C CCCCCCTCAC 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 C 6 7 73953 CASAVA_Build 13 70872322 3I TGACATGTTA ---/TTG TTGTCGGTGT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 TTG 1 2 73954 CASAVA_Build 13 70875550 1D CTTTACTCAC A/- AAATCTAGTG 3070 het 3070 hom 50 21 23 7 A 4 3 73955 CASAVA_Build 13 70876608 1I ATGATCTTGC -/A TCCATTTTTG 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 A 0 1 73956 CASAVA_Build 13 70890987 12D TTATCTTTTT GATGTGCTGCTA/------------ GATTCAGTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 10 GATGTGCTGCTA 1 0 73957 CASAVA_Build 13 70892250 1I TATTTCTCTC -/A AAAAATTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 5 6 73958 CASAVA_Build 13 70897974 3I GACGCACCGC ---/TCA TCAACAATCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TCA 1 2 73959 CASAVA_Build 13 70901850 7D AGAAATAGAG TGTATGA/------- TGTATGATTT 3070 hom 81 het 28 0 26 4 TGTATGA 2 1 73960 CASAVA_Build 13 70906202 2I GGTGTGTTGT --/GG GGGGGGGGGA 2201 hom 46 het 25 0 16 9 G 9 11 73961 CASAVA_Build 13 70906460 2D AATTAATAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 26 1 13 12 T 16 14 73962 CASAVA_Build 13 70907540 3I CAGATTTATC ---/AAT AATTTTATTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAT 1 2 73963 CASAVA_Build 13 70910731 4D TAATCCACAT AACA/---- AACAGGTGAC 3070 hom 87 het 36 0 29 9 AACA 2 1 73964 CASAVA_Build 13 70919810 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 1204 hom 16 3 9 4 A 7 8 73965 CASAVA_Build 13 70926199 1I AACAGGCAAG -/A AAGCACATTG 3070 hom 168 het 62 0 56 6 A 2 3 73966 CASAVA_Build 13 70939239 1D CTTCATACTT A/- AACAATGCCT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 3 2 73967 CASAVA_Build 13 70942447 1D CTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 27 0 16 11 T 13 12 73968 CASAVA_Build 13 70946287 1D AAATATAGGC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 9 8 73969 CASAVA_Build 13 70953090 2I CTCCCCACTC --/TT TTTTGTTTAA 3070 hom 97 het 42 0 31 11 T 4 6 73970 CASAVA_Build 13 70956335 1I CACTCAGTCA -/C CCCAGGGTGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 3 4 73971 CASAVA_Build 13 70965161 1D TCTTAATGAG T/- TTTTTTTTTT 1131 het 1131 ref 42 26 3 13 T 15 14 73972 CASAVA_Build 13 70969890 7I AGTTAGTTTG -------/GTGAACA GTTAAAATTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GTGAACA 0 1 73973 CASAVA_Build 13 70989064 2I TTTTTATGTT --/TA TATATATATA 3070 hom 40 het 21 0 14 7 TA 7 8 73974 CASAVA_Build 13 71003510 4D TCATAACTTT ATAA/---- ATAAAGAAGA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 ATAA 2 1 73975 CASAVA_Build 13 71060905 6I TGTCAATCAC ------/ATTTTG ACAATAATTT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 ATTTTG 0 1 73976 CASAVA_Build 13 71115158 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2326 het 747 hom 9 2 5 2 A 11 12 73977 CASAVA_Build 13 71130684 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 A 8 9 73978 CASAVA_Build 13 71146873 31I ACAGGAAACT -------------------------------/AATAGAGTGCTCCATTCAAGTTTGAAAACTA AATAAATTGC 3070 hom 71 het 31 0 21 12 AATAGAGTGCTCCATTCAAGTTTGAAAACTA 0 1 73979 CASAVA_Build 13 71147164 1I TCCAGCCGAA -/G GAGAAGGGGG 2082 hom 24 het 13 0 9 4 G 1 2 73980 CASAVA_Build 13 71147650 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 13 0 9 4 T 11 10 73981 CASAVA_Build 13 71166593 4D ACATAGATGA TACC/---- TACCTATGCA 3070 hom 115 het 43 0 38 6 TACC 2 1 73982 CASAVA_Build 13 71211712 2I ACTTAAAGAC --/TA TGTCAGTTTG 3070 hom 84 het 35 0 27 8 TA 0 1 73983 CASAVA_Build 13 71228658 2I CAAAACAATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 11 13 73984 CASAVA_Build 13 71231065 1I AGTCTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2991 het 2991 ref 55 20 12 23 T 13 14 73985 CASAVA_Build 13 71235669 1I TCTTCCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 T 11 12 73986 CASAVA_Build 13 71242498 1D AATATTTGGC T/- CTTAATCAGA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 T 1 0 73987 CASAVA_Build 13 71255974 1D TGATTTAAGG T/- TTTTTTTTTG 1045 het 1045 ref 33 24 3 6 T 10 9 73988 CASAVA_Build 13 71280051 2D CGATTACAGT TG/-- TCTCTTGATT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TG 1 0 73989 CASAVA_Build 13 71284639 50D TGGTTAGAGG CATCAAAATGGCACCATCAGAAACACATCAAAATGGCACCATCAGAAACA/-------------------------------------------------- CATCAAAATG 3070 hom 48 het 28 0 17 15 CATCAAAATGGCACCATCAGAAACA 3 1 73990 CASAVA_Build 13 71284907 1I GAAAAAAAGG -/A AAAAAACCTC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 7 73991 CASAVA_Build 13 71296706 2I GTGAGAGAGG --/GA GAAGGGATGA 3070 hom 145 het 58 0 49 9 GA 1 2 73992 CASAVA_Build 13 71307937 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 7 8 73993 CASAVA_Build 13 71309542 1D AAAATATGGG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 T 8 7 73994 CASAVA_Build 13 71309838 2D TGCTATAAAG AC/-- ACACATGCAC 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 AC 3 2 73995 CASAVA_Build 13 71320348 1D ATCCCCCCCC A/- AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 25 8 13 5 A 7 6 73996 CASAVA_Build 13 71345531 1I AACAAAGAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 6 7 73997 CASAVA_Build 13 71346447 1D TAGTGCTCAC T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 7 6 73998 CASAVA_Build 13 71350191 3D TTATATATAT CTA/--- TAATTATATA 454 het 454 ref 5 2 1 2 CTA 1 0 73999 CASAVA_Build 13 71352707 3D CACTTAATCT CAA/--- CAACAACTAT 3070 hom 134 het 50 0 41 10 CAA 3 2 74000 CASAVA_Build 13 71355970 1I AAAAAGAAAT -/A AAAAAAGGAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 7 74001 CASAVA_Build 13 71361756 2I ATTTAAAAAA --/AC AAAAATCTTG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AC 0 1 74002 CASAVA_Build 13 71364323 1D GCTGATTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 10 9 74003 CASAVA_Build 13 71372140 5I AATTAATGAA -----/AGGTC AATGTTTACT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AGGTC 0 1 74004 CASAVA_Build 13 71375352 2I ATAGGCGAGG --/CA CAGTGACTCA 3070 hom 18 het 10 0 7 3 CA 1 2 74005 CASAVA_Build 13 71380075 1I AAAGATGACA -/T TTTTTCAGTG 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 5 6 74006 CASAVA_Build 13 71381255 1I76M1I AGATGTCAAT -AAATATTCAAACTGAAAATAAGCCAAAAACAAATTATTTACTACCCCAGTTAAAAACTGCTTCTCTACTTGTCTTT-/AAAATATTCAAACTGAAAATAAGCCAAAAACAAATTATTTACTACCCCAGTTAAAAACTGCTTCTCTACTTGTCTTTC CCACTCCGGT 3070 hom 105 het 41 0 36 32 N/A 0 0 74007 CASAVA_Build 13 71385776 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2457 hom 31 12 12 7 T 17 16 74008 CASAVA_Build 13 71389191 1D TCTTAATTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 919 hom 19 3 13 3 A 10 9 74009 CASAVA_Build 13 71402304 1I TGACAGATCT -/A AAAAAACCCC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 6 7 74010 CASAVA_Build 13 71403727 11I TAAGCATCTG -----------/GCATTTCCCCT GCTTGCACTC 3070 hom 114 het 40 0 39 2 GCATTTCCCCT 0 1 74011 CASAVA_Build 13 71410740 1D AACAACATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 86 het 31 0 30 1 T 10 9 74012 CASAVA_Build 13 71427798 4D AACTAGAAAA TACT/---- TATATATAAG 3070 hom 114 het 40 0 39 2 TACT 1 0 74013 CASAVA_Build 13 71429464 2I AGGATCTTTC --/CT CTCTTTGTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 2 3 74014 CASAVA_Build 13 71431399 1D AGGCATCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 488 hom 24 2 19 3 A 12 11 74015 CASAVA_Build 13 71457336 1I AAAGTATACC -/A AAAAAATTGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 6 7 74016 CASAVA_Build 13 71459939 1I GTCCCACTGA -/T TGTCAAAATG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 1 2 74017 CASAVA_Build 13 71460219 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 A 8 9 74018 CASAVA_Build 13 71477608 1I ATAGGTACTA -/G GTTTGATAAT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 G 1 2 74019 CASAVA_Build 13 71491588 1D CTGTCCTCAC A/- ACCACATGTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 1 74020 CASAVA_Build 13 71507346 1I AGGGCTTTGG -/C CTTTTCGGGG 3070 hom 100 het 39 0 31 8 C 1 2 74021 CASAVA_Build 13 71522139 1D ATCAAGAATA G/- TTTTTTTTTT 3070 het 288 hom 44 1 39 4 G 1 0 74022 CASAVA_Build 13 71522645 4I AGATGGAGAG ----/TTTC TTTCTTTGCA 3070 hom 92 het 40 0 30 10 TTTC 1 2 74023 CASAVA_Build 13 71523456 1D ATCTTAACCA T/- TTTTAAGTGT 3070 hom 156 het 58 0 52 7 T 5 4 74024 CASAVA_Build 13 71525743 1D TCTATATAAA T/- TTTATGATGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 4 3 74025 CASAVA_Build 13 71526417 1I TTACTTCAGG -/T TTTTTCATAT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 5 6 74026 CASAVA_Build 13 71532324 4D GATCTAGGAT AAAG/---- AAAGGATTTT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 AAAG 2 1 74027 CASAVA_Build 13 71536446 1I CAGCCACTGC -/A AAAAAAACAT 3070 het 1556 hom 14 5 8 1 A 7 8 74028 CASAVA_Build 13 71547213 1I ACATAACCTT -/A AAGCCCTCAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 2 3 74029 CASAVA_Build 13 71550162 1I AATTTTTCTT -/C CTTGGTTTGG 3070 hom 123 het 51 0 41 10 C 1 2 74030 CASAVA_Build 13 71553145 1I ATCATTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 40 het 17 0 14 3 T 9 10 74031 CASAVA_Build 13 71558945 1D ATAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 29 1 25 4 A 11 10 74032 CASAVA_Build 13 71562173 9I CACCAAAATC ---------/TCATCTTGA ATTGTAGCTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 TCATCTTGA 0 1 74033 CASAVA_Build 13 71565746 3D AAGATGAAAT ATG/--- ATGTAGAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 ATG 2 1 74034 CASAVA_Build 13 71568298 1D TGGAATTAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 10 9 74035 CASAVA_Build 13 71571190 1D AGACTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1112 hom 33 4 16 13 T 17 16 74036 CASAVA_Build 13 71575117 1I TGCACTCCAG -/C CTGGGTGACA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 C 1 2 74037 CASAVA_Build 13 71575588 1D CCTGATCACA T/- TTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 38 23 11 7 T 7 6 74038 CASAVA_Build 13 71582995 1I GAACTCAATA -/G CAAAGAGGAG 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 G 0 1 74039 CASAVA_Build 13 71589900 1I TAACATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 10 11 74040 CASAVA_Build 13 71598406 2I GGCCTTAGAG --/TT TTTAAGAATA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 3 5 74041 CASAVA_Build 13 71601607 1I TCCCATATGA -/C CCCCCAGGGA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 C 5 6 74042 CASAVA_Build 13 71601969 1D AACTGTTTTC T/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 6 5 74043 CASAVA_Build 13 71604474 3D GGCCGTTTCT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 105 het 47 0 33 16 AAC 7 6 74044 CASAVA_Build 13 71609205 3D GCTAATTACA CCT/--- CCTTAAAGTC 3070 het 3070 hom 29 10 18 3 CCT 2 1 74045 CASAVA_Build 13 71621819 2D CCCATACGTT TA/-- TATATACATT 3070 hom 172 het 66 0 58 9 TA 4 3 74046 CASAVA_Build 13 71623367 1D TTTGACTGTC T/- TTGCCATGTA 3070 het 3070 ref 60 31 25 6 T 3 2 74047 CASAVA_Build 13 71624975 1I ATAAAAGCAT -/A GATGTCTCTG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 0 1 74048 CASAVA_Build 13 71625523 2D AGTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 30 9 T 13 11 74049 CASAVA_Build 13 71626013 1D CTCTCAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 181 hom 34 3 19 12 A 13 12 74050 CASAVA_Build 13 71630434 1D TGAGTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 15 12 A 13 12 74051 CASAVA_Build 13 71634242 1D ATGAGACTAT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 7 6 74052 CASAVA_Build 13 71638726 1D CAAGCACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 11 10 74053 CASAVA_Build 13 71648727 1I TGTGGTGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 660 hom 35 4 23 8 A 13 14 74054 CASAVA_Build 13 71651022 8D ACTCTGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 1048 hom 23 4 12 8 A 20 12 74055 CASAVA_Build 13 71658122 1D GGAAAAAAAA G/- GAAAAAAGAC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 G 2 1 74056 CASAVA_Build 13 71659836 4I ATTAATAGAC ----/AAAG AAAGTTTTCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AAAG 1 2 74057 CASAVA_Build 13 71665170 2I GGGAGGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 35 0 25 10 TG 8 9 74058 CASAVA_Build 13 71671346 1D GGGAGGGAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 9 8 74059 CASAVA_Build 13 71672308 2D TATTTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 TA 8 7 74060 CASAVA_Build 13 71676856 1I AGTAGTGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 9 10 74061 CASAVA_Build 13 71727654 1I CAAACCTTCA -/C CAATTTCTGT 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 C 1 2 74062 CASAVA_Build 13 71730956 1D AAGGCAGGCA G/- GAATTCCTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 2 1 74063 CASAVA_Build 13 71745258 1D TACATTTTTT G/- TCCGTGTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 1 0 74064 CASAVA_Build 13 71746370 1D ACTCCGATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 43 1 28 14 A 13 12 74065 CASAVA_Build 13 71761016 1I TGTTTTCTGT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 7 8 74066 CASAVA_Build 13 71772997 1D CTCAGGTCAG T/- TGACGCTAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 T 2 1 74067 CASAVA_Build 13 71773391 1I GCTGCTAAGT -/A AAAAAAAACA 3070 het 373 hom 48 1 38 9 A 8 9 74068 CASAVA_Build 13 71777560 4D TTGTTTCTGG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 41 1 33 9 T 16 12 74069 CASAVA_Build 13 71779525 2D ATTTCAACTC TT/-- AATATTATTA 3070 het 2976 hom 29 7 9 14 T 2 0 74070 CASAVA_Build 13 71792599 1D GAAAGGCCAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 97 het 37 0 29 8 A 8 7 74071 CASAVA_Build 13 71800122 1D GAGAAAAACT G/- TAAAGGCGTT 3070 hom 95 het 35 0 32 3 G 1 0 74072 CASAVA_Build 13 71807614 1I AAAGTAGATA -/T TGTTATGCAT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 T 1 2 74073 CASAVA_Build 13 71811811 1D ACAATCCTGT G/- GGGAAAAAAA 3070 het 719 hom 46 4 35 7 G 4 3 74074 CASAVA_Build 13 71812426 2D ACTCATTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 28 1 17 11 A 14 12 74075 CASAVA_Build 13 71817710 1D AACAATATGC A/- ACAAAGTCAT 3070 hom 132 het 49 0 43 8 A 2 1 74076 CASAVA_Build 13 71818254 1I AGAGAAAAAC -/A AAACTAAGGA 3070 hom 92 het 36 0 31 5 A 3 4 74077 CASAVA_Build 13 71831018 5I AATCTACAAA -----/TAACT TAAACAAATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TAACT 0 1 74078 CASAVA_Build 13 71832980 1I TTTTTTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 44 3 27 14 T 13 14 74079 CASAVA_Build 13 71849191 3I AAAACTAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 90 het 42 0 31 11 AAC 4 5 74080 CASAVA_Build 13 71859362 3I AACTAGAATT ---/AAA AAGTAAAATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 2 5 74081 CASAVA_Build 13 71868292 4D GCTTAGAAAT AGTC/---- AGGAAAGAAT 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 AGTC 1 0 74082 CASAVA_Build 13 71873005 1I AGGACAAAAG -/T TTCGCAGGCC 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 T 2 3 74083 CASAVA_Build 13 71873597 1D TAGTCCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 18 9 A 12 11 74084 CASAVA_Build 13 71879154 1D ATGTAGGTTG T/- TTAAATATTA 3070 hom 134 het 50 0 43 8 T 3 2 74085 CASAVA_Build 13 71879333 1I ATTTGACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 37 1 28 8 A 10 11 74086 CASAVA_Build 13 71879580 1I GGAAGATATT -/C CCCCCAAAGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 5 6 74087 CASAVA_Build 13 71884956 4D ATTTCCATGG CTGA/---- CTAATTGTGG 3070 het 3070 ref 55 29 23 5 CTGA 1 0 74088 CASAVA_Build 13 71888038 1D TGGTTTTTTT A/- AATTATATTC 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 A 3 2 74089 CASAVA_Build 13 71891858 1D TCCTTGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 12 11 74090 CASAVA_Build 13 71894017 4I AGGTTCCATT ----/TTAG TTAGGCTATG 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 TTAG 1 2 74091 CASAVA_Build 13 71898998 1I AAAAGAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 A 9 10 74092 CASAVA_Build 13 71903804 1I AAGGTTCTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 53 23 22 8 A 8 9 74093 CASAVA_Build 13 71905362 8D ATGGACACAC TGAAAGGG/-------- TAAAAGAGTA 3070 het 3070 hom 38 11 24 4 TGAAAGGG 1 0 74094 CASAVA_Build 13 71913676 11I TATTGAATAA -----------/TCAGGACACCG TCTTTTAATC 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 TCAGGACACCG 0 1 74095 CASAVA_Build 13 71930776 1D TCCCACAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 10 21 8 A 10 9 74096 CASAVA_Build 13 71935610 1I CTTTTTTTTT -/C TCTCTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 C 0 1 74097 CASAVA_Build 13 71936150 1D AGCATATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 A 15 14 74098 CASAVA_Build 13 71949738 4D AATGGACTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 1201 het 1201 ref 40 18 9 13 A 22 18 74099 CASAVA_Build 13 71950888 1I GATAACCTAG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 57 28 22 7 A 6 7 74100 CASAVA_Build 13 71954648 1I AGAGAGCAGA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 T 6 7 74101 CASAVA_Build 13 71954780 1D TTTGTAAATC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 8 7 74102 CASAVA_Build 13 71971645 1D ACAGAATTCC T/- ACCCACAGCC 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 T 1 0 74103 CASAVA_Build 13 71984423 4D TTCCTCCAGC AGGA/---- AGGAAGGGCT 3070 hom 59 het 24 0 18 6 AGGA 2 1 74104 CASAVA_Build 13 71986604 1D AAAGTATTTA T/- TTCATTAATC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 3 2 74105 CASAVA_Build 13 71991124 2D CCTGCTCCGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2044 hom 33 12 11 10 T 16 14 74106 CASAVA_Build 13 71993629 1D ATTTAATCTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 8 7 74107 CASAVA_Build 13 71993786 1D GCAAAGGCAG C/- CCCCTTTCAA 3070 hom 85 het 34 0 27 7 C 5 4 74108 CASAVA_Build 13 72000180 1I ATGGGGGAAC -/T TGCCCCCATG 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 T 1 2 74109 CASAVA_Build 13 72004455 1I GTCACTCCTG -/C TGAGCGCATT 3070 hom 117 het 45 0 38 7 C 0 1 74110 CASAVA_Build 13 72009332 1I CTTGAAAATC -/A ACAGGAGTAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 1 2 74111 CASAVA_Build 13 72022707 2I GGATGCAGGA --/AT ATATAGGATG 3070 het 3070 hom 53 15 27 11 AT 2 3 74112 CASAVA_Build 13 72023340 23D AGGTGTGAGT CACCGCCCCCGGCCACATTCAGC/----------------------- CACTTCTATG 3070 het 3070 ref 28 15 14 7 CACCGCCCCCGGCCACATTCAGC 1 0 74113 CASAVA_Build 13 72024615 1D CATCTGCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 11 10 74114 CASAVA_Build 13 72030853 1I TGACATGCAG -/A AATAATCTGT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 2 3 74115 CASAVA_Build 13 72032846 1D AGATAAGCTT C/- CTTAAAGGTA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 C 2 1 74116 CASAVA_Build 13 72042951 1D TTTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 12 11 74117 CASAVA_Build 13 72044234 6D TAGCCTCTCT CAGACA/------ CAGACACTGT 3070 het 3070 hom 47 16 23 10 CAGACA 2 1 74118 CASAVA_Build 13 72045578 3I GTGCTCTTAA ---/AAG AAGATAACTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 AAG 1 2 74119 CASAVA_Build 13 72054144 1I GAAATATACA -/G TCTTCTCTAG 3070 het 3070 hom 57 25 28 4 G 0 1 74120 CASAVA_Build 13 72073982 1D TGCAGTCTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 9 8 74121 CASAVA_Build 13 72080477 3I AAAAATAGAT ---/GAG GAGATGATTG 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 GAG 1 2 74122 CASAVA_Build 13 72081409 1D TTGAAGTCTT A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 25 9 13 4 A 8 7 74123 CASAVA_Build 13 72090298 1I ATCACAATTG -/C TTTCTCCTGG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 C 0 1 74124 CASAVA_Build 13 72091013 4I TCCATTTTCT ----/CTGA CTATCAGAAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 CTGA 0 1 74125 CASAVA_Build 13 72091891 2D CCTTTTTCTT TC/-- TCTGTTTACT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 TC 2 1 74126 CASAVA_Build 13 72091994 4D ATGATTCTCT TTAA/---- TTAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 27 22 5 TTAA 2 1 74127 CASAVA_Build 13 72093533 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 11 12 74128 CASAVA_Build 13 72100222 1D TAACACAATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 A 9 8 74129 CASAVA_Build 13 72119506 1D AATTTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2579 hom 33 15 12 7 A 15 14 74130 CASAVA_Build 13 72124839 4D TGTTGTAATG AATT/---- AGGTCCTAAG 3070 het 3070 ref 47 24 22 2 AATT 1 0 74131 CASAVA_Build 13 72129039 1D GTCATGCGGT C/- TACTCTGAAC 3070 hom 111 het 40 0 37 4 C 1 0 74132 CASAVA_Build 13 72136118 2I CAATTTCTCC --/CT CTTATTCACT 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 CT 1 2 74133 CASAVA_Build 13 72142043 1D GTCTTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 4 A 11 10 74134 CASAVA_Build 13 72142893 1D AGGAAAAGAC G/- GATCAACATT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 G 2 1 74135 CASAVA_Build 13 72147518 10I AGGCTTAAAG ----------/AGTCTAAATA AGTAAAACTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AGTCTAAATA 0 1 74136 CASAVA_Build 13 72149089 1I AATAAAATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 8 9 74137 CASAVA_Build 13 72151952 1I CCAGCCTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 10 11 74138 CASAVA_Build 13 72152969 1D CTGGGGACTC T/- TTTTTTTTTT 1357 het 47 hom 19 1 5 13 T 15 14 74139 CASAVA_Build 13 72156074 1I CTTTTACTTA -/G TAATAGGCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 74140 CASAVA_Build 13 72157037 1I AATACCTTGC -/A TATAGTTGTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 0 1 74141 CASAVA_Build 13 72157896 1D TAATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 42 2 22 18 A 12 11 74142 CASAVA_Build 13 72159046 13I GCTGTTAAAA -------------/ATAGCTTTCAGTC ATTCAGCATT 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 ATAGCTTTCAGTC 0 1 74143 CASAVA_Build 13 72174477 2D TTAAATACAT TA/-- TATGTTTCCA 3070 het 3070 hom 33 15 16 4 TA 2 1 74144 CASAVA_Build 13 72174548 2I TATTGGTGAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 9 11 74145 CASAVA_Build 13 72178016 5I TCATGATTCT -----/TCCTA TCCATGAGCA 2975 hom 15 het 6 0 6 0 TCCTA 0 1 74146 CASAVA_Build 13 72180967 1D ATTCTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 211 hom 16 1 10 5 A 13 12 74147 CASAVA_Build 13 72187497 1D TTAGATTTTA C/- AGGCTCATAG 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 C 1 0 74148 CASAVA_Build 13 72192034 15D TAAGTACACC GGTTCCACTGAATTT/--------------- TGTTTTAAGA 3070 hom 123 het 43 0 41 6 GGTTCCACTGAATTT 1 0 74149 CASAVA_Build 13 72193074 1I TTTGAGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 43 1 39 3 A 11 12 74150 CASAVA_Build 13 72195992 8D TAAGTAAAAT AAATAAAG/-------- AGTGGAATAC 3070 hom 51 het 21 0 18 6 AAATAAAG 1 0 74151 CASAVA_Build 13 72200159 1D AGGTACGCTC T/- TTGTGGTCCC 3070 hom 53 het 23 0 17 6 T 3 2 74152 CASAVA_Build 13 72201424 1D AGCTAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 T 13 12 74153 CASAVA_Build 13 72207888 13D AGCTGGGATT ACAGGCATGCGCC/------------- ACCACACGCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 ACAGGCATGCGCC 1 0 74154 CASAVA_Build 13 72209010 1I TAAAAATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 T 11 12 74155 CASAVA_Build 13 72212158 1D TATGAGGGTT G/- GGGGGTCAGT 3070 het 382 hom 40 6 16 18 G 6 5 74156 CASAVA_Build 13 72214511 2I TTCAATTTAT --/AA AAAACTTTAG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 4 6 74157 CASAVA_Build 13 72215485 13D TAATCCTTTA GTTTTATCCTTGT/------------- ATTCCCTCAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 GTTTTATCCTTGT 1 0 74158 CASAVA_Build 13 72220868 14D TTTTTCACTT TCTCTCTCTCTCTC/-------------- TCTCTCTCTC 3070 het 349 hom 35 4 14 20 TC 15 8 74159 CASAVA_Build 13 72221648 1D TCTAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 19 0 13 8 T 11 10 74160 CASAVA_Build 13 72224917 2D ATTAAGTGAT AA/-- AGAGTGCCGT 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 A 3 1 74161 CASAVA_Build 13 72228315 24I TTCAAAAGGG ------------------------/AATAATTCATATGTACCCTTAGGA AATAAAGACC 3070 hom 127 het 44 0 43 4 AATAATTCATATGTACCCTTAGGA 0 1 74162 CASAVA_Build 13 72231197 1D GCCACTAATT A/- ATCTGTTTTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 2 1 74163 CASAVA_Build 13 72242341 15D AGTATATATT CTTTGTAAGTTTCTG/--------------- AATACAGGAC 3070 het 3070 ref 35 25 12 2 CTTTGTAAGTTTCTG 1 0 74164 CASAVA_Build 13 72274152 3I TTAAAAAATG ---/TTC TTTTCTCTAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTC 0 1 74165 CASAVA_Build 13 72279318 1D GATAAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 A 12 11 74166 CASAVA_Build 13 72279714 1D AGTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 118 hom 22 2 17 3 A 11 10 74167 CASAVA_Build 13 72280293 3I GGACATGTTT ---/TTG TTTCTCTTGA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 TTG 0 1 74168 CASAVA_Build 13 72285996 1I AGATAAGCTA -/C CAAAATTTGA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 C 1 2 74169 CASAVA_Build 13 72296320 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1717 het 218 hom 10 1 6 3 T 17 18 74170 CASAVA_Build 13 72298186 1I TCATAAAAAA -/G AAAAAAAAAT 2374 het 1107 hom 15 4 8 3 G 0 1 74171 CASAVA_Build 13 72298768 1I ATAAGTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 T 11 12 74172 CASAVA_Build 13 72305055 1I ATCAAACGTA -/G TTTTTGTCTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 0 1 74173 CASAVA_Build 13 72307510 1I GAAAACAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1956 hom 27 8 15 4 A 13 14 74174 CASAVA_Build 13 72307730 1D CTGTTATGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 43 0 37 7 T 10 9 74175 CASAVA_Build 13 72309928 2D CTGTATACAC AT/-- ATATTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 AT 3 2 74176 CASAVA_Build 13 72317219 1D ATCAACGGGT C/- CATCTAGGTT 3070 het 3070 hom 18 8 7 5 C 2 1 74177 CASAVA_Build 13 72322907 5I GTTTGAGAAC -----/ATTAT TTTATCTATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATTAT 0 1 74178 CASAVA_Build 13 72325199 1D AAGGAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 A 11 10 74179 CASAVA_Build 13 72326957 1I TACTCCCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 T 12 13 74180 CASAVA_Build 13 72334760 4D ATCAGAAAAT ATAC/---- AAATAACAAT 3070 het 3070 hom 32 10 17 6 ATAC 1 0 74181 CASAVA_Build 13 72340147 1D ACAAAATAAT A/- ACATCTCTGG 3070 hom 85 het 31 0 29 2 A 2 1 74182 CASAVA_Build 13 72345913 1I TACTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2854 het 2236 hom 26 6 9 11 A 11 12 74183 CASAVA_Build 13 72347630 1D AGTGTGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 58 22 29 7 A 10 9 74184 CASAVA_Build 13 72360970 4I GTTTAAAAAA ----/AAAC AAACAAACCT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 AAAC 2 3 74185 CASAVA_Build 13 72363644 1I GTAAAAGGTA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 74186 CASAVA_Build 13 72365849 4D GAAAACATAG AAGT/---- AAGGTTTATG 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 AAGT 1 0 74187 CASAVA_Build 13 72370511 1D GAAAGAGCAC A/- AACAGACAAT 3070 het 2950 hom 16 7 8 1 A 3 2 74188 CASAVA_Build 13 72373360 1D GTAAAAAAAA C/- AATCCCATCA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 C 1 0 74189 CASAVA_Build 13 72374435 1D ACTGCCCCGG T/- TGATGGGTGC 2898 het 2898 ref 20 10 7 4 T 2 1 74190 CASAVA_Build 13 72377220 1D15M4D TTTTTTTTTT GGAGACAGAGTCTCACTCTA/-GAGACAGAGTCTCAC---- TCTGTCACCC 3070 het 3070 hom 31 10 14 10 N/A 0 0 74191 CASAVA_Build 13 72379384 5D TGATCTGAAA TAAGT/----- TAAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TAAGT 1 0 74192 CASAVA_Build 13 72380990 9D GAGTTCGAGA CCAGCCTGG/--------- CCAACGTGAC 2484 het 1977 hom 14 5 6 5 CCAGCCTGG 1 0 74193 CASAVA_Build 13 72381637 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2318 hom 33 9 11 13 T 14 15 74194 CASAVA_Build 13 72383558 1D AAATGGTGCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 A 9 8 74195 CASAVA_Build 13 72391872 4I TTTGAGAGGC ----/CAAT CAATGCAGGC 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 CAAT 1 2 74196 CASAVA_Build 13 72396856 1D ACCCTGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 12 11 74197 CASAVA_Build 13 72405233 1I CAGAAAAGAT -/A AATAAACAAA 1497 hom 21 het 21 0 8 13 A 2 3 74198 CASAVA_Build 13 72416586 1I AAGACTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 496 hom 23 3 15 5 A 13 14 74199 CASAVA_Build 13 72424774 1D TTCAACTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1148 hom 32 3 20 9 T 14 13 74200 CASAVA_Build 13 72424867 4I GTGAAGACTC ----/TGTA TGAGTTCCTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TGTA 0 1 74201 CASAVA_Build 13 72425028 1I TGCCCTTAAG -/A AAAAAAAAAA 2638 het 2638 ref 29 9 10 10 A 14 15 74202 CASAVA_Build 13 72426955 1I GCTTCTTGTG -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 49 29 15 5 A 7 8 74203 CASAVA_Build 13 72434736 1I TCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 A 13 14 74204 CASAVA_Build 13 72437213 1I AAAAGAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 1397 hom 16 3 10 3 A 8 9 74205 CASAVA_Build 13 72449762 1I TGTTAAACAG -/A AAAAAGCAAG 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 A 5 6 74206 CASAVA_Build 13 72466252 11D AACCTGTCTC AAAAAAAAAAG/----------- AAAAAAAAAG 3070 het 594 hom 32 5 16 15 AAAAAAAAAAG 1 0 74207 CASAVA_Build 13 72470021 4I ATAAATACCC ----/ACTA ACTAGTGTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ACTA 1 2 74208 CASAVA_Build 13 72471420 2D TTAAAGAAAA AG/-- AAATAAGAAA 3070 het 3070 hom 23 10 12 2 AG 1 0 74209 CASAVA_Build 13 72476641 2I4M1I AAAAAAAAAA --AAAG-/AGAAAGA AAAGAAAAGA 30 hom 5 het 18 0 2 18 N/A 0 0 74210 CASAVA_Build 13 72478221 1I ACCATGCCCA -/G ATAATTTTTG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 0 1 74211 CASAVA_Build 13 72479439 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2481 het 941 hom 19 3 11 6 T 15 14 74212 CASAVA_Build 13 72479949 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 505 hom 27 2 20 6 A 17 16 74213 CASAVA_Build 13 72483206 1I CTCAGGTGAT -/C CCCCCCCACC 1538 het 980 hom 8 3 4 1 C 7 8 74214 CASAVA_Build 13 72483575 1I AGTGGGAGGG -/A AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 A 6 7 74215 CASAVA_Build 13 72486910 3D GCTCACTTCA GCC/--- GCCTTGACCT 3070 hom 93 het 33 0 32 3 GCC 2 1 74216 CASAVA_Build 13 72488345 4I AAATATTTTG ----/GTGA GTATTTTTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GTGA 0 1 74217 CASAVA_Build 13 72488953 3D GTTCAGACAG TTC/--- TTCTGTCTCA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TTC 2 1 74218 CASAVA_Build 13 72495088 5D AGTTCAGAAA TAACT/----- TAAAAGCTAC 3070 hom 69 het 25 0 23 3 TAACT 1 0 74219 CASAVA_Build 13 72499032 1I ACTCCATCAC -/A AAAAAAAAAA 873 het 285 hom 12 1 5 6 A 17 18 74220 CASAVA_Build 13 72502912 13D GGCTAATTTG TTTTTTTTTTGTT/------------- TTTTTTTTTT 156 het 156 ref 28 18 2 8 TTTTTTTTTTGTT 2 1 74221 CASAVA_Build 13 72503383 1D GCCTCAACTT C/- CTGGGTTCAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 C 2 1 74222 CASAVA_Build 13 72503548 1D GATGAAAGTA T/- TTTTCTGAAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 T 5 4 74223 CASAVA_Build 13 72511890 1I CTTCTTCTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 9 10 74224 CASAVA_Build 13 72512748 3D AATGCCAAAT ATC/--- ATAATATATG 3070 het 3070 ref 51 30 18 5 ATC 1 0 74225 CASAVA_Build 13 72515719 4I GACACTTTTA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 TG 7 9 74226 CASAVA_Build 13 72518052 6D ACTCTGTCTC AAACAA/------ AAAAAAAAAA 1682 het 720 hom 14 4 7 3 AAACAA 1 0 74227 CASAVA_Build 13 72521335 1I CATTTTGTCG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 8 9 74228 CASAVA_Build 13 72529520 1D AAAGATGAAG A/- TGGACAGCAT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 A 1 0 74229 CASAVA_Build 13 72530832 1D CGCGTCTCCA C/- CCTAATTCCC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 3 2 74230 CASAVA_Build 13 72533558 1D TTTTTCTATT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 8 7 74231 CASAVA_Build 13 72535033 1D AAAAATTACC T/- TTTTTTTTTT 2652 het 2652 ref 37 21 10 6 T 11 10 74232 CASAVA_Build 13 72543688 2D CCTCCTACTT TA/-- TCTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 TA 1 0 74233 CASAVA_Build 13 72547139 1I TTTCATGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 10 11 74234 CASAVA_Build 13 72557547 6I18M6I TCTTAGGTAC ------CTCAGCAAATTAGGGTCA------/CTTAGACTAAGCAAATTAGGGTCATCTAAG TCTGAGTGAA 3070 hom 126 het 43 0 43 7 N/A 0 0 74235 CASAVA_Build 13 72572624 1D GCAGTAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2702 hom 23 6 16 1 A 12 11 74236 CASAVA_Build 13 72573412 2D CAGAAAACAG TT/-- TAAAACTGTG 3070 het 3070 hom 51 24 27 1 T 3 1 74237 CASAVA_Build 13 72575666 1I CCATAGTAAC -/A AAAATTTTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 4 5 74238 CASAVA_Build 13 72583858 3D ATTTAAATCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1595 hom 32 10 11 11 T 17 14 74239 CASAVA_Build 13 72588839 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 18 1 12 5 A 12 11 74240 CASAVA_Build 13 72589027 1D ATAGGACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 36 0 26 10 T 11 10 74241 CASAVA_Build 13 72602348 1D ACTCAGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 A 14 13 74242 CASAVA_Build 13 72612303 1I GTATGTGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1504 hom 22 9 12 1 T 13 14 74243 CASAVA_Build 13 72616259 1D TGACCTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 12 11 74244 CASAVA_Build 13 72617504 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 10 11 74245 CASAVA_Build 13 72621943 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 A 9 8 74246 CASAVA_Build 13 72627634 2I TACAACATGA --/TT TTTTTTTTTT 2094 het 2094 ref 23 12 6 5 T 12 14 74247 CASAVA_Build 13 72628909 1I ATTTTACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 10 11 74248 CASAVA_Build 13 72633346 1D TAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 A 11 10 74249 CASAVA_Build 13 72634211 1D TGGGTACAGT A/- AGCTCACGCC 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 2 1 74250 CASAVA_Build 13 72657040 1D21M36D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAATGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATACACAC/-AAAAAAAAAATGTGTATATAT------------------------------------ ACACACACAC 2418 het 805 hom 6 3 6 1 N/A 0 0 74251 CASAVA_Build 13 72659266 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 TA 6 5 74252 CASAVA_Build 13 72661365 1D61M1I AATTCCGTAA TTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGAATTTTACATTCTCT-/-TTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGAATTTTACATTCTCTA AAGCTCTTGA 3070 het 3070 hom 24 18 17 6 N/A 0 0 74253 CASAVA_Build 13 72663223 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1690 hom 20 8 10 3 A 14 13 74254 CASAVA_Build 13 72666475 1I TTAAACTCAT -/C CCCCCAAGGC 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 C 5 6 74255 CASAVA_Build 13 72666712 2I AGCATAGTTC --/TG TGTACAAGAT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TG 1 2 74256 CASAVA_Build 13 72668916 1I CTTTTCTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 T 9 10 74257 CASAVA_Build 13 72670654 1I CTGAAAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 51 19 27 5 A 9 10 74258 CASAVA_Build 13 72676049 4I CATTTTGTCT ----/ACAC ACACACACAC 3070 hom 96 het 44 0 33 11 AC 5 7 74259 CASAVA_Build 13 72676240 1I GGTCTAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 A 10 11 74260 CASAVA_Build 13 72679760 3D38M1I TCTGGTCTCT CTGCTGCTGCCCATCTTGTCCTCTGCGTTCCTATTCTGGGA-/---CTGCTGCCCATCTTGTCCTCTGCGTTCCTATTCTGGGAT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 28 19 3 N/A 0 0 74261 CASAVA_Build 13 72685178 1I TTTTCTGTCA -/T TTTTGGGGGG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 4 5 74262 CASAVA_Build 13 72694418 4I ATGAGTGACA ----/GAGT GAGACCCTGT 3070 hom 96 het 37 0 30 7 GAGT 0 1 74263 CASAVA_Build 13 72695629 1I AGAGAGATAG -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 A 7 8 74264 CASAVA_Build 13 72716063 1D TACACAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 18 2 8 8 T 15 14 74265 CASAVA_Build 13 72719395 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 32 0 27 5 A 13 14 74266 CASAVA_Build 13 72720596 5D ATAAGGTCCT TTAAA/----- TTAAAACTGA 3070 het 3070 ref 29 16 13 1 TTAAA 2 1 74267 CASAVA_Build 13 72722309 4I AGTGTCTTCC ----/TTGT ACAAGATGAG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 TTGT 0 1 74268 CASAVA_Build 13 72730639 1D TAGGGTAAAT A/- AAAAAAAACG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 A 9 8 74269 CASAVA_Build 13 72734647 4D AGCAGGAGGA AGAG/---- AGAGAGCAAG 3070 hom 10 het 40 2 35 3 AG 5 3 74270 CASAVA_Build 13 72735415 1I CTATGAAAAT -/A TTTTTTCTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 1 74271 CASAVA_Build 13 72737457 2D GCTATAAAGA CT/-- CTCTGGGTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CT 3 2 74272 CASAVA_Build 13 72739823 1I CTCTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 10 11 74273 CASAVA_Build 13 72739997 1I TGAATTATAA -/T TTGCTAATTG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 2 3 74274 CASAVA_Build 13 72750693 1D TTTATGTTAC T/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 7 6 74275 CASAVA_Build 13 72751469 2I TTTGTTTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 T 13 15 74276 CASAVA_Build 13 72754444 3D CTCCTTCTGC CTT/--- CTTCTCACTG 3070 het 3070 hom 46 15 24 8 CTT 2 1 74277 CASAVA_Build 13 72758677 2I TCTCAGTGGA --/CT CTCTACCTTT 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 CT 2 3 74278 CASAVA_Build 13 72763077 1D GTTCTGATCA C/- CCTATTTGAT 3070 het 3070 hom 62 26 28 9 C 3 2 74279 CASAVA_Build 13 72763653 1D TTTGTTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 12 11 74280 CASAVA_Build 13 72770103 1I CTAAAGAGTG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 6 7 74281 CASAVA_Build 13 72772341 1D TAGGGAGGAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 8 7 74282 CASAVA_Build 13 72773609 2D ATTATTATTA TT/-- TTTTTTTTTT 426 het 340 hom 25 3 2 20 T 13 11 74283 CASAVA_Build 13 72782126 1D TCGAGACCAG C/- CTGGTCAATA 3070 hom 24 het 14 0 12 2 C 2 1 74284 CASAVA_Build 13 72785697 4I ATGGTAAAAT ----/AAAC AAGCAAATAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAC 0 1 74285 CASAVA_Build 13 72787753 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 22 0 14 8 T 10 9 74286 CASAVA_Build 13 72793416 3D TAGTAAATGT AAG/--- AAGGCCAGAG 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AAG 2 1 74287 CASAVA_Build 13 72803303 1I AATACAGTGC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 7 74288 CASAVA_Build 13 72810077 4D AGACACATAC ATAT/---- ATATGTGTGT 1522 het 245 hom 30 4 12 15 AT 4 2 74289 CASAVA_Build 13 72811265 1D GAAAGGGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 209 hom 31 1 23 7 A 15 14 74290 CASAVA_Build 13 72816731 1D TCTTCTCAAA G/- GGCATTTCAA 3070 hom 72 het 27 0 24 4 G 3 2 74291 CASAVA_Build 13 72817328 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 10 11 74292 CASAVA_Build 13 72823671 8D5M19D TTTTCTAAAA TTACATCTTTTCTTTGAGGCTTAAATAGTATC/--------TTTCT------------------- AAAGATGGCA 3070 hom 117 het 37 0 39 5 N/A 0 0 74293 CASAVA_Build 13 72840641 1I TTTATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 10 11 74294 CASAVA_Build 13 72846883 3I GATTGACTGT ---/TGA TGAGTACAGA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TGA 1 2 74295 CASAVA_Build 13 72847030 1D TAGAGTTGTC A/- TTTTTTTTTA 3070 hom 59 het 31 0 24 7 A 1 0 74296 CASAVA_Build 13 72853779 4D TCTGGGAAGC TTGT/---- TTGTTTACAT 3070 het 3070 ref 36 22 11 6 TTGT 2 1 74297 CASAVA_Build 13 72865665 2I TATAGCTCTT --/CA ATTGTGACTA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 CA 0 1 74298 CASAVA_Build 13 72880752 1D GAGAAAAATT G/- CAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 G 1 0 74299 CASAVA_Build 13 72881816 4I GCAGAAGGAA ----/ACAG ACAGACCCTA 3070 hom 138 het 50 0 45 5 ACAG 1 2 74300 CASAVA_Build 13 72888900 1I ATGTCTCTGG -/A CCTTACTATT 3070 het 3070 ref 48 30 13 5 A 0 1 74301 CASAVA_Build 13 72891739 1D AGACATTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 11 10 74302 CASAVA_Build 13 72894820 1I TGCCTTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 36 3 25 8 A 13 14 74303 CASAVA_Build 13 72904533 1I AAGATGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 17 10 T 10 11 74304 CASAVA_Build 13 72920491 4D CATACTAAAA AATT/---- AATTAATAAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 AATT 2 1 74305 CASAVA_Build 13 72921217 1D AATACAGATT A/- AAAAAAAAAC 711 het 711 ref 42 33 3 6 A 10 9 74306 CASAVA_Build 13 72924051 2D CTCTACTAAA AC/-- ACACACACAC 2811 het 2327 hom 16 7 7 2 AC 10 9 74307 CASAVA_Build 13 72924995 1I CTGACTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 A 11 12 74308 CASAVA_Build 13 72933619 1I AATGTAGACT -/G GATAAAGAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 1 2 74309 CASAVA_Build 13 72936231 1D TGTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 12 11 74310 CASAVA_Build 13 72941629 7D GAATAATCAG CAGAGTT/------- CACAGATAAC 3070 het 3070 hom 31 14 18 0 CAGAGTT 1 0 74311 CASAVA_Build 13 72977634 11D GTTTTTTTTG TTTTTTTTTGT/----------- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 18 19 11 TTTTTTTTTGT 1 0 74312 CASAVA_Build 13 72982116 1D CCAGCTACTT G/- GGGGGCTGAG 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 G 6 5 74313 CASAVA_Build 13 72984516 1D AATTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 13 12 74314 CASAVA_Build 13 72994185 1D ACTTTCTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 A 10 9 74315 CASAVA_Build 13 72998973 1I ATTCAGCCAT -/A AAAAAGAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 5 6 74316 CASAVA_Build 13 73003404 1D GCCAGAACAC T/- TAGGGGAAGT 3070 hom 81 het 34 0 27 8 T 2 1 74317 CASAVA_Build 13 73024338 1I GTTTCCTCTG -/A AAGTAGAGTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 3 74318 CASAVA_Build 13 73027377 1D GTTTATACAA C/- TTTTTTGTAA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 C 1 0 74319 CASAVA_Build 13 73028486 1D GTCAGCAGGT G/- GGGGGTTGGA 3070 hom 113 het 42 0 37 7 G 6 5 74320 CASAVA_Build 13 73030563 1D CTCATCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1051 het 1051 ref 28 15 4 9 A 19 18 74321 CASAVA_Build 13 73036855 1D TATGAGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 36 1 28 7 A 12 11 74322 CASAVA_Build 13 73054228 1D GACTTAGGAG T/- TGAACTTAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 2 1 74323 CASAVA_Build 13 73054767 2I TCACTTATAA --/CT CTCTAAGAAG 3070 hom 114 het 49 0 39 10 CT 2 3 74324 CASAVA_Build 13 73066081 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 19 1 10 8 T 13 14 74325 CASAVA_Build 13 73067241 1I TAATTAAAAA -/C AGATCTTGGC 3070 hom 91 het 35 0 27 8 C 0 1 74326 CASAVA_Build 13 73067380 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 83 het 31 0 26 5 A 9 8 74327 CASAVA_Build 13 73069545 2D ACAAAATATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 23 4 T 12 10 74328 CASAVA_Build 13 73072983 1D ATGAAGAGGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 8 7 74329 CASAVA_Build 13 73085489 1I ATTATCAGGG -/T TTTTAAAAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 4 5 74330 CASAVA_Build 13 73086777 1I TAGGATTACA -/G GCATGAGCCA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 1 2 74331 CASAVA_Build 13 73118677 4D AAAGTATAAT TAAA/---- AAAAAAAAAA 2865 hom 24 het 9 0 9 1 TAAA 1 0 74332 CASAVA_Build 13 73119893 1I GGTTTGGCGA -/G GCATAATAGC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 1 2 74333 CASAVA_Build 13 73152546 1I AAAAGAAGAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 7 8 74334 CASAVA_Build 13 73192518 1D GGGAATGTGC A/- AGTAACTACT 3070 hom 138 het 57 0 47 10 A 2 1 74335 CASAVA_Build 13 73193951 2I TCGGCGTCCC --/AG AGTGTTGGGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AG 1 2 74336 CASAVA_Build 13 73204221 1D TATTAACCCT A/- TTTTTTTTTT 1938 het 726 hom 32 11 10 11 A 1 0 74337 CASAVA_Build 13 73208093 1I TTCTTTCTTT -/C TTCTTTTTTT 3070 het 314 hom 30 1 23 6 C 0 1 74338 CASAVA_Build 13 73214166 1D CAAGAGGCTG A/- AAAAGCCTAC 3070 het 3070 hom 51 18 22 11 A 5 4 74339 CASAVA_Build 13 73218207 3D GGAAACCACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 32 2 17 14 A 15 12 74340 CASAVA_Build 13 73222885 1D AGGTATTACG C/- CCAGAATGCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 3 2 74341 CASAVA_Build 13 73224589 31I ACTATCATTT -------------------------------/ATATAAATGATAGTTTATATAAATATATAAA ATATGCCAAT 3070 hom 102 het 34 0 33 4 ATATAAATGATAGTTTATATAAATATATAAA 0 1 74342 CASAVA_Build 13 73224882 15D TTTTTTTTTT GACACAGAGTCTTGC/--------------- TCTGTCACCC 2232 het 274 hom 18 3 7 8 GACACAGAGTCTTGC 1 0 74343 CASAVA_Build 13 73233278 1D ATCTGCCAAG A/- ATAAAAGTCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 2 1 74344 CASAVA_Build 13 73236616 2D TCCCCAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 14 12 74345 CASAVA_Build 13 73236659 1I TGGCAAGGAA -/C AAAAAAAATC 551 het 551 ref 19 7 2 10 C 0 1 74346 CASAVA_Build 13 73240693 2D AGGCAGCTCA TT/-- TTTTTCTGCT 3070 hom 99 het 39 0 33 7 T 7 5 74347 CASAVA_Build 13 73241057 5D TATATATATT CCCTC/----- CACCCAGCCC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 CCCTC 1 0 74348 CASAVA_Build 13 73242040 1I TCTTTCTTGT -/A AGGACATTAC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 1 2 74349 CASAVA_Build 13 73244291 4D ATACAACCTG TCTA/---- TCTTTTACTT 3070 hom 102 het 37 0 34 7 TCTA 1 0 74350 CASAVA_Build 13 73245032 3D GGGAGGAGTG AGA/--- AGAAGATGGA 3070 het 3070 hom 54 22 27 5 AGA 3 2 74351 CASAVA_Build 13 73245718 2D CCATTATATC TG/-- TGTTCCATTT 3070 hom 135 het 47 0 45 2 TG 2 1 74352 CASAVA_Build 13 73246422 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 45 het 25 0 16 9 AC 9 8 74353 CASAVA_Build 13 73268519 4D TTTTTCCCTC AACT/---- AACTAAACAG 3070 hom 72 het 27 0 25 4 AACT 2 1 74354 CASAVA_Build 13 73271639 2I ATTCAATAAC --/TA TGTGGGCTTT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TA 0 1 74355 CASAVA_Build 13 73273921 1D ACTAAAAAAA T/- TTCAACATAA 3070 hom 93 het 33 0 31 4 T 3 2 74356 CASAVA_Build 13 73284525 2I36M5D GCATTCTCAC --AAAAAAAAAAACTATGTAAGGTGAGGAATGTATTAATTAAC/AAAAAAAAAAAAACTATGTAAGGTGATGAATGTATTAA----- TTAATTGTGG 3070 hom 66 het 30 0 23 11 N/A 0 0 74357 CASAVA_Build 13 73287182 1D GCCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1869 het 1869 ref 47 33 5 9 A 13 12 74358 CASAVA_Build 13 73301839 12I AACAATAACA ------------/ACTGGCTGAATT ACTGACTGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ACTGGCTGAATT 0 1 74359 CASAVA_Build 13 73314994 1D AACAAAGAAC T/- GAGGAATTAC 3070 hom 123 het 46 0 40 6 T 1 0 74360 CASAVA_Build 13 73334194 1D TATAGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1989 het 1989 ref 31 14 7 10 T 16 15 74361 CASAVA_Build 13 73339747 1I AGACAGGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 355 hom 39 1 34 4 A 9 10 74362 CASAVA_Build 13 73344001 5D CAGATATCTC TCTTA/----- TAAGACGGCG 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 TCTTA 1 0 74363 CASAVA_Build 13 73347298 1I ACAGATTTAC -/T TTTGTAATAT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 3 4 74364 CASAVA_Build 13 73359798 1I66M1I ATAGCAATGC -AAAAAAAGCCTAATATAAAAGGTATCTTCATTTTTAAAAAGGTTCATTTTGTTCACATGGTTTTAC-/AAAAAAAAGCCTAATATAAAAGGTATCTTCATTTTTAAAAAGGTTCATTTTGTTCACATGGTTTTACA AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 30 24 2 N/A 0 0 74365 CASAVA_Build 13 73373437 3I CACCCACATT ---/CAA CAACCTTTTT 3070 het 3070 ref 49 27 14 8 CAA 1 2 74366 CASAVA_Build 13 73376740 4D GGAAAATCTG TCAT/---- TCATTTAAGT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 TCAT 2 1 74367 CASAVA_Build 13 73385060 12D51M1I CCCTCTCTCT CTCTCTCATATCCTTCCCCTACTTCTCCATGTTATTATCTTTCATAACTTATCTCATGCGTTA-/------------CTTCCCCTACTTCTCCATGTTATTATCTTTCATAACTTATCTCATGCGTTAC CCTTCTCCAA 3070 het 3070 ref 44 45 22 16 N/A 0 0 74368 CASAVA_Build 13 73386247 1I CACCTTTGCC -/T TTCCATCCTA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 2 3 74369 CASAVA_Build 13 73386664 1D TAAAGTTACA G/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 G 1 0 74370 CASAVA_Build 13 73416905 1I ATAACATTTC -/A AAACACCATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 3 4 74371 CASAVA_Build 13 73417787 1I AGGAATCAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 903 hom 38 2 34 2 A 9 10 74372 CASAVA_Build 13 73429355 1D CACCTGATAT A/- AAAATCATAC 3070 hom 82 het 31 0 28 3 A 5 4 74373 CASAVA_Build 13 73441168 2D CCCATACTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 27 0 17 11 A 16 14 74374 CASAVA_Build 13 73445780 8I ACCAACACAA --------/TATCACAG GACATAGAAC 3070 hom 162 het 59 0 54 5 TATCACAG 0 1 74375 CASAVA_Build 13 73454202 5I AAATACTTAA -----/TAACT TAAATTATCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAACT 0 1 74376 CASAVA_Build 13 73457168 2D CTGGTGTTAT CC/-- CCCCACCCAC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 6 4 74377 CASAVA_Build 13 73462119 1D AAGGGTTCAC G/- TAATACAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 1 0 74378 CASAVA_Build 13 73466612 1D CGCCCCCCCC A/- CCACCACACT 3070 hom 32 het 16 0 11 5 A 1 0 74379 CASAVA_Build 13 73479376 17D TTTACCCACT GAAATCAGAAAAAGACA/----------------- GAAATCAGAA 3070 hom 36 het 14 0 12 3 GAAATCAGAAAAAGACA 2 1 74380 CASAVA_Build 13 73479576 1D CGCCCGGTAA T/- TTTTTTTTTT 1964 het 100 hom 13 3 7 3 T 11 10 74381 CASAVA_Build 13 73484152 6D TCCTGGCCTT TAACTG/------ TATTTTATAT 3070 het 3070 ref 45 24 20 2 TAACTG 1 0 74382 CASAVA_Build 13 73500978 1I GAATTTTCAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 7 8 74383 CASAVA_Build 13 73503947 1I TGAAAAAAAA -/G TGTGCTTCTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 0 1 74384 CASAVA_Build 13 73519739 2D CATCTCAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 23 0 20 4 A 15 13 74385 CASAVA_Build 13 73520294 1I ACTGGGGGAC -/T TTTACAGGTG 3070 het 3070 hom 57 17 31 10 T 3 4 74386 CASAVA_Build 13 73525544 1D CAACAAGGAT G/- ATCATGTGTC 3070 hom 151 het 57 0 51 6 G 1 0 74387 CASAVA_Build 13 73534647 4D ATAGTCAGAC AATT/---- AAAATGCACT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AATT 1 0 74388 CASAVA_Build 13 73536203 2D AAGGGGTGCA AT/-- ATCCCTGTCC 3070 hom 99 het 34 0 34 1 AT 2 1 74389 CASAVA_Build 13 73536545 5I TCACTCAATA -----/TTTAG TTAAGTATTA 3070 hom 153 het 55 0 51 4 TTTAG 0 1 74390 CASAVA_Build 13 73537600 1D CTATAAGAGT C/- CCCCAAAGAA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 C 5 4 74391 CASAVA_Build 13 73539359 1I AATGAAGTGA -/G GATTTTCTGC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 G 1 2 74392 CASAVA_Build 13 73544803 1I CTGCAAGCTG -/T TGATGGCTCC 3070 het 3070 ref 56 30 18 8 T 1 2 74393 CASAVA_Build 13 73551349 3I AAAATAGAAC ---/GGT GGGTACCAGG 3070 het 3070 ref 54 26 23 5 GGT 0 1 74394 CASAVA_Build 13 73552424 1I AAAAAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 2312 het 2312 ref 38 20 9 9 T 10 11 74395 CASAVA_Build 13 73556962 1D CAAAGGAGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 A 10 9 74396 CASAVA_Build 13 73558207 1I TTTAAACTTT -/A AAAATCAATT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 4 5 74397 CASAVA_Build 13 73563832 1D GCACAGGGGA T/- TTTAAGGCAG 3070 het 3070 ref 44 28 11 5 T 4 3 74398 CASAVA_Build 13 73566117 1D AAAAAAAAAA T/- ACAATAGCTA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 1 0 74399 CASAVA_Build 13 73567540 1D TTTTTTTTCC T/- TTTGGAGACA 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 T 4 3 74400 CASAVA_Build 13 73571975 1D CTTTTTATTT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 40 het 31 1 27 3 A 9 8 74401 CASAVA_Build 13 73579249 1I GAAGGGATGT -/G GGGGGGCTAG 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 G 6 7 74402 CASAVA_Build 13 73602784 1D ACCTCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2880 hom 31 13 13 7 A 15 14 74403 CASAVA_Build 13 73613087 7D CCAGCTACTC GGGGGGT/------- GGGGGGTGCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 GGGGGGT 2 1 74404 CASAVA_Build 13 73625268 3I GACAAAATGC ---/TTT TTTTTTTCTC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 10 74405 CASAVA_Build 13 73626372 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 4 A 10 11 74406 CASAVA_Build 13 73627503 5D TTGTTTTTGT TTTTG/----- TTTTTTTTCT 902 het 902 ref 33 11 6 16 TTTTG 1 0 74407 CASAVA_Build 13 73636042 3D ATTAAAAAAA AAG/--- AAATAGTGAC 3069 het 3069 ref 21 10 8 6 AAG 1 0 74408 CASAVA_Build 13 73642125 1I AATATTGCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 9 10 74409 CASAVA_Build 13 73682881 1D AGACATGGTA C/- CTGGTGAGCC 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 C 2 1 74410 CASAVA_Build 13 73740305 1I TAAGGAGAGA -/C TTCTCTATAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 74411 CASAVA_Build 13 73752964 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2830 het 364 hom 36 5 14 17 T 16 15 74412 CASAVA_Build 13 73760218 1I GGGGGGAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 9 10 74413 CASAVA_Build 13 73764596 1I TTTTCTTTTT -/C TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 48 22 19 7 C 0 1 74414 CASAVA_Build 13 73779493 4D CTAGTCATCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 31 1 28 3 T 15 11 74415 CASAVA_Build 13 73785111 1D GACACTTCTC A/- AAAAAAGCCA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 7 6 74416 CASAVA_Build 13 73790640 1I ACTCAGGATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 9 10 74417 CASAVA_Build 13 73806340 1I TCCCGACCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 25 1 16 8 T 11 12 74418 CASAVA_Build 13 73806905 1I TGCTATGTCT -/A GGGGGAAGAG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 0 1 74419 CASAVA_Build 13 73810488 1I GGACAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 49 0 40 9 A 10 11 74420 CASAVA_Build 13 73812897 1I AGGATTTTTG -/T TTCTAATTCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 3 74421 CASAVA_Build 13 73816541 2I TGAATTTATG --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 9 11 74422 CASAVA_Build 13 73819720 1D TTCCCCCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 32 1 26 6 A 12 11 74423 CASAVA_Build 13 73826648 1I CAGCCTGGCC -/A AGATGGTGAA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 1 2 74424 CASAVA_Build 13 73828896 48D TGCAAAGTTT GTGAAAATTTTCTCCCATTCTGTATGTTGTCTGTTTACTCTGTTGATA/------------------------------------------------ GTTTCTTTTG 3070 hom 42 het 14 0 15 2 GTGAAAATTTTCTCCCATTCTGTATGTTGTCTGTTTACTCTGTTGATA 1 0 74425 CASAVA_Build 13 73837141 3D TTTTTCTCTC ATT/--- AATCTGTCTT 3070 hom 69 het 30 0 24 8 ATT 1 0 74426 CASAVA_Build 13 73852919 2D GTCCTAAAAC TT/-- TTGTCATCCA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 4 2 74427 CASAVA_Build 13 73858934 1D TCCATTGTTT G/- TTGACTTTCT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 1 0 74428 CASAVA_Build 13 73859448 1D ATACCTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 31 1 22 8 T 11 10 74429 CASAVA_Build 13 73869700 9D TAATAATCAA TTCCCTTGT/--------- TTCCTATCCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTCCCTTGT 1 0 74430 CASAVA_Build 13 73869928 1I TTTCTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 12 13 74431 CASAVA_Build 13 73872114 1D CATTAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 194 hom 30 1 19 10 T 12 11 74432 CASAVA_Build 13 73875984 1I AAACTTCAGG -/A AAACCTTTAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 3 4 74433 CASAVA_Build 13 73878066 3I TTAAAAAGTA ---/TTC TTCGTCTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TTC 1 2 74434 CASAVA_Build 13 73888284 1I GTACTTTCTA -/T TTTATACATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 3 4 74435 CASAVA_Build 13 73894638 1I ACTCCTGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 24 0 16 8 A 15 16 74436 CASAVA_Build 13 73895645 1D AAAGTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 30 0 17 13 T 12 11 74437 CASAVA_Build 13 73897751 2I ATTAAAAATA --/AC AGAGCAATGA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AC 0 1 74438 CASAVA_Build 13 73906151 1I TAATACATTT -/A TTTTTTTACT 3070 het 151 hom 35 1 33 1 A 0 1 74439 CASAVA_Build 13 73909116 2D GCAACAAAAA AT/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 39 0 30 10 AT 1 0 74440 CASAVA_Build 13 73909683 1I GAAAAGACAA -/T TTTTTTATAC 3070 hom 117 het 49 0 39 10 T 6 7 74441 CASAVA_Build 13 73913360 1D TATATATTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 9 74442 CASAVA_Build 13 73926906 1D GAGCAGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 17 7 A 11 10 74443 CASAVA_Build 13 73930007 1I TCATGTTCAT -/A AGCAGCATTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 2 74444 CASAVA_Build 13 73930395 2I TGCACAACTC --/TG TGAGTGTGCT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TG 1 2 74445 CASAVA_Build 13 73931390 3I CTCAAAACAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAC 3 4 74446 CASAVA_Build 13 73933819 4D CCATCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AAAT 6 5 74447 CASAVA_Build 13 73935641 1D ATGTGTTTGC T/- TTTTTCTTGT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 6 5 74448 CASAVA_Build 13 73937172 1I AATCAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1126 hom 35 3 25 7 T 14 15 74449 CASAVA_Build 13 73953600 3D TACCCACTAT TAG/--- TAGTTAATTC 3070 hom 126 het 46 0 43 5 TAG 2 1 74450 CASAVA_Build 13 73991330 3I TGATTTAGAT ---/GAA GAGTTTTTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 GAA 0 1 74451 CASAVA_Build 13 73991842 3D GCCACATGGA TGT/--- TGTTAGGTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 TGT 2 1 74452 CASAVA_Build 13 73998001 1D CTTCAGTGCA T/- TTTTTCCTTG 3070 hom 56 het 22 0 19 3 T 6 5 74453 CASAVA_Build 13 74003655 1D AAAATTAATT A/- ATTTTTTTTT 1207 het 517 hom 19 5 7 7 A 2 1 74454 CASAVA_Build 13 74004949 2I GTATGTGAAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 GT 5 6 74455 CASAVA_Build 13 74008567 1D AGCGTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 11 10 74456 CASAVA_Build 13 74024125 3D GGCCACACTG GAA/--- GAAGAATTGT 3070 het 3070 hom 29 10 16 5 GAA 3 2 74457 CASAVA_Build 13 74025787 1I AACACTTTTG -/A AACATCAGAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 2 3 74458 CASAVA_Build 13 74028770 1D CACATCTGTT G/- GGGAGGTCAA 3070 het 3070 ref 41 23 14 5 G 4 3 74459 CASAVA_Build 13 74071736 2D CCTCATCTCC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 17 het 22 0 13 9 T 11 9 74460 CASAVA_Build 13 74080128 1I TCACCTGGGT -/A AGTCACTGAC 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 A 1 2 74461 CASAVA_Build 13 74088888 1D TCTAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 11 10 74462 CASAVA_Build 13 74089418 1I GAGAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 2734 het 2734 ref 20 9 8 3 A 12 13 74463 CASAVA_Build 13 74091051 1I TTTATATTAG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 6 7 74464 CASAVA_Build 13 74096093 3D AGGCAACAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 25 10 A 13 10 74465 CASAVA_Build 13 74098147 1D TTCTGTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 333 hom 26 2 21 3 T 11 10 74466 CASAVA_Build 13 74099177 4D CCGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AAAC 5 4 74467 CASAVA_Build 13 74109206 1I TGAAAAAACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 A 9 10 74468 CASAVA_Build 13 74110918 1I CCAAAAATAG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 T 7 8 74469 CASAVA_Build 13 74111009 5D TATGAATATA TTAAT/----- TTATTTCATT 3070 het 3070 hom 33 9 21 4 TTAAT 1 0 74470 CASAVA_Build 13 74112103 2I ATACCTACAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 TA 5 6 74471 CASAVA_Build 13 74115794 1D AAAGGCAAAA G/- GGTGACATTA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 G 3 2 74472 CASAVA_Build 13 74120740 2I CTGTAAAACC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 79 hom 44 1 38 5 GT 6 7 74473 CASAVA_Build 13 74123714 1I TTATGCTAAT -/A AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 48 19 26 3 A 6 7 74474 CASAVA_Build 13 74126784 3D TAAACCATTT AGC/--- AGCTATAAGA 3070 het 3070 hom 50 21 28 5 AGC 2 1 74475 CASAVA_Build 13 74129633 4I ATGTTCTCTT ----/CTTA CTTACTTCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CTTA 1 2 74476 CASAVA_Build 13 74132074 7I ATGTGTCACA -------/ATCAGTT CACAAATAAC 1533 het 1533 ref 21 13 4 4 ATCAGTT 0 1 74477 CASAVA_Build 13 74132212 16D TTTGGGAGGC TGAGGCAGGCAGATCA/---------------- CGAGGTCAGG 2409 het 427 hom 8 2 6 3 TGAGGCAGGCAGATCA 1 0 74478 CASAVA_Build 13 74134807 1I AAACTCATCC -/T TTTTTTTATG 3012 het 3012 ref 28 11 10 7 T 7 8 74479 CASAVA_Build 13 74155625 2D AACTTAATTA GG/-- ATGTGTTCAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 G 2 0 74480 CASAVA_Build 13 74158140 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 14 10 A 12 11 74481 CASAVA_Build 13 74161619 1D ATATTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 A 13 12 74482 CASAVA_Build 13 74162092 1D TATATATATA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 8 7 74483 CASAVA_Build 13 74177783 16D ATATTAAACC AATATTATAAATATTA/---------------- AATATTATAA 1734 het 1495 hom 7 3 4 1 AATATTATAAATATTA 1 0 74484 CASAVA_Build 13 74179087 1D CCAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 A 12 11 74485 CASAVA_Build 13 74192037 2I TAAAATTTTC --/AA AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 4 6 74486 CASAVA_Build 13 74194283 1I AAAACAAGGC -/T TTTTTTTTTT 1602 het 1602 ref 46 36 5 5 T 11 12 74487 CASAVA_Build 13 74199519 4D AAAGAAAGAA AAAG/---- AAAGAGAAAG 3036 het 1562 hom 22 8 10 4 AAAG 2 1 74488 CASAVA_Build 13 74201071 1I TTTGCCCTCA -/G GAGTGACTTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 1 2 74489 CASAVA_Build 13 74202757 1I AGTTCTGGGA -/T TTTTTAATTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 5 6 74490 CASAVA_Build 13 74211444 1D TCTATTGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 19 11 T 11 10 74491 CASAVA_Build 13 74222480 1D GGCCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 29 1 22 6 A 12 11 74492 CASAVA_Build 13 74236386 1D TTCTGGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 316 hom 32 2 26 5 A 13 12 74493 CASAVA_Build 13 74239194 2I GAGACCAGCC --/TG TGGGCACCAC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 TG 1 2 74494 CASAVA_Build 13 74242747 1D TATCAACATG T/- TAAGTTCCAG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 2 1 74495 CASAVA_Build 13 74249891 1D TTTTATTTTT A/- TTTTTAATCT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 1 0 74496 CASAVA_Build 13 74251015 1D CTTAGAAAAT A/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 A 1 0 74497 CASAVA_Build 13 74252858 2D CAGAAGGCAC AA/-- TAGCTTAACA 3070 het 3070 ref 59 26 26 7 A 2 0 74498 CASAVA_Build 13 74255733 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1836 hom 24 7 9 8 A 10 11 74499 CASAVA_Build 13 74259623 3D TCGGTAGATA TTC/--- TTTTAACTGT 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 TTC 1 0 74500 CASAVA_Build 13 74260150 1I TATCTGATGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 8 9 74501 CASAVA_Build 13 74267496 1D CATTGTTGCT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 27 0 23 6 A 9 8 74502 CASAVA_Build 13 74276095 1I GTGGAAGAGA -/T TAACTAGTGA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 T 1 2 74503 CASAVA_Build 13 74284572 1D AGCTTCCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 976 hom 34 4 25 6 A 13 12 74504 CASAVA_Build 13 74285254 1I ATTATCCTTG -/T TTGCAGATGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 2 3 74505 CASAVA_Build 13 74300135 2I ATGGTGTATA --/AG TACTCAAGTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 0 1 74506 CASAVA_Build 13 74307681 2I CACATGATGC --/AG AGTGAGTGTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AG 1 2 74507 CASAVA_Build 13 74308902 1I GCAACTAAAC -/A AAAAAAACTC 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 7 8 74508 CASAVA_Build 13 74314118 1I TATCATGAAG -/C GAAAAAACAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 0 1 74509 CASAVA_Build 13 74314312 1D TTACCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 38 1 31 6 T 19 18 74510 CASAVA_Build 13 74328532 1I GTAAAGAAGG -/A AAAAGAGTGA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 4 5 74511 CASAVA_Build 13 74340517 1I CTGCTTTCAT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 27 7 15 5 A 7 8 74512 CASAVA_Build 13 74343836 1I ACAACATAAA -/T TTCTCCACTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 3 74513 CASAVA_Build 13 74356722 1D TTATTTATAT A/- AGTATGGTCT 3070 hom 123 het 44 0 41 4 A 2 1 74514 CASAVA_Build 13 74361581 1D ATGTAAGCAC T/- GATTAGTCTT 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 T 1 0 74515 CASAVA_Build 13 74368531 13I ATAGGTGTCT -------------/TTAAAATATTCTA TTAAAGGAAC 3070 hom 117 het 46 0 40 7 TTAAAATATTCTA 0 1 74516 CASAVA_Build 13 74370639 1I TCAATGGAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 24 0 16 8 T 9 10 74517 CASAVA_Build 13 74371438 2D GGAGAAGTAA AT/-- ATTTCTTACT 3070 hom 102 het 36 0 35 4 AT 2 1 74518 CASAVA_Build 13 74371899 2I AAACTAAAAA --/AC ACACAATCCC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AC 2 3 74519 CASAVA_Build 13 74372385 1D CCACAGAAAA C/- AAAATTCTGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 1 0 74520 CASAVA_Build 13 74372930 1I CTTTACAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 33 4 26 3 A 10 11 74521 CASAVA_Build 13 74390014 1D ACCTTGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 11 10 74522 CASAVA_Build 13 74391894 1D TTGTTGTTTT C/- TTTTTTTTCA 2539 hom 21 het 9 0 8 1 C 1 0 74523 CASAVA_Build 13 74397242 1I GGGGGAAAAG -/A AAAGCACATT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 3 4 74524 CASAVA_Build 13 74401222 5D GTCATAAAAG ATATA/----- GGCATAAATT 3070 hom 99 het 36 0 34 5 ATATA 1 0 74525 CASAVA_Build 13 74416027 1I TCCAGAAAGG -/A ACAAAGATAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 2 74526 CASAVA_Build 13 74429206 2D AGCTGCACAC AG/-- AGAGAAGACC 3070 hom 105 het 39 0 34 6 AG 3 2 74527 CASAVA_Build 13 74437452 1D AAAAACCATC A/- TTCTCAGCAA 3070 hom 84 het 30 0 27 4 A 1 0 74528 CASAVA_Build 13 74440222 1D GGCTTCTGCT C/- CCCCTCAGCC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 C 5 4 74529 CASAVA_Build 13 74448812 2D ATCTATTTAT TA/-- TATGTGTGTG 3070 hom 129 het 48 0 44 5 TA 2 1 74530 CASAVA_Build 13 74454180 1I AAGTATTTGC -/A CGTAAGTGCT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 74531 CASAVA_Build 13 74455990 1D TTTGGTAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 37 hom 33 1 28 4 T 10 9 74532 CASAVA_Build 13 74483247 1I TGTGGAGCAA -/C CCCCCCCAAC 3070 hom 44 het 17 0 15 2 C 7 8 74533 CASAVA_Build 13 74484736 3D CTCTCACCCT GAG/--- GAGGACATCA 3070 het 3070 hom 54 22 25 8 GAG 2 1 74534 CASAVA_Build 13 74488135 2I TAATGGGAAC --/AT TATCTTCATG 3070 het 3070 ref 50 26 22 2 AT 0 1 74535 CASAVA_Build 13 74495231 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1352 hom 27 8 11 9 A 12 11 74536 CASAVA_Build 13 74500174 1D GGTCTCTTTG C/- AACTATGAAG 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 C 1 0 74537 CASAVA_Build 13 74507064 1D GCCTGGCCAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 2737 hom 18 7 10 1 T 7 6 74538 CASAVA_Build 13 74515057 1I ATTTTGATAA -/T TTCACTACTT 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 T 2 3 74539 CASAVA_Build 13 74520495 1D AACTTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 A 11 10 74540 CASAVA_Build 13 74523201 78D AATAACCAAC ATGTACATTAGCACTAGCCATCCATTTCTGGGCCACACAGATGCACACTGCCACTTCAATGTTTCACTGAAAGTAGGG/------------------------------------------------------------------------------ CCAAAGAAGA 3070 het 3070 ref 29 34 10 2 ATGTACATTAGCACTAGCCATCCATTTCTGGGCCACACAGATGCACACTGCCACTTCAATGTTTCACTGAAAGTAGGG 1 0 74541 CASAVA_Build 13 74525588 2D TAATTTTTCT TG/-- TGTCATGCCA 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 TG 2 1 74542 CASAVA_Build 13 74527395 2I CTGCCTTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 10 12 74543 CASAVA_Build 13 74527861 1I ATAAGGAGAG -/A AAAATGTGAT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 4 5 74544 CASAVA_Build 13 74538799 3I TACAGTTAAC ---/TAT TAATGTTTGA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 TAT 0 1 74545 CASAVA_Build 13 74560151 1D TTCAAATTCC T/- TTTTTTTTTT 1248 het 1248 ref 28 18 3 7 T 13 12 74546 CASAVA_Build 13 74567267 1I GACCATTTAG -/T GGGCACTGTA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 0 1 74547 CASAVA_Build 13 74569875 1I TATAACAGCA -/T TTTTGTTTAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 4 5 74548 CASAVA_Build 13 74582081 1I AAGAATAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 23 16 13 A 11 12 74549 CASAVA_Build 13 74583172 2I CATGGAAATG --/GT AACAACCTGC 1395 het 1395 ref 16 11 3 2 GT 0 1 74550 CASAVA_Build 13 74586425 1D TATCCCTTTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 35 20 8 8 T 9 8 74551 CASAVA_Build 13 74597550 1D GTTAAAAACT C/- CAAAGTAGCA 3070 het 1438 hom 18 5 10 3 C 2 1 74552 CASAVA_Build 13 74605325 1D CACAACAAAA C/- AAAACCCATT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 C 1 0 74553 CASAVA_Build 13 74609798 1D TTATTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 26 0 21 5 A 12 11 74554 CASAVA_Build 13 74627458 3D CCATCCCACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1631 hom 39 9 13 18 A 15 12 74555 CASAVA_Build 13 74631617 1I TAAAAGTTTT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 A 7 8 74556 CASAVA_Build 13 74642982 1I CATGAAAAAT -/A AAAGGGGTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 4 74557 CASAVA_Build 13 74646438 4I AACTTTTCAT ----/GAAG GAAGCAAGAA 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 GAAG 1 2 74558 CASAVA_Build 13 74651852 1D CTCTTTTAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 10 9 74559 CASAVA_Build 13 74663752 1I TGCTGAGGGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 7 8 74560 CASAVA_Build 13 74675248 3I TTTTTTTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 33 1 30 2 TTC 0 1 74561 CASAVA_Build 13 74688725 4I AAGTACAGAG ----/AGTA AGTAAAATGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AGTA 1 2 74562 CASAVA_Build 13 74689646 1D AAGACAGTAT G/- GGGGGGGCGT 3070 hom 84 het 29 0 29 1 G 8 7 74563 CASAVA_Build 13 74689882 1I CCTTTCACTA -/T TCTCTTTCCT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 1 2 74564 CASAVA_Build 13 74698254 1D AAATCACGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1791 hom 29 10 16 3 T 11 10 74565 CASAVA_Build 13 74701325 1I AGGAAGAGAG -/C CCTCACCAGA 3070 het 3070 ref 55 32 17 6 C 2 3 74566 CASAVA_Build 13 74708928 1D ACAGGTGCAT A/- TAAATTGTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 1 0 74567 CASAVA_Build 13 74709594 2D GTGTGAAGAG AA/-- GAGAAGAGTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 4 A 2 0 74568 CASAVA_Build 13 74709830 4I TCAAGAGCAC ----/GTCT GTCTGAGGAC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 GTCT 1 2 74569 CASAVA_Build 13 74721314 6D ACTAAGATAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 504 hom 24 6 11 11 AT 10 7 74570 CASAVA_Build 13 74723688 11D TTTGGATATC TTTTTTTTCTT/----------- TTTTTTTTCT 3070 het 1727 hom 36 9 15 13 TTTTTTTTCTT 2 1 74571 CASAVA_Build 13 74724947 2I ATAAAGAGAA --/AG TGCATGTGAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AG 0 1 74572 CASAVA_Build 13 74725233 1I CCTCCTGAGG -/A AAAAAAAAAA 2404 het 2026 hom 31 10 10 11 A 15 16 74573 CASAVA_Build 13 74726443 1I AAACACTTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 A 7 8 74574 CASAVA_Build 13 74730245 1D GTGTTTAAAC A/- GCAGTATTAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 1 0 74575 CASAVA_Build 13 74731021 1D AAAAATCCAG T/- TTTGTCAGCA 3070 het 3070 hom 47 14 28 5 T 4 3 74576 CASAVA_Build 13 74731856 1D TGGACCCTGA T/- TGATACACCA 3070 het 3070 hom 34 12 17 7 T 2 1 74577 CASAVA_Build 13 74734839 3D CCAGAAAGAT ATC/--- ATAGGAATCT 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 ATC 1 0 74578 CASAVA_Build 13 74736113 2D TTTGCCAATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 60 31 18 13 TG 7 6 74579 CASAVA_Build 13 74759176 1I TTTGGGGGGG -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 45 22 21 2 A 6 7 74580 CASAVA_Build 13 74759777 1I TTTTGAAAAT -/A AGAGTATGTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 1 2 74581 CASAVA_Build 13 74764862 1D CCAGGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 A 13 12 74582 CASAVA_Build 13 74768214 1D ACAAAAAATT G/- TTTGTTCAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 G 1 0 74583 CASAVA_Build 13 74770239 2D TCTGGGAAAC AG/-- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 AG 1 0 74584 CASAVA_Build 13 74770887 2I AAGATTCCAT --/CA CACACACACA 2592 het 2592 ref 26 10 7 9 CA 8 9 74585 CASAVA_Build 13 74772523 1D TTGGTATGGG C/- ATTTTTCTAG 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 C 1 0 74586 CASAVA_Build 13 74778386 2D CAAATCAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 12 10 74587 CASAVA_Build 13 74787559 8D ATATATACAC ACACATAT/-------- ATATATATAT 883 het 158 hom 7 2 4 1 ACACATAT 1 0 74588 CASAVA_Build 13 74793579 4I CATATATATG ----/TATA TATATATATA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TA 5 7 74589 CASAVA_Build 13 74797404 1D GTTAACTTTA T/- TTTTTGTATC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 6 5 74590 CASAVA_Build 13 74804726 5D CCAAATTACT GGACC/----- CCACCCCGAG 3070 hom 99 het 37 0 34 8 GGACC 1 0 74591 CASAVA_Build 13 74811443 1D TAACCCCCTC A/- ACCAAGCAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 2 1 74592 CASAVA_Build 13 74811725 1I CTCAATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 904 hom 39 4 27 8 T 12 13 74593 CASAVA_Build 13 74811879 1I CACCGGCTAA -/T TTGTTTTTGT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 2 3 74594 CASAVA_Build 13 74812276 1I ATTCATCAGG -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 8 74595 CASAVA_Build 13 74813252 1I AGTAGGAAAT -/A ATCTTCTCAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 2 74596 CASAVA_Build 13 74818376 8I CGTGCCATGG --------/TGGTTTGC TGCACCCATC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TGGTTTGC 0 1 74597 CASAVA_Build 13 74821538 1I CTGACTAAAT -/A AAAAATAATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 5 6 74598 CASAVA_Build 13 74832239 4I ATTATAAGAT ----/ACAA ACAAATATTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ACAA 1 2 74599 CASAVA_Build 13 74832654 38D GCCTGGATGA CAGAGCGAGACCCTGTCTCTTAATTTTTTTTTTTTAAT/-------------------------------------- CAGGGGTGTG 3070 het 3070 ref 36 25 11 5 CAGAGCGAGACCCTGTCTCTTAATTTTTTTTTTTTAAT 1 0 74600 CASAVA_Build 13 74838590 1I CAAGAGAGGG -/A AAAAATCACC 3070 het 3070 ref 56 26 19 11 A 5 6 74601 CASAVA_Build 13 74838820 1D CACTCTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 A 13 12 74602 CASAVA_Build 13 74839025 1D AAATCTGGAG A/- GTGAAAAAGC 3070 het 3070 hom 43 15 24 6 A 1 0 74603 CASAVA_Build 13 74839895 1D CAGGCAACAC G/- GGGATGATGT 3070 het 3070 ref 41 24 14 5 G 4 3 74604 CASAVA_Build 13 74848513 4D TCTGGTGACA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 29 0 18 11 T 20 16 74605 CASAVA_Build 13 74850817 1I TATCCAAGAT -/A AGGGCCTATT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 1 2 74606 CASAVA_Build 13 74852675 1D CTAGATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 7 20 6 T 13 12 74607 CASAVA_Build 13 74854237 1D CTTTCCACTT G/- GCGATTAGCT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 G 2 1 74608 CASAVA_Build 13 74856241 2D ATAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 2237 het 1064 hom 9 3 6 0 AT 1 0 74609 CASAVA_Build 13 74857029 1I TTTAAATTTT -/G ATTGCCTTAT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 G 0 1 74610 CASAVA_Build 13 74858524 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTCTTTTT 3046 hom 48 het 19 0 16 3 T 5 4 74611 CASAVA_Build 13 74866735 3D AATATAAACC TTA/--- TTATTAAATA 3070 het 3070 hom 39 14 21 6 TTA 3 2 74612 CASAVA_Build 13 74876197 2D GGATATATAT AC/-- ATACACACAC 1773 het 1773 ref 27 14 10 3 AC 1 0 74613 CASAVA_Build 13 74894014 5I GCAATCCCTT -----/ATTTC ATTTCATCAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATTTC 1 2 74614 CASAVA_Build 13 74899023 1D GAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2715 het 484 hom 16 2 9 5 A 15 14 74615 CASAVA_Build 13 74908995 2D ATCAAGTGAT AA/-- AAGTTAATAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 A 4 2 74616 CASAVA_Build 13 74916115 1D TATCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 45 0 34 12 A 12 11 74617 CASAVA_Build 13 74926163 2D TAAATCTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2187 het 2187 ref 25 10 6 11 T 14 12 74618 CASAVA_Build 13 74935318 1I AACACTATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 710 hom 52 2 43 7 A 9 10 74619 CASAVA_Build 13 74943874 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2965 het 63 hom 25 2 13 10 A 15 14 74620 CASAVA_Build 13 74946752 4I GCTTCTACCA ----/GTAC AGGTCTTGTG 3070 hom 35 het 14 0 12 2 GTAC 0 1 74621 CASAVA_Build 13 74962710 1I TCAGGCATTG -/T TTTCTTTTTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 3 4 74622 CASAVA_Build 13 74965326 3I GTGGGAAACC ---/ATT ACTGGCCCTA 3070 hom 114 het 48 0 38 10 ATT 0 1 74623 CASAVA_Build 13 74971294 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 15 1 11 3 A 12 13 74624 CASAVA_Build 13 74974636 1I GAAAGAACCA -/C CCCCCATGAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 5 6 74625 CASAVA_Build 13 74975593 1I GTCCCATTGT -/A GAAAGCTCAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 0 1 74626 CASAVA_Build 13 74978360 2D GGAAAAATCC TA/-- TGTTGTCTTC 3070 het 3070 ref 59 29 26 6 TA 1 0 74627 CASAVA_Build 13 74992245 4I AGGTTGTTTA ----/AAAG TGTGTGGCAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAAG 0 1 74628 CASAVA_Build 13 74993597 1D TGCACCCTGC A/- CCTGGAAAAG 3070 het 2742 hom 32 8 13 13 A 1 0 74629 CASAVA_Build 13 74994361 3D CCCAGAAGCC GAG/--- GAGAAGCTGC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 GAG 2 1 74630 CASAVA_Build 13 74997351 6I TTCAAAAGAC ------/AAACTT AAACATGCAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAACTT 0 1 74631 CASAVA_Build 13 75000191 1D CACTCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1908 hom 32 8 11 13 A 12 11 74632 CASAVA_Build 13 75000364 1D CCAATTGTGA T/- TTTTTTTTTC 1247 het 1247 ref 35 24 3 8 T 10 9 74633 CASAVA_Build 13 75003655 4I ACATCTTTTA ----/TAAG TAAGAAGATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TAAG 1 2 74634 CASAVA_Build 13 75007293 2D GGACCTGGAG AA/-- AAGAGCATTC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 4 2 74635 CASAVA_Build 13 75011363 6I ACCAAACAAT ------/TAAGAA TAACTTTTTT 3070 het 71 hom 26 1 13 12 TAAGAA 0 1 74636 CASAVA_Build 13 75012107 1D CAAGGAAATC T/- TTTTTTTTTT 1599 het 622 hom 24 4 4 16 T 19 18 74637 CASAVA_Build 13 75018729 1D GCTGCAAAAT G/- TAACTATATG 3070 het 3070 hom 44 19 19 8 G 1 0 74638 CASAVA_Build 13 75024170 3D ATACATGGAA TAG/--- TGACAGGAGA 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 TAG 1 0 74639 CASAVA_Build 13 75025782 1D TAATGTTTTC T/- GTTGTATAGT 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 T 1 0 74640 CASAVA_Build 13 75026887 1I TACTTGAAAC -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 T 6 7 74641 CASAVA_Build 13 75027755 3I ATTTTTTATT ---/ATA ATAATAATAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 ATA 3 4 74642 CASAVA_Build 13 75038816 1D CACTGTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 11 10 74643 CASAVA_Build 13 75050381 4D GTAAACCACA ATTT/---- ATTTTTCATT 3070 het 3070 ref 39 24 13 4 ATTT 2 1 74644 CASAVA_Build 13 75058596 5I ATCAATAAAA -----/CAAAT AGATACAGAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 CAAAT 0 1 74645 CASAVA_Build 13 75062075 3D AATTATGTAG TCC/--- TCCTCGCCAT 3070 het 3070 ref 46 20 14 14 TCC 2 1 74646 CASAVA_Build 13 75066368 4D TAATTTCAAA TTGT/---- TTGTTAAGCA 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 TTGT 2 1 74647 CASAVA_Build 13 75066728 1I TTTCATTCAG -/A TAAGTATGCA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 0 1 74648 CASAVA_Build 13 75067925 1D ATACCTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 32 1 20 11 T 13 12 74649 CASAVA_Build 13 75069509 4D GTCATCTCTT AAAA/---- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 A 10 6 74650 CASAVA_Build 13 75074246 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 1337 hom 12 3 8 1 A 8 9 74651 CASAVA_Build 13 75075820 3D AGGATATTTT AAG/--- AAGACATTTT 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 AAG 2 1 74652 CASAVA_Build 13 75081041 1I GATTCCTTAT -/A AAAAATATTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 5 6 74653 CASAVA_Build 13 75083478 1D GCATCTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 14 13 74654 CASAVA_Build 13 75090419 1D GAAGGAAGGA G/- TTTTTCAGAG 3070 het 3070 hom 30 12 14 6 G 1 0 74655 CASAVA_Build 13 75097554 30D GAAGATGCAA GTGTGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGT/------------------------------ GTGTGTGTGC 3070 het 1706 hom 32 7 13 18 GTGTGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1 0 74656 CASAVA_Build 13 75098572 1D GAGAAAAGCA G/- GGGAAAAACC 1840 het 1840 ref 18 10 5 3 G 4 3 74657 CASAVA_Build 13 75099736 2D ACATAAACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 19 8 11 AC 8 7 74658 CASAVA_Build 13 75100093 1D TCTACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2049 hom 23 6 11 6 A 12 11 74659 CASAVA_Build 13 75103698 3I TGGGTGAGGG ---/AGA AGGTGAACTG 3070 hom 97 het 39 0 31 8 AGA 0 1 74660 CASAVA_Build 13 75119834 1D GTTTAGAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 9 8 74661 CASAVA_Build 13 75126626 1D AGAGCCTCTA G/- GTTGCAGCCT 2374 het 2374 ref 24 13 6 6 G 2 1 74662 CASAVA_Build 13 75129682 1I ATAATATGAT -/C CCAGATCCCT 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 C 2 3 74663 CASAVA_Build 13 75131185 4I TTTCCTTCCA ----/CTCT CTCATTATTT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 CT 1 3 74664 CASAVA_Build 13 75131718 1D TCTCGTGAGA C/- TTATTCACTA 1743 het 1743 ref 23 14 5 4 C 1 0 74665 CASAVA_Build 13 75138503 1I GTAACTAGTC -/T TTTTTCTTGA 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 T 5 6 74666 CASAVA_Build 13 75144378 2D TAAAAAAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 1031 het 716 hom 19 4 3 12 T 18 16 74667 CASAVA_Build 13 75144941 2I TCTGATAAGT --/GA GGTTAATATG 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 GA 0 1 74668 CASAVA_Build 13 75145057 2D TGACTTGATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 123 het 49 0 41 9 TG 6 5 74669 CASAVA_Build 13 75146096 23D GACTCACTGG TAAATCAAACTAACTGAGGAATT/----------------------- TAAATCATAG 3070 het 3070 ref 34 20 17 4 TAAATCAAACTAACTGAGGAATT 1 0 74670 CASAVA_Build 13 75147221 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 T 11 12 74671 CASAVA_Build 13 75156553 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 48 het 17 0 15 2 T 8 7 74672 CASAVA_Build 13 75164533 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1601 het 1601 ref 27 11 6 10 T 13 14 74673 CASAVA_Build 13 75173268 33D AGGAATAGAT TGTAGTGACCTTTTTGCTTCTGGAAGGTTGACA/--------------------------------- TGTAGTGACC 3070 het 3070 ref 32 20 9 12 TGTAGTGACCTTTTTGCTTCTGGAAGGTTGACA 2 1 74674 CASAVA_Build 13 75185434 2D AGCAAAGATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 32 13 14 9 TG 6 5 74675 CASAVA_Build 13 75195357 1D TCATCATTGC T/- CTTTAATTTG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 1 0 74676 CASAVA_Build 13 75195499 5I GTGAATGACT -----/AATAA AATAAATCAC 3070 het 3070 hom 30 16 13 1 AATAA 1 2 74677 CASAVA_Build 13 75204497 9D CCCTTCTTGC TTCATTTCA/--------- TTCATTTCAT 2072 het 1714 hom 9 4 5 0 TTCATTTCA 2 1 74678 CASAVA_Build 13 75240770 2D TCACATTGTT TG/-- TGAGTTTATT 3070 het 3070 hom 50 14 28 8 TG 2 1 74679 CASAVA_Build 13 75244044 12I CTTCAGTAGC ------------/AGGATTGCCCAG AATCCTGCTA 3070 hom 114 het 41 0 39 4 AGGATTGCCCAG 0 1 74680 CASAVA_Build 13 75246811 5D TATCTGAATG TTTTA/----- AAATCATTTG 3070 het 3070 ref 45 21 19 7 TTTTA 1 0 74681 CASAVA_Build 13 75257160 1D ATTCTGTAGT G/- TGTTGTATAT 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 G 1 0 74682 CASAVA_Build 13 75263084 1D AAGATAGGTA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 9 8 74683 CASAVA_Build 13 75268757 1D TGTTCATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 T 13 12 74684 CASAVA_Build 13 75271586 1I ATGTATTTCT -/C CCCCCAAATA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 C 5 6 74685 CASAVA_Build 13 75274097 4D TCTCTCTCTC CTCT/---- CTCTCTCTTT 2911 het 2911 ref 25 11 10 6 CT 6 4 74686 CASAVA_Build 13 75281539 2D AAATTTAAAC TT/-- CAGCTTCATC 3070 het 3070 ref 26 12 9 6 T 2 0 74687 CASAVA_Build 13 75284296 1D AGATACTGCT A/- AATGTCCTAC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 3 2 74688 CASAVA_Build 13 75294125 4I CATATGGTTT ----/ATAA AGCCTAGAGA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 ATAA 0 1 74689 CASAVA_Build 13 75301838 1D ATTGGCCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 8 T 11 10 74690 CASAVA_Build 13 75317423 1D AAGGAGGTTA T/- TTAATGAGAC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 3 2 74691 CASAVA_Build 13 75320757 2D GGATACCCAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 95 het 40 0 28 12 TA 7 6 74692 CASAVA_Build 13 75321638 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2691 het 1499 hom 25 6 12 7 T 10 11 74693 CASAVA_Build 13 75330175 1I TCTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 9 10 74694 CASAVA_Build 13 75360242 1I TTAACTTTGG -/T TTTCAGATAT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 3 4 74695 CASAVA_Build 13 75375023 4I3M3D GAGACCCAAA ----AAGCAC/TGTCAAG--- ACTCCCTGGG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 N/A 0 0 74696 CASAVA_Build 13 75379882 1I CAATTGCAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 9 10 74697 CASAVA_Build 13 75381261 1D TGCATTGAAG A/- AAAAAGCCTG 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 A 6 5 74698 CASAVA_Build 13 75385362 3D AGGGGAAGAG AGA/--- AGAAGAAAGG 3070 het 3070 ref 32 19 12 2 AGA 3 2 74699 CASAVA_Build 13 75391919 2D ATGATAGGAA AC/-- ACACGAAATC 3070 het 3070 ref 42 25 15 3 AC 3 2 74700 CASAVA_Build 13 75395996 1I GGAGAATGAA -/G GGGGGAGACA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 5 6 74701 CASAVA_Build 13 75408569 1D AATGCATATG A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 42 15 24 5 A 7 6 74702 CASAVA_Build 13 75410264 2I ACACACACAC --/AT ATATGTGTGT 1756 het 1756 ref 21 15 6 0 AT 2 3 74703 CASAVA_Build 13 75411826 5I GTTGAAAGAA -----/TCCTT TCCCCATAGG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 TCCTT 0 1 74704 CASAVA_Build 13 75418606 2I TGACTGTCAG --/AC AAAATGTAGC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AC 0 1 74705 CASAVA_Build 13 75443478 3D AAGAAACAAT ATA/--- ATTACTTGAT 3070 het 3070 ref 44 24 18 5 ATA 1 0 74706 CASAVA_Build 13 75443693 1D TTTTTACTTC A/- TTTGTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 1 0 74707 CASAVA_Build 13 75444310 2D TGTTTGTGAC TG/-- TAGTAAATTT 3070 het 3070 ref 45 27 17 1 TG 1 0 74708 CASAVA_Build 13 75446797 1I TTCCTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1262 hom 52 3 40 9 T 10 11 74709 CASAVA_Build 13 75458511 10I CCTTTTCCAT ----------/TGCCTGAGTG GCTCTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 TGCCTGAGTG 0 1 74710 CASAVA_Build 13 75460191 1D TTGAATCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 49 5 24 20 A 18 17 74711 CASAVA_Build 13 75461857 2D TAATTAAACT AA/-- AGAGTTTCTG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 3 1 74712 CASAVA_Build 13 75462178 6I ATTAAAAAGT ------/AAAAAC AAAAACAAAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 AAAAAC 2 3 74713 CASAVA_Build 13 75462262 4D ATATAAATTA TTAG/---- TTCAGTCATT 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 TTAG 1 0 74714 CASAVA_Build 13 75463474 1I TTTAAATATA -/T TTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 T 6 7 74715 CASAVA_Build 13 75468472 2D CTTTTTTATT AA/-- AGAGTTATTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 3 1 74716 CASAVA_Build 13 75481414 8D AATTGAATTC TTGATGTG/-------- TTGATGTGTT 3070 het 3070 ref 43 23 21 3 TTGATGTG 2 1 74717 CASAVA_Build 13 75483179 6D TACAGTACTA ACAAAT/------ ACAAATACAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 5 ACAAAT 3 2 74718 CASAVA_Build 13 75483511 1I GCTCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2971 het 2971 ref 31 11 10 10 T 14 15 74719 CASAVA_Build 13 75497319 1I CACGTGAGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 74720 CASAVA_Build 13 75513932 1D TCCTCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2677 hom 31 10 18 3 T 12 11 74721 CASAVA_Build 13 75517337 7D TCTAATGTGT TTTATGA/------- TGTGGGTAGA 3070 het 3070 ref 26 14 11 3 TTTATGA 1 0 74722 CASAVA_Build 13 75519323 5I TCTCTTTTAT -----/TTTAG TTTAGTTTGG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 TTTAG 1 2 74723 CASAVA_Build 13 75524918 1D TTATGATTTG A/- AAAAAACCAC 3070 hom 36 het 20 0 13 8 A 7 6 74724 CASAVA_Build 13 75530436 1I AACGCTATAG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 49 20 26 3 A 6 7 74725 CASAVA_Build 13 75531692 2D TTTTGACTTA AT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 34 2 28 4 AT 1 0 74726 CASAVA_Build 13 75533313 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2894 het 627 hom 28 2 8 19 A 17 16 74727 CASAVA_Build 13 75536527 5I TTTTTATGAC -----/TTGTT TTGTAGCCTA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TTGTT 0 1 74728 CASAVA_Build 13 75538413 4D TAATACCTCA GTTT/---- GTTCATCTGT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 GTTT 1 0 74729 CASAVA_Build 13 75539866 2D CTTGAGAGAG AT/-- GATTTAGGGT 2926 het 2926 ref 18 12 6 0 AT 1 0 74730 CASAVA_Build 13 75543303 2D TAAATTAAAA AG/-- TAAGAGTTGA 3070 het 3070 hom 33 15 17 3 AG 1 0 74731 CASAVA_Build 13 75543604 1I TTTTGAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 8 9 74732 CASAVA_Build 13 75544447 1I AAGGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 27 0 15 12 A 13 14 74733 CASAVA_Build 13 75544755 1D GAGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 53 30 15 8 A 10 9 74734 CASAVA_Build 13 75545599 1D GAATTCATGG A/- AAACCAGCTG 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 4 3 74735 CASAVA_Build 13 75545899 3I AAACAATAAA ---/AAG AAGGTCATTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAG 1 2 74736 CASAVA_Build 13 75547315 1I ATTTCCCAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 8 9 74737 CASAVA_Build 13 75547653 2I TAACAAAAAC --/TG TATGAATATC 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 TG 0 1 74738 CASAVA_Build 13 75548939 1I GAGTTTTTTT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 7 8 74739 CASAVA_Build 13 75549171 1I ACCTTCAGAA -/T TGGAAGAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 1 2 74740 CASAVA_Build 13 75549418 1D GGCTATTACC A/- AAAAGTATAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 5 4 74741 CASAVA_Build 13 75556476 2I GTGAATTAAC --/AT ATTTATCTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 AT 1 2 74742 CASAVA_Build 13 75560834 1I AGTATGAGGG -/T TGAGCCCAGA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 1 2 74743 CASAVA_Build 13 75562645 3I CATTTTATCA ---/AAT AATGTGGTTT 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 AAT 1 2 74744 CASAVA_Build 13 75565042 3D55M1D CCAATGGTTA TTTTTGATTTTATGTCTCCTACTCATAGCTGTGTCACTGTTAGTTGGAATCAGCACATA/---TTGATTTTATGTCTCCTACTCATAGCTGTGTCACTGTTAGTTGGAATCAGTACAT- AATTTAGTGT 3070 het 3070 ref 39 31 15 18 N/A 0 0 74745 CASAVA_Build 13 75568779 1I AACAATCCCA -/T TTTAAAAAAC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 3 4 74746 CASAVA_Build 13 75573051 1I TTGCTTAGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 8 9 74747 CASAVA_Build 13 75574679 1I AAAACCAAAC -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 A 6 7 74748 CASAVA_Build 13 75575948 4I ATTTGATAAA ----/TAAT TTTTATTTCA 3070 het 3070 hom 30 11 19 0 TAAT 0 1 74749 CASAVA_Build 13 75578451 1D TACATTGTGG A/- ACAGCTAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 2 1 74750 CASAVA_Build 13 75580057 3I AATATGGGTT ---/ATG ATATCTAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATG 0 1 74751 CASAVA_Build 13 75580899 1I CAGAGAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 9 10 74752 CASAVA_Build 13 75586516 1I ATGGCAGCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 9 10 74753 CASAVA_Build 13 75588346 1D CATCCAAATT A/- AAAAAGGAGT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 6 5 74754 CASAVA_Build 13 75591095 1I GGAAAGAAGG -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 A 7 8 74755 CASAVA_Build 13 75592265 2D TGATATTAAC CA/-- CTTAAATGTA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 CA 1 0 74756 CASAVA_Build 13 75594782 5I AAACCTGGTT -----/AAATC AAAGAGCTTC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 AAATC 0 1 74757 CASAVA_Build 13 75595104 1I TTGTTCAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 11 12 74758 CASAVA_Build 13 75595296 1I TCATTCCATC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 20 19 10 A 9 10 74759 CASAVA_Build 13 75615979 33D AGCTGTATAT ACATATATACACATATGTATGTATCTATATCTA/--------------------------------- ACATATATAC 3070 het 3070 ref 36 13 11 18 ACATATATACACATATGTATGTATCTATATCTA 2 1 74760 CASAVA_Build 13 75619440 1D GTATATATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 8 A 11 10 74761 CASAVA_Build 13 75620541 4I ACACCTCTGT ----/TCTC TCTCTACCTC 3070 hom 45 het 49 2 40 7 TC 2 4 74762 CASAVA_Build 13 75623536 3D ATATTGTATC AAA/--- AGAAACTCTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 A 4 1 74763 CASAVA_Build 13 75623681 1D ATTTTCAGTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 9 8 74764 CASAVA_Build 13 75629322 2D GTTGGTAGTT TA/-- TGTCTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 21 26 6 TA 1 0 74765 CASAVA_Build 13 75632053 1D AGAACTGAAG T/- GGAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 63 33 25 5 T 1 0 74766 CASAVA_Build 13 75640389 1D TGTTGAGGGC T/- TGTTTCCTGG 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 2 1 74767 CASAVA_Build 13 75649027 2I50M5D TCTCCTTTGG --ATATATACATATCCCCAAAATGGGGTTACTGGGCAACATGATAGTTCTATTTTTC/ATATATATATATATCCCCAAAATGGGGTTACTGGGCAACATGATAGTTCTAT----- TTTTTTTTTT 2880 het 2880 ref 21 18 7 20 N/A 0 0 74768 CASAVA_Build 13 75662023 1D GTCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 172 hom 24 2 14 8 A 15 14 74769 CASAVA_Build 13 75666381 11D TTTCTTTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTGAC 3070 hom 36 het 19 0 13 6 T 18 7 74770 CASAVA_Build 13 75678890 1D AAGGCAATTA C/- CCATGGTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 3 2 74771 CASAVA_Build 13 75707020 1D TCTTCTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 T 11 10 74772 CASAVA_Build 13 75717254 1D GGGTGTATCT G/- GGGGGGGGGT 1683 het 1683 ref 29 17 5 8 G 10 9 74773 CASAVA_Build 13 75722986 2D TTTTGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 14 12 74774 CASAVA_Build 13 75735059 1D TCTTTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 11 10 74775 CASAVA_Build 13 75738243 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 26 1 20 5 T 11 10 74776 CASAVA_Build 13 75752171 1D CAAATTAGTT C/- AGCTGCTGTG 3070 hom 66 het 27 0 23 5 C 1 0 74777 CASAVA_Build 13 75752279 1I AAATAAATCA -/T TTCTACCAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 3 74778 CASAVA_Build 13 75754000 1I AGAAGAGTTA -/T TTTCCCATCG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 3 4 74779 CASAVA_Build 13 75758869 8D GGAGTAAATG GATAGATA/-------- GATAGATAGA 3070 hom 81 het 35 0 27 12 GATA 5 3 74780 CASAVA_Build 13 75762165 1I ATATACTCTT -/G GGATATAGAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 2 3 74781 CASAVA_Build 13 75762323 1D CTCAAAGTAA C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 C 9 8 74782 CASAVA_Build 13 75762453 4I TTCCCAAGAT ----/TAAA TAAATATTTT 3070 het 3070 ref 26 13 13 0 TAAA 1 2 74783 CASAVA_Build 13 75764978 1D TTCTATGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 11 10 74784 CASAVA_Build 13 75766804 6D AGCTCCCTCT CCCTCC/------ CCCTCCCCCT 2455 het 640 hom 28 5 8 15 CCCTCC 3 2 74785 CASAVA_Build 13 75768864 1I TCCAAGTGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 8 9 74786 CASAVA_Build 13 75769294 4D TGAGAGAGGT TCTG/---- TCTAATAGTG 3070 het 3070 hom 53 19 26 12 TCTG 1 0 74787 CASAVA_Build 13 75774286 4I TCACAAGTTA ----/AATC AATCAATCTG 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 AATC 2 3 74788 CASAVA_Build 13 75776528 1I CAATACTGAC -/A AAAGACATGA 3070 het 3070 hom 56 16 34 6 A 3 4 74789 CASAVA_Build 13 75781194 1D ACTGAAACAC T/- TTTGGACAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 T 4 3 74790 CASAVA_Build 13 75782759 1D ACAGGTGCCC A/- ACCACCATGC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 2 1 74791 CASAVA_Build 13 75789971 1I AAAACATCCC -/A AAAATTTCAA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 4 5 74792 CASAVA_Build 13 75795009 4I AGTTTGATGG ----/CAAA CAAATGTTCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CAAA 1 2 74793 CASAVA_Build 13 75795466 1I ACTCTGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 10 11 74794 CASAVA_Build 13 75799550 1I TTTTTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 T 13 14 74795 CASAVA_Build 13 75802080 4D ACATGCACTA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 114 het 46 0 34 12 AC 10 8 74796 CASAVA_Build 13 75802558 2I GAAATAAAAC --/AG AGGGAAAAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AG 1 2 74797 CASAVA_Build 13 75803847 5I AATGAAAAGA -----/AAGGG AGAGACTGCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAGGG 0 1 74798 CASAVA_Build 13 75807964 1D AAACCAGGCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 9 8 74799 CASAVA_Build 13 75822472 1D CTCCCTATCT C/- CCATGTGTTC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 C 3 2 74800 CASAVA_Build 13 75829594 2I AAATATAAGA --/AT ACAACCTGTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AT 0 1 74801 CASAVA_Build 13 75847463 1D GTGACAGTGA T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 7 6 74802 CASAVA_Build 13 75881307 2I AAGTTTATCA --/TT TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 6 8 74803 CASAVA_Build 13 75888523 2D CTAATGTGAT AA/-- AAGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 52 28 22 3 A 4 2 74804 CASAVA_Build 13 75902156 1D TTAAGGATAG A/- AATAAATGCC 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 3 2 74805 CASAVA_Build 13 75904810 1D AGAAAAAGAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 11 20 3 A 9 8 74806 CASAVA_Build 13 75905220 1I GATGTGAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 49 28 14 7 A 9 10 74807 CASAVA_Build 13 75906103 1I TTCCAACATG -/T TTTTGATGTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 4 5 74808 CASAVA_Build 13 75909023 2I AAGCAGGAGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 48 15 22 11 GA 6 7 74809 CASAVA_Build 13 75910340 10I TTACAAAGTC ----------/TACAGTAGTG TACAGTAATA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 TACAGTAGTG 0 1 74810 CASAVA_Build 13 75911164 3I GTTCAAGGTC ---/AGG AGATCCATGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AGG 0 1 74811 CASAVA_Build 13 75913652 1I TCTACAAGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 56 27 26 3 T 8 9 74812 CASAVA_Build 13 75915573 1D TAAGCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1885 hom 41 7 16 19 A 17 16 74813 CASAVA_Build 13 75925701 1D ATTGATGAAA G/- ACTTAAACCT 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 G 1 0 74814 CASAVA_Build 13 75926755 4D TGGGTACAAA AGCC/---- AGTTAGATAG 3070 het 3070 ref 35 15 12 9 AGCC 1 0 74815 CASAVA_Build 13 75939000 1D TATTACTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 10 9 74816 CASAVA_Build 13 75950322 1D AATACTTGGA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 T 7 6 74817 CASAVA_Build 13 75962234 1D GTCTTATTTA T/- TTTTTTGCCG 3070 het 3070 hom 48 23 23 2 T 7 6 74818 CASAVA_Build 13 75964265 3I CCTTGAAAAC ---/ATT ATGCTAAGTG 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 ATT 0 1 74819 CASAVA_Build 13 75977081 1D AGAGTATGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 10 9 74820 CASAVA_Build 13 75980401 3D TAGTGAAATG AGC/--- AGATCACACA 3070 het 3070 hom 35 15 19 3 AGC 1 0 74821 CASAVA_Build 13 75981475 4D TCCTTCTGTC TGTT/---- CTCTCACATT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TGTT 1 0 74822 CASAVA_Build 13 75982398 5I CAATTAATGA -----/TTTTG TTTTACTTTT 3070 het 1000 hom 23 3 15 5 TTTTG 0 1 74823 CASAVA_Build 13 75991719 1I CAGAAAGCCT -/A AGGTCAACCT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 74824 CASAVA_Build 13 75992236 2D AAAAAAAGTT TA/-- TGATTGTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 TA 1 0 74825 CASAVA_Build 13 76011893 1I GGTAACATGC -/A AAAAATCAAA 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 5 6 74826 CASAVA_Build 13 76026208 1D ATGTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 43 0 33 10 A 12 11 74827 CASAVA_Build 13 76036400 1D ATATCTAAGA C/- AGGTCACATC 3070 het 3070 hom 49 19 23 8 C 1 0 74828 CASAVA_Build 13 76037248 23D TTCTTGGAAA TAATAGGAGTAATTTAAATGTAT/----------------------- TTCATAAGGC 3070 het 3070 ref 42 31 12 4 TAATAGGAGTAATTTAAATGTAT 1 0 74829 CASAVA_Build 13 76046905 5D GGTGAGGAAA AGGAG/----- AGGACTGGTT 3070 het 3070 ref 41 19 19 5 AGGAG 1 0 74830 CASAVA_Build 13 76050925 3D AGAAAGGACA CAG/--- CAGAAGAAGC 3070 het 3070 hom 37 10 17 11 CAG 2 1 74831 CASAVA_Build 13 76058186 1D CCATTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 11 10 74832 CASAVA_Build 13 76061571 2I AAAGTGCAGT --/AA CTAGTTGGGA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 0 2 74833 CASAVA_Build 13 76065723 1D CCCGGATCAG T/- TTTTCCCCCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 5 4 74834 CASAVA_Build 13 76071381 7D AAAGAAACTC TGGCAAT/------- TGGTAAAAGG 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 TGGCAAT 1 0 74835 CASAVA_Build 13 76074134 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 20 2 10 8 A 15 14 74836 CASAVA_Build 13 76074244 1I TATTTAGAAG -/C CCCCCCCCAG 3070 het 2175 hom 26 6 11 9 C 8 9 74837 CASAVA_Build 13 76093574 3D TCTCAATTGT AAG/--- AAGAAGGTAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 6 AAG 3 2 74838 CASAVA_Build 13 76099087 1I ACCTTTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 11 12 74839 CASAVA_Build 13 76100766 1D CATGTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 1442 het 1442 ref 33 12 7 14 A 16 15 74840 CASAVA_Build 13 76101621 6D GTTAGGTTTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 TTG 8 6 74841 CASAVA_Build 13 76104089 1D AAAGAGATGG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 61 het 30 0 22 9 A 9 8 74842 CASAVA_Build 13 76104460 1D CCTTGTGAAT A/- AAGGCATTTT 3070 het 3070 ref 52 28 21 4 A 3 2 74843 CASAVA_Build 13 76106399 1I TTAATCATAT -/A AATGTTAGAT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 A 2 3 74844 CASAVA_Build 13 76114929 4D AAAACCAAGC TATA/---- TAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TA 3 1 74845 CASAVA_Build 13 76116761 4I AACAAAGATA ----/AGTT AGTTCTTGAA 3070 het 3070 ref 57 27 26 4 AGTT 1 2 74846 CASAVA_Build 13 76122213 5D CACCGAATTA TTTTG/----- TCAGCCATTA 3070 hom 84 het 31 0 29 5 TTTTG 1 0 74847 CASAVA_Build 13 76123962 1D CTAAAAATTT C/- CCCCCCTAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 7 6 74848 CASAVA_Build 13 76131860 1D TAATTGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 9 10 5 A 11 10 74849 CASAVA_Build 13 76133118 1D ACTCCATCTC G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 4 het 19 1 15 4 G 6 5 74850 CASAVA_Build 13 76142639 1I GATGGGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2835 hom 35 10 13 12 A 13 14 74851 CASAVA_Build 13 76144342 1D ATTTACCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 10 9 74852 CASAVA_Build 13 76146460 1D ACCATATAAG A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 8 7 74853 CASAVA_Build 13 76148439 3I CTAAACAGTA ---/CTC CTCAAAACTG 3070 hom 147 het 52 0 49 3 CTC 1 2 74854 CASAVA_Build 13 76151292 1I AAAGTAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 11 12 74855 CASAVA_Build 13 76153215 3D TTCTGTATAA AAC/--- AACTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 21 13 4 AAC 2 1 74856 CASAVA_Build 13 76161100 2D ATCCACTCCC CT/-- GTCCCCCCGC 2338 het 2338 ref 23 14 7 2 CT 1 0 74857 CASAVA_Build 13 76173345 2D CAAAAGCAAA CT/-- CTAAGACAAA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 CT 2 1 74858 CASAVA_Build 13 76176049 1D GATATTTTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 A 10 9 74859 CASAVA_Build 13 76191843 1I ATAGCAACTA -/C AATTTACTGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 0 1 74860 CASAVA_Build 13 76198980 1D TGTGTCCCCA C/- CCAAATCTCA 3070 hom 73 het 28 0 22 6 C 3 2 74861 CASAVA_Build 13 76210484 1I TTCATTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 11 12 74862 CASAVA_Build 13 76218683 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2720 hom 30 8 13 9 A 14 15 74863 CASAVA_Build 13 76228755 2D TGGCGCAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 8 8 A 13 11 74864 CASAVA_Build 13 76240091 1I GAATCACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 T 12 13 74865 CASAVA_Build 13 76251777 3D ATTAAACTTA TTC/--- TTCCTTATGA 3070 hom 114 het 41 0 37 8 TTC 2 1 74866 CASAVA_Build 13 76268969 1D CTCACCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 10 7 T 12 11 74867 CASAVA_Build 13 76269222 1D TACTATAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 36 1 28 8 A 12 11 74868 CASAVA_Build 13 76272420 1D CATAAGAGGG T/- TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 T 7 6 74869 CASAVA_Build 13 76282026 1D GTGGGTCTTT C/- CCCCTCTTGG 3070 het 3070 hom 53 25 24 4 C 5 4 74870 CASAVA_Build 13 76282787 1D TTTAACTAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 74871 CASAVA_Build 13 76310709 1I8M3I8M3D CCTCAGTATC -CACATCTA---CAAGATGCAGA/TAACTTGTAGGGTTAGATAC--- AAATAGCTAA 3070 het 3070 ref 45 28 25 3 N/A 0 0 74872 CASAVA_Build 13 76313036 1I GAAGTTTACG -/A AAAGAAGAGT 3070 het 3070 hom 50 25 22 3 A 3 4 74873 CASAVA_Build 13 76324100 2D CAGTAGTCAT AG/-- AGTTCTTATG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 AG 2 1 74874 CASAVA_Build 13 76327437 1I TTGTGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 28 1 23 4 A 10 11 74875 CASAVA_Build 13 76328686 5D ATTTTCAGTT TTTCA/----- TTTGCCACAC 3070 hom 117 het 42 0 39 5 TTTCA 1 0 74876 CASAVA_Build 13 76337106 1I TTCCAGGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 14 15 74877 CASAVA_Build 13 76340508 1D AATTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 14 13 74878 CASAVA_Build 13 76341235 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3052 het 1088 hom 14 5 7 2 A 9 10 74879 CASAVA_Build 13 76346321 1I TTCTTATTTT -/A TGAAAGACAA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 0 1 74880 CASAVA_Build 13 76347799 1D AAATTCACAT G/- GGGCTTTGGA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 G 4 3 74881 CASAVA_Build 13 76348636 1I AACTGTGATT -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 A 0 1 74882 CASAVA_Build 13 76353802 3I6M2I6M4I CAATCAAAAA ---CCAGTA--GAATAC----/AACCAAGTAAGAAATACAATT ATAACAACAT 3070 hom 87 het 30 0 30 3 N/A 0 0 74883 CASAVA_Build 13 76353925 4I CACATGTATT ----/AAAC AAAAAACATG 3070 hom 56 het 26 0 19 9 AAAC 0 1 74884 CASAVA_Build 13 76353973 1D CTGGTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 28 0 14 15 T 16 15 74885 CASAVA_Build 13 76366839 5I TCAACAGTGC -----/AAGAT AAGTTTAGCT 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 AAGAT 0 1 74886 CASAVA_Build 13 76368248 1I AACCTGATCA -/C CTCCCAAGAC 3070 hom 68 het 32 0 24 8 C 1 2 74887 CASAVA_Build 13 76369242 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1622 het 1622 ref 24 13 5 6 T 13 12 74888 CASAVA_Build 13 76369850 4I TTCATGACAC ----/ACTT AAGAAAATTT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 ACTT 0 1 74889 CASAVA_Build 13 76410902 1D TGGGTTGTAT C/- CTGCTTGGTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 2 1 74890 CASAVA_Build 13 76411117 2I CAGTCCTTAG --/CA CAGTGTTTCT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 CA 1 2 74891 CASAVA_Build 13 76419004 3D TTGCTATGTG TGA/--- TGGTTATGTC 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 TGA 1 0 74892 CASAVA_Build 13 76420727 4D ATTTTATGTG ACTT/---- ACTTAAATTG 3070 het 3070 hom 53 22 27 4 ACTT 2 1 74893 CASAVA_Build 13 76442477 1I CTGTTTCTAC -/A AAAAAAGTAA 3070 hom 127 het 46 0 41 5 A 6 7 74894 CASAVA_Build 13 76445719 5D CCTTATGTGC TAAAA/----- TAAAATATTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TAAAA 2 1 74895 CASAVA_Build 13 76447922 1D ATTGATTTAT G/- GTTTTATTGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 2 1 74896 CASAVA_Build 13 76455043 1I GAAAAAAAAA -/G ATCAACAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 0 1 74897 CASAVA_Build 13 76455630 5I AATAAGCAAA -----/AGATT ATAAATCCAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AGATT 0 1 74898 CASAVA_Build 13 76461759 1I GATTGAAATT -/C AGTTCTGTCT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 C 0 1 74899 CASAVA_Build 13 76463587 2D CGGTAGGGGA GG/-- GGGTAGATTC 3070 hom 91 het 35 0 28 7 G 5 3 74900 CASAVA_Build 13 76484451 4D ACTCATTTGG AAAA/---- AAAAAATATG 3070 hom 69 het 25 0 23 3 A 10 6 74901 CASAVA_Build 13 76489205 1D AAAACATTTC T/- TCTATGTTCT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 T 2 1 74902 CASAVA_Build 13 76492742 1I TCATGCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 41 1 31 9 T 11 12 74903 CASAVA_Build 13 76501118 2I GAAAAAAAAC --/GT GTTTATTTTT 3070 hom 88 het 36 0 30 6 GT 1 2 74904 CASAVA_Build 13 76527280 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGTAGT 3070 hom 23 het 26 0 19 8 AAG 3 2 74905 CASAVA_Build 13 76544437 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 26 het 26 ref 22 12 2 8 A 17 16 74906 CASAVA_Build 13 76612661 1D GCCTGTACTT A/- CTCTTTAGAT 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 A 1 0 74907 CASAVA_Build 13 76625889 1I TAAAATAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 27 1 22 4 T 10 11 74908 CASAVA_Build 13 76648156 1I ACAAAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1161 hom 16 4 10 2 T 14 15 74909 CASAVA_Build 13 76667161 1D AAAAATGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 43 1 39 4 T 11 10 74910 CASAVA_Build 13 76667728 1I AGAGACTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 10 74911 CASAVA_Build 13 76686152 1D AAAAAGCACA G/- GGAAACACAT 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 G 3 2 74912 CASAVA_Build 13 76694544 3D TGTTTTTAAT AAG/--- AAGTTCAACT 3070 hom 75 het 26 0 26 3 AAG 2 1 74913 CASAVA_Build 13 76706981 2I TAATAATATT --/AA GTTATATTAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 2 74914 CASAVA_Build 13 76733522 1I CTTATGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 910 hom 28 3 18 7 A 11 12 74915 CASAVA_Build 13 76741766 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 1347 het 1347 ref 34 29 3 2 A 11 10 74916 CASAVA_Build 13 76764667 1I CACCAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 32 0 22 10 A 10 11 74917 CASAVA_Build 13 76771147 1I CTTCATACTA -/T TTTAGGAAAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 3 4 74918 CASAVA_Build 13 76775908 1I GCATATACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1379 hom 45 4 35 6 A 10 11 74919 CASAVA_Build 13 76782923 2I CGTGCGCATG --/CA CACACACACA 3070 het 283 hom 43 1 24 18 CA 8 9 74920 CASAVA_Build 13 76800305 1D GCCTTCTCTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 115 het 41 0 38 3 A 9 8 74921 CASAVA_Build 13 76814546 9D AAACTCCTTA AAAAGGCAT/--------- AAAAGACACA 3070 hom 89 het 30 0 28 6 AAAAGGCAT 1 0 74922 CASAVA_Build 13 76814813 1I AACATTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1082 hom 39 3 31 5 T 10 11 74923 CASAVA_Build 13 76822624 1D CTCTGGCTAC T/- GCTCTTGCTG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 1 0 74924 CASAVA_Build 13 76832639 3I CAGGAAGAAG ---/GAA GAAGAAGAAG 3070 hom 129 het 51 0 43 8 GAA 3 4 74925 CASAVA_Build 13 76844462 2I TGTGATCTGG --/GA GAGATCAAAA 3070 hom 102 het 41 0 33 8 GA 2 3 74926 CASAVA_Build 13 76847768 3D AAAGAGTCCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 44 0 35 11 T 14 11 74927 CASAVA_Build 13 76853487 1D CTTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 28 1 18 9 A 15 14 74928 CASAVA_Build 13 76855793 1I AAATAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 642 hom 25 4 15 6 T 11 12 74929 CASAVA_Build 13 76856820 1D ACTGGATTTC T/- TTTTTTTTTT 2901 het 186 hom 28 2 13 13 T 15 14 74930 CASAVA_Build 13 76857126 1I CCTTACTGGA -/T GGATATTCAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 0 1 74931 CASAVA_Build 13 76858532 1I AGGTTTTTTT -/C TTTTTTCTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 74932 CASAVA_Build 13 76873657 1I CACCAGAAGA -/T TTGGATGTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 74933 CASAVA_Build 13 76889681 1I TTTCTTACCC -/A AAATTTTAAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 3 4 74934 CASAVA_Build 13 76891535 4I TTTGGTTACA ----/TGAG TAAGTTCTTT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 TGAG 0 1 74935 CASAVA_Build 13 76898879 3I GGCAATGTAA ---/ACG ACGGATAGCT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 ACG 1 2 74936 CASAVA_Build 13 76922199 1I TTTGCAACTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 206 hom 40 1 31 8 A 8 9 74937 CASAVA_Build 13 76925698 1I CTCTGGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 T 10 11 74938 CASAVA_Build 13 76926161 10D ATATTAGAAG AGTCGATCAC/---------- AGCCTTAGGA 3070 het 3070 ref 38 23 16 0 AGTCGATCAC 1 0 74939 CASAVA_Build 13 76950215 1I GCTGTGGGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 9 10 74940 CASAVA_Build 13 76959243 1D GAGTAAATAG A/- AAATTATATA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 4 3 74941 CASAVA_Build 13 76993588 1I CTGCACTCTT -/A ACATGATTCA 3070 het 3070 hom 52 16 22 14 A 1 2 74942 CASAVA_Build 13 76993772 1D ATGACCAATA T/- TGCCTGTGGA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 2 1 74943 CASAVA_Build 13 76996288 1D CTAAACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 A 12 11 74944 CASAVA_Build 13 77002653 1D AAAAAAAAAA T/- CAGTGAGTGT 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 T 1 0 74945 CASAVA_Build 13 77006401 1I TTTTTGTTGG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 T 0 1 74946 CASAVA_Build 13 77035934 1I ATTGATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 13 14 74947 CASAVA_Build 13 77040655 1D ACTTTTGCAG A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 8 7 74948 CASAVA_Build 13 77048453 3I CCAGCACACT ---/CCC CCAACACACT 3070 hom 122 het 47 0 41 6 C 2 5 74949 CASAVA_Build 13 77066149 6D TCTTCCTTCT CCTTCC/------ CCTTCCCCTT 3070 hom 138 het 54 0 47 9 CCTTCC 2 1 74950 CASAVA_Build 13 77068479 1I TAAAAAAAAA -/G AAAGTATAGC 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 G 0 1 74951 CASAVA_Build 13 77076165 1D TCTAACTTAA T/- TGTTATTTCA 3070 hom 114 het 41 0 38 4 T 2 1 74952 CASAVA_Build 13 77088879 1D ACTTGCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1886 hom 36 9 13 14 T 17 16 74953 CASAVA_Build 13 77092937 1I TCTAAAGTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 220 hom 31 1 28 2 A 9 10 74954 CASAVA_Build 13 77099097 1D AGAAAAAAAA C/- AGAACTATCA 1251 het 1251 ref 41 33 6 2 C 1 0 74955 CASAVA_Build 13 77100307 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 37 het 21 0 13 8 TA 10 9 74956 CASAVA_Build 13 77128946 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2328 hom 30 6 14 10 T 14 13 74957 CASAVA_Build 13 77138104 3D AACGTTTCTC TTT/--- TTTTTAAGAC 3070 het 3070 ref 25 16 8 2 T 8 5 74958 CASAVA_Build 13 77138268 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 12 11 74959 CASAVA_Build 13 77138930 1D CCTCTGTCTC T/- TTTTTTTTCC 1062 het 1062 ref 41 32 3 6 T 9 8 74960 CASAVA_Build 13 77139667 1I AATAAGCGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 11 12 74961 CASAVA_Build 13 77146123 1D GGGGAAGGAC G/- GGGGGGGCAG 2463 het 2463 ref 23 14 7 2 G 8 7 74962 CASAVA_Build 13 77146265 1I CAACCTATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 9 10 74963 CASAVA_Build 13 77153360 1D GCAAACAGAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 A 9 8 74964 CASAVA_Build 13 77155070 2D ATACTTATTA TT/-- AATACATTGA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 2 0 74965 CASAVA_Build 13 77171996 14I TTTCTGTAAA --------------/GCCCAGGGTGTATT GTAATCTCAG 3070 het 3070 hom 52 20 27 6 GCCCAGGGTGTATT 0 1 74966 CASAVA_Build 13 77173377 1D ACTTCCTGCT A/- AAAATGTCAT 3070 het 3070 ref 45 19 16 11 A 5 4 74967 CASAVA_Build 13 77174853 1I ATCACTGATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 9 10 74968 CASAVA_Build 13 77178808 1D TTCGTTTGTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 43 16 18 9 T 8 7 74969 CASAVA_Build 13 77186311 1D GTATAGTAAT A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 7 6 74970 CASAVA_Build 13 77188468 1I TAGCTCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 34 1 27 6 T 12 13 74971 CASAVA_Build 13 77194133 5D TAAGGTTAGG TTTTT/----- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 T 9 4 74972 CASAVA_Build 13 77196069 1D TTTGGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 547 hom 18 3 11 4 A 15 14 74973 CASAVA_Build 13 77199585 1D AAAAAAAAAA C/- AAAACAATTT 2037 het 2037 ref 27 14 7 6 C 1 0 74974 CASAVA_Build 13 77202038 2D CCAGTAACTC TG/-- TGTGTGTGTG 1569 het 1569 ref 56 39 5 13 TG 9 8 74975 CASAVA_Build 13 77209229 1I GTTCAACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 T 10 11 74976 CASAVA_Build 13 77209950 1D TCATATTCCA C/- CTTACTTGCC 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 C 2 1 74977 CASAVA_Build 13 77210333 2D CACACACACC CA/-- CACACACACA 449 het 449 ref 27 16 2 9 CA 8 7 74978 CASAVA_Build 13 77215632 1I TAAGTCTGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 8 9 74979 CASAVA_Build 13 77246878 1D AATTTTAACC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 10 9 74980 CASAVA_Build 13 77251169 3D GCCTGCACTT AGG/--- AGGGAGTTAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 AGG 2 1 74981 CASAVA_Build 13 77260029 3I ATAGGCACTT ---/ACC ACAATACCTG 3070 hom 95 het 35 0 31 4 ACC 0 1 74982 CASAVA_Build 13 77262085 1D CTCTCATTTT A/- AAAAAATATT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 7 6 74983 CASAVA_Build 13 77267868 1I CTGCAAAAAG -/A AAAAAACAAC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 6 7 74984 CASAVA_Build 13 77272444 1I CTAAACTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 43 3 34 6 T 10 11 74985 CASAVA_Build 13 77282310 4I ATAAGCCAGA ----/GTGG GTGGGTAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 GTGG 1 2 74986 CASAVA_Build 13 77288963 5I TTCTCACTCG -----/TTTGT TTTAATAGGG 3070 hom 144 het 56 0 49 7 TTTGT 0 1 74987 CASAVA_Build 13 77290683 1I CAGTTTTGGC -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 8 74988 CASAVA_Build 13 77299392 1I GTAGTTTTTT -/A TAAATGTGAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 0 1 74989 CASAVA_Build 13 77307716 1D TTCTACCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 714 hom 40 7 13 21 T 15 14 74990 CASAVA_Build 13 77325642 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 8 9 74991 CASAVA_Build 13 77330469 7D TCCTTCAAAG GAGAAAA/------- TAATTTTCTC 3070 hom 99 het 34 0 33 3 GAGAAAA 1 0 74992 CASAVA_Build 13 77336013 1D TTTCATGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 11 10 74993 CASAVA_Build 13 77341031 22D TACCAATGGT AGTGACTGACTCACTTCCTAGA/---------------------- AGTGACTGAC 3070 hom 78 het 38 0 25 22 AGTGACTGACTCACTTCCTAGA 2 1 74994 CASAVA_Build 13 77345521 2I GAAATGAGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 51 17 13 21 TG 8 9 74995 CASAVA_Build 13 77350865 1I GGAGTAGAAT -/G TACTTGGTCA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 G 0 1 74996 CASAVA_Build 13 77353677 4I ATTGAGATTT ----/TTTC TTTCTTTTTT 1088 het 25 hom 13 1 5 7 TTTC 1 2 74997 CASAVA_Build 13 77353693 1D TTTTTTTTTT A/- AACTCAATTT 1872 hom 16 het 13 0 6 7 A 3 2 74998 CASAVA_Build 13 77355444 1D AAAATGCAGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 9 8 74999 CASAVA_Build 13 77371555 1D ACCTAAACTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 410 hom 35 1 28 6 T 10 9 75000 CASAVA_Build 13 77380563 1D AAGTTTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 306 hom 37 3 13 21 A 19 18 75001 CASAVA_Build 13 77412465 1I AAGAGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 939 hom 27 2 22 3 T 11 12 75002 CASAVA_Build 13 77413835 1I GTGGTGGTGA -/T TGGAAGTTTT 3070 hom 141 het 51 0 46 5 T 1 2 75003 CASAVA_Build 13 77414925 3D AAATAGAGAA AAG/--- AAGCATTTTC 3070 hom 59 het 23 0 20 3 AAG 2 1 75004 CASAVA_Build 13 77418013 1D GCAAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 508 hom 32 4 16 13 A 17 16 75005 CASAVA_Build 13 77454509 4I CTTTCATATG ----/TTTA TTAGTCACTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TTTA 0 1 75006 CASAVA_Build 13 77462998 3D AGGATTATAA TCT/--- TCTTTGTGCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TCT 2 1 75007 CASAVA_Build 13 77483712 1I AGCAGATGAT -/G GGGAGGCCTG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 G 3 4 75008 CASAVA_Build 13 77492052 1D CCAGAGCATA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 72 het 25 0 23 2 T 8 7 75009 CASAVA_Build 13 77499595 1I TTGTTCTCAC -/T TTATAGGCAG 3070 hom 105 het 41 0 33 8 T 2 3 75010 CASAVA_Build 13 77508674 2D CTTTATAGAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 11 9 75011 CASAVA_Build 13 77514454 2D CTAGCTGTCT CA/-- ATTACTAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 CA 1 0 75012 CASAVA_Build 13 77515937 2D CATTAGTCTC AG/-- AGTTATTGGG 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 AG 2 1 75013 CASAVA_Build 13 77516477 1D TTATAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 11 10 75014 CASAVA_Build 13 77523869 5D5M25D TTTAGAACTA ACAGTATTTGATTAATATATATGGCAAGAGCAAGA/-----ATTTG------------------------- AAAAGTCTGA 3070 het 3070 ref 53 39 18 2 N/A 0 0 75015 CASAVA_Build 13 77542899 1D TCTGATAATG A/- AAAAAACAGC 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 A 7 6 75016 CASAVA_Build 13 77543282 4I AATCAAAAAG ----/AAGA AAGAATTAGA 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 AAGA 1 2 75017 CASAVA_Build 13 77546865 1I TATTTGAATA -/C CCTTTATTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 2 3 75018 CASAVA_Build 13 77551489 1I TATCCTTCAG -/T TTTCATCCAT 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 T 3 4 75019 CASAVA_Build 13 77565587 2I AAATGTTGAA --/AT ATATAGGCTT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AT 2 3 75020 CASAVA_Build 13 77568367 1D AGTATAATAA T/- AATAAAAAAA 1539 hom 12 het 6 0 5 1 T 1 0 75021 CASAVA_Build 13 77571172 1D ATATAGAACC A/- AAAAAAGACC 3070 hom 108 het 46 0 37 10 A 7 6 75022 CASAVA_Build 13 77574775 1D GACACAGCAA T/- TTTTCATCAC 3070 het 3070 hom 46 18 25 4 T 5 4 75023 CASAVA_Build 13 77575427 1D AAAACTATAT A/- ATTAATTTGT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 2 1 75024 CASAVA_Build 13 77579935 1D GAGCCTTTCT A/- AAAAAAAAAA 2623 het 2623 ref 39 14 11 14 A 15 14 75025 CASAVA_Build 13 77580283 1D TACTCTGTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 10 9 75026 CASAVA_Build 13 77583008 1D ATTAGTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 174 hom 41 6 17 18 T 20 19 75027 CASAVA_Build 13 77584505 2I CAACCTTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 10 12 75028 CASAVA_Build 13 77586062 6D ACATGATTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2240 het 317 hom 29 7 6 16 T 20 14 75029 CASAVA_Build 13 77598410 3D ATATTTTAAT ATC/--- ATTACTTTAA 3070 het 3070 hom 37 15 21 2 ATC 1 0 75030 CASAVA_Build 13 77602464 1I AAAAAAAAAA -/C AAACCCAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 0 1 75031 CASAVA_Build 13 77604857 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 13 1 10 2 A 15 14 75032 CASAVA_Build 13 77605443 1I ATAATGAGAG -/A AAAAAAAGCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 8 75033 CASAVA_Build 13 77613372 6D ACTATTCTCT CTTTTA/------ CTTTTGAATA 3070 hom 111 het 42 0 38 8 CTTTTA 1 0 75034 CASAVA_Build 13 77614908 2I TTTTTCTTTT --/CA TCCCCCCCCA 3070 hom 47 het 20 0 16 4 CA 0 1 75035 CASAVA_Build 13 77618977 2I CAATATACCC --/CT CCCCACACAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CT 0 1 75036 CASAVA_Build 13 77619665 1D ACAGCTTCCA T/- TTTTTTCATC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 7 6 75037 CASAVA_Build 13 77620406 1I TTACCCATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 34 1 24 9 T 12 13 75038 CASAVA_Build 13 77624181 2I TTTTTGAAAC --/GT GTGTCTAAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GT 2 3 75039 CASAVA_Build 13 77624518 2I AGTGGGACCT --/AA TTAAAGAGCT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 0 2 75040 CASAVA_Build 13 77625552 1I TAGGCCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 318 hom 35 1 19 15 T 14 15 75041 CASAVA_Build 13 77625809 11D CATTTTTTTT CATTGTTTTTC/----------- TTTTTAATTA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 CATTGTTTTTC 1 0 75042 CASAVA_Build 13 77632356 8D AGACTTGCCA AGGAATTC/-------- AGGTACTGAA 3070 hom 151 het 55 0 51 6 AGGAATTC 1 0 75043 CASAVA_Build 13 77634452 1I CAGTCCTGGC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 100 het 40 0 38 2 T 6 7 75044 CASAVA_Build 13 77637096 2I GTGATATGTC --/AT ATACATTTCC 3070 hom 117 het 41 0 39 2 AT 1 2 75045 CASAVA_Build 13 77638208 1D GTGACTTCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 37 1 30 6 T 11 10 75046 CASAVA_Build 13 77643604 1I CTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2527 hom 23 11 8 4 A 11 12 75047 CASAVA_Build 13 77647801 1D AGAATTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 12 11 75048 CASAVA_Build 13 77650153 1D AACTTGGTAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 T 8 7 75049 CASAVA_Build 13 77660797 1I TGGAAAGAAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 8 9 75050 CASAVA_Build 13 77671610 5D GCATATGTAT GATAA/----- GATATCTTAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 GATAA 1 0 75051 CASAVA_Build 13 77675546 3I TTTACCCCTG ---/TTA CGTAACAGCT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 TTA 0 1 75052 CASAVA_Build 13 77680279 5D ATTTTTTCAC CTTAT/----- CTTGTGCACT 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 CTTAT 1 0 75053 CASAVA_Build 13 77680556 3D TCTCAAATAA ATT/--- ATTGTGATAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 ATT 2 1 75054 CASAVA_Build 13 77688652 1D ACAAATAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 A 12 11 75055 CASAVA_Build 13 77691265 2D GCAATAACAC AT/-- GTCTGGAAAG 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 AT 1 0 75056 CASAVA_Build 13 77695157 1D TTTCTTCTTC T/- TGTTATTGTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 2 1 75057 CASAVA_Build 13 77706364 1I ATACTGAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 666 hom 46 3 40 3 T 9 10 75058 CASAVA_Build 13 77707510 4D GTACTATTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 54 25 22 8 TTTG 3 2 75059 CASAVA_Build 13 77709090 1I AATTCTACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 11 75060 CASAVA_Build 13 77713733 4D TTAGGGCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 AAAC 4 3 75061 CASAVA_Build 13 77715065 2D CAGCCTAACC AA/-- AGTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 A 3 1 75062 CASAVA_Build 13 77720576 1I AAAGTATAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 T 7 8 75063 CASAVA_Build 13 77740323 1I ACTCCGTATG -/A AAAAAAAAAA 1561 het 452 hom 17 2 9 6 A 15 16 75064 CASAVA_Build 13 77742082 1I GATTATTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 9 10 75065 CASAVA_Build 13 77757377 1D CTCAGGATAC A/- AAAATCAATG 3070 hom 18 het 14 0 7 7 A 5 4 75066 CASAVA_Build 13 77765429 1D TCATGTATGG A/- AAAAATGTAA 3070 het 3070 ref 49 27 18 5 A 6 5 75067 CASAVA_Build 13 77770148 1I ACTCAAATGA -/T TTTTTGAAGG 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 T 5 6 75068 CASAVA_Build 13 77779352 1D CCACACATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 T 13 12 75069 CASAVA_Build 13 77784217 1D CTAAAATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 35 0 29 6 T 13 12 75070 CASAVA_Build 13 77785258 7I AGAAGAAAAG -------/AAAGAAA AAAGAAAAAA 3070 hom 39 het 21 0 12 9 AAAGAAA 2 3 75071 CASAVA_Build 13 77794557 1I TGTGAGCCTC -/T TAACTTCTCT 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 T 1 2 75072 CASAVA_Build 13 77813499 2I CCTGATAAAG --/AC ACACCTGAGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AC 2 3 75073 CASAVA_Build 13 77823502 1I CGGGGCCAAT -/A AAAAAAAATA 2631 het 2631 ref 25 16 6 3 A 8 9 75074 CASAVA_Build 13 77834346 1D TTTGTCTCTA G/- GGCTATTTTG 2389 het 2389 ref 26 12 8 6 G 3 2 75075 CASAVA_Build 13 77834405 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 335 hom 26 2 14 10 T 15 14 75076 CASAVA_Build 13 77836463 2D2M3I CCTTACCCTA TCTT---/--TTAAG ACTCAGGTAA 2702 hom 15 het 14 0 6 10 N/A 0 0 75077 CASAVA_Build 13 77864259 1I ACAGTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 A 13 14 75078 CASAVA_Build 13 77868673 1I TTTTTGTGAA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 7 8 75079 CASAVA_Build 13 77871681 1D AACTGCAAAA G/- CTTCGCCCAG 3070 het 3070 hom 34 13 20 2 G 1 0 75080 CASAVA_Build 13 77875668 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTGACA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 6 7 75081 CASAVA_Build 13 77878857 1I GATTTTAATA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 T 6 7 75082 CASAVA_Build 13 77880718 1D CTGATGCTGC A/- AGGTCTGGGA 3070 het 3070 ref 56 24 23 9 A 2 1 75083 CASAVA_Build 13 77884274 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 23 2 13 8 A 14 13 75084 CASAVA_Build 13 77896898 4D ATCAAAAAAA ACAG/---- AAAGAAAGAA 2552 hom 24 het 11 0 9 3 ACAG 1 0 75085 CASAVA_Build 13 77898133 1D TTCCCTCGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 15 8 T 11 10 75086 CASAVA_Build 13 77904212 4D TTTTGTTTGT TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TTTG 2 1 75087 CASAVA_Build 13 77907646 11I CTGGCTTGAC -----------/TTTAAGAGACT TTGTGTAAGA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 TTTAAGAGACT 0 1 75088 CASAVA_Build 13 77907901 4D CCAGTTCTGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2536 hom 36 14 14 9 A 25 21 75089 CASAVA_Build 13 77910030 1D CATTTCCCTC G/- GTTCATATAT 3070 het 3070 hom 60 25 27 8 G 2 1 75090 CASAVA_Build 13 77915690 2D GATAAATGAC TG/-- TAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 TG 1 0 75091 CASAVA_Build 13 77923865 1D TAATGACATA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 8 7 75092 CASAVA_Build 13 77924615 1I CGTGCCTCGG -/C CTCCCAAAGT 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 C 1 2 75093 CASAVA_Build 13 77929921 1I ATGTTATTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 9 10 75094 CASAVA_Build 13 77933619 1D GTATGTAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 15 22 6 A 9 8 75095 CASAVA_Build 13 77935113 1D AACTCAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 23 24 9 T 12 11 75096 CASAVA_Build 13 77940049 1D TAAAAAAAAA T/- AATAATAATA 1779 het 1779 ref 23 16 4 5 T 1 0 75097 CASAVA_Build 13 77948911 1D TGGGTAGTTC A/- AGGAGAAAAA 3070 het 347 hom 34 2 29 3 A 2 1 75098 CASAVA_Build 13 77955873 1D TCTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 10 9 75099 CASAVA_Build 13 77962916 1D AACCAAGTAG A/- AAAAACAGAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 5 75100 CASAVA_Build 13 77964553 3D TGTGAAAAAA AAT/--- AATGAAAGAA 3070 het 3070 hom 37 12 16 10 AAT 2 1 75101 CASAVA_Build 13 77979871 1D GACTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 2819 het 2819 ref 43 30 7 6 T 12 11 75102 CASAVA_Build 13 77985342 2D GGTACTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1841 hom 21 5 9 7 T 13 11 75103 CASAVA_Build 13 78004803 8I TTCTTAAGAA --------/AAGGGATG AAGGGGATAA 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 AAGGGATG 0 1 75104 CASAVA_Build 13 78017182 3I TCACAAAATA ---/ATT ATTATATGAA 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 ATT 1 2 75105 CASAVA_Build 13 78021403 2D ATTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2836 hom 24 7 13 5 TA 6 5 75106 CASAVA_Build 13 78025111 1I GATTCCAATG -/T TTAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 2 3 75107 CASAVA_Build 13 78027781 1I AAGGGAACCC -/T TTTTTTTTTT 2046 het 1367 hom 32 7 9 16 T 13 14 75108 CASAVA_Build 13 78027930 1I TGGTTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 10 11 75109 CASAVA_Build 13 78028257 1I AGAGGCAAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 T 8 9 75110 CASAVA_Build 13 78066776 4D AGCTTCTTTT TCTC/---- TCTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 20 15 7 TC 4 2 75111 CASAVA_Build 13 78068849 5D GTCCTCCCGT AAAGC/----- TGACTTGACA 2840 het 2733 hom 15 7 8 2 AAAGC 1 0 75112 CASAVA_Build 13 78117796 1I ATTTATAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 76 het 45 0 34 11 T 9 10 75113 CASAVA_Build 13 78127080 1D CAAATGTTTT C/- AAAATACTCT 3070 hom 113 het 43 0 37 6 C 1 0 75114 CASAVA_Build 13 78127481 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 134 het 53 0 44 9 A 10 9 75115 CASAVA_Build 13 78129593 1I CCACAGACTC -/T TAAGCTTTAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 1 2 75116 CASAVA_Build 13 78136955 3D GCTTTTTGTT AGA/--- AGGATAGTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 AGA 1 0 75117 CASAVA_Build 13 78144752 1I CTCAGTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1213 hom 43 4 31 8 T 12 13 75118 CASAVA_Build 13 78149016 3D AGTTAAAGCG ACA/--- ACAAGTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 6 ACA 2 1 75119 CASAVA_Build 13 78149197 1I TAGTCTCCAA -/C CCCCCCACTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 6 7 75120 CASAVA_Build 13 78150799 1D TTTTATCTTT C/- CAACTAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 2 1 75121 CASAVA_Build 13 78151548 2I ATGGCCTGAC --/TG TTATTTGTCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TG 0 1 75122 CASAVA_Build 13 78151706 1I ACAACTGGGA -/G GGGGTGGGAG 3070 hom 87 het 31 0 27 4 G 4 5 75123 CASAVA_Build 13 78155340 1D AAGAAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 32 1 21 10 T 14 13 75124 CASAVA_Build 13 78158548 1D ACTCCGATAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 9 8 75125 CASAVA_Build 13 78160548 1I AAAAAAAACC -/T TTTTGTATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 4 5 75126 CASAVA_Build 13 78165522 3D GACAAATTAG CAA/--- CAACGATTAG 3070 het 3070 ref 55 33 22 1 CAA 2 1 75127 CASAVA_Build 13 78165976 6D GCTTTTTTTT TTTTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TTTTTG 1 0 75128 CASAVA_Build 13 78168795 1I TTAGATTAAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 8 9 75129 CASAVA_Build 13 78172776 2D TTTTAAATAA AC/-- AGTCTATATC 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 AC 1 0 75130 CASAVA_Build 13 78175375 1D TAACCATAAC A/- GCATAGTACT 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 A 1 0 75131 CASAVA_Build 13 78178351 1I GGTGAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 919 hom 49 3 34 12 T 13 14 75132 CASAVA_Build 13 78180564 23I CCTTTTTTTT -----------------------/AATGAAAAAAATAAGGAATAAGA CATTGTCTTA 3070 het 3070 hom 33 16 18 1 AATGAAAAAAATAAGGAATAAGA 0 1 75133 CASAVA_Build 13 78188559 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 5 6 75134 CASAVA_Build 13 78196210 1D TGTGGCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1944 het 1944 ref 48 36 5 7 A 13 12 75135 CASAVA_Build 13 78200365 1D GCTACTTATA T/- TTCCCTTAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 3 2 75136 CASAVA_Build 13 78212305 1D AACCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 30 1 18 11 T 15 14 75137 CASAVA_Build 13 78215765 1I GTCTCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 30 1 25 4 T 10 11 75138 CASAVA_Build 13 78243339 1I ATTTTTCCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 T 8 9 75139 CASAVA_Build 13 78243441 1D AGCAAGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 14 14 T 13 12 75140 CASAVA_Build 13 78255647 1I GAAAAATAAA -/T TTTTTAAAGT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 5 6 75141 CASAVA_Build 13 78260160 1D TTGAAAAACA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 8 7 75142 CASAVA_Build 13 78265224 3D CAGCCACACT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 37 15 13 10 TTG 5 4 75143 CASAVA_Build 13 78269255 1I ATGACTTTTC -/A GTTGTTATTT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 A 0 1 75144 CASAVA_Build 13 78270980 2D CTCAAGAATC TT/-- TTTTCTGAGA 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 6 4 75145 CASAVA_Build 13 78276774 2D GCTTCATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 31 1 20 11 A 12 10 75146 CASAVA_Build 13 78277100 4I TAGAACTGAT ----/AAAC AAATTTAGTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAAC 0 1 75147 CASAVA_Build 13 78296552 6D AGTTTATTCT ATCTCC/------ AAGTGAAAAA 3070 het 3070 ref 32 21 8 4 ATCTCC 1 0 75148 CASAVA_Build 13 78300386 4D TTATCCACCC CTCA/---- CTCTTCCAAG 3070 hom 129 het 46 0 44 3 CTCA 1 0 75149 CASAVA_Build 13 78305918 3I GTAAAAATCT ---/CTC CTTTCTTACA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CTC 0 1 75150 CASAVA_Build 13 78306461 1I TTAGCAGTCT -/G GAAAAACATC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 G 1 2 75151 CASAVA_Build 13 78307035 1I GTGATAAAAA -/G CTTTACTATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 0 1 75152 CASAVA_Build 13 78327199 1I CCTCCCCTCT -/C CCCCCACCCC 2897 hom 15 het 7 0 6 1 C 5 6 75153 CASAVA_Build 13 78332388 1I TTGCTGCCTG -/A TCGTTCCTCT 3070 hom 51 het 18 0 16 2 A 0 1 75154 CASAVA_Build 13 78333802 2D TTGTAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 29 1 25 5 AT 8 7 75155 CASAVA_Build 13 78333987 1I TGTTTATAAC -/A AAAAAAACTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 8 75156 CASAVA_Build 13 78348368 1I GGGCCACAGG -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 64 het 27 0 19 8 T 7 8 75157 CASAVA_Build 13 78351216 1I TAAAACCATT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 8 9 75158 CASAVA_Build 13 78363289 1D AGACCTTGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 64 het 34 0 24 10 A 10 9 75159 CASAVA_Build 13 78383090 1D ACTAATGTCC T/- TACCCAAATA 3070 hom 83 het 32 0 27 6 T 2 1 75160 CASAVA_Build 13 78389818 5D TTTTCAGTGT ACAAA/----- ACAAATCTTT 3070 hom 126 het 48 0 43 7 ACAAA 2 1 75161 CASAVA_Build 13 78412923 1I TCAGTGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1093 hom 46 4 26 16 A 12 13 75162 CASAVA_Build 13 78427724 4I TAATTTCTTT ----/CAGA CAGTTTTCCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CAGA 0 1 75163 CASAVA_Build 13 78429175 1I CTCAGTACAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 115 het 48 0 38 10 A 6 7 75164 CASAVA_Build 13 78473146 4I CACACACACA ----/CTCT CTCTCTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 CT 3 5 75165 CASAVA_Build 13 78476683 4I GACACTGAAT ----/TTTC TTTCTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 13 27 6 TTTC 1 2 75166 CASAVA_Build 13 78478676 5D GTTGAAAGAT AAATG/----- AACATGAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 AAATG 1 0 75167 CASAVA_Build 13 78481974 1D TCATTCAGCA T/- TTTTTCACAA 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 T 6 5 75168 CASAVA_Build 13 78484498 1D GCATAAAATG T/- TTTTCCATTT 3070 het 3070 hom 46 17 25 5 T 5 4 75169 CASAVA_Build 13 78490779 1I CCAGAGCTGT -/G CCTTGGCATG 3070 hom 44 het 19 0 13 6 G 0 1 75170 CASAVA_Build 13 78495557 1I TTCCCCAATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 A 8 9 75171 CASAVA_Build 13 78496269 4D TGTGTGTGTG TGTT/---- TATGTGGGTG 3070 hom 123 het 43 0 42 2 TGTT 1 0 75172 CASAVA_Build 13 78502271 1D AGAATTTCAC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 9 8 75173 CASAVA_Build 13 78502424 5D TATAGTAAAG TAAAA/----- TATTATATGC 3070 het 3070 hom 39 16 21 4 TAAAA 1 0 75174 CASAVA_Build 13 78505528 2D CCCTTTCCAG TC/-- TCCCTCCGTG 3070 het 3070 ref 42 23 17 5 TC 2 1 75175 CASAVA_Build 13 78505829 2I GTTCTTTTTT --/AA AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 8 10 75176 CASAVA_Build 13 78506880 1D ATTTAAGCAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 8 7 75177 CASAVA_Build 13 78508489 1D GAGACTCTAT C/- AAAAAAAAGA 2517 het 2517 ref 16 7 6 3 C 1 0 75178 CASAVA_Build 13 78514724 1D TTCTTACACC T/- TTTCAAACAC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 4 3 75179 CASAVA_Build 13 78517229 1I CATTTTTTTT -/C TCCTGCCCTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 0 1 75180 CASAVA_Build 13 78532945 1D AATGGACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 47 1 44 2 A 11 10 75181 CASAVA_Build 13 78533212 4I AAAATAACAC ----/ACAA ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 54 29 14 11 ACAA 2 3 75182 CASAVA_Build 13 78540692 1D GGAAGATCTT C/- CAGAGGTAGG 3070 het 3070 ref 47 20 20 9 C 2 1 75183 CASAVA_Build 13 78543029 1I TTTTGTGCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 9 10 75184 CASAVA_Build 13 78549630 1D ACACAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 13 24 15 A 14 13 75185 CASAVA_Build 13 78557685 1D TTGCAGCCCT C/- TTTCCCCCAC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 C 1 0 75186 CASAVA_Build 13 78574381 2D ATGACAATGC AA/-- AGACAAGAAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 3 1 75187 CASAVA_Build 13 78575513 1I GAAGAACAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 8 9 75188 CASAVA_Build 13 78590764 3D TTGAAACAAA GCC/--- CTGGAGTTTG 3070 hom 117 het 43 0 40 4 GCC 1 0 75189 CASAVA_Build 13 78629506 5I CGGGAGTATG -----/AGACC AGCCTGGGCA 3070 het 1087 hom 17 4 9 4 AGACC 0 1 75190 CASAVA_Build 13 78632690 1I TATTAAGTAA -/C ACTTTCCTCA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 C 0 1 75191 CASAVA_Build 13 78634522 2I GGAGCTTGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 T 10 12 75192 CASAVA_Build 13 78643619 2D GATAGAGAAA GT/-- GTGTGGGAGT 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 GT 3 2 75193 CASAVA_Build 13 78673053 2I ACCATGGCCT --/AC GTCCACTGCT 3070 het 3070 ref 54 27 16 11 AC 0 1 75194 CASAVA_Build 13 78676684 1I ATGTTATATT -/A AAAAAAAAAA 1494 het 1008 hom 19 5 8 6 A 15 16 75195 CASAVA_Build 13 78680552 4D CATAACCTGA GAAT/---- GAATGACCCA 3070 het 3070 hom 45 20 24 4 GAAT 2 1 75196 CASAVA_Build 13 78691182 4D GAACAAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2062 het 184 hom 22 1 12 9 AAAG 3 2 75197 CASAVA_Build 13 78692052 1D AGACTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 13 0 9 4 A 17 16 75198 CASAVA_Build 13 78695188 2D AAACTGAGGC AG/-- AGACTGGAGT 3070 hom 135 het 47 0 45 3 AG 2 1 75199 CASAVA_Build 13 78697991 2D TCAAGAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 13 11 75200 CASAVA_Build 13 78721653 4D ACTATCTAAA AAAC/---- AAACAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 AAAC 2 1 75201 CASAVA_Build 13 78739368 8D TGGTTACCCA GTGATAAG/-------- GAATGGCAAC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 GTGATAAG 1 0 75202 CASAVA_Build 13 78744970 1I AAATAGTCTG -/C CATAGTCAAT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 C 1 2 75203 CASAVA_Build 13 78745633 1I TTCTTTTTCT -/A TTTTTTTTTT 2625 het 2625 ref 23 12 8 3 A 0 1 75204 CASAVA_Build 13 78749785 1D ACAAAACAAC A/- ACTCCTTTCC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 2 1 75205 CASAVA_Build 13 78754920 1D GATTTAAACA G/- GCATCTGAAC 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 G 2 1 75206 CASAVA_Build 13 78778232 5D AGCAAGCAGG CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 4 CAAAA 3 2 75207 CASAVA_Build 13 78782166 1I GTTTATGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 29 0 10 19 A 13 14 75208 CASAVA_Build 13 78784899 4D GGCTGGGCTC TCTA/---- TCTGACTCAG 3070 het 3070 ref 45 19 19 9 TCTA 1 0 75209 CASAVA_Build 13 78785494 5D TTTTGCTTTG TTTTT/----- AATTTTAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 23 3 T 5 0 75210 CASAVA_Build 13 78788552 1D GAACCCTTAT A/- AGCCAACAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 1 75211 CASAVA_Build 13 78795379 1D ACATATTGCC A/- AATAACTTAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 3 A 3 2 75212 CASAVA_Build 13 78796107 1D GATAAAACTA T/- TGTTTTATAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 1 75213 CASAVA_Build 13 78800961 2D CTACAATCAG AA/-- AAGTGAATTA 3070 het 3070 hom 35 17 16 5 A 4 2 75214 CASAVA_Build 13 78803196 1I GCCCAGGCTG -/A AAGCACAGTG 3070 het 3070 hom 34 8 20 6 A 2 3 75215 CASAVA_Build 13 78809936 3D CTGATATTCT ACC/--- ACATTATTCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 9 ACC 1 0 75216 CASAVA_Build 13 78810488 1I CCTCAAGATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 9 10 75217 CASAVA_Build 13 78812298 1D TTTTTCAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 10 9 75218 CASAVA_Build 13 78814794 1I CAATGAAATT -/A AAATACCTGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 4 75219 CASAVA_Build 13 78815149 2I TGATGCTAAC --/TT TATCTCAACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 3 75220 CASAVA_Build 13 78819372 4D CACGAATGTG ACTC/---- ACTAAGGCTA 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 ACTC 1 0 75221 CASAVA_Build 13 78819944 1I GTACAATACT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 8 9 75222 CASAVA_Build 13 78822868 1D CCTGCCTTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 8 7 75223 CASAVA_Build 13 78823741 1D TTGGGGCGGC G/- GGGGGGGAAA 3070 hom 35 het 15 0 11 5 G 8 7 75224 CASAVA_Build 13 78824603 2D ATACCTAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 A 12 10 75225 CASAVA_Build 13 78825159 1D AATGGAAACC A/- AAAGGTAGGA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 4 3 75226 CASAVA_Build 13 78827994 1D ATTTAAGAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 16 12 7 A 9 8 75227 CASAVA_Build 13 78829173 4D CTATGGGCTC ATAA/---- ATAGTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 ATAA 1 0 75228 CASAVA_Build 13 78831926 2D TTTTGTCTAA AT/-- ATATATATAT 1736 het 1736 ref 19 10 5 4 AT 9 8 75229 CASAVA_Build 13 78832845 1D TACTTGCTTT A/- AAAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 6 5 75230 CASAVA_Build 13 78836266 1I AAAAAAAATC -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 6 7 75231 CASAVA_Build 13 78837923 6D TAATATTGAT AAGAGA/------ AAAAGTAAAC 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 AAGAGA 1 0 75232 CASAVA_Build 13 78838152 2D CATCTAAAAC TG/-- TGTTACATTA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 TG 2 1 75233 CASAVA_Build 13 78841168 1D ACACTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3022 het 3022 ref 21 9 9 3 A 12 11 75234 CASAVA_Build 13 78841525 1D AATGGCTGTT A/- TATTAAGATA 3070 hom 90 het 33 0 28 5 A 1 0 75235 CASAVA_Build 13 78846114 1I AGGTAATTAG -/A AAAAAGGGAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 75236 CASAVA_Build 13 78850064 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 31 2 26 3 A 12 11 75237 CASAVA_Build 13 78851680 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 17 2 A 10 11 75238 CASAVA_Build 13 78853576 3I TACATAATAA ---/TAT TATTATTATG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TAT 3 4 75239 CASAVA_Build 13 78854012 1D TTGAAAGGCA G/- ATGACTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 G 1 0 75240 CASAVA_Build 13 78859429 1I GAACTATGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 10 75241 CASAVA_Build 13 78868078 1D CATAGTGACC A/- ATGAACTTTC 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 A 2 1 75242 CASAVA_Build 13 78868374 4I GTTCCACTTT ----/AAGA AAGAGGAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AAGA 1 2 75243 CASAVA_Build 13 78868821 4I AAAAAAATAG ----/TACT AACCCTAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 TACT 0 1 75244 CASAVA_Build 13 78875005 9I GTTACCTACT ---------/ATTTCCCCA ATATCTTGCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATTTCCCCA 0 1 75245 CASAVA_Build 13 78875227 1D ATGTTAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1377 het 1377 ref 36 22 5 9 A 15 14 75246 CASAVA_Build 13 78881277 1D CTTATGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 11 10 75247 CASAVA_Build 13 78886542 4I TCTGTCAGCT ----/CAGA CAGAGTCAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CAGA 1 2 75248 CASAVA_Build 13 78888240 18D TGATCTGCCC GCCTTGGCCTCTCAAAGT/------------------ GCTAGGATTA 3070 het 3070 hom 17 9 8 1 GCCTTGGCCTCTCAAAGT 1 0 75249 CASAVA_Build 13 78889829 3D GCCCCCTCTA ATC/--- ATGTAAACCC 3070 het 3070 hom 44 20 22 3 ATC 1 0 75250 CASAVA_Build 13 78893564 1D AGTGACTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 125 hom 27 2 10 15 T 13 12 75251 CASAVA_Build 13 78901234 4D ATAATTAGAA ATCT/---- ATCCACCAAC 3070 het 3070 hom 54 24 28 2 ATCT 1 0 75252 CASAVA_Build 13 78907230 1I GACTAAGTGC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 7 8 75253 CASAVA_Build 13 78932939 1D GCTGGCACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1587 hom 16 5 8 3 A 10 9 75254 CASAVA_Build 13 78952763 1D GAGTATACAA C/- AACCTGAGTG 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 C 1 0 75255 CASAVA_Build 13 78954767 1D ATGTAAGACA G/- GTTATAAGCC 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 G 2 1 75256 CASAVA_Build 13 78968809 1I AATTCCACAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 A 8 9 75257 CASAVA_Build 13 78976770 1D GTTCTCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 T 13 12 75258 CASAVA_Build 13 78987995 1I TTCTAATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 T 10 11 75259 CASAVA_Build 13 78990169 1I ATCTGTATTA -/C ACTTTTATTG 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 C 0 1 75260 CASAVA_Build 13 79010117 1I CAGGAAACTT -/A ACGATTGTGG 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 1 2 75261 CASAVA_Build 13 79011204 2D CCTGGAAGAC AT/-- GTAGAAACAT 3070 het 3070 ref 40 22 9 10 AT 1 0 75262 CASAVA_Build 13 79014649 1I CTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1120 het 1120 ref 36 27 3 6 T 10 11 75263 CASAVA_Build 13 79018360 1D ATTAGACAAT A/- AGTAATTTAT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 A 2 1 75264 CASAVA_Build 13 79033655 1D CTGTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 13 12 75265 CASAVA_Build 13 79070716 1D TCAACACTTT C/- CCTCTCTCAC 3070 hom 135 het 49 0 45 4 C 3 2 75266 CASAVA_Build 13 79076115 1D TGATTTCAAC A/- ATGGTTGAAC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 2 1 75267 CASAVA_Build 13 79080083 1I CCAACATCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 9 10 75268 CASAVA_Build 13 79102562 1D TTGATAACTG A/- GCTTCACTAT 3070 het 3070 hom 52 19 28 6 A 1 0 75269 CASAVA_Build 13 79120771 1I ATTACAAGAA -/G GGAACTCACT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 2 3 75270 CASAVA_Build 13 79123618 1D ATTTCTCTTT G/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 G 1 0 75271 CASAVA_Build 13 79124280 5I TAACCATCAC -----/ACTAT ACTGCCTCTT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 ACTAT 0 1 75272 CASAVA_Build 13 79126601 1I TCTTGGTCTA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 8 75273 CASAVA_Build 13 79127146 11I AACTGTAAGG -----------/CATAGAGTGGT CATATCTTTG 3070 hom 108 het 38 0 37 2 CATAGAGTGGT 0 1 75274 CASAVA_Build 13 79151274 1D AGGTATTGCG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 132 het 48 0 45 4 T 10 9 75275 CASAVA_Build 13 79151737 1I GAATAGGTAC -/A AAAAGTCAGA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 4 5 75276 CASAVA_Build 13 79153655 1D ATATATTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 24 2 20 2 T 11 10 75277 CASAVA_Build 13 79156850 1I TCGTATCAAA -/C CAAAGGCCTG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 C 1 2 75278 CASAVA_Build 13 79161861 1I TTTTGGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 21 1 17 3 T 10 11 75279 CASAVA_Build 13 79167992 1I ACTTTGATTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 399 hom 41 1 35 5 A 8 9 75280 CASAVA_Build 13 79168428 1I ATGTTAGTCT -/G TATCTTAACA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 75281 CASAVA_Build 13 79169076 1D AGAAAGAATT G/- TATCAGTCAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 1 0 75282 CASAVA_Build 13 79177807 2I GCTTTATAGT --/AA AGTCTTGAAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 3 75283 CASAVA_Build 13 79179238 4I TCTCACCAGT ----/TTTG TTTGTTTTTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTTG 1 2 75284 CASAVA_Build 13 79196237 1D TCCAAGAAAG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 8 7 75285 CASAVA_Build 13 79197670 4D GGTAATTTAT TTTA/---- TTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 TTTA 2 1 75286 CASAVA_Build 13 79205204 1D ATGATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 T 12 11 75287 CASAVA_Build 13 79218362 4D CCTTTCATTC ATTT/---- GTTTATTCAT 3070 het 3070 ref 34 19 15 1 ATTT 1 0 75288 CASAVA_Build 13 79237185 2D GGTAGGAACT CC/-- CCTTATCTTG 3070 hom 98 het 37 0 31 7 C 4 2 75289 CASAVA_Build 13 79241692 1I TTTAGTTCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 8 9 75290 CASAVA_Build 13 79259406 4I CTACATCCTC ----/ACCA ACCAGCATTT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 ACCA 1 2 75291 CASAVA_Build 13 79260234 1D AATTTTAAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 10 16 8 T 9 8 75292 CASAVA_Build 13 79272703 1D TCATGTCTCC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 T 8 7 75293 CASAVA_Build 13 79275718 3D GAGCGTTCAT CTC/--- CTGGAAACAG 3070 het 3070 hom 56 22 24 12 CTC 1 0 75294 CASAVA_Build 13 79276849 1I ACAAAAAAAA -/T GTGTGTGTGT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 0 1 75295 CASAVA_Build 13 79285343 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1916 het 191 hom 22 3 11 8 T 17 16 75296 CASAVA_Build 13 79298277 1D GGCTCTCTGA G/- AGCAATGCAG 3070 het 3070 hom 41 19 21 2 G 1 0 75297 CASAVA_Build 13 79306886 1D GAGCCTCCTG T/- TTTTTTTTTT 1435 het 1435 ref 25 10 12 4 T 15 14 75298 CASAVA_Build 13 79326578 1I ACTGAGGGTC -/T ACATAGTATG 3070 hom 108 het 39 0 35 4 T 0 1 75299 CASAVA_Build 13 79342049 1I CAAAAAGATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 9 10 75300 CASAVA_Build 13 79345765 1I CTTTGGTGAG -/T TTTTTCACTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 5 6 75301 CASAVA_Build 13 79347366 1D TAAGGCTTTA G/- GGCCCAAATA 3070 het 3070 hom 38 18 19 2 G 3 2 75302 CASAVA_Build 13 79358522 1I CAGAAAATTT -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 A 5 6 75303 CASAVA_Build 13 79377272 1D ACAGAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 33 3 19 11 A 15 14 75304 CASAVA_Build 13 79387126 2D AGCAGCAGCT TA/-- TATTTTCTTT 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 TA 2 1 75305 CASAVA_Build 13 79395128 1D GGTTTTCTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 25 5 T 10 9 75306 CASAVA_Build 13 79395358 1D AGTTTTTTTT G/- GTCTCTATCT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 G 2 1 75307 CASAVA_Build 13 79399782 1D AAGTAGAAGC T/- GGGCATGGTA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 1 0 75308 CASAVA_Build 13 79401943 5D AGAAGTACTA ATACT/----- TGAATGTGAA 3070 het 3070 ref 35 23 9 4 ATACT 1 0 75309 CASAVA_Build 13 79405772 4I GATCTCTGTT ----/ACTC ACTCCCCTTT 3070 hom 122 het 47 0 39 8 ACTC 1 2 75310 CASAVA_Build 13 79415079 1I TAGGGAGCTC -/T TATTTACTGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 75311 CASAVA_Build 13 79416982 1D AAAATTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1140 hom 44 3 33 8 T 12 11 75312 CASAVA_Build 13 79420188 1D TTCTAACCAT C/- CCTAGTGGTT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 C 3 2 75313 CASAVA_Build 13 79450973 2I TCCAATCAAT --/AG AGAGAGAGAG 2640 het 2640 ref 32 18 6 8 AG 5 6 75314 CASAVA_Build 13 79453530 1D AAAAAAGAAG C/- CCCAGGCTTA 3070 het 2748 hom 23 8 7 10 C 4 3 75315 CASAVA_Build 13 79458118 1I CCCACTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 8 T 11 12 75316 CASAVA_Build 13 79497622 4I ATTCCTGCCC ----/CTAA CTTTCAAGAT 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 CTAA 0 1 75317 CASAVA_Build 13 79498383 1I CTTGAAACAG -/A CAGAAGAGGA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 0 1 75318 CASAVA_Build 13 79521782 1D TCATAGGAAG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 7 6 75319 CASAVA_Build 13 79525138 4D AAGTAAGGCA CTTT/---- CTTTGGGAGG 1751 het 1751 ref 27 18 5 4 CTTT 2 1 75320 CASAVA_Build 13 79526005 1I TCCCTGACTG -/T GAAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 T 0 1 75321 CASAVA_Build 13 79532696 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 26 0 13 13 A 13 14 75322 CASAVA_Build 13 79546262 1I CTCCAAAGTA -/T AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 36 1 30 5 T 0 1 75323 CASAVA_Build 13 79556262 1I TGATGCTGCC -/A AAAAATGAAG 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 5 6 75324 CASAVA_Build 13 79630591 1D GACTCCACCG A/- AAAAAAAAAA 1703 het 1703 ref 35 24 4 7 A 12 11 75325 CASAVA_Build 13 79662198 1D CTCCTTTGCC A/- AAAAAAAAAA 2200 het 421 hom 16 1 6 9 A 17 16 75326 CASAVA_Build 13 79667894 4I AGAAAGAAAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AGAA 3 4 75327 CASAVA_Build 13 79675149 1I ACCATATTGG -/C CAGGCTGGTC 3070 hom 78 het 27 0 25 2 C 1 2 75328 CASAVA_Build 13 79682837 1D CTTGCTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 12 11 75329 CASAVA_Build 13 79684220 5I TTCATACTCC -----/CAAGG CTAGATAGAG 3070 hom 171 het 62 0 57 5 CAAGG 0 1 75330 CASAVA_Build 13 79685613 1D GGTGACAGAC A/- AAGACCCTGT 2920 het 2920 ref 25 12 7 6 A 3 2 75331 CASAVA_Build 13 79688196 5D GCTTCTCAAG TTTGA/----- TTTATCTGCA 3070 het 3070 ref 24 10 12 4 TTTGA 1 0 75332 CASAVA_Build 13 79689084 2D TTGTTGATGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 30 4 12 14 T 19 17 75333 CASAVA_Build 13 79693973 4I ATGAGGTCTA ----/AACT AACTAAGATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AACT 1 2 75334 CASAVA_Build 13 79697713 3D TTTTGTATGG TGT/--- TGTTGATTCT 3070 het 3070 ref 59 29 27 3 TGT 2 1 75335 CASAVA_Build 13 79700161 3I TTTTTTCTGC ---/AAG AAGAAGGATT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 AAG 2 3 75336 CASAVA_Build 13 79703746 1D ATTTTACAGG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 8 7 75337 CASAVA_Build 13 79705128 1I CAATGTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 10 11 75338 CASAVA_Build 13 79712468 1I GGGAGAATTC -/T TTTTTTTTTT 1393 het 1393 ref 18 9 3 6 T 13 14 75339 CASAVA_Build 13 79713971 2I GGGCAACAGA --/GC GAGACTCTGT 3070 het 1892 hom 16 4 9 3 GC 0 1 75340 CASAVA_Build 13 79716912 12D2M2D ATTATCTAGT TATAACCACCTAGTTA/------------GT-- TTACCTGTTA 3070 het 3070 ref 51 30 21 8 N/A 0 0 75341 CASAVA_Build 13 79728037 1D CTAGAATCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 475 hom 29 1 17 11 T 10 9 75342 CASAVA_Build 13 79728064 4D CACTCCCTCT CTAA/---- CTAATCTGAT 3070 het 1047 hom 33 3 12 19 CTAA 2 1 75343 CASAVA_Build 13 79737206 3I AAAAATTTAA ---/TAG TATTTACTTA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TAG 0 1 75344 CASAVA_Build 13 79740078 1I AAATTAGGCT -/G GGCGCAGCTG 3070 hom 39 het 15 0 13 3 G 2 3 75345 CASAVA_Build 13 79743064 1I AATTAATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 763 hom 25 4 14 7 T 15 16 75346 CASAVA_Build 13 79745571 4I TTTACTTTAT ----/TTAA TTAATTAATT 3070 hom 42 het 22 0 14 8 TTAA 2 3 75347 CASAVA_Build 13 79747883 1D ATGCTTAGGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 A 8 7 75348 CASAVA_Build 13 79749339 1I GCCTCTCGGC -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 6 7 75349 CASAVA_Build 13 79769676 1D TTCCTGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 15 14 75350 CASAVA_Build 13 79785523 1D CCACCCAGAG T/- TTGGTCACAG 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 T 3 2 75351 CASAVA_Build 13 79790470 2D TTTTTTAGAC AG/-- AGTCTTGATC 3070 het 2686 hom 27 7 12 8 AG 2 1 75352 CASAVA_Build 13 79796429 1I TTGCCCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 35 1 24 10 T 12 13 75353 CASAVA_Build 13 79797533 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2729 het 2729 ref 18 7 8 3 A 11 12 75354 CASAVA_Build 13 79798586 2D TCTTTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 80 het 31 0 27 5 TG 8 7 75355 CASAVA_Build 13 79801484 2D TATCCTAATG GT/-- GTGTAGGTCA 3070 hom 140 het 52 0 45 8 GT 3 2 75356 CASAVA_Build 13 79814301 4D ATTCATTAAT AGAC/---- AGGAACAAGA 2182 het 2182 ref 16 8 5 3 AGAC 1 0 75357 CASAVA_Build 13 79824567 1D TCACTGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 32 1 26 7 A 12 11 75358 CASAVA_Build 13 79826838 1D TGTTATTCTA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 75359 CASAVA_Build 13 79835210 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2222 het 1077 hom 27 5 7 15 T 17 16 75360 CASAVA_Build 13 79839390 1D TTGGCCTAGA G/- GGGGGTCTAT 3070 het 3070 ref 34 22 8 5 G 6 5 75361 CASAVA_Build 13 79841441 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1130 hom 5 het 8 0 3 5 T 15 16 75362 CASAVA_Build 13 79868703 5D ATGCACATAC CTTAA/----- CTTAAAAATA 3070 het 3070 ref 54 26 23 8 CTTAA 2 1 75363 CASAVA_Build 13 79870041 5D TTTAAAACAG TTTCT/----- TTTAAGTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 TTTCT 1 0 75364 CASAVA_Build 13 79886484 1I CAGCCATTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 53 19 22 12 A 9 10 75365 CASAVA_Build 13 79890133 3I CTTATACTCT ---/TTA TTGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 TTA 0 1 75366 CASAVA_Build 13 79891836 1I TTGGGCACAT -/G GCGTTTGATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 2 75367 CASAVA_Build 13 79898190 31D GGGATACCTG GTGATATGCTGTAGTCTCTACAGCTGGTATT/------------------------------- GTGATATGCT 3070 hom 69 het 35 0 24 12 GTGATATGCTGTAGTCTCTACAGCTGGTATT 1 0 75368 CASAVA_Build 13 79899498 1D GTGAAAAAGG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 A 8 7 75369 CASAVA_Build 13 79900046 3D AATACTGAGT AGG/--- AGGTTTCTAC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 AGG 2 1 75370 CASAVA_Build 13 79905661 2D GAAGTCACTA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 482 hom 39 2 22 17 T 11 9 75371 CASAVA_Build 13 79906265 1D TGTATTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 482 hom 39 7 18 15 A 12 11 75372 CASAVA_Build 13 79912571 3D ACTTGCAGTG ACA/--- ACAACAATAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 ACA 3 2 75373 CASAVA_Build 13 79916069 1I ATTTTAATGA -/G GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 G 5 6 75374 CASAVA_Build 13 79917603 1I GGACTGTATC -/T TTTTTTTTTT 2549 het 2549 ref 19 8 9 2 T 13 14 75375 CASAVA_Build 13 79927345 2D ATAAAACTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 13 11 75376 CASAVA_Build 13 79930326 1D TAAAATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 33 0 22 12 A 13 12 75377 CASAVA_Build 13 79938472 1D AGCATGGGAA G/- GGGGGGTGAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 G 7 6 75378 CASAVA_Build 13 79940924 2D CACATGTAAC TG/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 TG 1 0 75379 CASAVA_Build 13 79949266 2D ACTGAATCCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 68 het 45 0 30 15 GT 10 9 75380 CASAVA_Build 13 79950608 6D CTAGGTGTCG TATATA/------ TATATATATA 3070 het 281 hom 24 1 11 14 TA 12 9 75381 CASAVA_Build 13 79959366 8I AGGGATTTGG --------/ATGGAGTA AGACAGGAGG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 ATGGAGTA 0 1 75382 CASAVA_Build 13 79974081 5I CTAATTCTCC -----/CTCTT CTCTTGAGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CTCTT 1 2 75383 CASAVA_Build 13 79977200 1I TTTCATCAAC -/T TTTTTTTGAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 8 75384 CASAVA_Build 13 79987615 1I GATTTTGTTC -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 T 6 7 75385 CASAVA_Build 13 79988966 3D CGTTTTGTAG TTC/--- TTCTTGTAGA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TTC 2 1 75386 CASAVA_Build 13 79997839 1I TAGACAAGCC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 8 9 75387 CASAVA_Build 13 80000914 1D ATTCAAATAG A/- CATTATACTA 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 A 1 0 75388 CASAVA_Build 13 80003011 1D TAAATGTAAG T/- TTTTTTATCC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 7 6 75389 CASAVA_Build 13 80005905 1D GTAGTACTTG A/- AAAATAATCC 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 A 5 4 75390 CASAVA_Build 13 80012256 1D TATTGAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 4 T 12 11 75391 CASAVA_Build 13 80015663 1I AAATTAACTC -/T CTGATAACGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 1 75392 CASAVA_Build 13 80022577 1I TAACTTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 562 hom 33 2 25 6 T 10 11 75393 CASAVA_Build 13 80024678 3D GAAAGAAGAA AAG/--- AAGGAAAGAA 3070 het 2320 hom 18 8 9 1 AAG 2 1 75394 CASAVA_Build 13 80026067 1D CAAAGGGGGC A/- AAAAAAGATA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 7 6 75395 CASAVA_Build 13 80027616 1I GTTTCATAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 9 10 75396 CASAVA_Build 13 80029525 22I ACTTTCGTAA ----------------------/GGACCTTCATTGTAAAAGGCAG TGTTCTCAAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 GGACCTTCATTGTAAAAGGCAG 0 1 75397 CASAVA_Build 13 80030463 2D CTCCATTCCC CT/-- GTTTCTAACA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 CT 1 0 75398 CASAVA_Build 13 80031456 2D GGGTGATGAC TT/-- TGGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 26 11 7 T 3 1 75399 CASAVA_Build 13 80033840 1D GTGAGAAAAC A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 32 11 18 5 A 7 6 75400 CASAVA_Build 13 80042995 1I AATTCTCTTA -/T TTTCCCAAGT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 T 3 4 75401 CASAVA_Build 13 80047691 1D AGATTTTTTT C/- CCCCTCATTT 3070 het 3070 ref 38 24 14 0 C 5 4 75402 CASAVA_Build 13 80048668 15I GTTTAATACA ---------------/ATTTTGAATGGGATG ATTGGTCATT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 ATTTTGAATGGGATG 0 1 75403 CASAVA_Build 13 80052798 1D AAAGGCAGTG C/- TAAGAGGAAA 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 C 1 0 75404 CASAVA_Build 13 80054726 19D AAATCAGTAA GACAAAAACAAACGATCCC/------------------- GACAAAAACA 1477 het 1477 ref 23 21 4 3 GACAAAAACAAACGATCCC 2 1 75405 CASAVA_Build 13 80056033 1I TTAAAAAAAG -/A AAGAAATACA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 2 3 75406 CASAVA_Build 13 80058134 1D AAACCAACAC T/- TTTTTTTTTT 2335 het 2335 ref 29 14 6 9 T 11 10 75407 CASAVA_Build 13 80061917 1D TTCTGTAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 13 12 75408 CASAVA_Build 13 80062775 1I TCACTGGGTT -/A AAAATGTTGG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 4 5 75409 CASAVA_Build 13 80063645 1D AGGCAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 15 14 75410 CASAVA_Build 13 80085535 1D ATACAGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 11 10 75411 CASAVA_Build 13 80086103 2D TTCAGGGATC TT/-- TTTTTTTTTT 2955 het 2955 ref 27 10 7 10 T 12 10 75412 CASAVA_Build 13 80090076 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 1243 het 1243 ref 22 11 4 7 A 12 14 75413 CASAVA_Build 13 80092374 1I AACAGTGGGG -/A AAAATAGATT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 4 5 75414 CASAVA_Build 13 80092764 2I TAATAAAGCC --/AT ATATATATAT 3070 het 292 hom 33 2 23 8 AT 8 9 75415 CASAVA_Build 13 80096934 1D CCTGATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 29 1 16 12 T 11 10 75416 CASAVA_Build 13 80105104 1I AGACTGGTTA -/T TTTTCAGTTC 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 T 4 5 75417 CASAVA_Build 13 80108992 1D TCTTTTCCCA G/- GGGCCACCCA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 4 3 75418 CASAVA_Build 13 80110896 5I TTCCTTTTAT -----/ACTTC ACTTTATCTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 ACTTC 0 1 75419 CASAVA_Build 13 80113874 1I TTATTTAGAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 8 9 75420 CASAVA_Build 13 80117513 1D CAAGTCAGAG T/- TATTTAAGGT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 2 1 75421 CASAVA_Build 13 80124922 1D TTATTTGTAT G/- ATATACAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 G 1 0 75422 CASAVA_Build 13 80127917 1I ATAAATGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 9 10 75423 CASAVA_Build 13 80134055 1I TGTTGGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 32 0 22 10 T 11 12 75424 CASAVA_Build 13 80141276 1I AAATGCTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 736 hom 37 2 30 5 T 9 10 75425 CASAVA_Build 13 80142188 1D TATAGAGGGG A/- AAAACCACAT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 5 4 75426 CASAVA_Build 13 80182335 1I ATGAGCTGGA -/G GGAAAATGTT 3070 het 3070 ref 34 20 14 0 G 2 3 75427 CASAVA_Build 13 80187554 1I TACTTAAGAC -/T TTTATGTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 3 4 75428 CASAVA_Build 13 80189031 1D TCCTTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 2394 het 2394 ref 25 10 7 8 T 10 9 75429 CASAVA_Build 13 80194959 1I TTAAGCTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 T 9 10 75430 CASAVA_Build 13 80204253 1D AGGGTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2460 het 2056 hom 18 6 6 6 T 12 11 75431 CASAVA_Build 13 80205838 5I TACTACAATC -----/TTAAA TTAAGTACCT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TTAAA 0 1 75432 CASAVA_Build 13 80208153 4I TTTTCTTTTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 TCTT 2 3 75433 CASAVA_Build 13 80214254 1D ATAATGACTA T/- AATTTAAGCT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 1 0 75434 CASAVA_Build 13 80216412 1I ACCAACAAAG -/A TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 0 1 75435 CASAVA_Build 13 80218652 2D TAGAGATTAG AT/-- TTTGTTTGCT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 AT 1 0 75436 CASAVA_Build 13 80221015 2I AAACCCAGGG --/TT TTTTTTTTTT 2127 het 2127 ref 25 10 6 9 T 10 12 75437 CASAVA_Build 13 80223444 2D ACCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2815 het 1075 hom 31 13 8 10 A 18 16 75438 CASAVA_Build 13 80236758 1D TTTAGGTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 15 20 8 A 10 9 75439 CASAVA_Build 13 80240757 1D GTCTTAAACT G/- GGGGGGGAAC 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 G 8 7 75440 CASAVA_Build 13 80247251 1D CTAAAGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 11 10 75441 CASAVA_Build 13 80255158 2I ATTCATGTTT --/TA TATATATATA 3070 hom 59 het 31 0 19 12 TA 8 9 75442 CASAVA_Build 13 80258070 1D GTTGCTTTTT C/- TGAGAATTTC 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 C 1 0 75443 CASAVA_Build 13 80258428 2I GTAATTTAGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 21 10 8 TA 5 6 75444 CASAVA_Build 13 80260201 1I CATTAAAATA -/C TTTGTCTAGG 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 C 0 1 75445 CASAVA_Build 13 80264419 11D20M5D TCTTTCTTTC TTCTTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTCTCTCTTTCT/-----------TCTTTCTTTTTCTTTCTCTC----- TTTCTTTTCT 1238 het 1238 ref 14 5 5 7 N/A 0 0 75446 CASAVA_Build 13 80272714 7D TAAGTTCTTA TTTATTT/------- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 5 TTTATTT 3 2 75447 CASAVA_Build 13 80280014 5D AAATGAAGTT TATAA/----- TATTTTTCTC 3070 het 3070 hom 31 11 17 5 TATAA 1 0 75448 CASAVA_Build 13 80280978 2D GAAATAAAAC AG/-- AAGTGTGAAA 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 AG 1 0 75449 CASAVA_Build 13 80286641 1I ATAATTGGAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 6 7 75450 CASAVA_Build 13 80289123 3D ATATTACATA TTG/--- TAGCAGATTA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TTG 1 0 75451 CASAVA_Build 13 80293628 1D AGTTTTGGGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 9 8 75452 CASAVA_Build 13 80296974 1I CAATATGTAG -/T TTTTTTTATC 3070 het 1434 hom 16 4 9 3 T 7 8 75453 CASAVA_Build 13 80302813 1D GACACCAGCT G/- GGACAGACAA 3070 het 3070 ref 51 22 19 10 G 3 2 75454 CASAVA_Build 13 80311971 1I GGGTCAAACA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 8 9 75455 CASAVA_Build 13 80312449 1D GTTTCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 22 1 17 4 A 12 11 75456 CASAVA_Build 13 80317324 4I CCAGGCCTGT ----/GAAG GAAGCCATTA 3070 hom 71 het 27 0 24 3 GAAG 1 2 75457 CASAVA_Build 13 80319318 1D ATCTAAATTC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 7 6 75458 CASAVA_Build 13 80327075 2I CTCTATAGAC --/TG TGTTATTATT 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 TG 1 2 75459 CASAVA_Build 13 80333978 4D TTATTTTGTT TATC/---- TACTGTCATA 3070 het 3070 ref 28 17 9 4 TATC 1 0 75460 CASAVA_Build 13 80334645 1I TTCTAATTTT -/A AAAAATACTC 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 A 5 6 75461 CASAVA_Build 13 80337028 2I AAAACAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 A 10 12 75462 CASAVA_Build 13 80351386 1I GTATGTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2978 hom 28 7 14 7 T 14 15 75463 CASAVA_Build 13 80362427 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 10 11 75464 CASAVA_Build 13 80362526 1D50M1I ATTGTCTGCG TTTTTTTTTTAAGTAGCTGACTGACTTTAAAATTATCATGTGTGATGTGCA-/-TTTTTTTTTAAGTAGCTGACTGACTTTAAAATTATCATGTGTGATGTGCAT TTTTTTTCTA 1853 het 1853 ref 27 30 4 9 N/A 0 0 75465 CASAVA_Build 13 80368712 1D TAAGTGGACC A/- ATCAGCACTC 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 A 2 1 75466 CASAVA_Build 13 80369393 1I TAGTGTCAGA -/G GCTATCAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 G 1 2 75467 CASAVA_Build 13 80369923 1I CAATATGGAG -/A AAAAAGGGAG 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 5 6 75468 CASAVA_Build 13 80392481 1I AGATACTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 13 19 13 T 9 10 75469 CASAVA_Build 13 80397295 5D AGTATCATTC TTTTA/----- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 TTTTA 1 0 75470 CASAVA_Build 13 80410532 1I TCATTGTCTC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 44 25 12 7 T 7 8 75471 CASAVA_Build 13 80438794 2I GAGTAACACA --/AC ACACTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 AC 2 3 75472 CASAVA_Build 13 80475123 1I TCTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 A 12 13 75473 CASAVA_Build 13 80485657 1D ATGGATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 273 hom 27 3 18 7 T 15 14 75474 CASAVA_Build 13 80498911 4I GAAGGCAAGG ----/AAGA AAGAGCAAGT 3070 hom 80 het 32 0 25 7 AAGA 1 2 75475 CASAVA_Build 13 80500335 12D CTTTCCTTCT TTCCTTCCTTCC/------------ TTCCTTCCTT 3070 hom 35 het 16 0 12 6 TTCC 7 4 75476 CASAVA_Build 13 80501691 1I ATTTTTTATA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 64 het 24 0 22 2 T 8 9 75477 CASAVA_Build 13 80515836 1D GTGCTAAATA T/- TACTCCTGGA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 2 1 75478 CASAVA_Build 13 80568648 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 555 hom 10 3 7 0 A 10 9 75479 CASAVA_Build 13 80570566 1D GCATCCTTGC A/- AAAAAAAAAG 1385 het 1385 ref 53 39 4 10 A 10 9 75480 CASAVA_Build 13 80606215 1I ATATGCTGAG -/A AAAAAGTGGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 5 6 75481 CASAVA_Build 13 80627902 8D AACACAGAAA AAACTCAG/-------- AAACTCAGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 AAACTCAG 2 1 75482 CASAVA_Build 13 80633859 1D TCTATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 11 10 75483 CASAVA_Build 13 80644909 1I AAGCCAAACA -/G GTGCATAATG 3070 hom 129 het 56 0 43 13 G 1 2 75484 CASAVA_Build 13 80647346 4I23M4D TTTCTATATC ----TTCTCCTCCATTTCTGCTTTTTCTCTT/TTCTTTCTCCTCCATTTCTGCTTTTTC---- TCTTTCTTTC 3070 hom 102 het 26 0 35 0 N/A 0 0 75485 CASAVA_Build 13 80648161 2D TGACAGTAAC AT/-- AAATCTGAAA 3070 het 3070 hom 55 16 29 11 AT 1 0 75486 CASAVA_Build 13 80651844 14I GGGGTAGATC --------------/ACTTGAGGCCAGGA ATTCGAGACC 3070 hom 45 het 20 0 15 5 ACTTGAGGCCAGGA 0 1 75487 CASAVA_Build 13 80656985 5I TTTAGATAAT -----/AACTC AACCAATTGC 3070 het 3070 hom 50 23 25 2 AACTC 0 1 75488 CASAVA_Build 13 80659556 1I CCTGCCTTGG -/C CTCCCAAAGC 3070 hom 21 het 13 0 8 5 C 1 2 75489 CASAVA_Build 13 80659935 1I AAAACTCTGT -/C CCCCCCCTCC 1939 het 1939 ref 15 8 5 2 C 7 8 75490 CASAVA_Build 13 80669981 1D ATAAGCTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 11 10 75491 CASAVA_Build 13 80686427 2I GTAAATAATG --/TT TTGAAAGATC 3070 het 3070 ref 44 19 12 13 T 2 4 75492 CASAVA_Build 13 80686486 5D TGGACAGACC TTATT/----- TTAGTTCTTA 3070 het 3070 hom 42 14 23 6 TTATT 1 0 75493 CASAVA_Build 13 80693166 1I TCATCAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 11 12 75494 CASAVA_Build 13 80694877 4I TTATCTGTCA ----/TCTG TCTATCTATC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 TCTG 0 1 75495 CASAVA_Build 13 80696613 2D GGTCTGCCAC AT/-- GTTTTGGTAA 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 AT 1 0 75496 CASAVA_Build 13 80696937 3D ACTAAAATAA TTG/--- TTAATTGAAC 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 TTG 1 0 75497 CASAVA_Build 13 80698611 7D AAGGTATAAA TAAACAT/------- TATTATCATA 3070 het 3070 ref 26 16 11 1 TAAACAT 1 0 75498 CASAVA_Build 13 80700747 2I TAATGTATTG --/CA CAGTCCAGGT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 CA 1 2 75499 CASAVA_Build 13 80703408 1I GATACATAGG -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 T 6 7 75500 CASAVA_Build 13 80704154 1I ATTTATCTCA -/T TTTTAAGGCT 3070 het 2050 hom 23 6 11 6 T 4 5 75501 CASAVA_Build 13 80707430 3I GATATTTTAT ---/AGG AGGCTAGTTG 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 AGG 1 2 75502 CASAVA_Build 13 80708263 4D GAGTTGTCAG AAAT/---- AAAGAAATAT 2313 het 2313 ref 20 13 5 3 AAAT 1 0 75503 CASAVA_Build 13 80708765 1I TTAATCCAGG -/A AAAAAAAACA 2794 het 2794 ref 24 12 8 4 A 8 9 75504 CASAVA_Build 13 80710429 1D ATTTTTATTT A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 8 7 75505 CASAVA_Build 13 80715142 1D TACTATTGTA C/- CCCCCACACA 3070 het 3070 hom 45 22 22 2 C 6 5 75506 CASAVA_Build 13 80718850 1D TTTGGAAGGC A/- AAAGTACACC 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 A 4 3 75507 CASAVA_Build 13 80729650 1D GAAACTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 T 11 10 75508 CASAVA_Build 13 80729790 1D AAAGATAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 8 7 75509 CASAVA_Build 13 80733102 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 33 0 26 7 T 10 11 75510 CASAVA_Build 13 80733627 1D GACTTACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 9 8 13 T 15 14 75511 CASAVA_Build 13 80740090 1D TAATAAAAAA T/- AAATGCTTTG 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 T 1 0 75512 CASAVA_Build 13 80741169 1D GAGCTTCAGG A/- AACTTAATCA 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 A 3 2 75513 CASAVA_Build 13 80760979 1D CACAACAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 11 10 75514 CASAVA_Build 13 80778953 1D ACAGATTAAC A/- AAGAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 3 2 75515 CASAVA_Build 13 80804645 1D AAAATCTATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 10 9 75516 CASAVA_Build 13 80805453 1D TTCTACTTTC T/- TTTAAAAAGG 3070 het 3070 hom 40 14 25 1 T 4 3 75517 CASAVA_Build 13 80820868 1D GATTTTAAAC A/- GTAACACTCA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 A 1 0 75518 CASAVA_Build 13 80821430 1D AATTAGATAC T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 T 4 3 75519 CASAVA_Build 13 80827851 2D CCAAAGTGCT GG/-- GATTACAGGC 3070 het 907 hom 19 3 16 1 G 3 1 75520 CASAVA_Build 13 80834475 18I TCTGCATTTC ------------------/CAACTGAGGTACCTGGTT CATCTCAATG 2635 het 2635 ref 35 17 9 9 CAACTGAGGTACCTGGTT 0 1 75521 CASAVA_Build 13 80857947 3D CTTCTTCTTC TTT/--- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 10 7 75522 CASAVA_Build 13 80863822 4I AAATTTTAAT ----/AAAC AATTTTCATT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 AAAC 0 1 75523 CASAVA_Build 13 80866472 1I CAATCACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 10 11 75524 CASAVA_Build 13 80866593 1I TCACAAATTT -/C CCTTGAATGT 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 C 2 3 75525 CASAVA_Build 13 80896444 1I TGTCACTAAG -/A AAAAAACTAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 6 7 75526 CASAVA_Build 13 80898280 1D ATTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2243 hom 35 8 12 15 T 15 14 75527 CASAVA_Build 13 80904790 2D GTAAGAAGAC AT/-- ATATATGTGT 2822 het 2822 ref 37 20 11 6 AT 4 3 75528 CASAVA_Build 13 80913657 1I AAGTCCATGC -/T TTTATACCAC 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 T 3 4 75529 CASAVA_Build 13 80915271 1I AAGTCTGAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 9 10 75530 CASAVA_Build 13 80915527 2D GATGCTTCAG TT/-- TTTTTTTTTT 2658 het 2658 ref 18 9 7 2 T 12 10 75531 CASAVA_Build 13 80922462 1D ATCAGCTTGC G/- GATGGCCTAT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 2 1 75532 CASAVA_Build 13 80924837 1I GAAGAGTTAC -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 34 19 8 7 A 6 7 75533 CASAVA_Build 13 80958275 1D GTATTATATC T/- TTTTTTAATC 3070 hom 111 het 44 0 37 8 T 7 6 75534 CASAVA_Build 13 80959303 2I ACTCTTAACA --/CT CTCACTACTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 CT 1 2 75535 CASAVA_Build 13 80961117 2D TCAGTTGCTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 60 hom 30 1 24 6 TG 7 6 75536 CASAVA_Build 13 80965636 1I TTATTAATGG -/A TAAAGCAATT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 0 1 75537 CASAVA_Build 13 80966089 1I AATTTATACC -/A AAAAAAAAAG 1857 het 1857 ref 32 14 8 10 A 9 10 75538 CASAVA_Build 13 80991867 1I CTGTAATCCC -/A GCTACTTGGG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 0 1 75539 CASAVA_Build 13 80991984 5D TCCATCTCAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 AAAAT 5 4 75540 CASAVA_Build 13 81027059 2D TAGAAATCAA AG/-- AGAGATGATA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 AG 3 2 75541 CASAVA_Build 13 81030951 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 8 7 75542 CASAVA_Build 13 81044199 2D TCTTTAGATA CT/-- CTTTTTATTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 CT 2 1 75543 CASAVA_Build 13 81049225 1I TCTAGATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 12 16 17 T 13 14 75544 CASAVA_Build 13 81058682 2I AAATAAAAAC --/TG TCAACTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 TG 0 1 75545 CASAVA_Build 13 81067785 1D CCTTCCTGAG A/- AAAAGTTAGG 3070 het 3070 ref 39 19 17 6 A 5 4 75546 CASAVA_Build 13 81068052 1D ATGACATTCT G/- GAAGACTAAT 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 G 2 1 75547 CASAVA_Build 13 81070619 1D TCAGGTATTC T/- TTTATAGCAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 6 T 4 3 75548 CASAVA_Build 13 81070829 2I AATTTGAAAC --/AG AATATAACAT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 AG 0 1 75549 CASAVA_Build 13 81076283 2D TTAATCACAG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 11 9 75550 CASAVA_Build 13 81078197 4D TTTAGGAATC AATT/---- AATACATTAG 3070 het 3070 ref 37 18 17 4 AATT 1 0 75551 CASAVA_Build 13 81087824 1I TTTGTTGGTA -/T TTTTGCCTAA 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 T 4 5 75552 CASAVA_Build 13 81088291 4I TGTGAATATT ----/AGAC AGGCAAATAT 3070 het 3070 hom 40 15 25 0 AGAC 0 1 75553 CASAVA_Build 13 81090264 4I TTTGACAATT ----/TAAA TAAATAAATG 3070 het 3070 hom 53 23 25 5 TAAA 2 3 75554 CASAVA_Build 13 81090872 1D GAAGTAATTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 A 9 8 75555 CASAVA_Build 13 81091004 2D62M4I CCCTTTTACA CTCTCTGACTGCAGGAAATGAAAGCATACGTCTAGAAAATTGTTAAATTCTCCATTTTAGATAA----/--CTCTGACTGCAGGAAATGAAAGCATACGTCTAGAGAATTGTTAAATTCTCCATTTTAGATAACTCT CTATTTCAGA 3070 het 3070 hom 40 28 28 4 N/A 0 0 75556 CASAVA_Build 13 81092258 1D AGAAAATAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 10 9 75557 CASAVA_Build 13 81104011 2D TAGATAAAGA GT/-- CAAACCCACT 3070 het 3070 hom 25 13 12 0 GT 1 0 75558 CASAVA_Build 13 81113674 1D TGTTTTGTAA T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 T 7 6 75559 CASAVA_Build 13 81119110 2I TCCATCCCAA --/AT ATGTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 AT 1 2 75560 CASAVA_Build 13 81120448 2D TTATATATAC AT/-- ATATATATAT 2760 het 2760 ref 22 10 7 5 AT 7 6 75561 CASAVA_Build 13 81128519 1D TTGAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 11 10 75562 CASAVA_Build 13 81134286 4D ACACACACAT ACAC/---- ACACACACAC 2716 het 2716 ref 26 10 12 5 AC 8 6 75563 CASAVA_Build 13 81150972 1D CTAAAATAAT G/- CACCATGAAA 3070 het 3070 ref 33 22 8 3 G 1 0 75564 CASAVA_Build 13 81151755 1D GTGAAGTAAG A/- AAAATATATC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 5 4 75565 CASAVA_Build 13 81152148 1D GACTAATGTC A/- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 16 12 3 2 A 11 10 75566 CASAVA_Build 13 81164874 5D TTCATGTGAT TACTC/----- TATACTTTTT 3070 het 3070 hom 53 22 27 5 TACTC 1 0 75567 CASAVA_Build 13 81170994 1D ATTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 42 0 32 10 T 11 10 75568 CASAVA_Build 13 81175246 1D TGTAGCTTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 10 9 75569 CASAVA_Build 13 81175799 1I AAATGGGGTA -/T TACTCACCAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 2 75570 CASAVA_Build 13 81177071 1D TGAAAATCTA C/- GTAAAACAAA 3070 het 3070 hom 42 14 21 8 C 1 0 75571 CASAVA_Build 13 81180851 1I TCAGGATAGA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 6 7 75572 CASAVA_Build 13 81182246 3D TAGGAAGGAG CTC/--- CTCCTCCTTG 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 CTC 3 2 75573 CASAVA_Build 13 81186298 1D TTAATATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 12 11 75574 CASAVA_Build 13 81187507 6D TTACCCAAAC TAAAAG/------ TAAAACACTT 3070 het 3070 ref 36 23 12 7 TAAAAG 1 0 75575 CASAVA_Build 13 81189261 1D TTGTTGGATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 10 9 75576 CASAVA_Build 13 81191558 88D CCTTAGTAAG CACCGCTTACAAATAGGTGGTGATAGAAAGACATGGATATATTTGACATCTCTTTCTTATACTCTCAACGTGTTGTCAATATAATCAC/---------------------------------------------------------------------------------------- CACTGCATTT 2945 het 2945 ref 32 42 8 5 CACCGCTTACAAATAGGTGGTGATAGAAAGACATGGATATATTTGACATCTCTTTCTTATACTCTCAACGTGTTGTCAATATAATCAC 1 0 75577 CASAVA_Build 13 81194271 5D TTATAAAGTC AAAAT/----- AAAATATTTA 3070 het 3070 ref 27 16 11 1 AAAAT 2 1 75578 CASAVA_Build 13 81196033 4D GTTTTTGTTC GTTT/---- GTTTGTTTGA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 GTTT 3 2 75579 CASAVA_Build 13 81206104 1I AAATCCATGA -/T TCTCCTGTCT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 2 75580 CASAVA_Build 13 81206536 5I GGAAGGTAAC -----/TAGTT TACTAGAAAG 3070 hom 175 het 62 0 58 4 TAGTT 0 1 75581 CASAVA_Build 13 81207872 4I GGGAGGTGAG ----/AAAC AAACAAACAG 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 AAAC 2 3 75582 CASAVA_Build 13 81210009 1I GTGACCTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 9 10 75583 CASAVA_Build 13 81210389 20D TTTCTCATTT ATGCTGGTAACTTGGCCCTC/-------------------- ATTAAGTTCC 3070 het 3070 ref 47 30 21 1 ATGCTGGTAACTTGGCCCTC 1 0 75584 CASAVA_Build 13 81216316 1D ATTTCATTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 T 9 8 75585 CASAVA_Build 13 81232099 3D AAGGTGGGCC TGA/--- TAAGAAGTGA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 TGA 1 0 75586 CASAVA_Build 13 81235254 3D GTTCATGATA ATT/--- ATTTTTCATT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 ATT 2 1 75587 CASAVA_Build 13 81235601 2D TATTGCTGAG AC/-- AGTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 AC 1 0 75588 CASAVA_Build 13 81235809 1I AAGATGCACA -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 T 6 7 75589 CASAVA_Build 13 81245226 8D AGAGCAGATT TAAAGGAG/-------- TGATCTTAAA 1058 het 1058 ref 40 22 4 17 TAAAGGAG 1 0 75590 CASAVA_Build 13 81247545 1D GGAACCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 11 10 75591 CASAVA_Build 13 81251021 1I AGATCTCTAA -/T TTATTTCAGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 75592 CASAVA_Build 13 81254874 9D4M9I20M1I20M5D17M14D8M3D CAGTCTTATA AAACTGTCCTTGT---------ATAAACCATAGCTCCCTTAT-AGCAGCCAGGACTCACTGCTGAAAACTTAGAGAGGTTTTATTGTCATCTCAAAATATATCAAAGGTT/---------TTTTGAGATGACAATAAAACCTCTCTAAGTTTTCAGCAGTGAGTCCTGGCTGCT-----ATAAGGGAGCTATGGTT--------------TATACAAG--- GGCAAAAAGA 3070 het 422 hom 25 5 37 2 N/A 0 0 75593 CASAVA_Build 13 81255989 1D CACTCTAAAA G/- TTTCCTTATT 3070 hom 138 het 50 0 46 5 G 1 0 75594 CASAVA_Build 13 81257344 2I ATATATATAT --/AC ATACACACAC 3070 het 156 hom 24 2 20 2 AC 0 1 75595 CASAVA_Build 13 81259324 5I4M6D AGCATGGTAC -----TGGTACCAAA/TGTTTTGGT------ ACACATATAT 1793 hom 18 het 8 0 6 2 N/A 0 0 75596 CASAVA_Build 13 81259864 10D AACCCACAAC CCCATCAAAA/---------- CCCATCAAAA 1426 hom 18 het 17 0 5 12 CCCATCAAAA 2 1 75597 CASAVA_Build 13 81260883 4I CATCATTCTG ----/CTCT CTATGAGTTC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 CT 1 3 75598 CASAVA_Build 13 81261166 1D ATCTAGTAAA T/- GATGGCACAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 0 75599 CASAVA_Build 13 81263407 3D ATAAAAATAT AGA/--- AGGTATACTA 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 AGA 1 0 75600 CASAVA_Build 13 81264571 3D ATAAACAAAT AAC/--- AATACATTGT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 AAC 1 0 75601 CASAVA_Build 13 81267873 3I TTCTGCTTTT ---/TAC TTACTAAAAT 3070 hom 70 het 27 0 24 3 TAC 0 1 75602 CASAVA_Build 13 81269192 4D TTAAATTGAA TTGT/---- TTATTTTAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTGT 1 0 75603 CASAVA_Build 13 81269922 2D TCTCTGAATC AT/-- ATGTTATAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AT 2 1 75604 CASAVA_Build 13 81274532 1D CATATGTAAG T/- TACAACTCAG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 2 1 75605 CASAVA_Build 13 81274724 3D ATAAAAATAT ATA/--- ATGTTTTAAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ATA 1 0 75606 CASAVA_Build 13 81275156 6I TTATGGCATT ------/ATTACC ATTACTATTA 3070 hom 111 het 42 0 36 6 ATTACC 0 1 75607 CASAVA_Build 13 81275873 1I TAAAGTATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 6 A 9 10 75608 CASAVA_Build 13 81279021 6I ACTCACACTT ------/ATTTAG TCCTGGTGAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 ATTTAG 0 1 75609 CASAVA_Build 13 81282262 4I TGCTGAAGGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 AAAC 3 4 75610 CASAVA_Build 13 81285659 1I ACAGAAACAG -/A AAAAAATTCT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 6 7 75611 CASAVA_Build 13 81285728 1I AACAAAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 29 0 23 6 A 10 11 75612 CASAVA_Build 13 81289475 4D AAAGCCATCT ACAG/---- AGTAGACAGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 ACAG 1 0 75613 CASAVA_Build 13 81298739 1I GTATTTTTTT -/G TTTATGTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 G 0 1 75614 CASAVA_Build 13 81300923 1D TGAGAAATCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 9 8 75615 CASAVA_Build 13 81301670 1D ATCCATCTTG A/- GTTGATTTTT 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 A 1 0 75616 CASAVA_Build 13 81312385 3D14M2I ACCTTATGTG GATGATAGCAGGCAAGA--/---GATAGCAGGCAAGAAG AGAGAGCTTG 3070 het 473 hom 31 2 15 18 N/A 0 0 75617 CASAVA_Build 13 81318501 4I GAAATCTGAC ----/AAAT AAATTTCTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAAT 1 2 75618 CASAVA_Build 13 81318772 1D AACAGGCTGT G/- GGGGGTATAC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 G 6 5 75619 CASAVA_Build 13 81320834 2D TTATGAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 40 2 12 26 T 16 14 75620 CASAVA_Build 13 81321312 4I CTTGTTTAAC ----/AGTT TATTTGCAAC 2856 het 2856 ref 20 11 7 2 AGTT 0 1 75621 CASAVA_Build 13 81323107 1D AACTGTCATC T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 8 7 75622 CASAVA_Build 13 81323723 5D ATAAAAAATA TATAT/----- TATATATCAT 2389 het 448 hom 7 1 5 1 TATAT 2 1 75623 CASAVA_Build 13 81324317 3D AGAAGTAAAA AAG/--- AATATCAATA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 AAG 1 0 75624 CASAVA_Build 13 81324559 8D TACACCACAT TAACTTAG/-------- TAAAGGGAAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 9 TAACTTAG 1 0 75625 CASAVA_Build 13 81325664 1D CCTCACATAT G/- TGTTCAAATG 3070 het 3070 hom 46 20 20 8 G 1 0 75626 CASAVA_Build 13 81326266 12D ATAAGAAATA GAAAAAAACCTT/------------ TTTTACATTG 3070 het 3070 hom 25 12 11 9 GAAAAAAACCTT 1 0 75627 CASAVA_Build 13 81329359 1I CTCAGTTAGC -/A ATTATTGAAG 3070 het 3070 ref 56 26 24 6 A 1 2 75628 CASAVA_Build 13 81336657 1D AGGTCTTGTG C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 C 8 7 75629 CASAVA_Build 13 81344995 7D6M1D GTCGGGTGAC CATCAAGTGATGGT/-------TGATGG- CAGGCAATTG 3070 het 3070 hom 29 15 16 4 N/A 0 0 75630 CASAVA_Build 13 81348164 1I GCTTAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 13 14 75631 CASAVA_Build 13 81348234 1D CAAAATATAC A/- AATGACAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 9 7 A 3 2 75632 CASAVA_Build 13 81351320 1I TATCTCAGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 17 19 11 T 9 10 75633 CASAVA_Build 13 81358091 1I ATGACGTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 24 1 13 10 A 13 14 75634 CASAVA_Build 13 81368954 1I TATAGAGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 9 10 75635 CASAVA_Build 13 81370176 2D GTACAAAAAC AG/-- ACACATAGAC 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 AG 1 0 75636 CASAVA_Build 13 81372913 2I TTTAAGAGTT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 A 9 11 75637 CASAVA_Build 13 81376341 2D GACAGTAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 12 12 A 12 10 75638 CASAVA_Build 13 81391447 2I GCCGTTAATA --/TT TTCTCAACCA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 2 4 75639 CASAVA_Build 13 81391855 1D GCGGGGAGAG C/- GGGGGTGCAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 1 0 75640 CASAVA_Build 13 81395988 4D AGTAAAATAA TTAC/---- TTACATGACA 3070 het 3070 hom 28 12 15 5 TTAC 2 1 75641 CASAVA_Build 13 81402072 2D CCCAAAGCTC AG/-- AGTGTTCCAT 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 AG 2 1 75642 CASAVA_Build 13 81404548 1I ACAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 5 het 19 1 12 6 A 9 10 75643 CASAVA_Build 13 81410678 1D CATCTGTCAC A/- AAGTTTTTGA 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 A 3 2 75644 CASAVA_Build 13 81412393 1D TAAATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 9 8 8 T 12 11 75645 CASAVA_Build 13 81433044 1I ATAAACAGAA -/T TAAAAAGGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 2 75646 CASAVA_Build 13 81444607 41D AAAATATTTT AAAATATCCCTGAGTGACATTTAGCAGTAACTTGTCAAAAG/----------------------------------------- AAAATTGGAT 3070 hom 77 het 25 0 27 5 AAAATATCCCTGAGTGACATTTAGCAGTAACTTGTCAAAAG 1 0 75647 CASAVA_Build 13 81445380 3I7M11D11M3I4M2D5M4D10M6D3M10I AAAGATACAA ---TTTAGAACCTGCGAAATTCATGACTTGAA---ACTTAAACTCCATGTGGTGGTATTAAGAGGTGTG----------/GTGCTTTATA-----------TGAGGACTGGAGGGAACT--AACTC----AGGTTCTATT------TGTTCTTCCACTC GCTGCCATAT 3070 het 3070 ref 41 35 7 4 N/A 0 0 75648 CASAVA_Build 13 81445593 4D TTGATTAGGC TGCT/---- TGCTGTCTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 3 TGCT 2 1 75649 CASAVA_Build 13 81451455 4D GGGCATTATT TAAA/---- ATTCATAATC 3070 hom 60 het 23 0 21 4 TAAA 1 0 75650 CASAVA_Build 13 81454426 1I AATAATTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 9 10 75651 CASAVA_Build 13 81455587 1D CAGTATACAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 9 8 75652 CASAVA_Build 13 81461576 1D TTTGCTTTTG C/- CTAGCCATTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 2 1 75653 CASAVA_Build 13 81462318 1D CCTACATTTT A/- AAAAGTTTCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 5 4 75654 CASAVA_Build 13 81463703 1I ACTTTAAAAG -/A TACATTTACA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 0 1 75655 CASAVA_Build 13 81469923 1I GTATTTTCTT -/A GATTCCCTCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 0 1 75656 CASAVA_Build 13 81487858 1I AACAAAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 A 13 14 75657 CASAVA_Build 13 81493528 2I GGTTGAAAAC --/AT AGCCACACAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AT 0 1 75658 CASAVA_Build 13 81498416 1D TTTACATTCC T/- TTTTTTTTTT 2174 het 320 hom 12 3 5 4 T 13 12 75659 CASAVA_Build 13 81539392 3D TTGTCTTTTG ATC/--- ATGTCAACTG 3070 het 3070 ref 41 26 8 9 ATC 1 0 75660 CASAVA_Build 13 81548649 3I GCAAATCTTT ---/TGA TAGTTACAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 TGA 0 1 75661 CASAVA_Build 13 81564953 1I TTAATACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 A 10 11 75662 CASAVA_Build 13 81567961 1I AACATATTTG -/T TTTTTATGGT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 5 6 75663 CASAVA_Build 13 81568242 1D AAAATTACAA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 20 10 9 2 T 8 7 75664 CASAVA_Build 13 81570604 3D AAGTAATATT ATC/--- ATCAAGATTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 ATC 2 1 75665 CASAVA_Build 13 81571501 8D TCACTGTGTT CAGCCTAA/-------- AATCTATGTA 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 CAGCCTAA 1 0 75666 CASAVA_Build 13 81571813 1I AATATTTGTA -/T TTTTTTTAAA 3066 het 3066 ref 23 13 7 3 T 7 8 75667 CASAVA_Build 13 81591617 1I AAAACAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 832 hom 22 5 15 2 C 0 1 75668 CASAVA_Build 13 81599790 1D AGATATTTTA T/- TTTTTTGATA 3070 het 3070 hom 28 14 14 2 T 7 6 75669 CASAVA_Build 13 81602777 1D AAGTGCTAAT A/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 A 1 0 75670 CASAVA_Build 13 81602911 1I AAAATATTTT -/A TTTATTCATA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 0 1 75671 CASAVA_Build 13 81606638 4D TAGGGAACTT AAAC/---- AAATCAGCCA 3070 het 3070 ref 47 31 12 5 AAAC 1 0 75672 CASAVA_Build 13 81611133 1I ACAAATTGAT -/G TATGTTAAAA 2653 hom 21 het 10 0 8 2 G 0 1 75673 CASAVA_Build 13 81611694 1D TTAAGCAAAT C/- CAAAATGTAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 C 2 1 75674 CASAVA_Build 13 81630432 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2867 hom 23 8 9 6 T 9 10 75675 CASAVA_Build 13 81633965 1I GCTATTAAAA -/C CTCACTAATT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 C 1 2 75676 CASAVA_Build 13 81643993 1I TATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2124 hom 29 7 14 8 A 10 11 75677 CASAVA_Build 13 81653397 1D TCAACATGGT A/- AAACCCCACC 3051 het 3051 ref 19 8 7 4 A 4 3 75678 CASAVA_Build 13 81656221 5D CAACTCAAAT AACTC/----- AAGAATAATA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 AACTC 1 0 75679 CASAVA_Build 13 81671892 1D CCCAATACAA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 C 10 9 75680 CASAVA_Build 13 81688491 4I TTCTGGAAAA ----/TTCT TTCTATCTGG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 TTCT 1 2 75681 CASAVA_Build 13 81698343 2I CCCACATAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 AC 8 9 75682 CASAVA_Build 13 81699068 1D AAATATCTGT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 8 7 75683 CASAVA_Build 13 81716320 1D TCTTCAGGTT A/- AAAAAAAAAA 1316 het 1316 ref 37 22 4 11 A 13 12 75684 CASAVA_Build 13 81716376 1I ATGTTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 A 10 11 75685 CASAVA_Build 13 81727981 1D TTTTTAAAGT A/- AAAAAAAAAG 3031 het 3031 ref 26 15 9 2 A 10 9 75686 CASAVA_Build 13 81729817 2D GTAGGGAAAC TG/-- TGTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 51 21 20 10 TG 2 1 75687 CASAVA_Build 13 81732287 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3026 het 3026 ref 16 8 7 1 A 9 10 75688 CASAVA_Build 13 81736697 1I TAGTACAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1611 hom 27 5 14 8 T 13 14 75689 CASAVA_Build 13 81740304 3D TACAATTATT GTC/--- AATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 GTC 1 0 75690 CASAVA_Build 13 81747192 4D TATAGATTGG TTAA/---- TTGTTTAATT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 TTAA 1 0 75691 CASAVA_Build 13 81748839 2I CCTGGGAGAA --/AG ACTACTTTCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AG 0 1 75692 CASAVA_Build 13 81752848 2I TAAAGGTAAC --/TA TGCTGTCACA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 TA 0 1 75693 CASAVA_Build 13 81771633 25D AATTAATGTC TGCAGATAAAGAAAGACATTGTATT/------------------------- TGTTTATCTT 3070 het 3070 ref 31 19 15 3 TGCAGATAAAGAAAGACATTGTATT 1 0 75694 CASAVA_Build 13 81777788 1D AAGAAAGTAC T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 21 8 9 4 T 8 7 75695 CASAVA_Build 13 81783250 1D ATGAAGAGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 9 22 3 T 9 8 75696 CASAVA_Build 13 81801801 1I CTCCATTGTG -/T TTGGAGACCG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 2 3 75697 CASAVA_Build 13 81803864 1I AGGTTAGTTA -/C ATATGTATAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 0 1 75698 CASAVA_Build 13 81826186 2D AAGAGAACGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 126 het 55 0 43 12 TG 9 8 75699 CASAVA_Build 13 81828046 1D AATAGGTTTT G/- GCAGTGGCTG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 G 2 1 75700 CASAVA_Build 13 81828765 4D TTGAGGTATA AATT/---- AATAAAATAA 1993 het 1559 hom 10 4 5 1 AATT 1 0 75701 CASAVA_Build 13 81832038 1I CTGTCAGCTG -/A ATGGGTATAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 1 2 75702 CASAVA_Build 13 81833448 2D TAAGTCACAC AT/-- AGTTTCACTA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 AT 1 0 75703 CASAVA_Build 13 81846192 2D ATGTAGCACT GA/-- AACTTTTAAC 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 GA 1 0 75704 CASAVA_Build 13 81849866 1I GAAAAAAAAA -/T ATATGGCCTA 3070 het 356 hom 32 1 26 5 T 0 1 75705 CASAVA_Build 13 81854158 1I AGAAGCAGGC -/T TTTTTTGGGT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 6 7 75706 CASAVA_Build 13 81861943 1D TGGTATGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 A 11 10 75707 CASAVA_Build 13 81862194 1I TTCCCAAAAG -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 6 7 75708 CASAVA_Build 13 81862305 2I TGATATTTTG --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 22 0 12 10 AT 7 8 75709 CASAVA_Build 13 81865082 1D CAGGTGCAGG A/- AAACTAAACA 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 A 4 3 75710 CASAVA_Build 13 81867811 1D TTAGTTTTAT G/- GGGAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 G 4 3 75711 CASAVA_Build 13 81870042 1D AGGAGTTTCT C/- CAGCCAAAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 2 1 75712 CASAVA_Build 13 81874307 4I AATGGAAAAA ----/ATAG ATACTGGGGA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 ATAG 0 1 75713 CASAVA_Build 13 81874533 3D AACTAGTGGC AGG/--- AGTTTTTTGC 3070 hom 115 het 44 0 36 9 AGG 1 0 75714 CASAVA_Build 13 81886777 1D TAAGTACCCC T/- GATAGTCCCA 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 T 1 0 75715 CASAVA_Build 13 81898461 1I ATCACAATAG -/A GGTAACAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 0 1 75716 CASAVA_Build 13 81900090 1D GTGCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 A 15 14 75717 CASAVA_Build 13 81901147 1D ATTGTTTTTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 9 8 75718 CASAVA_Build 13 81903311 3I TATAGTACAA ---/GTT GTTGTTTGTA 2621 het 2621 ref 20 13 6 1 GTT 2 3 75719 CASAVA_Build 13 81913194 11D CTTTTCTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 1999 het 702 hom 12 4 5 4 T 20 9 75720 CASAVA_Build 13 81914259 1I TAACTCTGTT -/C TTTGTTCATC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 C 0 1 75721 CASAVA_Build 13 81914423 1I CTATTACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 11 12 75722 CASAVA_Build 13 81917925 2D ATAATTTAAT AA/-- GTCTCATTTA 3070 het 3070 hom 28 10 16 5 A 2 0 75723 CASAVA_Build 13 81921935 1D TGCATTTCTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 9 8 75724 CASAVA_Build 13 81925345 1I TAATAATAAT -/A AATACAATAC 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 A 2 3 75725 CASAVA_Build 13 81925501 9I CAGCCTGTTA ---------/AACAAATGG AACAAATGGT 3070 het 3070 ref 34 11 11 12 AACAAATGG 1 2 75726 CASAVA_Build 13 81928259 1I TATAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 9 10 75727 CASAVA_Build 13 81931021 1I AGAAATAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2024 hom 24 5 13 6 A 10 11 75728 CASAVA_Build 13 81931268 1I TCAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 10 11 75729 CASAVA_Build 13 81934844 1I CCCTACTGTA -/T GATTGAATAT 3070 het 2643 hom 19 7 9 3 T 0 1 75730 CASAVA_Build 13 81936439 1D7M3I TTAGTTTCAC AAAAAGCT---/-GAAAGCTTTC TTATTGCCCA 3070 het 3070 ref 33 18 15 1 N/A 0 0 75731 CASAVA_Build 13 81937468 1I ATATCGAAAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 7 8 75732 CASAVA_Build 13 81940024 2D ACATGCAATG TT/-- TGTCTTCCTA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 3 1 75733 CASAVA_Build 13 81941529 27D AGGGATTACT TTTTAAAATTTCTTTTTCACATTGTCA/--------------------------- TTGTACATTG 3070 het 3070 ref 28 17 16 4 TTTTAAAATTTCTTTTTCACATTGTCA 1 0 75734 CASAVA_Build 13 81941647 2D TCCAAAAGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 14 9 13 TG 10 9 75735 CASAVA_Build 13 81942240 1D CCTGTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2665 hom 33 11 18 4 T 13 12 75736 CASAVA_Build 13 81942321 3I TATTACCTCC ---/TCT ATTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 TCT 0 1 75737 CASAVA_Build 13 81942676 1D GTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 T 10 9 75738 CASAVA_Build 13 81943647 5D TGTATAGGTA CTTCT/----- CTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 CTTCT 2 1 75739 CASAVA_Build 13 81946562 1I ATAAATTTTT -/A AAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 4 5 75740 CASAVA_Build 13 81947562 1I TTTGAGATAG -/A AAAAAAAAAC 1330 het 1330 ref 31 25 3 3 A 9 10 75741 CASAVA_Build 13 81956648 16D AAATGCAAGG ATATATATATATATAT/---------------- ATATATATAT 3070 het 446 hom 23 3 12 10 AT 15 7 75742 CASAVA_Build 13 81968540 1I TATTACATCA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 6 7 75743 CASAVA_Build 13 81980014 1D GAGGGAAAGA T/- ATTTGGTGTA 3070 het 3070 hom 48 20 26 4 T 1 0 75744 CASAVA_Build 13 81987277 1D GCCATAAATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 T 9 8 75745 CASAVA_Build 13 81995978 16D AAACCATAAC AAACAAGCAAGAAAGA/---------------- AAACAAGCAA 3070 het 3070 ref 48 30 11 13 AAACAAGCAAGAAAGA 2 1 75746 CASAVA_Build 13 82026794 1I AAAAATTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2529 hom 26 7 17 2 A 9 10 75747 CASAVA_Build 13 82029480 1I CTAAAATATG -/T TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 T 6 7 75748 CASAVA_Build 13 82030591 14D TATATGTGTT TTTATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 het 754 hom 19 3 16 1 TTTATATATATATA 1 0 75749 CASAVA_Build 13 82043098 2D TTATATTCTG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 10 8 75750 CASAVA_Build 13 82088677 5D AAGTATTAAA TAACT/----- TAAATTTATC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TAACT 1 0 75751 CASAVA_Build 13 82091160 1D ATATGTACAT A/- AAAAATTTAT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 6 5 75752 CASAVA_Build 13 82103732 1I TGAAGACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 10 11 75753 CASAVA_Build 13 82108015 1I ATATTGAATA -/G GTATGTTAAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 G 1 2 75754 CASAVA_Build 13 82110781 1D ATGAAAGATT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 7 75755 CASAVA_Build 13 82112761 2D GTAATGGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 38 0 23 16 T 14 12 75756 CASAVA_Build 13 82123596 4D CAACAACAAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 199 het 199 ref 39 11 5 26 A 14 10 75757 CASAVA_Build 13 82124653 1I CATATATGTG -/T TTTTTTCGGA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 6 7 75758 CASAVA_Build 13 82130384 1D CAAAAGTGAG T/- TTATCACAAC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 3 2 75759 CASAVA_Build 13 82137058 2D CTCACCACGA AC/-- ACACACACAC 1032 het 1032 ref 54 44 3 8 AC 7 6 75760 CASAVA_Build 13 82143195 1I ACAGAGGTTG -/A AAAATATAAA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 4 5 75761 CASAVA_Build 13 82146591 1I TTAAGATTTT -/A AATTACTGAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 2 3 75762 CASAVA_Build 13 82156756 4I CCATCTCAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 39 hom 20 2 14 4 AAAT 3 4 75763 CASAVA_Build 13 82163393 1D AGTTGTCATG T/- TTTTTTTTTA 1284 het 1284 ref 59 49 3 8 T 10 9 75764 CASAVA_Build 13 82169966 1I ATTATTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 29 1 20 8 T 10 11 75765 CASAVA_Build 13 82172734 1D AAATATTTTC T/- TTTGGGAAAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 T 4 3 75766 CASAVA_Build 13 82175073 1I GATGCGATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 8 9 75767 CASAVA_Build 13 82183545 1I CTCTGATTTG -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 6 7 75768 CASAVA_Build 13 82191315 5I CTAAAAACTA -----/GGAGT GGAGTGGTTG 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 GGAGT 1 2 75769 CASAVA_Build 13 82196982 1I ATATGGATGT -/A CCGCCATTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 75770 CASAVA_Build 13 82199408 1D GTATCTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 T 13 12 75771 CASAVA_Build 13 82201498 2I ATTTTTTTTT --/TC TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 TC 0 1 75772 CASAVA_Build 13 82207438 1D ATTTGGAGCA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 8 7 75773 CASAVA_Build 13 82211562 1I GACTCATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 10 11 75774 CASAVA_Build 13 82232321 1D AAATGGCCAC A/- CCAAAAGGAC 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 A 1 0 75775 CASAVA_Build 13 82243248 1D TATAAAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 T 11 10 75776 CASAVA_Build 13 82251404 3I TTAACTATTT ---/TTG TTGTTGGTGT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 TTG 2 3 75777 CASAVA_Build 13 82252287 1D GATAATTGTG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 T 7 6 75778 CASAVA_Build 13 82268678 4D AATTGGTGAC AAAG/---- AAAAACAAGG 3070 het 3070 ref 53 24 23 8 AAAG 1 0 75779 CASAVA_Build 13 82273426 1D AAAGTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 8 10 A 12 11 75780 CASAVA_Build 13 82279192 1D CAAGAATTCC T/- GAAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 1 0 75781 CASAVA_Build 13 82281875 1D AAATTTATAT G/- GAACCAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 2 1 75782 CASAVA_Build 13 82292729 1I GCGAAATGGC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 8 9 75783 CASAVA_Build 13 82297656 1D ATTCTTTCCA T/- CTCCTCTCAT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 1 0 75784 CASAVA_Build 13 82302716 1I TATAGTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 T 11 12 75785 CASAVA_Build 13 82303544 1D TATGTGCATA T/- TTTCCCAATT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 4 3 75786 CASAVA_Build 13 82323561 1I TTTTTAATTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 8 9 75787 CASAVA_Build 13 82325267 1I GTGATCCTTT -/A AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 A 6 7 75788 CASAVA_Build 13 82330095 1I TATATATATA -/T TGTATATATA 967 hom 5 het 3 0 2 1 T 1 2 75789 CASAVA_Build 13 82339476 14D ATGGCTGTAA ATATCTATTAGTGT/-------------- AGCTACATTA 3070 hom 87 het 32 0 30 4 ATATCTATTAGTGT 1 0 75790 CASAVA_Build 13 82341751 1I47M1I ATATACTAGA -TTTTTTTTTTCATTAAAAAACTCAGCATATTTGTTTTCATCTTTCTT-/TTTTTTTTTTTCATTAAAAAACTCAGCATATTTGTTTTCATCTTTCTTA AGAGAAGTTA 3070 hom 114 het 23 0 39 6 N/A 0 0 75791 CASAVA_Build 13 82346020 2D TTTCTATGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1234 hom 38 5 11 22 T 12 10 75792 CASAVA_Build 13 82360522 1D CAGCAGAAAA G/- GACATACGAT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 G 2 1 75793 CASAVA_Build 13 82361422 2D AATAAAAATA TG/-- TGAGAAGTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TG 2 1 75794 CASAVA_Build 13 82361772 4D TATGGTAGAT AGAA/---- AGATAAGCAG 3070 hom 57 het 21 0 20 4 AGAA 1 0 75795 CASAVA_Build 13 82365900 1D ACAATTTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 7 75796 CASAVA_Build 13 82366029 1D AATTAAAAAT A/- AAAAAACTAC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 7 6 75797 CASAVA_Build 13 82376021 1I TAATAGTTAA -/T TTCATGTGTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 75798 CASAVA_Build 13 82377256 14I CTGGAAGTGC --------------/GTTTTTCCCATACT GTTCTTATGA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 GTTTTTCCCATACT 0 1 75799 CASAVA_Build 13 82380634 4D ATGCACCATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 93 het 43 0 32 13 TTTG 5 4 75800 CASAVA_Build 13 82401810 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 24 1 21 2 A 14 13 75801 CASAVA_Build 13 82406635 1I TAAGTGACAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 562 hom 55 2 43 10 T 9 10 75802 CASAVA_Build 13 82409672 4D AATGCAAAAA TAAT/---- TAATTAATTT 3070 hom 103 het 36 0 35 2 TAAT 3 2 75803 CASAVA_Build 13 82431628 1D TCTCTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2259 hom 30 10 13 7 T 12 11 75804 CASAVA_Build 13 82519838 26D AGACATGTAA ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 3070 het 891 hom 17 3 14 7 AT 22 9 75805 CASAVA_Build 13 82542670 1D ATATTAAGGA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 25 13 8 5 T 8 7 75806 CASAVA_Build 13 82546481 1I CAACAATAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 9 10 75807 CASAVA_Build 13 82557437 1I TATTCTCACG -/C CAAGTGGATA 3070 het 3070 hom 59 19 27 13 C 1 2 75808 CASAVA_Build 13 82578953 1I AGAAAAGCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 435 hom 33 2 25 6 T 9 10 75809 CASAVA_Build 13 82580845 1I AAAACATCTG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 7 8 75810 CASAVA_Build 13 82584591 2D GAAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 18 0 12 6 AT 8 7 75811 CASAVA_Build 13 82585486 3D TATGAGTGAT ATC/--- ATGCGATATT 3070 hom 138 het 50 0 47 5 ATC 1 0 75812 CASAVA_Build 13 82587902 4D AGATATAGAG TAGA/---- TAGATAGATA 3070 hom 75 het 36 0 26 10 TAGA 3 2 75813 CASAVA_Build 13 82588452 1D TTATATTTTT A/- AAAATATTTC 3070 hom 33 het 12 0 12 1 A 5 4 75814 CASAVA_Build 13 82596813 1D AAATTTTAGG A/- AAGTGTGAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 7 A 3 2 75815 CASAVA_Build 13 82597359 1I AATATTTCTA -/T AACAATTTGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 0 1 75816 CASAVA_Build 13 82599348 14D GTTATGTGTG TATGTGTGTATGTA/-------------- TATGTGTGTA 3070 hom 93 het 40 0 32 13 TATGTGTGTATGTA 2 1 75817 CASAVA_Build 13 82600176 2I AGAGAGAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 39 het 26 0 21 5 AG 7 8 75818 CASAVA_Build 13 82607557 9I TAAAAATTTG ---------/TAATACATT TAATACATTT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TAATACATT 1 2 75819 CASAVA_Build 13 82607725 5D CATATATGTA ATACG/----- ATACAATGTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 ATACG 1 0 75820 CASAVA_Build 13 82607940 1D ATTTGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 11 10 75821 CASAVA_Build 13 82608795 1I TTACATTATG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 9 75822 CASAVA_Build 13 82612482 2D TGTTTTTAAA AC/-- AGTTTTAACA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AC 1 0 75823 CASAVA_Build 13 82613086 4I ATGATTGATT ----/CTTA CTGTCTATCT 3070 hom 117 het 54 0 40 14 CTTA 0 1 75824 CASAVA_Build 13 82614564 4D ACATTTATAA TTTC/---- TTTATGATGA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TTTC 1 0 75825 CASAVA_Build 13 82617160 4I AAGGGTTGTT ----/TATG TAGCCTATTG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TATG 0 1 75826 CASAVA_Build 13 82620395 2D21M1I ATCATTGTAG TTTTTTAATTTGCATTGCATTTT-/--TTTTAATTTGCATTGCATTTTC CCTAATGATT 3070 hom 99 het 32 0 34 12 N/A 0 0 75827 CASAVA_Build 13 82620597 1D CCAACAGAAA T/- TTTTAAATGC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 5 4 75828 CASAVA_Build 13 82622596 1D GAGATGGGGT G/- GGGGGGGGTC 3070 het 15 hom 29 1 20 8 G 9 8 75829 CASAVA_Build 13 82625722 1I GAATATGGCC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 8 9 75830 CASAVA_Build 13 82626845 1I ATGAAAGCAG -/A AAAAATATAT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 5 6 75831 CASAVA_Build 13 82627620 2D ATATAGACAC AA/-- GTTAAAATTA 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 A 2 0 75832 CASAVA_Build 13 82628663 10D GATTTACAAC AGCAATAGGT/---------- AGCAATAGGT 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 AGCAATAGGT 2 1 75833 CASAVA_Build 13 82630031 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 T 7 8 75834 CASAVA_Build 13 82638699 1I TTCCAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 A 10 11 75835 CASAVA_Build 13 82638949 1I ATTGCTGACC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 7 8 75836 CASAVA_Build 13 82639456 1D AAAGCCTTTA C/- TGGAGTCCAT 3070 het 3070 hom 63 31 30 2 C 1 0 75837 CASAVA_Build 13 82641518 2D TATGATATAT TA/-- TATATATCAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TA 4 3 75838 CASAVA_Build 13 82647369 1I CAATATGGTT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 54 het 26 0 18 8 A 8 9 75839 CASAVA_Build 13 82647599 1D ACACATATAC A/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 A 1 0 75840 CASAVA_Build 13 82649621 2I AAAACAAGAC --/AT GTGGGTTTCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AT 0 1 75841 CASAVA_Build 13 82649792 2D ATCTCTGGGA CT/-- CTCTTCCCAT 3070 het 3070 hom 33 8 20 6 CT 3 2 75842 CASAVA_Build 13 82653494 2D TCCTTTTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 40 1 32 8 A 12 10 75843 CASAVA_Build 13 82662656 4D TCCACTCTAT ATTA/---- ATTTATAATT 3070 hom 85 het 35 0 28 8 ATTA 1 0 75844 CASAVA_Build 13 82667138 1D GTGGAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 8 A 12 11 75845 CASAVA_Build 13 82682410 4D CTAAAATCAA AGAC/---- AGAGGATTTC 3070 het 3070 ref 38 25 13 1 AGAC 1 0 75846 CASAVA_Build 13 82683267 1D ATGAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 117 hom 35 3 28 5 A 12 11 75847 CASAVA_Build 13 82684222 1I CAAAATTAGG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 7 8 75848 CASAVA_Build 13 82684425 2D GAAATAAAGT CA/-- CACACCTACA 3070 het 3070 hom 51 23 24 5 CA 3 2 75849 CASAVA_Build 13 82690231 1I AGAAATAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 28 1 19 8 T 13 14 75850 CASAVA_Build 13 82697487 1I AAATAATATA -/T TTTTTTTTTC 2484 het 2484 ref 20 9 6 5 T 9 10 75851 CASAVA_Build 13 82698197 1D TCTATATCAA T/- TTTGTCATGG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 4 3 75852 CASAVA_Build 13 82700027 1I TCTGACAGCA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 6 7 75853 CASAVA_Build 13 82700177 2D CCAACTCTGC AA/-- AAAAAAAAAA 1654 het 385 hom 17 4 4 9 A 18 16 75854 CASAVA_Build 13 82702563 1D CACCCCTTCC T/- TAGACGATGA 3070 het 3070 ref 44 23 16 7 T 2 1 75855 CASAVA_Build 13 82709761 1I TAATGTTCAC -/A AAGCCAAAAT 3070 het 3070 ref 52 26 24 2 A 2 3 75856 CASAVA_Build 13 82711155 1D TTTTAATCCC T/- TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 T 7 6 75857 CASAVA_Build 13 82711712 1I GTGGGATTAG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 6 7 75858 CASAVA_Build 13 82714694 1D ATTATAATAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 8 7 75859 CASAVA_Build 13 82720242 1D AATCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 11 10 75860 CASAVA_Build 13 82723124 2D ACCACTTAAC AT/-- GTGCAAAATA 3070 het 3070 hom 38 15 17 8 AT 1 0 75861 CASAVA_Build 13 82725315 1D CAACAGATGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 9 8 75862 CASAVA_Build 13 82729541 1D AGGAAAAGCT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 120 het 46 0 41 6 A 8 7 75863 CASAVA_Build 13 82729758 3I CATAATTTTA ---/CTT CTTCTTTTTC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 CTT 2 3 75864 CASAVA_Build 13 82730194 1I CCTGGAGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 237 hom 33 1 25 7 A 10 11 75865 CASAVA_Build 13 82732241 2D GAATGGCTAC TA/-- TTGAAAAATC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TA 1 0 75866 CASAVA_Build 13 82744285 1D AGCATATTGA T/- TTCAAGAAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 3 2 75867 CASAVA_Build 13 82747967 4D ATAGACATAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 63 het 27 0 22 6 AC 11 9 75868 CASAVA_Build 13 82749229 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 34 3 23 8 T 13 12 75869 CASAVA_Build 13 82749312 1I CATTTAAGCC -/T TTTTTTTTTT 861 het 861 ref 26 13 4 9 T 15 16 75870 CASAVA_Build 13 82750654 1D TGAGATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 934 hom 36 4 20 12 T 17 16 75871 CASAVA_Build 13 82816874 5I CAGACCGCCT -----/ACAGA ACAGAAGAAA 3070 hom 74 het 33 0 30 3 ACAGA 1 2 75872 CASAVA_Build 13 82825313 1I GGAAAGTAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 9 10 75873 CASAVA_Build 13 82839509 2D TATATATAAT TA/-- GAGGCGCCAT 3070 hom 66 het 28 0 23 8 TA 1 0 75874 CASAVA_Build 13 82845207 1D TCACTGCAGC T/- TTTTTTTTTT 1280 het 1280 ref 34 20 3 11 T 11 10 75875 CASAVA_Build 13 82846667 5I AGCTAGCCGG -----/AATTT AAGTTCTGAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AATTT 0 1 75876 CASAVA_Build 13 82848660 1D TAAAGAGACA T/- TTTTAGTTGA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 T 5 4 75877 CASAVA_Build 13 82849983 2D ATATATATAT AC/-- ACATATATAT 3070 hom 75 het 26 0 26 2 AC 2 1 75878 CASAVA_Build 13 82869497 3D CTTACTGAAT TCA/--- TCAAGTGAGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TCA 2 1 75879 CASAVA_Build 13 82878025 1D GAATAAACAT G/- TACTATTAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 1 0 75880 CASAVA_Build 13 82881973 2D AAATAAAGAA TT/-- TTGTTTTATA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 4 2 75881 CASAVA_Build 13 82887420 8I AGGCACAAAG --------/GAGCCATT GATCCATAGC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 GAGCCATT 0 1 75882 CASAVA_Build 13 82888916 1D CACACCCGGC T/- TTTTTTTTTT 1109 het 32 hom 15 1 3 11 T 13 12 75883 CASAVA_Build 13 82891220 1I TAGGAAAAAA -/T AATATATTGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 0 1 75884 CASAVA_Build 13 82891909 1I CCAAAACCCG -/A AGGAAAAATA 3070 hom 169 het 62 0 57 5 A 1 2 75885 CASAVA_Build 13 82899884 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 335 hom 39 3 25 11 T 15 14 75886 CASAVA_Build 13 82922990 1D ACCGTGCCCT G/- GTAACTTTTT 3070 het 370 hom 36 3 30 4 G 2 1 75887 CASAVA_Build 13 82974160 1D GGAAAAAAAA T/- GTGGTCTAAT 3070 het 3070 hom 43 12 23 8 T 1 0 75888 CASAVA_Build 13 82980720 1I CTGAACCACA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 8 9 75889 CASAVA_Build 13 82984796 1D GTCCTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 21 18 13 A 13 12 75890 CASAVA_Build 13 83001600 24I TCTTGTATAA ------------------------/ACAAAATCCTAGGTAAATACACAT AAAGTCTACT 3070 hom 114 het 41 0 39 4 ACAAAATCCTAGGTAAATACACAT 0 1 75891 CASAVA_Build 13 83013557 1D ACTGTATCAG T/- TTGCTATTAC 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 T 3 2 75892 CASAVA_Build 13 83015918 3D AAAAAGAAAT AGA/--- AGAAGAGCAC 3070 hom 93 het 40 0 29 12 AGA 3 2 75893 CASAVA_Build 13 83019062 5I TTTGAAAGTA -----/AAAGG AAAGGAGCAC 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 AAAGG 1 2 75894 CASAVA_Build 13 83034946 1D TACTTGTTCA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 T 8 7 75895 CASAVA_Build 13 83042122 1D GAAATTTGGA G/- GACATGTGAA 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 G 2 1 75896 CASAVA_Build 13 83045089 2D GACAGGCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1580 hom 40 7 24 9 A 14 12 75897 CASAVA_Build 13 83045441 20I ATTGGTTAAT --------------------/ACAAGGTTGTAGGATAAAAC ACTAGTAGTG 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 ACAAGGTTGTAGGATAAAAC 0 1 75898 CASAVA_Build 13 83047770 1D AACCCATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2726 hom 38 15 12 11 A 17 16 75899 CASAVA_Build 13 83064703 2I GACATGGGAC --/TT TTTTTTTTTT 2833 het 2833 ref 28 12 9 7 T 14 16 75900 CASAVA_Build 13 83095818 1D AGTGACAAAA C/- TGAAGACCTG 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 C 1 0 75901 CASAVA_Build 13 83122826 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1035 het 79 hom 9 1 6 2 T 13 14 75902 CASAVA_Build 13 83132972 1I CAAGTTAATC -/A ACTGGCAATG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 75903 CASAVA_Build 13 83133427 1D CTGTTCACCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 T 10 9 75904 CASAVA_Build 13 83142468 1I GTCTTGGTTA -/T TTTCTTCATA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 3 4 75905 CASAVA_Build 13 83150131 2I AATCAGAAAT --/AA AAAGTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 3 5 75906 CASAVA_Build 13 83153667 2D AGGGGAAAAC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 57 25 23 11 AT 1 0 75907 CASAVA_Build 13 83159756 1I CTGAGGTGTG -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 109 het 41 0 37 4 T 6 7 75908 CASAVA_Build 13 83161362 1D TACAAACTTT A/- AAAAAAAAAA 2789 het 1434 hom 19 6 8 5 A 14 13 75909 CASAVA_Build 13 83169911 3I AAAGAAAAAC ---/AGA AGAATTCATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AGA 1 2 75910 CASAVA_Build 13 83171073 42D TTTTTGGTTT TGAAAATTTTTTTCTCCCATCTTATTCAGAGTGGCAATATGA/------------------------------------------ TGCTGCGAAA 3070 het 3070 hom 31 20 19 6 TGAAAATTTTTTTCTCCCATCTTATTCAGAGTGGCAATATGA 1 0 75911 CASAVA_Build 13 83177304 1D CAGAAAGGAG A/- AAAAAATTAA 3070 hom 35 het 35 1 26 8 A 7 6 75912 CASAVA_Build 13 83180441 1I ATTTATATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 9 10 75913 CASAVA_Build 13 83185679 1I AAATGATACA -/C TTATATCTAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 0 1 75914 CASAVA_Build 13 83189913 7D TACTATTTAC TTTATGT/------- TTTATTATTT 3070 het 3070 hom 35 14 19 4 TTTATGT 1 0 75915 CASAVA_Build 13 83192992 1D AAGGAATAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 9 8 75916 CASAVA_Build 13 83195845 1I TCATAATATT -/A ATTCTGAAGA 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 1 2 75917 CASAVA_Build 13 83196741 1I AAATAAGAAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 40 14 19 11 A 7 8 75918 CASAVA_Build 13 83202663 11I CTGGTTATCT -----------/CTTCGGATTCC CTAACAGCGG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 CTTCGGATTCC 0 1 75919 CASAVA_Build 13 83211787 1I AAAAAGTCTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 2402 hom 23 10 8 5 T 8 9 75920 CASAVA_Build 13 83223532 2D TGTATAAATA TG/-- TGTGTGTGTG 2998 het 2998 ref 33 13 12 8 TG 9 8 75921 CASAVA_Build 13 83224875 1I CTAACTTTTT -/A ATGCATAGAA 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 A 1 2 75922 CASAVA_Build 13 83238683 2D AATTAGAAAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 28 12 10 7 TG 6 5 75923 CASAVA_Build 13 83240017 1D GCTACCTCAC T/- TTTTTGGATT 3070 het 3070 hom 55 19 32 4 T 6 5 75924 CASAVA_Build 13 83240780 1I TAGAATGTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 A 9 10 75925 CASAVA_Build 13 83286980 1I GGAGGCGGAG -/C TTGCAGTGAG 1454 het 1454 ref 22 12 4 6 C 0 1 75926 CASAVA_Build 13 83300448 1I TTCTTCCTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 53 18 28 7 A 8 9 75927 CASAVA_Build 13 83305019 6I CAATCTCCAA ------/TACTTT TACTATTCTG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 TACTTT 0 1 75928 CASAVA_Build 13 83378326 4I TCCGTCACAT ----/ACTC ACTAGGACGC 3070 het 3070 hom 39 11 11 17 ACTC 0 1 75929 CASAVA_Build 13 83392470 2D GAAATAACTC AG/-- AAACAGAAAT 3070 het 3070 hom 65 27 34 7 AG 1 0 75930 CASAVA_Build 13 83392918 3I TTTCATAATG ---/TTA TTATTAAGAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TTA 2 3 75931 CASAVA_Build 13 83393487 1D GCCTATCTCC G/- GGGGATGAAA 3070 het 3070 hom 32 7 20 6 G 5 4 75932 CASAVA_Build 13 83395248 3I AGAGCTGGAT ---/ACA ACAATTTTGA 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 ACA 1 2 75933 CASAVA_Build 13 83395461 1D TAAATCACTT A/- ACATGAATTA 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 A 2 1 75934 CASAVA_Build 13 83398444 1D AGTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 12 24 5 T 10 9 75935 CASAVA_Build 13 83398922 1I GAGCTCTAAA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 T 7 8 75936 CASAVA_Build 13 83400075 2I AAAGAAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 10 12 75937 CASAVA_Build 13 83400220 2D GTTTTCTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 9 T 13 11 75938 CASAVA_Build 13 83400887 1D CTCTTAATTA T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 T 7 6 75939 CASAVA_Build 13 83405748 1I CACCTTGTCA -/G AGCTGAAAGG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 G 0 1 75940 CASAVA_Build 13 83417692 1D TACACCCAGT A/- AATACCAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 15 7 A 3 2 75941 CASAVA_Build 13 83417870 1I TTCTCACATA -/C AGTTTGTGAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 C 0 1 75942 CASAVA_Build 13 83421773 2D TTTCAGAGAC AT/-- GTGTGGGTGG 3070 het 3070 ref 37 16 15 7 AT 1 0 75943 CASAVA_Build 13 83425451 1D CAAGGTGGGC G/- GGATCACTTG 1686 het 1686 ref 20 11 5 4 G 3 2 75944 CASAVA_Build 13 83429567 18I ACCACGTTAG ------------------/CCTGGCTGGTCTCGAACT CCTGACCTCA 3070 hom 73 het 32 0 25 7 CCTGGCTGGTCTCGAACT 0 1 75945 CASAVA_Build 13 83442754 1I ACAAAGCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 12 13 75946 CASAVA_Build 13 83447169 1D AATCACACAG A/- AGTCACCATC 3070 het 3070 hom 35 12 21 4 A 2 1 75947 CASAVA_Build 13 83450798 1I GGATTTTAAA -/T TTGGAATAGA 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 T 2 3 75948 CASAVA_Build 13 83454535 12D TTATTAACTT TATATATATATA/------------ TATATATATA 3070 het 1159 hom 18 3 12 3 TA 12 6 75949 CASAVA_Build 13 83455318 2D CCTTTTAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 19 18 12 T 14 12 75950 CASAVA_Build 13 83456545 4I CTTTAGTTGG ----/TTTA TTTTTGTATT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 TTTA 0 1 75951 CASAVA_Build 13 83458025 3D TATTTGAAGA AAG/--- AAGAAGATAA 3070 het 3070 hom 51 19 29 4 AAG 3 2 75952 CASAVA_Build 13 83462977 2D AACCAAGAGT AG/-- AGAGAGTGGA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 AG 4 3 75953 CASAVA_Build 13 83475171 1D CTGACTTCCA G/- GTGATCCACC 3070 hom 45 het 22 0 19 3 G 2 1 75954 CASAVA_Build 13 83477532 2D AGAATAAAAC AG/-- AAACTTTTGA 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 AG 1 0 75955 CASAVA_Build 13 83477861 1D TATTAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 12 11 75956 CASAVA_Build 13 83485176 20D AAAACAGGAG TTTCCCTGCAATACTCTGTC/-------------------- TTTGCCTGCC 3070 het 3070 ref 28 21 13 4 TTTCCCTGCAATACTCTGTC 1 0 75957 CASAVA_Build 13 83489558 2I ACACACAGAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 81 het 37 0 28 9 AC 5 6 75958 CASAVA_Build 13 83492809 1D ACACAGATGA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 108 het 40 0 35 6 C 9 8 75959 CASAVA_Build 13 83496950 2D CTAATTCTCT CA/-- GTTTTGCTGT 3070 het 3070 ref 52 27 17 8 CA 1 0 75960 CASAVA_Build 13 83497416 1I TTCTAGATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 904 hom 41 2 25 14 A 11 12 75961 CASAVA_Build 13 83514349 1D TGCTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 43 2 30 12 A 12 11 75962 CASAVA_Build 13 83514487 8D CTTTATTGTG AACTGACA/-------- GTATTTTTAG 3070 het 3070 ref 39 23 14 6 AACTGACA 1 0 75963 CASAVA_Build 13 83521809 1I ATACTCCTTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 11 21 0 T 8 9 75964 CASAVA_Build 13 83530522 2I CATTGTTGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 10 12 75965 CASAVA_Build 13 83533386 3D TATTTTTTAA TTT/--- TTATTTTCTG 3070 hom 96 het 34 0 33 3 T 5 2 75966 CASAVA_Build 13 83533461 1D GTTTTCCTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 9 8 75967 CASAVA_Build 13 83534629 1I TACATTATTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 7 8 75968 CASAVA_Build 13 83535518 3D TTTATTGGAT CTC/--- CTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 18 20 2 CTC 1 0 75969 CASAVA_Build 13 83535946 2I AGAGTTCCTC --/TT GTTATCAATT 3070 hom 81 het 29 0 26 3 T 0 2 75970 CASAVA_Build 13 83536709 2D TTTTTTACTT AA/-- GTCTATTTTA 3070 het 3070 hom 39 11 20 9 A 2 0 75971 CASAVA_Build 13 83537344 1D AAGAAAATAA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 2989 hom 25 8 15 2 T 8 7 75972 CASAVA_Build 13 83539679 1D ACTTGGAAAT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 8 7 75973 CASAVA_Build 13 83546595 5I TAGAGACAAT -----/AATAA AATAAAGCAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AATAA 1 2 75974 CASAVA_Build 13 83551139 1D TGATACTGGG T/- TAAACACTTT 3070 hom 125 het 45 0 42 3 T 2 1 75975 CASAVA_Build 13 83551834 9D ACATAATATA TTATGGAAC/--------- ATATATTATG 1268 het 1048 hom 34 3 6 26 TTATGGAAC 1 0 75976 CASAVA_Build 13 83559858 1I GGAAGATACT -/G GTGCTGTGCT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 1 2 75977 CASAVA_Build 13 83562026 2D AATTGAATAA AC/-- AGAGATTATA 3070 het 3070 hom 35 17 18 0 AC 1 0 75978 CASAVA_Build 13 83566765 4I TATTTCTTAC ----/CTTA CTTCTACTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CTTA 0 1 75979 CASAVA_Build 13 83568032 1D CTATAATCAG C/- CTTTAGCTGA 3070 het 3070 ref 36 19 15 4 C 2 1 75980 CASAVA_Build 13 83569420 1D ATTTTACTTT A/- TTTTATTTTG 3070 het 2636 hom 16 8 7 1 A 1 0 75981 CASAVA_Build 13 83571864 1I TTCTCATAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 9 10 75982 CASAVA_Build 13 83579562 5I ATATATCTTT -----/ATTTG ATTTATCTTA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 ATTTG 0 1 75983 CASAVA_Build 13 83587269 3I CATAGGTAAT ---/ATC ATGCCATGTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 ATC 0 1 75984 CASAVA_Build 13 83590477 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 10 11 75985 CASAVA_Build 13 83591923 2I ATATACTAGC --/AG AGTTACTTTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AG 1 2 75986 CASAVA_Build 13 83593780 1D CAAGCGCATT C/- CATGCCCAGG 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 C 2 1 75987 CASAVA_Build 13 83598155 1D GTTAAATAAC A/- CAAATGCGTC 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 A 1 0 75988 CASAVA_Build 13 83601250 4D TTGAGTTCTG CTTT/---- CTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 CTTT 1 0 75989 CASAVA_Build 13 83602374 1D TCAGGAAAGC T/- TTTTACCCAA 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 T 5 4 75990 CASAVA_Build 13 83611356 5D ATAGTAACTT TCAGC/----- TCATGACCTG 3070 het 3070 ref 49 27 16 7 TCAGC 1 0 75991 CASAVA_Build 13 83632743 2D ATATATATCA AT/-- ATATATATAT 1484 het 707 hom 13 4 6 3 AT 7 6 75992 CASAVA_Build 13 83633278 2I ATTGAGAGAC --/TG TGTCGTTGGC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TG 1 2 75993 CASAVA_Build 13 83637896 1D GTTTTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 T 11 10 75994 CASAVA_Build 13 83638989 2I GCTAGGCAGT --/GC CCCAGTGAGG 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 GC 0 1 75995 CASAVA_Build 13 83639393 1I AAAAAGGCTA -/C CTGAGGGCCA 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 C 1 2 75996 CASAVA_Build 13 83641635 1I AATTTTTTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 8 9 75997 CASAVA_Build 13 83649073 1D TCCTCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 13 12 75998 CASAVA_Build 13 83693248 1D ATATAGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 42 0 22 22 A 15 14 75999 CASAVA_Build 13 83731603 2D CTTTTTTCCT AG/-- AGTGTTTACT 3070 hom 58 het 22 0 19 3 AG 2 1 76000 CASAVA_Build 13 83737071 11I CTAGCCTATT -----------/AAACTATGAGA AAATACATTT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 AAACTATGAGA 0 1 76001 CASAVA_Build 13 83749871 1D TTGAAATGAA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 6 76002 CASAVA_Build 13 83758564 2I TAAATATATT --/AA GTTATTGTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 2 76003 CASAVA_Build 13 83772426 1I CAGTCTGCCT -/A AAAAACTGGC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 5 6 76004 CASAVA_Build 13 83776139 3I TTAATCAAAT ---/ATC AACAAATATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATC 0 1 76005 CASAVA_Build 13 83798131 4D TCTATAAATT ACTC/---- ACAGACATAT 3070 hom 111 het 39 0 38 3 ACTC 1 0 76006 CASAVA_Build 13 83799897 1D CAGTTGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 12 11 76007 CASAVA_Build 13 83800474 1D TTCATATTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 10 9 76008 CASAVA_Build 13 83801088 1D TGTGGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 39 1 31 8 T 11 10 76009 CASAVA_Build 13 83803066 2D ATATATATAT AC/-- ACACATACAC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 AC 3 2 76010 CASAVA_Build 13 83809292 7D ATTCTGTTTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 16 9 76011 CASAVA_Build 13 83817245 1D TTCATTTATG T/- TTTTGCATTT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 5 4 76012 CASAVA_Build 13 83821910 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 41 het 16 0 14 3 A 9 8 76013 CASAVA_Build 13 83836929 1D TTTTCACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 28 1 18 9 A 15 14 76014 CASAVA_Build 13 83861589 1D GGTATATATC T/- TTTTTTTTTT 1739 het 1739 ref 34 18 4 13 T 13 12 76015 CASAVA_Build 13 83893613 2I CTGCAGGAGC --/AG AGAGCCCTCA 3070 hom 77 het 29 0 26 3 AG 2 3 76016 CASAVA_Build 13 83894800 2D AAGATTTGTT AA/-- ACTTTCAACT 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 A 3 1 76017 CASAVA_Build 13 83903776 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAAAA 1092 het 1048 hom 28 5 6 17 AC 1 0 76018 CASAVA_Build 13 83933840 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 11 10 76019 CASAVA_Build 13 83941494 1I GTTATATATA -/T TATATGTGTT 3070 het 2123 hom 14 5 9 0 T 1 2 76020 CASAVA_Build 13 83942841 4D TTAATTAGTC AATT/---- AATTAATTAA 1835 het 1835 ref 29 11 7 14 AATT 4 3 76021 CASAVA_Build 13 83948260 1D TGAAATTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 25 het 40 1 33 6 T 9 8 76022 CASAVA_Build 13 83950452 1I GCAAGCAAAA -/T GTTACAGCTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 76023 CASAVA_Build 13 83953937 4I CAATTAAAAT ----/AAAC AAATCATAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAAC 0 1 76024 CASAVA_Build 13 83958659 1D GGACTTACAA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 T 7 6 76025 CASAVA_Build 13 83962781 1D AAAGGCTAAG A/- GGGGCCTTGG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 1 0 76026 CASAVA_Build 13 83966863 1I GGGCTAAAAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 46 11 31 4 A 7 8 76027 CASAVA_Build 13 83969866 1I GCATCCTTCA -/T GATCGAATGG 3070 het 3070 ref 56 30 22 4 T 0 1 76028 CASAVA_Build 13 83971279 1D TCCAGAGAAA C/- CGAGCCAATA 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 C 2 1 76029 CASAVA_Build 13 83976146 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 18 het 14 0 7 7 A 8 7 76030 CASAVA_Build 13 83976730 2D TTTTTTTTTT TA/-- ATCTTTTGCT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TA 1 0 76031 CASAVA_Build 13 83977230 1D AAATGTAAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 8 7 76032 CASAVA_Build 13 84012643 3I TTCATTCATA ---/TAT TATTTAGTCT 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 TAT 1 2 76033 CASAVA_Build 13 84015756 1D AAGAGACAGG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 A 8 7 76034 CASAVA_Build 13 84016467 1D AGATTAAAAT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 8 7 76035 CASAVA_Build 13 84017453 2I TAAAATATAC --/AT ATATATATAC 1890 het 1890 ref 20 8 6 6 AT 4 5 76036 CASAVA_Build 13 84020251 1D ATTTAAACTG T/- TAACGGGAGC 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 T 2 1 76037 CASAVA_Build 13 84026217 1I AAAAATGCAC -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 47 19 22 6 A 7 8 76038 CASAVA_Build 13 84028830 2D GTTAAGAAAA AC/-- AGTCAAATTG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 AC 1 0 76039 CASAVA_Build 13 84035188 1I TTTTTAAGGG -/T TTTTATAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 4 5 76040 CASAVA_Build 13 84038687 1I AAAATGGTTA -/T TTTTTAGTCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 5 6 76041 CASAVA_Build 13 84044614 1I TTAAGGGAGA -/C AGTGAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 C 0 1 76042 CASAVA_Build 13 84045690 1I AGAGAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 27 2 A 10 11 76043 CASAVA_Build 13 84047506 1I AAATAGTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 9 10 76044 CASAVA_Build 13 84048503 2I TGTGACTGCC --/AG AGAGAGACAG 3070 het 3070 ref 40 24 8 8 AG 3 4 76045 CASAVA_Build 13 84053614 7I TGGACTAGAG -------/TTTTATA TGCAAGCAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTTATA 0 1 76046 CASAVA_Build 13 84063730 5D CTAAGTTCAC CTTAT/----- CTTATGTCAA 3070 het 3070 ref 47 25 19 6 CTTAT 2 1 76047 CASAVA_Build 13 84076155 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 19 5 9 5 T 15 14 76048 CASAVA_Build 13 84080727 17D TTTGTTGTGC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTGA 3070 het 1855 hom 26 8 15 3 T 25 8 76049 CASAVA_Build 13 84093640 1I TTTTTTTTTT -/A ATGTTTCAAG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 1 2 76050 CASAVA_Build 13 84097918 1I CAGTTCTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 11 12 76051 CASAVA_Build 13 84106092 1D AGTGATTTTA C/- TAGACCTGTA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 C 1 0 76052 CASAVA_Build 13 84122941 1I AAAATCTTAA -/C ACCCCCCATC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 C 0 1 76053 CASAVA_Build 13 84134360 1D CATGTTAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 10 9 76054 CASAVA_Build 13 84135490 8D AACTGCCTTT TCACATAC/-------- TCACATACTT 3070 het 3070 hom 44 22 22 5 TCACATAC 2 1 76055 CASAVA_Build 13 84137248 3D AAAGGATAAC AAG/--- GAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 40 19 14 9 AAG 1 0 76056 CASAVA_Build 13 84141144 1I CTTCTCAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 10 11 76057 CASAVA_Build 13 84141869 1D TTTACATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 31 0 20 11 T 13 12 76058 CASAVA_Build 13 84145630 6D TGTCAATTTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 25 3 12 12 A 17 11 76059 CASAVA_Build 13 84150260 3I AAAAATAAAC ---/TTG TTAAAACATT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 TTG 0 1 76060 CASAVA_Build 13 84153360 1I AATCTAAGAT -/G TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 G 0 1 76061 CASAVA_Build 13 84154524 1D TCCTGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 17 7 T 12 11 76062 CASAVA_Build 13 84162569 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 9 8 76063 CASAVA_Build 13 84176204 2D ATACACACAC TT/-- ATATATATAA 3070 het 3070 ref 44 25 16 6 T 2 0 76064 CASAVA_Build 13 84183815 1I GGTTTCTTCA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 T 7 8 76065 CASAVA_Build 13 84186468 1D AACCAACAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 A 9 8 76066 CASAVA_Build 13 84187980 1D AAGTAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 11 9 A 10 9 76067 CASAVA_Build 13 84204771 1D ACCAAATGGC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 8 7 76068 CASAVA_Build 13 84222414 1D TTAGGTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 761 hom 19 2 14 3 A 11 10 76069 CASAVA_Build 13 84225056 2I ACTTATATAT --/AC ACACATACAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AC 2 3 76070 CASAVA_Build 13 84227920 5I ACCCTCTTTC -----/CTTTT ATTACTTCAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 CTTTT 0 1 76071 CASAVA_Build 13 84234228 1I GGTGGTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 34 1 21 12 T 14 15 76072 CASAVA_Build 13 84238683 1I AGTGGCTGAA -/T TTTTATTTTT 3070 het 1068 hom 31 4 21 6 T 4 5 76073 CASAVA_Build 13 84241927 3I AATTGTTCTC ---/TAT TATTATGCCA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TAT 2 3 76074 CASAVA_Build 13 84244202 1D TCCAATTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 417 hom 36 1 28 7 T 9 8 76075 CASAVA_Build 13 84249424 2D ATGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 2399 het 2399 ref 41 27 7 7 GT 10 9 76076 CASAVA_Build 13 84251092 1D TACAAAAAAG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 8 7 76077 CASAVA_Build 13 84251793 3I TTTATGTGTT ---/AGA AAATTAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AGA 0 1 76078 CASAVA_Build 13 84255099 1I GATTATACTC -/T TCTCTTCACT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 76079 CASAVA_Build 13 84258421 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 15 0 14 2 A 13 12 76080 CASAVA_Build 13 84260483 2D GGATCTCTGA AG/-- GAACTGCTGA 3070 hom 87 het 35 0 29 8 AG 1 0 76081 CASAVA_Build 13 84264177 1D TTTCTGAAAG A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 8 7 76082 CASAVA_Build 13 84267699 3D GCTCTTGGGG ACA/--- ACATCACTAT 3070 hom 114 het 43 0 38 7 ACA 2 1 76083 CASAVA_Build 13 84271155 1I CAGAGATGTG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 6 7 76084 CASAVA_Build 13 84276202 1I39M2D GGATAATAGG -AAAAAATTGATTTAATTCTAATCTAAAACAATTAGAAATAA/AAAAAAATTGATTTAATTCTAATCTAAAACAATTAGAAAT-- GTTTGGCAAC 3070 hom 99 het 27 0 34 6 N/A 0 0 76085 CASAVA_Build 13 84277606 2D AATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 47 25 17 6 TA 6 5 76086 CASAVA_Build 13 84345138 1I CTGTTCTCTA -/T TTTAAGAGGA 1842 het 1842 ref 33 26 4 3 T 3 4 76087 CASAVA_Build 13 84357794 1D CTATACTGCC T/- TTTTTTTTTT 1890 het 1890 ref 41 27 5 10 T 12 11 76088 CASAVA_Build 13 84362795 1I AAACTAAAAG -/A AAAGAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 3 4 76089 CASAVA_Build 13 84363351 1I CATCACCATT -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 A 0 1 76090 CASAVA_Build 13 84363507 7D AAGTGTCTCG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2622 het 2026 hom 19 9 8 5 A 19 12 76091 CASAVA_Build 13 84369075 2D GTCTTACTAA TC/-- TCTTACCACT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 TC 2 1 76092 CASAVA_Build 13 84383039 1I ATTTTAGAAA -/C CTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 C 1 2 76093 CASAVA_Build 13 84398016 4D GTAACAGCTG TTGA/---- TTATTATTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TTGA 1 0 76094 CASAVA_Build 13 84407526 10I CAAGTACAAA ----------/ATCTACCTCC AAGCCACATT 3070 hom 168 het 58 0 56 3 ATCTACCTCC 0 1 76095 CASAVA_Build 13 84413985 1D TGATTTTTTA C/- TTTTGCCTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 0 76096 CASAVA_Build 13 84421642 1I GTTCTTTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 447 hom 27 2 22 3 T 9 10 76097 CASAVA_Build 13 84427340 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 98 hom 37 2 30 5 T 10 9 76098 CASAVA_Build 13 84428657 1I AATTGTGATA -/T TTTTCAAATT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 4 5 76099 CASAVA_Build 13 84432764 3D TCAGCACATA GTG/--- GTGCATTATC 2043 hom 35 het 23 0 9 14 GTG 2 1 76100 CASAVA_Build 13 84437067 2D AAAGATAATA AG/-- AAAAAAAGAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AG 1 0 76101 CASAVA_Build 13 84439581 1I CCTTAATTAG -/A AAAAAATAAT 3070 hom 73 het 28 0 25 3 A 6 7 76102 CASAVA_Build 13 84443731 1D CCTAAATACA T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 7 6 76103 CASAVA_Build 13 84448944 1D TGTCTCTACG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 36 0 22 14 A 14 13 76104 CASAVA_Build 13 84449683 2D AGAGAGATAC AT/-- ATATATATAT 1015 het 1015 ref 35 27 3 5 AT 7 6 76105 CASAVA_Build 13 84453489 1D GCACATACTC A/- AATTTCCTTT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 3 2 76106 CASAVA_Build 13 84454519 1I GGCCATTTTT -/G GGGGGGAAAT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 G 6 7 76107 CASAVA_Build 13 84467025 1D AATAGCATTA C/- CAAGCCAGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 2 1 76108 CASAVA_Build 13 84468005 1D TACCTTACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 10 9 76109 CASAVA_Build 13 84469803 1I GCAAAGAGGT -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 7 8 76110 CASAVA_Build 13 84476951 2D TTTCATTTTT AC/-- ACACACACAC 783 het 783 ref 48 38 3 9 AC 7 6 76111 CASAVA_Build 13 84478150 1D TCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 651 hom 20 2 12 6 A 15 14 76112 CASAVA_Build 13 84482002 1I TGTTTATTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 151 hom 26 1 23 2 A 9 10 76113 CASAVA_Build 13 84483510 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 26 1 19 7 A 12 11 76114 CASAVA_Build 13 84485113 1D GAGCCAGGTG T/- TTTTTTTATC 3070 hom 95 het 42 0 32 10 T 8 7 76115 CASAVA_Build 13 84489936 16D ACAGCCCCAA GACTTAATTATAAGGT/---------------- GATCAGAACT 3070 hom 141 het 50 0 48 5 GACTTAATTATAAGGT 1 0 76116 CASAVA_Build 13 84491488 1D AAAGGAACTC A/- AAGAGTCACA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 2 76117 CASAVA_Build 13 84495120 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 54 het 52 1 45 6 T 6 7 76118 CASAVA_Build 13 84503598 1I TGATTTTTTT -/C CTTAGGATAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 1 2 76119 CASAVA_Build 13 84505484 1D ATTTTCTCTG T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 7 6 76120 CASAVA_Build 13 84508918 2I TTCATAGACA --/CT CTCTGAATTA 3070 hom 92 het 38 0 29 9 CT 2 3 76121 CASAVA_Build 13 84509345 3I CAACTTTTCA ---/AAG TAGAAGAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAG 0 1 76122 CASAVA_Build 13 84532050 1I CAAAATGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 10 11 76123 CASAVA_Build 13 84534501 1I GGGTGATCAG -/C CCCCATCTAG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 C 4 5 76124 CASAVA_Build 13 84535517 1D ATTTATGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 20 0 9 13 T 15 14 76125 CASAVA_Build 13 84538034 4I AACATGTAAT ----/AAGG AAGGACATTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 AAGG 1 2 76126 CASAVA_Build 13 84545358 1D CAAAGGCAGG A/- AAGAAGACTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 3 2 76127 CASAVA_Build 13 84545771 1I TTTTTTAATA -/C AACTTAATAC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 C 0 1 76128 CASAVA_Build 13 84550272 5D ACGAAATGGG TTTAC/----- TTTATTTTTC 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 TTTAC 1 0 76129 CASAVA_Build 13 84557218 1D TTATAAGTAG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 1451 hom 21 5 10 6 T 7 6 76130 CASAVA_Build 13 84557387 1D CATCCGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1654 het 680 hom 7 3 4 0 T 12 11 76131 CASAVA_Build 13 84559130 1I CTGGGGACTA -/C TGGAGGGAGG 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 C 0 1 76132 CASAVA_Build 13 84569546 2I AGTGAATGAT --/TA TAGAGTGTGT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 TA 1 2 76133 CASAVA_Build 13 84574071 1D ATTAACTAAG A/- AAAAAAGAGA 1715 het 1715 ref 19 9 4 7 A 7 6 76134 CASAVA_Build 13 84582518 1I CCTCAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 2615 het 2615 ref 31 13 8 10 T 13 14 76135 CASAVA_Build 13 84585131 1D TCTAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 11 10 76136 CASAVA_Build 13 84590247 1I ATATTATGGT -/A ATAATATATA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 1 2 76137 CASAVA_Build 13 84602766 2I TCATGTAGTA --/AC ACAGTGCAGA 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 AC 1 2 76138 CASAVA_Build 13 84608208 1D ATTTATTACA T/- TTTTTACTTA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 6 5 76139 CASAVA_Build 13 84608906 4D AGAATCTCTC TCTA/---- TATATATAAA 3070 het 3070 hom 32 12 18 4 TCTA 1 0 76140 CASAVA_Build 13 84608980 4D CATATATGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 31 12 19 3 TG 10 8 76141 CASAVA_Build 13 84609625 1I AATTCTAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 9 10 76142 CASAVA_Build 13 84611370 2D TTATAATAAA AT/-- GTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 AT 1 0 76143 CASAVA_Build 13 84615063 1D11M3D AAAATAAGAA CTCAGCATGAACTGA/-GCAGCATGAAC--- TGATAACATA 3070 het 3070 ref 60 38 22 8 N/A 0 0 76144 CASAVA_Build 13 84619120 2I TTAAAATAAA --/AT ATGTTACCCA 2313 het 2313 ref 14 8 5 1 AT 1 2 76145 CASAVA_Build 13 84619763 6I ATTCTTCTTG ------/TTAATC TTAACCACAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 TTAATC 0 1 76146 CASAVA_Build 13 84625030 2I CAAAAATAGA --/AC AAAGTATCTA 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 AC 0 1 76147 CASAVA_Build 13 84626681 1I ATACTTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 11 12 76148 CASAVA_Build 13 84629888 1I TCCACACCAC -/T CATAGTCTGT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 0 1 76149 CASAVA_Build 13 84630386 4D ATAAAAATAT TTTA/---- TTTATTTTTG 3070 het 3070 hom 24 8 12 6 TTTA 2 1 76150 CASAVA_Build 13 84631139 1D TGTCACATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 13 12 A 13 12 76151 CASAVA_Build 13 84637554 1I GTTTGGATTT -/G TGTTCCCACC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 G 0 1 76152 CASAVA_Build 13 84648508 1I GAAGAATCTT -/G GAACACGAGG 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 G 1 2 76153 CASAVA_Build 13 84650799 2I CCTCGCCCCT --/GC AGCAAACTTT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 GC 0 1 76154 CASAVA_Build 13 84659146 4D TTCTTAGAAT TAAG/---- TGTTATATAT 3070 het 3070 ref 44 21 20 4 TAAG 1 0 76155 CASAVA_Build 13 84664590 17I TGAGTTTGGC -----------------/ATTAATTCAGACATGCA ATTTTCATGC 3070 het 3070 hom 33 12 19 3 ATTAATTCAGACATGCA 0 1 76156 CASAVA_Build 13 84666302 1I CATAGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 11 12 76157 CASAVA_Build 13 84702732 2D CTATCCAAAC AT/-- GTGTGACTTC 3070 het 3070 hom 45 20 21 6 AT 1 0 76158 CASAVA_Build 13 84706301 1D CTTATATAAA T/- TTTTTACAGG 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 6 5 76159 CASAVA_Build 13 84706961 5I AACTGTCTAG -----/TTTTA TTTTATTTTG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TTTTA 1 2 76160 CASAVA_Build 13 84711327 2I AGATGAATAA --/TT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 8 10 76161 CASAVA_Build 13 84714189 1I AGAAGAAAAA -/C AAAACAATGA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 C 0 1 76162 CASAVA_Build 13 84715585 1I ATAATAAGCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 8 9 76163 CASAVA_Build 13 84717610 1I AAAATTTTAC -/T TTTTTTTTTT 2081 het 803 hom 24 3 13 8 T 15 16 76164 CASAVA_Build 13 84717779 2I ACATAAAAAC --/AT AGACACTTCT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AT 0 1 76165 CASAVA_Build 13 84718437 1D TAAAGGATGA G/- TTTTTGCACC 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 G 1 0 76166 CASAVA_Build 13 84720100 3D CTGCATGAGG AAC/--- AAGTCTTTCC 3070 het 3070 ref 49 30 18 2 AAC 1 0 76167 CASAVA_Build 13 84720724 19I AAATAAAAAG -------------------/ACTATTTCTACCTATTTAT ACTATTTCTA 3070 hom 123 het 50 0 42 11 ACTATTTCTACCTATTTAT 0 1 76168 CASAVA_Build 13 84738915 1D CTGCCCAAGG A/- AGAGTCTCAG 3070 hom 87 het 34 0 28 7 A 2 1 76169 CASAVA_Build 13 84740702 1D CAACACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 38 4 25 11 A 15 14 76170 CASAVA_Build 13 84741273 11D AACTTGACAG ATATTTACAGA/----------- ATATTCTACC 3070 het 3070 hom 39 18 20 6 ATATTTACAGA 1 0 76171 CASAVA_Build 13 84742143 4I TGGAAAAGAT ----/AAAC AAAATTGATA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 AAAC 0 1 76172 CASAVA_Build 13 84744592 3D AAAACAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 48 het 22 0 16 7 AAC 4 3 76173 CASAVA_Build 13 84751660 1D TTTTTTTTTT G/- CTGTGGTTTC 3070 het 379 hom 37 1 30 7 G 1 0 76174 CASAVA_Build 13 84771400 2D TATAATAAAC AT/-- GTACTATTTA 3070 hom 42 het 16 0 15 3 AT 1 0 76175 CASAVA_Build 13 84774523 1D TCAGAGTAAA C/- AGGCGACCTA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 1 0 76176 CASAVA_Build 13 84776992 1D TATTCACTCA T/- TTTTTTATGC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 T 7 6 76177 CASAVA_Build 13 84786698 1I AAATAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 25 0 15 10 T 13 14 76178 CASAVA_Build 13 84789550 1D CTGCAGTAAG A/- AAAAAACAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 6 76179 CASAVA_Build 13 84791865 6D AATGGCAAAA TGTAAG/------ TGCTCAGGAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 8 TGTAAG 1 0 76180 CASAVA_Build 13 84792482 4D AGTGGAAAAG TAAA/---- TAAATAAAGC 3070 het 2851 hom 17 6 9 4 TAAA 3 2 76181 CASAVA_Build 13 84792819 1D ACTATAAGAA T/- TTACAAGGTG 3070 het 3070 hom 41 10 27 4 T 3 2 76182 CASAVA_Build 13 84794953 1D TGTAATTTAT G/- GTAGCAGTAT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 G 2 1 76183 CASAVA_Build 13 84798629 6I AATACAAGCT ------/AGTATA AGTATGTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 AGTATA 0 1 76184 CASAVA_Build 13 84799490 2I ATTAAATAAC --/AT ATGCATAACT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 AT 1 2 76185 CASAVA_Build 13 84801120 1I ACTAAGCAAC -/A GGAACTTTTC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 0 1 76186 CASAVA_Build 13 84801412 1I30M1I TATTTATTAT -AAGGGTTAGTGATGTATTTTATTTTATTTC-/AAAGGGTTAGTGATGTATTTTATTTTATTTCT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 17 12 5 N/A 0 0 76187 CASAVA_Build 13 84805252 2D TAGTTACACA CT/-- CACACATATG 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 CT 1 0 76188 CASAVA_Build 13 84806355 2D GCTGACTTAC CA/-- CACCACCTAC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 CA 2 1 76189 CASAVA_Build 13 84807886 1I TATATTAAGG -/T TTTTGCCTAT 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 T 4 5 76190 CASAVA_Build 13 84808876 2I AATGATAAAC --/AT ATATAGTACA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AT 2 3 76191 CASAVA_Build 13 84809164 1I CTGGCTTCAG -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 95 het 38 0 31 7 A 6 7 76192 CASAVA_Build 13 84809711 1D GAGCCCAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 526 hom 38 8 16 15 A 12 11 76193 CASAVA_Build 13 84811744 3D CTTTCAACTT AAC/--- AATTCTAACT 3070 het 3070 hom 36 15 18 8 AAC 1 0 76194 CASAVA_Build 13 84814022 3D TCTATGTACT TTC/--- TTGTCTTAGA 3070 het 3070 hom 30 14 16 1 TTC 1 0 76195 CASAVA_Build 13 84814332 3D TATATCTTAC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 42 het 17 0 15 3 TTG 5 4 76196 CASAVA_Build 13 84814838 3I ATAAAATAAT ---/GAA GACTGATTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 GAA 0 1 76197 CASAVA_Build 13 84815527 3I GAGAGATAGG ---/AGC AGCTAAATCT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AGC 1 2 76198 CASAVA_Build 13 84815713 8D ATGTGGAACA TTCTGAAG/-------- TTGCAATTAA 1861 het 1799 hom 30 8 7 16 TTCTGAAG 1 0 76199 CASAVA_Build 13 84817052 4D CAAATTATAT ATAC/---- ATACATACAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 ATAC 3 2 76200 CASAVA_Build 13 84820448 1D AAATATTTTC T/- AGTTCTTGAT 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 T 1 0 76201 CASAVA_Build 13 84820897 20I AACTATTGTT --------------------/AACTTAAAAAAAAAGATTGA AACTTAAAAG 3070 het 3070 ref 30 14 13 6 AACTTAAAAAAAAAGATTGA 0 1 76202 CASAVA_Build 13 84822378 1I TAGAAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 11 12 76203 CASAVA_Build 13 84828770 1D AAACTACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 36 1 31 4 A 11 10 76204 CASAVA_Build 13 84832587 1D TCCAAAATGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 9 8 76205 CASAVA_Build 13 84833827 2I TATTGATACA --/CT GTTATTAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 CT 0 1 76206 CASAVA_Build 13 84836977 1I CAGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 759 het 759 ref 47 30 4 13 A 15 16 76207 CASAVA_Build 13 84837786 2I TATCTTTTTG --/TA TATATATATA 2023 het 2023 ref 28 17 7 4 TA 7 8 76208 CASAVA_Build 13 84838803 4D TATTTGTATT TATC/---- AGATGTTTAC 3070 hom 78 het 28 0 27 3 TATC 1 0 76209 CASAVA_Build 13 84877156 1I CTTTGAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 10 11 76210 CASAVA_Build 13 84878210 1I CTTCGCTCCT -/C TTTCCTTTAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 0 1 76211 CASAVA_Build 13 84882447 1D CACTCTGGTC T/- TTTTTTTTTG 1339 het 1339 ref 47 41 3 4 T 10 9 76212 CASAVA_Build 13 84887197 2D CTAGTATCTC TT/-- GTTCAAAGTA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 2 0 76213 CASAVA_Build 13 84907952 1I CAGAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 11 12 76214 CASAVA_Build 13 84911113 1D ACTATTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 15 17 14 A 15 14 76215 CASAVA_Build 13 84914288 5D AATTTCACAA AAGCT/----- AGAAGTTAGA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 AAGCT 1 0 76216 CASAVA_Build 13 84917103 1I GTAACTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 32 0 24 8 A 10 11 76217 CASAVA_Build 13 84917530 1D AAAGTGTGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 9 8 76218 CASAVA_Build 13 84921037 1I TAACTCAAAT -/A ATATTTCAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 2 76219 CASAVA_Build 13 84921618 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 11 10 76220 CASAVA_Build 13 84923013 1D GACCCTTTGT A/- AAAAATGAAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 6 5 76221 CASAVA_Build 13 84933257 13I AGCCTAAGCT -------------/CAGGAGTTCAGAC CAGCCTGGAC 3070 hom 71 het 30 0 21 10 CAGGAGTTCAGAC 0 1 76222 CASAVA_Build 13 84958471 3D TATTTTTAGT ATA/--- AGAGACAGGG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATA 1 0 76223 CASAVA_Build 13 84965752 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2938 het 266 hom 12 2 9 1 A 15 14 76224 CASAVA_Build 13 84968141 4I GAGGCAGAGT ----/CTTA CTTTGTTGTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CTTA 0 1 76225 CASAVA_Build 13 84985865 5I GATTAAATTA -----/TTAAC TTGTTTTATA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TTAAC 0 1 76226 CASAVA_Build 13 84995539 1D CGTAATGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 13 12 76227 CASAVA_Build 13 85007808 4I ACCAACCAAG ----/AATA AATAAAGCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AATA 1 2 76228 CASAVA_Build 13 85008097 1I TCTAAGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 34 1 24 9 A 11 12 76229 CASAVA_Build 13 85027122 1D AGGGTGCCAC T/- TTTTACCAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 5 4 76230 CASAVA_Build 13 85034043 1D TGGATATGAC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 7 6 76231 CASAVA_Build 13 85036170 4I CATAGGCATA ----/ATAG ATATGTGTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATAG 0 1 76232 CASAVA_Build 13 85036486 1D TAATTTACTA T/- TTAAAATTAC 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 T 3 2 76233 CASAVA_Build 13 85054099 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 AG 6 4 76234 CASAVA_Build 13 85063236 1D AGTCAGGCAT G/- GTGGCGGGCG 1928 het 1218 hom 13 4 6 3 G 2 1 76235 CASAVA_Build 13 85066043 1D GAATTATGTT A/- ACATTAAATT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 2 1 76236 CASAVA_Build 13 85070668 1D TCAAAAAGGG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 44 15 18 12 A 8 7 76237 CASAVA_Build 13 85070935 1D GACAAGTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 T 10 9 76238 CASAVA_Build 13 85071571 1D GTCTTGGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 11 10 76239 CASAVA_Build 13 85076836 1D AGATAATCTA T/- AGAAGACCTC 3070 het 3070 ref 47 23 23 1 T 1 0 76240 CASAVA_Build 13 85085932 1D GTATTGATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 15 17 9 A 10 9 76241 CASAVA_Build 13 85089175 3D ATATTTGATA TTG/--- TTGTTACAAT 3070 het 1563 hom 12 4 7 1 TTG 2 1 76242 CASAVA_Build 13 85101474 1I GTAAAAAAAA -/T AACTCCAAGG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 0 1 76243 CASAVA_Build 13 85113203 3I TGGTTAAAGA ---/CTT CTTCTTCAGC 3070 hom 117 het 41 0 39 2 CTT 2 3 76244 CASAVA_Build 13 85113276 8I ACCAAACCCC --------/TGGTATTT TGGTATTTTG 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 TGGTATTT 1 2 76245 CASAVA_Build 13 85114267 2I CTATAGGTTT --/AA CTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 A 0 2 76246 CASAVA_Build 13 85115518 3D ACGTATTTAT ATG/--- ATAAGGAAGT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 ATG 1 0 76247 CASAVA_Build 13 85118112 1I AATTTATTTA -/T ATGTTAACTT 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 T 0 1 76248 CASAVA_Build 13 85119650 1D TTTCTTATTA T/- TGCCTGATAT 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 T 2 1 76249 CASAVA_Build 13 85128251 3D ATATAATAAT AAA/--- AAATGTAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 7 A 6 3 76250 CASAVA_Build 13 85132533 1I CCGGATTTCC -/A AGAAACGTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 A 1 2 76251 CASAVA_Build 13 85138961 4D AGTAGAATTT ATTA/---- ATTATTATCT 3070 het 3070 hom 28 9 17 4 ATTA 2 1 76252 CASAVA_Build 13 85142398 1D TGCTTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 32 1 15 16 T 15 14 76253 CASAVA_Build 13 85145902 1I TCTCTCAATG -/A AAAAAATTGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 6 7 76254 CASAVA_Build 13 85148083 4D GACAATAAAA TCTT/---- TCTATTTTTA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 TCTT 1 0 76255 CASAVA_Build 13 85150825 1D148M1D ATACATTTCC AAAAAAAAATAAATAAATCATTCTGGACCTCAGATCCCTAAAATTTAAAGGGAATTTGTATAATTGGCTATTTCTATTAATGTTTAATTCTGTGAATTTGTTATTCACATATGTTTTAGATTAAATATTTTTACTCCTTATTGAAAACCA/-AAAAGAAATAAATAAATCATTCTGGACCTCAGATCCCTAAAATTTAAAGGGAATTTGTATAATTGGCTATTTCTACTAATGTTTAATTCTGTGAATTTGTTATTCACATATGTTTTAGATTAAATAATTTTACTCCTTATTGAAAACC- ATATTTATAT 3070 hom 105 het 33 0 36 42 N/A 0 0 76256 CASAVA_Build 13 85155912 3I TTTTTCTTCT ---/AAG AAGATCAAAG 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 AAG 1 2 76257 CASAVA_Build 13 85160681 3D ATTGTTTTTT TAA/--- TAATAAGGCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TAA 3 2 76258 CASAVA_Build 13 85162207 1I ATACTAAGAC -/A AAAAGTAACT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 4 5 76259 CASAVA_Build 13 85165116 1D TAATAATAAT A/- AATAAATAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 3 2 76260 CASAVA_Build 13 85165603 10I CATATTATAT ----------/ACTTAAAATA ATAAGTTAAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 ACTTAAAATA 0 1 76261 CASAVA_Build 13 85179552 10D TCAGGAAGCT GTTCCAAAGC/---------- GTTCCAAAGC 3070 hom 63 het 30 0 22 10 GTTCCAAAGC 2 1 76262 CASAVA_Build 13 85184002 7I AAAAAATGAT -------/AATAAAA AATAAAAACA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AATAAAA 1 2 76263 CASAVA_Build 13 85184327 1D CTAGATACAA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 7 6 76264 CASAVA_Build 13 85188326 1D TCAAACAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 57 hom 25 1 19 7 A 13 12 76265 CASAVA_Build 13 85194702 4I CATTTCATTC ----/ATTT GTTTTGTCCT 3070 het 3070 hom 46 17 17 12 ATTT 0 1 76266 CASAVA_Build 13 85201085 1I GGCAGCAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 10 26 12 A 10 11 76267 CASAVA_Build 13 85203792 1I TTAACTTTAA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 6 7 76268 CASAVA_Build 13 85210745 2D12M1D AAAAGAAAAG AAAAAAAAAAATAGA/--AAAAAAAAATAG- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 5 N/A 0 0 76269 CASAVA_Build 13 85211064 1D CATAGTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 17 1 T 10 9 76270 CASAVA_Build 13 85213780 1I AATGCTCGTG -/A AAAAAATACT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 6 7 76271 CASAVA_Build 13 85214810 2D ATTCTGAATC TT/-- TTTTATTCAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 T 6 4 76272 CASAVA_Build 13 85215317 4I ACCAAAGTTT ----/ATGA ATGAATGATG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 ATGA 2 3 76273 CASAVA_Build 13 85215666 3D TTTTCACTTC TTT/--- TGTGATTCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 1 76274 CASAVA_Build 13 85216206 1D TTTAATTTTA T/- TATTTTTATA 3070 het 1498 hom 21 5 13 3 T 2 1 76275 CASAVA_Build 13 85218948 2I CTGGACCTGT --/AA AAAAAACTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 6 8 76276 CASAVA_Build 13 85220591 1I ATTATTTGTA -/T TTTTTCACTT 3070 het 3070 ref 56 33 18 5 T 5 6 76277 CASAVA_Build 13 85222880 3I AACCTGTGTC ---/ATG ATACAACCTG 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 ATG 0 1 76278 CASAVA_Build 13 85223478 1I TAAATTACTG -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 7 8 76279 CASAVA_Build 13 85225053 2D TGGGATGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 GT 6 5 76280 CASAVA_Build 13 85225307 1I ACATTTTTTT -/C CCCTGCTATA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 C 3 4 76281 CASAVA_Build 13 85227647 1D AAATTTAGCT A/- AAGAATGAAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 3 2 76282 CASAVA_Build 13 85235649 20I CGATTTTTGT --------------------/TTGTGCAAAAATCACAGGTA TTGTCATCAA 3070 het 3070 hom 26 13 14 1 TTGTGCAAAAATCACAGGTA 0 1 76283 CASAVA_Build 13 85236025 2I TATACATTTA --/AT ATATATATTT 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 AT 4 5 76284 CASAVA_Build 13 85237851 1D TTACCAATTA T/- GATTTGTAGA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 1 0 76285 CASAVA_Build 13 85238315 1D CAGGGAAGTT A/- CCCAGCAAGG 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 A 1 0 76286 CASAVA_Build 13 85238622 2I TGAGGAGTGT --/GA ACTTCGGGCC 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 GA 0 1 76287 CASAVA_Build 13 85239399 5D AATTTTTAAC TTACG/----- TTAAGTAGTT 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 TTACG 1 0 76288 CASAVA_Build 13 85240382 3I TTACCAAAAA ---/AAT TGGCAGAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 AAT 0 1 76289 CASAVA_Build 13 85240659 4D TCCATCTATT TATC/---- TATCTCTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 TATC 2 1 76290 CASAVA_Build 13 85242982 2D CCAAACAAAC TT/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 3 1 76291 CASAVA_Build 13 85247397 2D ATGATATGCA GT/-- GTGGTGCTTG 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 GT 2 1 76292 CASAVA_Build 13 85248611 2I TGCTTCCCTT --/CA CACAGAGTGG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 CA 2 3 76293 CASAVA_Build 13 85248795 6D AAAAACAACA GGTGAG/------ TGCTGAGGGA 3070 het 3070 hom 41 18 21 4 GGTGAG 1 0 76294 CASAVA_Build 13 85249133 3D63M5D AAATGTGAAC AATGTTTGGTCCTAGGTAGAAAATTAAAACATCCTATATTTTTGTAAAAGCAGATTCAAAACAGGATAGTT/---GTTTGGTCCTAGGTAGAAAATTAAAACATCCTGTATTTTTGTAAAAGCAGATTCAAAACAGGA----- TAAAGTTAGG 3070 het 3070 ref 22 24 9 5 N/A 0 0 76295 CASAVA_Build 13 85249646 2I TCTAATAATT --/CC CACTAATGTG 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 C 1 3 76296 CASAVA_Build 13 85249719 3I TTTTTTTTTT ---/TTA TTTTTAAAGA 3070 het 2388 hom 25 10 12 3 TTA 0 1 76297 CASAVA_Build 13 85251581 1I TATATAATTG -/A AAAAATCTCT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 5 6 76298 CASAVA_Build 13 85251769 15I ACCTCTGAGA ---------------/ATTACATAATATTGC ATTTCCCAGG 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 ATTACATAATATTGC 0 1 76299 CASAVA_Build 13 85251946 1D TTCTTTTGAC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 9 8 76300 CASAVA_Build 13 85253494 1I TTTGTTATGG -/A AGGTAAACAT 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 A 1 2 76301 CASAVA_Build 13 85255901 5D AATAAAATTC AGATA/----- ATTTAACTAC 3070 het 3070 ref 20 10 9 2 AGATA 1 0 76302 CASAVA_Build 13 85256864 1D TTTCACAATG T/- TTTGAGAATT 3070 het 3070 hom 37 15 14 10 T 4 3 76303 CASAVA_Build 13 85258898 2D AAATTCTATC TT/-- TTATATGTTA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 4 2 76304 CASAVA_Build 13 85259822 1D ATCTCCACAC A/- AAATGCTTAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 4 3 76305 CASAVA_Build 13 85260697 2I GAAATAAAAC --/AT AAATTCCTAA 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 AT 0 1 76306 CASAVA_Build 13 85269176 2D CATATGTGTA TG/-- TGTGTATGCA 3070 het 3070 hom 45 20 21 6 TG 3 2 76307 CASAVA_Build 13 85271130 1D TTCCTTTATT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 A 8 7 76308 CASAVA_Build 13 85272120 4D TATTTTAATA TATT/---- TATTTAGAAG 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 TATT 2 1 76309 CASAVA_Build 13 85273393 1D50M2I ACACTTTTTT AAAAAAAAATTATTCAGTTGTTCTATAAGCTTTCATTGGGAATAAAAAACT--/-AAAAAAAATTATTCACTTGTTCTATAAGCTTTCATTGGGAATAAAAAACTAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 8 8 22 N/A 0 0 76310 CASAVA_Build 13 85279593 1I ATAGGAACAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 7 8 76311 CASAVA_Build 13 85279707 2D TCAGTTGAAA AC/-- ACAAAGATGA 3070 het 3070 ref 46 27 17 3 AC 2 1 76312 CASAVA_Build 13 85279942 1D ATAGCAGGGG A/- CCCAAACCCC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 1 0 76313 CASAVA_Build 13 85281601 1D ACAACACACG T/- TAACAACTTA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 2 1 76314 CASAVA_Build 13 85292529 1I GATGATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 10 11 76315 CASAVA_Build 13 85293201 10D AGAACTATTC TGTTTTGTTT/---------- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 9 TGTTT 6 4 76316 CASAVA_Build 13 85294703 1I ATTGACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 A 13 14 76317 CASAVA_Build 13 85298185 1D ATTCATTAGC A/- AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 52 30 19 4 A 7 6 76318 CASAVA_Build 13 85301581 1I ATAACAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 8 9 76319 CASAVA_Build 13 85310711 1D ATAAATTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 A 12 11 76320 CASAVA_Build 13 85323835 5I TAAATATTTA -----/TATAG TGTAACTACT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 TATAG 0 1 76321 CASAVA_Build 13 85324327 1D AGTATGGGGG A/- AAAAACGTCA 3070 het 3070 ref 57 29 22 6 A 6 5 76322 CASAVA_Build 13 85329146 1I CCTCACTATT -/A AACTTTTGTG 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 2 3 76323 CASAVA_Build 13 85331519 3D ACATTATTTA ATG/--- ATAATTTTTC 3070 het 3070 ref 52 25 24 5 ATG 1 0 76324 CASAVA_Build 13 85332312 1D TGTGCTTTAT A/- ATACAAAATG 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 2 1 76325 CASAVA_Build 13 85346305 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 T 10 9 76326 CASAVA_Build 13 85351702 1I CATAGCACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 8 9 76327 CASAVA_Build 13 85353329 4D GTATGGTATT TATC/---- AATACTGTAG 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 TATC 1 0 76328 CASAVA_Build 13 85353814 4D AGTCGGTAAG TGTT/---- TGTGTGCATA 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 TGTT 1 0 76329 CASAVA_Build 13 85355145 4D ATAGGGCGAA AAAC/---- AAACAAGCTT 3070 het 3070 ref 32 21 10 2 AAAC 2 1 76330 CASAVA_Build 13 85358007 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 761 hom 18 3 13 5 A 14 12 76331 CASAVA_Build 13 85359012 1I TAATTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 10 11 76332 CASAVA_Build 13 85369571 1I AAGTAAAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 A 8 9 76333 CASAVA_Build 13 85371845 1I TTAACAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 15 5 A 11 12 76334 CASAVA_Build 13 85378598 13I AGCAAGGTAA -------------/GGAGATCACCTGT GGCTAGTCTG 3070 het 3070 ref 55 27 25 4 GGAGATCACCTGT 0 1 76335 CASAVA_Build 13 85381263 1D CTTCTCTCTA T/- TTCCCCTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 3 2 76336 CASAVA_Build 13 85383775 1D AAATTATTAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 8 7 76337 CASAVA_Build 13 85391895 1D AGTATCATAT G/- TGGGAGTGGA 3070 het 3070 ref 34 17 11 8 G 1 0 76338 CASAVA_Build 13 85402371 1D GTGTTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 13 8 T 11 10 76339 CASAVA_Build 13 85407178 1D GTTCCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2102 hom 33 9 16 9 T 13 12 76340 CASAVA_Build 13 85410706 1D ATTGGAAGAA T/- TAGCAGTACC 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 T 2 1 76341 CASAVA_Build 13 85416570 1I AAATGTTAGT -/G TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 G 0 1 76342 CASAVA_Build 13 85417837 1D TGTATCCCTG C/- CACCATCACC 3070 het 3070 ref 59 25 24 11 C 2 1 76343 CASAVA_Build 13 85420645 1D TAAAACATTA T/- GCTGAGTAAA 3070 het 3070 hom 44 20 19 7 T 1 0 76344 CASAVA_Build 13 85420781 1D TCACTATGTC G/- GGTGGAGAAT 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 G 3 2 76345 CASAVA_Build 13 85423147 12I CCAAGAGAGT ------------/TATAGTGGTGTA TATAGTGGCA 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 TATAGTGGTGTA 0 1 76346 CASAVA_Build 13 85424937 1I AACATCACTA -/T TTTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 4 5 76347 CASAVA_Build 13 85427176 2D CTGATTATTC CA/-- CAGACTATGA 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 CA 2 1 76348 CASAVA_Build 13 85441885 2I TATTATGTGT --/TA TATTGCTCCT 3070 het 3070 ref 58 26 25 7 TA 1 2 76349 CASAVA_Build 13 85443588 1D AAATATTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 10 9 76350 CASAVA_Build 13 85445820 1D ATACAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 11 10 76351 CASAVA_Build 13 85454169 4D TCTATCTGTA TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 1632 hom 15 4 9 2 TATT 4 3 76352 CASAVA_Build 13 85456748 1I TCCTCTGGAT -/A AACTTGCTGC 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 2 3 76353 CASAVA_Build 13 85459661 3D AAATTCAGAA TTG/--- TTGTGCCCCT 3070 het 3070 ref 29 19 7 4 TTG 2 1 76354 CASAVA_Build 13 85461200 1I CATTCTTTCA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 6 7 76355 CASAVA_Build 13 85480609 5I GACATTTCTG -----/AAATA AAATATAAAG 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 AAATA 1 2 76356 CASAVA_Build 13 85482657 3D ATAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 17 het 26 0 20 6 AAG 5 4 76357 CASAVA_Build 13 85485261 2D TAAAACAAAC AG/-- AAATAATAAT 3070 het 3070 ref 18 8 8 3 AG 1 0 76358 CASAVA_Build 13 85487905 2D AGCATGAATA AC/-- AAACAAATAG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 AC 1 0 76359 CASAVA_Build 13 85488121 2D7M14I GAAATATTTT CCATCATTT--------------/--ATTATGTTAATAGTAATAAAA CCATTGAATA 1820 het 1820 ref 27 20 4 4 N/A 0 0 76360 CASAVA_Build 13 85488869 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2548 het 2548 ref 18 7 6 5 T 11 12 76361 CASAVA_Build 13 85493817 4D4M6D TGAAATTGTG CTTTATACTTTTCT/----AAAC------ TTATCACTTT 1129 het 1129 ref 17 17 3 0 N/A 0 0 76362 CASAVA_Build 13 85495306 1D TCAAGGCATC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 T 8 7 76363 CASAVA_Build 13 85499320 1D ATTTTTTTTT A/- AATTTTTTGA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 3 2 76364 CASAVA_Build 13 85503579 5D AATTAGAAAC ATAAA/----- ATAAATTGAT 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 ATAAA 2 1 76365 CASAVA_Build 13 85503895 5D TATGTGGCTA TAACT/----- TAACTTATGC 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 TAACT 2 1 76366 CASAVA_Build 13 85510672 1I TTTGCTACCA -/T TTTTTTTTTT 2562 het 2562 ref 35 13 8 14 T 12 13 76367 CASAVA_Build 13 85511692 1D AAATCAGTGG A/- ACTCAGTAAA 3070 het 3070 ref 63 31 26 7 A 2 1 76368 CASAVA_Build 13 85512950 4I TTGAAAAAAG ----/AGAT AGAGATATCA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 AGAT 0 1 76369 CASAVA_Build 13 85524877 1D TTAAACCATG A/- AACCTAAGAA 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 A 3 2 76370 CASAVA_Build 13 85532550 8D CACATATTTC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 398 hom 20 3 11 6 AT 13 9 76371 CASAVA_Build 13 85534119 1I CCAAAATACC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 7 8 76372 CASAVA_Build 13 85539955 6D TTAAACAACA ACAACC/------ ACAACAACAA 3070 het 3070 hom 55 29 24 3 ACAACC 1 0 76373 CASAVA_Build 13 85547296 1I GGCACTTAGA -/G GGAGTCCCAT 3070 het 3070 hom 48 21 19 8 G 2 3 76374 CASAVA_Build 13 85548197 2I CTCTACATAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 AC 6 7 76375 CASAVA_Build 13 85550983 1D AAATCTGGAA G/- CTTTGCTTTG 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 G 1 0 76376 CASAVA_Build 13 85551646 4I TATACTTTGT ----/TTTG TTTTTGTAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TTTG 0 1 76377 CASAVA_Build 13 85552248 2I TTCCTCTGTC --/TG TGTTATATAA 1808 het 1808 ref 27 17 4 6 TG 1 2 76378 CASAVA_Build 13 85552308 3D AATTTAGTTA TTT/--- TATTTTAAAT 2823 het 2823 ref 19 9 6 5 T 4 1 76379 CASAVA_Build 13 85552812 5I ATATTTTTTA -----/GAAGT GAGCTTGCTG 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 GAAGT 0 1 76380 CASAVA_Build 13 85553027 4D TCGTTTATTA TAAG/---- TAAGAGAAGG 3070 het 3070 ref 42 24 12 8 TAAG 2 1 76381 CASAVA_Build 13 85565017 3D TAGCAACTCT TTG/--- TTGTGAGAGG 3070 het 3070 ref 34 21 12 3 TTG 2 1 76382 CASAVA_Build 13 85571021 1D TCTCTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 2 A 11 10 76383 CASAVA_Build 13 85572558 1I TATATTTGAG -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 6 7 76384 CASAVA_Build 13 85573267 4I ATGTTCTTGA ----/TTGT TTAAGAGAGC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 TTGT 0 1 76385 CASAVA_Build 13 85573787 5I CTGCTTTATC -----/TTATA TTAAACAATA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 TTATA 0 1 76386 CASAVA_Build 13 85576323 1D TTTATTGAGA T/- TTTTTTTTTT 2770 het 2770 ref 29 16 8 6 T 11 10 76387 CASAVA_Build 13 85577497 4D13M1I TCTGACAGTC TGTTTGTTATGATTTCT-/----TGTTATGATTTCTG TTCTTTTGCA 3070 het 3070 ref 41 23 15 14 N/A 0 0 76388 CASAVA_Build 13 85582271 16D TGTCCTTTGC AGTGCAGGCCAGTGGA/---------------- CACCACACTG 3070 het 3070 ref 40 29 12 2 AGTGCAGGCCAGTGGA 1 0 76389 CASAVA_Build 13 85585677 1I TTTTACAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 55 25 23 7 A 8 9 76390 CASAVA_Build 13 85588219 2D GCACATACAC TG/-- TGTCATCATA 3070 het 3070 ref 43 27 15 2 TG 2 1 76391 CASAVA_Build 13 85589385 1I GGCTTTTTTG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 7 8 76392 CASAVA_Build 13 85591504 1D GAGATAAAAC A/- AAACAACACA 3070 het 3070 ref 44 14 16 15 A 4 3 76393 CASAVA_Build 13 85593685 3I CTACATTTTC ---/AGG AGGAGATATT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 AGG 1 2 76394 CASAVA_Build 13 85593777 1D CAGTGCTTTA T/- TTTTACCAAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 5 4 76395 CASAVA_Build 13 85594047 2I CAATATTTGT --/AG AGTTATAATA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 AG 1 2 76396 CASAVA_Build 13 85594293 1I AAGGATGTAG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 6 7 76397 CASAVA_Build 13 85594424 1I TTTTAAAAAA -/G TATTTCAATT 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 G 0 1 76398 CASAVA_Build 13 85597399 2I AATTTTTTTT --/TC CACAAGGTTC 3070 het 3070 hom 29 8 18 3 TC 0 1 76399 CASAVA_Build 13 85598390 1D AAAATTTGAG A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 7 6 76400 CASAVA_Build 13 85600080 1D ATTAGACATT A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 7 6 76401 CASAVA_Build 13 85602962 1D ATATTTACCT A/- AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 A 7 6 76402 CASAVA_Build 13 85603329 2D ATTGGAAATT AA/-- AAAAGATATT 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 A 6 4 76403 CASAVA_Build 13 85603423 4I GCAACATGTT ----/ATTA ATTATTATGA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 ATTA 1 2 76404 CASAVA_Build 13 85605289 1D AAATATATCC G/- GACAATGCAA 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 G 2 1 76405 CASAVA_Build 13 85606104 1I CATTGGAGAG -/A AAAATCACTA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 4 5 76406 CASAVA_Build 13 85611711 1I AATATGTCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 8 9 76407 CASAVA_Build 13 85613352 4I TTTGTGGGAA ----/GAGT TAGTTAAAAT 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 GAGT 0 1 76408 CASAVA_Build 13 85613600 1D ATTAAGTCCA G/- TTTGTTATTT 3070 het 2562 hom 26 6 18 2 G 1 0 76409 CASAVA_Build 13 85613705 2I TCTGTATACT --/TC TGTCTTTGCA 3070 het 3070 hom 40 10 24 6 TC 0 1 76410 CASAVA_Build 13 85615053 1D CAGATAGAAG A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 hom 24 8 15 2 A 6 5 76411 CASAVA_Build 13 85615767 1D CCAGTCCCCC T/- ATAAATGAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 1 0 76412 CASAVA_Build 13 85618177 1I CCTAACCTTT -/A AAAAAAATTT 2085 het 2085 ref 15 8 5 2 A 7 8 76413 CASAVA_Build 13 85623820 1I CACTTAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 A 9 10 76414 CASAVA_Build 13 85623967 1I ATTAGAAAAG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 6 7 76415 CASAVA_Build 13 85626184 1D ATGTTAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 10 9 76416 CASAVA_Build 13 85633078 4D GTTTTTATTT TACA/---- TACTCTTACT 3070 het 3070 hom 30 12 15 6 TACA 1 0 76417 CASAVA_Build 13 85643213 2D ATGTATATTC AT/-- ATATGTTTAT 3070 het 3070 ref 30 12 16 2 AT 3 2 76418 CASAVA_Build 13 85709471 2D GCTGTAAATC AG/-- AGTTTTAGTA 3070 het 3070 hom 31 9 19 5 AG 2 1 76419 CASAVA_Build 13 85709829 2I AATGTCATGC --/AA AGAGTGTATA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 1 3 76420 CASAVA_Build 13 85710132 4I TAAAGAATAT ----/TCAG TAAATATTCT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 TCAG 0 1 76421 CASAVA_Build 13 85712266 5D TGTAAATATA AATAT/----- AATATAAAAT 3070 het 1183 hom 17 3 13 1 AATAT 2 1 76422 CASAVA_Build 13 85715291 4D TGAGGTTGTT TGAC/---- TGGAGTATAG 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 TGAC 1 0 76423 CASAVA_Build 13 85716617 2I52M12I AATTTTAGCA --AGACATCCTTCCAAGAAGAAGGTCTAAGAGCAGAATTGGGGTAGGGAAACAT------------/ATAGACATCCTTCCAAGAAGAAGGTCTAAGAGCAAAATTGGGGTAGGGAAACATGGTATATTTTAG GAGAGAAGAA 3070 het 3070 ref 41 37 24 11 N/A 0 0 76424 CASAVA_Build 13 85716952 1I GGTCCCCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 9 10 76425 CASAVA_Build 13 85717303 6D AGCTTTCTTT TTAAGA/------ TTGTCACATA 3070 het 3070 ref 46 29 15 4 TTAAGA 1 0 76426 CASAVA_Build 13 85717486 1D AGTCTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 12 11 76427 CASAVA_Build 13 85718315 2D ATAAGAAATA AT/-- AGAGACAGTT 3070 het 3070 hom 58 26 29 4 AT 1 0 76428 CASAVA_Build 13 85719664 14D AAAGGCGGAC AGCATGAGACAGCT/-------------- AGCGTGAGTA 2543 het 2543 ref 28 16 9 7 AGCATGAGACAGCT 1 0 76429 CASAVA_Build 13 85720268 4I GCTTACGTGT ----/GTGA GTATGTGTGC 3070 het 3070 ref 47 20 21 6 GTGA 0 1 76430 CASAVA_Build 13 85721044 3I TATATGTGTG ---/CTT ATTATTACCT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 CTT 0 1 76431 CASAVA_Build 13 85721327 1I TATAAAAAGC -/A AAAATATCAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 4 5 76432 CASAVA_Build 13 85723524 3D AAAATATAAT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 26 9 14 4 TTA 4 3 76433 CASAVA_Build 13 85725319 5I CCCTAAAACT -----/TAAAA TAAAATGTTA 349 het 349 ref 18 8 2 8 TAAAA 1 2 76434 CASAVA_Build 13 85726762 1D AGAAGAAGAA G/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 G 1 0 76435 CASAVA_Build 13 85727510 1I GAGCCTGTAG -/A AGATGAGAAG 2370 het 2370 ref 23 11 9 3 A 1 2 76436 CASAVA_Build 13 85728986 1I TATGCAACAC -/T AAATTCTAGA 1066 het 1066 ref 38 31 3 4 T 0 1 76437 CASAVA_Build 13 85730173 4I TCTAGATAAG ----/AAAC AAACAATGAA 3070 hom 55 het 22 0 19 3 AAAC 1 2 76438 CASAVA_Build 13 85733156 1D GATTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3051 het 747 hom 30 6 8 16 A 13 12 76439 CASAVA_Build 13 85736464 3I TCTTGAAAAA ---/TTC TTCTTCACAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TTC 2 3 76440 CASAVA_Build 13 85737994 1D AAATGAATTG C/- ACCTGTTTAG 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 C 1 0 76441 CASAVA_Build 13 85738850 4D CATAGGTGTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 48 het 20 0 17 5 AT 8 6 76442 CASAVA_Build 13 85745095 6I AGCCATACTG ------/ATATAA ATAAAATATT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 ATATAA 0 1 76443 CASAVA_Build 13 85746677 1D AGGGAATCTA T/- AAACCTGAAG 3070 het 3070 ref 47 25 18 6 T 1 0 76444 CASAVA_Build 13 85748618 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATGTGTGTG 3070 het 18 hom 44 3 35 10 TA 2 1 76445 CASAVA_Build 13 85760519 1I TCCTAACATC -/T TTTTTTTTTT 1738 het 1738 ref 54 26 5 23 T 15 16 76446 CASAVA_Build 13 85769801 1I AAGGCCCAGG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 7 8 76447 CASAVA_Build 13 85782334 2D TCTGGGCCTA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 11 9 76448 CASAVA_Build 13 85782716 3D AATTTTTGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 1886 hom 25 het 15 0 9 6 T 15 12 76449 CASAVA_Build 13 85783522 5D TATGATTCTT TTGTC/----- TTGTTCATCA 3070 het 3070 ref 27 15 11 3 TTGTC 1 0 76450 CASAVA_Build 13 85784439 4D TTCACCTTTT TAAA/---- TAATTGTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 TAAA 1 0 76451 CASAVA_Build 13 85787947 5I TATTACTAGA -----/TATTT TATTTTATTT 2468 hom 15 het 8 0 6 2 TATTT 2 3 76452 CASAVA_Build 13 85787989 1I CTTTCTTAGG -/T TTTTTTTTTT 1881 het 1422 hom 15 4 4 7 T 10 11 76453 CASAVA_Build 13 85807891 3D ATAACTGAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 31 13 15 6 AAC 5 4 76454 CASAVA_Build 13 85808922 1I GGAGATCAAT -/C CCCTGTACTC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 3 4 76455 CASAVA_Build 13 85817984 3I TCAATGTCTC ---/ATA ATAACTCTAA 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 ATA 1 2 76456 CASAVA_Build 13 85820186 2D AGTCTAATGA CT/-- CTTTGACTTT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 CT 2 1 76457 CASAVA_Build 13 85829888 1I TCCATTTAGT -/A GTATAAGTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 0 1 76458 CASAVA_Build 13 85832094 3I CTAAGCTGTC ---/CTT CTTCATTCCC 3070 hom 54 het 23 0 19 5 CTT 1 2 76459 CASAVA_Build 13 85835660 6D GTCTCAAAAA AATAAT/------ AATAATAATA 2319 het 2285 hom 12 5 7 3 AAT 6 4 76460 CASAVA_Build 13 85838247 2D TGTAGAATTT GA/-- GTAAAAATGT 3070 het 3070 hom 36 17 19 2 GA 1 0 76461 CASAVA_Build 13 85852488 1D TTCAGTCTAG A/- GTTAGAATGG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 1 0 76462 CASAVA_Build 13 85864811 1I GGGACAATGG -/A AAAATGTAGT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 4 5 76463 CASAVA_Build 13 85865934 2D AACTTCAGTC TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 T 10 8 76464 CASAVA_Build 13 85869548 1D TTCTTCAATA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 73 het 30 0 25 7 T 9 8 76465 CASAVA_Build 13 85876473 1I AGCAAATATA -/C ACAACACCCA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 0 1 76466 CASAVA_Build 13 85881788 4D ATGTGTACAT AATA/---- TATAGGGATA 3070 het 1859 hom 11 4 7 0 AATA 1 0 76467 CASAVA_Build 13 85884970 1D AGGAAAATGT G/- GGGTCACAGA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 G 4 3 76468 CASAVA_Build 13 85909669 2D40M9D TTTAGTTTTT ACACCTCTTAGCAAAATTGTTTCCTAGTTTGTGCCAAAAACAATATGGAAT/--ACCTCTTAGCAAAATTGTTTCCTAGTTTGTGCCAAAAACA--------- ATATGGGACA 3070 het 3070 hom 34 31 31 5 N/A 0 0 76469 CASAVA_Build 13 85910537 4I AATATTGTTA ----/ATTT ATTTATTTTA 3070 hom 39 het 29 0 14 15 ATTT 2 3 76470 CASAVA_Build 13 85912676 8D CATATATATG TATATATA/-------- TATATATATA 3070 het 229 hom 24 3 15 6 TA 10 6 76471 CASAVA_Build 13 85915589 5I CCAAGTGTTT -----/TTTTA TTTTATTTCT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TTTTA 1 2 76472 CASAVA_Build 13 85919640 1D TTGTAATTGA T/- TGCATAAAGT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 2 1 76473 CASAVA_Build 13 85925568 1D CTCAATTTTT G/- TTGGACTTGG 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 G 1 0 76474 CASAVA_Build 13 85927707 2D AATTTTAGGG TT/-- TTTTTTTTGT 2584 het 2584 ref 18 11 7 0 T 10 8 76475 CASAVA_Build 13 85927999 1D AAAAAGGAGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 9 8 76476 CASAVA_Build 13 85929632 5I TATTTAACTC -----/AAATT ATATTATACA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 AAATT 0 1 76477 CASAVA_Build 13 85932074 2D CAAAAGGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 16 14 76478 CASAVA_Build 13 85938358 1D AATGCAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 10 9 76479 CASAVA_Build 13 85943589 3D ACAAACTATG ACA/--- ACATCTTTAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 ACA 2 1 76480 CASAVA_Build 13 85944518 1I ATTAAATAGG -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 T 7 8 76481 CASAVA_Build 13 85944706 1D AAAGACAAAT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 8 7 76482 CASAVA_Build 13 85953902 1I CTAAAAAAAG -/A GAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 0 1 76483 CASAVA_Build 13 85955828 2D TATAATACTT AG/-- AGTTATAGTA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 AG 2 1 76484 CASAVA_Build 13 85961718 2D AGTCAAATTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2938 hom 17 7 9 1 AT 7 6 76485 CASAVA_Build 13 85962185 4D TGTGGATTAA TACT/---- TACCATTTAC 3070 het 3070 hom 38 17 18 6 TACT 1 0 76486 CASAVA_Build 13 85963931 1I CCCAAGTAGC -/T AGAATTACAG 3041 het 3041 ref 20 11 7 2 T 0 1 76487 CASAVA_Build 13 85964307 1D AATGAAGAAC A/- AAAAAAGCTA 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 A 7 6 76488 CASAVA_Build 13 85965300 1D AATATATAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 9 8 76489 CASAVA_Build 13 85965460 4D CATCTAACAG ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 18 12 4 AT 8 6 76490 CASAVA_Build 13 85969651 1D TATTTTTTTT A/- GGCTGAAATG 3070 het 3070 hom 35 14 16 7 A 1 0 76491 CASAVA_Build 13 85969712 1I GAACACATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 9 10 76492 CASAVA_Build 13 85971478 1D AACACCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 42 0 25 18 A 12 11 76493 CASAVA_Build 13 85971712 4I AGAACAGAGC ----/TGGA TGAAAGTGTC 3070 het 3070 ref 52 29 19 4 TGGA 0 1 76494 CASAVA_Build 13 85971985 1I AATCATATAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 6 7 76495 CASAVA_Build 13 85976664 1I AAAGCTTAGA -/T TTTTATATCT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 4 5 76496 CASAVA_Build 13 85980911 3I GTTCATTGAT ---/TGC TGCTATTGTA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 TGC 1 2 76497 CASAVA_Build 13 85981393 1D TAAAACAATC T/- TAACTCAAAG 3070 het 3070 ref 52 33 17 3 T 2 1 76498 CASAVA_Build 13 85984728 1D GGACTCATGT A/- ACGTTGCACA 3070 het 3070 hom 47 16 17 14 A 2 1 76499 CASAVA_Build 13 85988579 2I CACATATACG --/TA TATATATATA 1155 het 1155 ref 22 14 3 5 TA 5 6 76500 CASAVA_Build 13 85991099 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 T 9 7 76501 CASAVA_Build 13 85993378 5D TAGAAGAGAA CAATT/----- CACTAATAAA 3070 het 2728 hom 30 8 20 3 CAATT 1 0 76502 CASAVA_Build 13 85998216 4I ATTGAGAAAA ----/TAAT TAATCTATAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TAAT 1 2 76503 CASAVA_Build 13 85998755 1D TGGGCCCACA G/- TATTTGCACA 3070 het 3070 hom 50 17 24 9 G 1 0 76504 CASAVA_Build 13 85999622 4D TTAATAATAA TGAG/---- TAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 TGAG 1 0 76505 CASAVA_Build 13 86000605 2D TTGTAATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 932 hom 27 4 15 10 TA 7 6 76506 CASAVA_Build 13 86002157 1D ACAAATTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 528 hom 31 6 17 8 A 14 13 76507 CASAVA_Build 13 86003950 1D AAAGACACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 33 5 12 16 T 11 10 76508 CASAVA_Build 13 86004211 1D TTTTTCAATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 10 9 76509 CASAVA_Build 13 86004972 1I GGAAAATAAT -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 7 8 76510 CASAVA_Build 13 86005673 1I AAGTATAATT -/A ACAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 1 2 76511 CASAVA_Build 13 86008189 7I AGATCACGGG -------/ACTGCAA ACAGCTGCAA 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 ACTGCAA 0 1 76512 CASAVA_Build 13 86013110 1D AAATAAATCG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 10 9 76513 CASAVA_Build 13 86014324 2D AAAGAGACAC AT/-- AGACTATCAA 3070 het 3070 hom 55 20 34 3 AT 1 0 76514 CASAVA_Build 13 86016666 5I CAAAAGTGTA -----/AAGAT AAGAAGCAGG 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 AAGAT 0 1 76515 CASAVA_Build 13 86019706 1D TACTTTTTTT G/- TTTAGATATA 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 G 1 0 76516 CASAVA_Build 13 86023379 2D TCTAATTTTC TA/-- TATGTTGCAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 TA 2 1 76517 CASAVA_Build 13 86026625 4D TCCGATGATA CTTT/---- TTAACTTTGA 3070 het 3070 ref 34 19 14 4 CTTT 1 0 76518 CASAVA_Build 13 86031850 1D TGGGGTCCAG A/- ACAGGAGAAG 3070 het 2740 hom 25 8 14 3 A 2 1 76519 CASAVA_Build 13 86038237 1D TATTTACCTC A/- ATTCCTATTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 A 2 1 76520 CASAVA_Build 13 86049551 4D AAAATACTAC TTAA/---- TTGAGTGTCA 3070 het 3070 hom 24 11 12 3 TTAA 1 0 76521 CASAVA_Build 13 86049680 4D ATTTTTAAAC CTCT/---- CTCTATTTCC 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 CT 4 2 76522 CASAVA_Build 13 86056124 1D CTTTCTTCTC A/- AAATGTAACA 3070 het 3070 ref 48 27 14 7 A 4 3 76523 CASAVA_Build 13 86063540 1D TATTTGTCTG A/- ATTTTAATAT 3070 het 3070 ref 29 12 12 6 A 2 1 76524 CASAVA_Build 13 86066611 3I GGAATGAGGG ---/ATA ATAACAAATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATA 1 2 76525 CASAVA_Build 13 86067449 4D CTAGAAAGTG AACT/---- AAATATTAAA 3070 het 3070 hom 25 9 16 0 AACT 1 0 76526 CASAVA_Build 13 86074027 1D CACAAATATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 T 10 9 76527 CASAVA_Build 13 86088163 4I AAATATAAAA ----/ACTT ACTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 52 25 23 4 ACTT 1 2 76528 CASAVA_Build 13 86103514 4D TCATTATCAT TGTC/---- TGCATAATCT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 TGTC 1 0 76529 CASAVA_Build 13 86111775 1I TTAAAGTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 T 9 10 76530 CASAVA_Build 13 86118564 1D ATTTCCTGAT A/- AAAAATTTCA 2604 het 2604 ref 21 13 6 2 A 6 5 76531 CASAVA_Build 13 86122764 1I GTCTCCATAA -/T TTTTGGGTCA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 4 5 76532 CASAVA_Build 13 86123361 1D ACAAATAAGG T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 7 6 76533 CASAVA_Build 13 86129607 1I CTCAAATTAG -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 6 7 76534 CASAVA_Build 13 86130809 4I TTCTCAGAAC ----/AATT AAATCATGTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 AATT 0 1 76535 CASAVA_Build 13 86131067 1I AAAATTCTGA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 21 10 8 3 T 6 7 76536 CASAVA_Build 13 86131798 10I TCACCTACAC ----------/TCAGATGATG GCAGACTAGA 3070 hom 125 het 46 0 39 7 TCAGATGATG 0 1 76537 CASAVA_Build 13 86147816 4I AACAAAAATA ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AC 7 9 76538 CASAVA_Build 13 86153976 1I CTGAATCAAA -/T TTATTATAGC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 2 3 76539 CASAVA_Build 13 86154458 3D ATTTCTTATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 131 hom 26 3 16 7 T 13 10 76540 CASAVA_Build 13 86155100 1D AGATAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 12 11 76541 CASAVA_Build 13 86164095 1I ACATAAATAG -/A AAAATATGAA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 A 4 5 76542 CASAVA_Build 13 86165895 5I TACAAGGGAA -----/CTCCT CTTATATTAT 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 CTCCT 0 1 76543 CASAVA_Build 13 86172000 1I AAATAGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 T 10 11 76544 CASAVA_Build 13 86177098 1D ACATTTGGCA T/- TTTTTTTTAA 3007 het 3007 ref 27 15 7 5 T 9 8 76545 CASAVA_Build 13 86178900 1I GATAGATTCA -/G GCAGAATCAT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 G 1 2 76546 CASAVA_Build 13 86196593 1D CAGAATCCAC A/- AGGAACTTAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 2 1 76547 CASAVA_Build 13 86198263 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 2482 het 1568 hom 18 6 7 5 A 8 9 76548 CASAVA_Build 13 86198736 1D AAAAAATTAG A/- AAAAATGATT 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 A 6 5 76549 CASAVA_Build 13 86201976 4I TGTTGGCCAC ----/ATAA ATGTCTTCTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 ATAA 0 1 76550 CASAVA_Build 13 86246648 1D TTTTAACCAT A/- AAAATAAATG 3070 het 3070 ref 28 14 9 6 A 5 4 76551 CASAVA_Build 13 86248601 1I CTTTTTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2924 hom 31 8 16 7 A 11 12 76552 CASAVA_Build 13 86258092 4I ATAAAAAACT ----/CAAA CAAATCAGCA 2742 het 2742 ref 33 15 9 9 CAAA 1 2 76553 CASAVA_Build 13 86267746 1D ATGAATTATT G/- TCTGAATAGT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 G 1 0 76554 CASAVA_Build 13 86273767 1D GAGGACACTA T/- AAGAAATGAA 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 T 1 0 76555 CASAVA_Build 13 86302230 1D CATTCCATGC T/- TATGGATAGG 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 2 1 76556 CASAVA_Build 13 86304265 1I AAATGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 1401 het 1401 ref 30 21 3 6 T 13 14 76557 CASAVA_Build 13 86315151 3I CACATAAAAA ---/TGT TGTTAATATT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 TGT 1 2 76558 CASAVA_Build 13 86337450 1D CCCATTCTTG T/- TTTCTAAATA 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 T 4 3 76559 CASAVA_Build 13 86337940 2I TTAAAAACTC --/TA TAGTGTTCAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TA 1 2 76560 CASAVA_Build 13 86338261 1D GTAAAAAATC T/- TTTTAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 5 4 76561 CASAVA_Build 13 86342685 4D CTGTATCATG TTTA/---- TTTATTTGTT 3070 het 3070 ref 42 27 12 6 TTTA 2 1 76562 CASAVA_Build 13 86343643 6D CACTATGCAC GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 GT 8 5 76563 CASAVA_Build 13 86351445 2D GCTTTAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 A 12 10 76564 CASAVA_Build 13 86353442 4I CAGGCCAAGA ----/TAAC TAACACAGAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 TAAC 1 2 76565 CASAVA_Build 13 86361060 1I TGCTTAGGAG -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 7 8 76566 CASAVA_Build 13 86362703 15D TCTCATACCC ATATCTTTATTAAGT/--------------- ATATCTTTAT 3070 het 2749 hom 25 7 13 6 ATATCTTTATTAAGT 1 0 76567 CASAVA_Build 13 86367420 1D CATGAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 15 7 A 12 11 76568 CASAVA_Build 13 86368223 6I ATCTTATTGA ------/TAAACT TAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 31 21 9 1 TAAACT 0 1 76569 CASAVA_Build 13 86376433 1D GGCATGAGGC T/- TTTTTTTTTT 2245 het 2245 ref 26 16 5 5 T 12 11 76570 CASAVA_Build 13 86401654 1D CAATTTGAGC A/- AGACATAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 2 1 76571 CASAVA_Build 13 86411863 4I GACTTGAAAA ----/TATT TATCCCAAAT 3070 het 3070 hom 47 16 27 4 TATT 0 1 76572 CASAVA_Build 13 86414122 2D GTATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 105 het 50 0 33 18 AC 10 9 76573 CASAVA_Build 13 86418316 1D GGACAGAGAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 8 7 76574 CASAVA_Build 13 86424231 1I AATCACGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 12 13 76575 CASAVA_Build 13 86453500 6D TATAAAGAAA AATATT/------ AATATTTGTA 3070 hom 78 het 31 0 27 8 AATATT 2 1 76576 CASAVA_Build 13 86455699 1I TCTGACTTAC -/T TTTTTGCCTG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 5 6 76577 CASAVA_Build 13 86461636 1D CCATGAAATA T/- AAGGTTAATA 3070 het 3070 ref 58 31 24 3 T 1 0 76578 CASAVA_Build 13 86477586 1I ATGATGAGGC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 A 7 8 76579 CASAVA_Build 13 86497995 4I AGACAAAGAA ----/AGAC AGACTTCTCT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AGAC 1 2 76580 CASAVA_Build 13 86501899 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2308 hom 22 6 11 5 A 13 14 76581 CASAVA_Build 13 86521822 4D TAGAACAGAT AGAG/---- ATTCTTTGAG 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 AG 2 0 76582 CASAVA_Build 13 86524161 2D TTCATTGTAA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 52 het 41 0 18 25 T 10 8 76583 CASAVA_Build 13 86530268 1I AGCCCAGGGA -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 T 6 7 76584 CASAVA_Build 13 86531479 1I ACAACAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 C 0 1 76585 CASAVA_Build 13 86531877 1I AAGAAAATCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 9 10 76586 CASAVA_Build 13 86540800 1I ACACTGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 T 10 11 76587 CASAVA_Build 13 86563247 2D GTGCAGAGAC AT/-- ATGCTTGACG 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 AT 2 1 76588 CASAVA_Build 13 86570165 5D CTTTTCCTTG TAAAT/----- TAAATATCAG 3070 hom 75 het 30 0 26 7 TAAAT 2 1 76589 CASAVA_Build 13 86577320 11I TATTTGTTAC -----------/ATGTTATTTTT ATGTTATTTA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 ATGTTATTTTT 0 1 76590 CASAVA_Build 13 86633523 5I TCATTAAATA -----/AATAC ATGTTCTTCT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 AATAC 0 1 76591 CASAVA_Build 13 86646268 1D AATGAGACTG T/- TGTTATGTAC 3070 het 3070 ref 53 25 24 4 T 2 1 76592 CASAVA_Build 13 86659129 7I TCTCCTGCTG -------/CAGGACA TCCTGTGAAG 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 CAGGACA 0 1 76593 CASAVA_Build 13 86724702 1D CTACCCCATA T/- TAAAAGATGG 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 T 2 1 76594 CASAVA_Build 13 86725970 1D AACAAGTTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 40 0 34 8 A 10 9 76595 CASAVA_Build 13 86737393 1I AAAAATATCC -/A GGGAAATTGT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 0 1 76596 CASAVA_Build 13 86740742 1D TTTTATCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 11 10 76597 CASAVA_Build 13 86780424 30D CACACACCAG TATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 3070 het 265 hom 15 3 11 3 TA 23 8 76598 CASAVA_Build 13 86787394 1D AGACGCCACC A/- CTTTTCCTTA 3070 het 3070 hom 21 8 9 5 A 1 0 76599 CASAVA_Build 13 86788648 2D ACAAGAAAAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 2964 hom 24 9 10 5 AT 8 7 76600 CASAVA_Build 13 86798066 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1559 het 654 hom 6 2 4 0 T 6 7 76601 CASAVA_Build 13 86799444 1I GTGGAGACTA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 7 8 76602 CASAVA_Build 13 86806277 1I CAAAATGCCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 50 22 18 10 T 8 9 76603 CASAVA_Build 13 86809268 2I TAAAACTTAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 AT 6 7 76604 CASAVA_Build 13 86824625 4D AATTTATAAA AGAT/---- AGAGCGAATA 964 het 964 ref 21 14 3 7 AGAT 1 0 76605 CASAVA_Build 13 86828352 1D GGAAAAGACA T/- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 T 1 0 76606 CASAVA_Build 13 86832720 1I TTTGATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 T 12 13 76607 CASAVA_Build 13 86850560 2D ATGGAAAAAC TG/-- TGCAAAGTTA 3070 het 3070 hom 47 22 23 5 TG 2 1 76608 CASAVA_Build 13 86878576 3I AGTCAAAGAG ---/AAC AACTAGTCCT 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 AAC 1 2 76609 CASAVA_Build 13 86885379 1D GAACGACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1913 hom 36 8 18 10 A 15 14 76610 CASAVA_Build 13 86887668 2I40M1I TGATTTTTTC --AAAAAAAACAGCTCCTGGATTCATTGATTTTTTTAAAGGG-/AAAAAAAAAACAGCTCCTGGATTCATTGATTTTTTTAAAGGGT TTTTTTGTGT 1913 het 1913 ref 6 9 4 1 N/A 0 0 76611 CASAVA_Build 13 86892565 1D CAATAAAGCT A/- AAAATATAGA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 A 5 4 76612 CASAVA_Build 13 86894248 5I ATGTGAATTA -----/TAATT TAATTTTCAT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 TAATT 1 2 76613 CASAVA_Build 13 86894802 1I CATCTGAATG -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 6 7 76614 CASAVA_Build 13 86896418 3D TTTTAATTTC ATT/--- TTTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 ATT 1 0 76615 CASAVA_Build 13 86899367 1D AAAAGTAATG A/- AAATGGAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 4 3 76616 CASAVA_Build 13 86899620 1I CTAAGAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 T 10 11 76617 CASAVA_Build 13 86900891 18D GAAATAAGCA AAGCAGGAACATCACACT/------------------ AAGCAGGAAC 3070 het 3070 ref 43 24 17 7 AAGCAGGAACATCACACT 2 1 76618 CASAVA_Build 13 86911427 2D ATAAAGTTTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 11 9 76619 CASAVA_Build 13 86911917 1D AGAGAAGAAG A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 A 7 6 76620 CASAVA_Build 13 86937542 5D ACACAGTAAT TATAA/----- TATGTTATTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 TATAA 1 0 76621 CASAVA_Build 13 86957444 15D AATTTTGAAA ATATGTAGTAACCCT/--------------- TGTTGGCATA 3070 het 3070 ref 34 16 17 4 ATATGTAGTAACCCT 1 0 76622 CASAVA_Build 13 86965570 1D TTTTTTAAAT A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 7 6 76623 CASAVA_Build 13 86968718 1D TTCAAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 10 9 76624 CASAVA_Build 13 86970289 4I TTAAGATTGT ----/TTAA TTAGGAGTCT 3070 het 3070 hom 39 14 24 1 TTAA 0 1 76625 CASAVA_Build 13 86980850 5D ACAACTATAG GAAAT/----- GAAATGAAAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 5 GAAAT 3 2 76626 CASAVA_Build 13 86981330 2D TATTTTTTAT AA/-- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 33 10 22 1 A 9 7 76627 CASAVA_Build 13 86987247 1D AAATGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 23 8 A 15 14 76628 CASAVA_Build 13 86991467 4D CACCTTAAAG TAGC/---- TAGCTGCATC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAGC 2 1 76629 CASAVA_Build 13 86997809 1I CATAGGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 11 12 76630 CASAVA_Build 13 87000010 1I TGAGAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 10 11 76631 CASAVA_Build 13 87001044 6D ATATATAACT TAGAGC/------ CTTATGTGCC 3070 het 3070 hom 34 16 18 1 TAGAGC 1 0 76632 CASAVA_Build 13 87007568 2D CAAAACTGAC TT/-- CTCTCTCATA 3070 hom 103 het 39 0 34 5 T 2 0 76633 CASAVA_Build 13 87025305 2D TTAGTTATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AT 8 7 76634 CASAVA_Build 13 87037727 1I TGCTGGTACC -/A AAACAGACAT 3070 het 65 hom 23 1 21 1 A 3 4 76635 CASAVA_Build 13 87042917 1D AAACTCTTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 32 het 30 1 26 3 A 10 9 76636 CASAVA_Build 13 87045127 10D GTTACTGGTT TATGTATTTG/---------- CTGTACTTTT 3070 hom 157 het 54 0 53 2 TATGTATTTG 1 0 76637 CASAVA_Build 13 87065989 1I TTAATGGCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 11 22 7 T 9 10 76638 CASAVA_Build 13 87067594 1D TATTTTCCAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 A 8 7 76639 CASAVA_Build 13 87068137 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 8 9 76640 CASAVA_Build 13 87069224 1D AGCAAAGGTT A/- AAAAATCCCC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 6 5 76641 CASAVA_Build 13 87074416 2I TAGTTGTCAC --/AA AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 7 9 76642 CASAVA_Build 13 87075239 2I ACATATATAC --/AT GTATACATAT 3070 het 2428 hom 27 7 14 6 AT 0 1 76643 CASAVA_Build 13 87095160 1I ATACTGTGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 T 9 10 76644 CASAVA_Build 13 87099117 3D AAATGTGAGT AGG/--- AGAAGAGGAG 3070 het 3070 ref 51 26 21 7 AGG 1 0 76645 CASAVA_Build 13 87101612 4D TGTATATATG TATA/---- TATATATATA 2368 het 1005 hom 19 5 10 5 TA 7 5 76646 CASAVA_Build 13 87115751 1D GAGGTATAAT A/- AGGGTGTAAT 3070 het 3070 ref 44 25 15 6 A 2 1 76647 CASAVA_Build 13 87116662 1I AGTCTGGAAG -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 6 7 76648 CASAVA_Build 13 87116871 1D CCAAAGCGTT G/- GGAGTTGGGA 3070 het 3070 ref 42 28 11 3 G 3 2 76649 CASAVA_Build 13 87117056 1I TTTTTCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 A 10 11 76650 CASAVA_Build 13 87129243 4I AATATTTTAT ----/TGTA TGTAGCACCT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 TGTA 1 2 76651 CASAVA_Build 13 87135436 1D TTTTTGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 10 9 76652 CASAVA_Build 13 87140268 4D TGACTAATTC ATAA/---- ATAAACTAAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 5 ATAA 2 1 76653 CASAVA_Build 13 87140460 1D AATACATAGC T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 38 17 21 1 T 7 6 76654 CASAVA_Build 13 87188893 5D TATATATTTC ATATA/----- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 ATATA 2 1 76655 CASAVA_Build 13 87207413 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 11 10 76656 CASAVA_Build 13 87218178 1D CCCAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 7 T 11 10 76657 CASAVA_Build 13 87227867 1I TTCATAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 26 9 14 T 13 14 76658 CASAVA_Build 13 87234726 1D ATTGAGATGG A/- AACACAATGA 3070 het 3070 hom 45 16 24 6 A 3 2 76659 CASAVA_Build 13 87261872 1D CTAAACTTAA C/- CAGCACAATA 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 C 2 1 76660 CASAVA_Build 13 87309742 1D ATTTATTTTA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 T 8 7 76661 CASAVA_Build 13 87318433 1I TGGTAAATTC -/T TTTGGCAGTC 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 3 4 76662 CASAVA_Build 13 87322097 1D AAATACTTAT A/- AAAACCATCA 3070 het 2788 hom 23 7 11 5 A 5 4 76663 CASAVA_Build 13 87339905 1D TTTTTCTTGC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 54 30 18 6 T 9 8 76664 CASAVA_Build 13 87345687 1I AGAAGAATGT -/G GGTGTCTTGC 3070 het 3070 ref 51 25 18 8 G 2 3 76665 CASAVA_Build 13 87349014 4I TGGTAATATT ----/TTGA TTAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TTGA 0 1 76666 CASAVA_Build 13 87351505 1I TATTAACTAC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 7 8 76667 CASAVA_Build 13 87353237 1D GTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2077 hom 36 8 17 11 T 13 12 76668 CASAVA_Build 13 87359146 1D GAAACTCAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2637 hom 20 7 10 3 A 10 9 76669 CASAVA_Build 13 87365525 2D ATCTGAAAAC AT/-- GTGTGCAAGA 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 AT 1 0 76670 CASAVA_Build 13 87373881 4D AAAGGAGAAT AGAA/---- AGAGAAGATA 3070 het 3070 ref 45 25 17 6 AGAA 1 0 76671 CASAVA_Build 13 87378580 1I AAGTTGATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 8 9 76672 CASAVA_Build 13 87403262 2D TATAAATTCT GA/-- GAGAAGTGCT 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 GA 3 2 76673 CASAVA_Build 13 87403880 1D CAGAAGAGAT A/- TTTTTGAAAG 3070 hom 54 het 29 0 25 4 A 1 0 76674 CASAVA_Build 13 87421461 3I TATAGGAACA ---/TAT TATAATTTGA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 TAT 1 2 76675 CASAVA_Build 13 87422995 31D AAAATTAATT AATTAATTCAACTTAATTTAAGTTGAATTAA/------------------------------- AATGAAATTT 1917 het 1917 ref 14 16 4 3 AATTAATTCAACTTAATTTAAGTTGAATTAA 1 0 76676 CASAVA_Build 13 87429520 1D GTGAGCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 A 13 12 76677 CASAVA_Build 13 87435348 1I GCAAAAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 9 10 76678 CASAVA_Build 13 87453096 1D AATCCAGTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 10 9 76679 CASAVA_Build 13 87455732 2D AAGTGCTTGG GT/-- GTCCCACATG 3070 het 3070 hom 53 23 28 4 GT 2 1 76680 CASAVA_Build 13 87462849 1D AATTCCCACT A/- AAAGGCCGGG 3070 het 1974 hom 20 7 11 2 A 4 3 76681 CASAVA_Build 13 87463398 1D TGAAAGTACT A/- AAGTCATATA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 3 2 76682 CASAVA_Build 13 87465106 1D CAGAGGGTGA T/- TTTTTAGACA 3070 het 3070 ref 49 21 22 7 T 6 5 76683 CASAVA_Build 13 87466160 1I TTTACCCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 10 11 76684 CASAVA_Build 13 87467568 3D AGGGTGATTC CTT/--- CTTTATATGC 3070 het 3070 hom 45 19 20 8 CTT 2 1 76685 CASAVA_Build 13 87473445 1D AAAAGATGAC T/- TTTTTTACAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 7 6 76686 CASAVA_Build 13 87475205 1D CAATACGAGG T/- ACTGAGGACT 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 T 1 0 76687 CASAVA_Build 13 87481161 1D TTAAAAAAAA G/- TGATTGTAAC 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 G 1 0 76688 CASAVA_Build 13 87488654 1D TTACAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 1050 het 1050 ref 38 33 3 2 A 10 9 76689 CASAVA_Build 13 87493101 1I ATATTTTCAA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 7 8 76690 CASAVA_Build 13 87501597 1D CTGTATTAAC T/- TTTTTGCAAA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 6 5 76691 CASAVA_Build 13 87502767 1D TGAGGGTGGT C/- CCCTATCTTA 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 C 4 3 76692 CASAVA_Build 13 87505905 2D AATGAGAAAA AT/-- AGTTATTTTA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AT 1 0 76693 CASAVA_Build 13 87519061 1I GATACACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 10 11 76694 CASAVA_Build 13 87526208 4I ATAGATAGAT ----/AGAA AGACAGATAG 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 AGAA 0 1 76695 CASAVA_Build 13 87535847 3D GGCATTAAGA AAT/--- AATAATAATG 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 AAT 4 3 76696 CASAVA_Build 13 87536622 4I AGAGAGGAAC ----/AGAG AGAGAGAGAG 2884 het 2884 ref 31 14 10 7 AG 5 7 76697 CASAVA_Build 13 87553933 2I ATTAAGGGAT --/GC GATTAGGCCA 3070 het 3070 hom 49 12 28 9 GC 0 1 76698 CASAVA_Build 13 87561974 1D ACATATTGGC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 A 8 7 76699 CASAVA_Build 13 87572635 1I ATTTTCCCCA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 T 6 7 76700 CASAVA_Build 13 87578697 1D AGCACAAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 9 8 76701 CASAVA_Build 13 87589520 4I AATACACTGC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 TTTG 3 4 76702 CASAVA_Build 13 87594756 1I AGAAGAGGCA -/T GTTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 39 17 9 13 T 0 1 76703 CASAVA_Build 13 87602671 1D ATTAAGCCTC T/- TTTTCTTAAT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 5 4 76704 CASAVA_Build 13 87618564 1I TTGATTATGA -/C CTTTATCTAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 C 1 2 76705 CASAVA_Build 13 87623421 1I CTGGCCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 13 14 76706 CASAVA_Build 13 87626982 1D TATGTAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2400 hom 27 8 14 5 A 11 10 76707 CASAVA_Build 13 87645321 1I CACAGGAGAG -/C CCCCCCATAG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 C 6 7 76708 CASAVA_Build 13 87649209 1D GTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 837 hom 16 3 9 4 T 12 11 76709 CASAVA_Build 13 87663915 1I TCTCAATGCT -/A ACTAATTTAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 1 2 76710 CASAVA_Build 13 87681902 1D TCCATGAATA G/- GTGCCAAACC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 2 1 76711 CASAVA_Build 13 87683094 1D TGGAAAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 8 7 76712 CASAVA_Build 13 87689954 3I TCTCATTCCT ---/TGC TGCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 TGC 1 2 76713 CASAVA_Build 13 87698855 1I CCACCTGCTG -/C TTGCTTGCCT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 C 0 1 76714 CASAVA_Build 13 87698965 1I GCAAATGGCA -/T TTTTTTTTTT 1763 het 1763 ref 40 19 7 14 T 13 14 76715 CASAVA_Build 13 87699147 1D AATAAGCCAG T/- TTTTTTTTTT 2272 het 2272 ref 30 18 5 7 T 11 10 76716 CASAVA_Build 13 87702056 1D TAGTCATTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 T 9 8 76717 CASAVA_Build 13 87706570 4D TAGTTTTGCT ATAG/---- ATATTGTCTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 ATAG 1 0 76718 CASAVA_Build 13 87708551 4I CCAGGAGCAG ----/CTTA CTTAGCTCTG 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 CTTA 1 2 76719 CASAVA_Build 13 87709526 1I GTAGCTGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 12 13 76720 CASAVA_Build 13 87719038 4D ATAAGAGAAC GACA/---- GACACTGGAG 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 GACA 2 1 76721 CASAVA_Build 13 87738213 1I TTCCTTTTTT -/G TTTTTAATGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 76722 CASAVA_Build 13 87738472 1I TATTTCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 47 2 31 14 T 13 14 76723 CASAVA_Build 13 87738794 1I CCCAGCTGTA -/G GTACTTCATA 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 G 1 2 76724 CASAVA_Build 13 87740405 1I TTTTTGTAGT -/G AGAACACTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 0 1 76725 CASAVA_Build 13 87751944 1I TTTTCGTTTC -/T TTTTTTTTTT 2113 het 2113 ref 22 7 7 8 T 10 11 76726 CASAVA_Build 13 87752187 5D ATCCGCCTCG GCCTC/----- GCCTCCCAAA 3070 hom 36 het 13 0 10 3 GCCTC 2 1 76727 CASAVA_Build 13 87768793 1D ATATAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1814 hom 25 5 13 8 A 12 11 76728 CASAVA_Build 13 87769447 11D GATGGATAAA CTAATTTTTGT/----------- CTTTTTAGCA 3070 het 3070 ref 40 23 17 5 CTAATTTTTGT 1 0 76729 CASAVA_Build 13 87783266 1D CTGGTGGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 11 6 A 12 11 76730 CASAVA_Build 13 87794108 3I TCCTCTGTGG ---/TCT TCTTTCATCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TCT 1 2 76731 CASAVA_Build 13 87796317 1D AAGAGTTGAA T/- TATCAACACT 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 T 2 1 76732 CASAVA_Build 13 87798257 2D TGAGGGAAAA AG/-- GGAGGGAGGA 2653 het 2653 ref 22 11 6 5 AG 1 0 76733 CASAVA_Build 13 87798987 1I TTTAATACTA -/T TTTTTTTTTT 1958 hom 22 het 18 0 7 11 T 13 14 76734 CASAVA_Build 13 87803030 32D TATACTATAT TAAATTATAGGACTGGCCTGTTAGCTTTAAAA/-------------------------------- TAAGTTAATA 3070 het 3070 hom 37 21 22 4 TAAATTATAGGACTGGCCTGTTAGCTTTAAAA 1 0 76735 CASAVA_Build 13 87803564 5D TACATAGATA ATATT/----- ATATTCATAT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 ATATT 2 1 76736 CASAVA_Build 13 87804607 6D AATCATACTT ATACTC/------ AGTTCAGAAA 3070 het 3070 hom 31 15 13 6 ATACTC 1 0 76737 CASAVA_Build 13 87805083 1I GAAAGATGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 9 10 76738 CASAVA_Build 13 87810405 4I AAAAAATGAG ----/ATTT ATAATATGAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 ATTT 0 1 76739 CASAVA_Build 13 87810634 1I TTGAATACTT -/A ACGCTACAGC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 1 2 76740 CASAVA_Build 13 87828629 1I ATCATACACT -/G GCCTGGATCT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 G 1 2 76741 CASAVA_Build 13 87829137 1I TTAGTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2187 hom 41 7 17 17 T 15 16 76742 CASAVA_Build 13 87829709 1D GTTCAGTGGA C/- CAATCTGCTA 3070 het 3070 hom 31 15 16 1 C 2 1 76743 CASAVA_Build 13 87839093 1I CAAATGCAAC -/A AAAACAAAAT 3070 het 3070 hom 43 21 19 3 A 4 5 76744 CASAVA_Build 13 87842211 2D ATTGCTAAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 11 9 76745 CASAVA_Build 13 87842806 4I CAGAAGAGAC ----/AAAA AAACATAAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 3 7 76746 CASAVA_Build 13 87845000 1D ATGTACTCAC A/- ATTTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 1 76747 CASAVA_Build 13 87849186 2D ATGTTCCCCA TT/-- TTTTTTTTCC 3070 hom 18 het 41 2 34 5 T 10 8 76748 CASAVA_Build 13 87854579 2I TGAAAGGCAA --/AT ACAAAATAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AT 0 1 76749 CASAVA_Build 13 87855824 8I CCACTGCACT --------/CCTGCCTA TGCAACAGAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 CCTGCCTA 0 1 76750 CASAVA_Build 13 87856417 3I TTTACAAGGC ---/TGT TATCAGCTGC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TGT 0 1 76751 CASAVA_Build 13 87857224 1I AAGGACCTTG -/A AAATGTATAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 3 4 76752 CASAVA_Build 13 87864550 1D TTGTTAGATG A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 7 6 76753 CASAVA_Build 13 87872992 1D GCTCAGTCTA T/- TTGCAAAATA 3070 het 3070 ref 42 21 21 1 T 3 2 76754 CASAVA_Build 13 87873287 1I CCTGAGTAAG -/A AAGTCGACTG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 2 3 76755 CASAVA_Build 13 87875588 1D CTAAATAGAT A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 7 6 76756 CASAVA_Build 13 87881015 1I CTTTTATGGG -/A AAAAATAACT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 5 6 76757 CASAVA_Build 13 87885862 1D CGTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 2960 het 2817 hom 32 12 9 11 T 13 12 76758 CASAVA_Build 13 87889983 1I TGTGTCTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 9 10 76759 CASAVA_Build 13 87902150 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 8 9 76760 CASAVA_Build 13 87902277 1I ACAGATTTGA -/C TTAAAGCCAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 C 0 1 76761 CASAVA_Build 13 87912424 1D AAATTGAAAA G/- ATGGTACAGA 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 G 1 0 76762 CASAVA_Build 13 87913258 7D AGGTGTATGG TAATATC/------- TAATATCTTG 3070 het 3070 hom 36 17 15 6 TAATATC 2 1 76763 CASAVA_Build 13 87913953 4I GAGATAGACT ----/ATAA ATAAATATTC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 ATAA 1 2 76764 CASAVA_Build 13 87914174 3I AAAATATAAA ---/GTC AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 20 7 9 4 GTC 0 1 76765 CASAVA_Build 13 87914991 8D ATAATTGTAT TATTGTAG/-------- TATTGTTATA 3070 het 2898 hom 22 9 12 2 TATTGTAG 1 0 76766 CASAVA_Build 13 87924399 9D ATTAGAAGTG TAAATAATA/--------- TAAATAATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 6 TAAATAATA 2 1 76767 CASAVA_Build 13 87934918 1D TGAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 12 11 76768 CASAVA_Build 13 87941901 1D TATTTTTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1487 hom 18 5 10 3 A 12 11 76769 CASAVA_Build 13 87942906 12I CATGTGCTTT ------------/TCAGGATAATTC TCTTGGATTC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 TCAGGATAATTC 0 1 76770 CASAVA_Build 13 87951293 3D GGGTTTAAAA TGT/--- TGTCAAATTA 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 TGT 2 1 76771 CASAVA_Build 13 87955361 3D TCTGGGCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TTG 6 5 76772 CASAVA_Build 13 87955608 2I ATTTGAATTT --/TC TCTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 TC 2 3 76773 CASAVA_Build 13 87981210 2D TTCCATTTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 AT 7 6 76774 CASAVA_Build 13 87999497 1I TGGCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 10 11 76775 CASAVA_Build 13 88012943 3I TACTTAATAC ---/TTG TTTTGTATAA 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 TTG 0 1 76776 CASAVA_Build 13 88013335 1D GAGAACTCAG A/- AAAAAGACAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 A 6 5 76777 CASAVA_Build 13 88015928 2D ACATTGAAAA TT/-- TCAGCCCTCT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 3 1 76778 CASAVA_Build 13 88016138 1I AGGATTTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 10 11 76779 CASAVA_Build 13 88017681 1I CACCTGTTTC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 7 8 76780 CASAVA_Build 13 88018090 1D GCTCTTGTGA G/- GGGGTCCCAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 G 5 4 76781 CASAVA_Build 13 88020093 1D TGTTCTTTAT A/- AGTTTCCTAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 2 1 76782 CASAVA_Build 13 88022600 1I TTTCTAAGAC -/A AAATAGTATC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 3 4 76783 CASAVA_Build 13 88024111 1I AAAAATAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 10 11 76784 CASAVA_Build 13 88029284 2D TTCAGGGATG GT/-- GAGTTTGTAA 3070 het 3070 ref 45 20 22 4 GT 1 0 76785 CASAVA_Build 13 88035791 6D CCCACATGTT GTGGGA/------ GGGACCTGGT 3070 het 3070 ref 29 16 12 4 GTGGGA 1 0 76786 CASAVA_Build 13 88037882 1I AAAAACAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 6 7 76787 CASAVA_Build 13 88054725 4D ATACAATTTT ATCA/---- ATCAAAATGT 2866 het 2866 ref 28 18 7 5 ATCA 2 1 76788 CASAVA_Build 13 88073809 1I TCAGGCTCTG -/C CTGGTTGTAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 1 2 76789 CASAVA_Build 13 88075932 5D AATGAGCTAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 30 1 26 4 A 15 10 76790 CASAVA_Build 13 88077581 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 1982 het 1982 ref 42 23 13 7 CA 6 5 76791 CASAVA_Build 13 88077714 1D TATTTGTGCA G/- CTTTTTGGGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 1 0 76792 CASAVA_Build 13 88085759 16D TTAATTTTTT AATATTTTTAATAATA/---------------- AAATTCCAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AATATTTTTAATAATA 1 0 76793 CASAVA_Build 13 88086713 5D TTTCTTTTCG TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 het 90 hom 37 3 22 12 TTTTC 3 2 76794 CASAVA_Build 13 88086742 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 771 hom 11 het 34 0 5 29 T 12 13 76795 CASAVA_Build 13 88091469 1D ATTTTTAGGG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 8 7 76796 CASAVA_Build 13 88094727 1D CTTTTTTTTT C/- CCCTTTTTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 4 3 76797 CASAVA_Build 13 88105033 2D ATGTATATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TA 8 7 76798 CASAVA_Build 13 88107858 1I TTTGGTTTTT -/C TGAGGAATCT 3070 hom 132 het 50 0 44 6 C 0 1 76799 CASAVA_Build 13 88116521 4D TGGTAGATAT GTAA/---- GTGATTTACT 3070 hom 135 het 48 0 45 5 GTAA 1 0 76800 CASAVA_Build 13 88123466 1I GCATCCCCGA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 92 het 34 0 29 5 T 7 8 76801 CASAVA_Build 13 88144260 3D GGGAGGCCTT TTG/--- TTGTTGTGGA 3070 hom 103 het 42 0 34 9 TTG 3 2 76802 CASAVA_Build 13 88148275 1I GTATTAGGAG -/T TTTTTTTTTT 1779 het 1779 ref 54 40 4 10 T 11 12 76803 CASAVA_Build 13 88149395 1D CACGTGAGGG T/- TGAGAAATTA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 T 2 1 76804 CASAVA_Build 13 88149990 1D AATGCTGGCT C/- CATAAAATGT 3070 hom 67 het 28 0 22 6 C 2 1 76805 CASAVA_Build 13 88151255 1I CTTTTGTGTA -/T TTTTTATATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 5 6 76806 CASAVA_Build 13 88157064 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 74 het 32 0 26 6 T 10 9 76807 CASAVA_Build 13 88161235 1I GGAAGGTGAC -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 76808 CASAVA_Build 13 88166463 1D TAAATTACTG T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 7 76809 CASAVA_Build 13 88203997 1D TTGTCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 38 1 29 8 T 13 12 76810 CASAVA_Build 13 88233945 10I CTTTGAGTAT ----------/ATACTCAGTA ATGGGATTGC 3070 hom 87 het 31 0 30 2 ATACTCAGTA 0 1 76811 CASAVA_Build 13 88248770 1D TAAAATTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 10 9 76812 CASAVA_Build 13 88251252 1D TGTGTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 44 1 38 5 T 11 10 76813 CASAVA_Build 13 88258033 1I GAAGAAATGA -/C CCCATGAGGA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 3 4 76814 CASAVA_Build 13 88259767 1I GTGCTCTAGG -/A ACCAGTTTCT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 1 2 76815 CASAVA_Build 13 88259913 1I CAACAGTGTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 157 hom 44 1 33 10 T 8 9 76816 CASAVA_Build 13 88266908 1D GGAGGTTAAA G/- TGGGAGAATC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 1 0 76817 CASAVA_Build 13 88275317 1I TTTCCAGGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 426 hom 30 1 24 5 T 9 10 76818 CASAVA_Build 13 88295142 4I CAGAAAATGA ----/TGTG TGTGTGTGTA 3070 hom 61 het 24 0 19 5 TG 4 6 76819 CASAVA_Build 13 88295436 1D CATCTCTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 T 10 9 76820 CASAVA_Build 13 88304226 1D ATTTCTCTAG T/- TCGTGTGTTG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 2 1 76821 CASAVA_Build 13 88313058 4I GTTCAATTTT ----/ATAA ATAAACAATA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 ATAA 1 2 76822 CASAVA_Build 13 88338066 1I GGAGTTGTTT -/C TCATAGATGA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 0 1 76823 CASAVA_Build 13 88350221 1I GAATGTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 37 2 26 9 T 10 11 76824 CASAVA_Build 13 88357782 2I TAAGAGAAAC --/AT ATGTTTTAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AT 1 2 76825 CASAVA_Build 13 88367145 1D TTGCTTACCC A/- AAATGGGCAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 4 3 76826 CASAVA_Build 13 88374817 2I TATATAATTC --/AT ATATATATAT 3070 het 237 hom 12 1 9 2 AT 6 7 76827 CASAVA_Build 13 88378703 7D AACCTCCCAG AAGAGAC/------- AAGAGACAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 6 AAGAGAC 2 1 76828 CASAVA_Build 13 88403722 1I CTTTATTATT -/A TTTTTTTTCT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 0 1 76829 CASAVA_Build 13 88407000 1D GGGCATGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 29 1 23 6 A 11 10 76830 CASAVA_Build 13 88427706 1I ACTTGGGTTG -/T TAAAAGTGTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 2 76831 CASAVA_Build 13 88453652 5I GACATTATGA -----/AAAGG AAAGAATAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAAGG 0 1 76832 CASAVA_Build 13 88467579 10D TTCGGTCTGA AAAAAAAAAC/---------- AAAAAAAAAC 2804 het 2804 ref 20 11 8 5 AAAAAAAAAC 2 1 76833 CASAVA_Build 13 88504100 3I TTACACCAGC ---/ACA ACATTATGGC 3070 hom 138 het 53 0 46 7 ACA 1 2 76834 CASAVA_Build 13 88504775 1D CTTTTGAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 10 9 76835 CASAVA_Build 13 88517385 4D AAGGCTCAGA AAAT/---- AAATGTATTT 3070 hom 135 het 49 0 46 6 AAAT 2 1 76836 CASAVA_Build 13 88547327 1D CAGCTCCAGG A/- AAAGGCTACG 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 4 3 76837 CASAVA_Build 13 88557567 2I GGCTGGGCTG --/TT TAACTCCCAA 3070 hom 63 het 26 0 17 9 T 1 3 76838 CASAVA_Build 13 88561014 3D AGTTAGGGAG ATA/--- ATAATATGAT 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 ATA 3 2 76839 CASAVA_Build 13 88563371 1I AATAATGCAA -/T TTTTTTGGAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 7 76840 CASAVA_Build 13 88566218 1I TTTCTCTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 8 9 76841 CASAVA_Build 13 88567685 1D ATATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 3 T 13 12 76842 CASAVA_Build 13 88570536 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 11 76843 CASAVA_Build 13 88572273 1D TTTTGTGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 43 0 34 9 A 10 9 76844 CASAVA_Build 13 88572999 1D TATTTTAGTA G/- AATGCTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 1 0 76845 CASAVA_Build 13 88573689 1D TGCCTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 27 0 19 9 T 11 10 76846 CASAVA_Build 13 88575385 2I ACACACACAC --/AT ATATGTATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 2 3 76847 CASAVA_Build 13 88576360 1I GGATGTTAGT -/A ACAACTAACT 3070 hom 88 het 37 0 29 8 A 1 2 76848 CASAVA_Build 13 88577066 1I TCCATCCAAT -/A AAGTAGATAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 2 3 76849 CASAVA_Build 13 88585459 1D CACACACACA C/- AAAAAAAAAA 2516 het 399 hom 29 3 8 19 C 1 0 76850 CASAVA_Build 13 88585842 4I TGTGTGGATG ----/TATA TATATATATA 3070 hom 64 het 27 0 22 5 TA 6 8 76851 CASAVA_Build 13 88590754 1D CTATTTTAAA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 7 6 76852 CASAVA_Build 13 88591438 1I AATAAGTTAT -/A ATATTATTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 2 76853 CASAVA_Build 13 88597612 1I AGACTATTTG -/T CTAATATTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 76854 CASAVA_Build 13 88612168 5D TTGTTGTTGT TGTTG/----- TTGTTTGTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TGTTG 1 0 76855 CASAVA_Build 13 88612300 1I GCGCGAGCTA -/C TGCGCCTGGC 3070 hom 47 het 18 0 14 4 C 0 1 76856 CASAVA_Build 13 88615216 2D CTACTTTCAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 TA 8 7 76857 CASAVA_Build 13 88618857 5I ATTGCACGTA -----/CTTAT CTTTGCTGTA 3070 hom 129 het 46 0 44 3 CTTAT 0 1 76858 CASAVA_Build 13 88619443 2D ATAACAGCCC CT/-- CTCTCTCTCT 1161 het 1161 ref 29 21 4 5 CT 7 6 76859 CASAVA_Build 13 88619664 2D TGTATATGTG TA/-- TATATATGTG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TA 4 3 76860 CASAVA_Build 13 88629575 4I ATGGGTTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TTTG 2 3 76861 CASAVA_Build 13 88632547 1D AAACAAACCT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 9 8 76862 CASAVA_Build 13 88641374 2I ATGTGGAGAA --/AG AGAAACATTC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AG 1 2 76863 CASAVA_Build 13 88646555 1D ATATGGAACC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 9 8 76864 CASAVA_Build 13 88655775 8D ATTTATTAAG GATTAAGA/-------- GATTAAGGGA 3070 het 3070 ref 32 16 16 0 GATTAAGA 1 0 76865 CASAVA_Build 13 88661902 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 A 9 10 76866 CASAVA_Build 13 88664647 2D CTGATTTCAT TC/-- TGACTGTCCT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 TC 1 0 76867 CASAVA_Build 13 88667653 1I TGACTTCAAC -/A AAAAAAGTTT 3070 het 2786 hom 22 6 12 4 A 6 7 76868 CASAVA_Build 13 88668380 3I AGCTCCACTG ---/TAT TATTAGTCTC 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 TAT 1 2 76869 CASAVA_Build 13 88671360 1D GCTCCATTTT C/- CCTAGGTTGT 3070 het 3070 ref 30 16 9 7 C 3 2 76870 CASAVA_Build 13 88673934 1D GAAATCTGTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 9 8 76871 CASAVA_Build 13 88675358 3I TGATCCCATG ---/GAA GAAGGAGAAA 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 GAA 1 2 76872 CASAVA_Build 13 88677588 1D CTCTCATCCT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 9 A 8 7 76873 CASAVA_Build 13 88680422 1D CTCAAGGGGG A/- TAGTTCGAGC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 1 0 76874 CASAVA_Build 13 88682418 3D CATATTTCAC TAA/--- TAATGTAGTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 TAA 2 1 76875 CASAVA_Build 13 88684648 1D ATAATGATTA T/- GGTGATAACT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 1 0 76876 CASAVA_Build 13 88689430 1D TTTTATTAAG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 9 8 76877 CASAVA_Build 13 88690008 1I AATACTCCTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 384 hom 42 1 39 2 A 8 9 76878 CASAVA_Build 13 88697013 1I CCCCAAATAC -/T TTTTTTTTTT 1159 het 1159 ref 21 7 3 11 T 15 16 76879 CASAVA_Build 13 88708767 2I ATTCATTTTT --/TC TCTCTTGCTT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 TC 2 3 76880 CASAVA_Build 13 88709254 1D AGCCAAGGAG T/- TTCCTGTAAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 3 2 76881 CASAVA_Build 13 88716035 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 20 0 13 7 A 9 10 76882 CASAVA_Build 13 88720888 1I AAAAAACTGC -/T AGCAATGTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 0 1 76883 CASAVA_Build 13 88723013 4D GCTATTGTTA TTAG/---- TTAGGCCTGA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 TTAG 2 1 76884 CASAVA_Build 13 88726906 4I TCAGATATTA ----/TTAT TCTCTATTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TTAT 0 1 76885 CASAVA_Build 13 88733840 3I ATCTAGTATA ---/TAT TATTATGCCA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TAT 2 3 76886 CASAVA_Build 13 88737413 1I GGGTAGCTCC -/T TCTCTGCAGC 3070 hom 132 het 48 0 43 5 T 1 2 76887 CASAVA_Build 13 88739731 1D TAACATTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 76888 CASAVA_Build 13 88742083 1I GTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 151 hom 40 1 30 9 T 10 11 76889 CASAVA_Build 13 88744409 2I CAGCTGGAAA --/CT CTTTTTCTCT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CT 1 2 76890 CASAVA_Build 13 88748238 3D CTCAGGGTGC AGA/--- AGAAGTTTCA 3070 hom 93 het 36 0 31 7 AGA 2 1 76891 CASAVA_Build 13 88749670 14D GCCATGCTAC CTGCTTCTTTGGTG/-------------- CTCTAGCTTG 3070 het 152 hom 21 1 11 12 CTGCTTCTTTGGTG 1 0 76892 CASAVA_Build 13 88749997 11D GGAAGCAAAT TGGTGTTTGCC/----------- TGGGCATGAA 3070 hom 96 het 35 0 33 8 TGGTGTTTGCC 1 0 76893 CASAVA_Build 13 88764402 5D47M4D TCTAAAAAAG AAGAAAAGAAAAGAAAAGAAGAAAGAAAAGAAAGGGAGAGAGAAAGAGAGAGAGGA/-----AAGAAAAGAAAAGAAGAAAGAAAAGAAAGGGAGAGAGAAAGAGAGAG---- AGGAAGGAAG 3070 het 535 hom 21 5 20 6 N/A 0 0 76894 CASAVA_Build 13 88765727 2I TTCTCAGCAC --/AA AGTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 A 1 3 76895 CASAVA_Build 13 88768012 4D TTATCTATTT ATTA/---- ATTATTATAT 3070 hom 78 het 30 0 26 5 ATTA 2 1 76896 CASAVA_Build 13 88768230 1D TTCCAGACTC A/- AAAAAAACAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 8 7 76897 CASAVA_Build 13 88774465 1D AGAGAAAAAC A/- AAAAAAGCAA 3070 hom 69 het 42 1 33 8 A 7 6 76898 CASAVA_Build 13 88776602 1I TGATTGTGAC -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 7 8 76899 CASAVA_Build 13 88776931 1I ATGTCCATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 495 hom 38 2 29 7 T 10 11 76900 CASAVA_Build 13 88777371 1I GATTGTTCCA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 8 9 76901 CASAVA_Build 13 88778956 4I CGTAACTCCC ----/TTAG TTAGTTGCCT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TTAG 1 2 76902 CASAVA_Build 13 88782100 1D TTATGTCTTG T/- TTTTTATCTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 5 76903 CASAVA_Build 13 88782522 1D TAACTATTAT A/- CAACCCTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 A 1 0 76904 CASAVA_Build 13 88786270 2I GGCATGCAGA --/AG AGAGAGTGAA 3070 hom 54 het 25 0 18 7 AG 3 4 76905 CASAVA_Build 13 88795680 4I CAATTAAAGA ----/TAAT TAATACAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TAAT 1 2 76906 CASAVA_Build 13 88798289 1I ATGCAAGAAG -/A AAAAAATCTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 6 7 76907 CASAVA_Build 13 88806092 14D CTAAACTTGA GATTCAAATCTACG/-------------- TATTTCTACA 3070 het 3070 ref 35 21 16 1 GATTCAAATCTACG 1 0 76908 CASAVA_Build 13 88809590 1D ATAAGATTTT A/- AAAAAATCAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 6 76909 CASAVA_Build 13 88814503 3D GAAATAAAAG AGA/--- AGAAGTTGAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AGA 2 1 76910 CASAVA_Build 13 88815426 1I CTGCTGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3041 hom 28 7 13 8 A 13 14 76911 CASAVA_Build 13 88817293 3I ATTGGTGAGT ---/TTG GATGTGATTT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 TTG 0 1 76912 CASAVA_Build 13 88819926 2D TATTTCAAAT AA/-- GTCAATTGAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 5 A 2 0 76913 CASAVA_Build 13 88822176 1D AACTACCATG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 7 6 76914 CASAVA_Build 13 88823343 1D AATGGGGCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 13 13 9 A 10 9 76915 CASAVA_Build 13 88840454 1I ACTTATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 10 11 76916 CASAVA_Build 13 88853424 1D TTTTAGAAGC A/- AAATTATTAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 4 3 76917 CASAVA_Build 13 88860195 1D TAATAGGTTA T/- CATGGGAGGG 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 T 1 0 76918 CASAVA_Build 13 88860719 1D TTTTTGATAT A/- AAATTTTACA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 4 3 76919 CASAVA_Build 13 88866486 1I TTAAGGAGAA -/T TTCCTACAGC 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 T 2 3 76920 CASAVA_Build 13 88869996 1D AAACCAAGGA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 8 7 76921 CASAVA_Build 13 88874897 1I ATAATTTCTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 51 31 10 10 A 8 9 76922 CASAVA_Build 13 88880639 1I TTATGGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 13 14 76923 CASAVA_Build 13 88883836 1D ATAATAGCAT G/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 G 1 0 76924 CASAVA_Build 13 88886288 1I ATCTAAAATT -/G TATGGACCAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 0 1 76925 CASAVA_Build 13 88886779 5I ATTTATTATC -----/ATATT ATATTATTTG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 ATATT 1 2 76926 CASAVA_Build 13 88889153 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 31 1 25 5 A 1 0 76927 CASAVA_Build 13 88892442 1D ATTCATTCTA T/- TTTTTGTATG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 6 5 76928 CASAVA_Build 13 88897197 1D TAGCTCTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 268 hom 50 1 48 2 T 10 9 76929 CASAVA_Build 13 88897995 1D70M4I TCTTTTCTAA GCTTCCCTAATGAGAACTGAAAGAGACTGAGTTCAATAGATGGATGAGTAAAGAAACAGACTTGTCTACTC----/-CTTCCCTAATGAGAACTGAAAGAGACTGAGTTCAATAGATGGATGAGTAAAGAAACAGACTTGTCTACTCCTTA CTTAAGTTGA 3070 hom 62 het 45 1 74 8 N/A 0 0 76930 CASAVA_Build 13 88903705 4I GAAATGCTTT ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 GA 6 8 76931 CASAVA_Build 13 88907529 2D TACATGTAGG TA/-- TATATATATG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TA 5 4 76932 CASAVA_Build 13 88907662 4I GTGTGTATTT ----/ACAC ACACACACCA 3070 hom 105 het 40 0 33 7 AC 4 6 76933 CASAVA_Build 13 88913604 1D TTCTTTTTCT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 7 76934 CASAVA_Build 13 88914197 4I TCTGAGAAAT ----/AGTC AGCCTCCTGA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 AGTC 0 1 76935 CASAVA_Build 13 88914283 1D TGTTAGGTTT A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 8 7 76936 CASAVA_Build 13 88915048 3I AGATTAAATG ---/TGA TGATGATTAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TGA 2 3 76937 CASAVA_Build 13 88915217 2D TGCATCCAAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 78 het 33 0 26 8 AG 7 6 76938 CASAVA_Build 13 88916055 2I ACTATCACTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 102 het 49 0 33 16 TC 7 8 76939 CASAVA_Build 13 88918842 1I GTTTTCAGTG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 9 76940 CASAVA_Build 13 88919778 5I CTGATATTGG -----/AAATA AAATAGTTTC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 AAATA 1 2 76941 CASAVA_Build 13 88920939 1I AATCATTAAT -/A AAAAAAACTA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 8 76942 CASAVA_Build 13 88923834 3I17M4I AGTGGTAATA ---TCCTTGTTGTTTCTAGT----/TCCTCCTTGTTGTTTCTAGTTGTG TGTATTTGAA 3070 hom 84 het 27 0 29 0 N/A 0 0 76943 CASAVA_Build 13 88929045 4D ATGTTCTGAC TATT/---- TGGTAAGCCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TATT 1 0 76944 CASAVA_Build 13 88929949 2D TATATCATGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AT 8 7 76945 CASAVA_Build 13 88933577 1D AAAGGAGAGA T/- TTCTAAGTGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 3 2 76946 CASAVA_Build 13 88935060 2I TCATTTATAT --/TC TATTTAATTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TC 0 1 76947 CASAVA_Build 13 88939223 1D ATTACATAGG T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 2 1 76948 CASAVA_Build 13 88940048 1D TTATTTTAGC A/- AAAAAAATGT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 8 7 76949 CASAVA_Build 13 88943814 1I ATCACTATCA -/T GAGAACAATA 3070 hom 99 het 36 0 29 7 T 0 1 76950 CASAVA_Build 13 88947419 1I AAGAAAAAAA -/G AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 G 0 1 76951 CASAVA_Build 13 88951064 1D AGAAAACAAA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 2 1 76952 CASAVA_Build 13 88951873 1I TCCCAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 2223 het 519 hom 16 2 7 7 T 13 14 76953 CASAVA_Build 13 88977570 3D GTATAGTGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 2 T 14 11 76954 CASAVA_Build 13 88980583 4I TTGAGAATAA ----/ATAT ATACTCTATT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 AT 1 3 76955 CASAVA_Build 13 88986653 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 34 het 25 0 21 5 T 8 7 76956 CASAVA_Build 13 88993739 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 21 0 10 11 A 15 14 76957 CASAVA_Build 13 89000198 2D AAATGTGCAA AG/-- AGAGAAAACA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 AG 3 2 76958 CASAVA_Build 13 89010379 2D ATAGTACCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2847 het 2847 ref 27 13 11 3 A 12 10 76959 CASAVA_Build 13 89023473 1D GTGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1847 het 1847 ref 57 43 6 8 A 11 10 76960 CASAVA_Build 13 89031917 1I TTTTTTTTTT -/A ATGTAGATAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 1 2 76961 CASAVA_Build 13 89050535 1D AGAAAAGAAG A/- AAAAAAAAGA 2574 hom 26 het 28 0 9 19 A 9 8 76962 CASAVA_Build 13 89050767 1D GTTTAAATAA T/- GCCAATGTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 0 76963 CASAVA_Build 13 89058678 1D ATATTTTAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 10 9 76964 CASAVA_Build 13 89059945 1I24M1D CTGACTACTC -TTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTGT/TTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTG- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 30 0 32 6 N/A 0 0 76965 CASAVA_Build 13 89063805 2I TATATTACTT --/TA TATATATATA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 TA 8 9 76966 CASAVA_Build 13 89066382 5I TAGTCTGTCA -----/TATAT TATATTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TATAT 1 2 76967 CASAVA_Build 13 89080362 1D ATTAGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 27 1 23 3 T 11 10 76968 CASAVA_Build 13 89085899 1D TTACTGTTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 25 9 4 A 10 9 76969 CASAVA_Build 13 89095850 2I TAAAGCTCTC --/TT TTTACAGGGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 3 5 76970 CASAVA_Build 13 89095942 1I GCTATAATAT -/A TGTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 0 1 76971 CASAVA_Build 13 89097523 1I AGGGTGAATC -/A GTAGTCAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 76972 CASAVA_Build 13 89099248 2I GCACGAAAAC --/AA ATGGATAAAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 3 76973 CASAVA_Build 13 89104677 2D ATAAATTTTT AA/-- AGATTCCTGT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 A 3 1 76974 CASAVA_Build 13 89108718 1I AGTTGATTGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 7 8 76975 CASAVA_Build 13 89120939 1D CTAATCTCCC T/- TTTTTTATTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 6 76976 CASAVA_Build 13 89124680 1I CAGGAGGCAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 8 9 76977 CASAVA_Build 13 89133546 1D AGCAGAAAGC A/- AAAACATATG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 5 4 76978 CASAVA_Build 13 89140977 4I TCCATCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 33 het 25 1 21 7 AAAC 3 4 76979 CASAVA_Build 13 89147701 1D GTAGCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 2392 het 2392 ref 24 8 8 8 T 15 14 76980 CASAVA_Build 13 89149875 5D GTGATAGAGA TGTTT/----- TGTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 4 TGTTT 2 1 76981 CASAVA_Build 13 89157365 8D TATATGTATA TGTATATC/-------- TATATATATA 1182 het 1182 ref 16 6 4 7 TGTATATC 1 0 76982 CASAVA_Build 13 89161301 1D TCATTCACTA T/- ATCACAAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 T 1 0 76983 CASAVA_Build 13 89166754 1D AGCTCATACA T/- TTTTTTTTTA 2965 het 2965 ref 29 17 8 4 T 10 9 76984 CASAVA_Build 13 89166953 3D ACAGAAGAAA TGT/--- TGTGTAAATC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TGT 2 1 76985 CASAVA_Build 13 89168021 1I AGCAAATGGG -/A AATGCAAGAA 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 2 3 76986 CASAVA_Build 13 89168181 1D ATGCAACAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 A 9 8 76987 CASAVA_Build 13 89173447 3D GAATTTACAC TTT/--- TTTTACAATA 3070 het 3070 ref 30 20 10 2 T 7 4 76988 CASAVA_Build 13 89178511 1I TTGCTTTAAG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 7 8 76989 CASAVA_Build 13 89181203 4D GTTCAAAGAT AGAA/---- AGATATTAAA 3070 het 3070 ref 36 23 11 5 AGAA 1 0 76990 CASAVA_Build 13 89183575 2D ATTTCACCTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 31 0 15 17 T 11 9 76991 CASAVA_Build 13 89192781 1I ATTTATGTAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 T 8 9 76992 CASAVA_Build 13 89194498 2D TAATTTAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 16 24 12 T 12 10 76993 CASAVA_Build 13 89194832 1I TTGAATATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 9 10 76994 CASAVA_Build 13 89194947 1I24M2D TATGTTGAAT -AAAAAAAGTATAAAAGAAGGAGAAAG/AAAAAAAAGTATAAAAGAAGGAGAA-- AGAAAAAATA 2534 het 2534 ref 26 21 7 3 N/A 0 0 76995 CASAVA_Build 13 89195043 4I ATTTAGATAT ----/TAAG TGTTTTATCA 3070 het 3070 ref 20 8 8 4 TAAG 0 1 76996 CASAVA_Build 13 89195719 1D AAAACTCTCA T/- TTTTTTTTTG 2560 het 2560 ref 24 9 6 9 T 10 9 76997 CASAVA_Build 13 89196130 1D TCCCAACACA C/- ACAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 C 1 0 76998 CASAVA_Build 13 89197263 2D GTTTTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 T 11 9 76999 CASAVA_Build 13 89197544 2I TTTTGGGGTT --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 TG 4 5 77000 CASAVA_Build 13 89197872 1I GATTTTTAGA -/T TTTTCTGTTG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 4 5 77001 CASAVA_Build 13 89198646 1D GTGAGACTGA T/- TTTTGACTTC 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 T 5 4 77002 CASAVA_Build 13 89208448 1D TTTGCTTTTT A/- AAATCTAGTA 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 A 4 3 77003 CASAVA_Build 13 89210164 1D CTCTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 32 1 26 6 T 16 15 77004 CASAVA_Build 13 89211307 2D TATGTGTATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 21 13 1 TA 6 5 77005 CASAVA_Build 13 89215395 6D AAAATCTTAC ATATAT/------ ATATATATAT 2582 het 360 hom 22 5 9 8 AT 11 8 77006 CASAVA_Build 13 89218041 1D CTAAAAACAC A/- AAAAAAAATT 2066 het 1047 hom 12 5 5 2 A 9 8 77007 CASAVA_Build 13 89220137 1I GTAAAGTAAA -/C AATGGTACTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 C 0 1 77008 CASAVA_Build 13 89220835 1I TTCAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 9 10 77009 CASAVA_Build 13 89232977 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 10 11 77010 CASAVA_Build 13 89243273 1D CACCCAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2737 hom 26 8 12 6 A 12 11 77011 CASAVA_Build 13 89248446 1I CACGAACAAC -/A AAAATGTATT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 4 5 77012 CASAVA_Build 13 89251537 1I ATGCACAACA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 7 8 77013 CASAVA_Build 13 89254334 1I AATCATAAGG -/T TCTGTTGCCA 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 T 1 2 77014 CASAVA_Build 13 89259624 7I GGGAAAGTAA -------/TATGATT GTAATTATCT 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 TATGATT 0 1 77015 CASAVA_Build 13 89260742 1D CCCCATTGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 10 9 77016 CASAVA_Build 13 89265603 1D AGGATGAAAG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 A 7 6 77017 CASAVA_Build 13 89272898 1D GTGCAGTTCA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 T 7 6 77018 CASAVA_Build 13 89273580 2D TGTGTTTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 191 hom 31 2 22 7 TA 10 9 77019 CASAVA_Build 13 89275106 1I TAAATATTCA -/T TTGGGGTGAT 3070 het 3070 ref 27 13 7 7 T 2 3 77020 CASAVA_Build 13 89279165 1I ACCGTATACA -/T TTTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 5 6 77021 CASAVA_Build 13 89306451 12D TGGCAAAACT ATCATTTAAATA/------------ ATCACCTGTA 3070 het 3070 hom 46 22 27 4 ATCATTTAAATA 1 0 77022 CASAVA_Build 13 89313505 2D ACACATACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 24 het 15 0 9 6 AT 6 5 77023 CASAVA_Build 13 89315650 3I TGAGCTCACC ---/ATT ATTATGATTA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 ATT 1 2 77024 CASAVA_Build 13 89325759 1I43M2D GGACAGTGAG -GGGGAAACTGGTTTTGTCAACCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC/AGGGGAAACTGGTTTTGTCAACCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAA-- TTTAAGAAAG 3070 het 149 hom 23 2 26 4 N/A 0 0 77025 CASAVA_Build 13 89326532 1D ACATGGGGGC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 111 het 44 0 38 7 A 8 7 77026 CASAVA_Build 13 89328811 2D AGATCAGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 AC 10 9 77027 CASAVA_Build 13 89340432 1I CTGCTTCCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 6 hom 41 2 36 3 T 9 10 77028 CASAVA_Build 13 89343705 2I TACTACAGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 29 2 20 7 T 13 15 77029 CASAVA_Build 13 89348290 7I CTCTCCAATA -------/TGGCCAT TGGCCATTGA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 TGGCCAT 1 2 77030 CASAVA_Build 13 89349329 2I ACTCTAATAA --/CT CTTTCAAAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CT 1 2 77031 CASAVA_Build 13 89349575 2I AAATATACTC --/AA ATATTATAGT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 A 1 3 77032 CASAVA_Build 13 89358192 4D GTTTTCACTA AAAT/---- TTGAGGTTAC 3070 hom 81 het 32 0 28 6 AAAT 1 0 77033 CASAVA_Build 13 89358574 4I AAGAAAAAAA ----/AAAG AAAAGAAAGA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AAAG 0 1 77034 CASAVA_Build 13 89364291 3I TAAGAAGTCC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 12 15 77035 CASAVA_Build 13 89367427 1D TGACAAATTC T/- TTTTTTAACC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 T 7 6 77036 CASAVA_Build 13 89369828 1D CTTTGTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 23 5 A 13 12 77037 CASAVA_Build 13 89371895 3I TTTCTAAATA ---/AAT AAATTTTAGG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAT 0 1 77038 CASAVA_Build 13 89373598 4I CCTGACTGAC ----/TGAT TGAGCTGGAA 3070 hom 101 het 38 0 34 4 TGAT 0 1 77039 CASAVA_Build 13 89375297 4I TGTTTGTTGC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 126 het 48 0 41 7 TTTG 2 3 77040 CASAVA_Build 13 89386997 1D GCAGGAATTT C/- CCCCACAAAG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 5 4 77041 CASAVA_Build 13 89391311 3D TTGTCATATG TTC/--- TTCTTTGTAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TTC 2 1 77042 CASAVA_Build 13 89396158 1I TTAGGTCTGC -/T TTTTTTTTTT 1298 het 1298 ref 25 20 3 2 T 11 12 77043 CASAVA_Build 13 89399749 1D ACATGAAGAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 249 hom 21 2 14 5 T 9 8 77044 CASAVA_Build 13 89402576 1I GCCAGATAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 A 9 10 77045 CASAVA_Build 13 89403963 1I ATAATTGATA -/T ACCAAAACTG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 0 1 77046 CASAVA_Build 13 89407927 1I ATTTAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 1104 het 1104 ref 37 23 3 11 T 15 16 77047 CASAVA_Build 13 89410089 1I CTGAGAATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 9 10 77048 CASAVA_Build 13 89410218 2D ATTAATAGAC TT/-- GCTATATTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 2 0 77049 CASAVA_Build 13 89411832 1D ATTTAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 A 12 11 77050 CASAVA_Build 13 89413301 4I TTAAGATTTT ----/AATA AATAAATGAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AATA 1 2 77051 CASAVA_Build 13 89413607 1D GTCAAAAATG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 9 8 77052 CASAVA_Build 13 89416043 10D TTTTCTTTTC TTTTGTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 628 het 307 hom 16 2 6 9 TTTTGTTTTT 1 0 77053 CASAVA_Build 13 89416355 1D CAAAAGCTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 T 10 9 77054 CASAVA_Build 13 89423066 1D CAATGAAAAC T/- TTTGGCTTAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 4 3 77055 CASAVA_Build 13 89424133 1D ATATTGCATA G/- AAAGAATTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 G 1 0 77056 CASAVA_Build 13 89424602 1D ATTTATAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2502 hom 28 7 12 9 A 10 9 77057 CASAVA_Build 13 89424631 7D GCTTATGATT TTGAAGG/------- TTGTACAGGA 3070 het 3070 ref 33 14 10 11 TTGAAGG 1 0 77058 CASAVA_Build 13 89426710 3I TGACAAAAAA ---/AAG AAGATTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 AAG 1 2 77059 CASAVA_Build 13 89428146 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 2957 het 1068 hom 15 4 9 3 A 10 9 77060 CASAVA_Build 13 89430460 3I TTGACAAGAA ---/TTG TTATTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 TTG 0 1 77061 CASAVA_Build 13 89431488 5D130M1I CTTTAAATCA CTTGTCTTAGGAAAGAAGATATGGAGTGTCTAACATTTAGTAAACATGATAGTTATCTAACACTTCAAATTGTATTGAAAGGTATTTGGAAATTCCAAAAACCTAAAGATATCCTTATACTATCGAGGAGAAAAT-/-----CTTAGGAAAGAAGATATGGAGTGTCTAACATTTAGTAAACACGATAGTTATCTGACACTTCAAATTGTATTGAAAGGTATTTGGAAATTCCAAAAACCTAAAGATATCCTTATACTATCGAGGAGAAAATA AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 46 48 20 35 N/A 0 0 77062 CASAVA_Build 13 89431993 2D TAAATAAAAC TT/-- AACATTTTCA 3070 het 3070 hom 24 12 11 2 T 2 0 77063 CASAVA_Build 13 89435873 6I TCATTAATAG ------/TATTAA TAATAATATT 2214 het 519 hom 7 2 5 0 TATTAA 0 1 77064 CASAVA_Build 13 89447299 1I TGAACTATCG -/T TAAGTGTTAT 3070 het 3070 hom 51 16 25 10 T 1 2 77065 CASAVA_Build 13 89447510 1I ATCTATGTTT -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 7 8 77066 CASAVA_Build 13 89455797 2I AACTGCAAAC --/AG ATTATTGGAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 AG 0 1 77067 CASAVA_Build 13 89460641 1D ATTGTTTTGC T/- TATGGTTCAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 1 77068 CASAVA_Build 13 89463959 1I ATGATAATTG -/A AAAAAGTTCC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 5 6 77069 CASAVA_Build 13 89487884 1I TTATCCAAGA -/C CAACCATGAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 C 1 2 77070 CASAVA_Build 13 89488852 4D GATTTAGCCC TAGT/---- TATAGTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 TAGT 1 0 77071 CASAVA_Build 13 89495399 1D TTTTATGCTG T/- TTTTGATAAA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 5 4 77072 CASAVA_Build 13 89503747 1D ATGGACACTA C/- CTAATTCCAC 3070 het 3070 hom 44 15 22 8 C 2 1 77073 CASAVA_Build 13 89504494 1D GATTGTATGT C/- TTTTGCAGCT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 C 1 0 77074 CASAVA_Build 13 89508869 4I AAATAATAAT ----/AATA AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 AATA 2 3 77075 CASAVA_Build 13 89509464 2I TTTAAAATTC --/AG AGAGAACAGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AG 2 3 77076 CASAVA_Build 13 89515538 2I AAATGACTTT --/TA AAAATAATTA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 TA 0 1 77077 CASAVA_Build 13 89521645 1I CATGCACATC -/A AAACACTATA 3070 het 3070 hom 46 17 27 2 A 3 4 77078 CASAVA_Build 13 89521969 2I CGAAATTCAC --/AT ATATATATAT 2538 het 2538 ref 20 13 6 1 AT 5 6 77079 CASAVA_Build 13 89524506 4D TTCTAAAGAC AAAT/---- AATCTCTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 4 AAAT 1 0 77080 CASAVA_Build 13 89524945 55D ACTTGAAAAG CTTGTATTGTAGGATGAATTCTTATTAAATTTTATCCTGGGAACACACTGCTCAT/------------------------------------------------------- ACATAGCACT 3070 het 3070 ref 25 25 10 2 CTTGTATTGTAGGATGAATTCTTATTAAATTTTATCCTGGGAACACACTGCTCAT 1 0 77081 CASAVA_Build 13 89525269 1D GCTATAAAAA T/- ATTTGAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 T 1 0 77082 CASAVA_Build 13 89525813 1D AAGATACATT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 839 hom 33 3 20 11 G 1 0 77083 CASAVA_Build 13 89525955 10I CTATTTGATC ----------/ATGAAAAAAA ATGAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 ATGAAAAAAA 0 1 77084 CASAVA_Build 13 89527790 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1887 hom 12 het 8 0 5 3 A 12 11 77085 CASAVA_Build 13 89529679 4D CTATACAAAT AAAC/---- AATCCCGATT 3070 het 3070 hom 31 12 17 5 AAAC 1 0 77086 CASAVA_Build 13 89529924 10D TATTTATTAT TCTGTTAATG/---------- TCTGTTAATG 3070 het 3070 ref 37 19 18 4 TCTGTTAATG 2 1 77087 CASAVA_Build 13 89533943 1D GAAAATAGTC T/- CCAAGGAGCT 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 T 1 0 77088 CASAVA_Build 13 89534046 1I TTCAAGAAAT -/A AATGTTAGTC 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 2 3 77089 CASAVA_Build 13 89538388 1D AGGTGGTAAA G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 46 het 30 0 20 12 G 10 9 77090 CASAVA_Build 13 89538705 1D AACACTGTGG T/- TTTAATATTT 3070 het 3070 ref 55 26 18 11 T 4 3 77091 CASAVA_Build 13 89540868 2D TGATATAAAC AG/-- AGTTTATATT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 AG 2 1 77092 CASAVA_Build 13 89541035 4D ATAAACAATT AATA/---- AATAAATGTC 3070 het 2904 hom 18 7 9 2 AATA 2 1 77093 CASAVA_Build 13 89544282 5I TATATATTAA -----/TATAT TATATATTAT 2686 hom 18 het 11 0 7 4 TATAT 1 2 77094 CASAVA_Build 13 89544532 11I TCTTGGAGCA -----------/TTCTGTGGTGC AACGTAGCAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 TTCTGTGGTGC 0 1 77095 CASAVA_Build 13 89544849 1D CCAAGGGGAT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 43 30 10 3 A 8 7 77096 CASAVA_Build 13 89545863 1I TTATATGAGA -/C ATGAAAGCTG 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 C 0 1 77097 CASAVA_Build 13 89547477 3D AACTGAAAGA TAT/--- TCTATAACTG 3070 het 3070 ref 28 17 8 4 TAT 1 0 77098 CASAVA_Build 13 89548183 1I TTAAGGAATG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 7 8 77099 CASAVA_Build 13 89548251 3I ACTGTTTTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 35 2 14 19 T 12 15 77100 CASAVA_Build 13 89548263 1I TTTTTTTTTT -/A AACTTAAAAG 3070 het 79 hom 38 2 16 20 A 2 3 77101 CASAVA_Build 13 89550046 1D AAAAAGTGTG T/- TAATGCATCT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 2 1 77102 CASAVA_Build 13 89551131 3I GCTGTTACAT ---/CTC CTTGTCTATT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CTC 0 1 77103 CASAVA_Build 13 89554102 1D TATTTTGGCA T/- TTTGGTCTGC 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 T 4 3 77104 CASAVA_Build 13 89555851 1I CCACTTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 30 0 22 8 T 13 14 77105 CASAVA_Build 13 89556535 4D GGGCTCCAAC TGGT/---- TGGTACTCAT 3070 hom 102 het 38 0 34 6 TGGT 2 1 77106 CASAVA_Build 13 89560830 1D GTTATAAAAA G/- CAAAAATATG 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 1 0 77107 CASAVA_Build 13 89561115 1D TATGGCAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 10 7 T 10 9 77108 CASAVA_Build 13 89563167 3D ATTAAGAGAT CAA/--- CAACAAAGGC 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 CAA 3 2 77109 CASAVA_Build 13 89564652 1I GGTCAGCCAC -/A AAAAAAGCTC 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 A 6 7 77110 CASAVA_Build 13 89565484 1I CAGGAAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 A 8 9 77111 CASAVA_Build 13 89566910 9D CCTAATCATT TGTAGTATC/--------- TGTAGTATCT 3070 het 3070 ref 40 21 17 6 TGTAGTATC 2 1 77112 CASAVA_Build 13 89567644 1D TGATAAGACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 77113 CASAVA_Build 13 89570230 1D TGAAATCAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 A 10 9 77114 CASAVA_Build 13 89575325 2D AATTCAAAAC AT/-- GTGTCCAAGT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 AT 1 0 77115 CASAVA_Build 13 89582500 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2283 het 2283 ref 23 10 7 6 A 13 12 77116 CASAVA_Build 13 89583942 1I CCCTACTTTA -/C AAATGTCCTA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 C 0 1 77117 CASAVA_Build 13 89587909 4D AGGGATAGAA AAAG/---- AGAGAGATTT 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 AAAG 1 0 77118 CASAVA_Build 13 89592786 2I AGGAGTACAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 107 hom 28 1 25 2 T 12 14 77119 CASAVA_Build 13 89595619 1D CCATCTACTT G/- GGAAGCTGAG 3070 het 2895 hom 16 6 9 1 G 3 2 77120 CASAVA_Build 13 89598791 1D TGATTAAGAG T/- GATTAAAAGT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 1 0 77121 CASAVA_Build 13 89600783 3D CTGAAGTTTC AGG/--- AGAACATGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 AGG 1 0 77122 CASAVA_Build 13 89601652 1I AAGTAATAAT -/C TTTTTGTTGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 0 1 77123 CASAVA_Build 13 89601880 1D TACTGATTTA T/- TAACTAAGTT 3070 het 3070 ref 38 21 16 3 T 2 1 77124 CASAVA_Build 13 89604626 1D CAAATTAGTC T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 7 6 77125 CASAVA_Build 13 89608115 2I23M1I AATAGGAAAC --AAAAAAAGATAAGAAAATAATTT-/AAAAAAAAAGATAAGAAAATAATTTA AAATTTTTTT 3070 hom 38 het 28 1 27 4 N/A 0 0 77126 CASAVA_Build 13 89608226 1D GAAAACGGTC T/- TGAACTAGGA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 T 2 1 77127 CASAVA_Build 13 89608304 1D AGAAAGGATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 20 8 10 6 A 9 8 77128 CASAVA_Build 13 89609078 3I AGTGCTTTAT ---/AAC TCCTTAGAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AAC 0 1 77129 CASAVA_Build 13 89609179 1D AATTTTTTTT C/- AGTTATGTAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 0 77130 CASAVA_Build 13 89609398 4I ATGGAATGAC ----/ACTT AATTTTGCAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 ACTT 0 1 77131 CASAVA_Build 13 89610869 1I AATCCTAAGC -/A AAAAGAACGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 4 5 77132 CASAVA_Build 13 89612340 1D TTAAAAAAAA T/- GTGAATGAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 1 0 77133 CASAVA_Build 13 89625155 1D GAGACCTCCA G/- GGTGTCATTA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 G 3 2 77134 CASAVA_Build 13 89627580 1I TATATTTTCC -/T TTTTGTGTTG 2886 het 2886 ref 23 13 7 3 T 4 5 77135 CASAVA_Build 13 89629979 1D GAGTAGAATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 4 A 8 7 77136 CASAVA_Build 13 89637699 2D TGGAAAAAGA CT/-- CTATTTGTCA 3070 het 3070 hom 50 26 22 3 CT 2 1 77137 CASAVA_Build 13 89649539 2D ATAAGTGTTT TA/-- TATATATATA 3070 het 2522 hom 26 7 15 4 TA 10 9 77138 CASAVA_Build 13 89651877 2I TGTGTATGTC --/TT TTTTTCTTCT 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 T 5 7 77139 CASAVA_Build 13 89662832 1D TTTCCAAATA T/- TTTTAGAAAA 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 T 5 4 77140 CASAVA_Build 13 89671772 1D TCAATTATCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 10 9 77141 CASAVA_Build 13 89673260 1D ATTTATATTA C/- ATTATACTAT 2845 het 1787 hom 13 5 6 2 C 1 0 77142 CASAVA_Build 13 89677287 2I TAGTCTCTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 17 0 12 5 A 14 16 77143 CASAVA_Build 13 89684656 3I TATCAGTTTT ---/AAG AAGATGATAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AAG 1 2 77144 CASAVA_Build 13 89684989 1D TTTTCTTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 42 0 32 10 T 9 8 77145 CASAVA_Build 13 89687330 1I GTGTAGAGCT -/A TCACTTAACA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 0 1 77146 CASAVA_Build 13 89687827 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 11 77147 CASAVA_Build 13 89689881 1D AAAAATATTA G/- GGAGAAAAAG 3070 hom 108 het 40 0 37 4 G 3 2 77148 CASAVA_Build 13 89690248 1I GGCCCCTCAG -/T TAAGGCATGG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 1 2 77149 CASAVA_Build 13 89692312 4I TTTAATATCT ----/ATTA ATTAATAAAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 ATTA 1 2 77150 CASAVA_Build 13 89693142 4D AACATGCTTA TTCT/---- TTCTTTTTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 7 TTCT 2 1 77151 CASAVA_Build 13 89698948 1D AGTTGCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 466 hom 35 2 18 15 A 14 13 77152 CASAVA_Build 13 89717107 1D GAAAACTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 11 10 77153 CASAVA_Build 13 89721177 1D TTCTGAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 12 11 77154 CASAVA_Build 13 89725420 1I TTTTATATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 1 77155 CASAVA_Build 13 89738562 2D GAAATGAAAC AG/-- GGGAGGAAGA 3070 hom 93 het 33 0 30 3 AG 1 0 77156 CASAVA_Build 13 89740803 1I CCCATTTCCA -/T TGAAGGGAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 2 77157 CASAVA_Build 13 89766905 2D ACTCAGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 26 0 13 13 A 14 12 77158 CASAVA_Build 13 89781821 2D AGAAGAGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 27 0 18 9 T 14 12 77159 CASAVA_Build 13 89782979 1I TATTCTTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 680 hom 33 2 24 7 A 10 11 77160 CASAVA_Build 13 89785614 7I CACCTGACAA -------/GGATTCC TATCTATGGA 3070 het 3070 ref 56 31 23 2 GGATTCC 0 1 77161 CASAVA_Build 13 89790503 2I AATCTCTTAC --/CT GAAACTACAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CT 0 1 77162 CASAVA_Build 13 89810974 2D TGCGCGCATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 5 het 41 1 28 13 CA 9 8 77163 CASAVA_Build 13 89818970 1D TCAGTGGAAG T/- TTTCAATAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 4 3 77164 CASAVA_Build 13 89823318 2I CAGACTATAT --/AC ACAATTGGCC 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 AC 1 2 77165 CASAVA_Build 13 89828486 1D GTAAAGAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 8 77166 CASAVA_Build 13 89838314 1D CCTGGTATCC A/- AAAAAAAAAA 1071 het 1071 ref 32 10 6 16 A 16 15 77167 CASAVA_Build 13 89839291 2I GGTTGCTGTT --/AA AAAGATTCAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 3 5 77168 CASAVA_Build 13 89850426 1I GATGGAAGTA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 6 7 77169 CASAVA_Build 13 89850957 1D AAATGTCTAC T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 T 7 6 77170 CASAVA_Build 13 89861806 9D GAAAGATGGC TGGGTGCGG/--------- TGGCTCACAC 2974 het 2102 hom 16 6 8 2 TGGGTGCGG 1 0 77171 CASAVA_Build 13 89862462 1D TGGAAAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 68 het 30 0 23 7 T 10 9 77172 CASAVA_Build 13 89864123 1I ATTAAACACT -/C CGAACTTAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 1 2 77173 CASAVA_Build 13 89866740 1I GTCTAAACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 9 10 77174 CASAVA_Build 13 89868537 1D GTGCTTTGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 T 9 8 77175 CASAVA_Build 13 89875423 1D CTGCCTATTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 8 7 77176 CASAVA_Build 13 89889244 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 10 11 77177 CASAVA_Build 13 89889892 1D CTTTGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 T 11 10 77178 CASAVA_Build 13 89896570 1D AATTCGGCAT A/- AAAAAAAAAA 1890 het 1890 ref 22 12 6 5 A 15 14 77179 CASAVA_Build 13 89899736 1D TACTCAACTA T/- TTTTTTTTAA 2410 het 2410 ref 22 11 5 6 T 9 8 77180 CASAVA_Build 13 89905891 1D TATCTGACAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 8 7 77181 CASAVA_Build 13 89909618 4I GAAACAAAAA ----/CACT CACATGCGTC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 CACT 0 1 77182 CASAVA_Build 13 89913089 3D ACAAAGAAAA GTT/--- GTACCTCATA 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 GTT 1 0 77183 CASAVA_Build 13 89917071 1D CCAATAGAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 9 8 77184 CASAVA_Build 13 89917922 1D CTTCTAATTT A/- AAGAAGTGTG 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 A 3 2 77185 CASAVA_Build 13 89919214 3D TGGTCAGAAG TTC/--- TTCTCATGAA 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 TTC 2 1 77186 CASAVA_Build 13 89926383 1I TTATACATAA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 8 9 77187 CASAVA_Build 13 89928940 1I ACCAATGTAC -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 T 6 7 77188 CASAVA_Build 13 89946680 3D GGGAAGAAAT TGA/--- TGGTTATTTC 3070 het 3070 ref 47 27 17 7 TGA 1 0 77189 CASAVA_Build 13 89947012 4I GTTCAATAAA ----/TAAT TAATTAGAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TAAT 1 2 77190 CASAVA_Build 13 89947942 1I TTCTGACTAG -/A AATTCTCTCT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 2 3 77191 CASAVA_Build 13 89948026 3D CTGCTTCTCT TTC/--- TTCTTCTCTC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 TTC 3 2 77192 CASAVA_Build 13 89949365 1I ATATTTCTAT -/G GAGTATTTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 1 2 77193 CASAVA_Build 13 89950638 1I CGTTTTCAAT -/A AAAAATGCCC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 5 6 77194 CASAVA_Build 13 89957541 1D GGTATGTGAG A/- AACTTCATAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 3 2 77195 CASAVA_Build 13 89957770 2D GAAAGGAAAA AG/-- AGATAAATAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 AG 2 1 77196 CASAVA_Build 13 89971943 4D AAGAAAAAAT GTTA/---- GAGACAGCTA 3070 het 3070 hom 33 11 20 3 GTTA 1 0 77197 CASAVA_Build 13 89972565 1I AACAAAGATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 9 10 77198 CASAVA_Build 13 89974571 9D TACAAGCTGA CAGCCAAAT/--------- CAAGAATTCA 3070 het 3070 ref 43 24 17 4 CAGCCAAAT 1 0 77199 CASAVA_Build 13 89974927 17D ACAAAGCTAT GTTACAAGGTTATAGTA/----------------- ACCAAAACAG 2080 het 2080 ref 32 18 8 12 GTTACAAGGTTATAGTA 1 0 77200 CASAVA_Build 13 89978646 1I CCCTTATAGG -/T TTTTTCCATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 5 6 77201 CASAVA_Build 13 89995519 1D TGGAGTACAC A/- AGGCACTGGA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 2 1 77202 CASAVA_Build 13 89997541 4I TGACTGGCAT ----/TGAG TGTCTGCAGC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TGAG 0 1 77203 CASAVA_Build 13 90000876 2I AAAAAGTAAC --/TT ATGATTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 2 77204 CASAVA_Build 13 90002068 2I AATTTCACTC --/TA AAATATAAGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TA 0 1 77205 CASAVA_Build 13 90004710 1I GATGAATCTA -/T TTTTTGTGAA 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 T 5 6 77206 CASAVA_Build 13 90006773 4D TTACCGTAGC AGAG/---- CAGGAGAGAC 3070 het 3070 hom 30 13 15 5 AG 2 0 77207 CASAVA_Build 13 90009989 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 7 6 77208 CASAVA_Build 13 90010242 3D ATAAAATTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 34 7 14 14 T 15 12 77209 CASAVA_Build 13 90012942 4I ACCTTGGCAC ----/ATTA ATTGAGACCT 3070 het 3070 hom 57 22 27 8 ATTA 0 1 77210 CASAVA_Build 13 90060483 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 TA 5 6 77211 CASAVA_Build 13 90062232 8D3M2D TATCCAGCAG TCCTAGCTGTTTG/--------GAT-- AAATAGGAGA 3070 het 3070 hom 36 15 21 5 N/A 0 0 77212 CASAVA_Build 13 90064857 1D GCCTGGGTTA T/- GGGGTATTAC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 1 0 77213 CASAVA_Build 13 90080408 1I TTGAGAACTT -/A AATGAGATTA 3070 het 3070 hom 43 18 24 1 A 2 3 77214 CASAVA_Build 13 90110204 6D CTATTTTCTA ATAGTT/------ TAATCCTTAC 3070 het 3070 ref 23 13 9 2 ATAGTT 1 0 77215 CASAVA_Build 13 90120585 1D ACATTGGTGC A/- AAAAAAAAAA 2314 het 2314 ref 41 28 6 7 A 15 14 77216 CASAVA_Build 13 90122830 1I AGATCTTTAT -/A AAAATTCTAC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 4 5 77217 CASAVA_Build 13 90134988 3I AAAACAACAA ---/AAC AACAACAAGA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 AAC 2 3 77218 CASAVA_Build 13 90144880 1I ACAAAGAAAG -/A AATAGGTTTC 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 2 3 77219 CASAVA_Build 13 90152533 1D AACAATCTCA T/- GTTGTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 11 19 3 T 1 0 77220 CASAVA_Build 13 90154706 1D AGTAAAAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 9 8 77221 CASAVA_Build 13 90161285 2D GTTGGCAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 AT 9 8 77222 CASAVA_Build 13 90164664 1D AAAATTAGGC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 77223 CASAVA_Build 13 90166901 1D TTCTGTGCTT C/- CCTCAGCTGA 3070 hom 117 het 46 0 38 8 C 3 2 77224 CASAVA_Build 13 90174981 1I AAAGATTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 21 1 18 2 A 12 13 77225 CASAVA_Build 13 90175221 1I GATTCTTTCA -/T TTTATGTTAT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 3 4 77226 CASAVA_Build 13 90184016 1D ATACCCATAC A/- ACCACTCTGT 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 A 2 1 77227 CASAVA_Build 13 90184538 1D TTTCAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 T 15 14 77228 CASAVA_Build 13 90187915 1I GGCAATGGGG -/A AAGGATTCCC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 2 3 77229 CASAVA_Build 13 90190985 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1180 het 1180 ref 21 10 5 6 T 17 16 77230 CASAVA_Build 13 90203403 1D ATGAAATGAC A/- AAAAAATGAC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 7 6 77231 CASAVA_Build 13 90215323 6D CTTCTTCTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 35 4 15 17 T 22 16 77232 CASAVA_Build 13 90225506 1I CTTGTTGAAT -/A AAAAGTTAGG 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 A 4 5 77233 CASAVA_Build 13 90239468 3D AGATGAAATT ATC/--- ATTCTTGAAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 ATC 1 0 77234 CASAVA_Build 13 90239868 1D CAAGCTAAGA C/- TAGAAAATAT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 C 1 0 77235 CASAVA_Build 13 90243124 1D GCATTTCGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3021 hom 24 7 11 6 A 11 10 77236 CASAVA_Build 13 90247462 2D GTGAGAATTC AT/-- AGTCTTGTGA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 AT 1 0 77237 CASAVA_Build 13 90267157 1D CAACAACAAC A/- AAAAAACTTC 3070 hom 27 het 10 0 9 1 A 7 6 77238 CASAVA_Build 13 90268491 2I GAAGAAAACC --/CA TGAAATACCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 CA 0 1 77239 CASAVA_Build 13 90271986 13D6M4D TTTTCAATCT CATGTAACCCTTACAAATTAAAA/-------------CAAATT---- AAGAGAGAGA 3070 hom 75 het 24 0 26 2 N/A 0 0 77240 CASAVA_Build 13 90279224 1I ATCTATTATC -/A AAAAAAATTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 7 8 77241 CASAVA_Build 13 90281629 4D TCTACCTACC ATTT/---- ATTTATGTAT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 ATTT 2 1 77242 CASAVA_Build 13 90284593 1I CAAGGAACTA -/G TATAGGTGCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 77243 CASAVA_Build 13 90285876 2D CTTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 71 het 31 0 27 6 T 11 9 77244 CASAVA_Build 13 90286435 1I CAAGATGAAG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 7 8 77245 CASAVA_Build 13 90298723 1I CAAAAATGAC -/A AAATATAAAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 3 4 77246 CASAVA_Build 13 90305764 1I TCCAAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 799 hom 33 2 28 3 A 11 12 77247 CASAVA_Build 13 90315841 2I TCGTTGCACC --/TT TTCACCAACA 3070 hom 111 het 43 0 36 7 T 2 4 77248 CASAVA_Build 13 90319258 2D GCAATATATT TA/-- TATGAGTATA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TA 2 1 77249 CASAVA_Build 13 90320506 2I TTTTGATACA --/TG TATAAATTAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TG 0 1 77250 CASAVA_Build 13 90321319 3I TAATAATTAG ---/TGT TGTTGAGAAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TGT 1 2 77251 CASAVA_Build 13 90333894 1D CCACATCGAG A/- AAAAAAAAAA 1225 het 1225 ref 32 26 3 4 A 11 10 77252 CASAVA_Build 13 90337135 4I TTTTTGTCTC ----/AAAA AAAAGCAACT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 4 8 77253 CASAVA_Build 13 90367758 2D CTCTTAGCAC AT/-- AGAGTCTAGA 3070 hom 96 het 40 0 33 8 AT 1 0 77254 CASAVA_Build 13 90377456 1D AATTTTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 32 1 24 7 A 13 12 77255 CASAVA_Build 13 90377794 1D TCACCTTTGA T/- TCCAGATTTC 3070 hom 84 het 35 0 28 8 T 2 1 77256 CASAVA_Build 13 90385255 1D CACAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 45 1 31 13 T 12 11 77257 CASAVA_Build 13 90405756 1D AACATGTTTT G/- ACATATGCAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 G 1 0 77258 CASAVA_Build 13 90407791 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 11 10 77259 CASAVA_Build 13 90421354 2I CTATCTGGCA --/AC ACAGTCAAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AC 1 2 77260 CASAVA_Build 13 90423183 5I AAACAACACT -----/TAGAG TAAACTTTTA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 TAGAG 0 1 77261 CASAVA_Build 13 90429342 1D ACTTTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 21 0 21 1 A 10 9 77262 CASAVA_Build 13 90439733 1I TATAAAGTAT -/A AAATTTAAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 3 4 77263 CASAVA_Build 13 90442131 1D ATGTATGTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 9 8 77264 CASAVA_Build 13 90447383 2D GTCTTAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 42 0 21 22 A 16 14 77265 CASAVA_Build 13 90453157 1I TTTGGCCCCA -/G GGTTTGTGCT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 2 3 77266 CASAVA_Build 13 90455786 1D CTGTCTTTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 25 hom 23 2 17 4 A 10 9 77267 CASAVA_Build 13 90460805 2I TTTAAACTAA --/AC ACACACCTAT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AC 3 4 77268 CASAVA_Build 13 90463200 1D TGTGTTTCTG A/- AAAGAAGGTG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 4 3 77269 CASAVA_Build 13 90464189 2I ACTCCTACCT --/TC GTTCTGTTTC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TC 0 1 77270 CASAVA_Build 13 90464846 2D TCTTCAGATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 20 0 18 3 TA 7 6 77271 CASAVA_Build 13 90504251 1D GAAGGAAAGA T/- TTTTCTGCAA 3070 hom 117 het 44 0 39 6 T 5 4 77272 CASAVA_Build 13 90506979 1D AAGGGACGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 27 2 15 12 T 11 10 77273 CASAVA_Build 13 90508386 1I CTTTTTCGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 10 77274 CASAVA_Build 13 90508765 2D AGCTTTAACT CA/-- CAGACAAATA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 CA 2 1 77275 CASAVA_Build 13 90510416 1D CTTAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 11 10 77276 CASAVA_Build 13 90518455 1D CTAAATATTC T/- GACTTCTTAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 0 77277 CASAVA_Build 13 90530356 1D TTTTCCTTTT C/- TACTGCACTA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 C 1 0 77278 CASAVA_Build 13 90546621 1I AACTGTAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 45 0 35 10 A 9 10 77279 CASAVA_Build 13 90553160 1D ATTTCTTAGT G/- TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 33 0 29 4 G 1 0 77280 CASAVA_Build 13 90563502 2D CTGGATTGTG TT/-- TTTTTTTCAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 9 7 77281 CASAVA_Build 13 90584506 2D AAGTTTTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 14 12 77282 CASAVA_Build 13 90586003 4I CTCTTTGTTT ----/GTTA AAGATAAATG 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 GTTA 0 1 77283 CASAVA_Build 13 90592182 1I TGAATGACTC -/T TTGGGATTTA 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 T 2 3 77284 CASAVA_Build 13 90595364 1I TCATTTTTTT -/A AAAAATTAAT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 5 6 77285 CASAVA_Build 13 90597861 1I AAGAAACAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 8 9 77286 CASAVA_Build 13 90598414 1D TTTTCCTAAG A/- AAAATAAGAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 5 4 77287 CASAVA_Build 13 90598502 1D44M1D GTATATCACC AAAAAAAAAAAGAACCAGTCATACAATATAACACTACTCAGCAATA/-AAAAAAAAAAGAACCAGTTATACAATATAACACTACTCAGCAAT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 30 25 4 N/A 0 0 77288 CASAVA_Build 13 90608682 1D AAATAATAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 10 9 77289 CASAVA_Build 13 90633350 1D ATGAGTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 508 hom 32 2 24 7 T 13 12 77290 CASAVA_Build 13 90643106 1D TGGCCACACA T/- TTTTTTTTTT 906 het 906 ref 47 31 3 13 T 11 10 77291 CASAVA_Build 13 90759334 1I GTGATTGGGG -/A AAAAAATGAA 2793 het 2793 ref 14 7 6 1 A 6 7 77292 CASAVA_Build 13 90809130 3D TGCCACAAAC TTT/--- TTTTGTTGTT 3070 hom 63 het 27 0 22 6 T 7 4 77293 CASAVA_Build 13 90817583 1D TTTGTTCCCA G/- CATTAAGGAG 3070 hom 120 het 49 0 41 8 G 1 0 77294 CASAVA_Build 13 90822717 1I ATTTGCACAC -/A AGAATTCTCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 2 77295 CASAVA_Build 13 90839414 1D CAAGATGCTG C/- CCCTGGCCTT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 C 4 3 77296 CASAVA_Build 13 90852214 1D AGTCAAGGTG C/- CCTTTGCTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 3 2 77297 CASAVA_Build 13 90860768 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2357 hom 18 het 8 0 6 2 T 7 6 77298 CASAVA_Build 13 90925093 1D CGACAAGGTA T/- TTTTTCATTA 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 T 6 5 77299 CASAVA_Build 13 90931213 1I ATCTTGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 11 12 77300 CASAVA_Build 13 90935469 2D TCTTGGTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 1910 het 1074 hom 28 10 7 11 T 16 14 77301 CASAVA_Build 13 90938185 1I TTTAAACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 31 1 24 6 T 14 15 77302 CASAVA_Build 13 90943250 1D ACCTCATTGA T/- TCCTACCATC 3070 het 3070 hom 50 21 21 9 T 2 1 77303 CASAVA_Build 13 90946285 2D CTCAAAAAAA AT/-- AAAAAATAAA 3070 hom 18 het 11 0 7 6 AT 1 0 77304 CASAVA_Build 13 90946396 2I TTTTAAAAAC --/AA AATTGCATTA 2623 het 2623 ref 20 12 6 3 A 2 4 77305 CASAVA_Build 13 90947564 2D GCTTCAGATA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 13 12 4 T 11 9 77306 CASAVA_Build 13 90948344 1I TAATCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 29 0 22 7 T 10 11 77307 CASAVA_Build 13 90949228 1I TCTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 32 0 28 4 A 9 10 77308 CASAVA_Build 13 90956981 5D TAAACATATT TAAAG/----- TAAAAGCACA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAAAG 1 0 77309 CASAVA_Build 13 90959555 1I TGTTGCAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 7 hom 19 1 16 2 A 8 9 77310 CASAVA_Build 13 90966037 5D CCATCTGTTT TAGTC/----- TGTTTTCACG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TAGTC 1 0 77311 CASAVA_Build 13 90970140 1I TTGAAAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 9 10 77312 CASAVA_Build 13 90984465 2D GTTGAAAAAC AT/-- ATTCTCCCCT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 AT 2 1 77313 CASAVA_Build 13 90989088 1I CCACCCCGCC -/G CCCCCCTCAG 139 het 139 ref 10 4 3 3 G 0 1 77314 CASAVA_Build 13 90992099 9I AAGCAGTGAT ---------/CATAACAAA CATTCTTATT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 CATAACAAA 0 1 77315 CASAVA_Build 13 90992251 1I CATATTGTGA -/T TTTTTTCCCA 2750 het 2750 ref 24 9 7 8 T 6 7 77316 CASAVA_Build 13 90994473 2I GCTAATTGAC --/TT TTAGGAATTT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 2 4 77317 CASAVA_Build 13 91001425 1I GAAAACAGTG -/A ATTCTTGGTG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 1 2 77318 CASAVA_Build 13 91005718 1I GATGTTTTCT -/G GGGGGCGAGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 5 6 77319 CASAVA_Build 13 91009094 2I TCTCAGTCAT --/GC GAGGGGGTTG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 GC 0 1 77320 CASAVA_Build 13 91026573 2D CAATACACAA TG/-- TGTATATATA 3026 het 929 hom 32 11 10 11 TG 2 1 77321 CASAVA_Build 13 91033862 1I TTTGTCAAGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 8 9 77322 CASAVA_Build 13 91039445 1D TTTCAAACTG T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 7 6 77323 CASAVA_Build 13 91043728 1D TCTCTGGGCC T/- TTCTATATGA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 3 2 77324 CASAVA_Build 13 91044883 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 103 het 43 0 36 8 T 9 8 77325 CASAVA_Build 13 91048582 1I AGTAAAATTG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 A 8 9 77326 CASAVA_Build 13 91057449 1D CAATAATGAT G/- CCAAGTGTGA 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 G 1 0 77327 CASAVA_Build 13 91065353 1I CATTAGGATT -/A ACAAACAACT 3070 het 3070 hom 60 28 28 4 A 1 2 77328 CASAVA_Build 13 91066568 1D CAAACTAAAC A/- AATCAAGACT 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 A 3 2 77329 CASAVA_Build 13 91068910 1D ATAACACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 44 1 36 7 T 11 10 77330 CASAVA_Build 13 91072016 1D GGACAGAACA T/- TATATATATA 2325 hom 23 het 12 0 8 4 T 2 1 77331 CASAVA_Build 13 91076281 5D GGCCCTACTA ATAAC/----- AAACAATGTA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 ATAAC 1 0 77332 CASAVA_Build 13 91078514 1D TAGTTATAGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 13 12 5 T 9 8 77333 CASAVA_Build 13 91089914 3I CAGTAGGTAA ---/AAT AATAGAGTCA 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 AAT 1 2 77334 CASAVA_Build 13 91092969 1I AAGGAAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 11 15 18 T 15 16 77335 CASAVA_Build 13 91094206 34D TTTTGAGCTT AACATATGAATTAAAATTCATATGTTAAGACTTC/---------------------------------- AACATATGAA 3070 het 3070 ref 35 22 14 17 AACATATGAATTAAAATTCATATGTTAAGACTTC 2 1 77336 CASAVA_Build 13 91171223 1I GACCACCCTT -/A AGCAAAGGCA 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 1 2 77337 CASAVA_Build 13 91173733 1I CTCTCCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 10 11 77338 CASAVA_Build 13 91184969 1I ACTGAATTCC -/T TTTGGTGGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 4 77339 CASAVA_Build 13 91187744 5I TTTCCATAGC -----/TTAAT TTAGTTTCTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTAAT 0 1 77340 CASAVA_Build 13 91194298 2I TAAGGAACAC --/TG TAACTTTGGG 3070 hom 156 het 58 0 52 6 TG 0 1 77341 CASAVA_Build 13 91195697 5I GTCTCTAAGG -----/AAATC AGCCCACTCT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 AAATC 0 1 77342 CASAVA_Build 13 91197897 2I ATGTATCTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 42 0 33 9 T 11 13 77343 CASAVA_Build 13 91212565 1I GTTAACCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 34 1 26 7 T 12 13 77344 CASAVA_Build 13 91219265 12D ACAAAACCAG TCTTTCTCTCTC/------------ TCTTTCTCTC 3070 hom 85 het 38 0 29 12 TCTTTCTCTCTC 2 1 77345 CASAVA_Build 13 91232229 1D ACTTTAGGTA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 8 7 77346 CASAVA_Build 13 91235766 2D ATTGATTAAC AT/-- ATTTATTTTA 3070 hom 99 het 40 0 34 7 AT 2 1 77347 CASAVA_Build 13 91237201 1D AGTGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 35 2 27 6 T 14 13 77348 CASAVA_Build 13 91239475 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 A 11 10 77349 CASAVA_Build 13 91249821 1I GTTTATGTCT -/C CTTCCCCCTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 1 2 77350 CASAVA_Build 13 91250389 1D TGATTTATGA T/- TTTTCCTGCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 5 4 77351 CASAVA_Build 13 91250722 2D ACTAAGACCC AG/-- AGAGAGGAGT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 AG 4 3 77352 CASAVA_Build 13 91255734 4I AATTTGACTT ----/TGAA TGGTCAAAGG 2185 het 2185 ref 22 13 6 3 TGAA 0 1 77353 CASAVA_Build 13 91255856 5D TAAATGGGAC TTTAA/----- TTTAAAGTGC 2349 het 2349 ref 45 39 5 3 TTTAA 2 1 77354 CASAVA_Build 13 91256693 1D ATTTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1949 hom 29 7 14 8 T 12 11 77355 CASAVA_Build 13 91261210 1D AAAAAAAAAA G/- AACCCAGGAA 2298 het 1567 hom 23 9 9 6 G 1 0 77356 CASAVA_Build 13 91261899 1D ATTTAGAGTA T/- TTTTTGAGAG 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 T 6 5 77357 CASAVA_Build 13 91276445 6I AAATAAATGA ------/TAAACT TGAGATGTCT 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 TAAACT 0 1 77358 CASAVA_Build 13 91295558 1I ATCAGTAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 9 10 77359 CASAVA_Build 13 91299753 1D TATTCAGAGA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 9 8 77360 CASAVA_Build 13 91300145 7D GGACTAAGAA ATAATTC/------- ATACCTTCAG 3070 het 3070 ref 43 23 21 3 ATAATTC 1 0 77361 CASAVA_Build 13 91301755 1I ATACGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1493 hom 16 4 8 4 T 10 11 77362 CASAVA_Build 13 91302533 7I CTAAGACTCA -------/AACACAC AACACACACA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 AACACAC 1 2 77363 CASAVA_Build 13 91309290 4D TATTTAGGTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 18 22 11 T 15 11 77364 CASAVA_Build 13 91309979 1I TTACTATTTA -/C TTTCAATTTC 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 C 0 1 77365 CASAVA_Build 13 91310781 1I TCTTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 1636 het 1636 ref 21 8 6 7 T 14 15 77366 CASAVA_Build 13 91312032 4D TTATTTTTGT TTAA/---- TTGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 TTAA 1 0 77367 CASAVA_Build 13 91336225 1I TTTTTTAGGA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 7 8 77368 CASAVA_Build 13 91339716 1I GTTTTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 T 10 11 77369 CASAVA_Build 13 91344227 1D TTTTTTCTGG C/- CCCTGCATGG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 C 4 3 77370 CASAVA_Build 13 91348937 1I AAAGACAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 648 hom 24 2 21 1 A 10 11 77371 CASAVA_Build 13 91357342 2I GTGATGTGCC --/AT ATATATATAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AT 5 6 77372 CASAVA_Build 13 91362994 1D TTGTGACCAG T/- TTTTTATGAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 5 77373 CASAVA_Build 13 91364920 16I7M6I ACTCTGTTCT ----------------TAGGATA------/TATATAATAAGATATATAAGATATATCTT CCGATATAAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 77374 CASAVA_Build 13 91373144 3I GATCTTACTC ---/TAA CTAAATGCTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAA 0 1 77375 CASAVA_Build 13 91373852 2D AGTTTTGCAT TA/-- TATGTTTCAC 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 TA 2 1 77376 CASAVA_Build 13 91380070 1I ATTTTCTATT -/A TTTTTTTTAT 3070 het 45 hom 26 1 21 4 A 0 1 77377 CASAVA_Build 13 91386996 4I TTCTAAGAAA ----/ATAG ATAGATAGAA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 ATAG 2 3 77378 CASAVA_Build 13 91392917 6D TGTGAAAAAA ATATAG/------ ATATAGATAT 3070 hom 84 het 33 0 29 7 ATATAG 2 1 77379 CASAVA_Build 13 91398483 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2395 hom 15 het 9 0 5 4 A 16 15 77380 CASAVA_Build 13 91400078 1I GGTAGAAAGG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 7 8 77381 CASAVA_Build 13 91402463 2D TGTGTGTGTG TA/-- TGTATTTGTG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 TA 1 0 77382 CASAVA_Build 13 91404809 1I ACTTCCACGT -/G ATAAAAATTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 0 1 77383 CASAVA_Build 13 91408535 1I CTGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 35 2 25 8 A 11 12 77384 CASAVA_Build 13 91409603 4I ACTGAATGAC ----/AAAT AAATAGAAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 AAAT 1 2 77385 CASAVA_Build 13 91410422 1D ATCTTATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 27 12 A 12 11 77386 CASAVA_Build 13 91429698 1I CATGTATTAA -/C TGTTTTGAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 0 1 77387 CASAVA_Build 13 91430067 1I ACAGCACTTA -/T TTATCCCTTG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 2 3 77388 CASAVA_Build 13 91433293 2D AACTGGACTA AG/-- AGCAACATAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 2 1 77389 CASAVA_Build 13 91433599 1I GACCCTGTCT -/A CAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 0 1 77390 CASAVA_Build 13 91435625 2I AAAATCAGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 28 9 T 14 16 77391 CASAVA_Build 13 91440104 3I TGACTATACA ---/GTT GTTATTACTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GTT 1 2 77392 CASAVA_Build 13 91442112 2I CTGCAAAATC --/AT GCTACATTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 77393 CASAVA_Build 13 91445126 1I CTGAAATTTA -/T TTTAATTCCA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 3 4 77394 CASAVA_Build 13 91449462 1D CAAAATAACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 49 0 40 10 T 10 9 77395 CASAVA_Build 13 91453706 1D CCAATCGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 37 0 31 7 T 10 9 77396 CASAVA_Build 13 91466327 3D CTGCAGTGGC AAT/--- AATTAGTACA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 AAT 2 1 77397 CASAVA_Build 13 91466982 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 23 2 12 9 T 13 12 77398 CASAVA_Build 13 91469530 4I AAGCATACTT ----/ATAA ATATCCATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATAA 0 1 77399 CASAVA_Build 13 91476708 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1147 het 1147 ref 26 19 3 4 T 12 11 77400 CASAVA_Build 13 91478215 1D ATGACTGATA T/- ATAACAAAAC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 1 0 77401 CASAVA_Build 13 91497685 2I CTTTTTAAAC --/TA TATATATATA 3070 hom 33 het 19 0 12 7 TA 6 7 77402 CASAVA_Build 13 91505089 1I TGAACTATAC -/A AAAATCCCCA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 4 5 77403 CASAVA_Build 13 91507835 1I TAGGTTTCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 8 9 77404 CASAVA_Build 13 91511043 1I GGAATTACAA -/T TTGAGAATAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 2 3 77405 CASAVA_Build 13 91511353 1I GGTGCTGTTA -/C GATAATACAT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 0 1 77406 CASAVA_Build 13 91515169 2I TAAATAATCC --/TT TTTTTTTATG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 7 9 77407 CASAVA_Build 13 91523294 1D AACCTACCTC T/- TTTTCATGAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 5 4 77408 CASAVA_Build 13 91528237 4D ATAGATAGAT ATAC/---- ATACATACAT 3070 hom 90 het 39 0 31 11 ATAC 4 3 77409 CASAVA_Build 13 91549213 1I TGTTCTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 8 13 11 T 13 14 77410 CASAVA_Build 13 91582186 1D GTATATACCC A/- ACAGATATAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 1 77411 CASAVA_Build 13 91586983 2D GATGAATGTT TC/-- TCTTTCACCA 3070 hom 111 het 43 0 37 9 TC 2 1 77412 CASAVA_Build 13 91630756 1I TTATGGGTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 8 9 77413 CASAVA_Build 13 91643429 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 9 8 77414 CASAVA_Build 13 91646395 1I ATTTATTGGG -/A AAAAAAGATG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 77415 CASAVA_Build 13 91647065 2I AAACAGGCGC --/AA AGACAGAAGC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 1 3 77416 CASAVA_Build 13 91647919 1D ATCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 881 hom 19 2 13 4 T 15 14 77417 CASAVA_Build 13 91650453 2I TTTTTCTCAC --/AT GTTTTCTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AT 0 1 77418 CASAVA_Build 13 91689408 1D GTCTTTCAAC T/- TTTTTTTTTT 2762 het 2762 ref 43 29 7 7 T 13 12 77419 CASAVA_Build 13 91690544 1I CAACTGGTGC -/T TTTTTTTTTT 1342 het 1342 ref 34 28 3 3 T 10 11 77420 CASAVA_Build 13 91719631 1D AGTAGCTTTA T/- TTTTTTAGAC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 7 6 77421 CASAVA_Build 13 91820795 1I AAAAAAAAAA -/C CAGCTTGTCA 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 C 1 2 77422 CASAVA_Build 13 91832815 10D CAAAACTTCT TTGACTGAAG/---------- TTGTTCACAC 3070 het 3070 ref 23 16 9 2 TTGACTGAAG 1 0 77423 CASAVA_Build 13 91846327 2I TTTTTTGCTC --/TT GTGTTTGAAT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 0 2 77424 CASAVA_Build 13 91851178 1D GGGATGGGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 T 10 9 77425 CASAVA_Build 13 91857737 4D AATATAGTCA TTAT/---- TTATTTCCTT 3070 het 3070 hom 44 18 21 7 TTAT 2 1 77426 CASAVA_Build 13 91865931 1I AGCTGGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2301 hom 34 9 14 11 A 14 15 77427 CASAVA_Build 13 91868625 4I ATTTGCTGAT ----/AGTG AGCACAGAGT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 AGTG 0 1 77428 CASAVA_Build 13 91877733 4D AGGGAATGGT GAGA/---- GAGAGAGTGA 3070 het 3070 ref 32 15 12 7 GA 5 3 77429 CASAVA_Build 13 91898792 1D TTAAAAATGC T/- TTTAGAAATG 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 T 4 3 77430 CASAVA_Build 13 91902833 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 A 8 9 77431 CASAVA_Build 13 91916446 4I AATTAAAAAT ----/ATAC ATAAATATAG 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 ATAC 0 1 77432 CASAVA_Build 13 91924402 1D CATTGATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 13 12 77433 CASAVA_Build 13 91931006 6D TACAGTCAGG CAACAA/------ ATCAATCTAC 3070 hom 114 het 41 0 38 4 CAA 2 0 77434 CASAVA_Build 13 91931361 1D TTTTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 2599 het 2599 ref 26 8 8 10 T 12 11 77435 CASAVA_Build 13 91937116 1I GGGACAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 33 1 23 9 T 12 13 77436 CASAVA_Build 13 91940131 1I TTGCAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 239 hom 30 1 23 6 A 11 12 77437 CASAVA_Build 13 91945880 1D TTAAGGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 17 16 77438 CASAVA_Build 13 91960457 1I TCTTTTGCTG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 7 8 77439 CASAVA_Build 13 91962778 14I AATGCTTCAT --------------/CAAATATATGAACA CTGTAGGCTT 3070 hom 93 het 31 0 32 3 CAAATATATGAACA 0 1 77440 CASAVA_Build 13 91974099 1D CATATAAAAG T/- AATGTTTAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 1 0 77441 CASAVA_Build 13 91980473 1I ATTATATAAT -/A AAACACACAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 4 77442 CASAVA_Build 13 91991828 1I TAGAAATAGC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 8 9 77443 CASAVA_Build 13 92009389 8D AGCATACATC ACCCAGCA/-------- ACGGACGAAA 3070 het 3070 ref 46 27 13 10 ACCCAGCA 1 0 77444 CASAVA_Build 13 92014246 1I GCACTTAATT -/A TTTTTTTAGA 3070 het 2762 hom 23 7 12 4 A 0 1 77445 CASAVA_Build 13 92033322 4I TCTTGTTCCT ----/GATC GATCACAGAG 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 GATC 1 2 77446 CASAVA_Build 13 92046437 1D ACTAGTGGCA G/- TCCCCAAACT 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 G 1 0 77447 CASAVA_Build 13 92050071 1D TTTTTTTTGT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 A 9 8 77448 CASAVA_Build 13 92074276 1D GCTCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2942 het 1153 hom 13 3 9 1 T 12 11 77449 CASAVA_Build 13 92080739 12I TTTAATAGTA ------------/AAATATATTAAT ACTATTTGAA 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 AAATATATTAAT 0 1 77450 CASAVA_Build 13 92083623 1D TATCTGAGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 10 9 77451 CASAVA_Build 13 92084375 2I ACGGACTATC --/AT TTTTAATGGA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 AT 0 1 77452 CASAVA_Build 13 92086897 1I TTATACTTAC -/A AACCATTGTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 2 3 77453 CASAVA_Build 13 92088822 1I TTATACTCCT -/C CTTTCTCAGA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 C 1 2 77454 CASAVA_Build 13 92092232 1I TTTTTTCTTA -/T TTCTGTTACC 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 T 2 3 77455 CASAVA_Build 13 92094141 1I TAAAAAAAGA -/C ACACACACAC 3070 het 2973 hom 24 9 11 6 C 0 1 77456 CASAVA_Build 13 92096108 1I ATTTTACCTA -/T ATTTTTTTAA 3050 het 3050 ref 21 11 9 1 T 0 1 77457 CASAVA_Build 13 92097073 1I51M4D CAATTTTCAG -TTTTAGCTCATATACAAGGGTGTGATTTTATATATATGTAAACATATACATCTAA/TTTTTAGCTCATATACAAGGGTGTGATTTTATATATATGTAAACATATACAT---- CTATCTGTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 12 N/A 0 0 77458 CASAVA_Build 13 92098681 1I TTCAATATTA -/G GGCATATTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 2 3 77459 CASAVA_Build 13 92101498 1I ATGAAAATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 9 10 77460 CASAVA_Build 13 92104760 1I CATATATCAG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 6 7 77461 CASAVA_Build 13 92105008 1D TGTATTCATC A/- AAAAAAAAAA 2573 het 2573 ref 32 17 7 8 A 12 11 77462 CASAVA_Build 13 92110825 1D TTTTCACATA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 9 8 77463 CASAVA_Build 13 92112721 1D ATCAAGTTGA G/- GGGTACCACT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 G 4 3 77464 CASAVA_Build 13 92114609 4D ATCCAATAGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 761 hom 20 3 10 8 T 18 14 77465 CASAVA_Build 13 92116771 1I AATTATACAT -/A AATCAATATG 2111 het 2111 ref 26 20 5 1 A 2 3 77466 CASAVA_Build 13 92122054 1I AAAGGGTTGT -/G GCTTTGTCCT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 G 1 2 77467 CASAVA_Build 13 92123411 1D TTCATTTACC T/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 T 5 4 77468 CASAVA_Build 13 92125410 2D AGAAATTATC AG/-- AGAGTTATAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 AG 3 2 77469 CASAVA_Build 13 92125835 1D GTCCCCCTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 10 9 77470 CASAVA_Build 13 92127171 2I GGTTAAAAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 2719 hom 32 9 12 11 AC 7 8 77471 CASAVA_Build 13 92128033 1I CGCCACCCCA -/C CCCATGTGCT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 C 3 4 77472 CASAVA_Build 13 92128694 2D ATAAGAACAT TC/-- TCCATCAAGG 3070 het 3070 hom 44 16 26 3 TC 2 1 77473 CASAVA_Build 13 92128943 1D AGATTTCTAT G/- GAGGTGAAAT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 G 2 1 77474 CASAVA_Build 13 92129923 2I ACCAGATGCT --/AC AGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 AC 0 1 77475 CASAVA_Build 13 92162719 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 10 9 77476 CASAVA_Build 13 92298800 1D GCAACTTTAA G/- GGGCTTAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 25 5 G 4 3 77477 CASAVA_Build 13 92299344 5I54M3I ATATCCTTAA -----TTATGTTACATAGTCCCATCTAAATACACACCTCCAGTTAAGAACACCATAGGG---/TTATGTTATGTTACATAGTCCCATCTAAATACACACCTCCAGTTAAGAACACCATAGGGGCA GCAAGCAAAG 3070 het 3070 hom 46 32 33 9 N/A 0 0 77478 CASAVA_Build 13 92303571 3I CACATGACAC ---/AGT AGATGGTGAT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 AGT 0 1 77479 CASAVA_Build 13 92304243 3I CCATAGATGA ---/GAT TAGTTGTAGG 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 GAT 0 1 77480 CASAVA_Build 13 92449049 1I AGGAAAAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 18 hom 36 1 26 9 T 9 10 77481 CASAVA_Build 13 92455136 1I CTCGCTAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 71 het 28 0 24 4 T 2 3 77482 CASAVA_Build 13 92460928 1I TAAGCTTTAT -/A AAGTGGACAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 2 3 77483 CASAVA_Build 13 92461469 1I CCACTTTTTT -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 27 het 35 1 27 7 A 6 7 77484 CASAVA_Build 13 92463225 2I GTTGCCAAAA --/CT CTACTAAAAC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CT 1 2 77485 CASAVA_Build 13 92463979 1I AAAATTCCCC -/A AGTAAGACTT 3070 hom 102 het 36 0 34 3 A 1 2 77486 CASAVA_Build 13 92464435 5D AAAGTTCTAG AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 AAATA 4 3 77487 CASAVA_Build 13 92464536 1D ATATTTCCTT A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 106 het 39 0 36 3 A 8 7 77488 CASAVA_Build 13 92464959 2D CACTGGAAAA AG/-- AGTAATCGTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AG 2 1 77489 CASAVA_Build 13 92479083 3I GTAGTTAATA ---/TCT TCTTATTAGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCT 1 2 77490 CASAVA_Build 13 92479311 2D TTGAGTTACT AG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 AG 1 0 77491 CASAVA_Build 13 92482021 10D TATTTTTTTA TTTATTTTAT/---------- TTTATTTTAT 1772 hom 12 het 9 0 5 5 TTTAT 6 4 77492 CASAVA_Build 13 92485950 1D TTTTTCTCAT A/- GGGGGCAGTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 1 0 77493 CASAVA_Build 13 92486072 1D TGTTAGTTTT A/- AAAAGAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 4 77494 CASAVA_Build 13 92486377 1I AAAAGCGTTG -/A GGTTTGAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 77495 CASAVA_Build 13 92492956 2D CAAACGGGAT CA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 13 1 12 0 CA 1 0 77496 CASAVA_Build 13 92496775 1D TTGCAAACAA T/- TTATCACACA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 3 2 77497 CASAVA_Build 13 92502716 1D AGTCAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 28 0 19 9 A 12 11 77498 CASAVA_Build 13 92508480 1D AGACATAAGT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 39 het 36 1 31 4 A 9 8 77499 CASAVA_Build 13 92508885 1I AGACCTTTTA -/C AAGGCTCAGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 77500 CASAVA_Build 13 92527953 2I CCTGATTATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 12 77501 CASAVA_Build 13 92532742 2D51M2D ACACCCACAA ACACACACACACACACACACAGTGTTAGGGTTCTCTAGCAAAACAGAACAGGATG/--ACACACACACACACACACAGTGTTAGGGTTCTCTAGCAAAACAGAACAGGA-- TGTGTGTGTG 3070 hom 19 het 45 1 31 31 N/A 0 0 77502 CASAVA_Build 13 92540226 3I GTTCTGGATA ---/TAT TTAGGAACAA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 TAT 0 1 77503 CASAVA_Build 13 92540584 4I GGGAGTAATA ----/TCAT TCATTCTCTC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 TCAT 1 2 77504 CASAVA_Build 13 92562746 4I TTAGCCACAT ----/TATA TATAGTATAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 TA 2 4 77505 CASAVA_Build 13 92573980 9I GTGGTGCATT ---------/CTCTGCTCA CTGTAACCCC 3070 hom 56 het 21 0 17 4 CTCTGCTCA 0 1 77506 CASAVA_Build 13 92582897 1D ACAGAAATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 10 9 77507 CASAVA_Build 13 92590272 1D CGAAATGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 13 15 18 T 13 12 77508 CASAVA_Build 13 92593871 1D TCTATTTTTA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 7 6 77509 CASAVA_Build 13 92601636 1D AAATCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 39 0 25 15 A 15 14 77510 CASAVA_Build 13 92606627 1I ATGATAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 11 12 77511 CASAVA_Build 13 92608574 4I TGGGTGAGTC ----/AGTG AGTGAGTGGC 3070 hom 78 het 34 0 26 8 AGTG 2 3 77512 CASAVA_Build 13 92610764 1I AAGATTGGCA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 6 7 77513 CASAVA_Build 13 92617577 1I TTGCCCATGA -/T TTTTTCGTCT 3070 hom 72 het 26 0 23 3 T 5 6 77514 CASAVA_Build 13 92630050 4D CTATTATGAT ATAG/---- ATAATCAACT 3070 hom 72 het 29 0 25 6 ATAG 1 0 77515 CASAVA_Build 13 92639193 2D ATACTATTAT AA/-- GTTTAATTTC 3070 hom 57 het 26 0 20 7 A 2 0 77516 CASAVA_Build 13 92641720 2D CCTGGCCAAC AT/-- AGTGAAACCC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AT 1 0 77517 CASAVA_Build 13 92642407 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAATTGTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 5 77518 CASAVA_Build 13 92645867 18I TCATGTAAGC ------------------/CAAGTCCTTATAATCAAA CAATCTTCTA 3070 hom 135 het 45 0 46 4 CAAGTCCTTATAATCAAA 0 1 77519 CASAVA_Build 13 92648795 1I CAACAATACA -/T CCAAAAGATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 77520 CASAVA_Build 13 92651235 1I CCATCCACTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 276 hom 34 1 24 9 A 9 10 77521 CASAVA_Build 13 92651519 4I GGGTAATTAA ----/AATT AATTAATTAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AATT 2 3 77522 CASAVA_Build 13 92652142 2I AAATGAACAC --/AT GTCAAAGATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AT 0 1 77523 CASAVA_Build 13 92653864 1D AAAACTGGTT A/- AAAGTAGAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 4 3 77524 CASAVA_Build 13 92653936 2D TAATATATCC TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 TA 6 5 77525 CASAVA_Build 13 92655505 9D GGAAATGTTG TTGTTGTTA/--------- TTGTTGTTAT 3070 hom 78 het 33 0 27 11 TTGTTGTTA 2 1 77526 CASAVA_Build 13 92656227 1I TTTAGGATTC -/A GACTTTGAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 0 1 77527 CASAVA_Build 13 92663160 5D TCTGAAAATC TAAGA/----- TAAGTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 TAAGA 1 0 77528 CASAVA_Build 13 92664818 4I TCTTTCTCTC ----/TCTT TGTCTCTCTA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 TCTT 0 1 77529 CASAVA_Build 13 92665111 1D TCAAGGCCAA C/- AAAACACATA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 C 1 0 77530 CASAVA_Build 13 92665796 9I GAACTCCTGA ---------/CCTCATGAT CCACCTGCCT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 CCTCATGAT 0 1 77531 CASAVA_Build 13 92669301 3D GTATATTAAT ATC/--- ATCAACCTGG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 ATC 2 1 77532 CASAVA_Build 13 92670128 3D TTTGTTTTCA TCT/--- TCTTATGTTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TCT 2 1 77533 CASAVA_Build 13 92672271 1D CTGCTTTTTA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 7 77534 CASAVA_Build 13 92720507 1I TTTTCTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 13 13 16 A 14 15 77535 CASAVA_Build 13 92743768 3I TTTGTGAAAA ---/TGT TGTAAGATTA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 TGT 1 2 77536 CASAVA_Build 13 92748870 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 12 11 77537 CASAVA_Build 13 92759544 3D TTTTTGTGAT AAG/--- AAATGACTTT 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 AAG 1 0 77538 CASAVA_Build 13 92763546 1D ATGAGGTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 10 9 77539 CASAVA_Build 13 92764967 20D ACAAGGAGGG GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/-------------------- GTGTGTGTGT 2812 het 1586 hom 33 7 12 18 GT 22 12 77540 CASAVA_Build 13 92765404 3D TTTGATTTTT TTA/--- TTAAGATCTA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 TTA 2 1 77541 CASAVA_Build 13 92766014 1I TTTTCTTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 108 hom 20 1 18 1 T 9 10 77542 CASAVA_Build 13 92769830 1I CATTTGAGCA -/T TTAAGGGTGT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 2 3 77543 CASAVA_Build 13 92771206 1I ATGGTTTTTG -/C TTTTTTCTCT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 C 0 1 77544 CASAVA_Build 13 92780097 1D CAACAATAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 10 9 77545 CASAVA_Build 13 92780780 2D ACTCTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 14 12 A 12 10 77546 CASAVA_Build 13 92781887 1D TTTTTTCATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 T 9 8 77547 CASAVA_Build 13 92791950 1D ACTCCGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 T 13 12 77548 CASAVA_Build 13 92804955 2I AAATCCTAAC --/AT GTGTTATATG 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 AT 0 1 77549 CASAVA_Build 13 92807931 1D CCATCTTTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 10 9 77550 CASAVA_Build 13 92809242 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 TG 1 0 77551 CASAVA_Build 13 92829251 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 A 13 14 77552 CASAVA_Build 13 92833987 1D AAACCAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 11 12 T 13 12 77553 CASAVA_Build 13 92836447 3D AAGTTCAGCG AAT/--- AACTGTAGAC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 AAT 1 0 77554 CASAVA_Build 13 92836730 5I TAATAGTGCA -----/GACAC TAACAAGGGT 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 GACAC 0 1 77555 CASAVA_Build 13 92837388 1I GGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 29 2 24 3 T 12 13 77556 CASAVA_Build 13 92839596 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1949 het 1388 hom 12 4 8 0 A 10 11 77557 CASAVA_Build 13 92844123 1D TCAACATTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 10 9 77558 CASAVA_Build 13 92848044 1I TCAAAAGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 9 10 77559 CASAVA_Build 13 92850593 1D GGCACTGGTC A/- AAAAAAAAAA 3036 het 1335 hom 33 6 8 19 A 15 14 77560 CASAVA_Build 13 92850728 1D GGGACAGGGT G/- GGGGGAGGTG 2560 het 2560 ref 29 10 7 13 G 6 5 77561 CASAVA_Build 13 92851781 1I AGGTTGCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 A 11 12 77562 CASAVA_Build 13 92873308 1I GTCACACCCC -/T ACCAGCTCCC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 0 1 77563 CASAVA_Build 13 92878444 2I AATTTAGCAA --/TG AAATAGAAGC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TG 0 1 77564 CASAVA_Build 13 92883221 1I GAAAAAAGAA -/G GAGGGAGAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 1 2 77565 CASAVA_Build 13 92890956 1I TATACACTGA -/T TTTTTTATTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 6 7 77566 CASAVA_Build 13 92894130 2D GAAGATACTT TA/-- TGACATCAGA 3070 hom 150 het 54 0 50 4 TA 1 0 77567 CASAVA_Build 13 92896661 1D TCAGAAATAC T/- GCAATCACAA 3070 het 3070 hom 50 24 24 2 T 1 0 77568 CASAVA_Build 13 92920045 1I TTACACTAGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 T 8 9 77569 CASAVA_Build 13 92920419 1D CCCATAGAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 9 8 77570 CASAVA_Build 13 92921947 1D GAATTTTATG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 T 8 7 77571 CASAVA_Build 13 92925669 1D AGTACCTTAA T/- TTACGTTTCA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 3 2 77572 CASAVA_Build 13 92929863 1D CGTGGTGAGA C/- CCCCCCCCAT 3070 het 15 hom 15 1 8 6 C 9 8 77573 CASAVA_Build 13 92931894 1D TCCAGCTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 116 hom 41 4 22 15 T 10 9 77574 CASAVA_Build 13 92950777 1D TCCAAACTGC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 84 het 31 0 28 4 A 8 7 77575 CASAVA_Build 13 92955687 2I ACACACGTGC --/AT ACACACACAC 2906 het 1312 hom 36 12 15 9 AT 0 1 77576 CASAVA_Build 13 92961297 1D AGATTATTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 9 8 77577 CASAVA_Build 13 92961707 1I CCAATATAAA -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 7 8 77578 CASAVA_Build 13 92967340 2D ATTCATAGAC AA/-- AGAGAGAATT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 3 1 77579 CASAVA_Build 13 92970797 1D AATAGACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 7 A 12 11 77580 CASAVA_Build 13 92971055 5I15M3D TTATAGACAA -----ACTATAGACAAACTATAC/ACTATACTATAGACAAACTA--- TATAGACAAA 3070 het 3070 ref 31 13 8 17 N/A 0 0 77581 CASAVA_Build 13 92973267 2D GAGGGAAAAA AT/-- ATATATATAT 2110 het 1927 hom 18 8 9 1 AT 9 8 77582 CASAVA_Build 13 92973636 2D79M3I TATATGTATG TATGTGTATATATATATCCTCTTTTAAATATTATCCTTACAGTTGGTGTATGACATTTTACACACACACACATACACACAT---/--TGTGTATATATATATCCTCTTTTAAATATTATCCTTACAGTTGGTGTATGACATTTTACACACACACACATACACACATATA ATGACATTTT 3070 het 3070 hom 46 23 23 26 N/A 0 0 77583 CASAVA_Build 13 92973822 1D GCACTTCCTC A/- TTTGCTGCAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 7 A 1 0 77584 CASAVA_Build 13 92989183 1I TACAATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1509 hom 18 5 10 3 T 13 14 77585 CASAVA_Build 13 92994588 1D ATTATAAATG A/- ATTTTAATCA 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 A 2 1 77586 CASAVA_Build 13 92997230 1D AACAAAAAAA T/- ATTAAATATT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 1 0 77587 CASAVA_Build 13 93001563 1D GTTTTCTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 227 hom 34 3 25 6 A 13 12 77588 CASAVA_Build 13 93004164 4I ATGCTGAGGT ----/GGGC GGATCACCTG 3070 hom 48 het 17 0 16 1 GGGC 0 1 77589 CASAVA_Build 13 93016189 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 12 2 7 4 A 12 11 77590 CASAVA_Build 13 93016713 3D GGAATCCCTC CTT/--- CTCTTCAGAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTT 1 0 77591 CASAVA_Build 13 93027746 1D ATAGATAGCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 40 0 32 9 T 9 8 77592 CASAVA_Build 13 93033678 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 9 77593 CASAVA_Build 13 93039528 1D ACATTTTCTC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 64 het 30 0 21 9 A 8 7 77594 CASAVA_Build 13 93041723 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2864 het 567 hom 24 3 14 10 A 17 16 77595 CASAVA_Build 13 93043183 1D CTTTTGGAAA C/- CCTTGATTTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 3 2 77596 CASAVA_Build 13 93058292 1D ACTTGGAGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 209 hom 50 1 42 7 T 9 8 77597 CASAVA_Build 13 93058467 1D CTTCCAGAAC T/- TTTTTTTTTT 1563 het 1563 ref 34 22 4 9 T 12 11 77598 CASAVA_Build 13 93072768 4I ACACACCCAC ----/ACAA ACAGACTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ACAA 0 1 77599 CASAVA_Build 13 93077951 1I GTTTCTATTA -/T TTTTCTCTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 4 5 77600 CASAVA_Build 13 93082800 21I GTATGTTGAG ---------------------/ACTGCAGTGAACTGCAATCCT ACCACTGCAC 2944 hom 18 het 8 0 7 1 ACTGCAGTGAACTGCAATCCT 0 1 77601 CASAVA_Build 13 93085395 1D ATAATACAGC T/- TTTTTTTTTT 2162 het 2162 ref 37 27 5 5 T 12 11 77602 CASAVA_Build 13 93090506 3I CCATATGCAA ---/TAG TAGTATACAC 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 TAG 1 2 77603 CASAVA_Build 13 93091535 3I ACACTTAATG ---/TCC TCCTCTCCTG 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TCC 1 2 77604 CASAVA_Build 13 93095502 1D GAGCCTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 32 2 25 5 T 15 14 77605 CASAVA_Build 13 93097113 1D TCATGACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 285 hom 42 1 34 7 A 12 11 77606 CASAVA_Build 13 93101124 1I CAAAATCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 50 1 42 7 T 10 11 77607 CASAVA_Build 13 93103899 1I CTTAAAAAAA -/T ATATATATTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 0 1 77608 CASAVA_Build 13 93121868 1I TTTTTAGGGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 8 9 77609 CASAVA_Build 13 93122913 2I TATATATGCC --/AT ATATATATAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 AT 5 6 77610 CASAVA_Build 13 93125102 2I CCTAAATGAC --/TT TTGGCTGCTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 2 4 77611 CASAVA_Build 13 93133527 1I ATACAATATC -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 7 8 77612 CASAVA_Build 13 93141734 1I CTTGCCATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 11 12 77613 CASAVA_Build 13 93161840 1I CTTTTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 11 12 77614 CASAVA_Build 13 93163968 1I GCCCATTTGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 8 9 77615 CASAVA_Build 13 93184368 1I TTTTGGGTTG -/A AAAATGAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 4 5 77616 CASAVA_Build 13 93199151 1D GGAACACAAA G/- AAATCTGACT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 G 1 0 77617 CASAVA_Build 13 93221979 1D AGTATAATAA T/- AATAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 1 0 77618 CASAVA_Build 13 93222419 4D CACTGATGAT AAAG/---- AAAAGTAATG 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 AAAG 1 0 77619 CASAVA_Build 13 93226386 1D ACCCAAGTAT C/- CTGTTCACTG 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 C 2 1 77620 CASAVA_Build 13 93266099 1I GCCTGATATT -/A TTTTCCTGTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 0 1 77621 CASAVA_Build 13 93266780 1D CTCTTTATGC T/- TTTTTTTTTT 1194 het 1194 ref 35 26 3 6 T 12 11 77622 CASAVA_Build 13 93323338 1D CTTTAACTAC T/- TTTTTTTTTA 1305 het 1305 ref 42 32 4 6 T 10 9 77623 CASAVA_Build 13 93337015 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 13 12 77624 CASAVA_Build 13 93359973 1D GGATTTTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 24 8 6 A 10 9 77625 CASAVA_Build 13 93377053 1D ACATCAGGTA C/- CCCCTCAACT 3070 hom 126 het 48 0 41 7 C 5 4 77626 CASAVA_Build 13 93411070 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 739 het 517 hom 12 2 4 6 T 15 14 77627 CASAVA_Build 13 93436328 1D CATGAATTGA T/- TCCATTACTC 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 2 1 77628 CASAVA_Build 13 93440953 2D TCTACAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 1725 het 1172 hom 26 9 7 12 T 16 14 77629 CASAVA_Build 13 93467094 1I AACAGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2800 hom 31 8 16 7 T 13 14 77630 CASAVA_Build 13 93485578 1I TTCCAGAAGG -/C CCAGAAACCC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 2 3 77631 CASAVA_Build 13 93487040 4D GCTTGAAGAG ATTA/---- GTTATCTCAT 3070 hom 123 het 45 0 41 5 ATTA 1 0 77632 CASAVA_Build 13 93499504 1I ATCTTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1454 hom 42 6 24 12 A 15 16 77633 CASAVA_Build 13 93527216 2D GGTGCTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 564 hom 44 4 20 20 T 18 16 77634 CASAVA_Build 13 93534842 1D34M4I TATTTGTGAT AAAAAAAAAACTTAATACACAATACATGGAGGCAA----/-AAAAAAAAACTTAATACACAATACATGGAGACAATTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 29 0 28 8 N/A 0 0 77635 CASAVA_Build 13 93536733 1D GTACATGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 39 1 25 13 A 13 12 77636 CASAVA_Build 13 93539003 1D TTCAATATGG T/- TTTAGACTCC 3070 hom 53 het 23 0 17 8 T 4 3 77637 CASAVA_Build 13 93539879 2D TGAAATTGCC AA/-- AAAAAAATGC 3070 hom 96 het 43 0 32 11 A 9 7 77638 CASAVA_Build 13 93540343 2I ATAAAGAAAA --/AG AGGTTTAATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AG 1 2 77639 CASAVA_Build 13 93540938 4D CATTACTTAA TACT/---- TACATCAACT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 TACT 1 0 77640 CASAVA_Build 13 93541597 4D TATTTAACTG AAAC/---- AAACAAAGAA 3070 hom 89 het 36 0 30 7 AAAC 2 1 77641 CASAVA_Build 13 93544326 1I TCGAAATGAA -/T TTGTTTAGCT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 2 3 77642 CASAVA_Build 13 93545083 2D ATAAAGACTC AT/-- AGAATGCTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 AT 1 0 77643 CASAVA_Build 13 93546991 1I ATAGGCAAAC -/A AGAATATTCA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 1 2 77644 CASAVA_Build 13 93551002 1D GGGTGAATTC T/- TTAATTCTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 2 77645 CASAVA_Build 13 93555601 11D ACAATAGAGC AAATAGAGCAA/----------- AATATCCTGT 3070 hom 129 het 44 0 41 6 AAATAGAGCAA 1 0 77646 CASAVA_Build 13 93557833 1D TTTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 26 2 22 2 T 16 15 77647 CASAVA_Build 13 93559110 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 13 6 A 11 10 77648 CASAVA_Build 13 93575977 1D ATTTCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 28 1 20 7 T 13 12 77649 CASAVA_Build 13 93585509 2D GCTAGTATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 34 0 26 8 A 16 14 77650 CASAVA_Build 13 93589334 1D GGAGTTAGCT G/- GGGGAAAAAA 1428 het 1428 ref 46 33 8 5 G 5 4 77651 CASAVA_Build 13 93595817 1I GTTGAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 8 9 77652 CASAVA_Build 13 93604522 4I AGGATTATTT ----/TAAA TAGTGTTGTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TAAA 0 1 77653 CASAVA_Build 13 93605488 1I CATCCCACAA -/C CCTGCTCCTC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 C 2 3 77654 CASAVA_Build 13 93608636 1I ATGATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 33 1 26 6 A 13 14 77655 CASAVA_Build 13 93632457 1I AGGTCTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 T 13 14 77656 CASAVA_Build 13 93642310 1I GATTTTTATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 8 9 77657 CASAVA_Build 13 93660413 1D GTATGTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2096 het 1789 hom 23 11 6 6 T 17 16 77658 CASAVA_Build 13 93666245 12I ATGTTTTTTA ------------/GAATAAACTTTT GACGTTAGTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 GAATAAACTTTT 0 1 77659 CASAVA_Build 13 93668156 1D GGTGTTGTGG A/- GAGTAAAAGA 3070 het 3070 hom 55 17 32 6 A 1 0 77660 CASAVA_Build 13 93675926 2D AAGTATACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2865 hom 25 7 12 6 AT 9 8 77661 CASAVA_Build 13 93703214 2D AATAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 144 hom 31 2 17 12 A 14 12 77662 CASAVA_Build 13 93725006 1D TATCAACATC T/- TTTTTTTTTT 2980 het 2980 ref 35 12 8 15 T 13 12 77663 CASAVA_Build 13 93726730 3I CTCATTTTTA ---/TTT TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 5 8 77664 CASAVA_Build 13 93734712 1I TACATGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 10 11 77665 CASAVA_Build 13 93736810 2D AAGTAACTAG AT/-- ATGTCGGCTG 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 AT 2 1 77666 CASAVA_Build 13 93766206 11I ATGAGATTTT -----------/TTTGCAATTTG TTTTTAGCTC 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 TTTGCAATTTG 0 1 77667 CASAVA_Build 13 93774961 1I GGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 11 12 77668 CASAVA_Build 13 93780529 2I AATTTTTACC --/CT GTTTAAAGTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CT 0 1 77669 CASAVA_Build 13 93785852 4D CACTGTTTTA GAAT/---- GAATATACAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 6 GAAT 2 1 77670 CASAVA_Build 13 93786085 3I AAATCAGCAC ---/CAT CATCTGTTAA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 CAT 1 2 77671 CASAVA_Build 13 93805283 1D GTGGCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 828 hom 34 2 21 11 T 13 12 77672 CASAVA_Build 13 93834810 1I ATATTTTTTT -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 38 10 21 7 A 7 8 77673 CASAVA_Build 13 93835888 2I CCTTTAGTTC --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 17 7 5 T 8 10 77674 CASAVA_Build 13 93836071 6I TAAACTATTT ------/TGTAAG TGTAAGAATC 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 TGTAAG 1 2 77675 CASAVA_Build 13 93841149 1D AAAAAAAAAA T/- AAATGTTAGG 791 het 791 ref 35 15 7 13 T 1 0 77676 CASAVA_Build 13 93851917 2I GTATGTGAAC --/AG GGGTAGTTGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AG 0 1 77677 CASAVA_Build 13 93853797 1I GTTGTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 31 1 21 9 T 10 11 77678 CASAVA_Build 13 93860406 4I ATAAATGACT ----/CCCC GGGGACTCTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 C 0 4 77679 CASAVA_Build 13 93869872 6D GTGATGTGTT TACTAA/------ TACTAACTAT 3070 het 3070 hom 42 16 23 5 TACTAA 2 1 77680 CASAVA_Build 13 93874949 5D ATTATATAAT ATATA/----- ATATAATATA 2561 het 651 hom 9 2 7 1 ATATA 3 2 77681 CASAVA_Build 13 93876002 1I AAAGAAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 10 11 77682 CASAVA_Build 13 93878336 1I AGGGCCTAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 8 9 77683 CASAVA_Build 13 93887308 1D AACTGTGGGG A/- ATATCAAAAG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 2 1 77684 CASAVA_Build 13 93889835 1D ATTTTTTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 77 het 33 0 24 9 T 9 8 77685 CASAVA_Build 13 93915702 1I GATTTTGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 T 10 11 77686 CASAVA_Build 13 93927916 1I AGTTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 11 21 11 A 11 12 77687 CASAVA_Build 13 93933699 1I CGTTTCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 7 13 8 T 12 13 77688 CASAVA_Build 13 93939083 4D CACCATATAT ATAC/---- ATACATATAC 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 ATAC 2 1 77689 CASAVA_Build 13 93939115 10D ATGTACACAT ACATACACAC/---------- ACATACACAC 3070 het 1024 hom 40 8 21 18 ACATACACAC 2 1 77690 CASAVA_Build 13 93940017 4D AATGATTAAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 63 het 32 0 22 13 AC 11 9 77691 CASAVA_Build 13 93941026 1D TTTCATTTCT A/- AAAAGTATTC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 5 4 77692 CASAVA_Build 13 93949721 2I ATGAGAGTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 424 hom 38 2 35 1 GT 8 9 77693 CASAVA_Build 13 93950940 1I ATCTCCTTGC -/T TTTTAAGGAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 4 5 77694 CASAVA_Build 13 93960287 1D ATCTTACTCA T/- TGGCAGCATC 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 T 2 1 77695 CASAVA_Build 13 93960670 1D CTTGCATTGT G/- GTGAGTCCAA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 G 2 1 77696 CASAVA_Build 13 93962977 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 2094 het 2094 ref 30 14 10 7 AC 6 5 77697 CASAVA_Build 13 93964571 1D CCACCAAAAC G/- GGGGTGGGCA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 G 5 4 77698 CASAVA_Build 13 93967062 1D AAATGTAGCC T/- CTCAACCTTG 3070 het 3070 hom 37 17 17 7 T 1 0 77699 CASAVA_Build 13 93975363 1I TGATACCTTC -/T TTTTTTTTTG 2402 het 2402 ref 31 13 12 7 T 9 10 77700 CASAVA_Build 13 93978145 1D AAAAACCTTG A/- AAAAAGGTTA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 A 6 5 77701 CASAVA_Build 13 93991760 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1247 hom 14 3 8 3 A 10 9 77702 CASAVA_Build 13 93995551 2D ATATAAAAAC AG/-- AACTGTGACC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AG 1 0 77703 CASAVA_Build 13 93997379 1I GCTTCTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 10 11 T 11 12 77704 CASAVA_Build 13 94004680 1D GAAGATAATA T/- TAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 T 2 1 77705 CASAVA_Build 13 94010584 3D TGGCAAAAGA TTT/--- TTTTTCTTGC 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 T 8 5 77706 CASAVA_Build 13 94010985 1D TGGTTTGATT A/- GTCCATTAAC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 1 0 77707 CASAVA_Build 13 94017525 1I CTTTCCTTGG -/C GGGGGGGGGG 1421 het 117 hom 31 3 9 19 C 0 1 77708 CASAVA_Build 13 94025140 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 AAG 1 0 77709 CASAVA_Build 13 94028626 15I TCAGTAGGAA ---------------/AGTGGCAAACATATT AGTGACCCCT 3070 hom 99 het 37 0 33 5 AGTGGCAAACATATT 0 1 77710 CASAVA_Build 13 94037429 1I TACATTAGAG -/A AAAACGTGAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 4 5 77711 CASAVA_Build 13 94040284 3D TATTAAGTAA ACT/--- ACTACAGTGT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 ACT 2 1 77712 CASAVA_Build 13 94045139 2D GTTTCCTGTT TA/-- TTACTCTTGC 3070 het 3070 hom 47 19 22 8 TA 1 0 77713 CASAVA_Build 13 94047097 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGTGCCT 3070 hom 35 het 13 0 11 2 C 1 2 77714 CASAVA_Build 13 94048735 1D43M2I AGGAGGAAAT GGGGAGTTTAATTTTTACTTTATATACTTTTGTTTTTTTGAGAC--/-GGGAGTTTAATTTTTACTTTATATACTTTTGTTTTTTTGAGACAG AGTCTCGCTC 3070 het 3070 hom 35 13 18 7 N/A 0 0 77715 CASAVA_Build 13 94050987 1D TCTGGTAGGG A/- AGTAAGGGAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 A 2 1 77716 CASAVA_Build 13 94063133 1D CTGTACTAGC T/- TGTTTGAACA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 2 1 77717 CASAVA_Build 13 94072379 2I ATGATTTGAG --/AA AGAGACCATA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 1 3 77718 CASAVA_Build 13 94074529 1I GCGAACCAGC -/A ATTCTGATCA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 A 1 2 77719 CASAVA_Build 13 94087429 4I TATAAAAAAC ----/TGTT AACGACCCAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TGTT 0 1 77720 CASAVA_Build 13 94095759 1I CATGATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 T 10 11 77721 CASAVA_Build 13 94096752 1I ACCCTGTCTC -/A AAAGGAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 3 4 77722 CASAVA_Build 13 94106141 1I GGCCTGCAGA -/T ATCCCTCTGG 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 T 0 1 77723 CASAVA_Build 13 94124119 1D AAATAGAGGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 A 9 8 77724 CASAVA_Build 13 94125049 1I TTTATATTTC -/A AAAATACCCT 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 4 5 77725 CASAVA_Build 13 94134930 1D CCTGTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 23 1 12 10 A 20 19 77726 CASAVA_Build 13 94140909 1D AGATAGTACG T/- TTTAAAAGCT 3070 het 3070 hom 41 16 20 7 T 4 3 77727 CASAVA_Build 13 94154953 1D CTTCTGTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 A 10 9 77728 CASAVA_Build 13 94155471 4I GGCTTCCGTG ----/CGGC CGGCCCCGAC 3070 het 2518 hom 17 7 10 0 CGGC 1 2 77729 CASAVA_Build 13 94194932 1I GACTTTTTTG -/A AAAAACAATT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 5 6 77730 CASAVA_Build 13 94270782 2I CAGGAAATAG --/TC TCTCTTCTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TC 2 3 77731 CASAVA_Build 13 94271469 1D TAAGAAAAAT G/- TTGTATGGAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 0 77732 CASAVA_Build 13 94290667 1D AAATTTTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 8 T 11 10 77733 CASAVA_Build 13 94318586 1D ACTGCAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2784 hom 41 8 20 13 A 15 14 77734 CASAVA_Build 13 94328351 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1774 hom 20 5 13 2 A 13 14 77735 CASAVA_Build 13 94334200 1D TGATAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 580 hom 37 2 26 9 T 13 12 77736 CASAVA_Build 13 94340029 1D AAGTGATCTA T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 T 7 6 77737 CASAVA_Build 13 94341176 1D TTTCTCAGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 4 T 9 8 77738 CASAVA_Build 13 94343012 1D GTGGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 36 1 24 11 T 13 12 77739 CASAVA_Build 13 94347230 1D TTCACTCAAC A/- TAATGTCCTC 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 A 1 0 77740 CASAVA_Build 13 94348727 1D CTATTTTGCG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 8 7 77741 CASAVA_Build 13 94351153 1I CTGTCTTTTA -/C TAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 C 0 1 77742 CASAVA_Build 13 94352396 1D ACTGTGTGGG A/- AAAGGAGGCT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 4 3 77743 CASAVA_Build 13 94352619 1I CTCTACCAAC -/G GTGGTTTTGG 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 G 1 2 77744 CASAVA_Build 13 94354214 1I AATTTTGCCA -/T TTTTTTCACC 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 6 7 77745 CASAVA_Build 13 94359699 3D AAACATCATG TTA/--- TTAAGAGCAT 3070 het 3070 hom 33 14 17 4 TTA 2 1 77746 CASAVA_Build 13 94359837 1D TCTTTATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 34 3 18 13 T 11 10 77747 CASAVA_Build 13 94360615 2I TGTCTGTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 2772 hom 33 11 15 7 TC 6 7 77748 CASAVA_Build 13 94361631 1I AAAATTTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 8 9 77749 CASAVA_Build 13 94365405 1D CAGGGATGAG T/- AAATGCATTC 3070 het 3070 hom 55 25 27 3 T 1 0 77750 CASAVA_Build 13 94369015 16D CAAGATGGTG AAACCCCGTCTCTCTA/---------------- AAAATACAAA 1894 het 1162 hom 6 3 4 0 AAACCCCGTCTCTCTA 1 0 77751 CASAVA_Build 13 94371478 4D GCTCAAACCA ACAG/---- ACAAACTTGC 3070 het 3070 hom 45 22 22 2 ACAG 1 0 77752 CASAVA_Build 13 94372250 2D TTCCTAGCCC CA/-- GAGTTCAGGC 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 CA 1 0 77753 CASAVA_Build 13 94372621 1I GACATAAAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 7 8 77754 CASAVA_Build 13 94376518 1D GTTTCCCAGA G/- GAAAAACGAG 3070 het 3070 ref 45 25 13 8 G 2 1 77755 CASAVA_Build 13 94386940 1I TGTTGAAATC -/A AGTTTTCTTT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 1 2 77756 CASAVA_Build 13 94393265 1D GCCTTTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 10 9 77757 CASAVA_Build 13 94409764 2I TTTTGTTTTG --/TT TTTTTTTCTG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 7 9 77758 CASAVA_Build 13 94410026 1I TCCTCCTTTT -/C CCCCATTACC 3070 hom 104 het 40 0 34 6 C 4 5 77759 CASAVA_Build 13 94410195 1I TCTCTGCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 9 10 77760 CASAVA_Build 13 94413796 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAATCT 3070 het 343 hom 31 1 25 6 C 1 0 77761 CASAVA_Build 13 94417481 3I ATATGCTGTT ---/ATG ATTTAAAAGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ATG 0 1 77762 CASAVA_Build 13 94422372 3D ACCTCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1879 het 1326 hom 27 7 7 14 A 19 16 77763 CASAVA_Build 13 94425908 24I GTGGGCAGTG ------------------------/ACTGACTAGTAACCAACCATGTTT ACTCAGAGAA 3070 hom 132 het 45 0 45 4 ACTGACTAGTAACCAACCATGTTT 0 1 77764 CASAVA_Build 13 94427036 1D ATTCTGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 12 11 77765 CASAVA_Build 13 94427719 2D TAAAATGGAT GA/-- GAGAACCCTG 3070 het 3070 ref 27 13 9 7 GA 3 2 77766 CASAVA_Build 13 94430460 4D AGTAGTGCTA TTTG/---- TTTGTTTATA 3070 hom 90 het 36 0 31 7 TTTG 2 1 77767 CASAVA_Build 13 94434813 1D GATAAAACAA T/- TGGGAAAAAA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 T 2 1 77768 CASAVA_Build 13 94436547 1I CGAGATGGGG -/C CACTGCACTC 3070 hom 42 het 18 0 14 4 C 1 2 77769 CASAVA_Build 13 94439267 4I TGTATGAACT ----/CTCA CTATTTCTCT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 CTCA 0 1 77770 CASAVA_Build 13 94440581 6D TAAGGACACT TATAAG/------ AGTCATTGGA 3070 hom 105 het 38 0 33 5 TATAAG 1 0 77771 CASAVA_Build 13 94444527 1D AAAAGCACAT G/- GGGGGGCTCA 3070 hom 89 het 34 0 28 6 G 7 6 77772 CASAVA_Build 13 94444769 2I CATGCCATAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 40 4 30 6 A 12 14 77773 CASAVA_Build 13 94445620 3D GACCCTGTCC AAA/--- AAAAAAGAAA 3070 het 362 hom 31 4 18 9 A 9 6 77774 CASAVA_Build 13 94446048 1I ACACACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 A 11 12 77775 CASAVA_Build 13 94446286 5D40M4I TAAGAAATAT TAAGATAAGAAGGCAGTGGACGCCATGTTATCAGGGTGTTAGAAT----/-----TAAGAAGGCAGTGGACGCCATGTTATCAGGGTGTTAGAATGAAG GGAGTGAGGA 3070 het 3070 hom 42 11 27 20 N/A 0 0 77776 CASAVA_Build 13 94448232 2D TTGTCTGATA CT/-- CTCTGGTTGG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CT 3 2 77777 CASAVA_Build 13 94450433 2D TACCTATTCA AT/-- ATGTTTGTGT 3070 het 3070 hom 35 8 24 3 AT 2 1 77778 CASAVA_Build 13 94450624 1I ACCTTTCACT -/A AAAAAAGAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 6 7 77779 CASAVA_Build 13 94451535 1D TTTTCTCCCC T/- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 7 6 77780 CASAVA_Build 13 94458515 2D GCCAAGGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 34 0 15 19 T 15 13 77781 CASAVA_Build 13 94461893 1D CCTATGTGGA C/- CCCCCCCCTG 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 C 9 8 77782 CASAVA_Build 13 94462155 1I AACCCGTGTT -/C CCCCCCCACT 2691 hom 28 het 15 0 9 6 C 7 8 77783 CASAVA_Build 13 94468331 2D CCAACTTTTT AA/-- AAAGTTAACT 3070 hom 63 het 23 0 21 3 A 5 3 77784 CASAVA_Build 13 94471252 1D CATGTATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 T 11 10 77785 CASAVA_Build 13 94476614 1D ACAAACAAAA T/- AACTAAAAGT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 1 0 77786 CASAVA_Build 13 94477144 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 27 0 20 7 A 12 11 77787 CASAVA_Build 13 94501976 1I GGCTGGAGTG -/C CAGTGGCACA 3070 hom 18 het 10 0 7 3 C 1 2 77788 CASAVA_Build 13 94504803 1D TCTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 11 10 77789 CASAVA_Build 13 94507214 1I GTTGAAAACA -/T TTTATTTGTG 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 T 3 4 77790 CASAVA_Build 13 94507502 1D GAATTCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 12 11 77791 CASAVA_Build 13 94509897 1I ATTGTGCACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 9 10 77792 CASAVA_Build 13 94511925 1I ATAGAGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1688 hom 25 6 12 7 A 14 15 77793 CASAVA_Build 13 94513150 4D TTAAAAAAAA AAAG/---- AAAAAAATCA 3070 hom 60 het 30 0 27 6 AAAG 1 0 77794 CASAVA_Build 13 94518787 1D GGCTGAGGCA G/- GAGAATCGCT 3070 het 2359 hom 27 8 12 8 G 2 1 77795 CASAVA_Build 13 94521336 2I CCTGCACAAA --/CT CTCTCTTTGC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 CT 3 4 77796 CASAVA_Build 13 94528681 6D AAAACAAAAA CAAAAG/------ CAAGAAAACA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 CAAAAG 1 0 77797 CASAVA_Build 13 94530645 5D TGTTTTTGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 66 het 34 0 23 11 TTTTG 5 4 77798 CASAVA_Build 13 94535535 1D CTCTACTGAG A/- AAAAAAAAAA 1828 het 303 hom 13 1 8 4 A 12 11 77799 CASAVA_Build 13 94536264 1I ACGATTCATA -/T TTTTTAAAGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 5 6 77800 CASAVA_Build 13 94545089 1I AAGAAAAAAA -/C AATCTCATCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 0 1 77801 CASAVA_Build 13 94547471 5I TGTGATAGAA -----/AAAAT AAAATAAGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AAAAT 1 2 77802 CASAVA_Build 13 94557029 4I GAAATCATGG ----/CTAT CTGTTTGGGA 3070 hom 100 het 42 0 34 8 CTAT 0 1 77803 CASAVA_Build 13 94563835 12D AAAAAAAAAA AAAAAATTACAT/------------ TTAGATTTTT 3070 het 1300 hom 31 7 12 13 AAAAAATTACAT 1 0 77804 CASAVA_Build 13 94565529 1I GGATTGTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 28 0 20 8 T 12 13 77805 CASAVA_Build 13 94568511 1D AAAGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 20 11 T 15 14 77806 CASAVA_Build 13 94573083 1I AACCCTCCGC -/A AGCTAGGGAA 3070 hom 92 het 36 0 29 7 A 1 2 77807 CASAVA_Build 13 94621651 1D TGGGAGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 29 0 21 9 A 12 11 77808 CASAVA_Build 13 94632600 2D ATTCCATGCC TT/-- TTTGGATACA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 T 5 3 77809 CASAVA_Build 13 94634237 3D TTCGACTTCT CCA/--- CCACCGGAGG 3070 hom 86 het 31 0 28 4 CCA 2 1 77810 CASAVA_Build 13 94640295 1D TGCTAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 39 1 36 2 A 12 11 77811 CASAVA_Build 13 94646467 1D AAATTTTGTA G/- ATGTGGCAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 1 0 77812 CASAVA_Build 13 94657282 2D TCCAAAAGCC AA/-- AAAAAAAATA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 10 8 77813 CASAVA_Build 13 94659309 2I ATATATACAC --/AT GTGAAAACAG 3070 hom 84 het 36 0 28 8 AT 0 1 77814 CASAVA_Build 13 94660862 4D AGTGTGAACA GAGT/---- GAGCCCCTGC 3070 hom 91 het 34 0 28 9 GAGT 1 0 77815 CASAVA_Build 13 94663382 1I ATTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 24 1 21 2 A 13 14 77816 CASAVA_Build 13 94663884 1I AATCTCCACT -/G GGGCCTCAGG 3070 hom 74 het 30 0 25 5 G 3 4 77817 CASAVA_Build 13 94670115 1I TTCTTTCTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 10 77818 CASAVA_Build 13 94670441 5D TTCTAAAAGA ATATT/----- ATAAGAAACA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 ATATT 1 0 77819 CASAVA_Build 13 94670793 1I GTGCAGCAGG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 9 77820 CASAVA_Build 13 94671912 2D GAAATATGTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 16 0 16 2 A 11 9 77821 CASAVA_Build 13 94673674 2I TATAAATGTA --/CT CAATGGGTTA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 CT 0 1 77822 CASAVA_Build 13 94674992 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 11 10 77823 CASAVA_Build 13 94676396 15D CCAACAGGGC AATTACTTCATCTGG/--------------- AATTACTTCA 3070 hom 38 het 22 0 13 11 AATTACTTCATCTGG 2 1 77824 CASAVA_Build 13 94677663 1D CTGTGGGGGA G/- AAAAGTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 G 1 0 77825 CASAVA_Build 13 94685986 1D AACCAGACTT G/- GGAGGATTCC 3070 hom 78 het 32 0 24 8 G 3 2 77826 CASAVA_Build 13 94689420 1D TGTAAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 8 A 14 13 77827 CASAVA_Build 13 94698762 1I TCTTTTTACT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 73 het 32 0 25 7 A 9 10 77828 CASAVA_Build 13 94705063 1I TATATTTCAC -/T TTTTTTGAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 6 7 77829 CASAVA_Build 13 94707918 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 11 10 77830 CASAVA_Build 13 94725868 1D TCTTGGCGGT G/- ACTCTAGAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 1 0 77831 CASAVA_Build 13 94738324 1I ATAAATAAAT -/A ATTTTATAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 1 2 77832 CASAVA_Build 13 94746586 1D AAGAAAAATA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 8 7 77833 CASAVA_Build 13 94748246 1I CTCAGACTTT -/A AAAATCCCTC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 4 5 77834 CASAVA_Build 13 94753550 1I CTACCAAAAG -/T TTTTAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 4 5 77835 CASAVA_Build 13 94759763 1D TCTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 49 0 40 9 A 11 10 77836 CASAVA_Build 13 94760321 1I ATGTTCTGGA -/G GGGCAAAGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 3 4 77837 CASAVA_Build 13 94760637 2I CTCTCAATAC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 9 11 77838 CASAVA_Build 13 94761058 1D GTTAAGTCCA T/- TTTTTTCATG 2205 hom 27 het 16 0 10 6 T 7 6 77839 CASAVA_Build 13 94764100 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 20 2 14 4 A 13 12 77840 CASAVA_Build 13 94764278 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 44 het 22 0 15 7 A 10 9 77841 CASAVA_Build 13 94764537 3D43M1I TCAGACCAAA TATTATATCATAGAAAGGAAATGTATAAATGTATGGCAAAATATGA-/---TATATCATAGAAAGGAAATGTATAAATGTATGGCAAAATATGAT TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 17 0 17 17 N/A 0 0 77842 CASAVA_Build 13 94765417 4D AACGAAATAA AAAT/---- AAATAAAGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AAAT 2 1 77843 CASAVA_Build 13 94770848 1I GGAGGCCAAG -/C GGGGCAGATC 3070 hom 54 het 19 0 19 5 C 0 1 77844 CASAVA_Build 13 94776116 2D TCTCTTTCTT TC/-- TCTCTTTTTT 1990 het 1252 hom 13 5 6 3 TC 3 2 77845 CASAVA_Build 13 94777279 1D TCTTCTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3019 hom 34 11 17 7 T 11 10 77846 CASAVA_Build 13 94777527 1I CTTGATTGAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 32 0 26 6 A 8 9 77847 CASAVA_Build 13 94782470 1D ACTGAAAATA C/- AAAAATTAGC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 1 0 77848 CASAVA_Build 13 94783144 4D CTGGAGTACC CTAA/---- CTAATATATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 CTAA 2 1 77849 CASAVA_Build 13 94783993 2D GATTTTTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 1576 het 1026 hom 13 4 8 1 T 14 12 77850 CASAVA_Build 13 94785868 1D CGCCCGGCTA T/- TTTTTTTTTG 2775 het 1387 hom 11 4 7 0 T 10 9 77851 CASAVA_Build 13 94786344 1D CCTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 34 0 14 20 T 12 11 77852 CASAVA_Build 13 94788496 2D ACCCCATCTC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 14 9 6 A 10 8 77853 CASAVA_Build 13 94792594 1I TTGCATCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 21 1 20 0 T 10 11 77854 CASAVA_Build 13 94795998 2I TGTTTGAGAC --/AG AGTCTCAGGC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 AG 1 2 77855 CASAVA_Build 13 94796584 1I AGCATTTTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 7 8 77856 CASAVA_Build 13 94798633 1I ACGCCCAACA -/T TTTTTGTTGT 1966 het 1966 ref 17 8 8 1 T 5 6 77857 CASAVA_Build 13 94799513 1I AATTTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 2259 het 2259 ref 24 15 8 1 T 10 11 77858 CASAVA_Build 13 94811164 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 664 hom 21 2 15 4 T 10 11 77859 CASAVA_Build 13 94816074 1I AGGGGACTTC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 849 hom 18 4 10 4 T 7 8 77860 CASAVA_Build 13 94822068 6D CTCCTGTTCT TTCTTA/------ TTCTTTTTCT 3070 hom 64 het 26 0 21 5 TTCTTA 1 0 77861 CASAVA_Build 13 94824658 2D GCTAATTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 323 hom 26 2 12 12 T 17 15 77862 CASAVA_Build 13 94825794 1I CCCCAAATGC -/A AAAGAAATCC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 3 4 77863 CASAVA_Build 13 94826420 1I ATTAGCAAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 8 9 77864 CASAVA_Build 13 94830006 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 8 9 77865 CASAVA_Build 13 94833970 1D CTCTAGCATG T/- TGGGGCTGGA 3070 het 3070 ref 53 25 23 6 T 2 1 77866 CASAVA_Build 13 94836370 11I ATTTCATCCC -----------/CAACCAATCAT CAACCAATCA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 CAACCAATCAT 1 2 77867 CASAVA_Build 13 94848057 6D TAATCTCAGC ACTTTG/------ GGAGGCTGAG 3070 hom 45 het 17 0 14 3 ACTTTG 1 0 77868 CASAVA_Build 13 94849275 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 25 2 16 7 A 15 16 77869 CASAVA_Build 13 94852403 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 6 7 77870 CASAVA_Build 13 94854939 1D ATGCCAAAAG A/- AAGGCAGAGG 2786 het 2786 ref 33 21 7 5 A 3 2 77871 CASAVA_Build 13 94862356 1D CATAGTGAGA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 9 8 77872 CASAVA_Build 13 94868620 2I AGATTCACAG --/AT ATATATATGA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 AT 4 5 77873 CASAVA_Build 13 94869451 1I GATAGAGATC -/A GGGGTGCTGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 77874 CASAVA_Build 13 94871600 1D CTTTAAACTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 T 9 8 77875 CASAVA_Build 13 94899160 1I ACGCCCAGCT -/A ATTTTTGTAT 2487 het 2487 ref 20 9 7 4 A 1 2 77876 CASAVA_Build 13 94907754 12D TCTGTTTGAC CTTGTACTTGGT/------------ GAATCACATA 3070 het 3070 ref 45 29 20 4 CTTGTACTTGGT 1 0 77877 CASAVA_Build 13 94914995 1D GTGTTTTTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 10 9 77878 CASAVA_Build 13 94917785 2I TGTTTTTTTT --/TG GGGGGGGGCA 2821 het 2821 ref 40 17 11 12 TG 0 1 77879 CASAVA_Build 13 94925409 8D CCCACAACTC GGATCAGA/-------- GGATCAGACG 3070 het 3070 ref 43 17 17 11 GGATCAGA 2 1 77880 CASAVA_Build 13 94927884 4I AATGCAAAAC ----/AGCT AGAGAACAAC 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 AGCT 0 1 77881 CASAVA_Build 13 94930320 1D TGGTGGAAGG T/- GAAGGAGGAA 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 T 1 0 77882 CASAVA_Build 13 94933613 1I TCATCTCTAA -/T TTTTTTTTCT 2659 het 2659 ref 27 11 11 5 T 8 9 77883 CASAVA_Build 13 94935407 1D AACCACCAGG A/- AGCTGTGGGA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 2 1 77884 CASAVA_Build 13 94939347 1I GCTGGGATTC -/A AGGCACTCAC 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 1 2 77885 CASAVA_Build 13 94950449 5D CTAGAGTCTA CATTC/----- CATTCTATTG 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 CATTC 2 1 77886 CASAVA_Build 13 94961883 1I TTCTCTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 23 15 12 T 11 12 77887 CASAVA_Build 13 94963833 1D AAAATAGAGC A/- TTTTCCCCTG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 1 0 77888 CASAVA_Build 13 94966796 3I ATCCAAGAGG ---/ATA ATGTTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 ATA 0 1 77889 CASAVA_Build 13 94969956 1I AGCTGCCACA -/G GGGCAAGTCT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 G 3 4 77890 CASAVA_Build 13 94973848 1D GTCTGCAAAT A/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 A 1 0 77891 CASAVA_Build 13 94974350 1I TTTGACTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 878 hom 33 7 18 8 T 15 16 77892 CASAVA_Build 13 94977043 8D ATTCCATCTC AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 3070 het 23 hom 11 1 10 3 AAAT 8 6 77893 CASAVA_Build 13 94979640 1D AATAAACACA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 T 8 7 77894 CASAVA_Build 13 94986439 1I CCTAAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 283 hom 40 2 32 6 A 12 13 77895 CASAVA_Build 13 94987057 1D ATGCCTTTTT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 101 het 37 0 34 3 A 8 7 77896 CASAVA_Build 13 94993497 1D AAAAAATAAA T/- AAATAAAATC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 1 0 77897 CASAVA_Build 13 95011305 1D ATCAGTTTGC T/- TGTTGGTGTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 8 T 2 1 77898 CASAVA_Build 13 95019469 1I ATGTTGGAGA -/C CCTAGTAGAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 C 2 3 77899 CASAVA_Build 13 95021325 4D TCTGCTTCCC TAAT/---- TAGTTAATGA 3070 het 3070 ref 20 9 10 3 TAAT 1 0 77900 CASAVA_Build 13 95023816 4D GAAAGATTTC CAGA/---- CAGAGACTAA 3070 het 3070 hom 27 12 15 2 CAGA 2 1 77901 CASAVA_Build 13 95033518 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2772 het 2000 hom 23 10 10 3 A 15 14 77902 CASAVA_Build 13 95045136 1D TTCCCCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 29 3 A 11 10 77903 CASAVA_Build 13 95045630 1D CATTAAATAG A/- AGAACAAAAT 2826 het 2826 ref 21 14 7 0 A 2 1 77904 CASAVA_Build 13 95047555 1I TGAAGTTCTA -/G TTTTGAAAGT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 G 0 1 77905 CASAVA_Build 13 95057298 5D TCAGCTACTT TTTTA/----- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 11 2 TTTTA 2 1 77906 CASAVA_Build 13 95063767 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2482 het 2482 ref 34 16 8 10 A 12 11 77907 CASAVA_Build 13 95067462 1I GTCTCACCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1904 hom 25 7 12 6 A 10 11 77908 CASAVA_Build 13 95069331 2D ATTGCAGTTC TG/-- TGATACAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 TG 2 1 77909 CASAVA_Build 13 95074284 3I TCATGGGCCA ---/TAG TTCGCCAAAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TAG 0 1 77910 CASAVA_Build 13 95084686 7D CTCCAGGTTT TAGAATA/------- TAGATTTCTG 3070 hom 87 het 34 0 29 9 TAGAATA 1 0 77911 CASAVA_Build 13 95089937 1I CCAAAAAAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 9 77912 CASAVA_Build 13 95090254 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 1985 het 203 hom 9 1 6 2 T 13 12 77913 CASAVA_Build 13 95097262 1I CTTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 18 4 A 10 11 77914 CASAVA_Build 13 95113486 1D CATCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1113 hom 21 8 9 4 A 16 15 77915 CASAVA_Build 13 95125919 1I AACAGAAGCC -/A AAAAAAAAAA 1989 het 1989 ref 34 10 11 13 A 13 14 77916 CASAVA_Build 13 95160489 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2706 het 1953 hom 32 9 13 10 T 15 14 77917 CASAVA_Build 13 95179437 2D ATTCACTCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 2550 hom 33 10 15 8 TC 10 9 77918 CASAVA_Build 13 95182820 1D CCTTTTCTCG T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 T 7 6 77919 CASAVA_Build 13 95212027 1D TGGGATTGGC T/- TTTTTTTTTT 1198 het 1198 ref 44 33 4 7 T 13 12 77920 CASAVA_Build 13 95240035 1D TATAAGCGTT C/- CTTTTTCACC 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 C 2 1 77921 CASAVA_Build 13 95241581 3D ACGTATTCTG TAT/--- TATTTTTCTA 3070 het 3070 ref 46 26 18 3 TAT 2 1 77922 CASAVA_Build 13 95269770 4I TACATATGTA ----/TGTG TGTATGTAAT 1286 het 1286 ref 33 20 5 8 TG 1 3 77923 CASAVA_Build 13 95270409 4I CTGTCTCAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 AAAT 3 4 77924 CASAVA_Build 13 95277060 1D TCCCACACAG C/- CCCCCAAGAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 C 6 5 77925 CASAVA_Build 13 95284473 2D ACATTGGGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 38 0 30 9 TG 9 8 77926 CASAVA_Build 13 95287097 1I TGATAAATCA -/T AGCCATGAAT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 0 1 77927 CASAVA_Build 13 95288171 1D TTTTAAGGTT C/- TTCTCTCAAC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 C 1 0 77928 CASAVA_Build 13 95295427 2I TATAAGATCC --/TT TTTCTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 3 5 77929 CASAVA_Build 13 95295634 7I GGTGATGACT -------/CTTAATG GGTATGCTGC 1934 hom 12 het 8 0 5 4 CTTAATG 0 1 77930 CASAVA_Build 13 95297313 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 18 3 9 6 TTTC 1 0 77931 CASAVA_Build 13 95297401 1I AAAAATTTTA -/T TTTTTTAGAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 6 7 77932 CASAVA_Build 13 95302166 1D TAAAAATACA T/- TGGTAAAATT 3070 het 3070 hom 49 20 24 6 T 2 1 77933 CASAVA_Build 13 95318665 2I AGCCTGGGCA --/AC ACAGTGAGAC 2246 het 1866 hom 16 6 5 5 AC 1 2 77934 CASAVA_Build 13 95322229 1I CTTCCTCCTA -/T CAAAAACATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 77935 CASAVA_Build 13 95326324 1I AATAATTGTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 7 8 77936 CASAVA_Build 13 95327378 4D GCCTTGTGAT CTGC/---- CTGCCTCGGC 2737 het 2737 ref 17 10 7 1 CTGC 2 1 77937 CASAVA_Build 13 95331814 2I GCAATCAAAC --/AG AAATTCTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 AG 0 1 77938 CASAVA_Build 13 95339428 22D AGGGATTTTG CATACTAAAAAGCATCATACTA/---------------------- GCTCCACTCC 1747 het 1747 ref 28 21 6 8 CATACTAAAAAGCATCATACTA 1 0 77939 CASAVA_Build 13 95343836 2D ATTCAATAAC AG/-- AGTGTGACTT 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 AG 2 1 77940 CASAVA_Build 13 95344009 1I TTCAGTAGTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 T 7 8 77941 CASAVA_Build 13 95353869 3D TTCCCCACTC AAT/--- AATGTGAGAT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 AAT 2 1 77942 CASAVA_Build 13 95357718 7I CTCAAGTGGG -------/TCCCTGA TCCCCATGTA 3070 hom 68 het 25 0 21 4 TCCCTGA 0 1 77943 CASAVA_Build 13 95365056 1D AGACTCTTTC A/- AAAAAACAAA 3070 het 2252 hom 22 7 13 2 A 7 6 77944 CASAVA_Build 13 95365182 5D CATCACACAC TAATT/----- TAAATGATGT 3070 het 3070 ref 36 17 17 5 TAATT 1 0 77945 CASAVA_Build 13 95371605 1I CTTAAAGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 24 3 17 4 A 15 16 77946 CASAVA_Build 13 95372702 1D CATGTACCCC T/- GGAATCAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 1 0 77947 CASAVA_Build 13 95372905 2I GGCAAAACCC --/CT GTCTCTACAA 3070 het 2138 hom 24 8 11 5 CT 0 1 77948 CASAVA_Build 13 95380682 3D TTAATCCATC TTG/--- TTAAGTTTTG 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 TTG 1 0 77949 CASAVA_Build 13 95383934 4D TCTAAATTTT TTTG/---- TTTTTGTTTT 2385 het 2385 ref 25 18 5 2 TTTG 1 0 77950 CASAVA_Build 13 95389229 1I TGCTCTTTAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 A 8 9 77951 CASAVA_Build 13 95392387 1D ATATTTGTGT C/- ATTTTTATCA 3070 het 3070 ref 46 26 16 5 C 1 0 77952 CASAVA_Build 13 95396011 1D AGTAAGTTAG T/- AAAACAAATA 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 T 1 0 77953 CASAVA_Build 13 95397960 7D TGATTCGGCC TCCCAAA/------- TCCCAAAGTG 3070 hom 27 het 10 0 10 1 TCCCAAA 2 1 77954 CASAVA_Build 13 95400325 3D GTCCTGGAGA AAT/--- ACTGAGTTGG 3070 het 3070 hom 40 16 18 10 AAT 1 0 77955 CASAVA_Build 13 95400851 1I ATGAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 33 0 22 11 A 12 13 77956 CASAVA_Build 13 95402311 3I AGACTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 2524 het 2524 ref 23 13 7 3 A 11 14 77957 CASAVA_Build 13 95436392 10D TTACAGTGCA TACACACATG/---------- TATGCACAAG 2677 het 2677 ref 23 12 8 6 TACACACATG 1 0 77958 CASAVA_Build 13 95450020 1D AAAGTAGTGG C/- AAAGGAGACA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 C 1 0 77959 CASAVA_Build 13 95451119 1D TCAACAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 9 A 11 10 77960 CASAVA_Build 13 95454432 1D CAACTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 14 13 77961 CASAVA_Build 13 95460090 1D AGTGAGCAAA G/- GACATGAACA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 G 2 1 77962 CASAVA_Build 13 95463250 3I TGTATATATT ---/ATC AGTATGTTGA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 ATC 0 1 77963 CASAVA_Build 13 95468995 1D GTTATAATTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 16 15 5 A 10 9 77964 CASAVA_Build 13 95489003 1I TCTAGCCCCC -/A AAAGCCCCCA 3070 het 90 hom 40 1 35 4 A 3 4 77965 CASAVA_Build 13 95489493 1I AGTAGCTCTA -/T TAGTCCATTT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 1 2 77966 CASAVA_Build 13 95511299 1I ATTGGTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2456 hom 20 6 10 4 T 11 12 77967 CASAVA_Build 13 95518491 7D ATAATGACCA TTAGATC/------- TTAGATCTTA 3070 hom 96 het 33 0 32 2 TTAGATC 2 1 77968 CASAVA_Build 13 95528050 1I CAATTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 11 12 77969 CASAVA_Build 13 95532834 1D CCACCTAGGA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 60 het 36 0 29 7 T 8 7 77970 CASAVA_Build 13 95542931 1I AGATAGCTTT -/A TGCATTTGAC 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 A 0 1 77971 CASAVA_Build 13 95543821 1I TCTGGTTTCC -/T TTTCTTTCTA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 3 4 77972 CASAVA_Build 13 95548922 5I AAAAATAAAT -----/AAATA AAATAAAATA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 AAATA 2 3 77973 CASAVA_Build 13 95554209 2D GTTTGAGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 40 1 32 7 T 19 17 77974 CASAVA_Build 13 95570110 1I TCACAGACTA -/T TTGCAGCATT 3070 hom 65 het 30 0 20 10 T 2 3 77975 CASAVA_Build 13 95581121 3D ATTTTCAACC TCT/--- TCTTCTCTGA 3070 hom 120 het 43 0 40 7 TCT 3 2 77976 CASAVA_Build 13 95582001 1I TATTCTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 21 6 T 12 13 77977 CASAVA_Build 13 95601661 2D TCCATCTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 19 13 A 16 14 77978 CASAVA_Build 13 95605599 1I ATAAAATAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 8 9 77979 CASAVA_Build 13 95605845 1D AGGTTAAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 9 8 77980 CASAVA_Build 13 95618948 1I GAGTGAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 481 hom 26 2 14 10 A 15 16 77981 CASAVA_Build 13 95619515 1I CAGTGTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 624 hom 42 2 33 7 T 10 11 77982 CASAVA_Build 13 95625614 1D TTTGTAACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 8 13 9 T 10 9 77983 CASAVA_Build 13 95628034 4D TAAAAGTTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 51 het 22 0 18 6 AAAT 4 3 77984 CASAVA_Build 13 95630048 5D CCTTTCATAT CTTTA/----- CTTATGTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 CTTTA 1 0 77985 CASAVA_Build 13 95630801 1I ACTTTTCAGC -/T GTTTTTAATG 3070 hom 33 het 18 0 12 6 T 0 1 77986 CASAVA_Build 13 95631018 1D TCTGAGGCTT A/- AAGCCATTAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 3 2 77987 CASAVA_Build 13 95638695 1D CATCGTGAGA C/- CCCCCCATCG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 7 6 77988 CASAVA_Build 13 95642857 2D CATGGGATGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 44 het 19 0 14 6 AT 10 9 77989 CASAVA_Build 13 95644595 1D CTGAATTTTT A/- AACATAATCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 3 2 77990 CASAVA_Build 13 95655357 5D ACTAATAAAG AAGAA/----- AAGAAGAATC 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 AAGAA 2 1 77991 CASAVA_Build 13 95691397 2I GTCCTTTCTG --/TT TTTTTTTTTT 1724 het 63 hom 31 1 6 24 T 10 12 77992 CASAVA_Build 13 95692042 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1355 hom 28 7 10 11 T 17 16 77993 CASAVA_Build 13 95713469 3I GTGACATGTC ---/ACT ACTTATCTTT 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 ACT 1 2 77994 CASAVA_Build 13 95715439 1D ATGCACACAC T/- TTTTTTTTTC 1277 het 1277 ref 39 30 3 6 T 10 9 77995 CASAVA_Build 13 95720869 7I AATGCTGAGG -------/GTATATA GTATATAAAG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 GTATATA 1 2 77996 CASAVA_Build 13 95742869 4I CTAAATAAAC ----/AGTT AGTAGGTTGA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 AGTT 0 1 77997 CASAVA_Build 13 95762208 1D ATTAAGTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 10 9 77998 CASAVA_Build 13 95765936 1D AAAAATGCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 9 8 77999 CASAVA_Build 13 95768921 1I TCATTACTTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 T 8 9 78000 CASAVA_Build 13 95771342 1D ATCAGCAGCC T/- TTTTTTTTTA 840 het 840 ref 36 20 3 13 T 10 9 78001 CASAVA_Build 13 95776423 1D TCATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 22 2 15 5 T 11 10 78002 CASAVA_Build 13 95776436 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 9 8 78003 CASAVA_Build 13 95794514 1I TGTCTAATTA -/T TTCAATAATC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 2 3 78004 CASAVA_Build 13 95801576 1D GGTGGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 24 1 14 10 T 15 14 78005 CASAVA_Build 13 95806153 1I GCTACTTCAT -/C AACTAAGTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 0 1 78006 CASAVA_Build 13 95810569 1D AGCTACTGAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 37 0 29 9 A 9 8 78007 CASAVA_Build 13 95812546 1I TTTTAAAATT -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 7 8 78008 CASAVA_Build 13 95825547 4D CTCTGAATAT TTTC/---- TTTATAGCCT 3070 het 3070 ref 32 19 9 5 TTTC 1 0 78009 CASAVA_Build 13 95833975 1I CCCTCAAAGT -/G GGGGGGGACA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 G 7 8 78010 CASAVA_Build 13 95848110 7I ACAACAACCT -------/TATGAGG TATCTAGACC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TATGAGG 0 1 78011 CASAVA_Build 13 95851589 1I TTAATACACA -/T TTATTTGTTT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 2 3 78012 CASAVA_Build 13 95854827 1I ATAGAAGACA -/T TTTTGTAGAG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 4 5 78013 CASAVA_Build 13 95857167 1D TTATTAAACA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 108 het 44 0 36 8 T 8 7 78014 CASAVA_Build 13 95878296 4D TAATTAATAA TAGT/---- TAGGGATATG 3070 het 3070 ref 31 19 11 3 TAGT 1 0 78015 CASAVA_Build 13 95886059 1D TTATCACTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 10 9 78016 CASAVA_Build 13 95887222 1D AGGGCCTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 43 hom 22 1 16 5 T 10 9 78017 CASAVA_Build 13 95889338 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 9 8 78018 CASAVA_Build 13 95890907 1D GAGAAGGGGA G/- GGGGGCTATG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 6 5 78019 CASAVA_Build 13 95896428 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 528 het 528 ref 16 8 3 5 A 15 16 78020 CASAVA_Build 13 95898816 1D ATAAATACTC A/- AAATAATGGT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 4 3 78021 CASAVA_Build 13 95902809 1D AGCTTTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 10 9 78022 CASAVA_Build 13 95905130 1D ATTGAACTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 774 hom 27 2 19 7 A 13 12 78023 CASAVA_Build 13 95907627 1D AACTCTCAAC T/- TCTAGCTTCT 3070 hom 163 het 58 0 55 3 T 2 1 78024 CASAVA_Build 13 95915203 22D AAGATGCTTC GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/---------------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 58 het 27 0 17 15 GT 20 9 78025 CASAVA_Build 13 95916214 1D CATTTTTTTA T/- TTGTGTGTGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 3 2 78026 CASAVA_Build 13 95916549 1D AGAAAAAAAA C/- ATCTACTATC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 1 0 78027 CASAVA_Build 13 95917027 1I TATATGCAAT -/C TCTATGTCAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 0 1 78028 CASAVA_Build 13 95967474 1D GTTCCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 30 1 20 9 A 13 12 78029 CASAVA_Build 13 95970591 1I TTGGCTATGC -/G GGGCTCTGTT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 G 3 4 78030 CASAVA_Build 13 95977341 1D ATTGGTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 25 8 T 11 10 78031 CASAVA_Build 13 95980430 3I TATGATGGAC ---/TTG TTGTTTTTGT 3070 hom 122 het 45 0 41 4 TTG 1 2 78032 CASAVA_Build 13 96022861 1D TATTGTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 35 1 24 11 T 13 12 78033 CASAVA_Build 13 96072266 1I CAAAGGGTGT -/A AACATCAATT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 2 3 78034 CASAVA_Build 13 96072872 1D CAATTACTAT A/- AAATATCTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 4 3 78035 CASAVA_Build 13 96082567 1I AATTTCTGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 9 10 78036 CASAVA_Build 13 96085143 16I AGTTTGAGTC ----------------/TTGTTGGACTTGTTGA ATTAGGTTTA 3070 hom 135 het 46 0 44 3 TTGTTGGACTTGTTGA 0 1 78037 CASAVA_Build 13 96091632 1I TAAATACTGA -/T TTTTTTATAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 6 7 78038 CASAVA_Build 13 96137346 3D CAAGAAGTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 30 1 22 7 T 15 12 78039 CASAVA_Build 13 96140059 15I GATGTTTGTC ---------------/AAGAAATAGAATTTT AACTTCGGAG 3070 hom 33 het 17 0 11 6 AAGAAATAGAATTTT 0 1 78040 CASAVA_Build 13 96141087 2I TGAATATGAC --/TT TTATTCTTCT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 2 4 78041 CASAVA_Build 13 96141879 5D CCTTACTTTT CTTCC/----- CTTCCCTTCC 3070 hom 60 het 29 0 21 11 CTTCC 5 4 78042 CASAVA_Build 13 96183075 12I TTGTGACTTC ------------/TCCAATTTCTTT CATCAACGTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 TCCAATTTCTTT 0 1 78043 CASAVA_Build 13 96184904 2I GATTATAAAT --/TA TGAGTCTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 TA 0 1 78044 CASAVA_Build 13 96185138 1I CTAATGGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 20 22 10 T 10 11 78045 CASAVA_Build 13 96199893 1I TATTGCCTTG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 7 8 78046 CASAVA_Build 13 96230025 1I ATATTTACTT -/A AAAAAAAAAA 1085 het 1085 ref 41 22 3 16 A 17 18 78047 CASAVA_Build 13 96235654 1D TCAGATCAGT C/- AAAATCACAC 3070 het 3070 ref 49 27 16 6 C 1 0 78048 CASAVA_Build 13 96236575 1I CCCTGTTCAG -/T TTCTTGGTAG 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 T 2 3 78049 CASAVA_Build 13 96237129 1I CATGCTACCC -/T TTTTTAATCA 3070 hom 132 het 47 0 44 3 T 5 6 78050 CASAVA_Build 13 96240014 1I CTGTGGTTTA -/T GATTTAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 0 1 78051 CASAVA_Build 13 96254403 1D CTGTTTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 8 12 A 13 12 78052 CASAVA_Build 13 96262322 2D TCACCTTTGA CT/-- CTGACATTCT 3070 het 3070 ref 38 22 10 10 CT 2 1 78053 CASAVA_Build 13 96267351 4I CCTCCAGAAC ----/TAAT TAATGGCTGT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 TAAT 1 2 78054 CASAVA_Build 13 96269264 4D TGGGATACTA AAAC/---- AAACAAACAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 AAAC 3 2 78055 CASAVA_Build 13 96292542 1D CGTGTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 9 12 T 17 16 78056 CASAVA_Build 13 96302770 1I AGCAAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 A 11 12 78057 CASAVA_Build 13 96316719 1D GGGGTTCCTC A/- AGGCACCTGG 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 A 2 1 78058 CASAVA_Build 13 96327405 1I TATTGTAACA -/T TTTTCTCATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 4 5 78059 CASAVA_Build 13 96335911 2D CCAGTCTCTC AT/-- AGAGAATCTT 3070 het 3070 hom 54 26 24 4 AT 1 0 78060 CASAVA_Build 13 96345353 1I AGTTTGGAAC -/A AGTTGAGTTT 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 A 1 2 78061 CASAVA_Build 13 96446992 1I AATTTGCAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 A 8 9 78062 CASAVA_Build 13 96448298 1I CATTTCTTTG -/A AAAAAAGGAC 3070 het 3070 hom 43 19 23 1 A 6 7 78063 CASAVA_Build 13 96455768 3D AGAAAAAAAT GAG/--- GAGTAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 23 4 GAG 2 1 78064 CASAVA_Build 13 96457690 1D29M1D ATAAGGGGCA TTTTTTTTATATATAAACAACAGAAATTTAT/-TTTTTTTATATATAAACAACAGAAATTTA- TTCTCACAGT 3070 het 3070 ref 43 26 20 9 N/A 0 0 78065 CASAVA_Build 13 96460464 1D CCGGCCAACA G/- AGAGCCCAGG 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 G 1 0 78066 CASAVA_Build 13 96492859 1D TCCTCTTAAG C/- CCTATATCAT 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 C 3 2 78067 CASAVA_Build 13 96510705 1D TTCCTAAAAC A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 7 6 78068 CASAVA_Build 13 96510897 1I GAGTTTTTTT -/C TATGTGATTT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 C 0 1 78069 CASAVA_Build 13 96514763 1D GTGCAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 2643 het 1346 hom 38 9 12 18 T 15 14 78070 CASAVA_Build 13 96516029 6I CTCTGCTATT ------/ATAACA ATAAAATTCT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 ATAACA 0 1 78071 CASAVA_Build 13 96526627 1D TACTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1510 hom 21 5 9 7 T 12 11 78072 CASAVA_Build 13 96536066 1D TTTCCTAAAA T/- ATATATTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 1 0 78073 CASAVA_Build 13 96559786 1I ACGGCACATG -/A AAAAAAAAAA 1807 het 1807 ref 28 12 8 8 A 15 16 78074 CASAVA_Build 13 96563727 10D TCTCTCTCTT TCTTTCTTTC/---------- TCTTTCTTTC 1750 het 1750 ref 36 17 11 9 TCTTTCTTTC 2 1 78075 CASAVA_Build 13 96591178 2D CTTGTGCCCA TC/-- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 TC 5 4 78076 CASAVA_Build 13 96613686 3I GGTCCAGGCA ---/CAG CACTCCTCAG 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 CAG 0 1 78077 CASAVA_Build 13 96615465 1I TGTCCAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 9 10 78078 CASAVA_Build 13 96616718 2I TGTGTATGTC --/TG TGAGGGTGTT 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 TG 1 2 78079 CASAVA_Build 13 96617645 1D TGCTTTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 13 12 78080 CASAVA_Build 13 96623873 3D AGACATGTCA CTC/--- CTCCTCTTTA 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 CTC 3 2 78081 CASAVA_Build 13 96626074 2I GCTAAGGGGC --/AG ACTCAGGACC 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 AG 0 1 78082 CASAVA_Build 13 96631003 3I TCTAAAAAAA ---/AAT AAAAAAAAAA 2536 het 1342 hom 17 9 6 2 AAT 0 1 78083 CASAVA_Build 13 96663898 1I TTCTCGGGGT -/C CCCATCTACA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 C 3 4 78084 CASAVA_Build 13 96664163 2D ACACACATGC TA/-- TATGCTTCAT 3070 het 3070 hom 40 17 15 9 TA 2 1 78085 CASAVA_Build 13 96664439 1D AATAGAAAAT C/- CTGATTCTGC 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 C 2 1 78086 CASAVA_Build 13 96666474 1I CCAACATGTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 A 8 9 78087 CASAVA_Build 13 96674035 4D AGAACTACTC ATTT/---- AAATAAGGGC 3070 het 3070 hom 49 21 22 8 ATTT 1 0 78088 CASAVA_Build 13 96683930 1D AGTTTCCCTG T/- TTTTTTTTTT 1028 het 1028 ref 41 34 3 4 T 13 12 78089 CASAVA_Build 13 96685246 3D CCTTCCTCGT AGA/--- AGGAGAAACC 3070 het 3070 hom 50 22 21 8 AGA 1 0 78090 CASAVA_Build 13 96685614 2I TTCCCCACTC --/AG GGTGAAATTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 AG 0 1 78091 CASAVA_Build 13 96686134 1D TTACAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 A 13 12 78092 CASAVA_Build 13 96700794 1D CTCTCTTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 10 9 78093 CASAVA_Build 13 96733501 1I ATCAGCTCTG -/A AAAGCTTATC 3070 het 3070 ref 50 18 16 16 A 3 4 78094 CASAVA_Build 13 96748212 4D TATAGAAAAT AAAC/---- AAAATATTTC 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AAAC 1 0 78095 CASAVA_Build 13 96755865 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 6 7 78096 CASAVA_Build 13 96769485 1I CCGGCGGGTG -/T TTAGGGCTTG 3070 het 3070 ref 43 27 12 4 T 2 3 78097 CASAVA_Build 13 96776229 1I GGCCTGAAGG -/T TTTTTCCCAG 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 T 5 6 78098 CASAVA_Build 13 96776355 21D CTGCCCCATA GTCCAGGTGATGCAGTGGAAT/--------------------- GATGCTCTAC 3070 het 3070 ref 47 31 14 8 GTCCAGGTGATGCAGTGGAAT 1 0 78099 CASAVA_Build 13 96778499 1D CTTCTGAAAT G/- TAACTCCAGA 3056 het 3056 ref 21 8 7 6 G 1 0 78100 CASAVA_Build 13 96780032 1D49M12D ACACACAACA GGAAACACACAATACATATAATACATACAACATACATGCATACACATGCAACACACACACAC/-GAAACACACAATACATACAATACATACAACATACATGCATACACATGCA------------ ACACACACAC 3070 het 2088 hom 33 7 26 25 N/A 0 0 78101 CASAVA_Build 13 96784051 3D TCAAAGACTC CTT/--- CTGATAGCCC 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 CTT 1 0 78102 CASAVA_Build 13 96790605 1D GACAGAAAAT A/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 47 24 22 2 A 1 0 78103 CASAVA_Build 13 96795301 2I TTTGCGCATT --/TA TTATGAACTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 TA 0 1 78104 CASAVA_Build 13 96799442 1I41M3D TGGAGATGTA -TGTATCCACACAAGAGGGTCAATAAAATAGAGAAATTCTCCCTT/TTGTATCCACACAAGAGGGTCAATAAAATAGAGAAATTCTCC--- TTTTTCTTCT 3070 het 3070 hom 44 26 30 6 N/A 0 0 78105 CASAVA_Build 13 96802456 1I CTGGAGTAGC -/A ACTTTTAATT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 1 2 78106 CASAVA_Build 13 96804418 1D GTCAGATGGA T/- TTCCAAGTGG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 3 2 78107 CASAVA_Build 13 96806493 1D TGTTTGAATA T/- TTTTTTGCCT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 7 6 78108 CASAVA_Build 13 96806678 1D AAATTTTGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 420 hom 34 1 27 6 T 9 8 78109 CASAVA_Build 13 96812400 1D AGATTTTGGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 9 8 78110 CASAVA_Build 13 96818847 21D TTTTAGCATA ATAAATATTTGACCATGTGTC/--------------------- ATATATATTG 3070 het 3070 ref 20 14 7 1 ATAAATATTTGACCATGTGTC 1 0 78111 CASAVA_Build 13 96819253 3D TTGCACTTAA ATG/--- ATGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 49 26 19 6 ATG 2 1 78112 CASAVA_Build 13 96820479 1D TGGTCTTGCT G/- GAGTTGAAAC 3070 het 3070 ref 55 28 19 9 G 2 1 78113 CASAVA_Build 13 96825331 1D AGTTGACAGC T/- TTTCTGTGCA 3070 het 3070 ref 56 22 24 11 T 4 3 78114 CASAVA_Build 13 96830749 4D ACTCTAGCAA AACC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 33 10 18 9 AACC 1 0 78115 CASAVA_Build 13 96856519 1D ACAGCCCACA T/- TTTAAAAAAA 1231 het 1231 ref 45 31 7 8 T 4 3 78116 CASAVA_Build 13 96860727 2D CTTTAATTAC TA/-- TGTCTTTCAT 3070 het 3070 hom 44 16 22 7 TA 1 0 78117 CASAVA_Build 13 96870645 1D CAAGTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 31 1 21 10 T 11 10 78118 CASAVA_Build 13 96874336 1D CATAGTTTCC T/- TTAGGCAGCT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 3 2 78119 CASAVA_Build 13 96879502 4D ACTATATACC CTTT/---- CTAATTCCTG 3070 het 3070 hom 22 11 10 2 CTTT 1 0 78120 CASAVA_Build 13 96880796 1D TTAGGAATCA G/- GGTTTTACAG 3070 hom 120 het 45 0 40 6 G 3 2 78121 CASAVA_Build 13 96894604 3D ATATTAGTAT TTG/--- TTAACACTTC 3070 het 3070 hom 38 17 20 2 TTG 1 0 78122 CASAVA_Build 13 96899982 1I ATTTGTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 19 18 11 T 10 11 78123 CASAVA_Build 13 96901920 7D TGAATATGTG TATACTT/------- TCTTTTGGTG 3070 het 3070 hom 47 15 29 5 TATACTT 1 0 78124 CASAVA_Build 13 96913270 1D TTCTGACAGA T/- TTAGCTGTTT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 T 3 2 78125 CASAVA_Build 13 96913375 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 AC 7 6 78126 CASAVA_Build 13 96917933 1I TATGGAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 577 hom 49 3 42 4 T 11 12 78127 CASAVA_Build 13 96930254 3I TTCTGTTAGT ---/AAC AACAGGTGTT 3070 het 3070 hom 54 21 26 7 AAC 1 2 78128 CASAVA_Build 13 96959192 1I AGTGCATGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 104 hom 32 1 27 4 T 9 10 78129 CASAVA_Build 13 96978689 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 11 12 78130 CASAVA_Build 13 96984639 6D CAGTAGTAGT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 22 1 17 4 A 22 16 78131 CASAVA_Build 13 97001539 2D GTTTCCCCAG CT/-- CTCTCTCTCC 3070 hom 56 het 24 0 19 5 CT 5 4 78132 CASAVA_Build 13 97005089 1D AGACTCTGAG A/- AAGCGAGTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 2 78133 CASAVA_Build 13 97010941 1D CAGATTTTTC T/- CTACGTATAG 3070 hom 105 het 41 0 35 7 T 1 0 78134 CASAVA_Build 13 97012890 4D CCAATTATGT TGAA/---- TGGTCTATTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 TGAA 1 0 78135 CASAVA_Build 13 97024320 1I CATACTTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 9 10 78136 CASAVA_Build 13 97033213 4I AATTAAAAAG ----/ATAA ATAATTAAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 ATAA 1 2 78137 CASAVA_Build 13 97034806 1I TGCCCTCAGG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 6 7 78138 CASAVA_Build 13 97046987 1D AAAATGGAAG T/- TTTTTTTTTT 1846 het 1846 ref 30 24 4 2 T 11 10 78139 CASAVA_Build 13 97047132 1I AAAGCGGGGC -/G GGGGGGGGAA 3070 hom 45 het 18 0 14 4 G 8 9 78140 CASAVA_Build 13 97051042 1I5M11I4M3I TGTAAACCTT -AATAA-----------CCTT---/AAATAACACCATGGGACCCATACA AAATAACACC 3070 hom 141 het 48 0 46 5 N/A 0 0 78141 CASAVA_Build 13 97110217 1D TTGAATTACA T/- TTTTTTAATG 3070 hom 141 het 53 0 48 6 T 7 6 78142 CASAVA_Build 13 97113473 1D TACTCTGTTG C/- CCAGGCTGTA 3070 hom 131 het 46 0 43 4 C 3 2 78143 CASAVA_Build 13 97127552 2D AAGATGGACA AT/-- ATATTACATT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 AT 3 2 78144 CASAVA_Build 13 97137466 1D TATTAAATAA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 55 het 21 0 19 3 T 7 6 78145 CASAVA_Build 13 97142914 1I AAAGTTGAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 330 hom 29 1 25 3 A 8 9 78146 CASAVA_Build 13 97143566 3I AGTGTCATTA ---/TCC TCCTTTTCAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TCC 1 2 78147 CASAVA_Build 13 97150704 9I AGTGTATTAG ---------/CAACAAGAA CAACAACAAC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 CAACAAGAA 0 1 78148 CASAVA_Build 13 97154991 2I CTCAAAATCC --/TA ACACACTATC 3070 hom 135 het 50 0 44 6 TA 0 1 78149 CASAVA_Build 13 97155979 2D AAGAATAAAC TG/-- TGTTCTAACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TG 2 1 78150 CASAVA_Build 13 97156302 16D CACCAAAGTG AACATGGGATGCATGA/---------------- AACATGCATG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 AACATGGGATGCATGA 1 0 78151 CASAVA_Build 13 97159297 1I TAAAAGAACT -/G GAGACTAAAT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 1 2 78152 CASAVA_Build 13 97167479 1D TCTAACTCTA C/- CCCCCCCCAT 2625 hom 15 het 8 0 6 2 C 9 8 78153 CASAVA_Build 13 97196218 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1328 hom 22 het 12 0 6 6 A 17 16 78154 CASAVA_Build 13 97206123 1I ATATTAAAAT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 7 8 78155 CASAVA_Build 13 97208987 3I CCCTGTCTCT ---/AAA AAAAAAATAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 10 78156 CASAVA_Build 13 97211454 1I TCAAAAATTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 8 9 78157 CASAVA_Build 13 97222110 3I CATTTAACCT ---/AGA AGTTTTGTGG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AGA 0 1 78158 CASAVA_Build 13 97225756 1I ATAAATACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 10 11 78159 CASAVA_Build 13 97231365 1D ATTTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 14 13 A 11 10 78160 CASAVA_Build 13 97236745 1I CTCTCTTCTT -/G AGAAAATTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 0 1 78161 CASAVA_Build 13 97237352 1I TATTGATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2182 hom 27 6 14 7 T 10 11 78162 CASAVA_Build 13 97245943 1I GTTGGAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 924 hom 37 3 26 8 T 12 13 78163 CASAVA_Build 13 97246253 4D GTATCCCTAC CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 47 21 22 5 CA 15 13 78164 CASAVA_Build 13 97249781 1I ATTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 171 hom 35 1 24 10 T 11 12 78165 CASAVA_Build 13 97260704 2I TAGCAGTTAA --/TC TCTGTTTCTT 3070 hom 100 het 40 0 34 6 TC 1 2 78166 CASAVA_Build 13 97263010 19D ACACCTGGCA AAAACACAATAAAAACAAG/------------------- AAAACTACAG 3070 het 3070 ref 39 25 19 5 AAAACACAATAAAAACAAG 1 0 78167 CASAVA_Build 13 97266149 1D GATGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 T 11 10 78168 CASAVA_Build 13 97270985 1D CTTTCAGTAC A/- ACCGTAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 2 1 78169 CASAVA_Build 13 97271299 3I GTGCTTTAGC ---/AGA AGGACCCCAA 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 AGA 0 1 78170 CASAVA_Build 13 97281467 5D1M2I GTATCACACA AAAAGT--/-----TCC TAATCCTAAT 3070 het 3070 hom 44 19 24 5 N/A 0 0 78171 CASAVA_Build 13 97288887 1I ACTCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 12 13 78172 CASAVA_Build 13 97289217 4I TTTCAAGACA ----/TCTT TCTATTATTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCTT 0 1 78173 CASAVA_Build 13 97290223 1I GCTTCTACAT -/G ATTTTTATCC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 0 1 78174 CASAVA_Build 13 97304294 1D TCGACATGTG A/- AAAAAAATGC 2961 het 2961 ref 28 20 8 0 A 8 7 78175 CASAVA_Build 13 97304385 1D TGGCTGTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 47 1 38 8 A 12 11 78176 CASAVA_Build 13 97305323 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1629 het 61 hom 15 2 7 6 A 17 16 78177 CASAVA_Build 13 97306511 10I ATGCAAATGA ----------/GAGCCAGCCG GAGCCAGTCC 3070 hom 112 het 41 0 34 7 GAGCCAGCCG 0 1 78178 CASAVA_Build 13 97311313 1D TTGAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 13 11 A 12 11 78179 CASAVA_Build 13 97316079 1I TTAAGCCGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 10 11 78180 CASAVA_Build 13 97316318 1I TATAGAATCC -/T TTGATTCCTT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 T 2 3 78181 CASAVA_Build 13 97339535 2I GAAAAACCCT --/AC AGTTTTAATG 3070 het 3070 ref 55 31 20 4 AC 0 1 78182 CASAVA_Build 13 97345586 6D AATAGAGTAA TACATT/------ TATGTATTTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 TACATT 1 0 78183 CASAVA_Build 13 97346058 1I CTCTCATACA -/T TCTGTGGAAG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 1 2 78184 CASAVA_Build 13 97346201 1I TACTAAAAGA -/T AAGTTTAAGA 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 T 0 1 78185 CASAVA_Build 13 97346671 1D TTTTTAAAAA T/- TCAAATCAGG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 2 1 78186 CASAVA_Build 13 97355316 2I ATTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2938 het 2938 ref 16 8 7 1 A 10 12 78187 CASAVA_Build 13 97362438 1I CCAATTCAAA -/G GGCAAGTGAT 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 G 2 3 78188 CASAVA_Build 13 97365667 1I AGGGGGCAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 82 het 33 0 29 4 A 8 9 78189 CASAVA_Build 13 97382053 1I AAGTATAATT -/A TAAAAAAAAA 1863 het 619 hom 7 2 5 0 A 0 1 78190 CASAVA_Build 13 97387482 1D CATGGTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1538 het 1538 ref 26 13 6 7 T 12 11 78191 CASAVA_Build 13 97410797 1I CAAATTTTAC -/T TTTTTATTTT 3070 het 1074 hom 35 7 25 5 T 5 6 78192 CASAVA_Build 13 97423125 1D GGCTTAGCGA C/- ATTAAGCACT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 C 1 0 78193 CASAVA_Build 13 97433793 2D GCTAATTCCA CC/-- CCCCCCCCCC 2102 het 32 hom 30 1 7 22 C 12 10 78194 CASAVA_Build 13 97435919 1D ATATCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 T 14 13 78195 CASAVA_Build 13 97438206 1D CTCTCATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 12 11 78196 CASAVA_Build 13 97439121 2D TTGTTTGGTC TT/-- TTTTTTTTTT 2578 het 2578 ref 26 13 7 6 T 13 11 78197 CASAVA_Build 13 97439225 1I CTACTCCAGG -/T TTTGAATGAG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 3 4 78198 CASAVA_Build 13 97444563 1I AACTCGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 8 9 78199 CASAVA_Build 13 97462276 1D AATAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1390 het 1390 ref 36 24 3 9 T 11 10 78200 CASAVA_Build 13 97469227 1D AGAATAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 585 hom 23 4 10 9 T 12 11 78201 CASAVA_Build 13 97476559 1D AGCTGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 30 0 17 13 T 13 12 78202 CASAVA_Build 13 97477214 2I AAAAGAAAAC --/AT GTTTATTTGG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AT 0 1 78203 CASAVA_Build 13 97479254 1I CTAAAAATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 A 9 10 78204 CASAVA_Build 13 97480237 4I CTCTACAACA ----/AAAT AAATCTTTGA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AAAT 1 2 78205 CASAVA_Build 13 97495975 1D TTTTTAATTG A/- AAAAAAAAAA 2708 het 577 hom 22 5 12 6 A 11 10 78206 CASAVA_Build 13 97510380 4D AAAATTAAGA AAGT/---- AAGAAGGTGA 3070 het 3070 ref 34 15 17 4 AAGT 1 0 78207 CASAVA_Build 13 97512053 4I AGAGCTGGCC ----/AGAG AGAGAGGTGT 3070 het 3070 hom 34 16 13 5 AG 3 5 78208 CASAVA_Build 13 97513898 1D CCCCTCCCCT C/- CCCCTCTCCT 1065 hom 10 het 6 0 4 2 C 5 4 78209 CASAVA_Build 13 97516096 1I TCAAATGGTT -/G GGGGGGTCTT 3070 het 3070 hom 41 16 14 11 G 6 7 78210 CASAVA_Build 13 97516879 9I TGAATGGTAG ---------/TTCCCATAA TTCCCATAAT 3070 het 3070 hom 61 21 20 20 TTCCCATAA 1 2 78211 CASAVA_Build 13 97518596 5I CAGCACAGTA -----/TTTAT TTTATTTTAT 3070 het 3070 ref 34 12 10 13 TTTAT 2 3 78212 CASAVA_Build 13 97521314 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 6 A 13 12 78213 CASAVA_Build 13 97527130 1D TAAATTTGAA C/- CCCTTAATTT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 C 4 3 78214 CASAVA_Build 13 97534770 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1749 het 1749 ref 39 8 11 20 A 15 16 78215 CASAVA_Build 13 97536291 1I AAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 20 1 19 1 A 11 12 78216 CASAVA_Build 13 97536807 2I TCTGTTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2643 hom 26 10 13 3 T 14 16 78217 CASAVA_Build 13 97538406 1I TAATTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 9 10 78218 CASAVA_Build 13 97544596 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2560 het 1456 hom 20 5 8 7 T 13 14 78219 CASAVA_Build 13 97589485 1I AAAAAAAAAA -/T AGTTACAGTG 2717 het 2717 ref 27 17 7 3 T 0 1 78220 CASAVA_Build 13 97596012 1I CAGCTGCTCA -/G GAGGCTAAGC 3070 hom 33 het 13 0 12 2 G 1 2 78221 CASAVA_Build 13 97596490 1D ACTTGCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 11 10 78222 CASAVA_Build 13 97598089 1D TTTTTTCTTT A/- AAAAAATTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 6 A 7 6 78223 CASAVA_Build 13 97598340 1D GTTCCTTTTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 62 het 24 0 19 5 A 9 8 78224 CASAVA_Build 13 97599901 6I GTGGTTTTGT ------/TTTATA TTTTCCTGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTTATA 0 1 78225 CASAVA_Build 13 97603011 4D TTTCTACCTG TTAA/---- TTATGTGGAA 3070 het 3070 ref 56 29 24 7 TTAA 1 0 78226 CASAVA_Build 13 97618427 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1512 het 1512 ref 12 6 4 4 A 12 11 78227 CASAVA_Build 13 97625779 1I AGCTTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 10 11 78228 CASAVA_Build 13 97627740 2D CATCCTTACT AA/-- AAATACAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 5 3 78229 CASAVA_Build 13 97629469 2I GGCAGCAGAC --/AA GAGAACAGAA 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 A 0 2 78230 CASAVA_Build 13 97642345 1D TAAATTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 10 9 78231 CASAVA_Build 13 97646779 1I GCTGGCTAAA -/T TAAAATAATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 2 78232 CASAVA_Build 13 97649251 1I GGAGGATTAC -/T TGAGCCCAAG 2291 het 2291 ref 18 10 6 2 T 1 2 78233 CASAVA_Build 13 97650643 2D GCAACCTTCA CC/-- CCCCCCCCCT 2305 het 291 hom 30 5 9 17 C 11 9 78234 CASAVA_Build 13 97654838 2D ACCATTTACC TT/-- TTGTTTTGCT 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 T 4 2 78235 CASAVA_Build 13 97655202 1I GACCCTATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 10 11 78236 CASAVA_Build 13 97661701 4D GCCTCTACTT TGTC/---- TGTGGAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 5 TGTC 1 0 78237 CASAVA_Build 13 97662276 3I CAGAGGGGAT ---/AGC AACACATGTG 3070 het 3070 ref 64 27 22 16 AGC 0 1 78238 CASAVA_Build 13 97670294 1D GAAGAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 7 7 T 12 11 78239 CASAVA_Build 13 97691593 1I AGCACCTCCA -/G GGGGAGTGTG 1865 het 1865 ref 23 13 6 4 G 4 5 78240 CASAVA_Build 13 97698523 1D TTTTGAACTC T/- TTTCTACTGT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 T 4 3 78241 CASAVA_Build 13 97700976 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2082 hom 22 8 13 3 A 11 10 78242 CASAVA_Build 13 97702269 1I TGCCCGGTTA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 T 6 7 78243 CASAVA_Build 13 97718073 3I CTGACTGCTG ---/TTT TCTACTCACT 3070 het 3070 ref 48 21 17 10 T 1 4 78244 CASAVA_Build 13 97718198 3D CTTAAAAAAA TCT/--- TCTAAAATTG 3070 het 3070 ref 34 16 15 6 TCT 2 1 78245 CASAVA_Build 13 97727152 2I GAAGGTAAAA --/AG AGGGGAAGAC 3070 hom 51 het 23 0 17 6 AG 1 2 78246 CASAVA_Build 13 97731628 1D TCTTGGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 19 6 A 12 11 78247 CASAVA_Build 13 97733800 3D AAGAAGCTGG TTT/--- TGTTTCTGTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 6 T 4 1 78248 CASAVA_Build 13 97734908 4I CTCAAGTATC ----/TATT TGAGTTACTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TATT 0 1 78249 CASAVA_Build 13 97746770 1I AAGACAGGGA -/C CCCCCCGCTC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 C 6 7 78250 CASAVA_Build 13 97752221 1D TTCATGATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 23 14 8 T 10 9 78251 CASAVA_Build 13 97755370 5D TATATATATA TATAT/----- TTTTTAATTT 3070 het 874 hom 11 2 7 2 TATAT 1 0 78252 CASAVA_Build 13 97756117 1I TTACTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 20 24 9 T 10 11 78253 CASAVA_Build 13 97756938 1D CCCGGCTAAC T/- TTTTTTTTTA 2129 het 1753 hom 17 7 5 5 T 10 9 78254 CASAVA_Build 13 97757260 2D ACGAAGAAAC AG/-- AGCAGAGCTG 3070 het 3070 ref 47 25 16 8 AG 2 1 78255 CASAVA_Build 13 97761061 1D ATTTTATTTG T/- CTTAAGTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 1 0 78256 CASAVA_Build 13 97771500 1I CCCTGTGACC -/T GAAACTGAGG 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 T 0 1 78257 CASAVA_Build 13 97778187 1D CATATTCAAT A/- AGCTATGGGG 3070 het 3070 hom 57 26 27 4 A 2 1 78258 CASAVA_Build 13 97781010 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2581 het 2581 ref 20 9 7 4 A 12 13 78259 CASAVA_Build 13 97784362 1D TTATGTAAGA G/- GAAACTGAGG 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 G 2 1 78260 CASAVA_Build 13 97791324 1D TGGAGAGTTT G/- GGGATCATCT 3070 het 3070 ref 50 31 13 6 G 4 3 78261 CASAVA_Build 13 97797793 9I TCAGCATAAT ---------/GTCCTCGAG GTTCATCTGT 3070 het 3070 ref 56 26 22 9 GTCCTCGAG 0 1 78262 CASAVA_Build 13 97807855 1D AGCTTGGATC T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 7 6 78263 CASAVA_Build 13 97810724 2I GGCCACTTGG --/AC ACAGACACTG 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 AC 1 2 78264 CASAVA_Build 13 97819986 1I TTCCATGGTG -/T TATGTGTGCC 3070 het 3070 ref 17 8 7 2 T 1 2 78265 CASAVA_Build 13 97835673 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 8 7 78266 CASAVA_Build 13 97837030 1D TTGAGCTCTT C/- CAGGTTTGCT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 C 2 1 78267 CASAVA_Build 13 97843090 1I TTTCAGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 10 11 78268 CASAVA_Build 13 97846695 22D GGCCTGCGTT TGAGTGAGGAACAGGAGGAGGA/---------------------- TGAGTGAGGA 2659 het 2659 ref 24 9 8 10 TGAGTGAGGAACAGGAGGAGGA 2 1 78269 CASAVA_Build 13 97848086 1D TAAGAAAAAC A/- TCACAAACAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 1 0 78270 CASAVA_Build 13 97849118 1D4M1D TACGATTGAG CACTAG/-GCGA- GTATGAACTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 N/A 0 0 78271 CASAVA_Build 13 97856846 1I AGTAGTTGTT -/A ACTGACATCT 3070 het 3070 hom 45 13 27 5 A 1 2 78272 CASAVA_Build 13 97857600 2D CTTTTTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 13 11 78273 CASAVA_Build 13 97859558 1I AAAAAATTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 9 10 78274 CASAVA_Build 13 97863328 1I GCAGAGCTGC -/T TTTCTGTGTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 3 4 78275 CASAVA_Build 13 97864618 2D CAAATACACG AC/-- ACTGGTCAGG 3070 het 3070 ref 47 28 12 7 AC 2 1 78276 CASAVA_Build 13 97868512 5D TGTTTATTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 TTTGT 4 3 78277 CASAVA_Build 13 97875149 1D GATTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2506 hom 23 7 13 3 T 12 11 78278 CASAVA_Build 13 97888168 1D CCTGATTCTT G/- GCACTCATCA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 2 1 78279 CASAVA_Build 13 97892223 1I CCAGGCCCAT -/A AGCTGTGTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 1 2 78280 CASAVA_Build 13 97894620 1I CTGAGGGAAT -/G GGGATCCAAG 3070 het 3070 hom 48 15 16 17 G 3 4 78281 CASAVA_Build 13 97896113 4I GACCTCAACG ----/TGTC TGTCTTTTGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TGTC 1 2 78282 CASAVA_Build 13 97898100 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2751 hom 32 7 13 12 A 10 11 78283 CASAVA_Build 13 97898993 4D GACTTCCCGG TGTT/---- TGTTTGTTTG 2592 het 2592 ref 30 11 9 12 TGTT 4 3 78284 CASAVA_Build 13 97899059 5I TTCAGATTTC -----/ATTTT ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 ATTTT 1 2 78285 CASAVA_Build 13 97900057 1D TTTTCTGTGT G/- GGGGGGGAGG 3070 het 3070 hom 34 16 12 7 G 8 7 78286 CASAVA_Build 13 97900281 4D10M4D TCTCCTCAGC TATTTATTTCTGAATGAT/----TATTTCTGAA---- TGATTGATTC 3070 het 3070 ref 40 22 17 9 N/A 0 0 78287 CASAVA_Build 13 97900479 1D GCTTTATTGG C/- CCCTGCATGA 3070 het 3070 hom 53 23 25 6 C 4 3 78288 CASAVA_Build 13 97904071 4D CTGTATTTAC ATAT/---- ATATATTAAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 AT 5 3 78289 CASAVA_Build 13 97905664 1D CCTAGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 29 0 19 10 T 12 11 78290 CASAVA_Build 13 97910470 7I GCAAGGTGGT -------/GCCTGAC GCTGACAGCC 3070 hom 141 het 51 0 44 7 GCCTGAC 0 1 78291 CASAVA_Build 13 97913840 1D TGGATTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 36 1 18 17 A 15 14 78292 CASAVA_Build 13 97917387 2D CCCAGAACTT AA/-- AAAAGTTTAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 6 4 78293 CASAVA_Build 13 97920562 1D9M1D GGTGGGAGTC GGGGGGGCAAG/-GGGGGGCAA- GGGGGGTCTT 3070 het 2368 hom 22 9 10 4 N/A 0 0 78294 CASAVA_Build 13 97926141 1D AACACCCAGG A/- AAGAAGGCCT 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 A 3 2 78295 CASAVA_Build 13 97943745 1I AAGAGAGAGA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 45 29 8 8 T 6 7 78296 CASAVA_Build 13 97951276 5D TTTAAAACTT TGAAA/----- TGAAATGAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TGAAA 2 1 78297 CASAVA_Build 13 97954460 1I AACTGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 A 10 11 78298 CASAVA_Build 13 97962060 1I TTGGAACGTT -/G GGCATTGTTC 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 G 2 3 78299 CASAVA_Build 13 97962975 1I CAAAACATGC -/A AAAAAACATG 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 6 7 78300 CASAVA_Build 13 97965631 5I ATAATGGCTG -----/GGACA GGACATGGAG 3070 het 3065 hom 22 7 9 6 GGACA 1 2 78301 CASAVA_Build 13 97966955 4D TTGTCAAGAT GAAG/---- GAACAATAAG 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 GAAG 1 0 78302 CASAVA_Build 13 97969212 3D AATAACTGTT ATA/--- ATAACTTAAT 3070 het 3070 ref 41 22 19 2 ATA 2 1 78303 CASAVA_Build 13 97970428 2D GCTACACAGT AC/-- AGAGTCGTGT 3070 het 3070 ref 52 30 18 4 AC 1 0 78304 CASAVA_Build 13 97980373 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 hom 15 het 38 2 29 9 CA 7 6 78305 CASAVA_Build 13 97986616 1D TTCTTCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 T 13 12 78306 CASAVA_Build 13 97988437 14D AAGGAAAGGG TATTCTCCATCGGC/-------------- TAGGTCAATC 1876 het 1876 ref 23 14 4 6 TATTCTCCATCGGC 1 0 78307 CASAVA_Build 13 97989741 5D TCAGCAAAGC AAAGT/----- GCTTAAGAGA 3070 hom 114 het 41 0 39 5 AAAGT 1 0 78308 CASAVA_Build 13 97989827 1D ATTTAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 809 hom 41 2 34 7 A 10 9 78309 CASAVA_Build 13 97992487 1I CAGCCATTTT -/A AAAGCATTGT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 3 4 78310 CASAVA_Build 13 97993113 1D ATGTCCGTAA G/- AGGTCAGTTG 3070 het 2878 hom 39 8 24 7 G 1 0 78311 CASAVA_Build 13 97996578 1I53M2D GGCCTGGTCC -ATCTGAGAAAGCCCTTACTTTCAAAAGCCTTCTATCTACCAACTCTTACAAAAAC/AATCTGAGAAAGCCCTTACTTTCAAAAGCCTTCTATCTACCAACTCTTACAAAA-- ACACACGAGT 3070 het 3070 ref 37 30 17 10 N/A 0 0 78312 CASAVA_Build 13 97997154 3I TATCTAATTG ---/TTC TTGTTTTTTT 3070 hom 79 het 31 0 26 6 TTC 0 1 78313 CASAVA_Build 13 98018259 1D AACAGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 2364 het 2364 ref 24 13 8 3 T 13 12 78314 CASAVA_Build 13 98019669 1D CAGCAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 2394 het 700 hom 27 6 7 14 A 13 12 78315 CASAVA_Build 13 98025103 1I TGACCCACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 10 11 78316 CASAVA_Build 13 98028994 3I ATTTTCATAC ---/AAT GAGTACTATG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 AAT 0 1 78317 CASAVA_Build 13 98041574 1I ACCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 2503 het 2503 ref 29 11 10 8 A 10 11 78318 CASAVA_Build 13 98042023 2I TCCATCTCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 846 hom 19 3 9 7 A 10 12 78319 CASAVA_Build 13 98053587 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 51 het 22 0 18 5 A 7 6 78320 CASAVA_Build 13 98054258 2I CGCGTGTGCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 28 16 6 TG 7 8 78321 CASAVA_Build 13 98057114 3D ACAGGCATGT GCC/--- ACCATGCCCG 1709 het 1709 ref 9 5 4 0 GCC 1 0 78322 CASAVA_Build 13 98059445 4D CCTTTTATGC TTGT/---- TTGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 50 22 25 3 TTGT 2 1 78323 CASAVA_Build 13 98060062 5D CACAGAATCC TTCAA/----- TTCAACAAGT 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 TTCAA 2 1 78324 CASAVA_Build 13 98067358 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 473 het 473 ref 54 36 2 18 CA 10 9 78325 CASAVA_Build 13 98125843 1D CTCTGCTCTA T/- TTTTTTTTTT 831 het 831 ref 48 31 4 13 T 13 12 78326 CASAVA_Build 13 98142911 2D AGTAAAACTC TA/-- TGTTTAACAT 3070 het 3070 ref 48 23 16 12 TA 1 0 78327 CASAVA_Build 13 98146494 1I TATGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 3070 hom 62 het 23 0 19 4 C 4 5 78328 CASAVA_Build 13 98146594 1I GCTTGAACCC -/A GGGGGCGGAG 3070 hom 65 het 24 0 20 4 A 0 1 78329 CASAVA_Build 13 98161921 5D ATTGCTTTTG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 hom 99 het 47 0 32 19 GTTTT 5 4 78330 CASAVA_Build 13 98172740 1I TCCTGAGTTG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 8 9 78331 CASAVA_Build 13 98190178 1I CTTAAAATAC -/A GACAAGAATT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 0 1 78332 CASAVA_Build 13 98196103 1I TGTATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 10 11 78333 CASAVA_Build 13 98216331 2I CCTCCATGAC --/TG TGTCGAAACA 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 TG 1 2 78334 CASAVA_Build 13 98217840 2D TACACACTTT CC/-- TAAACCTGGA 3070 het 3070 ref 38 20 11 9 C 2 0 78335 CASAVA_Build 13 98221957 1I AATAACCAGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 T 8 9 78336 CASAVA_Build 13 98228271 1D ATATGGAGTA G/- TTGCCCTAAA 3070 het 3070 ref 50 28 17 6 G 1 0 78337 CASAVA_Build 13 98229881 1I GAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAG 3070 het 2093 hom 20 7 11 2 G 0 1 78338 CASAVA_Build 13 98230142 2D AGTGGATAAC TG/-- TGAATTTTAA 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 TG 2 1 78339 CASAVA_Build 13 98233424 1D ACAGAGGCTA T/- TTTTTATAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 7 T 6 5 78340 CASAVA_Build 13 98233953 1D CTGTGAAGTC A/- AGAGAAACAG 3070 het 3070 hom 47 19 23 6 A 2 1 78341 CASAVA_Build 13 98235867 4I CCACTGGGGT ----/GGAA GGGCAACCTG 3070 hom 81 het 29 0 26 3 GGAA 0 1 78342 CASAVA_Build 13 98237841 1I ATGGACTCAT -/A ACACCTCCAC 3070 het 3070 hom 34 16 13 5 A 1 2 78343 CASAVA_Build 13 98241231 3D TGTTGCCAAC ATA/--- ATATTATATG 3070 het 3070 ref 31 15 13 5 ATA 2 1 78344 CASAVA_Build 13 98242933 1I ACCCTTTGCT -/A ACCTCTTTAT 3070 hom 129 het 49 0 40 9 A 1 2 78345 CASAVA_Build 13 98251389 1D TAAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 A 6 5 78346 CASAVA_Build 13 98254849 1I GCTGAGCAGG -/C CCATGCTAGA 3070 hom 141 het 50 0 46 4 C 2 3 78347 CASAVA_Build 13 98259534 5D TTTATTATAG TTTTT/----- TTTTTGTTTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 10 5 78348 CASAVA_Build 13 98273385 1D TATTTTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 16 8 A 11 10 78349 CASAVA_Build 13 98275983 3I ACAGGAATAG ---/ACC ACCAGCCAAC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 ACC 1 2 78350 CASAVA_Build 13 98276908 1D TAGTCCTGGC A/- ATTTCTGCTG 3070 hom 141 het 50 0 46 4 A 2 1 78351 CASAVA_Build 13 98283460 1D ATTCTCAACC A/- AAAAAAAAAA 2954 het 1287 hom 28 6 10 14 A 18 17 78352 CASAVA_Build 13 98287000 1D CTCATTATTC T/- TCCTAATAAA 3070 het 3070 hom 53 25 26 3 T 2 1 78353 CASAVA_Build 13 98287270 1I AAAACAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 10 11 78354 CASAVA_Build 13 98294867 17D ATCCACCTGC TGCTTGGCCACCAGCAG/----------------- CTTGGCCTCC 2147 het 1324 hom 14 4 8 9 TGCTTGGCCACCAGCAG 1 0 78355 CASAVA_Build 13 98299368 1I TCTAACAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 9 10 78356 CASAVA_Build 13 98305190 16D ACTAGGGATA AATCCCTAAATGGCTC/---------------- AGCTGTTTAT 3070 het 3070 ref 50 26 23 5 AATCCCTAAATGGCTC 1 0 78357 CASAVA_Build 13 98312947 1D TATCTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 26 1 20 5 A 13 12 78358 CASAVA_Build 13 98327058 1D TGCAGGGCCA G/- GGAAGCAGAA 3070 het 3070 ref 52 34 12 7 G 3 2 78359 CASAVA_Build 13 98332877 16D CTGGGACTGG TTCTGTGCATTATTTC/---------------- TTTATTTGAT 3070 het 3070 ref 37 24 19 3 TTCTGTGCATTATTTC 1 0 78360 CASAVA_Build 13 98334993 1D TTTTTCCGCT G/- AGACACCACT 3070 het 3070 hom 42 13 26 4 G 1 0 78361 CASAVA_Build 13 98342072 1I TTAAAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 24 1 18 5 T 11 12 78362 CASAVA_Build 13 98350422 1D TACATTCCAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 59 29 24 6 A 7 6 78363 CASAVA_Build 13 98353189 1D CCTCTGCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 16 17 7 T 10 9 78364 CASAVA_Build 13 98354810 4D CAAAGCAAAC AAAT/---- AAACAAATAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 AAAT 1 0 78365 CASAVA_Build 13 98356034 1D GCTTTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 18 2 11 6 A 15 14 78366 CASAVA_Build 13 98361152 5D GTCTCTGATT CTGTA/----- ACCATGGAAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 CTGTA 1 0 78367 CASAVA_Build 13 98365414 2D TGTCAGGGAA GT/-- AAGTTATAAT 3070 het 3070 hom 41 20 19 3 GT 1 0 78368 CASAVA_Build 13 98369372 1I GCTGTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2973 hom 29 8 14 7 T 11 12 78369 CASAVA_Build 13 98375636 1I TAAAGGAGAT -/A AAAAAAAAAA 2452 het 2452 ref 30 16 6 8 A 10 11 78370 CASAVA_Build 13 98376738 1D GTGTGTACAG A/- ATGTTTAATG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 2 1 78371 CASAVA_Build 13 98377197 1I CTATCTGTGT -/C CACAGGCCAT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 C 1 2 78372 CASAVA_Build 13 98384920 3I GAGTTAAGAC ---/AGA AGAAGTGAGG 3070 het 3070 hom 62 24 33 5 AGA 1 2 78373 CASAVA_Build 13 98387969 1D TTTGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2185 hom 32 11 14 7 T 15 14 78374 CASAVA_Build 13 98388966 1D TGGCACTGGA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 8 7 78375 CASAVA_Build 13 98389203 2D AACCAGTGAC AA/-- AGTGTCTCCA 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 A 3 1 78376 CASAVA_Build 13 98390961 1I ACTGCTCCTC -/T TTCACTGGCA 3070 het 3070 ref 38 23 10 5 T 2 3 78377 CASAVA_Build 13 98393812 2I GCAAATTTAC --/TG TGTCTACTTT 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 TG 1 2 78378 CASAVA_Build 13 98394106 1D AAAGAGGGAT A/- GGGGATGAAT 3070 het 3070 hom 51 20 27 5 A 1 0 78379 CASAVA_Build 13 98396285 11I TAGGTCCCAA -----------/GCCAGGAGCCT GCCTCGCGGG 3070 hom 54 het 21 0 17 4 GCCAGGAGCCT 0 1 78380 CASAVA_Build 13 98397666 2I GATGATAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 11 13 78381 CASAVA_Build 13 98399104 1D AACCTCCTCA G/- GGTCCATCCA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 G 3 2 78382 CASAVA_Build 13 98407815 1D TCAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 21 0 10 11 A 12 11 78383 CASAVA_Build 13 98413217 2D GATTGTGAAG AA/-- GAGAGCAGGC 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 A 2 0 78384 CASAVA_Build 13 98420400 3I CAGGTCTGCC ---/CCA CCAAGCTGGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CCA 1 2 78385 CASAVA_Build 13 98422678 1I GCGATTTTAG -/T TTTCTATACA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 3 4 78386 CASAVA_Build 13 98426649 1D TTGTGTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 39 1 34 4 A 12 11 78387 CASAVA_Build 13 98427194 1D CACGTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 42 0 29 13 A 11 10 78388 CASAVA_Build 13 98427963 4I GGCAACAGGC ----/TTGA GTCAACCCCG 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 TTGA 0 1 78389 CASAVA_Build 13 98433161 15D TGAAAACAGT AAAACTAAAGTTTTA/--------------- AAATGTACAA 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 AAAACTAAAGTTTTA 1 0 78390 CASAVA_Build 13 98436060 1I TTTGAGCGCT -/G GGTGAGGAGG 3070 hom 78 het 32 0 24 8 G 2 3 78391 CASAVA_Build 13 98437606 1D CTGAACAAAG A/- AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 45 20 16 10 A 7 6 78392 CASAVA_Build 13 98441334 1I AAGTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 47 2 39 6 T 11 12 78393 CASAVA_Build 13 98444044 4I TATTGTAAAT ----/AATA AATAAATAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AATA 2 3 78394 CASAVA_Build 13 98449884 1D AGGGCGATTC A/- AAAATTATAA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 5 4 78395 CASAVA_Build 13 98453222 8I TAAATAGACA --------/GGAAGAGC TGGAAACGGC 3070 hom 107 het 40 0 34 6 GGAAGAGC 0 1 78396 CASAVA_Build 13 98453917 1I TTGACTCCTT -/C GTCTCTTATT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 C 0 1 78397 CASAVA_Build 13 98456152 1I GCCAGATTTG -/C CCCCATAGAC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 C 4 5 78398 CASAVA_Build 13 98460256 2D GCCATAAGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 16 11 A 13 11 78399 CASAVA_Build 13 98461986 5D CAGAGTGGTT AAGTA/----- AATTACCCAA 3070 het 3070 hom 43 15 27 5 AAGTA 1 0 78400 CASAVA_Build 13 98462512 1D ATAGGGCAAG A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 41 24 15 3 A 7 6 78401 CASAVA_Build 13 98468794 1D TTGTGCCAAA T/- TTTAAGTATT 3070 het 3070 ref 36 16 16 5 T 4 3 78402 CASAVA_Build 13 98469171 6D TTTTGAGATG CAGGCC/------ CAGGTCTTCC 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 CAGGCC 1 0 78403 CASAVA_Build 13 98477010 1D GATGGAAAAA G/- GTTAACAGGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 G 2 1 78404 CASAVA_Build 13 98487985 4D TCCATCAACA AACT/---- AACTGACTGA 3070 het 3070 ref 39 21 18 4 AACT 2 1 78405 CASAVA_Build 13 98497344 1I TATGTTGGAC -/A TATTCATGGG 3070 hom 77 het 39 0 32 8 A 0 1 78406 CASAVA_Build 13 98506567 5D GTTTGGGCAC ATTAA/----- ATGGTACTGA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 ATTAA 1 0 78407 CASAVA_Build 13 98512135 1I TTTGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2431 het 2431 ref 36 15 8 13 T 10 11 78408 CASAVA_Build 13 98518972 1I ATCTTTTAGG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 7 8 78409 CASAVA_Build 13 98520402 2D CCAACATGCA TG/-- TGTGTGCCCT 3070 het 3070 hom 34 10 17 9 TG 4 3 78410 CASAVA_Build 13 98524894 1D AACAACAGAT G/- AGCCAATCAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 1 0 78411 CASAVA_Build 13 98526145 1I TGCTTTCAGA -/T TTCACTTTCA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 2 3 78412 CASAVA_Build 13 98526667 1I ACATTTTGTA -/C CAAGATGTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 1 2 78413 CASAVA_Build 13 98529592 5D GGTGTGAAGT TACAG/----- TGCCAAGCTT 3070 hom 108 het 38 0 34 7 TACAG 1 0 78414 CASAVA_Build 13 98530516 2I CTAAGTGCCT --/AC ACACACACAC 3070 hom 114 het 44 0 36 8 AC 5 6 78415 CASAVA_Build 13 98533868 4D ATTATACTAT TCTC/---- TCTACTTTTT 3070 het 3070 ref 53 29 19 6 TC 3 1 78416 CASAVA_Build 13 98541561 1D ACCTAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2189 het 2189 ref 22 10 7 5 T 13 12 78417 CASAVA_Build 13 98544054 1D CACTCCTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 9 78418 CASAVA_Build 13 98552465 1I GTGTCTTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2217 hom 26 6 14 6 A 9 10 78419 CASAVA_Build 13 98558552 1D GGAGAAACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 10 9 78420 CASAVA_Build 13 98558990 1D TTTTATAGAG A/- AAAAAACCCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 7 6 78421 CASAVA_Build 13 98559673 2D AATTTCTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 3 A 12 10 78422 CASAVA_Build 13 98561748 1I CAAGTTATCT -/A ACAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 1 2 78423 CASAVA_Build 13 98565071 1D AAGAAGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 20 15 6 A 10 9 78424 CASAVA_Build 13 98565198 1D17M2D CCCTATATTC TTTTTTTTTTCTTTTTTCTT/-TTTTTTTTTCTTTTTTC-- TTTTTTTTTT 2380 het 1416 hom 38 11 10 21 N/A 0 0 78425 CASAVA_Build 13 98566148 1I GGTGCTGGAG -/A GGATGTGGAG 2797 hom 15 het 7 0 6 1 A 0 1 78426 CASAVA_Build 13 98570253 7D CCACGTAAGA CTTCTGC/------- CTTCTGCCTT 2621 het 2621 ref 20 6 6 8 CTTCTGC 3 2 78427 CASAVA_Build 13 98575417 1I CCAAAACGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2130 hom 28 7 15 6 A 11 12 78428 CASAVA_Build 13 98575669 1D AAAAGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 38 1 27 11 T 15 14 78429 CASAVA_Build 13 98576657 1D ATGAAATGTC T/- TTATGCAGCA 3070 het 3070 ref 41 18 14 10 T 3 2 78430 CASAVA_Build 13 98582532 1I AGACAAATAG -/A AAAAAGGCTT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 5 6 78431 CASAVA_Build 13 98585567 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 12 11 78432 CASAVA_Build 13 98593040 1I AAGATGATTT -/C TTTGGAGCCT 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 C 0 1 78433 CASAVA_Build 13 98597409 4I TCACTTTAAT ----/TTGA TTGCCTCTGT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTGA 0 1 78434 CASAVA_Build 13 98602768 1D TAACAGTCTT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 6 78435 CASAVA_Build 13 98604684 1D ACTTGAGATC A/- GGAGTTCAAG 2335 het 2335 ref 18 9 5 5 A 1 0 78436 CASAVA_Build 13 98605057 2D AACAAACAGC AA/-- AAAAAAACCC 3070 hom 62 het 22 0 20 2 A 9 7 78437 CASAVA_Build 13 98630844 4D CTCTGTCCTG CTAA/---- CTGTGTTCAC 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 CTAA 1 0 78438 CASAVA_Build 13 98633205 1I CCTTTTAAAG -/A GGGTTTAAAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 0 1 78439 CASAVA_Build 13 98636919 1I TTTTCTTTTT -/C TTTTTTTTTT 946 het 72 hom 22 2 9 11 C 0 1 78440 CASAVA_Build 13 98643408 2I TAATTCTTTT --/AA AAAGTGTCTC 3070 hom 86 het 33 0 29 4 A 3 5 78441 CASAVA_Build 13 98643927 2I GGGCTGGCTC --/TT TGTTTCCAGC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 1 3 78442 CASAVA_Build 13 98651914 4D GCGTGTTAAC AGTT/---- AGGCACGGGT 3070 het 3070 ref 55 30 21 6 AGTT 1 0 78443 CASAVA_Build 13 98663478 1I TTTTTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 T 12 13 78444 CASAVA_Build 13 98665093 2I AGACTGTGGG --/TT TGGGGAAGGG 3070 hom 75 het 30 0 24 6 T 1 3 78445 CASAVA_Build 13 98681303 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2967 hom 23 9 9 5 A 10 11 78446 CASAVA_Build 13 98687231 1D GGAGGTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 30 1 21 8 A 12 11 78447 CASAVA_Build 13 98695068 4I TCAATTTTAT ----/ATTA ATTCTTTCTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 ATTA 0 1 78448 CASAVA_Build 13 98696755 1I ACTGAGTGAT -/G GGGAGGTATG 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 G 3 4 78449 CASAVA_Build 13 98697465 1D TTTTTTTTTG T/- TTTGTTTTGT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 4 3 78450 CASAVA_Build 13 98702896 1D TATACCTATT A/- TTTTTTGTTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 1 0 78451 CASAVA_Build 13 98708840 4I AGTCTGCATC ----/ATCT ATCTATGGAA 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 ATCT 1 2 78452 CASAVA_Build 13 98728064 2I CCATCCCCTC --/TT TGTCACCACC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 1 3 78453 CASAVA_Build 13 98732481 1I AATGACACTT -/G GGGGGGCAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 G 6 7 78454 CASAVA_Build 13 98748064 1I GGTTTAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 13 14 78455 CASAVA_Build 13 98753275 1I CCTGCCTCCT -/G GGGGGCTTGC 3070 hom 119 het 45 0 40 5 G 5 6 78456 CASAVA_Build 13 98755547 2D GGATTCTCAC AT/-- GTGTTATCTC 3070 hom 69 het 26 0 22 4 AT 1 0 78457 CASAVA_Build 13 98768431 1D CTCACCATTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 9 8 78458 CASAVA_Build 13 98779086 3D GATTAATTCA TTG/--- TTAACTGGTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 TTG 1 0 78459 CASAVA_Build 13 98783188 1I AAACTCGCTC -/A ATTCAGAAGA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 1 2 78460 CASAVA_Build 13 98789895 1I CACATCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 13 14 78461 CASAVA_Build 13 98791642 11I CTTAGAGTCC -----------/TCAAGGACCTG CATTGGAGAT 3022 het 3022 ref 34 10 10 15 TCAAGGACCTG 0 1 78462 CASAVA_Build 13 98793541 1D GGATTCTTGG C/- TGTTTGCGCA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 C 1 0 78463 CASAVA_Build 13 98793631 3I CGGTGTCTTT ---/CCC CCCCCCAGAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 6 9 78464 CASAVA_Build 13 98797161 10D GTGGGAATTA ATGAGCAAAT/---------- ATGAGCATAA 3070 het 3070 ref 50 26 21 5 ATGAGCAAAT 1 0 78465 CASAVA_Build 13 98797377 1D CTATTTAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2828 hom 24 8 8 8 A 9 8 78466 CASAVA_Build 13 98797451 1I GCAAAGAGGG -/A AAAAAAAAGA 2710 het 1977 hom 15 7 8 0 A 8 9 78467 CASAVA_Build 13 98802894 3D GTTGCCTCTT GGC/--- CTCACCAGTG 3070 het 3070 ref 61 28 23 11 GGC 1 0 78468 CASAVA_Build 13 98803987 1I TTTCCTCCCC -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 A 7 8 78469 CASAVA_Build 13 98810363 1I CATTTTACTC -/T TTTTATGGGG 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 T 4 5 78470 CASAVA_Build 13 98814417 3D TTTTGTTCTC ATT/--- ATGCTGTGAC 3070 hom 93 het 33 0 32 4 ATT 1 0 78471 CASAVA_Build 13 98816884 1D TTTAGTTTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 41 het 28 0 25 4 T 9 8 78472 CASAVA_Build 13 98820285 1D TGTACTGGAG A/- AAAAATGTCT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 6 5 78473 CASAVA_Build 13 98823427 3D TTTTTTATTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 15 3 7 6 T 17 14 78474 CASAVA_Build 13 98827465 1D GCCAGCCCTC A/- AGGGAGCTCA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 2 1 78475 CASAVA_Build 13 98833609 1I CCAGCCAACC -/A AAATGAATTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 3 4 78476 CASAVA_Build 13 98834375 1D AGCAGAGGAA G/- GGGTGGTGAT 3070 hom 60 het 22 0 20 3 G 4 3 78477 CASAVA_Build 13 98834587 1D ATATAAGTAC A/- AAAAAAATGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 8 7 78478 CASAVA_Build 13 98835804 1D TCTATCTATA T/- TTTTTATTGG 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 T 6 5 78479 CASAVA_Build 13 98841551 1I ATACTAACAC -/T TAAGGCCTGT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 1 2 78480 CASAVA_Build 13 98849101 2D CTGCCTGTAT AA/-- AATATTGCCT 3070 hom 99 het 40 0 33 8 A 4 2 78481 CASAVA_Build 13 98855560 1I CACAAGACTG -/C CCCCCCACTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 C 6 7 78482 CASAVA_Build 13 98856884 2I CAGGGCGAGA --/CT CTGTCTAAAA 2371 hom 36 het 16 0 12 4 CT 1 2 78483 CASAVA_Build 13 98859900 1D TTTAACATTT G/- GGGACCTTGC 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 G 4 3 78484 CASAVA_Build 13 98860885 3D GCAGCCTCCA CCT/--- CCTCCTGGGT 2760 het 2140 hom 14 7 6 3 CCT 3 2 78485 CASAVA_Build 13 98863435 15I CCATAGATTA ---------------/GATAGATAGATAGAT GATAGATAGA 3070 hom 96 het 43 0 33 11 GATAGATAGATAGAT 1 2 78486 CASAVA_Build 13 98865332 6D TCGCACACTC ACACAG/------ ACACACACAC 3070 hom 66 het 70 1 38 39 ACACAG 1 0 78487 CASAVA_Build 13 98867495 4D GGAAAAAAAA AAAG/---- AGAGAGAGAG 2773 het 2121 hom 26 7 13 7 AAAG 1 0 78488 CASAVA_Build 13 98873401 1I TCCCATGGCA -/G GGGGTCAGGG 2917 het 2917 ref 33 22 7 4 G 4 5 78489 CASAVA_Build 13 98874393 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 5 T 13 11 78490 CASAVA_Build 13 98886159 1D CTCAACTGCC T/- TGAGCTCTCC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 2 1 78491 CASAVA_Build 13 98886388 1I TGGATACTTC -/A GGCCTCTCAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 1 78492 CASAVA_Build 13 98887064 2D ACACACATAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 807 hom 43 8 20 16 AC 10 9 78493 CASAVA_Build 13 98887168 9D TTTTATTATT GATGCTTCC/--------- GATGACAGTC 3070 hom 81 het 27 0 25 6 GATGCTTCC 1 0 78494 CASAVA_Build 13 98887796 5D TGAATTAAAA AAAAT/----- AAAAATAAAA 28 het 28 ref 26 12 1 13 AAAAT 1 0 78495 CASAVA_Build 13 98893678 1I CTTTTAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 10 11 11 A 9 10 78496 CASAVA_Build 13 98895792 4I TTGGGAGGGC ----/TGTA TGTGTCTTTG 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 TGTA 0 1 78497 CASAVA_Build 13 98896623 3I GCTCTTCCTC ---/CCT CCTTTGTCCA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 CCT 1 2 78498 CASAVA_Build 13 98907132 1D CATGACCAAC T/- TTTAAATGAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 4 3 78499 CASAVA_Build 13 98907732 1D GTTGTGACAA C/- CGTAACAATT 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 C 2 1 78500 CASAVA_Build 13 98910108 1D CCCATTTATC T/- TTTTTTTTTT 1953 het 1318 hom 30 10 6 14 T 17 16 78501 CASAVA_Build 13 98916170 1D GTCTTTTTTT A/- AAAAAACTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 6 78502 CASAVA_Build 13 98919205 1I TTCCAATGTA -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 6 7 78503 CASAVA_Build 13 98921360 1D AAGAAAAAAA T/- ATATATATAT 386 het 386 ref 13 4 1 8 T 1 0 78504 CASAVA_Build 13 98923618 1I CTGTTAATGG -/C CTTTAGTGAT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 1 2 78505 CASAVA_Build 13 98924517 1I GACATCTCTC -/T TTTTTTTTTT 772 het 772 ref 28 10 6 12 T 13 14 78506 CASAVA_Build 13 98926708 18D GTTTGTTTCT GTTCTTGTTGTTGTTTCA/------------------ GTCTTTTTCC 1722 het 1722 ref 21 15 5 2 GTTCTTGTTGTTGTTTCA 1 0 78507 CASAVA_Build 13 98930738 1I AAACAAACAC -/A AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 2 3 78508 CASAVA_Build 13 98943179 12D TGGAGCTTAT CTCTAATGTCTG/------------ GGGCAGATTG 3070 het 3070 hom 35 15 19 5 CTCTAATGTCTG 1 0 78509 CASAVA_Build 13 98968083 16D AAAAATGTGA TCTTTTTTTTAATGTT/---------------- TCTTTGTAAT 3070 het 3070 ref 28 19 10 2 TCTTTTTTTTAATGTT 1 0 78510 CASAVA_Build 13 98969940 1D TGAATTAGAT A/- ATAGCAAGGA 3070 het 3070 ref 38 24 14 0 A 2 1 78511 CASAVA_Build 13 98980336 1D TATTGCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 12 11 78512 CASAVA_Build 13 98981112 2D ATATTCAAAC AT/-- AGAATTTTTT 2732 het 2732 ref 25 11 9 5 AT 1 0 78513 CASAVA_Build 13 98982303 1D CTGTGGATGA T/- TTTTTTTTTT 1098 het 1098 ref 24 12 4 8 T 12 11 78514 CASAVA_Build 13 98987396 2I GAGGCCATTA --/TT TTATATTTAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 2 4 78515 CASAVA_Build 13 99006433 4I TACTATTTAA ----/TATT TATTGTCTAT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TATT 1 2 78516 CASAVA_Build 13 99006830 1I ACTTCATTCC -/T TTTTTTTTTT 2396 het 155 hom 25 2 14 9 T 15 16 78517 CASAVA_Build 13 99008136 1I ACCCCCGACC -/A AAAAAAAAGA 3034 het 3034 ref 39 24 7 8 A 8 9 78518 CASAVA_Build 13 99041023 1I CTCTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 30 3 20 7 T 14 15 78519 CASAVA_Build 13 99052189 1D GCCTCCTGGG T/- TCAAGCGATT 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 T 2 1 78520 CASAVA_Build 13 99057465 1I TGATTTTTGT -/G GCATGAGGAA 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 G 1 2 78521 CASAVA_Build 13 99057559 1I ATAACTTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 A 9 10 78522 CASAVA_Build 13 99059103 18D GTGATGAGTC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 3070 het 2569 hom 29 10 12 9 T 29 11 78523 CASAVA_Build 13 99063951 2D TAAACATGAC TG/-- AGATGGAAAA 3070 het 3070 ref 55 27 23 7 TG 1 0 78524 CASAVA_Build 13 99067892 2I TCACGAACGC --/CT CTTTCAGAAG 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 CT 1 2 78525 CASAVA_Build 13 99072011 3D TTTTTGGCGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3051 het 3051 ref 36 20 9 7 T 13 10 78526 CASAVA_Build 13 99073059 3D TATTTTTTAA ATT/--- AAATTTAATT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 ATT 1 0 78527 CASAVA_Build 13 99074359 17I CAGGGGTAAC -----------------/CTGTTTGGAACAGAGGA CACCTGAAGC 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 CTGTTTGGAACAGAGGA 0 1 78528 CASAVA_Build 13 99080321 10D GGCTTCTCTG CCTAGGTAGC/---------- CTTGCACCCC 3070 het 3070 ref 20 10 9 5 CCTAGGTAGC 1 0 78529 CASAVA_Build 13 99083257 1I ACACTTTGGG -/A GGCCCAGGTG 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 0 1 78530 CASAVA_Build 13 99084919 1D GTATTACTTA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 T 7 6 78531 CASAVA_Build 13 99102193 1I TCTTGGGGGG -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 128 het 48 0 41 7 A 7 8 78532 CASAVA_Build 13 99107897 4I ATGGGGAAAA ----/AATT AAACTCTTTA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AATT 0 1 78533 CASAVA_Build 13 99118529 2I CCCTTGTCTT --/AA AAAAAAAAAA 2090 het 42 hom 11 1 7 3 A 12 14 78534 CASAVA_Build 13 99118841 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 980 hom 18 3 13 2 A 14 15 78535 CASAVA_Build 13 99120286 1I CGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 2835 hom 30 het 13 0 10 3 A 13 14 78536 CASAVA_Build 13 99122446 1D CGGGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 17 0 12 5 T 11 10 78537 CASAVA_Build 13 99127228 1I ACTAGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 26 0 21 5 A 13 14 78538 CASAVA_Build 13 99129549 1D ACTCCGACTC A/- AAAAAAAAAA 159 het 38 hom 10 1 2 7 A 15 14 78539 CASAVA_Build 13 99133994 1D TACAGTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1138 hom 21 6 11 4 T 13 12 78540 CASAVA_Build 13 99134058 1I GCATAATATA -/T AAACCAGTAA 3070 hom 24 het 15 0 9 6 T 0 1 78541 CASAVA_Build 13 99140032 1I TTTTCAAGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 78542 CASAVA_Build 13 99142552 1I TTTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 hom 73 het 27 0 25 2 G 0 1 78543 CASAVA_Build 13 99147037 5D CCATCTCTAC CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 hom 45 het 23 0 16 8 CAAAA 4 3 78544 CASAVA_Build 13 99148591 1D CTGGCTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 30 1 26 3 T 12 11 78545 CASAVA_Build 13 99180711 4D CTGGCCTCTT AGTG/---- AGAATACAGA 3070 het 3070 ref 31 14 9 10 AGTG 1 0 78546 CASAVA_Build 13 99181759 1D TGCTTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 12 10 A 14 13 78547 CASAVA_Build 13 99196144 1I GGCTAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 34 1 29 4 A 11 12 78548 CASAVA_Build 13 99196284 1I GACAGTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 26 2 22 2 A 11 12 78549 CASAVA_Build 13 99196611 3D TTAAATACTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1608 hom 48 12 13 24 T 19 16 78550 CASAVA_Build 13 99200991 1I CTCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 22 0 18 4 A 10 11 78551 CASAVA_Build 13 99216465 1D TTGATTCTCA T/- TTTTTAAAGA 3070 het 3070 hom 49 21 27 2 T 6 5 78552 CASAVA_Build 13 99220332 9D TTTTCTTTTC TTTCTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2632 het 1229 hom 15 7 8 2 TTTCTTTTT 1 0 78553 CASAVA_Build 13 99224323 1D CATTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2238 het 2238 ref 28 12 8 8 A 15 14 78554 CASAVA_Build 13 99233718 1D TGGGGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 12 11 78555 CASAVA_Build 13 99234133 2D TCAAGAAAAC AT/-- AACATTATTG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 AT 1 0 78556 CASAVA_Build 13 99241610 1D AAATAGTGTC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 3 het 29 2 27 0 T 6 5 78557 CASAVA_Build 13 99243143 2D GGCTTATTAT TA/-- GTCTTTATTA 2694 het 2694 ref 24 15 6 3 TA 1 0 78558 CASAVA_Build 13 99249860 2D GGCATCAATC AT/-- GTGTGTATCT 3070 het 3070 ref 51 25 23 6 AT 1 0 78559 CASAVA_Build 13 99251695 1I GACAGTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 10 11 78560 CASAVA_Build 13 99251777 1I AAAGTAATAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 8 9 78561 CASAVA_Build 13 99258755 1I ACTTAAAAAA -/G AAATTATAGA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 G 0 1 78562 CASAVA_Build 13 99262017 2D CGAAACAAAC AG/-- GGCACTCAGC 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 AG 1 0 78563 CASAVA_Build 13 99312738 1I TAGGTAAGCT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 A 6 7 78564 CASAVA_Build 13 99313163 5I TCAGGTCAAA -----/GACTT GACTTAAATA 3070 het 3070 ref 29 11 9 9 GACTT 1 2 78565 CASAVA_Build 13 99338113 1D GGATTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 16 15 78566 CASAVA_Build 13 99338532 7I ATGTTTTATG -------/TTTTATA TTTTTGCCAC 3070 hom 73 het 32 0 25 7 TTTTATA 0 1 78567 CASAVA_Build 13 99346126 1D AAAATCATTT G/- GGGACTTCTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 4 3 78568 CASAVA_Build 13 99350462 2D GATTACACAC AT/-- GAGCCACCTG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AT 1 0 78569 CASAVA_Build 13 99356683 4D AGAGCTTTTT TGAG/---- TTTTCTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TGAG 1 0 78570 CASAVA_Build 13 99362906 1D TTTTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 26 1 16 9 A 15 14 78571 CASAVA_Build 13 99363566 1D ACTCTAAAAC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 7 6 78572 CASAVA_Build 13 99370021 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1715 het 275 hom 20 3 10 7 T 17 16 78573 CASAVA_Build 13 99374392 4D CAGATGAGCC TTGA/---- TTGAAGACAT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 TTGA 2 1 78574 CASAVA_Build 13 99377026 1I CAATGGGCTT -/G ATCTCACCAT 3070 hom 81 het 29 0 26 3 G 0 1 78575 CASAVA_Build 13 99377151 10I GTGTTCAGGG ----------/AGCGGCAGGA AGCGGCAGGA 3070 hom 70 het 28 0 22 6 AGCGGCAGGA 1 2 78576 CASAVA_Build 13 99377666 3I ATAGTACAGT ---/TTG TTATTTTATT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TTG 0 1 78577 CASAVA_Build 13 99378699 1I TCTCACCAAG -/C CCCCCCATGA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 C 6 7 78578 CASAVA_Build 13 99388950 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 28 2 20 6 A 12 11 78579 CASAVA_Build 13 99396678 1D ATTTTACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 A 13 12 78580 CASAVA_Build 13 99414016 1I TCCAGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 11 12 78581 CASAVA_Build 13 99414744 1D GAATTCAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 9 23 7 A 13 12 78582 CASAVA_Build 13 99414757 1D AAAAAAAAAA C/- ATATAGGAAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 C 1 0 78583 CASAVA_Build 13 99415035 2D GGGTTTTTAC AA/-- ATGTTTTTGG 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 A 3 1 78584 CASAVA_Build 13 99419740 3D AGACGCACGC AGA/--- AGAAGGTGTG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 AGA 2 1 78585 CASAVA_Build 13 99422688 4D TCAAAATAAG TCTT/---- TCCCCCAAAG 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 TCTT 1 0 78586 CASAVA_Build 13 99426742 2D AATATTTATT TG/-- TGTTGGCCCC 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 TG 2 1 78587 CASAVA_Build 13 99451229 2D CTGGGCAAAC AA/-- GAGTGAAACT 3070 het 1234 hom 12 4 8 1 A 2 0 78588 CASAVA_Build 13 99461449 3I AGTGGCACGA ---/TCT TCTGCTCACT 2839 het 2731 hom 23 8 8 7 TCT 1 2 78589 CASAVA_Build 13 99466041 1I TAGGTGAAAT -/G GACAATTTCC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 G 1 2 78590 CASAVA_Build 13 99480862 5D CAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAGAA 3070 het 107 hom 14 1 10 4 AAAAG 1 0 78591 CASAVA_Build 13 99485440 1I TCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 A 11 12 78592 CASAVA_Build 13 99491652 1I CTTAATAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 35 1 16 18 A 13 14 78593 CASAVA_Build 13 99501366 4D GGCAGTTGGT AGAA/---- AGAATTAAGC 3070 het 3070 ref 29 17 11 3 AGAA 2 1 78594 CASAVA_Build 13 99516034 2D AGAAGAAAAC AT/-- ATGAATTTCT 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 AT 2 1 78595 CASAVA_Build 13 99521690 1D CAAATAAAAA G/- CTGAGGCCAC 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 G 1 0 78596 CASAVA_Build 13 99533613 2D AGGTCACGCC AT/-- AGTTAGTGAA 1260 het 1260 ref 17 10 4 4 AT 1 0 78597 CASAVA_Build 13 99534176 2D AAGCCAGGGT AA/-- AGTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 29 14 15 2 A 3 1 78598 CASAVA_Build 13 99534271 4I TGCACCTTAG ----/TCTT TCTAAGTCCC 3070 het 3070 ref 36 25 8 3 TCTT 0 1 78599 CASAVA_Build 13 99535891 1I TTAATGTATG -/T TTTTTATTCT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 5 6 78600 CASAVA_Build 13 99541248 3I CTAACAAACA ---/GAG GAGATGAATG 3070 hom 156 het 59 0 52 7 GAG 1 2 78601 CASAVA_Build 13 99563142 1D ACAGCAGGGA T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 T 8 7 78602 CASAVA_Build 13 99566904 6D ACAAGATTTT TATAAG/------ TATAACTTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TATAAG 1 0 78603 CASAVA_Build 13 99602225 4D TGCTTGAATA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 41 25 13 6 TTGT 3 2 78604 CASAVA_Build 13 99605418 1I GTTTGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3010 het 3010 ref 25 14 9 2 A 11 12 78605 CASAVA_Build 13 99611229 2D GGATCCTATC TG/-- TGTACTTGAA 3070 het 3070 hom 57 23 28 6 TG 2 1 78606 CASAVA_Build 13 99611915 1I ATATTTGGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 9 10 78607 CASAVA_Build 13 99612666 2D GCTGGTAAAT GA/-- GAGAGTATGG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 GA 3 2 78608 CASAVA_Build 13 99616499 1I GTTTTTTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 9 10 78609 CASAVA_Build 13 99623992 3D ATCTTGAATT GTA/--- GCTCCTCTAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 8 GTA 1 0 78610 CASAVA_Build 13 99629985 16D TTTTCCTGTC TGTGTGTGTGTGTGTT/---------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 46 21 17 12 TGTGTGTGTGTGTGTT 1 0 78611 CASAVA_Build 13 99644326 1D CCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 26 15 3 8 A 13 12 78612 CASAVA_Build 13 99659815 2I TTTGGGATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 AC 8 9 78613 CASAVA_Build 13 99668344 1I AAAAAAAAAA -/C TCCATTCATT 2503 het 968 hom 23 3 11 9 C 0 1 78614 CASAVA_Build 13 99684908 1D TTAAAGAAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 9 8 78615 CASAVA_Build 13 99691551 1I CTTTGTGTCT -/C TGTGGATTTA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 C 0 1 78616 CASAVA_Build 13 99702257 1I GGGAGGCTGA -/G GGGGGTTCAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 G 5 6 78617 CASAVA_Build 13 99707638 1I ACAAGTACCC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 6 7 78618 CASAVA_Build 13 99716095 1I TATGTACAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 30 0 24 6 A 9 10 78619 CASAVA_Build 13 99730268 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 28 0 10 18 T 14 13 78620 CASAVA_Build 13 99730560 1I CAACACAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 833 hom 34 2 29 3 T 10 11 78621 CASAVA_Build 13 99738073 1I AGTTAGGGGG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 78622 CASAVA_Build 13 99761492 1I CGTCTCAATG -/A AAAAAAAAAA 2888 het 2888 ref 21 10 7 4 A 10 11 78623 CASAVA_Build 13 99771300 1I ATTCCTCCCT -/A AATGTTACCA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 2 3 78624 CASAVA_Build 13 99775669 7D GAAGACAAAA TGTGAAG/------- GGGAAGCTGT 3070 het 3070 ref 41 25 15 5 TGTGAAG 1 0 78625 CASAVA_Build 13 99793045 4I GGCACAGTCA ----/TAAC TAACTCCCTG 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TAAC 1 2 78626 CASAVA_Build 13 99800033 1I ACATATCAAG -/T TATCACGGCT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 1 2 78627 CASAVA_Build 13 99800598 1D ACTATACAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 9 8 78628 CASAVA_Build 13 99811554 2I TAACAGTAAC --/GT ATTGATATTG 3070 het 3070 ref 53 30 17 6 GT 0 1 78629 CASAVA_Build 13 99811700 2D AAATAATGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 15 13 78630 CASAVA_Build 13 99834283 1D GAAAGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3047 het 488 hom 24 2 8 14 T 17 16 78631 CASAVA_Build 13 99842046 4D GTCTTGTGAG AATT/---- AATAGAATAC 3070 het 3070 hom 42 15 20 9 AATT 1 0 78632 CASAVA_Build 13 99869089 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 2916 het 732 hom 30 5 10 15 A 12 11 78633 CASAVA_Build 13 99887691 2I TCAGAATTTT --/AA AAAGTCTTTT 3070 het 2583 hom 31 6 21 4 A 3 5 78634 CASAVA_Build 13 99887795 1I TGTTTATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 T 11 12 78635 CASAVA_Build 13 99893910 1D GTTATTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 36 0 25 11 T 13 12 78636 CASAVA_Build 13 99894458 1D CAGCCCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 33 2 14 17 T 17 16 78637 CASAVA_Build 13 99895131 1I AAATTTGTAA -/T TTGGTTTTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 3 78638 CASAVA_Build 13 99895652 2D GCTAATTAAC AT/-- ATATGTATTA 3070 het 3070 ref 42 24 17 2 AT 3 2 78639 CASAVA_Build 13 99896039 1D ATTTTGCATA T/- TATACCACAT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 2 1 78640 CASAVA_Build 13 99903733 2D ACTCTAGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 13 11 78641 CASAVA_Build 13 99904088 1D CCGGAAAAAA G/- GGAAAAAAAG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 G 3 2 78642 CASAVA_Build 13 99906910 2D TAGCCGAAGC TG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 21 12 9 2 TG 1 0 78643 CASAVA_Build 13 99908533 2D CCTGGGCAAC AG/-- TGGGACCCCA 1192 het 538 hom 8 2 3 3 AG 1 0 78644 CASAVA_Build 13 99920513 1I GTGTTTTGGG -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 40 11 17 12 T 7 8 78645 CASAVA_Build 13 99935186 1I TTGATGCACT -/G GATAGGACCT 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 G 1 2 78646 CASAVA_Build 13 99938155 2I TAATTAAAAT --/AA AAAAAAAAAA 2071 het 2071 ref 28 17 8 3 A 10 12 78647 CASAVA_Build 13 99940026 1I TGTCTCAGAG -/A AGAGGAAGAA 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 A 1 2 78648 CASAVA_Build 13 99946223 4D TTCCTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 2532 hom 35 13 18 4 TC 9 7 78649 CASAVA_Build 13 99948491 1I TAGGTTAGCC -/A AAAAAAAAAA 2786 het 1389 hom 32 7 14 11 A 17 18 78650 CASAVA_Build 13 99950165 2I TATTGGCCAC --/AG AGTTTTGAAG 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 AG 1 2 78651 CASAVA_Build 13 99951973 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 1638 het 269 hom 7 1 4 2 A 7 8 78652 CASAVA_Build 13 99955190 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 16 7 A 10 11 78653 CASAVA_Build 13 99956098 1D TGGTACCCTG T/- TTCTCTGCCC 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 3 2 78654 CASAVA_Build 13 99959415 2D GCTGAAAGAT AC/-- AGTGTTTCTC 3070 het 3070 ref 48 29 15 5 AC 1 0 78655 CASAVA_Build 13 99980213 5D GATGGGCTCC GGTGG/----- GGTGGGGTGG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 GGTGG 3 2 78656 CASAVA_Build 13 99981519 4I TTTTAAGTGC ----/TGTT TGTTTGTATT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 TGTT 1 2 78657 CASAVA_Build 13 99982056 7D TGATCCTAAA TATTTAT/------- TATTATCTTG 3070 het 3070 ref 53 25 23 8 TATTTAT 1 0 78658 CASAVA_Build 13 100007794 1I ACTTTTAAAC -/G AATGGTGCTG 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 G 0 1 78659 CASAVA_Build 13 100011798 1D CCTTGTCTTA C/- CTGGGGCTAT 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 C 2 1 78660 CASAVA_Build 13 100015794 1D TTCTGCAAAA G/- CATCTCTGCA 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 G 1 0 78661 CASAVA_Build 13 100016899 1I TAACTGGGTG -/T GGTAGGTATT 3070 hom 104 het 38 0 32 6 T 0 1 78662 CASAVA_Build 13 100024150 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAACATG 3070 het 627 hom 33 7 12 14 AC 0 1 78663 CASAVA_Build 13 100044952 18D TTTGCATAAG CATGCAAAGCAGCTCACC/------------------ TTTATAACTT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 CATGCAAAGCAGCTCACC 1 0 78664 CASAVA_Build 13 100049251 1D TCATTTTGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 9 8 78665 CASAVA_Build 13 100050569 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 375 het 31 hom 13 1 6 6 T 14 13 78666 CASAVA_Build 13 100053431 1D AGTTTGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 A 10 9 78667 CASAVA_Build 13 100053861 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 24 1 22 1 A 13 11 78668 CASAVA_Build 13 100067383 1I TCTTCTAGGA -/T TTTTTTTTTT 1672 het 1672 ref 26 13 7 6 T 13 14 78669 CASAVA_Build 13 100069899 2I ACATTTATGA --/AC ACATCCATTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 AC 1 2 78670 CASAVA_Build 13 100084085 8D TTGTGTATCT AAACATAG/-------- AAAAGAGGCA 3070 het 3070 hom 33 16 18 2 AAACATAG 1 0 78671 CASAVA_Build 13 100106041 3D CTTGATAAGG TAA/--- TAATAATAAA 3070 hom 71 het 28 0 24 4 TAA 4 3 78672 CASAVA_Build 13 100107789 1I AATGTTGTAC -/G GTGATGAAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 1 2 78673 CASAVA_Build 13 100127246 1D TTTTAGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 11 10 78674 CASAVA_Build 13 100129416 2I CTGAGGTGGA --/AC AGTTTCATCC 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 AC 0 1 78675 CASAVA_Build 13 100130688 1I GGATGTAGTC -/A AGAGAGTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 1 2 78676 CASAVA_Build 13 100154683 1I TACCTATTGG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 6 7 78677 CASAVA_Build 13 100160235 2D TATACAATCT TA/-- TATATATATA 3070 hom 73 het 45 1 38 7 TA 7 6 78678 CASAVA_Build 13 100160896 1I TATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 9 10 78679 CASAVA_Build 13 100188071 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 56 het 40 1 37 3 T 10 9 78680 CASAVA_Build 13 100189548 5D AATAAAAAAT AAAAA/----- ATAAAATGGA 3070 hom 66 het 23 0 23 1 A 6 1 78681 CASAVA_Build 13 100240860 4D TATTCATGAC ATTT/---- ATCATCTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 ATTT 1 0 78682 CASAVA_Build 13 100243164 1I GGAAGTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 23 0 17 6 T 10 11 78683 CASAVA_Build 13 100249505 1D CTGTGTAGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 24 0 22 2 T 10 9 78684 CASAVA_Build 13 100251119 2D AGCAGATTCT GA/-- GAGTCTTCAG 3070 hom 105 het 41 0 35 10 GA 2 1 78685 CASAVA_Build 13 100251565 1I GGTCATGGGA -/G GGGGGAGGCG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 G 5 6 78686 CASAVA_Build 13 100253203 1I GTGATCCCAG -/C CCACTCAGGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 2 3 78687 CASAVA_Build 13 100259999 4I GCTTTTGTAG ----/TCTT TCTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TCTT 1 2 78688 CASAVA_Build 13 100272971 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1205 het 1205 ref 25 13 4 8 A 14 13 78689 CASAVA_Build 13 100276790 1D CAACAGATGG A/- AAAAAAAAAA 2662 het 2662 ref 34 25 6 3 A 11 10 78690 CASAVA_Build 13 100319649 2D TTGTTTTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3044 het 3044 ref 34 15 7 16 T 14 12 78691 CASAVA_Build 13 100322336 1D AATAGCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 26 1 18 7 T 13 12 78692 CASAVA_Build 13 100325242 6D CTTTTTTTGT TTATTA/------ TTATTATTAT 3070 hom 69 het 29 0 24 19 TTA 5 3 78693 CASAVA_Build 13 100335539 1D TAAGATGTTT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 7 6 78694 CASAVA_Build 13 100344224 1D AAAATACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 44 2 30 12 A 12 11 78695 CASAVA_Build 13 100360661 1I GAGAGAGAAT -/G CTCTGACCGT 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 G 0 1 78696 CASAVA_Build 13 100377940 4D TATCTCAGTC TGTT/---- TGTGCATCTA 3070 het 3070 ref 45 22 22 2 TGTT 1 0 78697 CASAVA_Build 13 100406999 3I GTGATGTCAA ---/AAT AATATGTTTG 3070 hom 99 het 44 0 34 10 AAT 1 2 78698 CASAVA_Build 13 100407645 1I CAGTGGAGGT -/C CTCCTTGCCA 3070 hom 149 het 53 0 48 5 C 1 2 78699 CASAVA_Build 13 100409061 3D TGGTGGTGAA AAC/--- AATGATTATC 3070 hom 92 het 35 0 29 6 AAC 1 0 78700 CASAVA_Build 13 100411055 1D ATTTGATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 909 hom 30 2 25 3 A 12 11 78701 CASAVA_Build 13 100420042 1D CTATGCCCTG C/- CCCCCAGAGG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 C 6 5 78702 CASAVA_Build 13 100420895 1D GTCAATTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 8 78703 CASAVA_Build 13 100421421 1D TTTCTGCAAT A/- AAAAGCCATT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 5 4 78704 CASAVA_Build 13 100434744 2D ACAGCAGATA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 129 het 49 0 42 9 T 14 12 78705 CASAVA_Build 13 100435273 5I CACCTTTGTT -----/AAAAC AAACAAAGGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAAAC 0 1 78706 CASAVA_Build 13 100440513 1D AAGCCTTCCA G/- AAAACTTCAG 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 G 1 0 78707 CASAVA_Build 13 100441750 2I ATCTTTAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 837 hom 36 2 26 8 A 12 14 78708 CASAVA_Build 13 100450140 8D ATTCTTCCTT TACTTGTA/-------- TGTGAATCTG 3070 het 3070 ref 35 23 14 1 TACTTGTA 1 0 78709 CASAVA_Build 13 100452338 2D CCTATCCCTC TT/-- TGCCTGTTCT 3070 het 3070 hom 42 14 19 10 T 3 1 78710 CASAVA_Build 13 100501323 1I CATGAAATGT -/G GGGCATTAAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 G 3 4 78711 CASAVA_Build 13 100503766 3I TTCTGCTGAA ---/CAT CATCAATTCC 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 CAT 1 2 78712 CASAVA_Build 13 100510867 3I TAGTTTCAAA ---/CTT CTTCTGGTCT 2789 het 2789 ref 26 8 7 11 CTT 1 2 78713 CASAVA_Build 13 100524693 1I TTGAATAACC -/T TTTTCAACTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 5 78714 CASAVA_Build 13 100528509 1D AGTTTGCTGT G/- GGGGTAGAGC 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 G 5 4 78715 CASAVA_Build 13 100528570 13D TGTGTGGTTG GAGTCCACACACA/------------- GAGTCCACAC 3070 het 3070 ref 24 11 7 12 GAGTCCACACACA 2 1 78716 CASAVA_Build 13 100531126 4I TATTATTTAT ----/TTAA TTAATAATTA 2363 het 790 hom 8 2 6 0 TTAA 1 2 78717 CASAVA_Build 13 100534954 4D CAACATGTGA TTAT/---- TTATGCTGTT 3070 het 3070 ref 32 19 9 6 TTAT 2 1 78718 CASAVA_Build 13 100541923 1D CTGCTTTATA T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 T 7 6 78719 CASAVA_Build 13 100551027 1I TGACCTCCAG -/A TTTCAAGTAA 3070 het 235 hom 35 3 16 16 A 0 1 78720 CASAVA_Build 13 100555987 1I AATTCAAGAT -/A AAAAAAAACG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 8 9 78721 CASAVA_Build 13 100562548 1D ACCACAGTTC A/- AAAAAAAAAA 1643 het 1643 ref 37 20 5 12 A 15 14 78722 CASAVA_Build 13 100596974 1D AGATCAGAGT G/- TAAGGCAGGT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 G 1 0 78723 CASAVA_Build 13 100599296 5D GTCGTTTAAC CTGAA/----- CTGATGTCTG 3070 hom 84 het 32 0 26 6 CTGAA 1 0 78724 CASAVA_Build 13 100600442 1D62M3D6M6D TCAGTGTAAG AAATGTGGATTTCACAACATAACATTGAGTGAAGGGAGCCAGACGCAACAACAGAGTACATACTGTTGTATGTACTCC/-AATGTGGATTTCACAACATAACATTGAGTGAAGGGAGCCAGACGCAACAACAGAGTACATAC---TGAATG------ ATTCCACGTG 3070 hom 120 het 29 0 39 14 N/A 0 0 78725 CASAVA_Build 13 100601124 3D AATTTTTAAG ATC/--- ATTATACTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 ATC 1 0 78726 CASAVA_Build 13 100605471 1D AAAAACACTA T/- TTTGAAGTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 4 3 78727 CASAVA_Build 13 100618052 24D6M6D TAGTTGGATT TGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGTAG/------------------------GATTCT------ ACTGAGGCAG 3070 hom 36 het 11 0 13 3 N/A 0 0 78728 CASAVA_Build 13 100619699 4D TAAAAATATT TTTA/---- TTTATTTTTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TTTA 2 1 78729 CASAVA_Build 13 100620449 1I GAGAGCTTCA -/G GGTGTGTTAG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 2 3 78730 CASAVA_Build 13 100621613 2I ATGTATAATT --/TA TATGTCATGT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TA 1 2 78731 CASAVA_Build 13 100623096 1D GTTTTTCGTA T/- TTTTAGTAGA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 5 4 78732 CASAVA_Build 13 100625589 1I TTCATAACAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 52 het 27 0 22 5 T 9 10 78733 CASAVA_Build 13 100627740 4I TGTTGAAAAC ----/ACTT ACATTATAAC 2800 hom 15 het 8 0 6 2 ACTT 0 1 78734 CASAVA_Build 13 100629666 1I AAATTGCAGC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 T 8 9 78735 CASAVA_Build 13 100630740 1I TTTTTTTTTT -/G TATTTTTTGT 3070 hom 42 het 17 0 13 4 G 0 1 78736 CASAVA_Build 13 100631194 2D ACACGCTTTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TC 7 6 78737 CASAVA_Build 13 100635345 1D TAATAATTTC T/- TATCTTTAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 1 78738 CASAVA_Build 13 100639033 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TA 7 6 78739 CASAVA_Build 13 100639146 2D AAGTGATTCT CC/-- CCTGCCTCAG 3070 hom 66 het 24 0 22 2 C 4 2 78740 CASAVA_Build 13 100656942 3I TCTCACTGAT ---/AAC GTTTAACTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAC 0 1 78741 CASAVA_Build 13 100657080 2D GGTTTTTTAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 AT 9 8 78742 CASAVA_Build 13 100666034 1I GGAGGCTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 31 het 20 0 13 7 T 9 10 78743 CASAVA_Build 13 100671506 1D TCCTTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 22 1 15 6 T 12 11 78744 CASAVA_Build 13 100677007 10I TATGTGTGAT ----------/CCATTCAGAC CTGATGGCAA 3070 hom 92 het 35 0 23 12 CCATTCAGAC 0 1 78745 CASAVA_Build 13 100680018 5D TACTAAAATA TTATT/----- TTATAGTGCT 3070 hom 99 het 36 0 33 4 TTATT 1 0 78746 CASAVA_Build 13 100681193 2D CGCATGTATA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 hom 123 het 47 0 40 10 TG 5 4 78747 CASAVA_Build 13 100694527 1I TTTTCATTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 429 hom 33 1 24 8 A 9 10 78748 CASAVA_Build 13 100696068 1D CATTTCACAC T/- GACTTCTTAG 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 1 0 78749 CASAVA_Build 13 100703249 3D ATTGAGATAA AAG/--- AAGATAAAGC 3070 hom 84 het 34 0 29 6 AAG 2 1 78750 CASAVA_Build 13 100704228 1D AAAGAGTTTG C/- CAAACCCTGG 3070 hom 59 het 26 0 20 7 C 2 1 78751 CASAVA_Build 13 100705802 1D CACCTGCCCA C/- CCTGTGCTAG 3070 hom 123 het 50 0 39 11 C 3 2 78752 CASAVA_Build 13 100710134 2I ATATATACAC --/AT ATATATATTT 1427 hom 24 het 13 0 9 4 AT 4 5 78753 CASAVA_Build 13 100716634 11D TGTAACATAA GAAATCAGGTG/----------- GAAGAGATTA 1077 het 1077 ref 46 9 4 34 GAAATCAGGTG 1 0 78754 CASAVA_Build 13 100729465 1I AGCAGACATC -/A AACAACTAAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 2 3 78755 CASAVA_Build 13 100736102 3I TCATTCTGAG ---/AAT AATATAGACA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AAT 1 2 78756 CASAVA_Build 13 100753215 1D AAACATGTTT A/- AAATTGAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 16 9 A 4 3 78757 CASAVA_Build 13 100765353 22I AAGGAAGGGC ----------------------/TTTTCGAATGGGAAGAAAAGCT TTACAAAGGA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTTTCGAATGGGAAGAAAAGCT 0 1 78758 CASAVA_Build 13 100766242 1D ACCAAGCCTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 115 het 42 0 37 7 T 8 7 78759 CASAVA_Build 13 100766527 3D AATAAATGTC CTT/--- CTCATCAAAA 3070 het 3070 ref 38 26 8 5 CTT 1 0 78760 CASAVA_Build 13 100771083 4D CAGAGCTCTA TCCT/---- TCCTTGTTCC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TCCT 2 1 78761 CASAVA_Build 13 100784537 2D CGCACGTGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 48 16 17 17 CA 8 7 78762 CASAVA_Build 13 100785253 1D AAGGAAGAGA G/- GGAAGGAGGG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 G 3 2 78763 CASAVA_Build 13 100796267 1I GTCAGTTAAG -/A ACTGAAGCGA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 1 2 78764 CASAVA_Build 13 100799991 1I GCCATTCTGC -/T TTTTCCATCT 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 T 4 5 78765 CASAVA_Build 13 100807673 9D TAACCTGATA AGCAACTTC/--------- AGCAAATCTC 3070 het 3070 ref 21 12 9 3 AGCAACTTC 1 0 78766 CASAVA_Build 13 100815927 2I AGCAAACTGC --/AA AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 7 9 78767 CASAVA_Build 13 100817268 2D TCAGCAGCTC CT/-- CATTCCCTTG 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 CT 1 0 78768 CASAVA_Build 13 100817761 4D ATAACACTTT CTAA/---- CTAATTATTA 3070 het 3070 ref 25 11 13 3 CTAA 2 1 78769 CASAVA_Build 13 100824747 1D CTTGTCTCAG C/- CTCCCGATCA 3070 het 2893 hom 19 7 9 4 C 2 1 78770 CASAVA_Build 13 100828784 5D TGTTAAAATA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 37 21 14 4 AAAAT 3 2 78771 CASAVA_Build 13 100829251 1D AATATCACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 T 10 9 78772 CASAVA_Build 13 100829954 1D ACTCTCAGCC A/- AACTAACACA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 3 2 78773 CASAVA_Build 13 100830307 3D ACAGTTCTGC ATA/--- ATAATATTGG 3070 het 3070 ref 34 21 9 6 ATA 3 2 78774 CASAVA_Build 13 100830437 2I ATATATACAC --/AT ATATATACAT 3070 het 29 hom 42 2 25 15 AT 3 4 78775 CASAVA_Build 13 100830590 1I CAAGACTAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 A 8 9 78776 CASAVA_Build 13 100832208 1I TGTGTTAGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 9 10 78777 CASAVA_Build 13 100864909 4I CCGGAATGAT ----/AAAA AAAATCACCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 4 8 78778 CASAVA_Build 13 100865557 6D18M2I TACAAATCAC ACACATATATATATATATATACAT--/------ATATATATATATATACATAC ACATATATAT 3070 het 102 hom 16 1 12 4 N/A 0 0 78779 CASAVA_Build 13 100874516 1I GGATGGGAGA -/C AGCCTTAGTA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 C 0 1 78780 CASAVA_Build 13 100881062 4I CATTTAGAAT ----/TTAG TTAGAGTTTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TTAG 1 2 78781 CASAVA_Build 13 100883444 1D TTCAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 40 1 32 7 T 12 11 78782 CASAVA_Build 13 100885585 2D31M1I AAGGCTTCAC ATATAGTCTTTTTTTCTGTGTCTTGTACTTTTG-/--ATAGTCTTTTTTTCTGTGTCTTGTACTTTTGT TTTTTTTTAA 3070 hom 157 het 41 0 53 3 N/A 0 0 78783 CASAVA_Build 13 100886297 1D GTGCAATTTT A/- AAAACAAGTG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 5 4 78784 CASAVA_Build 13 100887528 1I GTACACTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 39 1 29 9 T 10 11 78785 CASAVA_Build 13 100891304 1D ACAGAACTAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 A 9 8 78786 CASAVA_Build 13 100891960 4D AGCAAGAAAA AAAC/---- AAACAATCCC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AAAC 2 1 78787 CASAVA_Build 13 100892900 3I20M10D ATAAAATATT ---TTGTATGTTAAAATATATAATATTTTATAT/TTGTTGTATGTTAAAATATATAA---------- TATATTAAAT 2702 hom 18 het 6 0 7 4 N/A 0 0 78788 CASAVA_Build 13 100893052 4I TATATATGTT ----/TATA TATGTGTGTA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TA 1 3 78789 CASAVA_Build 13 100894062 6I TTAAGCTTGA ------/AATACT AATACTCTCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AATACT 1 2 78790 CASAVA_Build 13 100895782 1I GAAGCTTGAA -/G GGGTCAAACT 3070 hom 166 het 61 0 56 5 G 3 4 78791 CASAVA_Build 13 100895884 5D GGCATCACTT TAAAG/----- TAAAAGAAAA 3070 hom 120 het 44 0 38 9 TAAAG 1 0 78792 CASAVA_Build 13 100897909 2D TCATATCCAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 30 0 29 3 TG 13 12 78793 CASAVA_Build 13 100911135 12I ATGTCACATG ------------/GCAAGAGAAGGA GCAAGAGATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GCAAGAGAAGGA 0 1 78794 CASAVA_Build 13 100921262 10I ATAAACAAAT ----------/AGCAGGATAA ATCATCTTAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AGCAGGATAA 0 1 78795 CASAVA_Build 13 100922365 4D TAACCATATT AATC/---- AATTACATAG 3070 het 2561 hom 17 6 11 3 AATC 1 0 78796 CASAVA_Build 13 100930796 2D CCATTTGATA AC/-- ACAAATACTA 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 AC 2 1 78797 CASAVA_Build 13 100932690 1D TGAGTATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 30 1 21 8 T 12 11 78798 CASAVA_Build 13 100933558 1I ATCTCACCTG -/T GAATCCTCTT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 T 0 1 78799 CASAVA_Build 13 100954676 11D GAGTCACGAT CCAGCAAAGAA/----------- CCTGAAAATG 3070 het 3070 hom 37 17 23 1 CCAGCAAAGAA 1 0 78800 CASAVA_Build 13 100955467 1D AGACCTTTAC A/- AAAGGCCAAC 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 A 4 3 78801 CASAVA_Build 13 100960256 4D ATAACAATTA ACTT/---- ACTTAATTCA 3070 het 3070 hom 44 18 22 10 ACTT 2 1 78802 CASAVA_Build 13 100974087 1D AATTCTTGGA G/- GGGTTGTGAC 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 G 4 3 78803 CASAVA_Build 13 100974482 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 9 11 T 15 16 78804 CASAVA_Build 13 100974742 1D ATTCTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 12 11 78805 CASAVA_Build 13 100975009 1I ATTCTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2966 hom 31 8 13 10 T 13 14 78806 CASAVA_Build 13 100975823 11I ATCACCTCCT -----------/TTTCCTACCTC TTTCTTGGCC 2844 het 2844 ref 25 15 7 3 TTTCCTACCTC 0 1 78807 CASAVA_Build 13 100977975 1I AACAGTTTTA -/C ATAATCCTCA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 C 0 1 78808 CASAVA_Build 13 100981400 1I TATTAGAGGA -/T TTTTTTTTAT 2338 het 2338 ref 28 17 6 5 T 8 9 78809 CASAVA_Build 13 100984121 2D TGGCTAAGCA TC/-- TCTTGGCTAA 3070 het 3070 hom 40 18 22 1 TC 2 1 78810 CASAVA_Build 13 100986406 1D CTTTTCTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 13 9 T 10 9 78811 CASAVA_Build 13 100987419 1I TTCCCCATTG -/T GATAAAACGT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 0 1 78812 CASAVA_Build 13 100997514 4I GTTTATTGAC ----/TTAG TTAGCACTTT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 TTAG 1 2 78813 CASAVA_Build 13 100998436 3I ACAGATAAAC ---/ACT ATAAAACTTT 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 ACT 0 1 78814 CASAVA_Build 13 101009264 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 17 15 12 TG 8 9 78815 CASAVA_Build 13 101024611 14I ATGCTGTTCT --------------/GTATACCTCAATCC CATGTGGTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 GTATACCTCAATCC 0 1 78816 CASAVA_Build 13 101027318 4I AAAAAAAAAA ----/GAAG AGAAGAAGAC 448 het 448 ref 40 8 4 28 GAAG 0 1 78817 CASAVA_Build 13 101030798 3I TTTTTATTAT ---/TTA TTATTATTAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTA 4 5 78818 CASAVA_Build 13 101031043 1I CACAGTCACC -/A TTTTTAAGTA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 0 1 78819 CASAVA_Build 13 101031363 1I AGATGAGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 T 9 10 78820 CASAVA_Build 13 101039059 2D AAAAAAAAAA AC/-- CTGATGTAAT 3070 het 150 hom 34 6 21 9 AC 1 0 78821 CASAVA_Build 13 101043601 4D GAATTATAAT AAAA/---- AAAGACAAAA 3070 het 3070 ref 39 25 10 4 A 7 3 78822 CASAVA_Build 13 101046407 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 92 het 36 0 31 5 TA 6 5 78823 CASAVA_Build 13 101054043 1I TCTCTTTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 8 9 78824 CASAVA_Build 13 101056958 1I ACTTTGGTTT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 A 7 8 78825 CASAVA_Build 13 101062922 1I ATGTAATTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 408 hom 34 1 32 1 A 9 10 78826 CASAVA_Build 13 101076550 3I TGATTTGTAG ---/TCT TCTTCATAGA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 TCT 1 2 78827 CASAVA_Build 13 101088786 1D CTTAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 13 12 78828 CASAVA_Build 13 101103596 4D TGTGCCATTG ACTA/---- ACTGAGGCCA 3070 het 3070 ref 39 23 16 1 ACTA 1 0 78829 CASAVA_Build 13 101105760 4I TATGCATTAA ----/TAAT TTATCTTCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAAT 0 1 78830 CASAVA_Build 13 101109518 1I TCAAGGGATT -/C CCCCTGCCTC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 4 5 78831 CASAVA_Build 13 101109879 1D TTATTCCTGC T/- GACAGAATTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 1 0 78832 CASAVA_Build 13 101113180 1I ATAGTCAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 52 het 41 1 34 6 T 9 10 78833 CASAVA_Build 13 101116862 1I GTGAGGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 28 7 T 10 11 78834 CASAVA_Build 13 101117832 1D TAACACTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 27 0 24 4 A 11 10 78835 CASAVA_Build 13 101118252 1I TTAAAAGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 26 0 17 9 A 13 14 78836 CASAVA_Build 13 101118972 1I GAGAACTAGC -/T TTGTCTAATA 3070 hom 85 het 33 0 29 4 T 2 3 78837 CASAVA_Build 13 101126420 4D TTTAAAAGTA ATAG/---- ATATTTTAGT 3070 hom 123 het 43 0 42 3 ATAG 1 0 78838 CASAVA_Build 13 101130885 1D GGGAATACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 T 13 12 78839 CASAVA_Build 13 101139395 1D CTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 12 11 78840 CASAVA_Build 13 101150973 1I TAAATTTAGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 9 78841 CASAVA_Build 13 101152933 1D ATTAAATTTG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 9 8 78842 CASAVA_Build 13 101153526 1D CACAGGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 50 1 40 9 A 13 12 78843 CASAVA_Build 13 101168917 3D TGTTTGGCAA ATC/--- ATCATCACTG 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 ATC 3 2 78844 CASAVA_Build 13 101170218 1I TAATTTCTGA -/G GGGGAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 4 5 78845 CASAVA_Build 13 101171792 4I TTGGTTTGCC ----/TTTA TTTATTTTCA 3070 het 3070 ref 44 25 11 8 TTTA 1 2 78846 CASAVA_Build 13 101172210 1I CTGATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1574 het 1574 ref 30 14 6 10 T 13 14 78847 CASAVA_Build 13 101174168 4D GAGTGACTGA TGGT/---- TGGGGAAAAC 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 TGGT 1 0 78848 CASAVA_Build 13 101175039 1I CTTAATTTGT -/C CAAACATTTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 1 2 78849 CASAVA_Build 13 101179008 1I ACTTGTCTTT -/A TTACTGAGAC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 0 1 78850 CASAVA_Build 13 101180108 5I AAAATCTCAC -----/CAAAT CAAAAGTCAG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 CAAAT 0 1 78851 CASAVA_Build 13 101184986 3D CAATATTAAC AAT/--- AATAATGATG 3070 het 3070 hom 47 21 24 4 AAT 3 2 78852 CASAVA_Build 13 101187788 1D TTTGCTGTGC A/- AAAAAATGAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 7 6 78853 CASAVA_Build 13 101205761 3I AGGCTGAATC ---/AGG AGGATTGCTT 3070 hom 117 het 43 0 37 6 AGG 1 2 78854 CASAVA_Build 13 101213546 2D ACCTGTGATT AC/-- AGTTAGAAAC 3070 hom 150 het 54 0 50 4 AC 1 0 78855 CASAVA_Build 13 101218345 1D GCCCATATTT G/- TATTTCATTG 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 G 1 0 78856 CASAVA_Build 13 101220479 1D GTAAAAACAT A/- AAAGTCTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 4 3 78857 CASAVA_Build 13 101221727 2D TGCCCCCCCA CC/-- CAAGTATTGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 3 1 78858 CASAVA_Build 13 101237532 1I AATAATGTAT -/C CTTCAACACA 3070 hom 160 het 60 0 54 6 C 1 2 78859 CASAVA_Build 13 101240198 4D TATTATGCCT CAGA/---- CAATTTTCAG 3070 hom 42 het 20 0 15 6 CAGA 1 0 78860 CASAVA_Build 13 101240478 1D CTAGTATTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 30 1 26 3 G 2 1 78861 CASAVA_Build 13 101240761 3D ATTCATTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 29 0 19 10 T 16 13 78862 CASAVA_Build 13 101242142 1D AAATGTGTCT A/- AAAAATTTGT 3070 hom 87 het 37 0 30 9 A 6 5 78863 CASAVA_Build 13 101244549 1D TCTCTCCCCC T/- GGTTCTCTTT 3070 hom 143 het 52 0 44 9 T 1 0 78864 CASAVA_Build 13 101253898 36D TATTGTTTTT TTGTATGTTTAGAATGCTGAAGTTAATAAACAGTAA/------------------------------------ TTGTATGTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 13 TTGTATGTTTAGAATGCTGAAGTTAATAAACAGTAA 2 1 78865 CASAVA_Build 13 101259513 2I AAATTTTCCC --/CT GTTTTATGTT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 CT 0 1 78866 CASAVA_Build 13 101266367 1I TCACGCCTGT -/A ATCCTAGCAC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 1 2 78867 CASAVA_Build 13 101271247 2I CTTTTTAGTC --/CA CAGTCTCCCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CA 1 2 78868 CASAVA_Build 13 101273627 2I AGGAATTGAC --/AG ATTGTTTTCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AG 0 1 78869 CASAVA_Build 13 101274267 4I TATTTTTCTT ----/AATC AATAATCAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AATC 0 1 78870 CASAVA_Build 13 101302946 1I TCCTTTCTTT -/A AAGTTTTATG 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 A 2 3 78871 CASAVA_Build 13 101329301 6I TATAAGGCCT ------/ACAAGA ACAAGTATTT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 ACAAGA 0 1 78872 CASAVA_Build 13 101330106 1I TTAGCTATGG -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 6 7 78873 CASAVA_Build 13 101331987 1D CAATCCATCA C/- TTACAATCAC 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 C 1 0 78874 CASAVA_Build 13 101332902 1D ATATTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 7 T 12 11 78875 CASAVA_Build 13 101363851 1I TAATAAAGGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 24 9 2 T 6 7 78876 CASAVA_Build 13 101364063 1I ACCTGCTCTT -/A AAAATCTCTG 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 4 5 78877 CASAVA_Build 13 101365976 3I AAGGCAGTGA ---/AAG AAGGTCATCC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AAG 1 2 78878 CASAVA_Build 13 101379226 1D GCACAGTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 16 10 T 10 9 78879 CASAVA_Build 13 101388636 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 25 11 5 A 8 9 78880 CASAVA_Build 13 101402765 1I TTTTGGCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2660 hom 32 10 13 9 T 12 13 78881 CASAVA_Build 13 101415109 1I TCTACTTTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 T 8 9 78882 CASAVA_Build 13 101440794 1D ATCAAAATCC T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 33 20 8 6 T 7 6 78883 CASAVA_Build 13 101448201 3D GAAGTTTTCT TTC/--- TTATCTTTAG 3070 het 3070 hom 28 10 15 5 TTC 1 0 78884 CASAVA_Build 13 101462823 4I AGGTTCATAC ----/ACAT ACATGCTCCT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 ACAT 1 2 78885 CASAVA_Build 13 101471274 1D ACACAGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 11 10 78886 CASAVA_Build 13 101474847 2I TCTGTGTTTT --/TG TACATTCTGA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 TG 0 1 78887 CASAVA_Build 13 101479058 1I GGAATATGGG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 T 0 1 78888 CASAVA_Build 13 101483849 2D CGTGTGCACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 CA 9 8 78889 CASAVA_Build 13 101490328 1I TTTACATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 A 11 12 78890 CASAVA_Build 13 101491718 2D GTGTGAAATT AG/-- AGTCATTATG 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 AG 2 1 78891 CASAVA_Build 13 101491888 4D43M1I TAAAAAAAAA AAACAGTGTATGTTAAGCCATGCAAAAATTACTTTGTGTTTCCATGT-/----AGTGTATGTTAAGCCATGCAAAAATTACTTTGTGTTTCCATGTA AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 28 4 10 25 N/A 0 0 78892 CASAVA_Build 13 101492997 1D GCACAAAGGT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 A 8 7 78893 CASAVA_Build 13 101498572 1D CATAACCTTG C/- TCTGTTGTTC 3070 het 3070 ref 48 27 19 3 C 1 0 78894 CASAVA_Build 13 101499478 1D AAATTTTAGG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 8 7 78895 CASAVA_Build 13 101500342 1D ATCCAACCAG T/- TTGGGACACT 3070 het 3070 hom 51 22 24 6 T 3 2 78896 CASAVA_Build 13 101502838 31D ATTTGAAAAA TTGTAACCAATTTTTCAAAGACAGAGAGGAT/------------------------------- ACTAAAAGTA 3070 het 3070 ref 26 17 14 2 TTGTAACCAATTTTTCAAAGACAGAGAGGAT 1 0 78897 CASAVA_Build 13 101509299 1I AGTCTTAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 34 1 21 12 A 14 15 78898 CASAVA_Build 13 101513967 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2972 hom 21 8 12 1 A 12 13 78899 CASAVA_Build 13 101519291 1I GGGCTCCTGA -/G TCTGGTGGGG 3070 hom 33 het 14 0 11 3 G 0 1 78900 CASAVA_Build 13 101521308 6D ACAAAACAAA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 116 het 47 0 39 11 AC 12 9 78901 CASAVA_Build 13 101524006 1I AAACCTTTCA -/T TTAGTTGACT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 2 3 78902 CASAVA_Build 13 101533784 1D GTTTTTTTTT A/- AAATTAACCC 3070 het 3070 hom 47 12 28 8 A 4 3 78903 CASAVA_Build 13 101542972 1D TCTTAGCCCC T/- ATAAACACAT 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 1 0 78904 CASAVA_Build 13 101553696 1D GAATAGAAAG A/- AAAAAACTTA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 7 6 78905 CASAVA_Build 13 101553819 2I GAGCCCCTGA --/TT TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 T 8 10 78906 CASAVA_Build 13 101556931 8D TGTCGAAAAA GAGGGAGG/-------- GAGGGAGGGA 1691 het 1488 hom 17 3 6 9 GAGG 6 4 78907 CASAVA_Build 13 101559349 1I TAGGTTTCAT -/G GATGGTCATG 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 G 1 2 78908 CASAVA_Build 13 101559449 3I ATTTCTAGAG ---/AGA AGGTCTTTCA 3070 het 3070 ref 37 19 18 0 AGA 0 1 78909 CASAVA_Build 13 101566166 1I AACCAAAAAT -/A AAAGTAGAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 3 4 78910 CASAVA_Build 13 101567915 1D TATAAGGCAC A/- AGGAGGCATT 3070 hom 96 het 37 0 30 7 A 2 1 78911 CASAVA_Build 13 101568743 5I AAACTTTGAC -----/AACTT AACGGACCAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AACTT 0 1 78912 CASAVA_Build 13 101571790 1D ATATTTTGAA T/- AAAAAAATCT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 1 0 78913 CASAVA_Build 13 101573956 6I CTATGAAGCT ------/GTCTAA GTCCTTAGAT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 GTCTAA 0 1 78914 CASAVA_Build 13 101576525 3D AAAACTTTAT TCA/--- TCATCCCAAA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 TCA 2 1 78915 CASAVA_Build 13 101577851 1D CTTCTTATTC T/- GTAAGAGTTA 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 T 1 0 78916 CASAVA_Build 13 101582863 5D TCTTTCTTTC TTTCT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1386 hom 30 8 15 7 TTTCT 1 0 78917 CASAVA_Build 13 101592745 1D TTTACTCCTT A/- AAAAAAAAAA 700 het 700 ref 38 29 3 6 A 11 10 78918 CASAVA_Build 13 101600647 1D TGTTTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 31 1 25 5 T 12 11 78919 CASAVA_Build 13 101608886 1D TGGGGGTAGC G/- GGGGGGGGAT 1261 hom 10 het 4 0 4 1 G 9 8 78920 CASAVA_Build 13 101611917 1D8M7I AACTTTCTGT GAAGAAAGA-------/-TAGTCATAGTACCCC AAGAAGAAGA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 N/A 0 0 78921 CASAVA_Build 13 101616017 1I GGCCTGTTGT -/G GGGTGGGGGG 1080 hom 7 het 3 0 3 0 G 3 4 78922 CASAVA_Build 13 101618146 1D ATGCTAGCTC T/- TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 29 14 7 8 T 15 14 78923 CASAVA_Build 13 101622244 1D ATATTCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2363 hom 26 6 14 6 T 13 12 78924 CASAVA_Build 13 101644252 1I CAGTCATGAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 7 8 78925 CASAVA_Build 13 101644787 1I CCTCCCACTG -/C CCCCCCTGAC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 6 7 78926 CASAVA_Build 13 101645931 4D AAAAAGAGAG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2297 hom 21 6 11 6 AAAC 3 2 78927 CASAVA_Build 13 101646291 4D AATTTGTTGT AGAC/---- AGACAGAAAA 2151 het 2151 ref 24 11 6 8 AGAC 2 1 78928 CASAVA_Build 13 101647567 1I CTTCTTCACA -/T TTCTCCTTTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 2 3 78929 CASAVA_Build 13 101682650 6D AGAATAAAAC TAAAAA/------ TAACTTTCAC 3070 hom 105 het 38 0 35 8 TAAAAA 1 0 78930 CASAVA_Build 13 101683803 1I TTTAACTTGC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 8 9 78931 CASAVA_Build 13 101694815 1I ACTTTAAATG -/A AAAAAAAAAA 1186 het 1186 ref 24 16 3 5 A 12 13 78932 CASAVA_Build 13 101714363 1I TTCTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 534 hom 37 2 17 18 T 13 14 78933 CASAVA_Build 13 101714904 3I TTGGGGTTCT ---/AGC ATAGCAGAAA 3070 hom 135 het 53 0 46 7 AGC 0 1 78934 CASAVA_Build 13 101721862 2D AAGCTAAAAT CA/-- AATATTATTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 5 CA 1 0 78935 CASAVA_Build 13 101724296 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 30 2 20 8 A 14 16 78936 CASAVA_Build 13 101726033 1D CAAATAGGAC T/- TCTAAAGTTC 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 T 2 1 78937 CASAVA_Build 13 101728979 4D ATTTTATGTA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3024 hom 30 13 12 5 AT 9 7 78938 CASAVA_Build 13 101729598 3D AATGTTTTCA TTC/--- TTCTCCCAAG 3070 het 3070 ref 37 21 16 2 TTC 2 1 78939 CASAVA_Build 13 101737700 1D AGCAAAGCCA C/- CTTAGTTTAT 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 C 2 1 78940 CASAVA_Build 13 101743501 1D AGGCTCCGTG T/- TTCTTCCCCT 3070 het 3070 hom 48 20 20 9 T 3 2 78941 CASAVA_Build 13 101746470 1I CAATTAAAAG -/T TTTTGCATCC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 4 5 78942 CASAVA_Build 13 101748074 1D CTACCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 23 0 13 11 A 13 12 78943 CASAVA_Build 13 101751326 3D GTTTAACCTT AAC/--- AACATTTCAA 2417 het 2417 ref 23 9 5 10 AAC 2 1 78944 CASAVA_Build 13 101756770 4I GATGATGGAG ----/TTCC GGGAAGACAA 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 TTCC 0 1 78945 CASAVA_Build 13 101762574 1D GACCTAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 25 0 17 8 A 17 16 78946 CASAVA_Build 13 101764450 1D TTACGTATTG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 41 16 20 7 A 8 7 78947 CASAVA_Build 13 101770615 1I TGAAAACTCC -/A AAAAAAAAAA 1443 het 1443 ref 38 16 8 14 A 15 16 78948 CASAVA_Build 13 101778211 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAG 2641 het 2641 ref 20 9 7 4 A 9 10 78949 CASAVA_Build 13 101789361 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 23 0 17 6 A 16 14 78950 CASAVA_Build 13 101800728 1D CTCTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 1803 het 1803 ref 30 13 6 11 A 17 16 78951 CASAVA_Build 13 101807280 2D TATAAAATGC AT/-- ATATATATAT 2828 het 1759 hom 21 6 8 7 AT 10 9 78952 CASAVA_Build 13 101807475 1I CATTATAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 122 hom 28 1 17 10 T 13 14 78953 CASAVA_Build 13 101824996 38D TTACATATTT TATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------- TATATATATA 3070 het 83 hom 8 1 8 3 TA 26 7 78954 CASAVA_Build 13 101827439 1D CTAGGTCACC T/- TTTTTTTTTT 1567 het 1567 ref 47 39 4 4 T 12 11 78955 CASAVA_Build 13 101840141 1I ATTGCCCCTG -/A AAAGGATTTT 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 A 3 4 78956 CASAVA_Build 13 101858269 1D TGTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 12 11 78957 CASAVA_Build 13 101861298 1D ATAAGTGGTT A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 7 6 78958 CASAVA_Build 13 101867518 1I AAGGTAAAAT -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 6 7 78959 CASAVA_Build 13 101879889 4I TTTTTATTCA ----/TCTG TCTATGTGAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TCTG 0 1 78960 CASAVA_Build 13 101886642 5D TCGGGAGGCT GAGGC/----- GAGGCAGGAG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 GAGGC 2 1 78961 CASAVA_Build 13 101907981 2D GTCATGTGGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 314 hom 40 7 17 19 GT 16 15 78962 CASAVA_Build 13 101917602 1D CAATTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 11 10 78963 CASAVA_Build 13 101919915 1I GTATAGTTTT -/G GGTTTTACAT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 G 2 3 78964 CASAVA_Build 13 101924584 1D ATATACACAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 31 8 17 7 A 9 8 78965 CASAVA_Build 13 101925325 1I AAAGCAGCAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 19 10 0 T 7 8 78966 CASAVA_Build 13 101926271 5I TACAGGAAAC -----/CCCCT GCATACTGAC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 CCCCT 0 1 78967 CASAVA_Build 13 101932216 5D GAAGTTCTTA ACTTT/----- ATTTTCAATG 3070 het 3070 ref 55 29 18 8 ACTTT 1 0 78968 CASAVA_Build 13 101932910 1D ACTCTGTCCC A/- AAAATAAATA 3070 het 2810 hom 22 7 13 3 A 5 4 78969 CASAVA_Build 13 101934544 1I TTCAGGATAT -/A ATTAAAAATG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 1 2 78970 CASAVA_Build 13 101939169 1I ATCCCAATTC -/A AAAAAAAAAA 1877 het 1877 ref 40 17 6 17 A 16 17 78971 CASAVA_Build 13 101984133 1I TCTGCTCTCA -/T AACCCTGTCT 1460 het 81 hom 4 1 3 0 T 0 1 78972 CASAVA_Build 13 101987566 1I ATGATTTTGC -/T TTTTTTTGAC 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 7 8 78973 CASAVA_Build 13 101997933 1I AACAATCAAT -/A ATTATGTAAT 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 A 1 2 78974 CASAVA_Build 13 102002093 10D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAG 2788 het 875 hom 15 4 7 9 A 19 9 78975 CASAVA_Build 13 102005465 2D AGAGAGAGAG AA/-- AGAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 3 1 78976 CASAVA_Build 13 102012187 1D TTTGCTATAT C/- CCATAAGTTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 C 3 2 78977 CASAVA_Build 13 102013730 2D AAAAAAAAAA AG/-- TGTGTCAGTA 1446 het 56 hom 27 2 6 20 AG 1 0 78978 CASAVA_Build 13 102017780 1I GCATTAAAAT -/A TAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 0 1 78979 CASAVA_Build 13 102021456 1I AACAAAAAAA -/G TCCTGAAAGG 2389 het 2389 ref 26 14 6 6 G 0 1 78980 CASAVA_Build 13 102025177 1D CTATTTTTAA T/- TTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 7 6 78981 CASAVA_Build 13 102029414 2I AAAAAAAAAA --/AT AAAAAAAAAA 3070 het 864 hom 19 8 9 4 AT 0 1 78982 CASAVA_Build 13 102036355 1I GTCCTCTTTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 7 8 78983 CASAVA_Build 13 102041009 1I TGCCTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 10 11 78984 CASAVA_Build 13 102050338 1D TAGATTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2171 hom 33 7 14 12 A 15 14 78985 CASAVA_Build 13 102054227 3I GGGACCACTT ---/AGG AGGTAATTCA 3070 het 3070 ref 52 32 16 4 AGG 1 2 78986 CASAVA_Build 13 102055066 2D ATACACACAC AT/-- ATATATGTGG 3070 het 3070 hom 43 16 22 7 AT 4 3 78987 CASAVA_Build 13 102059663 1I ACAATCATGG -/T GGAAGGTGAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 0 1 78988 CASAVA_Build 13 102089135 8D TTATTCCTCT GGAACCAA/-------- GGAAAAATCA 3070 het 3070 ref 54 27 28 3 GGAACCAA 1 0 78989 CASAVA_Build 13 102090012 2D TCCTAATAAC AG/-- GGCCTCATGT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 AG 1 0 78990 CASAVA_Build 13 102093487 1I66M4D ATGGGAATTA -TCCCTAAGTGGGCATTATTAAAGCCACTTTATGTCAATTTTAGGTCTTATAAGTTTAAAGCTTTGCTTCT/TTCCCTAAGTGGGCATTATTAAAGCCACTTTATGTCAATTTTAGGTCTTATAAGTTTAAAGCTTTGC---- TTCTTTCTTA 3070 het 3070 ref 33 31 16 11 N/A 0 0 78991 CASAVA_Build 13 102094821 2I GTTTGAAAAC --/AT AGAATTGCTC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 AT 0 1 78992 CASAVA_Build 13 102095437 1D AAAAAGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2749 hom 31 9 15 7 T 12 11 78993 CASAVA_Build 13 102096335 3D AACACTTTTA GTT/--- GTCACCCTAG 3070 het 3070 hom 43 18 23 3 GTT 1 0 78994 CASAVA_Build 13 102099621 1I TTGGCTGAAG -/T TATTTCTTCC 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 1 2 78995 CASAVA_Build 13 102101931 1D TTTCTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 T 13 12 78996 CASAVA_Build 13 102102749 36D ACATACATAC ATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------ ATATATATAT 1503 het 32 hom 5 1 4 1 AT 28 10 78997 CASAVA_Build 13 102102981 3I TAACAGCTTA ---/AAT TCCTTTATTA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 AAT 0 1 78998 CASAVA_Build 13 102109112 1I TCCAGCTCCT -/G GGGGGAGGGA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 G 5 6 78999 CASAVA_Build 13 102110333 5D17M4D GACTGCAGAT AGTAAAGTAATTATTATAACAGTTAA/-----AGTAATTATTATAACAG---- TTAATTGGTG 3070 het 3070 ref 31 17 15 4 N/A 0 0 79000 CASAVA_Build 13 102110790 2I CATGTTTAAC --/AA AAGAGATGTA 3070 het 3070 ref 42 24 18 0 A 2 4 79001 CASAVA_Build 13 102111457 1D GTAACATAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 9 8 79002 CASAVA_Build 13 102117566 2I AATCTTAAAA --/GT AATATTAACT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 GT 0 1 79003 CASAVA_Build 13 102120523 1I TATTGTGGGT -/G GGGGGGGTGT 3070 hom 108 het 38 0 34 4 G 7 8 79004 CASAVA_Build 13 102122234 1I CCGAGCCTCC -/A ACTAGCTTTA 2976 het 2976 ref 25 14 7 4 A 1 2 79005 CASAVA_Build 13 102127723 1D CTCCACTCTG C/- CCCCCCCGCT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 C 8 7 79006 CASAVA_Build 13 102133494 1I GTTGTGAGAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 8 9 79007 CASAVA_Build 13 102139222 2D AACATTCCCC CG/-- CCAGCCCCTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CG 1 0 79008 CASAVA_Build 13 102142643 1D CCCTCAGGTC G/- GGGGCAGGGC 3070 het 3070 hom 42 14 23 8 G 5 4 79009 CASAVA_Build 13 102142922 1I GCAGCACACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 A 10 11 79010 CASAVA_Build 13 102148086 1D CAAGGCAGGG A/- TTTGAGTGAA 3070 het 3070 hom 34 10 16 9 A 1 0 79011 CASAVA_Build 13 102157450 4I TAATGGTGAG ----/TACA TACATGTCAT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 TACA 1 2 79012 CASAVA_Build 13 102179325 1I AAAGGATGTT -/C CCTTCTGTCA 3070 hom 163 het 60 0 55 5 C 2 3 79013 CASAVA_Build 13 102204670 2D TCAGCACAGT TC/-- TCTCTAATTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 TC 3 2 79014 CASAVA_Build 13 102205631 1I CACTCCATCT -/C CTAATGCAGT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 C 1 2 79015 CASAVA_Build 13 102206693 1I GTATAGTGAG -/T TTAAGTCATT 1730 hom 13 het 14 0 6 8 T 2 3 79016 CASAVA_Build 13 102207711 15I ATCCTCTGAT ---------------/TCACACAGCGACTAG TCACACAGTG 3070 hom 120 het 45 0 36 9 TCACACAGCGACTAG 0 1 79017 CASAVA_Build 13 102213355 1I AAAAAAACAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 8 9 79018 CASAVA_Build 13 102218673 1I CTAGAAAAAT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 7 8 79019 CASAVA_Build 13 102221506 1I TTTCACACGA -/G TGTAAGTGTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 0 1 79020 CASAVA_Build 13 102225059 1D TAATGCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 23 0 14 9 A 11 10 79021 CASAVA_Build 13 102226537 2I ATGTAGATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 AT 6 7 79022 CASAVA_Build 13 102229785 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 635 hom 27 2 23 2 A 10 11 79023 CASAVA_Build 13 102232075 2I CTCCAGGGCA --/TG TGTCAGAGAC 2728 het 2728 ref 23 11 6 6 TG 1 2 79024 CASAVA_Build 13 102236936 1I TTTCCATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 14 14 T 10 11 79025 CASAVA_Build 13 102243611 1I CCTGATAGTG -/T TATAATTTGT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 1 2 79026 CASAVA_Build 13 102245283 1D ACTGCTATTC T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 21 8 5 8 T 17 16 79027 CASAVA_Build 13 102252982 1D ATGATCTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 10 9 79028 CASAVA_Build 13 102256530 1D GTGAGGTGTT A/- ATCTCATTGT 3070 het 3070 ref 57 31 21 6 A 2 1 79029 CASAVA_Build 13 102260142 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 19 4 10 5 C 0 1 79030 CASAVA_Build 13 102277809 1D CTACTTTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 104 het 40 0 35 5 T 10 9 79031 CASAVA_Build 13 102279085 2I AGTTGTATTT --/AA AAGATGTCAG 3070 hom 98 het 43 0 29 14 A 2 4 79032 CASAVA_Build 13 102280215 4D ATAAAATAAA TAAT/---- TAAATAAATG 1521 het 909 hom 12 5 7 0 TAAT 1 0 79033 CASAVA_Build 13 102282337 1I CAGAACTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 26 0 22 4 A 10 11 79034 CASAVA_Build 13 102286553 5D AATTTTCTTC TTTTA/----- TATGTTTTGT 3070 het 3070 ref 20 11 8 2 TTTTA 1 0 79035 CASAVA_Build 13 102290642 1I ATCTGCCCTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 9 79036 CASAVA_Build 13 102298517 3I CATTCTAGTC ---/ATA ATGACAACCT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 ATA 0 1 79037 CASAVA_Build 13 102300295 2I TTTTTTTTTT --/TC CTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 TC 0 1 79038 CASAVA_Build 13 102304364 1D TAGGCTGCCA T/- TTTGACCTGG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 4 3 79039 CASAVA_Build 13 102306649 2I TACACACGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TA 7 8 79040 CASAVA_Build 13 102319802 5I TAATTTTAGA -----/CTTCT CTTCACACAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CTTCT 0 1 79041 CASAVA_Build 13 102321971 2D CATATGTATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TA 6 5 79042 CASAVA_Build 13 102336825 8I TTATGTATAT --------/TATTATTG ACAATTTTAT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 TATTATTG 0 1 79043 CASAVA_Build 13 102339077 1D AACAAAAAAA C/- AAACTATTAC 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 C 1 0 79044 CASAVA_Build 13 102346456 3D TAATGGTGCA ATT/--- ATTATTTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 ATT 3 2 79045 CASAVA_Build 13 102367775 2D GAGAGCAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 28 3 10 15 T 13 11 79046 CASAVA_Build 13 102376459 2I ATTCTCATTT --/TC TCTCTTGTCT 3070 hom 30 het 33 1 30 2 TC 2 3 79047 CASAVA_Build 13 102390813 2I47M3D CCCAGAGTTC --TGTTTAGCAACTCAAAGGTTCTGCGGATTCTTAAGCAGGAGGATGACATT/TGTGTTTAGCAACTCAAAGGTTCTGCGGATTCTTAAGCAGGAGGACGAC--- ATGAATAGTG 3070 hom 129 het 46 0 43 22 N/A 0 0 79048 CASAVA_Build 13 102402214 1D GGCTTTCACT A/- AAAGGCTCAG 3070 hom 111 het 41 0 36 5 A 4 3 79049 CASAVA_Build 13 102411213 1I TCTTTGCCAC -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 6 7 79050 CASAVA_Build 13 102412535 1D CCTTTTATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2978 hom 32 8 16 9 A 11 10 79051 CASAVA_Build 13 102413173 1D GAAAACGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 T 11 10 79052 CASAVA_Build 13 102420563 1D AGCATGGGTG A/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 7 6 79053 CASAVA_Build 13 102427112 1I CTGAAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3019 hom 33 8 12 13 T 13 14 79054 CASAVA_Build 13 102443306 1D TACTAATTTT C/- CCCCCAGATT 2317 het 2317 ref 17 11 5 1 C 6 5 79055 CASAVA_Build 13 102444365 2D GAATTTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2068 hom 34 11 12 11 T 14 12 79056 CASAVA_Build 13 102447503 1D TGTCATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 11 10 79057 CASAVA_Build 13 102459367 2I AACAACTAAC --/AT GTGGTATAAA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AT 0 1 79058 CASAVA_Build 13 102465504 1I ATTTTTTTTT -/G GTGATAAGGT 3070 hom 84 het 32 0 27 5 G 1 2 79059 CASAVA_Build 13 102468824 1D CGCTCCTCAT A/- AAAAAAACAT 3070 hom 90 het 35 0 31 6 A 8 7 79060 CASAVA_Build 13 102474778 2D TGTTCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2655 hom 29 9 14 6 T 14 12 79061 CASAVA_Build 13 102476341 4I CCTCTCTCTT ----/TCTC TCTCTCTTTC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 TC 3 5 79062 CASAVA_Build 13 102476788 4I TACTAATTAA ----/TTTC TTTCTCTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTTC 1 2 79063 CASAVA_Build 13 102477638 1D CTTCATTTTT G/- GGGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 G 8 7 79064 CASAVA_Build 13 102477896 1I TGGTGCTGGG -/C CCATGAGGTT 3070 hom 100 het 37 0 30 7 C 2 3 79065 CASAVA_Build 13 102481748 1I ATTTATTGCA -/C CTACTCATTG 3070 het 3070 ref 50 28 16 6 C 1 2 79066 CASAVA_Build 13 102481952 1I ACTTAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 A 9 10 79067 CASAVA_Build 13 102488673 5D TATAAAGTTA ATTAT/----- ATTATATCAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ATTAT 2 1 79068 CASAVA_Build 13 102495457 5D AATTGACTCT AGTTA/----- AGCATTTCAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 6 AGTTA 1 0 79069 CASAVA_Build 13 102502295 1D ACTGTTGTTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 8 7 79070 CASAVA_Build 13 102502791 2I GAGATCCCAC --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CT 5 6 79071 CASAVA_Build 13 102504208 1I TAAGAGTAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 9 10 79072 CASAVA_Build 13 102504469 1D ATTGAATTGT G/- GGGGGCAGAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 6 5 79073 CASAVA_Build 13 102511753 1I ATAAAATCAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 439 hom 27 2 21 4 T 8 9 79074 CASAVA_Build 13 102513560 2D CTATTGTCTA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 10 8 79075 CASAVA_Build 13 102515098 1D GGCTTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 41 0 26 16 A 12 11 79076 CASAVA_Build 13 102517631 1D TGAAATTCGA T/- TTTTTTTTTT 2500 het 2500 ref 30 13 8 9 T 13 12 79077 CASAVA_Build 13 102524909 1I TTCCATTGCC -/T TTTTTTTTTT 2461 het 2461 ref 38 19 8 11 T 12 13 79078 CASAVA_Build 13 102533764 11D GATCAGAAGG AATTTGTGAGT/----------- AAGAGCAAGA 3070 het 3070 ref 42 24 16 5 AATTTGTGAGT 1 0 79079 CASAVA_Build 13 102540825 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2152 het 35 hom 14 1 8 5 T 12 11 79080 CASAVA_Build 13 102562236 1I TTCTGCAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 9 10 79081 CASAVA_Build 13 102567111 1D TTTGGTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 41 1 27 13 T 15 14 79082 CASAVA_Build 13 102575052 1I ACTCCATCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 17 1 12 4 A 11 12 79083 CASAVA_Build 13 102575309 1D TCTTCTTTGC T/- ATTTTAGTGG 3070 hom 108 het 42 0 36 7 T 1 0 79084 CASAVA_Build 13 102579201 2D TTTAAGTATC TA/-- TAACTATTTC 3070 hom 87 het 30 0 29 1 TA 2 1 79085 CASAVA_Build 13 102605281 1D ACTGTAAACC T/- TCCTTTTTTG 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 2 1 79086 CASAVA_Build 13 102632411 1I CCTTCAGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 340 hom 51 1 40 10 T 9 10 79087 CASAVA_Build 13 102643152 1I GAGAAGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 656 hom 47 2 29 16 T 13 14 79088 CASAVA_Build 13 102643331 1I AAGGTAGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 130 het 47 0 44 3 A 9 10 79089 CASAVA_Build 13 102646067 1D GTATCACTTT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 69 het 30 0 24 7 A 8 7 79090 CASAVA_Build 13 102653041 1D TGGTCCTAAT A/- ACAGCTACAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 2 1 79091 CASAVA_Build 13 102653130 4D GGCTTTCTAT GTTA/---- GTTGGTTGAG 3070 hom 57 het 21 0 20 2 GTTA 1 0 79092 CASAVA_Build 13 102659605 4D TTTTTTTTAG TTTT/---- TTTTATTTAT 3070 hom 92 het 33 0 31 3 T 8 4 79093 CASAVA_Build 13 102659784 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1927 hom 25 8 14 4 T 10 9 79094 CASAVA_Build 13 102662054 1I CTTGAACTCA -/C GAGGCAGAGG 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 0 1 79095 CASAVA_Build 13 102662323 1I TGATTGTCTA -/T TTTTTACAAA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 5 6 79096 CASAVA_Build 13 102662616 3I CCTTGGTCTC ---/ATT AACACAATTC 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 ATT 0 1 79097 CASAVA_Build 13 102669117 1I CTTTAGAGGG -/T TTTTTTGGTC 2254 het 2254 ref 30 13 9 8 T 6 7 79098 CASAVA_Build 13 102670049 1D CCACAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 A 11 10 79099 CASAVA_Build 13 102670614 2I GACAGCACTC --/TT TTGTCTAAAG 3070 hom 148 het 51 0 50 1 T 2 4 79100 CASAVA_Build 13 102690750 1I AGGTAAAGAC -/A AAAAAATCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 79101 CASAVA_Build 13 102699937 8D AGGTGCCGTG GAAGAACA/-------- GAGAATAAGA 3070 hom 96 het 36 0 32 8 GAAGAACA 1 0 79102 CASAVA_Build 13 102708479 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 867 het 867 ref 15 9 3 3 A 13 12 79103 CASAVA_Build 13 102716908 1I TCACTGAGCC -/T TTTCGAGTCA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 T 3 4 79104 CASAVA_Build 13 102766824 2I TAGAAACCTT --/TC TGCCATATGC 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 TC 0 1 79105 CASAVA_Build 13 102768967 5I TGCTTTACTT -----/TGATA TCATATTATT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 TGATA 0 1 79106 CASAVA_Build 13 102770297 1I AATGCTTATG -/T TTTTCTCTTG 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 4 5 79107 CASAVA_Build 13 102771131 1I TTTGCTAGTG -/T TTTTTCCAGA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 5 6 79108 CASAVA_Build 13 102774274 1I TTCTAAATAC -/A AGGTCAAGTA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 1 2 79109 CASAVA_Build 13 102774657 4I AACCTTTCTG ----/TTGT TTATTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 TTGT 0 1 79110 CASAVA_Build 13 102774810 1D AAGAGTTCTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 T 9 8 79111 CASAVA_Build 13 102775796 2D AGAAGTAAGA CT/-- CTCTTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 CT 3 2 79112 CASAVA_Build 13 102779373 2I CAGATATGAT --/TG TGTGGGGGCT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 TG 2 3 79113 CASAVA_Build 13 102779639 1I AATCACATCT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 A 7 8 79114 CASAVA_Build 13 102781429 2I ATTTAATAAC --/TA TGAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TA 0 1 79115 CASAVA_Build 13 102781995 2I TCGTAAAACT --/TA TAGTCTCACG 3070 het 3070 hom 38 9 21 8 TA 1 2 79116 CASAVA_Build 13 102782112 3D CACAGGAAAT AAC/--- AACACATTCT 3070 het 3070 ref 35 19 12 6 AAC 2 1 79117 CASAVA_Build 13 102783106 5D GGCAGCAGAC AAGAG/----- AAGAGAGCAT 3070 het 3070 hom 33 10 22 5 AAGAG 2 1 79118 CASAVA_Build 13 102787622 3I83M2I TTCTCTGTAG ---GAAGAATGTAGGCTGTCAAAAATTGTAATTTCAACTGAAAAGTGACGTATCGATGTATTGATGCAGTACAGAACATATCTGAC--/GAAGAAGAATGTAGGCTGTCAAAAATTGTAATTTCAACTGAAAAGTGACGTATCGATGTATTGATGCAGTACAGAACATATCTGACAT GTGTATTGCC 3070 het 520 hom 41 5 34 28 N/A 0 0 79119 CASAVA_Build 13 102789082 1I TGACATACTA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 79120 CASAVA_Build 13 102789909 16I CTGCTGGATT ----------------/GTATGGTAGTTCTATA TCTCTTTGAG 3070 hom 59 het 22 0 20 3 GTATGGTAGTTCTATA 0 1 79121 CASAVA_Build 13 102790673 3I CTCTGTTTTG ---/TTT TTTTTTTATA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 7 10 79122 CASAVA_Build 13 102790838 1D TTTAGGCTTG T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 7 6 79123 CASAVA_Build 13 102792862 1D40M1D TTTTAAAGAA TTTTTTTCATAATTTTTTCTTTGACCCAGTGGTCACTTACGA/-TTTTTTCATAATTTTTTCTTTGACCCAGTGGTCACTTACG- AGCAGGTTGT 3070 hom 63 het 24 0 22 9 N/A 0 0 79124 CASAVA_Build 13 102794772 1D TGTCTAAATA C/- CTTGCTACAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 2 1 79125 CASAVA_Build 13 102795747 6I AAAAAAAAAA ------/AAAAAG AAAAAGAAAA 2558 het 2558 ref 31 12 13 6 AAAAAG 2 3 79126 CASAVA_Build 13 102823932 1I TCCTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 1551 het 1551 ref 42 33 4 5 T 10 11 79127 CASAVA_Build 13 102873232 1D TCAACCCAGG C/- CCTGCTTCTT 3070 het 3070 ref 35 23 10 3 C 3 2 79128 CASAVA_Build 13 102875760 1D AGAAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 11 10 79129 CASAVA_Build 13 102879926 2D GCAGCCTCCA TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 10 8 79130 CASAVA_Build 13 102881631 1I GTTCTCTTTT -/C TGATTCCTTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 0 1 79131 CASAVA_Build 13 102884049 1I TCTTACTGCT -/C CCCCCCCTGT 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 C 7 8 79132 CASAVA_Build 13 102885161 4D GTTCCCTGAC AGTT/---- AGCTGCACTT 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 AGTT 1 0 79133 CASAVA_Build 13 102885976 6I GGCTTTATAA ------/TTTACT TTTATAGTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TTTACT 0 1 79134 CASAVA_Build 13 102887944 1I TTCTTAATAA -/T TCTTATTTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 2 79135 CASAVA_Build 13 102899981 1I ATACAGCAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 T 8 9 79136 CASAVA_Build 13 102901264 5I ATATTTTTAG -----/ATTTT ATTAGTTTCA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 ATTTT 0 1 79137 CASAVA_Build 13 102903482 1D CAGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 22 6 A 11 10 79138 CASAVA_Build 13 102908883 17D TATGTGTATA TATATATGATATATATG/----------------- TATATATGAT 1907 het 1775 hom 10 4 5 2 TATATATGATATATATG 2 1 79139 CASAVA_Build 13 102910823 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 48 hom 16 1 9 6 CA 9 8 79140 CASAVA_Build 13 102911466 4I TTTGTTATGT ----/TTTG TTTCTCTTAT 2588 het 2588 ref 27 16 6 5 TTTG 0 1 79141 CASAVA_Build 13 102912438 1D TTAGCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 34 0 15 19 T 12 11 79142 CASAVA_Build 13 102913265 4I TCAGAAGAGT ----/TAGA TAGGAGGAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TAGA 0 1 79143 CASAVA_Build 13 102914331 4I CATTTATATC ----/TTCT TTATTAAAAT 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 TTCT 0 1 79144 CASAVA_Build 13 102915190 3D GCTTGCTGAA CTC/--- CTAGCGACTG 3070 hom 87 het 33 0 26 9 CTC 1 0 79145 CASAVA_Build 13 102917904 1D GATTAATGGA T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 7 6 79146 CASAVA_Build 13 102926607 2I TCAACAAGAC --/AG AGTTGATAGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AG 1 2 79147 CASAVA_Build 13 102927918 2I TGGTAGATCA --/AG AGAGAGAGCC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AG 4 5 79148 CASAVA_Build 13 102928922 1D TTTTATGTTC T/- GTCTCTGTGT 3070 hom 144 het 53 0 48 6 T 1 0 79149 CASAVA_Build 13 102931925 1I AAAAAGCGTA -/T AAGCTAAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 79150 CASAVA_Build 13 102934995 2D GTAAAGACAC TT/-- GATGTGATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 2 0 79151 CASAVA_Build 13 102944568 1I TCTGGTGTGG -/T TTTTTAGTTC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 5 6 79152 CASAVA_Build 13 102949545 1I TGGTGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 31 1 22 8 T 11 12 79153 CASAVA_Build 13 102968324 5I GTTTTTTAAC -----/TATCA TATCATGTAT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TATCA 1 2 79154 CASAVA_Build 13 102973322 2D TAAACAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 31 1 21 9 A 13 11 79155 CASAVA_Build 13 102978162 1D TTTTAATGTT A/- AAAAAAAAAA 1960 het 1960 ref 42 27 7 8 A 13 12 79156 CASAVA_Build 13 102986227 4D TCCCAACTCA GCCT/---- GCCTCCCAAG 3070 hom 72 het 25 0 24 5 GCCT 2 1 79157 CASAVA_Build 13 102986922 16I CCTATGCTAC ----------------/ATAAGTTGATCTTTGT ATTATTATTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 ATAAGTTGATCTTTGT 0 1 79158 CASAVA_Build 13 102987531 2D ACAGAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AG 8 7 79159 CASAVA_Build 13 102989495 2D TGAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 20 13 A 16 14 79160 CASAVA_Build 13 102992714 1I TTTATAGCAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 8 79161 CASAVA_Build 13 102993774 3D ATGTATAATT ATA/--- ATAATATCAC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 ATA 3 2 79162 CASAVA_Build 13 102994389 2D GGGGCACCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 25 7 T 14 12 79163 CASAVA_Build 13 102995306 1I TCAGGGAGAT -/G GGTTTGAGAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 G 2 3 79164 CASAVA_Build 13 102996761 17D AGGCAGTTTG TTTTAGCCTCCAGATTT/----------------- TTTTTGGCAT 3070 hom 111 het 38 0 37 4 TTTTAGCCTCCAGATTT 1 0 79165 CASAVA_Build 13 102998874 6I TGTCATTCTT ------/TATCAC TATAGTGAGC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TATCAC 0 1 79166 CASAVA_Build 13 103008258 1D TAGATTTTTT G/- TAAGCTTTCT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 G 1 0 79167 CASAVA_Build 13 103031765 3I AATGAAATGG ---/AGA AGAAGGAGAG 3070 hom 144 het 54 0 48 6 AGA 1 2 79168 CASAVA_Build 13 103052427 1I AAAATATAAG -/A AAAAAACCAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 6 7 79169 CASAVA_Build 13 103053073 4D TTTCTCAAAT AAAC/---- AAATGCTGAG 3070 hom 93 het 33 0 32 3 AAAC 1 0 79170 CASAVA_Build 13 103060752 1I AGAGCAGAGC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 7 8 79171 CASAVA_Build 13 103072006 4I TTCAATCTGG ----/CTTT CTTTGTTTTT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 CTTT 1 2 79172 CASAVA_Build 13 103075208 9D CTGTGTCTGT TTTCATAGC/--------- ATCATGTTGG 3070 hom 90 het 30 0 31 0 TTTCATAGC 1 0 79173 CASAVA_Build 13 103077656 2I TTATATGAAG --/AT ATATATATAT 3070 het 603 hom 29 2 25 2 AT 6 7 79174 CASAVA_Build 13 103083964 1I CAACTCAGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 8 9 79175 CASAVA_Build 13 103084199 2I100M1D CTTTTGTTTG --TTTTTTTTTGCATTTCTCCTATTCTTACGGTCAGACCGTGATTAAGCACATATCACTTTATTTCTAAAAAAAATTACTATACTTTTATTTTGCCAGCATCT/TTTTTTTTTTTGCATTTCTCCTATTCTTACGGTCAGACCGTGATTAAGCATATATCACTTTATTTCTAAAAAAAATTACTATACTTTTATTTTGCCAGCATC- TTTTTTTTTT 3070 het 1863 hom 33 8 34 18 N/A 0 0 79176 CASAVA_Build 13 103099252 1I GGCATTTTTC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 81 hom 51 1 43 7 T 7 8 79177 CASAVA_Build 13 103101049 1D ACACAATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 35 0 24 12 A 14 13 79178 CASAVA_Build 13 103102305 2I ATACTGACAC --/TT CATTCTAACA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 0 2 79179 CASAVA_Build 13 103102553 1D AATTTAAAAT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 8 7 79180 CASAVA_Build 13 103108273 1I TTCATGTATG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 7 8 79181 CASAVA_Build 13 103113588 5D TTGTGAACTA AAAAG/----- AAAAGAAATC 3070 hom 129 het 48 0 44 5 AAAAG 2 1 79182 CASAVA_Build 13 103114032 1D AAAATAAGTC A/- GCTTGTTGAT 3070 hom 105 het 36 0 35 1 A 1 0 79183 CASAVA_Build 13 103115496 2D GATGCAGTGT GC/-- TGAGAAACTC 3070 hom 129 het 47 0 43 5 GC 1 0 79184 CASAVA_Build 13 103115719 4D TTCCTCAAAT TCAG/---- TTTTTCTCCC 3070 hom 129 het 51 0 44 9 TCAG 1 0 79185 CASAVA_Build 13 103117980 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCCTCCC 1038 hom 12 het 8 0 4 5 C 7 6 79186 CASAVA_Build 13 103123643 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 18 0 15 4 T 10 9 79187 CASAVA_Build 13 103126091 3I CATTTTTAAT ---/CTC CTCCTACTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTC 1 2 79188 CASAVA_Build 13 103130592 2D GTACTCACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 67 het 27 0 23 4 AC 7 6 79189 CASAVA_Build 13 103133819 7I TGTGACCTCC -------/AGTATCA TTGGTAGAAA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 AGTATCA 0 1 79190 CASAVA_Build 13 103134635 1I TGCTATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 812 hom 33 2 26 5 A 10 11 79191 CASAVA_Build 13 103136367 1I CAATATGGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 86 het 34 0 28 6 T 8 9 79192 CASAVA_Build 13 103138213 1I GCAACCTTAG -/T TAAGATCAGT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 1 2 79193 CASAVA_Build 13 103139297 1I TCCGTCTCAA -/G GGGGAAAAAA 3070 het 178 hom 20 2 18 2 G 4 5 79194 CASAVA_Build 13 103140316 6I TTGTATGGGA ------/TTGCTT TTGCTTTTGT 3070 hom 86 het 31 0 29 2 TTGCTT 1 2 79195 CASAVA_Build 13 103153878 1D TTGATGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 951 hom 29 2 18 9 T 12 11 79196 CASAVA_Build 13 103154956 1I CCTGAAGCTT -/A AAAATATTTG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 4 5 79197 CASAVA_Build 13 103168728 1D GTCATGGCAG C/- CCCTAACAAA 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 C 4 3 79198 CASAVA_Build 13 103171962 1D CAATGTATAC T/- TTTAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 4 3 79199 CASAVA_Build 13 103175569 1I TCCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 9 10 79200 CASAVA_Build 13 103178550 8I GACCTAAACA --------/GTTCACAG GTTCACAGAA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 GTTCACAG 1 2 79201 CASAVA_Build 13 103180767 1D AAAGTGAAAA G/- GGGACCTTAA 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 G 4 3 79202 CASAVA_Build 13 103194773 1I TCTTAAAGGA -/C TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 C 0 1 79203 CASAVA_Build 13 103195893 4D CTGATACCAG ACTA/---- ACTATCACTG 3070 het 3070 ref 45 24 17 7 ACTA 2 1 79204 CASAVA_Build 13 103196082 1I CATTTATTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 14 17 8 T 8 9 79205 CASAVA_Build 13 103204450 4I TAGTATTTCC ----/TGCA TCTCACTCTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TGCA 0 1 79206 CASAVA_Build 13 103206778 2D AATTCAGCAC AA/-- AGACAAACGT 3070 hom 104 het 43 0 36 8 A 3 1 79207 CASAVA_Build 13 103207869 1I TGGATGTGGC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 170 hom 45 1 40 4 A 8 9 79208 CASAVA_Build 13 103214903 1I AAGATCAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 334 hom 49 3 32 14 A 10 11 79209 CASAVA_Build 13 103222015 2D CACACATATG CA/-- CACACACACA 733 het 733 ref 32 23 3 9 CA 7 6 79210 CASAVA_Build 13 103241684 1D CAAGACTGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 10 9 79211 CASAVA_Build 13 103251699 14D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAG 2178 het 456 hom 13 2 6 7 A 23 9 79212 CASAVA_Build 13 103251929 1I CTTTTTTTTT -/A TTTTTTCGTG 3070 het 2898 hom 37 13 18 6 A 0 1 79213 CASAVA_Build 13 103262954 1D AGTTGAGTAA T/- GATAATTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 1 0 79214 CASAVA_Build 13 103268094 2D CGCGCGCGCG CA/-- CACACACACA 3070 het 2773 hom 45 14 16 17 CA 9 8 79215 CASAVA_Build 13 103271812 1D TAGAATATGA T/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 7 6 79216 CASAVA_Build 13 103277995 1D ATGATTTCTG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 9 8 79217 CASAVA_Build 13 103290421 4D TTTGAGCTCT AAAG/---- AGAGTGGTCT 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 AAAG 1 0 79218 CASAVA_Build 13 103301024 3I TTGTGGAAAT ---/AGC AGGTACACTG 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 AGC 0 1 79219 CASAVA_Build 13 103302073 2D ACACATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 39 19 13 8 AT 7 6 79220 CASAVA_Build 13 103302851 1D AAGGAAAAAA C/- ATTGATGCTG 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 C 1 0 79221 CASAVA_Build 13 103303580 1I AAATTTGATG -/T TTTGGTATTA 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 T 3 4 79222 CASAVA_Build 13 103304132 1I TCATTTCACA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 7 8 79223 CASAVA_Build 13 103305286 1D GTCTGCCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 13 24 9 T 10 9 79224 CASAVA_Build 13 103305997 1I AGGGACTGGT -/A AAAGAAAAGG 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 3 4 79225 CASAVA_Build 13 103306081 1I ATTTTATACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1902 hom 21 5 11 5 T 9 10 79226 CASAVA_Build 13 103308316 3I CCATACACAC ---/ACA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 ACA 0 1 79227 CASAVA_Build 13 103309515 2I AATTTATAAC --/AT ATGTGTGGAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 AT 1 2 79228 CASAVA_Build 13 103309819 4D TTTTTTTTTA TTTT/---- TTTTATTTTT 308 het 308 ref 35 18 7 11 T 8 4 79229 CASAVA_Build 13 103325734 1I AAGCTGACCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 9 10 79230 CASAVA_Build 13 103327454 3I TATAAATCAA ---/ATG TTAAGCCCCA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 ATG 0 1 79231 CASAVA_Build 13 103330231 1I55M4I AGGTATGTCA -TTGAAATGTTGGATGAAAAAAGATACCATATATTTTCATATGGCATTGTAGATAC----/TTTGAAATATTGGATGAAAAAAGATATCATATATTTTCATATGGCATTGTAGATACTTAT GCAAATGAAA 3070 het 3070 ref 32 28 15 8 N/A 0 0 79232 CASAVA_Build 13 103343588 2D AACACAGACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 CA 10 9 79233 CASAVA_Build 13 103347593 1D CTCTTGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 A 12 11 79234 CASAVA_Build 13 103348119 3D AAAATACAAC AAT/--- GACAAAATTG 3070 het 3070 hom 28 11 15 4 AAT 1 0 79235 CASAVA_Build 13 103352463 1I GCTTAATATA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 6 7 79236 CASAVA_Build 13 103356663 3I GTTACCCTTC ---/TTT GTGTTCATAC 3070 het 3070 hom 56 19 28 9 T 0 3 79237 CASAVA_Build 13 103367017 1I TTAAATTATC -/A ATATGATGAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 1 2 79238 CASAVA_Build 13 103410228 1D AGCTACATCC T/- TCATTCCCTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 2 1 79239 CASAVA_Build 13 103412636 1I GTCCAGTTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 18 9 9 0 T 6 7 79240 CASAVA_Build 13 103417138 3D CATTTCAATA GAC/--- TACATATGTA 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 GAC 1 0 79241 CASAVA_Build 13 103417584 1I TTATTAAAGT -/G GTAACCAGTA 3070 hom 96 het 38 0 31 7 G 1 2 79242 CASAVA_Build 13 103418199 3D GTGTTGGTGT GAA/--- GGTGATCAGT 3070 het 3070 ref 50 27 12 14 GAA 1 0 79243 CASAVA_Build 13 103420322 1D AAAATCAGGA C/- CCTGAATTTC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 C 3 2 79244 CASAVA_Build 13 103425829 2D TCTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 12 14 11 TG 8 7 79245 CASAVA_Build 13 103429744 2D35M6D TGCTTGTGTG TATATATATATATTTTTTGCATATATATATCTATATGTGTATA/--TATATATATATTTTTTGCATATATATATCTATATG------ TATATATATA 3070 het 2912 hom 17 10 8 4 N/A 0 0 79246 CASAVA_Build 13 103429962 1D ATGAATCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 A 12 11 79247 CASAVA_Build 13 103481448 1I TAATTTCATA -/C CGATACATAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 C 1 2 79248 CASAVA_Build 13 103533244 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 2679 hom 15 het 6 0 6 0 A 8 9 79249 CASAVA_Build 13 103558166 1D AGGATTTATT A/- AAAAAAAAAA 1026 het 1026 ref 33 24 4 6 A 12 11 79250 CASAVA_Build 13 103563716 2I TCCTCAAGAG --/TT TAGTCCCAGA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 1 3 79251 CASAVA_Build 13 103564011 1D GCTGCTAAGA T/- TTTTTTTTTT 1564 het 1564 ref 42 31 4 7 T 12 11 79252 CASAVA_Build 13 103566931 5D AGCAGAACAT TTTAA/----- TTTGATAAAG 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 TTTAA 1 0 79253 CASAVA_Build 13 103582358 2D GAAATATAAT TC/-- TGTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 TC 1 0 79254 CASAVA_Build 13 103582477 1D TTTGTTTGCT G/- GTGGAAATAC 3070 het 3070 hom 43 19 21 7 G 2 1 79255 CASAVA_Build 13 103584239 7I CCTTCCACGG -------/GGAAAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 GGAAAAA 0 1 79256 CASAVA_Build 13 103589113 1I GAAACAATCT -/G CTATTTTTGG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 G 0 1 79257 CASAVA_Build 13 103600115 1I GTTTTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 12 20 16 A 13 14 79258 CASAVA_Build 13 103600303 1I TTGCTAACTA -/T TTTAACTCTG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 3 4 79259 CASAVA_Build 13 103600713 1D CCATTTATTA T/- TATACTAAAA 2838 het 2838 ref 26 16 7 3 T 2 1 79260 CASAVA_Build 13 103628454 1I ACAAGGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 22 1 15 6 A 11 12 79261 CASAVA_Build 13 103632288 1I ACTAGAATCA -/G GTTGGAATTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 1 2 79262 CASAVA_Build 13 103632996 1D TTATTAAAAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 51 het 24 0 18 7 A 8 7 79263 CASAVA_Build 13 103638003 1I ATTTTTACAG -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 7 8 79264 CASAVA_Build 13 103641573 1D AATGACTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 T 12 11 79265 CASAVA_Build 13 103642584 3D GACCATAATA GAC/--- AGTGTTTATT 3070 het 3070 ref 34 17 15 4 GAC 1 0 79266 CASAVA_Build 13 103695228 12D ATATACACAC ATATATACACAT/------------ ATATAATATG 3070 het 3070 ref 32 19 14 2 ATATATACACAT 1 0 79267 CASAVA_Build 13 103695689 2D CACTGTAGTC AG/-- GATCTATTGC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 AG 1 0 79268 CASAVA_Build 13 103703187 1I ATGGGGGAGG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 7 8 79269 CASAVA_Build 13 103704249 1D ATTTTTAGTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 28 14 13 2 T 7 6 79270 CASAVA_Build 13 103707405 1D TTGTTTCATT G/- GGAGAATATG 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 G 3 2 79271 CASAVA_Build 13 103709927 1D CTAAAATTTC T/- CCTTCCCCAG 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 T 1 0 79272 CASAVA_Build 13 103712347 2I TGAACTGGGT --/AA CTCAATTTCT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 0 2 79273 CASAVA_Build 13 103747471 5D TGATCTAAAG TATTA/----- TATTAGGTAG 3070 het 3070 hom 41 18 21 7 TATTA 2 1 79274 CASAVA_Build 13 103750773 6D GCCAATAAAT ATCAAA/------ GTTAAGATTA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 ATCAAA 1 0 79275 CASAVA_Build 13 103752443 1D TTTAGTTTTT A/- TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 1 0 79276 CASAVA_Build 13 103753632 2D CACCCGCCTT GG/-- GGCCTCCCAC 2940 het 1796 hom 22 6 10 6 G 4 2 79277 CASAVA_Build 13 103769500 1D CTATGGCATT G/- GTTGTCAATA 3070 het 3070 ref 57 38 18 1 G 2 1 79278 CASAVA_Build 13 103785649 1I TGGGATTATA -/G GCATGAGCCA 3070 het 3070 ref 52 22 18 12 G 1 2 79279 CASAVA_Build 13 103788180 1I AATAAAAGCT -/G GGCCAACTGA 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 G 2 3 79280 CASAVA_Build 13 103788705 3D GGGAGGGGGA AAG/--- AAGGCAATTT 3070 het 3070 hom 41 20 19 4 AAG 2 1 79281 CASAVA_Build 13 103790077 2I GGAACATCCC --/GG GGGGGATGTC 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 G 5 7 79282 CASAVA_Build 13 103801537 1D ACTTTTTTTT C/- CAACAGGATC 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 C 2 1 79283 CASAVA_Build 13 103817127 1D GTAATAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 12 11 79284 CASAVA_Build 13 103822016 6I5M5I AATATTCAGA ------GCAGA-----/TAGGCTTCAGAATATT TAGGCTTCAG 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 N/A 0 0 79285 CASAVA_Build 13 103826331 1D TCAGATTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 11 10 79286 CASAVA_Build 13 103826828 4D TTTTCTCATT AATA/---- AATCGATTTT 3070 het 3070 ref 46 20 19 8 AATA 1 0 79287 CASAVA_Build 13 103827844 4I TTATTTACTT ----/AGTA AGTACGTACA 3070 hom 185 het 65 0 62 3 AGTA 1 2 79288 CASAVA_Build 13 103828263 5I AACATTTAAA -----/CTTTT CTTGTTTAAC 3070 het 3070 ref 47 26 20 1 CTTTT 0 1 79289 CASAVA_Build 13 103844447 1D TCTTGTTTTG T/- TTTTTCTTCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 6 5 79290 CASAVA_Build 13 103846168 1D ACCAGCAATC T/- TTTTTTTTTT 1690 het 1690 ref 41 34 5 2 T 11 10 79291 CASAVA_Build 13 103883845 1D CTCAGGAAAA G/- TATTTTGGGG 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 G 1 0 79292 CASAVA_Build 13 103884522 1I AATATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 A 10 11 79293 CASAVA_Build 13 103885303 6D ACTCCATCTT AACAAC/------ AACAACAACA 3070 het 3070 ref 28 18 8 4 AAC 6 4 79294 CASAVA_Build 13 103888267 1I TGTCAAAATA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 7 8 79295 CASAVA_Build 13 103895196 1I GAAAACTGGC -/T AGCCATATGC 3070 het 3070 ref 25 10 12 3 T 0 1 79296 CASAVA_Build 13 103899046 2I TGAAATATTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 GT 7 8 79297 CASAVA_Build 13 103899740 3D GAAACGTGCT TTG/--- TTGTTGTGTT 3070 het 3070 ref 41 20 14 9 TTG 3 2 79298 CASAVA_Build 13 103901947 5D ATACATCAAA ACATT/----- ACATTATAAC 3070 het 3070 ref 26 13 12 3 ACATT 2 1 79299 CASAVA_Build 13 103907336 1I CACTGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1962 hom 19 5 13 1 A 9 10 79300 CASAVA_Build 13 103914258 1I ATTTAAGTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 9 10 79301 CASAVA_Build 13 103914921 2D AAGCAGAAGC AA/-- GAGAGAGAGA 2188 het 2188 ref 19 9 6 4 A 2 0 79302 CASAVA_Build 13 103916709 1I TAAACTAGCA -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 6 7 79303 CASAVA_Build 13 103916950 2I TAACTTTTTA --/TG TGTTTTTTCT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 TG 1 2 79304 CASAVA_Build 13 103917834 1I TGGGACCCAA -/G GTCTAAACAC 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 G 1 2 79305 CASAVA_Build 13 103919166 2D AGAATTTCAT AA/-- AGTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 A 3 1 79306 CASAVA_Build 13 103925048 1I AATAAAACTA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 T 7 8 79307 CASAVA_Build 13 103926422 1I CTATCACACG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 329 hom 43 1 35 7 A 9 10 79308 CASAVA_Build 13 103927394 4D AAGTAATGTG TTTA/---- TTTATTTTGA 3070 het 3070 ref 47 27 17 4 TTTA 2 1 79309 CASAVA_Build 13 103928452 1D GGGGATAGAG T/- TTTTATCATA 3070 het 3070 ref 19 10 8 2 T 5 4 79310 CASAVA_Build 13 103931103 1I AAGACTAATA -/T GGAAAAAAAA 3070 het 420 hom 30 2 25 3 T 0 1 79311 CASAVA_Build 13 103931854 2D ATTTGTACAC AT/-- GAGACTTCTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 AT 1 0 79312 CASAVA_Build 13 103933390 1D ATATATCTGT A/- AAAATCAAGT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 5 4 79313 CASAVA_Build 13 103933587 1D ACTAATTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 20 5 13 2 A 15 14 79314 CASAVA_Build 13 103935279 1I CTACCTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1951 hom 31 6 15 15 A 13 14 79315 CASAVA_Build 13 103935552 1I AGAAGCATCA -/C CACCACATAA 3070 hom 98 het 39 0 33 6 C 1 2 79316 CASAVA_Build 13 103935749 5D TTAATAATAA TGTAT/----- TGTATACTTG 3070 het 3070 ref 49 28 20 4 TGTAT 2 1 79317 CASAVA_Build 13 103941882 1D AAGCTCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 11 10 79318 CASAVA_Build 13 103946626 2D TAAAATAAAC TG/-- TTTACCACAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 9 TG 1 0 79319 CASAVA_Build 13 103948121 4I CATTTAAAAA ----/TAAC TATAACTTTC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 TAAC 0 1 79320 CASAVA_Build 13 103949237 12D ATACATACAT ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 het 1725 hom 28 8 16 6 AC 14 8 79321 CASAVA_Build 13 103953329 1D TTTTGTATTT G/- GTGATATCTT 3070 hom 132 het 47 0 45 3 G 2 1 79322 CASAVA_Build 13 103954066 1D30M1I ATATATATAT ATATATATATATATATATATATAGGTTTTTA-/-TAGATGTACCTATATATATATATGTTTTTAT TTTTTTTTTT 1944 het 434 hom 7 1 5 1 N/A 0 0 79323 CASAVA_Build 13 103966760 1I AACAAATTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2991 hom 24 8 14 2 T 7 8 79324 CASAVA_Build 13 103972424 1I TGCAGACCAG -/C TAAAATGGCA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 C 0 1 79325 CASAVA_Build 13 103973746 4D CTTTGGGAAC TTGA/---- TTAAGTCATG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TTGA 1 0 79326 CASAVA_Build 13 103974532 1D TCTTTGACTT A/- ACGGAAGCAC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 2 1 79327 CASAVA_Build 13 103975021 2I GTATATATAC --/AT ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 27 11 6 AT 0 1 79328 CASAVA_Build 13 103977359 1D ATCGTACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 11 10 79329 CASAVA_Build 13 103985725 4D ATCTCAAAAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 533 hom 23 4 14 6 A 30 26 79330 CASAVA_Build 13 103991112 1D TTTGTTCTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 16 22 7 T 9 8 79331 CASAVA_Build 13 103998147 2D TACACAAACA CT/-- CTATGTATTA 3070 het 3070 hom 54 21 27 7 CT 2 1 79332 CASAVA_Build 13 104001140 5D CTGGAAGCTT TAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 2306 hom 26 9 14 6 TAAAA 1 0 79333 CASAVA_Build 13 104014275 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 9 10 79334 CASAVA_Build 13 104014732 1I AGAGTGATGA -/G TAGTGTTCAC 3070 het 3070 ref 63 35 20 8 G 0 1 79335 CASAVA_Build 13 104015055 2I38M2I28M6I2M21I AAACATGCTC --ACACACACCACACACAAGCTCACACACCCACATGCGTG--CTCTCACACACACACATGCTCACACACA------GG---------------------/AGACACACACAACTCACAAGCTAACACACCCACACACATGCTCTCTCACACACACACATGCTCATACACACACATGGGCTACACTCACCCTCACAGACA CACACAGGTT 3070 het 3070 ref 69 64 15 10 N/A 0 0 79336 CASAVA_Build 13 104020719 5D TATGTTTTGA AAACT/----- AAACTAAACT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 AAACT 3 2 79337 CASAVA_Build 13 104026783 1D TTCTGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 9 6 A 12 11 79338 CASAVA_Build 13 104037889 1D CCTGTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 1768 het 1457 hom 32 11 6 15 A 17 16 79339 CASAVA_Build 13 104054247 1D TGTTTTCTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 417 hom 34 1 28 5 A 10 9 79340 CASAVA_Build 13 104064183 5I ATGTTTACCA -----/TAGAG TAGGCATTTA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TAGAG 0 1 79341 CASAVA_Build 13 104074097 1D CATTCACAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 10 9 79342 CASAVA_Build 13 104074375 1I ACTGCCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 548 hom 30 2 22 6 T 11 12 79343 CASAVA_Build 13 104074828 2D GGTAAAACTC TT/-- TTTTTATCAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 7 5 79344 CASAVA_Build 13 104079162 1D TATATAACTG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 35 hom 28 1 13 15 C 11 10 79345 CASAVA_Build 13 104079972 2I AACCTTTTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 14 8 T 10 12 79346 CASAVA_Build 13 104096134 4D ATGTGGAGAG TGAT/---- TGATTGGTTG 3070 het 3070 hom 44 20 23 2 TGAT 2 1 79347 CASAVA_Build 13 104099113 1D TTTTTTTTTT C/- TGAGACTGAG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 C 1 0 79348 CASAVA_Build 13 104099945 18I GTATTTTAAT ------------------/TACTCTAAAATTTAATAC ACTAAAGAGG 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 TACTCTAAAATTTAATAC 0 1 79349 CASAVA_Build 13 104101820 1D ATAAAAAGGT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 298 hom 28 4 13 11 G 13 12 79350 CASAVA_Build 13 104108081 1I ACATAACAGC -/A CCTAGTATAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 0 1 79351 CASAVA_Build 13 104113126 1I GAGGGGACCC -/A GGAGGGCTAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 0 1 79352 CASAVA_Build 13 104113595 1I TTTTTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2007 het 1263 hom 25 5 6 14 T 14 15 79353 CASAVA_Build 13 104122247 8D ATGCACACAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 90 het 40 0 28 15 AC 13 9 79354 CASAVA_Build 13 104125227 2I CCTGACAGAG --/AA AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 A 7 9 79355 CASAVA_Build 13 104131027 1I AAAACATAGA -/T TATATTCTAC 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 1 2 79356 CASAVA_Build 13 104136577 2D AACAATATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 31 1 16 15 A 12 10 79357 CASAVA_Build 13 104142476 1D CTAGGGATTC T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 7 79358 CASAVA_Build 13 104142948 1I AGGAATCAAC -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 7 8 79359 CASAVA_Build 13 104146430 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1673 het 376 hom 13 2 7 4 A 15 14 79360 CASAVA_Build 13 104148932 1D TAACACTTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 9 8 79361 CASAVA_Build 13 104151022 1D AGAAAAGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 262 hom 37 1 31 5 T 10 9 79362 CASAVA_Build 13 104152613 1D TTTGTTAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1699 hom 38 9 12 17 T 17 16 79363 CASAVA_Build 13 104154036 4D CACCTTTGAT TGAG/---- TGCAGGCTGT 3070 het 3070 hom 44 16 28 1 TGAG 1 0 79364 CASAVA_Build 13 104155222 3D ATAATCTTAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 27 11 T 14 11 79365 CASAVA_Build 13 104165318 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 9 10 79366 CASAVA_Build 13 104173671 1D GACCCCGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 21 9 6 A 10 9 79367 CASAVA_Build 13 104181604 5D TTTCTTCAGA TTTAT/----- TTTATTCTTG 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 TTTAT 2 1 79368 CASAVA_Build 13 104191905 3D AAATGAGTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 34 0 22 13 T 17 14 79369 CASAVA_Build 13 104194396 3I ATATTATTTT ---/ATC ATCATATTAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATC 1 2 79370 CASAVA_Build 13 104195588 1I TTAATGTGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 9 10 79371 CASAVA_Build 13 104196155 1I ATGTTATTTG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 7 8 79372 CASAVA_Build 13 104202769 1I TTTTGAAAAG -/T TGAATTACAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 2 79373 CASAVA_Build 13 104204612 1I TGAGACTTAG -/C TCTGGACACA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 79374 CASAVA_Build 13 104210043 12I CTATAGGCCC ------------/CTATGACATCTG CTATCTTATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CTATGACATCTG 0 1 79375 CASAVA_Build 13 104214072 14D TGCTTGTTTG TTTTTGTTTTTTGT/-------------- TTTTTGTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TTTTTGT 3 1 79376 CASAVA_Build 13 104214158 2D AGTGGTGTCA TC/-- TCGGCTCACT 1570 hom 10 het 6 0 4 3 TC 2 1 79377 CASAVA_Build 13 104217439 1I TTCTGATGTT -/A AAAAAATTCC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 6 7 79378 CASAVA_Build 13 104221055 1I TTGCCCAACG -/C TTTTATTAAT 3070 hom 86 het 30 0 26 4 C 0 1 79379 CASAVA_Build 13 104224830 2D TATATTTCCT GA/-- GAGACAGAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 GA 3 2 79380 CASAVA_Build 13 104226069 1D GACTCTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 12 11 79381 CASAVA_Build 13 104226521 1I TTCAAACATG -/A AGGTGAAATA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 1 2 79382 CASAVA_Build 13 104231359 17D AATGGCTGAG TGGGTGGCTGAAATGGC/----------------- TGGGTGGCTG 897 het 897 ref 41 9 5 39 TGGGTGGCTGAAATGGC 2 1 79383 CASAVA_Build 13 104264391 3I GACACATCTA ---/CTC CTTCTCAGGT 3070 hom 114 het 46 0 38 8 CTC 0 1 79384 CASAVA_Build 13 104278346 17D AATCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 1517 het 1325 hom 8 4 5 3 A 29 12 79385 CASAVA_Build 13 104280749 1D CACACCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 793 hom 40 2 23 15 T 14 13 79386 CASAVA_Build 13 104282967 1D AACAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 725 hom 37 2 27 10 A 13 12 79387 CASAVA_Build 13 104283272 1I TAATAAAAAA -/G GTAAAATAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 2 79388 CASAVA_Build 13 104283902 1D TCATGTTCAG A/- ATGTTTTTTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 1 79389 CASAVA_Build 13 104284231 1D TTTGAGGGGG A/- AAAAAGTATG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 6 5 79390 CASAVA_Build 13 104291440 1I GTACATTTCC -/T TTTAAAAAAA 3070 hom 4 het 25 1 23 1 T 3 4 79391 CASAVA_Build 13 104314044 1D TGCTGTAGCA T/- AGGGTACTCC 3070 het 3070 ref 59 29 23 7 T 1 0 79392 CASAVA_Build 13 104316543 1D GAGGGCTCCT C/- CCCAGCCTAT 3070 het 3070 hom 43 16 19 9 C 4 3 79393 CASAVA_Build 13 104317334 6D AGCCCCTTAT AAGACC/------ AAGACCATCA 3070 hom 111 het 38 0 38 2 AAGACC 2 1 79394 CASAVA_Build 13 104317895 1I TACATGTGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 23 16 10 T 9 10 79395 CASAVA_Build 13 104319592 1I TCCCGTTTAA -/G CTCTCGGCTA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 0 1 79396 CASAVA_Build 13 104320937 1I TATCTGATAA -/T TTTTTTCTAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 6 7 79397 CASAVA_Build 13 104322474 1I CATTTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 34 1 27 6 T 11 12 79398 CASAVA_Build 13 104328306 1I GTCTTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3053 het 2858 hom 27 11 10 6 A 13 14 79399 CASAVA_Build 13 104341474 2I GTATATACTT --/TA TATATATATG 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 TA 4 5 79400 CASAVA_Build 13 104342013 3D TAATAACTAG ACA/--- ACGAGATAAT 3070 het 2887 hom 29 7 17 5 ACA 1 0 79401 CASAVA_Build 13 104346897 1D ATAAATAGAA G/- GGTCTAATTA 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 G 3 2 79402 CASAVA_Build 13 104349913 3D ACCATTTGTG ACA/--- ACATGGATGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 6 ACA 2 1 79403 CASAVA_Build 13 104351353 1I GAATTAAAAG -/A AAAAAATAAT 3070 het 2612 hom 25 8 14 3 A 6 7 79404 CASAVA_Build 13 104369129 2I GCAGAACCGT --/GA GAGTCAATTA 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 GA 1 2 79405 CASAVA_Build 13 104373626 1I AAAGAAGGAA -/C CCCCCCCAAT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 C 7 8 79406 CASAVA_Build 13 104374442 7D CTTAGGAATA TTATTCC/------- TATATAACCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TTATTCC 1 0 79407 CASAVA_Build 13 104378917 1D CTATTCTTGG A/- AAATGGAAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 4 3 79408 CASAVA_Build 13 104380157 1D GCACTTACCG T/- TGAGTGGATC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 2 1 79409 CASAVA_Build 13 104380722 1I70M3D ATAAACTTAG -TTTTTTTTAACATTTTTACTCTTTTGTAATAACACTTAGCTTAAAACACAAACACATTATATACCAGTACAAT/TTTTTTTTTAACATTTTTACTCTTTTGTAATAACACTTAGCTTAAAACACAAACACATTATATACCAGTAC--- AATATTTTCT 3070 hom 51 het 20 0 18 13 N/A 0 0 79410 CASAVA_Build 13 104381832 1D ACTAATCAAT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 8 7 79411 CASAVA_Build 13 104383554 1I TTCACAGTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 30 1 26 3 A 9 10 79412 CASAVA_Build 13 104410761 1I CCCATTATTA -/T TTGTGTGGGA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 2 3 79413 CASAVA_Build 13 104416486 1D GTTCAATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 A 11 10 79414 CASAVA_Build 13 104420660 1D CTCTTACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 A 12 11 79415 CASAVA_Build 13 104424763 4D TATTTTTGGT AATA/---- AATATCGACT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 AATA 2 1 79416 CASAVA_Build 13 104437120 1I CTTTATTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 21 0 20 1 A 0 1 79417 CASAVA_Build 13 104445506 1D TATCCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 25 0 16 9 T 15 14 79418 CASAVA_Build 13 104451674 1I TACTAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 37 1 28 8 A 10 11 79419 CASAVA_Build 13 104462330 22D AACCAATTAT TATATACATCTGAGATGTATTA/---------------------- TATACATCTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TATATACATCTGAGATGTATTA 1 0 79420 CASAVA_Build 13 104482992 1D CGTGAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 7 6 79421 CASAVA_Build 13 104488678 9D ACGGGTGATT CAAGATGAC/--------- CAAGGACAAT 3070 het 3070 ref 35 22 16 0 CAAGATGAC 1 0 79422 CASAVA_Build 13 104491517 2D CTCAAGAAAC TT/-- ATAATAATGG 3070 het 3070 ref 54 27 19 10 T 2 0 79423 CASAVA_Build 13 104498850 3D AAATGATAAC ACA/--- ACAATACATT 3070 het 3070 ref 37 18 17 8 ACA 2 1 79424 CASAVA_Build 13 104510052 8D TCCCGCTCCA CTCCCTTT/-------- CTCCCTTTCC 3070 het 3070 ref 47 23 18 9 CTCCCTTT 2 1 79425 CASAVA_Build 13 104511206 3I AAAGTACTCT ---/ATC ATCTGGAGTC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 ATC 1 2 79426 CASAVA_Build 13 104512220 1D CTATCAGAAG C/- CAAGATTATA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 C 2 1 79427 CASAVA_Build 13 104512862 3D12M14I3M1I29M9I2M14I8M3D AACATAATTT AACAATATACATCTA--------------TCA-CTTGCTAAATAAAAAGCTGAAGACTTCCT---------AT--------------CTGACAAATTT/---TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAA--- GACTTTGCTG 1332 het 1332 ref 46 53 4 5 N/A 0 0 79428 CASAVA_Build 13 104515056 4I TCTATCTATC ----/TATT TATCTTCTTA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 TATT 0 1 79429 CASAVA_Build 13 104515348 2D TCCTATCTTA TG/-- TGTGTGTATA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 TG 4 3 79430 CASAVA_Build 13 104515755 1D AAGGAAGTGC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 15 24 2 A 9 8 79431 CASAVA_Build 13 104517047 5D TATGAGATAC TGAAG/----- ATCCTGAAGT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 TGAAG 1 0 79432 CASAVA_Build 13 104525450 1I CCCTGACATA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 8 9 79433 CASAVA_Build 13 104527068 1I AAACACTGAA -/T ATATGGGTTA 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 T 0 1 79434 CASAVA_Build 13 104528288 2D AAATACACAC AT/-- ATATATATGG 1669 het 1252 hom 11 3 5 3 AT 5 4 79435 CASAVA_Build 13 104534880 1I GAAAGATGTT -/C ATTCTTAAAC 3070 het 3070 ref 44 24 19 1 C 0 1 79436 CASAVA_Build 13 104536309 1I GTAAATATTC -/T TTGTAATATC 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 2 3 79437 CASAVA_Build 13 104543877 1I GAAGAATTCT -/G GCTTCATAGA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 G 1 2 79438 CASAVA_Build 13 104544350 1I CATTTTAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 T 9 10 79439 CASAVA_Build 13 104550470 4I AAATAACTAT ----/CAAA CAAACTATCC 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 CAAA 1 2 79440 CASAVA_Build 13 104551296 3I TTCTCAAATC ---/ATA ATAACTCCAT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 ATA 1 2 79441 CASAVA_Build 13 104552353 3D TAGAAAAGAA ATG/--- ATACTATTAT 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 ATG 1 0 79442 CASAVA_Build 13 104554833 1I GACAGAGACT -/G GTTTTTTTTT 2196 het 2090 hom 30 11 10 9 G 1 2 79443 CASAVA_Build 13 104568000 1D GGAAGAATGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 10 9 79444 CASAVA_Build 13 104578448 1D GATTGATCCA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 8 7 79445 CASAVA_Build 13 104590359 2D GTTTCTTCAC AG/-- AGTCACTGAC 3070 het 3070 ref 67 31 29 7 AG 2 1 79446 CASAVA_Build 13 104591980 1I ACTCTTAGGG -/A AAAAAAAAAG 1027 het 1027 ref 41 33 3 5 A 9 10 79447 CASAVA_Build 13 104592496 4D AAGAAAGAAA GGAG/---- GGAGGGAGGG 2083 het 2083 ref 36 10 14 12 GGAG 4 3 79448 CASAVA_Build 13 104594623 2D ACATGGCCCA AC/-- TCCTCCTTCC 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AC 1 0 79449 CASAVA_Build 13 104594760 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 T 10 11 79450 CASAVA_Build 13 104609786 1D TTAAATACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 42 0 34 9 T 11 10 79451 CASAVA_Build 13 104616531 1I ACAAACAGAC -/T TGAGAGTTTC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 1 2 79452 CASAVA_Build 13 104621334 1I GAACTTTCTT -/A AAAATAAGTA 3070 het 3070 ref 36 23 13 0 A 4 5 79453 CASAVA_Build 13 104640195 3I AGTTATTGAC ---/ATT ATATAGACAA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 ATT 0 1 79454 CASAVA_Build 13 104641978 2D CAAAATTGTA AC/-- ACAACAGGAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 8 AC 2 1 79455 CASAVA_Build 13 104647534 1D CAGATCCATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 10 9 79456 CASAVA_Build 13 104655362 1D TTATTAAGTG A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 ref 45 26 16 4 A 7 6 79457 CASAVA_Build 13 104656136 18D GGATGCCTGT AGTGAATAATCTTACAGG/------------------ AGCATATACA 3070 het 3070 hom 34 17 21 5 AGTGAATAATCTTACAGG 1 0 79458 CASAVA_Build 13 104667006 1I ATTCCATCCA -/T TTTTGTTGCA 3070 het 3070 hom 58 26 27 5 T 4 5 79459 CASAVA_Build 13 104669467 1D GAAGCAAAAA G/- AAAAGCATCT 875 het 875 ref 50 42 3 7 G 1 0 79460 CASAVA_Build 13 104670326 1D CTCCTTTTTC T/- TAATATAATC 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 T 2 1 79461 CASAVA_Build 13 104673857 3D AAATCACACT AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 50 21 21 12 AAC 4 3 79462 CASAVA_Build 13 104674571 1D ATTCTTCTAC T/- GATGGACAGT 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 T 1 0 79463 CASAVA_Build 13 104682188 1D TGTTTTCAGC T/- TAGTTACATT 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 T 2 1 79464 CASAVA_Build 13 104682262 1I GTGAAATCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 8 9 79465 CASAVA_Build 13 104686636 2D TATACAATAG AA/-- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 A 9 7 79466 CASAVA_Build 13 104688504 2D TTTTTCACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 553 hom 34 8 15 11 T 14 12 79467 CASAVA_Build 13 104709701 1I CCCCTTTTTT -/C TCCCCCAAAT 2604 het 2604 ref 21 9 9 3 C 0 1 79468 CASAVA_Build 13 104710809 1D TATTTAACAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 9 8 79469 CASAVA_Build 13 104713592 1I AGATATAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 10 11 79470 CASAVA_Build 13 104714072 1I ACACACCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 13 14 79471 CASAVA_Build 13 104729020 1I TTTCTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 12 13 79472 CASAVA_Build 13 104729785 2D CTTAAAAAGT AA/-- GATTTCCTTG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 2 0 79473 CASAVA_Build 13 104788691 14I TGGACTTCAC --------------/TGCATCGTAAACAA TGCTCAGGAT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 TGCATCGTAAACAA 0 1 79474 CASAVA_Build 13 104789522 1I AAGATGTTAG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 79475 CASAVA_Build 13 104791174 1I CTTAGAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 9 10 79476 CASAVA_Build 13 104801186 1I56M1I AAAAAAAAAT -ACAATACAGATTTCAAGAGTCTATGGCCATGCTGTATCTACATTAATCACCAGTGC-/AACAATACAGATTTCAAGAGTCTATGGCCATGCTGTATCTACATTAATCACCAGTGCA AAATTTCTAA 3070 hom 135 het 30 0 46 10 N/A 0 0 79477 CASAVA_Build 13 104825164 1I GGGGACCAGC -/A AATCTCCATG 3070 hom 74 het 28 0 22 6 A 2 3 79478 CASAVA_Build 13 104855538 1I AGAAATAAAA -/T TAACTCTTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 2 79479 CASAVA_Build 13 104855803 1I AAATATAATA -/T TTTTAAGATA 3070 hom 47 het 23 0 18 5 T 4 5 79480 CASAVA_Build 13 104858973 1D GAACTCATCA T/- TTTTTTATGG 1986 het 421 hom 7 1 6 0 T 7 6 79481 CASAVA_Build 13 104862056 1D TGCTTAAAAT A/- TTTTTCTCAG 1759 het 1759 ref 20 13 4 3 A 1 0 79482 CASAVA_Build 13 104863172 1I GTGAGTGAGG -/C CCTCCTCAGC 3070 hom 87 het 35 0 26 9 C 2 3 79483 CASAVA_Build 13 104868144 2I TGGATTAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 AT 6 7 79484 CASAVA_Build 13 104873254 1I TCTACAGGTG -/T TATGTTTATT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 1 2 79485 CASAVA_Build 13 104874710 3I AATAAGCTAA ---/TGT TGGTTACTAT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TGT 0 1 79486 CASAVA_Build 13 104879915 1I ATTTTAAATG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 8 9 79487 CASAVA_Build 13 104885011 1D CCCCGCCCCG C/- CCCCCCTGCT 3070 het 2842 hom 24 8 11 6 C 7 6 79488 CASAVA_Build 13 104885493 1I CAGTGTAGTC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 T 7 8 79489 CASAVA_Build 13 104889222 2D AATTTGCCTG AA/-- AAAAAAAAAC 1118 het 1118 ref 24 12 4 8 A 11 9 79490 CASAVA_Build 13 104896877 1D AGGTTTGGGG T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 94 het 35 0 31 4 T 8 7 79491 CASAVA_Build 13 104907405 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1901 het 83 hom 26 2 10 14 T 17 16 79492 CASAVA_Build 13 104912148 1I TAATAACGTG -/T TTTTTTTTTT 2696 het 2696 ref 42 20 10 12 T 10 11 79493 CASAVA_Build 13 104913445 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 17 16 12 AC 10 9 79494 CASAVA_Build 13 104921693 2I TGAAGGATAT --/AA GAGTCGAATA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 0 2 79495 CASAVA_Build 13 104922114 1I CTGGACACTC -/T CTTTGCATTT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 0 1 79496 CASAVA_Build 13 104949123 2D AATGTAGTGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AT 8 7 79497 CASAVA_Build 13 104962697 1D CCAGGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 11 10 79498 CASAVA_Build 13 104963283 1I GACTGATTAA -/T TTGGGGGCAA 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 T 2 3 79499 CASAVA_Build 13 104970794 1D TTTCCTCTAC A/- AAAAACAGCT 3070 het 3070 hom 43 18 16 10 A 6 5 79500 CASAVA_Build 13 104975456 1D GCCTTGGCCT C/- CCAAAGTGCT 3070 het 2673 hom 18 7 10 1 C 3 2 79501 CASAVA_Build 13 104979290 2D TAACATAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 13 11 79502 CASAVA_Build 13 104984495 1I AGGAGAGTAT -/C CCATGGGGTA 3070 het 3070 hom 55 24 27 4 C 2 3 79503 CASAVA_Build 13 104986583 1I TAACTCCTAC -/T TTTTTTCTAG 3070 het 3070 ref 54 26 18 10 T 6 7 79504 CASAVA_Build 13 104989375 1I AGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 32 0 26 6 T 10 11 79505 CASAVA_Build 13 104990018 3D AACGACAACA ACC/--- ACCTATTGGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 ACC 2 1 79506 CASAVA_Build 13 104998599 2D CACTTGAGAT AA/-- AAGAAAGCTG 3070 het 3070 hom 32 12 19 2 A 4 2 79507 CASAVA_Build 13 105004086 1I TCCCTCAGAA -/C TTTTGCAGAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 C 0 1 79508 CASAVA_Build 13 105008924 1I CCTCATTTGT -/A AATGAAAGAC 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 2 3 79509 CASAVA_Build 13 105011419 2D TTTTGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2856 het 2856 ref 27 14 9 4 T 16 14 79510 CASAVA_Build 13 105017987 1I AATCTAAGAT -/G GGGGGGCAAG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 G 6 7 79511 CASAVA_Build 13 105020038 1D AAACTTAATT A/- AAAAAAAAAA 990 het 990 ref 20 6 5 9 A 11 10 79512 CASAVA_Build 13 105027413 1I CTTTCATATT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 7 8 79513 CASAVA_Build 13 105035158 8I GCAGGAGAAT --------/AGGAGAAC GGCGTGAACC 1669 het 569 hom 7 3 4 0 AGGAGAAC 0 1 79514 CASAVA_Build 13 105039771 4D AAATATTTCA AAGT/---- ATTTCCCCTT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 AAGT 1 0 79515 CASAVA_Build 13 105043296 1I ACGCTGAAAG -/T TTTTCTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 4 5 79516 CASAVA_Build 13 105045900 1I TCATTTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 20 21 13 A 14 15 79517 CASAVA_Build 13 105046881 1I ACATTCTTTT -/C ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 C 0 1 79518 CASAVA_Build 13 105049932 2D GGAGGCAAAC TA/-- TGTAGGGAAT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 TA 1 0 79519 CASAVA_Build 13 105052772 2D GTCTCAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 3 AT 8 7 79520 CASAVA_Build 13 105058149 1D AATATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 10 16 T 15 14 79521 CASAVA_Build 13 105062165 1I GCATTTGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 13 13 12 A 11 12 79522 CASAVA_Build 13 105062735 1D GGGTTTTCCC A/- TTTTCTGTAT 3070 hom 156 het 57 0 52 6 A 1 0 79523 CASAVA_Build 13 105063595 10D CAACTTGACC AAGTCACTGG/---------- AAGTCACTGG 2954 het 2954 ref 40 32 7 4 AAGTCACTGG 2 1 79524 CASAVA_Build 13 105065356 1I TAGAATCATG -/A AAAAAAAAAT 1264 het 1264 ref 17 8 5 4 A 9 10 79525 CASAVA_Build 13 105067777 1I TGTAATACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 10 11 79526 CASAVA_Build 13 105073504 2I ATAAGGACAA --/AC TGATTATGGC 3070 het 3070 ref 39 21 10 8 AC 0 1 79527 CASAVA_Build 13 105082961 1I AACTAATAGA -/T AAAAAATTAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 0 1 79528 CASAVA_Build 13 105085381 1D ACTCTGAACC A/- AAAAAAAAAA 644 het 644 ref 45 32 5 8 A 13 12 79529 CASAVA_Build 13 105087893 1I TTTTTATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 10 11 79530 CASAVA_Build 13 105088678 1D ATCTTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1391 het 1391 ref 32 24 3 5 A 12 11 79531 CASAVA_Build 13 105096991 1I17M18I TCTACTAGGG -AAAATACATTTGGGGTA------------------/AAAAATACATTTGGGGTAAGAATTCACCATAGTCAG TTTCTACAAG 3070 hom 141 het 41 0 48 5 N/A 0 0 79532 CASAVA_Build 13 105107490 1I TGTCATATGG -/A TCCACCAATA 3070 hom 84 het 35 0 27 8 A 0 1 79533 CASAVA_Build 13 105120693 2I TACGTACATC --/AA AGTCTCCCAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 3 79534 CASAVA_Build 13 105128296 2D CTTAAATTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 231 hom 40 3 20 17 A 20 18 79535 CASAVA_Build 13 105134626 1I AGCTGTTTCC -/A CACGATTCTT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 0 1 79536 CASAVA_Build 13 105135047 1I TCCTGGATTC -/T TTTTTTTTTT 2933 het 2933 ref 42 17 11 14 T 13 14 79537 CASAVA_Build 13 105142466 1I ATTGTGGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 A 11 12 79538 CASAVA_Build 13 105146506 1D TTTATTCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 13 16 11 A 10 9 79539 CASAVA_Build 13 105147253 1I TAAAAATGAT -/C CACGTTGACC 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 C 1 2 79540 CASAVA_Build 13 105147361 1D GCATGGTCAC T/- TTTGTCTCAC 3070 hom 62 het 23 0 20 4 T 4 3 79541 CASAVA_Build 13 105149734 1D GTACCTTGAA C/- ACAAGATGTT 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 C 1 0 79542 CASAVA_Build 13 105153031 1D CAATCCTGAA G/- GGATAGAAGC 3070 het 3070 hom 52 24 24 4 G 3 2 79543 CASAVA_Build 13 105161552 1D TTTGGTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 11 10 79544 CASAVA_Build 13 105165801 4I CTCAACACAG ----/AACA AATATAAATA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 AACA 0 1 79545 CASAVA_Build 13 105166536 1I GTGTGGGTCT -/G CTGGTGATAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 0 1 79546 CASAVA_Build 13 105168894 3D GGACAGCAGC AGA/--- AGAATTATGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AGA 2 1 79547 CASAVA_Build 13 105171237 2I ATTAAGTAAC --/TG TTTTGATTTG 3070 hom 151 het 55 0 51 4 TG 0 1 79548 CASAVA_Build 13 105171749 1I AAAAAAAAAA -/C CATGTAGAAT 3070 het 904 hom 33 3 26 4 C 1 2 79549 CASAVA_Build 13 105171943 2D ATGGGACTGT GG/-- GTGACGACAT 3070 hom 108 het 43 0 37 9 G 3 1 79550 CASAVA_Build 13 105172181 1D TCATTCCCGC T/- TTCTGACACT 3070 hom 153 het 59 0 51 8 T 3 2 79551 CASAVA_Build 13 105172985 3D AGAAAATAGA AGC/--- AGTCAGAAAA 3070 hom 89 het 32 0 30 3 AGC 1 0 79552 CASAVA_Build 13 105173251 1I CTTTCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 10 11 79553 CASAVA_Build 13 105175297 1D TCAAATGCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 9 8 79554 CASAVA_Build 13 105180492 2D TGAGCAGAGC AA/-- AGAGGGACCC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 3 1 79555 CASAVA_Build 13 105183795 1I AAAATAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 802 hom 46 4 30 12 A 11 12 79556 CASAVA_Build 13 105185586 1D CACCTTAGTC T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 8 7 79557 CASAVA_Build 13 105186869 4I AAAATAAGAC ----/AAAA AAATTACAAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 3 7 79558 CASAVA_Build 13 105188406 2D TTAAAAAAAA AG/-- AGTAATTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AG 2 1 79559 CASAVA_Build 13 105189920 4D TTGCTACAAA CTCT/---- CTCACTCTGC 3070 hom 129 het 46 0 43 4 CT 3 1 79560 CASAVA_Build 13 105191984 1D TTCACTGAGG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 8 7 79561 CASAVA_Build 13 105199155 1D ATAGACCCTC A/- GTATCAGAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 1 0 79562 CASAVA_Build 13 105203636 24I TGAGCAATTG ------------------------/ATAGATATTAGTTTAATCATTATC GTCAGAAAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 2 ATAGATATTAGTTTAATCATTATC 0 1 79563 CASAVA_Build 13 105206964 4D TGTGGTTATA TGTG/---- TGTGTATCTA 3070 het 3070 hom 56 23 28 5 TG 4 2 79564 CASAVA_Build 13 105213620 7I TATCTGGACT -------/TGACTGG TGATCAGTTA 3070 hom 117 het 42 0 38 4 TGACTGG 0 1 79565 CASAVA_Build 13 105214030 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2857 het 2857 ref 24 11 10 3 A 10 11 79566 CASAVA_Build 13 105216195 1I TCAGCAGTGA -/G ATTGAAACTG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 0 1 79567 CASAVA_Build 13 105243925 6D TTTGTTTTTG TTTTTT/------ TTTTGAGACG 3070 hom 18 het 8 0 7 4 T 10 4 79568 CASAVA_Build 13 105244732 1D GAAAATGTAT A/- AAAACTTGAA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 5 4 79569 CASAVA_Build 13 105252250 1I TACAGATTTA -/T ATTTTCTTCA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 0 1 79570 CASAVA_Build 13 105264710 1D TCTTTCTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 57 21 27 9 A 10 9 79571 CASAVA_Build 13 105265420 2D CGGGATTAGC AA/-- AGTGTTCATT 3070 het 3070 hom 53 23 21 10 A 3 1 79572 CASAVA_Build 13 105272043 1D TTAAAAGTAG T/- TGGAGGATGA 3070 het 3070 ref 24 13 9 4 T 2 1 79573 CASAVA_Build 13 105275469 1I GATTTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 39 1 28 10 A 13 14 79574 CASAVA_Build 13 105280502 4D TTTTCTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 13 12 10 TTTG 3 2 79575 CASAVA_Build 13 105281682 1I TTCCATTGAT -/A AAAATAATAT 3070 het 3070 hom 40 15 25 0 A 4 5 79576 CASAVA_Build 13 105298763 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 106 het 43 0 36 8 A 10 9 79577 CASAVA_Build 13 105303572 1D CATAATATTA C/- CCCCCCAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 C 7 6 79578 CASAVA_Build 13 105303978 1I ATACTTCCAG -/T GAGTTTGAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 0 1 79579 CASAVA_Build 13 105313731 2D TTTTTGAGAA AC/-- ACAGTTTCTC 3070 het 3070 ref 44 23 16 8 AC 2 1 79580 CASAVA_Build 13 105320657 1D CTATTGATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1504 hom 34 5 15 14 T 10 9 79581 CASAVA_Build 13 105321289 1I GAAGCAGGGA -/G GGGGGGGTGT 3070 hom 98 het 39 0 31 8 G 7 8 79582 CASAVA_Build 13 105324079 20D TATCTTCCAG ATAATAAGGACATATAAACA/-------------------- TACAGATAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 ATAATAAGGACATATAAACA 1 0 79583 CASAVA_Build 13 105333470 1D TAGCATCCAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 87 het 32 0 30 4 A 9 8 79584 CASAVA_Build 13 105347182 2I GCTCATTTTG --/GT TTTTTTTGTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GT 0 1 79585 CASAVA_Build 13 105349315 1I TCTCCACAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 414 hom 38 1 29 8 A 9 10 79586 CASAVA_Build 13 105350309 2I AAATAAAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 10 12 79587 CASAVA_Build 13 105352441 1I CTTTTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1231 hom 41 3 30 8 A 11 12 79588 CASAVA_Build 13 105353904 1D AGACCTGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 25 0 17 8 A 12 11 79589 CASAVA_Build 13 105360634 1D CTTTCCCAAG A/- AAAAGACAAA 3070 het 3070 ref 50 32 15 4 A 5 4 79590 CASAVA_Build 13 105374324 1I AGGACTTGAC -/T GGGTCTACTG 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 0 1 79591 CASAVA_Build 13 105377830 3D GTTTCAGTTT CTG/--- CAGATCCTCA 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 CTG 1 0 79592 CASAVA_Build 13 105388874 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2240 het 2240 ref 17 7 5 5 A 11 12 79593 CASAVA_Build 13 105409372 1I AACTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 28 6 13 9 C 0 1 79594 CASAVA_Build 13 105409658 1I TGGCCAAATG -/T TTTAACTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 T 3 4 79595 CASAVA_Build 13 105413047 1I CCAGATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 T 10 11 79596 CASAVA_Build 13 105421271 1I ATGATACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1139 hom 18 3 9 6 T 10 11 79597 CASAVA_Build 13 105422608 1I AAAAGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 10 11 79598 CASAVA_Build 13 105425714 1D AACAGAACGT G/- GGTGCAGCAC 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 G 3 2 79599 CASAVA_Build 13 105430591 4D AATTTCTTTC TTTT/---- GTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 T 4 0 79600 CASAVA_Build 13 105431871 21D TTGTGCTATT AAATCCGGAAAGATTTTAAGA/--------------------- AAATCCGGAA 3070 het 3070 hom 43 14 17 16 AAATCCGGAAAGATTTTAAGA 2 1 79601 CASAVA_Build 13 105439596 1I ACTTTTAAGA -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 5 6 79602 CASAVA_Build 13 105441375 5I TTGCTCACTC -----/CTGCA TTGCATTTCA 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 CTGCA 0 1 79603 CASAVA_Build 13 105446209 1D TGATGCTTCC T/- TTTTGGGTAT 2605 het 2605 ref 34 22 7 5 T 5 4 79604 CASAVA_Build 13 105447419 1I AGCCCTATGC -/A AACATGTAGC 3070 het 3070 hom 62 25 28 9 A 2 3 79605 CASAVA_Build 13 105448938 4I AGTACATATA ----/TGTG TGTATGTGTT 3070 het 3070 ref 76 35 31 10 TG 1 3 79606 CASAVA_Build 13 105449003 4D12M17D25M2I CGTACGTGTG TGTATGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTAGAGTATGTGTGTGTGTTGTGCATACATA--/----TGTATGTGTGAA-----------------TATGTGTGTGTGTTGTGCATACATATG TGTTTATGTG 3070 het 3070 ref 58 33 17 51 N/A 0 0 79607 CASAVA_Build 13 105449098 2D16M1I GTATGTGTGA ATATGTGTGTGTAGAGTA-/--ATGTGTGTGTAGAGTAT TGTGTGTGGT 1520 het 1520 ref 79 53 4 38 N/A 0 0 79608 CASAVA_Build 13 105449339 3D TGGGTTATTA TTT/--- TTTTAAAAAC 3070 het 3070 ref 57 29 13 16 T 7 4 79609 CASAVA_Build 13 105451442 3D CTTAGTTTTT TTG/--- TTTATTTATT 3070 het 2325 hom 18 6 9 3 TTG 1 0 79610 CASAVA_Build 13 105451467 1I TTTGTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 2430 het 733 hom 20 3 8 9 T 10 11 79611 CASAVA_Build 13 105453121 3I GCTCATATAC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 11 24 6 T 10 13 79612 CASAVA_Build 13 105456072 1D ACTTTCTCTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 9 8 79613 CASAVA_Build 13 105457768 2D CTAAAATGCC AG/-- AGAGTATAGA 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 AG 3 2 79614 CASAVA_Build 13 105464170 12D AAATGCATAA TGAGGTAGAGAC/------------ AGTCAGGTTG 3070 het 3070 hom 54 24 26 7 TGAGGTAGAGAC 1 0 79615 CASAVA_Build 13 105464810 1D CTAATACTAT C/- CCCCCCCTCC 1900 hom 18 het 9 0 7 2 C 8 7 79616 CASAVA_Build 13 105479853 14D AGCACCTACA TTGTTACCAAGCTC/-------------- TTGGGGTTCA 3070 het 3070 ref 54 26 23 10 TTGTTACCAAGCTC 1 0 79617 CASAVA_Build 13 105492743 2D ATATGTGTTT TC/-- TTCTTCAATT 3070 het 2418 hom 23 7 16 0 TC 1 0 79618 CASAVA_Build 13 105497454 1I CCCAATTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 9 10 79619 CASAVA_Build 13 105499038 1I GGAAAGGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 A 10 11 79620 CASAVA_Build 13 105501813 1D ATACAGCTAA G/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 G 1 0 79621 CASAVA_Build 13 105506531 3D CTACTGCTGT ACA/--- ACATCATCAG 3070 hom 126 het 48 0 43 6 ACA 2 1 79622 CASAVA_Build 13 105515071 1I TTATTATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 10 11 79623 CASAVA_Build 13 105515841 1D ACAGCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 8 T 13 12 79624 CASAVA_Build 13 105529121 1D AAGTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3000 het 3000 ref 37 14 13 10 A 15 14 79625 CASAVA_Build 13 105532714 14I AGTATATACT --------------/TGTGTACTTACATA TATATGTATG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 TGTGTACTTACATA 0 1 79626 CASAVA_Build 13 105548234 1I ACATGTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 34 1 24 9 T 10 11 79627 CASAVA_Build 13 105563555 1D ACTTGGTGTC T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 7 6 79628 CASAVA_Build 13 105569249 1D AATGGTTGGC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 40 13 25 2 A 7 6 79629 CASAVA_Build 13 105570061 1D ACCCAATGGC T/- CTAAGAAAGT 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 T 1 0 79630 CASAVA_Build 13 105602876 1I AGTTTGTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 8 9 79631 CASAVA_Build 13 105611330 1I AGATAGAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 9 10 79632 CASAVA_Build 13 105614234 1D ATGGGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1535 hom 21 6 12 3 T 14 13 79633 CASAVA_Build 13 105619415 2D TCCAAAGATG TA/-- TATATATATA 2742 het 2738 hom 31 14 9 8 TA 7 6 79634 CASAVA_Build 13 105634585 5D GAAAAATGAC TTCTG/----- TTCTCTTCAT 3070 het 3070 ref 45 23 20 5 TTCTG 1 0 79635 CASAVA_Build 13 105641046 6I AGAGACAACA ------/TATTTT TAGTAAACTC 3070 het 3070 hom 41 14 25 2 TATTTT 0 1 79636 CASAVA_Build 13 105644274 1D AAATCTTCCA T/- CCAAAAAAAA 3070 het 1619 hom 33 11 11 12 T 1 0 79637 CASAVA_Build 13 105646036 11D AATGCTCAAT AGCACTAATCA/----------- CAAGGGAACG 3070 het 3070 hom 46 22 23 6 AGCACTAATCA 1 0 79638 CASAVA_Build 13 105647154 3I TGCTTTCATT ---/GTC GTTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 GTC 0 1 79639 CASAVA_Build 13 105647826 4I GAAACATGAC ----/AATT AAAGTACTGT 3070 het 3070 ref 53 25 23 5 AATT 0 1 79640 CASAVA_Build 13 105649430 1I CATTTACCAG -/T ATATTGTGAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 0 1 79641 CASAVA_Build 13 105650782 2I TTATTATCTC --/TA TATATATATT 2884 het 2884 ref 26 12 8 6 TA 4 5 79642 CASAVA_Build 13 105652783 1D GGTTTTGCAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 102 het 40 0 33 7 A 8 7 79643 CASAVA_Build 13 105653744 1I AACCTAAATG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 33 0 23 10 A 8 9 79644 CASAVA_Build 13 105662688 1I ATGGTGTAGG -/T TTAGTTATTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 3 79645 CASAVA_Build 13 105679205 1D GACCAAGAAA G/- AAAGTCCTCC 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 G 1 0 79646 CASAVA_Build 13 105684080 5D GCTAATTGAA ACTTG/----- AGTAAGGGTA 3070 het 3070 ref 25 16 9 0 ACTTG 1 0 79647 CASAVA_Build 13 105695033 1I TTTACACAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 9 10 79648 CASAVA_Build 13 105697107 1I AGACATGAAA -/T TCCTACTGAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 1 2 79649 CASAVA_Build 13 105708396 1I GTAAAGACCT -/G GGTTCTGGAG 3070 hom 62 het 24 0 21 3 G 2 3 79650 CASAVA_Build 13 105715983 1I CATAACGAAA -/C CCAGTCCGTA 3070 hom 63 het 25 0 18 7 C 2 3 79651 CASAVA_Build 13 105720602 1I GTCCTCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1747 hom 35 6 15 14 T 16 17 79652 CASAVA_Build 13 105727906 1D CATAAAAGGG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 7 79653 CASAVA_Build 13 105751940 1D ACATGGCAAA G/- CCCCGTCTCT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 G 1 0 79654 CASAVA_Build 13 105762738 1I AAAGAAAAAT -/A ACTATTGTAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 2 79655 CASAVA_Build 13 105777557 1D GAAAGCATGT A/- ACCTGCACTT 2817 het 2817 ref 21 13 7 2 A 2 1 79656 CASAVA_Build 13 105778284 1D TCAAAAGAAC A/- AAAAAGCAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 A 6 5 79657 CASAVA_Build 13 105778972 1D CCAGACACAT C/- CCCGAAGGGG 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 C 4 3 79658 CASAVA_Build 13 105785848 1I AGTGTGTGAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 7 8 79659 CASAVA_Build 13 105787701 4I TCATGTTTCT ----/ACTA ACTGTTAATC 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 ACTA 0 1 79660 CASAVA_Build 13 105789690 1I ACTCATGTTA -/T ATTCATGACA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 0 1 79661 CASAVA_Build 13 105793283 4D CCATGGGAAC ACAG/---- ACAGGTTCAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 ACAG 2 1 79662 CASAVA_Build 13 105800010 1I CATATGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 37 3 15 19 A 13 14 79663 CASAVA_Build 13 105802212 1D GTAAAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2634 hom 20 9 7 4 A 11 10 79664 CASAVA_Build 13 105812381 1D TTGGGAAAAA C/- AAAAACCAAA 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 C 1 0 79665 CASAVA_Build 13 105815826 1D AACTTAAAAA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 11 11 G 1 0 79666 CASAVA_Build 13 105820093 1I TTCTTACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 10 11 79667 CASAVA_Build 13 105837256 2D ACTTTACTTC GG/-- GGGGGGGGGG 2978 het 304 hom 29 4 10 16 G 12 10 79668 CASAVA_Build 13 105846449 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 7 8 79669 CASAVA_Build 13 105846899 1I TCTGTTGTTC -/T TCTTCTTTCT 3070 het 2904 hom 25 9 9 7 T 1 2 79670 CASAVA_Build 13 105849607 1I TGAAAAAAAA -/G GAAAAGGAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 79671 CASAVA_Build 13 105863524 1I GTATGTCATG -/A AAAAATAGTC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 5 6 79672 CASAVA_Build 13 105867886 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2816 het 2816 ref 32 14 10 8 T 12 13 79673 CASAVA_Build 13 105871850 1I GCAAAGCAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 425 hom 33 1 27 5 A 9 10 79674 CASAVA_Build 13 105872082 1D TTACACATTG A/- AAAAAACTAT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 7 6 79675 CASAVA_Build 13 105874602 1D TTAATCAATA T/- TTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 50 26 14 10 T 7 6 79676 CASAVA_Build 13 105880097 1I AACGTTCCAG -/C CCCACTCCAC 3070 hom 105 het 44 0 32 12 C 3 4 79677 CASAVA_Build 13 105886247 2D CTCCAGAAAC TG/-- TACTCTTAAC 3070 het 3070 ref 57 27 26 5 TG 1 0 79678 CASAVA_Build 13 105887940 1D CTTGTAAAAT G/- CTTTAGGACC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 G 1 0 79679 CASAVA_Build 13 105889192 4I GGAGGGAGGA ----/AGGG AGGGAGGGAG 3070 hom 45 het 22 0 13 9 AGGG 3 4 79680 CASAVA_Build 13 105890946 1D ACTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 11 10 15 A 12 11 79681 CASAVA_Build 13 105894672 21D ATTAAGGGTC TGTGTTCATGCACTCAGTGAT/--------------------- TGTGTTCATG 3070 hom 126 het 39 0 42 6 TGTGTTCATGCACTCAGTGAT 2 1 79682 CASAVA_Build 13 105899762 1D CAGCAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 13 12 79683 CASAVA_Build 13 105904142 1D GAAAAATGCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 9 8 79684 CASAVA_Build 13 105906780 1I GTACGAAAAT -/A AAAACTCACG 3070 het 3070 hom 47 15 28 4 A 4 5 79685 CASAVA_Build 13 105907620 1I TTCCTTCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 9 10 79686 CASAVA_Build 13 105907942 2D TTAACTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 AT 6 5 79687 CASAVA_Build 13 105910652 1I ATTTGGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 31 0 19 12 T 10 11 79688 CASAVA_Build 13 105911843 1I AGACCCTAGC -/A AAAAAATGCT 3070 hom 96 het 39 0 30 9 A 6 7 79689 CASAVA_Build 13 105915649 1I GGGGCAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 11 12 79690 CASAVA_Build 13 105925152 1I TTTCATGAAG -/C TTTTGCTTTA 3070 hom 109 het 44 0 34 10 C 0 1 79691 CASAVA_Build 13 105925199 4D TGTGTGTGTG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 52 het 40 0 18 22 GT 11 9 79692 CASAVA_Build 13 105934903 1D TTAAGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 13 14 T 13 12 79693 CASAVA_Build 13 105938058 1D TATTTTAGTA C/- CCCCCCCTCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 8 7 79694 CASAVA_Build 13 105941293 1D TGTCGCTACA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 41 0 34 9 T 8 7 79695 CASAVA_Build 13 105945730 1D CTGTAGTCAA G/- ATTCAGAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 G 1 0 79696 CASAVA_Build 13 105949621 1I TGACACAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 34 0 18 16 A 11 12 79697 CASAVA_Build 13 105951684 2D ATTTCATTCA TT/-- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 T 9 7 79698 CASAVA_Build 13 105953201 3I AAGAGCAGAA ---/AGC AGTGATGGCA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AGC 0 1 79699 CASAVA_Build 13 105962654 1I AATTCTAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 9 10 79700 CASAVA_Build 13 105964113 1I TCTCAGCTCG -/T TTCGTAAGCA 3070 hom 71 het 28 0 21 7 T 2 3 79701 CASAVA_Build 13 105971122 1I ATGTTTTTCC -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 6 7 79702 CASAVA_Build 13 105972405 1I CCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 10 11 79703 CASAVA_Build 13 105973035 1I TACCATCATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 9 10 79704 CASAVA_Build 13 105976934 1I CCCATAGCAA -/G GGGGGGGATT 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 G 7 8 79705 CASAVA_Build 13 105978820 1D GCTGCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2898 het 2898 ref 27 16 10 1 A 12 11 79706 CASAVA_Build 13 105982116 1I TTATATAGGG -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 A 6 7 79707 CASAVA_Build 13 105987173 1D TATGCCCACG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 8 7 79708 CASAVA_Build 13 105992653 1I AGTTACATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 13 14 79709 CASAVA_Build 13 105994175 1D TAGTGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1676 hom 37 6 19 12 A 17 16 79710 CASAVA_Build 13 106047847 1I CCAGAAATCT -/G GTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 1 2 79711 CASAVA_Build 13 106047970 1I CCTGGCATAT -/A TTTTTTTTTT 1167 het 794 hom 33 6 9 18 A 0 1 79712 CASAVA_Build 13 106056909 1D ACCATAATTG T/- TAAGTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 2 1 79713 CASAVA_Build 13 106058483 1D45M3D TGTAACATAT ATAATATATAGTATAGTACATACTAAACAGAATGCTATTCAGTCTTAAA/-TAATATATAGTATAGTACATACTAAACAGAATGCTATTCAGTCTT--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 16 11 9 N/A 0 0 79714 CASAVA_Build 13 106061691 1I GTCTCTTAGC -/A AAAAATCAGT 3070 het 3070 hom 58 20 27 11 A 5 6 79715 CASAVA_Build 13 106066290 1D TTTAAAAAAA T/- TTTTATGGGT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 5 4 79716 CASAVA_Build 13 106069805 1I CCAAAGTGAC -/A AAAAGCCCAG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 4 5 79717 CASAVA_Build 13 106071410 1D GCCTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 26 1 12 13 T 17 16 79718 CASAVA_Build 13 106077346 1D ATTGGCCAAA C/- AAATAACTGA 3070 hom 180 het 65 0 58 9 C 1 0 79719 CASAVA_Build 13 106079063 1I CCTTGTAGGG -/T GGTTGTCAGC 3070 hom 138 het 50 0 46 4 T 0 1 79720 CASAVA_Build 13 106085307 1I CATTGTTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 11 12 79721 CASAVA_Build 13 106088488 2I ATCCCTTAAT --/AA AAGGCTTGCA 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 A 2 4 79722 CASAVA_Build 13 106090809 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1080 het 1080 ref 31 22 3 6 A 12 11 79723 CASAVA_Build 13 106112916 1D TCATTACTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 10 9 79724 CASAVA_Build 13 106160232 1I ATTTGCTAAT -/A TACAGCTACC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 0 1 79725 CASAVA_Build 13 106170127 1I TAATGTAATC -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 93 het 41 0 31 10 T 7 8 79726 CASAVA_Build 13 106170956 1D GGATGTCTTT A/- AATTTATTCT 3070 het 3070 ref 34 18 10 7 A 3 2 79727 CASAVA_Build 13 106172661 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 2290 het 2290 ref 23 15 5 4 A 12 11 79728 CASAVA_Build 13 106177292 1D TCTATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2260 het 2260 ref 52 35 5 12 T 13 12 79729 CASAVA_Build 13 106188941 2D TCTTCTCGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 13 11 79730 CASAVA_Build 13 106189181 1D GTACTGGGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 286 hom 34 2 25 7 T 9 8 79731 CASAVA_Build 13 106193189 1I AAACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 526 hom 22 2 16 4 A 12 13 79732 CASAVA_Build 13 106197166 1D GGTTACAGTT A/- AAAAAAAAAA 1107 het 1107 ref 40 34 3 4 A 13 12 79733 CASAVA_Build 13 106197402 1D ATATGTTTTT A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 8 7 79734 CASAVA_Build 13 106202077 1I49M1I TTTAATGGGG -TTTTTTTTTGTTCTAGGACATATATACATTAGCAAGATTGTATTTATTT-/TTTTTTTTTTGTTCTAGGACATATATACATTAGCAAGATTGTATTTATTTA AAAAAAAAAT 3070 hom 148 het 39 0 50 8 N/A 0 0 79735 CASAVA_Build 13 106204435 1D ATTAAATTTG A/- AAAAAAATTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 8 7 79736 CASAVA_Build 13 106211520 2I ATTAATTACA --/AT TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 0 1 79737 CASAVA_Build 13 106215028 3D TGTTGATTTT ATA/--- ATTATCAATT 3070 hom 123 het 43 0 42 4 ATA 1 0 79738 CASAVA_Build 13 106216280 2D GACTGTAGCT GA/-- GTTTCACTCC 3070 hom 154 het 56 0 52 5 GA 1 0 79739 CASAVA_Build 13 106217241 1I ATTTTAGCAA -/T ACCATGTCTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 0 1 79740 CASAVA_Build 13 106218611 1I TCCTCATTTC -/T TCTTTTTTCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 1 2 79741 CASAVA_Build 13 106262713 1D TATATTAGAA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 4 T 7 6 79742 CASAVA_Build 13 106264833 4D AAAAAGAAAA AGAG/---- AGAGAGGAAG 3070 hom 56 het 23 0 19 6 AG 5 3 79743 CASAVA_Build 13 106265350 3D TTATCCCAAA TTC/--- TTCTTCAAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 4 TTC 3 2 79744 CASAVA_Build 13 106294328 1D TTATTACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 8 4 A 12 11 79745 CASAVA_Build 13 106294971 3I TTATGTCTTT ---/TTC TTCTTTTTTC 3070 hom 88 het 37 0 30 7 TTC 1 2 79746 CASAVA_Build 13 106296697 2D CCCTTATTTT TA/-- TATGTCTTCT 3070 hom 87 het 33 0 27 9 TA 2 1 79747 CASAVA_Build 13 106298011 2I TCAAAAATGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 16 3 A 14 16 79748 CASAVA_Build 13 106321463 5D TATTAATTAT GTTAA/----- GTTCTAAGCA 3070 het 3070 ref 29 14 14 2 GTTAA 1 0 79749 CASAVA_Build 13 106324462 1D AACTGCTTTG T/- TATCAGGCAC 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 T 2 1 79750 CASAVA_Build 13 106333968 5D ATTATTAGTA TAATG/----- TAAGTTGGAT 3070 het 3070 hom 54 23 28 5 TAATG 1 0 79751 CASAVA_Build 13 106334313 1I CTCTCTGAGG -/T TACTTTTATC 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 1 2 79752 CASAVA_Build 13 106337677 1D CAGAGATGGC A/- AAGGATACCA 3070 het 3070 hom 69 31 30 9 A 3 2 79753 CASAVA_Build 13 106342048 5D TATAATTTAA GCACC/----- GCACCGATGA 3070 het 3070 hom 39 18 18 5 GCACC 2 1 79754 CASAVA_Build 13 106351967 2D ACTCCATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 9 A 14 12 79755 CASAVA_Build 13 106396386 1D ACTCCATCAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 60 het 25 0 21 6 A 8 7 79756 CASAVA_Build 13 106397135 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 151 het 60 0 49 11 GT 6 5 79757 CASAVA_Build 13 106404231 4D TCCTTTTTAT TTAA/---- TTTATAGGTG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TTAA 1 0 79758 CASAVA_Build 13 106409543 1I ACATTGAAAT -/A TTTTTTTTAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 79759 CASAVA_Build 13 106415245 1I TCTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 256 hom 33 1 24 8 A 12 13 79760 CASAVA_Build 13 106431253 9D ACTCCATCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 1554 hom 15 het 9 0 7 5 A 27 18 79761 CASAVA_Build 13 106431709 1D AACATTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 29 1 25 3 A 14 13 79762 CASAVA_Build 13 106442808 1D AAAAAAACAA C/- CCCATCAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 4 3 79763 CASAVA_Build 13 106443467 2D CAGGGGAAAA AC/-- ACATACTGGG 3070 hom 118 het 44 0 39 5 AC 2 1 79764 CASAVA_Build 13 106444034 2D ATTTAAAGGC TG/-- TGATTCCATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TG 2 1 79765 CASAVA_Build 13 106448498 1D CCTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1608 het 1608 ref 30 15 6 9 T 17 16 79766 CASAVA_Build 13 106468771 1D CCAACGGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 129 het 52 0 44 9 A 10 9 79767 CASAVA_Build 13 106499585 1D CCTAAAGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 10 9 79768 CASAVA_Build 13 106507931 1I GAAAAAGATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 9 10 79769 CASAVA_Build 13 106521223 1I GCCAGCAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 9 10 79770 CASAVA_Build 13 106523398 4I GGAGGGAAGA ----/CTGT CTGGGAGAAG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 CTGT 0 1 79771 CASAVA_Build 13 106527466 1D AATACACAAG C/- TTTGGTAATT 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 C 1 0 79772 CASAVA_Build 13 106528971 1D TTCTACTTTG A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 46 24 21 1 A 7 6 79773 CASAVA_Build 13 106530952 1D CAACGTTCCC G/- GGGCACACTG 3070 het 3070 ref 56 26 24 6 G 4 3 79774 CASAVA_Build 13 106539864 1I CTACTTTTTT -/A TAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 0 1 79775 CASAVA_Build 13 106551860 2I CCTTAAATGT --/TA GCTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 TA 0 1 79776 CASAVA_Build 13 106556343 1I TGAAGAGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 9 10 79777 CASAVA_Build 13 106556462 2D TTTTTTTTTT TG/-- ATTTGCGTAT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 TG 1 0 79778 CASAVA_Build 13 106568904 1D AAACTATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 11 10 79779 CASAVA_Build 13 106587524 1D TTACTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 12 11 79780 CASAVA_Build 13 106587615 4D ATACTGTGAT AGTC/---- AGATGCAGTA 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 AGTC 1 0 79781 CASAVA_Build 13 106594167 1I TCTATATATG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 6 7 79782 CASAVA_Build 13 106618113 1D GTTTTTTTTT G/- GGGGGTGGGG 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 G 6 5 79783 CASAVA_Build 13 106619311 1D GAATGTAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 12 20 0 T 10 9 79784 CASAVA_Build 13 106619769 4D CCGCAATCCC TTTG/---- TTTGTTCCCT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 TTTG 2 1 79785 CASAVA_Build 13 106634531 1D AAAGTGTAAT A/- AAAAAAAAAA 2860 het 2860 ref 23 11 9 3 A 12 11 79786 CASAVA_Build 13 106638827 1I ATTCTGCAAA -/C TTTTGGATAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 0 1 79787 CASAVA_Build 13 106641613 1D ACTAAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 28 2 8 19 A 12 11 79788 CASAVA_Build 13 106642562 1D TATTAATTAT A/- ATAACCTGTG 2256 het 2256 ref 21 14 5 2 A 2 1 79789 CASAVA_Build 13 106643006 1D TATCTATTAC T/- GAAGTTATGC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 1 0 79790 CASAVA_Build 13 106653957 1I TGTGCTCCAT -/C CCCCGTGGTG 3070 het 3070 hom 40 11 19 10 C 4 5 79791 CASAVA_Build 13 106654784 1I ACCTTACAGT -/G GGGGGCGATT 3070 het 3070 ref 44 25 11 8 G 5 6 79792 CASAVA_Build 13 106663580 4D TTTTTAACTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1757 het 1325 hom 15 7 4 5 A 20 16 79793 CASAVA_Build 13 106676312 4D TTACACATTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 114 het 45 0 39 8 AAAC 3 2 79794 CASAVA_Build 13 106703523 3D GACTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 29 4 15 12 T 15 12 79795 CASAVA_Build 13 106705916 4D TTTTATAGAT AAAG/---- AAAGTCCATT 3070 het 3070 ref 57 31 25 3 AAAG 2 1 79796 CASAVA_Build 13 106707840 1D50M1I TTTCTTCTGC TTTTTTTTTTTTTCTGCTTTGAATTTGATATCATCTAGGCTCTAGAAGAAA-/-TTTTTTTTTTTTCTGCTTTGAATTTGATATCATCTAGGCTCTAGAAGAAAC CTCTGGGATA 3070 het 1178 hom 37 4 35 9 N/A 0 0 79797 CASAVA_Build 13 106709119 44D CCTACAAAAG GAAACATGTTTATGAAAGGCTTAAGGAATTGAGGATGTTTAGAT/-------------------------------------------- GAAACATGTT 3070 het 3070 ref 46 24 12 29 GAAACATGTTTATGAAAGGCTTAAGGAATTGAGGATGTTTAGAT 2 1 79798 CASAVA_Build 13 106719516 1I GTCTATGTTT -/A AAAAAAAAAA 2304 het 2304 ref 29 11 12 6 A 13 14 79799 CASAVA_Build 13 106721921 11I AGAACTCAGC -----------/CAGGCTGTGCT CAGGCTGTGC 3070 hom 76 het 34 0 23 13 CAGGCTGTGCT 1 2 79800 CASAVA_Build 13 106724386 1D TCTGTTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 10 9 79801 CASAVA_Build 13 106733800 1I ATGCTGAGTT -/A AAAAAAAAAA 2902 het 2902 ref 24 10 6 8 A 11 12 79802 CASAVA_Build 13 106734672 1D ACAAAGTATA T/- GAGTAAGCAG 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 T 1 0 79803 CASAVA_Build 13 106734908 27D ACTGCTATGG ACTGAACTGTGTCCCGCCCTCCCCCTC/--------------------------- AAATTCGTAT 3070 het 3070 ref 36 22 14 5 ACTGAACTGTGTCCCGCCCTCCCCCTC 1 0 79804 CASAVA_Build 13 106735257 1D ACCCATCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 14 6 T 10 9 79805 CASAVA_Build 13 106739348 1D TCAAAGTATG A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 7 6 79806 CASAVA_Build 13 106745335 1I ACTGAATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 T 9 10 79807 CASAVA_Build 13 106759503 1I TTTCTAACTG -/T TTGAAACCTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 2 3 79808 CASAVA_Build 13 106788774 1I CTTTCTCAAC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 114 het 48 0 38 10 A 7 8 79809 CASAVA_Build 13 106790526 1D CTTACATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 31 0 16 15 T 15 14 79810 CASAVA_Build 13 106820485 1D TGGTTTGAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 9 8 79811 CASAVA_Build 13 106820992 3I TGCTTCTTTA ---/AAC AAAAGAGTCA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 AAC 0 1 79812 CASAVA_Build 13 106822482 1I GTGTTGAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 8 9 79813 CASAVA_Build 13 106823315 5I CTAGCATCTG -----/TTAAC TTAATGAGGT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 TTAAC 0 1 79814 CASAVA_Build 13 106824937 2I ACGCTAAGAC --/TT TTACCCTTGT 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 T 2 4 79815 CASAVA_Build 13 106835902 14D ATTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 842 het 842 ref 14 7 3 6 A 25 11 79816 CASAVA_Build 13 106849805 4I ACATTCACGT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3053 hom 55 10 27 18 AC 6 8 79817 CASAVA_Build 13 106854072 1I CCACAAATTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 A 0 1 79818 CASAVA_Build 13 106861651 1D TAGAATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1827 hom 41 18 13 10 T 17 16 79819 CASAVA_Build 13 106862871 1I ATATACTATA -/T TACCATCTTC 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 T 1 2 79820 CASAVA_Build 13 106863834 1D TTTTAGATCA T/- ATATATTTAA 3070 het 3070 hom 32 10 21 1 T 1 0 79821 CASAVA_Build 13 106864105 3D ACTTTCCATC ATT/--- AAATGGAATA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 ATT 1 0 79822 CASAVA_Build 13 106864556 6I TTGAAAAACA ------/TGTATC TATATATATA 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 TGTATC 0 1 79823 CASAVA_Build 13 106865327 4I AAACTTCAGC ----/ATAT ATAAAGATAA 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 AT 1 3 79824 CASAVA_Build 13 106865722 2D GGGCCATAAG GA/-- GAGAGTTTTT 2660 het 2660 ref 34 14 12 8 GA 3 2 79825 CASAVA_Build 13 106866353 1I TATATGCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2705 hom 36 11 15 10 T 9 10 79826 CASAVA_Build 13 106867770 1D CATCTAACAA C/- CCCAAATTTG 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 C 4 3 79827 CASAVA_Build 13 106867871 4I TTAATATTTA ----/ATTG ATTGTCTCAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 ATTG 1 2 79828 CASAVA_Build 13 106902454 3D TCCTCTGCTC CCT/--- CCTCCTTCCA 3070 het 3070 hom 46 25 18 3 CCT 3 2 79829 CASAVA_Build 13 106909742 2I AAACATACAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 23 9 10 4 AT 7 8 79830 CASAVA_Build 13 106914576 1I AACTCACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 A 9 10 79831 CASAVA_Build 13 106929999 1I AAAAAAAATG -/T TAAGGAGGAG 3070 het 3070 hom 24 7 14 3 T 1 2 79832 CASAVA_Build 13 106934151 2D TCTGCATTAA AT/-- ATAAATTAAT 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 AT 2 1 79833 CASAVA_Build 13 106953641 1I GTAAGTTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 9 10 79834 CASAVA_Build 13 106956942 4I TGTGCATTTT ----/TCTC TCTCTATTTA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 TC 2 4 79835 CASAVA_Build 13 106969471 1D ACTAAGGAAT G/- ACTTGTGATA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 G 1 0 79836 CASAVA_Build 13 106981367 4D TGTCATTCAC ATAT/---- ATATATATAT 3017 het 3017 ref 26 11 7 10 AT 8 6 79837 CASAVA_Build 13 106983169 5I ATTATTCAGG -----/AATAT AATATAATTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 AATAT 1 2 79838 CASAVA_Build 13 107001251 1I TGACATTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 A 12 13 79839 CASAVA_Build 13 107004250 1D TTAGTTAAGT A/- AGTGCCTGGC 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 A 2 1 79840 CASAVA_Build 13 107007029 1I AGAGACGGGG -/T TTCACCATGT 1492 het 1492 ref 26 19 4 3 T 2 3 79841 CASAVA_Build 13 107027841 1I CCAAATTATC -/A AAGTCAGTAG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 2 3 79842 CASAVA_Build 13 107028632 2D AGTACCCTGT TC/-- TCTCCCTCAT 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 TC 3 2 79843 CASAVA_Build 13 107030026 3I GATTTCATAT ---/TTC TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 TTC 0 1 79844 CASAVA_Build 13 107035728 1I AATAGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 A 10 11 79845 CASAVA_Build 13 107036874 1I TAAATCATTG -/T TATTTATCTA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 1 2 79846 CASAVA_Build 13 107040224 4D GCAGGATAAC CAAA/---- CAGATTGCAC 3070 het 3070 ref 44 29 14 2 CAAA 1 0 79847 CASAVA_Build 13 107044168 1D TTTCAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1219 hom 39 6 24 9 A 13 12 79848 CASAVA_Build 13 107050824 6I CCAGATATTC ------/TAATTA TAACTATGTT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 TAATTA 0 1 79849 CASAVA_Build 13 107051367 1D TATAAGTCAC G/- GTAGGTCTTC 3070 het 3070 hom 61 28 29 4 G 2 1 79850 CASAVA_Build 13 107072346 1I CACAAAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 27 13 8 T 10 11 79851 CASAVA_Build 13 107077481 1D GAAATATTTC T/- AACCCAATTG 3070 het 3070 hom 40 11 24 7 T 1 0 79852 CASAVA_Build 13 107079969 19I CTCTCTCTTC -------------------/TCATTTTTGATAAACAATG TCACTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 TCATTTTTGATAAACAATG 0 1 79853 CASAVA_Build 13 107080538 2D TCTGACATAA AT/-- GGGTTAAGTA 3070 het 3070 hom 48 15 25 8 AT 1 0 79854 CASAVA_Build 13 107084071 6D TATGTGTGTG TATATA/------ TATATATATA 2942 het 897 hom 14 3 7 5 TA 9 6 79855 CASAVA_Build 13 107084342 5I26M2D CAAATTGATC -----TATTTGCTTTAGATACTATTATGTGCAG/TCATATATTTGCTTTAGATACTATTATGTGC-- AGTTATTTGA 3070 het 3070 hom 19 11 13 1 N/A 0 0 79856 CASAVA_Build 13 107085791 17I AGGGGTAACC -----------------/ACCTCCATCATTCAACT ACCTCCCACT 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 ACCTCCATCATTCAACT 0 1 79857 CASAVA_Build 13 107087603 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2366 hom 25 6 14 6 TA 7 6 79858 CASAVA_Build 13 107101481 1I TTGTTTAATG -/T ATGAGATAAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 0 1 79859 CASAVA_Build 13 107103833 1D CAGAGAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 34 0 27 8 T 11 10 79860 CASAVA_Build 13 107106486 1D AGGCAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 12 11 79861 CASAVA_Build 13 107108599 6D AATTCTTATC TATCTT/------ TAATTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 29 15 5 TATCTT 1 0 79862 CASAVA_Build 13 107109862 1D ATTTGGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 29 1 22 6 T 11 10 79863 CASAVA_Build 13 107115326 1D AAAGTGAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 10 9 79864 CASAVA_Build 13 107122348 1D AAATTGCCTT G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 G 1 0 79865 CASAVA_Build 13 107126948 9D TTAAATTAAT TTAATTTAA/--------- TTAATTTAAT 3070 het 324 hom 31 5 15 11 TTAATTTAA 2 1 79866 CASAVA_Build 13 107127393 4I CCTTGTTTGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTTG 2 3 79867 CASAVA_Build 13 107128179 4I GAAAGCAAAC ----/ACAA ACAAGCAAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ACAA 1 2 79868 CASAVA_Build 13 107130756 4I CATACGTGTA ----/TGAG TGAGTGTGTG 3070 het 3070 ref 54 23 16 15 TGAG 1 2 79869 CASAVA_Build 13 107130959 2I ATGTGTGCAC --/GA GAGTGAGGGT 3070 hom 100 het 68 0 38 30 GA 1 2 79870 CASAVA_Build 13 107131096 2I GAATGTGCAT --/GA GAGTGTAAGA 3070 hom 194 het 73 0 64 9 GA 1 2 79871 CASAVA_Build 13 107131223 2I AAATGTAAGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 78 37 30 11 GT 6 7 79872 CASAVA_Build 13 107131835 1I AGAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 A 9 10 79873 CASAVA_Build 13 107134202 1I ACATCCTGTG -/A GGGTCTCCTG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 0 1 79874 CASAVA_Build 13 107136729 3D TATTATTTAT TTA/--- TTATTATTAT 2277 het 19 hom 10 1 8 1 TTA 7 6 79875 CASAVA_Build 13 107137092 5D TACAACCACA ATGAG/----- ATATCATCTC 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 ATGAG 1 0 79876 CASAVA_Build 13 107143687 1I TAGGGGGGGC -/G GGGAGGGATA 2220 hom 18 het 10 0 6 4 G 3 4 79877 CASAVA_Build 13 107144664 1D GCTTTATACA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 55 27 20 8 T 9 8 79878 CASAVA_Build 13 107146248 2I ATCTATATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 13 15 79879 CASAVA_Build 13 107152604 1I TTCACTCTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 A 9 10 79880 CASAVA_Build 13 107152861 1D GTTTAAGAAG T/- TTTGTAGTTT 3070 het 3070 ref 19 12 7 0 T 4 3 79881 CASAVA_Build 13 107159063 4I ACCTTTTCTC ----/TTGT TTTATTTATT 3070 hom 123 het 47 0 42 7 TTGT 0 1 79882 CASAVA_Build 13 107162427 1D CTTCCACACT A/- AAAAAAAAAA 1249 het 1249 ref 37 29 3 5 A 11 10 79883 CASAVA_Build 13 107183498 1I CTAGTAGGAT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 8 9 79884 CASAVA_Build 13 107191877 8I AGGTATTTAA --------/GCACGGAT CACTGAGAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GCACGGAT 0 1 79885 CASAVA_Build 13 107207765 1D CCCTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 2642 het 1735 hom 39 14 9 16 T 19 18 79886 CASAVA_Build 13 107211714 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 4 hom 36 1 29 6 A 9 8 79887 CASAVA_Build 13 107220040 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 11 0 8 3 A 13 12 79888 CASAVA_Build 13 107224091 1I GGTGGGGGGA -/G GGGGGAGGGA 2100 hom 16 het 8 0 6 2 G 5 6 79889 CASAVA_Build 13 107244195 1D TCACTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 1249 het 1249 ref 25 18 4 3 T 12 11 79890 CASAVA_Build 13 107268203 1I CTTCCATTTG -/C TTTATTTGCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 0 1 79891 CASAVA_Build 13 107288040 6D TGCGCAGACT CCCAGG/------ AGTCAGCGTG 3070 het 3070 hom 43 18 22 5 CCCAGG 1 0 79892 CASAVA_Build 13 107288270 1I TATACAGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 9 10 79893 CASAVA_Build 13 107290033 1I CCTGCATAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 21 11 10 A 9 10 79894 CASAVA_Build 13 107294589 3I ATAAAATACA ---/GAT GATAAGAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 GAT 1 2 79895 CASAVA_Build 13 107306365 2I CCAATGACTT --/CC CACCTCAGCC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 C 1 3 79896 CASAVA_Build 13 107312215 1I TACATTATGT -/A AACCAAACTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 2 3 79897 CASAVA_Build 13 107327760 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2840 hom 27 9 14 4 A 11 12 79898 CASAVA_Build 13 107327969 1D ACCATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 15 14 79899 CASAVA_Build 13 107329064 5D TATGAAAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 37 16 16 8 AAAAG 3 2 79900 CASAVA_Build 13 107337079 1I GTGAAGCACT -/A AGCTATAAAG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 1 2 79901 CASAVA_Build 13 107341334 4D ATTTACCATC CTAA/---- CTATCTTTAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 CTAA 1 0 79902 CASAVA_Build 13 107346519 1D ATTCAGGAAT A/- AGCTTTTGTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 2 1 79903 CASAVA_Build 13 107348149 1D ACCTCATCCC A/- AGGGAAGACT 3070 hom 72 het 28 0 24 5 A 2 1 79904 CASAVA_Build 13 107348885 1D AGAAATCGTG T/- TTTTTTTACC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 8 7 79905 CASAVA_Build 13 107350103 1D CATATTCAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 10 9 79906 CASAVA_Build 13 107351004 1D AAAAATGTGC A/- AAAAGAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 5 4 79907 CASAVA_Build 13 107351176 7D TCTGACAGTA TATGAAG/------- TAAAGATGTA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 TATGAAG 1 0 79908 CASAVA_Build 13 107351380 1I GATTGCCACA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 293 hom 64 1 57 6 T 8 9 79909 CASAVA_Build 13 107353049 1I AATCCCTTGG -/A AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 4 5 79910 CASAVA_Build 13 107354596 3I ATGATAATCA ---/TTG TTATCTGTTA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 TTG 0 1 79911 CASAVA_Build 13 107354926 3D ATTTTTATTT ATA/--- ATAACATACA 2220 hom 12 het 5 0 5 0 ATA 2 1 79912 CASAVA_Build 13 107354981 1D TTTTTACACT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 A 8 7 79913 CASAVA_Build 13 107355580 1D ATGGTGATAG A/- AATAAGAACA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 3 2 79914 CASAVA_Build 13 107358847 1I ATCCTATGTG -/A AAAAAAACAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 8 79915 CASAVA_Build 13 107360606 1D GTCAAGTGTT A/- ACATTTCTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 2 1 79916 CASAVA_Build 13 107364450 2D18M4I CCTGGGCAAC AAGAGCAGAACTCCGTCTCA----/--GAGCAAAACTCCGTCTCAAAAC AAACAAACAG 3070 hom 90 het 29 0 31 4 N/A 0 0 79917 CASAVA_Build 13 107369454 3D AAAACTGAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 29 1 13 17 T 19 16 79918 CASAVA_Build 13 107384409 11D AAGATAAAGA AAGAAAGAAAG/----------- AAGAAAGAAA 2887 het 2887 ref 30 23 6 8 AAGAAAGAAAG 2 1 79919 CASAVA_Build 13 107388616 2I GCATGTGTTA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 GT 5 6 79920 CASAVA_Build 13 107394284 3I GCATTATATA ---/ATG ATAAAGTTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ATG 0 1 79921 CASAVA_Build 13 107409820 6D AGTAAGCCTA GAGTTT/------ GCCCATGGCT 2892 het 2892 ref 32 17 10 8 GAGTTT 1 0 79922 CASAVA_Build 13 107413490 2D TTAAACAAAG CA/-- CACTATTTTC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 CA 2 1 79923 CASAVA_Build 13 107426944 13I AAGAGTTTGT -------------/TAATGGCTACAAA GTAGCCACAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 TAATGGCTACAAA 0 1 79924 CASAVA_Build 13 107430100 1D AATGTTTTGC A/- AACATTTTCC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 3 2 79925 CASAVA_Build 13 107436473 1I CTCTGTGATA -/G TTTCTTTCAC 3070 het 3070 ref 47 30 9 8 G 0 1 79926 CASAVA_Build 13 107441121 1I TGACCTCGTG -/A CCCACCCACC 3070 het 1735 hom 18 5 10 3 A 0 1 79927 CASAVA_Build 13 107452131 4D CAGAAAAGCC ACAA/---- ACACTCAAGG 3070 het 2398 hom 22 6 11 7 ACAA 1 0 79928 CASAVA_Build 13 107457951 1I GTCCTCTGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 8 9 79929 CASAVA_Build 13 107458519 2I13M1I GTCAGATTTT --TGTTTTCTTCTTC-/TGTGTTTTCTTCTTCT TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 N/A 0 0 79930 CASAVA_Build 13 107459521 5D37M1D ATGATGAGGA TAATCTATGTATTTACCCACAGTTCTGCTCCTTCTGTTGCTGT/-----TATGTATTTACCCACAGTTCTGCTCCTTCTGTTGCTG- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 22 22 9 N/A 0 0 79931 CASAVA_Build 13 107460271 1I TAGCTTTTTC -/T CTTTGCTAGA 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 T 0 1 79932 CASAVA_Build 13 107460686 4I ATAATCGTTG ----/AAAT AATTATGCAT 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 AAAT 0 1 79933 CASAVA_Build 13 107464082 1D CTGATTCTCT C/- CATGCTTTAT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 C 2 1 79934 CASAVA_Build 13 107470846 2I CCAACAACAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 20 14 12 A 9 11 79935 CASAVA_Build 13 107478715 1I ACTTCATGTT -/A ACCATTGTTT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 1 2 79936 CASAVA_Build 13 107488172 4D CAATTTACAC AGTT/---- AGTAAAGTAG 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 AGTT 1 0 79937 CASAVA_Build 13 107488737 15D AACTTGGTGT ATAGATGACAAGTAG/--------------- ATAGATGATA 3070 het 3070 hom 32 14 17 5 ATAGATGACAAGTAG 1 0 79938 CASAVA_Build 13 107489239 3D CTCCCCCAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 1276 het 1276 ref 32 12 6 14 T 16 13 79939 CASAVA_Build 13 107491202 1D ATTTACTTTT C/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 C 1 0 79940 CASAVA_Build 13 107509111 4D GGAAGGAAAC AAAG/---- AAGGAATGAA 2810 het 2810 ref 25 16 7 3 AAAG 1 0 79941 CASAVA_Build 13 107512350 4I TCACCAAACA ----/AACT AAGTAAAGCA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AACT 0 1 79942 CASAVA_Build 13 107516350 4D TAATAAAAAT TATA/---- TATAAGAGCA 3070 het 3070 ref 33 16 15 3 TA 4 2 79943 CASAVA_Build 13 107516545 1D GGGAGAAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 10 9 79944 CASAVA_Build 13 107517982 1I TAATCTCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 70 het 28 0 24 4 T 9 10 79945 CASAVA_Build 13 107523748 2D AGAAAAGCAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 32 13 10 10 GT 10 9 79946 CASAVA_Build 13 107532702 12D AAAAAGGAAC GAAGACACCTTG/------------ GAGAAATGGC 3070 het 3070 ref 27 16 10 6 GAAGACACCTTG 1 0 79947 CASAVA_Build 13 107534383 2D TAACTTTTAT CA/-- CACAAAATAA 3070 hom 71 het 29 0 24 5 CA 3 2 79948 CASAVA_Build 13 107536158 2D AGAAACATCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 17 9 A 16 14 79949 CASAVA_Build 13 107542626 2D CCTTTGCAAA AT/-- AGTTACTCAT 3070 hom 63 het 25 0 22 6 AT 1 0 79950 CASAVA_Build 13 107555970 8D TATACTTAAG TTTTTGTT/-------- TTTTGTATAA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TTTTTGTT 1 0 79951 CASAVA_Build 13 107559705 1I GCTTTTTTTT -/A TATATAAGTG 3070 het 3070 hom 42 13 18 11 A 0 1 79952 CASAVA_Build 13 107562878 6I CAAAGTGCTA ------/GATTAC CTGCGTGAGC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 GATTAC 0 1 79953 CASAVA_Build 13 107567299 5D5M2D TGATTTTTAG GAATCAGTTCCA/-----ATTTC-- TGTTATTGCA 3070 hom 87 het 32 0 30 4 N/A 0 0 79954 CASAVA_Build 13 107576036 1I CGAGAGTGAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 8 79955 CASAVA_Build 13 107588927 1D ACTAGAGCTT C/- CCTTTCTCTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 3 2 79956 CASAVA_Build 13 107618852 1D GAAGAGCTAG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 33 17 10 8 A 8 7 79957 CASAVA_Build 13 107622057 1I AATCAAGATG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 7 8 79958 CASAVA_Build 13 107622334 1I AATCCAGGAG -/T TTTTTTTTAA 2316 het 2316 ref 21 12 6 3 T 8 9 79959 CASAVA_Build 13 107623905 1I CTCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 24 2 13 9 A 15 16 79960 CASAVA_Build 13 107628027 4I AGTTAGTAGG ----/TTGA TTAATTTTTG 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 TTGA 0 1 79961 CASAVA_Build 13 107630882 1D CCAAATTTGG A/- AAGTACCTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 3 2 79962 CASAVA_Build 13 107632127 1I TTTGGGGGAG -/A AAAATCACAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 4 5 79963 CASAVA_Build 13 107633937 4D TGGACCAATG GAGA/---- GAGAGCCTGA 3070 hom 125 het 45 0 41 6 GA 4 2 79964 CASAVA_Build 13 107636204 1I ATGTTTTTTA -/T TTTTTAATTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 5 6 79965 CASAVA_Build 13 107641041 1I GGAAAGTATC -/T CTACAAACTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 1 79966 CASAVA_Build 13 107643155 1I CAGAGGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 33 1 22 10 A 10 11 79967 CASAVA_Build 13 107643258 3D GCATTAAAGG TAT/--- TATTATATTT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 TAT 3 2 79968 CASAVA_Build 13 107654166 1I AGCTACCGGC -/T TTTTTTTTTT 2721 het 2721 ref 26 10 8 8 T 12 13 79969 CASAVA_Build 13 107654969 1D TTATGGGGTG T/- TATCAATGAA 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 2 1 79970 CASAVA_Build 13 107678569 1D TATATCAGTT A/- ACATATTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 A 2 1 79971 CASAVA_Build 13 107703472 1D ATTGGATGCC T/- TTTTTTTTTC 1032 het 1032 ref 61 45 4 12 T 10 9 79972 CASAVA_Build 13 107724716 2D ACACATACAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 22 0 17 6 AT 7 6 79973 CASAVA_Build 13 107731066 1D ATGATAATGC T/- TTTTTTTTTT 2254 het 2254 ref 32 18 5 9 T 13 12 79974 CASAVA_Build 13 107735562 3I TTAAATACCA ---/AGG AGAATTTCTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGG 0 1 79975 CASAVA_Build 13 107752887 1D GCAATGTAGT C/- CCCCCATGTG 3070 het 3070 ref 38 18 12 10 C 6 5 79976 CASAVA_Build 13 107757082 1I TATGTTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 10 11 79977 CASAVA_Build 13 107760766 1D AAAAAAAAAA C/- GTTTTGTCAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 C 1 0 79978 CASAVA_Build 13 107768184 1D TTTTCAGAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 10 9 79979 CASAVA_Build 13 107776655 1I TAACATATTC -/A AATGAAGAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 2 3 79980 CASAVA_Build 13 107777557 6D AACAGACCTA TTATCT/------ TTTTCTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 23 5 TTATCT 1 0 79981 CASAVA_Build 13 107778220 1D CATACACTCC G/- GGGGTTCTGC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 5 4 79982 CASAVA_Build 13 107781540 2D CTTGTAACAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 37 1 35 1 A 11 9 79983 CASAVA_Build 13 107785605 1D AGTTGAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 34 1 22 11 T 15 14 79984 CASAVA_Build 13 107792778 1D AAAAATTAAT A/- TACTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 11 11 5 A 1 0 79985 CASAVA_Build 13 107793882 2D TTTTCAACAC AT/-- ACACTGCATG 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 AT 1 0 79986 CASAVA_Build 13 107807043 1D ATATTTTTTT C/- ATCATACACA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 C 1 0 79987 CASAVA_Build 13 107810065 2I ATAGAAAAAC --/AG AAATCACAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AG 0 1 79988 CASAVA_Build 13 107814008 1D CTCGAGGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2833 hom 32 8 16 9 T 11 10 79989 CASAVA_Build 13 107826145 1I TGCTTGATTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 8 9 79990 CASAVA_Build 13 107829964 1I TAGTTGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2466 hom 29 9 10 10 T 13 14 79991 CASAVA_Build 13 107833549 2I GAAAAAAAAA --/CC AATGTGATAA 3070 hom 29 het 17 0 14 3 C 0 2 79992 CASAVA_Build 13 107849196 1D CTTGTGATGT A/- AAAGATACAA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 4 3 79993 CASAVA_Build 13 107850147 9I GAAAGTTAGA ---------/GTGAAAAAG GTGAAAAAGG 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 GTGAAAAAG 1 2 79994 CASAVA_Build 13 107869480 1I AGGATGAGAG -/A AATGCTAAAC 3070 hom 147 het 53 0 49 4 A 2 3 79995 CASAVA_Build 13 107871620 1I GGGCTAGGGG -/A GAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 A 0 1 79996 CASAVA_Build 13 107872830 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 743 het 452 hom 14 3 6 5 A 15 16 79997 CASAVA_Build 13 107881493 1I TCTTTAGTAG -/A AAAATAGCTG 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 A 4 5 79998 CASAVA_Build 13 107897151 1D ATTTAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 16 11 T 15 14 79999 CASAVA_Build 13 107903711 1I TCTCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 2735 het 2735 ref 21 10 7 4 A 12 13 80000 CASAVA_Build 13 107910679 1D TGCAGCCAAA G/- GCACGTACTT 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 G 2 1 80001 CASAVA_Build 13 107912074 2I AGCTGGGATT --/AC AGGTGTGCAT 3070 hom 81 het 29 0 26 4 AC 0 1 80002 CASAVA_Build 13 107918387 1I CCACCAAGCT -/A AAGCCCTTCC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 2 3 80003 CASAVA_Build 13 107941025 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1088 hom 28 4 16 8 A 15 14 80004 CASAVA_Build 13 107944953 1D ACCCAGTTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 2922 hom 24 9 11 4 T 7 6 80005 CASAVA_Build 13 107956889 4D ATTTCATTTA TTAG/---- TTCTAACAGT 3070 het 3070 ref 44 29 12 3 TTAG 1 0 80006 CASAVA_Build 13 107974492 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 8 7 80007 CASAVA_Build 13 107981975 1I TGCTTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 31 2 23 6 T 13 14 80008 CASAVA_Build 13 107986364 12D ATGCGCATAC GTGTGTGTGCAT/------------ GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 57 23 14 21 GTGTGTGTGCAT 2 1 80009 CASAVA_Build 13 107998772 3I TGAGGAGGAT ---/GAC GATGATGGTT 3070 het 3070 hom 74 27 29 18 GAC 0 1 80010 CASAVA_Build 13 107999767 1D CGTTTCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 43 1 15 27 T 12 11 80011 CASAVA_Build 13 108004149 1D GTGTCTTCTT A/- GCACAGCCTT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 1 0 80012 CASAVA_Build 13 108004597 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 29 0 23 8 A 11 10 80013 CASAVA_Build 13 108022764 1I TCTAATGTTC -/A AGTTATTATA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 1 2 80014 CASAVA_Build 13 108031493 1I TAGGATATTA -/T TTTTTGAGTA 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 T 5 6 80015 CASAVA_Build 13 108034866 1I AAATATACAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 7 8 80016 CASAVA_Build 13 108036314 9I AAAATATTTT ---------/AACCTCCCC AAGACTTGAT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 AACCTCCCC 0 1 80017 CASAVA_Build 13 108041795 1D TCTTTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 33 1 19 13 A 11 10 80018 CASAVA_Build 13 108046744 8I TTTGCTTTGG --------/TTTTTGTT TTTTTGTTTC 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 TTTTTGTT 1 2 80019 CASAVA_Build 13 108048668 4D AGAGAGAGAG AGAC/---- AGACAGACAG 3070 het 3070 hom 39 10 17 15 AGAC 4 3 80020 CASAVA_Build 13 108051900 1I AATATAGTAA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 7 8 80021 CASAVA_Build 13 108052926 1D AAATATGGGG A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 39 13 22 5 A 7 6 80022 CASAVA_Build 13 108059001 1D CCCACAAATG A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 9 A 1 0 80023 CASAVA_Build 13 108073357 1D ACAAATTTTC T/- CTTGGAGAAG 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 T 1 0 80024 CASAVA_Build 13 108085857 1D TACCTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1607 hom 18 5 8 5 T 13 12 80025 CASAVA_Build 13 108100528 1I AAATCATGCA -/T TTTTTTTCAG 2879 het 2879 ref 28 17 8 3 T 7 8 80026 CASAVA_Build 13 108116649 1I ATTATTCAAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 A 7 8 80027 CASAVA_Build 13 108131953 1D CTCATCTTTC T/- TTTTTTTTCC 2935 het 2935 ref 41 21 8 12 T 9 8 80028 CASAVA_Build 13 108133690 1D GCTTCCCTTT C/- CTTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 41 20 15 7 C 2 1 80029 CASAVA_Build 13 108152368 1D GGTAGAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 A 10 9 80030 CASAVA_Build 13 108153489 1I ATTAGCAGAA -/T TGATTAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 1 2 80031 CASAVA_Build 13 108155431 7D ATCCTGATCC AAAAATA/------- AAAAATAGAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 AAAAATA 2 1 80032 CASAVA_Build 13 108167718 1D11M1D GTGACTCACG CCCTGTAATCTCA/-CCTGTAATCTC- AGCACTTTGG 3070 hom 72 het 25 0 24 1 N/A 0 0 80033 CASAVA_Build 13 108173608 1I GATAAATGTC -/T TTTAACAGAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 3 4 80034 CASAVA_Build 13 108175260 2I TATAACTCAC --/AT AGTCACAATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 0 1 80035 CASAVA_Build 13 108176917 6D AAAAAAAAAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 2 AAAAAG 3 2 80036 CASAVA_Build 13 108178782 7D ATGCCTGCCA TACCAAT/------- TACCGCCTAG 3070 hom 87 het 31 0 29 3 TACCAAT 1 0 80037 CASAVA_Build 13 108184545 1D ATAATATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 T 11 10 80038 CASAVA_Build 13 108190516 28D AGCTTTGTTC CATTGTTGGCAAGGAGCTGTGTTCCTTT/---------------------------- GGAGGGGGAG 3070 hom 81 het 27 0 27 4 CATTGTTGGCAAGGAGCTGTGTTCCTTT 1 0 80039 CASAVA_Build 13 108194627 1D TAAAGAGGTG T/- TTATTATCCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 3 2 80040 CASAVA_Build 13 108204798 1I TCTCTGACAG -/A AAAACTATAT 3070 het 3070 hom 50 16 27 7 A 4 5 80041 CASAVA_Build 13 108205613 2I GAGGAAATGA --/GT GTTTACAAGC 3070 het 3070 hom 56 26 25 5 GT 1 2 80042 CASAVA_Build 13 108207055 1D TAGAAAAAAA C/- AAAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 7 C 1 0 80043 CASAVA_Build 13 108209514 1D GTAGTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 11 10 80044 CASAVA_Build 13 108210735 1I CACATGCCTC -/T TTGCTTCTGT 3070 het 3070 ref 45 22 21 2 T 2 3 80045 CASAVA_Build 13 108211825 2D TGTTATCATT TC/-- TGTTACCATC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 TC 1 0 80046 CASAVA_Build 13 108212637 1D TATTGTGAAT G/- GTGCTGCAAT 3070 het 3070 ref 44 21 20 5 G 2 1 80047 CASAVA_Build 13 108213307 1I CATAAACACC -/A AATTAATATT 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 A 2 3 80048 CASAVA_Build 13 108215633 3D ATAATTTTTC ACT/--- ACTTTTATAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 ACT 2 1 80049 CASAVA_Build 13 108224459 5D AATAAATAAC AATAA/----- AATAAAATAA 3070 het 3070 hom 27 9 15 4 AATAA 4 3 80050 CASAVA_Build 13 108244082 3D CTTTAAATAA TTG/--- TTGTGATCAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTG 2 1 80051 CASAVA_Build 13 108244559 1I GAATGACAAA -/C CCCCTAAGGG 3070 hom 90 het 40 0 30 10 C 4 5 80052 CASAVA_Build 13 108248420 3I AAGGCTAGGA ---/TGC TGCTGTCCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TGC 1 2 80053 CASAVA_Build 13 108248574 3D GGAGATAAGG AGA/--- AGAAGACAGT 3070 hom 93 het 39 0 31 9 AGA 3 2 80054 CASAVA_Build 13 108257772 1I AAACAAGAAC -/A ATTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 A 1 2 80055 CASAVA_Build 13 108258650 1I TCTTCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 T 11 12 80056 CASAVA_Build 13 108261014 2D AGATTTATAA CT/-- CTCTCTGAAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CT 4 3 80057 CASAVA_Build 13 108265085 1D AATCTAGCAA T/- AGGGCATACT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 1 0 80058 CASAVA_Build 13 108266762 3I TGAAGTAGCG ---/CCT CCCCCCACCC 3070 hom 66 het 23 0 22 1 CCT 0 1 80059 CASAVA_Build 13 108267876 1I ACAGTGGGAC -/A GGGGGGAACT 3070 hom 157 het 58 0 53 5 A 0 1 80060 CASAVA_Build 13 108271259 4D CTTATTTTTT AATA/---- AATATATTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AATA 2 1 80061 CASAVA_Build 13 108274042 1I TAAAAATAAC -/T TTCCTGTTGC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 2 3 80062 CASAVA_Build 13 108276188 1D AGTAGGTTAG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 8 7 80063 CASAVA_Build 13 108285146 1D AAATTATTTC T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 8 7 80064 CASAVA_Build 13 108285439 2I TACTTAGAAT --/TG TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TG 0 1 80065 CASAVA_Build 13 108293863 1D TAAAAGAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 10 9 80066 CASAVA_Build 13 108295070 1I TTGACTTATA -/T ACCAGGAATA 3070 het 3070 ref 56 25 25 6 T 0 1 80067 CASAVA_Build 13 108296229 1D TTCTCTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 T 11 10 80068 CASAVA_Build 13 108296877 2I ATCCTTTGGG --/GA GGGGAATATT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 GA 0 1 80069 CASAVA_Build 13 108299349 1D AGGGAAAGGG C/- CTGGTAGACT 3070 hom 68 het 26 0 23 3 C 2 1 80070 CASAVA_Build 13 108318477 1D ATCCTCACAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 52 19 26 7 T 9 8 80071 CASAVA_Build 13 108320976 4I AAAAAATTAT ----/GTTA GTTATATTTA 2807 het 2807 ref 21 11 8 2 GTTA 1 2 80072 CASAVA_Build 13 108327019 1D ATTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 15 14 80073 CASAVA_Build 13 108337053 1D TTGTTTAGGC A/- AAGCCCCCTG 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 A 3 2 80074 CASAVA_Build 13 108339601 2I AGATTTTAAA --/CT CTATTTGGAA 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 CT 1 2 80075 CASAVA_Build 13 108353736 1D CTATCCTCAG T/- TTTCAGGGGT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 T 4 3 80076 CASAVA_Build 13 108359390 5I ATAATCTGAT -----/TATTC TATTCATAAT 3070 het 1484 hom 10 3 7 0 TATTC 1 2 80077 CASAVA_Build 13 108359715 3I TGAGAATAAA ---/AGG AGAAGATGAC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 AGG 0 1 80078 CASAVA_Build 13 108360728 1I TTCAGATCAG -/A AAAAAACTTG 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 6 7 80079 CASAVA_Build 13 108367369 21D TTTGCCCCAG GAATGTGAGATGCAGAAACTC/--------------------- GAATGTGAGA 3070 hom 111 het 38 0 38 4 GAATGTGAGATGCAGAAACTC 2 1 80080 CASAVA_Build 13 108369339 2I CAAACTTATA --/CT CTCTGTTTTG 3070 het 82 hom 21 1 12 8 CT 2 3 80081 CASAVA_Build 13 108369863 21I TGACATCTTC ---------------------/TCCATTCCTTGTCTCAGCACT TCCTTTAGGG 3070 het 3070 ref 45 24 14 8 TCCATTCCTTGTCTCAGCACT 0 1 80082 CASAVA_Build 13 108375178 1I AACGTCTGTT -/G GCCGCACCCT 3070 hom 116 het 43 0 35 8 G 1 2 80083 CASAVA_Build 13 108400339 2D CAAAACAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 A 12 10 80084 CASAVA_Build 13 108405668 1I TTTTATGTGG -/T TTTTTTGGTG 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 T 6 7 80085 CASAVA_Build 13 108406871 1I TGACAAACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 30 0 23 7 T 9 10 80086 CASAVA_Build 13 108409566 14D CCCGGCCTCT GTTTTTCTCCTTTA/-------------- GTTTTTCTCC 3070 hom 84 het 32 0 27 9 GTTTTTCTCCTTTA 2 1 80087 CASAVA_Build 13 108423681 4D CAATGAAAAA AGAG/---- AGAATGTTTC 3070 het 3070 hom 33 9 23 5 AG 3 1 80088 CASAVA_Build 13 108424293 1D CTGGCTGGTT A/- AAAAAAAAAA 1133 het 1133 ref 41 32 3 6 A 11 10 80089 CASAVA_Build 13 108425539 1D TACTGTTTTT G/- TTTTTTTTTT 2622 het 2622 ref 32 17 10 5 G 1 0 80090 CASAVA_Build 13 108444684 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 AT 6 5 80091 CASAVA_Build 13 108452268 2I CACTATTCCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 60 het 29 0 20 9 TC 6 7 80092 CASAVA_Build 13 108458059 13D GGTTTTTCTT TAAGATTAAGAAA/------------- TAACATATTT 2896 het 2896 ref 21 12 7 2 TAAGATTAAGAAA 1 0 80093 CASAVA_Build 13 108474372 4D ATATACAATG TGTA/---- TGTATATATT 1404 het 994 hom 6 2 4 1 TGTA 2 1 80094 CASAVA_Build 13 108479262 1I AATACGTAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 7 8 80095 CASAVA_Build 13 108485512 1I TAACCAGGGA -/T TTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 5 6 80096 CASAVA_Build 13 108494488 1D GACTATGATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 A 10 9 80097 CASAVA_Build 13 108496681 1D TTCAGTCTTC A/- AAGATCAAGT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 3 2 80098 CASAVA_Build 13 108498303 1I TAAAACTAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 8 9 80099 CASAVA_Build 13 108498418 4I AATGCACTTC ----/TCTA TCTTTTATGG 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 TCTA 0 1 80100 CASAVA_Build 13 108498669 1D CAATTCAGTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 9 8 80101 CASAVA_Build 13 108499432 1D TTATTGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2152 hom 38 9 12 17 T 17 16 80102 CASAVA_Build 13 108500069 7I CTATAAATAA -------/TAATTAT TTATTTAAGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 TAATTAT 0 1 80103 CASAVA_Build 13 108501176 1D38M2D GAACCCCTTC AAAGCTAGCTCCTATTTCTTTTTGACATAGTCTCTTGACTT/-AAGCTAGCTCCTATTTCTTTTTGACATAGTCTCTTGAC-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 18 19 10 N/A 0 0 80104 CASAVA_Build 13 108502884 1D TATTTGCTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 9 8 80105 CASAVA_Build 13 108503674 4D GTGAGTGAGT GTGA/---- GTGTGTGCTC 3070 het 3070 ref 42 19 19 8 GTGA 1 0 80106 CASAVA_Build 13 108504622 1I TGCTTATTTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 8 9 80107 CASAVA_Build 13 108511460 1I AGTTTCCTCA -/C CCTCTCTCAG 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 C 2 3 80108 CASAVA_Build 13 108512189 1D GTGCACCTGT G/- CAGGATGCGA 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 G 1 0 80109 CASAVA_Build 13 108512977 3D TCTGAAATAA TAT/--- TACAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 17 8 TAT 1 0 80110 CASAVA_Build 13 108514132 3I TACTTGATAC ---/TTG TTATGCTGAT 3070 het 3070 ref 66 33 25 8 TTG 0 1 80111 CASAVA_Build 13 108517316 1D GTGGTATGAT C/- CCCCATAACA 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 C 5 4 80112 CASAVA_Build 13 108518865 1I CTTTAAGAAT -/A ATTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 A 1 2 80113 CASAVA_Build 13 108519943 4I3M1D GTAGAGGGGC ----TCTA/ACCTTCT- CACTGTGTGC 3070 hom 108 het 39 0 35 6 N/A 0 0 80114 CASAVA_Build 13 108523618 2D TCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 856 het 856 ref 15 8 2 5 T 14 12 80115 CASAVA_Build 13 108523779 5D TCTTTATATT CCACA/----- GGTGATCTGC 3070 het 3070 hom 40 14 23 7 CCACA 1 0 80116 CASAVA_Build 13 108524399 9D CCAGGACAGA TTTTTTAAG/--------- TTTCTCTGAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 4 TTTTTTAAG 1 0 80117 CASAVA_Build 13 108525688 2D TTGATCAGTC TT/-- TTACATTTCT 3070 het 3063 hom 26 8 16 2 T 4 2 80118 CASAVA_Build 13 108525733 41I GCATTTCCTT -----------------------------------------/GTGACTTTTCTTTGCATTTCTCTAATGACTAATGTTGAGCA TTTTTTTCTT 300 het 300 ref 18 3 2 15 GTGACTTTTCTTTGCATTTCTCTAATGACTAATGTTGAGCA 0 1 80119 CASAVA_Build 13 108526207 1I CCTGTCTTCT -/A CCTTGTGAAG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 0 1 80120 CASAVA_Build 13 108529408 1D CCCGAAACTC T/- TAACTGGTTG 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 T 2 1 80121 CASAVA_Build 13 108529737 1D ACTGTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 9 8 T 12 11 80122 CASAVA_Build 13 108530445 1D GGCTGGTCTC A/- AAACTCCTGA 3070 het 1987 hom 19 5 11 4 A 4 3 80123 CASAVA_Build 13 108530929 2D GCCCCTCTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 15 13 80124 CASAVA_Build 13 108534707 4I GCAGGTTGAT ----/GACA GACTTGATGA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 GACA 0 1 80125 CASAVA_Build 13 108545287 1I TGCTTTTTAA -/T TTCTAGCTCT 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 T 2 3 80126 CASAVA_Build 13 108547083 1D GTACAAAGAT G/- TCCCCTTACT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 G 1 0 80127 CASAVA_Build 13 108552856 6D TGTGTGTGTG TGTATA/------ TATATATATA 3070 hom 108 het 38 0 37 4 TGTATA 1 0 80128 CASAVA_Build 13 108554832 1D TGCCTTTGCA C/- CCTCATTCCC 3070 het 3070 hom 53 20 27 7 C 3 2 80129 CASAVA_Build 13 108563692 4D GGAAGGAAAA GAAG/---- GAAGGAAGAG 3070 hom 67 het 24 0 20 4 GAAG 3 2 80130 CASAVA_Build 13 108566312 1I ATAGCATCTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 249 hom 40 1 29 10 A 7 8 80131 CASAVA_Build 13 108567478 1I CTGTGACTTA -/C TTCTGGATTG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 C 0 1 80132 CASAVA_Build 13 108572678 1I CCTGGAACAG -/A AAAAAATGAA 3070 het 2489 hom 21 6 12 3 A 6 7 80133 CASAVA_Build 13 108595720 1I AAAGAGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 211 hom 32 1 22 9 A 11 12 80134 CASAVA_Build 13 108603748 6I AGCTATAGAT ------/ATATAG ATATAGATAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ATATAG 2 3 80135 CASAVA_Build 13 108609079 1D GAGCTTTTTT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 7 6 80136 CASAVA_Build 13 108613518 1D CTTTCTGGGC A/- GAACAGGCTG 3070 hom 97 het 36 0 29 7 A 1 0 80137 CASAVA_Build 13 108614703 1D TCGTACCTCT C/- AAAACACTTA 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 C 1 0 80138 CASAVA_Build 13 108617729 1D TGTTGAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 143 het 60 0 48 13 A 12 11 80139 CASAVA_Build 13 108619241 2D GCTCGGGTAC AG/-- TGTCGGTATG 3070 hom 95 het 37 0 30 8 AG 1 0 80140 CASAVA_Build 13 108619717 4D AATATAAAAC AAAT/---- AAAATAATGT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AAAT 1 0 80141 CASAVA_Build 13 108619977 1I ATACATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 32 0 23 9 A 10 11 80142 CASAVA_Build 13 108620481 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 11 10 80143 CASAVA_Build 13 108623186 1D TGAGGTAGAT G/- GAGGTGCAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 G 2 1 80144 CASAVA_Build 13 108625259 1I TGCCACCACA -/T TTTTTTTTTT 1752 het 1165 hom 17 4 7 6 T 11 12 80145 CASAVA_Build 13 108626303 1D TTGCTATGTT A/- AAAAAAAAAA 1300 het 1300 ref 54 41 3 10 A 12 11 80146 CASAVA_Build 13 108626644 2D TTTTCTAAAC TT/-- TTATTCTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 2 80147 CASAVA_Build 13 108679598 1D TGTGAAGGGA G/- GGGCTACCAC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 4 3 80148 CASAVA_Build 13 108686027 1D TACTGGAGGG A/- AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 40 20 5 15 A 15 14 80149 CASAVA_Build 13 108691499 3I CTAATAGCAA ---/AAG AATACTTAAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AAG 0 1 80150 CASAVA_Build 13 108698173 1I GTAGAATTAT -/A AAAAAAATGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 8 80151 CASAVA_Build 13 108701047 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 28 1 20 7 A 14 15 80152 CASAVA_Build 13 108702138 1D23M3I AATAGCAACG TTTTTTTCTTCAGAAAGTCAATAG---/-TTTTTTCTTCAGAAAGTCAATAGTTT CTTCTAATTG 3070 hom 87 het 30 0 30 3 N/A 0 0 80153 CASAVA_Build 13 108702845 1I TTGTTTTAAA -/T TTTTTTATTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 6 7 80154 CASAVA_Build 13 108713687 1D CTTCAACTTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 9 8 80155 CASAVA_Build 13 108713877 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 26 het 10 0 9 2 T 6 7 80156 CASAVA_Build 13 108725583 1I CTGTGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 534 hom 32 3 21 8 A 13 14 80157 CASAVA_Build 13 108783568 1I GATGCCTGCA -/G GCGCGCATTC 3070 hom 81 het 32 0 25 7 G 1 2 80158 CASAVA_Build 13 108787757 4D AATAGATGTG TCTA/---- TCTATCTATG 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 TCTA 3 2 80159 CASAVA_Build 13 108789061 3D GAAAAGTGGC TGA/--- TATCTCAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TGA 1 0 80160 CASAVA_Build 13 108794893 4D AATTTCTCTG TTCT/---- TTCTTCCCAT 3070 het 3070 hom 44 17 24 4 TTCT 2 1 80161 CASAVA_Build 13 108809609 1I AACAATTCAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 8 9 80162 CASAVA_Build 13 108811901 2D CAGCAAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 892 hom 36 7 17 12 A 12 10 80163 CASAVA_Build 13 108812599 1I TTGGCTTTTA -/T GTGGGTGAAT 3070 hom 169 het 60 0 56 4 T 0 1 80164 CASAVA_Build 13 108814208 2D TGGTATGTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 22 17 15 TG 9 8 80165 CASAVA_Build 13 108818585 1D AATGGGCCTC T/- TTTTTTTTTT 1271 het 1271 ref 29 19 4 6 T 12 11 80166 CASAVA_Build 13 108818802 1I GACTTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 507 hom 28 2 22 4 A 11 12 80167 CASAVA_Build 13 108822737 1D ATGAGGCACT G/- GGGGGGGAAA 3070 hom 95 het 41 0 29 12 G 8 7 80168 CASAVA_Build 13 108829680 6D GGTTTGGGGT TTTACA/------ TTTACATTTA 779 hom 7 het 8 0 3 7 TTTACA 3 2 80169 CASAVA_Build 13 108832736 6I AGTATAGGCT ------/GGACGC GGTGGCTCAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 GGACGC 0 1 80170 CASAVA_Build 13 108839265 2D ACTCCATGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 20 2 13 5 A 16 14 80171 CASAVA_Build 13 108841385 1I CAACCTCAAG -/T GATCTGCCCA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 0 1 80172 CASAVA_Build 13 108850342 2D ACCCAGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1516 het 1344 hom 17 9 4 4 A 15 13 80173 CASAVA_Build 13 108856452 3D TAATAAAATG ATA/--- ATAACAGAAA 3070 het 3070 hom 38 16 20 5 ATA 2 1 80174 CASAVA_Build 13 108865949 1D GAAAAGGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2659 hom 28 9 15 4 T 10 9 80175 CASAVA_Build 13 108867062 8I TGTCTGTCTG --------/TCTGTCTA TCTATCTATC 3070 het 3070 ref 65 34 24 7 TCTGTCTA 0 1 80176 CASAVA_Build 13 108869301 1I TAGTTACATG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 44 14 20 10 T 7 8 80177 CASAVA_Build 13 108876401 3I ATGTATTTCC ---/TGG TGAGTCAATT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 TGG 0 1 80178 CASAVA_Build 13 108889209 2I ATATTCAGAA --/AC ACATCCATAT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 AC 1 2 80179 CASAVA_Build 13 108902796 3D CTATTGAAAG TAA/--- TAATGCTGAG 3070 het 3070 hom 47 15 30 3 TAA 2 1 80180 CASAVA_Build 13 108909244 1D TTGGGGGATG A/- GGGGCGAGGG 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 1 0 80181 CASAVA_Build 13 108914540 30D GCTGACTTTT CTAAATATGTTTGAATTTATGCTGATTTTC/------------------------------ CTAAATACTT 3070 het 2587 hom 17 9 12 5 CTAAATATGTTTGAATTTATGCTGATTTTC 1 0 80182 CASAVA_Build 13 108914655 1D TATTTGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 31 5 12 14 A 11 10 80183 CASAVA_Build 13 108916397 1I GCCACTGGAA -/G TCAATGGTGA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 G 0 1 80184 CASAVA_Build 13 108920843 5I TTAAGTCGTA -----/TCCTT TCATTTGTTA 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 TCCTT 0 1 80185 CASAVA_Build 13 108931803 5D CAAAGTGGTT TACAA/----- TACAATTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 17 8 TACAA 2 1 80186 CASAVA_Build 13 108940621 1I21M1I GTTTTAAATA -TTTTTTTTTCCGAATCTGTCA-/TTTTTTTTTTCCGAATCTGTCAT TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 22 1 20 3 N/A 0 0 80187 CASAVA_Build 13 108941690 10D TATGAACCTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 28 1 18 9 T 24 14 80188 CASAVA_Build 13 108958990 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 6 7 80189 CASAVA_Build 13 108959141 6D CTTTCTTTAC CAGTTA/------ CAAATAATTA 3070 hom 72 het 28 0 24 7 CAGTTA 1 0 80190 CASAVA_Build 13 108962982 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 8 7 80191 CASAVA_Build 13 108971526 1I AATCCTTTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 41 0 32 9 A 9 10 80192 CASAVA_Build 13 108974174 1D GGTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 35 0 28 7 T 11 10 80193 CASAVA_Build 13 108979200 4I TGATTTTATC ----/TCTT TTTTTTGTCT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 TCTT 0 1 80194 CASAVA_Build 13 108979718 1I CTTTATGCTA -/T TCTAGGCTGG 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 1 2 80195 CASAVA_Build 13 108995606 1D CACCCCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1420 hom 32 10 13 9 A 15 14 80196 CASAVA_Build 13 108995901 1D TGTGAGAGTT G/- GCCATAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 19 3 G 2 1 80197 CASAVA_Build 13 109009824 1D ATTTACAATA G/- CCAAGATATG 3070 het 3070 hom 45 17 19 10 G 1 0 80198 CASAVA_Build 13 109033620 1D CAACCGGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 846 hom 32 2 22 10 A 12 11 80199 CASAVA_Build 13 109052504 4D11M1D TAATGGTCTC ATTTATAACTTCATAT/----ATAACTTCATA- TATGTGTGAG 3070 het 3070 ref 39 23 18 2 N/A 0 0 80200 CASAVA_Build 13 109057417 2D GCTACACGTC AA/-- AGTTTGTCAT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 3 1 80201 CASAVA_Build 13 109057502 4I TAGTACCAAA ----/TAGT TATTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TAGT 0 1 80202 CASAVA_Build 13 109059806 1D GGAAGAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 12 11 80203 CASAVA_Build 13 109061327 1D GGTAGAGATG C/- CCAAGGAATG 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 C 3 2 80204 CASAVA_Build 13 109065932 5D TCTACAGGCC TTTTA/----- TTTTATTTAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 9 TTTTA 2 1 80205 CASAVA_Build 13 109069918 1D AAAAATCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3033 hom 31 11 17 4 A 12 11 80206 CASAVA_Build 13 109078088 1D TGGTACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 T 11 10 80207 CASAVA_Build 13 109078480 1D CTCACTGGGG A/- CTGGCACGAC 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 A 1 0 80208 CASAVA_Build 13 109079485 1D AGGCAGCTTT A/- TTAGAGCAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 0 80209 CASAVA_Build 13 109084000 4I ATGCCAGGAG ----/GCAT GCATGATCTG 3070 het 3070 ref 56 25 25 6 GCAT 1 2 80210 CASAVA_Build 13 109090094 4D TAATTTTTTT TTTC/---- TTTTTGTATT 2609 hom 21 het 9 0 8 1 TTTC 1 0 80211 CASAVA_Build 13 109093246 1I TGGATTCCGT -/G GATCTACCCT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 G 1 2 80212 CASAVA_Build 13 109095272 1I TGAGCGACAG -/A AAAAAATAAT 1745 het 1745 ref 27 12 5 10 A 6 7 80213 CASAVA_Build 13 109097257 1D CCAAAGGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 37 0 29 9 A 10 9 80214 CASAVA_Build 13 109099581 4D TCTGCGCACC AAAT/---- ATCTGGCCCA 3070 hom 108 het 39 0 33 8 AAAT 1 0 80215 CASAVA_Build 13 109100516 1D CTTAAGCAAC T/- CTTGTGCCTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 1 0 80216 CASAVA_Build 13 109103010 1I TTTGAGTCCA -/G GGGTGAAAAT 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 G 3 4 80217 CASAVA_Build 13 109110443 2I AATAGACATT --/TC TCTCCAAAGA 3070 het 3070 ref 45 20 14 11 TC 2 3 80218 CASAVA_Build 13 109121635 15D AAATTCTTAC TGAAAAGTTAGAAAA/--------------- TGAGGAAACA 3070 het 3070 ref 52 30 19 4 TGAAAAGTTAGAAAA 1 0 80219 CASAVA_Build 13 109122044 5D CTTTATGGTG ATAAA/----- ATAAATGAGG 3070 het 3070 ref 51 27 19 6 ATAAA 2 1 80220 CASAVA_Build 13 109124107 1I GAACAACCAA -/T TCCATGAATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 2 80221 CASAVA_Build 13 109126160 1I GTTTGCCTAG -/A AATGAAAGTT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 2 3 80222 CASAVA_Build 13 109129684 1D GTGGGTTCAT A/- AATCTCCCCT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 3 2 80223 CASAVA_Build 13 109130090 1I AAGGCAGGGA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 91 het 34 0 27 7 T 8 9 80224 CASAVA_Build 13 109131773 1I CGTTTTTTTT -/G GGGGGGGAGG 3070 het 3070 ref 29 11 13 5 G 7 8 80225 CASAVA_Build 13 109133029 3I TTCCAAAATA ---/GGC CAGCAGAGGC 3070 het 3070 hom 49 16 22 11 GGC 0 1 80226 CASAVA_Build 13 109142384 1I ATTCTTCCAA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 T 7 8 80227 CASAVA_Build 13 109148310 1I GTGAGTGAGG -/A AGAGTAGGAA 3070 hom 111 het 42 0 35 7 A 1 2 80228 CASAVA_Build 13 109150986 3D AGCTACAATT AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 hom 80 het 35 0 26 9 AGG 5 4 80229 CASAVA_Build 13 109155449 2D TTTGAAACTG AA/-- AAAAAAAGAT 3070 hom 110 het 41 0 36 7 A 9 7 80230 CASAVA_Build 13 109155928 11I AGGACCGAAT -----------/CCCGGGGAACC CCCGGCTCCC 3070 hom 53 het 21 0 15 6 CCCGGGGAACC 0 1 80231 CASAVA_Build 13 109161756 1D AGCTCTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 32 1 24 7 T 12 11 80232 CASAVA_Build 13 109164538 1I TTACAGTCTT -/A AGAGTATTTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 1 2 80233 CASAVA_Build 13 109166709 1I TACTGATTTG -/A AAAAAAAAAA 1284 het 1284 ref 62 51 3 8 A 10 11 80234 CASAVA_Build 13 109175263 3I CAATTCAGAG ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 474 hom 38 2 28 8 CAA 5 6 80235 CASAVA_Build 13 109185410 4I TTGCATAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AG 5 7 80236 CASAVA_Build 13 109189054 1D AAAAGGACAA G/- GGAAGAGGGG 3070 hom 71 het 26 0 22 4 G 3 2 80237 CASAVA_Build 13 109189976 1D CATAGTGAAA C/- CCCCGTCTCT 3070 hom 21 het 8 0 8 3 C 5 4 80238 CASAVA_Build 13 109192817 1D CTACAAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 25 0 18 7 T 11 10 80239 CASAVA_Build 13 109197007 1D TTCATATTTG T/- TTTACTTGCT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 4 3 80240 CASAVA_Build 13 109198558 1D AATAAGAAGG C/- TGGAGAAATG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 C 1 0 80241 CASAVA_Build 13 109200470 5D ATGGAGATCA TACAT/----- TAGAGATATA 3070 het 3070 ref 50 25 24 3 TACAT 1 0 80242 CASAVA_Build 13 109204871 1I ACTTCAGGAT -/G TTTTATACAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 0 1 80243 CASAVA_Build 13 109208630 1I TGGCCACCAC -/A AAGCAGGTAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 2 3 80244 CASAVA_Build 13 109208898 1D ATTTTCATTG T/- TTTTTTTAGG 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 8 7 80245 CASAVA_Build 13 109211837 1D AGAATTACAA G/- GGAAAATTGA 3070 het 3070 hom 35 12 21 3 G 3 2 80246 CASAVA_Build 13 109214055 2D GACTTAACAC AT/-- GTTTATACGT 3070 het 3070 ref 44 24 14 7 AT 1 0 80247 CASAVA_Build 13 109218971 2I AGCAGGTCCT --/AC AGTTAACCAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AC 0 1 80248 CASAVA_Build 13 109222935 1I GTGCTGGCCA -/G GGAAGGAGGT 3070 het 2722 hom 26 7 11 8 G 2 3 80249 CASAVA_Build 13 109241306 16D GAATGCTTGG CCCCTGTAATATAATA/---------------- CACCGGTATT 3070 het 3070 ref 35 19 13 6 CCCCTGTAATATAATA 1 0 80250 CASAVA_Build 13 109243901 1D TCCTCAAATA T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 30 14 11 7 T 7 6 80251 CASAVA_Build 13 109245920 1I AGTACAACCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 52 15 30 7 T 8 9 80252 CASAVA_Build 13 109252121 1I TCTTTTCCCC -/T GATGTTCTTT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 0 1 80253 CASAVA_Build 13 109253929 7D AATTCTATCT AAAAACC/------- TTTTTTATGG 3070 het 601 hom 32 3 20 15 AAAAACC 1 0 80254 CASAVA_Build 13 109309878 1I AGCTGCTGAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 8 9 80255 CASAVA_Build 13 109317706 1D AACCTCTTAT A/- AAAAATTTAC 3070 het 3070 ref 45 25 20 0 A 6 5 80256 CASAVA_Build 13 109342051 2I AATAGGATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 AT 5 6 80257 CASAVA_Build 13 109385585 25D AATTTCTTAT AGATGCTGGACATTAGACCTTTGTC/------------------------- AGATGCATAG 3070 het 3070 ref 30 19 10 6 AGATGCTGGACATTAGACCTTTGTC 1 0 80258 CASAVA_Build 13 109403700 1I AAGCAGGGGG -/C TTTTGCCTAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 C 0 1 80259 CASAVA_Build 13 109475481 4D TATGTATTTT AAAC/---- AAACAGAGTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAAC 2 1 80260 CASAVA_Build 13 109496574 1D TGCCCAACGC A/- AAAAAAACAC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 8 7 80261 CASAVA_Build 13 109504724 1D CAAGGGGACT C/- TCCGCAGATT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 C 1 0 80262 CASAVA_Build 13 109509548 1I TCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1514 hom 21 5 13 3 A 12 13 80263 CASAVA_Build 13 109515974 1D ATTACCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1909 hom 22 6 10 6 A 11 10 80264 CASAVA_Build 13 109545620 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1701 het 1701 ref 17 6 7 4 T 13 14 80265 CASAVA_Build 13 109557522 1D GTGAGAACTG C/- CCCCAAACTG 3070 het 3070 hom 44 16 24 5 C 5 4 80266 CASAVA_Build 13 109566905 2D ATGGAGGGCC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 72 het 33 0 22 11 GT 10 9 80267 CASAVA_Build 13 109568867 9D TGGCTCTAAG AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 557 hom 17 4 10 9 A 25 16 80268 CASAVA_Build 13 109574827 1I GTGATAGCCA -/T TTTTTCCACC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 5 6 80269 CASAVA_Build 13 109578778 1D CATTTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 9 12 T 13 12 80270 CASAVA_Build 13 109583102 1I AGCAAAGGGT -/G GGGGGCTCTC 2585 het 1263 hom 19 7 9 3 G 5 6 80271 CASAVA_Build 13 109590450 1D ACAATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 56 1 27 28 T 13 12 80272 CASAVA_Build 13 109594009 1I TCCTGGCTCA -/T TTTTTCTTTT 3070 het 1460 hom 24 6 16 2 T 5 6 80273 CASAVA_Build 13 109598061 2I GCTCAGCAAT --/AA AAAAAGGAAC 3070 het 3070 hom 68 28 37 3 A 5 7 80274 CASAVA_Build 13 109608561 5D TTTAAGACCT ATAAA/----- ATAAGTTTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 ATAAA 1 0 80275 CASAVA_Build 13 109608921 7D ATCTTTCTTC ATATTCA/------- AAGACTGCTG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 ATATTCA 1 0 80276 CASAVA_Build 13 109609620 1D TGGTGGAACT G/- GGGAGTGTGT 3070 hom 84 het 35 0 29 8 G 4 3 80277 CASAVA_Build 13 109610277 1D AAAGTAGAAT G/- GGGGGTCACC 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 G 6 5 80278 CASAVA_Build 13 109610712 1D ATGGCGTGAA C/- CCCGGGAAGC 1921 hom 12 het 6 0 5 1 C 4 3 80279 CASAVA_Build 13 109610798 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1751 het 61 hom 11 2 7 2 A 17 18 80280 CASAVA_Build 13 109618376 1D TTTCTTCCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 15 6 T 10 9 80281 CASAVA_Build 13 109640250 1I TTGTATCCTT -/G GGCATCCAGA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 2 3 80282 CASAVA_Build 13 109659509 2D GGAAATATCA GT/-- GTGATTCCAA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 GT 2 1 80283 CASAVA_Build 13 109663617 1D AAATTGAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 9 8 80284 CASAVA_Build 13 109665636 4D GGGTGCGGTG GCTC/---- GCTCATGCCT 3070 hom 80 het 28 0 26 2 GCTC 2 1 80285 CASAVA_Build 13 109668563 10I CTGTCAAAGG ----------/CCCTATGACA CCTGTTTCAG 3070 hom 120 het 43 0 39 4 CCCTATGACA 0 1 80286 CASAVA_Build 13 109680474 6D GCCACGTGGT GGAGGG/------ GGAGGGCTGG 3070 hom 110 het 41 0 35 8 GGAGGG 2 1 80287 CASAVA_Build 13 109696769 5D AATGGTGAAT TAAAA/----- TAAAAGTCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 5 TAAAA 2 1 80288 CASAVA_Build 13 109698721 7D TGTAGCTGGG CCCTGGC/------- CCCTGGCCCC 2916 hom 36 het 18 0 10 8 CCCTGGC 2 1 80289 CASAVA_Build 13 109718363 1D TGCCCCCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 10 9 80290 CASAVA_Build 13 109726410 1I AACTATGGAC -/A GGGGGATAGT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 A 0 1 80291 CASAVA_Build 13 109745607 11D TCTTTCTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 37 14 15 11 T 18 7 80292 CASAVA_Build 13 109760816 1D TAACTCAACC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 47 14 27 7 A 8 7 80293 CASAVA_Build 13 109771527 2D ATAGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 2204 het 2204 ref 36 13 14 9 TG 8 7 80294 CASAVA_Build 13 109776826 1I AGTACTGCCC -/A AAAGTGTTTC 3070 het 3070 ref 47 18 16 13 A 3 4 80295 CASAVA_Build 13 109781411 1I TCCATGCAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 9 10 80296 CASAVA_Build 13 109799005 1D ATTGTATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 12 11 80297 CASAVA_Build 13 109818223 1I CAAGATCCAT -/A AATCTTTAAC 3070 hom 135 het 48 0 44 4 A 2 3 80298 CASAVA_Build 13 109819197 4D CCAAAGAAAA GGGG/---- GGGGGGGGGT 3070 hom 69 het 26 0 21 7 G 13 9 80299 CASAVA_Build 13 109836643 1D TGTAAAAAAT C/- CTCCAAGGTT 3070 het 3070 hom 59 27 28 5 C 2 1 80300 CASAVA_Build 13 109840214 1I TTTCTAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 813 hom 31 4 17 10 A 13 14 80301 CASAVA_Build 13 109841102 20D CTGTGTACAG GCCTGAGAAGCGACAGGGCA/-------------------- GCCTGCGGTT 3070 het 3070 ref 37 26 16 5 GCCTGAGAAGCGACAGGGCA 1 0 80302 CASAVA_Build 13 109847111 1I AATTAAAGGC -/G GTTTCCAATC 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 G 1 2 80303 CASAVA_Build 13 109848451 1I AGATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 710 hom 40 3 30 7 T 11 12 80304 CASAVA_Build 13 109853447 4D GGAGGTCCTT CCTC/---- AGTTGTCTTG 3070 het 3070 hom 30 14 13 6 CCTC 1 0 80305 CASAVA_Build 13 109856982 1I AGTGGGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 T 10 11 80306 CASAVA_Build 13 109859161 2I ACATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 816 hom 47 13 23 11 AC 5 6 80307 CASAVA_Build 13 109859195 2D ACACGCACAC AT/-- ATACACACAT 3070 het 152 hom 38 4 22 13 AT 2 1 80308 CASAVA_Build 13 109859335 4I CACACACATG ----/CACA CACACACGCA 3070 hom 101 het 39 0 33 6 CA 3 5 80309 CASAVA_Build 13 109864397 1I GTGGCTCATG -/C CCTGTAACCC 3070 hom 93 het 40 0 31 9 C 2 3 80310 CASAVA_Build 13 109869089 1I ACAGAGATAG -/A AAAGTGTCCA 3070 hom 129 het 50 0 43 7 A 3 4 80311 CASAVA_Build 13 109870825 3I CTGGCTTCTG ---/AGA AGTACTTTGT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 AGA 0 1 80312 CASAVA_Build 13 109873389 1D GGCTCAAGTT C/- CCCCCTCAAT 3070 het 3070 hom 51 22 21 8 C 6 5 80313 CASAVA_Build 13 109874618 1D TCTTTTTTTT C/- CCTCTATGTG 3070 het 3070 hom 32 12 20 0 C 3 2 80314 CASAVA_Build 13 109875402 1D AGGCAATACA T/- TTTGTGACTT 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 T 4 3 80315 CASAVA_Build 13 109877268 1I CCAGCTCTGC -/A AAACAGATCG 3070 het 2490 hom 22 6 10 6 A 3 4 80316 CASAVA_Build 13 109879262 1I CATCACCATC -/T TTTATCAGAT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 3 4 80317 CASAVA_Build 13 109883791 1I GGAGGCAGAG -/A AGGGACTGTG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 1 2 80318 CASAVA_Build 13 109887261 2I CCACCCACTC --/AG GGAGGTCCCA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AG 0 1 80319 CASAVA_Build 13 109897340 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 8 9 80320 CASAVA_Build 13 109898092 4D AACGCCTGAC TGAG/---- TGACGACGTG 3070 het 3070 ref 44 23 18 9 TGAG 1 0 80321 CASAVA_Build 13 109906791 4I AGAAGTGTGT ----/AGCA AGCAGTCTTG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AGCA 1 2 80322 CASAVA_Build 13 109914927 4I TCTCATAAAT ----/AGAG AGAGCTGGAC 3070 het 3070 hom 43 12 17 14 AG 2 4 80323 CASAVA_Build 13 109924310 1I CCATTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 41 0 28 13 A 10 11 80324 CASAVA_Build 13 109930363 4I AGCACAGCCT ----/CAAC CAACCTCCAG 3070 hom 59 het 24 0 18 6 CAAC 1 2 80325 CASAVA_Build 13 109934444 1D TATTTCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 35 1 30 5 A 12 11 80326 CASAVA_Build 13 109944168 1I GTCGGGTTCT -/G GGGGGGGGCC 1872 hom 27 het 13 0 8 5 G 8 9 80327 CASAVA_Build 13 109944419 2I GGGCTTCTTA --/TT CCACAGGAAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 2 80328 CASAVA_Build 13 109944680 1D ATAGTGCAGG A/- AGGCTTGGCA 3070 hom 88 het 32 0 30 2 A 2 1 80329 CASAVA_Build 13 109945052 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 14 15 80330 CASAVA_Build 13 109949873 5I ACTACAAGTC -----/AAGAT GAGATTTGGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAGAT 0 1 80331 CASAVA_Build 13 109960857 1I TATGAGTACC -/A AAGCCAGAGG 3070 hom 115 het 46 0 36 10 A 2 3 80332 CASAVA_Build 13 109960965 2D AAGCATGCAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 165 het 76 0 54 23 TG 8 7 80333 CASAVA_Build 13 109962630 2D TTTTTTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 16 0 14 2 A 12 10 80334 CASAVA_Build 13 109968108 1I AGGAACACTT -/A AGAGATGAGA 3070 het 2192 hom 25 6 16 3 A 1 2 80335 CASAVA_Build 13 109972089 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 6 7 80336 CASAVA_Build 13 109975414 1D TGGGTCTGGC G/- GGGAACAGGG 2477 het 2477 ref 31 16 9 6 G 4 3 80337 CASAVA_Build 13 109976819 1I AGTGGCCCAT -/C CATTGGCAGC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 1 2 80338 CASAVA_Build 13 109978882 7I CATCATGAGG -------/TTTTTAC TTTTTACATG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 TTTTTAC 1 2 80339 CASAVA_Build 13 109983025 5I ACGCCCAGCC -----/TATTT TATTTAATTA 2681 het 2681 ref 24 12 7 5 TATTT 1 2 80340 CASAVA_Build 13 109983868 1D CTATCTCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 9 8 80341 CASAVA_Build 13 109991146 1D ATACCACAAT A/- AAAAACCTCC 3038 het 2943 hom 17 6 9 2 A 6 5 80342 CASAVA_Build 13 109996443 1I GATAGGCACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 13 14 9 A 9 10 80343 CASAVA_Build 13 109998891 1I CAATTCAGTC -/T TCACCTGCCT 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 1 2 80344 CASAVA_Build 13 110002283 3D AAAAAAAAAA TAC/--- AAAAATTAGC 333 het 30 hom 14 1 5 10 TAC 1 0 80345 CASAVA_Build 13 110005349 8D GCACCGTGTC AGGGAGCG/-------- ACTGTGGGAG 3070 hom 81 het 31 0 27 6 AGGGAGCG 1 0 80346 CASAVA_Build 13 110016640 2I TGGGAGAAAG --/AC AGCCAACAAA 3070 hom 112 het 43 0 36 7 AC 0 1 80347 CASAVA_Build 13 110021729 1D GACTCCGACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 10 9 80348 CASAVA_Build 13 110029694 1I TGTAGAGTCA -/G GGTTTTGCCA 3070 hom 75 het 26 0 24 2 G 2 3 80349 CASAVA_Build 13 110038407 1I TATTTATTTA -/C AAAACCCCCA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 0 1 80350 CASAVA_Build 13 110039424 1I AACTATAAAA -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 C 0 1 80351 CASAVA_Build 13 110039680 5D CTAAGATTAC AGACA/----- TGAACTACTG 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AGACA 1 0 80352 CASAVA_Build 13 110039998 2D GATGATGGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 7 A 12 10 80353 CASAVA_Build 13 110044859 12D TTGTTTTTCA TTTTTTGTTTTT/------------ TTTTTTTTTG 3070 het 411 hom 20 3 11 6 TTTTTTGTTTTT 1 0 80354 CASAVA_Build 13 110052699 6D CCCCTCTGCT GACTGA/------ GATAAATGCT 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 GACTGA 1 0 80355 CASAVA_Build 13 110053368 1D AAGTGATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 5 A 12 11 80356 CASAVA_Build 13 110054201 3D CCATTACAAT CAA/--- CACATTTTTG 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 CAA 1 0 80357 CASAVA_Build 13 110055918 1I TGTGTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 10 11 80358 CASAVA_Build 13 110091587 1D CTCTTCTGTT G/- GCTGTGTTGT 3070 hom 60 het 26 0 16 10 G 2 1 80359 CASAVA_Build 13 110099818 1D GGAGATGGAT A/- GGGGACCAGC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 1 0 80360 CASAVA_Build 13 110107238 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2816 het 1341 hom 19 7 9 3 A 13 12 80361 CASAVA_Build 13 110107493 5I55M8I ATATGCTCTT -----ATGTTTAGTAAGAGAGGAAAATAAAGAGCTAAAACTAAAAAGCCCTGTGATATTA--------/ATAAGATGTTTAGTAAGAGAGGAAAATAAAGAGCTAAAACTAAAAAGCCCTGTGATATTAAATTTTAT AATTTTATTT 3070 het 3070 ref 17 16 10 8 N/A 0 0 80362 CASAVA_Build 13 110109846 1D CCAGATCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2776 hom 35 10 13 12 T 12 11 80363 CASAVA_Build 13 110127201 1D ATCTCTTCCC A/- AAAAATCACC 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 6 5 80364 CASAVA_Build 13 110129383 32I CGTTGTCCTT --------------------------------/AAAGGCTAGGACTTGCCACAGGGGAAAAGGGA ACCACACATG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 AAAGGCTAGGACTTGCCACAGGGGAAAAGGGA 0 1 80365 CASAVA_Build 13 110130979 1D ACCAGTTTGC A/- AAAAAACACA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 7 6 80366 CASAVA_Build 13 110149371 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 22 het 22 0 14 10 A 9 8 80367 CASAVA_Build 13 110157680 4D TCTGAAAGTT ACTC/---- ACAATAGCTT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 ACTC 1 0 80368 CASAVA_Build 13 110157995 1D ACTCCGCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 29 1 18 10 A 13 12 80369 CASAVA_Build 13 110158498 4I GGACTTGGGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTTG 2 3 80370 CASAVA_Build 13 110159160 11D GGAGTGCAGT GGCACGATCTC/----------- GGCTCACTGC 2096 hom 12 het 6 0 5 3 GGCACGATCTC 1 0 80371 CASAVA_Build 13 110160820 1I ATAATTTTAG -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 6 7 80372 CASAVA_Build 13 110161588 2D TTTTCCGGAG AT/-- AGTCTTGCTC 3070 hom 72 het 28 0 24 5 AT 1 0 80373 CASAVA_Build 13 110165631 1D GGGTGGGGGC A/- AAAAAAAAAA 1538 het 1538 ref 32 13 5 15 A 11 10 80374 CASAVA_Build 13 110172916 1D AGCCCTGTCC T/- TTAAGGGCTT 3070 hom 75 het 26 0 25 1 T 3 2 80375 CASAVA_Build 13 110208273 1D TTTCCCAGCT A/- ATTTTTTGTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 1 80376 CASAVA_Build 13 110215048 2I15M1D GCCATGATTG --TGTTGCCTGAAGTCTC/CAAGTTTCCTGAGGCCT- CGCCAGAAGC 1081 het 1081 ref 46 42 3 6 N/A 0 0 80377 CASAVA_Build 13 110218443 6D GACTTTCTCC TTTTAA/------ TTTTAAGTAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TTTTAA 2 1 80378 CASAVA_Build 13 110232580 2D ATGTGGAAGC TG/-- CTAAGGCTTG 2602 het 2602 ref 26 16 8 2 TG 1 0 80379 CASAVA_Build 13 110246005 13D CATTCTATCT TATAATTATGTGA/------------- TAGTTTATCC 3070 het 3070 ref 37 22 12 8 TATAATTATGTGA 1 0 80380 CASAVA_Build 13 110258596 1I ATGGAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 2684 het 2684 ref 31 11 10 10 A 13 14 80381 CASAVA_Build 13 110261105 4D GAAATGAAAA AAAT/---- AAATAAAATA 3070 het 3070 ref 40 19 20 2 AAAT 2 1 80382 CASAVA_Build 13 110270743 1I ATGCTTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 26 0 15 11 T 11 12 80383 CASAVA_Build 13 110279237 4I GAACAAGAGA ----/CAGC CAGCAGGAGG 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 CAGC 1 2 80384 CASAVA_Build 13 110282679 1D AAGGTGCCTT G/- GGGGGAGGAA 3070 hom 76 het 29 0 26 5 G 6 5 80385 CASAVA_Build 13 110284009 2D TTTTCCAGAA AT/-- ATCTATGACT 3070 hom 132 het 49 0 41 8 AT 2 1 80386 CASAVA_Build 13 110286489 4D GATCCACCTT AAAA/---- AGAGAGGAAA 3070 het 461 hom 37 3 15 20 A 5 1 80387 CASAVA_Build 13 110289247 4D AGGTAGATCA ATAG/---- ATGGATGGAT 3070 het 3070 hom 50 22 25 5 ATAG 1 0 80388 CASAVA_Build 13 110289926 1I ACCAAAAAAA -/T AAATTCATTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 80389 CASAVA_Build 13 110294066 1D CTGGTGATAT G/- GTTTGGTTGT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 G 2 1 80390 CASAVA_Build 13 110296548 3D ATTCCTTTAT AAG/--- AAGACAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 AAG 2 1 80391 CASAVA_Build 13 110301862 1I AAATGACAGA -/G TGAGGGTTAA 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 G 0 1 80392 CASAVA_Build 13 110306341 13I AAATGTGTGT -------------/GCCAGGTATTAGG GCCAGGTATT 3070 hom 135 het 50 0 45 5 GCCAGGTATTAGG 1 2 80393 CASAVA_Build 13 110311342 1I GAAATTTTTA -/T ATCTTCCCTC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 0 1 80394 CASAVA_Build 13 110314056 1D CATACCTGGC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 6 T 7 6 80395 CASAVA_Build 13 110320379 2D CAGCGGGTGG CT/-- CTCTGCTCTG 3070 hom 66 het 25 0 22 4 CT 3 2 80396 CASAVA_Build 13 110323104 1D TGGAGACCCC T/- TTCCCAAGCC 3070 hom 64 het 26 0 19 7 T 3 2 80397 CASAVA_Build 13 110325199 1I GAGGGCTCCT -/C CCCTTCCACC 939 het 94 hom 9 1 4 4 C 3 4 80398 CASAVA_Build 13 110325241 1I CCTTTCCGGG -/A AAACTCTTCA 744 het 42 hom 10 1 3 6 A 3 4 80399 CASAVA_Build 13 110326216 4D CTTCTACTTC AAGG/---- AAAACTGACA 3070 het 3070 ref 36 16 16 7 AAGG 1 0 80400 CASAVA_Build 13 110326517 1D CACCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1243 hom 7 het 6 0 3 3 T 13 12 80401 CASAVA_Build 13 110327759 1I TCAAGTCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 A 10 11 80402 CASAVA_Build 13 110328170 3D TCAGAGATTC ACA/--- ACGTTTTTCA 3070 het 3070 ref 47 28 18 2 ACA 1 0 80403 CASAVA_Build 13 110331814 1D62M1D TTAATCATCC TTTTTTTTTATATTTAAGCAACATAGTTTAATAATTGCTATAAATTCTTCACAGGACAATAGAT/-TTTTTTTTATATTTAAGCAACATAGTTTAATAATTGCTATAAATTCTTCACAGGACAATAGA- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 28 10 17 17 N/A 0 0 80404 CASAVA_Build 13 110334478 1I ATTCAGCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 9 10 80405 CASAVA_Build 13 110334565 1D TTCCATTAAC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 A 8 7 80406 CASAVA_Build 13 110336107 2D CGGTTTGTAC AA/-- AAGAGTGGAC 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 A 4 2 80407 CASAVA_Build 13 110339457 2I ATTGAAAAAC --/TT GACCACAGTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 0 2 80408 CASAVA_Build 13 110339680 2D AAATCCCACA CT/-- GAGGAAAGTA 3070 het 3070 ref 61 29 26 7 CT 1 0 80409 CASAVA_Build 13 110340714 1I AAAGGGGGGC -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 47 29 17 1 A 6 7 80410 CASAVA_Build 13 110341367 4I TTAGAAACTC ----/TTTT TGAGACTAGT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 T 1 5 80411 CASAVA_Build 13 110345101 2D TTTATTAGCC TT/-- ATTAAGACTG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 2 0 80412 CASAVA_Build 13 110347336 1D TATAGGGATT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 A 8 7 80413 CASAVA_Build 13 110350177 1D AGTAACTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 34 0 20 16 A 12 11 80414 CASAVA_Build 13 110352714 4I GCTCTATGGT ----/AAAC AAACAAAGGT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 AAAC 1 2 80415 CASAVA_Build 13 110353221 1D TGGTTGATAT G/- GAAACATCCT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 G 2 1 80416 CASAVA_Build 13 110355471 4D TATTCATAAC ACTT/---- AAGGTAAAAC 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 ACTT 1 0 80417 CASAVA_Build 13 110366704 6I TCACAAATTG ------/AACTTT AACAAGGCAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AACTTT 0 1 80418 CASAVA_Build 13 110368469 1I TAGACTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1741 hom 44 7 28 9 T 13 14 80419 CASAVA_Build 13 110369910 1D GTCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 2957 hom 29 het 12 0 11 7 A 15 14 80420 CASAVA_Build 13 110382077 2I AATATTAAAC --/TT ATATTTTTAT 3070 hom 103 het 40 0 35 5 T 0 2 80421 CASAVA_Build 13 110388722 2D GTCTGGAACA CT/-- CTGCACATGT 3070 het 3070 ref 65 40 20 6 CT 2 1 80422 CASAVA_Build 13 110397297 1I CCCTGCTGCT -/G GGGGCACGAG 3070 hom 45 het 18 0 13 5 G 4 5 80423 CASAVA_Build 13 110406324 1D CAGGCAGAGC T/- TTTCCCAGGC 1320 het 1320 ref 21 13 5 3 T 4 3 80424 CASAVA_Build 13 110408365 5I TGGTCCCTGG -----/AATCA TCCCTTGAGA 2739 het 2739 ref 39 19 9 11 AATCA 0 1 80425 CASAVA_Build 13 110411797 23D CCCATGGGGG AAACGCTGATCACAGAATGGGCT/----------------------- AATGCTCTCT 3070 het 3070 ref 25 15 15 4 AAACGCTGATCACAGAATGGGCT 1 0 80426 CASAVA_Build 13 110424238 1I AAAAAATAGA -/G GGTTTCAAAC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 G 2 3 80427 CASAVA_Build 13 110438526 2I TTGGGGAAAC --/AG GGGGGAAGAC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 AG 0 1 80428 CASAVA_Build 13 110491988 1I TCCATCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 14 15 80429 CASAVA_Build 13 110498484 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 12 11 80430 CASAVA_Build 13 110498737 25D CCTTTAGATA AAATTAATTTTAAGGTTCTTTCTAG/------------------------- AATGGCAAAG 3070 hom 54 het 17 0 17 3 AAATTAATTTTAAGGTTCTTTCTAG 1 0 80431 CASAVA_Build 13 110501428 3D ATGTATCTAT GCA/--- GCAGCTCATG 3070 hom 119 het 47 0 36 12 GCA 2 1 80432 CASAVA_Build 13 110504294 1I GGATTGTTTG -/T TTTTTTCTTG 2436 het 2436 ref 15 10 5 0 T 6 7 80433 CASAVA_Build 13 110505407 1D GATTTGGATG C/- CCCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 C 4 3 80434 CASAVA_Build 13 110510700 2D CCCAATCTCT AC/-- ACACACACAC 3070 het 2713 hom 21 7 9 6 AC 7 6 80435 CASAVA_Build 13 110511213 1I TCCTTCACAG -/A AAAAAACTTG 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 6 7 80436 CASAVA_Build 13 110512011 1D CATGAAGCAA G/- AACGTGTCAT 3070 het 3070 ref 73 32 32 10 G 1 0 80437 CASAVA_Build 13 110520731 19D ACCCCATTGT TATCCATGGGGTGGATGAC/------------------- ATGAAGGGCC 3070 hom 105 het 32 0 36 1 TATCCATGGGGTGGATGAC 1 0 80438 CASAVA_Build 13 110526272 8I TGGGCTGATT --------/TGGTGTCA CTTGGTGTCC 3070 hom 96 het 36 0 29 7 TGGTGTCA 0 1 80439 CASAVA_Build 13 110534980 11D TCTCAAAAAG AAAAGAAAAGA/----------- AAAAGAAATT 3070 hom 96 het 30 0 32 1 AAAAGAAAAGA 1 0 80440 CASAVA_Build 13 110537597 1I AATGGAGTGC -/T TTTTTTGTCA 3070 hom 73 het 30 0 25 5 T 6 7 80441 CASAVA_Build 13 110538998 3D TATATATATA TAT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 19 2 13 5 TAT 1 0 80442 CASAVA_Build 13 110544292 1I CCATGTCGCC -/T TGGAGGTGGG 2622 het 2622 ref 22 12 6 4 T 1 2 80443 CASAVA_Build 13 110548499 4I ACGTGTGCTC ----/TCTT TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 70 38 27 5 TCTT 0 1 80444 CASAVA_Build 13 110551711 1I CACAAATGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 A 9 10 80445 CASAVA_Build 13 110552603 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1902 het 1738 hom 14 4 4 6 A 11 10 80446 CASAVA_Build 13 110553367 1D TCAGTAGAAA C/- CTTATAAGCC 3070 het 3070 ref 35 16 18 2 C 2 1 80447 CASAVA_Build 13 110558541 1I GGAACTCTCT -/C TACTTTTTGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 0 1 80448 CASAVA_Build 13 110561320 1I AATCGATCCT -/A GCATCACAGA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 0 1 80449 CASAVA_Build 13 110570821 2D GCATGTAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 123 hom 61 4 25 32 AC 6 5 80450 CASAVA_Build 13 110574211 3D GTGGGCTGCG CCC/--- CCCCCCCCCG 883 hom 10 het 11 0 5 6 C 12 9 80451 CASAVA_Build 13 110575734 1I TTGGAGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1995 hom 31 7 12 12 T 13 14 80452 CASAVA_Build 13 110578211 1D ACATGTAAAA G/- ATAAGATATC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 G 1 0 80453 CASAVA_Build 13 110592735 41I GAACCAAATG -----------------------------------------/GAATTCTTGTGTATACATTAGCAGCTTTATCTTTAAGTAAT GAAGATCAGT 3070 hom 63 het 18 0 22 3 GAATTCTTGTGTATACATTAGCAGCTTTATCTTTAAGTAAT 0 1 80454 CASAVA_Build 13 110595382 1I TTCTTCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 26 11 T 11 12 80455 CASAVA_Build 13 110606560 2D GTTTTCTGGA AG/-- AGAGTTTTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 AG 3 2 80456 CASAVA_Build 13 110611457 1D ATAATGAAAA T/- ATCCCTAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 1 0 80457 CASAVA_Build 13 110612091 1I TTTTTGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2854 hom 29 8 14 7 T 10 11 80458 CASAVA_Build 13 110614410 4D TGCGTTTGGA TTAT/---- TTAAGAGGCT 3070 het 3070 ref 32 16 10 7 TTAT 1 0 80459 CASAVA_Build 13 110618451 1I AGGAGCCTGA -/G GGAGAGGGTC 3070 het 3070 ref 45 17 13 15 G 2 3 80460 CASAVA_Build 13 110620573 12I AACCTCTCGA ------------/GTAGCTGAGACT GTAGCTGAGA 3070 het 2735 hom 35 10 20 6 GTAGCTGAGACT 0 1 80461 CASAVA_Build 13 110628188 1I AAAAAGTGTT -/A AAGAAGGGTA 3070 het 3070 ref 46 24 12 10 A 2 3 80462 CASAVA_Build 13 110629427 4I CAAATGCCTG ----/TTTC TTCTTTTTTT 2458 het 2458 ref 31 14 9 8 TTTC 0 1 80463 CASAVA_Build 13 110665720 1D TAAAGTGCCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 50 21 18 11 T 9 8 80464 CASAVA_Build 13 110669994 1D CGCCAACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1005 hom 26 5 16 5 T 11 10 80465 CASAVA_Build 13 110671293 4D GTATTCTCCT GTTA/---- GTTATATATA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 GTTA 2 1 80466 CASAVA_Build 13 110671992 2D ATCTCCCCTT TA/-- TATATATATA 3070 het 1694 hom 15 5 9 1 TA 7 6 80467 CASAVA_Build 13 110672058 4I TATCTATCTG ----/TATC TATCTATCTA 2017 het 2017 ref 16 5 5 6 TATC 2 3 80468 CASAVA_Build 13 110693578 1D GAGTAAACTG T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 T 7 6 80469 CASAVA_Build 13 110714161 3D GGCGTGTTCT TCC/--- TCCTCTGTAG 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 TCC 2 1 80470 CASAVA_Build 13 110732542 8I GGCATTAGCT --------/GCTGTGTG GCCGTCCCTC 3070 hom 99 het 37 0 31 6 GCTGTGTG 0 1 80471 CASAVA_Build 13 110739014 1I TGCTGTGTGA -/T TTTTCTAGAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 4 5 80472 CASAVA_Build 13 110740144 1I CAGAAGCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 9 10 80473 CASAVA_Build 13 110758861 2I GCTCTAAAAC --/AT GTGGCAAGTG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 AT 0 1 80474 CASAVA_Build 13 110768967 1D AGGCTCATCT G/- TCTCCACTCC 3070 het 3070 hom 46 20 17 9 G 1 0 80475 CASAVA_Build 13 110772705 1I GGCAAGATGG -/C CCTGTAGCCA 3070 hom 43 het 17 0 13 4 C 2 3 80476 CASAVA_Build 13 110774964 2I TGCGTTTCAC --/AG AGAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 AG 4 5 80477 CASAVA_Build 13 110786908 1I AAGACTTGCC -/T TTCATTCTTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 2 3 80478 CASAVA_Build 13 110788466 3D CTCTGCACCT GCG/--- GCCTTGCTTC 3070 het 3070 ref 47 24 19 6 GCG 1 0 80479 CASAVA_Build 13 110797714 5D TGATGTGCCT GCTCC/----- GCTCCCGCTT 3070 het 3070 ref 39 21 11 9 GCTCC 2 1 80480 CASAVA_Build 13 110800110 1I CACCACGCCC -/G GGTCGTATAT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 G 2 3 80481 CASAVA_Build 13 110801260 1I CTTGCATTCT -/C CTTATTACTG 3070 het 3070 hom 57 26 26 5 C 1 2 80482 CASAVA_Build 13 110802636 1I GTGACTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 A 10 11 80483 CASAVA_Build 13 110803536 6D GTAGAAGAAA AGAAAT/------ AATAAAGATC 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 AGAAAT 1 0 80484 CASAVA_Build 13 110803658 2D15M5I CTAAGATGAA AGAGAGAAGATTAAAAT-----/--AGAGAAGATTAAAATAAATC AAAGATGAAA 3070 het 3070 hom 30 16 18 9 N/A 0 0 80485 CASAVA_Build 13 110803823 4D GTAAAGAAAT AGAA/---- AGCCTTGATA 3070 het 2874 hom 25 7 16 2 AGAA 1 0 80486 CASAVA_Build 13 110805389 1I CACCACGTGT -/G GAAACTTCCT 3070 het 3070 ref 45 16 13 16 G 1 2 80487 CASAVA_Build 13 110808629 2I TGTTGTGTGC --/TG TGTGTGTTGT 3070 het 3070 hom 55 19 23 13 TG 3 4 80488 CASAVA_Build 13 110813608 1D GAGCCTCTGT C/- CCCCACGTCA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 C 5 4 80489 CASAVA_Build 13 110827256 2I TTATATACAC --/AT ATACATATAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 1 2 80490 CASAVA_Build 13 110827879 1I TTTTATGTTG -/T TTTTTTCATG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 6 7 80491 CASAVA_Build 13 110834903 2D ATAAGCGTGC AT/-- ATGTGTGTAC 3070 het 3070 hom 77 30 33 16 AT 2 1 80492 CASAVA_Build 13 110835216 1I GTATCTGCAT -/G GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 73 37 28 8 G 1 2 80493 CASAVA_Build 13 110838161 3D TTATAGTTGC AAT/--- ATTACATATT 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 AAT 1 0 80494 CASAVA_Build 13 110847686 1D CCGCACATTG C/- CATGTGCTGA 3070 hom 87 het 33 0 27 6 C 2 1 80495 CASAVA_Build 13 110847881 9D CAGAGGGACA CACGCTTCC/--------- CATCCCCACC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 CACGCTTCC 1 0 80496 CASAVA_Build 13 110849246 1D CAGCGTGTGG A/- CAGCGCGCGC 1591 het 1591 ref 30 23 4 8 A 1 0 80497 CASAVA_Build 13 110849782 22D GGGTGTCTGG AATCTGGGTGGGCAGACCTGTC/---------------------- AACTACTGTC 3070 hom 94 het 31 0 28 7 AATCTGGGTGGGCAGACCTGTC 1 0 80498 CASAVA_Build 13 110853953 7I GTGAATCCCA -------/CACCTGC CACTTTTTAG 3070 hom 80 het 30 0 24 6 CACCTGC 0 1 80499 CASAVA_Build 13 110858358 11D TGGCTCACAG ATGTCCTCACC/----------- ATGTCCTCAC 3070 hom 99 het 37 0 34 8 ATGTCCTCACC 1 0 80500 CASAVA_Build 13 110863551 8D ATGCTGAAGT TGAATCGC/-------- TGAATCAATG 3070 het 3070 ref 48 24 22 6 TGAATCGC 1 0 80501 CASAVA_Build 13 110876016 1D TTTTCTGCCA G/- GGCCCCTCCT 3070 hom 71 het 28 0 24 5 G 3 2 80502 CASAVA_Build 13 110882091 12I ATGATTGGGG ------------/ATTGGCCATGAA ATTGGCCATG 3070 hom 60 het 22 0 21 2 ATTGGCCATGAA 0 1 80503 CASAVA_Build 13 110885486 4I11M4I13M4D AGTGGATGTG ----TGGGTGGGTGA----GTGGGTGGCTGTGTAGA/TAGATGGATGGATGAATAGGTGGGTGGATGTG---- TGAATGGATG 1116 het 1116 ref 16 10 3 10 N/A 0 0 80504 CASAVA_Build 13 110894655 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 17 9 T 10 11 80505 CASAVA_Build 13 110902610 1I CTGGGAGGCC -/T GAGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 T 0 1 80506 CASAVA_Build 13 110903342 1I CACTCTAACA -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 53 19 26 8 T 6 7 80507 CASAVA_Build 13 110912252 1D ATAAAGGAGC T/- CCCCAAGGCT 2261 het 1359 hom 17 6 7 4 T 1 0 80508 CASAVA_Build 13 110918347 2I CGCGAGAGAG --/AT ATGGGACATG 3070 het 1525 hom 37 12 14 11 AT 1 2 80509 CASAVA_Build 13 110923976 34D6M15D3M21D GACTGGAAGT CCAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGGGCGGTGGTGCAGTCTC/----------------------------------GAGACT---------------GTT--------------------- GGCTCACGGC 3070 het 3070 ref 23 20 9 6 N/A 0 0 80510 CASAVA_Build 13 110925548 1D5M2D GAGTAGCTGG AGGCTACT/-GATTA-- CAGACGTGCG 3016 hom 18 het 9 0 7 2 N/A 0 0 80511 CASAVA_Build 13 110945256 1D ACTGTGGCAA G/- GGGCTGTGGG 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 G 4 3 80512 CASAVA_Build 13 110949073 1I TTGTACCTCT -/G CTAGAATTCG 2390 het 163 hom 6 1 5 0 G 0 1 80513 CASAVA_Build 13 110952777 6I TGACTGTCTC ------/TGTATT TGTGTATTGC 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 TGTATT 0 1 80514 CASAVA_Build 13 110956184 25I ATATTGAAAA -------------------------/GGTCTGGGTGCCGGGCTCACACCTG AAATCCCAGA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 GGTCTGGGTGCCGGGCTCACACCTG 0 1 80515 CASAVA_Build 13 110956458 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 710 hom 12 3 9 1 T 1 0 80516 CASAVA_Build 13 110961679 2I TGTGTGTGTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 74 31 30 13 GT 5 6 80517 CASAVA_Build 13 110961872 2D GTGGTATGAA TG/-- TGTGGTGTTT 3070 het 3070 hom 81 32 38 12 TG 3 2 80518 CASAVA_Build 13 110961920 10I TGTGGAGTGT ----------/GTGTATGTGA GTGTATGTGA 3070 het 3070 hom 72 21 21 30 GTGTATGTGA 1 2 80519 CASAVA_Build 13 110986640 1D AATTCAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 31 1 18 14 A 11 10 80520 CASAVA_Build 13 110990011 1D TCTTTCAGTT G/- GTCAGACTGG 3070 het 3070 ref 45 24 13 10 G 2 1 80521 CASAVA_Build 13 110995328 1I ACATCCTAGT -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 6 7 80522 CASAVA_Build 13 111002372 1D TAGTGACTTA C/- CATGACCCCC 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 C 2 1 80523 CASAVA_Build 13 111017304 5D TTCTCTCCCA TGGGC/----- TGGCCAACTC 3070 hom 102 het 37 0 31 8 TGGGC 1 0 80524 CASAVA_Build 13 111029464 1I TGGGTGTGTC -/A GGGGGGCTGA 3070 hom 45 het 20 0 13 7 A 0 1 80525 CASAVA_Build 13 111030142 4D TTTTTAAGAC TGAG/---- TGTTTATTCT 3070 hom 117 het 47 0 40 11 TGAG 1 0 80526 CASAVA_Build 13 111033852 3D GGAATTTTCT AAG/--- AAGAAGCATC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 AAG 3 2 80527 CASAVA_Build 13 111035748 1D CTCAGACTCC A/- AGTAGCTGGG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 2 1 80528 CASAVA_Build 13 111036860 1I GGCTCCAGCC -/G GGTCACTTGC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 G 2 3 80529 CASAVA_Build 13 111043133 2D CAGCAAAAAT AG/-- AGTTTCAAGT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AG 2 1 80530 CASAVA_Build 13 111043771 1I GGTATACATA -/T TGCCATGTTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 1 2 80531 CASAVA_Build 13 111050752 14I GAGAGAGAGA --------------/GGCAGAGAGAGAGT GGCAGAGAGA 3070 hom 75 het 37 0 21 16 GGCAGAGAGAGAGT 1 2 80532 CASAVA_Build 13 111063858 1I TGCCGTTTTT -/A ATCATAAAAA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 A 1 2 80533 CASAVA_Build 13 111067029 1I TTGATATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 11 12 80534 CASAVA_Build 13 111078970 13D AGCGACTCAG AAGGAAAGGTGAA/------------- CACTCCGTGT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AAGGAAAGGTGAA 1 0 80535 CASAVA_Build 13 111089732 1I GGCGGGGGGG -/T CCACTGACCT 3070 hom 53 het 20 0 17 3 T 0 1 80536 CASAVA_Build 13 111091819 1D AAGAAGGTCA G/- GGAGGTTGCC 3070 hom 90 het 35 0 31 7 G 3 2 80537 CASAVA_Build 13 111096382 1D AAAGCCTGAA C/- CCCCCCAGCA 1989 hom 17 het 16 0 9 7 C 7 6 80538 CASAVA_Build 13 111105273 1D AGCTCCCCAG A/- AAAAATAGGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 5 80539 CASAVA_Build 13 111105557 1D CTTCCCTTTA C/- TGAGAACATA 3070 hom 126 het 46 0 41 5 C 1 0 80540 CASAVA_Build 13 111113683 20D8M7D9M12D CTCCTCCTTC TTCCTCACCTTCTTCCTCTTCTCCTTCTTCCTTTGCTTCTTCCTCCTCCTCTTCCC/--------------------CTCCTTGT-------CTTCTTCCT------------ CTTCCCCTCG 3045 het 3045 ref 46 37 14 13 N/A 0 0 80541 CASAVA_Build 13 111121767 1D GGCGGGGGTA G/- GGGGGTGGCG 1719 het 1719 ref 27 14 8 6 G 6 5 80542 CASAVA_Build 13 111124533 6D TTGCAAGAAG AAAAAA/------ AAAAAAAGCG 3070 het 1323 hom 23 9 9 9 A 13 7 80543 CASAVA_Build 13 111126407 1I ATGTAAACTC -/A AGAGCAAGAG 3070 het 3070 ref 57 33 19 5 A 1 2 80544 CASAVA_Build 13 111139896 1D TCGGGCACCA C/- CCCCCTCCCC 3070 hom 73 het 32 0 24 8 C 6 5 80545 CASAVA_Build 13 111140732 2D ACTTGTGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 45 22 17 8 AC 9 8 80546 CASAVA_Build 13 111140997 2D27M2D AACACACATG CACACACACACACATACAAACAGAAACACAT/--CACACACACACATACAAACAGAAACAC-- GTGCTTACAC 3070 het 3070 ref 63 33 24 19 N/A 0 0 80547 CASAVA_Build 13 111143182 1I CTCTGGCTGA -/C CCCCCCAGGG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 C 6 7 80548 CASAVA_Build 13 111557580 1D GTCTGGATAA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 31 11 11 10 T 7 6 80549 CASAVA_Build 13 111559148 1D GAGCCAGATG A/- AGACCCCCTA 3070 hom 42 het 18 0 11 7 A 2 1 80550 CASAVA_Build 13 111560063 1D GTTGGGGGAT G/- GGGGGATGTA 935 het 622 hom 13 4 4 6 G 6 5 80551 CASAVA_Build 13 111563083 1D ATTAGCACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 13 12 80552 CASAVA_Build 13 111572259 1D AATGAAAAAA T/- TGTTTCTATA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 2 1 80553 CASAVA_Build 13 111584835 1I CTCCACTCGT -/G GTGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 G 1 2 80554 CASAVA_Build 13 111585753 2D ACATGACTAC AA/-- AAAACTCGTA 3070 het 3070 ref 49 26 20 4 A 6 4 80555 CASAVA_Build 13 111585825 1I GCAGTACTAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 8 9 80556 CASAVA_Build 13 111588809 2D CTAAATATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2272 het 905 hom 16 5 7 5 A 13 11 80557 CASAVA_Build 13 111590068 1D GTTGATTTTT G/- GACTCTCAGT 3070 het 3070 hom 58 25 29 4 G 2 1 80558 CASAVA_Build 13 111594351 1I TTTTAGAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 567 hom 24 3 12 9 T 13 14 80559 CASAVA_Build 13 111597445 1D GGAAAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 18 21 11 A 11 10 80560 CASAVA_Build 13 111600089 12D AGAGGGAACA CAACAGCCGGGG/------------ GGGGGCCATG 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 CAACAGCCGGGG 1 0 80561 CASAVA_Build 13 111607421 1I GCTGCTGGGT -/G GGGCGGTGTC 3070 hom 85 het 33 0 27 6 G 3 4 80562 CASAVA_Build 13 111618383 3D TACCTGATCT GAG/--- GAGAACCAGA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 GAG 2 1 80563 CASAVA_Build 13 111618737 23D CTGGCTCTGG CCAGCCTCAGTGTGGGGCTTCCA/----------------------- CCAGCCTCAG 3070 hom 78 het 28 0 23 10 CCAGCCTCAGTGTGGGGCTTCCA 1 0 80564 CASAVA_Build 13 111618948 1D AACAGGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 26 6 T 11 10 80565 CASAVA_Build 13 111621911 4I CCATTACACA ----/GAGC GAGCCTGGAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 GAGC 1 2 80566 CASAVA_Build 13 111632265 1I TCTTCTGTGA -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 6 7 80567 CASAVA_Build 13 111632901 1I TTGCTTCGTC -/A TACATTGTGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 0 1 80568 CASAVA_Build 13 111641292 43D CACCTCCCAG GTGGCGCAGACTGCACTGGCCAGATTTTAAGGCAAAACACGGC/------------------------------------------- CATCAGATCA 2509 het 2509 ref 22 17 6 7 GTGGCGCAGACTGCACTGGCCAGATTTTAAGGCAAAACACGGC 1 0 80569 CASAVA_Build 13 111645911 1I AGCCAGCACT -/C CCGGGAAGGG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 C 2 3 80570 CASAVA_Build 13 111662967 4D ATTGATAGAT AGAG/---- AGGATGGATG 3070 het 3070 ref 68 40 25 4 AG 3 1 80571 CASAVA_Build 13 111675472 1D TTCTCTGAGA G/- TAGCTCCGTC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 G 1 0 80572 CASAVA_Build 13 111679747 2I ATGAGATTTC --/TT TTTTTTTTTT 3014 het 3014 ref 32 16 11 5 T 13 15 80573 CASAVA_Build 13 111682138 5I ATTTTTTTGA -----/TACTC TACTCTAACA 2661 het 2661 ref 19 10 7 2 TACTC 1 2 80574 CASAVA_Build 13 111703265 1D CAGCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 8 11 A 11 10 80575 CASAVA_Build 13 111713729 1D GGAGTGCAGT A/- TGCATGATCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 1 0 80576 CASAVA_Build 13 111715977 1D TGAGCTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1050 hom 28 3 17 9 T 15 14 80577 CASAVA_Build 13 111720980 1I TCCCTTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 33 0 24 9 T 10 11 80578 CASAVA_Build 13 111722217 4I TGATGAAGAC ----/AGAG AGAGGGCTCT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AG 2 4 80579 CASAVA_Build 13 111726858 1D CTCACTTGCA T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 7 6 80580 CASAVA_Build 13 111727226 1I TGCTTGGTTC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 9 80581 CASAVA_Build 13 111742160 1I ATCATCGACC -/A AAAAAAAAAT 1367 hom 15 het 38 0 6 32 A 9 10 80582 CASAVA_Build 13 111750978 1D TTCAATAGTT A/- AATCTTTCTC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 A 3 2 80583 CASAVA_Build 13 111786016 1I TAAGTGAATG -/C CCAGTGTTTA 3070 hom 154 het 55 0 52 3 C 2 3 80584 CASAVA_Build 13 111788745 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1463 het 303 hom 8 2 4 2 A 17 16 80585 CASAVA_Build 13 111801457 1D GACTTAATTT A/- AAAATTTTTA 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 A 5 4 80586 CASAVA_Build 13 111810267 1I AGGATGTGAA -/T GGGGTAGTGC 2207 het 1867 hom 13 5 6 2 T 0 1 80587 CASAVA_Build 13 111812057 3D GGTTGGGGGT GGG/--- GGGGGGGGGG 1719 hom 15 het 14 0 5 9 G 13 10 80588 CASAVA_Build 13 111814650 1I55M1D ATGAGGAATT -AAAAAAAAAAAGGAAAACATTAAGCTTCATGAAAAACAAGAGAGTTGGAGCTTTGC/AAAAAAAAAAAAGGAAAACATTAAGCTTCATGAAAAACAAGAGAGTTGGAGCTTTG- CTCACCCGTC 3070 het 274 hom 45 3 50 13 N/A 0 0 80589 CASAVA_Build 13 111817152 11I CTGGAACAAG -----------/CTGGGTGTGTC CTGGGTGTGT 3070 het 3070 ref 42 17 15 11 CTGGGTGTGTC 1 2 80590 CASAVA_Build 13 111830069 8D TATGTGTGCA AGTGCATG/-------- TGTGCATGTG 3070 het 3070 ref 59 32 24 8 AGTGCATG 1 0 80591 CASAVA_Build 13 111830882 2D TATTCCTTCC CT/-- GTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 38 15 16 8 CT 1 0 80592 CASAVA_Build 13 111837452 1I TGATGGATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 10 11 80593 CASAVA_Build 13 111841201 2D GTAAATGCAC AT/-- AGAGTCCTGT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AT 1 0 80594 CASAVA_Build 13 111863590 1I CGATTTGTGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 8 9 80595 CASAVA_Build 13 111865022 1D TTAGGTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 12 11 80596 CASAVA_Build 13 111865178 12D CTCAAAGTAA AAAAAATAACAG/------------ AAAATTAGAG 3070 het 3070 ref 35 22 14 2 AAAAAATAACAG 1 0 80597 CASAVA_Build 13 111873289 1D CCCTCCTCAT C/- CATGCGCACT 2328 het 1426 hom 19 6 7 7 C 2 1 80598 CASAVA_Build 13 111880697 2D CTACAAGATG TT/-- TTTAAGTCCC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 5 3 80599 CASAVA_Build 13 111898046 4D TCTTTCCTTT CCCC/---- CTTCCTCCCT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 C 5 1 80600 CASAVA_Build 13 111898585 8D TCCTTCCTTG TCTCCCTC/-------- TCTCCCTCTC 1952 het 1952 ref 19 8 5 6 TCTCCCTC 3 2 80601 CASAVA_Build 13 111916207 4D TGCCTGGCCA CAGC/---- CAGCCAGGGG 3070 hom 63 het 25 0 20 5 CAGC 2 1 80602 CASAVA_Build 13 111925788 1I CTGAAAACTT -/A ACAGCTCTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 A 1 2 80603 CASAVA_Build 13 111927161 4D GTATGTATGT ATGC/---- TTATATGTGT 3070 hom 120 het 45 0 40 7 ATGC 1 0 80604 CASAVA_Build 13 111927484 5D CACACTTGGC TTTTT/----- TTTTTTGTTT 1131 het 59 hom 29 1 7 21 T 11 6 80605 CASAVA_Build 13 111942690 1I CAGTTTTCTT -/C CCCCGTTCTT 3070 hom 38 het 32 0 19 13 C 4 5 80606 CASAVA_Build 13 111942789 4I TCTGCATAAA ----/TAAC TAATAATGAC 3070 hom 135 het 51 0 46 14 TAAC 0 1 80607 CASAVA_Build 13 111966903 8I TAAGAGACTT --------/TTCTTGTC TTCTAAGGTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TTCTTGTC 0 1 80608 CASAVA_Build 13 111988451 1I TCCTTCAGGA -/T TGAGTCACAT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 1 2 80609 CASAVA_Build 13 112014721 1I GGACCATTCC -/T TCAGGATGAG 3070 het 3070 ref 76 44 24 8 T 1 2 80610 CASAVA_Build 13 112017550 1D TTTTTTCAGG A/- CCAAGCCAGG 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 A 1 0 80611 CASAVA_Build 13 112030566 3D CTACAGGGAG GAA/--- GAACTCCCCC 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 GAA 2 1 80612 CASAVA_Build 13 112030990 1D AGTGGAAGGC A/- AAGGGTAAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 3 2 80613 CASAVA_Build 13 112037675 12I CAGGATTCGG ------------/GCACCTCCTGCT GCACGCGTTG 3022 het 2613 hom 31 11 10 10 GCACCTCCTGCT 0 1 80614 CASAVA_Build 13 112060617 4I GTGTAATGTG ----/TGTA TGTATGTGGA 3070 hom 247 het 90 0 81 9 TGTA 1 2 80615 CASAVA_Build 13 112060728 2I60M3I ATGTGGGTGT --TGTGTGAGTGTACATGCATCCATATGTGTTGTGTGTGTGTGTAGAATGTGCATGTGTGTT---/TGTGTGTGAGTGTACATGCATCCATATGTGTTGTGTGTGTGTGTAGAATGTGCATGTGTGTTGGG GGAGTATACA 3070 hom 227 het 92 0 72 81 N/A 0 0 80616 CASAVA_Build 13 112070015 1I TTCATGCAGG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 7 8 80617 CASAVA_Build 13 112071918 1D GTTTTGACCC T/- TTCCTCGGCT 3070 hom 150 het 56 0 47 10 T 3 2 80618 CASAVA_Build 13 112072021 2D CAGCCCACTC TG/-- TGTGTTGCTA 3070 hom 106 het 43 0 34 9 TG 3 2 80619 CASAVA_Build 13 112076463 1D CATATTTTAG T/- GCTCAAATCT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 T 1 0 80620 CASAVA_Build 13 112083384 1I AAGAAAACTT -/G TGCTTAGTAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 0 1 80621 CASAVA_Build 13 112083809 2D CCCTGTCCCC CA/-- AAAAAAAAAA 2388 hom 34 het 19 0 11 8 CA 1 0 80622 CASAVA_Build 13 112092454 1D TAATGGGGGT G/- GGGGGAGGAG 3070 hom 81 het 33 0 26 7 G 6 5 80623 CASAVA_Build 13 112096854 1D GAGGCCTGGG A/- AAAGCTCTGC 3070 het 1745 hom 23 7 12 4 A 4 3 80624 CASAVA_Build 13 112107007 1D CCACTTTATG T/- TTTTTGTTTG 3070 hom 68 het 28 0 22 7 T 6 5 80625 CASAVA_Build 13 112113449 2I ATTTGCTATG --/TT TTTTTTTTAG 3070 hom 49 het 23 0 17 6 T 8 10 80626 CASAVA_Build 13 112115684 1I GGAAGAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 46 2 37 7 T 11 12 80627 CASAVA_Build 13 112116625 4I AGCCCCAGGA ----/TTTG TTTATTATTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTTG 0 1 80628 CASAVA_Build 13 112122849 1D ACATAAAGGG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 111 het 41 0 36 5 A 8 7 80629 CASAVA_Build 13 112159737 6D AGGGACATTG TCCCTA/------ TAACCAGAAA 3070 hom 67 het 25 0 23 2 TCCCTA 1 0 80630 CASAVA_Build 13 112164233 1I GGGAGGGGGA -/G GGGGGTGGAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 5 6 80631 CASAVA_Build 13 112164999 1I AAGGACATTG -/A AAAAAATAAG 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 6 7 80632 CASAVA_Build 13 112166504 1D TTATATCCCA T/- TGAATAAAAT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 2 1 80633 CASAVA_Build 13 112168125 2D GTAGTACCTT CA/-- CACATGGGAT 2568 het 2568 ref 31 16 9 8 CA 3 2 80634 CASAVA_Build 13 112183268 1D TCTCAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 27 0 20 7 A 11 10 80635 CASAVA_Build 13 112190666 1D TATCACTAAG A/- TCACATTGAG 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 1 0 80636 CASAVA_Build 13 112206801 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 5 A 15 14 80637 CASAVA_Build 13 112266386 1I AAGATTTAAG -/A AAAGCAAATG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 3 4 80638 CASAVA_Build 13 112281473 2I TGAATGGCAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 AC 8 9 80639 CASAVA_Build 13 112283350 3I TGCTCACACA ---/CCC CCCATCACAC 3070 het 3070 ref 26 9 12 5 C 3 6 80640 CASAVA_Build 13 112296347 1I AGTTGAATTA -/G TAGTTAACTA 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 G 0 1 80641 CASAVA_Build 13 112298053 1I GTTGGGCCAT -/G TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 45 15 27 3 G 0 1 80642 CASAVA_Build 13 112305192 1D ATTTCTACAC A/- AATGGCCCAG 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 A 3 2 80643 CASAVA_Build 13 112314418 1I GTGCAGTTAC -/T TGGAAAATGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 80644 CASAVA_Build 13 112315499 2D GGGGATAAAC AT/-- GTGTCAAAAC 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 AT 1 0 80645 CASAVA_Build 13 112325696 1D TAAGGATCTG C/- CCCCATCTCA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 C 5 4 80646 CASAVA_Build 13 112328956 2D GATTAGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 823 het 653 hom 27 5 2 20 T 18 16 80647 CASAVA_Build 13 112336513 1D CCCGCAACAA C/- CCCACCTGCA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 C 4 3 80648 CASAVA_Build 13 112351202 16D ACACCTGGCC TCGTCCATTCAATCAT/---------------- TCGTCCATTC 1595 het 1595 ref 16 11 5 3 TCGTCCATTCAATCAT 1 0 80649 CASAVA_Build 13 112357925 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 9 10 80650 CASAVA_Build 13 112370836 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 22 1 20 3 A 12 11 80651 CASAVA_Build 13 112374084 1D ATGCTATTGC T/- TTTTTTTTTT 1386 het 1386 ref 21 11 4 6 T 17 16 80652 CASAVA_Build 13 112384944 1I TTCAAAACCA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 8 9 80653 CASAVA_Build 13 112391725 8I CGCAGCTTTG --------/GGGACAGA GGGACAGAGG 2662 het 2662 ref 34 10 7 17 GGGACAGA 1 2 80654 CASAVA_Build 13 112401065 2D CAAGGTCTCA CT/-- CTGTCACCCA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 CT 2 1 80655 CASAVA_Build 13 112405047 2D ACGTGTGCAT GA/-- GAGGAAGGCG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 GA 2 1 80656 CASAVA_Build 13 112410472 1I TCTCGACAAC -/T TTTTACAGGG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 4 5 80657 CASAVA_Build 13 112412044 5I AAATGTATTT -----/GATTG AAGTCTCATG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 GATTG 0 1 80658 CASAVA_Build 13 112416322 1D CCCTTCCACT C/- CCCCCCACCC 2367 hom 21 het 9 0 8 1 C 7 6 80659 CASAVA_Build 13 112419252 6I TGGAGGCCCG ------/TGCACC TGCACTTTCC 3070 hom 71 het 31 0 22 9 TGCACC 0 1 80660 CASAVA_Build 13 112421959 10D CTGATGGTGA ACTTCAGGTT/---------- ACTTCAGGTT 3070 het 3070 ref 39 20 19 2 ACTTCAGGTT 3 2 80661 CASAVA_Build 13 112425226 1D AAGTAAAGTA G/- GCGGATTCAG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 G 2 1 80662 CASAVA_Build 13 112426808 7I TGTCACGTGG -------/CCCTCCT CCCTCCTCCA 3070 het 1652 hom 37 7 16 14 CCCTCCT 1 2 80663 CASAVA_Build 13 112440689 5D ACACCGTCTC AAAAA/----- GAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 8 A 5 0 80664 CASAVA_Build 13 112441197 1I TGGGGCCTGC -/T TGTATGTCTT 2702 het 2702 ref 24 12 8 4 T 1 2 80665 CASAVA_Build 13 112448403 1I GTTCACCTGT -/G GATGGACTCT 3070 het 3070 hom 40 11 18 11 G 1 2 80666 CASAVA_Build 13 112449306 1D ATTGGCATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 12 12 T 13 12 80667 CASAVA_Build 13 112452121 1I GGGGTTGAAT -/C CCCCTTCAGC 1104 het 1104 ref 47 26 5 16 C 4 5 80668 CASAVA_Build 13 112452214 1D GGGGTTGAAT C/- CCCCTTCAGC 594 het 594 ref 43 31 4 9 C 5 4 80669 CASAVA_Build 13 112454046 1D TGCAGATAAT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 993 hom 25 4 12 9 C 10 9 80670 CASAVA_Build 13 112456078 1D TGAGTCACAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 A 8 7 80671 CASAVA_Build 13 112456773 3D CAGCCCTGCT CTC/--- CCGCCGAGGA 3070 het 3070 ref 43 21 11 12 CTC 1 0 80672 CASAVA_Build 13 112456840 1I AAAGTGGTGC -/T TTAGAGCCAG 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 2 3 80673 CASAVA_Build 13 112467467 1D TGCCCCCCCT C/- CCCCCCGCCC 2014 hom 16 het 14 0 7 7 C 7 6 80674 CASAVA_Build 13 112468549 3I CTGCCTTATT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 TTG 2 3 80675 CASAVA_Build 13 112469824 1D GGAGGATGTA G/- GGGTATCGGG 1701 het 1701 ref 17 9 4 4 G 4 3 80676 CASAVA_Build 13 112502532 1D TGGTTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2835 hom 24 8 10 6 A 11 10 80677 CASAVA_Build 13 112534275 4D CAGACACACA CACT/---- CACACATGCC 3070 het 3070 ref 75 34 23 20 CACT 1 0 80678 CASAVA_Build 13 112536783 4D TTATAATCTC TGTT/---- TAACTGAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 TGTT 1 0 80679 CASAVA_Build 13 112540002 7I CGGAACCAGA -------/CAGACTC CAGGCTGGAG 3070 hom 57 het 22 0 19 4 CAGACTC 0 1 80680 CASAVA_Build 13 112556539 1I CTTATTTGGA -/T TTCCTGGGTC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 2 3 80681 CASAVA_Build 13 112558990 1I TGGAATGTAT -/G TGTAAACATG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 0 1 80682 CASAVA_Build 13 112569080 3I CCTGTGCACC ---/ATT ATTTACCTGC 3070 hom 100 het 40 0 33 7 ATT 1 2 80683 CASAVA_Build 13 112569378 1D CGTAGCCCTT A/- AGAGAGAACT 3070 hom 97 het 35 0 31 5 A 2 1 80684 CASAVA_Build 13 112576140 19D GTCGTGGGGT CCTGGGATACAGTCGGGGG/------------------- CAAGACACCG 3070 het 3070 hom 29 12 15 4 CCTGGGATACAGTCGGGGG 1 0 80685 CASAVA_Build 13 112585435 3D GTCCCCTCGT CTC/--- CTCATCCCCA 3070 hom 67 het 30 0 18 12 CTC 2 1 80686 CASAVA_Build 13 112587551 4D24M2D GACGTGTGAT ACACACATGCATGTACAGGTAAGCACACAT/----ACATGCATGTACAGGTAAGCACAC-- GTACAAGCTC 3070 het 3070 ref 83 55 39 18 N/A 0 0 80687 CASAVA_Build 13 112587921 2I GCTCCCACAC --/AT GTACACATGC 3070 hom 138 het 53 0 46 7 AT 0 1 80688 CASAVA_Build 13 112588596 2D GGGGACTCCC CT/-- GAGTTGAGCC 2246 het 2246 ref 34 18 9 10 CT 1 0 80689 CASAVA_Build 13 112603236 1I CCTGAGGGAT -/G GGGATGGGGT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 G 3 4 80690 CASAVA_Build 13 112643129 1D ATGAGCACTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 9 8 80691 CASAVA_Build 13 112648601 1D CCTTTCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 13 12 80692 CASAVA_Build 13 112652469 1I TTAAAATTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 A 9 10 80693 CASAVA_Build 13 112660177 4D TGAGCAACTC AAAG/---- AAAGTGAATT 3070 het 3070 hom 47 21 22 5 AAAG 2 1 80694 CASAVA_Build 13 112663397 22D CCAAGGGGAG TCTGCTATGCCTCCACGTTGCA/---------------------- TCTGCTATGC 3070 het 3070 ref 46 22 14 16 TCTGCTATGCCTCCACGTTGCA 2 1 80695 CASAVA_Build 13 112664538 4D ACACAGTCAC ACTT/---- ACACATGCAC 3070 het 3070 ref 66 33 22 12 ACTT 1 0 80696 CASAVA_Build 13 112678243 4D CAAGCTCCTG GCCT/---- CCCTCCCTCC 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 GCCT 1 0 80697 CASAVA_Build 13 112678458 1D ATGTTCCGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2219 hom 32 9 12 11 T 11 10 80698 CASAVA_Build 13 112689627 25I CCTGGAGCAC -------------------------/ATGCAGCCCCCGGTGGGGGGCAGGG ACCTTGTGGA 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 ATGCAGCCCCCGGTGGGGGGCAGGG 0 1 80699 CASAVA_Build 13 112710204 1I CTTAAATGGG -/T TTTTTAGTAT 3070 het 1920 hom 18 6 9 3 T 5 6 80700 CASAVA_Build 13 112710683 1I TCTCAGCCCC -/T TGGACTCCAG 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 1 2 80701 CASAVA_Build 13 112711899 1I TCCTGTTTAT -/C CCCCTGACCC 1763 het 1763 ref 29 16 5 8 C 4 5 80702 CASAVA_Build 13 112723096 16D TATGTGTAGC TGTGTGTATGTGTAGA/---------------- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 58 37 24 6 TGTGTGTATGTGTAGA 1 0 80703 CASAVA_Build 13 112723184 2D24M6D AGTGTGTATA TGTGTGTATGTGTAGATGTGTGTATGTGTAGA/--TGTGTATGTGTAGATGTGTGTATG------ TGTGTGTATG 1691 het 1691 ref 57 49 9 19 N/A 0 0 80704 CASAVA_Build 13 112723327 4D GCTGTGTATC TGTA/---- TGGTAGCTGT 3070 het 3070 ref 81 40 38 7 TGTA 1 0 80705 CASAVA_Build 13 112724140 4D CTGACTTGGG AAGA/---- AAGAACAGGG 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 AAGA 2 1 80706 CASAVA_Build 13 112734886 1I TTTTATATAT -/A TTTTTTTTCA 1713 het 1713 ref 16 8 4 4 A 0 1 80707 CASAVA_Build 13 112739015 3I GCTCGCGCCT ---/TTC TTCTTCAGGT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 TTC 2 3 80708 CASAVA_Build 13 112740780 1D CCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 17 16 80709 CASAVA_Build 13 112750846 1D AGCTCTGCCT C/- CCCGGGTTCA 2774 hom 18 het 7 0 7 0 C 4 3 80710 CASAVA_Build 13 112751427 1D ATGATGGTGG A/- CATTGGATGG 3070 het 3070 ref 41 18 13 11 A 1 0 80711 CASAVA_Build 13 112752368 2I GAGAACTCAC --/AT GTCTCTTCTC 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 AT 0 1 80712 CASAVA_Build 13 112752592 8I TGTGTGAGAC --------/TGTGAGTG TGTGAGTGTG 3070 hom 89 het 39 0 30 9 TGTGAGTG 1 2 80713 CASAVA_Build 13 112753590 12D CCGATGGGGT GGGGCGGCTCTG/------------ GGGGCGGCCT 2370 het 2154 hom 21 9 9 6 GGGGCGGCTCTG 1 0 80714 CASAVA_Build 13 112753924 1I GCCACTTTGC -/T TCTCTCTAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 1 2 80715 CASAVA_Build 13 112755070 2I GTGCCCATTC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 58 24 20 14 GT 7 8 80716 CASAVA_Build 13 112761069 4D GGGCGCTGTG TGTT/---- TGGGGGCTGA 1258 het 1258 ref 34 16 9 11 TGTT 1 0 80717 CASAVA_Build 13 112775345 2D TTACTCCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2416 hom 34 12 10 12 T 17 15 80718 CASAVA_Build 13 112782125 16D GGCAGAGGAA TGTCTGAATGGAGGAG/---------------- GGTCCAGGCA 2811 het 2811 ref 20 14 9 7 TGTCTGAATGGAGGAG 1 0 80719 CASAVA_Build 13 112795898 1D CCTCTGTCCT C/- CCCATGCCCC 3070 hom 73 het 37 0 27 10 C 4 3 80720 CASAVA_Build 13 112840827 2D AACCTTCAGT GA/-- GAGGGGTTCA 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 GA 2 1 80721 CASAVA_Build 13 112845078 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 1687 het 1687 ref 10 6 4 1 A 11 10 80722 CASAVA_Build 13 112847197 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1007 het 1007 ref 15 10 3 2 T 15 14 80723 CASAVA_Build 13 112858017 3I ACACCCCAAC ---/TTA ATCTGAAGGA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 TTA 0 1 80724 CASAVA_Build 13 112862590 1I AATTAATTAG -/C CCTATTTACT 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 C 2 3 80725 CASAVA_Build 13 112866282 1D TCATGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 2501 het 95 hom 18 2 9 7 T 13 12 80726 CASAVA_Build 13 112866819 1I TTTTTTTTTT -/C CCTTTTCAGC 3070 het 669 hom 52 4 41 7 C 2 3 80727 CASAVA_Build 13 112870137 4D AAGCTATCAT CTTG/---- CTATCTTTTA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 CTTG 1 0 80728 CASAVA_Build 13 112873244 1D TATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2347 het 2347 ref 26 12 7 7 T 12 11 80729 CASAVA_Build 13 112875704 4I CATTTTAACT ----/CTGA CTTAGTTAAG 3070 hom 167 het 60 0 56 4 CTGA 0 1 80730 CASAVA_Build 13 112877792 1D AAGTCAAAAG T/- TGAAGGATGT 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 T 2 1 80731 CASAVA_Build 13 112888343 8D CTCAAAAAAC AAAAACAA/-------- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 AAAAACAA 1 0 80732 CASAVA_Build 13 112892332 1D AGCAAGAGTC T/- TGTCTCAAAA 2824 hom 12 het 11 0 8 3 T 2 1 80733 CASAVA_Build 13 112894778 4I CAGAACAGAA ----/AACT GACAGGCAGA 3070 hom 77 het 31 0 25 6 AACT 0 1 80734 CASAVA_Build 13 112913115 2D TTAAAAAAAC TT/-- TTTTTCTGGA 3070 het 3070 ref 44 23 18 5 T 7 5 80735 CASAVA_Build 13 112915804 2I GACTAGAAAC --/AA GAGTCCCACC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 0 2 80736 CASAVA_Build 13 112920553 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 10 11 80737 CASAVA_Build 13 112923409 1D GGAGGATGCG C/- CCTCCTGTGG 3070 het 3070 hom 45 19 17 10 C 3 2 80738 CASAVA_Build 13 112924711 1I TCTTATGGTT -/C AGAGGGAAAG 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 C 0 1 80739 CASAVA_Build 13 112946345 1D GAAAGTCTTT C/- TCTTTGAGAA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 C 1 0 80740 CASAVA_Build 13 112967263 1D CAGATTTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 10 9 80741 CASAVA_Build 13 112974220 1D CTGTGCCGGG C/- CCTCATTAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 3 2 80742 CASAVA_Build 13 112993507 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1752 het 1627 hom 28 10 6 12 A 12 11 80743 CASAVA_Build 13 112997325 2D8M1D TTTCTGAGCC TTTTTTTGATA/--TTTTTGAT- AATGCCCTCC 3070 hom 144 het 48 0 48 2 N/A 0 0 80744 CASAVA_Build 13 113008670 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 27 0 24 3 A 13 14 80745 CASAVA_Build 13 113037423 1I CAGGCATGAG -/T CACCATGCCT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 0 1 80746 CASAVA_Build 13 113037770 2I CCTGGGTAAC --/TG GGATCCACCC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TG 0 1 80747 CASAVA_Build 13 113038621 4I GTAGTTTTTT ----/TTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 24 0 14 10 TTTG 0 1 80748 CASAVA_Build 13 113038936 1D TACACTAGCT G/- TGCAGGACAC 3070 hom 68 het 24 0 18 8 G 1 0 80749 CASAVA_Build 13 113039048 70D CCCTAGAACG GTACCAACCATCCCTCCAGACAGCGGACGCACACAGGCCAAGTGCCCGCCTGGCGCTCAGCCCTAGAACT/---------------------------------------------------------------------- GTACCAACCA 3070 hom 58 het 26 0 19 18 GTACCAACCATCCCTCCAGACAGCGGACGCACACAGGCCAAGTGCCCGCCTGGCGCTCAGCCCTAGAACT 1 0 80750 CASAVA_Build 13 113044960 3I TATAACTTCG ---/AGA AGGATGGATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGA 0 1 80751 CASAVA_Build 13 113049729 2D TCTGTGGCTG AC/-- AGTGGACCCG 3070 het 1483 hom 24 7 14 3 AC 1 0 80752 CASAVA_Build 13 113063527 6D GACCAATGCT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 22 0 13 11 A 20 14 80753 CASAVA_Build 13 113069944 2I AAAATTGACA --/GT GATAAGCTTT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 GT 0 1 80754 CASAVA_Build 13 113071251 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2027 het 1290 hom 15 6 6 3 A 10 11 80755 CASAVA_Build 13 113071311 1I GATTAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 9 10 80756 CASAVA_Build 13 113073406 3I GGAGCAAATC ---/GTT GTCTCCGGGC 3070 hom 132 het 48 0 41 7 GTT 0 1 80757 CASAVA_Build 13 113076329 1D AGGTCGGGGT G/- GGGGGGGGCG 2114 hom 15 het 9 0 6 3 G 9 8 80758 CASAVA_Build 13 113080864 1I TACCCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2073 hom 29 6 14 9 T 12 13 80759 CASAVA_Build 13 113082248 9D CCAGGTCCTT CAGGTAGGG/--------- CCAAAGCAAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 4 CAGGTAGGG 1 0 80760 CASAVA_Build 13 113108987 3I CCACAAATAC ---/AAG AAGGTTTGTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 AAG 1 2 80761 CASAVA_Build 13 113125573 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 35 0 26 9 A 10 9 80762 CASAVA_Build 13 113128452 1D GGGACTTCTT A/- AGAGGTCATC 3070 hom 107 het 41 0 33 8 A 2 1 80763 CASAVA_Build 13 113130198 8D CCCCCGTGGA AAGCTGTG/-------- AACCAGACCC 3070 hom 47 het 16 0 15 4 AAGCTGTG 1 0 80764 CASAVA_Build 13 113131423 2I AGGGCAGGGA --/AG AGAGAGAGGG 390 het 390 ref 19 12 3 4 AG 4 5 80765 CASAVA_Build 13 113268171 5D AGACCCTCAG TCTGT/----- CCTCTCAGAC 215 het 215 ref 31 15 2 15 TCTGT 1 0 80766 CASAVA_Build 13 113276032 4D AAAAAATAAA AAAT/---- AAAAAAATAA 2645 het 1277 hom 19 5 10 4 AAAT 1 0 80767 CASAVA_Build 13 113282579 2D TCTGTTTGTG CA/-- CACACACACA 1052 het 1052 ref 56 43 5 9 CA 9 8 80768 CASAVA_Build 13 113306969 4I ACCTCGGCTG ----/GTGT TCCTGTTAAC 3070 hom 96 het 38 0 30 8 GT 0 2 80769 CASAVA_Build 13 113349057 2I GCCACCAAAC --/TG TGCATTAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 TG 1 2 80770 CASAVA_Build 13 113360607 1I GCCAGGGCCG -/A TTTATCAGCG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 0 1 80771 CASAVA_Build 13 113491083 16D ACTCAGGCCC GGCACACTCAGGATCT/---------------- GGCACACTCA 2159 hom 30 het 11 0 9 5 GGCACACTCAGGATCT 1 0 80772 CASAVA_Build 13 113506033 29D CTTGTATTTC TTCGTGGGTGTTTTTATGATCCTTCCTCT/----------------------------- TTCTTTATCA 3070 hom 84 het 27 0 28 6 TTCGTGGGTGTTTTTATGATCCTTCCTCT 1 0 80773 CASAVA_Build 13 113512203 1I AGAGGCTGTG -/T TCTCTATTGG 3070 hom 75 het 28 0 24 4 T 1 2 80774 CASAVA_Build 13 113518521 1D ATTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1872 het 1872 ref 33 27 4 2 A 11 10 80775 CASAVA_Build 13 113523589 1I CGCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1941 het 235 hom 14 1 7 6 T 15 16 80776 CASAVA_Build 13 113543219 1D GTGAGTAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 T 10 9 80777 CASAVA_Build 13 113551231 1D ACATTCACAC A/- TGGACACCAG 3070 het 3070 hom 63 27 31 7 A 1 0 80778 CASAVA_Build 13 113552426 2I36M2I ACTAGCAGAC --GTACACAGACATGCACACATTCACATAGATGTACAT--/ATGTACACATACATGCACACATTCACATAGATGTACATAC AGTCACACAC 3070 het 3070 ref 91 72 33 21 N/A 0 0 80779 CASAVA_Build 13 113559472 4D CCACCCACCT ATTC/---- ATTCATTCAT 3070 het 2918 hom 46 15 20 14 ATTC 3 2 80780 CASAVA_Build 13 113559609 8D TTCTTTCATT CATTCATC/-------- CATTCACTCA 3070 het 3070 ref 54 27 20 10 CATTCATC 1 0 80781 CASAVA_Build 13 113564766 2D ACATGTAAAC AT/-- GTGTGAGCGG 3070 het 3070 ref 42 18 11 14 AT 1 0 80782 CASAVA_Build 13 113565932 2D CAGATCCTGT CA/-- CGCGTGTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 CA 1 0 80783 CASAVA_Build 13 113628286 1D TCATAATGAA G/- CCCCCCCCTC 2927 het 53 hom 20 1 10 9 G 1 0 80784 CASAVA_Build 13 113635899 2I TGTGTGTGGA --/GT GTGTGTGGTG 3070 het 3070 ref 80 37 19 24 GT 3 4 80785 CASAVA_Build 13 113636200 7D ATTGTGTGTT GTGTGTG/------- GTGTGTGGTG 3070 het 1817 hom 72 13 22 40 GTGTGTG 3 2 80786 CASAVA_Build 13 113636382 3D TTTGTGTGTT GTG/--- TGGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 71 29 24 20 GTG 1 0 80787 CASAVA_Build 13 113657619 2D ATGGGTGCAC AT/-- GACTGTGTAC 3070 het 3070 ref 58 26 24 8 AT 1 0 80788 CASAVA_Build 13 113767567 2I GTGTGCCTCC --/TG TGTGTGCACC 3070 hom 76 het 43 0 18 25 TG 3 4 80789 CASAVA_Build 13 113767598 3I GTGTGCACCA ---/CCT CCTCCCACGT 3070 hom 83 het 46 0 21 25 CCT 1 2 80790 CASAVA_Build 13 113767942 40D CACCTCCTCC GTGTGTGCACCTCCTGCCATGTGTGTGCACCTCCACCCAT/---------------------------------------- GTGTGTGCAC 3070 hom 102 het 41 0 28 25 GTGTGTGCACCTCCTGCCATGTGTGTGCACCTCCACCCAT 1 0 80791 CASAVA_Build 13 113778146 1D AGGCCGAGGC A/- AGAAGGATCG 3070 hom 75 het 29 0 25 6 A 2 1 80792 CASAVA_Build 13 113781109 23D TGGGGCAGGT GGGACAGGGGTCCTGTGATTGGA/----------------------- GGGACAGGTC 2723 hom 41 het 15 0 10 8 GGGACAGGGGTCCTGTGATTGGA 1 0 80793 CASAVA_Build 13 113787934 4D AGAAGGAACT CAAA/---- CAACTTAACA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 CAAA 1 0 80794 CASAVA_Build 13 113797320 4D CTGTCTCTGG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 43 het 19 0 13 8 CT 8 6 80795 CASAVA_Build 13 113797531 4D TATCTCTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 1888 hom 39 het 15 0 14 2 TC 9 7 80796 CASAVA_Build 13 113797599 14D TCTCTCTCCA TCTCTCTCTCTCCG/-------------- TCTCTATCTC 2172 hom 36 het 14 0 11 6 TCTCTCTCTCTCCG 1 0 80797 CASAVA_Build 13 113811819 1I GTGTCATCCT -/G GGGGGCCAGG 3017 het 1656 hom 28 6 12 10 G 5 6 80798 CASAVA_Build 13 113813210 1D GTCATCCTGG T/- GGGCCAGGAC 2382 hom 55 het 33 0 10 23 T 1 0 80799 CASAVA_Build 13 113815121 2D CACCTGTGTA TG/-- TGTGTTTGTC 3070 hom 197 het 74 0 60 15 TG 3 2 80800 CASAVA_Build 13 113823272 2D CCACTGCTCC CT/-- CTGTTACAGG 3070 hom 61 het 25 0 18 7 CT 2 1 80801 CASAVA_Build 13 113829523 2I CCAAGCGTGT --/GG AAAGATATAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 0 2 80802 CASAVA_Build 13 113834730 1I AGCTGGGGGT -/C CCCCTGGGGG 3070 hom 42 het 17 0 12 5 C 4 5 80803 CASAVA_Build 13 113871708 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 9 8 80804 CASAVA_Build 13 113872133 4I CCAAATTAAT ----/TTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 TTTC 0 1 80805 CASAVA_Build 13 113877363 1I TCAAATACTC -/T TGTCTTTGAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 2 80806 CASAVA_Build 13 113917546 1D24M2I TGTGTATGAA CTGTAGGTGTGTATATGAACTGAGA--/-TGTAGGTGTGTGTATGAACTGAGACT CTACACTCCC 3070 hom 60 het 23 0 19 9 N/A 0 0 80807 CASAVA_Build 13 113923892 1D CACGCCCCCG C/- CCCCAGGCCC 1511 het 1511 ref 22 10 8 4 C 5 4 80808 CASAVA_Build 13 113924832 2D TAGACACACT CA/-- CACACACACT 3070 het 2420 hom 68 17 27 25 CA 5 4 80809 CASAVA_Build 13 113925617 4I CAGTCCCTCA ----/CACT CACACACAAG 3070 hom 168 het 64 0 54 10 CACT 0 1 80810 CASAVA_Build 13 113925873 2I ATGCACACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 70 30 26 14 AC 5 6 80811 CASAVA_Build 13 113933813 1I GCTTGGCACC -/A TGGGTGCTTC 3070 het 2782 hom 34 12 19 3 A 0 1 80812 CASAVA_Build 13 113950303 1I TGGCCAGATG -/A AAAAAGGAAC 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 5 6 80813 CASAVA_Build 13 113955743 1D ACAGCACAAA G/- GAAAATTATC 3027 het 3027 ref 32 14 10 9 G 2 1 80814 CASAVA_Build 13 113962689 1I AGATCTCCTG -/A AAAAAAAAAA 1190 het 1190 ref 34 24 3 7 A 11 12 80815 CASAVA_Build 13 113973304 6D ATCACATGAT CATATC/------ AGTAGATGCA 3070 het 3070 ref 45 20 19 7 CATATC 1 0 80816 CASAVA_Build 13 113973984 4D AATACCAAAT AATC/---- AATAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 23 13 2 AATC 1 0 80817 CASAVA_Build 13 113978312 1I CCTTCCCCCC -/T GTACCTAATG 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 T 0 1 80818 CASAVA_Build 13 114027076 1I ATAAGATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 958 hom 25 2 16 7 A 11 12 80819 CASAVA_Build 13 114030693 1D AGAATAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 11 10 80820 CASAVA_Build 13 114066763 1I CGGCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 247 hom 21 1 12 8 A 10 11 80821 CASAVA_Build 13 114071029 1I TTAGCAGGGC -/A ATGGTGGTGC 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 A 1 2 80822 CASAVA_Build 13 114076961 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1653 het 1653 ref 18 11 4 3 A 12 11 80823 CASAVA_Build 13 114101890 1D CTGATCATCA T/- TTTTTTTTTT 1897 het 1897 ref 30 13 6 11 T 15 14 80824 CASAVA_Build 13 114118207 5I AAAATTAGAA -----/CTCTT CTCTGCTCAA 3070 het 3070 hom 79 29 42 8 CTCTT 0 1 80825 CASAVA_Build 14 18079370 2D TGCAAAAATC AA/-- AAAGTAGTTT 3070 het 3070 ref 73 52 12 10 A 5 3 80826 CASAVA_Build 14 18081738 1D ACTCTGTGAG T/- TGAATGCAAG 3070 het 3070 ref 94 70 15 12 T 2 1 80827 CASAVA_Build 14 18082414 2D TGTTCAACTC TA/-- TATGAGTTGA 3070 het 3070 ref 87 61 17 9 TA 2 1 80828 CASAVA_Build 14 18083464 1I CAAACATCAC -/A ATGAATTTTC 3070 het 3070 hom 52 14 28 10 A 1 2 80829 CASAVA_Build 14 18088010 2D CGGATTCTAG AT/-- AAAGAGTGTT 2338 het 2338 ref 58 42 5 14 AT 1 0 80830 CASAVA_Build 14 18093690 6D TGTGAGTTGA ATGCAC/------ ACATCACTAA 2163 het 2163 ref 86 72 5 11 ATGCAC 1 0 80831 CASAVA_Build 14 18099412 1I TCAAAGGGCT -/C CAAATATCCA 3070 het 3070 ref 86 66 9 11 C 1 2 80832 CASAVA_Build 14 18104958 1D TCTGTGAGTT G/- AATGCAAACA 1682 het 1682 ref 92 67 4 21 G 1 0 80833 CASAVA_Build 14 18105920 2D TTCAAATTCT CC/-- AAAAAGAGTG 3070 het 3070 ref 84 62 10 16 C 2 0 80834 CASAVA_Build 14 18106191 1D TTCTGTCTAG T/- TTTTATATGA 2259 het 2259 ref 96 75 7 14 T 5 4 80835 CASAVA_Build 14 18107700 3I ACACATCACA ---/AAG AAGTTTCTGA 3070 het 3070 ref 84 59 8 17 AAG 1 2 80836 CASAVA_Build 14 18108787 1D30M2D CTTAGGCCTC TAAAGCGCTCCAAATGTCCATTTGCAGATTCTA/-AAAGCGCTCCAAATGTCCACTTGCAGATTC-- TAAAAAGAGT 3070 het 3070 ref 68 70 11 12 N/A 0 0 80837 CASAVA_Build 14 18110232 2I GGTTCATCTC --/TG TGAGTTGAAT 3070 het 3070 ref 101 70 20 11 TG 1 2 80838 CASAVA_Build 14 18110616 4D GAGAATGCTG CTGT/---- CTAATTTTTA 3070 het 3070 ref 95 76 14 13 CTGT 1 0 80839 CASAVA_Build 14 18116008 1I AACAGAGTTT -/A AAAAATGCTC 3070 het 3070 ref 73 53 11 9 A 5 6 80840 CASAVA_Build 14 18116848 4I TGAAGATTCT ----/ACAA ACAGAGTATT 2766 het 2766 ref 76 55 11 10 ACAA 0 1 80841 CASAVA_Build 14 18118324 1D CAGATTCTAC A/- AAAAAGAGTG 3070 het 3070 hom 60 22 31 8 A 6 5 80842 CASAVA_Build 14 18122412 2D AGAAGATATT TC/-- TTTTTCCACC 3070 het 3070 ref 78 66 8 5 TC 1 0 80843 CASAVA_Build 14 18122832 2D AAAGCTGCTC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 35 7 9 A 10 8 80844 CASAVA_Build 14 18124941 1I TCAAAAGAAA -/G ATTCAACTCT 3070 het 3070 hom 59 12 39 8 G 0 1 80845 CASAVA_Build 14 18137080 1D AACTGCATCT C/- AAAAACTTCT 3070 het 3070 ref 62 34 21 7 C 1 0 80846 CASAVA_Build 14 18138592 4I TTACATTATG ----/AATT GACTGTTAAT 2680 het 2680 ref 79 69 6 4 AATT 0 1 80847 CASAVA_Build 14 18138959 1I GTTTTTAAAA -/T TTTTTTACCC 2666 het 2666 ref 60 43 7 10 T 6 7 80848 CASAVA_Build 14 18139142 1D TTAAAATATT C/- CAAGTCCCAT 3070 het 3070 ref 31 14 9 10 C 2 1 80849 CASAVA_Build 14 18145150 1I TTTTGCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1134 hom 34 6 20 8 T 10 11 80850 CASAVA_Build 14 18157529 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 15 15 A 15 16 80851 CASAVA_Build 14 18157891 2D38M2D ATATATATAC ATATATACATACACACATATATACACGTATACACATATATAC/--ATATAAATACACACATATATACACGTATACACATATAT-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 77 100 8 10 N/A 0 0 80852 CASAVA_Build 14 18158483 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2765 hom 48 10 28 10 A 10 11 80853 CASAVA_Build 14 18158754 3D ATTTATCTAT CGG/--- GGTTCTATGT 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 CGG 1 0 80854 CASAVA_Build 14 18161988 1I ACTTTTTTAA -/C CTTTTGGCTC 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 C 1 2 80855 CASAVA_Build 14 18162327 2I CTCTACTGTT --/CA GTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 66 49 9 8 CA 0 1 80856 CASAVA_Build 14 18163331 1I TTGTCTGCTC -/A AAAAAAAACA 1561 het 1561 ref 88 69 4 15 A 8 9 80857 CASAVA_Build 14 18163769 1D CAGTGTCAGG A/- TTTTTTTCAT 1294 het 1294 ref 64 55 3 7 A 1 0 80858 CASAVA_Build 14 18169242 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 46 1 28 20 A 15 14 80859 CASAVA_Build 14 18171387 1I ACATGTATGG -/C CTTGGATGTC 3070 het 3070 ref 59 27 27 5 C 1 2 80860 CASAVA_Build 14 18173152 5D ATGTGATGTG ATGTT/----- TGTATACATT 2285 het 2285 ref 62 52 5 6 ATGTT 1 0 80861 CASAVA_Build 14 18175016 5I ATAAAATCAA -----/TAACT TAAGCTTCTG 3070 het 3070 ref 60 45 11 4 TAACT 0 1 80862 CASAVA_Build 14 18175070 1I GTAACAAGGG -/A AAAAAATATA 2266 het 2266 ref 63 48 6 9 A 6 7 80863 CASAVA_Build 14 18177907 8I TAAAAGAATT --------/GAGTCGTA GACATCAGTA 969 het 969 ref 83 72 3 8 GAGTCGTA 0 1 80864 CASAVA_Build 14 18178678 3D TGATCGTCCT ATC/--- ATCTCGGTCT 3070 het 3070 ref 86 58 19 10 ATC 2 1 80865 CASAVA_Build 14 18182800 1D TGGTTTTAAT A/- TAAAATGTTT 2981 het 2981 ref 72 56 8 8 A 1 0 80866 CASAVA_Build 14 18183105 4I ATAATTATAG ----/ATTA ATTAGTGTAC 1890 het 1890 ref 30 25 4 1 ATTA 1 2 80867 CASAVA_Build 14 18183832 1D AAATGTACTT G/- TAATAAATAA 3070 het 3070 ref 90 61 16 14 G 1 0 80868 CASAVA_Build 14 18184215 1D CAAGCTCAAG T/- TGAACTGAAT 3070 het 3070 ref 89 71 13 6 T 2 1 80869 CASAVA_Build 14 18187129 1D TAAGGAAAAG A/- AGTGAGCAAA 3070 het 3070 hom 45 21 21 5 A 2 1 80870 CASAVA_Build 14 18187213 1D GGTATAGTAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 48 30 11 8 T 8 7 80871 CASAVA_Build 14 18187492 7D TTAGTTTTAA GAAGTAT/------- GAATTTTTAG 1316 het 1316 ref 48 46 3 5 GAAGTAT 1 0 80872 CASAVA_Build 14 18187778 1D TACTCAGGAC A/- AATATTATTC 3070 het 3070 ref 69 58 10 1 A 3 2 80873 CASAVA_Build 14 18190230 1I AAGAAACACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 9 10 80874 CASAVA_Build 14 18193482 1D CTCTTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 12 11 80875 CASAVA_Build 14 18205941 1D TTGTTCTCCA T/- TTTAAAGTTT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 4 3 80876 CASAVA_Build 14 18206138 1D CTTGCACCCC T/- GTCCTCTTTG 2718 het 2718 ref 43 27 9 7 T 1 0 80877 CASAVA_Build 14 18209825 2I TGAATTAATC --/TA TGCTCATATC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TA 0 1 80878 CASAVA_Build 14 18229184 1I GTTTTAGTTA -/C TATAAAACAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 0 1 80879 CASAVA_Build 14 18233282 2I15M1D GTTACTGGTG --TAGAAATGTTCCTCAT/TATAGAAATGTTCCTCA- TTTTGAATGT 3070 het 3070 ref 51 45 7 7 N/A 0 0 80880 CASAVA_Build 14 18239492 4D ATTGTCTGTA ACAC/---- ACACAAAACA 2081 het 2081 ref 53 42 5 8 AC 4 2 80881 CASAVA_Build 14 18243951 1I ACAGTACCAC -/A GACATGCAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 0 1 80882 CASAVA_Build 14 18250841 1I TGTTCCAAAA -/T TATATAAAGC 1326 het 1326 ref 8 4 3 1 T 1 2 80883 CASAVA_Build 14 18294253 4D TATATGACGG ACAA/---- ACACTCAGAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 ACAA 1 0 80884 CASAVA_Build 14 18294449 4D GGGGGACAAA CACT/---- CAGTACCCAA 3070 het 3070 ref 72 49 20 3 CACT 1 0 80885 CASAVA_Build 14 18306278 1I AACTTCATAG -/C CCTGTTCTGG 3070 het 3070 ref 60 31 17 12 C 2 3 80886 CASAVA_Build 14 18309513 4D GAGAAACAAA CACT/---- CACAACCCAG 3070 het 3070 ref 44 35 8 4 CACT 1 0 80887 CASAVA_Build 14 18339966 1D TAAGTGTTTG T/- CCCACACATA 2273 het 2273 ref 15 8 5 2 T 1 0 80888 CASAVA_Build 14 18403765 2I GGAATTAAAG --/AC ACACACACAC 1837 het 1837 ref 14 7 6 1 AC 6 7 80889 CASAVA_Build 14 18425894 2D TAAGTACAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 67 26 20 22 A 16 14 80890 CASAVA_Build 14 18434181 4D GTAAACACCG GGCC/---- TTAGGTGGAT 2351 het 2351 ref 39 33 5 2 GGCC 1 0 80891 CASAVA_Build 14 18438390 1I GAGGTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 A 10 11 80892 CASAVA_Build 14 18450834 1I AAATTCACCA -/C CACAGGGTTT 1393 het 1393 ref 14 9 3 2 C 1 2 80893 CASAVA_Build 14 18466426 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 1308 het 1308 ref 31 21 3 7 A 10 11 80894 CASAVA_Build 14 18468674 1I TTTCTTCACA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 59 39 18 2 T 6 7 80895 CASAVA_Build 14 18495323 3D CCTCCTCCTT CTC/--- CTTCTTCTTT 3070 het 3070 ref 54 31 14 9 CTC 1 0 80896 CASAVA_Build 14 18502429 1D AAGGGGTGTG T/- GGGGGGGAAG 1401 het 1401 ref 20 14 3 3 T 1 0 80897 CASAVA_Build 14 18511848 5I TTTTTCTTTT -----/CTTTC CCCTTAAGGT 3070 het 3070 ref 42 27 8 7 CTTTC 0 1 80898 CASAVA_Build 14 18512587 1I TCTAACTTTG -/C TGAGAACATT 1358 het 1358 ref 24 17 3 4 C 0 1 80899 CASAVA_Build 14 18514936 3I AGATTCTAGC ---/CCA CCATGGATTA 1678 het 1678 ref 49 39 4 6 CCA 1 2 80900 CASAVA_Build 14 18515828 1I TGTTCTGGCA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 53 30 15 8 T 7 8 80901 CASAVA_Build 14 18516101 1D GGATGGGATT A/- AAAAAAAAAA 2332 het 1634 hom 26 7 8 11 A 15 14 80902 CASAVA_Build 14 18518054 4D AGTATTTTGG TTTT/---- TTTTTTTGTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 11 7 80903 CASAVA_Build 14 18519353 1I CTCAGAAATT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 2842 hom 15 6 9 0 A 7 8 80904 CASAVA_Build 14 18550395 3D ATTGGAAGAG ATA/--- CTGAATTAAG 3070 het 3070 ref 56 44 10 2 ATA 1 0 80905 CASAVA_Build 14 18564613 1I TTCAGAATAA -/T TTTTAAAATG 3070 het 911 hom 33 2 25 6 T 4 5 80906 CASAVA_Build 14 18568109 2D AACTGTGAGC AG/-- AGAGTCCCAT 3070 het 3070 ref 34 24 10 1 AG 3 2 80907 CASAVA_Build 14 18573747 3D CCATCTAAGA AAG/--- AAGATGACTG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AAG 2 1 80908 CASAVA_Build 14 18585057 2I TGTAGAAGGG --/GT GTTTTCCAAT 2513 het 2513 ref 14 8 6 0 GT 1 2 80909 CASAVA_Build 14 18590633 1D TGTTTGTATT C/- TTTTTTGTCT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 1 0 80910 CASAVA_Build 14 18590755 2I15M1I11M3I TCAGTTTTGG --ATAGGTCTTTCTTTC-AGTTGAATGAA---/GTTTAGGTATTTCTTTCGTGTTGAATGAATTG TTGTGAATTT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 N/A 0 0 80911 CASAVA_Build 14 18606030 4I CTCCGATCTC ----/GAGA ATCCAGGTTG 3070 het 3070 ref 32 24 7 1 GA 0 2 80912 CASAVA_Build 14 18606133 4I CTTAATCTAC ----/ACAT TCATTGATGG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 ACAT 0 1 80913 CASAVA_Build 14 18606247 1I TCTGGTAGAT -/A ACCCAGTAAT 1889 het 1889 ref 31 23 5 3 A 1 2 80914 CASAVA_Build 14 18606729 4D GTGGATTAAT TAAG/---- TCTCACCTGT 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 TAAG 1 0 80915 CASAVA_Build 14 18607871 1I TTACCTGAAG -/C TTTGTCCCTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 0 1 80916 CASAVA_Build 14 18616193 1I CTTTTGGGGG -/A AAAGCAAGAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 3 4 80917 CASAVA_Build 14 18617674 4I GAGCCTTTTC ----/TTTA TTTCTTATTT 3070 het 3070 ref 55 28 24 3 TTTA 0 1 80918 CASAVA_Build 14 18622533 1D GTTTGCCGGG A/- AACACCAGGC 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 A 3 2 80919 CASAVA_Build 14 18626928 1I ATATAAATGA -/T TATTACTATT 3070 het 1912 hom 24 4 15 5 T 1 2 80920 CASAVA_Build 14 18632166 4I ATAAATATTA ----/AATT AATAAGATTA 2388 het 2388 ref 18 10 5 3 AATT 0 1 80921 CASAVA_Build 14 18632294 2D TTATATTGAC TG/-- ATGTTATTTG 3070 het 2905 hom 15 6 9 0 TG 1 0 80922 CASAVA_Build 14 18641927 3D ACCTTATTAA AAG/--- AAGAATCAAT 2370 het 2370 ref 37 32 5 2 AAG 2 1 80923 CASAVA_Build 14 18652041 1D AATTTGGATG C/- CCTTTATTTC 3070 het 1163 hom 20 8 9 3 C 3 2 80924 CASAVA_Build 14 18660053 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2578 het 1649 hom 22 8 7 7 A 10 11 80925 CASAVA_Build 14 18663013 1D AAGATCAGGA G/- CAGGGTGTAC 1189 het 1189 ref 36 31 3 2 G 1 0 80926 CASAVA_Build 14 18670182 1D GCTGCTAGTT G/- GTAGCTCGTG 1251 het 1251 ref 30 21 5 4 G 2 1 80927 CASAVA_Build 14 18671651 4I ATGGAGACAC ----/AGAG AGGAAACAAG 1648 hom 12 het 7 0 4 3 AG 1 3 80928 CASAVA_Build 14 18674498 7I GTGGCTGCCA -------/CCTGATG GCTGATGGAG 3070 het 3070 ref 44 26 9 9 CCTGATG 0 1 80929 CASAVA_Build 14 18676351 1I TTTTACTTTC -/A AAATATTTAA 3070 het 3070 ref 47 36 7 4 A 3 4 80930 CASAVA_Build 14 18677992 2D CACTGTAATG TC/-- TATTTCTGTT 1659 het 1659 ref 64 56 4 5 TC 1 0 80931 CASAVA_Build 14 18679666 1D ACACAGATGC T/- TTTTTTGCCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 6 80932 CASAVA_Build 14 18680047 1I TTTGACAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 A 10 11 80933 CASAVA_Build 14 18680254 1D AAAAATTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 T 11 10 80934 CASAVA_Build 14 18681166 1D CCCCAGGCTC A/- GGTGATCCTC 1463 het 1463 ref 36 24 7 5 A 1 0 80935 CASAVA_Build 14 18688470 4I TTCCTCCAGT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 27 het 22 0 10 12 TTTA 3 4 80936 CASAVA_Build 14 18692432 4D GTCATTTCTT ACTC/---- ACTTCTTTCG 1418 het 1418 ref 20 14 3 5 ACTC 1 0 80937 CASAVA_Build 14 18704125 1I CCAATCTGGG -/T GACAGAGCAA 3070 het 2984 hom 20 8 8 4 T 0 1 80938 CASAVA_Build 14 18704146 1I AGCCTGTCTC -/A AAAAAAAATG 1953 het 1953 ref 23 8 4 11 A 8 9 80939 CASAVA_Build 14 18705967 1I AGAAACATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2659 hom 20 7 10 3 T 9 10 80940 CASAVA_Build 14 18706880 2D ACACAGACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 19 11 16 AC 8 7 80941 CASAVA_Build 14 18714384 1D CTTTAGTGTC A/- AAAATTATTT 1630 het 1630 ref 11 5 4 2 A 5 4 80942 CASAVA_Build 14 18714968 1D TGGGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1548 hom 29 6 18 7 T 11 10 80943 CASAVA_Build 14 18734815 4D AGTACTGCAG GGTT/---- ATAAGATTAT 3070 het 3070 ref 73 53 11 9 GGTT 1 0 80944 CASAVA_Build 14 18740386 1D TAATAACAGG A/- AAAACAACCC 3070 het 3070 ref 22 15 7 0 A 5 4 80945 CASAVA_Build 14 18742702 1I ACTTAGATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 9 10 80946 CASAVA_Build 14 18747533 1I CAAAAATTAG -/A AAAATCAACT 3070 het 2437 hom 25 8 11 6 A 4 5 80947 CASAVA_Build 14 18747618 4D TAGAAACAAT AGAA/---- AGACATTTCC 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 AGAA 1 0 80948 CASAVA_Build 14 18759321 1D CTGAGGTTAC A/- AGCAAATCTC 2920 het 2920 ref 45 34 7 5 A 2 1 80949 CASAVA_Build 14 18766575 1I AATTTTTATT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 77 59 12 6 A 6 7 80950 CASAVA_Build 14 18779800 1D28M1I TGGAGGTAGG CAAGATCACTGGACTAGTCAGGAAATTTG-/-AAGATCACTGGACTAGTCAGGAAATTTGA ATATTCTACC 2634 het 2634 ref 57 39 6 15 N/A 0 0 80951 CASAVA_Build 14 18783799 2D TGGTGAGGTC AT/-- GTTTTTCTGG 2003 het 2003 ref 35 28 5 2 AT 1 0 80952 CASAVA_Build 14 18793962 1I TATGACCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 95 34 35 26 T 10 11 80953 CASAVA_Build 14 18793972 1I TTTTTTTTTT -/C CCTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 77 36 34 7 C 2 3 80954 CASAVA_Build 14 18798397 1I TTTTTTTTTT -/A TTATTATTAT 1394 het 120 hom 10 1 6 3 A 0 1 80955 CASAVA_Build 14 18801257 1I ATTAAAAAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 T 9 10 80956 CASAVA_Build 14 18815108 1I AGAGAAAAAA -/G AAAAACGCAC 2761 het 279 hom 14 2 8 4 G 0 1 80957 CASAVA_Build 14 18816141 1I TGAGGCACCT -/G GGGGAAAAGC 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 G 4 5 80958 CASAVA_Build 14 18823620 1D CTAGTGTGCA C/- CTGAAGCCTG 3070 het 3070 ref 80 57 11 14 C 2 1 80959 CASAVA_Build 14 18826145 18D ACCATGCCCC AGGTGGACATCAGGCACT/------------------ AGGTGGACAC 759 het 759 ref 76 65 6 5 AGGTGGACATCAGGCACT 1 0 80960 CASAVA_Build 14 18830854 1D GAGTACCAAC A/- TTGATTTACT 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 A 1 0 80961 CASAVA_Build 14 18833470 1D ATACCTAGCT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 45 17 17 11 A 8 7 80962 CASAVA_Build 14 18834185 1I TCTCTGTAGC -/T CCTGTCACTC 848 het 848 ref 45 38 2 6 T 0 1 80963 CASAVA_Build 14 18835952 1D CTCAAGGGGT C/- CCCGCTGAGA 3070 het 1723 hom 31 5 24 2 C 4 3 80964 CASAVA_Build 14 18838134 1D CTTCGTTGAT G/- GGGGTAAGGA 1847 het 1847 ref 51 37 5 13 G 5 4 80965 CASAVA_Build 14 18838185 1I CCTGTCCCAC -/A AGTGCCCAGT 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 A 1 2 80966 CASAVA_Build 14 18864360 7D CATGGTGGAA GTGATGC/------- GTTACTAAAT 3070 het 3070 ref 88 59 21 11 GTGATGC 1 0 80967 CASAVA_Build 14 18865722 2D CTCAAATATT AA/-- AAAGACATTT 3070 het 3070 ref 81 45 28 8 A 5 3 80968 CASAVA_Build 14 18875192 1I ATTTTATAAC -/A AAAAAATGGG 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 6 7 80969 CASAVA_Build 14 18876890 1I GAGATGAGAA -/C AATGGGGATC 3070 het 3070 hom 62 18 33 11 C 0 1 80970 CASAVA_Build 14 18877081 1D TGGAGAAAAC A/- ATCCAGCAAA 3070 het 3070 hom 63 11 45 9 A 2 1 80971 CASAVA_Build 14 18886046 4D TTATGCTCTT TTAG/---- TTATTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 33 8 6 TTAG 1 0 80972 CASAVA_Build 14 18889705 1I TCACCTGAGA -/C CCGGGTGTTT 3070 het 3070 ref 101 54 15 33 C 2 3 80973 CASAVA_Build 14 18893588 1I AATCTACCTG -/A GGCCAGATGT 3070 het 3070 ref 98 69 14 15 A 0 1 80974 CASAVA_Build 14 18896354 1D GATACCTAGG C/- CCCTAGTAAA 3070 het 3070 ref 87 65 11 13 C 4 3 80975 CASAVA_Build 14 18896483 1I TGATACCCAA -/G TCCTATGTGG 2842 het 2842 ref 79 57 8 14 G 0 1 80976 CASAVA_Build 14 18900301 1D CTAAGGTGCG T/- TTTTTTTTTT 1467 het 1467 ref 19 6 4 9 T 12 11 80977 CASAVA_Build 14 18901997 1I GCACATAAGG -/T TTTTTTTAAA 2298 het 2298 ref 46 29 5 12 T 7 8 80978 CASAVA_Build 14 18919469 1I TCCTAACATG -/A AAAATTATAA 3070 het 3070 hom 46 16 28 2 A 4 5 80979 CASAVA_Build 14 18920733 1I AATTAGACAT -/A AAAAGTAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 4 5 80980 CASAVA_Build 14 18928655 2D CTTGTAATGC TT/-- TTTTTTTTTT 1348 het 1348 ref 68 38 3 27 T 12 10 80981 CASAVA_Build 14 18933172 1D AAACAGATGG A/- AAAAAGTTAT 3070 het 3070 ref 57 41 12 6 A 6 5 80982 CASAVA_Build 14 18934036 1I AAATTGAAAT -/A AAAAAAATAC 1898 het 1898 ref 28 20 5 3 A 7 8 80983 CASAVA_Build 14 18948835 1D GATAAGTGTA T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 T 7 6 80984 CASAVA_Build 14 18956063 1I AGAGATTTGC -/T TGTAACCTCA 2586 het 2586 ref 65 51 6 8 T 1 2 80985 CASAVA_Build 14 18957440 1D ACAGGCGTGA G/- CCACTGCACC 1204 het 1204 ref 15 10 4 1 G 1 0 80986 CASAVA_Build 14 18961083 1I ACACTCTCAC -/T CCTCTCCCCC 3070 het 3070 ref 64 45 8 11 T 0 1 80987 CASAVA_Build 14 18961725 1D GGGGAGGGGA G/- GGGGGACCGC 2382 het 1800 hom 15 8 6 1 G 6 5 80988 CASAVA_Build 14 18975652 1I GTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTGT 1260 het 1260 ref 63 57 3 3 T 8 9 80989 CASAVA_Build 14 18980901 3I TGAGACAAAT ---/AAC AAATTAGAAG 3070 het 3070 ref 60 43 11 6 AAC 0 1 80990 CASAVA_Build 14 18986025 1I TGCTCAGAGC -/A ATGTTCAGAG 3070 het 3070 hom 46 8 32 6 A 1 2 80991 CASAVA_Build 14 18986259 1D TCCATCTTGC T/- TTAGAGCTTC 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 T 3 2 80992 CASAVA_Build 14 18993423 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAATG 2968 het 510 hom 20 6 10 4 C 0 1 80993 CASAVA_Build 14 19009416 1I TATTTTGTGC -/A AAAAAAAAAA 1557 het 935 hom 12 2 4 6 A 10 11 80994 CASAVA_Build 14 19022313 1I GGGCTATTAT -/A AAAAAAAGAT 1356 het 1356 ref 22 16 3 3 A 7 8 80995 CASAVA_Build 14 19035391 1D AGCATTGGGA T/- TTTTTTTATT 2190 het 1036 hom 10 3 5 2 T 8 7 80996 CASAVA_Build 14 19037948 2D TGAAATCTCT AG/-- AGAAACAATG 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 AG 2 1 80997 CASAVA_Build 14 19039053 1I AATTTAAATA -/T TTTGAAAGTA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 3 4 80998 CASAVA_Build 14 19039374 3D CTTTTTATCC TCT/--- TCAAGTTTTT 2632 het 2632 ref 25 13 6 9 TCT 1 0 80999 CASAVA_Build 14 19039409 1I25M3I GTATTTTTTT -ATAGATAATAACTCCTGTTGAATAA---/CATAGATAATAACTCCTGTTGAATAACTT CTTTTTAGTC 3070 het 3070 ref 28 22 14 2 N/A 0 0 81000 CASAVA_Build 14 19070682 1I AATTAAACTT -/A AAAAAATAAA 1154 het 665 hom 6 2 3 1 A 6 7 81001 CASAVA_Build 14 19076502 1I TGAGCACCTT -/A AAAGATGAAA 3070 het 3070 hom 66 31 29 6 A 3 4 81002 CASAVA_Build 14 19091093 1D CAGCCTGGTG T/- TTCCCGGCAA 1942 het 946 hom 18 6 10 2 T 3 2 81003 CASAVA_Build 14 19091572 2I ATAAAATTTG --/AA AAAAAAAATC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 8 10 81004 CASAVA_Build 14 19101598 2I ACCAATAGAC --/AA AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 A 8 10 81005 CASAVA_Build 14 19104417 1D TGTGGGGGGC G/- GGGGGTGTTG 2274 het 2274 ref 61 50 6 5 G 6 5 81006 CASAVA_Build 14 19107348 2D27M2D AAGAAATTAT TATATATATATATTATCGATATAATATATAC/--TATATATATATTATCGATATAATATAT-- ACACACACAC 1390 het 1390 ref 23 16 3 14 N/A 0 0 81007 CASAVA_Build 14 19114368 2D AGGAAACTGT TG/-- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 69 30 16 29 TG 1 0 81008 CASAVA_Build 14 19123062 1D TGATGAGGCA T/- TTTTTTGGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 7 6 81009 CASAVA_Build 14 19127499 2I CTGTATCTCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 9 15 A 10 12 81010 CASAVA_Build 14 19128408 2I ACATTGGAAA --/AC ACCCCTTCTA 2534 het 2534 ref 36 20 8 8 AC 1 2 81011 CASAVA_Build 14 19149631 1D TTCCAAAGAT A/- TGGAAAGAGA 2642 het 987 hom 8 2 6 0 A 1 0 81012 CASAVA_Build 14 19158112 1D ATTTTACCTT C/- CTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 C 2 1 81013 CASAVA_Build 14 19172360 2D GACTCTTCTC AG/-- GGGCTAACAC 3070 het 3070 ref 56 40 13 3 AG 1 0 81014 CASAVA_Build 14 19175257 1D GGTGGTCATC T/- TTTAACAGGT 3070 het 3070 hom 53 11 37 7 T 4 3 81015 CASAVA_Build 14 19178100 1D AAAAAAACAC A/- AAAAACATAT 3002 het 3002 ref 62 44 7 12 A 6 5 81016 CASAVA_Build 14 19200088 1I GGGGCTCTCA -/T GGCCTTCGGC 1825 het 1825 ref 51 36 5 10 T 0 1 81017 CASAVA_Build 14 19204154 3I AGAGGAGGAA ---/GAG GAGGAGGAGG 2165 het 2165 ref 32 14 6 12 GAG 5 6 81018 CASAVA_Build 14 19205165 2I TGACAATCTC --/TT CTAGCAAATC 3070 het 3070 ref 45 34 8 3 T 0 2 81019 CASAVA_Build 14 19205253 1D CCAATGAATT C/- TGAAGTCTGT 2373 het 2373 ref 34 28 6 0 C 1 0 81020 CASAVA_Build 14 19206967 1D ATTCTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 2464 het 990 hom 28 9 9 10 A 11 10 81021 CASAVA_Build 14 19207640 1D TATGTGGGAC A/- CCCCCTGGTG 3070 het 3070 ref 34 18 11 7 A 1 0 81022 CASAVA_Build 14 19212779 2I GTGTGTGCAT --/GC GTCTTTATAG 1570 het 1570 ref 47 37 4 6 GC 0 1 81023 CASAVA_Build 14 19215471 1I GTTACTGTTT -/A AAAAAAAAAA 1754 het 1754 ref 63 41 7 15 A 10 11 81024 CASAVA_Build 14 19216369 1I TGGTCAATGG -/C CATGCCAACT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 C 1 2 81025 CASAVA_Build 14 19221991 1I TTAAAAGAAC -/A AAAAACATGT 2275 het 2275 ref 31 23 5 3 A 5 6 81026 CASAVA_Build 14 19232663 2D CTCTCTCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 470 hom 33 7 13 14 T 16 14 81027 CASAVA_Build 14 19232678 2D TTTTTTTTTT TG/-- TCAGTTCCTA 3070 het 704 hom 38 10 13 16 TG 1 0 81028 CASAVA_Build 14 19240703 1I ATGCTGAGGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 41 25 11 5 A 8 9 81029 CASAVA_Build 14 19241041 1D ATTGACAGAT A/- AAAAAATTGA 1748 het 1748 ref 19 14 4 1 A 7 6 81030 CASAVA_Build 14 19262989 6I ATCCTTCTGA ------/AAAAAC ACTCTTTATT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 AAAAAC 0 1 81031 CASAVA_Build 14 19263139 5I TATCAGGTTG -----/TTTAT TTTATCTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 TTTAT 1 2 81032 CASAVA_Build 14 19272662 6D TCTGGGTATG TAATTC/------ TTTCAACAGT 3070 het 3070 hom 33 13 18 4 TAATTC 1 0 81033 CASAVA_Build 14 19280152 1D AGTTATGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1604 hom 19 5 11 3 A 13 12 81034 CASAVA_Build 14 19281386 3D AACAGCAGCA GCC/--- TAGGGAATCC 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 GCC 1 0 81035 CASAVA_Build 14 19281790 3I GGCATTGATC ---/ATT ATTTTTAAAT 2866 het 2866 ref 28 13 7 8 ATT 1 2 81036 CASAVA_Build 14 19282060 1D TCTTTTTACT A/- AAATCCTCTT 3070 het 3041 hom 16 8 7 2 A 4 3 81037 CASAVA_Build 14 19282317 1I CAAATTTCCT -/C CCTCTAATAA 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 C 2 3 81038 CASAVA_Build 14 19283043 1I TATTGTCATT -/A AAAAAAATCC 1910 het 1910 ref 15 9 4 2 A 7 8 81039 CASAVA_Build 14 19284411 2D TAGCAAATCT TC/-- TTTATTTTCT 3070 het 3070 ref 53 33 14 11 TC 1 0 81040 CASAVA_Build 14 19284908 1I AGAGATTTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 8 9 81041 CASAVA_Build 14 19285402 4I AATTCTTCTT ----/TCTC TAGGTCACTT 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 TC 0 2 81042 CASAVA_Build 14 19289533 2D GTTAGTAGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 9 13 T 12 10 81043 CASAVA_Build 14 19289772 1D CATTTGGATC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 8 hom 28 1 14 13 T 9 8 81044 CASAVA_Build 14 19296080 8D TATCTATCAT CTATCTAG/-------- CTATCTATCT 2795 het 2795 ref 18 12 7 4 CTATCTAG 1 0 81045 CASAVA_Build 14 19301872 1I AAACCACTTT -/A AAAAAAAAAT 2946 het 2946 ref 24 12 8 4 A 9 10 81046 CASAVA_Build 14 19305479 3D ATTTCTCATC ATT/--- GAGTACAATG 3070 het 3070 ref 44 33 7 4 ATT 1 0 81047 CASAVA_Build 14 19315252 1D GTTCTTATGC T/- TCTACTAGTT 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 T 2 1 81048 CASAVA_Build 14 19316827 1I TCTTTTGATT -/A AAATCTTCCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 3 4 81049 CASAVA_Build 14 19319543 4D GTTTATTGAG TAAC/---- TACTCTGCAG 1656 het 1656 ref 39 33 4 3 TAAC 1 0 81050 CASAVA_Build 14 19333429 1I TAGCTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 2859 het 2859 ref 23 15 6 2 T 9 10 81051 CASAVA_Build 14 19339805 1I AATGATAATA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 8 9 81052 CASAVA_Build 14 19345092 3I AGTAAATAAG ---/ATA ATAAGAGGAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 ATA 1 2 81053 CASAVA_Build 14 19345588 1D AATCAATAAT A/- AAAAAAGCCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 6 81054 CASAVA_Build 14 19346823 1I AGAAATATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 10 11 81055 CASAVA_Build 14 19351841 3D TTTCTTCACC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 29 1 21 7 T 14 11 81056 CASAVA_Build 14 19354185 1D ATACAGGCTC T/- TTTTTTGTTC 3070 het 3070 ref 23 9 7 7 T 7 6 81057 CASAVA_Build 14 19368851 2D CACTGTTCTA CT/-- CTCTCCTTCG 3070 hom 39 het 26 0 14 13 CT 3 2 81058 CASAVA_Build 14 19372900 2D CCTGAGTAGC CA/-- CAGAGGGTGA 3070 het 3070 ref 32 19 8 8 CA 2 1 81059 CASAVA_Build 14 19382180 1I AATTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 11 12 81060 CASAVA_Build 14 19383422 1I TGGCACTGTC -/A AGACAGTTAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 1 2 81061 CASAVA_Build 14 19385669 1I TTCTCAGATC -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 7 8 81062 CASAVA_Build 14 19385888 2I AATGTTGTAG --/AC AGTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 AC 0 1 81063 CASAVA_Build 14 19388200 1I CTAAGCAAAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 8 9 81064 CASAVA_Build 14 19389803 24I5M1I CTCTGCTGCC ------------------------ACTGC-/ATCTCCCTAGACAAGGCAGTCTCTACTGCA TAGTAGTACC 3070 het 3070 hom 38 17 25 4 N/A 0 0 81065 CASAVA_Build 14 19393052 1D CTGTAAGATC G/- AACTTTTTTT 795 het 795 ref 24 7 4 13 G 1 0 81066 CASAVA_Build 14 19394738 2I GAAACAACAA --/AT ACAAGCCTGA 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 AT 0 1 81067 CASAVA_Build 14 19406522 1I AAGCACACCA -/G GGCAATCATG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 G 2 3 81068 CASAVA_Build 14 19409658 4I AAGTTTTGAC ----/TATT TATATTTCAC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 TATT 0 1 81069 CASAVA_Build 14 19418239 1I CTCTGGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 12 13 81070 CASAVA_Build 14 19419031 1I TTTCAAATTT -/A AAAAAACTAC 3070 hom 60 het 37 1 34 2 A 6 7 81071 CASAVA_Build 14 19423535 1I CAGGTTGTAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 7 8 81072 CASAVA_Build 14 19424450 1D CTTCTTTTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 T 9 8 81073 CASAVA_Build 14 19426720 1I15M3I AAAGAAACAA -TTTTTTGTTGCATTG---/TTTTTTTGTTGCATTGATT ATTACACTGT 3070 het 579 hom 37 2 24 15 N/A 0 0 81074 CASAVA_Build 14 19428584 1I CTTATAATCA -/T ATAATGCCTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 0 1 81075 CASAVA_Build 14 19429410 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 2127 het 240 hom 21 4 10 7 TC 0 1 81076 CASAVA_Build 14 19434909 1D AGGTCACTTC T/- GGTTGAACAT 3070 het 3070 ref 47 26 17 7 T 1 0 81077 CASAVA_Build 14 19436211 2D AATTATGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 19 9 8 3 T 12 10 81078 CASAVA_Build 14 19437858 1D CCCCCCCCCC T/- CAGAAAGTCA 3070 het 1049 hom 26 6 12 8 T 1 0 81079 CASAVA_Build 14 19440114 1D ACATATTTTT C/- CCCCCCAGAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 6 C 7 6 81080 CASAVA_Build 14 19442401 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 18 8 10 2 ATA 4 3 81081 CASAVA_Build 14 19443375 1D TTGCTTGAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 10 9 81082 CASAVA_Build 14 19453389 1I CCCTACACAA -/G TAAAATGCAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 0 1 81083 CASAVA_Build 14 19454839 1D GAAGGACACG A/- AAAAATGGAT 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 A 6 5 81084 CASAVA_Build 14 19455851 1I AAATTAAGAG -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 A 6 7 81085 CASAVA_Build 14 19458177 3I TTCAAAAGTT ---/AAG AAGAATGTTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AAG 1 2 81086 CASAVA_Build 14 19460070 1I TATGAGACTC -/T CCCCCCCCAA 3070 het 53 hom 26 3 17 6 T 0 1 81087 CASAVA_Build 14 19460589 1D GCCTATGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 11 10 81088 CASAVA_Build 14 19470949 3D28M3I TTTATATAAA AATAATAATATTTATAACACTTATAAATATA---/---AATAATATTTATAACACTTATAAATATATAT TATTTATAGC 3070 hom 24 het 9 0 9 2 N/A 0 0 81089 CASAVA_Build 14 19471231 1D GTGTAAAGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 10 9 81090 CASAVA_Build 14 19475106 4I TCTTATGTAT ----/TAAG TATTTTAGTA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TAAG 0 1 81091 CASAVA_Build 14 19485695 1D ATTATCCGGC A/- TTAAAATTCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 0 81092 CASAVA_Build 14 19486020 1D TTCATTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 10 9 81093 CASAVA_Build 14 19495532 1D CCAAGCAGGG T/- TTTTAGACAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 5 4 81094 CASAVA_Build 14 19498758 2D AATTAAATGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 AT 6 5 81095 CASAVA_Build 14 19506977 1I TAGAATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 15 2 11 2 A 10 11 81096 CASAVA_Build 14 19519718 7D AAGATATGTT AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 15 0 8 7 A 19 12 81097 CASAVA_Build 14 19524122 7D AGTGAAAATT CATCCAC/------- CATCCACTGG 3070 hom 57 het 23 0 12 11 CATCCAC 2 1 81098 CASAVA_Build 14 19526482 1I TAATAAATTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 9 10 81099 CASAVA_Build 14 19527520 1D ATTGAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 36 1 29 6 A 13 12 81100 CASAVA_Build 14 19551198 1D GATTTTTCGA T/- GTTAAAATGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 1 0 81101 CASAVA_Build 14 19551666 2I TTTTACAAAC --/AT ATAATCATAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AT 1 2 81102 CASAVA_Build 14 19555534 4I TAGATCATTT ----/ATAG ATAGATTTAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 ATAG 1 2 81103 CASAVA_Build 14 19561363 3I TATGTCAAAA ---/TAC AATGGAGTAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 TAC 0 1 81104 CASAVA_Build 14 19565024 2I CTTTTAGACA --/CT CTCATTGCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CT 1 2 81105 CASAVA_Build 14 19565111 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1790 hom 21 6 10 5 T 10 11 81106 CASAVA_Build 14 19566930 7D TGTTAAAAAA GTCAAAT/------- GTCAAATATT 3070 het 3070 hom 30 9 19 7 GTCAAAT 2 1 81107 CASAVA_Build 14 19568334 3D TTATATATTC ATA/--- ATAATTAAAA 2546 het 1165 hom 10 3 7 1 ATA 2 1 81108 CASAVA_Build 14 19568929 1I CTGAGAGAGG -/A AGAATCACTT 2663 het 418 hom 13 1 7 5 A 1 2 81109 CASAVA_Build 14 19574637 1I ATTATCTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 379 hom 23 1 20 2 A 9 10 81110 CASAVA_Build 14 19577993 1D GTGGTGATAT C/- CCCTTTATCA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 C 4 3 81111 CASAVA_Build 14 19580365 1D GGTGGGGGAA G/- GGGGGAGGGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 6 5 81112 CASAVA_Build 14 19580692 1I GTCTTGATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 24 1 17 6 A 12 13 81113 CASAVA_Build 14 19583458 1D TCCCCTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 34 4 25 5 T 12 11 81114 CASAVA_Build 14 19586580 1D CTTTCTTCCT G/- GGCAGAACTT 3070 hom 95 het 38 0 30 8 G 3 2 81115 CASAVA_Build 14 19587332 1I CAGTGATGCA -/C GTTCTGTTAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 81116 CASAVA_Build 14 19596691 1D GTCTCCCCCA C/- CCTTAACAAC 3070 het 3070 ref 51 27 16 8 C 3 2 81117 CASAVA_Build 14 19596960 1D CTGTCTCCAG T/- TTTTTCTTAG 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 T 6 5 81118 CASAVA_Build 14 19597242 2I ATCAAATAAC --/AT GTGTAATAAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 AT 0 1 81119 CASAVA_Build 14 19597839 2D CTTCAAATGA TT/-- TGTAATTACT 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 T 3 1 81120 CASAVA_Build 14 19598289 19D CCAAGATGAT CATAGATTTGCTCACTGAC/------------------- CACAAGACCA 3070 het 3070 ref 33 23 12 7 CATAGATTTGCTCACTGAC 1 0 81121 CASAVA_Build 14 19599145 4I AACATAAGGA ----/TAAT TAGAGATCTG 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 TAAT 0 1 81122 CASAVA_Build 14 19602031 5I CTGCAGGAGC -----/CTTGG CTTGGCTTCA 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 CTTGG 1 2 81123 CASAVA_Build 14 19605039 1I CTTTCATGTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 A 8 9 81124 CASAVA_Build 14 19611622 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 T 8 9 81125 CASAVA_Build 14 19617165 1D CTGGGATTAC A/- GGCATCAGCC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 1 0 81126 CASAVA_Build 14 19626269 1I AGGAGGCGGA -/G CTTGCAGTGA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 0 1 81127 CASAVA_Build 14 19626478 4D AGTGTAGACA TTGT/---- TTATTTTGAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 5 TTGT 1 0 81128 CASAVA_Build 14 19631121 5D TACAGAATTT TATAA/----- TATATTTCTC 3070 het 3070 ref 45 23 22 3 TATAA 1 0 81129 CASAVA_Build 14 19633400 1I21M5I TTCACCTGAC -AAAAAATTACACATAGAACAT-----/AAAAAAATTACACATAGAACATTTTAC TTTAATCTTT 3070 het 3070 ref 49 32 20 6 N/A 0 0 81130 CASAVA_Build 14 19633544 1D ATATTTTCCA G/- GCATTCCCTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 G 2 1 81131 CASAVA_Build 14 19651864 1I AAATACATAA -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 6 7 81132 CASAVA_Build 14 19672394 4I TGTAGTATAG ----/CTCA TAGTCAGGTA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 CTCA 0 1 81133 CASAVA_Build 14 19675750 1D TTATCCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 T 11 10 81134 CASAVA_Build 14 19676937 2I AGAGAAAAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 9 11 81135 CASAVA_Build 14 19715223 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAC 2683 hom 24 het 11 0 10 1 A 10 9 81136 CASAVA_Build 14 19718396 24D CCACTGAGAG ACTGCAAGGACAGAAAGACATCTC/------------------------ ACCCTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 28 20 8 ACTGCAAGGACAGAAAGACATCTC 1 0 81137 CASAVA_Build 14 19722767 1I GTTTCAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 A 9 10 81138 CASAVA_Build 14 19729891 3D CCAACTGGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 2436 het 395 hom 30 8 8 15 T 19 16 81139 CASAVA_Build 14 19731048 1I AACAGACTGA -/T TTCCAGCTTT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 T 2 3 81140 CASAVA_Build 14 19736016 1I TCTCACTTGC -/A AAAAAAGGCC 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 A 6 7 81141 CASAVA_Build 14 19736428 1D TTTGGGGTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1486 hom 17 6 9 2 A 10 9 81142 CASAVA_Build 14 19740318 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 972 het 283 hom 9 2 3 4 A 11 10 81143 CASAVA_Build 14 19740815 2D TGGTGCTGGT GG/-- GGAGGGGGTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 G 4 2 81144 CASAVA_Build 14 19749184 2D AAGTCTGGGA AC/-- AGTGGCTCAC 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 AC 1 0 81145 CASAVA_Build 14 19751448 2D CTGCCTTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 A 16 14 81146 CASAVA_Build 14 19751544 1D ATATATCGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 30 2 19 10 A 12 11 81147 CASAVA_Build 14 19752748 1I CAATTGACCA -/T TGCATAGGTT 3070 het 3070 hom 46 14 28 4 T 1 2 81148 CASAVA_Build 14 19757627 2I TTAGAATGTA --/TC CCGAGTCTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TC 0 1 81149 CASAVA_Build 14 19759275 1D ACATCCAACC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 T 7 6 81150 CASAVA_Build 14 19763663 1I AAGTGATCCA -/C CCCCCCTACC 3070 hom 39 het 15 0 11 4 C 6 7 81151 CASAVA_Build 14 19764713 4D CAAAAATATC AATT/---- AAACCCCCAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 AATT 1 0 81152 CASAVA_Build 14 19765388 2D CTCTGTTTTC CT/-- CTCTCTGTCC 3070 het 3070 hom 38 18 17 5 CT 4 3 81153 CASAVA_Build 14 19766274 1D ACTTTAATTG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 A 7 6 81154 CASAVA_Build 14 19774077 4I TCTTTGACTT ----/AGAA AGGGAACTCC 1780 hom 15 het 6 0 5 1 AGAA 0 1 81155 CASAVA_Build 14 19779372 4D ACCAATTTTA TTTT/---- TTTCAGTTAT 3070 het 3070 ref 33 16 16 2 T 7 3 81156 CASAVA_Build 14 19783318 4D ATATGAAGTT TATA/---- TATGTAAAAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TA 3 1 81157 CASAVA_Build 14 19826182 4D AGATAGAGAC AGAT/---- AGATAGATAG 3070 hom 102 het 44 0 35 10 AGAT 5 4 81158 CASAVA_Build 14 19830273 4D AAAATTTAAC TTAA/---- TTAAACTTTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TTAA 2 1 81159 CASAVA_Build 14 19836608 1D ATGCAAGTGG T/- TCCTAACACT 3070 hom 114 het 45 0 38 9 T 2 1 81160 CASAVA_Build 14 19852536 1D AAATCCAGGT G/- GATCTTGGAT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 G 2 1 81161 CASAVA_Build 14 19927147 1I ATTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2533 het 2141 hom 22 10 7 5 A 14 15 81162 CASAVA_Build 14 19930487 1I CCAGTGAACA -/T AAAACAGAAA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 T 0 1 81163 CASAVA_Build 14 19931001 3D GCAGATCACA AGG/--- AGATCGAGAC 2595 het 1917 hom 12 6 6 0 AGG 1 0 81164 CASAVA_Build 14 19949682 1D TTTTTCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 11 10 81165 CASAVA_Build 14 19951005 2D CACATTTAAG CA/-- CAGTCTGGGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 CA 2 1 81166 CASAVA_Build 14 19958700 1D ATTCCGTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1405 hom 23 5 13 5 A 15 14 81167 CASAVA_Build 14 19969501 1D TGAGGTGGGT A/- GGATCACTTG 3070 het 1212 hom 19 3 14 2 A 1 0 81168 CASAVA_Build 14 19970119 1I GGATAACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 13 14 81169 CASAVA_Build 14 19970466 1D ATAAAGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1939 hom 21 8 10 4 A 12 11 81170 CASAVA_Build 14 19983002 1D GGTTTCACCA T/- TGCTGGTCAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 T 2 1 81171 CASAVA_Build 14 19988048 1I TCTTTTCTTT -/G TTTTTTTTTT 2066 het 1763 hom 15 7 6 3 G 0 1 81172 CASAVA_Build 14 19988528 1I TCACTGCTCC -/T TTTCATCAAC 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 T 3 4 81173 CASAVA_Build 14 19990201 1I AAAAACAATA -/G GTGGGGGACA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 G 1 2 81174 CASAVA_Build 14 20001373 9D ATCGTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 1945 het 1945 ref 20 12 5 5 A 20 11 81175 CASAVA_Build 14 20006072 1I AGTATTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 11 0 A 11 12 81176 CASAVA_Build 14 20015705 1I ACTTGTGCTT -/G GTCAGAACCT 3070 het 3070 ref 53 26 18 9 G 1 2 81177 CASAVA_Build 14 20027763 1D AGAAAGAATC G/- TTTGTGGGTG 3070 hom 143 het 55 0 44 12 G 1 0 81178 CASAVA_Build 14 20029130 1I AAGTGAACTT -/A AGTCTGTGAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 1 2 81179 CASAVA_Build 14 20070129 2D ACTGAAAAGA GT/-- GTGCTGTGGA 3070 het 3070 ref 31 19 11 2 GT 2 1 81180 CASAVA_Build 14 20087895 1D TCAAAATTTC A/- AAAAATGAGT 3070 hom 102 het 39 0 34 6 A 6 5 81181 CASAVA_Build 14 20089165 5D TTCTAAAAAT ATGAC/----- AGTTCACAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 7 ATGAC 1 0 81182 CASAVA_Build 14 20092503 1D ATTGGTGCTG T/- TATTAGTCAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 81183 CASAVA_Build 14 20093577 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1153 hom 27 3 17 7 A 12 11 81184 CASAVA_Build 14 20111632 1D AGGGTTAAAC A/- AAACTCATCT 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 A 4 3 81185 CASAVA_Build 14 20112113 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 31 het 28 1 24 3 A 8 7 81186 CASAVA_Build 14 20130880 1D ACCCCAGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 10 9 81187 CASAVA_Build 14 20130978 1D AAATGAAAGC T/- TGAAATAACA 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 T 2 1 81188 CASAVA_Build 14 20169137 9I TCTTTTGCTT ---------/GGGAAAAGG GGGAAAAGTA 3070 hom 84 het 31 0 28 4 GGGAAAAGG 0 1 81189 CASAVA_Build 14 20171077 5D GGACGAGCCC CTTTA/----- CTTTCCTTTC 3070 hom 66 het 25 0 21 5 CTTTA 1 0 81190 CASAVA_Build 14 20171773 2I AGACCCATTA --/GT GCTCTTTGAT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 GT 0 1 81191 CASAVA_Build 14 20176029 1D TCAAAAACAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 60 het 23 0 21 5 A 8 7 81192 CASAVA_Build 14 20182412 3D CTGAATGTAC TTG/--- TTGTTTCCAC 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTG 2 1 81193 CASAVA_Build 14 20182600 3D GGATAATCTC CTT/--- CTTCTCCTGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CTT 2 1 81194 CASAVA_Build 14 20183312 1I GTAGAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 26 1 20 5 A 10 11 81195 CASAVA_Build 14 20184624 12D GCGATCTCGG TTCACCACAACC/------------ TTCACCTCCC 3070 het 1679 hom 14 5 9 1 TTCACCACAACC 1 0 81196 CASAVA_Build 14 20186676 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 T 8 9 81197 CASAVA_Build 14 20191875 1I GGTGAGGAGA -/C CCCCTCCCAG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 C 4 5 81198 CASAVA_Build 14 20199870 1I CGTCTGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 609 hom 38 2 24 12 T 13 14 81199 CASAVA_Build 14 20206268 2D TTCCTGCTCT CA/-- CAGCCTCCTA 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 CA 2 1 81200 CASAVA_Build 14 20213073 1D CCCAACAGGG T/- TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 28 20 3 5 T 13 12 81201 CASAVA_Build 14 20260009 1I AGAGCCAAAG -/A AAAGTCAGTA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 3 4 81202 CASAVA_Build 14 20268188 6D ATAAAAAATA AAAAAT/------ AAAAAAAAAG 2257 het 256 hom 20 2 9 12 AAAAAT 1 0 81203 CASAVA_Build 14 20271510 1I AGCAAGGAGA -/G GGGGGAGGGC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 5 6 81204 CASAVA_Build 14 20273463 8I GCTGTGCAAG --------/GAGTTTAC GTCACATTTT 3070 hom 157 het 55 0 53 2 GAGTTTAC 0 1 81205 CASAVA_Build 14 20285053 1I CAAATTTGTG -/T TTAGCTCTCA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 2 3 81206 CASAVA_Build 14 20292180 1D ACTCCATCAC A/- AAAAAAAAAA 2561 het 600 hom 11 3 6 2 A 13 12 81207 CASAVA_Build 14 20299167 1I CAAACCTCCA -/T GGCTCTAAAC 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 0 1 81208 CASAVA_Build 14 20301120 2D CTTGCGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1309 het 1309 ref 61 44 3 16 TG 10 9 81209 CASAVA_Build 14 20318970 1I ATAAAGCTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 43 0 34 9 A 9 10 81210 CASAVA_Build 14 20325266 1D GGCAATAGCA G/- AGCCAAAGAG 3070 hom 84 het 30 0 27 3 G 1 0 81211 CASAVA_Build 14 20326039 1D CTGCAACTAG T/- TTTTTTCACC 3070 het 3070 hom 39 12 24 4 T 7 6 81212 CASAVA_Build 14 20330348 1D GATCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 33 0 24 9 A 11 10 81213 CASAVA_Build 14 20332979 1D GTTGTTGTTG T/- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 3 2 81214 CASAVA_Build 14 20344217 1I GACACTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 30 0 18 12 A 13 14 81215 CASAVA_Build 14 20352166 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1624 het 337 hom 16 5 6 5 A 15 16 81216 CASAVA_Build 14 20365658 4I ACCAGGGGTG ----/TCTT TCTTGCCTTG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 TCTT 1 2 81217 CASAVA_Build 14 20368265 1D GATTTTCATT G/- TCTCTCTGTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 1 0 81218 CASAVA_Build 14 20375085 2D AAGAGTCAAA CT/-- CTGTAACGTA 3070 hom 108 het 44 0 36 8 CT 2 1 81219 CASAVA_Build 14 20377541 2D TTGTTTTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 26 1 20 5 A 12 10 81220 CASAVA_Build 14 20379395 4I ATGACATGAT ----/ACTC AGTCAGGGAG 3070 hom 169 het 59 0 57 2 ACTC 0 1 81221 CASAVA_Build 14 20380090 5I AAAGGGAGGG -----/GAGAA GAGAAGAGAA 3070 hom 73 het 27 0 22 5 GAGAA 2 3 81222 CASAVA_Build 14 20382421 6D ATTAAAAACA TAAAAT/------ TAAAATTAAA 3070 hom 39 het 24 0 14 11 TAAAAT 3 2 81223 CASAVA_Build 14 20382723 3I ATATTTAAAA ---/TAT TAATTAGATT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TAT 0 1 81224 CASAVA_Build 14 20383576 1I AAATATATCC -/A CTTGTAGCAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 0 1 81225 CASAVA_Build 14 20383759 2D TCAAGCATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 46 0 37 11 T 12 10 81226 CASAVA_Build 14 20386821 2I TGGTGTTTCT --/GA GAGAGACTTG 3070 hom 134 het 48 0 43 5 GA 3 4 81227 CASAVA_Build 14 20387008 2I CCTGGAAGGT --/TG TCTTTGGGTA 3070 hom 129 het 48 0 42 6 TG 0 1 81228 CASAVA_Build 14 20388728 1I TTGCTATGCC -/A GCAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 0 1 81229 CASAVA_Build 14 20389672 1I GAAGAATGTT -/A AAAAAAGGAG 3070 het 3070 ref 42 19 20 4 A 6 7 81230 CASAVA_Build 14 20391224 1I TTTTACAGCC -/T TGCACTCTCA 3070 het 3070 ref 49 22 23 4 T 1 2 81231 CASAVA_Build 14 20391461 1D AGTTCTATGT G/- GGGAACCAAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 G 4 3 81232 CASAVA_Build 14 20398055 1D AACATGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 11 10 81233 CASAVA_Build 14 20399254 1I GGAGAATCAC -/T TTTGACAAGT 3070 het 1434 hom 13 4 8 1 T 3 4 81234 CASAVA_Build 14 20404332 1I AAACAAAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 0 1 81235 CASAVA_Build 14 20406473 8D ATATTTTGAA ATCTATCT/-------- ATCTATCTAT 2801 het 2524 hom 25 9 10 6 ATCT 4 2 81236 CASAVA_Build 14 20406701 1I TATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAC 2126 het 421 hom 8 1 5 2 T 5 6 81237 CASAVA_Build 14 20410565 1D ACCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2687 het 1630 hom 31 10 10 11 A 15 14 81238 CASAVA_Build 14 20412465 3D TGGTGGACTC CTT/--- CTTATTTTTG 3070 het 3070 hom 46 19 17 10 CTT 2 1 81239 CASAVA_Build 14 20419168 3D ACAAGTGATT CTC/--- CTGCTTCAGC 2598 het 2598 ref 22 12 6 4 CTC 1 0 81240 CASAVA_Build 14 20425148 4I TGGACAAGAC ----/TATA TATACATAAT 3070 het 2788 hom 17 8 9 0 TA 2 4 81241 CASAVA_Build 14 20428849 1I AGGAGTAAAG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 A 7 8 81242 CASAVA_Build 14 20478294 4D ATTCTTTTTT TTTC/---- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 TTTC 1 0 81243 CASAVA_Build 14 20484995 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1761 het 975 hom 31 6 6 19 T 19 18 81244 CASAVA_Build 14 20489664 2D CTCTACAAAC AT/-- AGAAAAATTA 3070 het 2887 hom 29 8 15 6 AT 1 0 81245 CASAVA_Build 14 20508435 1D30M2D TACTATTTGT GGGGGGGGGGAATAGGAAATAAACACTCATCTA/-GGGGGAGGGAATAGGAAATAAACACTCATC-- TATATATATG 3070 het 1736 hom 28 5 23 11 N/A 0 0 81246 CASAVA_Build 14 20518511 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 8 7 81247 CASAVA_Build 14 20521010 1D ATATTCATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2846 hom 29 7 15 8 T 10 9 81248 CASAVA_Build 14 20522161 7D TTGGGAAGTA GGTTGTT/------- GGTTGTCACA 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 GGTTGTT 1 0 81249 CASAVA_Build 14 20523125 3D AAGATCTGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1465 hom 32 8 12 12 T 13 10 81250 CASAVA_Build 14 20523788 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2648 het 877 hom 19 4 7 8 A 10 11 81251 CASAVA_Build 14 20525634 1D AATAGGCTAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 41 17 11 14 A 8 7 81252 CASAVA_Build 14 20526386 1I AGACTCGCAC -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 A 6 7 81253 CASAVA_Build 14 20526474 5D AACAGGTATC AATTT/----- AATTTAATGG 3070 het 3070 ref 39 19 17 6 AATTT 2 1 81254 CASAVA_Build 14 20528161 4D CCTGGCAGCC CCCG/---- CCCTAGCGAT 1767 het 1767 ref 20 9 9 3 CCCG 1 0 81255 CASAVA_Build 14 20530887 1I CTCATCTCTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 8 9 81256 CASAVA_Build 14 20535976 1D TCTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 2945 het 2945 ref 31 11 11 9 A 10 9 81257 CASAVA_Build 14 20558293 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1941 het 853 hom 21 10 8 3 A 17 16 81258 CASAVA_Build 14 20561585 1I CACCTCCAGA -/C CCCCTCCCTC 3070 hom 111 het 42 0 35 7 C 4 5 81259 CASAVA_Build 14 20570382 1I ATGTGGAGGT -/A AAAAGTATCT 3070 het 3070 ref 63 34 24 5 A 4 5 81260 CASAVA_Build 14 20575119 1I GCTCTTCGCT -/C CCCCCCACCC 3070 hom 93 het 36 0 30 6 C 6 7 81261 CASAVA_Build 14 20584477 17I CCATGATCTG -----------------/CACTCCAGCCTGGGTAA CACTCCAGCC 3070 hom 84 het 36 0 25 11 CACTCCAGCCTGGGTAA 0 1 81262 CASAVA_Build 14 20596927 4I AAAAGGCCCT ----/AAAA GAAACACTTA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 0 4 81263 CASAVA_Build 14 20597485 1D TTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 421 hom 32 1 26 5 T 10 9 81264 CASAVA_Build 14 20598758 1D CCTGCAGCCT C/- TCAGTGTTCG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 C 1 0 81265 CASAVA_Build 14 20602393 2D CTCTGCCCCT TG/-- GGTTCAAGCG 3070 het 2251 hom 17 6 10 1 TG 1 0 81266 CASAVA_Build 14 20604299 1D TATTTGGATC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 58 het 27 0 20 7 T 10 9 81267 CASAVA_Build 14 20605282 1I AAAAGGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 40 1 33 6 T 10 11 81268 CASAVA_Build 14 20614683 1I CATCAGTAGT -/G GGGGAGAGGA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 G 4 5 81269 CASAVA_Build 14 20624382 1D CTTTAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 11 10 81270 CASAVA_Build 14 20624928 4D AAAAGAAAAA AATC/---- AACCATGACA 3070 het 3070 hom 44 15 21 9 AATC 1 0 81271 CASAVA_Build 14 20626515 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 10 5 A 13 14 81272 CASAVA_Build 14 20626804 1I TGTCCCTAAA -/T TTCACTGTAG 3070 hom 104 het 38 0 32 6 T 2 3 81273 CASAVA_Build 14 20643579 11D AAAAATGCAA AAATTAGGCCG/----------- GCATGGTGGT 3070 het 3070 hom 23 11 12 1 AAATTAGGCCG 1 0 81274 CASAVA_Build 14 20653517 1D CTTTTTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 196 hom 35 1 23 12 A 12 11 81275 CASAVA_Build 14 20662365 1D CCATCTTTAT A/- AAAAAGGTTG 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 6 5 81276 CASAVA_Build 14 20673308 1I10M1I AAACCAAAAA -AAAAACAAAA-/CAAAAACAAAAC AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 23 3 14 7 N/A 0 0 81277 CASAVA_Build 14 20680737 2D TTGCCTTTTT TG/-- TGGGGGGGGG 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 TG 2 1 81278 CASAVA_Build 14 20683749 1D TGGTCTGTAG T/- TTTCTTTGTA 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 T 4 3 81279 CASAVA_Build 14 20699277 3D TTTTGTTTTG TTT/--- TTTTTGTTTT 440 het 78 hom 26 2 9 15 T 8 5 81280 CASAVA_Build 14 20703576 4D AGAGATATGT ATAA/---- ATATGTGGCT 3070 het 3070 hom 67 31 30 6 ATAA 1 0 81281 CASAVA_Build 14 20763440 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1979 het 1979 ref 21 6 8 7 A 11 10 81282 CASAVA_Build 14 20763451 1D AAAAAAAAAA C/- AGAGAGAGAT 1640 het 1640 ref 22 8 9 5 C 1 0 81283 CASAVA_Build 14 20795561 1I TAAGTCTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 A 12 13 81284 CASAVA_Build 14 20847940 4I ATACAAAAAT ----/TATC TAGGTGTGGT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 TATC 0 1 81285 CASAVA_Build 14 20848240 2D ATGATCATTC TT/-- TTTTTTTTAC 3070 hom 96 het 41 0 32 9 T 10 8 81286 CASAVA_Build 14 20856313 4D GTTTTACCAT GTTA/---- GTTAGGCTGG 3070 hom 32 het 13 0 10 4 GTTA 2 1 81287 CASAVA_Build 14 20888490 3D ATTCTTACTG ATC/--- ATTATAAACA 3070 het 3070 hom 44 18 23 4 ATC 1 0 81288 CASAVA_Build 14 20902231 2I AAATCAGTTC --/CT GCTGAGGGAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CT 0 1 81289 CASAVA_Build 14 20904656 4I GTCCACTCAC ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 23 9 T 11 15 81290 CASAVA_Build 14 20913257 1I AAGTGATCCG -/C CCCCCACTTG 3070 hom 27 het 11 0 10 2 C 5 6 81291 CASAVA_Build 14 20913486 12I ATTCTAGACA ------------/CAAGTCCCTTAT CAGGATCTGC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 CAAGTCCCTTAT 0 1 81292 CASAVA_Build 14 20915623 4D TGGTGAGCTT TTTA/---- TTTATTCTTT 3070 hom 41 het 21 0 14 7 TTTA 2 1 81293 CASAVA_Build 14 20919608 2D TTGGGATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 24 1 19 4 T 14 12 81294 CASAVA_Build 14 20920677 4D ATAATATGAC ACTG/---- AGAGAAGCTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ACTG 1 0 81295 CASAVA_Build 14 20922082 1I CAGCGTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 21 0 15 6 T 10 11 81296 CASAVA_Build 14 20924836 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2891 het 445 hom 18 3 11 4 A 16 15 81297 CASAVA_Build 14 20928768 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2919 het 7 hom 22 1 12 9 A 16 14 81298 CASAVA_Build 14 20928920 1D GTGGGAATAG A/- GTGGTAATGC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 1 0 81299 CASAVA_Build 14 20930974 1I AGTTTCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1679 hom 25 4 13 8 A 15 16 81300 CASAVA_Build 14 20939546 1I TAAAGCTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 33 1 27 5 T 10 11 81301 CASAVA_Build 14 20988685 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 A 10 9 81302 CASAVA_Build 14 21002410 1D GGCGGGGAAG A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 9 A 7 6 81303 CASAVA_Build 14 21006603 1D CAGTAGATAG A/- AAAAAAAAAA 1934 het 1934 ref 42 25 5 12 A 13 12 81304 CASAVA_Build 14 21012443 6D AAACACTAAT AAAAAC/------ AAAACTACTA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AAAAAC 1 0 81305 CASAVA_Build 14 21016512 1D AGTGTTCGTT A/- AAAAAGTTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 5 81306 CASAVA_Build 14 21017026 3I TTACCCAGGC ---/TGG TCTTTAACTC 3070 hom 27 het 16 0 9 7 TGG 0 1 81307 CASAVA_Build 14 21020857 1I TACCCTATCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 10 81308 CASAVA_Build 14 21021802 4D TTTTGTTATT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 36 0 32 7 TG 8 6 81309 CASAVA_Build 14 21029131 4D GCCTATTTTT TTTC/---- TTTCTTTTTC 3070 hom 10 het 20 1 19 3 TTTC 2 1 81310 CASAVA_Build 14 21031405 1D CTTGCAGCAG T/- TGACTTCTCT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 T 2 1 81311 CASAVA_Build 14 21034032 1I CCATACAGTG -/A AACCCCATCT 3070 hom 49 het 19 0 17 2 A 2 3 81312 CASAVA_Build 14 21040977 2D CACTCCCCCA TG/-- TGTGTGACAA 3070 hom 150 het 58 0 50 9 TG 4 3 81313 CASAVA_Build 14 21043108 1I GAACATGGTG -/A AACCCAGTGT 3070 hom 53 het 22 0 18 4 A 2 3 81314 CASAVA_Build 14 21051162 4D AAAAAATAGT TTGA/---- TTGGCATGGC 3070 het 3070 hom 28 12 16 1 TTGA 1 0 81315 CASAVA_Build 14 21058519 1I TGTGACAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 9 10 81316 CASAVA_Build 14 21059313 15I CCACCTGGAG ---------------/CTGGTCTCCCAAAGT CTGGGACTCT 3070 hom 95 het 34 0 31 3 CTGGTCTCCCAAAGT 0 1 81317 CASAVA_Build 14 21059547 2I GAGAATGTCC --/AG ACATTCACAA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 AG 0 1 81318 CASAVA_Build 14 21070277 1I GAGGCTAACA -/G GGGCTAAGGG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 G 3 4 81319 CASAVA_Build 14 21070451 3I ACACATATTT ---/TAC TACAATAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 TAC 1 2 81320 CASAVA_Build 14 21071574 2I AGAGAGAAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 18 8 T 11 13 81321 CASAVA_Build 14 21073342 5D GAAAAAAAGA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3067 het 1138 hom 23 4 14 7 AAAAG 3 2 81322 CASAVA_Build 14 21073927 4D GGTTTAGTGG GTTT/---- AGTGAGCACT 3070 het 3070 ref 50 28 20 2 GTTT 1 0 81323 CASAVA_Build 14 21076774 1I TGAATCTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 12 14 8 T 9 10 81324 CASAVA_Build 14 21088177 4I AACCTCCCAA ----/AGTG AGTGATTACA 2228 het 2228 ref 31 16 7 8 AGTG 1 2 81325 CASAVA_Build 14 21102821 1I ATGTCTGGGA -/T TTTAAGTAAA 3070 het 3070 hom 49 17 22 10 T 3 4 81326 CASAVA_Build 14 21106670 3D GGTCTCTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 1671 het 96 hom 9 1 6 2 T 14 11 81327 CASAVA_Build 14 21109654 1D TTCGCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 11 17 T 12 11 81328 CASAVA_Build 14 21117212 1I AATTTTTTAA -/T TTTTTTAATT 3070 het 2931 hom 19 8 8 3 T 6 7 81329 CASAVA_Build 14 21119238 2D TGGGCATGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2188 hom 21 8 11 3 T 15 13 81330 CASAVA_Build 14 21122398 3I GAAGCACATC ---/ATA ATAACTGGAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 ATA 1 2 81331 CASAVA_Build 14 21159230 1I TGAATATATT -/A AAGATTATTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 81332 CASAVA_Build 14 21174291 4D TTAATAAGTT TAAC/---- TAATCTCTAT 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 TAAC 1 0 81333 CASAVA_Build 14 21175639 1I TAGGCGTGAG -/C CACCGCGCCC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 1 2 81334 CASAVA_Build 14 21177995 1I GCCTTTATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 9 10 81335 CASAVA_Build 14 21194159 1I CATAGCGAAG -/C CCCTGTCTCT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 C 3 4 81336 CASAVA_Build 14 21200195 1D CTTAAGTATA T/- TCTTTGCTCA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 2 1 81337 CASAVA_Build 14 21206539 1I TAAGCATGCC -/T TTTTTAGCGA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 5 6 81338 CASAVA_Build 14 21208402 2D AAGGACGTGG GT/-- GTGTCAATGC 3070 hom 163 het 65 0 53 12 GT 3 2 81339 CASAVA_Build 14 21210663 1D GAAGAGCTGA C/- CCAAGAATGG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 C 3 2 81340 CASAVA_Build 14 21213885 2D GGCTGGGGAT TG/-- TGTGGTAAGT 3070 het 3070 ref 42 23 14 7 TG 3 2 81341 CASAVA_Build 14 21215355 2I TAAAAAATCA --/CT GTTTATCTTC 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 CT 0 1 81342 CASAVA_Build 14 21220517 2D CTTCATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 25 0 18 9 T 13 11 81343 CASAVA_Build 14 21223515 1D CATGGTCAAC T/- TTTTTTTTGT 2211 het 2211 ref 14 7 6 1 T 9 8 81344 CASAVA_Build 14 21231836 1I GATGCTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 10 11 81345 CASAVA_Build 14 21234097 2D GTTTTTTTTT TG/-- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 25 10 9 8 TG 1 0 81346 CASAVA_Build 14 21237287 1I CTAAATAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 10 11 81347 CASAVA_Build 14 21240288 2D25M1I TATGATAGGC CTCTCAAAAACAAGTCTCAATAAATTT-/--CTCAAAAACAAGTCTCAATAAATTTA AGAAAACTGA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 N/A 0 0 81348 CASAVA_Build 14 21240386 1I ATGTCTTGGG -/T TTCCACACTT 3070 hom 27 het 21 0 10 11 T 2 3 81349 CASAVA_Build 14 21254506 1I GGAGAATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 11 12 81350 CASAVA_Build 14 21255773 1I TTCCATAAAT -/A AAATCCTTCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 3 4 81351 CASAVA_Build 14 21259253 6D AAGAATAAGA AGGAGG/------ AGGAGGAGGA 2631 het 2631 ref 34 12 12 13 AGG 8 6 81352 CASAVA_Build 14 21263393 1D AGGAACGTGC A/- AATTAAGACC 3070 het 3070 hom 40 13 26 1 A 3 2 81353 CASAVA_Build 14 21265528 1I TCAGATCTAC -/T TTTGAACTCT 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 3 4 81354 CASAVA_Build 14 21270662 1I TTATCAATGA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 6 7 81355 CASAVA_Build 14 21271693 1I TTGTAGATGG -/C CATCTTCTCC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 C 1 2 81356 CASAVA_Build 14 21277350 4D GGTCTGTGAC AAAA/---- AGATCAATAA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 5 1 81357 CASAVA_Build 14 21282600 2D TGTTATCAGC AG/-- AGTCATACTT 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 AG 2 1 81358 CASAVA_Build 14 21284576 1D CAAGTTCTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 T 10 9 81359 CASAVA_Build 14 21313729 1D CACAATGAGG A/- AAAAATCATG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 6 5 81360 CASAVA_Build 14 21345057 4I ACATAAATAA ----/AAAT AAATAAAAAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AAAT 1 2 81361 CASAVA_Build 14 21349310 1D GGTGTCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 13 12 81362 CASAVA_Build 14 21351887 1I TTATGCAGCC -/A AAAAACACAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 5 6 81363 CASAVA_Build 14 21354544 1I ACTTTGACTC -/T TTCATTTTTC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 2 3 81364 CASAVA_Build 14 21357569 1I TTTTACTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 11 21 9 T 10 11 81365 CASAVA_Build 14 21363395 1I CATAGCGAAG -/C CTGGTCTCTG 3070 hom 68 het 28 0 23 5 C 1 2 81366 CASAVA_Build 14 21377315 1D ATTTCCTTTG T/- TCGCCGTTGT 3070 hom 105 het 41 0 36 7 T 2 1 81367 CASAVA_Build 14 21378025 1I GAAGGGCCTG -/C CCAGGCCATC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 C 2 3 81368 CASAVA_Build 14 21399950 2I CAAAAAGAAA --/CT CTGAGGAGCT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 CT 1 2 81369 CASAVA_Build 14 21416234 1I GAGTCCTCCG -/T TGAGTCTGAG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 1 2 81370 CASAVA_Build 14 21419733 1D CTAAATGAAG A/- AAAAAACACT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 7 6 81371 CASAVA_Build 14 21427222 3D TCAAAAATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 22 0 10 12 T 17 14 81372 CASAVA_Build 14 21427548 4D AAAAATTCTT TTAA/---- TTATAGAAAC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTAA 1 0 81373 CASAVA_Build 14 21429789 4D CTTCTTCTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 18 1 10 7 T 18 14 81374 CASAVA_Build 14 21429869 2D TATTTCTTCT AA/-- AAAAAAACAG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 9 7 81375 CASAVA_Build 14 21437938 1I GTATTGATCT -/A TTTTCAATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 81376 CASAVA_Build 14 21444942 1D CTACATCGTA T/- TTTTTATCTG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 6 5 81377 CASAVA_Build 14 21446067 1I GAATAGCAGA -/G ATTTCTTTTC 3070 hom 69 het 24 0 22 2 G 0 1 81378 CASAVA_Build 14 21447442 4I GGTAACTGAT ----/AGTC AGATATTATG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AGTC 0 1 81379 CASAVA_Build 14 21448795 7I TAGCTTATAA -------/GATATTC AACATTGCAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GATATTC 0 1 81380 CASAVA_Build 14 21448993 2D TGCATGTTAC TT/-- TTTTTTTACC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 9 7 81381 CASAVA_Build 14 21453394 1D TTTAAACAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2799 hom 34 8 17 10 T 10 9 81382 CASAVA_Build 14 21459846 1D ACTGTCCTAG A/- AAAAACATGT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 A 6 5 81383 CASAVA_Build 14 21466896 1I GCCAAATGTA -/T TTTTTACAGC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 5 6 81384 CASAVA_Build 14 21467425 1I TATTCAATTG -/T TCAAGTGACA 2580 het 2580 ref 21 15 6 0 T 1 2 81385 CASAVA_Build 14 21476818 11D TTTTACAGTT CTTCTTGTATA/----------- CTTCTTTCAC 3070 het 3070 ref 38 20 15 8 CTTCTTGTATA 1 0 81386 CASAVA_Build 14 21477927 3D7M1I GTAAGAGACA TATTTCAGCT-/---TGGAGATG GCATTTAGTC 3070 het 3070 hom 48 24 25 3 N/A 0 0 81387 CASAVA_Build 14 21479358 6D GCTAAACAGA TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 51 het 22 0 17 7 TC 11 8 81388 CASAVA_Build 14 21482816 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 22 0 10 12 T 13 11 81389 CASAVA_Build 14 21485221 9D GCAAGTAAAG GCTCTGAGA/--------- GCCTGATGGT 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 GCTCTGAGA 1 0 81390 CASAVA_Build 14 21493377 1D GATAATGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 T 13 12 81391 CASAVA_Build 14 21503139 1D ATTGTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 7 T 11 10 81392 CASAVA_Build 14 21511981 1I TCTCTAGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 9 10 81393 CASAVA_Build 14 21513176 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 7 6 81394 CASAVA_Build 14 21513253 1I CTCTATCCTT -/A AACTCCAGGG 2088 het 2088 ref 29 19 5 5 A 2 3 81395 CASAVA_Build 14 21518160 1D AACCAACATG T/- TTAAGATATT 3070 het 3070 ref 27 12 14 1 T 3 2 81396 CASAVA_Build 14 21530635 1D TTTCATTCTT A/- TCTCCCAAAT 3070 hom 75 het 28 0 25 4 A 1 0 81397 CASAVA_Build 14 21540534 1I ATGATGTGAT -/A AGGACAGAAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 1 2 81398 CASAVA_Build 14 21540754 1D TCACATTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 80 het 29 0 25 4 T 9 8 81399 CASAVA_Build 14 21553144 1D TAGAATCTGC T/- TTTTTTTTTT 2969 het 1776 hom 21 8 8 5 T 15 14 81400 CASAVA_Build 14 21566624 1I AATTTATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 11 12 81401 CASAVA_Build 14 21574391 1I ATGAAACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1652 hom 37 4 21 12 A 13 14 81402 CASAVA_Build 14 21581860 1D AAATACAATT G/- GGTTTTTACA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 G 3 2 81403 CASAVA_Build 14 21582255 1I AAATGCAGGG -/A GGCCTAGAAA 3070 hom 77 het 35 0 29 6 A 0 1 81404 CASAVA_Build 14 21583082 1D11M1D GGATAGACAA GGCCTTTTAGTTG/-GCCTTTTAGTT- GCAGACTTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 3 N/A 0 0 81405 CASAVA_Build 14 21584786 1I CACTGAAAGT -/G GCCCAGAGGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 81406 CASAVA_Build 14 21593681 1D ATTCAATCAA G/- GAAAAAAATT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 2 1 81407 CASAVA_Build 14 21595650 5D TTTCTCAAAA AACTT/----- AACTTAAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 5 AACTT 2 1 81408 CASAVA_Build 14 21596024 1D ACACAAAACT G/- GGGAACAATA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 G 4 3 81409 CASAVA_Build 14 21597494 1I GCAGCGAGTT -/A TCCAGAAGAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 1 81410 CASAVA_Build 14 21598482 1D TGCCAGTTTT A/- AAAAGATCCA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 5 4 81411 CASAVA_Build 14 21599845 5I CATAATTTTA -----/TCATT TCAAGAATGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TCATT 0 1 81412 CASAVA_Build 14 21607998 1I AGGAAGACAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 8 9 81413 CASAVA_Build 14 21610316 1D TTACCTATCC T/- TTTTACTTTC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 5 4 81414 CASAVA_Build 14 21610606 1D TCATTCCTTT A/- ATTTTTTTCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 2 1 81415 CASAVA_Build 14 21611694 1I TTTTTGTTCC -/T TTTTCTTCCT 3070 het 267 hom 29 1 25 3 T 4 5 81416 CASAVA_Build 14 21612560 1I CCATCCAATA -/G GCTGCGCAGC 3070 hom 42 het 15 0 13 2 G 1 2 81417 CASAVA_Build 14 21618047 1D GTATTTCACA G/- CATTGAGTAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 1 0 81418 CASAVA_Build 14 21623536 1D ATATAAATAC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 A 8 7 81419 CASAVA_Build 14 21638788 8D TGTATTTATG TATTTATT/-------- TATTTATTTA 2691 het 2416 hom 16 8 7 1 TATT 6 4 81420 CASAVA_Build 14 21643665 1I GACTCTTTTT -/A TAAAAAAACA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 0 1 81421 CASAVA_Build 14 21649382 1I AAACACACAC -/T TTTTTTTTTT 2243 het 2243 ref 25 11 7 7 T 10 11 81422 CASAVA_Build 14 21653278 8D29M1I CTCTCTTTCT TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTTTTTTCTTTC-/--------TTCCTTCCTTCCTTTCTTTTTTTTCTTTCT TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 9 0 11 2 N/A 0 0 81423 CASAVA_Build 14 21677687 1I GAGAAAAAAG -/A AAAAAATAGA 3070 het 1528 hom 25 4 18 3 A 6 7 81424 CASAVA_Build 14 21680296 1I AGCCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 236 hom 11 1 7 3 A 9 10 81425 CASAVA_Build 14 21680431 1I AAATTGGGTA -/G AACAGATTTC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 G 0 1 81426 CASAVA_Build 14 21682069 7I TCTATTTCTC -------/TCGCTTG TCACTGAGCT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 TCGCTTG 0 1 81427 CASAVA_Build 14 21687508 1I CAAGATGATA -/T AGCAAAATGC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 0 1 81428 CASAVA_Build 14 21719775 3I AATGCTGGTG ---/TTA TTATGATTTC 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 TTA 1 2 81429 CASAVA_Build 14 21726111 1I ATCACTCGCC -/A AAAAAAAAAA 1656 het 1656 ref 34 23 6 5 A 13 14 81430 CASAVA_Build 14 21726818 1I ATAGATTATG -/T TTTTTTTTTT 1929 het 1929 ref 21 10 6 5 T 11 12 81431 CASAVA_Build 14 21752714 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1418 het 1418 ref 21 12 4 5 A 15 14 81432 CASAVA_Build 14 21753364 1D CTCTTTGGTT A/- AAATGTATTT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 4 3 81433 CASAVA_Build 14 21753438 1D TGATTTTTTT C/- CTTAGCTTGG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 2 1 81434 CASAVA_Build 14 21753704 1D TGGTGAGAGT G/- GGACATCCTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 3 2 81435 CASAVA_Build 14 21760436 1D CATTTTTAGT C/- GTATGTAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 1 0 81436 CASAVA_Build 14 21763195 1I21M1I ACTCTGTCTC -AAAAAAAAAAAAAGTTACATC-/AAAAAAAAAAAAAAGTTACATCA ATTAAGGGGC 3070 hom 30 het 14 0 11 6 N/A 0 0 81437 CASAVA_Build 14 21763480 1D TCATTGTCAC A/- AAAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 7 6 81438 CASAVA_Build 14 21767910 7I CCTTATATTA -------/CTGTGTG CTGAGATGCA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 CTGTGTG 0 1 81439 CASAVA_Build 14 21773227 1I GTGCAGTCAA -/C CCCCTGTCCA 2798 het 2798 ref 27 15 6 6 C 4 5 81440 CASAVA_Build 14 21783168 1D CCCTAAACTG A/- AAAAATGTGA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 6 5 81441 CASAVA_Build 14 21793283 1D ATTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2557 het 1686 hom 29 9 8 12 T 15 14 81442 CASAVA_Build 14 21801945 1I TCTTTCTAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 8 9 81443 CASAVA_Build 14 21830306 1D AGCTGCCATA T/- ACAATCATAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 0 81444 CASAVA_Build 14 21837510 1D AAAAAAATCC T/- GAATTCTGCC 3070 het 2584 hom 23 6 16 2 T 1 0 81445 CASAVA_Build 14 21837618 2I AGAAAAAAAC --/AT ATTGCATTCC 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 AT 1 2 81446 CASAVA_Build 14 21839760 1I AATAGAAACT -/G GGGACTACTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 G 3 4 81447 CASAVA_Build 14 21874024 1I CTCTCCATTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 9 10 81448 CASAVA_Build 14 21874872 1D TATCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 11 10 81449 CASAVA_Build 14 21877635 1I CTGTCTAAGC -/T TTGTCTCCCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 3 81450 CASAVA_Build 14 21880432 1D TATGTAAACT A/- AAAAAAAAAA 1237 het 1237 ref 28 23 3 3 A 11 10 81451 CASAVA_Build 14 21885065 1I ATTTGGGCTC -/T TTTTTTTTTC 2618 hom 15 het 9 0 6 3 T 9 10 81452 CASAVA_Build 14 21897301 1D GATGCCTTTT A/- ATTTCTTTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 2 1 81453 CASAVA_Build 14 21898356 1D GTGGTGGTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 61 het 24 0 21 3 T 10 9 81454 CASAVA_Build 14 21914596 1I36M1I TATCTCGAGT -CAATATACAATACAAGGAAATTAATATACCACTTTA-/ACAATATACAATACAAGGAAATTAATATACCACTTTAC CCTGGTGGCA 3070 hom 60 het 23 0 21 4 N/A 0 0 81455 CASAVA_Build 14 21914709 1I29M1D TTCATATTGG -AAGGAATGTATTCTATGACCTAGCAATTAC/AAAGGAATGTATTCTATGACCTAGCAATTA- CTGCGTCCCA 3070 hom 84 het 25 0 28 2 N/A 0 0 81456 CASAVA_Build 14 21927889 1D AACAGAGCTT C/- CTTTCATCTA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 C 2 1 81457 CASAVA_Build 14 21930180 1I GGGGGAGCCA -/C CCGGAACCCC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 2 3 81458 CASAVA_Build 14 21938425 1I4M1I CATAAGAAGC -AAGC-/AAAGCA AAAATTATGG 3070 hom 79 het 29 0 26 3 N/A 0 0 81459 CASAVA_Build 14 21942029 11D CGGGCATTAG GACACAGAGTA/----------- GACATAACGT 3070 hom 33 het 13 0 12 3 GACACAGAGTA 1 0 81460 CASAVA_Build 14 21942507 1I TTGCTTTTGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 8 9 81461 CASAVA_Build 14 21944795 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 18 0 13 5 T 11 12 81462 CASAVA_Build 14 21954375 1I CATTTCAGGG -/A ACTGGACACA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 1 2 81463 CASAVA_Build 14 21954673 16I TGTAAGGAAT ----------------/CCCAGCTAGTGGGCTC CCCAACTGAA 3070 hom 30 het 14 0 10 4 CCCAGCTAGTGGGCTC 0 1 81464 CASAVA_Build 14 21958819 1D ATAATTTTCT A/- AGAAAGACAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 2 1 81465 CASAVA_Build 14 21966052 1D ATTATACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 11 10 81466 CASAVA_Build 14 21967269 1D TAACTTTCAG A/- AAAAGAAATG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 5 4 81467 CASAVA_Build 14 21969993 1I AGTAGAGCGG -/T TTCACCCTCT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 2 3 81468 CASAVA_Build 14 22016249 1I CTTTCCCAGT -/G GGGTTGATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 3 4 81469 CASAVA_Build 14 22024046 1I TCACACCCCT -/G GGGGACAGGG 3070 hom 55 het 23 0 18 5 G 4 5 81470 CASAVA_Build 14 22031963 1I GTTAAATTTG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 8 9 81471 CASAVA_Build 14 22033473 1I CTGGCCAGAG -/C CCAGCTGCCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 2 3 81472 CASAVA_Build 14 22034484 1I TGCACCATTT -/G GGGACCTGTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 3 4 81473 CASAVA_Build 14 22034681 1I CTGCCATGCT -/G GGAGGTGGCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 2 3 81474 CASAVA_Build 14 22034959 1D25M1D TTGATGAATT CCTGGCAATCTTAAGGATTAGGTCAAC/-CTGGCAATCTTAAGGATTAGGTCAA- GAAGAAGTAG 3070 hom 57 het 22 0 19 5 N/A 0 0 81475 CASAVA_Build 14 22037178 1I GAACCCGGGA -/G GCAGAGATTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 1 2 81476 CASAVA_Build 14 22037349 1I3M1D4M1I GCTTTCTTCC -CTATCGAG-/TCTA-CGAGA ATAGCAGAAC 3070 hom 75 het 25 0 26 3 N/A 0 0 81477 CASAVA_Build 14 22039978 1D CCAGAAGGTG T/- TGACCAGCAC 3070 hom 66 het 26 0 21 5 T 2 1 81478 CASAVA_Build 14 22041546 1I ACGCTAGTGA -/C CGTGCTAGAG 3070 hom 117 het 46 0 39 7 C 1 2 81479 CASAVA_Build 14 22041733 1D AGAGTCTTCA G/- GGAGCATCTT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 G 3 2 81480 CASAVA_Build 14 22042624 1D GACAACTTTA C/- CAAGTAAAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 6 C 2 1 81481 CASAVA_Build 14 22043053 1I ATATGTTTTT -/G TTGGGGGGAA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 G 0 1 81482 CASAVA_Build 14 22043991 1D CACCGTTATT C/- CCCTGTAAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 4 3 81483 CASAVA_Build 14 22044703 1I GAGAAACAGA -/T TCTGAGTATC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 2 81484 CASAVA_Build 14 22044884 1D53M1I CACAGCCAGG AAAAATTTCTTTCCCCTAGAACTTGTGTGTGCTCACCAAGCAAAGCGTGACTAA-/-AAAATTTCTTTCCCCTAGAACTTGTGTGTGCTCACCAAGCAAAGCGTGACTAAT TTTGACATCC 3070 hom 114 het 35 0 38 15 N/A 0 0 81485 CASAVA_Build 14 22045185 1I TGGCTCAGGG -/C CCTGAGGGAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 C 2 3 81486 CASAVA_Build 14 22047713 1I61M1D AGAGAGCAGA -CCAGGTTGTTAGGGAATATCTAATTCCCTCTGATATGGTTAAAACTCTTTGCCAAGGGCAGA/GCCAGGTTGTTAGGGAATATCTAATTCCCTCTGATATGGTTAAAACTCTTTGCCAAGGGCAG- AACCAGCCTC 3070 hom 120 het 23 0 40 3 N/A 0 0 81487 CASAVA_Build 14 22048292 1I GAAGCGACAG -/C CACCCTTAGG 3070 hom 92 het 41 0 34 7 C 1 2 81488 CASAVA_Build 14 22050049 1I TTAACATTGT -/G GCTTAGCCCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 2 81489 CASAVA_Build 14 22051910 1I CTCCCCTCCA -/G GGCTGGAAAA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 G 2 3 81490 CASAVA_Build 14 22052578 1D TTTAATTATA C/- CCATACTTTG 3070 hom 122 het 49 0 42 9 C 3 2 81491 CASAVA_Build 14 22054272 1I69M3I CCAGGACTCT -GAGGACTCTGAGGAATGGTCTGTTCCATAGCCTGCCTCTGTAATGCCCTTCTCTCTTGCCTATTGTCCG---/GGAGGACTCTGAGGAATGGTCTGTTCCATAGCCTGCCTCTGTAATGCCCTTCTCTCTTGCCTATTGTCTGGTT GTTGTTACAG 3070 het 95 hom 34 2 33 24 N/A 0 0 81492 CASAVA_Build 14 22055328 1I TATGCACACA -/C GCATGCCCAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 81493 CASAVA_Build 14 22055666 1D CTGTACATCT G/- GGATTGAGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 3 2 81494 CASAVA_Build 14 22059493 1I ATTGCTCCTG -/A ATATATGTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 81495 CASAVA_Build 14 22060771 1I GCCTAATTCA -/T AAAGGAAGCA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 T 0 1 81496 CASAVA_Build 14 22062139 1I TGCATTGAGC -/A CAGAGGACAC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 0 1 81497 CASAVA_Build 14 22062960 1I ATCTCCGCTT -/C CACAGATGAG 3070 hom 102 het 35 0 33 2 C 1 2 81498 CASAVA_Build 14 22063119 1I GGTTTGTGTA -/G GGCGACCTCG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 2 3 81499 CASAVA_Build 14 22063623 1I AACTGCCCTG -/C AGTGGAAAGG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 81500 CASAVA_Build 14 22064651 1I GGACCCCAGT -/C CCTAGGTAGA 3070 hom 11 het 28 1 23 4 C 2 3 81501 CASAVA_Build 14 22065349 1I AGACAAAAAT -/G GCCAAGTGGG 3070 hom 120 het 49 0 41 8 G 1 2 81502 CASAVA_Build 14 22066111 1D2M1D TGCAGCCTCT GATG/-AT- AACCATTATT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 N/A 0 0 81503 CASAVA_Build 14 22066530 1D TTGACTACTT C/- CAAAGGATGC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 2 1 81504 CASAVA_Build 14 22066694 1D2M2I GCTCACTGCA CAG--/-AGCT CCGCCTCCCG 1473 hom 10 het 5 0 4 1 N/A 0 0 81505 CASAVA_Build 14 22066893 3I TACAGGCGTG ---/AGC CACCGCGCCC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 AGC 0 1 81506 CASAVA_Build 14 22067508 2I GGGGAGCAGA --/GC ATTCTTCATG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 GC 0 1 81507 CASAVA_Build 14 22067760 7I AAGTCACTCT -------/GAGAGAA GAGAGAAAAT 3070 het 2117 hom 35 8 8 19 GAGAGAA 1 2 81508 CASAVA_Build 14 22067783 1D TCTTACTTTA C/- CCTTTTCTAA 3070 hom 51 het 36 0 16 20 C 3 2 81509 CASAVA_Build 14 22068024 1I TCAAACACAG -/C CACTGCCTGG 3070 hom 78 het 31 0 24 7 C 1 2 81510 CASAVA_Build 14 22068431 1D28M1D CAACCAGGCA GGGAACTGCTCTGATCTTTGGGAAGGGAAC/-GGAACTGCTCTGATCTTTGGGAAGGGAA- CCACCTTATC 3070 hom 166 het 49 0 56 5 N/A 0 0 81511 CASAVA_Build 14 22069020 1I23M1I AAGGGGGAAT -CCAGCCAGAGCTCCCATGAGGGA-/CCCAGCCAGAGCTCCCATGAGGGAG GATAGCTGCA 3070 hom 129 het 36 0 43 6 N/A 0 0 81512 CASAVA_Build 14 22069664 1I TTTATAGAAC -/A AAAAAAAACT 2447 het 2447 ref 22 14 7 1 A 8 9 81513 CASAVA_Build 14 22071605 1D24M1I8M1I10M1I AGGACAAACG ATGGTTTTTCCAGAAATAGCCTCAC-TCCTGTTT-AAGCCTAGAC-/-TGGTTTTTCCAGAAATAGACTCACTTCCTGTTTAAAGCCTAGACT GTGGTCTCTC 3070 hom 138 het 41 0 47 6 N/A 0 0 81514 CASAVA_Build 14 22071763 1I TCTTACTGAG -/A ATATCTGCCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 1 2 81515 CASAVA_Build 14 22072106 1D GGTCCAATGG C/- CCTCTTTGGC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 3 2 81516 CASAVA_Build 14 22074588 1D24M1I ACATGTATAA TTAACAAACAGTTAAGTGTGGATGG-/-TAACAAACAGTTAAGTGTGGATGGA TAAAACTTCC 3070 hom 120 het 39 0 41 4 N/A 0 0 81517 CASAVA_Build 14 22074882 1I GGCAATCCTA -/G GCTATGGCCC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 1 2 81518 CASAVA_Build 14 22075956 2I TGTGCTCCAG --/CA CAGTGTGCAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 CA 1 2 81519 CASAVA_Build 14 22076504 1I ATGGCCACAG -/C CACCCCCATC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 C 1 2 81520 CASAVA_Build 14 22076909 1I GAGCCACACA -/G CTCTTTGCTA 3070 hom 144 het 51 0 47 4 G 0 1 81521 CASAVA_Build 14 22085233 1I44M1I GAGCAGAGAA -CACTGGGTGGGAAATTCTAATCCCCACCCTGCTGGAAACTCTCT-/CCACTGGGTGGGAAATTCTAATCCCCACCCTGCTGGAAACTCTCTG GGTGGCCCCA 3070 hom 93 het 35 0 31 14 N/A 0 0 81522 CASAVA_Build 14 22086043 1I CCAGGCCTGG -/C CGTGAACGTT 3070 hom 78 het 30 0 24 6 C 1 2 81523 CASAVA_Build 14 22088105 1I26M1I CTCGCTGCCT -CATTGGACTCTAGAATGAAGCCAGGC-/CCATTGGACTCTAGAATGAAGCCAGGCA AGAGCAGGGT 3070 hom 99 het 36 0 34 12 N/A 0 0 81524 CASAVA_Build 14 22089918 1D GTCCCCAGTC G/- GTCTTGCTGA 3070 hom 81 het 32 0 25 7 G 2 1 81525 CASAVA_Build 14 22090529 1I CCCGGCAATG -/C CACCAACTGG 3070 hom 89 het 37 0 27 10 C 1 2 81526 CASAVA_Build 14 22090661 1I GCTGCTGCAG -/C CTCCGCTGGC 3070 hom 107 het 39 0 32 7 C 1 2 81527 CASAVA_Build 14 22092056 4I AAGATGCCCC ----/AGTG AGTGAGCATT 3070 het 3070 hom 29 11 14 7 AGTG 1 2 81528 CASAVA_Build 14 22093603 1I TCGCATATCT -/G GCTCCAGGGC 3070 hom 99 het 39 0 31 8 G 1 2 81529 CASAVA_Build 14 22093699 1I GGTCAGCACT -/G GGCCTAACGC 3070 hom 134 het 48 0 40 8 G 2 3 81530 CASAVA_Build 14 22093869 2I45M1I TTGCGTGCCA --TGCAGCTGCAGCTCTACCAGCCTGGACCCAACCTCAGGCCGACAT-/GCTGCAGCTGCAGCTCTACCAGCCTGGACCCAACCTCAGGCCGACATC CCAGCAGGGA 3070 het 160 hom 28 2 19 24 N/A 0 0 81531 CASAVA_Build 14 22096047 1I CCTGTCACAT -/C CCCCCCGAAA 1998 het 1998 ref 21 8 8 5 C 6 7 81532 CASAVA_Build 14 22096210 1I GCTGGAGTCC -/G GGATCCACCA 3070 hom 66 het 23 0 21 2 G 2 3 81533 CASAVA_Build 14 22098550 1I CGGGCACGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 53 het 21 0 18 4 G 1 2 81534 CASAVA_Build 14 22098818 1I CACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2579 hom 22 10 10 2 A 13 14 81535 CASAVA_Build 14 22105079 1D ACATTACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 12 10 T 13 12 81536 CASAVA_Build 14 22108011 2I TGTCTCTCCT --/AA AAATACAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 A 3 5 81537 CASAVA_Build 14 22119682 1D CAAAAAAGGC A/- AAAAAAAAAG 769 het 769 ref 50 42 3 5 A 10 9 81538 CASAVA_Build 14 22120334 1D AAATACAAAA C/- AATTAGCCAG 2644 het 1054 hom 12 4 6 2 C 1 0 81539 CASAVA_Build 14 22134844 1D GAAATCTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 T 10 9 81540 CASAVA_Build 14 22135495 1D AATCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 12 11 81541 CASAVA_Build 14 22143310 1D GTTTTTTGTA T/- TTTTTTCTCT 2082 het 2082 ref 20 13 5 2 T 7 6 81542 CASAVA_Build 14 22148034 2I GTGAGCCACC --/GT GTGCCCAGCC 3070 het 1315 hom 17 3 9 5 GT 1 2 81543 CASAVA_Build 14 22148810 1I TTGGAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 10 11 81544 CASAVA_Build 14 22172079 3I2M4I CGAAAAAAAA ---AT----/TGGATTACA GGATATGATA 3070 het 3070 hom 53 24 27 2 N/A 0 0 81545 CASAVA_Build 14 22180586 4D37M4D AAGAAAGAAG GAAAGAAAGAAAGAAGGAAGGAAGAAATAAAGAAAAAGAAAAAAG/----GAAAGAAAGAAGGAAGGAAGAAATAAAGAAAAAGAAA---- AAAGAAAGAA 1865 het 1865 ref 16 11 6 9 N/A 0 0 81546 CASAVA_Build 14 22180769 1D CAGAGATGGT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 A 8 7 81547 CASAVA_Build 14 22184094 3D TCATATGATA ATC/--- GATCATTGCC 3070 het 3070 ref 64 38 22 8 ATC 1 0 81548 CASAVA_Build 14 22189954 1D AACGGACTGG A/- AAAAAAAAAA 1217 het 1217 ref 37 26 3 8 A 13 12 81549 CASAVA_Build 14 22198719 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 7 6 81550 CASAVA_Build 14 22199760 1I TGGGACTATT -/A AAAAAATATT 2086 het 2086 ref 22 14 5 3 A 6 7 81551 CASAVA_Build 14 22200506 10D TTTGTTCTAT ACATACACAC/---------- ACATACACAC 3070 het 3070 ref 42 24 9 12 ACATACACAC 3 2 81552 CASAVA_Build 14 22201629 2D ATGAGGGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2729 het 2729 ref 27 13 9 5 T 12 10 81553 CASAVA_Build 14 22201747 1D AAGTGATCCT C/- CCACCTCAAC 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 C 3 2 81554 CASAVA_Build 14 22201951 1I CCCAGCCTTA -/T TTTTTTTTCC 2622 het 2622 ref 19 8 9 2 T 8 9 81555 CASAVA_Build 14 22201991 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTGA 1299 het 1299 ref 20 11 4 5 T 8 9 81556 CASAVA_Build 14 22207608 4I GACTTAGTCA ----/TCTT TCTTTCTCTA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 TCTT 1 2 81557 CASAVA_Build 14 22222991 1I TATAATAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2084 hom 19 9 8 2 A 9 10 81558 CASAVA_Build 14 22235351 5I TACAGTGACC -----/TCTTA TCTTACAGGG 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 TCTTA 1 2 81559 CASAVA_Build 14 22252129 1D CTAATATCCA G/- GGGGGTAAAG 3070 het 3070 hom 45 21 20 5 G 6 5 81560 CASAVA_Build 14 22256886 1D ACTTAATGAT A/- AAAAAAAAAA 1222 het 1222 ref 43 30 4 10 A 11 10 81561 CASAVA_Build 14 22260264 4I AGTCAGAGAA ----/AAAT AAATAATGTA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 AAAT 1 2 81562 CASAVA_Build 14 22274037 1I ATGGGGAGGG -/A AAAAAAAAAA 1795 het 1795 ref 13 7 4 2 A 11 12 81563 CASAVA_Build 14 22277288 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 A 13 12 81564 CASAVA_Build 14 22280122 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTAGCAGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 4 5 81565 CASAVA_Build 14 22285068 2I TAAGTTATTA --/TG TGTTAACTAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TG 1 2 81566 CASAVA_Build 14 22294668 1D AATTTAGGCA T/- ACCAGGAGAC 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 T 1 0 81567 CASAVA_Build 14 22296823 1I GGCAACAAAA -/G CCAAAATAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 0 1 81568 CASAVA_Build 14 22298216 1D AGAGTCCCTC A/- AAAAAAAAAA 1596 het 1596 ref 43 31 4 9 A 11 10 81569 CASAVA_Build 14 22302730 3D GGCTCAGATG ATC/--- ATCAACATTT 3070 het 3070 ref 34 19 9 8 ATC 2 1 81570 CASAVA_Build 14 22302844 1D TAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 21 1 9 11 T 13 12 81571 CASAVA_Build 14 22310554 3I CAATATCCCT ---/AGC AGCAGCAGCA 3070 het 3070 hom 56 20 28 8 AGC 4 5 81572 CASAVA_Build 14 22311161 2D AAAAGAAAAC TG/-- AAGAATAGAG 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 TG 1 0 81573 CASAVA_Build 14 22314278 5D TACTTTTTGC CTTAT/----- CTTAGAGCAG 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 CTTAT 1 0 81574 CASAVA_Build 14 22316030 1I AAAACAAACC -/A AAAAAAAAAA 1622 hom 20 het 11 0 7 4 A 13 14 81575 CASAVA_Build 14 22317627 1I AAATGCCTTT -/A AAAAATTTAC 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 5 6 81576 CASAVA_Build 14 22319249 1D TGGAACCCTC G/- GGGCCCCAGA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 G 4 3 81577 CASAVA_Build 14 22323666 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1583 het 1583 ref 25 19 4 2 A 12 11 81578 CASAVA_Build 14 22325367 4I CTCCATCTAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAAC 2 3 81579 CASAVA_Build 14 22350894 7D ACTCTATCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 2648 hom 25 14 10 3 A 21 14 81580 CASAVA_Build 14 22351210 1D ACTACACCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 10 9 81581 CASAVA_Build 14 22351689 2D CTGTCTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 1204 het 1204 ref 17 8 3 6 A 18 16 81582 CASAVA_Build 14 22352749 4I TCGGCTCACT ----/GCAA GCAACCTCAG 2335 het 973 hom 17 4 5 8 GCAA 1 2 81583 CASAVA_Build 14 22356191 8I TTTTTTTTTT --------/ATTTTTTA TTTATTTATT 2674 het 2674 ref 18 8 7 3 ATTTTTTA 0 1 81584 CASAVA_Build 14 22359806 1D ACTCCAGTCC A/- AAAAAAAAAA 1376 het 1376 ref 23 16 4 5 A 12 11 81585 CASAVA_Build 14 22368850 1I GATGGCGGAG -/C CCGTGATTGA 3070 hom 87 het 33 0 27 6 C 2 3 81586 CASAVA_Build 14 22380883 1D ACAGCAAGTC T/- TACCCAACAC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 2 1 81587 CASAVA_Build 14 22391839 1D GAGGTTCATA C/- CCCCAGAACT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 C 5 4 81588 CASAVA_Build 14 22400223 1I GCACCTGGCC -/T TTTTTTTTTG 1813 het 1813 ref 15 7 5 3 T 9 10 81589 CASAVA_Build 14 22402680 1D TATAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 11 10 81590 CASAVA_Build 14 22406659 1I CGTCTCTACC -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 A 6 7 81591 CASAVA_Build 14 22409637 1D CAAAAAAAAA C/- AGATGCAATT 2179 het 2179 ref 23 14 6 3 C 1 0 81592 CASAVA_Build 14 22431971 11D TGTTCCCTTA CCAGCCCCTGC/----------- CCAGCCCCTG 3070 het 2787 hom 33 13 13 11 CCAGCCCCTGC 2 1 81593 CASAVA_Build 14 22440433 2I TTCCTTCAGT --/TA ATGCCCTATG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TA 0 1 81594 CASAVA_Build 14 22455490 1I TATTTTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 12 13 T 13 14 81595 CASAVA_Build 14 22456610 3I TTTTTCTTTT ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 het 1448 hom 24 9 14 1 TTC 2 3 81596 CASAVA_Build 14 22458635 2D TAAGCTTTGT AG/-- AGAACAGCGG 3070 het 3070 ref 35 19 12 7 AG 2 1 81597 CASAVA_Build 14 22461374 4I CTCTAATCAC ----/ACAA ACAAAGATCT 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 ACAA 1 2 81598 CASAVA_Build 14 22466310 6D AATTTGTGTT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 TTTTTG 2 1 81599 CASAVA_Build 14 22468937 13D AGTCGGTTGG GTTATGCAGCCAT/------------- GTAATGTCAG 3070 het 3070 ref 41 26 15 4 GTTATGCAGCCAT 1 0 81600 CASAVA_Build 14 22471244 1D ACTGCACTCC A/- AGCCTGGGTG 2232 het 2232 ref 21 10 6 5 A 2 1 81601 CASAVA_Build 14 22474749 1D CAGCCTAGGC A/- ACATAACAAT 3070 het 2700 hom 17 7 9 1 A 2 1 81602 CASAVA_Build 14 22481318 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2899 het 2744 hom 25 10 9 7 A 15 14 81603 CASAVA_Build 14 22491052 1I TGGTAACCAA -/C CCCCACCTCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 4 5 81604 CASAVA_Build 14 22507471 13D GATTTATTTA TTTTTTTTATTTT/------------- TTTTATTTTT 3070 het 1173 hom 16 3 11 2 TTTTTTTTATTTT 1 0 81605 CASAVA_Build 14 22511384 4I GAGAGTAAGA ----/AAGT AAGAGTGAGA 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 AAGT 0 1 81606 CASAVA_Build 14 22529524 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 481 hom 21 3 9 9 T 13 12 81607 CASAVA_Build 14 22536027 22D GACACACACG CACACGCACACACACACACACA/---------------------- CACACACACA 3070 het 2534 hom 34 12 17 6 CACACGCACACACACACACACA 1 0 81608 CASAVA_Build 14 22578349 2I CTTTGGGAGG --/CC CCCAGGTGGG 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 C 3 5 81609 CASAVA_Build 14 22582592 1I TCCTGATCAC -/T TTTGTCAGCA 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 T 3 4 81610 CASAVA_Build 14 22593978 1I AACAACCGAT -/G GGGGGGGGAT 3070 het 3070 hom 34 11 12 11 G 8 9 81611 CASAVA_Build 14 22603852 3I GTGCTGAAGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 het 2938 hom 18 8 8 2 AGG 0 1 81612 CASAVA_Build 14 22620316 5I ACTTAGTGTT -----/ATATC ATATAACTTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 ATATC 0 1 81613 CASAVA_Build 14 22626082 1D TAAAACAAAT A/- AAAAATCTCC 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 6 5 81614 CASAVA_Build 14 22626516 1D ACGTCTGGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1848 hom 29 10 10 9 T 10 9 81615 CASAVA_Build 14 22627706 3I CCCCCTCAAC ---/ACT ACTAATTATT 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 ACT 1 2 81616 CASAVA_Build 14 22631147 1D CCTTTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 T 13 12 81617 CASAVA_Build 14 22631428 1D GCACAAACCC G/- GTGTTAATAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 2 1 81618 CASAVA_Build 14 22633066 9D TGGCACCTAG ATTTATCAA/--------- ATTTATAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 20 7 ATTTATCAA 1 0 81619 CASAVA_Build 14 22636218 3D TTTCATCATA AAT/--- AATGTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 18 17 3 AAT 2 1 81620 CASAVA_Build 14 22642223 1I GTGGTATCAA -/G GGGATGGCTG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 3 4 81621 CASAVA_Build 14 22644809 2D GAAAATAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2463 het 31 hom 22 1 10 11 T 20 18 81622 CASAVA_Build 14 22673204 4D AAATGCTAAC TGAT/---- TGTCTCTGGG 3070 hom 63 het 22 0 22 2 TGAT 1 0 81623 CASAVA_Build 14 22677584 1I GCCTCTGTCT -/C CCAACTGCAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 2 3 81624 CASAVA_Build 14 22680666 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 9 8 81625 CASAVA_Build 14 22684584 3D TCAAAAAAAA AAG/--- AAAAAAAAAT 1811 het 1811 ref 16 8 7 1 AAG 1 0 81626 CASAVA_Build 14 22687165 1D TCTTTGGGAT G/- GGGGGCAGTT 3070 het 2703 hom 26 8 13 5 G 6 5 81627 CASAVA_Build 14 22699994 2I TAAAATACTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 2667 hom 30 9 11 10 TC 8 9 81628 CASAVA_Build 14 22700539 2D CACACCGGAA CT/-- CTCTACTGCG 2459 het 2459 ref 26 16 6 4 CT 3 2 81629 CASAVA_Build 14 22703660 1I AGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 27 1 14 12 T 13 14 81630 CASAVA_Build 14 22704662 3I AAATGGTTTA ---/ATG ATGAAGAGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATG 1 2 81631 CASAVA_Build 14 22724291 1I AAGACTCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 41 3 34 4 A 10 11 81632 CASAVA_Build 14 22724659 13D ACTGATAACG ATATGGTAAGCTT/------------- TAGCCCTCTC 3070 hom 148 het 50 0 50 3 ATATGGTAAGCTT 1 0 81633 CASAVA_Build 14 22728697 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1364 het 1364 ref 30 23 3 4 A 12 11 81634 CASAVA_Build 14 22737721 1D AACTCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 2578 het 760 hom 14 2 7 5 A 13 12 81635 CASAVA_Build 14 22741300 2D ACCCTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 1445 het 557 hom 23 3 7 13 A 18 16 81636 CASAVA_Build 14 22748807 3D CACTCTCTTA AAC/--- AACAACTCAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 AAC 3 2 81637 CASAVA_Build 14 22753696 2I AAAGCATAGG --/AA AAAGTCAGTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 3 5 81638 CASAVA_Build 14 22755118 1D CACGGTGAAA C/- CCCCATCTCT 2334 het 2291 hom 10 5 5 0 C 5 4 81639 CASAVA_Build 14 22756296 10D TGGCAGTGGT GGCAGTGGTG/---------- GGGGGGGGGC 3070 het 1143 hom 21 5 14 5 GGCAGTGGTG 1 0 81640 CASAVA_Build 14 22757425 1I TCAAAAAAAA -/T AAATAAATAA 3070 het 2804 hom 15 7 8 0 T 0 1 81641 CASAVA_Build 14 22759959 1I CACCTTCACT -/A AAAAGGAAGA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 4 5 81642 CASAVA_Build 14 22763619 1I TGAAACGAAA -/C CCCCTAGCTC 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 C 4 5 81643 CASAVA_Build 14 22773377 1D ATGCAAAAAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 8 7 81644 CASAVA_Build 14 22774264 1D CTGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 12 11 81645 CASAVA_Build 14 22781265 1I ACCTTTTAAA -/T GTTCGCTAAT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 0 1 81646 CASAVA_Build 14 22781967 1I GGTTGAGGCT -/G GCAGTGAGCC 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 G 1 2 81647 CASAVA_Build 14 22796212 1I ACACACACAA -/T AAAAAATAAA 3070 het 296 hom 16 1 15 0 T 0 1 81648 CASAVA_Build 14 22796433 1D AAAATGAGGG T/- TTAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 T 3 2 81649 CASAVA_Build 14 22797743 2D CCAAGAGAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 37 0 24 15 T 19 17 81650 CASAVA_Build 14 22798252 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 81651 CASAVA_Build 14 22798473 1I TCTGGAATCC -/T TTTTTTTTTC 3046 het 377 hom 21 3 12 6 T 9 10 81652 CASAVA_Build 14 22798494 1I TCTTTTAAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 486 hom 21 2 16 3 T 8 9 81653 CASAVA_Build 14 22801018 4I CTCTGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AAAC 2 3 81654 CASAVA_Build 14 22801696 1I GAGCCGCCTC -/T TTTTTTTTTC 1371 het 1371 ref 29 16 7 6 T 9 10 81655 CASAVA_Build 14 22802141 1I AAAGCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 38 2 24 12 T 11 12 81656 CASAVA_Build 14 22803819 1D ATTTCACTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 14 13 T 9 8 81657 CASAVA_Build 14 22810551 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 58 het 25 0 18 7 T 8 7 81658 CASAVA_Build 14 22816818 5D CTGTCTTTAG AAGTT/----- AAGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 AAGTT 1 0 81659 CASAVA_Build 14 22833260 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 25 2 19 4 A 13 12 81660 CASAVA_Build 14 22843116 1D AACATTAGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 14 hom 27 1 20 6 A 10 9 81661 CASAVA_Build 14 22858937 2I AATGAGTCAC --/TT TTGATTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 4 81662 CASAVA_Build 14 22859480 1I TTTGATTGAA -/G GGGGGACTAC 3070 het 3070 hom 53 18 24 11 G 5 6 81663 CASAVA_Build 14 22864092 2I ACTGTTTGGC --/AA AGTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 1 3 81664 CASAVA_Build 14 22864684 1D TGGTAGGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 14 9 T 11 10 81665 CASAVA_Build 14 22912651 1D AAACTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 13 12 81666 CASAVA_Build 14 22923239 1D TAGAGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 10 12 A 15 14 81667 CASAVA_Build 14 22938616 2D CACACACACG TA/-- CACACACACA 700 het 700 ref 48 41 4 3 TA 1 0 81668 CASAVA_Build 14 22958164 1I GGGAAGTGAT -/G TTGATGCAAG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 G 0 1 81669 CASAVA_Build 14 22991787 1D TGAATTGTAT A/- AAAGGGGTGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 4 3 81670 CASAVA_Build 14 22994608 1D AAGCTGAGAA T/- TTTTTTAAAT 1976 hom 14 het 8 0 6 3 T 7 6 81671 CASAVA_Build 14 22994861 1D12M1D TAAAGTGTTG AAAAAAAAATCCAC/-AAAAAAAATCCA- CCAAACTAAA 3070 hom 90 het 30 0 31 1 N/A 0 0 81672 CASAVA_Build 14 22995968 1I CTTGGAGGAT -/G GGGGCTGACT 3070 hom 80 het 30 0 27 3 G 4 5 81673 CASAVA_Build 14 23000911 2D AGCCAATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 30 2 19 9 T 16 14 81674 CASAVA_Build 14 23001089 1D TTGTATTTTA T/- TTTTTTGGTA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 T 7 6 81675 CASAVA_Build 14 23003002 1I CAGACAGTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 9 10 81676 CASAVA_Build 14 23009768 1D AAGTGGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 34 0 27 7 T 13 12 81677 CASAVA_Build 14 23009930 1D AATCTAATCA C/- TTGTTTTATT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 C 1 0 81678 CASAVA_Build 14 23013620 1I TTCATCATAT -/C CCCCCCCTAC 3070 het 360 hom 48 1 43 4 C 7 8 81679 CASAVA_Build 14 23030213 4D AGATGAACTT CTAC/---- GTAGGATCCT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 CTAC 1 0 81680 CASAVA_Build 14 23031176 10D AAATTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAG 3070 het 91 hom 23 1 20 3 A 19 9 81681 CASAVA_Build 14 23037081 1I GCAGCTAATT -/A TCTGTGTGGC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 0 1 81682 CASAVA_Build 14 23038003 1D CTTTTGGAGA T/- TTTTTCCTTA 3070 hom 73 het 27 0 25 2 T 6 5 81683 CASAVA_Build 14 23059445 1I TGGGCCTCCA -/G GGGGGGCAGC 3070 het 2730 hom 27 11 11 5 G 6 7 81684 CASAVA_Build 14 23076004 11I CTGGCCAACA -----------/TGGTGAAACCC TGGTGAAACC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TGGTGAAACCC 1 2 81685 CASAVA_Build 14 23101535 1D CCTCAGTGTA C/- CCCCAATGAG 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 C 5 4 81686 CASAVA_Build 14 23127162 1I ACTCAGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1149 hom 23 5 11 7 A 17 18 81687 CASAVA_Build 14 23131276 1I TGCCCAGGCC -/A AGAGTGCAGT 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 1 2 81688 CASAVA_Build 14 23142507 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 9 81689 CASAVA_Build 14 23161949 1D CTCGCTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 26 1 18 8 T 13 12 81690 CASAVA_Build 14 23168240 35I CAGCAATGAC -----------------------------------/CAGCTCAGTGGTTGGACTGAGAAGAAGCTCCAAAG CACTTACCAA 3070 hom 39 het 18 0 14 8 CAGCTCAGTGGTTGGACTGAGAAGAAGCTCCAAAG 0 1 81691 CASAVA_Build 14 23181371 1D CTTGCTTTTT C/- TTATTTTTCT 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 C 1 0 81692 CASAVA_Build 14 23185059 16D ATGGCTTTCT CAGAAAAGGCCCTGTG/---------------- TATTGTCCTG 3070 het 3070 ref 42 28 14 1 CAGAAAAGGCCCTGTG 1 0 81693 CASAVA_Build 14 23194968 2D TTTCTTTCTT TC/-- TTTTTTTTTT 1133 het 1133 ref 24 14 5 6 TC 1 0 81694 CASAVA_Build 14 23224896 1I CAGTTTTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 T 9 10 81695 CASAVA_Build 14 23233717 6D CTGGAAATGC CACATT/------ CCCTCCTACA 3070 het 3070 hom 42 19 22 6 CACATT 1 0 81696 CASAVA_Build 14 23242048 1I AACAGGGAGG -/A ACTTGTAGTA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 A 1 2 81697 CASAVA_Build 14 23256873 4D GCCTGATGGC TTTT/---- GTCAGGCCAC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 4 0 81698 CASAVA_Build 14 23259978 2I TGCTGGCTTC --/TG CTTCTGGGGA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 TG 0 1 81699 CASAVA_Build 14 23263357 1I AGTAGGGTAG -/A AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 A 4 5 81700 CASAVA_Build 14 23274227 1D ATCAATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 725 hom 26 2 19 6 A 12 11 81701 CASAVA_Build 14 23274239 1D AAAAAAAAAA C/- CATTAAAAGG 3070 het 852 hom 29 4 21 5 C 2 1 81702 CASAVA_Build 14 23285054 2D GCTAAACTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 18 9 A 13 11 81703 CASAVA_Build 14 23302104 1D CACAGAATCT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 9 8 81704 CASAVA_Build 14 23302407 1I ATAATAATAA -/T AAAAAAGAAC 3070 het 3070 hom 37 10 21 9 T 0 1 81705 CASAVA_Build 14 23305652 1I AAAGTTTTAA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 6 7 81706 CASAVA_Build 14 23306952 4D GTGTGGTTAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2697 hom 36 14 16 6 T 16 12 81707 CASAVA_Build 14 23307062 1I TCAAGCAATT -/C TCCTGCCTCA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 C 0 1 81708 CASAVA_Build 14 23308738 1D TTAATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 2832 het 2012 hom 21 8 7 8 A 12 11 81709 CASAVA_Build 14 23314066 4D TAAGAATCTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 46 18 16 13 TG 11 9 81710 CASAVA_Build 14 23315706 1I GACTCGGTAC -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 A 6 7 81711 CASAVA_Build 14 23320203 1D ACATGAAAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 9 8 81712 CASAVA_Build 14 23324064 2D AGGAGGGAAG AT/-- ATGGGCTGGA 3070 het 3070 ref 47 24 18 7 AT 2 1 81713 CASAVA_Build 14 23325804 4I TAGAAAACAA ----/AGTT AGAGTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 AGTT 0 1 81714 CASAVA_Build 14 23335065 1D ATACTTTTAA T/- TAGATATCTC 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 T 2 1 81715 CASAVA_Build 14 23336383 2D TGTCTGTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 1234 het 1234 ref 43 26 4 13 TC 10 9 81716 CASAVA_Build 14 23351098 1I TGCCTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 1520 het 376 hom 19 1 6 12 T 15 16 81717 CASAVA_Build 14 23380688 1I TGTCCAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 25 1 19 5 A 11 12 81718 CASAVA_Build 14 23382417 1I TAAGTTTGGG -/T TTTTACTGAC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 4 5 81719 CASAVA_Build 14 23405394 1I TACACATATT -/A AAAAAATTAT 3070 hom 93 het 42 0 32 10 A 6 7 81720 CASAVA_Build 14 23408519 1D CAAGAGGCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 10 9 81721 CASAVA_Build 14 23410981 1D ACAAAGCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 625 hom 35 2 22 12 A 12 11 81722 CASAVA_Build 14 23426447 2I CAATAAATGC --/AA AAAAAAAATG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 A 8 10 81723 CASAVA_Build 14 23441372 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2965 het 879 hom 18 2 8 9 A 17 16 81724 CASAVA_Build 14 23469070 8I5M1D AGATGGAAGC --------GTGATG/CTCCCAGGGTTCT- GATCTATCTG 3070 hom 105 het 39 0 32 9 N/A 0 0 81725 CASAVA_Build 14 23475999 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 6 T 13 12 81726 CASAVA_Build 14 23521604 2I GACTTCAAAC --/TA TACTGCAAGG 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 TA 1 2 81727 CASAVA_Build 14 23526958 4D ATCCATATTT ATTC/---- ATTCTCCCGG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 ATTC 2 1 81728 CASAVA_Build 14 23537321 1D AGCGTAAATC T/- TGAGAGCCCT 3070 het 3070 ref 45 31 12 2 T 2 1 81729 CASAVA_Build 14 23540320 2D AGTTTCCTAA CT/-- CTGCCCCTCC 3070 het 3070 hom 55 22 24 11 CT 2 1 81730 CASAVA_Build 14 23548258 1D CAGGAGACCC A/- ATCTCACGTG 3070 het 3070 ref 30 18 8 5 A 2 1 81731 CASAVA_Build 14 23549025 4I ATAGAATCTA ----/CATC ATAATTCAGT 1697 het 1697 ref 23 11 5 7 CATC 0 1 81732 CASAVA_Build 14 23549928 1D AATTTCCAAT G/- GTTTTAACCC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 G 2 1 81733 CASAVA_Build 14 23589608 4I TATGAAATAA ----/TTAC TTACTATTTT 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 TTAC 1 2 81734 CASAVA_Build 14 23602946 1D AGATCGAGAT C/- ATCCTGGCCA 1397 het 876 hom 8 4 3 1 C 1 0 81735 CASAVA_Build 14 23605064 2I CCAAACAATG --/GT GTGACTTGAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 GT 1 2 81736 CASAVA_Build 14 23652343 1I ACACGTTAGT -/G GGTGCAGCGC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 2 3 81737 CASAVA_Build 14 23716247 3I GATCGCAGAG ---/GAA GAAGAAGCTA 3070 hom 61 het 24 0 20 4 GAA 2 3 81738 CASAVA_Build 14 23788220 22D CTGACTCCCT CTCCGGGAGCCCTGGACTCCCC/---------------------- CTCCGGGAGC 3070 hom 75 het 37 0 20 22 CTCCGGGAGCCCTGGACTCCCC 2 1 81739 CASAVA_Build 14 23820926 1D TCCCCAACCC T/- TCCTCTACCC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 2 1 81740 CASAVA_Build 14 23821976 1I TATTCGCCCC -/A CACAGCTGGC 3070 het 2601 hom 30 10 11 9 A 0 1 81741 CASAVA_Build 14 23825030 4D ATAAACTGTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 20 3 13 5 A 15 11 81742 CASAVA_Build 14 23838788 1D CAGAGTCCCA G/- GCCAAAGTTA 2293 het 2293 ref 27 10 7 10 G 2 1 81743 CASAVA_Build 14 23842433 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2517 het 320 hom 23 1 9 13 T 17 16 81744 CASAVA_Build 14 23852628 8D TTTTAGTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 25 1 13 11 T 22 14 81745 CASAVA_Build 14 23860304 1I TAAAAAAAAA -/T AAATATAAAA 1915 hom 12 het 5 0 5 0 T 0 1 81746 CASAVA_Build 14 23865072 2D ATCCCTTCTC CA/-- CCATATGACC 3070 het 3050 hom 34 11 17 7 CA 1 0 81747 CASAVA_Build 14 23865426 1D GCATGGTGGG T/- GTTTTCCCTG 3070 het 3070 hom 36 17 16 5 T 1 0 81748 CASAVA_Build 14 23882172 1D AGCAGCATTA T/- TCGCAACAGC 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 T 2 1 81749 CASAVA_Build 14 23884843 1I CCAGCTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 836 hom 17 4 9 4 T 11 12 81750 CASAVA_Build 14 23894908 1I CTGGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 14 0 9 5 A 10 11 81751 CASAVA_Build 14 23895494 1I TCTCTGTGAC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 54 het 23 0 18 6 T 7 8 81752 CASAVA_Build 14 23904858 1D AACCAAGGAC G/- GGGGGGCTGG 3070 hom 58 het 25 0 16 10 G 7 6 81753 CASAVA_Build 14 23917872 1I ATCACCACTG -/A ACGGGCCTGG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 1 2 81754 CASAVA_Build 14 23918754 4D AGGGAGAGAT AGAG/---- AGAGAGAAAG 3070 hom 108 het 39 0 35 7 AG 5 3 81755 CASAVA_Build 14 23920547 2D GAAGAGCAGA CT/-- CTCTCTCATC 3070 hom 99 het 38 0 32 6 CT 4 3 81756 CASAVA_Build 14 23923916 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 453 hom 22 2 16 4 AT 6 7 81757 CASAVA_Build 14 23925654 1D ACAAATAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2085 hom 33 10 17 6 A 11 10 81758 CASAVA_Build 14 23926358 1D TACTGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 14 11 T 11 10 81759 CASAVA_Build 14 23926553 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2730 hom 25 9 12 4 T 9 10 81760 CASAVA_Build 14 23927562 1I TTGAGGTTCA -/T TTGGTTCAGA 3070 het 3070 hom 45 22 19 4 T 2 3 81761 CASAVA_Build 14 23932065 2I CCTCCTCTTC --/TT TCTCTCTCTC 3070 hom 94 het 36 0 31 5 T 1 3 81762 CASAVA_Build 14 23953561 13D CTTTGGAATG GGGTTTCCACAGA/------------- GGTGCTTTCC 3070 het 3070 hom 35 12 20 6 GGGTTTCCACAGA 1 0 81763 CASAVA_Build 14 23980158 2I GGAGGAACTC --/TT TGGTTGCAGG 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 1 3 81764 CASAVA_Build 14 23985657 12D TTCATCCCCT AGGTGATGTCTG/------------ ATCACCTTGG 3070 het 3070 ref 38 28 9 4 AGGTGATGTCTG 1 0 81765 CASAVA_Build 14 23986123 1I TTTCTCTAGG -/C CTTTGCTCTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 1 2 81766 CASAVA_Build 14 23986447 4I CAGATTTAGA ----/CAAT CAAAGATTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CAAT 0 1 81767 CASAVA_Build 14 24003524 1I GGAGGTACTC -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 6 7 81768 CASAVA_Build 14 24004183 1I AAACCAACTT -/A AAAAAAAAAA 1355 het 311 hom 13 2 7 6 A 13 14 81769 CASAVA_Build 14 24004382 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2915 het 1722 hom 29 5 14 10 T 12 13 81770 CASAVA_Build 14 24009010 3D TTTGTTAAAG GAT/--- ACAAAATTAG 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 GAT 1 0 81771 CASAVA_Build 14 24009302 1D ATAGCATCTT A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 22 9 8 5 A 6 5 81772 CASAVA_Build 14 24010442 2D ATCGGATCTT TA/-- TCTCTAAGGT 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 TA 1 0 81773 CASAVA_Build 14 24012297 1I CTTAGCACCT -/G GGCCAGCAGC 1847 hom 24 het 9 0 7 2 G 2 3 81774 CASAVA_Build 14 24013495 1D TTAAGAACTG T/- TAACACTCAC 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 2 1 81775 CASAVA_Build 14 24023043 1I AATATAGTGC -/G GGTCCTGGCT 3070 het 3070 ref 63 31 23 9 G 2 3 81776 CASAVA_Build 14 24024234 1D TATATATATA T/- TTTTTTTGAG 1919 hom 10 het 5 0 4 1 T 8 7 81777 CASAVA_Build 14 24035383 1I TGGTGGTGGG -/A AAACTGGCTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 3 4 81778 CASAVA_Build 14 24039094 1I GGTTTATTTC -/A ACTTAGCATA 3070 het 3070 hom 53 23 26 4 A 1 2 81779 CASAVA_Build 14 24039191 6D TGTGTGTGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 70 het 42 0 25 19 TG 12 9 81780 CASAVA_Build 14 24039411 1D AGCTCCATAC T/- TTTTTTCATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 6 81781 CASAVA_Build 14 24043347 1I TATAAAAAGT -/A AAAAGCATAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 4 5 81782 CASAVA_Build 14 24052655 1I TCAATGTGTG -/T TTTTTAAGGG 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 5 6 81783 CASAVA_Build 14 24052841 40I AAATTTTTTC ----------------------------------------/TTCAAATGAATAATTATAAATTAAACATTCATGGAATCAT TAACCAGCTT 3070 hom 87 het 23 0 30 1 TTCAAATGAATAATTATAAATTAAACATTCATGGAATCAT 0 1 81784 CASAVA_Build 14 24057720 1D AGCTCCCCAC T/- TCCACATCTG 3070 het 3070 ref 38 20 17 2 T 2 1 81785 CASAVA_Build 14 24058400 2I ATCCTGAGAC --/TT TGCTGAAGTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 1 3 81786 CASAVA_Build 14 24061217 1D CTCCTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1079 hom 24 7 11 6 T 15 14 81787 CASAVA_Build 14 24077962 5D CATCTACAGA ATTCT/----- ATTCTCCACC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 ATTCT 2 1 81788 CASAVA_Build 14 24085525 2D TTTCAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 27 14 6 T 13 11 81789 CASAVA_Build 14 24096825 1I TGCTTGTGGC -/T TTTCTAAAGC 3070 het 3070 ref 57 28 21 8 T 3 4 81790 CASAVA_Build 14 24121958 1I GGTAGCTCTA -/T TTTTTTTTTT 2251 het 2251 ref 34 15 14 5 T 13 14 81791 CASAVA_Build 14 24122242 3D TTTTCATAGG ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 ATT 7 6 81792 CASAVA_Build 14 24140703 11D AAAACTATAC AATTTGACACG/----------- AATTTGACAG 3070 het 3070 ref 49 29 16 8 AATTTGACACG 1 0 81793 CASAVA_Build 14 24142889 1I TGTTTATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 10 11 81794 CASAVA_Build 14 24165898 1I GTCTTATCTT -/A TTGGGCTACA 3070 hom 99 het 42 0 33 9 A 0 1 81795 CASAVA_Build 14 24171719 1I GTTTGTATTC -/T TATGCCAAAG 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 T 1 2 81796 CASAVA_Build 14 24179144 3I CATTTTACCA ---/GTG GAACTGTGGC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 GTG 0 1 81797 CASAVA_Build 14 24180013 4D GCAAACTTTC CTCT/---- CTATCAGTCT 3070 het 3070 ref 47 25 22 2 CT 3 1 81798 CASAVA_Build 14 24196552 1D CTATTTCTTT C/- CTTTTTTCTT 3070 hom 140 het 49 0 47 2 C 2 1 81799 CASAVA_Build 14 24214832 1D GTTAAAAAAA C/- ATTGTATTTT 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 C 1 0 81800 CASAVA_Build 14 24225256 1D CTTAAAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2261 hom 21 6 10 5 A 12 11 81801 CASAVA_Build 14 24231749 1D AAAAGAAAAT A/- AAAAAAAAGA 2440 het 2440 ref 15 9 5 1 A 9 8 81802 CASAVA_Build 14 24234939 1I GGAGTTAACG -/A AAAGGGGTGG 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 A 3 4 81803 CASAVA_Build 14 24251132 1I ACATAAGTGA -/T TTTTTAAAAG 3070 het 2977 hom 22 6 11 5 T 5 6 81804 CASAVA_Build 14 24257510 3I GAAGACTCAA ---/TAT TGTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 TAT 0 1 81805 CASAVA_Build 14 24275637 1D ATGTCTCTTC A/- AATATACAGA 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 A 3 2 81806 CASAVA_Build 14 24278763 1D CACAGGCAAC A/- AAAGCAAAAA 3070 het 1914 hom 19 4 12 3 A 4 3 81807 CASAVA_Build 14 24284960 2D AACAACAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 545 hom 33 5 10 18 A 14 12 81808 CASAVA_Build 14 24285515 1I TGGGAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 16 14 A 14 15 81809 CASAVA_Build 14 24286627 1D CACCTCTAAT C/- CCAACATTTT 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 C 3 2 81810 CASAVA_Build 14 24296650 2D ATAATATGAG AC/-- ACAATGAAGG 3070 het 3070 ref 33 15 15 4 AC 2 1 81811 CASAVA_Build 14 24297843 1D TGAAGTAAAT G/- GTTAAGGATA 3070 het 3070 ref 36 19 11 7 G 2 1 81812 CASAVA_Build 14 24314843 4D TAAAACAGTT AAAC/---- AAACTATCCA 3070 het 3070 hom 43 20 20 5 AAAC 2 1 81813 CASAVA_Build 14 24323902 17I GTTTTTAAGG -----------------/GGTAGATACCTTACTTA GGACGTTTAA 3070 hom 111 het 38 0 38 3 GGTAGATACCTTACTTA 0 1 81814 CASAVA_Build 14 24332827 1D GTCAAATGCA G/- GGCCCCTTCC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 G 3 2 81815 CASAVA_Build 14 24338844 3D TTTTTATTTA TTT/--- ATTTATTGAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 3 0 81816 CASAVA_Build 14 24343874 1I TGTCATGAGG -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 T 6 7 81817 CASAVA_Build 14 24344412 1I GTAGCATGAT -/C CCCCCTTGCT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 C 5 6 81818 CASAVA_Build 14 24352035 1D GGAGGGAGTG C/- CTGTGTGGTG 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 C 2 1 81819 CASAVA_Build 14 24352737 1I TCATCTGCAT -/C CCTGACCAGG 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 C 2 3 81820 CASAVA_Build 14 24356774 2I TCCAAGTTCA --/CT CTCTCTGCCT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 CT 3 4 81821 CASAVA_Build 14 24374394 1I TAATTGAGTG -/T TTTTTTGACC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 6 7 81822 CASAVA_Build 14 24377730 1I ATCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2697 het 2697 ref 21 9 8 4 A 10 11 81823 CASAVA_Build 14 24378558 1I CTACGTCTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 8 9 81824 CASAVA_Build 14 24404129 1D TTAATTTTTT A/- AAACTCTAGG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 4 3 81825 CASAVA_Build 14 24412341 1D ACATTTAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 17 19 11 A 11 10 81826 CASAVA_Build 14 24420563 1D GCAGAGATGA C/- ATTCATAAAT 3070 het 3070 hom 49 21 24 5 C 1 0 81827 CASAVA_Build 14 24422721 2I TATTTATTAC --/AA AAAAAAAATG 3070 hom 45 het 25 0 16 9 A 8 10 81828 CASAVA_Build 14 24423817 4I TTAATAATTT ----/ATTA ATTATTTATG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 ATTA 1 2 81829 CASAVA_Build 14 24428368 12I ACAACGACTA ------------/TCATTAATTCCC TCAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 TCATTAATTCCC 0 1 81830 CASAVA_Build 14 24433938 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 13 11 81831 CASAVA_Build 14 24435353 2D ACTAAGAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 51 27 19 7 AT 6 5 81832 CASAVA_Build 14 24438062 1D CCCAGAGGTT G/- GGGGTGGGGA 3070 het 3070 ref 49 20 16 13 G 5 4 81833 CASAVA_Build 14 24440191 1I ATAGACAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 10 11 81834 CASAVA_Build 14 24447699 1I CTCAGGTCTT -/C CCTCCACAAA 3070 het 3070 ref 55 33 18 4 C 2 3 81835 CASAVA_Build 14 24460900 1I ATTTCAGCTA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 7 8 81836 CASAVA_Build 14 24465396 2D GCTTTTCCTG AT/-- ATCTTTGGGC 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 AT 2 1 81837 CASAVA_Build 14 24465985 2I GCTGCTATTT --/AA AAAAAAAAAA 2554 het 2554 ref 23 11 8 4 A 10 12 81838 CASAVA_Build 14 24467438 2I CTTTTTTTTT --/TG GTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 TG 0 1 81839 CASAVA_Build 14 24468000 1D GCACTAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 13 27 7 A 10 9 81840 CASAVA_Build 14 24471936 2I AATCAACAGG --/CT CTCTGTTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 CT 2 3 81841 CASAVA_Build 14 24483035 1I TTCCCTCCCC -/A AAAAGTTTTA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 4 5 81842 CASAVA_Build 14 24486276 2I CAAAATAATT --/CA CAGTTTTCTG 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 CA 1 2 81843 CASAVA_Build 14 24487403 4I TTTCACCTGC ----/CTCT CTAAGTGCAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 CT 1 3 81844 CASAVA_Build 14 24489302 1I TGGTACCACC -/T TTTGGAAATC 2672 het 2672 ref 37 28 7 2 T 3 4 81845 CASAVA_Build 14 24490437 16I CCACATCCTC ----------------/TCCAGCACATGTTGTT TCCGGACTTT 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 TCCAGCACATGTTGTT 0 1 81846 CASAVA_Build 14 24495769 1D TAATGAGACA G/- GGGTTTCAGT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 G 4 3 81847 CASAVA_Build 14 24510632 4I ACAAAGAGGT ----/CATC CCTAGACTGA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 CATC 0 1 81848 CASAVA_Build 14 24526318 2D TGACAAGAAG TT/-- TTTACATTTG 3070 het 3070 ref 55 30 23 4 T 5 3 81849 CASAVA_Build 14 24544854 1D GGAAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 585 het 585 ref 32 24 3 5 A 12 11 81850 CASAVA_Build 14 24580682 2I TAGTCACCAG --/AC AGCGGTTATG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 AC 0 1 81851 CASAVA_Build 14 24591675 1D GTGCCTAGGA T/- TTTTTTTTTT 2864 het 2864 ref 32 11 10 11 T 15 14 81852 CASAVA_Build 14 24653760 1I TTATATACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 9 10 81853 CASAVA_Build 14 24655626 1I CCCTAAAATG -/T TTTAAAAAAA 2738 het 2738 ref 25 14 6 5 T 3 4 81854 CASAVA_Build 14 24672170 1I TTCAGCATCC -/A AGGGACAAAG 3070 het 2498 hom 27 9 11 7 A 1 2 81855 CASAVA_Build 14 24683590 1D CACCTATGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 82 het 35 0 28 8 T 10 9 81856 CASAVA_Build 14 24687959 1I TTTTTGGGTG -/T GGGGGGACAG 2054 het 223 hom 16 5 8 3 T 0 1 81857 CASAVA_Build 14 24689972 2D TTATATTTAT TA/-- TATATATGAT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TA 4 3 81858 CASAVA_Build 14 24706618 1I CAAAGCAGCC -/G GGAAGCTTGA 1426 hom 7 het 3 0 3 0 G 2 3 81859 CASAVA_Build 14 24715531 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 8 9 81860 CASAVA_Build 14 24728607 5D TTGTATTTAA TGTAT/----- TGTATTGTGT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 TGTAT 2 1 81861 CASAVA_Build 14 24730487 1D TGGCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 4 A 11 10 81862 CASAVA_Build 14 24736685 1D TTTAAGATAG A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 36 15 20 3 A 7 6 81863 CASAVA_Build 14 24737103 3I GCATTTGTGG ---/CCT CCTCTGTTCA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 CCT 1 2 81864 CASAVA_Build 14 24754608 4D TTCTAAATCT AATA/---- AATAAATAAG 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 AATA 3 2 81865 CASAVA_Build 14 24757555 1D GTGCATTTGG T/- TTAATACATA 3070 het 3070 hom 58 26 27 6 T 3 2 81866 CASAVA_Build 14 24763542 4I CTACTACACA ----/GGTC TGCTTTGGCA 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 GGTC 0 1 81867 CASAVA_Build 14 24770820 2I TAATTATGTG --/TA TATATATATA 1230 het 1230 ref 17 10 4 3 TA 8 9 81868 CASAVA_Build 14 24784973 2D TCCTGCCTCA GG/-- GGCTCCTGAG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 G 4 2 81869 CASAVA_Build 14 24787332 1D ATAAATACTT A/- ACCTTTCCCA 3070 hom 141 het 54 0 47 7 A 2 1 81870 CASAVA_Build 14 24789075 1I TAGCTCATAA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 78 het 32 0 29 3 T 8 9 81871 CASAVA_Build 14 24789391 2I TTTTTTTTTT --/TA AAAAGGCTTG 3070 hom 60 het 28 0 21 7 TA 0 1 81872 CASAVA_Build 14 24790888 2D ATCAAATAAC TG/-- TAATTTATCA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 TG 1 0 81873 CASAVA_Build 14 24796666 3I GAAGTAGCTT ---/CTC CTCTTATTAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CTC 1 2 81874 CASAVA_Build 14 24804458 5I TGTATTTGTA -----/TAGTT TAGGGTATAG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TAGTT 0 1 81875 CASAVA_Build 14 24813889 1D TATATTGCTA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 T 7 6 81876 CASAVA_Build 14 24820140 2D TATATATATC TA/-- TATATCTATA 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 TA 3 2 81877 CASAVA_Build 14 24830203 1D AATTACCTTA T/- TAAGTTCAGG 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 T 2 1 81878 CASAVA_Build 14 24830844 3I GCTCACTTGT ---/TGC ATAAGAGCTA 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 TGC 0 1 81879 CASAVA_Build 14 24830961 1D TCAAAATCTT G/- ATTACATTCA 3070 het 3070 hom 52 23 25 4 G 1 0 81880 CASAVA_Build 14 24831993 5D AGGAAAAATT TTATA/----- TTATTTTATT 3070 het 2928 hom 24 8 15 2 TTATA 1 0 81881 CASAVA_Build 14 24840458 2D TATGCAAAAC AT/-- ACTAACATTT 3070 het 3070 ref 49 22 22 7 AT 1 0 81882 CASAVA_Build 14 24841366 1I GCTGACAGAC -/A AAATAGCCAG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 3 4 81883 CASAVA_Build 14 24842449 1D CAAAACCACA T/- TTAAGTACAC 3070 het 3070 ref 58 31 22 7 T 3 2 81884 CASAVA_Build 14 24845175 1I TCAGAACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 49 1 41 7 A 11 12 81885 CASAVA_Build 14 24846026 4D CAATCTTTTC TAAG/---- TAAGAAATCC 3070 het 3070 hom 39 16 21 4 TAAG 2 1 81886 CASAVA_Build 14 24846748 1I CAGCTCCCAC -/T TAGATGGACA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 2 81887 CASAVA_Build 14 24848696 1D ATTTAGAAGA T/- CAAAAAATAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 0 81888 CASAVA_Build 14 24849480 1I AGAGCTGAAG -/A AAAAAATATG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 6 7 81889 CASAVA_Build 14 24850120 1I AGGAAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 10 11 81890 CASAVA_Build 14 24851616 4D CATTTCTGAC TTTA/---- TTTGAGTACT 3070 het 3070 hom 34 12 20 3 TTTA 1 0 81891 CASAVA_Build 14 24856914 1D TTTGGATGCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 9 8 81892 CASAVA_Build 14 24857572 1D TGCTGGGAGA C/- TTTTTATTAC 3070 het 3070 ref 28 17 11 1 C 1 0 81893 CASAVA_Build 14 24858450 1D GTGATATTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 9 8 81894 CASAVA_Build 14 24858681 1D TCTTTTTATA T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 7 6 81895 CASAVA_Build 14 24858923 1I CTGCCATTTT -/G TTATTCAGTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 G 0 1 81896 CASAVA_Build 14 24865249 1D GCAGAACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 866 hom 28 8 7 13 T 15 14 81897 CASAVA_Build 14 24872843 3I ACATGGTAAG ---/AGA AGGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 AGA 0 1 81898 CASAVA_Build 14 24874566 4D GGTATTGGCC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2887 hom 29 12 12 6 A 15 11 81899 CASAVA_Build 14 24874804 1I CTCATAACAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 8 9 81900 CASAVA_Build 14 24875189 2D AACTCAACAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 A 11 9 81901 CASAVA_Build 14 24885395 1I CATTTCTTTA -/T TTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 59 31 24 4 T 5 6 81902 CASAVA_Build 14 24889126 2D ATAGCGGAAC AT/-- ATGTGCTGCT 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 AT 2 1 81903 CASAVA_Build 14 24896989 1I CAACCCCATG -/A ACTTCAACCT 3070 het 3070 ref 56 24 19 13 A 1 2 81904 CASAVA_Build 14 24897241 6I CTGCTTCTGG ------/TCTCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 TC 6 9 81905 CASAVA_Build 14 24900932 1D TGGGGGTTGG T/- GTGTGACTTC 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 T 1 0 81906 CASAVA_Build 14 24917051 1I CTAGAGTGTA -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 T 6 7 81907 CASAVA_Build 14 24925458 1I TTCACTATGA -/T TGTGCTTAGG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 1 2 81908 CASAVA_Build 14 24937522 1D AAAAGCCCAC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 T 9 8 81909 CASAVA_Build 14 24939655 1I TGATATATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 10 11 81910 CASAVA_Build 14 24945062 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTAAGTT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 5 6 81911 CASAVA_Build 14 24946424 3D AAAGGAAAAG GAT/--- GATATTTAGC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 GAT 2 1 81912 CASAVA_Build 14 24949243 14I GCAAGCTACC --------------/TTGAATGCGTTGTA GGAGTATAGT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 TTGAATGCGTTGTA 0 1 81913 CASAVA_Build 14 24954020 1I ATTCTCATGT -/G GGGGATTTTG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 G 4 5 81914 CASAVA_Build 14 24955244 3D TTGGGACAAA TCT/--- TCTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 TCT 2 1 81915 CASAVA_Build 14 24955477 1I CTGTGATCTT -/A AGAGAAGCTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 A 1 2 81916 CASAVA_Build 14 24956551 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 726 het 726 ref 37 25 3 9 A 13 12 81917 CASAVA_Build 14 24956574 4D GAAGAAAAGA AAAG/---- AAAAAAGGTA 1206 het 1206 ref 38 24 8 9 AAAG 1 0 81918 CASAVA_Build 14 24956991 2D TAGCTCTCTC TA/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 TA 1 0 81919 CASAVA_Build 14 24959029 1D TAATTCATAT A/- AAATCCTTCC 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 4 3 81920 CASAVA_Build 14 24959513 1D TTCTCTAAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 T 9 8 81921 CASAVA_Build 14 24959733 1D TTTGTTAGTG T/- TTGTCTCCTC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 3 2 81922 CASAVA_Build 14 24963119 1I TTTATAATCC -/T TTGGGTATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 2 3 81923 CASAVA_Build 14 24964589 1D GTGCACAGGT G/- GGGGAGTTGA 3070 hom 83 het 41 0 31 10 G 5 4 81924 CASAVA_Build 14 24966721 1D ATATAATGGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 82 het 34 0 28 7 T 9 8 81925 CASAVA_Build 14 24970658 1D GGGAAGATGA G/- GGATAGGCAG 3070 hom 207 het 75 0 66 10 G 3 2 81926 CASAVA_Build 14 24973377 2D AATTGACAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 12 10 81927 CASAVA_Build 14 24973879 1I GAATTAAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 9 10 81928 CASAVA_Build 14 24977555 2D CTAGGCTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 97 hom 26 2 12 12 T 16 14 81929 CASAVA_Build 14 24981778 4D TTATCCAGGT CTTA/---- CTTACTATAG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CTTA 2 1 81930 CASAVA_Build 14 24982759 4D TACGTGATAC TCAT/---- AGATGAAGTT 3070 hom 120 het 46 0 41 9 TCAT 1 0 81931 CASAVA_Build 14 24984055 2I GACGTGGAAA --/CT CTGCACCCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CT 1 2 81932 CASAVA_Build 14 24986808 1I CAGAAGCCCC -/A AAGAGTAAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 2 3 81933 CASAVA_Build 14 24987388 1I CACTGCTAAG -/A AAAAAACTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 6 7 81934 CASAVA_Build 14 24987854 16I GTTCAAATAC ----------------/TGTACTATATTTCAAA TCTGTACTAT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 TGTACTATATTTCAAA 0 1 81935 CASAVA_Build 14 24998645 2I TAACAAAGCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 23 1 17 5 A 12 14 81936 CASAVA_Build 14 24999710 1D TCTGAAGCCT G/- CTACTTGGAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 1 0 81937 CASAVA_Build 14 25001245 2D TGACCTTGGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 79 het 33 0 26 9 TC 7 6 81938 CASAVA_Build 14 25015776 4I CATGCATTAA ----/TTAC TTACTTAGTA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 TTAC 1 2 81939 CASAVA_Build 14 25023357 2D TGTGTGTGGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 AT 6 5 81940 CASAVA_Build 14 25032361 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 81 hom 27 2 20 5 A 17 16 81941 CASAVA_Build 14 25039436 1D AAACAGATGG T/- TTTGACCATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 4 3 81942 CASAVA_Build 14 25041513 1I CAAAAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 A 11 12 81943 CASAVA_Build 14 25043858 1D TTGAAAATTC T/- TGTAGAGATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 2 1 81944 CASAVA_Build 14 25053536 1I TGGCTTTGCA -/G GGGTACAGCC 3070 hom 64 het 29 0 18 11 G 3 4 81945 CASAVA_Build 14 25059585 1I CATTAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 481 hom 30 2 15 13 A 14 15 81946 CASAVA_Build 14 25060614 2D CGGTTTCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 14 12 81947 CASAVA_Build 14 25062848 1D TTAGCTCATC T/- TTTTTTTTTT 2898 hom 19 het 17 0 12 5 T 17 16 81948 CASAVA_Build 14 25066601 5I TTTTAAAAAC -----/TTAAA TTAATTTGAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTAAA 0 1 81949 CASAVA_Build 14 25100037 1I TCAACACATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 820 hom 26 2 20 4 A 11 12 81950 CASAVA_Build 14 25101708 1I CTATGGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 34 1 25 8 A 11 12 81951 CASAVA_Build 14 25107070 2I ATTTGTGTGC --/GT GTGTGTATCT 3070 hom 78 het 37 0 27 10 GT 3 4 81952 CASAVA_Build 14 25107490 1D TCCTTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 38 1 24 14 T 15 14 81953 CASAVA_Build 14 25110450 2I TGGAATTGAT --/AC AGACTTTTAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AC 0 1 81954 CASAVA_Build 14 25118205 1I GCATGTATAT -/A AAAATGTCTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 5 81955 CASAVA_Build 14 25128614 1D CATGACCATG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 9 8 81956 CASAVA_Build 14 25134142 2D ATATTATAAC AT/-- ATAAAACAAG 3070 het 3070 ref 29 18 11 1 AT 2 1 81957 CASAVA_Build 14 25150202 2D ACACTACTAG TA/-- TATATATATA 1755 het 1755 ref 20 10 6 4 TA 8 7 81958 CASAVA_Build 14 25151304 1D AGCGTAATAG C/- CAATAGGTAG 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 C 2 1 81959 CASAVA_Build 14 25156305 4D ATGTGGCAAA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 59 25 23 17 GT 9 7 81960 CASAVA_Build 14 25157418 3D TATGTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 39 2 14 24 T 17 14 81961 CASAVA_Build 14 25159975 2D TCCCAATAAC TG/-- TGGTGTCCTG 3070 het 3070 ref 58 28 25 5 TG 2 1 81962 CASAVA_Build 14 25162318 4I AACCAAAGTT ----/AATC AACCAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AATC 0 1 81963 CASAVA_Build 14 25164828 3D AGCAAGTGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 658 hom 24 3 9 14 T 15 12 81964 CASAVA_Build 14 25165453 1D TTAAAATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 10 9 81965 CASAVA_Build 14 25165618 2I ATCTCAACGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 T 9 11 81966 CASAVA_Build 14 25166683 1I TAATTAATTA -/T TTTTTTTTTT 1700 het 1653 hom 15 5 7 3 T 10 11 81967 CASAVA_Build 14 25167750 1I ATCCTTTGAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 8 9 81968 CASAVA_Build 14 25167801 2D CTCATGCACA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 43 14 17 13 CT 6 5 81969 CASAVA_Build 14 25170167 1I AAAGACTTTC -/T TTAAATCCTC 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 T 2 3 81970 CASAVA_Build 14 25177135 4D GTTTTGCTTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 18 15 9 TG 10 8 81971 CASAVA_Build 14 25178593 1D TTACAGATAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 19 25 1 A 9 8 81972 CASAVA_Build 14 25190779 2I TTCAAGTAAC --/AT GTGAGTAATT 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 AT 0 1 81973 CASAVA_Build 14 25193544 2D GATTGATGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 38 3 15 21 A 16 14 81974 CASAVA_Build 14 25200799 1I CTTCCTCTCA -/C CACAGTCACT 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 C 1 2 81975 CASAVA_Build 14 25206508 1I ACTGTTTTTT -/C CCCCACCCTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 4 5 81976 CASAVA_Build 14 25207731 1I TTCTGTAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 9 10 81977 CASAVA_Build 14 25210404 2I TTTCTAAATC --/TT TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 24 13 5 6 T 16 18 81978 CASAVA_Build 14 25242022 1D TCAAGAAATA T/- TTTTTATGCA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 6 5 81979 CASAVA_Build 14 25242198 4I ATATATATAT ----/TAAA TAGTTAAATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TAAA 0 1 81980 CASAVA_Build 14 25244044 4D AAAGATGTCA TGAC/---- GAATTCTGAC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 TGAC 1 0 81981 CASAVA_Build 14 25254831 1I AAGTACATAG -/A AAAATCAGTA 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 A 4 5 81982 CASAVA_Build 14 25257931 4I CATTGGTCTA ----/TCTT TCTGTTTTGG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TCTT 0 1 81983 CASAVA_Build 14 25261980 1I CCATAGGCCT -/C CCAAAATTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 2 3 81984 CASAVA_Build 14 25262487 3D CTCCAGATAT TTG/--- TTAATTATGA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 TTG 1 0 81985 CASAVA_Build 14 25269912 1I AATAAACAAA -/G CATGTCCTGG 3070 het 3070 hom 49 18 22 9 G 0 1 81986 CASAVA_Build 14 25271306 1D ATCCTCTCCA G/- TACTATCTGC 3070 hom 102 het 36 0 34 2 G 1 0 81987 CASAVA_Build 14 25284435 1I TCGCAAGGAC -/A AAAAAACCAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 6 7 81988 CASAVA_Build 14 25285156 4D TTGATTAGCT GTAA/---- GTAACAAAGA 3070 hom 96 het 35 0 31 8 GTAA 2 1 81989 CASAVA_Build 14 25286758 4D TTTAGCTTGC TTCA/---- TTCACATTTG 3070 hom 119 het 43 0 39 5 TTCA 2 1 81990 CASAVA_Build 14 25316882 1D CACAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1926 het 1926 ref 39 29 5 7 A 12 11 81991 CASAVA_Build 14 25327645 4D TTCTAGAGTT TTTG/---- TTTGTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 TTTG 2 1 81992 CASAVA_Build 14 25378039 3I GCTGTTTTAG ---/ATC ATCACTGTCT 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 ATC 1 2 81993 CASAVA_Build 14 25383800 1I AATATTGGGG -/A AAATTCTGAA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 3 4 81994 CASAVA_Build 14 25383976 1D CTTTTATTCC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 45 23 14 9 A 9 8 81995 CASAVA_Build 14 25400112 1D CTTTTCTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 31 1 16 16 A 12 11 81996 CASAVA_Build 14 25402114 1D AACCAGAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 T 13 12 81997 CASAVA_Build 14 25402634 3I CATTACTGTC ---/TAT TATTTGTAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 TAT 1 2 81998 CASAVA_Build 14 25404160 4I ACTAGGAACA ----/CTAT CTATCTCCTT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 CTAT 1 2 81999 CASAVA_Build 14 25409456 3D AGTTTTTCTG TTT/--- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 11 8 82000 CASAVA_Build 14 25413070 1I AGCTAATTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 T 6 7 82001 CASAVA_Build 14 25418012 1I TCCAAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 11 12 82002 CASAVA_Build 14 25422381 1D GAGGGCAAAA T/- TTTTTTTTTA 1322 het 1322 ref 33 26 3 4 T 10 9 82003 CASAVA_Build 14 25427375 1D TGCAAATAAG T/- TTTTATCATC 3070 het 3070 hom 43 21 22 0 T 5 4 82004 CASAVA_Build 14 25427841 1I AAATACCGGC -/G ATCAAATCAG 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 G 0 1 82005 CASAVA_Build 14 25429146 1I GAGGAAAAAA -/T TTTTATAACA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 T 4 5 82006 CASAVA_Build 14 25429716 1I TAAAGAAGTG -/T GAGTGATTTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 0 1 82007 CASAVA_Build 14 25434133 1D TACTGCAATG C/- CCATGGTCTC 3070 hom 126 het 46 0 42 5 C 3 2 82008 CASAVA_Build 14 25440236 4I CCCTCCCCAG ----/CTCT CTATCTACAC 2282 het 5 hom 26 1 18 7 CT 1 3 82009 CASAVA_Build 14 25454197 5D AAGATGTTGA CTTTT/----- CTTTTAGCAT 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 CTTTT 2 1 82010 CASAVA_Build 14 25461100 2D GAAAATAAGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AT 9 8 82011 CASAVA_Build 14 25462578 3D TTTTCACTTA GTT/--- TTTTTCTAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 GTT 1 0 82012 CASAVA_Build 14 25474238 1D AAACCTACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 10 20 8 T 11 10 82013 CASAVA_Build 14 25486225 41I TATTTGTTTT -----------------------------------------/GAGGTGATTTTCATATTGAATTGCAAATTCGAAGAAGCAGC AGACAGATTC 3070 het 3070 ref 42 23 10 9 GAGGTGATTTTCATATTGAATTGCAAATTCGAAGAAGCAGC 0 1 82014 CASAVA_Build 14 25494384 2I GACACATTCA --/GT GTGCACATCT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 GT 1 2 82015 CASAVA_Build 14 25499304 1D TTGATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 11 10 82016 CASAVA_Build 14 25511868 1I AGTCCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 A 12 13 82017 CASAVA_Build 14 25529767 2I GTGGTTCCAC --/AT GAGTTTCTAA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AT 0 1 82018 CASAVA_Build 14 25535637 1D AAATAAACTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 9 8 82019 CASAVA_Build 14 25544071 1D CCAGTTGGAG T/- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 T 1 0 82020 CASAVA_Build 14 25557698 2D AGTTATAAAA AG/-- AGTTTAGTCA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 AG 2 1 82021 CASAVA_Build 14 25567090 2D TTTTTTTCTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 88 het 36 0 29 7 TG 8 7 82022 CASAVA_Build 14 25597115 2I ACAAAAATGG --/AT ATATATATAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AT 5 6 82023 CASAVA_Build 14 25600050 1I CTACTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 32 1 25 6 A 13 14 82024 CASAVA_Build 14 25601583 2I14M1I TATGGTTTGG --CTGTTTCCCCACCC-/CTCTGTTTCCCCACCCA AATCTCATCT 3070 hom 105 het 38 0 36 5 N/A 0 0 82025 CASAVA_Build 14 25610408 2D TATGGGGAGT GG/-- GGGGGGGCGC 3070 hom 72 het 33 0 21 13 G 9 7 82026 CASAVA_Build 14 25611688 2D CCTCATCAAT TA/-- TTTTTTTTTC 3070 het 227 hom 37 3 13 21 TA 1 0 82027 CASAVA_Build 14 25614924 5D GTACATATAG AATAA/----- AACAAGAATA 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 AATAA 1 0 82028 CASAVA_Build 14 25617517 1D TAAATTAGTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 9 8 82029 CASAVA_Build 14 25621345 1I AACTTTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1981 hom 45 8 22 15 A 16 17 82030 CASAVA_Build 14 25627597 1D CCCCACCCTG C/- CCCCCCCAGT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 8 7 82031 CASAVA_Build 14 25627990 1I GGGAACTACT -/A AAATTACATA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 3 4 82032 CASAVA_Build 14 25631523 4D TTTATAATTA ATTG/---- ATTAATACTT 2449 het 2449 ref 15 8 6 1 ATTG 1 0 82033 CASAVA_Build 14 25632970 1I CTGAGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 11 12 82034 CASAVA_Build 14 25633814 2I ATATATATAT --/AA AATCAGCAAC 3070 hom 42 het 23 0 15 8 A 2 4 82035 CASAVA_Build 14 25652849 1I CGTCACTGGG -/A AAAAATTCAC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 5 6 82036 CASAVA_Build 14 25663519 8I CCCAGGAAAA --------/AACAGACC AACAGACCAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AACAGACC 1 2 82037 CASAVA_Build 14 25695759 1I CATTTATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 10 11 82038 CASAVA_Build 14 25697682 2D ATTCCTATGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 AT 6 5 82039 CASAVA_Build 14 25698054 3D TGAGTTGAGT TTC/--- TTCTTATATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTC 2 1 82040 CASAVA_Build 14 25711267 3D AAATGGCAAG AAC/--- AACAATTACT 3070 het 1922 hom 31 8 10 13 AAC 2 1 82041 CASAVA_Build 14 25719210 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2512 het 2512 ref 33 15 8 10 T 15 14 82042 CASAVA_Build 14 25721195 12D ATTCAAATCT ATTCATTCTTTA/------------ ATTCATTCAA 3070 het 3070 ref 49 28 19 3 ATTCATTCTTTA 1 0 82043 CASAVA_Build 14 25723488 1I TTTTGCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 12 13 12 A 11 12 82044 CASAVA_Build 14 25728263 1D TTCAAGACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 13 13 7 T 10 9 82045 CASAVA_Build 14 25735983 3D AGGAGACAGT GTG/--- GTGATAAAGT 3070 het 3070 hom 46 20 25 3 GTG 2 1 82046 CASAVA_Build 14 25739358 4D TCCTCCTTCT TCTC/---- TCTATGTGCT 3070 het 3070 ref 39 17 20 3 TC 3 1 82047 CASAVA_Build 14 25765132 1D TCTTATAGTT A/- AAAAAATCTC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 7 6 82048 CASAVA_Build 14 25778072 1D AATATCATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 10 9 82049 CASAVA_Build 14 25779601 1D TTCCAAATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 8 17 6 A 10 9 82050 CASAVA_Build 14 25781226 1D TTTAGACATT A/- ATTAAAGGAA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 2 1 82051 CASAVA_Build 14 25781411 3I AATCAAAGTT ---/AAG AAGTAATTTG 3070 hom 104 het 40 0 35 5 AAG 1 2 82052 CASAVA_Build 14 25788853 2D TTAAAATGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 14 12 82053 CASAVA_Build 14 25816601 1D GTATTAAGAA G/- TTAGAAAGTA 3070 het 3070 ref 42 25 12 5 G 1 0 82054 CASAVA_Build 14 25826309 1I TTCTAAGAAC -/A AGATTAAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 1 2 82055 CASAVA_Build 14 25826467 1I AACAACTGAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 A 7 8 82056 CASAVA_Build 14 25828479 4I GAGCTTGTCT ----/CTTC CTTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 CTTC 1 2 82057 CASAVA_Build 14 25828801 2D CCTCCCTTTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 CT 6 5 82058 CASAVA_Build 14 25829030 1I CTTACTTTTT -/A ATCCATATAA 2913 het 2913 ref 28 14 6 8 A 1 2 82059 CASAVA_Build 14 25830428 1D ACAATGGAAA T/- TTATTTCTCA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 3 2 82060 CASAVA_Build 14 25833985 1D ATCAAATGTG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 18 11 10 A 9 8 82061 CASAVA_Build 14 25834440 1I AGGAAAAGGG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 6 7 82062 CASAVA_Build 14 25840638 1I AGCTTGTTCT -/A AGGAAGCTAG 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 A 1 2 82063 CASAVA_Build 14 25841815 1D AAGTCCTCAC T/- CTCTTTTATT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 1 0 82064 CASAVA_Build 14 25847423 4I CAAGAACCAC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 TTAT 2 3 82065 CASAVA_Build 14 25853256 4D ACAAGAAAAA AAAC/---- AAACAACCCC 3070 het 3070 hom 25 9 15 2 AAAC 2 1 82066 CASAVA_Build 14 25860276 10I GTATCATAAA ----------/ATTATACTGT ATTATACTGT 3070 het 2226 hom 28 6 15 7 ATTATACTGT 1 2 82067 CASAVA_Build 14 25866934 18D ATGAGTCAAC ATCACGGTGCAGATGAAA/------------------ ACTCTTTACA 3070 het 3070 ref 28 18 11 2 ATCACGGTGCAGATGAAA 1 0 82068 CASAVA_Build 14 25867158 1I ATGTCTTTCA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 6 7 82069 CASAVA_Build 14 25869721 1I ATCCCAATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 10 82070 CASAVA_Build 14 25877845 1D ATCTGACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 A 11 10 82071 CASAVA_Build 14 25879724 2D ATACTTCTCT TA/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 TA 1 0 82072 CASAVA_Build 14 25880716 4D ATATTTTGAC TTTA/---- TTTATTTAAC 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 TTTA 3 2 82073 CASAVA_Build 14 25881843 5I TAAATTCTGT -----/TTTTA TTTTAATATT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TTTTA 1 2 82074 CASAVA_Build 14 25885233 1D CCTCTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 34 0 14 20 T 15 14 82075 CASAVA_Build 14 25885506 1I TGCTTTGGAA -/T TTTTTTTTTT 2669 het 2669 ref 24 10 7 7 T 13 14 82076 CASAVA_Build 14 25890760 1D TGTAATAGGG A/- AAAAGAGTAA 3070 het 3070 hom 48 16 28 4 A 5 4 82077 CASAVA_Build 14 25901514 16D TACCTCTTTT CTTTTCGAGGTATAGA/---------------- CTTTACATTT 3070 het 3070 ref 32 21 15 1 CTTTTCGAGGTATAGA 1 0 82078 CASAVA_Build 14 25905306 1D AAAAGATAAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 24 7 16 2 A 8 7 82079 CASAVA_Build 14 25905723 1I AAAATCCAAC -/A AAAAAATTCC 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 6 7 82080 CASAVA_Build 14 25908253 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 24 1 18 5 A 10 11 82081 CASAVA_Build 14 25909714 1D TAAAATTACC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 38 0 34 6 A 10 9 82082 CASAVA_Build 14 25938732 3I GGGGATAGCA ---/CTT CTTTGATGCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 CTT 1 2 82083 CASAVA_Build 14 25948231 2D TTAATCATAT TA/-- TATATATGAT 1521 hom 10 het 8 0 4 4 TA 4 3 82084 CASAVA_Build 14 25971211 5I CATAATTAGT -----/TTTCA TTTATTATTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTTCA 0 1 82085 CASAVA_Build 14 25978441 3I TACTTTATAA ---/TAT TATGAGAATT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 TAT 1 2 82086 CASAVA_Build 14 25996228 1D TGAATCCTCC A/- AAAGTAGAAC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 4 3 82087 CASAVA_Build 14 25999355 3D CCATATAAAC ATT/--- AACATTTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 ATT 1 0 82088 CASAVA_Build 14 26010141 1I CAGATGTGTA -/C TTTACTAACC 3070 hom 98 het 43 0 32 11 C 0 1 82089 CASAVA_Build 14 26016193 1D AGTATATTTT G/- CTACTTACTA 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 G 1 0 82090 CASAVA_Build 14 26031855 3I TCTACTAAAC ---/ATT ATAAAAATTA 3070 hom 51 het 21 0 16 5 ATT 0 1 82091 CASAVA_Build 14 26032786 2I TCTCTGAGTC --/TT TGGTTTCCTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 1 3 82092 CASAVA_Build 14 26034640 4D GCGCTGCACC CACT/---- AACTCATCAT 3070 het 194 hom 18 1 15 2 CACT 1 0 82093 CASAVA_Build 14 26044057 13I TTTTGTCTTG -------------/AGAGTCTAGGGGT AGCTAGCTAG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 AGAGTCTAGGGGT 0 1 82094 CASAVA_Build 14 26045258 1I CAACACTTGT -/A TAAACTATTC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 0 1 82095 CASAVA_Build 14 26051886 1I ATATCATAAG -/A AGGTAATCAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 82096 CASAVA_Build 14 26053860 4D ATGAATTGAG ACAA/---- ACACACTAAA 3070 hom 114 het 39 0 38 1 ACAA 1 0 82097 CASAVA_Build 14 26058243 3I TAGAAATATT ---/TTA TTGTCAATGC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TTA 0 1 82098 CASAVA_Build 14 26068175 1D GTGGTTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 40 1 29 10 T 12 11 82099 CASAVA_Build 14 26078578 2I AGCTCTTATG --/TA TATATATATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TA 4 5 82100 CASAVA_Build 14 26078917 1D GAGGCAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 10 9 82101 CASAVA_Build 14 26087194 1D AAACATTATC A/- CTCAGCATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 82102 CASAVA_Build 14 26088378 1D GAATTACAAG T/- TTTTTTTTTT 2772 het 454 hom 26 2 10 14 T 19 18 82103 CASAVA_Build 14 26093038 1D CTACAAATAC A/- AAAAAAACTG 3070 hom 44 het 21 0 14 7 A 8 7 82104 CASAVA_Build 14 26098929 4D TTTCTAGCAT AAAG/---- AAAGATAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 AAAG 2 1 82105 CASAVA_Build 14 26109434 1D CTATGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 12 11 82106 CASAVA_Build 14 26117402 1D AGAAACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 11 10 82107 CASAVA_Build 14 26124857 2I CAAAATTCCC --/CT GTCATACTCC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CT 0 1 82108 CASAVA_Build 14 26125955 1I ATCATCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2823 hom 33 12 13 8 T 16 17 82109 CASAVA_Build 14 26127928 1D ATTCCAACTA T/- TCATAATTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 1 82110 CASAVA_Build 14 26131025 4D AGTGTAAAAT AGAC/---- AGATTCCAAC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AGAC 1 0 82111 CASAVA_Build 14 26133825 4I ACTGTACTAC ----/ACTA ACTGTCAACA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ACTA 0 1 82112 CASAVA_Build 14 26151137 2I TTGTTGACTA --/TC TCTGTGACAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TC 1 2 82113 CASAVA_Build 14 26164002 4I TGATTAAACT ----/TTGA TTGAAAACTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTGA 1 2 82114 CASAVA_Build 14 26176224 2I ACAAAATGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 33 1 17 15 T 13 15 82115 CASAVA_Build 14 26181513 1I TGGTAAGCTA -/T TTAATTACTG 3070 het 2366 hom 20 6 13 1 T 2 3 82116 CASAVA_Build 14 26187579 1I TAAGTTAAAA -/T TTTAATTTGT 1038 het 1038 ref 47 37 3 7 T 3 4 82117 CASAVA_Build 14 26190136 1I CTATATATAT -/A ATATATGGAA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 1 2 82118 CASAVA_Build 14 26192542 2D ATAGACTGAC AT/-- ATGTGAAATG 3070 hom 99 het 38 0 34 6 AT 2 1 82119 CASAVA_Build 14 26197324 1I AACCCCAAAA -/G ATGGAATGAG 3070 hom 102 het 38 0 31 7 G 0 1 82120 CASAVA_Build 14 26210916 1D TTAGTACTTG A/- AAAAGGCACA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 5 4 82121 CASAVA_Build 14 26252461 1I GCTAAAAACG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 7 8 82122 CASAVA_Build 14 26259087 1I ATGAAGAAAA -/G TTTTCACCAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 G 0 1 82123 CASAVA_Build 14 26262140 2I CTGATTAAAC --/AT AAATATTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 AT 0 1 82124 CASAVA_Build 14 26273071 2I GAAAATTAAT --/AC ATTTTCAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AC 0 1 82125 CASAVA_Build 14 26273742 2D GGTGCCTGTC TT/-- TTATTTATTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 4 T 4 2 82126 CASAVA_Build 14 26292215 1I ATGTGAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 9 82127 CASAVA_Build 14 26311717 1D ATTTTTATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 36 het 18 0 12 9 T 9 8 82128 CASAVA_Build 14 26316301 1I AAATTGATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 9 10 82129 CASAVA_Build 14 26317758 1I ATATATTATA -/T ATTAACTCTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 0 1 82130 CASAVA_Build 14 26326469 9I TCTCATTTTG ---------/CTGTGCTCT CTGTGTCCTC 3070 hom 141 het 52 0 47 5 CTGTGCTCT 0 1 82131 CASAVA_Build 14 26337700 1D ACAGTGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 18 0 9 9 A 12 11 82132 CASAVA_Build 14 26339134 2I AGAGAGAGAG --/AA AAAGCTGGGG 2665 het 2665 ref 30 11 9 10 A 3 5 82133 CASAVA_Build 14 26346556 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1749 het 766 hom 13 3 7 3 A 15 14 82134 CASAVA_Build 14 26348638 4D CTCTGGTATT TTAA/---- TTAATTTATT 336 het 336 ref 26 12 1 13 TTAA 2 1 82135 CASAVA_Build 14 26359079 2I GAAGATATTG --/AT ATATATATAT 2803 het 2716 hom 23 6 9 8 AT 7 8 82136 CASAVA_Build 14 26362521 1I ATAGGCTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 9 10 82137 CASAVA_Build 14 26376053 2I GAATTAATTT --/AA GTTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 A 0 2 82138 CASAVA_Build 14 26380896 1D TATTCTCTAA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 7 6 82139 CASAVA_Build 14 26382743 4D GTATTAAATG AAAT/---- AAATAGCTGT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AAAT 2 1 82140 CASAVA_Build 14 26390914 1I CCATCCTCAA -/G GTAGCCCCCA 3070 het 3070 ref 50 23 16 11 G 1 2 82141 CASAVA_Build 14 26396675 1D AACTGCTGTT A/- ACGGCAAAAG 3070 het 3070 ref 62 34 20 10 A 2 1 82142 CASAVA_Build 14 26421884 4I ATTAAAATTC ----/CTTA CTTTATCTAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 CTTA 0 1 82143 CASAVA_Build 14 26425196 1D TTGTTATTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 G 2 1 82144 CASAVA_Build 14 26439055 37D AATAAATTCC TTAAGGAATTTATTCCTTAGGGATATTATATCCCTAA/------------------------------------- TGAGAAAAAT 3070 hom 66 het 22 0 23 5 TTAAGGAATTTATTCCTTAGGGATATTATATCCCTAA 1 0 82145 CASAVA_Build 14 26445768 1D TGATGTTATA T/- TTCTTTTATC 3070 het 3070 hom 23 7 12 4 T 3 2 82146 CASAVA_Build 14 26451684 2D TACATGTCTT TA/-- TATATATATA 2223 het 2223 ref 19 9 7 3 TA 6 5 82147 CASAVA_Build 14 26466757 1D AAAGTATGGC A/- AAAAAAAAAA 2110 het 1380 hom 31 8 6 17 A 15 14 82148 CASAVA_Build 14 26488227 1I GGAAATCCCC -/A CAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 A 0 1 82149 CASAVA_Build 14 26493462 1I CAGAAAGAGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 A 8 9 82150 CASAVA_Build 14 26503449 3I GTTATAAAAC ---/AAA AAAGATTCTC 3070 het 3070 ref 51 22 20 9 A 3 6 82151 CASAVA_Build 14 26507380 1I AGTTATTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 9 10 82152 CASAVA_Build 14 26510831 2D TTTGAAAAAC AT/-- GTGGCAAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 AT 1 0 82153 CASAVA_Build 14 26511115 1D AAGTGTTCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 10 9 82154 CASAVA_Build 14 26511324 1D GATAATAAGC T/- TTTGGAACAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 4 3 82155 CASAVA_Build 14 26516573 5I CTTATATACT -----/TAAAA TAAACCCCAG 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 TAAAA 0 1 82156 CASAVA_Build 14 26517928 4I ATCTTTTAAG ----/CTGT CTATTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 CTGT 0 1 82157 CASAVA_Build 14 26519639 1I ACAAGAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 9 10 82158 CASAVA_Build 14 26521248 2D CTGGATTTAT TA/-- TCTTACTGAA 2898 het 2898 ref 21 11 8 2 TA 1 0 82159 CASAVA_Build 14 26537760 3I TGCTAGATTG ---/AGA AGGACATTTT 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 AGA 0 1 82160 CASAVA_Build 14 26543613 1D ACCATAGACT C/- CTTCCACATG 3070 hom 108 het 39 0 37 3 C 2 1 82161 CASAVA_Build 14 26544445 2D CTACAGACTG TT/-- TTTTTTTTTT 2450 hom 43 het 33 0 13 20 T 18 16 82162 CASAVA_Build 14 26549204 1D GAGAAATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 44 0 37 8 A 10 9 82163 CASAVA_Build 14 26552647 1D GAGTTTCCCC T/- AACATTGTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 8 T 1 0 82164 CASAVA_Build 14 26553213 1I TTTTGAGTGG -/T AAATAATGAC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 T 0 1 82165 CASAVA_Build 14 26561727 1D ACTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 19 0 12 7 A 13 12 82166 CASAVA_Build 14 26573985 2I TATGAGTATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 TA 5 6 82167 CASAVA_Build 14 26597609 2D TGGGTGCCTA CT/-- CTGTTTTCCT 3070 het 3070 hom 56 22 27 9 CT 2 1 82168 CASAVA_Build 14 26605946 2I GTTTAATAAC --/AG TGATTTAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 AG 0 1 82169 CASAVA_Build 14 26611490 1D AAGTTTTTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 G 2 1 82170 CASAVA_Build 14 26612413 20D AACATTTTAT AATGGAGGAAAAAGCTATGC/-------------------- AATGGAGGAA 3070 het 3070 ref 22 16 8 3 AATGGAGGAAAAAGCTATGC 1 0 82171 CASAVA_Build 14 26613837 1D CAGTTTTATG T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 7 6 82172 CASAVA_Build 14 26615042 1D TCTGTATTTG A/- AAGCACTTAG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 3 2 82173 CASAVA_Build 14 26617392 1D CCTTCACTCT A/- TTAAGAGATT 3070 het 3070 ref 64 30 29 5 A 1 0 82174 CASAVA_Build 14 26618124 2D TCTATTCCTG TC/-- TCTCTCTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TC 4 3 82175 CASAVA_Build 14 26620904 4D TGTTTATTTA TTTG/---- TTTATCACAT 3070 het 3070 hom 31 15 15 2 TTTG 1 0 82176 CASAVA_Build 14 26625285 1D TTAAAATGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 T 10 9 82177 CASAVA_Build 14 26628266 1I GTGCTGACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 9 10 82178 CASAVA_Build 14 26629402 1D AATGTGGCAT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 53 22 21 11 A 8 7 82179 CASAVA_Build 14 26633570 1D TATTATTATT A/- TTTTTATCTA 3070 het 3070 hom 25 9 15 4 A 1 0 82180 CASAVA_Build 14 26633683 1D CATCAAAATT A/- TTTCCATACT 2207 het 2207 ref 23 16 6 1 A 1 0 82181 CASAVA_Build 14 26635779 2D TACATGAAAC AG/-- ATTTTTCCGT 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AG 1 0 82182 CASAVA_Build 14 26643328 1I TCGGCCATTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 A 8 9 82183 CASAVA_Build 14 26643570 4D TCATTATTTA TTTT/---- TTTGTGTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 7 3 82184 CASAVA_Build 14 26645799 1I TAGTTAACAA -/G GGTATTAACT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 G 2 3 82185 CASAVA_Build 14 26646826 5I CATAAAAAAA -----/TGAGC TGGGTGTGAT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 TGAGC 0 1 82186 CASAVA_Build 14 26647037 1I AAGAGTATGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 8 9 82187 CASAVA_Build 14 26656245 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2432 het 2432 ref 32 16 7 9 T 15 16 82188 CASAVA_Build 14 26660513 1I TCTCCACAAT -/C CCCTCTAGAG 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 C 3 4 82189 CASAVA_Build 14 26664990 1D GCCTTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 A 13 12 82190 CASAVA_Build 14 26677385 2D ACAATATAGC AA/-- AAAAAAACAA 766 het 766 ref 41 21 7 13 A 9 7 82191 CASAVA_Build 14 26696001 1D CACTGTTTAA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 T 8 7 82192 CASAVA_Build 14 26719830 1I TCTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 T 10 11 82193 CASAVA_Build 14 26733583 5I GTTTGATAGC -----/AGAGT AGAGTGACTA 3070 hom 156 het 60 0 51 9 AGAGT 1 2 82194 CASAVA_Build 14 26747154 4I CCAGAATTAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 43 18 15 10 AAAC 3 4 82195 CASAVA_Build 14 26764638 1D TAAAGGAGTG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 8 7 82196 CASAVA_Build 14 26790102 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 29 0 19 10 A 11 12 82197 CASAVA_Build 14 26820689 4I AGGCAAATGC ----/TTCA TTCATCATAC 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 TTCA 1 2 82198 CASAVA_Build 14 26832636 2I TATTTTAATC --/AT GTGCCTTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 21 4 AT 0 1 82199 CASAVA_Build 14 26833194 2I36M1D CTATACATAT --TGTGTGTAACATACCAATAAGGATACAATCTATTAGA/TGTGTGTGTAACATACCAATAAGGATACAATCTATTAG- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 9 N/A 0 0 82200 CASAVA_Build 14 26833834 4D42M2D ACTATTAACC GTATTAAGTTAATAGTTAAACTATTAACTGTATTAAGTTAATAGTTAA/----AAAGTTAATAGTTAAACTATTAACTGTATTAAGTTAATAGTT-- AAATCAAAGT 2978 het 2978 ref 22 17 7 17 N/A 0 0 82201 CASAVA_Build 14 26835168 1D TCTGCCCCAG C/- CCCCCCAAAC 3070 het 3070 ref 53 29 18 7 C 7 6 82202 CASAVA_Build 14 26838798 17D AACTAGTTCA TCCTTATACCTAATCTG/----------------- TCCATTCTAA 3070 het 3070 ref 53 36 18 6 TCCTTATACCTAATCTG 1 0 82203 CASAVA_Build 14 26840405 1I TGTCTCTATG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 7 8 82204 CASAVA_Build 14 26853398 6I AAGGCCAAAG ------/GCCAAA GCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 GCCAAA 0 1 82205 CASAVA_Build 14 26853586 3I TTTCAGATTT ---/CTA CTAACTTCCT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 CTA 1 2 82206 CASAVA_Build 14 26864833 1I TTTATTTCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 8 9 82207 CASAVA_Build 14 26866125 1D GTGTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 48 29 16 3 G 1 0 82208 CASAVA_Build 14 26866374 1I TGCCTCGTAA -/T TTTTTCTTGA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 5 6 82209 CASAVA_Build 14 26890197 1I ACATCATTCC -/T TTTTTTACAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 6 7 82210 CASAVA_Build 14 26892743 2I TGCTATAATC --/AT GTTTTAATTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AT 0 1 82211 CASAVA_Build 14 26893051 4I GTTTATATAT ----/TTTG TTTGCTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTTG 1 2 82212 CASAVA_Build 14 26896016 2I CAGTCAAAAC --/TG TTATTTCTCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TG 0 1 82213 CASAVA_Build 14 26904086 3D TCTAGCTTTG TTC/--- TTCTTTCTCA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 TTC 2 1 82214 CASAVA_Build 14 26905188 10D TTGTATGTGT ATGTGTGTGC/---------- ATGTGTGTGT 3070 hom 100 het 42 0 32 12 ATGTGTGTGC 1 0 82215 CASAVA_Build 14 26910538 1D TTTAAGCATT A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 7 6 82216 CASAVA_Build 14 26911894 10D ACTTTGCACA TTCATCTCAT/---------- TTCATCTCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 6 TTCATCTCAT 2 1 82217 CASAVA_Build 14 26912759 1I32M1D TTATTTTTAA -TATTCTGACATCACATTTCTATCTCCAAGAGCA/TTATTCTGACATCACATTTCTATCTCCAAGAGC- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 33 0 39 6 N/A 0 0 82218 CASAVA_Build 14 26919496 1D AAAATTTTCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 373 hom 36 1 29 8 A 10 9 82219 CASAVA_Build 14 26923145 3I GAGAAGGAAT ---/AAG AAGTTTTACT 3070 hom 95 het 38 0 30 8 AAG 1 2 82220 CASAVA_Build 14 26926609 2D GTAAATCAAA CT/-- CTGATAGAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 CT 2 1 82221 CASAVA_Build 14 26933573 4I5M2I AATGGCTTAT ----ACCCA--/TGTAAGCCATT AAAGATAGGC 3070 hom 96 het 32 0 32 3 N/A 0 0 82222 CASAVA_Build 14 26934056 8I TTAAAATAAT --------/TGAACTCA TGAACTCATA 3070 hom 47 het 20 0 15 5 TGAACTCA 1 2 82223 CASAVA_Build 14 26936286 4I TAAAACTCAC ----/TGTT TGTTTACCAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TGTT 1 2 82224 CASAVA_Build 14 26943456 2I AGTGAAAGAA --/AT ATATATATAT 3070 het 13 hom 13 1 10 2 AT 8 9 82225 CASAVA_Build 14 26946486 1D ATAAGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 43 1 34 8 T 12 11 82226 CASAVA_Build 14 26947633 6I TCCACAAAAC ------/TAAATT TATATTTTCA 3070 hom 98 het 37 0 34 3 TAAATT 0 1 82227 CASAVA_Build 14 26947849 1D TTTACATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 11 10 82228 CASAVA_Build 14 26966051 1D CCTTCCAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 9 82229 CASAVA_Build 14 26968605 1I TTACCTAGGG -/A AGAATATATA 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 A 1 2 82230 CASAVA_Build 14 26973533 1D ATACAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 12 11 82231 CASAVA_Build 14 26990841 1I TTAGAAGCTG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 144 het 50 0 48 2 T 7 8 82232 CASAVA_Build 14 26998004 5D AATTTAGAAG TTTTC/----- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TTTTC 1 0 82233 CASAVA_Build 14 27015316 3D CAACTATTAT ATC/--- ATCAATGTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ATC 2 1 82234 CASAVA_Build 14 27023869 4I ATCCATGCTG ----/AATT TATTCAAATG 3070 hom 54 het 22 0 17 5 AATT 0 1 82235 CASAVA_Build 14 27050460 1D CTGGCTGTTG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 63 het 43 1 33 10 T 8 7 82236 CASAVA_Build 14 27052810 1I TCTCTTCCTC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 7 8 82237 CASAVA_Build 14 27058102 1I TCTCCCTGAT -/A ATAAGCATGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 1 2 82238 CASAVA_Build 14 27058336 5D TAAAGTTACT ATTTG/----- ATTTGACTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 ATTTG 2 1 82239 CASAVA_Build 14 27058627 16I ATGAATAAAT ----------------/TAATGCATGAATAAAA TAATACATTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TAATGCATGAATAAAA 0 1 82240 CASAVA_Build 14 27059091 4I AAAATAAAAT ----/AGAG AGAAGACTTT 3070 hom 135 het 47 0 46 1 AG 1 3 82241 CASAVA_Build 14 27060044 1I TACAAACACA -/T TTTCAATATT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 3 4 82242 CASAVA_Build 14 27083942 14I GTGAAAATAA --------------/AAATATGTGAAAAT AAATATGTGA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AAATATGTGAAAAT 1 2 82243 CASAVA_Build 14 27086214 5I AGTTGCTATA -----/TCGAT CCTATGCTAT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 TCGAT 0 1 82244 CASAVA_Build 14 27086561 4I TATTGAAATA ----/ATTG ATTGGCTAAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 ATTG 1 2 82245 CASAVA_Build 14 27087545 1I CCTTCACAAC -/A GCCCCTGTCA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 0 1 82246 CASAVA_Build 14 27091374 2I ACATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 60 het 29 0 21 8 AC 5 6 82247 CASAVA_Build 14 27095572 1I CAGAATCTAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 8 9 82248 CASAVA_Build 14 27098324 4I ATCCTCATTG ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AT 5 7 82249 CASAVA_Build 14 27101988 1D ATAAAAATTA T/- TTATAACCAT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 3 2 82250 CASAVA_Build 14 27103533 1I ACATAGTACT -/A AGAAGTACCA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 1 2 82251 CASAVA_Build 14 27120683 1I GGAATGGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 114 hom 33 1 23 9 T 9 10 82252 CASAVA_Build 14 27123682 1D AATCGAAGTT G/- ATTCACCTAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 0 82253 CASAVA_Build 14 27124350 2D ATGTCATTTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AT 7 6 82254 CASAVA_Build 14 27125756 1D CCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 16 1 11 4 T 13 12 82255 CASAVA_Build 14 27133078 3I AATATATAAT ---/AAC AATCTTATGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AAC 0 1 82256 CASAVA_Build 14 27133469 3I GTTAGAAACA ---/AGC AGAAGTCATG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AGC 0 1 82257 CASAVA_Build 14 27133651 2D TAAACAGACA TC/-- TCTCATAAGA 3070 hom 127 het 47 0 43 5 TC 3 2 82258 CASAVA_Build 14 27174324 2D TTTAGGGGAA AG/-- AGAGTGAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 AG 3 2 82259 CASAVA_Build 14 27181406 4I ATATTTTATA ----/ATAG ATAGGGCTAA 3070 het 2802 hom 25 6 13 6 ATAG 1 2 82260 CASAVA_Build 14 27181858 1D CTTATGATGC T/- GTTTGGTCAC 3070 het 3070 hom 36 9 22 6 T 1 0 82261 CASAVA_Build 14 27183541 1I AGAAAGGCAG -/A AAAAAAAAAA 1547 het 1547 ref 26 9 6 11 A 13 14 82262 CASAVA_Build 14 27189238 2D CAAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2530 het 1058 hom 15 4 7 5 A 14 12 82263 CASAVA_Build 14 27201005 1I ACAAAAATGG -/A AATATATTCC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 2 3 82264 CASAVA_Build 14 27202852 5D TTGACTCACT TTGAG/----- TTAATTTTTG 3070 het 3070 ref 28 19 8 2 TTGAG 1 0 82265 CASAVA_Build 14 27205793 1I TTTTTCTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 T 9 10 82266 CASAVA_Build 14 27218384 4I AAACTTTAAT ----/AATA AATAAGTGAA 3070 het 3070 hom 50 22 26 2 AATA 1 2 82267 CASAVA_Build 14 27219038 6I AAAAATTTAT ------/TATTTA TATTTTGTTT 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 TATTTA 0 1 82268 CASAVA_Build 14 27231825 1D AGCCATTTAA G/- GTGAGAATGA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 G 2 1 82269 CASAVA_Build 14 27258353 4D ATATTTTGAC TAAT/---- TATTGCCCTG 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 TAAT 1 0 82270 CASAVA_Build 14 27279861 5D CAGCTATTAT ATAAC/----- ATGTCTATTG 3070 het 3070 ref 22 14 8 2 ATAAC 1 0 82271 CASAVA_Build 14 27315419 9D TATAGACAAA AAATAGAAG/--------- AAATGGGGAA 3070 hom 21 het 8 0 8 1 AAATAGAAG 1 0 82272 CASAVA_Build 14 27316424 1D TAGATATAGA T/- TTTTATTGTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 5 4 82273 CASAVA_Build 14 27317131 1I AGAATGTTCT -/G GGGTACTGGG 3070 hom 57 het 21 0 17 4 G 3 4 82274 CASAVA_Build 14 27324110 1D AACTAGTATA T/- TAAAAAAGTT 2707 het 1019 hom 14 4 7 4 T 2 1 82275 CASAVA_Build 14 27328340 1I CAAATCTACT -/A AAAAATAGAT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 A 5 6 82276 CASAVA_Build 14 27334337 1D ACTGTACCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 T 10 9 82277 CASAVA_Build 14 27339543 1I GTTACATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 10 11 82278 CASAVA_Build 14 27348206 1D ATCTTTCTTT C/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 38 27 8 3 C 1 0 82279 CASAVA_Build 14 27348353 1D GGCCCCAGTT A/- ACTCTTAGAC 1385 het 1385 ref 33 26 3 4 A 2 1 82280 CASAVA_Build 14 27353676 4I ACAGAAACAA ----/CAAC AAAAAAAGAT 1357 het 1357 ref 32 21 3 8 CAAC 0 1 82281 CASAVA_Build 14 27354212 1I GGCACATATC -/A AAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 52 31 18 3 A 5 6 82282 CASAVA_Build 14 27355073 4D CTAGGATAGG CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 77 40 23 17 CTTT 3 2 82283 CASAVA_Build 14 27359226 3I TCTTTTTCTA ---/TTG TTTGGAATAA 2348 het 2348 ref 43 30 5 8 TTG 0 1 82284 CASAVA_Build 14 27362777 1D ATATACTAAC A/- TTGTAGTATT 2689 het 2689 ref 47 41 6 0 A 1 0 82285 CASAVA_Build 14 27364108 1I TAAATCACTA -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 6 7 82286 CASAVA_Build 14 27364787 2I ATACTTCTGA --/AT ATGTTTTCTA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 AT 1 2 82287 CASAVA_Build 14 27366003 2D TTAATATTAT AA/-- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 10 8 82288 CASAVA_Build 14 27368475 1D CCACATTCTT G/- GGAGTGGCAG 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 G 3 2 82289 CASAVA_Build 14 27368692 1I54M4D TCATGGGTAC -TTTTTTTTAACTTATGTTCATAAGGCAGATTCATTCAGCAAAAGAGTAACCGATAGTA/ATTTTTTTTAACTTGTGTTCATAAGGTAGATTCATTCAGCAAAAGAGTAACTGGT---- ACTAGAAGAG 1333 het 1333 ref 25 42 3 5 N/A 0 0 82290 CASAVA_Build 14 27368812 2I27M2D TCTGTAACTC --TGTCTCTGAGGAAGCTTTTAAAATTATTC/TTTCTCTCTGAGGAAGCTTTTAAAATTAT-- TTTTTCATTT 956 het 956 ref 29 35 3 4 N/A 0 0 82291 CASAVA_Build 14 27369649 8I25M4D GTTACTCTTA --------TGATGATTTCAGGCACCTTATTCATTTTC/CATTTTTCTGATAATTTCAGGCCCCTTATTCAT---- TTTATGTTTC 1547 het 1547 ref 42 39 4 7 N/A 0 0 82292 CASAVA_Build 14 27370002 1D TCTATGTTGA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 31 14 17 0 T 8 7 82293 CASAVA_Build 14 27372670 5D TTCTGATTGC TTATT/----- TTATTTTGTA 2077 het 2077 ref 47 39 5 6 TTATT 2 1 82294 CASAVA_Build 14 27373869 1D TTCTTAATTG A/- AAAAAAAGGT 1303 het 1303 ref 37 28 3 6 A 8 7 82295 CASAVA_Build 14 27378916 2I TCTCAGGTGT --/TC TGTTACAGCA 3070 het 3070 ref 44 29 10 5 TC 0 1 82296 CASAVA_Build 14 27379268 1D TCTAGGATTT G/- GGATATATTT 3070 het 3070 ref 63 26 28 9 G 3 2 82297 CASAVA_Build 14 27382070 2D ATACACATAC AT/-- ATATATGTAT 2572 het 2572 ref 43 31 6 6 AT 4 3 82298 CASAVA_Build 14 27382347 17D ACTGCATTCC TTTCAGCAACCTGCATT/----------------- TTTCAGCAAC 2337 het 2337 ref 38 28 5 6 TTTCAGCAACCTGCATT 1 0 82299 CASAVA_Build 14 27382574 3D CCCTTTGTTT ATA/--- ATATTAAACA 3070 het 3070 ref 43 23 14 8 ATA 2 1 82300 CASAVA_Build 14 27382854 1I AGCACTGTGC -/T TGTATACACT 3070 het 3070 ref 46 30 9 7 T 1 2 82301 CASAVA_Build 14 27383798 1I TGGGTATTTC -/G GGGGCAGGGG 3070 het 3070 ref 48 29 13 6 G 4 5 82302 CASAVA_Build 14 27384085 1D CATTATCAAA C/- CTAATGTCAC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 C 2 1 82303 CASAVA_Build 14 27385166 1I GGATGTGGGT -/G GGGGGTCAGA 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 G 5 6 82304 CASAVA_Build 14 27385770 1I TTACAATAAG -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 6 7 82305 CASAVA_Build 14 27386145 5D TATTTATTGA TTTAT/----- TTTATTTTAT 2076 het 2076 ref 25 17 5 5 TTTAT 4 3 82306 CASAVA_Build 14 27386882 5I TACTGAGATA -----/AAGTT AACTGAGGAT 3070 het 3070 ref 58 47 9 2 AAGTT 0 1 82307 CASAVA_Build 14 27398650 1I AAGGACACGC -/A AAAAAAGTGA 1866 het 1866 ref 38 33 4 1 A 6 7 82308 CASAVA_Build 14 27401727 1D CATTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 11 10 82309 CASAVA_Build 14 27403825 1D GTCTAGAGGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 A 9 8 82310 CASAVA_Build 14 27404654 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 6 T 10 9 82311 CASAVA_Build 14 27407720 1D GTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2793 het 1414 hom 23 7 9 7 T 13 12 82312 CASAVA_Build 14 27426641 1I ATACAAACAC -/T TTTTTTGTAT 3070 het 2888 hom 25 8 12 5 T 6 7 82313 CASAVA_Build 14 27433135 2D GATGGGATTG TT/-- TGTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 6 T 3 1 82314 CASAVA_Build 14 27433831 1I TAATAAAAAT -/A AAAAAATAGA 3070 het 2381 hom 16 6 9 1 A 6 7 82315 CASAVA_Build 14 27443475 3I AGTAATCTAT ---/ATA ATGACATAAA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 ATA 0 1 82316 CASAVA_Build 14 27452918 1D AGCACGAACG A/- AAAAAAAAAA 894 het 894 ref 33 21 3 9 A 13 12 82317 CASAVA_Build 14 27454245 1D ATAAAAAAAA T/- ACAGTCTCGT 3070 het 3070 ref 36 14 17 5 T 1 0 82318 CASAVA_Build 14 27463853 1D AGTGTGTCTC A/- TTGTAAGCTG 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 1 0 82319 CASAVA_Build 14 27475823 1D TTTTTTTCCT G/- CAAAATGGAC 3070 het 3070 hom 37 19 17 1 G 1 0 82320 CASAVA_Build 14 27482107 1I TCTGCACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1639 hom 29 6 12 11 A 11 12 82321 CASAVA_Build 14 27482120 3D AAAAAAAACA AAC/--- AACAACAACA 2507 het 812 hom 27 3 8 19 AAC 5 4 82322 CASAVA_Build 14 27535167 1D TAGCAATGCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 8 82323 CASAVA_Build 14 27537737 1D GAAATAATTA C/- CCAATGTTAT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 C 3 2 82324 CASAVA_Build 14 27546302 1I TAAAAAAAAA -/C ATATCAAGCC 3070 hom 59 het 24 0 20 4 C 0 1 82325 CASAVA_Build 14 27550643 1D TTTGCCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 10 9 T 12 11 82326 CASAVA_Build 14 27553184 1D GATTGCTGCC A/- AAAAACAAGG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 6 5 82327 CASAVA_Build 14 27553363 1D TAAAGTATAA T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 T 7 6 82328 CASAVA_Build 14 27555967 2I ATATAAAATT --/TA TATATATATA 2250 het 988 hom 10 2 6 2 TA 6 7 82329 CASAVA_Build 14 27561447 1I AAAGCACCTA -/C CACTAAGTGT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 C 1 2 82330 CASAVA_Build 14 27569797 1D ATCTTCATTG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 44 19 18 9 A 8 7 82331 CASAVA_Build 14 27572199 2D AAAAAAAAAA AC/-- TAAAAAATAA 2857 het 1950 hom 32 14 11 7 AC 1 0 82332 CASAVA_Build 14 27589649 1I TTAATAAGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 53 32 17 4 T 9 10 82333 CASAVA_Build 14 27591722 1D AGCGGTGATA G/- TAGCAGTGCT 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 G 1 0 82334 CASAVA_Build 14 27599894 1I ATACATTGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 8 9 82335 CASAVA_Build 14 27604351 8D CTCCAATTTG TTTAATAA/-------- TTTATTTATA 3070 het 3070 ref 30 16 14 5 TTTAATAA 1 0 82336 CASAVA_Build 14 27604828 9I GTGTGTTACT ---------/GGCATATTA GGCATATTAT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 GGCATATTA 1 2 82337 CASAVA_Build 14 27605444 1I AATAGTTTCA -/T TTCCCTGAAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 3 82338 CASAVA_Build 14 27610567 4D TTATCATTAT TAAG/---- TATTATGCAC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 TAAG 1 0 82339 CASAVA_Build 14 27616783 1I ACTCATTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 15 19 12 A 10 11 82340 CASAVA_Build 14 27624588 7D GCCCTACAGA AGCTCTG/------- AGTTTCGTTG 3070 het 3070 hom 43 12 25 8 AGCTCTG 1 0 82341 CASAVA_Build 14 27625107 2D CTTTTGAGTT AG/-- AGTCTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 AG 2 1 82342 CASAVA_Build 14 27626001 3I TCCATATAAT ---/AAG AATATGTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 4 AAG 0 1 82343 CASAVA_Build 14 27626081 1I CATTATACAT -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 6 7 82344 CASAVA_Build 14 27632951 1D CCCACAATTA T/- TTTTTAATGA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 6 5 82345 CASAVA_Build 14 27648061 1D TAATTTCTTT G/- TTTTAAGTTT 3070 het 3070 hom 46 17 24 6 G 1 0 82346 CASAVA_Build 14 27658896 4D AGGTATATAC TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 12 11 7 T 13 9 82347 CASAVA_Build 14 27660118 4I AAATGTTTGC ----/TTGA TTATCAGGAT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 TTGA 0 1 82348 CASAVA_Build 14 27661139 1I CACAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 15 18 10 A 10 11 82349 CASAVA_Build 14 27693470 2D AATATCTGGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 111 het 44 0 37 9 GA 8 7 82350 CASAVA_Build 14 27702418 2D AAGCAGATTG TT/-- TTCTTCAAGT 3070 het 3070 hom 52 18 30 4 T 4 2 82351 CASAVA_Build 14 27746761 3D TCTTTGACTA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 AAC 5 4 82352 CASAVA_Build 14 27747736 1D AATGGTAGCA G/- TTATCATCAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 G 1 0 82353 CASAVA_Build 14 27751812 1D TATTTTAAAT G/- GGGCTACTTT 3070 het 3070 hom 32 12 19 2 G 4 3 82354 CASAVA_Build 14 27768522 4D TACTGTACAT AGAA/---- AGAGGAACAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 AGAA 1 0 82355 CASAVA_Build 14 27786218 1I TAAGCAGAAA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 G 1 2 82356 CASAVA_Build 14 27787538 1D CTGGATCTCA T/- TTTTTATGGT 3070 het 3070 ref 37 20 11 7 T 6 5 82357 CASAVA_Build 14 27793182 1I TTTCACCGTG -/T TTAGCCAGGA 2032 het 901 hom 11 2 6 4 T 2 3 82358 CASAVA_Build 14 27799552 1I CTGGTAAAAT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 34 7 20 7 A 6 7 82359 CASAVA_Build 14 27801499 3I TCCCAGTGTG ---/ACA AGAGGAGCAT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 ACA 0 1 82360 CASAVA_Build 14 27822274 2D AATAACTGAT TA/-- TACAAGAATG 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 TA 2 1 82361 CASAVA_Build 14 27825914 1D TCATTTTTTT A/- ACCCAAGGTC 3070 hom 120 het 45 0 39 7 A 2 1 82362 CASAVA_Build 14 27828263 1I TCTCACTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 635 hom 23 2 13 8 T 13 14 82363 CASAVA_Build 14 27832116 1I TTTCTTTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 9 10 82364 CASAVA_Build 14 27850677 1D CTTAAAAAAC G/- TATTTTCATG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 G 1 0 82365 CASAVA_Build 14 27859380 1D GCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 803 hom 39 7 15 17 T 13 12 82366 CASAVA_Build 14 27859716 1I AGGGGAAGAT -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 6 7 82367 CASAVA_Build 14 27866611 1I TTTTATTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 T 9 10 82368 CASAVA_Build 14 27871520 5I GTATAATAAT -----/AATAA AATAAAAATA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AATAA 1 2 82369 CASAVA_Build 14 27874876 1D TTCAGCGATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 9 8 82370 CASAVA_Build 14 27900578 1D AGCTTTCCCT C/- CCCTTTAGCA 3070 het 3070 hom 42 14 23 6 C 4 3 82371 CASAVA_Build 14 27917446 2D TCTACTTATC TT/-- ATAGTTAACT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 2 0 82372 CASAVA_Build 14 27940973 1I TGACCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 551 hom 24 2 13 9 T 15 16 82373 CASAVA_Build 14 27951815 1D CCATTCTCTA T/- TTTTTTTAAT 2759 het 1863 hom 14 5 6 3 T 8 7 82374 CASAVA_Build 14 27959068 1D GAATATAACC A/- AAGTGAGTAT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 3 2 82375 CASAVA_Build 14 27963296 2D AAGTTTTATA TG/-- TGTAGTATTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 6 TG 2 1 82376 CASAVA_Build 14 27979665 1D TTTCACTGGG A/- ACAGTTAAGA 3070 hom 84 het 35 0 29 7 A 2 1 82377 CASAVA_Build 14 27983428 1I TTCTTTTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 39 2 31 6 A 11 12 82378 CASAVA_Build 14 27996966 4I ATACACACAC ----/ACAT ATACATGTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ACAT 0 1 82379 CASAVA_Build 14 28015447 2D ATTTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 T 12 10 82380 CASAVA_Build 14 28018690 1D TCTATGATAG A/- AACCTGTAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 3 2 82381 CASAVA_Build 14 28032366 1D TCAACATCGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 10 9 82382 CASAVA_Build 14 28036815 1I AAGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 9 10 82383 CASAVA_Build 14 28040777 1D AAGAACAAAA G/- TGGAGAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 7 G 1 0 82384 CASAVA_Build 14 28046493 1I AGTTTGCTAG -/T TTTTTATTGA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 5 6 82385 CASAVA_Build 14 28050392 1I GTCCCTGACT -/G GGGCTGCCGC 3070 hom 70 het 28 0 22 6 G 3 4 82386 CASAVA_Build 14 28052248 1D ATATTGTCTG T/- TTTCTTGAGA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 4 3 82387 CASAVA_Build 14 28061108 2I AGCTTAACAG --/TT CAGAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 0 2 82388 CASAVA_Build 14 28061927 3D TTTGATTGCC CTG/--- CTGCTGGATT 3070 het 3070 hom 49 20 25 6 CTG 3 2 82389 CASAVA_Build 14 28063499 1D GTGGTTTATA T/- TGTAACCCAA 3070 het 3070 hom 40 15 22 4 T 2 1 82390 CASAVA_Build 14 28065018 1D ACTCCCCACC A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 8 7 82391 CASAVA_Build 14 28065422 4D AATAGATTCT ATAA/---- ATAAAGTTCA 3070 het 3070 ref 29 13 12 7 ATAA 2 1 82392 CASAVA_Build 14 28066024 1D CAGCTCATGC A/- AAAAAAAAGG 2210 het 2210 ref 27 10 8 9 A 9 8 82393 CASAVA_Build 14 28067367 1D ATATCAAATA T/- TGAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 T 2 1 82394 CASAVA_Build 14 28068723 1D TAGGCAATTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 29 12 15 4 T 8 7 82395 CASAVA_Build 14 28069909 2D TAAGCAAAGC CT/-- CTTATTCTGC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 CT 2 1 82396 CASAVA_Build 14 28081019 1D TTATTCTTCT A/- AACACATCAC 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 A 3 2 82397 CASAVA_Build 14 28083365 1I GTCTTGTTAA -/T TTTTTTTTTA 1996 het 1697 hom 13 5 5 3 T 9 10 82398 CASAVA_Build 14 28088248 1I ATCTTAGTAG -/A AAAAAATCTT 2783 het 2783 ref 16 9 6 1 A 6 7 82399 CASAVA_Build 14 28102674 1D TGTACAGCAT G/- GTGCATACAG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 2 1 82400 CASAVA_Build 14 28102836 1D AAGTAGGCAT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 8 7 82401 CASAVA_Build 14 28106349 1D49M1D TCTCAAGGTT GTTTTCTTATTAGCAAAATTAAAACATAATCTTACTCTCATAGGGTAACCA/-TTTTCTTATTAGCAAAATTAAAACATAATCTTACTCTCATTGGGTAACC- TGCAAATTAA 3070 het 3070 ref 37 31 16 12 N/A 0 0 82402 CASAVA_Build 14 28106502 5D GCTGGAATCA TTAGT/----- TTAGTTGTTT 3070 het 3070 hom 58 27 25 10 TTAGT 2 1 82403 CASAVA_Build 14 28107230 1D ATGTAGAACC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 9 8 82404 CASAVA_Build 14 28112108 16I TGAGTCAATC ----------------/CTGTTAAACCCTGTCT CTGCTTTATC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 CTGTTAAACCCTGTCT 0 1 82405 CASAVA_Build 14 28119222 1D GTAACTAAGA T/- TTTTCTGATA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 5 4 82406 CASAVA_Build 14 28123954 4D CATAGTAACC TGAT/---- TGATAGGTAG 3070 het 3070 ref 45 20 19 8 TGAT 2 1 82407 CASAVA_Build 14 28124699 6D ATTTAACACT ACTGAA/------ CTACCCACTA 3070 het 3070 ref 38 22 15 3 ACTGAA 1 0 82408 CASAVA_Build 14 28134569 3D TTCCATAAGA TTT/--- TATCAGAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 4 1 82409 CASAVA_Build 14 28135366 1D AGTGAGGCCT A/- AATCTTTCCA 3070 het 3070 hom 47 21 24 4 A 3 2 82410 CASAVA_Build 14 28135956 1I GTTCAGATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 A 9 10 82411 CASAVA_Build 14 28148694 1I TGAAAAAAAA -/G ACGTTTAATT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 G 0 1 82412 CASAVA_Build 14 28149252 1I TCTATAGATT -/A TAAAAAAAAC 3070 het 331 hom 48 1 43 4 A 0 1 82413 CASAVA_Build 14 28153975 1I CTTACTTCAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 59 24 30 5 A 7 8 82414 CASAVA_Build 14 28162506 7D CTGCAAAGAG ATGTCCT/------- ATGTCCTACA 3070 hom 87 het 30 0 30 1 ATGTCCT 2 1 82415 CASAVA_Build 14 28163177 2I AGTGACAAAC --/AT GTAACTTACA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AT 0 1 82416 CASAVA_Build 14 28169484 1I40M1I TTGGATTCTC -TTTTTCTTTGTTAATCTAGCTAATGGTCAATGTGGTTTTG-/TTTTTTCTTTGTTAATCTAGCTAATGGTCAATGTGGTTTTGT TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 37 1 56 5 N/A 0 0 82417 CASAVA_Build 14 28173666 1I AGAGGTATGC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 82418 CASAVA_Build 14 28181675 1D GTTCTTTGTC T/- TTTTTTATCT 3070 het 2985 hom 25 7 16 2 T 7 6 82419 CASAVA_Build 14 28183010 1D TAAAAATTGT A/- AAAAAAAAAA 2318 het 388 hom 12 1 8 3 A 17 16 82420 CASAVA_Build 14 28203513 2D TTCAAGGTTT TA/-- TATATATATA 1548 het 794 hom 7 2 4 2 TA 8 7 82421 CASAVA_Build 14 28209010 1D TTAAAAAAAA T/- AATATAACTA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 1 0 82422 CASAVA_Build 14 28210561 1I AGATGATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 32 1 27 4 A 10 11 82423 CASAVA_Build 14 28227093 1D TTAAGGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 35 1 22 13 T 11 10 82424 CASAVA_Build 14 28227915 1D TTTCCTTTTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 T 8 7 82425 CASAVA_Build 14 28234243 1D TTATTTTAAT A/- ATATGATGTC 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 A 2 1 82426 CASAVA_Build 14 28235138 1D TGACTCGTTA C/- CTATACAATA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 2 1 82427 CASAVA_Build 14 28250430 1I AATTGGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 10 11 82428 CASAVA_Build 14 28252694 1D TGCACATGTA C/- CCCCTAAATC 3070 het 1793 hom 18 4 12 2 C 5 4 82429 CASAVA_Build 14 28256740 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2178 hom 20 6 11 3 A 9 10 82430 CASAVA_Build 14 28257786 4D AAGACTAACT AATA/---- AATGTAGAAG 3070 het 3070 ref 38 19 18 6 AATA 1 0 82431 CASAVA_Build 14 28258316 1I TTTCACTTGA -/T TTCAGTATTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 2 3 82432 CASAVA_Build 14 28260167 2D TGGAGACAGT AA/-- AAAGATCAGT 3070 het 3070 hom 56 20 29 8 A 5 3 82433 CASAVA_Build 14 28261770 17D AAAAAAGCAA AAAGGATTTATCAACTG/----------------- AAATGCGACT 2901 het 2901 ref 24 20 6 3 AAAGGATTTATCAACTG 1 0 82434 CASAVA_Build 14 28263190 1I ATCTCTACAA -/T TTTTTTTTTT 2687 het 2687 ref 19 11 7 1 T 10 11 82435 CASAVA_Build 14 28264778 1D TTTTTAAGAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 9 8 82436 CASAVA_Build 14 28267497 1I GACAAAACGG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 8 9 82437 CASAVA_Build 14 28270867 1I ACCACATAAA -/T TTTTTGCTAA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 5 6 82438 CASAVA_Build 14 28274239 1D TTTAAAGTAT A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 A 7 6 82439 CASAVA_Build 14 28282263 4I TCTAAATTAT ----/TTGA TTATTATTAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTGA 0 1 82440 CASAVA_Build 14 28285279 3I CCCTTTTTAC ---/CAG CTTAAATTCC 3070 het 3070 ref 44 17 18 9 CAG 0 1 82441 CASAVA_Build 14 28286463 1D TTTAAGCCTT A/- AATGTGTAGT 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 A 3 2 82442 CASAVA_Build 14 28288319 1D CCTCCCCACC A/- AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 29 15 7 8 A 15 14 82443 CASAVA_Build 14 28291429 2I AGTAGTAGGA --/AG ACTAAGAAGT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 AG 0 1 82444 CASAVA_Build 14 28292490 5I ATATTGGTGA -----/AAAAT AAAATAGAAT 3070 hom 124 het 47 0 42 5 AAAAT 1 2 82445 CASAVA_Build 14 28308180 5D TTGTTTTGTC CTTTT/----- CTTTAAAGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 CTTTT 1 0 82446 CASAVA_Build 14 28331056 1D CTTCAGCACT A/- AAAAAAACAA 1428 het 1428 ref 43 15 9 20 A 8 7 82447 CASAVA_Build 14 28331552 5D AAAAAAAAAA AAAAT/----- TATATGTTTC 824 het 602 hom 14 4 6 5 AAAAT 1 0 82448 CASAVA_Build 14 28349390 1I AGTTAACAGT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 7 8 82449 CASAVA_Build 14 28397738 1D TCTCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2903 het 2698 hom 27 10 10 7 T 12 11 82450 CASAVA_Build 14 28564968 1D TCATCCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 28 1 23 4 T 12 11 82451 CASAVA_Build 14 28564980 1D TTTTTTTTTT A/- TTGGTAGGCT 3070 het 212 hom 31 4 22 5 A 1 0 82452 CASAVA_Build 14 28575075 1D ATACAACGTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 111 het 44 0 38 7 T 9 8 82453 CASAVA_Build 14 28576139 1D TGGCTTCTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 34 hom 25 1 18 6 T 10 9 82454 CASAVA_Build 14 28592940 1D CTTTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 34 1 29 4 A 12 11 82455 CASAVA_Build 14 28613422 1D CAAAATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 116 het 43 0 37 6 A 11 10 82456 CASAVA_Build 14 28623808 1D TGATTATGAT A/- AAATGTTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 22 1 A 4 3 82457 CASAVA_Build 14 28626914 5D GAAACTCAAA CAACT/----- CAACAATTAA 3070 het 3070 ref 41 26 13 3 CAACT 1 0 82458 CASAVA_Build 14 28631111 8D TGCCAAATTT ATGGAACC/-------- ATAGGTATAT 3070 het 3070 hom 36 14 22 4 ATGGAACC 1 0 82459 CASAVA_Build 14 28632368 1D TCTTAGGAAG C/- CAGTGCTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 2 1 82460 CASAVA_Build 14 28634768 1D TCTTCTAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 T 10 9 82461 CASAVA_Build 14 28640029 1I GTGTAACTTC -/A AGGCAATAGA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 1 2 82462 CASAVA_Build 14 28648002 1I GAGAAGAAAG -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 7 82463 CASAVA_Build 14 28648112 4I AGAAAGAAAG ----/GAAA GAAAGAAAGA 3070 hom 72 het 35 0 24 11 GAAA 3 4 82464 CASAVA_Build 14 28648674 1D TAAGAATTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 370 hom 47 1 39 8 T 10 9 82465 CASAVA_Build 14 28651182 1I AGTTTTGTTG -/C CCTATATTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 2 3 82466 CASAVA_Build 14 28651967 1I CTCAAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 10 11 82467 CASAVA_Build 14 28652316 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1288 het 1288 ref 32 20 3 9 T 14 13 82468 CASAVA_Build 14 28653127 2D TGAATTACTT AC/-- AGTTATTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 AC 1 0 82469 CASAVA_Build 14 28653863 5I TTGATCACAG -----/TGTTT TGTTTAATTT 3069 het 3069 ref 19 9 8 2 TGTTT 1 2 82470 CASAVA_Build 14 28661084 1I GAAAAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 10 11 82471 CASAVA_Build 14 28662570 4I CTTAAAAAAC ----/TATT TATCTCTAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TATT 0 1 82472 CASAVA_Build 14 28663479 1D AGACAAAGGA G/- GAGAAAAGTC 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 G 2 1 82473 CASAVA_Build 14 28694573 1D TGAGAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 11 13 T 15 14 82474 CASAVA_Build 14 28695781 1I CTCAAAGCAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 7 8 82475 CASAVA_Build 14 28721776 1D TCTTATTGCT A/- AAAAAACTCT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 7 6 82476 CASAVA_Build 14 28729704 1I TACTCACTGA -/T TACTAAACTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 1 2 82477 CASAVA_Build 14 28744903 1I ATGAAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 13 14 82478 CASAVA_Build 14 28744986 1I TTTATCATTT -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 A 6 7 82479 CASAVA_Build 14 28745118 3I GAAAATAATC ---/TTG TTGGTGAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 TTG 1 2 82480 CASAVA_Build 14 28757687 1D TTTTTTTTTC T/- TTAAAACTAT 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 T 3 2 82481 CASAVA_Build 14 28776959 1D AAAAAAAAAA T/- AATAATAACA 2492 het 2492 ref 40 18 10 13 T 1 0 82482 CASAVA_Build 14 28807722 2D CGTCCTCTGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AT 9 8 82483 CASAVA_Build 14 28808396 5D TTTCTGTTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 386 het 386 ref 29 6 6 19 TTTTG 1 0 82484 CASAVA_Build 14 28818375 1I TTATTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 38 1 32 5 T 10 11 82485 CASAVA_Build 14 28820768 4I GCAGATAAAA ----/CTAT CTATAATAAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CTAT 1 2 82486 CASAVA_Build 14 28827512 3I CATATAATCA ---/AAC AACAAGGAAC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AAC 1 2 82487 CASAVA_Build 14 28827918 1D TTCCCCACAC T/- GTGACAATAT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 1 0 82488 CASAVA_Build 14 28843592 4D ACATGAAAAT AAAC/---- AAACAAAATA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AAAC 2 1 82489 CASAVA_Build 14 28844807 1D GGTTTCAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 33 2 23 8 A 11 10 82490 CASAVA_Build 14 28874104 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 8 82491 CASAVA_Build 14 28877157 1D AATTTATCTG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 6 82492 CASAVA_Build 14 28880088 1I TTTGGAACAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 7 8 82493 CASAVA_Build 14 28897344 1D AATAATAATT G/- GGGGGGGGGC 3070 hom 63 het 40 0 29 12 G 10 9 82494 CASAVA_Build 14 28908414 9D TCTTTCTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 20 0 14 6 T 25 16 82495 CASAVA_Build 14 28909857 1D AGAGTAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 43 1 37 5 T 11 10 82496 CASAVA_Build 14 28921494 1I TTTCCCAACC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 85 het 37 0 29 8 T 8 9 82497 CASAVA_Build 14 28930831 1D AGAACGGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 804 hom 37 2 21 14 A 15 14 82498 CASAVA_Build 14 28932127 1I ATTGTTACGG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 57 20 31 6 T 8 9 82499 CASAVA_Build 14 28937605 3D TAACAAAAGT ATA/--- ATAACATGTA 3070 het 3070 ref 54 27 22 6 ATA 2 1 82500 CASAVA_Build 14 28946661 1I TTGCTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 1638 het 1638 ref 45 25 5 15 T 15 16 82501 CASAVA_Build 14 28959623 2I TGTGAGGGGG --/AA AAAAAAATAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 7 9 82502 CASAVA_Build 14 28963034 2D AGCTCACGGT AA/-- AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 10 8 82503 CASAVA_Build 14 28970298 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1526 het 31 hom 13 1 6 6 A 17 16 82504 CASAVA_Build 14 28971657 2I TTCTCAAGAA --/AT AGAATTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 AT 0 1 82505 CASAVA_Build 14 28984943 1D TTGGGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 12 11 82506 CASAVA_Build 14 28991233 1D AATTAGTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 10 9 82507 CASAVA_Build 14 29002859 1D TTTCCCCCCC T/- GAAGAGGTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 1 0 82508 CASAVA_Build 14 29005343 2I TATATCAATT --/TA TATATATAAA 1863 hom 10 het 5 0 4 1 TA 4 5 82509 CASAVA_Build 14 29023860 2I CCACATCTAC --/AA AAAAAAAAAA 3027 hom 45 het 17 0 16 1 A 14 16 82510 CASAVA_Build 14 29040859 1D TTTTCACATT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 8 7 82511 CASAVA_Build 14 29054640 2D ATTTTTAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 27 0 13 16 T 18 16 82512 CASAVA_Build 14 29062743 3D TCAAAACAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 AAC 5 4 82513 CASAVA_Build 14 29065157 1D CTATTAATGG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 23 12 9 4 A 7 6 82514 CASAVA_Build 14 29068704 1I GATCATCCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 61 het 29 0 23 6 T 8 9 82515 CASAVA_Build 14 29069078 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 T 7 8 82516 CASAVA_Build 14 29070202 1I TTGGTAAGCA -/T TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 52 39 3 10 T 10 11 82517 CASAVA_Build 14 29072143 1I GATTTCATTC -/T TTTTTATGGC 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 5 6 82518 CASAVA_Build 14 29083578 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 68 het 28 0 22 6 T 8 7 82519 CASAVA_Build 14 29085961 1I TTTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1585 hom 32 5 19 8 T 15 16 82520 CASAVA_Build 14 29086868 2I ATTTATACTT --/TG TAGAAAGACC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TG 0 1 82521 CASAVA_Build 14 29087255 1I AGAAGCTCTC -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 6 7 82522 CASAVA_Build 14 29097088 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 249 hom 22 1 19 2 A 13 12 82523 CASAVA_Build 14 29102747 1D AAAAGAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 10 9 82524 CASAVA_Build 14 29111961 1D ATAATATCAC A/- AAAAAGGGTG 3070 hom 135 het 52 0 46 7 A 6 5 82525 CASAVA_Build 14 29123817 1D ACAATGTGTA T/- TTTTTCAGGC 3070 hom 126 het 46 0 43 4 T 6 5 82526 CASAVA_Build 14 29133950 1I GCTAGGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1618 hom 39 9 21 9 T 14 15 82527 CASAVA_Build 14 29139822 1D TCAACAAATG C/- CTTTGATCAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 1 82528 CASAVA_Build 14 29140498 12D CTTCGAATAG ACCTCACCTCCC/------------ ACGTTGCTCT 3070 hom 138 het 45 0 47 4 ACCTCACCTCCC 1 0 82529 CASAVA_Build 14 29141385 1D TGTATTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 862 hom 46 7 16 23 T 17 16 82530 CASAVA_Build 14 29148675 1I TTCTTTATTT -/A TTTTTTTTTT 2216 het 42 hom 13 1 8 4 A 0 1 82531 CASAVA_Build 14 29149054 1I TTTTTCTAGT -/C TTTTTTGACT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 C 0 1 82532 CASAVA_Build 14 29166657 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAGAAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 5 6 82533 CASAVA_Build 14 29167828 5D31M1I AGAAAAATTA CTAATCTATATAATTTAATATTTCTAAAATATCACA-/-----CTATATAATTTAATATTTCTAAAATATCACAG AAAAAATATC 3070 hom 69 het 16 0 24 1 N/A 0 0 82534 CASAVA_Build 14 29168980 3I TCTTCTTCTG ---/CTT CTTCTTCTTC 3070 hom 72 het 34 0 25 9 CTT 4 5 82535 CASAVA_Build 14 29175002 2D TCTCACATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 41 0 24 17 A 16 14 82536 CASAVA_Build 14 29187154 1D ACTTTTATGA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 6 82537 CASAVA_Build 14 29189525 1I GAGACTGAAT -/G GGGGGGGGCA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 G 8 9 82538 CASAVA_Build 14 29206889 1D GGTAAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 36 1 28 7 T 12 11 82539 CASAVA_Build 14 29210561 1I AAACTAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 9 82540 CASAVA_Build 14 29220400 2I TCTGAGTAAT --/CA CAGTTTTATT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 CA 1 2 82541 CASAVA_Build 14 29225968 1D TGCCCAGGTT G/- CTGTGGCTTG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 G 1 0 82542 CASAVA_Build 14 29231168 1I TTCCTGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 27 1 21 5 T 12 13 82543 CASAVA_Build 14 29232026 1D AATTTGGGCA T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 82544 CASAVA_Build 14 29235197 2D TTATCTAGTA AT/-- AGAGTCAGGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 1 0 82545 CASAVA_Build 14 29239048 1D TTATCCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 11 10 82546 CASAVA_Build 14 29239921 16D10M30D ATTTGTGTGT ACGCGTGCGCATGCGCGCGCGCGCGCACACACACACACACACACCCTGTTGTGTGT/----------------GCGCGCGCGC------------------------------ GGGAACTCTG 3070 hom 62 het 17 0 21 5 N/A 0 0 82547 CASAVA_Build 14 29244413 2D CCAGATTCTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 11 9 82548 CASAVA_Build 14 29257361 1I CCTGAGCCCT -/C CCCAACCATG 3070 hom 141 het 51 0 46 5 C 3 4 82549 CASAVA_Build 14 29289574 2D TGAACGCGCG CA/-- CACACACACA 2122 het 2122 ref 41 25 5 11 CA 10 9 82550 CASAVA_Build 14 29343546 1I CAATCCAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 36 1 24 11 A 14 15 82551 CASAVA_Build 14 29369632 1I CCATAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 1127 het 1127 ref 39 22 4 13 T 13 14 82552 CASAVA_Build 14 29412444 1D TTACTGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 11 10 82553 CASAVA_Build 14 29441801 1D AAGGAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 10 9 82554 CASAVA_Build 14 29525070 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 17 0 11 6 A 18 16 82555 CASAVA_Build 14 29529548 4I GTGTATATAC ----/ATAT ATACGTATAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 AT 1 3 82556 CASAVA_Build 14 29529855 16D TATGTGTGTA TATATACACATATATG/---------------- TGTATATATA 3070 het 3070 hom 26 8 14 8 TATATACACATATATG 1 0 82557 CASAVA_Build 14 29532031 2D TTAGGAGATT TC/-- TCTCTCTCTC 1141 het 1141 ref 30 22 3 5 TC 9 8 82558 CASAVA_Build 14 29537571 1I ATCTTAATTT -/C TTGGTGGTTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 82559 CASAVA_Build 14 29541405 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 92 het 35 0 29 6 T 8 7 82560 CASAVA_Build 14 29542041 1D GCTAGCTGGC T/- TTTTTTTTTG 2253 hom 33 het 42 0 11 31 T 10 9 82561 CASAVA_Build 14 29543418 1D AAACTAAAAC T/- ATTTTTAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 1 0 82562 CASAVA_Build 14 29559839 1I GTTTGTAGGG -/A AAAAAATTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 6 7 82563 CASAVA_Build 14 29561718 1D AAGACAAAGA G/- GGGGGAGAAC 3070 hom 126 het 49 0 42 9 G 6 5 82564 CASAVA_Build 14 29564477 1I CTTCAACCCC -/T TTTTCACCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 4 5 82565 CASAVA_Build 14 29568194 1I AATTTTAGGT -/A AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 6 7 82566 CASAVA_Build 14 29578675 1D TCGTTATTCA T/- TAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 T 2 1 82567 CASAVA_Build 14 29583361 1I AGAAAGAAAT -/A AAAGCCATCT 3070 het 3070 hom 30 16 13 1 A 3 4 82568 CASAVA_Build 14 29592596 1D ATGAAATGGA C/- CCTGTTAGTT 3070 hom 141 het 52 0 48 6 C 3 2 82569 CASAVA_Build 14 29608965 1I TGTAAAGAAT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 8 9 82570 CASAVA_Build 14 29618741 1D TATCTCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 11 10 82571 CASAVA_Build 14 29628609 4I TGAATGACCA ----/GTGG GTAAATGAAG 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 GTGG 0 1 82572 CASAVA_Build 14 29635306 1I TGGGGAAGGC -/A ATGATTGGTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 1 2 82573 CASAVA_Build 14 29657025 1I TCATCTCTAT -/A AAAAAAAAAA 2509 het 2509 ref 23 9 7 7 A 14 15 82574 CASAVA_Build 14 29657916 5I GAACGTTTCT -----/ATTAA ATTATTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 ATTAA 0 1 82575 CASAVA_Build 14 29665488 2D GTATTTCAAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 21 0 13 8 AT 8 7 82576 CASAVA_Build 14 29665890 1I CTTGCAGTTC -/A GCCTCATGTG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 0 1 82577 CASAVA_Build 14 29670233 1I CACCTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 A 10 11 82578 CASAVA_Build 14 29681254 1I GGCCCTTAAT -/C CAATATGACT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 1 2 82579 CASAVA_Build 14 29681668 1I ATATTAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 30 2 16 12 T 13 14 82580 CASAVA_Build 14 29684033 2D ATATATATAT AG/-- AGAGAGAGAG 2401 hom 18 het 9 0 7 3 AG 10 9 82581 CASAVA_Build 14 29688233 1D AAACGATTTC A/- AAAAAATTGA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 6 82582 CASAVA_Build 14 29690428 1I TAACTATGCT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 7 8 82583 CASAVA_Build 14 29697382 4I AGCTAACTTC ----/CCTG CCTATCTCTT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 CCTG 0 1 82584 CASAVA_Build 14 29711368 4I TTTTTCTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 TTTG 2 3 82585 CASAVA_Build 14 29715576 1I AAAAAAAAAA -/C AACTTCATTC 3070 het 699 hom 35 2 23 10 C 0 1 82586 CASAVA_Build 14 29716748 1D CTGTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 25 18 10 A 11 10 82587 CASAVA_Build 14 29725177 1I TTCTACTGAG -/A AATCAAGGAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 2 3 82588 CASAVA_Build 14 29732146 1I AGTTTCCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1309 hom 44 4 33 7 A 10 11 82589 CASAVA_Build 14 29735950 12I CATCTACCTC ------------/TGAGGGTTGTTT TGAGGATTAA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 TGAGGGTTGTTT 0 1 82590 CASAVA_Build 14 29743805 1I ACTGTAGCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 46 2 35 9 A 12 13 82591 CASAVA_Build 14 29763274 1D TGAAAGGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 10 9 82592 CASAVA_Build 14 29766156 1D ATAAGAAATG A/- AAAAAAAAAG 2427 het 2427 ref 23 13 5 5 A 10 9 82593 CASAVA_Build 14 29793425 32D TTCATGATCC ATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------- ATATATATAT 3070 het 477 hom 12 1 9 5 AT 24 8 82594 CASAVA_Build 14 29914785 1I TTTAGTGGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 9 10 82595 CASAVA_Build 14 29949726 1D TGCCAATGAG A/- TGAGCTGTGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 1 0 82596 CASAVA_Build 14 29959109 1D CTTAATTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 159 hom 31 3 12 16 A 11 10 82597 CASAVA_Build 14 29977862 3D AGAGGCTAAA CTC/--- CTCCAAATCA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 CTC 2 1 82598 CASAVA_Build 14 29981618 1D TGAAAAAAAA C/- ATTTTAGAAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 C 1 0 82599 CASAVA_Build 14 29984120 1I CCCTGATGAG -/A AAAAAAAAAA 1533 het 1533 ref 48 32 5 11 A 12 13 82600 CASAVA_Build 14 30009193 6D CTACTCTACC TTAATT/------ TTAAGTGGAG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TTAATT 1 0 82601 CASAVA_Build 14 30039535 1D ACCGAACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 A 12 11 82602 CASAVA_Build 14 30045889 1I TTCCTTTAAG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 7 8 82603 CASAVA_Build 14 30047607 1D ATATTTCTAA T/- TTACAGTCAA 3070 het 3070 ref 27 13 13 2 T 3 2 82604 CASAVA_Build 14 30049997 1D AATAAGAATG A/- AAAAAAAAAA 1300 het 1300 ref 28 19 3 6 A 12 11 82605 CASAVA_Build 14 30050060 4D CAAATTACAG GTTT/---- GTTAATTGTA 3070 hom 66 het 25 0 22 4 GTTT 1 0 82606 CASAVA_Build 14 30128010 4D ATTGTAGGTG TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 TTCT 3 2 82607 CASAVA_Build 14 30166761 1D ACTCACACTT A/- AAAAAAAAAA 984 het 984 ref 25 17 3 5 A 11 10 82608 CASAVA_Build 14 30195073 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1951 het 1951 ref 43 21 6 16 A 13 14 82609 CASAVA_Build 14 30218641 1D ATAAACTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 190 hom 42 1 30 11 T 15 14 82610 CASAVA_Build 14 30260547 1I ACCCAGACTT -/A ACGCTCCTCC 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 1 2 82611 CASAVA_Build 14 30277211 4I ACACACAGAC ----/AAAA AAAAAAAGTT 3070 hom 91 het 37 0 30 7 A 7 11 82612 CASAVA_Build 14 30297306 1D TAAAAACTAA T/- TTTTTATTGA 3070 hom 123 het 43 0 42 2 T 6 5 82613 CASAVA_Build 14 30298606 3I CTATAATGGT ---/TAG TAGATCAAGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TAG 1 2 82614 CASAVA_Build 14 30302198 1I CAGAATAGAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 321 hom 28 1 25 2 T 8 9 82615 CASAVA_Build 14 30305994 1D TTACCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 462 hom 36 2 28 6 A 13 12 82616 CASAVA_Build 14 30309039 1D TTAAAAACAA C/- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 20 8 C 2 1 82617 CASAVA_Build 14 30309164 2I TTTTGTACCC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 41 15 13 13 AG 7 8 82618 CASAVA_Build 14 30313218 1D TGCTGTATGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 87 het 36 0 29 9 T 8 7 82619 CASAVA_Build 14 30314809 1I CATAGGGAGA -/C CCCCCCCCTC 1660 hom 12 het 7 0 5 2 C 8 9 82620 CASAVA_Build 14 30318121 1D TGACCCACCC A/- AGGATAGTGA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 2 1 82621 CASAVA_Build 14 30326899 1I AATCAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 27 1 22 4 A 11 12 82622 CASAVA_Build 14 30330841 13D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 19 0 13 8 T 25 12 82623 CASAVA_Build 14 30351680 4I AGTGCCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 31 19 7 5 AAAC 2 3 82624 CASAVA_Build 14 30352431 1I AGTGCCGGGA -/G GGGAGGCCCA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 G 3 4 82625 CASAVA_Build 14 30361626 1I CTTAGAGCTA -/G GAAGTGGGGG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 G 1 2 82626 CASAVA_Build 14 30368045 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAATACA 463 hom 7 het 3 0 3 0 A 7 6 82627 CASAVA_Build 14 30368214 5D CATCTCAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 2056 het 2014 hom 14 7 6 2 AAAAG 4 3 82628 CASAVA_Build 14 30368536 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 1533 hom 26 10 12 4 C 1 0 82629 CASAVA_Build 14 30369040 1D AGTGATGTAA C/- CACCAGCCAA 3070 het 3070 hom 46 18 22 7 C 2 1 82630 CASAVA_Build 14 30373037 7D GGTACCGCCT CTCCCTC/------- CTCCCTCCCA 3070 hom 48 het 19 0 15 5 CTCCCTC 2 1 82631 CASAVA_Build 14 30377655 1D AATCCTTGAG T/- TTAGTTGTGT 3070 hom 127 het 48 0 43 5 T 3 2 82632 CASAVA_Build 14 30380349 4I GTTTATTGTC ----/TGTT TATTTTTTTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TGTT 0 1 82633 CASAVA_Build 14 30380488 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTATAGAT 3070 hom 8 het 21 1 17 5 T 5 4 82634 CASAVA_Build 14 30386552 1I TTTTATTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 339 hom 33 1 29 3 T 10 11 82635 CASAVA_Build 14 30393993 1D ATTGAATAGC T/- TTTTTTTTTT 2150 het 1101 hom 24 8 7 9 T 19 18 82636 CASAVA_Build 14 30414594 2D TCTACACGCT AG/-- AGAGTTTAAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 5 AG 3 2 82637 CASAVA_Build 14 30420936 4D ATAAAAATAA AAAT/---- AAATAAATAA 1946 het 198 hom 5 1 4 2 AAAT 5 4 82638 CASAVA_Build 14 30421203 3D TCTCCTGCCT CAG/--- CCTCCTGAGT 3070 het 1997 hom 17 7 9 1 CAG 1 0 82639 CASAVA_Build 14 30427089 1D GGTGTGATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 T 11 10 82640 CASAVA_Build 14 30427482 1I CTTATGCCTG -/T TAATCCCAGC 3070 het 2043 hom 18 5 12 1 T 1 2 82641 CASAVA_Build 14 30430002 1D TCTCCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 11 10 82642 CASAVA_Build 14 30431062 4D TATAAAGTAC TATT/---- TAATAGTGAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TATT 1 0 82643 CASAVA_Build 14 30439705 1D AGACTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 18 1 13 4 A 15 14 82644 CASAVA_Build 14 30448352 14I CAGCTCCTCA --------------/GGAGGATGGCTTGG GCCTGGGAGG 3070 hom 87 het 33 0 26 7 GGAGGATGGCTTGG 0 1 82645 CASAVA_Build 14 30449967 1D CCATTCACTT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 7 82646 CASAVA_Build 14 30453654 1D ATTTTAATGT C/- CCATTCTAGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 3 2 82647 CASAVA_Build 14 30457480 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 11 10 82648 CASAVA_Build 14 30461817 5I AAGTGCACTG -----/ATTAA ATTAGAGTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 ATTAA 0 1 82649 CASAVA_Build 14 30471429 1I TCATTTCTTA -/C CAAAAATAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 1 2 82650 CASAVA_Build 14 30483526 4D ATATATATAT ATAC/---- ACACACAGAC 3070 hom 27 het 11 0 10 2 ATAC 1 0 82651 CASAVA_Build 14 30488208 1D TCACTTATAA G/- GAGAGCCTGG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 G 2 1 82652 CASAVA_Build 14 30488642 1I CTCCGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 337 hom 26 1 20 5 A 11 12 82653 CASAVA_Build 14 30491079 1I TGTCTTAAAC -/A AACAAAAAAA 3070 het 308 hom 18 1 16 1 A 2 3 82654 CASAVA_Build 14 30496950 3I CAACTAATAA ---/TTT AAACACCTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 3 82655 CASAVA_Build 14 30498465 8D CCTGATAGTG ATAATAAC/-------- ATAATAATGA 3070 het 3070 hom 51 23 26 5 ATAATAAC 1 0 82656 CASAVA_Build 14 30500942 1I GTCCTTCAGG -/A AAGTATTCCA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 2 3 82657 CASAVA_Build 14 30502047 3D ATGACTACGC TAA/--- TAATGACAAG 3070 hom 146 het 51 0 49 4 TAA 2 1 82658 CASAVA_Build 14 30507713 1I AGTTGTGGAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 8 9 82659 CASAVA_Build 14 30512222 1D AACAGAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 10 9 82660 CASAVA_Build 14 30513774 4D ACAAATAAAT AAAC/---- AAACAAACAG 3070 hom 96 het 37 0 33 7 AAAC 3 2 82661 CASAVA_Build 14 30514513 1I AAAAAAAAAA -/G AAGAAGAAGA 3070 het 192 hom 24 1 16 7 G 0 1 82662 CASAVA_Build 14 30518956 1D CTGTAATCCC A/- ACCACCTTGG 1266 hom 24 het 14 0 6 8 A 2 1 82663 CASAVA_Build 14 30524561 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 11 10 82664 CASAVA_Build 14 30524670 3D ATATGTATAA ATG/--- ATGATCCATG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 ATG 2 1 82665 CASAVA_Build 14 30532657 2D ATTTTTTGAG AC/-- ACAGTCTCAC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 AC 2 1 82666 CASAVA_Build 14 30537726 1I AACCCTGGGG -/A GGTGGGTGAA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 0 1 82667 CASAVA_Build 14 30539800 1I GCCGATGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 30 1 22 7 A 11 12 82668 CASAVA_Build 14 30547148 11D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAG/----------- AAAAAGAAAA 2770 hom 21 het 7 0 8 1 AAAAAAAAAAG 1 0 82669 CASAVA_Build 14 30556362 2I AGGCTGAGGC --/AG AGGAGAATGG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AG 1 2 82670 CASAVA_Build 14 30561340 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 783 hom 19 3 14 2 A 15 14 82671 CASAVA_Build 14 30577950 1D AATGTAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 32 1 25 7 T 14 13 82672 CASAVA_Build 14 30584922 1D AGGAGCTAGA T/- TTTTTTTTTT 1644 het 16 hom 15 0 5 10 T 19 18 82673 CASAVA_Build 14 30594686 2I CCTTAGTGTT --/TG TGTGTGTGTA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 TG 4 5 82674 CASAVA_Build 14 30597044 1D CCAGCTCTTG T/- TTTTTCGCTT 3070 hom 93 het 35 0 33 2 T 6 5 82675 CASAVA_Build 14 30613784 1I CCCTCATTAT -/C CCCCTCCACC 3070 hom 59 het 25 0 19 6 C 4 5 82676 CASAVA_Build 14 30614699 1I GATATACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 29 2 17 10 T 15 16 82677 CASAVA_Build 14 30618858 3I GCCCATCAGT ---/TAC TACTGATAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TAC 1 2 82678 CASAVA_Build 14 30661596 1D TGGGACTACA G/- GGCATGAGCC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 G 3 2 82679 CASAVA_Build 14 30679890 1D GGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 30 2 20 8 T 13 12 82680 CASAVA_Build 14 30716847 1D ATAGGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 38 0 28 10 T 11 10 82681 CASAVA_Build 14 30737162 2D TTAAAGGAAA TG/-- GGAATTAATT 3070 hom 93 het 35 0 30 7 TG 1 0 82682 CASAVA_Build 14 30749343 4D TCTACATGTA CCAC/---- CCACCCACTT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 CCAC 3 2 82683 CASAVA_Build 14 30753528 6D TCATGTCTTC TTCTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 29 1 22 7 TTCTTT 1 0 82684 CASAVA_Build 14 30754972 1I AACCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 A 10 11 82685 CASAVA_Build 14 30755446 1I ACCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1011 het 759 hom 20 6 5 9 T 17 18 82686 CASAVA_Build 14 30759296 3D CTCCATCTCA ACG/--- ACAACAACAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 ACG 1 0 82687 CASAVA_Build 14 30766768 2I ACAAGACAGC --/TG TGATTTTTAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TG 1 2 82688 CASAVA_Build 14 30768142 1D AGCTCTGAGT A/- AGATAGTATT 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 A 2 1 82689 CASAVA_Build 14 30775513 1I ATCTGCTAAG -/T TTTTGTATCT 3070 hom 27 het 11 0 7 4 T 4 5 82690 CASAVA_Build 14 30787012 3I44M1I GGGAATTGTA ---AGAGTTTATAGGTTTTAGAAGCCCATGCTGTAGCAGGCGAGTGA-/AGGAGAGTTTATAGGTTTTAGAAGCCCATGCTGTAGCAGGCGAGTGAT TAACAGGCTT 2866 hom 15 het 6 0 6 2 N/A 0 0 82691 CASAVA_Build 14 30800229 1I TTGAATCTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 579 hom 34 2 25 7 T 9 10 82692 CASAVA_Build 14 30813598 5D GAATCTAAAG TTATA/----- TTAAATTAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 TTATA 1 0 82693 CASAVA_Build 14 30814725 1I AAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1154 hom 18 4 9 5 A 10 11 82694 CASAVA_Build 14 30814935 1I AAGATTTATT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 A 8 9 82695 CASAVA_Build 14 30837222 1I TTTAAGCCAC -/T TAAGTTTTGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 2 82696 CASAVA_Build 14 30863641 1D ATGTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 39 3 18 19 T 17 16 82697 CASAVA_Build 14 30872835 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 11 12 82698 CASAVA_Build 14 30873108 1D TACTGCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 11 10 82699 CASAVA_Build 14 30874931 1D GATAATTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 9 7 T 13 12 82700 CASAVA_Build 14 30875543 1I ATATACACTT -/A AAATCTTACT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 3 4 82701 CASAVA_Build 14 30879320 1I GATGCAGAGG -/A AAACAAACAT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 3 4 82702 CASAVA_Build 14 30883467 3D GAACTCCTGA CCC/--- GATTCAGTGA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 3 0 82703 CASAVA_Build 14 30892693 1I ACGCTGCCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 9 10 82704 CASAVA_Build 14 30894161 3D ACCTGAGGTC AGG/--- AGTTCAAGAA 3070 hom 60 het 26 0 21 8 AGG 1 0 82705 CASAVA_Build 14 30916380 1I TACCTAAAAA -/C AAAAACCTCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 0 1 82706 CASAVA_Build 14 30932616 1D TTGAAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 12 11 82707 CASAVA_Build 14 30939802 1D ATTATTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 18 1 12 5 T 13 12 82708 CASAVA_Build 14 30950290 1I AGAAATGGTT -/A AAATTTGACA 3070 hom 95 het 36 0 32 4 A 3 4 82709 CASAVA_Build 14 30963229 3I ATTATGTATC ---/ATT GAGTCCAACT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 ATT 0 1 82710 CASAVA_Build 14 30968036 1I GGACATTATC -/A AAAAAAAATT 3070 het 420 hom 34 1 27 6 A 8 9 82711 CASAVA_Build 14 30970449 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1234 het 1234 ref 38 30 3 6 A 12 11 82712 CASAVA_Build 14 30974907 1D TTTGTATCTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 8 82713 CASAVA_Build 14 30978338 1D GGGATTTTTT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 9 8 82714 CASAVA_Build 14 30981190 4D TCAAATATAG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 hom 65 het 27 0 22 6 GTTT 4 3 82715 CASAVA_Build 14 30984844 2D CACATTTTTT AA/-- AGAGGATTGC 3070 hom 135 het 49 0 46 4 A 3 1 82716 CASAVA_Build 14 30985290 1D TTTTACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 32 1 27 4 A 11 10 82717 CASAVA_Build 14 31041961 1I ATTTGTAAGC -/T TTAGTGTGGG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 2 3 82718 CASAVA_Build 14 31043871 7I CCATTGCAAG -------/TTATTCT TTATTCTGGG 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 TTATTCT 1 2 82719 CASAVA_Build 14 31047049 1I ATAAGAGTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 A 12 13 82720 CASAVA_Build 14 31060735 4D TGATTGAATT AGAG/---- GGAAAAATAA 3070 het 3070 hom 39 18 20 5 AG 2 0 82721 CASAVA_Build 14 31068309 5D TTGGGATTCA TACTT/----- TACTTGTTTG 3070 het 3070 hom 58 25 29 5 TACTT 2 1 82722 CASAVA_Build 14 31110422 1D TGTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2563 het 1331 hom 25 6 10 9 T 13 12 82723 CASAVA_Build 14 31111024 1D GCAGAGCTAA G/- GTTCGAATGC 3070 het 3070 ref 54 30 18 6 G 2 1 82724 CASAVA_Build 14 31113218 1D TTATGTACTC A/- AAAAAAATTT 3070 het 2902 hom 40 11 18 11 A 8 7 82725 CASAVA_Build 14 31113859 2I TTCTTTTAGC --/AA AACTTATTTT 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 A 2 4 82726 CASAVA_Build 14 31127375 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 44 0 34 10 T 10 9 82727 CASAVA_Build 14 31133514 1I AGCCAGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 T 10 11 82728 CASAVA_Build 14 31135446 1I AAATCCTGCC -/G GTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 G 1 2 82729 CASAVA_Build 14 31141350 6I GTATAATAAT ------/AATAAA AGAAAAAAAA 2960 hom 33 het 20 0 11 9 AATAAA 0 1 82730 CASAVA_Build 14 31165897 3I TCATGAAGGG ---/AGT AGTACATCAG 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 AGT 1 2 82731 CASAVA_Build 14 31170440 1D CACACACACA C/- CCCCACCCCA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 C 5 4 82732 CASAVA_Build 14 31179917 6D TTTGTTTTTC TTTTTG/------ TTTTTGAGAC 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 TTTTTG 2 1 82733 CASAVA_Build 14 31184027 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2757 het 930 hom 15 2 8 5 T 14 13 82734 CASAVA_Build 14 31185805 1I TCTCAAATTT -/C GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 C 0 1 82735 CASAVA_Build 14 31187933 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2312 hom 23 7 15 1 T 8 9 82736 CASAVA_Build 14 31190395 1D ATGAATCACA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 8 7 82737 CASAVA_Build 14 31191195 1I TGCGGAATCT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 A 7 8 82738 CASAVA_Build 14 31210835 1D GTCTCTTGAC A/- AGAGGGGAAA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 2 1 82739 CASAVA_Build 14 31222924 1I GTTCTGTGAG -/T TAAGGTGGTT 3070 hom 126 het 43 0 43 0 T 1 2 82740 CASAVA_Build 14 31228890 1D TTCCCCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 29 0 21 9 T 12 11 82741 CASAVA_Build 14 31230030 4I AAAAAAAAAT ----/CAGA CAGAAATTAC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 CAGA 1 2 82742 CASAVA_Build 14 31242883 1D CAAATTATCA T/- TTTTAGAGAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 5 4 82743 CASAVA_Build 14 31245117 1D CAATCCCCCC T/- CTAAACAGGA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 1 0 82744 CASAVA_Build 14 31258448 1D TTCCTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 12 11 82745 CASAVA_Build 14 31263418 1I AAAATGTCCT -/A AAACCTAGCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 4 82746 CASAVA_Build 14 31265626 1I CTAAATGAAT -/G AATGAGTTAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 0 1 82747 CASAVA_Build 14 31273713 2I AGACATGAAA --/CG TAGTAGCAAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 CG 0 1 82748 CASAVA_Build 14 31276051 7I GTTGCAGATA -------/TCTTATT TCAATCAATG 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 TCTTATT 0 1 82749 CASAVA_Build 14 31276434 3I TTGTATATAC ---/TTA TTATAACAAT 3070 hom 95 het 34 0 32 2 TTA 1 2 82750 CASAVA_Build 14 31290822 2I AAACTTAGGA --/GG GGAGGTTCCC 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 G 2 4 82751 CASAVA_Build 14 31301740 1I CCAGTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 T 10 11 82752 CASAVA_Build 14 31304592 3D AAGCAACAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 24 2 16 8 T 13 10 82753 CASAVA_Build 14 31310111 1D GTAGATTATT A/- AAAGCTAAAG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 4 3 82754 CASAVA_Build 14 31328277 1D AGTGAGACTC T/- TGTCTCAAAA 3070 hom 42 het 15 0 14 1 T 2 1 82755 CASAVA_Build 14 31331448 4I TGATTCATAT ----/ACCA GCCTTGAACA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 ACCA 0 1 82756 CASAVA_Build 14 31341243 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 12 13 T 11 10 82757 CASAVA_Build 14 31342420 2D TAATGACCTC AA/-- AATGTAGCTC 3070 het 3070 hom 34 10 19 7 A 4 2 82758 CASAVA_Build 14 31344031 1I TTTACAAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 9 10 82759 CASAVA_Build 14 31355404 4D CTGGTTAGAG TCTA/---- TCTATTTTGT 2867 het 2867 ref 22 14 6 2 TCTA 2 1 82760 CASAVA_Build 14 31359101 11D CATCTCAAAA AAAAAAAAAAG/----------- AAAAAGAAAA 3070 het 1198 hom 11 4 8 2 AAAAAAAAAAG 1 0 82761 CASAVA_Build 14 31362889 1I AGGGGAAGAG -/A AGTGTTAATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 2 82762 CASAVA_Build 14 31364163 3D AGAATATAAA CTT/--- CTAGGACTCA 3070 het 3070 hom 41 19 19 5 CTT 1 0 82763 CASAVA_Build 14 31366308 1I CTACAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1601 hom 30 7 15 8 A 15 16 82764 CASAVA_Build 14 31366995 2I CTTATAAGGA --/AG AGGTGCCTGT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 AG 1 2 82765 CASAVA_Build 14 31380507 2I TGTATGTGTA --/AT TTGTATATAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AT 0 1 82766 CASAVA_Build 14 31383605 1I AGAATAACAA -/T TTTTTTCGCC 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 6 7 82767 CASAVA_Build 14 31394049 5I TTTATGTCTC -----/TAATT TAATGTAGAT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 TAATT 0 1 82768 CASAVA_Build 14 31396801 1I TCCAAACTTT -/C CCACATTTTC 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 C 2 3 82769 CASAVA_Build 14 31400408 1I AACTTTTTTC -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 6 7 82770 CASAVA_Build 14 31405183 1I TAATATGACC -/A AAAAAAAAAG 2332 het 2332 ref 27 13 6 8 A 9 10 82771 CASAVA_Build 14 31409190 7D TAGCTGCAAA AAAAACC/------- CAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 AAAAACC 1 0 82772 CASAVA_Build 14 31413264 1D CGTGCCATAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 A 9 8 82773 CASAVA_Build 14 31421306 2D CTGTCTCTGC CT/-- CTCTCTCTCT 1688 het 1688 ref 55 31 5 19 CT 10 9 82774 CASAVA_Build 14 31453215 2I TGCTGGGGTC --/CT CTCTTGCCTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 CT 2 3 82775 CASAVA_Build 14 31454738 1I CAGGTACCCC -/T GTATCCTGAT 3070 hom 99 het 39 0 32 7 T 0 1 82776 CASAVA_Build 14 31455186 8D TCTGTGTGTA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 1987 hom 36 11 13 16 TG 10 6 82777 CASAVA_Build 14 31455650 1D TCCATGTGAA C/- CCTGCCTTCT 3070 het 3070 hom 49 20 26 5 C 3 2 82778 CASAVA_Build 14 31458805 6D GTCAGTTTGA CCCAAG/------ CAGCCGTGGA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 CCCAAG 1 0 82779 CASAVA_Build 14 31467542 1D TCCCCTAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 13 8 T 10 9 82780 CASAVA_Build 14 31471551 1I CTTTTCACCA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 T 6 7 82781 CASAVA_Build 14 31472048 4I TTAGAGTAAT ----/TAAA TAGTCTTCTG 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 TAAA 0 1 82782 CASAVA_Build 14 31473137 1D TTTATACTTT C/- TTTGGAGAAA 2903 het 2903 ref 26 20 6 0 C 1 0 82783 CASAVA_Build 14 31474841 1D GAGACAGTAA T/- TTTTTTGGAT 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 T 7 6 82784 CASAVA_Build 14 31479622 1D TTATCCCTCA C/- CCCCTCCCAC 3070 het 3070 hom 26 9 12 6 C 5 4 82785 CASAVA_Build 14 31484641 1I ACCCTGTGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 10 11 82786 CASAVA_Build 14 31486607 26D ACTAAACATA CAAGTATTGAATGGCTACTGTGTTCT/-------------------------- CAAGTATTGA 3070 hom 125 het 44 0 42 10 CAAGTATTGAATGGCTACTGTGTTCT 1 0 82787 CASAVA_Build 14 31487890 3D GTGCAACCAT CAC/--- CACCATCCAT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 CAC 2 1 82788 CASAVA_Build 14 31488766 2D16M1I AGGAGGAAAC TGGAACCTGAGAGATGAG-/--GAACCTGAGAGATGAGC CCCAAGGCTA 3070 het 371 hom 37 3 18 22 N/A 0 0 82789 CASAVA_Build 14 31489378 1I ATAAGGTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 10 11 82790 CASAVA_Build 14 31493538 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 23 1 13 9 T 13 14 82791 CASAVA_Build 14 31502435 1D CTTAAAAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 T 10 9 82792 CASAVA_Build 14 31505461 1D GCTTTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 1575 het 1575 ref 44 32 4 8 T 11 10 82793 CASAVA_Build 14 31513789 1D GCCCTCAGCA C/- CCCCCCACCT 1894 het 1894 ref 31 13 8 10 C 7 6 82794 CASAVA_Build 14 31517072 2I TACTTCTTTT --/TG TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 TG 0 1 82795 CASAVA_Build 14 31517285 1I TTAGTTTGCT -/C CTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 C 1 2 82796 CASAVA_Build 14 31518449 1D TGGGTCTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 10 9 82797 CASAVA_Build 14 31519561 1D GGTTGGTAGG T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 45 15 22 9 T 7 6 82798 CASAVA_Build 14 31550630 5I AGCAAGCAAT -----/AGAAG AGAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 AGAAG 1 2 82799 CASAVA_Build 14 31563634 1D AACTGCCGTT A/- GTCTATTCAG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 1 0 82800 CASAVA_Build 14 31565795 1I ACTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 10 11 82801 CASAVA_Build 14 31565983 3D AGAGGGAGTT TCA/--- TCACCGTATT 3070 het 2182 hom 14 6 8 0 TCA 2 1 82802 CASAVA_Build 14 31570641 1D ATGGGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1847 hom 34 7 21 7 A 12 11 82803 CASAVA_Build 14 31571897 3I GACAACAATG ---/ACA ACAACAACAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 ACA 4 5 82804 CASAVA_Build 14 31600707 14D TGGTTGCTAA ATAAAGGGCTTGAT/-------------- ATAATCAAAG 3070 het 3070 ref 42 28 17 6 ATAAAGGGCTTGAT 1 0 82805 CASAVA_Build 14 31665180 1I CAGCTGTGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 8 9 82806 CASAVA_Build 14 31668614 1D GAACTCCCAC T/- TTTTTTTTTT 1920 het 1920 ref 36 28 5 3 T 12 11 82807 CASAVA_Build 14 31679383 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2302 het 960 hom 8 2 5 1 A 12 11 82808 CASAVA_Build 14 31697629 1I ACATGGTTGA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 T 7 8 82809 CASAVA_Build 14 31709904 1D AAATATATAT A/- AAAAAAAAAA 2698 hom 18 het 7 0 7 0 A 12 11 82810 CASAVA_Build 14 31710066 4I CTCTGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 51 het 18 0 16 4 AAAC 4 5 82811 CASAVA_Build 14 31711005 1I AAACAATCTT -/G GGAGGATCAT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 G 2 3 82812 CASAVA_Build 14 31713770 1D GTTGATGGAC A/- ACGTAGGTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 2 1 82813 CASAVA_Build 14 31722758 1I AAGCAACATG -/T TTACAGAAGC 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 T 2 3 82814 CASAVA_Build 14 31738291 2I CGAGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 832 hom 27 2 18 7 TA 7 8 82815 CASAVA_Build 14 31744080 1D TCCAATCACG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 9 8 82816 CASAVA_Build 14 31751632 1D ACTTCAGAAT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 G 8 7 82817 CASAVA_Build 14 31753291 1D TTATTTTATT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 127 hom 16 3 9 4 A 1 0 82818 CASAVA_Build 14 31761709 1D CATCCACTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 10 9 82819 CASAVA_Build 14 31766811 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1345 het 1345 ref 27 22 4 1 A 15 14 82820 CASAVA_Build 14 31768937 1I ATAGGGGGGG -/A GAAAAAGCAT 3070 het 3070 hom 49 19 29 1 A 0 1 82821 CASAVA_Build 14 31784256 1I TCTTTGAAAA -/G TTAACTTATA 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 G 0 1 82822 CASAVA_Build 14 31803980 1I ACTTAAACTA -/G AACGGTATAA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 G 0 1 82823 CASAVA_Build 14 31807613 1D GAACAACAAC A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 18 10 7 1 A 7 6 82824 CASAVA_Build 14 31831190 1D CACCATGCCC G/- GATAATTTTT 1203 het 1203 ref 14 7 3 4 G 2 1 82825 CASAVA_Build 14 31832642 3I TTGGGGGGCT ---/GTG GGGGGACACA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 GTG 0 1 82826 CASAVA_Build 14 31834330 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 693 hom 28 6 11 11 A 15 14 82827 CASAVA_Build 14 31835339 1I AGTATTAGTT -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 7 8 82828 CASAVA_Build 14 31849131 1I ACTCCCCTCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 8 9 82829 CASAVA_Build 14 31849624 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 13 11 82830 CASAVA_Build 14 31851708 4D TCTTCCCCAT AGAA/---- AGAAAACTTT 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 AGAA 2 1 82831 CASAVA_Build 14 31853333 4I CACCAGTGTC ----/TGTT TGTACCAACA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 TGTT 0 1 82832 CASAVA_Build 14 31877445 2D CAATTTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 AT 6 5 82833 CASAVA_Build 14 31882189 5I TTGTCAAGTA -----/AGTAT TACCTTCCTT 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 AGTAT 0 1 82834 CASAVA_Build 14 31888225 1D TGTATAGGAG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 10 11 9 T 8 7 82835 CASAVA_Build 14 31889971 1D CTATGGCTTA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 T 8 7 82836 CASAVA_Build 14 31890520 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2665 het 2373 hom 26 9 9 8 A 14 15 82837 CASAVA_Build 14 31892011 1D CATACCAGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 17 22 8 T 10 9 82838 CASAVA_Build 14 31892325 1D GAAACCATCC T/- GGCTAACACG 3070 het 966 hom 10 2 7 1 T 1 0 82839 CASAVA_Build 14 31893388 1D TATACTACCT A/- AACTGGCAGT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 3 2 82840 CASAVA_Build 14 31894206 5D TTTATTTTCT TATAG/----- TATAGACCAT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 TATAG 2 1 82841 CASAVA_Build 14 31894384 5I TCTTGTTCTC -----/ATGCT ATCCCAGATG 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 ATGCT 0 1 82842 CASAVA_Build 14 31904339 2I ATTGGCAGGA --/AC ACTTGCCATC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 AC 1 2 82843 CASAVA_Build 14 31911521 1I TTAAGATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 37 3 26 8 T 12 13 82844 CASAVA_Build 14 31917152 1D ATATTATATA G/- GGGAAAAAAC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 4 3 82845 CASAVA_Build 14 31917875 2D TCTTTCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 32 2 15 15 T 18 16 82846 CASAVA_Build 14 31924105 1I TGACACTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 25 1 19 5 A 10 11 82847 CASAVA_Build 14 31924363 1I TTTTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3004 het 588 hom 25 5 10 10 T 13 14 82848 CASAVA_Build 14 31940924 1D AGAACAGTGA T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 152 het 55 0 51 5 T 7 6 82849 CASAVA_Build 14 31944657 4I TTCTTGTGAT ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 hom 74 het 27 0 24 3 AGTG 1 2 82850 CASAVA_Build 14 31947672 3D TCCAAGTAGG AGA/--- TATGTGTAGG 3070 het 3070 hom 32 13 18 4 AGA 1 0 82851 CASAVA_Build 14 31949104 3I ATCCCCTTCC ---/CCT CCTCCTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 12 6 CCT 2 3 82852 CASAVA_Build 14 31950929 1D AAATGGCTTT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 8 7 82853 CASAVA_Build 14 31954358 2D TTGAGACTTT AA/-- GTTAACTTAG 3070 het 3070 hom 48 21 25 2 A 2 0 82854 CASAVA_Build 14 31960301 10I TCACTAATTA ----------/TCTTACCTTT TCTCTCCTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCTTACCTTT 0 1 82855 CASAVA_Build 14 31981598 1I CCCGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 1832 het 1832 ref 24 9 7 8 A 15 16 82856 CASAVA_Build 14 31982000 1D ATGGCATGTG T/- TAGAGACCAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 2 1 82857 CASAVA_Build 14 31983698 2D AAGGTCTTCA GT/-- GTGCTTCTTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 GT 2 1 82858 CASAVA_Build 14 31998261 1D TGTTCTAGAG T/- TTGGTCATAC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 3 2 82859 CASAVA_Build 14 32007135 1I TTTTCTACTG -/A AAAATGATTA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 4 5 82860 CASAVA_Build 14 32011852 1D GTATTAAAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 A 9 8 82861 CASAVA_Build 14 32013337 7I TCCTAGACCA -------/CTTCCAT CTTCCATCCA 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 CTTCCAT 1 2 82862 CASAVA_Build 14 32015083 2D GTTCTTAAAC AT/-- ATTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AT 2 1 82863 CASAVA_Build 14 32016899 1D ATTTGTGAAA T/- TGCTTAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 T 2 1 82864 CASAVA_Build 14 32018739 3I ATGAGGACAC ---/AAG AAGAAGACAC 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 AAG 2 3 82865 CASAVA_Build 14 32022378 2D GGAATGTAAA AC/-- AGTTTTATAG 3070 het 2896 hom 17 7 9 1 AC 1 0 82866 CASAVA_Build 14 32027605 15D TGAAACTCAG GGCCCGGGTGGTGTA/--------------- GGCACTGGAG 3070 het 3070 ref 28 14 9 13 GGCCCGGGTGGTGTA 1 0 82867 CASAVA_Build 14 32029112 1I GATAGGGCAG -/A AACAAATCAC 3070 het 3070 hom 26 7 15 4 A 2 3 82868 CASAVA_Build 14 32037300 1I GCAGGAGCCA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 7 8 82869 CASAVA_Build 14 32046499 1D ATTGTGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 15 13 T 12 11 82870 CASAVA_Build 14 32066322 27D TTCCAAGTTT TGGCAATCCTTGGTTGCTTCCAAGTTG/--------------------------- TGGCAATTAT 2976 het 2976 ref 30 24 10 5 TGGCAATCCTTGGTTGCTTCCAAGTTG 1 0 82871 CASAVA_Build 14 32101345 1D TAAAACTGAC A/- AGTTGAGCTA 3070 het 3070 hom 29 11 18 1 A 2 1 82872 CASAVA_Build 14 32102720 1D ATTGTATTAG A/- GATAATTCTC 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 1 0 82873 CASAVA_Build 14 32109270 1D GTATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2501 het 1480 hom 15 5 7 4 T 11 10 82874 CASAVA_Build 14 32130606 2D GTGTCTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1783 hom 28 5 16 8 T 16 14 82875 CASAVA_Build 14 32246136 5D AAGTATTAAC TTATT/----- TAATTTAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 TTATT 1 0 82876 CASAVA_Build 14 32251934 1D CACTATCTAT G/- GCAGCTATAG 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 G 2 1 82877 CASAVA_Build 14 32252419 1D CTAGATGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 41 0 34 7 T 11 10 82878 CASAVA_Build 14 32254404 1I TTAGAAAAGC -/A AAAACGAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 4 5 82879 CASAVA_Build 14 32263036 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 9 8 82880 CASAVA_Build 14 32275751 7D TCCGTCAGAA AATTTAG/------- TCACATGTGA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AATTTAG 1 0 82881 CASAVA_Build 14 32278157 1D TAGTATGATC T/- GCTATTTATA 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 1 0 82882 CASAVA_Build 14 32280502 1D TCCATCCCCA T/- TTTTTTTTTA 1976 het 1976 ref 46 32 5 9 T 10 9 82883 CASAVA_Build 14 32281298 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 34 10 22 2 T 7 6 82884 CASAVA_Build 14 32290120 1I TGAACTTCAG -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 82885 CASAVA_Build 14 32290634 2D GCCTTCACTT AA/-- AAAAAAATCT 3070 hom 97 het 40 0 32 9 A 9 7 82886 CASAVA_Build 14 32308510 2D GCTTCATGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 33 0 30 5 T 20 18 82887 CASAVA_Build 14 32314391 1D ATTTTTATCC T/- TTTTTTTTTT 1662 het 1662 ref 33 19 7 7 T 15 14 82888 CASAVA_Build 14 32321269 1I ACTCAATAGG -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 6 7 82889 CASAVA_Build 14 32324681 1I TTGAAAGATC -/T TTGTACAGGA 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 T 2 3 82890 CASAVA_Build 14 32326474 1D CTAGATTTCA C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 C 8 7 82891 CASAVA_Build 14 32327643 2D GTGAGCCCAC TA/-- ACTACCAGGT 3070 het 3070 hom 39 11 17 14 TA 1 0 82892 CASAVA_Build 14 32338413 7D GTAAGTTTCC CTCTAAG/------- CTCTAAGCAC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 CTCTAAG 2 1 82893 CASAVA_Build 14 32346027 2D AGGGGGGGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 67 het 28 0 23 5 AT 9 8 82894 CASAVA_Build 14 32346150 1D ATACAAACTT A/- AAAAATTAGC 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 6 5 82895 CASAVA_Build 14 32351397 1D TTGAAACTCT G/- GGGGGAAATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 6 5 82896 CASAVA_Build 14 32381794 2D AGAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGGG 1650 het 1650 ref 22 8 4 11 AG 5 4 82897 CASAVA_Build 14 32382190 1I AATTCATTGT -/C TTCTGGCTGA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 0 1 82898 CASAVA_Build 14 32383226 4I TAAATGTCTT ----/CCTC CCAGTTTCCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CCTC 0 1 82899 CASAVA_Build 14 32383545 2I CTCCTTCTTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 84 het 38 0 27 11 TC 7 8 82900 CASAVA_Build 14 32389173 1I ATTTAACTCA -/T TTTTGATTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 4 5 82901 CASAVA_Build 14 32397123 1D TAAATAAAAC A/- AAAAAATCCC 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 7 6 82902 CASAVA_Build 14 32397566 5D TAAAATGCTG TTCAA/----- TTCAATTTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 TTCAA 2 1 82903 CASAVA_Build 14 32401818 1I GCAGTGGAGT -/G GATGTTGGCT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 G 1 2 82904 CASAVA_Build 14 32402179 1D GCAATGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 10 9 T 12 11 82905 CASAVA_Build 14 32406412 1D TTTAAAATAT A/- AAAACGTCTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 5 4 82906 CASAVA_Build 14 32412075 1D AAAGCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 17 9 T 13 12 82907 CASAVA_Build 14 32419010 4I CCTCCCTTTA ----/CTTT CTTTCTTTCT 3070 hom 80 het 36 0 27 9 CTTT 2 3 82908 CASAVA_Build 14 32426627 1D CAACTACAGG A/- AAAAAAAAAA 2255 het 2255 ref 32 22 5 5 A 13 12 82909 CASAVA_Build 14 32430031 1I TAATTTCTTT -/A AAAAAAACAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 7 8 82910 CASAVA_Build 14 32448748 1D AAATCCAATG T/- TTATGTGAAA 3070 het 3070 ref 36 18 12 8 T 3 2 82911 CASAVA_Build 14 32451911 1D CTGTCACCCC T/- AATTGTCCAC 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 T 1 0 82912 CASAVA_Build 14 32452331 1D ATATGAAATT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 A 9 8 82913 CASAVA_Build 14 32460971 1D CCATTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 15 14 82914 CASAVA_Build 14 32461477 1D TATGATGATA T/- TTTTAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 5 4 82915 CASAVA_Build 14 32464431 2D TATGTCTGAC AG/-- GGTATAATTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AG 1 0 82916 CASAVA_Build 14 32465887 3D CCCATTCATA ATT/--- ATTTGATAGT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 ATT 2 1 82917 CASAVA_Build 14 32475888 1D AGACTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 T 16 15 82918 CASAVA_Build 14 32497136 1D TCCACCTTGG T/- TTTTTTCATC 3004 het 3004 ref 25 15 8 2 T 7 6 82919 CASAVA_Build 14 32497955 1D AAAATACACT A/- ATAATAACGA 3070 het 3070 hom 34 17 15 3 A 2 1 82920 CASAVA_Build 14 32498934 2D TGAGTTTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 1970 het 925 hom 42 8 12 24 T 20 18 82921 CASAVA_Build 14 32506870 2D14M1D CATTGTGAGA GTGTGTGTGTGTGTCAT/--GTGTGTGTGTGTCA- TTGTGACAAC 3070 het 3070 hom 41 10 25 15 N/A 0 0 82922 CASAVA_Build 14 32507730 2I ACTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 13 15 82923 CASAVA_Build 14 32517070 1I GTGAAGATGT -/G GGGGGGGTGA 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 G 7 8 82924 CASAVA_Build 14 32524076 1I ATATGATATG -/A GACATCAGAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 0 1 82925 CASAVA_Build 14 32530103 1I AATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 18 6 T 11 12 82926 CASAVA_Build 14 32542028 1D TTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 23 8 T 12 11 82927 CASAVA_Build 14 32545977 1D GAATTATGAC T/- TTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 7 6 82928 CASAVA_Build 14 32551043 5I CTGTGCCTGC -----/CTTTA CTTCCCTTCC 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 CTTTA 0 1 82929 CASAVA_Build 14 32602964 4D GTTATAGTTG TTGT/---- TTATTACTAT 3070 het 3070 hom 46 20 23 6 TTGT 1 0 82930 CASAVA_Build 14 32616199 1D AAAATGGGGT G/- GTCAGAAGAG 3070 het 3070 ref 46 25 19 4 G 2 1 82931 CASAVA_Build 14 32616509 1D AAGCTTCCAT A/- AATACTCCAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 A 3 2 82932 CASAVA_Build 14 32617490 1D AAACAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 27 1 16 10 A 13 12 82933 CASAVA_Build 14 32622179 6D AAAGAAGGGA CTTTGC/------ CTTTGCCTCC 3070 hom 61 het 28 0 21 9 CTTTGC 2 1 82934 CASAVA_Build 14 32622670 1D AATATTTGAA G/- GGTATCCAGT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 G 3 2 82935 CASAVA_Build 14 32627996 26I CACCATCATC --------------------------/AAAGATCAAAGGTAGATAAAACCACA AAGATGAGGA 2308 hom 12 het 9 0 5 4 AAAGATCAAAGGTAGATAAAACCACA 0 1 82936 CASAVA_Build 14 32629245 1I GGCTCAAAAT -/A AAAGGATGGA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 3 4 82937 CASAVA_Build 14 32633072 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 22 1 12 9 A 12 11 82938 CASAVA_Build 14 32634118 3D GTTTTAAATC ATT/--- ATAAAATTGG 3070 het 3070 hom 40 19 17 6 ATT 1 0 82939 CASAVA_Build 14 32644642 2D TCCCAAATTA GT/-- GCTAGTTGCA 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 GT 1 0 82940 CASAVA_Build 14 32646087 4I TCTCTTGAGC ----/TTCA TGAACTCTCT 3070 het 3070 hom 45 17 26 2 TTCA 0 1 82941 CASAVA_Build 14 32649735 2D AGGTTCAGTC CG/-- GGGACGGGAA 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 CG 1 0 82942 CASAVA_Build 14 32654044 3D CATCACTAAC ATT/--- ATTGAGTGCT 3070 het 3070 ref 52 27 20 8 ATT 2 1 82943 CASAVA_Build 14 32658970 1D AGATACTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 10 9 82944 CASAVA_Build 14 32670394 22I CTTCCACGTG ----------------------/GTCTAGCTATTATCTCCTAAGA GTTAAGCAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 GTCTAGCTATTATCTCCTAAGA 0 1 82945 CASAVA_Build 14 32673819 2I TAAAGACTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 47 0 37 10 T 10 12 82946 CASAVA_Build 14 32678901 1I GCCTGCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 10 11 82947 CASAVA_Build 14 32697017 1D AAATTTAAGG A/- AAAAAATGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 7 6 82948 CASAVA_Build 14 32714788 1D AACGTTATCA T/- TTTTTTATCT 3070 hom 102 het 36 0 35 2 T 7 6 82949 CASAVA_Build 14 32719324 1I CACCATTCTG -/T TTAAATAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 2 3 82950 CASAVA_Build 14 32726447 1D CTCTGGACTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 8 7 82951 CASAVA_Build 14 32738587 17D GTATCTGTTT CTTTCCTCCTTACCTTC/----------------- CTTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 34 14 11 12 CTTTCCTCCTTACCTTC 2 1 82952 CASAVA_Build 14 32739532 1D ACTAAACCAC A/- GGTTGCTAAT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 1 0 82953 CASAVA_Build 14 32741665 1D TATTCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1857 hom 23 6 10 7 T 12 11 82954 CASAVA_Build 14 32746926 1I TAATTGATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 9 10 82955 CASAVA_Build 14 32747063 1I AAAACTGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 37 1 29 7 T 10 11 82956 CASAVA_Build 14 32749316 1D GTAGCACCCC T/- TTTTTCAAAC 3070 het 1939 hom 24 7 12 5 T 6 5 82957 CASAVA_Build 14 32751424 1I GAGGTAGGAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 98 hom 41 1 36 4 A 8 9 82958 CASAVA_Build 14 32752196 1I TTACTGGACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 17 hom 38 1 29 8 A 9 10 82959 CASAVA_Build 14 32783471 1D AATGTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 6 A 12 11 82960 CASAVA_Build 14 32786675 5D CCTTCCATAA TTTGT/----- TTTAAGAAGT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 TTTGT 1 0 82961 CASAVA_Build 14 32791598 1I TAGTTATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 10 11 82962 CASAVA_Build 14 32798815 2D CAGCAGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 33 3 11 22 T 14 12 82963 CASAVA_Build 14 32800259 1I GCTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 11 12 82964 CASAVA_Build 14 32804459 1D ATGCATTACA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 9 8 82965 CASAVA_Build 14 32814666 3D GGTTGTTTTC CTT/--- CTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 26 6 CTT 2 1 82966 CASAVA_Build 14 32817939 5D CACGAAATAA CTATG/----- CTGTAAATAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 4 CTATG 1 0 82967 CASAVA_Build 14 32836180 2D ATTACCTCTC TT/-- TGCCTCAGTT 3070 het 3070 ref 33 20 12 3 T 3 1 82968 CASAVA_Build 14 32838555 4I GCTAGTTTCT ----/TTTC TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 TTTC 0 1 82969 CASAVA_Build 14 32842751 2I GCTGAATAAA --/AG AAGAAAATAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 AG 0 1 82970 CASAVA_Build 14 32845162 1I CTCCAGGTTA -/T TTTTTATCTC 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 T 5 6 82971 CASAVA_Build 14 32849261 1D ATAGCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 58 24 24 10 A 11 10 82972 CASAVA_Build 14 32875832 1I GCCTTCCTTA -/T TATCTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 T 1 2 82973 CASAVA_Build 14 32876921 1I TTTCTAGGAA -/T TTTTTTTTTG 2093 het 2093 ref 30 17 7 6 T 9 10 82974 CASAVA_Build 14 32882826 1I TGCTCTGGCG -/T TCCTCAGTGC 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 T 1 2 82975 CASAVA_Build 14 32884227 1I AACTTGCCCT -/A AAAAGATATG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 4 5 82976 CASAVA_Build 14 32891011 1D AAAAAAAAAA C/- ATCTGCGGTT 3070 het 2857 hom 28 8 15 5 C 1 0 82977 CASAVA_Build 14 32893971 6I ATGGATGCCG ------/AATGCC AATGCCGTGT 3070 het 3070 hom 59 25 25 9 AATGCC 1 2 82978 CASAVA_Build 14 32897931 1D ATAGCAGGTG C/- TGTTATAAGC 3070 het 3070 ref 52 26 21 6 C 1 0 82979 CASAVA_Build 14 32906547 2I TAAGTGGATC --/TA TGTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 TA 0 1 82980 CASAVA_Build 14 32908553 20D TGGCTTGGTA AAGATGCTTTCAAGAAAGGC/-------------------- ATCTAAGCAT 3070 het 3070 ref 33 18 16 7 AAGATGCTTTCAAGAAAGGC 1 0 82981 CASAVA_Build 14 32913442 1I CTACCAGAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 65 het 36 0 28 8 T 8 9 82982 CASAVA_Build 14 32919002 1D AGTGGGGGGG A/- AAAAGAAAAT 2904 hom 30 het 22 0 12 10 A 5 4 82983 CASAVA_Build 14 32923119 1I AGAAGCAATC -/A AGCTTCATTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 1 2 82984 CASAVA_Build 14 32925470 1D AGTTTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 12 11 82985 CASAVA_Build 14 32929000 1D GATTTGTGTT A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 A 8 7 82986 CASAVA_Build 14 32938617 1D TGAAGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 20 19 9 T 12 11 82987 CASAVA_Build 14 32939889 1D ACTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 34 0 22 12 T 11 10 82988 CASAVA_Build 14 32957007 1D CAATGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 11 10 82989 CASAVA_Build 14 32957628 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTAAAGG 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 T 5 6 82990 CASAVA_Build 14 32976539 5I GAGAGTCCTT -----/TACTG TACTGGAATA 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 TACTG 1 2 82991 CASAVA_Build 14 32978057 1D ACCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 12 11 82992 CASAVA_Build 14 32980355 1D AAAAAAAGAT A/- AAAGAATCTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 4 3 82993 CASAVA_Build 14 33018724 3I TGGCTGTCTC ---/CTT CTTTGCCAGC 3070 het 3070 hom 54 11 36 7 CTT 1 2 82994 CASAVA_Build 14 33037670 5I TAGGGAAGGG -----/GTAGC GTTAGGAGAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 GTAGC 0 1 82995 CASAVA_Build 14 33040588 1I TCTGGATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2447 hom 34 11 15 8 T 14 15 82996 CASAVA_Build 14 33041230 1D CTCTCCCCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 10 18 9 T 10 9 82997 CASAVA_Build 14 33045973 1I CTCAGATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 11 12 82998 CASAVA_Build 14 33057747 1I CCAAATACTT -/C CTCCTTCTTA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 C 1 2 82999 CASAVA_Build 14 33088044 1I TCTGTGTCTG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 7 8 83000 CASAVA_Build 14 33096143 1D TATACTACAT C/- CCTGCGCTTG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 C 3 2 83001 CASAVA_Build 14 33123359 1I ATGTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 27 1 20 6 A 11 12 83002 CASAVA_Build 14 33124025 1D TCAATTCTTT C/- TTTTTTTTCG 1053 het 1053 ref 35 27 5 4 C 1 0 83003 CASAVA_Build 14 33193136 1D TCCTGTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 T 11 10 83004 CASAVA_Build 14 33196510 2D AGGAAAAAGG AC/-- AGATGAAAAT 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 AC 1 0 83005 CASAVA_Build 14 33196747 1D CAGATTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 12 11 83006 CASAVA_Build 14 33208092 4I GAAAGTGACA ----/TCTT TCTTTCTTAC 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 TCTT 2 3 83007 CASAVA_Build 14 33209573 1I ATAAATGTGA -/C CCCCCCCTCA 3070 het 2545 hom 32 11 16 5 C 7 8 83008 CASAVA_Build 14 33214030 6I ATATCCACCA ------/AGAAAC AGAAACTTGT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 AGAAAC 1 2 83009 CASAVA_Build 14 33216576 2D ACACAGAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 A 12 10 83010 CASAVA_Build 14 33220842 4I AGGGTAAGTG ----/ACAA ACAAACAGTG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 ACAA 1 2 83011 CASAVA_Build 14 33222014 5D GAAACTAACT TTCTC/----- TTCTCTTTCA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TTCTC 2 1 83012 CASAVA_Build 14 33257598 2D GATATGGTAT CA/-- CAGTGCCAGG 3070 hom 129 het 48 0 44 5 CA 2 1 83013 CASAVA_Build 14 33262672 1D ACTTCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 638 hom 36 2 26 9 A 14 13 83014 CASAVA_Build 14 33266170 1I CCCCATGGAT -/A GGCCGCAGAG 3070 hom 84 het 38 0 27 11 A 0 1 83015 CASAVA_Build 14 33270381 1D GTCTCATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 638 hom 35 3 14 18 A 17 16 83016 CASAVA_Build 14 33289173 1D CAGCTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 T 13 12 83017 CASAVA_Build 14 33302775 1D CACTAAAGAA T/- TTTTTATCTA 1783 het 1783 ref 32 22 6 4 T 6 5 83018 CASAVA_Build 14 33302803 1D GGAGTATTGG T/- TTTTTTTTTT 1905 het 1905 ref 36 21 6 10 T 12 11 83019 CASAVA_Build 14 33304255 2D TTTCTGCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2907 hom 17 9 8 0 A 14 12 83020 CASAVA_Build 14 33326003 1D ATAACAAATT C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 C 8 7 83021 CASAVA_Build 14 33326557 3D ATAGATTTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 2880 het 1128 hom 35 9 13 14 A 17 14 83022 CASAVA_Build 14 33332786 3D TTGCAGAGAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 23 0 21 2 A 15 12 83023 CASAVA_Build 14 33340691 1D TAGAATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 A 12 11 83024 CASAVA_Build 14 33343226 1D TTCTTTATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 9 83025 CASAVA_Build 14 33350006 1I TTTTGTGGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 2368 hom 23 9 13 2 T 7 8 83026 CASAVA_Build 14 33352726 1I CTAACAAAAC -/G GATTACCTTA 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 G 1 2 83027 CASAVA_Build 14 33376232 28D AAGTCGCTTA TGTGCTATATGCCTCAGCTTCTCGCTTT/---------------------------- TGTGCTATAT 3070 het 3070 hom 41 15 25 7 TGTGCTATATGCCTCAGCTTCTCGCTTT 1 0 83028 CASAVA_Build 14 33390407 1D AGCAGAGGTA G/- GGGGGGTGAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 7 G 7 6 83029 CASAVA_Build 14 33439527 1D TTAAAACATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 10 9 83030 CASAVA_Build 14 33463495 2D CTTGGAAGAC TA/-- TATATATATA 1382 het 1382 ref 39 27 3 10 TA 7 6 83031 CASAVA_Build 14 33464900 1D GACAGAAAGG A/- GAATAAAGAG 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 A 1 0 83032 CASAVA_Build 14 33475777 1D AGTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 7 A 13 12 83033 CASAVA_Build 14 33478473 3I GGCCGAAACA ---/ATC ATCTTAAAAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 ATC 1 2 83034 CASAVA_Build 14 33480517 1D TATCCCCCCC A/- AAAAAAATTC 3070 hom 68 het 28 0 20 9 A 8 7 83035 CASAVA_Build 14 33506079 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1763 het 1763 ref 18 5 6 7 A 16 15 83036 CASAVA_Build 14 33511744 1I ATCAATGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 9 10 83037 CASAVA_Build 14 33520474 9D AAAAAAAGAA AAAAGAAAC/--------- AAAAGAAACT 1880 het 788 hom 9 2 6 1 AAAAGAAAC 2 1 83038 CASAVA_Build 14 33521274 8D AGCACTTGCC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 1885 hom 30 10 14 6 T 19 11 83039 CASAVA_Build 14 33529369 1D CTTTCCTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 42 0 31 12 T 11 10 83040 CASAVA_Build 14 33531157 1I GGAAGTTATA -/G GAAGATCTGT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 1 2 83041 CASAVA_Build 14 33536216 5I GGGAAGAAGA -----/AGGAG AGATCATTCT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AGGAG 0 1 83042 CASAVA_Build 14 33541994 54D GGAAGGAACT GCTTTATGCAATTTAAGACCTTTTTATCCTTTAACAGAACAGAAGCTGAAAATA/------------------------------------------------------ TTAAAAGCTT 2839 het 2839 ref 31 34 6 4 GCTTTATGCAATTTAAGACCTTTTTATCCTTTAACAGAACAGAAGCTGAAAATA 1 0 83043 CASAVA_Build 14 33569528 1D GCATTCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 24 10 5 9 T 17 16 83044 CASAVA_Build 14 33569945 2D CCCACACACC CA/-- CACACACACA 3070 hom 102 het 40 0 31 11 CA 10 9 83045 CASAVA_Build 14 33577957 1D GCTTGCTATT G/- GTGGAGTGCT 3070 het 3070 ref 50 23 17 10 G 2 1 83046 CASAVA_Build 14 33585968 2D GGGCCTGGGG GA/-- GAGAGAGAGA 1819 het 1819 ref 41 28 4 10 GA 8 7 83047 CASAVA_Build 14 33602290 1I TGCCCCACTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 A 8 9 83048 CASAVA_Build 14 33603265 1D TATAGGTTGC A/- AAAAGAAACT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 A 5 4 83049 CASAVA_Build 14 33603487 1I ACAGGCACAC -/A AGGCAGAATG 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 A 1 2 83050 CASAVA_Build 14 33610907 2I AATTTTCTAT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 48 21 15 12 TC 5 6 83051 CASAVA_Build 14 33625794 1D ATATCAGGTA T/- GTCAGTATGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 0 83052 CASAVA_Build 14 33626338 4I ATTCTGCCAA ----/ACTT ACTTGAATCA 3070 hom 76 het 33 0 26 7 ACTT 1 2 83053 CASAVA_Build 14 33627831 1D TATTAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 26 9 A 12 11 83054 CASAVA_Build 14 33627843 1D AAAAAAAAAA C/- TCTCAGAAAA 3070 het 238 hom 31 6 22 3 C 1 0 83055 CASAVA_Build 14 33629833 1I TCCCTCAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 9 10 83056 CASAVA_Build 14 33660728 9I TTATGAGGCT ---------/AAAATGCCA AAAATGCCAA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 AAAATGCCA 1 2 83057 CASAVA_Build 14 33662288 1D TTTAAAAATG T/- TTTTTACCCA 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 T 6 5 83058 CASAVA_Build 14 33702694 1D ATCAGTTAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 A 9 8 83059 CASAVA_Build 14 33719306 4D AGGTAAAAAA AAAT/---- AAATAAACTA 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 AAAT 2 1 83060 CASAVA_Build 14 33720136 2D TGTCAGTAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 AC 7 6 83061 CASAVA_Build 14 33746572 3D GTTATTTTTC CTT/--- CTTATCATCA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 CTT 2 1 83062 CASAVA_Build 14 33753352 1I AAAGCAGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 9 14 T 12 13 83063 CASAVA_Build 14 33755585 2I GATGAAGAAT --/AA AAGTTTCAGA 3070 het 2555 hom 21 6 11 4 A 2 4 83064 CASAVA_Build 14 33770973 1I TTGTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 30 0 19 11 T 12 13 83065 CASAVA_Build 14 33779949 2I AATTTGATTG --/AA AAATATTGAC 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 3 5 83066 CASAVA_Build 14 33780436 6D TCTCTCTCTC TGTCTT/------ TATCTCTGTC 3070 het 3070 ref 51 31 15 8 TGTCTT 1 0 83067 CASAVA_Build 14 33783072 1D ATTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 7 A 11 10 83068 CASAVA_Build 14 33784848 1D CTGGGATTAC A/- AGGCGTGAGC 1761 het 1554 hom 13 5 5 3 A 2 1 83069 CASAVA_Build 14 33785184 4D TAGCAAGAAT GCGG/---- GGGGCGGGGG 3070 het 2262 hom 31 9 19 3 GCGG 1 0 83070 CASAVA_Build 14 33785349 4D CACAGGCACC CCTA/---- CCTAGCTCAG 3070 het 3070 ref 32 17 9 12 CCTA 2 1 83071 CASAVA_Build 14 33787961 1D CATTCATTCA T/- TCATTTATTC 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 T 2 1 83072 CASAVA_Build 14 33788367 2I CTCCAAAAAA --/AC AAGTTTCTTC 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 AC 0 1 83073 CASAVA_Build 14 33789572 3D TGGTATTATG ATT/--- ATTATTATAT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 ATT 3 2 83074 CASAVA_Build 14 33789741 2I TATGGACTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 1799 hom 43 10 22 11 TC 0 1 83075 CASAVA_Build 14 33792254 16I GTGCCCCATA ----------------/TAACTCCTGAGCTACT TAACTCCTGA 3070 het 3070 ref 58 23 21 14 TAACTCCTGAGCTACT 0 1 83076 CASAVA_Build 14 33795947 8I AGCCAAGATC --------/GCACCACT GCACTCCAAC 2286 hom 12 het 5 0 5 0 GCACCACT 0 1 83077 CASAVA_Build 14 33797693 2I AGGATTATGT --/TC TTTCTGAAAA 3070 hom 108 het 45 0 35 10 TC 0 1 83078 CASAVA_Build 14 33798197 6D ATGATGTTTT AGTATA/------ AGTATGTCCC 3070 het 3070 ref 37 21 13 4 AGTATA 1 0 83079 CASAVA_Build 14 33807563 1D ACACACCACA T/- TTTTTTTTTA 2293 het 2293 ref 25 12 8 6 T 10 9 83080 CASAVA_Build 14 33810107 1I GCTGATTCAC -/A TAAACCCCAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 0 1 83081 CASAVA_Build 14 33836730 11D GATATGAGCA GGGCAGGATAG/----------- GGCCCCAAAG 3070 het 3070 ref 38 25 16 2 GGGCAGGATAG 1 0 83082 CASAVA_Build 14 33837121 1D AGACTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 35 1 31 3 A 11 10 83083 CASAVA_Build 14 33841269 1I TGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 2533 het 389 hom 22 4 10 8 A 17 18 83084 CASAVA_Build 14 33861516 1I AGATATAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 11 12 83085 CASAVA_Build 14 33862827 16D TTACCTATCC TTTTTTTTTCTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 22 0 20 7 TTTTTTTTTCTTTTTT 1 0 83086 CASAVA_Build 14 33863423 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 24 0 13 12 T 17 16 83087 CASAVA_Build 14 33864023 2I CTTTTTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 2978 hom 40 het 19 0 13 6 T 12 14 83088 CASAVA_Build 14 33864544 3D ACATTATTTT TTG/--- TCTTGCCATT 3070 het 3070 hom 45 19 24 3 TTG 1 0 83089 CASAVA_Build 14 33865113 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 34 het 15 0 11 4 T 8 9 83090 CASAVA_Build 14 33865660 22D TATTTCTTTT CACACACACACACACACACACA/---------------------- CACACACACA 3070 hom 63 het 26 0 22 6 CA 19 8 83091 CASAVA_Build 14 33876936 1D ATGATAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2125 hom 20 6 10 4 A 13 12 83092 CASAVA_Build 14 33879848 2D TGAAGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 35 1 32 2 T 24 22 83093 CASAVA_Build 14 33902805 1I ACATGAGAGC -/A GTTGACAGGA 3070 hom 93 het 39 0 29 10 A 0 1 83094 CASAVA_Build 14 33907491 2I ACCAAAGTAC --/AG AGAGAAAAAT 3070 hom 95 het 42 0 32 10 AG 2 3 83095 CASAVA_Build 14 33971793 1D ATATTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 2312 het 2312 ref 58 43 5 10 T 12 11 83096 CASAVA_Build 14 34013633 1D GTTTCAAAGT C/- TTTAGATAAG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 C 1 0 83097 CASAVA_Build 14 34024353 2I CACCTGATCA --/TT TTTTTTTTTT 2156 hom 21 het 11 0 8 3 T 13 15 83098 CASAVA_Build 14 34025097 2I ACTGCGACTC --/TG GAGGCCACCC 3070 hom 53 het 22 0 18 4 TG 0 1 83099 CASAVA_Build 14 34025383 1D GGATGTTGCC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 62 het 26 0 21 6 A 9 8 83100 CASAVA_Build 14 34032572 1I ACTGCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1295 het 445 hom 11 2 3 6 A 13 14 83101 CASAVA_Build 14 34033328 1D AGTGAGTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 12 11 83102 CASAVA_Build 14 34036881 14I CCAGCCTGGA --------------/CAACATGGTGAAAC CCCGTCTCTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CAACATGGTGAAAC 0 1 83103 CASAVA_Build 14 34037063 3D AAAAAAAATA AAT/--- AAATAAAATA 673 het 673 ref 23 5 8 11 AAT 1 0 83104 CASAVA_Build 14 34038416 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2550 hom 19 het 11 0 7 4 T 11 12 83105 CASAVA_Build 14 34040690 1D AAACTCTATT A/- AAAAAAAAAA 1009 het 1009 ref 22 17 3 2 A 11 10 83106 CASAVA_Build 14 34058803 1D ATGAAATCAC A/- AAAAAAAAAC 2224 het 2224 ref 22 9 5 8 A 10 9 83107 CASAVA_Build 14 34061239 2I TTTCGATCTC --/TT TGTTAAATTT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 1 3 83108 CASAVA_Build 14 34065835 1I TCTTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 14 1 10 3 A 10 11 83109 CASAVA_Build 14 34068984 1I AAAGAAAAAG -/A AAAATAATAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 4 5 83110 CASAVA_Build 14 34094026 15D GAATCGCTGA CCTGGAGCTTACATT/--------------- CCAAGTGGGT 3070 het 3070 ref 39 22 16 7 CCTGGAGCTTACATT 1 0 83111 CASAVA_Build 14 34101687 1D AAAAAGGCAA T/- CTTTATCTTG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 1 0 83112 CASAVA_Build 14 34102693 3I TTCAGTAAAT ---/TTC TTTTTTTCTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTC 0 1 83113 CASAVA_Build 14 34111056 3D ACCACATTCC TTA/--- TATTAACAGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TTA 1 0 83114 CASAVA_Build 14 34115356 5I AACAGAAAAA -----/AGATC AGATCAAATG 3070 hom 37 het 17 0 12 5 AGATC 1 2 83115 CASAVA_Build 14 34122397 4I TTTTTTTCTT ----/TTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 28 0 25 3 TTTC 0 1 83116 CASAVA_Build 14 34130188 1I CAAAGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 32 2 21 9 A 10 11 83117 CASAVA_Build 14 34130805 2I ATTCATAAAC --/AT AGTTTATCAG 3070 hom 108 het 37 0 36 1 AT 0 1 83118 CASAVA_Build 14 34134718 1I TACACACCGA -/T TTTTATTATG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 4 5 83119 CASAVA_Build 14 34140177 12D ACCCTATTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2306 het 24 hom 22 1 9 12 T 24 12 83120 CASAVA_Build 14 34141012 1D TTTGGGAGGC T/- GAGGCAGGTG 3070 hom 27 het 14 0 9 5 T 1 0 83121 CASAVA_Build 14 34143013 1D AGTTTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 2480 het 2480 ref 38 17 7 14 A 15 14 83122 CASAVA_Build 14 34143815 2I CAAATACTCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 31 1 21 9 A 12 14 83123 CASAVA_Build 14 34144517 1D AACAACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 46 1 33 12 A 12 11 83124 CASAVA_Build 14 34145411 1I CCAACTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 30 3 21 6 T 13 14 83125 CASAVA_Build 14 34235805 1I TTAAAGGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 10 11 83126 CASAVA_Build 14 34240281 1D GAGAATATAA T/- TTTTTTTTTT 2682 het 1041 hom 17 8 6 3 T 15 14 83127 CASAVA_Build 14 34241144 1D TGAAGTATTT A/- AATGCTTTCA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 3 2 83128 CASAVA_Build 14 34245696 1I CTCAAAAAAA -/C AACAACAACA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 C 0 1 83129 CASAVA_Build 14 34247482 1D GTCTCAACAA T/- TTTTTTTTTT 1876 het 1876 ref 24 12 8 4 T 13 12 83130 CASAVA_Build 14 34250429 1D AAGACTGCTA T/- TATCAATTCC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 2 1 83131 CASAVA_Build 14 34252100 1D AGCCCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 13 7 A 12 11 83132 CASAVA_Build 14 34252158 3D ACTGACTATG ATA/--- ATAATAATCC 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 ATA 3 2 83133 CASAVA_Build 14 34253868 1D ATCACCCGTC A/- AGCCGGTGGG 3070 hom 38 het 14 0 11 3 A 2 1 83134 CASAVA_Build 14 34269709 1I TTACTCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 10 11 83135 CASAVA_Build 14 34274094 8D ATAGACACGC ACACACAG/-------- ACACACAGAC 3070 het 112 hom 58 3 24 32 ACACACAG 2 1 83136 CASAVA_Build 14 34291441 4I CTTTAATTAA ----/TTAT TTATTTCCAG 3070 het 3070 ref 32 19 8 5 TTAT 1 2 83137 CASAVA_Build 14 34292140 3D TTAAAAAAAA ATC/--- ATCAATAACA 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 ATC 2 1 83138 CASAVA_Build 14 34292378 4I GGTCAATCAA ----/TTGT TTGTTATTGC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 TTGT 1 2 83139 CASAVA_Build 14 34294594 2D CTCAAATCAA TC/-- TCTGTCTACT 3070 het 3070 ref 35 16 17 7 TC 2 1 83140 CASAVA_Build 14 34294689 2I ACATTCTGCC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 55 23 28 4 AT 6 7 83141 CASAVA_Build 14 34296642 1D CAAAAACAAC A/- AAAAAAGAAT 3070 het 2155 hom 17 6 11 0 A 7 6 83142 CASAVA_Build 14 34298627 4I AGATCTTAAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 30 het 19 0 11 9 TTTA 2 3 83143 CASAVA_Build 14 34299446 1D GAACAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1219 hom 33 6 15 12 T 15 14 83144 CASAVA_Build 14 34309894 2D CAAATAACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 38 0 29 10 A 12 10 83145 CASAVA_Build 14 34320485 1D CACTAGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 33 1 14 18 T 15 14 83146 CASAVA_Build 14 34336342 1I CATGGTGAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 3 4 83147 CASAVA_Build 14 34340416 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 9 8 83148 CASAVA_Build 14 34342600 3I TACATAAATG ---/AAT AATCAATCTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AAT 1 2 83149 CASAVA_Build 14 34344596 2D TGCTATAGAC AG/-- AGCATAATTG 3070 het 3070 ref 38 20 17 3 AG 2 1 83150 CASAVA_Build 14 34353211 4I ATATCTAATT ----/ATAA ATGTTATAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 ATAA 0 1 83151 CASAVA_Build 14 34358945 3D GTCATATCTC ATT/--- GTTGTTTTAA 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 ATT 1 0 83152 CASAVA_Build 14 34359717 1D TATGTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 T 12 11 83153 CASAVA_Build 14 34359925 6D GTGTAGTTTC AGAGTA/------ AGTCTTGAAG 3070 het 3070 ref 51 26 23 4 AGAGTA 1 0 83154 CASAVA_Build 14 34363237 3D ACGATGAAGC AGG/--- AGGACTGCCT 3070 het 1564 hom 21 7 12 3 AGG 2 1 83155 CASAVA_Build 14 34364895 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 28 0 20 8 A 9 10 83156 CASAVA_Build 14 34366043 2I CCTTCTCCTA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 TC 8 9 83157 CASAVA_Build 14 34367512 4I ATTAGAAAAT ----/GAAA GAAAGAAGAG 3070 hom 132 het 54 0 45 9 GAAA 1 2 83158 CASAVA_Build 14 34369478 1D GCGGCGGGGG A/- TGGCGGGGGC 1367 het 1367 ref 22 9 6 7 A 1 0 83159 CASAVA_Build 14 34371410 2D CTCACAACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 25 6 A 13 11 83160 CASAVA_Build 14 34378873 2I AAGAACAATT --/AA AAAAATTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 5 7 83161 CASAVA_Build 14 34379913 1I AAATCAATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 0 1 83162 CASAVA_Build 14 34382077 1I GGGACTGGCT -/A AAAAAAAAAA 2890 het 1855 hom 33 11 14 8 A 14 15 83163 CASAVA_Build 14 34392007 1I GAACAATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 11 12 83164 CASAVA_Build 14 34393050 2I TGAAAGGGAT --/AG AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 AG 4 5 83165 CASAVA_Build 14 34395310 1I32M2I GTGGCGCAAT -ATAGCTCACTGCAGCCTAGAATTCCTGGGCTC--/CATAGCTCACTGCAGCCTAGAATTCCTGGGCTCAA GTGATCCTCC 3070 het 2929 hom 23 7 12 11 N/A 0 0 83166 CASAVA_Build 14 34397063 1I AACCACCAAC -/A AACAAAATAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 2 3 83167 CASAVA_Build 14 34402807 3I ATTGTTTGAA ---/TTT TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 8 11 83168 CASAVA_Build 14 34406414 1D ATGCCATGGC A/- GGGGGACAGC 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 1 0 83169 CASAVA_Build 14 34411462 1D GTGGTAAGGT G/- GGGGGGGATT 3070 hom 55 het 26 0 17 10 G 8 7 83170 CASAVA_Build 14 34412735 2I CCCCGGAGAC --/GA GAGTTAGTCA 2452 hom 37 het 14 0 11 3 GA 1 2 83171 CASAVA_Build 14 34416698 6D AAGTTTAGAA AATTAT/------ AATTAAAATG 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 AATTAT 1 0 83172 CASAVA_Build 14 34417066 4I TTTTAACAAT ----/TTAA TTAAACATTT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 TTAA 1 2 83173 CASAVA_Build 14 34431673 1I GTTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 2545 het 2174 hom 15 6 7 2 T 5 6 83174 CASAVA_Build 14 34438317 1I GTATGTATCC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 8 9 83175 CASAVA_Build 14 34439799 1I CTCTGAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 44 14 20 10 A 8 9 83176 CASAVA_Build 14 34440582 1D GATTCGGGGG T/- GGGGGGGGGT 3070 het 946 hom 18 4 11 4 T 1 0 83177 CASAVA_Build 14 34457493 1D AATAAGAGCA C/- CAACATTAGA 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 C 2 1 83178 CASAVA_Build 14 34467399 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2200 het 644 hom 19 3 7 9 T 16 15 83179 CASAVA_Build 14 34468584 1I AGAATATGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 29 17 8 T 9 10 83180 CASAVA_Build 14 34476294 1I GGAAAATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 949 hom 28 5 17 6 A 11 12 83181 CASAVA_Build 14 34476314 1I AGTTTTTATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 764 hom 27 3 18 6 A 8 9 83182 CASAVA_Build 14 34496228 1D GCTATGTGTC T/- TTTTTTTTTT 1677 het 1173 hom 21 6 6 9 T 17 16 83183 CASAVA_Build 14 34501625 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3020 het 2660 hom 28 11 9 8 A 17 16 83184 CASAVA_Build 14 34517325 1D TGTCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 11 10 83185 CASAVA_Build 14 34522324 2I TCTTTATCTC --/TT GTCTTCCATG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 0 2 83186 CASAVA_Build 14 34526269 4I CATAATTCTT ----/ACAC AGTTCACCTA 2108 het 1235 hom 11 3 6 2 AC 0 2 83187 CASAVA_Build 14 34536003 2D TAAAAATAAC AT/-- ATTTTATCTT 3070 het 3070 ref 43 24 19 1 AT 2 1 83188 CASAVA_Build 14 34542334 4D CTGGACTCTC TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 38 13 19 7 TATT 4 3 83189 CASAVA_Build 14 34542530 1D GTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2636 het 1408 hom 24 7 10 7 T 14 13 83190 CASAVA_Build 14 34545545 6D GTATCACCTG TTTTTA/------ CTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 TTTTTA 1 0 83191 CASAVA_Build 14 34546764 5I CATATTAAGA -----/TATCT TATAAAGCCA 2116 het 489 hom 7 1 5 1 TATCT 0 1 83192 CASAVA_Build 14 34554347 1I CCTTGAAGTT -/A AAACAGGTTA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 A 3 4 83193 CASAVA_Build 14 34559147 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAATAAA 3060 het 2402 hom 14 6 8 0 A 7 6 83194 CASAVA_Build 14 34563620 1D TATTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2977 het 2561 hom 22 9 9 5 T 12 11 83195 CASAVA_Build 14 34573311 2I GTAGGGACTC --/TG TGGGGGGCCT 1425 het 1425 ref 19 7 7 5 TG 1 2 83196 CASAVA_Build 14 34574443 2I GAACTTTTGT --/TC TCTGTTTCCC 2447 het 2447 ref 11 6 5 0 TC 1 2 83197 CASAVA_Build 14 34582540 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2722 het 2655 hom 22 8 8 6 A 16 15 83198 CASAVA_Build 14 34582663 1I TGGATAACTT -/A AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 6 7 83199 CASAVA_Build 14 34582809 1I CAAATTTACC -/T TTTTTAGCTC 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 5 6 83200 CASAVA_Build 14 34600043 2I AGGAAAAAAC --/AT AGTATAGGGT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 AT 0 1 83201 CASAVA_Build 14 34610549 1I CAAAGGGCCC -/T TATATATTCA 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 T 1 2 83202 CASAVA_Build 14 34619011 4I TCCTAAATGG ----/TCTC TCTCTATTCT 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 TC 2 4 83203 CASAVA_Build 14 34620907 5D TGGCATCCTG GTTAT/----- GTTATCGGTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 GTTAT 2 1 83204 CASAVA_Build 14 34625938 1I TTTGGTTTAA -/T TTTTTTTTTG 2725 het 2725 ref 31 21 7 3 T 9 10 83205 CASAVA_Build 14 34628624 1D GATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 T 11 10 83206 CASAVA_Build 14 34633431 1I TGGCCTCAGC -/T TTTTTTTTAA 1979 het 1979 ref 26 6 8 12 T 8 9 83207 CASAVA_Build 14 34638507 2I TTTCTAATTT --/AA GTTTTAGCAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 0 2 83208 CASAVA_Build 14 34639105 2D GCTTCCACTC TT/-- TGAGAATAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 T 3 1 83209 CASAVA_Build 14 34643181 14I TGTCTTCCTT --------------/GCTAGAAAGAGATG GCCAGAAGCA 3070 het 3070 ref 37 26 9 2 GCTAGAAAGAGATG 0 1 83210 CASAVA_Build 14 34646775 5I TTTGAAACTA -----/TCCTT TCAGTCAACT 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 TCCTT 0 1 83211 CASAVA_Build 14 34658303 1I CCCAAATGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 8 9 83212 CASAVA_Build 14 34669345 1I CACCATAGTT -/A ACAGTGTTAT 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 A 1 2 83213 CASAVA_Build 14 34692364 4I AGACCGTGGG ----/GAGA GAGAGAGGGA 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 GA 3 5 83214 CASAVA_Build 14 34694820 2I TCATTTGCAC --/AT GTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 AT 0 1 83215 CASAVA_Build 14 34695423 1D TTTTGTTTTT G/- TAATGAGTTC 3070 het 3070 hom 51 17 27 8 G 1 0 83216 CASAVA_Build 14 34699673 1D AGATTCTGTA T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 46 21 25 0 T 7 6 83217 CASAVA_Build 14 34700035 2D ATGTGAAGAC CG/-- GAGCCCATTT 3070 het 3070 ref 54 27 27 1 CG 1 0 83218 CASAVA_Build 14 34701572 1I TTGAGGCTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 8 9 83219 CASAVA_Build 14 34704603 1I TTTTTTCATT -/G TTTCCCAGAG 3070 het 3070 ref 28 17 11 0 G 0 1 83220 CASAVA_Build 14 34708038 4D GTTTTATGAC CTTT/---- CTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 16 1 CTTT 3 2 83221 CASAVA_Build 14 34713099 1D GCCCATATTC A/- AAGCATAGGG 3070 het 3070 hom 49 21 27 1 A 3 2 83222 CASAVA_Build 14 34717714 3I AAGGTTAATA ---/TTG TTATGTGTGA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 TTG 0 1 83223 CASAVA_Build 14 34723128 1D GAGAAGATAA C/- TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 C 1 0 83224 CASAVA_Build 14 34725303 1D AATGGTTGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 9 8 83225 CASAVA_Build 14 34731939 1D GACAGAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2419 hom 35 12 18 5 A 14 13 83226 CASAVA_Build 14 34733951 2I ACATGATTTT --/AA GTTTTATTTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 0 2 83227 CASAVA_Build 14 34748131 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1947 het 1354 hom 13 4 6 3 A 12 11 83228 CASAVA_Build 14 34758702 1I TATTTGCTTG -/T TATCAAAATA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 1 2 83229 CASAVA_Build 14 34760205 6D ACCAAAAAAC TTATAA/------ TTAAGATAAA 3070 het 3070 hom 32 12 19 2 TTATAA 1 0 83230 CASAVA_Build 14 34761076 3I TCTTTAGCTT ---/AAG AAGAAGAATA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 AAG 2 3 83231 CASAVA_Build 14 34783880 11I TAGCTGTGTG -----------/AGGAAGGGGCA AGGAAGGGGC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 AGGAAGGGGCA 1 2 83232 CASAVA_Build 14 34802507 1D AGCCAGGCAT G/- GGTGGCAGGT 3070 het 2207 hom 23 7 11 5 G 3 2 83233 CASAVA_Build 14 34814817 1I GAGCAGGAGT -/A AACCTTAGAG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 2 3 83234 CASAVA_Build 14 34826890 1I TTTCCCTTTG -/C AATGGAATTG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 C 0 1 83235 CASAVA_Build 14 34829952 1I CAGTTCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1509 hom 26 6 13 7 T 13 14 83236 CASAVA_Build 14 34840941 1D GCTTAGGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 T 10 9 83237 CASAVA_Build 14 34844643 1I ATAATCTGTT -/A ATATGTCAAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 1 2 83238 CASAVA_Build 14 34849149 1D TCTCAAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 23 0 15 8 T 15 14 83239 CASAVA_Build 14 34853701 1D TAAGTGTTTT C/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 C 1 0 83240 CASAVA_Build 14 34863058 4D CTCTGTTTAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 25 8 14 4 AAAG 4 3 83241 CASAVA_Build 14 34879106 1D TGCCCCCCCC G/- CCAAAACCTC 3070 het 2945 hom 34 12 14 8 G 1 0 83242 CASAVA_Build 14 34896854 1D AGAAGTAAAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 48 29 14 5 A 8 7 83243 CASAVA_Build 14 34900880 1D TTTATTTTTT C/- TTTCTTTTTT 3070 het 2759 hom 23 10 12 1 C 1 0 83244 CASAVA_Build 14 34941193 19I TAAAAAAAGA -------------------/GTAAGCTATTAAAAAAAGG GGGGGGGCAG 2398 het 2398 ref 32 13 8 11 GTAAGCTATTAAAAAAAGG 0 1 83245 CASAVA_Build 14 34951718 1I CCATGAGCAG -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 7 8 83246 CASAVA_Build 14 34959890 7D TCCTGAACTC TAAGAGA/------- TTATATTCTA 3070 het 3070 ref 32 22 11 3 TAAGAGA 1 0 83247 CASAVA_Build 14 34968228 2D CTAATTTACA CT/-- CTATTTTTAA 3070 het 2432 hom 18 7 10 2 CT 2 1 83248 CASAVA_Build 14 35000118 1D TTGAAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2442 hom 32 10 12 10 T 13 12 83249 CASAVA_Build 14 35000744 1D ATACTGTAAC T/- TTTTTTTTTT 1626 het 1626 ref 17 9 4 4 T 15 14 83250 CASAVA_Build 14 35004191 1D CTGGTCGTTT A/- AAAATGTGTG 3070 het 3070 hom 24 10 11 4 A 5 4 83251 CASAVA_Build 14 35124415 1I AAAGTTCTGT -/A AAGAGACAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 3 83252 CASAVA_Build 14 35190839 1D ATCTGTAAGC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 9 8 83253 CASAVA_Build 14 35238853 1D ATCAAACAGC A/- AAAAAAAAAA 1853 het 1853 ref 32 13 7 12 A 19 18 83254 CASAVA_Build 14 35277998 2D AATAAATGAC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 8 hom 30 1 10 19 A 11 9 83255 CASAVA_Build 14 35285417 4D ATGTTAACCA GATT/---- GATTGTAGTA 3070 het 3070 hom 49 23 23 4 GATT 2 1 83256 CASAVA_Build 14 35439203 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 527 het 527 ref 9 4 3 2 T 13 12 83257 CASAVA_Build 14 35461589 8D TGCTATAAAG ACACATGC/-------- ACACGTATCT 3070 hom 36 het 13 0 13 1 ACACATGC 1 0 83258 CASAVA_Build 14 35466519 1D TGAGCTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 739 hom 36 3 21 13 T 14 13 83259 CASAVA_Build 14 35483150 1D TATACTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1788 het 1788 ref 36 20 5 11 T 13 12 83260 CASAVA_Build 14 35556894 1I CAAGATACAC -/A TACATAAAAC 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 A 0 1 83261 CASAVA_Build 14 35569303 1D AATTGACTCA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 8 7 83262 CASAVA_Build 14 35595910 1I GCTTCATGGG -/C CAGCTGGTTC 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 C 1 2 83263 CASAVA_Build 14 35596510 1D GGTCTCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2429 hom 27 10 13 4 T 13 12 83264 CASAVA_Build 14 35607794 1D TATGTACCTG C/- CCCCCCCCCG 3070 het 3070 hom 36 9 22 6 C 10 9 83265 CASAVA_Build 14 35608740 1I AAGACCAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 9 10 83266 CASAVA_Build 14 35614592 2D TTTAAATGAG AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 A 10 8 83267 CASAVA_Build 14 35623217 4D CGTCTGCAAG AAGT/---- AAGAAATAAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 5 AAGT 1 0 83268 CASAVA_Build 14 35624540 4D TCTGTCTGTC TCAA/---- TCAATCAATC 3070 het 3070 hom 45 13 22 11 TCAA 6 5 83269 CASAVA_Build 14 35624978 1D GGCCGAAAGC T/- TACCCCCCTT 3070 het 3070 ref 47 24 14 11 T 2 1 83270 CASAVA_Build 14 35629529 1I TCTAAATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 9 10 83271 CASAVA_Build 14 35632513 1D TTGTTAGTTG T/- TTTTTTTTTA 1849 het 1849 ref 37 27 4 6 T 10 9 83272 CASAVA_Build 14 35635603 2I TTTTTTTTTT --/AA AAAAAAAGTG 2280 het 2280 ref 33 12 8 13 A 7 9 83273 CASAVA_Build 14 35637659 1D GTGAAAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 13 12 83274 CASAVA_Build 14 35639570 1I TTTTTAAATA -/T TTTTCACAGT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 4 5 83275 CASAVA_Build 14 35641374 1D TATTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 9 A 11 10 83276 CASAVA_Build 14 35644271 1D TAGTTCAGAT G/- GGAAAGGGTT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 G 3 2 83277 CASAVA_Build 14 35651228 1D GTAGAGAGTT A/- AAAAAAAAAG 1650 het 1650 ref 25 11 7 7 A 10 9 83278 CASAVA_Build 14 35654603 1D ACTTGGTTTG A/- ACTTGCTATA 3070 het 3070 ref 50 22 24 4 A 2 1 83279 CASAVA_Build 14 35657841 1I TCAACCCACA -/T GTCTCAAAGG 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 0 1 83280 CASAVA_Build 14 35657937 1I TTTAGATACG -/A AAATTCTGAC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 3 4 83281 CASAVA_Build 14 35664316 1I AACATTAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 9 10 83282 CASAVA_Build 14 35677139 1I CATGTGGGGG -/A AAAAATGAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 5 6 83283 CASAVA_Build 14 35689899 1I GTATTTTTTT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 7 8 83284 CASAVA_Build 14 35691027 10D GATGACTTGC AAACTCTTTA/---------- AAACTCTTTA 3070 het 3070 ref 32 21 12 3 AAACTCTTTA 2 1 83285 CASAVA_Build 14 35691857 1D TCTCGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1457 het 1457 ref 15 10 4 1 A 11 10 83286 CASAVA_Build 14 35703549 2D AACTATTTTT TA/-- TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 TA 1 0 83287 CASAVA_Build 14 35730406 1D63M1D CCTTCAGTGA TTTTTTTTTCCCCCTCCTTCTGCACTGAACACGTGTATCTCTTTAAGAATTGGTCTGGCCTGGTG/-TTTTTTTTCCCCCTCCTTCTGCACTGAACACGTGTATCTCTTTAAGAATTGGTCTGGCCTGGT- GGTAACCTGT 3070 het 3070 ref 35 26 14 12 N/A 0 0 83288 CASAVA_Build 14 35731043 1D TCTTTTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2672 hom 28 8 17 3 T 11 10 83289 CASAVA_Build 14 35736286 1D ATCAACATCA C/- AGCCTTGATA 3070 het 3070 ref 55 29 23 3 C 1 0 83290 CASAVA_Build 14 35739244 4D AGCATGTCCT TCTG/---- GAATTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TCTG 1 0 83291 CASAVA_Build 14 35744697 1D ACAGTATAAG A/- AAACGTAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 4 3 83292 CASAVA_Build 14 35751525 3I AGAAATCATA ---/AGC AGTTCAATTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AGC 0 1 83293 CASAVA_Build 14 35756616 1D CTTTCTAAGC A/- AAAAGGAAAG 3070 het 3070 ref 46 28 18 0 A 5 4 83294 CASAVA_Build 14 35768153 1D ACAGATTAAG A/- AAAAAAAAAT 1569 het 1569 ref 24 9 6 9 A 10 9 83295 CASAVA_Build 14 35768446 1I GACGCTAACC -/T TTGACTCCAT 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 T 2 3 83296 CASAVA_Build 14 35772250 1D AGTGCCCAGT G/- GGACCTCATT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 3 2 83297 CASAVA_Build 14 35775286 3I ATTGTTGTGC ---/TAT TATTAGAAAA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 TAT 1 2 83298 CASAVA_Build 14 35798573 1D TTCTTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 12 11 83299 CASAVA_Build 14 35804972 1I GAAACTGAAG -/C CCCAGAGTGA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 3 4 83300 CASAVA_Build 14 35812754 1I CATATGGAAA -/C CTTTACCATT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 1 2 83301 CASAVA_Build 14 35813064 1D GAAAATACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 39 0 33 7 T 11 10 83302 CASAVA_Build 14 35814809 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 2718 het 590 hom 34 7 15 12 C 0 1 83303 CASAVA_Build 14 35827760 1I ATGCTAGACT -/C CGTCTAGTGA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 C 1 2 83304 CASAVA_Build 14 35828988 5I TTGCCAGTGA -----/TTAGT TTAGGAAGAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 TTAGT 0 1 83305 CASAVA_Build 14 35832323 1D ATTTTCTTTA T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 7 6 83306 CASAVA_Build 14 35838418 1D AGAATAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 36 1 23 12 A 15 14 83307 CASAVA_Build 14 35840560 1D AAGAAACCTG T/- TTTCTCACAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 4 3 83308 CASAVA_Build 14 35854894 4I CTGACCAATC ----/CAAA CAGTTTTTCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CAAA 0 1 83309 CASAVA_Build 14 35863730 3I AAAAGGTAAT ---/AAG AAAACAAAGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AAG 0 1 83310 CASAVA_Build 14 35866948 1D GCATTTGCTG C/- AATCGCTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 1 0 83311 CASAVA_Build 14 35870090 4I ACTTAGTAAG ----/CACT CAATGTTAGT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 CACT 0 1 83312 CASAVA_Build 14 35872113 1D CATTCTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 34 2 22 10 T 14 13 83313 CASAVA_Build 14 35873577 2I TCCTGCCTCA --/AC CTTCCCAAGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AC 0 1 83314 CASAVA_Build 14 35880370 2D AGAATTACTG TT/-- TTTTTCACTT 3070 hom 138 het 48 0 47 3 T 7 5 83315 CASAVA_Build 14 35880627 28D GGAGTATATC AATAACTCTCTTCAAGGATTTATGAGAG/---------------------------- AATAACTCTC 3070 hom 48 het 31 0 17 18 AATAACTCTCTTCAAGGATTTATGAGAG 2 1 83316 CASAVA_Build 14 35898323 1D CCAATTAAAC A/- AAACTACAGT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 4 3 83317 CASAVA_Build 14 35901750 1I CAAATAACCA -/G GGACTCATAC 3070 hom 154 het 57 0 52 5 G 2 3 83318 CASAVA_Build 14 35902704 1I TTTCATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 886 hom 34 2 25 7 T 12 13 83319 CASAVA_Build 14 35903335 3I TGTGAATCTT ---/TTC TTTTCTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 TTC 0 1 83320 CASAVA_Build 14 35939335 1I CAAAGCAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 10 83321 CASAVA_Build 14 35946184 1D TGCCCACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 11 10 83322 CASAVA_Build 14 35958512 2I GCTAGTACTC --/TG TATCCCTGCT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 TG 0 1 83323 CASAVA_Build 14 35963217 1D GTGGATCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 11 10 83324 CASAVA_Build 14 36002698 1D TAGTCAAATG T/- TTTTAGTATT 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 T 5 4 83325 CASAVA_Build 14 36004961 1I AACCCAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 10 11 83326 CASAVA_Build 14 36018298 3I ACTCCTGAGC ---/ACA ACAAGCAATC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 ACA 1 2 83327 CASAVA_Build 14 36029708 1D GCTATCGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 671 hom 23 2 15 6 A 15 14 83328 CASAVA_Build 14 36054355 1I TGACCCGGAA -/G GGGCTACAGC 3070 hom 91 het 36 0 26 10 G 3 4 83329 CASAVA_Build 14 36054521 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 T 8 9 83330 CASAVA_Build 14 36056017 1I TTTCATTTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2063 hom 24 8 11 5 T 7 8 83331 CASAVA_Build 14 36061932 2D AAACCAGTGA TT/-- TTTTTTTCCA 2497 het 2497 ref 20 10 7 3 T 9 7 83332 CASAVA_Build 14 36066107 2I TCTGCCAAAC --/TT AACATATCCA 3070 hom 135 het 48 0 45 3 T 0 2 83333 CASAVA_Build 14 36076009 1I GTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1997 het 38 hom 22 1 9 12 T 11 12 83334 CASAVA_Build 14 36080783 1I GTTTTATATC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 28 het 28 1 23 4 T 8 9 83335 CASAVA_Build 14 36084680 4D CAGCATAAGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 39 het 19 0 14 6 AT 8 6 83336 CASAVA_Build 14 36084872 2D TATATATCAC TA/-- TATATATATA 3070 het 2175 hom 16 5 9 2 TA 6 5 83337 CASAVA_Build 14 36087544 3I CAGCAGCAAT ---/ATA AAAATAATTG 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 ATA 0 1 83338 CASAVA_Build 14 36088993 10I TTGAGGGTAA ----------/ATTTTATTTT ATTTTACTTT 3070 hom 101 het 41 0 34 9 ATTTT 1 3 83339 CASAVA_Build 14 36089926 1I AAGATTGTAT -/G GGATCTAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 G 2 3 83340 CASAVA_Build 14 36090937 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 10 9 83341 CASAVA_Build 14 36094383 1D ATAAAAAAAA C/- TTTTCTATCA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 C 1 0 83342 CASAVA_Build 14 36099605 1D ATCAGTCATG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 148 hom 38 2 15 22 T 9 8 83343 CASAVA_Build 14 36102950 1I TCTCTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2934 hom 34 9 17 8 A 11 12 83344 CASAVA_Build 14 36114248 1D TTCTTCCTGG T/- TTTTCTCTAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 5 4 83345 CASAVA_Build 14 36116350 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 35 0 24 11 T 10 11 83346 CASAVA_Build 14 36128176 1I GAAAACACAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 34 1 29 4 T 8 9 83347 CASAVA_Build 14 36146806 9D ACAACAGCCC AACTATTGG/--------- GCTTACCCAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AACTATTGG 1 0 83348 CASAVA_Build 14 36147138 2I TTTTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 35 het 18 0 11 7 T 9 11 83349 CASAVA_Build 14 36211671 1D CCCCAAGCTA G/- GGTCATAATT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 3 2 83350 CASAVA_Build 14 36212487 25I GCCATCTTCC -------------------------/AGGGGGAACATCTCTGGGCAAAAAG AAGTGGGTCC 3070 hom 114 het 37 0 38 3 AGGGGGAACATCTCTGGGCAAAAAG 0 1 83351 CASAVA_Build 14 36217972 2I TGTTGCTTTT --/AA AAACTGGCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 3 5 83352 CASAVA_Build 14 36218919 9I43M3I CAACAGTGTT ---------TTAACATTCTGTTTTAAACAATGTTTTAAAATACCTATTTATT---/AAAACACTGTTAAAATTCTGTTTTAAACAATGTTTTAAAATACCTATTTATTATC ATCTTACAGC 3070 hom 48 het 22 0 17 20 N/A 0 0 83353 CASAVA_Build 14 36221697 1I GGCCAATAAC -/A TAACGGAAGG 3070 het 3070 ref 61 26 23 12 A 0 1 83354 CASAVA_Build 14 36247963 1D CTGATTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2716 hom 23 9 10 4 T 11 10 83355 CASAVA_Build 14 36257466 2D TAACTCAACT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 TC 7 6 83356 CASAVA_Build 14 36262892 1D GGGGTAAGAT G/- GGAACACCGG 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 G 3 2 83357 CASAVA_Build 14 36265408 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 2020 het 2020 ref 30 13 8 10 AG 1 0 83358 CASAVA_Build 14 36266644 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2019 hom 21 6 13 2 A 9 10 83359 CASAVA_Build 14 36273369 2I25M1D TTTAGTGCTT --TATATATAATTCATTTTAATGTCTTA/TATATATATAATTCATTTTAATGTCTT- AGAGTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 23 17 2 N/A 0 0 83360 CASAVA_Build 14 36274769 2D CCCAGAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2297 hom 31 12 8 12 T 18 16 83361 CASAVA_Build 14 36279587 1I AACCCCCCCA -/C CCCCCATCTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 C 5 6 83362 CASAVA_Build 14 36283820 1I GGCATTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2775 hom 17 6 8 3 T 9 10 83363 CASAVA_Build 14 36285282 1D CCACTATCCT A/- AAGTGGGATG 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 A 3 2 83364 CASAVA_Build 14 36292511 1D TCAAAGGCAG T/- TTCTTGGGAT 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 T 3 2 83365 CASAVA_Build 14 36293692 1I CCCAAAAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 9 10 83366 CASAVA_Build 14 36300719 5D TGATCAAATT ATCAA/----- ATCAACTATA 3070 het 3070 ref 40 29 10 2 ATCAA 2 1 83367 CASAVA_Build 14 36304988 1I CATTCCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 10 11 83368 CASAVA_Build 14 36310711 1D CAAGAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 694 hom 29 3 21 5 A 13 12 83369 CASAVA_Build 14 36329937 4D CAGCAAAATA TCTT/---- TCTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 TCTT 2 1 83370 CASAVA_Build 14 36333280 2D TCACTTTATT TA/-- AAGTTTTAAT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 TA 1 0 83371 CASAVA_Build 14 36333837 4D AAGTAAAAAT ATTA/---- ATTAAAATCT 3070 het 3070 ref 22 12 8 3 ATTA 2 1 83372 CASAVA_Build 14 36337523 1D TTTTTTTTTT A/- ATGTAACTGG 3070 het 304 hom 36 1 26 9 A 2 1 83373 CASAVA_Build 14 36345467 1I ATGTCAATTT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 6 7 83374 CASAVA_Build 14 36352323 1I GACGCATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 11 12 83375 CASAVA_Build 14 36353333 6I GCTATTTCTT ------/ATCTTA ATAAGTCTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 ATCTTA 0 1 83376 CASAVA_Build 14 36355912 5D AAAACCAAGA CTCTT/----- CTCTAACTGT 3070 het 3070 ref 26 16 10 3 CTCTT 1 0 83377 CASAVA_Build 14 36356172 1I AAGAAATATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 A 9 10 83378 CASAVA_Build 14 36358317 1I TTTTAAAGAC -/A AAAAAATGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 7 83379 CASAVA_Build 14 36367058 20D ATGTGTGGCA ATGTGAGGTCTTCTGGGACC/-------------------- ATGTGAGGTC 3070 hom 121 het 47 0 40 7 ATGTGAGGTCTTCTGGGACC 1 0 83380 CASAVA_Build 14 36367154 1I ACTGTCCACT -/A AAACCTCCTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 3 4 83381 CASAVA_Build 14 36368676 1D GTTCCCTTAA C/- CCATGTCCAG 3070 hom 117 het 45 0 38 7 C 3 2 83382 CASAVA_Build 14 36368886 1I TGCTGTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 10 11 83383 CASAVA_Build 14 36370699 1D TCCTTTGCTG T/- TTTCTTCAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 4 3 83384 CASAVA_Build 14 36382574 1D ACTTGAAACT A/- AGTTGAAGAC 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 A 2 1 83385 CASAVA_Build 14 36401587 1D CTAGGGGAGG A/- ATAGCATTAG 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 2 1 83386 CASAVA_Build 14 36404863 1D AATTCACCCA G/- TGATTAATAT 3070 hom 114 het 44 0 39 7 G 1 0 83387 CASAVA_Build 14 36407102 1I AAATATAATT -/A AAAGATTATT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 3 4 83388 CASAVA_Build 14 36408370 3I TTTGCAAGAT ---/GGA TTCGGATGGA 3070 het 3070 ref 54 24 23 7 GGA 0 1 83389 CASAVA_Build 14 36413981 1I ATAAAGAAAA -/G TCCAATAAAC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 0 1 83390 CASAVA_Build 14 36415555 1D TTGCTAACTG T/- TAAGGTCTCC 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 T 2 1 83391 CASAVA_Build 14 36416703 1I AAAAAAGAAG -/A AAAAGAGGCA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 4 5 83392 CASAVA_Build 14 36418775 1D ACTCTTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 16 13 A 12 11 83393 CASAVA_Build 14 36419601 1D TATGTCAGCT A/- AATTCTCAAG 3070 het 3070 hom 37 16 21 0 A 3 2 83394 CASAVA_Build 14 36420304 2D AAAATGTAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 141 het 55 0 48 9 TG 9 8 83395 CASAVA_Build 14 36426519 1I ACTCCATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 31 1 19 11 A 13 14 83396 CASAVA_Build 14 36442637 1D GTTTTCACAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 8 83397 CASAVA_Build 14 36523504 5D CTTGTTTAAA TATTT/----- TATAATATTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 3 TATTT 1 0 83398 CASAVA_Build 14 36531385 1I AATAAATAAT -/A AAAAAAATTT 2262 het 1486 hom 13 3 7 3 A 7 8 83399 CASAVA_Build 14 36536358 1D CAAGTACAGA T/- CAGGCTGTTG 3070 het 3070 hom 35 14 21 0 T 1 0 83400 CASAVA_Build 14 36536776 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2879 hom 31 9 12 10 A 14 15 83401 CASAVA_Build 14 36544262 1D TGCATCCGCA G/- GAAGCTCAGG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 G 2 1 83402 CASAVA_Build 14 36546911 1D GATCGCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 12 11 83403 CASAVA_Build 14 36558609 1D GACAACTGGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 11 13 15 A 9 8 83404 CASAVA_Build 14 36561012 1I TTCATAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 17 12 T 10 11 83405 CASAVA_Build 14 36562379 1D AGAGGAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 18 23 10 A 10 9 83406 CASAVA_Build 14 36566212 1D AATACATCTA T/- TATCTAGCTA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 2 1 83407 CASAVA_Build 14 36572981 1I ACAATTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1802 hom 20 6 12 2 T 10 11 83408 CASAVA_Build 14 36575378 2D ACAGTAAAAC TT/-- AGCGCAACAT 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 T 2 0 83409 CASAVA_Build 14 36575630 4D ATAGATATGG TTTA/---- TTTTTCTACC 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 TTTA 1 0 83410 CASAVA_Build 14 36576547 1D ATTTAAAAAA T/- TTTTTTCACC 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 T 7 6 83411 CASAVA_Build 14 36578997 1D CTAAAAATAT A/- AAAAAAAAAT 2819 het 2819 ref 18 10 7 1 A 10 9 83412 CASAVA_Build 14 36582896 1I ATGTTTTTTT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 G 1 2 83413 CASAVA_Build 14 36589981 1I TACCCTACTC -/T TATCTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 1 2 83414 CASAVA_Build 14 36591036 4D ATGATTTGAA TTAT/---- TTAAACACAC 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 TTAT 1 0 83415 CASAVA_Build 14 36591607 1D CTTTTTTTTT C/- CCCCCGAGAC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 C 6 5 83416 CASAVA_Build 14 36593672 1D AAATAGAACT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 8 7 83417 CASAVA_Build 14 36594873 11I GAATTGTGAT -----------/CCCCAGTGTTG CCCCAGTGTT 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 CCCCAGTGTTG 1 2 83418 CASAVA_Build 14 36600975 1I AACAGTATGG -/C CCCCCCTGTA 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 C 6 7 83419 CASAVA_Build 14 36610012 1I GGGAAAGGAG -/A AAGACACTGG 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 A 2 3 83420 CASAVA_Build 14 36631874 2I ATTTACACAC --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 CA 8 9 83421 CASAVA_Build 14 36636853 1I AAAAAAAAAT -/A AATAATCAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 3 83422 CASAVA_Build 14 36645713 3D TTGAAACCCT TAA/--- TAAAAACTTG 3070 hom 33 het 12 0 12 1 TAA 2 1 83423 CASAVA_Build 14 36656825 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 12 11 83424 CASAVA_Build 14 36657361 1I TCCTCCCAAC -/T TATTTTTGAA 3070 hom 44 het 20 0 15 5 T 1 2 83425 CASAVA_Build 14 36658529 5D GAAAAAAGAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 6 AAAAG 3 2 83426 CASAVA_Build 14 36660755 1D AAAAAGAACC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 8 83427 CASAVA_Build 14 36660933 1D CCATCTCCCC T/- GATGATAGTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 0 83428 CASAVA_Build 14 36661597 3I ACGATATAGT ---/ATG ATGAGTACAA 3070 hom 129 het 52 0 43 9 ATG 1 2 83429 CASAVA_Build 14 36671693 1I ATAGCTATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 0 1 83430 CASAVA_Build 14 36673605 1D CTCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2187 het 59 hom 17 1 10 6 A 15 14 83431 CASAVA_Build 14 36675681 1D TTCAGCAATT G/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 G 1 0 83432 CASAVA_Build 14 36679790 1D GGTGGTACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 11 10 83433 CASAVA_Build 14 36683741 2D TTGTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 11 9 83434 CASAVA_Build 14 36688406 1I CTGCTCCATC -/A AAAAAAAAAA 2471 het 2471 ref 21 11 6 4 A 10 11 83435 CASAVA_Build 14 36693426 2D TAAAAAAAAA TC/-- AATGAAATAT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 TC 1 0 83436 CASAVA_Build 14 36693600 2D AAAAGATAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2414 het 1580 hom 21 7 6 10 T 16 14 83437 CASAVA_Build 14 36698172 1I CACGGAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 466 hom 21 1 16 4 A 11 12 83438 CASAVA_Build 14 36709888 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 17 0 12 5 A 11 12 83439 CASAVA_Build 14 36710388 5I TTAGAGTTAC -----/TATAA TATAATTTAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TATAA 1 2 83440 CASAVA_Build 14 36713913 1I ATATCCTAAT -/A GGGGCAAAAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 0 1 83441 CASAVA_Build 14 36721461 1I ACTGAGTTAG -/T TTTTTTTTTT 2200 het 2200 ref 20 10 7 3 T 10 11 83442 CASAVA_Build 14 36723196 2D TCAAATATAC AG/-- AGTCTTAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 AG 2 1 83443 CASAVA_Build 14 36724084 2I GAGGTAACAC --/AT GTGTTAATTA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 AT 0 1 83444 CASAVA_Build 14 36757312 1D CATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 12 11 83445 CASAVA_Build 14 36759993 1D TGTTTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 9 10 T 13 12 83446 CASAVA_Build 14 36767998 5D CAAACATCTT TACTG/----- TATATAGCTT 3070 het 3070 hom 29 13 16 3 TACTG 1 0 83447 CASAVA_Build 14 36771519 1D CTGACTATTC T/- TTTTCCTCTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 T 5 4 83448 CASAVA_Build 14 36780932 4D AAGCAAGCAG TCAA/---- TCAATCATAA 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 TCAA 2 1 83449 CASAVA_Build 14 36782511 5D ATAAAATGAA GTATT/----- GTAAATGATC 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 GTATT 1 0 83450 CASAVA_Build 14 36795706 4I4M3I AGTAGAAACC ----AGCA---/TCAGAGAAATC TCAGAGACTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 N/A 0 0 83451 CASAVA_Build 14 36801004 1D ATGTGGGGGG A/- AAAACACATA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 5 4 83452 CASAVA_Build 14 36822014 8D TTGATGTTGC TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 3070 het 1567 hom 26 6 9 11 TGTT 7 5 83453 CASAVA_Build 14 36830408 4I ATGTTATTTA ----/TTTG TTTATTTTTG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 TTTG 0 1 83454 CASAVA_Build 14 36832101 3D TGAAAAGTTT TTC/--- TTACTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TTC 1 0 83455 CASAVA_Build 14 36838424 5D AAATAAAAAT TACTC/----- TACAACATCC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TACTC 1 0 83456 CASAVA_Build 14 36849156 4I AATGAATCTC ----/TCTA TCTGTTTTGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TCTA 0 1 83457 CASAVA_Build 14 36850982 4I CTGAATTTGG ----/GTTT GTTTGTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GTTT 2 3 83458 CASAVA_Build 14 36852092 4D AACATTTGAC AAAT/---- AAATCATATT 3070 het 3070 ref 34 19 13 4 AAAT 2 1 83459 CASAVA_Build 14 36855695 1D CACTTTAGGA G/- GGCAAGGCGG 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 G 3 2 83460 CASAVA_Build 14 36857611 1D GAAAAAATTG C/- CCCCAAGCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 5 4 83461 CASAVA_Build 14 36866991 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCGCTC 3070 het 1978 hom 21 7 11 3 AG 2 1 83462 CASAVA_Build 14 36868988 2I CCAGAGAAGT --/AA AGTCATCATC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 3 83463 CASAVA_Build 14 36870510 1I TACATTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 10 11 83464 CASAVA_Build 14 36871655 6I AAATGGCAGG ------/CAACCA CAATTTTAGT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 CAACCA 0 1 83465 CASAVA_Build 14 36872513 5D ACGTGGAAAT ATATA/----- ATATGTGAGC 3070 het 3070 ref 44 23 21 3 ATATA 1 0 83466 CASAVA_Build 14 36872949 1I GGCATATATG -/T TCTGTCTACA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 1 2 83467 CASAVA_Build 14 36875062 2D AAATTCATGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 39 5 14 20 T 18 16 83468 CASAVA_Build 14 36881884 4I AATTACTATA ----/TTTG TTATTAAATC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 TTTG 0 1 83469 CASAVA_Build 14 36884216 1D CACGCCACAA T/- GTCTGGCTAA 3070 hom 75 het 29 0 25 6 T 1 0 83470 CASAVA_Build 14 36887785 1D CCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 671 hom 28 5 16 7 T 18 17 83471 CASAVA_Build 14 36898586 4I TATTTGGCTC ----/TCTG TCTGTTATTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TCTG 1 2 83472 CASAVA_Build 14 36906163 2D TCAAAATTGC AG/-- AGTTTAATAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 AG 2 1 83473 CASAVA_Build 14 36907313 3I ACATTTTGTA ---/TAT TACTCAAAGT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TAT 0 1 83474 CASAVA_Build 14 36908356 1I TTCTTGTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 33 0 23 10 A 10 11 83475 CASAVA_Build 14 36909382 2I AGATTCATCA --/TT GTTTTTATTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 2 83476 CASAVA_Build 14 36911857 1D TGAAAGTTAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 7 T 8 7 83477 CASAVA_Build 14 36923342 1I AAATTTTGGG -/A AAAAATATAG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 5 6 83478 CASAVA_Build 14 36931199 1D CTTTGATTTA T/- TTAATAAACA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 3 2 83479 CASAVA_Build 14 36949200 1I TTAAATATAC -/T AAAAGAAAAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 0 1 83480 CASAVA_Build 14 36956836 1I CTGGATACTT -/G GTTAGTTCCA 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 G 1 2 83481 CASAVA_Build 14 36969458 5I ATTAAAATAG -----/TTTTT TTTTTTTTTT 372 het 372 ref 22 5 3 14 T 11 16 83482 CASAVA_Build 14 36969469 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 93 hom 26 2 12 12 A 8 7 83483 CASAVA_Build 14 36974774 1D TAGCAATGAG T/- TTTGTAAGTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 4 3 83484 CASAVA_Build 14 36976367 1D TATAAAAAAT A/- AAAATTTTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 5 4 83485 CASAVA_Build 14 37003213 1D ACTACTGGAT A/- ATCTACCCAA 3070 hom 105 het 38 0 33 5 A 2 1 83486 CASAVA_Build 14 37011392 4D ATTATGGAGA AACT/---- AACTAGTGAG 3070 hom 96 het 37 0 33 7 AACT 2 1 83487 CASAVA_Build 14 37034074 1D GTAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 20 2 T 14 13 83488 CASAVA_Build 14 37044927 4I ACAGACAAAC ----/AGAG AGCCAAATCA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AG 1 3 83489 CASAVA_Build 14 37048663 3I ATATATATGT ---/ATC ATGTTTATGT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 ATC 0 1 83490 CASAVA_Build 14 37051250 3I ACGAGTAAGA ---/ACC GTCTGTAGTT 3070 hom 105 het 41 0 34 7 ACC 0 1 83491 CASAVA_Build 14 37054719 6D TAGCACAGTT CAAGAA/------ CAAGAATGAA 3070 hom 123 het 44 0 42 7 CAAGAA 2 1 83492 CASAVA_Build 14 37057887 2I AAATAAACTC --/TA TTTGATTACA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TA 0 1 83493 CASAVA_Build 14 37060196 1I CCCAGCCACA -/T TTTACTTTTA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 3 4 83494 CASAVA_Build 14 37089501 1D TTTACCTTTT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 45 het 18 0 16 4 A 7 6 83495 CASAVA_Build 14 37092538 3D TTATTCTATT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 TTA 4 3 83496 CASAVA_Build 14 37096995 4I TTTAAATTTC ----/CTTT ATTATAATTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 CTTT 0 1 83497 CASAVA_Build 14 37120926 4D TACATATTAT GTTA/---- AACTCTTATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 GTTA 1 0 83498 CASAVA_Build 14 37128374 1D ATAGCGGCTA C/- CCTAAAATGT 3070 hom 108 het 42 0 36 7 C 3 2 83499 CASAVA_Build 14 37135003 1D ATGACATAAC T/- TTTTTTTTTT 2292 het 2292 ref 31 12 7 12 T 11 10 83500 CASAVA_Build 14 37135717 3D ATCCGCAAAA TCT/--- TCTTGTTTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TCT 2 1 83501 CASAVA_Build 14 37136501 1D TCATATTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 933 hom 31 2 24 5 A 12 11 83502 CASAVA_Build 14 37144425 4D TGGTATGTGG GTGA/---- GTGAGTATGG 3070 hom 147 het 52 0 49 5 GTGA 2 1 83503 CASAVA_Build 14 37160662 9D TGTTGTAGCA GGGGTCCTG/--------- GGGATTTTCT 3070 het 3070 ref 30 15 14 6 GGGGTCCTG 1 0 83504 CASAVA_Build 14 37221112 1D GAACCACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 33 0 21 12 T 13 12 83505 CASAVA_Build 14 37221397 6D AATTTCTTGG TCTAGC/------ TATACCTTCT 3070 het 3070 hom 35 15 20 1 TCTAGC 1 0 83506 CASAVA_Build 14 37228083 4D TGAAATAATT AGAA/---- AGAATCAAGC 3070 het 3070 ref 20 10 9 2 AGAA 2 1 83507 CASAVA_Build 14 37244728 2D CAGAGTGCTA TG/-- TGGAAACATG 3070 hom 126 het 49 0 42 8 TG 2 1 83508 CASAVA_Build 14 37254979 2D TGGTTGTAAC AG/-- AATATAGAGG 3070 het 3070 ref 25 14 8 5 AG 1 0 83509 CASAVA_Build 14 37257512 1I AAGAAGTGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 8 9 83510 CASAVA_Build 14 37266503 1D CCCGCCTTGG C/- CTCCCAAAGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 2 1 83511 CASAVA_Build 14 37267135 3I TAATAGACTT ---/AAC TATTATACTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAC 0 1 83512 CASAVA_Build 14 37267374 2D TATCACTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 22 20 83513 CASAVA_Build 14 37271585 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTGAG 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 1 0 83514 CASAVA_Build 14 37271741 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAC 3070 hom 30 het 11 0 11 2 T 7 6 83515 CASAVA_Build 14 37271837 1I GCTGGACTTA -/C AAGCGTGAGC 3070 hom 24 het 12 0 9 3 C 0 1 83516 CASAVA_Build 14 37276387 1I GTTGAATTTT -/A TTAAAAAAAC 3070 het 315 hom 36 1 34 1 A 0 1 83517 CASAVA_Build 14 37276760 1I AATCACCTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 9 10 83518 CASAVA_Build 14 37279440 1I GTAAGAGAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 8 9 83519 CASAVA_Build 14 37280384 1I AGCTGGGAGT -/A ACAGGCGTGT 3070 hom 63 het 22 0 20 2 A 1 2 83520 CASAVA_Build 14 37281541 2I AATTTTTGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 18 10 T 13 15 83521 CASAVA_Build 14 37282277 3D GGGACTATAA TTC/--- TTCTTCATAA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 TTC 3 2 83522 CASAVA_Build 14 37287548 1I TTGCATGGCA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 7 8 83523 CASAVA_Build 14 37291474 1I ATCTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 29 1 23 5 T 11 12 83524 CASAVA_Build 14 37303904 1D TTTTAATTGA T/- TTTTTTCTAC 2099 het 2099 ref 23 15 5 3 T 7 6 83525 CASAVA_Build 14 37316317 1I TTTGAACTCT -/G AGATTTTTTT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 G 0 1 83526 CASAVA_Build 14 37318327 1I CTTAGAAGTC -/G TTTTTTTTGG 3070 hom 83 het 36 0 29 7 G 0 1 83527 CASAVA_Build 14 37328297 1I TTAAGAAGAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 7 8 83528 CASAVA_Build 14 37337350 2I AAAGGGTATC --/TT TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 3 5 83529 CASAVA_Build 14 37340856 1D TGAGTATATA T/- TCCAAAGGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 1 83530 CASAVA_Build 14 37369707 1I CTAAAATAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 8 83531 CASAVA_Build 14 37370572 1D GCAATAGCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 413 hom 36 1 29 8 T 10 9 83532 CASAVA_Build 14 37370715 1I TTTCAGATCA -/T TTGCCCACTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 2 3 83533 CASAVA_Build 14 37373243 4D TCTATGACTT TTTC/---- TTTTCTTTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTTC 1 0 83534 CASAVA_Build 14 37381649 4I ATTAAAAAAT ----/AAAC AAACCGATGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAAC 1 2 83535 CASAVA_Build 14 37383535 4D CAAGCTAAGA TAGT/---- TAGTAATTTA 3070 hom 120 het 44 0 41 5 TAGT 2 1 83536 CASAVA_Build 14 37393051 1I GGTTTAAAAG -/T TGTTTGGCAG 3070 hom 157 het 57 0 53 4 T 1 2 83537 CASAVA_Build 14 37407482 2I CATTGTAGGA --/GT GAGCCACCTG 3070 het 3070 ref 61 29 26 6 GT 0 1 83538 CASAVA_Build 14 37408683 1I GGAATTGTAT -/C CCCTCAGAAG 3070 hom 86 het 34 0 25 9 C 3 4 83539 CASAVA_Build 14 37411713 5I13M1D ATATTGTCTT -----AAATAGAAGAGGGA/AAGAGAAATAGAAGAGGG- AAAAAGAAAA 3070 hom 72 het 24 0 25 0 N/A 0 0 83540 CASAVA_Build 14 37417155 1I CCAGGCTGGA -/G GGTTTTTTCA 3070 hom 94 het 37 0 30 7 G 2 3 83541 CASAVA_Build 14 37421208 1I CCCTCCCCCC -/T CCCCCCACCC 2788 het 449 hom 13 5 7 1 T 0 1 83542 CASAVA_Build 14 37423613 1I TGTCAATTCA -/T TTAGATTTTC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 2 3 83543 CASAVA_Build 14 37434246 1D GACAAAGCCA G/- GTATGTTCAC 3070 hom 91 het 37 0 30 8 G 2 1 83544 CASAVA_Build 14 37448035 4I AGCAAGAAGG ----/AAAA AAAAAAAAAG 3070 hom 71 het 31 0 24 7 A 9 13 83545 CASAVA_Build 14 37448433 4I ATAGACTGAA ----/AGTC AATTCAGCAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AGTC 0 1 83546 CASAVA_Build 14 37456776 3I CATCTTAAAA ---/GTT GTGTTCTCTG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 GTT 0 1 83547 CASAVA_Build 14 37463112 1I CCTCAAACTT -/A ACAGAAAAAG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 1 2 83548 CASAVA_Build 14 37485903 1I CATGATGACA -/G GATCAAATCC 3070 hom 123 het 42 0 42 0 G 1 2 83549 CASAVA_Build 14 37557155 1D AGGGCCTTAT C/- AAAAAGCCCT 3070 het 3070 hom 42 16 23 4 C 1 0 83550 CASAVA_Build 14 37559281 1I TTCTTTACAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 8 9 83551 CASAVA_Build 14 37559562 18D GGACTGGGGA GAGGGAGAATGAAGAAAG/------------------ GAGGGAGAAT 3070 hom 96 het 34 0 32 4 GAGGGAGAATGAAGAAAG 2 1 83552 CASAVA_Build 14 37560798 5D GAGTCAACTT AAAAG/----- AAAAGAAAAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 AAAAG 2 1 83553 CASAVA_Build 14 37561915 1I ATTCCGGCGA -/C TAAGGAATTG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 C 0 1 83554 CASAVA_Build 14 37567596 1D ATTATTAAGT A/- AAAAAAAAAA 2763 het 2763 ref 20 10 7 3 A 12 11 83555 CASAVA_Build 14 37572298 1I ACCTTATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 A 10 11 83556 CASAVA_Build 14 37583429 1I TTTGAGCACA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 7 8 83557 CASAVA_Build 14 37589324 4I CCAAAACAGT ----/AAAC AAACACTGAA 3070 het 3070 hom 42 13 26 3 AAAC 1 2 83558 CASAVA_Build 14 37604518 1D TCCTCCTTCT C/- CTCCTCCTCC 3070 het 3070 ref 47 27 14 6 C 2 1 83559 CASAVA_Build 14 37605788 3D23M2I ATTCTTAACA AATAATAAGGTGTATATATATATATG--/---AATAAGGTGTATATATATATATGTA TATATATATA 3070 het 3070 hom 17 8 13 2 N/A 0 0 83560 CASAVA_Build 14 37610839 1D ATCTAATTCA G/- TGGTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 G 1 0 83561 CASAVA_Build 14 37611862 7I ACATGAGGGG -------/ATTAAGT AGTGCCCAGA 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 ATTAAGT 0 1 83562 CASAVA_Build 14 37615866 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAAGA 2153 het 379 hom 9 1 5 3 A 8 9 83563 CASAVA_Build 14 37622800 15D CGACTTCCTT ATAAAAATCTTCCAA/--------------- ATAAAAATCT 3070 het 3070 hom 32 15 21 4 ATAAAAATCTTCCAA 2 1 83564 CASAVA_Build 14 37626845 1I TCTAATACTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 A 8 9 83565 CASAVA_Build 14 37628195 14D GTAGAAACAG AATATTGCCTTCCC/-------------- AATATTAATA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AATATTGCCTTCCC 1 0 83566 CASAVA_Build 14 37628297 1D AAACACTTAC A/- AAAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 6 5 83567 CASAVA_Build 14 37646446 3I AACTAAGGGA ---/TTG TTGAAACTCC 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 TTG 1 2 83568 CASAVA_Build 14 37650379 1D TTGATTTTTC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 48 25 11 13 A 8 7 83569 CASAVA_Build 14 37654916 3I CAAGATGTAC ---/AGA AGACCAATAA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 AGA 1 2 83570 CASAVA_Build 14 37655508 2D AATAAATATA TG/-- TATATACATA 1895 het 1895 ref 20 11 4 6 TG 1 0 83571 CASAVA_Build 14 37656475 1I ACACCAGACA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 7 8 83572 CASAVA_Build 14 37663150 1D GGTGGTGGAG A/- GGGGATAGGC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 1 0 83573 CASAVA_Build 14 37667244 3D ATTTAATTTG ATA/--- ATAATTCAGT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 ATA 2 1 83574 CASAVA_Build 14 37707174 34D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATACACACACACAC/---------------------------------- ACACACACAC 3070 hom 45 het 15 0 16 1 ATATATATATATATATATATATACACACACACAC 1 0 83575 CASAVA_Build 14 37707697 2I CTTACCACGA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 12 22 13 AC 7 8 83576 CASAVA_Build 14 37710551 2I ATTCTTCTCT --/CA GTCGATATCC 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 CA 0 1 83577 CASAVA_Build 14 37711522 4D CAATATCTGA AATT/---- AATTTTATTT 3070 het 3070 ref 35 21 13 2 AATT 2 1 83578 CASAVA_Build 14 37716463 4D TAATATAAGA GAAC/---- CTAGAACTGT 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 GAAC 1 0 83579 CASAVA_Build 14 37718098 1I CATTGAGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 A 9 10 83580 CASAVA_Build 14 37718887 1I AAAGACACAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 7 8 83581 CASAVA_Build 14 37738217 7D ACTCAGCTAC TGATTGT/------- TGATTGTTGT 3070 hom 94 het 36 0 30 7 TGATTGT 2 1 83582 CASAVA_Build 14 37740178 2D AAGGCCCAAC TG/-- TTTTGTTTGG 3070 het 3070 hom 52 18 28 7 TG 1 0 83583 CASAVA_Build 14 37740777 4D TAGAAAGTAG GTAA/---- GTAAGTTAAA 3070 hom 151 het 54 0 51 6 GTAA 2 1 83584 CASAVA_Build 14 37789019 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 8 het 16 1 12 3 A 7 6 83585 CASAVA_Build 14 37801296 2D AAGTTAAAGA TT/-- TATCATAAAT 3070 hom 72 het 30 0 22 9 T 3 1 83586 CASAVA_Build 14 37817918 1D TCTCTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 13 12 83587 CASAVA_Build 14 37818975 1I ATGATGGTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 9 10 83588 CASAVA_Build 14 37821795 2D TGCATCAGCC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2945 hom 21 7 8 8 TG 10 9 83589 CASAVA_Build 14 37822629 1I CAATAAGGTA -/C CCATTTATGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 2 3 83590 CASAVA_Build 14 37824651 1I TAGATCAAAA -/G ATCACATTGT 3070 hom 52 het 28 0 20 8 G 0 1 83591 CASAVA_Build 14 37838544 1I CTCAAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 23 1 19 3 T 10 11 83592 CASAVA_Build 14 37839014 1I ATATAAATAG -/A AAAATAGAAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 4 5 83593 CASAVA_Build 14 37839179 2D ACTGAAAATT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 42 0 40 3 A 11 9 83594 CASAVA_Build 14 37841432 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 8 A 10 9 83595 CASAVA_Build 14 37851641 1D GAATGCTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 372 hom 47 1 38 8 A 10 9 83596 CASAVA_Build 14 37858775 4D ATTGTGCAAA TAGT/---- TAGTTACGTG 3070 hom 111 het 43 0 36 9 TAGT 2 1 83597 CASAVA_Build 14 37860389 4I GAAGTTCTCA ----/AGCC AGCCTCAACT 3070 hom 91 het 38 0 28 10 AGCC 1 2 83598 CASAVA_Build 14 37863472 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 9 83599 CASAVA_Build 14 37875354 1I GCACAAAGAT -/A AAAGGAAATT 3070 hom 79 het 36 0 29 7 A 3 4 83600 CASAVA_Build 14 37882445 4D AGCTCAGCAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 76 het 35 0 24 11 AG 8 6 83601 CASAVA_Build 14 37886916 9I CTAGAAATCC ---------/TAGTTATAG TAGTTATAGT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TAGTTATAG 1 2 83602 CASAVA_Build 14 37887475 1D CTATCCTGAG T/- TAAAAAACAA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 T 2 1 83603 CASAVA_Build 14 37890143 2I TGTTGATTCC --/AA ATGATGACAT 3070 hom 105 het 42 0 34 8 A 1 3 83604 CASAVA_Build 14 37891466 1D TCTTAAATAG T/- ATTTAAACCA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 1 0 83605 CASAVA_Build 14 37894291 1I GGTCTTCACC -/G CAGCCCCTCC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 G 0 1 83606 CASAVA_Build 14 37898489 1I AGAAAAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 26 1 21 4 T 10 11 83607 CASAVA_Build 14 37899920 1I TTTACACAGC -/A AAAAAATGAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 6 7 83608 CASAVA_Build 14 37903388 2D GTATCCAAAT AC/-- AGTTTGTTGA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 AC 1 0 83609 CASAVA_Build 14 37906630 1I ATTTGATTGG -/A ACAAACAAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 2 83610 CASAVA_Build 14 37909727 1D CTATTTGGTT A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 69 het 26 0 24 6 A 8 7 83611 CASAVA_Build 14 37910216 1I ACAGTACCTA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 8 9 83612 CASAVA_Build 14 37912073 2I TGGGTGTGTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 11 83613 CASAVA_Build 14 37913392 4D ATCATTTAAG AATT/---- AATATATAGA 3070 hom 123 het 43 0 42 3 AATT 1 0 83614 CASAVA_Build 14 37914964 1I CAACAATCTG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 359 hom 38 1 36 1 A 8 9 83615 CASAVA_Build 14 37918999 14D TGTTATATCT CTCTCTCTCACACA/-------------- CACACACACA 3070 het 411 hom 29 5 16 15 CTCTCTCTCACACA 1 0 83616 CASAVA_Build 14 37932405 1I GTCTCTCATG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 A 8 9 83617 CASAVA_Build 14 37975966 1I CAAAAAAAAA -/G AAAAATTGTA 3070 het 122 hom 14 3 9 2 G 0 1 83618 CASAVA_Build 14 37981867 1I GTACATATTA -/T TTCATCACCC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 2 3 83619 CASAVA_Build 14 37988518 1I CTGGGGTAGA -/C CCCCCAGTAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 C 5 6 83620 CASAVA_Build 14 37997999 2I TGTTTTTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 31 1 21 9 T 14 16 83621 CASAVA_Build 14 38003882 5D GATTCTTCTC TCTTT/----- TCTTTTTTAT 2977 het 2362 hom 13 5 7 1 TCTTT 2 1 83622 CASAVA_Build 14 38009241 1D ATCAGACTTT C/- TGAAACATTA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 C 1 0 83623 CASAVA_Build 14 38018114 2D GGATGAATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 AT 7 6 83624 CASAVA_Build 14 38019842 6D ATGGCTTGTT GCAATA/------ GCAATAGCTA 3070 hom 75 het 29 0 25 6 GCAATA 2 1 83625 CASAVA_Build 14 38020293 1I TGTCTGTAGG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 98 het 35 0 32 3 T 8 9 83626 CASAVA_Build 14 38027083 1I AAGGATCCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 9 10 83627 CASAVA_Build 14 38035582 1D TGGCTCCCTT A/- ATTATTTCTC 3070 het 3070 ref 28 12 10 7 A 2 1 83628 CASAVA_Build 14 38037519 1I TTTCTGAGTT -/A ATTTCACTAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 1 2 83629 CASAVA_Build 14 38038952 1D TTTCTATGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 41 het 25 0 19 7 T 10 9 83630 CASAVA_Build 14 38043098 1D ACCTCCCCCT A/- AGGTCCCTCC 3070 hom 51 het 20 0 16 5 A 2 1 83631 CASAVA_Build 14 38069341 2D TGTACTGAGG AA/-- AAAAGCCTTT 3070 hom 105 het 37 0 34 4 A 6 4 83632 CASAVA_Build 14 38071655 1D GAGCCTCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1058 hom 35 4 14 17 A 13 12 83633 CASAVA_Build 14 38074001 1D ACACTTTTAC A/- TGTCAATATA 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 A 1 0 83634 CASAVA_Build 14 38086117 1D CATTAAACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 10 9 83635 CASAVA_Build 14 38091051 4D CTGAAATAGC AAAT/---- AAATAGCAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AAAT 2 1 83636 CASAVA_Build 14 38091556 2I23M2I TAAAAAAAAA --AAACTTATTTTAAACCAAACTGA--/ACAAACTTATTTTAAACCAAACTGAAC ATCAGAACTA 3070 hom 123 het 35 0 42 5 N/A 0 0 83637 CASAVA_Build 14 38091697 4I4M8D TCTGGCAAAA ----GAAATCAAAATC/TGGGGAAA-------- TGTAGCTCTT 3070 het 3070 hom 35 14 22 3 N/A 0 0 83638 CASAVA_Build 14 38092022 3D ATCTGCTGTA TTC/--- TTAATATTTT 3070 het 2852 hom 30 8 22 2 TTC 1 0 83639 CASAVA_Build 14 38093127 4I GAATCACATA ----/TCCT TCCTTGGACA 3070 het 3070 hom 43 15 26 2 TCCT 1 2 83640 CASAVA_Build 14 38097422 38D GAACTTAAAG TATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------- TATATATATA 3070 hom 27 het 13 0 10 4 TA 24 5 83641 CASAVA_Build 14 38099506 1D TCAATACCAA T/- TTTTCTATAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 5 4 83642 CASAVA_Build 14 38100118 4I ACAAGAAAGG ----/GTGA GTGAGTGTCT 3070 hom 121 het 46 0 40 6 GTGA 1 2 83643 CASAVA_Build 14 38100844 1I TGCCTGCCAC -/T AGGGGGCCCA 3070 hom 86 het 34 0 26 8 T 0 1 83644 CASAVA_Build 14 38106002 2I ATATGGAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 23 1 16 6 A 12 14 83645 CASAVA_Build 14 38111123 11D AAATGTAAGA CCTAAAACTAT/----------- AAAACCATTT 3070 het 3070 hom 36 19 18 4 CCTAAAACTAT 1 0 83646 CASAVA_Build 14 38116291 8D CAGTGCATTT TGCATTTC/-------- TGCATTTCTG 3070 hom 63 het 24 0 22 4 TGCATTTC 3 2 83647 CASAVA_Build 14 38122240 1I CAGTTTATGG -/T TTTTGTAAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 4 5 83648 CASAVA_Build 14 38137955 2D AGCTTTGTCC CA/-- GAGATTCTGG 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 CA 1 0 83649 CASAVA_Build 14 38152177 1D TTAAAAACAG A/- GAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 A 1 0 83650 CASAVA_Build 14 38158337 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1989 het 1709 hom 21 7 6 8 T 13 14 83651 CASAVA_Build 14 38162181 1I AAGATGTGAC -/T TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 6 7 83652 CASAVA_Build 14 38167246 1D AAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2361 hom 29 8 14 9 A 10 9 83653 CASAVA_Build 14 38167525 2I GCATGAGGGT --/AA CCACCCCCAT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 A 0 2 83654 CASAVA_Build 14 38170079 4I AATGAAAAAG ----/AATA AACAAAACCT 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 AATA 0 1 83655 CASAVA_Build 14 38171319 1D TAAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2391 het 929 hom 18 3 8 7 T 17 16 83656 CASAVA_Build 14 38173697 1I TACAGTAACC -/A AAACAGCTTG 3070 hom 24 het 13 0 9 4 A 3 4 83657 CASAVA_Build 14 38186027 1D AAAAATAAAA T/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 18 20 7 T 1 0 83658 CASAVA_Build 14 38186942 2D ACATCACTGC AA/-- AAAAAAAAAA 1234 het 850 hom 30 8 8 15 A 18 16 83659 CASAVA_Build 14 38189619 6I AACTAAACAC ------/TGACCA TGACCACACA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 TGACCA 1 2 83660 CASAVA_Build 14 38197731 1D AGGTTTTTCC T/- TAATGGTGAC 3070 hom 154 het 58 0 50 8 T 2 1 83661 CASAVA_Build 14 38205641 1D TTATTGTGGG A/- AAAGTAGGCA 3070 het 3070 ref 44 20 22 2 A 4 3 83662 CASAVA_Build 14 38210028 2I TTTGTGAAAC --/AT ATGTTTGTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AT 1 2 83663 CASAVA_Build 14 38210143 1I CATAATTTCA -/T TTTTTTATAA 3070 het 2229 hom 22 5 16 1 T 6 7 83664 CASAVA_Build 14 38210230 1D GGCCCTTTTT C/- TCTCTCTCTC 366 het 366 ref 28 18 1 9 C 1 0 83665 CASAVA_Build 14 38216242 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAG 1026 het 1026 ref 17 7 3 7 A 9 10 83666 CASAVA_Build 14 38219538 2D GTTGCATTTG CT/-- TTTGGAGTCT 2591 het 2591 ref 19 12 6 1 CT 1 0 83667 CASAVA_Build 14 38220844 1I TGATCATGTA -/T TTTTTTTTTT 2028 het 2028 ref 28 13 6 9 T 13 14 83668 CASAVA_Build 14 38231966 1D AGAAGAAATA C/- TTTTGATGTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 6 C 1 0 83669 CASAVA_Build 14 38238138 1D TCCTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 12 11 83670 CASAVA_Build 14 38239513 1I GATACATAGA -/C CTATGGAACA 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 C 1 2 83671 CASAVA_Build 14 38239692 1D TTGCCATATA C/- AAAAATCAAA 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 C 1 0 83672 CASAVA_Build 14 38257055 1D CCATTTTTAA T/- TTTTTTTTAA 2677 het 2677 ref 26 11 8 7 T 9 8 83673 CASAVA_Build 14 38294683 1D AAATGAGATT A/- AAATTTGAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 4 3 83674 CASAVA_Build 14 38359859 1I AGTCAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 10 11 83675 CASAVA_Build 14 38380326 2I TTCTAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 17 18 14 A 12 14 83676 CASAVA_Build 14 38383315 1D TTTGCTATTA C/- TTTTAATGGT 3070 het 3070 ref 31 18 9 5 C 1 0 83677 CASAVA_Build 14 38386304 2I GGAGAGAAAC --/AG GGACTCAGCC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AG 0 1 83678 CASAVA_Build 14 38388944 8I3M4I GACGGAGGGA --------AGA----/TATCACACATATCTG TGATATGAAG 3070 het 3070 ref 38 26 10 2 N/A 0 0 83679 CASAVA_Build 14 38408964 1D TCTCATGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 15 17 7 A 9 8 83680 CASAVA_Build 14 38418858 1I ATAAAGCAAA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 57 het 24 0 20 7 T 8 9 83681 CASAVA_Build 14 38420037 4D CTACACTCAA GAGG/---- GAGGAAGTAC 3070 het 3070 ref 52 28 21 5 GAGG 2 1 83682 CASAVA_Build 14 38420193 1D CTCTGGTAGA C/- AGTTCCTCAT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 C 1 0 83683 CASAVA_Build 14 38420583 1I AAAAGATAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 9 10 83684 CASAVA_Build 14 38421305 1D GAAAATGACC A/- ATCACTTTGG 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 A 2 1 83685 CASAVA_Build 14 38422469 1I GTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 47 28 13 6 T 8 9 83686 CASAVA_Build 14 38425659 1I ACTCAATGAA -/T TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 T 6 7 83687 CASAVA_Build 14 38431075 1D GTGAAGCAAT G/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 G 1 0 83688 CASAVA_Build 14 38435937 1D CCATCAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 9 8 83689 CASAVA_Build 14 38455820 1D GGCAGCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 24 1 17 6 A 13 12 83690 CASAVA_Build 14 38469736 1I AAGTTTTAAA -/T AATTTAAACC 3070 hom 99 het 38 0 35 3 T 0 1 83691 CASAVA_Build 14 38470502 4D GTGTGTGTTA AATT/---- AATTAATTCA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AATT 3 2 83692 CASAVA_Build 14 38482155 1I GCAAGAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1364 hom 31 3 17 11 T 12 13 83693 CASAVA_Build 14 38485209 7I TTTTGTTTGT -------/TTGTTTG TTGTTTGTTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTGTTTG 2 3 83694 CASAVA_Build 14 38485761 1I GCAGACCGTA -/G GCTACATATA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 G 1 2 83695 CASAVA_Build 14 38496227 1D TTAATCTTAT A/- AAAAAACTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 6 83696 CASAVA_Build 14 38505050 1I CAGCATTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1786 hom 32 6 23 3 A 13 14 83697 CASAVA_Build 14 38511676 4D GAAGTAAATA AAAT/---- AAATAAAATA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 AAAT 2 1 83698 CASAVA_Build 14 38519102 3D TCCTTTAGCT AGG/--- AGGAGTTTGT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AGG 2 1 83699 CASAVA_Build 14 38540022 4D TCCTAGGCAC TATA/---- TATACCAAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 TA 4 2 83700 CASAVA_Build 14 38549174 3I TAAAAAATAC ---/ATA ATACTATTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATA 1 2 83701 CASAVA_Build 14 38550437 1I TAACCCACTA -/C CCCATCCATT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 3 4 83702 CASAVA_Build 14 38565722 1D AGACTAACAT A/- AAAAAAAAAC 1371 het 1371 ref 33 24 3 6 A 10 9 83703 CASAVA_Build 14 38572291 1I CTCCTAGAGG -/A AAAAAAGATA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 6 7 83704 CASAVA_Build 14 38572378 8I AATCATTTGA --------/AATAGAAC AATGCCTATG 3070 hom 120 het 40 0 40 1 AATAGAAC 0 1 83705 CASAVA_Build 14 38574411 4D TAACATTTAC TGAG/---- TATTACTGTC 3070 het 3070 hom 31 14 16 5 TGAG 1 0 83706 CASAVA_Build 14 38581704 1D GTAAAAAGAC T/- TTACATGCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 2 83707 CASAVA_Build 14 38584865 4D TGGCTACATC CCCA/---- CCCACCCACA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 CCCA 3 2 83708 CASAVA_Build 14 38593230 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1560 het 1560 ref 29 20 4 5 A 13 12 83709 CASAVA_Build 14 38594366 1D ACTACTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 20 0 16 4 T 15 14 83710 CASAVA_Build 14 38606491 1D TTGGTAATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 9 8 83711 CASAVA_Build 14 38613566 3I AAAATGATCT ---/AAG AAGGACTAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AAG 1 2 83712 CASAVA_Build 14 38628425 18D AAGGTACTCC GCTTCCTGTGCTCCTGAA/------------------ GGAATCCCTA 3070 hom 150 het 50 0 50 3 GCTTCCTGTGCTCCTGAA 1 0 83713 CASAVA_Build 14 38646762 1I GCACTTGTAG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 6 7 83714 CASAVA_Build 14 38649347 4I AGATAACAAT ----/AGTA ACTACCACTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AGTA 0 1 83715 CASAVA_Build 14 38654173 2I TGTTTGTTTG --/TT TTTATAGAGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 3 5 83716 CASAVA_Build 14 38655581 4I AGTAGTTTCT ----/CTAA CTGATACTTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CTAA 0 1 83717 CASAVA_Build 14 38656226 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 21 1 12 8 A 15 16 83718 CASAVA_Build 14 38672143 2I TGCATTATAT --/AG AGAGGAACAA 2960 hom 15 het 8 0 6 2 AG 2 3 83719 CASAVA_Build 14 38672266 2I CATATATAAT --/AC ATATATGAAT 3070 het 242 hom 18 1 15 2 AC 0 1 83720 CASAVA_Build 14 38680532 16D CTCCCTGAGG GCCCCACACCTGCAGC/---------------- AAACTTGCCT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 GCCCCACACCTGCAGC 1 0 83721 CASAVA_Build 14 38704633 1D ATGCCCATAG C/- CCTAGCTATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 3 2 83722 CASAVA_Build 14 38715673 1I CCACTCCCTG -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 36 het 24 0 21 3 C 8 9 83723 CASAVA_Build 14 38718533 1D CTGTGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 31 1 26 4 T 11 10 83724 CASAVA_Build 14 38725393 2I AGACTCCATC --/AA AAAAAAAAAA 2422 hom 16 het 17 0 10 7 A 14 16 83725 CASAVA_Build 14 38725774 2I TATATATCTC --/TG TTTTGATGGA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 TG 0 1 83726 CASAVA_Build 14 38728485 1I TTCTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1129 het 1129 ref 24 13 3 8 T 13 14 83727 CASAVA_Build 14 38732089 4I AAATACCTCT ----/TACA TATAGAGGAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TACA 0 1 83728 CASAVA_Build 14 38749413 1D AGGCCTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 12 11 83729 CASAVA_Build 14 38756116 1I GTTGAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 9 14 A 13 14 83730 CASAVA_Build 14 38757792 8D TAAAAAATAA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 3070 het 1465 hom 15 3 11 1 AAAT 5 3 83731 CASAVA_Build 14 38757951 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 20 7 13 0 A 8 9 83732 CASAVA_Build 14 38759995 10I TACAAATTCC ----------/AAACAAACAA AAACAAACAA 3070 hom 87 het 38 0 30 9 AAACAAACAA 1 2 83733 CASAVA_Build 14 38761345 2I AAAAGTAATG --/AC AGTTATTTCT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 AC 0 1 83734 CASAVA_Build 14 38766032 1D AGTTTTGCTC T/- TGTTGCCCAG 2387 het 271 hom 10 1 7 2 T 2 1 83735 CASAVA_Build 14 38784656 2I GGGAGAAAGC --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 GA 6 7 83736 CASAVA_Build 14 38791031 1D AAAAGGCACG T/- TAGAGAATAG 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 2 1 83737 CASAVA_Build 14 38812307 1D GTGTGTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 62 het 39 1 35 3 T 8 7 83738 CASAVA_Build 14 38812555 1D TGATCATGCG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 21 15 13 T 10 9 83739 CASAVA_Build 14 38819001 2D GCAGTTGAGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 105 het 48 0 35 14 GT 9 8 83740 CASAVA_Build 14 38828183 1D GCAGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 39 2 20 17 T 13 12 83741 CASAVA_Build 14 38843187 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTATTTT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 5 6 83742 CASAVA_Build 14 38848900 1D ATGGCATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 37 2 14 21 T 15 14 83743 CASAVA_Build 14 38850279 41D GTGAAGTGTT AAATTTATATTCTTGCTGCATATAGTATAATTTAAGTTCAG/----------------------------------------- TCTGGATGTT 3070 hom 39 het 12 0 14 3 AAATTTATATTCTTGCTGCATATAGTATAATTTAAGTTCAG 1 0 83744 CASAVA_Build 14 38851658 1I GTAAGATGGG -/A ATAACAGTAC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 1 2 83745 CASAVA_Build 14 38852116 3D CGGTTTATAA TAT/--- TAAATTCAAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TAT 1 0 83746 CASAVA_Build 14 38861580 1D AGGCCTAATC A/- TTAGCTATTC 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 A 1 0 83747 CASAVA_Build 14 38865800 1D GATTTGTATG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 9 8 83748 CASAVA_Build 14 38882459 2D GTGAATGAAG TA/-- TATGAGAGTA 3070 het 3070 ref 38 24 14 1 TA 2 1 83749 CASAVA_Build 14 38885002 3D CTTTGTGCTT TTC/--- TTCTTTAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 TTC 2 1 83750 CASAVA_Build 14 38889753 4D AAATGTGCTC TCTT/---- TCTTGTAAAT 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 TCTT 2 1 83751 CASAVA_Build 14 38889916 1D TCTTTATTGC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 58 het 37 1 32 4 T 8 7 83752 CASAVA_Build 14 38890637 1D ATGCAGCAAG A/- AGGTTCCATC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 2 1 83753 CASAVA_Build 14 38894040 2I GTTTTTTCCA --/AT TCTGTGAAGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AT 0 1 83754 CASAVA_Build 14 38896840 2D TTGGCCCGCA CT/-- CTCTTCTGGC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 CT 3 2 83755 CASAVA_Build 14 38900393 1I AGGTGTGTGG -/T TTTTTTTTTT 2297 het 1712 hom 26 5 13 8 T 15 16 83756 CASAVA_Build 14 38903391 1D GGTTTGTTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 10 9 83757 CASAVA_Build 14 38903810 1I TGTAACTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3022 hom 22 8 11 3 T 9 10 83758 CASAVA_Build 14 38906783 1D TTGTCGTCGG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 23 het 35 1 24 10 T 9 8 83759 CASAVA_Build 14 38907636 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 8 7 83760 CASAVA_Build 14 38908808 1D TTCTCCCCCC T/- ATGTTGGCAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 1 0 83761 CASAVA_Build 14 38912405 1D AAAGATAAAA G/- AATAAAAGCC 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 G 1 0 83762 CASAVA_Build 14 38916192 1D GGGGAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 A 14 13 83763 CASAVA_Build 14 38924280 1I AATCCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 A 10 11 83764 CASAVA_Build 14 38927342 1I CCTTTAAGTC -/T TAAATTTTAT 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 1 2 83765 CASAVA_Build 14 38963454 1D CTTAGTTTAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 8 7 83766 CASAVA_Build 14 38976004 14I AAAAGGGGAG --------------/TCATACTTTCACTT TCATACTTTC 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 TCATACTTTCACTT 0 1 83767 CASAVA_Build 14 38976446 4I TTCAGCTCTC ----/ACTT ACACGTGAGA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 ACTT 0 1 83768 CASAVA_Build 14 38978840 1I TAGTGGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 hom 66 het 23 0 22 1 G 3 4 83769 CASAVA_Build 14 38980693 5I GCTCAATAAA -----/TCTCT TCTCTGCCTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TCTCT 1 2 83770 CASAVA_Build 14 38990072 1D TGGTTAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 40 0 33 8 A 10 9 83771 CASAVA_Build 14 39001940 3D CTGATTTCCT TTA/--- TTTTGGGTAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 TTA 1 0 83772 CASAVA_Build 14 39004316 1D TCTCTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1915 hom 37 6 23 9 T 15 14 83773 CASAVA_Build 14 39022210 1D CAACTTACAA G/- GGATGTGAAG 3070 het 477 hom 10 1 9 0 G 3 2 83774 CASAVA_Build 14 39030152 1D TAATAAAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 9 8 83775 CASAVA_Build 14 39045110 2D TTAAAATCTG AA/-- AATCACAGTG 3070 het 3070 ref 46 24 19 5 A 4 2 83776 CASAVA_Build 14 39046272 1I TCCCCAACTC -/T TATCAGTGGT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 1 2 83777 CASAVA_Build 14 39069058 1I TGGTATGTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 8 9 83778 CASAVA_Build 14 39069311 8D GTTCCTCTCT ATGTGTTC/-------- ATGTGTTCTC 3070 het 3070 hom 46 20 24 4 ATGTGTTC 2 1 83779 CASAVA_Build 14 39070355 1D CAGGGTTTCA C/- CATGTTGGCC 3070 het 1957 hom 14 5 9 0 C 2 1 83780 CASAVA_Build 14 39079354 1D TGGCAAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 12 11 83781 CASAVA_Build 14 39081451 1I AATAAAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1897 hom 29 9 13 7 A 13 14 83782 CASAVA_Build 14 39084932 1D TAGCCAGGAT G/- GTCTCGATCT 3070 het 2710 hom 16 6 9 2 G 2 1 83783 CASAVA_Build 14 39096029 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2819 hom 25 9 13 3 A 11 10 83784 CASAVA_Build 14 39097722 1I TCTCTTGTGA -/T TTTTTAAGAC 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 T 5 6 83785 CASAVA_Build 14 39098334 1I TTGCCTCCAA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 7 8 83786 CASAVA_Build 14 39099271 2D CTCTTCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1717 het 1717 ref 22 8 6 8 T 16 14 83787 CASAVA_Build 14 39099786 1I GTTGTGGGGT -/G GGGGAGGGGG 3014 hom 21 het 9 0 8 1 G 4 5 83788 CASAVA_Build 14 39117369 1D GTATAGGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 82 het 36 0 28 8 T 10 9 83789 CASAVA_Build 14 39119333 1D ACTGTCATTT A/- AAAAATGGAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 6 5 83790 CASAVA_Build 14 39122855 2I AACTTGGACT --/TG TCACTTTTAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TG 0 1 83791 CASAVA_Build 14 39137377 1D AAGAGGTATT A/- TTTTTTGAGG 3070 het 3070 hom 32 15 14 5 A 1 0 83792 CASAVA_Build 14 39138926 1D GAGACATAAC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 7 6 83793 CASAVA_Build 14 39144498 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1774 het 222 hom 14 3 6 5 A 15 16 83794 CASAVA_Build 14 39144824 2D CATTAAGTAG CT/-- GCGCAATGTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 8 CT 1 0 83795 CASAVA_Build 14 39146122 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2947 het 72 hom 29 1 11 17 T 17 16 83796 CASAVA_Build 14 39150991 1I AGATGGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 38 2 24 12 T 13 14 83797 CASAVA_Build 14 39166916 3I TATTCATTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 132 het 54 0 44 10 TTG 3 4 83798 CASAVA_Build 14 39168003 1I TGCTATGTTC -/A AAAATGCTGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 4 5 83799 CASAVA_Build 14 39170109 1D AAGGTATAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 10 9 83800 CASAVA_Build 14 39170386 1D TTAAGTTCAG C/- CTAAAGGTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 2 1 83801 CASAVA_Build 14 39171754 5D AAGCTGCTTA ATATT/----- ATATCTCACA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 ATATT 1 0 83802 CASAVA_Build 14 39172497 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 9 8 83803 CASAVA_Build 14 39177586 1D TTCTGCTCTG T/- TTTTTTCCCC 2994 hom 21 het 8 0 8 0 T 7 6 83804 CASAVA_Build 14 39179159 2D ACAAAGGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 13 11 83805 CASAVA_Build 14 39179864 1I CTAATATAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 8 9 83806 CASAVA_Build 14 39180969 1I CCCCACCCCA -/C CCCCCCCTTT 2394 het 213 hom 11 1 5 5 C 7 8 83807 CASAVA_Build 14 39181533 1D ATCTCATGAC T/- TTCCCTTTTT 3070 hom 138 het 52 0 45 7 T 3 2 83808 CASAVA_Build 14 39182242 4I AAACATTTTT ----/TACA TACAACTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 TACA 1 2 83809 CASAVA_Build 14 39183165 2I AAAAAAAAAA --/AG GAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AG 0 1 83810 CASAVA_Build 14 39183457 1I GTGGGATGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 53 26 16 11 A 9 10 83811 CASAVA_Build 14 39190832 1D ACAGTAGCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 11 10 83812 CASAVA_Build 14 39207056 1D TGACTTTTTT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 64 het 38 0 33 5 A 9 8 83813 CASAVA_Build 14 39210053 1I TTCTGTTCCC -/T TAAATAAATT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 T 1 2 83814 CASAVA_Build 14 39211102 1I ATGAAAGTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 8 9 83815 CASAVA_Build 14 39213167 1D GAAAGCCATG T/- TTTTTTTTTT 1767 het 1767 ref 48 35 4 9 T 13 12 83816 CASAVA_Build 14 39228029 1I GTTACTAAAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 7 8 83817 CASAVA_Build 14 39229717 4D TATTTTCTAA CTAT/---- CAGTAGATTG 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 CTAT 1 0 83818 CASAVA_Build 14 39231204 3I AGGGTAGTAG ---/CTA CTGCCTCAAA 3070 het 3070 hom 51 18 22 11 CTA 0 1 83819 CASAVA_Build 14 39233128 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 9 10 83820 CASAVA_Build 14 39236196 4D TAGTGCAGTA CTTT/---- CTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 42 21 19 4 CTTT 2 1 83821 CASAVA_Build 14 39249440 1D AACCTAGATG C/- CCATCAATGG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 C 3 2 83822 CASAVA_Build 14 39253152 2I TTAGTCAGAC --/TT ATGTTTTAGA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 0 2 83823 CASAVA_Build 14 39261119 1D TTTGTACTTT G/- GGGATTTGTA 3070 hom 138 het 58 0 47 12 G 4 3 83824 CASAVA_Build 14 39283253 1D GATTTCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 11 10 83825 CASAVA_Build 14 39283612 1D GCCTGTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 11 10 83826 CASAVA_Build 14 39313020 1D GTTATTACAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 47 21 23 4 A 9 8 83827 CASAVA_Build 14 39316630 2D AGTTTTAATC AT/-- AACGCGATGC 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 AT 1 0 83828 CASAVA_Build 14 39331949 1I TAGCATAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 41 1 31 9 T 12 13 83829 CASAVA_Build 14 39338928 1I TATATCTTTG -/T AGTTTCAGAA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 T 0 1 83830 CASAVA_Build 14 39341870 1D GCAAAGCCAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 A 8 7 83831 CASAVA_Build 14 39354899 1I TGAATGTTTT -/G GAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 G 1 2 83832 CASAVA_Build 14 39363280 1D GGATTGAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 11 10 83833 CASAVA_Build 14 39371141 2I GGGTATGCTG --/CA CACACACACG 3070 het 3070 hom 66 29 29 8 CA 4 5 83834 CASAVA_Build 14 39371589 1I TAAATAACTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 8 9 83835 CASAVA_Build 14 39375212 4D TTATGAGAAA TTAT/---- TTAACAGGAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 TTAT 1 0 83836 CASAVA_Build 14 39379695 4D GATCCTTGTC CCTT/---- CCACTATGTG 3070 het 3070 hom 51 24 23 5 CCTT 1 0 83837 CASAVA_Build 14 39391003 1I AGCTTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 11 12 83838 CASAVA_Build 14 39395796 1I AGTTCAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 546 hom 40 3 29 8 T 10 11 83839 CASAVA_Build 14 39410393 2I TGATTTGCAT --/AA GAGTCGTACT 3070 het 3070 hom 46 15 27 4 A 0 2 83840 CASAVA_Build 14 39421304 3I TCAAATCCTT ---/CTC CTACCACTTA 1967 het 1967 ref 25 17 6 2 CTC 0 1 83841 CASAVA_Build 14 39447311 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 1853 het 17 hom 9 1 5 3 A 8 9 83842 CASAVA_Build 14 39452662 1I TTCTATCTCC -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 T 7 8 83843 CASAVA_Build 14 39486636 1D AGCTTACAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 13 25 8 A 10 9 83844 CASAVA_Build 14 39492884 1D TATCTTCAGC A/- AATGATTTCA 3070 het 3070 ref 55 26 24 5 A 3 2 83845 CASAVA_Build 14 39500417 1D AATTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 17 7 A 11 10 83846 CASAVA_Build 14 39511668 5D GGTAGCCTTG AGAAA/----- AGAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 AGAAA 2 1 83847 CASAVA_Build 14 39532481 1D TATTTTATTC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 9 8 83848 CASAVA_Build 14 39542886 1D TCTTGGGAGA C/- CTGTTAGTCA 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 C 2 1 83849 CASAVA_Build 14 39544626 1I CCCGATACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 10 11 83850 CASAVA_Build 14 39580436 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2909 het 2130 hom 16 6 8 2 A 13 14 83851 CASAVA_Build 14 39583975 13D GTCATTTTTA GGTGGTAATTTAC/------------- CCTTTCCTGG 3070 het 3070 hom 30 9 18 7 GGTGGTAATTTAC 1 0 83852 CASAVA_Build 14 39593849 1D GGAAATAGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 9 8 83853 CASAVA_Build 14 39594851 1D CTTTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 35 1 22 13 A 14 13 83854 CASAVA_Build 14 39596025 4D TGTGTATTAA CAGC/---- CAGCACCTTG 3070 hom 111 het 44 0 37 7 CAGC 2 1 83855 CASAVA_Build 14 39598445 62I TTTAATATTT --------------------------------------------------------------/AACTTAACCACTCAGTCAGTACCGAAACAGCTGTTAGTGAGACCTGCCCTGACACATTTATA TCACACTGAC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AACTTAACCACTCAGTCAGTACCGAAACAGCTGTTAGTGAGACCTGCCCTGACACATTTATA 0 1 83856 CASAVA_Build 14 39599020 2I AATTTAAATT --/AA GTTAATAAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 2 83857 CASAVA_Build 14 39602166 1D GTGTTCACTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 8 7 83858 CASAVA_Build 14 39613720 1D GAACACACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 26 0 21 7 A 12 11 83859 CASAVA_Build 14 39614735 1D TCAAATCTGT A/- GTTGGCTCTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 0 83860 CASAVA_Build 14 39615995 4D ATATAAATTG ATAA/---- ATAGACAAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 6 ATAA 1 0 83861 CASAVA_Build 14 39633519 1I ATATTTTATT -/A AAAAAATCAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 6 7 83862 CASAVA_Build 14 39634412 2D ATTTTATATT TA/-- TATATATATA 3009 hom 18 het 7 0 7 0 TA 8 7 83863 CASAVA_Build 14 39634872 2D TAAAAATATC TT/-- TTTTTTATTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 8 6 83864 CASAVA_Build 14 39636275 1I30M1D TTATTTTGTC -TTTTTTTTTCTTAATAGCCTTATATTCTGCA/TTTTTTTTTTCTTAATAGCCTTATATTCTGC- AAAAAAAATC 3070 hom 66 het 29 0 23 11 N/A 0 0 83865 CASAVA_Build 14 39637096 1D CCATTGCTGG A/- AAAACCTACT 3070 hom 132 het 54 0 45 10 A 5 4 83866 CASAVA_Build 14 39638327 1I TCCTTTAAAG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 7 8 83867 CASAVA_Build 14 39643997 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAACC 2716 het 2716 ref 30 16 10 4 A 9 8 83868 CASAVA_Build 14 39645513 1I TAAACAAGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 8 9 83869 CASAVA_Build 14 39654517 1D TTTGATGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 10 9 83870 CASAVA_Build 14 39657434 1I TTTTGCTTTC -/T TTTTTTCGCT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 T 6 7 83871 CASAVA_Build 14 39657974 1I TCCTGAACAT -/G TTTTTATTTG 3070 hom 66 het 28 0 23 6 G 0 1 83872 CASAVA_Build 14 39659192 1I TTGGTTTGGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3043 hom 26 7 16 3 A 8 9 83873 CASAVA_Build 14 39661824 1D AAGAGCCAAT A/- AGATTAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 2 1 83874 CASAVA_Build 14 39664541 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 2150 het 492 hom 13 1 7 5 T 5 4 83875 CASAVA_Build 14 39666593 2D GGAACTGTGA GT/-- CAATTAAACC 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 GT 1 0 83876 CASAVA_Build 14 39672778 2D TTGTAATGTA TT/-- GTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 T 2 0 83877 CASAVA_Build 14 39698012 1D GTGTTGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 10 9 83878 CASAVA_Build 14 39698797 1D AGAAACACAC T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 108 het 48 0 37 11 T 7 6 83879 CASAVA_Build 14 39705365 1I TAAAATTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 11 12 83880 CASAVA_Build 14 39705847 2D TGGCAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2349 hom 33 8 17 8 A 15 13 83881 CASAVA_Build 14 39710933 4I GCAAAATTAG ----/CTTT CTGAGACCTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CTTT 0 1 83882 CASAVA_Build 14 39711083 1I AGTTTCTTTG -/T AGATACAGCC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 0 1 83883 CASAVA_Build 14 39715029 2D TGTGTATGTG TA/-- TATATATATA 2859 hom 33 het 15 0 12 3 TA 8 7 83884 CASAVA_Build 14 39717321 2D GTTGGGCATC AA/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 3 1 83885 CASAVA_Build 14 39717809 1I TCCAATCTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 9 10 83886 CASAVA_Build 14 39718342 1D TATGAAAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 12 12 7 T 10 9 83887 CASAVA_Build 14 39720280 1I AGTTTTCACC -/T TTTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 5 6 83888 CASAVA_Build 14 39720368 1I AAGCCAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 9 10 83889 CASAVA_Build 14 39732527 2I GTTTGCCATG --/AA AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 8 10 83890 CASAVA_Build 14 39732922 3I CTCAAATGCA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 99 het 50 0 33 17 AAC 5 6 83891 CASAVA_Build 14 39748002 4D GTTTAAAGAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 57 het 27 0 20 8 AAAT 5 4 83892 CASAVA_Build 14 39748628 1D GAAAATCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 11 10 83893 CASAVA_Build 14 39754323 2I ACATAGTGTG --/AC ACTCTATCAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 AC 1 2 83894 CASAVA_Build 14 39760042 1D TTGTATAAGT A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 6 A 7 6 83895 CASAVA_Build 14 39764913 4D AATTATTAAT TATA/---- TATGTATATA 2238 het 2238 ref 14 8 6 1 TA 3 1 83896 CASAVA_Build 14 39798620 1D ACTATCTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 210 hom 27 1 18 8 A 12 11 83897 CASAVA_Build 14 39801759 1D TCCACAAAAA T/- GTTTATTTGG 3070 hom 163 het 57 0 55 2 T 1 0 83898 CASAVA_Build 14 39809791 2I CATGATTGCC --/AA AAAAAAAAAA 2823 het 2823 ref 29 15 9 5 A 11 13 83899 CASAVA_Build 14 39810934 2D TATTTATGGA TG/-- GAATAACATG 3070 het 3070 ref 43 25 12 8 TG 1 0 83900 CASAVA_Build 14 39811172 2I AAATAAATAA --/AT ATATATATAT 3070 het 235 hom 23 3 16 4 AT 7 8 83901 CASAVA_Build 14 39814595 1D TTCCTAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 6 T 12 11 83902 CASAVA_Build 14 39814748 1D TAGGAGCTTT C/- TGGAGGAGTC 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 C 1 0 83903 CASAVA_Build 14 39816889 4D TTCTCTCAGC GTTT/---- GTTTGTCTGA 3070 het 3070 ref 48 29 18 1 GTTT 2 1 83904 CASAVA_Build 14 39820426 1D TATCCAGAAA T/- TAATCAAAAT 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 T 2 1 83905 CASAVA_Build 14 39822102 2D CACATGGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2145 het 852 hom 44 11 6 27 A 13 11 83906 CASAVA_Build 14 39838080 4I AGATACATAT ----/GTCA GTCATCCAAG 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 GTCA 1 2 83907 CASAVA_Build 14 39841893 1I AAAGACAAGG -/A GAAACAGCAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 0 1 83908 CASAVA_Build 14 39852049 4I CTTGGGGAAG ----/TGAC TGACTGGGTA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 TGAC 1 2 83909 CASAVA_Build 14 39853290 1I AGGTGAAAAG -/T TAAGTGAGAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 1 2 83910 CASAVA_Build 14 39854089 3I GTGAAAGAGG ---/AGA AGGAAATAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AGA 0 1 83911 CASAVA_Build 14 39859720 4I GCAGTTGACA ----/TGAT TGATTGATTG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 TGAT 2 3 83912 CASAVA_Build 14 39861645 1D52M1I TATAAAAAAA TGTACACTGAAATAGTTTTTCATAGCAATGTCAAGAAAATTTAAAATGAGGGG-/-GTACACTGAAATAGTTTTTCATAGCAATGTCAAGAAAATTTAAAATGAGGGGA AAAAACCTAT 3070 het 3070 ref 29 24 18 11 N/A 0 0 83913 CASAVA_Build 14 39874492 2D AGGTATGTAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 25 0 20 6 TA 7 6 83914 CASAVA_Build 14 39874532 1D TAACCATCTC T/- TTTTTTTTTT 1517 hom 21 het 20 0 6 14 T 15 14 83915 CASAVA_Build 14 39875948 3D GAGGGTTCTT CTC/--- CTTTTCAGAC 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 CTC 1 0 83916 CASAVA_Build 14 39880614 1I TCTGAATATA -/T TACACACACA 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 T 1 2 83917 CASAVA_Build 14 39880767 6D TTTCTATGTT TATCTG/------ TATATATAAT 2624 het 2624 ref 28 22 7 1 TATCTG 1 0 83918 CASAVA_Build 14 39881642 1I TTAAGTTTTC -/T TTCTCACCTA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 2 3 83919 CASAVA_Build 14 39883169 5D AGCCTTACAC AATTT/----- AATTTAATCA 3070 het 3070 ref 51 22 19 11 AATTT 2 1 83920 CASAVA_Build 14 39886278 4I TATAAATCTT ----/ACTG AGTGTTATCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 ACTG 0 1 83921 CASAVA_Build 14 39893224 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAGAAA 2899 het 2899 ref 23 11 8 4 A 7 6 83922 CASAVA_Build 14 39895756 1I CCCCACCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 A 10 11 83923 CASAVA_Build 14 39897562 1I GTTGAATGAT -/G GGGGCAAATC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 4 5 83924 CASAVA_Build 14 39899804 1D TACTTTTCTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 8 T 8 7 83925 CASAVA_Build 14 39906453 3I20M1D AGGTTCTTAA ---TCTTGGGCTCCTTTTCCATGA/TATTCTTGGGCTCCTTTTCCATG- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 22 12 0 N/A 0 0 83926 CASAVA_Build 14 39910519 1D CGTTGTGAAT A/- AAAAGAGTTA 3070 het 2536 hom 24 7 14 3 A 5 4 83927 CASAVA_Build 14 39914466 2I AGTATGCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 T 14 16 83928 CASAVA_Build 14 39930617 1D GTACTTCCCC G/- CTATCCCCCT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 1 0 83929 CASAVA_Build 14 39933394 1I CTTGAGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2385 hom 31 5 22 4 T 11 12 83930 CASAVA_Build 14 39938565 2D GAGTTGGGAA AG/-- TTTCCAGTAG 3070 het 3070 hom 42 18 19 7 AG 1 0 83931 CASAVA_Build 14 39940377 6D TATATATATA TATATG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TATATG 1 0 83932 CASAVA_Build 14 39942256 1D AGGATCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 521 hom 34 2 14 18 A 15 14 83933 CASAVA_Build 14 39957749 7I TATCAAATTA -------/TTTCTAC TTTCTACTTT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 TTTCTAC 1 2 83934 CASAVA_Build 14 39960157 7D CAATAACTGG TCGGGCC/------- TCGGGCCATT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 TCGGGCC 2 1 83935 CASAVA_Build 14 39961284 4D GCAAACATAA AGAG/---- AGAAAGACTC 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 AG 3 1 83936 CASAVA_Build 14 39965390 1D GGTAGCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 18 18 14 T 14 13 83937 CASAVA_Build 14 39971533 3I TTGATCAGTT ---/CTC CTCAAAACTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTC 1 2 83938 CASAVA_Build 14 39989677 1I CATTTTATTA -/C CAAGCAACTA 3070 hom 160 het 57 0 54 3 C 1 2 83939 CASAVA_Build 14 39990462 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1064 hom 26 7 15 4 A 11 12 83940 CASAVA_Build 14 39997660 4I GTATATATAC ----/ATAT ATATATATAT 1798 het 1798 ref 17 9 5 3 AT 7 9 83941 CASAVA_Build 14 40005169 1I ACATTCTGTC -/A AAAAGGTAAG 3070 het 3070 ref 43 18 21 4 A 4 5 83942 CASAVA_Build 14 40005866 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 9 10 83943 CASAVA_Build 14 40009664 1D TTTTGTTCTG T/- TTTTGTCAAT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 5 4 83944 CASAVA_Build 14 40011552 1I TACAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 22 1 18 3 A 13 14 83945 CASAVA_Build 14 40015051 1I GGTACAAAAA -/G GGGAGGGAAT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 3 4 83946 CASAVA_Build 14 40019236 2D TAACATTTGA GT/-- GATTAAGAAA 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 GT 1 0 83947 CASAVA_Build 14 40021739 1D CTCATGATGG T/- TTTACTGATG 3070 het 3070 hom 47 19 26 2 T 4 3 83948 CASAVA_Build 14 40023832 1I TGTGGCAAAA -/G GTTCAGAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 G 1 2 83949 CASAVA_Build 14 40025637 1D ATAAAATTAC T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 42 11 27 5 T 7 6 83950 CASAVA_Build 14 40025680 1I ATGTGAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 12 17 T 11 12 83951 CASAVA_Build 14 40033152 1D ATGATGGGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 9 8 83952 CASAVA_Build 14 40034685 2I TACACTTATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 TG 6 7 83953 CASAVA_Build 14 40038420 1I AGTGGACTGA -/T CCGCCTAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 0 1 83954 CASAVA_Build 14 40045144 1I TCTGATGTAT -/A AAACTAGCAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 3 4 83955 CASAVA_Build 14 40045314 1I GAAAATATTA -/T TTTTTCCATA 3070 hom 36 het 21 0 13 8 T 5 6 83956 CASAVA_Build 14 40046797 1I TAAATAACTT -/A CAATGAAAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 83957 CASAVA_Build 14 40048444 1D CTTTAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 46 0 41 6 T 11 10 83958 CASAVA_Build 14 40049745 2D TATGCAAAAC AG/-- AATAAAAAAT 3070 hom 138 het 50 0 47 4 AG 1 0 83959 CASAVA_Build 14 40052062 3I CTACCTACAC ---/AAA AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 8 11 83960 CASAVA_Build 14 40059476 8I ATTGTGCAAC --------/TCAATGCT TGTGGTTATG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TCAATGCT 0 1 83961 CASAVA_Build 14 40060145 1D TATTTACGTA G/- CCATTGAGCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 0 83962 CASAVA_Build 14 40061664 1I GTATTCAACA -/G TGTTGTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 0 1 83963 CASAVA_Build 14 40063261 4D AATCTTCTGT TAGA/---- TAGAAAGCTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAGA 2 1 83964 CASAVA_Build 14 40063474 1D TTGGCACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 17 9 T 12 11 83965 CASAVA_Build 14 40066998 1D43M1D GATTACTTTG AGGGAAACAATAAAAACGGCACTGTAAACATGCTTATGCATTTGT/-GGGAAACAATAAAAACGGCACTGTAAACATGCTTATGCATTTG- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 26 0 23 18 N/A 0 0 83966 CASAVA_Build 14 40068079 2I GGTAATACAC --/AG AGTTTCCTCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AG 1 2 83967 CASAVA_Build 14 40068305 1I AAGAGTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 37 3 28 6 T 11 12 83968 CASAVA_Build 14 40072197 1I AAAATAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 22 0 20 5 A 8 9 83969 CASAVA_Build 14 40072518 3I TGGTGCCCCA ---/GAG GAGAAGGAAA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 GAG 1 2 83970 CASAVA_Build 14 40075948 1I AAAAAAAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 9 10 83971 CASAVA_Build 14 40076572 1D ACAGAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 34 1 27 7 A 11 10 83972 CASAVA_Build 14 40078163 1I GTGACTCTTC -/A AAAAAATTGC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 6 7 83973 CASAVA_Build 14 40082481 1D TGACATAAAT A/- AATAGAAAAA 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 A 3 2 83974 CASAVA_Build 14 40088983 1D ATGAGTCCTT A/- GGAAGATTTC 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 A 1 0 83975 CASAVA_Build 14 40094791 1D GTTGAACTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 8 7 83976 CASAVA_Build 14 40102000 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 11 10 83977 CASAVA_Build 14 40106996 1D70M3D TAACAATAGA GGAACTATCTATTTATTTTAATGAAGCAAAGTAGTTGACATCTCTATGCCTGGAAGGAATTTAGGGTAATCCAA/-GAACTATCTATTTATTTTAATGAAGCAAAGTAGTTGACATCTCTATGCCTGGAAGGAATTTAGGGTAATC--- ATTGTATCAC 3070 hom 231 het 52 0 78 2 N/A 0 0 83978 CASAVA_Build 14 40107348 2D CACACACACC CA/-- CACACACACA 1087 het 1087 ref 45 36 3 7 CA 6 5 83979 CASAVA_Build 14 40113210 1D TGAAATGAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 10 9 83980 CASAVA_Build 14 40114356 1I CAGAAGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2973 hom 38 13 18 7 T 12 13 83981 CASAVA_Build 14 40118087 3D CATAAACATC ATT/--- GAGAATTCAA 3070 het 3070 ref 43 22 20 2 ATT 1 0 83982 CASAVA_Build 14 40121113 4D GAAGATTAAA AACT/---- AATAAATATG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AACT 1 0 83983 CASAVA_Build 14 40121233 4D TATCAAAAAC TAAT/---- TATAAGTTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 6 TAAT 1 0 83984 CASAVA_Build 14 40121455 1D GTTCTAGTAC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 A 8 7 83985 CASAVA_Build 14 40129324 1D ATGCAAATTT G/- GTCTTTGTCC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 2 1 83986 CASAVA_Build 14 40132960 4D TATCAGTAAC AGTG/---- GGACAGCACA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 AGTG 1 0 83987 CASAVA_Build 14 40134875 4I CAGTTTCCTC ----/ACTT ACAACATGAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ACTT 0 1 83988 CASAVA_Build 14 40136479 1I TTGGTGTCCG -/T TTTTTTAATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 6 7 83989 CASAVA_Build 14 40138472 4D AAAATTTCTC CTAT/---- CTAACTGAAA 3070 het 3070 hom 26 13 13 1 CTAT 1 0 83990 CASAVA_Build 14 40146451 9D TGAGAAGTGT CTGTTCATA/--------- CTGTTCATAT 3070 hom 24 het 9 0 9 1 CTGTTCATA 2 1 83991 CASAVA_Build 14 40146814 1D CTTCAGTTAA T/- TTTTTTATGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 7 6 83992 CASAVA_Build 14 40150900 4D CTCCTTTATC AATT/---- AAGAAAGGAT 3070 het 3070 hom 43 13 27 5 AATT 1 0 83993 CASAVA_Build 14 40153792 2D TTTAAACTAT AA/-- AGAGTATCTG 3070 hom 132 het 51 0 45 7 A 3 1 83994 CASAVA_Build 14 40155211 3D GCCATTTCTC TTA/--- TTATGTTCTA 2827 het 2827 ref 23 11 8 6 TTA 2 1 83995 CASAVA_Build 14 40156292 13D CGCTAGTATT TAATTTACTTACA/------------- AATTTACTTA 3070 het 3070 hom 40 15 24 5 TAATTTACTTACA 1 0 83996 CASAVA_Build 14 40158055 1D GCTGTTTTAA T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 T 7 6 83997 CASAVA_Build 14 40158461 4D ATAGGGAGAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 TTTA 4 3 83998 CASAVA_Build 14 40160131 1D GTCACTTTCA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 8 7 83999 CASAVA_Build 14 40165351 1I TAATTTACTT -/C CAAAATGATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 2 84000 CASAVA_Build 14 40173484 1I TTCTTAAGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 10 84001 CASAVA_Build 14 40175096 4D TATAGTGTCT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 162 het 66 0 51 16 AG 10 8 84002 CASAVA_Build 14 40178196 3I TAAGAAAAAT ---/AAG AACACATTAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAG 0 1 84003 CASAVA_Build 14 40187123 4D AGTGGAAGTG TTAA/---- TTGTTTGGAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TTAA 1 0 84004 CASAVA_Build 14 40199298 4D TAATATAGAA ATTG/---- ATTATTTATT 3070 het 3070 hom 33 15 18 0 ATTG 1 0 84005 CASAVA_Build 14 40199623 1I TATTTGTTAC -/T TGCCTTTACT 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 T 1 2 84006 CASAVA_Build 14 40204485 1D ATCTTTTTCA T/- GTTCATATTC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 1 0 84007 CASAVA_Build 14 40208568 1I GTTATCAGAT -/C CCCCTTCTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 4 5 84008 CASAVA_Build 14 40225236 1I AAATAACAAT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 7 8 84009 CASAVA_Build 14 40226979 3D TCATGGTGAA AAC/--- AACCTAAGTG 3070 het 3070 hom 49 18 30 4 AAC 2 1 84010 CASAVA_Build 14 40229679 2I ATAAGAGGTC --/TA TGACCTTTTA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 TA 0 1 84011 CASAVA_Build 14 40236989 1I TCCACAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 10 11 84012 CASAVA_Build 14 40244553 1D TTGGATGGGG A/- CACAGAGACA 3070 het 3070 ref 36 25 9 3 A 1 0 84013 CASAVA_Build 14 40245578 4D ATTTGGCTTC ATAT/---- ATATATATAT 2472 hom 23 het 13 0 7 6 AT 11 9 84014 CASAVA_Build 14 40247888 1I ATCCCACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 A 10 11 84015 CASAVA_Build 14 40252389 2I AATGGGTGTG --/TA TATATATATC 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 TA 4 5 84016 CASAVA_Build 14 40262799 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 26 11 2 A 9 10 84017 CASAVA_Build 14 40269480 1D TAGAGTTCTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 31 0 24 7 A 9 8 84018 CASAVA_Build 14 40270443 1I GAGGCACCCC -/A AAGAGCACTG 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 2 3 84019 CASAVA_Build 14 40272093 3D ATAGATACTT CTC/--- CTAGTCTATT 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 CTC 1 0 84020 CASAVA_Build 14 40288896 1D TTTGCTACAG C/- TTGCCTGGTA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 C 1 0 84021 CASAVA_Build 14 40294033 2D GTTAGCTTAA TG/-- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TG 1 0 84022 CASAVA_Build 14 40295440 7D TCTTAGCCCA GTTCTGT/------- GCCCTTGCTG 3070 het 3070 hom 49 22 24 4 GTTCTGT 1 0 84023 CASAVA_Build 14 40315836 2D CTAGAATTTT TA/-- TAGTTTCAAG 3070 het 3070 ref 34 15 15 6 TA 2 1 84024 CASAVA_Build 14 40316441 1I TTCCTAAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 13 12 11 T 9 10 84025 CASAVA_Build 14 40321752 1D GATCTGCATG T/- TTTTATGGTA 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 T 5 4 84026 CASAVA_Build 14 40321822 3D AGAGAGAAAC TTT/--- TACTTTCAAT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 4 1 84027 CASAVA_Build 14 40325417 1D TGTCCTGTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 70 hom 34 2 26 6 T 10 9 84028 CASAVA_Build 14 40325590 11D GAGATTAACC TATACATATTT/----------- TATACATATT 3070 hom 87 het 36 0 30 9 TATACATATTT 2 1 84029 CASAVA_Build 14 40326371 1D TTAAATGTGT G/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 G 1 0 84030 CASAVA_Build 14 40330158 4D ATTATATATA TTTG/---- TTTATTTCAT 3070 het 3070 hom 28 10 16 4 TTTG 1 0 84031 CASAVA_Build 14 40339991 3D TTCCATACAT CTC/--- CTGAAATCTA 2908 het 2908 ref 32 19 7 7 CTC 1 0 84032 CASAVA_Build 14 40341838 4I AACACAAATA ----/CCTT CCTTATTAGG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 CCTT 1 2 84033 CASAVA_Build 14 40345469 1D TATTTAAATG C/- ACTACTTGCT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 C 1 0 84034 CASAVA_Build 14 40351360 1D AAAACCCAAA C/- CAGAAATGGT 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 C 2 1 84035 CASAVA_Build 14 40355630 1I TTCTTACACT -/A AAGCTTTCTC 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 A 2 3 84036 CASAVA_Build 14 40358547 1I AAATTGTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 11 12 84037 CASAVA_Build 14 40361224 1D AAGATACAAC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 41 16 18 7 A 8 7 84038 CASAVA_Build 14 40369431 2I AATTAGTTTT --/TA TATATATATA 3070 het 1789 hom 14 5 8 1 TA 6 7 84039 CASAVA_Build 14 40371273 1D CATGATTTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 53 30 18 5 T 9 8 84040 CASAVA_Build 14 40371698 4I CCTGAACCTA ----/CAGT CAAACTTATG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 CAGT 0 1 84041 CASAVA_Build 14 40372861 2D ATATACACAG TA/-- TATATATATA 3070 het 2028 hom 28 7 16 5 TA 8 7 84042 CASAVA_Build 14 40374197 3D TGGGAAAAAT AAC/--- TTTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 AAC 1 0 84043 CASAVA_Build 14 40375234 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 10 11 84044 CASAVA_Build 14 40376721 1D GGACCATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 A 12 11 84045 CASAVA_Build 14 40383301 14I TATATATACA --------------/TATATATATACACG TATATATATG 2059 hom 12 het 5 0 5 0 TATATATATACACG 0 1 84046 CASAVA_Build 14 40385422 1D AATTTCCTGT C/- CTATGGAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 C 2 1 84047 CASAVA_Build 14 40388131 1D GTATTCTGCC T/- TTCAATGCTG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 3 2 84048 CASAVA_Build 14 40390798 4D CTGAAGAGAA AAAG/---- AAAAACAGTT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 AAAG 1 0 84049 CASAVA_Build 14 40392352 1I GTATAGGAAT -/A AAAATAGATT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 4 5 84050 CASAVA_Build 14 40398732 16D ATGCACCATG GCCACAGAGGTTTCCA/---------------- GCCAGAAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 15 7 GCCACAGAGGTTTCCA 1 0 84051 CASAVA_Build 14 40400594 1I AAGCAGGGAA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 7 8 84052 CASAVA_Build 14 40401751 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 736 hom 23 5 15 3 A 15 14 84053 CASAVA_Build 14 40404844 4D TATGTTTATG TATA/---- TATATATATA 2970 het 339 hom 17 3 7 10 TA 7 5 84054 CASAVA_Build 14 40405033 1D AATTTAGGGC T/- ATTTAGCTGA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 1 0 84055 CASAVA_Build 14 40405854 2I AATATCTGTG --/AC TGTGTAATTT 3070 het 2185 hom 19 5 12 2 AC 0 1 84056 CASAVA_Build 14 40405917 6D ATATATGTTT TATATA/------ TATATATATA 2233 het 268 hom 10 1 5 4 TA 11 8 84057 CASAVA_Build 14 40406489 2I ATTCACAAAC --/TG TGTATGTGAC 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 TG 1 2 84058 CASAVA_Build 14 40406907 1I ATATTATTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 9 10 84059 CASAVA_Build 14 40408336 1I ATCTTCCTTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 7 8 84060 CASAVA_Build 14 40409177 5D TACAGAAAAA TAATT/----- TAATTTGGTG 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 TAATT 2 1 84061 CASAVA_Build 14 40410178 2I AGTAGCCATT --/GG GGAGGTACTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 G 2 4 84062 CASAVA_Build 14 40413788 1I ACGGGCTTGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 8 9 84063 CASAVA_Build 14 40413870 8D GTTCATGTAT AGACAAAA/-------- TACATGAACA 3070 het 3070 ref 36 24 13 2 AGACAAAA 1 0 84064 CASAVA_Build 14 40419470 1D AATTGATATT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 57 het 34 0 20 14 A 8 7 84065 CASAVA_Build 14 40419519 5D AGTTTCTTGT TGTTG/----- TTTTTTTTTT 2972 het 2972 ref 28 11 10 7 TGTTG 1 0 84066 CASAVA_Build 14 40426609 1I AATAGCCAAT -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 6 7 84067 CASAVA_Build 14 40429056 2D GGATCCACTT TA/-- TGTCAGTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TA 1 0 84068 CASAVA_Build 14 40429172 2D TTCTGGGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2841 hom 25 9 12 4 A 13 11 84069 CASAVA_Build 14 40453176 1D ATTTCTATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 23 hom 49 1 42 6 T 10 9 84070 CASAVA_Build 14 40453814 4I GGACTGAATG ----/TACT TGGGTAGTTA 3070 hom 83 het 34 0 24 10 TACT 0 1 84071 CASAVA_Build 14 40461505 4D TTTACAAGTA ATAG/---- ATAGCTATAT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 ATAG 2 1 84072 CASAVA_Build 14 40461900 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 736 hom 18 5 12 1 T 10 9 84073 CASAVA_Build 14 40475331 1I GACATATGTA -/T TGTATATTCA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 1 2 84074 CASAVA_Build 14 40477478 4I TATGTATATT ----/TCTA TCTATCTACC 3070 hom 117 het 50 0 40 10 TCTA 2 3 84075 CASAVA_Build 14 40481969 1I TTGTTGTTTC -/A AAAAGAACTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 4 5 84076 CASAVA_Build 14 40483596 1D AACCCTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 30 0 21 9 T 12 11 84077 CASAVA_Build 14 40501324 4D AATTATTATC AGAT/---- AGAGAAATAA 3070 hom 87 het 32 0 30 6 AGAT 1 0 84078 CASAVA_Build 14 40503270 1D TATCATAGGT A/- AAAATGCCAT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 5 4 84079 CASAVA_Build 14 40504166 1I TCAATCAAGC -/A AAACGTTTTC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 3 4 84080 CASAVA_Build 14 40506687 1D CGAAACTTCC T/- TTTTTTTTTT 2558 het 2558 ref 40 30 6 4 T 12 11 84081 CASAVA_Build 14 40508756 1I CTGATTATTG -/T TACATATACT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 2 84082 CASAVA_Build 14 40509991 1D TATGTTCTGC T/- TTTATTTGTC 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 4 3 84083 CASAVA_Build 14 40511555 1I AGATAATCCA -/C AACTAACTAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 C 0 1 84084 CASAVA_Build 14 40517051 1D AATAACGTGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 9 8 84085 CASAVA_Build 14 40528663 1D ATTTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 13 12 84086 CASAVA_Build 14 40530669 10I CTGGCGTGAG ----------/ATAGTATCTC AATGTGGTTT 3070 hom 36 het 13 0 11 2 ATAGTATCTC 0 1 84087 CASAVA_Build 14 40534346 1I GTAGCAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 33 2 25 6 T 10 11 84088 CASAVA_Build 14 40548754 1D TCTGTTTTAT C/- CTTGAATTTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 C 2 1 84089 CASAVA_Build 14 40586711 1I ATTGGAAGAG -/A AGTAGAATCA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 1 2 84090 CASAVA_Build 14 40587088 5I TTCCTTACTC -----/TACTT CGTCTTCTCA 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 TACTT 0 1 84091 CASAVA_Build 14 40587876 1D CAAATGTTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 8 7 84092 CASAVA_Build 14 40588153 1D GTGGAAAACT G/- AGCTGACTAC 3070 het 3070 ref 28 13 14 1 G 1 0 84093 CASAVA_Build 14 40589780 1D AATGGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 A 12 11 84094 CASAVA_Build 14 40591129 4D ACTATTCAGA TAAT/---- TAATTAGATG 3070 het 3070 ref 35 16 19 0 TAAT 2 1 84095 CASAVA_Build 14 40592658 1I ACTTCTGACC -/T TCCAGAATTG 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 T 1 2 84096 CASAVA_Build 14 40592742 1I AGAAACTAAT -/A CACATACCGT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 A 0 1 84097 CASAVA_Build 14 40593108 1D CGTATCCACA T/- TTCATTTGTA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 T 3 2 84098 CASAVA_Build 14 40596831 1D45M1I ACTTAGCATG TTTATAAGGTTCATCCATGTTGTAGCATATGTCAGAATTTCATGTC-/-TTATAAGGTTCATCCATGTTGTAGCATATGTCAGAATTTCATGTCT TTTTAAGGCT 3070 het 3070 ref 39 32 18 12 N/A 0 0 84099 CASAVA_Build 14 40607423 1D TTCAGAAACA C/- CTCACTGAGA 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 C 2 1 84100 CASAVA_Build 14 40610311 4I ATGCAAATGA ----/TGAC TAAGTACAGA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 TGAC 0 1 84101 CASAVA_Build 14 40611101 1D GTACGTGTGA T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 2 1 84102 CASAVA_Build 14 40613126 1D TGAAAAAAAA T/- ATCAGCCTTT 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 T 1 0 84103 CASAVA_Build 14 40613880 1I AACCGGCAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 8 9 84104 CASAVA_Build 14 40615071 1D AAAGTTAACT A/- AAGATGAGAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 3 2 84105 CASAVA_Build 14 40617614 1D ATTTTTACAT A/- AAAAACTTTA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 A 6 5 84106 CASAVA_Build 14 40619097 2D TACAAAACTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TA 6 5 84107 CASAVA_Build 14 40619223 2D TATATGTATA TG/-- TATGTGTGTG 3070 het 188 hom 31 2 20 9 TG 1 0 84108 CASAVA_Build 14 40619435 5I TTATATGAGT -----/ATGAC ATGCCATAAA 3070 het 3070 ref 55 25 23 7 ATGAC 0 1 84109 CASAVA_Build 14 40620983 5D ATAACAACTT AAGAA/----- AAGAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 AAGAA 2 1 84110 CASAVA_Build 14 40628833 1D TTTTAAAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 6 T 10 9 84111 CASAVA_Build 14 40629148 3D ACAGACAAGC AGA/--- GAGCCAAATC 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 AGA 1 0 84112 CASAVA_Build 14 40635849 1D GGCTCCTTTA T/- TTTTTTCAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 7 6 84113 CASAVA_Build 14 40640789 1D TGCTGACTTC A/- AAAATCACTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 5 4 84114 CASAVA_Build 14 40642788 2I CTGATTACTC --/TG TAGATAGTTT 3070 het 3070 hom 38 13 24 1 TG 0 1 84115 CASAVA_Build 14 40645235 1D AATTTTGACC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 10 9 84116 CASAVA_Build 14 40649102 4I ATATTCACAG ----/AAGT AAGATGTAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AAGT 0 1 84117 CASAVA_Build 14 40649950 1D AAATTAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 13 4 A 11 10 84118 CASAVA_Build 14 40650527 2I TATCAAAAAC --/TG TATTAATCAG 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 TG 0 1 84119 CASAVA_Build 14 40651995 1I CTCAGCCCAC -/A AAAGTAGACC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 3 4 84120 CASAVA_Build 14 40654267 11D ACATATTATG CATAGAAAGTA/----------- CATACTGCAA 3070 het 3070 ref 40 24 18 4 CATAGAAAGTA 1 0 84121 CASAVA_Build 14 40656956 11D TTCTTGTTTG ACATGATCTTA/----------- TATATGACAT 3070 het 3070 ref 35 18 17 2 ACATGATCTTA 1 0 84122 CASAVA_Build 14 40662810 4I TCTGTTTAAC ----/TCTT TCTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 TCTT 0 1 84123 CASAVA_Build 14 40664354 2I GTCTAAATAG --/AA AAACTGAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 3 5 84124 CASAVA_Build 14 40665726 1D ACATTGTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 10 9 84125 CASAVA_Build 14 40671347 21I TTATAGATTC ---------------------/TTTATTTAGTTTCTTGCTTGT TATTTAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 TTTATTTAGTTTCTTGCTTGT 0 1 84126 CASAVA_Build 14 40682102 4D22M4D7M2I ATAGTATATG TATATATACACTGTGTGTGTATATATAGAGAGTGTAC--/----TATACACTGTGTGTGTATATAT----AGTGTACAT ATATATATAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 N/A 0 0 84127 CASAVA_Build 14 40683063 1I ATTTTCCATT -/A TTTTTTGGGG 3070 hom 33 het 13 0 11 2 A 0 1 84128 CASAVA_Build 14 40685888 1I TCTAATTGTT -/A CAGGAAGTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 0 1 84129 CASAVA_Build 14 40690001 1I ATGTCTTGGG -/A AAAAAAAAAA 2653 het 437 hom 12 1 8 3 A 12 13 84130 CASAVA_Build 14 40699214 1I CTTTAAGTAT -/A AAAAAAAAAG 2822 hom 15 het 7 0 6 1 A 9 10 84131 CASAVA_Build 14 40701586 2I AAAGTATGAC --/TT TGGGCAATAA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 1 3 84132 CASAVA_Build 14 40715753 3I AACATAAGAT ---/CTA CTGCTGACAA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 CTA 0 1 84133 CASAVA_Build 14 40747864 6I AAAGCAAAAG ------/CAAAAT CAAAATCAAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 CAAAAT 2 3 84134 CASAVA_Build 14 40771716 1I CTAAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 14 10 T 11 12 84135 CASAVA_Build 14 40772740 1D AACAAACAAA C/- AAAAAATACA 3070 hom 60 het 21 0 21 1 C 1 0 84136 CASAVA_Build 14 40778094 2D GGCTCCTGAG GA/-- GAATCAACAT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 GA 2 1 84137 CASAVA_Build 14 40782121 4D TATGAATACA ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 45 het 22 0 14 8 ATTT 6 5 84138 CASAVA_Build 14 40782449 1D TATTGATTGA T/- TTTTTGAATG 3070 hom 106 het 41 0 36 5 T 6 5 84139 CASAVA_Build 14 40782595 5D TGATCTGTGG TTTTC/----- TTTTCTTGTG 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 TTTTC 2 1 84140 CASAVA_Build 14 40784064 1I GGAAGTAGAG -/T GAAGGATAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 0 1 84141 CASAVA_Build 14 40785464 2D CTAAAGAAAG CT/-- CTTTTACTTT 3070 hom 126 het 46 0 42 6 CT 2 1 84142 CASAVA_Build 14 40786454 1D TCCCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 11 10 84143 CASAVA_Build 14 40787991 3D AATTACTAGG ATT/--- ATTAACATAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 ATT 2 1 84144 CASAVA_Build 14 40788570 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 22 1 20 1 A 13 12 84145 CASAVA_Build 14 40790295 1D AATCTGCATA C/- CCACTTCTAT 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 C 3 2 84146 CASAVA_Build 14 40801187 1D AAAAGCAAGT A/- AAATTAGTTT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 4 3 84147 CASAVA_Build 14 40801313 28I CAATTATTAG ----------------------------/ATATTATTATTTTAGAATCATAATTATC ATTTTTTTTG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ATATTATTATTTTAGAATCATAATTATC 0 1 84148 CASAVA_Build 14 40803156 1D GCTCCACAAG T/- CATTTTATTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 1 0 84149 CASAVA_Build 14 40804060 1I TTCATTCTGT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 7 8 84150 CASAVA_Build 14 40809420 4I CTGTATACAG ----/AGTA AGTGTTCCAA 3070 hom 148 het 57 0 50 7 AGTA 0 1 84151 CASAVA_Build 14 40810665 3D CCACACCATC ATT/--- GATTCTTACT 3070 het 3070 hom 26 10 14 4 ATT 1 0 84152 CASAVA_Build 14 40811049 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 24 0 17 7 A 11 10 84153 CASAVA_Build 14 40811103 13D AACTTGCAAA GGATATGGGTGGG/------------- GCACAAATGC 3070 het 3070 ref 25 16 8 5 GGATATGGGTGGG 1 0 84154 CASAVA_Build 14 40813030 1I CCCTAAGGTA -/T ACAAGGAGAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 0 1 84155 CASAVA_Build 14 40813418 1I AGGCTCACTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 9 84156 CASAVA_Build 14 40816884 1I TCTGCCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 32 1 22 9 T 10 11 84157 CASAVA_Build 14 40817105 1I GAATAAAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 9 10 84158 CASAVA_Build 14 40818928 2D GATGACATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 102 hom 23 2 18 4 TA 7 6 84159 CASAVA_Build 14 40819975 5I GAAAATTCAT -----/ATAAA TAGAGAGTCC 3070 hom 111 het 46 0 37 9 ATAAA 0 1 84160 CASAVA_Build 14 40831317 1D AAATCTAAAG A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 8 7 84161 CASAVA_Build 14 40833985 2I CTTAGTAGAG --/TT TTAAAGTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 4 84162 CASAVA_Build 14 40834631 4I AAAGAAAAAT ----/AAAC AAAGTGGTAA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AAAC 0 1 84163 CASAVA_Build 14 40839994 1I ATATTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 10 11 84164 CASAVA_Build 14 40855107 3D TTGAGATAAA TCT/--- TCTGGCACAC 3070 het 3070 ref 54 31 21 5 TCT 2 1 84165 CASAVA_Build 14 40858724 4D TATTTTTCTT TAAC/---- TAAATAATAG 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 TAAC 1 0 84166 CASAVA_Build 14 40860371 1D CTATGAAACC A/- GGCCTGAAGG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 1 0 84167 CASAVA_Build 14 40865933 5D TTGGCTGTTA GTCTG/----- TCTGGTCCTG 2863 het 2863 ref 25 18 6 1 GTCTG 1 0 84168 CASAVA_Build 14 40869997 1I TTGCAATATG -/A AAAAAAAAAA 2717 het 2717 ref 26 12 7 7 A 11 12 84169 CASAVA_Build 14 40872598 4D TTACACATAT ATAA/---- ATACGTATGT 3070 het 3070 hom 30 10 17 5 ATAA 1 0 84170 CASAVA_Build 14 40872851 4I GACTCATAAT ----/AAAG AGTGTGTTTA 3070 hom 70 het 30 0 24 6 AAAG 0 1 84171 CASAVA_Build 14 40881345 1I AGTAATGGGA -/T TTGCTGGGCC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 2 3 84172 CASAVA_Build 14 40883884 2I GACAACAATA --/TC TCTGTCAGGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TC 1 2 84173 CASAVA_Build 14 40884740 1I AACATTCAAA -/G CACTTAATGT 3070 hom 151 het 52 0 51 1 G 0 1 84174 CASAVA_Build 14 40887121 1I GAAAATGCTA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 7 8 84175 CASAVA_Build 14 40890026 4D ACTAAAAAAT ACAA/---- ACAAATAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 5 ACAA 2 1 84176 CASAVA_Build 14 40896867 4D TATCTTAACT TTAA/---- TTATCTGTCC 3070 het 3070 hom 28 7 16 7 TTAA 1 0 84177 CASAVA_Build 14 40897119 1I TGCTCACCAA -/C ATAAAAGTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 0 1 84178 CASAVA_Build 14 40897210 1I ATTACAGGTT -/A GGGGTGATTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 0 1 84179 CASAVA_Build 14 40910204 1I TATCTGTCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 T 8 9 84180 CASAVA_Build 14 40919564 1D TTCTTTTTTT G/- TTACATGGAT 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 G 1 0 84181 CASAVA_Build 14 40925805 1I TTAAATTGTC -/T TTTGATAGAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 3 4 84182 CASAVA_Build 14 40930625 1D ATTCCTCGGT A/- AAAAAACATA 3070 hom 101 het 42 0 34 8 A 7 6 84183 CASAVA_Build 14 40931034 5D ACCCATTCTC AACTT/----- AACAGTTTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 7 AACTT 1 0 84184 CASAVA_Build 14 40941675 1I AGTGATTAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 8 9 84185 CASAVA_Build 14 40941946 3I AAATATGTTC ---/TTA TTATTAATTA 3070 hom 76 het 31 0 26 5 TTA 2 3 84186 CASAVA_Build 14 40943951 1D TTAAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 0 84187 CASAVA_Build 14 40952138 2I AAATTGCTTA --/TT TTTTTTTATC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 7 9 84188 CASAVA_Build 14 40955268 1I GAGCTGGATG -/A AAGCCTCAAG 1280 het 1280 ref 44 35 3 6 A 2 3 84189 CASAVA_Build 14 40961848 1I GCCTTGGCCT -/C CCAAAGTGCT 3070 hom 101 het 35 0 32 3 C 2 3 84190 CASAVA_Build 14 40964547 1D TTCTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 13 12 84191 CASAVA_Build 14 40972916 2D TTAAAAATAT TG/-- TGTTAAAAGT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TG 2 1 84192 CASAVA_Build 14 40975024 1I AAAATGCATT -/G GGAAACATTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 2 3 84193 CASAVA_Build 14 40975656 2D CAACCTAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 12 10 84194 CASAVA_Build 14 40987483 1D TAACATTTGC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 337 hom 44 1 36 7 A 1 0 84195 CASAVA_Build 14 40989481 1D TTTTTTTTTG T/- TTTGTTTTGT 3070 hom 50 het 32 0 25 7 T 4 3 84196 CASAVA_Build 14 41007421 1D TATTTTTGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 84197 CASAVA_Build 14 41011690 1I TTTTTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1921 hom 26 5 15 6 A 12 13 84198 CASAVA_Build 14 41014665 1I CCTTTATATA -/T TTTCCAGTTT 3070 het 136 hom 31 1 24 6 T 3 4 84199 CASAVA_Build 14 41022392 1I ACTTAATCTT -/C TTATATTTGT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 C 0 1 84200 CASAVA_Build 14 41032834 1D AAATGCAAAA G/- AACTGAAATC 3070 het 2309 hom 16 6 9 2 G 1 0 84201 CASAVA_Build 14 41037260 2I GACATTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 499 hom 43 2 25 16 T 11 13 84202 CASAVA_Build 14 41038183 1I ATGTTATAAG -/A ATTAAATTTC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 1 2 84203 CASAVA_Build 14 41038275 1D GCTCCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 39 1 35 3 A 11 10 84204 CASAVA_Build 14 41040019 5D TGGAAAATGA CTGAG/----- CTTTGAAATG 3070 hom 129 het 45 0 44 3 CTGAG 1 0 84205 CASAVA_Build 14 41047175 1D GAAGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 22 0 13 9 T 13 12 84206 CASAVA_Build 14 41048337 1I AAGTGCTATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 9 10 84207 CASAVA_Build 14 41054849 1I CCCAAGCCAA -/G CCATCCCAGC 3070 hom 99 het 34 0 33 1 G 0 1 84208 CASAVA_Build 14 41061870 1I ATTGTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 276 hom 33 1 25 7 T 11 12 84209 CASAVA_Build 14 41146258 1D GTTATATCAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 2776 hom 23 10 11 2 A 9 8 84210 CASAVA_Build 14 41149730 1D ATCTTCTCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 9 8 84211 CASAVA_Build 14 41158007 4I TAGGAGTAAT ----/GCTA TTCACCTAAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 GCTA 0 1 84212 CASAVA_Build 14 41159930 1I ATACATTAAT -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 6 7 84213 CASAVA_Build 14 41164220 4D TGGGTTCATC TGGA/---- TGGAGATAAT 3070 het 3070 ref 25 12 11 3 TGGA 2 1 84214 CASAVA_Build 14 41165672 1I AAAAATACCA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 T 6 7 84215 CASAVA_Build 14 41182665 2D ATAAACACAC CA/-- CACACACACA 1218 het 1218 ref 45 33 3 10 CA 10 9 84216 CASAVA_Build 14 41184481 1I ACATTTTAAG -/T TCTCAAACTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 1 2 84217 CASAVA_Build 14 41189220 6D ACACACACAC AAAAAA/------ AAAAAAGATA 741 het 741 ref 22 7 7 12 A 12 6 84218 CASAVA_Build 14 41208892 1I ATAGTTAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 8 9 84219 CASAVA_Build 14 41208939 1I AAATATAGTT -/A AAAAATATAG 2431 het 2431 ref 25 15 6 4 A 5 6 84220 CASAVA_Build 14 41211677 13D ATCCTTACCC TGGGATTTGTGGA/------------- TGGGTTTCAA 3070 het 3070 ref 35 22 14 5 TGGGATTTGTGGA 1 0 84221 CASAVA_Build 14 41218014 2D TTTACACCAG CT/-- CTCTAGCCAG 3070 hom 150 het 51 0 46 6 CT 3 2 84222 CASAVA_Build 14 41228051 3D CCATCTCTAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 40 15 21 6 AAT 4 3 84223 CASAVA_Build 14 41241415 4D TGGTGAAGGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 20 15 6 TTTG 3 2 84224 CASAVA_Build 14 41244140 1D ATGCAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 10 9 84225 CASAVA_Build 14 41244794 2D23M2D TATCCCTCAA ACACACCCACACCCCTCACTTACACAT/--ACACCCACACCCCTCACTTACAC-- GTGTTATCAC 3070 het 3070 ref 51 33 26 5 N/A 0 0 84226 CASAVA_Build 14 41247672 1I GCTGAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 11 12 84227 CASAVA_Build 14 41247933 1D TTGAGCATTA T/- TTGAGAGTCA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 3 2 84228 CASAVA_Build 14 41248036 13D AAAACTCGTA CCAACTGTTTCTT/------------- CCACTTAGGC 3070 het 3070 hom 52 25 29 1 CCAACTGTTTCTT 1 0 84229 CASAVA_Build 14 41249844 9I GTCCTTGCGA ---------/CAGTTTGCT CAGAATGATG 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 CAGTTTGCT 0 1 84230 CASAVA_Build 14 41249935 15I GGTGTATATG ---------------/TGCCATATTTTTAAA TGCTGATGCA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 TGCCATATTTTTAAA 0 1 84231 CASAVA_Build 14 41251256 1I GGCTTACACC -/T TATAATCCCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 2 84232 CASAVA_Build 14 41264504 3D TAATTCCATA GTT/--- GTTGTACCAT 3070 hom 148 het 53 0 50 4 GTT 2 1 84233 CASAVA_Build 14 41271894 3D CAGAAAAGAA AAG/--- AAAAAAATTC 3070 hom 84 het 30 0 29 5 AAG 1 0 84234 CASAVA_Build 14 41281646 10I AACAAGAGCC ----------/AGAAGAGTCA AGAAGAGCCA 3070 hom 108 het 45 0 36 10 AGAAGAGTCA 0 1 84235 CASAVA_Build 14 41288160 1D CAATACATGA G/- CGTTGAGAGA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 G 1 0 84236 CASAVA_Build 14 41292114 7I CTGTTTTGGT -------/TACTGGG TACTGTAGCC 1341 hom 10 het 4 0 4 0 TACTGGG 0 1 84237 CASAVA_Build 14 41304309 2D AAAAAGGAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 26 3 15 9 A 18 16 84238 CASAVA_Build 14 41326465 1I TTTTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 10 11 84239 CASAVA_Build 14 41327328 1D TCTTTTCTGG T/- TTTTTGTCCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 5 84240 CASAVA_Build 14 41327508 1I AATTATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 34 2 29 3 A 10 11 84241 CASAVA_Build 14 41328860 1I TTATGAGTGA -/T TTTTCCTGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 5 84242 CASAVA_Build 14 41329531 1D GCTAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 30 1 22 7 T 12 11 84243 CASAVA_Build 14 41329728 3I ACCATGGTCT ---/TTA TTATTCCAGA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 TTA 1 2 84244 CASAVA_Build 14 41333965 2D AATTATGCAT AC/-- ACACATATGT 3070 hom 54 het 20 0 19 3 AC 3 2 84245 CASAVA_Build 14 41334878 1I TAAAGTATAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 9 10 84246 CASAVA_Build 14 41339731 1I TACCCTGGAG -/A AAAAAAAAAA 2103 het 2103 ref 36 22 6 8 A 10 11 84247 CASAVA_Build 14 41349885 1I ATGGTTGTGG -/T TTTTTTTATG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 7 8 84248 CASAVA_Build 14 41353049 1D AAAATTTTTC T/- TCCATTCTGT 3070 het 88 hom 27 1 25 1 T 2 1 84249 CASAVA_Build 14 41358913 1I GGGTTATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 T 11 12 84250 CASAVA_Build 14 41359160 1I AATCCCAGAG -/T TTTTTTTTCT 2838 het 2838 ref 29 12 9 8 T 8 9 84251 CASAVA_Build 14 41410541 1D AAAATCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 28 2 20 6 A 13 12 84252 CASAVA_Build 14 41416989 3D TTAGAGGCTC AAT/--- AATAATATTA 3070 hom 101 het 39 0 34 5 AAT 3 2 84253 CASAVA_Build 14 41418724 1I GTAATTTGCA -/T TTTTTCAATG 3070 hom 64 het 25 0 22 3 T 5 6 84254 CASAVA_Build 14 41422314 1I AAAATGCAAT -/A AAAATATTGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 4 5 84255 CASAVA_Build 14 41427956 2I ATGTATACAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AT 5 6 84256 CASAVA_Build 14 41428064 4I TATATATATG ----/TCTC TCTCTATATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TC 2 4 84257 CASAVA_Build 14 41432323 1I TCTATAAACA -/G GTTACCATCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 2 84258 CASAVA_Build 14 41455984 1I TTCCATCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 28 1 19 8 T 13 14 84259 CASAVA_Build 14 41456240 2D TCTCTTTGCC TT/-- TGGTTTTCAG 3070 hom 99 het 35 0 34 3 T 3 1 84260 CASAVA_Build 14 41458452 4I AAAGAATGCA ----/TTAT TTATCTATAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TTAT 1 2 84261 CASAVA_Build 14 41463050 4D ATAAGCATAG TAGA/---- TAGATGAAGT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 TAGA 2 1 84262 CASAVA_Build 14 41472144 1I GACAAGAAAA -/C CGTTTTCTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 2 84263 CASAVA_Build 14 41483871 1I TTAGTTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 39 1 34 4 T 12 13 84264 CASAVA_Build 14 41485170 16I TTTTAAAAGA ----------------/CAAGGTCTCACTCTGT CTCCAAGGCT 3070 hom 36 het 14 0 13 3 CAAGGTCTCACTCTGT 0 1 84265 CASAVA_Build 14 41491251 1I TATATAAAGC -/T TTTTTTATTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 6 7 84266 CASAVA_Build 14 41493978 1D GTGTAAAGAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 32 20 10 3 A 7 6 84267 CASAVA_Build 14 41516940 2I TGTTTTTCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 31 0 24 7 T 12 14 84268 CASAVA_Build 14 41525599 1D TTGTAAAACG A/- AAAAAAAAAA 1384 het 1384 ref 30 22 3 6 A 12 11 84269 CASAVA_Build 14 41560867 1D ATCCTGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 31 0 26 6 T 14 13 84270 CASAVA_Build 14 41563807 1I GCTTGGACTC -/T TGACATAGTT 3070 hom 98 het 37 0 31 6 T 1 2 84271 CASAVA_Build 14 41572218 1I CAGTGATGCC -/T TTTTAAAGGA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 4 5 84272 CASAVA_Build 14 41581668 1D CCTTTTATCA T/- TTATACAATA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 3 2 84273 CASAVA_Build 14 41586082 1D TTAAGGAATT G/- GCGTTCAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 2 1 84274 CASAVA_Build 14 41589885 1D ACTTAACCTA T/- TTTTTTATGG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 7 6 84275 CASAVA_Build 14 41594426 2I ATATATTTAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AT 6 7 84276 CASAVA_Build 14 41597587 1I ATTTCCAGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 34 2 21 11 T 14 15 84277 CASAVA_Build 14 41602135 1D ACAATTAAGT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 39 0 35 4 G 2 1 84278 CASAVA_Build 14 41604817 1D TGTACATTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 98 het 37 0 32 6 T 9 8 84279 CASAVA_Build 14 41626403 1I CTTTAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 10 11 84280 CASAVA_Build 14 41629653 1D CATTTAGACA G/- GTTTATCACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 2 1 84281 CASAVA_Build 14 41635293 1I GCTGCCTGGA -/G TGTGTGCACA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 0 1 84282 CASAVA_Build 14 41656594 1D ATTAGCCATG T/- AATTTTTGTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 1 0 84283 CASAVA_Build 14 41689432 2D TAAGTGTCTC AT/-- ATTAAATATG 3070 hom 68 het 26 0 23 4 AT 2 1 84284 CASAVA_Build 14 41717644 1I GGCTGAGGAG -/A AAAAAAAAAA 797 het 797 ref 45 28 2 15 A 10 11 84285 CASAVA_Build 14 41750443 1D TTCTGAGGCC T/- TTTTTTTTTT 1754 het 1754 ref 32 12 5 15 T 17 16 84286 CASAVA_Build 14 41750817 1D ATAAGTGCTC A/- AAAAAAAAAA 2906 het 392 hom 17 4 9 4 A 17 16 84287 CASAVA_Build 14 41773505 3D GGGTACGTGC TGA/--- ACAGGATGTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TGA 1 0 84288 CASAVA_Build 14 41779662 2D TTTCAAAAAC AT/-- GTATGAAATA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 AT 1 0 84289 CASAVA_Build 14 41783837 1D ATCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 600 hom 40 2 29 10 T 12 11 84290 CASAVA_Build 14 41783849 1D TTTTTTTTTT G/- GCAATTTACT 3070 het 633 hom 39 4 24 11 G 2 1 84291 CASAVA_Build 14 41786039 1D ATCTGCTTTT G/- AATTAAACTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 0 84292 CASAVA_Build 14 41786324 1D CCCTAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 19 10 T 12 11 84293 CASAVA_Build 14 41798914 1I GATCTGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 9 10 84294 CASAVA_Build 14 41799568 3D AATCAGGAAA TCT/--- TCTTCCTTAA 3070 het 3070 hom 40 16 23 1 TCT 2 1 84295 CASAVA_Build 14 41804122 4D AACTTTCTCC CTAT/---- CTGTGTCATT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 CTAT 1 0 84296 CASAVA_Build 14 41820076 7I ATGCTGTCTT -------/GGTTACC GTAGACTTGT 2340 het 2340 ref 27 15 5 7 GGTTACC 0 1 84297 CASAVA_Build 14 41821042 5D TCGACTTGAT AATCA/----- TGTGGTCGAT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 AATCA 1 0 84298 CASAVA_Build 14 41831137 2I AAAAAAAAAA --/AT AAATAAAAAA 955 het 168 hom 5 2 3 0 AT 0 1 84299 CASAVA_Build 14 41832330 1D GATGACACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 A 11 10 84300 CASAVA_Build 14 41841581 5D TTCTTTCAAT TAATA/----- TAATATCTGG 3070 het 3070 hom 37 12 22 5 TAATA 2 1 84301 CASAVA_Build 14 41842569 4I CTGAATTCTT ----/AATA AATCAAATGT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 AATA 0 1 84302 CASAVA_Build 14 41860803 1D AATTTTTTGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 9 8 84303 CASAVA_Build 14 41861621 1D GACAGAGAGC T/- TTTTTTTTTC 1379 het 1379 ref 44 35 3 6 T 10 9 84304 CASAVA_Build 14 41864319 2D CTGCCATCTT CC/-- CCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 57 18 30 9 C 4 2 84305 CASAVA_Build 14 41865365 3D TATTTAATAA TAG/--- CTATTCTGAC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 TAG 1 0 84306 CASAVA_Build 14 41882292 4I AGATCAAAAT ----/AGTG AGGACAAATC 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 AGTG 0 1 84307 CASAVA_Build 14 41883706 1D TTCTTATGGG A/- AAAAAAAAAA 1339 het 1339 ref 42 19 5 18 A 17 16 84308 CASAVA_Build 14 41887329 2D GTATGTATAC AT/-- ATATATATAT 1133 het 1133 ref 12 7 3 2 AT 6 5 84309 CASAVA_Build 14 41888873 1D TACTTCTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2503 hom 27 6 15 8 A 10 9 84310 CASAVA_Build 14 41889605 1I TGCCAGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 11 12 84311 CASAVA_Build 14 41890047 1I TTTCTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1169 hom 29 7 18 4 C 0 1 84312 CASAVA_Build 14 41892704 2I TTTATGTGTG --/TA TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 TA 0 1 84313 CASAVA_Build 14 41920987 4D TTTGAATATA TATC/---- TATTTATCTA 3070 het 2993 hom 19 9 9 1 TATC 1 0 84314 CASAVA_Build 14 41931981 1D ATGAATGACC A/- AAAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 7 6 84315 CASAVA_Build 14 41937704 3D AAAAAAAGTT AAC/--- AATCCGTTCT 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 AAC 1 0 84316 CASAVA_Build 14 41940808 2D TTTGCTATAT AA/-- GTTTTCAATA 1327 het 1327 ref 22 16 4 3 A 2 0 84317 CASAVA_Build 14 41952639 1D ATCTGAGGGG C/- CTTCTGTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 C 2 1 84318 CASAVA_Build 14 41955609 3I TTATTTTCTA ---/ATT ATTATTATCT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 ATT 2 3 84319 CASAVA_Build 14 41961721 2D TTTATGTAAC TT/-- ATATCACTGT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 T 2 0 84320 CASAVA_Build 14 41985418 3I ATAAAATAAC ---/AGT AGGCAGGTGC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AGT 0 1 84321 CASAVA_Build 14 41994496 1I GTCTACTGTT -/A AGAGTGAGGG 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 1 2 84322 CASAVA_Build 14 42021906 4D TGCCTCTCAA AAGT/---- AAGTATCAGT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 AAGT 2 1 84323 CASAVA_Build 14 42025300 1D ATGCAAACTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 10 9 84324 CASAVA_Build 14 42026295 6D TTTCTCCATC TTTATT/------ TTTATTAGTG 3070 het 3070 ref 53 27 25 4 TTTATT 2 1 84325 CASAVA_Build 14 42027739 1I TTCATAAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 52 31 18 3 A 8 9 84326 CASAVA_Build 14 42029659 5D GTAGTTTAGC CATGT/----- CATAGCTCAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 CATGT 1 0 84327 CASAVA_Build 14 42031430 2D TTAAAAACAC AT/-- AAATTCTTGA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 AT 1 0 84328 CASAVA_Build 14 42031875 3D TCTCCACAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 AAT 7 6 84329 CASAVA_Build 14 42038751 1D TTTAATGTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2114 hom 20 7 11 2 T 9 8 84330 CASAVA_Build 14 42041760 1D GTATAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2778 hom 27 10 14 4 T 12 11 84331 CASAVA_Build 14 42048739 2D AGAAATGTGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 TA 7 6 84332 CASAVA_Build 14 42049214 5D AAAGAAAAAA GAAAG/----- GAAGAAAGAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 GAAAG 1 0 84333 CASAVA_Build 14 42049299 5I ATGGTTAACA -----/GCAAT GCAAAAGCAC 3070 hom 117 het 41 0 39 2 GCAAT 0 1 84334 CASAVA_Build 14 42050005 2D AGTCAAAAAC TG/-- TGCCTAGTGA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 TG 2 1 84335 CASAVA_Build 14 42050882 4D AAGAAGAGTC AAAT/---- AAATAAAATA 3070 het 3070 hom 33 12 19 3 AAAT 2 1 84336 CASAVA_Build 14 42051784 6D CAGATTATAA ACATAT/------ ACATATACAT 3070 hom 72 het 25 0 25 2 ACATAT 2 1 84337 CASAVA_Build 14 42053519 1I ACTATTTGTT -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 A 6 7 84338 CASAVA_Build 14 42059599 1D GCTTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 13 12 84339 CASAVA_Build 14 42062523 8I TTTTGTATAT --------/TTATCTAA GATAGAAATG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TTATCTAA 0 1 84340 CASAVA_Build 14 42067417 4I CAATTTAAAC ----/AAAG AACTCCCTGC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 AAAG 0 1 84341 CASAVA_Build 14 42069669 2D TGTAAATCTT TG/-- TGTGTTCATA 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 TG 3 2 84342 CASAVA_Build 14 42072020 1D GATCAAATGG T/- TTTAATCCCA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 4 3 84343 CASAVA_Build 14 42081960 4D AACTATAGTT ACTC/---- ACCATGCTGT 3070 het 3070 ref 36 20 14 7 ACTC 1 0 84344 CASAVA_Build 14 42082089 2I TGAGTTCCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2509 hom 35 8 17 10 T 14 16 84345 CASAVA_Build 14 42092991 2I GAATTATCTC --/AT ATAATTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 AT 1 2 84346 CASAVA_Build 14 42095483 5I TAATTTATTT -----/ATAGA ATTTGTTCAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 ATAGA 0 1 84347 CASAVA_Build 14 42110331 3D GGAGCTATGG TTC/--- TTCTTCTGGG 2063 het 2063 ref 37 26 6 5 TTC 3 2 84348 CASAVA_Build 14 42112894 8I CTTAATCTAT --------/AAAGATAC AAAGATACAC 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 AAAGATAC 1 2 84349 CASAVA_Build 14 42118631 3D AGCACAGAAA GAG/--- GAGAGACGAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 7 GAG 2 1 84350 CASAVA_Build 14 42134853 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 26 het 16 0 9 7 TG 6 5 84351 CASAVA_Build 14 42146404 1D TTCTGGGCCA G/- GGTATGGTGG 3070 het 2807 hom 22 7 13 2 G 3 2 84352 CASAVA_Build 14 42158027 2D ATTATATTAT TA/-- TATATATATA 2401 het 911 hom 8 2 5 1 TA 7 6 84353 CASAVA_Build 14 42159196 1I CGTGGTAATT -/C CCCCCCACCA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 C 6 7 84354 CASAVA_Build 14 42162235 3I GTGAAGAGAT ---/AAG AAGATCAGAT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 AAG 1 2 84355 CASAVA_Build 14 42169257 2D CAATATGAAA AT/-- ATGTCTTTCA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 AT 2 1 84356 CASAVA_Build 14 42171379 5D TTTAATACTT ATATC/----- ATATATGTTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 4 ATATC 1 0 84357 CASAVA_Build 14 42177924 3D CTAAATAATA ATT/--- ATGTCTTTTG 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 ATT 1 0 84358 CASAVA_Build 14 42179356 1D TCTCATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 11 10 84359 CASAVA_Build 14 42180481 5I ACAAATTATT -----/ATTTA ATTAAGATTT 3070 het 1924 hom 16 4 10 2 ATTTA 0 1 84360 CASAVA_Build 14 42180532 8D27M1D CACACACATT TATATATATATATATATATATATATATTGGTAGATG/--------TATATATATATATATATATTGGTAGAT- GGGGTAAGGA 3070 het 2050 hom 18 5 7 10 N/A 0 0 84361 CASAVA_Build 14 42184799 1I GTTTATTGAG -/A TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 36 23 8 5 A 0 1 84362 CASAVA_Build 14 42186998 4I TGGTTAGGAA ----/TAAG TAAGTATTTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TAAG 1 2 84363 CASAVA_Build 14 42193232 4I CTCTACCCCT ----/TTTG TTTATGTAAA 3070 het 3070 ref 45 22 12 11 TTTG 0 1 84364 CASAVA_Build 14 42193690 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2493 hom 35 9 15 11 A 10 9 84365 CASAVA_Build 14 42197731 1D GAACAGTGAA G/- GGGGTCTTTC 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 G 5 4 84366 CASAVA_Build 14 42203654 1D ATATGCAGAA C/- AAATGCTTAA 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 C 1 0 84367 CASAVA_Build 14 42205676 12D TTGCTAAAAA GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 26 15 8 4 GT 14 8 84368 CASAVA_Build 14 42218194 1I AGGTGGAAAA -/G TCTTTCTATT 3070 hom 102 het 40 0 33 7 G 0 1 84369 CASAVA_Build 14 42237990 1D TTGCAGGGTA G/- CTTCTATAGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 1 0 84370 CASAVA_Build 14 42251310 1D TATTAGGTCA T/- TCTCACACAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 T 2 1 84371 CASAVA_Build 14 42292984 2D TATGTAAAAC AT/-- ATATGCAAAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AT 3 2 84372 CASAVA_Build 14 42295573 1D TTACATTATA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 T 8 7 84373 CASAVA_Build 14 42299028 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 8 10 A 13 12 84374 CASAVA_Build 14 42299840 2I TATATATATA --/TG TACATGGGAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 TG 0 1 84375 CASAVA_Build 14 42302836 1D ATTTAAAAAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 8 7 84376 CASAVA_Build 14 42303036 3I CTGAATTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTC 0 1 84377 CASAVA_Build 14 42303143 1D CGGGGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 12 11 84378 CASAVA_Build 14 42304522 2D CTGTTGATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 21 8 T 16 14 84379 CASAVA_Build 14 42310714 1D CAACAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 12 11 84380 CASAVA_Build 14 42315865 9I ACATTATGTG ---------/TACTGTTTA TGTAGAATAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TACTGTTTA 0 1 84381 CASAVA_Build 14 42318164 1D AAGGAGCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 T 11 10 84382 CASAVA_Build 14 42327361 7I AAAAAGAATA -------/ATAAAAC ATAAAAACCT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 ATAAAAC 0 1 84383 CASAVA_Build 14 42328100 1I CTTGCTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 19 15 19 T 13 14 84384 CASAVA_Build 14 42328445 1I GAACATGATC -/T TTTTTTATGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 6 7 84385 CASAVA_Build 14 42334084 1D TTTTTGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 13 12 84386 CASAVA_Build 14 42335849 1I GGTCTTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 T 10 11 84387 CASAVA_Build 14 42336528 15I5M3D CAGATTTAAG ---------------TGAGTTTC/TGCACAACTTAATCCTGAGT--- TTTATCCTGA 3070 het 3070 ref 29 23 9 3 N/A 0 0 84388 CASAVA_Build 14 42343561 7D AAATTAGTCA TGCCTAG/------- TGCCTAGGCT 3070 het 3070 ref 32 21 9 4 TGCCTAG 2 1 84389 CASAVA_Build 14 42352235 4D TTTTCACTGT ATTG/---- ATTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 ATTG 2 1 84390 CASAVA_Build 14 42370153 5D ATTTAAAAAT AAATA/----- AATAAATAAA 3070 het 2232 hom 18 5 13 1 AAATA 1 0 84391 CASAVA_Build 14 42372908 4D ACTGGCCATT GTTA/---- GTTCTCTTCA 3070 het 3070 ref 46 24 19 5 GTTA 1 0 84392 CASAVA_Build 14 42376754 4D TTGTTTAACT CAAA/---- CAAAAACATC 3070 het 3070 ref 27 16 11 2 CAAA 2 1 84393 CASAVA_Build 14 42377438 3D TGTTATGAAT ACA/--- ACAATACATT 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 ACA 2 1 84394 CASAVA_Build 14 42382570 1D CTTCTGAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 10 9 84395 CASAVA_Build 14 42388958 1I AAAAATCAGC -/T CGGCGTGGTG 2210 het 1386 hom 11 3 5 3 T 0 1 84396 CASAVA_Build 14 42393846 1D TATTCTGTAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 8 7 84397 CASAVA_Build 14 42396237 2D ATATATAATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 TA 9 8 84398 CASAVA_Build 14 42398881 1I CAAGTTCTCC -/T TTTTTTACCT 3070 hom 10 het 54 1 48 5 T 6 7 84399 CASAVA_Build 14 42410326 1D TGTAAACAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 10 9 84400 CASAVA_Build 14 42430460 1I AAAAGTTGGT -/A TTTTTTACTT 3070 hom 78 het 29 0 27 9 A 0 1 84401 CASAVA_Build 14 42432925 1D TTAGCTGGAC A/- AAAAAAATCG 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 8 7 84402 CASAVA_Build 14 42441450 3D CTGATTCTGA TAT/--- TATTTCTGTA 3070 het 3070 ref 58 29 27 3 TAT 2 1 84403 CASAVA_Build 14 42473613 1D GTAAAATCAC A/- AGACCTTATA 3070 het 3070 ref 59 29 24 6 A 2 1 84404 CASAVA_Build 14 42522225 4D CAAAATAAAT AAAC/---- AAACAGCTTC 3070 hom 45 het 20 0 16 6 AAAC 2 1 84405 CASAVA_Build 14 42528779 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 A 7 8 84406 CASAVA_Build 14 42529108 1D AATTTTCAGG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 7 84407 CASAVA_Build 14 42534794 4D TTTGAAGAAA TAAT/---- TAATGAATTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 TAAT 2 1 84408 CASAVA_Build 14 42544725 1D GAAGGTAAAC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 9 8 84409 CASAVA_Build 14 42545170 1D CCTCCTCAGA C/- CATGCAACAG 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 C 2 1 84410 CASAVA_Build 14 42548900 4D CAGCAAATTA ATTT/---- ATTTTACAGA 3070 het 3070 hom 38 19 18 5 ATTT 2 1 84411 CASAVA_Build 14 42553674 1I GGCAATGCTT -/C CATGGAAAGA 3070 hom 120 het 50 0 41 9 C 1 2 84412 CASAVA_Build 14 42559152 1D ATATCCTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 10 9 84413 CASAVA_Build 14 42560211 2I TGTGTCTCTC --/TT ATATAAAATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 0 2 84414 CASAVA_Build 14 42566658 1I GGATAAAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 9 10 84415 CASAVA_Build 14 42572773 5D AATTTGTATT AAATA/----- ATATATTTAA 3070 het 54 hom 11 1 9 1 AAATA 1 0 84416 CASAVA_Build 14 42578817 4D TTCACCATTA TTTG/---- TTTATCTACT 3070 het 3070 hom 55 24 26 11 TTTG 1 0 84417 CASAVA_Build 14 42589949 1D AGGGACTTTT A/- AAATGTTGAA 2891 het 2891 ref 22 14 7 1 A 4 3 84418 CASAVA_Build 14 42592916 4D ATTGGTTGAT AGAA/---- AGTAAATTCA 3070 het 3070 ref 50 28 20 3 AGAA 1 0 84419 CASAVA_Build 14 42611304 2I TAAAGACATA --/AT ATGTTATTAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AT 1 2 84420 CASAVA_Build 14 42617539 3I GACAGAGTGA ---/GAT GATTCTGTCT 3070 hom 26 het 17 0 11 6 GAT 1 2 84421 CASAVA_Build 14 42622707 5D CTTGAATACT GAGAA/----- GAGATGTAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GAGAA 1 0 84422 CASAVA_Build 14 42632611 3I ACCATTTATG ---/GTA ACATAGGCAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 GTA 0 1 84423 CASAVA_Build 14 42633902 1I AGCAACATGG -/A AAAATGTAAC 3070 hom 84 het 30 0 29 4 A 4 5 84424 CASAVA_Build 14 42634010 1I GGAACCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 984 hom 36 3 20 13 T 11 12 84425 CASAVA_Build 14 42636003 1D TACCACCTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 10 9 84426 CASAVA_Build 14 42640860 2I AAATATAAAC --/AA AGTCTTCAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 1 3 84427 CASAVA_Build 14 42641238 1D CAGCCTGCTT A/- AAAAAAAAAA 891 het 891 ref 36 24 4 10 A 12 11 84428 CASAVA_Build 14 42642449 1I ATGTTACAAT -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 7 8 84429 CASAVA_Build 14 42650218 4D TGACCAAAAA TTGT/---- TTGTTTGTGT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TTGT 3 2 84430 CASAVA_Build 14 42650444 4D ATTGCCCCCA ACTC/---- ACAGGTAAAA 3070 hom 52 het 28 0 14 14 ACTC 1 0 84431 CASAVA_Build 14 42653059 6I GCAATATATA ------/GTATTC CCTTTGCCTC 3070 hom 126 het 51 0 43 8 GTATTC 0 1 84432 CASAVA_Build 14 42660164 1D AGAAATGGAG A/- AAAACATGCA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 5 4 84433 CASAVA_Build 14 42664059 1D GGGTTTTTTT C/- ATCAATAGAT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 C 1 0 84434 CASAVA_Build 14 42665477 1I ATTTTTCACA -/T TATAATACCA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 1 2 84435 CASAVA_Build 14 42666543 1I TTGTAATACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 9 84436 CASAVA_Build 14 42668504 1D CAAGGCTTAT G/- TTGAGAAAAG 3070 hom 90 het 36 0 31 7 G 1 0 84437 CASAVA_Build 14 42677332 2D GTGCGTAAAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 63 het 29 0 22 9 AC 10 9 84438 CASAVA_Build 14 42681617 1D CATAAAATTT A/- AAAAACTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 A 6 5 84439 CASAVA_Build 14 42689710 1I CATATGTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 9 10 84440 CASAVA_Build 14 42697796 1I AGGTTGGGGG -/A AGGGAGAGGA 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 A 1 2 84441 CASAVA_Build 14 42699856 5D GATATTTGTC TTAAT/----- TTAGTGTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 TTAAT 1 0 84442 CASAVA_Build 14 42707960 2D TAGAAGATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AC 7 6 84443 CASAVA_Build 14 42718536 1D GTTATAAGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 9 8 84444 CASAVA_Build 14 42719838 1D ACATGTGACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 10 9 84445 CASAVA_Build 14 42720725 1D AATAAAAAAA T/- GTAGCAAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 1 0 84446 CASAVA_Build 14 42746405 1I CAATTTATCA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 7 8 84447 CASAVA_Build 14 42754482 4D AAAAGTACTA TCTC/---- TCAGAATATT 3070 het 3070 ref 29 21 8 0 TC 3 1 84448 CASAVA_Build 14 42755446 1I TTCAGTTTCA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 7 8 84449 CASAVA_Build 14 42761718 14D AATTTTTGTG CATGGTGTAATATA/-------------- CATGGTGTAA 3070 hom 96 het 42 0 31 16 CATGGTGTAATATA 2 1 84450 CASAVA_Build 14 42776751 4I GTAATTCTAC ----/CTAA CTAATAACTC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 CTAA 1 2 84451 CASAVA_Build 14 42784384 3I CTATGGACTT ---/CTC CCAAATACTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 CTC 0 1 84452 CASAVA_Build 14 42787405 1D AAAGGATACA T/- TTTTTTCCCG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 7 6 84453 CASAVA_Build 14 42792349 4I TGTATATATA ----/TATG TATATATATC 3070 hom 9 het 25 1 17 7 TATG 0 1 84454 CASAVA_Build 14 42797865 1D TACCCAGACT A/- ATTTTTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 A 2 1 84455 CASAVA_Build 14 42808571 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 8 7 84456 CASAVA_Build 14 42826515 8D TAGTCCTTTG AATAGGGT/-------- AATAGGGTGC 3070 hom 102 het 39 0 34 7 AATAGGGT 2 1 84457 CASAVA_Build 14 42826924 1D TTGACTCTGC T/- TTTTTTTATG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 8 7 84458 CASAVA_Build 14 42828532 1D TTTTAGCCTC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 8 7 84459 CASAVA_Build 14 42838933 1D ATAAATACAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 8 7 84460 CASAVA_Build 14 42840307 16D ACAAAAAGTC AAATACTACATGTTCT/---------------- CAGTTATAAG 3070 hom 99 het 34 0 34 4 AAATACTACATGTTCT 1 0 84461 CASAVA_Build 14 42843589 1I GTACTCTTCT -/A AAATCAAAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 3 4 84462 CASAVA_Build 14 42844988 1D TAAGGGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 23 6 A 11 10 84463 CASAVA_Build 14 42846131 7I TATATATTTA -------/ATATAAT ATATATGTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 ATATAAT 0 1 84464 CASAVA_Build 14 42849874 1I GCCTGACTAA -/T TTTTTTTTTG 2543 hom 15 het 6 0 6 0 T 9 10 84465 CASAVA_Build 14 42852673 1I AATTTTAGAT -/A AAAAAACAGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 6 7 84466 CASAVA_Build 14 42854484 1D AAACTGGGTC T/- TTTTTTATCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 6 84467 CASAVA_Build 14 42878920 1D TTCATCTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 6 A 11 10 84468 CASAVA_Build 14 42879348 1D TGAGATCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 13 12 84469 CASAVA_Build 14 42884296 1I AAAACTGGCA -/C AAGACAGGGA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 0 1 84470 CASAVA_Build 14 42887176 1D GTAAGTTTTT A/- AAACTTAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 4 3 84471 CASAVA_Build 14 42887558 1I GTGACACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 39 1 31 7 A 10 11 84472 CASAVA_Build 14 42892903 1I TGGGGTAAAA -/G GATGTATAAT 3070 hom 114 het 45 0 40 5 G 1 2 84473 CASAVA_Build 14 42893109 2I ATACTGAGGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 GT 6 7 84474 CASAVA_Build 14 42895456 1I AAACCACTAG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 A 7 8 84475 CASAVA_Build 14 42907447 1I AAGTTCTAAC -/T TCAATTATTC 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 1 2 84476 CASAVA_Build 14 42908462 1D TTTTTATCAT G/- TTTAAGCCTT 3070 het 1742 hom 29 5 13 11 G 1 0 84477 CASAVA_Build 14 42909527 1I TTTTCAGACC -/G CCTCAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 0 1 84478 CASAVA_Build 14 42915219 1D16M1I CATGTACCCT AAAACTTAAAGTGTAAT-/-AAACTTAAAGTGTAATA AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 N/A 0 0 84479 CASAVA_Build 14 42918853 2I TGTCTATGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TA 5 6 84480 CASAVA_Build 14 42920075 3D TCTTAAAAAC CTA/--- CTTGGTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 6 CTA 1 0 84481 CASAVA_Build 14 42920640 1D TACACTTCAC A/- AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 6 5 84482 CASAVA_Build 14 42921619 1I AATTTCATGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 8 9 84483 CASAVA_Build 14 42923987 2I AACAATCAAC --/AG AGTGTAGAGA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 AG 1 2 84484 CASAVA_Build 14 42928769 4D GGCTAGAGAG AATT/---- AATATATGAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 AATT 1 0 84485 CASAVA_Build 14 42930049 1I TTTTGTATTC -/T TTTTTTTTTA 2728 het 2728 ref 25 18 6 1 T 9 10 84486 CASAVA_Build 14 42933189 2D ATACATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 55 22 21 12 AC 8 7 84487 CASAVA_Build 14 42942507 2I TTTTGCATTT --/TA TGTTTTCAGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TA 0 1 84488 CASAVA_Build 14 42945174 1I GGTGGGGGGA -/G GGGGGGGATA 1850 hom 10 het 4 0 4 0 G 7 8 84489 CASAVA_Build 14 42947300 4I AAACTTTTAA ----/AACT AACTCTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AACT 1 2 84490 CASAVA_Build 14 42950678 3D TTACGTATTT CTC/--- CTCATTTGCT 3070 het 2898 hom 22 8 12 2 CTC 2 1 84491 CASAVA_Build 14 42959854 1I TAAATTTTTC -/A AAATGTCTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 3 4 84492 CASAVA_Build 14 42960659 1I GGTAAAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 11 12 84493 CASAVA_Build 14 42962531 2D GTTATGCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 406 hom 20 4 10 6 TC 10 9 84494 CASAVA_Build 14 42971507 1I ATTTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 17 0 10 7 T 13 14 84495 CASAVA_Build 14 42976728 1D AATATAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 7 T 11 10 84496 CASAVA_Build 14 42981729 1I AGGCCTTTTA -/T TGTGACTCTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 2 84497 CASAVA_Build 14 42988136 1I GAATTTGGGT -/G GGGACATAGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 3 4 84498 CASAVA_Build 14 42988564 1D CCTTCACAGC A/- AAAGAAACTA 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 A 4 3 84499 CASAVA_Build 14 42989929 6D CCTTAATTCA TTTAAT/------ TTTAATAACA 3070 het 3070 ref 26 12 11 5 TTTAAT 2 1 84500 CASAVA_Build 14 42994249 1I TTCAGGATGT -/G GATAACAATG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 2 84501 CASAVA_Build 14 42996236 1I CAGCAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 10 11 84502 CASAVA_Build 14 42998332 1D AATTTACTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 A 10 9 84503 CASAVA_Build 14 43000708 6D TAAAAGTGTC ATTGTA/------ AAAGTTTAGA 2205 het 2205 ref 27 10 5 15 ATTGTA 1 0 84504 CASAVA_Build 14 43000752 1D AGCTGGAGAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 9 8 84505 CASAVA_Build 14 43000945 3I AAACAAAAAC ---/AAA AAAACAAACA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 A 4 7 84506 CASAVA_Build 14 43007633 5D AATAGTACGA TTTGT/----- TTTGAGGAAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 TTTGT 1 0 84507 CASAVA_Build 14 43011199 4I TAATCATAAG ----/ATCA ATCAATTTTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATCA 1 2 84508 CASAVA_Build 14 43015374 2D AAAAAGAAAC AT/-- AAATAATTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 AT 1 0 84509 CASAVA_Build 14 43016543 47D ACTTACCAGC ATTTAAAGTAGACTATAATTGTTGTTGAAAATATTATTGTACGTTTA/----------------------------------------------- AAATCTTTTG 3070 het 3070 ref 19 19 10 2 ATTTAAAGTAGACTATAATTGTTGTTGAAAATATTATTGTACGTTTA 1 0 84510 CASAVA_Build 14 43016945 1D TTACAGTCAT G/- GGAAAGGGAT 2357 het 2357 ref 19 12 5 2 G 3 2 84511 CASAVA_Build 14 43022333 2D CAAAAACCTC CA/-- CAGAGTAGTA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 CA 2 1 84512 CASAVA_Build 14 43025078 1I GATTATAACA -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 6 7 84513 CASAVA_Build 14 43027821 3D TAAATAAATA AAT/--- GAGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 AAT 1 0 84514 CASAVA_Build 14 43029393 4D CACGTGAGAC AAGT/---- AAGCCCCAGG 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 AAGT 1 0 84515 CASAVA_Build 14 43029764 1I ATATGATAAA -/T TTAGGCAAAA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 2 3 84516 CASAVA_Build 14 43044341 1D CTTCCTCTTA G/- CTATTTGTGA 3070 hom 160 het 58 0 54 4 G 1 0 84517 CASAVA_Build 14 43045554 1D CATTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3001 hom 35 9 16 10 T 12 11 84518 CASAVA_Build 14 43049486 1I CCAAATTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1042 hom 28 3 20 5 T 10 11 84519 CASAVA_Build 14 43049636 1D TGTTTTCACA T/- TTTAACTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 4 3 84520 CASAVA_Build 14 43050801 1I GCCAACTTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 84521 CASAVA_Build 14 43053375 1D GCAAGAACAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 9 8 84522 CASAVA_Build 14 43059159 1I CTGTTCCCCC -/T GATCTATTGA 3070 het 3070 ref 21 10 7 4 T 0 1 84523 CASAVA_Build 14 43060463 3D AAAATGTACA AAG/--- AAGGATAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 8 AAG 2 1 84524 CASAVA_Build 14 43064185 1I TCTCAAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 84525 CASAVA_Build 14 43064932 1D CAGCAGTGAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 9 8 84526 CASAVA_Build 14 43067670 1D CTGAAAGTCT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 8 7 84527 CASAVA_Build 14 43070524 2D TATTATAATT TC/-- TGTCAAAGAA 3070 het 3070 hom 44 14 29 4 TC 1 0 84528 CASAVA_Build 14 43074435 4D TGGGAAAGGG CTCT/---- CTAACAACTT 3070 het 3070 ref 43 25 16 3 CT 3 1 84529 CASAVA_Build 14 43092324 1D GACTACAGTT A/- AGCAATACTG 3070 het 3070 ref 50 29 14 8 A 2 1 84530 CASAVA_Build 14 43100271 1D AAACCCCAGG T/- TGCTATAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 2 1 84531 CASAVA_Build 14 43111278 2I63M2I TATATATGCG --TATGTGTGTGTATATACATATATACATATATATGCATTACATATAATGTGTCTACATATGTAC--/TATATGTGTGTGTATATACATATATACATATATATGCATTACATATAATGTATCTACATATGTACAT ATGTGTATAT 3070 het 3070 ref 23 20 13 3 N/A 0 0 84532 CASAVA_Build 14 43114909 4I CTGATTTATG ----/TTTC TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 TTTC 0 1 84533 CASAVA_Build 14 43122837 4I TTGTGCATAG ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 GT 6 8 84534 CASAVA_Build 14 43131521 1D CATAACTTAG C/- TTCCAATTAT 3070 het 3070 ref 26 12 7 8 C 1 0 84535 CASAVA_Build 14 43133154 2D TTCCTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 31 0 24 8 T 14 12 84536 CASAVA_Build 14 43134591 1I AACAAGTGAG -/T GGAAAAAACA 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 T 0 1 84537 CASAVA_Build 14 43142344 2I AAAGTATAAT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 20 1 15 4 TA 0 1 84538 CASAVA_Build 14 43142656 2I CAAAGGAATC --/AG AAAGTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 24 24 1 AG 0 1 84539 CASAVA_Build 14 43145173 4I GTTATCTATC ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 het 3070 hom 64 27 28 11 ATCT 3 4 84540 CASAVA_Build 14 43145361 1I TTCTCTCTTA -/T TAAGTGGGAG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 1 2 84541 CASAVA_Build 14 43145954 5D CAAATATGAT AATAA/----- AATAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 8 17 1 AATAA 2 1 84542 CASAVA_Build 14 43146930 1I AATTTAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 11 12 84543 CASAVA_Build 14 43147156 1D TGATGAACTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 9 8 84544 CASAVA_Build 14 43156759 3I ATAAAATAGT ---/TTA TTATTTTCAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 TTA 1 2 84545 CASAVA_Build 14 43157322 1I CCATGATTAT -/A AAGTTTCCTG 3070 het 2965 hom 24 7 15 2 A 2 3 84546 CASAVA_Build 14 43168367 2I TTTCCAATAA --/CT CTTAGAATTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CT 1 2 84547 CASAVA_Build 14 43173443 1D CACATTCATA C/- CAGAGCATTA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 C 2 1 84548 CASAVA_Build 14 43174679 5D CCAGAGTCTT CAAAA/----- CTTATGGCTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 CAAAA 1 0 84549 CASAVA_Build 14 43176000 4D AGTAAAATTG AACA/---- AACACTTTTA 3070 het 3070 ref 61 33 24 7 AACA 2 1 84550 CASAVA_Build 14 43185262 4D GGACATCTTT TATA/---- TATATATATA 2800 hom 30 het 17 0 9 9 TA 11 9 84551 CASAVA_Build 14 43185632 3D ATTGTCATGC AAG/--- AAGAAGTCAT 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 AAG 3 2 84552 CASAVA_Build 14 43185827 4D ATATTGTAAC CAGA/---- CAGTCTATTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 CAGA 1 0 84553 CASAVA_Build 14 43187340 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1522 hom 31 4 24 3 A 11 12 84554 CASAVA_Build 14 43188441 5I CACTGTTTTC -----/AAACT AAAGTACTCC 3070 hom 132 het 50 0 44 6 AAACT 0 1 84555 CASAVA_Build 14 43188678 1I AATGTTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 T 10 11 84556 CASAVA_Build 14 43189819 2I AAATTAAAAT --/GA AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 30 0 17 13 GA 0 1 84557 CASAVA_Build 14 43194585 4D CATGGATGAC ACAA/---- ACAAATGGAA 3070 het 3070 ref 37 19 18 1 ACAA 2 1 84558 CASAVA_Build 14 43196954 1D CTAAAAAAAA T/- AATAATTATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 0 84559 CASAVA_Build 14 43197326 1I GAGAACAGAA -/C CCACCAGCTG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 C 2 3 84560 CASAVA_Build 14 43199935 1I GAGCTAATTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 9 10 84561 CASAVA_Build 14 43201921 1D ACTAACTTGT A/- AAAAAACAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 7 6 84562 CASAVA_Build 14 43202797 1I TGGTTTTCTG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 T 8 9 84563 CASAVA_Build 14 43203032 4I CCAAGTGTAC ----/TGAG TATTTTTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TGAG 0 1 84564 CASAVA_Build 14 43217467 1D ATTCATGGGG A/- TTCCTGGAAC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 1 0 84565 CASAVA_Build 14 43219646 1I TAAACTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 36 1 25 10 A 10 11 84566 CASAVA_Build 14 43223558 2I TTGAATATGT --/TC TTTTTAATAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TC 0 1 84567 CASAVA_Build 14 43224676 1D ATAATTCAAA G/- TTCAGTGTCT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 G 1 0 84568 CASAVA_Build 14 43226830 1D CCCTCCTCAC T/- TTTGACATTT 3070 het 3070 hom 48 20 21 9 T 4 3 84569 CASAVA_Build 14 43227016 4D CTCATGCTCT TAAC/---- TAAGATATAA 3070 het 3070 hom 38 18 20 1 TAAC 1 0 84570 CASAVA_Build 14 43230366 4D AAATATTGGT TGGA/---- TGAAGATAAC 3070 het 3070 hom 35 18 17 0 TGGA 1 0 84571 CASAVA_Build 14 43236428 1D ATTTTATAAA G/- AAAAAATTTG 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 G 1 0 84572 CASAVA_Build 14 43243555 3D TACATGTATA CAT/--- ATGTAACTAA 2397 het 1348 hom 9 3 5 1 CAT 1 0 84573 CASAVA_Build 14 43244311 1D AGCAAGTATG C/- CGACATTAAA 3070 het 2382 hom 15 6 8 1 C 2 1 84574 CASAVA_Build 14 43254267 1I TTTCAGGAAT -/A GATGTATCAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 1 84575 CASAVA_Build 14 43262486 4D CATCTATTCC ATAA/---- ATAGTTATGG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 ATAA 1 0 84576 CASAVA_Build 14 43267857 1D ATGCAGGATA T/- TTTTTTATCA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 7 6 84577 CASAVA_Build 14 43279400 1I AAAAAAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 11 12 84578 CASAVA_Build 14 43279662 1D ATCAGAGCTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 9 8 84579 CASAVA_Build 14 43281496 1I CCAGGGGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 9 10 84580 CASAVA_Build 14 43287080 1D ACTCAGCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 10 9 84581 CASAVA_Build 14 43302541 1I AAAAAGAGAG -/A AAAAGGGAAC 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 A 4 5 84582 CASAVA_Build 14 43311002 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2938 het 2938 ref 25 13 7 5 A 11 10 84583 CASAVA_Build 14 43313215 1D AGGTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2725 hom 33 14 11 8 A 15 14 84584 CASAVA_Build 14 43323934 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 6 A 12 11 84585 CASAVA_Build 14 43324957 1I ATAATTTTTT -/C CTCCCCCTCA 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 C 1 2 84586 CASAVA_Build 14 43330836 1I CCCCCCCGCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2097 hom 30 10 12 8 A 9 10 84587 CASAVA_Build 14 43345658 4I TAAATTAAAC ----/AAAA AGCTGGTTCT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 1 5 84588 CASAVA_Build 14 43351219 1D CCGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 T 9 8 84589 CASAVA_Build 14 43362276 1D TTGTAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 2758 het 2758 ref 28 14 7 7 T 13 12 84590 CASAVA_Build 14 43363792 2I TCCTTGTCTC --/AT ATTTAGTATG 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 AT 1 2 84591 CASAVA_Build 14 43365963 9D AGAATAGCAT TAGTAGTAG/--------- TAGTAGTAGT 3070 het 3070 hom 42 16 20 10 TAG 9 6 84592 CASAVA_Build 14 43371543 1I TATCTAATGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 8 9 84593 CASAVA_Build 14 43402880 26I TACGTACTTT --------------------------/AAAAAATTTCTGACCATTATCTCTTC AAATAATTTT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 AAAAAATTTCTGACCATTATCTCTTC 0 1 84594 CASAVA_Build 14 43436869 1I TGGCTAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 10 11 84595 CASAVA_Build 14 43445380 3I CTACTACTAC ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 2304 hom 30 8 14 8 TAA 5 6 84596 CASAVA_Build 14 43456073 1I ACAGATACAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 6 7 84597 CASAVA_Build 14 43457961 4I TCAACTGAAT ----/AAAC CACAAAAGCC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 AAAC 0 1 84598 CASAVA_Build 14 43460379 5D GAAACTAAAC CCCAT/----- CTCTTGCCAC 3070 het 3070 ref 32 13 14 7 CCCAT 1 0 84599 CASAVA_Build 14 43460749 1D TTCTATATAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 A 9 8 84600 CASAVA_Build 14 43485096 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1215 het 1215 ref 38 28 4 6 A 12 11 84601 CASAVA_Build 14 43486338 1I TAAATCTAAC -/A TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 0 1 84602 CASAVA_Build 14 43494872 1D TTGTTGTGAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 T 8 7 84603 CASAVA_Build 14 43503287 4I TTCATTAATT ----/AATA GTTAATATCT 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 AATA 0 1 84604 CASAVA_Build 14 43575510 1D CACTCTTGCA T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 T 7 6 84605 CASAVA_Build 14 43588520 1I AGTGCCAGGG -/A AAAAAAAAAA 2187 het 2187 ref 41 32 5 4 A 10 11 84606 CASAVA_Build 14 43589113 1I CTAGAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 A 9 10 84607 CASAVA_Build 14 43598022 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2097 hom 26 5 17 4 A 11 10 84608 CASAVA_Build 14 43612978 1I AAGTGACATA -/G GGTACATTCA 3070 hom 148 het 57 0 50 7 G 2 3 84609 CASAVA_Build 14 43679962 4D TTTTATTTTT TTAA/---- TTAATTGTTA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 TTAA 2 1 84610 CASAVA_Build 14 43699221 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 15 7 8 1 A 10 9 84611 CASAVA_Build 14 43699795 1I ACGTTTCCCC -/T CAACCTTTAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 0 1 84612 CASAVA_Build 14 43709324 1D CACATATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 41 0 25 16 A 13 12 84613 CASAVA_Build 14 43710675 2D CATATTACAG AT/-- ATATATATAT 1471 het 811 hom 15 2 5 8 AT 7 6 84614 CASAVA_Build 14 43722290 7I AAAACAAAAA -------/ACAAAAC ACAAAACACA 3070 het 3070 ref 27 9 13 5 ACAAAAC 1 2 84615 CASAVA_Build 14 43726790 1I54M1I CAATAAAGGA -TTTTTTTTTACTTCAGTTTATCCATTTGAGCCAATAATGTGCAGAGGTGAATAG-/TTTTTTTTTTACTTCAGTTTATCCATTTGAGCCAATAATGTGCAGAGGTGAATAGT TTTTTCTGTT 3070 het 3070 ref 39 32 26 5 N/A 0 0 84616 CASAVA_Build 14 43729808 17D CCTTGTGGAA CTGTGAGTCAATTAAAT/----------------- CTCTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 CTGTGAGTCAATTAAAT 1 0 84617 CASAVA_Build 14 43736451 1D CCAAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 1631 het 1631 ref 33 24 4 5 A 12 11 84618 CASAVA_Build 14 43737338 2I TCAAACTTTA --/TG TGTGTGTGTG 1829 het 1829 ref 28 13 5 10 TG 8 9 84619 CASAVA_Build 14 43739218 5D AAAAAGAAAG GGAAA/----- GGAAAGGAAA 1248 het 1248 ref 19 10 5 6 GGAAA 3 2 84620 CASAVA_Build 14 43744351 1D AATGTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 T 11 10 84621 CASAVA_Build 14 43752861 1I GAATCACAGA -/G GGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 G 5 6 84622 CASAVA_Build 14 43763553 1I ACTCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 13 14 84623 CASAVA_Build 14 43781526 1D TTGTATTGTT A/- TTATAAGGTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 1 0 84624 CASAVA_Build 14 43789021 1D CATCTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 24 0 20 4 A 13 12 84625 CASAVA_Build 14 43804917 5I AATAAGAAGA -----/GTTTT CTTAGGAGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 GTTTT 0 1 84626 CASAVA_Build 14 43808123 1I AGGTAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 9 10 84627 CASAVA_Build 14 43808457 1I CATTTGTCCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 9 10 84628 CASAVA_Build 14 43810395 1I AAAAAAAAAA -/C CAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 C 1 2 84629 CASAVA_Build 14 43814256 5I ATATGACAGG -----/CTATC CTGTGGAAGG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 CTATC 0 1 84630 CASAVA_Build 14 43815361 4I GTCCTCCATT ----/CTAA CTAACTAGAA 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 CTAA 1 2 84631 CASAVA_Build 14 43871164 1I ACTCAACTTT -/A AAATGCCAAA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 3 4 84632 CASAVA_Build 14 43873563 6D GGTAACATTG AGAACA/------ AGAACACATG 2533 het 2533 ref 20 11 7 2 AGAACA 2 1 84633 CASAVA_Build 14 43873850 1I TTACACACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 A 13 14 84634 CASAVA_Build 14 43884034 1I ACCTCTGACA -/T TTTAATATTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 3 4 84635 CASAVA_Build 14 43890570 2I AAAAAAACAC --/AT GTCATTGAAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 AT 0 1 84636 CASAVA_Build 14 43893683 3D GATATTTTGA CCT/--- CCTCCTCTTG 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 CCT 3 2 84637 CASAVA_Build 14 43908085 3D AACACTAAAA GAT/--- TATACAAAGA 3070 het 3070 hom 47 22 22 5 GAT 1 0 84638 CASAVA_Build 14 43918304 4I GCAGACAATT ----/TGAA TGGTGAGTGA 3070 het 3070 ref 40 26 9 5 TGAA 0 1 84639 CASAVA_Build 14 43918866 1I CCCGACTGGT -/A AAAAAAAAAA 1622 het 1494 hom 26 9 7 10 A 15 16 84640 CASAVA_Build 14 43920889 1D CTCTTAAGGT C/- CCAGGATAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 C 3 2 84641 CASAVA_Build 14 43926862 1I AGTAAGTGAG -/C CCCCCTTCAT 3070 het 3070 hom 38 11 13 14 C 5 6 84642 CASAVA_Build 14 43930988 10D TAGGTTACTA TGGGGGATGT/---------- TGTTACATAG 3070 het 3070 ref 53 30 24 7 TGGGGGATGT 1 0 84643 CASAVA_Build 14 43932993 1D TTACCAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 13 12 84644 CASAVA_Build 14 43934665 1I AACCAGGCTG -/A AGTCTTAGTG 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 1 2 84645 CASAVA_Build 14 43954333 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 9 8 84646 CASAVA_Build 14 43956798 23I ACCTTGAAAC -----------------------/AGCCCTCATTAAGTCCACTCTCA AGCCCACCCT 3070 hom 96 het 31 0 32 3 AGCCCTCATTAAGTCCACTCTCA 0 1 84647 CASAVA_Build 14 43963324 1I11M1D GAACAATGTG -AAAAAGTAATCA/AAAAAAGTAATC- AGAAAGTAAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 N/A 0 0 84648 CASAVA_Build 14 43964239 1I ACTCTATGGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 52 23 16 13 A 7 8 84649 CASAVA_Build 14 43967812 1D TTATGATAAA C/- CCCCCCTCAC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 C 7 6 84650 CASAVA_Build 14 43968878 2I AGTACCCGGG --/AA AAGTCAGGTC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 2 4 84651 CASAVA_Build 14 43971823 1I GAAGGTGCAG -/A GTATGTCAAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 0 1 84652 CASAVA_Build 14 43979093 2D GTCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 15 14 A 12 10 84653 CASAVA_Build 14 43979417 1D CATATGACAC A/- AATGGAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 3 2 84654 CASAVA_Build 14 44004659 2D GCCCCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2925 het 1751 hom 35 8 12 15 T 16 14 84655 CASAVA_Build 14 44004841 1D TTTAACTCTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 8 7 84656 CASAVA_Build 14 44006595 1I AAGTTTTTTT -/A TAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 0 1 84657 CASAVA_Build 14 44020740 1D ATATTTCACC T/- TTCCTGCTCT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 3 2 84658 CASAVA_Build 14 44021439 1I CTAGCATCAG -/A TACTTCTGAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 84659 CASAVA_Build 14 44025670 1D AGGAAATGAC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 A 8 7 84660 CASAVA_Build 14 44032760 16D GCAGGTGGAT TATATATATATATATA/---------------- TATATATATA 3070 hom 26 het 21 0 10 12 TA 17 9 84661 CASAVA_Build 14 44037178 1D TCTGTGTGTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 91 het 33 0 31 2 A 9 8 84662 CASAVA_Build 14 44037471 1D TAGTCAAGAA T/- TTTTTTTTTT 2577 hom 9 het 17 0 6 11 T 17 16 84663 CASAVA_Build 14 44038848 1I AAAGGAAAAG -/A AAAAAACTAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 6 7 84664 CASAVA_Build 14 44039424 2I GATCTTAATA --/GT GATCCATAAA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 GT 0 1 84665 CASAVA_Build 14 44064972 1D TGTTTTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 11 10 84666 CASAVA_Build 14 44066314 1D TACAGAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 510 hom 36 2 13 21 T 19 18 84667 CASAVA_Build 14 44069762 1I GGGCAGTACT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 A 7 8 84668 CASAVA_Build 14 44070956 1I TCCTGGATAG -/A GATCCCTCTA 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 A 0 1 84669 CASAVA_Build 14 44075537 1D AGAGACAGAG C/- AAAATCCATT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 C 1 0 84670 CASAVA_Build 14 44077067 1I ATTTTTATAT -/A AAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 5 6 84671 CASAVA_Build 14 44078232 1D GAAACTATTT A/- AAAAAAAAAT 2318 het 2318 ref 32 16 6 10 A 10 9 84672 CASAVA_Build 14 44083011 5D GTATATAATA TATAT/----- TATATGTATA 3070 het 3070 hom 20 7 12 4 TATAT 2 1 84673 CASAVA_Build 14 44088695 5D AAGTTCACTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1552 het 1552 ref 40 11 10 19 T 15 10 84674 CASAVA_Build 14 44095699 1I TTCTGCTCTG -/T TTTTTCCCCA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 T 5 6 84675 CASAVA_Build 14 44102527 1I TAAAAACTTG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 7 8 84676 CASAVA_Build 14 44105848 1I CTCTTTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 10 11 84677 CASAVA_Build 14 44115963 3I GGAAGAACTA ---/ATT ATTAGAAAGG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATT 1 2 84678 CASAVA_Build 14 44128498 1D AACTTTTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 9 8 84679 CASAVA_Build 14 44147859 1I CTTTGCATCC -/T TTCAAAGCAT 3070 het 3070 hom 56 27 28 1 T 2 3 84680 CASAVA_Build 14 44160763 4I GTAAACATCC ----/TTCT TTGAGAAATG 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 TTCT 0 1 84681 CASAVA_Build 14 44161916 1I ATTTCTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 0 1 84682 CASAVA_Build 14 44164558 3D ATACAGGGTC ATG/--- ATATGTTGCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 ATG 1 0 84683 CASAVA_Build 14 44167857 1I GGCTCTTATC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 A 9 10 84684 CASAVA_Build 14 44168145 1D ATGAATGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 11 10 84685 CASAVA_Build 14 44169969 1I TGCAAAGACA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 46 20 22 4 T 6 7 84686 CASAVA_Build 14 44173834 1D TGCCTTATAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 73 het 33 0 23 13 A 9 8 84687 CASAVA_Build 14 44175539 9D TTAGAGGTAA TTATAGCAG/--------- TTATAGCAGT 3070 het 3070 ref 39 18 12 10 TTATAGCAG 2 1 84688 CASAVA_Build 14 44180722 3D TTTTTTTTTT ATA/--- TATATACTTT 2213 het 1309 hom 9 3 6 0 ATA 1 0 84689 CASAVA_Build 14 44184858 1I TATGAATTTC -/T TTTTCTATTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 4 5 84690 CASAVA_Build 14 44186437 3D ATAATGTTTT ATA/--- ATACTACACA 3070 het 3070 ref 31 16 13 5 ATA 2 1 84691 CASAVA_Build 14 44187080 4I CACTCATTAT ----/AAAG ATAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AAAG 0 1 84692 CASAVA_Build 14 44194898 9D GAATCACCTA TGTTGTTGT/--------- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 43 20 13 12 TGT 8 5 84693 CASAVA_Build 14 44197842 1I TTTAACGGTT -/A AAAAAAAAAA 2608 het 2608 ref 38 20 9 9 A 12 13 84694 CASAVA_Build 14 44206660 4I AAATTTATAT ----/AAGC AAGCAGAAAG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AAGC 1 2 84695 CASAVA_Build 14 44211438 1D GTCAGCTGTG C/- CCCTGTGGCT 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 C 4 3 84696 CASAVA_Build 14 44220712 1I CTGAACTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 T 11 12 84697 CASAVA_Build 14 44241352 6D ACATGAAATC TTTTCT/------ TTTTCTTTTT 3070 hom 77 het 37 0 27 10 TTTTCT 3 2 84698 CASAVA_Build 14 44241419 1I CCACACACAC -/A AAAAAAAAAA 2333 het 2333 ref 27 10 5 12 A 10 11 84699 CASAVA_Build 14 44244130 1I47M1D GTGCGCTGCA -CCACTAACGTGTCATCTAGCATTAGGTATATCTCCCAATGCTATCCCT/CCCACTAACGTGTCATCTAGCATTAGGTATATCTCCCAATGCTATCCC- CCCCCCTCCC 1442 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 84700 CASAVA_Build 14 44252253 6D TTGTGTACTT TATTTC/------ TATTATTATT 2814 het 1069 hom 11 3 7 1 TATTTC 1 0 84701 CASAVA_Build 14 44266518 3D GAATTAATAC TCT/--- TCATCATTAT 3070 het 3070 hom 45 19 19 9 TCT 1 0 84702 CASAVA_Build 14 44267465 10D AGTTCTGTGC CTTTTTCATA/---------- CTGCTTTTCA 550 het 550 ref 42 27 4 14 CTTTTTCATA 1 0 84703 CASAVA_Build 14 44270911 1I AAAAGAAAAA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 G 1 2 84704 CASAVA_Build 14 44277348 2D TGAAAATATG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 18 22 2 A 11 9 84705 CASAVA_Build 14 44281415 1D CCTTCTCTAC A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 6 5 84706 CASAVA_Build 14 44283184 1D CTGAAGATGT A/- AAAAAAAAAA 1624 het 1624 ref 19 12 4 3 A 12 11 84707 CASAVA_Build 14 44292095 1D AAGGCTCCTG A/- AAAAAAAAAT 2921 het 2921 ref 29 16 9 4 A 10 9 84708 CASAVA_Build 14 44383672 1D CATGAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 20 0 18 2 A 15 14 84709 CASAVA_Build 14 44523972 1D CAAAACTATC T/- TTTTTTTTTT 818 het 818 ref 16 7 3 6 T 11 10 84710 CASAVA_Build 14 44661239 3D AATTAAAAAA AAG/--- AAGAAGTGTA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 AAG 3 2 84711 CASAVA_Build 14 44729676 1D ATTGTCCCCA T/- TTTTTTTTTT 1180 het 1180 ref 37 22 4 11 T 15 14 84712 CASAVA_Build 14 44742745 1I TTCTTGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 9 10 84713 CASAVA_Build 14 44803435 1D GCCCTAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 44 1 34 9 T 11 10 84714 CASAVA_Build 14 44811370 1D TCTCAACATA T/- TTTTTTTTGG 1084 het 1084 ref 35 26 3 6 T 9 8 84715 CASAVA_Build 14 44822719 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1510 hom 10 het 4 0 4 0 A 13 12 84716 CASAVA_Build 14 44825976 1I CTTTTATATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 9 10 84717 CASAVA_Build 14 44828876 1I CATTTAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 625 hom 35 2 29 4 T 9 10 84718 CASAVA_Build 14 44854343 1D TGTCTTACTG A/- AAAAAAAAAA 1340 het 1340 ref 43 34 3 7 A 11 10 84719 CASAVA_Build 14 44856960 1D GGGCTTTTTT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 9 8 84720 CASAVA_Build 14 44903294 1I AAGAAATTTC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 8 9 84721 CASAVA_Build 14 45050143 4D ATTTTTATTG TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TATT 6 5 84722 CASAVA_Build 14 45084629 1I GGATCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1661 hom 20 4 9 7 T 12 13 84723 CASAVA_Build 14 45109984 2D TTAGTGAAGC TA/-- TGTTATTTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TA 1 0 84724 CASAVA_Build 14 45117180 2I CTATCTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 1466 het 649 hom 38 2 8 28 T 10 12 84725 CASAVA_Build 14 45122725 2D CTTTTTCATT TC/-- TGATTCTATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TC 1 0 84726 CASAVA_Build 14 45139385 4I TATACAATAA ----/ATTG ATTGTTCATG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATTG 1 2 84727 CASAVA_Build 14 45140811 1I CCTGTTGCTT -/A AACTTGCACT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 2 3 84728 CASAVA_Build 14 45180168 1I GATTAGTGAA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 7 8 84729 CASAVA_Build 14 45192239 1D GGGGGAAGGG A/- GGAATTTGGT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 A 1 0 84730 CASAVA_Build 14 45198572 1I CATGATCTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 T 8 9 84731 CASAVA_Build 14 45212025 1D TTTGGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 2156 het 2112 hom 27 12 8 7 T 17 16 84732 CASAVA_Build 14 45214152 1I TTTGAGGTTG -/T TTTATTCTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 3 4 84733 CASAVA_Build 14 45219304 1D TTATTAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 34 0 23 11 T 11 10 84734 CASAVA_Build 14 45231437 1I TATTCTGAGA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 60 het 36 1 33 2 T 6 7 84735 CASAVA_Build 14 45231950 3D AACCTTTCTT CTC/--- TGATCTCTCT 3070 hom 63 het 27 0 23 5 CTC 1 0 84736 CASAVA_Build 14 45233663 4I AAACTATATC ----/AGAT AGAGTCCAGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AGAT 0 1 84737 CASAVA_Build 14 45234930 1I AAAGGCATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 551 hom 35 2 12 21 T 14 15 84738 CASAVA_Build 14 45240929 1I ATTTATTGGA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 7 8 84739 CASAVA_Build 14 45242710 1D AATGTTCCTG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 409 hom 17 1 15 1 T 9 8 84740 CASAVA_Build 14 45246159 1D AATAAATAAA T/- AAAAATTTAT 3070 het 3070 hom 21 8 9 5 T 1 0 84741 CASAVA_Build 14 45247968 2D TGGTACCACA AT/-- ATATATATAT 3070 het 442 hom 31 2 28 2 AT 7 6 84742 CASAVA_Build 14 45248042 4I CCACTACAAT ----/TTTG TTTTTTTGTT 3070 hom 34 het 35 1 33 1 TTTG 0 1 84743 CASAVA_Build 14 45251826 2D AGATCTACTC TT/-- ATAATAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 0 84744 CASAVA_Build 14 45251926 5D TAATTTATAA TTTCT/----- TTAAAGGATT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 TTTCT 1 0 84745 CASAVA_Build 14 45266922 1I CCATCCAGCA -/C TCTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 49 21 27 1 C 0 1 84746 CASAVA_Build 14 45311350 1D TCAGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 7 T 11 10 84747 CASAVA_Build 14 45316517 2D TATTTCTGGG TT/-- TTTTATATTC 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 T 6 4 84748 CASAVA_Build 14 45316920 1D TTCCTAGGTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 T 8 7 84749 CASAVA_Build 14 45318270 1D GTTTTCTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 8 7 84750 CASAVA_Build 14 45320593 1D TTGGAATTCC T/- TTTTTTTTTT 2857 het 1063 hom 31 6 11 14 T 17 16 84751 CASAVA_Build 14 45322304 1D TCAGCAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 12 11 84752 CASAVA_Build 14 45329299 7D TTCACATGAC TTTAATA/------- TTTAAGAAAT 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 TTTAATA 1 0 84753 CASAVA_Build 14 45363058 1D GGGTGTACAA C/- CCCCCCTATG 3070 hom 30 het 46 1 37 10 C 7 6 84754 CASAVA_Build 14 45375568 1I ACCACCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 26 12 8 T 10 11 84755 CASAVA_Build 14 45376683 1I CACAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 15 11 T 13 14 84756 CASAVA_Build 14 45388237 1D CCTTAAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2252 hom 25 7 12 7 T 12 11 84757 CASAVA_Build 14 45392700 1I TTTTAATACT -/A TTTTAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 0 1 84758 CASAVA_Build 14 45393148 1I TAGGGGTCAT -/C CTTTTTTTGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 1 2 84759 CASAVA_Build 14 45393955 13I CTTCAGACCT -------------/TTACAAAGACATA TAGTTGCTTA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTACAAAGACATA 0 1 84760 CASAVA_Build 14 45394286 1D GTTTTTCTAC T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 T 8 7 84761 CASAVA_Build 14 45395456 1D TATTACTAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 10 9 84762 CASAVA_Build 14 45396097 1I TGCTAACTTA -/T TTTCCATAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 3 4 84763 CASAVA_Build 14 45399699 1I AATTTGCTAA -/G AATTGCTTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 7 G 0 1 84764 CASAVA_Build 14 45400584 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 34 1 22 11 T 15 14 84765 CASAVA_Build 14 45404151 1I TTTTAAAAAA -/T ATAAATCAAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 0 1 84766 CASAVA_Build 14 45406738 1I TCAAAGACTT -/G AATAGTTCTG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 G 0 1 84767 CASAVA_Build 14 45411167 1I ACCAATTTAC -/T ATATTAGTCC 3070 het 113 hom 15 2 13 0 T 0 1 84768 CASAVA_Build 14 45412330 12D TGTAGTCCCA GCTACTCGGGAG/------------ GCTGAGGCAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 GCTACTCGGGAG 1 0 84769 CASAVA_Build 14 45418320 7D AGTTTTGGCA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 14 8 T 21 14 84770 CASAVA_Build 14 45419681 1I CAGGCCGGTA -/C GGGGTTCATT 3070 hom 57 het 23 0 18 5 C 0 1 84771 CASAVA_Build 14 45420521 1I AGCTACTTTC -/A AAAAAAATGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 84772 CASAVA_Build 14 45421745 1I ATTTTTTCTT -/A AACTGTTTAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 2 3 84773 CASAVA_Build 14 45421922 1D CACTCAAAGG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 8 7 84774 CASAVA_Build 14 45430070 1D AGAGTATGGC T/- TTCCCTCCCT 3070 hom 140 het 51 0 44 10 T 3 2 84775 CASAVA_Build 14 45430872 4D AAAAGCTGAC AGAG/---- AGAGCGCACA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AG 4 2 84776 CASAVA_Build 14 45432184 5D TAAAAAAGAA AAATT/----- AAATAAAATG 3070 hom 99 het 37 0 34 5 AAATT 1 0 84777 CASAVA_Build 14 45443195 2I GGAGTTCATA --/TG TATTGAGCTA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 TG 0 1 84778 CASAVA_Build 14 45452720 1D GTCATATCCA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 84779 CASAVA_Build 14 45461476 5D TTTTAAAATT TTCTC/----- TTATGCATTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTCTC 1 0 84780 CASAVA_Build 14 45462644 1D ACCAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 45 het 20 0 16 6 A 7 6 84781 CASAVA_Build 14 45468613 6D TTGATACAGC TGTGCA/------ TGTATCTAGC 3070 hom 120 het 41 0 39 5 TGTGCA 1 0 84782 CASAVA_Build 14 45468865 1I TTTTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 318 hom 27 2 22 3 T 10 11 84783 CASAVA_Build 14 45469759 1I TTTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 28 1 22 5 T 11 12 84784 CASAVA_Build 14 45482550 1D GAGTAAATTT A/- AAAAAAACTG 3070 hom 93 het 39 0 32 8 A 8 7 84785 CASAVA_Build 14 45489727 2I AACTGAAGAC --/AG GGGTAACTAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AG 0 1 84786 CASAVA_Build 14 45500185 8D GTTTTCTATT TTTTTTTC/-------- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 25 11 8 7 TTTTTTTC 2 1 84787 CASAVA_Build 14 45500460 1D CTTGATATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 22 5 A 10 9 84788 CASAVA_Build 14 45513354 7D TTTATGTCTC TAATGGT/------- TAATGATGCT 3070 hom 81 het 30 0 28 4 TAATGGT 1 0 84789 CASAVA_Build 14 45515277 1I CAGGTCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 31 1 21 9 T 11 12 84790 CASAVA_Build 14 45523595 1I ATATTGTTAT -/A AGTATCATTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 84791 CASAVA_Build 14 45524433 1I CTCCTCTTAC -/T TTTTCTTCAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 4 5 84792 CASAVA_Build 14 45526600 1D TTTCCAGGTG T/- TTTTTTTGGC 3070 hom 132 het 48 0 45 6 T 8 7 84793 CASAVA_Build 14 45529977 4I CTTTTTTCTC ----/TATT TATTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 TATT 1 2 84794 CASAVA_Build 14 45541943 1D TTAAGCTGCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 8 84795 CASAVA_Build 14 45545096 1D CAGATGGAGA C/- TGAGGGACTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 1 0 84796 CASAVA_Build 14 45560546 9I GTATTTAATA ---------/GGATGACAT GGATGGTTAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 GGATGACAT 0 1 84797 CASAVA_Build 14 45560730 9I2M1D GAACAATGCT ---------ATA/TCTTGAAGCAT- TGATATATTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 N/A 0 0 84798 CASAVA_Build 14 45560826 1I AAATCATATA -/T TTTTCTAGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 4 5 84799 CASAVA_Build 14 45570522 1I CTTTCATCAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 8 9 84800 CASAVA_Build 14 45573174 6I CTATGTTTCA ------/TTAGGG TTAGTTTCTG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TTAGGG 0 1 84801 CASAVA_Build 14 45575698 1I AAAATTGCGC -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 6 7 84802 CASAVA_Build 14 45583636 1D TTGAGGTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 10 9 84803 CASAVA_Build 14 45591384 1D21M1D4M5I16M5D7M1I TCTTGAATTG TTTTTTAATTGTTTGATACTTTATAAC-----TATGAAATAATAGGACAGAAAAAAGTTA-/-TTTTTAATTGTTTGATACTTT-TAACTTTTTTCTGTCCTATTATTTC-----ATAGTTAT AAACTTTATG 3070 hom 75 het 20 0 25 4 N/A 0 0 84804 CASAVA_Build 14 45595804 1D TCAGGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 98 het 43 0 34 10 T 13 12 84805 CASAVA_Build 14 45597041 2D ATTCAGACTG TA/-- GAGTAGCTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TA 1 0 84806 CASAVA_Build 14 45601106 2D32M2D GTGGTGTCAC AGAGAACAGCTAAGTTTGCTATGAAAGAAATGGTAA/--AGAACAGCTAAGTTTGCTATGAAAGAAATGGT-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 33 24 9 N/A 0 0 84807 CASAVA_Build 14 45601873 1I CCTTCGAGAA -/T TTTTTCTCAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 5 6 84808 CASAVA_Build 14 45603492 1D6M2D TGCCTGTATA TTTCATTTC/-TTCATT-- AATTCCCCAC 3070 hom 93 het 34 0 32 4 N/A 0 0 84809 CASAVA_Build 14 45608889 2D TTTTGTGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 AC 6 5 84810 CASAVA_Build 14 45622963 2D TGTGCTACAC AT/-- GTCATTTATA 3070 het 3070 ref 40 26 11 4 AT 1 0 84811 CASAVA_Build 14 45624177 10D AAACTTTACA ATATAGTGGT/---------- ATATACGTAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 3 ATATAGTGGT 1 0 84812 CASAVA_Build 14 45627925 4I TTTCCCTGAT ----/ACTG ACTAATTTTA 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 ACTG 0 1 84813 CASAVA_Build 14 45628143 2I ATGATGAGAC --/AG AGATTTTTGA 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 AG 1 2 84814 CASAVA_Build 14 45630085 1I TTTAAAGATT -/A AGAGACAATA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 A 1 2 84815 CASAVA_Build 14 45633769 1D TATATTATCA T/- TTTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 7 6 84816 CASAVA_Build 14 45634517 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCTCCCC 1931 het 1077 hom 10 4 5 1 C 6 5 84817 CASAVA_Build 14 45653238 14D AAAAGAGCAT TCATAAGCAATAAA/-------------- TCATAAGCAA 236 het 236 ref 33 25 3 11 TCATAAGCAATAAA 1 0 84818 CASAVA_Build 14 45688211 6D TTTTGTTTTG TTTTGT/------ TTTGTTTGTT 801 het 801 ref 29 15 4 12 TTTTGT 1 0 84819 CASAVA_Build 14 45702553 1D TAAAATTCTG T/- TTTTTTTGTT 1950 het 1620 hom 15 5 4 6 T 8 7 84820 CASAVA_Build 14 45717966 5D ATATGAACTT TAAAG/----- TAGTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 11 11 3 TAAAG 1 0 84821 CASAVA_Build 14 45735444 4D CTAAAATAAC TGAG/---- TATTTGACAT 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 TGAG 1 0 84822 CASAVA_Build 14 45756516 1D ATATCTCTAA G/- TATTGATGTA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 G 1 0 84823 CASAVA_Build 14 45760994 2I AAAAGAAAAC --/TT CAGATAAATA 3070 het 3070 ref 48 28 13 7 T 0 2 84824 CASAVA_Build 14 45763280 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2803 het 1901 hom 16 5 7 4 A 11 12 84825 CASAVA_Build 14 45763814 3D TCATTAGTAA TAT/--- TATGTAGTAT 1668 het 1077 hom 8 3 4 2 TAT 2 1 84826 CASAVA_Build 14 45766785 1D ATACCTAATG C/- TACATGACGA 3070 het 2909 hom 18 7 9 2 C 1 0 84827 CASAVA_Build 14 45768455 1D GGCTTCTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 10 A 11 10 84828 CASAVA_Build 14 45774766 1D GGTAAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 15 10 A 11 10 84829 CASAVA_Build 14 45777965 2D ATGTTATCAC AT/-- GTTAGAAGAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 AT 1 0 84830 CASAVA_Build 14 45783337 3D GCAGCCATTT TTG/--- TTGTTGTTCT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 TTG 3 2 84831 CASAVA_Build 14 45815075 1D TGGACTCTAT A/- ATAGGAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 A 2 1 84832 CASAVA_Build 14 45844940 1I TTCTTGAACC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 T 8 9 84833 CASAVA_Build 14 45849354 1I GAAAAAGTAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 8 9 84834 CASAVA_Build 14 45861636 1I AGATGGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 785 hom 32 3 24 5 A 11 12 84835 CASAVA_Build 14 45868151 1D TTTTTGTGTC T/- CAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 1 0 84836 CASAVA_Build 14 45876107 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1358 het 359 hom 9 1 4 4 A 15 14 84837 CASAVA_Build 14 45885583 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 1094 hom 16 3 8 5 A 8 9 84838 CASAVA_Build 14 45889289 1D TAATTTGTAT A/- ACCACTTCGT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 2 1 84839 CASAVA_Build 14 45889720 1I GAAGATGGCA -/T TAAGTGCCCT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 1 2 84840 CASAVA_Build 14 45891413 1I TAGAAGAAAT -/A TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 0 1 84841 CASAVA_Build 14 45891797 2D GTTCATTGAG AA/-- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 10 8 84842 CASAVA_Build 14 45893498 2I ATGTATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 AT 5 6 84843 CASAVA_Build 14 45893850 6I ACTTATTACC ------/TTATAT TTATACCATC 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 TTATAT 0 1 84844 CASAVA_Build 14 45894771 4I TAAATAAATG ----/AGTA AGTGTTATAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AGTA 0 1 84845 CASAVA_Build 14 45895456 3I ATATTAAGAC ---/ATG AGAACTTTAG 3070 het 3070 ref 53 30 20 3 ATG 0 1 84846 CASAVA_Build 14 45897139 3D TTTTTCAAAG TTT/--- CAAAATTATT 3070 het 3070 hom 34 16 17 3 T 3 0 84847 CASAVA_Build 14 45902436 1D TTAGAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 A 12 11 84848 CASAVA_Build 14 45902756 4D TCAATTCTGC TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 14 24 9 T 13 9 84849 CASAVA_Build 14 45910539 1D TTGAAGGCTT C/- AATTGATTTT 1633 het 1628 hom 31 4 8 19 C 1 0 84850 CASAVA_Build 14 45910554 4D GATTTTCTAT TTTA/---- TTTATTTCTT 3070 hom 48 het 24 0 17 10 TTTA 2 1 84851 CASAVA_Build 14 45911288 1I AGCTTTTTTT -/C ATATGTTTGT 2839 hom 18 het 8 0 7 1 C 0 1 84852 CASAVA_Build 14 45913366 1I GTATTTCTGT -/G GGGGTCAGTG 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 G 4 5 84853 CASAVA_Build 14 45915025 1D TATGTGTCTT G/- GGGGTTGATC 3070 hom 68 het 26 0 23 3 G 5 4 84854 CASAVA_Build 14 45915741 3I GGGGGCCTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTG 5 6 84855 CASAVA_Build 14 45918607 1I CTTCCATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 T 10 11 84856 CASAVA_Build 14 45920472 1I TTCCAAGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 11 12 84857 CASAVA_Build 14 45926677 1I TTTAACAGTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 8 9 84858 CASAVA_Build 14 45932354 1I ATTATTAATA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 6 7 84859 CASAVA_Build 14 45933706 1D AGGGCTAATG C/- TGATGACTTT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 C 1 0 84860 CASAVA_Build 14 45934053 1D TTGACTTTCC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 8 7 84861 CASAVA_Build 14 45937746 3I CAGAAATTAT ---/ACA AAAAAGTTAT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 ACA 0 1 84862 CASAVA_Build 14 45944176 1D CCCTCCATTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 600 hom 47 2 38 8 T 9 8 84863 CASAVA_Build 14 45947571 3D CTGAAGAATG TAT/--- TATTATTACA 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 TAT 3 2 84864 CASAVA_Build 14 45948432 1D GGTTTTTTTT A/- GCAATTAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 A 1 0 84865 CASAVA_Build 14 45956178 12D AGATCCAATG AAATCTATATTA/------------ AAATCTATAT 2305 het 2305 ref 20 9 5 6 AAATCTATATTA 2 1 84866 CASAVA_Build 14 45962756 1I TTAATCTTTG -/C CTATATGTAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 1 2 84867 CASAVA_Build 14 45983609 1D GATTATGATA C/- AATTTGGTTT 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 C 1 0 84868 CASAVA_Build 14 45990391 4D TATCACAAAT TAAA/---- TATCCATATT 3070 het 3070 ref 39 23 12 6 TAAA 1 0 84869 CASAVA_Build 14 45990786 4D TATAATTTAG AACT/---- GACTGTTCCC 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 AACT 1 0 84870 CASAVA_Build 14 45991547 1I TTCCTAAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 9 10 84871 CASAVA_Build 14 45992454 11D GTATTTCCAG CCATGTTTCTT/----------- CCATTTTAAC 3070 het 3070 ref 41 24 14 6 CCATGTTTCTT 1 0 84872 CASAVA_Build 14 45993912 2I CAATTACCCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TG 5 6 84873 CASAVA_Build 14 45998464 5D TTGGGACCAT AATAA/----- AATAAACCTA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 AATAA 2 1 84874 CASAVA_Build 14 46000373 21D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC/--------------------- ATAGTTAGAG 2122 het 2122 ref 28 19 7 12 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC 1 0 84875 CASAVA_Build 14 46006747 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2829 het 286 hom 15 1 10 4 A 13 12 84876 CASAVA_Build 14 46006993 1I TGGTATTCAG -/A AAATGTCTTT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 A 3 4 84877 CASAVA_Build 14 46009083 8D GGCTATCTGG CTATCTGT/-------- CATAGACTTA 3070 het 3070 ref 23 17 8 4 CTATCTGT 1 0 84878 CASAVA_Build 14 46010501 3D TTCCAAAATG TTT/--- TCCATTTCTT 3070 het 3070 ref 39 26 12 3 T 4 1 84879 CASAVA_Build 14 46011936 1D TTTAGAATTC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 9 8 84880 CASAVA_Build 14 46013835 3D AATGTCCTAA GCG/--- AAGATCATTA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 GCG 1 0 84881 CASAVA_Build 14 46013890 4I ATGAAACTAG ----/TCTC TCTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 TC 1 3 84882 CASAVA_Build 14 46015073 4I ATAGGAATAT ----/ATTA ATTAATAATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATTA 1 2 84883 CASAVA_Build 14 46015760 1I TGACAGGAAT -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 6 7 84884 CASAVA_Build 14 46018573 2D GGTGTGCATG CA/-- CACACACACA 1312 het 1312 ref 56 50 3 3 CA 6 5 84885 CASAVA_Build 14 46020393 4I GAAGAGAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 AG 4 6 84886 CASAVA_Build 14 46020575 1D CCCAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 A 12 11 84887 CASAVA_Build 14 46020931 1I AGGGTAGCAT -/A AGGAGGGATT 3070 het 3070 ref 48 21 22 5 A 1 2 84888 CASAVA_Build 14 46028718 22D AATAATAACT TTAAAATTTGAATGTGATAAAA/---------------------- TTAAAATTTG 3070 hom 69 het 29 0 24 9 TTAAAATTTGAATGTGATAAAA 2 1 84889 CASAVA_Build 14 46034077 5I AATAATATAC -----/TTTCT TTTATTTCCT 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 TTTCT 0 1 84890 CASAVA_Build 14 46039216 5I TTTTTTATTG -----/TTTAA TTTAACAGCC 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 TTTAA 1 2 84891 CASAVA_Build 14 46040559 25D CTTTTCTGTG GAATCAGTTTTTCATTATCCTTATA/------------------------- GAATCAGTTT 3070 het 3070 hom 40 14 20 19 GAATCAGTTTTTCATTATCCTTATA 2 1 84892 CASAVA_Build 14 46040644 4I TCCTTAAAAT ----/CTAA CTAACTAACT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 CTAA 2 3 84893 CASAVA_Build 14 46041419 4D61M4D ACAACCTAGA AAATAAATAAATAGAAATATGCTAACTTTTCAAAGGCGATATCAAACAGGGAATTGATTAAAAAGTGTT/----AAATAAATAGAAATATGCTAACTTTTCAAAGGCGATATCAAACAGGGAATTGATTAAAAAG---- TGTTAGAAGG 3070 hom 154 het 28 0 52 6 N/A 0 0 84894 CASAVA_Build 14 46046974 1I AGTGAAAGGG -/T TAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 42 20 22 0 T 1 2 84895 CASAVA_Build 14 46050333 1I ATCAAACTAG -/A ACTCAGGATT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 1 2 84896 CASAVA_Build 14 46055502 21D CAAATTCTGT AAAGTTTTAGGATACAAAATA/--------------------- AAAGTTTTAG 3070 het 3070 ref 26 19 11 5 AAAGTTTTAGGATACAAAATA 2 1 84897 CASAVA_Build 14 46057048 1I GTTTAGCCAT -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 115 het 53 0 48 5 A 7 8 84898 CASAVA_Build 14 46057511 3D CTATGTATCC ATA/--- ATAACTAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 ATA 2 1 84899 CASAVA_Build 14 46059439 2I TATCCATAGC --/TA TATATATATA 3070 het 467 hom 35 2 28 5 TA 5 6 84900 CASAVA_Build 14 46060688 1D ACACTATGCT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 8 7 84901 CASAVA_Build 14 46061600 4D TGATCAAAAT AATC/---- AAGAGACAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 AATC 1 0 84902 CASAVA_Build 14 46063032 2I ACAACTTATA --/AT AACTCCAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AT 0 1 84903 CASAVA_Build 14 46063735 3D ATCTGTTGTT ATC/--- ATAATATTGA 3070 hom 148 het 54 0 50 5 ATC 1 0 84904 CASAVA_Build 14 46067881 1D TACTAAACTT G/- GAGAGCTAAT 3070 het 3070 hom 30 11 19 0 G 2 1 84905 CASAVA_Build 14 46075263 1D AGCCATAAAT A/- AAAATCTAGT 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 A 5 4 84906 CASAVA_Build 14 46080513 1D ATAGTAATGA T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 T 7 6 84907 CASAVA_Build 14 46081155 6D ATAAAAATTA TTAAAT/------ TTAAAGTTCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTAAAT 1 0 84908 CASAVA_Build 14 46082499 2D AATATAAAAC AT/-- GTATCAAATC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 AT 1 0 84909 CASAVA_Build 14 46088737 1D TTTATCCGTC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 7 84910 CASAVA_Build 14 46095759 1D TTTACAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 29 5 16 8 T 13 12 84911 CASAVA_Build 14 46127243 1I AGAAAAGATT -/A AAAAAAAAAA 1381 het 296 hom 32 2 15 15 A 17 18 84912 CASAVA_Build 14 46141051 17D TATCAAAAAT AGACATTCAGAGACAAG/----------------- AGTAGAGAAA 3070 hom 123 het 42 0 42 5 AGACATTCAGAGACAAG 1 0 84913 CASAVA_Build 14 46153037 2D TAAATGTATG TA/-- TATATATATA 2957 hom 24 het 11 0 9 2 TA 6 5 84914 CASAVA_Build 14 46155685 1D ATAGTATATA G/- GTTCCTCAAA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 G 2 1 84915 CASAVA_Build 14 46156084 1I AATGAAAAGT -/G GGTACAAATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 2 3 84916 CASAVA_Build 14 46157346 1D AAATCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 11 10 84917 CASAVA_Build 14 46158395 2D32M3D TCTATTTGGG TTTTTTTTTTTGTGGTACCATATAATTTGTTTAATTG/--TTTTTTTTTGTGGTACCATATAATTTGTTTAA--- TTGTTTTTCT 3070 hom 123 het 35 0 42 10 N/A 0 0 84918 CASAVA_Build 14 46173065 1D TCTCTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 T 11 10 84919 CASAVA_Build 14 46178708 2I GAGTGGGGGA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 192 hom 42 1 35 6 AG 5 6 84920 CASAVA_Build 14 46182111 1I TCTCTGGTGG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 7 8 84921 CASAVA_Build 14 46182359 1D TTACTTTAGT A/- AAGTTTTTGA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 3 2 84922 CASAVA_Build 14 46183973 3D GAAAGAGGAA ATT/--- ATGCTCTCTT 3070 hom 96 het 34 0 33 3 ATT 1 0 84923 CASAVA_Build 14 46184266 4D CAACCATTGT GAAA/---- GACAGTGTGG 3070 het 1960 hom 19 4 14 1 GAAA 1 0 84924 CASAVA_Build 14 46202292 10D TGTGTGTGTA TGTATGTGTG/---------- TGTGTATATA 720 het 70 hom 8 1 3 5 TGTATGTGTG 1 0 84925 CASAVA_Build 14 46220029 30D CTTTCTTTTG TATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 3070 het 611 hom 20 5 12 10 TA 21 6 84926 CASAVA_Build 14 46220562 1I CATTTGTTCA -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 T 6 7 84927 CASAVA_Build 14 46229759 1D TAGATGAATA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 7 6 84928 CASAVA_Build 14 46281530 1I CCTGTCCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 34 3 19 12 T 16 17 84929 CASAVA_Build 14 46289484 4I CTTTTTTCTT ----/TTTC TTTTTTTTTT 1418 het 111 hom 29 4 11 14 TTTC 0 1 84930 CASAVA_Build 14 46292818 1I CAAAAAAAAA -/C AATGAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 0 1 84931 CASAVA_Build 14 46311041 1D ATTCAATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 42 0 29 13 T 12 11 84932 CASAVA_Build 14 46312305 8D CAGCTTGTAA GAGGAATC/-------- GTAGCATTCA 3070 het 3070 hom 44 13 31 2 GAGGAATC 1 0 84933 CASAVA_Build 14 46323822 2D TCTGGGACTA TT/-- TTTTTTTTTT 1434 het 1434 ref 29 13 5 11 T 18 16 84934 CASAVA_Build 14 46327050 12D TTATAATGTA TTCTCGTATTTC/------------ AAGCTTATCA 3070 het 3070 ref 41 28 15 2 TTCTCGTATTTC 1 0 84935 CASAVA_Build 14 46330087 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1301 hom 22 6 15 3 TA 9 8 84936 CASAVA_Build 14 46330728 2D TTCTCCCACA AC/-- AGTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 AC 1 0 84937 CASAVA_Build 14 46331328 4I CACTAAAACC ----/AATT AATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 AATT 1 2 84938 CASAVA_Build 14 46340161 1D GCTCCTCTTT C/- AAAGAAACTT 3070 het 3054 hom 21 9 9 3 C 1 0 84939 CASAVA_Build 14 46351162 2D TGGATCTATA AT/-- ATTTATACCT 3070 het 3070 ref 61 27 26 10 AT 2 1 84940 CASAVA_Build 14 46357945 1D TCTTACCCTT C/- CCCCCCTACC 3070 hom 96 het 36 0 30 6 C 7 6 84941 CASAVA_Build 14 46368194 1I ACTTTATGTA -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 8 84942 CASAVA_Build 14 46380561 1I TCTATAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 620 hom 27 3 14 10 T 10 11 84943 CASAVA_Build 14 46384624 1D CAACTAAAAA T/- AACTCCGTTT 3070 het 3070 hom 36 17 15 6 T 1 0 84944 CASAVA_Build 14 46390859 1I GATTTTTGGG -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 20 14 3 T 1 2 84945 CASAVA_Build 14 46391320 1I TACAAAGTTT -/A TAGGCCATGG 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 A 0 1 84946 CASAVA_Build 14 46396481 6I GAGAATTTCC ------/CTTTGT CTTTGGTTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CTTTGT 0 1 84947 CASAVA_Build 14 46399698 3D TCACAGAATT CTC/--- CTTTATATCT 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 CTC 1 0 84948 CASAVA_Build 14 46406883 1D CTTCTGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 11 10 84949 CASAVA_Build 14 46410106 2D AATTATGCGA TT/-- TGTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 33 14 11 10 T 3 1 84950 CASAVA_Build 14 46411948 1D TAAAAACATG A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 7 6 84951 CASAVA_Build 14 46415659 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 9 10 84952 CASAVA_Build 14 46422582 2D TACGTAGGAA TC/-- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 TC 4 3 84953 CASAVA_Build 14 46424702 1D ATGACTCAGC A/- TAAATCCCAA 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 A 1 0 84954 CASAVA_Build 14 46436588 3D13M12D7M5D2M3D TATAAAGCAC TTAAAGATGTTTAACAGTAAGTAAGAATTATACAAGTGTTAGCTA/---AATATATATAATA------------TATATAA-----AG--- ATGCAATAAT 3070 het 3070 ref 28 21 12 5 N/A 0 0 84955 CASAVA_Build 14 46452449 1D AATAACTTTT A/- AAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 5 4 84956 CASAVA_Build 14 46452840 1I TAATTTAATC -/A AAATTTTATT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 3 4 84957 CASAVA_Build 14 46455953 1I TAGAAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 10 11 84958 CASAVA_Build 14 46457236 1I CATGTATAAC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 7 8 84959 CASAVA_Build 14 46462633 1I GAAAAGCTTT -/A AAAAGGAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 4 5 84960 CASAVA_Build 14 46465376 2D CACTGATTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 33 0 15 18 A 12 10 84961 CASAVA_Build 14 46465634 1I TCTTGAGTAA -/T ATTAATTAGA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 0 1 84962 CASAVA_Build 14 46467505 4D TTATTGAATA AATC/---- AATCAATGAA 3070 het 3070 hom 64 24 35 6 AATC 2 1 84963 CASAVA_Build 14 46469068 1I CCCAAAGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 84964 CASAVA_Build 14 46470905 1I ATAGAATATC -/A AAAAATATCG 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 5 6 84965 CASAVA_Build 14 46472753 42D TATGTAACAA ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------------ ATATATATAT 2482 hom 18 het 9 0 7 4 AT 26 5 84966 CASAVA_Build 14 46476249 2I AATACTGGTT --/AA AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 10 84967 CASAVA_Build 14 46479111 5I TCATATTTGC -----/TATGT TATATCACTA 3070 hom 117 het 51 0 40 11 TATGT 0 1 84968 CASAVA_Build 14 46492271 1I TTAACTTTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 A 9 10 84969 CASAVA_Build 14 46512857 1D ATTATTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 25 1 16 8 T 13 12 84970 CASAVA_Build 14 46516808 1D GAAAATCTTG C/- TGGAGAAATT 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 C 1 0 84971 CASAVA_Build 14 46525478 3I TGATGTAAGA ---/TCT TCTTTCTGAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TCT 1 2 84972 CASAVA_Build 14 46528286 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGTATCC 3070 het 3070 hom 41 11 16 14 G 6 5 84973 CASAVA_Build 14 46539287 2I TATATATATT --/TA TATATATATA 759 hom 7 het 6 0 3 3 TA 8 9 84974 CASAVA_Build 14 46543505 11I TCCCTTATAT -----------/TTCCATCTAAA TTCCATCTAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TTCCATCTAAA 1 2 84975 CASAVA_Build 14 46550953 3I TCCTGAATTG ---/TGT TGTCATCGTT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 TGT 1 2 84976 CASAVA_Build 14 46556566 27D CAAGAAAATA TTCACATGATTTCTTAAGAAAATTGTT/--------------------------- TTAAAATTCC 3070 hom 75 het 25 0 26 3 TTCACATGATTTCTTAAGAAAATTGTT 1 0 84977 CASAVA_Build 14 46557099 1D GGTAATTGAC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 9 8 84978 CASAVA_Build 14 46557794 1I ACCTATTGAT -/G GCTGTTGAAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 2 84979 CASAVA_Build 14 46559091 7D4M2D AATGTAAATG CGGATCTTCAATC/-------TAAA-- TTTTTCCAAC 3070 hom 93 het 33 0 32 3 N/A 0 0 84980 CASAVA_Build 14 46559547 1D GAGGAAAGAG A/- GAGAAAAACT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 1 0 84981 CASAVA_Build 14 46566581 2I TATTATATAT --/TA TATATATATA 3070 het 379 hom 12 1 9 2 TA 8 9 84982 CASAVA_Build 14 46572288 2I TACTAGTATC --/AG AGCTTCTGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AG 1 2 84983 CASAVA_Build 14 46581266 1D CAAATCTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 615 hom 36 4 21 13 T 16 15 84984 CASAVA_Build 14 46596554 2I CTCTCTTTTC --/TT TTCTTTCCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 4 84985 CASAVA_Build 14 46605677 4I TGATAATCTG ----/AAGA AAGATGGAAG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 AAGA 1 2 84986 CASAVA_Build 14 46609545 4D CTTCCAGTAC TTTT/---- TTTTTATTAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 5 84987 CASAVA_Build 14 46613107 1D AACAACAACT A/- ATATAATACA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 2 1 84988 CASAVA_Build 14 46618176 4D AATTAGGGCA ATTT/---- ATTATGTGGA 3070 hom 84 het 31 0 29 5 ATTT 1 0 84989 CASAVA_Build 14 46618653 4D ATATACTGTG TTAT/---- TTGTTTCAGC 3070 hom 42 het 16 0 14 2 TTAT 1 0 84990 CASAVA_Build 14 46621286 1D CCAGGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 27 1 18 8 A 15 14 84991 CASAVA_Build 14 46622425 3D TATATTCTAG GAA/--- GAAGAAGTTC 3070 hom 66 het 29 0 23 7 GAA 3 2 84992 CASAVA_Build 14 46625566 1I TAAACATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 10 84993 CASAVA_Build 14 46628810 1I TTTACTTCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 10 84994 CASAVA_Build 14 46629337 1I TCCTATCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 34 0 32 2 A 10 11 84995 CASAVA_Build 14 46633748 4I ATTTTTAAAG ----/CAAA CAAACAAAAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 CAAA 2 3 84996 CASAVA_Build 14 46649120 1I CACCACTCCC -/A AAAAAAAAAA 2174 het 2174 ref 39 29 6 4 A 12 13 84997 CASAVA_Build 14 46651105 5D AGAGGAAAGA AAGAT/----- AAAAGAAATG 3070 het 3070 ref 35 23 11 3 AAGAT 1 0 84998 CASAVA_Build 14 46655878 1D ACATCAAAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 51 17 25 9 A 9 8 84999 CASAVA_Build 14 46667179 3D TTATGTGTCA GAT/--- GATAGAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 15 1 GAT 2 1 85000 CASAVA_Build 14 46673731 2D ACACACACAC TA/-- TATATATATA 1163 het 1163 ref 38 23 5 10 TA 9 8 85001 CASAVA_Build 14 46678825 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 715 het 152 hom 8 1 5 2 AC 6 5 85002 CASAVA_Build 14 46680667 4D AGCAGTGGTT AGAG/---- AGAGGGAGGT 3070 het 3070 ref 35 18 14 5 AG 4 2 85003 CASAVA_Build 14 46709649 2D AATTAGATAC AG/-- AGTTATCATA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 AG 2 1 85004 CASAVA_Build 14 46710788 1I AGCTGAAGCA -/G GGGCGAGGCA 2543 het 2543 ref 30 18 8 4 G 3 4 85005 CASAVA_Build 14 46718969 3D TCTTATTCTA TTC/--- TTTAACTTTT 3070 het 379 hom 29 1 16 12 TTC 1 0 85006 CASAVA_Build 14 46737008 1I AAAAAATGTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 T 8 9 85007 CASAVA_Build 14 46738952 4D AACCAAATGC AATG/---- AATAAGGGTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 AATG 1 0 85008 CASAVA_Build 14 46747484 1D CTCTAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1317 hom 31 6 10 16 T 15 14 85009 CASAVA_Build 14 46752583 4I TTTGTTTTAC ----/TGTT TGTTTTCCAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TGTT 1 2 85010 CASAVA_Build 14 46759560 4D CATGGAGTTA TACC/---- TACCTAACCT 3070 het 3070 ref 30 13 13 7 TACC 2 1 85011 CASAVA_Build 14 46760096 3D GACATAGAAT AAG/--- AAGATTTGTA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 AAG 2 1 85012 CASAVA_Build 14 46766611 1I AGTAATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 A 11 12 85013 CASAVA_Build 14 46767351 1D ACTTTATGAT G/- GTGTGAAAAC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 G 2 1 85014 CASAVA_Build 14 46797686 1D GATGAGGCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 9 8 85015 CASAVA_Build 14 46807901 1I ATATTAACAC -/T TTTGGGATTA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 3 4 85016 CASAVA_Build 14 46813976 1D GTTGCTTCAC T/- TTCTTAATGG 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 3 2 85017 CASAVA_Build 14 46817343 1I ATGAAGCCAG -/A AACTCAGACT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 2 3 85018 CASAVA_Build 14 46831064 9D TACCATAAGC TATTATATA/--------- TCATAATCCG 3070 het 3070 ref 46 23 21 8 TATTATATA 1 0 85019 CASAVA_Build 14 46839618 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1310 het 1310 ref 32 21 5 6 T 15 14 85020 CASAVA_Build 14 46842715 2I GATAGCCCAC --/AT GTTTATTAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 0 1 85021 CASAVA_Build 14 46845440 12D CTAATCAGGC ATTTATGGTTTT/------------ ATTTATGGTT 3070 hom 138 het 50 0 46 5 ATTTATGGTTTT 2 1 85022 CASAVA_Build 14 46870143 2I TACATAAATT --/CC CCCCAAAATA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 4 6 85023 CASAVA_Build 14 46883709 1D AGTTACATGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 54 het 24 0 20 4 A 9 8 85024 CASAVA_Build 14 46891363 1D ACCTAGTTTT A/- ACCATCCTGA 3070 hom 117 het 43 0 38 6 A 2 1 85025 CASAVA_Build 14 46898613 1I CTGAGGCAGG -/A AGAATCACTT 3070 het 1054 hom 16 4 10 2 A 1 2 85026 CASAVA_Build 14 46908218 4D TGATGATATC ATTT/---- ATTTAATTCC 3070 het 3070 hom 26 9 14 5 ATTT 2 1 85027 CASAVA_Build 14 46909266 1I TGCTTTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 27 2 20 5 A 10 11 85028 CASAVA_Build 14 46914155 1I GCCTCTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 11 12 85029 CASAVA_Build 14 46915518 3I GTGCCTTTAG ---/TTC TTCTCACCTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TTC 1 2 85030 CASAVA_Build 14 46919441 5I ACTAATAAAG -----/AAGAA AAGAGAGAAG 3070 het 3070 ref 21 14 7 0 AAGAA 0 1 85031 CASAVA_Build 14 46927087 1I GTCTTTATTG -/T TTTTGATTAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 4 5 85032 CASAVA_Build 14 46929340 3I TCCTAAGGAA ---/CTT GAGTAGGAGC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 CTT 0 1 85033 CASAVA_Build 14 46930830 1D AAGCAATTTA G/- AAGCACTAAT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 G 1 0 85034 CASAVA_Build 14 46932360 1I TGCAATTATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 8 9 85035 CASAVA_Build 14 46934169 1I ATTGCAACAT -/A AATATCACAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 2 3 85036 CASAVA_Build 14 46938709 1I ATCATGTCTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 T 7 8 85037 CASAVA_Build 14 46939803 1D TCCGCCTCCC G/- GGGTTCACGC 2151 hom 12 het 5 0 5 0 G 4 3 85038 CASAVA_Build 14 46941286 4D CCCAGAAACC CCCG/---- CCCCCCCACC 3070 het 102 hom 24 1 18 7 CCCG 1 0 85039 CASAVA_Build 14 46942418 4D GTATTTTTCC CTCT/---- CTATTTTCTG 3070 het 3070 ref 59 30 23 8 CT 3 1 85040 CASAVA_Build 14 46943144 1D AATACCAACC T/- TTTTTTTTTT 2244 het 1645 hom 15 4 6 5 T 13 12 85041 CASAVA_Build 14 46943451 1D TACCAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 2735 het 2735 ref 23 11 7 6 A 13 12 85042 CASAVA_Build 14 46952624 1I TAGTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 10 10 T 13 14 85043 CASAVA_Build 14 46955251 1I TCCAAAAAAG -/A AAAAAGAAAT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 A 5 6 85044 CASAVA_Build 14 46960452 2I AAAGCAAAAC --/AG AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 52 29 18 5 AG 0 1 85045 CASAVA_Build 14 46960928 5D GTGACTGTAA TAAAG/----- TATTGTACAA 3070 het 3070 ref 35 21 14 3 TAAAG 1 0 85046 CASAVA_Build 14 46962510 2I TCCCCACGCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 TG 8 9 85047 CASAVA_Build 14 46963367 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2090 hom 41 8 21 12 A 15 14 85048 CASAVA_Build 14 46965751 4I GACTTTAATA ----/TAAT TAAATATATT 2543 het 2543 ref 13 7 6 0 TAAT 0 1 85049 CASAVA_Build 14 46979627 10D ATTCTACACT TTCTGTAGGC/---------- TTCTGTAGGC 3070 het 3070 ref 37 16 15 12 TTCTGTAGGC 2 1 85050 CASAVA_Build 14 46980986 1D GTCTAGTGAA G/- AAAAGATAAA 3070 het 3070 hom 46 23 22 1 G 1 0 85051 CASAVA_Build 14 46985434 3D TAGGGTATGG TTC/--- ACTGTGAAAT 3070 het 3070 hom 43 19 23 2 TTC 1 0 85052 CASAVA_Build 14 46985693 1I AAGTAAAATT -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 A 7 8 85053 CASAVA_Build 14 46988999 2D CGATGTTTTC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 43 14 24 6 TA 6 5 85054 CASAVA_Build 14 46990323 1D GATTTTTTTT C/- CTGATCACTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 C 2 1 85055 CASAVA_Build 14 46991570 1I CATACTGCAA -/C CAGAAATGAC 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 1 2 85056 CASAVA_Build 14 46993816 1I TGACTTTGAG -/A AAAAGATTAA 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 A 4 5 85057 CASAVA_Build 14 46996766 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 42 4 19 19 T 12 11 85058 CASAVA_Build 14 46998364 1D TTAGTTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 T 12 11 85059 CASAVA_Build 14 47007616 1D TCTTATGGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 85 het 36 0 31 5 T 10 9 85060 CASAVA_Build 14 47009074 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 34 het 16 0 11 6 T 10 9 85061 CASAVA_Build 14 47019037 1I TACAAAAAAA -/T TCAATGTTTC 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 T 1 2 85062 CASAVA_Build 14 47021857 1D TGGAGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 18 5 A 13 12 85063 CASAVA_Build 14 47028165 1D CAAAAAAAAA T/- TTGAACTGAA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 3 2 85064 CASAVA_Build 14 47030756 1D AATCTGATTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 103 hom 40 1 36 3 A 10 9 85065 CASAVA_Build 14 47042264 1D TAGGTATCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 11 10 85066 CASAVA_Build 14 47061565 2D TTTTAACAGT TA/-- TACAAGGAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 7 TA 2 1 85067 CASAVA_Build 14 47063203 5D AAAATGTTTG GGGCA/----- GGAAATAAGT 3070 het 3070 hom 42 19 21 4 GGGCA 1 0 85068 CASAVA_Build 14 47067947 7D GAGATTTTAC AAACTTT/------- AAACTTTTTT 3070 hom 35 het 16 0 8 8 AAACTTT 2 1 85069 CASAVA_Build 14 47091758 1D TTACTACCCC T/- AATCTTGCCT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 1 0 85070 CASAVA_Build 14 47092700 3I AGTTCATAAT ---/ATA AGAAAAAATA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATA 0 1 85071 CASAVA_Build 14 47105860 1D TCCATCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 38 2 29 7 T 11 10 85072 CASAVA_Build 14 47125838 2I ACATCTGTCC --/CT GTTTCCAGTG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 CT 0 1 85073 CASAVA_Build 14 47131995 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 A 9 8 85074 CASAVA_Build 14 47141420 1I CTCTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 31 11 8 A 11 12 85075 CASAVA_Build 14 47172162 1I TTTTATTGTT -/C CAAATCTTCC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 C 1 2 85076 CASAVA_Build 14 47174790 3I TGAGTGTAGG ---/TTT TTTAATACAA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 3 6 85077 CASAVA_Build 14 47199692 4D AAAGTAGTAC ACCT/---- GACAGTGGTT 3070 het 3070 ref 27 15 9 5 ACCT 1 0 85078 CASAVA_Build 14 47201455 1I AAGCTTAGAG -/A ATTAAGGCAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 1 2 85079 CASAVA_Build 14 47220729 1I CTCTGACACA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 6 7 85080 CASAVA_Build 14 47223551 1D CATTTTTTCA T/- TTTTATACAG 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 5 4 85081 CASAVA_Build 14 47225279 1I TATTTTTGAG -/T TTATCTGTTT 3070 het 3070 hom 39 16 22 1 T 2 3 85082 CASAVA_Build 14 47231268 1D GTTCTCTTTT C/- CTTATTAGTT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 2 1 85083 CASAVA_Build 14 47233444 12I5M4I GGATGACTAG ------------AGGTG----/ATATACACAGAAAAGTGCATA TTTCAGAATA 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 N/A 0 0 85084 CASAVA_Build 14 47238113 4D AAACTAAACA AAAC/---- AAACAAAGAG 3070 het 3070 hom 38 16 17 7 AAAC 2 1 85085 CASAVA_Build 14 47240259 1D CAGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 2962 het 2962 ref 24 13 7 4 A 13 12 85086 CASAVA_Build 14 47240494 12D TCCAACTTTT CAAGAGGTTGCC/------------ CAAGAAACTG 3070 het 3070 ref 43 21 20 8 CAAGAGGTTGCC 1 0 85087 CASAVA_Build 14 47245714 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 23 7 13 3 A 8 9 85088 CASAVA_Build 14 47248879 1D TGACCCTGGA G/- GGGCAGCAGT 3070 hom 99 het 39 0 33 7 G 4 3 85089 CASAVA_Build 14 47252731 1I GGAAATACTG -/A TGAAGCAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 0 1 85090 CASAVA_Build 14 47253047 1I TACTTTTTCA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 7 8 85091 CASAVA_Build 14 47255480 4I TCTTGACCTT ----/TTAA TTAATTGTCA 3070 het 3070 ref 46 34 7 5 TTAA 1 2 85092 CASAVA_Build 14 47271289 1I AGAAATTGCA -/T TTTTTTTATA 2010 het 2010 ref 23 15 5 3 T 7 8 85093 CASAVA_Build 14 47285654 4D ATATATGTGC TATA/---- TATATATATA 2314 het 1973 hom 12 4 6 3 TA 7 5 85094 CASAVA_Build 14 47294175 1D AAATATATGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 10 9 85095 CASAVA_Build 14 47314565 1I ATTCTGAGGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 8 9 85096 CASAVA_Build 14 47319037 3D GCCCGGCTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2118 het 1464 hom 16 7 6 4 T 14 11 85097 CASAVA_Build 14 47323854 1I TGAAGAAGAC -/A ATTGTTCAGA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 1 2 85098 CASAVA_Build 14 47331517 2I ACTTCAACAT --/AG AGACTTTCAG 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 AG 1 2 85099 CASAVA_Build 14 47342060 2D ATTTCTGAAG AC/-- ACATATAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 19 6 AC 2 1 85100 CASAVA_Build 14 47344335 1D CTATTTATTG T/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 T 7 6 85101 CASAVA_Build 14 47349261 2I TTTCATGCAT --/CA AGGTTTTGTA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 CA 0 1 85102 CASAVA_Build 14 47350580 1D TGCTCTGATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3019 hom 22 8 9 5 T 10 9 85103 CASAVA_Build 14 47351756 1D AGTTTTTGAT C/- CATATTGAGT 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 C 2 1 85104 CASAVA_Build 14 47370399 1I TAGCTAATTA -/T TTTGCAATAA 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 T 3 4 85105 CASAVA_Build 14 47372395 1D TTGTAACTTT A/- AATCACTTAC 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 A 3 2 85106 CASAVA_Build 14 47373110 1I27M5D ACTAAGTAAA -TTTGTTTATAAATATTTTCAACAAGAAACTTT/TTTTGTTTATAAATATTTTCAACAAGAA----- ACTTTGGTCT 3070 het 3070 ref 30 22 12 3 N/A 0 0 85107 CASAVA_Build 14 47373477 1I TTGCAAGGTT -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 6 7 85108 CASAVA_Build 14 47373968 8D AGAAGATCAG TGGCTTGC/-------- TGGGGTCATT 3070 het 3070 ref 43 23 17 7 TGGCTTGC 1 0 85109 CASAVA_Build 14 47376868 4D TTCTTTTGAA TATT/---- TTTGTTTATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TATT 1 0 85110 CASAVA_Build 14 47377061 5D AAAAATAACT TTATA/----- TTATATGTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 6 TTATA 2 1 85111 CASAVA_Build 14 47377345 1D TTTTGGATTG T/- TTTTTATCTT 3070 hom 27 het 21 0 10 11 T 6 5 85112 CASAVA_Build 14 47377385 2I56M1I TATATAAAAC --GAATTTTCTATCCTTTGTCTATATATAAAATATAAAAACTATATGTAAAACTATAT-/TTGAATTTTCTATCCTTTGTCTATATATAAAATATAAAAACTATATGTAAAACTATATA AAATCTTCAT 3070 hom 52 het 20 0 18 13 N/A 0 0 85113 CASAVA_Build 14 47378347 1I GATATTTTTT -/G GGGGGGGATA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 7 8 85114 CASAVA_Build 14 47378771 1D TATTACCATA T/- TTTTTTGATG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 6 85115 CASAVA_Build 14 47379072 3D TGAGTTCAGG CGA/--- TAATGATATA 3070 hom 58 het 30 0 20 10 CGA 1 0 85116 CASAVA_Build 14 47380408 1D CATGATCTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 25 15 12 T 10 9 85117 CASAVA_Build 14 47380655 1I AATCTCCAGA -/C CCCTTTCCAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 3 4 85118 CASAVA_Build 14 47380929 4D GAGGTTATTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 TTTG 3 2 85119 CASAVA_Build 14 47383716 2I TTTTTTTTTT --/TC TTTTTGCAAT 3070 het 3021 hom 48 12 21 15 TC 0 1 85120 CASAVA_Build 14 47391206 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAACTAT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 7 6 85121 CASAVA_Build 14 47392835 1D TGTGAATGCA T/- TATGTACCTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 1 85122 CASAVA_Build 14 47396362 1I TAAACCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 T 11 12 85123 CASAVA_Build 14 47398585 4D TTCTTGTTGA TTTG/---- TTTATGTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 TTTG 1 0 85124 CASAVA_Build 14 47399916 1D ATTCAACCAA T/- TGCAGATCAG 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 T 2 1 85125 CASAVA_Build 14 47400752 14I GTCCATTGCT --------------/AAGTTTATGTGTCC ATAATTAAGT 3070 het 3070 hom 61 24 33 4 AAGTTTATGTGTCC 0 1 85126 CASAVA_Build 14 47405403 3D TATTAAAAAA ATC/--- ACTAAAAATT 3070 het 3070 ref 41 22 17 4 ATC 1 0 85127 CASAVA_Build 14 47408531 1I TAAGTTCCAC -/T TTTTCCCCTC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 4 5 85128 CASAVA_Build 14 47409379 1I TCCAACAAGG -/C CTAGGCTTCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 85129 CASAVA_Build 14 47417733 3D TTTACTATAA TAT/--- TATTATAAAT 3070 het 3070 hom 22 11 10 3 TAT 3 2 85130 CASAVA_Build 14 47422813 1D TTCATCTGGG A/- AAAAAAAAAT 1107 het 1107 ref 46 37 3 7 A 10 9 85131 CASAVA_Build 14 47427674 1I TTTATTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 18 1 13 4 A 15 16 85132 CASAVA_Build 14 47433541 1I GTTTGAGGTA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 6 7 85133 CASAVA_Build 14 47434088 1D CTCAATGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 39 2 27 10 T 13 12 85134 CASAVA_Build 14 47447727 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAGAGTA 3070 hom 77 het 32 0 25 8 A 6 5 85135 CASAVA_Build 14 47452128 1I CTCACCCTTC -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 7 8 85136 CASAVA_Build 14 47454074 1D TTGCCTGCTG C/- CCATTCAGGT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 C 3 2 85137 CASAVA_Build 14 47462167 1D AGTTTAATTG T/- TTTAATTTTG 3070 het 3070 hom 48 20 26 3 T 4 3 85138 CASAVA_Build 14 47471774 1I GCTATTCCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 9 10 85139 CASAVA_Build 14 47472051 1I TTTCTTCTGC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 7 8 85140 CASAVA_Build 14 47485242 5D TAGTCCCCAA CAAAC/----- CAAACCAAAC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 CAAAC 4 3 85141 CASAVA_Build 14 47485428 1D ACCCACTATT G/- GAAACCAGTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 2 1 85142 CASAVA_Build 14 47490807 1D AAACAATGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 40 0 34 8 T 10 9 85143 CASAVA_Build 14 47492548 1D AGTTAACTAT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 49 het 20 0 17 3 A 8 7 85144 CASAVA_Build 14 47495914 8I CAGATATCTC --------/TATTTATG TATTTATGTA 3070 hom 45 het 25 0 16 9 TATTTATG 1 2 85145 CASAVA_Build 14 47497375 3I ATTTTCGTAA ---/ACT ACTACAAGAT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 ACT 1 2 85146 CASAVA_Build 14 47504784 1I TACTCAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 839 hom 24 3 18 3 T 10 11 85147 CASAVA_Build 14 47505522 1I GGCAAAAAGC -/A AAAGGCAGAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 3 4 85148 CASAVA_Build 14 47506855 1I CTCAGAAAAA -/T TTTTAGAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 4 5 85149 CASAVA_Build 14 47528512 4D TGCTTACCTC TATT/---- TAATATTGTT 3070 het 3070 hom 38 18 16 5 TATT 1 0 85150 CASAVA_Build 14 47531966 3D TAATACAGTT TAC/--- TATGATTTAG 3070 het 3070 hom 17 7 8 4 TAC 1 0 85151 CASAVA_Build 14 47536681 2I CTTTGATAAC --/TT TCTGCCAATT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 1 3 85152 CASAVA_Build 14 47557258 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTGTTAT 2838 het 1951 hom 12 4 6 3 TGTT 1 0 85153 CASAVA_Build 14 47561425 1D TGTCATCAAT G/- TATTAGATTA 589 het 589 ref 9 5 2 2 G 1 0 85154 CASAVA_Build 14 47564178 1D CATAATCTAC T/- TTTGCCTCAC 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 4 3 85155 CASAVA_Build 14 47565907 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 19 9 T 13 12 85156 CASAVA_Build 14 47573885 2I GTTCTTGTAC --/TG TGTTTCTCAG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TG 1 2 85157 CASAVA_Build 14 47582626 1D ACAACTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 710 hom 40 3 33 4 T 12 11 85158 CASAVA_Build 14 47584083 1I ACTTCCGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 30 1 27 2 A 11 12 85159 CASAVA_Build 14 47595005 1I TGCCTTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 95 het 37 0 30 7 A 9 10 85160 CASAVA_Build 14 47597613 1D GGAAATTTTC T/- TTTACAAGTT 3070 het 3070 ref 51 25 20 7 T 4 3 85161 CASAVA_Build 14 47609763 5D AAGAATAAAT AAAAG/----- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 17 10 7 2 AAAAG 1 0 85162 CASAVA_Build 14 47614436 4I GAAAGAAAAG ----/GAGA GAGAGAAAGC 2477 het 2477 ref 32 23 7 2 GA 3 5 85163 CASAVA_Build 14 47614493 6D35M4I AAGGAAGGAG AGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAAAGAGAAAGAAAGACAAGAG----/------AGAGAAAGAGAAAGAAAGAGAAAGAAAGACAAGAGAAGA AAGAAAGAAA 2414 het 2414 ref 23 11 8 8 N/A 0 0 85164 CASAVA_Build 14 47615092 3D ATTACATACA TCT/--- TCTCCTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 TCT 2 1 85165 CASAVA_Build 14 47625433 1I TTTCATATAC -/A AGGGGAGCTA 3070 hom 95 het 36 0 33 3 A 1 2 85166 CASAVA_Build 14 47633926 1I GTAGAATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 T 13 14 85167 CASAVA_Build 14 47641694 2D TCCCATCAGG TC/-- TCTCCCGCAA 3070 het 3070 hom 56 23 25 8 TC 3 2 85168 CASAVA_Build 14 47648194 1I GTATTTGTTT -/C TTTCTCCCAG 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 C 0 1 85169 CASAVA_Build 14 47671747 1D ATACCACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 12 11 85170 CASAVA_Build 14 47674981 5D TTGTATCCAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 773 hom 24 4 11 11 A 18 13 85171 CASAVA_Build 14 47712385 1I CCATTTCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3038 hom 28 7 12 9 A 12 13 85172 CASAVA_Build 14 47723916 3I AGCATATGAA ---/AAT AATGTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AAT 1 2 85173 CASAVA_Build 14 47736901 11D TTGATACTAG AAAGTCTTATA/----------- ACAGCTTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 6 AAAGTCTTATA 1 0 85174 CASAVA_Build 14 47745514 1I TATGACCTGT -/G GTAATATTGG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 G 1 2 85175 CASAVA_Build 14 47761593 3D CATTTGTCAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 20 13 10 A 14 11 85176 CASAVA_Build 14 47762661 1D TAAAATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 11 10 85177 CASAVA_Build 14 47771741 5D TAGTGAACTT AGAAG/----- AAGAGGAAAT 3070 het 3070 hom 44 16 27 3 AGAAG 1 0 85178 CASAVA_Build 14 47789237 4I AATTTAACCT ----/TATA TAAAGTAATG 2206 het 2206 ref 28 17 6 5 TA 1 3 85179 CASAVA_Build 14 47793654 1I TCATATGACT -/A AAGTTCTATT 3070 het 3070 ref 61 30 21 10 A 2 3 85180 CASAVA_Build 14 47806100 2I GCGCAGAAAC --/AA GGGATCGGGG 2814 het 2814 ref 25 13 8 4 A 0 2 85181 CASAVA_Build 14 47809635 3D TTTAATATAA TAT/--- TAATCAGTCA 3070 het 3070 hom 20 8 11 2 TAT 1 0 85182 CASAVA_Build 14 47812882 1D CTGTACGTGA T/- TTTTGCCTAA 3070 het 3070 ref 58 29 26 3 T 5 4 85183 CASAVA_Build 14 47813878 1I AAACAACCAC -/A AAAAAAAAAA 1937 het 675 hom 20 5 9 6 A 12 13 85184 CASAVA_Build 14 47816930 2I GTAGCAGAAA --/AC ACTCAAAGAA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 AC 1 2 85185 CASAVA_Build 14 47827137 1I3M3I ATTCATGTAT -CAT---/GCATGAA AGCAAGGTTA 2433 het 2433 ref 24 15 6 3 N/A 0 0 85186 CASAVA_Build 14 47827785 1I TCCGAGAAGG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 7 8 85187 CASAVA_Build 14 47828247 2D GAGTTCATTA GC/-- ATAAAAACCT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 GC 1 0 85188 CASAVA_Build 14 47830585 2D AAAAGAGTTC AT/-- TTTTTTTTTT 2769 het 2769 ref 32 16 13 4 AT 1 0 85189 CASAVA_Build 14 47831746 3I13M3D AAAATAGATC ---ATTATTGACAAATAAC/ATTATTATTGACAAAT--- AATTTTATAT 3070 het 3070 ref 34 19 16 3 N/A 0 0 85190 CASAVA_Build 14 47832258 4D TATCTATCTA TCTT/---- CTATGGATCT 3070 het 3070 hom 46 16 28 3 TCTT 1 0 85191 CASAVA_Build 14 47833438 5D CTCATATAAT TTATA/----- TTATAATATG 3070 het 3070 hom 28 12 15 3 TTATA 2 1 85192 CASAVA_Build 14 47833967 4D TACGTCCCAT GTTA/---- GTTTTCTATA 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 GTTA 1 0 85193 CASAVA_Build 14 47834168 3D GGGAGTTTCC AAG/--- AAGGTTCCCA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AAG 2 1 85194 CASAVA_Build 14 47834380 1D GTAACCTATT A/- AACCCATTCA 3070 het 3070 ref 40 26 12 3 A 3 2 85195 CASAVA_Build 14 47836383 1D TTGTTTTTGG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 A 7 6 85196 CASAVA_Build 14 47836737 1I ATGCTCCTGA -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 T 6 7 85197 CASAVA_Build 14 47839403 4I ATTTCTACAC ----/ACTA ACAATAAAGA 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 ACTA 0 1 85198 CASAVA_Build 14 47839972 2I AGGAGAACTC --/TA TGTCTACATT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 TA 0 1 85199 CASAVA_Build 14 47840863 2D16M4D GTTAAAAATC AGAAAATTTTGTAAAAATAAAG/--AAAATTTTTTAAAAAT---- GAAGAGAAGA 3070 het 3070 hom 31 16 19 4 N/A 0 0 85200 CASAVA_Build 14 47841567 3D ATTTACTGTG AAC/--- AACATGTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 AAC 2 1 85201 CASAVA_Build 14 47843831 1I TCTGCTGTAG -/T TCTGATAATG 3070 het 3070 hom 48 23 19 6 T 1 2 85202 CASAVA_Build 14 47848084 1D GCAAAAAATA T/- TTTCAAAGAG 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 4 3 85203 CASAVA_Build 14 47856036 7I AAACAAACAT -------/AAAAGTA TAAAGAGGTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AAAAGTA 0 1 85204 CASAVA_Build 14 47865188 1D TTTTTTGTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 12 26 7 A 10 9 85205 CASAVA_Build 14 47871261 1D ACTAAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 821 hom 15 3 12 0 A 9 8 85206 CASAVA_Build 14 47873777 5D GGTTTTCTGT TTCTG/----- TTCTGTATTA 3070 hom 93 het 36 0 32 6 TTCTG 2 1 85207 CASAVA_Build 14 47889740 6I TTGTTTTTCA ------/TTATAT TTATACGTTT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 TTATAT 0 1 85208 CASAVA_Build 14 47908187 1D TTTTGAAGGA T/- TTTTTGTGTC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 6 5 85209 CASAVA_Build 14 47915187 5I CTCAGTTAAA -----/TATAT TAAATTAGTC 3070 het 3070 hom 42 21 20 1 TATAT 0 1 85210 CASAVA_Build 14 47943346 12I GACTGATGCA ------------/TGTATATATATG TGTATATATA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 TGTATATATATG 1 2 85211 CASAVA_Build 14 47951588 1D TTTTGTTCTT G/- CGATAGTTTA 2913 het 2489 hom 11 5 6 0 G 1 0 85212 CASAVA_Build 14 47956316 1D CTGATTTCAC A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 51 25 24 2 A 8 7 85213 CASAVA_Build 14 47957013 1I ACCTATTCCT -/G GGGTGTAGAG 3070 het 3070 ref 50 29 15 6 G 3 4 85214 CASAVA_Build 14 47959273 4D TGTTTATTTT ATAA/---- ATAAATTACA 3070 het 3070 ref 47 24 16 10 ATAA 2 1 85215 CASAVA_Build 14 47959800 4D AAACATTGTA TTAG/---- TTAGTCTGTG 3070 het 3070 hom 39 19 20 0 TTAG 2 1 85216 CASAVA_Build 14 47960250 1D ATCTGCTTAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 T 8 7 85217 CASAVA_Build 14 47962988 22D GTACAAAAGA AGCTACTAAAAATGAGTTAGGT/---------------------- AAAAGGACAC 3070 het 3070 ref 33 24 14 6 AGCTACTAAAAATGAGTTAGGT 1 0 85218 CASAVA_Build 14 47963605 4D AGATACATGG ATAA/---- ATAAATAAAA 3070 het 3070 ref 57 27 26 6 ATAA 3 2 85219 CASAVA_Build 14 47965521 4D TATTTTGATA TAAT/---- TAATTACTAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 TAAT 2 1 85220 CASAVA_Build 14 47965750 4I AAAAAAAAAA ----/ATCC ATCCAACATG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 ATCC 1 2 85221 CASAVA_Build 14 47966512 1D TTTAACAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 9 8 85222 CASAVA_Build 14 47967449 1I AACTGTATTC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 49 20 21 8 A 8 9 85223 CASAVA_Build 14 47967532 1D TAAAAACTTG A/- AACAAGCTGA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 3 2 85224 CASAVA_Build 14 47970750 1D TGCCTCTGTC A/- TTGTATCAGC 3070 het 3070 hom 47 17 26 5 A 1 0 85225 CASAVA_Build 14 47971705 1D TTGGTTAAAA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 8 7 85226 CASAVA_Build 14 47973149 8D TATCAATTTG AATTGGTT/-------- AATTGTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 AATTGGTT 1 0 85227 CASAVA_Build 14 47973373 1I26M11D TTCTGTGGGA -TTTTTTTTTCTTTATTATTTCCTTTCTATTTCCTTTG/TTTTTTTTTTCTTTATTATTTCCTTTC----------- GGCTTAACTT 3070 het 2048 hom 20 8 17 10 N/A 0 0 85228 CASAVA_Build 14 47975139 2I GTGTGCGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 1803 hom 28 6 9 13 GT 7 8 85229 CASAVA_Build 14 47977655 1I TAAGAAAAAA -/G AAAAACTTCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 0 1 85230 CASAVA_Build 14 47987717 4D TTTTTGAAAT ATTA/---- ATTGATGTTT 3070 het 3070 hom 41 16 22 5 ATTA 1 0 85231 CASAVA_Build 14 47994093 1D CATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 31 0 18 13 T 13 12 85232 CASAVA_Build 14 47995354 4D AATCAGCTGT TTTC/---- TTTCTTTATT 3070 hom 87 het 37 0 29 9 TTTC 2 1 85233 CASAVA_Build 14 47996532 1D AAAGTTATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 35 2 27 7 A 11 10 85234 CASAVA_Build 14 47998377 2D ATTTTTGAAA AC/-- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 AC 1 0 85235 CASAVA_Build 14 48005293 1I GAATCAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 13 14 85236 CASAVA_Build 14 48005978 1D TTAAAATACT C/- TAAAAGATTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 C 1 0 85237 CASAVA_Build 14 48010729 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 32 1 23 9 A 15 14 85238 CASAVA_Build 14 48016262 10I CATTCAATGA ----------/TAAATGAAAT TAAAAACTAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TAAATGAAAT 0 1 85239 CASAVA_Build 14 48017741 1D GGAAGCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 T 13 12 85240 CASAVA_Build 14 48026500 4D TTTATACGTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 41 0 29 14 TTTG 5 4 85241 CASAVA_Build 14 48029429 1I TGGATCATGG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 7 8 85242 CASAVA_Build 14 48055336 4I ATATGTATAA ----/TTGT TTATGTGTAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TTGT 0 1 85243 CASAVA_Build 14 48056692 1D TTATCCTGTG A/- AGATATTTCA 3070 hom 69 het 28 0 24 7 A 2 1 85244 CASAVA_Build 14 48059057 1I ATAAAAAGTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 12 het 38 1 32 5 A 8 9 85245 CASAVA_Build 14 48059223 1D TCAGTAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 85246 CASAVA_Build 14 48059618 1I TTTCTAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1541 hom 36 4 25 7 A 11 12 85247 CASAVA_Build 14 48061600 1D GACTAGGGAT A/- AAAAAAAAAA 1504 het 1504 ref 21 10 5 7 A 14 13 85248 CASAVA_Build 14 48062918 1I CTGACTCTGT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 8 9 85249 CASAVA_Build 14 48064707 1D CTAGTAAAAT G/- ACAAAATCTA 3070 het 2830 hom 32 7 22 3 G 1 0 85250 CASAVA_Build 14 48064999 1D AATTTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 A 11 10 85251 CASAVA_Build 14 48074208 1D TATTATTTTG A/- AAAAAATTTA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 7 6 85252 CASAVA_Build 14 48082215 3I CCATTTTCTC ---/AAT GATATGTGGG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AAT 0 1 85253 CASAVA_Build 14 48084219 1D TATTATCTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 9 8 85254 CASAVA_Build 14 48088153 1D CACAACCTGA T/- CTTCAAACTA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 1 0 85255 CASAVA_Build 14 48098929 1I TAAAAGATTT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 7 8 85256 CASAVA_Build 14 48114856 4D AAGGTGGGCT CCCC/---- CCTGTTCGAG 2131 het 1565 hom 18 6 10 3 C 6 2 85257 CASAVA_Build 14 48116182 1D TAGATTTTAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 9 8 85258 CASAVA_Build 14 48124681 4I AAACCTTGTA ----/TAAC TAACTATAGG 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 TAAC 1 2 85259 CASAVA_Build 14 48128082 1D TCTTTGGTGA G/- CAACTTCTGT 3070 het 3070 ref 51 21 21 10 G 1 0 85260 CASAVA_Build 14 48149341 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 8 7 85261 CASAVA_Build 14 48153633 1D AAATTTTTTT A/- AAAAAAATTT 2210 het 1707 hom 11 5 5 1 A 8 7 85262 CASAVA_Build 14 48156863 38D TGTATACACC TATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------- TATATATATA 3034 het 554 hom 13 3 8 4 TA 25 6 85263 CASAVA_Build 14 48169311 1I TGAATTATTC -/T TTTTTTTTTA 1529 het 1529 ref 26 12 7 7 T 9 10 85264 CASAVA_Build 14 48171519 1D TTCAATCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 10 9 85265 CASAVA_Build 14 48176719 1I AAGCCAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2414 hom 33 8 17 8 A 9 10 85266 CASAVA_Build 14 48176870 4I CTCACCAACC ----/AACT ATCTGTTGCC 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 AACT 0 1 85267 CASAVA_Build 14 48184089 1I TTTAGCGGAC -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 A 6 7 85268 CASAVA_Build 14 48189142 1I TACAATAAAA -/G CTATTGGAAC 3070 het 3070 hom 53 21 22 10 G 0 1 85269 CASAVA_Build 14 48192111 1D AATAAAAAAG A/- GAAAAGTACA 3070 het 3070 hom 34 12 20 3 A 1 0 85270 CASAVA_Build 14 48206885 1I AATATTTGGT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2734 hom 25 8 14 3 A 8 9 85271 CASAVA_Build 14 48216731 1D CTCACAAGAT A/- ACTGAATTCA 3070 hom 147 het 56 0 48 8 A 2 1 85272 CASAVA_Build 14 48219336 2I TTTTTATCTC --/TT GTTTTCTTTG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 0 2 85273 CASAVA_Build 14 48219710 1D ATGTTTATTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 28 0 25 9 T 9 8 85274 CASAVA_Build 14 48222252 4D TATTAATGAC TTAT/---- TTATATGCAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 3 TTAT 2 1 85275 CASAVA_Build 14 48295797 3I TAAGCAAAAC ---/ATT ATTATCTCTA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 ATT 1 2 85276 CASAVA_Build 14 48298129 23D AGTATCAGAT GGATTCACAGCTGAATTCTATCA/----------------------- GACATTCAAA 3070 het 3070 ref 29 19 14 7 GGATTCACAGCTGAATTCTATCA 1 0 85277 CASAVA_Build 14 48306717 3I TAAAATGCTA ---/TTT TTTTTTTTTT 2704 het 2704 ref 29 12 9 8 T 12 15 85278 CASAVA_Build 14 48312706 6D TACATTCATA TTTAGT/------ TTTAGTCATT 2254 het 2197 hom 25 7 9 10 TTTAGT 2 1 85279 CASAVA_Build 14 48313695 4I TGTCAAGGAT ----/ACAC ACACTAAGCA 3070 het 3070 ref 53 26 17 10 AC 2 4 85280 CASAVA_Build 14 48314759 1I TCCTTTTTTT -/A TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 A 0 1 85281 CASAVA_Build 14 48325864 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1737 het 1737 ref 29 10 9 11 TG 8 7 85282 CASAVA_Build 14 48328119 1D TATATTAAAG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 7 6 85283 CASAVA_Build 14 48336242 2I GAAAAAAAAA --/AG AGAATGGTCA 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 AG 1 2 85284 CASAVA_Build 14 48351878 1I ACTATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 11 12 85285 CASAVA_Build 14 48366956 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 36 15 17 4 TA 7 6 85286 CASAVA_Build 14 48386620 3D CTTATAGGGC TCA/--- TCATGTCCTG 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 TCA 2 1 85287 CASAVA_Build 14 48410399 2I AGGAGCTAAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 63 het 28 0 21 7 AC 8 9 85288 CASAVA_Build 14 48440650 4I AGAATTTCAT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 TTTC 2 3 85289 CASAVA_Build 14 48441166 1D GGCTGTCATG A/- AAAAAAAAAA 2827 het 2827 ref 41 16 11 15 A 18 17 85290 CASAVA_Build 14 48442538 1I ATGGAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 10 11 85291 CASAVA_Build 14 48460084 1I GCAGTGGCTC -/A ACGCCTGTAA 2338 hom 15 het 9 0 6 3 A 1 2 85292 CASAVA_Build 14 48462330 1I AAAACTCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 290 hom 31 1 28 2 A 9 10 85293 CASAVA_Build 14 48464675 1D TGTCCCCCAC A/- AAAAATTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 6 5 85294 CASAVA_Build 14 48476661 3D TTTCAGAGGT ATG/--- ATGACCTGGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATG 2 1 85295 CASAVA_Build 14 48493857 2D TTATATAGAC CT/-- AGCTTGCTGT 3070 hom 123 het 54 0 42 12 CT 1 0 85296 CASAVA_Build 14 48506502 4D CTGATGGAAG TACA/---- TACATAGCAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TACA 2 1 85297 CASAVA_Build 14 48514368 1I TAGATAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 10 11 85298 CASAVA_Build 14 48520950 5D TGAGCTATTT AACAC/----- AACACACTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 9 AACAC 2 1 85299 CASAVA_Build 14 48525016 1D TGGTGACCTC T/- TTATCCCATG 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 T 3 2 85300 CASAVA_Build 14 48526244 1I TGCAGAAAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 7 8 85301 CASAVA_Build 14 48534466 1D AAACATCTTC T/- ATGGGATTTT 3070 het 875 hom 33 4 21 8 T 1 0 85302 CASAVA_Build 14 48534485 1D TTCTAAGAAA T/- TAGAATGAGC 3070 het 900 hom 35 4 23 9 T 2 1 85303 CASAVA_Build 14 48534597 1I TAAAAATAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 8 20 15 A 9 10 85304 CASAVA_Build 14 48538395 5I ATTACTTACA -----/TTACT TTAATAACCA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TTACT 0 1 85305 CASAVA_Build 14 48539227 1D GGCAAAATCC T/- TTCTCTACTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 T 3 2 85306 CASAVA_Build 14 48547989 1I ACTCTACTTT -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 6 7 85307 CASAVA_Build 14 48558147 1D GGGGCTTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 11 10 85308 CASAVA_Build 14 48568227 2D TCTGTTTTCT CA/-- GTGTTCTTCC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 CA 1 0 85309 CASAVA_Build 14 48600326 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 9 8 85310 CASAVA_Build 14 48613297 1D AATGAAATAT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 9 8 85311 CASAVA_Build 14 48614022 4I GACGGGAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 2737 het 2737 ref 27 12 8 7 AG 5 7 85312 CASAVA_Build 14 48617278 2D ACATGATCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 44 11 23 10 TC 6 5 85313 CASAVA_Build 14 48623611 1I GTCTTAACAT -/C AATGGACCCA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 C 0 1 85314 CASAVA_Build 14 48625786 1D TGCCTCGCTA C/- CATACTATTC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 C 2 1 85315 CASAVA_Build 14 48651693 1I AATTGTTTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 8 9 85316 CASAVA_Build 14 48654172 1I CACCACAATC -/T TGGGAGGCAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 1 2 85317 CASAVA_Build 14 48656482 1I ATAAGTATCT -/A AAAAAAAAAA 2704 het 1406 hom 19 6 9 4 A 13 14 85318 CASAVA_Build 14 48660993 1D TCAAATAAAC A/- AAAAAAAAAA 2786 het 2786 ref 24 13 8 4 A 15 14 85319 CASAVA_Build 14 48674531 1D AATAATTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 13 8 T 10 9 85320 CASAVA_Build 14 48676114 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAATAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 18 14 4 TA 1 0 85321 CASAVA_Build 14 48685153 1I GCTTTGTTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 9 85322 CASAVA_Build 14 48691288 1D CTGCACACAC A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 35 14 21 0 A 7 6 85323 CASAVA_Build 14 48705068 13D TCTGCATTAC ATATGAAAGTTTA/------------- GAGAATTCAT 3070 het 3070 hom 42 18 23 6 ATATGAAAGTTTA 1 0 85324 CASAVA_Build 14 48707462 1I TCTACAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 10 11 85325 CASAVA_Build 14 48710150 4I ACAAACTAAA ----/AAAT AAAAAAAAAA 1343 het 618 hom 47 10 9 28 AAAT 0 1 85326 CASAVA_Build 14 48710546 1I TCGAGACTGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 7 8 85327 CASAVA_Build 14 48710809 1I TCTCAATAAC -/A GAATTGATCA 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 A 0 1 85328 CASAVA_Build 14 48717206 1D AGAAAGATCC A/- AAAATCAACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 5 4 85329 CASAVA_Build 14 48721464 1D GGTAATTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 12 11 85330 CASAVA_Build 14 48742550 1D AAGCAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 124 het 49 0 41 8 A 11 10 85331 CASAVA_Build 14 48742780 14I AAGCAAAGAT --------------/TTAATACACAGATA TTAATGTAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 6 TTAATACACAGATA 0 1 85332 CASAVA_Build 14 48759726 1D TACCCCCCAG A/- AAAACTCTGA 3070 het 3070 hom 30 10 15 6 A 5 4 85333 CASAVA_Build 14 48822920 1D TCCTTATTGG C/- AGTCATTAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 0 85334 CASAVA_Build 14 48828898 1I TGGAGAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 10 11 85335 CASAVA_Build 14 48842568 1I TCAAAGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 A 10 11 85336 CASAVA_Build 14 48843169 2D CATTTATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 TA 6 5 85337 CASAVA_Build 14 48854371 1D AACAGACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 9 A 13 12 85338 CASAVA_Build 14 48858019 1D GGCATGCCAT G/- GTAAGGAGAT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 G 2 1 85339 CASAVA_Build 14 48861207 1D CACATATGGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 9 8 85340 CASAVA_Build 14 48861355 2D ATATTCACAT AC/-- ATAGCCCAGT 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 AC 1 0 85341 CASAVA_Build 14 48874193 1I CTTTCTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 13 14 85342 CASAVA_Build 14 48878692 1I GAGTTCCTCA -/T TGGGGATGGC 3070 hom 127 het 58 0 51 7 T 1 2 85343 CASAVA_Build 14 48880034 1D CCCTCTCTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 9 8 85344 CASAVA_Build 14 48880227 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 2952 het 2952 ref 27 15 8 4 TA 6 7 85345 CASAVA_Build 14 48882476 3I AGGGAACATA ---/GAG GAGGAAATGA 3070 hom 89 het 33 0 28 5 GAG 1 2 85346 CASAVA_Build 14 48883905 1D CGTGCTTTTG A/- AAAATGTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 A 5 4 85347 CASAVA_Build 14 48885054 1D AGGTGGGCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 10 9 85348 CASAVA_Build 14 48885310 1I GTTTGGTTTT -/C TGTTCTTGTG 3070 hom 106 het 40 0 36 4 C 0 1 85349 CASAVA_Build 14 48887964 1I TAATCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 28 1 20 7 A 10 11 85350 CASAVA_Build 14 48888385 1D CACTGTGGTC T/- TGAGAGACTG 3070 hom 36 het 13 0 13 1 T 2 1 85351 CASAVA_Build 14 48891823 1I ATTGTAATTC -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 6 7 85352 CASAVA_Build 14 48894375 9D CTGAAAACCA TGCCATGAG/--------- AACTTTGTGA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 TGCCATGAG 1 0 85353 CASAVA_Build 14 48904287 1I GCCTGACAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 85354 CASAVA_Build 14 48911004 1I ATTAATAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 8 9 85355 CASAVA_Build 14 48912809 4D ACTCCATCTC AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 hom 22 7 14 1 AATA 3 2 85356 CASAVA_Build 14 48972972 1D TATTTTCCCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 9 85357 CASAVA_Build 14 49025683 1I ATAATCAAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 33 17 16 0 T 7 8 85358 CASAVA_Build 14 49028637 1D ACATTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 31 1 26 4 A 12 11 85359 CASAVA_Build 14 49035404 1D AAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 159 hom 17 1 12 4 T 14 13 85360 CASAVA_Build 14 49039860 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 A 17 14 85361 CASAVA_Build 14 49041154 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 8 7 85362 CASAVA_Build 14 49065901 1I TTCACTGCTG -/A ATTCTATCAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 A 1 2 85363 CASAVA_Build 14 49067813 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 7 8 85364 CASAVA_Build 14 49069841 1D TAGATCTAGC T/- TTTTTAGGCA 3070 het 3070 ref 45 24 18 4 T 6 5 85365 CASAVA_Build 14 49074545 1I GTCCACACTT -/A ACTCAGAAAT 3070 het 3070 hom 62 24 24 14 A 1 2 85366 CASAVA_Build 14 49078460 1D ATCATGGGGG T/- GGGTTTCCCC 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 T 1 0 85367 CASAVA_Build 14 49096687 2D TAAGCACCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 11 9 T 14 12 85368 CASAVA_Build 14 49105639 2I AGAAAAGCCT --/AA GTTTAACAAC 3070 het 3070 ref 56 27 22 7 A 0 2 85369 CASAVA_Build 14 49112758 1D TTTGGTAGAT A/- GGGGATCTCC 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 1 0 85370 CASAVA_Build 14 49121398 2I CCAAAAGTTT --/CA CACAGTCAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 CA 2 3 85371 CASAVA_Build 14 49129377 1D ACCGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 10 5 A 13 12 85372 CASAVA_Build 14 49134128 2I AAGTAATTTC --/TT TTTTTTTTTT 2554 het 2554 ref 31 11 8 12 T 12 14 85373 CASAVA_Build 14 49139695 1I TTGCAGGTTT -/G TTTGAAGAGG 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 G 0 1 85374 CASAVA_Build 14 49141289 7D GGTGGTTTTT TTCTGCC/------- TTCTGCCCTC 1745 het 1745 ref 17 13 4 2 TTCTGCC 2 1 85375 CASAVA_Build 14 49152227 1I ATGTTTATTA -/T TTTTGTCATA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 T 4 5 85376 CASAVA_Build 14 49154145 4D TCTTATAACC CCTA/---- CCTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 40 19 20 5 CCTA 1 0 85377 CASAVA_Build 14 49160563 1I CCATCTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2986 hom 29 9 13 7 A 13 14 85378 CASAVA_Build 14 49169168 1D CCCGCCTTGG C/- CCCCCCAAAG 2543 het 1184 hom 16 4 6 7 C 7 6 85379 CASAVA_Build 14 49169384 1D TTTTAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 17 0 11 6 T 11 10 85380 CASAVA_Build 14 49175454 12D CAGTCTAATG TCAGAATACTCT/------------ TGACTCCTGT 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 TCAGAATACTCT 1 0 85381 CASAVA_Build 14 49180226 4D ATAGGTATAG TTAA/---- TTGATTTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 11 4 TTAA 1 0 85382 CASAVA_Build 14 49190248 1I AGCCTCTTCA -/G TAGAACCACA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 0 1 85383 CASAVA_Build 14 49228721 2I TGCATAACGT --/TA TTCATCGCAG 3070 hom 78 het 37 0 26 11 TA 0 1 85384 CASAVA_Build 14 49229051 1I AGTATTTTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 9 10 85385 CASAVA_Build 14 49240140 21D ATTCATACAT TGCTTATAGTCAACTGGTGTG/--------------------- TGCTTGTATG 3070 het 3070 ref 25 17 11 6 TGCTTATAGTCAACTGGTGTG 1 0 85386 CASAVA_Build 14 49244296 1D TTTTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 11 10 85387 CASAVA_Build 14 49245981 1D ATTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 1423 het 1423 ref 40 29 4 7 T 13 12 85388 CASAVA_Build 14 49247495 2I TGGAGTCTCA --/CT CTGTTGCTCA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 CT 1 2 85389 CASAVA_Build 14 49251328 2I AAAATATGTC --/TA TTTATATATT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 TA 0 1 85390 CASAVA_Build 14 49269088 1I TGAGGGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 10 11 85391 CASAVA_Build 14 49280590 1D ACGACTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 20 10 A 12 11 85392 CASAVA_Build 14 49289739 1I TGCTGATGAA -/C TTTAGCATCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 C 0 1 85393 CASAVA_Build 14 49302433 1I AGGTACCCAC -/G GGGGCTTGGA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 G 4 5 85394 CASAVA_Build 14 49302913 1I TCGAACAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 6 7 85395 CASAVA_Build 14 49306221 2D28M1D CCTGGCCAAC ATAGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACA/--AGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATAC- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 N/A 0 0 85396 CASAVA_Build 14 49313314 2I TTGAACCCAG --/GA GGCAGAAATT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 GA 0 1 85397 CASAVA_Build 14 49313711 2D TTGGGGACTC AG/-- GGGTAAAGGG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AG 1 0 85398 CASAVA_Build 14 49314036 1I ACTCCAGCCT -/G GGCAAGAGAG 3070 hom 89 het 35 0 28 7 G 2 3 85399 CASAVA_Build 14 49319766 3D ACATTATAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 13 10 85400 CASAVA_Build 14 49319838 1D ATAATAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2573 hom 26 7 16 3 T 11 10 85401 CASAVA_Build 14 49322358 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2423 het 48 hom 21 1 15 5 A 16 18 85402 CASAVA_Build 14 49330375 1D CTGTCATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 29 1 21 7 T 12 11 85403 CASAVA_Build 14 49335842 1D AAATTTAATG A/- AGGAAGTCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 2 1 85404 CASAVA_Build 14 49337961 1D TCTCGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 36 0 26 10 A 11 10 85405 CASAVA_Build 14 49341972 1D CTCTATAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 35 1 25 9 A 11 10 85406 CASAVA_Build 14 49344030 2D TCACCAGCAC AT/-- GTTAGTGGGT 3070 hom 72 het 35 0 26 11 AT 1 0 85407 CASAVA_Build 14 49347895 1D CTAATTTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 9 8 85408 CASAVA_Build 14 49356410 1D CAGCCACCCA T/- TTTTTTTTTT 1409 het 1409 ref 24 16 4 4 T 12 11 85409 CASAVA_Build 14 49367904 1D CAGAATTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 10 9 85410 CASAVA_Build 14 49378695 1I AGTAGAAAGA -/G GGTTACCTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 2 3 85411 CASAVA_Build 14 49384175 15D CTACCAATTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 26 2 15 9 T 28 13 85412 CASAVA_Build 14 49388642 1D TACAAGGGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 76 het 34 0 29 7 A 10 9 85413 CASAVA_Build 14 49394396 1I GAAACCTAAT -/A AAAACCTAGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 4 5 85414 CASAVA_Build 14 49397491 2D GAAGGTAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 13 11 85415 CASAVA_Build 14 49409354 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 12 13 85416 CASAVA_Build 14 49416906 1I AAAAAAAAAA -/G AAGAAGAAGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 0 1 85417 CASAVA_Build 14 49417414 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 39 0 35 7 A 12 11 85418 CASAVA_Build 14 49423857 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2921 het 2801 hom 22 10 7 5 A 13 12 85419 CASAVA_Build 14 49424444 1I GAAGCCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 29 1 20 9 T 11 12 85420 CASAVA_Build 14 49424699 1I GCCATGGCCT -/C CCAAAGTGCT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 2 3 85421 CASAVA_Build 14 49438925 1I CAGTGTAGAG -/A AAATGAGAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 3 4 85422 CASAVA_Build 14 49442024 1D AAGTATTAAA C/- CTAAGTTTGC 3070 hom 60 het 26 0 21 7 C 2 1 85423 CASAVA_Build 14 49442672 1I GATTACAGGC -/G TAAGCCACTG 3070 hom 42 het 22 0 15 7 G 0 1 85424 CASAVA_Build 14 49445375 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2532 hom 18 het 7 0 7 0 A 9 10 85425 CASAVA_Build 14 49468941 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 965 het 965 ref 19 6 4 9 A 15 16 85426 CASAVA_Build 14 49481610 1I GACTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 15 13 16 A 12 13 85427 CASAVA_Build 14 49495385 3I AATAATAATG ---/ATA ATAATAACAG 2557 het 2557 ref 19 9 7 4 ATA 2 3 85428 CASAVA_Build 14 49497175 3I TGAGTTTTAT ---/TTC TTCTTCTTCT 2411 het 2327 hom 29 11 9 9 TTC 3 4 85429 CASAVA_Build 14 49508307 2D GGTTTCCCCA CC/-- CCCCCCCACC 3070 het 2989 hom 32 12 13 8 C 9 7 85430 CASAVA_Build 14 49540300 1I GGGAAGTGGC -/T TTTTTTTTTT 2351 het 1960 hom 23 7 9 7 T 12 13 85431 CASAVA_Build 14 49545360 2I GCTGTGTGTG --/TC TCTTTAATAA 3070 hom 82 het 33 0 26 7 TC 1 2 85432 CASAVA_Build 14 49545450 1I TAATAGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 9 17 10 A 9 10 85433 CASAVA_Build 14 49552874 2D TTGACCTAGA CT/-- CTGAAATCCC 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 CT 2 1 85434 CASAVA_Build 14 49561352 1D TCTAAGGGCA C/- TTTAACATCG 3070 het 2211 hom 27 7 13 7 C 1 0 85435 CASAVA_Build 14 49583098 1D GCCCCACCCC T/- ATCTCCCTTC 3070 het 1822 hom 17 5 11 1 T 1 0 85436 CASAVA_Build 14 49584691 2D AGCCAGATCT AA/-- GTCTTCACTG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 2 0 85437 CASAVA_Build 14 49586915 2I TTCGAGCAGC --/CT CTCACTATTT 3070 hom 84 het 34 0 22 12 CT 1 2 85438 CASAVA_Build 14 49594430 1I ACACTTACTT -/A ATTCTTAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 1 2 85439 CASAVA_Build 14 49606337 1I GTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 200 hom 38 1 31 6 T 8 9 85440 CASAVA_Build 14 49619884 4I CCAATCTCTC ----/TCTG TCTGTCTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TCTG 1 2 85441 CASAVA_Build 14 49628628 1D TCCTCTACAT A/- ACAATGGGCA 3070 het 3070 hom 35 13 17 8 A 2 1 85442 CASAVA_Build 14 49629893 6D AAATGATGGC TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 2678 het 2678 ref 28 21 6 5 TTTTGT 3 2 85443 CASAVA_Build 14 49630274 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3018 hom 34 11 11 12 T 13 12 85444 CASAVA_Build 14 49631227 1I CCTGGTCAGA -/T TTTTTTTTTT 2946 het 2946 ref 36 14 11 11 T 15 16 85445 CASAVA_Build 14 49638176 1I AGCTTCGTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 224 hom 32 1 28 3 A 9 10 85446 CASAVA_Build 14 49638746 1D GGTAACTTTT A/- AAAAAACTAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 7 6 85447 CASAVA_Build 14 49638994 1D AGATTGCACC A/- ACTACACTCC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 2 1 85448 CASAVA_Build 14 49641161 1I TTACTCTATT -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 17 17 13 G 1 2 85449 CASAVA_Build 14 49641502 1D AAAGGTAGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 10 9 85450 CASAVA_Build 14 49647636 1I16M1D AAAATAAGAG -TTTTTTTTTTTGGCCGA/TTTTTTTTTTTTGGCCG- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 N/A 0 0 85451 CASAVA_Build 14 49655325 1I TATTTCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2328 hom 24 6 12 6 A 10 11 85452 CASAVA_Build 14 49662077 7I AGATGAAACC -------/CAAATGT CTACAGAGAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 CAAATGT 0 1 85453 CASAVA_Build 14 49663380 1D TGACAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 26 3 13 12 A 11 10 85454 CASAVA_Build 14 49689433 1D GCTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2989 het 2989 ref 26 11 7 8 A 12 11 85455 CASAVA_Build 14 49691725 1D ATATTTATAT A/- AACAGGTTTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 3 2 85456 CASAVA_Build 14 49692744 1I ACACACACAC -/A ACACACGCAA 3070 het 1857 hom 30 8 13 9 A 1 2 85457 CASAVA_Build 14 49704291 2I TGAGCCGAGA --/TC TCACCACTGC 3070 hom 39 het 16 0 13 3 TC 1 2 85458 CASAVA_Build 14 49710657 4D TTTTTTAAGT TATA/---- TATATATTTT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 TA 5 3 85459 CASAVA_Build 14 49710805 4D TAAAAATTAT TAAA/---- TACTTACATA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TAAA 1 0 85460 CASAVA_Build 14 49711535 1I GCAACATCAG -/A CTCAGTTTGT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 0 1 85461 CASAVA_Build 14 49711897 12D GGAGTAATAC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 1335 hom 27 6 16 9 T 22 10 85462 CASAVA_Build 14 49716484 1D TTTTCTATTT A/- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 1 0 85463 CASAVA_Build 14 49718757 10I CTCCCAGGCT ----------/CAAGCAGTCC TCCTACCTCA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 CAAGCAGTCC 0 1 85464 CASAVA_Build 14 49719856 1I TTGCTTGTAC -/A AAAAAAAAAA 1742 het 1742 ref 40 32 5 3 A 11 12 85465 CASAVA_Build 14 49724897 4D AAAAAGTGAC TATT/---- TATGATTTTA 3070 het 3070 hom 36 18 17 3 TATT 1 0 85466 CASAVA_Build 14 49729715 1D TTGCTATGCT A/- CCCAGGCTGG 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 1 0 85467 CASAVA_Build 14 49733307 1D AACCAAGCTA G/- GGCTCCTAAT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 G 3 2 85468 CASAVA_Build 14 49737081 1I TTGGGAGGCC -/A AAGTAGGTGG 3070 hom 116 het 40 0 38 2 A 2 3 85469 CASAVA_Build 14 49740060 2D AGTTTTTCAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 93 het 43 0 35 8 AT 8 7 85470 CASAVA_Build 14 49740560 1D TTGTTCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 T 11 10 85471 CASAVA_Build 14 49741369 5I TTTTTTTTTC -----/TTTCT TTTCTTTTTT 3070 hom 107 het 44 0 33 11 TTTCT 1 2 85472 CASAVA_Build 14 49742449 1D GATTTATAGT A/- AAAATCCCTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 5 4 85473 CASAVA_Build 14 49743245 2I TAATAATCAC --/AT GTCGTCAGAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AT 0 1 85474 CASAVA_Build 14 49747501 4D CCACTATAGG ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 633 hom 27 4 12 12 AT 8 6 85475 CASAVA_Build 14 49750582 3D TATTTTTCAT AAC/--- AAGCTTTGCA 3070 het 3070 hom 34 15 17 4 AAC 1 0 85476 CASAVA_Build 14 49752570 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 31 0 23 8 T 12 11 85477 CASAVA_Build 14 49753236 6D AAACATGAAT AAATAA/------ AAATAAAAAT 3070 het 2286 hom 14 6 9 4 AAATAA 3 2 85478 CASAVA_Build 14 49761189 1D TTGTCTCCAC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 7 85479 CASAVA_Build 14 49762421 4D GACCTATTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 7 AAAC 4 3 85480 CASAVA_Build 14 49765972 1D GCCTAACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 987 hom 41 7 16 18 A 17 16 85481 CASAVA_Build 14 49771297 4D ACAAAAAAAG AAAA/---- AAGAAGACAT 2238 het 2238 ref 25 18 6 1 A 6 2 85482 CASAVA_Build 14 49771970 8D ATGGTTCCTC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 hom 36 het 18 0 13 6 AT 12 8 85483 CASAVA_Build 14 49792818 3I CTCTGTCTCT ---/AGG AAAATAATAA 3070 hom 99 het 35 0 31 4 AGG 0 1 85484 CASAVA_Build 14 49798897 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3049 het 3049 ref 33 11 10 12 A 17 16 85485 CASAVA_Build 14 49802612 1I ACTTTGACTC -/A AAAAAAAAAA 1306 het 1306 ref 23 13 4 6 A 15 16 85486 CASAVA_Build 14 49812931 1I TTGAATTGTG -/C CCCCCCCCAC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 8 9 85487 CASAVA_Build 14 49814874 6I TCTCTCAGAA ------/TTACTT TTACATTAGA 3070 het 3070 ref 45 24 11 10 TTACTT 0 1 85488 CASAVA_Build 14 49815847 1D CTTAAACTGT G/- GGGGCTGGGC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 G 5 4 85489 CASAVA_Build 14 49820950 1I ATAGCCTGGA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 T 7 8 85490 CASAVA_Build 14 49833840 2I GAATTCATAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 AC 7 8 85491 CASAVA_Build 14 49834403 1D ATCCTAACTC A/- AAAAAAAAAA 2053 het 2053 ref 21 10 6 5 A 11 10 85492 CASAVA_Build 14 49845491 10D CAAAGGCTTG TTTTGAGAGT/---------- TCTTTATGTA 3070 het 3070 ref 30 18 11 4 TTTTGAGAGT 1 0 85493 CASAVA_Build 14 49858829 1D22M4I TTTGTTTTTG TTTTTTTTGCATGGATCTCACTA----/-TTTTTTTGCATGGATCTCACTAATAC ATTTATCTTC 3070 het 3070 hom 36 14 24 5 N/A 0 0 85494 CASAVA_Build 14 49861600 4D ATTATGTATC TAAT/---- TAATGTAGTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 5 TAAT 2 1 85495 CASAVA_Build 14 49869998 4I AACTCATAAA ----/TAAT CCACCCCTTG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 TAAT 0 1 85496 CASAVA_Build 14 49873332 1I TCACAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 11 12 85497 CASAVA_Build 14 49886211 3D TCTTGTCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 36 18 7 11 TTG 7 6 85498 CASAVA_Build 14 49889998 5D TATTACTAAG AATTT/----- ATCCTAAAGA 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 AATTT 1 0 85499 CASAVA_Build 14 49909365 1I ATGTGTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 11 12 85500 CASAVA_Build 14 49914118 1I GGGTGGGAGG -/A AGCCCAGGGA 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 A 1 2 85501 CASAVA_Build 14 49915323 1D CAAGACAATC T/- TTTTTTTTTT 928 het 928 ref 24 9 4 11 T 15 14 85502 CASAVA_Build 14 49920031 1I AAAAAAAAAA -/C AAACAAACAA 62 het 62 ref 24 7 2 15 C 0 1 85503 CASAVA_Build 14 49923992 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 A 12 10 85504 CASAVA_Build 14 49931261 1D AATAAATACC T/- TTCCCCCCTC 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 T 3 2 85505 CASAVA_Build 14 49944228 1D CTAGCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 40 1 29 10 T 11 10 85506 CASAVA_Build 14 49946349 5I CCACCCAAGC -----/TTCCA TTCCACCCAT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 TTCCA 1 2 85507 CASAVA_Build 14 49948332 17I GAGTAGAGAA -----------------/TCTTAATTTTAATGATG AGTATTTTAC 3070 hom 59 het 20 0 18 3 TCTTAATTTTAATGATG 0 1 85508 CASAVA_Build 14 49951070 2D AGGATTTCCT TC/-- TCTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 4 TC 2 1 85509 CASAVA_Build 14 49958363 1D TCCACAATTC T/- TTTTTTTTTT 1520 het 6 hom 15 1 7 7 T 16 15 85510 CASAVA_Build 14 49961624 2D ATGTGAAATG TC/-- TCTGTTAGTA 3070 hom 105 het 41 0 36 9 TC 2 1 85511 CASAVA_Build 14 49964919 2D AGACGGGGTT TC/-- TCTCCATGTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TC 3 2 85512 CASAVA_Build 14 49979819 1I ACTGGCCAGG -/A AAAATGCATT 3070 hom 87 het 36 0 28 8 A 4 5 85513 CASAVA_Build 14 49984371 2D ATACAGCAAC AT/-- ATTTACAGTA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 AT 2 1 85514 CASAVA_Build 14 49984506 2D AATGGAGTCT CA/-- CACTCTGTCG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CA 2 1 85515 CASAVA_Build 14 49986194 1D CTTTAAAAAA T/- AATCTAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 1 0 85516 CASAVA_Build 14 49989562 2I GTCTGGAGAA --/TG TGAGTCTAAC 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 TG 1 2 85517 CASAVA_Build 14 50014750 2D ACTTGTTTCT TC/-- TCTTTTTACT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TC 2 1 85518 CASAVA_Build 14 50015469 5D GTGTAGTTTT TTTCG/----- TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 44 4 19 22 TTTCG 1 0 85519 CASAVA_Build 14 50018947 1D CAGTCTACTT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 60 het 24 0 20 7 A 8 7 85520 CASAVA_Build 14 50023841 3D ACATTTATTT ATA/--- ATCATTGGAA 3070 hom 123 het 42 0 41 1 ATA 1 0 85521 CASAVA_Build 14 50050056 2D AACTGGGGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 26 10 A 13 11 85522 CASAVA_Build 14 50050712 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 11 12 85523 CASAVA_Build 14 50051317 1D CAGGACAGAA T/- GTATCACCGC 3070 hom 57 het 26 0 23 3 T 1 0 85524 CASAVA_Build 14 50064318 2D ATAAATAAAT AA/-- AAATAAAAAT 455 het 76 hom 6 1 3 2 A 5 3 85525 CASAVA_Build 14 50066120 3D AAATAAGTAA AAC/--- ATTATGTTGG 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 AAC 1 0 85526 CASAVA_Build 14 50067296 5D TGCTAGGGCT GTTTG/----- ATAATACCAC 3070 hom 129 het 45 0 43 4 GTTTG 1 0 85527 CASAVA_Build 14 50072067 2D TTACTAATTA GG/-- GCCACTTGTC 3070 hom 75 het 31 0 26 7 G 3 1 85528 CASAVA_Build 14 50083306 1D GTGTTTAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 9 8 85529 CASAVA_Build 14 50087819 4D CTGAACAGAC CAAT/---- AACAAGCAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 5 CAAT 1 0 85530 CASAVA_Build 14 50090578 1D TTTTAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 951 het 951 ref 33 19 3 12 T 12 11 85531 CASAVA_Build 14 50091731 10D GTTCCTTCAT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 hom 48 het 23 0 17 6 TTTTG 4 2 85532 CASAVA_Build 14 50102720 1D CCCACCTCAG C/- CCCCCAAAGT 3070 hom 56 het 20 0 17 3 C 6 5 85533 CASAVA_Build 14 50112223 1D GAAAAATAGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 67 het 29 0 23 6 T 9 8 85534 CASAVA_Build 14 50129011 1I TAAAAGTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2190 hom 22 6 9 7 A 10 11 85535 CASAVA_Build 14 50132354 1D AAATGTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2430 hom 31 10 16 5 T 11 10 85536 CASAVA_Build 14 50140563 1D ACAGTTCTAT A/- AAAAAACTAA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 7 6 85537 CASAVA_Build 14 50144948 1I AAGGCTTTTG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 7 8 85538 CASAVA_Build 14 50147812 1D TCAGGATGAT A/- TGGGAACACA 3070 het 3070 ref 51 27 21 6 A 1 0 85539 CASAVA_Build 14 50155359 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTC 3070 het 955 hom 16 5 11 0 A 1 0 85540 CASAVA_Build 14 50159853 2I CCTGTATCAC --/AT GTCTATTTAT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 AT 0 1 85541 CASAVA_Build 14 50160365 1I CTAAAATAAC -/A AAAAAAAAAT 1711 het 1711 ref 18 12 5 1 A 9 10 85542 CASAVA_Build 14 50161554 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 85543 CASAVA_Build 14 50166361 5I ATCTGTTCTG -----/TTCTT AAATGCTCAC 3070 hom 81 het 41 0 27 14 TTCTT 0 1 85544 CASAVA_Build 14 50167741 1D AAGTAAAAAA C/- AAAAACAAAA 2774 het 1771 hom 20 7 8 5 C 1 0 85545 CASAVA_Build 14 50172803 1D AACAGCAAAC A/- AGGAACCAAA 3070 het 3070 ref 40 20 19 2 A 2 1 85546 CASAVA_Build 14 50175839 1I TAATTGATTC -/T TCATTATCTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 2 85547 CASAVA_Build 14 50177860 1D CACAGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 25 8 8 A 12 11 85548 CASAVA_Build 14 50181028 1I GAGAAAAGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 7 8 85549 CASAVA_Build 14 50182172 2D AAAATTTCCC CT/-- GATTAAAGAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 CT 1 0 85550 CASAVA_Build 14 50187298 1D GAGACCAGCC G/- GGCCAAGACG 3070 het 2703 hom 21 6 12 3 G 3 2 85551 CASAVA_Build 14 50187539 1I CAGAGCGAAG -/C CTTCGGATAA 3070 hom 42 het 30 0 21 9 C 1 2 85552 CASAVA_Build 14 50191476 1I ATAATTTTTT -/A AAAGATGGTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 3 4 85553 CASAVA_Build 14 50191898 1D AAAAGCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 16 6 T 15 14 85554 CASAVA_Build 14 50203694 1D AACTTTTCGA G/- GGGGGGGTTC 2739 het 559 hom 20 4 10 6 G 8 7 85555 CASAVA_Build 14 50205135 2D TGACTCTCTT TC/-- CCCCCAAGAC 3070 hom 108 het 48 0 36 14 TC 1 0 85556 CASAVA_Build 14 50206623 2D GCAGAGTGTA CT/-- CTGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 CT 2 1 85557 CASAVA_Build 14 50216796 1D AAGCAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 A 12 11 85558 CASAVA_Build 14 50218346 3D AGCTAGGCTA ATT/--- ATTTTCATTT 3070 het 3070 hom 29 16 13 1 ATT 2 1 85559 CASAVA_Build 14 50220485 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2770 het 2472 hom 22 5 7 10 T 10 11 85560 CASAVA_Build 14 50220866 1I CAGTTCCCTG -/C CCCCCCTCCA 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 C 6 7 85561 CASAVA_Build 14 50227268 1D TACTTTATAC T/- TTTTTTTTTT 2945 het 2817 hom 22 8 9 6 T 13 12 85562 CASAVA_Build 14 50231107 3D AAATGGGATT TTC/--- TTTTCTATCG 2778 het 2778 ref 25 14 7 4 TTC 1 0 85563 CASAVA_Build 14 50232364 6D ATTTTTTGTC TTTATG/------ TTTATGCATC 3070 het 3070 ref 33 19 12 4 TTTATG 2 1 85564 CASAVA_Build 14 50244453 1I AAATACAAAA -/T TTTTTTTTTT 2585 het 2585 ref 29 13 9 7 T 13 14 85565 CASAVA_Build 14 50245082 1D TAAAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 792 hom 30 2 20 8 T 15 14 85566 CASAVA_Build 14 50251787 2D GAAGCCAAAC AG/-- AGTTTAGTAT 3070 hom 101 het 38 0 34 5 AG 2 1 85567 CASAVA_Build 14 50254476 4D ATACGGGGAA TGGC/---- TGTAAATACA 3070 het 3070 hom 32 16 14 3 TGGC 1 0 85568 CASAVA_Build 14 50258611 3I GGAAGTGGCT ---/AGA AGCAGAGATT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 AGA 0 1 85569 CASAVA_Build 14 50259611 4D TGTAATAATT AAAA/---- AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 29 17 12 1 A 10 6 85570 CASAVA_Build 14 50263601 4I AAATACAAAA ----/TGTC TGATGTCTAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TGTC 0 1 85571 CASAVA_Build 14 50264523 1I GGTTGGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 10 11 85572 CASAVA_Build 14 50266536 2I TTTTAAAAAC --/TG GGGTTGGAGA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TG 0 1 85573 CASAVA_Build 14 50269567 1D GCATTAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 21 0 18 3 T 12 11 85574 CASAVA_Build 14 50270555 1D TTCTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 1503 het 1503 ref 17 7 7 3 T 15 14 85575 CASAVA_Build 14 50271320 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1873 het 428 hom 20 3 7 10 T 15 16 85576 CASAVA_Build 14 50277987 3I TAACCAAGTT ---/GTA GTCCTAAGAT 3070 hom 97 het 39 0 35 4 GTA 0 1 85577 CASAVA_Build 14 50284219 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGGATTT 3056 het 3056 ref 31 15 11 5 G 7 6 85578 CASAVA_Build 14 50287955 2I AAATTATACA --/AC AGTGTTGTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AC 0 1 85579 CASAVA_Build 14 50289251 1D TACTTGTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 9 A 15 14 85580 CASAVA_Build 14 50292626 1I TTAGCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 A 12 13 85581 CASAVA_Build 14 50295965 1D CGACTGGCAC T/- TTTTTTTTTT 792 het 518 hom 10 3 3 4 T 15 14 85582 CASAVA_Build 14 50300182 2D GGCCAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 T 14 12 85583 CASAVA_Build 14 50308479 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 62 het 25 0 22 3 A 10 9 85584 CASAVA_Build 14 50314150 1I AACTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 30 0 19 11 A 12 13 85585 CASAVA_Build 14 50319435 3D AACCCAAAAG CGT/--- CGTCAGATAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CGT 2 1 85586 CASAVA_Build 14 50319692 1D CATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1873 hom 21 het 12 0 7 5 T 13 12 85587 CASAVA_Build 14 50337254 1D TTTTCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 36 0 23 13 T 14 13 85588 CASAVA_Build 14 50340372 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2936 het 2610 hom 26 9 9 8 T 11 12 85589 CASAVA_Build 14 50342958 20I AAGAATGAGT --------------------/TATTGCCACACCATCTGACA TATTGCCTAG 3070 hom 158 het 61 0 51 12 TATTGCCACACCATCTGACA 0 1 85590 CASAVA_Build 14 50355365 3D ATTAGGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 36 1 16 21 A 14 11 85591 CASAVA_Build 14 50364439 1I TAGCTACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 10 11 85592 CASAVA_Build 14 50369728 1I GAGTCATGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 8 9 85593 CASAVA_Build 14 50376842 6I AGCCTCCTCC ------/CAGGTA CAGGTACTCT 3070 hom 163 het 63 0 45 18 CAGGTA 1 2 85594 CASAVA_Build 14 50378253 4I AAAAAAAAAA ----/AGTT AGCCAGGTGT 3070 hom 48 het 24 0 18 6 AGTT 0 1 85595 CASAVA_Build 14 50381371 1D AATTAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 635 hom 33 4 18 12 A 10 9 85596 CASAVA_Build 14 50414335 2I AACTCTGTCC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 83 het 33 0 27 6 A 9 11 85597 CASAVA_Build 14 50418395 3D9M12D GTTGAGAGAG GTTTTTTTTGTTGTCGTTGTTGTG/---TTTTTTGTT------------ GTTGTTGTTT 3070 het 2337 hom 24 10 16 2 N/A 0 0 85598 CASAVA_Build 14 50420420 2I81M3D CTTTTGTTAC --TATGATTGTATCTATATATACGTTTAGGTTGTGCTCTTTTACTTCCCACTATTTTATAGACATTCTTCCATGTTTTCACAGTCA/TATATGACTGTATCTATATATACGTTTAGGTTGTGCTCTTTTACTTCCCACTATTTTATAGACATTCTTCCATGTTTTCACAG--- TCATAGTTAG 3070 het 4 hom 33 1 34 26 N/A 0 0 85599 CASAVA_Build 14 50427719 1D GAGACGTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 23 0 16 7 T 10 9 85600 CASAVA_Build 14 50438671 1D TTTAAAGGGC T/- TGGTAGTGTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 2 1 85601 CASAVA_Build 14 50439579 1D GTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1607 het 1607 ref 39 29 5 6 T 12 11 85602 CASAVA_Build 14 50441849 1D TTCTAGAGAC A/- ATTCTAGAGT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 2 1 85603 CASAVA_Build 14 50444228 1D AAAAATTTAC A/- ACTGGCTGGG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 2 1 85604 CASAVA_Build 14 50445450 1I GGTGGGTGAT -/A AAAAAAAGGC 3070 het 1910 hom 23 4 14 5 A 7 8 85605 CASAVA_Build 14 50448341 1D TGGGGCAGCC T/- TTGGGGAAGA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 3 2 85606 CASAVA_Build 14 50453035 3D AAAAACTAAA AAG/--- GGAGTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 21 20 6 AAG 1 0 85607 CASAVA_Build 14 50474875 1D GATGGGGTTT A/- CTCCATGTTG 3070 hom 35 het 15 0 12 3 A 1 0 85608 CASAVA_Build 14 50500138 1I ACGGAAGGGA -/G TGGAGCAGCT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 0 1 85609 CASAVA_Build 14 50503876 3D CTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 37 5 19 14 T 17 14 85610 CASAVA_Build 14 50506045 3D CAGGCGTGAG CCA/--- CCACCGCTCC 2596 het 1768 hom 12 5 7 1 CCA 2 1 85611 CASAVA_Build 14 50515227 2I TTTTTATCTG --/TT TTTTTTTGTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 7 9 85612 CASAVA_Build 14 50529050 4D TGGAAAGATA AATG/---- AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 46 22 16 11 AATG 5 4 85613 CASAVA_Build 14 50540174 1D CAGATTTAGA C/- AAATTAGCAA 3070 het 3022 hom 31 9 15 7 C 1 0 85614 CASAVA_Build 14 50542480 3I TCTTTTTTAT ---/CAA CAACAACAAC 2794 het 2794 ref 45 25 10 10 CAA 5 6 85615 CASAVA_Build 14 50549695 2D TCTAACTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 16 14 85616 CASAVA_Build 14 50562228 2I TTGGTCTGGG --/AT TAGGGCAGAA 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 AT 0 1 85617 CASAVA_Build 14 50566245 1D AGGATACCCC T/- GAGTGAAGGT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 1 0 85618 CASAVA_Build 14 50581526 1D GAAAATATGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 47 17 22 9 A 9 8 85619 CASAVA_Build 14 50584428 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 A 15 14 85620 CASAVA_Build 14 50585041 11I CTGGGGATCC -----------/AGAAGAGGGGA TAGGCACATA 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 AGAAGAGGGGA 0 1 85621 CASAVA_Build 14 50606985 1I GTGTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 13 10 17 T 15 16 85622 CASAVA_Build 14 50615979 1D AAAGAAAAGA T/- ATTATGTGAG 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 T 1 0 85623 CASAVA_Build 14 50625457 1D TAAAGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 12 13 A 13 12 85624 CASAVA_Build 14 50635707 1D AACTCAGAAG A/- AAAAAAAAAG 1383 het 1383 ref 31 26 3 3 A 10 9 85625 CASAVA_Build 14 50640764 1I CTGCTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 1789 het 1789 ref 24 13 7 4 T 13 14 85626 CASAVA_Build 14 50642772 1D TATTTATTTA T/- TTATTATTTT 2595 het 2424 hom 13 7 6 0 T 3 2 85627 CASAVA_Build 14 50654927 1D TTTATGTAAT A/- TTTTAAATGA 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 A 1 0 85628 CASAVA_Build 14 50664043 21D CTACTTGATC ATGGTGGATTATCTTTTTGAT/--------------------- ATGCTGTTGG 2999 het 2999 ref 19 16 7 2 ATGGTGGATTATCTTTTTGAT 1 0 85629 CASAVA_Build 14 50690745 1I TTTTGATCTA -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 52 20 21 11 T 6 7 85630 CASAVA_Build 14 50731888 1D CTCACCACTT G/- TCTGGTATCT 3070 het 3070 hom 50 17 28 6 G 1 0 85631 CASAVA_Build 14 50738944 1D AAAGGACCAA C/- CTTTGAGCTC 3070 het 3070 ref 43 25 17 2 C 2 1 85632 CASAVA_Build 14 50753058 1I AGGAAGGAGA -/C AGGTTCTCTG 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 C 0 1 85633 CASAVA_Build 14 50756034 1D AGAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 11 A 12 11 85634 CASAVA_Build 14 50762275 4D CTGAATTTGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 AAAC 4 3 85635 CASAVA_Build 14 50770536 1D GGGAGCAAAG T/- TGTATTGGAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 2 1 85636 CASAVA_Build 14 50783746 3I CAGATAATTA ---/TAT TATTTTATGT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 TAT 1 2 85637 CASAVA_Build 14 50785912 1D AGATTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 11 10 85638 CASAVA_Build 14 50788571 2D TAGAAACTTT AA/-- AAGAGTTGAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 A 4 2 85639 CASAVA_Build 14 50791862 5D CTTGAAATTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 T 15 10 85640 CASAVA_Build 14 50795917 1I GACTATAAAT -/A ACTTGGGTTT 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 A 1 2 85641 CASAVA_Build 14 50798215 2D TAGAGCAAAC AG/-- AAGTTTCACA 3070 hom 128 het 48 0 42 7 AG 1 0 85642 CASAVA_Build 14 50798653 1I ATTTTGGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 22 0 14 10 T 9 10 85643 CASAVA_Build 14 50801306 1I GTAATACCCC -/T TTACCTCTGG 3070 het 3070 ref 52 25 16 11 T 2 3 85644 CASAVA_Build 14 50802120 1I ATGTGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 581 hom 43 3 26 14 T 13 14 85645 CASAVA_Build 14 50824963 1D CTTTAAGCTT C/- ATTATAACTC 3070 hom 99 het 39 0 34 7 C 1 0 85646 CASAVA_Build 14 50835171 14I GGTGAATGTC --------------/TCTCTAAACTCATA ACAGTGAGTT 3070 het 3070 ref 45 21 20 5 TCTCTAAACTCATA 0 1 85647 CASAVA_Build 14 50835751 4D TTTATAACTC AGTA/---- AATATATATT 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 AGTA 1 0 85648 CASAVA_Build 14 50838689 2D CAGGGATAAA CT/-- CTGAAGAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 CT 2 1 85649 CASAVA_Build 14 50840831 4I TAAAAATAAT ----/AAAA AAATTAGCTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 7 85650 CASAVA_Build 14 50842200 2D ACTCTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2022 het 1996 hom 27 12 7 9 A 16 14 85651 CASAVA_Build 14 50854165 1I ATGTTAAGTG -/A AAAAAAAAAA 2924 het 2924 ref 39 26 9 4 A 12 13 85652 CASAVA_Build 14 50862885 1I GATAGACCCT -/C CTTGGCCTCC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 1 2 85653 CASAVA_Build 14 50863057 1D AATATACATA T/- TTTTTTAGTC 3070 het 2305 hom 21 6 14 1 T 7 6 85654 CASAVA_Build 14 50874655 1D AACACAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 30 0 16 14 A 11 10 85655 CASAVA_Build 14 50884988 1I CTTGCTGTGT -/C CCCTAGGCTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 3 4 85656 CASAVA_Build 14 50889670 1D TCTTCTAACC T/- TTTTTTTTTT 2222 het 59 hom 21 1 8 12 T 15 14 85657 CASAVA_Build 14 50889846 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 264 hom 4 het 4 0 2 2 T 12 11 85658 CASAVA_Build 14 50894988 1D TCATTTTAAC A/- AAAAAAAAAA 1259 het 1259 ref 44 37 4 3 A 11 10 85659 CASAVA_Build 14 50904573 4D GGACCCAAAT TAAG/---- TAGGTAGAAA 3070 het 3070 ref 36 20 15 4 TAAG 1 0 85660 CASAVA_Build 14 50908848 7D TCCTCCCACC CTCCATG/------- CTCCAATAGG 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 CTCCATG 1 0 85661 CASAVA_Build 14 50912635 1D AGCCATATGA C/- CCCCCCAGAT 3070 het 2303 hom 18 7 8 3 C 7 6 85662 CASAVA_Build 14 50918704 2D GTGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 592 het 592 ref 41 28 3 10 GT 7 6 85663 CASAVA_Build 14 50924929 1I AATTAGGACC -/A CTATTATATG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 0 1 85664 CASAVA_Build 14 50926683 3D GATATTACAG TAA/--- TCCCTTATCA 3070 hom 81 het 30 0 28 5 TAA 1 0 85665 CASAVA_Build 14 50927187 10D CTAGCCTAAA AACATAAAAT/---------- AACAAGTGTT 3070 hom 101 het 37 0 33 10 AACATAAAAT 1 0 85666 CASAVA_Build 14 50936436 1D TTCCTTTTTT A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 7 6 85667 CASAVA_Build 14 50948555 1I TTGGCACGTT -/A ATATAGTTTG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 85668 CASAVA_Build 14 50965893 1D GTCATGAAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 51 19 25 8 T 9 8 85669 CASAVA_Build 14 50970998 19I AAAAAATTGT -------------------/AATAATGGATTAGACTCAA AATAAGTATC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 AATAATGGATTAGACTCAA 0 1 85670 CASAVA_Build 14 50973372 3D GGATGAAGGT GAA/--- GAAGAAGAAG 3070 het 1612 hom 34 10 15 9 GAA 4 3 85671 CASAVA_Build 14 50975349 1I CTGGCTATGT -/A AAAATGTGGC 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 4 5 85672 CASAVA_Build 14 50981943 2D17M4I AGAAGTGCAA TTTTTTTTTTTTTTACAAA----/--TTTTTTTTTTTTACAAACAAT CAAATCTCCA 3070 het 150 hom 29 3 14 17 N/A 0 0 85673 CASAVA_Build 14 50989618 1I AAAAGCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 11 12 85674 CASAVA_Build 14 50991292 1D TCCTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 13 22 12 A 11 10 85675 CASAVA_Build 14 51023405 1D TATAAAACCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 61 20 23 18 T 13 12 85676 CASAVA_Build 14 51067115 1D CACCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 2536 hom 37 het 16 0 9 7 T 14 13 85677 CASAVA_Build 14 51082990 1I TAATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 A 11 12 85678 CASAVA_Build 14 51086739 1D CAATTACTGG T/- TCTGTTGTCC 3070 het 3070 ref 22 12 8 3 T 2 1 85679 CASAVA_Build 14 51093316 1I ACCAAAACTT -/C TATTCAAGTG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 C 0 1 85680 CASAVA_Build 14 51096532 1I GGGACTATAC -/T TTTATAATCA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 3 4 85681 CASAVA_Build 14 51099723 1D CCAGATTCAA G/- GGGCAGAGTG 3070 het 3070 ref 28 17 9 3 G 4 3 85682 CASAVA_Build 14 51102205 1D ACAGCAGCAG T/- TCTAGAGGTG 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 2 1 85683 CASAVA_Build 14 51138531 3I TTAGCCTCAC ---/TGG TGGTACATGT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TGG 1 2 85684 CASAVA_Build 14 51139727 1I TAAGCCACAT -/A AGTTTATGAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 1 2 85685 CASAVA_Build 14 51141723 2I TGAACAAAGG --/TC TCTGGTTTTC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TC 1 2 85686 CASAVA_Build 14 51142737 4I ATACACATGG ----/ACAA ACATTCAGAA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 ACAA 0 1 85687 CASAVA_Build 14 51144521 1I AACCATTATT -/C CCCAAACCCA 3070 hom 122 het 46 0 37 9 C 3 4 85688 CASAVA_Build 14 51146617 4I TCTCTTGACC ----/TAGG TAGGCACAGG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TAGG 1 2 85689 CASAVA_Build 14 51160588 1I GGACACACAC -/A GGGGAACAAC 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 0 1 85690 CASAVA_Build 14 51161932 3D TCTTTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 1970 het 1970 ref 36 17 7 12 TTG 4 3 85691 CASAVA_Build 14 51170484 4D GCATGTAGTT CAGA/---- CAGTCTGCAA 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 CAGA 1 0 85692 CASAVA_Build 14 51175465 2D TGATACATAG TT/-- TTTGCTGTCC 3070 hom 85 het 30 0 29 2 T 5 3 85693 CASAVA_Build 14 51178403 1D AATCACCCCC T/- ATCCAAGGAC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 1 0 85694 CASAVA_Build 14 51180451 4D GAATGATTTC TTAT/---- TAAGAAATTA 3070 het 3070 ref 45 31 14 1 TTAT 1 0 85695 CASAVA_Build 14 51189674 1I ATTTTCCGAG -/T TATGATTCCC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 1 2 85696 CASAVA_Build 14 51194875 11D CTTGAGGTCC CTCTTGATTCA/----------- CTCTTGTTGA 3070 het 3070 ref 33 18 15 1 CTCTTGATTCA 1 0 85697 CASAVA_Build 14 51207748 1I ATTCCCCTTT -/C TTTGGTTTTC 3070 het 3070 ref 43 17 18 8 C 0 1 85698 CASAVA_Build 14 51215768 2I ATATACACAC --/AT GTGTATAGAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 0 1 85699 CASAVA_Build 14 51216024 2D ATTTGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 41 2 23 17 T 18 16 85700 CASAVA_Build 14 51217233 1D ATTGATGTTA T/- TTTTTTATAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 7 6 85701 CASAVA_Build 14 51219914 1D TGCTCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 13 12 85702 CASAVA_Build 14 51220630 1D AATGACCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 36 1 26 9 A 13 12 85703 CASAVA_Build 14 51222288 1D GGGAGTATCT A/- ATGCTTTTGT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 2 1 85704 CASAVA_Build 14 51227319 1I AGGAATGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 9 10 85705 CASAVA_Build 14 51228424 2I TTATGCTGAA --/AT ATATATGACA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 AT 3 4 85706 CASAVA_Build 14 51230091 1I TGAAGTGCCT -/G GCATATGTGA 3070 hom 141 het 53 0 45 8 G 1 2 85707 CASAVA_Build 14 51236408 1I GTAGCATTCC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 T 7 8 85708 CASAVA_Build 14 51247646 4D AGGTCAAAAA AATC/---- AAACAATGCA 3070 het 3070 ref 35 16 11 9 AATC 1 0 85709 CASAVA_Build 14 51249575 1I GCTATATCCG -/T TTTTTTGGTA 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 6 7 85710 CASAVA_Build 14 51249989 1D AAAATACATG A/- GGAAAGGAAG 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 1 0 85711 CASAVA_Build 14 51250786 1D TCAGAGATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 10 9 85712 CASAVA_Build 14 51252765 1D TTTGGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1461 het 1461 ref 40 30 5 5 T 11 10 85713 CASAVA_Build 14 51255697 1I GGTTAGTTTA -/G TATGTAATAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 G 0 1 85714 CASAVA_Build 14 51263778 1I TATCCTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2092 hom 33 7 11 15 A 11 12 85715 CASAVA_Build 14 51264840 1I TAACATCACA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 62 26 30 6 T 7 8 85716 CASAVA_Build 14 51273180 1I AATATACTGA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 7 8 85717 CASAVA_Build 14 51277231 1D TACGGGGGGC G/- GGGGGGTTAC 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 G 7 6 85718 CASAVA_Build 14 51285018 3I AATAACTGAG ---/ATT ATTAATTGCG 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 ATT 1 2 85719 CASAVA_Build 14 51295141 1D AGTATGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1105 hom 25 5 15 5 T 13 12 85720 CASAVA_Build 14 51295347 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2221 het 2221 ref 25 8 6 11 T 11 12 85721 CASAVA_Build 14 51326991 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 19 17 85722 CASAVA_Build 14 51340089 1I AGGCTGGGGG -/A AATGAAGCCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 3 85723 CASAVA_Build 14 51348655 2D TTTTTATTGT TG/-- TGTTATTATT 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 TG 2 1 85724 CASAVA_Build 14 51352619 9D TCGAAGCCCC GGTGAGCGT/--------- GTGTTGCAGC 2531 het 2531 ref 31 22 8 5 GGTGAGCGT 1 0 85725 CASAVA_Build 14 51360766 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAGAC 2031 hom 18 het 8 0 7 1 A 7 8 85726 CASAVA_Build 14 51366314 1D CTACTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 38 2 18 19 T 15 14 85727 CASAVA_Build 14 51368608 1D ATTAGTCGGG C/- ATGGTGGCAC 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 C 1 0 85728 CASAVA_Build 14 51368753 2D TTACAGGGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 29 1 21 7 A 12 10 85729 CASAVA_Build 14 51370450 1I CATCAGACTG -/C CCTTGAGACA 3070 hom 129 het 50 0 43 7 C 2 3 85730 CASAVA_Build 14 51374912 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2102 het 2102 ref 23 8 10 5 A 10 11 85731 CASAVA_Build 14 51375518 1I GTATTTGACA -/T TCTGGGAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 2 85732 CASAVA_Build 14 51380057 1I AAAAAAAAAA -/C AAACTCAAAT 3070 hom 91 het 39 0 31 8 C 0 1 85733 CASAVA_Build 14 51388513 1I GCAGTGAGGG -/A TGTACGTAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 85734 CASAVA_Build 14 51391099 1D CTGCCTCAGC T/- CCCCCCGAGT 2704 hom 21 het 8 0 8 0 T 1 0 85735 CASAVA_Build 14 51394680 9D GGATTAATCT ATCCTGGCC/--------- AAGCTATACC 3070 het 3070 hom 39 16 21 5 ATCCTGGCC 1 0 85736 CASAVA_Build 14 51402418 2D TTAAACACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 17 7 A 12 10 85737 CASAVA_Build 14 51407800 2I ATTCCTAGGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 A 11 13 85738 CASAVA_Build 14 51428573 1D GTTCTCTGAA T/- TTTAATTTTT 3070 het 3070 ref 50 24 19 9 T 4 3 85739 CASAVA_Build 14 51431513 1I AAAGAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 10 11 85740 CASAVA_Build 14 51448335 1D TTTTCTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2141 hom 29 7 18 4 T 12 11 85741 CASAVA_Build 14 51452979 1D AATAATCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 37 0 32 5 A 11 10 85742 CASAVA_Build 14 51460036 2D AACACACAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 438 hom 32 1 22 11 AC 9 8 85743 CASAVA_Build 14 51463619 106D CTGTTATTTA CTCAAAAGTCAGGTCTTTTGAGGTCTCCTGTTATTTACTGTTATTTGGCCAGTGGGTCTACTTCAATTAAGACTCATTGGGTGAATAACAGTAAATAACAGGAGAC/---------------------------------------------------------------------------------------------------------- CTCAAAAGTC 3070 het 3070 ref 39 47 20 11 CTCAAAAGTCAGGTCTTTTGAGGTCTCCTGTTATTTACTGTTATTTGGCCAGTGGGTCTACTTCAATTAAGACTCATTGGGTGAATAACAGTAAATAACAGGAGAC 1 0 85744 CASAVA_Build 14 51480273 1D CATAAATAAA T/- GGAAAAAGAC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 1 0 85745 CASAVA_Build 14 51481987 1D GGTGGCTGCC A/- GGGGTTGAGG 3070 hom 90 het 31 0 30 1 A 1 0 85746 CASAVA_Build 14 51493625 4I TGTGCAGTAG ----/ATCC ATCCCACCTC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 ATCC 1 2 85747 CASAVA_Build 14 51494835 1D AGTGTTGCTG C/- CCCCCAGGAC 3070 hom 94 het 35 0 32 3 C 6 5 85748 CASAVA_Build 14 51494908 1D CTCTTCCGTT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 17 het 29 1 23 5 C 10 9 85749 CASAVA_Build 14 51496203 4I TACCAAAAGA ----/TTGC TTATTTTCTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTGC 0 1 85750 CASAVA_Build 14 51496643 1I GTTTTGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 45 1 35 9 T 10 11 85751 CASAVA_Build 14 51497126 5I TAACAATAGT -----/TAAAA TAACAGTTAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TAAAA 0 1 85752 CASAVA_Build 14 51498677 9I TAAATAATAT ---------/TCTTTAAAA TATTTAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TCTTTAAAA 0 1 85753 CASAVA_Build 14 51504836 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAGC 1358 het 1358 ref 32 24 5 4 A 9 8 85754 CASAVA_Build 14 51519171 2D TCTTTGAATT AA/-- AAGAGTCACA 3070 hom 141 het 54 0 48 8 A 4 2 85755 CASAVA_Build 14 51557691 1D GTGTGAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 29 1 26 2 A 12 11 85756 CASAVA_Build 14 51562314 1D AGTTTCAACA T/- GAGTTTTGAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 1 0 85757 CASAVA_Build 14 51569047 10D CAAGAACGTG ATCATCTCCC/---------- ATCATTTCTC 3070 hom 117 het 41 0 40 5 ATCATCTCCC 1 0 85758 CASAVA_Build 14 51570085 2I AATTCCAACA --/AG ACTATCGTTC 3070 hom 123 het 47 0 41 6 AG 0 1 85759 CASAVA_Build 14 51570778 3I AGCCTGGGAA ---/ATT ATTTCACTAA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 ATT 1 2 85760 CASAVA_Build 14 51571487 1I CAGAAAGTAC -/A GAGCTCCCAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 0 1 85761 CASAVA_Build 14 51573341 1I AGTTGTAAGA -/G TACTTCGTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 0 1 85762 CASAVA_Build 14 51577648 1I ACCTAACAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 7 8 85763 CASAVA_Build 14 51579010 1D TCCTCCTTCT A/- CTCCACTACA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 1 0 85764 CASAVA_Build 14 51580880 1D TGGGACTACA G/- GCACCCACCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 2 1 85765 CASAVA_Build 14 51581079 1D TAGCAGGGAC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 8 7 85766 CASAVA_Build 14 51582026 2I AGGCAGAAAA --/AT AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 31 0 17 14 AT 0 1 85767 CASAVA_Build 14 51582368 2I CTATGCAAAC --/TG TGTCTTTCAG 3070 hom 66 het 25 0 21 4 TG 1 2 85768 CASAVA_Build 14 51585642 1I24M3D TTTAAATCTC -TTTTTTTTCTATTTAATGTTTTTTTTG/TTTTTTTTTCTATTTAATGTTTTTT--- TTTGTTTTTA 3070 hom 93 het 31 0 32 4 N/A 0 0 85769 CASAVA_Build 14 51585922 2D GGCCAGACAC AG/-- GGGAGGTTCC 3070 hom 81 het 30 0 26 5 AG 1 0 85770 CASAVA_Build 14 51586169 2D CTTTTTCGTC CA/-- GTTTTCATGT 3070 hom 108 het 39 0 36 4 CA 1 0 85771 CASAVA_Build 14 51587083 3D ACCCTACAGG ACA/--- ACTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 ACA 1 0 85772 CASAVA_Build 14 51587659 1D CCCTAAGGGG A/- AAAAAATGTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 6 85773 CASAVA_Build 14 51612316 2D ATAGTCCCAC AT/-- AGTCACTGGA 3070 hom 111 het 41 0 38 7 AT 1 0 85774 CASAVA_Build 14 51623041 1D TTGACTCTCA T/- AATATTCTCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 85775 CASAVA_Build 14 51631216 1D CAAAATCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 29 1 26 2 A 11 10 85776 CASAVA_Build 14 51633083 1I CATATTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 43 1 36 6 A 10 11 85777 CASAVA_Build 14 51633426 2I TAAATAGTAA --/AT ATGTTTTTTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AT 1 2 85778 CASAVA_Build 14 51642027 1D GTGTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2499 hom 30 11 14 6 T 13 12 85779 CASAVA_Build 14 51644267 2D AAAGTTAAAC AT/-- GTGTGGCATT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 AT 1 0 85780 CASAVA_Build 14 51647672 3D GTCGAGGTAT AGG/--- AGAAGGGGCT 3070 het 3070 hom 39 17 21 2 AGG 1 0 85781 CASAVA_Build 14 51650214 4D31M12I AGAAAGAAAG AGAAAGAAAGAAGAAAAGAAGAGAAAGAAGGAAAG------------/----AGAAAGAAGAAAAGAAGAGAAAGAAGGAAAGAAAAGAAAAGAA AAAAGAAAAG 3070 het 1262 hom 28 5 22 10 N/A 0 0 85782 CASAVA_Build 14 51651470 1D TCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2746 het 927 hom 12 4 6 2 T 13 12 85783 CASAVA_Build 14 51653512 1I CTCCCCAGCT -/G CTGATGAGTC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 0 1 85784 CASAVA_Build 14 51661328 18I GGCTCTTTGT ------------------/GCAGCAGGCTGCACGTGC AGCCTCATAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 GCAGCAGGCTGCACGTGC 0 1 85785 CASAVA_Build 14 51662292 1I CCAAACAACA -/T CCAAATTCAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 0 1 85786 CASAVA_Build 14 51662969 1D CCAGTTCTCA C/- CTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 C 2 1 85787 CASAVA_Build 14 51667708 1D ACTTTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2877 hom 32 11 17 4 T 12 11 85788 CASAVA_Build 14 51668825 1I TCACTGAAAT -/C ATCATAGAGA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 C 0 1 85789 CASAVA_Build 14 51680529 4D ATTAATATCC AATA/---- AATAGTTTTT 3070 het 3070 ref 49 26 18 7 AATA 2 1 85790 CASAVA_Build 14 51680745 1D GATTTCATTC T/- TTTTCATGGC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 5 4 85791 CASAVA_Build 14 51683119 1D TAACTTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 21 10 T 12 11 85792 CASAVA_Build 14 51690514 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAGCTC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 6 7 85793 CASAVA_Build 14 51690822 1D GTTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 39 1 29 9 T 12 11 85794 CASAVA_Build 14 51700497 3D AACTTGAAGT AGA/--- AGATTTCCTT 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 AGA 2 1 85795 CASAVA_Build 14 51702078 2D TTAGAATACA CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 73 het 26 0 23 3 C 13 11 85796 CASAVA_Build 14 51709900 1I ATTCAGGAAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 T 8 9 85797 CASAVA_Build 14 51710271 2D AGAAAAAGAA AG/-- AAGGGCAGTG 3070 het 3070 ref 34 18 16 1 AG 1 0 85798 CASAVA_Build 14 51718166 2I TTCCCAGAAA --/AT GTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AT 0 1 85799 CASAVA_Build 14 51724925 1I ATAAATAAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 358 hom 42 1 34 7 T 9 10 85800 CASAVA_Build 14 51727757 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 32 0 28 8 A 13 11 85801 CASAVA_Build 14 51728365 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 17 0 15 2 A 13 12 85802 CASAVA_Build 14 51729043 1I CAAAAGAGAT -/C CCTTGCCTCC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 2 3 85803 CASAVA_Build 14 51732000 3I3M2I2M5I AGGCAGTTCT ---TAG--GC-----/TTATAGCAGCATGAG AATTTAGTAA 3070 hom 72 het 23 0 25 3 N/A 0 0 85804 CASAVA_Build 14 51733193 1I CAAAGCCACA -/G GGGTGGAGGT 3070 hom 57 het 21 0 18 3 G 3 4 85805 CASAVA_Build 14 51735410 1D GTTTTTCTTT A/- AAAAATTATG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 6 5 85806 CASAVA_Build 14 51741563 1D45M1D AATTTACAAT AAAAAAAAACCCCATTAAAAAGGTGGCACAGGACATGAATAGACACT/-AAAAAAAACCCCATTAAAAACGTGGCACAGGACATGAATAGACAC- TTTTCAAAAG 3070 hom 66 het 22 0 23 4 N/A 0 0 85807 CASAVA_Build 14 51750965 4I AAAAAGATTC ----/TTTG TTTGGCCAAC 3070 hom 110 het 45 0 37 8 TTTG 1 2 85808 CASAVA_Build 14 51754717 1D TTTATCATGT C/- CCCCATCCTA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 C 5 4 85809 CASAVA_Build 14 51761585 7I CATAGTTCCT -------/CCTACAA CCTGTTAAGT 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 CCTACAA 0 1 85810 CASAVA_Build 14 51761893 3D ATATAGATAT AGA/--- AAGATACCAG 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 AGA 1 0 85811 CASAVA_Build 14 51766810 1D TTTCATTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 13 7 T 10 9 85812 CASAVA_Build 14 51773826 1I AAACTTTTTT -/C TTTTTTTAAC 3070 het 2685 hom 31 10 15 6 C 0 1 85813 CASAVA_Build 14 51775847 1D AAGTAGGAAG A/- AGAGGGTCAG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 2 1 85814 CASAVA_Build 14 51780782 5D GAAAATGACC TACTT/----- AAATCAGATT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TACTT 1 0 85815 CASAVA_Build 14 51787581 1I GTCGGTACAC -/A CAAACATAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 85816 CASAVA_Build 14 51791182 1D ATGGCTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 256 hom 24 4 13 7 T 18 17 85817 CASAVA_Build 14 51798655 2D CTTAAAGTAT AA/-- AAAAAAAAAA 1429 het 1332 hom 13 6 3 4 A 13 11 85818 CASAVA_Build 14 51807508 1D TCAGACATGG T/- TTTGAATCAG 3070 het 3070 ref 49 28 20 1 T 4 3 85819 CASAVA_Build 14 51809984 3I TTATGGAGAA ---/GTT GTTGTTAAGA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 GTT 2 3 85820 CASAVA_Build 14 51816263 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 10 11 85821 CASAVA_Build 14 51816336 1I AGATATAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 11 12 85822 CASAVA_Build 14 51817575 2D TTTGATGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 1675 het 971 hom 23 7 8 9 A 16 14 85823 CASAVA_Build 14 51817877 1D TTGTTAGGTG T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 T 7 6 85824 CASAVA_Build 14 51824382 1D ATAAATGTTT G/- TTTCTAAATA 3070 het 2714 hom 24 8 11 6 G 1 0 85825 CASAVA_Build 14 51830327 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2426 hom 36 13 20 3 A 13 12 85826 CASAVA_Build 14 51831896 1D GTGGATTAGT C/- TGAATAGTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 C 1 0 85827 CASAVA_Build 14 51834041 1I TCTTTATGTC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 7 8 85828 CASAVA_Build 14 51837821 1D TTCTTCCTCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 9 8 85829 CASAVA_Build 14 51844810 1I TATTGACTAC -/T TTTTTTTTTT 2626 het 1820 hom 32 7 12 13 T 16 17 85830 CASAVA_Build 14 51849471 2D TAGTGGGAAC CA/-- CCCCCCCCAA 3070 hom 72 het 30 0 22 8 CA 1 0 85831 CASAVA_Build 14 51854113 1D TTTATGGCTT A/- GGGGGAGCCA 3070 hom 17 het 28 1 22 5 A 1 0 85832 CASAVA_Build 14 51857731 1I CCCCAAAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 254 hom 34 1 28 5 T 9 10 85833 CASAVA_Build 14 51859761 1I TCACTCTGTC -/A ACCCAGGCTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 2 85834 CASAVA_Build 14 51861695 1D39M1D TAGTAGATGA TAAAGGAAAGGAAACAGTACAGAATTGCTTCATCCTCTACA/-AAAGGAAAGGAAACAGTACAGAATTGCTTCATCCTCTAC- ACCAATTTTC 3070 hom 141 het 38 0 48 10 N/A 0 0 85835 CASAVA_Build 14 51865363 2I GCCACTCCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 16 7 A 12 14 85836 CASAVA_Build 14 51870596 2D TGCTTGCACA GT/-- GTGGCCTGCC 3070 hom 97 het 37 0 29 10 GT 2 1 85837 CASAVA_Build 14 51875459 2I TGTGGGACCT --/AC ACACACACAC 3070 het 784 hom 53 2 43 8 AC 5 6 85838 CASAVA_Build 14 51875929 3I CACCAATACT ---/AAC AACAACACTA 3070 hom 180 het 70 0 59 11 AAC 2 3 85839 CASAVA_Build 14 51886949 1I GGTGGGGGAC -/G GGGGGGTCAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 6 7 85840 CASAVA_Build 14 51888225 2I GAGAGATGTC --/TG TGTGTGTGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TG 4 5 85841 CASAVA_Build 14 51892369 1I GCCTGCCCAC -/A GTAGTAACCC 3070 hom 106 het 42 0 34 8 A 0 1 85842 CASAVA_Build 14 51906044 1D ATGTGGCAAC T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 7 6 85843 CASAVA_Build 14 51934793 2D AGCTAGTACA CG/-- GGACATTATG 3070 het 3070 hom 40 15 19 7 CG 1 0 85844 CASAVA_Build 14 51934871 1D CTCACCTTCA C/- CCCTCAACAA 3070 het 3070 ref 56 27 18 11 C 4 3 85845 CASAVA_Build 14 51940256 1I AGATCATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 10 11 85846 CASAVA_Build 14 51942100 24D CCTCCCAACC CTGCATGTGACCCAGACCCTGGAG/------------------------ CTGCAGCTGC 3070 het 3070 ref 35 28 13 6 CTGCATGTGACCCAGACCCTGGAG 1 0 85847 CASAVA_Build 14 51952308 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 11 9 A 12 11 85848 CASAVA_Build 14 51953912 2D GTTTATTTTC CT/-- CTCTTATGGG 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 CT 3 2 85849 CASAVA_Build 14 51960705 5D CTGACATTTC AGATT/----- AGATTAAATT 3070 het 3070 ref 38 25 11 2 AGATT 2 1 85850 CASAVA_Build 14 51961401 2D GTAGATTCAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 TG 6 5 85851 CASAVA_Build 14 51984482 1D AAGAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 1862 het 1862 ref 39 32 4 3 A 11 10 85852 CASAVA_Build 14 52030611 2D TTTAGGAAAG AT/-- ATATATATAT 1412 het 1412 ref 20 12 3 6 AT 8 7 85853 CASAVA_Build 14 52130265 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTGAAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 7 6 85854 CASAVA_Build 14 52161049 1D AAAATTAGCC G/- GGTGTGGTGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 3 2 85855 CASAVA_Build 14 52168422 1D GCAAGTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 35 2 21 14 A 16 15 85856 CASAVA_Build 14 52210216 1I CAATTACTCC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 8 9 85857 CASAVA_Build 14 52212682 1D TCCTTTTTCC T/- TTTTATTTCA 3070 hom 129 het 47 0 44 6 T 5 4 85858 CASAVA_Build 14 52221278 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTCACC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 6 7 85859 CASAVA_Build 14 52236548 6I GACTCTGTCT ------/TAAAAA TAAAAATAAA 3070 het 2028 hom 22 5 14 3 TAAAAA 2 3 85860 CASAVA_Build 14 52243431 1D GAAGACCGGG A/- TAACTGAGTC 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 1 0 85861 CASAVA_Build 14 52247480 34D GGGTAAAAAT GAGTGTTTGGCTTCTAAATATTAAACTCTCGTTA/---------------------------------- GAGTGTTATT 3070 het 3070 ref 37 23 18 5 GAGTGTTTGGCTTCTAAATATTAAACTCTCGTTA 1 0 85862 CASAVA_Build 14 52251600 1I CTTGCAGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 37 1 26 10 A 13 14 85863 CASAVA_Build 14 52267412 1D GCGCCTGAAG T/- TTGGAAGCGC 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 T 3 2 85864 CASAVA_Build 14 52268418 1D CTAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 28 1 14 13 T 15 14 85865 CASAVA_Build 14 52271525 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2658 het 1560 hom 15 5 7 3 A 13 14 85866 CASAVA_Build 14 52273288 4D TAGAAAATAT CTTA/---- CTTGAGTACT 3070 het 3070 hom 31 13 14 7 CTTA 1 0 85867 CASAVA_Build 14 52281592 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1903 het 1903 ref 26 11 10 6 T 14 13 85868 CASAVA_Build 14 52308786 2I TTGTGGGAGA --/CT CTAGTGTATT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CT 1 2 85869 CASAVA_Build 14 52310868 4D ACCTGGCGGA TTTT/---- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 13 9 85870 CASAVA_Build 14 52311007 1I CTGAAAGACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 9 10 85871 CASAVA_Build 14 52311060 1D AATGCTGGAA T/- TTTTTTTTTT 2159 het 1296 hom 25 6 6 13 T 17 16 85872 CASAVA_Build 14 52319153 4I TGGGAAAAAG ----/AAAT AAATTCAGTG 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 AAAT 1 2 85873 CASAVA_Build 14 52358943 15D CACATTTCCA ATTTAGGGATTCCTT/--------------- CCCTGAAGTT 3070 het 3070 ref 39 23 11 8 ATTTAGGGATTCCTT 1 0 85874 CASAVA_Build 14 52371354 1D TAGCTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 30 2 18 11 T 13 12 85875 CASAVA_Build 14 52381279 15D TTCTTTTCTT CTTTCAGTCAAGGAA/--------------- CTGGTTTAGG 3070 het 3070 ref 23 14 10 1 CTTTCAGTCAAGGAA 1 0 85876 CASAVA_Build 14 52391636 2I CTTGAAAGAG --/TA TGAGTACTTA 3070 het 3070 hom 49 17 30 2 TA 0 1 85877 CASAVA_Build 14 52399528 9I AATTTTAAAA ---------/TATTTAAAT AACTACGAAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 TATTTAAAT 0 1 85878 CASAVA_Build 14 52399720 1I GTCATTAAAA -/C TTCTGAACAT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 C 0 1 85879 CASAVA_Build 14 52419258 6I AGTCTAGGAA ------/GCAAAG GCAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 GCAAAG 1 2 85880 CASAVA_Build 14 52430301 1D CCCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2052 hom 26 7 8 11 T 13 12 85881 CASAVA_Build 14 52431355 2D ATTTAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 117 hom 30 2 15 13 A 16 14 85882 CASAVA_Build 14 52435202 2I GGTGGTGGTA --/CT CTCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 CT 4 5 85883 CASAVA_Build 14 52435764 1I TTATTTATTT -/A TTTTTGAGAC 2760 het 1859 hom 12 5 6 1 A 0 1 85884 CASAVA_Build 14 52436839 9I TAAATACTAT ---------/ACATATAAA ACATATAAAA 3070 hom 89 het 38 0 29 9 ACATATAAA 1 2 85885 CASAVA_Build 14 52436964 1I CACTCCTTTC -/A AAAATCACGT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 4 5 85886 CASAVA_Build 14 52438873 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 A 10 11 85887 CASAVA_Build 14 52443482 1I AGGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 10 11 85888 CASAVA_Build 14 52450893 1I ACAACAACAA -/C ATATTAAACT 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 C 0 1 85889 CASAVA_Build 14 52455923 4I TTAACAGCAA ----/TAAT TAATTAACTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TAAT 1 2 85890 CASAVA_Build 14 52458951 1D TTATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 8 A 12 11 85891 CASAVA_Build 14 52460892 1I GCTGTCTGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 312 hom 48 1 34 13 T 8 9 85892 CASAVA_Build 14 52462618 20I GATGACTTTA --------------------/AAAGGAAAATGGTTATCTAC AAATACTTAC 3070 hom 187 het 64 0 62 6 AAAGGAAAATGGTTATCTAC 0 1 85893 CASAVA_Build 14 52490958 2D TCTTTTTGAC TA/-- TTTCAAGCTG 3070 het 3070 ref 39 20 16 6 TA 1 0 85894 CASAVA_Build 14 52503938 1D TGGGATTACT G/- GTGTGAGCCA 3070 het 3070 hom 29 7 18 6 G 2 1 85895 CASAVA_Build 14 52508900 13D AACAATTCTA CTATTAAAAGACT/------------- CTGATGCATT 3070 het 3070 ref 21 14 9 0 CTATTAAAAGACT 1 0 85896 CASAVA_Build 14 52512272 1D CCTCATAAAT G/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 45 21 21 5 G 1 0 85897 CASAVA_Build 14 52516488 2D TCTTTCACAG GT/-- GTGTTGATCC 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 GT 3 2 85898 CASAVA_Build 14 52519030 1I TACCAAAACC -/A AAAATCTAAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 4 5 85899 CASAVA_Build 14 52519534 3I AAATTACAGT ---/ATG ATAAATTATA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 ATG 0 1 85900 CASAVA_Build 14 52521359 3I AGTAAATGCT ---/AAG AAGAAGATAT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 AAG 2 3 85901 CASAVA_Build 14 52521920 2I GTGGAGAGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 6 het 21 1 13 7 AG 7 8 85902 CASAVA_Build 14 52523983 27I CACTGCTATA ---------------------------/ACCGCAATGCCTTCTGAGGCATTGTGG ACTCAGTAAG 3070 hom 84 het 29 0 28 5 ACCGCAATGCCTTCTGAGGCATTGTGG 0 1 85903 CASAVA_Build 14 52535758 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 8 9 85904 CASAVA_Build 14 52537313 9D TCTGTCTCAA AACATCAAC/--------- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 21 11 11 5 AACATCAAC 1 0 85905 CASAVA_Build 14 52541270 1D GCCGAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 1506 het 1093 hom 13 6 5 2 T 17 16 85906 CASAVA_Build 14 52583229 2D ATGTCCTTCA AG/-- AGAGTTCAGA 3070 hom 115 het 43 0 36 8 AG 3 2 85907 CASAVA_Build 14 52589446 1I TGTTAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 10 11 85908 CASAVA_Build 14 52592075 1I CCCCAAACTT -/A ATGTCTAGGA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 1 2 85909 CASAVA_Build 14 52619626 1I TATTCTCCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 8 9 85910 CASAVA_Build 14 52639130 2D CAGAGAGGTA AG/-- AGAGAGCAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 AG 4 3 85911 CASAVA_Build 14 52652178 3D CCTGCCTTAC AAG/--- AACTCCTGAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 AAG 1 0 85912 CASAVA_Build 14 52673887 4I TGGCAAAACC ----/CTGT CTGTCTCTAC 3070 hom 27 het 10 0 10 1 CTGT 1 2 85913 CASAVA_Build 14 52697565 2D ATTCCCACAC TG/-- TGTGTGTATA 3070 hom 90 het 31 0 31 3 TG 4 3 85914 CASAVA_Build 14 52710335 1I ATAAATAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 9 9 10 A 10 11 85915 CASAVA_Build 14 52728181 1I AACTTGGGGA -/G GGGGGGGTCT 3070 hom 73 het 29 0 24 5 G 7 8 85916 CASAVA_Build 14 52734339 3I TGGACACACC ---/AGA AGAACAGCCT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AGA 1 2 85917 CASAVA_Build 14 52739630 1D CCCGGTGGGA C/- AAAATAATCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 1 0 85918 CASAVA_Build 14 52746048 2D44M2D GTCAGATGGT TATATTTCACAATAGCACAATTTATTGAATTTGGCACATTGTCATCTT/--TATTTCACAATAGCACAATTTATTGAATTTGGCACATTGTCATC-- TTTTTTTTTT 3070 hom 181 het 45 0 60 5 N/A 0 0 85919 CASAVA_Build 14 52748122 2I GTTACTGATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 12 85920 CASAVA_Build 14 52760015 4I ATGATCTTTT ----/TTTC TTTTTTCTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TTTC 0 1 85921 CASAVA_Build 14 52765077 1D ATATAGGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 10 9 85922 CASAVA_Build 14 52789176 1D AATAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 13 12 85923 CASAVA_Build 14 52802050 1I AAAAACGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 52 hom 30 1 22 7 T 9 10 85924 CASAVA_Build 14 52829461 1I TGTTGCTGAT -/A ATGGCCAGTG 3070 hom 126 het 55 0 41 14 A 1 2 85925 CASAVA_Build 14 52863974 8I GATAAATGTG --------/TTTCTGGC TTTTTCCCAC 3070 hom 157 het 54 0 53 1 TTTCTGGC 0 1 85926 CASAVA_Build 14 52865580 5D GTAAGATAAA CAACT/----- CAAAGAGGAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 8 CAACT 1 0 85927 CASAVA_Build 14 52887190 1I AGGATGGAGA -/C TTAAAAAAAA 3070 hom 83 het 37 0 27 10 C 0 1 85928 CASAVA_Build 14 52889302 1I GGGAAGAATC -/A GGGGCAAAGT 3070 hom 68 het 25 0 22 3 A 0 1 85929 CASAVA_Build 14 52890309 9I AACCTCAGGG ---------/CTAGACCTT CGTTATAGGT 3070 hom 138 het 48 0 46 3 CTAGACCTT 0 1 85930 CASAVA_Build 14 52892686 1D56M1D TCAGCAATAC TTTTTTTTTTTCTGAAATCCTTTTTTGCAAGAAGAATGTAAATCTTCCCTGCAGCACT/-TTTTTTTTTTCTGAAATCCTTTTTTGCAAGAAGAATGTAAATCTTCCCTGCAGCAC- TTAATTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 26 N/A 0 0 85931 CASAVA_Build 14 52894112 4D ATTCAGTCAC CACT/---- CACTCACTCA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 CACT 3 2 85932 CASAVA_Build 14 52894526 6D TATATATATA TATATC/------ TCTTTATATA 3070 hom 82 het 31 0 28 5 TATATC 1 0 85933 CASAVA_Build 14 52895529 3I AAATTACAGT ---/TCA TCATCTCTCA 3070 hom 135 het 48 0 45 3 TCA 1 2 85934 CASAVA_Build 14 52955179 1D GCCTCCACAC A/- AGAGTCCACA 3070 hom 78 het 31 0 25 7 A 2 1 85935 CASAVA_Build 14 52959032 1I AGGTTCAAAG -/A AAAAAATTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 85936 CASAVA_Build 14 52995895 1I CAGGCGTGAG -/C CACCATGCCT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 C 1 2 85937 CASAVA_Build 14 52998878 1D GGAAGGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 17 17 T 11 10 85938 CASAVA_Build 14 53004915 1I TTTAGTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 10 11 85939 CASAVA_Build 14 53017314 1I AAAGTCTTAA -/C TTGTTCCAAC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 C 0 1 85940 CASAVA_Build 14 53020175 1D CAGCTTTCTC A/- AGGCATTTTG 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 A 2 1 85941 CASAVA_Build 14 53021531 1I CAAAAATAGG -/A AAAAAAAAAA 2816 het 2816 ref 33 18 10 5 A 15 16 85942 CASAVA_Build 14 53025147 1I CTCAAAGAAC -/T AAAAATAGAA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 T 0 1 85943 CASAVA_Build 14 53035672 1D TCTGGCTAGC T/- TTTTTTTTTT 2640 het 2003 hom 24 10 6 9 T 15 14 85944 CASAVA_Build 14 53058320 7D GATGAGTAGG TGAACAA/------- TGAACAATTT 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 TGAACAA 2 1 85945 CASAVA_Build 14 53059400 1I GAACTTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 9 10 85946 CASAVA_Build 14 53073584 1D ATTATCCCTA T/- TTTACAGATT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 4 3 85947 CASAVA_Build 14 53074574 1D TGCCACAGCT G/- GGGAGCAACT 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 G 4 3 85948 CASAVA_Build 14 53085524 4D ATATAGTAAC AATT/---- AAAGGGGCAG 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 AATT 1 0 85949 CASAVA_Build 14 53088157 3I AAGCTAGTTT ---/TAG GAAAGAGACC 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 TAG 0 1 85950 CASAVA_Build 14 53107295 2I TGTTGATGAT --/AA AAGACACCAA 3070 het 3070 hom 52 15 30 7 A 2 4 85951 CASAVA_Build 14 53107780 3D TGTTCTTCAA GTT/--- GATGGTTCTA 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 GTT 1 0 85952 CASAVA_Build 14 53110795 1D CTACCAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1603 hom 33 9 16 9 T 17 16 85953 CASAVA_Build 14 53123340 1I AAAGAATATA -/T AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 0 1 85954 CASAVA_Build 14 53142958 1D TAGATCACAA G/- TACAACTAAA 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 G 1 0 85955 CASAVA_Build 14 53157084 1I AAAGACATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 18 12 T 12 13 85956 CASAVA_Build 14 53164464 3I TAAAAACATG ---/AAT AATATACTTT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 AAT 1 2 85957 CASAVA_Build 14 53182084 1I AATTTTAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 9 10 85958 CASAVA_Build 14 53201376 4D TTCTGCACTT AAAC/---- TAATGTATTT 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 AAAC 1 0 85959 CASAVA_Build 14 53203566 1D GTGAGAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 26 6 A 11 10 85960 CASAVA_Build 14 53212499 1I GATTTTTTTT -/C CTCTGGTCAC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 C 1 2 85961 CASAVA_Build 14 53226454 1I GATAAGTGAC -/T TTTTTTTTTC 2528 het 2528 ref 31 19 7 5 T 9 10 85962 CASAVA_Build 14 53230841 6D CTTGAACCTG GGAGGT/------ GGAGGTGGAG 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 GGAGGT 3 2 85963 CASAVA_Build 14 53245797 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 10 9 85964 CASAVA_Build 14 53253193 1I AAACGTGGGA -/T TTTTTTGTGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 6 7 85965 CASAVA_Build 14 53262257 1D CTTTCAAGTT A/- ACAGGAAAAC 3070 hom 131 het 48 0 44 5 A 2 1 85966 CASAVA_Build 14 53266443 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 11 12 85967 CASAVA_Build 14 53291943 1D TTTGATTATC T/- TGTTGTTAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 2 1 85968 CASAVA_Build 14 53292544 1I GGCAAAAAAA -/C ATACAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 C 0 1 85969 CASAVA_Build 14 53350844 1D TTGGTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 34 2 18 15 T 17 16 85970 CASAVA_Build 14 53351505 1I TTTGCTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 13 14 85971 CASAVA_Build 14 53352618 1I GAAGGGCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 23 0 12 11 T 10 11 85972 CASAVA_Build 14 53369572 1I GTTAGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 9 10 85973 CASAVA_Build 14 53369827 4D AGCTGAAAGG TAAA/---- TAAATGGAGA 3070 hom 57 het 20 0 20 2 TAAA 2 1 85974 CASAVA_Build 14 53381458 1I TAGAAAATAC -/A AATGAAAAGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 2 3 85975 CASAVA_Build 14 53383259 1I AAACAACAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 9 85976 CASAVA_Build 14 53390720 1I GGTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 192 hom 43 1 30 12 T 10 11 85977 CASAVA_Build 14 53391196 2D TTGAAACATT CA/-- CAGTGTGGTA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 CA 2 1 85978 CASAVA_Build 14 53413094 1I ACTCCAGGAA -/G ATACGAATCA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 G 0 1 85979 CASAVA_Build 14 53419503 2D TCAGTCTCAG AT/-- ATATGACATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 3 2 85980 CASAVA_Build 14 53419808 1I TATAAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 33 2 28 3 A 10 11 85981 CASAVA_Build 14 53421632 1I AGTTGCCAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 79 het 36 0 27 9 A 9 10 85982 CASAVA_Build 14 53425049 1I GTTAAGTTGG -/T TTTTTTTTTT 1247 het 1247 ref 39 27 4 8 T 10 11 85983 CASAVA_Build 14 53425892 1I TCCTTCCTCT -/C CCCATTTTGT 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 C 3 4 85984 CASAVA_Build 14 53427832 9I ATAAAAGGAT ---------/GACAAAACA GACCAAGAGA 3070 hom 104 het 40 0 35 5 GACAAAACA 0 1 85985 CASAVA_Build 14 53432146 1I GGGCAAAATA -/T TCCTTGCTCT 3070 het 3070 ref 36 21 7 8 T 1 2 85986 CASAVA_Build 14 53439158 1D ATTTATCCCT A/- AAGGTAACTA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 A 3 2 85987 CASAVA_Build 14 53440142 1D ATTGATAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1551 hom 30 5 11 14 T 12 11 85988 CASAVA_Build 14 53460286 6I CCAGAAATAA ------/AACAAG AACATGTTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AACAAG 0 1 85989 CASAVA_Build 14 53464353 1I ACTCATGAAA -/T TTTGTCTCAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 3 4 85990 CASAVA_Build 14 53465326 1I17M1I AAAAAAAAAA -AATAAAAATAAAAACTT-/TAATAAAAATAAAAACTTG GTAAAGTGCA 3070 hom 33 het 12 0 12 2 N/A 0 0 85991 CASAVA_Build 14 53485499 2D TATTTGTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 2653 het 283 hom 24 5 8 11 A 16 14 85992 CASAVA_Build 14 53485623 2D AACTTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 26 1 21 5 A 13 11 85993 CASAVA_Build 14 53486188 1D GATTAAGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 10 9 85994 CASAVA_Build 14 53504710 3I CATGTAATAT ---/AAC AACATTAGGT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AAC 1 2 85995 CASAVA_Build 14 53505012 13D CGTCTCAGAT AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 4 A 27 14 85996 CASAVA_Build 14 53516460 1D TGGTTTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 728 hom 32 5 18 10 A 17 16 85997 CASAVA_Build 14 53518609 6D AAATAATGTG GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 132 het 52 0 45 12 GT 9 6 85998 CASAVA_Build 14 53532307 2D ACATGGAAAC AT/-- GTGCAAGATA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AT 1 0 85999 CASAVA_Build 14 53533192 4I TTATAAAGAT ----/TAAA TAAGTAAACT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TAAA 0 1 86000 CASAVA_Build 14 53536731 1I TAATCAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 646 hom 39 3 30 6 T 10 11 86001 CASAVA_Build 14 53537124 1I ACCAAGCAAT -/G GGTGGCCTGA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 G 2 3 86002 CASAVA_Build 14 53543848 1I TAATATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 31 2 13 16 T 15 16 86003 CASAVA_Build 14 53561212 1D CCAATATTGT G/- GGGATTTTCC 3070 hom 75 het 30 0 25 10 G 4 3 86004 CASAVA_Build 14 53571276 1I TTTTTTTTTT -/A TTTAAATATG 3070 het 380 hom 29 1 22 6 A 0 1 86005 CASAVA_Build 14 53586417 2D AAGATAGCCC CT/-- GTTATCAGTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 CT 1 0 86006 CASAVA_Build 14 53618515 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 6 5 86007 CASAVA_Build 14 53625804 1I ATACACATTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 9 86008 CASAVA_Build 14 53643431 2D45M8D TGTGTGTGTT TGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGAGTGTGTGT/--TGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGCGTGTGTATGTGTGTGTGTTTGA-------- GTGTGTGTGT 3070 het 30 hom 41 3 45 21 N/A 0 0 86009 CASAVA_Build 14 53646108 1D TTCTTGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 20 2 10 8 T 15 14 86010 CASAVA_Build 14 53646905 5D CAGCTAACTA TACTC/----- TACAGACTAT 3070 hom 138 het 48 0 47 5 TACTC 1 0 86011 CASAVA_Build 14 53648667 1D GTCTTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 725 hom 39 2 29 8 A 11 10 86012 CASAVA_Build 14 53649720 1D TTATAAATCA C/- CCCAGTCTCA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 4 3 86013 CASAVA_Build 14 53650002 1I TCCACACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 934 hom 35 3 27 5 A 10 11 86014 CASAVA_Build 14 53653608 2I AAAAGCTATC --/TG TGTTTAAAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TG 1 2 86015 CASAVA_Build 14 53653741 1I CACTTTCCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 36 1 20 15 T 10 11 86016 CASAVA_Build 14 53656334 1D TCAGACACTA T/- TTTTAATAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 5 4 86017 CASAVA_Build 14 53657798 1D TTTGCACTCC A/- AAGATGAGTT 3070 hom 120 het 44 0 40 5 A 3 2 86018 CASAVA_Build 14 53660940 3I TTGTGGAAAC ---/AAT AATTTTATGT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAT 1 2 86019 CASAVA_Build 14 53681799 1I TATGGAAGGC -/A AAAAAATACA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 7 86020 CASAVA_Build 14 53712982 1I CAAGACTCCG -/A AAAAAAAAAA 2432 hom 21 het 9 0 8 1 A 10 11 86021 CASAVA_Build 14 53721597 2I TCTTTGCTGC --/TG TGTTTGCTGA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 TG 1 2 86022 CASAVA_Build 14 53724275 1I TGCATTTTCC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 8 9 86023 CASAVA_Build 14 53728408 3D AAACCAAGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 35 1 21 14 A 17 14 86024 CASAVA_Build 14 53731744 1I GAAGTCCCAG -/T TACTGCTTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 2 86025 CASAVA_Build 14 53736166 2D TTTCTGGTAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 42 0 38 5 A 11 9 86026 CASAVA_Build 14 53743062 1I AGAAGCTTAA -/T CAGGCAGGAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 1 86027 CASAVA_Build 14 53750885 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 11 10 86028 CASAVA_Build 14 53753638 1D TTTCTCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 489 hom 36 4 23 9 T 14 13 86029 CASAVA_Build 14 53754678 1I TAAAATCAAG -/A TAAGAGATGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 0 1 86030 CASAVA_Build 14 53756000 1D CTCCAGGCTC T/- TGCAACTGTC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 2 1 86031 CASAVA_Build 14 53810209 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 8 7 86032 CASAVA_Build 14 53812371 3D CTTTGGGGCT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 123 het 49 0 40 9 TTG 5 4 86033 CASAVA_Build 14 53834435 1D AGAGCAGCAA G/- AAATGATATA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 1 0 86034 CASAVA_Build 14 53838172 2I TTAGTTTCCC --/CT GTGTGTAAAA 3070 hom 123 het 52 0 40 12 CT 0 1 86035 CASAVA_Build 14 53849273 2I TAGGTATGAT --/TC TGTTTTACAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TC 0 1 86036 CASAVA_Build 14 53874711 2I TAAAAAATCA --/AC AGAGAGTACT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AC 0 1 86037 CASAVA_Build 14 53875044 5D TTGGTTGTTC TGTTG/----- TGTTGTGTTG 3070 hom 117 het 43 0 35 11 TGTTG 3 2 86038 CASAVA_Build 14 53876144 1D GAGCAAGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 23 2 10 11 A 17 16 86039 CASAVA_Build 14 53876827 1D TTAAAGAGAC A/- AAAAAAAAAC 1079 het 1079 ref 53 39 3 11 A 10 9 86040 CASAVA_Build 14 53883980 2D GGGCCGGGCC TA/-- TTTTAGATGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TA 1 0 86041 CASAVA_Build 14 53888833 1I CAGCATGTCA -/C ATGTATACAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 0 1 86042 CASAVA_Build 14 53890351 1I TCCCAGTGTT -/A ACACAGTTTG 3070 hom 138 het 56 0 46 10 A 1 2 86043 CASAVA_Build 14 53893550 1I GGGATTCATG -/A GGGGAAAGTT 3070 hom 65 het 29 0 21 8 A 0 1 86044 CASAVA_Build 14 53908059 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 269 hom 27 2 18 7 A 16 15 86045 CASAVA_Build 14 53909679 2D GGAGGGAGAC AG/-- AAAGAGAATG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AG 1 0 86046 CASAVA_Build 14 53910536 13D11M3D4M10D TACAGGTAAT AATAAAAGGTACAAATACTCCTCACTGTAAATTTCATATAG/-------------AATACTCCTCA---TAAA---------- CCAATTGATT 3070 hom 48 het 14 0 17 3 N/A 0 0 86047 CASAVA_Build 14 53922592 2I TGGAAGAGAT --/CA CAGTGACCCC 3070 het 3070 ref 36 22 8 6 CA 1 2 86048 CASAVA_Build 14 53927058 1I GTGTTAAGAC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 7 8 86049 CASAVA_Build 14 53928346 1I CCTTAAGGAT -/C CCTCGCTTTG 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 C 2 3 86050 CASAVA_Build 14 53936706 10I9M1I TTTACTCTTT ----------ATAAGACCC-/ATAATATAGAATAAGACCCT TTTTTTTTTT 2509 het 2509 ref 26 14 9 5 N/A 0 0 86051 CASAVA_Build 14 53945342 1D AACAAATCAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 9 8 86052 CASAVA_Build 14 54079252 4I CTGGTTTCTT ----/TTAC TTAGCGTGTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTAC 0 1 86053 CASAVA_Build 14 54107501 1D TCAGTATAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 9 8 86054 CASAVA_Build 14 54136613 1I TTCTTTCTTC -/T TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 5 6 86055 CASAVA_Build 14 54143723 2I AAGTTCCTCA --/TG TGTGAGATCG 3070 hom 133 het 50 0 42 8 TG 2 3 86056 CASAVA_Build 14 54152251 1I ATTACTAATA -/T TTTTAAGCAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 4 5 86057 CASAVA_Build 14 54153923 3I17M1I AGAATCTGTA ---AGGAGAGAATCTTTCCC-/AGGAGGAGAGAATCTTTCCCT TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 31 0 32 5 N/A 0 0 86058 CASAVA_Build 14 54158108 1D GGGATTATAG C/- CGTGAGCCAC 3070 hom 72 het 28 0 25 5 C 2 1 86059 CASAVA_Build 14 54160094 9I GGGATCAGTT ---------/GGGGAGAGC GGGGAGGGTG 3070 hom 77 het 29 0 25 4 GGGGAGAGC 0 1 86060 CASAVA_Build 14 54165561 1D CAATGTGACT G/- GGTATCCCTA 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 G 3 2 86061 CASAVA_Build 14 54192046 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 11 10 86062 CASAVA_Build 14 54209570 14D TAAAGGAATT TACTTTCATATTCC/-------------- TCCAGTGGCT 3070 het 3070 ref 42 27 17 2 TACTTTCATATTCC 1 0 86063 CASAVA_Build 14 54213012 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2166 het 237 hom 13 1 8 4 T 13 12 86064 CASAVA_Build 14 54223505 1D ACCCTGTGAT A/- GGGGTTATAC 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 A 1 0 86065 CASAVA_Build 14 54225371 1I TCAGTAGATC -/A TATAGAGAGG 3070 het 3070 ref 35 13 8 14 A 0 1 86066 CASAVA_Build 14 54241660 3I GTTAGATGAA ---/TAT TAAATGAAAG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 TAT 0 1 86067 CASAVA_Build 14 54243082 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 62 het 26 0 17 10 AAAG 4 3 86068 CASAVA_Build 14 54259572 2D TTTTAAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 30 0 21 9 A 12 10 86069 CASAVA_Build 14 54263234 1D GGCATCGGGG T/- TTTTTTTTTA 1368 het 1368 ref 35 22 3 10 T 10 9 86070 CASAVA_Build 14 54269832 1D TAAAATTTTT A/- TAGAGGTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 1 0 86071 CASAVA_Build 14 54271679 1D TGCCGCTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 116 hom 29 2 13 15 T 13 12 86072 CASAVA_Build 14 54274428 1D ACCCTCTTCT A/- AAAGATATTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 4 3 86073 CASAVA_Build 14 54275987 1D GTTAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 31 1 19 11 A 16 15 86074 CASAVA_Build 14 54297458 10D TCCTCACCAC TGAAAGTGTT/---------- CTCAGATGTG 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 TGAAAGTGTT 1 0 86075 CASAVA_Build 14 54316147 1D ATGGACAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 42 1 29 12 T 19 18 86076 CASAVA_Build 14 54330132 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2046 het 9 hom 19 1 6 12 A 17 16 86077 CASAVA_Build 14 54335704 4D CAGCACCCTT TTTA/---- TTTATTTCTC 3070 hom 79 het 31 0 27 5 TTTA 2 1 86078 CASAVA_Build 14 54337646 4D AATTTACAAG AAAA/---- AAAAAACATT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 10 6 86079 CASAVA_Build 14 54337730 1D CAAACATATG A/- AAAAAAGCTC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 7 6 86080 CASAVA_Build 14 54337828 1D TCAAAAAGTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 9 8 86081 CASAVA_Build 14 54339229 5I ATGACCATCC -----/TGAGA TATTTGTTTA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 TGAGA 0 1 86082 CASAVA_Build 14 54343045 1D ATAAAGGGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 37 0 31 6 T 10 9 86083 CASAVA_Build 14 54349816 1D TGTTTCCTCA G/- TTGTAAATCA 3070 hom 117 het 46 0 38 8 G 1 0 86084 CASAVA_Build 14 54352821 10I AAAAGCAGGG ----------/AAAAAGATCA TACAAAATTG 3070 het 77 hom 37 1 20 17 AAAAAGATCA 0 1 86085 CASAVA_Build 14 54363882 1D CAACTTCAAT A/- TCAGTTCTTG 3070 hom 135 het 50 0 44 7 A 1 0 86086 CASAVA_Build 14 54372395 1D GGTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTC 1048 het 1048 ref 35 27 3 5 T 10 9 86087 CASAVA_Build 14 54384135 2I AACTCCCCTT --/TA TATATATATA 3070 het 10 hom 17 1 14 2 TA 8 9 86088 CASAVA_Build 14 54392496 1I GTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 269 hom 32 1 25 6 A 9 10 86089 CASAVA_Build 14 54394603 1I GCTGGAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 T 10 11 86090 CASAVA_Build 14 54398190 2D AAACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 2 A 16 14 86091 CASAVA_Build 14 54412964 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 10 11 86092 CASAVA_Build 14 54421169 1D ACCCAGAAGA C/- AGAGGTTGCA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 1 0 86093 CASAVA_Build 14 54423898 2I ACAAACAAAC --/AA AAAAATCATA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 7 86094 CASAVA_Build 14 54427571 4I ATAAGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 TTTG 2 3 86095 CASAVA_Build 14 54431212 2D ATAATATGTC AA/-- AAGTGCCTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 4 2 86096 CASAVA_Build 14 54433760 1I AACCTCTACT -/C CACTTTTTTT 2211 hom 18 het 9 0 7 2 C 1 2 86097 CASAVA_Build 14 54440329 1I CAAAATAATA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 34 het 14 0 13 1 T 8 9 86098 CASAVA_Build 14 54443261 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1637 hom 31 4 18 9 A 12 13 86099 CASAVA_Build 14 54452230 1I TCCATTTTGA -/T AGAGGAAGAA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 0 1 86100 CASAVA_Build 14 54452601 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 28 2 16 10 T 13 12 86101 CASAVA_Build 14 54461496 1I CTGGCTAACA -/C GGTGAAACCC 3070 hom 39 het 15 0 12 3 C 0 1 86102 CASAVA_Build 14 54463142 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 14 1 10 3 A 15 14 86103 CASAVA_Build 14 54463487 4D TCCCTCCCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 1592 het 8 hom 20 1 8 11 CCTT 4 3 86104 CASAVA_Build 14 54464381 2D GAGACATAAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 15 0 13 3 AT 7 6 86105 CASAVA_Build 14 54466688 1I AGAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 475 hom 39 2 26 11 A 11 12 86106 CASAVA_Build 14 54476064 4D GAAAAAAAAA AAAG/---- AACACTGGAA 2037 hom 24 het 31 0 10 23 AAAG 1 0 86107 CASAVA_Build 14 54502809 3I TCGCACAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAC 5 6 86108 CASAVA_Build 14 54509508 2D CAGAATGATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TA 6 5 86109 CASAVA_Build 14 54510961 1D GTTTTGTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 G 1 0 86110 CASAVA_Build 14 54514381 1D GGTTGTGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 760 hom 34 3 26 5 A 13 12 86111 CASAVA_Build 14 54517670 2I AATATATATT --/CA GTTTTATTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CA 0 1 86112 CASAVA_Build 14 54520149 1D TTTATTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 13 12 86113 CASAVA_Build 14 54524701 1I TGTTTTTCCG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 85 het 34 0 28 6 T 9 10 86114 CASAVA_Build 14 54530217 1I TTCTCACTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 86115 CASAVA_Build 14 54531850 4I ATTTCCTTCC ----/TTCT ATTTGCTTGG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTCT 0 1 86116 CASAVA_Build 14 54533200 2I AGTTTGGTAT --/AA AAGTCTAATG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 2 4 86117 CASAVA_Build 14 54535099 1D TCTAGTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 11 10 86118 CASAVA_Build 14 54539087 1I ACTTTTTTTT -/C CCCCCAAGAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 5 6 86119 CASAVA_Build 14 54540221 1I CAGTAGAGAC -/G GGGGTCTTAT 3070 hom 27 het 10 0 9 1 G 4 5 86120 CASAVA_Build 14 54552168 1D TCCAATGGAA T/- TTTTTTTTTT 2156 het 2156 ref 24 11 6 7 T 17 16 86121 CASAVA_Build 14 54563010 1D ACTACAACTA C/- CATGACGGCC 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 C 2 1 86122 CASAVA_Build 14 54569240 3D CTTATTATTA TTC/--- TTCTACCTCA 3070 het 3070 ref 28 14 9 7 TTC 2 1 86123 CASAVA_Build 14 54571732 16D TAGCACACGT AAAAACAGTTACCCTA/---------------- AAATCCAAAC 3070 het 3070 hom 53 24 29 12 AAAAACAGTTACCCTA 1 0 86124 CASAVA_Build 14 54572311 1D ACCATGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 12 11 86125 CASAVA_Build 14 54577896 9D TTTATTTTTC ATTTGTAAA/--------- ATATTTGAGA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 ATTTGTAAA 1 0 86126 CASAVA_Build 14 54602452 1I TATAACCACC -/A AAAAAAAAAA 2367 het 2367 ref 35 22 8 5 A 11 12 86127 CASAVA_Build 14 54602899 3I CAAGGACAGG ---/TGT TGTTAGCTGT 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 TGT 1 2 86128 CASAVA_Build 14 54605482 1D GTGGCATGCC T/- TTTTTTTTTT 1824 het 1824 ref 39 29 4 6 T 13 12 86129 CASAVA_Build 14 54614662 1D AATGAGCAAA G/- ATATTTTAGC 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 G 1 0 86130 CASAVA_Build 14 54616940 1I GAGTGAGACC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 2233 hom 20 5 10 5 A 7 8 86131 CASAVA_Build 14 54617387 1I TTATTTTAAT -/A TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 0 1 86132 CASAVA_Build 14 54624005 1D TTTGGAACCC T/- TTTTTTTTTC 1363 het 1363 ref 40 27 3 10 T 10 9 86133 CASAVA_Build 14 54629274 4D TGTAGACATT CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 62 21 32 9 CA 9 7 86134 CASAVA_Build 14 54631781 1D GCTCCATTAT A/- ATCTTATGGG 3070 het 3070 ref 56 32 21 3 A 2 1 86135 CASAVA_Build 14 54638524 2I CTATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 389 hom 35 1 30 4 AT 5 6 86136 CASAVA_Build 14 54640764 1I CCTTCCCTTC -/T TTTGACACAT 3070 hom 130 het 52 0 41 11 T 3 4 86137 CASAVA_Build 14 54665013 12D ATCTCATTCA TAAGGACCCTGC/------------ CCCTATGACC 3070 hom 78 het 27 0 26 3 TAAGGACCCTGC 1 0 86138 CASAVA_Build 14 54669040 5I AGTTATAATG -----/CTTTT CTTTTCTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 CTTTT 3 4 86139 CASAVA_Build 14 54669667 1I AGTGTGATGT -/A TTTCTATTGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 86140 CASAVA_Build 14 54675081 1D TTGTAGTAAT G/- GAGAACATTT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 G 2 1 86141 CASAVA_Build 14 54676555 3I TTTCTTTTCA ---/ATT ATTATTTGTA 3070 hom 69 het 25 0 23 3 ATT 2 3 86142 CASAVA_Build 14 54680999 1D TTGCTGCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 26 0 18 8 A 10 9 86143 CASAVA_Build 14 54686287 3D GAATCGGGGC GGG/--- GGGGGGGCAT 3070 hom 37 het 17 0 11 6 G 10 7 86144 CASAVA_Build 14 54687332 1D GAAAAACAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 8 86145 CASAVA_Build 14 54687815 1I AAGGACAACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 192 hom 38 2 23 13 A 9 10 86146 CASAVA_Build 14 54697391 4D TCAGTGACTG GATA/---- GAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 7 GATA 1 0 86147 CASAVA_Build 14 54697449 4I ACACCACAGG ----/TTTC TTTGTTTTAA 3070 hom 67 het 42 0 29 13 TTTC 0 1 86148 CASAVA_Build 14 54708932 4D TAGTACAAAA TTCT/---- TTATTTTTAT 3070 hom 45 het 16 0 16 1 TTCT 1 0 86149 CASAVA_Build 14 54717329 1D ATGGTAGTGC A/- ATGCCTGTAG 3070 hom 84 het 34 0 28 9 A 2 1 86150 CASAVA_Build 14 54728814 1I AAAATAATAG -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 69 het 35 0 23 12 T 5 6 86151 CASAVA_Build 14 54732737 1I CATTGTATAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 461 hom 37 2 27 8 T 9 10 86152 CASAVA_Build 14 54753968 4I TAGTGAGTGC ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 237 hom 36 1 28 7 AT 6 8 86153 CASAVA_Build 14 54775342 1D CTGGATCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 10 9 86154 CASAVA_Build 14 54784056 4D10M5D GAGTAGAAAC TACTAGAAGAAACAGGAGT/----AGAGGAATCA----- TTCCTGTATC 1951 het 1257 hom 40 5 5 33 N/A 0 0 86155 CASAVA_Build 14 54786696 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 T 15 14 86156 CASAVA_Build 14 54788849 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 86157 CASAVA_Build 14 54800857 1D AGAGATGGAC G/- GGGGGGGGTC 3036 hom 14 het 12 0 8 4 G 9 8 86158 CASAVA_Build 14 54802205 7D GACCAGCCTG GTCAACA/------- TGGTGAAACA 876 hom 12 het 7 0 3 4 GTCAACA 1 0 86159 CASAVA_Build 14 54802394 6D GACTCCATCT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 198 hom 5 het 5 0 2 3 A 22 16 86160 CASAVA_Build 14 54803256 1D GAATTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 T 11 10 86161 CASAVA_Build 14 54812350 4D GGCCAGAGGT GTTA/---- GTTAAAGGTC 3070 hom 35 het 26 0 18 8 GTTA 2 1 86162 CASAVA_Build 14 54812445 1D GGGCCTAGAT A/- ACCACAGATT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 2 1 86163 CASAVA_Build 14 54819750 1D ATAAAAAGCT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 79 het 30 0 27 3 A 9 8 86164 CASAVA_Build 14 54826862 1D GACTTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 21 0 18 3 A 12 11 86165 CASAVA_Build 14 54830306 1I TGAAGTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 49 2 32 15 T 11 12 86166 CASAVA_Build 14 54830776 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 8 9 86167 CASAVA_Build 14 54833378 5D TGCAAATATT TGTTC/----- TGTTCTAAGG 3070 hom 69 het 26 0 24 4 TGTTC 2 1 86168 CASAVA_Build 14 54834677 1I ACACTGTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 23 0 17 6 T 11 12 86169 CASAVA_Build 14 54834851 1D GGATTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 21 4 T 11 10 86170 CASAVA_Build 14 54835966 1D TTGCAAATCC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 9 8 86171 CASAVA_Build 14 54836617 2I GATGTCATAG --/TT TTTTAGTAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 4 6 86172 CASAVA_Build 14 54839004 3D TCAGGCAGTT CTC/--- CTGCTTTGGC 3070 hom 72 het 27 0 25 3 CTC 1 0 86173 CASAVA_Build 14 54839600 1D TTTACAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 32 1 23 8 T 12 11 86174 CASAVA_Build 14 54845619 2I GTGTGGGTAT --/AC ACACTTTTTG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AC 2 3 86175 CASAVA_Build 14 54846510 1I GAAATAGTTT -/G GGAAAACTCA 3070 hom 98 het 36 0 32 4 G 2 3 86176 CASAVA_Build 14 54851010 1D TTGGGTATCA T/- TATGACATAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 86177 CASAVA_Build 14 54853036 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1604 het 106 hom 15 2 7 6 A 17 16 86178 CASAVA_Build 14 54853196 1I GGAACATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 89 hom 35 2 27 6 A 13 14 86179 CASAVA_Build 14 54857540 4D AGCTTTGGAA TTCC/---- TTCATTCAGA 3070 hom 66 het 23 0 23 3 TTCC 1 0 86180 CASAVA_Build 14 54861954 1I AACTAAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 10 11 86181 CASAVA_Build 14 54868032 4I ATATATATAT ----/ATAC ACACACACAC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 ATAC 0 1 86182 CASAVA_Build 14 54870194 1I CTGGGGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1098 hom 40 3 33 4 T 11 12 86183 CASAVA_Build 14 54873451 2D TTTTATTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 18 1 14 3 T 16 14 86184 CASAVA_Build 14 54876873 1D CATGCTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 43 1 24 20 T 15 14 86185 CASAVA_Build 14 54878500 2I ACTGTCAAAC --/TG TATTAGGTGT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TG 0 1 86186 CASAVA_Build 14 54889748 1D TAATTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 53 2 35 17 T 12 11 86187 CASAVA_Build 14 54895095 2D CTTCAAACTC CT/-- TGCCCATGAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CT 1 0 86188 CASAVA_Build 14 54900421 1D GCCAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 28 1 23 4 T 12 11 86189 CASAVA_Build 14 54903114 4I AAAACTTTTC ----/TTAG TTATATTCCA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 TTAG 0 1 86190 CASAVA_Build 14 54904216 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 31 2 25 6 A 12 11 86191 CASAVA_Build 14 54904582 3I TATTAAAAAT ---/AAA AAACTACTTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 3 6 86192 CASAVA_Build 14 54905527 3I GCATGAATAA ---/AAT AATACGTGTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AAT 1 2 86193 CASAVA_Build 14 54906874 3D TTAAAAATAT CAC/--- CACAATTTTC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 CAC 2 1 86194 CASAVA_Build 14 54908778 1I CCATCTGCCT -/C CCTCTTGCTG 3070 hom 80 het 31 0 26 5 C 2 3 86195 CASAVA_Build 14 54909482 11I GAGCAGGAGG -----------/AGGGTCCTGGC AGAGGCCCCT 3070 hom 60 het 23 0 19 4 AGGGTCCTGGC 0 1 86196 CASAVA_Build 14 54910276 2D AATTTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 30 1 21 8 A 16 14 86197 CASAVA_Build 14 54910688 2I TATTTTAATG --/TT TTTTTTTTTA 1804 hom 32 het 28 0 9 19 T 9 11 86198 CASAVA_Build 14 54929689 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAACACA 1429 hom 10 het 4 0 4 2 A 7 6 86199 CASAVA_Build 14 54931837 4I TGTTTGTTTG ----/TTTT TTTGTTTGAG 3070 hom 111 het 42 0 37 6 T 3 7 86200 CASAVA_Build 14 54935104 2D CAAAATATAT TG/-- TGTGATTTCG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TG 3 2 86201 CASAVA_Build 14 54946033 1D GCAGGCACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 34 0 26 8 A 11 10 86202 CASAVA_Build 14 54947392 4I GAACTTGTAG ----/CTCT CTGTTTAGAT 3070 hom 157 het 60 0 52 8 CT 1 3 86203 CASAVA_Build 14 54982897 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGGGAGC 3070 het 89 hom 33 3 19 13 G 8 7 86204 CASAVA_Build 14 54994568 1I TTAGGGGTCT -/A ACCCTACTTC 3070 hom 172 het 63 0 57 6 A 1 2 86205 CASAVA_Build 14 55000691 1D ACCACTATAA T/- TTTTTTTTTT 1431 het 1431 ref 29 18 4 7 T 17 16 86206 CASAVA_Build 14 55002240 3I CAGCTCTCTT ---/CTC CTTCAGGGTC 3070 hom 135 het 53 0 43 10 CTC 0 1 86207 CASAVA_Build 14 55005532 3I CCAGTCACTG ---/TTC TAAGCATGTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTC 0 1 86208 CASAVA_Build 14 55009021 4D3M2I ATCTCAGGCT CCCACCT--/----CCTGA GTAGCTGGGA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 N/A 0 0 86209 CASAVA_Build 14 55012603 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGTGTGC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 1 2 86210 CASAVA_Build 14 55019707 4D ACATTTGAAG CAGA/---- CAGCACACTG 3070 hom 157 het 56 0 52 6 CAGA 1 0 86211 CASAVA_Build 14 55022179 2D TTTTTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2754 het 21 hom 9 0 6 3 T 14 12 86212 CASAVA_Build 14 55023177 1D TCAACAGTGT G/- GTTCATGAGC 3070 hom 93 het 39 0 32 9 G 2 1 86213 CASAVA_Build 14 55023309 5I ACATCTATTG -----/AATAT AATTATTAAA 3070 hom 21 het 11 0 8 3 AATAT 0 1 86214 CASAVA_Build 14 55026114 2I ATTGAGAATC --/CT CTGTCTCAAA 2305 hom 18 het 7 0 7 0 CT 1 2 86215 CASAVA_Build 14 55027179 1D AATGTGATTC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 8 7 86216 CASAVA_Build 14 55027371 1D TGTAGAGATT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 60 het 22 0 19 3 G 8 7 86217 CASAVA_Build 14 55037273 4D AGTGTGGCAG AAGT/---- AAGTGATGAG 3070 hom 101 het 38 0 34 5 AAGT 2 1 86218 CASAVA_Build 14 55046216 1D AGTGTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 767 hom 26 2 20 4 T 12 11 86219 CASAVA_Build 14 55068280 8D TAAAAAAAAC AAAAACAA/-------- AAAAACAAAA 3070 hom 53 het 24 0 18 6 AAAAACAA 2 1 86220 CASAVA_Build 14 55079681 1D TTTACTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 32 2 22 8 T 11 10 86221 CASAVA_Build 14 55105423 3D CCCAGAAGGC CTT/--- CTTCTGTCTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CTT 2 1 86222 CASAVA_Build 14 55123576 2I AGGCAGGGAC --/TG TGTCTTGTTC 3070 hom 141 het 54 0 48 6 TG 1 2 86223 CASAVA_Build 14 55131933 2I CAGGTAACTC --/AA AGAGTAACAC 3070 hom 154 het 53 0 52 1 A 1 3 86224 CASAVA_Build 14 55134977 1I ACTGTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 23 1 20 2 A 11 12 86225 CASAVA_Build 14 55136570 1I TTTGTGAGAT -/G GTTTTAGGTA 425 het 425 ref 37 26 6 6 G 1 2 86226 CASAVA_Build 14 55150363 4D TGTAGGAGAT AGAG/---- AAAGTATAGA 3070 het 3070 hom 43 16 23 9 AG 2 0 86227 CASAVA_Build 14 55157777 3I ACTGTTCCAG ---/CTC CTCTGCCTGT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CTC 1 2 86228 CASAVA_Build 14 55169069 2D GAGAGTTATG GA/-- GAGATGAATG 3070 hom 84 het 31 0 29 4 GA 3 2 86229 CASAVA_Build 14 55170918 4D AGCTCAGCAA AACT/---- AACAAAGTAT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 AACT 1 0 86230 CASAVA_Build 14 55175785 3D TTATACCTCT GAC/--- GACCTGTTCA 3070 hom 84 het 34 0 28 7 GAC 2 1 86231 CASAVA_Build 14 55175834 1D CAACTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 32 2 16 14 T 17 16 86232 CASAVA_Build 14 55185835 4I TAATACTGAT ----/TGTA TGCCAGGTAC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 TGTA 0 1 86233 CASAVA_Build 14 55186330 1D CTTTGGTCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 10 9 86234 CASAVA_Build 14 55186466 1D CAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 482 hom 31 2 23 9 A 13 12 86235 CASAVA_Build 14 55190820 4I TCTTTCTAAA ----/AATG AGGGAGATTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AATG 0 1 86236 CASAVA_Build 14 55191010 2D CTGCCTTACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 14 12 86237 CASAVA_Build 14 55204377 1D GTGTAGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 41 1 26 15 T 13 12 86238 CASAVA_Build 14 55209067 1D TCCTTGGTGG T/- TTTACTTGGC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 4 3 86239 CASAVA_Build 14 55213945 11D AAGACTGTCT AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 23 1 21 4 A 22 11 86240 CASAVA_Build 14 55224138 3D ATTTATACTC ATA/--- AAAAAAATTT 3070 hom 81 het 34 0 28 8 ATA 1 0 86241 CASAVA_Build 14 55224510 4D TGGCTTCCAA TTGT/---- TTGTTTGTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 9 TTGT 3 2 86242 CASAVA_Build 14 55229134 2D TCTCTGTCCC CT/-- CTCTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CT 3 2 86243 CASAVA_Build 14 55229370 10I TGGAATATAT ----------/ACATGTTCCA TTTTACTAGG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 ACATGTTCCA 0 1 86244 CASAVA_Build 14 55229879 4I AATTGATTTA ----/TTTG TTCATTTATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTTG 0 1 86245 CASAVA_Build 14 55233425 5I4M1I GCTTATTGCT -----CCTA-/ATCTGCTTAT TGGTATGGCT 3070 hom 45 het 21 0 16 6 N/A 0 0 86246 CASAVA_Build 14 55310575 2D ATAGTTAATT AA/-- TTACCTGTCA 3070 het 3070 ref 54 26 24 5 A 2 0 86247 CASAVA_Build 14 55317459 2D GAAAGGAGAC AG/-- GGGAGGTGGG 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 AG 1 0 86248 CASAVA_Build 14 55327766 1I AAACAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 13 14 86249 CASAVA_Build 14 55329694 1I AATTGCGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 A 10 11 86250 CASAVA_Build 14 55342945 5D TTTTAAAAAA TTATT/----- TTATTTTGTT 3070 het 3070 hom 25 9 15 2 TTATT 2 1 86251 CASAVA_Build 14 55349991 1D TCCCCAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2498 hom 24 6 11 7 T 11 10 86252 CASAVA_Build 14 55351037 1D CAGAATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 11 10 86253 CASAVA_Build 14 55362717 1D TTATGCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 21 5 T 12 11 86254 CASAVA_Build 14 55364282 1I GATAGGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 10 11 86255 CASAVA_Build 14 55364852 1I GTGAGATGAA -/T TGGTGGGAAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 1 2 86256 CASAVA_Build 14 55373797 8I CTGTGTAGCA --------/TTCCTTCC TTCCTTCCTC 3070 hom 79 het 31 0 25 6 TTCC 2 4 86257 CASAVA_Build 14 55375816 13I ATATTGAGAG -------------/GTGACAGCGTGCT GGCAGTCCTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 GTGACAGCGTGCT 0 1 86258 CASAVA_Build 14 55377183 1I AAAGGGAAAT -/G GGGGAAATTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 4 5 86259 CASAVA_Build 14 55377498 1I ATACCTGCTA -/G GGGGCTGACA 3070 het 3070 ref 47 27 11 9 G 4 5 86260 CASAVA_Build 14 55377571 2D AGAGAGAAAA AT/-- ATGTCATGTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 AT 2 1 86261 CASAVA_Build 14 55393750 1D CCAACATTAT G/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 G 1 0 86262 CASAVA_Build 14 55393952 1I AGCATTATCA -/T TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 46 25 20 1 T 6 7 86263 CASAVA_Build 14 55405382 1D TTGTCATAGG A/- AATATTGTTT 3070 het 3070 hom 43 18 23 3 A 3 2 86264 CASAVA_Build 14 55410374 3I CCTGGGCAAT ---/ATG ATGAAACCCC 3070 hom 36 het 17 0 13 4 ATG 1 2 86265 CASAVA_Build 14 55416879 5D GAGATCTAAT TAAAC/----- TAAAGAGCTT 3070 het 3070 hom 26 8 18 0 TAAAC 1 0 86266 CASAVA_Build 14 55418785 4D TAACTTTTTT TCTG/---- TCTGTGTCCT 3070 hom 117 het 46 0 39 9 TCTG 2 1 86267 CASAVA_Build 14 55421980 1I TTGATCATCC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 8 9 86268 CASAVA_Build 14 55429241 1D ACACTGAGGA G/- GCTGTCAGGG 3070 het 3070 ref 41 20 19 3 G 2 1 86269 CASAVA_Build 14 55431873 2I ATACTTCAGA --/CT CTTTCTTCCT 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 CT 1 2 86270 CASAVA_Build 14 55432428 1I CACAGATTCC -/A AGGAACAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 1 2 86271 CASAVA_Build 14 55436300 12I CAGCACTGGG ------------/GAAACATTCTGA GAAATGCCTC 3070 het 3070 hom 56 23 28 9 GAAACATTCTGA 0 1 86272 CASAVA_Build 14 55437209 6D ATAGTCATTT ATTATC/------ ATTATCAAGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 ATTATC 2 1 86273 CASAVA_Build 14 55437513 9I CCTTTCCCAC ---------/CAGGAGGGA CACAAAAAAG 3070 het 3070 ref 62 29 24 9 CAGGAGGGA 0 1 86274 CASAVA_Build 14 55441448 1D ATGGTTAATA C/- GTAGTATCTA 3070 het 3070 ref 38 22 8 8 C 1 0 86275 CASAVA_Build 14 55446565 2D TTGTCAGGGG AC/-- ACACACACAC 1794 het 1794 ref 56 32 6 19 AC 10 9 86276 CASAVA_Build 14 55480097 1I AAAACTGTTA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 54 23 22 9 T 7 8 86277 CASAVA_Build 14 55481172 1I TCCAAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 13 14 86278 CASAVA_Build 14 55493324 1I TGCTTGCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 A 9 10 86279 CASAVA_Build 14 55521876 1D TGTTTTTATG T/- AAAGCAAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 T 1 0 86280 CASAVA_Build 14 55521992 1D TATTTTTTGG T/- TTGCATTCTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 3 2 86281 CASAVA_Build 14 55539689 1D GCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 10 9 86282 CASAVA_Build 14 55541127 1D TCCCCCCCCC A/- AAAAAAAAAC 2410 het 2410 ref 21 9 8 4 A 10 9 86283 CASAVA_Build 14 55575547 1D TCCAAGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 12 11 86284 CASAVA_Build 14 55591430 4D TTTATTTACT TAAA/---- TATTGTTTTA 3070 hom 89 het 34 0 30 7 TAAA 1 0 86285 CASAVA_Build 14 55629572 1D AAGATAAGTG T/- TATGGTCTCT 3070 het 3070 ref 57 26 24 8 T 2 1 86286 CASAVA_Build 14 55640793 2D GAGTGTGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 39 14 17 9 GT 8 7 86287 CASAVA_Build 14 55648913 1I ACATTTAGGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 8 9 86288 CASAVA_Build 14 55666532 1D GAGATCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 35 0 28 7 T 11 10 86289 CASAVA_Build 14 55691712 1D ATCTGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 40 2 34 4 T 11 10 86290 CASAVA_Build 14 55692220 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 43 het 21 0 16 5 T 8 9 86291 CASAVA_Build 14 55699423 1D GATTGTTAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 28 0 23 7 T 10 9 86292 CASAVA_Build 14 55701439 1D ATTTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 39 1 33 5 T 11 10 86293 CASAVA_Build 14 55701554 5I GTTTGGTTTG -----/GTTTT CTCTTGCTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 GTTTT 0 1 86294 CASAVA_Build 14 55703247 1I TGTTGATTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 143 hom 28 1 21 6 T 9 10 86295 CASAVA_Build 14 55704735 1D GAGCAGCGTG C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 56 het 22 0 20 2 C 9 8 86296 CASAVA_Build 14 55724884 1I CTGGAATCTT -/G GGATTATACT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 2 3 86297 CASAVA_Build 14 55733511 4D TGCATTAGAA TTTT/---- TTGTTTATTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 6 2 86298 CASAVA_Build 14 55737603 1I CAGATAAATG -/A TTCACTGTCT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 0 1 86299 CASAVA_Build 14 55738807 1I TAAGAGTTGC -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 8 86300 CASAVA_Build 14 55738974 1I CGCTACACTT -/G GAGCCTGCTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 1 2 86301 CASAVA_Build 14 55739469 1D TGAATTTTTC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 79 het 35 0 26 9 A 9 8 86302 CASAVA_Build 14 55742473 1D CTACAGATAA C/- CTACCAAATA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 2 1 86303 CASAVA_Build 14 55742991 1D AATGACTCTT A/- AAAATGTGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 4 86304 CASAVA_Build 14 55746013 5D TAATAAAATA TTTCG/----- TTTCGTGGTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTTCG 2 1 86305 CASAVA_Build 14 55747729 4I TTGCACAGTT ----/GCTG GCTGGCTGGC 3070 hom 97 het 45 0 28 17 GCTG 2 3 86306 CASAVA_Build 14 55748274 1D TAAAAGGCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 10 9 86307 CASAVA_Build 14 55751499 3I AGTCACACAT ---/GTA GTTGGTCAGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GTA 0 1 86308 CASAVA_Build 14 55752671 1D AGATTTTACA T/- TTGTGGGGCT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 3 2 86309 CASAVA_Build 14 55753537 4D AAAGTGTTTC CAAA/---- CAGACTGTTG 3070 hom 114 het 41 0 39 3 CAAA 1 0 86310 CASAVA_Build 14 55758544 1I AGCTTTGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 43 2 29 12 T 13 14 86311 CASAVA_Build 14 55761328 1I TGGCCCCCAT -/A ACCCTCTTCC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 1 2 86312 CASAVA_Build 14 55762547 1I ACCAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 36 2 28 6 A 10 11 86313 CASAVA_Build 14 55764090 7D GACTTACATG TAGTCTC/------- TAGCTCTGTT 3070 hom 144 het 50 0 48 6 TAGTCTC 1 0 86314 CASAVA_Build 14 55771218 1I ACTTAAAGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 7 het 24 1 21 2 T 8 9 86315 CASAVA_Build 14 55774591 8I CTAAGTTGTT --------/TAAAAGCC TAAAAGCCTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAAAAGCC 1 2 86316 CASAVA_Build 14 55777343 1D TGCCTTCTCT G/- TAAAGTGGGT 3070 hom 147 het 57 0 49 9 G 1 0 86317 CASAVA_Build 14 55777577 1I TTTGAGTATT -/C CTTCTCTGAG 3070 hom 93 het 36 0 30 6 C 1 2 86318 CASAVA_Build 14 55785718 1D AGGCAGGGAT A/- GGGGTGGGAG 3070 hom 129 het 46 0 43 3 A 1 0 86319 CASAVA_Build 14 55794035 2I ACAGAGGAAC --/AG AGAAGAGATT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AG 1 2 86320 CASAVA_Build 14 55799289 2I TATCCCTGAC --/TT TTTTGATCAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 6 86321 CASAVA_Build 14 55800363 1D ATGCAGACGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 8 7 86322 CASAVA_Build 14 55805921 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 A 10 9 86323 CASAVA_Build 14 55810675 2I AGGGAAAAGG --/AT ACATTAGTAA 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 AT 0 1 86324 CASAVA_Build 14 55813278 14D CCTAACCCTG GCCATTTGCCTTAA/-------------- GCAACGTACA 3070 het 3070 ref 60 29 29 6 GCCATTTGCCTTAA 1 0 86325 CASAVA_Build 14 55825179 1I TAATTGGAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 166 hom 27 1 21 5 A 9 10 86326 CASAVA_Build 14 55829985 4I GTGAGAACTA ----/AATT AATTCAGTAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AATT 1 2 86327 CASAVA_Build 14 55834807 1I CAAATGAGTG -/T TTGCTGAGGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 2 3 86328 CASAVA_Build 14 55836373 1I CGTTTACTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 9 10 86329 CASAVA_Build 14 55846665 8I AGATGGTCTC --------/GGCTTTGG GGCTTTGGCG 3070 het 3070 ref 52 21 19 12 GGCTTTGG 1 2 86330 CASAVA_Build 14 55853167 4I ACACAAACAT ----/TAAC TAATAAATTA 3070 hom 120 het 43 0 39 4 TAAC 0 1 86331 CASAVA_Build 14 55853286 2I AGGTCATGAA --/GC GTGGGGGGGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 GC 0 1 86332 CASAVA_Build 14 55854146 1D AAAGAAGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 T 11 10 86333 CASAVA_Build 14 55859804 3I GCTCCTAGCA ---/CCT CCTCCACCCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CCT 1 2 86334 CASAVA_Build 14 55861531 1D CATTAAAAAA G/- AATTTTTAAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 1 0 86335 CASAVA_Build 14 55863735 1I CGGCAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 345 hom 29 1 21 7 T 12 13 86336 CASAVA_Build 14 55883205 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 30 1 24 5 A 10 11 86337 CASAVA_Build 14 55885783 1I CTTAGTTTTT -/A AAATAATTAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 3 4 86338 CASAVA_Build 14 55889583 4I CAGCCTTGTG ----/GAGA GAGAGTGCTG 3070 het 3070 hom 60 25 25 10 GA 2 4 86339 CASAVA_Build 14 55891849 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 2682 het 2682 ref 22 13 9 1 TA 6 5 86340 CASAVA_Build 14 55904498 1I AGCTTTCTTC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 19 19 0 A 0 1 86341 CASAVA_Build 14 55912524 1I AATGTATTGA -/C CCCCCCACCC 3070 hom 68 het 27 0 23 4 C 6 7 86342 CASAVA_Build 14 55913664 1D TTTCTTTGTC T/- TTACCTCCAT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 T 3 2 86343 CASAVA_Build 14 55922547 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 366 hom 41 1 31 9 T 10 9 86344 CASAVA_Build 14 55926430 1I CATTGTTTGA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 T 6 7 86345 CASAVA_Build 14 55927783 1I GAAACGTGTA -/T TACCTGCACC 3070 het 3070 hom 57 26 27 4 T 1 2 86346 CASAVA_Build 14 55947939 1D TACAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 14 10 A 11 10 86347 CASAVA_Build 14 55959102 1D ATAGTGGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 424 hom 35 1 26 8 A 10 9 86348 CASAVA_Build 14 55971147 3D TGAAGCCCAA AAG/--- AAGATTATCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 AAG 2 1 86349 CASAVA_Build 14 55971323 2D AGAAAATAAC TT/-- TAAATGATGA 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 T 3 1 86350 CASAVA_Build 14 56018191 1I GTTTTATGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 9 10 86351 CASAVA_Build 14 56026284 1D ACAAATCCCA C/- TGATACTACC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 C 1 0 86352 CASAVA_Build 14 56032121 2D AGTCTTATTC AT/-- ATATGTCATA 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 AT 3 2 86353 CASAVA_Build 14 56032865 1I CGCTCCGTAT -/C ACGCACATAT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 C 0 1 86354 CASAVA_Build 14 56052751 1I TTAGCTGCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 T 8 9 86355 CASAVA_Build 14 56054254 2I GATTTTTTTT --/TA AATTAAAAAA 1874 het 1874 ref 22 15 5 2 TA 0 1 86356 CASAVA_Build 14 56058575 8D19M2D CTTTCCTTTC TTTTCTTTCTTTCTTTTCTTTCTTTCCTT/--------CTTTCTTTTCTTTCTTTCC-- TTTTTTTTTT 717 het 717 ref 26 23 2 5 N/A 0 0 86357 CASAVA_Build 14 56062172 1I AGACCTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 246 hom 33 2 19 12 A 13 14 86358 CASAVA_Build 14 56067904 1I CAAATACTTT -/A AAAATCCCCT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 4 5 86359 CASAVA_Build 14 56069609 5D TATTGTAAAC ATAAT/----- ATATTTATAT 3070 het 2577 hom 17 6 9 3 ATAAT 1 0 86360 CASAVA_Build 14 56072941 3D ATTTTTACCA TCT/--- TCTACTTCAT 3070 het 3070 ref 40 23 13 5 TCT 2 1 86361 CASAVA_Build 14 56076908 2I CATTGGTGTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 CA 7 8 86362 CASAVA_Build 14 56077929 1D TTTACAAATG T/- TTTTTTATCA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 7 6 86363 CASAVA_Build 14 56081087 1D AAATATTTCA C/- CCACCACGCT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 3 2 86364 CASAVA_Build 14 56083547 1I TTAGTTATCT -/G GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 G 8 9 86365 CASAVA_Build 14 56083823 1I TCTAAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 10 11 86366 CASAVA_Build 14 56089663 1I CAACTATTAT -/C CCCCAGCCAT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 C 4 5 86367 CASAVA_Build 14 56095127 1I TATAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 A 10 11 86368 CASAVA_Build 14 56096851 1D TTTTTCTATC T/- TTTTTTTTTT 1880 het 1880 ref 37 21 6 10 T 15 14 86369 CASAVA_Build 14 56105123 1D TGCAGAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 489 hom 29 3 9 17 T 15 14 86370 CASAVA_Build 14 56109001 2D ATGGTGTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 A 13 11 86371 CASAVA_Build 14 56110804 1D GAAATAGGTA T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 8 7 86372 CASAVA_Build 14 56125182 4I TTTCTGTAAG ----/TATT TATTTATGTA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 TATT 1 2 86373 CASAVA_Build 14 56139218 2I GAAAGAAAAC --/AG AAATAAATTG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AG 0 1 86374 CASAVA_Build 14 56139726 1I TTGTCTAAAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 A 8 9 86375 CASAVA_Build 14 56145166 3D TCTACTCCTA ATG/--- ATGATGACAA 3070 het 3070 ref 40 17 18 7 ATG 3 2 86376 CASAVA_Build 14 56153962 4I AATGCAGTGT ----/TTAA TTAACACAGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTAA 1 2 86377 CASAVA_Build 14 56168101 2I CTCAAAAAAA --/AC AAAAAAAAAG 3070 het 1513 hom 24 6 16 2 AC 0 1 86378 CASAVA_Build 14 56172316 2I ATGATTGCAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 AT 7 8 86379 CASAVA_Build 14 56183658 1D TTTGTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 2339 het 2339 ref 45 30 6 9 A 11 10 86380 CASAVA_Build 14 56184039 1I TTTTTCCTTC -/A AAGAAAAGAA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 2 3 86381 CASAVA_Build 14 56184394 1I TGTTTCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 10 11 86382 CASAVA_Build 14 56200551 2D CAACAGAGAC AG/-- GGGGTGCAAA 3070 hom 123 het 45 0 41 5 AG 1 0 86383 CASAVA_Build 14 56209966 1D CATGTATACA T/- TATGTAACTA 3070 hom 36 het 14 0 13 3 T 2 1 86384 CASAVA_Build 14 56211968 1D TCCCTGTAGG C/- CCCCCTGCTA 3070 hom 129 het 49 0 38 11 C 6 5 86385 CASAVA_Build 14 56221343 2D ACTGAATTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 127 het 52 0 42 12 A 12 10 86386 CASAVA_Build 14 56222609 1I CTTGGTTCTT -/C CTCCTTTCCA 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 1 2 86387 CASAVA_Build 14 56223756 1I GCCCTCAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 24 het 34 1 30 3 T 9 10 86388 CASAVA_Build 14 56226193 2I AGCATCAAAC --/AT GTGCCAGGCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AT 0 1 86389 CASAVA_Build 14 56236889 1I AGTATGTGGC -/A TCAGGGAGCT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 0 1 86390 CASAVA_Build 14 56239832 1I CCCCCTCCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 9 10 86391 CASAVA_Build 14 56243621 1I TGCATGCTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3052 hom 20 7 10 3 T 8 9 86392 CASAVA_Build 14 56256498 3D AGAAACTCTG TTC/--- TTCTTACTAC 3070 hom 88 het 31 0 29 4 TTC 2 1 86393 CASAVA_Build 14 56261389 1I ACACCCCCCC -/A CCCCACACAC 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 0 1 86394 CASAVA_Build 14 56264584 1I ACCCTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2643 hom 31 8 18 5 A 13 14 86395 CASAVA_Build 14 56271659 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 993 het 993 ref 21 9 4 8 T 16 15 86396 CASAVA_Build 14 56278139 1I TTGTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2735 hom 38 10 13 15 T 12 13 86397 CASAVA_Build 14 56286253 1D GTGTCTGGCA G/- GGGGAGGGCC 3070 hom 135 het 53 0 45 10 G 5 4 86398 CASAVA_Build 14 56294626 2D AACAAATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 31 1 23 7 A 15 13 86399 CASAVA_Build 14 56303969 1D CATACACCCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 10 9 86400 CASAVA_Build 14 56308021 1D TACTGAAACC T/- TAGAGTCCCC 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 T 2 1 86401 CASAVA_Build 14 56308340 2D CAACTAAAAA AC/-- ACATTCATTC 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 AC 2 1 86402 CASAVA_Build 14 56309492 3D GATCAAGTAA ATG/--- ATGATAAATT 3070 het 3070 ref 49 22 23 6 ATG 2 1 86403 CASAVA_Build 14 56312421 1I GAATTTGTCG -/T TATCAGTTCC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 1 2 86404 CASAVA_Build 14 56315065 1I GCCAAACCAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 8 9 86405 CASAVA_Build 14 56316024 1I ACAAATTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2853 hom 27 7 15 5 T 9 10 86406 CASAVA_Build 14 56320416 1D13M3D GCTATTTTAG AAAAAAAAAAGAACAAG/-AAAAAAAAAGAAC--- AAGAAGAAGA 3070 hom 81 het 27 0 28 2 N/A 0 0 86407 CASAVA_Build 14 56323964 2D AAAGCTGAAG TA/-- TATCTTCAAG 3070 hom 138 het 50 0 47 4 TA 2 1 86408 CASAVA_Build 14 56325844 1D AATTTACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2748 hom 35 10 16 9 T 13 12 86409 CASAVA_Build 14 56333273 1I TAAAAAACAA -/C CCCCCCCCCC 3070 het 305 hom 28 2 16 10 C 10 11 86410 CASAVA_Build 14 56336755 1D TTTGGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 33 0 27 6 A 12 11 86411 CASAVA_Build 14 56341348 1I GGAGGAAGTC -/A ACGCCTCTTG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 1 2 86412 CASAVA_Build 14 56349746 1D AGACAAGGAA G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 36 het 22 0 11 11 G 12 11 86413 CASAVA_Build 14 56370575 6I GACTACTTGT ------/TTTTTG TTTTTGTTTT 3070 hom 103 het 42 0 35 7 TTTTTG 1 2 86414 CASAVA_Build 14 56381775 1I CTCAACTAAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 7 8 86415 CASAVA_Build 14 56386815 1D ATTTAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 11 5 T 13 12 86416 CASAVA_Build 14 56416704 1I ACATGCTAAT -/G TACTACATAA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 G 0 1 86417 CASAVA_Build 14 56417657 3D TTACTTCAGT AGA/--- AGAACCACCC 3070 het 3070 hom 56 22 27 8 AGA 2 1 86418 CASAVA_Build 14 56431537 2I TCAGCTGGAG --/AC GTTCTCGATG 3070 hom 101 het 41 0 35 6 AC 0 1 86419 CASAVA_Build 14 56438339 1I TTTTTTTTTT -/A TTTGAGACAG 3070 het 888 hom 26 5 17 4 A 0 1 86420 CASAVA_Build 14 56439493 11D TCTACTACTA AAACCACCAGG/----------- ATTTGACTAC 3070 hom 144 het 50 0 48 6 AAACCACCAGG 1 0 86421 CASAVA_Build 14 56441818 3D ATGGTTAGGT AGG/--- AGATCAGCAG 3070 het 3070 ref 45 17 15 15 AGG 1 0 86422 CASAVA_Build 14 56441868 3I GATCCTGCTC ---/AAG AAAACAGGAG 3070 hom 110 het 49 0 37 12 AAG 0 1 86423 CASAVA_Build 14 56456282 1D GTGATAATTC T/- TTTTTTTACC 3070 hom 132 het 52 0 45 8 T 8 7 86424 CASAVA_Build 14 56461770 1I TATGCATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 9 10 86425 CASAVA_Build 14 56461981 1D TATAGAATAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 9 8 86426 CASAVA_Build 14 56464187 2I ACAGTGTGAC --/AG AAGGTATTTA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 AG 0 1 86427 CASAVA_Build 14 56466103 4D TTGTTGTAGG TTCT/---- TTAATTTTGA 2400 het 2400 ref 19 11 7 1 TTCT 1 0 86428 CASAVA_Build 14 56466679 4D TCTTTCTCTC TCTT/---- TCTCTCTCCC 1699 het 1440 hom 21 6 8 8 TCTT 1 0 86429 CASAVA_Build 14 56466910 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 11 8 8 T 10 9 86430 CASAVA_Build 14 56482401 4D AGTGTGTGTG TGTT/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 TGTT 1 0 86431 CASAVA_Build 14 56483192 1I TCTCTGCCAC -/A AAAAAAAAAA 2142 het 2142 ref 26 10 8 8 A 12 13 86432 CASAVA_Build 14 56486411 4D TGCACACACA CACT/---- CACTCACTTC 3070 het 3070 hom 41 17 20 6 CACT 3 2 86433 CASAVA_Build 14 56488577 3D GAATTGATGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 276 hom 37 6 13 18 T 17 14 86434 CASAVA_Build 14 56489944 1D GCCTTACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 T 11 10 86435 CASAVA_Build 14 56499545 1I ACCATTTCAC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 6 7 86436 CASAVA_Build 14 56507383 1I TAGATACATA -/T TTTTAATAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 4 5 86437 CASAVA_Build 14 56520988 1I TCCTATCTCT -/A AAAACAAACA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 4 5 86438 CASAVA_Build 14 56522830 2D AGAACTATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 31 0 23 9 AT 7 6 86439 CASAVA_Build 14 56524631 1I AATCATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 11 12 86440 CASAVA_Build 14 56532953 2D ATTGGCAATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 41 3 13 25 A 14 12 86441 CASAVA_Build 14 56539966 1D ATGTCTCAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 9 8 86442 CASAVA_Build 14 56550645 1D ATGGCGAGAG C/- CCCCAGTAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 5 4 86443 CASAVA_Build 14 56564892 1D TCACATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 34 1 25 8 T 13 12 86444 CASAVA_Build 14 56569165 1D AAGTGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 42 2 26 14 T 12 11 86445 CASAVA_Build 14 56576479 1I TAAAACTTAC -/T ACAGCTGCAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 86446 CASAVA_Build 14 56577318 1D AAGAAAAGTA G/- GTTTGCAGCT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 G 2 1 86447 CASAVA_Build 14 56578811 7D CCAGAAGCCT TCCAAGC/------- TCCAAGCCCT 3070 hom 33 het 14 0 12 5 TCCAAGC 2 1 86448 CASAVA_Build 14 56591738 2D TTGGCTCTCT AA/-- AATAAGGATC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 4 2 86449 CASAVA_Build 14 56620962 1I AAACTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 26 2 19 5 A 16 17 86450 CASAVA_Build 14 56622594 3D GGGAGAAAGT GAA/--- GAAGAATAGG 3070 hom 138 het 52 0 46 7 GAA 3 2 86451 CASAVA_Build 14 56632599 1D AGCCAGGTGA T/- TGATGTTACA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 2 1 86452 CASAVA_Build 14 56664695 1I TGAAACCCAA -/G CATCACATTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 0 1 86453 CASAVA_Build 14 56679649 1D CCCACCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1473 het 1473 ref 39 23 5 12 A 15 14 86454 CASAVA_Build 14 56742854 1D ACATGACACA T/- TTTTTTTTTT 1377 het 1377 ref 39 29 3 7 T 11 10 86455 CASAVA_Build 14 56746577 1D TCTAACTTAC T/- CTATGTTTAT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 T 1 0 86456 CASAVA_Build 14 56795586 1D CACACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1280 het 1280 ref 30 19 4 9 T 13 12 86457 CASAVA_Build 14 56803177 2D ATATATACGT TA/-- TATATATATA 753 het 753 ref 24 5 6 13 TA 6 5 86458 CASAVA_Build 14 56839498 1D TTCTTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 25 0 17 8 A 15 14 86459 CASAVA_Build 14 56843489 8D AAGAAACTTT TGCCCTGA/-------- TGCCCTCCGT 3070 hom 105 het 35 0 35 7 TGCCCTGA 1 0 86460 CASAVA_Build 14 56854224 4I GTGCTCAAAA ----/TTGT TTGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 TTGT 1 2 86461 CASAVA_Build 14 56861406 1D TTCTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 33 1 21 11 T 11 10 86462 CASAVA_Build 14 56898300 1I CTGATTAAAA -/G GGGGGGGGGG 683 het 683 ref 34 11 3 20 G 10 11 86463 CASAVA_Build 14 56910858 1I AAGAAAGGAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 7 8 86464 CASAVA_Build 14 56915031 4I AAATCAGGCC ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 AT 6 8 86465 CASAVA_Build 14 56918454 3D AATTGTCCTT CTC/--- CTCATTGTGA 3070 hom 137 het 48 0 46 2 CTC 2 1 86466 CASAVA_Build 14 56919534 1D AGAGTTATAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 10 9 86467 CASAVA_Build 14 56922082 1D TGTATTAAAC A/- CTTTACATAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 0 86468 CASAVA_Build 14 56932882 4I TCCAGAACCT ----/TAGG TAGGTCTTTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAGG 1 2 86469 CASAVA_Build 14 56935115 1I TTTATTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 14 0 10 4 T 9 10 86470 CASAVA_Build 14 56951232 17D CAGAAATAGG CATAGTAAACACCTGGA/----------------- CACAAAGACA 3070 hom 126 het 44 0 43 4 CATAGTAAACACCTGGA 1 0 86471 CASAVA_Build 14 57005416 3D ATCCTTGAAT TCA/--- TCATAACTGC 3070 hom 118 het 45 0 39 9 TCA 2 1 86472 CASAVA_Build 14 57008201 2D TATATATATA AT/-- ATATATATAT 1778 hom 15 het 6 0 6 1 AT 7 6 86473 CASAVA_Build 14 57032646 16I AAACTCTTAA ----------------/GATGAAGCTCAGAAGG GATTAGCTAA 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 GATGAAGCTCAGAAGG 0 1 86474 CASAVA_Build 14 57032830 17D TTGAAGTTCC CAAGAAATAGCCGTGTA/----------------- CAAGCTCCTG 3070 het 3070 ref 34 19 13 6 CAAGAAATAGCCGTGTA 1 0 86475 CASAVA_Build 14 57033852 1I AATGTTTATA -/G GGTTCTTAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 2 3 86476 CASAVA_Build 14 57034606 1I CAATAAAACA -/C CAGAACCTAT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 C 1 2 86477 CASAVA_Build 14 57037160 1I TTTTAGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 11 86478 CASAVA_Build 14 57037380 1I TCAGTTTTCA -/G TTATGTGTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 86479 CASAVA_Build 14 57040646 1D GGGTCCCAGA C/- AGCCTTGGCC 3070 het 3070 hom 59 27 25 7 C 1 0 86480 CASAVA_Build 14 57041258 1I GTGCCTGTCA -/T TTTTCCCTGC 3070 het 3070 ref 46 20 15 11 T 4 5 86481 CASAVA_Build 14 57042025 10D CTATGCGCTA GGCACTCTAC/---------- AGAACTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 GGCACTCTAC 1 0 86482 CASAVA_Build 14 57043290 14D TCAGAGTTCC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 7 T 24 10 86483 CASAVA_Build 14 57046510 1I AAAATTCTGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2110 hom 17 7 8 2 A 8 9 86484 CASAVA_Build 14 57046661 3D CTAAAAGGAT CTG/--- CTGAGTGCCA 3070 het 3070 hom 36 16 19 3 CTG 2 1 86485 CASAVA_Build 14 57054768 1I TCATTAATTT -/G ATCTTCGATC 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 G 0 1 86486 CASAVA_Build 14 57057292 1D AGCGCATGCA G/- CGTATGGTTT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 G 1 0 86487 CASAVA_Build 14 57061816 6I CCTCTTTACC ------/TTAAGT TTATTTGAGT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 TTAAGT 0 1 86488 CASAVA_Build 14 57074291 1D ATTCATTTGC T/- TCAGCATCCA 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 T 2 1 86489 CASAVA_Build 14 57078213 1I GATTCATTGA -/T TTTTTTTTGA 2393 het 2393 ref 18 11 5 2 T 8 9 86490 CASAVA_Build 14 57083183 1I CACTGTTTTG -/C CTTATGGTTC 3070 het 3070 ref 39 18 19 2 C 1 2 86491 CASAVA_Build 14 57095841 1D AGGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 11 10 86492 CASAVA_Build 14 57109003 2I2M4I TCAGGCCAAT --GG----/TAGGCCAA GAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 33 10 21 3 N/A 0 0 86493 CASAVA_Build 14 57113125 5I GAGGTGTGGC -----/AATCT AATCTATAGC 3070 het 3070 ref 48 28 13 7 AATCT 1 2 86494 CASAVA_Build 14 57114616 1D TCTTTTTACA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 2 1 86495 CASAVA_Build 14 57118675 3D CTAAACATGA TTT/--- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 T 10 7 86496 CASAVA_Build 14 57119835 4I TTACAACTAC ----/TGAT TGATTGCCTT 3070 hom 138 het 51 0 43 8 TGAT 1 2 86497 CASAVA_Build 14 57120510 16D AATAGCATCT TAAGCATATTTTATAG/---------------- TAAGCATATT 3070 hom 63 het 23 0 22 5 TAAGCATATTTTATAG 2 1 86498 CASAVA_Build 14 57121684 5I CATGCCTATA -----/ATCCC ATCCCAGCAC 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 ATCCC 1 2 86499 CASAVA_Build 14 57124523 1I CAGGCATGGT -/G GGCGGGCGCT 2344 het 1959 hom 14 6 7 1 G 2 3 86500 CASAVA_Build 14 57135363 4D TGTGTGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 25 15 12 TG 11 9 86501 CASAVA_Build 14 57138631 1D ATTTCAGCCT G/- GATGGTAAAA 3070 het 400 hom 34 4 24 6 G 2 1 86502 CASAVA_Build 14 57141554 7D AAAGCAATTG AAAACAA/------- AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 33 20 12 3 AAAACAA 2 1 86503 CASAVA_Build 14 57142725 4D74M1D AATAAACATC TCTTTCTTTTAGGTGGCAAGATACTGGCATTAAGACTGCAAGACTACTTTGCTTTCTATAATACTTATATATTTCTCCA/----TCTTTTAGGTGGCAAGATACTGGCATTAAGACTGCAAGACTACTTTGCTTTCTATAATACTTATATATTTCTCC- AAAACCCATA 3070 het 3070 ref 52 46 25 10 N/A 0 0 86504 CASAVA_Build 14 57145258 13D AAAAGATGGC CGGGGGGGGGCGG/------------- CGGGGGGAGA 3070 het 399 hom 11 1 7 4 CGGGGGGGGGCGG 1 0 86505 CASAVA_Build 14 57148063 2I AGTTAAAAAA --/AC AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 46 15 24 7 AC 0 1 86506 CASAVA_Build 14 57149335 1D TCCATGAAAG A/- ATGTTGGGCA 3070 het 3070 ref 57 27 26 4 A 2 1 86507 CASAVA_Build 14 57150650 2D GGGGAAACAC AT/-- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 43 19 21 4 AT 1 0 86508 CASAVA_Build 14 57151829 3I ACATTTTCCT ---/TTC TTTTTTTTTT 1127 het 1127 ref 42 20 7 15 TTC 0 1 86509 CASAVA_Build 14 57152275 1D CAATATTATG A/- GGCTTTTAGA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 1 0 86510 CASAVA_Build 14 57154380 3I CTGTCATTCA ---/GAG AAGAAAATAA 3070 het 3070 hom 45 18 25 2 GAG 0 1 86511 CASAVA_Build 14 57162845 1D GTAAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 36 3 17 16 A 12 11 86512 CASAVA_Build 14 57163342 3I TAATGACTGA ---/TAG TAGAGTGGTA 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 TAG 1 2 86513 CASAVA_Build 14 57171717 1D ACTCTTACTC A/- AAAAAAAAAA 2794 het 1951 hom 33 11 9 13 A 17 16 86514 CASAVA_Build 14 57179545 4I CTAATTAGCC ----/CAAT CAAATATAAA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 CAAT 0 1 86515 CASAVA_Build 14 57183962 2I ATGTGGCCAT --/TG TGTCTTGGAA 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 TG 1 2 86516 CASAVA_Build 14 57185470 4D GCACACTTGC TGTT/---- TGTTCACTTC 3070 het 3070 ref 39 18 17 8 TGTT 2 1 86517 CASAVA_Build 14 57186271 10D ACCAAATCCC CCAAAATTTA/---------- CCAAAGAGAA 3070 hom 102 het 34 0 34 4 CCAAAATTTA 1 0 86518 CASAVA_Build 14 57203182 1D AAGGAACTTC T/- TTTTTTTTTT 2460 het 2460 ref 36 17 8 11 T 13 12 86519 CASAVA_Build 14 57203863 4I CAACGTGCAG ----/GTTA GTTACATATG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GTTA 1 2 86520 CASAVA_Build 14 57209255 2D TTTTATTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 30 1 23 8 T 12 10 86521 CASAVA_Build 14 57213890 4I AAAAAATAAA ----/AATT AATTATTTAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 AATT 1 2 86522 CASAVA_Build 14 57217529 1I GAGCCCATAT -/A AGCCAAGACA 3070 het 2949 hom 24 7 16 1 A 1 2 86523 CASAVA_Build 14 57219110 1I AAGTATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 28 1 21 6 A 11 12 86524 CASAVA_Build 14 57219540 1D ATCTCAAGTA T/- TTTTTAGATA 3070 het 3070 ref 33 23 10 0 T 6 5 86525 CASAVA_Build 14 57219931 3I ATCGCCTTTT ---/CCC CCCCTTCAAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 C 4 7 86526 CASAVA_Build 14 57228300 3I TGTGACAGAC ---/TTA TTAGATGAAC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 TTA 1 2 86527 CASAVA_Build 14 57234171 1D GACCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 129 hom 16 1 12 3 A 15 14 86528 CASAVA_Build 14 57236830 11I GAAGTTTACA -----------/AGGAAGTTTAC AGGAAGTTTA 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 AGGAAGTTTAC 1 2 86529 CASAVA_Build 14 57238803 4D CATTTTCTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 1665 hom 44 13 19 12 A 19 15 86530 CASAVA_Build 14 57248767 1I GCCTACACAG -/T TATGAGGTTG 3070 hom 160 het 65 0 54 11 T 1 2 86531 CASAVA_Build 14 57252767 1I TCATTTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 19 7 T 11 12 86532 CASAVA_Build 14 57254812 5D ACTGATTTCC TTTCT/----- TTTGAGTATT 3070 hom 99 het 34 0 34 6 TTTCT 1 0 86533 CASAVA_Build 14 57256066 1D TTTCCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 20 7 T 12 11 86534 CASAVA_Build 14 57266875 1D GATGTTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 11 10 86535 CASAVA_Build 14 57267256 13D TTTATCTCAT AAGTCTGTCAAGG/------------- AAGTCTGTCA 3070 hom 87 het 40 0 29 15 AAGTCTGTCAAGG 2 1 86536 CASAVA_Build 14 57269832 3D AATTTTCTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 28 2 11 16 A 21 18 86537 CASAVA_Build 14 57270645 3D ATTTCACATT ATG/--- GTACAGTGGA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 ATG 1 0 86538 CASAVA_Build 14 57296352 1D TCTTTGCTTG T/- TTTTTTTTTT 2067 het 2067 ref 34 23 5 6 T 12 11 86539 CASAVA_Build 14 57308044 2I AATTTTTTCA --/AC ACTTTTAATT 3070 hom 87 het 31 0 29 3 AC 1 2 86540 CASAVA_Build 14 57308855 1D TTAGTTTTTA T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 8 7 86541 CASAVA_Build 14 57310127 1D GAAAATAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 10 9 86542 CASAVA_Build 14 57318767 1D TATACATGGA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 T 8 7 86543 CASAVA_Build 14 57336736 1D CCTGCAGCAG T/- CCCTGCAGTA 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 T 1 0 86544 CASAVA_Build 14 57352950 1D TCAACCCCTG A/- AAAAAAACTC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 8 7 86545 CASAVA_Build 14 57381413 1D TCTTCCCCCA C/- CCCCCCATGC 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 C 7 6 86546 CASAVA_Build 14 57385941 1D CCCACAAAAA T/- TTTTTTTTAA 2317 het 1609 hom 15 7 5 3 T 9 8 86547 CASAVA_Build 14 57390156 1D GGCAGTGGCT A/- TTTTCGACCA 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 A 1 0 86548 CASAVA_Build 14 57417122 8I TTCTACATTA --------/AATAAAAC AATAAAACAT 3070 het 3070 hom 46 15 19 12 AATAAAAC 1 2 86549 CASAVA_Build 14 57427023 9I AGCCCCTCTC ---------/CCCATGCTA CACTGCATGG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 CCCATGCTA 0 1 86550 CASAVA_Build 14 57431244 1D CTTTTGGCAT G/- GTTGCACTTG 3070 het 3070 ref 46 31 13 4 G 2 1 86551 CASAVA_Build 14 57435866 2D ACTGCTCCAG GT/-- GTGTTTCACC 3070 het 3070 ref 54 29 18 7 GT 3 2 86552 CASAVA_Build 14 57436554 24D CTGATTGGTA CATTTTACAGAGCACTGATTGGTG/------------------------ CATTTTACAG 3070 het 3070 hom 38 19 20 8 CATTTTACAGAGCACTGATTGGTG 2 1 86553 CASAVA_Build 14 57444187 1I ACATATTTGC -/A AGAACCTGTA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 1 2 86554 CASAVA_Build 14 57451585 1D GGATTGAGTT A/- ACACCTGAGG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 2 1 86555 CASAVA_Build 14 57452134 7I GGTCTTTGCC -------/ACATTAT ACATTATAAC 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 ACATTAT 1 2 86556 CASAVA_Build 14 57462113 1I TTGAAGGAGC -/T TTTTTTTTTT 2601 het 1993 hom 23 7 9 7 T 13 14 86557 CASAVA_Build 14 57480733 2D CAAATATTCC CT/-- GATATCTATA 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 CT 1 0 86558 CASAVA_Build 14 57486908 1I ATATCCTGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 T 8 9 86559 CASAVA_Build 14 57489244 1D AACTTCCAAG A/- AATATGGGAC 2309 het 2309 ref 21 13 5 3 A 3 2 86560 CASAVA_Build 14 57500879 1D CTCTAAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 10 9 86561 CASAVA_Build 14 57501815 1I TTTTCTACCT -/C CCTCTTCTAC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 2 3 86562 CASAVA_Build 14 57502959 1D AAAAGAAACA G/- TGTTGATTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 G 1 0 86563 CASAVA_Build 14 57508571 10D AAAGAGTGTG ATGTGTTCCA/---------- GAAACTAGTG 3070 het 3070 ref 37 21 15 4 ATGTGTTCCA 1 0 86564 CASAVA_Build 14 57509016 1D GCTGAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 1444 het 1444 ref 46 36 4 7 A 12 11 86565 CASAVA_Build 14 57512471 1D TAGAGCAGAG T/- TATTACCTGA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 2 1 86566 CASAVA_Build 14 57516113 1D ACCAATGCAA G/- AGGGAAACTG 3070 het 3070 ref 57 38 18 1 G 1 0 86567 CASAVA_Build 14 57516300 2D ACACTGACTC AG/-- GGGAGCTGAT 3070 het 3070 ref 68 36 23 10 AG 1 0 86568 CASAVA_Build 14 57517122 4I AGAAAATGGC ----/TAGG TGTGTTTGTG 3070 hom 132 het 49 0 43 6 TAGG 0 1 86569 CASAVA_Build 14 57521791 1D ATCGCTTGAA C/- CCCAGGAGGC 1627 het 1627 ref 16 7 7 2 C 4 3 86570 CASAVA_Build 14 57522739 1D GTGGCTCACG C/- CTGTAGTTTC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 C 2 1 86571 CASAVA_Build 14 57530257 1I18M1D ATTCGTTTTG -TTTTTTTCTTTTAGAACCA/CTTTTTTTCTTTTAGAACC- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 23 18 5 N/A 0 0 86572 CASAVA_Build 14 57530778 2D CTACTGAAGC AG/-- AGTGTTTACA 3070 het 3070 hom 34 11 18 6 AG 2 1 86573 CASAVA_Build 14 57531386 1D TTTATTTGCC T/- TTTTTTTTTC 2851 het 559 hom 25 3 8 14 T 10 9 86574 CASAVA_Build 14 57536056 1I AGGGAAGAGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 T 8 9 86575 CASAVA_Build 14 57539509 7D TGTAAAGGAA ATAACTG/------- ATAACTGAGA 3070 het 3070 hom 42 19 21 5 ATAACTG 2 1 86576 CASAVA_Build 14 57539627 10D TGACCAGGCA GCTATTCCCT/---------- GCTATTCCCT 3070 het 3070 ref 40 17 18 9 GCTATTCCCT 2 1 86577 CASAVA_Build 14 57546718 2D AAGATATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 229 hom 36 4 18 14 TA 6 5 86578 CASAVA_Build 14 57547309 1D TTCTTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 11 10 86579 CASAVA_Build 14 57547431 1D TTTTTCCCTG A/- AAAAATAACA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 6 5 86580 CASAVA_Build 14 57548627 1D TCTCACTAGG A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 7 6 86581 CASAVA_Build 14 57549417 1I TTTTTTACCC -/T TAATTACCTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 T 1 2 86582 CASAVA_Build 14 57549877 6D AATGTAAAAA GCATTC/------ GCATTCTTTG 3070 het 3070 hom 22 7 15 3 GCATTC 2 1 86583 CASAVA_Build 14 57555373 1D GAAAATGTGG T/- TACTGTATAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 8 T 2 1 86584 CASAVA_Build 14 57564011 1D TAAAATAATA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 7 6 86585 CASAVA_Build 14 57600069 10D2M4D TTTGCAAGGC ACTACAGAAACTACAA/----------CT---- AAAATATCAT 3070 hom 138 het 47 0 44 8 N/A 0 0 86586 CASAVA_Build 14 57624928 1D AGCTAATGTG A/- AAAAAAAAAA 1471 het 1471 ref 30 21 4 5 A 13 12 86587 CASAVA_Build 14 57656468 1I CTTAACAATC -/G GGATACATTC 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 G 2 3 86588 CASAVA_Build 14 57667081 3D ATATTTCTAG TCT/--- TCTTATTTGT 3070 het 3070 ref 56 28 25 5 TCT 2 1 86589 CASAVA_Build 14 57671025 4I AACCTTATTG ----/TCTC TCTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 TC 1 3 86590 CASAVA_Build 14 57672018 6I AATTGCTGTT ------/AGAGAA AGAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 AGAGAA 0 1 86591 CASAVA_Build 14 57701610 1D CAGGACTCTT C/- CTCTCCTATT 3070 het 3070 ref 57 30 22 5 C 2 1 86592 CASAVA_Build 14 57711735 1D ACACTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1901 hom 44 11 11 22 A 17 16 86593 CASAVA_Build 14 57715134 1D ATGAAATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 469 hom 41 3 29 9 A 13 12 86594 CASAVA_Build 14 57726016 1D TTAGCTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 T 11 10 86595 CASAVA_Build 14 57739414 1D TAAAAAAAAA T/- ATTAGCAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 1 0 86596 CASAVA_Build 14 57756835 3I GGCTGTGAAA ---/TGT TGTTATTTGT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 TGT 1 2 86597 CASAVA_Build 14 57763638 4D GATTTCCAGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 15 11 86598 CASAVA_Build 14 57767549 2I TTTTTTTGAC --/AG AGTGTTGCTC 2525 het 2525 ref 20 10 6 4 AG 1 2 86599 CASAVA_Build 14 57771400 3I TTACGCCATT ---/CTC CTGTCTCAGC 1280 het 1280 ref 22 19 3 0 CTC 0 1 86600 CASAVA_Build 14 57772627 1D CCCCTGTACC T/- TGTGAACGTG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 2 1 86601 CASAVA_Build 14 57780519 2D CCTAAACCAC TG/-- TCTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 51 22 25 6 TG 1 0 86602 CASAVA_Build 14 57789293 1I CTACTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1888 hom 32 8 14 10 A 14 15 86603 CASAVA_Build 14 57791658 1D TTAGTAGCCG T/- TTTTTTTTTT 2328 het 2328 ref 26 14 8 4 T 12 11 86604 CASAVA_Build 14 57794571 2I ATAGAAACTC --/TT GTCGATAAGT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 T 0 2 86605 CASAVA_Build 14 57795413 2I ATTAGGGTTT --/TA TGTTTTTACT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 TA 0 1 86606 CASAVA_Build 14 57797207 6D TCAGAAAGAT TAATAC/------ TAAACAAACA 3070 het 3070 hom 47 20 26 2 TAATAC 1 0 86607 CASAVA_Build 14 57812069 2I AGACCCACAA --/AT ATAGTCAACT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 AT 1 2 86608 CASAVA_Build 14 57823527 2I AACAAGACAC --/TT AACACCTTTA 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 T 0 2 86609 CASAVA_Build 14 57827247 1I CTCATCCCTG -/T TAATCCCAGC 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 T 1 2 86610 CASAVA_Build 14 57827385 1D CTGTAGTCCC A/- AGCTACCCAG 3070 het 931 hom 11 3 7 1 A 2 1 86611 CASAVA_Build 14 57827730 1I TTTTTGAGAC -/G GAGTCTCACT 1766 het 1766 ref 23 11 5 7 G 1 2 86612 CASAVA_Build 14 57828085 1I TACCTAAGAG -/T TAACTAAGTA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 1 2 86613 CASAVA_Build 14 57828313 1I ATAAGACTGG -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 T 1 2 86614 CASAVA_Build 14 57829459 2D CAAAAGCACT GA/-- GAGAATGAAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 GA 3 2 86615 CASAVA_Build 14 57836839 6I TTTTAAAACA ------/TATACT TATACTAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 TATACT 1 2 86616 CASAVA_Build 14 57837772 3D GCTTATATAA TAG/--- TAGAATTTTT 2869 het 2869 ref 22 13 6 5 TAG 2 1 86617 CASAVA_Build 14 57844475 6I TTGTACTCAC ------/GTTACT TTTGAAGCTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 GTTACT 0 1 86618 CASAVA_Build 14 57868371 4I TAAATTAACC ----/TTAG TTAGGATCTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 TTAG 1 2 86619 CASAVA_Build 14 57873034 3I AGGTGTTGTG ---/ACA ACAAAATATA 3070 het 3070 ref 56 29 25 2 ACA 1 2 86620 CASAVA_Build 14 57876809 8D GCTAATTTTG TTTTTGGT/-------- TTTTTGGTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 9 TTTTTGGT 3 2 86621 CASAVA_Build 14 57907247 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 6 7 86622 CASAVA_Build 14 57912222 7D TCTCTGCTTA TCCAAAC/------- TCATGTAATT 3070 het 3070 hom 38 16 17 7 TCCAAAC 1 0 86623 CASAVA_Build 14 57922818 1D AATTGATGTT A/- AAAAAAACTC 3070 hom 102 het 39 0 34 7 A 8 7 86624 CASAVA_Build 14 57924246 1I ATGTTGCCCA -/G GCTGGGCTTG 3070 hom 88 het 34 0 27 7 G 1 2 86625 CASAVA_Build 14 57926463 2D AATGAAAACA CT/-- GAGATACTAC 3070 het 3070 ref 47 22 15 12 CT 1 0 86626 CASAVA_Build 14 57962016 1D CTGTCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 1054 het 1054 ref 32 21 4 7 A 15 14 86627 CASAVA_Build 14 57977579 1D ATATATACAA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 7 86628 CASAVA_Build 14 57991714 5D CATTCTTATA CTTTC/----- CTTTAATTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 6 CTTTC 1 0 86629 CASAVA_Build 14 57992506 1I ATTGCCACCG -/T TTTTTTGAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 6 7 86630 CASAVA_Build 14 57999601 2D CTTGCATGGT TC/-- TCTCTCTCAA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TC 5 4 86631 CASAVA_Build 14 58000298 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 A 13 14 86632 CASAVA_Build 14 58000793 2I GTTTATAAAG --/CA GTTTATCCCC 3070 hom 78 het 35 0 27 8 CA 0 1 86633 CASAVA_Build 14 58000895 1D TCCTGCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 12 11 86634 CASAVA_Build 14 58006548 2D AGGAAGAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TG 10 9 86635 CASAVA_Build 14 58019636 2D GTCAGCCCTC TA/-- TATATATATG 3070 hom 87 het 36 0 30 9 TA 5 4 86636 CASAVA_Build 14 58024342 1I CTGTCCTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 112 het 40 0 36 4 A 9 10 86637 CASAVA_Build 14 58026282 1D CTAGAAAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 334 hom 39 1 32 6 T 10 9 86638 CASAVA_Build 14 58030801 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 24 1 20 3 T 11 12 86639 CASAVA_Build 14 58038082 4I ATTGTAGGTA ----/TTTG TTTAATTGGA 3070 hom 124 het 49 0 41 8 TTTG 0 1 86640 CASAVA_Build 14 58043372 3D AATCCCAGCA CTT/--- TGGGAGGCTG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 CTT 1 0 86641 CASAVA_Build 14 58053725 1I GTCCAGAATA -/T TATTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 1 2 86642 CASAVA_Build 14 58076594 2D CGTACCTCAC AT/-- GTGTATTTTC 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 AT 1 0 86643 CASAVA_Build 14 58156091 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 10 11 86644 CASAVA_Build 14 58159117 2I GTGTAAAAAC --/AG AGCAAGTCCT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 AG 1 2 86645 CASAVA_Build 14 58164450 1D TACAGGGACA C/- CCCCCCGTGG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 7 6 86646 CASAVA_Build 14 58176293 2D TTCCTATGTA AC/-- ATTCATTTGA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 AC 1 0 86647 CASAVA_Build 14 58184147 4D TCTCAGAACT GTTA/---- CTAGACTCAT 3070 het 3070 hom 46 19 25 5 GTTA 1 0 86648 CASAVA_Build 14 58185242 3D AATTTCAGGT ATC/--- ATGATATTCT 3070 het 3070 ref 40 20 19 4 ATC 1 0 86649 CASAVA_Build 14 58194178 1D AACGGTGGGC A/- AAAATCAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 5 4 86650 CASAVA_Build 14 58201789 1D AATTCAGTGA C/- CCCCAGGGTA 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 C 5 4 86651 CASAVA_Build 14 58210216 1I ACATTCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 11 12 86652 CASAVA_Build 14 58221511 1D TATGTTTTTA T/- TTCTCTTAGG 3070 het 3070 hom 48 18 25 6 T 3 2 86653 CASAVA_Build 14 58225594 1I ACACGGTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 A 10 11 86654 CASAVA_Build 14 58227995 1D TCAGACCATG T/- TATAGCCCAA 3070 het 3070 ref 40 17 16 8 T 2 1 86655 CASAVA_Build 14 58242760 1D GGAACTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 T 11 10 86656 CASAVA_Build 14 58243451 1D TCCTTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 8 A 12 11 86657 CASAVA_Build 14 58245204 10I CCTTCCTACC ----------/TTGTTGCCCA TCATTTCTGC 3070 het 3070 ref 55 27 25 4 TTGTTGCCCA 0 1 86658 CASAVA_Build 14 58257707 3I TAGTGCTAAA ---/TAT TATTATACTT 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 TAT 2 3 86659 CASAVA_Build 14 58261081 1D TTAGATTTAC T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 41 26 13 3 T 8 7 86660 CASAVA_Build 14 58264752 4D TTTCAGCATG CAGT/---- CAATTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 13 22 6 CAGT 1 0 86661 CASAVA_Build 14 58266195 1D26M3I ATCTTGGTTT AAAAAAAAAATCACTATTTGGCCGGGC---/-AAAAAAAAATCACTATTTGGCCGGGCACG GCGGTGGCTC 3070 het 3070 ref 31 18 16 6 N/A 0 0 86662 CASAVA_Build 14 58271792 2D CCCTGTGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 13 11 86663 CASAVA_Build 14 58284106 2D TTTTTTTTTT TA/-- ATCTGTGAAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 3 TA 1 0 86664 CASAVA_Build 14 58285218 1D TTTTCCATTT A/- ATATTTTTGA 3070 het 2854 hom 22 8 12 2 A 2 1 86665 CASAVA_Build 14 58285304 2D TGCATGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TG 6 5 86666 CASAVA_Build 14 58286235 1D GCCCAAATGG T/- CTATACATTG 2239 het 2239 ref 17 10 6 1 T 1 0 86667 CASAVA_Build 14 58286614 4I GCCCAAGGAA ----/CTGC CTGCCTTTAG 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 CTGC 1 2 86668 CASAVA_Build 14 58303353 1I TTGGTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 797 hom 44 2 36 6 T 10 11 86669 CASAVA_Build 14 58307307 7D AAATTGTGAA TCAATTT/------- GTCAGTGAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 6 TCAATTT 1 0 86670 CASAVA_Build 14 58307359 1D CAATAAAATA T/- TTTCATTGGT 2214 het 2214 ref 25 13 5 7 T 4 3 86671 CASAVA_Build 14 58317993 13I CAGAAAATAG -------------/CTATTTGTTTGAT CTTACCAGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTATTTGTTTGAT 0 1 86672 CASAVA_Build 14 58320199 4D ATCACCTAGA GAGT/---- GAGTGTAGAT 3070 het 3070 hom 58 25 29 5 GAGT 2 1 86673 CASAVA_Build 14 58325711 2D TTGGCCAGGA CT/-- CTCGAGAACA 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 CT 2 1 86674 CASAVA_Build 14 58326718 1I ACTTCATGGA -/T TTTTTTTTTA 3008 het 3008 ref 31 12 11 8 T 9 10 86675 CASAVA_Build 14 58328063 1D ATGGCGTGAG C/- CCGGGAGGTG 1753 hom 7 het 6 0 4 2 C 3 2 86676 CASAVA_Build 14 58330147 2D GAGCTACAGT CA/-- GGGAGGGATG 3070 het 3070 ref 38 14 9 15 CA 1 0 86677 CASAVA_Build 14 58330844 16I TAGGACCTTT ----------------/ATAACTCTCAGCCACC ATAACTCTTA 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 ATAACTCTCAGCCACC 0 1 86678 CASAVA_Build 14 58337378 12D AGAATAAAGT TCTCCACATAAA/------------ TGTGGAAACA 3070 het 3070 ref 50 33 18 5 TCTCCACATAAA 1 0 86679 CASAVA_Build 14 58338632 2D GATGTTGAGC TT/-- TTTTTTTTCA 3070 hom 39 het 26 0 14 13 T 10 8 86680 CASAVA_Build 14 58345610 1D GGAGCAAAAT G/- ATTTTGCTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 1 0 86681 CASAVA_Build 14 58347596 1I ACTCCCACTT -/A CCACAGCAGA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 A 0 1 86682 CASAVA_Build 14 58357721 1D TAATATTACC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 7 6 86683 CASAVA_Build 14 58362267 11I CCATTCCTGG -----------/ACAACAGTTCC ACAACAGTTC 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 ACAACAGTTCC 1 2 86684 CASAVA_Build 14 58369038 4D AATTGAAATT AGAA/---- GGCAGTGAGT 3070 het 3070 hom 49 19 27 6 AGAA 1 0 86685 CASAVA_Build 14 58369162 1I CCATTTTTCA -/T TTCTTGATAA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 2 3 86686 CASAVA_Build 14 58369293 1D AAATGCTTCA T/- TTAGGTGATT 3070 het 3070 ref 54 24 22 9 T 3 2 86687 CASAVA_Build 14 58378058 1D TTTGTTATAG A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 A 7 6 86688 CASAVA_Build 14 58380344 1I AAATAAAAAA -/T AAAACAATGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 0 1 86689 CASAVA_Build 14 58384962 2I GGCCAGAAAA --/CT CTCCCCTTCC 3070 het 1279 hom 12 3 9 0 CT 1 2 86690 CASAVA_Build 14 58386462 4D AAAGGACAAG AAGA/---- AAGAAAGTTG 3070 het 3070 ref 43 22 15 7 AAGA 2 1 86691 CASAVA_Build 14 58393065 1I TGTTAAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 T 11 12 86692 CASAVA_Build 14 58394217 1D TTTCTATTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 8 86693 CASAVA_Build 14 58396045 1I TGTAGCAGTC -/A CCTCTTTCAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 0 1 86694 CASAVA_Build 14 58398931 1D GACTGCCTGA G/- GAGAAAAGTG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 G 2 1 86695 CASAVA_Build 14 58403664 2I CAAAGAGTGC --/CA CAAATTATGA 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 CA 1 2 86696 CASAVA_Build 14 58410932 1I CCTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1406 het 1052 hom 19 4 5 10 A 10 11 86697 CASAVA_Build 14 58413501 1D ATGGAGTGAG A/- GGGGGCAGGA 3070 het 3070 ref 41 28 9 4 A 1 0 86698 CASAVA_Build 14 58424150 7D CACAGTTGTG TGCCCAC/------- TGCCCAGTGT 3070 het 3070 ref 53 28 24 4 TGCCCAC 1 0 86699 CASAVA_Build 14 58425797 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 7 6 86700 CASAVA_Build 14 58429003 1D ATTGAGAAGA G/- GTAAAGAGCA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 G 2 1 86701 CASAVA_Build 14 58438277 2D TTTCACACAC TT/-- TCTCTATCAC 3070 het 3070 ref 51 26 20 7 T 3 1 86702 CASAVA_Build 14 58450041 2I TTTTCAAAAG --/TA TTTATTGTCC 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 TA 0 1 86703 CASAVA_Build 14 58454908 7D AGGCCAATAT AGTCTCA/------- GGAAAGATTC 3070 het 3070 ref 40 24 17 7 AGTCTCA 1 0 86704 CASAVA_Build 14 58456206 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 11 10 86705 CASAVA_Build 14 58460264 1D GAAACTCTCA C/- CCCCCCAGCC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 7 6 86706 CASAVA_Build 14 58463432 4I TATTAATAAA ----/ATAG ATAGCCTGCT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 ATAG 1 2 86707 CASAVA_Build 14 58477234 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1202 het 1202 ref 17 12 3 3 A 10 11 86708 CASAVA_Build 14 58477389 1D TGGTTGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 15 14 86709 CASAVA_Build 14 58485618 2D CATTAGAATC TG/-- TATCTATTTA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 TG 1 0 86710 CASAVA_Build 14 58491938 1D ACTCTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 8 T 13 12 86711 CASAVA_Build 14 58493834 1D CACATTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 12 11 86712 CASAVA_Build 14 58495747 1I TCTCTGCTCA -/G GCTCAAATCA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 G 1 2 86713 CASAVA_Build 14 58500923 1D CTTGGTTTGT A/- AAAAAAAAAA 1171 het 1171 ref 37 25 3 9 A 12 11 86714 CASAVA_Build 14 58517114 1I AAGAAGCCAT -/C CCTGATTCAT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 C 2 3 86715 CASAVA_Build 14 58525003 1I AGGATCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 T 10 11 86716 CASAVA_Build 14 58531689 1I CATATTTTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 49 21 23 5 T 9 10 86717 CASAVA_Build 14 58537044 1D CAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 21 1 14 6 T 15 14 86718 CASAVA_Build 14 58539416 1D TTTGTCCCAG A/- AAAAAAACCG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 8 7 86719 CASAVA_Build 14 58545107 1D GTTTTTATTG T/- TTTTTTTTTT 2861 het 130 hom 18 2 14 2 T 17 16 86720 CASAVA_Build 14 58548334 4D GAGGAGACTC ACTT/---- GAACCTGGGA 3070 hom 36 het 18 0 12 6 ACTT 1 0 86721 CASAVA_Build 14 58549549 1D TTAAATATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 640 hom 19 2 11 6 T 15 14 86722 CASAVA_Build 14 58554309 7D GATTCAGAAG TTGCCAT/------- TTGAGATCGT 3070 hom 126 het 46 0 42 7 TTGCCAT 1 0 86723 CASAVA_Build 14 58559535 1D CTTGAGATAC A/- AAAAAATGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 A 7 6 86724 CASAVA_Build 14 58567996 1D GCAAGAGAGT A/- GGAAAGGGGA 3070 het 3070 hom 48 21 23 5 A 1 0 86725 CASAVA_Build 14 58568780 1D TATATGAAAT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 A 7 6 86726 CASAVA_Build 14 58582697 1D AAATGTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 13 13 T 13 12 86727 CASAVA_Build 14 58584455 1I TGTATTTGAG -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 6 7 86728 CASAVA_Build 14 58584544 1D CTCAATTTCC T/- TTATTGATTT 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 T 3 2 86729 CASAVA_Build 14 58589526 1D AAATTCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 11 10 86730 CASAVA_Build 14 58594537 4I CCCAACCTCT ----/CCCA CCAAGTTTTT 1716 het 1716 ref 11 7 4 0 CCCA 0 1 86731 CASAVA_Build 14 58601912 3D ATATACTACC TCT/--- TCATTCATTC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 TCT 1 0 86732 CASAVA_Build 14 58616034 1D AATTCTTTCC T/- TTTTCCCACA 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 5 4 86733 CASAVA_Build 14 58635178 4I ACACATCTCT ----/CAGA CAAATATCTT 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 CAGA 0 1 86734 CASAVA_Build 14 58636371 1D CTAGGGGCTT C/- CCAAGAGAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 C 3 2 86735 CASAVA_Build 14 58655085 1I GACTTAGAAA -/G AACTCTATTC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 G 0 1 86736 CASAVA_Build 14 58673223 1I AGTGAGCTGA -/G GATTGCACCA 3070 het 482 hom 13 1 8 4 G 1 2 86737 CASAVA_Build 14 58678058 1D ACTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 966 het 633 hom 19 7 4 8 A 19 18 86738 CASAVA_Build 14 58690480 1D CTTCATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 11 10 86739 CASAVA_Build 14 58691316 1I AATAACCACA -/C CCTTCTCTAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 C 2 3 86740 CASAVA_Build 14 58697188 1D ACTGTCAGCA C/- TCTGGATTTC 3070 het 3070 hom 57 20 29 8 C 1 0 86741 CASAVA_Build 14 58700829 4D ATTTTATCAG TTGT/---- TTGTCTTTTC 3070 het 3070 ref 50 29 19 3 TTGT 2 1 86742 CASAVA_Build 14 58701412 1I AAAAAAAAAA -/C AACAACTTTA 3070 het 2399 hom 38 14 17 7 C 0 1 86743 CASAVA_Build 14 58723791 3I AATAAATGAT ---/AAG AAGAGTTCCA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AAG 1 2 86744 CASAVA_Build 14 58730604 8I TATACATCCT --------/GATGTTGC GATGTTGCCT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 GATGTTGC 1 2 86745 CASAVA_Build 14 58734679 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2147 het 2147 ref 26 16 6 4 T 16 15 86746 CASAVA_Build 14 58738992 1D TCATTTGCCA T/- TTAAAAAATG 3070 het 3070 hom 48 14 24 11 T 3 2 86747 CASAVA_Build 14 58745709 16I GCTGGATGGC ----------------/CAGCCTGCAGGCTGTT ACCTTTTATG 2212 het 2212 ref 31 23 5 3 CAGCCTGCAGGCTGTT 0 1 86748 CASAVA_Build 14 58747446 5D AATGCTTGTC TAAAA/----- TATTTGCAGC 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 TAAAA 1 0 86749 CASAVA_Build 14 58753389 2D GTCTATATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 28 1 14 14 T 13 11 86750 CASAVA_Build 14 58753712 2D GACTGCTCCC TG/-- TGTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 41 14 18 10 TG 5 4 86751 CASAVA_Build 14 58792210 1I CATGAATTCT -/A ATTGTTTCAG 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 A 1 2 86752 CASAVA_Build 14 58793850 1I AATGGACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 10 15 A 11 12 86753 CASAVA_Build 14 58800176 3D GAGCCAGAGA AGG/--- AGAAGAGGAG 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 AGG 1 0 86754 CASAVA_Build 14 58804374 2D CGCCCCCCCC TT/-- TTTTTTTTTT 857 het 77 hom 19 1 3 15 T 18 16 86755 CASAVA_Build 14 58810865 1D AGTCAGAATC T/- TTTGCCATCT 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 T 4 3 86756 CASAVA_Build 14 58815414 2D ATGTTCAAAC AG/-- AATTTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 AG 1 0 86757 CASAVA_Build 14 58817513 3D GCAGGATGAG TTC/--- TTCTTACTGT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 TTC 2 1 86758 CASAVA_Build 14 58821152 12D TACAATTGGA AGCATTAACAAC/------------ AGAATAGACC 3070 het 3070 ref 29 16 14 3 AGCATTAACAAC 1 0 86759 CASAVA_Build 14 58826239 6D ACAAAATGTG ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AT 8 5 86760 CASAVA_Build 14 58837571 1I AGGAAACTAA -/T TATCTCATTG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 1 2 86761 CASAVA_Build 14 58842554 1I TTGACTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 42 2 31 9 T 10 11 86762 CASAVA_Build 14 58847442 1I GAAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 8 9 86763 CASAVA_Build 14 58857600 1D ATTTGGCTAC A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 A 8 7 86764 CASAVA_Build 14 58858973 1D TCTCTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1518 hom 23 8 13 3 A 13 12 86765 CASAVA_Build 14 58866756 5I TCAGTCTCTT -----/ACAGA ACGTAGTTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ACAGA 0 1 86766 CASAVA_Build 14 58872495 1D AGTGGTGTTG T/- TTTTTTTTTT 1596 het 1596 ref 29 19 4 6 T 12 11 86767 CASAVA_Build 14 58874341 1I TCAACCTGTC -/T TTTTCTCAAT 3070 het 3070 ref 45 29 15 1 T 4 5 86768 CASAVA_Build 14 58874971 1D CAGGGTTTTG T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 49 18 25 7 T 5 4 86769 CASAVA_Build 14 58883785 3I CATAGAACAT ---/AGC AGCAGCTTTG 3070 het 3070 hom 43 12 30 1 AGC 2 3 86770 CASAVA_Build 14 58884829 1D GGCATCTTTG T/- CTGGTTGTCC 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 T 1 0 86771 CASAVA_Build 14 58895308 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2335 het 1447 hom 19 6 8 5 A 16 15 86772 CASAVA_Build 14 58898424 7D ATACCTCTAA TAAAAAT/------- TAAAGTCACA 3070 het 3070 ref 31 18 14 1 TAAAAAT 1 0 86773 CASAVA_Build 14 58898491 1I GTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2532 het 1238 hom 23 7 8 8 T 15 16 86774 CASAVA_Build 14 58901033 1I CTTTATAAAT -/G GATATTAACA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 1 2 86775 CASAVA_Build 14 58901960 1I CCAAATAAGT -/A AAACATTGAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 3 4 86776 CASAVA_Build 14 58906099 1D CAATCCATGC T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 7 6 86777 CASAVA_Build 14 58907581 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 67 het 31 0 23 8 A 10 9 86778 CASAVA_Build 14 58918781 1I TGATCAAAGA -/T GTTCAGCACT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 0 1 86779 CASAVA_Build 14 58922495 1D TTGGGTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 13 10 T 13 12 86780 CASAVA_Build 14 58927020 1I CAGTATTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 8 9 86781 CASAVA_Build 14 58927714 1D ATTTTTGGTA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 2951 hom 32 8 20 4 T 8 7 86782 CASAVA_Build 14 58928242 1I AGTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 1746 het 1746 ref 16 9 4 3 G 0 1 86783 CASAVA_Build 14 58932755 7I2M6I GCAAATCAAA -------TG------/ACCACAGTGAGATAC CATCTCACAC 3070 hom 39 het 13 0 14 0 N/A 0 0 86784 CASAVA_Build 14 58933964 3D TTTCTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 31 3 17 11 T 19 16 86785 CASAVA_Build 14 58941416 1D TCCTTTCTGC T/- TTTTAGTTTT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 T 5 4 86786 CASAVA_Build 14 58962131 1D TGCAAGTGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 86787 CASAVA_Build 14 58964228 6D ATGAAATTGG CCAGCA/------ CCCTGTTTCT 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 CCAGCA 1 0 86788 CASAVA_Build 14 59040213 1D CAAACATTTT A/- TGATTCTGAG 3070 hom 78 het 31 0 26 6 A 1 0 86789 CASAVA_Build 14 59041922 1D AGAGTAGGGA G/- GGGTGTCATG 3070 hom 87 het 36 0 30 7 G 4 3 86790 CASAVA_Build 14 59048120 2I TCCACCCTGA --/TG TGCGTGCATG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TG 1 2 86791 CASAVA_Build 14 59067595 1I GGTTTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 27 0 19 8 A 13 14 86792 CASAVA_Build 14 59076043 2D AAGAGTGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 CT 2 1 86793 CASAVA_Build 14 59076965 1I GTTCAATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1206 hom 38 3 26 9 A 13 14 86794 CASAVA_Build 14 59089346 1I AGTGATTGAA -/G ATCAAATGAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 G 0 1 86795 CASAVA_Build 14 59094103 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 11 12 86796 CASAVA_Build 14 59098785 2I CGTCCCATGT --/GA GAGTTAATCT 3070 hom 138 het 54 0 46 8 GA 1 2 86797 CASAVA_Build 14 59107213 8I CTCTTTTGTT --------/TTTGTTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TTTG 2 4 86798 CASAVA_Build 14 59111766 1D GGTGTAATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 8 86799 CASAVA_Build 14 59120925 1I AAAATCTGTC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 6 7 86800 CASAVA_Build 14 59125372 3I GAAATCTAAT ---/ACA ACATTATTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 ACA 1 2 86801 CASAVA_Build 14 59126324 1I TAAACAATCT -/A AAAACCTTAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 4 5 86802 CASAVA_Build 14 59152850 6I5M2I CTCATTTTGG ------TGAAA--/TCCTCTTTAAATG ATTGTTTCAT 1270 het 1270 ref 39 33 3 5 N/A 0 0 86803 CASAVA_Build 14 59158993 4I AGAGTAAGAA ----/GGCT GGCTAGACAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 GGCT 1 2 86804 CASAVA_Build 14 59169055 1D CCAGTTATCA T/- TCCCTAAGTC 3070 hom 120 het 46 0 35 11 T 2 1 86805 CASAVA_Build 14 59174633 1I ACAAAATGTA -/T TTTTAAATAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 4 5 86806 CASAVA_Build 14 59189860 1I CTCACTTTCG -/A AAAAATTCTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 5 6 86807 CASAVA_Build 14 59211915 2D CTATAGGACT TG/-- GGGGGGGGGC 3070 hom 57 het 21 0 19 3 TG 1 0 86808 CASAVA_Build 14 59212030 3D ATAAATAATT TAA/--- TAATAATATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TAA 3 2 86809 CASAVA_Build 14 59213132 4D CTCTGCTAAC CTAA/---- CTATCTTCTT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 CTAA 1 0 86810 CASAVA_Build 14 59219925 1D TAGAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 29 3 A 11 10 86811 CASAVA_Build 14 59226456 1D TGTAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 41 0 34 8 T 13 12 86812 CASAVA_Build 14 59232940 2D TTTTAATTAC TT/-- TTTTTTTTTT 2082 het 1247 hom 30 5 7 18 T 14 12 86813 CASAVA_Build 14 59354102 1I CTCCCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 44 1 31 12 T 13 14 86814 CASAVA_Build 14 59479491 1D TTGTATTTTG T/- TTTTTTGCTG 3070 hom 114 het 42 0 39 5 T 7 6 86815 CASAVA_Build 14 59481935 1I TACCAGTAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 9 86816 CASAVA_Build 14 59482976 1D TTTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 12 11 86817 CASAVA_Build 14 59501274 14I GATTGCAACA --------------/CTATTCATATCAAG CTATTCATAT 3070 hom 138 het 58 0 46 12 CTATTCATATCAAG 0 1 86818 CASAVA_Build 14 59511506 2D GTGTCACAGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AT 9 8 86819 CASAVA_Build 14 59540326 1I ACAACAAAGC -/A AAAAAATAAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 6 7 86820 CASAVA_Build 14 59551470 1D TTTGTTCATA C/- TGGGTAATGT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 C 1 0 86821 CASAVA_Build 14 59551731 1D AAATGCAATT A/- AAAAATATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 6 5 86822 CASAVA_Build 14 59562151 1D TATATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 33 0 21 13 A 15 14 86823 CASAVA_Build 14 59562166 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGTGACAT 3070 het 118 hom 31 5 18 8 G 1 0 86824 CASAVA_Build 14 59571575 1D ACTTTGAGCA T/- TTTTTTTTTT 2217 het 2217 ref 41 23 5 13 T 13 12 86825 CASAVA_Build 14 59573200 1D TCTTTGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 35 1 26 8 T 11 10 86826 CASAVA_Build 14 59586556 19D CAACCTCCAC CTCCTGGGTTCAAGTGATT/------------------- CTCCTGCCTC 63 het 3 hom 4 0 1 3 CTCCTGGGTTCAAGTGATT 1 0 86827 CASAVA_Build 14 59599366 1I GTCCACAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1127 hom 36 6 23 7 T 14 15 86828 CASAVA_Build 14 59620464 1D CAGCCTAGAG A/- AAAGAACGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 4 3 86829 CASAVA_Build 14 59626198 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 592 het 382 hom 28 6 3 19 T 13 12 86830 CASAVA_Build 14 59634120 1I TGAAAAACTT -/A AAAGGTCTAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 A 3 4 86831 CASAVA_Build 14 59637884 5D AGGAACACTC AGATT/----- AAAGAAGAGC 3070 hom 96 het 33 0 33 3 AGATT 1 0 86832 CASAVA_Build 14 59641986 2I TACAGCCATC --/TA TATATATATA 3070 hom 85 het 41 0 33 8 TA 5 6 86833 CASAVA_Build 14 59651427 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 10 9 86834 CASAVA_Build 14 59654589 1I AGTGTTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 12 13 86835 CASAVA_Build 14 59656087 1I GTCTATACTT -/A ACAATACTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 2 86836 CASAVA_Build 14 59658056 1D GAATCAGTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 9 8 86837 CASAVA_Build 14 59664636 1D GAGAAGGGAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 54 het 23 0 18 6 A 8 7 86838 CASAVA_Build 14 59666430 4D GATATGAGAC AAAG/---- AAAACAAAGG 3070 hom 102 het 36 0 35 2 AAAG 1 0 86839 CASAVA_Build 14 59667513 1I TCTTTCTGCT -/G TAGAACAGAA 3070 hom 72 het 28 0 22 6 G 0 1 86840 CASAVA_Build 14 59671853 1I TATGTTATTC -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 8 86841 CASAVA_Build 14 59672579 1D CTCCCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 38 0 31 7 A 13 12 86842 CASAVA_Build 14 59675470 5D AAAGCAAAAT AAAAC/----- AATCGTAGAA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AAAAC 1 0 86843 CASAVA_Build 14 59675850 2D ACAAAGAGAG AC/-- AATTTGTAAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AC 1 0 86844 CASAVA_Build 14 59676424 1I AACGCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 10 11 86845 CASAVA_Build 14 59677419 1D ACCTGATAAG A/- AACTCATGGG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 3 2 86846 CASAVA_Build 14 59678107 5D ATCTCCTGAT AAAAG/----- AAATCTCCAG 3070 hom 93 het 33 0 32 3 AAAAG 1 0 86847 CASAVA_Build 14 59678950 1I CTTCCTACTT -/A AAAAGTCCAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 4 5 86848 CASAVA_Build 14 59682604 3I TGCCCAGCTT ---/ATC ATAATAAAGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 ATC 0 1 86849 CASAVA_Build 14 59683159 2I TGTCTGTGTG --/TA TGTATATATA 3070 het 330 hom 37 1 34 2 TA 0 1 86850 CASAVA_Build 14 59687637 4D TTTAGCAAAC ATTT/---- ATCTTTTTGG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 ATTT 1 0 86851 CASAVA_Build 14 59692698 4I TAGAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGCC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAAG 2 3 86852 CASAVA_Build 14 59694230 4I ACTACTGAAT ----/AAAC AAACACCCAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAAC 1 2 86853 CASAVA_Build 14 59697000 2I TGGCACAGAG --/TA TAGATCTTTT 3070 hom 54 het 19 0 17 2 TA 1 2 86854 CASAVA_Build 14 59702196 4D GCCAGGAGAC AGAT/---- AGAATCATTC 3070 hom 51 het 18 0 18 2 AGAT 1 0 86855 CASAVA_Build 14 59703115 1D CTACCTGCCT C/- CCCACCCTCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 4 3 86856 CASAVA_Build 14 59706719 2D TACTGCCTCT CA/-- CACCAGAGCA 3070 hom 132 het 47 0 43 6 CA 2 1 86857 CASAVA_Build 14 59710706 1I TCAAACCCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 31 hom 32 1 29 2 T 9 10 86858 CASAVA_Build 14 59714191 1D GTATGCATGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 39 het 22 0 11 12 G 11 10 86859 CASAVA_Build 14 59747242 1I CTTCATTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 4 hom 35 1 25 9 T 9 10 86860 CASAVA_Build 14 59762396 1I TTGGTCATTT -/C ATAGGCCCAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 0 1 86861 CASAVA_Build 14 59790748 8I ACTAAAAGTT --------/AAGACGTA ATAGAAGAAA 3070 hom 146 het 53 0 49 4 AAGACGTA 0 1 86862 CASAVA_Build 14 59792748 14D AAATTAGCCA GGCGTGGTGGCACG/-------------- GGCATGGTGG 3070 hom 60 het 21 0 18 3 GGCGTGGTGGCACG 1 0 86863 CASAVA_Build 14 59808514 1I GGTATTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 15 16 86864 CASAVA_Build 14 59813891 5D CACAAAACTA TTAAT/----- TTACCCTTGA 3070 hom 63 het 23 0 21 3 TTAAT 1 0 86865 CASAVA_Build 14 59818747 3I CAACCAAGAT ---/AAG ATATTTGAGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AAG 0 1 86866 CASAVA_Build 14 59821950 4I CACGCACGCA ----/TGCG TGCGTGCACA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 TGCG 1 2 86867 CASAVA_Build 14 59832586 2D TTAAAAATGT AA/-- ATATCTCTAG 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 3 1 86868 CASAVA_Build 14 59840450 2I TAATTTTAAC --/TG TGCACTTTGA 3070 hom 99 het 37 0 31 6 TG 1 2 86869 CASAVA_Build 14 59841441 3I ATTTCCAGTC ---/ATT ATTTTCTTGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 ATT 1 2 86870 CASAVA_Build 14 59841968 1D ACCAGCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 11 10 86871 CASAVA_Build 14 59855530 1I AGCACCTCCC -/T TGGCCCCCCT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 1 2 86872 CASAVA_Build 14 59867022 1I GAGATACAAC -/A AAAAATAACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 5 6 86873 CASAVA_Build 14 59869322 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 17 0 14 3 A 10 9 86874 CASAVA_Build 14 59875719 1D TTGAAACTTA T/- TTTTAGGAAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 5 4 86875 CASAVA_Build 14 59881075 1I TTTTTCCTAG -/T TTTTTTTACT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 7 8 86876 CASAVA_Build 14 59885061 4I GGGAAAAAAC ----/CTTT CTTTCCTCTT 3070 hom 99 het 38 0 29 9 CTTT 1 2 86877 CASAVA_Build 14 59901244 1D GTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 10 9 86878 CASAVA_Build 14 59932453 3I CTTGAGTCAA ---/TTT TTTTTTATAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 6 9 86879 CASAVA_Build 14 59971953 1D TGTTTGATGG T/- TTTTTTTTTA 1213 het 1213 ref 40 30 3 7 T 10 9 86880 CASAVA_Build 14 59992898 1I TTAGCTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 40 3 24 13 T 15 16 86881 CASAVA_Build 14 60004757 5I CTCATAATAT -----/TTAAG TTAATAATAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTAAG 0 1 86882 CASAVA_Build 14 60008713 1D ATTAGAACTC T/- TGTGTTCACC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 86883 CASAVA_Build 14 60015404 1D ATCTTATACA T/- TTTTTATTAT 3070 hom 56 het 25 0 20 5 T 6 5 86884 CASAVA_Build 14 60016144 3D TAAATTAGCT TAA/--- TATTATGAAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TAA 1 0 86885 CASAVA_Build 14 60017244 1D ATACAGCCTG A/- AAAAAAGTAG 3070 hom 120 het 47 0 41 8 A 7 6 86886 CASAVA_Build 14 60028604 1I GCAAAACTTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 8 9 86887 CASAVA_Build 14 60029075 1D TATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3049 hom 27 het 13 0 8 6 A 12 11 86888 CASAVA_Build 14 60033860 9I TACAGGCCCA ---------/ATTCTCCAT ATGCACACAC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 ATTCTCCAT 0 1 86889 CASAVA_Build 14 60034596 1D TGAATTTATT G/- TAATGAAGCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 1 0 86890 CASAVA_Build 14 60035739 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATACTG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 0 1 86891 CASAVA_Build 14 60048482 22D GTATGTGCAT ATATGTATGTACCTATACAAAC/---------------------- ATATGTATGT 3070 hom 95 het 45 0 30 21 ATATGTATGTACCTATACAAAC 2 1 86892 CASAVA_Build 14 60065466 1I GCCTCAGCAA -/T GGTGGACACC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 0 1 86893 CASAVA_Build 14 60077781 1D ATAAATGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 28 0 22 6 T 12 11 86894 CASAVA_Build 14 60084665 4I ATGGTTTTTG ----/TCCT TCATTCTGTT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TCCT 0 1 86895 CASAVA_Build 14 60087635 3D AGCAGGACTG TTC/--- TTCTGGCTGG 3070 hom 124 het 45 0 34 12 TTC 2 1 86896 CASAVA_Build 14 60094477 9I ATATTTAAGA ---------/AAGATAGTT TTCTTTGCAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAGATAGTT 0 1 86897 CASAVA_Build 14 60105999 1D8M3D AAAACAAAAC AAAACAAACAAA/-AAACAAAC--- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 15 0 16 3 N/A 0 0 86898 CASAVA_Build 14 60108769 3I CTTTCCCAAC ---/AAT GACATTCCCT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 AAT 0 1 86899 CASAVA_Build 14 60118816 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1783 het 105 hom 23 2 6 15 T 14 13 86900 CASAVA_Build 14 60119537 3D TTAGTTATTG TTA/--- TTATTATTGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TTA 3 2 86901 CASAVA_Build 14 60127114 19D6M11D AATATTATAT ATAATATTATATATTATAATATATAATATAATATAT/-------------------TATATA----------- ATATTATATA 1459 hom 7 het 4 0 3 1 N/A 0 0 86902 CASAVA_Build 14 60157591 1D ATTATATTCC T/- TTTTTTCAAT 3070 hom 72 het 39 0 33 6 T 7 6 86903 CASAVA_Build 14 60163195 1D CATGTACAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 10 9 86904 CASAVA_Build 14 60171465 1D TAATACATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 28 1 21 6 T 15 14 86905 CASAVA_Build 14 60177416 1I GTTTAATCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 32 1 27 4 A 9 10 86906 CASAVA_Build 14 60180977 3I TTTAAAAAAT ---/AAG AAGGCCTTGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAG 1 2 86907 CASAVA_Build 14 60181988 1D TTTGTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 37 1 25 11 A 12 11 86908 CASAVA_Build 14 60182489 1D TTTGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 24 1 18 5 T 17 16 86909 CASAVA_Build 14 60187865 1D TACCTTAGGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 51 het 30 0 26 5 T 9 8 86910 CASAVA_Build 14 60197256 1I TGTCAACGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 407 hom 26 1 21 4 T 9 10 86911 CASAVA_Build 14 60203514 3D AATATAAAGA GAT/--- GATAAGAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GAT 2 1 86912 CASAVA_Build 14 60217088 1D TAAGCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 2406 het 188 hom 15 2 8 5 T 17 16 86913 CASAVA_Build 14 60219211 2I GCCATTTGTA --/TG TGTGTTCTTT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TG 2 3 86914 CASAVA_Build 14 60224495 4D ACCCTGGTTG CAGT/---- CAGTTTTAGC 3070 hom 105 het 36 0 35 4 CAGT 2 1 86915 CASAVA_Build 14 60225427 1I TTAACTAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 843 hom 27 2 16 9 T 10 11 86916 CASAVA_Build 14 60227696 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 43 1 32 10 A 10 11 86917 CASAVA_Build 14 60229484 1I TACCTAGTTG -/A AACTATATAT 2468 hom 18 het 7 0 5 2 A 2 3 86918 CASAVA_Build 14 60230906 3D CATTTGTATG TCT/--- TCTTTGGATA 3070 hom 108 het 38 0 37 3 TCT 2 1 86919 CASAVA_Build 14 60234084 5D GCAGAAACTT TTTAG/----- TTTAATTAGG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTTAG 1 0 86920 CASAVA_Build 14 60235965 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 21 1 17 3 T 17 16 86921 CASAVA_Build 14 60240099 2D ATATATATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 AT 8 7 86922 CASAVA_Build 14 60244829 1I CATTTATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 720 hom 38 3 27 8 T 13 14 86923 CASAVA_Build 14 60275860 1I TATTAACTTA -/T TTTTTTTTTT 1305 het 1305 ref 37 24 3 10 T 13 14 86924 CASAVA_Build 14 60300950 1I GCTATTTGGG -/T TTGGAACCCA 3070 het 87 hom 42 1 39 2 T 2 3 86925 CASAVA_Build 14 60305793 4I ACCCAGGGTA ----/TACC GAGTGCAGTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TACC 0 1 86926 CASAVA_Build 14 60322785 4I AAAATATTTT ----/ACTC AGTACTAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACTC 0 1 86927 CASAVA_Build 14 60352801 2I ATTTTAAAAA --/AC AGTTTGGAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 AC 0 1 86928 CASAVA_Build 14 60367270 1D TTCTTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 783 het 783 ref 29 19 3 7 T 13 12 86929 CASAVA_Build 14 60367575 1D CTTTTGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 784 hom 45 2 29 15 T 14 13 86930 CASAVA_Build 14 60380608 3I TTTCAATAAC ---/TTA TTATCTTGAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TTA 1 2 86931 CASAVA_Build 14 60387913 1D AGTTTATCAG C/- CACCATTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 C 2 1 86932 CASAVA_Build 14 60398045 2I TAAAAAAATT --/TG TGAAAAGGTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TG 1 2 86933 CASAVA_Build 14 60423675 1D ATCAGAGCTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 8 86934 CASAVA_Build 14 60436420 3D TTGCTGTTAC TAT/--- TATTATTGTT 3070 hom 144 het 52 0 49 5 TAT 3 2 86935 CASAVA_Build 14 60439607 1I TGTTTAAGTG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 7 8 86936 CASAVA_Build 14 60451028 1I CAGATATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 28 1 24 3 A 11 12 86937 CASAVA_Build 14 60453776 1D TTTTACCAGG A/- AAAAATAGTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 6 5 86938 CASAVA_Build 14 60461108 1I TCACCCTCCC -/T TGACTCTCAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 2 86939 CASAVA_Build 14 60480088 1D TTTGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 11 10 86940 CASAVA_Build 14 60496001 3I ATGCCAGTGA ---/TAC TTACAAACTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TAC 0 1 86941 CASAVA_Build 14 60508348 2D GGCTTAAGGG GA/-- TTAAGTCTAT 3070 hom 7 het 33 1 30 2 GA 1 0 86942 CASAVA_Build 14 60523493 1I TCTGTTTCTC -/T TTCTTTTTTC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 3 86943 CASAVA_Build 14 60544178 20I ACACCGATAT --------------------/TTCTTTAATCTCATGCCTCA AAGTGACATA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTCTTTAATCTCATGCCTCA 0 1 86944 CASAVA_Build 14 60544782 3D TTCTTTCTAA CTT/--- TGTAGTAATG 3070 hom 93 het 38 0 32 8 CTT 1 0 86945 CASAVA_Build 14 60551997 5I AGAAATGAGA -----/TATAT TAGAGAAACA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TATAT 0 1 86946 CASAVA_Build 14 60564214 4D GTGTTAAAGT GCTA/---- GCTAGTTCTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 GCTA 2 1 86947 CASAVA_Build 14 60600181 4I AAGATCAAGA ----/TACT TATTTAGCAA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 TACT 0 1 86948 CASAVA_Build 14 60611151 12D AGCCTATTAT TCCCTCCCTCCC/------------ TCCCTCCCTC 1296 hom 12 het 14 0 5 9 TCCC 8 5 86949 CASAVA_Build 14 60615203 1D CTCTGGCATC T/- TTTTTTTTTT 2713 hom 23 het 10 0 8 2 T 11 10 86950 CASAVA_Build 14 60623416 1D AAGGGCATCT A/- AAAAAATGAA 3070 hom 66 het 27 0 22 6 A 7 6 86951 CASAVA_Build 14 60636131 4I CCATAGCAGC ----/CAGT CAATGATTAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 CAGT 0 1 86952 CASAVA_Build 14 60636289 1I CCCACGTATC -/A GGGGGAGGGA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 0 1 86953 CASAVA_Build 14 60636518 2I GCAGAATTGT --/GA GTCAATTAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 GA 0 1 86954 CASAVA_Build 14 60637318 1I TATTTTCATG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 129 hom 35 1 30 4 T 8 9 86955 CASAVA_Build 14 60639288 1I ACATGTCTCC -/T TCCAGTTAGG 3070 hom 117 het 43 0 36 7 T 1 2 86956 CASAVA_Build 14 60641883 4D AAGTGTGGAT ATCC/---- GGTCATGAAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ATCC 1 0 86957 CASAVA_Build 14 60643432 4I ATTGCAATTA ----/AGAC AGGTGCCCTC 3070 hom 73 het 28 0 20 8 AGAC 0 1 86958 CASAVA_Build 14 60656289 5D ACTGTTGTTG TTGTT/----- TTAACTATTT 3070 hom 99 het 36 0 33 5 TTGTT 1 0 86959 CASAVA_Build 14 60657518 3I2M2I TCCGTGTCAC ---AG--/TTAAGCT GGCTGGAGTC 3070 hom 80 het 29 0 25 4 N/A 0 0 86960 CASAVA_Build 14 60659639 1I TTTGACTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 9 10 86961 CASAVA_Build 14 60694470 1I GGGAAAAAAA -/T ATACATATAT 3070 het 324 hom 24 1 10 13 T 0 1 86962 CASAVA_Build 14 60707520 1I AAAAAAAAAA -/C AACAACTCCC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 C 0 1 86963 CASAVA_Build 14 60709684 1D TAATTAATTA C/- CCAGTCTCAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 3 2 86964 CASAVA_Build 14 60715405 1D TGGGAGAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 38 0 27 12 T 10 9 86965 CASAVA_Build 14 60717588 1D ACGACGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 49 het 19 0 15 4 A 10 9 86966 CASAVA_Build 14 60718429 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 491 hom 25 4 14 7 T 14 13 86967 CASAVA_Build 14 60734544 1D ATTGATCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 A 10 9 86968 CASAVA_Build 14 60744546 1I TGACAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 10 11 86969 CASAVA_Build 14 60765088 1I CCTCCCAAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 8 9 86970 CASAVA_Build 14 60777434 5I GCTCTAATTC -----/AATTT AATTCTGACA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AATTT 0 1 86971 CASAVA_Build 14 60779556 1D AAGGCTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 11 10 86972 CASAVA_Build 14 60780420 1D CATCTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 31 0 24 7 A 15 14 86973 CASAVA_Build 14 60782122 15I GCCGGTGGGG ---------------/CAGCTTTACAGTGGT CAGCCTTACA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CAGCTTTACAGTGGT 0 1 86974 CASAVA_Build 14 60786556 1I CATGGTGAAA -/C CCCCATCTCT 1792 hom 15 het 6 0 4 2 C 4 5 86975 CASAVA_Build 14 60792709 1D GGAATGCATT A/- AATTGGCTCC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 3 2 86976 CASAVA_Build 14 60794446 1I GTTTTATGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 143 hom 26 1 23 2 T 9 10 86977 CASAVA_Build 14 60808721 1D ATGACATGAG A/- AAAACCAAGG 2388 hom 12 het 6 0 5 2 A 5 4 86978 CASAVA_Build 14 60813175 10I TCTTATATCC ----------/AAGGGCATAT AAGGAACTAG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 AAGGGCATAT 0 1 86979 CASAVA_Build 14 60818506 1I AAATAACTCT -/C TAGCTGGTGT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 0 1 86980 CASAVA_Build 14 60822802 1I CAGCAGACTT -/C CTGTTTCAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 1 2 86981 CASAVA_Build 14 60832312 1I GATAACCCCC -/T GATAAATAAC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 0 1 86982 CASAVA_Build 14 60835950 1I AACTTTCAGG -/T TTTTTTCTAC 3070 hom 129 het 45 0 43 2 T 6 7 86983 CASAVA_Build 14 60836693 2I TTTCTTTCTC --/AG GGGTTTTGGA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AG 0 1 86984 CASAVA_Build 14 60840315 2D TATGTCTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 13 11 86985 CASAVA_Build 14 60840670 2D CTTAAAATAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AC 9 8 86986 CASAVA_Build 14 60845561 1I TCAAGACCAG -/C CTGGGCAACA 3070 hom 30 het 12 0 8 4 C 1 2 86987 CASAVA_Build 14 60846412 2I GTGGCAGGCA --/AG AGAGAGAGTG 3070 hom 68 het 27 0 22 5 AG 4 5 86988 CASAVA_Build 14 60850663 1I GTATGAAGTC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 7 8 86989 CASAVA_Build 14 60867427 2I TGATGAGCTC --/AA AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 8 10 86990 CASAVA_Build 14 60876587 1I CTTCCCTGAC -/A AGCTGTCTGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 86991 CASAVA_Build 14 60930738 1D TACTTGACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 21 10 A 11 10 86992 CASAVA_Build 14 60932553 1D CTTGTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 16 0 10 6 A 17 16 86993 CASAVA_Build 14 60940720 1I TGGGGAGTGT -/G GGGCATGGAC 3070 hom 94 het 37 0 30 7 G 3 4 86994 CASAVA_Build 14 60941427 2I CTCTTCAAGA --/AC ATACCCTTGT 3070 hom 162 het 58 0 54 4 AC 0 1 86995 CASAVA_Build 14 60942668 1D CACATACAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 10 9 86996 CASAVA_Build 14 60962833 3I TAATGTCAGA ---/ATT ATTTTCTTAG 3070 hom 99 het 39 0 32 7 ATT 1 2 86997 CASAVA_Build 14 60967231 1I AGCAGCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 584 hom 31 3 18 10 T 13 14 86998 CASAVA_Build 14 60967651 1I TTGGTAAGGG -/A AAAAATGCCT 3070 hom 47 het 23 0 16 7 A 5 6 86999 CASAVA_Build 14 60968058 1I GCCATTTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 9 10 87000 CASAVA_Build 14 60972925 1I TAACTATGAG -/T TACATAGTTA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 1 2 87001 CASAVA_Build 14 60977397 2I ATTTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 10 12 87002 CASAVA_Build 14 60977577 1I CATTATGTTG -/C CCAGACTGGT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 2 3 87003 CASAVA_Build 14 61007727 1D CTGATAGGAC T/- TTTTAAAGAG 3070 hom 108 het 47 0 31 16 T 5 4 87004 CASAVA_Build 14 61036239 2D AAGAGGAACT TA/-- TACTTCCTCC 3070 hom 129 het 51 0 44 9 TA 2 1 87005 CASAVA_Build 14 61036360 1I GGGTAGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 34 0 28 6 A 11 12 87006 CASAVA_Build 14 61040668 1D GTTTATTGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 9 8 87007 CASAVA_Build 14 61056345 1D TTTCTGTGGT A/- AAAAAAAAAA 1193 het 1193 ref 39 26 3 10 A 15 14 87008 CASAVA_Build 14 61063749 3I TCTCCATAAT ---/CTA CTAGGCTTCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 CTA 1 2 87009 CASAVA_Build 14 61064360 1I CCTTCTCACT -/C CCCCTTCTCT 3070 hom 80 het 31 0 25 6 C 4 5 87010 CASAVA_Build 14 61072654 1I2M2I TCACCCTCAT -GA--/AGACT TTTTTTGCCA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 N/A 0 0 87011 CASAVA_Build 14 61076173 1D AAATGCCAGC T/- TTTTTTTTTT 1671 het 1671 ref 44 28 4 12 T 11 10 87012 CASAVA_Build 14 61078842 3D TTCTGTCAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 A 15 12 87013 CASAVA_Build 14 61081587 1I CCACCGGCTG -/C CCCCCGCAGT 3070 hom 72 het 27 0 22 5 C 5 6 87014 CASAVA_Build 14 61097545 5I AAAAAAAAAA -----/AAGAG AGAGAGAGAG 3070 het 168 hom 25 1 19 5 AAGAG 0 1 87015 CASAVA_Build 14 61098079 1D ATTTCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 240 hom 35 3 17 15 A 15 14 87016 CASAVA_Build 14 61107717 4D GCCTTTTATT TTTA/---- CCATCTTTAC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TTTA 1 0 87017 CASAVA_Build 14 61111090 1D GACAGCTGCC A/- AATTAGTCCT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 A 3 2 87018 CASAVA_Build 14 61121088 1D AACCCTTCAA T/- AGCACCCCCT 3070 hom 138 het 50 0 47 4 T 1 0 87019 CASAVA_Build 14 61131080 2I ATTCTTTATT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 300 hom 53 1 41 11 TC 8 9 87020 CASAVA_Build 14 61132246 2D CAGATACTTT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 168 het 63 0 52 13 AC 7 6 87021 CASAVA_Build 14 61134655 3I TTAATGTTTC ---/TTA TTATTAAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTA 2 3 87022 CASAVA_Build 14 61148621 1I CAGTCCCACC -/A AAACATCTCC 3070 hom 193 het 70 0 65 5 A 3 4 87023 CASAVA_Build 14 61149649 2I GAAACTTTTT --/TC TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 TC 0 1 87024 CASAVA_Build 14 61150538 1I GTGCCTTCCA -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 G 3 4 87025 CASAVA_Build 14 61159945 2D ACTTTCCATT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 10 8 87026 CASAVA_Build 14 61181403 2D TTTGATAAAG GT/-- AATGCAATGC 3070 hom 82 het 32 0 28 5 GT 1 0 87027 CASAVA_Build 14 61181817 1D GGTATCCTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 10 9 87028 CASAVA_Build 14 61186599 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 32 0 17 15 A 17 16 87029 CASAVA_Build 14 61191066 1I AAAACAGAGA -/T TTTTGTCATC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 4 5 87030 CASAVA_Build 14 61191168 9I CCTGAAGATT ---------/AAATGGTTA AAATGGTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAATGGTTA 1 2 87031 CASAVA_Build 14 61192548 1I CCCAGCACAC -/A AATTCCTCTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 3 87032 CASAVA_Build 14 61206174 3D GAGAAGAGGC TGA/--- TGATGAAATA 3070 hom 74 het 26 0 25 1 TGA 3 2 87033 CASAVA_Build 14 61206260 1D AGCCAAGGAT G/- GGTATCCTAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 3 2 87034 CASAVA_Build 14 61207011 1I TCCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 271 hom 25 1 16 8 A 12 13 87035 CASAVA_Build 14 61208945 2D CAGAGTAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 2384 hom 10 het 12 0 8 4 CT 2 1 87036 CASAVA_Build 14 61215370 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 723 hom 39 2 29 8 A 12 13 87037 CASAVA_Build 14 61216592 1I CTTAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 12 13 87038 CASAVA_Build 14 61238974 4D TGAGATTCAC TGAT/---- TGGTAAGAAG 3070 hom 51 het 19 0 16 4 TGAT 1 0 87039 CASAVA_Build 14 61240287 11I CTCTTGACCA -----------/GTGCTACCATT GTAATTAATG 3070 hom 60 het 30 0 21 9 GTGCTACCATT 0 1 87040 CASAVA_Build 14 61243776 1D GCATTCTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 37 het 18 0 13 5 T 10 9 87041 CASAVA_Build 14 61245091 1I TTGTAGATAA -/T GCGGCATTAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 0 1 87042 CASAVA_Build 14 61247519 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 16 11 A 19 16 87043 CASAVA_Build 14 61252696 10D ACATTCATGA ACTGGCAGAG/---------- ACAAAAATGG 3070 hom 69 het 29 0 24 6 ACTGGCAGAG 1 0 87044 CASAVA_Build 14 61258558 1D TACAAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 24 2 13 9 T 17 16 87045 CASAVA_Build 14 61259761 3D TTTATTCCTC ACA/--- ACAACCCTGT 3070 hom 84 het 31 0 29 5 ACA 2 1 87046 CASAVA_Build 14 61261893 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 25 1 20 4 T 11 10 87047 CASAVA_Build 14 61288958 2I TTATTTCCTC --/TT TGAAATGGAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 1 3 87048 CASAVA_Build 14 61294673 1D CAAATAAAAA C/- ATCACTTCAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 C 1 0 87049 CASAVA_Build 14 61323867 1I GATTAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 29 2 23 4 T 12 13 87050 CASAVA_Build 14 61435720 1D GTCCAGGTAG T/- TATGACTTCA 3070 het 3070 hom 58 20 25 13 T 2 1 87051 CASAVA_Build 14 61437083 1D GAACAATAGA G/- GAGGGCCTGC 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 G 2 1 87052 CASAVA_Build 14 61442230 4D CTTCTTCTTC TTCT/---- TTTTTTTTTT 2219 het 2219 ref 26 15 9 3 TTCT 1 0 87053 CASAVA_Build 14 61446701 10D TGTCTCCTTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 TTTTG 4 2 87054 CASAVA_Build 14 61462718 2D8M4I AAATTAATGC AAAGAGTCAA----/--AGAGTCAAAGTT AGAGTATGTG 3070 het 3070 ref 60 33 28 6 N/A 0 0 87055 CASAVA_Build 14 61490780 1I TTGGTTAGCC -/T TTTTTTTTTT 2464 het 1426 hom 32 7 15 10 T 17 18 87056 CASAVA_Build 14 61501370 1D GATTTTTAGC T/- TTTTTTTTTT 1163 het 1163 ref 47 29 4 14 T 12 11 87057 CASAVA_Build 14 61507821 25D TGTAAGGCTG CAGTTAGAATGTCATCTCAAGGCTT/------------------------- CAGTTAGAAT 3070 hom 73 het 34 0 24 13 CAGTTAGAATGTCATCTCAAGGCTT 1 0 87058 CASAVA_Build 14 61524216 1I ATTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1685 hom 40 5 23 12 T 14 15 87059 CASAVA_Build 14 61550435 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2975 het 2975 ref 28 13 9 6 A 15 16 87060 CASAVA_Build 14 61566252 1D GTCTAGTTGG A/- AAAAAAAAAA 1330 het 1330 ref 44 30 3 12 A 12 11 87061 CASAVA_Build 14 61569496 1D TTTCATGAAA T/- TAAGGTACCA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 2 1 87062 CASAVA_Build 14 61569706 1I AGAATGTGTA -/C CTTCGGATTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 1 2 87063 CASAVA_Build 14 61570159 5D19M4I AACAGCCTTC TCATATCATACACACAATAAACTC----/-----TCATACACACAATAAACTCAGAT AGACCCATAG 3070 het 3070 hom 32 18 22 7 N/A 0 0 87064 CASAVA_Build 14 61573664 1D AAGCATGAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 10 9 87065 CASAVA_Build 14 61610205 1D TGAATGCTTA C/- TATACATGGG 3070 het 3070 hom 30 9 19 3 C 1 0 87066 CASAVA_Build 14 61619626 1I CAGGTTAGGT -/G GGGGGGCGCT 3070 het 275 hom 35 1 29 5 G 6 7 87067 CASAVA_Build 14 61624262 1I CTGTTGGGGT -/C TTAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 C 0 1 87068 CASAVA_Build 14 61625986 1D GTGATTTTTT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 76 het 30 0 25 5 A 8 7 87069 CASAVA_Build 14 61656722 3I CAAGCAGGTT ---/AAA ACTAAACCAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 1 4 87070 CASAVA_Build 14 61684885 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAACAAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 7 6 87071 CASAVA_Build 14 61686423 1D AATAACTTAT G/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 29 16 9 6 G 1 0 87072 CASAVA_Build 14 61689619 2I TATTATTGTT --/AA GTTATAGAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 2 87073 CASAVA_Build 14 61690003 1D CATTAAGTTA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 8 7 87074 CASAVA_Build 14 61694290 2I ATTAAATTGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 AT 6 7 87075 CASAVA_Build 14 61698413 2D TGTGTATGTA TG/-- TGTATGTGTG 3070 hom 69 het 39 0 24 16 TG 2 1 87076 CASAVA_Build 14 61710026 1I TTGGCCCTAC -/T TTTTTTTTTT 1444 het 1444 ref 27 12 7 8 T 11 12 87077 CASAVA_Build 14 61711854 1D GTCTCTACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 24 het 21 0 16 5 A 10 9 87078 CASAVA_Build 14 61715328 2I TGAGAGGAGG --/GA GAGAGGATCA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 GA 2 3 87079 CASAVA_Build 14 61717175 2D TGGCTTCAGA CT/-- CTGCCATTTC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 CT 2 1 87080 CASAVA_Build 14 61717379 4D AGGGTCTTTA TACT/---- TACTTATTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 7 TACT 2 1 87081 CASAVA_Build 14 61718153 1D TCTGTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 T 11 10 87082 CASAVA_Build 14 61723032 1I CTTTCATACC -/T GTTCAAATGC 3070 hom 123 het 52 0 42 10 T 0 1 87083 CASAVA_Build 14 61728226 3D TTATTTACAT ATG/--- ATATACACAG 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 ATG 1 0 87084 CASAVA_Build 14 61730007 1D AGTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2665 hom 31 12 13 6 A 13 12 87085 CASAVA_Build 14 61746392 1D CTTGATGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 11 7 T 13 12 87086 CASAVA_Build 14 61746600 1D GCTCTTCTCC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 9 8 87087 CASAVA_Build 14 61756255 1I TTTAAAGTAA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 7 8 87088 CASAVA_Build 14 61772855 1I CACAAAAAAA -/C AAAACACTAC 3070 het 2453 hom 28 7 15 6 C 0 1 87089 CASAVA_Build 14 61781860 1D AAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 2521 het 2521 ref 25 15 6 4 A 11 10 87090 CASAVA_Build 14 61785592 2I ATGTGAGGTC --/TT TTACATAGAT 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 2 4 87091 CASAVA_Build 14 61787029 2I TCTCTTTCTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 49 17 15 17 TG 7 8 87092 CASAVA_Build 14 61795418 1I GCTTCTTTGG -/T TAAGTGGATA 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 T 1 2 87093 CASAVA_Build 14 61795757 1I TAGTCGTCAG -/T AGGCCTAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 0 1 87094 CASAVA_Build 14 61796773 1D AGTAACAGGC A/- AAAAAACACA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 7 6 87095 CASAVA_Build 14 61796983 2D AAATGGAAAC AT/-- AAAATAAATT 3070 het 3070 hom 39 15 23 3 AT 1 0 87096 CASAVA_Build 14 61825593 3D GAAAAGAAAT GGG/--- AGGAATTGGG 3070 het 3070 hom 50 22 24 6 G 3 0 87097 CASAVA_Build 14 61829974 2D CATGGGATAA TT/-- TTTTTTTTTT 1969 het 77 hom 30 2 8 20 T 16 14 87098 CASAVA_Build 14 61841906 1I GGTTAGAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 9 10 87099 CASAVA_Build 14 61857708 3D TTAGAATTTA TTG/--- TTCTTTCTTG 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 TTG 1 0 87100 CASAVA_Build 14 61859299 1I AATCACAGAA -/G GGTATGAATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 2 3 87101 CASAVA_Build 14 61865676 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 48 het 18 0 16 3 A 9 8 87102 CASAVA_Build 14 61865805 1D GGTGGTTGTT G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 31 0 28 4 G 1 0 87103 CASAVA_Build 14 61868532 1D TTGTTTTTTT C/- AAATCAACTT 2729 het 2489 hom 12 5 7 0 C 1 0 87104 CASAVA_Build 14 61870270 6D GCTTCACTGA TTAACT/------ TTAAATCTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 4 TTAACT 1 0 87105 CASAVA_Build 14 61874090 1D TTAAAAGAAA C/- CATCTGTTAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 2 1 87106 CASAVA_Build 14 61875264 1D TTAGAACTAA G/- CCAGTCCAGT 3070 hom 90 het 40 0 31 10 G 1 0 87107 CASAVA_Build 14 61876196 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 11 12 87108 CASAVA_Build 14 61878985 2I CTACCACCGA --/CT CTCTGGTTCA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 CT 2 3 87109 CASAVA_Build 14 61880821 1D AAAAAAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 16 2 11 3 A 12 11 87110 CASAVA_Build 14 61886092 1D AAATAAATGA G/- GGAGAATAGG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 G 3 2 87111 CASAVA_Build 14 61886961 4D AACCAATAAT TGTA/---- TGTGTTTGTA 3070 hom 73 het 30 0 24 6 TGTA 1 0 87112 CASAVA_Build 14 61888232 1D TAAAAATACC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 7 6 87113 CASAVA_Build 14 61889672 1D TTTTTTTCCC G/- AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 0 87114 CASAVA_Build 14 61890161 1D TTTGTTAGTA T/- TTTTGTTTAC 3070 hom 105 het 42 0 35 8 T 5 4 87115 CASAVA_Build 14 61890529 2I TTAAAATAAC --/TT ATTTCTTTAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 0 2 87116 CASAVA_Build 14 61897975 1D CAAACTGCAG C/- CCCCCCTAAT 3070 hom 113 het 45 0 36 9 C 7 6 87117 CASAVA_Build 14 61898602 23D CCAGGTTGGA AGCACAAAATCAGTTAGATTTTT/----------------------- AGTGACTGTG 3070 het 3070 ref 36 23 21 8 AGCACAAAATCAGTTAGATTTTT 1 0 87118 CASAVA_Build 14 61908284 1D CAGTAAGTGA G/- GGGTGCCTCA 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 G 4 3 87119 CASAVA_Build 14 61914303 1D TAATAAAATA T/- TTTTTTCTTT 2576 het 2576 ref 31 18 8 5 T 7 6 87120 CASAVA_Build 14 61916348 3I AGGAAGCCTT ---/GTG GTGATGGAAC 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 GTG 1 2 87121 CASAVA_Build 14 61916628 3I ATTGCAAAAT ---/AAA AAGATTAAGA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 2 5 87122 CASAVA_Build 14 61917081 1D ACTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 2053 het 605 hom 19 2 5 12 A 14 13 87123 CASAVA_Build 14 61920384 1D TGTAAATAGC T/- TTATTGAGGC 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 T 3 2 87124 CASAVA_Build 14 61924062 1D CTAGTGGAGC T/- GTGAGAAGAG 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 1 0 87125 CASAVA_Build 14 61951054 5D GCAAGAAAAA TAATT/----- TAAAAGGGCA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 TAATT 1 0 87126 CASAVA_Build 14 61958480 1D ATCTCCAATT C/- CCTCCTGGAA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 C 3 2 87127 CASAVA_Build 14 61958679 1D GTATTATTCT A/- AAATTATTTT 3070 hom 89 het 34 0 29 5 A 4 3 87128 CASAVA_Build 14 61959513 5D GCAAAAATAT AAGAA/----- AAGAAAAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAGAA 2 1 87129 CASAVA_Build 14 61961846 1I CAGGTGATAT -/G GGGGGTTTGC 3070 hom 148 het 56 0 50 6 G 5 6 87130 CASAVA_Build 14 61968557 7D TTCATTTCTT TCTTTCC/------- TCTTTCCTCT 3070 het 3070 ref 38 19 12 9 TCTTTCC 2 1 87131 CASAVA_Build 14 61970096 1I GGGTGGCTTT -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 6 7 87132 CASAVA_Build 14 61970923 1I CATATAATTG -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 6 7 87133 CASAVA_Build 14 61971261 2D AATTTATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 22 0 13 9 T 13 11 87134 CASAVA_Build 14 61974498 1I GAGAAATAGT -/A CTGGATATTA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 0 1 87135 CASAVA_Build 14 61975784 2I TGCCTGGCAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2596 hom 27 8 16 3 T 12 14 87136 CASAVA_Build 14 61976173 1I GTAGGTTTCC -/T TTCTTTCTCT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 T 2 3 87137 CASAVA_Build 14 61993531 3I CTTTGTAGCT ---/ATC ATCTTATTTA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 ATC 1 2 87138 CASAVA_Build 14 61996006 1I ATTCTGCCAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 2607 hom 45 6 15 24 T 8 9 87139 CASAVA_Build 14 62016632 4D ATGTATTTCA TTAT/---- TTATTTTTGG 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 TTAT 2 1 87140 CASAVA_Build 14 62019006 5D TGCAACTTTT TAAAG/----- TAAAGTAAAG 3070 hom 84 het 35 0 29 7 TAAAG 3 2 87141 CASAVA_Build 14 62019590 4I TATCTGACAA ----/TGTT TGTTTGGATT 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 TGTT 1 2 87142 CASAVA_Build 14 62020450 4D ATAGAGCTTC TGTT/---- TGTTTGCAAA 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 TGTT 2 1 87143 CASAVA_Build 14 62022308 1D ACTAAAGACC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 A 8 7 87144 CASAVA_Build 14 62048907 1D GTCTAAATGG A/- AAAAAAACTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 8 7 87145 CASAVA_Build 14 62056727 1D ATCAAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 11 10 87146 CASAVA_Build 14 62064916 2I TTACTGTCTC --/AT AATTTCAGGG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AT 0 1 87147 CASAVA_Build 14 62070798 5I GGCTCGTGAT -----/AAATC AATTTATTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAATC 0 1 87148 CASAVA_Build 14 62071505 1D AGGCCAACAG T/- TGAGGCTTAT 3070 het 3070 hom 39 13 17 11 T 2 1 87149 CASAVA_Build 14 62082484 2D TGGGAGTGAC AA/-- GAGATAAAAT 3070 het 1582 hom 18 4 12 2 A 2 0 87150 CASAVA_Build 14 62085069 1D AAATATCACC T/- TATTAATCAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 1 87151 CASAVA_Build 14 62089108 1D GAAGGGTAGT G/- GGGGGGACGG 3070 hom 35 het 20 0 15 5 G 7 6 87152 CASAVA_Build 14 62116134 1D GAAAAAAAAT A/- AAAGGTATTG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 4 3 87153 CASAVA_Build 14 62130056 1D ACTGTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 693 hom 36 3 19 15 A 15 14 87154 CASAVA_Build 14 62132315 1I ACCTTCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 234 hom 40 1 32 7 T 10 11 87155 CASAVA_Build 14 62139990 2D TGAAATATAC TG/-- TGTTTCTGTA 2610 het 2610 ref 17 8 7 2 TG 2 1 87156 CASAVA_Build 14 62147018 1D ACTCAGAAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 9 8 87157 CASAVA_Build 14 62147882 2D GAAATATTAT GA/-- GAGAAAATAG 3070 het 3070 hom 44 20 21 4 GA 3 2 87158 CASAVA_Build 14 62158351 1I TCCAGAACTT -/G AAGAGTGGTA 3070 het 3070 hom 50 19 21 10 G 0 1 87159 CASAVA_Build 14 62159706 1I TCATACTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 255 hom 33 1 27 5 T 10 11 87160 CASAVA_Build 14 62161668 4I CCATACAATT ----/TTTA TTTGTCTTCA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TTTA 0 1 87161 CASAVA_Build 14 62162219 1I ACATGCACCC -/A ATCGCCACAT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 A 1 2 87162 CASAVA_Build 14 62163628 1D ATAAAAATTC A/- TTGTTGCACT 3070 het 3070 hom 35 12 18 6 A 1 0 87163 CASAVA_Build 14 62180407 1I GTTTTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 20 13 5 G 0 1 87164 CASAVA_Build 14 62186564 1D GCAGGCAGAA G/- GAGAGAGGAG 3070 het 3070 hom 60 25 27 10 G 2 1 87165 CASAVA_Build 14 62188046 1D AAAAGTTGAG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 8 7 87166 CASAVA_Build 14 62190837 1I GAATGATTTA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 6 7 87167 CASAVA_Build 14 62190958 2I GAAACAAAGG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 9 11 87168 CASAVA_Build 14 62195867 1D ACTAAGAAAC T/- GATACTAGGA 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 T 1 0 87169 CASAVA_Build 14 62199559 1D TAAAACAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 29 0 21 10 A 10 9 87170 CASAVA_Build 14 62200797 2I TTCCTGAGAC --/AT GTTTAACTGT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 AT 0 1 87171 CASAVA_Build 14 62201425 1D TTTATTTTCC T/- TTTTTCCTGT 3070 het 3070 hom 32 13 19 0 T 6 5 87172 CASAVA_Build 14 62202407 1D CATACTAGCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 9 8 87173 CASAVA_Build 14 62204184 2I GTCATTTACC --/CA CAGAGTCTGC 3070 hom 137 het 54 0 45 9 CA 1 2 87174 CASAVA_Build 14 62205962 1I TGGTAAAGAT -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 6 7 87175 CASAVA_Build 14 62207571 8I TAAACCTATA --------/GAGATGAG GAGATGAGAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 GAGATGAG 1 2 87176 CASAVA_Build 14 62209650 4D GCAGAGGATA AAGT/---- AAGAGTGACA 3070 het 3070 ref 58 28 27 4 AAGT 1 0 87177 CASAVA_Build 14 62210070 1D AAAGCAGCTG C/- TATACCCCTT 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 C 1 0 87178 CASAVA_Build 14 62210171 1I TTTCCACAGA -/G GGTACCAGTG 3070 het 3070 hom 47 23 21 3 G 2 3 87179 CASAVA_Build 14 62216113 2I AAGGAAAACA --/AC ACTCTCCCCC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AC 1 2 87180 CASAVA_Build 14 62216807 2D AAAACAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 A 12 10 87181 CASAVA_Build 14 62218699 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 219 hom 25 2 12 11 A 16 15 87182 CASAVA_Build 14 62224087 1D AAATGAGTGC A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 55 31 17 7 A 8 7 87183 CASAVA_Build 14 62228030 2D TTTATAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 12 10 87184 CASAVA_Build 14 62234660 1I ATGTTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 1678 het 1678 ref 32 15 5 12 T 15 16 87185 CASAVA_Build 14 62248673 1D TAAGAGGTAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 8 7 87186 CASAVA_Build 14 62249752 3D GCTATCTGTA TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TAT 6 5 87187 CASAVA_Build 14 62250601 1I AATAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 129 hom 22 2 13 7 A 11 12 87188 CASAVA_Build 14 62256887 1D CGTCTCTACT A/- AACAACAACA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 3 2 87189 CASAVA_Build 14 62264697 1D ATTAAACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 16 1 10 5 A 13 12 87190 CASAVA_Build 14 62270044 2I ACTTTTACTC --/AA ATGCTGTTTG 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 A 1 3 87191 CASAVA_Build 14 62288946 5D GGGAATCCTA CTGTC/----- CTGTCCTGAA 3070 het 3070 ref 41 22 12 11 CTGTC 2 1 87192 CASAVA_Build 14 62295712 2I ATTAGTCAGC --/TG TGTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TG 1 2 87193 CASAVA_Build 14 62304687 1D TACAAATTAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 A 8 7 87194 CASAVA_Build 14 62314332 5D ATGTGTATTT GTGTG/----- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 21 21 5 GTGTG 1 0 87195 CASAVA_Build 14 62314815 1I GCATTTGGGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 8 9 87196 CASAVA_Build 14 62317501 3D AAGAAGACCT TTA/--- TCGGGGAATC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 TTA 1 0 87197 CASAVA_Build 14 62326540 1I TTGAGTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 19 12 T 10 11 87198 CASAVA_Build 14 62349083 1D GATAATTAAC A/- GAGAAGGCAA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 A 1 0 87199 CASAVA_Build 14 62354353 6D TATAATAGCC ATAAAT/------ ATAAATATAA 2767 hom 21 het 11 0 8 3 ATAAAT 4 3 87200 CASAVA_Build 14 62354575 1D ACCAGGAGCT G/- GGGGCGGGGG 1272 het 398 hom 15 3 7 6 G 5 4 87201 CASAVA_Build 14 62356823 1I TGTTATATAC -/T TTTTTTTTTT 2393 het 2180 hom 18 7 7 4 T 13 14 87202 CASAVA_Build 14 62368798 1D GTTTGACTAC T/- TTAGATACCT 3070 het 3070 hom 47 24 22 3 T 3 2 87203 CASAVA_Build 14 62369463 2D TTGAATTGAT AG/-- AGTTTCTTAT 3070 het 3070 hom 38 19 18 1 AG 2 1 87204 CASAVA_Build 14 62376058 1D TACCAATATG T/- TCCTGGATCA 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 T 2 1 87205 CASAVA_Build 14 62389066 1D ACTAGAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 11 10 87206 CASAVA_Build 14 62409621 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 777 hom 29 8 17 4 A 14 13 87207 CASAVA_Build 14 62414673 1D TTGTGGGGAT G/- GGGGGGGGGG 1679 hom 10 het 6 0 4 2 G 11 10 87208 CASAVA_Build 14 62438694 1I TTCATTAGTT -/C CCCATGTGTC 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 C 3 4 87209 CASAVA_Build 14 62453204 1D GAGCACAGCT C/- CAACGGAGGG 3070 het 3070 ref 55 31 19 6 C 2 1 87210 CASAVA_Build 14 62465676 1I TTAACAACCA -/C CCCCCCGCAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 C 6 7 87211 CASAVA_Build 14 62500029 5I AAAGCAAGAC -----/AAGAT GAGATGAGAT 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 AAGAT 0 1 87212 CASAVA_Build 14 62508130 1I AAAAATAGAC -/A AATAGATTAA 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 A 2 3 87213 CASAVA_Build 14 62509586 5D GGAGCAAAGG GTACA/----- GTACATGGGA 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 GTACA 2 1 87214 CASAVA_Build 14 62512569 2I TAGGAGATTT --/AA AAAAAAAAAA 2081 het 2081 ref 26 12 10 4 A 14 16 87215 CASAVA_Build 14 62562092 1I CAATAGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 32 1 25 6 A 11 12 87216 CASAVA_Build 14 62564099 1I TATTGAAGAG -/A AAGGCAAAGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 2 3 87217 CASAVA_Build 14 62586879 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2378 het 2250 hom 28 8 10 10 T 13 14 87218 CASAVA_Build 14 62590260 3D TGAGAAACAG AGA/--- AGTTCAGTAA 3070 het 3070 ref 39 20 18 3 AGA 1 0 87219 CASAVA_Build 14 62591714 1D ATCTCTAACC T/- TTTTTTTTTT 2386 het 1364 hom 20 7 6 8 T 11 10 87220 CASAVA_Build 14 62600491 8I TGGGGAGAAG --------/AAATAAAT AAATAAATAA 2953 het 1687 hom 18 5 7 6 AAAT 3 5 87221 CASAVA_Build 14 62605096 1D AACTATGTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 9 8 87222 CASAVA_Build 14 62612295 4I TGCTTCATAA ----/TAAT TAATATTAAA 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 TAAT 1 2 87223 CASAVA_Build 14 62615415 1D CAGAAGGGAC T/- TTTTTTAACC 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 T 7 6 87224 CASAVA_Build 14 62620905 1I TGATAACCAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 12 23 7 A 9 10 87225 CASAVA_Build 14 62622325 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1230 het 981 hom 22 6 6 10 T 15 14 87226 CASAVA_Build 14 62624283 5D CAGAAGATCG TATAT/----- TATATTATTC 3070 het 3070 ref 55 27 22 9 TATAT 2 1 87227 CASAVA_Build 14 62628654 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 452 hom 27 1 15 11 A 9 10 87228 CASAVA_Build 14 62636149 1I TGTCCTCTGG -/A AAATTCAATT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 3 4 87229 CASAVA_Build 14 62661663 1D CCCCATCTCT A/- CTAAAAATAC 3070 het 2085 hom 24 5 16 3 A 1 0 87230 CASAVA_Build 14 62684988 1D GATAAGTGAC T/- TTTTTTATCA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 7 6 87231 CASAVA_Build 14 62686496 1I GAGGCTTACC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 101 het 39 0 34 5 A 8 9 87232 CASAVA_Build 14 62687702 1D AAATTATACA G/- GAAAAAAAGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 2 1 87233 CASAVA_Build 14 62688469 10I ATTTTCATCA ----------/ATTGATCGAT ATATAGCCTT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 ATTGATCGAT 0 1 87234 CASAVA_Build 14 62689406 1I TTCTGATAAG -/A TCACAAAACA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 0 1 87235 CASAVA_Build 14 62689565 2I GCCAACCATC --/AA AAGAGACCAA 3070 hom 116 het 43 0 39 4 A 2 4 87236 CASAVA_Build 14 62690165 1D ATTTATACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 14 22 10 A 10 9 87237 CASAVA_Build 14 62690603 5I AAATTAGCCA -----/GGTGT GATGGTGGGT 3061 hom 18 het 7 0 7 0 GGTGT 0 1 87238 CASAVA_Build 14 62690916 4I TAATGAAAAC ----/AGTA AGTATCAGAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AGTA 1 2 87239 CASAVA_Build 14 62691111 22D TGAACAGAAT ATCAATAGAGCTAATACCTAAA/---------------------- ACAATAATAA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 ATCAATAGAGCTAATACCTAAA 1 0 87240 CASAVA_Build 14 62696735 3D AAAACATTCT TAC/--- TACTTATAAA 3070 het 2726 hom 37 8 24 8 TAC 2 1 87241 CASAVA_Build 14 62696798 1D CCGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 A 11 10 87242 CASAVA_Build 14 62698906 1D CTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 2612 het 2451 hom 18 8 7 3 A 12 11 87243 CASAVA_Build 14 62703541 3D AAAAAAGAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 31 9 14 11 AAG 5 4 87244 CASAVA_Build 14 62720252 1I TTTCTAATTA -/C CCCCACTGTC 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 C 4 5 87245 CASAVA_Build 14 62727124 1I ATTTCAGGTT -/A AAAAAAAAAA 2808 het 2808 ref 45 23 11 11 A 13 14 87246 CASAVA_Build 14 62727892 3D AAATGTTGGC AGG/--- GCGCAGTTGC 3070 het 3070 ref 41 20 14 10 AGG 1 0 87247 CASAVA_Build 14 62728175 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 13 0 11 2 A 18 17 87248 CASAVA_Build 14 62735325 1D GAGACATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 11 10 87249 CASAVA_Build 14 62743507 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 162 hom 23 3 13 7 T 14 13 87250 CASAVA_Build 14 62745974 1D AGATCCCCCC T/- AGCTTCAATT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 1 0 87251 CASAVA_Build 14 62753427 1D TCCTCAGAAT A/- ATTACTCTTC 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 A 2 1 87252 CASAVA_Build 14 62756838 1D CTGAGTAATT A/- AAAAAAAATC 3007 het 3007 ref 31 17 8 7 A 9 8 87253 CASAVA_Build 14 62756922 1I CTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2314 het 2301 hom 24 10 8 6 A 14 15 87254 CASAVA_Build 14 62760306 1I TTTTTTCCAT -/G GAAAGCTCTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 1 2 87255 CASAVA_Build 14 62771151 5D TTTAAAACAG ATAAA/----- ATAAACCATT 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 ATAAA 2 1 87256 CASAVA_Build 14 62795812 1I GAGCCAAATA -/C TGCACAAGGC 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 C 0 1 87257 CASAVA_Build 14 62800456 1I AAGCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2040 hom 30 9 13 8 T 11 12 87258 CASAVA_Build 14 62808585 1I GAAGCACTAC -/T CTAAACGTTT 3070 het 3070 ref 57 33 21 3 T 0 1 87259 CASAVA_Build 14 62833739 1D GTTCTCAATC T/- TCCTGACCTT 3032 het 2546 hom 23 7 8 8 T 2 1 87260 CASAVA_Build 14 62836794 1I CCTGAAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 24 0 15 9 T 13 14 87261 CASAVA_Build 14 62842324 1I CAGACAAGAG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 38 het 17 0 13 4 A 6 7 87262 CASAVA_Build 14 62842442 1I TAGAACTGAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 8 9 87263 CASAVA_Build 14 62842575 1D CAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 9 87264 CASAVA_Build 14 62843914 1D TGGGTATTTA C/- CCAGAGGAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 3 2 87265 CASAVA_Build 14 62849600 1I CCATAGATAG -/A AAACAGAGAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 3 4 87266 CASAVA_Build 14 62850773 1D CTGAAGACTC A/- AGTTTCCTCC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 2 1 87267 CASAVA_Build 14 62850893 1D ATGCAATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 33 1 17 15 T 15 14 87268 CASAVA_Build 14 62851373 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1319 hom 15 het 15 0 8 7 T 17 16 87269 CASAVA_Build 14 62851983 3I GAGGGGATTG ---/GTT GTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 GTT 1 2 87270 CASAVA_Build 14 62854161 1I GTGATCCGAA -/G GCCCCTGCAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 1 2 87271 CASAVA_Build 14 62858638 1D AGCTGCCAAT A/- AAAAAATTAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 7 6 87272 CASAVA_Build 14 62865275 1D TTTCACCCCA C/- CACCAATTTG 3070 hom 153 het 55 0 50 5 C 2 1 87273 CASAVA_Build 14 62918021 2I TATCAAAATG --/AC AGTGTCAGGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AC 0 1 87274 CASAVA_Build 14 62956082 9D3M16D TGAGACCAAG TCAGGAGCCTTGGTCCAAAAGCAACAGA/---------TTG---------------- TGGTGAAGGC 3070 het 3070 ref 40 36 16 1 N/A 0 0 87275 CASAVA_Build 14 62962884 1D TGGGAGCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 12 11 87276 CASAVA_Build 14 62966567 1D ATGAATGTCA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 25 13 11 1 T 6 5 87277 CASAVA_Build 14 62998319 4I CCTCACACAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 AC 7 9 87278 CASAVA_Build 14 63005160 4D TGTGCAAAGG AAAT/---- AAATAAACAA 3070 het 3070 hom 49 23 25 1 AAAT 2 1 87279 CASAVA_Build 14 63006544 1I TACCTCCCCA -/C CACCCCCCAC 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 C 1 2 87280 CASAVA_Build 14 63006875 1I CCAGTTCCAA -/C CCCCAAGGCA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 C 4 5 87281 CASAVA_Build 14 63012249 5I TAAAAAACAT -----/AAGAA AAGATAGTTT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 AAGAA 0 1 87282 CASAVA_Build 14 63015061 5I GAAAACACGG -----/TATAC TCATGGGAGA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 TATAC 0 1 87283 CASAVA_Build 14 63015419 1D TATGGTGAAA C/- CCCCATCTTG 2022 het 2022 ref 13 7 5 1 C 5 4 87284 CASAVA_Build 14 63019904 3D GCAAAAAGAA GGG/--- GTTGGCCAGA 3070 het 3070 ref 48 24 17 9 G 4 1 87285 CASAVA_Build 14 63024675 1D CAGTGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 12 11 87286 CASAVA_Build 14 63027706 6D GAAGGGGGAA GCCAGG/------ TGGCAAGGGT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 GCCAGG 1 0 87287 CASAVA_Build 14 63029955 2I CCGCGCGCGC --/GT GTGTGTGTGT 2878 het 1880 hom 37 10 13 14 GT 5 6 87288 CASAVA_Build 14 63030128 2D AGTTTTGCAC AT/-- GTGGCAAGAC 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 AT 1 0 87289 CASAVA_Build 14 63049301 1D CCCTACCTAT A/- AATGTTCTGT 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 A 3 2 87290 CASAVA_Build 14 63053931 4I TCATTTAAGC ----/ACTG ACTATCAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 26 2 ACTG 0 1 87291 CASAVA_Build 14 63060189 1D TAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3027 het 3027 ref 31 18 9 4 A 11 10 87292 CASAVA_Build 14 63073778 4I ACCCATTACA ----/TATC TATCTACTTC 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 TATC 1 2 87293 CASAVA_Build 14 63077540 1I CAATGTATCA -/C CAGCAAGGTG 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 C 1 2 87294 CASAVA_Build 14 63093498 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1341 het 1341 ref 24 15 4 5 A 13 14 87295 CASAVA_Build 14 63095951 1I ATAATAATTG -/A AAAAAAAAAA 1888 het 1888 ref 20 9 6 5 A 12 13 87296 CASAVA_Build 14 63098736 3I CAATGACATA ---/ATC ATCTCAGCTC 3070 het 1677 hom 14 4 7 3 ATC 1 2 87297 CASAVA_Build 14 63100925 1I TGAAGGCAGG -/C CCCCCCCACA 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 C 7 8 87298 CASAVA_Build 14 63102454 1I CCTTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1773 het 1773 ref 26 16 8 2 A 14 15 87299 CASAVA_Build 14 63148801 1I AAATTTCAAG -/T TTTTTTTTTT 1292 het 1292 ref 27 11 4 12 T 15 16 87300 CASAVA_Build 14 63162331 1D AGAAGAGGAC T/- TTTTTTTTTT 1287 het 1287 ref 38 24 3 11 T 15 14 87301 CASAVA_Build 14 63186029 43D AGCCTGGGCA ACAGAGTGAGGCTCTGTCATCGCGACGCTCTGTCACAGCGATG/------------------------------------------- ACAGAGTGAG 3070 het 3070 ref 22 19 9 8 ACAGAGTGAGGCTCTGTCATCGCGACGCTCTGTCACAGCGATG 1 0 87302 CASAVA_Build 14 63315388 15D AGTGTTGGGA GTCTCCCAAAGTAGC/--------------- TCATGGCTAT 2459 het 2459 ref 28 22 8 3 GTCTCCCAAAGTAGC 1 0 87303 CASAVA_Build 14 63322719 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3052 hom 24 10 10 4 A 12 13 87304 CASAVA_Build 14 63328363 1I TTGTAGTGAG -/C TGAGATCGCG 1339 het 1339 ref 11 6 3 2 C 0 1 87305 CASAVA_Build 14 63330020 2I GAAATGTCAA --/CT CTCTCAACTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 CT 2 3 87306 CASAVA_Build 14 63330410 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1494 hom 17 4 10 6 A 12 11 87307 CASAVA_Build 14 63332928 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 2428 hom 23 5 13 5 A 8 9 87308 CASAVA_Build 14 63343295 1I CTCTTTTTTT -/A ATTAGTCTAA 2719 het 2719 ref 23 12 8 3 A 1 2 87309 CASAVA_Build 14 63344143 1D TTCCTTACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2677 hom 20 8 10 2 T 11 10 87310 CASAVA_Build 14 63344713 1D TTTCCTTATC T/- TTTAAGAAAT 3070 het 1771 hom 13 4 9 0 T 4 3 87311 CASAVA_Build 14 63351778 1I AAGTTCCCAT -/A ATAGGCCGTC 1300 het 1300 ref 19 11 4 5 A 1 2 87312 CASAVA_Build 14 63356292 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGCATCC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 1 2 87313 CASAVA_Build 14 63360095 1D GGAAGGAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2401 hom 29 11 9 10 T 15 14 87314 CASAVA_Build 14 63362750 1I CAAGCATGCC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 7 8 87315 CASAVA_Build 14 63370344 1D GAAATGCAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 9 8 87316 CASAVA_Build 14 63374216 2D TAAGACCCCC CT/-- GTCTCTACAA 2509 het 1491 hom 13 4 7 2 CT 1 0 87317 CASAVA_Build 14 63387057 1D TGATTATCAC T/- TCAAAGTACA 3070 het 3070 ref 50 29 16 5 T 2 1 87318 CASAVA_Build 14 63390635 1I TTGGCATCAC -/T TTTTTTTTTT 1858 het 987 hom 31 7 9 15 T 16 17 87319 CASAVA_Build 14 63398097 1D CCCCAATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 14 0 11 3 A 11 10 87320 CASAVA_Build 14 63408904 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1673 het 1673 ref 12 8 4 0 A 12 11 87321 CASAVA_Build 14 63409769 1I TATGACTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 10 11 87322 CASAVA_Build 14 63415051 2I AGTCTCACTC --/TG TTACCCAGGC 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 TG 0 1 87323 CASAVA_Build 14 63420000 1D TTTTTTGGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 8 7 87324 CASAVA_Build 14 63421803 2I TTTCTCACTG --/TC TCTCTCTGTG 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 TC 3 4 87325 CASAVA_Build 14 63428694 1D ACAAACATAC T/- GTTATAATTA 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 T 1 0 87326 CASAVA_Build 14 63431581 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1834 hom 28 6 11 11 T 14 12 87327 CASAVA_Build 14 63460763 2D AAATTCGAAT TG/-- TGTGTCTTCC 3070 het 3070 ref 30 14 15 2 TG 3 2 87328 CASAVA_Build 14 63461881 2D TGTATATATT TA/-- TGAGTTACAT 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 TA 1 0 87329 CASAVA_Build 14 63495253 4D CCCCATTTAC TTAT/---- TTATTCAGTC 3070 het 3070 hom 30 13 16 5 TTAT 2 1 87330 CASAVA_Build 14 63511231 2D43M10I ATGTATATAC GTGTGTGTGTATATATATATGTGTGTATATATATGTGTATATATG----------/--GTGTGTGTATATATATATGTGTGTATATATATGTGTATATATGTGTATATATA TGTATATATG 2756 het 2756 ref 16 8 10 1 N/A 0 0 87331 CASAVA_Build 14 63517834 2I TCCACTGGTT --/TA TATATATACA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 TA 4 5 87332 CASAVA_Build 14 63539913 2D TTCCATCCCA CT/-- CTATTCAGTG 3070 het 3070 ref 59 32 24 3 CT 2 1 87333 CASAVA_Build 14 63540241 1D CCCTCCTCCT C/- CCAGCAGGAT 3070 het 3070 ref 52 23 23 6 C 3 2 87334 CASAVA_Build 14 63542839 3D TTCTCCTCTT CTC/--- CTATATCATG 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 CTC 1 0 87335 CASAVA_Build 14 63547616 1D TGACACCCAG A/- GTGTCAGGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 1 0 87336 CASAVA_Build 14 63563590 1I TTAAGCTATA -/G AAAGCATAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 0 1 87337 CASAVA_Build 14 63566145 1D AGAAGCATGG A/- AAAAACATTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 6 5 87338 CASAVA_Build 14 63569987 1D CAGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 605 hom 20 2 14 4 A 13 12 87339 CASAVA_Build 14 63575329 18D GGAGACCGTG GGGAGAGGGAGAGGGAGA/------------------ GGGAGAGGGA 3070 hom 38 het 14 0 11 7 GGGAGA 5 2 87340 CASAVA_Build 14 63578321 1D ACCCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 32 1 26 5 A 13 12 87341 CASAVA_Build 14 63579235 1I AACCTCTTTC -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 6 7 87342 CASAVA_Build 14 63579970 1D AGGCCTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 20 0 15 6 A 12 11 87343 CASAVA_Build 14 63585381 1D TCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 551 hom 33 3 15 15 A 17 16 87344 CASAVA_Build 14 63592304 5I GTATAATAAT -----/AATAA AATAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AATAA 1 2 87345 CASAVA_Build 14 63605769 1D GATACAATGG A/- AACCCTTATC 3070 hom 134 het 53 0 44 10 A 3 2 87346 CASAVA_Build 14 63613857 1D CAAAGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 996 hom 46 3 34 9 T 12 11 87347 CASAVA_Build 14 63614107 2D CAGATAGAGT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TG 1 0 87348 CASAVA_Build 14 63621544 1D AGAAGCCACA T/- TTTTTTTTTT 1271 het 1271 ref 34 17 3 14 T 12 11 87349 CASAVA_Build 14 63691759 2D TAGTACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 AT 7 6 87350 CASAVA_Build 14 63730771 4I TCTTTTCTTC ----/TTCT TTTTTTTTTT 3070 het 2372 hom 31 11 12 8 TTCT 0 1 87351 CASAVA_Build 14 63743314 1D GTATTATTTA T/- TTTAATACCA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 4 3 87352 CASAVA_Build 14 63760082 1I ATTTTTAAAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 10 13 15 T 7 8 87353 CASAVA_Build 14 63763170 6I TACTCTACTC ------/TTTTTT TTTTTTTTGA 2439 het 2439 ref 36 15 11 10 T 8 14 87354 CASAVA_Build 14 63766669 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1881 het 857 hom 14 2 6 6 A 17 16 87355 CASAVA_Build 14 63774410 2D ATGAAAATGT TC/-- TAAAATTGAT 3070 het 3070 ref 47 21 21 6 TC 1 0 87356 CASAVA_Build 14 63774829 2I TGGTGGGGTA --/GG GGGGGGCAGT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 G 6 8 87357 CASAVA_Build 14 63779321 2I TACAAAAGAA --/AG AGGTTTATTG 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 AG 1 2 87358 CASAVA_Build 14 63780871 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2049 hom 22 8 8 6 A 15 14 87359 CASAVA_Build 14 63788776 2I GAGCGGGACC --/CT GTCTCTAAAA 2547 het 2157 hom 27 9 10 8 CT 0 1 87360 CASAVA_Build 14 63791298 1I TAGTCATTCC -/A AAAAAAAAAA 1585 het 1585 ref 26 16 7 3 A 15 16 87361 CASAVA_Build 14 63797455 2D ACCTGTTTCC AA/-- ACCATGAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 A 3 1 87362 CASAVA_Build 14 63803841 1I TTGAGAGAAT -/A AACCAATAAT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 2 3 87363 CASAVA_Build 14 63807794 4D GTTCAATTGT TTTC/---- TTTCTTTTTC 2546 het 2546 ref 18 9 8 1 TTTC 2 1 87364 CASAVA_Build 14 63809485 1I CCATTTTTTT -/G TGTCCTCTTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 G 0 1 87365 CASAVA_Build 14 63814447 1D CCCCAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 9 A 12 11 87366 CASAVA_Build 14 63816687 1I GCTTTCTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 9 10 87367 CASAVA_Build 14 63822298 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1473 het 952 hom 23 7 6 11 A 16 14 87368 CASAVA_Build 14 63826185 1I TTGACTTCTG -/T TCCACAGAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 1 2 87369 CASAVA_Build 14 63828719 1D AAGGAAAATA T/- GTCTAAGTAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 T 1 0 87370 CASAVA_Build 14 63831670 1I CATTGTGAGA -/C ACCCCCCAGT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 C 0 1 87371 CASAVA_Build 14 63857782 1D GTCTAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 2320 het 2320 ref 30 21 6 4 A 15 14 87372 CASAVA_Build 14 63859986 3D CAAGCACACG TTA/--- TTTTGTACAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 TTA 1 0 87373 CASAVA_Build 14 63881307 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 598 het 598 ref 15 8 3 4 A 13 12 87374 CASAVA_Build 14 63881328 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 957 het 957 ref 19 9 6 4 A 11 12 87375 CASAVA_Build 14 63891858 1I ATACAGGCGA -/T TTTTAGGATT 2274 het 2274 ref 20 10 6 4 T 4 5 87376 CASAVA_Build 14 63892203 4D ATCATCTCAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2257 het 1063 hom 22 5 8 9 T 20 16 87377 CASAVA_Build 14 63894503 1D AGAATACAAG A/- AAAATTAGCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 5 4 87378 CASAVA_Build 14 63900071 3I GAATGCGATA ---/AAG AAGATAGCCC 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 AAG 1 2 87379 CASAVA_Build 14 63904011 1I ATCCCATCTC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 7 8 87380 CASAVA_Build 14 63905522 1D AGTAAGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3004 hom 28 7 11 10 A 13 12 87381 CASAVA_Build 14 63906511 1I CAGGCGCGGT -/G GCTCACGCCT 2836 hom 21 het 10 0 8 2 G 1 2 87382 CASAVA_Build 14 63906781 1D CATCTCGGGG A/- AAAAAAAAAA 2707 het 2707 ref 17 9 7 2 A 13 12 87383 CASAVA_Build 14 63907450 11D GCTGGGACCA CAGGCGCCCGC/----------- CACCACGCCC 1403 het 932 hom 6 3 3 0 CAGGCGCCCGC 1 0 87384 CASAVA_Build 14 63913216 24D TAAAATGGAA ATATATATATATATATATATATAT/------------------------ ATATATATAT 3070 hom 23 het 11 0 8 7 AT 19 7 87385 CASAVA_Build 14 63914100 1I AAATAAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 11 12 87386 CASAVA_Build 14 63918071 1D TCCATCTAAT A/- AAAAAAAAAA 2595 het 2296 hom 15 7 6 2 A 13 12 87387 CASAVA_Build 14 63920653 1D AGAGCGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 57 hom 25 1 22 2 A 11 10 87388 CASAVA_Build 14 63920666 1D AAAAAAAACA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 189 hom 25 2 21 2 T 8 7 87389 CASAVA_Build 14 63920912 1I TGTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 475 hom 28 2 20 6 G 0 1 87390 CASAVA_Build 14 63926826 1D TTGAGATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2939 hom 38 7 17 14 T 11 10 87391 CASAVA_Build 14 63934635 1D AATCCCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 26 1 22 3 A 11 10 87392 CASAVA_Build 14 63939262 2I16M1I CTTAGGTGAC --AGTGAGATCCTGTCTC-/AGAGTGAGATCCTGTCTCA AAAAAAAAAT 3070 hom 73 het 27 0 24 6 N/A 0 0 87393 CASAVA_Build 14 63940065 1I TTTTGTAGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 59 het 30 0 27 3 T 9 10 87394 CASAVA_Build 14 63946089 12D ATAGAAAGTG ACCAAAGAGGAA/------------ ACATGAGAGG 3070 het 3070 hom 27 15 14 1 ACCAAAGAGGAA 1 0 87395 CASAVA_Build 14 63955844 2D CAAGAATGCG CA/-- CACACACACA 3070 hom 95 het 40 0 32 8 CA 6 5 87396 CASAVA_Build 14 63976425 1D TAATTAATAT A/- TTTTTTTGCT 3070 hom 60 het 21 0 21 1 A 1 0 87397 CASAVA_Build 14 63985274 1I GCAAAAAATC -/T TTTTTTTTTT 1818 het 1024 hom 24 8 9 7 T 13 14 87398 CASAVA_Build 14 63992678 1D ACACAGCCTG C/- CGAACTCAAG 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 C 2 1 87399 CASAVA_Build 14 63995959 2D GCTAGAACAC TA/-- TTCTTTGAGA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 TA 1 0 87400 CASAVA_Build 14 63996187 4D AACATTTCAG TGCT/---- TGCTTAGAGA 3070 hom 138 het 51 0 45 8 TGCT 2 1 87401 CASAVA_Build 14 63998749 2I CAAAACTCAG --/CT CTGAGTGTGT 2689 het 2689 ref 22 13 7 2 CT 1 2 87402 CASAVA_Build 14 64008182 1D TGAAACAGAT G/- AAGTAATAAA 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 G 1 0 87403 CASAVA_Build 14 64013207 2I CAATTCAGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 14 12 A 10 12 87404 CASAVA_Build 14 64022687 1D GCAGGAGAAT G/- GCGTGAACCC 2630 het 544 hom 9 3 6 0 G 2 1 87405 CASAVA_Build 14 64025771 1D ATAAAAAAAA C/- AAAAGTGTTA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 C 1 0 87406 CASAVA_Build 14 64033638 1I AAAATCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 10 11 87407 CASAVA_Build 14 64034001 2D CAGAATCAAA AT/-- ATGAGTGCTA 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 AT 2 1 87408 CASAVA_Build 14 64035575 1I CTAGATTGTA -/G TAACTCTGGA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 0 1 87409 CASAVA_Build 14 64036056 5D AAAGAAAAAG AAAAA/----- AAAGAATCAA 3070 het 2483 hom 29 9 17 3 A 8 3 87410 CASAVA_Build 14 64040836 1I TGGGCCCAAC -/G GGGCAGGGGT 762 het 634 hom 14 4 5 5 G 3 4 87411 CASAVA_Build 14 64047800 2D TCTGCTTCTG GA/-- GAGGGAGAGA 3070 het 3070 ref 43 19 18 7 GA 2 1 87412 CASAVA_Build 14 64048021 4I AACTTTACAT ----/CTTA CTTATGAGCA 3070 het 3070 ref 53 31 17 5 CTTA 1 2 87413 CASAVA_Build 14 64057868 2I TTGTAATAGC --/AA AGTCATGCAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 3 87414 CASAVA_Build 14 64061442 1D ATGTGAATTA C/- TTGCAATGTA 3070 het 3070 hom 28 11 17 1 C 1 0 87415 CASAVA_Build 14 64067349 1I GATTACAATT -/A AAATACTTGG 3070 het 3070 hom 31 8 19 4 A 3 4 87416 CASAVA_Build 14 64072353 32I GGGGGAGTCC --------------------------------/AGGGGCAAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGAA ACCCCTTTTG 3070 hom 48 het 18 0 16 2 AGGGGCAAGATCTGATGGTTTTATAAGGGGAA 0 1 87417 CASAVA_Build 14 64079288 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 190 hom 30 2 26 2 T 9 10 87418 CASAVA_Build 14 64080964 1I CATAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 952 hom 33 5 22 6 T 13 14 87419 CASAVA_Build 14 64085476 2I AGAACATGAA --/AT TCTAGATGAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 0 1 87420 CASAVA_Build 14 64089053 1D TTGGACAAAT G/- GGGGCTGGAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 5 4 87421 CASAVA_Build 14 64091903 1I GAAATAACTC -/T TAAGAATAGT 3070 het 3070 ref 50 30 17 3 T 1 2 87422 CASAVA_Build 14 64092324 4I TTCCCCTCTC ----/TCTG TCTCTCTACA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 TCTG 0 1 87423 CASAVA_Build 14 64094473 4I GAAAAAAAAT ----/AGAA AGAGAAAGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AGAA 0 1 87424 CASAVA_Build 14 64095111 1I TTGTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2279 het 2203 hom 22 9 8 5 T 13 14 87425 CASAVA_Build 14 64095798 2I AACCGAACTC --/TT TTTCCCTGGG 3070 hom 117 het 46 0 37 9 T 3 5 87426 CASAVA_Build 14 64099926 1I CAGTCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 33 0 17 16 A 13 14 87427 CASAVA_Build 14 64114190 15D CCATGATTAC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2204 het 1034 hom 12 4 7 5 T 25 10 87428 CASAVA_Build 14 64128435 3D GCCGCAAAAG AGA/--- AGAAGAGGAT 3070 het 3070 hom 46 18 20 11 AGA 3 2 87429 CASAVA_Build 14 64136860 2D TTATTTTTCC CT/-- GTTCGCGTAC 3070 het 3070 ref 48 30 14 5 CT 1 0 87430 CASAVA_Build 14 64138483 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2517 het 845 hom 24 5 8 12 T 15 14 87431 CASAVA_Build 14 64141432 1D TGAGAATGTT A/- AAAAAAAAAA 2367 het 1115 hom 31 4 10 17 A 17 16 87432 CASAVA_Build 14 64143725 1D TCATGGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 288 hom 27 1 19 7 T 13 12 87433 CASAVA_Build 14 64163619 3D AGAGGGCCAC AGG/--- AGGTTTTTTA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AGG 2 1 87434 CASAVA_Build 14 64190436 2I CTGTATATTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 9 het 59 1 45 13 TG 7 8 87435 CASAVA_Build 14 64190690 2I TGGGGCATGA --/AG AGAGGTTGAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AG 2 3 87436 CASAVA_Build 14 64191317 6I TAAGTAACAC ------/CAGCTT AGCTTCAGCT 3070 het 3070 hom 58 11 39 8 CAGCTT 0 1 87437 CASAVA_Build 14 64192825 2D ATCCCAACAC TT/-- TGGGAGGCCG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 3 1 87438 CASAVA_Build 14 64193289 2I CTGCTTGTAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 9 11 87439 CASAVA_Build 14 64193509 4I TTTAAGTAGG ----/CTGT CTGTTTTTTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 CTGT 1 2 87440 CASAVA_Build 14 64196298 1I CTTTTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 21 11 T 13 14 87441 CASAVA_Build 14 64197696 1D CGAAACAACT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 103 het 38 0 33 5 A 9 8 87442 CASAVA_Build 14 64197999 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 290 hom 15 1 12 2 A 10 9 87443 CASAVA_Build 14 64203899 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 189 hom 22 1 16 5 A 11 12 87444 CASAVA_Build 14 64258457 1I TCCCACACTG -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 6 7 87445 CASAVA_Build 14 64304966 1D TGGCCAGGGG C/- ACCAGTTGGC 3070 hom 72 het 25 0 21 4 C 1 0 87446 CASAVA_Build 14 64311347 5D AGGGTAAAGA AAAGT/----- AGAGAACCCT 3070 het 3070 hom 39 14 23 3 AAAGT 1 0 87447 CASAVA_Build 14 64313079 1I ATCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1815 het 768 hom 11 5 4 2 T 6 7 87448 CASAVA_Build 14 64317532 1I TTAGACATAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 7 8 87449 CASAVA_Build 14 64321823 1D TTCAGATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 12 11 87450 CASAVA_Build 14 64333344 1I AATAAAAGCC -/T TTTGGCTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 3 4 87451 CASAVA_Build 14 64339968 1D ATTTACAGCC T/- TCCCAGAATG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 2 1 87452 CASAVA_Build 14 64343344 2I TACTACTGAC --/TG TGTGAATCCT 3070 het 3049 hom 39 8 21 10 TG 2 3 87453 CASAVA_Build 14 64351494 10I TGTGTATGTG ----------/TGTGTGTGCA TGTGTGTGCA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 TGTGTGTGCA 1 2 87454 CASAVA_Build 14 64351736 18D AAATGGGAAG GGGCATCTCCCATGAAGC/------------------ GGGCATCTCC 3070 het 3070 hom 34 10 14 14 GGGCATCTCCCATGAAGC 2 1 87455 CASAVA_Build 14 64378802 2D AGAAAGAGCC AG/-- AGGGTAGCAG 3070 hom 57 het 27 0 20 7 AG 2 1 87456 CASAVA_Build 14 64392089 1I CAATGTAATT -/G CCTGAGAGAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 G 0 1 87457 CASAVA_Build 14 64393020 4I GGGCAAGTCA ----/TTTC TCTTCCTCAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTTC 0 1 87458 CASAVA_Build 14 64399304 4D37M1I CTCTGTCACA AAACAAACAAAAAGCTAAAACAAATAAACAACAATAACAAC-/----AAACAAAAAGCTAAAACAAATAAACAACAATAACAACA AAAAAAAAAC 3070 het 2497 hom 22 7 12 21 N/A 0 0 87459 CASAVA_Build 14 64404331 16D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2114 hom 19 9 11 1 A 27 11 87460 CASAVA_Build 14 64417371 1I TTCTAACGAT -/A CAAGGTCATT 3070 hom 96 het 39 0 31 8 A 0 1 87461 CASAVA_Build 14 64417999 1I CTGTTTTGTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 364 hom 35 1 32 2 A 8 9 87462 CASAVA_Build 14 64418231 2I AATTATATAC --/TA TATGCAAGCC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 TA 1 2 87463 CASAVA_Build 14 64419270 2I GCCAGAGAGT --/GG GGGGGGTAAA 3070 hom 117 het 44 0 38 6 G 6 8 87464 CASAVA_Build 14 64419828 1D CCTGCAGGAC T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 2 1 87465 CASAVA_Build 14 64421029 3D AAATCCCCGC CAA/--- CAACAATGGA 3070 hom 117 het 42 0 40 3 CAA 3 2 87466 CASAVA_Build 14 64425668 1I CAAAGGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 81 hom 35 1 32 2 A 10 11 87467 CASAVA_Build 14 64426299 1D CAGTCTCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 9 8 87468 CASAVA_Build 14 64426782 4D AGCTTTTTTT TTTC/---- TTTTCTTTTC 457 het 309 hom 31 2 6 23 TTTC 1 0 87469 CASAVA_Build 14 64427251 2I ATAGTGAATA --/AC AGTTTTGAAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AC 0 1 87470 CASAVA_Build 14 64438574 5D TCTTGACTTG CTTGA/----- CTTATTTTGC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 CTTGA 1 0 87471 CASAVA_Build 14 64442278 1D GTAATCAATC A/- AAAAACACTT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 6 5 87472 CASAVA_Build 14 64504057 1D ACCTAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 13 12 87473 CASAVA_Build 14 64516529 2D TAAAAAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3004 het 2253 hom 23 10 8 5 T 14 12 87474 CASAVA_Build 14 64521802 3I GGAATGTCTG ---/TTA TTATCATACC 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 TTA 1 2 87475 CASAVA_Build 14 64523247 1D TCTGCCCAAT G/- GGGGGCGGCA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 G 6 5 87476 CASAVA_Build 14 64534925 1D GATCAGTAAC A/- AGTGTGACCA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 2 1 87477 CASAVA_Build 14 64555980 1I AAACAAAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 8 9 87478 CASAVA_Build 14 64558756 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 2338 het 2338 ref 30 7 13 10 T 13 14 87479 CASAVA_Build 14 64560800 1I GGTGTTGGGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 7 8 87480 CASAVA_Build 14 64569382 1I TGGCAAAGAT -/A AAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 A 6 7 87481 CASAVA_Build 14 64583324 3I GTGATGTTTG ---/CTT CTTCTGTTTG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 CTT 1 2 87482 CASAVA_Build 14 64584797 1D CTGTGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 1008 het 1008 ref 33 21 4 8 A 13 12 87483 CASAVA_Build 14 64600629 2D TTGGTATTAT TG/-- AGCATTCTTC 3070 het 3070 hom 53 18 27 9 TG 1 0 87484 CASAVA_Build 14 64645008 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 13 0 9 4 A 11 12 87485 CASAVA_Build 14 64648822 1D CAATAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 26 1 19 6 T 13 12 87486 CASAVA_Build 14 64654236 1D AACTAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 20 2 11 9 A 15 14 87487 CASAVA_Build 14 64681589 1I CACTTGTACA -/T TTTTTTTTTT 2976 het 2976 ref 30 11 9 10 T 13 14 87488 CASAVA_Build 14 64687266 9I CTTTTTCCTC ---------/TTCCCAGTT TTCCCAGTTT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 TTCCCAGTT 1 2 87489 CASAVA_Build 14 64688503 1D GCACTGCTTT A/- AAATATCTCT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 A 4 3 87490 CASAVA_Build 14 64691017 1D CTATTCTTAC A/- AAAAAAAAAA 2715 het 2715 ref 25 11 7 9 A 13 12 87491 CASAVA_Build 14 64703770 1D CACCCCTTTC T/- GTGGCAATGA 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 T 1 0 87492 CASAVA_Build 14 64741144 2I CAGCTGGGTG --/GA GAGGAGGAGT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 GA 1 2 87493 CASAVA_Build 14 64805565 1I AAATGCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1822 hom 33 7 13 13 T 13 14 87494 CASAVA_Build 14 64806858 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCCCCCC 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 CT 2 1 87495 CASAVA_Build 14 64881172 15D CAAGCCTGTT CCTGGAAGTTCTTTC/--------------- CCTGGAAGTT 3070 hom 69 het 24 0 22 4 CCTGGAAGTTCTTTC 2 1 87496 CASAVA_Build 14 64899737 7D4M16D3M14D5M5D27M1I GGATTACAGG TGCCCGCCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCCTGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACT-/-------CACC----------------TGT--------------TGGTG-----CCCTGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC CTGACCTCAG 3070 hom 20 het 10 0 8 5 N/A 0 0 87497 CASAVA_Build 14 64900675 1I TCCAAAACCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 9 10 87498 CASAVA_Build 14 64902061 1I CCAGCTAAAA -/C CCACCAAAAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 2 3 87499 CASAVA_Build 14 64921367 1I GGTTAGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1890 hom 25 6 10 9 T 13 14 87500 CASAVA_Build 14 64921838 1D GAAGTCACAG T/- AAACCAATTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 0 87501 CASAVA_Build 14 64926793 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 872 het 872 ref 13 5 3 5 A 17 16 87502 CASAVA_Build 14 64947965 3D CCTGGTACAT AAG/--- AAGGTCTCAA 3070 het 3070 ref 42 24 17 3 AAG 2 1 87503 CASAVA_Build 14 64953784 1D TCTCCTGGCA T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 7 6 87504 CASAVA_Build 14 64966498 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1646 hom 20 5 10 5 T 11 10 87505 CASAVA_Build 14 64968133 1D GTAGGTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 32 2 20 10 T 15 14 87506 CASAVA_Build 14 65014331 1D TTGTGATGTC T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 27 18 3 7 T 13 12 87507 CASAVA_Build 14 65038367 6D GACGGGTCTA CTTTGT/------ CTTTTCTTTT 1905 het 1905 ref 23 12 8 4 CTTTGT 1 0 87508 CASAVA_Build 14 65044578 1D TTGCTCTGTT G/- GCCAGGCTGG 830 het 830 ref 17 7 2 8 G 2 1 87509 CASAVA_Build 14 65050127 5I AAAACAAAAC -----/AAAAT AAAAAATCGA 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 AAAAT 0 1 87510 CASAVA_Build 14 65050691 2I CGGTTGGGCA --/GT GTTTCTCTAG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 GT 1 2 87511 CASAVA_Build 14 65052667 1I AAAGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 10 11 87512 CASAVA_Build 14 65054439 1D TTTGTGGTGA T/- TTTTAAAGGC 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 T 5 4 87513 CASAVA_Build 14 65056713 4D ATTAAATGGC AAAG/---- AACGGAAGTT 3070 het 3070 hom 23 7 15 3 AAAG 1 0 87514 CASAVA_Build 14 65058340 1D AATCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2852 hom 40 11 18 11 T 15 14 87515 CASAVA_Build 14 65073500 1D AGTTCTATGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 8 7 87516 CASAVA_Build 14 65090905 2I ATATATATAT --/TA TATATATATA 3070 het 2070 hom 16 5 9 2 TA 6 7 87517 CASAVA_Build 14 65099177 2I TGGTATAGAG --/AA AAAGAGCTGA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 3 5 87518 CASAVA_Build 14 65106877 1I TATTTGCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 T 11 12 87519 CASAVA_Build 14 65121514 2I TAATTTATTT --/AC AAACAGATCT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 AC 0 1 87520 CASAVA_Build 14 65125181 2D TGAAAATAAG AT/-- ATTTTGAGAG 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 AT 2 1 87521 CASAVA_Build 14 65130049 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 269 het 269 ref 16 3 2 11 TTTC 1 0 87522 CASAVA_Build 14 65133673 1D GACTCTTACT A/- AAGTCTGTCT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 3 2 87523 CASAVA_Build 14 65168113 1D GAAAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 T 11 10 87524 CASAVA_Build 14 65172794 1I GTATTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 G 0 1 87525 CASAVA_Build 14 65183081 1I TAAGTCAGCC -/A ATACCCTAGG 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 1 2 87526 CASAVA_Build 14 65183140 1D TTCCAATGAC T/- TTTTTTTTTT 943 het 943 ref 33 21 3 9 T 12 11 87527 CASAVA_Build 14 65191063 1D TTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 12 11 87528 CASAVA_Build 14 65192479 1D GTACCATAAT G/- GGGGAGAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 13 9 G 5 4 87529 CASAVA_Build 14 65201443 1I TTTAGAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 A 10 11 87530 CASAVA_Build 14 65224329 1I CTCAACCACC -/T GAGTAGCTGG 2708 het 1980 hom 14 5 7 2 T 0 1 87531 CASAVA_Build 14 65230508 4D TTGTTGTGGC CTGT/---- CTTTTATTTC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 CTGT 1 0 87532 CASAVA_Build 14 65240812 1I GGAATTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 59 22 21 16 T 11 12 87533 CASAVA_Build 14 65241633 16D TAGAGCAGTG ATAGAATTCATATGAC/---------------- ATAGAATTCA 3070 het 3070 ref 34 15 16 15 ATAGAATTCATATGAC 2 1 87534 CASAVA_Build 14 65257716 1I CCAATAGATT -/A AAAAAAAAAA 2325 het 2325 ref 31 15 8 8 A 12 13 87535 CASAVA_Build 14 65258117 1D TTTAACTTCC T/- TTGTAAAGTG 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 3 2 87536 CASAVA_Build 14 65259796 1D ACCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2102 het 2102 ref 22 13 6 3 A 13 12 87537 CASAVA_Build 14 65265158 1D ATGTTTAGAT A/- ACACAAATAG 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 A 2 1 87538 CASAVA_Build 14 65265998 7D GGATATAAAC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 2339 hom 39 14 19 6 T 19 12 87539 CASAVA_Build 14 65271691 1D TGCTTTACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 13 21 9 T 10 9 87540 CASAVA_Build 14 65276800 1D TAAAAATATT G/- GGGCAAATGT 3070 het 3070 hom 36 16 20 0 G 4 3 87541 CASAVA_Build 14 65295210 2D TGAGAAACTC AT/-- ATGACTCAAT 3070 het 3070 ref 44 24 19 1 AT 2 1 87542 CASAVA_Build 14 65302712 1I TTATTGTGTT -/A TGCCACTAAG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 0 1 87543 CASAVA_Build 14 65307135 1I AGGACCGAGG -/C TTTTAACCAG 3070 hom 131 het 52 0 40 12 C 0 1 87544 CASAVA_Build 14 65307340 1I AAGTGCTGCC -/A AGCCTCCTTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 1 2 87545 CASAVA_Build 14 65335415 1D AGGAGACAGA G/- GGTGGCTGGG 3070 het 3070 ref 42 18 13 11 G 3 2 87546 CASAVA_Build 14 65340998 4D CCCATAGGTG GCTC/---- GCTCGGCTCC 2382 het 2382 ref 27 16 7 7 GCTC 2 1 87547 CASAVA_Build 14 65354120 2D CACACACCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 83 44 23 18 AC 7 6 87548 CASAVA_Build 14 65354374 2I CCATACACAC --/CA CACACACACC 3070 het 3070 ref 68 29 22 17 CA 4 5 87549 CASAVA_Build 14 65368868 1D CAATAATTTA T/- TTTAAAAATA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 4 3 87550 CASAVA_Build 14 65369323 1I TAGGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 767 het 767 ref 28 18 3 7 T 13 14 87551 CASAVA_Build 14 65400763 3I GAGTTAACAT ---/GTA GTGAGTGTCT 3070 hom 144 het 56 0 49 7 GTA 0 1 87552 CASAVA_Build 14 65406482 1D TTAGACTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 42 1 28 13 T 11 10 87553 CASAVA_Build 14 65414492 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 116 het 52 0 43 9 T 10 9 87554 CASAVA_Build 14 65472476 3I GGTATATTTC ---/TTA TTTTATATAT 1452 het 1352 hom 7 4 3 0 TTA 0 1 87555 CASAVA_Build 14 65477348 1I AAAAGAAAAT -/A AAAACCAAAA 3070 het 2765 hom 25 7 13 5 A 4 5 87556 CASAVA_Build 14 65488685 1D TCCTTGGTCC A/- GGCTTCCTTT 3070 hom 56 het 26 0 17 9 A 1 0 87557 CASAVA_Build 14 65501485 1I GCTTCTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 T 11 12 87558 CASAVA_Build 14 65521213 1D GTAAGATAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2370 hom 31 7 14 10 T 10 9 87559 CASAVA_Build 14 65532976 1D GGTCTTAGAC T/- TTCCAGCCTT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 3 2 87560 CASAVA_Build 14 65533287 1D CATAGTTTTT C/- CTGTCTCTTC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 C 2 1 87561 CASAVA_Build 14 65552205 3I GGTCTTGTGG ---/AGC AGATGAGGCT 3070 het 3070 ref 55 31 18 6 AGC 0 1 87562 CASAVA_Build 14 65557030 1I ACCCACTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 10 11 87563 CASAVA_Build 14 65687619 1D TCTAGTATCC A/- AGAATGTATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 1 87564 CASAVA_Build 14 65723683 1D CTGTTGATTT G/- GGGTGGAGAG 2437 het 2437 ref 22 14 7 1 G 4 3 87565 CASAVA_Build 14 65891744 1I CAGAAACCCT -/A AAAAAAAAAG 1854 het 1854 ref 28 16 7 5 A 9 10 87566 CASAVA_Build 14 66023195 3I GAAGCAGGAA ---/CTG CTGCTAGAGA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 CTG 1 2 87567 CASAVA_Build 14 66167385 1I TTAATGTGTT -/A TTTTTTTTCT 3070 het 2301 hom 29 10 13 6 A 0 1 87568 CASAVA_Build 14 66191824 1D ACCTATTTCA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 8 7 87569 CASAVA_Build 14 66192786 1D TTGGGTGAGT A/- TTTGGTAGCC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 1 0 87570 CASAVA_Build 14 66313355 1D AATATCAGTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 7 87571 CASAVA_Build 14 66370136 1I TGCCCTGGTT -/A AAAAAAAAAA 2085 het 2085 ref 36 18 6 12 A 15 16 87572 CASAVA_Build 14 66391317 1D TATTTTAGCC T/- TTTTTTTTTT 1675 het 1675 ref 33 18 6 9 T 15 14 87573 CASAVA_Build 14 66423469 1I TGGAACAAGT -/C CTTCGGAACA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 1 2 87574 CASAVA_Build 14 66458742 1D AGAGTGTATG T/- TTTTTTTTTT 2481 het 2481 ref 42 28 6 8 T 14 13 87575 CASAVA_Build 14 66480161 1I ATCCAAGCAC -/T TATCTTCCTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 1 2 87576 CASAVA_Build 14 66490506 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2807 het 714 hom 21 4 7 10 A 17 16 87577 CASAVA_Build 14 66528091 1D CCAATATAGC A/- AAAAAAAAAA 1236 het 1236 ref 36 23 5 8 A 15 14 87578 CASAVA_Build 14 66535348 1D GTCCCTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3023 het 621 hom 12 2 7 3 A 12 11 87579 CASAVA_Build 14 66566459 1D TTGGTAGCTC T/- TTTTTTTTTT 1931 het 1931 ref 36 17 7 12 T 17 16 87580 CASAVA_Build 14 66599084 2I GAATTTCAGA --/GT GTATAGTACA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 GT 1 2 87581 CASAVA_Build 14 66641758 1D TGTGCAAGTG A/- AAAAAAAATG 1382 het 1382 ref 34 27 3 4 A 9 8 87582 CASAVA_Build 14 66768440 1D CTGTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1786 het 1786 ref 29 17 6 6 A 17 16 87583 CASAVA_Build 14 66879680 1D TTCATAACAC T/- TTTTTTTTTT 518 het 518 ref 47 35 3 9 T 11 10 87584 CASAVA_Build 14 66883973 1I AAGTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 34 2 17 15 T 14 15 87585 CASAVA_Build 14 66889321 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 11 10 87586 CASAVA_Build 14 66964396 1I GACAATGCCC -/T TTTTTTTTTT 2892 het 2892 ref 27 11 10 6 T 14 15 87587 CASAVA_Build 14 66971495 4I GGAGTGCAAT ----/AGTG AGTGCCATTT 3070 hom 45 het 18 0 14 4 AGTG 1 2 87588 CASAVA_Build 14 66988796 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2535 het 548 hom 23 3 11 9 A 17 16 87589 CASAVA_Build 14 67005818 1D GCAATCATAG C/- TCACTGCAAC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 C 1 0 87590 CASAVA_Build 14 67010736 2I AAAACAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 1716 het 1716 ref 23 8 7 8 A 10 12 87591 CASAVA_Build 14 67011048 1D GTGCATGCCA T/- TTTTTAACCA 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 T 6 5 87592 CASAVA_Build 14 67015371 1D TGTTTAAGAT A/- GTGGTAAGAG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 1 0 87593 CASAVA_Build 14 67036315 1D ACAAAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 11 10 87594 CASAVA_Build 14 67040153 1I CTCAGCTTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2346 hom 22 7 11 4 T 7 8 87595 CASAVA_Build 14 67041366 12D CAAACAAAAC AAAACAAAAACA/------------ AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 7 AAAACA 4 2 87596 CASAVA_Build 14 67045795 1D CAACTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 11 10 87597 CASAVA_Build 14 67046500 1I TTTTTATTAA -/G AAAAAAAAAG 2474 het 2474 ref 20 10 8 2 G 0 1 87598 CASAVA_Build 14 67047825 1D TTAAAAAAAC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 A 7 6 87599 CASAVA_Build 14 67052306 1I GCACTGTGGA -/C CCTGCGGTCA 3070 hom 69 het 24 0 22 2 C 2 3 87600 CASAVA_Build 14 67052868 1D CTAGCTGGAG A/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 1 0 87601 CASAVA_Build 14 67053100 1I GTCTTCCCCT -/A AATTGTCTGA 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 A 2 3 87602 CASAVA_Build 14 67056185 1D TGTAAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2613 het 451 hom 31 6 8 17 T 15 14 87603 CASAVA_Build 14 67056696 14D TAGGGTTCAC TCTTGGTGTTCTTT/-------------- TTATGAGTTT 3070 het 3070 ref 31 23 12 8 TCTTGGTGTTCTTT 1 0 87604 CASAVA_Build 14 67060409 21I AGGGAAGAAT ---------------------/AGTGACACAAAGAGCATTTCC AGTGACACAA 3070 hom 8 het 35 2 31 4 AGTGACACAAAGAGCATTTCC 0 1 87605 CASAVA_Build 14 67067609 1D AAGGGGCTCT A/- GGGGTGATGG 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 A 1 0 87606 CASAVA_Build 14 67068215 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1045 het 507 hom 16 8 3 5 T 17 16 87607 CASAVA_Build 14 67102765 1D AAGCACTGGT C/- CCCCTGGGCT 3070 hom 102 het 40 0 33 7 C 5 4 87608 CASAVA_Build 14 67109088 4I TTGAACTCTT ----/AGAG GGCACCAGGC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 AG 0 2 87609 CASAVA_Build 14 67115594 4I CCCCTCTTCC ----/TTCT GTCTTTTTAG 3070 hom 107 het 40 0 35 5 TTCT 0 1 87610 CASAVA_Build 14 67129961 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 12 8 A 13 12 87611 CASAVA_Build 14 67132233 1I AGGACGCTAA -/G GGGTGGAAGT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 G 3 4 87612 CASAVA_Build 14 67134244 6I AAAAAAAAAG ------/AAAAAT ACATTAAAGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAAAAT 0 1 87613 CASAVA_Build 14 67135421 1I CTCAAGTGAT -/C CCGCCCGCCT 3070 hom 62 het 26 0 17 9 C 2 3 87614 CASAVA_Build 14 67141003 7D TGACTCTACC AAACAAA/------- AAACAAAAAA 3070 hom 62 het 28 0 21 7 AAACAAA 3 2 87615 CASAVA_Build 14 67141193 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAACTTT 617 het 617 ref 26 10 2 14 A 8 6 87616 CASAVA_Build 14 67144545 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1687 het 1687 ref 20 11 5 4 A 11 10 87617 CASAVA_Build 14 67146374 5D TGCACAAGGC TCCTG/----- TCCTGGAAAC 3070 het 3070 ref 28 11 10 9 TCCTG 2 1 87618 CASAVA_Build 14 67149411 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2728 hom 24 9 10 5 A 12 11 87619 CASAVA_Build 14 67151316 1D GTCCTTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 12 11 87620 CASAVA_Build 14 67152951 1I CTGTAATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 13 14 87621 CASAVA_Build 14 67155010 1I CATCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 1448 het 1448 ref 19 10 5 4 T 13 14 87622 CASAVA_Build 14 67173881 12D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3005 het 1973 hom 14 7 7 7 A 23 11 87623 CASAVA_Build 14 67174840 1D CAAATAATCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 35 0 23 12 A 10 9 87624 CASAVA_Build 14 67181561 1I AGGTCTTTAA -/T TGGTTTACCC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 1 2 87625 CASAVA_Build 14 67188174 1D ACCAAAGCAT A/- AAAATGGATT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 5 4 87626 CASAVA_Build 14 67188927 3D GGCTCTATAC AGG/--- AGGTCATCAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 AGG 2 1 87627 CASAVA_Build 14 67194244 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCGCTC 1390 hom 23 het 10 0 6 4 AG 1 2 87628 CASAVA_Build 14 67196613 4D GTATATGAAC TGAA/---- TGAATGAATG 3070 het 3070 hom 52 18 23 12 TGAA 3 2 87629 CASAVA_Build 14 67198191 1I TGGTAGAGAT -/G GGGGGGTCTC 3070 het 2358 hom 28 7 11 10 G 6 7 87630 CASAVA_Build 14 67205741 1D TTCTTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1921 hom 36 8 10 18 T 17 16 87631 CASAVA_Build 14 67207038 1D GTTTGTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 11 10 87632 CASAVA_Build 14 67215309 1I CTGGAGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 A 12 13 87633 CASAVA_Build 14 67223937 3D CTCCATATTC CTT/--- TTTTTTTTTT 2254 het 510 hom 30 7 11 12 CTT 1 0 87634 CASAVA_Build 14 67229988 1D AATAAACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 10 9 87635 CASAVA_Build 14 67234509 7D GATATTCACA GGACTGG/------- GGCTAATCAA 3070 het 3070 ref 63 29 28 12 GGACTGG 1 0 87636 CASAVA_Build 14 67239461 1I CTTAAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2948 hom 26 9 13 4 T 10 11 87637 CASAVA_Build 14 67260580 1I CATGCATATG -/T TTTTGAATGT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 4 5 87638 CASAVA_Build 14 67260863 3D CTGGATAGAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 44 1 29 15 T 17 14 87639 CASAVA_Build 14 67268900 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2953 het 481 hom 22 2 10 10 A 16 15 87640 CASAVA_Build 14 67276834 3D AATGTTTTAG ATT/--- ATTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 22 10 9 4 ATT 2 1 87641 CASAVA_Build 14 67282771 1I CAACTGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 31 0 24 7 A 10 11 87642 CASAVA_Build 14 67282917 1I TTCCCCACTC -/A CCTTTTCTTT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 0 1 87643 CASAVA_Build 14 67288091 1D CGCCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 3 2 87644 CASAVA_Build 14 67290253 3I AGGAAAGGGA ---/ATC ATCATGCTTA 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 ATC 1 2 87645 CASAVA_Build 14 67298242 4D ATAAAAAAAC AAAT/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AAAT 1 0 87646 CASAVA_Build 14 67307430 1D TCCTAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 41 0 33 8 T 13 12 87647 CASAVA_Build 14 67332691 1I GAAGAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 10 12 T 14 15 87648 CASAVA_Build 14 67343166 1D AACAAGACGG T/- TATCAGGAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 2 1 87649 CASAVA_Build 14 67357924 4D TTTATAGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 47 16 18 14 TTTG 3 2 87650 CASAVA_Build 14 67364570 3D ATTTACACTC CCA/--- CCAACAGTGT 2914 het 2914 ref 32 16 7 9 CCA 2 1 87651 CASAVA_Build 14 67366045 1I AATTGTGAAT -/G GGAGTTCATT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 G 2 3 87652 CASAVA_Build 14 67366881 1D ATAATTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 9 8 87653 CASAVA_Build 14 67367361 1I ACTTGTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 12 13 14 T 13 14 87654 CASAVA_Build 14 67368932 1D TTTCTTTAAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 T 9 8 87655 CASAVA_Build 14 67371521 1I ATAGAGGTTG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 8 9 87656 CASAVA_Build 14 67372017 2I31M2D ATGTACACAC --GTCACATATATGTAATATATACACATATGTCAT/ATGTCACATATATGTAATATATACACATATGTC-- ATATGTAATA 3070 het 3070 hom 28 17 17 4 N/A 0 0 87657 CASAVA_Build 14 67373461 1I TAACTGTGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 8 9 87658 CASAVA_Build 14 67374105 2I ATCCTCAAAC --/AA AGAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 1 3 87659 CASAVA_Build 14 67377277 1D ATTTTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 2459 het 2459 ref 28 11 8 9 T 15 14 87660 CASAVA_Build 14 67378157 1D CCTTTCCCCA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 41 18 15 10 T 7 6 87661 CASAVA_Build 14 67379720 4I43M1D GTGCTGCACC ----AACTGGTCATTTTGCATTAGGTATATCTCCTAATGCTGTCCCTC/CATTAACTGGTCATTTTGCATTAGGTATATCTCCTAATGCTGTCCCT- CCCCCCTCCC 3070 het 1515 hom 16 4 14 5 N/A 0 0 87662 CASAVA_Build 14 67380206 1I TATTTGGATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 661 hom 32 2 26 4 T 9 10 87663 CASAVA_Build 14 67384357 1D GGTGTTGAAG C/- CCCCCCCCAT 3070 het 2848 hom 37 11 16 10 C 9 8 87664 CASAVA_Build 14 67389259 1D GTGTATAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 10 9 87665 CASAVA_Build 14 67391868 1D GCTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2149 het 386 hom 13 2 6 5 T 13 12 87666 CASAVA_Build 14 67393314 1D CACTACTGAC T/- TTTTTTTTTT 2114 het 2114 ref 34 14 8 12 T 13 12 87667 CASAVA_Build 14 67410893 1I TTTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 2435 het 2435 ref 28 20 6 2 T 11 12 87668 CASAVA_Build 14 67412662 3D TATATATTGA ATG/--- ATGAATGAAC 3070 hom 81 het 35 0 28 9 ATG 2 1 87669 CASAVA_Build 14 67426090 1I CTAGAAAACC -/T TCGTCTTTTG 3070 het 2895 hom 20 9 10 1 T 1 2 87670 CASAVA_Build 14 67454289 2D AGTTCAGTAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 TA 7 6 87671 CASAVA_Build 14 67459018 1D ATGTACTTAA T/- TTTTTTTTTT 1143 het 1143 ref 30 16 3 11 T 15 14 87672 CASAVA_Build 14 67474275 1D AATACAATGG T/- AATAGTGAGG 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 1 0 87673 CASAVA_Build 14 67477253 1I TATCAGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 A 10 11 87674 CASAVA_Build 14 67492038 1I TTACATGCCT -/A AATGTGTAAA 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 A 2 3 87675 CASAVA_Build 14 67501868 1I ATTTCAGTTC -/T TTGGAGAGCT 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 T 2 3 87676 CASAVA_Build 14 67512571 1D TTTCGCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2250 hom 28 8 13 8 T 13 12 87677 CASAVA_Build 14 67514860 21D TGTCACCTCA GTTAATCCCTCCAGCCTCTGC/--------------------- GTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 35 20 18 3 GTTAATCCCTCCAGCCTCTGC 1 0 87678 CASAVA_Build 14 67522482 2D TACCTTGATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 TG 10 9 87679 CASAVA_Build 14 67529226 1I AGGAAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 10 11 87680 CASAVA_Build 14 67548903 2I CAAAGAATTT --/TA TATATATATA 1436 het 1436 ref 22 11 4 7 TA 6 7 87681 CASAVA_Build 14 67550670 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2321 hom 38 14 14 11 T 15 14 87682 CASAVA_Build 14 67560289 1D TGATAGTTTC T/- TTTGCTGTGT 3070 het 3070 hom 40 18 17 7 T 4 3 87683 CASAVA_Build 14 67568504 7D ACAATCAGGC TTTGTGT/------- CTGATTTGAC 3070 het 3070 hom 56 23 28 11 TTTGTGT 1 0 87684 CASAVA_Build 14 67569368 2I TTCATTCAGA --/TC TCTCTTATTT 3070 het 3070 hom 46 22 23 1 TC 2 3 87685 CASAVA_Build 14 67570023 5D TTCAACTAGA AGTTG/----- AGTTGAGATA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AGTTG 2 1 87686 CASAVA_Build 14 67589099 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2984 hom 29 9 13 9 T 11 10 87687 CASAVA_Build 14 67602503 4D TGTATATAAA TATT/---- TATCTGCAAA 2831 het 2831 ref 19 11 8 1 TATT 1 0 87688 CASAVA_Build 14 67604777 2I TGGCAACCAC --/AA ATCCATTTTC 3070 het 3070 ref 32 20 12 0 A 1 3 87689 CASAVA_Build 14 67605472 3D GTGTTCTTGT TGC/--- TTTTAGGAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 TGC 1 0 87690 CASAVA_Build 14 67619125 1D ACATAAAATG C/- TGCTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 C 1 0 87691 CASAVA_Build 14 67631767 1D AAAGAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 1178 het 1178 ref 44 32 4 9 A 11 10 87692 CASAVA_Build 14 67637915 1D TAGATACAGT G/- GGGGTACAGG 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 G 5 4 87693 CASAVA_Build 14 67653342 3I GTTTTAAGTA ---/AAT AATATTAAGG 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 AAT 1 2 87694 CASAVA_Build 14 67674615 1D CCATTTAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 11 16 3 T 10 9 87695 CASAVA_Build 14 67682523 2I CCAGGACTGT --/TC TGTTAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 TC 0 1 87696 CASAVA_Build 14 67686419 1I AGTTGAAGAC -/T TTTTTTTTTT 1263 het 1263 ref 38 26 3 9 T 13 14 87697 CASAVA_Build 14 67696568 1I TGACAGACTT -/G CATGGTTAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 G 0 1 87698 CASAVA_Build 14 67710850 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 A 10 11 87699 CASAVA_Build 14 67719839 8I AGAAAGATGA --------/AGGCCTAT AGACTCAGCA 3070 het 3070 hom 44 21 17 6 AGGCCTAT 0 1 87700 CASAVA_Build 14 67726666 1I AGTTTAGTAG -/T TTTCCTTGAA 3070 het 3070 hom 52 17 27 8 T 3 4 87701 CASAVA_Build 14 67727504 1D TACTACAAGC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 T 8 7 87702 CASAVA_Build 14 67731885 1D TCCTAACTGC T/- CTCCCAGTTT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 1 0 87703 CASAVA_Build 14 67744590 1D TATAATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 110 het 42 0 36 6 A 11 10 87704 CASAVA_Build 14 67759005 1I GGAAAAGGTT -/G GGGGTGGCGA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 G 4 5 87705 CASAVA_Build 14 67760175 2D GAAAGAAAAG AA/-- AATCCTACCT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 4 2 87706 CASAVA_Build 14 67768556 1I TCGTAGAGAT -/A AAATAGTTGG 3070 het 3070 hom 48 17 28 3 A 3 4 87707 CASAVA_Build 14 67823534 1I ATGACATTGA -/T TTCCCAGCCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 3 87708 CASAVA_Build 14 67830769 1D TTTTTCTAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 20 13 10 T 10 9 87709 CASAVA_Build 14 67834661 1I TATTATGTGA -/G GTAGGGGAGG 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 G 1 2 87710 CASAVA_Build 14 67843050 1D TATCTTTTGA C/- CAATTTGCAT 3070 het 3070 hom 58 25 28 5 C 2 1 87711 CASAVA_Build 14 67850401 1I AGGAAGGAGC -/A TAAAGACCCC 3070 het 3070 ref 45 22 13 10 A 0 1 87712 CASAVA_Build 14 67852928 1I CCATGGCAGG -/C CCAGGGAGAG 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 C 2 3 87713 CASAVA_Build 14 67853775 10I TTCACTTTGA ----------/ACATCTCATC ACATATTTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACATCTCATC 0 1 87714 CASAVA_Build 14 67862044 1D CACATTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 14 13 87715 CASAVA_Build 14 67863849 1D3M1D GTTTTTTTTT GTTGT/-TTG- TTTTTTTTTT 3070 het 553 hom 35 6 15 16 N/A 0 0 87716 CASAVA_Build 14 67864198 1D AGGTATTATT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 8 7 87717 CASAVA_Build 14 67869223 6I AGAGAGAGAA ------/ATAAAG ATAAATATCT 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 ATAAAG 0 1 87718 CASAVA_Build 14 67869746 2D GGATATAAAC TG/-- GTGATTTTTA 3070 het 3070 hom 30 14 16 1 TG 1 0 87719 CASAVA_Build 14 67873732 2I AGCTAAATAA --/TT TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 5 7 87720 CASAVA_Build 14 67879201 1I AAGGACACTT -/A GGGGAGCAGA 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 A 0 1 87721 CASAVA_Build 14 67879593 4D TCGCTCCAAA TACT/---- TACCAGTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 15 6 TACT 1 0 87722 CASAVA_Build 14 67891953 1I3M2I CTATTCCTGA -TAT--/TTATTA TAATAAACTC 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 N/A 0 0 87723 CASAVA_Build 14 67893018 1D CTTAATTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 11 10 87724 CASAVA_Build 14 67899518 1D AGGCGGAGCC T/- TTGTGCACTG 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 3 2 87725 CASAVA_Build 14 67930971 7D CACCAACTCA TTTTTGT/------- TTTTCTCAGC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TTTTTGT 1 0 87726 CASAVA_Build 14 67941914 1D CCCTTTCTCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 A 9 8 87727 CASAVA_Build 14 67950407 1D TTTTTTAGGG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 T 8 7 87728 CASAVA_Build 14 67975977 1I CTTGACAGAT -/A ACAGGTCTAC 3070 hom 141 het 56 0 47 9 A 1 2 87729 CASAVA_Build 14 67980911 14D AATTGTGAAT TGTGTGTGTGTGTG/-------------- TGTGTGTGTG 3070 het 1251 hom 37 6 19 17 TG 15 8 87730 CASAVA_Build 14 67983960 1D CAGTAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 32 0 25 7 A 11 10 87731 CASAVA_Build 14 67990897 1D TTTATTTGAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 8 7 87732 CASAVA_Build 14 68008164 1I CTCCTTTTGC -/A AAAAAAAAAA 2434 het 178 hom 14 1 12 1 A 14 15 87733 CASAVA_Build 14 68010709 2I CACGTTTCCA --/TT TTTACTATAT 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 T 3 5 87734 CASAVA_Build 14 68012516 2D TATAAGGCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 13 13 A 16 14 87735 CASAVA_Build 14 68017753 1D GTCTGCCACG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 12 12 A 10 9 87736 CASAVA_Build 14 68018576 19D TTTGTATCAT TAATTACTTTTACTGAAAG/------------------- TAATTACTTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 15 TAATTACTTTTACTGAAAG 2 1 87737 CASAVA_Build 14 68024670 6D AGGGTTTGTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 2804 hom 42 21 12 11 T 22 16 87738 CASAVA_Build 14 68034468 1I TTTATTTGAA -/T ACCTATTTTC 3070 hom 147 het 53 0 49 4 T 0 1 87739 CASAVA_Build 14 68039871 2I GAGGAGAAAC --/AG AGCTGAGGAG 3070 hom 56 het 22 0 18 4 AG 1 2 87740 CASAVA_Build 14 68039965 5D CACCACTCAC TAGAT/----- TTCTATCTTT 3070 het 3070 hom 44 17 22 8 TAGAT 1 0 87741 CASAVA_Build 14 68053676 5D GTCATCACAC AAAGA/----- AAAGAAAGGG 3070 het 2142 hom 37 11 20 7 AAAGA 2 1 87742 CASAVA_Build 14 68065133 74D GTTCAGAACT AATTATTTACCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAG/-------------------------------------------------------------------------- AATTATTTAC 3070 hom 45 het 19 0 16 5 AATTATTTACCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAG 1 0 87743 CASAVA_Build 14 68094420 9D AGTATCTTGA GGGGGCTGG/--------- GGGAGAATTC 3070 het 3070 hom 40 14 26 1 GGGGGCTGG 1 0 87744 CASAVA_Build 14 68103776 1I TCTCAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 14 10 A 11 12 87745 CASAVA_Build 14 68108272 4D ATGGCTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 108 het 49 0 37 12 TTTG 5 4 87746 CASAVA_Build 14 68129374 4I ATGGTCTGAG ----/ATCT ATCAGGAAGG 936 het 936 ref 40 25 3 12 ATCT 0 1 87747 CASAVA_Build 14 68134274 1I AATACAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 33 3 23 7 A 14 15 87748 CASAVA_Build 14 68137463 4I ACAAACTGAG ----/TGAC TGCATGCTTT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 TGAC 0 1 87749 CASAVA_Build 14 68144123 3D ATTCCATTTA TCT/--- TCTTCTTCCC 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 TCT 3 2 87750 CASAVA_Build 14 68148355 1D CAGTGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 T 11 10 87751 CASAVA_Build 14 68155789 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 2203 het 1846 hom 12 5 5 2 A 7 8 87752 CASAVA_Build 14 68155932 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2988 het 1805 hom 19 6 8 5 A 11 12 87753 CASAVA_Build 14 68158267 1I AATAAAACAA -/T GCTGTCAGCA 3070 hom 79 het 29 0 23 6 T 0 1 87754 CASAVA_Build 14 68164394 4I TATTTTTTTT ----/AAAA TAAATAAACA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 0 4 87755 CASAVA_Build 14 68166650 3I GGACTGTGCT ---/CAC CACAAGCTTA 3070 hom 165 het 60 0 54 6 CAC 1 2 87756 CASAVA_Build 14 68167191 1D GGGCACATCC T/- TTTTTTCGTA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 7 6 87757 CASAVA_Build 14 68175896 1D GCCAGAACTC A/- AGTCACCTGG 3070 hom 71 het 27 0 23 4 A 2 1 87758 CASAVA_Build 14 68182393 1I CTAGATAAAA -/T TACAGGATGT 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 T 1 2 87759 CASAVA_Build 14 68182535 1I GCTAGGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 T 11 12 87760 CASAVA_Build 14 68189844 13D ACCCTGTCTT TCAAAAAAACAAA/------------- GCCAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 18 22 2 TCAAAAAAACAAA 1 0 87761 CASAVA_Build 14 68192906 2D ATGGGGTAAC TG/-- AGGACTGAGG 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 TG 1 0 87762 CASAVA_Build 14 68209881 2D ATACACACAC AT/-- ACTGTATGCA 3070 het 3070 ref 89 49 29 11 AT 1 0 87763 CASAVA_Build 14 68210660 1I ACATATACAT -/G CACATACACA 3070 hom 165 het 65 0 55 10 G 0 1 87764 CASAVA_Build 14 68211331 1D CCACAGACCC A/- CTTCTCCCTG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 1 0 87765 CASAVA_Build 14 68226617 3I CAAGTGGAGG ---/TGA AGCTCCTCCA 2743 het 2743 ref 26 12 9 5 TGA 0 1 87766 CASAVA_Build 14 68228175 1I TGTTCCTGTG -/C CCCCCGGGGC 3070 het 2042 hom 29 8 12 9 C 5 6 87767 CASAVA_Build 14 68246580 1D AACATGTAGG T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 8 7 87768 CASAVA_Build 14 68254535 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1483 het 1061 hom 13 4 5 4 A 13 14 87769 CASAVA_Build 14 68258107 1D TTTCTCTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 10 9 87770 CASAVA_Build 14 68264014 1I CCCCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 1899 het 1898 ref 15 6 7 2 A 15 16 87771 CASAVA_Build 14 68272196 12D ACTCCAACTC AAAAAAAAAAAG/------------ AAAAAAAAAA 2411 het 2411 ref 17 11 7 5 AAAAAAAAAAAG 1 0 87772 CASAVA_Build 14 68272546 1I GGCTGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 A 10 11 87773 CASAVA_Build 14 68273228 1D TCTCCTCAGA G/- GGAAATTCCT 3070 het 2711 hom 29 10 13 6 G 3 2 87774 CASAVA_Build 14 68281797 1I AAAAGCTGGA -/T TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 T 6 7 87775 CASAVA_Build 14 68294171 1D GGGCTAATGG C/- CCCCACAGTC 3070 hom 93 het 37 0 30 7 C 5 4 87776 CASAVA_Build 14 68323136 1D CAGCTGAACT C/- CCAAAACTTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 C 3 2 87777 CASAVA_Build 14 68323552 1D CCAAGCAGGC A/- GTGCTTCCTT 3070 het 3070 hom 48 14 25 9 A 1 0 87778 CASAVA_Build 14 68324189 1D TTACAAAAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 9 8 87779 CASAVA_Build 14 68334318 1I TTCCTGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 19 18 12 T 11 12 87780 CASAVA_Build 14 68334813 1D CTTATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 720 hom 28 6 10 12 T 15 14 87781 CASAVA_Build 14 68337752 1D TCTTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 10 10 T 11 10 87782 CASAVA_Build 14 68366355 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 9 8 87783 CASAVA_Build 14 68368518 2D AATTTTAGGG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 136 hom 32 1 25 7 T 11 9 87784 CASAVA_Build 14 68369150 3I TATGTAAATG ---/CTA CTGATTTTTG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CTA 0 1 87785 CASAVA_Build 14 68373721 2I TGGCGATCAC --/TG TGTTTCCTTA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 TG 1 2 87786 CASAVA_Build 14 68375601 1I TTATCTTGGG -/A GTAAATAACT 3070 hom 114 het 45 0 37 8 A 0 1 87787 CASAVA_Build 14 68377375 6D CTGCCTCTAC AAAAAT/------ AAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 37 11 18 10 AAAAAT 2 1 87788 CASAVA_Build 14 68381991 1D AACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 17 0 11 6 A 13 12 87789 CASAVA_Build 14 68405891 1D GGATATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 23 0 11 12 T 15 14 87790 CASAVA_Build 14 68410309 1I CAGCAAAAAT -/A AAAACGAGTG 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 4 5 87791 CASAVA_Build 14 68423851 1D CAATTCTACT A/- AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 28 18 9 2 A 7 6 87792 CASAVA_Build 14 68427669 2I TCCTGTTACT --/TG TTTCACTTAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 TG 0 1 87793 CASAVA_Build 14 68447130 2D CACTACCCCC CT/-- GCTAGGTTTG 3070 hom 92 het 33 0 27 6 CT 1 0 87794 CASAVA_Build 14 68454991 1I GGGAGGCGGA -/G CTTGCAGCGA 2902 hom 21 het 8 0 8 0 G 0 1 87795 CASAVA_Build 14 68465933 1I CATGTTACTG -/C CTCAGCCCGA 3070 hom 53 het 21 0 17 4 C 1 2 87796 CASAVA_Build 14 68470451 2D CTGTCTCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 33 2 16 15 A 17 15 87797 CASAVA_Build 14 68478673 2D AGGCAAAAAA CT/-- CTGTCTCTAC 3070 hom 86 het 30 0 28 3 CT 2 1 87798 CASAVA_Build 14 68478849 1D ACCCCAGCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 89 het 34 0 30 4 A 10 9 87799 CASAVA_Build 14 68484691 4D ATTCACTGAC ACTT/---- ACCTACGCAC 3070 hom 82 het 32 0 27 7 ACTT 1 0 87800 CASAVA_Build 14 68485223 1D TGGGCATCCA G/- GAAGTACAGG 2380 het 2380 ref 31 15 8 9 G 2 1 87801 CASAVA_Build 14 68518160 1I GAGATCTGAC -/A AAGTGTACTG 3070 het 3070 hom 53 18 28 7 A 2 3 87802 CASAVA_Build 14 68524941 2D TTATTATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1882 het 99 hom 13 1 4 9 T 13 11 87803 CASAVA_Build 14 68544629 1I TTTGTTCATT -/C ATTCAAAAAT 3070 het 2292 hom 18 6 10 2 C 0 1 87804 CASAVA_Build 14 68564106 1I TTTCTGGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 9 10 87805 CASAVA_Build 14 68573267 8D AAATAATCTT TTCATTTA/-------- TTCATTTATT 2423 het 2066 hom 20 6 9 7 TTCATTTA 2 1 87806 CASAVA_Build 14 68577614 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 23 6 13 4 T 12 11 87807 CASAVA_Build 14 68585899 3I TGGCCGACTT ---/ACA ACATTTTCAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 ACA 1 2 87808 CASAVA_Build 14 68590114 1D ATTTTTTTTT C/- CCCTTTCTTA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 C 4 3 87809 CASAVA_Build 14 68597417 5I AAATAATCAC -----/AAGTT AATTTTTATT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AAGTT 0 1 87810 CASAVA_Build 14 68601200 4I ACCATAAGCC ----/ATTT ATTTCATCAC 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 ATTT 1 2 87811 CASAVA_Build 14 68607261 1D TTTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1774 het 1774 ref 27 12 7 8 T 13 12 87812 CASAVA_Build 14 68615552 1D TGCTACCCTG C/- CCCCCATACC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 C 6 5 87813 CASAVA_Build 14 68618223 4D TTATAGAAAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 61 27 22 13 TG 7 5 87814 CASAVA_Build 14 68618936 4I AAAAAATTCT ----/ATTA ATTAAGGAAT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 ATTA 1 2 87815 CASAVA_Build 14 68625460 1I CTTCTTGTGC -/A ACACTTAAAA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 1 2 87816 CASAVA_Build 14 68632021 2I TTTTTTAAGT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 44 15 17 12 AC 7 8 87817 CASAVA_Build 14 68634616 3I CCTAGGACTC ---/TCT TCTTACCTTA 3070 hom 145 het 51 0 47 4 TCT 1 2 87818 CASAVA_Build 14 68636258 1I ACAAAAAAAA -/C AATACAAAAA 3070 het 379 hom 35 1 26 8 C 0 1 87819 CASAVA_Build 14 68646699 1D TGTATTATGC T/- TTTTTTTTTC 1769 het 1769 ref 27 10 5 12 T 10 9 87820 CASAVA_Build 14 68659343 1I CTCTTACAGT -/A AATAGGATCT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 2 3 87821 CASAVA_Build 14 68677814 2D AACTGGGACC TT/-- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 9 7 87822 CASAVA_Build 14 68682138 1D TATAAGAATA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 7 6 87823 CASAVA_Build 14 68686916 2D ACTAGAGAAA AT/-- AGAGTTCATT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 AT 1 0 87824 CASAVA_Build 14 68698854 2I AATTAGTAAC --/AA GAGGAATTTT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 0 2 87825 CASAVA_Build 14 68728974 2D TTTTAAACAC AG/-- ATCTTTCTTA 3070 het 3024 hom 29 9 17 3 AG 1 0 87826 CASAVA_Build 14 68734252 1D CAATTCATTC T/- TTTAAAAAGT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 4 3 87827 CASAVA_Build 14 68737180 1D CCTTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 A 11 10 87828 CASAVA_Build 14 68750393 1D CTTTGCTTAC A/- TTTTTCTTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 1 0 87829 CASAVA_Build 14 68759173 1I GATTGTTTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 T 8 9 87830 CASAVA_Build 14 68768291 2D ATAGTAGATC CT/-- CTGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 CT 2 1 87831 CASAVA_Build 14 68785536 4D CCTCTCTCTC TATA/---- TATATATATA 3070 het 22 hom 25 2 18 5 TA 10 8 87832 CASAVA_Build 14 68788773 1D TTTTTTTCCC A/- AAGCCCTCCC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 3 2 87833 CASAVA_Build 14 68805143 1D ATATTCTAGT G/- GGGAGAGGGA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 G 4 3 87834 CASAVA_Build 14 68805851 2I TGGGGCGCAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 68 30 16 22 GT 6 7 87835 CASAVA_Build 14 68807426 3I GAGGCCGGAT ---/GAA GAAGGAGAAC 3070 het 3070 hom 51 21 20 10 GAA 1 2 87836 CASAVA_Build 14 68821915 2D GTGTAGTGTC AT/-- GTGTGGTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 20 6 AT 1 0 87837 CASAVA_Build 14 68834102 1I TGGAAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 11 12 87838 CASAVA_Build 14 68838912 2D TTTAACATGA TT/-- TTTTTATTTA 3070 hom 120 het 44 0 41 5 T 7 5 87839 CASAVA_Build 14 68841495 1I CTATTGTTAA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 7 8 87840 CASAVA_Build 14 68853253 3I GTGAGGGGGG ---/GGC GGGGCACTGA 2330 het 11 hom 17 1 6 10 GGC 0 1 87841 CASAVA_Build 14 68870420 7I TACCAGCAAG -------/GCTGGGA GCTGGGAGGT 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 GCTGGGA 1 2 87842 CASAVA_Build 14 68877359 1D ATTATATTAC A/- AATGTAAGAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 3 2 87843 CASAVA_Build 14 68879000 5D AGAGGGAGAG GAAAA/----- GAAAAGAAAA 1386 het 1386 ref 14 7 7 1 GAAAA 3 2 87844 CASAVA_Build 14 68893193 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 862 hom 7 het 4 0 3 1 T 8 9 87845 CASAVA_Build 14 68893345 2D GAATAAGTTA TT/-- TCATCTCTCA 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 T 3 1 87846 CASAVA_Build 14 68916451 9I GTTATTAGCT ---------/TCACATAAA TCACAGCAAA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 TCACATAAA 0 1 87847 CASAVA_Build 14 68921179 5D TCCTCAAATA ACAAC/----- ACAAGTGACG 3070 het 3070 hom 45 19 23 4 ACAAC 1 0 87848 CASAVA_Build 14 68928680 1D TTACTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 A 13 12 87849 CASAVA_Build 14 68931082 4I ATACATAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AAAC 2 3 87850 CASAVA_Build 14 68938696 1D GTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 1524 het 1524 ref 25 20 4 2 A 12 11 87851 CASAVA_Build 14 68943156 1D AGACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1233 het 1233 ref 18 9 3 6 A 17 16 87852 CASAVA_Build 14 68952122 1D GCTGGGGATC A/- GGGGGGATTC 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 A 1 0 87853 CASAVA_Build 14 68954350 1I CTGAGATGAT -/G GGGTTTTCTA 2398 het 2398 ref 18 12 5 1 G 3 4 87854 CASAVA_Build 14 68967876 1D CCTATCTGCC T/- TTTTTTTTTT 583 het 583 ref 51 34 3 15 T 13 12 87855 CASAVA_Build 14 68981523 1I TGTTAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 10 11 87856 CASAVA_Build 14 68993646 2I TGAGATATAC --/AT ATATATATAC 2904 het 2135 hom 26 10 8 9 AT 4 5 87857 CASAVA_Build 14 69012874 1I TTCAAAAAAA -/G AAAAAAAGTT 3070 het 1755 hom 30 8 19 3 G 0 1 87858 CASAVA_Build 14 69013028 3I TATCTCTTAA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 hom 24 7 14 3 AAT 5 6 87859 CASAVA_Build 14 69022044 1D ACCCACCCTT A/- AGACGGAGAG 3070 het 3070 ref 44 17 10 17 A 2 1 87860 CASAVA_Build 14 69025489 6I CATCAGGTCA ------/GGCTTC CTGGGGTCGT 3070 hom 126 het 47 0 41 6 GGCTTC 0 1 87861 CASAVA_Build 14 69029362 1D ACCTCAGCCT C/- CCAAGTAGCT 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 C 3 2 87862 CASAVA_Build 14 69052814 1D TGTCACCAAA C/- TTTTTGGTGC 2889 het 2889 ref 18 9 7 3 C 1 0 87863 CASAVA_Build 14 69069449 3I AAATGAACTT ---/CAC CACTCCATCT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CAC 1 2 87864 CASAVA_Build 14 69082421 1I TAAAAATCTT -/G GGGCCCCAGA 3070 hom 90 het 32 0 28 4 G 3 4 87865 CASAVA_Build 14 69101560 1D CATTTTACCC A/- TCATTTAAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 0 87866 CASAVA_Build 14 69105242 1D CTGTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1123 het 1123 ref 37 29 4 4 T 13 12 87867 CASAVA_Build 14 69114677 1D ACTCCGTTTC G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 6 5 87868 CASAVA_Build 14 69184123 1D AACCCCCTGG A/- AAAAAAAAAA 1721 het 1721 ref 23 12 5 6 A 12 11 87869 CASAVA_Build 14 69192111 1I TCTTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1190 het 1190 ref 33 19 3 11 A 13 14 87870 CASAVA_Build 14 69193130 12D AGCACTTTGC CAGGCACTTTGT/------------ CTATCCTAAT 3070 het 3070 ref 56 36 15 8 CAGGCACTTTGT 1 0 87871 CASAVA_Build 14 69203285 1I CTTGGCCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 11 87872 CASAVA_Build 14 69205106 1I AATTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 25 1 20 4 A 13 14 87873 CASAVA_Build 14 69206178 1D CATACTTCTC T/- TTATCCTTCA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 3 2 87874 CASAVA_Build 14 69212013 1D GTTTCTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 37 1 24 13 T 11 10 87875 CASAVA_Build 14 69213860 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2053 hom 12 het 7 0 5 2 A 8 9 87876 CASAVA_Build 14 69230566 1D CTAGGGATAC A/- AAAATGAGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 5 4 87877 CASAVA_Build 14 69272243 1D TTTTCTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 31 1 19 11 T 12 11 87878 CASAVA_Build 14 69357218 3I TATTATACTT ---/TAA GTTTTAGGGT 2748 het 2173 hom 13 5 6 2 TAA 0 1 87879 CASAVA_Build 14 69357885 1D ATGAGGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 11 10 87880 CASAVA_Build 14 69358395 2I ACTTATTTTG --/TA TATATATATA 3070 het 1347 hom 19 5 8 6 TA 5 6 87881 CASAVA_Build 14 69367929 3I AATTAATAAA ---/AAT AATAATTAAT 1568 het 1568 ref 13 8 4 1 AAT 2 3 87882 CASAVA_Build 14 69370250 1D TCCTATTATT A/- AGTTGCCTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 A 2 1 87883 CASAVA_Build 14 69370955 1I ACCTCGTTGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 307 hom 33 1 29 3 T 8 9 87884 CASAVA_Build 14 69371752 4D AAGTCTCCTA TTAG/---- TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 5 TTAG 1 0 87885 CASAVA_Build 14 69372278 1I AAAGTTTTAA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 T 6 7 87886 CASAVA_Build 14 69390317 1I GGAAGGTGAC -/A GGGGGCGTGT 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 A 0 1 87887 CASAVA_Build 14 69394355 9D TTTTCTAGAC ATTGTGTAT/--------- ATTATATGCA 3070 het 3070 ref 37 19 17 4 ATTGTGTAT 1 0 87888 CASAVA_Build 14 69409720 1I CTCTTAGGGG -/T GAGAGATTTA 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 T 0 1 87889 CASAVA_Build 14 69425143 1I GCTGAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 10 11 87890 CASAVA_Build 14 69447069 1I GTTTGAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 990 hom 28 5 12 11 T 13 14 87891 CASAVA_Build 14 69578732 1D TGCTAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 44 32 3 9 T 13 12 87892 CASAVA_Build 14 69598613 1I GGAGGGGAGG -/C CTAAGAACTA 1264 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 2 87893 CASAVA_Build 14 69608904 1D AGTAGATGCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 11 20 0 T 9 8 87894 CASAVA_Build 14 69622872 3D TTCTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2901 hom 21 het 10 0 8 2 T 18 15 87895 CASAVA_Build 14 69634778 1D ACTTTTTTTT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 8 7 87896 CASAVA_Build 14 69650378 1I CTAGGGGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 31 het 30 1 22 7 T 9 10 87897 CASAVA_Build 14 69655662 1I GCACTCTTTT -/C CCCCCCACCC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 6 7 87898 CASAVA_Build 14 69658293 1I AAATTTTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 9 10 87899 CASAVA_Build 14 69687994 1I GTCCTGAGGG -/A CAAGTAGCAC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 A 0 1 87900 CASAVA_Build 14 69688975 1I CAACAACAAC -/A AAAACAACAA 3070 hom 100 het 40 0 32 8 A 4 5 87901 CASAVA_Build 14 69698122 1D GAGCTTGCAG T/- CTTGTGACTC 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 T 1 0 87902 CASAVA_Build 14 69698513 4I TTTCCGTGGG ----/CTCA CTATTTTCCT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 CTCA 0 1 87903 CASAVA_Build 14 69708329 1D AATGCAGGCA C/- CCAGTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 C 3 2 87904 CASAVA_Build 14 69717936 1I AGCCACACGC -/A AAAAAAAAAA 1976 het 1976 ref 37 13 7 17 A 16 17 87905 CASAVA_Build 14 69723744 4D AGAGAGAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 2404 hom 23 het 13 0 9 4 AG 10 8 87906 CASAVA_Build 14 69733399 1I TAATCTTTTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 A 8 9 87907 CASAVA_Build 14 69739486 1I TATTTAATAT -/A AAAAATATAT 2921 hom 15 het 7 0 6 1 A 5 6 87908 CASAVA_Build 14 69745182 1D GATTACAGAA T/- TTTCTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 4 3 87909 CASAVA_Build 14 69747234 1I CACCTTATAC -/T ATTTTGTTAG 3070 hom 114 het 42 0 37 5 T 0 1 87910 CASAVA_Build 14 69747961 1D CAGGCTGCTG A/- AAAAATGATG 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 6 5 87911 CASAVA_Build 14 69748265 1I ACCCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 34 1 30 3 A 10 11 87912 CASAVA_Build 14 69758163 1D TTAAATGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 376 hom 37 1 26 10 A 12 11 87913 CASAVA_Build 14 69760310 1D CAATGGGAGA T/- TTCTCCAGGT 3070 hom 61 het 25 0 17 9 T 3 2 87914 CASAVA_Build 14 69767796 1D ATCTCATGGC T/- CCTGTTCCTG 3070 het 3070 hom 33 15 13 6 T 1 0 87915 CASAVA_Build 14 69768716 2D CATGTGAACT GA/-- GAGGAAAAGG 3070 het 3070 ref 46 23 17 7 GA 2 1 87916 CASAVA_Build 14 69769264 1I CTTAATTTCC -/T TTTTTTTTTT 2096 het 1382 hom 24 6 10 8 T 15 16 87917 CASAVA_Build 14 69782078 1D AATCAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 32 0 25 8 A 11 10 87918 CASAVA_Build 14 69784960 1I TTTAGAAAAG -/A AAAAATAATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 5 6 87919 CASAVA_Build 14 69785471 1D ATTTTGTGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1769 hom 22 6 10 6 T 10 9 87920 CASAVA_Build 14 69786536 2D GGGAAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 20 het 44 1 30 14 AG 10 9 87921 CASAVA_Build 14 69788550 2I GGAGTGCAGT --/GG GGCGATCCTG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 2 4 87922 CASAVA_Build 14 69789795 6D ATAACTCTCT TATAAC/------ TATAACATGC 3070 het 3070 ref 41 22 16 5 TATAAC 2 1 87923 CASAVA_Build 14 69790839 3D TTAGCAAAAC TTT/--- TTAAGTTAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 T 5 2 87924 CASAVA_Build 14 69793693 2D ATTCAAAAAA AG/-- AAAGGCAATA 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 AG 1 0 87925 CASAVA_Build 14 69795900 4D ATGAAAACTC AGAA/---- AGCTACATTT 3070 het 3070 ref 56 32 20 5 AGAA 1 0 87926 CASAVA_Build 14 69796888 2I AAATTCCCAC --/CT GAGTTTTTGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CT 0 1 87927 CASAVA_Build 14 69799837 1I TATGTCTTTA -/T CAGCAGTGTG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 0 1 87928 CASAVA_Build 14 69811280 1I TTGCCAGAGA -/C CCCCCACATG 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 C 5 6 87929 CASAVA_Build 14 69815353 2I GTTGTGGACA --/CT CTGTAGAATC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CT 1 2 87930 CASAVA_Build 14 69817858 3I CACAAAAAAA ---/CAC ACACATACAA 3070 het 1228 hom 42 5 18 19 CAC 0 1 87931 CASAVA_Build 14 69817998 3I TCACCTCAGC ---/ATA ATAATAATAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 ATA 3 4 87932 CASAVA_Build 14 69818699 1D TCTGCCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 41 1 31 9 T 11 10 87933 CASAVA_Build 14 69819225 2D GAAACAAACA AC/-- AACAACAACA 2955 het 564 hom 44 4 16 24 AC 1 0 87934 CASAVA_Build 14 69820141 3D GAGAAGTGTA GAG/--- GAGAGTGTGA 3070 het 3070 ref 60 35 20 6 GAG 2 1 87935 CASAVA_Build 14 69823565 2D CAGATATGTC TT/-- TATCAGCAGC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 3 1 87936 CASAVA_Build 14 69834451 5D GAGGGGGATA CGTAT/----- CCTGATATCC 3070 hom 26 het 11 0 8 3 CGTAT 1 0 87937 CASAVA_Build 14 69835213 3I TAGTCAGGGA ---/AGC AGCAGATAAT 3070 het 1311 hom 16 3 8 5 AGC 1 2 87938 CASAVA_Build 14 69837807 2I GAAAGGAGAA --/AG AGATTGAGGG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AG 1 2 87939 CASAVA_Build 14 69838477 1I GATTTGGCAT -/C CATCTTTAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 1 2 87940 CASAVA_Build 14 69838803 5D AAAAGCACTT AAATC/----- AAATACTTTA 3070 hom 39 het 15 0 14 3 AAATC 1 0 87941 CASAVA_Build 14 69838876 4D TAAAATCATT AATA/---- AATAAACTAG 3070 het 3070 ref 28 16 7 6 AATA 2 1 87942 CASAVA_Build 14 69840669 1I GGCTTGATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 21 2 17 2 A 10 11 87943 CASAVA_Build 14 69841129 4D CATGTATCTT TCTG/---- TATGTGATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TCTG 1 0 87944 CASAVA_Build 14 69841216 1I TTGCTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 32 1 25 6 T 11 12 87945 CASAVA_Build 14 69841347 4I TCATTTACAT ----/TAAG TATTTCTCTT 3070 hom 42 het 15 0 15 1 TAAG 0 1 87946 CASAVA_Build 14 69854205 21D GCAGTTCCTC AGGGTTCCTTTGGGAACCCTG/--------------------- AGGGTTCCTG 3070 het 3070 hom 30 14 11 12 AGGGTTCCTTTGGGAACCCTG 1 0 87947 CASAVA_Build 14 69857436 4D GTGGCATATA TATT/---- CATATTTGCA 3070 het 3070 ref 26 13 8 7 TATT 1 0 87948 CASAVA_Build 14 69862151 7D GTCATCTATG GATTTAC/------- TGAACAAATT 3070 het 3070 ref 35 18 15 6 GATTTAC 1 0 87949 CASAVA_Build 14 69864731 1D GGAAAGATAG C/- TAGCCCTTCA 3070 hom 48 het 29 0 25 4 C 1 0 87950 CASAVA_Build 14 69865074 2D GCATCTCTTC AT/-- ATGTTTAAGA 3070 het 3070 ref 48 24 20 6 AT 2 1 87951 CASAVA_Build 14 69865526 2I AAATGATTAT --/AC AGTTTATCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AC 0 1 87952 CASAVA_Build 14 69868213 72D2M4D TTGAAGTATG ATACAACACCCTATAATCTAGCAATTCCTTTTTGTACATGTACAGGAGAAAAGCATACAAGAATGGGAATGTTCAGGA/------------------------------------------------------------------------TC---- TGTCACCAAG 3070 hom 84 het 28 0 29 2 N/A 0 0 87953 CASAVA_Build 14 69889056 4D ATTACATACA TTAT/---- TTATGTGCAC 3070 het 1877 hom 13 4 7 2 TTAT 2 1 87954 CASAVA_Build 14 69893237 3I CCACAAAAAC ---/AAT GAGAATATTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AAT 0 1 87955 CASAVA_Build 14 69894849 1I CAATTTTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 1157 hom 29 9 14 6 A 0 1 87956 CASAVA_Build 14 69904555 2D TACACTTCCT TA/-- TGTTTCATTT 3070 het 3070 hom 53 20 28 8 TA 1 0 87957 CASAVA_Build 14 69905051 1I AACACTCACT -/A AATCATACAT 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 2 3 87958 CASAVA_Build 14 69914197 2I TTACAAAACT --/CA CACAGACACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CA 2 3 87959 CASAVA_Build 14 69914572 1D ACACTTAGCA T/- TCTTTGTTCT 3070 hom 92 het 36 0 31 5 T 2 1 87960 CASAVA_Build 14 69914784 1D GATGCCTACA C/- CTGTATACTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 2 1 87961 CASAVA_Build 14 69915491 8I CTTCAGCCTA --------/CTTTTCCC CTTTAAATAT 3070 hom 75 het 28 0 24 5 CTTTTCCC 0 1 87962 CASAVA_Build 14 69920960 1D ATACGATGTC A/- CGGGTAAGTG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 1 0 87963 CASAVA_Build 14 69926657 1I ACCTATGCAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 7 8 87964 CASAVA_Build 14 69930436 1I ACTTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 560 hom 20 3 12 5 A 15 16 87965 CASAVA_Build 14 69933053 10I TGTGTATGTA ----------/TGTATGTATG TGTATGTATG 3070 hom 39 het 17 0 13 4 TGTATGTATG 1 2 87966 CASAVA_Build 14 69939137 1D AGCCTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 13 12 87967 CASAVA_Build 14 69940646 1I ATGAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2973 het 2973 ref 21 10 8 3 A 11 12 87968 CASAVA_Build 14 69943600 1I TTTTTGCTAT -/A AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 6 7 87969 CASAVA_Build 14 69944005 1D TTAATTAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 10 9 87970 CASAVA_Build 14 69951656 1I AAAAAAAAAA -/T ATATTAATAA 2341 het 250 hom 21 5 9 7 T 0 1 87971 CASAVA_Build 14 69952021 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1410 het 959 hom 12 5 4 3 A 14 13 87972 CASAVA_Build 14 69952121 3I TAATCTATCC ---/ATG ATGATTAAGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 ATG 1 2 87973 CASAVA_Build 14 69960776 5I ATACATATAC -----/ATAAT ATATGTCCAC 3070 hom 108 het 47 0 37 10 ATAAT 0 1 87974 CASAVA_Build 14 69981403 1I GCTGTCTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2092 hom 18 5 9 4 A 10 11 87975 CASAVA_Build 14 70001978 1D CTGGATAGCA G/- GGGGAGGTAA 3070 het 2755 hom 19 8 9 2 G 5 4 87976 CASAVA_Build 14 70003143 2I TGGCCAGATC --/TG TGTGTAGACA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 TG 2 3 87977 CASAVA_Build 14 70010466 1I TGACGTGAAG -/A GGACTGTTTG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 0 1 87978 CASAVA_Build 14 70019453 2I GCCAGATGTC --/TA TATATATATA 3070 het 1417 hom 13 3 8 2 TA 7 8 87979 CASAVA_Build 14 70023485 4D AACAACCCAT TAAG/---- TAATAAGCAA 3070 het 3070 ref 47 25 19 5 TAAG 1 0 87980 CASAVA_Build 14 70034578 1I GCCTAAGTGT -/C ACCTGCTGGA 3070 het 3070 ref 54 32 17 6 C 0 1 87981 CASAVA_Build 14 70045666 2I TAAAAAAAAT --/AG AGAAAACTCA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 AG 1 2 87982 CASAVA_Build 14 70050022 1I CTGGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 A 11 12 87983 CASAVA_Build 14 70053014 1D CAGAGTAGGA G/- GAGGGTGTTA 3070 hom 144 het 50 0 49 3 G 2 1 87984 CASAVA_Build 14 70056444 2D ACGGAAGATT AA/-- ACCAGCCACA 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 3 1 87985 CASAVA_Build 14 70058719 5D ATAGTACAGC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1526 het 1526 ref 40 19 9 15 A 19 14 87986 CASAVA_Build 14 70072305 1D AAAATAAAGT G/- GATATACTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 G 2 1 87987 CASAVA_Build 14 70079409 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1411 het 1411 ref 15 7 3 5 A 13 12 87988 CASAVA_Build 14 70090222 1D CCTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 A 12 11 87989 CASAVA_Build 14 70095749 1D AGTTGCCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2279 hom 31 8 13 10 A 12 11 87990 CASAVA_Build 14 70095783 1I CCTTAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2162 hom 32 8 11 13 T 10 11 87991 CASAVA_Build 14 70100168 1I TGCTGTAAAG -/T TGTGGCACCT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 1 2 87992 CASAVA_Build 14 70100925 1D CAGGGAAAAA G/- TGTTGTTTCA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 G 1 0 87993 CASAVA_Build 14 70104831 1I CCCTAAAGGG -/A AAAAAGGATT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 5 6 87994 CASAVA_Build 14 70111326 1I ATTCAACCTT -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 6 7 87995 CASAVA_Build 14 70116819 1D CCCTCAGGGA T/- TGCTGGTTGA 3070 het 3070 hom 42 17 23 3 T 2 1 87996 CASAVA_Build 14 70118316 3D TGAAACATAA TAC/--- TACACAGAAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 4 TAC 2 1 87997 CASAVA_Build 14 70122032 5I AGACTTTTTT -----/TTTTC TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 TTTTC 0 1 87998 CASAVA_Build 14 70131616 4I GGCTTCAGCT ----/ACAG ACAGAGATTG 3070 hom 87 het 36 0 29 7 ACAG 1 2 87999 CASAVA_Build 14 70136197 1D ATAAACTAAA T/- ATTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 1 0 88000 CASAVA_Build 14 70136282 4D GCAAGTGATG AAAT/---- AAATAATGAA 3070 het 3070 ref 47 26 16 6 AAAT 2 1 88001 CASAVA_Build 14 70139705 1D TTATTATGTT A/- AAAATACACA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 5 4 88002 CASAVA_Build 14 70139873 6I TAATTTAATA ------/TGTAAG TGTGAGAATG 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 TGTAAG 0 1 88003 CASAVA_Build 14 70140890 1D AATCATAAAC A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 A 8 7 88004 CASAVA_Build 14 70141634 2I TTGTATTTTT --/TC TGTTTCACTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 TC 0 1 88005 CASAVA_Build 14 70142208 1I TTTGATTTGA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 T 6 7 88006 CASAVA_Build 14 70160275 1D CATTGCTACC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 15 19 10 A 9 8 88007 CASAVA_Build 14 70162439 4D ATAAATTCCT AGAA/---- AGATACAACC 2774 het 2774 ref 28 19 8 1 AGAA 1 0 88008 CASAVA_Build 14 70164931 1I CATACCTGTA -/C ATCCCAGCAC 3070 het 911 hom 21 2 19 0 C 0 1 88009 CASAVA_Build 14 70169406 1I TACTATCCTT -/A AAAAAAAAAT 1841 het 1841 ref 20 11 7 2 A 9 10 88010 CASAVA_Build 14 70174672 1D AGCTTTAAAT G/- GTTGTGACCA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 G 2 1 88011 CASAVA_Build 14 70185914 2I TGAACTTATG --/TA TATATATAAT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 TA 4 5 88012 CASAVA_Build 14 70187295 4D TTAATATGAT TTTC/---- TTTGTGTAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 4 TTTC 1 0 88013 CASAVA_Build 14 70189910 3D CCACCATGCC TGG/--- TGTATTCCTG 3070 het 3070 hom 53 21 25 8 TGG 1 0 88014 CASAVA_Build 14 70198884 2D TCTCTATGCC AA/-- AAAAAAAAAA 2773 het 662 hom 31 7 13 12 A 20 18 88015 CASAVA_Build 14 70201198 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 35 4 21 10 A 17 16 88016 CASAVA_Build 14 70219561 1D ACCATCATCA T/- TTCCCTACCT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 3 2 88017 CASAVA_Build 14 70225321 1D CCAGAAAACA T/- TTTTTTTTAA 1565 het 1565 ref 18 7 6 5 T 9 8 88018 CASAVA_Build 14 70241688 1D ACCCCACCTC A/- AAAAAAAAAG 1373 het 1373 ref 41 30 3 9 A 10 9 88019 CASAVA_Build 14 70251990 1D CGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 32 1 20 11 A 13 12 88020 CASAVA_Build 14 70252799 5D AAAGAAAAAG AAAAA/----- GAAAAAAAAA 1265 het 808 hom 18 6 6 7 A 5 0 88021 CASAVA_Build 14 70254817 1D CAGTCTTCTT A/- AGACACCTAG 3070 hom 72 het 27 0 25 4 A 2 1 88022 CASAVA_Build 14 70261011 1I AAGGGGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 29 1 25 3 A 10 11 88023 CASAVA_Build 14 70284506 1I TGAACCCAGA -/G GGCAGAGCCT 3070 hom 36 het 13 0 11 2 G 2 3 88024 CASAVA_Build 14 70286617 2I GCAATAGCTC --/AT GAGTCTTTTC 3070 hom 180 het 63 0 59 4 AT 0 1 88025 CASAVA_Build 14 70287530 4I AACGGAGATC ----/TCTA TCTAATTCAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 TCTA 1 2 88026 CASAVA_Build 14 70296524 1D CTGTATCCAG C/- CAACTTATAC 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 C 2 1 88027 CASAVA_Build 14 70299466 4D GCTTTAAAAC ACAA/---- ACAGAGGGGA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 ACAA 1 0 88028 CASAVA_Build 14 70299954 8I GTACCATACA --------/TAATACCT TAATACCTGA 3070 het 3070 ref 54 33 15 6 TAATACCT 1 2 88029 CASAVA_Build 14 70300005 1D ATGTATTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 15 12 23 T 13 12 88030 CASAVA_Build 14 70300817 4I AGACTGTGAT ----/ATTG ATGATCTTGA 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 ATTG 0 1 88031 CASAVA_Build 14 70300920 1I AATGTATGTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 8 9 88032 CASAVA_Build 14 70305626 1D GGCTATAGCA C/- CACCATGTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 C 2 1 88033 CASAVA_Build 14 70314557 3I TTTTTGTTGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 2627 hom 40 12 19 9 TTG 4 5 88034 CASAVA_Build 14 70315494 1D CCAGGGGGAG A/- ATCAGAAGAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 2 1 88035 CASAVA_Build 14 70319932 1I TGAAGGATTC -/T ACTCTTTGTC 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 0 1 88036 CASAVA_Build 14 70323978 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1204 het 242 hom 32 5 7 20 A 17 18 88037 CASAVA_Build 14 70332613 1I ATCCTGAAGT -/C CATCTACCTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 1 2 88038 CASAVA_Build 14 70334896 27I CCAGCAATAT ---------------------------/ATCTGCTTCTTTTTACCCCATCACTTA AAGCAATCTC 2463 hom 11 het 7 0 5 2 ATCTGCTTCTTTTTACCCCATCACTTA 0 1 88039 CASAVA_Build 14 70341163 2D TTGAAAAAAT AA/-- ATGCAGGGAG 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 A 3 1 88040 CASAVA_Build 14 70350641 1I24M6D ACTTTGATGT -AAAAAAAAAAAATCCCTCAAGCAGACTTTT/AAAAAAAAAAAAATCCCTCAAGCAG------ ACCTTTTTTT 1402 het 1402 ref 20 11 4 11 N/A 0 0 88041 CASAVA_Build 14 70365180 1I TTCTTTTCTT -/C TTTTTTTTTT 1371 het 167 hom 14 3 6 5 C 0 1 88042 CASAVA_Build 14 70365792 1D AGAGAGAAAA G/- AGTCAGGGAG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 G 1 0 88043 CASAVA_Build 14 70373128 1I ACTTAAAAAG -/A AGAGTAAGGG 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 A 1 2 88044 CASAVA_Build 14 70378669 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 8 7 88045 CASAVA_Build 14 70380126 22D3M2D GCTCACCTCT GGCTAAAGGTAAGTGAGCTTACCCTGG/----------------------CCT-- CTCACTTTGG 3070 hom 114 het 37 0 39 7 N/A 0 0 88046 CASAVA_Build 14 70383361 1I CTTTTTATTA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 45 23 17 6 T 6 7 88047 CASAVA_Build 14 70383647 30D GATCTGCCCA CCTCAACCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAG/------------------------------ CCTCAACCTC 2553 het 2553 ref 17 14 8 3 CCTCAACCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAG 2 1 88048 CASAVA_Build 14 70391924 1I GAAATGTCAG -/A GGTGTTTGAA 2821 het 2821 ref 31 19 7 5 A 0 1 88049 CASAVA_Build 14 70411820 1D ACAAGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 2200 het 850 hom 27 6 7 14 T 19 18 88050 CASAVA_Build 14 70433070 1D CAAATACCAC A/- TATTCTCACT 3070 het 3070 hom 55 23 25 7 A 1 0 88051 CASAVA_Build 14 70435360 1D TTTATAAGTT G/- GGGGGGCAGG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 G 7 6 88052 CASAVA_Build 14 70436219 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2853 het 1659 hom 20 7 8 6 A 12 11 88053 CASAVA_Build 14 70447815 4I AGTCTTAGGA ----/CTTT CTTTATAGGA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 CTTT 1 2 88054 CASAVA_Build 14 70448705 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1129 het 1129 ref 15 5 4 8 A 11 10 88055 CASAVA_Build 14 70450804 2I AATCTAAAGG --/AA AAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 A 4 6 88056 CASAVA_Build 14 70456180 4D TTTCTCTGCT CCCC/---- CCCCCCCCCC 1367 het 68 hom 14 2 4 8 C 20 16 88057 CASAVA_Build 14 70459578 2I ACACACACAC --/AT GTCTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 AT 0 1 88058 CASAVA_Build 14 70470866 1I CATCTAGCTT -/A AAAAAAAATT 1588 het 1588 ref 26 20 6 0 A 8 9 88059 CASAVA_Build 14 70471473 4I GACCGGTGTG ----/TGTC TATGCACTTT 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 TGTC 0 1 88060 CASAVA_Build 14 70480259 1I TTGGGCGAGG -/C CCAGGGCCTT 3070 hom 77 het 33 0 25 8 C 2 3 88061 CASAVA_Build 14 70480884 1D GGGGCCTGTA G/- TCCCTTTGTT 3070 het 727 hom 26 2 21 3 G 1 0 88062 CASAVA_Build 14 70482049 1D AAAACTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 10 9 88063 CASAVA_Build 14 70485664 4I GCATTTACTC ----/ATAA ATAGTGTGTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 ATAA 0 1 88064 CASAVA_Build 14 70485870 2I TATGTGTGTG --/TA TGTGTACATA 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 TA 0 1 88065 CASAVA_Build 14 70494297 4I TGTGTATGTA ----/TGTG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 TG 4 6 88066 CASAVA_Build 14 70503902 1I ATTTAGTAAC -/T TGTTATGTTA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 1 2 88067 CASAVA_Build 14 70511813 2I AATAAAGAAC --/AG GGGTTTTACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AG 0 1 88068 CASAVA_Build 14 70527035 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1550 hom 27 5 17 6 A 12 11 88069 CASAVA_Build 14 70529033 1I AGCAGTATAA -/G CAGAATGTGT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 0 1 88070 CASAVA_Build 14 70531345 1I TCTAATAAAT -/A AATTTTAATC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 2 3 88071 CASAVA_Build 14 70537631 4I TTTAATCAAT ----/TAAC TAACCCCATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAAC 1 2 88072 CASAVA_Build 14 70550127 2D TTATCATCTC AT/-- GTGAAACAAC 3070 het 3070 hom 59 20 32 9 AT 1 0 88073 CASAVA_Build 14 70551162 1I TGAAACAGAA -/G GAGTCCACTG 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 G 1 2 88074 CASAVA_Build 14 70558223 3D TTTTGATATT CTC/--- CTCATTTTTG 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 CTC 2 1 88075 CASAVA_Build 14 70562295 2I GCTGTGAGCA --/CT CTCTACTGCA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 CT 2 3 88076 CASAVA_Build 14 70570380 1I GTATTTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 33 1 29 3 T 9 10 88077 CASAVA_Build 14 70579472 1I TAATAAATTC -/T CTTAGTCTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 0 1 88078 CASAVA_Build 14 70583684 1D GCAAGGCACT G/- TGAGATTAAA 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 G 1 0 88079 CASAVA_Build 14 70585617 4D AAATATAAAG TAAA/---- TAATCTTTGA 3070 het 3070 ref 19 9 8 3 TAAA 1 0 88080 CASAVA_Build 14 70587493 1D ACTAAATGAG C/- CGGGTGTGGT 2119 het 2119 ref 18 9 5 4 C 2 1 88081 CASAVA_Build 14 70589065 1I CAGTAATATT -/A GAATTATTTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 1 88082 CASAVA_Build 14 70595551 2D TTAAAATAAA TG/-- TGCATGGGAG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 TG 2 1 88083 CASAVA_Build 14 70604447 1D GCACATGGAG A/- AAAAAGCTAA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 6 5 88084 CASAVA_Build 14 70611866 2D TAACCTCAGG AA/-- GCTAGAGATT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 2 0 88085 CASAVA_Build 14 70612027 1D CACAGTAAAG T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 8 7 88086 CASAVA_Build 14 70626655 15D TTAGGCTTAG CTAAATATCTTAGTA/--------------- GGGTAATAAC 3070 het 3070 ref 43 28 20 2 CTAAATATCTTAGTA 1 0 88087 CASAVA_Build 14 70629792 1D TGGATATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 13 12 88088 CASAVA_Build 14 70631584 4I TCATCTGTTC ----/TCTT TCTTGTCCTC 3070 hom 150 het 55 0 49 6 TCTT 1 2 88089 CASAVA_Build 14 70641393 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 A 13 12 88090 CASAVA_Build 14 70648167 1D GCATTTCCAC T/- TTAAAACCTA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 3 2 88091 CASAVA_Build 14 70651152 1I GGGTTATACC -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 56 20 28 8 T 6 7 88092 CASAVA_Build 14 70652126 4I AGGATAAAAA ----/TGTG TGTTCAATCA 3070 het 3070 ref 65 35 25 5 TG 1 3 88093 CASAVA_Build 14 70652204 4I AGGTACAAAC ----/TTGT TTGTTTGGTA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 TTGT 1 2 88094 CASAVA_Build 14 70652409 4D AAATAATTTG CTAT/---- CTATCTTTCC 3070 hom 102 het 37 0 35 4 CTAT 2 1 88095 CASAVA_Build 14 70653989 3D ATATCTTCCA GTT/--- GTTATTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 GTT 2 1 88096 CASAVA_Build 14 70654265 2D TTGTCTTTTG TC/-- TGTGTATTTC 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 TC 1 0 88097 CASAVA_Build 14 70659595 1I GACGCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 1866 het 1866 ref 25 11 5 9 A 13 14 88098 CASAVA_Build 14 70659686 1I TTCTGCACCT -/G GGAAGATAAG 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 G 2 3 88099 CASAVA_Build 14 70672044 5I TTATATGCTT -----/AAGGA AATGGGAAAT 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 AAGGA 0 1 88100 CASAVA_Build 14 70672894 1I TCCCTTTCTC -/T TATCACTTGC 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 T 1 2 88101 CASAVA_Build 14 70673284 2D GCTTAGTAGA CT/-- CTCTGCCTTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 CT 3 2 88102 CASAVA_Build 14 70676150 1I TCCGCACAGA -/G GGGGACCGCT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 G 4 5 88103 CASAVA_Build 14 70677166 5I AACAGGAGAC -----/AAGAT AAGGATAATC 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 AAGAT 0 1 88104 CASAVA_Build 14 70688803 1D GGCTAATACA G/- GTGGCTAGAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 G 2 1 88105 CASAVA_Build 14 70696910 16I CTTGCTGTGT ----------------/CACTCAGGCTGGAGTA CAGTGGAGTA 3070 hom 43 het 26 0 17 9 CACTCAGGCTGGAGTA 0 1 88106 CASAVA_Build 14 70698655 1I TGTGGAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 36 1 26 9 A 12 13 88107 CASAVA_Build 14 70715322 1D ATTTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 2663 het 2663 ref 38 18 7 13 T 15 14 88108 CASAVA_Build 14 70716672 2D AGATGCACAC CA/-- CACACACACA 1448 het 1448 ref 46 28 4 14 CA 10 9 88109 CASAVA_Build 14 70727030 1I ATAGTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 13 12 A 11 12 88110 CASAVA_Build 14 70727410 4D TCTGAAAGAG ATTA/---- ATTAGCATTT 3070 het 3070 hom 44 20 22 4 ATTA 2 1 88111 CASAVA_Build 14 70741948 3D CTTGGGATTT CCA/--- CTATCTCACT 3070 het 3070 ref 47 23 21 4 CCA 1 0 88112 CASAVA_Build 14 70749180 1I ACCCTGCCCT -/C CCAGACAATT 3070 hom 111 het 43 0 32 11 C 2 3 88113 CASAVA_Build 14 70769817 2D AAGATTTCAC AT/-- GTGAGTCCAG 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 AT 1 0 88114 CASAVA_Build 14 70770611 3I GCTTCTAGCC ---/AGG AGGCACTGTG 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AGG 1 2 88115 CASAVA_Build 14 70771670 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1518 hom 13 4 8 1 A 9 10 88116 CASAVA_Build 14 70773558 1I GCTAATTTTT -/G TATTTTTAGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 0 1 88117 CASAVA_Build 14 70774660 1D GTAATTAAAG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 8 7 88118 CASAVA_Build 14 70774867 2D GATGGATATT AA/-- AAAAAAAAAA 1355 het 391 hom 17 3 6 8 A 14 12 88119 CASAVA_Build 14 70785789 4I CAGCTAGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 2663 het 2663 ref 17 8 6 3 TTTG 3 4 88120 CASAVA_Build 14 70802280 9D AAAGAGTGAA TGTGAAGAT/--------- TGTGAAGATA 3070 het 3070 hom 26 11 11 6 TGTGAAGAT 2 1 88121 CASAVA_Build 14 70821373 1D ACTCCAGCTC A/- AAAAAAAAAA 2880 het 2880 ref 22 10 7 5 A 15 14 88122 CASAVA_Build 14 70822166 4D TGTTTTTTGC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 TTGT 4 3 88123 CASAVA_Build 14 70827172 1D GACCTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 2752 het 1019 hom 12 3 8 1 T 12 11 88124 CASAVA_Build 14 70828805 2D AGCTGAACAC TG/-- TGATCATCTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 TG 2 1 88125 CASAVA_Build 14 70830770 1D TTAATTTATT G/- GGGGTTACAA 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 G 5 4 88126 CASAVA_Build 14 70836409 2D CTCCATTCCT GA/-- GAGATCCCAT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 GA 3 2 88127 CASAVA_Build 14 70837579 9I GCTGTTAGTA ---------/ACAGCAGTT ACAGCAGTTG 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 ACAGCAGTT 1 2 88128 CASAVA_Build 14 70841050 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2608 hom 28 8 14 7 A 12 11 88129 CASAVA_Build 14 70888089 1D CGGTTTATTA T/- TACCATAAAC 2585 het 2585 ref 24 15 6 4 T 2 1 88130 CASAVA_Build 14 70908026 10D CCTGGCTAAT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 2911 het 2911 ref 23 10 9 4 TTTTG 5 3 88131 CASAVA_Build 14 70914578 1D GTGTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 11 10 88132 CASAVA_Build 14 70926835 2D TTTTTGGAGG GA/-- GAGGCAGCCA 1504 het 1504 ref 18 12 5 1 GA 2 1 88133 CASAVA_Build 14 70943059 1D AGATTACCTT G/- GGGGGATTTA 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 G 6 5 88134 CASAVA_Build 14 70958063 1I GAGACCTTAT -/C TCTTAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 C 0 1 88135 CASAVA_Build 14 70962315 3D CTCTTTGGTT TTA/--- TTTTAGATTT 3070 het 3070 ref 37 23 14 2 TTA 1 0 88136 CASAVA_Build 14 70965875 1D ATATCTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 12 11 88137 CASAVA_Build 14 70972566 12D AAGTGAGGTT GAACATACTATC/------------ GTGTGCTTAA 3070 het 3070 ref 25 18 8 2 GAACATACTATC 1 0 88138 CASAVA_Build 14 70975199 1I GAGGGCCATC -/T GGGAATCTGG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 0 1 88139 CASAVA_Build 14 70985169 3I GCCGGGTGTT ---/GTG GTACCTGCCT 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 GTG 0 1 88140 CASAVA_Build 14 70997749 1D CTCTGCAGCT G/- GCAAATTGGG 3070 het 3070 ref 39 22 11 8 G 2 1 88141 CASAVA_Build 14 71033196 5I ATTGTCTCTC -----/TCCTT TCAGTTCTGT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 TCCTT 0 1 88142 CASAVA_Build 14 71033663 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2125 hom 18 6 10 3 A 9 8 88143 CASAVA_Build 14 71053549 1D AAGTACCTTC T/- TATAAATAAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 2 1 88144 CASAVA_Build 14 71054752 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 13 14 88145 CASAVA_Build 14 71056143 1D CAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 11 10 88146 CASAVA_Build 14 71060601 4I TTATCTGTTC ----/CTGT CTGTCTGTTG 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 CTGT 2 3 88147 CASAVA_Build 14 71086495 5I TTGGGAGGCT -----/GAGCA GAGGTAGGAG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 GAGCA 0 1 88148 CASAVA_Build 14 71090818 4I AGATGACCTT ----/AAAG AAAATCGTGC 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 AAAG 0 1 88149 CASAVA_Build 14 71096303 1D TTATATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 8 23 5 T 12 11 88150 CASAVA_Build 14 71102299 3I TATTTATAAA ---/AAG AAAAATCCTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 AAG 0 1 88151 CASAVA_Build 14 71105612 1D CAAGGAATAT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 A 8 7 88152 CASAVA_Build 14 71111177 1D AAAGGTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2622 hom 29 9 11 9 A 13 12 88153 CASAVA_Build 14 71127791 1D CTTAAGTGAT A/- AGACTCTCAT 3070 het 3070 ref 28 14 9 6 A 2 1 88154 CASAVA_Build 14 71150342 3D GCCTGAAGGA AGG/--- AGGAGACTGC 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 AGG 2 1 88155 CASAVA_Build 14 71161182 4D TCTGGGACAC AGAG/---- AGATTAAGTA 3070 het 3070 ref 39 22 16 4 AG 3 1 88156 CASAVA_Build 14 71192807 1I ACCAATGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 10 11 88157 CASAVA_Build 14 71251056 1D CTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 11 10 88158 CASAVA_Build 14 71252612 4I CCTACTTCAC ----/TTGT TTGTTTTCCC 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 TTGT 1 2 88159 CASAVA_Build 14 71255058 2I AGGCTGAGGC --/TA TATAGTGAGC 3070 het 3070 hom 35 9 21 5 TA 2 3 88160 CASAVA_Build 14 71275907 2D GCACAATATC TT/-- TATCTGTTAT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 3 1 88161 CASAVA_Build 14 71293769 4I GAACAAGATT ----/GTTA GTTATGAGTA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 GTTA 1 2 88162 CASAVA_Build 14 71302132 1D TTTTGGGGGG C/- CTAGAAAATG 3018 het 3018 ref 27 20 7 0 C 2 1 88163 CASAVA_Build 14 71314619 1I TCCACCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 40 1 29 10 T 12 13 88164 CASAVA_Build 14 71317364 4D GTTGTAAAAT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 TC 8 6 88165 CASAVA_Build 14 71322210 9I ACATTATGAT ---------/ATATTGGTC AGTGACAGTG 3070 hom 60 het 21 0 21 1 ATATTGGTC 0 1 88166 CASAVA_Build 14 71323306 1I AGATACCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 T 10 11 88167 CASAVA_Build 14 71327800 1D TGTAAACATG T/- GTGTGCAAGT 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 T 1 0 88168 CASAVA_Build 14 71329395 26D TATTCTGCTG ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 3070 het 1444 hom 24 4 19 5 AT 19 6 88169 CASAVA_Build 14 71330692 1I GTTTTGGTAG -/T TTTATGTCTT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 3 4 88170 CASAVA_Build 14 71335042 1I GCACTTTACC -/A ATCCCACTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 2 88171 CASAVA_Build 14 71335544 2I ATGGAGATTG --/TA TAAATATTTG 3070 het 3070 ref 59 28 23 8 TA 1 2 88172 CASAVA_Build 14 71354864 1I TTTTGCTGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 8 9 88173 CASAVA_Build 14 71357726 1I CTCCCCACCC -/T GGGCTCAAGC 3070 hom 63 het 25 0 20 5 T 0 1 88174 CASAVA_Build 14 71359225 1D GAGTTTGTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 T 10 9 88175 CASAVA_Build 14 71362742 1I GATAGGGAGA -/G GGCCCCTTGG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 2 3 88176 CASAVA_Build 14 71373355 1I ATAAATGATC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 7 8 88177 CASAVA_Build 14 71373817 4D AGTGTTGTTT ATAA/---- ATAAAGACAA 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 ATAA 2 1 88178 CASAVA_Build 14 71377284 1D CTTTTTATGT C/- CCCCTTCTCC 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 C 5 4 88179 CASAVA_Build 14 71377653 1D TTTTTCCTGA T/- CAATCTGGCT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 1 0 88180 CASAVA_Build 14 71378392 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2722 het 2369 hom 25 8 11 7 T 13 12 88181 CASAVA_Build 14 71379249 2D GAAATGAATA TG/-- TGTTTCTTAC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TG 2 1 88182 CASAVA_Build 14 71379423 4D ATTATATCTT TTTA/---- TTTATTTATT 1458 het 668 hom 10 2 3 5 TTTA 5 4 88183 CASAVA_Build 14 71385759 3D TCATATTTTC CTA/--- CTTCTTTGGA 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 CTA 1 0 88184 CASAVA_Build 14 71387264 1I TATAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 850 hom 14 2 10 2 A 10 11 88185 CASAVA_Build 14 71389171 1D TATCTCATTT G/- AAAGCTGAAG 3070 hom 126 het 48 0 42 8 G 1 0 88186 CASAVA_Build 14 71390274 4D CCATTTCTTT TTTC/---- TTTCTTTTTT 1981 hom 30 het 18 0 11 7 TTTC 2 1 88187 CASAVA_Build 14 71393597 1I CTTATCAAGC -/T AATCAGGGAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 0 1 88188 CASAVA_Build 14 71396830 3D CAATAGCTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 31 6 A 13 10 88189 CASAVA_Build 14 71403908 3D TCTCCCATCC CAT/--- CATCTCACAT 3070 het 3070 hom 32 11 19 3 CAT 2 1 88190 CASAVA_Build 14 71422240 2D TCCAATGCTG TC/-- TCTACTTTTA 3070 hom 126 het 48 0 41 7 TC 2 1 88191 CASAVA_Build 14 71424853 1D CTGTCATTGC A/- TGCCAGCCTG 3070 hom 60 het 23 0 19 5 A 1 0 88192 CASAVA_Build 14 71431303 1I CCTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 10 88193 CASAVA_Build 14 71434756 3D TCCCTGACTT CTC/--- CTCCAACCCT 3070 hom 101 het 41 0 34 9 CTC 2 1 88194 CASAVA_Build 14 71437628 14D TCTCAAAGTG AGTAAAACTGAAGA/-------------- AAGTTATTTG 3070 hom 126 het 41 0 43 1 AGTAAAACTGAAGA 1 0 88195 CASAVA_Build 14 71438546 3I TTCTGAGGAG ---/AAA AAAAAACCTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 9 88196 CASAVA_Build 14 71455459 1I AAATTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 10 11 88197 CASAVA_Build 14 71472514 1D8M1D ATATATATGT ACATATATAT/-CATATATA- CATATATACA 1064 het 1064 ref 12 3 3 7 N/A 0 0 88198 CASAVA_Build 14 71492303 1D CTCAGCCTCA T/- TTTACCCAGC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 4 3 88199 CASAVA_Build 14 71495131 1D GCTAAAGGAG C/- CCCCCCATTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 7 6 88200 CASAVA_Build 14 71508815 1I TTTCTGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 T 10 11 88201 CASAVA_Build 14 71524401 4D TTTTTCAAAC AATG/---- AGAGAAAGTG 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 AATG 1 0 88202 CASAVA_Build 14 71528493 2D CTAGAATATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 645 hom 29 7 11 12 T 16 14 88203 CASAVA_Build 14 71529356 2D CTTATGAATA CT/-- CTCTATATTT 3070 het 3070 hom 32 14 12 7 CT 3 2 88204 CASAVA_Build 14 71529783 1D TGACAAAATA T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 8 7 88205 CASAVA_Build 14 71535536 1D CCCTATCTCT A/- AAAAATAATA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 6 5 88206 CASAVA_Build 14 71536337 1I ATTAAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 30 1 22 7 T 13 14 88207 CASAVA_Build 14 71539076 1I CCAACTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2687 hom 32 12 11 9 A 10 11 88208 CASAVA_Build 14 71543623 1I TGCTTTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1139 hom 39 3 27 9 T 12 13 88209 CASAVA_Build 14 71544995 1D CATTGTACTA G/- GGTTGGCCTG 3070 hom 117 het 41 0 37 4 G 3 2 88210 CASAVA_Build 14 71548053 2D TCAAAAATAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 12 10 88211 CASAVA_Build 14 71549829 7D CATTAATGAC TCCATTT/------- TCCATTTGAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TCCATTT 2 1 88212 CASAVA_Build 14 71550280 1I GGCTGGGGCC -/T TTCAGGCTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 2 3 88213 CASAVA_Build 14 71554665 5I TCTTTTCTTG -----/TTTGT TTTGTTTTGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTTGT 2 3 88214 CASAVA_Build 14 71556090 1D TTTTAAAGAT A/- ATACTGTCAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 2 1 88215 CASAVA_Build 14 71559184 4D TTTCACTCTT TGGC/---- TGGCTCAGGA 3070 hom 99 het 39 0 31 8 TGGC 2 1 88216 CASAVA_Build 14 71560547 50D TAGCACATAA CGAGGACTCGGTAAATATTTGTTGAATGAATGAAAAATAATTGCTGCCTG/-------------------------------------------------- GGAGAAGTTG 3070 het 3070 ref 32 29 16 2 CGAGGACTCGGTAAATATTTGTTGAATGAATGAAAAATAATTGCTGCCTG 1 0 88217 CASAVA_Build 14 71570875 1D TTTTCAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 870 hom 40 2 31 7 T 12 11 88218 CASAVA_Build 14 71571775 3D GCAATATATT ATA/--- ATCCTTTTTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 ATA 1 0 88219 CASAVA_Build 14 71571843 2I TATTTGAATC --/CT CTCTATATTT 3070 hom 63 het 28 0 21 7 CT 2 3 88220 CASAVA_Build 14 71579118 1D TATAATAAAC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 9 8 88221 CASAVA_Build 14 71579965 1D TTTTGAAGGA T/- AACTTTGCTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 0 88222 CASAVA_Build 14 71581350 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAACCA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 8 7 88223 CASAVA_Build 14 71589123 1I TTTTCTTACT -/G GAATTTTTTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 1 2 88224 CASAVA_Build 14 71590732 5D TGTTTGGGAG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 14 14 GTTTT 5 4 88225 CASAVA_Build 14 71591783 1I CAGACATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 10 11 88226 CASAVA_Build 14 71594978 1I ATATAAAGGG -/T TTTTTTTTTT 1458 het 1458 ref 35 20 4 11 T 11 12 88227 CASAVA_Build 14 71627476 2I CACTAAATAA --/AC CCCTCTTTTA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 AC 0 1 88228 CASAVA_Build 14 71627607 2I ACACTGGCTG --/TC TCTCCACAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TC 2 3 88229 CASAVA_Build 14 71678363 1D ATTTTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 40 0 27 13 A 13 12 88230 CASAVA_Build 14 71693176 4I CAGCAGGAAA ----/CAAT CAAGTAAGGA 3070 hom 102 het 39 0 34 6 CAAT 0 1 88231 CASAVA_Build 14 71695323 7D AGCAAGGGCT CTAGAGC/------- TTTCCGCCTG 3070 hom 157 het 55 0 53 5 CTAGAGC 1 0 88232 CASAVA_Build 14 71698650 1D AGTACAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 38 0 31 9 A 11 10 88233 CASAVA_Build 14 71701159 2D ATGTCATGAC TT/-- TGCCCTCCCC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 3 1 88234 CASAVA_Build 14 71705805 2I ATGTCTTCTA --/AG AAGAAAATTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AG 0 1 88235 CASAVA_Build 14 71710578 1D CATTGGATTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 9 8 88236 CASAVA_Build 14 71730924 1D CTCAAGCTCC T/- TGGGCTCAAG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 2 1 88237 CASAVA_Build 14 71743326 2D GTATATATAT AA/-- AATACATGTA 3070 hom 108 het 42 0 37 7 A 4 2 88238 CASAVA_Build 14 71745380 17D AAATAAGAAT AATGAAATAAGAATATC/----------------- AATGAAATAA 3070 hom 72 het 39 0 25 15 AATGAAATAAGAATATC 2 1 88239 CASAVA_Build 14 71745858 4D TCTATAAATT TTTC/---- TTTCTATTTC 3070 het 3061 hom 21 9 12 1 TTTC 2 1 88240 CASAVA_Build 14 71750549 1I GTTTTATGCA -/T TTTTGAGTTA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 4 5 88241 CASAVA_Build 14 71750639 1D TATTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 2089 het 1240 hom 18 5 6 8 T 17 16 88242 CASAVA_Build 14 71760920 1D TGGGTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 T 11 10 88243 CASAVA_Build 14 71767758 1I TATCATTGTT -/A ACGATTTCAT 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 A 1 2 88244 CASAVA_Build 14 71767943 4D GGCAAACAGA ACAG/---- ACAAAGTCTC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 ACAG 1 0 88245 CASAVA_Build 14 71779790 15D ATCTCAGTTT CTTGAATCTCAGTTC/--------------- CTTGAATCTT 1676 het 1676 ref 25 17 4 7 CTTGAATCTCAGTTC 1 0 88246 CASAVA_Build 14 71783367 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1568 het 1299 hom 20 9 4 7 A 18 14 88247 CASAVA_Build 14 71786702 1I AAACTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1997 hom 20 7 13 0 A 11 12 88248 CASAVA_Build 14 71787070 1D AGTGGGTTTC A/- ATCTTGAATA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 2 1 88249 CASAVA_Build 14 71788718 1D TGACAGAAAA G/- GTTTTCAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 2 1 88250 CASAVA_Build 14 71797910 15D GAAATTACTA TACTTTTAGTAAGTG/--------------- AGTGAGTCTT 3070 het 3070 ref 52 30 24 7 TACTTTTAGTAAGTG 1 0 88251 CASAVA_Build 14 71799981 1D ATGTATGTGT C/- CCCCCCAAAT 3070 hom 80 het 32 0 28 5 C 7 6 88252 CASAVA_Build 14 71802400 1D TCGCTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 2660 het 1278 hom 21 6 9 6 G 11 10 88253 CASAVA_Build 14 71803456 4D ATTGTCATAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 38 10 16 14 TTTG 6 5 88254 CASAVA_Build 14 71805601 3D CTCCGCCCCC CCA/--- CCACCCACCT 3070 hom 89 het 35 0 28 7 CCA 2 1 88255 CASAVA_Build 14 71806029 4D CTATCTTAAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 201 hom 23 4 12 7 T 27 23 88256 CASAVA_Build 14 71806729 6I AAACGAGGTT ------/CATGCC CATGCCCACA 3070 het 3070 hom 63 28 29 6 CATGCC 1 2 88257 CASAVA_Build 14 71818048 2D GATCGAGTGA TG/-- GAGGAGAAGA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TG 1 0 88258 CASAVA_Build 14 71820821 1I GAAAAAATGG -/C CCCCCCCACC 2617 het 2617 ref 28 12 10 6 C 7 8 88259 CASAVA_Build 14 71822984 1I AATTTTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 T 10 11 88260 CASAVA_Build 14 71828521 3I ACACAGTAAC ---/TCA ACGGTAGGGA 3070 hom 75 het 29 0 23 6 TCA 0 1 88261 CASAVA_Build 14 71834141 1D CGGTGTTTGG T/- TTTTTGTTCT 2363 hom 12 het 6 0 5 1 T 6 5 88262 CASAVA_Build 14 71843721 1I ATAAACATAA -/C TTTTATATGT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 C 0 1 88263 CASAVA_Build 14 71851018 1I GGGAGACAGC -/T TCTAGAGTGA 3070 het 3070 hom 49 14 26 9 T 1 2 88264 CASAVA_Build 14 71851617 1I TAAATATCAG -/C CTGAGAGATT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 1 2 88265 CASAVA_Build 14 71861933 1I TCTTCTAGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 1325 hom 12 3 9 0 T 7 8 88266 CASAVA_Build 14 71868080 2D TGTCATCATC CT/-- CTCTCTCTCT 2279 het 2279 ref 46 27 5 15 CT 8 7 88267 CASAVA_Build 14 71871534 24I TCTTAGGAGG ------------------------/TCTGATGGTTTTATAAAGGGGAGT TCTTCTGCAC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 TCTGATGGTTTTATAAAGGGGAGT 0 1 88268 CASAVA_Build 14 71885609 1I GCCTGGGTGA -/C AGAGTGAGAC 1727 het 1727 ref 15 8 4 3 C 0 1 88269 CASAVA_Build 14 71896827 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 911 het 384 hom 3 1 2 1 A 7 6 88270 CASAVA_Build 14 71906612 1I AAAATCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3018 het 3018 ref 29 15 9 5 A 14 15 88271 CASAVA_Build 14 71916930 1D TCTTGACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 12 11 88272 CASAVA_Build 14 71992067 2D GGCCCGAGTC TT/-- TTCACCCCCT 3070 het 3070 hom 33 14 18 3 T 4 2 88273 CASAVA_Build 14 71999167 2I TGTCATAGAG --/GA GAAACTCTGC 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 GA 1 2 88274 CASAVA_Build 14 72013950 1D TGGATATATG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 10 9 88275 CASAVA_Build 14 72018932 1D TCAGTGGCTT A/- AAAAATAGGC 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 A 6 5 88276 CASAVA_Build 14 72020430 1I TCTCCAAGTG -/A AAAAAAAAAA 2883 het 2883 ref 27 13 8 6 A 11 12 88277 CASAVA_Build 14 72022563 1D TAAAGGGCTT C/- CCCCCTTCAT 3070 hom 135 het 50 0 45 5 C 6 5 88278 CASAVA_Build 14 72024325 1I AAACAAATAT -/A AAAACCCCAG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 4 5 88279 CASAVA_Build 14 72027747 1I60M1D CCAGAAGATG -AAAAAAAAAAATCTGTGTGAACAACGGTGTTCTACCACAGCACTATGTATATTAAAAAAGA/AAAAAAAAAAAATCTGTGTGAACAACGGTGTTCTACCACAGCACTATGTATATTAAAAAAG- AAAAAATCTG 3070 hom 90 het 35 0 31 26 N/A 0 0 88280 CASAVA_Build 14 72032486 2I GTCTCTGTCA --/CT CTCACATTGT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 CT 1 2 88281 CASAVA_Build 14 72032692 1I GTGGTTCCCA -/G GAGTGGATCA 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 G 1 2 88282 CASAVA_Build 14 72034319 1I TTATTGCTGC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 7 8 88283 CASAVA_Build 14 72037860 1D TTCAGAGGGG A/- AAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 40 25 13 3 A 7 6 88284 CASAVA_Build 14 72061192 1D CCCAGATGGC T/- TTTTTTTTGC 1357 het 1357 ref 32 25 3 4 T 9 8 88285 CASAVA_Build 14 72062739 1I TAATTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 1230 het 1230 ref 12 6 4 2 T 9 10 88286 CASAVA_Build 14 72067452 1I ATCTGTAAAA -/G ATAAACACAT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 G 0 1 88287 CASAVA_Build 14 72084202 1I AGTGGCAGGG -/C CCACAGGGCA 3070 hom 62 het 29 0 16 13 C 2 3 88288 CASAVA_Build 14 72087309 1D TTTGGGGGGG T/- GTTTTTTTTG 3070 het 2096 hom 20 6 13 1 T 1 0 88289 CASAVA_Build 14 72125637 5D GTGTTTAAAA AAAAT/----- AAAATAAAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AAAAT 2 1 88290 CASAVA_Build 14 72127530 1D AAATTCATAC A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 8 7 88291 CASAVA_Build 14 72140173 1D AAACATAGAT A/- AGAGGTTGGA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 2 1 88292 CASAVA_Build 14 72219934 1I TGGCTTTAAT -/G TGGTGTGACA 3070 hom 117 het 42 0 38 4 G 0 1 88293 CASAVA_Build 14 72233517 10D GACCTTTGTT CAGTTATTAG/---------- CAGTTATTAG 3070 hom 69 het 27 0 21 9 CAGTTATTAG 2 1 88294 CASAVA_Build 14 72235340 1I TGTATCCGCA -/G GTGCTGTGTC 3070 hom 82 het 31 0 27 4 G 1 2 88295 CASAVA_Build 14 72239981 1D AATGCAGAAA C/- CCCCCAAAAC 3070 hom 95 het 40 0 32 8 C 6 5 88296 CASAVA_Build 14 72244273 1D TTTTCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 41 0 31 10 T 13 12 88297 CASAVA_Build 14 72254625 4I ACCTGGGTTC ----/CTTA CTGTTTCCCA 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 CTTA 0 1 88298 CASAVA_Build 14 72256806 1D TAATAATTAT A/- AAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 6 5 88299 CASAVA_Build 14 72307440 1I GAGTTCGAGA -/C CAGCCTGACC 1821 het 1821 ref 15 5 6 4 C 1 2 88300 CASAVA_Build 14 72307628 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2400 het 1277 hom 15 4 5 6 A 13 12 88301 CASAVA_Build 14 72309595 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2610 het 1344 hom 25 9 8 8 T 17 16 88302 CASAVA_Build 14 72312447 1D TATTTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 1690 het 1690 ref 48 23 6 19 A 17 16 88303 CASAVA_Build 14 72317257 1I AAGCTCACTG -/A ATTCTCAATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 88304 CASAVA_Build 14 72319298 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 11 12 88305 CASAVA_Build 14 72329393 1D ATAATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 A 12 11 88306 CASAVA_Build 14 72332719 1D GCCTGTAATT C/- CAGAAGGCGG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 C 2 1 88307 CASAVA_Build 14 72342278 1I CTGCACTCTA -/C CCTGGGTGAC 3070 hom 66 het 24 0 20 4 C 2 3 88308 CASAVA_Build 14 72347074 4I GGGAAAAGAA ----/AAAC TAACTCTAAG 3070 hom 125 het 45 0 38 7 AAAC 0 1 88309 CASAVA_Build 14 72358308 1I CTCCACTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 49 1 39 9 T 10 11 88310 CASAVA_Build 14 72363587 1I TATAAGTCCA -/G GCTTCTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 2 88311 CASAVA_Build 14 72367045 1D CCCATCCCAG T/- TGTGGGGAGG 3070 het 3070 hom 49 20 25 5 T 2 1 88312 CASAVA_Build 14 72371450 5D ATGGAATATC TAGAA/----- TAGGGAAATC 2854 het 2854 ref 27 17 6 4 TAGAA 1 0 88313 CASAVA_Build 14 72377620 3I TGTTTCTAGC ---/TTG TTGTTTGGGG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTG 1 2 88314 CASAVA_Build 14 72381688 1I GTAAGGAAAG -/A AACAGTGAAA 3070 het 3070 ref 52 28 17 7 A 2 3 88315 CASAVA_Build 14 72389676 1I CATGTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 T 11 12 88316 CASAVA_Build 14 72394856 2D CACAGGCTAC AG/-- AGAGAGCAGG 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 AG 4 3 88317 CASAVA_Build 14 72396637 10D TATTAACATC TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 het 2112 hom 28 6 18 7 TTTTG 4 2 88318 CASAVA_Build 14 72397105 1D GGCTCACCAC A/- AACCTCCACC 3070 hom 27 het 11 0 9 2 A 3 2 88319 CASAVA_Build 14 72399520 26D TTATTCCATT TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 3070 hom 33 het 13 0 11 3 TA 21 8 88320 CASAVA_Build 14 72410629 1D AATCAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2900 hom 23 10 11 2 A 13 12 88321 CASAVA_Build 14 72412501 3D GGTTGTTGTT GAA/--- GAAGAAGAAG 3070 hom 97 het 41 0 28 14 GAA 5 4 88322 CASAVA_Build 14 72424153 3I ATGCGGCTCA ---/AAG AAGTTCTGTG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 AAG 1 2 88323 CASAVA_Build 14 72430573 4I AACAGAATAT ----/TGTC TGTCTCAGAG 3070 hom 45 het 18 0 14 4 TGTC 1 2 88324 CASAVA_Build 14 72432742 1I TAAAGATTTC -/T TTTTTTTTTT 2944 het 679 hom 25 2 17 6 T 17 18 88325 CASAVA_Build 14 72435971 5I CATTTCTAAC -----/GCTGG GCTGGTCGAG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 GCTGG 1 2 88326 CASAVA_Build 14 72440386 12I AGTGAGCCAT ------------/GCAGTGTACATG GATTACACCA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 GCAGTGTACATG 0 1 88327 CASAVA_Build 14 72442975 2D TGCCAGAAAC TT/-- AGATTCAGTA 3070 het 3070 ref 53 27 20 8 T 2 0 88328 CASAVA_Build 14 72447733 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 1521 het 1521 ref 44 29 5 12 CA 10 9 88329 CASAVA_Build 14 72456025 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1517 het 177 hom 24 2 11 11 T 15 13 88330 CASAVA_Build 14 72473689 4D ATGGGGGAAC AGAT/---- AGATGTCTGC 3070 hom 69 het 33 0 24 12 AGAT 2 1 88331 CASAVA_Build 14 72477436 1I TTTTTTGGGG -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 37 het 16 0 12 4 T 7 8 88332 CASAVA_Build 14 72478073 1I CACCGTCAGA -/T TTTTTATGCA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 5 6 88333 CASAVA_Build 14 72487272 1D TTTCTGTATG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 43 0 39 5 T 9 8 88334 CASAVA_Build 14 72488087 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 911 het 911 ref 31 24 3 5 A 10 9 88335 CASAVA_Build 14 72488486 1D GAAGCATGTG T/- TTTTTTTACA 3070 hom 123 het 45 0 40 5 T 8 7 88336 CASAVA_Build 14 72491016 3D TGAAATTGGA CTC/--- CTCTGTGTGC 3070 het 3070 ref 41 23 14 6 CTC 2 1 88337 CASAVA_Build 14 72498643 1I GTGAGACGAG -/A AAGGGCTTCT 3070 hom 101 het 38 0 32 6 A 2 3 88338 CASAVA_Build 14 72500108 4D AAAAACAAAC AAAA/---- AAAAAACCTC 3070 hom 105 het 37 0 35 3 A 10 6 88339 CASAVA_Build 14 72500965 1I TTGGCATCCC -/A AAGCACTGGG 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 2 3 88340 CASAVA_Build 14 72506427 5D TAAGACACTT TAAAA/----- TAAGCAATGA 1872 het 1872 ref 23 13 6 5 TAAAA 1 0 88341 CASAVA_Build 14 72512368 3I CCATAAGACT ---/TGA TGATGTGTAG 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 TGA 1 2 88342 CASAVA_Build 14 72522253 1D ATTATTTTCA T/- TTTTTAAAAT 1856 het 1856 ref 17 9 4 4 T 6 5 88343 CASAVA_Build 14 72528064 1D AGATTTACAG C/- CCCTTTGCCT 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 C 4 3 88344 CASAVA_Build 14 72531962 1I CCAAAGTGCT -/G GGACTATAGG 3070 hom 93 het 38 0 30 8 G 2 3 88345 CASAVA_Build 14 72534781 1I TGTTACCTGC -/A AAAAAAAAAA 2910 het 2395 hom 26 7 9 10 A 15 16 88346 CASAVA_Build 14 72538938 1I GAGTTTTTGC -/T CTGTTGCCCA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 0 1 88347 CASAVA_Build 14 72547633 1D TCACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 A 13 12 88348 CASAVA_Build 14 72552430 1D AAGAACGAAG A/- AAAACAAATG 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 5 4 88349 CASAVA_Build 14 72555876 1I GACCCCATCT -/A AAAAAAAAAA 2589 het 2589 ref 22 11 6 5 A 10 11 88350 CASAVA_Build 14 72571802 6D GAAAAAAAAA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 2084 het 2084 ref 20 7 7 6 AG 12 9 88351 CASAVA_Build 14 72578548 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 10 11 88352 CASAVA_Build 14 72591746 1I GCTTAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3061 hom 21 8 11 2 A 11 12 88353 CASAVA_Build 14 72597447 2I ATCAGGAAAC --/TT TAACACTGAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 1 3 88354 CASAVA_Build 14 72606904 1D TTTTAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 880 hom 29 2 22 5 A 11 10 88355 CASAVA_Build 14 72609080 4I AGCATGGAGA ----/ATCC ATCCACATTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 ATCC 1 2 88356 CASAVA_Build 14 72617963 1D TATCCTTGGA T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 47 20 22 7 T 7 6 88357 CASAVA_Build 14 72623523 7I CACACTGAAA -------/ATGTTAT TGTCAAATTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 ATGTTAT 0 1 88358 CASAVA_Build 14 72623795 4D CTGCAGTCTG TTCT/---- TTCTTGTGGC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 TTCT 2 1 88359 CASAVA_Build 14 72631800 1I GGTGTGGTCG -/C TCACGCCTGT 3070 hom 54 het 19 0 17 2 C 0 1 88360 CASAVA_Build 14 72632068 1I ACTCCGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2537 het 1808 hom 16 5 7 4 A 13 14 88361 CASAVA_Build 14 72648875 1I TTTTGGTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 9 10 88362 CASAVA_Build 14 72656088 1I TCAGTGGATG -/A AAAAACTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 5 6 88363 CASAVA_Build 14 72660609 4I ATGTGATAAG ----/CTAA CTGAGAGGAA 3070 hom 87 het 40 0 30 10 CTAA 0 1 88364 CASAVA_Build 14 72670600 2I GTTGCAGGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 30 0 19 11 T 14 16 88365 CASAVA_Build 14 72690124 1I CATTAAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3039 hom 35 8 15 12 T 14 15 88366 CASAVA_Build 14 72690896 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 20 0 15 5 A 10 11 88367 CASAVA_Build 14 72698935 2D CCATGAGAAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 37 10 14 14 GA 10 9 88368 CASAVA_Build 14 72703609 3D TATATGGTAC CAG/--- CAGCACCTGA 3070 hom 108 het 38 0 36 4 CAG 2 1 88369 CASAVA_Build 14 72704204 1D ACGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 T 11 10 88370 CASAVA_Build 14 72716477 1I ACGGAGTCTC -/A AGTCTCTCGC 3070 het 2882 hom 17 9 8 0 A 1 2 88371 CASAVA_Build 14 72719754 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1739 hom 16 5 9 2 T 12 11 88372 CASAVA_Build 14 72738673 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 10 11 88373 CASAVA_Build 14 72760399 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 12 11 88374 CASAVA_Build 14 72761059 1D GGTGTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 2671 het 344 hom 20 1 9 10 T 12 11 88375 CASAVA_Build 14 72788874 1I CAGGACCGGA -/G GCTGGGCCTG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 1 2 88376 CASAVA_Build 14 72789958 1I GAAGGAGAAA -/G GGGGGATAGG 1909 het 1909 ref 21 7 8 6 G 5 6 88377 CASAVA_Build 14 72793872 1I CATTATTTCA -/G GGGGGGGTCC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 7 8 88378 CASAVA_Build 14 72801735 2I TGGCTGGAGA --/GG GGGAGAAGGG 3070 hom 92 het 33 0 28 5 G 3 5 88379 CASAVA_Build 14 72805757 1D ACTCCCCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 585 hom 39 3 33 3 T 13 12 88380 CASAVA_Build 14 72806317 2D GGTTACACTC AG/-- AGGGGCAGGC 3070 hom 73 het 26 0 19 7 AG 2 1 88381 CASAVA_Build 14 72808330 5D GAAAACAAGG GCTTT/----- GCTTTGTTCT 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 GCTTT 2 1 88382 CASAVA_Build 14 72814224 1I ATTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1649 hom 23 8 11 4 A 13 14 88383 CASAVA_Build 14 72822387 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2934 het 1558 hom 16 6 7 3 A 14 12 88384 CASAVA_Build 14 72823056 1D AGGGCTATAG A/- AAAAAAGAGT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 7 6 88385 CASAVA_Build 14 72836022 26D TATCATATAT GTCATATATATGACATGACATATGTC/-------------------------- ATGTCATATA 3070 het 3070 ref 29 25 9 5 GTCATATATATGACATGACATATGTC 1 0 88386 CASAVA_Build 14 72836527 2D ATTAATAAAC TT/-- TTAAAAACCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 T 4 2 88387 CASAVA_Build 14 72840250 1D ACAAAAATCC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 420 hom 38 1 27 10 T 9 8 88388 CASAVA_Build 14 72847205 1D AGCACATAAT A/- AACTATAAAG 3070 het 3070 hom 49 17 25 9 A 3 2 88389 CASAVA_Build 14 72855308 1D TAGTTATAAT A/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 1 0 88390 CASAVA_Build 14 72857879 2I TGTATTTATT --/TA TAGTTGAGAC 3070 het 3070 ref 28 11 14 3 TA 1 2 88391 CASAVA_Build 14 72863391 4I TCATACACAC ----/AGCT AGCTAGTCAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 AGCT 1 2 88392 CASAVA_Build 14 72863512 1I AAGGAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 10 11 88393 CASAVA_Build 14 72867202 4I GTCTACTGTT ----/AGTC AGGGTTTTCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AGTC 0 1 88394 CASAVA_Build 14 72873598 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 798 het 798 ref 34 29 2 4 A 12 11 88395 CASAVA_Build 14 72874765 1I ACAAGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 1191 het 1191 ref 33 26 3 4 A 11 12 88396 CASAVA_Build 14 72879464 1I ATTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 2869 het 2869 ref 36 14 14 8 T 11 12 88397 CASAVA_Build 14 72880229 3I3M6I TGTTGATATC ---AAA------/TCTAAATTAATT AAGGAGATAG 3070 hom 60 het 21 0 21 1 N/A 0 0 88398 CASAVA_Build 14 72892484 3I TCCTTGTAAG ---/AAC AACAATAACT 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 AAC 1 2 88399 CASAVA_Build 14 72898850 3I GAGGGAAAAG ---/AGA AGGAGGAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 AGA 0 1 88400 CASAVA_Build 14 72905506 1D GAACATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 30 0 18 12 T 15 14 88401 CASAVA_Build 14 72906587 1I TAATGGTAGT -/G GGGGGGGGTG 1948 het 1948 ref 20 6 8 6 G 8 9 88402 CASAVA_Build 14 72907497 1D TGGACTCCCA T/- TCTCGGCCTC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 2 1 88403 CASAVA_Build 14 72912991 1D GTTTATATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 12 11 88404 CASAVA_Build 14 72927745 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2093 het 2093 ref 30 9 7 14 T 13 14 88405 CASAVA_Build 14 72929315 1I CTACCAAGGG -/T TAAGAGGATC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 1 2 88406 CASAVA_Build 14 72931108 1D CCAGAACTTA T/- TCATCCTAAC 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 T 2 1 88407 CASAVA_Build 14 72931742 1I GGTTGATTCC -/A TATCTTGGCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 0 1 88408 CASAVA_Build 14 72931849 7I TTTGGGAGGC -------/AGAGGTA AGAGGTAGGT 3070 het 1913 hom 21 6 10 5 AGAGGTA 1 2 88409 CASAVA_Build 14 72932188 1D TCATTCACAT A/- GGGATTAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 16 6 A 1 0 88410 CASAVA_Build 14 72932994 3I TGTATTTTTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TTG 2 3 88411 CASAVA_Build 14 72935578 4D ATCAAAAAAG AATA/---- AATAGATTCA 3070 het 3070 hom 43 17 24 4 AATA 2 1 88412 CASAVA_Build 14 72938353 4I GAGACAGGGT ----/CTCA CTCTGTCACC 3070 het 1898 hom 16 4 11 1 CTCA 0 1 88413 CASAVA_Build 14 72942555 4I ATATTTTTGT ----/TTTA TTTTTTTTTT 3070 het 845 hom 19 8 11 0 TTTA 0 1 88414 CASAVA_Build 14 72944688 1D25M1D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAAACGT/-AAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAAACG- TAAGATATTT 3070 hom 69 het 24 0 22 6 N/A 0 0 88415 CASAVA_Build 14 72947815 3I TTAAACCTCA ---/GTT AGTTTATTTG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 GTT 0 1 88416 CASAVA_Build 14 72947881 2D AAGATGCTAT AA/-- GAGGCCAATC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 0 88417 CASAVA_Build 14 72951650 4D CAGACTGTAG TGCT/---- TGCTTCTCAT 3070 het 3070 hom 56 27 26 3 TGCT 2 1 88418 CASAVA_Build 14 72951768 3D ATATGCAAGA AAC/--- AACATTGTTA 3070 het 3070 hom 43 18 23 4 AAC 2 1 88419 CASAVA_Build 14 72954566 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 12 11 88420 CASAVA_Build 14 72958603 1D AGACTTCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 13 12 88421 CASAVA_Build 14 72982461 1D TAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2614 hom 30 9 10 12 T 15 14 88422 CASAVA_Build 14 72984136 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 11 10 88423 CASAVA_Build 14 72986160 4I AATGTTTTGG ----/TGTT TGTTTGTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TGTT 2 3 88424 CASAVA_Build 14 72992758 1I TTTTAAAGAT -/G GGGGGTCTCA 2377 het 1448 hom 11 5 5 1 G 5 6 88425 CASAVA_Build 14 72993507 1D AACTCACATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 31 hom 49 1 23 25 A 10 9 88426 CASAVA_Build 14 72994490 1I CCGGCCGCTG -/C CGGGCTTCCC 1203 hom 24 het 11 0 5 6 C 1 2 88427 CASAVA_Build 14 72996100 1D CATTATACCC T/- TTATGATGCT 3070 het 3070 ref 17 9 7 1 T 3 2 88428 CASAVA_Build 14 72996218 2D TTTAAAAGCT TC/-- TCTCTCTCTC 2015 het 2015 ref 33 18 8 8 TC 8 7 88429 CASAVA_Build 14 72996310 1I TGTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 1253 het 1253 ref 28 20 3 5 T 12 13 88430 CASAVA_Build 14 73000512 1I TGTTCAATTC -/A GGGCCAGCAT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 0 1 88431 CASAVA_Build 14 73002545 7D TCTCTCCTTC CTATTCT/------- CTATTCTGTG 3070 hom 99 het 41 0 34 8 CTATTCT 2 1 88432 CASAVA_Build 14 73003705 1I TCCTCCAGGT -/G GGGGGCTATC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 G 5 6 88433 CASAVA_Build 14 73005141 1D ACACTTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 56 2 34 20 T 15 14 88434 CASAVA_Build 14 73031519 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 795 hom 38 2 29 7 A 10 9 88435 CASAVA_Build 14 73043262 9D ACTTTAACTG TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 949 hom 21 6 10 5 T 21 12 88436 CASAVA_Build 14 73064012 1I TTCGCAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 8 9 88437 CASAVA_Build 14 73073434 3D TAGCTGCCTG GTT/--- GTTGTTGTTT 2216 het 1726 hom 27 11 8 9 GTT 4 3 88438 CASAVA_Build 14 73103973 23D CCAATCAGCA CTCTGTAAAATGGAAAATCAGCG/----------------------- CTCTGTAAAA 2603 het 2603 ref 28 18 6 9 CTCTGTAAAATGGAAAATCAGCG 1 0 88439 CASAVA_Build 14 73110494 1D AATATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1737 het 1114 hom 13 5 5 3 T 13 12 88440 CASAVA_Build 14 73119997 3I GAATGTCAGG ---/TGA TGATGGTTCG 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TGA 1 2 88441 CASAVA_Build 14 73122239 1I GAAGGGAATG -/A AAAAAAAAAA 3044 het 3044 ref 20 9 7 4 A 10 11 88442 CASAVA_Build 14 73123815 1D CAACATCCAC T/- TTTTTTTTTT 2952 het 1708 hom 30 9 10 11 T 13 12 88443 CASAVA_Build 14 73130893 8D TGGGATCTGT GGCTCAGC/-------- GGCTCAGCGG 3070 het 3070 hom 44 16 19 11 GGCTCAGC 3 2 88444 CASAVA_Build 14 73139537 2D CTCTTAGCAA TT/-- TTTAATTTTA 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 T 5 3 88445 CASAVA_Build 14 73154373 1D AGGCCAAGGC G/- GGCAGATCAC 3070 het 749 hom 14 3 9 2 G 3 2 88446 CASAVA_Build 14 73154432 2I TGAAACCCCA --/TC TCTACTAAAG 2680 het 483 hom 11 1 7 3 TC 1 2 88447 CASAVA_Build 14 73155081 5D AAGGCAGGAG AAAAT/----- AATATACTGT 3070 het 3070 hom 31 12 17 5 AAAAT 1 0 88448 CASAVA_Build 14 73156377 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 1349 het 1244 hom 24 7 7 10 T 15 16 88449 CASAVA_Build 14 73157691 2D TGTCTCTGAA CG/-- CCAGTCTGAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 CG 1 0 88450 CASAVA_Build 14 73164238 1I CTCCTCCCCA -/G GGTTTGGTAG 801 het 801 ref 23 12 4 9 G 2 3 88451 CASAVA_Build 14 73168882 11D AAGTGTTTCC TTCCAGAACCA/----------- TTCCAGAACC 2513 het 2513 ref 21 11 7 6 TTCCAGAACCA 2 1 88452 CASAVA_Build 14 73170278 1I TGGCGCCGCA -/G GGACCAGCCC 2508 hom 27 het 13 0 9 4 G 2 3 88453 CASAVA_Build 14 73175034 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2929 het 400 hom 16 3 7 6 A 16 15 88454 CASAVA_Build 14 73177202 1D ACTCTTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 12 6 A 12 11 88455 CASAVA_Build 14 73180014 1D ACTATGGGTG T/- TGTACCACCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 1 88456 CASAVA_Build 14 73210343 1I GACAGAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 35 0 26 9 A 10 11 88457 CASAVA_Build 14 73254391 1I AGGAGGCTGG -/C CCCCAGGAGG 3070 hom 79 het 29 0 22 7 C 4 5 88458 CASAVA_Build 14 73273089 1I TCTGCCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2121 het 2121 ref 22 9 9 5 A 13 14 88459 CASAVA_Build 14 73290326 1I CAGGGATACA -/G GGGGGATGAG 2328 het 2328 ref 33 19 8 6 G 5 6 88460 CASAVA_Build 14 73304968 10D TATTGCCAAC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 2862 hom 26 10 9 7 T 22 12 88461 CASAVA_Build 14 73333732 1D ATGCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 534 hom 34 3 25 6 A 22 21 88462 CASAVA_Build 14 73335445 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 15 14 88463 CASAVA_Build 14 73338946 1I CAGGGCCAGG -/C CCTGTGGGGT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 2 3 88464 CASAVA_Build 14 73340064 1I AGACTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 11 12 88465 CASAVA_Build 14 73369918 1I AGTGGGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 490 hom 37 2 28 7 T 10 11 88466 CASAVA_Build 14 73372043 1I GGTAGATTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 88467 CASAVA_Build 14 73374244 1I AAAAAGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 11 12 88468 CASAVA_Build 14 73374763 1D AGCAGCAGGC T/- TTCAGGTGTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 T 3 2 88469 CASAVA_Build 14 73378269 6D AAATTCTGTA TGTTTT/------ TGTTTTTGTT 3070 hom 48 het 21 0 16 6 TGTTTT 4 3 88470 CASAVA_Build 14 73384740 1I AGTGCTGGGA -/T TTACAGGCAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 2 3 88471 CASAVA_Build 14 73403959 1D TTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 10 9 88472 CASAVA_Build 14 73409922 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 15 1 10 4 T 12 11 88473 CASAVA_Build 14 73414070 1I GTAGAAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 788 hom 38 3 27 8 T 12 13 88474 CASAVA_Build 14 73416102 10I CCCCAGACCT ----------/TGCGTAGAGA ATGGGTTTCA 3070 hom 135 het 44 0 44 3 TGCGTAGAGA 0 1 88475 CASAVA_Build 14 73418022 3I AAATGTAAAA ---/TTG TTATGTTTAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTG 0 1 88476 CASAVA_Build 14 73437216 1I GGCCTGTGGG -/C CACGTGTGGC 3070 hom 21 het 24 1 13 10 C 1 2 88477 CASAVA_Build 14 73445289 4I CTGCATCTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TTTG 3 4 88478 CASAVA_Build 14 73461601 4I TTTTCTTTTT ----/ATTC ATTGTTGTGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATTC 0 1 88479 CASAVA_Build 14 73463198 1D GCCAGGAATT G/- GGAGTTTTTG 3070 hom 29 het 14 0 10 5 G 3 2 88480 CASAVA_Build 14 73472005 1I TACAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 169 hom 24 1 20 3 A 11 12 88481 CASAVA_Build 14 73487832 2D GTCTTTTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 30 2 23 6 T 12 10 88482 CASAVA_Build 14 73490278 3D TCACTTGTGA TGT/--- TGTGTCATTA 3070 hom 147 het 56 0 47 9 TGT 2 1 88483 CASAVA_Build 14 73499163 2D CCCAGCACTT TA/-- TAGGAGGCTG 3070 hom 72 het 27 0 23 4 TA 2 1 88484 CASAVA_Build 14 73502925 1I CAAAACCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 613 hom 33 2 23 8 T 11 12 88485 CASAVA_Build 14 73509136 1D TAAACATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 11 10 88486 CASAVA_Build 14 73518264 2D CTCTGTTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 16 14 88487 CASAVA_Build 14 73535039 1D ACTAAGTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 10 9 88488 CASAVA_Build 14 73543822 1I CTAAAAATAT -/A AAAAAATTAG 3070 hom 27 het 14 0 9 5 A 6 7 88489 CASAVA_Build 14 73551537 1D ACTACCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 18 7 A 15 14 88490 CASAVA_Build 14 73553783 2D TCAAAAAAAA AG/-- AAAAGAAAAA 3070 hom 34 het 15 0 12 3 AG 1 0 88491 CASAVA_Build 14 73556700 1D TTTTATGGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 38 0 30 9 T 10 9 88492 CASAVA_Build 14 73569673 1D TTTTCCAAAA T/- TTTTTTCTTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 7 6 88493 CASAVA_Build 14 73572313 4D CCTTCAAAGT CACA/---- TAGCATTACT 3070 hom 72 het 27 0 25 5 CA 2 0 88494 CASAVA_Build 14 73574478 8I CTTTTTTATA --------/CCACTTAG CCCCATTCTG 3070 hom 75 het 30 0 26 5 CCACTTAG 0 1 88495 CASAVA_Build 14 73576052 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2333 het 477 hom 11 1 7 3 T 14 15 88496 CASAVA_Build 14 73578494 3D CTCTGTCTCA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AAC 7 6 88497 CASAVA_Build 14 73585836 1I TGGAATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 10 11 88498 CASAVA_Build 14 73599265 1D GCTGGCACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 80 het 33 0 25 9 A 10 9 88499 CASAVA_Build 14 73607125 6I ATCCTGGCTT ------/TGACGG TTTCTAGCAC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 TGACGG 0 1 88500 CASAVA_Build 14 73623126 1D AAAAAGAAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 449 hom 28 2 24 2 A 9 8 88501 CASAVA_Build 14 73630440 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1288 het 1288 ref 25 15 3 7 A 15 16 88502 CASAVA_Build 14 73639399 2D AGTAATCAAC AT/-- ATAGCCAATC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AT 2 1 88503 CASAVA_Build 14 73639884 13D AAATGTAAGA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 8 het 14 0 10 4 T 22 9 88504 CASAVA_Build 14 73642035 2D AAAAACAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 34 0 23 11 T 13 11 88505 CASAVA_Build 14 73647912 2D GCCTGACTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 17 0 11 6 T 15 13 88506 CASAVA_Build 14 73655764 1D ACTACAGGCG C/- CCCCCCACCA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 7 6 88507 CASAVA_Build 14 73672276 1D GAACAGGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 12 11 88508 CASAVA_Build 14 73680068 1I TACTGTGAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 9 10 88509 CASAVA_Build 14 73680584 1D TATTCTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 31 2 23 6 T 15 14 88510 CASAVA_Build 14 73681074 8I TTCTGTGGTA --------/AATTAGAG AGTCAGCTTG 3070 hom 84 het 37 0 29 8 AATTAGAG 0 1 88511 CASAVA_Build 14 73687961 5D GAGCAGAAAT TAAAA/----- GAAAAAAGTG 3070 hom 93 het 34 0 32 5 TAAAA 1 0 88512 CASAVA_Build 14 73694576 1I TATATATATA -/T TATATATTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 1 2 88513 CASAVA_Build 14 73695625 4I TCTTATTTGT ----/ATTA ATTATATTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATTA 1 2 88514 CASAVA_Build 14 73696024 1D GTGGGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 38 2 33 3 T 20 19 88515 CASAVA_Build 14 73706963 1D TACCAACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 11 10 88516 CASAVA_Build 14 73707338 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTAAGACA 3070 het 865 hom 29 3 20 6 T 5 4 88517 CASAVA_Build 14 73711246 1I AATACATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 10 11 88518 CASAVA_Build 14 73713937 2D AATGGTCCAA AT/-- ACATTTTACT 3070 hom 48 het 20 0 17 5 AT 1 0 88519 CASAVA_Build 14 73715089 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 48 het 17 0 17 1 T 7 6 88520 CASAVA_Build 14 73716719 1D GGAGGAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 25 0 17 8 T 21 20 88521 CASAVA_Build 14 73718614 3D CCACAGGTGC ATG/--- CCACCATGCC 3070 hom 69 het 25 0 24 2 ATG 1 0 88522 CASAVA_Build 14 73728543 1D ATTTGTGTTA C/- CATTTATCTT 3070 hom 114 het 49 0 39 11 C 2 1 88523 CASAVA_Build 14 73742150 1D TCTCTACTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 10 9 88524 CASAVA_Build 14 73743569 1I GTGGTCGGGG -/A GGCTCATGGG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 0 1 88525 CASAVA_Build 14 73764009 7I TGGCAGAAAG -------/AGGGGAC GGAAGGAGGC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 AGGGGAC 0 1 88526 CASAVA_Build 14 73770616 1D TCATTGGGGC G/- GGGGGGGCTG 3070 het 3043 hom 23 9 7 7 G 8 7 88527 CASAVA_Build 14 73784257 1I GGCACTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 9 11 A 13 14 88528 CASAVA_Build 14 73785161 1I ACAAACGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 A 12 13 88529 CASAVA_Build 14 73786693 1D ATCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2040 het 27 hom 17 1 6 11 A 13 12 88530 CASAVA_Build 14 73786705 2D AAAAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTTT 1923 het 285 hom 21 7 7 7 AT 1 0 88531 CASAVA_Build 14 73787161 1I CCAGGGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 10 11 88532 CASAVA_Build 14 73788846 1D GCTTTCTTTT C/- TTTCTTTTTT 1017 het 1017 ref 17 11 3 3 C 1 0 88533 CASAVA_Build 14 73796269 1I TGGGGTCCTG -/C CCCTGCGGTG 3070 hom 28 het 26 1 12 13 C 3 4 88534 CASAVA_Build 14 73801477 1D AGATTCCCTG T/- TTTTTTTTTT 1388 het 1388 ref 35 23 3 9 T 12 11 88535 CASAVA_Build 14 73821567 5I AAAAATAAAT -----/AAGTA AATAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 AAGTA 0 1 88536 CASAVA_Build 14 73830514 1D AACTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1621 het 1285 hom 21 5 4 12 T 13 12 88537 CASAVA_Build 14 73833716 3D CATTACATGA ATG/--- ATATTTCATC 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 ATG 1 0 88538 CASAVA_Build 14 73845323 1D CTTCTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1116 hom 30 9 13 8 T 16 15 88539 CASAVA_Build 14 73849482 1I CAGGCATGCG -/C CGCTGCGCCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 1 2 88540 CASAVA_Build 14 73861218 1I GTGGCGCATG -/C CTATGGCCCC 3070 hom 59 het 24 0 20 4 C 1 2 88541 CASAVA_Build 14 73863265 1I ATGGCCACGG -/C CTCAGGCCCA 3070 hom 82 het 33 0 28 5 C 1 2 88542 CASAVA_Build 14 73868198 2I TGTGTAAGAC --/AT GTGAAATCTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AT 0 1 88543 CASAVA_Build 14 73870343 1I AAAACAACAT -/A AACAACATTT 2934 het 2934 ref 14 7 6 1 A 2 3 88544 CASAVA_Build 14 73871986 1D CTTGTATTTC T/- TTCATTTAAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 2 88545 CASAVA_Build 14 73878441 1D AATAACCAGG C/- CCTTAATTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 C 3 2 88546 CASAVA_Build 14 73879097 1D CACAAATGGC T/- TTTTTTTTTT 2291 het 2291 ref 41 26 5 10 T 11 10 88547 CASAVA_Build 14 73885735 1I TTGCCCAGCT -/G GGCCTCCAGG 3070 hom 54 het 24 0 14 10 G 2 3 88548 CASAVA_Build 14 73885794 1I GGCCCTGGCA -/G GGCGCAGCCT 2479 hom 36 het 16 0 10 6 G 2 3 88549 CASAVA_Build 14 73911687 1D GATTCCATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 4 A 11 10 88550 CASAVA_Build 14 73927235 4D TTCTTTCTTT CATC/---- CTTCCTTCCT 1843 het 1456 hom 13 5 6 2 CATC 1 0 88551 CASAVA_Build 14 73934356 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 10 11 10 A 16 15 88552 CASAVA_Build 14 73950037 2I CTTTTTTATA --/CT CTGTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 CT 1 2 88553 CASAVA_Build 14 73954099 1I TAAACAGTGG -/C AGAGACTGGA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 C 0 1 88554 CASAVA_Build 14 73966897 1D ATACGCATTC T/- TTTTTTTTTT 2720 het 2570 hom 23 9 7 7 T 13 12 88555 CASAVA_Build 14 73994912 1I TGTGTCTACT -/A AAAAAAAAAT 2674 het 928 hom 9 2 7 0 A 9 10 88556 CASAVA_Build 14 74038830 2D TGAACAGCTT TC/-- TCTCTCTCTC 1283 het 1283 ref 46 39 3 5 TC 7 6 88557 CASAVA_Build 14 74040202 1I GCCTGGAAGG -/C CCCTCCTGGG 3070 hom 71 het 29 0 24 5 C 3 4 88558 CASAVA_Build 14 74040861 2D GTGTGTTCCC CA/-- GAGTTTCTGG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 CA 1 0 88559 CASAVA_Build 14 74050260 4D GACTCTGTCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3046 hom 32 7 19 9 CAAA 6 5 88560 CASAVA_Build 14 74053245 1D GGTGGTGGGG T/- GGCAGGGCGC 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 T 1 0 88561 CASAVA_Build 14 74057881 5D GGCAGTGGGC CACAT/----- CACATCTTCC 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 CACAT 2 1 88562 CASAVA_Build 14 74073659 1I TAAAAACAGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 A 7 8 88563 CASAVA_Build 14 74074961 5D TTTGTGTGGG TTAGT/----- TTAGTTAACA 3070 hom 84 het 33 0 28 7 TTAGT 2 1 88564 CASAVA_Build 14 74085767 4D GAGTATTTGC TGAA/---- TGAATGAATG 3070 hom 117 het 47 0 40 8 TGAA 6 5 88565 CASAVA_Build 14 74088496 1D TGAAACTTAG C/- GCTGAGGGCC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 1 0 88566 CASAVA_Build 14 74091553 10I CACAGAGATT ----------/CTGTTTCCTC CTGTGGGAAG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 CTGTTTCCTC 0 1 88567 CASAVA_Build 14 74096105 2D GAGTGGAGAC TG/-- TGAGCTGTGG 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 TG 2 1 88568 CASAVA_Build 14 74099080 1I CAGGTCACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 9 10 88569 CASAVA_Build 14 74107088 1I AGGCATTTTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 69 het 32 0 21 11 T 7 8 88570 CASAVA_Build 14 74108419 1I AAATAAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1376 hom 23 5 14 4 A 11 12 88571 CASAVA_Build 14 74114246 1I TACAGGCATG -/A GCCAGCGCGC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 0 1 88572 CASAVA_Build 14 74127230 9D TACAAGTGGG AGCTAAGCT/--------- AGCTAAGCTA 3070 hom 51 het 19 0 16 5 AGCTAAGCT 2 1 88573 CASAVA_Build 14 74183488 1D TCAGTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1304 hom 17 5 10 2 A 13 12 88574 CASAVA_Build 14 74253477 1D TCTTTAGATG C/- CCAAAAATTA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 C 3 2 88575 CASAVA_Build 14 74260285 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2967 het 778 hom 11 2 8 1 A 15 16 88576 CASAVA_Build 14 74261526 1I GGGTTCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 33 2 28 3 A 11 12 88577 CASAVA_Build 14 74284978 1I CCATATAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 741 hom 26 4 17 5 A 13 14 88578 CASAVA_Build 14 74290545 1I GCTTAGGGAG -/A AAAAAAAAAA 1232 het 1232 ref 27 16 3 8 A 10 11 88579 CASAVA_Build 14 74298240 1D TGTTTCTCTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 7 88580 CASAVA_Build 14 74324574 1D TCACATACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 11 10 88581 CASAVA_Build 14 74331056 1I ACACAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 38 1 31 6 T 10 11 88582 CASAVA_Build 14 74342326 1D TCCTGGCTCA T/- TTTTTTTGTA 2749 hom 21 het 9 0 8 1 T 8 7 88583 CASAVA_Build 14 74352627 1D CTCTCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 32 1 22 9 T 15 14 88584 CASAVA_Build 14 74355368 4D TGAATTTGTC TGTT/---- TGTTTCCACA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 TGTT 2 1 88585 CASAVA_Build 14 74381596 2I TGGGGGTTTC --/AA AAAATTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 6 88586 CASAVA_Build 14 74383760 1D GGCTTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 1527 het 1527 ref 49 41 4 4 T 12 11 88587 CASAVA_Build 14 74385777 11D AAAAATAAAT AAATAAAAAAA/----------- AAATAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 3 AAATAAAAAAA 2 1 88588 CASAVA_Build 14 74428852 1D AGCAACTGCA C/- CCAGCCTATT 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 C 3 2 88589 CASAVA_Build 14 74448050 6D TGTGTGTTTG TGTGTA/------ TGTGTATGTG 3070 hom 89 het 43 0 29 16 TGTGTA 4 3 88590 CASAVA_Build 14 74459934 16D GTGGGGAGAG CAGGTCTAGAATCATC/---------------- CAGGGATGCG 2039 hom 15 het 6 0 6 1 CAGGTCTAGAATCATC 1 0 88591 CASAVA_Build 14 74464855 4I CAATATGAAG ----/TTAA TTAATAACAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTAA 1 2 88592 CASAVA_Build 14 74478762 1I GCATCCCTAC -/T TTTGGACAGG 3070 hom 52 het 23 0 15 8 T 3 4 88593 CASAVA_Build 14 74500665 1D TCTGCACGTT C/- CAGGTGGCCT 3070 hom 99 het 39 0 32 7 C 2 1 88594 CASAVA_Build 14 74523671 1D GGTAAGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 33 1 29 3 T 11 10 88595 CASAVA_Build 14 74525837 4I ATACACACTT ----/CACA CACACACACA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 CA 6 8 88596 CASAVA_Build 14 74540931 8D TGGATTGCTT GAGACCAG/-------- GAGTTCAAAA 3070 hom 90 het 32 0 30 4 GAGACCAG 1 0 88597 CASAVA_Build 14 74549765 4I ATTCTGCAGT ----/TAAC TAATATGAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TAAC 0 1 88598 CASAVA_Build 14 74554432 2D AGAAACGCTG TC/-- TCTACTAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TC 2 1 88599 CASAVA_Build 14 74554609 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 9 10 88600 CASAVA_Build 14 74602840 1D TAATAAAGCT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 G 9 8 88601 CASAVA_Build 14 74613218 4D TGCTGCCTCC TAAG/---- TTTTTGTTTG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 TAAG 1 0 88602 CASAVA_Build 14 74633286 1I AAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 10 88603 CASAVA_Build 14 74640624 1D CTACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 295 hom 33 2 17 14 T 15 14 88604 CASAVA_Build 14 74650404 1D TCTTGGTCAT A/- AAAAATCGAG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 6 5 88605 CASAVA_Build 14 74651571 4I GTGTGTGCGT ----/ACAC ACACACACAC 3070 hom 80 het 35 0 26 9 AC 6 8 88606 CASAVA_Build 14 74674165 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 701 hom 12 het 6 0 4 2 T 16 15 88607 CASAVA_Build 14 74675282 1I TTTTTTTTTT -/A TTTTTTTATT 3070 het 520 hom 24 3 16 5 A 0 1 88608 CASAVA_Build 14 74680390 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2611 het 503 hom 25 2 14 9 A 17 18 88609 CASAVA_Build 14 74683642 7D TTCAAGGCTG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 22 0 10 13 T 21 14 88610 CASAVA_Build 14 74685929 5I CTACTGTTTA -----/TAAAT TACCCACTCT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 TAAAT 0 1 88611 CASAVA_Build 14 74690694 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1726 hom 12 het 5 0 5 1 A 15 14 88612 CASAVA_Build 14 74748722 1I AATCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 1065 het 1065 ref 10 6 3 1 A 9 10 88613 CASAVA_Build 14 74757063 4D TTAGTGAAAC AAAG/---- GAAGGAGAAT 3070 het 3070 hom 31 16 13 7 AAAG 1 0 88614 CASAVA_Build 14 74770712 1D AAAAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 208 hom 32 2 23 7 A 12 11 88615 CASAVA_Build 14 74776099 1D CCTTGGCACA T/- TTTTTTTTTT 1568 het 1568 ref 30 15 5 10 T 15 14 88616 CASAVA_Build 14 74782852 1D CAAGAGTTCC A/- AACACATCAA 3070 hom 153 het 58 0 51 7 A 3 2 88617 CASAVA_Build 14 74787193 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 38 1 31 6 A 10 11 88618 CASAVA_Build 14 74810396 3D GTGTGTGTGT GGG/--- GGGGGGGTGG 3070 hom 101 het 37 0 35 3 G 10 7 88619 CASAVA_Build 14 74817161 1D TAAAACTTAA G/- GGGAAAGTTG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 4 3 88620 CASAVA_Build 14 74854495 1D GAAGCACGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 62 19 28 16 T 16 15 88621 CASAVA_Build 14 74855248 8I CTGGGACCCA --------/TATCTGAT TCACCCTGGG 3070 hom 42 het 17 0 13 4 TATCTGAT 0 1 88622 CASAVA_Build 14 74857795 4D AAAGAACCTA CTCT/---- CTCTATCTCA 2698 het 2414 hom 15 6 8 1 CT 4 2 88623 CASAVA_Build 14 74857864 1D ATTATTATTA T/- TTTTTGAGAT 2602 het 1546 hom 12 4 7 1 T 6 5 88624 CASAVA_Build 14 74861632 1I AGTGTGAGGT -/C CTCCATTGGG 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 C 1 2 88625 CASAVA_Build 14 74864290 1D TTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 5 A 11 10 88626 CASAVA_Build 14 74866582 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 11 12 88627 CASAVA_Build 14 74874609 1D GAAAAAAAAA G/- AAAGAATTTG 3070 hom 39 het 16 0 13 4 G 1 0 88628 CASAVA_Build 14 74881847 2I GATGCTAAAA --/GT GTATTTGTTG 3070 hom 62 het 26 0 18 8 GT 1 2 88629 CASAVA_Build 14 74914467 1D CTCTCGCCCC T/- TTTTTCGCCC 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 T 6 5 88630 CASAVA_Build 14 74917947 1D ACAAATCACT A/- CCTTGAAATA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 1 0 88631 CASAVA_Build 14 74933527 1D CAGAGAGGAG A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 7 6 88632 CASAVA_Build 14 74936543 1D ACTAACTGGA T/- TAAGAGGGCA 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 T 2 1 88633 CASAVA_Build 14 74940178 1I AACTCAAGCC -/A AAAATAACAC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 4 5 88634 CASAVA_Build 14 74949331 1D TGAGATTTGT G/- TGCTTTTTGG 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 G 1 0 88635 CASAVA_Build 14 74953851 1I CAACAGGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1645 hom 31 4 23 4 A 11 12 88636 CASAVA_Build 14 74955390 4D AAATATTTAT TGAA/---- TGAATGAATG 3070 hom 87 het 37 0 30 9 TGAA 5 4 88637 CASAVA_Build 14 74955881 1D TTCTGGTCTC A/- GGGGGTGAGT 3070 hom 63 het 23 0 19 4 A 1 0 88638 CASAVA_Build 14 74980366 1I TTGTTATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 11 12 88639 CASAVA_Build 14 74988307 2I TTTCCTCATC --/TG TAAAATCTAG 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 TG 0 1 88640 CASAVA_Build 14 75001758 1D ATAGCTTTTT A/- AAAAATATAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 5 88641 CASAVA_Build 14 75019825 1I AAATTCCATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 9 10 88642 CASAVA_Build 14 75022987 3D AAGAAAAGAA AAG/--- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 6 AAG 1 0 88643 CASAVA_Build 14 75035408 1I TGTGCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 666 hom 37 3 27 7 T 13 14 88644 CASAVA_Build 14 75040024 1I CACAAGATTC -/T GTTTAGAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 88645 CASAVA_Build 14 75043642 2I GCTGAAGTGG --/GT AAAGCTCCTG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 GT 0 1 88646 CASAVA_Build 14 75059318 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAAGAAGA 3070 het 26 hom 28 1 22 5 AG 0 1 88647 CASAVA_Build 14 75080889 8D TGAACTGAAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 26 0 17 10 T 22 14 88648 CASAVA_Build 14 75087718 2I TTTAATACTC --/TT GTTTCTGCCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 0 2 88649 CASAVA_Build 14 75106224 2I TGAGATGGAG --/TC TCACTCTGTC 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 TC 1 2 88650 CASAVA_Build 14 75109641 2I CGGCAGACAA --/AT ATCGCATGAT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 AT 1 2 88651 CASAVA_Build 14 75120519 1I AGAATAAGGC -/G GCCTTCCGGC 3070 hom 40 het 15 0 13 2 G 1 2 88652 CASAVA_Build 14 75140659 1D GTCTCTACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 13 10 A 12 11 88653 CASAVA_Build 14 75146549 1I TCAGTGTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 9 10 88654 CASAVA_Build 14 75148280 2D GTGCTTTGAG CA/-- CAGTGTATCA 3070 het 3070 ref 36 15 17 5 CA 2 1 88655 CASAVA_Build 14 75173825 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1102 het 18 hom 10 1 5 5 A 17 16 88656 CASAVA_Build 14 75180135 1I CTCCATCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1174 hom 31 5 18 8 A 13 14 88657 CASAVA_Build 14 75180249 1I TGACATAAGA -/T TTTGCTGTGT 3070 hom 129 het 45 0 43 2 T 3 4 88658 CASAVA_Build 14 75189704 1D ACTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1886 het 1886 ref 21 9 5 9 A 15 14 88659 CASAVA_Build 14 75190047 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 34 2 31 1 A 11 12 88660 CASAVA_Build 14 75195964 1D AACACCGCCG C/- CCCCCCCCGC 3070 hom 37 het 15 0 11 4 C 9 8 88661 CASAVA_Build 14 75201962 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 A 7 8 88662 CASAVA_Build 14 75203165 1D CCTTAAGTGC T/- TTTTTTTTTT 1106 het 1106 ref 47 30 5 12 T 11 10 88663 CASAVA_Build 14 75214792 1D TCAGATTTTT A/- AAAATCTGCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 4 88664 CASAVA_Build 14 75226723 1I GTAAGTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 41 2 27 12 T 13 14 88665 CASAVA_Build 14 75238763 1I GTGACATGTC -/T TTAGAGAATG 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 2 3 88666 CASAVA_Build 14 75268572 1D CTTAAAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 T 12 11 88667 CASAVA_Build 14 75285659 2D CTGACCCTAT AG/-- GAGCAGTAGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AG 1 0 88668 CASAVA_Build 14 75303260 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 2597 het 320 hom 22 1 11 10 A 17 16 88669 CASAVA_Build 14 75328663 4I CAAGAAAAAC ----/AAAT AAGAATTATA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 AAAT 0 1 88670 CASAVA_Build 14 75363020 13I CCTTTAACTA -------------/AAGATCTCATCCT ACCCACCTGC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAGATCTCATCCT 0 1 88671 CASAVA_Build 14 75364500 3D ATAGTAAATA TAT/--- TATTTCTCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAT 2 1 88672 CASAVA_Build 14 75365656 1D ATACATTTAC T/- TTTTTTTTTT 2745 het 2745 ref 34 17 7 10 T 15 14 88673 CASAVA_Build 14 75384070 1I TTTGGTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 237 hom 19 1 15 3 T 11 12 88674 CASAVA_Build 14 75391247 1D ATGCTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 28 1 18 9 A 16 15 88675 CASAVA_Build 14 75397274 5I ACAATTGAGC -----/AACTG AACTGAACTG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AACTG 2 3 88676 CASAVA_Build 14 75409746 14D ATGTTTTCTC TTTTTTTAGTTTTT/-------------- TTTTTTTAGT 3070 hom 93 het 42 0 32 17 TTTTTTTAGTTTTT 2 1 88677 CASAVA_Build 14 75415087 1D AGTTTTTGCT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 87 het 30 0 30 1 A 8 7 88678 CASAVA_Build 14 75418767 1D ATTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTG 1406 het 1406 ref 37 26 4 7 T 10 9 88679 CASAVA_Build 14 75425032 2I ACTGTCTCCG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 22 1 14 7 A 12 14 88680 CASAVA_Build 14 75433278 1I CAGACCTCAG -/A AAAAATGGCA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 A 5 6 88681 CASAVA_Build 14 75436035 3D GCTTCTTCCC TTT/--- TTTTTTTTTT 1494 het 193 hom 31 3 8 20 T 19 16 88682 CASAVA_Build 14 75444485 1I GCCTCAGCCC -/A TCACCTGAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 88683 CASAVA_Build 14 75448165 1I GTTAGCCCAT -/C CCCGTGGCCA 3070 hom 93 het 35 0 28 7 C 3 4 88684 CASAVA_Build 14 75473219 1I TACATTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 25 1 17 7 T 13 14 88685 CASAVA_Build 14 75478121 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAACTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 7 8 88686 CASAVA_Build 14 75480808 2D GGCAGTTGTT GA/-- AACTGTCTCT 3070 hom 104 het 41 0 31 10 GA 1 0 88687 CASAVA_Build 14 75484036 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 29 0 21 8 A 15 16 88688 CASAVA_Build 14 75484269 2D GGAAATTAAG AA/-- AGAGTTAACT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 A 3 1 88689 CASAVA_Build 14 75513753 1D TCTCCCGGGC A/- AAAAAAAAAA 1050 het 1050 ref 23 10 4 9 A 19 18 88690 CASAVA_Build 14 75524614 1D GCTTGTCATC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 58 het 30 0 25 5 T 9 8 88691 CASAVA_Build 14 75538463 1D AAAAAGGTAA G/- GGGGGGGGTG 2640 hom 5 het 17 0 7 10 G 9 8 88692 CASAVA_Build 14 75566039 1I GTGCAGTGGT -/G GCAATCATAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 2 88693 CASAVA_Build 14 75566326 2D TTTCCATCAT CA/-- CAGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 CA 2 1 88694 CASAVA_Build 14 75573273 5I TGATAGTTAG -----/GTGTA GTGTAGCTCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 GTGTA 1 2 88695 CASAVA_Build 14 75577847 1D AAAGTCTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 43 0 30 13 T 10 9 88696 CASAVA_Build 14 75579466 5I AGAGAAGAGC -----/TCGTG TCGTGTGCAG 3070 hom 119 het 46 0 36 10 TCGTG 1 2 88697 CASAVA_Build 14 75585825 3I AGAATAAGAA ---/CTT CTTCCATTTA 3070 hom 101 het 39 0 33 6 CTT 1 2 88698 CASAVA_Build 14 75585963 1I TAATTTCAAG -/C CCCCCAAATC 3070 hom 88 het 37 0 28 9 C 5 6 88699 CASAVA_Build 14 75593339 1I TATATTATTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 8 9 88700 CASAVA_Build 14 75593650 1D TTTAATTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 610 hom 20 3 15 2 A 14 13 88701 CASAVA_Build 14 75594724 1D TTGTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 112 het 47 0 37 10 T 11 10 88702 CASAVA_Build 14 75598807 1I GAGGTCAGGA -/G TTCAAGACCA 3070 hom 47 het 17 0 14 3 G 0 1 88703 CASAVA_Build 14 75622298 1I TACTATAGAG -/A AAAAATGAAG 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 5 6 88704 CASAVA_Build 14 75629739 1D CTCTGCTCTG C/- CCCCACCCAT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 C 5 4 88705 CASAVA_Build 14 75640145 1D GCTGAGGGTC A/- GGGGGATCAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 A 1 0 88706 CASAVA_Build 14 75642693 1I ACTTTCCTAA -/G GCCCACTTTT 3070 het 3070 ref 54 25 17 12 G 1 2 88707 CASAVA_Build 14 75656958 2D TCTCTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 80 het 36 0 26 10 TC 6 5 88708 CASAVA_Build 14 75662344 1D TCCCACGGTG A/- ATCGGAACTG 3070 het 3070 hom 31 14 13 8 A 2 1 88709 CASAVA_Build 14 75665613 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1846 hom 25 7 17 1 A 12 11 88710 CASAVA_Build 14 75670738 2D TCCTTTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 2688 het 2210 hom 27 9 7 11 T 12 10 88711 CASAVA_Build 14 75672700 1D CTTTTCCCCC A/- ACCCAGTCCT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 2 1 88712 CASAVA_Build 14 75676655 4D AGAAAGAAAA GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 hom 97 het 37 0 32 5 GAAG 5 4 88713 CASAVA_Build 14 75677839 4I TAAAATGAAA ----/CACT CAGAGAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 CACT 0 1 88714 CASAVA_Build 14 75689036 1I TTTAATCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 10 11 88715 CASAVA_Build 14 75697419 5I AGCCATAAAC -----/TTTAT TTTAAGATAT 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 TTTAT 0 1 88716 CASAVA_Build 14 75698226 2I GTTCTGGTTC --/AG AGTCTTCTCA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 AG 1 2 88717 CASAVA_Build 14 75707680 2D ATCCATCCCC AA/-- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 31 7 21 3 A 7 5 88718 CASAVA_Build 14 75709934 1D AAGTACTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 12 11 88719 CASAVA_Build 14 75713069 1I TGTCCCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 T 11 12 88720 CASAVA_Build 14 75719582 1I TATAGCAAAA -/T TTTTTTTTGT 2564 het 2564 ref 22 13 9 0 T 8 9 88721 CASAVA_Build 14 75724632 9I TGTTCAAATC ---------/TTTTGCCCA TTTTTTGATT 2473 het 2473 ref 22 14 6 2 TTTTGCCCA 0 1 88722 CASAVA_Build 14 75725244 5D GGTTCCTTCA GTTTT/----- GTTCTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 22 12 6 GTTTT 1 0 88723 CASAVA_Build 14 75725461 3D TTTTTTGGTG TCT/--- TCTTCAATTT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 TCT 2 1 88724 CASAVA_Build 14 75726211 1I TCTCAAAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 9 10 88725 CASAVA_Build 14 75732130 1I AAATTATGTG -/T TTTTGTATAC 3070 het 3070 ref 53 29 17 7 T 4 5 88726 CASAVA_Build 14 75734202 1I AATGACCATA -/G GGTTGTTAAA 3070 hom 166 het 62 0 55 7 G 2 3 88727 CASAVA_Build 14 75736550 2I TATGAGTGAG --/TA TATATGTGCC 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 TA 2 3 88728 CASAVA_Build 14 75743627 1I CATAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 13 24 14 A 10 11 88729 CASAVA_Build 14 75753693 1D TTGACTGTTG A/- AAAAAAAACC 3070 het 919 hom 36 4 17 15 A 9 8 88730 CASAVA_Build 14 75763831 1I AAGAACTCCA -/G TAGGATTGAT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 G 0 1 88731 CASAVA_Build 14 75764432 2D TGGTGTTTGA TG/-- TGTGTGTGTG 1479 het 1479 ref 30 22 4 5 TG 7 6 88732 CASAVA_Build 14 75773480 1I CAGCAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 9 10 88733 CASAVA_Build 14 75786092 1I GGATATTCCA -/G GGGGTAACGA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 G 4 5 88734 CASAVA_Build 14 75788993 1D GGCCAGTATG A/- AAAACTAAGT 3070 het 3070 ref 58 29 26 3 A 5 4 88735 CASAVA_Build 14 75791986 2D GTTTGCCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2340 het 297 hom 33 5 8 20 A 18 16 88736 CASAVA_Build 14 75794166 1D AAGATGGCTG C/- CACAGCCCTT 3070 het 3070 hom 45 18 17 11 C 2 1 88737 CASAVA_Build 14 75801595 2I GCATGTCCAT --/AC ACAATGGACT 3070 het 3070 ref 56 33 17 6 AC 1 2 88738 CASAVA_Build 14 75805832 13I CTTGTCTCAA -------------/AGAAGAGAAGAAG AGAAGAGAAG 3070 hom 54 het 29 0 18 11 AGAAGAGAAGAAG 1 2 88739 CASAVA_Build 14 75805849 3I AAGAAGAGAA ---/GAG AAGAAGCGAA 1640 het 1640 ref 29 9 8 12 GAG 0 1 88740 CASAVA_Build 14 75808767 2I AGAGAGAGAA --/AG AGAGAGAGGG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AG 4 5 88741 CASAVA_Build 14 75808902 2D GGGGGGAGGG GA/-- GAGAGAGAGA 3010 het 1897 hom 24 9 10 5 GA 6 5 88742 CASAVA_Build 14 75812854 1D AGTCAGGTCC T/- GATCTTTTGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 0 88743 CASAVA_Build 14 75819848 2D CACACACACT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 51 20 18 13 CA 6 5 88744 CASAVA_Build 14 75825835 1D TTACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 27 3 18 6 A 17 16 88745 CASAVA_Build 14 75831478 1I TCTTATTTCT -/G GGGGGAAAAA 3070 het 202 hom 38 2 29 7 G 5 6 88746 CASAVA_Build 14 75849413 1I ATCAAATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 10 11 88747 CASAVA_Build 14 75851374 8I CCTGTGCTAT --------/GCTTGTTA GCTTCTGTGT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 GCTTGTTA 0 1 88748 CASAVA_Build 14 75852580 3I TTTTTGCCTC ---/CTT ATTATTCACC 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 CTT 0 1 88749 CASAVA_Build 14 75853259 1I AGACAGGGGA -/T TAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 T 1 2 88750 CASAVA_Build 14 75867993 2D GAACTGAGTT AA/-- TAGAAGTCCA 3070 het 2361 hom 28 6 17 5 A 2 0 88751 CASAVA_Build 14 75872401 7I GCTCAGCGAT -------/GGAAAAA GACTGGCCCA 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 GGAAAAA 0 1 88752 CASAVA_Build 14 75880931 4I CTGGGTGACA ----/GAGT GAGACTCCAT 1842 het 680 hom 10 2 5 3 GAGT 0 1 88753 CASAVA_Build 14 75881463 1D CAATCCCATC A/- AAAAAGTGGG 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 A 6 5 88754 CASAVA_Build 14 75881762 1D TAGAACCACC A/- ATTTGATCCA 3070 hom 126 het 45 0 43 3 A 2 1 88755 CASAVA_Build 14 75896516 2D AGAGAGAGAC AG/-- AGAGAGACAG 3070 het 3070 hom 53 15 29 10 AG 4 3 88756 CASAVA_Build 14 75905377 1D TTCTTTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2674 hom 26 9 9 8 T 12 11 88757 CASAVA_Build 14 75908488 1D TCCCAGGAAA C/- CCACTGGGGG 3070 hom 71 het 34 0 24 12 C 3 2 88758 CASAVA_Build 14 75919440 1D TTTTTATTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 T 10 9 88759 CASAVA_Build 14 75931201 4D CCGTTTCCGA CAGT/---- CAGCCCCTCG 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 CAGT 1 0 88760 CASAVA_Build 14 75986239 1D GACTGAGAAA G/- GGGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 G 9 8 88761 CASAVA_Build 14 75988043 1D CAGGAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 2325 het 2325 ref 26 15 8 3 T 11 10 88762 CASAVA_Build 14 75993550 1D GCAGGATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 758 hom 26 4 11 11 T 15 14 88763 CASAVA_Build 14 75996067 1I TGTAGATCTC -/T TGAGGTGCTC 3070 het 3070 hom 41 20 20 1 T 1 2 88764 CASAVA_Build 14 75996967 1I CCAACTAATT -/G TTTTTTTGTA 3070 het 2694 hom 20 8 11 1 G 0 1 88765 CASAVA_Build 14 76002821 1I AATTTTTTTT -/G TTTTCTTTTG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 G 0 1 88766 CASAVA_Build 14 76004507 1I AACACCACCA -/C CCCCCCAAAC 932 het 932 ref 32 13 5 14 C 6 7 88767 CASAVA_Build 14 76009228 3I TTCCCTGTGA ---/CGT CGTTTCTTGG 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 CGT 1 2 88768 CASAVA_Build 14 76012166 1D GTGAAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2418 hom 26 10 12 4 T 11 10 88769 CASAVA_Build 14 76013837 1I AACAGGCTAC -/T TGTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 T 1 2 88770 CASAVA_Build 14 76018016 1I AGCAAGGCCC -/T TGAAGGACCC 3070 hom 75 het 27 0 24 3 T 1 2 88771 CASAVA_Build 14 76022655 1D AATTACGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2385 hom 34 8 10 16 T 11 10 88772 CASAVA_Build 14 76026808 1D CAGCCTCCTC A/- AATAGCAGGG 3070 hom 66 het 27 0 21 7 A 3 2 88773 CASAVA_Build 14 76052664 1D ATTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 23 0 16 11 A 15 14 88774 CASAVA_Build 14 76059340 1I CTTTTTGAGG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 7 8 88775 CASAVA_Build 14 76059581 2I ATGCTTCCTA --/TT TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 7 9 88776 CASAVA_Build 14 76065787 4I GTTGTTGTTG ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 TTGT 2 3 88777 CASAVA_Build 14 76081597 4I TTTTTTAAAA ----/ATGT ATGTATGTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 ATGT 3 4 88778 CASAVA_Build 14 76108708 1D GGATGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 42 0 29 13 T 11 10 88779 CASAVA_Build 14 76109430 7I CAAGGCCACC -------/TGGAGAA TGGTTCTGCA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TGGAGAA 0 1 88780 CASAVA_Build 14 76117861 2D CATCTCTCTC TT/-- GGCACCTGGC 3070 het 3070 hom 38 13 19 8 T 2 0 88781 CASAVA_Build 14 76118923 5D TTAAAATACA AATTG/----- TTTTGTTAGA 3070 het 3070 hom 40 17 22 3 AATTG 1 0 88782 CASAVA_Build 14 76119550 1I GAAGAATCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 8 9 88783 CASAVA_Build 14 76124544 1I TAAATTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 T 13 14 88784 CASAVA_Build 14 76135818 1D ATTCCTGTCA C/- AAACTTTGGC 3070 hom 81 het 35 0 28 9 C 1 0 88785 CASAVA_Build 14 76138072 1D TATTAAACAC T/- TTTTATGTGT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 T 5 4 88786 CASAVA_Build 14 76144062 1I CCAGTTTGAT -/A CGGCTCCCTT 3070 hom 81 het 29 0 26 3 A 0 1 88787 CASAVA_Build 14 76153682 1D TAAAACAAAC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 49 27 19 4 T 7 6 88788 CASAVA_Build 14 76154984 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 62 hom 14 2 12 0 AC 6 7 88789 CASAVA_Build 14 76193710 1I AATAAAAAAA -/T AAAATAAAAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 0 1 88790 CASAVA_Build 14 76197983 2D TTTTACAGAC TG/-- AGAAAACTGA 3070 hom 116 het 44 0 39 6 TG 1 0 88791 CASAVA_Build 14 76199819 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAA 2458 het 461 hom 20 1 13 6 A 10 11 88792 CASAVA_Build 14 76201617 1I GGACCAATGC -/A GAAGAAAAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 1 88793 CASAVA_Build 14 76201816 2I CTAACTACTT --/AA GAGTTTAGTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 0 2 88794 CASAVA_Build 14 76209025 4D ACAGATAGAT AGAA/---- AGAAAGATAG 3070 het 3070 hom 46 22 20 8 AGAA 2 1 88795 CASAVA_Build 14 76209168 4I GGGCCATCTT ----/TTTG TTTTTCTCAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 TTTG 0 1 88796 CASAVA_Build 14 76213441 1I ACCCCTCGTA -/T TTGCAGGTGG 3070 hom 99 het 38 0 32 6 T 2 3 88797 CASAVA_Build 14 76213790 12D GGACAGCCTT CACCATCATCAC/------------ CACCATCATC 3070 hom 102 het 39 0 34 8 CACCATCATCAC 2 1 88798 CASAVA_Build 14 76215773 11I TGCCCTACTC -----------/TGTCTATGGAG TAGCTGTTCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TGTCTATGGAG 0 1 88799 CASAVA_Build 14 76216584 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 784 hom 25 2 18 5 A 12 11 88800 CASAVA_Build 14 76220115 2I32M2I TTAAAATGTG --ATATATATATGTATATATGTACATGTATATAC--/ATATATATATATGTATATATGTACATGTATATACAT ATATATATAT 2683 het 2683 ref 28 28 7 7 N/A 0 0 88801 CASAVA_Build 14 76221500 1I CTATTTCTGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 8 9 88802 CASAVA_Build 14 76221890 4I CTGAAGTTTA ----/CTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CTTG 0 1 88803 CASAVA_Build 14 76222105 1I46M1D AATAAAATTT -AAAAAAAACACATAAAGAGAAAAAAATGAATACTGTTTCACAAATTA/AAAAAAAAACACATAAAGAGAAAAAAATGAATACTGTTTCACAAATT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 15 8 14 N/A 0 0 88804 CASAVA_Build 14 76222450 2I TAAATTACTA --/TC TCTTTCATAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TC 1 2 88805 CASAVA_Build 14 76222949 1D TTAGCCACTC T/- TAAGAGGTGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 1 88806 CASAVA_Build 14 76227983 1D GGATACAAGG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 10 hom 22 1 10 11 A 8 7 88807 CASAVA_Build 14 76231956 4D TCATATCCTT ATAC/---- ATACATGCCC 3070 hom 90 het 39 0 31 9 ATAC 2 1 88808 CASAVA_Build 14 76236764 1I ATCTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 38 1 33 4 A 10 11 88809 CASAVA_Build 14 76237374 1D GTTCACTCAC A/- GAGGAAAGGC 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 A 1 0 88810 CASAVA_Build 14 76238364 2I AGCTGAGAAA --/AT AGTCTCCATG 3070 hom 108 het 45 0 33 12 AT 0 1 88811 CASAVA_Build 14 76240698 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 6 7 88812 CASAVA_Build 14 76240894 1D TCTCTACTCC T/- TTGTCACTTC 3070 hom 54 het 21 0 16 6 T 3 2 88813 CASAVA_Build 14 76242695 1I ATCCCTTAGC -/T TAGACATAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 1 2 88814 CASAVA_Build 14 76246204 1I CAAGGGGCCT -/C CTCTCTCCTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 2 88815 CASAVA_Build 14 76246364 2I AACTCAGCCC --/AA GAGTCCAAGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 2 88816 CASAVA_Build 14 76247861 4D ACCTGCTGTT GTAA/---- GTTTCATCAG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 GTAA 1 0 88817 CASAVA_Build 14 76249008 1I CTGGGATTAC -/A GGTGTGCACC 1855 het 1855 ref 18 10 5 3 A 0 1 88818 CASAVA_Build 14 76257912 2D GTGGCCCAAG TC/-- TCTCTCAGTT 2750 het 2750 ref 25 14 8 4 TC 4 3 88819 CASAVA_Build 14 76261437 1D CAGGTGCATG T/- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 62 29 26 7 T 2 1 88820 CASAVA_Build 14 76268043 11I AATCCCAGCA -----------/CTTTGGGAGGC CAAGGCAGGA 2387 het 2387 ref 34 20 6 8 CTTTGGGAGGC 0 1 88821 CASAVA_Build 14 76273086 2D AGTAGGGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 13 11 88822 CASAVA_Build 14 76277179 1D TCAGGTATTA T/- TTTTGTTAAA 3070 het 3070 hom 41 17 21 6 T 5 4 88823 CASAVA_Build 14 76277293 4D GCTTTGTTCA TTCT/---- TTTTTATTCT 3070 het 3070 hom 24 11 12 3 TTCT 1 0 88824 CASAVA_Build 14 76293775 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1656 hom 28 6 12 10 T 11 12 88825 CASAVA_Build 14 76294127 5D GATTAAACTC CTTTT/----- CTTTTCTTCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CTTTT 2 1 88826 CASAVA_Build 14 76306469 3I TAGATAGATC ---/TCA TGCTCTGTTG 3070 hom 63 het 25 0 19 6 TCA 0 1 88827 CASAVA_Build 14 76306720 4D TCTAGCCCCT GCAC/---- CCTGCCCCTG 2127 het 833 hom 14 3 8 3 GCAC 1 0 88828 CASAVA_Build 14 76309732 1D AAACTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 2989 het 2989 ref 29 12 10 9 A 14 13 88829 CASAVA_Build 14 76321453 2D CAACTATCAC AT/-- GTCAATTTTA 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 AT 1 0 88830 CASAVA_Build 14 76330859 2D TGTTGCTCTT AC/-- ACAGTGTATT 3070 hom 41 het 16 0 14 4 AC 2 1 88831 CASAVA_Build 14 76335043 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1399 het 1062 hom 27 12 3 12 A 19 18 88832 CASAVA_Build 14 76347617 6D GTGTAGGTGG GGGGGC/------ GGGGGGGGCC 2774 hom 25 het 19 0 11 10 GGGGGC 1 0 88833 CASAVA_Build 14 76350625 4I CACTTATCCC ----/TTTG TTTGAGATGA 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 TTTG 1 2 88834 CASAVA_Build 14 76360029 2D AAAAAAAAAA AT/-- AATAAAAAGT 2853 hom 35 het 22 0 15 7 AT 1 0 88835 CASAVA_Build 14 76373420 1D CAAAGATGGT A/- AATAATATGT 3070 het 3070 hom 40 12 23 7 A 3 2 88836 CASAVA_Build 14 76382931 1I GGCCATTTGA -/C ACCTACATAG 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 C 0 1 88837 CASAVA_Build 14 76383672 4D ACGGGAAAAA TAAC/---- TGAGTACTAG 3070 het 3070 ref 29 19 9 2 TAAC 1 0 88838 CASAVA_Build 14 76385760 3D TTAGCTGGAC GTG/--- GTGACTTGGG 3069 het 1109 hom 13 4 8 3 GTG 2 1 88839 CASAVA_Build 14 76398540 7D GCACAAGAAT CGCTCGA/------- CGCTTGAACC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 CGCTCGA 1 0 88840 CASAVA_Build 14 76405581 1I TGGGCGCGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 1 2 88841 CASAVA_Build 14 76459967 1D ATGAGGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 451 hom 28 1 14 14 T 12 11 88842 CASAVA_Build 14 76475183 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 12 11 88843 CASAVA_Build 14 76475568 4D TTTTCTTTTC TTCT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 23 0 16 8 TTCT 1 0 88844 CASAVA_Build 14 76508775 1I TCCACAAAAA -/G GGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 G 2 3 88845 CASAVA_Build 14 76515733 10D ACCCTGTCTC AAACAAAACA/---------- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 41 23 17 3 AAACA 5 3 88846 CASAVA_Build 14 76520696 1D TCTCTGCTGT C/- GCTTTCCCCA 2277 het 1667 hom 15 6 7 2 C 1 0 88847 CASAVA_Build 14 76526349 2I TCCTCTCCTC --/CT CTCTCTTTCT 3070 hom 69 het 27 0 21 6 CT 3 4 88848 CASAVA_Build 14 76530952 2D TGCCTCCCTG GT/-- TCAAGCGATT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 GT 1 0 88849 CASAVA_Build 14 76532963 1D GTGGATCACT G/- GTCTCCTAAG 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 G 2 1 88850 CASAVA_Build 14 76533366 3D CCAACAAAAA ATG/--- ATGAAGACCT 3070 hom 66 het 28 0 21 10 ATG 2 1 88851 CASAVA_Build 14 76560944 2I AAAACAAAAC --/AG AACAAAATAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AG 0 1 88852 CASAVA_Build 14 76566161 1D TTGGGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 678 hom 30 3 15 12 T 16 15 88853 CASAVA_Build 14 76575321 1D TCCTTCAGGA T/- TTTTTTTTTT 1372 het 1372 ref 22 7 4 12 T 11 10 88854 CASAVA_Build 14 76575379 4I TGGCACTGAT ----/AAAG AAAAGCCAAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AAAG 0 1 88855 CASAVA_Build 14 76578030 1D CCTTGTATTC A/- AACACTTGAA 3070 hom 110 het 42 0 38 4 A 3 2 88856 CASAVA_Build 14 76584813 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1798 het 75 hom 18 1 11 6 T 15 14 88857 CASAVA_Build 14 76598642 2D AACAGCCCCC CA/-- GACTCAGAGT 3070 hom 137 het 49 0 42 8 CA 1 0 88858 CASAVA_Build 14 76599051 1I ACAGTTACTG -/T GTTTTTTTTT 2459 hom 48 het 20 0 14 6 T 0 1 88859 CASAVA_Build 14 76614766 1I ATACTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 24 2 16 6 A 14 15 88860 CASAVA_Build 14 76617306 1I ATCATTTCTT -/C CTATTTTGAT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 C 1 2 88861 CASAVA_Build 14 76631770 1D ACTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 30 0 26 4 T 11 10 88862 CASAVA_Build 14 76632473 1I GTTTTTTTTT -/C CTCCCTTTAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 C 1 2 88863 CASAVA_Build 14 76632663 4I CACGGTTTTC ----/TTTT GTTTGTTTGT 3070 hom 84 het 31 0 26 6 T 0 4 88864 CASAVA_Build 14 76635497 1D5M1I AGGGAAGATG AATATT-/-ATATTC AGACATTTAG 3070 hom 131 het 47 0 42 8 N/A 0 0 88865 CASAVA_Build 14 76638188 5D CTATAAATAA AAAAC/----- AAAACAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 4 AAAAC 2 1 88866 CASAVA_Build 14 76646786 5D TTGGTTAAGT TAGAA/----- TAGAGAAGTC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TAGAA 1 0 88867 CASAVA_Build 14 76658936 1I TTGAGGCCCA -/G GGTCTATAGA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 2 3 88868 CASAVA_Build 14 76663720 4I CTACAGGAGA ----/GAGT GAGTAAGAGT 3070 hom 121 het 46 0 38 8 GAGT 1 2 88869 CASAVA_Build 14 76671287 1D CTCCTCTGGT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 4 hom 23 1 17 5 G 10 9 88870 CASAVA_Build 14 76692393 1I TGTATTTTGA -/G TAGAGACAGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 88871 CASAVA_Build 14 76694436 4D ATCACAGCCA GAGT/---- GAGGAGCAGG 3070 hom 66 het 24 0 21 4 GAGT 1 0 88872 CASAVA_Build 14 76714247 1I ATATGTGGTC -/T TATAGTAGGA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 1 2 88873 CASAVA_Build 14 76717991 3D GGACGCAAAT GTG/--- GTGAGCACGC 1528 het 904 hom 13 2 5 6 GTG 2 1 88874 CASAVA_Build 14 76725373 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 20 1 17 2 T 13 14 88875 CASAVA_Build 14 76730837 1D ATCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 17 2 11 4 T 13 12 88876 CASAVA_Build 14 76740344 1D ATGCGCCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1532 hom 27 4 14 9 T 10 9 88877 CASAVA_Build 14 76749888 4I TAAACGTGCT ----/AGTG AGTGAGTTAA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AGTG 1 2 88878 CASAVA_Build 14 76764494 8I TCCATTCCAC --------/TTCTGGCA TTCTGGCATT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 TTCTGGCA 1 2 88879 CASAVA_Build 14 76765588 1I AGGTCACCCA -/G GGCTGGAGTG 1463 het 1463 ref 10 4 4 2 G 2 3 88880 CASAVA_Build 14 76766435 2D CCCATTCTAA CT/-- CTATAGCTCA 3070 het 3070 hom 34 17 17 0 CT 2 1 88881 CASAVA_Build 14 76773853 1D GATGACTGAC G/- GGGGGCCACG 3070 hom 102 het 42 0 33 9 G 6 5 88882 CASAVA_Build 14 76795721 4I GCAGCAGAAG ----/TCTC TCTCTGGTGA 2158 het 658 hom 13 3 7 3 TC 2 4 88883 CASAVA_Build 14 76832698 3I AATAAAGAAG ---/GAA GAAGTATCTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 GAA 1 2 88884 CASAVA_Build 14 76838789 1I AATCTAAGTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 7 8 88885 CASAVA_Build 14 76863247 1D GACCCTGGGA G/- GGTGGGTGGC 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 G 3 2 88886 CASAVA_Build 14 76868388 19D GTGCTGGGAA TGGGAGGCAGGCTCCCCCG/------------------- TGGGCAGTGT 3070 het 3070 ref 38 22 13 6 TGGGAGGCAGGCTCCCCCG 1 0 88887 CASAVA_Build 14 76869100 1I ACTCATACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 22 0 18 5 T 9 10 88888 CASAVA_Build 14 76876083 8I AATCTAACAA --------/TGAAGGAG TGAGTCAAAG 3070 het 3070 hom 45 13 22 10 TGAAGGAG 0 1 88889 CASAVA_Build 14 76878532 12I GACCCTAGGA ------------/TCTTTACCTGGC TTCCTGAAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TCTTTACCTGGC 0 1 88890 CASAVA_Build 14 76884828 5D TATTAGTTTG TTTCT/----- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 TTTCT 2 1 88891 CASAVA_Build 14 76895996 1I CAAATAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 9 10 88892 CASAVA_Build 14 76897801 2D AACACAGGAT AG/-- ATCTTCCCAT 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 AG 1 0 88893 CASAVA_Build 14 76904374 1I TGTAGCATCA -/T TTTCATTACT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 3 4 88894 CASAVA_Build 14 76905214 5D TCCTTTCTCT TAGAA/----- TATTCAATTG 3070 het 3070 hom 42 20 21 3 TAGAA 1 0 88895 CASAVA_Build 14 76906268 10D ACTCCGTTTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 22 12 88896 CASAVA_Build 14 76919047 3I CCTGACCTCA ---/GGT GATCCACCCG 3070 het 1652 hom 23 5 13 5 GGT 0 1 88897 CASAVA_Build 14 76925187 5D CCCCATCTCT AAAAC/----- AAAACAAAAC 2948 het 2948 ref 36 20 9 9 AAAAC 3 2 88898 CASAVA_Build 14 76925433 1D GCTTTAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 A 10 9 88899 CASAVA_Build 14 76928150 4D ACTCTGTCTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 32 9 14 10 AAAC 3 2 88900 CASAVA_Build 14 76932433 1D ACAACCTCCG C/- CTCCTGGGTT 1899 hom 12 het 5 0 5 2 C 2 1 88901 CASAVA_Build 14 76945091 1D GCCTCCCAAA T/- GTGCTGGGAT 3070 hom 75 het 31 0 24 8 T 1 0 88902 CASAVA_Build 14 76950278 2D CTAGTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2496 het 10 hom 26 1 11 14 T 18 16 88903 CASAVA_Build 14 76953987 1D ATTTCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 8 16 11 T 12 11 88904 CASAVA_Build 14 76954796 1D CAGCTAATTG T/- TTTTTTTTTT 1023 het 1023 ref 37 29 3 5 T 11 10 88905 CASAVA_Build 14 76959643 1I AGGAGAATTA -/C CCAAGAAACT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 2 3 88906 CASAVA_Build 14 76962184 2D ATGTCTATTT AA/-- AAAAACAGGC 3070 het 1787 hom 14 6 7 1 A 7 5 88907 CASAVA_Build 14 76976982 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTGTATTT 3070 hom 84 het 30 0 27 3 T 4 5 88908 CASAVA_Build 14 76977469 1D TTGGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 58 24 22 13 T 11 10 88909 CASAVA_Build 14 76982036 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 17 16 88910 CASAVA_Build 14 76996669 1D TCAGACCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 32 1 24 7 T 13 12 88911 CASAVA_Build 14 77001046 1I TTTAGCACCA -/G GTTAGGAGGT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 G 1 2 88912 CASAVA_Build 14 77004355 2D TTCTGAACTC TA/-- TAGGTAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TA 2 1 88913 CASAVA_Build 14 77004993 1I TAGTAGAGAT -/G GGAGTTTCAC 3070 het 2303 hom 17 6 10 1 G 2 3 88914 CASAVA_Build 14 77006423 4D GAGCCTTGGA TTTC/---- TTAACACCCA 3070 het 3070 ref 56 28 22 7 TTTC 1 0 88915 CASAVA_Build 14 77011619 11I GGGGCGGGTG -----------/AGGGCCCTACC AGGAAAGTTC 3070 hom 70 het 27 0 18 9 AGGGCCCTACC 0 1 88916 CASAVA_Build 14 77016792 4I TAGCTGGGAC ----/TACA TACAGGCAGG 1317 het 1317 ref 19 10 6 3 TACA 1 2 88917 CASAVA_Build 14 77017904 2I AGAAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 1933 het 1933 ref 16 7 7 2 A 10 12 88918 CASAVA_Build 14 77019021 1D GAACTGGTCT G/- GGCTGGGGCC 3070 het 3070 hom 38 17 14 7 G 3 2 88919 CASAVA_Build 14 77022364 4I TCTCACTCTT ----/ACTG ACTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 ACTG 0 1 88920 CASAVA_Build 14 77025649 1I AGTACTATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 9 10 88921 CASAVA_Build 14 77026487 16I AAAGAAAAAG ----------------/AAAAGTAAACCAAAAA AACGGAGCCA 3070 hom 57 het 22 0 18 4 AAAAGTAAACCAAAAA 0 1 88922 CASAVA_Build 14 77030981 4D CTTTTTTCAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 31 12 13 12 TTTA 3 2 88923 CASAVA_Build 14 77038417 1D AGGTTGTAGG T/- TAACTGGTAG 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 T 2 1 88924 CASAVA_Build 14 77040887 4I ATTTATTTTG ----/AATT AATTATTGTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AATT 1 2 88925 CASAVA_Build 14 77041444 9D ACTAGTCTGA CCCCCACCC/--------- CCTGCATAAG 2785 het 2785 ref 16 10 7 1 CCCCCACCC 1 0 88926 CASAVA_Build 14 77043707 2I GGATTACAGG --/CA TGAGCCACTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 CA 0 1 88927 CASAVA_Build 14 77044291 1D TAGAAAAAAA T/- TTTTGTAGAG 3070 het 3070 hom 40 12 23 6 T 5 4 88928 CASAVA_Build 14 77045468 3D CTTTTGACAT CTC/--- CTAGCTATGC 3070 het 3070 ref 42 27 14 1 CTC 1 0 88929 CASAVA_Build 14 77052085 30D GAGCTCTAGC TGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCGCA/------------------------------ TGTGTGTGTG 3070 het 2383 hom 24 9 8 11 TGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGCGCA 1 0 88930 CASAVA_Build 14 77055985 2I TCTCTAAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 10 12 88931 CASAVA_Build 14 77056244 2I CCTTCTTTAA --/AG AGAGAGCTCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AG 3 4 88932 CASAVA_Build 14 77061993 4I CTGGGTGACA ----/GAGT GAGACTCCAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 GAGT 0 1 88933 CASAVA_Build 14 77062213 2I GCATTTACAC --/AT GTTAGAAAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AT 0 1 88934 CASAVA_Build 14 77062896 1I TATTTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 12 10 T 13 14 88935 CASAVA_Build 14 77063843 2D CTTTTTTTTT TG/-- TTTTTTTGAA 3070 het 450 hom 29 5 12 12 TG 1 0 88936 CASAVA_Build 14 77066413 1D GATCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2877 hom 23 9 12 2 A 12 11 88937 CASAVA_Build 14 77072371 4D CCGAAAAATG ATTA/---- ATTTTGTTAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 ATTA 1 0 88938 CASAVA_Build 14 77073383 1I GGCAGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 40 2 28 10 A 14 15 88939 CASAVA_Build 14 77083271 1I GAAACAAGTA -/T TTTTTTTTTT 1605 het 1605 ref 27 14 5 8 T 15 16 88940 CASAVA_Build 14 77092440 1D ACCAAAAAAC A/- AAAAACAAGC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 6 5 88941 CASAVA_Build 14 77094427 1I CAGGCGTGAG -/C CACCACGCCT 3070 hom 51 het 21 0 15 6 C 1 2 88942 CASAVA_Build 14 77096727 2D AAAAATAAAA AT/-- ATATATATAT 1782 het 151 hom 9 1 5 3 AT 8 7 88943 CASAVA_Build 14 77096997 4D GTTCGAAAAA CTAC/---- CTACCTATCA 3070 het 3070 hom 52 20 26 8 CTAC 2 1 88944 CASAVA_Build 14 77097124 1D AATAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 23 6 A 11 10 88945 CASAVA_Build 14 77100384 12D GAGGAGGAAA AGGAGGAAGAGG/------------ AGGAGAAGGA 2108 het 843 hom 17 6 5 12 AGGAGGAAGAGG 1 0 88946 CASAVA_Build 14 77103893 3D34M3I GTTTAATTTG TTTTTCTTTTTCTAATTTTTTAAGCTACAAGCTTTAC---/---TTCTTTTTCTAATTTTTTAAGCTACAAGCTTTACTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 21 18 12 N/A 0 0 88947 CASAVA_Build 14 77105215 3I TACACAATGT ---/TCC TCTTTATCAC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TCC 0 1 88948 CASAVA_Build 14 77106653 1D CTGAATTTAA G/- AATTACTCAT 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 G 1 0 88949 CASAVA_Build 14 77106996 1D GAACATGGGC G/- GGGGGATGGG 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 G 6 5 88950 CASAVA_Build 14 77108075 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 3070 hom 90 het 31 0 30 1 G 2 3 88951 CASAVA_Build 14 77118147 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 2856 het 2225 hom 24 10 10 4 A 11 12 88952 CASAVA_Build 14 77120615 3I TAAGGAAGAT ---/ATC ATTTCTTACA 3070 het 3070 hom 62 26 30 6 ATC 0 1 88953 CASAVA_Build 14 77123978 1I ACAAGATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 9 7 5 A 10 11 88954 CASAVA_Build 14 77124799 1D CTCTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2632 het 2632 ref 24 10 8 7 A 12 11 88955 CASAVA_Build 14 77133577 1D ACCTTAAGAA T/- TTTCTAAGTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 4 3 88956 CASAVA_Build 14 77133696 1I CATGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 C 2 3 88957 CASAVA_Build 14 77138211 4I TTAAACTTGC ----/CTCA CTATCTATAG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 CTCA 0 1 88958 CASAVA_Build 14 77140214 1D GATGCGCCCC T/- GGTGGTCACG 3070 hom 105 het 38 0 34 4 T 1 0 88959 CASAVA_Build 14 77146234 5D TCTAACTGAG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 GTTTT 4 3 88960 CASAVA_Build 14 77146967 16D CATAGTGAGA CTCTGTCTCCCTCTCT/---------------- CTCTGTCTCC 2003 het 2003 ref 17 9 5 3 CTCTGTCTCCCTCTCT 2 1 88961 CASAVA_Build 14 77149167 4D AAACAAACAC ACAA/---- ACAAACTACT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 ACAA 2 1 88962 CASAVA_Build 14 77157950 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 8 9 88963 CASAVA_Build 14 77160308 1D TTAAAAAAAC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 8 7 88964 CASAVA_Build 14 77162143 1D TGCTGAGTAG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 8 7 88965 CASAVA_Build 14 77168343 1D TAAAACCACC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 47 het 23 0 15 8 T 10 9 88966 CASAVA_Build 14 77184709 13D GAAAGGAAAG AAAGGAAAGAAGA/------------- AAGAAAGAAA 2791 hom 18 het 7 0 7 0 AAAGGAAAGAAGA 1 0 88967 CASAVA_Build 14 77186137 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 7 A 9 8 88968 CASAVA_Build 14 77210647 1D TTATTGATGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 10 9 88969 CASAVA_Build 14 77216325 1I CCTCCAGCAT -/C CTTGGTAATG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 2 88970 CASAVA_Build 14 77220465 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 11 10 88971 CASAVA_Build 14 77221533 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAC 2661 het 68 hom 17 1 11 5 A 9 10 88972 CASAVA_Build 14 77224013 4I TCATCTCATC ----/TCTT TCTCTTCGTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TCTT 0 1 88973 CASAVA_Build 14 77227905 1I CAGAGTCATA -/T TATCAGAAGG 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 1 2 88974 CASAVA_Build 14 77250134 4D TGAGACAGGT TCTC/---- TCTCTCACTC 3070 hom 75 het 27 0 25 4 TC 5 3 88975 CASAVA_Build 14 77251591 2D AATATAAAAA AT/-- GAGGCAGACA 3070 hom 107 het 38 0 36 3 AT 1 0 88976 CASAVA_Build 14 77255746 4I CAGAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 AAAC 2 3 88977 CASAVA_Build 14 77256330 8I TTGGCTCACC --------/ATAAGCTG AAGCAATTCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ATAAGCTG 0 1 88978 CASAVA_Build 14 77269321 4I GATTTAAACT ----/CAGA CAGCAGGATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 CAGA 0 1 88979 CASAVA_Build 14 77270833 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 12 11 88980 CASAVA_Build 14 77286764 1D TATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 42 1 38 3 A 12 11 88981 CASAVA_Build 14 77295253 1D GCTCTGGAGT C/- CTCAAGACTG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 C 2 1 88982 CASAVA_Build 14 77302234 1D AAATTATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 22 1 17 4 T 12 11 88983 CASAVA_Build 14 77303866 1I AATTATTTTG -/T TGCATTCTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 1 2 88984 CASAVA_Build 14 77318400 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2370 het 1501 hom 31 9 11 11 A 17 18 88985 CASAVA_Build 14 77319190 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1246 hom 33 4 18 11 A 15 16 88986 CASAVA_Build 14 77323154 1D GGCTCATGCC T/- ATAATGAGTA 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 T 1 0 88987 CASAVA_Build 14 77323413 4I AGAAACCCCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 AAAC 2 3 88988 CASAVA_Build 14 77325611 1I GGTTTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 13 14 88989 CASAVA_Build 14 77328163 4D TATGCATGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TG 9 7 88990 CASAVA_Build 14 77348476 1D GAGATCATGC A/- GTATTTGTCT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 1 0 88991 CASAVA_Build 14 77350523 1I CTCTTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 18 1 14 3 A 10 11 88992 CASAVA_Build 14 77352524 6I TTTCTGATTG ------/ATCCAC TGGATCTTAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 ATCCAC 0 1 88993 CASAVA_Build 14 77354006 1I TAATTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2519 hom 26 het 10 0 7 3 T 10 11 88994 CASAVA_Build 14 77355215 1D CTACGGTAGG T/- TTTTCCCTTT 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 T 5 4 88995 CASAVA_Build 14 77357366 1I GCTTTATAAA -/C CAGCCACAAA 3070 hom 81 het 33 0 26 7 C 1 2 88996 CASAVA_Build 14 77361481 1D GGGATATTCA T/- TTAGCCTTTT 3070 het 3070 ref 46 29 12 5 T 3 2 88997 CASAVA_Build 14 77362472 1D GGAGGCTAGC T/- TCGGCAGGCG 3070 hom 65 het 25 0 21 4 T 2 1 88998 CASAVA_Build 14 77387219 1I CATTTGGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2831 hom 34 8 15 11 T 13 14 88999 CASAVA_Build 14 77390652 5D CGGAGTGGGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2973 het 654 hom 26 4 10 13 T 19 14 89000 CASAVA_Build 14 77392677 1I CTTTAGATAT -/G GGTAAAGGAT 3070 het 3070 ref 49 22 22 5 G 2 3 89001 CASAVA_Build 14 77397651 3D GCCCTAAGAC CTT/--- CTGCAGAAAG 1387 het 1387 ref 20 9 7 4 CTT 1 0 89002 CASAVA_Build 14 77397695 3I AAAGAGGCTG ---/TCA TCAGTTATGC 3070 het 3070 ref 33 12 9 12 TCA 1 2 89003 CASAVA_Build 14 77401247 4D TGAATTAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 80 het 33 0 27 6 AAAC 4 3 89004 CASAVA_Build 14 77410782 1I ACTTTGCAGG -/T TATTTAGTGC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 1 2 89005 CASAVA_Build 14 77413125 2D ATCCTGGCCA AC/-- ACAGTGAAGC 3070 het 2219 hom 20 8 12 0 AC 2 1 89006 CASAVA_Build 14 77414083 2D CTCAGAGAAG CT/-- CTCTCTGCTC 3070 het 3070 hom 40 11 25 5 CT 4 3 89007 CASAVA_Build 14 77415021 1I ACTGTCCCTT -/C CCCCCCCCAC 3067 het 3067 ref 34 18 10 6 C 8 9 89008 CASAVA_Build 14 77415993 1D GGCAGTTATT G/- GGGGGCTACT 3070 het 3070 ref 39 14 13 12 G 6 5 89009 CASAVA_Build 14 77419053 2D TCTTACACCA CC/-- CCCCCCCCCG 2055 het 106 hom 28 1 5 22 C 11 9 89010 CASAVA_Build 14 77436179 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGAAAATT 3070 het 99 hom 20 2 12 6 AAG 0 1 89011 CASAVA_Build 14 77436687 3I CGTCTCAAGG ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 54 21 24 9 AAC 5 6 89012 CASAVA_Build 14 77464562 1D TGTTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 12 12 T 14 13 89013 CASAVA_Build 14 77472006 2I TGAGCCACAC --/AG GGGAGATCTG 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 AG 0 1 89014 CASAVA_Build 14 77487385 1D AGACCAGCCT G/- GGGGGACATG 3070 hom 105 het 39 0 33 6 G 6 5 89015 CASAVA_Build 14 77488558 1D GTATCAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 12 11 89016 CASAVA_Build 14 77497127 1D GTGAGAAAAT A/- AATTTCTGTT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 3 2 89017 CASAVA_Build 14 77504244 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTGGAG 3070 hom 150 het 57 0 49 8 T 6 7 89018 CASAVA_Build 14 77507431 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2532 het 317 hom 11 1 8 2 A 17 18 89019 CASAVA_Build 14 77513755 1I ATGTGGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 44 2 37 5 T 10 11 89020 CASAVA_Build 14 77523325 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 33 2 18 13 T 15 14 89021 CASAVA_Build 14 77526143 1D CTGCGATTTA T/- TTGACTTGCC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 3 2 89022 CASAVA_Build 14 77528273 1I CTGCAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 2667 het 1056 hom 19 3 8 8 T 15 16 89023 CASAVA_Build 14 77539465 1I AGTTTGTAGG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 6 7 89024 CASAVA_Build 14 77543811 2I GGAAGAAAGG --/GA GAGTGTCAGC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 GA 1 2 89025 CASAVA_Build 14 77549518 4D AGCCTCCACA GCGT/---- GCGTGGAAGG 2090 hom 20 het 12 0 7 5 GCGT 2 1 89026 CASAVA_Build 14 77554338 13D2M1D TATACATCCA GTGGGATATTATTCAG/-------------CA- CCTTGAAAAA 3070 hom 126 het 43 0 43 2 N/A 0 0 89027 CASAVA_Build 14 77577761 1D AGATTGAGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 9 8 89028 CASAVA_Build 14 77584878 2D GGGGACTTTT TA/-- TATATATATA 1553 hom 10 het 8 0 4 4 TA 8 7 89029 CASAVA_Build 14 77591755 1I GACTGTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 26 1 20 5 T 15 16 89030 CASAVA_Build 14 77595680 1D TTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1732 het 1732 ref 40 26 5 9 T 14 13 89031 CASAVA_Build 14 77611850 2I TGAAGAGGGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 98 het 40 0 33 7 TG 5 6 89032 CASAVA_Build 14 77618148 4I GAGTCCAGGT ----/GAGA GAGCTAGGAA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 GA 1 3 89033 CASAVA_Build 14 77619496 7D CAGTAAGAAA TATATCT/------- TATATTATGA 3070 het 3070 hom 38 13 20 11 TATATCT 1 0 89034 CASAVA_Build 14 77620946 3I TAACTGACTC ---/CTT CTTCCAGGTA 3070 het 3070 ref 54 26 21 7 CTT 1 2 89035 CASAVA_Build 14 77638625 2D GATAAACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 114 het 47 0 38 9 AC 14 13 89036 CASAVA_Build 14 77644496 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1843 het 1843 ref 26 12 5 9 T 13 12 89037 CASAVA_Build 14 77644994 1I TGATTTTATC -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 6 7 89038 CASAVA_Build 14 77658865 7D AAAAAGCAAG AGCCCGT/------- ATGATAATCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 AGCCCGT 1 0 89039 CASAVA_Build 14 77698692 8I AAGTTTCCAC --------/TGCCTGTT TGACTTCGGG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TGCCTGTT 0 1 89040 CASAVA_Build 14 77707049 3D CTTCTTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2876 hom 37 13 12 12 T 19 16 89041 CASAVA_Build 14 77707835 1I ATTACTTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 9 10 89042 CASAVA_Build 14 77709902 2D TCGGCACATC CA/-- CACACACACT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 CA 5 4 89043 CASAVA_Build 14 77711286 1I TGCCTAAAAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 7 8 89044 CASAVA_Build 14 77730419 3D GAGAGTTGGG AGA/--- AGGTCAGGGC 3070 het 3070 ref 62 31 26 7 AGA 1 0 89045 CASAVA_Build 14 77745078 3D GTTAACTGAA CTT/--- CTGGGCCTCA 3070 het 3070 hom 32 12 19 4 CTT 1 0 89046 CASAVA_Build 14 77749373 1I GATCTGAGAT -/G GGGGGAAGAG 3070 het 3070 ref 55 25 25 5 G 5 6 89047 CASAVA_Build 14 77755255 1I TTTGGTGGGA -/G GGGGGGATGC 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 G 6 7 89048 CASAVA_Build 14 77760282 1I TCAACAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 13 14 89049 CASAVA_Build 14 77774236 1I GTTGTGTGAG -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 48 het 24 0 14 10 C 8 9 89050 CASAVA_Build 14 77799147 2I GTGAAGTCAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 396 hom 48 1 35 12 T 9 11 89051 CASAVA_Build 14 77803760 1D ACTGTCTCTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 50 16 27 7 A 8 7 89052 CASAVA_Build 14 77835556 20D TCCCAATAAG CCCCTCCTACATTCTTTTTT/-------------------- CCCCTCCTAC 3070 het 3070 ref 41 20 8 22 CCCCTCCTACATTCTTTTTT 2 1 89053 CASAVA_Build 14 77837251 1I ATGTGGAATT -/G GGGGGGGATA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 G 7 8 89054 CASAVA_Build 14 77848682 1I AAAAGAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 10 11 89055 CASAVA_Build 14 77864064 1D CAATGTGTAT G/- GGCTGCAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 G 3 2 89056 CASAVA_Build 14 77868415 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1827 het 36 hom 20 1 5 14 T 17 16 89057 CASAVA_Build 14 77868926 4I TTTGTCTGGG ----/GCCA GCCAGTCCCA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 GCCA 1 2 89058 CASAVA_Build 14 77886386 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1542 hom 23 6 13 7 A 15 14 89059 CASAVA_Build 14 77887073 1D TATAAAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 7 89060 CASAVA_Build 14 77888189 2D GTCTTAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 31 0 24 7 A 16 14 89061 CASAVA_Build 14 77891447 1D CCATATTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 45 2 29 14 T 13 12 89062 CASAVA_Build 14 77898400 1I TTGAAACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 29 1 26 2 T 11 12 89063 CASAVA_Build 14 77906027 2D TAGCCTGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 42 1 19 22 A 20 18 89064 CASAVA_Build 14 77908178 1I GAGAGTTTGT -/C CTTAGAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 2 89065 CASAVA_Build 14 77908272 1D GAAAAAAAAA T/- TTTTACCAGA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 5 4 89066 CASAVA_Build 14 77908390 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2559 het 1968 hom 19 7 7 5 T 11 10 89067 CASAVA_Build 14 77909370 1I AAGATGAGGT -/G GGGAAGATGT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 G 3 4 89068 CASAVA_Build 14 77915138 1D TCACATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 31 1 27 3 A 11 10 89069 CASAVA_Build 14 77922126 1D31M1I AGGTATTAGA TTTTTTTTTTTTAACTGGCAAAACAAAAGAGC-/-TTTTTTTTTTTAACTGGCAAAACAAAAGAGCA AAAAAAAGTC 3070 het 39 hom 31 1 31 5 N/A 0 0 89070 CASAVA_Build 14 77925153 1D TTTAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1605 het 992 hom 21 3 8 10 T 15 14 89071 CASAVA_Build 14 77940302 3D CCTATTTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 1056 het 840 hom 34 11 7 16 T 17 14 89072 CASAVA_Build 14 77949898 1I CACTATAGTG -/A TTTGAGGTCA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 0 1 89073 CASAVA_Build 14 77956082 1D CACACACACA C/- GTAAAGTCCT 2446 het 17 hom 17 1 8 10 C 1 0 89074 CASAVA_Build 14 77957358 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2453 het 1511 hom 18 7 7 4 A 14 13 89075 CASAVA_Build 14 77976542 1D CTTGAGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 A 13 12 89076 CASAVA_Build 14 77996907 1D GATATTGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 86 het 34 0 29 5 T 10 9 89077 CASAVA_Build 14 77999457 4I AATAAACATA ----/TGAG TGAGTGCCAG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 TGAG 1 2 89078 CASAVA_Build 14 78010604 16I GCTCAACTTA ----------------/TCATGCAGTGGTAGCT TCAAGTTATG 3070 hom 132 het 47 0 42 7 TCATGCAGTGGTAGCT 0 1 89079 CASAVA_Build 14 78011330 4I TGGATATTCC ----/CCTT CCTTTCAGAT 3070 hom 113 het 41 0 37 4 CCTT 1 2 89080 CASAVA_Build 14 78027408 1D GGATGAGATT C/- TGGTCAAGTC 3070 het 3070 hom 47 13 20 15 C 1 0 89081 CASAVA_Build 14 78030985 1D GTGAGGTGTG T/- TTTTACCAAT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 5 4 89082 CASAVA_Build 14 78034896 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 T 9 10 89083 CASAVA_Build 14 78041894 1I AAAATCTATA -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 6 7 89084 CASAVA_Build 14 78046137 8D GACAAAATTT TATATATA/-------- TATATATATA 3070 het 1799 hom 21 5 14 3 TA 9 5 89085 CASAVA_Build 14 78055842 3I TGAGGACCTT ---/GAA GAAGGAGTAG 3070 hom 150 het 52 0 50 2 GAA 1 2 89086 CASAVA_Build 14 78067714 1D TATCATTTCC T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 41 21 14 7 T 8 7 89087 CASAVA_Build 14 78072705 2D ATTATTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 12 10 89088 CASAVA_Build 14 78079503 1I TGATGTCCAA -/T TTTCAGTGCT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 3 4 89089 CASAVA_Build 14 78083312 1D TTTTCATTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 43 het 27 0 16 11 T 9 8 89090 CASAVA_Build 14 78083897 1D AAGGTACTGA T/- TTTGTATATT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 4 3 89091 CASAVA_Build 14 78084339 7I GAATAAGATA -------/CTTTGAT CTTTGATAAG 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 CTTTGAT 1 2 89092 CASAVA_Build 14 78086127 3D TTCTGCAAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 1298 het 863 hom 30 10 4 16 T 21 18 89093 CASAVA_Build 14 78086636 2D GATAGTAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 35 0 17 19 AC 1 0 89094 CASAVA_Build 14 78181737 1D GTTATTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 10 16 A 11 10 89095 CASAVA_Build 14 78221907 7D TTTTTCTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTG 3070 het 1378 hom 20 6 14 2 T 16 9 89096 CASAVA_Build 14 78259891 2D TTTTACTCCA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 98 het 51 0 41 10 T 11 9 89097 CASAVA_Build 14 78267704 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TG 10 9 89098 CASAVA_Build 14 78268057 44I ACCCCACAAC --------------------------------------------/TTTGTGGCTTATAAGAAGCAGTATTTAATTTCTATACTTACAGA TTTGTGGATA 3070 hom 101 het 33 0 31 9 TTTGTGGCTTATAAGAAGCAGTATTTAATTTCTATACTTACAGA 0 1 89099 CASAVA_Build 14 78272242 2I CATGTATCTT --/GA ATTCTGAAAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 GA 0 1 89100 CASAVA_Build 14 78276480 1I CCTTGTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 35 1 26 8 T 10 11 89101 CASAVA_Build 14 78284457 1I GCATAATATG -/T TTGGAAAACA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 2 3 89102 CASAVA_Build 14 78301821 4D ATAAATGTTG ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 AT 7 5 89103 CASAVA_Build 14 78324377 2I CTGAGCATGG --/GT TATTATCAGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GT 0 1 89104 CASAVA_Build 14 78331681 4I ATAAAATTAA ----/TTAC TTATATCCTC 3070 hom 79 het 34 0 27 7 TTAC 0 1 89105 CASAVA_Build 14 78343831 2D51M2I ATTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAAAGAGAAAGAAAGAA--/--AAAAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAAG AAAAACTTTC 3070 het 76 hom 19 1 21 11 N/A 0 0 89106 CASAVA_Build 14 78345429 2D TCACAGAGTG AA/-- AAATACTCAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 3 89107 CASAVA_Build 14 78346120 1D GCTTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 12 11 89108 CASAVA_Build 14 78349126 1D ATATAATACA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 8 7 89109 CASAVA_Build 14 78365630 1D CAACTATTAG T/- TTCACTATGG 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 3 2 89110 CASAVA_Build 14 78369828 1D AATCTAAATG T/- TTTTAAGGTG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 5 4 89111 CASAVA_Build 14 78473282 1D CGTGCCATTG A/- AAAAAAAAAA 2525 het 2525 ref 25 12 7 6 A 17 16 89112 CASAVA_Build 14 78523616 3D CTAAATCCTC CTT/--- CTTCTCCTTC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 CTT 2 1 89113 CASAVA_Build 14 78526152 4D GAGTATCACA CTGT/---- CTGACTTGGG 3070 het 3070 ref 50 27 22 2 CTGT 1 0 89114 CASAVA_Build 14 78543554 1D AGTCATGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 17 12 2 T 11 10 89115 CASAVA_Build 14 78544662 1D CTCTCCCTGC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 8 7 89116 CASAVA_Build 14 78553330 2D GATCACTGGC TG/-- TGTGTGCCCA 3070 hom 136 het 56 0 44 13 TG 4 3 89117 CASAVA_Build 14 78554434 1D TGAAAACAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 2839 hom 21 8 13 0 A 9 8 89118 CASAVA_Build 14 78565881 1I ATAATTGACA -/T TTTTTGACCG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 5 6 89119 CASAVA_Build 14 78573843 2D CAGTGGGCGT AA/-- ATTCAGTCCG 3070 het 3070 hom 45 18 23 6 A 3 1 89120 CASAVA_Build 14 78584194 5I AATAATAAAC -----/TACAA TACAAGTAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 TACAA 1 2 89121 CASAVA_Build 14 78584720 1D TCAGTGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 17 10 T 13 12 89122 CASAVA_Build 14 78587318 1D GTTTCCTCTG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 A 9 8 89123 CASAVA_Build 14 78589732 2D GTGTGTGTGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 132 het 54 0 42 13 TG 6 5 89124 CASAVA_Build 14 78590109 18D CTTTGTAGTG ACATGGATGAAGCTGGAA/------------------ ACCATCATTC 2779 het 2779 ref 15 9 7 6 ACATGGATGAAGCTGGAA 1 0 89125 CASAVA_Build 14 78592490 1D TATCCGTGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 10 9 89126 CASAVA_Build 14 78605660 1D GAAATTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 31 1 21 10 A 13 12 89127 CASAVA_Build 14 78606051 1I TGAGCTGCTT -/A ATAATAAGCA 3070 het 3070 hom 64 30 29 5 A 1 2 89128 CASAVA_Build 14 78607313 1I AAGAAACACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 8 9 89129 CASAVA_Build 14 78608122 1D TTACTATTTA T/- TTTTGATTTC 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 T 5 4 89130 CASAVA_Build 14 78615372 4I AATAAATTCC ----/TTTG TTTGTGAAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTTG 1 2 89131 CASAVA_Build 14 78617712 1D ACTTTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1012 hom 24 3 11 10 A 19 18 89132 CASAVA_Build 14 78625782 1D TAAAATCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 70 hom 57 1 45 12 T 10 9 89133 CASAVA_Build 14 78629914 1I TTTTGGACTC -/A AGAGTATGGG 3070 hom 83 het 34 0 26 8 A 1 2 89134 CASAVA_Build 14 78631655 1D GCACCTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 30 1 22 8 T 12 11 89135 CASAVA_Build 14 78631759 2D AAATACATGT GA/-- GATTTGAAGA 3070 het 3070 hom 33 15 18 2 GA 2 1 89136 CASAVA_Build 14 78632705 1D GTGTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 44 1 30 13 A 12 11 89137 CASAVA_Build 14 78645391 3D ATTAGCCTTA TCT/--- TCTTGTAAGT 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 TCT 2 1 89138 CASAVA_Build 14 78654869 1I CTTTTTTAGC -/A ACCCAAATTA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 1 2 89139 CASAVA_Build 14 78670244 1D AATAAGTTAA G/- TGTAAGTGGT 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 G 1 0 89140 CASAVA_Build 14 78673557 1I TGAGACATAA -/C ACAATGTCTA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 C 0 1 89141 CASAVA_Build 14 78686805 1D TTAGATAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 35 1 16 19 A 13 12 89142 CASAVA_Build 14 78692649 1I CCATTCTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 9 10 89143 CASAVA_Build 14 78698205 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2256 hom 21 het 10 0 7 3 T 12 11 89144 CASAVA_Build 14 78708289 1I CTTGCTAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 34 1 30 3 A 10 11 89145 CASAVA_Build 14 78711076 1D TCAGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 2024 het 199 hom 24 2 11 11 T 17 16 89146 CASAVA_Build 14 78718418 1D TATACTGTAA T/- TATATAATGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 2 1 89147 CASAVA_Build 14 78721564 1I CACTTGGGAA -/T TTTTTTTTTT 2976 het 587 hom 17 3 9 5 T 17 18 89148 CASAVA_Build 14 78723680 99D AATGATTCTT AAAAATGTGTAAGCATGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/--------------------------------------------------------------------------------------------------- AAAAATGTGT 3070 hom 54 het 18 0 19 11 AAAAATGTGTAAGCATGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 89149 CASAVA_Build 14 78724493 1I ACAATACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 40 0 33 7 T 11 12 89150 CASAVA_Build 14 78729237 1D TTTTAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 454 hom 27 2 19 6 A 11 10 89151 CASAVA_Build 14 78758839 3D ATGGCATCTC ATT/--- GTTGTTTTAA 3070 hom 114 het 43 0 39 7 ATT 1 0 89152 CASAVA_Build 14 78764453 1I TTCAAAATCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 9 10 89153 CASAVA_Build 14 78774400 3I GATTAGTTAC ---/ATG ATGCCCACAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATG 1 2 89154 CASAVA_Build 14 78778165 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2979 hom 24 7 11 6 A 11 12 89155 CASAVA_Build 14 78794047 1D AATAGACTGG A/- AAAAAAAAAG 1203 het 1203 ref 43 34 3 6 A 10 9 89156 CASAVA_Build 14 78883627 2D AAGCGATTCT CC/-- TGCTTCAGCC 3070 het 3003 hom 23 8 15 0 C 2 0 89157 CASAVA_Build 14 78895667 1D ACATTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 2100 het 505 hom 16 2 5 9 T 17 16 89158 CASAVA_Build 14 78900770 2I AAAATGAAAC --/AG AAAATAAATG 3070 het 3070 ref 52 29 15 8 AG 0 1 89159 CASAVA_Build 14 78958321 2D CCCCCAGCAA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 108 het 45 0 34 12 T 10 8 89160 CASAVA_Build 14 78968225 3I AATCATTTTT ---/TTC TTTAGTTTTG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TTC 0 1 89161 CASAVA_Build 14 78981435 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1398 hom 16 4 9 3 A 11 12 89162 CASAVA_Build 14 78986677 1D AAATAAGGCC A/- GGGGCGGTGG 3070 het 1641 hom 29 6 15 8 A 1 0 89163 CASAVA_Build 14 78999572 1I GTTGTGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 59 19 26 14 A 10 11 89164 CASAVA_Build 14 79005463 1D9M6I GGAACCAGAA CATTCCAGTA------/-ATTCCATTAAAATGG TATTTTAATA 3070 het 3070 hom 41 22 22 2 N/A 0 0 89165 CASAVA_Build 14 79009884 36D TTCTGAGCTT AGGAGTTTTTCCAGATCATTAGCCACTTATACGGAG/------------------------------------ AGGACCTGCT 3070 het 3070 ref 36 29 16 4 AGGAGTTTTTCCAGATCATTAGCCACTTATACGGAG 1 0 89166 CASAVA_Build 14 79037842 1D TCCCTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 A 13 12 89167 CASAVA_Build 14 79053763 1D AAATTTAATA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 36 17 10 10 T 8 7 89168 CASAVA_Build 14 79064755 1D TGTGTATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 11 10 89169 CASAVA_Build 14 79069185 6I TTAATAATTT ------/CTTATA CTTATCAAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CTTATA 0 1 89170 CASAVA_Build 14 79078988 1D GTGTGGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 26 7 A 11 10 89171 CASAVA_Build 14 79138833 1D AGAGAGGAGC T/- TTTTTTTTTT 1186 het 1186 ref 35 28 4 3 T 12 11 89172 CASAVA_Build 14 79238986 21I GAGAAACAAG ---------------------/TCTTTTACCACTAAAGTGTAT TCTTTTACCT 3070 het 3070 ref 42 21 12 9 TCTTTTACCACTAAAGTGTAT 0 1 89173 CASAVA_Build 14 79239023 1I TTATCAGCAG -/A AAAAAAAAAA 2366 het 2366 ref 39 16 9 14 A 12 13 89174 CASAVA_Build 14 79242099 2I CATCCACCAG --/TA TACCTTCTCA 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 TA 1 2 89175 CASAVA_Build 14 79244124 2D TATATCTCCC CT/-- CTTTGCTGAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 CT 2 1 89176 CASAVA_Build 14 79244230 4D GCATTCAACC AACT/---- AACTGTGAAT 3070 hom 75 het 27 0 25 6 AACT 2 1 89177 CASAVA_Build 14 79246447 1I GGGCTACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 9 10 89178 CASAVA_Build 14 79248863 3D AGTCGTCTGA CCT/--- CCTGCTTTAG 3070 het 3070 ref 36 16 13 8 CCT 2 1 89179 CASAVA_Build 14 79251747 2I TTCATGGTAC --/TT TTATATCATG 3070 het 3070 hom 54 18 26 10 T 2 4 89180 CASAVA_Build 14 79269178 4I AAATATGCAG ----/TGAA TGAATAATTA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 TGAA 1 2 89181 CASAVA_Build 14 79269771 1D GCTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 2587 het 2587 ref 40 24 8 8 T 14 13 89182 CASAVA_Build 14 79278301 1I TTATACACTA -/C CCTCTAAACT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 C 2 3 89183 CASAVA_Build 14 79299756 1I GTGAGAGCTT -/G CTTCCTGGTT 3070 hom 129 het 48 0 39 9 G 0 1 89184 CASAVA_Build 14 79326426 1D GGCGCCACCC T/- TTTTTTTATT 2490 het 2490 ref 22 12 8 2 T 8 7 89185 CASAVA_Build 14 79356780 16D TCAAGTAGAC TCCATTGTCTGTCGTT/---------------- TCCTTGTGTT 3070 het 3070 ref 40 27 15 4 TCCATTGTCTGTCGTT 1 0 89186 CASAVA_Build 14 79359253 1I GTGTATCTAC -/A GTCCTCATCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 1 89187 CASAVA_Build 14 79360500 3I TTTTTGATGG ---/TTC TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTC 0 1 89188 CASAVA_Build 14 79362097 1I TCCTCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 10 11 89189 CASAVA_Build 14 79363788 4D TGCCACAAAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2455 het 239 hom 22 4 7 12 T 20 16 89190 CASAVA_Build 14 79366968 1D GCAAGGCTCT G/- TTAATAGCTG 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 G 1 0 89191 CASAVA_Build 14 79367161 6D ACAGTCCTAT TAGAGA/------ TAGAGACCAC 3070 het 3070 ref 36 18 14 6 TAGAGA 2 1 89192 CASAVA_Build 14 79369729 1I TGAGAAATCA -/C CCTTAAAAGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 2 3 89193 CASAVA_Build 14 79370389 1I GAGCCTATTC -/T TTTTCATTTT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 T 4 5 89194 CASAVA_Build 14 79372563 1I ACTATTCTGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 39 0 29 10 A 8 9 89195 CASAVA_Build 14 79373396 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAACCGT 3070 hom 126 het 50 0 42 9 A 7 6 89196 CASAVA_Build 14 79384584 1D AGTGTTAGTG T/- TTTTTTATGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 6 89197 CASAVA_Build 14 79393314 4D AAACTACTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 28 14 13 2 TTTG 4 3 89198 CASAVA_Build 14 79393698 1I TGCCTTTGAT -/C CCCCCAGGAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 5 6 89199 CASAVA_Build 14 79400694 2D GAGATAATTA TC/-- TGTTACTTGA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 TC 1 0 89200 CASAVA_Build 14 79404057 1D GATATCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 864 hom 56 2 44 11 T 12 11 89201 CASAVA_Build 14 79408292 1D ATCATTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 10 9 89202 CASAVA_Build 14 79409804 2I TCATTCCCCC --/CT CCCACCTCAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CT 0 1 89203 CASAVA_Build 14 79413823 7D AAACAAAAAC AAAAACA/------- AAAAAACACC 3070 hom 23 het 28 1 24 4 AAAAACA 1 0 89204 CASAVA_Build 14 79416136 2I CTAAAATGTA --/TT TTTTTTTATT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 7 9 89205 CASAVA_Build 14 79416666 2I ACATTTGTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 21 9 T 10 12 89206 CASAVA_Build 14 79417204 2I TAAAAGTAAC --/AA GAGTTCTACT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 0 2 89207 CASAVA_Build 14 79417819 3I GTAGAAAGAC ---/TAT GTTTTAGACA 3070 hom 172 het 64 0 58 6 TAT 0 1 89208 CASAVA_Build 14 79419101 7D TTAACAGGGT AAAAAAA/------- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 29 0 25 5 A 15 8 89209 CASAVA_Build 14 79420929 4I ACATATGTTC ----/ATAT ATATATAAAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AT 3 5 89210 CASAVA_Build 14 79459535 1I CTATCATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 A 11 12 89211 CASAVA_Build 14 79473218 1D CAACTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 11 10 89212 CASAVA_Build 14 79473673 4I GGCAACACTA ----/AGAC AGCAAAATAA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 AGAC 0 1 89213 CASAVA_Build 14 79475690 1D GGGACGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 11 10 89214 CASAVA_Build 14 79485912 3D AGGAAAGAAA GAC/--- GACAAAGCAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 6 GAC 2 1 89215 CASAVA_Build 14 79486125 1I CAGTCATCAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 8 9 89216 CASAVA_Build 14 79489358 1D GCAAAAGGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 10 9 89217 CASAVA_Build 14 79494685 1I CCCAAACTAT -/A AAAAAACCCT 3070 het 2213 hom 19 6 8 5 A 6 7 89218 CASAVA_Build 14 79495039 1I CAAACAAATG -/A AAAAAAAGCT 2144 het 2144 ref 23 14 6 3 A 7 8 89219 CASAVA_Build 14 79498438 1I TCTCCCCCCC -/T AAAATAACAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 0 1 89220 CASAVA_Build 14 79508919 1D AAGGTTACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 31 8 A 11 10 89221 CASAVA_Build 14 79509075 1I CTTGCTATCC -/T GGCATTCATC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 1 89222 CASAVA_Build 14 79510281 1I AAACAATAAT -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 A 6 7 89223 CASAVA_Build 14 79516081 1I GATAGACAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 9 10 89224 CASAVA_Build 14 79519120 1I TCAGAGATCT -/G GGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 G 4 5 89225 CASAVA_Build 14 79520913 1I AAAAGAGAAT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 7 8 89226 CASAVA_Build 14 79523721 1I AGTTTGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 10 11 89227 CASAVA_Build 14 79526880 4D TTTTTTCTTT TTTA/---- TTTGTTTTTT 982 het 982 ref 26 19 6 1 TTTA 1 0 89228 CASAVA_Build 14 79550207 1D GAAATAATAG C/- TAAAGGTGAG 3070 het 3070 ref 51 28 21 2 C 1 0 89229 CASAVA_Build 14 79552144 1D AACTGCATGA G/- CAGGGCTGAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 G 1 0 89230 CASAVA_Build 14 79569796 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 713 hom 17 3 11 3 A 17 16 89231 CASAVA_Build 14 79587574 3I AAACATTTGC ---/TCT TCTTCTAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 TCT 2 3 89232 CASAVA_Build 14 79621178 1I TAAAAAAAAA -/T GTATATTCTT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 0 1 89233 CASAVA_Build 14 79644809 1I CTCCAGAGGG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 T 0 1 89234 CASAVA_Build 14 79649352 2I GCCCAGGCAG --/GA GAGTGCAGTG 1736 het 1736 ref 17 6 4 7 GA 1 2 89235 CASAVA_Build 14 79650638 1I AGGGATATTG -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 6 7 89236 CASAVA_Build 14 79657310 1D GCTGTCTTTT G/- TGTGTGGATG 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 G 1 0 89237 CASAVA_Build 14 79661581 1D ACTATGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1186 het 1186 ref 31 21 3 8 A 12 11 89238 CASAVA_Build 14 79661819 4D ATGTTGAAAT ACTC/---- ACTTCTAACT 3070 het 3070 ref 41 22 17 7 ACTC 1 0 89239 CASAVA_Build 14 79663628 1D ATCAGGGACC T/- TTTTTTTTTT 973 het 973 ref 35 20 4 11 T 11 10 89240 CASAVA_Build 14 79669304 1I CAAGAGACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 10 11 89241 CASAVA_Build 14 79683562 3I TAAATGATGA ---/TGG TGGTGTCAGT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 TGG 1 2 89242 CASAVA_Build 14 79715249 1I TTTTTGTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 10 11 89243 CASAVA_Build 14 79717685 4D TTTAAATTTT GGGG/---- GGGGGGGGTG 3070 het 2070 hom 24 9 10 7 G 12 8 89244 CASAVA_Build 14 79722266 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1906 hom 20 6 10 4 A 13 12 89245 CASAVA_Build 14 79722791 29I TAGACACAGG -----------------------------/GTCTGCACACGTGTGAACAAATCGCTTAA ATTGCCTCAC 3070 het 3070 ref 39 28 13 4 GTCTGCACACGTGTGAACAAATCGCTTAA 0 1 89246 CASAVA_Build 14 79724975 1D GGGAGAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 A 11 10 89247 CASAVA_Build 14 79726103 1D TCAGAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 24 3 10 11 A 11 10 89248 CASAVA_Build 14 79731911 6D TCTCTTTCTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 13 8 A 20 14 89249 CASAVA_Build 14 79748433 1I ACTCGACAAC -/T TTTTTTTTTT 2271 het 2271 ref 28 13 8 7 T 11 12 89250 CASAVA_Build 14 79758957 1D TCTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1856 het 1856 ref 38 25 6 7 T 15 14 89251 CASAVA_Build 14 79809145 3D CTCAAACAGC ATA/--- ATAATGACCA 3070 het 3070 hom 38 15 17 9 ATA 2 1 89252 CASAVA_Build 14 79829997 1D GGTTATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1804 hom 28 5 16 7 T 13 12 89253 CASAVA_Build 14 79852288 1D GAAGCATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 12 11 89254 CASAVA_Build 14 79892004 1I TTATTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 30 0 23 7 T 9 10 89255 CASAVA_Build 14 79897922 1D GAAAGGATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 479 hom 46 3 26 18 A 15 14 89256 CASAVA_Build 14 79901079 1D TGGGTGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 34 4 A 11 10 89257 CASAVA_Build 14 79906506 1I ATCCCCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 47 1 39 7 A 10 11 89258 CASAVA_Build 14 79910767 1D CCACACCACA C/- CCGGCACTCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 3 2 89259 CASAVA_Build 14 79929926 1I TTGTGAAAAT -/A CACTGTGTTC 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 A 0 1 89260 CASAVA_Build 14 79936877 3D TCCTGATCAT CTC/--- CTCATTACAG 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 CTC 2 1 89261 CASAVA_Build 14 79942467 1I ATTTGTTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 30 1 22 7 A 13 14 89262 CASAVA_Build 14 79961486 24D AAATAGCTGT GGCAGAAATTTTGTGGCCCACAGA/------------------------ GCCTAAAATA 3070 het 3070 hom 27 13 15 5 GGCAGAAATTTTGTGGCCCACAGA 1 0 89263 CASAVA_Build 14 79971122 1D AACTGCCCTG A/- AGGGAAGGAC 3070 het 3070 ref 49 25 20 6 A 2 1 89264 CASAVA_Build 14 79972979 1I ATTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 9 10 89265 CASAVA_Build 14 79978107 1D CCTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 11 10 89266 CASAVA_Build 14 79982888 2I TAATATTTTA --/AT ATATATATAT 2548 het 2548 ref 18 10 7 1 AT 6 7 89267 CASAVA_Build 14 79992724 2I GCAAATATAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 50 25 12 13 GT 8 9 89268 CASAVA_Build 14 79995257 1D TGTTTTTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 A 10 9 89269 CASAVA_Build 14 80000889 1D TCAGCTGGAC T/- GACAGGCAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 T 1 0 89270 CASAVA_Build 14 80014400 1I TAGGCATAGC -/A AAAACCTGAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 4 5 89271 CASAVA_Build 14 80033137 2I TAGGGAGAAA --/GC ATTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 GC 0 1 89272 CASAVA_Build 14 80042507 1I CTTTGATTTA -/T TTTTTTTTTT 2476 het 2476 ref 35 17 7 11 T 13 14 89273 CASAVA_Build 14 80044654 1D AATTGATTCC T/- AGTATTCTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 1 0 89274 CASAVA_Build 14 80047151 1I GGCCTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 994 hom 30 7 18 5 T 10 11 89275 CASAVA_Build 14 80062094 1I AACCTTTAGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 8 9 89276 CASAVA_Build 14 80063084 1I GGAATCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 12 13 89277 CASAVA_Build 14 80070241 2D TTCTGGCTCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 TC 6 5 89278 CASAVA_Build 14 80070324 1D ACATTGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 33 1 31 1 T 12 11 89279 CASAVA_Build 14 80071730 2D ACACACACAC AT/-- GGGGTCTGGA 3070 het 1369 hom 41 8 14 19 AT 1 0 89280 CASAVA_Build 14 80073011 10D TTGGGGTAAG AGGGTACATA/---------- AGGCTTGTTA 3070 het 3070 ref 41 21 18 5 AGGGTACATA 1 0 89281 CASAVA_Build 14 80074247 1I AAACAGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 10 10 T 11 12 89282 CASAVA_Build 14 80075846 2D GCGTATAAAC AG/-- ATGTGCAAGT 3070 het 3070 ref 34 20 14 1 AG 1 0 89283 CASAVA_Build 14 80078081 1D CAGAGTTGTT G/- TAAGGATCAA 3070 het 3070 hom 55 25 26 4 G 1 0 89284 CASAVA_Build 14 80088407 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 29 0 22 7 A 12 11 89285 CASAVA_Build 14 80089177 1I TCTTTCTTTC -/T TTTCTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 19 5 T 3 4 89286 CASAVA_Build 14 80098441 4I GTTCATTAAC ----/CTGA CTTTCAGTAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 CTGA 0 1 89287 CASAVA_Build 14 80102952 1I CATATTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1111 hom 31 3 14 14 A 10 11 89288 CASAVA_Build 14 80104044 1I ATTTACATTT -/A AAAAAAAAAA 2976 het 2976 ref 46 18 13 15 A 12 13 89289 CASAVA_Build 14 80107907 4D GAACAAAAAA AAAG/---- AAAGGTGAGG 982 het 982 ref 22 8 3 13 AAAG 2 1 89290 CASAVA_Build 14 80107942 5I TTCATTGCTC -----/TTGAG TTAAGTATAG 3070 hom 78 het 35 0 26 9 TTGAG 0 1 89291 CASAVA_Build 14 80108800 1D TGAAAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 342 hom 49 1 44 5 A 9 8 89292 CASAVA_Build 14 80112749 4D TGTGTGTGTG TGTC/---- TGTGTCTGTG 3070 hom 4 het 30 1 25 5 TGTC 1 0 89293 CASAVA_Build 14 80116564 7I CAATGTAAAA -------/ACGAGTT ACGAGTTGCC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 ACGAGTT 1 2 89294 CASAVA_Build 14 80122004 6D AAAATTCATC AGATAA/------ AGCAGCACAT 3070 het 3070 ref 44 23 19 3 AGATAA 1 0 89295 CASAVA_Build 14 80132823 5D GGCAGAAGGA TCACT/----- TCACTTGAGC 2488 het 2488 ref 21 10 7 5 TCACT 2 1 89296 CASAVA_Build 14 80133111 1D CAAGAACCTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 9 8 89297 CASAVA_Build 14 80137970 2D TCTTAAGTGG CA/-- CACATAACTG 3070 hom 123 het 43 0 42 2 CA 3 2 89298 CASAVA_Build 14 80152641 3D TGATATGTGA ATT/--- ATTTTTTTAA 3070 hom 68 het 42 1 35 9 ATT 2 1 89299 CASAVA_Build 14 80153199 1D AAACATTTGG A/- ACTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 A 2 1 89300 CASAVA_Build 14 80161952 4D TCTTTCTTTC CTTT/---- CTTTCTCTCT 3070 het 3070 hom 30 13 15 5 CTTT 2 1 89301 CASAVA_Build 14 80164936 2I4M6I CACATATATA --TATG------/TGTATGGGGCCA TATAGTCACT 3070 het 3070 ref 50 24 22 7 N/A 0 0 89302 CASAVA_Build 14 80165657 6I GTTGGGAAAC ------/TGATAA ATAAAATTTT 3029 het 3029 ref 20 9 7 5 TGATAA 0 1 89303 CASAVA_Build 14 80169268 1D AGGTTGCCTT G/- AGCCGTGACT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 G 1 0 89304 CASAVA_Build 14 80169598 2I GCCACCTCTG --/TC TCTCTCTCTA 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 TC 4 5 89305 CASAVA_Build 14 80170596 1D CAAAGTAATA T/- TTTTGAATAT 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 T 5 4 89306 CASAVA_Build 14 80179807 5I26M2D ACTCCATCTC -----AAAAAAATCGTGGTGGTACATGGAATAC/AAAAAAAAAAAATCGTGGTGGTACATGGAAT-- ACACAGCAAT 3070 het 3070 ref 39 25 16 10 N/A 0 0 89307 CASAVA_Build 14 80188269 1D CCCTTCCTTA C/- ACCCTATAAA 3019 het 3019 ref 23 13 8 3 C 1 0 89308 CASAVA_Build 14 80194104 1I TGACAGCGTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 A 8 9 89309 CASAVA_Build 14 80200589 1D ATATGAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 12 11 89310 CASAVA_Build 14 80201454 4D GACATGGAAG TTAA/---- TTAACTTGGG 3070 het 3070 ref 48 21 24 5 TTAA 2 1 89311 CASAVA_Build 14 80208405 1D CTAATAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 27 0 20 8 A 12 11 89312 CASAVA_Build 14 80208452 1D TGTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 11 8 14 A 10 9 89313 CASAVA_Build 14 80210170 1I TAATTCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 41 1 34 6 T 11 12 89314 CASAVA_Build 14 80235753 9D ACACAGAGAG ATTAAACCT/--------- ATTAAACCTG 3070 hom 141 het 54 0 48 10 ATTAAACCT 2 1 89315 CASAVA_Build 14 80286496 1D GAAACTCTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 126 het 49 0 42 7 T 10 9 89316 CASAVA_Build 14 80296005 10D ATATATATAG GTGTGTGTGT/---------- GTGTGTGTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 GT 13 8 89317 CASAVA_Build 14 80316730 3D AAGCTTTGTT ATC/--- ATCTCACAAC 3070 hom 141 het 50 0 48 3 ATC 2 1 89318 CASAVA_Build 14 80337492 2D TCCCTTACTA GT/-- TTTTGACATA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 GT 1 0 89319 CASAVA_Build 14 80337575 1D AAGGCCTTTT G/- CTGCATTTAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 1 0 89320 CASAVA_Build 14 80339453 1I GCCCTATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 39 3 24 12 A 14 15 89321 CASAVA_Build 14 80342900 1D AGATCAATTT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 8 89322 CASAVA_Build 14 80350581 1I TTATTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 11 89323 CASAVA_Build 14 80358032 13I TGACAGGCAC -------------/GTCTGACATGGTG GCAGACAAGA 3070 hom 56 het 23 0 16 7 GTCTGACATGGTG 0 1 89324 CASAVA_Build 14 80359715 1I AAAAAAAAAA -/C AAACTCCAAA 3070 het 389 hom 32 1 20 11 C 0 1 89325 CASAVA_Build 14 80380976 4I TTCTCCAATG ----/AACA AACAAACTTC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 AACA 1 2 89326 CASAVA_Build 14 80382556 2I AAAGAAGAAC --/AA AAAAGTCATA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 6 89327 CASAVA_Build 14 80389616 1I ATGCAATTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 416 hom 38 1 29 8 A 9 10 89328 CASAVA_Build 14 80391751 3D CTTGAAAAGG TAA/--- GCAAAGGCGA 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 TAA 1 0 89329 CASAVA_Build 14 80427683 1D TACTAGGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 10 9 A 17 16 89330 CASAVA_Build 14 80503284 4D TATGTATGTG TATA/---- TATATATATA 2318 hom 15 het 8 0 6 2 TA 10 8 89331 CASAVA_Build 14 80518705 1I AAATTAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1022 hom 36 3 30 3 A 10 11 89332 CASAVA_Build 14 80529467 1D TCACTAAATA T/- TTTTTCACAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 5 89333 CASAVA_Build 14 80532696 1D GGTCCTCAAC T/- GGCAAGAAGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 0 89334 CASAVA_Build 14 80536033 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 313 het 313 ref 14 5 3 6 T 14 13 89335 CASAVA_Build 14 80544273 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 16 10 T 15 14 89336 CASAVA_Build 14 80545538 2I AAGTAATCAT --/TG TGTGTTTTTA 3070 hom 105 het 44 0 35 9 TG 2 3 89337 CASAVA_Build 14 80547321 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 100 het 40 0 34 6 T 9 10 89338 CASAVA_Build 14 80561917 1I TCATTATTAG -/A AAAATCTTCA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 4 5 89339 CASAVA_Build 14 80619127 1D TAGTGGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 51 1 38 12 A 11 10 89340 CASAVA_Build 14 80644592 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1753 het 1753 ref 40 27 6 8 T 13 12 89341 CASAVA_Build 14 80693498 1D TTGAAATTTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 150 het 59 0 49 10 A 8 7 89342 CASAVA_Build 14 80694723 1D AGCTTTTTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 35 het 22 0 11 11 T 9 8 89343 CASAVA_Build 14 80694752 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1229 het 203 hom 22 4 7 11 T 14 13 89344 CASAVA_Build 14 80708932 1I AAGATGGAAA -/C CATTTGTTCC 3070 hom 123 het 49 0 41 8 C 1 2 89345 CASAVA_Build 14 80722192 1D TCGTGATCCA C/- CCCGCCTAGG 3070 hom 41 het 18 0 14 4 C 4 3 89346 CASAVA_Build 14 80726105 1D CTGAACAGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 9 8 89347 CASAVA_Build 14 80727238 3D ACCAAAATGA AAT/--- AATACTATTT 3070 hom 102 het 36 0 34 4 AAT 2 1 89348 CASAVA_Build 14 80736043 1D ATAGTGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 12 11 89349 CASAVA_Build 14 80749436 1I TCTCAAAGAT -/A GCTCATTCTC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 0 1 89350 CASAVA_Build 14 80750873 5D ATAATGGATC CATTA/----- TATGTTAACA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CATTA 1 0 89351 CASAVA_Build 14 80754192 1I TATAAAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 31 1 24 6 T 12 13 89352 CASAVA_Build 14 80756732 1D AAGATTGGGG A/- AAAAATTTTA 2260 hom 21 het 10 0 6 4 A 6 5 89353 CASAVA_Build 14 80760443 2D AGATTTCACC TA/-- TGTTTTTGTC 3070 hom 87 het 34 0 29 7 TA 1 0 89354 CASAVA_Build 14 80781409 4D73M4I AGGGAGAGAC TGTTTGCTTCTTTTTATGATATCTATCTTTTTGTTGAATTTCTCATTCAAATAATAAACTGATTTTTGTGATTTCAT----/----TGCTTCTTTTTATGATATCTATCTTTTTGTTGAATTTCTCATTCAAATAATAAACTGATTTTTGTGATTTCATTAAA TAGTCTATCT 2942 hom 15 het 5 0 6 13 N/A 0 0 89355 CASAVA_Build 14 80791450 1D TCTTGTGTTG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 141 het 55 0 47 8 T 8 7 89356 CASAVA_Build 14 80797547 1D TTACACACTC A/- AACATACCAT 3070 hom 135 het 47 0 46 1 A 3 2 89357 CASAVA_Build 14 80801854 1D AACTCTTGGT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 8 7 89358 CASAVA_Build 14 80802913 10D CCACACACAT AAACACACAC/---------- AAACACACAC 3070 hom 101 het 38 0 33 13 AAACACACAC 2 1 89359 CASAVA_Build 14 80811142 2D TCTAAAGTCT TC/-- TCTTGATCAG 3070 hom 84 het 30 0 27 3 TC 2 1 89360 CASAVA_Build 14 80833025 2D GTAAGAGGAA AT/-- AAGCACATAC 3070 hom 69 het 30 0 23 7 AT 1 0 89361 CASAVA_Build 14 80835982 1I GGAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 45 1 28 16 T 14 15 89362 CASAVA_Build 14 80837937 1D AGTCATATTG C/- CCAATATACA 3070 hom 135 het 55 0 45 10 C 3 2 89363 CASAVA_Build 14 80842484 1D ATATGCTCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 72 hom 27 1 18 8 T 9 8 89364 CASAVA_Build 14 80851616 3I AGGCAGGTGA ---/CGC CGATACTGGC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 CGC 0 1 89365 CASAVA_Build 14 80881858 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 13 12 89366 CASAVA_Build 14 80959132 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 862 het 862 ref 31 21 2 8 A 13 12 89367 CASAVA_Build 14 81005871 3I TTCCTTCGCA ---/TTT TAGGGCCATT 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 T 1 4 89368 CASAVA_Build 14 81022746 1D ACAGGTTTAT A/- AAAAAAAAAA 1167 het 1167 ref 33 26 4 3 A 12 11 89369 CASAVA_Build 14 81029607 4D CCCTGTCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 2771 hom 26 6 15 5 AAAT 5 4 89370 CASAVA_Build 14 81040089 1D TCATTGTTTG T/- TACTGTAATC 3070 het 3070 ref 47 28 17 2 T 2 1 89371 CASAVA_Build 14 81090331 1D CATGGTGATA C/- CCCCTTCTCT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 C 5 4 89372 CASAVA_Build 14 81093826 4I CTTCATCAAC ----/ATGA ATTTTGACCC 3070 het 3070 hom 20 7 10 3 ATGA 0 1 89373 CASAVA_Build 14 81096230 1I TTTTTGTGTT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 A 7 8 89374 CASAVA_Build 14 81117666 1D ACACTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1566 het 410 hom 19 5 6 8 A 16 15 89375 CASAVA_Build 14 81120514 4I28M4I TTTTTGCGAA ----TTTCTTTTAAAAAAATCTAAGAATTCTT----/TTTCTTTCTTTTAAAAAAATCTAAGAATTCTTAAGA AAAAGGCCTG 3070 het 3070 ref 26 13 11 9 N/A 0 0 89376 CASAVA_Build 14 81122233 1I TAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 9 10 89377 CASAVA_Build 14 81124241 2D GCTCTGTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 14 10 T 12 10 89378 CASAVA_Build 14 81126306 2I AGTTCTTTTT --/TC TCTTTTATTA 3070 het 3070 ref 30 13 15 2 TC 1 2 89379 CASAVA_Build 14 81126987 2D AACTTTCTGA CT/-- CTCTCTCTCT 1948 het 1948 ref 56 40 6 11 CT 8 7 89380 CASAVA_Build 14 81127255 1I TTCACTTGGG -/C CTGCTGAGGA 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 C 1 2 89381 CASAVA_Build 14 81129111 1D TCTCTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 2260 het 1280 hom 23 7 8 8 T 17 16 89382 CASAVA_Build 14 81131948 1I CCAGAAAAAT -/A TAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 54 26 23 5 A 0 1 89383 CASAVA_Build 14 81132832 3I TGAAACATAA ---/TCT TCTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 TCT 1 2 89384 CASAVA_Build 14 81133059 1D CACGCAGTTC T/- TTTTTTTTTT 1750 het 1750 ref 24 11 5 8 T 13 12 89385 CASAVA_Build 14 81193674 4D GAGTTTTAAC AGAG/---- AGAATGCTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 3 AG 3 1 89386 CASAVA_Build 14 81196981 4D CAAAAAACAA AAAC/---- AAAAACAAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 2 AAAC 1 0 89387 CASAVA_Build 14 81200140 2I TTTTTCAAAC --/TT ATTTCTTTTA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 0 2 89388 CASAVA_Build 14 81202269 4D GATAAATAAA TAAG/---- TATTAATGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 5 TAAG 1 0 89389 CASAVA_Build 14 81222551 1I TTGAAATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 9 10 89390 CASAVA_Build 14 81223535 1D TAGTAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 T 15 14 89391 CASAVA_Build 14 81228156 1D GTAGTTCAGG C/- TGCTTCCAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 1 0 89392 CASAVA_Build 14 81229203 1D ATGAAGAATC A/- ATATGTGAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 2 1 89393 CASAVA_Build 14 81230207 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1415 hom 10 het 4 0 4 0 T 13 12 89394 CASAVA_Build 14 81239831 1D TTTTGGCCTT G/- GGTAAATCAC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 G 3 2 89395 CASAVA_Build 14 81240370 1I TTAAAACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 34 2 21 11 T 12 13 89396 CASAVA_Build 14 81244074 8I GAGCCCATTG --------/ATCCAGGC ATCCAGGCAG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 ATCCAGGC 1 2 89397 CASAVA_Build 14 81248628 1I ACTCCACAGG -/T TTTTGGCCCA 3070 hom 98 het 36 0 32 4 T 4 5 89398 CASAVA_Build 14 81252410 1D AGTTCGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 19 2 14 4 T 13 12 89399 CASAVA_Build 14 81268650 3D GAACAACTTT TCA/--- TCATCATCAT 3070 hom 129 het 53 0 44 10 TCA 6 5 89400 CASAVA_Build 14 81274546 1D CTTGTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 727 hom 46 3 31 13 T 12 11 89401 CASAVA_Build 14 81311165 1D ATAATATAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 25 0 22 4 T 10 9 89402 CASAVA_Build 14 81360954 1D TTTTGTAGAG A/- AAAAAAGTAT 3070 hom 91 het 34 0 31 3 A 7 6 89403 CASAVA_Build 14 81402346 1I TTCTTACATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 9 10 89404 CASAVA_Build 14 81419322 4I GGGGGTGTGA ----/TGTT TGTTTGTGAG 3070 het 3070 ref 49 27 12 10 TGTT 1 2 89405 CASAVA_Build 14 81419502 2D CCTCTGTCTC CT/-- GGGTTCAAAC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 CT 1 0 89406 CASAVA_Build 14 81441588 16I TTTCACAGTA ----------------/ACTTATCTAGTTCTGT ACAAGGAAGA 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 ACTTATCTAGTTCTGT 0 1 89407 CASAVA_Build 14 81448823 1I ATATCTTTCC -/A TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 0 1 89408 CASAVA_Build 14 81450913 1D CTTCAATGTT A/- TTTTTGATAA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 A 1 0 89409 CASAVA_Build 14 81457195 3I CTAACATTAT ---/ATA AAATGGGTAT 3070 het 3070 hom 43 15 28 0 ATA 0 1 89410 CASAVA_Build 14 81460356 16D GAGCTACAAC TTGCTCTATAAACCGT/---------------- TTGATTCAGA 3070 het 3070 ref 40 28 11 2 TTGCTCTATAAACCGT 1 0 89411 CASAVA_Build 14 81479799 1D AGTGTTGGGA G/- GTGGGGCCTA 3070 het 3070 ref 43 21 11 11 G 2 1 89412 CASAVA_Build 14 81487684 1I CTGAAACACA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 48 24 23 1 T 8 9 89413 CASAVA_Build 14 81494269 1I CCTACCTACC -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 T 6 7 89414 CASAVA_Build 14 81504947 8I TACTAATCCT --------/CTCTTCAG CTGTGTCTAA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 CTCTTCAG 0 1 89415 CASAVA_Build 14 81511343 1D TACATGAATC T/- TTTTTTTTTG 831 het 831 ref 38 30 3 5 T 10 9 89416 CASAVA_Build 14 81511946 2D CGGAGTCATC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 41 15 21 6 TA 7 6 89417 CASAVA_Build 14 81513123 5D TCACTAATGA TAGAG/----- TAAACATTAG 3070 het 3070 hom 55 26 24 9 TAGAG 1 0 89418 CASAVA_Build 14 81523746 1D TAAATGAATA G/- CAAACAACTA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 1 0 89419 CASAVA_Build 14 81525219 1I ATGGTCGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 T 10 11 89420 CASAVA_Build 14 81526808 1D ATAGCAGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 A 10 9 89421 CASAVA_Build 14 81533439 8I TCGAATAACT --------/GAAACATA GAAACATAGT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 GAAACATA 1 2 89422 CASAVA_Build 14 81537310 1I GCCTTTAGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 9 10 89423 CASAVA_Build 14 81540452 1I GAATTCATTC -/T TTTTTTATGG 2254 het 2254 ref 31 18 6 7 T 6 7 89424 CASAVA_Build 14 81550148 4I AAAAAAAGAC ----/AAAT AAGGTCATTA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 AAAT 0 1 89425 CASAVA_Build 14 81554985 1D ATATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3038 hom 28 9 8 11 T 11 10 89426 CASAVA_Build 14 81556774 1I TTCATTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 11 89427 CASAVA_Build 14 81559997 1I CATCTCAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 27 hom 26 1 17 9 A 9 10 89428 CASAVA_Build 14 81572242 1I CCTTATATTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 8 9 89429 CASAVA_Build 14 81572390 1D CATTGAGAAC A/- ACATTTGCAT 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 A 2 1 89430 CASAVA_Build 14 81582899 1D TTGCTAGTAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 T 9 8 89431 CASAVA_Build 14 81583347 1I TTTTTATAAC -/T TTTTATTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 4 5 89432 CASAVA_Build 14 81586869 3D TCCATTAAAT TAA/--- TTAGTCTCAT 3070 het 3070 ref 44 22 21 3 TAA 1 0 89433 CASAVA_Build 14 81587561 1I CGCAGGTTCT -/G GGTGAACATA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 G 2 3 89434 CASAVA_Build 14 81588540 1D ATACATACTG T/- GATCAGTAAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 1 0 89435 CASAVA_Build 14 81607389 2I TCACACAAAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 AT 5 6 89436 CASAVA_Build 14 81607456 2I AGTTTATTGT --/TA TATATATATA 2025 het 2025 ref 22 13 5 4 TA 7 8 89437 CASAVA_Build 14 81613020 1I CTCCCACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 25 0 17 8 A 11 12 89438 CASAVA_Build 14 81613753 1D TCAGCTTTCC A/- AAAAATGCCT 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 A 6 5 89439 CASAVA_Build 14 81621745 1D ATCAGCTTCT A/- TTTTTTTTTT 2668 het 2668 ref 23 11 10 2 A 1 0 89440 CASAVA_Build 14 81632697 1I TGGTTGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 11 12 89441 CASAVA_Build 14 81636205 1I TTATTATACA -/T TTTTTACTTA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 5 6 89442 CASAVA_Build 14 81637805 1D CATTTTACCA T/- TTTTGGCAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 5 4 89443 CASAVA_Build 14 81645546 4I TTAATTCTTA ----/TCAC TCACTCAGTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TCAC 1 2 89444 CASAVA_Build 14 81659891 5D TTTTACAGAT AAAAA/----- AGAAGCTTGA 3070 hom 60 het 21 0 21 2 A 6 1 89445 CASAVA_Build 14 81662335 1D AGTCTGGAGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 8 89446 CASAVA_Build 14 81683639 4I GTAAAAACTC ----/ACTT ACATAAAAAG 3070 hom 159 het 56 0 53 3 ACTT 0 1 89447 CASAVA_Build 14 81690793 2D TCAGTTATCC TA/-- TATATATATA 485 het 24 hom 7 1 4 2 TA 8 7 89448 CASAVA_Build 14 81703797 1I ATATCTAATT -/A AAAAAATTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 6 7 89449 CASAVA_Build 14 81707857 1I TTGCCAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1681 hom 42 4 27 11 T 13 14 89450 CASAVA_Build 14 81725352 11D GGGCGGAAAA CCGGTTAAAGG/----------- CCGGTTAAAG 3070 hom 56 het 23 0 19 4 CCGGTTAAAGG 2 1 89451 CASAVA_Build 14 81743883 5I TTTTTGCATC -----/AATGT TCATCAGGGA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 AATGT 0 1 89452 CASAVA_Build 14 81746533 2D ATTGTTTATA AT/-- AATCTCTTGT 3070 hom 102 het 39 0 35 6 AT 1 0 89453 CASAVA_Build 14 81747099 3I TGACCATTTG ---/CCC CCCCTTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 4 7 89454 CASAVA_Build 14 81753985 1D TGGACAAAAG T/- TTTAAAACAG 3070 hom 75 het 33 0 26 9 T 4 3 89455 CASAVA_Build 14 81754125 1I ATTTTTCTTA -/C TTAGAAATTG 3070 hom 91 het 37 0 33 4 C 0 1 89456 CASAVA_Build 14 81756174 1I CCTCAAAGTA -/G GAGAGAACTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 G 1 2 89457 CASAVA_Build 14 81757595 1D ATGATCCACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 10 9 89458 CASAVA_Build 14 81763671 3I11M3D AAAAATAATT ---AGTAGAATAAAAAG/GTAAGTAGAATAAA--- AAGTTCCTAT 3070 hom 84 het 29 0 29 3 N/A 0 0 89459 CASAVA_Build 14 81764927 2I CCTCTGCTGC --/TT TTTTTTTTGC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 8 10 89460 CASAVA_Build 14 81769839 2I TTGTGGACAC --/TT TGCATCAAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 3 89461 CASAVA_Build 14 81770094 2I CATTCCCCCA --/TT TCTCTCTCCC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 3 89462 CASAVA_Build 14 81771851 1D GAAAGTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 43 0 35 8 T 13 12 89463 CASAVA_Build 14 81782061 2I TCCAATGGTA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 GT 5 6 89464 CASAVA_Build 14 81795178 5I AATACCTCTT -----/TTCTC ATCTCATTTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TTCTC 0 1 89465 CASAVA_Build 14 81827183 1D AAGTATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 81 hom 19 1 16 2 T 12 11 89466 CASAVA_Build 14 81839430 1I TCCTGATCTT -/G TCAGAAAAGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 89467 CASAVA_Build 14 81843508 3I CTTAGGTCAC ---/ACA ACAAGTTATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ACA 1 2 89468 CASAVA_Build 14 81872376 1D TTTTAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 19 0 15 4 T 11 10 89469 CASAVA_Build 14 81882156 4I ACAAAGAAAA ----/AAAC AAATTTTATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAC 0 1 89470 CASAVA_Build 14 81893469 1D CTCTTTATTA G/- TCTGAAATTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 1 0 89471 CASAVA_Build 14 81893821 1D ACAGAAAGTA C/- CCCCCCCCCC 3002 het 28 hom 29 0 8 22 C 11 10 89472 CASAVA_Build 14 81895894 5I AATAAAAGAA -----/GAAAG GAAAGAATAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 GAAAG 1 2 89473 CASAVA_Build 14 81896615 2I TTTTCCTAAC --/TG TTATTTTTGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TG 0 1 89474 CASAVA_Build 14 81901907 6I TCTTACAACT ------/ACATGA GAAGTTGCCA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 ACATGA 0 1 89475 CASAVA_Build 14 81905305 1D CTACAAGAAA T/- ACTAAAGAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 1 0 89476 CASAVA_Build 14 81914480 1D ATAATATGTA T/- TTTTTTATTA 3070 hom 51 het 23 0 18 7 T 7 6 89477 CASAVA_Build 14 81917646 5I GTAATAAACA -----/TATTT TATTTCTTTT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 TATTT 1 2 89478 CASAVA_Build 14 81932512 1D TCTATCTGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 426 hom 33 1 26 6 T 10 9 89479 CASAVA_Build 14 81948413 1D ACTTGATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 37 1 20 16 A 17 16 89480 CASAVA_Build 14 81953511 1D TAGTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 32 2 21 9 T 14 13 89481 CASAVA_Build 14 81978735 1D AATCTAGCAC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 57 29 24 5 T 8 7 89482 CASAVA_Build 14 81988716 4I TGGCAAAGAA ----/AGAC AGACAGAGAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AGAC 1 2 89483 CASAVA_Build 14 82005427 2D TTAAAAAGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 26 1 17 9 A 16 14 89484 CASAVA_Build 14 82025315 1I GTTATCAAAG -/A ATTGTTATTT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 1 2 89485 CASAVA_Build 14 82030236 1D TCAAAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 34 1 24 10 T 12 11 89486 CASAVA_Build 14 82036257 1D TACATAAGTT G/- TTTTTTAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 1 0 89487 CASAVA_Build 14 82048425 1D TGTTCAAATC T/- TTGTCTCTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 3 2 89488 CASAVA_Build 14 82049076 1D TTTATTATTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 278 hom 30 1 26 3 A 8 7 89489 CASAVA_Build 14 82051950 2I TTAGGATTTA --/TT GTAAAAGCAC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 0 2 89490 CASAVA_Build 14 82052034 2D TCAGGTTTAT TA/-- TATATATATC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TA 5 4 89491 CASAVA_Build 14 82061157 1D CTTATTTGGC A/- AAAAAAAAAA 2832 het 1032 hom 28 4 10 14 A 19 18 89492 CASAVA_Build 14 82061648 2I GATTGCTGGA --/CC TAAAGCTATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 0 2 89493 CASAVA_Build 14 82078231 1D TTCAGATTTG T/- TTTTTGTTTG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 6 5 89494 CASAVA_Build 14 82089632 4D GGCCTCCCAA AGTG/---- AGTAATCAAC 463 hom 5 het 4 0 2 4 AGTG 1 0 89495 CASAVA_Build 14 82091260 1D ACAAGTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 10 9 89496 CASAVA_Build 14 82136727 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 563 hom 7 het 3 0 3 0 TA 7 6 89497 CASAVA_Build 14 82138674 1I CACTAAATTG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 89498 CASAVA_Build 14 82149679 2D GAATAAGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 25 0 13 13 T 16 14 89499 CASAVA_Build 14 82149694 2D TTTTTTTTTT TG/-- TATTGGATTC 3070 het 100 hom 20 4 15 1 TG 1 0 89500 CASAVA_Build 14 82160529 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 1979 hom 27 het 11 0 10 1 A 11 12 89501 CASAVA_Build 14 82162172 1I TTCATGGGAG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 7 8 89502 CASAVA_Build 14 82177965 1I CTCCACAATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 411 hom 37 1 30 6 A 8 9 89503 CASAVA_Build 14 82185047 1D GACCATAAAC T/- TTTAACTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 21 0 T 4 3 89504 CASAVA_Build 14 82208699 1I TCTTAGGGTT -/G GGGATACTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 3 4 89505 CASAVA_Build 14 82219917 1I TCTCCACATA -/C CAGACAGGAA 3070 hom 144 het 57 0 49 8 C 1 2 89506 CASAVA_Build 14 82221912 1I AAATCTTTTG -/T TTTTTTCAGG 2562 het 2562 ref 21 10 8 3 T 6 7 89507 CASAVA_Build 14 82246810 1D ACCTCTGCCC A/- TGTGGAGAAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 1 0 89508 CASAVA_Build 14 82266375 1I TTAAAGCATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 499 hom 34 2 29 3 A 9 10 89509 CASAVA_Build 14 82268064 1D TGTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 116 hom 21 1 16 5 T 13 12 89510 CASAVA_Build 14 82283563 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 29 0 26 3 T 10 11 89511 CASAVA_Build 14 82302073 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1109 het 1109 ref 24 12 4 8 A 15 14 89512 CASAVA_Build 14 82306645 2I GCTGGAGTGC --/AA AGTGGCGCGA 3070 het 2878 hom 23 7 9 7 A 1 3 89513 CASAVA_Build 14 82320812 1I CCAGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2632 hom 39 10 18 11 A 16 17 89514 CASAVA_Build 14 82339768 1I TTCACAGTGC -/A CTTTTTATGC 3070 het 3070 ref 53 39 12 2 A 0 1 89515 CASAVA_Build 14 82341088 1D AATCCACCCC T/- GACTGGTATC 3070 het 3070 ref 61 30 24 7 T 1 0 89516 CASAVA_Build 14 82345925 1D AAAATAAATC T/- TTTGAAATCC 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 T 4 3 89517 CASAVA_Build 14 82347359 1I TTTTTCAAGG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 7 8 89518 CASAVA_Build 14 82360050 1D TCTAATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1523 hom 28 7 13 8 T 14 13 89519 CASAVA_Build 14 82369277 1D AGATATTTTT A/- AAAATGATAA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 5 4 89520 CASAVA_Build 14 82372082 1D11M9I3M5D TTTGTAATTC TAATACAGCAAC---------ATCGCTTT/-CATACAGCAACTATGGAATGATC----- GACAATTCCA 3070 het 3070 ref 29 19 14 6 N/A 0 0 89521 CASAVA_Build 14 82372274 1D TACTTACCAG T/- TTTTTTTTTG 906 het 906 ref 34 20 5 9 T 10 9 89522 CASAVA_Build 14 82372767 2I CTATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 AC 6 7 89523 CASAVA_Build 14 82373069 1I TAATCTGAAG -/C TTTAACACAG 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 C 0 1 89524 CASAVA_Build 14 82374281 1D AGCCTCTTAC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 T 7 6 89525 CASAVA_Build 14 82379206 1D TTTTATTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 10 9 89526 CASAVA_Build 14 82389837 1D CAAAACTCTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 A 9 8 89527 CASAVA_Build 14 82394049 1I TTAGAAAGAT -/A AAAAACTAAA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 5 6 89528 CASAVA_Build 14 82409886 1D AACTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 28 1 16 11 T 15 14 89529 CASAVA_Build 14 82410504 4D AATGAATCTA TTCT/---- TTCTTTCATA 3070 het 3070 ref 45 23 21 3 TTCT 2 1 89530 CASAVA_Build 14 82411037 1I ACAAAAACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 9 10 89531 CASAVA_Build 14 82414868 3I TGATGTAAGA ---/TGT TAATAATTGA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 TGT 0 1 89532 CASAVA_Build 14 82417875 1I CATGCCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 T 10 11 89533 CASAVA_Build 14 82444197 1I CTTGAGTCTC -/A TATGAAGGTA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 0 1 89534 CASAVA_Build 14 82458640 1I ACACAAATAA -/G TCAAAGGACA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 G 0 1 89535 CASAVA_Build 14 82461991 1I GTGAGCCCAA -/T TTTTTTTTTT 2925 hom 36 het 17 0 12 5 T 10 11 89536 CASAVA_Build 14 82468569 3D TTTGCCTCTC CTT/--- CTCCTCCTCC 2732 het 2732 ref 25 13 9 4 CTT 1 0 89537 CASAVA_Build 14 82470944 2I TAACCGAATC --/GG GGGGGGGTCA 1117 het 1117 ref 31 14 5 12 G 7 9 89538 CASAVA_Build 14 82471706 4D AATATGGATA TGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 30 12 17 5 TGAG 1 0 89539 CASAVA_Build 14 82472680 1I TTACTATCAA -/C AGAGAAATGC 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 C 0 1 89540 CASAVA_Build 14 82475628 1D AATCCAAAGC A/- AAAATTGCTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 5 4 89541 CASAVA_Build 14 82476275 4D TGTTTATGTA TCTG/---- TCTGTATATT 3070 hom 68 het 25 0 23 2 TCTG 2 1 89542 CASAVA_Build 14 82477623 12I GTTTTTTTTT ------------/TTTGTTTTTTTG TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 TTTGTTTTTTTG 0 1 89543 CASAVA_Build 14 82478552 1D TAAAAGAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 289 hom 35 1 31 3 A 10 9 89544 CASAVA_Build 14 82482728 3D TTACTTTCTT CTC/--- CTTTCCAGGG 3070 het 3070 hom 52 25 25 4 CTC 1 0 89545 CASAVA_Build 14 82496320 1D AATAGAAATA T/- TTTTGCTTCT 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 T 5 4 89546 CASAVA_Build 14 82500375 5D TTTATTTTAT TTTAG/----- TTTAGTTTAG 3070 het 3070 hom 40 15 18 10 TTTAG 5 4 89547 CASAVA_Build 14 82502318 1I ATAACTGGTC -/G AATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 G 0 1 89548 CASAVA_Build 14 82502800 1I TAATACTTCA -/G GTTAGGGGAA 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 G 1 2 89549 CASAVA_Build 14 82522644 1I TCTTTCAAAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 0 1 89550 CASAVA_Build 14 82558434 1D GCAGTCAGTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 9 8 89551 CASAVA_Build 14 82564323 3I CAGAATGTCA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 81 het 38 0 27 11 AAT 5 6 89552 CASAVA_Build 14 82572613 1D AGTTAAAAAA G/- AAAATAGACT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 G 1 0 89553 CASAVA_Build 14 82578193 2I AAAAGATAAC --/TT ATTTTATATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 2 89554 CASAVA_Build 14 82596180 1D CCTTGAAGTC T/- TTTGGTTTGA 3070 hom 34 het 18 0 13 5 T 4 3 89555 CASAVA_Build 14 82598597 6I3M4D TAGGCTATTG ------GGTCAGC/TAACTTGAT---- AGTAATATCA 3070 hom 117 het 42 0 39 5 N/A 0 0 89556 CASAVA_Build 14 82600421 3D CATGTTTCAC CTT/--- CTTGCCACAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CTT 2 1 89557 CASAVA_Build 14 82601021 1I TCATCTATTT -/A AAAAAATTAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 6 7 89558 CASAVA_Build 14 82603545 2D TTAAGTTTAC GT/-- GTATATTTAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 GT 2 1 89559 CASAVA_Build 14 82604885 1I TGGCTGACTG -/T TTGATGCAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 2 3 89560 CASAVA_Build 14 82605651 1D TTTTTTTTTT A/- AAATTAAATG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 4 3 89561 CASAVA_Build 14 82605743 1D TATGCAGTGA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 92 het 39 0 31 8 T 8 7 89562 CASAVA_Build 14 82606127 1D CTATTGGTAT A/- CTTTTCCAGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 1 0 89563 CASAVA_Build 14 82608219 2I TAATTCAGAC --/AG GGAGAAATCA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 AG 0 1 89564 CASAVA_Build 14 82608739 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 733 het 733 ref 29 7 5 18 T 13 12 89565 CASAVA_Build 14 82609706 1I TTAGGGTACC -/T TTTTTTTCTT 899 hom 27 het 23 0 9 14 T 7 8 89566 CASAVA_Build 14 82613088 30D AGTTAATTTT TGATGAGGAAATGCCTTTGTGTATGATGAG/------------------------------ TGATGAGGAA 3070 hom 63 het 32 0 22 15 TGATGAGGAAATGCCTTTGTGTATGATGAG 2 1 89567 CASAVA_Build 14 82623741 1D ATACTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 12 11 89568 CASAVA_Build 14 82626449 1D GGGCCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 A 11 10 89569 CASAVA_Build 14 82656385 3D CATGTGGTTG ACT/--- ATAGGGACAA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 ACT 1 0 89570 CASAVA_Build 14 82667585 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1118 hom 32 4 16 12 A 17 18 89571 CASAVA_Build 14 82681766 1D TGAGAGCAGG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 8 7 89572 CASAVA_Build 14 82696413 2D ATTCAACAAC CT/-- CTATAGCATG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 CT 2 1 89573 CASAVA_Build 14 82696826 1I AGTAGTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 12 13 89574 CASAVA_Build 14 82700001 1I TTAAAAAAAA -/T ATGTACATAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 0 1 89575 CASAVA_Build 14 82701882 1D TACATATATT G/- GGGGGTGTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 6 5 89576 CASAVA_Build 14 82705477 1I TGCAGCTTTA -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 6 7 89577 CASAVA_Build 14 82708136 1I TACACTTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 46 0 38 8 A 9 10 89578 CASAVA_Build 14 82708997 1D TTCTGAGAAA T/- TTTCTTTAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 4 3 89579 CASAVA_Build 14 82715223 4D ATAAAAGTTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 34 1 25 9 A 18 14 89580 CASAVA_Build 14 82735836 2D AATAATAGAC TT/-- TTGCCATGTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 4 2 89581 CASAVA_Build 14 82735945 1I TATGAGCGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1052 hom 38 3 25 10 A 13 14 89582 CASAVA_Build 14 82763170 1I CAAAAAGTAG -/T TTAGAAGGAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 3 89583 CASAVA_Build 14 82769414 1I ATTTTTTAAC -/A AAAACTTGAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 5 89584 CASAVA_Build 14 82774231 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1273 het 1273 ref 52 43 3 6 T 11 10 89585 CASAVA_Build 14 82784836 1I ATAAAGGAAA -/T AATAATGGGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 0 1 89586 CASAVA_Build 14 82786095 23D TTCCGTGAGT CACACCAATCCACTTCAGTGAGC/----------------------- CACACCAATC 3070 hom 54 het 25 0 19 9 CACACCAATCCACTTCAGTGAGC 2 1 89587 CASAVA_Build 14 82790146 3D TTAAGTAAGC ATA/--- ATGAGTGCTG 3070 hom 100 het 37 0 34 3 ATA 1 0 89588 CASAVA_Build 14 82794654 1D TGGAAGAATG T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 8 7 89589 CASAVA_Build 14 82799878 6D CGGCATCAGT ATTAGA/------ ATTAGAAGAC 3070 hom 132 het 47 0 45 3 ATTAGA 2 1 89590 CASAVA_Build 14 82804431 1D GCAGGAAGTC G/- GGGGGGAGGA 3070 hom 88 het 37 0 29 8 G 7 6 89591 CASAVA_Build 14 82809723 1D ATGGAATTAC A/- AAAAAAAAAA 1623 het 1623 ref 27 17 4 6 A 13 12 89592 CASAVA_Build 14 82814207 3I ACATTAACAT ---/ATC ATCAGTGCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 ATC 1 2 89593 CASAVA_Build 14 82817120 1D AAGCATATGA C/- TTTTTTAATG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 0 89594 CASAVA_Build 14 82822179 3I AAAAAAAAAA ---/AAG GAGAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAG 0 1 89595 CASAVA_Build 14 82828268 1I TGTAGTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 89596 CASAVA_Build 14 82832053 1D CAATAAACAG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 8 hom 34 1 25 8 C 11 10 89597 CASAVA_Build 14 82840721 1I CTAAAAAAAA -/T ATGACTATTA 3070 het 230 hom 38 1 30 7 T 0 1 89598 CASAVA_Build 14 82841963 1D ATCTCCTCTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 20 het 11 0 7 4 T 8 7 89599 CASAVA_Build 14 82848035 5I GTTATAATCC -----/TATTA TAATAGTTTA 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 TATTA 0 1 89600 CASAVA_Build 14 82848604 1I TGAAGAGTAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 7 8 89601 CASAVA_Build 14 82851989 4I TGATCTTCTC ----/CTGT CTGTTGTCTG 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 CTGT 1 2 89602 CASAVA_Build 14 82863740 1D AAAGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 904 hom 43 7 15 22 A 13 12 89603 CASAVA_Build 14 82863839 1D GTAAAGATTT A/- TTTATTCTAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 A 1 0 89604 CASAVA_Build 14 82864163 2D CAGTTCTCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 81 het 42 0 28 14 TC 8 7 89605 CASAVA_Build 14 82878570 4I CACAAAACCT ----/CCAG ATCACTCAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CCAG 0 1 89606 CASAVA_Build 14 82887776 2I AAAATAAAAC --/AT CACATTATCT 3070 hom 151 het 53 0 51 2 AT 0 1 89607 CASAVA_Build 14 82927342 1D GCAACTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 11 10 89608 CASAVA_Build 14 82949154 3D CAGTCCTCTT CTC/--- CTACTCCTGA 3070 het 3070 hom 51 18 21 14 CTC 1 0 89609 CASAVA_Build 14 82951277 1I CAAACCCTGT -/A ATATTTGTGT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 A 1 2 89610 CASAVA_Build 14 82956844 2D ATATACCCAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2723 hom 30 9 19 2 AT 8 7 89611 CASAVA_Build 14 82965439 2D TTCTCAGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 16 14 89612 CASAVA_Build 14 82969867 2D TGAGATTTTG GT/-- GTATTCATCA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 GT 2 1 89613 CASAVA_Build 14 82972156 1D TTAAATTTGT A/- AAAAAACAAG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 7 6 89614 CASAVA_Build 14 82972659 3D ACAAAACGAT AAC/--- AACAACAACT 3070 het 3070 hom 40 14 23 7 AAC 4 3 89615 CASAVA_Build 14 82981031 3D CTTCTAAGTC AAT/--- AAATCTCTGT 3070 het 3070 ref 42 22 19 2 AAT 1 0 89616 CASAVA_Build 14 82981784 1I CCTACTGAAA -/T TAGAGTTCCA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 1 2 89617 CASAVA_Build 14 82990022 1I AGCAATACAA -/T TTTTTTTTTC 1924 het 1924 ref 20 13 4 3 T 9 10 89618 CASAVA_Build 14 82992705 1D TCTTGTGTGT G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 41 19 15 9 G 8 7 89619 CASAVA_Build 14 83003143 1I TTCAACCCCC -/T GTGCTAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 T 0 1 89620 CASAVA_Build 14 83003840 1D TATGTCTGCC T/- TTAGGTTCAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 3 2 89621 CASAVA_Build 14 83014157 1D GTAGCCAGGG T/- TTTTTTTTTT 1905 het 1905 ref 24 12 5 7 T 11 10 89622 CASAVA_Build 14 83024761 1I AATTTAATAG -/A AATTTTTTTA 3070 het 1634 hom 22 5 15 2 A 2 3 89623 CASAVA_Build 14 83026880 2D AAAAAACAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 9 9 A 12 10 89624 CASAVA_Build 14 83030622 1I ACTTTGCATC -/T CTGTGACTGC 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 0 1 89625 CASAVA_Build 14 83031017 1I TCTAATCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 11 89626 CASAVA_Build 14 83033264 1I TTTTTTTCTA -/T GTTGTTTATC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 0 1 89627 CASAVA_Build 14 83035508 1D ATTTTTTTTT A/- TTATTTTTTG 3070 het 2220 hom 22 8 10 4 A 1 0 89628 CASAVA_Build 14 83057432 1D GATGAGAGAC A/- AAGGGAACTT 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 A 3 2 89629 CASAVA_Build 14 83057977 5D ATGTATAGTA AATTG/----- AACAAAGAAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 6 AATTG 1 0 89630 CASAVA_Build 14 83059933 10D TGTAACTACT TACCCACACA/---------- TTTTCAAGTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 TACCCACACA 1 0 89631 CASAVA_Build 14 83071865 1D GCATCACACA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 53 27 20 6 T 8 7 89632 CASAVA_Build 14 83072928 1I49M1I GCTATGGAAG -TTTTACCGAGTAACCAGGGATTCAGTTTGTGCTCTGGTGCAGAATGTGG-/TTTTTACCGAGTAACCAGGGATTCAGTTTGTGCTCTGGTGCAGAATGTGGA AAAAAAAAAG 3070 het 753 hom 24 3 7 22 N/A 0 0 89633 CASAVA_Build 14 83075697 3D CTGTGTCTCT ACA/--- ACATCAAGAT 3070 het 3070 hom 44 17 24 4 ACA 2 1 89634 CASAVA_Build 14 83076750 1D CTTACAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2944 hom 22 10 8 4 A 11 10 89635 CASAVA_Build 14 83086491 1D TTATTCAAAG T/- TTTCTTAAAG 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 T 4 3 89636 CASAVA_Build 14 83090408 4D GAGGGAAACT CTAA/---- CTAAGATTTC 3070 het 3070 hom 30 9 19 6 CTAA 2 1 89637 CASAVA_Build 14 83093154 4I TGAGTGAGAC ----/AAAT AAACTATATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AAAT 0 1 89638 CASAVA_Build 14 83101399 2D TGTCAGGTGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 AT 9 8 89639 CASAVA_Build 14 83137088 1I TCCATTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 10 11 89640 CASAVA_Build 14 83138245 18D GTATTCTCCC ATGAAGAAATAATGTCAT/------------------ ATGAAGAAAT 3070 hom 78 het 27 0 27 5 ATGAAGAAATAATGTCAT 2 1 89641 CASAVA_Build 14 83152100 1I AAATTGTTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 7 8 89642 CASAVA_Build 14 83152409 1I TTAAAAATAT -/A TTTTGTGTAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 0 1 89643 CASAVA_Build 14 83162834 2D CACATACCCA AT/-- ATGTTTATAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AT 2 1 89644 CASAVA_Build 14 83163956 6D TGTGTGTGTG TGTGTA/------ TGTGTATGTG 3070 hom 93 het 39 0 31 10 TGTGTA 3 2 89645 CASAVA_Build 14 83164799 1I TCCCACCAAC -/A GTGTAAAAGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 0 1 89646 CASAVA_Build 14 83173562 1I TCTTACTCTC -/A AAGTAAAATC 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 2 3 89647 CASAVA_Build 14 83174337 1D AATTAAGTTA C/- AATGAAATTC 3070 het 3070 ref 38 16 15 9 C 1 0 89648 CASAVA_Build 14 83189966 2D ACTTCATAAT TA/-- TATGTTTCAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 TA 2 1 89649 CASAVA_Build 14 83198018 1D ATTAAAATAA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 8 7 89650 CASAVA_Build 14 83206914 2I CTAACAAATC --/AT AGAATTTCGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AT 0 1 89651 CASAVA_Build 14 83223279 1D TGTTTTGTTG A/- AAAAGAAGTA 3070 hom 157 het 60 0 53 7 A 5 4 89652 CASAVA_Build 14 83224001 1D TTCTTCCTTA T/- TTCTTAAAAT 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 T 3 2 89653 CASAVA_Build 14 83229225 2D GAGGATTTAC AG/-- AGTGTATAAA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 AG 2 1 89654 CASAVA_Build 14 83232556 1D GAAGCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 31 2 22 7 T 12 11 89655 CASAVA_Build 14 83234969 1D ATTTTATGTT A/- AAAAAACATG 3070 hom 105 het 43 0 36 9 A 7 6 89656 CASAVA_Build 14 83236373 1D ATGCACCATC A/- AAAAAAGGTG 3070 hom 117 het 47 0 40 8 A 7 6 89657 CASAVA_Build 14 83237335 2D AGATATCCAC AA/-- AGAGATAATG 3070 het 2955 hom 35 9 16 12 A 3 1 89658 CASAVA_Build 14 83237603 1I TCCATATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 10 11 89659 CASAVA_Build 14 83241434 5I TTCAAAACAA -----/GTATT GTAACACAAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 GTATT 0 1 89660 CASAVA_Build 14 83242641 4D GTTCCCTCTC TCTT/---- TCACTCTTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 5 TCTT 1 0 89661 CASAVA_Build 14 83243302 1D CTGGGTGACA T/- AGACATGTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 0 89662 CASAVA_Build 14 83247069 3D AGCAGTAGCT GAA/--- GAAGAAGATA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 GAA 3 2 89663 CASAVA_Build 14 83249751 5I AAAAACTCTT -----/ATCTC ATATTTATCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATCTC 0 1 89664 CASAVA_Build 14 83256875 1I TAAATGAAAA -/C CCCCCAGTTG 3070 het 308 hom 35 1 32 2 C 5 6 89665 CASAVA_Build 14 83260080 1D CTGAAGTTAT A/- AAAAATATAA 3070 het 3070 hom 31 16 15 0 A 6 5 89666 CASAVA_Build 14 83260650 3D AATAACAAAC ATT/--- ATACTTGATG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 ATT 1 0 89667 CASAVA_Build 14 83266994 2I CTCATAATTC --/CA CACAGGCTTA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 CA 2 3 89668 CASAVA_Build 14 83276685 2I TGGATGTTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 22 0 12 10 A 12 14 89669 CASAVA_Build 14 83289691 4I ACCAGCAACT ----/AGTA TCTGGAATTC 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 AGTA 0 1 89670 CASAVA_Build 14 83292150 1I TGCTATGCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 9 10 89671 CASAVA_Build 14 83296039 1I TGAGATTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 19 4 A 10 11 89672 CASAVA_Build 14 83296568 16I TGGAACCAAA ----------------/AAGGGGAGACCAATTC AATTGTCTAG 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 AAGGGGAGACCAATTC 0 1 89673 CASAVA_Build 14 83298531 1D TAAGAGAGTG A/- AAAGCAAAAC 3070 het 3070 ref 42 19 17 7 A 4 3 89674 CASAVA_Build 14 83317843 1D AAGAGGTCAA G/- GGTGCTGTAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 3 2 89675 CASAVA_Build 14 83319675 1I CAGTTATTAG -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 7 8 89676 CASAVA_Build 14 83320973 2I ATGAAGTTGC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 28 7 14 7 TA 7 8 89677 CASAVA_Build 14 83325669 11D AGAATACCAG GGAGAGGAAGC/----------- GGAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 GGAGAGGAAGC 1 0 89678 CASAVA_Build 14 83326451 1I TCACCACAAA -/G GTAGAGTGCT 3070 hom 80 het 32 0 26 6 G 1 2 89679 CASAVA_Build 14 83333234 1I TGTATTTCTT -/A ACAGTTCTGG 3070 het 3070 hom 48 15 24 9 A 1 2 89680 CASAVA_Build 14 83341943 2D ACAGGAAAAC TA/-- TGAATTTAGT 2821 het 2821 ref 73 60 7 7 TA 1 0 89681 CASAVA_Build 14 83344686 1D CAAAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 2523 het 2523 ref 24 11 8 5 A 13 12 89682 CASAVA_Build 14 83347954 2D GGTAGGATAC AT/-- ATATATATAT 1443 het 1443 ref 20 12 4 4 AT 6 5 89683 CASAVA_Build 14 83348974 1I ATTTACTTAA -/T AAGTAAACTA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 0 1 89684 CASAVA_Build 14 83372526 1D AATGCCTCAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 9 8 89685 CASAVA_Build 14 83378661 1I TTATCTTCCT -/A AAGAGGTGAG 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 A 2 3 89686 CASAVA_Build 14 83391185 1D AACAGCTTTT G/- TTTCATGTAT 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 G 1 0 89687 CASAVA_Build 14 83398347 1I ATATTAAATA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2876 hom 25 7 15 3 T 8 9 89688 CASAVA_Build 14 83409412 10D ATTTTCTTCC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2771 het 2345 hom 24 10 11 8 T 22 12 89689 CASAVA_Build 14 83415312 1D CTAAGGGTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 9 8 89690 CASAVA_Build 14 83418003 1I AGATTTCCAG -/A AGTGGCTTTG 3070 het 3070 ref 49 29 18 2 A 1 2 89691 CASAVA_Build 14 83441860 1D TTCAGTTTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 8 18 6 T 9 8 89692 CASAVA_Build 14 83442125 1D GAAGACATGT A/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 1 0 89693 CASAVA_Build 14 83443396 1I GGTAATGCAT -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 5 6 89694 CASAVA_Build 14 83443914 2D TTACCTCTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 51 1 41 12 A 12 10 89695 CASAVA_Build 14 83447468 1D CAATCCCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2340 hom 21 7 11 4 A 10 9 89696 CASAVA_Build 14 83452914 2D AGGAAGTCTG AA/-- AATCCCTTTA 3070 het 3070 ref 52 23 23 7 A 4 2 89697 CASAVA_Build 14 83458474 1D CCCTCATTCT G/- TGTCCCTACC 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 G 1 0 89698 CASAVA_Build 14 83458973 2I AATAAATAAC --/TT AGTTTATTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 2 89699 CASAVA_Build 14 83463425 1D AGAAAGAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 8 7 89700 CASAVA_Build 14 83465823 1D GCCATAGCTG A/- AAAGGGCCAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 4 3 89701 CASAVA_Build 14 83467759 2I AGTCCCATAA --/CG CTTCCCTTGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CG 0 1 89702 CASAVA_Build 14 83471746 1D ATGCTTCTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 10 9 89703 CASAVA_Build 14 83480998 2I CACCAGTCTC --/TT TACTAAAACC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 3 89704 CASAVA_Build 14 83481926 2D CAATTTGAGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AT 9 8 89705 CASAVA_Build 14 83483312 1I CCACAACTTC -/T TTTATCCATT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 3 4 89706 CASAVA_Build 14 83487882 1D TTTCATTTGC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 T 8 7 89707 CASAVA_Build 14 83489782 26D TGTGTGTGTG TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 2927 het 239 hom 9 1 9 3 TA 24 11 89708 CASAVA_Build 14 83498802 1D CAAGAGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 9 11 A 12 11 89709 CASAVA_Build 14 83501121 1D CTATAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 11 10 89710 CASAVA_Build 14 83502997 4D CCTTCCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTT 840 het 435 hom 23 4 6 14 TCTT 3 2 89711 CASAVA_Build 14 83506086 1I GGCCAAGGAG -/A AAAAAAACCC 3070 hom 120 het 51 0 41 10 A 7 8 89712 CASAVA_Build 14 83514190 6D AATGAATTTG CCCTTA/------ CCTGTCTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 CCCTTA 1 0 89713 CASAVA_Build 14 83514305 1I TCTTTTTTTT -/C CCCTTTAGCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 C 3 4 89714 CASAVA_Build 14 83515510 3D GAAACCTGAA GAT/--- GATGTATAAT 3070 het 3070 hom 44 18 24 5 GAT 2 1 89715 CASAVA_Build 14 83520466 2D AGAAACTGTG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 AT 7 6 89716 CASAVA_Build 14 83530177 4D TGCAATAGGC CACA/---- CACACACACA 687 het 115 hom 36 1 3 32 CA 10 8 89717 CASAVA_Build 14 83531922 1D TGTCCCCCCG C/- CCCCTGCCCC 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 C 5 4 89718 CASAVA_Build 14 83532859 2D TCTACTAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 26 3 11 14 T 16 14 89719 CASAVA_Build 14 83533143 1D TAAGGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 13 12 89720 CASAVA_Build 14 83534702 8I GTATATATAC --------/ACATATAT ACATATATAC 2288 het 2288 ref 16 7 5 4 ACATATAT 2 3 89721 CASAVA_Build 14 83535192 2I56M6D ACATATATAC --ATATGTGTGTGTATATATATACACATATATGTATATGTATATACATATGTGTATATATATAC/ATATATGTGTGTGTATATATATACACATATATGTATATGTATATACATATGTGTATAT------ ACATATATGT 1768 het 1768 ref 9 8 4 0 N/A 0 0 89722 CASAVA_Build 14 83540688 1I GTGGTCCCTG -/A ACTTAACCTC 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 1 2 89723 CASAVA_Build 14 83546001 1D CATCGAACAC A/- GAGGGCATTG 3070 het 3070 hom 39 15 14 11 A 1 0 89724 CASAVA_Build 14 83567452 1D CCGCCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 10 6 A 11 10 89725 CASAVA_Build 14 83597897 2D ACACACACTC TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 ref 42 22 16 5 TA 5 4 89726 CASAVA_Build 14 83598434 1I TTTCATCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 T 9 10 89727 CASAVA_Build 14 83601912 1D AGTTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 13 12 89728 CASAVA_Build 14 83604585 4D TGTGCAATAG TTTT/---- TGTACAAGGA 3070 het 3070 ref 44 23 17 6 T 5 1 89729 CASAVA_Build 14 83610271 1I TTAAGGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3066 het 3066 ref 29 15 9 5 T 10 11 89730 CASAVA_Build 14 83610440 8D AGCCAAAAAT AATTAAAC/-------- AATTAAACAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 7 AATTAAAC 2 1 89731 CASAVA_Build 14 83635117 10D GGACCCTGCG GCCTTCCGCA/---------- GTGTTTGTGT 3070 het 2696 hom 18 7 12 0 GCCTTCCGCA 1 0 89732 CASAVA_Build 14 83641510 1D AGACCCCCCC T/- CCAACCACCT 2898 het 2898 ref 28 15 12 1 T 1 0 89733 CASAVA_Build 14 83643232 1D GACTCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 2467 het 149 hom 20 2 10 8 A 17 16 89734 CASAVA_Build 14 83657223 1I ATGTGGATAC -/A AATAATGAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 3 89735 CASAVA_Build 14 83660427 4D CATCTACACT TGTC/---- TGTCTTGTGG 3070 het 3070 ref 41 18 17 9 TGTC 2 1 89736 CASAVA_Build 14 83661004 1I CACATTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 41 1 38 2 T 10 11 89737 CASAVA_Build 14 83677982 4D TAAAATTAAT AGAG/---- AGAGGGAATT 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 AG 4 2 89738 CASAVA_Build 14 83678419 1I ACACACAAAC -/A ACCCAGTAAT 2844 het 2844 ref 31 22 6 3 A 1 2 89739 CASAVA_Build 14 83688249 3I ACATGAGAGA ---/AGG AGGAGTTTTT 3070 hom 120 het 46 0 39 7 AGG 1 2 89740 CASAVA_Build 14 83695005 1I ACAATCAGAG -/C ACATAGAGTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 89741 CASAVA_Build 14 83695702 1D TCAGTTATGT G/- GGTCATTCTG 3070 het 3070 hom 43 18 23 3 G 3 2 89742 CASAVA_Build 14 83697499 1D GTATGGGGGG A/- AACATTAACC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 3 2 89743 CASAVA_Build 14 83719907 1D ATTCTGATGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 56 hom 28 1 23 6 T 10 9 89744 CASAVA_Build 14 83731241 1D GAGAAAGAGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 A 9 8 89745 CASAVA_Build 14 83737125 1I TTGGAACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 33 0 26 7 A 11 12 89746 CASAVA_Build 14 83741392 1I CCTCCTCGAT -/C CCTTTCATCC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 C 2 3 89747 CASAVA_Build 14 83759399 1D TTGAAAACGG T/- AAGTCCTATC 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 1 0 89748 CASAVA_Build 14 83761136 4I TTTTAAATTG ----/ATTA ATTAATTTGC 3070 hom 95 het 39 0 32 7 ATTA 1 2 89749 CASAVA_Build 14 83765589 3D CCCAGGACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 90 het 43 0 31 13 AAC 6 5 89750 CASAVA_Build 14 83775269 1I GCAGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 24 2 17 5 A 13 14 89751 CASAVA_Build 14 83775447 1D GTGTAGTTGA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 6 89752 CASAVA_Build 14 83781648 3D TGAATTTTTT CAA/--- CAACATCATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 CAA 2 1 89753 CASAVA_Build 14 83782844 1I CTCATATTTT -/A TTTCTTTTTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 1 89754 CASAVA_Build 14 83788830 4I CAAAAAATCA ----/AAAG AAAGAAAGGA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AAAG 2 3 89755 CASAVA_Build 14 83789143 1D ATCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 1828 het 1828 ref 40 26 4 11 T 10 9 89756 CASAVA_Build 14 83792622 1I AATAGGACAA -/G TAGGCCTGTT 3070 hom 76 het 37 0 30 7 G 0 1 89757 CASAVA_Build 14 83793766 4D GAAATATGAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 26 8 A 16 12 89758 CASAVA_Build 14 83797407 2D AATCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 13 11 89759 CASAVA_Build 14 83812132 1I GCTTTTTCCA -/G AACTTGATGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 89760 CASAVA_Build 14 83837376 1D AAAAGATCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 10 9 89761 CASAVA_Build 14 83869021 2D GATGCCCTCA TC/-- TTGCTTGGGG 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 TC 1 0 89762 CASAVA_Build 14 83890250 1I CCAAACCTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 15 7 5 A 9 10 89763 CASAVA_Build 14 83891871 1I TCACCCAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 10 11 89764 CASAVA_Build 14 83892446 4D AATTAAAATG AAAA/---- AATATATATC 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 A 6 2 89765 CASAVA_Build 14 83912201 1I GTCCAGAGAC -/T TAAGTTTTCA 3070 het 2445 hom 18 5 11 2 T 1 2 89766 CASAVA_Build 14 83919839 1I AACAACCTGA -/T TTAAAAATGA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 2 3 89767 CASAVA_Build 14 83922631 1D TTGATACATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 49 21 20 8 A 9 8 89768 CASAVA_Build 14 83927058 1D AAAATAGCAA G/- GTGATTTGCA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 G 2 1 89769 CASAVA_Build 14 83927389 3D CTAAGAAGCA TCT/--- ACACTCTTGC 3070 het 3070 hom 35 18 14 3 TCT 1 0 89770 CASAVA_Build 14 83938467 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3001 het 1228 hom 19 3 8 8 A 8 9 89771 CASAVA_Build 14 83940738 5I TTTTTTTTTC -----/TTTTT TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 8 13 89772 CASAVA_Build 14 83951980 1D TAGGTTTTTC A/- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 53 29 20 5 A 1 0 89773 CASAVA_Build 14 83953068 1I GTGAAGTGAG -/A TTTCTTATAG 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 A 0 1 89774 CASAVA_Build 14 83968234 1D GCATTGTAAC T/- TTTTTTTTTT 2809 het 2808 ref 23 11 8 4 T 12 11 89775 CASAVA_Build 14 83972387 1D GAGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 129 hom 32 1 24 10 A 12 11 89776 CASAVA_Build 14 83977881 5I18M1D CATACCTATT -----AAAGCTTCAATTTAGCAAT/AAATCAAAGCTTCAATTTAGCAA- TTTTTTTTAG 3070 hom 75 het 31 0 26 8 N/A 0 0 89777 CASAVA_Build 14 83978028 1I TTTTAAAAAC -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 7 8 89778 CASAVA_Build 14 83981154 2I TAAGTTAAAC --/TA GCAATATATT 3070 hom 114 het 44 0 37 7 TA 0 1 89779 CASAVA_Build 14 83982943 1D ATATACCCCC T/- AGGGAATTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 1 0 89780 CASAVA_Build 14 83983488 1D TAAACATAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 9 89781 CASAVA_Build 14 83987414 4D ATATAGAGAG AGAT/---- GTGGATGATT 3070 hom 123 het 45 0 42 4 AGAT 1 0 89782 CASAVA_Build 14 83989746 1I GCCTCTTGCA -/T CTGCCGAAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 0 1 89783 CASAVA_Build 14 83991373 1D TCAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 35 1 34 2 A 11 10 89784 CASAVA_Build 14 83992058 4D TATGGCTGAA AAAT/---- AAAAATAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AAAT 1 0 89785 CASAVA_Build 14 83992260 6D ATTCCTTAAA ACACAT/------ ACACATACAA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 ACACAT 2 1 89786 CASAVA_Build 14 84017943 15I GGATTACTGT ---------------/AGTTGATGCTACTCC AGTATTTTGT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AGTTGATGCTACTCC 0 1 89787 CASAVA_Build 14 84023530 4D TGGGAGTGGA AGAG/---- AGAGAGGAGG 3070 hom 84 het 31 0 28 6 AG 5 3 89788 CASAVA_Build 14 84045490 4D GGAGGAAGGG AGGA/---- AGGAAGGGAG 35 het 35 ref 35 18 2 19 AGGA 2 1 89789 CASAVA_Build 14 84045744 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2250 het 20 hom 33 1 10 23 T 20 18 89790 CASAVA_Build 14 84050596 1I ATGTATCACA -/T TTTTCTTTGT 3070 hom 152 het 55 0 50 5 T 4 5 89791 CASAVA_Build 14 84052323 3D TTTCTTTATT ATG/--- AAGACATGTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATG 1 0 89792 CASAVA_Build 14 84052692 3D TCGGTATTAG TTC/--- TTCTTTAAAT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TTC 2 1 89793 CASAVA_Build 14 84053862 8I TCATTATTTA --------/ATGACCTT ATGACCTTCT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 ATGACCTT 1 2 89794 CASAVA_Build 14 84062282 4D ACATAGGTGA TAGG/---- TAGGTAAATT 3070 hom 18 het 41 2 33 8 TAGG 2 1 89795 CASAVA_Build 14 84062902 5D GAAGAGAAAT AAAAA/----- ATAAAATAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 1 89796 CASAVA_Build 14 84066049 1I22M1D AATCGGAAGC -AAAAAAAACAACAACAACAAATA/AAAAAAAAACAACAACAACAAAT- AAAAACAATC 3070 hom 96 het 33 0 33 6 N/A 0 0 89797 CASAVA_Build 14 84069021 3I TTTATAGCAC ---/TTT GAACTTATAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 3 89798 CASAVA_Build 14 84069388 2D TCCGCATTCA CT/-- GTCTTCCAAT 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 CT 1 0 89799 CASAVA_Build 14 84069839 4D TTTCAATCTT TATA/---- TATATACATA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 TA 5 3 89800 CASAVA_Build 14 84071505 1D GTAGAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 12 11 89801 CASAVA_Build 14 84080124 2I GGGAAGAGTC --/TG TGATGCCAAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TG 1 2 89802 CASAVA_Build 14 84080948 1I TCTTTACAGC -/T GAGAAAAATG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 89803 CASAVA_Build 14 84090537 1D GAGAAGGTGA T/- TACATTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 2 1 89804 CASAVA_Build 14 84093936 1D CCACATTTTT G/- GGTATCTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 G 3 2 89805 CASAVA_Build 14 84102633 1I GCTATGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 17 15 17 T 15 16 89806 CASAVA_Build 14 84103409 1D AAACCCTCTC A/- ACATTGAAAA 3070 hom 80 het 32 0 26 7 A 2 1 89807 CASAVA_Build 14 84104397 11I AAAAGACTGG -----------/ACTGTACTTTA TACTGTACTT 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 ACTGTACTTTA 0 1 89808 CASAVA_Build 14 84105925 2D GTAAGGCTGA AT/-- AATATTTTAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 AT 1 0 89809 CASAVA_Build 14 84117039 1D TATAAATTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 T 9 8 89810 CASAVA_Build 14 84119405 1D CATCCTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 10 9 89811 CASAVA_Build 14 84123048 2D ATATGTATAC AT/-- ATATATATAC 3070 het 2048 hom 21 8 9 5 AT 5 4 89812 CASAVA_Build 14 84124157 1D GATCTCGGCT C/- CCTGCAACCT 3070 het 1524 hom 20 5 13 3 C 3 2 89813 CASAVA_Build 14 84124579 6I TATGAAAAAT ------/AAAAAC AAAAACGAAT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 AAAAAC 1 2 89814 CASAVA_Build 14 84139874 1I AGACTTCTTG -/T CCTTTCACTA 3070 het 3070 ref 59 31 23 5 T 0 1 89815 CASAVA_Build 14 84140556 2I ATTTTAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 A 10 12 89816 CASAVA_Build 14 84143744 6D CCTTCTCTGG ACCTGT/------ ACACAAGCAA 3070 het 3070 hom 42 13 22 9 ACCTGT 1 0 89817 CASAVA_Build 14 84150298 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTGA 3070 het 2368 hom 18 7 9 2 A 1 0 89818 CASAVA_Build 14 84152013 2I TGAGAATCTC --/TT GAACCCAGGA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 0 2 89819 CASAVA_Build 14 84152243 1D AATTAAGTAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 18 19 2 A 9 8 89820 CASAVA_Build 14 84155740 4D TGCATATAAT AAAC/---- AAACCCAAGA 1456 het 1456 ref 11 5 4 6 AAAC 2 1 89821 CASAVA_Build 14 84159806 1D GATGATGTCC T/- TTTTTTTTTT 1636 het 1636 ref 38 28 4 6 T 12 11 89822 CASAVA_Build 14 84164262 1D TATTTGTTTC G/- GGGGGAAAGA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 6 5 89823 CASAVA_Build 14 84172554 1D ATTGGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 T 12 11 89824 CASAVA_Build 14 84189815 1D GCCTAGTGGT G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 2 1 89825 CASAVA_Build 14 84191715 4D ACTGGGGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 AAAC 4 3 89826 CASAVA_Build 14 84207483 4I TTGCTATAAT ----/AATC CATCAAAATA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AATC 0 1 89827 CASAVA_Build 14 84207809 1I TGGGAACTGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 423 hom 37 1 27 9 T 8 9 89828 CASAVA_Build 14 84215201 2I CTTTTTCCAA --/TT TCATTAGAGC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 1 3 89829 CASAVA_Build 14 84220916 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1866 het 789 hom 23 5 7 11 A 19 18 89830 CASAVA_Build 14 84232369 1D GGTGACATAG T/- TTTTTTTTTT 1230 het 1230 ref 38 28 4 6 T 12 11 89831 CASAVA_Build 14 84244450 4D TATTCATGTT AATA/---- AATGTTAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 AATA 1 0 89832 CASAVA_Build 14 84245756 1D TCAGTATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 24 1 21 2 T 11 10 89833 CASAVA_Build 14 84257115 1D CCCAGTTTAG A/- AAAAAAAAAA 2384 het 2384 ref 32 18 7 8 A 15 14 89834 CASAVA_Build 14 84268951 1I ATACTATGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 8 9 89835 CASAVA_Build 14 84270881 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 25 3 10 12 A 15 14 89836 CASAVA_Build 14 84282040 1D GTGAGCAGTG A/- TCACGCCACT 3070 het 3070 hom 23 9 11 4 A 1 0 89837 CASAVA_Build 14 84285373 1I CTCTCGGACA -/T CCCCTAATCC 3070 hom 75 het 36 0 26 10 T 0 1 89838 CASAVA_Build 14 84287929 5D TGAATTTAGT TAAAA/----- TAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 TAAAA 3 2 89839 CASAVA_Build 14 84290222 2D ATAAGGAAAC AT/-- AGCATAAAAG 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 AT 1 0 89840 CASAVA_Build 14 84292220 2I TTGTTTTATT --/TA TATATATATA 1758 het 1758 ref 24 11 7 6 TA 7 8 89841 CASAVA_Build 14 84294011 1I GCAAGAGATT -/A AAAAAAACGG 3070 het 3070 ref 52 31 14 7 A 7 8 89842 CASAVA_Build 14 84306613 10I GAAATATTGC ----------/CTAATATTGA CAGTTTTCCA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 CTAATATTGA 0 1 89843 CASAVA_Build 14 84319475 4D CAGTACCTGT TTTA/---- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 TTTA 1 0 89844 CASAVA_Build 14 84323577 1D CAGCATAAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 50 22 20 9 T 9 8 89845 CASAVA_Build 14 84332637 1I TTTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 13 14 89846 CASAVA_Build 14 84339037 1I AACAAACAAG -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 A 6 7 89847 CASAVA_Build 14 84362973 3D TATATATATA TTT/--- TTTTTTTTTT 676 hom 6 het 7 0 2 5 T 13 10 89848 CASAVA_Build 14 84366317 1D CATCCTTGAC A/- GACCACAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 1 0 89849 CASAVA_Build 14 84366801 1D CCCAATAAAA C/- TTTTGGCAAC 3070 hom 105 het 40 0 36 6 C 1 0 89850 CASAVA_Build 14 84367991 1I CAATCGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 487 hom 31 4 16 11 A 15 16 89851 CASAVA_Build 14 84368763 3I GAGAAACATG ---/ATA ATGTTATTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATA 0 1 89852 CASAVA_Build 14 84368830 1I TCAGGGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 514 hom 29 3 19 7 T 12 13 89853 CASAVA_Build 14 84371083 26I TGTGTAATAT --------------------------/ACATTTAAAGCTAAAATACTGTTAAA GACAGATAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 ACATTTAAAGCTAAAATACTGTTAAA 0 1 89854 CASAVA_Build 14 84380655 1D CTTATTTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 33 0 31 4 A 9 8 89855 CASAVA_Build 14 84383172 1I GTTAAATTCC -/A ATTGCATTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 1 2 89856 CASAVA_Build 14 84406558 1D CATTTAAATG T/- TTTTTTTTTT 1275 het 1275 ref 32 25 3 4 T 13 12 89857 CASAVA_Build 14 84413029 1I TTAATAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 C 0 1 89858 CASAVA_Build 14 84414107 1I ATGGAAAGAC -/A AAAAAACCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 7 89859 CASAVA_Build 14 84417320 1I AGAAAGCTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 9 89860 CASAVA_Build 14 84433507 1I TGATACTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 35 2 29 4 T 12 13 89861 CASAVA_Build 14 84440020 1D AGGCCTGTAG A/- CCCTTTGTTT 3070 hom 114 het 46 0 39 8 A 1 0 89862 CASAVA_Build 14 84454980 1D AGCAGCAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 A 9 8 89863 CASAVA_Build 14 84461930 1D AAGATAATTT A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 144 het 56 0 49 7 A 8 7 89864 CASAVA_Build 14 84470356 1I CTATTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 T 10 11 89865 CASAVA_Build 14 84472984 1D TAACAGTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 11 10 89866 CASAVA_Build 14 84474242 1I AAGAAGAAAG -/A AGAAGAAAGG 3070 hom 33 het 17 0 12 5 A 1 2 89867 CASAVA_Build 14 84480570 1D CTCCTCTTAT G/- GGCATTTTTC 3070 hom 105 het 44 0 33 11 G 3 2 89868 CASAVA_Build 14 84511240 1D ATGTAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3001 het 1915 hom 31 11 9 11 T 19 18 89869 CASAVA_Build 14 84538044 5I CCCTCTGCAA -----/ACCAG ACCGACTTAT 3070 hom 78 het 30 0 23 7 ACCAG 0 1 89870 CASAVA_Build 14 84564999 1D TAAATATTGT G/- GGGAATATAC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 G 4 3 89871 CASAVA_Build 14 84565248 1D TTCCAAAGTG T/- TTTTACTAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 5 4 89872 CASAVA_Build 14 84565895 1D TATTTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 37 1 31 5 A 10 9 89873 CASAVA_Build 14 84570390 8I ATGCTATGGG --------/GCCTGGTT GCCTGGTTGC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 GCCTGGTT 1 2 89874 CASAVA_Build 14 84570544 1D TTATACAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 26 0 19 7 T 18 17 89875 CASAVA_Build 14 84585902 2D AGACAGACAG AC/-- ACACACACAC 2703 het 2703 ref 40 20 6 15 AC 10 9 89876 CASAVA_Build 14 84615213 1I TGGATGACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 9 10 89877 CASAVA_Build 14 84622397 4I GAAATACCTT ----/TAAA TAACAGACTT 3070 hom 120 het 50 0 41 9 TAAA 0 1 89878 CASAVA_Build 14 84628619 2D ATAATAAATC AT/-- ATATATATAG 2257 het 2257 ref 18 8 7 3 AT 5 4 89879 CASAVA_Build 14 84632073 1I ATAGATATTG -/A AAAAATTAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 5 6 89880 CASAVA_Build 14 84637675 1D AACTTAATAA T/- TTTTTTTTTT 1648 het 1648 ref 25 13 4 9 T 14 13 89881 CASAVA_Build 14 84640861 10I CTGACTTTTA ----------/TACAGTTTTT AAAATGTAGT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 TACAGTTTTT 0 1 89882 CASAVA_Build 14 84644981 1I TGAAAAGGTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 432 hom 28 1 24 3 T 8 9 89883 CASAVA_Build 14 84655117 1D TAGTGATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 34 1 28 6 A 12 11 89884 CASAVA_Build 14 84658839 1I CAAATGCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 623 hom 23 2 15 6 A 16 17 89885 CASAVA_Build 14 84659227 1I TTGTACAGGC -/T TTTTTTTTTT 2929 het 2929 ref 29 14 8 7 T 11 12 89886 CASAVA_Build 14 84661341 2D TAGGCAACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 26 12 A 14 12 89887 CASAVA_Build 14 84669456 1D ATAAAAACTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 9 8 89888 CASAVA_Build 14 84670975 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 31 1 25 5 A 11 10 89889 CASAVA_Build 14 84675862 4D TTAGTAACAT TAAA/---- TATCTTTTCT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 TAAA 1 0 89890 CASAVA_Build 14 84694109 1I CTAAAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 15 1 14 0 A 11 12 89891 CASAVA_Build 14 84700299 2I ACAGACAACT --/CA CAGAGTGGGA 3070 hom 69 het 24 0 23 1 CA 1 2 89892 CASAVA_Build 14 84702943 2D AAGGGATCTC TT/-- TGTGTAATTT 3070 hom 129 het 46 0 44 4 T 3 1 89893 CASAVA_Build 14 84708141 1D TTATCTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 24 1 20 3 A 15 14 89894 CASAVA_Build 14 84709220 1I ACATAGAGAG -/A GGGGGGGGGA 3070 het 499 hom 32 3 23 6 A 0 1 89895 CASAVA_Build 14 84744442 2D TGATCACACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 40 1 24 16 T 16 14 89896 CASAVA_Build 14 84750336 1I ATGGTTACAA -/T TTGCCTTATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 3 89897 CASAVA_Build 14 84763113 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 9 8 89898 CASAVA_Build 14 84771472 3D AGATTCAGCC AAG/--- AAGTTTCTCA 3070 hom 69 het 24 0 24 3 AAG 2 1 89899 CASAVA_Build 14 84778859 1I TACTTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 34 1 29 4 T 11 12 89900 CASAVA_Build 14 84794033 1I ACTGCCTTGA -/T TTCCCAAGTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 3 89901 CASAVA_Build 14 84801210 1I TCATATAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 816 hom 34 2 23 9 T 11 12 89902 CASAVA_Build 14 84807345 1D CCCACTCACA T/- TTCCTGCTTA 3070 hom 108 het 46 0 37 10 T 3 2 89903 CASAVA_Build 14 84814158 2I CACACGGGCA --/CG CACACACACC 3070 hom 97 het 40 0 33 7 CG 0 1 89904 CASAVA_Build 14 84814296 1I TTTATTAAAG -/C CTATAGTTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 1 2 89905 CASAVA_Build 14 84896094 1D AGAACTGTGA T/- TTTTTTTTTA 921 het 921 ref 46 37 3 6 T 10 9 89906 CASAVA_Build 14 84932035 2I ATATATATAT --/AC ATATCCATAT 3070 het 1553 hom 21 5 11 5 AC 0 1 89907 CASAVA_Build 14 84942108 1D TGGTTTAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 10 9 89908 CASAVA_Build 14 84945545 1I CATGAAAAGG -/A AAAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 A 6 7 89909 CASAVA_Build 14 84945981 1I ATTTACTTAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 8 9 89910 CASAVA_Build 14 84946513 1I AGTCAAACTG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 7 8 89911 CASAVA_Build 14 84946624 1D TATGGAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 13 12 89912 CASAVA_Build 14 84950852 1I ATTGGCATTT -/G GAGCTGAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 G 1 2 89913 CASAVA_Build 14 84951549 2D GTCTGAACTC AG/-- GGGGAGATGG 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 AG 1 0 89914 CASAVA_Build 14 84952329 4D ACATGAGAGG TTAT/---- TTATTCTAAT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TTAT 2 1 89915 CASAVA_Build 14 84952560 1D TCTTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 11 10 89916 CASAVA_Build 14 84955576 3D ACAATTCCTA ATC/--- ATCAGTTGGA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 ATC 2 1 89917 CASAVA_Build 14 84957023 1D CCATTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 11 10 89918 CASAVA_Build 14 84958166 1D GGTATGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2118 hom 32 7 17 9 A 11 10 89919 CASAVA_Build 14 84968193 2I CATATACATG --/TA TATATATATA 2415 het 2415 ref 28 16 7 5 TA 8 9 89920 CASAVA_Build 14 85003004 1D TTATCATGGG T/- TTTTTCTTCG 3070 het 3070 hom 49 24 22 3 T 6 5 89921 CASAVA_Build 14 85007574 1D AGAAGCATGT A/- AAAAAAAAAA 1196 het 1196 ref 36 13 7 16 A 14 13 89922 CASAVA_Build 14 85027824 1D CTAAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 1340 hom 10 het 4 0 4 0 A 13 12 89923 CASAVA_Build 14 85030358 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 A 13 14 89924 CASAVA_Build 14 85042682 13D TGTTGGTAAA ACAAGATCCTTCT/------------- ACAGAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 5 ACAAGATCCTTCT 1 0 89925 CASAVA_Build 14 85044517 1I GTGGAGGTCA -/G GGGGCAAAGG 3070 hom 143 het 51 0 47 4 G 4 5 89926 CASAVA_Build 14 85047325 8D CTTTCAATGC GGGGGGGG/-------- GGGGGGGGGG 3070 hom 81 het 28 0 28 3 G 19 11 89927 CASAVA_Build 14 85047460 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 630 hom 40 2 34 4 T 9 10 89928 CASAVA_Build 14 85052831 1I AACCAGTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 31 1 19 11 A 12 13 89929 CASAVA_Build 14 85054801 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 22 4 T 12 11 89930 CASAVA_Build 14 85055221 2D TAAAATGAAT GG/-- GGGGGGGTTC 3070 hom 81 het 35 0 27 8 G 9 7 89931 CASAVA_Build 14 85057246 10I AGATGTAATA ----------/GACATGATAT GACCCTATTC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 GACATGATAT 0 1 89932 CASAVA_Build 14 85057714 1D GAAAGATAGA T/- TTTTTATTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 6 5 89933 CASAVA_Build 14 85066717 1D CTTCGGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 12 11 89934 CASAVA_Build 14 85071452 2D GCCCCCCCCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1941 hom 38 12 17 10 A 12 10 89935 CASAVA_Build 14 85074646 1D CATGTCATAC T/- GTTATATTTC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 1 0 89936 CASAVA_Build 14 85075477 1D TTGGAACAGT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 104 het 37 0 34 4 A 9 8 89937 CASAVA_Build 14 85076150 2I TTGGAAAGAG --/TT AATTTTGAGG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 0 2 89938 CASAVA_Build 14 85076819 1D TTTTTTAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 T 10 9 89939 CASAVA_Build 14 85083423 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 28 1 12 15 T 15 14 89940 CASAVA_Build 14 85084846 1D GTAGAAGAAG T/- GTGGTCCCTG 3070 hom 90 het 35 0 27 8 T 1 0 89941 CASAVA_Build 14 85085824 1I TCTGCCACAC -/T TTCAAGTACT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 2 3 89942 CASAVA_Build 14 85086136 1D TATTTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 33 2 24 7 A 12 11 89943 CASAVA_Build 14 85086833 1D ATAGAACACA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 T 8 7 89944 CASAVA_Build 14 85093350 1I ATTTCCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 T 11 12 89945 CASAVA_Build 14 85106994 1I ATTCCCCTTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 2369 hom 22 10 9 3 T 6 7 89946 CASAVA_Build 14 85116848 1I GTAGAGCAAG -/A CGTTCCTGTG 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 0 1 89947 CASAVA_Build 14 85122650 1D ATGAACACTT A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 7 6 89948 CASAVA_Build 14 85122791 6D ATATATATGT ACACAC/------ ACACACACAC 2269 het 2269 ref 31 16 9 8 AC 10 7 89949 CASAVA_Build 14 85124555 1D ACTAGCTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1469 hom 33 6 18 9 T 15 14 89950 CASAVA_Build 14 85126156 1D TTTGCTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 35 3 21 11 T 15 14 89951 CASAVA_Build 14 85136042 3D AGAAATAAAA GTT/--- GTTAATAGGA 3070 hom 141 het 53 0 48 6 GTT 2 1 89952 CASAVA_Build 14 85147365 2I GCTTCATCAG --/AC ACACAGTGGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AC 2 3 89953 CASAVA_Build 14 85148246 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 11 10 89954 CASAVA_Build 14 85150471 1D CCCTTTGAAA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 2 1 89955 CASAVA_Build 14 85168699 1D AAAGCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 35 0 29 6 T 12 11 89956 CASAVA_Build 14 85169731 1D CCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2231 het 22 hom 23 1 10 13 A 17 16 89957 CASAVA_Build 14 85169897 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 43 1 25 17 A 15 14 89958 CASAVA_Build 14 85176904 1I TCACTCTCTT -/A AATAGCTTGA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 2 3 89959 CASAVA_Build 14 85181257 2D ATATACACAC AT/-- ATGTGTGTAT 3070 hom 115 het 44 0 39 6 AT 2 1 89960 CASAVA_Build 14 85196066 4D TTTAGATATC TATT/---- TATCATATAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TATT 1 0 89961 CASAVA_Build 14 85201793 49D AACTTGACTC TGTATTTATGCATTATGTTGAGTAATTTCTCCAAGTATGCTTGTTGAAT/------------------------------------------------- TGTATTTAGT 3070 hom 75 het 27 0 26 8 TGTATTTATGCATTATGTTGAGTAATTTCTCCAAGTATGCTTGTTGAAT 1 0 89962 CASAVA_Build 14 85207379 5D TCATTTGTCT CTTAA/----- CTTAATTTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 CTTAA 2 1 89963 CASAVA_Build 14 85210407 2I TTATTTCTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 10 12 89964 CASAVA_Build 14 85216437 1I GATCAAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 22 2 17 3 T 10 11 89965 CASAVA_Build 14 85229575 4I11M1D AACTATTTGA ----TTCTATTCTAAT/TTCTTTCTATTCTAA- TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 31 0 26 8 N/A 0 0 89966 CASAVA_Build 14 85242475 1D ACGAGGAAAT G/- AGACGTCAAA 3070 hom 157 het 59 0 53 6 G 1 0 89967 CASAVA_Build 14 85244286 4D TTAAAAAAAT AAAG/---- AAACTATATA 3070 hom 81 het 28 0 27 2 AAAG 1 0 89968 CASAVA_Build 14 85249121 1I AATATCTCAC -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 7 8 89969 CASAVA_Build 14 85251760 1I CAATGTTTTC -/T ATGACAGCTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 0 1 89970 CASAVA_Build 14 85252718 2I TTTTTTTTTT --/AA AAGTCATTGT 3070 hom 55 het 26 0 20 6 A 2 4 89971 CASAVA_Build 14 85253930 1D TCAGCAGAAT C/- CCTGGTAAAG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 3 2 89972 CASAVA_Build 14 85254647 2I ATATGCACTC --/AT AGATGCATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 0 1 89973 CASAVA_Build 14 85255328 2D TACAGGCATG CA/-- CCAGCACCCC 3070 hom 30 het 11 0 10 1 CA 1 0 89974 CASAVA_Build 14 85256064 1D AATGTCTGGT A/- AATTTTTGTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 2 89975 CASAVA_Build 14 85260195 1D CAATGTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 36 1 32 3 A 11 10 89976 CASAVA_Build 14 85270449 1D CTAGAGCAAT G/- GGATCTGACG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 G 3 2 89977 CASAVA_Build 14 85281500 3I TGCATTATTC ---/ATA ATGTCTAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATA 0 1 89978 CASAVA_Build 14 85283407 1D AAGACCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 11 10 89979 CASAVA_Build 14 85291330 3D TCTTAACTTC TTT/--- GAGATGTGAT 3070 hom 196 het 73 0 66 9 T 3 0 89980 CASAVA_Build 14 85292301 1I TTGGTACTAG -/T TTGGTGCAAA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 2 3 89981 CASAVA_Build 14 85300923 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 129 het 45 0 44 2 A 9 8 89982 CASAVA_Build 14 85311721 2I ATATTACCAG --/TA TATATATATA 1967 hom 13 het 9 0 5 4 TA 7 8 89983 CASAVA_Build 14 85315105 1D TATAGAGATA C/- AAGGTAGGCT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 C 1 0 89984 CASAVA_Build 14 85315456 1I ACTGTATCTT -/A ATATTTCTAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 89985 CASAVA_Build 14 85316456 12D TCTATTGATC GATCAATTGATT/------------ GATCGGTCTA 3070 hom 90 het 32 0 31 4 GATCAATTGATT 1 0 89986 CASAVA_Build 14 85317943 1D GGAAACCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 10 9 89987 CASAVA_Build 14 85346271 1I TCAGTACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 40 3 32 5 A 11 12 89988 CASAVA_Build 14 85346842 1D TCCCAAAAAA T/- TATGGTTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 T 2 1 89989 CASAVA_Build 14 85352591 1I AAAGTTGAGC -/T TTTTAGATCA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 4 5 89990 CASAVA_Build 14 85354616 1I TTTTTTTTTT -/A CAATACAAAT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 0 1 89991 CASAVA_Build 14 85354868 2I5M4I GGTTAAAGAG --GGCCT----/AACACCTATTA CAAACGGAGG 3070 hom 87 het 32 0 28 6 N/A 0 0 89992 CASAVA_Build 14 85360545 1I TTTATTTGCC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 8 9 89993 CASAVA_Build 14 85377298 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2946 het 555 hom 12 2 8 2 A 12 11 89994 CASAVA_Build 14 85377767 1I TTTTGTACTT -/A CAGTTTGAGA 1827 het 1827 ref 52 46 4 2 A 0 1 89995 CASAVA_Build 14 85385607 1I TTTTCATTTA -/T TTTTTTTTTA 2499 het 2499 ref 28 14 9 5 T 9 10 89996 CASAVA_Build 14 85393823 1D ATTGAATTAT G/- GGGACTGGTC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 G 4 3 89997 CASAVA_Build 14 85396441 1I TAACTGAAAA -/T TGACTGCATT 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 T 1 2 89998 CASAVA_Build 14 85404512 9I TGCTTTAAAC ---------/TGGTTACTA TGAATGTTCA 3070 het 3070 ref 57 26 22 10 TGGTTACTA 0 1 89999 CASAVA_Build 14 85407274 1D AAATATATGA T/- CTTTTGTAGC 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 T 1 0 90000 CASAVA_Build 14 85408170 2I TGGTCTTGAG --/TA TATTAGCTAC 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 TA 1 2 90001 CASAVA_Build 14 85435657 5D ATCCAAGAAC ATATT/----- ATATCTTTCC 3070 het 3070 hom 32 8 21 4 ATATT 1 0 90002 CASAVA_Build 14 85448191 1I GATACTGCTT -/G GAGGATAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 G 1 2 90003 CASAVA_Build 14 85452138 1D AGCCATGCTC T/- TTTTTTTTTT 1281 het 1281 ref 36 14 3 19 T 13 12 90004 CASAVA_Build 14 85462867 1I TATTATTGCC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 8 9 90005 CASAVA_Build 14 85475124 1D CCTTTCAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 10 9 90006 CASAVA_Build 14 85475873 1D AACCTTGCAT C/- TTGTGAACTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 C 1 0 90007 CASAVA_Build 14 85477679 3I AAATAAATTG ---/TTA TTATTATTAC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 TTA 3 4 90008 CASAVA_Build 14 85492065 5D CCAACAGTTC TCTTA/----- TAAGATCGAA 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 TCTTA 1 0 90009 CASAVA_Build 14 85495209 1D CTTTCCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 48 1 30 17 T 13 12 90010 CASAVA_Build 14 85498118 1I AATAACAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 32 3 25 4 T 10 11 90011 CASAVA_Build 14 85498129 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 5 hom 28 1 22 5 T 8 9 90012 CASAVA_Build 14 85501875 2I ACACATGCAC --/AT ATATATATGT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 AT 4 5 90013 CASAVA_Build 14 85504659 1D ATTAATAGAG A/- AAAAATGTAA 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 A 6 5 90014 CASAVA_Build 14 85511670 2D TATGATTAAC AT/-- ATTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 25 12 11 3 AT 2 1 90015 CASAVA_Build 14 85513311 4D ATATATTGAA ACTG/---- ACTACAATCT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 ACTG 1 0 90016 CASAVA_Build 14 85521865 1D CCAATTGTAC T/- TTTGTAATTA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 4 3 90017 CASAVA_Build 14 85522872 1I ACCCGATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 40 1 31 8 T 10 11 90018 CASAVA_Build 14 85540843 1I TTCTGCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 10 11 90019 CASAVA_Build 14 85541042 10D CAAAGCATAC TTGACTACAG/---------- TTGACAACTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTGACTACAG 1 0 90020 CASAVA_Build 14 85543664 1D AGAATGGAAT A/- ATCAACTTTG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 2 1 90021 CASAVA_Build 14 85559797 1I CTCTTGTCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 8 9 90022 CASAVA_Build 14 85567984 1D ACAAGCAAAG T/- TTTGTTAATT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 T 4 3 90023 CASAVA_Build 14 85599645 1D CAGGGGTTTT C/- CCCTAACAAA 3070 hom 66 het 24 0 22 3 C 4 3 90024 CASAVA_Build 14 85600043 1I CTGAATTCAC -/A GGCATGGCAT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 A 0 1 90025 CASAVA_Build 14 85607956 4D AGAGGAAGGA AAGG/---- AAGGAAGGAA 1718 het 1150 hom 18 5 5 9 AAGG 5 4 90026 CASAVA_Build 14 85625908 1D CCCCTACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 482 hom 42 8 24 11 A 11 10 90027 CASAVA_Build 14 85625942 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 2958 hom 48 14 19 15 A 8 9 90028 CASAVA_Build 14 85638434 8D CAAGCATCTA TCTATCTG/-------- TCTATCTATC 3070 het 3070 hom 17 8 8 4 TCTATCTG 1 0 90029 CASAVA_Build 14 85640248 4D TCAACTTAAA CTCT/---- CTCTTTGTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 9 CT 4 2 90030 CASAVA_Build 14 85641543 1D TAGGAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1655 hom 28 9 13 6 T 12 11 90031 CASAVA_Build 14 85641557 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 374 hom 25 1 15 9 T 9 10 90032 CASAVA_Build 14 85655057 1D CTTGTTGAGG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 422 hom 27 1 23 3 T 8 7 90033 CASAVA_Build 14 85657295 4D ACATCAAAGA CAAT/---- CAATCACATT 3070 het 3070 hom 39 14 18 8 CAAT 2 1 90034 CASAVA_Build 14 85665424 4D ATAAAGAAAT AAAA/---- AAAAAATAGA 3070 hom 80 het 33 0 27 8 A 10 6 90035 CASAVA_Build 14 85666208 1D AAATTTAGGG T/- TTTTTTGGTA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 7 6 90036 CASAVA_Build 14 85666610 14D TGCAGAAATT TATTATATGAGACA/-------------- TATTATATGA 3070 het 3070 ref 22 11 9 4 TATTATATGAGACA 2 1 90037 CASAVA_Build 14 85666853 4I AATACAATAC ----/TATT TATTATATCT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TATT 1 2 90038 CASAVA_Build 14 85667633 3D TATAATAGGA AAC/--- AACATAACCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAC 2 1 90039 CASAVA_Build 14 85667819 4I ACTCGATAAA ----/TTCT TTCTTATATT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 TTCT 1 2 90040 CASAVA_Build 14 85670899 1D TTGTAAAGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 10 9 90041 CASAVA_Build 14 85674174 1D CTACTAGGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 10 9 90042 CASAVA_Build 14 85678746 1I GCACACATGG -/T TTTTTTTTTT 1174 het 1174 ref 21 7 3 11 T 10 11 90043 CASAVA_Build 14 85681262 1I ATAAGAAAAA -/G TGTAATGAAT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 G 0 1 90044 CASAVA_Build 14 85694191 4I ACCACTATGC ----/CTGA CTAATTTTTG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 CTGA 0 1 90045 CASAVA_Build 14 85698536 4I AATTCATTTG ----/ATCA ATTATTGAAC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 ATCA 0 1 90046 CASAVA_Build 14 85702079 2I TTTGAAACTC --/TT TGAATTTGTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 1 3 90047 CASAVA_Build 14 85702294 1D CAGCTGTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 67 het 30 0 26 4 T 10 9 90048 CASAVA_Build 14 85721339 1I ACAATGTTTA -/T TTTTTCTATG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 5 6 90049 CASAVA_Build 14 85722624 2I AGTAATCTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 10 12 90050 CASAVA_Build 14 85736805 1D AGCTTTTGAA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 T 8 7 90051 CASAVA_Build 14 85740807 2I TATAGAGTTC --/CT CTGTTTGGGA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CT 1 2 90052 CASAVA_Build 14 85747702 4I TTATTCTGTT ----/AATA AATACTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 AATA 1 2 90053 CASAVA_Build 14 85753038 1I ATTATTACAC -/G GAAGGATATC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 1 2 90054 CASAVA_Build 14 85764645 1I TTTTATCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 10 11 90055 CASAVA_Build 14 85764760 1D AATATTTTAA C/- TGTCTGCAAT 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 C 1 0 90056 CASAVA_Build 14 85770030 1I AAAAACCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 10 11 90057 CASAVA_Build 14 85773807 1I AAGTAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1201 hom 23 4 12 7 A 12 13 90058 CASAVA_Build 14 85775047 1D TTTGCTTACA C/- GGTTTTTTTT 1512 het 1512 ref 34 21 6 7 C 1 0 90059 CASAVA_Build 14 85777699 5I CAAAGCTCTC -----/ATAAA ATAAATCAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 ATAAA 1 2 90060 CASAVA_Build 14 85778869 1I ATTGCAACAT -/A TTTACTAGAA 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 A 0 1 90061 CASAVA_Build 14 85780725 1I GGCTAGCCAG -/T TTTCCCAGCA 3070 het 946 hom 23 3 14 6 T 3 4 90062 CASAVA_Build 14 85783070 22I AACTTAAAGT ----------------------/ATAATAATTAAAAAAATCAATA AAAAAAAAAT 1318 het 576 hom 9 4 3 2 ATAATAATTAAAAAAATCAATA 0 1 90063 CASAVA_Build 14 85786187 1D GAATATTATC A/- TATGCACTAT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 1 0 90064 CASAVA_Build 14 85790706 1I GCTACATAGT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 A 7 8 90065 CASAVA_Build 14 85791919 5I TTAGACTCTC -----/CCTTT CCTTTCATCA 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 CCTTT 1 2 90066 CASAVA_Build 14 85792321 4D CCTCGGGGCT GAGA/---- GAATTTTGAG 2706 het 2296 hom 14 6 7 2 GA 3 1 90067 CASAVA_Build 14 85795338 4I TTGAAGTCCC ----/TTTA TTTATTCAAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TTTA 1 2 90068 CASAVA_Build 14 85796119 6D AAGATACATG TTTTGA/------ TTTTGATTTT 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 TTTTGA 2 1 90069 CASAVA_Build 14 85799036 1D TTGATTTGCT A/- ATATTTTGTG 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 A 2 1 90070 CASAVA_Build 14 85799314 1D ATCTTAACCA T/- TTTTTAGAGT 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 T 6 5 90071 CASAVA_Build 14 85800557 1D CTAGCTTTTC A/- ATGTGGGCAT 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 A 2 1 90072 CASAVA_Build 14 85803355 1D TACATTTTAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 A 8 7 90073 CASAVA_Build 14 85803854 2D AAAAGAAACG AC/-- ACAGATGGTG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 AC 2 1 90074 CASAVA_Build 14 85804642 1I TATTTTTTTT -/A AAAAGTATAG 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 A 4 5 90075 CASAVA_Build 14 85805568 1I GGTCAATAAC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 36 15 17 4 T 7 8 90076 CASAVA_Build 14 85805804 10D ATTCAGATTT TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 46 27 17 5 TG 9 4 90077 CASAVA_Build 14 85806533 1D CAGGCTATTT G/- GTCATTCAGG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 G 2 1 90078 CASAVA_Build 14 85807407 6D TCAATTGGCT TTCAAC/------ TTCAACTGTG 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 TTCAAC 2 1 90079 CASAVA_Build 14 85808120 3I TTGAGGCAAA ---/ATT ATTCTTTTTT 3070 het 1881 hom 31 7 15 9 ATT 1 2 90080 CASAVA_Build 14 85810091 1I45M2D TCTCTTCTCG -TATCATAAAATCTATTTTTACCTTCCAAAACATATGCAAAAAAAAAT/TTATCATAAAATCTATTTTTACCTTCCAAAACATATGTAAAAAAAA-- ATTAAAGTCA 3070 het 3070 ref 38 32 20 5 N/A 0 0 90081 CASAVA_Build 14 85811426 4D TATACAACTT GAAC/---- GGTGTCTAGA 3070 het 3070 ref 43 23 20 0 GAAC 1 0 90082 CASAVA_Build 14 85812164 2I ATTAGAATAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 A 9 11 90083 CASAVA_Build 14 85812304 4I TTTTTCAAAA ----/TAAC TAACTGAACT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 TAAC 1 2 90084 CASAVA_Build 14 85814654 1D TAAAAGTTAT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 A 8 7 90085 CASAVA_Build 14 85815582 1D GTCAGAAAAG A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 A 7 6 90086 CASAVA_Build 14 85821141 1D TTTCCTTCAG A/- AAAAAACCTG 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 7 6 90087 CASAVA_Build 14 85821812 1I GACTGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 A 10 11 90088 CASAVA_Build 14 85825777 2D TTCACCAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 15 13 90089 CASAVA_Build 14 85826030 4I CATTTTGATT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 TTTG 2 3 90090 CASAVA_Build 14 85831721 1D GAGTACAAAT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 A 8 7 90091 CASAVA_Build 14 85837388 1I CAACATTGAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 8 9 90092 CASAVA_Build 14 85841624 2I6M3I TAAATTCTCA --GCAATT---/GTGGATTTTTA TTAAAGCAAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 N/A 0 0 90093 CASAVA_Build 14 85841771 4D GCATCCAGTT TTTA/---- TTGTTATTAT 3070 het 3070 ref 27 17 10 1 TTTA 1 0 90094 CASAVA_Build 14 85846566 2D ATACACACAG AC/-- ACACACATAC 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 AC 4 3 90095 CASAVA_Build 14 85849894 3I CTCTACAGGA ---/TAT GAACCAGGAG 2478 hom 12 het 6 0 5 1 TAT 0 1 90096 CASAVA_Build 14 85878355 1I ATGGGAGATG -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 6 7 90097 CASAVA_Build 14 85878949 1I GTTGTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2442 hom 18 7 9 2 T 10 11 90098 CASAVA_Build 14 85882342 1I TTTTTGTCCC -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 6 7 90099 CASAVA_Build 14 85882464 1D TAAAAAGACC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 8 7 90100 CASAVA_Build 14 85909598 1D CATGAGATAT G/- GGGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 G 8 7 90101 CASAVA_Build 14 85912195 1D TTATAACAGG A/- AAAAAAAGGT 2972 hom 15 het 11 0 6 5 A 8 7 90102 CASAVA_Build 14 85913457 1D AAAATAGCAA C/- AAAAATATAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 1 0 90103 CASAVA_Build 14 85914576 3D TGTGGAGAAA AAG/--- AAGAAGTTAC 3070 hom 84 het 35 0 29 7 AAG 3 2 90104 CASAVA_Build 14 85924138 1D GTTCATTATT G/- TTTAATAATT 3070 het 3070 hom 43 17 23 5 G 1 0 90105 CASAVA_Build 14 85933191 1I AATGTAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 14 9 T 10 11 90106 CASAVA_Build 14 85939791 1D ATTTTTTTTT A/- AAATCAAGAA 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 A 4 3 90107 CASAVA_Build 14 85943610 1D TATTGGAAAT A/- AAATATTTTA 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 A 4 3 90108 CASAVA_Build 14 85946211 2D TACCTCTATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 CA 10 9 90109 CASAVA_Build 14 85946834 36D ACATATACTT TTCTCAAGAATTATTCTCAAGAATTCTCAAGAATAA/------------------------------------ TTCTCAAGAA 3070 hom 84 het 26 0 29 5 TTCTCAAGAATTATTCTCAAGAATTCTCAAGAATAA 1 0 90110 CASAVA_Build 14 85949286 1D GGGTACTCAT A/- AAAAATATTA 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 A 6 5 90111 CASAVA_Build 14 85953075 6I GTATGTGATG ------/CCACTT CCACTTCCAC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 CCACTT 1 2 90112 CASAVA_Build 14 85960423 5D AATTTTATTT TAATA/----- TAATTGTGTG 3070 hom 33 het 16 0 12 6 TAATA 1 0 90113 CASAVA_Build 14 85964700 4I TTTTTATACA ----/GTCT TTCTTCTGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GTCT 0 1 90114 CASAVA_Build 14 85974590 1I CAAAGAGGGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 8 9 90115 CASAVA_Build 14 85976392 3D GCTTAATAAT AGC/--- AGCATTATAG 3070 hom 66 het 24 0 23 3 AGC 2 1 90116 CASAVA_Build 14 85978845 6D CTGGGCCCTA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 2728 hom 32 11 8 15 T 18 12 90117 CASAVA_Build 14 85982522 1D GAAATTATCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 9 8 90118 CASAVA_Build 14 85983662 1D TAAATTAATC T/- TTTTGCCAAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 5 4 90119 CASAVA_Build 14 85984286 1I TACTTTAACG -/T TTTTATAAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 4 5 90120 CASAVA_Build 14 85985508 3D15M1D TTTTTTTGTG TTTTTTTTTTTCCTCTAAG/---TTTTTTTTCCTCTAA- ATAACAGAGG 3070 hom 90 het 35 0 31 8 N/A 0 0 90121 CASAVA_Build 14 85985598 3D AAAACTAAAG ATC/--- ATCTTGGAAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 ATC 2 1 90122 CASAVA_Build 14 85987910 1D56M1I AGAAAGAAAG AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAATTAAGAAA-/-AAGACAGACAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGGAAAGAAAGAAATTAAGAAAG AAAGAAAGAG 1471 hom 7 het 8 0 3 8 N/A 0 0 90123 CASAVA_Build 14 85992281 2D ATTATGTGAC TA/-- TATATATATG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 TA 5 4 90124 CASAVA_Build 14 85992442 1I TTTTAATTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 8 9 90125 CASAVA_Build 14 85994080 1I GAATATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 T 11 12 90126 CASAVA_Build 14 86000908 4D CTTCTCCTCC TCTT/---- TCTTTCTTTC 2381 het 2381 ref 28 10 8 10 TCTT 4 3 90127 CASAVA_Build 14 86011369 3I AACTGAAAGT ---/AAA ATAATAATAA 2908 het 2908 ref 20 8 7 5 A 1 4 90128 CASAVA_Build 14 86011515 1I ACTGAGGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 21 0 12 9 T 11 12 90129 CASAVA_Build 14 86013155 1I CTTTTGTAAT -/A TATATAGTCT 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 0 1 90130 CASAVA_Build 14 86013895 2I58M2D TAACCTACTC --ATATATGTGTGTATATATATGCATATATATGTATATACATATATACATACATATACTCAT/ATATATATGTATGTATATATATGCATATATATGTATATACATATATACATACATATACTC-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 24 20 9 11 N/A 0 0 90131 CASAVA_Build 14 86015156 4I TTTCTACAAG ----/TATT TATTTATCAT 3070 het 3070 ref 36 13 14 9 TATT 1 2 90132 CASAVA_Build 14 86026811 1D CAGAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 892 het 892 ref 26 20 3 4 T 17 16 90133 CASAVA_Build 14 86027289 1I CTGATGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 T 11 12 90134 CASAVA_Build 14 86028207 7I ATATTTTGTG -------/TTTTTAA TTTTACATAA 3070 het 3070 ref 35 24 9 2 TTTTTAA 0 1 90135 CASAVA_Build 14 86029933 1I ATATTTTGGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 8 9 90136 CASAVA_Build 14 86037096 4D AAATCTACAT TAAA/---- TAAATAATTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TAAA 2 1 90137 CASAVA_Build 14 86040704 4D ATAGAAAAAT TAAA/---- TAAATTCAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 3 TAAA 2 1 90138 CASAVA_Build 14 86049581 1I TGCATTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 37 1 31 5 A 10 11 90139 CASAVA_Build 14 86060532 1I ATTTTCTCAT -/A AATCAGTCTG 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 A 2 3 90140 CASAVA_Build 14 86061757 1D ACTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 11 10 90141 CASAVA_Build 14 86063408 1D TTTGTCAGGG C/- CCCCCCAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 7 6 90142 CASAVA_Build 14 86065707 1I CAAAATTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 T 9 10 90143 CASAVA_Build 14 86070099 1I TCACCTTTGG -/T TTTTGTCTTC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 4 5 90144 CASAVA_Build 14 86071346 1D ACCTAATGCT A/- AATGACCAGT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 3 2 90145 CASAVA_Build 14 86071894 3I ATATATATAT ---/TTA TTATTTATTT 2908 hom 15 het 8 0 6 2 TTA 1 2 90146 CASAVA_Build 14 86078095 33D AACTAATGTT AATTGTAATTATTGTGGTAATAGAGAGGTTTAC/--------------------------------- AATTGTAATT 3070 hom 67 het 24 0 23 9 AATTGTAATTATTGTGGTAATAGAGAGGTTTAC 2 1 90147 CASAVA_Build 14 86081557 1D GAAAAAGGTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 37 0 34 5 A 9 8 90148 CASAVA_Build 14 86083335 1I TATAGTGTTA -/T TTTTTCCCAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 5 6 90149 CASAVA_Build 14 86090783 1I TATATTAAGA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 T 5 6 90150 CASAVA_Build 14 86092704 1D ATTCTATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 A 11 10 90151 CASAVA_Build 14 86093181 1D AAAGAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 52 28 16 10 T 1 0 90152 CASAVA_Build 14 86098717 1I ATATGTACTG -/T TTTTTTTTCT 2859 het 2735 hom 23 7 7 9 T 8 9 90153 CASAVA_Build 14 86102311 5D ACCTCTTTTC TTTTT/----- CTCTTTCTTG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 5 0 90154 CASAVA_Build 14 86104394 1I GTATTTAATA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 7 8 90155 CASAVA_Build 14 86126526 1I ACTTCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 A 13 14 90156 CASAVA_Build 14 86134738 1D AAAATGGCTC T/- TTTTTTTTTT 2561 het 2561 ref 24 10 6 8 T 11 10 90157 CASAVA_Build 14 86177521 1I TACCTTTTTT -/A AAAAACTATG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 5 6 90158 CASAVA_Build 14 86184680 1I TATGCAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 834 hom 36 2 30 4 A 11 12 90159 CASAVA_Build 14 86186160 8D GATGCAGAAA AAGTCTTC/-------- AATAAAATTC 3070 hom 81 het 30 0 28 5 AAGTCTTC 1 0 90160 CASAVA_Build 14 86202860 1D AAGAATGAAA G/- GAGATAATTG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 2 1 90161 CASAVA_Build 14 86215378 2I ATTATTATTT --/TA TATAGTTGAT 2652 hom 15 het 7 0 6 1 TA 2 3 90162 CASAVA_Build 14 86215664 1I TCACTCACAA -/T TTCAGCATGG 3070 hom 39 het 27 1 25 1 T 2 3 90163 CASAVA_Build 14 86216288 1I GAATCAATTA -/T TTGAGTTTGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 3 90164 CASAVA_Build 14 86217575 1D TCAACTATAT A/- AACAGCATCT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 3 2 90165 CASAVA_Build 14 86234539 1I CTTTTTGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 9 10 90166 CASAVA_Build 14 86246362 1I ACAAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 32 1 26 5 T 11 12 90167 CASAVA_Build 14 86248271 1I AGAAGCAAAC -/A AAAAAAGCAA 3070 hom 172 het 66 0 58 8 A 6 7 90168 CASAVA_Build 14 86250339 1D AAGGTCTTCC T/- TTGTCCACAT 3070 hom 117 het 41 0 40 3 T 3 2 90169 CASAVA_Build 14 86252410 1I TAATTTAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 7 8 90170 CASAVA_Build 14 86253458 1D CTTAAAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 22 5 13 4 A 15 14 90171 CASAVA_Build 14 86254189 1D TTTTGTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 12 11 90172 CASAVA_Build 14 86255682 1D TATATATTTA G/- CTTTGTATAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 G 1 0 90173 CASAVA_Build 14 86256391 4D TACATACATT TCTC/---- TCTACCTCAG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TC 3 1 90174 CASAVA_Build 14 86257142 1I ATCCTGATAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 8 9 90175 CASAVA_Build 14 86261073 1I AGAATCATCT -/A AACTGAGATT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 2 3 90176 CASAVA_Build 14 86286671 1D TTCTGCTGCC T/- TTTGTTCAGC 3070 het 172 hom 22 1 18 3 T 4 3 90177 CASAVA_Build 14 86303329 1D ACTATGTCAC T/- TTGTTAATGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 2 90178 CASAVA_Build 14 86329428 1I AAAAGCTCTC -/T TTGGAGAGTG 3070 hom 117 het 42 0 38 4 T 2 3 90179 CASAVA_Build 14 86370381 1D ACATAGTTAC A/- AAAATCCTGA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 A 5 4 90180 CASAVA_Build 14 86373158 1D GTATGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 1804 het 1804 ref 44 22 7 15 T 15 14 90181 CASAVA_Build 14 86383733 1I GGTAAGGGTA -/G GTGGGGGGTT 3070 het 3070 ref 50 21 19 10 G 1 2 90182 CASAVA_Build 14 86387408 1D TTTCTACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 9 A 11 10 90183 CASAVA_Build 14 86388594 1D TTGGTATTGG A/- GAGGTATAAT 3070 het 3070 ref 43 27 13 4 A 1 0 90184 CASAVA_Build 14 86400807 3I CTTTTGCTTA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 hom 92 het 36 0 30 6 T 9 12 90185 CASAVA_Build 14 86403604 4D TTAAGTTTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 43 1 32 10 T 15 11 90186 CASAVA_Build 14 86403940 2D TAAAGAATGT GA/-- GAGATTGTAA 3070 hom 69 het 26 0 24 5 GA 3 2 90187 CASAVA_Build 14 86404117 4D ATATATACAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 41 het 21 0 16 6 AT 8 6 90188 CASAVA_Build 14 86410300 1D GCACAGAGTT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 8 7 90189 CASAVA_Build 14 86410555 2D AGGTAAAGCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2193 hom 34 12 16 6 T 13 11 90190 CASAVA_Build 14 86414441 1I TATTATTTAC -/T TTTTTTATTA 2394 het 2394 ref 11 6 5 0 T 6 7 90191 CASAVA_Build 14 86416323 1D TAGTTTGGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2071 hom 17 7 8 2 T 10 9 90192 CASAVA_Build 14 86420885 2I TATCACACAC --/AT ATATACACAT 3070 het 3070 hom 86 37 40 9 AT 2 3 90193 CASAVA_Build 14 86425546 4I TTTAAAAATA ----/AATT AATTAATTAA 3070 het 2615 hom 29 10 13 6 AATT 2 3 90194 CASAVA_Build 14 86434708 1D ATTACCTTTT C/- TTTTTACAAC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 C 1 0 90195 CASAVA_Build 14 86442087 2I ACGCTGTCAC --/CT CTCGTCTCTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CT 1 2 90196 CASAVA_Build 14 86442735 10D ATTAACATTT CTAAATGATG/---------- CTTTGAATTA 3070 het 3070 ref 45 28 17 2 CTAAATGATG 1 0 90197 CASAVA_Build 14 86444204 4D TACCATTATG AAGA/---- AAGAGAGTAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 4 AAGA 2 1 90198 CASAVA_Build 14 86444519 6I GTAATACCTT ------/AGACAG AGTGTCTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGACAG 0 1 90199 CASAVA_Build 14 86445948 4D AAGCTCCAGG GTAA/---- GTGTTTGCGC 3070 het 3070 hom 53 26 24 6 GTAA 1 0 90200 CASAVA_Build 14 86455443 4I TTGGATTTTA ----/TTGT TTGTTTGGTT 3070 hom 141 het 58 0 48 10 TTGT 1 2 90201 CASAVA_Build 14 86456565 1D TTGAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 9 T 15 14 90202 CASAVA_Build 14 86456938 1I TCTAATTGGA -/T TTTTTTATTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 6 7 90203 CASAVA_Build 14 86458127 2I30M1D GCATTTCTAA --TTGTTTCTCATATATTCTTTGCTAATATGTA/TTTTGTTTCTCATATATTCTTTGCTAATATGT- AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 39 23 20 2 N/A 0 0 90204 CASAVA_Build 14 86458411 4D TTTCTGTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 41 14 14 13 TTTC 5 4 90205 CASAVA_Build 14 86459950 2D GTATTTGGTA AC/-- ACAAATTCTC 3070 het 3070 hom 40 21 15 5 AC 2 1 90206 CASAVA_Build 14 86460947 2D ATTTTGAATG TT/-- TTCTATAGTG 3070 hom 99 het 39 0 34 6 T 4 2 90207 CASAVA_Build 14 86461575 1D CTCAGTATAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 9 8 90208 CASAVA_Build 14 86464119 1I TGGAAAGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 9 10 90209 CASAVA_Build 14 86466256 2I CTATCCTGTC --/TA TGTTAACTTT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 TA 0 1 90210 CASAVA_Build 14 86468278 3I TGTATAAAGT ---/AAA AAAGTTACAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 3 6 90211 CASAVA_Build 14 86468440 9I AGCAACTTCC ---------/AGTCCTACA AGCTCCATTT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 AGTCCTACA 0 1 90212 CASAVA_Build 14 86472331 4I TTGGATACAT ----/GTTG GTTGATTTCC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 GTTG 1 2 90213 CASAVA_Build 14 86480428 1D GTCAGATCAC T/- GGTATTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 T 1 0 90214 CASAVA_Build 14 86485247 1D CACAGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 2679 het 977 hom 8 2 6 0 C 4 3 90215 CASAVA_Build 14 86492306 1D AGATGAACAG A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 115 het 50 0 38 12 A 8 7 90216 CASAVA_Build 14 86497058 1D TCTCCACATA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 T 8 7 90217 CASAVA_Build 14 86499571 1I AAATGGGTTA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 6 7 90218 CASAVA_Build 14 86499657 4I CTGCACTGAA ----/TTTG TTTAACAGTT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 TTTG 0 1 90219 CASAVA_Build 14 86515092 1D AAAACCCTAG A/- AAAAAACCTA 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 A 7 6 90220 CASAVA_Build 14 86530505 1D AGACATACGT G/- TGGTAAACAA 3070 het 3070 hom 41 17 19 6 G 1 0 90221 CASAVA_Build 14 86540739 1I TCTCCTTCAG -/T ATTTCTATTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 0 1 90222 CASAVA_Build 14 86576055 1I CTATTGAAAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 7 8 90223 CASAVA_Build 14 86589690 1D16M1I ATGTGTGTAT GTATATGTGTATATATA-/-TATATATACACATATAC ACACACACAT 3070 het 3070 hom 27 13 14 3 N/A 0 0 90224 CASAVA_Build 14 86590815 1I AATAAAAAAA -/G ATTCAACGAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 0 1 90225 CASAVA_Build 14 86593696 2D TAAAACACAG TT/-- TATGGGAAAG 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 T 3 1 90226 CASAVA_Build 14 86604934 1D TACAAAAAAA T/- ATGCTGATGT 3070 het 3070 ref 42 20 19 5 T 1 0 90227 CASAVA_Build 14 86605507 2D GTCAAGGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 34 1 17 16 T 18 16 90228 CASAVA_Build 14 86608604 1D AAACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 1415 het 1415 ref 21 16 3 2 A 13 12 90229 CASAVA_Build 14 86624720 7D GTGGGGGTGG GGGAAGT/------- GGGAAGTGGG 953 hom 5 het 4 0 2 2 GGGAAGT 2 1 90230 CASAVA_Build 14 86628702 5D TTGATTTGGT CAAAC/----- CAATAAATGT 3070 het 3070 ref 53 26 20 9 CAAAC 1 0 90231 CASAVA_Build 14 86666344 1D TATAAATGTC T/- TTTTTCCCAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 6 5 90232 CASAVA_Build 14 86671396 2D GTGAAATTCA TC/-- TATGTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 TC 1 0 90233 CASAVA_Build 14 86702260 2D ATAAAATTAG TA/-- TAGGTGATAT 3070 hom 135 het 50 0 46 6 TA 2 1 90234 CASAVA_Build 14 86703415 1I CGTCTCTACT -/A AAAAATACAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 5 6 90235 CASAVA_Build 14 86707977 5D GAAGAGCTCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1699 het 32 hom 27 1 7 19 T 23 18 90236 CASAVA_Build 14 86734729 1D CACAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 A 11 10 90237 CASAVA_Build 14 86749828 1I ATTAGGTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 55 het 35 1 29 5 T 9 10 90238 CASAVA_Build 14 86779136 1I ATGTTACGTA -/T TATCATATGT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 1 2 90239 CASAVA_Build 14 86780908 1D GTTAAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 11 10 90240 CASAVA_Build 14 86782693 3D TATCGTCACT TTA/--- TTGTTTTCTT 3070 hom 70 het 29 0 25 5 TTA 1 0 90241 CASAVA_Build 14 86784534 1I TCCATATGAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 7 8 90242 CASAVA_Build 14 86784652 4I GAAGACTATC ----/TTTA TTGCTTAGGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTTA 0 1 90243 CASAVA_Build 14 86785639 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 13 1 A 13 14 90244 CASAVA_Build 14 86786354 1D AATCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2971 het 980 hom 20 4 7 9 A 17 16 90245 CASAVA_Build 14 86789671 1D GACAAGGCTT A/- AAAAAATCAG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 7 6 90246 CASAVA_Build 14 86804280 1I TATGGAAGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 9 10 90247 CASAVA_Build 14 86811142 3I AAGCCATTTT ---/TTA TTATTATTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTA 3 4 90248 CASAVA_Build 14 86814377 1D GTAATTATTA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 7 90249 CASAVA_Build 14 86828608 1D ATCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 45 0 36 9 T 12 11 90250 CASAVA_Build 14 86830873 1D AATTGGTAAA G/- GAAGGAAGGA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 G 2 1 90251 CASAVA_Build 14 86842248 3I ACGTGAAAAA ---/AAG AAGTTAAATC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 AAG 1 2 90252 CASAVA_Build 14 86847619 1I TACTCCCTAG -/A ATACATATTT 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 A 1 2 90253 CASAVA_Build 14 86863862 3D AAATTTAAAT AAC/--- AACATGAGTG 3070 het 3070 hom 33 12 21 0 AAC 2 1 90254 CASAVA_Build 14 86866607 4D CCAAAGTAAT AAAG/---- AAAGAAGCAA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 AAAG 2 1 90255 CASAVA_Build 14 86869704 3I CAAGACTGAT ---/AAG AATAGCACCT 3070 het 3070 hom 56 24 25 7 AAG 0 1 90256 CASAVA_Build 14 86878620 26I GACATAGGGG --------------------------/GAAGATGCTGTGAAAAGAGAGTGGGA GAAGATGGCC 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 GAAGATGCTGTGAAAAGAGAGTGGGA 0 1 90257 CASAVA_Build 14 86879581 3I TGTCTGACAG ---/TGA TGATATGCAG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 TGA 1 2 90258 CASAVA_Build 14 86880685 4I TTTCTTTCCT ----/TTTC TTTCTTTTTT 2149 het 1058 hom 18 5 9 4 TTTC 1 2 90259 CASAVA_Build 14 86885775 1I TAAACCCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 10 11 90260 CASAVA_Build 14 86888287 1I TAGAAAAGGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 T 8 9 90261 CASAVA_Build 14 86896879 13I CCTCAGTTGG -------------/AAATGCAGAAATC ACCCGTCTTC 3070 het 1677 hom 25 6 11 8 AAATGCAGAAATC 0 1 90262 CASAVA_Build 14 86903921 1I TAACTATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 24 1 21 2 A 11 12 90263 CASAVA_Build 14 86917904 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 12 11 A 11 12 90264 CASAVA_Build 14 86927637 3D ACTCACTCAA TAC/--- TTACTCAATT 3070 het 3070 hom 45 12 28 6 TAC 1 0 90265 CASAVA_Build 14 86930359 1D GGCTATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 11 10 90266 CASAVA_Build 14 86930939 1I GATTTTTTTT -/C TCCACCAAAC 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 C 0 1 90267 CASAVA_Build 14 86932687 1D TTCTTGTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 6 A 12 11 90268 CASAVA_Build 14 86933285 1D AATCAGCTTT C/- CTCATACTGC 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 C 2 1 90269 CASAVA_Build 14 86934009 4I CAGTGTTAGC ----/ATTA ATTAATATTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 ATTA 1 2 90270 CASAVA_Build 14 86936242 3D CATAAATACA TAT/--- TATTTATATA 1275 het 996 hom 5 2 3 1 TAT 2 1 90271 CASAVA_Build 14 86944072 1D AAACTACCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 11 10 90272 CASAVA_Build 14 87074474 3I AGAATTATAA ---/AAT AATAATATTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAT 2 3 90273 CASAVA_Build 14 87085411 1D ATTAGAGCTT G/- GTACTTTACA 3070 hom 134 het 48 0 42 6 G 2 1 90274 CASAVA_Build 14 87110797 1I AATAAAGATT -/A ATGGTTGTGA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 1 2 90275 CASAVA_Build 14 87114059 4D GCACAGGCCA AAGT/---- AAGTCACATG 3070 het 3070 ref 60 30 23 9 AAGT 2 1 90276 CASAVA_Build 14 87151176 3D GGTATTTCTG TCT/--- TCTTTAGGTT 3070 hom 63 het 29 0 22 8 TCT 2 1 90277 CASAVA_Build 14 87219777 1D31M1I AAGTTATCTT GAAAAGTCTCCCATTGCTAATCTGAGACATTT-/-AAATGTCTCAGATTAGCAATGGGAGACTTTTC TAGATTAAAA 3070 het 3070 ref 36 22 19 0 N/A 0 0 90278 CASAVA_Build 14 87231241 1D TAATGAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 31 0 28 3 A 11 10 90279 CASAVA_Build 14 87236422 2I ACATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AC 6 7 90280 CASAVA_Build 14 87236536 2I ATACACACAC --/AT ATGTTTTACA 3070 hom 83 het 33 0 27 6 AT 1 2 90281 CASAVA_Build 14 87257529 1D TGCAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 601 hom 39 4 21 14 T 17 16 90282 CASAVA_Build 14 87258144 1D TTCTTTCTTT G/- TCTTGAAGAT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 G 1 0 90283 CASAVA_Build 14 87260069 4D ATAAAAAAGG AATT/---- AATTGAATCA 3070 het 3070 hom 38 19 19 1 AATT 2 1 90284 CASAVA_Build 14 87261523 2I CAAAGAGAAA --/AG AGAGGACTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AG 2 3 90285 CASAVA_Build 14 87271759 4I TCACATCCTT ----/TTTC TTTCTTTATT 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 TTTC 1 2 90286 CASAVA_Build 14 87277636 4D TTTGACTTCT CTCA/---- CTCCCTCTGT 1366 het 1366 ref 41 18 7 17 CTCA 1 0 90287 CASAVA_Build 14 87277654 1D CTCTGTGAAG A/- AAAAAAAAAA 1617 het 1617 ref 40 11 4 25 A 15 14 90288 CASAVA_Build 14 87278338 1I GAGAAAATAC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 7 8 90289 CASAVA_Build 14 87341554 2I AGAGGGTGTT --/AG ACGTGGAGAG 3070 hom 144 het 59 0 46 13 AG 0 1 90290 CASAVA_Build 14 87351107 2D GAGAAAATAA CT/-- CTGTGAGTAG 3070 hom 108 het 40 0 36 5 CT 2 1 90291 CASAVA_Build 14 87352406 1D CTGCCTGAGG C/- CCCCCCGGCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 7 6 90292 CASAVA_Build 14 87360247 1D CTTTTTAGCT A/- AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 7 6 90293 CASAVA_Build 14 87366239 1D AAGGTCTCTA C/- CTTTGCCCTC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 C 2 1 90294 CASAVA_Build 14 87403019 1D CTGAGTCCCT G/- GGAATGGTAT 3070 het 3070 ref 43 21 19 4 G 3 2 90295 CASAVA_Build 14 87410571 1I TCTACAAAAT -/G GGGGGTGGCA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 G 5 6 90296 CASAVA_Build 14 87410776 1D AATGGATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 41 0 29 12 T 14 13 90297 CASAVA_Build 14 87411424 1I GTTTTATCAG -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 T 7 8 90298 CASAVA_Build 14 87415996 1D TAAAAGAAAT G/- GGTATGGAGG 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 G 3 2 90299 CASAVA_Build 14 87419427 3D TCCCTCAAAC AAT/--- GAGTTCATCC 3070 het 3070 hom 40 15 22 5 AAT 1 0 90300 CASAVA_Build 14 87420299 1I AAAATAATAA -/T AAACAGCACT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 90301 CASAVA_Build 14 87425221 1I CTGGAACCCC -/G CCCCCTCCCC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 0 1 90302 CASAVA_Build 14 87427348 1I AGGAGAGACA -/G GGTTTCACCA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 2 3 90303 CASAVA_Build 14 87432294 1I GATTTAGATT -/A ACAGCCATTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 1 2 90304 CASAVA_Build 14 87435109 1D CTGCAAAGCC T/- TTTAAGGCTC 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 4 3 90305 CASAVA_Build 14 87437013 1I GGTGATGCGC -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 A 7 8 90306 CASAVA_Build 14 87445939 2I TATGGGAAGT --/AG AGTAAATTAG 3070 hom 202 het 72 0 68 4 AG 1 2 90307 CASAVA_Build 14 87450693 3D TAACATTCAA AGT/--- TAGAATTGAT 3070 het 3070 hom 21 7 13 2 AGT 1 0 90308 CASAVA_Build 14 87452633 1I GGCAGCAGTG -/A ACAGGGCAGG 2390 het 2390 ref 23 10 7 6 A 1 2 90309 CASAVA_Build 14 87453793 1D TTACCACAAC T/- TTTAAGTCCT 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 T 4 3 90310 CASAVA_Build 14 87455502 1I GTAGTCTCCA -/G CCCACACCCA 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 G 0 1 90311 CASAVA_Build 14 87455796 3I GCTCTCTGCT ---/CTC CTCTGTTCTA 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 CTC 1 2 90312 CASAVA_Build 14 87456461 1D TGTGCATCAA G/- GGGTATGTTA 3070 het 3070 hom 54 21 24 9 G 4 3 90313 CASAVA_Build 14 87457595 3D TTCCCAAGCA TTC/--- TTCTACCTTC 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 TTC 2 1 90314 CASAVA_Build 14 87458085 2I CCTGCACACA --/CT CTCTTCCCTG 3070 hom 87 het 41 0 28 13 CT 2 3 90315 CASAVA_Build 14 87465728 1D TAGACACAAT A/- AAAAATGATA 3070 hom 21 het 11 0 7 5 A 6 5 90316 CASAVA_Build 14 87468703 3I TTTTTTTTTT ---/AAA AAAAAAACAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 7 10 90317 CASAVA_Build 14 87469641 3D TCTAGCACTT ATC/--- TTCTTGTCTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ATC 1 0 90318 CASAVA_Build 14 87473388 3I ATATTCTAGT ---/AGA AGGAGATGGA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 AGA 0 1 90319 CASAVA_Build 14 87474025 1D CATTATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 12 11 90320 CASAVA_Build 14 87475449 1I CATTATACAC -/A AAAAATTTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 5 6 90321 CASAVA_Build 14 87478074 1D CAATGAAGGC A/- ATGCTAGGAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 2 1 90322 CASAVA_Build 14 87481077 1I TTCTGTAACT -/A AAAGAGGAAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 4 90323 CASAVA_Build 14 87481227 4I CACCTGGTAA ----/ATAG ATCTTTTAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATAG 0 1 90324 CASAVA_Build 14 87482610 1I AATATTTAAC -/T TTAGTTTTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 2 3 90325 CASAVA_Build 14 87482718 3I TGGTGCTGGC ---/AGA AGTTCTTCAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AGA 0 1 90326 CASAVA_Build 14 87483376 1I AAGCTCAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 9 10 90327 CASAVA_Build 14 87484783 1D AAATACCTGA C/- CGTTATATTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 2 1 90328 CASAVA_Build 14 87486849 1D TATGACTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 44 0 38 7 A 11 10 90329 CASAVA_Build 14 87491680 1I ATCCCTACCT -/A AAAAACCGTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 5 6 90330 CASAVA_Build 14 87509127 2I GAATTGTGTC --/AA GTTACTTATA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 0 2 90331 CASAVA_Build 14 87509477 6D GTAATTAAAT TATATA/------ TATAACTATT 3070 hom 105 het 36 0 36 2 TA 5 2 90332 CASAVA_Build 14 87517399 2I TTAGGGACTC --/AG GGGGAAAGGA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AG 0 1 90333 CASAVA_Build 14 87521041 2I CAAACTACTC --/CT TTGAGTTATG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CT 0 1 90334 CASAVA_Build 14 87531403 1D TGAGGTGTTA T/- CCAAGCTTGT 3070 hom 105 het 44 0 34 10 T 1 0 90335 CASAVA_Build 14 87535613 2D TTTCCTCTAC AT/-- CCTTGACAAA 3070 hom 114 het 45 0 39 7 AT 1 0 90336 CASAVA_Build 14 87537996 1I CATCCGTGAC -/T ACAAAGTGCC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 0 1 90337 CASAVA_Build 14 87540609 6I CTCAAAAAAA ------/AAAAAG AAAAGAAAAG 3070 hom 8 het 36 1 30 5 AAAAAG 0 1 90338 CASAVA_Build 14 87555893 1D CATCTACCAG A/- AAAAAAGGTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 6 90339 CASAVA_Build 14 87557678 2D TCTAGTGAGT GG/-- CTCTCCAAGA 3070 hom 129 het 50 0 44 7 G 2 0 90340 CASAVA_Build 14 87582236 1D AGTACAATAC A/- TTTGGGGATA 3070 hom 120 het 48 0 42 8 A 1 0 90341 CASAVA_Build 14 87582928 1I CCAAGAGCAA -/G TCCGGCTGAA 3070 hom 105 het 41 0 34 7 G 0 1 90342 CASAVA_Build 14 87584300 1I GCTTTTGTTT -/G GGGAAATGCT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 G 3 4 90343 CASAVA_Build 14 87587602 1I TATTCAATAG -/T TTTTTTAAGG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 7 90344 CASAVA_Build 14 87590815 1D ATCTTTTGTG T/- TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 4 3 90345 CASAVA_Build 14 87594627 2I AGATTCTGTT --/TA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TA 0 1 90346 CASAVA_Build 14 87596724 1D TCTAAGAAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 77 het 30 0 27 3 A 9 8 90347 CASAVA_Build 14 87598618 1I CAAATTTGGC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 7 8 90348 CASAVA_Build 14 87598782 1D TCAACAAGGG A/- AAAAAACAAC 3070 hom 117 het 44 0 40 5 A 7 6 90349 CASAVA_Build 14 87599421 1I AGCCAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 10 90350 CASAVA_Build 14 87606656 1D CAAAATAAAA G/- GTAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 G 2 1 90351 CASAVA_Build 14 87611475 1I GATTGAAGGC -/T TTATGTTCAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 90352 CASAVA_Build 14 87611832 1I GCACAGAAAA -/T TTTTAGGGTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 4 5 90353 CASAVA_Build 14 87623234 1D ATGCAGCAAT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 109 het 45 0 37 8 A 8 7 90354 CASAVA_Build 14 87625305 1D GTACTTGGGA G/- GCTGAGGCAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 2 1 90355 CASAVA_Build 14 87648431 1D TTGCATGTGA T/- TTTTTTTTTT 1207 het 1207 ref 42 33 3 7 T 11 10 90356 CASAVA_Build 14 87717627 1D CAGCTTAAAA T/- TTCTTTAACT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 T 3 2 90357 CASAVA_Build 14 87731124 1I CTAGGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2688 hom 25 7 13 5 A 13 14 90358 CASAVA_Build 14 87747625 1D TTTAACACAA T/- TAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 2 1 90359 CASAVA_Build 14 87748207 8D GATAGTGAGA ATATATAT/-------- ATATATATAT 549 het 549 ref 23 10 4 9 AT 11 7 90360 CASAVA_Build 14 87749881 1D GGAAAGAGCT A/- AAATGGCTCT 2616 het 2616 ref 24 14 7 4 A 4 3 90361 CASAVA_Build 14 87756702 1I CAACATGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 A 11 12 90362 CASAVA_Build 14 87760117 1D ATCTCCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2475 hom 31 8 15 8 A 15 14 90363 CASAVA_Build 14 87772414 1D ACCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 517 hom 31 4 21 6 A 13 12 90364 CASAVA_Build 14 87790974 4D CGCTTGAGAG AAGA/---- AAGACGGGTG 3070 het 3070 hom 43 22 19 5 AAGA 2 1 90365 CASAVA_Build 14 87791629 1I TGTCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 2971 het 9 hom 19 1 12 6 A 15 16 90366 CASAVA_Build 14 87797870 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 27 0 20 7 A 12 11 90367 CASAVA_Build 14 87806502 1D CTGTTTCCAT G/- GGACAGCCCT 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 G 3 2 90368 CASAVA_Build 14 87813311 1D ACTTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 A 12 11 90369 CASAVA_Build 14 87813695 2I ATATTCATAA --/CT CTGATTAGTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CT 1 2 90370 CASAVA_Build 14 87816028 3I TTTTGCTTCT ---/TCC TCCTCATTTT 3070 het 2320 hom 23 9 9 6 TCC 1 2 90371 CASAVA_Build 14 87829091 1D TGAATATCTG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 A 8 7 90372 CASAVA_Build 14 87832589 10D ATTAGGTATA CACACCGAGC/---------- CTAATCTCTC 3070 het 3070 ref 52 26 21 9 CACACCGAGC 1 0 90373 CASAVA_Build 14 87836952 2D TTTATTTATC AT/-- ATGTTTTAAA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 AT 2 1 90374 CASAVA_Build 14 87861777 9D ATTTTCCAAG CCTCCAGGC/--------- CCTCCTCCTT 3070 het 3070 ref 38 22 14 4 CCTCCAGGC 1 0 90375 CASAVA_Build 14 87870816 2D TTTAACAGGT TA/-- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 TA 1 0 90376 CASAVA_Build 14 87871551 1I CCTGCTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 11 12 90377 CASAVA_Build 14 87873363 1D TTCATTTACC T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 28 10 17 3 T 8 7 90378 CASAVA_Build 14 87874466 2I ACACAAAAAC --/AG AGAGAGTAAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AG 3 4 90379 CASAVA_Build 14 87876660 4I ATTTTTATTT ----/TTAA TTAAATTTAA 1545 het 1495 hom 8 3 4 1 TTAA 1 2 90380 CASAVA_Build 14 87877570 2I21M3D TTGGTAAGGC --TTTCAGTCAACAGTAGGCTATTAG/GATTTCAGTCAACAGTAGGCTAT--- TAGTTAAGTT 3070 het 3070 ref 34 21 12 4 N/A 0 0 90381 CASAVA_Build 14 87878045 14I CCAGCCCACT --------------/GACATATATTTTGA GACATATATT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 GACATATATTTTGA 1 2 90382 CASAVA_Build 14 87906059 1I AGTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 2246 het 2246 ref 19 10 6 3 G 0 1 90383 CASAVA_Build 14 87931604 2D GAATTTCTTA AT/-- ATGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 28 8 17 4 AT 2 1 90384 CASAVA_Build 14 87938435 6D CAAATAAAAC AATCTT/------ GAGCAAGAAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 AATCTT 1 0 90385 CASAVA_Build 14 87938531 1D TGGAACTGGC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 9 8 90386 CASAVA_Build 14 87940002 1I TTCTCACCAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 A 8 9 90387 CASAVA_Build 14 87953294 1D GTTTGTGAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 10 9 90388 CASAVA_Build 14 87953402 1D ATCTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 11 1 8 2 T 13 12 90389 CASAVA_Build 14 87975429 2I ACATTTAGTC --/AG AGACCTGTCT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AG 1 2 90390 CASAVA_Build 14 87988601 1I GATTATGTCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 T 8 9 90391 CASAVA_Build 14 87989595 1D AGTGAACTAA T/- TAGCTGTATG 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 T 2 1 90392 CASAVA_Build 14 87996494 1I TCTTGGAGGC -/T TTTGTTCATT 2388 het 2388 ref 11 6 5 0 T 3 4 90393 CASAVA_Build 14 87999954 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 9 8 90394 CASAVA_Build 14 88002865 3D TGGCCAGGGA ATT/--- ATTAAGGAGC 3070 hom 135 het 48 0 45 3 ATT 2 1 90395 CASAVA_Build 14 88007697 1D TTCTTCAAAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 56 het 24 0 20 4 A 8 7 90396 CASAVA_Build 14 88020145 1I TTCTAAGGTG -/T TTTTTTTTTT 2177 het 2177 ref 40 14 10 16 T 14 15 90397 CASAVA_Build 14 88020601 2D CTGGGAATTC TT/-- TGTCAGATAG 3070 het 3070 ref 41 23 16 4 T 3 1 90398 CASAVA_Build 14 88020975 2D8M1I CACATTGAGA CTCTGTCTCC-/--CTGTCTCCA AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 50 25 25 5 N/A 0 0 90399 CASAVA_Build 14 88023258 1I AAAGGCAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 T 9 10 90400 CASAVA_Build 14 88025915 2D CTGCTTACAG GT/-- CACTGACTTG 3070 het 3070 ref 43 28 11 5 GT 1 0 90401 CASAVA_Build 14 88028125 1I GTTAATTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 11 12 90402 CASAVA_Build 14 88035002 4D TCTCCATTAG ATTT/---- ATTTATTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 ATTT 3 2 90403 CASAVA_Build 14 88036248 1I GAAAGAGCCC -/T TTCAGGCTGG 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 2 3 90404 CASAVA_Build 14 88037913 1D CTGTCACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 11 10 90405 CASAVA_Build 14 88039836 1D ATCTCGACTT A/- AAGAGTATTT 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 A 3 2 90406 CASAVA_Build 14 88043146 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 8 14 9 A 10 11 90407 CASAVA_Build 14 88043885 2D AGCCCCTTAG AT/-- AACAGAATAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 5 AT 1 0 90408 CASAVA_Build 14 88044248 2D GTTGTGTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1104 hom 36 6 18 12 T 17 15 90409 CASAVA_Build 14 88046287 1D TGTCTTATAT A/- AAAAATCACA 3070 het 3070 hom 52 23 28 2 A 6 5 90410 CASAVA_Build 14 88047013 1I GACAGATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 17 8 T 15 16 90411 CASAVA_Build 14 88053750 24I CATATATATG ------------------------/TATATATACAGGTGTATATATACA TATATATACA 3070 hom 63 het 26 0 22 7 TATATATACAGGTGTATATATACA 0 1 90412 CASAVA_Build 14 88053851 1D TGTGTATATA C/- TAGTGTATAT 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 C 1 0 90413 CASAVA_Build 14 88055088 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 54 het 25 0 19 7 AC 10 9 90414 CASAVA_Build 14 88059046 1I GGTAAGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 34 0 23 11 T 11 12 90415 CASAVA_Build 14 88080081 2I ATACCACAGC --/AA AAACATGAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 3 5 90416 CASAVA_Build 14 88083395 1D CCATAATAGG A/- AAAAAAAAAA 1986 het 164 hom 22 2 7 13 A 15 14 90417 CASAVA_Build 14 88107236 2I GATTCATAAC --/AT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 AT 0 1 90418 CASAVA_Build 14 88116651 4I TAAAAGTCTA ----/AAAG AAAGGGCTCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAAG 1 2 90419 CASAVA_Build 14 88120164 1I ACCCTCTGCA -/G AAAAAGATGT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 0 1 90420 CASAVA_Build 14 88121478 1D CTTTCTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 24 0 12 12 T 15 14 90421 CASAVA_Build 14 88123265 1I CTTCAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 11 12 90422 CASAVA_Build 14 88127093 1I TCATCTGCTG -/C CACCTTGTAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 C 1 2 90423 CASAVA_Build 14 88128286 4D TTCCTTGAGG TTGT/---- TTATCTGTCC 3070 hom 129 het 45 0 42 4 TTGT 1 0 90424 CASAVA_Build 14 88129992 1D AGATACTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 33 1 25 7 A 12 11 90425 CASAVA_Build 14 88147338 13I TCCTCCCACC -------------/TCAGCCTCCCACT TGTAGCTGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TCAGCCTCCCACT 0 1 90426 CASAVA_Build 14 88152150 1I GACTAGCTGA -/T TTTCATAAAC 3070 het 3070 ref 52 28 20 4 T 3 4 90427 CASAVA_Build 14 88154109 1I TGATTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 28 1 22 5 A 10 11 90428 CASAVA_Build 14 88157032 1I TTCTGCATTT -/A AAAAAAAAAA 2762 het 2762 ref 36 12 11 13 A 17 18 90429 CASAVA_Build 14 88158903 1I AAGCAGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 10 11 90430 CASAVA_Build 14 88160956 3I ATATGAGGAG ---/GAA GAAGGTCGGA 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 GAA 1 2 90431 CASAVA_Build 14 88192844 4D TTGAAATGAG GACT/---- GACTATGCTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 7 GACT 2 1 90432 CASAVA_Build 14 88194174 3D TAAAAACAGT ACC/--- ACTACAATTA 3070 het 3070 hom 48 22 21 6 ACC 1 0 90433 CASAVA_Build 14 88210919 1D TAGATACAAT G/- GGGGTACAGG 3070 het 3070 ref 38 17 16 6 G 5 4 90434 CASAVA_Build 14 88220627 4I TTTTAGCATA ----/CATT CATTTTTATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CATT 1 2 90435 CASAVA_Build 14 88223780 1I ACTACCTGAT -/A GGATATGGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 1 90436 CASAVA_Build 14 88225419 2D TTCCGAAGTT TA/-- TATACCAATG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 TA 3 2 90437 CASAVA_Build 14 88231307 6D AATCATTTAC TATGAT/------ TATATTATTT 2853 het 2853 ref 22 15 6 2 TATGAT 1 0 90438 CASAVA_Build 14 88245256 1I TATGGGAATA -/T ATAAATATAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 0 1 90439 CASAVA_Build 14 88249489 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 42 1 34 8 A 12 11 90440 CASAVA_Build 14 88249717 1D AACCTGCTCA T/- TTTTTTTTTT 1500 het 1395 hom 37 12 6 19 T 17 16 90441 CASAVA_Build 14 88260667 1I ATGTATAACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 9 10 90442 CASAVA_Build 14 88264298 1I ATGTACAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 30 0 26 4 T 11 12 90443 CASAVA_Build 14 88264419 13D CTTGAATAAT GCACCAGTTAGAA/------------- GCACCAATTC 3070 het 3070 ref 37 26 16 5 GCACCAGTTAGAA 1 0 90444 CASAVA_Build 14 88265964 4I GGTCTTGTTT ----/TTTC TTTGTTTTTT 3070 hom 50 het 25 0 18 7 TTTC 0 1 90445 CASAVA_Build 14 88267422 1I CAGTGTTTGG -/T TTTTTGTCCT 2386 hom 12 het 5 0 5 0 T 5 6 90446 CASAVA_Build 14 88274515 1D TCCCCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 29 3 15 11 A 12 11 90447 CASAVA_Build 14 88287712 5D GTGATATTTA GAGTT/----- GAGAAGCCAG 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 GAGTT 1 0 90448 CASAVA_Build 14 88293544 1D CATTAGTGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 10 9 90449 CASAVA_Build 14 88296577 1D ATCTATATTA C/- TTTTCCACAA 3070 het 3070 hom 48 19 26 4 C 1 0 90450 CASAVA_Build 14 88301219 10D ATGCTGATGT CACAAATTAC/---------- CATAAATTTA 3070 het 3070 ref 58 31 24 4 CACAAATTAC 1 0 90451 CASAVA_Build 14 88303980 1D AACCTTATTC A/- AAAATTCACC 3070 hom 72 het 29 0 24 6 A 5 4 90452 CASAVA_Build 14 88304515 1I TGTGATTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2396 hom 29 9 13 7 T 11 12 90453 CASAVA_Build 14 88309917 1D TGGAGGTGAT A/- AAAAACTTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 6 5 90454 CASAVA_Build 14 88313345 1I AAGACTTTAC -/A AGTGGAAACC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 1 2 90455 CASAVA_Build 14 88315599 2D ATGAGTTGGT TC/-- TCTGTCATCT 3070 het 3070 hom 45 15 27 3 TC 2 1 90456 CASAVA_Build 14 88316479 3D AAGGGTAGAT TTG/--- TTTACTGTTC 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TTG 1 0 90457 CASAVA_Build 14 88324996 1D ATCTTTACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 24 0 15 9 A 15 14 90458 CASAVA_Build 14 88352659 4I ATCACCTGAG ----/GTCA GTCAGGAGTT 3070 hom 74 het 30 0 23 7 GTCA 1 2 90459 CASAVA_Build 14 88358462 2D TAAAAATAAC AT/-- ATTTTTATAT 3070 het 3070 hom 31 12 18 2 AT 2 1 90460 CASAVA_Build 14 88364296 2D TTAAAAATCA AT/-- TTTTAAAATG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AT 1 0 90461 CASAVA_Build 14 88375046 1D AGATATAAAA G/- TTTGCTAGAG 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 G 1 0 90462 CASAVA_Build 14 88379049 1D TATAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 11 10 90463 CASAVA_Build 14 88387906 11D CATTAGAGGC TCAGCATGGTG/----------- TCACCATTTC 3048 het 3048 ref 29 20 8 6 TCAGCATGGTG 1 0 90464 CASAVA_Build 14 88449258 1D TCCTGGCTCT A/- CAAAAAATAA 3070 het 3031 hom 28 8 15 5 A 1 0 90465 CASAVA_Build 14 88451979 5I ACCTCTTTAT -----/ATAAA GTCACTGATT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 ATAAA 0 1 90466 CASAVA_Build 14 88461740 1I TGACTTTGAA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 1 2 90467 CASAVA_Build 14 88473283 4D TTTGTCTTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 AAAC 5 4 90468 CASAVA_Build 14 88477303 3D CAATATTGCT AGG/--- AGAAGCTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 AGG 1 0 90469 CASAVA_Build 14 88508185 1I CTAGTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 T 11 12 90470 CASAVA_Build 14 88509523 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAATTAG 3070 het 2916 hom 18 7 10 1 A 6 7 90471 CASAVA_Build 14 88511878 2D TTTTTCTTTT TC/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 TC 1 0 90472 CASAVA_Build 14 88520170 1D GTTGGTGGGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 56 21 25 11 A 9 8 90473 CASAVA_Build 14 88525484 5D TCTCTCTCTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2214 het 916 hom 22 7 8 11 T 19 14 90474 CASAVA_Build 14 88530906 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 787 het 752 hom 13 6 2 5 A 15 14 90475 CASAVA_Build 14 88532804 1D CCAAGTCACC A/- CCCCCTCTCA 2656 het 2656 ref 39 20 10 9 A 1 0 90476 CASAVA_Build 14 88538296 6I TTATAATTAG ------/ACTCAA ACTCAAACTT 3070 het 3070 hom 45 19 16 10 ACTCAA 1 2 90477 CASAVA_Build 14 88548064 1I CAAGCAGATA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 6 7 90478 CASAVA_Build 14 88548915 1D AGAAGGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 16 20 12 T 11 10 90479 CASAVA_Build 14 88552733 1I TGAAATAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 10 11 90480 CASAVA_Build 14 88575139 23D TCTGTAGGCT CAGGCAGGAGGATCAATTAAGCC/----------------------- CAGGAGTTCG 3070 het 3070 ref 29 21 11 3 CAGGCAGGAGGATCAATTAAGCC 1 0 90481 CASAVA_Build 14 88580705 3I CCAGAAACAC ---/ATT ATATAGAAGT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 ATT 0 1 90482 CASAVA_Build 14 88584211 1I TTTTTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 2885 het 1944 hom 38 11 15 12 T 16 17 90483 CASAVA_Build 14 88584377 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 10 90484 CASAVA_Build 14 88586556 2D GAGAAAAGAA AT/-- ATAATAATAA 607 hom 4 het 23 0 3 21 AT 2 1 90485 CASAVA_Build 14 88595379 1D GTGCCCAGCC A/- AAAAAATCTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 6 90486 CASAVA_Build 14 88605226 2D CATAGTGAGA CT/-- CTATCTCTAC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 CT 2 1 90487 CASAVA_Build 14 88609777 1D AGAAACTCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1680 hom 15 6 8 1 A 10 9 90488 CASAVA_Build 14 88622562 1D TATAATCCAG A/- CCTGACTGAG 3070 hom 93 het 36 0 32 6 A 1 0 90489 CASAVA_Build 14 88625904 1I GATCTTGGAC -/T TTCCAGCCTC 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 T 2 3 90490 CASAVA_Build 14 88634392 1I AATAAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 11 12 90491 CASAVA_Build 14 88683980 1I TTGTGATGCC -/A TTACTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 A 0 1 90492 CASAVA_Build 14 88685577 3D GGATGGACAG GTT/--- GACTTCTTCA 3070 het 3070 hom 50 21 21 12 GTT 1 0 90493 CASAVA_Build 14 88691350 1I GAAAGTGATT -/C CAACAGTGGG 3070 hom 144 het 51 0 49 2 C 1 2 90494 CASAVA_Build 14 88707160 1I TGATTCTTTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 8 20 8 A 8 9 90495 CASAVA_Build 14 88712460 1I TCTGTGGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 A 9 10 90496 CASAVA_Build 14 88717013 18I51M6D GAGACAGAGG ------------------GCAGAGACAGAGAGAAACACACACACACACGTGCACATACACACACACACACACAGT/GCAGAGAACATGCATGGAGCAGAGACAGAGAGAAACACACACACACACGTGCACATACACACACACACA------ CACACAGACA 3070 het 3070 hom 43 22 31 22 N/A 0 0 90497 CASAVA_Build 14 88719792 1I ATGTGCTCAA -/G GAACTAAAAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 1 2 90498 CASAVA_Build 14 88730815 3I TGCTCACTGT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 A 11 14 90499 CASAVA_Build 14 88733601 1I AGACTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2289 hom 31 10 10 11 A 13 14 90500 CASAVA_Build 14 88749917 1D GAAGGCATAC A/- AATATCAAAA 3070 het 3070 hom 36 9 19 8 A 3 2 90501 CASAVA_Build 14 88750270 7I GGCAGGTTTC -------/TTAGCAT GGATGGCCAC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 TTAGCAT 0 1 90502 CASAVA_Build 14 88751297 1I AGGAACCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 805 hom 32 3 23 6 T 13 14 90503 CASAVA_Build 14 88759982 1I AAACAAGACA -/T TCAATGCAGA 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 T 1 2 90504 CASAVA_Build 14 88773234 1I CATTTCAGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 9 10 90505 CASAVA_Build 14 88773624 1I ATCTTGACTA -/T TATCAATGTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 1 2 90506 CASAVA_Build 14 88781574 1D GGCATTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2797 hom 27 10 10 7 A 12 11 90507 CASAVA_Build 14 88798837 1I ATGATGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 9 10 90508 CASAVA_Build 14 88818372 1D TTAATGAACC T/- TTTGTTTTAT 3070 het 488 hom 55 5 28 22 T 4 3 90509 CASAVA_Build 14 88823723 5I AACTGCACTT -----/TTCTC TTCCTTTTTT 3070 hom 80 het 31 0 25 6 TTCTC 0 1 90510 CASAVA_Build 14 88824158 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 28 het 13 0 10 4 A 9 8 90511 CASAVA_Build 14 88824646 5D ACATTATACG AACAA/----- AACTTTTATA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AACAA 1 0 90512 CASAVA_Build 14 88825302 10D AAAGAAAAGA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 7 AAAAG 3 1 90513 CASAVA_Build 14 88833226 2D TAAAACTAAC AA/-- GAGGAAAGGC 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 A 2 0 90514 CASAVA_Build 14 88839607 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 903 hom 36 7 27 2 A 10 11 90515 CASAVA_Build 14 88842432 2D CAGACGCATG CA/-- CACACACACA 1575 het 1575 ref 37 14 6 17 CA 10 9 90516 CASAVA_Build 14 88849694 4I GAAGTCCATG ----/TATA TATACTACTG 3070 hom 87 het 38 0 30 10 TA 2 4 90517 CASAVA_Build 14 88849775 1D ATGTGAAAAG A/- TATTCCAATA 3070 het 3070 hom 54 23 24 8 A 1 0 90518 CASAVA_Build 14 88850534 1D TTGTTTTGTC A/- GCTTCATTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 1 0 90519 CASAVA_Build 14 88852470 6D CAAACAATGA TTCTTC/------ TTCTTCTTCT 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 TTC 5 3 90520 CASAVA_Build 14 88857890 1D TCTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2958 hom 21 8 11 2 T 12 11 90521 CASAVA_Build 14 88863166 6D GTCCAATTCT GAAAGA/------ GAAAAAGCAC 3070 het 3070 ref 43 20 15 9 GAAAGA 1 0 90522 CASAVA_Build 14 88867584 1D TGAGTGTTGC T/- TTTTAAACAG 3070 het 3070 hom 47 23 21 4 T 5 4 90523 CASAVA_Build 14 88869370 1I ATAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2415 het 742 hom 12 3 6 3 A 9 10 90524 CASAVA_Build 14 88880365 1D CTCATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 10 12 A 15 14 90525 CASAVA_Build 14 88884050 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 8 9 90526 CASAVA_Build 14 88889995 1I CCTGGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 11 12 90527 CASAVA_Build 14 88896448 4D AGAAAGAGAA AGGG/---- AGGGAGGGAG 997 hom 10 het 10 0 3 7 AGGG 5 4 90528 CASAVA_Build 14 88899609 2D GTGTTACTGG AT/-- GGACAAACCA 3070 hom 196 het 69 0 66 6 AT 1 0 90529 CASAVA_Build 14 88900360 1I ATTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 37 0 28 9 A 10 11 90530 CASAVA_Build 14 88903941 1D GCCCCAGAAA C/- CCTCCCCTCG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 C 3 2 90531 CASAVA_Build 14 88905644 1D GACTGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 14 13 90532 CASAVA_Build 14 88906181 2I GTGCACACAC --/AT GTTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 AT 0 1 90533 CASAVA_Build 14 88907097 2D TTCAGCACCA CT/-- GTCTTTCCCT 3070 het 3070 hom 51 19 25 8 CT 1 0 90534 CASAVA_Build 14 88909421 3I ACAGCTTTCC ---/AAG AAGACCTGAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAG 1 2 90535 CASAVA_Build 14 88919895 1I TATGTATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 11 12 90536 CASAVA_Build 14 88920421 5I TGCAGATATA -----/GAAAC GAAACTAAGC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 GAAAC 1 2 90537 CASAVA_Build 14 88942499 2I CCTGTGTGAC --/AG AGAGACCCTG 1909 het 1909 ref 24 14 5 5 AG 2 3 90538 CASAVA_Build 14 88942874 2I AGGAAAGGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 15 13 A 10 12 90539 CASAVA_Build 14 88945449 1I CGGTGGGGGA -/G CGGGGGGGTC 2006 hom 33 het 22 0 8 14 G 0 1 90540 CASAVA_Build 14 88957626 3I CCCAGGGAAA ---/GAT TTTTTTTTTT 3057 hom 42 het 22 0 15 7 GAT 0 1 90541 CASAVA_Build 14 88962490 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 21 het 9 0 8 3 T 6 7 90542 CASAVA_Build 14 88972110 1I TTCTTTATTA -/T TTTTTTTTTT 2640 het 2640 ref 20 8 8 4 T 10 11 90543 CASAVA_Build 14 88980449 2I CTAGTATCTC --/AT ATATGTTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 AT 2 3 90544 CASAVA_Build 14 88980579 2I TTTCAAGAGG --/TA TATAGGTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 TA 2 3 90545 CASAVA_Build 14 88985042 2D ACACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 A 12 10 90546 CASAVA_Build 14 88999371 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2689 het 1909 hom 16 5 8 3 A 10 11 90547 CASAVA_Build 14 89001321 1D CATGTCTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 9 8 90548 CASAVA_Build 14 89013108 1I ATAAAATTTC -/A AAAAATAGTT 3070 hom 119 het 43 0 40 3 A 5 6 90549 CASAVA_Build 14 89017186 1I GTGGTTAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 919 hom 33 4 24 5 T 15 16 90550 CASAVA_Build 14 89032468 3I AAGGCTTTAG ---/GCT GAGTGCAGCA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 GCT 0 1 90551 CASAVA_Build 14 89034021 1I GTTTGTTTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 19 20 8 T 9 10 90552 CASAVA_Build 14 89052235 1D AGCATTATTG T/- TTGTGAGGCA 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 T 3 2 90553 CASAVA_Build 14 89055660 1I ATTTGGAGGA -/G GAGAGTCTGG 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 G 1 2 90554 CASAVA_Build 14 89059869 1D TTTCTTTATG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 9 8 90555 CASAVA_Build 14 89060602 1I AAAATTAGGG -/A AAAAAAATCA 1746 het 1746 ref 28 20 4 4 A 7 8 90556 CASAVA_Build 14 89061392 1D AAACCAAGAT G/- GCCACCAAAG 3070 het 3070 ref 26 18 8 0 G 2 1 90557 CASAVA_Build 14 89062107 1I AACTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 10 11 90558 CASAVA_Build 14 89062218 1I AGGAACTTTT -/A TCAACTTCAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 0 1 90559 CASAVA_Build 14 89071302 1I TTCTTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 10 10 T 13 14 90560 CASAVA_Build 14 89072881 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3010 het 2929 hom 18 9 8 1 A 11 10 90561 CASAVA_Build 14 89079147 2D AAAGACACTC TT/-- TGACTGAAGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 T 3 1 90562 CASAVA_Build 14 89091226 1D AATAATGTGG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 T 8 7 90563 CASAVA_Build 14 89102401 1D TTTAATCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 76 het 29 0 26 3 T 10 9 90564 CASAVA_Build 14 89116098 1D TTCTGAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 9 8 90565 CASAVA_Build 14 89117117 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 13 1 12 0 A 13 12 90566 CASAVA_Build 14 89117584 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 28 1 22 5 A 11 12 90567 CASAVA_Build 14 89126236 1D ATAGAGAACA T/- TTTTTTTTTA 1034 het 1034 ref 50 43 3 4 T 10 9 90568 CASAVA_Build 14 89143915 1D ACATGCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 12 11 90569 CASAVA_Build 14 89161104 2I TTATTGCCTC --/TT AGCGGTGACA 3070 hom 135 het 55 0 46 9 T 0 2 90570 CASAVA_Build 14 89165031 2D CAGGGAAAAC TT/-- TTTTTGCTAT 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 T 7 5 90571 CASAVA_Build 14 89167693 1D ATCTGGGGAG C/- TTTTTTTTAA 3070 het 3032 hom 28 8 16 4 C 1 0 90572 CASAVA_Build 14 89182662 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 17 1 13 4 A 16 15 90573 CASAVA_Build 14 89188739 2D AATGCAGTAC AG/-- AGTCTCCTGA 3070 het 3070 ref 47 27 13 7 AG 2 1 90574 CASAVA_Build 14 89193199 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1819 het 1819 ref 41 22 4 15 A 13 12 90575 CASAVA_Build 14 89195236 2D CGAGGTCTGT CC/-- AACAGCATTC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 2 0 90576 CASAVA_Build 14 89195998 1D TAACACTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 7 90577 CASAVA_Build 14 89196881 1I AAACCATGTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 739 hom 30 2 25 3 T 8 9 90578 CASAVA_Build 14 89202327 1I ATCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2844 het 386 hom 28 3 10 15 T 17 18 90579 CASAVA_Build 14 89222830 1D CAAAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 11 10 90580 CASAVA_Build 14 89225438 1D TAGGCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2552 hom 30 9 11 10 T 13 12 90581 CASAVA_Build 14 89228132 1D TTTGTTTTTT A/- GTAGAGACGG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 A 1 0 90582 CASAVA_Build 14 89241334 3I AGTCCTATAT ---/TAG TAGATCTTGT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TAG 1 2 90583 CASAVA_Build 14 89269699 1D TTAACATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 335 hom 26 1 18 7 T 13 12 90584 CASAVA_Build 14 89280602 1I AGGAAGCCTC -/T TTTCCCCAGC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 3 4 90585 CASAVA_Build 14 89288724 3I ATTCTGTGTA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 25 1 18 6 T 12 15 90586 CASAVA_Build 14 89295627 2D TTTAAAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 32 1 23 8 A 14 12 90587 CASAVA_Build 14 89300042 3I CTGTCCAGTC ---/CTT CTTCCTTCAT 3070 hom 122 het 43 0 40 3 CTT 1 2 90588 CASAVA_Build 14 89300512 12D TTCAGACCCC GGTGGGTGGGTT/------------ GGTGGGAGAG 3070 hom 111 het 41 0 37 6 GGTGGGTGGGTT 1 0 90589 CASAVA_Build 14 89301021 1D AATCAAAAAT A/- AAAACAGGCC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 A 5 4 90590 CASAVA_Build 14 89301328 4D ATAAAAATAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 65 het 24 0 22 3 AAAT 4 3 90591 CASAVA_Build 14 89303433 5I CCCAGAGATC -----/AGTTT ATTGGCCCAA 3070 hom 108 het 39 0 33 6 AGTTT 0 1 90592 CASAVA_Build 14 89304561 5D ACTAGTCACA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 26 12 T 17 12 90593 CASAVA_Build 14 89305141 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 1726 hom 13 het 8 0 5 3 T 10 9 90594 CASAVA_Build 14 89305280 3I CCCTGCCACT ---/AAA AAAAAAAAAA 2305 hom 25 het 15 0 11 4 A 11 14 90595 CASAVA_Build 14 89314773 1D TTCACTTCCT G/- CTTGGATGTC 3070 hom 113 het 41 0 34 7 G 1 0 90596 CASAVA_Build 14 89338305 1D CAAGTTACTT A/- AAAAAAAAAA 1657 het 1657 ref 30 20 6 4 A 17 16 90597 CASAVA_Build 14 89355555 3D CTCACTTTGT CAC/--- CTAGGCTGGA 3070 hom 75 het 27 0 25 3 CAC 1 0 90598 CASAVA_Build 14 89379462 4D TGCAAAACAA AAGT/---- AAGAAGAATA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AAGT 1 0 90599 CASAVA_Build 14 89390335 1D TACAAACACA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 77 het 32 0 25 8 T 8 7 90600 CASAVA_Build 14 89393609 1I CTGGTCTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 112 het 44 0 37 7 T 8 9 90601 CASAVA_Build 14 89401929 1I GCTCGGCTAA -/T TTTTGTATTT 3070 hom 54 het 20 0 17 3 T 4 5 90602 CASAVA_Build 14 89457982 5D AAATACAGAT TTCTC/----- TTATTTTATA 3070 het 3070 ref 26 14 11 3 TTCTC 1 0 90603 CASAVA_Build 14 89486710 3D ATGAAAATCA TTG/--- TTATCATTTT 2827 het 2827 ref 25 17 6 2 TTG 1 0 90604 CASAVA_Build 14 89509978 3I TCTTGCCAGC ---/TTA TTATAGATGG 3070 het 3070 hom 50 18 20 12 TTA 1 2 90605 CASAVA_Build 14 89515410 1D CATTTAACAA T/- TTTTTTTTTT 2314 het 2314 ref 35 19 6 10 T 15 14 90606 CASAVA_Build 14 89596155 4I CACTGTAAAA ----/TTCT TTCAACTTTT 3070 hom 120 het 49 0 41 8 TTCT 0 1 90607 CASAVA_Build 14 89605627 1I TTTGGAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 T 13 14 90608 CASAVA_Build 14 89605777 1I CAGAAAGAAT -/A AAAAATATCC 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 A 5 6 90609 CASAVA_Build 14 89614507 2I ACAGAGCAAG --/AC ACAGTCTCAA 3070 hom 52 het 20 0 17 3 AC 1 2 90610 CASAVA_Build 14 89615208 1D GGTGTAACCC T/- AGTGCTCAGG 3070 het 3070 hom 42 13 21 10 T 1 0 90611 CASAVA_Build 14 89635194 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1759 het 1759 ref 17 10 5 2 A 11 12 90612 CASAVA_Build 14 89641054 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTGTTTT 3070 het 1103 hom 17 3 13 1 T 6 5 90613 CASAVA_Build 14 89662629 3D GACTCTATTC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 54 14 23 18 TTG 7 6 90614 CASAVA_Build 14 89665844 1D GAAACTTAGA T/- AACTGAGACT 3070 het 3070 ref 50 28 16 7 T 1 0 90615 CASAVA_Build 14 89675571 1D TCGAGCATGC G/- GGGGCCCTGT 3070 hom 75 het 29 0 25 5 G 5 4 90616 CASAVA_Build 14 89683533 3I GGGATAGGAT ---/CTC CTTCTTTCTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTC 0 1 90617 CASAVA_Build 14 89706922 1D TCAGATATGC A/- TTTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 48 24 21 4 A 1 0 90618 CASAVA_Build 14 89708737 3I TGTTCTGGTG ---/TTA TTATATGAGT 3070 het 3070 ref 65 34 28 3 TTA 1 2 90619 CASAVA_Build 14 89734757 4I TAGAGACATT ----/TGAC TGGTAAAGGA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 TGAC 0 1 90620 CASAVA_Build 14 89751292 1D TGCTTAGAAA T/- TTTTTCCACC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 6 5 90621 CASAVA_Build 14 89752094 1D CCCACCCATG T/- CTGAAACTTA 3070 hom 91 het 37 0 33 4 T 1 0 90622 CASAVA_Build 14 89762203 1D CTGTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 834 hom 29 2 17 12 A 14 13 90623 CASAVA_Build 14 89765022 1D GGCCCCTCAA T/- CAATTTCCAG 3070 hom 63 het 25 0 19 8 T 1 0 90624 CASAVA_Build 14 89765261 1I ATTGATTCCA -/G GGGAACCAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 3 4 90625 CASAVA_Build 14 89796181 1I TTTCATGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 935 hom 31 2 23 6 T 9 10 90626 CASAVA_Build 14 89805477 1I ATTCCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 36 1 30 5 T 11 12 90627 CASAVA_Build 14 89807158 6I GATCTTAAAA ------/TTTTAT TTTTAAGATA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 TTTTAT 0 1 90628 CASAVA_Build 14 89809483 3I GGTGAAACCC ---/CAT CATCTTTACT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 CAT 1 2 90629 CASAVA_Build 14 89810078 3D AAGTTTACAA TCT/--- TCTTAATTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TCT 2 1 90630 CASAVA_Build 14 89810539 4D AGTTAGACAC AGAA/---- AGAAGAAAAC 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 AGAA 2 1 90631 CASAVA_Build 14 89810644 4I CTGCTAAAAG ----/TATT TATTATTCTC 3070 hom 92 het 34 0 29 5 TATT 1 2 90632 CASAVA_Build 14 89832886 1I TGAATGTCTT -/A AGAGTTGTGC 3070 hom 105 het 36 0 34 2 A 1 2 90633 CASAVA_Build 14 89835177 1D AGTCTCGCTC T/- TGTTGCCCAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 2 1 90634 CASAVA_Build 14 89835506 7I CGAGCATTAG -------/GTCTGCA GTGTGTGGTA 3070 hom 141 het 51 0 46 5 GTCTGCA 0 1 90635 CASAVA_Build 14 89846619 1D TTGACTGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 32 1 17 14 T 17 16 90636 CASAVA_Build 14 89866905 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2487 het 241 hom 21 3 7 11 A 17 16 90637 CASAVA_Build 14 89871234 1I TATTTGCCTA -/T TTTTTTCAAC 3070 het 370 hom 38 1 30 7 T 6 7 90638 CASAVA_Build 14 89871431 3D ACAACTCACT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 48 het 22 0 17 6 TTA 7 6 90639 CASAVA_Build 14 89877161 8D GATCGATATC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 22 1 14 7 T 20 12 90640 CASAVA_Build 14 89883621 1D ACAGCTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 27 0 16 11 T 13 12 90641 CASAVA_Build 14 89884815 4D AAGTGTAGGT TATA/---- TATAGTGAAC 3070 hom 126 het 44 0 43 2 TA 4 2 90642 CASAVA_Build 14 89889919 4I AAACTCCTAA ----/TTAG CTTCAAGTGA 3070 hom 41 het 19 0 14 5 TTAG 0 1 90643 CASAVA_Build 14 89890372 1I ACTGGAGGCC -/G GGCATGGTAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 2 3 90644 CASAVA_Build 14 89892058 4I ATTTTCAAAT ----/AGTC AGCACAGCAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AGTC 0 1 90645 CASAVA_Build 14 89904712 1D GCGGGCGGGG T/- GGGGGGGTGG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 1 0 90646 CASAVA_Build 14 89911603 1I AAAATCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 16 1 14 1 T 11 12 90647 CASAVA_Build 14 89917499 1D TAGATCTGAG T/- TTTGTCCATC 3070 hom 114 het 39 0 39 0 T 4 3 90648 CASAVA_Build 14 89922793 3D ATTCTTAACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 33 4 17 12 T 17 14 90649 CASAVA_Build 14 89922883 1D TCTGCCTTCC G/- GGTTCAAGTG 3070 hom 87 het 32 0 30 5 G 3 2 90650 CASAVA_Build 14 89927758 1D GTTTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1799 het 1799 ref 43 33 4 6 A 12 11 90651 CASAVA_Build 14 89941988 1D GCTCTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 34 0 25 9 A 11 10 90652 CASAVA_Build 14 89945852 1I GATTGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 24 1 18 5 T 10 11 90653 CASAVA_Build 14 89952057 2D CACCCAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 13 2 10 2 T 14 12 90654 CASAVA_Build 14 89959538 6I TGGGACTCGC ------/CAGGAG CAGGAGCGTA 3070 het 3061 hom 32 12 10 10 CAGGAG 1 2 90655 CASAVA_Build 14 89962028 1I CGCCTGTAGT -/C CCAGCTCCTC 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 C 2 3 90656 CASAVA_Build 14 89983231 1D AAGGTACTGC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 A 9 8 90657 CASAVA_Build 14 89988272 1D GAGAGGTGGT G/- GGCAGCTGGA 3070 hom 135 het 50 0 46 5 G 3 2 90658 CASAVA_Build 14 89997248 1D AGAGACATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 35 2 18 15 T 12 11 90659 CASAVA_Build 14 90006727 1I TTTATTAATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 90660 CASAVA_Build 14 90019976 1D CTTGGGCTCT G/- GGAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 G 3 2 90661 CASAVA_Build 14 90021523 2D AAAGATATAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2460 hom 15 6 9 0 TA 7 6 90662 CASAVA_Build 14 90035505 2I TTGGATGTGT --/TC TGTCTGAGGT 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 TC 0 1 90663 CASAVA_Build 14 90050984 4D TCCATCTCTT AAAA/---- AAGAAAATGA 3070 hom 27 het 11 0 10 2 A 6 2 90664 CASAVA_Build 14 90053505 1I CTCAGCATAC -/A GCAGGTGTGA 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 A 0 1 90665 CASAVA_Build 14 90056325 3I GGGTGTGTGT ---/GCA GGAGTGCATG 3070 het 3070 ref 59 26 27 6 GCA 0 1 90666 CASAVA_Build 14 90060987 2D CTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2655 het 470 hom 25 5 8 14 A 12 10 90667 CASAVA_Build 14 90073933 1D TTTCCTTCTA C/- CAGAAGGTAG 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 C 2 1 90668 CASAVA_Build 14 90095765 3D CTCACAACAC ACA/--- CGATTCTCAC 3070 het 3070 ref 47 18 18 13 ACA 1 0 90669 CASAVA_Build 14 90135244 1I TGTCTCAAAC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 2829 hom 22 7 12 3 A 7 8 90670 CASAVA_Build 14 90147032 1D CCAATGAATA C/- TTTCTGTGCA 3070 het 3070 hom 64 26 30 9 C 1 0 90671 CASAVA_Build 14 90173502 1D CAGAGAAAAA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 9 8 90672 CASAVA_Build 14 90176374 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 10 11 90673 CASAVA_Build 14 90183715 2I GATAACTGTC --/AT GTGTAAGAGT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 AT 0 1 90674 CASAVA_Build 14 90188578 1I GTTTGACATG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 596 hom 27 3 17 7 T 8 9 90675 CASAVA_Build 14 90205262 1D TTCCACATGC A/- AAAGAATGGA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 A 4 3 90676 CASAVA_Build 14 90211162 8I4M5D GGGTGATGAC --------CACCCCCTA/CGGTGGTTCACC----- GAACGTTCAC 3070 hom 75 het 27 0 26 5 N/A 0 0 90677 CASAVA_Build 14 90212335 10I TCAGTTGGTG ----------/GAAATTAACT GAAAGAGAAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 GAAATTAACT 0 1 90678 CASAVA_Build 14 90217989 2D TGTGTGTGTG TA/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 123 het 51 0 40 13 TA 1 0 90679 CASAVA_Build 14 90236161 3D TTCTTTTCTC CTT/--- CTTTCTCACT 3070 hom 129 het 50 0 42 10 CTT 2 1 90680 CASAVA_Build 14 90237787 10D CAAAAGAAAC GTATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GTATATATAT 1 0 90681 CASAVA_Build 14 90247027 4I CTCTGAGGTA ----/TGGC GGTATTCAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TGGC 0 1 90682 CASAVA_Build 14 90250555 1D GCTGTATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 17 16 90683 CASAVA_Build 14 90266042 1I TCTTTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 399 hom 30 2 23 5 A 9 10 90684 CASAVA_Build 14 90279880 1D TTATGGACGG A/- AAAAATCGAG 3070 hom 102 het 40 0 33 9 A 6 5 90685 CASAVA_Build 14 90282085 1I CAGGTGTGAG -/C CCACTGTGCC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 2 3 90686 CASAVA_Build 14 90291757 1D CCCTGTCACT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 7 90687 CASAVA_Build 14 90292482 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 823 het 67 hom 17 1 7 9 T 12 11 90688 CASAVA_Build 14 90292942 1D GCTTGCTTCC A/- AAAAGAGAAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 5 4 90689 CASAVA_Build 14 90324184 1D ATCACTTGAA C/- CCAGGAGTGG 3070 hom 108 het 41 0 32 10 C 3 2 90690 CASAVA_Build 14 90324668 1D ATGTGCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 24 1 13 10 A 11 10 90691 CASAVA_Build 14 90324878 1D TGGCAAACAT G/- GTGAAACTCT 3070 hom 9 het 20 1 15 4 G 2 1 90692 CASAVA_Build 14 90325748 1D ATCCCAGCAC T/- TTTAGGAGGC 2479 hom 24 het 10 0 9 1 T 4 3 90693 CASAVA_Build 14 90337189 1I AGGCTTTGTG -/T GTGGACGCCT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 0 1 90694 CASAVA_Build 14 90338555 19D GAGGGCTCCA AGCAGTGACAGAGGGCGCC/------------------- AGCAGTGACA 3070 hom 72 het 26 0 24 10 AGCAGTGACAGAGGGCGCC 1 0 90695 CASAVA_Build 14 90343010 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAGAGTG 3070 hom 90 het 32 0 29 3 A 5 6 90696 CASAVA_Build 14 90382130 1D CTAGATTCAT G/- GCTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 G 2 1 90697 CASAVA_Build 14 90431250 20D TGCCCATGTG AGGCCTGGCACACCCATCCA/-------------------- AGGCCTGGCA 3070 hom 75 het 35 0 21 15 AGGCCTGGCACACCCATCCA 2 1 90698 CASAVA_Build 14 90440047 1I CTACCATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 18 0 13 5 T 15 16 90699 CASAVA_Build 14 90453831 3I AAATCATTCC ---/TTT TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 8 11 90700 CASAVA_Build 14 90479369 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 11 12 90701 CASAVA_Build 14 90482401 1D TGCCCCTCAA C/- CCCCCCATTA 3070 hom 111 het 43 0 36 8 C 7 6 90702 CASAVA_Build 14 90485845 1D GCTTCAGTTC T/- TTATAAAGCA 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 3 2 90703 CASAVA_Build 14 90491734 4I AATGTTTTAA ----/GATT AATTAATTTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 GATT 0 1 90704 CASAVA_Build 14 90498407 1D CTTGGCACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 12 11 90705 CASAVA_Build 14 90504662 1I ACCTCCATGA -/T TAACACCATA 3070 het 3070 hom 61 27 26 8 T 1 2 90706 CASAVA_Build 14 90507009 1I TTGTTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 894 hom 33 3 26 4 A 11 12 90707 CASAVA_Build 14 90542049 1I TGCATGCCTA -/G GATCAGACTG 3070 hom 148 het 54 0 50 4 G 1 2 90708 CASAVA_Build 14 90543807 1I TACTATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 11 12 90709 CASAVA_Build 14 90556288 2D GTTTATGTGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 80 het 42 0 27 16 GT 9 8 90710 CASAVA_Build 14 90556844 12D TATAAAATCC AGTATATAATCA/------------ AGTATATAAT 3070 hom 54 het 24 0 19 7 AGTATATAATCA 2 1 90711 CASAVA_Build 14 90559767 1I AAGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 88 hom 30 1 23 6 A 9 10 90712 CASAVA_Build 14 90559866 5D CCGTTTATAA TTTAT/----- TTTATCTTTT 3070 hom 96 het 35 0 32 6 TTTAT 2 1 90713 CASAVA_Build 14 90568885 1D GAATTCATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 44 1 37 6 A 11 10 90714 CASAVA_Build 14 90571023 1I CACAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 10 11 90715 CASAVA_Build 14 90572196 1I AATAGACTGT -/G GGGGGGTGCA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 6 7 90716 CASAVA_Build 14 90578876 1I CCCCTTCTCA -/G GGACCATGAC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 G 2 3 90717 CASAVA_Build 14 90586461 1I GGGCAACAGA -/G GAAGACCTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 2 90718 CASAVA_Build 14 90587727 1D TGGGATTACA G/- GTGCCCGCCA 3070 hom 36 het 14 0 12 5 G 2 1 90719 CASAVA_Build 14 90603336 1I AAAGGGAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 10 11 A 11 12 90720 CASAVA_Build 14 90635626 1D ACCCAATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 38 2 15 21 A 17 16 90721 CASAVA_Build 14 90654575 1D TTTACAGATA C/- AAAAAGCAGT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 C 1 0 90722 CASAVA_Build 14 90662502 5I TGTCTGTGCC -----/TTCTT TTCTTATAAT 3070 hom 64 het 27 0 22 5 TTCTT 1 2 90723 CASAVA_Build 14 90662803 4D ACACACAAAA AAAT/---- ATGTTACTGG 3070 hom 105 het 36 0 33 6 AAAT 1 0 90724 CASAVA_Build 14 90667483 1D AGATATTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 304 hom 42 2 32 8 T 10 9 90725 CASAVA_Build 14 90704436 1I TGATCTCAAG -/A CCCATGGTGA 3070 hom 21 het 11 0 8 3 A 0 1 90726 CASAVA_Build 14 90718393 3D TGGCTTTTTC TTG/--- TTGTTCTAAA 3070 het 3070 ref 44 20 20 5 TTG 2 1 90727 CASAVA_Build 14 90721803 1I AGCTCAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 593 hom 35 3 18 14 A 13 14 90728 CASAVA_Build 14 90722993 1I GGATGAGGCC -/A AGGTCACACA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 1 2 90729 CASAVA_Build 14 90723104 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 243 hom 36 1 27 8 T 11 10 90730 CASAVA_Build 14 90730642 1I TGAGGGATCC -/T TTTTTTTTTT 1582 het 1582 ref 30 12 8 10 T 15 16 90731 CASAVA_Build 14 90740111 1D GGTAGAGGTA T/- CTGCTAGTTA 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 T 1 0 90732 CASAVA_Build 14 90743845 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTCTTTT 22 het 22 ref 25 4 2 19 T 6 5 90733 CASAVA_Build 14 90750136 2D TTTGTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 33 0 26 7 T 12 10 90734 CASAVA_Build 14 90752322 1I TCAGACCGCA -/G GGCCCACAAG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 G 2 3 90735 CASAVA_Build 14 90783993 1I GGATTGCTTG -/A ACTCAGGGTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 1 2 90736 CASAVA_Build 14 90799112 1I GCGGGGAGTA -/G GAACTGGGGT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 G 1 2 90737 CASAVA_Build 14 90805197 2D AAAAGTGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 1796 hom 18 5 10 3 CT 2 1 90738 CASAVA_Build 14 90821542 1D TCCTGAGGCT C/- CCCCTAAAAC 3070 hom 74 het 30 0 24 6 C 5 4 90739 CASAVA_Build 14 90828476 2D AATAATCCCC CT/-- GAGTGCTCCT 2981 het 2981 ref 27 12 8 8 CT 1 0 90740 CASAVA_Build 14 90833725 1D CTCTCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2349 hom 37 11 12 15 T 12 11 90741 CASAVA_Build 14 90867648 4D CGAGAGAGAG GAGA/---- GAGAAAGACA 3070 het 3070 ref 37 14 15 10 GA 4 2 90742 CASAVA_Build 14 90886844 1D GCCAGGCTCA G/- GGTTTAACCC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 G 3 2 90743 CASAVA_Build 14 90912251 1D CCCGCTGCTG C/- CCCCCAGGAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 6 5 90744 CASAVA_Build 14 90914737 2D CATTCCCATG CT/-- CTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 52 23 27 4 CT 2 1 90745 CASAVA_Build 14 90916647 4I GATTGGCTCC ----/ATCT ATCTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 ATCT 1 2 90746 CASAVA_Build 14 90917931 3I GAAAAACAAA ---/AAC AACAACAAAA 3070 het 2767 hom 23 9 10 4 AAC 2 3 90747 CASAVA_Build 14 90948538 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2126 het 1349 hom 18 6 9 3 T 13 12 90748 CASAVA_Build 14 90951474 1D TGTGAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 12 11 90749 CASAVA_Build 14 90959962 3I3M3I TCTAGCGTGA ---TCT---/GACTCTTGC CAGCTTGCTG 1166 het 1166 ref 16 9 3 4 N/A 0 0 90750 CASAVA_Build 14 90964932 1D GTCAGTGGAT C/- CAGCCACAAG 3070 het 3070 hom 32 8 14 11 C 2 1 90751 CASAVA_Build 14 90976710 1I TTAGACAGAG -/T TCTCACTCTG 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 T 1 2 90752 CASAVA_Build 14 90980772 3D AAAGAAAAAG GAA/--- GAAGGAAGAA 157 het 157 ref 28 21 2 6 GAA 2 1 90753 CASAVA_Build 14 90982066 5D CCATGTACAA AAATC/----- AAATCAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 AAATC 2 1 90754 CASAVA_Build 14 90983293 3D AAATAGAGCT AGC/--- AGCATATGAT 3070 het 3070 ref 30 19 11 0 AGC 2 1 90755 CASAVA_Build 14 90985333 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 9 7 T 12 11 90756 CASAVA_Build 14 90985880 1I TTCAACAATG -/T TTTTTTAGCT 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 T 6 7 90757 CASAVA_Build 14 90990941 2I CCCAGCTACT --/AG AGAGTCCTGG 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 AG 2 3 90758 CASAVA_Build 14 90998599 1D CTGTTTGGTC T/- TTTTTTTTTT 2481 het 1632 hom 29 9 11 10 T 15 14 90759 CASAVA_Build 14 90999035 5D AAGATGAGGC TTAAT/----- TTAATCAATT 3070 het 3070 hom 34 17 16 3 TTAAT 2 1 90760 CASAVA_Build 14 91003397 5D CAAGTCACTC AAAGT/----- AGAGTGGAGA 3070 het 3070 ref 36 19 15 4 AAAGT 1 0 90761 CASAVA_Build 14 91003686 6I CCATGTTTTT ------/AACAAG AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 25 5 AACAAG 0 1 90762 CASAVA_Build 14 91004834 1D CATGCCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 T 11 10 90763 CASAVA_Build 14 91006038 1I GATTTAAGGA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 1220 hom 11 3 8 0 T 5 6 90764 CASAVA_Build 14 91009946 2I TCGTCTTACT --/AC AACCTCCACC 3070 het 2369 hom 20 7 11 2 AC 0 1 90765 CASAVA_Build 14 91011663 5D CTTCAGAATT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 AAAAC 3 2 90766 CASAVA_Build 14 91012072 1I CCCTGCAGAC -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 6 7 90767 CASAVA_Build 14 91014049 5I CTCGACCAAG -----/ATTTT ATTTTAATTA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 ATTTT 1 2 90768 CASAVA_Build 14 91022347 1D AGGTTTTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 G 1 0 90769 CASAVA_Build 14 91023811 4D GACACTTCTG TTTT/---- TTTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 34 15 14 8 T 9 5 90770 CASAVA_Build 14 91029741 1I TATAAAATTT -/A AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 A 6 7 90771 CASAVA_Build 14 91032032 4D ACAAAACAAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 11 29 10 AC 8 6 90772 CASAVA_Build 14 91033045 3D CAGTGTTAAT ATC/--- AATTAACACA 3070 het 3070 hom 43 10 27 8 ATC 1 0 90773 CASAVA_Build 14 91036328 1I TTGAGACGGA -/G TTTCACTCTT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 G 0 1 90774 CASAVA_Build 14 91039391 1D CCGAGCTACA T/- TTTTTTTTTT 2292 het 2292 ref 29 13 7 9 T 12 11 90775 CASAVA_Build 14 91040268 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 A 10 9 90776 CASAVA_Build 14 91048675 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 A 12 11 90777 CASAVA_Build 14 91083300 1D ACCCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1189 het 1189 ref 25 15 3 7 A 12 11 90778 CASAVA_Build 14 91097857 1I AAACCTGACC -/A AAAAAAAGCA 2430 het 2430 ref 21 12 5 4 A 7 8 90779 CASAVA_Build 14 91098365 2I GCCAACAAAC --/AT ATGAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AT 1 2 90780 CASAVA_Build 14 91105551 3D TTTCCTCCTC CTT/--- TTCTTTCTCT 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 CTT 1 0 90781 CASAVA_Build 14 91105647 4I TCCCTTCTTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TCTT 2 3 90782 CASAVA_Build 14 91105771 1I TGGTTGCATT -/A AAAAAAATTT 3070 het 2397 hom 23 7 13 3 A 7 8 90783 CASAVA_Build 14 91107506 1D GAATTTGGCC T/- TCTTTATTTT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 2 1 90784 CASAVA_Build 14 91107771 1I TCTGAGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 10 11 90785 CASAVA_Build 14 91113104 1I CCAAGCCCGG -/T TACAAAGTCT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 1 2 90786 CASAVA_Build 14 91119448 1D CCCGGGAGGC G/- GAACTTGCAG 1096 het 846 hom 10 2 3 7 G 2 1 90787 CASAVA_Build 14 91130008 3D AATCATGGGC GCT/--- GCTGGTCTTT 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 GCT 2 1 90788 CASAVA_Build 14 91140063 1D ACTTCATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 24 1 13 10 T 14 13 90789 CASAVA_Build 14 91142978 1I AATCCTGGTG -/A AAAAACCTGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 6 90790 CASAVA_Build 14 91143047 20I GAGGTGGTTC --------------------/TAGTGACAGACATATCAAGG TTTGTCTTTG 3070 hom 60 het 25 0 21 5 TAGTGACAGACATATCAAGG 0 1 90791 CASAVA_Build 14 91144737 1D GTCAATGCAA T/- TAAAGTTTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 3 T 2 1 90792 CASAVA_Build 14 91150392 1I TCTAGGGCTC -/T ACACTTTTAT 3070 hom 101 het 40 0 33 7 T 0 1 90793 CASAVA_Build 14 91155643 2I CAAATAAGCC --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 8 10 90794 CASAVA_Build 14 91171456 1D ATTCATATTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 10 9 90795 CASAVA_Build 14 91173893 1I ACCTGTAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 10 90796 CASAVA_Build 14 91175930 2D TGGCTCAGGA TG/-- AAAAAGACTA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 TG 1 0 90797 CASAVA_Build 14 91196748 1D ATTTCTGTTG T/- TTGGATTTTT 3070 hom 87 het 31 0 29 3 T 3 2 90798 CASAVA_Build 14 91213390 1I GGCAACCTAC -/A GAATGGGAGA 3070 hom 59 het 24 0 20 4 A 0 1 90799 CASAVA_Build 14 91230217 1I CATAAATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 312 hom 31 2 27 2 A 9 10 90800 CASAVA_Build 14 91238008 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 40 2 19 20 A 17 16 90801 CASAVA_Build 14 91249383 1D ACAAACTAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3054 hom 30 9 15 7 A 10 9 90802 CASAVA_Build 14 91271421 1D CACCCCATCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 9 8 90803 CASAVA_Build 14 91273458 1D AGGAGTTCAA G/- ATCAGTCCTG 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 G 1 0 90804 CASAVA_Build 14 91277670 1D TGAATAGACA T/- TTTTTCAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 6 5 90805 CASAVA_Build 14 91278377 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 11 10 90806 CASAVA_Build 14 91282568 2I TGTGTGTATG --/TA TGTATATATA 551 het 551 ref 19 12 5 2 TA 0 1 90807 CASAVA_Build 14 91282636 24D TACATATATA TGTGTATATATGTATATATATATG/------------------------ TGTGTATATA 1836 het 1836 ref 12 7 5 1 TGTGTATATATGTATATATATATG 1 0 90808 CASAVA_Build 14 91283998 1I GAGATCCAAC -/T TTTTTTTTTT 2637 het 2637 ref 21 9 8 4 T 11 12 90809 CASAVA_Build 14 91295076 1D ACTATAAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 17 10 9 A 9 8 90810 CASAVA_Build 14 91299519 1D GGAATGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 26 1 21 4 A 12 11 90811 CASAVA_Build 14 91299698 1D CAACAACAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 10 9 90812 CASAVA_Build 14 91301948 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 15 9 A 13 12 90813 CASAVA_Build 14 91302777 5I TATTATATTG -----/TATAT TATGTATTAT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 TATAT 0 1 90814 CASAVA_Build 14 91303229 5I ATACACACAC -----/CACAT ATGTATATAT 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 CACAT 0 1 90815 CASAVA_Build 14 91308811 3D AATCTGAATT ACA/--- ACAAGACAAC 3070 hom 117 het 43 0 40 5 ACA 2 1 90816 CASAVA_Build 14 91310732 4D ATCATCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 69 het 31 0 22 12 AAAC 4 3 90817 CASAVA_Build 14 91325059 1D TGGTAGCCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 10 9 90818 CASAVA_Build 14 91328319 1I AATAATTTCT -/A AAATATTTGA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 3 4 90819 CASAVA_Build 14 91332683 1I ACTGGTATCC -/T TTTAAGAAGA 3070 hom 154 het 59 0 51 8 T 3 4 90820 CASAVA_Build 14 91333069 4I TTTATATATT ----/TTTG TTTGTATTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTTG 1 2 90821 CASAVA_Build 14 91335311 1D CAGGTAGTGG A/- AAAAAAAAAA 2927 het 2927 ref 24 10 8 6 A 15 14 90822 CASAVA_Build 14 91358564 3I CATATTTCAG ---/TTC TTCTTATTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTC 1 2 90823 CASAVA_Build 14 91359634 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 126 hom 29 1 24 4 A 6 7 90824 CASAVA_Build 14 91365149 1D CTGTTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2665 hom 31 12 15 4 A 15 14 90825 CASAVA_Build 14 91366753 1I ATGAATATAC -/A AAAAAAAAAC 2965 het 2965 ref 23 11 8 4 A 9 10 90826 CASAVA_Build 14 91380151 1I AGAAGAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 9 10 90827 CASAVA_Build 14 91386147 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 24 3 16 5 A 17 16 90828 CASAVA_Build 14 91386280 1I TCTCTTTCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 503 hom 34 3 26 5 A 11 12 90829 CASAVA_Build 14 91403185 4I TTTTATGAGC ----/CTCT CTGAGTTTCT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 CT 1 3 90830 CASAVA_Build 14 91415668 1I AGCCACAGAC -/A GGGGTGGCCT 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 0 1 90831 CASAVA_Build 14 91417218 8D GTTCTATTCT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 594 hom 43 7 20 20 AC 17 13 90832 CASAVA_Build 14 91417724 1D TTGATGACTT A/- GTACCAAGAA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 1 0 90833 CASAVA_Build 14 91422754 1I TCGAGAACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 125 het 54 0 41 13 T 9 10 90834 CASAVA_Build 14 91429113 1D GGAATGTCCG A/- GTTGCTGGCA 3070 het 3070 hom 49 16 28 5 A 1 0 90835 CASAVA_Build 14 91432549 4D2M2I CACCGAATGG ACCATG--/----TGAA GTGCAGTCGG 3070 hom 122 het 45 0 39 12 N/A 0 0 90836 CASAVA_Build 14 91447086 1I AGCTTTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 787 hom 26 2 21 4 T 13 14 90837 CASAVA_Build 14 91447901 1D GAAAAGACGG A/- AAAAAAAAAA 1530 het 1496 hom 25 10 6 9 A 14 13 90838 CASAVA_Build 14 91456626 1D TTTGGGCTTT A/- TTCAGCGCTG 3070 hom 119 het 45 0 38 7 A 1 0 90839 CASAVA_Build 14 91460630 1D TCTAAAATAC A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 7 6 90840 CASAVA_Build 14 91461225 5D TAGAGCTCAT AAATC/----- AACTCTGGCT 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 AAATC 1 0 90841 CASAVA_Build 14 91475435 2D CCTCCATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 986 het 775 hom 20 7 3 10 T 20 18 90842 CASAVA_Build 14 91477878 1I TCTGTAAAAT -/G GGGGGGGTAT 3070 hom 124 het 47 0 41 6 G 7 8 90843 CASAVA_Build 14 91513710 1D CATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1540 het 1540 ref 40 25 5 10 T 13 12 90844 CASAVA_Build 14 91534789 1D TTTTACAACT A/- AAAAAAAAAA 813 het 813 ref 32 17 3 12 A 13 12 90845 CASAVA_Build 14 91537045 1I GCAACCTCCG -/C CCTCCTGGGT 1491 het 199 hom 5 1 4 0 C 2 3 90846 CASAVA_Build 14 91631596 1D ACCTCGGCCT C/- CCCAAAGTGC 2721 hom 15 het 6 0 6 0 C 4 3 90847 CASAVA_Build 14 91649818 4I CTGCTCTTCC ----/TAAT TGATTACAGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TAAT 0 1 90848 CASAVA_Build 14 91649939 2I TTTTTGACAC --/AG GGGCTCACTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AG 0 1 90849 CASAVA_Build 14 91650481 1I CTATGTTGAT -/A AGACATTTGG 3070 hom 141 het 49 0 46 3 A 1 2 90850 CASAVA_Build 14 91688108 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1093 het 225 hom 7 2 3 2 A 17 16 90851 CASAVA_Build 14 91750028 2D ACTTGACAAA CT/-- CTCAGAATGC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 CT 2 1 90852 CASAVA_Build 14 91753715 4D AACTCCGTCT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 19 0 13 7 A 18 14 90853 CASAVA_Build 14 91754469 1I GATACCAAAC -/T TTTTTTTTTT 2844 het 2844 ref 30 14 9 7 T 14 15 90854 CASAVA_Build 14 91758322 10D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAGGA 3070 hom 75 het 25 0 26 5 A 17 7 90855 CASAVA_Build 14 91762214 4I TTCTTTCTCC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 TCTT 2 3 90856 CASAVA_Build 14 91774841 4D ATGATAGGAT CTTA/---- CTTTCTTTCC 3070 hom 77 het 28 0 24 5 CTTA 1 0 90857 CASAVA_Build 14 91775619 1I AAACTCCATC -/T TTGTTTCTCT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 2 3 90858 CASAVA_Build 14 91779293 5D ATCCAGTGAC AAATT/----- AAAATATCTC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 AAATT 1 0 90859 CASAVA_Build 14 91784403 1D GCTGTGTACT G/- GGGTGGAGAC 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 G 4 3 90860 CASAVA_Build 14 91785166 1D GAATATTTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 10 9 90861 CASAVA_Build 14 91785725 4D TGATAGCAGC TTTA/---- TTTGTGATCA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 TTTA 1 0 90862 CASAVA_Build 14 91788873 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1903 het 121 hom 19 2 11 6 TG 12 11 90863 CASAVA_Build 14 91792527 1D TATGGACGTC T/- TTTTCTGCTT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 5 4 90864 CASAVA_Build 14 91792928 1I TCACCTAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 T 8 9 90865 CASAVA_Build 14 91793340 1D TCCACTGTTG A/- TCGGCACCTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 1 0 90866 CASAVA_Build 14 91802210 1D TTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAC 3040 het 2483 hom 22 7 7 8 A 10 9 90867 CASAVA_Build 14 91802729 4I CTTTCTTTTC ----/TTTT TTTTAACTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 4 8 90868 CASAVA_Build 14 91810203 1I TGGGTCCTGG -/C TTTCCTTCAT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 C 0 1 90869 CASAVA_Build 14 91810330 1I GGGTGGCTGG -/C CCCCTCCCGC 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 C 4 5 90870 CASAVA_Build 14 91817373 1I TAGGGGAATA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 64 het 28 0 22 6 T 9 10 90871 CASAVA_Build 14 91824431 1D ACTAGTGGCA C/- ATTTAAATGA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 C 1 0 90872 CASAVA_Build 14 91828121 1D TGAGACATGG C/- CCCTTCCGTG 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 C 4 3 90873 CASAVA_Build 14 91831298 1D TACTGTGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 22 2 11 9 T 11 10 90874 CASAVA_Build 14 91836980 1D GCAAGATCTG T/- TCTGGAAGTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 90875 CASAVA_Build 14 91842176 5I AAAGAAGGCC -----/TTGGT CATTCTCACA 3070 hom 93 het 34 0 29 5 TTGGT 0 1 90876 CASAVA_Build 14 91846563 4I CTGCAAAGGC ----/AGAT GGATGCATGC 3070 hom 121 het 49 0 41 8 AGAT 0 1 90877 CASAVA_Build 14 91856739 3D CAAGTCATGG AGA/--- AGGTCATTCT 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 AGA 1 0 90878 CASAVA_Build 14 91862371 3I GCTCTCTTGA ---/TGT TGTTTGCGGC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TGT 1 2 90879 CASAVA_Build 14 91864175 1D GGGCAGCTGG A/- AACATACTGG 3070 hom 69 het 30 0 25 5 A 3 2 90880 CASAVA_Build 14 91866253 1I GAGTCTCAGG -/C CCCCCCAATC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 C 6 7 90881 CASAVA_Build 14 91871627 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 12 13 90882 CASAVA_Build 14 91876679 1I TCATGCCAAA -/C CCTGCAGGGG 3070 hom 96 het 38 0 28 10 C 2 3 90883 CASAVA_Build 14 91897381 1D CTAACAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 48 2 31 15 T 14 13 90884 CASAVA_Build 14 91898317 7I6M2I TCTCAGGTCC -------CTGTCC--/CTAGACTCTGTACTG CTGTCCAGCC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 N/A 0 0 90885 CASAVA_Build 14 91906599 4D CTGCATTTAT TCAC/---- TCACTCATTC 3070 hom 105 het 40 0 35 6 TCAC 2 1 90886 CASAVA_Build 14 91908075 4D TTCATCAGAC ACTT/---- ACTGACCACC 3070 hom 84 het 30 0 28 3 ACTT 1 0 90887 CASAVA_Build 14 91917450 1D ACACTGCATG T/- TCTCACTCAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 2 1 90888 CASAVA_Build 14 91917861 1I GCAGAGCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 376 hom 32 1 25 6 A 9 10 90889 CASAVA_Build 14 91926227 1D TTCCCAGTCC G/- GGTCATCCCT 3070 hom 52 het 26 0 13 15 G 3 2 90890 CASAVA_Build 14 91942897 1I GGCTTGTGAT -/G GGGGGGGTCT 3049 het 3049 ref 21 9 8 4 G 7 8 90891 CASAVA_Build 14 91950458 2D GCTTCCCCAC AT/-- GAGGGCTTCT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 AT 1 0 90892 CASAVA_Build 14 91951161 3I GGTTGAAAGG ---/CGA CGACGGTTCA 3070 het 3070 hom 57 20 24 13 CGA 1 2 90893 CASAVA_Build 14 91953635 2D AGTGTAGCCT AA/-- GTGTCCAGTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 5 A 2 0 90894 CASAVA_Build 14 91958759 1I ATATCATGCT -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 6 7 90895 CASAVA_Build 14 91962831 1I TCTTAGCAAA -/G GTTATTTTAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 G 1 2 90896 CASAVA_Build 14 91965457 17D GAGTTTTAGT GTATGTGAGATAGATAA/----------------- GTATGTGAGA 3070 het 3070 hom 46 18 28 6 GTATGTGAGATAGATAA 2 1 90897 CASAVA_Build 14 91982273 1D TGCATTCTAT G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 32 0 23 9 G 1 0 90898 CASAVA_Build 14 91986483 2D GAGGGAGGAG TC/-- TCTCCGTATA 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 TC 3 2 90899 CASAVA_Build 14 91993388 11D TAGAACACAC TGTCATTCCTA/----------- GAACTGCGCA 3070 hom 68 het 22 0 19 8 TGTCATTCCTA 1 0 90900 CASAVA_Build 14 92005605 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2632 het 370 hom 12 1 10 1 A 11 12 90901 CASAVA_Build 14 92010763 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATATATA 886 het 119 hom 7 2 3 2 TGTA 1 0 90902 CASAVA_Build 14 92014745 1I TCCCAGCTTT -/G GTTTTGTTTT 3070 het 665 hom 21 2 17 2 G 1 2 90903 CASAVA_Build 14 92016242 1I ATTCTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 9 10 90904 CASAVA_Build 14 92019112 2D TGCATGACTC TG/-- TGTCAGGTAC 3070 hom 153 het 55 0 48 7 TG 2 1 90905 CASAVA_Build 14 92023543 3I CACAGGAGAC ---/AGG AGAAGAGAAC 3070 hom 141 het 55 0 47 8 AGG 0 1 90906 CASAVA_Build 14 92024123 4D CTCCTCCTCC CCTT/---- CCTTCCTTCC 2050 het 2050 ref 18 8 6 4 CCTT 4 3 90907 CASAVA_Build 14 92028256 1D CAGGGCACGT G/- TGTTTGATTT 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 G 1 0 90908 CASAVA_Build 14 92035773 7I CACATACAGC -------/TAATTTG TAATTTGTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 TAATTTG 1 2 90909 CASAVA_Build 14 92072960 1I AATGATAACC -/A GAGTAACCTT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 0 1 90910 CASAVA_Build 14 92073103 2D GGATTTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2996 hom 23 7 12 5 AT 7 6 90911 CASAVA_Build 14 92076467 1D CTTTTGGTTT C/- CCCAAGGGAG 3070 hom 87 het 35 0 26 9 C 4 3 90912 CASAVA_Build 14 92077410 2I AGAAAAACTG --/AT GTTAGGTCAT 3070 hom 186 het 67 0 61 6 AT 0 1 90913 CASAVA_Build 14 92080818 1D TTTTTTTTTT A/- AATTAAATAT 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 A 3 2 90914 CASAVA_Build 14 92081681 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1058 het 26 hom 14 1 6 8 T 16 14 90915 CASAVA_Build 14 92085113 1D CTCCCTCCCT C/- CCACGCCGGC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 C 3 2 90916 CASAVA_Build 14 92092716 4I ACATACAGAC ----/AGAT AGACAACAGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AGAT 0 1 90917 CASAVA_Build 14 92097592 1D TTCAGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 11 10 90918 CASAVA_Build 14 92099729 1I CAAAAGCTTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 A 8 9 90919 CASAVA_Build 14 92106758 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 22 2 18 2 A 13 14 90920 CASAVA_Build 14 92109601 1I GGGGGCCGAA -/G GTTCCAACCC 3070 hom 50 het 19 0 15 4 G 1 2 90921 CASAVA_Build 14 92123511 1D TACAGTAATG C/- CCCTCTAGGA 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 C 4 3 90922 CASAVA_Build 14 92130280 5I CCTGTAATCC -----/CAGCA CAGCACTTTG 3070 het 1675 hom 22 6 14 2 CAGCA 1 2 90923 CASAVA_Build 14 92133271 2D TTTATATATA TT/-- ATTTTTTATA 3070 hom 110 het 38 0 36 3 T 2 0 90924 CASAVA_Build 14 92143015 2I AAGTAAAAAC --/AT ATCCACACAA 3070 het 3070 hom 52 27 24 1 AT 1 2 90925 CASAVA_Build 14 92147393 1D CATGACCTTC T/- TTTTTTTTGG 2028 het 2028 ref 22 11 7 5 T 9 8 90926 CASAVA_Build 14 92148400 2D AGTACAGGAC AG/-- GGGGCAGTCT 3070 het 3070 ref 46 25 16 8 AG 1 0 90927 CASAVA_Build 14 92155134 6D CATAATAATC ATAATT/------ ATAATTGATA 3070 het 3070 ref 38 26 12 3 ATAATT 2 1 90928 CASAVA_Build 14 92173004 1D AAAAATATAT A/- AAAAAATAGT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 7 6 90929 CASAVA_Build 14 92182050 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 23 2 15 6 A 14 13 90930 CASAVA_Build 14 92187541 6D GAGGGGAAAA CAACCT/------ CAACCTCGGA 3070 hom 47 het 18 0 14 8 CAACCT 2 1 90931 CASAVA_Build 14 92190412 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 15 1 13 1 A 13 12 90932 CASAVA_Build 14 92190431 1D AAAAGAAAAG A/- AAAGAAAAAA 3070 het 1039 hom 19 5 13 1 A 4 3 90933 CASAVA_Build 14 92193473 1I AACAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 10 11 90934 CASAVA_Build 14 92193768 1I CCCTGCTCCC -/A AGGTCAACCC 3070 het 3070 hom 37 17 14 6 A 1 2 90935 CASAVA_Build 14 92201819 1D AAGGATACTG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 105 het 39 0 34 5 T 8 7 90936 CASAVA_Build 14 92202680 1D GGAGCAGACC G/- GGATTCTTCA 3070 hom 119 het 46 0 36 11 G 3 2 90937 CASAVA_Build 14 92206161 1I ACCCAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 1677 het 1677 ref 21 8 6 7 T 15 16 90938 CASAVA_Build 14 92217436 1I ACTCCAGCAC -/G CAAGAGTGCA 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 G 0 1 90939 CASAVA_Build 14 92228881 1D GAGAAGCAGT G/- GGGGGGGTCC 2462 het 2297 hom 22 9 9 4 G 8 7 90940 CASAVA_Build 14 92238474 3I CTGGGGGTCT ---/GAG AAGGTATCCC 3070 hom 85 het 41 0 32 9 GAG 0 1 90941 CASAVA_Build 14 92259838 1D CCCAAACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 40 1 32 8 T 12 11 90942 CASAVA_Build 14 92267032 7D TGTCTCAACC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAG 2389 het 2389 ref 21 10 7 6 A 16 9 90943 CASAVA_Build 14 92270305 1D GGTTAGGGTC T/- GAGAGCAATG 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 1 0 90944 CASAVA_Build 14 92270759 1D AAAAAAAAAA C/- TTTATTATTA 2174 het 623 hom 26 6 11 9 C 1 0 90945 CASAVA_Build 14 92271197 2I AAGTGCTGAG --/TC TCTTGAAAAG 3070 hom 105 het 36 0 35 1 TC 1 2 90946 CASAVA_Build 14 92278255 1I ATTCCACTAA -/C CCCCCCCTCA 3070 het 2513 hom 29 6 20 3 C 7 8 90947 CASAVA_Build 14 92302669 1I GGGACAGCTT -/C CCACAACCAA 3070 hom 54 het 23 0 17 6 C 2 3 90948 CASAVA_Build 14 92312317 1D CTGGCACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 599 hom 23 2 11 10 A 16 15 90949 CASAVA_Build 14 92319970 2D AAATCCCCTT GA/-- GTCATCCAAG 3070 hom 102 het 39 0 35 6 GA 1 0 90950 CASAVA_Build 14 92324153 4I TTGCAAAGTG ----/TTTA TTTATTAGCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TTTA 1 2 90951 CASAVA_Build 14 92330992 2I ATCCCACGCA --/CT CTCTCTGCCC 3070 hom 42 het 19 0 14 5 CT 3 4 90952 CASAVA_Build 14 92331186 1D AAAGAATTAA T/- GAGCGTGTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 0 90953 CASAVA_Build 14 92331835 1I TGTTAAAAAA -/G ATACGTAATT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 0 1 90954 CASAVA_Build 14 92340920 9I TGCCCAGCTA ---------/ATTTTTTGT ATTTTTAGTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 ATTTTTTGT 0 1 90955 CASAVA_Build 14 92343415 5D TAAATAAATA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AAAAT 3 2 90956 CASAVA_Build 14 92343922 2I AGAAGAAAAC --/AA GAGTGACAAA 3070 hom 103 het 38 0 35 3 A 0 2 90957 CASAVA_Build 14 92348040 1D CACTTCTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 9 90958 CASAVA_Build 14 92356045 1D CTTAGGGTTA C/- CCCACAAGTT 3070 hom 71 het 28 0 24 4 C 4 3 90959 CASAVA_Build 14 92359520 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 28 0 18 10 T 10 11 90960 CASAVA_Build 14 92362389 1D ATACATTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 264 hom 35 3 17 15 A 15 14 90961 CASAVA_Build 14 92373604 1I TAGTTTTTTT -/G TTTTGTTTGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 90962 CASAVA_Build 14 92375914 1I AAATAAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 9 10 90963 CASAVA_Build 14 92376861 6I TTGATTTAAA ------/CTTTCT CTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 19 5 CTTTCT 0 1 90964 CASAVA_Build 14 92377040 3D TTTTTTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 28 0 23 5 TTC 1 0 90965 CASAVA_Build 14 92378023 1D TTTGATTTTT C/- CCCCCCCCTC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 9 8 90966 CASAVA_Build 14 92379603 1I CATGCTACAT -/A ATGGAAGGCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 90967 CASAVA_Build 14 92438707 1I GTGGGTAACT -/G GGGCTTGATT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 G 3 4 90968 CASAVA_Build 14 92450245 1D AAACAGCTAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 9 8 90969 CASAVA_Build 14 92450598 1I CACCTCCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 16 10 A 12 13 90970 CASAVA_Build 14 92452297 1D GAGGTGGGTA C/- TGATATCAAC 3070 het 3070 hom 50 17 22 11 C 1 0 90971 CASAVA_Build 14 92452948 1I GGTCTTCTCT -/G GTTCAGAGAC 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 G 1 2 90972 CASAVA_Build 14 92457247 1D CTGAGAGTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 103 het 37 0 35 2 T 9 8 90973 CASAVA_Build 14 92461584 1D GCAGCTGGCT A/- AGACCTGAAG 3070 hom 132 het 48 0 44 6 A 2 1 90974 CASAVA_Build 14 92471406 5D TTCGCCTCTC AACTT/----- AAGAGTGGAG 3070 het 5 hom 40 1 16 28 AACTT 1 0 90975 CASAVA_Build 14 92475255 4D TCCTTGGACC CAGA/---- CACTCTCAGT 3070 het 3070 ref 34 18 11 7 CAGA 1 0 90976 CASAVA_Build 14 92476949 1I GTGCTGGCTT -/A AGGGGAAGGA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 1 2 90977 CASAVA_Build 14 92484611 1I ATTTTATTTG -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 6 7 90978 CASAVA_Build 14 92492393 1I AATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 975 het 975 ref 22 9 6 7 T 15 16 90979 CASAVA_Build 14 92502278 1D TGGTAGAGAT G/- GGGGTCTCAC 3070 hom 70 het 26 0 24 2 G 5 4 90980 CASAVA_Build 14 92540933 1I TGGTGATGTC -/A AACCACAAAG 2421 het 2421 ref 17 9 7 1 A 2 3 90981 CASAVA_Build 14 92542785 1D CAGGCTCTCT G/- GGGGGGAAAC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 G 7 6 90982 CASAVA_Build 14 92544490 2D TGTCTTTTAG GA/-- GAACTCTGGC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 GA 2 1 90983 CASAVA_Build 14 92549403 2I AAACAAAAAC --/AA AAAAAAAATC 2094 het 2094 ref 19 10 7 2 A 8 10 90984 CASAVA_Build 14 92579113 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 10 11 90985 CASAVA_Build 14 92580446 1D TCCAACCCCC T/- CCGCAGAGAT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 1 0 90986 CASAVA_Build 14 92608714 1D AATATTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 30 1 19 10 T 17 16 90987 CASAVA_Build 14 92611961 2I CACAGACCAC --/AG AGTCACCCTC 3070 hom 110 het 42 0 29 13 AG 1 2 90988 CASAVA_Build 14 92617432 1D ATGCCGTCTC A/- AAAAAAACAC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 8 7 90989 CASAVA_Build 14 92640561 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 A 11 10 90990 CASAVA_Build 14 92640974 1D CCCAGAGTGA C/- CCCAGGCTAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 C 4 3 90991 CASAVA_Build 14 92643063 1I ACTAACATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2916 hom 29 9 15 5 T 11 12 90992 CASAVA_Build 14 92653017 4D CTCAAAAAAA AAAG/---- AAAGACAAGG 3070 het 3070 ref 33 20 9 6 AAAG 2 1 90993 CASAVA_Build 14 92662559 1D CATGGTGAAA C/- CCCCCCCCTC 2500 het 752 hom 13 3 7 3 C 9 8 90994 CASAVA_Build 14 92667001 1I ATGTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3041 het 953 hom 12 3 8 1 T 8 9 90995 CASAVA_Build 14 92671142 3I ACTTTTTTAA ---/ATT ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 ATT 5 6 90996 CASAVA_Build 14 92678456 1D AAGTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 A 12 11 90997 CASAVA_Build 14 92705321 3D AAAAAGAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 2255 het 2255 ref 16 10 6 0 AAG 1 0 90998 CASAVA_Build 14 92714737 3I CCTTCTTTTT ---/TTA TTATTTTTTA 2788 het 2788 ref 23 9 8 6 TTA 1 2 90999 CASAVA_Build 14 92734315 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1710 het 964 hom 13 6 5 2 A 10 11 91000 CASAVA_Build 14 92743985 1D ATCCATAGGG C/- ATTTGCGGTG 3070 hom 78 het 30 0 25 5 C 1 0 91001 CASAVA_Build 14 92756322 2D CTCCTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1113 het 1113 ref 35 19 4 12 T 18 16 91002 CASAVA_Build 14 92761027 4I GGTTTTCTTT ----/ATTA ATTTTATCAC 3070 hom 90 het 42 0 29 13 ATTA 0 1 91003 CASAVA_Build 14 92767889 3D AGATTCTCAC AGG/--- AGAACTCTAT 3070 hom 66 het 25 0 22 4 AGG 1 0 91004 CASAVA_Build 14 92770642 1D CATTCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 T 12 11 91005 CASAVA_Build 14 92781277 1D AAAAAAAAAA C/- TTTTTAAAGT 3070 het 376 hom 32 9 14 9 C 1 0 91006 CASAVA_Build 14 92794233 1I GAATAAGATC -/T TTATTATTCA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 2 3 91007 CASAVA_Build 14 92798882 1I CTGCTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 1510 het 1510 ref 41 27 5 9 T 14 15 91008 CASAVA_Build 14 92808942 3D ACTATTTCTC AGG/--- AGGACAATTC 3070 het 3070 hom 49 18 19 15 AGG 2 1 91009 CASAVA_Build 14 92811457 1D TCTGAACAGT G/- GGAAGAATAT 3070 het 3070 ref 45 27 11 8 G 3 2 91010 CASAVA_Build 14 92816548 2D CGCTAGAAAC AA/-- AGACATTTAA 3070 het 3070 hom 43 16 25 3 A 3 1 91011 CASAVA_Build 14 92820558 1I CACTCCCCAC -/T TTTTTTTTTT 1398 het 1398 ref 26 12 8 6 T 13 14 91012 CASAVA_Build 14 92823562 4D TGTTTATAAT TAAA/---- TAGTGCTTAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 TAAA 1 0 91013 CASAVA_Build 14 92834147 1I TTATTATTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 T 8 9 91014 CASAVA_Build 14 92844397 8D AAAAAAAAAA AAAAAAAG/-------- AAAAGAAAAG 1652 het 1327 hom 12 5 5 6 AAAAAAAG 1 0 91015 CASAVA_Build 14 92845508 1D TGTCTCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 33 2 16 15 A 16 15 91016 CASAVA_Build 14 92847845 1I ATATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 15 16 91017 CASAVA_Build 14 92848032 5I TTATATAATT -----/ACTTA AAACATTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 ACTTA 0 1 91018 CASAVA_Build 14 92858197 1I GTTGTTTTTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 A 7 8 91019 CASAVA_Build 14 92861529 1I GTCTGGCCTG -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 T 6 7 91020 CASAVA_Build 14 92861844 5I TCTGGTGTTC -----/TATTA TATCACAACT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 TATTA 0 1 91021 CASAVA_Build 14 92870072 2D CCTCTGATAG AC/-- ATTAGCAACT 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 AC 1 0 91022 CASAVA_Build 14 92903743 5D AATAGGAAAA ATAAC/----- ATAAGAGGGT 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 ATAAC 1 0 91023 CASAVA_Build 14 92912056 1I GAGCTAGCAT -/A GTTAGGCCCT 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 A 0 1 91024 CASAVA_Build 14 92920012 2I CCTGCACAAA --/CT CTCTGTCTGC 3070 hom 76 het 31 0 26 5 CT 2 3 91025 CASAVA_Build 14 92921504 4I AATTAATTCC ----/TAGT TATTTTATCT 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 TAGT 0 1 91026 CASAVA_Build 14 92930004 1D TATTGTCCCC T/- AACCTCAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 1 0 91027 CASAVA_Build 14 92933225 1I TTGTTTATTT -/G TTTATTTTAT 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 G 0 1 91028 CASAVA_Build 14 92948589 1I GGCATTTAAT -/A ATCAAACTAC 2839 het 2839 ref 21 10 7 4 A 1 2 91029 CASAVA_Build 14 92965840 1I GCTATGACCA -/T TGCCCCTCAG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 1 2 91030 CASAVA_Build 14 92975415 5I CTTGTATTTC -----/TCTTT TAAGTAAGAT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 TCTTT 0 1 91031 CASAVA_Build 14 92976627 1D TGGCTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 15 14 91032 CASAVA_Build 14 92990544 11I GTATGTGTAT -----------/GTGTATGTAGC ACATAATTAG 3070 het 3070 hom 55 25 26 5 GTGTATGTAGC 0 1 91033 CASAVA_Build 14 93003547 1D ATTTTGTGTG C/- CGAATACAAT 3070 het 3070 hom 22 11 10 2 C 2 1 91034 CASAVA_Build 14 93006179 1D TCAGGTTCTT G/- GGGGAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 5 4 91035 CASAVA_Build 14 93008573 1D TTTAAATTAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 9 8 91036 CASAVA_Build 14 93023661 1I ATTGGAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 45 4 38 3 T 11 12 91037 CASAVA_Build 14 93024598 2I TGACACTGTG --/TT GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 15 5 T 0 2 91038 CASAVA_Build 14 93034249 1I TGCCTGTAAT -/C CCAGCTACTC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 2 3 91039 CASAVA_Build 14 93037442 5D AAAATAAATT AAAAA/----- AAAAAGCAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 10 5 91040 CASAVA_Build 14 93037786 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 23 0 21 2 A 11 10 91041 CASAVA_Build 14 93040373 3I CCTCCTCCTC ---/CTT CATTTCTTCC 3070 hom 78 het 32 0 23 9 CTT 0 1 91042 CASAVA_Build 14 93048502 1D GTTTGCTGAG C/- TTCTCGAATC 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 C 1 0 91043 CASAVA_Build 14 93053572 1I TTTTCATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 T 13 14 91044 CASAVA_Build 14 93054597 1D ACTTTTCAAA G/- AACCAGTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 G 1 0 91045 CASAVA_Build 14 93074904 6D TCACATGACC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1827 het 1015 hom 27 8 6 13 A 18 12 91046 CASAVA_Build 14 93079056 1I ACATTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 24 0 15 9 T 14 15 91047 CASAVA_Build 14 93083512 1D GGAAATTTCA G/- GTCAGTTCAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 2 1 91048 CASAVA_Build 14 93091406 4D GTAAGACATC ACAT/---- ACATACATGA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 ACAT 3 2 91049 CASAVA_Build 14 93092784 1D ATTGACTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 820 hom 47 4 35 9 A 12 11 91050 CASAVA_Build 14 93101773 2D CTTTAACAGC AA/-- ACTAACAGTC 3070 het 3070 ref 48 27 17 5 A 3 1 91051 CASAVA_Build 14 93104804 4D CAAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 AAAC 3 2 91052 CASAVA_Build 14 93110298 1D ACAGCTTTGT C/- CCCCCCTATA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 C 7 6 91053 CASAVA_Build 14 93147428 1I AGAGGCTCTT -/A ACGCTAAGCT 3070 het 3070 hom 59 19 37 3 A 1 2 91054 CASAVA_Build 14 93193618 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1614 het 741 hom 7 2 4 1 T 6 7 91055 CASAVA_Build 14 93203561 1D CAGTAGGTAC A/- ATTTTCTAGA 3070 het 3070 ref 54 26 22 7 A 2 1 91056 CASAVA_Build 14 93215557 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 11 10 91057 CASAVA_Build 14 93245108 1I TTTCCCTGTC -/A AACTGACCCA 3070 hom 91 het 35 0 24 11 A 2 3 91058 CASAVA_Build 14 93252433 1D GAACAGGAAG C/- CAGTCACTCA 3070 het 3070 ref 46 21 18 8 C 2 1 91059 CASAVA_Build 14 93254733 2D TAGTTGTATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 TA 8 7 91060 CASAVA_Build 14 93271872 3D CGCACTGCAA CCT/--- CCGCCTCCCA 2434 het 992 hom 21 5 8 9 CCT 1 0 91061 CASAVA_Build 14 93283899 1I GAGAGTGTAA -/G GGGGACTGAG 3070 hom 150 het 56 0 50 6 G 4 5 91062 CASAVA_Build 14 93285197 2D ACAGCATCTA CT/-- CTCTTTTAGT 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 CT 3 2 91063 CASAVA_Build 14 93307332 1D TGCTCCATCA G/- GGGTGGTGTC 3070 hom 114 het 44 0 38 7 G 4 3 91064 CASAVA_Build 14 93334254 1D AAATTTAATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 1152 hom 18 4 9 6 A 9 8 91065 CASAVA_Build 14 93363671 1I CATTCAAGTG -/C CCCCCCCCCA 3070 het 120 hom 26 2 20 4 C 9 10 91066 CASAVA_Build 14 93372949 1D GATAGTTAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 10 9 91067 CASAVA_Build 14 93403291 1I ACACTCAATG -/A ATATTTGTTG 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 1 2 91068 CASAVA_Build 14 93404588 1D CCTCTTGACC A/- AAAGTGATGC 3070 hom 117 het 46 0 38 8 A 4 3 91069 CASAVA_Build 14 93405807 2I GCCTTTGGGG --/AT CTACTGGATG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AT 0 1 91070 CASAVA_Build 14 93423440 13D ATAAACTTTA GATCCAGTTTGTT/------------- GATATCCAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 4 GATCCAGTTTGTT 1 0 91071 CASAVA_Build 14 93425987 1I TAACAGGGCT -/G GGTCCCTTGA 3070 hom 171 het 60 0 54 6 G 2 3 91072 CASAVA_Build 14 93428192 1D TGCAGCCCCC T/- GGGGGGTGCC 3070 hom 65 het 28 0 21 8 T 1 0 91073 CASAVA_Build 14 93430387 22D CTCAAGGAAA CGCTCTCGTGTCCCCTTCCTTC/---------------------- CCCTCAATCA 3070 hom 51 het 16 0 18 2 CGCTCTCGTGTCCCCTTCCTTC 1 0 91074 CASAVA_Build 14 93437392 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 2491 hom 18 het 8 0 7 1 G 3 4 91075 CASAVA_Build 14 93437904 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 28 1 15 13 A 17 14 91076 CASAVA_Build 14 93441067 1I TACATGTCTG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 99 het 48 0 34 14 T 7 8 91077 CASAVA_Build 14 93469016 2D GTCCCTTCCC CT/-- CTCTGGGCCA 3008 het 3008 ref 31 12 8 12 CT 3 2 91078 CASAVA_Build 14 93492622 1I GGGCATCTGA -/G GGGGGGGATC 1974 het 1974 ref 24 12 7 5 G 7 8 91079 CASAVA_Build 14 93500868 4I CCATCTATAT ----/ATCC ATCCATCCAT 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 ATCC 4 5 91080 CASAVA_Build 14 93504969 4I GATGGACAGG ----/TGAA TGAATGATAG 3070 het 3070 hom 62 27 28 7 TGAA 1 2 91081 CASAVA_Build 14 93508308 26D AACTGGGCTG TTCCTTGGCACCCAGGGCGCTCGACC/-------------------------- TCCTTCCTTG 3070 het 3036 hom 19 8 9 4 TTCCTTGGCACCCAGGGCGCTCGACC 1 0 91082 CASAVA_Build 14 93573749 1D15M1D CTTTCATTCC AAAAAAAAAAAAAGGAT/-AAAAAAAAAAAAGGA- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 16 13 8 N/A 0 0 91083 CASAVA_Build 14 93575713 1I CCATAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 10 11 91084 CASAVA_Build 14 93578031 1D GGAACACTGA C/- CTGGGGTGTT 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 C 2 1 91085 CASAVA_Build 14 93583021 1D GACAAGCCAT G/- GGAAGTTGGC 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 G 3 2 91086 CASAVA_Build 14 93584868 1I AGTCTAGGAG -/C CAAACACATC 3070 het 3070 ref 43 14 15 14 C 1 2 91087 CASAVA_Build 14 93585832 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 12 13 91088 CASAVA_Build 14 93586004 1D AAAAAAAAAA G/- AAAATTATTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 G 1 0 91089 CASAVA_Build 14 93587287 5I CACACTTGAC -----/CACGG CAGTTAATTT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 CACGG 0 1 91090 CASAVA_Build 14 93592706 2D TAAATGTGTT TC/-- TTTTAGTTCT 3070 het 3070 ref 37 21 9 8 TC 1 0 91091 CASAVA_Build 14 93599433 3D AACTTTTGAT AAG/--- AAGAACAGCA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 AAG 2 1 91092 CASAVA_Build 14 93603912 3D CCAAGCCACC ACT/--- ACAAGAACTG 3070 het 3070 hom 15 7 8 0 ACT 1 0 91093 CASAVA_Build 14 93621099 1D TGTGTGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2771 hom 23 7 13 3 A 10 9 91094 CASAVA_Build 14 93624602 3I AACAATCTTT ---/TTC TTTTTTTTTT 2765 het 440 hom 23 6 10 7 TTC 0 1 91095 CASAVA_Build 14 93627810 2D TTTAAAAGGC AA/-- AAAACCTTTA 3070 het 3070 ref 21 11 10 0 A 6 4 91096 CASAVA_Build 14 93629854 1D TGTACTATTG T/- TTTTTGCATT 3070 het 3070 ref 56 31 19 7 T 6 5 91097 CASAVA_Build 14 93633192 1I ATGGAAAAGA -/G ATTATTCAGG 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 G 0 1 91098 CASAVA_Build 14 93635947 2D3M5I GGTCTAGGAC AGAAT-----/--AATTCTTA GCTAATAGAA 3070 het 3070 ref 42 24 15 7 N/A 0 0 91099 CASAVA_Build 14 93638392 1I CCTCTTCGGG -/C CAGTGGCCTG 2538 het 2538 ref 35 18 10 7 C 1 2 91100 CASAVA_Build 14 93643005 2I GTGCCAAGCA --/CC CCCCCATGAC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 C 5 7 91101 CASAVA_Build 14 93644852 1D GTGTCAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 A 13 12 91102 CASAVA_Build 14 93651884 9I CTGCAGTTGT ---------/GGCCATGGC GGCTGTGCCC 3070 het 2255 hom 34 12 13 9 GGCCATGGC 0 1 91103 CASAVA_Build 14 93657097 11I TTGAGTTGCC -----------/TCTGAGTCTCA TCCTCTGAGT 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 TCTGAGTCTCA 0 1 91104 CASAVA_Build 14 93669058 10D ATATATTTAT ACACACACAC/---------- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 AC 9 4 91105 CASAVA_Build 14 93670388 1D AAGAAAGAAG A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 34 11 22 1 A 7 6 91106 CASAVA_Build 14 93670907 1I TTTTTGTTTT -/C TTTTTAATGA 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 C 0 1 91107 CASAVA_Build 14 93671753 11I CACGTGGGCC -----------/GAGATTGTAGT GGTGCAGCCA 3070 het 3070 hom 46 14 17 15 GAGATTGTAGT 0 1 91108 CASAVA_Build 14 93684976 1I TTATTGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 7 5 T 11 12 91109 CASAVA_Build 14 93702781 2I CTTAGTATCT --/CA GATTGTGACT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CA 0 1 91110 CASAVA_Build 14 93713164 1D ATGATTCTGT A/- AAAAAAAAAA 1159 het 1159 ref 39 29 3 7 A 12 11 91111 CASAVA_Build 14 93716041 3D AATTAAGGAA CTT/--- CTGATATTTT 3070 hom 114 het 46 0 39 8 CTT 1 0 91112 CASAVA_Build 14 93726139 1D TGCTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 40 3 23 16 T 15 14 91113 CASAVA_Build 14 93726963 2I GATTTCCAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 146 hom 35 1 24 10 T 15 17 91114 CASAVA_Build 14 93727441 4I ATTTTGAGCC ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TTTA 1 2 91115 CASAVA_Build 14 93739072 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 19 1 14 4 A 14 15 91116 CASAVA_Build 14 93770005 1D GAATTTACTT A/- TTCAGATGCC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 1 0 91117 CASAVA_Build 14 93780066 1I CCAGGGACCA -/T TTTTTTTTTT 1626 het 1626 ref 28 19 5 4 T 10 11 91118 CASAVA_Build 14 93834901 1I AAACTGAATG -/C CTTTGACAGC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 91119 CASAVA_Build 14 93845404 6D2M2I GATGTATACA TTTCATTA--/------GAGG TCATTTTCAT 3070 het 3070 ref 30 20 10 0 N/A 0 0 91120 CASAVA_Build 14 93846508 1D GCCATCTCCA C/- CCCTGCCAGC 2164 het 2164 ref 28 15 9 4 C 4 3 91121 CASAVA_Build 14 93851380 4I AACTGGAAAC ----/AGGT AGGAACAGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AGGT 0 1 91122 CASAVA_Build 14 93861911 1D TTCTTGTATC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 8 91123 CASAVA_Build 14 93879354 3I TTCAAAGGAG ---/AAC AACAGTTCTG 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 AAC 1 2 91124 CASAVA_Build 14 93884080 4D GCCCGGCTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1060 het 709 hom 9 3 4 2 T 15 11 91125 CASAVA_Build 14 93885918 1D TTTCCTTATT C/- CCCCCCTCCC 3070 het 2228 hom 44 12 25 7 C 7 6 91126 CASAVA_Build 14 93886596 1I ACAAAACTTT -/G CATCCTTCAA 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 G 0 1 91127 CASAVA_Build 14 93890261 1D TTGTGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 A 11 10 91128 CASAVA_Build 14 93893181 1I TATTGATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 8 8 T 11 12 91129 CASAVA_Build 14 93894985 1I TCCTTAGTGA -/G CATTATTATA 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 G 0 1 91130 CASAVA_Build 14 93895085 1I AACATGGCAA -/C CCCCAGTTTG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 C 4 5 91131 CASAVA_Build 14 93899170 16D GAGACACACC CACGCAGCCACACACA/---------------- CACACAGACA 3070 het 3070 hom 44 22 25 5 CACGCAGCCACACACA 1 0 91132 CASAVA_Build 14 93926140 2I GTGTCAGGGG --/CC CTGGTGTCAC 3070 het 2660 hom 33 9 13 11 C 1 3 91133 CASAVA_Build 14 93928330 1I TTTTTTCCAG -/A AAAAGGCTGT 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 A 4 5 91134 CASAVA_Build 14 93934825 1I ATGACCTCCA -/G CAATGCCGTG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 G 0 1 91135 CASAVA_Build 14 93946134 1I TCAAAGAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 31 0 23 8 A 9 10 91136 CASAVA_Build 14 93953181 1I CAGTCTAAAG -/A AAAAAAAAAA 2331 het 2331 ref 17 11 6 0 A 10 11 91137 CASAVA_Build 14 93956553 1I GTCCCCCCCC -/A AAATTTATAT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 3 4 91138 CASAVA_Build 14 93958346 1I ATATTTAAAA -/T TTGGAAATAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 2 3 91139 CASAVA_Build 14 93969965 1D AAGAAGGCCC T/- TGGCAGATGT 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 T 2 1 91140 CASAVA_Build 14 93981831 1D GCTATATATG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 T 9 8 91141 CASAVA_Build 14 93983854 1D GATATGCTAG T/- TTTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 53 23 18 12 T 7 6 91142 CASAVA_Build 14 93989431 2I78M2D TTCACTTAGA --ATAATAGTCTCAAGGTCCACCCAGGCTGATGTGAATGCAATTAATTCGTTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATCAT/ATATAATAGTCTCAAGGTCCACCCAGGCTGCTGTGAATGCAACTAATTCGTTCCTTTTTATGGCTGAGTAGTATTCCATC-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 29 15 11 N/A 0 0 91143 CASAVA_Build 14 93994549 1I GTTTTTGTTG -/T TTAATGCACT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 2 3 91144 CASAVA_Build 14 94000618 1D AGGGATAACA G/- ATGCTGCATG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 G 1 0 91145 CASAVA_Build 14 94008462 1D AGCTATTACC G/- GCTTGAGAGG 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 G 2 1 91146 CASAVA_Build 14 94013059 1D ATTCTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 11 10 91147 CASAVA_Build 14 94037710 1D TTGGTTTCTT C/- CCCCATGAGA 2777 het 2777 ref 19 8 7 4 C 5 4 91148 CASAVA_Build 14 94037755 2D ACCACCTCCC CG/-- CCCCCCCACC 1299 het 275 hom 7 1 3 3 CG 1 0 91149 CASAVA_Build 14 94044479 9D AGGAGAGAAA TAGAAAATT/--------- TAGAAAATTT 3070 hom 26 het 18 0 10 9 TAGAAAATT 2 1 91150 CASAVA_Build 14 94048192 2D TCTCAAAAAC AA/-- AACAAAACAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 2 A 4 2 91151 CASAVA_Build 14 94053044 2D GCAGCTATTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 47 15 21 12 CA 7 6 91152 CASAVA_Build 14 94067822 1I TTTTTAAATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 9 10 91153 CASAVA_Build 14 94083051 1I CCACCAAAAA -/G ACTTGGATAA 3070 het 3070 ref 62 29 28 5 G 0 1 91154 CASAVA_Build 14 94130741 3D GGCCAATCCT AAA/--- TGGGATGATC 3070 het 3070 ref 35 17 11 10 A 3 0 91155 CASAVA_Build 14 94130976 1I GTCACATATA -/G GCCTGACTAC 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 G 1 2 91156 CASAVA_Build 14 94131297 1I AGAATTAGGG -/C CCCCCCAATG 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 C 6 7 91157 CASAVA_Build 14 94168112 6D GAAGAAGAGC AAACAT/------ GCCCAGTGCC 3070 het 3070 ref 40 19 20 8 AAACAT 1 0 91158 CASAVA_Build 14 94170155 1I GGAGCTTCGT -/C CCCCTGGCTC 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 C 4 5 91159 CASAVA_Build 14 94171964 1I TTTCCATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 7 4 A 10 11 91160 CASAVA_Build 14 94191229 3D AAGGAGAAGG AGA/--- AGAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 AGA 3 2 91161 CASAVA_Build 14 94192630 1I CTAAAAATAT -/A AAAAATTAGC 2625 het 628 hom 11 2 8 1 A 5 6 91162 CASAVA_Build 14 94192906 1I TATGTATAAA -/T TTTTTTAAGA 2297 hom 15 het 6 0 6 0 T 6 7 91163 CASAVA_Build 14 94201024 2I CCGGTGTATA --/TG TGTGTGTGTA 3070 hom 11 het 38 1 32 5 TG 4 5 91164 CASAVA_Build 14 94205828 1I ATTTTAATGC -/A AAAAAAATGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 7 8 91165 CASAVA_Build 14 94206121 1I TGAGAAACAG -/A AAAAAAACAC 3070 hom 117 het 44 0 40 5 A 7 8 91166 CASAVA_Build 14 94206963 4D AGCCAAACAC CTCT/---- CTCTGCCTCT 3070 hom 78 het 31 0 25 9 CT 4 2 91167 CASAVA_Build 14 94209111 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 16 hom 46 1 21 24 A 10 9 91168 CASAVA_Build 14 94210783 1I TATAAAATTT -/A AAAAAAGGAA 3070 het 855 hom 22 6 14 2 A 6 7 91169 CASAVA_Build 14 94223303 18D AGGCTGAGGC GGGTGGATCACTTGAGGT/------------------ CAGGACCTCA 3070 hom 35 het 12 0 12 1 GGGTGGATCACTTGAGGT 1 0 91170 CASAVA_Build 14 94224780 1D TAATTTTCAC T/- TTTTTTTTTT 2525 het 1024 hom 15 3 7 6 T 14 13 91171 CASAVA_Build 14 94225501 2D GGGCTTGCCC GG/-- GGGGCTCTTC 2934 het 2054 hom 23 9 9 5 G 6 4 91172 CASAVA_Build 14 94328210 1D TTTAATTTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 8 91173 CASAVA_Build 14 94338547 1D CAGTAGAGAT G/- GGGTTTTGCC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 4 3 91174 CASAVA_Build 14 94341300 5D TGGGATAATT CCCTC/----- CCCTCCCCTC 1125 het 1125 ref 26 8 15 3 CCCTC 4 3 91175 CASAVA_Build 14 94354491 3I TTCCATCTCC ---/AAA AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 A 8 11 91176 CASAVA_Build 14 94365029 1I CAGCTACTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 9 10 91177 CASAVA_Build 14 94376746 1D AGCATGGCAG T/- AAATCACCTC 3070 hom 105 het 39 0 34 5 T 1 0 91178 CASAVA_Build 14 94385571 1D TCCTCAAAAT C/- CCCCCCCTTG 3070 hom 83 het 34 0 25 9 C 8 7 91179 CASAVA_Build 14 94389619 1D GTTAAGTGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 13 21 9 A 10 9 91180 CASAVA_Build 14 94406525 16D GGGATTCTCA CAGATTTACAATGTGG/---------------- CAGATTTACA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 CAGATTTACAATGTGG 2 1 91181 CASAVA_Build 14 94407182 3D AACTTTGTTT ACA/--- ACATTAGTTG 3070 het 3070 ref 33 14 14 7 ACA 2 1 91182 CASAVA_Build 14 94407615 1I AGAATAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 9 10 91183 CASAVA_Build 14 94410563 1D GATCCTCCCA C/- CTCGACCTCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 2 1 91184 CASAVA_Build 14 94433747 2D GGAAGCTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 38 0 24 14 T 12 10 91185 CASAVA_Build 14 94434252 1I CACGAGAAAA -/G ACTGCTTGGC 3070 hom 99 het 39 0 31 8 G 0 1 91186 CASAVA_Build 14 94436017 1I CTTCCTGGGT -/A TAATCTAATA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 0 1 91187 CASAVA_Build 14 94436379 1I CCACTGGGGC -/T TTTTCTTGTA 3070 hom 144 het 54 0 48 6 T 4 5 91188 CASAVA_Build 14 94448294 1I AAAAGACATT -/G AAAAATAAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 0 1 91189 CASAVA_Build 14 94456604 1I TGATGGAGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 8 9 91190 CASAVA_Build 14 94459542 1D TTTCTCCTTT C/- CCCCCCAAAA 3070 hom 46 het 20 0 16 4 C 7 6 91191 CASAVA_Build 14 94469238 3D TGTGAGCCAC CAT/--- GCCTGGCCAA 3070 hom 75 het 27 0 25 5 CAT 1 0 91192 CASAVA_Build 14 94474149 4I TCTGTGTGTG ----/TGTC TGTGTGATGT 3070 het 3070 hom 83 30 35 18 TGTC 0 1 91193 CASAVA_Build 14 94478414 1I AGGAGATAGA -/G GCTGCAGTGA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 G 1 2 91194 CASAVA_Build 14 94507463 1I CATTATCTTC -/T TTTTTTTTTT 2474 het 1761 hom 35 10 12 13 T 14 15 91195 CASAVA_Build 14 94513550 1D ACTCATACAG T/- AGACTGCAAA 3070 het 3070 ref 56 24 24 9 T 1 0 91196 CASAVA_Build 14 94514427 12D CTTCCCTCCA ACCCTCAGTGCT/------------ ACCCTCTGTG 3070 hom 102 het 38 0 34 5 ACCCTCAGTGCT 1 0 91197 CASAVA_Build 14 94526185 2I GGACTTGAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 21 9 T 12 14 91198 CASAVA_Build 14 94526565 1D GAGAGAGAGA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 826 hom 34 2 29 3 G 1 0 91199 CASAVA_Build 14 94528854 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 958 het 958 ref 21 15 3 3 A 15 14 91200 CASAVA_Build 14 94536822 9D GAAACTAATA CAAACACAC/--------- CTTCTCGAGC 3070 het 3070 ref 40 20 14 9 CAAACACAC 1 0 91201 CASAVA_Build 14 94536901 1I GGAGCCTTAG -/T TTTCTTAATT 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 3 4 91202 CASAVA_Build 14 94543669 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 811 hom 28 2 21 5 T 13 12 91203 CASAVA_Build 14 94546516 4D AGGGAAGGAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 hom 57 het 24 0 19 5 GGAA 5 4 91204 CASAVA_Build 14 94550933 1I ATTCTTTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 10 11 91205 CASAVA_Build 14 94562389 2D TGGGTTTCAC AT/-- GTCATGGCAC 3070 hom 108 het 40 0 33 7 AT 1 0 91206 CASAVA_Build 14 94572186 1I CACAGGGGGG -/A CAGATATGAA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 0 1 91207 CASAVA_Build 14 94573629 1I GGCTCACATG -/T CCATCTCCAC 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 0 1 91208 CASAVA_Build 14 94595327 1D GTTTTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3061 het 3061 ref 29 15 10 5 A 11 10 91209 CASAVA_Build 14 94595394 1D TGGGCATGCT G/- GGGATCTGTC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 G 4 3 91210 CASAVA_Build 14 94596737 4I TCAGTATCGC ----/CAAG CAGTTTTCCC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 CAAG 0 1 91211 CASAVA_Build 14 94598666 1I TTCTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 T 10 11 91212 CASAVA_Build 14 94607878 1I TGCTGCGGAA -/T TTTTTTTTTT 2651 het 2651 ref 23 11 8 4 T 11 12 91213 CASAVA_Build 14 94614832 3D ACCAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 2722 hom 24 11 12 3 A 12 9 91214 CASAVA_Build 14 94626262 1D ACATAAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 13 12 91215 CASAVA_Build 14 94635392 1D TTATGGATGA T/- TTTTTTTTTT 1378 het 1378 ref 37 28 3 6 T 12 11 91216 CASAVA_Build 14 94662175 2I AAACTGAAGA --/CT CTGCAAACAG 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 CT 1 2 91217 CASAVA_Build 14 94675066 1D ATAAAAAAAA T/- AAAAATAAAT 937 hom 10 het 5 0 4 1 T 1 0 91218 CASAVA_Build 14 94699430 1D TACTCATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 A 11 10 91219 CASAVA_Build 14 94713563 1I CCCTCAAGCA -/T TTTTTTTTTT 2248 het 2248 ref 28 19 5 4 T 10 11 91220 CASAVA_Build 14 94715498 7I TGCCCACATC -------/TGGCCTA ACCCCTGACA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 TGGCCTA 0 1 91221 CASAVA_Build 14 94731900 2D TTGTGACGAT GA/-- GAGAGGGGAG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 GA 3 2 91222 CASAVA_Build 14 94743045 1I TAATCACTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 19 1 12 6 T 12 13 91223 CASAVA_Build 14 94748877 1D TCTGACATTC T/- TTTTTTTTTT 2279 het 1862 hom 36 11 9 16 T 17 16 91224 CASAVA_Build 14 94750830 1I AGAGACAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 T 13 14 91225 CASAVA_Build 14 94813037 1I AAAAAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 11 12 91226 CASAVA_Build 14 94844804 4I AGTCCCTGAC ----/TTAA TTGATTTTTA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 TTAA 0 1 91227 CASAVA_Build 14 94858245 1D GCCCCTCAAT C/- CTGGCTCTAC 3070 het 3070 hom 66 27 29 10 C 2 1 91228 CASAVA_Build 14 94874788 1I GGTAGGTTCT -/C CAGGTTGCCC 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 C 1 2 91229 CASAVA_Build 14 94889893 1D AAACTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1088 hom 29 5 18 6 A 15 14 91230 CASAVA_Build 14 94903699 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 11 11 A 12 13 91231 CASAVA_Build 14 94913120 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 2866 het 284 hom 21 2 9 10 A 15 14 91232 CASAVA_Build 14 94915168 11D TTTCTTTTCC TTTTCTTTTTT/----------- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 27 18 9 1 TTTTCTTTTTT 2 1 91233 CASAVA_Build 14 94916132 1D TTAGTTCTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 9 11 T 10 9 91234 CASAVA_Build 14 94917536 1D GTTCATGTAA T/- TGAAACTTCA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 2 1 91235 CASAVA_Build 14 94917696 1I ACACATACCC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 7 8 91236 CASAVA_Build 14 94919983 2D AGCATGTGAC TG/-- TGGCGCTACA 3070 het 3070 ref 46 26 15 7 TG 2 1 91237 CASAVA_Build 14 94933902 1I GTATGCAGGT -/G GGGGGGTATG 3070 hom 161 het 67 0 51 16 G 6 7 91238 CASAVA_Build 14 94936987 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1690 het 57 hom 7 1 5 1 A 13 14 91239 CASAVA_Build 14 94947868 1D CAGCCTCCCT G/- GGGGGGTCCC 3070 hom 59 het 25 0 19 6 G 7 6 91240 CASAVA_Build 14 94949286 4I TTCTCTCTCT ----/TCTC TCTCTCTGTC 3070 hom 52 het 24 0 15 9 TC 3 5 91241 CASAVA_Build 14 94961334 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 26 0 18 8 A 12 11 91242 CASAVA_Build 14 94963880 1D GTCCCCAGGG C/- CCCAGCTGTC 2539 hom 15 het 8 0 6 3 C 4 3 91243 CASAVA_Build 14 94979922 16D CTTTTTTAAA AAAAATTTTTTATTTT/---------------- AAGTAGAGAC 3070 het 3070 ref 24 13 14 1 AAAAATTTTTTATTTT 1 0 91244 CASAVA_Build 14 94980723 2D CAGGCTCTGC AG/-- AGACACAGGA 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 AG 2 1 91245 CASAVA_Build 14 94982486 1I CCTCTGCCCC -/T GACTGCAGTG 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 0 1 91246 CASAVA_Build 14 94988302 1D TTCCAGCACA C/- CCTGAGTCCC 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 C 3 2 91247 CASAVA_Build 14 94996721 1I GGAGCAAGCG -/C AGGGGACAGT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 C 0 1 91248 CASAVA_Build 14 95001432 8I GTAGATAATG --------/GTGGATGC GTGAGTGGGT 3070 het 3070 hom 69 27 33 9 GTGGATGC 0 1 91249 CASAVA_Build 14 95005967 12D CAATAATCGT TGATGATGACGA/------------ TGATGATGAC 3070 het 3070 ref 31 21 11 3 TGATGATGACGA 2 1 91250 CASAVA_Build 14 95013838 1D CTGTTTTGAC T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 T 7 6 91251 CASAVA_Build 14 95018299 1D CAAGGCAGGC G/- GATCACCTGA 3070 het 842 hom 16 3 12 1 G 2 1 91252 CASAVA_Build 14 95025841 1I GCCTGGCTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 T 9 10 91253 CASAVA_Build 14 95027812 1D AAAAATAGAT A/- AATTAGGCAT 2699 het 2699 ref 33 18 6 10 A 3 2 91254 CASAVA_Build 14 95030237 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 10 9 91255 CASAVA_Build 14 95033545 2D CCGAGGGGAG AA/-- AAAAAAAGAT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 9 7 91256 CASAVA_Build 14 95033836 20D CATGTAAATA AATGAGCATGACTGCGTTCC/-------------------- AACAAAACTT 3070 het 3070 ref 42 25 20 2 AATGAGCATGACTGCGTTCC 1 0 91257 CASAVA_Build 14 95040385 1D TTTGTTCTAG A/- AGCTCCAGAG 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 A 2 1 91258 CASAVA_Build 14 95040913 7D TCTATCTAAA AAAAAAG/------- AAAAAAGAAA 2757 het 2757 ref 23 10 8 6 AAAAAAG 4 3 91259 CASAVA_Build 14 95062046 14D TCTCCTAAGT GGCCCCGTTAGCTC/-------------- GGCCACCTCC 2558 het 2558 ref 25 13 8 8 GGCCCCGTTAGCTC 1 0 91260 CASAVA_Build 14 95074185 4D TAGTTCCTAA CAGT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 27 2 15 11 CAGT 1 0 91261 CASAVA_Build 14 95075988 4D TATATATATA TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 het 709 hom 23 7 13 3 T 13 9 91262 CASAVA_Build 14 95082178 1D TAATTAATAA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 108 het 42 0 36 7 T 7 6 91263 CASAVA_Build 14 95083166 2D CAGAAACAAA TT/-- TAAATGTGAG 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 T 3 1 91264 CASAVA_Build 14 95095817 1D CTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 1942 het 1942 ref 17 6 6 5 T 9 8 91265 CASAVA_Build 14 95096233 4I ATGTGTGTGT ----/GAGA GAGAGATGGT 3070 hom 80 het 30 0 27 3 GA 3 5 91266 CASAVA_Build 14 95097494 1D TCCACATCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 9 8 91267 CASAVA_Build 14 95105467 1D5M1D TCTCTCTCTC TTCTCTC/-TCTCT- TCTCTCTCTC 1945 het 46 hom 20 2 12 6 N/A 0 0 91268 CASAVA_Build 14 95111176 2I ATATAGAAAC --/AT AAATATTTAA 1348 hom 7 het 3 0 3 0 AT 0 1 91269 CASAVA_Build 14 95111845 1I TCCCTGCAGA -/G GGCTATTCTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 2 3 91270 CASAVA_Build 14 95111943 1I TTGGAAGTAC -/A TGGAATTAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 1 91271 CASAVA_Build 14 95114882 3D CCTTCAAACC CTT/--- CTTCTTTTTT 3070 het 2766 hom 21 9 9 3 CTT 3 2 91272 CASAVA_Build 14 95115878 2D GAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCCAA 2430 het 2430 ref 12 7 5 0 CT 2 1 91273 CASAVA_Build 14 95116027 3I ACAATACATA ---/AAT AATAATATAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAT 2 3 91274 CASAVA_Build 14 95117211 1D GTTTGTACCA G/- CCCCCTTTGG 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 G 1 0 91275 CASAVA_Build 14 95118600 4D GAGACAGAAC ATAT/---- ATATATATAT 2248 het 90 hom 20 2 7 11 AT 9 7 91276 CASAVA_Build 14 95118835 2I AAAAATACTT --/TA TATATATATA 1455 het 750 hom 5 2 3 0 TA 5 6 91277 CASAVA_Build 14 95126361 4D TTTCCTTCCT TCCC/---- TCCCTCCCTC 2169 het 632 hom 21 3 11 9 TCCC 4 3 91278 CASAVA_Build 14 95130146 13I AGCATTGGGC -------------/CCACATGTGCACA CCACATGTGC 3070 het 3070 ref 47 21 14 13 CCACATGTGCACA 1 2 91279 CASAVA_Build 14 95130680 1I GCTTCTCTCA -/G TTTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 G 0 1 91280 CASAVA_Build 14 95131168 5I CTTTTCTTTA -----/TAAAT TATTCAGTCT 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 TAAAT 0 1 91281 CASAVA_Build 14 95134613 4D ATGTGTGTGA CTGT/---- CTGAGTATGT 3070 het 3070 ref 58 31 24 6 CTGT 1 0 91282 CASAVA_Build 14 95134955 8D TGTGTGTGAA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 837 hom 58 12 20 30 TG 12 8 91283 CASAVA_Build 14 95136662 1I TTTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 36 0 27 9 A 9 10 91284 CASAVA_Build 14 95150301 8D GGATCTGTGC TCCTGTCA/-------- GCCTTCTCAT 3070 het 3070 ref 47 23 22 5 TCCTGTCA 1 0 91285 CASAVA_Build 14 95150930 1I CAACTATAAA -/C TAAATTCCTC 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 C 0 1 91286 CASAVA_Build 14 95154175 1D AGGATAAGGG A/- AAGAGCATGA 3070 hom 102 het 41 0 29 12 A 3 2 91287 CASAVA_Build 14 95154961 4I TGTGTGTCTC ----/TCTG TCTGTATCCT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 TCTG 1 2 91288 CASAVA_Build 14 95158357 2I7M4D AGGAATGAAA --CTGTCTTAAAA/CTCTGTCTT---- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 13 0 12 1 N/A 0 0 91289 CASAVA_Build 14 95158898 1I46M1D GTTTTCATTA -TTTTTTTTCTGTCATTATCATGTAAACAATGACCATTTGTTTTCTTA/TTTTTTTTTCTGTCATTATCATGTAAACAATGACCATTTGTTTTCTT- AAAAGATCTT 3070 hom 99 het 28 0 34 6 N/A 0 0 91290 CASAVA_Build 14 95169903 1D GCCAGGGGTG C/- CCCCAGCCAG 3070 het 3070 hom 47 21 19 7 C 5 4 91291 CASAVA_Build 14 95176394 3D AAAATTCTAA TCT/--- TCTAATGGCT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 TCT 2 1 91292 CASAVA_Build 14 95178827 1D TTTGAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 A 12 11 91293 CASAVA_Build 14 95190743 1D CTGGCAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1591 hom 15 4 7 4 A 10 9 91294 CASAVA_Build 14 95191410 5D TATATCTATA TTGAG/----- TTATCATTTA 3070 het 3070 ref 23 11 10 5 TTGAG 1 0 91295 CASAVA_Build 14 95191664 1D TGCCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 A 12 11 91296 CASAVA_Build 14 95192314 1D CATTGAACTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 8 7 91297 CASAVA_Build 14 95195676 2D CATATATATT TA/-- TATATATATA 2672 hom 18 het 12 0 7 6 TA 6 5 91298 CASAVA_Build 14 95197461 2I TAGGGCTGTG --/CT CTCTCTCCTG 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 CT 3 4 91299 CASAVA_Build 14 95199956 1D ACCAAACACA T/- TTTTTTTTTT 2341 het 251 hom 22 3 11 8 T 17 16 91300 CASAVA_Build 14 95202051 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTTCATT 1731 het 89 hom 11 2 7 2 C 0 1 91301 CASAVA_Build 14 95210244 1I GTGCCAGGCA -/C TGTTCTAAGA 3070 hom 132 het 52 0 44 8 C 0 1 91302 CASAVA_Build 14 95211693 1D AGGCACACAA G/- GGCAGCCTCC 3070 het 3070 ref 58 27 23 10 G 3 2 91303 CASAVA_Build 14 95216540 1I ACTTTTTGTA -/T TTTTTTGTAG 3047 het 3047 ref 25 10 8 7 T 6 7 91304 CASAVA_Build 14 95224276 1I CAGGAGAGAC -/A AAAGTTTAAT 3070 hom 42 het 18 0 13 5 A 3 4 91305 CASAVA_Build 14 95226480 1I CTCAGATCCA -/G GAGTCCATGG 3070 hom 80 het 32 0 25 7 G 1 2 91306 CASAVA_Build 14 95291499 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1658 het 335 hom 10 3 4 3 A 16 15 91307 CASAVA_Build 14 95295702 2D TGTCTGTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 1489 het 1489 ref 49 35 4 11 TG 7 6 91308 CASAVA_Build 14 95314886 1D ATCAGATCAT G/- GGGGCAGTTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 G 5 4 91309 CASAVA_Build 14 95318384 3I TAAGCATTAT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 402 hom 46 1 34 11 TTA 5 6 91310 CASAVA_Build 14 95331882 3D CACCACCCAC TCT/--- TCTTCACACA 3070 hom 117 het 44 0 40 6 TCT 2 1 91311 CASAVA_Build 14 95334868 2D GGATGAAAAC AT/-- GAGTTCTGAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 AT 1 0 91312 CASAVA_Build 14 95335555 1D AATAGCATTA G/- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 G 3 2 91313 CASAVA_Build 14 95337234 1D TTAGTTTCAA G/- GGGGTACTTG 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 G 5 4 91314 CASAVA_Build 14 95351384 1I GCGATGTAAA -/G TGGCCATTTA 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 G 0 1 91315 CASAVA_Build 14 95353141 2I GACTTGTGGG --/CA GAGATCTGGG 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 CA 0 1 91316 CASAVA_Build 14 95366014 6I ACACACAATG ------/CACACA CACACGCACA 3070 het 3070 hom 65 22 31 12 CA 2 5 91317 CASAVA_Build 14 95366561 1I CCTTGTGGTG -/T TGTGGCCTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 91318 CASAVA_Build 14 95380351 1D TAGGAATCTG T/- TTTTAATATT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 5 4 91319 CASAVA_Build 14 95445373 1D CTGCCATCTC T/- TTTTTTTTTT 1856 het 1075 hom 27 7 6 14 T 19 18 91320 CASAVA_Build 14 95461743 1I TTTATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 39 1 29 9 A 11 12 91321 CASAVA_Build 14 95462724 3I AAGAGGGGAT ---/AAC AACAACAGTC 3070 hom 63 het 29 0 21 8 AAC 2 3 91322 CASAVA_Build 14 95464670 1I TAACTCAGGG -/C CCCCTTCCCA 3070 hom 37 het 16 0 12 4 C 4 5 91323 CASAVA_Build 14 95464873 1D AAAAGAGCTC A/- CCTAGGAGAC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 1 0 91324 CASAVA_Build 14 95466197 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 7 6 91325 CASAVA_Build 14 95475159 1D GCTTGGAGAC A/- GGGAAGCTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 1 0 91326 CASAVA_Build 14 95475381 1I TTTGGTGTTG -/T TCCCATTTGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 2 91327 CASAVA_Build 14 95479908 1I CCAGTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 47 2 32 13 A 10 11 91328 CASAVA_Build 14 95485930 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2469 hom 21 het 9 0 8 1 T 11 10 91329 CASAVA_Build 14 95496244 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAGGAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 6 7 91330 CASAVA_Build 14 95502484 1D ACCATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 1537 het 1537 ref 24 13 5 6 T 17 16 91331 CASAVA_Build 14 95508689 4D ACACAGACAC ACAA/---- ACAATGTACA 3070 hom 138 het 53 0 46 8 ACAA 2 1 91332 CASAVA_Build 14 95517993 4I AAAGAGTCTC ----/AAAA AAAGGTGGGG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 3 7 91333 CASAVA_Build 14 95522615 1D TCTGTCTCAC T/- TTTTTTGACA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 7 6 91334 CASAVA_Build 14 95529490 4I ACGACCAGAG ----/GTCA GTCACTCTCG 3070 hom 122 het 46 0 40 6 GTCA 1 2 91335 CASAVA_Build 14 95532426 3I TTCCTTTGGG ---/TTA TATATACCCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TTA 0 1 91336 CASAVA_Build 14 95532764 2D TTTTAATGGG GT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 GT 1 0 91337 CASAVA_Build 14 95533820 1I CCAAGAAAAA -/G TCATTAGTTG 3070 hom 71 het 28 0 24 4 G 0 1 91338 CASAVA_Build 14 95609241 1I GAACATCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 T 10 11 91339 CASAVA_Build 14 95610957 2I ACCAAATTTG --/TT TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 T 4 6 91340 CASAVA_Build 14 95612707 1D AGCTGATGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 11 11 1 A 10 9 91341 CASAVA_Build 14 95615568 2D ATTTTATGAC TG/-- TGTGTGTTTC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 TG 4 3 91342 CASAVA_Build 14 95632861 4D GCTTCTGGAT AGAG/---- AGAGTTTTGT 3070 het 3070 ref 52 26 20 9 AG 4 2 91343 CASAVA_Build 14 95635916 4D ATGAACAAAC TAAG/---- TATTTTGAGA 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 TAAG 1 0 91344 CASAVA_Build 14 95648810 1D TTTTCCCACT C/- AAGAGTCCAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 C 1 0 91345 CASAVA_Build 14 95649177 2I AGCAAAAATC --/AA AGACTAATGA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 1 3 91346 CASAVA_Build 14 95649942 1I AAAAATTAGC -/T TGGGGGGGTG 2923 het 2923 ref 17 9 7 1 T 1 2 91347 CASAVA_Build 14 95656163 1I TGATCTGGGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 52 21 17 14 A 9 10 91348 CASAVA_Build 14 95659919 1D CACACACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 11 10 91349 CASAVA_Build 14 95666986 3I GGAGTATTAT ---/TAA TAATTACATC 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 TAA 1 2 91350 CASAVA_Build 14 95670049 3I TAGGATGGGT ---/ATA ATCAAAGAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATA 0 1 91351 CASAVA_Build 14 95689082 3D ACTCTGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 28 1 21 6 A 15 12 91352 CASAVA_Build 14 95690817 4I45M1D ATTGTGCCAC ----TGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAT/TGCATGCACTCCAGCCTAGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAA- AAAAAAAAGA 3070 hom 27 het 8 0 10 0 N/A 0 0 91353 CASAVA_Build 14 95691380 3D TATCACAAAA CTT/--- CTGCGTAAGA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 CTT 1 0 91354 CASAVA_Build 14 95692954 5I CAGGGCGCCA -----/CCTGC CCTGCACGAT 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 CCTGC 1 2 91355 CASAVA_Build 14 95694126 1I AGAGACGGGG -/T TTTCACTATG 3070 hom 33 het 14 0 11 4 T 3 4 91356 CASAVA_Build 14 95700904 1I CTAAAATTAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 1664 hom 16 5 11 0 A 7 8 91357 CASAVA_Build 14 95714771 1D TCCACATTCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 T 8 7 91358 CASAVA_Build 14 95720673 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 10 9 91359 CASAVA_Build 14 95728989 1I TTCTGGGTGT -/G GGGGATTCTC 3070 hom 99 het 38 0 32 6 G 4 5 91360 CASAVA_Build 14 95732527 3D CAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAATAC 35 het 35 ref 29 16 1 13 AAG 1 0 91361 CASAVA_Build 14 95740961 9D TCCGAGGAGG GGTGGGGAC/--------- GGTGGGGACG 2085 hom 24 het 12 0 7 5 GGTGGGGAC 3 2 91362 CASAVA_Build 14 95743516 1D AGTAAAAAAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 A 8 7 91363 CASAVA_Build 14 95746088 3D TCTATCTCAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 12 het 22 1 16 5 AAT 7 6 91364 CASAVA_Build 14 95751562 1I AATGCCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 31 1 25 5 A 10 11 91365 CASAVA_Build 14 95753832 1D GGAGCCCCGA G/- GCAGGGACAG 2786 het 2165 hom 22 9 9 4 G 2 1 91366 CASAVA_Build 14 95758808 1D TGCTTCAAAC T/- GGTATGCTAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 T 1 0 91367 CASAVA_Build 14 95761548 1D GATATCCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 T 10 9 91368 CASAVA_Build 14 95763775 2D GTGCACACAA AC/-- ACACACATGC 3070 het 3070 ref 74 36 23 16 AC 4 3 91369 CASAVA_Build 14 95771906 2I CCCACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 48 15 15 18 CA 8 9 91370 CASAVA_Build 14 95779572 16D CAGAACCTGG AGGGCTAGAACCTGGA/---------------- AGGGCTAGAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 9 AGGGCTAGAACCTGGA 1 0 91371 CASAVA_Build 14 95780537 1D AAGAAGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 12 11 91372 CASAVA_Build 14 95807839 1I CAGGCAGCTA -/G TCACTCTGCT 3070 hom 99 het 36 0 32 4 G 0 1 91373 CASAVA_Build 14 95809186 9D ATCCGGTTTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 32 2 18 15 A 23 14 91374 CASAVA_Build 14 95819394 1I GCATGACACC -/A AACCCAACCA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 2 3 91375 CASAVA_Build 14 95824103 1D ACTTAGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 137 het 57 0 45 12 T 12 11 91376 CASAVA_Build 14 95829439 1I CCTTTCTCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 9 10 91377 CASAVA_Build 14 95835010 4I GTGCAATCAA ----/TGTT TGTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 TGTT 1 2 91378 CASAVA_Build 14 95837408 8D CTAGTAAAAG CTACAGAA/-------- CTAAGACTGG 3070 hom 105 het 38 0 36 4 CTACAGAA 1 0 91379 CASAVA_Build 14 95838268 1I TAAAAATAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 9 10 91380 CASAVA_Build 14 95838670 1D TGTTGGGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 A 10 9 91381 CASAVA_Build 14 95843189 2D CACCTCAGCA AG/-- AGTCAGAAAT 3070 het 3070 hom 44 19 22 4 AG 2 1 91382 CASAVA_Build 14 95850687 1D ACATATAAGA T/- AACTCTGTCA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 1 0 91383 CASAVA_Build 14 95860091 1I GAACGATCCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 A 9 10 91384 CASAVA_Build 14 95870600 1I AACTTAAGGG -/A AAAAAAAAAA 650 het 650 ref 28 15 4 9 A 11 12 91385 CASAVA_Build 14 95912430 1I TTTGCTTATG -/C CTTTGTTCCC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 C 1 2 91386 CASAVA_Build 14 95924869 2I GTTCAAAAAC --/AT AGAATGTGCT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 AT 0 1 91387 CASAVA_Build 14 95925476 1D ACTCAATGTC A/- AAAAAAAAAA 2486 het 2486 ref 26 13 8 7 A 15 14 91388 CASAVA_Build 14 95928760 1D AATAAATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 19 2 11 6 T 12 11 91389 CASAVA_Build 14 95929919 2D ATCAAAAAAC AG/-- AGATTTAGGG 3070 het 3070 hom 30 12 12 8 AG 2 1 91390 CASAVA_Build 14 95998870 4D TGGCTTGCAG CTAT/---- CTAATTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 21 5 CTAT 1 0 91391 CASAVA_Build 14 95999810 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 490 het 38 hom 6 1 3 2 A 19 18 91392 CASAVA_Build 14 96019501 1D TTTTGCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1880 hom 23 9 12 2 T 13 12 91393 CASAVA_Build 14 96051089 1D GAAGTCACAG T/- TTTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 7 6 91394 CASAVA_Build 14 96055186 1I TAAAATACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2104 hom 27 7 14 6 T 13 14 91395 CASAVA_Build 14 96069751 13D TTCATGCTAT TCTCCTGCCTTAG/------------- TCTCCTGAGT 1777 het 1536 hom 9 5 4 1 TCTCCTGCCTTAG 1 0 91396 CASAVA_Build 14 96085340 1D GTTATTCTAA T/- TTTTTTTTTT 2581 het 1969 hom 36 11 7 18 T 17 16 91397 CASAVA_Build 14 96088035 6D CTGAAGTCTC TTGCTT/------ TTGAGAGAGG 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 TTGCTT 1 0 91398 CASAVA_Build 14 96093660 1D TTTCATTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2465 hom 28 8 10 11 T 12 11 91399 CASAVA_Build 14 96094239 1D GTTTTTGGGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 8 7 91400 CASAVA_Build 14 96111758 3I AGAGGTTGTT ---/GAG GAGGTGCTTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 GAG 1 2 91401 CASAVA_Build 14 96112175 1D CATAATCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 15 14 91402 CASAVA_Build 14 96112502 1I AGAAAGTTAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 57 27 22 8 A 8 9 91403 CASAVA_Build 14 96140208 1D TCCTTCCCCC T/- GAACACACTC 3070 het 3070 ref 36 20 11 6 T 1 0 91404 CASAVA_Build 14 96152107 11I ACGCAGTGAC -----------/CTGGCACTGTG AGCACCTGGC 3070 hom 114 het 45 0 38 7 CTGGCACTGTG 0 1 91405 CASAVA_Build 14 96154194 1I TTTCCTGGGA -/C CCCTGCTTCC 3070 hom 111 het 39 0 37 2 C 3 4 91406 CASAVA_Build 14 96183805 1I TTGTCTATGA -/C TTTTGACAGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 91407 CASAVA_Build 14 96192618 1I TAGTTGACAG -/T TTTTTTTTTT 1198 het 1198 ref 43 36 3 4 T 11 12 91408 CASAVA_Build 14 96235548 1D CCAGCCTGCA G/- GGGGGGGCCA 3070 hom 85 het 36 0 28 8 G 8 7 91409 CASAVA_Build 14 96237420 1D TGGGCCAGGA C/- CCCCCCTCCC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 7 6 91410 CASAVA_Build 14 96244243 1D TAAAATAGTT C/- CCCCCCCCAG 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 C 9 8 91411 CASAVA_Build 14 96246477 1I GCATTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 A 11 12 91412 CASAVA_Build 14 96253392 1I TGAAGCCCCC -/G CCCCAACCCC 1024 het 1024 ref 24 11 4 9 G 0 1 91413 CASAVA_Build 14 96259237 1D CTCTACCCTC G/- AGCGGCACTC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 G 1 0 91414 CASAVA_Build 14 96263614 4D GAGAGGAGTC AGAG/---- AGGCTATTAG 3070 het 3070 hom 43 20 20 5 AG 3 1 91415 CASAVA_Build 14 96264306 1I GGTCTGCCCA -/G GGGAAGGGCC 2994 het 2994 ref 27 12 9 6 G 3 4 91416 CASAVA_Build 14 96280275 2D ACACGGGCTC TG/-- TGGGAAGAGA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TG 2 1 91417 CASAVA_Build 14 96281715 5D CTTCCCAACC TGCAG/----- TGACTTAACA 3070 het 3070 ref 54 24 22 9 TGCAG 1 0 91418 CASAVA_Build 14 96287592 2I TAAAACAGAA --/TT TTACCATTTG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 2 4 91419 CASAVA_Build 14 96288601 1I GGGGCCTAGG -/A AAAAATTACA 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 A 5 6 91420 CASAVA_Build 14 96288875 1D AGCTATGGCT C/- CCGGATGTAA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 C 3 2 91421 CASAVA_Build 14 96298196 1I ACAAATGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 10 11 91422 CASAVA_Build 14 96310723 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 35 0 25 11 T 10 9 91423 CASAVA_Build 14 96351978 1D CCCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 1530 het 1530 ref 34 21 4 9 A 13 12 91424 CASAVA_Build 14 96364246 3D TTCATTTTCC TGT/--- TGTTGGACAT 3070 hom 150 het 54 0 49 8 TGT 2 1 91425 CASAVA_Build 14 96368212 1D AATTCAATTT A/- AAAAGTCCCC 3070 hom 104 het 37 0 34 3 A 5 4 91426 CASAVA_Build 14 96374662 1I TACTTTTTCT -/C CTACGGGATA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 C 1 2 91427 CASAVA_Build 14 96381302 1I CTTTAAAAAC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 91428 CASAVA_Build 14 96387231 1I TTGTCACAAA -/T TTTTTTTTTT 1907 het 1907 ref 26 16 5 5 T 15 16 91429 CASAVA_Build 14 96395355 4D CTAGTTCTAG TAGT/---- TCTTTGTAGA 3070 hom 144 het 50 0 49 1 TAGT 1 0 91430 CASAVA_Build 14 96400971 1D TTGATAATCC T/- TTTTTTTTGG 1094 het 1094 ref 29 23 3 4 T 9 8 91431 CASAVA_Build 14 96411884 1D TATAACAAAT A/- TATCTACCAT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 1 0 91432 CASAVA_Build 14 96461570 1I GCTTGAGTGG -/C CCCCCGGGCT 3070 hom 60 het 26 0 15 11 C 5 6 91433 CASAVA_Build 14 96466458 1I TAAAGGGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 284 hom 36 2 21 13 T 16 17 91434 CASAVA_Build 14 96470850 1I CCCAAAAGCA -/G CCAAGGTGCA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 G 0 1 91435 CASAVA_Build 14 96474779 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2176 het 53 hom 14 1 9 4 A 17 16 91436 CASAVA_Build 14 96491479 3I TTAAAAACTA ---/AAC AAAACCTAGG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAC 0 1 91437 CASAVA_Build 14 96515232 1D GCCACTATGT G/- GGGCTTGAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 4 3 91438 CASAVA_Build 14 96557491 1I AAAAGGAATT -/A AAAAAAAAAA 1082 het 1082 ref 35 22 4 9 A 13 14 91439 CASAVA_Build 14 96606748 4I ATATATGTGA ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 ATCT 3 4 91440 CASAVA_Build 14 96628015 1I TCAAAAAAAC -/A AAAACAAACA 1246 het 1246 ref 20 9 3 10 A 4 5 91441 CASAVA_Build 14 96631960 2D TCATGCACTC AG/-- AGAACATCTG 3070 het 3070 hom 40 18 19 5 AG 2 1 91442 CASAVA_Build 14 96633427 1I CCTGCAATGG -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 54 23 22 9 A 6 7 91443 CASAVA_Build 14 96649395 1D TTTTATAGTG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 33 14 14 8 T 8 7 91444 CASAVA_Build 14 96649994 1D ATGTTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 A 11 10 91445 CASAVA_Build 14 96651638 1I CAGTCCTTGA -/T TCAAACAGAT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 1 2 91446 CASAVA_Build 14 96654862 1D TAGTGATGGT G/- GGGTTTTGTC 3070 het 3070 ref 46 21 19 8 G 4 3 91447 CASAVA_Build 14 96668924 1D GCCTCACAAT C/- ATGGTGGAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 3 C 1 0 91448 CASAVA_Build 14 96669245 1I AAATTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 19 1 15 3 T 10 11 91449 CASAVA_Build 14 96670586 1I AAGACCTAGA -/G GGGGCACCTG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 G 4 5 91450 CASAVA_Build 14 96671968 3D CCAACATCAT CAC/--- CACCACCACC 3070 het 4 hom 48 0 28 22 CAC 7 6 91451 CASAVA_Build 14 96677962 1I GTGTGTGTGT -/G CGGGGGGGGG 2611 het 424 hom 24 4 12 8 G 0 1 91452 CASAVA_Build 14 96679225 2D TTACATACTA AG/-- AGCTGTGTGG 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 AG 2 1 91453 CASAVA_Build 14 96684489 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2260 het 2155 hom 16 7 6 3 A 10 11 91454 CASAVA_Build 14 96687626 1I TTTAGGTCAC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 7 8 91455 CASAVA_Build 14 96706491 1I CATCTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 11 12 91456 CASAVA_Build 14 96732817 1I CAGACTCATG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 38 0 26 12 T 9 10 91457 CASAVA_Build 14 96741094 1I TTCTATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 10 11 91458 CASAVA_Build 14 96800052 1D GTTTAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 2982 het 2761 hom 32 12 12 8 A 15 14 91459 CASAVA_Build 14 96890467 2I AAAGATAGAG --/TA TTTCTCTCAT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 TA 0 1 91460 CASAVA_Build 14 96890855 1I TGGTCATGCA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 158 het 59 0 51 8 T 7 8 91461 CASAVA_Build 14 96893443 2D GTTTTCTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 12 10 91462 CASAVA_Build 14 96894095 4D TGAAAAGATA GATG/---- GATGGATGGA 3070 hom 78 het 32 0 26 8 GATG 3 2 91463 CASAVA_Build 14 96964015 1I TTAGTGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 T 13 14 91464 CASAVA_Build 14 96984158 10D TTATTTGTTC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 2938 het 61 hom 14 2 7 5 AT 16 11 91465 CASAVA_Build 14 97025828 1I GTGCTTATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 28 4 14 10 A 13 14 91466 CASAVA_Build 14 97031952 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 6 7 91467 CASAVA_Build 14 97037266 1D CTGGGAAAGG T/- TTCTGAACTC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 3 2 91468 CASAVA_Build 14 97048560 1D AATCTATACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 T 10 9 91469 CASAVA_Build 14 97056192 23D2M6D GAATTCCTGA GATATCAGTTTGATATCAGTTTGAGATATCA/-----------------------AG------ GTTGACATGC 3070 het 3070 ref 49 38 19 9 N/A 0 0 91470 CASAVA_Build 14 97056983 1D GATTTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 A 13 12 91471 CASAVA_Build 14 97064074 1D AAGCAGCATC A/- GGGGTGTTCA 3070 het 3070 ref 62 27 29 7 A 1 0 91472 CASAVA_Build 14 97071165 1I AAGTCAAACA -/C CATTCCTCAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 C 1 2 91473 CASAVA_Build 14 97150943 1I TCTCTCTCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 8 9 91474 CASAVA_Build 14 97175428 1I GTAGCCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 10 11 91475 CASAVA_Build 14 97187280 2D AATTAAATGC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 224 hom 41 2 17 23 A 11 9 91476 CASAVA_Build 14 97187518 1D GGGACCTGGT G/- GGAAGTGATT 3070 het 3070 hom 35 9 12 15 G 3 2 91477 CASAVA_Build 14 97219524 4D CAGCCTTCCC TCTG/---- TCTGCAGAGA 3070 hom 66 het 26 0 22 8 TCTG 2 1 91478 CASAVA_Build 14 97242222 1D GAGTGCACAG C/- CCAGTGTACA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 3 2 91479 CASAVA_Build 14 97244717 4D GGGAGGGAAG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 83 het 35 0 26 9 GA 7 5 91480 CASAVA_Build 14 97247125 2I GTGTGAGAGC --/TA TGAGTCCAAA 3070 hom 123 het 52 0 42 10 TA 0 1 91481 CASAVA_Build 14 97248286 2D CAGAAATAGA CT/-- CTGCAGACAG 3070 hom 110 het 41 0 31 10 CT 2 1 91482 CASAVA_Build 14 97249974 1D GCTGTGGTCT A/- AAAAAATAGA 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 7 6 91483 CASAVA_Build 14 97252914 1D TAACTTGCTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 108 het 43 0 37 8 T 9 8 91484 CASAVA_Build 14 97253750 2D TCTTTCTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 31 1 26 4 T 14 12 91485 CASAVA_Build 14 97261180 1I TGAACTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 36 1 28 8 T 12 13 91486 CASAVA_Build 14 97263231 8I ACTGTATCAT --------/TTTATTTC TTCATAGCCC 3070 hom 82 het 34 0 27 7 TTTATTTC 0 1 91487 CASAVA_Build 14 97266271 1I ACCACATACT -/G GGTGGCTTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 2 3 91488 CASAVA_Build 14 97280311 1I GGAGGTGGCT -/A AAAAAATATT 3070 hom 94 het 40 0 32 8 A 6 7 91489 CASAVA_Build 14 97297600 3D AACAAAACAA AAC/--- AACAAACAAT 2335 hom 30 het 21 0 11 10 AAC 2 1 91490 CASAVA_Build 14 97298077 1D TTAAGTCTTA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 54 18 26 10 T 9 8 91491 CASAVA_Build 14 97311075 1D CAACATATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 10 9 91492 CASAVA_Build 14 97313261 3I GGCCTACTTT ---/GGA GGAGAACAGC 3070 hom 77 het 30 0 24 6 GGA 1 2 91493 CASAVA_Build 14 97319949 1I AGAAAGAAGG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 7 8 91494 CASAVA_Build 14 97328602 1I TACTCAGAAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 7 8 91495 CASAVA_Build 14 97346323 1I CTAATTAATT -/G GATCCTGGAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 G 1 2 91496 CASAVA_Build 14 97351105 1D TAGCTGCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 19 9 T 12 11 91497 CASAVA_Build 14 97355148 5I AGATAGCCCC -----/CTATG CTTACCAGCT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 CTATG 0 1 91498 CASAVA_Build 14 97362356 1I CATTTATAAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 8 9 91499 CASAVA_Build 14 97363111 1I TACATGATAG -/A AAAAAAGCCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 6 7 91500 CASAVA_Build 14 97364268 1D TCAAGAGTTC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 8 7 91501 CASAVA_Build 14 97365062 3I AATAGCATAA ---/ATG ATGATTATGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 ATG 1 2 91502 CASAVA_Build 14 97366520 1I TTTTAAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 10 11 91503 CASAVA_Build 14 97366877 4D TCCTCTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 15 13 9 TTTG 4 3 91504 CASAVA_Build 14 97372504 1I CAAGAACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 T 10 11 91505 CASAVA_Build 14 97373408 4D AGAGGGAGAC AGAG/---- AGAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AG 3 1 91506 CASAVA_Build 14 97375030 1D GCAGCGCGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 13 8 T 13 12 91507 CASAVA_Build 14 97381569 1I ATCTCTTATC -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 6 7 91508 CASAVA_Build 14 97388648 2I ACACACACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 AC 7 8 91509 CASAVA_Build 14 97390647 4D TTTGAATGGC TAAA/---- TAAATAAATA 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 TAAA 4 3 91510 CASAVA_Build 14 97392521 2D TGGGAAATTT CC/-- CCCCCCCCGA 3070 het 1192 hom 23 6 11 7 C 10 8 91511 CASAVA_Build 14 97392921 4I TCAAAAAAAT ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 AAAG 3 4 91512 CASAVA_Build 14 97393319 1D ACATAACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 T 12 11 91513 CASAVA_Build 14 97398207 2I TAATTTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 1640 het 1640 ref 21 9 7 5 T 12 14 91514 CASAVA_Build 14 97401130 1D AAGATTCTTT C/- CCCCCGCTCA 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 C 6 5 91515 CASAVA_Build 14 97401460 1D CACTACATGT A/- GAGGGTTCTG 3070 het 3070 ref 52 30 19 3 A 1 0 91516 CASAVA_Build 14 97402515 1I CATTGCCCTG -/A AGCCTTGGCA 3070 het 3070 hom 60 22 32 6 A 1 2 91517 CASAVA_Build 14 97408496 1I TATCAAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 A 8 9 91518 CASAVA_Build 14 97425512 1I GGGGACACAG -/C AAAACCTTAT 3070 het 2883 hom 33 7 13 13 C 0 1 91519 CASAVA_Build 14 97425536 1I AAGGCATGCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 8 17 12 T 7 8 91520 CASAVA_Build 14 97426098 1D AGTATAATCA T/- TTTTATACAC 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 5 4 91521 CASAVA_Build 14 97429115 1D AAGGCACTGG A/- AAGGGAGGGT 3070 het 3070 hom 52 23 21 8 A 3 2 91522 CASAVA_Build 14 97431486 2D CAGACTCACA CT/-- CACACACATA 3070 het 3070 ref 71 34 26 12 CT 1 0 91523 CASAVA_Build 14 97431590 18D TACAGATTCA CACACACATAGACACAGT/------------------ CACACATACA 3070 het 3070 ref 74 40 33 18 CACACACATAGACACAGT 1 0 91524 CASAVA_Build 14 97431997 4I ATACACACAG ----/ACTC ACAGACTCAC 3070 hom 272 het 101 0 89 12 ACTC 0 1 91525 CASAVA_Build 14 97436656 1I TCTACTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 18 12 A 11 12 91526 CASAVA_Build 14 97437564 2D ACATGTTGTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 11 9 91527 CASAVA_Build 14 97440555 3D AGACAGGGGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 A 14 11 91528 CASAVA_Build 14 97444424 1D ATGGTTGAGG T/- TTTGAAGGAA 3070 het 3070 hom 47 15 27 8 T 4 3 91529 CASAVA_Build 14 97444767 1D GGCAACTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 8 9 T 13 12 91530 CASAVA_Build 14 97445376 1D CTTGTCCTCC T/- CTTCCTCTCT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 1 0 91531 CASAVA_Build 14 97446562 6D TTATCATGAA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 4 het 15 0 9 7 AT 12 9 91532 CASAVA_Build 14 97448906 1D GATGGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1066 hom 36 5 20 12 A 14 13 91533 CASAVA_Build 14 97455620 1D ATACAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 36 1 28 7 T 15 14 91534 CASAVA_Build 14 97456204 1D TGCCCCGCCT G/- ACTCTTCAAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 7 G 1 0 91535 CASAVA_Build 14 97456769 2D ACACACACCG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 87 het 38 0 29 9 AC 10 9 91536 CASAVA_Build 14 97460361 1D GAAATGAGTC A/- GGGGTGGAGC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 1 0 91537 CASAVA_Build 14 97461717 1D TTTGTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 22 4 T 11 10 91538 CASAVA_Build 14 97473063 1D CCTATTATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 26 0 25 1 T 9 8 91539 CASAVA_Build 14 97478732 1D AAGTCCAAGA T/- TCAAGGCACC 3070 het 3070 hom 41 12 22 9 T 2 1 91540 CASAVA_Build 14 97481186 5I GGTTGAGTCA -----/CTTCT CTTCTCAGAG 3070 het 3070 ref 47 27 13 7 CTTCT 1 2 91541 CASAVA_Build 14 97481339 2D ACATACAGAG AC/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 AC 1 0 91542 CASAVA_Build 14 97481430 7D GTTTAATAGG CTCAAAT/------- CTTCAGGATT 3070 het 3070 ref 44 30 12 2 CTCAAAT 1 0 91543 CASAVA_Build 14 97494401 2I CCAAATGCAC --/TG AGAGTACAGG 3070 hom 144 het 49 0 48 2 TG 0 1 91544 CASAVA_Build 14 97496536 1D AAAGAATAGT G/- TTCTATGGCC 3070 het 3070 ref 45 25 18 3 G 1 0 91545 CASAVA_Build 14 97497695 1D TCAAGAAAGT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 40 1 35 5 A 9 8 91546 CASAVA_Build 14 97501141 1I GTGGACACCG -/C CCCCCCCCGC 2527 het 2527 ref 22 11 8 3 C 8 9 91547 CASAVA_Build 14 97513484 2D GGTACATTTC AA/-- AAAAAAATAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 9 7 91548 CASAVA_Build 14 97515579 2D ACGCACACAC AT/-- GTTTGTGTCC 3070 het 3070 hom 58 23 32 5 AT 1 0 91549 CASAVA_Build 14 97519306 2I CACTATCCCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 T 9 11 91550 CASAVA_Build 14 97546224 4D TAATAATAAT AAAC/---- AATAGCAACA 3070 het 3070 hom 31 12 18 2 AAAC 1 0 91551 CASAVA_Build 14 97550858 12D AGATGAATGA ATTAATGTATCC/------------ ATTCACTCAC 3070 het 3070 ref 35 19 15 4 ATTAATGTATCC 1 0 91552 CASAVA_Build 14 97568223 1I TGCAATGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 10 11 91553 CASAVA_Build 14 97682910 1I TAGCTACTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 8 8 7 A 9 10 91554 CASAVA_Build 14 97684303 4D AAAGAGAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAC 3070 het 3070 hom 24 10 14 2 AG 6 4 91555 CASAVA_Build 14 97687038 4I TCTTTCTCCT ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 CA 7 9 91556 CASAVA_Build 14 97691094 2D CCCAATAGAG TC/-- TCTCTCTCTC 2028 het 1036 hom 15 4 8 3 TC 10 9 91557 CASAVA_Build 14 97693690 2D TTTAACCTAC TT/-- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 9 7 91558 CASAVA_Build 14 97696865 3I TCTTTCTCTC ---/CTT CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 CTT 1 2 91559 CASAVA_Build 14 97698312 1D ACTCTGACTG T/- TTTTAAATGA 3070 het 3070 hom 33 13 16 6 T 5 4 91560 CASAVA_Build 14 97712101 3D CCGGCATTTC AGG/--- AGGTGATAAG 3070 het 3070 hom 35 14 17 7 AGG 2 1 91561 CASAVA_Build 14 97715064 1I TTAATGTGGG -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 7 8 91562 CASAVA_Build 14 97725983 1I ACACCCTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 T 9 10 91563 CASAVA_Build 14 97751322 1D GTGTGAGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 39 1 30 8 T 11 10 91564 CASAVA_Build 14 97752071 1I AGATATCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 246 hom 35 1 27 7 A 10 11 91565 CASAVA_Build 14 97773339 1D GTTTTGAATC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 8 7 91566 CASAVA_Build 14 97778434 1D TCTTCCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 31 2 15 14 T 12 11 91567 CASAVA_Build 14 97782941 1I TCTCTGCCCC -/T AGCTTCCCTA 3070 hom 106 het 42 0 36 6 T 0 1 91568 CASAVA_Build 14 97792086 1I CCTCCATAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 9 10 91569 CASAVA_Build 14 97806550 1I GTGGAAAAAG -/C TTTCCTGAGT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 C 0 1 91570 CASAVA_Build 14 97810791 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 814 het 423 hom 36 8 4 24 T 17 15 91571 CASAVA_Build 14 97814212 1I GAAAAAAAAA -/G ATACCACAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 G 0 1 91572 CASAVA_Build 14 97814299 1D GGGAGTGAGG T/- GGGGGCCAGG 3070 het 3070 hom 52 23 25 4 T 1 0 91573 CASAVA_Build 14 97814692 7I GCACCTATCC -------/AGAAGAA AACATAAAGG 3070 het 3070 ref 54 26 20 8 AGAAGAA 0 1 91574 CASAVA_Build 14 97815190 1D CCAGGGATGT G/- TGAGTTCCCC 3070 het 3070 ref 58 29 25 4 G 1 0 91575 CASAVA_Build 14 97819973 1I GTGTTATTTT -/C CTTATGGAAA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 C 1 2 91576 CASAVA_Build 14 97829364 1I GCTTGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 12 13 91577 CASAVA_Build 14 97834271 1D ATGGTGCTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 9 8 91578 CASAVA_Build 14 97838941 2I GCTGACTGTC --/TT TTAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 2 4 91579 CASAVA_Build 14 97848483 2I CGAATCCTGT --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 8 10 91580 CASAVA_Build 14 97853451 2D TAGATATCAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 23 12 11 0 TA 6 5 91581 CASAVA_Build 14 97858211 1I TTCTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2341 hom 40 11 16 13 T 15 16 91582 CASAVA_Build 14 97864578 2D GTTTAATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 37 1 29 9 A 13 11 91583 CASAVA_Build 14 97871993 1I AGATGGTTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 2561 hom 21 8 10 3 T 7 8 91584 CASAVA_Build 14 97872376 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3012 hom 36 het 14 0 13 1 A 14 15 91585 CASAVA_Build 14 97874179 1I TTTGGTTATC -/T TTTTTTGAAT 3070 hom 97 het 39 0 33 6 T 6 7 91586 CASAVA_Build 14 97882453 1I TAGTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 33 3 28 2 A 10 11 91587 CASAVA_Build 14 97886050 2I AATTTTTTTA --/TT TTTTTTTTTT 2211 het 2211 ref 23 14 6 3 T 10 12 91588 CASAVA_Build 14 97891649 20D AGTGTCCTAT TGCTATGGTAAGTGATACCA/-------------------- TGCTATGGTA 3070 het 3070 ref 66 34 28 15 TGCTATGGTAAGTGATACCA 2 1 91589 CASAVA_Build 14 97910856 1I GTATGGTTTG -/C CCTGTTGCTA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 C 2 3 91590 CASAVA_Build 14 97916310 3I CTGTGTGTGC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 11 14 91591 CASAVA_Build 14 97916445 1I ATTTAATGTA -/G AGAAGGATTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 0 1 91592 CASAVA_Build 14 97917627 1D ATACTGTTAA C/- CTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 C 2 1 91593 CASAVA_Build 14 97920875 1I AAAGAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 11 12 91594 CASAVA_Build 14 97927648 1D AAATAAAAAA T/- ATATATATAT 926 hom 7 het 6 0 3 3 T 1 0 91595 CASAVA_Build 14 97930475 1I AAATCACTTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 48 18 18 12 T 8 9 91596 CASAVA_Build 14 97930981 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAAAAC 3070 het 89 hom 31 2 25 4 C 1 0 91597 CASAVA_Build 14 97936635 2D AGAAATTGTG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 6 5 91598 CASAVA_Build 14 97942736 1I ACAATTATTC -/T TTTCCGAGAA 3070 hom 154 het 54 0 52 2 T 3 4 91599 CASAVA_Build 14 97943505 1D ATTTCTTCAA G/- GAATGTATAG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 G 2 1 91600 CASAVA_Build 14 97944010 3D TCCTTTTAAC AAG/--- AAGAACTGAT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 AAG 2 1 91601 CASAVA_Build 14 97945161 1I TTTTCCGATT -/G GAATTGAGAA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 G 1 2 91602 CASAVA_Build 14 97954181 4D GTGTGAGAGA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 54 hom 45 3 26 17 GT 15 13 91603 CASAVA_Build 14 97976535 2I CGAGAACAGC --/TG ATGAGGGAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TG 0 1 91604 CASAVA_Build 14 97995584 9I TCTAGTACAT ---------/AAAAAAAGA AAAAAAAGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAAAAAAGA 1 2 91605 CASAVA_Build 14 97997187 1I GTTCATGACC -/T GATATAGTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 91606 CASAVA_Build 14 98005859 2I GCTTAATGTA --/CG CACACGAGTG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 CG 0 1 91607 CASAVA_Build 14 98052199 1D ATTTGTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 38 1 25 14 A 13 12 91608 CASAVA_Build 14 98055401 1D CCGTGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 2206 het 2206 ref 42 27 7 9 A 13 12 91609 CASAVA_Build 14 98076169 1D CCCCACAATT A/- AAAAAAAAAA 1641 het 1641 ref 39 28 5 7 A 12 11 91610 CASAVA_Build 14 98083380 1I AGTACAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 33 0 18 15 A 11 12 91611 CASAVA_Build 14 98089261 1D GAATCACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 40 1 34 5 A 11 10 91612 CASAVA_Build 14 98092173 2I AAAGCAAATT --/CA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 CA 0 1 91613 CASAVA_Build 14 98093835 1D CTTGTGTCTA T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 T 7 6 91614 CASAVA_Build 14 98097669 1D ATGAGTTTCA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 T 6 5 91615 CASAVA_Build 14 98099420 1D GTGAGAGATG C/- ACATACTGAA 3070 het 3070 ref 37 24 9 4 C 1 0 91616 CASAVA_Build 14 98105584 13D CTGGACCCAA TATAATTTTGAAT/------------- TACTTTACTG 3070 het 3070 ref 33 22 14 8 TATAATTTTGAAT 1 0 91617 CASAVA_Build 14 98112883 1I AAGTGAAAAA -/T TAATCATCAT 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 T 1 2 91618 CASAVA_Build 14 98113379 2D AATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 1013 het 1013 ref 39 28 3 8 TG 9 8 91619 CASAVA_Build 14 98118939 1I CAATGCGTCC -/A ACACAACAGT 3070 het 3070 ref 60 28 25 7 A 1 2 91620 CASAVA_Build 14 98131371 1D CATTATGTAG C/- ATAAACAAGG 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 C 1 0 91621 CASAVA_Build 14 98133224 1D GTTGAAACTT A/- ATGGCCAATG 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 A 2 1 91622 CASAVA_Build 14 98136606 1I AAAACTAATA -/T AAATTAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 0 1 91623 CASAVA_Build 14 98137426 1D TGGGTGTCTG C/- CCCCCTCCCA 3070 het 3070 hom 37 10 13 14 C 6 5 91624 CASAVA_Build 14 98146220 1I GGAACTCATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 9 10 91625 CASAVA_Build 14 98167827 1I AAAACGACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 9 10 91626 CASAVA_Build 14 98168270 1D GCAAAAAAAA T/- GTGAGAAATG 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 1 0 91627 CASAVA_Build 14 98177352 1D TTACACAGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 T 9 8 91628 CASAVA_Build 14 98193310 1I TTCTATGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 T 11 12 91629 CASAVA_Build 14 98195101 1I TACTGCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 34 1 19 14 A 10 11 91630 CASAVA_Build 14 98198276 1I GATTTTTTTT -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 A 7 8 91631 CASAVA_Build 14 98207901 12D AATAAAACTC ACCAGTTTAGAG/------------ TGTACAGTTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 3 ACCAGTTTAGAG 1 0 91632 CASAVA_Build 14 98211506 11D GTTCTTTAGG TGTACTATCTT/----------- TGTCTGATTA 3070 hom 57 het 21 0 20 4 TGTACTATCTT 1 0 91633 CASAVA_Build 14 98214866 25I4M8I12M8I AGAGCTTCCA -------------------------TCTA--------AAAAAAAAAAAA--------/GACAACCGAGATCATGCCACTGCATTCTAGTCTGGGCAACAAAGAGAGACTCCATCT AAAAAAAAAT 3070 het 1022 hom 10 5 7 0 N/A 0 0 91634 CASAVA_Build 14 98216745 1D GATGTAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 46 1 32 14 A 13 12 91635 CASAVA_Build 14 98222762 4I ACCAACTCTC ----/TGTT TGTTTCCTTA 3070 het 3070 ref 52 23 20 9 TGTT 1 2 91636 CASAVA_Build 14 98223452 2I ACGCGCCCCA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 AC 6 7 91637 CASAVA_Build 14 98226366 1I AAGAAACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 T 10 11 91638 CASAVA_Build 14 98228062 14D AACTCCTTCT AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 2288 het 2288 ref 16 12 6 1 A 26 12 91639 CASAVA_Build 14 98228775 11D CTGAGAGAGG ACTGCAAGGCC/----------- ACTGGTCCCC 3070 het 3070 ref 46 24 20 5 ACTGCAAGGCC 1 0 91640 CASAVA_Build 14 98230669 7D CTGATTTTAG GCAGATT/------- GCAGATTCAT 3070 hom 111 het 42 0 38 8 GCAGATT 2 1 91641 CASAVA_Build 14 98237951 7D TTCATTACCC TAATGTA/------- CAGTAATGTA 3070 hom 102 het 36 0 35 4 TAATGTA 1 0 91642 CASAVA_Build 14 98244300 1D AATCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 11 10 91643 CASAVA_Build 14 98250585 1I ACTCCGTCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 21 2 12 7 A 14 15 91644 CASAVA_Build 14 98280990 11D CTCTCAAGGG TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2733 het 2733 ref 37 13 10 15 T 23 12 91645 CASAVA_Build 14 98302889 4D GAAAACAAAC AAAT/---- AAATTCATGC 3070 het 3070 hom 43 17 24 4 AAAT 2 1 91646 CASAVA_Build 14 98305142 10D GAAGCATAAA ATCGCAGTGG/---------- ATCTCAACCG 1772 het 1772 ref 43 19 8 18 ATCGCAGTGG 1 0 91647 CASAVA_Build 14 98311928 1I ACTAGTCCAG -/C CCCCCCAGAT 3070 het 3070 ref 46 20 15 11 C 6 7 91648 CASAVA_Build 14 98314632 3D TGGCCAAGTA ATT/--- ATTATCCAGC 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 ATT 2 1 91649 CASAVA_Build 14 98323468 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1733 het 1733 ref 26 7 9 10 T 15 16 91650 CASAVA_Build 14 98326625 1D ATGCTTGGCC A/- AAAAATGACA 3070 het 3070 hom 51 21 24 7 A 6 5 91651 CASAVA_Build 14 98327731 2D ATAATCACTC TA/-- GATTCATTTT 3070 het 2270 hom 19 5 14 1 TA 1 0 91652 CASAVA_Build 14 98330081 2D AAGAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3048 het 860 hom 19 5 9 9 AG 10 9 91653 CASAVA_Build 14 98331773 2D GCAATATGTA TT/-- CTTTCTAGCT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 2 0 91654 CASAVA_Build 14 98340442 1I AGAATTCACA -/G TACCTGGTAC 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 G 0 1 91655 CASAVA_Build 14 98438399 2I GGCACAAAGT --/GG GGGAGCTATG 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 G 3 5 91656 CASAVA_Build 14 98458170 1I AATGTTCTGG -/A AAATTAAATA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 3 4 91657 CASAVA_Build 14 98459717 2D ATTGTGAGGG GT/-- GTGTGTGTAT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 GT 5 4 91658 CASAVA_Build 14 98461481 3I CCCTACTGAG ---/AAC AACAAGATTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 AAC 1 2 91659 CASAVA_Build 14 98491242 4D AATGAATTAG TGAA/---- TGAATGAATG 3070 het 3070 ref 56 24 24 10 TGAA 4 3 91660 CASAVA_Build 14 98495208 1D24M1D TTGGGAGCAG CCCCCGGACCTCACACATAGGAGGTG/-CCCCGGACCTCACACATAGGAGGT- TTGACTACTT 3070 hom 88 het 28 0 28 6 N/A 0 0 91661 CASAVA_Build 14 98504288 3D TGAAGTTGAA AGG/--- AGCACTATCC 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 AGG 1 0 91662 CASAVA_Build 14 98506290 1I AAGGATGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1382 hom 46 3 37 6 A 10 11 91663 CASAVA_Build 14 98510650 1I GATAGTTAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 8 9 91664 CASAVA_Build 14 98537134 1I AGTGCTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 36 3 22 11 T 14 15 91665 CASAVA_Build 14 98557438 1D GGTACTGGGT C/- GGGGGGCGGG 2986 het 966 hom 21 3 12 6 C 1 0 91666 CASAVA_Build 14 98567275 2D ACATGCACAG AC/-- ACACACACAC 924 het 924 ref 71 58 3 11 AC 7 6 91667 CASAVA_Build 14 98586687 1D CAGAATTGGT A/- AAAAAAAAAA 769 het 769 ref 40 29 3 9 A 11 10 91668 CASAVA_Build 14 98598207 1D ATTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 11 17 9 T 10 9 91669 CASAVA_Build 14 98601265 1D ACCCTGCCAC A/- AGTTTCTGCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 A 2 1 91670 CASAVA_Build 14 98609979 1D GCATTGGAGA T/- GAGTCCAAAC 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 T 1 0 91671 CASAVA_Build 14 98626617 1D GTAATTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 11 10 91672 CASAVA_Build 14 98627616 3I TAACTAGTAT ---/TTA TTATTATTAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TTA 3 4 91673 CASAVA_Build 14 98639513 2D TTTTGTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 2327 het 219 hom 41 3 9 29 TG 1 0 91674 CASAVA_Build 14 98640548 1I AAATTAATTT -/G GGTAGAGATA 3070 het 3070 ref 35 21 14 0 G 2 3 91675 CASAVA_Build 14 98641481 5D GTCTTTGGGT GGGGG/----- GGGGGGGGCT 2130 het 137 hom 12 2 7 4 G 13 8 91676 CASAVA_Build 14 98641928 4D TAAAAATGGT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 TTTC 4 3 91677 CASAVA_Build 14 98643814 2I GAGATCGTGC --/CA CACTGCACTC 1696 het 1677 hom 9 5 4 1 CA 1 2 91678 CASAVA_Build 14 98645027 1I CAATATGCTT -/C TTTAAGCTAT 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 C 0 1 91679 CASAVA_Build 14 98650452 1I CGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 2520 het 2520 ref 20 10 7 3 T 11 12 91680 CASAVA_Build 14 98671876 1I CCCATCTCTA -/C TAAAAATACA 3070 het 2345 hom 17 5 11 1 C 0 1 91681 CASAVA_Build 14 98726310 1D CAGGCGCGGT G/- GCTCACGCCT 3070 hom 78 het 31 0 25 6 G 2 1 91682 CASAVA_Build 14 98726998 1I TCGGCCACAC -/G GGGGGGGGTC 2540 het 180 hom 20 1 10 9 G 8 9 91683 CASAVA_Build 14 98727308 1D GGGCTTGGGC T/- TTGGGGTGCT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 3 2 91684 CASAVA_Build 14 98732622 1D CAGTGGGTTG A/- AAACCTAAGG 3070 hom 113 het 43 0 34 9 A 4 3 91685 CASAVA_Build 14 98740004 1I CGCCCCTGAA -/C CCCCCCGCTC 3070 het 3070 ref 24 12 7 5 C 6 7 91686 CASAVA_Build 14 98748426 3D GTGCAAACCT GCA/--- GCCTCCCCTG 3070 het 3070 ref 40 14 11 16 GCA 1 0 91687 CASAVA_Build 14 98753014 2I ATGTACTCAC --/AT ATGCACAAAT 3070 het 3070 ref 65 35 25 5 AT 1 2 91688 CASAVA_Build 14 98753392 2D TCACAAATAC AT/-- ACACTTACAT 3070 het 3070 ref 58 28 25 6 AT 1 0 91689 CASAVA_Build 14 98755136 1D TTATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2747 het 114 hom 21 1 8 13 T 13 12 91690 CASAVA_Build 14 98758352 1D CCAGTGGGGG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 8 7 91691 CASAVA_Build 14 98771997 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 48 het 20 0 13 7 A 8 7 91692 CASAVA_Build 14 98777109 1D TTTGTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 11 10 91693 CASAVA_Build 14 98780009 23D CATTGCTCCT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------------- AAAAAAAAAA 1720 het 1720 ref 19 8 6 5 A 34 11 91694 CASAVA_Build 14 98786958 1I ACCTTAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 11 91695 CASAVA_Build 14 98794985 1I TTCTCTTGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 8 9 91696 CASAVA_Build 14 98795096 1I CTCGGCAGCC -/G AAAAGTGTCA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 G 0 1 91697 CASAVA_Build 14 98800232 1D TCAAAGGTGC G/- GAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 G 2 1 91698 CASAVA_Build 14 98800588 1I AAAGAGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 10 11 91699 CASAVA_Build 14 98803635 2D AGGAACTTCA CC/-- CCCCCCCCAC 2564 hom 6 het 18 0 11 7 C 10 8 91700 CASAVA_Build 14 98827170 1D CTGGTTTTTT C/- CCCCATCTCA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 C 5 4 91701 CASAVA_Build 14 98840875 2D TGATATGTTG GA/-- GAGAGAGAGA 1180 het 1180 ref 55 38 3 15 GA 8 7 91702 CASAVA_Build 14 98849420 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 8 9 91703 CASAVA_Build 14 98856506 17D CAGATGGGTT AGGAAGTATCACTCCCA/----------------- AGGAAGTCAG 3070 hom 40 het 14 0 11 6 AGGAAGTATCACTCCCA 1 0 91704 CASAVA_Build 14 98859649 6D TATTGTTGGT ATTATG/------ ATTATAAGTT 3070 hom 102 het 35 0 34 2 ATTATG 1 0 91705 CASAVA_Build 14 98876713 2D TGTGCACATG CA/-- CACACACACA 1074 het 1074 ref 43 31 3 11 CA 7 6 91706 CASAVA_Build 14 98880990 1I TGGTATTTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 86 het 30 0 29 1 T 7 8 91707 CASAVA_Build 14 98895872 1D ATCTTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 766 hom 24 6 13 5 A 11 10 91708 CASAVA_Build 14 98906385 1I ACTACATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 9 10 91709 CASAVA_Build 14 98911343 8D GCGCGGGACG CCCACCTT/-------- CCCACCTTCC 2358 het 2358 ref 31 15 10 8 CCCACCTT 2 1 91710 CASAVA_Build 14 98911892 1I GGTAAACATG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 6 7 91711 CASAVA_Build 14 98950877 4I ACAGTCTGAT ----/AGAC AGATTGTAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AGAC 0 1 91712 CASAVA_Build 14 98960050 1D TTTCACTCTC T/- TTTTTTTTTT 1836 het 1836 ref 50 39 4 7 T 12 11 91713 CASAVA_Build 14 98983066 1D ATTTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 27 1 13 13 T 15 14 91714 CASAVA_Build 14 98990859 1D CAGTTCTAAG T/- GGTGCTGCAG 3070 hom 117 het 43 0 36 8 T 1 0 91715 CASAVA_Build 14 99003185 1I GCCATGTGCT -/A AAAACAGTAG 3070 hom 163 het 62 0 55 7 A 4 5 91716 CASAVA_Build 14 99010966 1I CTTTTCGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 15 0 15 1 T 12 13 91717 CASAVA_Build 14 99022984 2D TGTGGCACTT AA/-- GATTCCCTGA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 2 0 91718 CASAVA_Build 14 99024368 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 1498 het 1498 ref 27 15 6 7 A 15 14 91719 CASAVA_Build 14 99027679 1D TCTCCAGGTA C/- TTAATTCTTC 3070 hom 69 het 24 0 23 3 C 1 0 91720 CASAVA_Build 14 99041601 1I GTTAAATAAA -/T TTTTATCCTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 4 5 91721 CASAVA_Build 14 99049935 3D CTGTGGGATC AAA/--- ATCCCTGTCA 3070 hom 111 het 41 0 35 7 A 4 1 91722 CASAVA_Build 14 99058768 7I ACAGGCGAGG -------/CCTCCCA CCTCCCACCT 3070 hom 71 het 32 0 22 10 CCTCCCA 2 3 91723 CASAVA_Build 14 99060270 1I AATGGAGAAT -/G GCATTCTAAG 3070 hom 51 het 19 0 16 3 G 1 2 91724 CASAVA_Build 14 99076245 1D TAAAAAAAAA G/- GGGGGGGAAC 3070 hom 60 het 29 0 23 7 G 8 7 91725 CASAVA_Build 14 99099986 12D GCAGGGGGTG GGCACAGGTCCT/------------ TGGCAATGGA 3070 hom 86 het 30 0 28 4 GGCACAGGTCCT 1 0 91726 CASAVA_Build 14 99102417 2D TATCAGTGCC CT/-- GTTTTACAGG 3070 hom 111 het 46 0 37 9 CT 1 0 91727 CASAVA_Build 14 99114606 2I CTCCCATCAC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 58 32 14 12 TG 6 7 91728 CASAVA_Build 14 99116025 1I CTGGCTCAGT -/C CCAAGACTTT 3070 hom 72 het 31 0 20 11 C 2 3 91729 CASAVA_Build 14 99125153 1I TCATATAAAC -/A AAAAACAGCT 3070 het 2082 hom 20 6 8 6 A 5 6 91730 CASAVA_Build 14 99136804 1I CTGCTTCCCC -/A AGGGTTCCTG 3070 hom 126 het 44 0 41 3 A 1 2 91731 CASAVA_Build 14 99143870 1I TTGAGTCTGA -/G GGCTTCATTT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 G 2 3 91732 CASAVA_Build 14 99146851 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 9 10 91733 CASAVA_Build 14 99147832 2D TTTTGGGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1098 het 605 hom 27 4 3 20 T 12 10 91734 CASAVA_Build 14 99161710 1D TGGGGCCTCA C/- CCCCACCCTC 3070 hom 71 het 35 0 22 13 C 5 4 91735 CASAVA_Build 14 99172914 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 7 6 91736 CASAVA_Build 14 99173568 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATTGCTT 2031 het 1759 hom 24 5 7 12 AGG 1 0 91737 CASAVA_Build 14 99175940 6D TTAGTACAGA CTGGAT/------ TTCACCATAT 3070 hom 16 het 13 0 12 1 CTGGAT 1 0 91738 CASAVA_Build 14 99176550 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTGTCGA 3070 hom 63 het 25 0 21 6 T 6 5 91739 CASAVA_Build 14 99194916 4I ACTGACTCTG ----/CAAA CACTTAATGG 3070 hom 108 het 41 0 35 6 CAAA 0 1 91740 CASAVA_Build 14 99197234 3I CGTGACCACC ---/TTG TTGTCCCATT 3070 hom 99 het 34 0 33 1 TTG 1 2 91741 CASAVA_Build 14 99212962 1D GAGCACGGGT G/- GGGGGTGGGT 3070 hom 24 het 16 0 10 6 G 6 5 91742 CASAVA_Build 14 99216345 1I GCCTGCATCT -/C CCCCAACAAT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 C 4 5 91743 CASAVA_Build 14 99216669 5D ATTTTAATAA TATAT/----- TTTATTTAAC 3070 het 3070 ref 18 10 7 1 TATAT 1 0 91744 CASAVA_Build 14 99216904 4D GGCCAGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 6 TTTG 4 3 91745 CASAVA_Build 14 99224074 1I AAGGAATGGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2483 hom 27 9 12 6 T 8 9 91746 CASAVA_Build 14 99230178 1I GCATTTGTCC -/T TTTCGCATCT 3070 het 3070 hom 54 19 30 5 T 3 4 91747 CASAVA_Build 14 99230386 2D ATTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1011 hom 44 7 17 20 T 13 11 91748 CASAVA_Build 14 99241499 1I ACGGAGTCTT -/G GCTGTGTTGT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 G 1 2 91749 CASAVA_Build 14 99248638 9I CATTTACAAT ---------/TCTACATTA TGTTATGTAG 3070 het 3070 ref 23 10 7 6 TCTACATTA 0 1 91750 CASAVA_Build 14 99248943 4I CTCTGAGCAA ----/AAAG AAAGAACAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AAAG 1 2 91751 CASAVA_Build 14 99260318 2D GGACTCCAAC AT/-- ATGAGGATTT 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 AT 2 1 91752 CASAVA_Build 14 99277719 1D TTTGCGCCCA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 48 het 18 0 12 6 C 9 8 91753 CASAVA_Build 14 99298015 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1144 het 183 hom 12 2 4 6 A 17 16 91754 CASAVA_Build 14 99347253 1D ATGTATAATA G/- GGGTTTTTTT 1767 het 1767 ref 32 22 4 6 G 4 3 91755 CASAVA_Build 14 99347905 2D TGTCTCAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 51 23 17 11 AG 8 7 91756 CASAVA_Build 14 99353189 1I AAGTTCTTTC -/T TTTTTTTTCT 1381 het 1381 ref 31 18 7 6 T 8 9 91757 CASAVA_Build 14 99370189 4D CCTAGTTCAC TGAG/---- TGTTTATCAG 3070 het 3070 hom 44 20 22 4 TGAG 1 0 91758 CASAVA_Build 14 99370400 1I GAATGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 24 2 20 2 T 11 12 91759 CASAVA_Build 14 99371085 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 T 8 9 91760 CASAVA_Build 14 99372155 2I GATATTTACA --/AC AAATAGCTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AC 0 1 91761 CASAVA_Build 14 99372297 6I TTAATTTCTT ------/TTATTA TTATTATGTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTA 2 4 91762 CASAVA_Build 14 99373082 1I ATTGTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 1740 het 1740 ref 31 6 11 14 T 15 16 91763 CASAVA_Build 14 99375179 1D GCAAATTCCC T/- TAAATACTCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 1 91764 CASAVA_Build 14 99376123 4D ACTGATTGCT TGTA/---- TGTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 6 TGTA 1 0 91765 CASAVA_Build 14 99378118 2I ACAAGAATGT --/AA AAAAACTTGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 5 7 91766 CASAVA_Build 14 99378557 3D AAGAAAATCC ATT/--- ACAGGTTAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 ATT 1 0 91767 CASAVA_Build 14 99379515 6I TTTTATTGGA ------/AACAAC AACAACAATA 3070 het 3070 hom 41 10 21 10 AAC 2 4 91768 CASAVA_Build 14 99380637 5D ATAAAATTAC TTTAT/----- TTTATATGTT 3070 het 3070 hom 43 19 20 7 TTTAT 2 1 91769 CASAVA_Build 14 99383163 7I CATTTGATTA -------/AAATTTT TTCTAATTTC 3070 het 3070 ref 48 27 18 3 AAATTTT 0 1 91770 CASAVA_Build 14 99392393 5D TTAAAACATG AATAT/----- AATTTGAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AATAT 1 0 91771 CASAVA_Build 14 99402661 14D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 2415 het 2415 ref 18 9 6 9 A 26 12 91772 CASAVA_Build 14 99402793 1I AATAGTAACT -/C CCCCTCTACT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 C 4 5 91773 CASAVA_Build 14 99403764 1I TGGTTTTGTA -/T CCTGAAACTT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 T 0 1 91774 CASAVA_Build 14 99412230 2D CAGAGGAGAC AG/-- AGAGGGGAAG 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 AG 3 2 91775 CASAVA_Build 14 99412273 3D ACTGGCTACC AAG/--- AAGGAGAGTG 3070 het 2686 hom 40 13 16 14 AAG 2 1 91776 CASAVA_Build 14 99414242 2D GGAAACCAAA AG/-- ATTGGACATC 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 AG 1 0 91777 CASAVA_Build 14 99414924 4D GGTGGAAAAA CTGT/---- CACTCAGATT 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 CTGT 1 0 91778 CASAVA_Build 14 99419622 1D ACCCTTCCTC A/- AAAAAAAAAA 2336 het 1557 hom 36 12 10 16 A 19 18 91779 CASAVA_Build 14 99423620 1D GGACTGGGCA T/- TCTCCCCCGC 2074 het 2074 ref 22 11 7 5 T 2 1 91780 CASAVA_Build 14 99429352 1I AGGGCTCCGT -/A AAACCTGGTT 3070 hom 123 het 49 0 38 11 A 3 4 91781 CASAVA_Build 14 99432450 1D CCCAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 11 12 T 11 10 91782 CASAVA_Build 14 99432831 1I AGGGGCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 13 14 91783 CASAVA_Build 14 99435288 4I CTGAAACTAA ----/TTTC TTTAAGTACA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTTC 0 1 91784 CASAVA_Build 14 99440637 6D TGATTTAAGC TTATTA/------ TTATTATTAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 TTA 5 3 91785 CASAVA_Build 14 99448023 2I GGTCTGGCTC --/TG TCACCCAGGC 3070 het 2864 hom 18 7 10 1 TG 0 1 91786 CASAVA_Build 14 99449256 2I ATGGCAGTGT --/TA TATTATTATT 2138 het 2138 ref 13 7 6 0 TA 1 2 91787 CASAVA_Build 14 99450088 4I CCAGCTGTGG ----/TATC TATCTATGTG 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 TATC 1 2 91788 CASAVA_Build 14 99453786 4D TGTGAGCGTT TGTG/---- TGTGCACGCA 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 TG 4 2 91789 CASAVA_Build 14 99456996 1I CACTACTTTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 7 8 91790 CASAVA_Build 14 99459729 1D CTCAGTTCTG C/- CCCCTTCACC 3070 hom 57 het 48 1 43 4 C 5 4 91791 CASAVA_Build 14 99460271 1I AAAATAAGTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 T 8 9 91792 CASAVA_Build 14 99468737 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 1932 hom 23 het 28 0 11 17 A 17 18 91793 CASAVA_Build 14 99478472 2D AAAAGCCCTC AG/-- GGGATTTTTT 2862 het 2862 ref 30 20 7 3 AG 1 0 91794 CASAVA_Build 14 99480864 1I GGCTGCTGTC -/A ATCCTATCTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 1 2 91795 CASAVA_Build 14 99481114 1D AGGTCAGGAG T/- TTTGAGACCA 2567 het 2567 ref 23 11 7 5 T 4 3 91796 CASAVA_Build 14 99483501 2I4M4D TTAGACGACC --TTGCTTGG/CGTCCC---- ATCCTTGCTT 3070 hom 90 het 31 0 28 6 N/A 0 0 91797 CASAVA_Build 14 99484575 3D AAAGAAAGAA AAG/--- AAGAGAAAGA 2239 hom 25 het 19 0 11 8 AAG 2 1 91798 CASAVA_Build 14 99485061 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 18 0 13 5 A 10 9 91799 CASAVA_Build 14 99487208 1D CATCTATTCA C/- CCAACAAACA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 C 3 2 91800 CASAVA_Build 14 99488244 3D GTGGTGATGG TGA/--- TGATGAAGGT 3070 hom 9 het 74 2 36 39 TGA 3 2 91801 CASAVA_Build 14 99488552 6D GTGATGCTGA GGTGAT/------ GGTGATGGTG 3070 hom 187 het 76 0 60 22 GGTGAT 3 2 91802 CASAVA_Build 14 99500287 1I GGAGGCGGAG -/C TTGCAGCGAG 1469 hom 8 het 8 0 3 5 C 0 1 91803 CASAVA_Build 14 99542902 1D GTAAAACATC A/- AAAAAAAAAA 1321 het 1321 ref 33 21 3 9 A 15 14 91804 CASAVA_Build 14 99570666 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 40 1 24 17 A 12 11 91805 CASAVA_Build 14 99571429 2I AGTGTATGTG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 11 91806 CASAVA_Build 14 99586451 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 1 0 91807 CASAVA_Build 14 99589547 2I CAGCTTCCTT --/CA GTCTTTAATA 3070 hom 95 het 36 0 31 5 CA 0 1 91808 CASAVA_Build 14 99598313 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TA 7 6 91809 CASAVA_Build 14 99600316 3D ATATCAATAA TAT/--- TTTAATGGAT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TAT 1 0 91810 CASAVA_Build 14 99601195 4I GCATTGACTT ----/AGAC AGACTATAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGAC 1 2 91811 CASAVA_Build 14 99650261 1I AAGGAGGGCC -/G GGGGGGGAAT 3070 hom 72 het 29 0 23 6 G 7 8 91812 CASAVA_Build 14 99651136 1D GATTAGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 11 10 91813 CASAVA_Build 14 99672204 13D TCTTATGGGT CCCCCAGAGCCTC/------------- CCCCAGGAGC 3070 hom 58 het 23 0 16 10 CCCCCAGAGCCTC 1 0 91814 CASAVA_Build 14 99673112 1D TGCCCCACTA C/- CCCCTAGAGA 3070 hom 87 het 32 0 27 7 C 5 4 91815 CASAVA_Build 14 99691678 2D CCCGTACGTT AC/-- AGAGATGGGT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 AC 1 0 91816 CASAVA_Build 14 99692917 1D ACATTCACCT G/- GGGGAACAGC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 5 4 91817 CASAVA_Build 14 99697250 18D GCTTCCAAAA TCAGAGCCTTCGCCCCTG/------------------ TGTTGAACTC 3070 het 3070 ref 28 18 10 3 TCAGAGCCTTCGCCCCTG 1 0 91818 CASAVA_Build 14 99704873 3I AAGGGGGTGG ---/AGA AGAAGAAGGA 2385 hom 18 het 8 0 6 2 AGA 2 3 91819 CASAVA_Build 14 99730526 1D TGCCGCTGAC T/- TAGACAACAC 3070 het 3070 hom 48 18 18 12 T 2 1 91820 CASAVA_Build 14 99731803 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 24 0 19 5 A 11 10 91821 CASAVA_Build 14 99740943 1D TGGAGTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 13 12 91822 CASAVA_Build 14 99776624 1D CTCGTGGGCG C/- CCTCCGGCCT 1305 hom 15 het 6 0 5 1 C 3 2 91823 CASAVA_Build 14 99803622 1D ACATAGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1017 hom 23 4 14 5 T 12 11 91824 CASAVA_Build 14 99808386 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 518 hom 18 4 11 3 A 14 13 91825 CASAVA_Build 14 99818388 1D CAGATGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 12 14 A 12 11 91826 CASAVA_Build 14 99822986 2I CTGGCTCCTG --/GC GCGCTGGCTT 3070 het 2640 hom 28 12 11 5 GC 2 3 91827 CASAVA_Build 14 99831536 1I GAGGACCCCC -/A AATCCAGAGG 2424 het 1713 hom 17 7 6 4 A 2 3 91828 CASAVA_Build 14 99841285 9D GAAGCAGGCT CCGACGCCA/--------- CAGATTTAAT 1592 het 1592 ref 25 13 6 9 CCGACGCCA 1 0 91829 CASAVA_Build 14 99850445 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 19 0 16 3 T 10 11 91830 CASAVA_Build 14 99852708 1I TTCTTGGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2258 hom 25 7 11 7 T 11 12 91831 CASAVA_Build 14 99878247 1I GGAAAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 8 9 91832 CASAVA_Build 14 99878797 2I CCTCCCCTTC --/AT ATCTTTTCCT 3070 hom 57 het 25 0 18 7 AT 1 2 91833 CASAVA_Build 14 99886276 4I ACTTGAGGTC ----/AGGA GTTCGAGACC 3070 hom 56 het 20 0 16 4 AGGA 0 1 91834 CASAVA_Build 14 99889530 1I CAATAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 3 4 91835 CASAVA_Build 14 99899359 12D GTCAAACATT TAACCAATGTCC/------------ CTGCTCAAGG 3070 hom 99 het 36 0 34 6 TAACCAATGTCC 1 0 91836 CASAVA_Build 14 99904057 1D AAAGAGGAAT A/- AAGATGCAGG 3070 hom 116 het 48 0 38 10 A 3 2 91837 CASAVA_Build 14 99915481 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1993 het 117 hom 14 1 9 4 T 15 14 91838 CASAVA_Build 14 99921939 2I GACTTTGATG --/CC CCTTTTTTTG 3070 hom 111 het 40 0 34 6 C 2 4 91839 CASAVA_Build 14 99927743 1D ATCCAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 18 9 A 13 12 91840 CASAVA_Build 14 99940239 1I TGGGCCCCAT -/A ACGCACATGA 3070 hom 86 het 33 0 27 6 A 1 2 91841 CASAVA_Build 14 99941259 1I CTGCCCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 10 11 91842 CASAVA_Build 14 99946872 1D TTTAAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 1204 het 1204 ref 33 14 4 15 T 19 18 91843 CASAVA_Build 14 99950089 1D AGGTAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 526 hom 28 4 16 8 T 15 14 91844 CASAVA_Build 14 99997995 1D TATTTTTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 124 hom 35 1 33 2 T 9 8 91845 CASAVA_Build 14 100006602 1I TGTGAGTGGG -/T GTGTCTTGAC 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 0 1 91846 CASAVA_Build 14 100013654 11I TGCCCAGGAG -----------/AGGATATGATA AACAAGCTCC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 AGGATATGATA 0 1 91847 CASAVA_Build 14 100015508 1D GAAGAGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 12 11 91848 CASAVA_Build 14 100020554 2D CAGAGAATTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 50 12 26 12 GT 10 9 91849 CASAVA_Build 14 100125050 1D CTCTTTGCTC A/- AGGGGGCCTT 3070 hom 82 het 32 0 25 8 A 2 1 91850 CASAVA_Build 14 100131500 2D ACGGTACGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2772 het 2772 ref 40 15 9 16 T 13 11 91851 CASAVA_Build 14 100132093 1D GAGACAGAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 18 15 4 A 10 9 91852 CASAVA_Build 14 100134436 1D TAAAAAATGG T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 8 7 91853 CASAVA_Build 14 100137489 1I CCTCTGTTCA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 6 7 91854 CASAVA_Build 14 100137720 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1130 hom 19 4 13 2 T 10 11 91855 CASAVA_Build 14 100198413 9D TCACTTTACA TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 1695 hom 25 7 8 11 T 19 10 91856 CASAVA_Build 14 100202194 1D ATCTCTCAGA G/- GGGGACGTTC 3070 hom 90 het 33 0 28 5 G 5 4 91857 CASAVA_Build 14 100205754 2I CCTTGCTCCA --/AC ACACACACAC 2830 het 2830 ref 35 12 10 13 AC 8 9 91858 CASAVA_Build 14 100217130 1I GAGGGCCCCC -/G GGGGGACACG 2484 het 2443 hom 28 11 10 7 G 5 6 91859 CASAVA_Build 14 100218586 8D GTGAAAGTGA GCCTGGAG/-------- GCCCGCGCCC 3070 het 1605 hom 26 7 13 11 GCCTGGAG 1 0 91860 CASAVA_Build 14 100243267 2I ATGACATACA --/CT CTCACACTCA 3070 het 3070 hom 64 25 29 10 CT 1 2 91861 CASAVA_Build 14 100255175 1I GCTGGACCTT -/A AGTGTGCACA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 1 2 91862 CASAVA_Build 14 100276140 4I AGCCACATTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TTTG 4 5 91863 CASAVA_Build 14 100278307 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 T 10 11 91864 CASAVA_Build 14 100284481 1I AAAAAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 32 0 25 7 A 11 12 91865 CASAVA_Build 14 100285592 1D CCAACACTCT G/- GGAAGCTGAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 G 3 2 91866 CASAVA_Build 14 100295685 2D ATTAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 29 2 12 15 A 13 11 91867 CASAVA_Build 14 100298177 1I TCTAATAGCC -/A AAAAAAAAAA 2995 het 2393 hom 47 14 19 14 A 15 16 91868 CASAVA_Build 14 100336416 1I ATTCATATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 A 10 11 91869 CASAVA_Build 14 100340237 2D TCCTACTCTG CA/-- CAGAGAGAGC 2903 het 2903 ref 31 14 10 8 CA 2 1 91870 CASAVA_Build 14 100344754 1I TTGCTGCTGC -/T TTTTTTTTTT 2505 het 2505 ref 36 17 9 10 T 10 11 91871 CASAVA_Build 14 100355575 3I ATAAATGCAA ---/ACT ACTACATGGA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 ACT 1 2 91872 CASAVA_Build 14 100359522 1D AACATATGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 T 10 9 91873 CASAVA_Build 14 100359618 1D CTCCCCCCCC T/- CATCATTTTC 2649 het 2649 ref 30 12 8 10 T 1 0 91874 CASAVA_Build 14 100376038 2I CATGGAAAAC --/TG TGGTCACTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TG 1 2 91875 CASAVA_Build 14 100376595 1D GCCTTTTTTT C/- CAGATGAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 2 1 91876 CASAVA_Build 14 100381485 3D CCTCATCCGC CCT/--- CCTCCTCCTC 3070 het 1801 hom 24 5 11 8 CCT 4 3 91877 CASAVA_Build 14 100384699 1I AATGAAAATA -/G GAAAAAAGGA 2160 het 2160 ref 24 15 6 3 G 1 2 91878 CASAVA_Build 14 100408042 2D GGAGTCCCTC CT/-- CTTCCCACGT 3070 het 3070 ref 43 20 17 8 CT 2 1 91879 CASAVA_Build 14 100423737 3D CTAGCTACTT CTC/--- CTAGGCTGAG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 CTC 1 0 91880 CASAVA_Build 14 100423840 1I ATTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 15 3 A 10 11 91881 CASAVA_Build 14 100424025 8D CATGGAGCCC AGCCTGGG/-------- TGCCCTTGTG 3070 het 3070 ref 33 18 14 3 AGCCTGGG 1 0 91882 CASAVA_Build 14 100452047 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2832 het 2832 ref 27 10 8 9 T 15 14 91883 CASAVA_Build 14 100456748 3D ATCCACTGTT GAA/--- GGAGATTTGG 3070 het 3070 hom 46 21 25 1 GAA 1 0 91884 CASAVA_Build 14 100458291 1D TTTTTTTTTT G/- TGTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 17 14 9 G 1 0 91885 CASAVA_Build 14 100471605 1D CAATATTTTT G/- GTGCTATTGT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 2 1 91886 CASAVA_Build 14 100472061 2I TATCTATAAC --/AG AAATTAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 AG 0 1 91887 CASAVA_Build 14 100486325 1D TGTGAGGTCA T/- TTGGGTCAGG 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 T 3 2 91888 CASAVA_Build 14 100487426 12D TTTTAAATGT CTAAATGATTGG/------------ CTAAATGAAA 3070 het 3070 ref 39 19 19 4 CTAAATGATTGG 1 0 91889 CASAVA_Build 14 100487946 1D GCCCAAGCTT G/- GGACCAATGA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 3 2 91890 CASAVA_Build 14 100501204 4D AATGATGACA TAGT/---- TAGTATAATT 3070 het 3070 ref 36 18 16 5 TAGT 2 1 91891 CASAVA_Build 14 100502194 3I GGTCCATCAC ---/AGA AGAAGTAGAG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 AGA 1 2 91892 CASAVA_Build 14 100506323 1I TTAAAGATGA -/T GTCAACTGTG 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 T 0 1 91893 CASAVA_Build 14 100513862 1D TGTTCATGCA T/- TTTTTTTTTT 3006 het 134 hom 21 2 9 10 T 15 14 91894 CASAVA_Build 14 100520371 1D AGGCAGGGTG C/- AAAAGCCAGG 3070 hom 81 het 37 0 28 9 C 1 0 91895 CASAVA_Build 14 100522674 2D AATGTCTCAA TT/-- TTGTCATTAT 3070 het 3070 hom 46 17 28 1 T 4 2 91896 CASAVA_Build 14 100529597 2D AATTGTTAAC AT/-- ATGTGGCAAG 3070 het 3070 ref 39 25 13 1 AT 2 1 91897 CASAVA_Build 14 100575145 1D GTACATTCAC T/- TTTTTTTTTT 1525 het 949 hom 30 9 6 15 T 19 18 91898 CASAVA_Build 14 100589716 1I CAAGAAGGCC -/A AGTGGGATTG 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 1 2 91899 CASAVA_Build 14 100599015 1I TTTTAAATGG -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 A 6 7 91900 CASAVA_Build 14 100604859 1D CGGCCCCCCC G/- CCGAGTCTCC 827 het 342 hom 19 4 4 11 G 1 0 91901 CASAVA_Build 14 100611486 1D ACACAGCCAC A/- GGACTCTCTC 3070 het 3070 hom 48 16 25 8 A 1 0 91902 CASAVA_Build 14 100627589 2I AAATATATGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 AT 5 6 91903 CASAVA_Build 14 100628323 4D TGTTATAATA TGTC/---- TGTCTAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 6 TGTC 2 1 91904 CASAVA_Build 14 100629526 1I CAACATGAAG -/A AAAACCAGTC 3070 het 3070 ref 27 10 11 6 A 4 5 91905 CASAVA_Build 14 100633998 1D AGCTGTGTTT A/- AATCAAATAT 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 3 2 91906 CASAVA_Build 14 100635430 1D CTTTGTCCAA T/- TTTAATCAGG 3070 het 3070 hom 49 23 22 5 T 4 3 91907 CASAVA_Build 14 100649902 4D CATCCCTCAG ACCC/---- ACCCACGCCT 2096 het 2096 ref 26 11 7 11 ACCC 2 1 91908 CASAVA_Build 14 100651621 6D GCTAAACAAT GCATAC/------ GCATGGATGC 3070 het 3070 ref 38 25 9 9 GCATAC 1 0 91909 CASAVA_Build 14 100652176 1D GTGGACAGGC G/- GGAAAATCTA 3070 het 3070 hom 42 16 17 10 G 3 2 91910 CASAVA_Build 14 100653005 1D CAGGCAAGAC T/- TCCGATACTC 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 2 1 91911 CASAVA_Build 14 100662923 1D AAGGCCAGGG C/- ACTGAGACAT 3070 hom 93 het 35 0 28 7 C 1 0 91912 CASAVA_Build 14 100668427 1D GCCAGGCTCA G/- GGGGGGGTCC 3070 het 3070 ref 35 18 10 8 G 8 7 91913 CASAVA_Build 14 100681544 1I AAGTTCAGAA -/T TTTTTTTTTT 1402 het 1402 ref 40 22 4 14 T 13 14 91914 CASAVA_Build 14 100683201 1D AATAGAGATA C/- TTTTACCTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 1 0 91915 CASAVA_Build 14 100688440 3D CAATGGGAAA AGG/--- AGGAGTCTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 AGG 2 1 91916 CASAVA_Build 14 100701858 1D GAATGTAGCC T/- TTTCAAACTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 6 T 4 3 91917 CASAVA_Build 14 100704320 1D TTGTCTTTCT A/- AAAAAAAAAA 2540 het 1643 hom 23 5 10 8 A 13 12 91918 CASAVA_Build 14 100714356 1D TGGGTCCACA G/- GGACAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 15 9 G 3 2 91919 CASAVA_Build 14 100715752 1D GTAGGGCCCC A/- AAATGCCAGG 3070 hom 51 het 22 0 16 6 A 4 3 91920 CASAVA_Build 14 100716549 3D ATGGACAAGA TAT/--- TATTAGAATG 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 TAT 2 1 91921 CASAVA_Build 14 100716885 2D CTCTGGGTCA CC/-- CCCCCCCCCG 3070 het 449 hom 27 5 14 9 C 11 9 91922 CASAVA_Build 14 100724513 1D TCATGACCTT G/- GCCAGCCATG 3070 hom 80 het 30 0 26 4 G 2 1 91923 CASAVA_Build 14 100734725 1D AGCCGCTGCT G/- GGGGGACTGC 2733 hom 30 het 11 0 10 1 G 6 5 91924 CASAVA_Build 14 100740866 1I AAGTTCATTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 175 hom 41 1 37 3 T 8 9 91925 CASAVA_Build 14 100746949 1I TTAATTTCTC -/T GGCTAAAACC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 0 1 91926 CASAVA_Build 14 100748056 1I TTTGTGGGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 8 9 91927 CASAVA_Build 14 100756939 1D CTGCCCCACC A/- AAACCCTAGT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 4 3 91928 CASAVA_Build 14 100771176 2D GTCTGTGTAC AT/-- GTGTGAGTAT 3070 het 3070 hom 68 26 34 11 AT 1 0 91929 CASAVA_Build 14 100775921 1I CTCCACAACA -/C CCCCCTCCCC 3070 hom 54 het 39 1 35 3 C 5 6 91930 CASAVA_Build 14 100814280 1D AACAAAAAAA T/- AACAGCTTGA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 T 1 0 91931 CASAVA_Build 14 100817443 1I ATGATGTCGC -/T TAGGTGATAG 3070 het 3070 ref 61 27 28 6 T 1 2 91932 CASAVA_Build 14 100825658 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 11 12 91933 CASAVA_Build 14 100826364 4D GCATACATAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 AC 8 6 91934 CASAVA_Build 14 100833339 1D ATGTAGCCCT A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 hom 45 20 18 7 A 7 6 91935 CASAVA_Build 14 100847399 1D CAACATATGT A/- AAATGAACAT 3070 het 3070 ref 26 16 7 4 A 4 3 91936 CASAVA_Build 14 100877033 4D AGGAATTCAC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 130 het 53 0 43 11 CTTT 3 2 91937 CASAVA_Build 14 100882457 1D GAGAAGAAAT A/- AAAAAATATA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 A 7 6 91938 CASAVA_Build 14 100892108 1D TCTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 88 het 35 0 30 6 T 10 9 91939 CASAVA_Build 14 100904669 2D AGCTCAACAC AT/-- GTGCTCAGAA 3070 hom 89 het 35 0 29 7 AT 1 0 91940 CASAVA_Build 14 100905133 1D CTGGAGGGGC T/- TGCTCTCTGC 3070 hom 67 het 28 0 21 7 T 2 1 91941 CASAVA_Build 14 100917659 3D TCCCAGACCC CAG/--- CAGGAGTGTT 3070 hom 112 het 42 0 37 8 CAG 2 1 91942 CASAVA_Build 14 100927795 2I CTGGGGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 859 hom 39 2 32 5 TG 8 9 91943 CASAVA_Build 14 100935946 2D GGAAGGGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 1085 het 1085 ref 32 21 3 8 GA 7 6 91944 CASAVA_Build 14 100974421 1D AGCAATTTGC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 8 7 91945 CASAVA_Build 14 100985041 1I ATTTGCCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 26 1 20 5 A 10 11 91946 CASAVA_Build 14 100985140 1D TGCTCTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 12 13 A 13 12 91947 CASAVA_Build 14 100996404 1I AAAAGACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 35 1 30 4 T 10 11 91948 CASAVA_Build 14 100997899 2I GAGAGAGGCG --/CT CTCTCTGCCC 3070 hom 88 het 31 0 29 4 CT 3 4 91949 CASAVA_Build 14 100998961 1D AAATCCTCCT C/- CCCCCTTCCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 6 5 91950 CASAVA_Build 14 100999935 2I CTGATATCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 50 hom 77 2 28 47 AC 6 7 91951 CASAVA_Build 14 101004160 1I CTCCGCCTCC -/T GGGTACAAGC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 0 1 91952 CASAVA_Build 14 101009304 2D AATCCCTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 107 het 47 0 34 13 TG 9 8 91953 CASAVA_Build 14 101015400 4D CACGGCCCTG CGGT/---- CGGTCGTATT 3070 het 3070 ref 48 24 17 8 CGGT 2 1 91954 CASAVA_Build 14 101016287 1D CAGGCCGGGT C/- CCCGGGCCAC 3070 het 2777 hom 24 8 11 6 C 4 3 91955 CASAVA_Build 14 101035560 38D AAGGCCATGC ACACGCACACGCACACGCACACGCACACGCACACACAT/-------------------------------------- ACACTCACAC 3070 het 3070 ref 42 23 19 6 ACACGCACACGCACACGCACACGCACACGCACACACAT 1 0 91956 CASAVA_Build 14 101035965 20D GGGGGAGTCT TTGCTCTGCAGCCAAGCGCC/-------------------- TTTCTTGGCT 3070 het 3070 ref 30 19 16 3 TTGCTCTGCAGCCAAGCGCC 1 0 91957 CASAVA_Build 14 101143220 3I GAAGTATCAA ---/AAG AAGTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AAG 1 2 91958 CASAVA_Build 14 101146316 4D ATCTTAAGAT AAGA/---- AAGGAGCAAT 3070 het 3070 ref 43 29 10 6 AAGA 1 0 91959 CASAVA_Build 14 101162484 3D CGGGATGAAC CCT/--- CCTTAAAGGA 3070 het 3070 hom 42 18 19 7 CCT 2 1 91960 CASAVA_Build 14 101175454 1I ATGTTATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 11 11 A 10 11 91961 CASAVA_Build 14 101180997 1D CTAGATAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2383 hom 35 9 21 5 A 11 10 91962 CASAVA_Build 14 101186352 1I CAACCCTAAT -/G GGGCTGGCCA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 G 3 4 91963 CASAVA_Build 14 101188026 1I ATACAACATA -/C CCAAACTCAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 C 2 3 91964 CASAVA_Build 14 101195634 1I CTCTGGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2627 hom 29 11 15 3 T 10 11 91965 CASAVA_Build 14 101199100 1D TCACTGTGAG T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 7 6 91966 CASAVA_Build 14 101206731 8I AACCAAAAGA --------/GAGCAGGG GAAGCTATAC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 GAGCAGGG 0 1 91967 CASAVA_Build 14 101244863 3D TTACTATACT TTA/--- TTGTTTTCTC 3070 het 3070 ref 35 16 17 3 TTA 1 0 91968 CASAVA_Build 14 101303631 1D AGAACCTCCC T/- ATGCCTTAGC 3070 hom 84 het 30 0 28 3 T 1 0 91969 CASAVA_Build 14 101385598 3D CTTTTTCCTA TTC/--- TTCTATTTGT 3070 het 3070 ref 47 26 18 4 TTC 2 1 91970 CASAVA_Build 14 101386227 1D CTAGTAAAAG C/- TCCCCTCTGA 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 C 1 0 91971 CASAVA_Build 14 101416004 2D CCTGCCCAAA GT/-- GTGTGTGTGT 1056 het 1056 ref 54 34 3 19 GT 7 6 91972 CASAVA_Build 14 101433493 1D AGAGGTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2295 het 2295 ref 38 18 6 14 T 15 14 91973 CASAVA_Build 14 101444772 1D CTTGCATTGA T/- TTTTTTTTTT 1150 het 1150 ref 29 22 3 4 T 13 12 91974 CASAVA_Build 14 101470711 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3039 het 1168 hom 26 7 11 8 A 15 16 91975 CASAVA_Build 14 101484497 2I GGAAACGGCC --/AG AGAGACCTCG 3070 het 3070 hom 45 15 18 12 AG 2 3 91976 CASAVA_Build 14 101485780 2I AAAAGGACTC --/AG TGGCGGCCGG 1908 het 759 hom 12 3 7 2 AG 0 1 91977 CASAVA_Build 14 101489183 1D AAGGAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 11 10 91978 CASAVA_Build 14 101569008 1D CACCTGAGAA C/- CAAGGGTCAG 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 C 2 1 91979 CASAVA_Build 14 101575921 12D TTATTTTCTC TTTTATTTTCTT/------------ TATTTTATTT 2797 het 2797 ref 25 10 11 5 TTTTATTTTCTT 1 0 91980 CASAVA_Build 14 101587346 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1418 het 236 hom 14 4 5 5 A 13 12 91981 CASAVA_Build 14 101593178 2I AGATGCACAC --/AT GTGCACACAC 3070 het 3070 hom 60 18 25 17 AT 0 1 91982 CASAVA_Build 14 101600470 2I CCCAGGATGA --/AC ACACACACTT 3070 hom 75 het 29 0 22 7 AC 4 5 91983 CASAVA_Build 14 101603315 1D TTTTCTTATA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 111 hom 16 1 11 4 T 10 9 91984 CASAVA_Build 14 101606796 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAACCG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 7 91985 CASAVA_Build 14 101615517 3I CAAGCATGAG ---/CCA CCACACCTGG 3070 hom 105 het 41 0 34 7 CCA 1 2 91986 CASAVA_Build 14 101617523 2I CACTTTAGAC --/CA CACAAAGTTA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 CA 2 3 91987 CASAVA_Build 14 101621549 3I AAAATTGACT ---/TAA TAATACATTC 3070 hom 103 het 40 0 36 4 TAA 1 2 91988 CASAVA_Build 14 101626563 1D TTTTTGAGAC G/- GAGTCTTGCT 1855 het 797 hom 13 3 5 5 G 2 1 91989 CASAVA_Build 14 101628112 2D TTATTTTTAC AT/-- GTTTTACTTT 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 AT 1 0 91990 CASAVA_Build 14 101630091 1I GGGAGGACCC -/T GGGAGCGGGT 3070 hom 63 het 23 0 20 3 T 0 1 91991 CASAVA_Build 14 101651227 1I ACAGAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 2328 hom 36 het 14 0 10 4 A 13 14 91992 CASAVA_Build 14 101654945 1D TTTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1869 het 107 hom 17 2 6 9 T 17 16 91993 CASAVA_Build 14 101659615 1I AGTAGTTTCT -/A AAAACCTTGT 3070 hom 4 het 32 1 26 5 A 4 5 91994 CASAVA_Build 14 101663129 1D TGAGAAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 242 hom 24 1 16 7 T 15 14 91995 CASAVA_Build 14 101670240 1D GACCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 13 12 91996 CASAVA_Build 14 101674303 1D GCTCGCTGGG T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 7 6 91997 CASAVA_Build 14 101674600 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 30 0 28 4 T 10 9 91998 CASAVA_Build 14 101679472 4I CAAATTTATT ----/TAAC TAAAGACAGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TAAC 0 1 91999 CASAVA_Build 14 101681866 3D GTTTCAAAAA AAC/--- AAAACAATCA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 AAC 1 0 92000 CASAVA_Build 14 101684631 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1940 hom 29 9 9 11 A 15 14 92001 CASAVA_Build 14 101696245 5D TCTTGCTATC TGTTT/----- TAAGTGTACA 3070 het 3070 ref 38 20 16 5 TGTTT 1 0 92002 CASAVA_Build 14 101698664 4D TCTTTCTTTT TCTC/---- TCTCTCTCTT 2691 het 2691 ref 33 18 11 4 TC 6 4 92003 CASAVA_Build 14 101700459 1I AGTACCTTGG -/C TGCTAGCTTT 3070 hom 179 het 69 0 56 13 C 0 1 92004 CASAVA_Build 14 101706714 1I TCTGGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2457 hom 18 6 8 4 A 13 14 92005 CASAVA_Build 14 101715532 1D TTTTTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 19 0 13 6 A 14 13 92006 CASAVA_Build 14 101717573 1D CAAGTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 T 11 10 92007 CASAVA_Build 14 101719065 2I GAGGCAGGGT --/GA AATCACATGA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 GA 0 1 92008 CASAVA_Build 14 101747312 10I GGCATTTAGG ----------/TTTTTCTGTT TTGTACACCT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 TTTTTCTGTT 0 1 92009 CASAVA_Build 14 101759614 2D TAAAATAAAC TG/-- TTGTTTCCAA 3070 het 3070 ref 42 27 8 10 TG 1 0 92010 CASAVA_Build 14 101766912 1I GGAAGGCCAT -/G GGGAAGCCAC 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 G 3 4 92011 CASAVA_Build 14 101769255 1D AGTCCAAAAT G/- GTTGCCACCT 2834 het 2834 ref 21 9 8 4 G 2 1 92012 CASAVA_Build 14 101772770 3D CAGGGTGGGA CAC/--- CACCACCCCT 3070 het 2267 hom 18 6 8 5 CAC 3 2 92013 CASAVA_Build 14 101776712 2I ACTCAGGAAT --/AC AGTCTTCTCT 3055 het 3055 ref 35 24 8 3 AC 0 1 92014 CASAVA_Build 14 101778618 1I CTCTACTCTC -/T CCCTGGCAAC 3070 hom 63 het 22 0 20 2 T 0 1 92015 CASAVA_Build 14 101782241 1I CTAATCGTTA -/C CCCTTACAGC 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 C 3 4 92016 CASAVA_Build 14 101782996 7D CACAACTCAA ACCCTCC/------- ACCGAACAGA 3070 het 3070 hom 42 19 20 7 ACCCTCC 1 0 92017 CASAVA_Build 14 101794570 3I TCTTGATAAT ---/TTC TTCATTTGTT 3070 het 3070 hom 54 19 30 5 TTC 1 2 92018 CASAVA_Build 14 101817698 1I GTTTTTTTGT -/G GTTTTTTTTT 2649 het 611 hom 15 5 8 2 G 1 2 92019 CASAVA_Build 14 101826234 1I ACACTTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 14 15 92020 CASAVA_Build 14 101833481 4D ATAAATAAAC AAAT/---- AAAATAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 AAAT 1 0 92021 CASAVA_Build 14 101835258 1D TCCATGGCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 15 13 1 A 11 10 92022 CASAVA_Build 14 101844616 4D AGAGCCAGGA GCCT/---- GCTCAGCACA 3070 het 3045 hom 27 9 11 7 GCCT 1 0 92023 CASAVA_Build 14 101859109 4D TACTAGTATA ACAG/---- ACAGACGAGA 3070 het 3070 ref 34 16 16 8 ACAG 2 1 92024 CASAVA_Build 14 101863994 3I TTACAGAGGG ---/TGT TGTTGAGAAA 3070 het 3070 hom 52 22 20 10 TGT 1 2 92025 CASAVA_Build 14 101865796 2D TTCTAATATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 TG 10 9 92026 CASAVA_Build 14 101869352 1D AATGCCAATC T/- TTTTTTTTTT 2320 het 592 hom 25 4 11 10 T 19 18 92027 CASAVA_Build 14 101875920 1I GACGGGTCCC -/A AGGACACATC 2470 het 2470 ref 21 13 8 0 A 1 2 92028 CASAVA_Build 14 101880187 3D TGGCGCTGTG CTC/--- CTTCCAGGTC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 CTC 1 0 92029 CASAVA_Build 14 101887713 1D TATCTTAATT C/- CTTTACTTGG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 C 2 1 92030 CASAVA_Build 14 101904703 1D ATTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 23 15 4 4 T 12 11 92031 CASAVA_Build 14 101920013 1D GTAGTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 1302 het 1302 ref 41 23 4 14 T 15 14 92032 CASAVA_Build 14 102020056 1D CTGGCTGATT C/- TTATATTTTC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 C 1 0 92033 CASAVA_Build 14 102024409 1D GTGCTCGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 20 0 10 10 T 14 13 92034 CASAVA_Build 14 102031286 2I CCTGGGTGAC --/AG AGCGAGACCC 3070 hom 45 het 17 0 14 3 AG 1 2 92035 CASAVA_Build 14 102035121 5D CGCCACATCT CACCA/----- CACCACACCA 2646 het 2646 ref 40 13 10 21 CACCA 4 3 92036 CASAVA_Build 14 102047682 1I CCTTTGGGAG -/C CCCAAACCCT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 3 4 92037 CASAVA_Build 14 102059627 6D GAAGGAAGAA AGAAAG/------ AGAAAAAAAG 568 het 568 ref 12 5 3 7 AGAAAG 1 0 92038 CASAVA_Build 14 102072706 4I CAGGGGCTTG ----/TTTC TTTCTTTCTT 2757 het 1823 hom 24 6 9 9 TTTC 3 4 92039 CASAVA_Build 14 102078341 2D TCTGCCCATC TG/-- AGCCTCCCAA 3070 het 428 hom 14 1 13 0 TG 1 0 92040 CASAVA_Build 14 102087768 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2819 het 1662 hom 19 5 8 7 A 11 10 92041 CASAVA_Build 14 102104294 3I AAGGAAAAAA ---/AAG AAGTAGTGGG 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AAG 1 2 92042 CASAVA_Build 14 102117424 1D TGTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2164 het 1013 hom 29 5 6 19 T 14 13 92043 CASAVA_Build 14 102120639 1D GAAACCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1938 het 1938 ref 39 18 8 13 T 13 12 92044 CASAVA_Build 14 102130451 2D ATTTGAAAAG AT/-- AAACGCATAC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 AT 1 0 92045 CASAVA_Build 14 102134664 1D CAGCCTCCCG A/- GTAGCTGGGA 3009 het 998 hom 11 2 7 2 A 1 0 92046 CASAVA_Build 14 102147063 1D GAATTCCTCT A/- GGGGTGTATT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 1 0 92047 CASAVA_Build 14 102156479 1I CCAACATGGA -/G GAAACCCCAT 3070 het 1777 hom 16 4 11 1 G 1 2 92048 CASAVA_Build 14 102157801 5D AAAATCACTT AAATG/----- AATGAATGAG 3070 het 3070 hom 50 22 23 8 AAATG 1 0 92049 CASAVA_Build 14 102158273 1I TCTCTTTCTT -/A ACTCTTAAGA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 1 2 92050 CASAVA_Build 14 102165533 1D TTAACAGCCT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 210 hom 19 2 12 5 C 11 10 92051 CASAVA_Build 14 102170692 2I TTTATATTAC --/AT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 AT 0 1 92052 CASAVA_Build 14 102178334 4I AATAAACTTC ----/TTTG TTTGACGGTA 3070 het 3070 hom 54 20 29 5 TTTG 1 2 92053 CASAVA_Build 14 102188577 2I AAACGCCCTG --/TT TTTTCTTTAG 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 4 6 92054 CASAVA_Build 14 102193242 2I CAAAACACAT --/AC AGGGTAGAAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 AC 0 1 92055 CASAVA_Build 14 102196444 1D TGGGTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 18 9 T 12 11 92056 CASAVA_Build 14 102221153 2I TGGCTTTTCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2671 hom 44 11 23 10 TG 8 9 92057 CASAVA_Build 14 102224055 1D TAGCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 2590 het 967 hom 33 9 10 15 T 19 18 92058 CASAVA_Build 14 102227376 4D30M2I AGATGGGACC AATAAATAAGACACTGGGGACTACCTAGGATGGG--/----AATAAGACACTGGGGACTACCTAGGATGGGGA GAGAGGTGGG 3070 het 3070 hom 54 28 31 14 N/A 0 0 92059 CASAVA_Build 14 102231490 1I CTGGTCCGAA -/G GTAGTGAGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 1 2 92060 CASAVA_Build 14 102308336 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 11 10 92061 CASAVA_Build 14 102308795 4D TCACCATGTT AGTC/---- AGGCTGGTTT 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 AGTC 1 0 92062 CASAVA_Build 14 102310569 1D GCATGTTTGA G/- TGAGAGAAGT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 G 1 0 92063 CASAVA_Build 14 102314688 4I TGTGTGTGCC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 54 23 19 12 TG 5 7 92064 CASAVA_Build 14 102317266 1D CCCTCTTACA G/- GGCCCCCTCC 3070 het 3070 ref 38 17 16 7 G 3 2 92065 CASAVA_Build 14 102318792 1D TTCGAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 15 14 92066 CASAVA_Build 14 102320306 15D ATGCTTGGCC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1274 hom 26 4 12 14 T 27 12 92067 CASAVA_Build 14 102325560 1I AATTTATTTT -/G TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 G 0 1 92068 CASAVA_Build 14 102330252 2D AAGCTGCCAG TC/-- TCTCTCTCTC 2626 het 2626 ref 37 20 7 10 TC 6 5 92069 CASAVA_Build 14 102338421 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 1848 het 428 hom 6 1 5 0 T 5 6 92070 CASAVA_Build 14 102344603 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2761 het 1039 hom 19 5 8 6 A 15 14 92071 CASAVA_Build 14 102349253 54D TTAGTAGAGA CGGGGTTTCTCCATGTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGATAATC/------------------------------------------------------ CGCCCGCCTC 1397 het 988 hom 7 4 3 2 CGGGGTTTCTCCATGTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGATAATC 1 0 92072 CASAVA_Build 14 102359971 6I TTTCTGTGTG ------/CAGCCT CAGTCTCTGT 3070 het 3070 ref 57 37 17 3 CAGCCT 0 1 92073 CASAVA_Build 14 102370085 1I TCTCGGGGGG -/A AAAAAAAAGA 2882 het 2714 hom 19 9 7 3 A 8 9 92074 CASAVA_Build 14 102411619 1I TCCTCTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 12 13 92075 CASAVA_Build 14 102450797 1D TCTAGGAGCC A/- GGGGCACAGC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 1 0 92076 CASAVA_Build 14 102460438 1D GTCCCCAACA C/- CCCCCCCTCT 3070 het 2893 hom 27 11 10 6 C 8 7 92077 CASAVA_Build 14 102460999 1D ATCGTTGGGG A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 A 7 6 92078 CASAVA_Build 14 102478325 2D CTGCCCACAC AT/-- GTCTGCTGTG 3070 het 3070 hom 34 13 11 10 AT 1 0 92079 CASAVA_Build 14 102495081 5I GAATTTGTAT -----/TAAAG TATTTTCTTG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 TAAAG 0 1 92080 CASAVA_Build 14 102495387 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1712 het 68 hom 13 2 7 4 A 17 16 92081 CASAVA_Build 14 102500106 1I ACTGACTGAA -/C TCACTGCTGT 3070 hom 120 het 49 0 41 8 C 0 1 92082 CASAVA_Build 14 102522219 2D TGGTTAATGC CT/-- GCCCACCCGA 3070 het 3070 ref 28 19 9 0 CT 1 0 92083 CASAVA_Build 14 102524444 1D TCCAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 2495 het 2495 ref 26 8 9 9 A 17 16 92084 CASAVA_Build 14 102527210 1I CCCCACAGGG -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 6 7 92085 CASAVA_Build 14 102543889 3I TGAAGCAGGA ---/AGC AGCAGGTCAA 3070 het 3070 hom 47 16 19 12 AGC 1 2 92086 CASAVA_Build 14 102552911 1D CTGTCTACCG A/- AGAGTATCCG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 2 1 92087 CASAVA_Build 14 102579090 3D ATTAAAAATA AAC/--- AAAAGGTACT 3070 het 3070 ref 41 21 13 10 AAC 1 0 92088 CASAVA_Build 14 102586720 1I AGCGGTGTAT -/G GCCTATTGTC 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 G 1 2 92089 CASAVA_Build 14 102621547 2D GCCAAGTGCA GG/-- GGCAGGACTT 2977 het 2121 hom 21 7 10 7 G 4 2 92090 CASAVA_Build 14 102622190 1D TCGGGACCCT G/- GGGGGGTCGG 3070 het 1121 hom 25 7 14 5 G 7 6 92091 CASAVA_Build 14 102648224 1I CATTTTTTTT -/C CCAGCTGTGA 3070 het 2465 hom 24 9 9 6 C 2 3 92092 CASAVA_Build 14 102665595 2D AGGACCTAAT GG/-- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 G 10 8 92093 CASAVA_Build 14 102669234 2I GAGCATGTAA --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 hom 91 37 39 15 AC 4 5 92094 CASAVA_Build 14 102679040 1I CCTGTAAAAT -/A AGAGTCCATC 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 A 1 2 92095 CASAVA_Build 14 102679989 3I TGTTTTAAAG ---/ATA ATAATATCGA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 ATA 2 3 92096 CASAVA_Build 14 102686783 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2193 hom 20 5 8 7 A 15 14 92097 CASAVA_Build 14 102687093 1D TATTACCAGG T/- TTTTCATAGT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 5 4 92098 CASAVA_Build 14 102687396 4D GTATGCAATC AATT/---- GTTTGTTAGG 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 AATT 1 0 92099 CASAVA_Build 14 102688281 4D AGGCTGGTCT CGAA/---- CGAACTCCTG 2429 het 1998 hom 14 6 6 3 CGAA 2 1 92100 CASAVA_Build 14 102688766 1D TCTCAATAAA G/- TTGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 G 1 0 92101 CASAVA_Build 14 102688823 4D TCAAAAAAAT AAAC/---- AAACAGGGTG 2202 het 2202 ref 17 8 6 3 AAAC 2 1 92102 CASAVA_Build 14 102690929 1I GTAATCCTTT -/A AAAATGTGTG 3070 het 3070 hom 55 17 29 9 A 4 5 92103 CASAVA_Build 14 102713407 1D CCCAAGCCCA C/- TTCCTGGCTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 1 0 92104 CASAVA_Build 14 102753691 2D ATGCAAAGAG AA/-- AGAGAGAGTT 3070 hom 129 het 49 0 41 8 A 3 1 92105 CASAVA_Build 14 102759840 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 183 hom 40 2 29 9 A 14 13 92106 CASAVA_Build 14 102762485 4D CTGTGTGATG TTAA/---- TTAACACTGT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 TTAA 2 1 92107 CASAVA_Build 14 102763048 4I ACACTCACCT ----/GCAG GCAGGCCTGA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 GCAG 1 2 92108 CASAVA_Build 14 102763354 1D CTGGTCCAGA G/- CCCCCAGGGC 1732 het 1667 hom 14 7 5 2 G 1 0 92109 CASAVA_Build 14 102780800 2D TCATTCCCAT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 het 355 hom 36 5 13 18 G 14 12 92110 CASAVA_Build 14 102781605 5I TGCCTTTTTA -----/TTTAT TTTATTTTTT 3070 hom 82 het 30 0 28 2 TTTAT 1 2 92111 CASAVA_Build 14 102790151 3I ATTTTGCAGA ---/CGT CCCCCCCCCA 3070 hom 96 het 39 0 27 12 CGT 0 1 92112 CASAVA_Build 14 102791113 1D CTGTGCCAAA T/- AGCTAGTCTT 3070 hom 44 het 31 0 15 17 T 1 0 92113 CASAVA_Build 14 102793241 1I AATTGAAAAA -/T CTAAGATTCG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 92114 CASAVA_Build 14 102795024 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 31 1 20 10 A 12 11 92115 CASAVA_Build 14 102795905 1I TGTTTGTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 11 92116 CASAVA_Build 14 102797545 1D CTCTTCTAGC T/- TTTTTTTTTT 916 het 916 ref 35 19 3 13 T 15 14 92117 CASAVA_Build 14 102811020 1D TTCTCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 1083 het 1083 ref 19 13 4 2 T 11 10 92118 CASAVA_Build 14 102824264 1D CTGTAGGCTT G/- GCGTGCCCCA 2530 hom 35 het 14 0 9 5 G 2 1 92119 CASAVA_Build 14 102842509 1D TTTGAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 13 12 92120 CASAVA_Build 14 102863268 25D AGAACACACG CACACCTGGAAGGGGAGAGCACACA/------------------------- CACACACATG 3070 het 3070 ref 47 26 23 7 CACACCTGGAAGGGGAGAGCACACA 1 0 92121 CASAVA_Build 14 102885800 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 23 0 18 5 A 10 11 92122 CASAVA_Build 14 102886238 10D TCAATCTACA TCAGTCTATG/---------- TCAGTCTATG 3070 hom 200 het 78 0 65 21 TCAGTCTATG 2 1 92123 CASAVA_Build 14 102892238 1D GCTGTTGAAA G/- TGTCATATCA 3070 het 3070 hom 38 9 21 9 G 1 0 92124 CASAVA_Build 14 102897309 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2058 hom 22 5 16 1 A 11 12 92125 CASAVA_Build 14 102898526 1I CTTTAGTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 T 9 10 92126 CASAVA_Build 14 102901748 1D CCAGCCAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 20 1 12 7 T 13 12 92127 CASAVA_Build 14 102902846 1I ATCTTGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 10 11 92128 CASAVA_Build 14 102916708 3D TCATCTGTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 24 1 16 7 A 16 13 92129 CASAVA_Build 14 102918849 3I CTCCGGCCTT ---/CTC CTGCAGTCTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 CTC 0 1 92130 CASAVA_Build 14 102925685 4D CTAATTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTTG 3 2 92131 CASAVA_Build 14 102926557 1I TTTCTAAAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 83 het 34 0 27 7 T 8 9 92132 CASAVA_Build 14 102929853 1D ATTTTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 9 9 T 15 14 92133 CASAVA_Build 14 102931457 1I ATAACATCAT -/C TCAAGTTGTG 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 C 0 1 92134 CASAVA_Build 14 102932263 1I GAGGAGACCC -/A GGGGGTCTGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 0 1 92135 CASAVA_Build 14 102945325 1I ACTCGTAAGT -/G GGAGTTGAAC 3070 het 1948 hom 18 5 10 3 G 2 3 92136 CASAVA_Build 14 102949520 1I AATAGCATGC -/T TTTTTTTTTT 1231 het 667 hom 13 3 7 3 T 15 16 92137 CASAVA_Build 14 102951315 4D GTTTTAATTT AACA/---- AACATGTTGG 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 AACA 2 1 92138 CASAVA_Build 14 102953300 2D6M12D AACACCCCAG GAGCATTGTTATACAACAAC/--GGAGTG------------ ATCACAATGA 3070 hom 90 het 40 0 29 15 N/A 0 0 92139 CASAVA_Build 14 102953361 3D CTAAGAACTT GAG/--- GAGGAAGACT 3070 het 3070 hom 36 12 11 14 GAG 2 1 92140 CASAVA_Build 14 102956487 1I ATCCGGCTGA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 2582 hom 31 10 14 7 T 6 7 92141 CASAVA_Build 14 102960633 3I AAAAACAAAA ---/AAC AAAAGAATCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AAC 0 1 92142 CASAVA_Build 14 102968643 3D GGCAAAGGCT GAA/--- GAAGGCTGAG 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 GAA 2 1 92143 CASAVA_Build 14 102972708 2I GGCACTTCTT --/AA ATATTGATTG 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 A 1 3 92144 CASAVA_Build 14 102975083 1I TTCTCTAATT -/A AAAAAAAAAA 2646 het 2646 ref 28 12 9 7 A 14 15 92145 CASAVA_Build 14 102977935 3D TGGTTCACTT AAC/--- AATTGCCATT 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 AAC 1 0 92146 CASAVA_Build 14 102978614 3I AGAGTTGGGC ---/AAT AATACATAAC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 AAT 1 2 92147 CASAVA_Build 14 102979034 1I GGTGGGTGTC -/T CCCCCCCCTC 3070 het 228 hom 32 4 16 12 T 0 1 92148 CASAVA_Build 14 102984966 5D GTTTAATAAC TTGTG/----- TTGGGGGGAT 3070 het 3070 ref 28 14 14 5 TTGTG 1 0 92149 CASAVA_Build 14 102999238 3D TCTATATACC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 36 1 18 17 T 13 10 92150 CASAVA_Build 14 103006150 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1786 het 1786 ref 21 11 8 2 A 17 16 92151 CASAVA_Build 14 103007859 4I TTTCAAGGGG ----/TTCT TTAGCTTGTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TTCT 0 1 92152 CASAVA_Build 14 103011558 1D TTTATTTCTT A/- ACAATTCTGG 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 2 1 92153 CASAVA_Build 14 103012602 7D AAGTAGATAA TATTTAC/------- TAAATTAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 TATTTAC 1 0 92154 CASAVA_Build 14 103018609 1D AGACTCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 806 hom 40 2 29 9 A 13 12 92155 CASAVA_Build 14 103019339 3I CCTGGACCTA ---/TGT TGTTAACTTC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 TGT 1 2 92156 CASAVA_Build 14 103020857 3D CCTGTCTAAA ATT/--- AATTAGCTGG 3070 hom 48 het 17 0 16 1 ATT 1 0 92157 CASAVA_Build 14 103022156 3D AGGCCATGAC AGG/--- AGGATTGCTT 3070 het 1622 hom 16 4 9 4 AGG 2 1 92158 CASAVA_Build 14 103024135 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 19 6 A 13 12 92159 CASAVA_Build 14 103026788 2D63M1D TCATAGAAAC AGATATTCAAACATGTAATCTGCTATTTTATTTTAAGGTAATAGATTTTTATGATTACTGTTTGGA/--ATATTCAAACATGTAATCTGCTATTTTATTTTAAGGTAATAGATTTTTATGATTACTGTTTGG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 14 N/A 0 0 92160 CASAVA_Build 14 103031545 1I ACTCCAGCCT -/G GGCGACAGAT 3070 hom 42 het 42 1 33 8 G 2 3 92161 CASAVA_Build 14 103031883 1D TAATCAGCTA C/- TGACAGTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 C 1 0 92162 CASAVA_Build 14 103034299 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 30 2 20 8 A 15 14 92163 CASAVA_Build 14 103035958 12I GTGGTGTGCG ------------/GTGTGTGCAGCA GTGTGTGCAG 3070 hom 79 het 37 0 25 12 GTGTGTGCAGCA 0 1 92164 CASAVA_Build 14 103041000 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 34 1 29 4 A 10 11 92165 CASAVA_Build 14 103041819 2I TTGGATAAAC --/AT GTGAGGGGTT 3070 hom 92 het 35 0 30 5 AT 0 1 92166 CASAVA_Build 14 103043209 1I ACAAAAATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 9 10 92167 CASAVA_Build 14 103048962 3D CAACTCAGGC GTG/--- GGGGCAGCGG 3070 het 3070 ref 39 16 14 10 GTG 1 0 92168 CASAVA_Build 14 103050508 1D TGTGATCCTG C/- CCACTGCACT 3070 hom 38 het 17 0 10 7 C 3 2 92169 CASAVA_Build 14 103050978 2I GGGAAGAGAC --/AG AGGACAGAGC 3070 hom 70 het 31 0 21 10 AG 1 2 92170 CASAVA_Build 14 103053733 2I ACAGGCAGAC --/AG GACTGTAGCT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 AG 0 1 92171 CASAVA_Build 14 103082827 2D TAGGTTAGAG AC/-- TGCCAGATCT 3070 het 3070 hom 30 10 13 10 AC 1 0 92172 CASAVA_Build 14 103089753 1I TGGGCGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 640 hom 21 4 12 5 A 11 12 92173 CASAVA_Build 14 103090399 6D CTGCCTGGTG ACCCCC/------ ACCCCCACCC 3070 het 3070 hom 38 16 14 9 ACCCCC 2 1 92174 CASAVA_Build 14 103095091 1D GAGTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2823 hom 34 12 15 8 T 13 12 92175 CASAVA_Build 14 103097950 1I CCACTCTCTC -/A AAAAAAAAAC 2591 het 2591 ref 29 13 7 9 A 9 10 92176 CASAVA_Build 14 103130380 18D AACCTCCCCA GGGAAAGGCCGCCGTGTG/------------------ GGGAGCATCT 2480 het 2480 ref 20 11 7 4 GGGAAAGGCCGCCGTGTG 1 0 92177 CASAVA_Build 14 103135605 7I GTCTCAAAAA -------/AAAAAAC AAAAAACAAA 3070 hom 63 het 26 0 25 1 AAAAAAC 1 2 92178 CASAVA_Build 14 103146973 1I AAAAAAAAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 41 16 18 7 A 7 8 92179 CASAVA_Build 14 103148688 2D CCACAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 2218 het 2218 ref 23 10 9 4 A 12 10 92180 CASAVA_Build 14 103149693 1I AAATGTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2103 hom 24 8 12 4 A 10 11 92181 CASAVA_Build 14 103155042 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 757 het 583 hom 17 2 6 9 A 15 16 92182 CASAVA_Build 14 103164101 13I AGGAGCTCCC -------------/CCTTTGTAGCCCA CCTTTGTCTT 3070 hom 61 het 29 0 21 8 CCTTTGTAGCCCA 0 1 92183 CASAVA_Build 14 103177455 1D TTTCTTAGAC T/- TTCCTTGCAT 3070 hom 108 het 39 0 36 4 T 3 2 92184 CASAVA_Build 14 103186323 1D GCCTGTACTA T/- TGTTCCAGGT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 T 2 1 92185 CASAVA_Build 14 103191693 6D GGCCTCTGAA TTTTAT/------ TTTTATTTTT 3070 hom 42 het 18 0 13 5 TTTTAT 3 2 92186 CASAVA_Build 14 103200604 1D TAGCTCTTAA T/- TAGATTGAGA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 2 1 92187 CASAVA_Build 14 103206223 1D AAATGTACTC T/- TATTTGGTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 2 1 92188 CASAVA_Build 14 103210013 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1141 het 1141 ref 15 8 3 4 A 13 14 92189 CASAVA_Build 14 103210510 1I GCTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 36 2 25 9 T 12 13 92190 CASAVA_Build 14 103213383 1D AAAGTACAAG A/- GAAAGTTAAA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 1 0 92191 CASAVA_Build 14 103216365 1D AGCACATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 34 2 21 11 T 17 16 92192 CASAVA_Build 14 103226727 1D TGTTCGCTGT C/- CCATGTTGCA 3070 hom 114 het 44 0 37 7 C 3 2 92193 CASAVA_Build 14 103232975 1I GGTCAGTGTT -/C CTGGGACTGA 3070 hom 53 het 22 0 15 7 C 1 2 92194 CASAVA_Build 14 103239742 2D CTCCTTCCCC CT/-- GTGAACCTCC 3070 hom 69 het 27 0 21 6 CT 1 0 92195 CASAVA_Build 14 103246678 3I AATTTACAAA ---/AAG AAAATTAGCC 3070 hom 36 het 18 0 12 6 AAG 0 1 92196 CASAVA_Build 14 103248199 12I AGGGAGACAG ------------/GCCCGGCGTGGA GAACAGACTA 3070 hom 42 het 20 0 14 6 GCCCGGCGTGGA 0 1 92197 CASAVA_Build 14 103283609 1I TGAGATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 T 11 12 92198 CASAVA_Build 14 103286290 1I ACAGGAGACT -/G AGTGCGGTGT 3070 hom 175 het 61 0 59 2 G 0 1 92199 CASAVA_Build 14 103289332 1I TAGTTGATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 517 hom 36 2 30 4 T 11 12 92200 CASAVA_Build 14 103291182 3I AGAGAGGGTT ---/TTC TTATTACACT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TTC 0 1 92201 CASAVA_Build 14 103293016 1D GCCTGGGTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 8 7 92202 CASAVA_Build 14 103295049 1D TTTAACAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 27 2 16 10 T 15 14 92203 CASAVA_Build 14 103311371 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 10 5 A 0 1 92204 CASAVA_Build 14 103315272 1D TCAGCTACTT G/- GGGGGCTGAG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 6 5 92205 CASAVA_Build 14 103319304 1I ATCTTTTGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 9 10 92206 CASAVA_Build 14 103321325 1I GTTTGTTTGG -/T TTGAGATGGG 3070 hom 71 het 39 0 34 5 T 2 3 92207 CASAVA_Build 14 103327216 2I TTTTTCTTCT --/TC TTTTTTTTTT 1066 het 151 hom 26 3 11 12 TC 0 1 92208 CASAVA_Build 14 103351037 1D TCCGTCTCAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 40 het 28 1 26 1 A 9 8 92209 CASAVA_Build 14 103355858 2I CATCTGAAGA --/TC TCTGGTTGTT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 TC 1 2 92210 CASAVA_Build 14 103356536 1D AGGACCCGTA T/- TTTTGACACA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 T 5 4 92211 CASAVA_Build 14 103361046 1D CATTTTTTTT A/- ACAAATTGAC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 2 1 92212 CASAVA_Build 14 103380042 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2104 het 234 hom 12 1 9 2 A 15 16 92213 CASAVA_Build 14 103381328 4I ACATTTTTGG ----/ATAC ATAGTTTAAA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 ATAC 0 1 92214 CASAVA_Build 14 103387838 1D CATAGCAAGA C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 50 het 22 0 20 2 C 9 8 92215 CASAVA_Build 14 103429819 4D AATCTGTAGT TTTA/---- TTTGTGTGTG 3070 hom 81 het 30 0 27 4 TTTA 1 0 92216 CASAVA_Build 14 103453484 1D CATGTCATTT A/- AGGGCCTTGG 3070 hom 102 het 40 0 33 7 A 2 1 92217 CASAVA_Build 14 103473948 1I17M1I GTTGATTTTC -TTTTTTTTTTAATTTTC-/TTTTTTTTTTTAATTTTCT TTTTTTGAAT 3070 hom 134 het 43 0 44 7 N/A 0 0 92218 CASAVA_Build 14 103475835 6I AAAAAAGTGT ------/TTTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 19 4 9 6 TTTTTG 0 1 92219 CASAVA_Build 14 103479057 1D GTTGTCAGGG A/- AAAATAGAGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 5 4 92220 CASAVA_Build 14 103492752 1D TTAAAACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 12 11 92221 CASAVA_Build 14 103508396 1D GACTGCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 23 11 A 11 10 92222 CASAVA_Build 14 103519304 1I CAGGTGTGTG -/C CCCCATGCCC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 4 5 92223 CASAVA_Build 14 103525162 4I CTCTCATTTT ----/TTTG TTTATCTGGG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TTTG 0 1 92224 CASAVA_Build 14 103527850 1D AAGAGTTCAA T/- TTTTTTTTTT 2509 het 346 hom 11 1 8 2 T 15 14 92225 CASAVA_Build 14 103529228 1D CCTGGCCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 26 1 15 11 T 13 12 92226 CASAVA_Build 14 103531057 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 639 hom 33 2 26 5 A 9 10 92227 CASAVA_Build 14 103538408 12D ATGCTGTTTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 30 0 29 1 A 20 8 92228 CASAVA_Build 14 103546350 1I TTTTTTATTC -/T TTTTATTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 4 5 92229 CASAVA_Build 14 103546660 1D GTTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 27 0 21 6 T 15 14 92230 CASAVA_Build 14 103550954 1I TTCCTGGATA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 8 9 92231 CASAVA_Build 14 103553037 1D TCTTTGATGA G/- CACCAAAAGG 3070 het 3070 ref 51 24 19 9 G 1 0 92232 CASAVA_Build 14 103570421 7D GCTGGGACTA CAAGCAC/------- CTGCCACCAT 2219 het 455 hom 7 1 5 1 CAAGCAC 1 0 92233 CASAVA_Build 14 103582740 5D TTCTTTTTCT TTTTC/----- TTTTTTTTTG 78 het 78 ref 22 10 1 11 TTTTC 1 0 92234 CASAVA_Build 14 103588583 1D GAAAAAACTT A/- AAAAAACAAA 3070 het 196 hom 29 1 26 3 A 7 6 92235 CASAVA_Build 14 103611868 40D GGTTTTGCCT CTGCAGCTTTTGACTTTGTAGGCAAAAGGTGAAGTTTCTC/---------------------------------------- CTGCAGCTTT 3070 hom 62 het 28 0 21 12 CTGCAGCTTTTGACTTTGTAGGCAAAAGGTGAAGTTTCTC 2 1 92236 CASAVA_Build 14 103615255 2I TATAAACGAC --/AG AGATTTATTT 3070 hom 114 het 43 0 35 8 AG 1 2 92237 CASAVA_Build 14 103654940 2D GCAGCCCCGT GA/-- GAGGGGCTGA 3070 hom 75 het 32 0 18 16 GA 2 1 92238 CASAVA_Build 14 103681710 1I TCTGGCGGAG -/C GTGCCGCATG 3070 hom 63 het 23 0 19 4 C 0 1 92239 CASAVA_Build 14 103691581 1D TTTCCTTCCG T/- TTGCTGCTGT 3070 hom 62 het 25 0 17 8 T 3 2 92240 CASAVA_Build 14 103697126 1I TGCGCTGCCC -/T GAGGCTTAGC 2209 het 2209 ref 29 15 9 5 T 0 1 92241 CASAVA_Build 14 103700986 2D TATGTGTCTC TG/-- TGTCTTTATG 3070 het 3070 hom 65 28 28 9 TG 2 1 92242 CASAVA_Build 14 103701628 2I TATCTTTGTG --/TC TCTATGCGTG 3070 het 3070 ref 91 47 35 9 TC 1 2 92243 CASAVA_Build 14 103715509 1I CCCAGCCCGG -/C CCCACCGTGT 1421 het 6 hom 5 0 4 1 C 3 4 92244 CASAVA_Build 14 103716278 5D AGCAGTTTTT GTGGA/----- GTGGAGTGGG 3070 hom 65 het 27 0 21 7 GTGGA 2 1 92245 CASAVA_Build 14 103716391 1D GGATCTGTGT G/- GGGTTCTCAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 G 4 3 92246 CASAVA_Build 14 103717137 1D CCTGCCTTGC A/- GCCCCTGTGG 2439 het 1326 hom 19 5 8 6 A 1 0 92247 CASAVA_Build 14 103719007 1I ATAGAGCACA -/C CCCTGCCCCC 3070 hom 48 het 19 0 15 4 C 3 4 92248 CASAVA_Build 14 103720567 15D TGGGATGGGA ACAGTGGCAGCAATG/--------------- ACAGTGGGAG 3070 hom 84 het 30 0 29 5 ACAGTGGCAGCAATG 1 0 92249 CASAVA_Build 14 103725749 4I32M4D CCGTACACAT ----ACATGCACACACGGGCGCACATGCACCTAGGGACAC/ACACACATGCACACACGGGCGCACATGCACCTAGGG---- ACACGTGCAC 3070 hom 155 het 57 0 53 22 N/A 0 0 92250 CASAVA_Build 14 103742853 4D GACACACACA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3025 het 146 hom 40 3 12 26 GT 11 9 92251 CASAVA_Build 14 103756318 1D GCATCCATTA G/- GGCGGTGGCT 3070 hom 70 het 26 0 19 7 G 3 2 92252 CASAVA_Build 14 103760480 1D CCAGGGCCCT G/- GGGAGGGGGC 3070 het 3070 hom 21 8 10 4 G 4 3 92253 CASAVA_Build 14 103760616 1D GGGTGTGGGT G/- GGGGGTCCCC 1987 hom 39 het 16 0 9 7 G 6 5 92254 CASAVA_Build 14 103765674 1I CCCACGAAGG -/C CCCCCCTGGG 2403 het 1883 hom 23 10 7 6 C 6 7 92255 CASAVA_Build 14 103775314 1D GGGAGGCCAT G/- GGGGTGTTTC 3070 hom 79 het 31 0 26 5 G 5 4 92256 CASAVA_Build 14 103779954 1I GTTATTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 99 hom 30 1 17 12 T 10 11 92257 CASAVA_Build 14 103786640 1D GTGCTGCAGA G/- GGGGTGTCAG 2528 het 2528 ref 15 6 6 3 G 5 4 92258 CASAVA_Build 14 103790943 1I AGGGGCCCCA -/G GGGGGCAACA 2778 het 2778 ref 27 13 8 6 G 5 6 92259 CASAVA_Build 14 103795516 4D AGACAGAGTG ACTA/---- ACAGAATTAA 3070 het 3070 hom 47 21 21 7 ACTA 1 0 92260 CASAVA_Build 14 103802979 2D TGGGTATGAC TA/-- TGTGTGCACG 1727 het 1727 ref 36 21 8 9 TA 1 0 92261 CASAVA_Build 14 103804273 6D TTCACAAACC TCCGCT/------ TCCGCTTCCG 2268 het 1869 hom 23 10 8 6 TCCGCT 3 2 92262 CASAVA_Build 14 103804479 1D AATGCATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 11 10 92263 CASAVA_Build 14 103809512 5D TAGTCTCAAG TTTCT/----- TTTCTTGTAA 3070 het 3070 hom 40 15 17 11 TTTCT 2 1 92264 CASAVA_Build 14 103821701 1I AGGAAGGGGA -/G GGGGCTTCTC 2621 het 1796 hom 26 7 8 11 G 4 5 92265 CASAVA_Build 14 103825500 4I TTTTTAACAT ----/AAAG AAAAGGCAAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 AAAG 0 1 92266 CASAVA_Build 14 103826178 2D10M2D AGTGTGTAAC TGTGTGCATGTCTG/--TGTGCATGTC-- TGAATGTGTG 3070 het 3070 ref 68 48 28 7 N/A 0 0 92267 CASAVA_Build 14 103826396 2D TGTGCATATC TG/-- TGTGTGTGGG 3070 het 3070 ref 78 36 23 20 TG 5 4 92268 CASAVA_Build 14 103837353 1D TGCTGAGCTG C/- TCTGTTTGCT 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 C 1 0 92269 CASAVA_Build 14 103847297 1I ATCTTGCCTG -/T GAGCAGACAG 3070 het 3070 hom 49 23 17 9 T 0 1 92270 CASAVA_Build 14 103848521 1D GCTAAAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 10 9 92271 CASAVA_Build 14 103852575 2I TAAAGAAATT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 9 11 92272 CASAVA_Build 14 103860927 1I ATTGGTTACT -/G GGGCACCCAA 3070 hom 83 het 37 0 26 11 G 3 4 92273 CASAVA_Build 14 103861930 7I ACAGGTGTGT -------/ATATCCA GAATGTAGTT 3070 het 3070 ref 85 40 34 13 ATATCCA 0 1 92274 CASAVA_Build 14 103866724 1I TATGGTGAAG -/A CTCGTCTCTA 3070 het 1265 hom 12 3 8 1 A 0 1 92275 CASAVA_Build 14 103869116 2I AACCCCAGGC --/AG AGACTGCTCT 3070 het 2806 hom 25 9 13 3 AG 1 2 92276 CASAVA_Build 14 103869254 1I GTCCTGCCCT -/G GGGGTTCAGG 3070 het 3070 ref 40 18 10 12 G 4 5 92277 CASAVA_Build 14 103875790 1D ATTTGCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 11 10 92278 CASAVA_Build 14 103904108 13I CTGAGGGAGG -------------/GCAGGTCCTATAC CCAGCTAAGA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 GCAGGTCCTATAC 0 1 92279 CASAVA_Build 14 103922875 1D GGTCGTCCTC A/- CCGCAGTCAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 1 0 92280 CASAVA_Build 14 103936023 4D AAGTTCCTTT TAAA/---- TAAATAAATA 3070 het 3070 ref 36 15 17 4 TAAA 3 2 92281 CASAVA_Build 14 103963318 2I GTCTGTACAC --/AT GTGTGCGTGT 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 AT 0 1 92282 CASAVA_Build 14 104029814 1D ATTTATCATT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 8 7 92283 CASAVA_Build 14 104034217 1D TGTCCTGCCC T/- GCTCCATACT 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 T 1 0 92284 CASAVA_Build 14 104035573 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 54 het 54 ref 20 18 1 1 A 11 10 92285 CASAVA_Build 14 104045566 3D ATGGCTAGGA TGT/--- TGTTCAGCCA 3070 hom 110 het 44 0 34 12 TGT 2 1 92286 CASAVA_Build 14 104049244 14D ATCTCAAAAA AAAAAAAAAAAAAG/-------------- AAAAAGAAAA 3070 hom 57 het 19 0 18 5 AAAAAAAAAAAAAG 1 0 92287 CASAVA_Build 14 104055885 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 21 0 13 8 A 16 15 92288 CASAVA_Build 14 104058846 14I ATTGCACACA --------------/CACACACACACACG CACACACACA 3070 hom 144 het 57 0 47 11 CACACACACACACG 0 1 92289 CASAVA_Build 14 104064136 8D CACACACACT CACACACA/-------- GTCACACACT 3070 het 3070 ref 56 20 18 29 CA 4 0 92290 CASAVA_Build 14 104064398 10I ACCACACACT ----------/CACACTCATA CATTCAGACA 3070 hom 85 het 50 0 30 20 CACACTCATA 0 1 92291 CASAVA_Build 14 104064435 2D AGACACACAG AC/-- ACACACATAC 751 het 751 ref 61 8 6 48 AC 4 3 92292 CASAVA_Build 14 104064985 2D CACACTTTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 75 26 32 17 CA 6 5 92293 CASAVA_Build 14 104065704 2D CATAAGCCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 12 10 92294 CASAVA_Build 14 104071063 1D TAGCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1530 het 1530 ref 35 14 4 17 T 15 14 92295 CASAVA_Build 14 104148555 1D GCTCTTAGAA T/- TTAAGCCCTG 3070 hom 75 het 30 0 24 6 T 3 2 92296 CASAVA_Build 14 104154126 3D GACCCATCAC ATA/--- ATGTCGCTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATA 1 0 92297 CASAVA_Build 14 104180472 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 728 hom 17 3 11 3 A 8 7 92298 CASAVA_Build 14 104181317 2I CTACACGCAC --/AT GTCTCCCTGA 3070 het 3070 hom 51 20 28 3 AT 0 1 92299 CASAVA_Build 14 104185185 1D AAAGAAACTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 8 7 92300 CASAVA_Build 14 104186852 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCGGC 1756 het 1756 ref 11 6 4 1 CTC 0 1 92301 CASAVA_Build 14 104192161 1D GGTTGCAGTG C/- AGCCAAGATT 3070 hom 39 het 14 0 12 2 C 1 0 92302 CASAVA_Build 14 104223311 1I GGGTGAGTGG -/A CAAATGGGTG 2715 hom 49 het 22 0 10 12 A 0 1 92303 CASAVA_Build 14 104242413 1I GAAGCTCTAT -/C CCAGGCCTCA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 C 2 3 92304 CASAVA_Build 14 104242799 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2733 het 1150 hom 21 4 9 8 A 12 11 92305 CASAVA_Build 14 104246284 1D AGCTAGGGGC T/- GTCCAGGCTC 2165 het 2165 ref 21 10 7 5 T 1 0 92306 CASAVA_Build 14 104247739 1D CCACCACCTC G/- GTGCACACAC 2788 het 2258 hom 27 7 8 13 G 2 1 92307 CASAVA_Build 14 104248397 1D TACGTAAGTC A/- GGGGCAGCTC 1032 het 1032 ref 17 8 4 5 A 1 0 92308 CASAVA_Build 14 104256129 2D CTGATATTGT AC/-- CCAGCAAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 14 8 AC 1 0 92309 CASAVA_Build 14 104260357 1D GGCACGGTCA G/- GTGCCAAGAG 1745 het 1745 ref 18 7 6 5 G 2 1 92310 CASAVA_Build 14 104272767 7D AGCGGGAGTG CCTGATC/------- CCTGATCCCT 2126 het 2126 ref 35 19 8 11 CCTGATC 4 3 92311 CASAVA_Build 14 104282608 1I CCCACCTGCA -/G GGGAGCCACG 1511 het 1511 ref 24 14 6 4 G 3 4 92312 CASAVA_Build 14 104283307 2I CTAGAGTCTC --/TT AGAATTTCCA 3070 hom 128 het 50 0 38 12 T 0 2 92313 CASAVA_Build 14 104285864 2D GTTGTCATCG TT/-- TTCTTTCCTC 3070 het 3070 ref 33 16 11 8 T 4 2 92314 CASAVA_Build 14 104294240 2I GAACACACAC --/AT GTGTGGCCCC 3070 hom 80 het 34 0 24 10 AT 0 1 92315 CASAVA_Build 14 104300601 4D TTGAATAAAC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 2879 hom 26 8 13 5 TTAT 3 2 92316 CASAVA_Build 14 104301271 4D TTTATTTTAT TTTA/---- TTTATTATTT 2251 het 565 hom 11 2 9 0 TTTA 2 1 92317 CASAVA_Build 14 104309637 5D CAGCAGGCTC CTGAG/----- GTGAGGGCGA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 CTGAG 1 0 92318 CASAVA_Build 14 104323809 12D GGCTCCTTCC GGGGCTCGGCCG/------------ GGGGCACGCA 3070 hom 52 het 26 0 16 10 GGGGCTCGGCCG 1 0 92319 CASAVA_Build 14 104331952 1I AATACTCTGT -/G TTTCGAAAGG 3070 hom 74 het 31 0 23 8 G 0 1 92320 CASAVA_Build 14 104334394 1I GGAAGGGCCC -/T ACCTCCAGGG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 0 1 92321 CASAVA_Build 14 104340459 1I GGGGTGGGGG -/C GGGGGGTGCA 2764 hom 24 het 16 0 10 6 C 0 1 92322 CASAVA_Build 14 104342190 1D ACAGGGCTGA G/- GTGGCACCCC 2738 het 2738 ref 29 12 8 9 G 2 1 92323 CASAVA_Build 14 104347088 1I CTGAGATTAC -/A GGCACCCACT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 0 1 92324 CASAVA_Build 14 104358439 2I AACCCCAAAC --/AG GGAAGAAACC 3070 hom 72 het 29 0 23 6 AG 0 1 92325 CASAVA_Build 14 104361467 3I GATTCAATTA ---/CCT CCCACTGGGT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 CCT 0 1 92326 CASAVA_Build 14 104368795 2I GGCTTTTCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 12 14 92327 CASAVA_Build 14 104379295 4I TCCTTCCTTT ----/CTTC CTTCCTTCCT 3070 hom 52 het 24 0 17 7 CTTC 3 4 92328 CASAVA_Build 14 104386567 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAA 2844 het 3 hom 20 1 12 8 AG 1 0 92329 CASAVA_Build 14 104390077 1I TTAAAAAAAA -/T ATATATGTAT 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 T 0 1 92330 CASAVA_Build 14 104393970 1D TTGAAGCTTT C/- ACTGCCTGAG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 1 0 92331 CASAVA_Build 14 104394467 1D CCCCATGCCC T/- CCCCCCCGAC 1778 het 1166 hom 13 5 5 3 T 1 0 92332 CASAVA_Build 14 104397563 2D CATCCATCAC CA/-- CTCTCCATCA 3070 het 3070 hom 51 21 15 16 CA 1 0 92333 CASAVA_Build 14 104401181 3D TCTGCTTCCA CCC/--- CCCCCCCCCC 1667 hom 20 het 14 0 6 8 C 15 12 92334 CASAVA_Build 14 104407492 1I TGTTTTCTAC -/A AAGGGCCTGG 1910 het 1910 ref 27 10 6 11 A 2 3 92335 CASAVA_Build 14 104433676 1I TTCCTCTGAG -/C CCTGCGGCCC 3070 hom 47 het 18 0 16 2 C 2 3 92336 CASAVA_Build 14 104450716 3D GGGAAAAAAT GAA/--- GAAGACTGCA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 GAA 2 1 92337 CASAVA_Build 14 104452292 1D ATCCAATCTC A/- AAAATGTATA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 5 4 92338 CASAVA_Build 14 104453228 1I ACAGCAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 401 hom 34 1 27 6 A 9 10 92339 CASAVA_Build 14 104454498 1I CATTAAGTTG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 92340 CASAVA_Build 14 104492282 17D TCCCAGGCTC AGCCAGCAGGGTAGTGA/----------------- AGCCAGCTGG 3070 hom 70 het 24 0 22 5 AGCCAGCAGGGTAGTGA 1 0 92341 CASAVA_Build 14 104493358 1D CCTTCATGCA T/- TCTTCACAAA 3070 hom 119 het 45 0 38 7 T 2 1 92342 CASAVA_Build 14 104514182 4I AGCAGAAAGG ----/CTGT CTGTGCAGGG 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 CTGT 1 2 92343 CASAVA_Build 14 104525470 4D GAAATTTCAC AAGA/---- AAGAGTAGAT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 AAGA 2 1 92344 CASAVA_Build 14 104538450 4D ATTCAGCTGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 2661 het 423 hom 31 5 7 21 A 22 18 92345 CASAVA_Build 14 104540079 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 3070 hom 38 het 16 0 13 3 AG 2 1 92346 CASAVA_Build 14 104546622 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 12 11 92347 CASAVA_Build 14 104547159 1D GCAACCCTGT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 88 het 34 0 27 7 G 9 8 92348 CASAVA_Build 14 104559594 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGTCTCTT 3070 hom 12 het 34 1 20 13 G 5 4 92349 CASAVA_Build 14 104563400 4D ATAATAAAAT ACTG/---- ACTATGTCAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ACTG 1 0 92350 CASAVA_Build 14 104564278 3D9M4D ATAAAATAAA AATAATAAAATTAGTC/---AATAAAATT---- AGGTGTAGTG 2359 hom 21 het 8 0 6 7 N/A 0 0 92351 CASAVA_Build 14 104568838 1I ATTTGTCCAC -/A AGAAAATTCC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 1 2 92352 CASAVA_Build 14 104572864 1D GTCGGCATAC T/- TTTTTTTTTT 2042 hom 10 het 23 0 9 14 T 17 16 92353 CASAVA_Build 14 104582831 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 9 8 92354 CASAVA_Build 14 104612924 1I CACAGGCCCT -/C CTGCGGATCA 3070 hom 38 het 15 0 12 3 C 1 2 92355 CASAVA_Build 14 104618429 1D AAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 4 hom 17 1 10 6 T 10 9 92356 CASAVA_Build 14 104618580 2D TTAAACTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 18 1 10 7 T 15 13 92357 CASAVA_Build 14 104620027 4I AGTGTAACCC ----/CAAA CACTCACCAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CAAA 0 1 92358 CASAVA_Build 14 104621250 4D CATCCATCTA TCTC/---- TCTATCTGCC 3070 hom 80 het 31 0 24 9 TC 3 1 92359 CASAVA_Build 14 104634229 36I CACTCTGAGC ------------------------------------/CCTACCGGCCCCTACTCCAGTGCTGACTCTTCCTCA CCTGTCCCAT 3070 hom 75 het 28 0 25 7 CCTACCGGCCCCTACTCCAGTGCTGACTCTTCCTCA 0 1 92360 CASAVA_Build 14 104634950 30D ACACACACGT ACACACACACACACACACACACACACACAC/------------------------------ ACACACACAC 3070 hom 48 het 20 0 14 9 AC 21 6 92361 CASAVA_Build 14 104635542 1D TTGTTTTTGC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 8 7 92362 CASAVA_Build 14 104636086 2I GATTACAATT --/TC TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TC 0 1 92363 CASAVA_Build 14 104638198 1I AGGACTACCT -/A AAGCAGGTCC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 2 3 92364 CASAVA_Build 14 104638843 2I AGGTTTTATT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TA 0 1 92365 CASAVA_Build 14 104639413 1I TTCCAATTGC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 8 92366 CASAVA_Build 14 104644237 4D CAGAAAAGAG AGAA/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 133 het 46 0 42 6 AGAA 1 0 92367 CASAVA_Build 14 104647736 1I TGTTTTGTTT -/G TTTTTTTTTT 368 het 220 hom 17 2 3 12 G 0 1 92368 CASAVA_Build 14 104650987 1I GAGCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 10 11 92369 CASAVA_Build 14 104654971 1I TAGAAACCAT -/C CCAGAATCTC 3070 hom 111 het 44 0 36 8 C 2 3 92370 CASAVA_Build 14 104667462 2I ATCTGCAGCT --/AC AGAGTTATTA 3070 hom 42 het 25 0 14 11 AC 0 1 92371 CASAVA_Build 14 104700152 16D ATGGCCCAGT GTACCCACAGTCCAGG/---------------- GCACCCCAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 7 GTACCCACAGTCCAGG 1 0 92372 CASAVA_Build 14 104700303 1I GCCCACTGTA -/C CCCCAATCTA 3066 het 3066 ref 27 11 12 4 C 4 5 92373 CASAVA_Build 14 104728868 1I GAGACCCGCA -/G GAGCCGAAAG 2818 hom 41 het 20 0 13 7 G 1 2 92374 CASAVA_Build 14 104763033 1I ACTTACATTC -/T TTTTTTTTTT 2423 het 1663 hom 20 7 9 4 T 11 12 92375 CASAVA_Build 14 104781889 3I TGACTAGGGT ---/GGA GGAGGAGGAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 GGA 3 4 92376 CASAVA_Build 14 104783602 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 A 10 9 92377 CASAVA_Build 14 104824889 2I TGCTGCAATC --/AG GGGACGCGCA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 AG 0 1 92378 CASAVA_Build 14 104966100 1D GAAGTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 274 hom 24 2 15 7 T 12 11 92379 CASAVA_Build 14 104986095 2I CCGGCCCAGA --/AC ACAGGCCCAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AC 1 2 92380 CASAVA_Build 14 105010413 16D TGTCCTCCAG AGCAAGCCCCACAGGT/---------------- AGCAAGCCCC 3070 hom 34 het 19 0 11 9 AGCAAGCCCCACAGGT 2 1 92381 CASAVA_Build 14 105032256 4D TTTAATTTAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 37 het 19 0 12 7 TTTA 3 2 92382 CASAVA_Build 14 105089480 1D AGGAAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1690 hom 29 5 17 7 T 17 16 92383 CASAVA_Build 14 105089856 1I TTTAGAAAAC -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 6 7 92384 CASAVA_Build 14 105100344 2D GGTTGTGATG GT/-- GTGTGTGGGT 3070 het 3070 hom 64 20 25 20 GT 4 3 92385 CASAVA_Build 14 105100501 3I CAGTGTGTGA ---/TGG TGGGTGAGGG 3070 het 3070 hom 65 24 26 15 TGG 1 2 92386 CASAVA_Build 14 105100807 2D TGTGTGAGAA TG/-- TGGGTGTATG 3070 het 3070 ref 68 32 26 11 TG 2 1 92387 CASAVA_Build 14 105102544 2I TATATGTGTC --/TG TGTGTGCCTC 3070 het 3070 hom 61 20 25 16 TG 3 4 92388 CASAVA_Build 14 105107090 3D CTCACACAAC CCA/--- TGCACCACAT 207 het 207 ref 64 57 2 9 CCA 1 0 92389 CASAVA_Build 14 105107264 4D ATATACCACA CACT/---- CACACACAAC 3070 het 3070 hom 50 20 26 7 CACT 1 0 92390 CASAVA_Build 14 105107495 4I CACCTATACA ----/CACT CACACTCAAT 3070 hom 166 het 64 0 53 11 CACT 0 1 92391 CASAVA_Build 14 105107915 4I ACACACTAAT ----/AAAC AAGCCATACA 3070 hom 178 het 72 0 53 19 AAAC 0 1 92392 CASAVA_Build 14 105114614 4D TCTTTCTCTG TCTC/---- TCTGTATCTC 3070 het 3070 hom 28 13 13 4 TC 3 1 92393 CASAVA_Build 14 105136342 3D GGCTGTGGGG TGC/--- TGCTGCTGAC 3070 hom 54 het 21 0 14 7 TGC 3 2 92394 CASAVA_Build 14 105146768 1D CAGATTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 11 1 7 3 T 13 12 92395 CASAVA_Build 14 105149556 1I TTCTGCTATG -/A CTGTAAGTTT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 A 0 1 92396 CASAVA_Build 14 105152107 1D ATCAATTATG T/- TAAGTGTAGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 2 1 92397 CASAVA_Build 14 105152963 1D CTGAGTCATG A/- AAAAAAAAAA 3045 het 405 hom 18 1 9 8 A 13 12 92398 CASAVA_Build 14 105153699 2D9M4I18M2I GGTTGCAAAC ATTCGTGTGCC----TGTGAGGCCCGTGTGTGT--/--GCGTGTGTCCCTGTGTGAGGACCGTGTGAGTAC ATGTGTGTGT 3070 het 122 hom 36 2 36 19 N/A 0 0 92399 CASAVA_Build 14 105157298 3D ATGTGTGTTC TTA/--- TAAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 51 34 14 5 TTA 1 0 92400 CASAVA_Build 14 105160943 2I TGTGTTCCCC --/TG TGTGTGTGTG 1977 het 321 hom 20 2 10 8 TG 5 6 92401 CASAVA_Build 14 105167352 1D TGAAGCTTCT G/- GCCCCCCACT 2150 het 2150 ref 29 15 7 7 G 2 1 92402 CASAVA_Build 14 105167547 2I CAGGGAGAAC --/GT GTGTGCTTGA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 GT 2 3 92403 CASAVA_Build 14 105171500 4D CCAGTTTTGC ATCT/---- ATCTATGAAC 3070 het 3070 hom 53 23 25 9 ATCT 2 1 92404 CASAVA_Build 14 105172397 3D CTGAGTCATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1201 hom 37 8 20 10 A 15 12 92405 CASAVA_Build 14 105177129 4I CTCGAGTCTC ----/CCTT CCTGTCTGCG 2542 hom 24 het 10 0 8 2 CCTT 0 1 92406 CASAVA_Build 14 105178960 2I AGGAGGAAAC --/AG TGTGGGGGAC 3070 hom 86 het 34 0 25 9 AG 0 1 92407 CASAVA_Build 14 105186782 1D CCTGGGGCCT G/- GGGGATGCTG 2042 het 2042 ref 20 13 5 2 G 5 4 92408 CASAVA_Build 14 105192406 2D CAGATTCATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1176 hom 27 6 13 9 T 14 12 92409 CASAVA_Build 14 105194925 1D TTGGGGGACC A/- GGGGTGGAAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 A 1 0 92410 CASAVA_Build 14 105200013 3I ATGTGTGTTC ---/TTA TAAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 TTA 0 1 92411 CASAVA_Build 14 105202594 2D GGGGAAAGTG TT/-- GGGGACAGGA 2346 het 2208 hom 20 7 9 4 T 2 0 92412 CASAVA_Build 14 105203469 2D AGGAGGAAAC TG/-- TGGGGGACAT 3070 het 3070 ref 48 19 15 16 TG 2 1 92413 CASAVA_Build 14 105204181 1I AGCATGGGGG -/A CAATGTCAAG 2672 het 2672 ref 52 29 7 16 A 0 1 92414 CASAVA_Build 14 105205185 1D GAGTGGGCAT G/- GGGGGTCGGA 2277 het 2277 ref 57 41 6 10 G 6 5 92415 CASAVA_Build 14 105205634 1D CACTCATTTA C/- CCCGGGGACA 2569 het 2336 hom 24 8 8 8 C 4 3 92416 CASAVA_Build 14 105207740 2D CCTCTGCCTC TT/-- GGGTTCAAGC 1903 het 1383 hom 11 3 4 4 T 2 0 92417 CASAVA_Build 14 105221040 3I10M10D TGGGTGTGTG ---GTGTGTGAGGGTGTGTGTAT/TATGTGTGTGAGG---------- GTGTGTGAGG 2107 het 2107 ref 44 22 12 19 N/A 0 0 92418 CASAVA_Build 14 105221097 10D TGGATGTGGG GTGTGGGGAT/---------- GTGTGGGGAT 993 het 993 ref 37 14 7 16 GTGTGGGGAT 2 1 92419 CASAVA_Build 14 105224910 2D TTTATGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 2662 het 2662 ref 75 53 7 18 TG 7 6 92420 CASAVA_Build 14 105225048 2D TGTGTGTCTC TG/-- TGTGTCTGTG 1754 het 1754 ref 68 56 4 9 TG 3 2 92421 CASAVA_Build 14 105227398 4D ATATACCACA CACT/---- CACACACAGC 3070 het 3070 ref 69 35 26 8 CACT 1 0 92422 CASAVA_Build 14 105227856 2D AAGCCGTACA CC/-- CCCCCCCACA 3070 het 3070 hom 51 14 21 17 C 9 7 92423 CASAVA_Build 14 105231647 2D ATAGAAACAC AG/-- AGATACAGAC 3070 het 3070 hom 45 21 16 11 AG 2 1 92424 CASAVA_Build 14 105232888 2D AAGCAGAGAG AC/-- AGAGAGAGAC 1437 het 1437 ref 22 15 4 3 AC 1 0 92425 CASAVA_Build 14 105235614 4D GTGACAGTGA CTAT/---- CTATCTCTGT 3070 het 3070 ref 54 27 19 10 CTAT 2 1 92426 CASAVA_Build 14 105238231 2D CCCATCCCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 2501 hom 41 10 14 17 TC 7 6 92427 CASAVA_Build 14 105268466 1D CATGCAACGT G/- GGGGGCTCAG 3070 het 3070 ref 47 29 17 2 G 6 5 92428 CASAVA_Build 14 105270868 3I ACACCATTAA ---/CTC CTCATCACAC 3070 hom 155 het 61 0 50 12 CTC 1 2 92429 CASAVA_Build 14 105272938 1D TGCTGAGACA G/- GATGAATGTG 1823 het 1823 ref 21 12 4 5 G 2 1 92430 CASAVA_Build 14 105273138 3I ATGTGTGTTC ---/TTA TAAGAAGAGA 3070 het 641 hom 14 2 11 1 TTA 0 1 92431 CASAVA_Build 14 105273817 3D AGAAGAAAAG CTA/--- CCAAAGCTGA 2072 het 2072 ref 14 8 5 4 CTA 1 0 92432 CASAVA_Build 14 105291553 1D CTTAGAGACT G/- ATTAAATGGT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 G 1 0 92433 CASAVA_Build 14 105301095 1D TGCTGAGACA G/- GATGAATGTA 3070 het 3070 ref 50 27 18 6 G 2 1 92434 CASAVA_Build 14 105301963 3D GAAAATTTAA AAG/--- AAGAAGAAAA 2716 het 2716 ref 37 28 6 7 AAG 3 2 92435 CASAVA_Build 14 105315254 2I AATGCAGGGT --/GA GATTCATTCT 3070 het 3070 ref 48 30 8 10 GA 1 2 92436 CASAVA_Build 14 105323895 1D TTCTAATACC A/- GGGCAGACTC 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 A 1 0 92437 CASAVA_Build 14 105329143 10D ATCTGTTATC AGCTCTGACA/---------- AGCCTGGCCC 3070 het 3070 ref 46 22 19 9 AGCTCTGACA 1 0 92438 CASAVA_Build 14 105332411 2I AGAAGAAAAC --/AT AGGGAAAACA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AT 0 1 92439 CASAVA_Build 14 105339270 1D AGGCCAAGAT G/- GGGCGGATTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 4 3 92440 CASAVA_Build 14 105341859 1I TCATTGGAGC -/A AGCTCTTAAC 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 A 1 2 92441 CASAVA_Build 14 105351388 1D AGATAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2494 hom 25 10 9 7 T 12 11 92442 CASAVA_Build 14 105366790 1D GTTCTTTGTG C/- CTCTTGTATT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 2 1 92443 CASAVA_Build 14 105370534 1I CCTTAATAGA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 6 7 92444 CASAVA_Build 14 105375599 2D CCGGGAAAAA CG/-- CGCTTCCGTG 3070 hom 91 het 34 0 30 4 CG 2 1 92445 CASAVA_Build 14 105386370 1I AGGAATTTCA -/C CCCAGAATGA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 3 4 92446 CASAVA_Build 14 105388957 1I GCTTTCCTCG -/A AACCCCCTGC 2687 hom 43 het 22 0 11 11 A 2 3 92447 CASAVA_Build 14 105403714 1I AGGGGAGGTG -/C CCCTGCGGGC 3070 hom 38 het 16 0 12 4 C 3 4 92448 CASAVA_Build 14 105446528 1D GGTTGATGTT A/- GGGAGGTGCC 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 1 0 92449 CASAVA_Build 14 105446928 1I TTCAGGGGCT -/C CTGAGGCTGT 2673 hom 29 het 11 0 9 2 C 1 2 92450 CASAVA_Build 14 105461629 1D ATCTTCCATG A/- AGGAACTGTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 2 1 92451 CASAVA_Build 14 105472368 1D TAGCTAATGC G/- ATCATTTCTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 1 0 92452 CASAVA_Build 14 105472489 1I13M1I28M1I GGGCGCTGAA -GGGAGGCTGAGTA-GGTGGTCTGGTGAGTGCTTGTCTAAGCA-/GGGGAGGCTGAGTAGGGTGGTCTGGTGAGTGCTTGTCTAAGCAG GGACTTGCCA 3070 hom 63 het 24 0 22 5 N/A 0 0 92453 CASAVA_Build 14 105480539 3D CTGGAAAGTC CTT/--- CTGTAGAGAA 3070 het 3070 ref 53 25 19 11 CTT 1 0 92454 CASAVA_Build 14 105486187 90D CCTGTGTCTG TCTGTGTTCCACAGTGATTGTGCAAACTCTAAATACATCGATGACCCACCACTGCCTTTATGTTAGAATAAACAAAACAGAAAACAAATA/------------------------------------------------------------------------------------------ TCTGATGACC 2962 hom 21 het 10 0 7 3 TCTGTGTTCCACAGTGATTGTGCAAACTCTAAATACATCGATGACCCACCACTGCCTTTATGTTAGAATAAACAAAACAGAAAACAAATA 1 0 92455 CASAVA_Build 14 105487414 1D AATGAATGAG C/- CCCGAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 4 3 92456 CASAVA_Build 14 105487500 1D AACCTGAATG C/- CCCCTTGCAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 5 4 92457 CASAVA_Build 14 105506861 2D AAGGCACCAA TG/-- TGTGTTTTTG 3070 hom 102 het 37 0 33 4 TG 3 2 92458 CASAVA_Build 14 105512208 1I GACATAAGGC -/G GGGGGGCTCA 3059 hom 35 het 14 0 10 4 G 6 7 92459 CASAVA_Build 14 105513590 1D TGACCATTAG A/- ATGTCAGTAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 2 1 92460 CASAVA_Build 14 105515231 3I TTGAACTCAG ---/AGA AGTAGAGAGT 3070 hom 63 het 22 0 22 3 AGA 0 1 92461 CASAVA_Build 14 105515588 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 34 0 19 16 T 12 11 92462 CASAVA_Build 14 105531175 8I GCATTGCGTC --------/TGTGGGTG TGTGGGGCCC 3070 hom 56 het 26 0 19 7 TGTGGGTG 0 1 92463 CASAVA_Build 14 105532154 1D ACTTAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 12 11 92464 CASAVA_Build 14 105533566 1I TAAAATAGAA -/T TTATTATAGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 2 3 92465 CASAVA_Build 14 105534379 3I TGAAAATAAT ---/AAA ATTGTTACTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 1 4 92466 CASAVA_Build 14 105536934 2D ACCCCTGGTG GT/-- TCCTGAGCGC 61 het 61 ref 23 12 1 10 GT 1 0 92467 CASAVA_Build 14 105538622 1I ATGGTCCTGA -/G TGCCCCCTGG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 0 1 92468 CASAVA_Build 14 105540259 1D AACTGCTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 T 9 8 92469 CASAVA_Build 14 105540407 1I TTATTTTATA -/C CCAGTCTCTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 C 2 3 92470 CASAVA_Build 14 105543554 2I TGGTCGTAGG --/AA AAAGCCAGTG 3070 het 1286 hom 26 6 16 4 A 3 5 92471 CASAVA_Build 14 105545770 6D GAGTGCCACT AATAAC/------ AACAACAACA 1261 het 1261 ref 29 25 3 2 AATAAC 1 0 92472 CASAVA_Build 14 105547751 23D TGCATGACCT GGAATCATACATGTGCATGACCC/----------------------- GGAATCATAC 3070 hom 45 het 27 0 14 15 GGAATCATACATGTGCATGACCC 2 1 92473 CASAVA_Build 14 105550997 1I GGTGTCTGAG -/A CATTTGTTAG 3070 hom 37 het 16 0 12 4 A 0 1 92474 CASAVA_Build 14 105551503 1D TAGGGCAAGT G/- GGGGCCAGAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 G 5 4 92475 CASAVA_Build 14 105553342 1I AACTGAAGCA -/C ACCCACTACA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 0 1 92476 CASAVA_Build 14 105553497 3I CTTTTTCATA ---/TAT TATTTATTGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TAT 1 2 92477 CASAVA_Build 14 105555106 1I AGGTAGCAGT -/G GGCAGGTGAG 3070 het 214 hom 84 7 64 13 G 2 3 92478 CASAVA_Build 14 105556456 1I ATCCACACAC -/A AAAGGATTCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 3 4 92479 CASAVA_Build 14 105557882 2I CTCTTAAAGA --/AT ATAAACTGTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AT 1 2 92480 CASAVA_Build 14 105562887 1D TCATTTATTG C/- ATCACACGTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 0 92481 CASAVA_Build 14 105567463 1I CAGATCACAA -/G GTCAGAAGAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 G 1 2 92482 CASAVA_Build 14 105573687 1I AAAGAAAGAA -/G GCTACGGATG 3070 hom 138 het 50 0 46 4 G 1 2 92483 CASAVA_Build 14 105576278 1I AAATTAAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 9 10 92484 CASAVA_Build 14 105577303 1D ATTCAAAAAG C/- CCACTTGAGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 3 2 92485 CASAVA_Build 14 105577394 1I AGTAGAAAAG -/A AAATCTTATT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 3 4 92486 CASAVA_Build 14 105580086 3D AACTTTAGTC TTA/--- TTATTCATGG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 TTA 2 1 92487 CASAVA_Build 14 105585888 1D GAAAGGGCAT G/- GAAGTCTAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 4 G 2 1 92488 CASAVA_Build 14 105585971 1D10M1D GGCGGTCACA GGGCTCCCTGGA/-GGCTCCCTGG- CTGGTTCCTC 3070 hom 99 het 32 0 33 5 N/A 0 0 92489 CASAVA_Build 14 105586617 1D ACAGGCTCCC A/- AGGTGCTCTA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 A 2 1 92490 CASAVA_Build 14 105586860 1D33M1D AAGGTCTCTG CCACATGGAGAAAAACCAGTGAATGTGGAAAATGC/-CACATGGAGAAAAACCAGTGAATGTGGAAAATG- CATCATCTCG 3070 hom 126 het 37 0 43 9 N/A 0 0 92491 CASAVA_Build 14 105587831 1D8M1D AAACTGTCTT GGGGGCTGGA/-GGGGCTGG- AGGGAGTGTT 3070 hom 114 het 38 0 38 3 N/A 0 0 92492 CASAVA_Build 14 105590994 1I AAAAATCTTT -/C TGTCCCAATG 1708 het 1708 ref 39 31 4 5 C 0 1 92493 CASAVA_Build 14 105594117 1D GGTAGCTCAG C/- CAGTGTGTGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 2 1 92494 CASAVA_Build 14 105594212 1D67M1I AACAACTGAG CCCTGGATATTAGGTCATGTTATAATGCTAGTGGGAAGACTCAGTAGAAGAAAAAGTGTCATAGCAAC-/-CCTGGATATTAGGTCATGTTATAATGCTAGTGGGAAGACTCAGTAGAAGAAAAAGTGTCATAGCAACA AAAAATGAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 22 N/A 0 0 92495 CASAVA_Build 14 105595093 2I GGTTGTATCA --/TT GTATAATTGG 3070 hom 117 het 44 0 38 6 T 0 2 92496 CASAVA_Build 14 105595712 1D GGATGCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 817 hom 36 2 28 7 A 15 14 92497 CASAVA_Build 14 105596632 4D GCTCACTCCT ATCA/---- ATCAGCAAAA 3070 hom 99 het 36 0 33 6 ATCA 2 1 92498 CASAVA_Build 14 105596833 1I GTTTTACAAC -/G TGAATAAGGA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 0 1 92499 CASAVA_Build 14 105599140 5I TATATATAGA -----/ATTAT ATCTAAAGTA 3070 hom 72 het 26 0 25 4 ATTAT 0 1 92500 CASAVA_Build 14 105600968 1D TTTGGACTAG C/- CATGGGGCCT 3070 hom 75 het 27 0 25 4 C 2 1 92501 CASAVA_Build 14 105601522 2I TCCCTATAAG --/GC TTCCTGCTAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 GC 0 1 92502 CASAVA_Build 14 105601953 1I AAAATGGGAG -/A ATATAAGCAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 1 2 92503 CASAVA_Build 14 105602161 10D TACATATATA AGTGTGTGTG/---------- TGTATATATA 1305 hom 7 het 2 0 3 1 AGTGTGTGTG 1 0 92504 CASAVA_Build 14 105602506 1D67M2D ATGTCAGAAA CCCTGAAACTGTACATTGAAGATGTATGCAATTATGCATACATTAATTTTATCTCATAAAAATAGAAAAG/-CCTGAAACTGTACATTGAAGATGTATGCAATTTTGTATACATTAATTTTATCTCATAAAAATAGAAA-- AGACAATTGT 3070 hom 57 het 23 0 20 14 N/A 0 0 92505 CASAVA_Build 14 105641352 3I GGTGCTGGGG ---/ACA ACAAGGGTAT 3070 hom 36 het 17 0 12 5 ACA 1 2 92506 CASAVA_Build 14 105641445 6D ATAAAAACAA AAAATG/------ AAAAAGTGTA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 AAAATG 1 0 92507 CASAVA_Build 14 105641643 1D CATAGAGAAG A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 39 het 16 0 14 3 A 8 7 92508 CASAVA_Build 14 105641724 2D TATTTTAACC TG/-- TGTCATTAGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TG 2 1 92509 CASAVA_Build 14 105644216 1D CCCTGGTGGT C/- CCAAGGGACC 1512 het 298 hom 10 1 6 4 C 3 2 92510 CASAVA_Build 14 105646024 1D GAGAAAAAAA C/- CCCTGAAATC 3070 hom 74 het 29 0 25 4 C 4 3 92511 CASAVA_Build 14 105647813 1I AAAAGATGCC -/A AAAAAAGACT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 7 92512 CASAVA_Build 14 105649007 1I41M1I AAAAACAAAA -GATGAGCTTTGCTGTTAGGATGCACGATCCAAACTAAATGA-/GGATGAGCTTTGCTGTAAGGATGCAGGATCCAAACTAAATGAG GTCCCAGCAC 3070 hom 93 het 27 0 32 10 N/A 0 0 92513 CASAVA_Build 14 105651383 1D AAAAATAGTT C/- CCCAGTGCCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 4 3 92514 CASAVA_Build 14 105660214 4I TTTCCCAAAG ----/TGTC TGTCTGAGAC 3070 hom 30 het 14 0 10 4 TGTC 1 2 92515 CASAVA_Build 14 105663927 1D22M1D3M1D TGAGACTTGG CCCTGGTTTTTTTGTATAAGATGCCAGC/-CCTGGTTTTTTTGTATAAGATG-CAG- CAAAGTAACC 3070 hom 45 het 16 0 16 1 N/A 0 0 92516 CASAVA_Build 14 105664016 1D10M1D TGTACATAGG CCAATTTTATTC/-CAATTTTATT- CATAAATTGA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 N/A 0 0 92517 CASAVA_Build 14 105664923 1D GCTTATTTCT G/- GCAATAAACA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 2 1 92518 CASAVA_Build 14 105665637 1D ACTGTATAAA G/- AAACTCTCAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 1 0 92519 CASAVA_Build 14 105666198 1D AAAAGTTATG C/- CAGATAGTTA 3070 hom 33 het 14 0 12 4 C 2 1 92520 CASAVA_Build 14 105666815 1D13M1D ATACTTTAAG CACAATTTTTCATTC/-ACAATTTTTCATT- CTAACCAATC 3070 hom 63 het 22 0 21 3 N/A 0 0 92521 CASAVA_Build 14 105668995 1I GAGTACCCCC -/T GGTGGTTGTG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 0 1 92522 CASAVA_Build 14 105670591 1D CAGGCCTCTT C/- CCATCTCTGT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 3 2 92523 CASAVA_Build 14 105682114 2D GCACTAATCA CT/-- CTCTTACATT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 CT 3 2 92524 CASAVA_Build 14 105684113 1D AGCATCTATA G/- TCTCTGGTGG 3070 hom 54 het 20 0 18 4 G 1 0 92525 CASAVA_Build 14 105687151 1I ATTCTGTAGG -/T TGCCTGTTCA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 1 2 92526 CASAVA_Build 14 105692282 1D TTGAGCCCCA G/- GGATTTAGAC 3070 hom 58 het 22 0 15 7 G 3 2 92527 CASAVA_Build 14 105692387 1D CAGATCAGTG A/- CTGATACTCA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 1 0 92528 CASAVA_Build 14 105693474 1I TGCAGGGTCA -/G GGCTGCGCTG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 2 3 92529 CASAVA_Build 14 105693621 1I CAAATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 10 11 92530 CASAVA_Build 14 105694846 1D AATGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 39 1 32 6 T 12 11 92531 CASAVA_Build 14 105697579 2D TTATTATTTT AC/-- ATATATATAT 2424 hom 11 het 6 0 5 1 AC 1 0 92532 CASAVA_Build 14 105698745 1I GGCTGTACAA -/T TTTTCCCCCC 3070 hom 53 het 27 0 17 10 T 4 5 92533 CASAVA_Build 14 105703788 1I TTTTCCCTTC -/T TCCTAATATG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 1 2 92534 CASAVA_Build 14 105706769 3I CTGTTTCTAA ---/CTT CTTCTTAGCA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CTT 2 3 92535 CASAVA_Build 14 105707368 1I26M1I CAATGTCACG -AAGAGTCAAGTCGACAACTTTCTTGG-/AAAGAGTCAAGTCGACAACTTTCTTGGA TTAAAGCCAG 3070 hom 30 het 15 0 11 4 N/A 0 0 92536 CASAVA_Build 14 105707865 1I GGTCAGAGAC -/A ACATCGTAGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 1 2 92537 CASAVA_Build 14 105709539 1I CTGGAAATTG -/A ATTTCAATGT 3070 het 7 hom 19 1 16 2 A 1 2 92538 CASAVA_Build 14 105709751 1D32M1D ATAGAATAGA GGATCTTGAAAAGCATTTTTTCTCTGTAGGATCT/-GATCTTGAAAAGCATTTTTTCTCTGTAGGATC- TGTCTGGAGG 3070 hom 36 het 13 0 11 6 N/A 0 0 92539 CASAVA_Build 14 105710226 1D TAGAAGGATC T/- TGTTGATGTT 3070 hom 123 het 43 0 42 2 T 2 1 92540 CASAVA_Build 14 105712331 2D GATTTTAAAA AC/-- GGTATGTCTG 3070 hom 78 het 27 0 26 1 AC 1 0 92541 CASAVA_Build 14 105715153 1I AGACAAACCT -/G GGCCAAATCC 3070 hom 51 het 20 0 17 3 G 2 3 92542 CASAVA_Build 14 105721414 1D TGCATTCTGC A/- AGACCTGCCA 2318 hom 15 het 8 0 5 4 A 2 1 92543 CASAVA_Build 14 105721553 1I TTTTGATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 11 12 92544 CASAVA_Build 14 105724157 6D AGTCCTCCTA TCATAT/------ TACAATGATT 2034 het 2034 ref 26 20 6 5 TCATAT 1 0 92545 CASAVA_Build 14 105727078 1D7M1I6M1I AAGGTGACTT GCCCTGGA-GTACCA-/-CCTTGGAGGTACCAG CCTTCCAAGT 3070 hom 90 het 34 0 28 11 N/A 0 0 92546 CASAVA_Build 14 105729815 1I TGGCTCGGAA -/G GGTATAAGAT 3070 hom 74 het 29 0 23 6 G 2 3 92547 CASAVA_Build 14 105738948 1I CACAGAGACA -/C CCTGGTCAGA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 C 2 3 92548 CASAVA_Build 14 105739176 1I24M1I CAGGGCTGGG -TGGTTTTCATCGGCAGAGGGAGGA-/CTGGTTTTCATCGGCAGAGGGAGGAC CCCACCTGCA 3070 hom 41 het 17 0 12 10 N/A 0 0 92549 CASAVA_Build 14 105740712 1D GCTACTAGGG C/- AGGCTGAGGC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 0 92550 CASAVA_Build 14 105740905 1D GGAAGAGCTG C/- CCCGGCGGAC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 C 4 3 92551 CASAVA_Build 14 105742124 1D CAGCATCCTC A/- AATCATCAGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 3 2 92552 CASAVA_Build 14 105745038 1D AGTGGATAAT A/- GAAAAGGCCC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 0 92553 CASAVA_Build 14 105746486 1D CTAAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 11 10 92554 CASAVA_Build 14 105747618 1D27M1D AGACTGGCTT CCTCTCACTTAGCGTAATGCCTGGAGTTC/-CTCTCACTTAGCGTAATGCCTGGAGTT- CACCTGTAAT 3070 hom 87 het 23 0 29 6 N/A 0 0 92555 CASAVA_Build 14 105750330 1I AGATGAGGCA -/T TTTTTCGTTC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 5 6 92556 CASAVA_Build 14 105755324 1I TGATATTAAC -/T TTTTGGTGAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 4 5 92557 CASAVA_Build 14 105759331 2D ATATACAGAT TA/-- TATATATATA 2899 hom 21 het 8 0 8 0 TA 7 6 92558 CASAVA_Build 14 105760560 1I AGTAAAAGCA -/G GCGTTCTTTA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 G 1 2 92559 CASAVA_Build 14 105761763 1D TGCCTAGCCA G/- GGCCCTACTA 3070 hom 72 het 26 0 24 3 G 3 2 92560 CASAVA_Build 14 105761876 1D AGCACAAGAT C/- CAGCTCTACA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 2 1 92561 CASAVA_Build 14 105762088 3I TTCGGGGAAG ---/AGA AGAAGAAAGG 1263 het 1263 ref 54 42 3 9 AGA 2 3 92562 CASAVA_Build 14 105762666 1I GTCCTGGGGA -/C CCCTGCAGGG 1169 hom 10 het 9 0 4 5 C 3 4 92563 CASAVA_Build 14 105763622 1D CTGTGCTCCT C/- CGTCACTGGC 3070 hom 90 het 35 0 30 7 C 2 1 92564 CASAVA_Build 14 105764050 1D49M1D AGCAACTACT GGATCCTCATTATTTTACTTCAGATGCATTTTTTATTCATCAGCATTTATA/-GATCCTCATTATTTTACTTCAGATGCATTTTTTATTCATCAGCATTTAT- AAAAATGAAA 3070 hom 78 het 30 0 25 22 N/A 0 0 92565 CASAVA_Build 14 105764406 1D GTAAACAGAG C/- AAAATGGGAT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 C 1 0 92566 CASAVA_Build 14 105764803 1D CCCCATTGCA G/- GAACTAAGAA 3070 hom 56 het 22 0 18 5 G 2 1 92567 CASAVA_Build 14 105765050 1D3M1I AAGAGGACTC TCAC-/-CACA CCAGGGAAAA 564 het 564 ref 53 47 3 6 N/A 0 0 92568 CASAVA_Build 14 105765993 1I53M1D AGATAAAGAG -AAGTATTTGAAAAAGTAATGGCTAAGAATGTTCCCAATTTTTTGAAACACACTG/AAAGTATTTGAAAAAGTAATGGCTAAGAATGTTCCCAATTTTTTGAAACACACT- GAGCTACAGA 3070 hom 75 het 30 0 26 20 N/A 0 0 92569 CASAVA_Build 14 105766098 1D6M1D AAACACAAAC AAGACACA/-AGACAC- AGACACACAC 3070 hom 57 het 34 0 19 16 N/A 0 0 92570 CASAVA_Build 14 105767944 1D12M1D GATACTAGAT CCATGTTATAATGC/-CATGTTATAATG- CTAGTGGGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 N/A 0 0 92571 CASAVA_Build 14 105770543 4D GGAATCATAT TAAA/---- TAATCTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TAAA 1 0 92572 CASAVA_Build 14 105775682 1I CCCATCTTTG -/T GGTTTTATCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 92573 CASAVA_Build 14 105777922 1D AACTCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 36 1 22 13 A 13 12 92574 CASAVA_Build 14 105778996 2D CGTGGAAAAG TT/-- TGAAATTTCC 3070 hom 120 het 45 0 40 6 T 3 1 92575 CASAVA_Build 14 105781223 1D ATAATAGTTT G/- GGTTTATGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 G 3 2 92576 CASAVA_Build 14 105784172 1D GCTCCTGCTT C/- CTCCCTGTCC 2323 hom 39 het 23 0 8 15 C 2 1 92577 CASAVA_Build 14 105784465 3I TATTGTGACA ---/ACC ACATTTGAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 ACC 0 1 92578 CASAVA_Build 14 105784722 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 8 7 92579 CASAVA_Build 14 105784872 1D CAATACGCAC A/- AGCTGATTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 2 1 92580 CASAVA_Build 14 105785284 2D AGAAAGGAAA AC/-- CTTCTCCCGG 3070 hom 48 het 18 0 15 4 AC 1 0 92581 CASAVA_Build 14 105786754 1I ATGGTGGTGC -/A CAACTGTAGT 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 A 0 1 92582 CASAVA_Build 14 105787971 1D AGACATCAGT G/- GGAAGACATA 537 het 537 ref 37 26 3 8 G 3 2 92583 CASAVA_Build 14 105789501 1I GGAACTCCTT -/G GTGAAGAGGA 3070 hom 148 het 58 0 50 8 G 1 2 92584 CASAVA_Build 14 105792189 1I17M1D CTTGATGGAA -TAGCTTGGACCACAGGGT/TTAGCTTGGACCACAGGG- TTGTTAGTAA 3070 hom 147 het 44 0 44 11 N/A 0 0 92585 CASAVA_Build 14 105797479 4D TTTAACAAAT TATC/---- TATCCACTTA 3070 het 3070 ref 70 48 18 8 TATC 2 1 92586 CASAVA_Build 14 105798718 1I TCAGGAATAA -/C AGCCTCATCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 0 1 92587 CASAVA_Build 14 105800385 1I TGAAGAGGAA -/G GGTCCATCTG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 2 3 92588 CASAVA_Build 14 105802098 1D ATCCAGAAAT A/- GTTTCTAATA 2662 het 2662 ref 44 31 6 8 A 1 0 92589 CASAVA_Build 14 105803892 1D ATGATTTATA G/- GATCCAATTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 2 1 92590 CASAVA_Build 14 105806157 1I TTAATCCAGA -/T TAATCATATT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 1 2 92591 CASAVA_Build 14 105807354 1I GTGTCTTCTG -/A AAAAAATCTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 6 7 92592 CASAVA_Build 14 105813696 1D CTCCCAGCTT C/- CAAGTGATTC 3070 hom 33 het 18 0 12 6 C 2 1 92593 CASAVA_Build 14 105813726 2D AGCCTCCCTC TT/-- TTTTTTTAAT 1157 het 568 hom 12 2 4 6 T 9 7 92594 CASAVA_Build 14 105815880 1I CAGGACAATC -/T TAATCACATC 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 T 1 2 92595 CASAVA_Build 14 105817943 1I TAACCTCTAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 7 8 92596 CASAVA_Build 14 105819535 1I ATATGCACTC -/A AAATAGAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 3 4 92597 CASAVA_Build 14 105821474 1D ACAGACTGAG T/- AACAGCCTCA 3070 hom 115 het 44 0 34 10 T 1 0 92598 CASAVA_Build 14 105824344 1I CTCTCCATAT -/C CTTGTGTACA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 C 1 2 92599 CASAVA_Build 14 105825703 1I19M1I CTGATGATAG -TTCTTTTGCTGTGCAGAAG-/TTTCTTTTGCTGTGCAGAAGC TCTTTAGTTT 3070 hom 57 het 17 0 20 0 N/A 0 0 92600 CASAVA_Build 14 105830389 1I ACTTTCCCCT -/C TCATTGTCTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 92601 CASAVA_Build 14 105834891 1D GAATTAAATA G/- GAATAACTCT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 G 2 1 92602 CASAVA_Build 14 105834940 1I18M1D9M1D24M1I TAGGATGTTC -ACTAGGATAACTAATTGACCCATAATATGGCATTATGGAACTAAACCCAGCCC-/AAATAGAATAACTAATTGA-CCATAATAT-GCATTATGAAACTAAACCCAGCCCA TGCTTTTCAG 3070 hom 61 het 18 0 20 7 N/A 0 0 92603 CASAVA_Build 14 105835508 1D AAAGAAACAA C/- AACACCATGC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 1 0 92604 CASAVA_Build 14 105838424 1D CTGTAGTTTT C/- GGCTTTTACA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 C 1 0 92605 CASAVA_Build 14 105838651 1I9M1I TGTCCTGAAA -TGTGCAGCT-/TTGTGCAGCTA AGTAATACAA 3070 hom 132 het 48 0 44 8 N/A 0 0 92606 CASAVA_Build 14 105839260 1D ACTAAATAGA G/- GAAATAATGG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 G 2 1 92607 CASAVA_Build 14 105841264 1D AAGGGCTTGA G/- GCCCTGGAAT 3070 hom 124 het 48 0 38 12 G 2 1 92608 CASAVA_Build 14 105841484 2I CTGGCCCAGC --/CT CTCTCTTGGC 3070 het 3070 ref 64 36 14 14 CT 3 4 92609 CASAVA_Build 14 105841856 1D GCCCTTCCCC A/- AGTGGTCGTG 3070 hom 90 het 33 0 29 4 A 2 1 92610 CASAVA_Build 14 105843345 1D TGGGAGCCAC A/- ATGAGGCATC 3070 het 3070 ref 63 42 15 6 A 2 1 92611 CASAVA_Build 14 105843645 1I CATGATGAAT -/G GCTCTTTTGA 3070 het 3070 ref 75 49 19 8 G 1 2 92612 CASAVA_Build 14 105843985 1D TGTTACTGAT C/- CTGTTCAATT 3070 hom 75 het 36 0 25 11 C 2 1 92613 CASAVA_Build 14 105844329 1D TATGTTTGGA T/- TTTGATTTGC 3070 hom 60 het 23 0 21 3 T 4 3 92614 CASAVA_Build 14 105846104 6D GAATGTTCAG CAGTCT/------ TTGTCAAATA 517 het 517 ref 34 27 3 5 CAGTCT 1 0 92615 CASAVA_Build 14 105852569 1I ATTATTTTTT -/A AGGATTCTGT 3070 het 3070 ref 35 24 8 3 A 1 2 92616 CASAVA_Build 14 105853061 2D ATCTCTTCAG AA/-- AAAAACAAAC 2519 het 2519 ref 57 35 6 17 A 7 5 92617 CASAVA_Build 14 105853142 4D CCAAATAATG AATA/---- AACAAATTAC 3070 het 3070 hom 47 18 21 12 AATA 1 0 92618 CASAVA_Build 14 105855150 1I TAGGATGCTC -/T TGCCCCGCTC 3070 het 3070 ref 96 68 9 20 T 1 2 92619 CASAVA_Build 14 105855860 6D GATCTTTTTA TGTAAC/------ TTTAAGTTCA 1545 het 1545 ref 90 82 4 8 TGTAAC 1 0 92620 CASAVA_Build 14 105856600 2I CTGATGCGAA --/GC CTTGATCCTG 3070 hom 199 het 76 0 66 10 GC 0 1 92621 CASAVA_Build 14 105856956 1I18M1I GTGCAGGTGA -GGAGAGGGTCTGCAAGGA-/GGGAGAGGGTCTGCAAGGAC GTCTCAAGCC 3070 hom 205 het 92 0 82 32 N/A 0 0 92622 CASAVA_Build 14 105858053 1I TCTGGCATTG -/T GGGGTGGCAG 3070 het 3070 ref 75 54 13 8 T 0 1 92623 CASAVA_Build 14 105859551 2I ATAAACTTTA --/TC TGTTTCTCAG 3070 het 3070 ref 67 39 17 11 TC 0 1 92624 CASAVA_Build 14 105859873 1D AATTAAAAGG A/- AAAGGTAAGC 2711 hom 15 het 8 0 6 2 A 4 3 92625 CASAVA_Build 14 105860506 1D AAGGCAAGAA T/- GCAAGCTTTA 3070 hom 111 het 44 0 38 7 T 1 0 92626 CASAVA_Build 14 105864670 1D ACAGCATCCC T/- CCTCAGCTGG 3070 het 3070 ref 58 38 13 7 T 1 0 92627 CASAVA_Build 14 105865590 4I CCATTGAGAG ----/GATT GATTAACATT 3070 het 3070 ref 75 64 9 2 GATT 1 2 92628 CASAVA_Build 14 105865719 1D AGAAGGCAGG A/- AACATTGAAC 3070 het 3070 ref 72 52 12 9 A 3 2 92629 CASAVA_Build 14 105866041 1I CCAACCTCGA -/G GGGTCCACCC 3070 hom 54 het 36 1 26 9 G 3 4 92630 CASAVA_Build 14 105866771 1D AATCTTATCA G/- GAAACTTTTA 3070 hom 216 het 79 0 71 8 G 2 1 92631 CASAVA_Build 14 105868129 1D GCTGGACATG T/- TGCTATAGAT 3070 hom 129 het 47 0 44 6 T 2 1 92632 CASAVA_Build 14 105869289 4I ATCATACAAA ----/CACT CACATGCATT 2983 het 2983 ref 56 38 11 7 CACT 0 1 92633 CASAVA_Build 14 105870311 1D AGCTGCACCT G/- GGGGGTCTCT 3070 het 3070 hom 78 17 50 11 G 6 5 92634 CASAVA_Build 14 105871317 1D TTGCAGGAAA T/- CTGTGTCTGT 3070 hom 139 het 67 0 42 25 T 1 0 92635 CASAVA_Build 14 105873242 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTTGGAT 3070 het 3070 ref 101 58 34 10 A 2 3 92636 CASAVA_Build 14 105877626 5D TCAAGCCAAG CCAAA/----- CCTCCTGGCA 3070 het 3070 ref 97 66 24 10 CCAAA 1 0 92637 CASAVA_Build 14 105877855 4D CCAAATAATG AACA/---- AACAAATTAC 3070 het 3070 ref 64 26 24 17 AACA 2 1 92638 CASAVA_Build 14 105877923 1I ATATTTTCTT -/C CCCCACCATA 1207 het 1207 ref 70 57 4 10 C 4 5 92639 CASAVA_Build 14 105878120 1D ATGCCATTAC T/- TTTTATCTAC 3070 het 3070 ref 89 46 35 8 T 5 4 92640 CASAVA_Build 14 105879198 1D ATGAAAAGAA C/- CGGCCAAGTG 3070 het 3070 ref 56 25 14 18 C 2 1 92641 CASAVA_Build 14 105879359 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 190 hom 39 4 18 17 A 11 10 92642 CASAVA_Build 14 105879565 6I CCTCCATATC ------/CTCCTT CTACTCATTA 1286 het 1286 ref 37 30 4 3 CTCCTT 0 1 92643 CASAVA_Build 14 105879857 8D AAGTAGGATG CTCTGCCC/-------- CGCTCCCCAC 3070 het 3070 ref 71 46 12 21 CTCTGCCC 1 0 92644 CASAVA_Build 14 105880469 4I ACAGAGAAAA ----/AATC AATTATCCTA 3070 het 3070 ref 64 42 13 9 AATC 0 1 92645 CASAVA_Build 14 105880956 2I TGGGAAGCTC --/TG TGTGTGTGTC 2892 het 2892 ref 56 40 9 10 TG 4 5 92646 CASAVA_Build 14 105881764 1I AATACATGCA -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 66 40 11 24 T 6 7 92647 CASAVA_Build 14 105882008 1D TAATTCTGAG C/- CCACAATTAG 3070 het 3070 ref 87 70 10 7 C 3 2 92648 CASAVA_Build 14 105882421 1D GGTTTTTATA C/- AAAAATTAAC 3070 het 3070 ref 59 34 12 15 C 1 0 92649 CASAVA_Build 14 105882633 1D ACACATGGGA G/- GATCCCTGAT 3070 hom 92 het 56 1 39 16 G 2 1 92650 CASAVA_Build 14 105883614 1I CAAATGGAAA -/C CCCCTGGGAA 3070 het 3070 ref 55 20 16 19 C 4 5 92651 CASAVA_Build 14 105884029 1D ATGTGCCTCT G/- GAACTTGAAC 3070 hom 154 het 52 0 52 1 G 2 1 92652 CASAVA_Build 14 105884119 1D49M1D TCCTTCTCAA GGAACACATTGAACATTCTCCATGATAGGTTATCTGTTACATCATAAAATG/-GAACACATTGAACATTCTCCATGATAGGTTATCTGTTACATCATAAAAT- GAACCTTAAC 3070 hom 120 het 25 0 41 10 N/A 0 0 92653 CASAVA_Build 14 105884509 1I AAATGATTTA -/T TTTTTACTAA 1293 het 1293 ref 42 35 4 3 T 5 6 92654 CASAVA_Build 14 105890438 1D AGAAGGCAGG A/- AACATTGAAC 3070 het 3070 ref 47 30 12 5 A 3 2 92655 CASAVA_Build 14 105893812 2I GTTTCTGTGT --/GA GAGAGAGAGA 1373 het 1373 ref 23 10 3 10 GA 5 6 92656 CASAVA_Build 14 105894322 1D CACCCCCACA G/- GGGAGGCTTG 3070 hom 129 het 45 0 43 2 G 4 3 92657 CASAVA_Build 14 105895013 1D AATGTCTGAC T/- TCACTGAAGC 3070 hom 96 het 37 0 31 7 T 2 1 92658 CASAVA_Build 14 105895441 3D CCAGCATCAG GGA/--- GCCCAATAGA 139 het 139 ref 34 26 1 7 GGA 1 0 92659 CASAVA_Build 14 105911264 1I TACTTGTAGA -/T TCTATATATT 3070 hom 78 het 36 0 26 10 T 1 2 92660 CASAVA_Build 14 105914263 1I TTGATCTCAT -/A TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 0 1 92661 CASAVA_Build 14 105914582 1I CCAGCTACTC -/G GGAGGCTGAG 1930 het 423 hom 8 1 5 2 G 2 3 92662 CASAVA_Build 14 105922470 1D GGGTGGCATC A/- AGTCCAATCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 1 92663 CASAVA_Build 14 105926614 1I CTCCCCTGAA -/C CAGAGCACAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 1 2 92664 CASAVA_Build 14 105934313 1D TTTGACCCAG C/- CCATCCCATT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 C 3 2 92665 CASAVA_Build 14 105936425 1D TCTTATCAGG A/- AATATGTGTG 3070 hom 63 het 26 0 20 6 A 3 2 92666 CASAVA_Build 14 105938440 2D ATTTTCCCTT CA/-- CACAGCAGGC 3070 hom 84 het 31 0 29 4 CA 3 2 92667 CASAVA_Build 14 105938812 1I AGATGAGATT -/G GGGTGGGGAC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 G 3 4 92668 CASAVA_Build 14 105942591 1D CAAGATTACT G/- TATGAAAATT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 G 1 0 92669 CASAVA_Build 14 105943618 1I ATTTTTAAGC -/A CAAAAAAAAA 3070 het 1550 hom 28 6 17 5 A 0 1 92670 CASAVA_Build 14 105943858 1D TGTACATTTT C/- CTTTACAAAG 3070 hom 114 het 48 0 39 9 C 2 1 92671 CASAVA_Build 14 105946803 1I ATAAATAAAA -/C CCTGCCAAGA 3070 het 3070 hom 49 16 23 10 C 2 3 92672 CASAVA_Build 14 105947376 1D TTCAAAAGTG T/- TTTTCAATAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 T 5 4 92673 CASAVA_Build 14 105948295 2D TAGAATATAT AC/-- ATATATAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 AC 1 0 92674 CASAVA_Build 14 105948493 6I AGGGAGACGA ------/TGATCT CTGAGAAGAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 TGATCT 0 1 92675 CASAVA_Build 14 105949328 1I TTCTCTTCTT -/G GGGCCTCCCC 3070 hom 62 het 26 0 20 6 G 3 4 92676 CASAVA_Build 14 105950799 1I GTTCCATCTG -/A AAGCTCATTT 3070 hom 113 het 42 0 37 5 A 2 3 92677 CASAVA_Build 14 105952111 1I TTCTGGAAAA -/C CCATCAAAAT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 C 2 3 92678 CASAVA_Build 14 105952578 4I GATTGACACT ----/TAGA TAGATTATTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 TAGA 1 2 92679 CASAVA_Build 14 105952924 3D TGAGTATATT TTC/--- TTATTTGTGT 3070 het 3070 hom 38 13 22 6 TTC 1 0 92680 CASAVA_Build 14 105954348 2D AAAGAAGAAA AG/-- AGAGAAGAAT 1434 het 453 hom 4 1 3 0 AG 3 2 92681 CASAVA_Build 14 105958718 1I TGTTAGTCCA -/T TCTCAGACTA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 1 2 92682 CASAVA_Build 14 105961577 1D ATCGTTGGAC T/- CAATATTAAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 1 0 92683 CASAVA_Build 14 105962099 1I ACTGAAGAGC -/A AGTCCATCCC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 1 2 92684 CASAVA_Build 14 105966904 1D GAGGACAGGG C/- AACTTTGTGA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 1 0 92685 CASAVA_Build 14 105972860 1D AAAAGCTCTT G/- CCCTGTAGCT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 G 1 0 92686 CASAVA_Build 14 105990969 11D TTATTATACA CAAGTAACAAT/----------- CAAGTAACAA 2727 het 2727 ref 30 20 8 5 CAAGTAACAAT 2 1 92687 CASAVA_Build 14 105991325 2I AAAAGTAAAC --/AG AATAAAAACC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 AG 0 1 92688 CASAVA_Build 14 105991433 1I AGAATGGGAT -/A AAACTATTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 3 4 92689 CASAVA_Build 14 105991573 1D GACAAAAAAA T/- CATCAACCAG 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 T 1 0 92690 CASAVA_Build 14 105991684 1D26M2D ACTATTAAAA CAGTCAAAAAGAAAAATGGAACAAAACAA/-AGTCAAAAAGAAAAATGGAACAAAAC-- AAAACAGATG 3070 het 3070 ref 32 21 13 5 N/A 0 0 92691 CASAVA_Build 14 105993094 1I GGAAATTGCA -/T TATTTAGGCT 2419 het 2419 ref 28 15 6 7 T 1 2 92692 CASAVA_Build 14 105993893 3I TTTTTTTTTT ---/TAG TTAGTTATTT 3070 het 112 hom 24 1 11 12 TAG 0 1 92693 CASAVA_Build 14 105995031 1D ATGGAAACAT G/- GGGGATTTAA 3070 hom 54 het 26 0 19 8 G 5 4 92694 CASAVA_Build 14 105996176 1I CCCTGATGGG -/A AACTGTGACA 3070 het 69 hom 33 3 22 8 A 2 3 92695 CASAVA_Build 14 105996974 1D GCTCCCCCAA T/- AGTCACAGGT 3070 hom 63 het 33 0 27 6 T 1 0 92696 CASAVA_Build 14 105997697 2D CATGGTGCGT TC/-- TCTGTGTTCA 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 TC 2 1 92697 CASAVA_Build 14 105998462 1D CACAATTTCT C/- CCTCCTATAC 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 C 3 2 92698 CASAVA_Build 14 105999066 1D ATGCACCCAC A/- AGATGGCTAT 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 A 2 1 92699 CASAVA_Build 14 105999124 3I9M1I ACACCCATAC ---ACATTAGAA-/ATTAGATTAGAAT TAGATGTGCT 3070 het 3070 ref 31 16 13 5 N/A 0 0 92700 CASAVA_Build 14 105999903 1I ACCCACTCCA -/G TCCCTTCCCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 0 1 92701 CASAVA_Build 14 106001068 1D TTGGCCCAAG A/- GACTGATGAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 1 0 92702 CASAVA_Build 14 106001718 1D AGACATGGCT G/- GAATACTAGC 3070 hom 33 het 34 0 12 22 G 2 1 92703 CASAVA_Build 14 106001930 2D ATGACAGAAG TT/-- TTATTGTGGT 3070 het 3070 ref 31 18 9 6 T 4 2 92704 CASAVA_Build 14 106002065 1I AAAAATTCTC -/A ACCAAAGAAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 1 2 92705 CASAVA_Build 14 106002196 1D GGTCATTATA C/- CCAAACAGTC 3070 het 32 hom 30 1 24 6 C 3 2 92706 CASAVA_Build 14 106002936 1D AAATAGAGAT C/- CAAAAGAATG 3070 hom 126 het 45 0 43 3 C 2 1 92707 CASAVA_Build 14 106003623 3I GTAGATTGTG ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 13 16 22 T 9 12 92708 CASAVA_Build 14 106006390 1D CAGGATGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 25 11 11 3 T 13 12 92709 CASAVA_Build 14 106008513 1I CTTTGAGAGG -/C CAAGGTGGGT 3070 hom 37 het 15 0 10 5 C 1 2 92710 CASAVA_Build 14 106008954 1D GGCCTTCTAG A/- AAAGGGCTGG 3070 hom 102 het 36 0 33 3 A 4 3 92711 CASAVA_Build 14 106009080 1I GCTACCCGTT -/C CCCACATCGT 3070 hom 30 het 12 0 8 4 C 3 4 92712 CASAVA_Build 14 106017297 1D15M1D15M1D11M1D AGACTGCTTT GCTTTATTTTTTTTCTGGTTAAGCATATTGTTGCAACATTTGTTG/-CTTTATTTTTTTTCT-TTTAAGCATATTGTT-CAACATTTGTT- CTATTTTAAA 3070 hom 144 het 34 0 49 1 N/A 0 0 92713 CASAVA_Build 14 106020799 3D AGTTATTTAA TAT/--- TATTGTAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 TAT 2 1 92714 CASAVA_Build 14 106028207 1D GTCCTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1317 het 1317 ref 37 22 4 11 T 15 14 92715 CASAVA_Build 14 106029615 1I GTGGGAGAGG -/C TCAGTCTACC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 0 1 92716 CASAVA_Build 14 106031486 1I AGTGGGTGCC -/T TTGCCACTAT 3070 het 3070 ref 60 31 24 5 T 2 3 92717 CASAVA_Build 14 106032388 1I ATTTATATAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 8 9 92718 CASAVA_Build 14 106035458 1I GCAACACGGG -/A TGCTCAACCA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 0 1 92719 CASAVA_Build 14 106036253 1D CAAGCAAGCA G/- GATGGACTTG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 2 1 92720 CASAVA_Build 14 106037027 1I CTGGCCTGCT -/C AGGCTTCTCA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 C 0 1 92721 CASAVA_Build 14 106039768 1D CTCCTCAGTG C/- CCCCTCCTGC 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 C 5 4 92722 CASAVA_Build 14 106042213 4D AGATTCATAT TCTC/---- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 TC 5 3 92723 CASAVA_Build 14 106043603 4I CCAGGATGGT ----/TAAC CTCCATCTCC 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 TAAC 0 1 92724 CASAVA_Build 14 106045304 5I ATAGGTTCTC -----/ATATT AAAATAATCA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 ATATT 0 1 92725 CASAVA_Build 14 106049827 1I ATTAATTTTT -/C CAAAGTTATG 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 C 1 2 92726 CASAVA_Build 14 106050957 3D TGCCAAAGTT AGG/--- AACTCACCCA 3070 het 3070 ref 47 30 17 1 AGG 1 0 92727 CASAVA_Build 14 106052275 1I TAATTTATTT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 A 7 8 92728 CASAVA_Build 14 106053229 1I GGGCCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 2524 het 2524 ref 36 15 10 11 A 15 16 92729 CASAVA_Build 14 106055272 1D TTGTCTCATG C/- CCAGTTACCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 3 2 92730 CASAVA_Build 14 106064679 1D TGGAGAAGTT C/- CCTGGGGAAA 1765 het 1765 ref 35 24 5 7 C 3 2 92731 CASAVA_Build 14 106066140 1D CTCAACATTT G/- CCCCTTGTTC 3070 hom 57 het 27 0 20 8 G 1 0 92732 CASAVA_Build 14 106066991 1I CTGTACACCT -/G GCTCCGCCCT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 1 2 92733 CASAVA_Build 14 106068228 1I25M1I14M1I7M1I GAGAACAAAG -AATTATTCTGGAGGGGCAAGCCACC-AAACCAGTATCTTA-GGGCACT-/AAATTATTCTGGAGGGGCAAGCCACCAAAACCAGTATCTTAGGGGCACTG GGGCAATCCC 3070 hom 114 het 31 0 38 6 N/A 0 0 92734 CASAVA_Build 14 106068907 1D GAAATAATAA G/- GCCAGTATCC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 G 2 1 92735 CASAVA_Build 14 106070120 2I CCTCTTCTTA --/TC TCTCAGCCTT 3070 het 3070 hom 58 21 25 12 TC 2 3 92736 CASAVA_Build 14 106073378 4D AAAGCATATC AGTG/---- CTTAGATCCT 3070 hom 117 het 40 0 40 2 AGTG 1 0 92737 CASAVA_Build 14 106077573 1D AAAGCTCACA C/- TTGCTATGCT 3070 het 3070 hom 31 14 14 6 C 1 0 92738 CASAVA_Build 14 106081534 1D16M1D GCTGGAGAGT GGGAGGGAGAGGTCGGTG/-GGAGGGAGAGGATGGT- GGAATCTGTA 3070 hom 120 het 39 0 41 2 N/A 0 0 92739 CASAVA_Build 14 106082291 1D GAGTCTTTGG A/- AAAATTAATT 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 A 5 4 92740 CASAVA_Build 14 106085155 1D AAGTTTATAA C/- GTTTAGTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 C 1 0 92741 CASAVA_Build 14 106085386 2I ATGAAATAAC --/AT AGTATATATT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 AT 0 1 92742 CASAVA_Build 14 106087368 4I AGTGGTGGTT ----/ATTA ATTAATAATA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 ATTA 1 2 92743 CASAVA_Build 14 106087721 4I ATCGTTACAC ----/CAAA CACTCAGTCT 3070 het 3070 hom 31 8 20 3 CAAA 0 1 92744 CASAVA_Build 14 106088057 1I AGTAATTTTT -/G TATTATACTC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 G 0 1 92745 CASAVA_Build 14 106088345 1D AACAAAACCA G/- GGGGAATCAC 3070 het 106 hom 43 3 34 7 G 5 4 92746 CASAVA_Build 14 106089511 1I TCCTGAGAGA -/C CAGCTCTACT 3070 hom 96 het 37 0 32 7 C 1 2 92747 CASAVA_Build 14 106090486 1I GGGTATTATT -/A TAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 0 1 92748 CASAVA_Build 14 106091241 3I CCTTTTCCTC ---/ACA TTGCACCTGC 2608 het 2608 ref 28 15 7 6 ACA 0 1 92749 CASAVA_Build 14 106094498 1I GAAACAATAC -/T TTCCCAGCCA 3070 hom 92 het 37 0 29 8 T 2 3 92750 CASAVA_Build 14 106095601 2D AAATGAGAGA GG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 31 13 3 G 2 0 92751 CASAVA_Build 14 106095972 1I GGGGTAAATA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 52 31 14 7 T 7 8 92752 CASAVA_Build 14 106097384 1I40M2D GATCGTTTGT -TTTTTCTTGGCGACTTGTTTTAGTATTTTGTAGATTCTGAAT/TTTTTTTCTTGGCGACTTGTTTTAATATTTTGTAGATTCTG-- ATACCAATTT 3070 het 3070 ref 71 68 10 22 N/A 0 0 92753 CASAVA_Build 14 106098857 1D87M1D TTCAAATAAT CCCTGCAATTCTGAGATGAAACACGCTTGATCATGAGGAATTATCTTTTTGATGTGCTGTTGAACTCAACTAGCTATTTTTTTTTTTGC/-TGTGCATTTCTGAGATGAAACCCGCTTGATCATGAGGAATTGTATTTTTGATGTGCTGTTGAACTCAGATAGCTATTATTTTTTGTG- TATTTTTGCA 3070 het 3070 ref 46 57 9 17 N/A 0 0 92754 CASAVA_Build 14 106099911 1D TCATTGTTTT A/- AAAATTTATT 3070 het 3070 ref 56 28 20 8 A 5 4 92755 CASAVA_Build 14 106100985 1D GAGAAGTTTT C/- CCAAACTTAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 C 3 2 92756 CASAVA_Build 14 106102931 1D AGACTCAGGA T/- CTCCTGGTCA 1545 het 1545 ref 63 56 5 4 T 1 0 92757 CASAVA_Build 14 106104210 1D GGTGATAGTG A/- AGCATCTTGT 3070 het 3070 ref 68 35 29 6 A 2 1 92758 CASAVA_Build 14 106104581 1I TTTGAAACTA -/T GATAATCAGG 2437 het 2437 ref 41 32 7 3 T 0 1 92759 CASAVA_Build 14 106105645 4D TCCTGAGGAC ACAA/---- ACAGCCAGTG 3070 het 3070 ref 44 27 10 7 ACAA 1 0 92760 CASAVA_Build 14 106106492 1D GAGACCCATA C/- CAGGGCCTCC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 C 2 1 92761 CASAVA_Build 14 106107208 4I GGATCAGCTA ----/GAGC CGTCTGTCAT 2122 het 2122 ref 68 58 5 5 GAGC 0 1 92762 CASAVA_Build 14 106107287 2I ACACGAAGCC --/AA AGAGAAGCTG 3070 het 3070 ref 57 41 10 6 A 1 3 92763 CASAVA_Build 14 106109187 1I ACTAGTATAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 60 41 15 6 A 7 8 92764 CASAVA_Build 14 106109281 1I ATGGTAACAA -/T TTTGTCTCTT 3070 het 3070 ref 55 40 10 5 T 3 4 92765 CASAVA_Build 14 106110051 1D CAGGAGTGAT C/- CCCTGATGGG 3070 hom 154 het 58 0 48 10 C 4 3 92766 CASAVA_Build 14 106111380 4I25M2D AGGAAGAGAG ----AGAGAGAATATAGACAGAAGGAGAAAC/AGACAGAGAGAATATAGACAGAAGGAGAA-- ACACAAAAGG 3070 hom 13 het 32 1 28 6 N/A 0 0 92767 CASAVA_Build 14 106111665 1I GTTTTCATGG -/A GCCTGAGTGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 0 1 92768 CASAVA_Build 14 106115512 5D CATTTAAGTT AACAC/----- ACGATTAAAG 3070 hom 75 het 30 0 26 7 AACAC 1 0 92769 CASAVA_Build 14 106119302 1D TGTTCTTGAC G/- GGGGAACCTC 3070 hom 69 het 26 0 22 4 G 5 4 92770 CASAVA_Build 14 106119654 2D CCGCTGATTT CC/-- CCCCAGCGTT 3070 hom 54 het 29 0 17 13 C 6 4 92771 CASAVA_Build 14 106120916 1I66M1D AAAATGTAGA -CTATGTTTGGAGCCATTCACTCGGCACTTCAATCAAGTTTTGAATAATTAAATTAATCCCTAAATCT/GCTATGTTTGCAGCCATTCACTCGGCACTTCAATCAACTTTTGAATAATTAAATTAATCCCTAAATC- TTTTTCTTAT 3070 hom 18 het 11 0 12 12 N/A 0 0 92772 CASAVA_Build 14 106121442 1D TATTACAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 28 0 18 11 A 12 11 92773 CASAVA_Build 14 106122477 4D13M2D GGTTGGCCTT TGTCTGTATTCTAACGGCA/----TGTATTCTAACGG-- GTTAGATGCA 3070 hom 39 het 14 0 14 3 N/A 0 0 92774 CASAVA_Build 14 106123436 10D ATCAAATCTT TAATAAAATG/---------- TAATAAAATG 3070 hom 111 het 38 0 38 5 TAATAAAATG 2 1 92775 CASAVA_Build 14 106125703 1D TACTCACAGT G/- GAACTACTGA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 G 2 1 92776 CASAVA_Build 14 106127720 1D AAAATCATGG T/- TTTTATATAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 5 4 92777 CASAVA_Build 14 106128648 8I AGGGATCCCC --------/CAAGTTGT CAAGTTGTCT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 CAAGTTGT 1 2 92778 CASAVA_Build 14 106130438 1I CAGGGGAAAT -/C CAATCAAACC 3070 hom 53 het 20 0 17 3 C 1 2 92779 CASAVA_Build 14 106130591 1I ACCATTGTGG -/T TGGGAAGACA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 T 1 2 92780 CASAVA_Build 14 106131002 1D CTGCTTTTTT G/- GGCTTCCTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 3 2 92781 CASAVA_Build 14 106131205 1I TAAAAGTGTC -/T TTCACTTTCC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 2 3 92782 CASAVA_Build 14 106131479 1D16M1D GAGATCAGCA GGGTGCCTGAGTGCCTCA/-GGTGCCTGAGTGCCTC- AGAACACAGG 3070 hom 75 het 26 0 26 5 N/A 0 0 92783 CASAVA_Build 14 106131789 1D18M1D14M1D GGAAGAGATT CCAGTGCAAATTTAGAAAGTTTGAAGAAATAGACT/-CAGTGCAAATTTAGAAAG-TTGAAGAAATAGAC- TATACTGCAG 3070 hom 66 het 22 0 23 4 N/A 0 0 92784 CASAVA_Build 14 106132556 1D40M1D ATTTCAAATA GGGCACAATTCCATTGATGACACAAATCAAGAGATGGTGAGA/-GGCACAATTCCATTGATGACACAAATCAAGAGATGGTGAG- AACCATATAT 3070 hom 84 het 20 0 29 1 N/A 0 0 92785 CASAVA_Build 14 106134330 1I ATTGCGATAG -/C AGTGTCAACT 3070 hom 151 het 57 0 51 6 C 0 1 92786 CASAVA_Build 14 106134775 1D ACAAGTGGGC T/- TGACCTTATG 3070 het 188 hom 42 1 33 8 T 2 1 92787 CASAVA_Build 14 106138128 1D10M1D GAAACCCAGA GGAACTCTGCAG/-GAACTCTGCA- GGGAGACCTG 3070 hom 30 het 18 0 11 8 N/A 0 0 92788 CASAVA_Build 14 106141839 2D TGCCTTTATA AG/-- AGAGAGAGAC 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 AG 5 4 92789 CASAVA_Build 14 106147089 1D GAAGCTTGTA G/- GAAAATCTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 G 2 1 92790 CASAVA_Build 14 106153917 3I10M3I8M3I AATCAAGAGA ---TGAGAAGCTT---GATATATA---/TGCTGAGAAGCGTTAGAATATATATTT TTTAATCTGT 3070 hom 69 het 18 0 24 3 N/A 0 0 92791 CASAVA_Build 14 106158208 1I GTACCCTGCA -/G GGAGGTTTGT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 G 2 3 92792 CASAVA_Build 14 106167471 1D TCTTGTCCTT C/- CCCTGACAGG 3070 hom 57 het 25 0 18 7 C 4 3 92793 CASAVA_Build 14 106167675 1D AATAATCTAT C/- CTCCATGGAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 1 92794 CASAVA_Build 14 106168081 1D3M1D GTATTGTTTG CCACA/-CAC- AATGTGTGAG 3070 het 3070 ref 36 27 7 3 N/A 0 0 92795 CASAVA_Build 14 106170139 1I GTACCCTGCA -/G GGAGGTTTGT 2569 het 2569 ref 52 38 10 4 G 2 3 92796 CASAVA_Build 14 106170430 1I CAGGGACCCC -/T CCAGGCTGGA 2180 het 2180 ref 27 21 5 1 T 0 1 92797 CASAVA_Build 14 106172278 2I AGGAGGCTGC --/AG AGAGAAGCAG 2738 het 2738 ref 35 25 7 3 AG 2 3 92798 CASAVA_Build 14 106177550 1D TCACACTGTG T/- ATTCCCTCAC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 1 0 92799 CASAVA_Build 14 106178228 10D AGCTGCACCT GGCGGGGGGG/---------- GGGGGTCTCT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 GGCGGGGGGG 1 0 92800 CASAVA_Build 14 106178735 1D CCTGGGAGCT C/- CCTCCCAGAC 3070 hom 86 het 35 0 28 8 C 3 2 92801 CASAVA_Build 14 106179318 1I CATGTCCTCA -/G GCTCTCAGAC 3070 het 3070 ref 73 48 19 6 G 1 2 92802 CASAVA_Build 14 106180066 1D GAGTTAGTGG C/- AATGACAGCA 3070 het 3070 ref 53 27 18 10 C 1 0 92803 CASAVA_Build 14 106180263 1D CCTCACTTAG C/- AATAATGTAT 3070 het 796 hom 34 6 22 6 C 1 0 92804 CASAVA_Build 14 106181629 1I CAAATTTATT -/C CTGAGATGCA 3070 het 3070 ref 41 25 8 8 C 1 2 92805 CASAVA_Build 14 106182827 8D AGGAAAGTGG TGTGTCCC/-------- TCTGCAGCTT 3070 het 3070 ref 69 59 12 4 TGTGTCCC 1 0 92806 CASAVA_Build 14 106182963 1I AAAGACAAGT -/A GTCTGAAGGA 3070 het 3070 ref 81 57 19 5 A 0 1 92807 CASAVA_Build 14 106199572 1D ATGGAAAAAA T/- TTCCAACCCA 1349 het 1349 ref 43 38 3 2 T 3 2 92808 CASAVA_Build 14 106203349 1D AAATCTTTTT C/- CTTATTCCTC 3070 het 3070 ref 40 25 11 4 C 2 1 92809 CASAVA_Build 14 106204184 1D ACAGTCTCTT C/- CAATTGTTTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 C 2 1 92810 CASAVA_Build 14 106204900 1I6M2D AAAATTGTCT -TTATCATT/CTTATCA-- CTCTGATAAA 1792 het 1792 ref 42 38 4 4 N/A 0 0 92811 CASAVA_Build 14 106209998 1D GGGCAGAATA C/- CAATGATTCT 1755 het 1755 ref 39 28 4 7 C 2 1 92812 CASAVA_Build 14 106221564 1I7M2D GCCAGATTAT -ATGATAACT/AATGATAA-- CTATCGTCAG 3070 het 3070 ref 59 37 18 12 N/A 0 0 92813 CASAVA_Build 14 106221825 15D GTTTCCTCAG AGCCCCCCCCCCCCC/--------------- CCCCCCCCGG 3070 het 628 hom 21 6 14 1 AGCCCCCCCCCCCCC 1 0 92814 CASAVA_Build 14 106222105 2D CCTCCTGTCT CC/-- CTGCAGATTT 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 C 3 1 92815 CASAVA_Build 14 106223687 1I GAATTTTTTT -/A AATTGAATAT 3070 het 3070 ref 43 33 8 3 A 2 3 92816 CASAVA_Build 14 106223807 4D TAAACACCAC ATTT/---- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 55 36 12 10 ATTT 1 0 92817 CASAVA_Build 14 106224483 1I GATTCTATGT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 68 41 16 11 A 7 8 92818 CASAVA_Build 14 106224559 7I AAAACAAAAA -------/AATGAGG TATGAGGTGT 3070 het 3070 ref 75 49 20 7 AATGAGG 0 1 92819 CASAVA_Build 14 106227043 4I4M7I TGGCTAAACA ----GTCT-------/AATTATCTTACAATG CTGAGATCGC 881 het 881 ref 51 40 3 11 N/A 0 0 92820 CASAVA_Build 14 106227088 4I4M7I TGGCTAAACA ----GTCT-------/AATTATCTTACAATG CTGAGATCGC 3070 het 3070 ref 48 38 8 6 N/A 0 0 92821 CASAVA_Build 14 106227540 2I ACAAACCTTA --/TT TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 53 40 10 3 T 7 9 92822 CASAVA_Build 14 106228606 1I TTTGTGCCAA -/T GGGGGGATGG 3070 het 3070 ref 74 44 20 10 T 0 1 92823 CASAVA_Build 14 106231827 1I CCACGTGAGT -/G GCCAGCACGT 3070 hom 141 het 57 0 43 14 G 1 2 92824 CASAVA_Build 14 106232065 1D GGAATTTGTG T/- TTTGGATAAG 3070 het 3070 ref 68 43 19 6 T 4 3 92825 CASAVA_Build 14 106234896 1D ATCACATCAG C/- TCTGTCTTCG 3070 het 3070 ref 75 51 19 6 C 1 0 92826 CASAVA_Build 14 106235004 1I TTAATAAATA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 T 6 7 92827 CASAVA_Build 14 106235598 1D GGGGATTTCT A/- AGCAAAGTGT 3070 het 3070 ref 50 26 15 9 A 2 1 92828 CASAVA_Build 14 106235762 2I CTTAAAAAAA --/AG TGAAGGAACT 3070 het 3070 ref 36 23 9 5 AG 0 1 92829 CASAVA_Build 14 106235815 2I64M4I TAATAAAAAC --ATATTTAAGTGCAAAAAGAGATACACAGAAGATGAAACTTCTGCAGCAGATAATTTTGCCAAAT----/TTAGATTTAGGTGCAAAAACAGATACATGGAAGATGAAAATTCTGCAGCAGATAATTTTGTCAAGTAGGC AGCTTTATAC 2527 het 2527 ref 30 36 7 6 N/A 0 0 92830 CASAVA_Build 14 106236207 1I CAATCACTGA -/C TGGAGTGATT 1100 het 1100 ref 51 42 4 5 C 0 1 92831 CASAVA_Build 14 106236398 1D ATCAATGAAT A/- AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 59 39 15 5 A 7 6 92832 CASAVA_Build 14 106237986 1I TCTCATTCTA -/G GGAATAAGAT 2270 het 2270 ref 56 39 5 12 G 2 3 92833 CASAVA_Build 14 106238530 1D AATAACAATC A/- ATTACCTGTA 3070 het 3070 ref 59 24 25 13 A 2 1 92834 CASAVA_Build 14 106240195 2I CTAAAAGCTT --/AA AAAAATCTTA 3070 het 3070 ref 59 36 12 11 A 5 7 92835 CASAVA_Build 14 106240815 3I CTTAAAATTA ---/GAG GAGTATGTAC 3070 het 3070 ref 74 42 23 9 GAG 1 2 92836 CASAVA_Build 14 106241995 1D ACCTCCCAGG T/- CCTTCAGTGG 3070 het 3070 hom 74 24 41 10 T 1 0 92837 CASAVA_Build 14 106244444 1D TAATCTGTAA G/- GACATCTACT 3070 het 3070 hom 85 32 46 7 G 2 1 92838 CASAVA_Build 14 106245041 1I GATGAACTGA -/C CCCCTGTTCC 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 C 4 5 92839 CASAVA_Build 14 106246094 1D ACACCGCACC T/- TTTATAGATT 3070 het 3070 ref 48 32 12 4 T 4 3 92840 CASAVA_Build 14 106246784 1D CTATGAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 57 33 15 10 A 11 10 92841 CASAVA_Build 14 106247333 1I GAAGCTTCTG -/C CCAACCCTCC 3070 hom 166 het 61 0 54 7 C 2 3 92842 CASAVA_Build 14 106249750 1D CGCACGCCCT G/- GGCAGGAAAT 3070 hom 148 het 51 0 50 2 G 3 2 92843 CASAVA_Build 14 106249821 1I CTGAAAAACA -/G CCTGGGTTCT 3070 hom 117 het 44 0 38 8 G 0 1 92844 CASAVA_Build 14 106251479 7I CACTGAGCAT -------/CCTCACA CCTCACAGCA 3070 het 3070 ref 38 18 10 10 CCTCACA 1 2 92845 CASAVA_Build 14 106251604 2I ACTGACATAT --/CC CCCCCCACAC 3070 het 3070 ref 62 35 16 12 C 6 8 92846 CASAVA_Build 14 106252035 1I CAAATCCCTG -/C TCTTTCCCGG 3070 hom 155 het 64 0 57 7 C 0 1 92847 CASAVA_Build 14 106252347 2I ATGCACGTCC --/CT TCCTCCTCCT 3070 hom 113 het 42 0 37 5 CT 0 1 92848 CASAVA_Build 14 106252745 1I31M1D ATTCATGAGT -CCCTGGGCAATTCCCGAAGCTGAGGTGTCCTC/CCCCTGGGCAATTCCCGAAGCTGAGGTTTCCT- CCCTCCTTTG 3070 het 3070 hom 39 10 25 22 N/A 0 0 92849 CASAVA_Build 14 106252913 1I GATCACTTTT -/G TTGCCATCCT 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 G 0 1 92850 CASAVA_Build 14 106253013 1D CCTATCTCAT C/- CCTGTGACTA 3070 hom 144 het 54 0 47 7 C 3 2 92851 CASAVA_Build 14 106259871 1I ATGGCCCTTA -/T TATTTTGTGG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 1 2 92852 CASAVA_Build 14 106273709 1I AATCTTCTGT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 43 3 35 5 C 0 1 92853 CASAVA_Build 14 106274544 1D ATCCAGTCTA T/- TCATTGTTGG 1546 het 144 hom 7 1 4 2 T 2 1 92854 CASAVA_Build 14 106289530 1I11M1I ACAGAATTGT -AATCTGAAAGG-/AAATCTGAAAGGT TCTCTGAGGA 3070 hom 74 het 28 0 21 8 N/A 0 0 92855 CASAVA_Build 14 106292864 1I GGCAGGAAGA -/T TCCTGTGCAC 3070 hom 60 het 24 0 17 7 T 1 2 92856 CASAVA_Build 14 106298874 1I TGGACACAGG -/A AGGGGAACAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 1 2 92857 CASAVA_Build 14 106302102 2D AAATTTCCAC AT/-- GAGTCCCCAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 4 AT 1 0 92858 CASAVA_Build 14 106308517 1I TTCTGTGTTA -/T TATATTTAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 2 92859 CASAVA_Build 14 106311281 30D AAAGGCTCTG AGAACAGTTAGGCTGTATCATTTCTCTTCC/------------------------------ AGATTCCACC 1172 het 1172 ref 49 57 3 4 AGAACAGTTAGGCTGTATCATTTCTCTTCC 1 0 92860 CASAVA_Build 14 106312617 1I GAAACAATAC -/T TTCCCAGCCA 3070 hom 154 het 56 0 52 4 T 2 3 92861 CASAVA_Build 14 106315202 9D TATTTCATTG GTTTTTTGT/--------- GTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 49 28 16 6 GTTTTTTGT 2 1 92862 CASAVA_Build 14 106317463 2I AGGATTCAGG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 T 9 11 92863 CASAVA_Build 14 106318370 1D AGAGCTTGCT G/- TTTTCTCAAG 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 G 1 0 92864 CASAVA_Build 14 106322993 1I ACTGCATCAA -/G TCAACGAGAG 3070 hom 186 het 66 0 60 6 G 0 1 92865 CASAVA_Build 14 106323690 1I CCTCGGCCGG -/C CAGCCGACCC 2929 het 2929 ref 25 10 9 6 C 1 2 92866 CASAVA_Build 14 106324775 1D TCAGGGTTAG C/- AATACTCCTT 3070 het 3070 ref 43 20 12 11 C 1 0 92867 CASAVA_Build 14 106329876 1D AATATTTACG A/- ATTGGCACAA 3070 het 2799 hom 19 6 11 2 A 2 1 92868 CASAVA_Build 14 106332730 3I TGATATTATA ---/AAC AATGCTATAG 3070 het 3070 ref 60 44 11 6 AAC 0 1 92869 CASAVA_Build 14 106333275 13D67M6I6M2I TAATCATAAT ACTAAGAATAAAAAGAATAAAGAGGAATGTTTTGGAAGTCATTGCTATGTTTATGACCTTGATGGTGATGGTAACTTTGC------ATACTT--/-------------AGAGATAAGAGGAATGTTTTGGAAGTGAGTGCTATGGGTATGACCTTGATTGTGGTGACAGCTTTGCAGATGTATACTTCA AACTCAATGA 2216 het 2216 ref 43 71 5 1 N/A 0 0 92870 CASAVA_Build 14 106334279 4I11M1I GTAAATGAAA ----TAAGTGAAAAA-/TAAGTAAGTGAAAAAT AGACTTTACA 3070 het 3070 ref 58 40 10 13 N/A 0 0 92871 CASAVA_Build 14 106334336 1D GAGTTTTTTC T/- TAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 49 20 17 12 T 2 1 92872 CASAVA_Build 14 106334475 1I CTCTGACATT -/G TTCAAAGTTG 3070 het 3070 ref 71 44 20 8 G 0 1 92873 CASAVA_Build 14 106339363 2D GGGAAGATTA TG/-- TGAGCCAGGT 3070 het 3070 hom 48 20 25 5 TG 2 1 92874 CASAVA_Build 14 106342018 1D AGATCATTCT C/- TCAGGATCCT 2448 het 2448 ref 11 6 5 1 C 1 0 92875 CASAVA_Build 14 106347156 1I TCTCAGGGAA -/C CCCAGGTTGT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 3 4 92876 CASAVA_Build 14 106350295 1I CCCTGTAGCT -/C CTCATTTAGG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 1 2 92877 CASAVA_Build 14 106352191 1I GACTGGCGGA -/C CCAGCTCCAC 1987 hom 30 het 12 0 10 2 C 2 3 92878 CASAVA_Build 14 106352261 1I36M1I GGTCTCCGAA -GCTTCACCAGTCCTGGGCCCCACTCCTGCAGCTGCA-/GGCTTCACCAGTCCTGGGCCCCACTCCTGCAGCTGCAC CTGGGACAGG 3070 hom 36 het 13 0 12 9 N/A 0 0 92879 CASAVA_Build 14 106352525 1D GTGGTGGTTT C/- CCTGTGGGCG 3070 hom 88 het 37 0 26 11 C 3 2 92880 CASAVA_Build 14 106354428 1I TGAGAAAGAG -/A AAATCCATGA 3070 hom 102 het 39 0 32 7 A 3 4 92881 CASAVA_Build 16 4403 3I GTCGTCCTCG ---/TCC TCCTCTGCCT 3070 hom 47 het 19 0 16 3 TCC 1 2 92882 CASAVA_Build 16 5444 1D GATCTTGCCC A/- AAGGCCCTCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 3 2 92883 CASAVA_Build 16 41523 2D CATAATTATC CA/-- CAGTTTAGCA 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 CA 2 1 92884 CASAVA_Build 16 42776 21D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC/--------------------- AATAAAAAAA 3070 hom 51 het 11 0 16 4 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC 1 0 92885 CASAVA_Build 16 43450 1I AGTCGCCCGC -/G GCCCAGCGCC 2809 hom 42 het 16 0 12 4 G 1 2 92886 CASAVA_Build 16 46953 1I ATGGCCACTG -/C CACTTCCTGG 3070 hom 79 het 31 0 24 7 C 1 2 92887 CASAVA_Build 16 47970 1I ACACTCAGTT -/C CCTGCCCGGG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 2 3 92888 CASAVA_Build 16 48797 1I CAGTGGGGCT -/G GGCAGGCCCC 3070 hom 47 het 23 0 13 10 G 2 3 92889 CASAVA_Build 16 53884 2I3M1D GGGCAGCATG --CTGC/CCCTG- CCCCAGGCCT 3070 hom 40 het 15 0 11 4 N/A 0 0 92890 CASAVA_Build 16 58658 1I AGGACCAGCT -/G GGGGGGGCTG 2599 hom 49 het 23 0 11 12 G 7 8 92891 CASAVA_Build 16 64239 1I GCATTATTGA -/C CCTGCCAGGG 3070 hom 84 het 36 0 28 8 C 2 3 92892 CASAVA_Build 16 64381 1D TCAGCAGGTC T/- TCCTCCTGCA 3070 hom 80 het 34 0 23 13 T 2 1 92893 CASAVA_Build 16 64811 1D CCCCCACTGA G/- GCACCTTGTG 2488 hom 36 het 18 0 7 11 G 2 1 92894 CASAVA_Build 16 66983 1I TTGGAGACCA -/G GGTCCTGCCC 3070 hom 64 het 29 0 20 9 G 2 3 92895 CASAVA_Build 16 71553 1D TAAGGATTTC T/- GGGCTTCCCG 3070 hom 89 het 33 0 26 7 T 1 0 92896 CASAVA_Build 16 78387 7D ACTCCGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1710 het 1710 ref 9 7 4 0 A 21 14 92897 CASAVA_Build 16 78773 1I TGCTCCGACA -/G GCTGGCCAGC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 G 1 2 92898 CASAVA_Build 16 84082 1I CATGGCCTTG -/C CCCGATGATG 3070 hom 63 het 26 0 18 8 C 3 4 92899 CASAVA_Build 16 86962 3I CTAACGTGCT ---/AAG AAGCAGAGAC 3070 hom 99 het 38 0 31 7 AAG 1 2 92900 CASAVA_Build 16 90778 3D CCAGCCTGGC TAA/--- TAACACGGTG 2961 hom 18 het 7 0 7 1 TAA 2 1 92901 CASAVA_Build 16 95509 2I GGTACTACAA --/CT CTCAGGATAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 CT 1 2 92902 CASAVA_Build 16 97375 1I CGGGCACGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 55 het 23 0 19 4 G 1 2 92903 CASAVA_Build 16 101797 1D AGAGGCTGTT C/- CTTTATTATT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 C 2 1 92904 CASAVA_Build 16 105490 1I TTCCTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 34 1 25 8 T 12 13 92905 CASAVA_Build 16 106974 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 30 0 25 5 A 12 11 92906 CASAVA_Build 16 114111 1D ACTCCCAACA T/- GTGAGAAACA 3070 hom 91 het 38 0 28 11 T 1 0 92907 CASAVA_Build 16 117994 4I CATCTTCTTC ----/TTCT TTTTTTTTTT 1339 hom 24 het 11 0 9 2 TTCT 0 1 92908 CASAVA_Build 16 120407 4D AAACGGAAAA AAAC/---- AAACACCAGA 3070 hom 98 het 35 0 30 5 AAAC 2 1 92909 CASAVA_Build 16 122008 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 36 1 28 8 T 15 11 92910 CASAVA_Build 16 126531 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2794 hom 18 het 8 0 7 1 A 11 12 92911 CASAVA_Build 16 128835 1D GGCACAGGGG C/- CCCTCTTGCT 3070 hom 62 het 25 0 14 11 C 4 3 92912 CASAVA_Build 16 131045 1I TGGACATGGT -/G GCGGGCGCCT 3010 hom 21 het 8 0 8 0 G 1 2 92913 CASAVA_Build 16 156191 1I GCGGATCCCC -/G GGGCTCTGGG 1859 hom 30 het 11 0 9 2 G 3 4 92914 CASAVA_Build 16 157947 1I TTTTGGGGGT -/C TTTTTTTTTT 2696 hom 21 het 19 0 14 5 C 0 1 92915 CASAVA_Build 16 164399 1I ACCTCCTGGT -/G CTTCTGCTTC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 0 1 92916 CASAVA_Build 16 174792 1I CATGGGTGAC -/A AAAGCAAGCA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 3 4 92917 CASAVA_Build 16 186524 4D TCCAGTGGCT AACA/---- AACAATTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 AACA 2 1 92918 CASAVA_Build 16 192246 1D GGCAAAAGAA G/- GAGTGAGACA 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 G 2 1 92919 CASAVA_Build 16 215998 1D TGCATCCTAT G/- AAAATACCCT 3070 het 3070 ref 61 28 26 8 G 1 0 92920 CASAVA_Build 16 228015 2D ATGTTATTTA TT/-- TTTATTTATT 34 het 34 ref 11 7 1 3 T 5 3 92921 CASAVA_Build 16 235665 1D TGATGAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 A 11 10 92922 CASAVA_Build 16 256779 2D TGAAAGGGCC AT/-- ATAGGGCTCT 1645 het 1645 ref 18 5 8 6 AT 2 1 92923 CASAVA_Build 16 257551 2D ATGCATGCCT CA/-- CAGTACACCT 3070 het 3070 ref 78 46 21 13 CA 2 1 92924 CASAVA_Build 16 258156 2I ATGCATGCCT --/CA CAGTACACCT 3070 het 3070 ref 84 49 16 19 CA 1 2 92925 CASAVA_Build 16 260258 5I AAAACAAAAG -----/AAAAC AAAACAAAAC 2327 het 1368 hom 13 4 5 4 AAAAC 2 3 92926 CASAVA_Build 16 263178 1D GCCAAGGCCG C/- CCCCCACTCT 936 hom 26 het 11 0 5 6 C 6 5 92927 CASAVA_Build 16 273001 4D CATGGCCCTG TCTC/---- TCTCGGTGCC 2116 hom 19 het 12 0 7 5 TC 4 2 92928 CASAVA_Build 16 277549 1I CCCCTGCTGG -/C CCTAGCCTGA 2804 het 1238 hom 19 4 10 5 C 2 3 92929 CASAVA_Build 16 278334 1I CGTGTCCACA -/C CCCCATCCCG 983 het 982 ref 20 5 5 10 C 4 5 92930 CASAVA_Build 16 282124 1I CAGCAAGGAT -/G GGCTCAGGAA 3070 hom 41 het 17 0 11 6 G 2 3 92931 CASAVA_Build 16 285968 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2061 hom 21 6 8 7 A 9 8 92932 CASAVA_Build 16 290370 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 T 10 11 92933 CASAVA_Build 16 301116 2I3M1I TCACTGCAAG --CCG-/CTCCGC CTCCCGGGTT 3070 hom 24 het 12 0 9 4 N/A 0 0 92934 CASAVA_Build 16 313627 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1599 het 637 hom 9 2 4 3 A 6 7 92935 CASAVA_Build 16 356524 1D AGGTACCCCC A/- AAACCTCAGG 3070 hom 62 het 28 0 15 13 A 4 3 92936 CASAVA_Build 16 359285 1I GGGGGGCCCA -/G GGCAACTGCC 3070 hom 96 het 33 0 32 1 G 2 3 92937 CASAVA_Build 16 378079 2D GCAGGGAAAC AT/-- GTGAGCAAAG 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 AT 1 0 92938 CASAVA_Build 16 385126 1I TAATATCTGC -/T TTTTTCCTTT 3070 het 3021 hom 20 8 9 3 T 5 6 92939 CASAVA_Build 16 390142 2I AGAGGGCAAC --/AG GGGAGCAGCA 2723 het 2723 ref 33 16 9 8 AG 0 1 92940 CASAVA_Build 16 393214 1I TAGAGGTGAG -/T TGTCACCATG 3070 hom 83 het 29 0 28 3 T 1 2 92941 CASAVA_Build 16 396241 1I GGGCCTTCAG -/C CCTGGACTGG 3070 hom 39 het 18 0 13 5 C 2 3 92942 CASAVA_Build 16 439884 1D CCCGGGAAGC A/- GAGGTTGCAG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 1 0 92943 CASAVA_Build 16 443949 1D AGTGAGCACA T/- TTCAGAGTAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 3 2 92944 CASAVA_Build 16 449126 1D GTGTTCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1805 het 984 hom 25 3 5 17 T 19 18 92945 CASAVA_Build 16 460981 2I TGTCTTGCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 27 1 22 4 T 11 13 92946 CASAVA_Build 16 463612 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 398 hom 39 1 29 9 T 10 9 92947 CASAVA_Build 16 472970 2D TCAGGACGAC TG/-- TGGTTTCAAA 3070 hom 60 het 23 0 17 6 TG 2 1 92948 CASAVA_Build 16 475422 1I TTTGTTTCTG -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 92949 CASAVA_Build 16 478713 2I TCCAGCCCAC --/TT TTTTTTTTTT 1946 het 73 hom 29 1 15 13 T 15 17 92950 CASAVA_Build 16 479090 2I GTGCATTGGT --/AA GAGAGAACTT 3070 hom 125 het 47 0 39 8 A 0 2 92951 CASAVA_Build 16 479782 12I TGCAGGAGGG ------------/GCTGTCCCTTGC GCTGAGCAGC 3070 hom 58 het 24 0 18 6 GCTGTCCCTTGC 0 1 92952 CASAVA_Build 16 546901 2I GCACGTCTAT --/GA GAGAGTGTAG 3070 het 1136 hom 18 4 11 3 GA 2 3 92953 CASAVA_Build 16 552590 8D11M2D ACACATGCAC ACACACAGACACACACAGGCA/--------ACAGACACAGG-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 56 31 28 8 N/A 0 0 92954 CASAVA_Build 16 561896 1I CACAAGGCAC -/T TTTTTTTTTT 3005 het 1611 hom 34 10 12 12 T 11 12 92955 CASAVA_Build 16 574315 1D GGTGTAGGCA G/- GTGAACCCGG 1662 het 632 hom 15 3 7 5 G 2 1 92956 CASAVA_Build 16 576794 2D GGCCAGGACT GG/-- GGGGGGTCCC 3070 het 2698 hom 37 14 17 6 G 8 6 92957 CASAVA_Build 16 615089 1D GCCGAGAGGA C/- ACTTAGCTTC 3070 het 2687 hom 25 11 10 4 C 1 0 92958 CASAVA_Build 16 621645 1D CCTCCACCCT G/- GGGCACCATC 2381 hom 34 het 14 0 10 4 G 4 3 92959 CASAVA_Build 16 638508 1D GGAGGGTGTA G/- GGGGGGTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 G 7 6 92960 CASAVA_Build 16 644549 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1384 het 800 hom 10 3 3 4 T 12 11 92961 CASAVA_Build 16 653422 4I CTGGGCGACA ----/GAGT GAGACTCCAT 2040 het 1795 hom 23 5 6 12 GAGT 0 1 92962 CASAVA_Build 16 653440 1D ATCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAG 966 het 966 ref 20 8 3 9 A 10 9 92963 CASAVA_Build 16 653697 2D CACAGCACTC AT/-- CTCTCTGGGA 3070 het 3070 ref 47 21 19 8 AT 1 0 92964 CASAVA_Build 16 654178 13D CAGCTTTGGA AACCCCGTGCGTG/------------- CCTAGAGGAA 3070 het 3070 ref 38 25 12 3 AACCCCGTGCGTG 1 0 92965 CASAVA_Build 16 659328 1D GCTTCTCTGA G/- GGTTCAGCAG 3070 het 652 hom 25 6 13 6 G 3 2 92966 CASAVA_Build 16 672289 1D GCAGGTGAGG C/- CTGCGGCTGG 2770 het 2770 ref 33 15 12 6 C 2 1 92967 CASAVA_Build 16 682051 4I CCCGCTTCGG ----/CCTC CCTAAGTGCT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 CCTC 0 1 92968 CASAVA_Build 16 688928 7D AAAAAAAAAA AAAAAAG/------- AAAGAAAGAA 1078 het 645 hom 21 3 7 12 AAAAAAG 1 0 92969 CASAVA_Build 16 688956 5D GAAAAAGAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAA 2030 het 1439 hom 20 5 10 6 AAAAG 2 1 92970 CASAVA_Build 16 742899 1I TGTTTTCTTT -/C CCGTCTGTGT 3070 hom 83 het 29 0 25 4 C 2 3 92971 CASAVA_Build 16 746283 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 12 11 92972 CASAVA_Build 16 751631 1D TTCTGGCTGT G/- GGGGGGGTCT 1666 het 1666 ref 20 8 6 7 G 8 7 92973 CASAVA_Build 16 757018 15D TCCTGGGTGA GCCAGGGAGTCCCTG/--------------- GCCAGGGTGG 2045 het 2045 ref 21 8 7 11 GCCAGGGAGTCCCTG 1 0 92974 CASAVA_Build 16 788699 2D AGGATGGTGT GA/-- GAGGGGCCGG 1856 het 1856 ref 17 8 6 4 GA 2 1 92975 CASAVA_Build 16 795080 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2195 hom 38 11 13 14 A 11 10 92976 CASAVA_Build 16 811325 1I TGGATATTGG -/A AAAACGTGAA 2201 het 2201 ref 19 7 5 7 A 4 5 92977 CASAVA_Build 16 811378 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2603 het 737 hom 18 3 10 5 T 13 14 92978 CASAVA_Build 16 813042 1D TTTTAGGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 12 11 92979 CASAVA_Build 16 820162 16D GTGAGTGGAC GCTGGGCTGCTGGGCT/---------------- GCTGGGCTGC 3070 hom 37 het 19 0 10 11 GCTGGGCT 4 2 92980 CASAVA_Build 16 830982 1D GGTGACCCCA C/- CCCCCCCAGA 1877 het 1485 hom 14 4 6 4 C 8 7 92981 CASAVA_Build 16 835626 1I CCCGGGTCCT -/G GGCTGCAGTA 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 G 2 3 92982 CASAVA_Build 16 840723 1I TCTCGTCAGA -/G GGTACCTGGC 3070 hom 71 het 27 0 20 7 G 2 3 92983 CASAVA_Build 16 850213 1I TCTCTTAACA -/G GGTCTTTTTA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 2 3 92984 CASAVA_Build 16 878738 1D CAGAAGCACT G/- GGGGGGGTCC 3070 hom 54 het 24 0 17 7 G 8 7 92985 CASAVA_Build 16 891374 1D ACAGAGCTGT G/- GGGCTCCACC 2639 het 2639 ref 28 10 9 10 G 4 3 92986 CASAVA_Build 16 913232 2I ATGGCAAAAC --/AG AGCAGGGGCA 1273 het 1273 ref 42 23 7 12 AG 1 2 92987 CASAVA_Build 16 929256 1D CAGCACGCTG T/- CCCCGCCGTG 1644 het 1467 hom 25 12 8 5 T 1 0 92988 CASAVA_Build 16 931238 1I TTTAAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 11 12 92989 CASAVA_Build 16 934920 1I TTGTTAGGTT -/A AAAAAAAATA 2928 het 2189 hom 13 5 7 1 A 8 9 92990 CASAVA_Build 16 935527 1I40M9I AGGCTGTCTC -AAAAAAAAAAGAAAAAAGTTCAGCTGGCACTGGGTCAGAG---------/AAAAAAAAAAAGAAAAAAGTTCAGCTGGCACTGGGTCAGAGTTAAAAAAT TTAAAAAATT 3070 het 3070 ref 22 19 8 9 N/A 0 0 92991 CASAVA_Build 16 947625 2D TTAAAAAGCC AA/-- AATCATCTGG 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 A 4 2 92992 CASAVA_Build 16 953845 2D TTGAGATTTC AG/-- AGAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 AG 3 2 92993 CASAVA_Build 16 956149 3D GCAGAGGCCA GGT/--- GGTCTCAGGA 3070 het 3070 ref 35 14 13 9 GGT 2 1 92994 CASAVA_Build 16 956609 4D CGACGTTCAG ATAT/---- ATATACTCCG 3070 het 3070 ref 41 17 16 10 AT 4 2 92995 CASAVA_Build 16 967688 9D GGTGGATGGA GGGGGACGG/--------- GGAGGACGGG 1751 het 862 hom 13 4 5 7 GGGGGACGG 1 0 92996 CASAVA_Build 16 967989 6I CCACACACAT ------/ACATAC ACACGCACAC 3070 het 3070 hom 56 25 15 17 ACATAC 0 1 92997 CASAVA_Build 16 968042 4D53M2D CACCACACAT CACACACACACAAACACACCCACACCCTGCACACATACACCACACCAAACACACACGGA/----CACACACAAACACACCCACACCCTGCACACATACACCACACCAAACACACATG-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 58 53 14 23 N/A 0 0 92998 CASAVA_Build 16 968355 2I AAACACACAC --/CA CACACACACA 1855 het 1855 ref 45 20 6 19 CA 6 7 92999 CASAVA_Build 16 986301 1D CAAGGTGATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 10 9 93000 CASAVA_Build 16 1013959 1D CCTTTCAGGC A/- AGGGTGACCC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 2 1 93001 CASAVA_Build 16 1053935 2D CGCAGAGCCA CG/-- CCCCACCTGT 2419 het 2419 ref 32 20 7 5 CG 1 0 93002 CASAVA_Build 16 1056222 1I GGGCCGCCCT -/G GGGGGACGCT 1466 het 24 hom 10 1 6 3 G 5 6 93003 CASAVA_Build 16 1066726 1I TTTTGTAGTG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 7 8 93004 CASAVA_Build 16 1105191 1I CACCTGTGGG -/C CCTGTCGGTG 3070 hom 29 het 12 0 10 2 C 2 3 93005 CASAVA_Build 16 1120165 1D CAGCTCATTT A/- ATATGAACAA 1764 hom 21 het 11 0 7 5 A 2 1 93006 CASAVA_Build 16 1206805 1I TCCACTTGGC -/T CGGGCCCGGA 3070 hom 45 het 17 0 13 4 T 0 1 93007 CASAVA_Build 16 1209791 2D CCGGGAGCCT CA/-- CAGGTCAGGA 3070 hom 63 het 23 0 16 7 CA 2 1 93008 CASAVA_Build 16 1216603 1D GGTGCCGTTC A/- CCCCCACCAT 1579 hom 15 het 8 0 4 4 A 1 0 93009 CASAVA_Build 16 1228795 2D AAATGAATAC AT/-- AGTCTGATGA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 AT 1 0 93010 CASAVA_Build 16 1234285 1D GTCCAATGGT G/- GGGGGGAACG 2242 het 2238 hom 23 12 7 4 G 7 6 93011 CASAVA_Build 16 1234912 1I ACATCAAAGA -/G GGGATCCCTG 3070 hom 44 het 22 0 14 8 G 3 4 93012 CASAVA_Build 16 1238275 2I CATTCACACA --/TG CACACATGCA 3070 hom 16 het 13 0 8 5 TG 0 1 93013 CASAVA_Build 16 1238379 10I CACACATTCA ----------/CACACACATG CACACACACA 3070 hom 82 het 34 0 26 8 CACACACATG 0 1 93014 CASAVA_Build 16 1243759 3I CACTCCCGGA ---/CTC CTCCGCCCCT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 CTC 1 2 93015 CASAVA_Build 16 1245681 1D GAGTTCCTCA C/- CCCGTGTCCC 2041 het 2041 ref 45 25 5 15 C 4 3 93016 CASAVA_Build 16 1250785 2D GACGCACGTC CA/-- CACAGAGCCC 2227 het 580 hom 28 3 8 18 CA 3 2 93017 CASAVA_Build 16 1253152 1I GGACATGGAG -/C CCCCCCCAGG 3070 hom 41 het 19 0 13 6 C 7 8 93018 CASAVA_Build 16 1254476 2D TGTGTGCATG TA/-- TGTGTGGATG 3070 hom 111 het 45 0 38 8 TA 1 0 93019 CASAVA_Build 16 1254536 4D CGAGTGTGTG TGTA/---- TGAGTGTGTA 3070 hom 144 het 55 0 48 8 TGTA 1 0 93020 CASAVA_Build 16 1254700 4D28M36D20M2D34M2I CATGCGTGTA TGAGTGTGTGTGTGCGTGTATGAGTGTGTGCATGTGTGTATGCGTGTGCATATGTAAGGATGTGTGCGTGTGTGCGCGTCAGTTTGCATGTGTTTGTGTGCCTGTGTGTGCGTATGAGTGTGCA--/----TGTGTGTGTGCGTGTATGAGTGTGTGCA------------------------------------TGTGTGCGCGTCAGTTTGCA--TGTTTGTGTGCCTGTGTGTGCGTATGAGTGTGCATG TGTGTGCATG 3070 hom 163 het 50 0 53 28 N/A 0 0 93021 CASAVA_Build 16 1254936 2D18M2D TTTGAAAGCA TGTGTGTGCGTGCATGTGAATG/--TGTGTGCGTGCATGTGAA-- TGTGTGTGCA 3070 het 2621 hom 66 13 19 45 N/A 0 0 93022 CASAVA_Build 16 1255065 2D8M4D37M2D TGCATGTGTG TATGAGTGTGTGTCTGCATGCATGTGTGTGCATGCTTGTGAGTATGAGTGCAT/--TGAGTGTG----TGCATGCATGTGTGTGCATGCTTGTGAGTATGAGTGC-- GTGTGCGTGT 3070 hom 88 het 40 0 32 34 N/A 0 0 93023 CASAVA_Build 16 1255274 2I GCGTGTATGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 848 hom 59 3 41 15 GT 6 7 93024 CASAVA_Build 16 1259027 1D CTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 24 3 15 7 T 13 12 93025 CASAVA_Build 16 1264543 1D CACCACCACG C/- CCAGCTAATT 3070 hom 57 het 23 0 19 15 C 3 2 93026 CASAVA_Build 16 1268516 3I TGCCGGAGGT ---/GAG GAGGTCAGTG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 GAG 1 2 93027 CASAVA_Build 16 1277091 1I CATCTCTACT -/A AAAATACAAA 1914 het 417 hom 8 1 5 2 A 4 5 93028 CASAVA_Build 16 1283337 1D CCTATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 11 10 93029 CASAVA_Build 16 1297846 4D ATGAATAAGG GAGA/---- GAATCAGTGA 3070 hom 82 het 31 0 18 13 GA 3 1 93030 CASAVA_Build 16 1303797 1I GGCCATGGGG -/A AGGGGTCCTA 2795 hom 38 het 14 0 9 5 A 1 2 93031 CASAVA_Build 16 1307733 1I GGCTGTGACA -/C CCTGAGGGAT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 C 2 3 93032 CASAVA_Build 16 1310754 2I GCCAGGTGAC --/AG GGGCTGTCTT 3070 hom 46 het 20 0 15 5 AG 0 1 93033 CASAVA_Build 16 1311225 1D GGGCCTCCGA C/- CCCCCACTGC 3070 hom 59 het 22 0 19 3 C 6 5 93034 CASAVA_Build 16 1311424 9D AGGGGGGAGG CTGAGGGGT/--------- CCCGGTTGCC 3070 hom 42 het 15 0 12 3 CTGAGGGGT 1 0 93035 CASAVA_Build 16 1312071 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2964 het 316 hom 23 3 11 11 A 15 14 93036 CASAVA_Build 16 1314404 1I TGGGCCCTCT -/G GGGCCTGAGC 3070 hom 98 het 35 0 28 7 G 3 4 93037 CASAVA_Build 16 1319646 1I AAAAACTTAT -/A AAAAAAAAAA 2704 het 232 hom 12 1 8 3 A 11 12 93038 CASAVA_Build 16 1319984 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1830 het 11 hom 10 1 6 4 A 12 11 93039 CASAVA_Build 16 1337520 1I CACCCAGGGG -/C CCCCTCCTGA 3070 hom 67 het 29 0 18 11 C 4 5 93040 CASAVA_Build 16 1338079 2I CGAGACTCCC --/CT GACTGGCCTC 2561 hom 34 het 17 0 11 6 CT 0 1 93041 CASAVA_Build 16 1344195 2D GGCAGGCCAC TG/-- TGTAACAGCG 3070 hom 65 het 28 0 20 10 TG 2 1 93042 CASAVA_Build 16 1348870 1D GTGTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 32 3 20 9 T 12 11 93043 CASAVA_Build 16 1354670 1D GCCGGGACCT G/- GGGGGGGTCG 3070 hom 53 het 27 0 18 10 G 8 7 93044 CASAVA_Build 16 1362095 1D CGTCTCAACC A/- AAAAAAAAAA 2526 het 76 hom 13 1 8 4 A 13 12 93045 CASAVA_Build 16 1366709 1I CATTCCAAGA -/C CCCCCCCATG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 C 7 8 93046 CASAVA_Build 16 1389961 1D CTCTGGGTGA C/- AAGCACACAT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 C 1 0 93047 CASAVA_Build 16 1396937 1D GTCAGGAGTT A/- AGAGATCAGC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 A 2 1 93048 CASAVA_Build 16 1399416 1I GGAGGAGAGA -/T TCTCAGGGGA 3070 hom 72 het 30 0 23 7 T 1 2 93049 CASAVA_Build 16 1410903 1D CAGGCCCGGA G/- TGCGCGATGG 3070 hom 48 het 18 0 16 2 G 1 0 93050 CASAVA_Build 16 1452091 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 14 13 93051 CASAVA_Build 16 1453777 1D ACCTGCCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 333 hom 23 4 14 5 A 15 14 93052 CASAVA_Build 16 1454969 1I CTCCTCACTG -/C CCCCCCCAAG 3070 hom 45 het 21 0 12 9 C 7 8 93053 CASAVA_Build 16 1464087 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2066 het 2066 ref 21 7 7 7 A 13 14 93054 CASAVA_Build 16 1475513 1I GTGGCAGGCG -/C CTATAGTCCC 2202 het 1828 hom 17 7 7 4 C 1 2 93055 CASAVA_Build 16 1480379 1D CCTTCACTTC A/- AGACTTCCAG 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 A 2 1 93056 CASAVA_Build 16 1482678 4D GGCGCCTCTT TAGG/---- TGTCTTCCTG 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 TAGG 1 0 93057 CASAVA_Build 16 1488725 7I TATTTCTTTG -------/TGATATT TGTGGAATTT 3070 hom 59 het 25 0 17 8 TGATATT 0 1 93058 CASAVA_Build 16 1616318 1I GTGGGCTCTA -/G GCCTTGCCCA 3070 hom 85 het 35 0 27 8 G 1 2 93059 CASAVA_Build 16 1692979 3D TAGAAGTTCG TTC/--- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 TTC 2 1 93060 CASAVA_Build 16 1717427 2D TGTGAGTCAC AT/-- GTGTCACGTG 3070 hom 195 het 73 0 61 15 AT 1 0 93061 CASAVA_Build 16 1726914 2I CCGTCTGTGT --/GA GAGTGACCAT 3070 hom 132 het 57 0 29 28 GA 1 2 93062 CASAVA_Build 16 1727778 2I ATCCGTGTGA --/GT GTGACCATCC 3070 hom 165 het 63 0 48 15 GT 1 2 93063 CASAVA_Build 16 1766491 2D CCCAGGGGAG GC/-- CTCAGCAGCA 3070 hom 42 het 20 0 14 6 GC 1 0 93064 CASAVA_Build 16 1776160 4I GAGTGGAGTC ----/TGTT TGGTTCCCGT 3070 hom 62 het 26 0 17 9 TGTT 0 1 93065 CASAVA_Build 16 1788438 1I TCAGGAGTTT -/C GAGACCAGCC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 0 1 93066 CASAVA_Build 16 1794247 34D TTTCCTTTCC TCTATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------- TATATATATA 3070 hom 63 het 21 0 21 3 TCTATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 93067 CASAVA_Build 16 1796083 4D TTCATTTCTT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 3 TTTC 2 1 93068 CASAVA_Build 16 1796498 2I AAGGAACCAA --/CT CTTTTGGTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CT 1 2 93069 CASAVA_Build 16 1796896 1D GTTGAAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 11 10 93070 CASAVA_Build 16 1797852 1I CATGTGGTCT -/A GAAGTGCAGT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 0 1 93071 CASAVA_Build 16 1798594 1I AGCCACCACG -/C CCCAGCCCTA 1018 hom 9 het 12 0 3 9 C 3 4 93072 CASAVA_Build 16 1800167 2I GTCTCAAAAA --/AG ATGCTTCAGA 3070 hom 108 het 40 0 34 6 AG 0 1 93073 CASAVA_Build 16 1801494 1I GCAGGTGGAT -/C CACCTGAGGT 2272 hom 17 het 11 0 6 5 C 1 2 93074 CASAVA_Build 16 1802517 4I AAAAAAAAAA ----/AAAC AAAAACAAAA 3070 hom 64 het 24 0 22 2 AAAC 0 1 93075 CASAVA_Build 16 1805119 11I AAGATGGTCA -----------/ACCCCACTAGT CATGGGGAAA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 ACCCCACTAGT 0 1 93076 CASAVA_Build 16 1811945 2D TGTTTTTTTT TG/-- TTTTTTTGTT 162 het 162 ref 15 6 3 6 TG 1 0 93077 CASAVA_Build 16 1815144 1D TATGGTGAAA C/- CCTGTCTCTA 2530 hom 7 het 10 0 6 5 C 3 2 93078 CASAVA_Build 16 1844835 1D AAAGCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1317 het 1317 ref 32 18 5 10 A 15 14 93079 CASAVA_Build 16 1845934 1D TGTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 36 3 18 15 T 15 14 93080 CASAVA_Build 16 1846972 1D CACCATGTTG C/- CCCAGGCTGG 3070 hom 95 het 36 0 32 4 C 4 3 93081 CASAVA_Build 16 1853728 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 14 13 93082 CASAVA_Build 16 1854485 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTCTTTTT 1141 het 904 hom 20 4 15 1 T 4 5 93083 CASAVA_Build 16 1855434 3I CCTCCATCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3059 het 94 hom 17 1 11 5 A 11 14 93084 CASAVA_Build 16 1855479 10D ACATATATAC ACACACGTGT/---------- ACACACATAC 77 hom 5 het 17 0 1 16 ACACACGTGT 1 0 93085 CASAVA_Build 16 1855529 2D ACATACACAC GT/-- GTGTGTATAC 3070 hom 33 het 20 0 12 11 GT 4 3 93086 CASAVA_Build 16 1856733 14D AAAAAATAAA AATAAAAAAAAAAT/-------------- AATAAAAAAT 3070 hom 60 het 20 0 21 1 AATAAAAAAAAAAT 1 0 93087 CASAVA_Build 16 1857912 4I CTCTACACAC ----/AAAT AAAGATTAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAT 0 1 93088 CASAVA_Build 16 1858545 10D TAAATAAAAC AAAATAAAAT/---------- AAAATAAAAT 2436 hom 12 het 7 0 5 4 AAAAT 5 3 93089 CASAVA_Build 16 1864522 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 19 1 16 2 A 11 12 93090 CASAVA_Build 16 1865560 1D AAGTTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 7 6 93091 CASAVA_Build 16 1889802 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 12 11 93092 CASAVA_Build 16 1921665 1D CTGAAATAAC G/- AAAATAATAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 G 1 0 93093 CASAVA_Build 16 1922995 1D TTGAGAGACA C/- CCCCCTGCTC 3070 het 2763 hom 27 10 15 3 C 6 5 93094 CASAVA_Build 16 1955554 3D CTATCAGCCT GGC/--- GGCAAGTGCA 3070 hom 35 het 21 0 18 5 GGC 2 1 93095 CASAVA_Build 16 1985123 5I TGTTTTTTTT -----/GTTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3031 hom 19 8 9 2 GTTTG 0 1 93096 CASAVA_Build 16 1999175 5I CTTGTTTCCT -----/CGACC CGAATGGAGG 2699 het 2699 ref 24 12 7 5 CGACC 0 1 93097 CASAVA_Build 16 2001626 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2369 het 1223 hom 20 4 9 7 A 13 14 93098 CASAVA_Build 16 2014958 1I AGCCACTGCT -/C CCGGCCCCTC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 C 2 3 93099 CASAVA_Build 16 2019332 6D ACCCTGGGCT AAGGGC/------ AAGGCTCTGG 2839 het 2263 hom 20 7 8 5 AAGGGC 1 0 93100 CASAVA_Build 16 2049050 2I GGCTTTAGTC --/TT TTTTTTTTTT 2789 het 2789 ref 29 10 12 7 T 14 16 93101 CASAVA_Build 16 2111751 1I TCCTGGCACA -/G GGACTATGGC 3070 hom 48 het 19 0 14 5 G 2 3 93102 CASAVA_Build 16 2129234 3I TCCCTCGAAG ---/TTT AAGGATCAAG 3070 hom 60 het 27 0 19 8 T 0 3 93103 CASAVA_Build 16 2131854 1D GCTGGGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 478 hom 29 4 9 16 A 17 16 93104 CASAVA_Build 16 2136488 5I AGCCACCACA -----/CCTGG CCTCTTTCAC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 CCTGG 0 1 93105 CASAVA_Build 16 2140624 24I GCTCCCTCCA ------------------------/GTCTGGGGAGCTGTTCTCTACCCC GTCTGGGGGT 3070 hom 73 het 33 0 23 10 GTCTGGGGAGCTGTTCTCTACCCC 0 1 93106 CASAVA_Build 16 2146732 1I GGTGCATGGT -/G GGGGTGGGGC 3070 hom 44 het 18 0 14 4 G 4 5 93107 CASAVA_Build 16 2190195 1D GGTTAGAGAG C/- CCCTGTCTAC 3070 het 2969 hom 23 9 11 3 C 4 3 93108 CASAVA_Build 16 2196049 1D TGACCTTTGA C/- CCCTGCCGTT 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 C 4 3 93109 CASAVA_Build 16 2201331 1I ACCCAAGACC -/A GGGGGTTCCT 2030 het 2030 ref 19 7 8 4 A 0 1 93110 CASAVA_Build 16 2202927 4I AGTTAAAAAC ----/TGTT TGGTAGCAGC 3070 het 3070 hom 46 14 20 12 TGTT 0 1 93111 CASAVA_Build 16 2229021 1D GGGCCCTGCA G/- GGGCCCCCAG 1861 het 1609 hom 17 7 7 3 G 4 3 93112 CASAVA_Build 16 2231160 4I ATCTCAAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 42 het 15 0 14 1 AAAT 2 3 93113 CASAVA_Build 16 2239021 4D TTGTCATTCC TATT/---- TATTTATTTA 1063 het 1063 ref 14 4 6 4 TATT 5 4 93114 CASAVA_Build 16 2249126 1I AAAAAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1257 het 364 hom 10 2 4 4 A 17 18 93115 CASAVA_Build 16 2254883 2D AATAAGTGTC CA/-- CACAGTCAGG 3070 het 3070 ref 46 24 20 5 CA 3 2 93116 CASAVA_Build 16 2258172 1D GCGATGACGT A/- AACGCCTGGC 1682 het 1544 hom 16 7 6 3 A 3 2 93117 CASAVA_Build 16 2305577 1I CAGAGAAGAG -/T TGACTCTAAA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 T 1 2 93118 CASAVA_Build 16 2334216 5I TTTTTTTTTT -----/CCCCC GAGACGGTGT 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 C 0 5 93119 CASAVA_Build 16 2589745 15D ATCTCAGAAC GTCCTGTGTCTCCAT/--------------- GTAGGAGAGT 1989 het 1989 ref 28 21 5 7 GTCCTGTGTCTCCAT 1 0 93120 CASAVA_Build 16 2645105 1D ATCCTTTCCC A/- CAGGGGAAGT 1610 het 1610 ref 19 10 5 4 A 1 0 93121 CASAVA_Build 16 2646958 4I GTCAGGAGAG ----/TACA TACAGTCTGC 3070 het 3070 ref 45 27 14 4 TACA 1 2 93122 CASAVA_Build 16 2654802 4I TTTGATCTAG ----/ATAA ATAGTTAGTG 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 ATAA 0 1 93123 CASAVA_Build 16 2668200 19I CTCAGAACGT -------------------/AGGAGAGTGGCTCTCTCAG ATCTCTCAGG 2644 het 2644 ref 22 11 7 4 AGGAGAGTGGCTCTCTCAG 0 1 93124 CASAVA_Build 16 2670061 2D CAAAGCCTCT AC/-- TTGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 28 8 4 AC 1 0 93125 CASAVA_Build 16 2719828 1I TCTCTACTAA -/C AAAATACAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 0 1 93126 CASAVA_Build 16 2735469 1I ACCCCGCACA -/G CACAGATGGA 3070 hom 88 het 38 0 31 7 G 0 1 93127 CASAVA_Build 16 2761990 1D TCTTGGGGGT C/- CTCACTGCAC 3070 hom 67 het 27 0 17 10 C 2 1 93128 CASAVA_Build 16 2762856 3D GCTCTCTATG TTC/--- TTCTGTAAGT 3070 hom 148 het 56 0 50 7 TTC 2 1 93129 CASAVA_Build 16 2764823 1D AGCTTGGGCA G/- GGGTGGGGTA 3070 hom 95 het 34 0 30 5 G 4 3 93130 CASAVA_Build 16 2772421 1D CCTTATTTGT A/- AGAGTGTTTT 3070 hom 156 het 58 0 52 7 A 2 1 93131 CASAVA_Build 16 2819462 1I CCGCCTGCAC -/A AGGCCTCCCT 3070 hom 84 het 31 0 22 9 A 1 2 93132 CASAVA_Build 16 2824280 1D GAACTGGGAT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 46 het 30 1 25 4 G 10 9 93133 CASAVA_Build 16 2825691 5I AAAGGAAAGG -----/AAAGA AAAGAAAAGA 3070 hom 50 het 26 0 17 9 AAAGA 2 3 93134 CASAVA_Build 16 2833307 1I ACAAAAAAAA -/C CTTTATCATT 3070 hom 43 het 21 0 15 6 C 1 2 93135 CASAVA_Build 16 2834242 2I TATTTTAAGA --/CT CTGTAAATTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CT 1 2 93136 CASAVA_Build 16 2836419 1I AAGACCCCCC -/T CCCTTCCAGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 0 1 93137 CASAVA_Build 16 2840161 1I CCTAGCCTGT -/C CCTCAGGGCC 3070 hom 79 het 31 0 21 10 C 2 3 93138 CASAVA_Build 16 2841212 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 10 9 93139 CASAVA_Build 16 2841407 2I TGAAACCCCG --/TC TCTGTAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TC 1 2 93140 CASAVA_Build 16 2851918 26D CTCCCGAGTT CAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCC/-------------------------- CAAGCAATTC 3070 hom 33 het 19 0 11 10 CAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 2 1 93141 CASAVA_Build 16 2857263 1I TGGGACTACA -/G GCGCCCGCCA 1622 hom 12 het 6 0 4 2 G 1 2 93142 CASAVA_Build 16 2862841 1I TCTTCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 2401 het 2401 ref 33 9 9 15 A 13 14 93143 CASAVA_Build 16 2878001 4D GTGTCTGTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 TTTG 5 4 93144 CASAVA_Build 16 2879136 1D GTGTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 35 23 8 4 G 1 0 93145 CASAVA_Build 16 2880086 7D CTGTCTCTCA AAAAAAG/------- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 6 AAAAAAG 2 1 93146 CASAVA_Build 16 2880231 4D TTTGTTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 13 9 93147 CASAVA_Build 16 2883022 2I TTATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 455 hom 16 2 8 6 AC 7 8 93148 CASAVA_Build 16 2889271 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1695 het 1695 ref 31 13 8 10 T 17 18 93149 CASAVA_Build 16 2890845 1I GACAAAGGTG -/C CCCTGGGCCT 3070 het 2808 hom 24 10 13 1 C 3 4 93150 CASAVA_Build 16 2892123 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAATTGG 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 A 6 7 93151 CASAVA_Build 16 2893075 2D AAAAAATATA TG/-- TGTGTGTGTG 1725 het 1725 ref 16 7 6 3 TG 7 6 93152 CASAVA_Build 16 2898622 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1143 het 541 hom 17 5 5 7 A 18 17 93153 CASAVA_Build 16 2976630 14D GCTGCCCTCC GTGAATACACGGGG/-------------- GACATGCGCC 944 het 944 ref 19 12 4 7 GTGAATACACGGGG 1 0 93154 CASAVA_Build 16 3010710 1D AATTGGGGTT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 8 7 93155 CASAVA_Build 16 3018618 3D AGTGGGGATC ATT/--- ATAACCCGTA 3070 hom 30 het 14 0 9 5 ATT 1 0 93156 CASAVA_Build 16 3027589 1D CTTGTTGACC T/- TTTTTTTTTT 2729 hom 29 het 17 0 9 8 T 15 14 93157 CASAVA_Build 16 3041171 2D ACCAACAGGA TG/-- TGTGTGTGTG 838 het 838 ref 40 33 3 5 TG 7 6 93158 CASAVA_Build 16 3066716 1D GATTGGGGCA G/- GGGGGTGCTG 3070 hom 53 het 22 0 17 6 G 6 5 93159 CASAVA_Build 16 3068650 1I GGTTTCTGGA -/G ATGCTGTTCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 0 1 93160 CASAVA_Build 16 3147130 1I AAAATTTGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 8 9 93161 CASAVA_Build 16 3161477 1I CGCAAAACCA -/C CAGCGCCTGG 2811 het 2811 ref 34 21 8 5 C 1 2 93162 CASAVA_Build 16 3165483 1D TGCCGGCCTG T/- GGGGCGTCCG 1661 het 1167 hom 19 3 7 9 T 1 0 93163 CASAVA_Build 16 3169431 3D GTGACAGAGC GAG/--- ACTCATCTCA 3070 het 3070 hom 38 13 18 8 GAG 1 0 93164 CASAVA_Build 16 3181602 1D4M1D CTACCTTGGA GTTCTG/-TTCT- GAAACAGCCA 3070 het 3070 hom 29 10 14 8 N/A 0 0 93165 CASAVA_Build 16 3201532 1I TACAAAAAAA -/T AATCTGGGCG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 0 1 93166 CASAVA_Build 16 3207293 8D AATGAGTATC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1633 het 696 hom 20 3 6 11 T 24 16 93167 CASAVA_Build 16 3218042 2D AAACATAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 T 12 10 93168 CASAVA_Build 16 3219202 1I GTATCTGAGT -/G GGGGGTCCTG 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 G 5 6 93169 CASAVA_Build 16 3219865 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2116 het 1535 hom 16 7 6 4 A 12 11 93170 CASAVA_Build 16 3234156 1D AGGTGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 T 11 10 93171 CASAVA_Build 16 3237553 1D ATTTGGAGAT A/- AGAGTTCTTG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 2 1 93172 CASAVA_Build 16 3242053 2D CCCCATATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 29 0 22 7 A 15 13 93173 CASAVA_Build 16 3251511 1I AAGTTGGGGG -/A AAAAAACAGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 6 7 93174 CASAVA_Build 16 3259048 1I TGTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 10 11 93175 CASAVA_Build 16 3259792 5I ATAACAAGAC -----/TTTTT TTTCTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 3 8 93176 CASAVA_Build 16 3328540 5D TATAGGTACC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2075 het 703 hom 17 5 8 4 T 17 12 93177 CASAVA_Build 16 3330280 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 9 10 93178 CASAVA_Build 16 3334729 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2541 hom 15 7 8 1 A 10 9 93179 CASAVA_Build 16 3335487 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1476 hom 21 6 12 4 A 14 11 93180 CASAVA_Build 16 3337847 14D ATACACACAT GCACACGCACACAC/-------------- GCGCACACAC 3070 het 3070 ref 49 27 21 8 GCACACGCACACAC 1 0 93181 CASAVA_Build 16 3343992 1I TTCTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 2794 het 761 hom 16 4 7 5 C 0 1 93182 CASAVA_Build 16 3355601 2I ACCCTGAGAG --/AT GTTACAGACA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 AT 0 1 93183 CASAVA_Build 16 3356853 4D AAAGTGGGTA TTAT/---- TTATTTATTA 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 TTAT 3 2 93184 CASAVA_Build 16 3361766 1I GCCTGTAGGC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3049 hom 17 7 9 1 T 7 8 93185 CASAVA_Build 16 3362347 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1729 hom 23 4 12 7 T 10 9 93186 CASAVA_Build 16 3369527 1I GGTAGAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 A 9 10 93187 CASAVA_Build 16 3370126 2D AGGCAATCAC AT/-- GTTTCCGGAA 3070 het 3070 hom 36 9 23 5 AT 1 0 93188 CASAVA_Build 16 3400165 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 A 12 13 93189 CASAVA_Build 16 3406398 1D ACAGGCATGC T/- GCCACCATGC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 1 0 93190 CASAVA_Build 16 3413577 1I ATATTTTGTT -/A ACTTATTTCT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 1 2 93191 CASAVA_Build 16 3415569 1D ATGCCAACCC T/- TGTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 2 1 93192 CASAVA_Build 16 3416975 1I AGAAGCCTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 51 19 21 11 T 9 10 93193 CASAVA_Build 16 3418816 1D GAAATGAAAC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 9 8 93194 CASAVA_Build 16 3421319 1I TAAAAGACGA -/T CTCCTGTAGG 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 T 0 1 93195 CASAVA_Build 16 3423593 2I AAGGCTAGTA --/TC TCTGAGTTAA 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 TC 1 2 93196 CASAVA_Build 16 3423979 1D AGAAAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 A 11 10 93197 CASAVA_Build 16 3424575 2I AGAATGACAA --/AG AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 AG 4 5 93198 CASAVA_Build 16 3427745 3I TCCAAAGGTA ---/AGG AGGAGAGAAT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 AGG 1 2 93199 CASAVA_Build 16 3432326 1D GAGCCGAGGT G/- GGAGGATAGC 2992 het 2992 ref 23 14 7 2 G 3 2 93200 CASAVA_Build 16 3444529 1D CAAAAAGCTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 14 13 9 A 9 8 93201 CASAVA_Build 16 3451052 4I TACAGGAGTG ----/AGAT AGTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 43 27 12 4 AGAT 0 1 93202 CASAVA_Build 16 3460673 1D CAGTGGGGTT G/- GGGGGGGCCG 1222 het 1222 ref 23 5 5 13 G 8 7 93203 CASAVA_Build 16 3460980 3I TTTTTAAATC ---/AAG GAGTGTAAAG 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 AAG 0 1 93204 CASAVA_Build 16 3463013 5D CTTTGTCATC TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 51 16 30 6 TGTTT 5 4 93205 CASAVA_Build 16 3477309 3I AGGCAGGAGA ---/ATC GCTTGAACCC 3070 het 2298 hom 23 6 15 2 ATC 0 1 93206 CASAVA_Build 16 3478567 4I GAGATGGAAT ----/CTCA CTCATTCTGT 626 het 626 ref 13 5 3 5 CTCA 1 2 93207 CASAVA_Build 16 3482747 2I CCTGGGCAAC --/AT AGCAGGACCC 3070 het 2259 hom 20 6 12 2 AT 0 1 93208 CASAVA_Build 16 3542229 1D TCTGCTTCAA G/- GGCATCTGCC 3070 hom 84 het 36 0 27 10 G 3 2 93209 CASAVA_Build 16 3637265 2D AATCATGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 1403 het 1403 ref 31 16 4 12 T 20 18 93210 CASAVA_Build 16 3648284 1D CACCTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 268 hom 29 1 21 7 T 13 12 93211 CASAVA_Build 16 3650957 1D GCTACATTGT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 72 het 29 0 25 5 G 8 7 93212 CASAVA_Build 16 3663586 3D TGCGGGGAGA TCT/--- TATTAAAATG 3070 hom 67 het 25 0 20 5 TCT 1 0 93213 CASAVA_Build 16 3663877 1D ACGGAGAGGC A/- AGACCACAGG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 2 1 93214 CASAVA_Build 16 3683405 10D AAAAAAAAAA ATCCCGGGAC/---------- ATTTCTTCTG 3070 hom 39 het 23 0 13 11 ATCCCGGGAC 1 0 93215 CASAVA_Build 16 3684353 1D TATCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2775 hom 40 9 22 9 T 11 10 93216 CASAVA_Build 16 3689485 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 4 5 93217 CASAVA_Build 16 3694017 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 13 2 9 2 A 12 11 93218 CASAVA_Build 16 3706637 1D TTTTTAGAAT A/- AAAAATACTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 6 5 93219 CASAVA_Build 16 3716415 13D AACGCTGAGC CGCCCACCTCAGT/------------- CGCCCACCTC 3070 hom 39 het 16 0 11 5 CGCCCACCTCAGT 2 1 93220 CASAVA_Build 16 3744541 4I AGGGTTGCTA ----/AAGT TAGTACCATG 3070 het 3070 hom 48 23 24 1 AAGT 0 1 93221 CASAVA_Build 16 3759878 1I CTCAATGGAA -/T TTTTTTTTTT 992 het 992 ref 29 15 3 11 T 13 14 93222 CASAVA_Build 16 3765924 1D GATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 451 hom 31 2 27 2 T 12 11 93223 CASAVA_Build 16 3787778 1I CCTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 13 14 93224 CASAVA_Build 16 3839230 4I TCTCTGTGCT ----/CCTC CCTGTCAGTC 3070 hom 98 het 38 0 30 8 CCTC 0 1 93225 CASAVA_Build 16 3869033 5I CTACATTCCT -----/TAACA TAATTCTTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TAACA 0 1 93226 CASAVA_Build 16 3874155 1D TAAAAAAAAA G/- AAAAGAAAAG 2911 het 1753 hom 26 7 14 5 G 1 0 93227 CASAVA_Build 16 3897207 1D GACCCCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 11 10 93228 CASAVA_Build 16 3898001 2D AAAGGCCCCT CC/-- CCCCCCCCCT 3070 het 126 hom 28 2 12 14 C 11 9 93229 CASAVA_Build 16 3898144 1D TAGCTGGGAC T/- TACAGGCGCC 1538 hom 18 het 8 0 6 2 T 2 1 93230 CASAVA_Build 16 3911348 1D TACCACTCTT G/- GGGGTCTAGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 G 5 4 93231 CASAVA_Build 16 3912905 4I ATTGAGGGTG ----/AGGC AGGCAGGGAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 AGGC 1 2 93232 CASAVA_Build 16 3918336 1D ATCCCAGCAC T/- TTTGGGAGGC 3070 hom 43 het 18 0 13 5 T 4 3 93233 CASAVA_Build 16 3919721 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1470 het 94 hom 25 1 13 13 A 11 10 93234 CASAVA_Build 16 3922882 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2360 het 1397 hom 10 3 6 1 T 7 6 93235 CASAVA_Build 16 3935336 2I CAGGTTACTT --/TC TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 TC 0 1 93236 CASAVA_Build 16 3942348 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 15 10 4 T 9 10 93237 CASAVA_Build 16 3945875 1D TTTAAAGCTT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 A 8 7 93238 CASAVA_Build 16 3951009 1D TTCCCACAGT G/- GGGGAAAAGC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 G 5 4 93239 CASAVA_Build 16 3952040 1I TAAATAAAAA -/T TTAAAAAAAA 2163 het 1129 hom 12 4 6 2 T 2 3 93240 CASAVA_Build 16 3962237 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2368 het 1515 hom 18 5 7 6 T 13 12 93241 CASAVA_Build 16 3969973 2I GTGGTCTCTG --/CT CTGTTTGGGG 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 CT 1 2 93242 CASAVA_Build 16 3971537 2D CTAAAAATCA CT/-- GAGTTGTCCA 3070 het 3070 hom 51 20 25 7 CT 1 0 93243 CASAVA_Build 16 3975985 2I TCCCCATGGG --/CT CGAAACCCAG 3070 hom 60 het 21 0 18 3 CT 0 1 93244 CASAVA_Build 16 3979361 2I AGCACACATC --/AT ATCAGAACCT 3070 hom 81 het 28 0 26 2 AT 1 2 93245 CASAVA_Build 16 3980468 2D ACTATGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 41 0 32 10 A 15 13 93246 CASAVA_Build 16 3980775 3D AGAAGCGACA CTG/--- CTATTAGCTG 3070 hom 117 het 41 0 36 6 CTG 1 0 93247 CASAVA_Build 16 3985606 1D AAGAAATATA T/- TTTTTTTTTT 1319 het 1319 ref 32 22 4 6 T 15 14 93248 CASAVA_Build 16 3993519 1I ACTGAAGAGG -/A AAAACTCTCA 3070 het 3057 hom 26 8 12 6 A 4 5 93249 CASAVA_Build 16 3996280 1D CACATGACTA C/- CTGGTCCAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 C 2 1 93250 CASAVA_Build 16 4003262 2I AAAAAAAAAG --/AA AAAAAGAAAA 2131 hom 24 het 10 0 9 1 A 5 7 93251 CASAVA_Build 16 4022514 1I TATCACACAA -/T TTTTTTTTTT 1796 het 1796 ref 25 7 9 9 T 15 16 93252 CASAVA_Build 16 4039083 1I AGGACACTAC -/T TAAGAGCAAG 3070 het 3070 hom 43 13 19 11 T 1 2 93253 CASAVA_Build 16 4043697 1D GGCACGGGGA C/- CCGATTGCAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 3 2 93254 CASAVA_Build 16 4060252 1D ATCGTTATAA T/- TTTCACGCAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 4 3 93255 CASAVA_Build 16 4061164 1D ATATCCCATC T/- CTCCTAAAAA 2329 het 2329 ref 24 12 7 5 T 1 0 93256 CASAVA_Build 16 4061812 1I CACGAATTCT -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 61 het 25 0 20 5 G 3 4 93257 CASAVA_Build 16 4065178 2I GACCTGTTAC --/TA TATATATATA 3070 het 2692 hom 22 7 10 5 TA 5 6 93258 CASAVA_Build 16 4065847 3I GATACCTGGC ---/TAA TGAGAGTATC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 TAA 0 1 93259 CASAVA_Build 16 4079121 1I17M16I TGAGACAGAG -ATTGCTCTGTCACCCAG----------------/TTTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC GCAATCTCAG 3070 het 3070 hom 27 12 12 7 N/A 0 0 93260 CASAVA_Build 16 4085202 1I CAGGGTTTCG -/C GACGTTGGCC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 0 1 93261 CASAVA_Build 16 4095060 1D AACAAGAGGG A/- AAAAAATCCA 3070 het 227 hom 18 1 14 3 A 7 6 93262 CASAVA_Build 16 4101272 1D ACCCAGTATT G/- GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 G 4 3 93263 CASAVA_Build 16 4101822 1D TTTGAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 1753 het 1753 ref 42 23 4 15 A 13 12 93264 CASAVA_Build 16 4124998 10D GGTGCGTGGA TCACCTGAGG/---------- TCAGGAGCTC 3070 het 3070 hom 30 12 13 7 TCACCTGAGG 1 0 93265 CASAVA_Build 16 4132793 1D CTCCGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 1875 het 1875 ref 27 16 6 5 A 13 12 93266 CASAVA_Build 16 4166265 1D TCAGCGGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 968 hom 32 6 14 13 A 12 11 93267 CASAVA_Build 16 4177312 1I CTCCCCCAAA -/C CCCACTTATT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 3 4 93268 CASAVA_Build 16 4194405 4D CCAGCCTCCA AGAT/---- AGATACAGCC 1443 hom 34 het 16 0 10 8 AGAT 2 1 93269 CASAVA_Build 16 4195571 1D GGTCTCTGCT G/- GGGGGAGTGA 3070 hom 61 het 26 0 20 6 G 6 5 93270 CASAVA_Build 16 4196757 1D GACTCTCCCT C/- CCCCTGATGT 3070 hom 63 het 31 0 23 8 C 5 4 93271 CASAVA_Build 16 4201165 1D CATCATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2865 hom 37 11 17 9 A 13 12 93272 CASAVA_Build 16 4201315 1D CTCCCACGTT G/- GGGGGGGTCT 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 G 8 7 93273 CASAVA_Build 16 4213391 1I CCTTTTTTTT -/A ATTTTAAGAT 2932 het 2932 ref 23 11 9 3 A 1 2 93274 CASAVA_Build 16 4215160 1I TTGAGGTGAT -/A AAAAAATGTT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 6 7 93275 CASAVA_Build 16 4217059 8I GATGAATGGA --------/TGGATGGG TGGATGGATG 3070 hom 144 het 57 0 45 12 TGGATGGG 0 1 93276 CASAVA_Build 16 4217073 3D TGGATGGATG GAT/--- GATGGATGGA 1373 het 1373 ref 59 29 13 17 GAT 2 1 93277 CASAVA_Build 16 4218223 2I GGTGGATCAC --/CT GAGGTCAGGA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CT 0 1 93278 CASAVA_Build 16 4251287 1D CACGGTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 17 2 13 2 T 13 12 93279 CASAVA_Build 16 4300747 1I CTGGGTGACA -/G AGCAAGACTC 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 G 0 1 93280 CASAVA_Build 16 4360819 1I AGCCTTCAGG -/C CCCCCCAAAG 3070 hom 50 het 19 0 16 3 C 6 7 93281 CASAVA_Build 16 4373609 1D GGAGCCAGGG C/- CCCTCAGCAG 3070 het 2722 hom 28 10 12 7 C 4 3 93282 CASAVA_Build 16 4386083 1I GCCATAATAA -/T TTTTTTTTTT 2851 het 2851 ref 28 10 13 5 T 10 11 93283 CASAVA_Build 16 4418099 11D GACTACAGGC GCCCGCCACCA/----------- CGCCCAGCTA 2993 het 208 hom 8 1 7 1 GCCCGCCACCA 1 0 93284 CASAVA_Build 16 4421586 1D GTTGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1153 hom 24 5 12 7 T 12 11 93285 CASAVA_Build 16 4422340 10D TTTCTTTCTT TTTTTTTTTC/---------- TTTTTTTTTT 828 het 828 ref 22 10 5 7 TTTTTTTTTC 1 0 93286 CASAVA_Build 16 4447680 1D GAAATACTGA T/- TGCCTGCCTA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 2 1 93287 CASAVA_Build 16 4467923 5D ACCCTGTCTC AAAAA/----- AGAAAAAAAT 3070 het 2710 hom 21 7 12 5 A 6 1 93288 CASAVA_Build 16 4478828 1D TGTACATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 924 hom 26 5 10 11 T 17 16 93289 CASAVA_Build 16 4507753 1I AAAAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 2887 het 1601 hom 18 10 7 1 C 0 1 93290 CASAVA_Build 16 4523700 1I ACTATCTCAT -/C CCCCCCACCC 3070 het 2698 hom 28 9 11 8 C 6 7 93291 CASAVA_Build 16 4524227 1I TGCTGGGAAT -/A ACAGCCATGA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 1 2 93292 CASAVA_Build 16 4525885 1D GGCTTGGAGA C/- TCCTGACTAG 3070 het 3070 hom 45 20 19 7 C 1 0 93293 CASAVA_Build 16 4536999 1I CGATATATTG -/C CCTGGCAGGT 3070 hom 84 het 34 0 27 7 C 2 3 93294 CASAVA_Build 16 4540089 1D CAGTGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 2934 het 2652 hom 26 12 11 3 T 17 16 93295 CASAVA_Build 16 4541671 1I TAGCCAGGAT -/G GTCTCCATCT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 1 2 93296 CASAVA_Build 16 4545332 1I GGAACACTGT -/G GGGGGGCCTT 1835 het 1835 ref 16 6 4 6 G 6 7 93297 CASAVA_Build 16 4549553 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 12 13 93298 CASAVA_Build 16 4561727 1D TGGGGGTTGG A/- GCAATGAGGA 3070 hom 106 het 45 0 34 11 A 1 0 93299 CASAVA_Build 16 4587096 1I TTGGGGAGCA -/C CATTCAACAC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 C 1 2 93300 CASAVA_Build 16 4612525 3I TGGTCTTGAA ---/CTC CTGACCTTGG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CTC 0 1 93301 CASAVA_Build 16 4621905 3I TAGCTTCTCA ---/GTT GTTGTTTTTT 3070 hom 42 het 24 0 15 9 GTT 2 3 93302 CASAVA_Build 16 4622208 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 het 23 hom 14 1 11 2 G 3 4 93303 CASAVA_Build 16 4632983 2I GTTTTGAGAC --/AG AGTCCCACTC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 AG 1 2 93304 CASAVA_Build 16 4648544 1I TCTCAGAAAA -/G AAAAAAAACA 3070 het 1699 hom 24 5 10 9 G 0 1 93305 CASAVA_Build 16 4650781 2D GTGTGGACTC AG/-- TGGAGTGGGC 3070 het 3070 ref 29 12 10 9 AG 1 0 93306 CASAVA_Build 16 4668290 2I AGCAACACAA --/GG GGGAGGTGGA 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 G 3 5 93307 CASAVA_Build 16 4676082 11D CGCGTTGAAT TCTGGCTGCGC/----------- TCTGCCTCCC 3070 het 3070 ref 31 12 12 8 TCTGGCTGCGC 1 0 93308 CASAVA_Build 16 4677210 1I CATCCCCCAT -/C CCCCCCCAAG 2377 het 2377 ref 18 7 7 4 C 7 8 93309 CASAVA_Build 16 4679770 1D TTCTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1669 het 1669 ref 23 7 7 9 T 15 14 93310 CASAVA_Build 16 4689862 1I TTTCATTTCA -/G TTTACTTTTC 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 G 0 1 93311 CASAVA_Build 16 4693879 2D GGCTTCAGAC AT/-- GTATGATTTT 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 AT 1 0 93312 CASAVA_Build 16 4698123 2D TCTGAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2752 hom 20 9 10 2 AT 7 6 93313 CASAVA_Build 16 4716327 1I AAAAAGCAAG -/A AAAATGGAAG 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 4 5 93314 CASAVA_Build 16 4726307 2I GTACACACAC --/AG AGTGCCTGGC 2455 het 2455 ref 32 16 9 7 AG 1 2 93315 CASAVA_Build 16 4733513 2I CACCTTCTGT --/GC GCGCAGTCAG 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 GC 2 3 93316 CASAVA_Build 16 4734637 4I TCACTCCTAC ----/TTCA TTCACCAAGC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 TTCA 1 2 93317 CASAVA_Build 16 4737796 1D GCTCAGTCAC A/- GGTGCATGAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 1 0 93318 CASAVA_Build 16 4748913 1D AAAATAGGAG A/- AAATATTTCC 3070 het 3070 hom 23 11 12 2 A 4 3 93319 CASAVA_Build 16 4749102 1D TCCCAGCTAC T/- TTGGGAGGCT 3070 hom 61 het 22 0 21 2 T 3 2 93320 CASAVA_Build 16 4753422 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2156 hom 27 9 16 2 A 10 9 93321 CASAVA_Build 16 4753739 2I CCCCAAACAC --/TG TGAAGCTGTG 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 TG 1 2 93322 CASAVA_Build 16 4776157 1I TTTTAGGCAG -/T TTTTTCTCTA 2876 het 2876 ref 27 14 8 5 T 5 6 93323 CASAVA_Build 16 4788809 2D GGGACCTGTT AA/-- AGACAGGTAG 3070 het 2032 hom 30 7 16 8 A 3 1 93324 CASAVA_Build 16 4805270 1I CCATGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 27 16 6 5 T 13 14 93325 CASAVA_Build 16 4855701 1I TGGTGGCTCA -/C GCCTGTAATC 1384 het 1384 ref 19 12 4 3 C 0 1 93326 CASAVA_Build 16 4879234 1D CAGTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 1244 hom 22 het 12 0 7 5 G 1 0 93327 CASAVA_Build 16 4889691 1I AAACCCTTAC -/G GGAACTGACA 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 G 2 3 93328 CASAVA_Build 16 4898718 1I ATTTTTCATA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 2742 hom 27 7 14 6 T 6 7 93329 CASAVA_Build 16 4911890 2D GCCAGGACAG CA/-- CACAGTCCTC 3070 hom 36 het 20 0 12 8 CA 3 2 93330 CASAVA_Build 16 4912791 2I TCACGCTGAT --/TC CCTGGTGCAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TC 0 1 93331 CASAVA_Build 16 4922201 1D GCATGGCAGG C/- CCGCTGTCAG 3070 hom 114 het 43 0 37 6 C 3 2 93332 CASAVA_Build 16 4937530 2D CAGTCGGCAC AG/-- AGTCACCGTC 3070 hom 93 het 37 0 30 9 AG 2 1 93333 CASAVA_Build 16 4963405 37D CATGTCAGGG CTTCCGGAACAGTGTCAGCCTGGTTCTGCCAGGCCCA/------------------------------------- CTTCCCTTCA 3070 hom 125 het 40 0 40 8 CTTCCGGAACAGTGTCAGCCTGGTTCTGCCAGGCCCA 1 0 93334 CASAVA_Build 16 4964607 1D GGGGTACAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 10 9 93335 CASAVA_Build 16 4969734 3I TCTTGCTCCT ---/GTG GTCATTTTCC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 GTG 0 1 93336 CASAVA_Build 16 4971086 1I AAAGAGTGCA -/G GGTTTATTCT 3070 hom 54 het 22 0 17 5 G 2 3 93337 CASAVA_Build 16 4980172 1D TATTTTATTA T/- TTTTTTTTTG 1502 het 1502 ref 16 7 4 5 T 10 9 93338 CASAVA_Build 16 4988740 17D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 2672 hom 21 het 7 0 7 2 A 29 12 93339 CASAVA_Build 16 5002766 10I AATTAGCCGG ----------/GTGTGGTGGC GCATGCCTAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 GTGTGGTGGC 0 1 93340 CASAVA_Build 16 5003389 4D AGGGGGTCTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TTTA 3 2 93341 CASAVA_Build 16 5028414 1I TTGGGGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 27 1 18 8 T 13 14 93342 CASAVA_Build 16 5028807 4I CAAATGCCAA ----/TCAG TCAATGAGTG 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TCAG 0 1 93343 CASAVA_Build 16 5034002 1D TCTATTAATT A/- AAAAAAAAAA 2435 het 1798 hom 23 11 7 5 A 15 14 93344 CASAVA_Build 16 5036486 1I TCCAGGTAGC -/T GGGATTACAG 3070 het 2241 hom 14 5 7 2 T 0 1 93345 CASAVA_Build 16 5047031 1D CACGAGGTCC G/- GAATTCAAGA 1205 het 1205 ref 17 6 4 7 G 2 1 93346 CASAVA_Build 16 5052644 1D TTGGAACAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 A 9 8 93347 CASAVA_Build 16 5062074 4I GTGGCCAAGG ----/GTCT GTCTGGGAGG 2637 het 1778 hom 25 9 8 8 GTCT 1 2 93348 CASAVA_Build 16 5062193 1I TTAGACGAGC -/G GGTTCTGCCC 3070 hom 69 het 28 0 22 6 G 2 3 93349 CASAVA_Build 16 5072336 1I ACACAACAAC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 7 8 93350 CASAVA_Build 16 5074900 2I GGCCAGAGGC --/TA TAAAACCCCA 2705 het 2705 ref 29 15 10 4 TA 1 2 93351 CASAVA_Build 16 5078263 1D GCGAGGTTGT G/- GGGGGACTCT 3070 hom 41 het 16 0 14 2 G 6 5 93352 CASAVA_Build 16 5086590 3I TTAATAAGAA ---/AAC AACAGCACAG 1608 het 1608 ref 39 27 4 8 AAC 1 2 93353 CASAVA_Build 16 5090579 1D ACTGAAGGGA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 45 het 19 0 16 4 T 8 7 93354 CASAVA_Build 16 5091014 4I CAGGACAAGC ----/TGAG TGGTTTCAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TGAG 0 1 93355 CASAVA_Build 16 5092287 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 7 8 93356 CASAVA_Build 16 5099941 4I TTATTTTTTA ----/TTAT TTGTTTATTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 TTAT 0 1 93357 CASAVA_Build 16 5102581 3D GTTTTTGTTC TTT/--- TTTTTTTGTT 3070 het 2180 hom 23 7 11 5 T 10 7 93358 CASAVA_Build 16 5115687 4I ACCACCATGC ----/CTAG CTAATTTTTG 2838 het 2838 ref 31 21 6 4 CTAG 0 1 93359 CASAVA_Build 16 5115963 2D CAATCCCTCG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 32 14 12 7 GA 7 6 93360 CASAVA_Build 16 5116050 5D TGCACAGCAC AACCT/----- GTGGCCAGCC 3070 het 3070 hom 22 10 11 6 AACCT 1 0 93361 CASAVA_Build 16 5123279 1I GCTATAGAAA -/T GAGGCTTCTC 2862 het 2862 ref 48 38 7 3 T 0 1 93362 CASAVA_Build 16 5123726 1D TGTTAGTTCG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 9 8 93363 CASAVA_Build 16 5124272 4D AGAGGAGGAA ACCC/---- ACCCAGACAG 3070 hom 45 het 17 0 15 3 ACCC 2 1 93364 CASAVA_Build 16 5125254 10I TTAGTTTCAT ----------/TCATGTTAAA TCTATTAACT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TCATGTTAAA 0 1 93365 CASAVA_Build 16 5126065 1D AATCTCCTGA T/- CTCGTGATGT 2069 hom 15 het 6 0 5 1 T 1 0 93366 CASAVA_Build 16 5129386 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AGAAAGAAAG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 A 5 1 93367 CASAVA_Build 16 5134994 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 12 11 93368 CASAVA_Build 16 5135338 11D AGAAGAGCCG TGGGGTGATTC/----------- TGTAATTTTA 2902 het 2902 ref 25 16 8 3 TGGGGTGATTC 1 0 93369 CASAVA_Build 16 5140578 1I AACTAAAAAG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 7 8 93370 CASAVA_Build 16 5142056 1D TAAAACTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 30 2 20 8 T 15 14 93371 CASAVA_Build 16 5143529 1I TTTTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 0 1 93372 CASAVA_Build 16 5144709 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 10 11 93373 CASAVA_Build 16 5152419 4D TTACTTATTT TTTG/---- TTTGTCTCCC 3070 hom 54 het 22 0 17 5 TTTG 2 1 93374 CASAVA_Build 16 5158581 16D TATATCATTC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 15 0 12 6 T 28 12 93375 CASAVA_Build 16 5162406 1D CATGGAGAAA C/- CCCGTCTCTA 3070 hom 69 het 25 0 23 3 C 4 3 93376 CASAVA_Build 16 5163243 1D GGGTTGGGGT G/- GGGTGGTCAT 3070 hom 116 het 43 0 38 5 G 4 3 93377 CASAVA_Build 16 5164840 1I AAATGATCCA -/T TATGCTCTTC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 1 2 93378 CASAVA_Build 16 5168628 1I ACACTCCCGG -/A GTGGCCATTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 1 93379 CASAVA_Build 16 5168890 2I GTTCAAACAC --/AT GTTTTACAAT 3070 het 145 hom 47 1 42 5 AT 0 1 93380 CASAVA_Build 16 5171389 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 7 93381 CASAVA_Build 16 5172426 1D AAATGTGGCC T/- TATTCATACA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 T 2 1 93382 CASAVA_Build 16 5177301 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 979 hom 10 het 7 0 4 3 T 9 8 93383 CASAVA_Build 16 5178082 11D ACTCCATACC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2231 het 1733 hom 19 8 8 9 A 25 14 93384 CASAVA_Build 16 5191708 1I AGTAGTAGTA -/T TTTTTTTTTT 2142 hom 15 het 7 0 6 1 T 11 12 93385 CASAVA_Build 16 5218766 4D GGAGAGAGAG AGAA/---- AGGGAGGGAG 3070 hom 82 het 30 0 26 6 AGAA 1 0 93386 CASAVA_Build 16 5220155 2D AATTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 18 0 15 6 T 11 9 93387 CASAVA_Build 16 5221287 8D CCTTCCCCTG CTCCCCAT/-------- CTCTCTATCT 3070 hom 81 het 28 0 28 2 CTCCCCAT 1 0 93388 CASAVA_Build 16 5224590 2I CTAAATGGCT --/AA AAGTTTTCAA 3070 hom 62 het 22 0 18 4 A 2 4 93389 CASAVA_Build 16 5235788 1D ACTATACATT G/- GAAAAGTCAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 2 1 93390 CASAVA_Build 16 5241130 1D TGCTAACGGT C/- CCCCCAGCCC 3070 hom 54 het 21 0 16 5 C 6 5 93391 CASAVA_Build 16 5241775 1I TGTAGCTGCA -/T ACATGTGTCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 1 93392 CASAVA_Build 16 5256047 1I CAGGCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 10 11 93393 CASAVA_Build 16 5267480 1D ATAAATTGTT A/- ATAGTCACTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 2 1 93394 CASAVA_Build 16 5270956 3I GCTATGTTAT ---/TTA TTATTTTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TTA 1 2 93395 CASAVA_Build 16 5275368 1I GTTTTCCTGA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 7 8 93396 CASAVA_Build 16 5286087 1D GGGTTCCCCC T/- GAGCTTCTCC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 1 0 93397 CASAVA_Build 16 5294836 1I TATAAAGTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 7 8 93398 CASAVA_Build 16 5296085 1D CACTGGGAGT C/- CCAGCTACTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 C 3 2 93399 CASAVA_Build 16 5296326 1I TCTAGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 31 1 18 12 T 13 14 93400 CASAVA_Build 16 5298349 1D AAGAACAAAG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 29 het 24 1 20 3 A 8 7 93401 CASAVA_Build 16 5298755 1D TATGTGTTAC A/- TTTTTTTTCA 3070 hom 91 het 34 0 31 3 A 1 0 93402 CASAVA_Build 16 5308591 4D TATACCAAAA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 37 8 AAAC 2 1 93403 CASAVA_Build 16 5320986 1D TCTCTGGTGG T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 126 het 47 0 42 7 T 7 6 93404 CASAVA_Build 16 5323193 4I CCATCTCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAAC 2 3 93405 CASAVA_Build 16 5323448 1D CCTGGCCCTT A/- ATAGGAAGAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 2 1 93406 CASAVA_Build 16 5325205 4D AAAAATTGGG TTCT/---- TTATCTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 TTCT 1 0 93407 CASAVA_Build 16 5339624 1I TCAGTGAGCC -/T AGACCATGCC 3070 hom 53 het 27 0 17 10 T 0 1 93408 CASAVA_Build 16 5344082 1I CCAGTCTCCA -/C CCGGCCCCTT 3070 hom 85 het 34 0 28 6 C 2 3 93409 CASAVA_Build 16 5345011 4D ATGTGTATAT GAGA/---- GAGAGAGAGG 3070 hom 96 het 34 0 31 3 GA 6 4 93410 CASAVA_Build 16 5354781 1I CTGTGAGGCA -/G GGTGCTGCTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 2 3 93411 CASAVA_Build 16 5361766 18D GTCCCTGGGC TGCACCTTGGCCCTGGGT/------------------ TGCACCTTGG 3070 het 2734 hom 27 10 12 9 TGCACCTTGGCCCTGGGT 1 0 93412 CASAVA_Build 16 5362454 4D TGGTCATGAA AAAT/---- AAATAAGTAA 3070 hom 138 het 49 0 46 3 AAAT 2 1 93413 CASAVA_Build 16 5366910 29D GCCCCTGTTG CCTGCGTTGGCAGTCTCTTCATAGCACAC/----------------------------- CCTGCACTGG 3070 hom 97 het 35 0 29 12 CCTGCGTTGGCAGTCTCTTCATAGCACAC 1 0 93414 CASAVA_Build 16 5367563 5I GAGGGAAAGG -----/AAGGA AAGGAAAGGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AAGGA 2 3 93415 CASAVA_Build 16 5372395 1D CATTTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 874 hom 45 2 30 13 T 12 11 93416 CASAVA_Build 16 5376108 2D AGTTTGCAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 24 0 19 5 T 14 12 93417 CASAVA_Build 16 5391976 2D GAAACAAAAG AC/-- ACACAATGAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AC 3 2 93418 CASAVA_Build 16 5400374 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 36 1 28 9 A 13 11 93419 CASAVA_Build 16 5400786 1I CCTTTCTGAC -/T TTTAAAATTC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 3 4 93420 CASAVA_Build 16 5410883 1I CTCCCTCCCT -/C CCCCCTCCTC 3070 hom 18 het 13 0 10 3 C 5 6 93421 CASAVA_Build 16 5422339 1I GCTAACCAAA -/T TTAGTCATCG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 2 3 93422 CASAVA_Build 16 5424908 1D AAGGTAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 41 0 36 5 A 11 10 93423 CASAVA_Build 16 5429035 1D AGAGAATAAT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 4 hom 26 1 15 10 G 11 10 93424 CASAVA_Build 16 5434096 15I TATTGGCAAA ---------------/AACACTGACGTTAAT GGTGACACTG 3070 hom 108 het 36 0 37 2 AACACTGACGTTAAT 0 1 93425 CASAVA_Build 16 5444757 1D TTTTCTTTTC T/- TTTCTTTCTT 726 het 726 ref 21 7 9 6 T 4 3 93426 CASAVA_Build 16 5454633 1D CCAGACTGTA G/- GGCGCCACGA 3070 hom 96 het 36 0 30 6 G 3 2 93427 CASAVA_Build 16 5500506 3I CCACCAAGTT ---/TTA TTGGCCAAAG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 TTA 0 1 93428 CASAVA_Build 16 5502437 2D TCTCTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 41 15 17 9 TC 6 5 93429 CASAVA_Build 16 5508357 1D CAAAGTGACA T/- TTTTTTTGAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 7 93430 CASAVA_Build 16 5511527 1I TATCTGTAAA -/C CTATTGCCTT 3070 hom 101 het 41 0 29 12 C 1 2 93431 CASAVA_Build 16 5511662 1I TGCCTCTAGG -/T TTTGTAAGCA 3070 het 3070 ref 55 27 20 8 T 3 4 93432 CASAVA_Build 16 5512994 1I AAAGTGCTGC -/A AAAATCATGG 3070 hom 108 het 49 0 37 12 A 4 5 93433 CASAVA_Build 16 5519574 2I CATTTATGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 12 14 93434 CASAVA_Build 16 5521129 5D CTCTATCTCA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 68 het 30 0 21 11 AAAAT 3 2 93435 CASAVA_Build 16 5521659 1D AGCATTGCCA T/- GAGGATTAAA 3070 hom 160 het 55 0 54 1 T 1 0 93436 CASAVA_Build 16 5521805 3D TCAAGAGGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1382 het 557 hom 31 8 4 19 T 17 14 93437 CASAVA_Build 16 5528420 1D AACTACTGTT C/- AGGGAGGTCA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 1 0 93438 CASAVA_Build 16 5528622 1D TTATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 943 hom 34 3 23 8 T 15 14 93439 CASAVA_Build 16 5528944 1D AACTGCTGGG A/- GAGGGTTCAG 3070 hom 99 het 37 0 31 6 A 1 0 93440 CASAVA_Build 16 5532247 4D CAGGTATTGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2655 het 18 hom 19 1 10 8 T 22 18 93441 CASAVA_Build 16 5535302 4I AACAAATATT ----/TAGG AAAGAAATAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TAGG 0 1 93442 CASAVA_Build 16 5542847 1D TGGGAAACGA G/- GGAAAAGGGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 3 2 93443 CASAVA_Build 16 5543672 32D TAGAATGTTC TATATATGTGTGTATATACACATATATATGTA/-------------------------------- TATATATGTG 3070 hom 30 het 24 0 11 16 TATATATGTGTGTATATACACATATATATGTA 2 1 93444 CASAVA_Build 16 5547407 1D GGCATTGGGT C/- CCCATATGAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 4 3 93445 CASAVA_Build 16 5549909 1I GAGATCCTTT -/C ATTCTTCCTC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 C 0 1 93446 CASAVA_Build 16 5567978 2D CTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCTCTC 3070 hom 105 het 40 0 36 6 AG 2 1 93447 CASAVA_Build 16 5600695 1I TCAGAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 10 93448 CASAVA_Build 16 5606687 1D CCTTTATCTT C/- CGCCCCCTGA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 C 2 1 93449 CASAVA_Build 16 5608332 6D TGGCTGCAGA TTTTTT/------ TTTTTTGTGT 968 het 23 hom 20 1 9 13 T 12 6 93450 CASAVA_Build 16 5619111 3I ATGCTGTAAA ---/AAG AAGAAGAAGC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 AAG 3 4 93451 CASAVA_Build 16 5622237 1I TGTCATGAGA -/C CAACTAGCCA 3070 het 3070 hom 58 23 26 9 C 1 2 93452 CASAVA_Build 16 5626554 1D GTCAGGGTTG T/- CATGTTTTTC 3070 hom 85 het 37 0 27 10 T 1 0 93453 CASAVA_Build 16 5630836 4D CACATACATG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 241 het 93 0 78 20 CA 11 9 93454 CASAVA_Build 16 5635084 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 24 0 21 3 A 14 12 93455 CASAVA_Build 16 5635278 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 7 A 11 10 93456 CASAVA_Build 16 5662721 1D TGTCAAGAGG A/- AAAAAACTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 A 7 6 93457 CASAVA_Build 16 5679808 1I AATACAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1384 hom 51 4 34 13 A 11 12 93458 CASAVA_Build 16 5680568 4D GTCTGCTTGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 132 het 51 0 42 12 AAAC 4 3 93459 CASAVA_Build 16 5682025 1D TCTTTTTTTA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 35 het 30 1 26 3 T 9 8 93460 CASAVA_Build 16 5684796 12D GGGAGTTGGG TTTGTTTTTGTT/------------ TTTGTTTTTG 3070 hom 76 het 30 0 24 11 TTTGTT 4 2 93461 CASAVA_Build 16 5687703 1D6M1D GCTCGGCTAA TTTTTGTA/-TTTTGT- TTTTTAGTAG 3070 hom 63 het 23 0 21 6 N/A 0 0 93462 CASAVA_Build 16 5691121 1I TGCCTGTTTA -/T TTGTTAAAGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 2 3 93463 CASAVA_Build 16 5691479 1D GGATGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 240 hom 37 2 26 10 T 12 11 93464 CASAVA_Build 16 5702628 2D ATTTGTCCTC AT/-- GTGTAGTTTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AT 1 0 93465 CASAVA_Build 16 5702980 3D GGACATCCTT GTA/--- GTAGTACATG 3070 hom 76 het 30 0 26 5 GTA 3 2 93466 CASAVA_Build 16 5714027 1I TGTTAGCAAA -/G CCATTTGTGT 3070 het 3070 hom 52 25 22 5 G 0 1 93467 CASAVA_Build 16 5719399 3D TTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1982 het 1094 hom 23 8 9 6 T 19 16 93468 CASAVA_Build 16 5727494 4I TCTCAAAAAT ----/AAAC AAATAAATAA 3070 het 1293 hom 31 3 17 11 AAAC 0 1 93469 CASAVA_Build 16 5728291 2D TTAACGTCTC TA/-- TGTGTTAGGT 3070 het 3070 ref 41 25 12 5 TA 1 0 93470 CASAVA_Build 16 5728990 4I CTTACTCCAC ----/ACAA ACACCCCTTC 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 ACAA 0 1 93471 CASAVA_Build 16 5739786 1D TTTTTCAAGG T/- TTTTAGCTTC 3070 het 2420 hom 16 7 8 2 T 5 4 93472 CASAVA_Build 16 5741350 4D GCATCCCTTA TCTT/---- TCTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 TCTT 2 1 93473 CASAVA_Build 16 5749796 1D CTCTCTGGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 T 9 8 93474 CASAVA_Build 16 5750010 1I CCACTGGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 15 16 93475 CASAVA_Build 16 5754138 15D AGGAAGATGC TGTGGGGCAGTAGGG/--------------- TGTGGGTAGG 3070 het 3070 ref 39 25 15 5 TGTGGGGCAGTAGGG 1 0 93476 CASAVA_Build 16 5754800 1I ACCATCATCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 8 9 93477 CASAVA_Build 16 5773167 1I TTACATGCAA -/T AAACACACAA 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 T 0 1 93478 CASAVA_Build 16 5774433 1I CGTCTGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2136 hom 16 7 9 1 A 10 11 93479 CASAVA_Build 16 5776447 2D GTGTTTATGC AG/-- AGTTGAAATA 3070 het 3070 hom 62 23 32 8 AG 2 1 93480 CASAVA_Build 16 5780513 2I CAATATGCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 12 14 93481 CASAVA_Build 16 5782846 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 1394 het 1394 ref 32 22 3 7 A 10 9 93482 CASAVA_Build 16 5791314 4D TTTTAAAGTC TCTA/---- TCTGCCTCTC 2679 hom 32 het 13 0 11 3 TCTA 1 0 93483 CASAVA_Build 16 5799437 8I CTGACAAAGG --------/GCTAATAT GCTAATATCC 3070 hom 22 het 12 0 8 4 GCTAATAT 1 2 93484 CASAVA_Build 16 5807702 1D GTGGGCTGTA T/- TTTTTTTTTT 2198 het 1822 hom 27 9 10 9 T 15 14 93485 CASAVA_Build 16 5820970 1D CATTTCCTAT C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 99 het 49 1 43 6 C 8 7 93486 CASAVA_Build 16 5827255 1D CTTTTCTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2654 hom 30 9 18 3 T 12 11 93487 CASAVA_Build 16 5827609 1D CAGCCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 1409 het 121 hom 18 3 5 10 T 15 14 93488 CASAVA_Build 16 5829734 1D ATGGCTGCCA T/- TGCTCCAGGC 3070 hom 131 het 50 0 43 7 T 2 1 93489 CASAVA_Build 16 5838980 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 9 10 93490 CASAVA_Build 16 5854550 1I CATACTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 46 2 33 11 T 14 15 93491 CASAVA_Build 16 5866302 2D CATCCTCACA AT/-- ATAACCCTAT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AT 2 1 93492 CASAVA_Build 16 5873525 2I CGGGTGGCAA --/AC ACCCACAGTC 3070 hom 95 het 36 0 31 5 AC 1 2 93493 CASAVA_Build 16 5885024 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1773 hom 23 6 16 1 A 9 10 93494 CASAVA_Build 16 5887837 1D TTAACTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 15 14 93495 CASAVA_Build 16 5888503 3D AGTAATGATG ATA/--- ATAATAAGCA 3066 het 3066 ref 39 17 10 12 ATA 3 2 93496 CASAVA_Build 16 5888528 1I AGTAGCAGGG -/T TTTTTTTTTT 1262 het 1262 ref 40 17 5 18 T 13 14 93497 CASAVA_Build 16 5906199 1I ACACTCTAGC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 57 32 17 8 A 7 8 93498 CASAVA_Build 16 5910913 60D TCTATTTGTA CGTGCAGTGGTGGGATGTGAACATGTGCCGTGCAAGGCTACCTGAAGAATCTGTTCTCCT/------------------------------------------------------------ CTTCCCTGTG 3070 het 3070 ref 44 39 20 5 CGTGCAGTGGTGGGATGTGAACATGTGCCGTGCAAGGCTACCTGAAGAATCTGTTCTCCT 1 0 93499 CASAVA_Build 16 5921977 1I TCCTAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 9 10 93500 CASAVA_Build 16 5923791 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 10 11 93501 CASAVA_Build 16 5926037 1I TCTGAACCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 10 11 93502 CASAVA_Build 16 5975325 1I GGCCATTGTC -/A ATGGATGCCA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 1 2 93503 CASAVA_Build 16 5980719 1I CCTGTAATCG -/C CAACACTTCA 2633 het 1739 hom 19 5 11 3 C 1 2 93504 CASAVA_Build 16 5986455 1D GTGAGGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 25 1 17 7 T 13 12 93505 CASAVA_Build 16 5987854 1D TTTACTTTAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 T 9 8 93506 CASAVA_Build 16 5996378 1D TACTGTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 18 10 A 12 11 93507 CASAVA_Build 16 6012257 1D AGCAAATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 20 7 T 13 12 93508 CASAVA_Build 16 6022383 1I TCTACTTATT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 7 8 93509 CASAVA_Build 16 6026612 1I TGTCTGTCTC -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 T 5 6 93510 CASAVA_Build 16 6032253 1D CAGGCACACA C/- CACCATGCCC 3070 het 1096 hom 17 5 10 3 C 2 1 93511 CASAVA_Build 16 6036621 1I AATATTGGGG -/T TTTGAAGAAA 3070 het 3070 ref 55 31 22 2 T 3 4 93512 CASAVA_Build 16 6039328 1D AGTCTCCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 50 het 19 0 17 2 A 10 9 93513 CASAVA_Build 16 6048708 12D TCCATACATT CACCCACCCATC/------------ CACCCACCCA 3070 het 1422 hom 36 7 17 14 CACCCACCCATC 2 1 93514 CASAVA_Build 16 6052294 1I CCATCTTTAG -/C CCCCCCTGCC 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 C 6 7 93515 CASAVA_Build 16 6058100 1I TCTTCATTCA -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 7 8 93516 CASAVA_Build 16 6066302 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 12 11 93517 CASAVA_Build 16 6066651 1I TAAAATTTTT -/C TGTTATGTAT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 0 1 93518 CASAVA_Build 16 6067323 2I TTTAGGTGTT --/AA AAAAAACAAG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 6 8 93519 CASAVA_Build 16 6068679 3I AAGGCAGGGC ---/ACG ATCGTGCTTG 3070 hom 141 het 51 0 45 6 ACG 0 1 93520 CASAVA_Build 16 6069166 1I AAGAAAATTA -/G CCAGCCGCAT 3070 hom 68 het 26 0 21 5 G 0 1 93521 CASAVA_Build 16 6074789 1D TATGTTTTGC A/- GGACAAACGT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 A 1 0 93522 CASAVA_Build 16 6076503 1D CATTGAGGCC T/- GAGTGTTCTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 1 0 93523 CASAVA_Build 16 6079068 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 714 hom 6 het 13 0 4 9 A 14 10 93524 CASAVA_Build 16 6095681 1I TGGAAAGTAG -/A AAAAAAAATA 1952 het 1325 hom 9 4 4 1 A 8 9 93525 CASAVA_Build 16 6104041 4I TGGGGAGAAA ----/GTCT TTATTTACCG 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 GTCT 0 1 93526 CASAVA_Build 16 6104574 1I TTTCTTGGAG -/A GGGGCGTAAC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 0 1 93527 CASAVA_Build 16 6105436 1D TTGAAGCCAT A/- TGCAGTAGTG 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 A 1 0 93528 CASAVA_Build 16 6112963 1I AGCAAACCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 11 12 93529 CASAVA_Build 16 6119095 1I ATAATGCATT -/A ATGCATCTTG 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 A 1 2 93530 CASAVA_Build 16 6123041 1D TGTTGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 34 2 25 7 T 13 12 93531 CASAVA_Build 16 6124847 1D AGGCAGGCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 24 0 21 3 T 10 9 93532 CASAVA_Build 16 6132051 1I AGCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 7 8 A 10 11 93533 CASAVA_Build 16 6142699 3D CAAATCACAT ATG/--- ATATGTGGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 ATG 1 0 93534 CASAVA_Build 16 6148913 1D CATAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 12 11 93535 CASAVA_Build 16 6149897 1D CCTTAAATTT G/- TGCTGCTCTT 3070 het 3070 hom 51 17 25 9 G 1 0 93536 CASAVA_Build 16 6159840 9I AATCTCAGCT ---------/CACTGCAAC CACTGCAACC 3070 het 837 hom 17 5 10 2 CACTGCAAC 1 2 93537 CASAVA_Build 16 6166695 1I TCTTAGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1442 hom 44 4 29 11 T 11 12 93538 CASAVA_Build 16 6171931 1I TTCCATCGAT -/A GGGGATGCCG 3070 hom 160 het 56 0 54 2 A 0 1 93539 CASAVA_Build 16 6181132 1D GCGTCTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 484 hom 32 6 12 15 T 17 16 93540 CASAVA_Build 16 6190948 1D CTTAGTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 121 het 56 0 40 16 T 15 14 93541 CASAVA_Build 16 6198430 2I GTGCTTAGTG --/CC TAAGGTGTGT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 C 0 2 93542 CASAVA_Build 16 6199409 3D AATGTACATC CAA/--- ACTTCCAAAC 3070 hom 151 het 55 0 51 4 CAA 1 0 93543 CASAVA_Build 16 6208866 8D AAAAAAAAAA AAAAGAAG/-------- AAGGAGAAAA 3070 hom 44 het 26 0 23 3 AAAAGAAG 1 0 93544 CASAVA_Build 16 6210734 2I GCCCCCCCCC --/CA AGTGGAAAAT 3070 hom 93 het 33 0 30 3 CA 0 1 93545 CASAVA_Build 16 6212634 8D TCCAGAGACT GTGATTCA/-------- GTGATTCAGT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 GTGATTCA 2 1 93546 CASAVA_Build 16 6218431 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 10 het 42 1 31 11 AC 9 8 93547 CASAVA_Build 16 6221834 3D AGCTTTCCAG TTT/--- TTTTTTTTTT 2793 het 209 hom 27 3 9 15 T 21 18 93548 CASAVA_Build 16 6243612 4D TAGATGGATA GATG/---- GATGGATGGA 3070 hom 85 het 33 0 29 5 GATG 5 4 93549 CASAVA_Build 16 6249961 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 25 17 4 4 A 17 16 93550 CASAVA_Build 16 6251658 1D GCGAGGCTGT G/- AGTGACAGAA 3070 hom 154 het 54 0 52 2 G 1 0 93551 CASAVA_Build 16 6260195 1D AAGAACAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 36 0 32 6 A 10 9 93552 CASAVA_Build 16 6265313 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 11 10 93553 CASAVA_Build 16 6266821 1D TTTTCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 26 0 17 9 T 12 11 93554 CASAVA_Build 16 6278243 1D GTGTGAACGG T/- TTTTTTATAG 3070 hom 120 het 50 0 41 9 T 7 6 93555 CASAVA_Build 16 6283459 3D GTTATTCATT ATG/--- ATGAGATGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 ATG 2 1 93556 CASAVA_Build 16 6283897 1D CCAGGGTGAG C/- GGGGGGGTGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 0 93557 CASAVA_Build 16 6287418 2D GCTGTTTCAC TG/-- TGGCTTAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TG 2 1 93558 CASAVA_Build 16 6293337 1D ATTAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 T 13 12 93559 CASAVA_Build 16 6297904 3I TTTATTTGGA ---/TTG TTATTTACAT 3070 het 2703 hom 14 6 8 0 TTG 0 1 93560 CASAVA_Build 16 6303828 2I CATTTTAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 10 12 93561 CASAVA_Build 16 6306204 4I AGGATGCCGT ----/AAAC AAACATCTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AAAC 1 2 93562 CASAVA_Build 16 6307546 1D AAATTACTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 37 0 31 7 A 10 9 93563 CASAVA_Build 16 6310776 1D AACTGTTATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 8 93564 CASAVA_Build 16 6321611 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TA 8 7 93565 CASAVA_Build 16 6321774 1I ACCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 11 12 93566 CASAVA_Build 16 6363560 3D GGTACGAGGA TTG/--- TTGTGTAGAA 1234 het 1234 ref 71 61 3 8 TTG 2 1 93567 CASAVA_Build 16 6384510 1I GGAAAATTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 9 10 93568 CASAVA_Build 16 6387444 1D CTGTTTTCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 10 9 93569 CASAVA_Build 16 6396350 3D CTCCATAGAA GAT/--- GTTAGACATG 3070 hom 105 het 37 0 34 6 GAT 1 0 93570 CASAVA_Build 16 6407705 4I AACTCCTTTC ----/TTTT TTTTTAAAAA 936 hom 19 het 17 0 6 11 T 5 9 93571 CASAVA_Build 16 6407783 1I CATAGGTTTT -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 1 93572 CASAVA_Build 16 6410346 1I TGTGGGGAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 499 hom 32 2 26 4 T 8 9 93573 CASAVA_Build 16 6412059 1D AGTAGGTGGG A/- TTACAGGTAA 3070 het 36 hom 18 1 16 3 A 1 0 93574 CASAVA_Build 16 6417581 1I AATTCTCCTT -/A ACACCTTAAT 3070 het 3070 hom 55 21 28 6 A 1 2 93575 CASAVA_Build 16 6432574 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 9 10 93576 CASAVA_Build 16 6435968 2I CTTTTTTAAA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 9 11 93577 CASAVA_Build 16 6447447 2I AAGTCCCCCC --/CT CCCCGCAATA 3070 het 17 hom 30 0 13 17 CT 0 1 93578 CASAVA_Build 16 6448014 2I CTCAAAACTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 110 het 46 0 37 9 A 10 12 93579 CASAVA_Build 16 6448288 7I CTGGTTAAGG -------/ATCTGTA ATCTGTGGGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 ATCTGTA 0 1 93580 CASAVA_Build 16 6453113 1I CAACTTTTAT -/A AAAAACAGCC 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 A 5 6 93581 CASAVA_Build 16 6454436 1I GTATGCTTGT -/G GAAAGTCTTG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 G 1 2 93582 CASAVA_Build 16 6460829 1D ACATGTCTTC T/- AGTGTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 T 1 0 93583 CASAVA_Build 16 6463556 1I TCCTGTTGAC -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 A 6 7 93584 CASAVA_Build 16 6475357 2D CTTACCCCTC TT/-- CTCTTCTCTC 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 2 0 93585 CASAVA_Build 16 6476020 1I ATTATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 11 12 93586 CASAVA_Build 16 6482120 2I GTATATGAAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 GT 7 8 93587 CASAVA_Build 16 6494902 1D CTAAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 2638 het 1085 hom 13 4 8 1 A 13 12 93588 CASAVA_Build 16 6498872 1D GAATCATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 15 15 13 A 13 12 93589 CASAVA_Build 16 6510388 1D TGAGGTTGTG T/- TTTAAGAAAT 3070 het 3070 hom 53 25 23 5 T 4 3 93590 CASAVA_Build 16 6519586 1D TATTAATAAT A/- TATTATTATT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 1 0 93591 CASAVA_Build 16 6525435 1D CAGAAAAGAA C/- CCCTATGCAT 3070 hom 166 het 60 0 56 4 C 4 3 93592 CASAVA_Build 16 6544433 1D CCGGGGTAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 32 10 13 10 A 9 8 93593 CASAVA_Build 16 6550386 1I GGAGGAGAGG -/A GCCAGTGTGG 3070 hom 42 het 19 0 12 7 A 0 1 93594 CASAVA_Build 16 6566668 1I GGGTGAGGGA -/G GGTGGTGACT 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 G 2 3 93595 CASAVA_Build 16 6570591 1D GAAATGTCAC A/- GGGGGGGATG 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 A 1 0 93596 CASAVA_Build 16 6570911 4D TTGGGCTTGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2067 hom 34 10 17 8 T 16 12 93597 CASAVA_Build 16 6572860 2I CAACAGAAAC --/TG AACTGAGCTA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 TG 0 1 93598 CASAVA_Build 16 6574004 2I AACAACATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 12 14 93599 CASAVA_Build 16 6575781 1D ACTAATTTAG T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 T 7 6 93600 CASAVA_Build 16 6577293 1D GAGTTTGGCC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 12 17 12 T 9 8 93601 CASAVA_Build 16 6579106 1I TCTATATTAC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 110 het 41 0 37 4 A 7 8 93602 CASAVA_Build 16 6580852 1I GTTTGACATG -/C CAAGAATTGT 3070 hom 169 het 59 0 57 2 C 1 2 93603 CASAVA_Build 16 6584698 1D ATCTTTGTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 9 93604 CASAVA_Build 16 6588949 5D CTCCATGTTA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 50 23 19 13 AAAAC 4 3 93605 CASAVA_Build 16 6601993 9D TCTCAGATCT CCCGAGTCC/--------- CCTTGATGAA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 CCCGAGTCC 1 0 93606 CASAVA_Build 16 6613446 1I GTGAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 129 hom 32 1 19 12 T 13 14 93607 CASAVA_Build 16 6618877 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 81 het 32 0 28 9 A 6 7 93608 CASAVA_Build 16 6619976 3I TTTTTTTTTT ---/TTA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 19 7 TTA 0 1 93609 CASAVA_Build 16 6625090 2D TTTATATATC AT/-- ATATATTATA 2095 hom 12 het 5 0 5 0 AT 4 3 93610 CASAVA_Build 16 6631747 35D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT/----------------------------------- AGGTTCTGCC 3070 hom 54 het 16 0 19 4 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1 0 93611 CASAVA_Build 16 6632671 4D TAGGGGACTC AAAG/---- AAAGAAGTCA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 AAAG 2 1 93612 CASAVA_Build 16 6633424 5D TTGTTTGTTA GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 hom 75 het 39 0 26 14 GTTTT 5 4 93613 CASAVA_Build 16 6633842 1I AAAAAATCAT -/A ATAAGGCTGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 2 93614 CASAVA_Build 16 6636102 2D TACTTAACAC TT/-- TTAAGTAGTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 4 2 93615 CASAVA_Build 16 6640295 1I TATTTTTTTC -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 93616 CASAVA_Build 16 6644111 4D GCTGTTTGGG TGGA/---- TGGATGGATG 3070 hom 132 het 49 0 41 13 TGGA 3 2 93617 CASAVA_Build 16 6644895 2D GGTGCTGATT TC/-- TGTTTCAGTC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TC 1 0 93618 CASAVA_Build 16 6644996 3I CATATGTATA ---/ATT ATTAATTATA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 ATT 1 2 93619 CASAVA_Build 16 6649244 9I AGAGCCCATT ---------/TGTCAGAGG TTATAAACAC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TGTCAGAGG 0 1 93620 CASAVA_Build 16 6650776 1D TTTTATTTTT G/- CTGGTATCCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 0 93621 CASAVA_Build 16 6652134 1D6M1D GGGCTGGGGG CGGGGTGA/-GGGGTG- AAAAAAAGGG 3070 hom 98 het 40 0 33 8 N/A 0 0 93622 CASAVA_Build 16 6658823 3I AGCAAGTCTA ---/TTC TTTTGTGTAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTC 0 1 93623 CASAVA_Build 16 6660002 4D AAAATCTATC TCTG/---- TCTGTCTATC 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 TCTG 2 1 93624 CASAVA_Build 16 6671523 2I TGTCTCCAGA --/AG AGAGGTGTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 AG 2 3 93625 CASAVA_Build 16 6680569 3I AAAACTATAC ---/TAA TGAGATGCAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TAA 0 1 93626 CASAVA_Build 16 6681470 1I TTTTTCTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 8 9 93627 CASAVA_Build 16 6682342 1I AGTGTTTCAT -/C CTTCTTTATT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 C 1 2 93628 CASAVA_Build 16 6682638 2D TCCAAACACA TT/-- TTTTTTTTTT 2653 het 281 hom 52 6 7 39 T 13 11 93629 CASAVA_Build 16 6683094 3D CCATCACAAC CAT/--- CATCATCATC 3070 hom 182 het 89 1 67 27 CAT 4 3 93630 CASAVA_Build 16 6685574 12D TGTTTCAAGT ATGAGATATAGA/------------ ATGATGAGCA 3070 hom 66 het 21 0 23 1 ATGAGATATAGA 1 0 93631 CASAVA_Build 16 6686696 1D TCAAAGGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 229 hom 43 1 39 3 T 10 9 93632 CASAVA_Build 16 6690370 1I AAAAAAAAAA -/C AGAATTTTGA 3070 het 318 hom 41 1 37 3 C 0 1 93633 CASAVA_Build 16 6692556 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 218 hom 31 1 27 3 A 12 11 93634 CASAVA_Build 16 6703269 4I TACCTGGGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TTTG 3 4 93635 CASAVA_Build 16 6705269 1D AGTTTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 188 hom 26 1 23 3 T 12 11 93636 CASAVA_Build 16 6706026 1I CCTACATAAA -/T GAAGCCACTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 0 1 93637 CASAVA_Build 16 6712323 1I TTATTTTCTG -/T TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 T 5 6 93638 CASAVA_Build 16 6712531 5I GCATTTTGCC -----/CTAAA AAGTCATTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CTAAA 0 1 93639 CASAVA_Build 16 6717067 10D ACACACACAC AGACACAGAG/---------- AGAGACACAC 35 hom 4 het 16 0 2 17 AGACACAGAG 1 0 93640 CASAVA_Build 16 6718377 1I AATGTCTTGT -/C CGTTGTTTCT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 1 2 93641 CASAVA_Build 16 6720430 4I25M4D ATCTCATCTA ----TATCTAATCTATCAATTTATCAAATTATC/TATCTATCTAATCTATCAATTTATCTAAT---- TAATCTATCC 3070 hom 138 het 42 0 47 8 N/A 0 0 93642 CASAVA_Build 16 6724584 1I GACTGTGCTC -/T TTAACTACTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 3 93643 CASAVA_Build 16 6725960 1D31M1D12M1D TTTTTGGAAT AAATAAGGTTTGCTTCCCTACTGGGCCTGCTCAAGGGTAATTAACT/-AATTATGTTTGCTTTCCTAGTTGGGCTGCTC-AGGTGAATTAAC- TCTTCTTTTT 3070 hom 66 het 21 0 22 6 N/A 0 0 93644 CASAVA_Build 16 6726088 1I ACAATTTTTG -/C TTCAAATTAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 0 1 93645 CASAVA_Build 16 6742820 1D CCTACTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 13 12 93646 CASAVA_Build 16 6743081 1I GTAATGGCAT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 7 8 93647 CASAVA_Build 16 6743734 3D GAGTTAGCGG AGC/--- AGCAGCTCTG 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 AGC 3 2 93648 CASAVA_Build 16 6749152 1I TTATCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 38 2 28 8 T 12 13 93649 CASAVA_Build 16 6753040 1I CGTTCATTCA -/G TGGCTGTTTA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 G 0 1 93650 CASAVA_Build 16 6753340 1D AGACACTTGT A/- AGCCCATCAC 3070 hom 125 het 47 0 40 7 A 2 1 93651 CASAVA_Build 16 6755533 1I AAAGTTTAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 A 7 8 93652 CASAVA_Build 16 6766433 4D AAAAAACAAA AAAC/---- AAACAAACAA 2809 het 2809 ref 21 7 9 8 AAAC 4 3 93653 CASAVA_Build 16 6773175 1D GGGTCTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 A 9 8 93654 CASAVA_Build 16 6774697 1D TAATGTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 T 12 11 93655 CASAVA_Build 16 6775830 16I CTTTAGAATA ----------------/CAGAGCTAGTAAGTGG CAGAGCTAGA 3070 het 3070 ref 70 34 28 9 CAGAGCTAGTAAGTGG 0 1 93656 CASAVA_Build 16 6776911 1D TTTTACTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 11 10 93657 CASAVA_Build 16 6796761 1I19M2D TCTTTTTCTA -TTTTTTCTTTGTTTCTTTTTC/TTTTTTTCTTTGTTTCTTTT-- TCTTTCCTTT 1975 hom 10 het 4 0 4 0 N/A 0 0 93658 CASAVA_Build 16 6797899 4D TATATATTAT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 66 het 28 0 23 6 TG 9 7 93659 CASAVA_Build 16 6804038 4I AAATTAGATT ----/CAAA CAAACATAAC 3070 hom 141 het 56 0 47 9 CAAA 1 2 93660 CASAVA_Build 16 6806733 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTCAAA 2375 hom 24 het 9 0 8 1 CT 1 2 93661 CASAVA_Build 16 6808997 1D AGAATCAAAC T/- TGACACAGAG 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 2 1 93662 CASAVA_Build 16 6810678 4I AAAACAAGCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 111 het 40 0 36 4 AAAC 3 4 93663 CASAVA_Build 16 6834138 3I TTTTCTCTCT ---/CTC CTCCATCATT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 CTC 1 2 93664 CASAVA_Build 16 6835153 2D TCTGGTAGTT TC/-- TTTTTCTGCA 3070 hom 93 het 33 0 32 3 TC 1 0 93665 CASAVA_Build 16 6835375 1D GTAAGGAAGA G/- GTCCAGTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 16 5 G 2 1 93666 CASAVA_Build 16 6835666 2D CATTCTACAA AG/-- AGAAAATTTC 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 AG 2 1 93667 CASAVA_Build 16 6836923 1I CCTAGGAAAC -/A AAAAAAAAAA 1053 het 1053 ref 33 27 3 3 A 11 12 93668 CASAVA_Build 16 6852901 1I GCAGGAGAAT -/C CACTTGAACC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 1 2 93669 CASAVA_Build 16 6852978 2D CAGAGGGAGA CT/-- CTGTCTAAAA 3070 hom 49 het 18 0 14 4 CT 2 1 93670 CASAVA_Build 16 6853673 1I TTTTTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 2633 het 341 hom 19 1 11 7 A 13 14 93671 CASAVA_Build 16 6853992 1D TTTATGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 15 14 93672 CASAVA_Build 16 6858485 1I TGGTTTATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 9 10 93673 CASAVA_Build 16 6859475 1D TCTTTTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 46 1 37 8 T 12 11 93674 CASAVA_Build 16 6864185 2I GTGTGTGCAT --/AC ACACACACAA 3070 hom 103 het 39 0 35 4 AC 4 5 93675 CASAVA_Build 16 6866436 1I AGTCACTCTT -/C AAAAATGAAG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 0 1 93676 CASAVA_Build 16 6868874 1D ATTAACAGCT A/- ATCTTTGATA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 2 1 93677 CASAVA_Build 16 6870206 2I18M1I AAGGTATAAA --AGAGCAAAATTTTCCACC-/AGAGAGCAAAATTTCCCACCT GGGGGGTAGC 3070 hom 123 het 41 0 41 4 N/A 0 0 93678 CASAVA_Build 16 6871856 1I ACTGAGGCTG -/A AAAAATCTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 5 6 93679 CASAVA_Build 16 6876058 4D AGTGAAAGTA TTTT/---- TTTTTTCTTT 3070 hom 50 het 23 0 18 5 T 10 6 93680 CASAVA_Build 16 6880522 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 120 het 48 0 40 11 AAAC 3 2 93681 CASAVA_Build 16 6882686 1I AACAAACAAA -/C AAAGCCTGAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 93682 CASAVA_Build 16 6888903 3I TGTGCATCTC ---/TGT GTATGTGTTT 3070 hom 274 het 98 0 91 7 TGT 0 1 93683 CASAVA_Build 16 6889094 2I ACGTGTATAA --/TG TGTGTGTACA 3070 hom 184 het 72 0 62 10 TG 3 4 93684 CASAVA_Build 16 6901205 2D ATTGTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 22 13 A 16 14 93685 CASAVA_Build 16 6902627 2D GTTATTACTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 29 1 21 7 T 12 10 93686 CASAVA_Build 16 6904565 1D AAAACAAAAA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 1 0 93687 CASAVA_Build 16 6906015 1D GGGAAAACTT A/- AAGACAGCTG 3070 het 3070 hom 46 19 19 9 A 3 2 93688 CASAVA_Build 16 6909453 1D ACATAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 11 10 93689 CASAVA_Build 16 6910257 1D TGCACATGTG T/- TTTTTTATAT 3070 hom 84 het 32 0 29 6 T 7 6 93690 CASAVA_Build 16 6911644 5D TATATATATA TATAT/----- TTTTTTTTTT 2323 hom 15 het 11 0 6 5 TATAT 1 0 93691 CASAVA_Build 16 6911789 2D GTTGTATATG CA/-- CACACACATG 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 CA 5 4 93692 CASAVA_Build 16 6929505 5I AGAATTTTTC -----/TTTCT TTTCTTTTTT 2845 het 2845 ref 33 12 11 10 TTTCT 1 2 93693 CASAVA_Build 16 6930194 6D ACTCCATCTC AAAAAT/------ AAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 23 9 14 2 AAAAAT 2 1 93694 CASAVA_Build 16 6935473 1D GATATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 2984 het 2984 ref 34 20 7 7 T 11 10 93695 CASAVA_Build 16 6939582 1D TCACTTGGCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 T 9 8 93696 CASAVA_Build 16 6943377 1D ATATACATGA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 17 23 4 T 8 7 93697 CASAVA_Build 16 6951973 1D TGACTAAGAA T/- GTCTAACCTC 3070 het 3070 hom 49 15 24 12 T 1 0 93698 CASAVA_Build 16 6955871 1D ACTGAGGCAT G/- GGGGGATTAA 3070 het 3070 hom 36 9 24 3 G 6 5 93699 CASAVA_Build 16 6962199 1D ATCACGAAAG C/- TTTTTCATCC 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 C 1 0 93700 CASAVA_Build 16 6965275 1D TTTTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 32 8 T 11 10 93701 CASAVA_Build 16 6966138 4D CAAAAAGGAA AAAG/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 8 AAAG 1 0 93702 CASAVA_Build 16 6966788 2I ATCAATATAT --/TA TATATATATG 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 TA 4 5 93703 CASAVA_Build 16 6966879 3I CATATGTCAT ---/ATG ATCCATATCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 ATG 0 1 93704 CASAVA_Build 16 6968566 7D TCATAGAGCC CCTTTCT/------- CCTTTCTATA 3070 het 3070 ref 45 21 18 8 CCTTTCT 2 1 93705 CASAVA_Build 16 6969391 1D GCACTTTCCA T/- TGTGCGATAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 2 1 93706 CASAVA_Build 16 6972996 12D GACTCTGTCT AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 1690 het 1690 ref 26 12 8 6 A 24 12 93707 CASAVA_Build 16 6973094 2D TGGCCATGCT GA/-- GACATGAGTT 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 GA 2 1 93708 CASAVA_Build 16 6983215 1D ATTGATAGCT G/- TGCAATGACT 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 G 1 0 93709 CASAVA_Build 16 6990076 1I TGTTTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 2868 het 2198 hom 28 7 9 12 A 15 16 93710 CASAVA_Build 16 7013462 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 961 het 961 ref 24 17 3 4 A 11 12 93711 CASAVA_Build 16 7017528 1D GCTTCAGGGC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 8 7 93712 CASAVA_Build 16 7022584 8D CAGCTATTTC TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 2506 het 2506 ref 28 13 7 10 TGTT 7 5 93713 CASAVA_Build 16 7026205 1I CACCTTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 13 14 93714 CASAVA_Build 16 7029053 3I AAGGAATATC ---/AGG AGAAGTGCTC 3070 het 3070 ref 61 33 25 3 AGG 0 1 93715 CASAVA_Build 16 7037620 1D TATTTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 T 11 10 93716 CASAVA_Build 16 7040338 7D TGGGAACTCA GCTCACT/------- GCAACCTCTG 3070 het 1467 hom 16 4 10 2 GCTCACT 1 0 93717 CASAVA_Build 16 7042038 1D ACTTTTCCCC T/- TCATTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 2 1 93718 CASAVA_Build 16 7044299 4I TGGAGTGCCG ----/TGGC TGGCGCAATC 2227 het 1729 hom 13 5 6 2 TGGC 1 2 93719 CASAVA_Build 16 7057311 1D AAATTACCAC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 26 11 11 5 A 8 7 93720 CASAVA_Build 16 7059162 4D CCTATGAACC TATA/---- TATTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 TA 3 1 93721 CASAVA_Build 16 7072983 1I GTAAATATGG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 A 7 8 93722 CASAVA_Build 16 7075100 2D TATCTAAAGT TG/-- TGTGTGTGTG 1241 het 1241 ref 58 43 3 13 TG 8 7 93723 CASAVA_Build 16 7078547 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 554 hom 41 2 35 4 T 9 10 93724 CASAVA_Build 16 7079916 1I TTCTGCATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 A 10 11 93725 CASAVA_Build 16 7081140 1I CTCTTTACTT -/C TTTAGTTGGT 3070 het 3070 hom 43 15 26 2 C 0 1 93726 CASAVA_Build 16 7084399 1I CATTCCAGGT -/G GAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 G 1 2 93727 CASAVA_Build 16 7095794 4I ATATAGAGAT ----/AGAG AGATAGATAG 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 AG 1 3 93728 CASAVA_Build 16 7098344 1D TTTCAGTACA G/- CTTGTCCTTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 G 1 0 93729 CASAVA_Build 16 7100409 1I CATTGAGGGG -/T TTGAAAGATG 3070 het 3070 ref 66 33 29 4 T 2 3 93730 CASAVA_Build 16 7110345 1D AAATGTAAGA T/- TAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 T 2 1 93731 CASAVA_Build 16 7111951 1D AACAACTGGT G/- TTGGAATAAT 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 G 1 0 93732 CASAVA_Build 16 7122001 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2190 het 2190 ref 29 13 8 8 T 17 16 93733 CASAVA_Build 16 7136232 1I GCCTCACAAT -/C CCATATGCAG 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 C 2 3 93734 CASAVA_Build 16 7157869 1I GGCCCTCTGC -/A GAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 0 1 93735 CASAVA_Build 16 7159834 1D CACTTTGGCA G/- GGCCAAAGCA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 G 3 2 93736 CASAVA_Build 16 7163495 1I CATTTGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 T 10 11 93737 CASAVA_Build 16 7169598 1D CATGGTTTCC T/- TTTTTTTTTA 1075 het 1075 ref 37 29 3 5 T 10 9 93738 CASAVA_Build 16 7169736 1D TCTTCCCAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 9 8 93739 CASAVA_Build 16 7183957 1D TCTAGCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 T 12 11 93740 CASAVA_Build 16 7185051 1I TAATTCTAGC -/A AACAAAACTT 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 A 2 3 93741 CASAVA_Build 16 7189330 1I GTTTAAAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 26 10 9 T 8 9 93742 CASAVA_Build 16 7189912 3D AACAAAACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 40 16 16 10 AAC 7 6 93743 CASAVA_Build 16 7196438 3D15M2I TACATATATG TATTATATTTCCTTATTA--/---TATATTTCCTTATTAAT ATATATATAA 1829 het 1829 ref 17 14 4 5 N/A 0 0 93744 CASAVA_Build 16 7203560 1D CTCTAATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 22 6 A 11 10 93745 CASAVA_Build 16 7203944 1I GGTTGTTAAG -/A AACTAAAATA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 2 3 93746 CASAVA_Build 16 7212186 1I TGCCATAGAC -/A ACGACCACAC 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 1 2 93747 CASAVA_Build 16 7213829 2D CAAAAGAGCA TT/-- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 10 8 93748 CASAVA_Build 16 7228330 1D TTAAAATGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2620 hom 26 6 16 4 A 10 9 93749 CASAVA_Build 16 7228540 1I TGGGCTACAC -/A ACGCACCTTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 1 2 93750 CASAVA_Build 16 7229894 1I GTGCTAAAAG -/A GAACATTTCT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 0 1 93751 CASAVA_Build 16 7233983 5I CTAACATACA -----/TTTCT TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 TTTCT 1 2 93752 CASAVA_Build 16 7235461 4I ACTCAAGGTT ----/AAAC AAACCATACC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 AAAC 1 2 93753 CASAVA_Build 16 7241016 1D TTTTGTAGTG A/- AAACACTTAA 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 A 4 3 93754 CASAVA_Build 16 7244501 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 T 9 10 93755 CASAVA_Build 16 7249566 1I TCTCCAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2634 hom 36 8 22 6 A 11 12 93756 CASAVA_Build 16 7252316 1I CATTTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 11 93757 CASAVA_Build 16 7262672 1I CTGAGAAGGG -/T GGAGGGATGG 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 0 1 93758 CASAVA_Build 16 7262989 2D CCGTCCCTCC CT/-- CTCTCCCTTC 2297 het 2297 ref 23 11 6 6 CT 3 2 93759 CASAVA_Build 16 7290619 1I ATAGAAAGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 93760 CASAVA_Build 16 7291054 1I GCTAGTGGCC -/T TTGATATGGC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 2 3 93761 CASAVA_Build 16 7292759 1D TTTTTTTTTT C/- CTGTCAGGAC 3070 het 81 hom 31 1 26 4 C 2 1 93762 CASAVA_Build 16 7304045 1D CCCGATTTTG T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 82 het 37 0 27 10 T 8 7 93763 CASAVA_Build 16 7305094 4I AGAAAAGCTC ----/TATT TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 35 0 24 11 TATT 0 1 93764 CASAVA_Build 16 7313933 3I CGGATGGGTG ---/GAT GATGATGAGT 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 GAT 2 3 93765 CASAVA_Build 16 7322663 4D GGTCTCTTGG TCTC/---- TCTCTCTGTC 3070 het 3070 hom 43 19 18 8 TC 5 3 93766 CASAVA_Build 16 7323770 1D ATTGGGGACC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 9 8 93767 CASAVA_Build 16 7325598 15D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAC/--------------- CAAGTGATTT 3070 het 3070 hom 43 20 21 5 AAAAAAAAAAAAAAC 1 0 93768 CASAVA_Build 16 7339532 1I TTTAAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 25 13 9 T 10 11 93769 CASAVA_Build 16 7349986 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 30 hom 14 2 10 2 A 9 10 93770 CASAVA_Build 16 7352179 2D ATGCTTGCTA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 75 27 29 22 GT 7 6 93771 CASAVA_Build 16 7353498 1I CTAATAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1539 hom 28 7 14 7 A 10 11 93772 CASAVA_Build 16 7362939 1D AGAAATTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2745 hom 27 8 15 5 T 13 12 93773 CASAVA_Build 16 7389742 1D TATCAAGATC T/- TTTAACTTGA 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 T 4 3 93774 CASAVA_Build 16 7400196 1D AGCTCATCTG C/- GCTGGGTGAC 3070 het 3070 ref 57 31 16 10 C 1 0 93775 CASAVA_Build 16 7400687 5I CCCAAAAACA -----/AAACC AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 AAACC 0 1 93776 CASAVA_Build 16 7401248 1D GCCAATCAAC T/- TTGAATTCTA 3070 het 3070 hom 28 11 11 7 T 3 2 93777 CASAVA_Build 16 7408777 12I TGTGTCTGTG ------------/TCTCTATCCCTA TCTCTATCTC 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 TCTCTATCCCTA 0 1 93778 CASAVA_Build 16 7408884 1D AGAGTCGAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 T 9 8 93779 CASAVA_Build 16 7414284 1D ATATGGGGGT G/- GGGGTCTAGC 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 G 5 4 93780 CASAVA_Build 16 7424739 2D CTTGTTAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 195 hom 23 3 15 5 T 14 12 93781 CASAVA_Build 16 7427261 2I TGCCCCCCCC --/CG CCCTTTCTGT 3070 het 216 hom 25 3 11 11 CG 0 1 93782 CASAVA_Build 16 7435014 1D GAAGTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 9 14 14 T 11 10 93783 CASAVA_Build 16 7444744 1D GATGTATACA T/- TTTCTACCAT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 4 3 93784 CASAVA_Build 16 7446901 1D ACTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 11 10 93785 CASAVA_Build 16 7451828 1I CTCTTAGCGA -/G CTTCTGGGAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 0 1 93786 CASAVA_Build 16 7456347 1I TGAATGCTTA -/T TTTCATGCCA 3070 hom 154 het 55 0 52 3 T 3 4 93787 CASAVA_Build 16 7459230 1I AGCCACCTAA -/T TTTTTTTTTT 2224 het 2093 hom 16 7 6 3 T 10 11 93788 CASAVA_Build 16 7472492 1D3M2D GTTGTTGTTG TTGTTG/-TGT-- TTTCTTAAAT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 N/A 0 0 93789 CASAVA_Build 16 7478447 2I ATTCTTTCGT --/TC TGTTTGTCTA 3070 hom 163 het 58 0 55 3 TC 0 1 93790 CASAVA_Build 16 7479519 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2077 hom 21 5 16 0 T 10 9 93791 CASAVA_Build 16 7485907 1D TACTAGACTA T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 7 93792 CASAVA_Build 16 7488452 1I ATGTAGTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 10 93793 CASAVA_Build 16 7489899 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1581 het 1581 ref 37 26 5 8 A 12 11 93794 CASAVA_Build 16 7503083 2I CCTGGCCAAC --/AT AGTAAAACGC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AT 0 1 93795 CASAVA_Build 16 7505264 1D ACAGCAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1010 hom 40 5 25 10 T 15 14 93796 CASAVA_Build 16 7507827 1D AGGATCTGCC A/- AAAAAAAAAA 1733 het 1733 ref 41 28 5 8 A 15 14 93797 CASAVA_Build 16 7511109 1I ACGTGTAGTC -/T TGAGAGCATT 3070 hom 159 het 60 0 52 8 T 1 2 93798 CASAVA_Build 16 7522150 1I TTTTTTTTTT -/C CACTAAGAAA 3070 het 481 hom 23 2 13 8 C 1 2 93799 CASAVA_Build 16 7524794 1D TTTTAGGGGG C/- CCTTAATTCT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 C 3 2 93800 CASAVA_Build 16 7532816 1I30M16D CTGTCTGAGG -AAAAAAAAAATAGAGGAACAGAGGGGAGAGAGAAGGAGAGGGAGAA/AAAAAAAAAAATAGAGGAACAGAGGGGAGAG---------------- AGAGGGAAAG 3070 hom 66 het 22 0 21 14 N/A 0 0 93801 CASAVA_Build 16 7533899 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 5 6 93802 CASAVA_Build 16 7540255 1D CTCCAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 28 2 20 6 T 12 11 93803 CASAVA_Build 16 7550446 1I AATGAAAGTA -/C CCCCCAGTGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 5 6 93804 CASAVA_Build 16 7553828 3D GCAACAAGAA GAG/--- GAGAAGAAAG 3070 het 3070 hom 41 19 22 4 GAG 2 1 93805 CASAVA_Build 16 7554802 1D ATTCATCCTA T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 7 6 93806 CASAVA_Build 16 7566102 1I ATCAGCTATT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 536 hom 39 4 23 12 C 0 1 93807 CASAVA_Build 16 7568785 1I AATTGCAGAG -/A AAGTATCAAA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 2 3 93808 CASAVA_Build 16 7573152 1D CTAGCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 47 3 25 19 T 17 16 93809 CASAVA_Build 16 7573893 2D TCCACTAAAC CT/-- CTCTTTATTG 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 CT 3 2 93810 CASAVA_Build 16 7589461 1I ACCTGTAGGA -/T TTTTTTAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 7 93811 CASAVA_Build 16 7589803 1I GCCTGGCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 30 1 28 1 T 11 12 93812 CASAVA_Build 16 7600974 1I GAAATGAAGA -/C CCCCTTGTCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 4 5 93813 CASAVA_Build 16 7608011 1I GAGAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 10 11 93814 CASAVA_Build 16 7609521 1I AGAAGGCTTA -/G GAAGGCAATT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 1 2 93815 CASAVA_Build 16 7617191 1D TCTATTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2671 hom 29 11 12 6 A 15 14 93816 CASAVA_Build 16 7626851 2I AGAGAAACAG --/AC AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 AC 0 1 93817 CASAVA_Build 16 7628428 1I TCTCAACTTA -/G CCCCAGAGGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 93818 CASAVA_Build 16 7637559 1I GAAAAAAAAA -/G AAAAAAGCAA 3070 het 2065 hom 31 10 19 2 G 0 1 93819 CASAVA_Build 16 7641072 1D TAGCAAGAAT A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 A 7 6 93820 CASAVA_Build 16 7644644 1D TCAGTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 56 23 25 12 A 11 10 93821 CASAVA_Build 16 7646009 10D AACAATGTGT TTGTAACTAC/---------- TTGGGATGAA 3070 het 3070 ref 41 21 20 8 TTGTAACTAC 1 0 93822 CASAVA_Build 16 7652016 3D CATGGTGCAT AAC/--- AACTTGTCTT 3070 het 3070 hom 46 18 25 7 AAC 2 1 93823 CASAVA_Build 16 7656393 1I CCTACCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 10 11 93824 CASAVA_Build 16 7657681 2I TTTAAACCTC --/TT TTTTTGTTAT 3070 hom 49 het 21 0 17 4 T 5 7 93825 CASAVA_Build 16 7659286 4I CCAAGACATC ----/TGTT TGTTGGTTGA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 TGTT 1 2 93826 CASAVA_Build 16 7665247 1D TCCGTCACTC T/- GTTGAACTCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 1 0 93827 CASAVA_Build 16 7673845 1I TTCTATTGCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 A 9 10 93828 CASAVA_Build 16 7674628 1D GAATTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 14 13 A 11 10 93829 CASAVA_Build 16 7680684 1I TTTAATTTTT -/C CTGAAGTTGT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 C 1 2 93830 CASAVA_Build 16 7682893 1I CTTTTTCTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 9 10 93831 CASAVA_Build 16 7685401 1D CTACATGCTG A/- AAAAACCTGC 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 6 5 93832 CASAVA_Build 16 7687519 4D GATATACATA CATG/---- CATGTATATG 3070 het 3070 ref 66 40 23 5 CATG 2 1 93833 CASAVA_Build 16 7689282 9D TAATCCTGGA CCTCCTGGG/--------- ATCTAGCGAT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 CCTCCTGGG 1 0 93834 CASAVA_Build 16 7698502 6D CAGTCTGATT GAATGG/------ GAATGGGAAT 3070 het 3070 hom 45 15 25 6 GAATGG 3 2 93835 CASAVA_Build 16 7698826 8I TGTAAGTACG --------/TGTGTATA TGTGTATATA 3070 hom 113 het 47 0 37 10 TGTGTATA 1 2 93836 CASAVA_Build 16 7701231 1D TGGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2869 het 2459 hom 29 10 8 12 A 13 12 93837 CASAVA_Build 16 7707444 1D ACTGCCGCTC A/- AGCTGGACGG 3070 hom 61 het 27 0 21 7 A 2 1 93838 CASAVA_Build 16 7720654 2I ACACACATAC --/AT ATATATACAT 2016 hom 30 het 15 0 11 4 AT 3 4 93839 CASAVA_Build 16 7720754 2D ATATATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 477 hom 40 4 24 13 AC 9 8 93840 CASAVA_Build 16 7724977 1I AGAATCGCTT -/G AAACCTGGAG 3070 hom 111 het 42 0 37 6 G 0 1 93841 CASAVA_Build 16 7725669 2I CATGTAATAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 10 12 93842 CASAVA_Build 16 7728157 1D AGATATTTGC G/- TAGTATTTCT 3070 het 3070 ref 60 30 22 11 G 1 0 93843 CASAVA_Build 16 7733844 3I TGCTGCTCCT ---/ATC ATCACCCATC 3070 het 3070 ref 50 24 21 6 ATC 1 2 93844 CASAVA_Build 16 7738125 1I GATCTGCCCC -/A CCCCTTGGCC 3070 hom 54 het 20 0 17 3 A 0 1 93845 CASAVA_Build 16 7738549 4D ATCTGTTCTG TTTA/---- TTTATCATCC 3070 het 3070 hom 57 28 24 9 TTTA 2 1 93846 CASAVA_Build 16 7743836 1I GAAAATTTAC -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 A 7 8 93847 CASAVA_Build 16 7744983 2I GTGGGATTTG --/GA GATAAAAACA 3070 hom 61 het 25 0 21 4 GA 1 2 93848 CASAVA_Build 16 7746285 6I CCATTTGTTC ------/CAGTAG CAGCAATTGA 3070 hom 54 het 30 0 19 12 CAGTAG 0 1 93849 CASAVA_Build 16 7746397 3I TAAGAGGCCC ---/CCT CCTCTTTTAA 2940 het 2940 ref 24 13 7 4 CCT 1 2 93850 CASAVA_Build 16 7748355 4I AGAATCTAGA ----/TAAG TAAGATAAGT 3070 hom 185 het 68 0 61 7 TAAG 1 2 93851 CASAVA_Build 16 7749272 4I AATCAGGTGT ----/AATC AATAGTAGGA 3070 het 3070 hom 39 17 13 9 AATC 0 1 93852 CASAVA_Build 16 7765559 8D AGTTTATACA CAAATGTT/-------- CAAATGTTCA 3070 hom 120 het 42 0 41 3 CAAATGTT 2 1 93853 CASAVA_Build 16 7766883 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTG 2691 het 2691 ref 23 10 9 4 T 9 10 93854 CASAVA_Build 16 7771772 4D TCCTTCCTTC GTAA/---- GTGTCAACCG 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 GTAA 1 0 93855 CASAVA_Build 16 7776367 1I ACAATGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1190 hom 35 3 23 9 A 13 14 93856 CASAVA_Build 16 7779836 1D ACAAATTAAG T/- TAAGAATGCC 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 T 2 1 93857 CASAVA_Build 16 7780438 2D CCACAGTAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 60 19 26 15 TG 9 8 93858 CASAVA_Build 16 7793910 1D TATGCAATAA T/- TTTTTCCCAA 3070 hom 136 het 52 0 45 7 T 6 5 93859 CASAVA_Build 16 7801260 2D TGCCACAGAA TT/-- TTTAAAATGG 3070 hom 116 het 44 0 39 5 T 5 3 93860 CASAVA_Build 16 7804113 1I GGAGGGCCAG -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 111 het 44 0 36 8 T 8 9 93861 CASAVA_Build 16 7810744 4D TGGAAAAGAA AGAG/---- AAAGGAATAT 3070 hom 99 het 38 0 33 7 AG 2 0 93862 CASAVA_Build 16 7836051 1I CAAATGGTAA -/T TTTTGCTGGG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 4 5 93863 CASAVA_Build 16 7838566 1D CAATTCTGCC T/- AATTGATTGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 0 93864 CASAVA_Build 16 7840093 1I CCACCTGGTA -/T TTTCCTCATT 3070 hom 141 het 51 0 48 4 T 3 4 93865 CASAVA_Build 16 7842010 1I AATTATTTTA -/T TTTTTTATTA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 6 7 93866 CASAVA_Build 16 7847331 4I GAAAGAATGG ----/CTGT CTATTCTATA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CTGT 0 1 93867 CASAVA_Build 16 7848698 1D GCAATGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 811 hom 19 2 11 7 T 15 14 93868 CASAVA_Build 16 7852572 4I CTTCTTCTAG ----/GGAA GGAAGGGGCT 3070 hom 68 het 28 0 20 8 GGAA 1 2 93869 CASAVA_Build 16 7854258 1D TATATATCCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 10 9 93870 CASAVA_Build 16 7855287 4D CACAAAGAAG CAGA/---- CAGTCAATAA 3070 hom 69 het 26 0 22 8 CAGA 1 0 93871 CASAVA_Build 16 7855484 1I TAAAAATAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 9 93872 CASAVA_Build 16 7870806 7D GTTGAGTCTG TATCTGT/------- TATCTGTATT 3070 hom 28 het 15 0 9 6 TATCTGT 2 1 93873 CASAVA_Build 16 7894659 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 2337 het 1984 hom 20 5 8 7 T 9 10 93874 CASAVA_Build 16 7901241 2D ACTCTTAAAC AA/-- CGTGGAGGTT 3070 hom 123 het 44 0 41 4 A 2 0 93875 CASAVA_Build 16 7910658 1D CAATGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 A 11 10 93876 CASAVA_Build 16 7910985 1I CAAAACAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1105 hom 44 3 34 7 C 0 1 93877 CASAVA_Build 16 7911937 1I TTTAGAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 37 3 22 12 T 12 13 93878 CASAVA_Build 16 7929004 1D ATGACTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 19 9 T 13 12 93879 CASAVA_Build 16 7932857 7D TTTATTTTTA TTTTTAT/------- TTTTTGGCTT 3070 het 876 hom 30 5 16 10 TTTTTAT 1 0 93880 CASAVA_Build 16 7937239 10D ATGACTCAAG GGGAAAGGGT/---------- GGGAAAGGGT 3070 het 3070 hom 54 17 30 12 GGGAAAGGGT 2 1 93881 CASAVA_Build 16 7948039 1D TCCCAGCTGA T/- TTTTTTTTTC 2556 het 2556 ref 26 10 9 8 T 10 9 93882 CASAVA_Build 16 7948547 2I GAAAGCTCTG --/TA CAGTCATTCT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 TA 0 1 93883 CASAVA_Build 16 7949575 4D TTTCTTTCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 16 12 93884 CASAVA_Build 16 7949924 3I TGTGGTGGCA ---/TCT TCTTCTTGTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 TCT 2 3 93885 CASAVA_Build 16 7962892 1I TGAAGCCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 A 9 10 93886 CASAVA_Build 16 7963709 1D CTTACAGGAA G/- GGGGCTGAAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 G 5 4 93887 CASAVA_Build 16 7975546 1I ACCTATCTTC -/T TTCTCTTATC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 2 3 93888 CASAVA_Build 16 7977269 12D ATCTTAGTAG CTCTGTGCGTTT/------------ CTTCTTTGAT 3070 het 3070 ref 34 22 11 4 CTCTGTGCGTTT 1 0 93889 CASAVA_Build 16 7981213 1D CCTTTTTCTC T/- GCAGCCTCGT 3070 het 3070 hom 42 22 19 1 T 1 0 93890 CASAVA_Build 16 7981692 3D ACAAGTATTC AAG/--- AAGAAGTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 AAG 3 2 93891 CASAVA_Build 16 7982813 3I GAGCAAGAAA ---/GCT GCATATGTGC 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 GCT 0 1 93892 CASAVA_Build 16 7995426 6D CCTCTTCTGT TTACTC/------ TCCCTCATTT 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 TTACTC 1 0 93893 CASAVA_Build 16 7999657 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 858 hom 18 4 11 3 A 13 12 93894 CASAVA_Build 16 8004748 1I ATTCTAGATA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 7 8 93895 CASAVA_Build 16 8010295 2I GGTTATGGGC --/CT TGATGAAAAG 3070 het 3070 hom 65 25 34 6 CT 0 1 93896 CASAVA_Build 16 8019114 3I ATAAAAAGAT ---/AAG AAGTATCATC 3070 het 3070 ref 37 25 10 2 AAG 1 2 93897 CASAVA_Build 16 8031502 9I AGAAATTAGC ---------/TGGGTGTGG TGGTGAGCGC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 TGGGTGTGG 0 1 93898 CASAVA_Build 16 8040026 18D GGAAGCCATT TTCAGAAGGGAAGGTAAG/------------------ TTCAGAAGGG 3070 het 3070 ref 34 13 15 15 TTCAGAAGGGAAGGTAAG 2 1 93899 CASAVA_Build 16 8052632 2I ACTTTTCTTC --/TT TTTTTCTCCT 3070 hom 144 het 50 0 49 1 T 5 7 93900 CASAVA_Build 16 8057623 2D AGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 1184 het 1184 ref 56 41 3 14 TG 7 6 93901 CASAVA_Build 16 8060349 4I ACACGGATTC ----/AAAT AAATCCCTGC 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 AAAT 1 2 93902 CASAVA_Build 16 8093272 1I AAGTATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 A 10 11 93903 CASAVA_Build 16 8100032 7I TGTTTTACAA -------/GCATCCT TGACACGTGC 3070 het 3070 hom 49 21 19 9 GCATCCT 0 1 93904 CASAVA_Build 16 8100481 1D ACTTTTTGAT G/- GGGGGAGTCA 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 G 6 5 93905 CASAVA_Build 16 8101604 4I CATATGTGTG ----/TATA TATATAGAGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TA 3 5 93906 CASAVA_Build 16 8127331 1I TCACAACCCT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 A 8 9 93907 CASAVA_Build 16 8127650 4I TGCCCCCCTA ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 60 26 21 13 AC 6 8 93908 CASAVA_Build 16 8137228 3I TGAGCCAAGA ---/CTG CGCCACTGCA 3070 het 2206 hom 18 7 9 2 CTG 0 1 93909 CASAVA_Build 16 8140372 3D AAATACAAAA ATT/--- ATCCTGGCGT 2261 het 869 hom 12 3 7 3 ATT 1 0 93910 CASAVA_Build 16 8143814 1I TCTGGATACC -/T TTTTAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 4 5 93911 CASAVA_Build 16 8144906 2I GAGTTTAACT --/CC CCTCTCTCAG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 C 2 4 93912 CASAVA_Build 16 8147458 2D TTTCTTTCTT TC/-- TTTTTTTTTT 1839 het 1839 ref 19 10 8 1 TC 1 0 93913 CASAVA_Build 16 8154361 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 67 hom 31 1 17 14 T 11 10 93914 CASAVA_Build 16 8162900 2I CCTGAGCAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 39 2 25 12 A 13 15 93915 CASAVA_Build 16 8176308 1D TTTTGCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 12 11 93916 CASAVA_Build 16 8177103 1I GGAGGCTGAG -/C CACGAGAATT 3070 hom 89 het 32 0 29 4 C 1 2 93917 CASAVA_Build 16 8178039 1I AGAAAAGAAA -/G GAGGGAAGGA 3070 hom 80 het 37 0 24 13 G 1 2 93918 CASAVA_Build 16 8189237 8D CTGCTTCTTA GGCAGCAC/-------- GTGCTGCAAG 3070 het 3070 ref 46 21 21 8 GGCAGCAC 1 0 93919 CASAVA_Build 16 8190696 1I CAAAAATGTG -/A AATCATCATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 3 93920 CASAVA_Build 16 8207752 1I GAGTACATAT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 7 8 93921 CASAVA_Build 16 8210773 1I TGAGTCAATT -/A AACTTCCTTC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 2 3 93922 CASAVA_Build 16 8211466 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2236 hom 28 8 12 9 A 13 12 93923 CASAVA_Build 16 8211634 1D CACAAAGAAG T/- TTTTTAGTGA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 6 5 93924 CASAVA_Build 16 8215975 1I CAAAAAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 8 9 93925 CASAVA_Build 16 8230391 4D TAGATATTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1991 hom 39 13 15 11 T 16 12 93926 CASAVA_Build 16 8241351 1I ACTCAATAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 A 9 10 93927 CASAVA_Build 16 8242165 1I GTAAATGCTG -/A AAAAAAAAAA 2360 het 2360 ref 19 9 7 3 A 10 11 93928 CASAVA_Build 16 8243525 2D GTGAATGTCT CA/-- CACGCACACA 3070 het 3070 ref 39 21 11 8 CA 2 1 93929 CASAVA_Build 16 8256631 2I TTCCCCTTTG --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 38 14 13 11 CT 6 7 93930 CASAVA_Build 16 8265338 4D ACATTGTTCC AGTT/---- AGTTACCCAT 3070 hom 73 het 32 0 29 5 AGTT 2 1 93931 CASAVA_Build 16 8266628 1D AACAAGTGAA T/- TTCTGAGACT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 3 2 93932 CASAVA_Build 16 8267829 1I GGCTGTCAGG -/C CCCCCACTGG 3070 hom 122 het 44 0 41 3 C 5 6 93933 CASAVA_Build 16 8280742 1D GAAAATATTC A/- AAAAATTAAT 3070 hom 116 het 46 0 39 8 A 6 5 93934 CASAVA_Build 16 8282051 2D TCCAGACCTG TC/-- CTGTCTAACA 3070 het 3070 ref 39 19 11 10 TC 1 0 93935 CASAVA_Build 16 8292600 1I ACGAAAGCCC -/T CATGTTCAGA 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 T 0 1 93936 CASAVA_Build 16 8303126 2I TACATATATG --/TA TATATATATA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TA 5 6 93937 CASAVA_Build 16 8336841 1D CAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 46 2 32 13 A 11 10 93938 CASAVA_Build 16 8341614 4D TTGTTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 2104 het 1492 hom 32 7 14 11 TTTG 1 0 93939 CASAVA_Build 16 8343360 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAGAAAGT 3070 hom 45 het 37 1 28 8 A 6 4 93940 CASAVA_Build 16 8350027 7I TTCACACCCT -------/TAAACGA GGGCCAGTTG 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 TAAACGA 0 1 93941 CASAVA_Build 16 8350247 1D GTGACATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2264 hom 29 8 12 9 T 15 14 93942 CASAVA_Build 16 8352399 1D ACAATTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 17 11 A 11 10 93943 CASAVA_Build 16 8397146 1I CCAGCAAGAA -/G GGGCATTCCA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 G 3 4 93944 CASAVA_Build 16 8402562 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 18 0 13 5 A 12 11 93945 CASAVA_Build 16 8403053 2I CTTCAGCCAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 26 7 A 9 11 93946 CASAVA_Build 16 8413348 2I CTTCTAAGTG --/TC TGTGTGGCAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TC 0 1 93947 CASAVA_Build 16 8414078 1I TTTTTATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1511 hom 34 4 18 12 T 10 11 93948 CASAVA_Build 16 8414706 1D GAAGAGGGGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 8 93949 CASAVA_Build 16 8422507 1D CTATTTATAA T/- TTGGTGTCTT 3070 hom 85 het 31 0 28 4 T 3 2 93950 CASAVA_Build 16 8435150 1D AACAGGCATG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 8 7 93951 CASAVA_Build 16 8454670 1I ATGCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 28 1 17 10 A 11 12 93952 CASAVA_Build 16 8456717 4D AAAGGAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAA 1596 het 1596 ref 19 8 7 4 AAAG 4 3 93953 CASAVA_Build 16 8459043 1I ATTCTCCACT -/C CCTAGATTTG 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 C 2 3 93954 CASAVA_Build 16 8463462 2D ACACTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 1981 het 497 hom 22 1 6 15 A 14 12 93955 CASAVA_Build 16 8469853 1D TTAAAACTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 10 9 93956 CASAVA_Build 16 8471033 2I ATCTTGAGAC --/AG AGAGGAAATA 3070 het 3070 ref 46 23 22 1 AG 2 3 93957 CASAVA_Build 16 8475264 1I TAGGCAGTAG -/A AAGTTATAAC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 2 3 93958 CASAVA_Build 16 8477672 1I ATAATAAACT -/A GGGGGCAATG 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 A 0 1 93959 CASAVA_Build 16 8478863 6I ATGGATTTGA ------/TTTTCT TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 11 12 TTTTCT 2 3 93960 CASAVA_Build 16 8493769 1I TATTAACTGG -/A AAAAAAACGA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 7 8 93961 CASAVA_Build 16 8494348 1I TCAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 T 12 13 93962 CASAVA_Build 16 8498228 6D CTGGAAGATG CAGCTT/------ CCAGCTGCAT 3070 het 3070 ref 59 30 17 13 CAGCTT 1 0 93963 CASAVA_Build 16 8511253 1D TTCATACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2836 hom 40 11 15 14 A 15 14 93964 CASAVA_Build 16 8517547 1I TGTAGTAAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 8 9 93965 CASAVA_Build 16 8518247 2D CACCCAAAAT GC/-- GCACACACAC 3070 het 3070 hom 51 23 21 7 GC 2 1 93966 CASAVA_Build 16 8520575 2D CGAGGGAGAC AG/-- AGAGGAGAGA 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 AG 3 2 93967 CASAVA_Build 16 8523158 1D ACACATAAAC A/- AAAGCAAACA 3070 het 3070 hom 48 15 30 4 A 4 3 93968 CASAVA_Build 16 8531573 5I CAACATGAAG -----/CTTCA CTTCATTCCA 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 CTTCA 1 2 93969 CASAVA_Build 16 8557070 2D CAGCTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2712 hom 29 het 11 0 10 1 T 14 12 93970 CASAVA_Build 16 8560329 1I TTTTGTGTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 33 0 28 5 T 9 10 93971 CASAVA_Build 16 8561134 1D TTTTTTTTTT A/- AAAGGAACAT 3070 het 137 hom 31 1 24 6 A 4 3 93972 CASAVA_Build 16 8576523 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2242 hom 30 7 16 7 T 10 11 93973 CASAVA_Build 16 8595593 6D GCTCCTAGGC AAAGAT/------ AACCTTATAG 3070 hom 107 het 38 0 34 7 AAAGAT 1 0 93974 CASAVA_Build 16 8615142 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 28 2 16 10 A 16 17 93975 CASAVA_Build 16 8618258 4D CCCTGTCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 59 het 26 0 20 7 AAAT 4 3 93976 CASAVA_Build 16 8618450 5I TACTTTTAAA -----/AAATG AAATGAAATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AAATG 1 2 93977 CASAVA_Build 16 8619595 1I TAATCCCTTG -/T ATGCATACAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 0 1 93978 CASAVA_Build 16 8619698 7I CTGTAACTTA -------/TTTTGTT TTTTGTTTTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 TTTTGTT 2 3 93979 CASAVA_Build 16 8622546 4D CAGTCTGTAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 24 7 A 15 11 93980 CASAVA_Build 16 8622890 22I ATGAGTTTAG ----------------------/CCACCCATATGCGGAGATGACC CCACCTAGGC 3070 hom 45 het 19 0 12 7 CCACCCATATGCGGAGATGACC 0 1 93981 CASAVA_Build 16 8631386 1D GCGCTGCTCA T/- TTGGGGAGCG 3070 hom 91 het 33 0 29 5 T 3 2 93982 CASAVA_Build 16 8631559 4D ATCTGCTCAG CAAA/---- CAGTTACTAA 3070 hom 122 het 46 0 39 9 CAAA 1 0 93983 CASAVA_Build 16 8638011 1I TTGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 64 het 28 0 22 6 T 9 10 93984 CASAVA_Build 16 8639477 1I TGTACTTCAG -/C TTGGTCAACA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 C 0 1 93985 CASAVA_Build 16 8640384 1D CTCTCTAGGC A/- AAAAACATGG 3070 hom 99 het 35 0 32 3 A 6 5 93986 CASAVA_Build 16 8641889 3I ATGATGGATG ---/AGA AGGAGGGAAG 3070 hom 60 het 27 0 19 8 AGA 0 1 93987 CASAVA_Build 16 8643002 1D TAAAGATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 11 10 93988 CASAVA_Build 16 8645478 2D CCAGCAGTTT TC/-- TCTCTGTTCT 3070 hom 96 het 34 0 29 5 TC 3 2 93989 CASAVA_Build 16 8646977 1D AAAAATCAAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 27 0 26 3 A 8 7 93990 CASAVA_Build 16 8648642 1I GATACCCACA -/T TTACAGCGGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 3 93991 CASAVA_Build 16 8648955 1I ATGCGGTAAT -/G CACGGAGCAT 3070 hom 114 het 45 0 35 10 G 0 1 93992 CASAVA_Build 16 8651181 5D TTAAAAAAAA AAAAC/----- CATTAGTGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAAAC 1 0 93993 CASAVA_Build 16 8654047 2I AAAAAAAAAA --/AT TTTTTTTAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AT 0 1 93994 CASAVA_Build 16 8655121 1D TCAGTTAGTT A/- AACCTGCTTC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 3 2 93995 CASAVA_Build 16 8661468 1D GGTACAGTGA T/- TTTTGCCCTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 5 4 93996 CASAVA_Build 16 8661537 4D TTTTTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 45 het 20 0 15 6 TTTG 3 2 93997 CASAVA_Build 16 8662588 2D GTGTGGGTCT AC/-- AGTGACTCTC 3070 hom 58 het 23 0 17 6 AC 1 0 93998 CASAVA_Build 16 8666506 1D TACAAAAAAA G/- TAATAATAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 G 1 0 93999 CASAVA_Build 16 8670365 4D AGAAAAAAAT GAGA/---- GAGAGAGAAA 3070 hom 53 het 21 0 17 5 GA 6 4 94000 CASAVA_Build 16 8680885 1I CATGAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 2580 het 756 hom 28 4 12 12 A 15 16 94001 CASAVA_Build 16 8683971 1D CCCCGACCCC T/- GCCAACCTTG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 1 0 94002 CASAVA_Build 16 8684910 1I CCCTGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 567 hom 25 4 17 4 A 12 13 94003 CASAVA_Build 16 8685323 2D TGAGAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 23 het 29 1 23 5 AG 8 7 94004 CASAVA_Build 16 8704074 1I AGATTTGGGT -/G GGGACATGGA 3070 hom 111 het 45 0 31 14 G 3 4 94005 CASAVA_Build 16 8706428 1I AGAGTTGGGA -/T TTTTTTTTTT 1034 het 1034 ref 26 16 3 7 T 10 11 94006 CASAVA_Build 16 8707171 1I AGCTAAGAGC -/G AAGTCAGGTT 3070 hom 102 het 40 0 33 7 G 0 1 94007 CASAVA_Build 16 8709530 1I AAAAGGAGTC -/T TGCTGGGAGA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 1 2 94008 CASAVA_Build 16 8710597 1I ATTATTTATC -/T TTTTTTCAAC 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 6 7 94009 CASAVA_Build 16 8713364 1I TTGGGAGGTC -/G GGGGGGGAGG 3070 hom 55 het 25 0 17 8 G 7 8 94010 CASAVA_Build 16 8729914 1D CCTGGAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 37 0 35 2 A 10 9 94011 CASAVA_Build 16 8730504 1I GGCTCTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 19 1 14 4 A 13 14 94012 CASAVA_Build 16 8736405 1I ATCTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 22 0 19 3 A 11 12 94013 CASAVA_Build 16 8737600 2I CTCCCATGAC --/AT GTGGGAATTA 3070 hom 80 het 33 0 26 7 AT 0 1 94014 CASAVA_Build 16 8738843 4I AAAAAATAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AAAT 3 4 94015 CASAVA_Build 16 8739127 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2470 hom 33 het 14 0 10 4 A 10 11 94016 CASAVA_Build 16 8741121 5D AAAACAAAAA AACAG/----- AAAAAATAGA 3070 hom 132 het 51 0 44 11 AACAG 1 0 94017 CASAVA_Build 16 8743915 4D AAAGGAAAAG ATAA/---- ATAGTTTAGT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 ATAA 1 0 94018 CASAVA_Build 16 8744677 6D TGTGTGTCTC TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 36 het 20 0 13 9 TG 17 14 94019 CASAVA_Build 16 8745043 3D17M2I TATATTTTAG TTATAATATATATTTTAGTT--/---TGATATATATTTTAGTTAA ATATATGTAG 1983 hom 12 het 5 0 5 1 N/A 0 0 94020 CASAVA_Build 16 8750045 1I TCTGTTTTTG -/C TCTGTGTATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 0 1 94021 CASAVA_Build 16 8751561 3I CATACAGAAA ---/AAT AATTCATAAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 AAT 1 2 94022 CASAVA_Build 16 8760722 1I GGAACAGAGT -/A AAAAAATTTT 55 het 55 ref 20 14 2 4 A 6 7 94023 CASAVA_Build 16 8769734 1D ACACAATCCC A/- CTGCAGAGTG 3070 hom 104 het 39 0 30 9 A 1 0 94024 CASAVA_Build 16 8774818 1D CCTTAAAATC T/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 T 5 4 94025 CASAVA_Build 16 8776626 8I ACCATCAGCC --------/TTTTCCTG TTTTCCTGTT 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 TTTTCCTG 1 2 94026 CASAVA_Build 16 8776924 2D ATACAGATTT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 17 het 47 1 31 19 AC 9 8 94027 CASAVA_Build 16 8782182 1I AGCTGTAACT -/G GTGAAGTCAC 3070 het 3070 hom 45 11 21 13 G 1 2 94028 CASAVA_Build 16 8791875 1D TGTGACTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 T 11 10 94029 CASAVA_Build 16 8794368 2I CCTTCACAGC --/AG AGTGACGTGA 3070 hom 99 het 42 0 31 11 AG 1 2 94030 CASAVA_Build 16 8798813 1D CAAGGAGGGC A/- AGAGAAAGCC 3070 hom 54 het 23 0 17 6 A 2 1 94031 CASAVA_Build 16 8804191 1I TCCGTCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 884 hom 33 3 25 5 A 13 14 94032 CASAVA_Build 16 8808849 4D CTTTTTGTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 31 hom 4 het 19 0 1 18 TTTG 1 0 94033 CASAVA_Build 16 8810901 1D ACCTCCGCCT C/- CCGGGTTCAA 3070 hom 80 het 32 0 25 7 C 3 2 94034 CASAVA_Build 16 8811144 3D AAAAAAACTC TTT/--- GTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 T 3 0 94035 CASAVA_Build 16 8812379 3I CTGTTTATCT ---/ATG ATGTTGCCCA 3070 hom 156 het 60 0 52 8 ATG 1 2 94036 CASAVA_Build 16 8816934 2D CAGTAGACAC AT/-- GAGTTGTTTC 3070 het 3070 ref 61 31 24 8 AT 1 0 94037 CASAVA_Build 16 8817937 1D CCGTCTCTAC T/- AAAAATACAA 2585 het 1429 hom 9 3 6 0 T 1 0 94038 CASAVA_Build 16 8819562 3D GCCTGGCGCA AAG/--- AAGATTTTTA 1221 het 1221 ref 17 11 4 2 AAG 2 1 94039 CASAVA_Build 16 8822370 1D TCCTGGACTT A/- ACCATGCCTA 3070 hom 153 het 56 0 50 6 A 2 1 94040 CASAVA_Build 16 8834852 5I ATTAATAAGA -----/CAAAT AAAATAAAAT 1180 het 868 hom 5 2 3 0 CAAAT 0 1 94041 CASAVA_Build 16 8837380 1D GGGGATAACT G/- AAAAGGAGTG 3070 hom 78 het 28 0 27 2 G 1 0 94042 CASAVA_Build 16 8837526 1D TGGAGTGGGT A/- GCCTCCGTAT 2247 het 701 hom 12 2 5 5 A 1 0 94043 CASAVA_Build 16 8841241 4I AGAAAGGAGA ----/ATAT AAGGAGAAAG 3070 hom 39 het 14 0 14 2 AT 0 2 94044 CASAVA_Build 16 8854699 1I GGCTGGAGAG -/A AAAAGGCCAC 2102 het 2102 ref 30 17 8 5 A 4 5 94045 CASAVA_Build 16 8854779 5I AGGCGAGGAA -----/ACAAC ACAATGGCCA 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 ACAAC 0 1 94046 CASAVA_Build 16 8857360 1I AAAGTCAGGG -/T TTTCACCATG 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 3 4 94047 CASAVA_Build 16 8858857 9I CAGGATTTCA ---------/CCATGTTGG CCAGGCTGGT 1625 hom 15 het 6 0 5 1 CCATGTTGG 0 1 94048 CASAVA_Build 16 8859287 3D GCCCGGCTAA TTT/--- TTTTTGTGTT 3070 het 1908 hom 15 5 9 1 T 8 5 94049 CASAVA_Build 16 8860261 2D CCAGACTCTC AT/-- GTGTGGTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 AT 1 0 94050 CASAVA_Build 16 8862016 4D AGGGAGAAGC CTAA/---- CTAACTCAGG 3070 hom 87 het 32 0 28 6 CTAA 2 1 94051 CASAVA_Build 16 8862414 4D TCTCAAAAAA AAAT/---- AAATAACTTT 3070 hom 39 het 18 0 11 8 AAAT 2 1 94052 CASAVA_Build 16 8870836 2I AAATACACAC --/AT GCACACACAC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 AT 0 1 94053 CASAVA_Build 16 8874378 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2015 hom 34 8 16 10 A 15 16 94054 CASAVA_Build 16 8875185 1I ATTTTACTAT -/A AAATTGCTTT 3070 het 3070 ref 49 24 15 10 A 3 4 94055 CASAVA_Build 16 8882498 1I TGAAGCAGGC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 27 5 A 9 10 94056 CASAVA_Build 16 8886837 4I AGCCACAGTC ----/CATA CATAGTTCAG 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 CATA 1 2 94057 CASAVA_Build 16 8895888 1I ACCAGCCCCC -/G GGGGGGGGGA 2937 hom 20 het 33 1 16 16 G 9 10 94058 CASAVA_Build 16 8897264 1I GCATGGTCTC -/A AGCTCACTGC 1285 het 1285 ref 15 5 3 7 A 1 2 94059 CASAVA_Build 16 8902679 1D CAAAAAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 224 hom 45 2 34 9 A 12 11 94060 CASAVA_Build 16 8917948 1I TCCATTTAAA -/C GCTCAACTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 0 1 94061 CASAVA_Build 16 8924563 35I GTAATGAAAT -----------------------------------/ACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA ACTGTCTTAC 3070 hom 75 het 25 0 26 3 ACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA 0 1 94062 CASAVA_Build 16 8927512 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1377 hom 15 het 6 0 4 2 A 15 14 94063 CASAVA_Build 16 8930404 1I CCTCCCCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1148 hom 27 5 9 13 A 11 12 94064 CASAVA_Build 16 8933978 4D AATTTAAAAA AGAG/---- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 48 31 15 6 AG 2 0 94065 CASAVA_Build 16 8945591 1D ACAGAGGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 9 A 12 11 94066 CASAVA_Build 16 8946263 1I GTCAGGAGTT -/C CGAGATCAGC 2141 het 2141 ref 24 11 6 7 C 1 2 94067 CASAVA_Build 16 8948995 3I TGTGCGCTTA ---/TTG TTTTTCAATC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TTG 0 1 94068 CASAVA_Build 16 8953435 1D AAAAAGTAGA C/- CCCCCCGTCT 3070 hom 95 het 37 0 29 8 C 7 6 94069 CASAVA_Build 16 8959122 1D CTCTTAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 12 9 7 A 10 9 94070 CASAVA_Build 16 8960715 1I ACACTAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 622 hom 31 4 12 15 A 14 15 94071 CASAVA_Build 16 8969319 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 940 het 940 ref 27 14 4 9 T 19 18 94072 CASAVA_Build 16 8974576 4I TAAAAGTAAT ----/AATA AATAAAATAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 AATA 1 2 94073 CASAVA_Build 16 8975453 1D CCCTGTCTCA G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 35 0 16 19 G 2 1 94074 CASAVA_Build 16 8979446 1I GAAACCCCCC -/T CTCTCCTAAA 2960 hom 24 het 9 0 8 1 T 0 1 94075 CASAVA_Build 16 8983999 3I ACTTGTTTAT ---/CTG CTGACCTTCC 1326 hom 7 het 3 0 3 0 CTG 1 2 94076 CASAVA_Build 16 8991541 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 874 het 874 ref 25 12 4 9 A 15 14 94077 CASAVA_Build 16 9002494 1D ATTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 14 8 T 11 10 94078 CASAVA_Build 16 9010544 1I TCTCTCGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 562 hom 31 2 25 4 T 10 11 94079 CASAVA_Build 16 9024039 2D TTTGTCTCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 26 0 14 12 A 20 18 94080 CASAVA_Build 16 9025196 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 20 19 94081 CASAVA_Build 16 9025413 1D AAAATCTTTG C/- TTTGCCACTT 3070 hom 89 het 32 0 30 3 C 1 0 94082 CASAVA_Build 16 9029765 4I ATTATTTTTA ----/TTTG TTTATTTATG 3070 het 1834 hom 23 8 10 5 TTTG 0 1 94083 CASAVA_Build 16 9030512 1D CCTAGCTTTA T/- TTTTTTTTTC 2015 het 642 hom 18 5 10 3 T 10 9 94084 CASAVA_Build 16 9033583 1D TCATCAATCC T/- TTTTTTTTTT 2242 het 1340 hom 21 6 6 9 T 13 12 94085 CASAVA_Build 16 9054322 1I TCAAAAGGAC -/A AAAAAAAACA 1817 het 1817 ref 23 11 7 5 A 8 9 94086 CASAVA_Build 16 9056704 1D GCTCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2567 het 2413 hom 28 10 10 8 A 15 14 94087 CASAVA_Build 16 9058298 1D CCAACAACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 T 10 9 94088 CASAVA_Build 16 9061334 1D GCCTGGCTAG T/- TTTTTTTGTA 1667 het 530 hom 7 2 4 1 T 8 7 94089 CASAVA_Build 16 9064819 1D ACGCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2629 het 900 hom 15 5 6 4 A 16 15 94090 CASAVA_Build 16 9082469 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2966 het 2966 ref 26 10 9 7 A 10 11 94091 CASAVA_Build 16 9097237 4D AAGCCAAAAT ACTG/---- ACTGCTGGTT 3070 het 3070 ref 48 24 20 6 ACTG 2 1 94092 CASAVA_Build 16 9097318 1I GATCAGTATA -/T TTTTTTGATT 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 T 6 7 94093 CASAVA_Build 16 9097749 3D ATTTCCTTCT TCA/--- TCTTCTTTCC 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 TCA 1 0 94094 CASAVA_Build 16 9100498 1D AGCATTTAAA G/- AAAAAAAAGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 1 0 94095 CASAVA_Build 16 9100622 9D ATGGTGCAAT CTTGGCTCA/--------- TTGCAACCTC 3070 het 3070 ref 30 16 13 5 CTTGGCTCA 1 0 94096 CASAVA_Build 16 9103660 1I ATTTTCAAAT -/A TTTTTTTCAA 3070 hom 94 het 34 0 32 2 A 0 1 94097 CASAVA_Build 16 9109227 1I GTCTTGGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 15 12 T 10 11 94098 CASAVA_Build 16 9111517 1D TGGGTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1390 het 1390 ref 36 10 6 20 T 17 16 94099 CASAVA_Build 16 9112409 1I AAAACAAAAC -/A AAAAACCTGT 3070 het 2823 hom 40 10 24 6 A 5 6 94100 CASAVA_Build 16 9113266 1D GCATATATGA T/- TACTGTATCT 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 T 2 1 94101 CASAVA_Build 16 9114364 1I TACAACTTGG -/T TTTTTTTTTT 680 het 680 ref 33 18 3 12 T 12 13 94102 CASAVA_Build 16 9122937 2I TCTCTGGGCT --/CA GTTTTCTCAT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 CA 0 1 94103 CASAVA_Build 16 9134324 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2871 het 2871 ref 28 12 9 7 T 11 10 94104 CASAVA_Build 16 9138208 6D4M18D TGATTGTCAC AGACATTATGTCACAGGATGCGCATAAT/------TCTG------------------ GCTGATGGCA 3070 het 3070 ref 32 25 11 3 N/A 0 0 94105 CASAVA_Build 16 9142081 4D TGGTCTGATC ACAA/---- ACAAATTCAC 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 ACAA 2 1 94106 CASAVA_Build 16 9142382 1D TATCTGGGCA T/- TTTTTTTTTT 1223 het 1223 ref 31 19 5 7 T 12 11 94107 CASAVA_Build 16 9154465 8D TATTTGTGTG TATGTGTT/-------- TATGTGTGTG 3070 het 3070 hom 62 28 27 7 TATGTGTT 1 0 94108 CASAVA_Build 16 9154551 4D8M16D62M4D44M4D TGTGTATGTA TGTGTATGTGTTTGTGTGTGTGTATTTGTATGTGTATTTGTGTGTATTTGTACGTATATGCGTGTGTATGTGTATTTGTGTGTATATGTATGTGTGTATTTGTGTGTGTATATGTGTGTATATGTGTGTGTACGTGTGTGTA/----TATGTGTT----------------TATGTGTATTTGCGTGTATTTGTACGTATATGCGTTTGTATGTGTATTTGTGTGTATGTGTA----TGTATTTGTGTGTGTATATGTGTGTATATGTGTGTGTACGTGTG---- TGTATGTATT 3070 het 3070 ref 53 70 17 44 N/A 0 0 94109 CASAVA_Build 16 9155037 2D39M2D GTGTATTTGG GTGTGTGTGTATGTGTGTACGTGTGTATATGTGCGTGTGTATG/--GTGTGTGTATGTGTGTACGTGTGTATATGTGCGTGTGTA-- TGTGTATTTG 3070 het 3070 ref 51 32 19 37 N/A 0 0 94110 CASAVA_Build 16 9155102 2D71M1D TGTATGTATA TGTGTGTATGTGTGTTTGTGTGTATTTGTATGTATAAGTGTGTGTGCATATGTATGTATATGTACTTGTGTGTA/--TGTGTATGTGTGTTTGTGTGTATTTGTATGTATAAGTGTGTGTGCATGTGTATGTATATGTACTTGTGTGT- ATGTGTGTGT 1590 het 1590 ref 54 34 6 46 N/A 0 0 94111 CASAVA_Build 16 9163261 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 6 7 94112 CASAVA_Build 16 9171858 1I TGGATGTTTT -/C CTTCAGGGGA 3070 hom 101 het 40 0 31 9 C 1 2 94113 CASAVA_Build 16 9177913 1D ACCTGGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 25 1 18 6 T 12 11 94114 CASAVA_Build 16 9182364 2D GAGGCGAAAC TG/-- TTAATTAAGA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TG 1 0 94115 CASAVA_Build 16 9185067 1I CCCACAGAGC -/A AAAAAAATAA 3070 het 824 hom 33 2 28 3 A 7 8 94116 CASAVA_Build 16 9189811 1D CAGGGCCCCC T/- GTCCATCTCC 3070 hom 102 het 38 0 34 5 T 1 0 94117 CASAVA_Build 16 9192724 3I ATGGTGATGA ---/TGG TGGTAATGAT 2246 het 16 hom 46 2 19 25 TGG 1 2 94118 CASAVA_Build 16 9192760 4D TGGTGATGAT AGTG/---- ATGATGATGA 3070 hom 96 het 45 0 33 16 AGTG 1 0 94119 CASAVA_Build 16 9192876 3D16M3I58M3D TGCTGATGAT ATGATAATGGTGGTGATGA---TGGTGGTGATATGATGATAGTGATGATGAGAATGATAATGGTATGGTGATGATAGTGATAT/---ATAATGGTGGTGATGACGGTGGTGATGATATGATGATAGTGATGATGAGAATGATAATGGTATGGTGATGATAGTGA--- TGTTGATGAT 3070 hom 384 het 79 0 124 14 N/A 0 0 94120 CASAVA_Build 16 9193283 1D TGATGATAAT G/- ATATAGTGTT 3070 hom 168 het 62 0 56 6 G 1 0 94121 CASAVA_Build 16 9202269 1I TCCCTGGAGT -/A AAAATCCCTG 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 A 4 5 94122 CASAVA_Build 16 9203602 1I CCCAAAGTGC -/T TGGGATTACA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 T 1 2 94123 CASAVA_Build 16 9204677 3D TTTCCCTGGA ACT/--- GTCTCACAGT 3070 het 3070 hom 44 14 24 7 ACT 1 0 94124 CASAVA_Build 16 9215486 10D GGAGCCGATG CCCATGAATA/---------- GTGGCTCTTG 3070 het 3070 hom 40 16 20 10 CCCATGAATA 1 0 94125 CASAVA_Build 16 9223824 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 7 8 94126 CASAVA_Build 16 9225118 1I TCTCTGTGCA -/C CCTCCCCCAT 3070 hom 40 het 19 0 13 6 C 2 3 94127 CASAVA_Build 16 9227854 2D ACCTGGGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 21 0 11 10 T 14 12 94128 CASAVA_Build 16 9229384 2D TGTAGGCATG GT/-- GTCCAACATG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 GT 2 1 94129 CASAVA_Build 16 9231551 2I TTTGTTGGTC --/TG TGTGTCTGTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 TG 2 3 94130 CASAVA_Build 16 9232192 4D AATATAAAAA TATT/---- TATGAGATAT 3070 het 3070 hom 38 14 23 3 TATT 1 0 94131 CASAVA_Build 16 9234257 4D AAGATTAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 AAAC 3 2 94132 CASAVA_Build 16 9237803 2I CCTACCAATA --/CT CACAGATAGA 3070 het 3070 ref 63 32 22 9 CT 0 1 94133 CASAVA_Build 16 9238477 3D TTTCTAACTC CTT/--- CTTACCGAGA 3070 het 3070 ref 43 24 15 6 CTT 2 1 94134 CASAVA_Build 16 9238566 1I TCTGCAGGTG -/A TTTTTCTGGG 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 A 0 1 94135 CASAVA_Build 16 9240437 4D TTTGGCTGTG TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 6 TTTC 3 2 94136 CASAVA_Build 16 9240969 1I TATATGAATT -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 6 7 94137 CASAVA_Build 16 9241266 4D TTTCTTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2560 hom 36 13 16 8 T 15 11 94138 CASAVA_Build 16 9241562 6D TTGAACGCAT ATCTTA/------ ATCTTACTAG 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 ATCTTA 2 1 94139 CASAVA_Build 16 9241640 1D GAATTGATAT A/- AAAAATTATA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 6 5 94140 CASAVA_Build 16 9242093 1I TTTTGAATAG -/T ATTTTTGGGA 3070 het 2592 hom 32 8 13 12 T 0 1 94141 CASAVA_Build 16 9248229 6I TACTCTGAGC ------/ACATAG ACATAAACAG 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 ACATAG 0 1 94142 CASAVA_Build 16 9249931 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1221 het 579 hom 18 7 3 9 T 18 16 94143 CASAVA_Build 16 9251707 6D TGCCCATTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1664 het 489 hom 13 2 4 8 T 22 16 94144 CASAVA_Build 16 9252698 1D ACACATGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 30 1 22 7 T 13 12 94145 CASAVA_Build 16 9253187 4D TGTATGTTTA TGTC/---- TGTCTGTGTA 3070 het 3070 ref 81 41 30 14 TGTC 2 1 94146 CASAVA_Build 16 9253544 4D TGTATGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 75 32 33 13 TG 7 5 94147 CASAVA_Build 16 9255424 3D GTGGCTCTGC TTG/--- GATCGTATGC 3070 het 3070 hom 45 16 20 13 TTG 1 0 94148 CASAVA_Build 16 9266274 1D TGGTACAGCA T/- TTTTATATAT 960 hom 7 het 6 0 3 3 T 5 4 94149 CASAVA_Build 16 9271185 2D CAATTCTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2859 hom 25 8 11 8 A 12 10 94150 CASAVA_Build 16 9278223 1I TAACACAGCA -/G GATCTTTAAC 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 G 1 2 94151 CASAVA_Build 16 9284273 1I TCTACAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 25 0 20 5 A 10 11 94152 CASAVA_Build 16 9284482 2D ACACACACAC CA/-- CACACACACA 1923 hom 51 het 29 0 18 11 CA 6 5 94153 CASAVA_Build 16 9286919 1D25M9D ATACGGATTC TTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTAC/-TTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTT--------- ATGTGCACAA 3070 hom 75 het 22 0 26 3 N/A 0 0 94154 CASAVA_Build 16 9288857 1I ACTTAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 27 1 17 10 T 12 13 94155 CASAVA_Build 16 9297039 1I GGAAATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 9 10 94156 CASAVA_Build 16 9298161 1D AGTAAAAATA T/- TTTTTTAATA 629 het 629 ref 32 19 5 8 T 7 6 94157 CASAVA_Build 16 9299955 2D AGCCCAGGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2827 het 1046 hom 38 10 8 20 T 16 14 94158 CASAVA_Build 16 9301611 1I AGCCACCACA -/C CCAGCCTATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 C 2 3 94159 CASAVA_Build 16 9308509 1I ATAATAGGTG -/C CCCAGTGAGT 3070 het 3070 ref 60 32 22 6 C 3 4 94160 CASAVA_Build 16 9310130 1I CCAAGCAGCA -/G GTAAAACTCA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 G 1 2 94161 CASAVA_Build 16 9319974 12I GCCACCTCTG ------------/TGCCTTTGACCA TGTTGATGCT 3070 het 3070 ref 51 32 15 4 TGCCTTTGACCA 0 1 94162 CASAVA_Build 16 9331444 3D CCTCTTGCTT CTC/--- CTCTTGCACA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 CTC 2 1 94163 CASAVA_Build 16 9333167 4D TGTATTTATG TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 11 TATT 4 3 94164 CASAVA_Build 16 9342295 1D ATTTATTTGG C/- CCTGACCTTT 3070 het 3070 ref 32 18 10 6 C 3 2 94165 CASAVA_Build 16 9342939 1D ATCCCAGCAC T/- TTTGGGAGGC 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 T 4 3 94166 CASAVA_Build 16 9345409 1D GTAATGGACG T/- TTTTTTTTTT 761 het 761 ref 32 20 3 9 T 13 12 94167 CASAVA_Build 16 9347677 1D ATATTTTGAT A/- ATAAGCATCC 3070 hom 102 het 42 0 35 8 A 2 1 94168 CASAVA_Build 16 9349566 4I AATAAACTAA ----/CAAG CAAAAAGAAA 3070 hom 67 het 28 0 23 5 CAAG 0 1 94169 CASAVA_Build 16 9370093 2D35M2I TATATACATG TATATATATGTGTGTGTTTATATATATATAAATGTGA--/--TATATATGTGTGTGTTTATATATATATAAATGTGATG TATATATATA 3070 het 3070 ref 22 14 11 8 N/A 0 0 94170 CASAVA_Build 16 9371251 2I GAAGGAATCA --/CC CCCCTGCTGA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 C 4 6 94171 CASAVA_Build 16 9372005 3I ACCTCTCCTT ---/CTC CTTGCTGTTC 3070 hom 141 het 55 0 44 11 CTC 0 1 94172 CASAVA_Build 16 9384047 2I TCATTTTTTT --/TC CCCCTTTTTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TC 0 1 94173 CASAVA_Build 16 9388443 1D CCTGAATAAA G/- TCCAGACTCC 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 G 1 0 94174 CASAVA_Build 16 9394798 2D AGGAAGGGAA AT/-- TTAAAAATTG 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 AT 1 0 94175 CASAVA_Build 16 9397192 1D TTCCTGATAA G/- GGATCATTTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 G 3 2 94176 CASAVA_Build 16 9400070 1I CTCTGAGGCA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 7 8 94177 CASAVA_Build 16 9407136 4I AGTTACACAT ----/ATAC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 85 45 32 8 ATAC 0 1 94178 CASAVA_Build 16 9409135 2D GGGGAGAAAT GA/-- GAGAAGTGCT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 GA 3 2 94179 CASAVA_Build 16 9414720 1D CTCATGAAAT A/- AAGAGTAGCA 3070 het 3070 hom 29 12 16 2 A 3 2 94180 CASAVA_Build 16 9421420 1D GCAAGATGTG A/- AGACTCTGCC 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 A 2 1 94181 CASAVA_Build 16 9426523 2I AGAGAGAAAA --/AG AGAGAGACGG 3070 het 2857 hom 28 9 12 7 AG 3 4 94182 CASAVA_Build 16 9435988 3D GTCCAATGGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 22 7 A 15 12 94183 CASAVA_Build 16 9445233 1D GCACTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1614 hom 17 4 8 5 A 13 12 94184 CASAVA_Build 16 9451112 1D GCAGTCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 21 21 13 T 11 10 94185 CASAVA_Build 16 9453566 1D CCTTCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2151 hom 21 6 11 4 A 12 11 94186 CASAVA_Build 16 9459979 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2459 het 1597 hom 27 6 7 14 A 13 14 94187 CASAVA_Build 16 9472178 1I8M1I ATGGACATTT -AGTTGTTT-/AAGTTGTTTC CATACTTGGC 3070 hom 81 het 27 0 28 1 N/A 0 0 94188 CASAVA_Build 16 9476949 1I TCTGTCAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 10 11 94189 CASAVA_Build 16 9479836 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 13 0 9 7 T 10 11 94190 CASAVA_Build 16 9480293 1I ACCCCACTTC -/T TCTTCCTCTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 1 2 94191 CASAVA_Build 16 9483650 4D TGTGTGTGAA AGAG/---- AGAGAGAAAT 3070 het 3070 hom 62 25 29 8 AG 5 3 94192 CASAVA_Build 16 9485391 3D CTGGCTGTGG CAT/--- CATCATACAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CAT 3 2 94193 CASAVA_Build 16 9493651 4D AACAGGTAAT TATC/---- TACTTAACTA 3070 het 3070 hom 47 22 22 4 TATC 1 0 94194 CASAVA_Build 16 9494494 2D TTTACTTCTC AG/-- AGTCACCCTG 3070 het 3070 hom 47 19 22 8 AG 2 1 94195 CASAVA_Build 16 9496323 1D TCAGTGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 T 12 11 94196 CASAVA_Build 16 9497128 4D57M1I GATGGTGTCC TAATTCATGGCCCCGTAGACCTGGGCTTCGAATCTTTTATTTTATTTAGCCTTTATTTTTT-/----TCATGGCCCCGTAGACCTGGGCTTCGAATCTTTTATTTTATTTAGCCTTTATTTTTTA AAAAAATTCT 3070 hom 120 het 35 0 40 6 N/A 0 0 94197 CASAVA_Build 16 9497260 1D GTCATGGGTT G/- TTGTTTTTTT 1523 het 1523 ref 21 13 6 2 G 1 0 94198 CASAVA_Build 16 9499454 1D GGAGGGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1034 hom 32 3 21 8 T 13 12 94199 CASAVA_Build 16 9515793 16D TAAAGTAGGT TCTATGAGGCAGTGGC/---------------- TCTATGAGGC 3070 het 3070 ref 35 22 14 4 TCTATGAGGCAGTGGC 2 1 94200 CASAVA_Build 16 9516966 1D CATTTTGTGA T/- GATATAACAG 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 T 1 0 94201 CASAVA_Build 16 9517200 4D TTCTTGATAA TAAC/---- TAACTCACTC 3070 het 3070 ref 35 22 8 6 TAAC 2 1 94202 CASAVA_Build 16 9522213 4D TGTCTATCTG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 TCTA 6 5 94203 CASAVA_Build 16 9522352 4D AATTATTTTA AAAT/---- AAATGTTTAT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 AAAT 2 1 94204 CASAVA_Build 16 9522960 1I TAATTGTATA -/T TTTTTATATA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 T 5 6 94205 CASAVA_Build 16 9524101 2I CATTGTGGAC --/TT TCTTTGTTGC 3070 hom 88 het 41 0 35 6 T 1 3 94206 CASAVA_Build 16 9525674 14D TTCCTTCATT CCTCCCTCCCTTCC/-------------- TCCCTTCCTT 1540 het 1540 ref 19 11 5 6 CCTCCCTCCCTTCC 1 0 94207 CASAVA_Build 16 9529854 1I CCATCCTTTT -/G GGACAGAGGT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 G 2 3 94208 CASAVA_Build 16 9537260 3I AATGTGTTGA ---/ATT ATTATCAGTG 3070 het 3070 hom 61 25 31 5 ATT 1 2 94209 CASAVA_Build 16 9541719 1D TAGAGACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 12 14 T 13 12 94210 CASAVA_Build 16 9577227 1D TCAGGGTATA G/- GGGGGCTAAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 G 6 5 94211 CASAVA_Build 16 9580682 1D AGTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 30 2 22 7 T 15 14 94212 CASAVA_Build 16 9584065 2D ACTACAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 2884 het 794 hom 31 9 10 12 A 18 16 94213 CASAVA_Build 16 9594316 1D GTAGCCAGAG C/- CTTAAACACT 3070 het 3070 hom 58 24 28 6 C 2 1 94214 CASAVA_Build 16 9600033 1D GACAAATGAA C/- CCCCCCCCAC 3044 het 3044 ref 26 10 9 7 C 9 8 94215 CASAVA_Build 16 9604254 3D TAACTGCCTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 13 10 94216 CASAVA_Build 16 9608060 1I CCTTGGGTGA -/T TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 T 4 5 94217 CASAVA_Build 16 9641863 1D CAGAATACTT G/- ACATTGGTCT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 G 1 0 94218 CASAVA_Build 16 9642112 1D ATGTATAAGC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 62 23 35 4 T 8 7 94219 CASAVA_Build 16 9643924 1I TTTTCATATA -/T TAGAACAGAG 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 T 1 2 94220 CASAVA_Build 16 9646750 1D AAGGCTGGGT G/- GAAGGGAGGG 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 G 2 1 94221 CASAVA_Build 16 9654306 1D AGGAAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 13 12 94222 CASAVA_Build 16 9667238 1I CCACCACCTC -/T TGAGAGTCAT 3070 hom 125 het 49 0 45 4 T 1 2 94223 CASAVA_Build 16 9670167 1I ACTCCCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2081 het 235 hom 17 1 9 7 A 14 15 94224 CASAVA_Build 16 9676711 1I GAAAAAGGTA -/T CATGTGCGTT 3070 hom 72 het 25 0 23 2 T 0 1 94225 CASAVA_Build 16 9678691 1D AATAAATAAG T/- TTTCCTCTGA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 4 3 94226 CASAVA_Build 16 9679059 25D ATATCCATAA TAGCACTGATCATCTAGCAGATAGT/------------------------- TAGCACTGAT 2714 hom 15 het 10 0 6 6 TAGCACTGATCATCTAGCAGATAGT 2 1 94227 CASAVA_Build 16 9680545 1D AACCCCTATG T/- TCCTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 2 1 94228 CASAVA_Build 16 9680797 2I AACATGAGGG --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 8 10 94229 CASAVA_Build 16 9683836 1D AGACAAACAA T/- CCCCCCACAG 3070 hom 94 het 36 0 31 5 T 1 0 94230 CASAVA_Build 16 9685739 1D CCCATATTTC T/- TTTTATTTAT 1300 hom 12 het 12 0 4 9 T 5 4 94231 CASAVA_Build 16 9688760 11I GTATTTGGGG -----------/GGTCTGGGAGA GCTCTCCCAG 3070 hom 62 het 27 0 19 8 GGTCTGGGAGA 0 1 94232 CASAVA_Build 16 9690891 9D AAAGTTTGGC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 6 A 18 9 94233 CASAVA_Build 16 9694620 6D CATTTAGCAA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 21 0 13 8 T 22 16 94234 CASAVA_Build 16 9696213 2D GCAGCAGGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 100 het 40 0 33 7 AG 6 5 94235 CASAVA_Build 16 9706365 2D AGAGGTTAAC AA/-- GACGTCTTCA 3070 hom 169 het 59 0 57 3 A 2 0 94236 CASAVA_Build 16 9708364 5D AAAAACAAAC AAAAG/----- AAATAAAGTT 3070 het 3070 ref 35 20 13 9 AAAAG 1 0 94237 CASAVA_Build 16 9712681 3D AAGAAAGGAT CTC/--- ACTATGTTGT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 CTC 1 0 94238 CASAVA_Build 16 9714681 2D GGCTGGTAAC AG/-- GGACAGGGCA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 AG 1 0 94239 CASAVA_Build 16 9716528 1I ATTATATTGT -/C CAGATGATGC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 C 1 2 94240 CASAVA_Build 16 9719235 4I ACCCATTATT ----/CATC AATGCATCTA 3070 hom 169 het 64 0 56 8 CATC 0 1 94241 CASAVA_Build 16 9720723 3D CATTTACTCA TCT/--- TCTTTAATCT 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 TCT 2 1 94242 CASAVA_Build 16 9724622 3D GGAGGAGGAA GAG/--- GAGGAGGAGA 3070 het 1177 hom 26 7 14 6 GAG 4 3 94243 CASAVA_Build 16 9724805 3I GGAGGGAGAA ---/GAG GAGGAGGAGG 3070 het 3011 hom 45 10 20 15 GAG 3 4 94244 CASAVA_Build 16 9726870 12D CATACAAAGT CACACACACACA/------------ CACACACACA 3070 het 1744 hom 46 10 17 21 CA 15 9 94245 CASAVA_Build 16 9727759 1I AAGACGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 34 1 25 8 T 11 12 94246 CASAVA_Build 16 9771582 4I AGTAAAAATC ----/AAGG AAGATGTGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAGG 0 1 94247 CASAVA_Build 16 9814880 1I TTTTTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 25 1 14 10 T 12 13 94248 CASAVA_Build 16 9876446 1I CCTTGACCTA -/C TGGGCTCAAG 3070 hom 30 het 26 0 12 14 C 0 1 94249 CASAVA_Build 16 9912378 1D TACTTTAACT A/- AAAAAAAAAA 2024 het 2024 ref 44 31 6 7 A 12 11 94250 CASAVA_Build 16 9920181 1D GGTTGCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 24 1 16 8 A 13 12 94251 CASAVA_Build 16 9921925 1I GTGAATTGAA -/T TTTTTTTTTT 2186 het 2186 ref 40 22 9 9 T 15 16 94252 CASAVA_Build 16 9926070 1I TGCATAGTTC -/A AATTGTGTTT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 2 3 94253 CASAVA_Build 16 9928287 1I CTCTAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 12 13 94254 CASAVA_Build 16 9971985 2I CTTAACTGAC --/AA TGTGAATTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 2 94255 CASAVA_Build 16 9973365 3D TTTCTGGCCT GAG/--- GAGGTGGAAG 3070 het 3070 ref 37 17 11 11 GAG 2 1 94256 CASAVA_Build 16 9985588 1I TTTAATCGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 44 1 33 10 T 10 11 94257 CASAVA_Build 16 9989627 2D ATCCATAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 26 het 43 1 24 18 GT 7 6 94258 CASAVA_Build 16 9990788 1D CTCAAACTAT A/- AAAAAATCCT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 7 6 94259 CASAVA_Build 16 9994420 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAC 2140 het 2140 ref 18 8 7 3 A 9 10 94260 CASAVA_Build 16 10011107 1D AATGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2942 het 2906 hom 36 12 12 13 A 12 11 94261 CASAVA_Build 16 10019206 1I ATCAAAATTT -/G AAATAAAGAC 3070 hom 86 het 39 0 29 10 G 0 1 94262 CASAVA_Build 16 10020476 4I AATTGCAGGA ----/TCTG TCTGTGCCTC 3070 hom 82 het 43 0 34 14 TCTG 1 2 94263 CASAVA_Build 16 10027850 2D CCAGGCCATT AG/-- AGAGAGAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 12 7 AG 4 3 94264 CASAVA_Build 16 10030553 1D TTGCACACAC T/- TTTTTTTTTT 879 het 879 ref 32 24 2 6 T 12 11 94265 CASAVA_Build 16 10031547 1I GTGATTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 269 hom 32 1 24 7 A 9 10 94266 CASAVA_Build 16 10041931 2D CCCACATATT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 78 32 26 23 CA 9 8 94267 CASAVA_Build 16 10046771 1D CTCTTGCAAA T/- TTTTTTTTTT 2925 het 2925 ref 31 15 8 8 T 12 11 94268 CASAVA_Build 16 10047687 1D TTTTAAATTG T/- TTTTTTTTTT 2484 het 2484 ref 22 12 7 5 T 13 12 94269 CASAVA_Build 16 10050124 1I CTGGTGCCAC -/A AGGGGCTCAA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 1 2 94270 CASAVA_Build 16 10079844 1D GCAGAGTCCA G/- GGGGGAGGCA 3070 hom 92 het 38 0 29 10 G 6 5 94271 CASAVA_Build 16 10084302 2I TTCCTGTCAT --/TC TCTTTTTTAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TC 1 2 94272 CASAVA_Build 16 10088261 1D CCAGAATGAG C/- CCAGAGGCTG 3070 het 3070 hom 34 8 22 4 C 3 2 94273 CASAVA_Build 16 10102932 1I GGGTCATTTA -/G GGTGGTGATG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 G 2 3 94274 CASAVA_Build 16 10109946 1D GGAATCAGAA T/- TTGTGTTCAC 3070 het 3070 ref 56 28 19 9 T 3 2 94275 CASAVA_Build 16 10110704 1D ACATTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 12 11 94276 CASAVA_Build 16 10113352 4I TCAGCCTAGC ----/AAGA AAGGGAAGCT 3070 het 3070 hom 50 22 20 8 AAGA 0 1 94277 CASAVA_Build 16 10118420 1D CAAGTGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 59 21 23 15 A 15 14 94278 CASAVA_Build 16 10118883 1I AAAAAGTTAA -/T TTTGAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 3 4 94279 CASAVA_Build 16 10120750 12I3M1D TGAGTTGTTT ------------TCAT/GATAAATAAATATCA- GCTTAATATT 3070 het 3070 ref 36 22 11 7 N/A 0 0 94280 CASAVA_Build 16 10122839 1I TCAGGCAGAG -/C CCCCGGGAGC 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 C 4 5 94281 CASAVA_Build 16 10125837 2D TTGATAACTC TT/-- TGTTTATCCG 3070 het 3070 hom 47 18 23 7 T 3 1 94282 CASAVA_Build 16 10127022 1I TTCCGAGTCT -/C CCCCTCCCTG 3070 het 16 hom 27 1 16 10 C 4 5 94283 CASAVA_Build 16 10127521 3D TTCTTTATAT ATA/--- TATATATTTT 2284 het 199 hom 21 1 8 12 ATA 1 0 94284 CASAVA_Build 16 10129255 1D GATAGGAGTG T/- TTTTTTGCTT 3070 het 410 hom 37 3 21 14 T 7 6 94285 CASAVA_Build 16 10129270 1I TTGCTTGTGG -/A GGGCCTTGGG 3070 het 630 hom 34 4 11 19 A 0 1 94286 CASAVA_Build 16 10130731 2D GAGTTTGATT AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 117 het 46 0 37 9 A 10 8 94287 CASAVA_Build 16 10136298 1D ACGAACTAGC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 8 94288 CASAVA_Build 16 10141194 2I AGATAAATAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 11 13 94289 CASAVA_Build 16 10146872 1D AGCTGTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 12 11 94290 CASAVA_Build 16 10148995 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3016 het 2093 hom 27 7 9 11 A 16 15 94291 CASAVA_Build 16 10168484 1D ATCAACTGTG T/- TTAATAAACC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 3 2 94292 CASAVA_Build 16 10170700 9D ACTGAAGCAT CACCCCACA/--------- CCCTTGCTAA 3070 het 3070 ref 48 27 19 4 CACCCCACA 1 0 94293 CASAVA_Build 16 10183960 1D CCTCCCACCT C/- CCCCCTTCCC 2524 hom 36 het 17 0 10 7 C 6 5 94294 CASAVA_Build 16 10187273 4D AAAAATAAAT AAAG/---- AAAATAAAAC 3070 het 3070 ref 34 19 14 3 AAAG 1 0 94295 CASAVA_Build 16 10188507 5D AAAAAAATAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 2710 het 34 hom 10 1 8 1 AAAAT 4 3 94296 CASAVA_Build 16 10189105 2D CCAATGCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2556 het 343 hom 32 7 8 18 T 16 14 94297 CASAVA_Build 16 10190002 4I TTTATTTTAC ----/TTGT TTGTTTATTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 TTGT 1 2 94298 CASAVA_Build 16 10197782 1D TAAATGGTAG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 91 het 35 0 28 7 A 8 7 94299 CASAVA_Build 16 10198487 4D CAGTGTTTTC TCTA/---- TCTTTTTTTT 2509 het 2509 ref 31 18 11 2 TCTA 1 0 94300 CASAVA_Build 16 10198997 5I AGCAGACCCA -----/GGGAC GGGACTCTCA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 GGGAC 1 2 94301 CASAVA_Build 16 10200843 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 39 0 33 7 A 10 9 94302 CASAVA_Build 16 10201114 1D ATAGCTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 14 27 15 T 11 10 94303 CASAVA_Build 16 10204682 7D AAACTATGAT ACAATAA/------- ATGGGTGTTG 3070 het 3070 ref 33 22 9 4 ACAATAA 1 0 94304 CASAVA_Build 16 10216668 1I TTCTTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 36 1 25 10 T 13 14 94305 CASAVA_Build 16 10225043 1D AAGAAAAGAA T/- TTTTTTTAAA 910 het 910 ref 20 13 4 4 T 8 7 94306 CASAVA_Build 16 10244419 1D CAAGAGGGGG A/- TTTTCCCAAA 3070 het 3070 ref 50 29 15 6 A 1 0 94307 CASAVA_Build 16 10248422 12D GGAGTTCAAG AACAGCCTGGGC/------------ AACAGAGCAA 3070 hom 72 het 27 0 24 6 AACAGCCTGGGC 1 0 94308 CASAVA_Build 16 10255256 3D TACTAAATTA AAT/--- AATTTCATTT 2910 het 2910 ref 16 8 7 1 AAT 2 1 94309 CASAVA_Build 16 10255788 9D TTTCAGAGCA ATTATTATT/--------- ATTATTATTA 3070 het 144 hom 16 1 9 8 ATT 9 6 94310 CASAVA_Build 16 10258126 1D AAAAGCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1585 hom 39 8 16 15 A 12 11 94311 CASAVA_Build 16 10262205 9I AGAAATGTCT ---------/GTCACTGCA AAGGTTGTAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 GTCACTGCA 0 1 94312 CASAVA_Build 16 10271321 1D TGTCTGACCA C/- CCTAGCTTGG 3070 hom 151 het 56 0 51 5 C 3 2 94313 CASAVA_Build 16 10274750 1D TAGTAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 23 2 14 7 T 15 14 94314 CASAVA_Build 16 10282060 4D ATTAAAACAT TGTC/---- TGTTTTATTT 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 TGTC 1 0 94315 CASAVA_Build 16 10282119 2D TGACAGTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 16 14 94316 CASAVA_Build 16 10283617 8D TTTAAAAAAG AAAAAAAA/-------- AAAAAGAAAC 3070 het 2283 hom 20 9 12 5 A 13 5 94317 CASAVA_Build 16 10293486 1D CTGAGGGGTG C/- CTCCCAGTTA 3070 hom 30 het 13 0 11 3 C 2 1 94318 CASAVA_Build 16 10299443 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1840 het 1840 ref 28 12 8 8 T 11 12 94319 CASAVA_Build 16 10304911 12D GTCCCATTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 2665 hom 28 13 10 8 T 22 10 94320 CASAVA_Build 16 10312684 1D GACACAAGTC A/- GACTAGCAAG 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 A 1 0 94321 CASAVA_Build 16 10314972 4I CATCAAAAAC ----/AAAG AAATTCTGAG 3070 hom 172 het 61 0 58 3 AAAG 0 1 94322 CASAVA_Build 16 10361385 1I CTAAAACAAG -/T GCAACTAATA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 0 1 94323 CASAVA_Build 16 10365388 1I TTTCTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 9 10 94324 CASAVA_Build 16 10366396 4D ACCCGACAGC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 22 11 8 5 TTGT 3 2 94325 CASAVA_Build 16 10369977 2I3M5D ACCAGTAACA --AAGCAAAC/TTTTG----- CAGATTGGTG 3070 het 3070 hom 44 21 23 5 N/A 0 0 94326 CASAVA_Build 16 10374433 2D55M1I CAGGAATTGA GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTAACATGAGACAGAGGGCAAAATATG-/--GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTAACATGAGACAGAGGGCAAAATATGT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 32 25 11 N/A 0 0 94327 CASAVA_Build 16 10382534 1D TTTCATCTTC T/- TTTTTTTTGG 1625 het 1625 ref 21 5 6 10 T 9 8 94328 CASAVA_Build 16 10388214 1I GACGCAATAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 8 9 94329 CASAVA_Build 16 10398177 1I CTGACTAATT -/A AAAAAAAAAA 1997 het 1997 ref 18 8 6 4 A 10 11 94330 CASAVA_Build 16 10400476 1I AGACTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 A 9 10 94331 CASAVA_Build 16 10403116 1D GTTGGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 2419 het 2419 ref 27 12 10 5 T 14 13 94332 CASAVA_Build 16 10404266 1D ACCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1553 hom 24 7 13 4 A 15 14 94333 CASAVA_Build 16 10424056 1I CCCTGAACAG -/T TTATTTCACA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 2 3 94334 CASAVA_Build 16 10432158 3D TCATAACTAG GAC/--- GACTGAAATA 3070 het 3070 ref 43 29 12 4 GAC 2 1 94335 CASAVA_Build 16 10437750 1I TTACTGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 10 11 94336 CASAVA_Build 16 10444127 1D TTCTATTTTC A/- CAGGCCATTT 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 A 1 0 94337 CASAVA_Build 16 10457341 14I ATTTTATTTC --------------/TTTTTTTATTTTTA TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 TTTTTTTATTTTTA 0 1 94338 CASAVA_Build 16 10475698 2I TGTAACAGTA --/GT GTGTGTTCCT 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 GT 3 4 94339 CASAVA_Build 16 10485604 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 A 8 10 94340 CASAVA_Build 16 10504131 1D CCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 17 0 13 4 A 13 12 94341 CASAVA_Build 16 10505940 1I AATGCACCCC -/T TTGTCTCTCA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 T 2 3 94342 CASAVA_Build 16 10518562 3I GTTTCTTTTT ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 TTC 2 3 94343 CASAVA_Build 16 10520629 1I GCCTCCCAAA -/G GGCTCCCCTC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 2 3 94344 CASAVA_Build 16 10528882 2I CCATATGGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 43 0 30 13 A 11 13 94345 CASAVA_Build 16 10529101 1I CAGAATATGT -/C GGTAGAAGAT 3070 hom 72 het 41 0 25 16 C 0 1 94346 CASAVA_Build 16 10529210 1I CAGGAAGGTT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 6 7 94347 CASAVA_Build 16 10533561 1D TCTGGGGTGA G/- GGGGGGGGCG 3070 hom 70 het 27 0 19 10 G 9 8 94348 CASAVA_Build 16 10540615 1D TCTTTCTGTC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 8 7 94349 CASAVA_Build 16 10549388 1I CAAGGCTCTG -/A TCTGTTAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 0 1 94350 CASAVA_Build 16 10556955 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2662 het 2662 ref 24 10 9 5 T 9 10 94351 CASAVA_Build 16 10564543 3D CATTTCCTCT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 2307 hom 23 7 11 5 TTA 7 6 94352 CASAVA_Build 16 10588200 4D CAAGTGTGTG CTTT/---- CTTGCTTATT 3070 hom 108 het 39 0 37 4 CTTT 1 0 94353 CASAVA_Build 16 10591774 1I TCAGAATCTA -/T TATTTTCACA 3070 hom 102 het 40 0 33 7 T 1 2 94354 CASAVA_Build 16 10593528 1D GTTTCAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 38 0 28 10 T 11 10 94355 CASAVA_Build 16 10595767 1D CCCCCTCAAG C/- TTTCTCTCCT 3070 hom 129 het 50 0 43 8 C 1 0 94356 CASAVA_Build 16 10596438 1I AGAAGTTCTT -/C CCCAAGGGGA 3070 hom 92 het 35 0 29 6 C 3 4 94357 CASAVA_Build 16 10601552 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 1006 hom 22 5 9 8 AAAC 3 2 94358 CASAVA_Build 16 10618565 1I AGTAACCCCT -/A GGGCCCAGTG 3070 het 3024 hom 33 11 11 11 A 0 1 94359 CASAVA_Build 16 10623320 6I CCCTGTCTCA ------/AAAAAT AAAAATAAAA 3070 het 2583 hom 22 7 10 5 AAAAAT 2 3 94360 CASAVA_Build 16 10623645 2D CCACTCCCAG CA/-- CACACACACA 1649 het 1569 hom 24 9 7 9 CA 8 7 94361 CASAVA_Build 16 10626166 1I AGCAGTGGCC -/A AATTTCAGGA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 A 2 3 94362 CASAVA_Build 16 10626546 1D TGTCTCTGCT A/- AAAAATACAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 6 5 94363 CASAVA_Build 16 10627835 3I TTTCTCTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 1809 het 650 hom 9 3 5 1 TTC 0 1 94364 CASAVA_Build 16 10628725 4D AGCAGGTGAT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 2512 hom 29 8 17 5 AG 7 5 94365 CASAVA_Build 16 10629373 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2941 het 2264 hom 26 7 7 12 T 11 12 94366 CASAVA_Build 16 10631131 1D AGACAATGGC T/- TGGCTGACTC 3070 hom 56 het 24 0 17 7 T 2 1 94367 CASAVA_Build 16 10632428 2I ATCTATGTCC --/AT ATATATATAT 3070 het 111 hom 21 1 18 2 AT 7 8 94368 CASAVA_Build 16 10637734 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1154 het 767 hom 12 2 5 5 A 13 14 94369 CASAVA_Build 16 10647493 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2047 het 2047 ref 41 25 5 11 A 15 14 94370 CASAVA_Build 16 10651969 1I CTGGCCAGGT -/G GGGTGGCTCA 3070 het 1968 hom 22 6 11 5 G 3 4 94371 CASAVA_Build 16 10652242 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 1565 het 91 hom 22 3 9 10 A 15 16 94372 CASAVA_Build 16 10660079 4I GATATTTCTT ----/TTTC TTTCTTTTTT 3070 het 2117 hom 28 8 15 5 TTTC 1 2 94373 CASAVA_Build 16 10681816 1D GTGCTAGGGA T/- TTTTTTTTTT 1673 het 1673 ref 33 14 6 13 T 15 14 94374 CASAVA_Build 16 10684499 3I AGGCTTTCCA ---/AGG AGGTGTCTGA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 AGG 1 2 94375 CASAVA_Build 16 10692535 1I AAAAAATTTT -/A AAATTAGCCA 3070 hom 114 het 41 0 37 4 A 3 4 94376 CASAVA_Build 16 10696723 13D TACAGGAGTT ACTAGTATAGGAG/------------- ACTAGTATAG 3070 hom 95 het 43 0 29 18 ACTAGTATAGGAG 2 1 94377 CASAVA_Build 16 10699402 4D CTGTTAACTC ACTA/---- TGATATTAAT 3070 het 2652 hom 16 7 8 2 ACTA 1 0 94378 CASAVA_Build 16 10703654 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 127 hom 17 2 11 4 A 15 14 94379 CASAVA_Build 16 10704345 23D TAGAAATAAT ATATCCCCAGGATATTACAAATA/----------------------- ATATCCCAGT 3070 het 3070 ref 40 36 10 1 ATATCCCCAGGATATTACAAATA 1 0 94380 CASAVA_Build 16 10706848 2I GTGTACACAC --/AT GTTGTACACC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 AT 0 1 94381 CASAVA_Build 16 10707764 5I GTGTACACTC -----/GATGA GATATTAGGA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 GATGA 0 1 94382 CASAVA_Build 16 10708752 26I CCCTGGATAT --------------------------/TATGAAATATGTCACAGAAAGGTGTA TACTTCCTGC 3070 hom 91 het 31 0 28 6 TATGAAATATGTCACAGAAAGGTGTA 0 1 94383 CASAVA_Build 16 10709268 1D ATCACAGGAC G/- TTTTATACCC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 G 1 0 94384 CASAVA_Build 16 10710936 1D TTTCCCCCCC T/- GGATATTAGT 3070 het 3070 hom 31 9 20 3 T 1 0 94385 CASAVA_Build 16 10744016 4I ATAAATAAAT ----/AAAC AAACGTTTCC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 AAAC 1 2 94386 CASAVA_Build 16 10757755 4D AAAAATAAAA AAAT/---- AAAAGAGTTA 3070 het 3070 ref 24 15 8 3 AAAT 1 0 94387 CASAVA_Build 16 10779692 3I TCGCTGTCTC ---/AAA GAAGAATTAG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 0 3 94388 CASAVA_Build 16 10788062 31D CGGGCCACAT CCTGGTGATGACTGGGGATGGGCATTGGGAA/------------------------------- CCTGGTGATG 3070 hom 57 het 25 0 17 15 CCTGGTGATGACTGGGGATGGGCATTGGGAA 2 1 94389 CASAVA_Build 16 10827264 3I ACGCTGGTGT ---/GGA GGACATGGAC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 GGA 1 2 94390 CASAVA_Build 16 10842669 1I AAAGCCTCTC -/T CGAAGTCAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 0 1 94391 CASAVA_Build 16 10849373 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 9 94392 CASAVA_Build 16 10855958 1D CGTCTCAAAC A/- AAACAAAACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 4 3 94393 CASAVA_Build 16 10858274 1I AGCTCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 534 hom 29 2 20 7 A 11 12 94394 CASAVA_Build 16 10871451 1I GAGAAGTTAA -/G TGATTTGCCT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 0 1 94395 CASAVA_Build 16 10900769 1D GTTGGCTAAA C/- TGTCACCTCT 3070 hom 121 het 45 0 39 7 C 1 0 94396 CASAVA_Build 16 10902098 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2720 het 2720 ref 29 13 10 6 A 15 14 94397 CASAVA_Build 16 10911398 1I CAGACAGATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2759 hom 22 7 10 5 T 9 10 94398 CASAVA_Build 16 10914633 4D TCTTTCCCTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 CTTT 4 3 94399 CASAVA_Build 16 10920639 3D GCAACTTCTG CCC/--- CCCCCCAGGT 3070 hom 38 het 14 0 11 4 C 9 6 94400 CASAVA_Build 16 10932508 2I CACAGTGAGA --/CT CTGTCTCTAT 3070 hom 69 het 25 0 22 3 CT 1 2 94401 CASAVA_Build 16 10950962 2I CATGCTTGGC --/AG AGTCTCCAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 1 2 94402 CASAVA_Build 16 10952745 1I CTATTTGGTG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 T 7 8 94403 CASAVA_Build 16 10960931 1D TGTATTTTTA G/- TAGAGATGGT 3070 het 1661 hom 24 4 16 4 G 1 0 94404 CASAVA_Build 16 10977705 1I TTGTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 11 12 94405 CASAVA_Build 16 10992483 1D AAATAGTAAC A/- TCAGGGCACG 3070 het 3070 ref 53 31 17 5 A 1 0 94406 CASAVA_Build 16 10995102 1D TCATTGTTTA G/- TAAGGGAGTG 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 G 1 0 94407 CASAVA_Build 16 11007324 1D ACATGATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2608 hom 34 8 14 12 T 13 12 94408 CASAVA_Build 16 11008242 1D TGGGTGACTC A/- TTCTGCAACC 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 A 1 0 94409 CASAVA_Build 16 11008666 1I GAGACCCATC -/T TTGCCTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 2 3 94410 CASAVA_Build 16 11011512 1D CTTGTTTCTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2704 hom 18 7 8 3 A 9 8 94411 CASAVA_Build 16 11021914 2D GATAGCGCAA CT/-- CTCTCCCTGC 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 CT 3 2 94412 CASAVA_Build 16 11024971 1I TTTTTCCTAC -/T TTTTTTTTTT 1788 het 1788 ref 22 13 6 3 T 11 12 94413 CASAVA_Build 16 11027107 6D ATGATATAAC TAAGTT/------ TATGTGTTCT 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 TAAGTT 1 0 94414 CASAVA_Build 16 11045242 1D AAGAAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 5 A 12 11 94415 CASAVA_Build 16 11048375 1D TACATAGTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 18 13 10 T 10 9 94416 CASAVA_Build 16 11050372 1D GATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 T 11 10 94417 CASAVA_Build 16 11056291 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1792 het 1792 ref 39 17 8 14 T 17 16 94418 CASAVA_Build 16 11063499 4D CCTTGGAGCT GGGA/---- GGGAGGGAGG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 GGGA 3 2 94419 CASAVA_Build 16 11068716 1D GGTGACGGGG T/- TTAACCTGGC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 3 2 94420 CASAVA_Build 16 11075512 1D TTTTCTTCTC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 T 8 7 94421 CASAVA_Build 16 11077443 1D GGGATTCTAG A/- AAACTGGGAC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 4 3 94422 CASAVA_Build 16 11079559 1D GGTGCGAAGG C/- CCTGTGGTTT 3070 hom 64 het 25 0 20 5 C 3 2 94423 CASAVA_Build 16 11084507 4D GTTGTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 37 11 16 13 TTGT 6 5 94424 CASAVA_Build 16 11097536 2I CCCCATCTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 9 11 8 A 12 14 94425 CASAVA_Build 16 11100461 7I CAGGCTGAGT -------/GAGCCAA GAGCCAAGAG 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 GAGCCAA 1 2 94426 CASAVA_Build 16 11108015 1D GCTTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1042 het 1042 ref 33 24 3 6 T 11 10 94427 CASAVA_Build 16 11108605 1D CACCAGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1993 hom 31 5 20 6 T 11 10 94428 CASAVA_Build 16 11111895 2D TCATTTAGTC AA/-- GAGTTTGCAT 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 A 2 0 94429 CASAVA_Build 16 11118589 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 A 7 8 94430 CASAVA_Build 16 11119732 1D ATAAGGGACG T/- TAATTCTCAT 3070 het 3070 ref 57 27 19 11 T 2 1 94431 CASAVA_Build 16 11123470 1D GAAGGGCCTT G/- GCTCAGGCCG 3070 hom 55 het 22 0 15 9 G 2 1 94432 CASAVA_Build 16 11160279 1I CTCCAGCTCA -/G GGGAAAAAAA 2767 het 1510 hom 20 6 9 5 G 3 4 94433 CASAVA_Build 16 11164846 4D TGGTGATTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 57 26 27 4 TTTG 4 3 94434 CASAVA_Build 16 11166688 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1210 het 1210 ref 29 18 3 8 A 13 12 94435 CASAVA_Build 16 11174852 1D TCAGTCTTGA T/- TTTTCAAAGG 2697 het 2697 ref 27 14 7 6 T 5 4 94436 CASAVA_Build 16 11191341 3D TCAGGCAATT CTC/--- CTGCCTCGGT 3070 het 1804 hom 15 5 10 0 CTC 1 0 94437 CASAVA_Build 16 11193180 1D CACTTTGTCT A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 7 A 7 6 94438 CASAVA_Build 16 11197487 25D ATGAATAGAT GTGGAAGCAATGATGTGTAACATCC/------------------------- AAGATTAGGA 3070 het 3070 ref 37 22 18 3 GTGGAAGCAATGATGTGTAACATCC 1 0 94439 CASAVA_Build 16 11198089 4I GACTTGCAGA ----/TTTT TTTTTTTTTT 1105 het 309 hom 19 3 9 7 T 14 18 94440 CASAVA_Build 16 11200104 1D TTAGGACTCA G/- GTCCCCCTGA 3070 hom 96 het 36 0 32 6 G 2 1 94441 CASAVA_Build 16 11204697 1D ACAACAAAGA G/- CAACAATACC 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 G 1 0 94442 CASAVA_Build 16 11204983 1D CATAGTGAGA C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 C 5 4 94443 CASAVA_Build 16 11208401 1I TCTCTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 7 17 10 T 10 11 94444 CASAVA_Build 16 11217535 1D TAGCAAGTTA G/- GCCCAAAATT 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 G 2 1 94445 CASAVA_Build 16 11229353 1D AGATTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2831 het 2145 hom 35 10 10 16 T 15 14 94446 CASAVA_Build 16 11235302 8D CTAAAAAAAA AAAAAAAG/-------- AAAAGAAAAG 2575 het 606 hom 25 7 9 10 AAAAAAAG 1 0 94447 CASAVA_Build 16 11237452 1D ACCCCGGCTT A/- AAAAAAAAAA 1322 het 1020 hom 18 7 7 4 A 17 16 94448 CASAVA_Build 16 11240650 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 22 1 15 6 T 14 13 94449 CASAVA_Build 16 11245851 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 710 hom 23 3 17 4 A 16 15 94450 CASAVA_Build 16 11246524 7D TTTTTTTTTG TTTGTTT/------- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 13 8 TTTGTTT 3 2 94451 CASAVA_Build 16 11247060 1D GCCAGATGGC G/- GGGGGGCCTC 3070 hom 133 het 47 0 44 3 G 7 6 94452 CASAVA_Build 16 11250287 1D TTTCACCATG T/- TGGCCAGGCT 3070 het 1108 hom 21 4 12 5 T 2 1 94453 CASAVA_Build 16 11255766 1D AGAAAACTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 60 hom 18 2 11 5 T 9 8 94454 CASAVA_Build 16 11258313 2D CGGAAGAAAC TG/-- AGGCTGGGGA 1792 het 1792 ref 17 8 7 4 TG 1 0 94455 CASAVA_Build 16 11264218 1D CCAATTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 12 11 94456 CASAVA_Build 16 11268109 1D ACAGTGGGGG A/- AAAAAATTAC 1999 het 1999 ref 21 12 7 2 A 7 6 94457 CASAVA_Build 16 11269035 10D GTGCATCTTG TGTGTCCACA/---------- TGTGTACACA 3070 het 3070 ref 58 32 21 10 TGTGTCCACA 1 0 94458 CASAVA_Build 16 11276059 2D ACTCCGTCTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 106 het 42 0 37 6 T 11 9 94459 CASAVA_Build 16 11280189 2I TCAAAAAAAA --/AG AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 22 0 20 3 AG 0 1 94460 CASAVA_Build 16 11283671 1D GAACCCTAAA T/- GGATGCTATA 3070 het 3070 ref 34 16 12 7 T 1 0 94461 CASAVA_Build 16 11285223 1I CCCTGTACTC -/A ACAGGGAATG 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 1 2 94462 CASAVA_Build 16 11306183 3D AAATAATAAC AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 50 het 18 0 17 2 AAT 5 4 94463 CASAVA_Build 16 11315101 2D GATACATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 T 13 11 94464 CASAVA_Build 16 11323286 1D TGCATGCACA C/- ATACATGCAT 3070 het 3070 ref 101 47 29 27 C 1 0 94465 CASAVA_Build 16 11324551 1D CACGTTCTAA C/- CCCCCCAGAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 C 7 6 94466 CASAVA_Build 16 11336733 28D CCTTTGCTTA TTTTTATTTTTATTTTTTTATTTTTTAT/---------------------------- TTTTTATTTT 1033 het 1033 ref 10 4 3 3 TTTTTATTTTTATTTTTTTATTTTTTAT 1 0 94467 CASAVA_Build 16 11347297 3D GGTCCCTCCT TGG/--- TGAAGTTGAT 1556 het 1556 ref 15 5 6 5 TGG 1 0 94468 CASAVA_Build 16 11351956 1D TCAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 11 10 94469 CASAVA_Build 16 11359714 1I GTCTCAAGAG -/A AAAAAAGAGT 3070 het 3070 hom 42 14 18 11 A 6 7 94470 CASAVA_Build 16 11362678 1D GTCTCTTCTC A/- GTTGACTTAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 1 0 94471 CASAVA_Build 16 11365779 1D AGCCTCAGCG A/- CAGAACAAGA 3070 hom 117 het 43 0 39 5 A 1 0 94472 CASAVA_Build 16 11367923 3I GTTAATAGAG ---/CTT TTTTATAATT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CTT 0 1 94473 CASAVA_Build 16 11368652 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1694 het 628 hom 19 2 10 7 T 17 16 94474 CASAVA_Build 16 11376042 2I AGGCTGAATC --/AT ATGATTGATT 3070 het 3070 ref 53 25 17 11 AT 1 2 94475 CASAVA_Build 16 11382061 1I CCCTTGATTT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 94476 CASAVA_Build 16 11383306 1I CATTCTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 25 0 17 8 T 13 14 94477 CASAVA_Build 16 11383769 4I TTCTATGCCC ----/ATTT ATTTAGTGGG 3070 het 3070 ref 60 28 23 9 ATTT 1 2 94478 CASAVA_Build 16 11383979 21D ACAGGGCTGA GTATTTTCCCTAAACAGTGGT/--------------------- GTACATTCAA 3070 het 3070 ref 47 28 15 7 GTATTTTCCCTAAACAGTGGT 1 0 94479 CASAVA_Build 16 11384430 2I16M8D TGCCAGGGTC --TTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCT/TTTTTTTTTTTTTTGAGA-------- CACTCTGTTG 1769 het 618 hom 14 3 5 6 N/A 0 0 94480 CASAVA_Build 16 11388997 9I GTCTAGGAAA ---------/TTTTTTTTG TTTTGTTTTT 2943 het 2943 ref 31 16 9 6 TTTTTTTTG 0 1 94481 CASAVA_Build 16 11392750 2I AAGAAAGCAG --/GC GCGGGAGACT 3070 het 3070 hom 33 18 14 1 GC 1 2 94482 CASAVA_Build 16 11395010 1D GAGGCTGGCT G/- GGGAGGCTGC 2563 het 2563 ref 27 12 7 8 G 4 3 94483 CASAVA_Build 16 11400025 2I TGCGGCAGGA --/TT TTTTTTTTTT 2524 het 1771 hom 27 7 15 5 T 13 15 94484 CASAVA_Build 16 11400848 1I TCAAGTTCTG -/C CGCATGCGGT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 C 1 2 94485 CASAVA_Build 16 11401418 2D CATTTAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 37 0 25 12 A 13 11 94486 CASAVA_Build 16 11405188 3D GCTCCCCTGG CAC/--- CACAACTGCC 3070 het 3070 hom 50 20 19 11 CAC 2 1 94487 CASAVA_Build 16 11408392 14D ATAAATCATG CAATAAATCCAGCT/-------------- CAATAAATCC 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 CAATAAATCCAGCT 1 0 94488 CASAVA_Build 16 11408704 1D GCTGGGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2935 hom 34 11 14 9 A 12 11 94489 CASAVA_Build 16 11412066 1D TCATGCCCTA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 T 8 7 94490 CASAVA_Build 16 11413213 1D TCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 36 3 23 10 T 13 12 94491 CASAVA_Build 16 11424377 1D CCAGGGATGT G/- GGGGGCTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 13 7 G 6 5 94492 CASAVA_Build 16 11425619 2D GCTGAGCCCC CG/-- CGTTCCACAG 1520 het 1520 ref 18 6 5 7 CG 2 1 94493 CASAVA_Build 16 11442984 3D ATCTTGAGAT GAG/--- GAGATTATCT 3070 het 3070 hom 48 23 21 5 GAG 2 1 94494 CASAVA_Build 16 11445197 1I ATCCCAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2468 hom 31 9 12 10 T 13 14 94495 CASAVA_Build 16 11447682 1I AATTAAACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2679 hom 26 10 14 2 T 9 10 94496 CASAVA_Build 16 11458081 1D CACTGTGCCT G/- GCCCAGTTTG 3070 het 2825 hom 31 10 12 9 G 2 1 94497 CASAVA_Build 16 11464626 1D CACGCCCCCC T/- GATGGCCACC 3070 hom 56 het 22 0 16 6 T 1 0 94498 CASAVA_Build 16 11465528 6I ATGGACATGT ------/GTATGG GTATGTCATA 3070 hom 174 het 65 0 58 7 GTATGG 0 1 94499 CASAVA_Build 16 11468279 2D ATATGTGTAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 TG 8 7 94500 CASAVA_Build 16 11469495 1D AAAAAACACC T/- TGATTTCAGA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 2 1 94501 CASAVA_Build 16 11478017 2I ACACGCAGAC --/AT GTGATCACAC 3070 het 3070 hom 81 35 39 7 AT 0 1 94502 CASAVA_Build 16 11486164 8I CAAGTCTCAG --------/GTTCAAAA GTTCAAAAGT 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 GTTCAAAA 1 2 94503 CASAVA_Build 16 11488885 1D GGAAACAGCC T/- TTAAGCCTTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 T 3 2 94504 CASAVA_Build 16 11490861 1I TGAATCCAAC -/G GGGAATATTA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 G 3 4 94505 CASAVA_Build 16 11494142 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1927 het 1927 ref 17 8 5 4 A 13 12 94506 CASAVA_Build 16 11499076 1D ACCCAGTTGG T/- TCTGTGTATG 2437 het 2437 ref 22 13 8 1 T 2 1 94507 CASAVA_Build 16 11499189 5D AAGGGAAATA AATTT/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 AATTT 1 0 94508 CASAVA_Build 16 11502469 1I ACCCGGGTCT -/G GGGACCCCGC 3070 hom 56 het 22 0 15 7 G 3 4 94509 CASAVA_Build 16 11511403 1I TCATGCATTC -/G GTCCTGTGAC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 G 1 2 94510 CASAVA_Build 16 11511579 1I TTAGCAAAGG -/C CGTGTGCCTT 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 C 1 2 94511 CASAVA_Build 16 11514594 3D AACCCTGTCT CAA/--- CAACAACAAC 3070 hom 54 het 19 0 18 2 CAA 5 4 94512 CASAVA_Build 16 11523479 2D CCTGAAGGGC AG/-- AGAGAGAGAC 3070 het 3070 ref 36 16 12 9 AG 5 4 94513 CASAVA_Build 16 11532206 15I TCTGCCTGGG ---------------/AAGGGTCTCTGTACC AAGGGTCTCT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 AAGGGTCTCTGTACC 1 2 94514 CASAVA_Build 16 11536743 3I2M1I GCACAAAAAC ---AC-/GATACA AAATGCCTCT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 N/A 0 0 94515 CASAVA_Build 16 11550412 1I CCTTGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 10 11 94516 CASAVA_Build 16 11553198 1D CAAACAAAAC A/- AAACAAGTTT 654 het 654 ref 34 17 4 13 A 4 3 94517 CASAVA_Build 16 11553735 1I CAGACATAAA -/T ATTTATATAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 0 1 94518 CASAVA_Build 16 11558428 9I GTTGTTTTTT ---------/TTTTGTTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 TTTTGTTTG 0 1 94519 CASAVA_Build 16 11564513 1D ATAATAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 938 hom 16 2 7 9 T 11 10 94520 CASAVA_Build 16 11565961 1I GGGAGTGCAA -/T GGATAAGCCT 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 T 0 1 94521 CASAVA_Build 16 11567179 10I AATTCCGCTT ----------/ATCATATCCC AGCTTGCGTG 3070 het 3070 ref 26 10 13 3 ATCATATCCC 0 1 94522 CASAVA_Build 16 11576159 1D CAATATAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 6 het 27 1 16 10 T 10 9 94523 CASAVA_Build 16 11596261 6D AAAATAAAGT AAAATA/------ AAAATAAAAA 2606 het 812 hom 9 3 6 1 AAAATA 4 3 94524 CASAVA_Build 16 11606123 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 27 3 17 7 T 13 14 94525 CASAVA_Build 16 11610338 2I ACAAACAAAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 27 0 19 8 A 9 11 94526 CASAVA_Build 16 11611775 1D GCAGGAAATC T/- TTATTCTGGT 3070 hom 75 het 29 0 21 9 T 3 2 94527 CASAVA_Build 16 11630041 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2942 het 434 hom 18 1 9 8 T 11 12 94528 CASAVA_Build 16 11640977 2D AAAGATTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 12 10 94529 CASAVA_Build 16 11642406 1I ATCTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 11 12 94530 CASAVA_Build 16 11647127 1I CCCTTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 28 0 18 10 A 11 12 94531 CASAVA_Build 16 11648564 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 22 2 12 9 A 18 16 94532 CASAVA_Build 16 11661297 2D AATTTTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 23 0 18 5 T 12 10 94533 CASAVA_Build 16 11666294 1D CCCCTAGAAT G/- GGGAGCTGCT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 G 4 3 94534 CASAVA_Build 16 11716820 1D CTGTCACGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 699 hom 39 3 17 19 A 17 16 94535 CASAVA_Build 16 11741253 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 1317 het 1317 ref 35 27 3 5 A 11 10 94536 CASAVA_Build 16 11745425 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2865 het 1491 hom 32 6 10 16 T 12 13 94537 CASAVA_Build 16 11758350 1I GCCAAGTGCT -/A AAAGCTGAGG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 3 4 94538 CASAVA_Build 16 11768701 1I CAATGTATCC -/T TGTCATTAAG 3070 hom 187 het 69 0 63 6 T 1 2 94539 CASAVA_Build 16 11769878 1I AAATAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1152 hom 25 6 15 4 A 14 15 94540 CASAVA_Build 16 11777639 1I CCTTCCCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 A 9 10 94541 CASAVA_Build 16 11781234 1D GTGTTTATTT A/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 32 0 27 5 A 1 0 94542 CASAVA_Build 16 11785349 4I AGGGGGGGGC ----/TGGG TGTGAGGTGG 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 TGGG 0 1 94543 CASAVA_Build 16 11788502 1D CCCATCTCTA C/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 29 18 11 2 C 1 0 94544 CASAVA_Build 16 11789931 1D24M4D TTACCAGTCT CAGAAAAGTCCAGACAAATATATTGCTTT/-AGAAAAGTCCAGACAAATATATTG---- CTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 15 10 4 N/A 0 0 94545 CASAVA_Build 16 11794890 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 54 het 22 0 16 6 A 8 9 94546 CASAVA_Build 16 11803740 1I GTTTTGTTTT -/G TTTTGTGTGT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 G 0 1 94547 CASAVA_Build 16 11805247 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAAAG 3070 het 2681 hom 28 12 11 5 AG 3 4 94548 CASAVA_Build 16 11806479 10D GTTGCCCAGG CTGGTCTCAA/---------- ACTCCTAGGC 3070 het 2792 hom 22 7 14 4 CTGGTCTCAA 1 0 94549 CASAVA_Build 16 11808356 1D GCTTACAGGC G/- GGCACCTGTA 2994 het 2994 ref 22 11 9 3 G 3 2 94550 CASAVA_Build 16 11810843 1D ATACCCTTTG A/- GGGACCAGTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 0 94551 CASAVA_Build 16 11811204 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1024 hom 23 6 10 8 A 17 16 94552 CASAVA_Build 16 11815199 1D GGGGCGTGGC G/- GGGGGGTGGG 1565 hom 11 het 6 0 4 2 G 7 6 94553 CASAVA_Build 16 11817220 5D GTCCTCCGAC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 T 16 11 94554 CASAVA_Build 16 11820206 1D CCGACTTGGA T/- TTTTTTTTTT 2745 het 402 hom 12 3 8 1 T 16 15 94555 CASAVA_Build 16 11827551 1I ATGTAGGAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 A 8 9 94556 CASAVA_Build 16 11847081 1D AGAACTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 14 14 T 13 12 94557 CASAVA_Build 16 11856541 1D AGTTTCATGG C/- CCGGGGAAGG 3070 hom 24 het 12 0 9 3 C 3 2 94558 CASAVA_Build 16 11856796 1I AGTACTCCAG -/C CTGGGTGACA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 C 1 2 94559 CASAVA_Build 16 11862128 1I CCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 36 0 25 11 A 10 11 94560 CASAVA_Build 16 11866032 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 8 94561 CASAVA_Build 16 11868062 1I AATTTCACTT -/A AAAAAAAAAA 1377 het 1377 ref 33 12 3 18 A 17 18 94562 CASAVA_Build 16 11873740 1I ATAAATTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2619 hom 26 10 9 7 A 14 15 94563 CASAVA_Build 16 11875813 17D CCAAGTTAGC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 T 30 13 94564 CASAVA_Build 16 11876776 1I AATTAGGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 11 12 94565 CASAVA_Build 16 11880463 2D AATAATAATA AT/-- AAAAAAAAGG 779 het 23 hom 5 0 3 2 AT 1 0 94566 CASAVA_Build 16 11886426 1D AGATTCTGTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 74 het 29 0 24 6 A 10 9 94567 CASAVA_Build 16 11903948 3D GAACTGGATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 14 11 94568 CASAVA_Build 16 11904090 1I GACTATAGGC -/G GTGTGCCACC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 1 2 94569 CASAVA_Build 16 11919253 2I CTAAAAATAC --/AA AAGTTAGGCC 2116 hom 27 het 11 0 7 4 A 2 4 94570 CASAVA_Build 16 11934976 2D TTGTTTCCAC AT/-- GTCTCCGTAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 1 0 94571 CASAVA_Build 16 11956266 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 656 hom 23 3 19 1 A 13 14 94572 CASAVA_Build 16 11957093 7I AAAAAAAAAG -------/AAAAGAA AAAAGAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 AAAAGAA 2 3 94573 CASAVA_Build 16 11958524 1D TAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1376 het 251 hom 18 4 7 7 T 17 16 94574 CASAVA_Build 16 11965169 1D CGAGGTGGGT G/- GATCACTTGA 3070 hom 93 het 34 0 30 5 G 2 1 94575 CASAVA_Build 16 11965390 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2021 het 2021 ref 30 16 5 9 A 15 14 94576 CASAVA_Build 16 11969414 1I GATTAAACTC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 9 94577 CASAVA_Build 16 11971308 5D CCTCTACCTC AAGAG/----- GTAGGTTCAA 3070 hom 57 het 20 0 20 1 AAGAG 1 0 94578 CASAVA_Build 16 11983579 4D GTGGTCACAA TTTG/---- TTTATTTTTC 3070 hom 91 het 33 0 31 3 TTTG 1 0 94579 CASAVA_Build 16 11985742 6I CAAAAAAAAA ------/AAAAAG AAAAGAAAAG 3070 het 30 hom 28 1 18 9 AAAAAG 0 1 94580 CASAVA_Build 16 12001883 1I TGTGTTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2691 hom 23 8 10 5 T 11 12 94581 CASAVA_Build 16 12031304 1I ATAGGTTGGC -/T AGTCAATTAC 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 T 0 1 94582 CASAVA_Build 16 12059182 1D TTTTATATAT A/- TATTTTTTTT 2183 het 324 hom 6 1 5 0 A 1 0 94583 CASAVA_Build 16 12069365 1D AAAATTGGCC T/- TTTTAGAAAG 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 5 4 94584 CASAVA_Build 16 12087047 3I AGAATAATAA ---/TCT TCTATCAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 TCT 1 2 94585 CASAVA_Build 16 12090467 19D GAAAGAGAGG AGAGAGAGAGAGAGAGAAA/------------------- AGAGAGAGAG 2929 het 2929 ref 24 12 9 9 AGAGAGAGAGAGAGAGAAA 2 1 94586 CASAVA_Build 16 12098901 1I CCACACATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 T 11 12 94587 CASAVA_Build 16 12111096 1I TGCCCTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1085 hom 27 6 12 9 T 11 12 94588 CASAVA_Build 16 12130177 1D GATGTACCAT G/- GTTGGTAATT 3070 het 3070 ref 59 27 25 7 G 2 1 94589 CASAVA_Build 16 12139543 1D CACGAGACTG A/- AAAAAAAAGA 2149 het 2149 ref 18 9 7 2 A 9 8 94590 CASAVA_Build 16 12139956 5D AATGTAAAAT AAAAC/----- AAAACTTTGC 3070 het 3070 hom 41 20 18 5 AAAAC 2 1 94591 CASAVA_Build 16 12144776 1D CTTCTCAGGG T/- TAGGGCAAGG 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 T 2 1 94592 CASAVA_Build 16 12153393 1D CCTGGGCAAT G/- TGGTGAAACC 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 G 1 0 94593 CASAVA_Build 16 12183069 1D TGGTGATTGA G/- GGGGGGTCCT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 G 7 6 94594 CASAVA_Build 16 12183242 1D GGCTTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 1782 het 1782 ref 34 13 8 13 T 15 14 94595 CASAVA_Build 16 12189111 1D TGGTACTGTT G/- GCATTCACTC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 G 2 1 94596 CASAVA_Build 16 12193129 1D AGATTTAGGA T/- GTGGCTGCAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 1 0 94597 CASAVA_Build 16 12201846 1D TTCACGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 27 3 19 5 T 13 12 94598 CASAVA_Build 16 12214848 6D AGGAAAAAAA TAAAAT/------ TAAAAACAAC 3070 hom 95 het 32 0 32 7 TAAAAT 1 0 94599 CASAVA_Build 16 12215500 1I CCCTGGCAGG -/A GGCTTTCTTC 3070 hom 116 het 43 0 34 9 A 0 1 94600 CASAVA_Build 16 12228509 1I CTGGCGGATT -/G GGGTGCTGCT 3070 hom 150 het 53 0 47 6 G 3 4 94601 CASAVA_Build 16 12241178 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 29 0 22 7 A 11 10 94602 CASAVA_Build 16 12259049 2D TTATTTAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 39 hom 18 1 10 8 T 18 16 94603 CASAVA_Build 16 12274701 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 337 hom 34 4 23 7 T 13 12 94604 CASAVA_Build 16 12277051 1D TCTCCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 588 hom 39 3 26 10 T 13 12 94605 CASAVA_Build 16 12280005 14D TATACGTCTC TATCTTGGTTCAGG/-------------- TATGCATTAC 3070 hom 72 het 25 0 25 2 TATCTTGGTTCAGG 1 0 94606 CASAVA_Build 16 12296254 1I TAATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 10 11 94607 CASAVA_Build 16 12298025 3D GCAGGTACTT CTC/--- CTACTTAGTG 3070 hom 173 het 60 0 57 5 CTC 1 0 94608 CASAVA_Build 16 12311477 10I TACACGTGCA ----------/CACACACATG CGCACACATG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 CACACACATG 0 1 94609 CASAVA_Build 16 12311876 1D GTGCCAAGTG A/- AAAAAAAAAA 2157 het 2157 ref 54 34 5 16 A 12 11 94610 CASAVA_Build 16 12314053 1D ACAGAGGGGG A/- AGAGCTTCCA 3070 hom 117 het 45 0 37 8 A 2 1 94611 CASAVA_Build 16 12314380 1I TTGTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 27 2 15 10 T 12 13 94612 CASAVA_Build 16 12328125 1I ATTATACTAG -/C CTTGTGGTAC 3070 hom 107 het 38 0 33 5 C 1 2 94613 CASAVA_Build 16 12347456 1I AAGCAGTAAA -/G GGGGTGTGAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 4 5 94614 CASAVA_Build 16 12352569 2D ACACTTAGTT GG/-- TGCTCCGGAG 3070 hom 99 het 37 0 32 6 G 2 0 94615 CASAVA_Build 16 12359557 1D ATTAACCCCC T/- GTTTGTGTGC 3070 hom 93 het 38 0 31 8 T 1 0 94616 CASAVA_Build 16 12365777 1I TCTTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 81 hom 31 1 26 4 C 0 1 94617 CASAVA_Build 16 12375649 1D CAGTCTGCAG C/- CTGGTGGAGG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 2 1 94618 CASAVA_Build 16 12408534 1D AGGGCCCCCG C/- TTTTTCAGCC 3070 hom 144 het 54 0 48 6 C 1 0 94619 CASAVA_Build 16 12414938 4D AGTGACAGGG CCCT/---- CGAGACAATG 3070 hom 159 het 57 0 51 7 CCCT 1 0 94620 CASAVA_Build 16 12415246 1D CATCCCTTGC T/- TGTCTGGGGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 1 94621 CASAVA_Build 16 12419731 1I ATTGTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 41 0 33 8 T 10 11 94622 CASAVA_Build 16 12419881 2I TTTTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 12 94623 CASAVA_Build 16 12420921 1D TCAGACTCAG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 26 het 34 1 23 10 C 11 10 94624 CASAVA_Build 16 12424555 1D CATGGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 1486 het 1486 ref 35 24 4 7 T 12 11 94625 CASAVA_Build 16 12474661 1D TTTTGAGTAA T/- TTTAATGGCA 3070 het 3070 ref 53 30 17 9 T 4 3 94626 CASAVA_Build 16 12556485 1D TATCAAAAGG C/- TTATTCTCAG 3070 hom 117 het 41 0 37 5 C 1 0 94627 CASAVA_Build 16 12559597 1I CAGCCCCCCC -/T AGTAGATGGT 3070 hom 77 het 31 0 25 6 T 0 1 94628 CASAVA_Build 16 12564463 3D GACGCACGCT AAC/--- AACAGAGCCT 3070 hom 129 het 45 0 41 6 AAC 2 1 94629 CASAVA_Build 16 12564566 2I ATGCTGGGAT --/TC TGAGGCTCAT 3070 hom 141 het 52 0 45 7 TC 0 1 94630 CASAVA_Build 16 12564960 3D ATGTCTGTAT CAC/--- CACATCTCAC 3070 hom 93 het 38 0 31 9 CAC 2 1 94631 CASAVA_Build 16 12567787 2D CAGGGCCTCT CC/-- CCCCAAGCTC 3070 hom 74 het 30 0 24 9 C 6 4 94632 CASAVA_Build 16 12568060 2D TAAGTGGGGT CC/-- CCCATCCTTT 3070 hom 109 het 40 0 34 6 C 5 3 94633 CASAVA_Build 16 12569663 1I GAGTGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 47 3 24 20 A 13 14 94634 CASAVA_Build 16 12570994 4D GCATCCCCTA AGAC/---- AGAGTCCTCT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 AGAC 1 0 94635 CASAVA_Build 16 12572142 2I ATAATGCAAC --/AG AGTCCCCCAT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 AG 1 2 94636 CASAVA_Build 16 12573666 1I TCACAATCCA -/G GGTTGGAAAC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 2 3 94637 CASAVA_Build 16 12575994 2I TAAATATTGC --/AA AAGAGTGACA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 2 4 94638 CASAVA_Build 16 12577405 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1108 het 471 hom 16 1 4 11 T 17 18 94639 CASAVA_Build 16 12578995 2D GGGGGCTGTC AT/-- AGAAACTTGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AT 1 0 94640 CASAVA_Build 16 12580452 1D GAGGCTGTTA T/- TCCTAAGAGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 2 1 94641 CASAVA_Build 16 12580697 3D AAGGAAAAAA AAG/--- AATTCACAGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAG 1 0 94642 CASAVA_Build 16 12581398 2D TGTATTTAGT AC/-- ACACAGGGTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AC 3 2 94643 CASAVA_Build 16 12582592 1D AAACCCTTTG T/- TCTACTCAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 2 1 94644 CASAVA_Build 16 12582759 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 41 het 16 0 13 3 A 6 7 94645 CASAVA_Build 16 12595639 3D TTCCACAGAT CAA/--- CGAGACAGAA 3070 hom 30 het 13 0 10 3 CAA 1 0 94646 CASAVA_Build 16 12614204 1D CCGGTTCTGT A/- GCAGTCATTC 3070 hom 80 het 29 0 27 2 A 1 0 94647 CASAVA_Build 16 12614419 3I TAAAATTGCC ---/TTG TTGAGGAAAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TTG 1 2 94648 CASAVA_Build 16 12614671 2D CCCGCTGCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 18 0 13 6 A 14 12 94649 CASAVA_Build 16 12616978 2I CCGTGTGTTT --/GA AAAAAAAAAA 1987 het 90 hom 19 1 12 6 GA 0 1 94650 CASAVA_Build 16 12617345 1I AGTTTTTTTT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 7 8 94651 CASAVA_Build 16 12618180 3I TATCACCCTC ---/ATG AAAGACTGTC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 ATG 0 1 94652 CASAVA_Build 16 12619976 1I GGGAAGGGGG -/A AAGGAGACTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 2 3 94653 CASAVA_Build 16 12620726 6I ACCCCAAGGG ------/AAAAAA AAAAAAAAAA 2213 hom 24 het 10 0 7 3 A 10 16 94654 CASAVA_Build 16 12621428 1D79M2I TTACACTGCA TTCTAAAAGCCCAGATGAGATCATCACCCAAGCAGTAAAAATGAAAGCATCAAAAAGGGTTCCTGAACATAGAGAAAATA--/-TCTAAAAGCCCAGATGAGATCATCACCCAAGCAGTAAAAATGAAAGCATCAAAAAGGGTTCCTGAACATAGAGAAAATATT GTTTATCTTT 3070 hom 60 het 12 0 21 4 N/A 0 0 94655 CASAVA_Build 16 12622228 1I25M2D AACCTTTTTT -GGGAGGTGGTGGTGGTTGTGAAGACAG/GGGGGGGTGGTGGTGGTTGTGAAGAC-- GGTCTCACTG 3070 hom 63 het 17 0 21 1 N/A 0 0 94656 CASAVA_Build 16 12623931 2I GCAGGAAGAC --/TT CATCTCTATT 3070 hom 48 het 22 0 16 6 T 0 2 94657 CASAVA_Build 16 12625188 2D ACTCCGTGTC AA/-- AAAAAAAAAC 2092 hom 21 het 9 0 5 4 A 11 9 94658 CASAVA_Build 16 12626249 1D AAATGCTAAG A/- AAAAAAAAAA 2055 hom 29 het 13 0 10 3 A 13 12 94659 CASAVA_Build 16 12627044 2D GGGGGGAAAA AT/-- ATCTTTCTAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AT 2 1 94660 CASAVA_Build 16 12628709 1I CATTATGGGG -/A ATTGGAAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 94661 CASAVA_Build 16 12629084 1I CCATTAACAC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 102 het 42 0 34 8 T 7 8 94662 CASAVA_Build 16 12629537 2I AGCCTGGGAG --/AC ACAACGAGAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AC 1 2 94663 CASAVA_Build 16 12629862 1I CATTACTAAG -/T CATTGTGTGG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 0 1 94664 CASAVA_Build 16 12634906 1D CTCTTCTTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 34 3 25 6 C 1 0 94665 CASAVA_Build 16 12638916 1D TACCAAAAAA G/- TACAAAAACT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 1 0 94666 CASAVA_Build 16 12640403 4I AGTAGGACAA ----/AGTT AGTATTTTCT 3070 hom 96 het 34 0 31 3 AGTT 0 1 94667 CASAVA_Build 16 12640984 1I ACTTTTCAAT -/G CCTTTTTATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 94668 CASAVA_Build 16 12641485 2D TAAATTTCTA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 8 94669 CASAVA_Build 16 12646916 3D TCAAAAAAAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 hom 54 het 19 0 18 2 AAC 3 2 94670 CASAVA_Build 16 12651124 1I TGGGATACAC -/A ATCCTTGGTT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 1 2 94671 CASAVA_Build 16 12652763 1D GCTCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 24 0 17 8 A 13 12 94672 CASAVA_Build 16 12653335 4I CCATGCCAAT ----/ACAA ACAATTAGCT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 ACAA 1 2 94673 CASAVA_Build 16 12689391 1I ACTCACACTA -/T TTTTTTTTTT 1368 het 1368 ref 43 14 7 22 T 15 16 94674 CASAVA_Build 16 12698741 8I GTCTGCAATC --------/CATCCCCA CATCACATCC 3070 het 3070 ref 58 25 21 12 CATCCCCA 0 1 94675 CASAVA_Build 16 12709532 1I ATTTATTGTT -/G GGAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 2 3 94676 CASAVA_Build 16 12711813 1D GTTACAGGCC A/- AAAAAAAAAA 1528 het 1528 ref 30 13 7 11 A 13 12 94677 CASAVA_Build 16 12714569 2D ATTTTCAAAA AG/-- AGAGTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 AG 3 2 94678 CASAVA_Build 16 12715190 11I CTGAAGGTAT -----------/GTAATTCAGTG GTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 GTAATTCAGTG 0 1 94679 CASAVA_Build 16 12715776 1D CAATGTATGA G/- GGTCCCAATG 3070 het 3070 ref 50 32 15 3 G 3 2 94680 CASAVA_Build 16 12716143 1I AGGTACAAAA -/G TATTCAAGTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 G 0 1 94681 CASAVA_Build 16 12723112 1I ATTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 1985 het 1951 hom 28 6 8 14 A 14 15 94682 CASAVA_Build 16 12726837 3D TTTCACACTA CTT/--- TGGATTCACG 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 CTT 1 0 94683 CASAVA_Build 16 12742659 1D CTGGCTGCCC T/- TTTTTTTTTT 1906 het 1296 hom 26 7 9 10 T 17 16 94684 CASAVA_Build 16 12747842 1I TCAGCAGCCT -/G GGGGCTGGTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 G 4 5 94685 CASAVA_Build 16 12756047 1I CAATGGACCC -/A AACTGAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 A 2 3 94686 CASAVA_Build 16 12763374 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 808 hom 25 2 15 8 A 12 13 94687 CASAVA_Build 16 12765562 1D TTGATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 37 1 27 9 T 13 12 94688 CASAVA_Build 16 12768362 1D GAGGTCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 T 11 10 94689 CASAVA_Build 16 12770605 1D AACACATGAA T/- TATTACTATA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 2 1 94690 CASAVA_Build 16 12775824 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1443 het 1443 ref 23 16 4 3 A 13 12 94691 CASAVA_Build 16 12779173 3D CATTTTTGTG GAT/--- GATAAGTACT 3070 het 3070 ref 25 12 8 6 GAT 2 1 94692 CASAVA_Build 16 12779228 1D TACTTTCATT A/- AAAAAAAAAT 1139 het 1139 ref 19 5 4 10 A 10 9 94693 CASAVA_Build 16 12788764 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1386 hom 37 13 15 9 T 18 16 94694 CASAVA_Build 16 12838239 1D GGACGACACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2317 hom 42 10 15 17 A 16 15 94695 CASAVA_Build 16 12839149 1D CAAAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 791 het 791 ref 34 28 2 4 A 12 11 94696 CASAVA_Build 16 12844220 12D ATGGGGAATC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 9 8 T 24 12 94697 CASAVA_Build 16 12851691 1D CCATTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 11 12 A 13 12 94698 CASAVA_Build 16 12866750 1I AGGATGTGCT -/G GGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 G 2 3 94699 CASAVA_Build 16 12869060 2D TTGCAGAGAT GG/-- GGGGGGGTCT 3070 hom 101 het 38 0 32 8 G 9 7 94700 CASAVA_Build 16 12873469 3D CCTCCTTCTC CTT/--- CTTTTTTCTT 2171 hom 27 het 14 0 10 4 CTT 2 1 94701 CASAVA_Build 16 12875416 1I ACTCCGACTC -/A AAAAAAAAAA 2195 het 301 hom 15 1 8 6 A 12 13 94702 CASAVA_Build 16 12876367 1D TATGATGGGG A/- AATGACCCTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 3 2 94703 CASAVA_Build 16 12882900 1D TGCTCTTGTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 9 8 94704 CASAVA_Build 16 12885394 1I TTCCCTCATT -/G TGTGTTCTTG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 0 1 94705 CASAVA_Build 16 12888120 4I GGCAATCTTT ----/TTTG TTTATTTATT 3070 hom 100 het 42 0 34 8 TTTG 0 1 94706 CASAVA_Build 16 12891976 8D TTCTTAACAT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 1891 het 1891 ref 24 10 5 9 TTTG 5 3 94707 CASAVA_Build 16 12892974 1I ACTGACTTTT -/C TTCCCCCCGA 3070 hom 129 het 50 0 40 10 C 0 1 94708 CASAVA_Build 16 12895725 2I AGTGTAACTT --/TG TGGCTCTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TG 1 2 94709 CASAVA_Build 16 12896513 1I CAGAGAGACA -/G GGGGTCTGCA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 G 4 5 94710 CASAVA_Build 16 12899222 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 39 2 28 9 T 13 12 94711 CASAVA_Build 16 12901942 4D AATTCGCTAG GAGA/---- GAGAGGGCAG 3070 hom 41 het 18 0 11 7 GA 4 2 94712 CASAVA_Build 16 12904871 7D CTTTTGCTTT TTTTAAA/------- TTTTTTTTAT 3070 hom 68 het 23 0 22 3 TTTTAAA 1 0 94713 CASAVA_Build 16 12908395 7D CTTCCCTCCA TCCCCCT/------- TCCCCCTTCC 3018 het 1392 hom 20 4 7 9 TCCCCCT 2 1 94714 CASAVA_Build 16 12909488 16I GGACCTGTCA ----------------/CATGGCTACTGCTCAG CAACTATTAC 3070 hom 87 het 35 0 30 6 CATGGCTACTGCTCAG 0 1 94715 CASAVA_Build 16 12911641 2D GGTTTACCTG GC/-- ACAACAAAGT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 GC 1 0 94716 CASAVA_Build 16 12919040 1D TTTCAAGTAA C/- CCCCACATTA 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 C 5 4 94717 CASAVA_Build 16 12920183 1I AAGAATTGCC -/G CAGATATTAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 G 0 1 94718 CASAVA_Build 16 12920529 4D AGAGAACATT TTGA/---- TTGATAGCAA 3070 het 3070 hom 35 13 20 3 TTGA 2 1 94719 CASAVA_Build 16 12921733 1D AATATTTACA G/- CAGAAAGGTT 3070 het 3070 hom 20 8 9 4 G 1 0 94720 CASAVA_Build 16 12925410 2D CAAATTATCC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 41 15 19 8 AG 6 5 94721 CASAVA_Build 16 12929535 1D TTATCTTATA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 10 9 94722 CASAVA_Build 16 12936351 13D GGAGCTCTCC TGCTGATATGAAT/------------- TATTCCAACA 3070 het 3070 hom 53 26 24 7 TGCTGATATGAAT 1 0 94723 CASAVA_Build 16 12956876 1D ATTATAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 A 11 10 94724 CASAVA_Build 16 12957572 1I GGCTATTACT -/A AAAAATCAGA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 5 6 94725 CASAVA_Build 16 12967712 1I CTTCTCAAAT -/C CCTAAAGCGC 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 C 2 3 94726 CASAVA_Build 16 12974029 1I GAATTCTTAA -/T TTTTATTTAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 4 5 94727 CASAVA_Build 16 13006321 23I AAAAAAGAAA -----------------------/AAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAG AAAAGAAAGA 2977 het 1682 hom 23 8 8 7 AAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAG 0 1 94728 CASAVA_Build 16 13018965 1I CAATCATATG -/C CAGGCACTGT 3070 het 3070 ref 54 25 22 7 C 1 2 94729 CASAVA_Build 16 13027608 1I CCTATCCCCC -/T GGCAACTACC 3070 hom 111 het 45 0 37 8 T 0 1 94730 CASAVA_Build 16 13034228 1D AAACAGAAAA C/- CCAATTCATA 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 C 3 2 94731 CASAVA_Build 16 13036895 2D AATTTTCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 12 10 94732 CASAVA_Build 16 13038107 1I TCAGAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 11 12 94733 CASAVA_Build 16 13047119 1D CCCTGCCCCC A/- CTGTGTCCCC 1869 het 1869 ref 34 22 6 7 A 1 0 94734 CASAVA_Build 16 13047515 4D TTTTCCTCTG TGAC/---- TGACTGTGTA 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 TGAC 2 1 94735 CASAVA_Build 16 13085457 1D ATAGTTTTCT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 9 8 94736 CASAVA_Build 16 13098781 1D CTGATCAGTA T/- TTTTTTTTTT 1598 het 1598 ref 47 29 5 13 T 13 12 94737 CASAVA_Build 16 13112703 1D AACAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 15 14 94738 CASAVA_Build 16 13128262 2I CTGAAAGAAG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 2421 hom 28 9 10 9 GA 7 8 94739 CASAVA_Build 16 13132471 3D CATTACTGGG TAT/--- TATATACCCA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TAT 2 1 94740 CASAVA_Build 16 13138820 1I AATCTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2204 het 2204 ref 22 7 8 7 T 13 14 94741 CASAVA_Build 16 13142482 1I TTAAAGCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 A 9 10 94742 CASAVA_Build 16 13168434 2I TTTTTTCTTT --/TC TTTTTTTTTT 2460 het 218 hom 14 1 9 4 TC 0 1 94743 CASAVA_Build 16 13177461 1I AATTTCCGTG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 T 7 8 94744 CASAVA_Build 16 13184659 1I ATACAATCTG -/C CCACAGATTA 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 C 2 3 94745 CASAVA_Build 16 13217084 1D CTGCCTTGTC G/- GGGGAGAGGA 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 G 5 4 94746 CASAVA_Build 16 13237660 1I AAATTAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1507 hom 41 5 21 15 T 12 13 94747 CASAVA_Build 16 13257627 2I CAGCATATTG --/TA TATATGTGTA 3070 hom 91 het 35 0 29 6 TA 2 3 94748 CASAVA_Build 16 13261205 1I CCAGGCCTCT -/G GGGCCTGTGA 3070 het 1533 hom 30 6 15 9 G 3 4 94749 CASAVA_Build 16 13265529 1D GTTTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 2268 het 1595 hom 38 11 8 19 T 19 18 94750 CASAVA_Build 16 13267179 1D AGATAACTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 243 hom 30 2 14 15 A 10 9 94751 CASAVA_Build 16 13267431 1I GTTCAGTGGG -/T TGATTCTTAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 1 2 94752 CASAVA_Build 16 13267773 1I TCTCTGTCTC -/T TAAGAGCCTG 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 T 1 2 94753 CASAVA_Build 16 13314621 7I TCAAAAAAAA -------/AAAAAAC AAAAAAAAAA 2189 het 433 hom 9 2 5 2 AAAAAAC 0 1 94754 CASAVA_Build 16 13315410 1D TGTACCTCAT G/- GGTGGGTTCC 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 G 3 2 94755 CASAVA_Build 16 13315562 1I TTTTATTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2976 hom 24 9 13 2 T 9 10 94756 CASAVA_Build 16 13315946 1I TTGATATACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 A 9 10 94757 CASAVA_Build 16 13316440 1D CCTTGTCAAA T/- AGAACCTGCT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 1 0 94758 CASAVA_Build 16 13328238 1I CCTACTTTTA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 T 6 7 94759 CASAVA_Build 16 13329776 1D CTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1699 hom 29 8 12 9 T 15 14 94760 CASAVA_Build 16 13347319 1D TTACTCTTGT A/- AAAAAATTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 7 6 94761 CASAVA_Build 16 13349205 1D GTACCCCCCC A/- CAAAGATGTC 3070 hom 90 het 35 0 30 6 A 1 0 94762 CASAVA_Build 16 13369010 1I46M4D CAAGTAGGAT -GCGGGGGGGAATGAAGATGTTTCCTGAAGTGTACACGCGTGTGCGTGCGC/GGCGGGGGGGAATGAAGATGTTTCCTGAAGTGTACACGCGTGTGCGT---- GCGCGCGCGC 3070 het 1539 hom 26 9 17 10 N/A 0 0 94763 CASAVA_Build 16 13370097 1D AGATATGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 37 1 25 13 A 13 12 94764 CASAVA_Build 16 13374284 4I ATATACTGTT ----/TATA TAGTGTATGT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TA 1 3 94765 CASAVA_Build 16 13379391 3D ACTCCATCTA AAC/--- AACACCACCA 3070 hom 108 het 38 0 36 5 AAC 2 1 94766 CASAVA_Build 16 13389289 1I CCCCTCCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 10 11 94767 CASAVA_Build 16 13390145 1D ACCTCATGTG A/- ACAAAAGAAA 3070 hom 77 het 34 0 25 9 A 2 1 94768 CASAVA_Build 16 13391483 2D TTTTCTAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 13 11 94769 CASAVA_Build 16 13401722 4D CTCTGTTCCA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 AC 10 8 94770 CASAVA_Build 16 13407300 1D AAATCATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2439 hom 32 9 13 10 A 14 13 94771 CASAVA_Build 16 13417174 1D TTCTTTCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 12 11 94772 CASAVA_Build 16 13422572 3I GTTATTACTG ---/ACA ACAAGTACTT 3070 hom 108 het 45 0 36 9 ACA 1 2 94773 CASAVA_Build 16 13425578 2D CCTCTCCTGA AT/-- ATCTCACTAG 3070 het 3070 hom 44 16 21 8 AT 2 1 94774 CASAVA_Build 16 13429562 1D TATTTGTTGT G/- GGTAATTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 G 3 2 94775 CASAVA_Build 16 13432103 1D ATCTCTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 27 0 18 10 A 14 13 94776 CASAVA_Build 16 13434481 2I AAAAGACAAT --/TA AAATTGTGTT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TA 0 1 94777 CASAVA_Build 16 13434893 4I GGTCAGAGAG ----/ATTA ATTAATGTGT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 ATTA 1 2 94778 CASAVA_Build 16 13436586 1D TCTTAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 43 0 34 9 T 12 11 94779 CASAVA_Build 16 13438130 1I GAGATGTTAT -/C CCCCCCAGGA 3070 hom 93 het 42 0 30 12 C 6 7 94780 CASAVA_Build 16 13445450 4I TGTTAAATAT ----/TAGA TAGAAAATAT 3070 hom 59 het 22 0 20 2 TAGA 1 2 94781 CASAVA_Build 16 13458665 4I ACTCTATCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 AAAC 4 5 94782 CASAVA_Build 16 13482671 1D ATTTCTATAT G/- TTGGGTACAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 1 0 94783 CASAVA_Build 16 13510631 1I TCAGAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 710 hom 40 2 29 9 A 10 11 94784 CASAVA_Build 16 13526092 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 30 1 22 7 T 15 14 94785 CASAVA_Build 16 13537360 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1030 het 1030 ref 22 10 4 11 T 15 14 94786 CASAVA_Build 16 13540662 43D TAAATTTTAC ATATATATATATATAAAGACAGGATCTTTATATATATATAAAG/------------------------------------------- ATATATATAT 2223 het 1998 hom 13 5 6 6 ATATATATATATATAAAGACAGGATCTTTATATATATATAAAG 1 0 94787 CASAVA_Build 16 13541291 1I GATCCTACTC -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 53 23 22 8 T 6 7 94788 CASAVA_Build 16 13543951 1D AATAAGTATG C/- CCCCCCCTAC 3070 hom 134 het 64 1 58 6 C 8 7 94789 CASAVA_Build 16 13549624 1D CTACTAAAAG A/- AAACATAGAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 4 3 94790 CASAVA_Build 16 13555843 1D ATTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2727 het 2270 hom 26 7 10 9 T 11 10 94791 CASAVA_Build 16 13555875 1D CTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1437 het 1436 ref 24 5 6 13 T 13 12 94792 CASAVA_Build 16 13560713 1D CAAGCATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 10 9 94793 CASAVA_Build 16 13567545 1D AATATAAGCC A/- AAAAAAAAAA 1164 het 71 hom 18 1 3 14 A 12 11 94794 CASAVA_Build 16 13571568 3D CCCTGCTGGT CTC/--- CTTAATTTCT 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 CTC 1 0 94795 CASAVA_Build 16 13576155 1D CCATAATGAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 A 9 8 94796 CASAVA_Build 16 13576992 1I TGTTAAATAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 8 9 94797 CASAVA_Build 16 13585905 1D TATTAAATTG T/- TATTGGGTCT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 2 1 94798 CASAVA_Build 16 13592871 2D TTTCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 32 1 22 9 T 14 12 94799 CASAVA_Build 16 13606283 2I ATCGCGAGAA --/TC TGTCTCCCAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TC 0 1 94800 CASAVA_Build 16 13610044 5D AAAAAAAAGT AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 11 15 4 AAAGA 3 2 94801 CASAVA_Build 16 13610885 4D GACTCCATCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 1820 hom 21 7 12 4 CAAA 5 4 94802 CASAVA_Build 16 13619385 2D CCTAAAATGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 15 20 11 AC 10 9 94803 CASAVA_Build 16 13625178 1D ATCAGTTCAT C/- CCCCCCCAAG 3070 hom 93 het 45 1 39 5 C 8 7 94804 CASAVA_Build 16 13631202 2D CTGCTGGACT AA/-- GTCCTAGGAG 3070 het 3070 ref 51 27 16 9 A 2 0 94805 CASAVA_Build 16 13639458 3D39M1I ACAGAGCCTC CTTCTGCCTTGCATTTTCCTCACTTCTGGAGGTTGCCAGCAA-/---CTGCCTTGCATTTTCCTCACTTCTGGAGGTTGCCAGCAAT TTTTTGGCTT 3070 het 3070 ref 46 41 13 19 N/A 0 0 94806 CASAVA_Build 16 13640864 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 10 11 94807 CASAVA_Build 16 13642952 7I GACTAATACG -------/ACATCCT ACAACACACG 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 ACATCCT 0 1 94808 CASAVA_Build 16 13646944 24I TACATTCAAG ------------------------/TCTGCCTGACTTCAAACTCCAGAT TCCAGTCATC 3070 het 3070 hom 36 12 25 1 TCTGCCTGACTTCAAACTCCAGAT 0 1 94809 CASAVA_Build 16 13655352 2D TATACATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 TG 8 7 94810 CASAVA_Build 16 13657379 1D ACAAACAGGG T/- TTTTCCCCCC 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 T 5 4 94811 CASAVA_Build 16 13676877 1D ACATGATTTA T/- TTTTGTGGGT 1518 het 1518 ref 33 19 8 7 T 5 4 94812 CASAVA_Build 16 13677818 1D TGAAATGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 A 11 10 94813 CASAVA_Build 16 13680487 3I TTTTTCCTTT ---/TTC TTTCTTTCTT 1886 het 1886 ref 20 9 10 1 TTC 0 1 94814 CASAVA_Build 16 13681942 3I TGAGAAGTCC ---/TCT TCCTTTCACC 1755 het 1755 ref 52 41 4 7 TCT 0 1 94815 CASAVA_Build 16 13685538 4D ATATTGAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 AAAC 3 2 94816 CASAVA_Build 16 13692451 1D CAAAATTGAA C/- CAGGAAGAAA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 C 2 1 94817 CASAVA_Build 16 13695907 1I AATTGAGGGG -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 T 6 7 94818 CASAVA_Build 16 13709548 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 A 10 9 94819 CASAVA_Build 16 13715529 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 het 3070 ref 41 18 15 9 T 4 5 94820 CASAVA_Build 16 13716017 2I CACATATATC --/TA TATATATATA 2368 het 2368 ref 18 10 8 0 TA 5 6 94821 CASAVA_Build 16 13718354 1D AATGAGTTTC A/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 1 0 94822 CASAVA_Build 16 13723032 1D GCATGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 18 11 T 14 13 94823 CASAVA_Build 16 13730225 4D GTGTGTGTGT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 45 24 15 10 GA 8 6 94824 CASAVA_Build 16 13734813 1I TAATGCCCAC -/A CTTTCTGGGC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 0 1 94825 CASAVA_Build 16 13744160 2I GTCTCTCTCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 18 13 A 13 15 94826 CASAVA_Build 16 13751371 1I TGCTCTTTTC -/G CCCAGGCTTG 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 G 0 1 94827 CASAVA_Build 16 13755730 2I TTTAAAAATA --/TT TTTTCCAAGC 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 T 4 6 94828 CASAVA_Build 16 13760765 2I ATATGAATTT --/TC CCCCCCCTCG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 TC 0 1 94829 CASAVA_Build 16 13764556 1I GCAATGGCGC -/A AATTTCAGCT 3070 het 2860 hom 26 8 14 4 A 2 3 94830 CASAVA_Build 16 13774595 1I CACTTTTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 A 9 10 94831 CASAVA_Build 16 13782235 1I CCATGTGTCC -/T TGGGGGGGGG 1599 het 1408 hom 31 8 9 14 T 1 2 94832 CASAVA_Build 16 13782457 6D TTACATCTGA GAAATT/------ GAAATTCTAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 GAAATT 2 1 94833 CASAVA_Build 16 13786287 1I CAACAATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 A 11 12 94834 CASAVA_Build 16 13786606 1I TATAACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 10 11 94835 CASAVA_Build 16 13791227 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 14 14 A 10 11 94836 CASAVA_Build 16 13830403 1I TTCTGTGTCT -/C CCCCCCGCTA 3070 hom 98 het 39 0 32 7 C 6 7 94837 CASAVA_Build 16 13833904 2D TTTTTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 18 0 11 8 T 13 11 94838 CASAVA_Build 16 13838691 1D ATTCTGTAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 33 het 14 0 12 4 T 9 8 94839 CASAVA_Build 16 13839627 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 11 10 94840 CASAVA_Build 16 13840710 7D CTGTCAGTGC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 39 3 20 18 A 23 16 94841 CASAVA_Build 16 13842630 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 491 hom 23 2 17 4 T 10 11 94842 CASAVA_Build 16 13842968 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1098 hom 12 het 9 0 5 4 T 13 12 94843 CASAVA_Build 16 13846350 1I CTCAGAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 40 1 30 9 A 10 11 94844 CASAVA_Build 16 13848035 1I TGACTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 10 11 94845 CASAVA_Build 16 13850271 14I61M1I CTTCTTGAAG --------------TCTGCCTCTTACTAGCTATGGGTTCTTGGAGGAATTACTTTACCTCTCAGGGTCTCAGTGT-/TCTTGAGCCCCAGCTCTGCCTCTTACTAGCTATGGGTTCTTGGAGGAATTACTTTACCTCTCAGGGTCTCAGTGTC CTCTAGAGGG 3070 hom 220 het 49 0 74 8 N/A 0 0 94846 CASAVA_Build 16 13882389 1D TTTATTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 15 8 T 12 11 94847 CASAVA_Build 16 13906187 1D ATTATATATG A/- ATATCATTAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 2 1 94848 CASAVA_Build 16 13914673 2D TTATTTTGTC AA/-- AGAGACATCT 3070 het 3070 ref 44 24 19 3 A 3 1 94849 CASAVA_Build 16 13924382 1I CTCCTTAAGA -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 T 7 8 94850 CASAVA_Build 16 13924786 1I CATAATCTTA -/C TTCCCACTGT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 C 0 1 94851 CASAVA_Build 16 13952277 1D AATACCAGTG C/- CCCCCTGGCT 3070 het 3070 hom 40 12 25 4 C 6 5 94852 CASAVA_Build 16 13955748 5I TTGAAAACTA -----/TAAAT TGATTAGATA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 TAAAT 0 1 94853 CASAVA_Build 16 13963306 3I GTGCAATAGT ---/GCA ATCTCAGCTC 2450 het 2450 ref 22 12 6 4 GCA 0 1 94854 CASAVA_Build 16 13966375 2D TGACAGGATT AA/-- GAGATTAAAG 3070 het 2364 hom 20 6 13 1 A 2 0 94855 CASAVA_Build 16 13975616 1D AGCCACCACG C/- CCAGCCCAGT 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 C 3 2 94856 CASAVA_Build 16 13983839 1I CCATATATTC -/T CTTCCTTTAC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 0 1 94857 CASAVA_Build 16 13985950 3I TTGCTCAGGG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 13 16 94858 CASAVA_Build 16 13994023 1D TGGACTGTCG T/- TTTATGGATG 3070 hom 163 het 59 0 53 6 T 4 3 94859 CASAVA_Build 16 14017731 2I TTAAATATGA --/TT TTTTTTTTAG 3070 hom 64 het 29 0 21 8 T 8 10 94860 CASAVA_Build 16 14021188 1I TTATAGATCC -/A AAAAAAGGCT 3070 hom 127 het 47 0 43 4 A 6 7 94861 CASAVA_Build 16 14028241 1D TGGCTCAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 104 het 41 0 36 5 A 9 8 94862 CASAVA_Build 16 14030197 4D GCCAGGCAGA TTGT/---- TTGTGCTCAG 3070 hom 144 het 51 0 47 6 TTGT 2 1 94863 CASAVA_Build 16 14034741 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAATGTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 6 94864 CASAVA_Build 16 14035194 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1956 hom 31 het 14 0 9 6 A 19 18 94865 CASAVA_Build 16 14038323 1I ATCATCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 34 7 T 10 11 94866 CASAVA_Build 16 14079953 1D TCCTGGCAAA T/- TTTTTTTTTT 1451 het 1272 hom 15 7 4 5 T 17 16 94867 CASAVA_Build 16 14103515 1I GAGTCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 13 13 A 13 14 94868 CASAVA_Build 16 14204503 1D CTGCTCAGGC T/- TTTTTTTTTC 1443 het 1443 ref 46 36 4 7 T 10 9 94869 CASAVA_Build 16 14207420 1D AGCCTTTTTT C/- CCCTCCATGC 3070 hom 160 het 60 0 50 10 C 4 3 94870 CASAVA_Build 16 14223931 1I CCTGTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 11 12 94871 CASAVA_Build 16 14228340 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 30 6 A 10 9 94872 CASAVA_Build 16 14230163 1D TTCAATGAAA T/- TCAGCCAGTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 1 94873 CASAVA_Build 16 14230704 4I TTTATTCAAC ----/TCAT TCATTTTTCA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TCAT 1 2 94874 CASAVA_Build 16 14292025 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 1689 het 1689 ref 47 36 4 7 A 11 10 94875 CASAVA_Build 16 14301939 17D CCCAGCACTT TGGGAGGCCGAGGCGGG/----------------- TGGATCACCT 3070 het 72 hom 14 1 14 0 TGGGAGGCCGAGGCGGG 1 0 94876 CASAVA_Build 16 14302575 1D ATGAGCTGCT G/- GGGGGGGGCA 1889 het 1710 hom 14 5 5 5 G 9 8 94877 CASAVA_Build 16 14305670 1D AGAAAGTACA T/- TCCCCCTGAC 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 T 2 1 94878 CASAVA_Build 16 14307194 1D ACCAATAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 22 15 2 A 10 9 94879 CASAVA_Build 16 14307336 1I TGGATTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 11 12 94880 CASAVA_Build 16 14307564 2D CAAGGGAACA CT/-- CTCTCTGTTT 3070 het 3070 ref 43 27 12 4 CT 4 3 94881 CASAVA_Build 16 14310290 8I TGTTGAAGGA --------/TTTGTTGT TAACTTAGAT 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 TTTGTTGT 0 1 94882 CASAVA_Build 16 14314130 1D CCAGAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1638 het 1638 ref 21 9 4 8 A 13 12 94883 CASAVA_Build 16 14321766 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 28 3 19 6 A 11 10 94884 CASAVA_Build 16 14330836 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAG AAAAAGAAAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 AAAAG 0 1 94885 CASAVA_Build 16 14331206 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 27 1 15 11 A 12 11 94886 CASAVA_Build 16 14335676 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 13 12 94887 CASAVA_Build 16 14343763 8D TACCAGACTA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 141 hom 34 3 23 11 T 20 12 94888 CASAVA_Build 16 14347877 1D TGAAAACAGT A/- AAAAGGGGCC 3070 hom 99 het 42 0 29 13 A 5 4 94889 CASAVA_Build 16 14350796 1D CAACGTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 28 het 18 0 14 4 T 10 9 94890 CASAVA_Build 16 14359395 1I GAATGGGCTA -/C CAAGAAGATC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 C 1 2 94891 CASAVA_Build 16 14364168 1D TTCTCTTCTG T/- AAAGTGGGGA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 1 0 94892 CASAVA_Build 16 14378303 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTGTATTT 2167 het 2031 hom 11 5 5 1 T 4 5 94893 CASAVA_Build 16 14434372 2I AAATAGTCAC --/GT GTGTCACTTA 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 GT 2 3 94894 CASAVA_Build 16 14445215 1D CTGCTGAGAT G/- CTTTTCTGAG 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 G 1 0 94895 CASAVA_Build 16 14445666 1I TCTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 10 11 94896 CASAVA_Build 16 14446342 17D AATATTTAAA TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 25 8 94897 CASAVA_Build 16 14459261 14D TTGTGGAATA GGGGTGTGTGTGTG/-------------- GGGGTGTGTG 2851 het 2374 hom 18 10 9 7 GGGGTGTGTGTGTG 2 1 94898 CASAVA_Build 16 14460391 1D ATCAATCTCT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 48 23 20 7 A 8 7 94899 CASAVA_Build 16 14465146 1I CGGGAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 2056 hom 15 6 7 2 A 8 9 94900 CASAVA_Build 16 14469822 2I GAGGAGGGAA --/AG AGAGAAGGAA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 AG 2 3 94901 CASAVA_Build 16 14477566 4D AAAGAAGTCA AATT/---- AATTTAATAT 3070 het 3070 ref 35 21 12 4 AATT 2 1 94902 CASAVA_Build 16 14484966 2D GTACACCCAC AT/-- GTCATCCATC 3070 het 3070 hom 35 16 19 1 AT 1 0 94903 CASAVA_Build 16 14502644 1D10M1D AAAAAACAAA CAAAAAAACAAT/-AAACAAACAA- AATAATAATA 3070 het 1226 hom 11 3 10 0 N/A 0 0 94904 CASAVA_Build 16 14504789 2I CGTATCATGA --/TC ATATGTCATG 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 TC 0 1 94905 CASAVA_Build 16 14506242 3I TTTAAAAGTT ---/AAA AAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 4 7 94906 CASAVA_Build 16 14512806 1D ATGGCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 22 19 11 A 12 11 94907 CASAVA_Build 16 14516631 3D ACCACTCCTG GCT/--- GCTAACTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 GCT 2 1 94908 CASAVA_Build 16 14521175 2D GCAGACAAGT AA/-- AAGTTTCTCT 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 A 4 2 94909 CASAVA_Build 16 14531342 2I CTCAGCTTCC --/AA AAGAGACCCC 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 A 2 4 94910 CASAVA_Build 16 14531903 1I AGGTTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 12 13 94911 CASAVA_Build 16 14542650 3D AGGAAGTTAG AGA/--- AGAAGAAGAA 3070 het 3070 ref 51 29 16 9 AGA 4 3 94912 CASAVA_Build 16 14543926 1D CAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 11 10 94913 CASAVA_Build 16 14548451 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2569 hom 32 10 13 11 A 14 13 94914 CASAVA_Build 16 14553018 1D ATCAACAAAT G/- GGGGGAAAGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 6 5 94915 CASAVA_Build 16 14560934 2D AACGACACTC TA/-- TTTAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 TA 1 0 94916 CASAVA_Build 16 14572963 1I TATGCAAACC -/A AACAGCCCTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 3 94917 CASAVA_Build 16 14574252 1D GTATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2114 het 2114 ref 48 30 5 13 T 13 12 94918 CASAVA_Build 16 14575070 1I TGTACTGTTA -/T TTTTGATAGT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 4 5 94919 CASAVA_Build 16 14585851 1I GATTCACTGA -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 C 7 8 94920 CASAVA_Build 16 14586290 1D GAAAATACTT A/- AACACAGACA 3070 het 3070 ref 40 24 15 3 A 3 2 94921 CASAVA_Build 16 14606887 5I AACTTACATA -----/TATGT TATATGTTGT 3070 het 3070 hom 44 19 24 1 TATGT 0 1 94922 CASAVA_Build 16 14616662 1D CTTTTATGGG A/- AAAAAAAAAA 1645 het 1645 ref 36 23 4 11 A 15 14 94923 CASAVA_Build 16 14632562 1D ACTTGTTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2219 hom 22 6 12 4 A 10 9 94924 CASAVA_Build 16 14659762 3I GAGAAGGGAA ---/GAT GATGGAGCTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 GAT 1 2 94925 CASAVA_Build 16 14689194 1I ACCTCTACTG -/A AAAAAATACA 2214 hom 12 het 5 0 5 0 A 6 7 94926 CASAVA_Build 16 14780543 7D GCTAAGTAAA TGTCACC/------- TGTCAGCATC 3070 het 3070 ref 33 22 8 6 TGTCACC 1 0 94927 CASAVA_Build 16 14857335 1I CCATTTGCTG -/A AAAAAAAAAT 2540 het 2540 ref 47 27 6 14 A 9 10 94928 CASAVA_Build 16 14879274 5I AAATAAAAAT -----/AAAAC TAAGTGCCTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AAAAC 0 1 94929 CASAVA_Build 16 14901253 1D GGAATAGTGC T/- CAATAAATGT 3070 het 3070 ref 33 19 8 7 T 1 0 94930 CASAVA_Build 16 14902567 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1432 het 1432 ref 17 6 4 7 T 13 14 94931 CASAVA_Build 16 14906068 1I TTTTATTTAA -/T TTTTTTTTTT 1452 het 1452 ref 10 5 4 1 T 11 12 94932 CASAVA_Build 16 14960058 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2447 hom 41 11 21 9 A 15 14 94933 CASAVA_Build 16 14960814 1I23M4I GTAACTTCTC -TGCGAATCCTGAAATTTCTACTG----/TTGCGAATCCTGAAATTTCTACTGACAA ACAAAAGACT 3070 hom 54 het 22 0 19 6 N/A 0 0 94934 CASAVA_Build 16 14961957 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 8 94935 CASAVA_Build 16 14964518 2D CTCCATTTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2251 hom 31 8 17 8 A 14 12 94936 CASAVA_Build 16 14967243 2I CATTTCTGCA --/TT ATTTTGGTCA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 0 2 94937 CASAVA_Build 16 14980656 1D GCAATTCGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 56 27 18 12 T 10 9 94938 CASAVA_Build 16 14984775 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAACTAG 1981 het 1981 ref 12 7 5 0 A 7 6 94939 CASAVA_Build 16 14986419 4D TTTTAGTAGA GATG/---- GATGGGGTTT 2701 het 2701 ref 26 18 7 1 GATG 2 1 94940 CASAVA_Build 16 14988455 1D TGGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1145 het 1145 ref 38 27 3 8 A 12 11 94941 CASAVA_Build 16 15009428 1I AATACCTGTA -/T TTTTTTTTGA 2700 het 2700 ref 60 44 8 8 T 8 9 94942 CASAVA_Build 16 15009489 1D CTTTAAGGAG A/- AAAATGTGCT 3070 het 3070 ref 66 45 10 13 A 5 4 94943 CASAVA_Build 16 15009954 1D AAATTCACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2272 hom 24 6 11 7 T 12 11 94944 CASAVA_Build 16 15013629 1I ACCTAGCTAG -/T TTTTTTGTAT 2116 het 647 hom 12 3 7 2 T 6 7 94945 CASAVA_Build 16 15016289 2D CAAATTCATC TA/-- TATGTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 22 10 9 TA 2 1 94946 CASAVA_Build 16 15018207 2I AAAGAATGAT --/AA AACTGGAAAA 1583 het 1583 ref 59 50 4 5 A 2 4 94947 CASAVA_Build 16 15018348 1D TGTTGCTGTT A/- ATGAAAGCTA 2332 het 2332 ref 54 44 5 5 A 2 1 94948 CASAVA_Build 16 15019151 1D AGGTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 2421 het 1857 hom 36 11 8 17 T 17 16 94949 CASAVA_Build 16 15028394 1I AATCTGTATC -/T TTAAAGAATG 3070 het 3070 ref 54 32 17 5 T 2 3 94950 CASAVA_Build 16 15037835 2I GTAGAACCAC --/AT GTTTGCTGTC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 AT 0 1 94951 CASAVA_Build 16 15045673 1I TGGGGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 1028 het 1028 ref 40 28 4 8 A 10 11 94952 CASAVA_Build 16 15047327 4I CACCATGGCT ----/TTGC TTGCCACTGG 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 TTGC 1 2 94953 CASAVA_Build 16 15053370 1D ATATTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 1165 het 1165 ref 33 22 3 8 A 12 11 94954 CASAVA_Build 16 15061356 1D ACATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 13 12 94955 CASAVA_Build 16 15082192 2I CTGCCTCTTT --/GA GACATTTCAT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 GA 1 2 94956 CASAVA_Build 16 15085680 1I TTTTTATTCA -/T TATGGCATGA 3070 het 2942 hom 21 7 11 3 T 1 2 94957 CASAVA_Build 16 15085816 2D AAAAACAATT AA/-- AGAGAATAAA 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 A 3 1 94958 CASAVA_Build 16 15086685 1I TGTGCTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 10 11 94959 CASAVA_Build 16 15164451 6I TGAAATACAC ------/ATTATT ATTAACTATA 1347 het 1347 ref 41 33 3 5 ATT 1 3 94960 CASAVA_Build 16 15184991 1I AATTAAAGTA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 954 hom 16 2 9 5 T 6 7 94961 CASAVA_Build 16 15191959 2D TCCAGCATCT TC/-- TCTGTTAATG 1648 het 1648 ref 57 47 4 8 TC 2 1 94962 CASAVA_Build 16 15205430 1I AACTCTCTGG -/A AAAAAAAATC 1495 het 1495 ref 21 16 4 1 A 8 9 94963 CASAVA_Build 16 15221504 20D CGGCACTGCA GCCTCCCGCCCTGGAGCTTC/-------------------- GCCTCCAGGT 3070 het 3070 ref 30 23 12 5 GCCTCCCGCCCTGGAGCTTC 1 0 94964 CASAVA_Build 16 15231034 1I TTAAATGCAA -/T TTGGTATCTA 3070 het 3070 ref 49 37 8 4 T 2 3 94965 CASAVA_Build 16 15235126 1I AAAAAAAAAA -/T TTTAAGAGCT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 3 4 94966 CASAVA_Build 16 15237483 1D ACACACTTTA T/- TTTTTTTTGT 1375 het 468 hom 30 7 6 17 T 9 8 94967 CASAVA_Build 16 15237502 1I GTTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 2984 het 303 hom 27 4 9 14 G 0 1 94968 CASAVA_Build 16 15250361 4I TTCTCCTGAT ----/AGTG AGTAAGTCTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AGTG 0 1 94969 CASAVA_Build 16 15254959 7D GAGTAAGAGG GGCTCCT/------- TCATCCTCCG 3070 het 3070 ref 43 34 9 1 GGCTCCT 1 0 94970 CASAVA_Build 16 15255322 1D ATTACTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 11 10 94971 CASAVA_Build 16 15260777 1I ACCAACAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 6 7 94972 CASAVA_Build 16 15297943 1D AAAGAGCCTC A/- TCTTCTCCGT 3070 het 3070 ref 59 44 9 6 A 1 0 94973 CASAVA_Build 16 15300801 3D TGGGCAACAT AAG/--- AAGACCCCAT 2640 het 2640 ref 27 19 7 1 AAG 2 1 94974 CASAVA_Build 16 15301258 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1454 het 166 hom 15 4 4 7 A 19 18 94975 CASAVA_Build 16 15303471 2I TTTTTCAGAG --/AC AGAGTCTCAC 3063 het 309 hom 9 1 7 1 AC 0 1 94976 CASAVA_Build 16 15311200 1I TGAATCCCTT -/C CCCCCTCCCC 3070 hom 49 het 21 0 16 5 C 5 6 94977 CASAVA_Build 16 15311981 1D TTGTTATTTC A/- AAAAAAAAAA 2729 het 647 hom 27 6 10 11 A 17 16 94978 CASAVA_Build 16 15314637 1D ACTCTACCTC A/- AAAAAAACAA 831 het 831 ref 20 12 3 5 A 8 7 94979 CASAVA_Build 16 15315140 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1134 het 1134 ref 11 6 5 0 A 10 11 94980 CASAVA_Build 16 15316629 1I CCACCATGGT -/A AAAAAAATAC 2866 het 2866 ref 19 10 8 1 A 7 8 94981 CASAVA_Build 16 15378568 1D TTGTAGAGAT G/- GGGTTTCGCT 1942 hom 12 het 5 0 5 0 G 4 3 94982 CASAVA_Build 16 15384362 13I TCCAAGAAAG -------------/CCTCCTACACCTC CCATAATACT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 CCTCCTACACCTC 0 1 94983 CASAVA_Build 16 15385325 4D AAAAAAAGTT ATTA/---- ATTATTTCTG 3070 het 3070 ref 39 28 8 4 ATTA 2 1 94984 CASAVA_Build 16 15395304 1D CCAGGGGATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1755 hom 18 6 11 1 T 10 9 94985 CASAVA_Build 16 15399607 5D TCACCATGTT GGCCA/----- GGCTGGTCTC 3070 het 3070 ref 26 14 12 3 GGCCA 1 0 94986 CASAVA_Build 16 15403924 3I CAGTAACTAT ---/AAG AAGTGTGTTC 3070 hom 98 het 38 0 29 9 AAG 1 2 94987 CASAVA_Build 16 15404771 3I CAGCTCACAC ---/CTG CTGTAATCCC 1770 het 1234 hom 11 4 4 3 CTG 1 2 94988 CASAVA_Build 16 15408429 1I CATGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2600 hom 25 8 8 9 A 11 12 94989 CASAVA_Build 16 15408872 1I ATGCCGAGGT -/G GGTGGATCAC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 2 3 94990 CASAVA_Build 16 15409160 1I AAGTTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 9 6 T 11 12 94991 CASAVA_Build 16 15413789 1D CTGTGTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 555 hom 25 4 18 3 A 15 14 94992 CASAVA_Build 16 15414098 1I GACCCACTAA -/T TTTTTTTTTT 1508 het 435 hom 13 3 7 3 T 14 15 94993 CASAVA_Build 16 15417574 3D CAGGGGATCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 28 0 19 10 T 14 11 94994 CASAVA_Build 16 15417887 1D GGGCCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3023 hom 42 het 19 0 11 8 T 15 14 94995 CASAVA_Build 16 15418210 8D CTGGCTAATT TTTTTGTA/-------- TTTTTGTATT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TTTTTGTA 2 1 94996 CASAVA_Build 16 15418361 1I CTGGTATTTT -/A TTTTTTTTTT 2522 het 378 hom 13 1 9 3 A 0 1 94997 CASAVA_Build 16 15418425 11I CATTCCTGGA -----------/CTCAAGTGATC CTCCGACCTT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 CTCAAGTGATC 0 1 94998 CASAVA_Build 16 15429689 1D TCATAAAATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 35 0 30 7 A 9 8 94999 CASAVA_Build 16 15432993 4I ACACACAAAC ----/TATA TATATATATA 3070 hom 71 het 28 0 24 4 TA 6 8 95000 CASAVA_Build 16 15433317 1I AAGGTCTGTA -/T TTTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 T 5 6 95001 CASAVA_Build 16 15440721 1D TAGATGAGAT A/- ATGTATATAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 1 95002 CASAVA_Build 16 15466712 1D AAGATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1482 hom 32 5 17 10 T 17 16 95003 CASAVA_Build 16 15468079 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 40 0 31 11 TG 9 8 95004 CASAVA_Build 16 15471892 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 37 0 23 15 T 12 11 95005 CASAVA_Build 16 15486875 2D ATTTGGATGG TC/-- TCTGAACCAT 3070 hom 156 het 56 0 52 4 TC 2 1 95006 CASAVA_Build 16 15509806 1I GTGATCAGTG -/T TCCAGAACAA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 T 1 2 95007 CASAVA_Build 16 15537007 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1613 het 46 hom 11 1 7 3 A 15 16 95008 CASAVA_Build 16 15546340 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 9 het 25 1 18 7 T 9 10 95009 CASAVA_Build 16 15625269 1D TCACTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1003 het 1003 ref 14 6 3 5 T 19 18 95010 CASAVA_Build 16 15639944 1D ACTGCACCTC A/- AAAAAAAAAA 1543 het 1543 ref 24 13 4 7 A 12 11 95011 CASAVA_Build 16 15684374 1D AACTTACACA T/- TTTTTTTTTT 1582 het 1582 ref 41 25 4 13 T 12 11 95012 CASAVA_Build 16 15714160 7I AGGGGACCTC -------/TGGCCAT TGGCCATTAG 3070 hom 73 het 29 0 22 7 TGGCCAT 1 2 95013 CASAVA_Build 16 15735662 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 9 10 95014 CASAVA_Build 16 15761464 4D CAAAAACAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 70 het 28 0 23 6 AAAC 4 3 95015 CASAVA_Build 16 15766587 4D GGTAGATGAA TGGG/---- TGAATGATGG 3070 hom 120 het 45 0 40 7 TGGG 1 0 95016 CASAVA_Build 16 15770517 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3018 het 2903 hom 20 8 8 4 A 8 9 95017 CASAVA_Build 16 15808128 24I AGCTCCTGAA ------------------------/GGTCAAGGGCTGTGCCTGATCCCG GGTACAAGGA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 GGTCAAGGGCTGTGCCTGATCCCG 0 1 95018 CASAVA_Build 16 15808315 1I TAAGATCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 T 10 11 95019 CASAVA_Build 16 15825480 2D GCTCATCATT TA/-- ACAGGTGGCA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 TA 1 0 95020 CASAVA_Build 16 15827953 10I CTCAAAAAAG ----------/AAAAAGAAAA AAAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AAAAAGAAAA 0 1 95021 CASAVA_Build 16 15830543 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2014 het 1041 hom 23 9 6 8 A 13 12 95022 CASAVA_Build 16 15831493 1I ACTTGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 827 hom 34 2 20 12 A 11 12 95023 CASAVA_Build 16 15845058 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 18 0 12 7 A 13 14 95024 CASAVA_Build 16 15857976 1D TCGGGACTAA T/- TTTTTTTTTT 1173 het 1173 ref 39 31 3 6 T 13 12 95025 CASAVA_Build 16 15867491 5D AATGTTGTGT AAGTA/----- TAGTTTAAAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 AAGTA 1 0 95026 CASAVA_Build 16 15893108 4D CTTCCTTCCT TCCC/---- TCCCTCCCTC 2111 het 619 hom 16 2 9 6 TCCC 4 3 95027 CASAVA_Build 16 15900426 1D CACATGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 39 0 25 14 T 11 10 95028 CASAVA_Build 16 15907690 3D CAATGACAAG AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 36 13 16 10 AAC 4 3 95029 CASAVA_Build 16 15908080 4D GCTTTTCATA TCTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2081 hom 23 9 10 4 TCTT 1 0 95030 CASAVA_Build 16 15908306 1D CATATTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1632 hom 20 8 10 2 A 12 11 95031 CASAVA_Build 16 15935698 6D AAAAGAAAAT AAAATA/------ AAAATAAAAA 3070 hom 35 het 16 0 12 5 AAAATA 2 1 95032 CASAVA_Build 16 15940966 3D CAATGCACTC ATT/--- GTCTAAGGCT 3070 het 3070 hom 57 24 25 10 ATT 1 0 95033 CASAVA_Build 16 15942018 1D CTAAAAACAC T/- TAAGTTAGCC 3070 het 1408 hom 18 6 9 3 T 2 1 95034 CASAVA_Build 16 15946705 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2831 hom 31 10 15 6 A 12 11 95035 CASAVA_Build 16 15949811 1D TGCATATTAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 8 7 95036 CASAVA_Build 16 15951588 1D ATACTCCGTG A/- CCAACGGGGT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 1 0 95037 CASAVA_Build 16 15969130 2D AAAAAAAAAA AC/-- AACAAAAAAA 1053 het 700 hom 21 6 5 10 AC 1 0 95038 CASAVA_Build 16 15970971 1D CTCAGGTGAT C/- CCCCCTGCCT 3070 hom 24 het 25 0 11 14 C 6 5 95039 CASAVA_Build 16 15973477 1I TTTTTATTTT -/A AAATGGGGAA 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 A 3 4 95040 CASAVA_Build 16 15975746 1D ATGATGCTCA G/- ACCCCCATTA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 G 1 0 95041 CASAVA_Build 16 15980881 3D AATAAACAGC TTT/--- TTTGTTGAGA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 6 3 95042 CASAVA_Build 16 15985154 1I CCTCAAGTGA -/T TTCGCCTGCC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 2 3 95043 CASAVA_Build 16 15985807 4I TGATATATAC ----/GTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 GTTT 0 1 95044 CASAVA_Build 16 15992989 1I AGCAGCACCT -/G GTACTCACTG 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 G 1 2 95045 CASAVA_Build 16 15993854 9D GCCTCCCAGG TTCCAGCGA/--------- TTCTCCTGCC 2498 het 842 hom 10 4 6 0 TTCCAGCGA 1 0 95046 CASAVA_Build 16 15993905 1D TTATAGGCAC A/- ATGGCACCGT 2155 het 1760 hom 14 5 6 3 A 2 1 95047 CASAVA_Build 16 15996875 1I CATAGAGTTG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 T 8 9 95048 CASAVA_Build 16 15999535 3D GCTGGAGTGC CTG/--- GGTGGGACGA 3070 hom 47 het 17 0 15 2 CTG 1 0 95049 CASAVA_Build 16 16001730 1I TTTGAACTCC -/T TGGGCTCAAG 3070 hom 68 het 26 0 22 4 T 1 2 95050 CASAVA_Build 16 16005593 1I AAGCAGTTGC -/A ATAGTCCTGG 3070 hom 128 het 48 0 40 8 A 1 2 95051 CASAVA_Build 16 16006220 1I ATGTTTTTAT -/G GGGGGGTTCT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 6 7 95052 CASAVA_Build 16 16007784 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 10 11 95053 CASAVA_Build 16 16007924 1I AAATACAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 11 12 95054 CASAVA_Build 16 16012591 5D ACCTCATCTC AAAAA/----- AGAAAAAGAA 2338 het 2338 ref 17 9 6 4 A 6 1 95055 CASAVA_Build 16 16014059 2D3M4D13M1I TTTTTTTTTT CCTTTGAGGCAGAGTTTCGCTC-/--TTT----CAGAGTTTCGCTCT TTTTTTCCCA 2390 het 2390 ref 24 15 8 3 N/A 0 0 95056 CASAVA_Build 16 16014921 1D ACCTGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 14 0 10 4 T 13 12 95057 CASAVA_Build 16 16018343 2D TTAGGCCTAT AA/-- TCCTACAGGG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 2 0 95058 CASAVA_Build 16 16018441 2D TGCCTGGCCC CT/-- GAGGGATTTG 3070 het 3070 hom 30 11 18 11 CT 1 0 95059 CASAVA_Build 16 16020162 6I TGTGTGTGTT ------/TGAATA TGTGTGTGTG 3070 hom 149 het 56 0 48 10 TGAATA 0 1 95060 CASAVA_Build 16 16022675 1I AAGAGCCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 T 11 12 95061 CASAVA_Build 16 16025656 4I GGCAAGAGTC ----/AGGG AGCATCAGAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AGGG 0 1 95062 CASAVA_Build 16 16033260 15I CTGACTCTTT ---------------/GGGGCTCACATCCTC GGGGCTCACA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 GGGGCTCACATCCTC 1 2 95063 CASAVA_Build 16 16036851 1D CTTCAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 13 12 95064 CASAVA_Build 16 16044061 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2108 het 1182 hom 21 7 6 9 A 17 16 95065 CASAVA_Build 16 16056598 1I CAAAAAAAAA -/G GAAAACTGGG 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 G 1 2 95066 CASAVA_Build 16 16061562 6D GCTGGCTCTA GATTTT/------ GTCACATGGA 3070 het 3070 ref 44 25 16 4 GATTTT 1 0 95067 CASAVA_Build 16 16073540 1D GTTACTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1328 hom 39 6 26 7 T 15 14 95068 CASAVA_Build 16 16073843 1I TCTCCTGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 551 hom 30 3 20 7 T 13 14 95069 CASAVA_Build 16 16082238 4I TTGTTGTGGG ----/TTTT TTTTGAGACA 3070 hom 94 het 35 0 31 4 T 4 8 95070 CASAVA_Build 16 16083925 1I AAATGGATGC -/T TTGATATAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 2 3 95071 CASAVA_Build 16 16085989 1D CTCAAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1194 hom 17 5 8 4 T 13 12 95072 CASAVA_Build 16 16090073 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 9 10 95073 CASAVA_Build 16 16097585 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1006 hom 29 5 17 7 A 10 9 95074 CASAVA_Build 16 16098276 1D TGTTTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 11 10 95075 CASAVA_Build 16 16101722 1D GGTAGGAGAG C/- GGGGGGGCTC 3070 hom 89 het 35 0 27 8 C 1 0 95076 CASAVA_Build 16 16101841 2D AGTGTCACAC AT/-- GTGTGTGAGG 3070 het 3070 hom 54 20 24 12 AT 1 0 95077 CASAVA_Build 16 16102374 1D GTTTTTTAGA T/- TTTTTTTTTA 2862 het 2718 hom 19 8 8 3 T 10 9 95078 CASAVA_Build 16 16103569 3D TTGAATATCA CTT/--- CTTCTTTCAA 3070 het 3070 hom 49 19 25 6 CTT 3 2 95079 CASAVA_Build 16 16107739 1D TTTTATTGGC T/- TTTTTTTTTT 2023 het 1879 hom 22 5 7 10 T 12 11 95080 CASAVA_Build 16 16107775 1D TTGATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 123 hom 22 1 15 6 A 15 14 95081 CASAVA_Build 16 16107932 1I GTGACATGGT -/G GGGGTGTGGT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 G 4 5 95082 CASAVA_Build 16 16109802 1I CTAATTTTTG -/T TATTTTCGGT 3070 het 2651 hom 20 8 8 4 T 1 2 95083 CASAVA_Build 16 16129542 1D TTGAATTCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 459 hom 17 1 12 4 T 10 9 95084 CASAVA_Build 16 16137372 2D CTTTCCAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 2641 het 2625 hom 24 8 6 11 T 14 12 95085 CASAVA_Build 16 16139025 8I ATTGTTCTGC --------/CTCTGCCT CTCTGCCTCC 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 CTCTGCCT 1 2 95086 CASAVA_Build 16 16148586 5D AAGTGGGTCT TTTTG/----- TTTTGTGTTT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 TTTTG 2 1 95087 CASAVA_Build 16 16160785 1D GGACCCATTG C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 57 het 26 0 19 7 C 9 8 95088 CASAVA_Build 16 16177135 1D AGGGCACCAT G/- GGGGGGACTT 3070 hom 124 het 48 0 37 11 G 7 6 95089 CASAVA_Build 16 16186477 1D CCATCCCCCG C/- CCCCCCCAGG 2712 het 6 hom 21 1 10 10 C 8 7 95090 CASAVA_Build 16 16187135 2D GGAGTAAGAC TG/-- TGTCTCAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 TG 2 1 95091 CASAVA_Build 16 16190778 2D TTTGTGGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2885 het 666 hom 20 4 8 8 T 16 14 95092 CASAVA_Build 16 16193001 5D TCCCTCTTTC CTTTT/----- ATTTCCTTCC 3070 hom 87 het 31 0 28 4 CTTTT 1 0 95093 CASAVA_Build 16 16200359 1I TTCGGGGGGG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 26 het 14 0 10 4 A 6 7 95094 CASAVA_Build 16 16218538 1I TTCTAGTTTT -/G GGGTTTTTGT 2338 het 2338 ref 41 26 6 9 G 3 4 95095 CASAVA_Build 16 16218629 1D ACTCCCACTG T/- TTTCCCCACT 3070 het 3070 ref 32 18 9 6 T 4 3 95096 CASAVA_Build 16 16219373 1I GATTGAACCC -/G GGAGGTGGAG 2283 het 2283 ref 20 13 6 1 G 2 3 95097 CASAVA_Build 16 16251592 1I GCAACACGTA -/C AGAGAAACCT 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 C 0 1 95098 CASAVA_Build 16 16431970 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 13 14 95099 CASAVA_Build 16 16441635 1I AGCATCCAGT -/G GGGGCATTAT 1820 het 1820 ref 13 5 4 4 G 4 5 95100 CASAVA_Build 16 16446703 1I ATGTGCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 18 1 13 4 T 13 14 95101 CASAVA_Build 16 16448359 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2347 hom 28 het 14 0 9 5 A 17 16 95102 CASAVA_Build 16 16452225 1D TCAAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 1471 het 1471 ref 33 21 5 7 A 15 14 95103 CASAVA_Build 16 16453544 1D CGGAGGAAGT G/- GGGGGTGGGG 1675 het 1675 ref 11 7 4 0 G 6 5 95104 CASAVA_Build 16 16457065 4I AATTGAGGTT ----/TCTG TCTAAGAGCC 3070 het 3070 ref 79 54 9 16 TCTG 0 1 95105 CASAVA_Build 16 16457876 1D TCCTGGGCTC A/- AATTGATCCT 2995 het 2995 ref 22 14 7 2 A 3 2 95106 CASAVA_Build 16 16462284 1I AATACCAAAG -/T GACAGATTTC 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 T 0 1 95107 CASAVA_Build 16 16468619 1I GTCTTTCAAT -/A AAATTTTCCA 3070 het 3070 ref 42 25 7 10 A 3 4 95108 CASAVA_Build 16 16474363 1D ATTAAACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 9 11 T 11 10 95109 CASAVA_Build 16 16476016 1I GCAAATTGTT -/A ACGGGCCCCA 2511 het 2511 ref 29 15 6 8 A 1 2 95110 CASAVA_Build 16 16489566 2D TGAAACTCTA TC/-- TCTAAACAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 TC 2 1 95111 CASAVA_Build 16 16509073 4I CATGAGACTT ----/ACTC ACTATCAGGA 3070 het 991 hom 22 3 15 4 ACTC 0 1 95112 CASAVA_Build 16 16509497 1D TGGGGTGCAG A/- AAGAGAGGCA 1435 het 1435 ref 11 6 3 2 A 3 2 95113 CASAVA_Build 16 16513639 1I CCGACTAATA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 T 7 8 95114 CASAVA_Build 16 16515575 4D ATGTACCATA CTTT/---- CTTTATCTAG 2730 het 2730 ref 46 36 6 7 CTTT 2 1 95115 CASAVA_Build 16 16521969 2I GTGTAGAGAC --/AG AGTCTCACTG 1251 het 1251 ref 16 7 3 7 AG 1 2 95116 CASAVA_Build 16 16531459 1D CCATTTTGCC A/- ACATCTGTCC 1833 het 1833 ref 17 11 4 2 A 2 1 95117 CASAVA_Build 16 16537451 1I AAACAAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3051 het 689 hom 22 3 10 9 A 15 16 95118 CASAVA_Build 16 16552108 1I ATTTTTAAAT -/A TTTTTAATGC 3070 het 1160 hom 13 4 7 2 A 0 1 95119 CASAVA_Build 16 16591735 4D ACAGCCAGTG TTAA/---- TTATTATTTT 2458 het 2458 ref 31 20 6 7 TTAA 1 0 95120 CASAVA_Build 16 16591985 6I CAACAAATAG ------/GGATAT AGAGGACCAA 3070 het 3070 ref 44 29 11 4 GGATAT 0 1 95121 CASAVA_Build 16 16601444 1I ATCACAACTG -/T CATCATAATT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 0 1 95122 CASAVA_Build 16 16602070 10D TCTCTCTCTC TCTCTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2268 het 1164 hom 19 4 9 7 TCTCTTTTTT 1 0 95123 CASAVA_Build 16 16606627 5I TTCTCTTTTC -----/TTTCT TTTCTTTTCT 2758 het 2054 hom 23 7 7 9 TTTCT 3 4 95124 CASAVA_Build 16 16608973 1D TGGAATCTGG C/- AGCATGGGGC 3070 het 3070 ref 51 39 11 1 C 1 0 95125 CASAVA_Build 16 16622557 4I GTGCTTTCTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 2945 hom 18 het 12 0 7 5 TTTG 3 4 95126 CASAVA_Build 16 16627822 1D TTTTAAATAA T/- TTTTTTTTTT 1778 het 1778 ref 10 6 4 0 T 11 10 95127 CASAVA_Build 16 16630312 2D GCCATCTCAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AT 6 5 95128 CASAVA_Build 16 16637290 1I CAGATGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1320 hom 36 4 24 9 T 13 14 95129 CASAVA_Build 16 16640539 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1352 hom 17 3 14 0 A 11 10 95130 CASAVA_Build 16 16646868 2I TCTTTCCTGC --/TT TTTTTTTTCC 2799 het 2799 ref 35 27 6 2 T 8 10 95131 CASAVA_Build 16 16696225 1D CATGTATATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 14 14 1 A 9 8 95132 CASAVA_Build 16 16716270 2D TTATTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 30 0 23 7 T 11 9 95133 CASAVA_Build 16 16719597 2D TCCTGGGAGA CT/-- CTGCAGTCAG 2004 het 941 hom 9 3 6 0 CT 2 1 95134 CASAVA_Build 16 16742602 3I TTTTTTTTTT ---/GCG GGGGGGGGGG 1783 hom 17 het 16 0 9 7 GCG 0 1 95135 CASAVA_Build 16 16773316 1I GATTCATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 20 2 12 6 T 14 15 95136 CASAVA_Build 16 16775223 2I TTTCTCCCCA --/TC TTCATGGATT 3070 hom 90 het 32 0 31 3 TC 0 1 95137 CASAVA_Build 16 16778250 2D TAGTCAGTTG TT/-- TTTTTTTGTT 3040 het 15 hom 40 1 12 28 T 9 7 95138 CASAVA_Build 16 16783106 1I GATCCTCCCT -/G GCTCTTGTGT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 G 1 2 95139 CASAVA_Build 16 16783577 1D GAAGCCCTAG C/- CCCCAGTGTG 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 C 5 4 95140 CASAVA_Build 16 16802318 1D GTCCAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 18 9 A 12 11 95141 CASAVA_Build 16 16813712 4I GAGAAGAGGG ----/GAGA GAGAGGAAGA 3070 hom 85 het 33 0 29 4 GA 2 4 95142 CASAVA_Build 16 16823635 12D TCAGGCAGAT AAACATGTTCAA/------------ AAACATGTTC 3070 hom 113 het 44 0 41 6 AAACATGTTCAA 2 1 95143 CASAVA_Build 16 16824661 6I TTTATTCTTC ------/TTCTTT TTCTTCTTCT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 TTCTTT 0 1 95144 CASAVA_Build 16 16824893 2D TCTTGATCTC TT/-- GACCTCGTGA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 2 0 95145 CASAVA_Build 16 16828838 5D CTTGAACAGT GACTC/----- GACTCAGGGA 3070 hom 55 het 27 0 22 5 GACTC 2 1 95146 CASAVA_Build 16 16829061 1I TGTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 41 het 18 0 14 4 T 9 10 95147 CASAVA_Build 16 16833640 1D TTTTTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 T 11 10 95148 CASAVA_Build 16 16836044 2D CTTAAAGTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 13 11 95149 CASAVA_Build 16 16837788 1D ATATACATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 16 0 11 5 A 13 12 95150 CASAVA_Build 16 16841648 19D ATTCATTGAC ATGAATCATATTCATTGAT/------------------- ATGAATCATA 3070 het 3070 ref 33 18 11 9 ATGAATCATATTCATTGAT 1 0 95151 CASAVA_Build 16 16841807 1I TGTAATTTCC -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 T 6 7 95152 CASAVA_Build 16 16849267 4D TTTCCAGCTT CATC/---- CATGTCCCTA 3039 het 1688 hom 12 4 7 3 CATC 1 0 95153 CASAVA_Build 16 16859560 13I GTGTTGAGCC -------------/ACATTTGATATTG ACATTTGATA 3070 hom 153 het 54 0 50 6 ACATTTGATATTG 1 2 95154 CASAVA_Build 16 16869909 1D TAGAGGAAAA G/- CATCAGTATC 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 G 1 0 95155 CASAVA_Build 16 16871783 1D71M1I ACTTGAGTGC GGGGGGGGGTTGAGGCTGCAGAGAGCTACGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGATCCTGTCTC-/-GGGGGGGGTTGAGGCTGCAGAGAGCTACGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGATCCTGTCTCA AAAAAAAAAA 3070 het 577 hom 28 4 21 22 N/A 0 0 95156 CASAVA_Build 16 16876685 2D ACCACGCTTG GA/-- GAGAAGCCAG 3070 het 3070 ref 25 13 12 1 GA 3 2 95157 CASAVA_Build 16 16880668 2I GACTTGAAAC --/AG AACTTTGGCT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 AG 0 1 95158 CASAVA_Build 16 16882300 1I GATACATTTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 9 95159 CASAVA_Build 16 16883712 4I AAGTTTGAAA ----/AATG AATGAATAAA 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 AATG 1 2 95160 CASAVA_Build 16 16884103 5D CCCAGAACTT AAAAA/----- AAAAGTTCAG 3070 het 3070 ref 42 25 15 5 A 9 4 95161 CASAVA_Build 16 16887842 1I TGGCGCATGC -/T TTATAATCCC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 2 3 95162 CASAVA_Build 16 16892756 2D TGTTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGC 3070 het 35 hom 36 1 20 16 TG 1 0 95163 CASAVA_Build 16 16893492 25I GGTCTTGCTC -------------------------/TGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGCAG TGTTATCTTG 3070 hom 50 het 20 0 17 3 TGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGCAG 0 1 95164 CASAVA_Build 16 16895564 1D ATTTTCTTAA T/- TTTTGTATTC 3070 hom 105 het 43 0 36 8 T 5 4 95165 CASAVA_Build 16 16896295 1D AAGGAGAATG A/- AAAAAACTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 6 95166 CASAVA_Build 16 16915513 1I GGAAAAAAAA -/C ATCTGTTATT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 0 1 95167 CASAVA_Build 16 16916615 2D TAGTTTATAG AT/-- ATATATATAG 3070 hom 93 het 35 0 31 5 AT 5 4 95168 CASAVA_Build 16 16923270 1D TATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1265 hom 25 4 18 3 T 13 12 95169 CASAVA_Build 16 16933175 1D CTCTTGGAAA T/- TTTTTGGGTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 5 T 6 5 95170 CASAVA_Build 16 16944311 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1736 hom 24 6 11 7 A 14 13 95171 CASAVA_Build 16 16951898 13D CCTCTATCCT TTTATTTTGAGCC/------------- TTTATTTTGA 3070 het 3070 ref 49 33 11 13 TTTATTTTGAGCC 2 1 95172 CASAVA_Build 16 16967818 1D AGCCCAAAGC T/- TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 47 37 3 7 T 11 10 95173 CASAVA_Build 16 16985458 3D CCTTTAGTAT TGC/--- TGCTGCTGCT 3070 het 3070 hom 47 13 21 13 TGC 5 4 95174 CASAVA_Build 16 16989969 4I TCATCTGCTG ----/TTTC TTCTTTTTCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTTC 0 1 95175 CASAVA_Build 16 16995170 1I TTACTGCAGT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 A 8 9 95176 CASAVA_Build 16 16996437 1D TAGCCAACTC T/- TTTTATATGG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 5 4 95177 CASAVA_Build 16 17003481 1D CCATTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 T 11 10 95178 CASAVA_Build 16 17011657 1D TCCCTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2801 hom 29 8 13 8 A 12 11 95179 CASAVA_Build 16 17014872 1D ATTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 T 10 9 95180 CASAVA_Build 16 17016100 1I CCCTCCCTGC -/T TCAAGTAGGC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 1 2 95181 CASAVA_Build 16 17019500 1D TTTGTAAGAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 A 9 8 95182 CASAVA_Build 16 17031295 1I GAGACTTCAC -/T TTTGATACCA 3070 het 3070 hom 50 24 23 4 T 3 4 95183 CASAVA_Build 16 17035867 1D TTTGGAAAGA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 37 15 19 5 T 8 7 95184 CASAVA_Build 16 17039162 18I CAGGGCTGTA ------------------/TAAGTAAGTTTTATTACC ATTATACATT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 TAAGTAAGTTTTATTACC 0 1 95185 CASAVA_Build 16 17047727 2I TTTTTCTATT --/TC TGTGACAAAT 3070 het 3070 hom 48 17 20 11 TC 0 1 95186 CASAVA_Build 16 17049138 2D ATTTTTTCTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 A 11 9 95187 CASAVA_Build 16 17085021 1D13M1I CGAACAGAAA TCACCTTATCACAT-/-CACCTTATCACATG CAGCACAGAT 3070 het 1250 hom 26 5 10 12 N/A 0 0 95188 CASAVA_Build 16 17094219 4D ATAAGATGAC CTGT/---- CTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 52 31 20 3 CTGT 1 0 95189 CASAVA_Build 16 17094711 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 10 11 95190 CASAVA_Build 16 17104124 2I ATTTACAGAT --/TC TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 46 25 20 1 TC 0 1 95191 CASAVA_Build 16 17116186 1I GAACATACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 9 10 95192 CASAVA_Build 16 17121682 1D GTCCAGTTGC T/- TTACCTGTCC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 3 2 95193 CASAVA_Build 16 17126156 3D TTTTTAAAAA TTC/--- TTTTTTGTGT 3070 hom 93 het 32 0 32 2 TTC 1 0 95194 CASAVA_Build 16 17131829 1D TTACTTGCCT C/- CCTTCACCTT 3070 hom 116 het 45 0 38 7 C 3 2 95195 CASAVA_Build 16 17132241 1I CTTTCTCTAG -/C CCCCCTTTTG 3070 hom 127 het 46 0 38 8 C 5 6 95196 CASAVA_Build 16 17132592 1D GAGTGAGCAC A/- AAAGCCCTCT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 4 3 95197 CASAVA_Build 16 17133385 1D ATGAATACTA G/- GGAGCAACCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 3 2 95198 CASAVA_Build 16 17136305 4I TCTAAAGCAA ----/TGAT TGATAGGCAC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 TGAT 1 2 95199 CASAVA_Build 16 17139406 3I AAGATGATAT ---/GAA GAGTATGGCC 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 GAA 0 1 95200 CASAVA_Build 16 17158303 2D CTAGGGTTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 14 12 95201 CASAVA_Build 16 17158757 2D GATTACAAAC AG/-- AGATGTGGTC 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 AG 2 1 95202 CASAVA_Build 16 17159389 8D ACAGGCATGA GCCACTGC/-------- GCCTGGCCTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 GCCACTGC 1 0 95203 CASAVA_Build 16 17163768 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 25 1 19 5 A 14 16 95204 CASAVA_Build 16 17165653 1I TGTCACAAAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 1490 hom 40 5 24 11 A 0 1 95205 CASAVA_Build 16 17209589 4I AGCAATCCTC ----/CCTT CCTTAGCCTC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 CCTT 1 2 95206 CASAVA_Build 16 17210824 1D GAACATGGGT G/- TACAAGTACC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 1 0 95207 CASAVA_Build 16 17217934 1D AATGCAGACA G/- GAATAATTAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 2 1 95208 CASAVA_Build 16 17219316 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 15 0 11 4 A 13 12 95209 CASAVA_Build 16 17219721 1I CGGACTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 39 1 29 9 T 11 12 95210 CASAVA_Build 16 17253485 1D GTAATTGCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 15 8 A 10 9 95211 CASAVA_Build 16 17269267 5I AATTTAAAAC -----/ACTTA ACTTAATACC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 ACTTA 1 2 95212 CASAVA_Build 16 17284319 1I CAATAAGTCA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 C 8 9 95213 CASAVA_Build 16 17289298 1I ATAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2347 het 2347 ref 43 13 12 18 T 13 14 95214 CASAVA_Build 16 17305831 9D TGCTGCAGGG ATTTGGACC/--------- ATTTGGACCG 3070 het 3070 ref 38 20 14 7 ATTTGGACC 2 1 95215 CASAVA_Build 16 17316897 1I TGTGTTGGTT -/G GTTGGTTTTG 3070 het 3070 ref 53 29 18 6 G 1 2 95216 CASAVA_Build 16 17327547 2I ATCTACTCTC --/TT AATACATTTT 3070 het 3070 hom 53 22 28 3 T 0 2 95217 CASAVA_Build 16 17332865 2I ACAGACACAC --/AT GTTTTCCATT 3070 het 3070 ref 64 28 27 9 AT 0 1 95218 CASAVA_Build 16 17341501 20D CTCTATCCAT CCGCCCATCCCTCCATCCAA/-------------------- CATATATCCA 3070 het 3070 ref 28 22 14 6 CCGCCCATCCCTCCATCCAA 1 0 95219 CASAVA_Build 16 17382780 11D AGGCAACACC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1573 het 1573 ref 17 9 4 4 T 21 10 95220 CASAVA_Build 16 17382830 5D TCACCCAAGC TGGAT/----- TGGAGCGCAG 1061 het 1061 ref 13 5 3 6 TGGAT 1 0 95221 CASAVA_Build 16 17387990 4D TGATTCCTAC TCAG/---- TATTTCCGTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TCAG 1 0 95222 CASAVA_Build 16 17405459 1D ATGTGTGGTT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 1831 hom 24 8 12 5 G 10 9 95223 CASAVA_Build 16 17406107 1I CAGTTTGGGC -/A ATATATTGAG 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 1 2 95224 CASAVA_Build 16 17422046 1D ATTATTCAGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 T 9 8 95225 CASAVA_Build 16 17442923 4D TAGAGTACCA ACTT/---- ACTTCTCCTG 3070 het 3070 ref 31 14 13 6 ACTT 2 1 95226 CASAVA_Build 16 17449130 1I CGAAAGCCAC -/T TTTTCACCCT 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 T 4 5 95227 CASAVA_Build 16 17453664 1D AGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2912 het 2912 ref 36 15 12 9 T 17 16 95228 CASAVA_Build 16 17464720 5D AGAACTCAAA CAACT/----- CAACAGCAAA 3070 het 3070 hom 29 14 15 1 CAACT 1 0 95229 CASAVA_Build 16 17474150 2I TATATAATAT --/TA TATATATATA 1835 hom 12 het 6 0 5 1 TA 7 8 95230 CASAVA_Build 16 17494012 1D CAGTCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 27 1 11 15 A 17 16 95231 CASAVA_Build 16 17494173 4I AAACCCTGTC ----/TCAA TCAATCAATC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TCAA 4 5 95232 CASAVA_Build 16 17501580 2I CAGAGCGAGA --/CT CTGCCCCCCC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 CT 1 2 95233 CASAVA_Build 16 17503689 2I CGTCCACCTC --/TT GGGCTTAAGC 3070 hom 108 het 37 0 36 2 T 0 2 95234 CASAVA_Build 16 17504708 1D ACTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 39 1 30 8 T 11 10 95235 CASAVA_Build 16 17510515 4D CTTTCCTTGC TTTG/---- TTTGTGCATT 3070 hom 121 het 43 0 40 5 TTTG 2 1 95236 CASAVA_Build 16 17510935 2D ACTGCCATCA CT/-- CACCAAACAG 3070 hom 135 het 50 0 45 7 CT 1 0 95237 CASAVA_Build 16 17519473 1D GGGTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2454 hom 31 9 11 11 T 17 16 95238 CASAVA_Build 16 17523216 8I TAGCTAGTGA --------/CTGCCTGC CTGCCCCTTT 3070 hom 163 het 58 0 55 3 CTGC 1 3 95239 CASAVA_Build 16 17542209 1D GCCTTAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 393 hom 37 1 33 3 A 10 9 95240 CASAVA_Build 16 17551671 2D TGTGTATATA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 TG 5 4 95241 CASAVA_Build 16 17553894 1D AACATCCTGA C/- TTGCCCAAAC 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 C 1 0 95242 CASAVA_Build 16 17564623 2I CATGAAGAAT --/AG AGTCACAATT 3070 het 3070 ref 49 29 18 2 AG 1 2 95243 CASAVA_Build 16 17568423 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2958 het 2958 ref 28 11 11 6 A 11 12 95244 CASAVA_Build 16 17578933 3I CAAAATTGAC ---/AGT AGCAATATTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AGT 0 1 95245 CASAVA_Build 16 17590531 1I TCAGGTAAGA -/C AATTAATTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 0 1 95246 CASAVA_Build 16 17595019 1D TTGCATAGAA G/- GTAGTTGAGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 2 1 95247 CASAVA_Build 16 17596561 4I TTTTCTTTTC ----/TTTT TTTTGTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 4 8 95248 CASAVA_Build 16 17610042 6I AAATATTTCC ------/CAATTG CAAAGTTCTC 3070 het 3070 hom 52 16 26 11 CAATTG 0 1 95249 CASAVA_Build 16 17615061 1I GTCACCCTAT -/A TGGTCTAAAA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 0 1 95250 CASAVA_Build 16 17619687 21D GAATGAGAAA GATGGGGAGGAGGACAGTGAG/--------------------- GATGGGGAGG 3070 hom 117 het 47 0 39 12 GATGGGGAGGAGGACAGTGAG 2 1 95251 CASAVA_Build 16 17684755 1D AATAAAATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 12 15 12 T 10 9 95252 CASAVA_Build 16 17716589 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 71 het 29 0 23 7 T 10 9 95253 CASAVA_Build 16 17716884 10D TCCATTTTAA TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1982 hom 26 het 14 0 9 5 T 24 14 95254 CASAVA_Build 16 17741784 1D GCCAGGAGCC T/- TTTTTTTTTT 2624 het 2471 hom 24 7 9 8 T 13 12 95255 CASAVA_Build 16 17747844 1I TCCTTATGGA -/C CTAGGCCATG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 1 2 95256 CASAVA_Build 16 17756605 1D CAATGTGTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 9 8 95257 CASAVA_Build 16 17756739 1I ACAGCAATAT -/G GGGTTGTTTG 2743 het 2743 ref 21 12 7 2 G 3 4 95258 CASAVA_Build 16 17764323 1D CCATTTGGTA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 8 7 95259 CASAVA_Build 16 17779264 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 10 7 T 11 10 95260 CASAVA_Build 16 17780555 1I GTTATGAAAG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 A 6 7 95261 CASAVA_Build 16 17799730 13D GAGATGTCAG CCCTTTGTTCATT/------------- TCTTCCATGG 3070 het 3070 ref 40 22 17 6 CCCTTTGTTCATT 1 0 95262 CASAVA_Build 16 17803241 1I AAACGATTCT -/C CCCCCCTCAG 3070 het 3070 ref 23 13 9 2 C 6 7 95263 CASAVA_Build 16 17806739 3I AATAACTATC ---/ATT ATTATTATTG 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 ATT 3 4 95264 CASAVA_Build 16 17811894 2D ATGAGCATCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 12 10 95265 CASAVA_Build 16 17813735 1D TAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 20 13 19 T 12 11 95266 CASAVA_Build 16 17818269 1D CACTCAGGAG T/- TTTTTTGTGC 3070 het 3070 ref 36 20 8 8 T 7 6 95267 CASAVA_Build 16 17819329 1D TCTAAATTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 26 1 T 10 9 95268 CASAVA_Build 16 17830801 4I TAACACTCAC ----/TAAT TAAGGGTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 TAAT 0 1 95269 CASAVA_Build 16 17842611 1D AACCAGAGCG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2326 hom 24 9 12 3 T 10 9 95270 CASAVA_Build 16 17863297 4I TTGTCCCTAT ----/ATCC ATCCCTACTA 3070 het 3070 hom 52 20 28 4 ATCC 1 2 95271 CASAVA_Build 16 17874706 1I ATGTTAATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 9 10 95272 CASAVA_Build 16 17878576 4I GATAGATTAC ----/ATAG ATAGACTGGA 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 ATAG 1 2 95273 CASAVA_Build 16 17878624 14D ACACATGTAT GTGTGTGTGTGTGC/-------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 25 12 8 GTGTGTGTGTGTGC 1 0 95274 CASAVA_Build 16 17885505 1D TCTCTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 11 10 95275 CASAVA_Build 16 17906324 1I AGAGGAAGAT -/A ATATTGTCCA 3070 het 3070 ref 43 18 12 13 A 1 2 95276 CASAVA_Build 16 17906375 2D AGCATTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 1185 het 1185 ref 30 13 4 15 A 18 16 95277 CASAVA_Build 16 17926099 4D AAAAAAACAA AAAC/---- AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 44 22 19 6 AAAC 1 0 95278 CASAVA_Build 16 17951144 22D GTCAACAAAT AAAGGGGGAGGGAAGGAAAGGC/---------------------- AAAGGGGGAG 3070 het 3070 hom 35 14 11 16 AAAGGGGGAGGGAAGGAAAGGC 2 1 95279 CASAVA_Build 16 17958968 1I GACTCCGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 A 13 14 95280 CASAVA_Build 16 17987203 1D TGTTCTAGTG A/- AAAAAAAAAA 2275 het 2275 ref 31 16 8 7 A 15 14 95281 CASAVA_Build 16 18016426 1D TTTATTATTG T/- GGGGGGGGGA 3070 hom 66 het 34 0 26 8 T 1 0 95282 CASAVA_Build 16 18016580 3D TATAGAGCAC CTG/--- CTAAGCTTGA 3070 hom 135 het 47 0 46 2 CTG 1 0 95283 CASAVA_Build 16 18017038 1D AAGAGGTAAT A/- AAAAAAAAAA 1354 het 1354 ref 36 25 4 8 A 12 11 95284 CASAVA_Build 16 18020307 1I CACCTTGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 19 18 12 A 13 14 95285 CASAVA_Build 16 18030630 1D CTGAATCCAC A/- TTACCTCTGA 3070 het 3070 hom 58 21 34 5 A 1 0 95286 CASAVA_Build 16 18033511 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 24 13 8 5 A 8 9 95287 CASAVA_Build 16 18037042 1I AAGGGATTAG -/A AAAAAAAAAA 2371 het 2371 ref 26 16 6 4 A 10 11 95288 CASAVA_Build 16 18038602 3D ATAATGATGG TGA/--- TGATGATGAT 3070 het 3070 hom 68 26 26 19 TGA 5 4 95289 CASAVA_Build 16 18041792 4I AGAGGTTTGT ----/CTCA CTCAATCTGC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 CTCA 1 2 95290 CASAVA_Build 16 18044470 2I GAGTGTAGCG --/TA AGTTCAGCAA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TA 0 1 95291 CASAVA_Build 16 18046066 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 33 1 25 7 A 14 13 95292 CASAVA_Build 16 18049283 2D TGCACACACA TG/-- TATATACATA 3070 het 3070 hom 64 28 31 6 TG 1 0 95293 CASAVA_Build 16 18052393 1I ATGTTAAGTG -/C CCCAGGACAA 3070 hom 57 het 25 0 18 7 C 3 4 95294 CASAVA_Build 16 18055751 2I ATTAGGCCTC --/AG GGGACTCGCA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AG 0 1 95295 CASAVA_Build 16 18058602 1I GCCCCCCCCC -/A AAAAAAATCT 2645 het 2645 ref 24 15 8 1 A 7 8 95296 CASAVA_Build 16 18066180 4I CAGAAATCTA ----/TTCT TTGTCATTTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TTCT 0 1 95297 CASAVA_Build 16 18068617 1I TATCTGCAAC -/A AAAAAAACTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 8 95298 CASAVA_Build 16 18070352 4D ACCAAGTCAT AGTG/---- AGAGCAGGTG 3070 hom 117 het 43 0 38 7 AGTG 1 0 95299 CASAVA_Build 16 18102784 1I GAAATTAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 T 9 10 95300 CASAVA_Build 16 18107575 2I ATTTTTATTA --/AG AGAGTCATAA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 AG 2 3 95301 CASAVA_Build 16 18117044 1I AACTCTCTGG -/A AAAAAAAATC 2321 het 2321 ref 22 13 6 3 A 8 9 95302 CASAVA_Build 16 18118169 1D TTTAAGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 10 9 95303 CASAVA_Build 16 18125645 2I CCATCAGGAT --/GG GATCCTTATG 3006 het 3006 ref 45 28 7 10 G 1 3 95304 CASAVA_Build 16 18125758 1I CAGGAAGAGC -/G CCCTCCCCAA 3070 het 3070 ref 71 42 18 12 G 0 1 95305 CASAVA_Build 16 18134057 1D TGTCCCATCC A/- GCCCTCTTCA 1852 het 1852 ref 34 25 4 5 A 1 0 95306 CASAVA_Build 16 18138507 1I CCAGAATGGA -/T TTTTTTTTAC 1768 het 1768 ref 32 27 4 1 T 8 9 95307 CASAVA_Build 16 18142467 2I CTAAAACCAC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 9 9 7 A 9 11 95308 CASAVA_Build 16 18142896 3I CCAAAACAAC ---/GTA GTGATTTCTA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 GTA 0 1 95309 CASAVA_Build 16 18163018 2I ACTTACATGT --/TA TATATATATA 2902 het 2902 ref 34 21 6 7 TA 5 6 95310 CASAVA_Build 16 18195593 1I GAATAGAATT -/C AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 20 7 1 C 0 1 95311 CASAVA_Build 16 18197492 2I CTCCGTCTGG --/AT ATATCACCTT 2267 het 2267 ref 38 30 5 3 AT 2 3 95312 CASAVA_Build 16 18199185 1I AGCAATCCCA -/T TCATGGGTAT 1884 het 1884 ref 32 26 4 2 T 1 2 95313 CASAVA_Build 16 18205408 1D TCTGCCTCTC T/- TTCTGCACCC 792 het 792 ref 67 45 3 19 T 3 2 95314 CASAVA_Build 16 18215113 4I GGCGGCATTA ----/GAGC GAGCCTTCCA 2430 het 2430 ref 23 16 6 1 GAGC 1 2 95315 CASAVA_Build 16 18239890 2I GAGTCAACTC --/TT TACTGCAGGG 2913 het 2913 ref 38 27 7 4 T 1 3 95316 CASAVA_Build 16 18240329 1I GTAATTTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3015 hom 41 10 17 14 A 10 11 95317 CASAVA_Build 16 18241702 1D CCCCTGTGAT G/- GTTAATACTG 2915 hom 18 het 7 0 7 0 G 2 1 95318 CASAVA_Build 16 18246120 1D ACTTGGAAAA T/- TTTATTGAAA 2427 het 2177 hom 12 7 5 0 T 4 3 95319 CASAVA_Build 16 18258552 1D ATTTTACCTT A/- GGTATTTGTG 3070 het 1408 hom 16 4 11 1 A 1 0 95320 CASAVA_Build 16 18286359 1D TCTCACCAGA T/- AAGCATTTGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 1 0 95321 CASAVA_Build 16 18454216 1D GTCGGCCAAT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 8 7 95322 CASAVA_Build 16 18511068 1I CAGAGGTACT -/G GGGGGTCGGG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 5 6 95323 CASAVA_Build 16 18523564 1I TAGCACACTG -/C CTGGCACATA 3070 het 3070 ref 59 48 7 4 C 1 2 95324 CASAVA_Build 16 18524188 1I AAACAAAAAA -/G TTCTCTCAAA 1370 het 1370 ref 27 21 3 3 G 0 1 95325 CASAVA_Build 16 18524263 1D TGAAGCTATT A/- AAAAAGTGTA 3070 het 3070 ref 51 29 14 8 A 6 5 95326 CASAVA_Build 16 18526080 1I CCGTGTCTCT -/A AAAAAAATTT 1398 het 1398 ref 28 14 3 11 A 7 8 95327 CASAVA_Build 16 18570735 3D AATTGGTCAC AAG/--- AAGGTCTCTG 1570 het 1570 ref 17 12 4 5 AAG 2 1 95328 CASAVA_Build 16 18576213 3D AAATTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1821 het 1821 ref 28 13 4 12 A 15 12 95329 CASAVA_Build 16 18582813 13I GTACAAACTG -------------/AACAGCTGTGTGT AACATCGCTA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 AACAGCTGTGTGT 0 1 95330 CASAVA_Build 16 18585571 5I TAGTGGGAGT -----/TTAAA TTAACACAAG 3070 het 3070 hom 37 9 24 4 TTAAA 0 1 95331 CASAVA_Build 16 18586000 2D AAGAGGACAC TA/-- TGGCATTTTT 2388 het 2388 ref 24 18 5 1 TA 1 0 95332 CASAVA_Build 16 18589660 1D CCAATATCCC T/- GATGAACATT 944 hom 5 het 3 0 2 1 T 1 0 95333 CASAVA_Build 16 18613262 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1239 het 191 hom 4 1 3 0 A 13 12 95334 CASAVA_Build 16 18614339 3D GGTGGCAGGA AGG/--- AGAAGTCCTG 3070 het 3070 ref 21 10 9 3 AGG 1 0 95335 CASAVA_Build 16 18623876 4I TCATTGGAAA ----/TACT TACTATATAG 3070 het 3070 hom 22 13 9 0 TACT 1 2 95336 CASAVA_Build 16 18624897 10I GTATCACCAA ----------/TTGAGTTTAT TGGATTGTCT 3070 het 3070 hom 37 9 20 8 TTGAGTTTAT 0 1 95337 CASAVA_Build 16 18632363 1D ACCACTGAAG A/- AAAAAAAATG 2766 het 2766 ref 19 8 8 3 A 9 8 95338 CASAVA_Build 16 18632407 2D TAACAGGGGG AA/-- AAAAAAAAGC 1736 het 1736 ref 28 14 4 10 A 10 8 95339 CASAVA_Build 16 18645962 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1949 hom 15 7 7 2 A 11 10 95340 CASAVA_Build 16 18654616 1D GCAGGACAAT C/- ACTTGAACCC 2622 het 2622 ref 30 20 7 3 C 1 0 95341 CASAVA_Build 16 18654763 1D GTGAAGCCAA G/- AACCCTCCCA 3070 het 3070 ref 31 21 8 3 G 1 0 95342 CASAVA_Build 16 18671434 3D GCATTGCAAA TGC/--- TGTAAATGGC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 TGC 1 0 95343 CASAVA_Build 16 18673072 1I TGCTCCTGCC -/A GGGGCCTTTT 3070 het 2679 hom 26 7 10 9 A 0 1 95344 CASAVA_Build 16 18681916 6I CAGTTGGTCC ------/TCAATA TCTCTATTTG 1875 het 1875 ref 30 21 4 5 TCAATA 0 1 95345 CASAVA_Build 16 18683221 1D GTTTCCTTAA T/- TTTTATGGAG 3070 het 3070 ref 18 11 7 0 T 5 4 95346 CASAVA_Build 16 18687883 4D CAGTTTTTGT TTTG/---- TTTGTTTTTT 2163 het 2163 ref 12 6 6 0 TTTG 2 1 95347 CASAVA_Build 16 18692511 10D AGGCCAAGAG GTTTTTTTTC/---------- GTTTTTTTTG 3070 het 2297 hom 15 7 9 2 GTTTTTTTTC 1 0 95348 CASAVA_Build 16 18710137 4D CAGCTTCGTC CTCT/---- CTCACACGTC 3070 het 3070 hom 34 12 16 9 CT 3 1 95349 CASAVA_Build 16 18714620 2D GAGAGAGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 977 het 977 ref 43 34 3 7 GT 7 6 95350 CASAVA_Build 16 18723083 4D TCTTTAGAGC TTTG/---- TTTTTGTCCT 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 TTTG 1 0 95351 CASAVA_Build 16 18723259 4D AGGAATGCAC CTAT/---- CTGTCAATAA 2983 het 2983 ref 20 13 7 0 CTAT 1 0 95352 CASAVA_Build 16 18732993 2I TATTAACTGG --/AA AAAGGCAACA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 3 5 95353 CASAVA_Build 16 18733565 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 934 het 934 ref 6 2 2 2 T 8 7 95354 CASAVA_Build 16 18737584 1I TCCGTAATAG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 2907 hom 22 7 14 1 T 7 8 95355 CASAVA_Build 16 18738138 1I GCAGTAAAGG -/C CCAAGGAAAT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 C 2 3 95356 CASAVA_Build 16 18747351 2D AAGCCTGTGC TG/-- TTATACATCC 3070 het 3070 hom 37 13 22 3 TG 1 0 95357 CASAVA_Build 16 18752390 1D ATTTCCCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 5 A 11 10 95358 CASAVA_Build 16 18764595 5I AAGTCTAAAT -----/AAAGC AAAGCAATAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 AAAGC 1 2 95359 CASAVA_Build 16 18765895 2I ATTATATCAC --/AT GTTACAACAT 3070 hom 104 het 40 0 33 7 AT 0 1 95360 CASAVA_Build 16 18772826 7D TGCTCAAGCA TAGGAGG/------- CTCCTACTGT 3070 het 3070 hom 44 16 22 8 TAGGAGG 1 0 95361 CASAVA_Build 16 18779653 1D TGGAACCATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 26 12 9 6 A 9 8 95362 CASAVA_Build 16 18780012 2D TGAGCCCTTG CA/-- CAGCTCTCCC 3070 hom 56 het 20 0 19 1 CA 2 1 95363 CASAVA_Build 16 18795488 1I GAAATGGCCG -/T TTTTTTTTTT 1420 het 3 hom 22 0 9 13 T 15 16 95364 CASAVA_Build 16 18800195 5D AATATGCTGG TTTCA/----- TTTAAGTTCT 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 TTTCA 1 0 95365 CASAVA_Build 16 18815606 2I CAATAAGAAA --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 AT 4 5 95366 CASAVA_Build 16 18817261 1I AATATTTTCT -/G GAGTATACTA 3070 het 3070 ref 34 22 8 4 G 1 2 95367 CASAVA_Build 16 18825010 1D CTTCACCAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 A 9 8 95368 CASAVA_Build 16 18830171 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 25 0 18 8 A 11 10 95369 CASAVA_Build 16 18831510 1I CTATTAAGTG -/T TAAGTTAATT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 1 2 95370 CASAVA_Build 16 18835446 1I AAACACACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 A 9 10 95371 CASAVA_Build 16 18843793 3I CTGGACAATT ---/ATA ATAACAATTG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 ATA 1 2 95372 CASAVA_Build 16 18847430 1D GACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2216 het 2216 ref 19 9 6 4 A 13 12 95373 CASAVA_Build 16 18854590 1D TAGAGTAAGA C/- CCTATCTTAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 3 2 95374 CASAVA_Build 16 18883710 1D CTGTCTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 11 10 95375 CASAVA_Build 16 18884391 16D AAACAAACAG ACAAACAAACAAACAA/---------------- ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 36 25 13 2 ACAA 7 3 95376 CASAVA_Build 16 18888487 6D TATAACATTA ATTATG/------ ATTATGATTA 2559 het 2559 ref 21 12 6 3 ATTATG 3 2 95377 CASAVA_Build 16 18889604 1D CCAGTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 2901 het 2901 ref 21 11 7 3 T 11 10 95378 CASAVA_Build 16 18894568 1I AAATGGGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 9 10 95379 CASAVA_Build 16 18901729 3D AAATCTGCAC AGG/--- AGATTTCTCT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 AGG 1 0 95380 CASAVA_Build 16 18904080 1I AGACTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 1403 het 1403 ref 13 6 3 4 A 13 14 95381 CASAVA_Build 16 18917577 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 20 0 11 9 A 13 12 95382 CASAVA_Build 16 18918577 1D TCTGGGGACG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 T 7 6 95383 CASAVA_Build 16 18922865 2D AAAATAAATT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 13 3 TA 1 0 95384 CASAVA_Build 16 18947205 1D TTTTTTATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 A 9 8 95385 CASAVA_Build 16 18947793 1D TGCACTTTTT A/- AAAAAAAATT 2404 het 1360 hom 10 3 5 2 A 9 8 95386 CASAVA_Build 16 18953250 2D TGAAATCCTG TC/-- TCTACTAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 TC 2 1 95387 CASAVA_Build 16 18962284 1D TTTGGTGGCA T/- TTAAGTACAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 3 2 95388 CASAVA_Build 16 18971543 1D GATTTTGTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2460 hom 17 5 8 4 T 9 8 95389 CASAVA_Build 16 18972131 1I ATTAATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 32 0 24 8 T 10 11 95390 CASAVA_Build 16 18975792 1D TACAAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 1 0 95391 CASAVA_Build 16 18984448 1D TACAGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 506 hom 29 3 14 12 T 17 16 95392 CASAVA_Build 16 18984515 1D GGTGTGATCA T/- GGCTCAGTGC 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 1 0 95393 CASAVA_Build 16 18986094 1D GGATACAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 A 11 10 95394 CASAVA_Build 16 18987729 2I AAAAACAAAC --/TG AAATTAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TG 0 1 95395 CASAVA_Build 16 18992132 9I ACTCCGTCTC ---------/AAAAAAACA AAAAAAACAA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 AAAAAAACA 1 2 95396 CASAVA_Build 16 18992149 11I CAAAAAAAAC -----------/AAAAAAAACCG CGCACACACA 3070 het 67 hom 22 1 16 6 AAAAAAAACCG 0 1 95397 CASAVA_Build 16 18994266 4I CAGGTGATCC ----/GCCT GCCTCGGCCT 3070 hom 55 het 21 0 17 4 GCCT 1 2 95398 CASAVA_Build 16 19001581 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTAAAA 1604 het 1604 ref 19 12 6 1 CT 2 1 95399 CASAVA_Build 16 19001648 3I AATTTTAAAA ---/AAT CATGCTAAGT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AAT 0 1 95400 CASAVA_Build 16 19003527 1I GATTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 12 13 95401 CASAVA_Build 16 19004223 2I AATTGGTAAA --/TC TCTGTTACCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TC 1 2 95402 CASAVA_Build 16 19011851 4D TCCCTCCCTC CCTT/---- CCTTTCTTTC 1356 het 1356 ref 17 9 8 0 CCTT 2 1 95403 CASAVA_Build 16 19014788 1D TAGATGGACT C/- CCCGGCAATG 3070 hom 68 het 25 0 23 2 C 4 3 95404 CASAVA_Build 16 19025706 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2801 het 2801 ref 24 10 7 7 T 13 12 95405 CASAVA_Build 16 19056423 6D4M2I AAAACGTCCT CCACCCCCCA--/------GTGATG CTCAGGACAG 3070 hom 116 het 36 0 37 6 N/A 0 0 95406 CASAVA_Build 16 19057281 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 330 het 37 hom 15 1 5 9 A 15 16 95407 CASAVA_Build 16 19057692 1I GATGTTGCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 10 95408 CASAVA_Build 16 19097073 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 6 7 95409 CASAVA_Build 16 19100299 1I AAAAAAGTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 9 10 95410 CASAVA_Build 16 19100526 1D GACAGTGAGG A/- AAAAAAAAAA 1952 hom 14 het 18 0 10 8 A 15 14 95411 CASAVA_Build 16 19115373 1D AGCTGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 12 11 95412 CASAVA_Build 16 19116152 2I TAGAAATTGA --/TT TTCATTTTAG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 2 4 95413 CASAVA_Build 16 19124265 1I CCTTGACTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 908 hom 20 6 11 3 C 0 1 95414 CASAVA_Build 16 19128902 5D TTATATTTTA TTATT/----- TTATTTTTAT 3070 het 3070 ref 25 13 10 4 TTATT 2 1 95415 CASAVA_Build 16 19141354 4I TTTCTCACTC ----/AGAT AGTTCCTCTG 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 AGAT 0 1 95416 CASAVA_Build 16 19142753 3D TAGGAGTCAA ATG/--- ATGTGGCTTA 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 ATG 2 1 95417 CASAVA_Build 16 19146880 1D TTCTGGGGGT G/- GGGGGGTATG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 G 7 6 95418 CASAVA_Build 16 19151085 1I GCAATGACAG -/T ACACGCCTCA 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 T 0 1 95419 CASAVA_Build 16 19159167 1I AGGGGACCCG -/T TAACAGGTAG 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 T 1 2 95420 CASAVA_Build 16 19161351 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAATTT 3070 het 1978 hom 29 9 18 2 A 7 8 95421 CASAVA_Build 16 19169548 1D CCATTAGTTC T/- TTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 T 7 6 95422 CASAVA_Build 16 19172465 5D CCTGCTTCTT AAGAA/----- AAGAAAAGAA 3070 hom 72 het 26 0 25 4 AAGAA 3 2 95423 CASAVA_Build 16 19176777 1D GGTAAAGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 485 hom 48 2 34 12 T 12 11 95424 CASAVA_Build 16 19186102 1D CCGCCCTCAG T/- TGAGTGAGGC 3070 het 3070 hom 46 12 25 9 T 2 1 95425 CASAVA_Build 16 19191807 1D CTGTAAACGA C/- CCCCCCAAGA 3070 hom 110 het 40 0 37 3 C 7 6 95426 CASAVA_Build 16 19192019 1D AAGTACAACC A/- AAAATGTGTG 3070 hom 93 het 35 0 30 6 A 5 4 95427 CASAVA_Build 16 19199824 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 1673 het 1673 ref 15 9 6 0 A 13 14 95428 CASAVA_Build 16 19209650 4D ATTTTTGCTC CTTT/---- TTCTTTTTCT 1527 het 161 hom 36 2 12 22 CTTT 1 0 95429 CASAVA_Build 16 19212594 1I TTTAATTTTT -/A ATGGGCTATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 95430 CASAVA_Build 16 19212978 1I AAGTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 146 hom 29 1 22 6 A 11 12 95431 CASAVA_Build 16 19215225 1I TGCAGCCCAT -/C AGTTTTGGTT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 C 0 1 95432 CASAVA_Build 16 19225583 2D ATGTGGAAAC TG/-- GGGCTCAGAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TG 1 0 95433 CASAVA_Build 16 19238381 1I CTGTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 890 hom 31 5 14 12 A 16 17 95434 CASAVA_Build 16 19247315 1D TGGTTCACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 29 1 21 8 T 12 11 95435 CASAVA_Build 16 19248065 4I AGGAGCTTGC ----/AATA AATAGCATAG 3070 hom 45 het 17 0 14 3 AATA 1 2 95436 CASAVA_Build 16 19255212 23D CTGGTCTCTC ATTCTCTTCTTATTAAGAAGAGA/----------------------- ATTCTCTTCT 2727 het 2727 ref 40 22 7 19 ATTCTCTTCTTATTAAGAAGAGA 1 0 95437 CASAVA_Build 16 19258971 1I TCCTGTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 47 3 31 13 T 11 12 95438 CASAVA_Build 16 19260609 10D TGCCTATGCA TTATTACCCC/---------- TTATTCCTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TTATTACCCC 1 0 95439 CASAVA_Build 16 19265203 1I GGATTTGGTG -/A AAAATAATGT 3070 hom 153 het 54 0 50 4 A 4 5 95440 CASAVA_Build 16 19266638 1D AGTCAAGTCC T/- GCCTCCTACC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 0 95441 CASAVA_Build 16 19268206 77D AAAAGTGTCA TTATTTTTTACAAAGACTTTTTTTTTACAAAGATTAACAGGGCTCTTACCATGTATATGAATGATGTAATCTTCATT/----------------------------------------------------------------------------- AACAATTCTA 3070 hom 93 het 29 0 32 4 TTATTTTTTACAAAGACTTTTTTTTTACAAAGATTAACAGGGCTCTTACCATGTATATGAATGATGTAATCTTCATT 1 0 95442 CASAVA_Build 16 19273179 1I GTTTCAGTGT -/G AAAGCTGGAA 3070 hom 96 het 38 0 31 7 G 0 1 95443 CASAVA_Build 16 19277066 1D CTGGTGGGAC T/- TTTTTTTTTT 1217 het 1217 ref 24 12 5 7 T 17 16 95444 CASAVA_Build 16 19292273 1I CTTCTCAGGA -/G GCTGAGGCAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 1 2 95445 CASAVA_Build 16 19302047 4I TGTCGGCTGG ----/CTCC CTCCGTCTGG 2238 het 1946 hom 29 6 9 14 CTCC 1 2 95446 CASAVA_Build 16 19304150 13I CCCCTGAGAT -------------/GGCCTGCATGACA GGACATCTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 GGCCTGCATGACA 0 1 95447 CASAVA_Build 16 19316363 1I CCAAATCTGA -/T TTTTATTCAT 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 T 4 5 95448 CASAVA_Build 16 19322900 1D GTCAGGAATC A/- GCCATGCTCA 3070 het 3070 ref 50 31 18 1 A 1 0 95449 CASAVA_Build 16 19323504 1I CATGTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 A 11 12 95450 CASAVA_Build 16 19327537 1I CTCTAAGCCA -/T TTGGCAACCA 3070 het 3070 hom 62 22 29 11 T 2 3 95451 CASAVA_Build 16 19346684 2D CCACTCTCTT TC/-- TTAAATAGAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 TC 1 0 95452 CASAVA_Build 16 19351228 4I GGTGCTAGAG ----/AAAC AAAAACCAGG 3070 hom 150 het 59 0 50 9 AAAC 0 1 95453 CASAVA_Build 16 19354408 2D ATTTTTACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 AC 10 9 95454 CASAVA_Build 16 19360131 1D TTTTTGGTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 448 hom 29 3 21 5 T 9 8 95455 CASAVA_Build 16 19366722 4I TCAGAGATGC ----/TAAG TAAGACACAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TAAG 1 2 95456 CASAVA_Build 16 19371835 2I ATATATATAT --/TA TATATATATA 1454 hom 12 het 5 0 4 1 TA 7 8 95457 CASAVA_Build 16 19378907 1I CATATATGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 T 8 9 95458 CASAVA_Build 16 19399053 1I TGAATTAATG -/T TATTAATTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 1 2 95459 CASAVA_Build 16 19402603 5D CTCTGTCTCA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 2081 hom 24 7 12 6 AAAAG 5 4 95460 CASAVA_Build 16 19405444 1I AGGTGATTCA -/C CCCCCTCTTG 3070 het 1623 hom 19 5 10 4 C 5 6 95461 CASAVA_Build 16 19410671 1D TCTTAGGGAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 6 T 9 8 95462 CASAVA_Build 16 19412707 1D TACATATATC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 10 9 95463 CASAVA_Build 16 19417440 2I GCTAGCTTTG --/CA CAGTGGCAGT 3070 hom 81 het 34 0 25 9 CA 1 2 95464 CASAVA_Build 16 19417886 4D TGCCTCAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 2967 het 2677 hom 15 7 7 1 AAAT 5 4 95465 CASAVA_Build 16 19418064 6I TAACACTGAA ------/CAGCAG AGGTCCAGCA 2281 het 2281 ref 51 25 9 18 CAG 0 2 95466 CASAVA_Build 16 19418211 1D ATTTATTCCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 17 15 11 T 10 9 95467 CASAVA_Build 16 19418731 4D GGAGTTGGAG CCTC/---- CCTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 CCTC 2 1 95468 CASAVA_Build 16 19419448 4D CTCAAAAAAT AAAG/---- AAACTACTGT 3070 het 3070 ref 40 24 16 2 AAAG 1 0 95469 CASAVA_Build 16 19425465 4D TCCGTCTCAA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 11 2 AAAC 2 1 95470 CASAVA_Build 16 19427554 1D GCTTTTAGTA T/- CCCCATTTTA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 1 0 95471 CASAVA_Build 16 19431372 3D TTTGCTGTGC AGA/--- AGCTTTTTAG 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 AGA 1 0 95472 CASAVA_Build 16 19432177 1I TATTTTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 10 11 95473 CASAVA_Build 16 19432931 6D TTTTGATTTG TTTTCC/------ TTTTCTGGTA 3070 het 3070 hom 41 16 22 5 TTTTCC 1 0 95474 CASAVA_Build 16 19442066 1D GGATTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 T 13 12 95475 CASAVA_Build 16 19443978 1I TAGGTTCTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 A 9 10 95476 CASAVA_Build 16 19444142 2I TGGAGAAGAC --/AG GGCATGTCTG 3070 het 3070 ref 57 28 21 8 AG 0 1 95477 CASAVA_Build 16 19445503 1D ATTTTGACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 11 8 T 10 9 95478 CASAVA_Build 16 19452058 1I AATTCGTATC -/A GATGACACGT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 0 1 95479 CASAVA_Build 16 19453465 8D ACTAAGTATG TCTTGTAC/-------- TCTTGTACTG 3070 het 3070 ref 39 21 17 4 TCTTGTAC 2 1 95480 CASAVA_Build 16 19454529 2D CTTTTTATAA CT/-- CTTTTATAAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 5 CT 2 1 95481 CASAVA_Build 16 19456546 1D AGAAAGCATA T/- TAGTCAGCTA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 T 2 1 95482 CASAVA_Build 16 19473497 1D AGTAATAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2755 hom 21 8 10 4 A 10 9 95483 CASAVA_Build 16 19477800 1I ATTTTAAGAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 8 9 95484 CASAVA_Build 16 19497197 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2286 het 2286 ref 29 14 8 7 A 13 14 95485 CASAVA_Build 16 19498562 2D GAAGCAGCCT TA/-- TATGGAGCAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 TA 2 1 95486 CASAVA_Build 16 19500492 1I CTCTAGTGAT -/C CCCCCACCCC 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 5 6 95487 CASAVA_Build 16 19501969 1D AATTCATTGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 9 8 95488 CASAVA_Build 16 19507337 1D GTCTTTTAAC T/- TTTTTTTTCT 2892 het 2892 ref 29 19 9 1 T 9 8 95489 CASAVA_Build 16 19511513 1D ACTGTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 2628 het 2551 hom 31 15 9 7 T 17 16 95490 CASAVA_Build 16 19515105 1I GCATATACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1262 hom 37 3 28 6 T 11 12 95491 CASAVA_Build 16 19517609 1I TCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 29 2 22 5 A 12 13 95492 CASAVA_Build 16 19519082 1D AAGGGTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 A 15 14 95493 CASAVA_Build 16 19520248 1D CTCCTTTAGA T/- TCCAAAGGGT 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 T 2 1 95494 CASAVA_Build 16 19524713 4D ATGAAGATAG GATC/---- TACCTTGTGC 3070 hom 148 het 52 0 50 3 GATC 1 0 95495 CASAVA_Build 16 19542037 1I ACAAAATACC -/A CAGACTAGGA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 A 0 1 95496 CASAVA_Build 16 19543898 2I CCAATGAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 A 12 14 95497 CASAVA_Build 16 19544468 1D TCCAAGTGTG C/- CTGATGCCAG 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 C 2 1 95498 CASAVA_Build 16 19550782 1D AAGTTACTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 10 9 95499 CASAVA_Build 16 19553241 2D ACACGGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2584 het 1457 hom 31 10 6 16 A 18 16 95500 CASAVA_Build 16 19560623 1D AGTTAAAAAC A/- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 A 3 2 95501 CASAVA_Build 16 19579890 2D TCTATATTCT TA/-- TATATATATA 2256 het 898 hom 13 3 7 3 TA 9 8 95502 CASAVA_Build 16 19581166 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2359 het 2359 ref 23 13 7 3 A 11 12 95503 CASAVA_Build 16 19583722 1I GAGTTCATCT -/A AAAAAAAAAA 2167 het 1095 hom 19 6 9 5 A 15 16 95504 CASAVA_Build 16 19584793 1D GCCATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 11 10 95505 CASAVA_Build 16 19590292 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3010 het 180 hom 9 2 7 0 A 15 14 95506 CASAVA_Build 16 19593182 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 913 het 913 ref 9 3 4 2 T 10 9 95507 CASAVA_Build 16 19595893 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1988 hom 27 9 10 8 T 14 13 95508 CASAVA_Build 16 19600067 1I GCAGCAGCAT -/G ATGCAGGGCA 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 G 0 1 95509 CASAVA_Build 16 19600704 1D CAGGGCTTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 9 8 95510 CASAVA_Build 16 19610637 4I TCTGAAATGT ----/TCTG TCTGTCTGTC 3070 het 3070 hom 44 11 16 17 TCTG 2 3 95511 CASAVA_Build 16 19613312 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 863 het 863 ref 26 14 3 9 T 13 12 95512 CASAVA_Build 16 19614919 1D CTGTTAGCCA G/- GATGGTCTCG 3070 het 941 hom 18 2 8 8 G 2 1 95513 CASAVA_Build 16 19621870 4D TCCACATGAG ACTT/---- ACTTACATTA 3070 het 3070 ref 36 19 12 7 ACTT 2 1 95514 CASAVA_Build 16 19627287 3D CTTGGTGCCC TCA/--- TCTCTAAGGT 3070 het 3070 hom 34 16 16 4 TCA 1 0 95515 CASAVA_Build 16 19635370 2I GGACAGGTGA --/AT ATATATATGG 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 AT 4 5 95516 CASAVA_Build 16 19640774 4I TTCATCACTT ----/AATC AATCAAGCAC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 AATC 1 2 95517 CASAVA_Build 16 19673461 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 10 9 95518 CASAVA_Build 16 19702828 1D ATCGGTTGTG A/- AAAACATACT 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 A 5 4 95519 CASAVA_Build 16 19709052 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 13 6 A 13 12 95520 CASAVA_Build 16 19709448 1I TACAATTAAT -/C AACAAATATT 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 C 0 1 95521 CASAVA_Build 16 19712888 4D TAAATATCTA AATG/---- AAAGTGTGAA 3070 het 3070 ref 42 20 18 5 AATG 1 0 95522 CASAVA_Build 16 19717987 4I CTTTTTTAAG ----/CCTA CCTACTCTCT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 CCTA 1 2 95523 CASAVA_Build 16 19719707 4I TAATAAAAAC ----/TTTA TTTACTTAGA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 TTTA 1 2 95524 CASAVA_Build 16 19724064 2I TGGCACAGAG --/AC AATGGCCAGC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 AC 0 1 95525 CASAVA_Build 16 19725355 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 A 10 11 95526 CASAVA_Build 16 19732281 1I AGCAATGAGA -/C TGATTATAGA 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 C 0 1 95527 CASAVA_Build 16 19747876 1D AACAGTCTGG A/- AAGAAAATTA 3070 het 2954 hom 16 6 10 0 A 3 2 95528 CASAVA_Build 16 19751206 4I GCAGAGACTT ----/GGAG GGAGAGATTG 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 GGAG 1 2 95529 CASAVA_Build 16 19786630 1D ATCCCAGCAC T/- TTGGGAGGCT 2759 het 1335 hom 16 3 8 5 T 3 2 95530 CASAVA_Build 16 19789800 1D ATTGGTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 11 10 95531 CASAVA_Build 16 19798333 2I GGAGGAACAG --/CA CACACTCTAT 3070 het 3070 ref 55 25 22 8 CA 2 3 95532 CASAVA_Build 16 19818417 1D CACCTCATTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 17 16 10 A 9 8 95533 CASAVA_Build 16 19821310 1I TGTCTTTACT -/A AAAAAAAAAT 1770 het 1770 ref 20 10 7 3 A 9 10 95534 CASAVA_Build 16 19821975 1D GTCCGGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1899 hom 25 8 11 6 T 12 11 95535 CASAVA_Build 16 19827190 9D CAGTTACTTC GGGCCATCT/--------- GGGCCATCTG 3070 het 3032 hom 23 8 8 11 GGGCCATCT 2 1 95536 CASAVA_Build 16 19827741 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 12 24 7 A 10 9 95537 CASAVA_Build 16 19829606 1I ACTTAGTCTG -/T TTTTTTTTTT 2169 het 2169 ref 25 9 7 9 T 11 12 95538 CASAVA_Build 16 19830517 1I CTATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2412 het 1946 hom 19 7 8 4 A 10 11 95539 CASAVA_Build 16 19831190 1I GGCTTCAGAT -/C CTTGTGTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 9 9 C 1 2 95540 CASAVA_Build 16 19833795 3D TGGTTCCTCA TCT/--- TCTCCCATTG 3070 het 3070 ref 18 8 8 2 TCT 2 1 95541 CASAVA_Build 16 19839506 3D ACATTTTCAC CAA/--- CAACAGTATA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 CAA 2 1 95542 CASAVA_Build 16 19849887 4D CCCATTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2818 het 2818 ref 42 15 8 20 TTTC 5 4 95543 CASAVA_Build 16 19855175 1D TTATTCAGAA T/- TATATCCCCA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 T 2 1 95544 CASAVA_Build 16 19892606 1D ACTTCATCTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 11 20 13 A 10 9 95545 CASAVA_Build 16 19895861 1D GCTGTGTACC T/- TGCTCTCATT 3070 het 3070 ref 54 26 22 9 T 2 1 95546 CASAVA_Build 16 19896289 19I ACATGGGTCC -------------------/TCCAACATGGCAGCTTGCG TTGTCAGAAT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 TCCAACATGGCAGCTTGCG 0 1 95547 CASAVA_Build 16 19897322 1I AGATGGGGAC -/T TTTTTTTTTT 2749 hom 25 het 20 0 9 11 T 11 12 95548 CASAVA_Build 16 19901678 1D AAGACATTCC T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 54 19 29 6 T 7 6 95549 CASAVA_Build 16 19927481 2I TTTTTGTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 17 5 T 10 12 95550 CASAVA_Build 16 19940537 12I TAGTTCTACA ------------/TTAGCCCATTAC TTAGGAATTC 3070 het 3070 hom 38 9 23 6 TTAGCCCATTAC 0 1 95551 CASAVA_Build 16 19944372 8I GTGTAGCTTT --------/GGATGAGG GGCTCTCTTG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 GGATGAGG 0 1 95552 CASAVA_Build 16 19947035 1D TTCTCACCAC A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 A 8 7 95553 CASAVA_Build 16 19949251 2D GAATATAATC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AT 1 0 95554 CASAVA_Build 16 19949423 1I AACTGGCACC -/A CCCTTTTGAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 0 1 95555 CASAVA_Build 16 19954021 1D TCCAAATCAC T/- TTGAAATAAC 3070 het 3070 ref 41 19 20 2 T 3 2 95556 CASAVA_Build 16 19956266 2D CAGAGTAAGA CT/-- CTGTCTCAGA 1798 het 1720 hom 22 10 8 5 CT 2 1 95557 CASAVA_Build 16 19962787 1D TTTTCTAGCT G/- GTGCTTTTGG 3070 het 3070 ref 56 31 20 5 G 2 1 95558 CASAVA_Build 16 19965933 1I TTCTTAGGGA -/T TTTTTTTTTT 2930 hom 4 het 17 0 8 9 T 10 11 95559 CASAVA_Build 16 19966540 8I AGAAGGCATG --------/TCAGGGGC TCCTAGCGTC 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 TCAGGGGC 0 1 95560 CASAVA_Build 16 19968758 1D ATTTTGCCTT A/- TTCATCAAGC 3070 het 3070 ref 59 33 19 8 A 1 0 95561 CASAVA_Build 16 19970776 2I TTCTCTGTGC --/CT CTGTTTCCTC 3070 het 3070 hom 61 29 28 4 CT 1 2 95562 CASAVA_Build 16 19972653 2D TCTCATCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 27 11 T 12 10 95563 CASAVA_Build 16 19973237 2D TTCTTATCAG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 11 9 95564 CASAVA_Build 16 19977041 1I TACCCAGCAA -/G AAACTCCAGG 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 G 0 1 95565 CASAVA_Build 16 19979063 2I TGGCTGCAGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 63 22 19 22 GT 8 9 95566 CASAVA_Build 16 19979883 6D TAGTCTTTCC TCTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 673 hom 46 8 21 17 TCTGTG 1 0 95567 CASAVA_Build 16 19988102 32I ATCACTCCCA --------------------------------/GTTTAAAGTTGGAGAAACTGAGGCACAGACTG GTTAAAGTCA 3070 hom 123 het 42 0 42 7 GTTTAAAGTTGGAGAAACTGAGGCACAGACTG 0 1 95568 CASAVA_Build 16 19994530 1I AGCCAGGGGC -/G GGGGGAAATG 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 G 5 6 95569 CASAVA_Build 16 20016764 1D CCATAAAATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 9 8 95570 CASAVA_Build 16 20030553 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 12 13 95571 CASAVA_Build 16 20037929 4I CACAGCATAA ----/TTAC TTTGAGATTC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TTAC 0 1 95572 CASAVA_Build 16 20041708 2I GTATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2631 hom 23 10 8 5 AT 6 7 95573 CASAVA_Build 16 20044059 1D CGAAGCTTTC T/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 T 7 6 95574 CASAVA_Build 16 20054501 2I TGCATGCTCA --/CC ACCACCCTGT 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 C 0 2 95575 CASAVA_Build 16 20061286 2D AATACATATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 TA 7 6 95576 CASAVA_Build 16 20089813 1D AATACAGGTT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 8 7 95577 CASAVA_Build 16 20094264 2I GAAACGAAAC --/TG AGAGTCAGAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 TG 0 1 95578 CASAVA_Build 16 20104091 1I TTGATGGTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 28 het 23 0 14 9 T 9 10 95579 CASAVA_Build 16 20117648 1D ATATAATGAC G/- TTTTTTTCCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 1 0 95580 CASAVA_Build 16 20121313 1I ATTACAGGCG -/T TGAGCCACTG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 1 2 95581 CASAVA_Build 16 20140322 1D CAGAAAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 39 0 24 15 T 11 10 95582 CASAVA_Build 16 20145692 1D TTTGGTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 A 13 12 95583 CASAVA_Build 16 20149112 3I TGTCTCTAAT ---/GAG AACACAGAGG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 GAG 0 1 95584 CASAVA_Build 16 20150626 4D AATAATTTTA TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 TTTG 2 1 95585 CASAVA_Build 16 20151341 4D AGAGTCTAAC AGAT/---- AGAGCAGAAC 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AGAT 1 0 95586 CASAVA_Build 16 20156897 4I ATACAGTAAG ----/TACT TGCCTAGTGA 3070 hom 156 het 59 0 51 8 TACT 0 1 95587 CASAVA_Build 16 20189543 1D GTTGTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 33 1 25 7 T 11 10 95588 CASAVA_Build 16 20198336 1D AGTCTGCCTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 80 het 41 0 33 8 T 9 8 95589 CASAVA_Build 16 20201580 1I ATGAGAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 38 1 31 6 T 11 12 95590 CASAVA_Build 16 20202181 2D GTGTGTGTGT GA/-- GTTTATGTTT 2257 hom 30 het 29 0 20 10 GA 1 0 95591 CASAVA_Build 16 20207690 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 7 6 95592 CASAVA_Build 16 20215100 1I CATGTCCATT -/G TGGTTAGACA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 0 1 95593 CASAVA_Build 16 20216393 1D CGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 10 9 95594 CASAVA_Build 16 20222516 5I GTGATTGCCG -----/TATCA TTTGAATGCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TATCA 0 1 95595 CASAVA_Build 16 20232085 2I TGTCTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TC 8 9 95596 CASAVA_Build 16 20263514 1D TATAAATTAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 9 8 95597 CASAVA_Build 16 20265707 16D AAAGAAAGAG AGAAAGAAAGAAAGAA/---------------- AGAAAGAAAG 3070 hom 63 het 26 0 22 8 AGAA 8 4 95598 CASAVA_Build 16 20276100 1D ATACGGCAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 8 7 95599 CASAVA_Build 16 20287435 3D GGGGGGGTGG TGC/--- TGGACAGGGT 3070 hom 107 het 39 0 36 3 TGC 1 0 95600 CASAVA_Build 16 20292596 4D CTGTTTTCTG TACA/---- TACATCACTT 3070 hom 132 het 48 0 45 5 TACA 2 1 95601 CASAVA_Build 16 20292999 2D CTAGGCATAA GG/-- CTTCTTCCCT 3070 het 3070 ref 32 19 8 5 G 2 0 95602 CASAVA_Build 16 20297843 1I TTTTAGGGCA -/T TTTTTTTTTT 2015 het 2015 ref 29 19 5 5 T 12 13 95603 CASAVA_Build 16 20315724 1I CTGCCTGTGG -/A AGTGCCCCCT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 1 2 95604 CASAVA_Build 16 20322481 1D ACTTTTGTGC A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 51 het 23 0 14 9 A 8 7 95605 CASAVA_Build 16 20330593 1I AGGCTCCAAG -/A CATGTTGATG 1622 het 1622 ref 64 45 5 14 A 0 1 95606 CASAVA_Build 16 20350409 2I AAGCGTAAAC --/AT ATGACATGAG 779 het 779 ref 50 44 3 3 AT 1 2 95607 CASAVA_Build 16 20375735 1D AAGATTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 13 12 95608 CASAVA_Build 16 20394510 1D CGTCACTGTA G/- GGGAGTCCCT 3070 het 2843 hom 21 8 8 5 G 4 3 95609 CASAVA_Build 16 20402215 1D CAACATGGTG A/- AACCCCATCT 3070 het 867 hom 10 2 8 0 A 3 2 95610 CASAVA_Build 16 20403324 1D TCCTCAGCAC A/- GGCTAATTGT 1703 het 1507 hom 10 4 4 2 A 1 0 95611 CASAVA_Build 16 20408868 1I CAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 2571 het 505 hom 14 5 8 1 G 0 1 95612 CASAVA_Build 16 20424060 6D CTGTCTTAAA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 het 314 hom 24 2 10 13 AAC 5 3 95613 CASAVA_Build 16 20424503 1D TTCCAATGAT A/- TTTTTAACAA 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 A 1 0 95614 CASAVA_Build 16 20440511 1I GCCTCTACCT -/A CTAGATACCA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 A 0 1 95615 CASAVA_Build 16 20458125 1D ATGACAATTA G/- CCTGTGCTGA 1433 het 911 hom 5 2 3 0 G 1 0 95616 CASAVA_Build 16 20458223 1I CTAGACTCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 8 9 95617 CASAVA_Build 16 20472587 11I TAGAGAGAAA -----------/GAGCTCAGCTT GAGCTCAGCT 3070 het 3070 ref 50 19 17 14 GAGCTCAGCTT 1 2 95618 CASAVA_Build 16 20480792 1I CAGTGTTTGG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 2166 hom 30 5 20 5 T 7 8 95619 CASAVA_Build 16 20499295 4I TGCATAAGAT ----/TGTC TGTAAGTGTA 3070 het 3070 hom 50 21 28 1 TGTC 0 1 95620 CASAVA_Build 16 20517115 1D ATGGATCCAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 26 12 8 8 A 9 8 95621 CASAVA_Build 16 20536520 1D GAAAGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 11 10 95622 CASAVA_Build 16 20539337 1I CTAGACCAAC -/T TTTTTTTTTT 1481 het 1481 ref 38 26 4 8 T 13 14 95623 CASAVA_Build 16 20541928 1I GTGCTTAGGT -/C AACCCTGAGA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 C 0 1 95624 CASAVA_Build 16 20552469 1I ATCCCAATGG -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 6 7 95625 CASAVA_Build 16 20556074 5I GGGATAAATG -----/ATAAA AGAAGAGAGG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 ATAAA 0 1 95626 CASAVA_Build 16 20567999 5D CAAAGCTCTG TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 het 2581 hom 30 6 14 10 TTTTA 5 4 95627 CASAVA_Build 16 20584451 1I CCTTTCTAAC -/T CATTCTATGA 3070 het 3070 ref 55 27 24 4 T 0 1 95628 CASAVA_Build 16 20593551 1D GGGAGTTTCA C/- CCGGATGGAG 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 C 3 2 95629 CASAVA_Build 16 20594815 2I2M1I CTCAGGAAAG --AG-/GCAGA AAAACCAGTT 9 het 9 ref 40 34 1 7 N/A 0 0 95630 CASAVA_Build 16 20605634 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 11 10 95631 CASAVA_Build 16 20607918 2D CATCAATAAC AT/-- AAAGTGTGGG 2619 het 2383 hom 16 6 8 2 AT 1 0 95632 CASAVA_Build 16 20633032 1D ATATGGAGGC A/- AAAAAAAAAA 2874 het 2874 ref 39 19 9 11 A 12 11 95633 CASAVA_Build 16 20633824 4I CGAAAGATAG ----/ATAA ATAGATAGGT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 ATAA 0 1 95634 CASAVA_Build 16 20634869 1D GGCTAAGTTA C/- CCCCCAGGGA 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 C 6 5 95635 CASAVA_Build 16 20647670 1I GTGGCTCATA -/C CTGTAATTGC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 2 95636 CASAVA_Build 16 20652933 6D TACCAAATAC AAATAA/------ ATATAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 13 18 4 AAATAA 1 0 95637 CASAVA_Build 16 20654200 1D GTTTTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 813 hom 30 2 17 12 T 15 14 95638 CASAVA_Build 16 20661082 1I TTGAGTTATT -/G GAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 G 1 2 95639 CASAVA_Build 16 20661362 21I7M2D ACTACTCGGG ---------------------AGGCTGAGG/CAAGTTGATCTTTTGTGTTCCTTGAGCC-- CAGGGGAATC 1114 het 1114 ref 29 25 3 3 N/A 0 0 95640 CASAVA_Build 16 20665899 1D CAGGAGATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 A 11 10 95641 CASAVA_Build 16 20666964 4D ATGTCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAAT 5 4 95642 CASAVA_Build 16 20677749 1D CAGTTTCCAT G/- TAGTTGAGCG 2272 hom 12 het 6 0 5 1 G 1 0 95643 CASAVA_Build 16 20681908 5I TCTTTAAGTA -----/AATTT AAGTTGGGTC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AATTT 0 1 95644 CASAVA_Build 16 20691239 1D AAATTAAAAT A/- AAAAATAAAA 1384 het 1384 ref 10 6 4 0 A 6 5 95645 CASAVA_Build 16 20698595 2D GTCAGCAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2361 het 87 hom 26 2 9 15 T 18 16 95646 CASAVA_Build 16 20702636 1I CCCGTCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 24 0 16 8 T 13 14 95647 CASAVA_Build 16 20722845 1D TTAGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1196 het 1196 ref 44 31 4 10 T 15 14 95648 CASAVA_Build 16 20724243 6D ACTCCGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAG 3070 het 2383 hom 20 8 11 1 A 15 9 95649 CASAVA_Build 16 20734368 3I GGTCACCATT ---/TTC TTTTTTGCTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTC 0 1 95650 CASAVA_Build 16 20735149 2D ACAAAAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 650 hom 38 6 16 17 T 14 12 95651 CASAVA_Build 16 20739781 16D GTCTTGATAA GGAATATCAAGTCATT/---------------- GGTCAATCTA 3070 het 3070 ref 34 21 14 2 GGAATATCAAGTCATT 1 0 95652 CASAVA_Build 16 20740107 1D TTTCTCTGTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 2718 hom 18 6 10 2 T 8 7 95653 CASAVA_Build 16 20754463 2I TTCTTAGGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 10 12 95654 CASAVA_Build 16 20761090 1I ACTCTGTGTA -/C CGTACCTCAC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 C 1 2 95655 CASAVA_Build 16 20764203 3I CTGGCCACAT ---/CTC CTTTTCTCGC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CTC 0 1 95656 CASAVA_Build 16 20776648 1I TTTAGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 11 12 95657 CASAVA_Build 16 20780573 1I GTTATTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 A 11 12 95658 CASAVA_Build 16 20783635 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 59 31 19 9 A 6 7 95659 CASAVA_Build 16 20798327 1D TTAACAGGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 9 8 95660 CASAVA_Build 16 20801076 1D AACATTGCTA T/- TTTTTTTTTT 1986 het 652 hom 19 6 7 7 T 17 16 95661 CASAVA_Build 16 20801813 10D TGAGTATCCC TTATCCCAAA/---------- TGCTTGAGAC 3070 het 3070 ref 45 24 20 3 TTATCCCAAA 1 0 95662 CASAVA_Build 16 20804888 1I TTTTTCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1138 hom 34 4 24 6 A 14 15 95663 CASAVA_Build 16 20814101 1I TAAATTTTTT -/A TAGAGACAGG 3070 hom 82 het 31 0 27 4 A 0 1 95664 CASAVA_Build 16 20817695 1D TCTGTCTGAG A/- GGCTAGAAGA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 1 0 95665 CASAVA_Build 16 20839765 4I AAAAAATTAT ----/ATAA ATAAACTTAA 1710 hom 10 het 4 0 4 0 ATAA 1 2 95666 CASAVA_Build 16 20840819 1D TCCCTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 11 10 T 13 12 95667 CASAVA_Build 16 20845333 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1888 hom 18 7 10 2 A 10 9 95668 CASAVA_Build 16 20853298 1I TAGCCTATAG -/C TGGGCAGGAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 0 1 95669 CASAVA_Build 16 20857218 1I TGTCTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1730 hom 33 7 14 12 A 13 14 95670 CASAVA_Build 16 20863029 2I CAAAAGAAAA --/AG AAAAAAAGAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AG 0 1 95671 CASAVA_Build 16 20888250 4D TTTCTCTGCT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 48 24 14 11 TC 9 7 95672 CASAVA_Build 16 20909462 4I TACAGGTAAA ----/AGAT AGATACAGAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AGAT 1 2 95673 CASAVA_Build 16 20927260 2D GCACTGTACC CT/-- CTCTCTGAAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 CT 4 3 95674 CASAVA_Build 16 20927399 1I AAACCTGGCG -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 49 16 20 13 T 6 7 95675 CASAVA_Build 16 20961380 1I TTATACACTC -/T TTTGTGATGC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 3 4 95676 CASAVA_Build 16 21022640 2D CCTGGAGTGG GT/-- GTGTGTGTGT 513 het 513 ref 61 50 3 9 GT 7 6 95677 CASAVA_Build 16 21028557 1D TACCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1132 het 1132 ref 21 16 3 2 T 12 11 95678 CASAVA_Build 16 21048612 1I CCATTAGTGG -/A ACAGGGGTAG 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 1 2 95679 CASAVA_Build 16 21070144 1D TTTTTCCCCG T/- TTTTTTTTTT 793 het 793 ref 18 5 2 11 T 17 16 95680 CASAVA_Build 16 21094229 2D CCTCTTAATC AA/-- GATACAAAGT 3070 het 3070 hom 34 12 18 6 A 2 0 95681 CASAVA_Build 16 21111491 1I TCTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 22 0 17 5 T 11 12 95682 CASAVA_Build 16 21118009 1D TGGGTATGTT G/- GGGGGGTTCC 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 G 7 6 95683 CASAVA_Build 16 21121603 2I ATATTCACTC --/TG TATTTAAGAA 3070 het 3070 ref 51 22 19 10 TG 0 1 95684 CASAVA_Build 16 21139924 23I9M1D CTGATAGTTT -----------------------TTCCTTTATA/TCCATACCTGCACTCCAGGTAACTTCCAGCAT- GGTTACCTGA 3070 het 3070 ref 22 11 9 9 N/A 0 0 95685 CASAVA_Build 16 21141118 4I TGCAAAGAGG ----/CATT CCTTCCTCTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 CATT 0 1 95686 CASAVA_Build 16 21141558 4I GTCTGATCTC ----/TCTT TCTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TCTT 1 2 95687 CASAVA_Build 16 21157303 2D GTAAACATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 AT 8 7 95688 CASAVA_Build 16 21183061 1D AAGCACTAGC T/- TAAGGAAGCT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 2 1 95689 CASAVA_Build 16 21190848 1D ACTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1403 het 676 hom 13 5 4 4 T 17 16 95690 CASAVA_Build 16 21191474 1D TTGGTGTGAA T/- TTTTTTTTTT 2405 het 1729 hom 28 11 7 10 T 16 15 95691 CASAVA_Build 16 21195770 2D CCTGATGCAT TA/-- TAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 44 19 17 9 TA 2 1 95692 CASAVA_Build 16 21198701 1D GAGTAGCCAT G/- TAATAAGTGA 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 G 1 0 95693 CASAVA_Build 16 21207335 3I TGAGGCTTCT ---/TTC TTCTTATTTT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 TTC 1 2 95694 CASAVA_Build 16 21219838 1I AGAAGCCGCA -/G GGGCTGCGCT 2158 hom 31 het 17 0 10 7 G 3 4 95695 CASAVA_Build 16 21225508 1I CAACCCATCA -/C CTACATTAGG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 1 2 95696 CASAVA_Build 16 21238126 1D CTTGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 11 10 95697 CASAVA_Build 16 21257494 1D CTAGGGGATG A/- AAATGTGGCT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 4 3 95698 CASAVA_Build 16 21272254 2D GCGCCTTTGT CC/-- CCCGTGGTTC 2200 het 2200 ref 42 31 6 5 C 5 3 95699 CASAVA_Build 16 21272891 1I ATAAATCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 11 95700 CASAVA_Build 16 21272901 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCTTGTGA 3070 hom 20 het 24 1 21 2 C 4 5 95701 CASAVA_Build 16 21394587 2I AAAAAAAAAA --/AC GAATGATATT 3070 hom 63 het 25 0 20 5 AC 0 1 95702 CASAVA_Build 16 21404307 1D AATTTTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 A 11 10 95703 CASAVA_Build 16 21421265 2I ATCCTAAGAC --/AG GGGATCTCCA 3035 hom 24 het 10 0 8 2 AG 0 1 95704 CASAVA_Build 16 21449277 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 27 10 4 A 9 10 95705 CASAVA_Build 16 21458462 1D CCAGTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 52 2 40 11 A 12 11 95706 CASAVA_Build 16 21463251 1D ACCTCAGGTG A/- TCTACCCACC 939 het 179 hom 7 1 2 5 A 1 0 95707 CASAVA_Build 16 21506226 1I TGACCAACAT -/G GGGAAACCCC 2352 hom 15 het 7 0 6 1 G 3 4 95708 CASAVA_Build 16 21521488 1I AAATAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 10 11 95709 CASAVA_Build 16 21538250 1D AAGAAGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 40 1 33 6 T 12 11 95710 CASAVA_Build 16 21558929 9D CCCGCTAAAT TTTTTTGTA/--------- TTTTTAGTAG 1413 het 1413 ref 13 8 4 1 TTTTTTGTA 1 0 95711 CASAVA_Build 16 21564981 1I AAATTCCCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 214 hom 29 1 24 4 T 9 10 95712 CASAVA_Build 16 21577906 1D GGCTGGTCTC A/- AAACTCCTGA 3070 hom 47 het 20 0 15 5 A 4 3 95713 CASAVA_Build 16 21605112 1D AAATGGAGGC T/- TTTTTTTTTT 1062 het 1062 ref 28 18 5 5 T 13 12 95714 CASAVA_Build 16 21615787 11I GTAGAGTGAG -----------/CACATAGCTCA CTGTAGCCTC 3070 hom 48 het 17 0 16 1 CACATAGCTCA 0 1 95715 CASAVA_Build 16 21647865 1I TTAAAGACTA -/T TTTTTTTTTT 2481 het 2481 ref 26 12 8 6 T 10 11 95716 CASAVA_Build 16 21649436 1D AGAGATACCA G/- AGAAAGGAGA 3070 het 3070 ref 61 43 15 4 G 1 0 95717 CASAVA_Build 16 21657271 1D TTGTTCTCCC G/- TTTTTTTTTT 2118 het 2118 ref 31 17 6 8 G 1 0 95718 CASAVA_Build 16 21665891 1I AGCTGTTTTT -/A ATGTTGATAT 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 A 1 2 95719 CASAVA_Build 16 21677842 1I AAACAGCAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 A 8 9 95720 CASAVA_Build 16 21678725 1D CTGTCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2412 hom 22 8 10 4 T 11 10 95721 CASAVA_Build 16 21716690 2I CCTTTGGTTT --/AA AAAAAAAAAA 1652 het 1652 ref 31 18 5 8 A 12 14 95722 CASAVA_Build 16 21719054 1D CAAGTCCTAT G/- GGTGAATAAT 3070 het 3070 ref 45 33 8 6 G 3 2 95723 CASAVA_Build 16 21719214 1D AATGCAAATG A/- AAAAAATGAC 1782 het 1782 ref 25 19 4 3 A 7 6 95724 CASAVA_Build 16 21724900 1I AAATGAAAAT -/A AAAAAAATAA 2628 het 2628 ref 30 20 8 2 A 7 8 95725 CASAVA_Build 16 21726441 4I TTTTCATGTG ----/CTTT TTTTGCAGAA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 CTTT 0 1 95726 CASAVA_Build 16 21729478 1I AAGTGGATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 24 2 17 5 A 11 12 95727 CASAVA_Build 16 21735218 1D ATCAGCATGT A/- AAAAAAAAAC 618 het 618 ref 39 30 2 8 A 10 9 95728 CASAVA_Build 16 21739181 1D CCCGACAAAC A/- ACGTGTGAAG 1052 het 1052 ref 29 12 5 13 A 2 1 95729 CASAVA_Build 16 21787091 4D TCAAAAAATG AATA/---- AATAAATAAA 2613 het 1110 hom 10 3 7 0 AATA 4 3 95730 CASAVA_Build 16 21819582 5D GATATGCCGG TTTCA/----- TTTATCTTTA 3070 het 3070 ref 46 30 13 3 TTTCA 1 0 95731 CASAVA_Build 16 21841837 1I ATGTCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 35 26 3 6 T 11 12 95732 CASAVA_Build 16 21860166 2D TAGTTTCCAC TT/-- TGTTAGGCTG 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 T 3 1 95733 CASAVA_Build 16 21868109 1I AGAATCTTCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 8 9 95734 CASAVA_Build 16 21886823 1D TTTTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 1359 het 351 hom 18 3 5 10 T 19 18 95735 CASAVA_Build 16 21898548 1I CTGTAGATAC -/T TAAACACTGT 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 T 1 2 95736 CASAVA_Build 16 21898951 2D CACTGACAGC AG/-- AGAGATCTTC 3070 het 3070 ref 50 21 21 9 AG 3 2 95737 CASAVA_Build 16 21899313 1I CACCACTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 10 11 95738 CASAVA_Build 16 21925255 1I GTATAATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 12 13 95739 CASAVA_Build 16 21931562 7D GAAGGAATAG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 1989 hom 38 12 16 12 A 18 11 95740 CASAVA_Build 16 21945749 1D TGTTTTTTTT A/- AATTACAGTG 2707 het 2707 ref 28 14 7 8 A 3 2 95741 CASAVA_Build 16 21961140 1D TTATTTGACA C/- CTTTTCTAGG 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 C 2 1 95742 CASAVA_Build 16 21964703 1I ACTAGAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2125 hom 24 7 9 8 T 12 13 95743 CASAVA_Build 16 21981090 4I ATATATAAAA ----/AATT AAGAGAAAGA 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 AATT 0 1 95744 CASAVA_Build 16 21985091 1I TCTATTCCTA -/G GGCATTTGTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 2 3 95745 CASAVA_Build 16 22021180 3D CTCAAATAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 AAG 4 3 95746 CASAVA_Build 16 22046142 1I AGAGATGGGG -/T TTCACCATGT 3070 het 2902 hom 17 7 8 2 T 2 3 95747 CASAVA_Build 16 22049693 1D ATGTGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 A 12 11 95748 CASAVA_Build 16 22054052 1I CTTAGAGGAG -/C CCGGCTAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 C 2 3 95749 CASAVA_Build 16 22064602 1D GGCTTTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 12 11 95750 CASAVA_Build 16 22067593 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 546 het 546 ref 21 18 2 2 A 10 9 95751 CASAVA_Build 16 22094947 1D GAAGAGTGGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 8 7 95752 CASAVA_Build 16 22107045 4I TAGGAAAATT ----/ATTG ATTTGTCCAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 ATTG 0 1 95753 CASAVA_Build 16 22123405 1I GCTTAATAAA -/T ATTTGCCATA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 0 1 95754 CASAVA_Build 16 22137850 1D AGCTTTCAAG A/- AAAATCCTGA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 5 4 95755 CASAVA_Build 16 22146761 1I TTTATTAAAG -/A AAAAAAAAAA 983 het 983 ref 16 8 3 5 A 11 12 95756 CASAVA_Build 16 22151704 1D ACCTAAGTGG T/- TTTTTTTTTA 762 het 762 ref 44 35 3 6 T 10 9 95757 CASAVA_Build 16 22154177 1I CAGTAACCAG -/T TTTTTTTCGG 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 T 7 8 95758 CASAVA_Build 16 22155162 1D GTTGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2086 hom 30 9 10 11 T 15 14 95759 CASAVA_Build 16 22157472 1I ACCTGGTCTC -/A AAAAAAAAAG 1262 het 1262 ref 29 11 7 11 A 9 10 95760 CASAVA_Build 16 22157914 3I TGTGCTTATT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 A 12 15 95761 CASAVA_Build 16 22170440 1I AGAGATGTGG -/T TTTCACCATG 3070 het 798 hom 18 3 15 0 T 3 4 95762 CASAVA_Build 16 22172486 1D TCATTCTAAC T/- TTTTTTTTTT 1110 het 1110 ref 43 27 3 13 T 13 12 95763 CASAVA_Build 16 22198266 4D GTGGGTACAT AGTA/---- AGTGTGTATA 3070 het 3070 hom 38 14 24 2 AGTA 1 0 95764 CASAVA_Build 16 22253540 1D CACTCAGTTT G/- GACTAGCCAC 3070 het 3070 ref 41 16 17 9 G 2 1 95765 CASAVA_Build 16 22263802 1D CCCCCGCTCT A/- AAAAAAAAAA 1188 het 1188 ref 12 4 3 6 A 17 16 95766 CASAVA_Build 16 22265352 2I GTATTCAAAC --/AG TGTTTGCAAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AG 0 1 95767 CASAVA_Build 16 22317706 4D TCAGAAGCAA ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 7 ATTT 3 2 95768 CASAVA_Build 16 22391559 1I TTTTTTTTTT -/G GGTCACAGGA 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 2 3 95769 CASAVA_Build 16 22457105 6D CTCTCTGGGT CTCGAG/------ CTCCTGTGAC 26 het 26 ref 16 6 1 9 CTCGAG 1 0 95770 CASAVA_Build 16 22462026 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTCAGG 2101 het 2101 ref 45 29 5 11 T 6 7 95771 CASAVA_Build 16 22470536 1D TACACATACA T/- TTTTTTTTGT 2685 het 2685 ref 67 54 6 8 T 9 8 95772 CASAVA_Build 16 22479251 1D GCACAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1393 hom 24 7 10 7 T 13 12 95773 CASAVA_Build 16 22482014 1I AGCTGTTTTT -/A ATGTTGATAT 1547 het 1547 ref 16 9 4 3 A 1 2 95774 CASAVA_Build 16 22485052 1I AACACAAACT -/G GCTTGAACAA 3070 het 3070 hom 36 10 24 2 G 1 2 95775 CASAVA_Build 16 22494436 1D GTTGTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 2959 het 2959 ref 69 46 9 14 T 15 14 95776 CASAVA_Build 16 22501164 5I CCACTAGTGC -----/TTGAA CTCAGCCTCC 1873 het 1873 ref 13 8 4 1 TTGAA 0 1 95777 CASAVA_Build 16 22518062 1I TCCACACCTC -/A GAAAGATGGA 2807 het 2807 ref 47 35 6 6 A 0 1 95778 CASAVA_Build 16 22541756 1D ACACAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 74 36 19 20 A 14 13 95779 CASAVA_Build 16 22553598 1D TGCCCAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 12 11 95780 CASAVA_Build 16 22561598 1D CATAGATTTT G/- TGGGAGCTTC 3070 het 3070 ref 92 65 19 8 G 1 0 95781 CASAVA_Build 16 22562487 4D ATAAATAAAC AAAT/---- AAATAAATAT 3070 het 3070 ref 47 25 21 1 AAAT 3 2 95782 CASAVA_Build 16 22571215 5D GCTCTGCCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1192 het 1192 ref 38 24 4 12 A 23 18 95783 CASAVA_Build 16 22572686 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 9 7 A 12 11 95784 CASAVA_Build 16 22586459 1D GTACTTTTTA G/- GGTTATTTCT 3070 het 3070 hom 68 18 45 6 G 3 2 95785 CASAVA_Build 16 22603610 1I CCTGGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2191 hom 58 12 29 17 T 15 16 95786 CASAVA_Build 16 22605797 1I TTATGCATCA -/C CCTTAAAAGT 3070 hom 175 het 68 0 59 9 C 2 3 95787 CASAVA_Build 16 22607728 1I ACTTTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1088 hom 57 3 45 9 T 10 11 95788 CASAVA_Build 16 22612235 1I ATGATGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 80 23 32 25 T 12 13 95789 CASAVA_Build 16 22612945 1D TTTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 35 18 9 A 13 12 95790 CASAVA_Build 16 22629398 1D TAATGCTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 T 10 9 95791 CASAVA_Build 16 22640458 2D26M4I CCACACACCT CCCCCCCACCGCCCCCATACCTCTCCAC----/--CCCCCACCGCCCCCATAGCTCTCCACTTCA TTCAGAGTCA 3070 het 3070 hom 37 15 17 11 N/A 0 0 95792 CASAVA_Build 16 22641158 1D ACAGTGAGTG T/- TTACAGCTCT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 3 2 95793 CASAVA_Build 16 22642485 6D AGCTACTCCA GAGGCT/------ GAGGCTGAGG 3070 het 3070 hom 28 8 19 1 GAGGCT 2 1 95794 CASAVA_Build 16 22643033 1I AAAAAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2158 hom 41 13 16 12 A 11 12 95795 CASAVA_Build 16 22653213 1I CAAAATGAGT -/G GCTCATCTCT 3070 hom 96 het 33 0 31 2 G 1 2 95796 CASAVA_Build 16 22655050 6D ACTCCATCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAG 3070 het 6 hom 10 1 8 1 A 15 9 95797 CASAVA_Build 16 22665817 1D TTGAGACCAG A/- AAAAAAATTC 2114 het 2114 ref 20 13 6 2 A 8 7 95798 CASAVA_Build 16 22681852 1D TGCTTTCTCT G/- GGGGAACTTA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 G 5 4 95799 CASAVA_Build 16 22686114 3D GGATACTATC TTG/--- TTGTTTTATT 3070 het 3070 ref 44 16 18 12 TTG 2 1 95800 CASAVA_Build 16 22696914 1I AAAAAAATAA -/T AATAAAATAA 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 T 0 1 95801 CASAVA_Build 16 22723824 10D TTGAACACAA GCACTGTGAT/---------- GCTGCAACAG 3070 het 3070 ref 40 27 11 5 GCACTGTGAT 1 0 95802 CASAVA_Build 16 22736715 1D AAAGGAGGGG C/- TTCTTTCTGT 3070 het 3070 hom 50 22 24 6 C 1 0 95803 CASAVA_Build 16 22760885 3D CTTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2120 het 861 hom 25 6 6 13 T 19 16 95804 CASAVA_Build 16 22762729 6D AAGGAAGGCA AGAAAC/------ AGACAGTTTC 3070 het 3070 hom 47 19 26 4 AGAAAC 1 0 95805 CASAVA_Build 16 22809128 1D CATTGCTTTA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 7 6 95806 CASAVA_Build 16 22810300 1D TCTTCATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 47 2 38 7 A 11 10 95807 CASAVA_Build 16 22837713 1I TGTCTCTATG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 73 het 31 0 24 7 A 9 10 95808 CASAVA_Build 16 22843079 1I GAAGACTGGG -/A AAAAAATTTA 3070 het 333 hom 36 1 31 4 A 6 7 95809 CASAVA_Build 16 22851035 11I CCTTCCGCTT -----------/GGGGTAACACA GAATCCTCTA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 GGGGTAACACA 0 1 95810 CASAVA_Build 16 22856149 2D CTGCCACCCC TT/-- TTTTTTTTTT 858 het 858 ref 36 16 3 18 T 14 12 95811 CASAVA_Build 16 22856374 5I GTTGCGAACT -----/CCTGA CCTCAGGTGA 2833 het 2833 ref 36 19 7 10 CCTGA 0 1 95812 CASAVA_Build 16 22876683 1I TTTCATACAA -/C CACACGTTAT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 1 2 95813 CASAVA_Build 16 22882969 1D GTGGGCTCTG C/- CCCCCCCCGG 3012 het 1109 hom 16 4 9 3 C 9 8 95814 CASAVA_Build 16 22894307 2D AACAAGTGAT TC/-- TCTTATCATA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TC 2 1 95815 CASAVA_Build 16 22902413 1I ATACAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 T 10 11 95816 CASAVA_Build 16 22916460 1D AATACATGAA T/- TTTTTTTTTT 1186 het 1186 ref 42 35 3 4 T 12 11 95817 CASAVA_Build 16 22918786 1I GACATTACAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 A 8 9 95818 CASAVA_Build 16 22919941 1D AGAAACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 A 11 10 95819 CASAVA_Build 16 22920959 1I ACATCTACTG -/T TTTTTTGACT 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 T 6 7 95820 CASAVA_Build 16 22925843 2D ATATGAAATA AT/-- AATCTCAGAG 3070 het 3070 hom 37 13 23 2 AT 1 0 95821 CASAVA_Build 16 22928682 1I CCGATAAAAG -/T TTTTTTTTTT 2457 het 2457 ref 23 12 7 4 T 10 11 95822 CASAVA_Build 16 22943444 6D TGATATCTCA TTGTAG/------ TTTAACTTGC 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 TTGTAG 1 0 95823 CASAVA_Build 16 22959194 7I TCTGAGCGAT -------/AAAAGAA TTCAGCATGT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 AAAAGAA 0 1 95824 CASAVA_Build 16 22959335 1I GCTCAGTTCC -/A AGGCAACCAC 2487 het 2487 ref 31 20 6 5 A 1 2 95825 CASAVA_Build 16 22959381 2I AGTCGCATGC --/AT TTTTTTTTTA 1971 het 1971 ref 29 18 6 5 AT 0 1 95826 CASAVA_Build 16 22960299 1I AAGACCCCCC -/A CCTCCAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 0 1 95827 CASAVA_Build 16 22961913 1D TTGTTGCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1299 hom 34 6 11 17 T 17 16 95828 CASAVA_Build 16 22975771 1I AGAAGAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2237 hom 24 5 15 4 A 10 11 95829 CASAVA_Build 16 22976442 1D TCCTAGAATC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2746 hom 21 6 11 4 T 10 9 95830 CASAVA_Build 16 22978105 13D GAGCAGGGAA TAAGTGGCAAACT/------------- TGCTGAAACG 3070 het 3070 ref 81 41 38 6 TAAGTGGCAAACT 1 0 95831 CASAVA_Build 16 22982557 1I AATTGTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 10 11 95832 CASAVA_Build 16 22983659 1D ATGAATGATG A/- AAACAAGATT 3070 het 3070 ref 27 14 9 6 A 4 3 95833 CASAVA_Build 16 22986736 2I CGCATACACT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 CA 8 9 95834 CASAVA_Build 16 22990181 3I GCTGCACTCA ---/CTC CTCCTTCCAG 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 CTC 1 2 95835 CASAVA_Build 16 22998064 1I TATCGCAATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 8 9 95836 CASAVA_Build 16 23010903 4I CCCATTTACT ----/GCCA GCCAGCTGTG 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 GCCA 1 2 95837 CASAVA_Build 16 23033119 1D ATTTTGTAAA G/- AAAGTAGAGG 3070 het 3070 ref 46 27 15 5 G 1 0 95838 CASAVA_Build 16 23033868 1D ACTGGTTATC A/- AGAGGCAACT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 2 1 95839 CASAVA_Build 16 23034034 1I CCTTTTACGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 8 9 95840 CASAVA_Build 16 23037928 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2478 het 1495 hom 25 7 8 10 T 13 12 95841 CASAVA_Build 16 23046154 7I GGGACTGAGG -------/ATCACTT ATCACTTGAG 2511 het 2511 ref 23 9 8 6 ATCACTT 1 2 95842 CASAVA_Build 16 23049509 3D CAGAAATTAC ATG/--- ATATCCTAGG 3070 het 3070 ref 36 23 8 6 ATG 1 0 95843 CASAVA_Build 16 23060204 1I TATACAATAA -/T TTTTTTTTTT 1988 het 755 hom 21 5 8 8 T 15 16 95844 CASAVA_Build 16 23097350 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1481 het 1481 ref 27 11 4 12 A 15 14 95845 CASAVA_Build 16 23099833 1D TATTTGGGGA G/- GGGGGGGCAC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 G 8 7 95846 CASAVA_Build 16 23102522 2D CTCATATAAC TG/-- TAGTGAGGAT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 TG 1 0 95847 CASAVA_Build 16 23103018 1D TCCTTCACTT G/- GGGGCTCCTC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 G 5 4 95848 CASAVA_Build 16 23103571 1I TCAGGGTGGG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 7 8 95849 CASAVA_Build 16 23108890 1I AGACTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 1533 het 1533 ref 9 4 4 1 A 10 11 95850 CASAVA_Build 16 23110901 1I GACCCTGAAG -/A AGCTGGTTTT 3070 het 3070 ref 56 29 19 8 A 1 2 95851 CASAVA_Build 16 23112790 2D AACAGAAGGC AG/-- AGAGTCTAGT 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 AG 3 2 95852 CASAVA_Build 16 23114610 1D AATTGTTTAC A/- AATCGTTTGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 3 2 95853 CASAVA_Build 16 23116701 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 41 1 26 15 A 13 12 95854 CASAVA_Build 16 23117848 1D CCTGCCTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 T 10 9 95855 CASAVA_Build 16 23120352 1I GAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 11 12 95856 CASAVA_Build 16 23124982 1I TGGCAAGACA -/G GCAATCTTTC 3070 hom 126 het 50 0 40 10 G 1 2 95857 CASAVA_Build 16 23155936 2D TTCTTTCTTC TT/-- TCTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 3 1 95858 CASAVA_Build 16 23156064 1I CTTCCTCCCT -/C CCTTCCCTTC 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 C 2 3 95859 CASAVA_Build 16 23156891 28D CCAAATCCAG TCACCAAGCCTTACATGTTGGACAGGCT/---------------------------- TCAAAAGAGA 2513 het 2513 ref 34 26 8 17 TCACCAAGCCTTACATGTTGGACAGGCT 1 0 95860 CASAVA_Build 16 23164825 1D GTCTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1307 het 1307 ref 28 19 4 5 A 13 12 95861 CASAVA_Build 16 23175632 3D TACTCTGGTC CCA/--- CCACTGTATT 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 CCA 2 1 95862 CASAVA_Build 16 23180906 1D TTTTTACGTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 A 9 8 95863 CASAVA_Build 16 23181913 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2062 het 1368 hom 17 4 7 6 A 17 16 95864 CASAVA_Build 16 23183980 4I CACAGACCAA ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 TTGT 2 3 95865 CASAVA_Build 16 23186288 2D CTTCCAGCAG TT/-- TTTTTTTTTT 2537 het 879 hom 36 9 8 19 T 19 17 95866 CASAVA_Build 16 23187420 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 A 9 8 95867 CASAVA_Build 16 23192859 2D CATTAGGAGA TT/-- TTTTTTTTGC 3070 hom 36 het 20 0 12 9 T 10 8 95868 CASAVA_Build 16 23204869 1I ATGATATTTT -/A AAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 4 5 95869 CASAVA_Build 16 23209891 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2416 het 2292 hom 33 9 9 15 T 13 12 95870 CASAVA_Build 16 23225368 1I AAGGGAGGGA -/G GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 G 1 2 95871 CASAVA_Build 16 23237868 2D GTTTGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1565 het 1565 ref 17 7 5 5 T 14 12 95872 CASAVA_Build 16 23258236 1D TTCATTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 11 10 95873 CASAVA_Build 16 23259364 1I AAAATTACAC -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 34 14 18 2 T 6 7 95874 CASAVA_Build 16 23261489 1D ATGAGCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 10 4 A 11 10 95875 CASAVA_Build 16 23285038 1D ATTATTATTG T/- TTTTTTGATA 3070 het 1258 hom 23 5 13 5 T 7 6 95876 CASAVA_Build 16 23285204 4I TTTATTTTAT ----/TTTA TTTATTTTTT 3005 het 2584 hom 18 8 8 2 TTTA 1 2 95877 CASAVA_Build 16 23286879 1I GTGGGACTGA -/G GGGGGGACCA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 G 6 7 95878 CASAVA_Build 16 23291320 1I GAGAAGTCCC -/T TTTTTTTTTT 1840 het 746 hom 20 4 7 9 T 15 16 95879 CASAVA_Build 16 23296542 4D TCCTCCTTCC TTCT/---- CCCTCCCTCC 3070 hom 50 het 18 0 17 3 TTCT 1 0 95880 CASAVA_Build 16 23317835 1D CTAAAGCCAG C/- CCTGGAAAAC 3070 het 3070 ref 32 13 12 8 C 3 2 95881 CASAVA_Build 16 23321168 1D ATTTATTAGA T/- TTTTTTTTTT 2770 het 2770 ref 19 7 6 6 T 12 11 95882 CASAVA_Build 16 23348206 1D ATGTGTCTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2694 hom 25 7 13 6 A 10 9 95883 CASAVA_Build 16 23352642 1I GAAAGGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 11 13 21 A 13 14 95884 CASAVA_Build 16 23354479 6D GCCACAGCCT TAGAAC/------ TATATCAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 TAGAAC 1 0 95885 CASAVA_Build 16 23360592 1D AGCTACATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1875 hom 22 4 14 4 A 10 9 95886 CASAVA_Build 16 23361856 1I ACCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2360 hom 27 5 14 8 A 10 11 95887 CASAVA_Build 16 23365763 2I TTGCAGAGAC --/AG AGTTTCACCA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AG 1 2 95888 CASAVA_Build 16 23370548 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1606 het 1548 hom 37 11 9 17 A 20 18 95889 CASAVA_Build 16 23373836 1I CATCCCCCCC -/A AAAAAAAAAA 2364 het 1937 hom 40 11 15 14 A 14 15 95890 CASAVA_Build 16 23375828 1D GACTCCACCC A/- AAAAAAAAAA 1355 het 198 hom 21 5 5 11 A 19 18 95891 CASAVA_Build 16 23386939 6D TTCTTTTTCT CTTCTC/------ CTTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 37 22 12 7 CTTCTC 1 0 95892 CASAVA_Build 16 23394774 4I AGAAAAAAAC ----/AAAG AAAAGCACTT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 AAAG 0 1 95893 CASAVA_Build 16 23397048 1D AAAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 680 het 680 ref 17 7 2 10 A 14 13 95894 CASAVA_Build 16 23405047 2D GGGATGGGAA AG/-- AGTCACTATT 3070 het 3070 hom 42 14 22 8 AG 2 1 95895 CASAVA_Build 16 23415862 10I GAAAGACTGC ----------/TTGAGGCTGA GGCTGCAGTG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTGAGGCTGA 0 1 95896 CASAVA_Build 16 23415933 1D CCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 19 0 12 7 A 12 11 95897 CASAVA_Build 16 23425716 1I GAGGCCAGGT -/C CCCCCTTTTT 3070 hom 103 het 37 0 33 4 C 5 6 95898 CASAVA_Build 16 23430141 2D CACCCAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 715 het 28 hom 6 1 2 3 T 14 12 95899 CASAVA_Build 16 23430798 10I GCATTGGTAT ----------/CAGCTGTCTA CAACTTAACA 3070 hom 105 het 38 0 35 5 CAGCTGTCTA 0 1 95900 CASAVA_Build 16 23431391 3I AACACACAGA ---/CTT CTTCTTGTGG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 CTT 2 3 95901 CASAVA_Build 16 23432103 1I CTTTGAACTC -/A AAAGACAGTG 3070 het 3070 ref 55 25 21 9 A 3 4 95902 CASAVA_Build 16 23434997 1D GCCCGGCCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 T 9 8 95903 CASAVA_Build 16 23435794 3D GTGGAGAGAG AGA/--- AGGACCCTGG 2537 het 2537 ref 38 19 9 11 AGA 1 0 95904 CASAVA_Build 16 23437542 1D GGTAACTGTT A/- AGAGTCTGGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 2 1 95905 CASAVA_Build 16 23442658 1D ATAATGAAAC T/- TAGAGATGTG 3070 hom 141 het 52 0 47 5 T 2 1 95906 CASAVA_Build 16 23442809 5D AAAATAAATC TCTGT/----- TGTTTAAACC 3070 het 3070 hom 47 16 27 7 TCTGT 1 0 95907 CASAVA_Build 16 23445795 1I ATTAATTATT -/A TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 A 0 1 95908 CASAVA_Build 16 23452875 1D GTTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2591 het 382 hom 27 5 10 12 A 17 16 95909 CASAVA_Build 16 23456919 1D CAGATATTCT A/- ATCGATACAT 3070 het 2500 hom 22 6 10 6 A 2 1 95910 CASAVA_Build 16 23458535 1D ATAATTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 12 11 95911 CASAVA_Build 16 23461764 4D TGGCGAAACC CTCT/---- CTCTATTAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 CT 4 2 95912 CASAVA_Build 16 23477606 1D CTTTTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 2332 het 1330 hom 23 5 8 10 T 15 14 95913 CASAVA_Build 16 23480646 1I TCAGTGGTGA -/T TTTTTTTTTT 1587 het 510 hom 29 5 8 16 T 17 18 95914 CASAVA_Build 16 23488544 1I GTCTTCCCCT -/C CCCCCATTAC 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 C 5 6 95915 CASAVA_Build 16 23489763 1I AAAAGCTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 T 8 9 95916 CASAVA_Build 16 23501487 3I TAGTATATTC ---/ACA ACATTGTGCA 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 ACA 1 2 95917 CASAVA_Build 16 23507102 1D CATGGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 2755 het 280 hom 13 1 9 3 C 4 3 95918 CASAVA_Build 16 23515652 4I ATTTCAATAC ----/CTAA CTAAGACTAA 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 CTAA 1 2 95919 CASAVA_Build 16 23516783 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2349 hom 20 7 11 3 A 12 11 95920 CASAVA_Build 16 23527686 2I AGTTTCGCTC --/TT GTTGCCCAGG 2501 het 982 hom 13 4 7 2 T 0 2 95921 CASAVA_Build 16 23536403 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1834 het 1834 ref 23 11 8 5 T 13 12 95922 CASAVA_Build 16 23562505 1I AGTAATACTT -/A ATAAAATTAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 1 2 95923 CASAVA_Build 16 23567680 4I TTAGTGATTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 TTTG 3 4 95924 CASAVA_Build 16 23568885 1I CCTATGTGTC -/T TTTTTGTAAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 5 6 95925 CASAVA_Build 16 23570969 5I CGTATGCAGT -----/TGAGA TGAGTAAGTT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 TGAGA 0 1 95926 CASAVA_Build 16 23577546 3I AGGTCTGTCC ---/TGT TGTTTGAAGC 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 TGT 1 2 95927 CASAVA_Build 16 23589608 1I ACTTCTAGAG -/C CCCCCCAGCA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 C 6 7 95928 CASAVA_Build 16 23590125 2D AACGGCAGTT TA/-- TTAGGCACTT 3070 het 3070 hom 38 15 15 9 TA 1 0 95929 CASAVA_Build 16 23607733 1I ACTCCCCAGC -/T TTTTTTTTTT 2097 het 2097 ref 22 10 8 4 T 11 12 95930 CASAVA_Build 16 23609576 13I TGCACCCAGC -------------/CTGGCGGTCTTTT CTGATTCTGA 3070 het 2753 hom 24 10 10 5 CTGGCGGTCTTTT 0 1 95931 CASAVA_Build 16 23612424 4I AAAAAAAAAA ----/ATAT ATATATATAT 2023 het 1241 hom 15 7 5 3 AT 7 9 95932 CASAVA_Build 16 23615836 1I CCATCTTTAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 2911 hom 17 6 10 1 A 8 9 95933 CASAVA_Build 16 23624296 2D CTTACAGTGT GA/-- GAGGGGTCAG 3070 hom 135 het 51 0 46 6 GA 2 1 95934 CASAVA_Build 16 23626375 1D GTCTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 2364 het 2364 ref 18 10 6 2 A 13 12 95935 CASAVA_Build 16 23632790 2I TGAGACAGAG --/TT TCGATCTTGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 1 3 95936 CASAVA_Build 16 23633035 13D TACAGGCATA AGCCACCGCGCCC/------------- AGCCAATAAA 3070 het 3070 hom 46 15 27 9 AGCCACCGCGCCC 1 0 95937 CASAVA_Build 16 23636261 4D GAAATCAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 43 22 12 10 AG 6 4 95938 CASAVA_Build 16 23636333 2I CTGAAAATAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 AC 7 8 95939 CASAVA_Build 16 23642416 1D TTATTTTATA T/- TTTATTTTTA 2850 het 2850 ref 18 9 6 3 T 4 3 95940 CASAVA_Build 16 23644894 2D TGCAGTGAGC TG/-- TGTTTGTGTT 2511 het 2153 hom 18 6 7 5 TG 2 1 95941 CASAVA_Build 16 23648007 3D TCCAAAAAAA TCT/--- TCTTTTCATT 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 TCT 2 1 95942 CASAVA_Build 16 23650511 2D TATGCCTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 153 hom 22 2 10 10 T 13 11 95943 CASAVA_Build 16 23652032 1D GGTGACAGGG C/- CAAGACTCCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 2 1 95944 CASAVA_Build 16 23653701 1D ATTTTCGTAT G/- TTTTTTTAGT 1826 het 1826 ref 26 15 6 5 G 1 0 95945 CASAVA_Build 16 23654082 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1126 het 1126 ref 44 29 3 12 GT 8 7 95946 CASAVA_Build 16 23660275 1I GTGCCACCAT -/G CCCGGCAGCA 3070 het 2692 hom 30 8 15 7 G 0 1 95947 CASAVA_Build 16 23661044 2D TCAAGTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 13 11 95948 CASAVA_Build 16 23665849 1I AGCTCAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 T 10 11 95949 CASAVA_Build 16 23672033 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 24 1 14 9 T 13 14 95950 CASAVA_Build 16 23675882 1I GAAAATTATT -/G GGGGGATATG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 G 5 6 95951 CASAVA_Build 16 23679543 3I CTTTTAACAT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 49 25 12 12 TTA 5 6 95952 CASAVA_Build 16 23688946 1I TATTTTCTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 T 8 9 95953 CASAVA_Build 16 23690478 2D TTTTGAATAT AA/-- GTTAGACTTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 2 0 95954 CASAVA_Build 16 23698719 3I ATCTGTAAAG ---/ATA ATAACAGTAC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 ATA 1 2 95955 CASAVA_Build 16 23699210 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2891 hom 21 7 13 1 A 10 9 95956 CASAVA_Build 16 23702541 2D AGCAAGACTC TG/-- TCTCAAAAAA 2285 het 2285 ref 15 9 6 1 TG 1 0 95957 CASAVA_Build 16 23704481 2D TTTTATTGAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 11 9 95958 CASAVA_Build 16 23714761 1D CACTAGGCCT C/- CATGGATACC 3070 het 3070 ref 25 9 10 6 C 2 1 95959 CASAVA_Build 16 23716969 59D CAGGAGTTCG AGACTAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTGGTA/----------------------------------------------------------- AGACGTGGTG 1958 het 1958 ref 17 13 6 2 AGACTAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTGGTA 1 0 95960 CASAVA_Build 16 23724956 1I TGAAGCTGGA -/T TTTTTTTTTT 1750 het 1730 hom 23 7 9 7 T 15 16 95961 CASAVA_Build 16 23726387 2D TTCTTCTTCT TC/-- TTTTTTTTTT 494 het 494 ref 40 29 2 9 TC 1 0 95962 CASAVA_Build 16 23727584 1D GAAAAAAAAA C/- CAGCCAGGTG 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 C 2 1 95963 CASAVA_Build 16 23730033 1D TATCTGTCTA T/- GAACCCTGTG 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 T 1 0 95964 CASAVA_Build 16 23733027 9I CTGTATCAAA ---------/ATACCCCAT ATACCCCATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATACCCCAT 1 2 95965 CASAVA_Build 16 23735511 2D TCTGCTGATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 29 4 19 7 T 12 10 95966 CASAVA_Build 16 23739617 1D TTTTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 69 het 69 ref 23 14 2 7 G 1 0 95967 CASAVA_Build 16 23744514 1D TGCTTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 31 1 23 7 T 11 10 95968 CASAVA_Build 16 23765097 1D TTGAATATTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 9 8 95969 CASAVA_Build 16 23773594 1D ATTTGTGATA T/- TTTTTGGAAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 6 5 95970 CASAVA_Build 16 23777142 6I ACTGTCTGTT ------/CCCAGA CACCAAGGTG 3070 hom 107 het 38 0 35 3 CCCAGA 0 1 95971 CASAVA_Build 16 23777365 2D CATCAAACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 34 1 17 17 T 12 10 95972 CASAVA_Build 16 23783556 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 2224 hom 33 9 18 6 T 8 7 95973 CASAVA_Build 16 23784867 4D ACACCTAAGT GAAA/---- GAAAGTAGGA 3070 hom 93 het 36 0 32 7 GAAA 2 1 95974 CASAVA_Build 16 23786815 2D ACATAAAACA GG/-- GGAGATCTGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 4 2 95975 CASAVA_Build 16 23788844 1I ACTCCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1265 hom 20 6 9 5 A 13 14 95976 CASAVA_Build 16 23795405 1I TTTCTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 A 11 12 95977 CASAVA_Build 16 23795552 3I AGAGTTGAAC ---/TAA TAATTTAAGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAA 1 2 95978 CASAVA_Build 16 23801573 2D TACAAATATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 34 1 15 19 T 18 16 95979 CASAVA_Build 16 23803768 27I GGTGCAGGGC ---------------------------/CTTTGGGATCAGACAAACCTGGATTTG ACTCCCAGGT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 CTTTGGGATCAGACAAACCTGGATTTG 0 1 95980 CASAVA_Build 16 23811055 1D AAAACTTACA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 81 het 33 0 26 8 T 8 7 95981 CASAVA_Build 16 23811789 4D TTAACAGGAT TGGA/---- TGGAAATCTG 3070 het 927 hom 34 5 17 15 TGGA 2 1 95982 CASAVA_Build 16 23819435 1I CTCACACATA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 342 hom 43 1 34 8 T 7 8 95983 CASAVA_Build 16 23821812 5D TTTTCTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 22 0 17 6 T 15 10 95984 CASAVA_Build 16 23823882 2D TTTTTTTAAT AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 14 hom 17 1 11 5 A 10 8 95985 CASAVA_Build 16 23824726 11D TCATACTCCT CTAAGGGTTTC/----------- CTAGCATTCC 3070 hom 137 het 50 0 46 7 CTAAGGGTTTC 1 0 95986 CASAVA_Build 16 23827515 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 11 10 95987 CASAVA_Build 16 23835757 1D GATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 11 10 95988 CASAVA_Build 16 23843005 1D GGTTTTATAA G/- GGGCTCCTCC 3070 hom 82 het 37 0 25 12 G 4 3 95989 CASAVA_Build 16 23845297 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTTTCAAA 2673 hom 20 het 9 0 7 2 CT 1 2 95990 CASAVA_Build 16 23846000 17D CAGGAAGGCT TCCAGGACTAAATGATA/----------------- TCAAAGTCCC 3070 hom 120 het 40 0 39 5 TCCAGGACTAAATGATA 1 0 95991 CASAVA_Build 16 23849390 1D GAACCTGTCT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 9 8 95992 CASAVA_Build 16 23851847 13I ATGAATGCTG -------------/TAGCAGATGCTAT TAGCAGATGC 3070 hom 96 het 43 0 31 13 TAGCAGATGCTAT 1 2 95993 CASAVA_Build 16 23878545 2I CTTTCCATAA --/CT CTGTGTTGAA 3070 hom 144 het 57 0 47 10 CT 1 2 95994 CASAVA_Build 16 23885835 1I GTGGTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 12 11 T 15 16 95995 CASAVA_Build 16 23919812 2D AATAAAGCGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 13 11 95996 CASAVA_Build 16 23924049 1D TTGCTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 A 11 10 95997 CASAVA_Build 16 23932604 1D GTGGAATTGC A/- AAAAAAAAAA 2876 het 2876 ref 49 31 9 9 A 15 14 95998 CASAVA_Build 16 23961206 7I GTCACACACA -------/GAATGGG GATAGGGCCC 3070 het 3070 hom 37 14 15 9 GAATGGG 0 1 95999 CASAVA_Build 16 23970975 2I GGATAGGCAT --/AG AGTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 7 13 1 AG 1 2 96000 CASAVA_Build 16 23977724 8D6M35D TCCCTGTAGG ATGGAGGAGATGAAACATACATGAATTAAGGAAGTGGAAGGATAAGAAT/--------GATCAA----------------------------------- AAATTGATGT 3070 het 3070 ref 44 37 22 5 N/A 0 0 96001 CASAVA_Build 16 24018700 4D TGGAGGCTGA CCAG/---- GAGAATTGCT 3070 hom 68 het 24 0 23 2 CCAG 1 0 96002 CASAVA_Build 16 24027106 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 7 96003 CASAVA_Build 16 24031651 10D AACATACTGA AAAACAAACC/---------- AAAACAAACC 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AAAACAAACC 2 1 96004 CASAVA_Build 16 24037951 1D ATCAGACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 26 1 14 11 T 13 12 96005 CASAVA_Build 16 24038423 5I AGGTGATGGG -----/GTGGT GCAGCAGGGA 3070 hom 116 het 44 0 33 11 GTGGT 0 1 96006 CASAVA_Build 16 24039560 1I GAGTCCATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 9 10 96007 CASAVA_Build 16 24041569 1D GGTGTGAGCC A/- CTGTGCCCAG 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 A 1 0 96008 CASAVA_Build 16 24044140 2D TATCATCTGG CC/-- CTTGTTCTCT 3070 het 3070 hom 46 18 20 9 C 3 1 96009 CASAVA_Build 16 24054919 1D TTGCAGCGTG T/- TTTTTTTTTT 1383 het 1383 ref 30 13 3 14 T 17 16 96010 CASAVA_Build 16 24114025 1I CCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1509 hom 25 5 16 4 A 13 14 96011 CASAVA_Build 16 24120858 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1479 het 336 hom 9 2 5 2 A 15 14 96012 CASAVA_Build 16 24135980 1D GGAAAGAAGG A/- AGGAAAAGAA 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 A 2 1 96013 CASAVA_Build 16 24138157 5I GTTTGTTGAC -----/TAGAT ACATGCTAAA 2374 het 2374 ref 28 16 5 7 TAGAT 0 1 96014 CASAVA_Build 16 24150706 1D GTTAAGCTAC A/- GACAAAACTG 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 A 1 0 96015 CASAVA_Build 16 24161350 1I AGCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 A 9 10 96016 CASAVA_Build 16 24169891 4I CTATGAAGAA ----/AAAC AAAGCAGAGT 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 AAAC 0 1 96017 CASAVA_Build 16 24184292 2I AGGAAGGAAG --/GA GAGAGAGAGA 2380 het 1836 hom 28 6 6 16 GA 7 8 96018 CASAVA_Build 16 24186910 2D TGATTTATTT GA/-- GAGATAGATA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 GA 3 2 96019 CASAVA_Build 16 24190683 1D GTTTGTGAGT C/- CCCCAAGGTG 3070 het 3070 ref 49 20 16 13 C 5 4 96020 CASAVA_Build 16 24190945 1D CTTTAACTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 10 9 96021 CASAVA_Build 16 24194017 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2867 hom 29 8 12 9 A 11 10 96022 CASAVA_Build 16 24215359 1D AGGAAGGTCT G/- GGCTTGCTGG 3070 het 2660 hom 25 8 12 6 G 3 2 96023 CASAVA_Build 16 24230331 1D ACTACATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2677 hom 28 9 13 6 A 13 12 96024 CASAVA_Build 16 24255386 1D CGTGAGCCAC T/- GTGCCCAGCC 3070 het 2799 hom 24 10 11 3 T 1 0 96025 CASAVA_Build 16 24260195 1I ATTGCTTCTT -/A AAAATCTCAC 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 4 5 96026 CASAVA_Build 16 24265500 1I GACCCAGGCT -/G GGCCCCCAGA 3070 hom 77 het 29 0 25 4 G 2 3 96027 CASAVA_Build 16 24271353 8D TTTGTTGTTG TTGTTTGT/-------- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 8 TTGT 6 4 96028 CASAVA_Build 16 24274202 1I TCGAGACCAG -/C CTGGGCAGCA 3070 hom 129 het 46 0 43 4 C 1 2 96029 CASAVA_Build 16 24287467 1I GAAGGCAGGA -/C CCTGTCCTTG 3070 het 14 hom 54 1 48 5 C 2 3 96030 CASAVA_Build 16 24287610 2I TCTAAGAGAC --/TT TTAACTAAGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 2 4 96031 CASAVA_Build 16 24308545 1I GCCATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1932 het 1931 ref 29 8 8 13 T 15 16 96032 CASAVA_Build 16 24310968 5D CTCCCTACAC TGTGT/----- CCAGCTCTTC 3070 het 3070 ref 54 36 14 8 TGTGT 1 0 96033 CASAVA_Build 16 24312377 1D GGCAGCAGCT A/- ATGAAGACCC 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 A 2 1 96034 CASAVA_Build 16 24315722 1D GGCTGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 12 21 12 T 13 12 96035 CASAVA_Build 16 24316874 3D CTGTTCTACT CAA/--- CAATACAAAG 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 CAA 2 1 96036 CASAVA_Build 16 24317921 1D TCCAAAAACG A/- AAATTAAGAA 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 A 4 3 96037 CASAVA_Build 16 24321922 4D GCAACTGGAA CTCT/---- CTCTCATACG 3070 het 3070 ref 51 28 17 10 CT 4 2 96038 CASAVA_Build 16 24323152 1D AAAGCCAAGG A/- GACAAAAGAT 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 A 1 0 96039 CASAVA_Build 16 24338427 1D TATATTATCA T/- TTTTTAAACA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 6 5 96040 CASAVA_Build 16 24339506 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 A 11 12 96041 CASAVA_Build 16 24339718 3I TCTCCATCCT ---/GAA GAACATAGCA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 GAA 1 2 96042 CASAVA_Build 16 24356543 1I AAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2016 hom 35 5 22 8 A 14 15 96043 CASAVA_Build 16 24362859 12D GGAAACTTAG AGCTGGTTGGTT/------------ AGAAGTACTG 3070 hom 87 het 31 0 30 4 AGCTGGTTGGTT 1 0 96044 CASAVA_Build 16 24363791 2D TAAAAATACC AA/-- AAAAAAAAAA 971 het 7 hom 13 0 3 10 A 18 16 96045 CASAVA_Build 16 24365992 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2255 het 85 hom 21 3 12 6 T 17 16 96046 CASAVA_Build 16 24370333 1D GATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1515 het 1515 ref 47 24 4 19 T 13 12 96047 CASAVA_Build 16 24372467 5I AGAAAGAAAA -----/GAAAG GAAAAGAAAG 3070 het 1156 hom 26 10 11 5 GAAAG 0 1 96048 CASAVA_Build 16 24377462 1D AATAATGAGA T/- TTTTTTTTTT 1577 het 1199 hom 32 6 8 18 T 19 18 96049 CASAVA_Build 16 24396473 1I TCTTCCCAGA -/T TGCCCCACAG 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 T 1 2 96050 CASAVA_Build 16 24407099 1I TATCATAGAT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 33 2 20 11 G 0 1 96051 CASAVA_Build 16 24407950 1I TATTGGATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 16 18 4 T 9 10 96052 CASAVA_Build 16 24413517 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3025 het 41 hom 15 1 9 5 A 13 12 96053 CASAVA_Build 16 24418884 1D TCTCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 10 8 A 13 12 96054 CASAVA_Build 16 24420990 1I GTTCCACTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 9 10 96055 CASAVA_Build 16 24425451 1I CCTGAGATAA -/T TTTTTTTTTT 1590 het 1590 ref 28 15 6 7 T 13 14 96056 CASAVA_Build 16 24427210 1D CATCAGATTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 9 8 96057 CASAVA_Build 16 24429374 1D CTCTTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 11 10 96058 CASAVA_Build 16 24439590 1I TGTCTCACTC -/T GTTGACCAGA 3070 het 3070 ref 28 12 12 5 T 0 1 96059 CASAVA_Build 16 24441644 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2753 het 1306 hom 25 7 10 8 A 12 13 96060 CASAVA_Build 16 24443926 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2883 hom 30 10 14 6 A 10 11 96061 CASAVA_Build 16 24446049 1I GTGGAGGGGG -/A GGAGAGAAGG 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 0 1 96062 CASAVA_Build 16 24449341 2I TCTTCTTTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 12 14 96063 CASAVA_Build 16 24450113 1D CTATTTGGAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 A 9 8 96064 CASAVA_Build 16 24456103 1I AATATTGGTA -/G GGGAGAGAAG 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 G 3 4 96065 CASAVA_Build 16 24465121 1I CAAAATAGAC -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 7 8 96066 CASAVA_Build 16 24466856 1D CAAAGCTCAG T/- TTTTTTTTTA 1752 het 1752 ref 29 16 4 9 T 10 9 96067 CASAVA_Build 16 24472381 2D CTTACAAAGG TA/-- TATATATATA 3070 het 2233 hom 26 6 15 6 TA 8 7 96068 CASAVA_Build 16 24473127 1D TTGTGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 9 A 11 10 96069 CASAVA_Build 16 24476532 1D ATTTACAGAA T/- TAGGTGTTCA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 2 1 96070 CASAVA_Build 16 24479867 1D TTAATCTTCG T/- ATCTGTAATT 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 T 1 0 96071 CASAVA_Build 16 24480386 2D TCGTAAACAC TT/-- TGAGTTCCTA 3070 het 3070 hom 37 13 24 1 T 3 1 96072 CASAVA_Build 16 24482147 1D TAATTTGGGA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 38 20 9 10 T 8 7 96073 CASAVA_Build 16 24491214 6D GAACAAAGAT AAAGAG/------ AAGGAGAAGG 3070 het 3070 hom 33 16 16 3 AAAGAG 1 0 96074 CASAVA_Build 16 24501467 1I ATCCATCTCG -/A AAAAAAAAAA 1585 het 415 hom 15 3 4 8 A 13 14 96075 CASAVA_Build 16 24507821 4D ATTTATTTAT TTAC/---- TTACTTACTT 2685 het 2685 ref 20 11 7 4 TTAC 5 4 96076 CASAVA_Build 16 24509835 3D TATATATATA GTT/--- GTTGTTTGTT 2038 het 2038 ref 15 7 6 2 GTT 3 2 96077 CASAVA_Build 16 24510263 2I TCTTCTAGTC --/TG TGGCTTGTTT 2692 het 2692 ref 30 20 7 3 TG 1 2 96078 CASAVA_Build 16 24517017 1D TTAGCTGTAT A/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 A 1 0 96079 CASAVA_Build 16 24525127 1I CTACAAAAAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 6 7 96080 CASAVA_Build 16 24525777 1D GCCCTTTAAA G/- TCCAGCATTC 3070 hom 72 het 25 0 25 1 G 1 0 96081 CASAVA_Build 16 24544955 1D ACACATTCAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 T 9 8 96082 CASAVA_Build 16 24547657 1D GTCCACTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 T 10 9 96083 CASAVA_Build 16 24550594 1D ATTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2956 hom 20 8 9 3 A 12 11 96084 CASAVA_Build 16 24552609 1D TTTATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1992 het 1992 ref 21 10 6 5 T 13 12 96085 CASAVA_Build 16 24557533 1D AGGTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2290 hom 26 8 13 5 A 11 10 96086 CASAVA_Build 16 24565841 1I GTTTTGACCT -/C CCTGGGCTCA 3070 hom 62 het 24 0 20 4 C 2 3 96087 CASAVA_Build 16 24591604 3I AAGTATTTAG ---/AGA AGAAGTGTCA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 AGA 1 2 96088 CASAVA_Build 16 24596718 1D GATGATCTTT G/- TTTTGGTAGG 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 G 1 0 96089 CASAVA_Build 16 24601949 1D ATACTGGAAG C/- CCCCAAAACA 3070 het 2245 hom 19 6 8 5 C 5 4 96090 CASAVA_Build 16 24612720 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 100 het 38 0 32 6 A 9 8 96091 CASAVA_Build 16 24618773 1D TAGCAGAGAC A/- GGCTTTAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 1 0 96092 CASAVA_Build 16 24620408 1I AGGCTAGTCT -/G GAACTCCTGA 3070 het 2376 hom 18 6 10 2 G 1 2 96093 CASAVA_Build 16 24629048 2D ACTTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1377 hom 19 7 10 2 A 16 14 96094 CASAVA_Build 16 24630495 1I GTTCCTTTTT -/A ATTGCTGAGT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 1 2 96095 CASAVA_Build 16 24631392 1D ATAAGAAAAA T/- GTTTCATATT 3070 het 3070 ref 59 37 18 4 T 1 0 96096 CASAVA_Build 16 24649319 1D TTCTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1146 het 743 hom 19 6 5 8 A 17 16 96097 CASAVA_Build 16 24649800 1I GAAGGGAGAA -/T TTTTTTTTTT 1830 het 1830 ref 26 11 6 9 T 15 16 96098 CASAVA_Build 16 24662393 1D GCAATCTGCC T/- TGGCCTCCCA 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 T 2 1 96099 CASAVA_Build 16 24665902 7I GTTGTGTGGA -------/ATGTACC ATCCTAATCT 3070 het 3070 ref 55 24 22 9 ATGTACC 0 1 96100 CASAVA_Build 16 24669684 1I ACATAGAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 9 10 96101 CASAVA_Build 16 24676119 1I AATATTAGGG -/T AGTTACTATA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 0 1 96102 CASAVA_Build 16 24682970 1D TATTTGACTG T/- TTTTTTTTTT 1675 het 1675 ref 47 36 4 7 T 12 11 96103 CASAVA_Build 16 24699580 1D TTTGAAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2381 hom 29 6 18 5 T 12 11 96104 CASAVA_Build 16 24705116 2D TCCTTTTTTG TT/-- TTTTTTTGTT 2937 het 2855 hom 20 8 7 5 T 9 7 96105 CASAVA_Build 16 24715564 8D ATGGGAAGGG GTAATGAA/-------- GTAATGAAGG 3070 het 3070 ref 55 29 23 4 GTAATGAA 2 1 96106 CASAVA_Build 16 24720792 2D GAGAGAGAAC AG/-- AGGAGGGAGC 3070 het 3070 hom 36 13 16 9 AG 2 1 96107 CASAVA_Build 16 24729822 2D CAGACCCCTC AG/-- AGGTCAGACA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 AG 2 1 96108 CASAVA_Build 16 24745340 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1823 het 1823 ref 22 10 5 7 T 13 14 96109 CASAVA_Build 16 24750200 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1826 hom 15 het 20 0 9 11 T 19 18 96110 CASAVA_Build 16 24756665 1I16M1I AAAACGAAAC -AAAAAAAACAAAAAAC-/AAAAAAAAACAAAAAACA AAAAAAAAAA 2591 het 607 hom 28 6 14 14 N/A 0 0 96111 CASAVA_Build 16 24759437 1I GAAGTGGGCT -/G GGCACAGTGG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 2 3 96112 CASAVA_Build 16 24769635 1D AGTTTATTCG T/- TTTTTTTTTT 1325 het 1325 ref 29 18 3 8 T 12 11 96113 CASAVA_Build 16 24778442 1I AAATTTTAAT -/A TGCATATTTC 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 A 0 1 96114 CASAVA_Build 16 24779335 15I CTATAAGATA ---------------/AATTCCCTGCAGCAG AATTCCCTGC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AATTCCCTGCAGCAG 1 2 96115 CASAVA_Build 16 24780413 4D GAGAAAGAGA AAGG/---- AAGGAAGGAA 1570 het 1570 ref 20 7 5 8 AAGG 4 3 96116 CASAVA_Build 16 24785398 1D GATCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2478 hom 33 12 12 9 A 15 14 96117 CASAVA_Build 16 24790090 1D TGCTTGTTTG T/- TTTGTTTTGT 966 het 966 ref 28 13 5 10 T 4 3 96118 CASAVA_Build 16 24791510 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2562 hom 27 8 14 5 T 10 11 96119 CASAVA_Build 16 24791798 2D TGTCTCTACT AA/-- AAAAATACAA 2316 het 418 hom 6 1 5 0 A 7 5 96120 CASAVA_Build 16 24794229 3I TGGTCTCAAA ---/CTT CTGCACTCAA 3070 hom 81 het 28 0 27 1 CTT 0 1 96121 CASAVA_Build 16 24802080 1D CTAGCTACTT G/- GGGGACTGAG 3070 hom 77 het 29 0 25 4 G 5 4 96122 CASAVA_Build 16 24814456 1D GGGACCCCTC A/- GTTGGACAGC 2924 hom 26 het 10 0 9 1 A 1 0 96123 CASAVA_Build 16 24891760 1D TCAGGGATAA T/- TTTTTTTTTT 2802 het 2802 ref 34 14 12 8 T 15 14 96124 CASAVA_Build 16 24896386 2I TGGAAAAAAC --/CA CAGAGATGCC 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 CA 1 2 96125 CASAVA_Build 16 24897638 1I AACAAAACTG -/A TTTTCTTTCC 2836 het 2836 ref 26 12 7 7 A 0 1 96126 CASAVA_Build 16 24897689 1D GTTTCTGGTT A/- AAAAAAAAAA 1162 het 1151 hom 23 11 7 5 A 19 18 96127 CASAVA_Build 16 24900918 1I CAGGCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 2834 het 2649 hom 23 7 10 6 T 12 13 96128 CASAVA_Build 16 24904011 4D AATGCAACCC CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 50 22 16 14 CA 9 7 96129 CASAVA_Build 16 24922645 1D AATCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 13 8 5 A 13 12 96130 CASAVA_Build 16 24924533 1I ACATACAGAG -/T AAAACTCATA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 0 1 96131 CASAVA_Build 16 24930521 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2326 het 1789 hom 34 9 8 17 A 15 14 96132 CASAVA_Build 16 24936539 1D TTACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 30 1 18 11 A 13 12 96133 CASAVA_Build 16 24936763 1D GAGAAAGCAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 7 6 96134 CASAVA_Build 16 24936896 1I TCCATGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 357 hom 24 1 22 1 A 9 10 96135 CASAVA_Build 16 24940814 1D TCTCTACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2700 hom 22 8 11 3 A 15 14 96136 CASAVA_Build 16 24942143 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2363 hom 16 5 8 3 A 10 9 96137 CASAVA_Build 16 24942352 1D TTGTTTGTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 G 2 1 96138 CASAVA_Build 16 24942802 12D ATATATATAT ACACACACACAC/------------ ACATACATAT 1449 het 1449 ref 8 4 3 4 AC 7 1 96139 CASAVA_Build 16 24944226 1D CTTTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2554 hom 26 9 12 5 T 13 12 96140 CASAVA_Build 16 24944877 1D TCAACATGTC T/- TAAGAAGAAG 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 2 1 96141 CASAVA_Build 16 24946006 1I AGCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 1538 hom 23 5 16 2 T 6 7 96142 CASAVA_Build 16 24948366 3D TTCCTCTTCC TCT/--- TCTTCTTCTT 2653 het 2160 hom 29 7 9 13 TCT 7 6 96143 CASAVA_Build 16 24949333 1D ATTTTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 16 8 A 12 11 96144 CASAVA_Build 16 24949547 1D CAGGAAACTT A/- ACAGTTATGG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 2 1 96145 CASAVA_Build 16 24951958 3D TCTGTGTCAA AAC/--- AACAACAACA 2521 het 2521 ref 22 14 6 4 AAC 6 5 96146 CASAVA_Build 16 24960986 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 13 12 96147 CASAVA_Build 16 24966321 2D CTAGAATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2123 hom 38 7 15 16 A 16 14 96148 CASAVA_Build 16 24966850 2I TGTGAGCCAC --/TG TGCCCAGCCA 3070 hom 99 het 36 0 32 4 TG 1 2 96149 CASAVA_Build 16 24970094 10D AAAAAAAAAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAG 2899 het 1149 hom 26 4 14 13 AAAAG 5 3 96150 CASAVA_Build 16 24973823 1I AGGGGCACTA -/G GAGGTGGGAG 2480 hom 22 het 9 0 7 2 G 1 2 96151 CASAVA_Build 16 24975266 4D ATTCCATTTC TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 TTCT 3 2 96152 CASAVA_Build 16 24976645 3I AATGGGCGGT ---/ACA ACGTGAACAT 3070 hom 138 het 51 0 44 7 ACA 0 1 96153 CASAVA_Build 16 24977153 1I TTGTTCCTTC -/A TGATGTTTGG 3070 hom 60 het 26 0 20 9 A 0 1 96154 CASAVA_Build 16 24977309 1D TGCAAAGAGC A/- AAAAGAACAA 3070 hom 42 het 15 0 14 2 A 5 4 96155 CASAVA_Build 16 24977431 1D GTAGAGCCTA G/- GGGTCTGTTT 3070 hom 32 het 13 0 10 5 G 4 3 96156 CASAVA_Build 16 24977562 1I CTGAGCTAGA -/C CCAGGGTGCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 2 3 96157 CASAVA_Build 16 24978875 1I TCCAGCTGTG -/C GCAAAACTGC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 0 1 96158 CASAVA_Build 16 24983542 1D AATTTATATA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 87 het 35 0 28 7 T 8 7 96159 CASAVA_Build 16 24984891 1D TTCCCAGGCT C/- CCACCTGGGG 2616 het 2616 ref 33 14 11 8 C 3 2 96160 CASAVA_Build 16 24985289 2I TCCCAGCACT --/GG GAAGATTTGC 3070 hom 80 het 31 0 25 6 G 1 3 96161 CASAVA_Build 16 24989480 3D TCTGAAGATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 6 T 14 11 96162 CASAVA_Build 16 24990679 12D TCGCTGCCGG TCCTGCAGCCGA/------------ TCCTGCAATG 3070 het 3070 hom 48 23 21 10 TCCTGCAGCCGA 1 0 96163 CASAVA_Build 16 25003315 2I GGAATTTCCA --/TG CAAAGGAGTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TG 0 1 96164 CASAVA_Build 16 25003408 4I TGTTATTCAC ----/TATT TATTAAAATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TATT 1 2 96165 CASAVA_Build 16 25003541 1D ATGTTGAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 408 hom 31 1 22 8 A 10 9 96166 CASAVA_Build 16 25013869 1I TCGTTGAGAG -/A AAAATCTCAC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 4 5 96167 CASAVA_Build 16 25041121 3D TCCTCTCTCC TGA/--- TGATGATGAT 3070 hom 75 het 34 0 26 9 TGA 6 5 96168 CASAVA_Build 16 25045318 1I GGCCTCCCCC -/T GTGACCGTCT 1388 het 1388 ref 41 21 4 16 T 0 1 96169 CASAVA_Build 16 25046704 5D TAATTCCTTG TAGTA/----- TAGACTGGCT 3070 hom 120 het 44 0 39 6 TAGTA 1 0 96170 CASAVA_Build 16 25056564 1I CTGTACTTGG -/C CGTCCTTTTT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 C 1 2 96171 CASAVA_Build 16 25058900 2I TCCTTAAACA --/CT CTATTGCTCT 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 CT 1 2 96172 CASAVA_Build 16 25069053 4D ACTGAGGCTT AAAG/---- AAGTTAATTT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 AAAG 1 0 96173 CASAVA_Build 16 25072412 1D TTTCCAACAC A/- ACGAACTTCG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 2 1 96174 CASAVA_Build 16 25079138 2I48M3D CCTATCAATC --TGGTTTAGCACGCCACCCAGTTGATTCTGATGACCACTGAAGCCTGAGAAT/TGTGGTTTAGCACGCCACCCAGTTGATTCTGATGACCACTGAAGCCTGAG--- AATCACTATA 3070 hom 54 het 24 0 19 14 N/A 0 0 96175 CASAVA_Build 16 25081703 4I TTTGGAACTT ----/TTTG TTTGTTTGGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TTTG 2 3 96176 CASAVA_Build 16 25083931 2I GTTTGGGGAC --/TG TGGTGAAACG 3070 hom 114 het 42 0 36 6 TG 1 2 96177 CASAVA_Build 16 25089176 1I TAGTGAACTT -/C CCCCCCATTA 3070 het 3070 hom 31 10 20 1 C 6 7 96178 CASAVA_Build 16 25092149 1D CATCCTGGAG C/- CTTCAGTATG 3070 het 3070 hom 58 20 35 3 C 2 1 96179 CASAVA_Build 16 25095966 7I GGCACCACTG -------/TACTCCA TACTCCAGCC 3070 het 579 hom 15 3 9 3 TACTCCA 1 2 96180 CASAVA_Build 16 25101630 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 11 5 A 14 12 96181 CASAVA_Build 16 25103765 2D ATAAATAGTC TT/-- TATTATATTG 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 T 3 1 96182 CASAVA_Build 16 25110840 4D TACAACAGAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 73 het 26 0 25 1 AAAC 4 3 96183 CASAVA_Build 16 25117341 1I CTTAAGAAAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 8 9 96184 CASAVA_Build 16 25118398 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2675 het 2266 hom 29 10 8 13 A 12 11 96185 CASAVA_Build 16 25123998 1I GAGGTCAGGA -/G AATGAGATCA 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 G 0 1 96186 CASAVA_Build 16 25142371 1D AAAAAATTTT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 24 14 9 3 A 8 7 96187 CASAVA_Build 16 25154080 5D TGGGTCTTCA TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 het 1494 hom 20 7 13 0 TTTCT 3 2 96188 CASAVA_Build 16 25158086 1D ACTTCTTGAC A/- AAAAAAAAAA 2146 het 1506 hom 31 11 5 15 A 15 14 96189 CASAVA_Build 16 25176850 16D GGAGGGTCCT CCCCGGGGCGGAGGGA/---------------- CACAGAGGGA 2523 het 1083 hom 10 4 7 1 CCCCGGGGCGGAGGGA 1 0 96190 CASAVA_Build 16 25180783 2D GTAAGACAAT AG/-- GGGATGGTGG 3070 het 3070 ref 36 22 8 9 AG 1 0 96191 CASAVA_Build 16 25182852 3D TAGCTTCAAT ATC/--- ATCATAAGCT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 ATC 2 1 96192 CASAVA_Build 16 25183846 6I TCATTTTTTC ------/CTTTTT CTTTTTCTTT 3070 het 1414 hom 26 8 11 7 CTTTTT 2 3 96193 CASAVA_Build 16 25186261 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 19 het 21 0 13 8 A 9 10 96194 CASAVA_Build 16 25189736 3I TGGGGCTGAA ---/AGC AGCGCTGCCA 3070 hom 123 het 43 0 40 3 AGC 1 2 96195 CASAVA_Build 16 25190097 2I TACAGTGAGC --/TA TGATTGCACC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TA 0 1 96196 CASAVA_Build 16 25191426 2D AAAAAGAAAA AG/-- AAAAAGTGTG 927 het 670 hom 27 11 9 9 AG 1 0 96197 CASAVA_Build 16 25191596 4D ATGTAGTCTC AGTT/---- AGTTCCTTAT 3070 het 3070 hom 52 25 22 6 AGTT 2 1 96198 CASAVA_Build 16 25193532 1D CCAAAGTGGG T/- TGGAAGGTTC 2745 hom 29 het 23 0 10 14 T 2 1 96199 CASAVA_Build 16 25196090 1D TCCCAAAGTG C/- TGGTATCACA 3070 het 1877 hom 18 5 10 3 C 1 0 96200 CASAVA_Build 16 25196563 1I CTTAGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 A 13 14 96201 CASAVA_Build 16 25198800 1D CCCACAACTC T/- TAGATGATGG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 2 1 96202 CASAVA_Build 16 25199233 4D ACATTTTTTT TCTC/---- TCTCTCTATT 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 TC 5 3 96203 CASAVA_Build 16 25199565 1D AGGGAGTTGG A/- AAAAAATGGG 3070 hom 81 het 41 0 32 10 A 7 6 96204 CASAVA_Build 16 25199990 1I GGGAGTGAGG -/A GTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 0 1 96205 CASAVA_Build 16 25200271 1I TGTGTGTATA -/T TTTTTAAATG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 5 6 96206 CASAVA_Build 16 25200459 1I AAAACTTGGT -/A AAAAAAAAAA 1709 het 1320 hom 26 8 12 6 A 13 14 96207 CASAVA_Build 16 25203146 1I CGAGAAAGGA -/C CCCTTTATTC 3070 hom 91 het 38 0 29 9 C 3 4 96208 CASAVA_Build 16 25204408 4I CAAGTGGGAG ----/ATAA ATAAATATGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATAA 1 2 96209 CASAVA_Build 16 25204557 3I AGTAAGTGTA ---/TAT TTTTTTTTTT 1035 hom 21 het 22 0 7 15 TAT 0 1 96210 CASAVA_Build 16 25204613 1D GGCTATACCA T/- TTTTACACTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 5 4 96211 CASAVA_Build 16 25205500 1I CAGAGTACTT -/A AAAAATTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 5 6 96212 CASAVA_Build 16 25206402 9D14M1D ATTGTTTCAT CTTTTGAGCAATTATAAAAGGCAT/---------AAAAATATGTTACA- TATATTTTTA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 N/A 0 0 96213 CASAVA_Build 16 25208594 1I TTTAAAAAAA -/T TTTTTTATAG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 T 6 7 96214 CASAVA_Build 16 25210131 2I TGAAAGGACT --/GA TGATCTATTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GA 0 1 96215 CASAVA_Build 16 25214433 1I AATGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 A 11 12 96216 CASAVA_Build 16 25253761 3I ACTCCATCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 8 A 10 13 96217 CASAVA_Build 16 25254147 1D TTTCTGTGAT A/- GGGGCCATTA 3070 het 3070 ref 58 28 22 8 A 1 0 96218 CASAVA_Build 16 25256960 1D AAACAAAAAA C/- AATGCAGTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 C 1 0 96219 CASAVA_Build 16 25258825 3I CATTACCCAG ---/GTT GTGAACATAA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 GTT 0 1 96220 CASAVA_Build 16 25260955 1I CAGTTTCTAG -/A AAAAAAAAAA 2429 het 1246 hom 20 6 8 6 A 13 14 96221 CASAVA_Build 16 25262328 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 14 0 11 3 T 13 14 96222 CASAVA_Build 16 25273945 13I GGAGTTCAAG -------------/ACCAGCCTGGCCA GCTGGATGAA 3070 hom 45 het 15 0 16 2 ACCAGCCTGGCCA 0 1 96223 CASAVA_Build 16 25285898 2D TCCATGGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 222 hom 39 2 12 25 A 18 16 96224 CASAVA_Build 16 25311332 4I GAAAGGAAGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 3070 hom 47 het 23 0 16 7 AAGG 3 4 96225 CASAVA_Build 16 25314951 5D AAAGTTTCCC CTTTA/----- CTTTACTTGC 3070 het 3070 hom 49 19 28 6 CTTTA 2 1 96226 CASAVA_Build 16 25315611 1D TGATGGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 984 hom 14 4 8 2 A 15 14 96227 CASAVA_Build 16 25321518 2D GAAAATCGTC AT/-- ATATTTATGT 3070 het 3070 ref 45 26 18 2 AT 3 2 96228 CASAVA_Build 16 25325866 1I AAAATATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 T 10 11 96229 CASAVA_Build 16 25333860 1I GGAAACGGAC -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 A 7 8 96230 CASAVA_Build 16 25338953 3D TTCAGTTCTT CAC/--- CACCACAGCG 3070 het 3070 hom 51 21 23 8 CAC 3 2 96231 CASAVA_Build 16 25342407 10D CCTGTTGGTA TCTAAGTAAG/---------- TCTGCTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 25 4 TCTAAGTAAG 1 0 96232 CASAVA_Build 16 25343116 1D AAGTGTACAA T/- TAGCAATTAA 3070 het 3070 ref 48 23 14 13 T 2 1 96233 CASAVA_Build 16 25343510 1I GCATGGGAAA -/T TTTTTTTTTT 2457 het 2457 ref 25 11 9 5 T 13 14 96234 CASAVA_Build 16 25345208 1I GGGGTCTGGT -/A ATGACATCTA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 1 2 96235 CASAVA_Build 16 25349326 1D TGGACATTGC T/- TTTTGGCTAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 5 4 96236 CASAVA_Build 16 25349819 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 11 10 96237 CASAVA_Build 16 25354572 28D TCCTGAGCTC AAGTGACCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAA/---------------------------- GGTTCTGGGA 2598 het 2598 ref 14 11 6 2 AAGTGACCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAA 1 0 96238 CASAVA_Build 16 25358275 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 9 10 96239 CASAVA_Build 16 25358625 2D81M4D TGTTTTTGTG TTTTTTTTTTTTGTTGTTTTGGTGGCAAAGTTTCTAACTATAATTACACTTTCGTTCATAGATTTAGGGCTATTAAAATTGTCTATT/--GTTTTTTTTTGTTGTTTTGGTGGCAAAGTTTCTAACTATAATTACACTTTCGTTCATAGATTTAGGGCTATTAAAATTGTC---- TATTCTTAAG 3070 hom 114 het 39 0 39 22 N/A 0 0 96240 CASAVA_Build 16 25359071 1D TAGCTTTTTG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 8 T 8 7 96241 CASAVA_Build 16 25364779 1I TCAGAGATAT -/G GGGTCTTGCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 3 4 96242 CASAVA_Build 16 25380380 10D ATCTTAAAAC AAAACAAAAG/---------- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 AAAACAAAAG 1 0 96243 CASAVA_Build 16 25382913 1D TGCTCCAGTG A/- AAAACCTAAT 3070 het 3070 hom 56 21 29 8 A 5 4 96244 CASAVA_Build 16 25385855 1D TAGAGATTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 8 96245 CASAVA_Build 16 25390407 1I TCATCTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 10 11 96246 CASAVA_Build 16 25393173 1D AAAGGAAAGA G/- GTTTAATTGA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 G 2 1 96247 CASAVA_Build 16 25395714 1D ACCTTGGCCT C/- CCCAAGGTGC 3070 het 3070 hom 32 15 16 2 C 4 3 96248 CASAVA_Build 16 25397129 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 582 hom 21 3 8 12 A 15 14 96249 CASAVA_Build 16 25403141 1I CTTGAATTGA -/T TTTTTTATGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 6 7 96250 CASAVA_Build 16 25415474 2D TTTTTTTTTT TA/-- AATAAGTTTC 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 TA 1 0 96251 CASAVA_Build 16 25415586 1I AAGTAAGAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 T 9 10 96252 CASAVA_Build 16 25416963 1I TTAGCAAGGG -/T TTACACCTAA 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 T 2 3 96253 CASAVA_Build 16 25417078 2I GAATCTGCTC --/TT GTCACCCTCC 3070 het 3070 ref 61 32 26 3 T 0 2 96254 CASAVA_Build 16 25418641 2D GCTAAGAGAC TT/-- TTTAGCATCC 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 T 5 3 96255 CASAVA_Build 16 25418942 1I TTTTATAGGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 8 9 96256 CASAVA_Build 16 25420160 1I AAAGGGGCAG -/C TGGGGGGGTA 2492 het 2492 ref 22 8 10 4 C 0 1 96257 CASAVA_Build 16 25433408 1I CCTCAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 9 10 96258 CASAVA_Build 16 25433597 1I GAGAATGAAT -/G GGTGATTTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 2 3 96259 CASAVA_Build 16 25437690 2D TTTCAGAATC CT/-- CTGTGTATCC 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 CT 2 1 96260 CASAVA_Build 16 25438369 2I ACACCTCCAC --/AG AGAGTTAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AG 2 3 96261 CASAVA_Build 16 25438957 1D TTCATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2905 het 44 hom 29 2 10 17 T 13 12 96262 CASAVA_Build 16 25441393 5D GGCGGGGACC TGTAA/----- TCCCAGCTAG 2499 het 2499 ref 28 16 8 4 TGTAA 1 0 96263 CASAVA_Build 16 25442015 3I2M2I8M7I GAGGTGGTTA ---CC--TCTGTTAC-------/AAGCCAGTCTAATTCCTGGGCT CAAGCAGTAA 3070 hom 129 het 41 0 43 4 N/A 0 0 96264 CASAVA_Build 16 25442618 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 870 hom 18 3 9 7 A 13 12 96265 CASAVA_Build 16 25442961 1I CCATCAACTC -/A AAACATTTAT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 3 4 96266 CASAVA_Build 16 25444292 1D AGTTCAACCT C/- TTACATTTAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 7 C 1 0 96267 CASAVA_Build 16 25445519 1D CATTGCCATG T/- TTGCATTAAT 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 T 3 2 96268 CASAVA_Build 16 25446066 1I GAGGAATCAA -/C CCCCCATAGC 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 C 5 6 96269 CASAVA_Build 16 25454348 2D AGAGAGAAGT GA/-- GAGAGAAAGA 3070 het 3070 hom 45 16 26 6 GA 4 3 96270 CASAVA_Build 16 25491347 1I TAAAAAAGAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 8 9 96271 CASAVA_Build 16 25499779 1D GATGCAGTGG A/- AAAGACAATT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 4 3 96272 CASAVA_Build 16 25505019 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 2193 het 408 hom 9 1 7 2 T 9 10 96273 CASAVA_Build 16 25510676 2I TTATATACAG --/TA TATATATATA 2253 hom 12 het 10 0 5 5 TA 6 7 96274 CASAVA_Build 16 25512182 1I GCAGTATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 10 11 96275 CASAVA_Build 16 25514020 1I CCACATTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 T 9 10 96276 CASAVA_Build 16 25541343 5D CCTCAGTATC TCCTT/----- TCCAGGCTAT 3070 het 3070 ref 43 25 17 2 TCCTT 1 0 96277 CASAVA_Build 16 25542902 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2144 hom 22 7 11 4 A 13 12 96278 CASAVA_Build 16 25550777 1D GCTTTTTGTG T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 47 23 13 12 T 7 6 96279 CASAVA_Build 16 25559329 1D CAGTGCAGAC T/- TTCGTTCAGG 3070 hom 167 het 61 0 53 8 T 3 2 96280 CASAVA_Build 16 25569989 1D17M1D TACCGGACCA CCCTTATTTAAATTGCAGC/-CCTTATTTAAATTGCAG- CCTGCCTACC 3070 hom 108 het 39 0 33 8 N/A 0 0 96281 CASAVA_Build 16 25578059 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 34 1 28 5 A 12 13 96282 CASAVA_Build 16 25579071 1D CTAAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 35 0 31 4 A 12 11 96283 CASAVA_Build 16 25585931 1I AACAAAAAAA -/C ATATAAGGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 0 1 96284 CASAVA_Build 16 25586632 1D AAGTGTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 34 3 27 5 T 13 12 96285 CASAVA_Build 16 25587334 1D CTCTCTCTTT A/- CATCTAAGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 1 0 96286 CASAVA_Build 16 25588068 4I ATTGAGAAAC ----/AAAT AAAAGACTCA 3070 hom 42 het 34 0 14 20 AAAT 0 1 96287 CASAVA_Build 16 25588241 1I AAGGCTTGAC -/A ACCCTTCATA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 2 96288 CASAVA_Build 16 25593843 4I AGATAAAAAT ----/ATAG ATAAATAGAC 3070 hom 110 het 40 0 37 3 ATAG 0 1 96289 CASAVA_Build 16 25600327 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 22 2 17 3 A 13 12 96290 CASAVA_Build 16 25601897 4D11M1D AATGCCTTAT TTAATAAATAGCTCAT/----TAAATAGCTCA- TTTTTTTCTC 3070 hom 54 het 18 0 19 2 N/A 0 0 96291 CASAVA_Build 16 25605187 1D TATCTGTTAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 66 het 26 0 22 5 A 9 8 96292 CASAVA_Build 16 25610639 1I CGTGCGTGCT -/G GGGGGCTGGG 1464 hom 18 het 7 0 5 2 G 5 6 96293 CASAVA_Build 16 25638197 13D AGACAGACAG ACAAGTGACAATC/------------- ACAATTTAGC 3070 het 3070 ref 51 34 17 3 ACAAGTGACAATC 1 0 96294 CASAVA_Build 16 25640300 1D TAAAGCAATA T/- TTTTTTCACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 7 6 96295 CASAVA_Build 16 25640833 5D TAGTGCACCC TATTT/----- TATTAAACTC 3070 het 3070 ref 52 30 19 3 TATTT 1 0 96296 CASAVA_Build 16 25645457 1D GGATATGCCC T/- TGTTCTCCCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 1 96297 CASAVA_Build 16 25656429 1D GAGAGTGGGA G/- GGGGGTGAGA 3070 het 3070 hom 51 15 30 6 G 6 5 96298 CASAVA_Build 16 25658538 1I TCTCTGTCTG -/T TTGGGATGGT 3070 het 3070 ref 49 22 22 5 T 2 3 96299 CASAVA_Build 16 25709008 3D GGTGAGCAGG TGA/--- TCACCTGAAG 3070 hom 111 het 41 0 35 6 TGA 1 0 96300 CASAVA_Build 16 25725169 1I GTGTCTACGT -/G GGGGGCAGGA 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 G 5 6 96301 CASAVA_Build 16 25727652 5I ATACTATACC -----/TGTCT TATTAAGCTT 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 TGTCT 0 1 96302 CASAVA_Build 16 25731526 1I AAGTACTTCC -/T TTTTTTTTTT 2795 het 2795 ref 37 16 7 14 T 12 13 96303 CASAVA_Build 16 25739395 3D AATACAAGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 2144 hom 25 7 14 4 TTG 7 6 96304 CASAVA_Build 16 25748579 1I GAGCTCATTC -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 T 6 7 96305 CASAVA_Build 16 25770699 2I GACACTTTCG --/AA AAGTTATTAA 3070 het 3070 hom 39 11 18 10 A 2 4 96306 CASAVA_Build 16 25781507 2D ACCGTTTAGT AC/-- TTACAGACAT 3070 het 3070 hom 49 20 22 11 AC 1 0 96307 CASAVA_Build 16 25783768 2I ATACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2272 hom 25 11 10 4 AT 5 6 96308 CASAVA_Build 16 25790778 1D GGCTCAAAGT G/- TAATGGTGAT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 G 1 0 96309 CASAVA_Build 16 25791092 22D AAAGAAATGG CTTTGTCACACCAGTGTGTTCA/---------------------- CTTAGTCTGC 3070 het 3070 ref 30 19 14 5 CTTTGTCACACCAGTGTGTTCA 1 0 96310 CASAVA_Build 16 25791425 2I CCTGAGTGTT --/CA CACAACAGTG 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 CA 2 3 96311 CASAVA_Build 16 25796560 1I CAGTTTGTGG -/T TTTTTTGCTG 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 T 6 7 96312 CASAVA_Build 16 25802220 1D ACAAAAAAAA T/- ACCCCACACT 3070 hom 83 het 36 0 32 4 T 1 0 96313 CASAVA_Build 16 25814563 2D AAAGAGGGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 41 16 12 15 AG 10 9 96314 CASAVA_Build 16 25816271 1I GAGATCCTGT -/C CCCCCCACAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 C 6 7 96315 CASAVA_Build 16 25818327 1D CCTTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1967 hom 26 7 11 9 T 12 11 96316 CASAVA_Build 16 25818494 1I CGCTCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 2963 het 1660 hom 34 7 11 16 T 13 14 96317 CASAVA_Build 16 25818595 1I AGGGGTAAGG -/A AAAACATGGC 3070 het 386 hom 38 1 29 8 A 4 5 96318 CASAVA_Build 16 25819022 2I TTTATTATTA --/TT GTTACCTACA 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 T 0 2 96319 CASAVA_Build 16 25819193 4I TTATGCCACC ----/TTTA TTTAACAACT 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 TTTA 1 2 96320 CASAVA_Build 16 25820519 2I TGCTCTCTCA --/TC TCTTTCTTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TC 1 2 96321 CASAVA_Build 16 25821601 1D CATTAAAAAC A/- AAAAAAACAG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 8 7 96322 CASAVA_Build 16 25831322 4D GCCCCACACA CCTG/---- CCTGCTGACT 3070 hom 137 het 52 0 40 13 CCTG 2 1 96323 CASAVA_Build 16 25844867 1D TGGCACCGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 167 hom 27 1 16 10 A 10 9 96324 CASAVA_Build 16 25844880 2I AAAAAAAGTT --/GA GATCAAGGTT 3070 het 1018 hom 28 5 8 15 GA 1 2 96325 CASAVA_Build 16 25845889 1I CGTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 A 10 11 96326 CASAVA_Build 16 25847197 1D TATTAAAAAA T/- AAAATAGAAG 3070 het 3070 hom 40 12 18 12 T 1 0 96327 CASAVA_Build 16 25848211 1I AAACAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 A 10 11 96328 CASAVA_Build 16 25854734 1I GAGATACTAG -/A ACTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 1 2 96329 CASAVA_Build 16 25859024 2D CCAGATTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2130 hom 30 8 13 9 T 16 14 96330 CASAVA_Build 16 25859095 10I GATGATTAAG ----------/CTTAACAGTA CTATTCTGGG 3070 hom 82 het 35 0 27 8 CTTAACAGTA 0 1 96331 CASAVA_Build 16 25860241 3I TTGGCCACCC ---/GAA GAAGTGCTAG 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 GAA 1 2 96332 CASAVA_Build 16 25864313 2I TGGGTGAGTG --/TT TCCTTTGGTA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 1 3 96333 CASAVA_Build 16 25867874 1I TATCTGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 36 1 33 2 T 11 12 96334 CASAVA_Build 16 25868837 1I TGCACACCCC -/T TTGCAGAAGG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 2 3 96335 CASAVA_Build 16 25876238 4D ACCTTCATAG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 CT 7 5 96336 CASAVA_Build 16 25880629 1D26M2I AGAGTTGGAC AAAAAAAAATTAATGACCTAAAATCAT--/-AAAAAAAATTAATGACCTAAAATCATAA AAAACTTACA 3070 het 1023 hom 25 5 15 16 N/A 0 0 96337 CASAVA_Build 16 25885514 2D TCTGTTTCTG CT/-- CTCTGCATAG 3070 hom 123 het 46 0 42 6 CT 3 2 96338 CASAVA_Build 16 25890068 1D ACTTTACATT C/- TTTTGAGCCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 0 96339 CASAVA_Build 16 25890831 4D CTGCCACTTA CTAG/---- CTAGCTACAG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 CTAG 2 1 96340 CASAVA_Build 16 25893417 2D GAGGGTGCTT GA/-- GTGCCTTTGA 3070 hom 144 het 53 0 49 7 GA 1 0 96341 CASAVA_Build 16 25895753 2I TAATTTTCAC --/AT GTCGCAAAAT 3070 hom 130 het 48 0 44 4 AT 0 1 96342 CASAVA_Build 16 25902723 4D CTTGTGTCTG TGTT/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 85 het 35 0 28 11 TGTT 1 0 96343 CASAVA_Build 16 25905020 11D ATGGTATACT TATTCATTCTC/----------- TACCTTCTCC 3070 het 3070 ref 42 21 19 4 TATTCATTCTC 1 0 96344 CASAVA_Build 16 25905998 1I CATAGAGAAA -/C CCCCGTCTCT 2001 hom 12 het 6 0 5 1 C 4 5 96345 CASAVA_Build 16 25906599 1D GATTAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 11 10 96346 CASAVA_Build 16 25910749 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATGGCGT 3070 het 417 hom 10 1 9 0 AGG 1 0 96347 CASAVA_Build 16 25914825 1D TTCCTCCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 9 10 A 16 15 96348 CASAVA_Build 16 25918333 1I CTTCAGCCAC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 7 8 96349 CASAVA_Build 16 25921508 1I32M4D AGAGATAGAG -AAAAAAGAAGGAAGGAAGAAGGGAAGGAAGGAAGGG/AAAAAAAGAAGGAAGGAAGAAGGGAAGGAAGGA---- AGGGAGGGAG 3070 het 2741 hom 23 9 14 3 N/A 0 0 96350 CASAVA_Build 16 25924555 1D TTACTGTGTG A/- AAAAAAAAAA 1701 het 1701 ref 33 17 6 12 A 15 14 96351 CASAVA_Build 16 25937655 1D CTCCTCATGG A/- AAAAAAAAAA 1761 het 1761 ref 30 15 5 10 A 15 14 96352 CASAVA_Build 16 26016076 1I ATATGGAACC -/A AAAAAGAGCC 2826 het 1370 hom 9 3 6 0 A 5 6 96353 CASAVA_Build 16 26020038 1D CATCTCCAAT C/- CATTTCACCC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 C 2 1 96354 CASAVA_Build 16 26021079 2D ACAGCAATGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 44 2 37 7 T 12 10 96355 CASAVA_Build 16 26028541 2D ATACTCACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 470 hom 25 4 13 9 T 13 11 96356 CASAVA_Build 16 26030070 1I CTGGCTAATT -/A AAAAAAAAAT 2897 het 2897 ref 24 12 8 4 A 9 10 96357 CASAVA_Build 16 26031740 1I GCATTAGCTT -/A TAAGGTGAGC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 0 1 96358 CASAVA_Build 16 26035401 1D AATATTGAGT C/- CATGATAGCA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 C 2 1 96359 CASAVA_Build 16 26043144 1I AAACGAAGAG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 7 8 96360 CASAVA_Build 16 26061761 1D CTATTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 1343 het 1343 ref 24 18 3 3 A 13 12 96361 CASAVA_Build 16 26092169 1D AGTCCTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 39 1 30 8 T 11 10 96362 CASAVA_Build 16 26095285 1I GACCACCCAG -/A AACACAAAAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 2 3 96363 CASAVA_Build 16 26100249 1I TGATTCTAAA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 457 hom 43 2 34 7 C 8 9 96364 CASAVA_Build 16 26103954 1D AGGTGGAAAA T/- TTTTTTTTTT 1604 het 1604 ref 34 17 4 13 T 15 14 96365 CASAVA_Build 16 26107003 4I TTTAAGTAAA ----/AAAC AAACAAACCA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AAAC 2 3 96366 CASAVA_Build 16 26116919 2D AAGAAGAAAC AG/-- AAATATTGAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AG 1 0 96367 CASAVA_Build 16 26137755 1I AGTTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 25 1 22 2 A 10 11 96368 CASAVA_Build 16 26154582 1D AAAGCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 29 0 23 7 A 11 10 96369 CASAVA_Build 16 26155142 1D CTGTTCCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 46 0 30 16 T 12 11 96370 CASAVA_Build 16 26156696 1I TCCTACCATC -/G GTGACTTTAT 3070 hom 114 het 50 0 39 11 G 1 2 96371 CASAVA_Build 16 26160963 1D CAGAGGAGAC A/- AAAGAAAAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 4 3 96372 CASAVA_Build 16 26176502 5D GCTCAACAAT AAACA/----- AAACAAAACA 3070 hom 105 het 47 0 36 12 AAACA 5 4 96373 CASAVA_Build 16 26177754 1I TGTCTTTATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 390 hom 35 2 30 3 T 9 10 96374 CASAVA_Build 16 26186754 7D AGAAGAAAGC CTGGAGG/------- CATTTTCTGG 3070 hom 93 het 32 0 31 1 CTGGAGG 1 0 96375 CASAVA_Build 16 26190744 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1296 hom 41 3 33 6 T 12 11 96376 CASAVA_Build 16 26204044 2I CTTATAAGTT --/AA GTCTCATTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 2 96377 CASAVA_Build 16 26218866 6D AAATACTCAG TTTAGA/------ TTTAGATTTG 3070 hom 117 het 43 0 40 5 TTTAGA 2 1 96378 CASAVA_Build 16 26223793 4D TCTGCCTCTT TGTC/---- TGTAGATTCG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 TGTC 1 0 96379 CASAVA_Build 16 26233037 3D CATAGCAAAA CTT/--- CTTGAAAACA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 CTT 2 1 96380 CASAVA_Build 16 26235230 1I ACTATTATTT -/C CCACCTATAT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 2 3 96381 CASAVA_Build 16 26238043 1I CGTCAATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 24 1 21 2 T 10 11 96382 CASAVA_Build 16 26238454 18D AGTGGTGAAC AGAGGTAGAGAGGTAGAG/------------------ AGCACAGAGG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 AGAGGTAGAGAGGTAGAG 1 0 96383 CASAVA_Build 16 26252451 1I AGCCGAGAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 872 hom 52 2 42 8 A 9 10 96384 CASAVA_Build 16 26256601 2I AGTGAATGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 12 14 96385 CASAVA_Build 16 26258918 7I GGAGGTTGCA -------/GTGAGCT GTGAGCTGAG 3070 het 257 hom 17 1 14 2 GTGAGCT 1 2 96386 CASAVA_Build 16 26259434 1I TTCCTGAGAT -/A AACTTTGTGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 2 3 96387 CASAVA_Build 16 26259951 13D AATAAGTTCT TCAGATTCTTCTA/------------- AACACGCTCC 3070 hom 150 het 53 0 50 7 TCAGATTCTTCTA 1 0 96388 CASAVA_Build 16 26264646 1I GTCCATAGCA -/G GGGGCAGAGA 3070 hom 129 het 48 0 42 6 G 4 5 96389 CASAVA_Build 16 26284331 40D3M2D4M6D TTGGCTTAAG CCAAACAATATCACTCTGATAAATAGGGCATTTTATCACTCTGATAAATAGGGCA/----------------------------------------CTG--AAAT------ TTTATCACTC 3070 hom 75 het 20 0 25 2 N/A 0 0 96390 CASAVA_Build 16 26284858 1D TGCTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 43 20 8 15 T 17 16 96391 CASAVA_Build 16 26293083 3D ATGGGTGAAT GGG/--- GGGGGGGTAG 3070 het 3070 hom 78 34 29 18 G 10 7 96392 CASAVA_Build 16 26293178 4I AGTGGGCAGG ----/TAGA TGGATGGGTG 3070 het 3070 hom 88 34 37 17 TAGA 0 1 96393 CASAVA_Build 16 26315037 1I CCCTTCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1286 hom 36 4 14 18 A 15 16 96394 CASAVA_Build 16 26336513 6D ATAGGTTTAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 1366 hom 21 5 10 8 AT 10 7 96395 CASAVA_Build 16 26344893 1D GATATTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 11 23 11 A 12 11 96396 CASAVA_Build 16 26366495 2D ATCTGCCTCA TG/-- TCGGTGATTT 3070 het 3070 ref 41 15 14 12 TG 1 0 96397 CASAVA_Build 16 26368883 1I AAAAAAAAAA -/G GCTGGGCATG 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 G 1 2 96398 CASAVA_Build 16 26369969 1D CTATTACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2835 hom 32 10 14 8 T 17 16 96399 CASAVA_Build 16 26375525 1D ATTATTTTCT A/- GGCTGGTCAT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 1 0 96400 CASAVA_Build 16 26383985 1I ACTCCCCCCC -/T ACCTCCCCCA 2681 het 1087 hom 15 4 7 4 T 0 1 96401 CASAVA_Build 16 26388540 1I AAAGAAGTGA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 7 8 96402 CASAVA_Build 16 26414164 1D GCTTGATTAT A/- AAAAGAATAT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 5 4 96403 CASAVA_Build 16 26416768 3D5M7I CAGCACAAAG AGAAGTAC-------/---AGTACCTGCATT CTGCATTCGA 3070 het 3070 ref 39 14 11 16 N/A 0 0 96404 CASAVA_Build 16 26417921 1D ATGTTAGCCA G/- GATGGTCTTG 3070 het 654 hom 13 2 8 3 G 2 1 96405 CASAVA_Build 16 26419272 4D GTGTGTGTAC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 56 29 18 12 GT 8 6 96406 CASAVA_Build 16 26419849 1D AAACCAACAC A/- AAAAAAACAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 8 7 96407 CASAVA_Build 16 26427101 1I CAGGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 10 11 96408 CASAVA_Build 16 26427381 1I GGTGCAAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 905 hom 40 2 31 7 T 9 10 96409 CASAVA_Build 16 26431281 2D GGGATTTTGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 22 11 17 TG 8 7 96410 CASAVA_Build 16 26436467 1D TGATCAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 10 13 T 13 12 96411 CASAVA_Build 16 26442742 1D TTCTTTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 11 10 96412 CASAVA_Build 16 26445070 1D AATGCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 59 30 21 8 A 12 11 96413 CASAVA_Build 16 26449189 1D TGCAAACCCA T/- TTTTTCACCA 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 T 6 5 96414 CASAVA_Build 16 26454989 1I TCGTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 10 11 96415 CASAVA_Build 16 26457657 1I ATTTACTCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 9 10 96416 CASAVA_Build 16 26458102 3D GTGTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2245 hom 19 7 10 2 T 15 12 96417 CASAVA_Build 16 26463995 1D GAAGGGAGCA C/- TTGAAGTTTC 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 C 1 0 96418 CASAVA_Build 16 26466068 1I GTAGGAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 T 10 11 96419 CASAVA_Build 16 26470317 1D TAGGTAGGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 9 8 96420 CASAVA_Build 16 26471894 2D AGCAGAAGTC CA/-- CATCTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 CA 2 1 96421 CASAVA_Build 16 26480466 1D ACTGGAGTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 A 10 9 96422 CASAVA_Build 16 26487988 2D CTCTTATGGG AA/-- AAAAAAAAAA 1540 het 982 hom 17 5 4 8 A 12 10 96423 CASAVA_Build 16 26544273 1D AAAAATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 11 10 96424 CASAVA_Build 16 26558575 1D CATATTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 22 2 A 14 13 96425 CASAVA_Build 16 26561638 2D TGAGACAGGG TC/-- TCTCTCTCTC 1214 het 1214 ref 11 5 4 2 TC 7 6 96426 CASAVA_Build 16 26565919 1I GCGACCCCCA -/C CCCCCCGCCT 2034 het 2034 ref 33 17 6 10 C 6 7 96427 CASAVA_Build 16 26567115 8I TCAGCTGCTA --------/TGGCTCAT TGGCCCATTA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 TGGCTCAT 0 1 96428 CASAVA_Build 16 26571972 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 17 0 13 4 T 14 13 96429 CASAVA_Build 16 26572941 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 837 het 837 ref 12 6 5 2 T 10 9 96430 CASAVA_Build 16 26590738 1I CTCTCCCCTG -/C CCCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 C 9 10 96431 CASAVA_Build 16 26597727 3I AATCAGAAAG ---/AAT AATGACTGCA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AAT 1 2 96432 CASAVA_Build 16 26600090 1D CCAAAATCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 A 10 9 96433 CASAVA_Build 16 26602516 1D GAAGAGGAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 10 9 96434 CASAVA_Build 16 26620378 5D ATGATTGCTC TCTTT/----- TCTTCTCTCA 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 TCTTT 1 0 96435 CASAVA_Build 16 26622704 1D AGAAACCACA G/- GGGCATTAGA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 G 4 3 96436 CASAVA_Build 16 26632934 1I AGGGAAGGAA -/T TGTGTCCAAT 3070 het 3070 ref 56 26 24 6 T 1 2 96437 CASAVA_Build 16 26636197 1D AATGACACTT A/- ACCACTCTCC 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 A 2 1 96438 CASAVA_Build 16 26638174 1I GTGAATGAAT -/G GATGATTGAG 3070 het 3070 hom 50 15 28 7 G 1 2 96439 CASAVA_Build 16 26644489 1D ATGATTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 19 22 11 T 10 9 96440 CASAVA_Build 16 26645251 1D CATTCTAATT C/- CCCCACCATA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 C 5 4 96441 CASAVA_Build 16 26652459 1D AAAAGAGAAG T/- GCAGTTATTA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 1 0 96442 CASAVA_Build 16 26654372 1I ATTACATACT -/G TGATAAAAAG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 0 1 96443 CASAVA_Build 16 26672921 1I TCCTGTGTGA -/T TATTTCTGTA 3070 het 3070 ref 53 27 21 5 T 1 2 96444 CASAVA_Build 16 26694967 1I GATCCACAGA -/G ACTTAAGAAA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 G 0 1 96445 CASAVA_Build 16 26707579 8D14M10D TGTACTTTGT TTTATATATATATATATATATGTATATATATA/--------TATATATATATATG---------- TATGTATAGT 3070 hom 75 het 26 0 26 3 N/A 0 0 96446 CASAVA_Build 16 26708177 1D CAACAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 40 1 34 5 A 11 10 96447 CASAVA_Build 16 26710819 1I TCTGGAAATA -/C CATTTTGATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 2 96448 CASAVA_Build 16 26711857 2I GTCTATATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 10 12 96449 CASAVA_Build 16 26712888 1D TCTTCATATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 10 9 96450 CASAVA_Build 16 26715541 5I CAAGTGAACT -----/GCCCA CCTCGGCCTC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 GCCCA 0 1 96451 CASAVA_Build 16 26720015 1D ATATGCATCT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 50 17 22 11 G 10 9 96452 CASAVA_Build 16 26720699 1I TGCTGTTTTT -/A ACCACTGGGC 3070 het 3070 hom 56 24 24 8 A 1 2 96453 CASAVA_Build 16 26721375 1D ACAAAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 17 14 T 12 11 96454 CASAVA_Build 16 26721826 4D GGATAAAAGG AGGA/---- AGGAAGGAAG 2692 het 2692 ref 24 12 8 4 AGGA 3 2 96455 CASAVA_Build 16 26739955 1D ACGTCAAAAT G/- AACTGGAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 17 9 G 1 0 96456 CASAVA_Build 16 26741962 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 21 5 A 10 9 96457 CASAVA_Build 16 26744165 1I TAGAGGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 10 12 A 10 11 96458 CASAVA_Build 16 26748911 3I CAGTGATTCT ---/CTC TTTTTTTTTT 2808 het 1360 hom 39 14 14 11 CTC 0 1 96459 CASAVA_Build 16 26750421 1D AATTCAGGTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 9 8 96460 CASAVA_Build 16 26752243 1I AAGAAATGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 9 10 96461 CASAVA_Build 16 26753429 1D CAGAATAGAT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 A 8 7 96462 CASAVA_Build 16 26763413 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 1436 het 260 hom 13 4 6 3 A 15 16 96463 CASAVA_Build 16 26774843 1D ATTTATAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 24 1 18 5 A 12 11 96464 CASAVA_Build 16 26781181 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 24 1 17 7 A 17 16 96465 CASAVA_Build 16 26787076 6I TGGAAGTTAC ------/TTAACG TTAAGTTGCC 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 TTAACG 0 1 96466 CASAVA_Build 16 26793417 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1622 hom 41 10 14 17 A 16 14 96467 CASAVA_Build 16 26803256 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2377 hom 33 9 16 9 A 13 12 96468 CASAVA_Build 16 26842568 1D AATTAAAATT A/- AAAAAAAATT 3033 het 1861 hom 15 5 7 3 A 9 8 96469 CASAVA_Build 16 26843425 1D TCACAAGAAC A/- GCATGGGAAA 3070 hom 138 het 50 0 47 4 A 1 0 96470 CASAVA_Build 16 26859176 1I GTATGTCCCC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 8 9 96471 CASAVA_Build 16 26860875 1I CTACAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 A 9 10 96472 CASAVA_Build 16 26865310 1I TCAATTAGGA -/C CCCCCACCCC 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 C 5 6 96473 CASAVA_Build 16 26870756 132D TCTTGGAGGA ACCAAACAGAATGCTCCTTGGAAATGTCCCACTCGAGAGTGGGGAGGCTGGGGCATTTATCCACCACCTCACATCTGATGGTGGTTGAGGGTTTCCCCGGGGCTGTTAACTTCACTTCCTGGTTGCACCTGC/------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ACTGTGCTGA 3070 het 3070 ref 30 32 12 22 ACCAAACAGAATGCTCCTTGGAAATGTCCCACTCGAGAGTGGGGAGGCTGGGGCATTTATCCACCACCTCACATCTGATGGTGGTTGAGGGTTTCCCCGGGGCTGTTAACTTCACTTCCTGGTTGCACCTGC 1 0 96474 CASAVA_Build 16 26882413 2D GATTTAGATG TT/-- AGGGCTTTGA 3070 hom 165 het 62 0 55 8 T 2 0 96475 CASAVA_Build 16 26884382 8D GTATATATAT ATATATAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 39 het 17 0 14 4 ATATATAC 1 0 96476 CASAVA_Build 16 26887601 33D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACC/--------------------------------- ATGGAAATCC 1303 het 118 hom 11 3 6 7 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACC 1 0 96477 CASAVA_Build 16 26889981 3D AAAATAAAAT AAG/--- AAGAACAAGA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 AAG 2 1 96478 CASAVA_Build 16 26897426 3D ATCCCAGGCA GTG/--- GTGGAAAGCT 3070 hom 83 het 35 0 25 12 GTG 2 1 96479 CASAVA_Build 16 26897707 4I TCTCTCCCCT ----/TCTC TCTCTCTCTA 3070 hom 117 het 46 0 37 9 TC 4 6 96480 CASAVA_Build 16 26906034 4I AAAAAAAAAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 78 het 36 0 24 12 AG 6 8 96481 CASAVA_Build 16 26906682 1I AGTGATGGGG -/A AAATATAAAC 3070 hom 119 het 47 0 38 9 A 3 4 96482 CASAVA_Build 16 26911998 1D ATGAAGGCAG T/- TGCCTGCCTT 3070 hom 99 het 43 0 34 10 T 2 1 96483 CASAVA_Build 16 26922510 1I GAAACAAATG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 A 7 8 96484 CASAVA_Build 16 26922866 1D TGACACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 29 3 16 10 A 12 11 96485 CASAVA_Build 16 26924898 1D CAATAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 A 14 13 96486 CASAVA_Build 16 26927196 1D TTCATAGGTT A/- AAAAAAAAAA 1664 het 1664 ref 26 16 4 7 A 13 12 96487 CASAVA_Build 16 26933267 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 2760 het 424 hom 11 2 8 1 A 6 7 96488 CASAVA_Build 16 26934319 2D AGATGCCCAG AC/-- ACAGTTTCCA 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 AC 2 1 96489 CASAVA_Build 16 26938490 1I ATAAAAAATT -/A AAAAAAAATC 1847 het 1847 ref 17 10 4 3 A 8 9 96490 CASAVA_Build 16 26943686 7D CAGTGCTGTG CCCCCCC/------- CCCCCCCCAC 1340 het 268 hom 27 2 5 20 C 15 8 96491 CASAVA_Build 16 26948445 10I AGTGGGTAAT ----------/GACCTGGCCG GACCAACCCC 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 GACCTGGCCG 0 1 96492 CASAVA_Build 16 26951050 8D GTTTTCTGGA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 12 5 T 18 10 96493 CASAVA_Build 16 26955932 13D ATGAAAGGAA GGAAGAAAAAAAG/------------- GAAGGGAGGG 3070 hom 141 het 44 0 45 4 GGAAGAAAAAAAG 1 0 96494 CASAVA_Build 16 26957620 101D4M20D CTACCACTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTATTTTTTTTCCTTTCTTTTTTTTTTTTTATTATACTCTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACATTGTGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGC/-----------------------------------------------------------------------------------------------------TTAG-------------------- CACTGTCTGT 3070 het 25 hom 13 1 12 4 N/A 0 0 96495 CASAVA_Build 16 26962994 1D TGTATAATTA C/- CCCCCATTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 C 6 5 96496 CASAVA_Build 16 26970030 1I TGAACTGGGC -/A AAACCCCTCC 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 3 4 96497 CASAVA_Build 16 26982851 9I AACAGGGCAG ---------/CCAGCCCTC GCCAGACCTC 3070 het 937 hom 46 9 27 10 CCAGCCCTC 0 1 96498 CASAVA_Build 16 26983538 1D CCGTTGCTAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 9 8 96499 CASAVA_Build 16 26989074 1D ACGATAAACT G/- GGTTGCTTAC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 3 2 96500 CASAVA_Build 16 26995610 2I TTGGAATTGT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 48 24 13 11 CA 5 6 96501 CASAVA_Build 16 27002108 8I CATAGACAGA --------/TGGCACCG TGGTGGTGCT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 TGGCACCG 0 1 96502 CASAVA_Build 16 27007983 1D TCACTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 843 hom 32 2 24 7 T 12 11 96503 CASAVA_Build 16 27013359 1D AAAGAAGTTT C/- CAGGCCCAGA 3070 het 3070 ref 29 13 13 4 C 2 1 96504 CASAVA_Build 16 27017314 1I AATTTTTGTA -/T TTTTACTAGA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 4 5 96505 CASAVA_Build 16 27031666 1D TGTGTGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2400 hom 31 9 11 11 T 15 14 96506 CASAVA_Build 16 27034650 1D AAAAAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1430 hom 21 5 16 0 A 11 10 96507 CASAVA_Build 16 27037200 1D TGCATGGCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1894 hom 34 12 9 13 T 15 14 96508 CASAVA_Build 16 27038321 1I TCATCACCCA -/T TGTCATACAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 1 2 96509 CASAVA_Build 16 27040131 2I TATCAGACTC --/TT TTAAAAATCA 3070 hom 77 het 29 0 26 3 T 2 4 96510 CASAVA_Build 16 27050334 1I CACTTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 T 10 11 96511 CASAVA_Build 16 27054057 1D AAACCATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2224 hom 25 8 11 6 A 12 11 96512 CASAVA_Build 16 27054332 2D TTCCTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 2741 het 1331 hom 30 10 10 11 A 18 16 96513 CASAVA_Build 16 27055913 1I GTGGTCTACG -/T GTCAGTGGCT 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 T 0 1 96514 CASAVA_Build 16 27058702 1D ATCTTCTGTT C/- CAGAGGCTTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 C 2 1 96515 CASAVA_Build 16 27068989 9D TCACACTTCT GAAACTGAG/--------- AAGTTTCAGA 3070 het 3070 ref 39 27 9 7 GAAACTGAG 1 0 96516 CASAVA_Build 16 27078755 1I GAGAAAAAAA -/G GGGGGGGGAA 3070 hom 48 het 24 0 18 6 G 8 9 96517 CASAVA_Build 16 27078861 1D ATTAAGCTAC T/- TTTAATGTCA 3070 het 3070 ref 33 17 16 0 T 4 3 96518 CASAVA_Build 16 27080431 1D CACATGACCA C/- CATCCCTGCA 3070 hom 129 het 47 0 42 5 C 2 1 96519 CASAVA_Build 16 27080501 4D GACTCTGCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 AAAC 5 4 96520 CASAVA_Build 16 27081033 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAATTAG 3070 hom 33 het 13 0 11 3 A 7 6 96521 CASAVA_Build 16 27084943 1D ATTTCTGACA C/- ATTTGTTTGA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 C 1 0 96522 CASAVA_Build 16 27085981 1D CAGAATCGCC A/- CCCAGACCCA 3070 hom 63 het 22 0 21 2 A 1 0 96523 CASAVA_Build 16 27086715 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 8 9 96524 CASAVA_Build 16 27089192 1I GCAGTTTCAT -/G TTAGCCCTAA 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 G 0 1 96525 CASAVA_Build 16 27091748 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2924 het 384 hom 29 6 8 15 A 17 16 96526 CASAVA_Build 16 27100116 1I CCATGGTGAG -/A CTCTCTGGAT 3070 het 3070 hom 47 19 26 2 A 0 1 96527 CASAVA_Build 16 27131064 5D TTAAAAAAAT AAAAG/----- AGAGAGATGC 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 AAAAG 1 0 96528 CASAVA_Build 16 27143812 2I GAACACAGAC --/AG GGGCTGCAGC 3070 hom 53 het 23 0 18 5 AG 0 1 96529 CASAVA_Build 16 27228116 1I AGCCACAAAA -/G GAAATGAGGT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 G 1 2 96530 CASAVA_Build 16 27237270 2I TTTGAGAGGG --/AA ATGAGGAAGA 3070 hom 135 het 53 0 42 11 A 1 3 96531 CASAVA_Build 16 27240926 1I CACTATGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1801 hom 44 5 29 10 T 13 14 96532 CASAVA_Build 16 27243100 1I GCCCCGAGGT -/G GGCTGAGATC 3070 hom 117 het 44 0 35 9 G 2 3 96533 CASAVA_Build 16 27278434 3D CTGGAATCTA GTG/--- GTGTTGGCTT 3070 hom 135 het 51 0 45 7 GTG 2 1 96534 CASAVA_Build 16 27303450 4D TCATCAGGGG TCGC/---- TCGTGTCTGC 3070 hom 114 het 42 0 37 7 TCGC 1 0 96535 CASAVA_Build 16 27305570 2I TGTCTCATGG --/TT TTTTTTTTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 10 96536 CASAVA_Build 16 27310163 5D GCTTAGTCGT GGCTA/----- TGAGTACAGT 3070 hom 114 het 39 0 38 3 GGCTA 1 0 96537 CASAVA_Build 16 27310718 2I GGGGAGTATC --/TT TTTTATTTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 4 6 96538 CASAVA_Build 16 27326716 1D TCAATCCCCT A/- AAGCTCCAGA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 A 3 2 96539 CASAVA_Build 16 27328106 2D ATAAATTTAC AT/-- ATATATATAA 1157 het 1156 ref 7 3 3 2 AT 5 4 96540 CASAVA_Build 16 27328440 3I TTTAAGAAAA ---/CAT CATGTTTTCT 3070 hom 144 het 49 0 48 1 CAT 1 2 96541 CASAVA_Build 16 27336484 4I TTACAGCCTA ----/TTGC TAATTGGCTA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TTGC 0 1 96542 CASAVA_Build 16 27339731 2I AAGATTTACA --/CT CCTAGGTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 CT 0 1 96543 CASAVA_Build 16 27345921 1D AGAGTTCTAG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 A 8 7 96544 CASAVA_Build 16 27362559 2I GAGCTGGGAT --/CG CGCGCTACTG 3070 hom 59 het 27 0 17 10 CG 2 3 96545 CASAVA_Build 16 27375309 3I AATGTGAAGG ---/TTT TTCTTTCAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 2 5 96546 CASAVA_Build 16 27417619 1I TTGGCTCCAC -/A AGTCGATTCC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 1 2 96547 CASAVA_Build 16 27420916 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1070 het 1070 ref 28 22 3 3 A 13 12 96548 CASAVA_Build 16 27437977 1D AGAATTGTCT G/- ATAAGGCAGA 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 G 1 0 96549 CASAVA_Build 16 27444774 2I CCTATGTTTG --/TT TTTCTTATGA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 3 5 96550 CASAVA_Build 16 27463797 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 44 4 18 24 T 15 14 96551 CASAVA_Build 16 27493616 13I GAACTCCCGA -------------/CCTCAGGTGATCT GCCCGCCTCA 2614 hom 30 het 11 0 10 2 CCTCAGGTGATCT 0 1 96552 CASAVA_Build 16 27512365 1D CGTCCTAAAC T/- TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 T 8 7 96553 CASAVA_Build 16 27559500 2D TGGTTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2319 het 1118 hom 27 7 9 11 T 18 16 96554 CASAVA_Build 16 27568994 1I AACTGTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 701 hom 29 3 20 6 A 11 12 96555 CASAVA_Build 16 27611870 1I GGCTATTTCA -/G GGACCTGATC 3070 hom 111 het 43 0 36 7 G 2 3 96556 CASAVA_Build 16 27633054 3D CCTTTTTCAT TTC/--- TTCAGAGCAC 3070 het 3070 hom 44 14 24 6 TTC 2 1 96557 CASAVA_Build 16 27646886 1I CTTGGAAGTC -/A AAAGATGCAA 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 3 4 96558 CASAVA_Build 16 27659816 1I CCAGTTAGCT -/C CCTGGACCTC 3070 hom 110 het 43 0 35 8 C 2 3 96559 CASAVA_Build 16 27701388 1D CCCAGAAGGA C/- CCCCCCAGAG 3070 hom 42 het 20 0 14 6 C 7 6 96560 CASAVA_Build 16 27731604 4D TGTTTTAATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 22 7 13 2 TTTA 5 4 96561 CASAVA_Build 16 27740114 1I ATTTCTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 11 12 96562 CASAVA_Build 16 27755100 1D ACTGTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1222 het 1222 ref 35 26 4 5 T 13 12 96563 CASAVA_Build 16 27756676 1D TAGTTGGGCC T/- TTTTTTTTTT 1764 het 1764 ref 35 25 5 5 T 13 12 96564 CASAVA_Build 16 27798797 4D GCCCCAGTCT CTGC/---- TTTCTCTACC 2815 het 2815 ref 19 8 6 6 CTGC 1 0 96565 CASAVA_Build 16 27801271 2I GGTAAAATCC --/AA AGACTCTATA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 1 3 96566 CASAVA_Build 16 27802090 1D GATGGAGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 A 10 9 96567 CASAVA_Build 16 27819645 1D TCAAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 13 12 96568 CASAVA_Build 16 27823066 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 2990 hom 30 9 11 10 T 7 8 96569 CASAVA_Build 16 27835705 1D CACTCAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 15 7 A 11 10 96570 CASAVA_Build 16 27878843 2I TGCCAGGAGG --/GA GAGAGGGTAG 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 GA 2 3 96571 CASAVA_Build 16 27885334 2D ACAAACAAAC AA/-- TATTGAAGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 2 0 96572 CASAVA_Build 16 27888427 1D ACCACCTTTT A/- TTTATCCATT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 1 0 96573 CASAVA_Build 16 27910160 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 8 96574 CASAVA_Build 16 27911318 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 32 2 21 10 A 13 12 96575 CASAVA_Build 16 27912894 1I AAACTTTTGC -/T GCAACCTCAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 1 96576 CASAVA_Build 16 27915332 2D AACAAGGCTA CT/-- CTCTCTCTCA 3070 hom 111 het 44 0 38 7 CT 5 4 96577 CASAVA_Build 16 27923413 5D CCAGGGCAAC AGAAT/----- AGAATGAGAC 3070 hom 42 het 16 0 14 3 AGAAT 2 1 96578 CASAVA_Build 16 27931407 1I AATTTTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 33 0 26 7 A 10 11 96579 CASAVA_Build 16 27932042 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 17 0 14 3 A 14 15 96580 CASAVA_Build 16 27932220 5I TGGCATGTGC -----/AAAGG CCCTGCCACA 3070 hom 95 het 38 0 29 9 AAAGG 0 1 96581 CASAVA_Build 16 27955322 1I CGCTCCTCAC -/A GTCTCCCAGG 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 0 1 96582 CASAVA_Build 16 27957109 1D AGAATTTGAT C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 8 7 96583 CASAVA_Build 16 27962856 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 9 8 96584 CASAVA_Build 16 27974301 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1947 het 1602 hom 16 4 8 4 T 11 12 96585 CASAVA_Build 16 27974754 1I GGGGGAGTGA -/C CGTGAGCTCC 3070 hom 74 het 30 0 24 6 C 1 2 96586 CASAVA_Build 16 27983515 1D AAAGGGAGGA C/- CCCCCCCCCT 3070 het 484 hom 28 2 12 14 C 10 9 96587 CASAVA_Build 16 27984957 3D CTAAAAATAC AAA/--- AATTAGCCTG 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 5 2 96588 CASAVA_Build 16 27990085 9D ATCTGAAATA TGTTGTTGT/--------- TGTTGTTGTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 TGT 7 4 96589 CASAVA_Build 16 28013796 1I GTAGGATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1637 hom 34 4 26 4 T 13 14 96590 CASAVA_Build 16 28032610 3I AGAATTCTTT ---/ATA ATAATTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ATA 1 2 96591 CASAVA_Build 16 28056465 1D CCAGAGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 27 5 T 12 11 96592 CASAVA_Build 16 28066266 5I GAAGAAAAAG -----/AAAGA AAAGAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAAGA 1 2 96593 CASAVA_Build 16 28094508 1I AAGAGGTTAA -/C AAAGAGATTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 0 1 96594 CASAVA_Build 16 28097425 1D CTATTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 29 1 24 4 A 11 10 96595 CASAVA_Build 16 28100341 1I GGGAGAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 21 1 16 4 T 13 14 96596 CASAVA_Build 16 28105495 1I TTCAGCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 23 1 16 6 T 15 16 96597 CASAVA_Build 16 28108436 4I TCTACTGAAG ----/CAAA CAAACAGACA 3070 hom 109 het 42 0 36 6 CAAA 1 2 96598 CASAVA_Build 16 28109724 3I GGAACGTGCA ---/AAT AATAACGTTA 3070 hom 129 het 52 0 44 8 AAT 1 2 96599 CASAVA_Build 16 28117153 1D ATGGTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 11 10 96600 CASAVA_Build 16 28134145 4D GTTTTGTGTG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3038 het 3038 ref 26 10 9 7 TGTT 6 5 96601 CASAVA_Build 16 28139294 1I CAAAATGTTA -/G TCAGGCTGGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 0 1 96602 CASAVA_Build 16 28156475 1I CATCGCCTGA -/G GTCAGGAGTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 96603 CASAVA_Build 16 28159039 1I GACCTTGGAC -/A GGGGTGCTAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 0 1 96604 CASAVA_Build 16 28165208 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 19 6 T 14 13 96605 CASAVA_Build 16 28187088 1I GTGTAGAGAT -/A AGAGTCTCAC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 1 2 96606 CASAVA_Build 16 28201646 2I GAGCTTCCTC --/TG AGAATCCCCA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 TG 0 1 96607 CASAVA_Build 16 28210387 1D CTAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 10 12 5 A 10 9 96608 CASAVA_Build 16 28243042 1D GTTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 11 10 96609 CASAVA_Build 16 28424807 1D CAGACTCCCT G/- GTTTTGGGGC 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 G 2 1 96610 CASAVA_Build 16 28471648 1D CTTGAGCCCA G/- GAACTCAAGA 3070 hom 110 het 41 0 32 10 G 2 1 96611 CASAVA_Build 16 28472771 1D TCATAAAAGG A/- AAAAAAAGCG 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 A 8 7 96612 CASAVA_Build 16 28534837 1I CACAGGGAGA -/C CGCTGGACCA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 C 1 2 96613 CASAVA_Build 16 28538557 1I23M8I AAATTTTATT -AAAAAATATATATATACATATAT--------/AAAAAAAAATATATATACATATATATATATCC ATATATAGAC 3070 hom 24 het 6 0 9 0 N/A 0 0 96614 CASAVA_Build 16 28556645 12D GAATCTAAAC AGAATAGAATCT/------------ AAACATGCAT 2597 het 2597 ref 34 29 6 4 AGAATAGAATCT 1 0 96615 CASAVA_Build 16 28662338 1D CTGGGAGGAA C/- CCTGTGTCAC 1398 hom 7 het 3 0 3 0 C 3 2 96616 CASAVA_Build 16 28729376 1I AAACTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 24 9 9 A 10 11 96617 CASAVA_Build 16 28746563 4D TGTCTCAAAA AAAT/---- AAATAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 AAAT 2 1 96618 CASAVA_Build 16 28779639 1D TCCAGATTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 74 het 29 0 25 4 T 10 9 96619 CASAVA_Build 16 28811266 4D GAGAAAGGCT GTAA/---- CCTTGGCTCC 3070 hom 105 het 36 0 36 3 GTAA 1 0 96620 CASAVA_Build 16 28812235 6D CTTAAAAAAC AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 hom 51 het 22 0 17 7 AAAAAG 3 2 96621 CASAVA_Build 16 28812478 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2592 het 990 hom 34 5 14 15 T 17 16 96622 CASAVA_Build 16 28817575 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 7 8 96623 CASAVA_Build 16 28818626 1D CTACTAAAAT A/- AAAAAATTAG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 7 6 96624 CASAVA_Build 16 28827085 2I TATTAAGAAA --/TT AAGTTGACAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 2 96625 CASAVA_Build 16 28831020 1D GTGAGCCGAG A/- ACCACACCAC 3070 hom 39 het 15 0 13 3 A 2 1 96626 CASAVA_Build 16 28834029 2D7M2I3M3I ACTACAGGCA TGTGCACCA--ATG---/--CACACCAACATGCCC AGCTAATTTT 989 het 989 ref 21 21 3 1 N/A 0 0 96627 CASAVA_Build 16 28847553 1D CTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 16 7 T 15 14 96628 CASAVA_Build 16 28848101 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 24 0 13 11 T 22 20 96629 CASAVA_Build 16 28863204 8D ACACCACCAA GCCCAGCT/-------- GCCCAGCTAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GCCCAGCT 2 1 96630 CASAVA_Build 16 28887113 1I GCCCACCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 T 7 8 96631 CASAVA_Build 16 28892607 2D CACCTAATAT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 79 het 36 0 28 9 G 16 14 96632 CASAVA_Build 16 28901151 1D CAGGGACAAA C/- CCCCCATTCC 3070 hom 94 het 38 0 27 11 C 6 5 96633 CASAVA_Build 16 28909952 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1047 het 1047 ref 31 18 5 8 T 14 15 96634 CASAVA_Build 16 28918653 1I GGGGTTGGGT -/G GGGGGTGTTA 3070 hom 106 het 38 0 33 5 G 5 6 96635 CASAVA_Build 16 28929069 2D CTGTCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 27 0 14 14 A 16 14 96636 CASAVA_Build 16 28938397 6D TAAAAAAAAA GAAAAG/------ GAAAAGGCAG 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 GAAAAG 2 1 96637 CASAVA_Build 16 28952923 1D AATAGAGACA G/- GGTCTTACCA 2634 het 2634 ref 15 8 6 1 G 3 2 96638 CASAVA_Build 16 28995630 65D AGGTCAGAAT ACAACTATTGCTGTTATACTAAAGACCAATAGAAATAGCAAGATTAATTAAGATACCAGTTGAAA/----------------------------------------------------------------- TCAAATATTT 2013 het 2013 ref 16 20 6 0 ACAACTATTGCTGTTATACTAAAGACCAATAGAAATAGCAAGATTAATTAAGATACCAGTTGAAA 1 0 96639 CASAVA_Build 16 29012102 1D TCGGCCTCCC A/- AAAGTGCTGG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 4 3 96640 CASAVA_Build 16 29012704 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2853 het 496 hom 16 3 9 4 A 17 16 96641 CASAVA_Build 16 29016701 4I TTTCTAAGAG ----/TTAC TTATAATTCA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 TTAC 0 1 96642 CASAVA_Build 16 29029780 1I ACCTCCTTCC -/T TTTGTCTAAA 3070 het 2646 hom 25 8 9 8 T 3 4 96643 CASAVA_Build 16 29037580 2I CCATGAAAAC --/AT GTGATGTTAG 2779 het 2779 ref 28 12 8 8 AT 0 1 96644 CASAVA_Build 16 29044435 2D ATCATTAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 2326 het 2326 ref 23 9 7 7 T 13 11 96645 CASAVA_Build 16 29056343 4D GCCCAAGGAT AGAG/---- AGAATAAAAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 AG 3 1 96646 CASAVA_Build 16 29058138 1I CCAAGGGTGA -/C CCCCCCACAG 3070 het 1432 hom 21 5 12 4 C 6 7 96647 CASAVA_Build 16 29059097 2D CTCATTACGC TT/-- TTTTTTTTTT 1758 het 1758 ref 20 11 6 3 T 14 12 96648 CASAVA_Build 16 29064502 1D CACTGCCCCC T/- GGGCTCTCAC 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 T 1 0 96649 CASAVA_Build 16 29069292 4D CATTTGTGAT TGTC/---- TGTCTTTTGG 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 TGTC 2 1 96650 CASAVA_Build 16 29075083 1I CCTCCCCAGT -/A AGCTGGGACT 3070 het 483 hom 10 2 8 0 A 1 2 96651 CASAVA_Build 16 29093148 1D ATATAGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 11 10 96652 CASAVA_Build 16 29097116 4I AAAACAGGAC ----/TCTG TCTGGCGTCA 3070 het 3070 ref 31 20 7 4 TCTG 1 2 96653 CASAVA_Build 16 29097605 1I TGTTTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 2979 het 1219 hom 28 5 12 11 T 13 14 96654 CASAVA_Build 16 29097920 1D TAACGATTAC A/- AAAAAAAAAA 2927 het 1264 hom 19 5 8 6 A 13 12 96655 CASAVA_Build 16 29098905 11D CAGCTCCTTG GGCACAGTCCA/----------- GGCTGCTCAG 2073 het 2073 ref 16 10 6 3 GGCACAGTCCA 1 0 96656 CASAVA_Build 16 29111815 5I TGTGGCCTAC -----/GAGGT GATGTCTTAT 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 GAGGT 0 1 96657 CASAVA_Build 16 29115374 2I CTTTTTAGTG --/CC CCCCCCCCAC 1192 het 1192 ref 15 6 5 4 C 8 10 96658 CASAVA_Build 16 29124707 1I TGATTTTGTT -/C AAAAAAACTC 1233 het 1233 ref 41 34 3 4 C 0 1 96659 CASAVA_Build 16 29135241 1I CTCATCAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 28 1 18 9 T 11 12 96660 CASAVA_Build 16 29138373 2I14M2D CAGACCCACA --CACACATTTGCACACT/CTCACACATTTGCACA-- CACATGACTA 1151 het 1151 ref 69 64 5 10 N/A 0 0 96661 CASAVA_Build 16 29138523 4I CCTACAGACA ----/CACT CACATTTGCA 1915 het 1915 ref 56 18 5 33 CACT 0 1 96662 CASAVA_Build 16 29138706 2D ATAGTACTCG CA/-- CACACACGCA 3070 het 3070 hom 89 19 55 15 CA 4 3 96663 CASAVA_Build 16 29138845 3I CATGTGAATA ---/TAC TACATGCACA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 TAC 1 2 96664 CASAVA_Build 16 29140615 1D ATTGCCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 28 3 13 12 T 18 17 96665 CASAVA_Build 16 29141342 2I GGCCTAGTGG --/AC GGCATGGGCT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 AC 0 1 96666 CASAVA_Build 16 29142039 2D TAGCTCCTAA CG/-- CAGTCGGCTG 311 het 311 ref 47 37 3 8 CG 1 0 96667 CASAVA_Build 16 29157219 12D AGAGAGGGAA GAAGGAAGGAGG/------------ GAAGGAAGGA 3070 hom 26 het 15 0 9 7 GAAGGAAGGAGG 2 1 96668 CASAVA_Build 16 29167064 1I ACATTGTTCA -/G GTTTGGCTCC 3070 hom 57 het 25 0 18 7 G 1 2 96669 CASAVA_Build 16 29173399 1I CGGGAACAAT -/G TCTAACACAG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 G 0 1 96670 CASAVA_Build 16 29174058 1D CATCGTTACA G/- GGCGTTCTTC 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 G 3 2 96671 CASAVA_Build 16 29176649 1I CCGGGGACGC -/T CCCCAGAGGA 3070 het 3070 ref 48 35 8 5 T 0 1 96672 CASAVA_Build 16 29181973 1D CGAGGCAATA G/- ATGGCAAATG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 1 0 96673 CASAVA_Build 16 29184675 3D AAAAGAAGAT GAA/--- GAAGATTCTT 3070 hom 129 het 48 0 43 9 GAA 2 1 96674 CASAVA_Build 16 29185637 2D TGATGGGGGA AG/-- AGAGAGAGAT 3070 hom 93 het 35 0 29 7 AG 5 4 96675 CASAVA_Build 16 29186018 1D CTTAGGGACG T/- TTTTGGAGAC 3070 hom 67 het 28 0 17 11 T 5 4 96676 CASAVA_Build 16 29189257 1I29M22D GAACTGATGG -AGACTGGCTGGATGCATATATATATATATATATATATATATATATATATAA/CTGACTGGCTGGATGCATATATATATATAT---------------------- AAATGTATGT 3070 hom 122 het 31 0 35 11 N/A 0 0 96677 CASAVA_Build 16 29189397 4D GGATGGGTGA ATGG/---- ATGGATGGAT 3070 hom 64 het 33 0 23 21 ATGG 3 2 96678 CASAVA_Build 16 29190772 13D TCCCTCATGG ACCGTCCTCCCGC/------------- ACCGTCCTCC 2163 hom 42 het 17 0 15 2 ACCGTCCTCCCGC 2 1 96679 CASAVA_Build 16 29191420 3I TGCTCAAAGG ---/GCT TCCCTCGTGC 3070 hom 21 het 12 0 8 4 GCT 0 1 96680 CASAVA_Build 16 29192279 1I18M4D TGAGTGAATG -GTGAATGAGTGAGTGAATGAGC/AGCGAATGAGTGAGTGAAT---- GAATGAGTGA 3070 het 3070 ref 53 21 8 30 N/A 0 0 96681 CASAVA_Build 16 29192320 4D AGTGAATGAA TGAG/---- TGAGTGAATG 612 hom 5 het 38 0 10 29 TGAG 2 1 96682 CASAVA_Build 16 29194309 15D TTTCTTTTTC TTTCTTTCTTTTCTT/--------------- TTTTTTTTTT 131 het 131 ref 21 9 2 12 TTTCTTTCTTTTCTT 1 0 96683 CASAVA_Build 16 29195525 2I TAGGTTTCTG --/AA GTTCTATTCC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 0 2 96684 CASAVA_Build 16 29196312 3D ATCTGTTGTG TTC/--- TTCTGAAGAT 3070 hom 72 het 30 0 22 9 TTC 2 1 96685 CASAVA_Build 16 29196911 2D CTGCCAGCTT TG/-- GGCTCTGTCC 2931 hom 42 het 17 0 11 6 TG 1 0 96686 CASAVA_Build 16 29197747 2I TCCCAGAGGC --/AT AGCCACTCTT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 AT 0 1 96687 CASAVA_Build 16 29201106 1I CCCCGGGCAA -/C CACTCATCTT 3070 hom 57 het 27 0 18 9 C 1 2 96688 CASAVA_Build 16 29203225 1D TCACCCCCCA C/- CCCCCCCCCA 984 hom 17 het 10 0 3 7 C 10 9 96689 CASAVA_Build 16 29211755 1I GCCATAACCA -/G GGGGGTCCTG 3070 hom 57 het 21 0 18 3 G 5 6 96690 CASAVA_Build 16 29223567 3I GCACATGGAA ---/AGG AGAACATTTA 867 het 867 ref 55 43 3 9 AGG 0 1 96691 CASAVA_Build 16 29226457 2D GTCAGCACTC AT/-- AATGTGGCTG 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 AT 1 0 96692 CASAVA_Build 16 29235700 1D GGCCTGGAGG C/- TGCACATGTG 2824 het 2824 ref 37 15 10 13 C 1 0 96693 CASAVA_Build 16 29244934 3I GTTTTGTCAT ---/AGC AGCATCACGC 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 AGC 1 2 96694 CASAVA_Build 16 29245153 5I CCCGTTCACA -----/CAGAG CCTGTTTCCT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 CAGAG 0 1 96695 CASAVA_Build 16 29246579 13D GTCATATGAG TGTTTCTTTGATT/------------- TGAAAAACGT 2234 het 2234 ref 20 17 5 1 TGTTTCTTTGATT 1 0 96696 CASAVA_Build 16 29249863 5D GAAATCTAAA TATTT/----- TGTTTTGGGG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 TATTT 1 0 96697 CASAVA_Build 16 29252007 3I ATGTGAAACA ---/AAT AATAATTTAT 3070 hom 39 het 14 0 13 1 AAT 2 3 96698 CASAVA_Build 16 29299329 2D TTATTTTATT TA/-- TATTTTTTGA 1823 hom 12 het 5 0 5 0 TA 2 1 96699 CASAVA_Build 16 29330135 1I CATGGAGAAA -/C CCCCCGTCTC 1708 hom 10 het 4 0 4 0 C 5 6 96700 CASAVA_Build 16 29332348 1D ACTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 253 hom 15 1 12 2 T 10 9 96701 CASAVA_Build 16 29333065 2I CTATAAAGAG --/GT GTGAGGATCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GT 1 2 96702 CASAVA_Build 16 29335678 3D CACTTCTCAA AAG/--- AAGACATTTA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AAG 2 1 96703 CASAVA_Build 16 29344563 1D AAGCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 30 1 20 9 A 13 12 96704 CASAVA_Build 16 29345863 2D TTCATATATC AT/-- ATGACTTCTA 3070 hom 112 het 42 0 38 4 AT 2 1 96705 CASAVA_Build 16 29425211 2I GTAAGTACAC --/AT GATCGCCAGC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AT 0 1 96706 CASAVA_Build 16 29469554 4D TCATTTTTAA TTTG/---- TTTATGTTCT 3070 het 3070 ref 28 15 12 3 TTTG 1 0 96707 CASAVA_Build 16 29507621 1D TTTGAGAAGC A/- CAAGGTGGGA 3070 hom 36 het 18 0 12 6 A 1 0 96708 CASAVA_Build 16 29551340 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 A 4 5 96709 CASAVA_Build 16 29562268 1I CAACATGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 T 11 12 96710 CASAVA_Build 16 29575341 1D ACTCCATCTC A/- AAAAATAAAA 3070 het 2542 hom 25 7 13 5 A 6 5 96711 CASAVA_Build 16 29587428 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 7 T 11 10 96712 CASAVA_Build 16 29595483 1I CCCTGTATCC -/A AAAAAAAAAA 2690 het 256 hom 16 3 10 3 A 13 14 96713 CASAVA_Build 16 29595547 12D AGAAAAAAAA AGCTCACTGCAT/------------ AGCTCACTGC 3070 hom 33 het 14 0 10 5 AGCTCACTGCAT 1 0 96714 CASAVA_Build 16 29638436 1I TGAAAGCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 11 12 96715 CASAVA_Build 16 29639973 1I ATAAAGACAC -/A AGACAAAGAG 2704 hom 27 het 10 0 8 2 A 1 2 96716 CASAVA_Build 16 29653217 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 2416 hom 19 6 9 4 CT 2 1 96717 CASAVA_Build 16 29674128 1D TTTATAGACC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 8 7 96718 CASAVA_Build 16 29681185 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 29 het 11 0 10 1 A 8 9 96719 CASAVA_Build 16 29688913 1D AAAATTTGCT G/- GGGGGTGGTC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 G 6 5 96720 CASAVA_Build 16 29697355 2D GGAGAAAAGA AT/-- AGTGACACAT 3070 hom 93 het 34 0 31 6 AT 1 0 96721 CASAVA_Build 16 29699320 1D ATGGCTCAAT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 A 8 7 96722 CASAVA_Build 16 29703911 1D GACGTGACAG C/- CCTTTGGCTG 3070 het 3070 ref 49 17 18 14 C 3 2 96723 CASAVA_Build 16 29704860 9D TTATTATTAT TATTTTTTG/--------- AGACGGAGTC 1267 het 1267 ref 10 6 4 0 TATTTTTTG 1 0 96724 CASAVA_Build 16 29710990 11I TTTATGATGT -----------/AAAAGAGGCCA AAGATGCTCT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 AAAAGAGGCCA 0 1 96725 CASAVA_Build 16 29714551 4D AAGTTTTATC TTCA/---- TTGTGTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 TTCA 1 0 96726 CASAVA_Build 16 29736403 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGCCTCAGC 3070 het 2333 hom 17 7 8 2 CTC 1 0 96727 CASAVA_Build 16 29739309 1I GAGGCGTTTG -/T TTGCAGCTAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 2 3 96728 CASAVA_Build 16 29756574 1D AGACTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 22 13 3 7 A 12 11 96729 CASAVA_Build 16 29757256 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1416 het 1416 ref 17 13 3 1 A 15 16 96730 CASAVA_Build 16 29768537 2I GGCATCTAGA --/CT CTGTCCTCCC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 CT 1 2 96731 CASAVA_Build 16 29774297 1I TTAAACTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 9 10 96732 CASAVA_Build 16 29776477 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2793 het 2793 ref 24 14 9 1 T 11 10 96733 CASAVA_Build 16 29785061 1I TTTCCAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 32 3 20 9 A 10 11 96734 CASAVA_Build 16 29804032 4D TCGTCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 2904 het 480 hom 13 1 8 4 AAAT 5 4 96735 CASAVA_Build 16 29807903 4I CTGTAATAAC ----/AGAT AGTATTTGCA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 AGAT 0 1 96736 CASAVA_Build 16 29810085 2D AGTGTTTCAC TA/-- TGTTGGCCAG 1396 het 1103 hom 10 4 4 2 TA 1 0 96737 CASAVA_Build 16 29814800 1I TTTTGTTTTG -/T TTTGAGACAG 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 3 4 96738 CASAVA_Build 16 29816449 4D GTTTTTCTGT CTGA/---- CTGTCACCTA 3070 het 3070 ref 44 27 10 9 CTGA 1 0 96739 CASAVA_Build 16 29820304 3I GGCAGCTCAG ---/GGT GGTGGCCCAG 2342 het 2342 ref 25 10 7 8 GGT 1 2 96740 CASAVA_Build 16 29821497 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1313 hom 18 5 12 1 T 9 10 96741 CASAVA_Build 16 29844583 1I GGGTCTGGGG -/A TGGGGGCACG 2480 het 174 hom 13 1 8 4 A 0 1 96742 CASAVA_Build 16 30003970 1I GGCTGGGCGT -/G GGGGGGGGCT 1374 het 657 hom 10 2 5 3 G 8 9 96743 CASAVA_Build 16 30022447 2I ATTGTAACAA --/GT GTGTACTTAT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 GT 2 3 96744 CASAVA_Build 16 30048228 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 38 3 24 11 T 12 13 96745 CASAVA_Build 16 30054989 2D ACCAGGAGGC AG/-- AGAGGTTGCA 3070 het 2472 hom 19 6 9 4 AG 3 2 96746 CASAVA_Build 16 30061342 2I GCTCCCGAAC --/CT CTGTCTTCTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CT 1 2 96747 CASAVA_Build 16 30065024 1I TTTTTGAGAC -/A AGAGTCTCGC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 1 2 96748 CASAVA_Build 16 30073006 1I GTTAGTGGCA -/C CCCCTCCTCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 4 5 96749 CASAVA_Build 16 30078517 1D GGCAATTCTG T/- TGGAAAGGAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 1 96750 CASAVA_Build 16 30084366 1D CATTATGGGA C/- CCCCCCCGCC 3070 hom 98 het 35 0 29 6 C 8 7 96751 CASAVA_Build 16 30202817 1D CTTTTTTTTT C/- CCCCCCTCCT 2410 het 2410 ref 25 15 7 3 C 7 6 96752 CASAVA_Build 16 30218830 1I TACTTGTCTT -/C CCCTCCAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 3 4 96753 CASAVA_Build 16 30231771 1I ATGTCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2439 het 2439 ref 23 14 6 3 T 10 11 96754 CASAVA_Build 16 30244142 1I ACTCTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 10 11 96755 CASAVA_Build 16 30269036 2I CTGCATATAT --/AC ACACACACAA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 AC 4 5 96756 CASAVA_Build 16 30281358 1I CTCAATTGTT -/G GGACATTTCG 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 G 2 3 96757 CASAVA_Build 16 30299434 3D CAAAAAAATA TTT/--- TTTAAGTTAG 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 6 3 96758 CASAVA_Build 16 30304403 1I GCCAAGATCA -/C CACCACTGCA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 C 1 2 96759 CASAVA_Build 16 30312712 1I TAAATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1075 het 1075 ref 44 34 3 7 T 10 11 96760 CASAVA_Build 16 30332390 1D AAATTTTGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 104 het 40 0 34 7 T 9 8 96761 CASAVA_Build 16 30349225 4I AGGTATTAAA ----/TCTC TCAGGGCTTA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 TC 1 3 96762 CASAVA_Build 16 30352500 1D ACACAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 85 het 38 0 27 11 A 10 9 96763 CASAVA_Build 16 30359305 1D TTCTAGAACT C/- CGCTTAGATG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 C 2 1 96764 CASAVA_Build 16 30366206 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 19 2 12 6 A 20 19 96765 CASAVA_Build 16 30368302 1D CATTTCCCCC T/- TTTTTTTTTT 1001 het 1001 ref 26 18 3 5 T 11 10 96766 CASAVA_Build 16 30369412 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 123 hom 26 2 17 8 A 15 14 96767 CASAVA_Build 16 30381988 10D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 1793 hom 5 het 9 0 7 4 A 26 16 96768 CASAVA_Build 16 30388612 1D TATATGTGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 10 9 96769 CASAVA_Build 16 30411078 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 26 2 15 9 T 15 14 96770 CASAVA_Build 16 30420507 1I AAACTTAGGG -/T ATTTTTTAAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 0 1 96771 CASAVA_Build 16 30422264 1D TTTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 18 0 11 7 T 13 12 96772 CASAVA_Build 16 30502668 1D ACTCTCTAAT A/- AAAAAAAAAA 559 het 559 ref 20 8 4 8 A 15 14 96773 CASAVA_Build 16 30530314 1D AGTTATTCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 T 11 10 96774 CASAVA_Build 16 30618469 1D TTTTGCTGTA T/- TTTTTTTTTG 1265 het 1265 ref 25 18 3 4 T 10 9 96775 CASAVA_Build 16 30649161 21I ACTAACAGTC ---------------------/GCTTAAACCACAAGAGCATTT ATTGTTTTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 GCTTAAACCACAAGAGCATTT 0 1 96776 CASAVA_Build 16 30669603 4D GAGACTTAGA TCTT/---- TCTTTCCCCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TCTT 2 1 96777 CASAVA_Build 16 30671863 1I CATGGCATAA -/T TGCAGGTATT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 1 2 96778 CASAVA_Build 16 30675994 7D CTCCTCTGGG CTCTGGC/------- CTCTGGCCTC 3070 hom 83 het 33 0 25 12 CTCTGGC 2 1 96779 CASAVA_Build 16 30707343 2D ATCCTGTCGC AA/-- AAAAAAAAAA 2085 het 1350 hom 36 10 9 17 A 17 15 96780 CASAVA_Build 16 30712165 2D TTTGTATCTA TC/-- TCTAAAACTA 3070 het 3070 hom 39 9 24 6 TC 2 1 96781 CASAVA_Build 16 30718523 1D AGTAGAGACA G/- GGGTTTCACC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 4 3 96782 CASAVA_Build 16 30726193 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 495 hom 22 3 10 9 T 13 14 96783 CASAVA_Build 16 30736497 1D AGTAGAGACA G/- GGTTTCACTA 1866 het 1866 ref 17 8 5 4 G 3 2 96784 CASAVA_Build 16 30760837 1D AGGTGCCCCC T/- GACCCCTTCT 3070 hom 26 het 16 0 10 8 T 1 0 96785 CASAVA_Build 16 30768009 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1510 het 700 hom 15 4 6 5 A 13 14 96786 CASAVA_Build 16 30784550 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1550 het 77 hom 20 2 7 11 T 17 16 96787 CASAVA_Build 16 30791914 1I AGGTGTATTC -/A AAAAGGAAAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 4 5 96788 CASAVA_Build 16 30792054 4D GCTCAAGGAG TTGA/---- TTTTGTTAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 TTGA 1 0 96789 CASAVA_Build 16 30814497 4I TTCCAGCAAT ----/TGTC TGCTCACGGC 3070 hom 132 het 47 0 42 5 TGTC 0 1 96790 CASAVA_Build 16 30824287 4I TTATATTAAT ----/ATCA ATCAATGAAC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 ATCA 1 2 96791 CASAVA_Build 16 30837490 25D CCGCCTTCTT CTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTC/------------------------- CTTCTTCTCC 3070 het 3070 ref 45 23 18 13 CTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTC 1 0 96792 CASAVA_Build 16 30853480 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2678 het 2379 hom 22 7 10 5 A 11 12 96793 CASAVA_Build 16 30855789 4I GGTCTTGAAC ----/TCCT TCCTGACCTC 3070 het 503 hom 14 2 11 1 TCCT 1 2 96794 CASAVA_Build 16 30870951 2D CTTATCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 20 1 9 10 T 16 14 96795 CASAVA_Build 16 30873051 1I GTTGGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2742 het 2742 ref 45 17 12 16 T 15 16 96796 CASAVA_Build 16 30874779 1D AGCTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 1822 het 566 hom 18 2 8 8 T 15 14 96797 CASAVA_Build 16 30878563 3D GGTCCCTTCA TTC/--- TTCTTCTTCT 2701 het 412 hom 33 5 14 15 TTC 4 3 96798 CASAVA_Build 16 30894882 1D TTTGACCCTG T/- TGCTGTAGGA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 2 1 96799 CASAVA_Build 16 30910334 2I GTGCACGCAC --/AT GTGTGTGTGT 3070 het 473 hom 60 2 48 10 AT 0 1 96800 CASAVA_Build 16 30913449 1I GAAGAGACCG -/T TGACCCACAG 3070 het 3070 hom 52 18 16 18 T 1 2 96801 CASAVA_Build 16 30913791 8I TGGAGTGCAG --------/TGGTGCTA TGGTGCTATC 3070 het 2509 hom 23 8 14 1 TGGTGCTA 1 2 96802 CASAVA_Build 16 30934361 2I TGGCGAAACC --/CT GTCTCTACTA 3070 het 2766 hom 23 8 10 5 CT 0 1 96803 CASAVA_Build 16 30939911 1I GCGCCCGCCA -/C CACGCCCAGC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 1 2 96804 CASAVA_Build 16 30942883 1D TCCCGAGTAG C/- TGGGGTTACA 3070 het 3070 hom 49 16 28 5 C 1 0 96805 CASAVA_Build 16 30950354 1D ACTAGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 20 1 13 6 T 12 11 96806 CASAVA_Build 16 30963594 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2944 het 810 hom 34 5 12 17 A 16 17 96807 CASAVA_Build 16 30969426 16D TTTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TGAGATGGAG 3070 het 2428 hom 29 9 15 6 T 17 1 96808 CASAVA_Build 16 30974484 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 547 hom 16 4 11 1 A 13 12 96809 CASAVA_Build 16 30974987 2D ATCTCTTTTC TT/-- TTCTTCTTCT 2170 het 1597 hom 24 5 6 14 T 4 2 96810 CASAVA_Build 16 30977217 4I CACTCTAGCC ----/TGAG TGACAGAATG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 TGAG 0 1 96811 CASAVA_Build 16 30981933 5D CAAACAAACA AAAAC/----- AAAACAAAAC 2855 het 1617 hom 13 4 6 3 AAAAC 4 3 96812 CASAVA_Build 16 30982289 1D TGAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 11 10 96813 CASAVA_Build 16 31016789 7I ATCCAGGCTG -------/TCATCCA GAGTACGGTG 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 TCATCCA 0 1 96814 CASAVA_Build 16 31034515 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTC 1726 het 1726 ref 19 10 6 4 T 10 9 96815 CASAVA_Build 16 31035174 16D AGCTGGGACT ACAGGTGCGTGCCACC/---------------- ACGCCCGGCT 1676 het 1177 hom 5 4 4 0 ACAGGTGCGTGCCACC 1 0 96816 CASAVA_Build 16 31083648 1D CCCAAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 T 11 10 96817 CASAVA_Build 16 31089376 1I TAGAAGTTGC -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 7 8 96818 CASAVA_Build 16 31103643 11D TTCCTAGCTG TCTTTTTACTT/----------- TCTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 31 17 13 6 TCTTTTTACTT 1 0 96819 CASAVA_Build 16 31144209 1D GGGCCAGGTT G/- GGGGATTGAT 3070 hom 85 het 35 0 27 8 G 5 4 96820 CASAVA_Build 16 31156286 1D TCTCTCAGCC T/- TTTTTTTTTG 2766 hom 24 het 12 0 7 5 T 10 9 96821 CASAVA_Build 16 31159720 4I ACATGATGGG ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAAT 3 4 96822 CASAVA_Build 16 31160182 1I ATCTGCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 35 0 27 8 T 12 13 96823 CASAVA_Build 16 31162265 4D ATATATATAT ATAC/---- ACACACACAC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 ATAC 1 0 96824 CASAVA_Build 16 31170530 1I ATTTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 2139 het 2139 ref 35 13 8 14 T 15 16 96825 CASAVA_Build 16 31172940 2D ACACCAGATT TC/-- TACATACGTA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TC 1 0 96826 CASAVA_Build 16 31250683 10I GTGTATGTGC ----------/GTGTGTGCGA GTGTGTGCAA 3070 het 3070 ref 52 19 13 20 GTGTGTGCGA 0 1 96827 CASAVA_Build 16 31253866 1I GTGCCCAGCC -/A AAAAAATGGT 3070 het 2802 hom 24 8 12 6 A 6 7 96828 CASAVA_Build 16 31255767 3D CTTCTTCTTA TTC/--- TTCTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 TTC 2 1 96829 CASAVA_Build 16 31268576 6I CGTGACTGGG ------/ACTGGA ACTGGAACTA 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 ACTGGA 1 2 96830 CASAVA_Build 16 31302867 1D CATGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2463 het 2463 ref 35 20 6 9 A 15 14 96831 CASAVA_Build 16 31336769 1D AATCCGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 A 9 8 96832 CASAVA_Build 16 31365240 4D ACCCCTGTGA TAAC/---- TAACTCATTC 3070 het 3070 ref 46 23 21 3 TAAC 2 1 96833 CASAVA_Build 16 31427877 1D TTCTTGTGTG T/- TTTTTTGCGG 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 7 6 96834 CASAVA_Build 16 31430255 2I GTGCTGGGCT --/TA TATAGGCATG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TA 2 3 96835 CASAVA_Build 16 31434176 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 12 11 96836 CASAVA_Build 16 31434450 10I CCCTGACTTC ----------/ATGAAAGAAT ATGGTCTTTT 3070 het 3070 hom 44 21 20 4 ATGAAAGAAT 0 1 96837 CASAVA_Build 16 31434716 2I ACTACAAAAC --/TT TTTAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 3 5 96838 CASAVA_Build 16 31436933 4I TGAATTATAA ----/ATAG ATAAATGGTA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 ATAG 0 1 96839 CASAVA_Build 16 31438171 1D AATTTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 21 0 19 2 A 12 11 96840 CASAVA_Build 16 31440616 1D GGGGGTGAGG C/- CTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 53 22 23 9 C 2 1 96841 CASAVA_Build 16 31457136 1I AGAAAAAAAC -/A GATGATCTAT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 0 1 96842 CASAVA_Build 16 31465801 2I CTAGGTTATA --/CT CTCTAAAGGA 3070 het 3070 ref 32 22 8 2 CT 2 3 96843 CASAVA_Build 16 31470528 3I CAGCGTGAAA ---/CAC CATCTCTACT 3070 het 2941 hom 36 7 28 1 CAC 0 1 96844 CASAVA_Build 16 31472217 2D CAGTGTTACC TT/-- TGAGTACTTC 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 T 3 1 96845 CASAVA_Build 16 31489268 8I TGGCGCCATT --------/GCACTCCA GCCTGGGCAA 3070 het 1499 hom 17 5 9 3 GCACTCCA 0 1 96846 CASAVA_Build 16 31501621 1D CAGTTTGAAT A/- AAAAAAGTAG 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 7 6 96847 CASAVA_Build 16 31503377 1D TTTAAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 2578 het 2578 ref 26 10 8 8 T 11 10 96848 CASAVA_Build 16 31519650 6D TCTGTGAGGC ATTTTT/------ ATTTTTAACA 3070 het 3070 ref 21 10 8 5 ATTTTT 2 1 96849 CASAVA_Build 16 31521127 1D GAAGAATAAG T/- AAAACATTTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 1 0 96850 CASAVA_Build 16 31536975 1I GAAAGAATGG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 7 8 96851 CASAVA_Build 16 31544878 1I CCCCCCCACC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 9 10 96852 CASAVA_Build 16 31545740 3I AGCATAAAGG ---/TCT TCTTCACCAG 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 TCT 1 2 96853 CASAVA_Build 16 31548445 2D ACTCCATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 1725 het 510 hom 13 4 4 5 A 16 14 96854 CASAVA_Build 16 31556670 1D GGCCTAATTA T/- ATTTTTGATC 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 T 1 0 96855 CASAVA_Build 16 31571935 1I2M2I TGTAGACCCC -CA--/TCAAG GGATGACAAG 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 N/A 0 0 96856 CASAVA_Build 16 31584620 1D CAGACCCTCC A/- AACATGGGGA 3070 het 3070 ref 62 49 9 7 A 3 2 96857 CASAVA_Build 16 31592836 1I ATGGTTCCAA -/T TTTATGGGTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 3 4 96858 CASAVA_Build 16 31610739 1I AACTATACTT -/A ACTACAAGCC 1834 het 1834 ref 12 5 4 3 A 1 2 96859 CASAVA_Build 16 31612364 1I TCCCTGGCTT -/C CCCCACCATG 3070 hom 84 het 30 0 27 3 C 4 5 96860 CASAVA_Build 16 31612820 2I ACACGTACGC --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 51 21 15 15 CA 8 9 96861 CASAVA_Build 16 31613596 2I TGCACACACT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 68 26 24 18 AC 6 7 96862 CASAVA_Build 16 31614505 1D TGATTATAGA T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 7 6 96863 CASAVA_Build 16 31619339 1I CTATCCATTC -/A AGCGGCGCCG 746 het 746 ref 26 10 3 13 A 1 2 96864 CASAVA_Build 16 31619946 3D CTGAGCAAAT AAC/--- GACCCGTGAA 2928 het 2928 ref 27 14 10 5 AAC 1 0 96865 CASAVA_Build 16 31641699 1I TGTTTCCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 9 10 96866 CASAVA_Build 16 31649051 1I ATTCCTTTAA -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 96867 CASAVA_Build 16 31650187 1D GGAAGACAAC T/- TTCTTCAGGA 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 T 3 2 96868 CASAVA_Build 16 31653884 12D CTGCCTGCCC TTTCTTTTCTCT/------------ TTTCTTTTCT 3070 hom 53 het 24 0 15 11 TTTCTTTTCTCT 2 1 96869 CASAVA_Build 16 31655232 2D GTACATTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 25 1 13 11 T 16 14 96870 CASAVA_Build 16 31663671 5D TAGTATTGGG AGGGT/----- AGGGTGTATG 3070 hom 74 het 28 0 24 4 AGGGT 2 1 96871 CASAVA_Build 16 31664518 1I TGTCTTGTTG -/A ATCTGTCTAA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 A 1 2 96872 CASAVA_Build 16 31669540 1D TGTTGAGGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 10 9 96873 CASAVA_Build 16 31678198 1I TCCTATGGTG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 7 8 96874 CASAVA_Build 16 31695250 3D GTCTGGCCAG CAT/--- CATAGTGAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 CAT 2 1 96875 CASAVA_Build 16 31697392 1I GTAGCATTCT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 G 1 2 96876 CASAVA_Build 16 31698444 1D ACTGAATCAT G/- GGGGTAGGTC 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 G 5 4 96877 CASAVA_Build 16 31700461 2D AAGTTCTCTC TG/-- TGTGTCTGCT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 TG 3 2 96878 CASAVA_Build 16 31702661 1I GTTTTTTGTG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 2733 hom 28 11 13 4 T 7 8 96879 CASAVA_Build 16 31705345 4D AATTTTACTG AATT/---- TATTGATCAA 3070 het 3070 ref 30 14 14 4 AATT 1 0 96880 CASAVA_Build 16 31707388 10D CTCTTTGCAA TCAATGTATG/---------- TGTCTTTACA 3070 het 3070 ref 45 25 20 4 TCAATGTATG 1 0 96881 CASAVA_Build 16 31709860 1I AGCCACTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 12 13 96882 CASAVA_Build 16 31712591 2I AACCAAAGGC --/CT CTCTGACACT 1671 het 1671 ref 32 21 4 7 CT 2 3 96883 CASAVA_Build 16 31715379 15D CCCATTCTTA TGTCTAGGATGGTAT/--------------- TGTCTAGGAT 3070 hom 36 het 18 0 12 8 TGTCTAGGATGGTAT 2 1 96884 CASAVA_Build 16 31718363 4I TATAGCAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 AAAT 2 3 96885 CASAVA_Build 16 31719965 6I GATACAACTA ------/AAACAT AAACATAATC 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 AAACAT 1 2 96886 CASAVA_Build 16 31739144 1I CTTAAAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 11 12 96887 CASAVA_Build 16 31740981 1D ACGTTACTTC T/- CATCGTTTGC 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 T 1 0 96888 CASAVA_Build 16 31741764 1I TGTTTTGGGG -/T TTTTTTTTTG 2398 het 2398 ref 26 13 9 4 T 9 10 96889 CASAVA_Build 16 31744366 2I AAAGAATCTC --/AG AGCTCAAAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AG 1 2 96890 CASAVA_Build 16 31746158 1D AAATAAATAA T/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 T 1 0 96891 CASAVA_Build 16 31751588 12I CTCCCCAAGC ------------/CTGAACAAGAGG CTGGACACTT 3070 hom 129 het 47 0 42 5 CTGAACAAGAGG 0 1 96892 CASAVA_Build 16 31764982 1I TGCTGGGACT -/A CAGGTGTGAG 3070 hom 135 het 49 0 42 7 A 0 1 96893 CASAVA_Build 16 31775937 1D AAAAATAGAA G/- GGGGGGGAAT 3070 hom 66 het 29 0 22 9 G 8 7 96894 CASAVA_Build 16 31778315 3D GGACATGATG AGA/--- AGAAGTGACC 3070 hom 90 het 32 0 29 3 AGA 2 1 96895 CASAVA_Build 16 31797455 1I ACCCAGGGAT -/A ATGTCAGAGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 1 2 96896 CASAVA_Build 16 31807989 1I GTCCTCTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 9 10 96897 CASAVA_Build 16 31815008 4D AGTTTAAAAC ATTT/---- TTTTTTAGGG 3070 hom 99 het 35 0 32 4 ATTT 1 0 96898 CASAVA_Build 16 31817370 1I GTTTTATTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 10 96899 CASAVA_Build 16 31842579 3I AATAAAATGA ---/TGT TGTAGAATTC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 TGT 1 2 96900 CASAVA_Build 16 31843232 1D TTTGAAGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 30 8 T 10 9 96901 CASAVA_Build 16 31849473 1I AATTCATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 36 1 28 7 A 11 12 96902 CASAVA_Build 16 31853619 1D CAAAATAAAC A/- AAAAAATATC 3070 hom 105 het 42 0 37 5 A 7 6 96903 CASAVA_Build 16 31872654 1I GCAGTAAAAT -/A AAAAAAATTG 1342 het 1342 ref 37 32 3 2 A 7 8 96904 CASAVA_Build 16 31873869 4D CTTGTCTCAG ACAA/---- ACAAACATGT 3070 hom 184 het 64 0 62 3 ACAA 2 1 96905 CASAVA_Build 16 31878542 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1602 het 1602 ref 18 11 4 4 A 15 14 96906 CASAVA_Build 16 31894167 1I CTCTGTTTGA -/G TGGGAGATGT 1939 het 1939 ref 44 31 5 8 G 0 1 96907 CASAVA_Build 16 31912431 1I TATTTTCTTA -/T TTTTTCCCCA 2377 het 2377 ref 33 25 5 3 T 5 6 96908 CASAVA_Build 16 31945085 5I AATTTTCATA -----/TTTAT TTTAAGATTT 1905 het 1905 ref 25 20 4 1 TTTAT 0 1 96909 CASAVA_Build 16 31961417 1I AACTTCTAAC -/T GTTGTTAGCT 766 het 766 ref 34 28 3 3 T 0 1 96910 CASAVA_Build 16 31965886 1D GTCTTGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 47 0 39 9 A 10 9 96911 CASAVA_Build 16 31997271 4I TACAAGAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 het 1639 hom 18 6 10 2 AAAC 1 2 96912 CASAVA_Build 16 32001508 2D AAAATACAGA CT/-- TATATAAGTA 3070 het 3070 hom 56 16 35 5 CT 1 0 96913 CASAVA_Build 16 32001600 1D TAAATGACAA T/- GAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 77 35 23 21 T 1 0 96914 CASAVA_Build 16 32001784 2I TGCACAAACC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 83 51 17 15 T 10 12 96915 CASAVA_Build 16 32004985 1I29M3I CTTGATGTTA -TGTAGCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTA---/GTCTATCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGAG AAGGGGTTTT 3070 het 3070 ref 23 17 9 3 N/A 0 0 96916 CASAVA_Build 16 32005451 5I14M5I TTTCTGCATG -----TATATGTCAATAAA-----/TATGATATATGTCAATAAATGTCT TAAATTATAT 1381 het 1381 ref 19 8 3 8 N/A 0 0 96917 CASAVA_Build 16 32005809 4D38M5I AAAATATTTT AATAAATTGAGTGCATTTCACACGCTAAGGAAATGATCTTAC-----/----AATTGAGTGCATTTCACACGCTAAGGAAGTGATCTTACTTGAT TTGATAGTTG 2421 het 2421 ref 17 15 5 10 N/A 0 0 96918 CASAVA_Build 16 32007223 1D GCCCATCAAA G/- TCTCACCTGA 2530 het 2530 ref 57 39 6 12 G 1 0 96919 CASAVA_Build 16 32007543 1I CATTTGTATG -/A ACTTGCAATT 1748 het 1748 ref 56 46 4 6 A 1 2 96920 CASAVA_Build 16 32009556 3I TTTGAGTAAT ---/AAG AACAGAAATC 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 AAG 0 1 96921 CASAVA_Build 16 32010948 2D AATGTTATGA CT/-- CTATTTAGTA 1329 het 1329 ref 35 31 3 2 CT 2 1 96922 CASAVA_Build 16 32012045 1I AACATTCAAA -/G ATGACCTGCC 3070 het 534 hom 44 2 38 4 G 0 1 96923 CASAVA_Build 16 32012337 1I CCTAGTGGTG -/T TTGTAAAACA 3070 het 3070 ref 83 46 13 24 T 2 3 96924 CASAVA_Build 16 32012442 18D ACTAGGGGCT TAGTCTATAGTCCTATGA/------------------ ATCAAAGACA 2069 het 2069 ref 80 75 5 4 TAGTCTATAGTCCTATGA 1 0 96925 CASAVA_Build 16 32012540 4D ATGATGTATT GCAA/---- TTAATCTCAA 2947 het 2947 ref 36 21 7 10 GCAA 1 0 96926 CASAVA_Build 16 32012580 2I AAAATTAATA --/AG GTTTATTATT 1703 het 1703 ref 39 25 4 10 AG 0 1 96927 CASAVA_Build 16 32013161 1D TACAAGTCAA T/- GGCTTTTAGT 3070 het 3070 ref 72 39 24 9 T 1 0 96928 CASAVA_Build 16 32015125 6I TGAGTTTTTA ------/CTTTTT TTTTTAATCA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 CTTTTT 0 1 96929 CASAVA_Build 16 32016130 1I ATCATGTTTC -/T TTTCTCCAAA 3070 het 3070 hom 83 36 41 6 T 3 4 96930 CASAVA_Build 16 32016570 1I AGCATTTTAG -/T CCAGTCACGC 3070 het 3070 hom 78 15 49 15 T 0 1 96931 CASAVA_Build 16 32016840 5I AAATATGTAT -----/TATAA TCTCATGGGA 3070 het 3070 ref 81 29 36 16 TATAA 0 1 96932 CASAVA_Build 16 32018626 1I GACTAGTGCC -/A CCGTGGAAAA 1129 het 1129 ref 17 13 3 1 A 0 1 96933 CASAVA_Build 16 32026479 1I112M1I8M6D TACCTTTGGA -TTTTTTCCCAAATACCTTTTTATTTCTTCTTTTCTTTATGGTTTTAGAAAATGTAGTTTACATAATTGCAGCTTGATTTTTTTACTCAGTTAATGGCATGCCTAATGGAGAG-AAAAATATTAAATA/TTTTTTTCCCAAATACCTTTTTATTTCTTCTTTTCTTTATGGTTTTAGAAAACGTAGTTTACATAATTGCAGCTTGATTCTTTTACTCAGTTAATGGCATGCTTAATGGAGAGAAAAAATAT------ TATTTCCCTT 2949 het 2353 hom 14 6 6 27 N/A 0 0 96934 CASAVA_Build 16 32026779 6D TATTTTCTCT TTTTTG/------ TTTTTTAAGG 1446 het 1446 ref 11 6 3 2 TTTTTG 1 0 96935 CASAVA_Build 16 32030500 2D AAGAGATAAC AG/-- AAATTCTGGA 2741 het 2741 ref 70 56 6 8 AG 1 0 96936 CASAVA_Build 16 32030781 3I39M5D CCTCCTTCCC ---CCTCCTCCTTTTTACTTTTCTTCCTCTTCCTTTCTCTTCTTCTT/CCTCCTCCTCCTTTTTACTTTTCTTCCTCTTCCTTTCTCTTC----- TCTCTCCTTC 2078 het 2078 ref 62 46 7 29 N/A 0 0 96937 CASAVA_Build 16 32030853 2D TTTCGCTGTT TC/-- TCTTTCTCCC 2161 het 2161 ref 77 48 6 25 TC 2 1 96938 CASAVA_Build 16 32030874 4D CTTTCTCTTT TTTC/---- TTTTCTTTCA 3070 het 3070 ref 75 50 17 8 TTTC 1 0 96939 CASAVA_Build 16 32032969 1D TCTTGTGTGC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 65 28 36 1 A 9 8 96940 CASAVA_Build 16 32034059 1D CTCATCCCCC A/- GCCAATCAGT 3070 het 3070 ref 29 21 8 0 A 1 0 96941 CASAVA_Build 16 32034201 27D ATGCCTGCCA AATGTGAACATACAAAAAACAAATCAG/--------------------------- AATGTGCCAT 1155 het 1155 ref 13 11 3 0 AATGTGAACATACAAAAAACAAATCAG 1 0 96942 CASAVA_Build 16 32037214 5I28M1I AGGTAGAGAT -----AACATGGTCTCAGGACAGCTGTTGAGAT-/GTAGAGAAATGCTCTCAGGACAGCTGTTGAGATA AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 36 21 16 8 N/A 0 0 96943 CASAVA_Build 16 32041149 1I CTACTGTGCA -/G GGGGGCAAGC 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 G 5 6 96944 CASAVA_Build 16 32042658 2D GCCTAATAAA CT/-- CAACCCCTTG 3070 het 3070 ref 80 59 16 5 CT 1 0 96945 CASAVA_Build 16 32044377 4I18M4D GTGTGTGTGA ----GAGTGTGTGGTTTGTGTGTCTA/GAGGGAGTGTGTGGTTTGTGTG---- TATATATGTA 3070 het 3070 ref 85 39 13 66 N/A 0 0 96946 CASAVA_Build 16 32044761 1D TAATTTTGTA T/- TATTAATTTG 3070 het 3070 ref 80 49 14 17 T 2 1 96947 CASAVA_Build 16 32044876 2I TAGATACAAC --/AG AGAGAAATGC 1768 het 1768 ref 69 59 6 4 AG 2 3 96948 CASAVA_Build 16 32046315 4I TTTGCATATT ----/AGTA AGAAGAAAAT 3070 het 3070 hom 75 21 48 6 AGTA 0 1 96949 CASAVA_Build 16 32046796 1D TATATTTTAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 87 58 17 12 T 9 8 96950 CASAVA_Build 16 32046858 4I ACTATACTAT ----/AAGA AAGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 79 35 36 8 AAGA 1 2 96951 CASAVA_Build 16 32046956 1I TTTTTTGCTA -/T TTATTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 2 3 96952 CASAVA_Build 16 32049357 1I GGTACCTAAC -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 78 43 28 7 T 6 7 96953 CASAVA_Build 16 32050418 1I TTATCACTTT -/A TTCCACTATT 3070 het 3070 ref 60 28 24 8 A 0 1 96954 CASAVA_Build 16 32050545 4D15M1D TTATAAACTG AGTCAGTATCTCAAGATTTG/----AGTATCTCAAGATTT- ATCCCCATTA 1253 het 1253 ref 66 70 3 17 N/A 0 0 96955 CASAVA_Build 16 32051279 3I TGAGAAAATG ---/TGT TTATTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 TGT 0 1 96956 CASAVA_Build 16 32051549 2D TTCACGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2032 hom 26 8 10 9 TA 7 6 96957 CASAVA_Build 16 32056482 1I AGACATGATT -/G TTTATCAGCA 2439 het 2439 ref 17 9 5 3 G 0 1 96958 CASAVA_Build 16 32057113 37D CCTGATGGAC AGGTTTCACTCAAGTTCAGAGAACAGCATGCAAAATT/------------------------------------- AGCTATCAAT 867 het 867 ref 68 77 3 2 AGGTTTCACTCAAGTTCAGAGAACAGCATGCAAAATT 1 0 96959 CASAVA_Build 16 32058750 1I AAATGAAAAA -/T GTGACATATA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 0 1 96960 CASAVA_Build 16 32059913 1I CATGGAAGAG -/A AAAAAAAGAA 1237 het 1237 ref 21 16 3 3 A 7 8 96961 CASAVA_Build 16 32060285 1D TAGGTCTGTG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 8 7 96962 CASAVA_Build 16 32061821 1D TCCTACAGCT A/- AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 A 7 6 96963 CASAVA_Build 16 32070597 2I AAAAAAAAAA --/AC CTTAAAAAAA 3070 het 1981 hom 14 4 9 1 AC 0 1 96964 CASAVA_Build 16 32085348 4D GATGCAATTG TTGA/---- CTCACCAAGC 2223 het 718 hom 7 2 5 0 TTGA 1 0 96965 CASAVA_Build 16 32088057 1D CTTAATTTCC A/- AAAAAAAAAA 2640 het 2640 ref 56 34 7 15 A 13 12 96966 CASAVA_Build 16 32097383 1D TATGGTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 72 33 30 9 A 11 10 96967 CASAVA_Build 16 32097577 1I TGTATTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 24 17 11 T 10 11 96968 CASAVA_Build 16 32111159 2D ACACACACAC AT/-- ATATATACAA 3070 het 2540 hom 26 14 9 3 AT 4 3 96969 CASAVA_Build 16 32119822 1D GCTTCCTGGG C/- CCCCTCCTGT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 C 5 4 96970 CASAVA_Build 16 32127808 1D TGCAGTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 34 2 15 19 T 12 11 96971 CASAVA_Build 16 32134458 4D34M1I ATCTGAGTAA TTTGTTTGCTTACATTAAATATCATAATACTTTTCAGC-/----TTTGCTTACATTAAATATCGTAATACTTTTCAGCA AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 25 14 12 13 N/A 0 0 96972 CASAVA_Build 16 32138020 1D GCAATATTTA C/- CAAAAGACAA 1392 het 966 hom 7 2 4 2 C 2 1 96973 CASAVA_Build 16 32156295 17D GATTCAAGAA GTTTAATGTAGGAGAAT/----------------- GTTTAATGTA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 GTTTAATGTAGGAGAAT 2 1 96974 CASAVA_Build 16 32159999 5I TTATTATTAC -----/TTATT TTATTTTATT 1449 het 1449 ref 9 5 3 1 TTATT 3 4 96975 CASAVA_Build 16 32164858 1D GTGTGAAGTG T/- TTTTTTTTCT 1931 het 1931 ref 35 25 8 2 T 9 8 96976 CASAVA_Build 16 32167775 1I TTAAATTACT -/A AAAAAAAAAA 1611 het 1611 ref 49 32 6 11 A 15 16 96977 CASAVA_Build 16 32174124 1I TCTTTAGATT -/A AAAAAAAAAA 2399 het 2399 ref 23 10 5 8 A 11 12 96978 CASAVA_Build 16 32180838 1D GAGCTTCCAG A/- AAGCCCCACC 3070 het 3070 ref 72 41 19 12 A 3 2 96979 CASAVA_Build 16 32181416 2D CTCTAGATGC TG/-- TGTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 32 16 8 10 TG 2 1 96980 CASAVA_Build 16 32203243 5I TGAAATGACT -----/ACATG AGATGAAATC 1832 het 1832 ref 43 31 5 7 ACATG 0 1 96981 CASAVA_Build 16 32212040 1D TTTTATGATC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 T 8 7 96982 CASAVA_Build 16 32212272 5D CAGAAAATTC TTTTA/----- TTTTAAGGTG 3070 het 3070 ref 58 47 8 11 TTTTA 2 1 96983 CASAVA_Build 16 32212392 1D CATAGAACAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 55 20 21 14 T 8 7 96984 CASAVA_Build 16 32215552 1D AGGCAATGTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 T 8 7 96985 CASAVA_Build 16 32219708 1D CTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 58 40 9 9 T 9 8 96986 CASAVA_Build 16 32223887 2D CACCACCAAC CA/-- CAGTGAGGCA 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 CA 2 1 96987 CASAVA_Build 16 32225269 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 60 42 8 10 A 7 8 96988 CASAVA_Build 16 32227927 2D AGACGAACCT CG/-- CTATGTTTCC 3070 het 3070 ref 81 65 9 10 CG 1 0 96989 CASAVA_Build 16 32228114 1I ACATGGCATT -/A AAAACAATCA 3070 het 3070 ref 98 77 11 10 A 4 5 96990 CASAVA_Build 16 32228401 4D ACTTGGGAGC TTGT/---- TTAAGTTCCA 2789 het 2789 ref 38 25 7 7 TTGT 1 0 96991 CASAVA_Build 16 32232578 2D AGTAACAAGG AA/-- AAAAAAAATA 2379 het 2379 ref 37 29 5 3 A 10 8 96992 CASAVA_Build 16 32234491 2I CCCCAATGCA --/AC AGTGTTGAGA 3070 het 3070 ref 32 14 8 10 AC 0 1 96993 CASAVA_Build 16 32234789 1I ATAGCAATAC -/A AAAAAAGACT 3070 het 3070 ref 78 40 29 9 A 6 7 96994 CASAVA_Build 16 32240122 2I GAGGCCGCAT --/GA GAGGGGGGTC 3070 het 3070 hom 49 15 26 8 GA 1 2 96995 CASAVA_Build 16 32240223 3D GGGGAAAGGT TTG/--- TTATTATTAG 3070 het 3070 ref 94 56 27 13 TTG 1 0 96996 CASAVA_Build 16 32244103 4I CACTTGTGTC ----/TTAT TTAATGATTT 2418 het 2418 ref 20 14 5 1 TTAT 0 1 96997 CASAVA_Build 16 32248585 1I ATTAACCACA -/T TTTTTCTTAT 1248 het 1248 ref 25 17 3 5 T 5 6 96998 CASAVA_Build 16 32248828 1D CATTATATAT G/- TATGTCACAT 1361 het 1361 ref 17 7 3 7 G 1 0 96999 CASAVA_Build 16 32250324 3I7M2D TCTTAAATAA ---TAAAATTAA/AATTAAAATT-- AATGAATTGT 1194 het 1194 ref 67 65 3 6 N/A 0 0 97000 CASAVA_Build 16 32254893 1D TTACACTGAG A/- AAAAATCTAA 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 A 6 5 97001 CASAVA_Build 16 32255123 1I TCAGATTTTG -/T TTTTTTTTCT 2244 het 2244 ref 58 48 5 5 T 8 9 97002 CASAVA_Build 16 32263629 1D AGCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2907 hom 62 10 29 23 A 12 11 97003 CASAVA_Build 16 32264465 2I ATAACACACT --/GA GAGACTAAAA 2656 het 2656 ref 98 86 6 6 GA 2 3 97004 CASAVA_Build 16 32266516 1D ACATGGCATT A/- AAAACAATCA 3070 het 3070 ref 92 72 14 6 A 5 4 97005 CASAVA_Build 16 32266549 3I GCTGAGAAAA ---/ATC ATATACTGTA 1125 het 1125 ref 82 63 3 16 ATC 0 1 97006 CASAVA_Build 16 32270611 1I ACTAGTCTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 71 37 15 21 T 9 10 97007 CASAVA_Build 16 32275167 1D AACTTTCCAA G/- GGGCCCTTAG 3070 het 3070 ref 63 31 16 17 G 4 3 97008 CASAVA_Build 16 32276587 1D AATAAAAATC G/- GGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 59 25 16 19 G 9 8 97009 CASAVA_Build 16 32280891 5D TATATCTGTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1116 het 1116 ref 52 41 4 8 T 15 10 97010 CASAVA_Build 16 32284387 1I TGGTCCAGAA -/T TTATTTTAGA 1722 het 1722 ref 76 67 4 5 T 2 3 97011 CASAVA_Build 16 32285985 1D TCCTCAGAAT G/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 80 47 28 5 G 1 0 97012 CASAVA_Build 16 32286677 1I AAGTTTCCTC -/A TGCTTATTTG 2779 het 2779 ref 74 60 6 8 A 0 1 97013 CASAVA_Build 16 32288629 2D GTCTTGACTC TT/-- TATCCAGTTT 3070 het 3070 hom 65 21 40 5 T 3 1 97014 CASAVA_Build 16 32293001 4D ATTAATTGAC TATT/---- TATGTGGGTT 3070 het 3070 ref 60 28 23 14 TATT 1 0 97015 CASAVA_Build 16 32296957 1D TTGGTATTTG T/- TTTTTTTTCT 2182 het 2182 ref 76 62 6 8 T 9 8 97016 CASAVA_Build 16 32298928 2I TAGCATACAT --/AG ATTTATCAAT 866 het 866 ref 85 74 3 8 AG 0 1 97017 CASAVA_Build 16 32299647 4D AAAAGGAGAC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 58 43 7 9 AAAT 4 3 97018 CASAVA_Build 16 32300749 1D ACATACAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2489 hom 34 10 16 8 T 15 14 97019 CASAVA_Build 16 32301944 2D CTGAATTGAG AC/-- AGTTTCTATT 3070 het 3070 ref 58 43 9 8 AC 1 0 97020 CASAVA_Build 16 32302273 3I ATATTAAAGC ---/TAG TAGTAAGGCT 3070 het 3070 ref 89 52 30 7 TAG 1 2 97021 CASAVA_Build 16 32304341 4D AAGACTTTAT TTAA/---- TTATCTTCCA 1057 het 1057 ref 65 53 3 11 TTAA 1 0 97022 CASAVA_Build 16 32304369 3I CTATTGTTGC ---/TGA TAAGAATTGA 3070 het 3070 ref 43 30 9 4 TGA 0 1 97023 CASAVA_Build 16 32304698 1I TTCCACCTCG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 49 27 10 12 T 7 8 97024 CASAVA_Build 16 32306361 5D TTAACTATCA TATAT/----- TATAAGTTAA 3070 het 3070 ref 61 43 9 10 TATAT 1 0 97025 CASAVA_Build 16 32306561 1D CAGGCACGCA C/- CACCACGCCT 2257 het 2257 ref 27 22 5 0 C 2 1 97026 CASAVA_Build 16 32306656 1D TGTGATCCAG C/- CCACCTCAGC 3070 het 3070 ref 61 32 22 9 C 3 2 97027 CASAVA_Build 16 32307272 2D ATTTGCTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 90 42 17 31 TG 10 9 97028 CASAVA_Build 16 32309561 5D CATTAGAAAA TAAAG/----- TAAACATTTC 3070 het 3070 ref 57 30 22 8 TAAAG 1 0 97029 CASAVA_Build 16 32309844 1D GAAAAAGAAG C/- AAAAATTGTA 3070 het 3070 ref 71 57 10 4 C 1 0 97030 CASAVA_Build 16 32310094 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAACAA 97 het 97 ref 55 20 2 34 A 10 7 97031 CASAVA_Build 16 32310653 1D ATATTTTAAT A/- ATTAAAATAC 3070 het 3070 hom 42 17 24 1 A 2 1 97032 CASAVA_Build 16 32311354 4D TATGTATGTG TGTA/---- TATATATATT 3070 het 3070 ref 99 64 9 31 TGTA 1 0 97033 CASAVA_Build 16 32311481 1D TCTTTATTTA C/- CATCCATTTA 3070 het 3070 ref 78 45 24 11 C 2 1 97034 CASAVA_Build 16 32313480 6I TGTTAGATTT ------/AGGATC AAGTCTTTGA 3070 het 3070 ref 97 75 14 8 AGGATC 0 1 97035 CASAVA_Build 16 32315613 4I32M1D GGGCTTTTTT ----TTTTTTTTGGCTCCAAATGAATTTTAGAATGCT/TTTCTTTTTTTTGGCTCCAAATGAATTTTAGAATGC- TTTTTTTTAA 2608 het 2608 ref 66 58 6 30 N/A 0 0 97036 CASAVA_Build 16 32316976 1D TCTGATTGTG T/- TTTTTGTATC 3070 het 3070 ref 88 58 12 20 T 6 5 97037 CASAVA_Build 16 32316992 1I GTATCTTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 90 42 17 31 T 9 10 97038 CASAVA_Build 16 32317583 3D AGATATATTC TGT/--- TGTTGTTGGG 3070 het 3070 ref 86 68 10 8 TGT 3 2 97039 CASAVA_Build 16 32317835 5D AGTCTTCTTG TTGAA/----- TTGAACCCTT 3070 het 3070 ref 94 69 15 17 TTGAA 2 1 97040 CASAVA_Build 16 32320407 2I GAACCCAGAG --/AA AAAAAGAGTA 3070 het 3070 hom 50 22 26 2 A 5 7 97041 CASAVA_Build 16 32320946 1I CTGTTCATAT -/C CTTTGTCCAT 2474 het 2474 ref 70 56 7 7 C 1 2 97042 CASAVA_Build 16 32322010 1D TAATTCATTT G/- GGGGAGAGAT 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 G 5 4 97043 CASAVA_Build 16 32322242 4D TTGTGAAATG TCTC/---- TCTAAGTATT 3070 het 3070 ref 69 51 15 4 TC 3 1 97044 CASAVA_Build 16 32322446 1I ACCCCATTGG -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 ref 67 48 14 5 A 6 7 97045 CASAVA_Build 16 32322577 1I CCCACAGAAG -/T CATAAGACAA 3070 het 3070 ref 94 69 16 9 T 0 1 97046 CASAVA_Build 16 32323485 3D TCTTGTCCAT TGA/--- TGATTCACCT 3070 het 3070 ref 84 51 13 24 TGA 2 1 97047 CASAVA_Build 16 32323533 1I TTTTCTATGA -/C CTTTACATCT 3070 het 3070 ref 66 32 28 6 C 1 2 97048 CASAVA_Build 16 32324108 1D ATCTCCATAG A/- AAGCTCATTC 3070 het 3070 ref 70 51 11 8 A 3 2 97049 CASAVA_Build 16 32324819 2D CTTACCCCTC TT/-- TCTCTGTCAA 3070 het 3070 ref 30 12 9 12 T 3 1 97050 CASAVA_Build 16 32324876 2D TGTTCTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 15 13 T 13 11 97051 CASAVA_Build 16 32325683 1D GTCTCAAAAA G/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 62 42 17 4 G 1 0 97052 CASAVA_Build 16 32326582 2D TGAAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 19 17 13 A 13 11 97053 CASAVA_Build 16 32330754 1I CTAATGCTAT -/C CCCCCCTCCC 2419 het 2419 ref 33 16 7 10 C 6 7 97054 CASAVA_Build 16 32333325 1D CAACTTCTTC T/- TGGTTTAGTC 2997 het 2997 ref 27 19 7 1 T 2 1 97055 CASAVA_Build 16 32333938 2D TCTTAATCCT AA/-- GTTTGAATTT 3070 het 3070 ref 92 70 15 10 A 2 0 97056 CASAVA_Build 16 32335361 1I ATTTATTTGA -/T CTTCAATCAC 3070 het 3070 ref 45 27 14 4 T 0 1 97057 CASAVA_Build 16 32335514 1I TCGTCTAATC -/T TTTTTCAAGG 3070 het 3070 ref 72 41 27 4 T 5 6 97058 CASAVA_Build 16 32336290 1I CCAGTTCAAG -/C TTCCCTGGCC 3070 het 3070 hom 63 20 31 12 C 0 1 97059 CASAVA_Build 16 32337296 4D GCCATTTGTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 14 15 T 15 11 97060 CASAVA_Build 16 32337759 1D48M1I TAGATATTAA CCCCTTATCAGGTATTTGGTTTGCTGGGAGGTTTTTGATTCCTGATTCA-/-CCCTTATCAGGTATTTGGTTTGCTGGGAGGTTTTTGATTCCTGATTCAG CTACTAGTTA 3070 het 3070 ref 67 56 15 17 N/A 0 0 97061 CASAVA_Build 16 32338110 7I TTCTCTAGCC -------/TTTTTAT TTTTTTTTTT 281 het 281 ref 44 26 2 16 TTTTTAT 0 1 97062 CASAVA_Build 16 32339357 2I ACCAATTGGT --/TA AGAGAGTATA 1597 het 1597 ref 75 57 5 13 TA 0 1 97063 CASAVA_Build 16 32339479 1I TTTTCTTAAA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 83 55 19 9 T 5 6 97064 CASAVA_Build 16 32341010 7D CTGGGGAACT CTTTGTC/------- CTTCATTTTT 2132 het 2132 ref 49 32 8 12 CTTTGTC 1 0 97065 CASAVA_Build 16 32341068 2I GGTTGACAGT --/TA TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 57 26 22 9 TA 0 1 97066 CASAVA_Build 16 32341891 1D TGCTTGAGAT A/- TTTTGCAGAC 3070 het 3070 ref 61 44 9 9 A 1 0 97067 CASAVA_Build 16 32341996 3D AGCAAGAAAA CGT/--- CATCACTTCA 3070 het 3070 ref 100 61 35 9 CGT 1 0 97068 CASAVA_Build 16 32343986 1I TCACTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 63 38 12 13 T 11 12 97069 CASAVA_Build 16 32344572 1I TCTTTGTGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 56 22 22 12 T 9 10 97070 CASAVA_Build 16 32344753 1I ACATTTTTTT -/C CAAAATATTA 1835 het 1835 ref 55 44 5 6 C 1 2 97071 CASAVA_Build 16 32345007 11I TGATAATTTC -----------/CCCCAAATTTT CCCTTAAACA 3070 het 3070 ref 71 53 8 10 CCCCAAATTTT 0 1 97072 CASAVA_Build 16 32346544 2D TTTTTTTGAG AC/-- ACAGTTTCAC 3070 het 3070 hom 39 16 15 9 AC 2 1 97073 CASAVA_Build 16 32346834 1I CTAGAAATGA -/T TTTTTTTTTT 2041 het 2041 ref 44 21 7 16 T 11 12 97074 CASAVA_Build 16 32347350 1D7M12D ATTGCATATA TTTTTTGCTTATCTTCAACT/-ATTTTGC------------ TTGTTTATGG 2748 het 2748 ref 52 47 7 4 N/A 0 0 97075 CASAVA_Build 16 32347879 4D TTTTGCCAAA TTGT/---- TTATTTATTG 3070 het 3070 ref 57 33 17 7 TTGT 1 0 97076 CASAVA_Build 16 32347968 7D GTCTATTTAA TCCTACT/------- TCTCTATTTC 1648 het 1648 ref 52 49 4 3 TCCTACT 1 0 97077 CASAVA_Build 16 32348186 5I AATTATAAAA -----/GACAT GAAATGAATG 3070 het 3070 ref 63 54 8 1 GACAT 0 1 97078 CASAVA_Build 16 32348464 1I TTTAAAAAAA -/G AAATTAAACC 2297 het 2297 ref 57 43 5 9 G 0 1 97079 CASAVA_Build 16 32349606 3D TTGAATCAAA TAT/--- TGTTGGTAAG 3070 het 3070 ref 62 46 12 5 TAT 1 0 97080 CASAVA_Build 16 32349719 3D CTACAAGGAC CTT/--- CTTCAGAAAC 3070 het 3070 ref 75 62 8 6 CTT 2 1 97081 CASAVA_Build 16 32349848 3D GGAAATAAAT ATA/--- AGATTTCTTT 3070 het 3070 ref 78 60 10 14 ATA 1 0 97082 CASAVA_Build 16 32351683 1I TGAAAATATG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 48 27 10 11 T 6 7 97083 CASAVA_Build 16 32352110 1D GACACATTGA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 86 50 31 5 T 7 6 97084 CASAVA_Build 16 32353575 3D ACCATTATCG TCA/--- TCATCTCTTA 2753 het 2753 ref 86 71 6 12 TCA 2 1 97085 CASAVA_Build 16 32355437 2I CTACAAAAAG --/AA AAAAAAAAGG 1449 het 1449 ref 65 55 4 6 A 8 10 97086 CASAVA_Build 16 32357453 1I TCTTTGCCTA -/T TTTTTTCACT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 T 6 7 97087 CASAVA_Build 16 32359271 2D TTAATCCAAC AA/-- AGACTTTGCT 1742 het 1742 ref 70 59 4 10 A 3 1 97088 CASAVA_Build 16 32359689 1D CTGAGAGTTA T/- TTTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 92 58 27 8 T 5 4 97089 CASAVA_Build 16 32361056 1I23M1I GCCCTTGATA -TGGCATTGCAGCTCAAGTAGAGG-/TTGGCATTGCAGCTCAAGTGGAGGA AATGACTGAT 3070 het 3070 ref 95 70 37 10 N/A 0 0 97090 CASAVA_Build 16 32361256 1I CCAACATGGT -/G GAAACCCCGT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 G 1 2 97091 CASAVA_Build 16 32365175 3I11M1I TGCCTACTGA ---TTTTTTTTTAA-/ATTTTTTTTTTTAAT TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 81 21 48 16 N/A 0 0 97092 CASAVA_Build 16 32366813 1D TCCATTTGTG T/- TTTTTTTTTT 1961 het 1961 ref 31 9 5 17 T 15 14 97093 CASAVA_Build 16 32367129 1I CTATTTGGAG -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 83 52 25 6 T 6 7 97094 CASAVA_Build 16 32367527 2I GTTCCAACAG --/TT TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 52 22 19 11 T 8 10 97095 CASAVA_Build 16 32368329 4D CTCATGATAT TGAG/---- TGAGTTCTCA 3070 het 3070 ref 49 27 19 5 TGAG 2 1 97096 CASAVA_Build 16 32370637 2D ATGTGTACAC AT/-- GTTTAATTTA 3070 het 3070 ref 77 56 14 9 AT 1 0 97097 CASAVA_Build 16 32372348 2I TGTTTGTTTT --/TA TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 50 18 17 15 TA 0 1 97098 CASAVA_Build 16 32372690 1D TTTCTTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 63 26 31 7 A 8 7 97099 CASAVA_Build 16 32372866 1D CAGAAAATTA C/- CCATTTTCTC 1581 het 1581 ref 53 46 4 3 C 3 2 97100 CASAVA_Build 16 32373130 1I TTTTGTAGAG -/A CGAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 60 39 16 5 A 0 1 97101 CASAVA_Build 16 32374257 2D34M4D TAGGACAAAC TATGTTAACACAACCTCAGATGATGCAGCATAGTTAAAAC/--TGTTAACACAACCTCAGATGATGCAGCATAGTTA---- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 48 58 7 10 N/A 0 0 97102 CASAVA_Build 16 32375556 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 58 35 12 11 T 7 8 97103 CASAVA_Build 16 32376326 1I GTTACTTTTT -/C TTTTCCTTTA 3070 het 3070 ref 88 49 31 8 C 0 1 97104 CASAVA_Build 16 32377329 1D AAAGAAAAGC T/- TTTGTATTTG 2255 het 2255 ref 80 65 5 12 T 4 3 97105 CASAVA_Build 16 32378137 4I CTCACTGAGT ----/CAAA CAGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 47 31 11 5 CAAA 0 1 97106 CASAVA_Build 16 32379275 1I ATCACTTGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 59 14 24 21 A 9 10 97107 CASAVA_Build 16 32380604 1D ATTCGGGTTC A/- GGTGCGCCTC 3070 het 3070 ref 79 56 12 13 A 1 0 97108 CASAVA_Build 16 32381781 27I GGTTCCCACT ---------------------------/CTGTTAGTTGTCTGTTTACTCTGCTGA CTGTTCCCTT 2872 het 2872 ref 35 21 8 7 CTGTTAGTTGTCTGTTTACTCTGCTGA 0 1 97109 CASAVA_Build 16 32382500 1D TTTCTTGGTC T/- TTTTTTTTTT 1221 het 1221 ref 56 28 3 25 T 11 10 97110 CASAVA_Build 16 32382753 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 27 13 1 T 8 7 97111 CASAVA_Build 16 32383275 1D ATCATGTGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 57 32 18 11 T 10 9 97112 CASAVA_Build 16 32385459 5I TCCTTTATAG -----/TGCTT GTTACCTAGT 3070 het 3070 ref 69 47 13 9 TGCTT 0 1 97113 CASAVA_Build 16 32386230 2D TCAGACTCTT TG/-- GTCGCATGGA 3070 het 3070 ref 83 67 8 8 TG 1 0 97114 CASAVA_Build 16 32386521 1D TATATTTGTG C/- TGGTTGGCCT 2165 het 2165 ref 64 49 7 8 C 1 0 97115 CASAVA_Build 16 32389106 1I AGATGGGGGG -/T TCTCACTGTG 1482 het 1482 ref 35 26 4 5 T 1 2 97116 CASAVA_Build 16 32389465 1D TTCCATATTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 85 44 32 12 T 9 8 97117 CASAVA_Build 16 32389634 1D CATTTTTGTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 63 48 9 7 T 7 6 97118 CASAVA_Build 16 32389946 3D AATGCTTCCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 73 21 22 30 T 15 12 97119 CASAVA_Build 16 32394354 3D TGATTCTCAT GGC/--- GGCACTGGTG 1232 het 1232 ref 49 38 4 10 GGC 2 1 97120 CASAVA_Build 16 32397729 1D ATCTTGAGGG T/- ATTAACTAAT 1821 het 1821 ref 72 65 5 2 T 1 0 97121 CASAVA_Build 16 32399018 1I TCAATACGTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 72 38 16 18 T 8 9 97122 CASAVA_Build 16 32399689 1I GCTGAGCTTT -/C AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 C 0 1 97123 CASAVA_Build 16 32401720 2D GGTTTAAAAC AG/-- TGTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 96 74 13 13 AG 1 0 97124 CASAVA_Build 16 32401869 1I TAAACCCTTC -/T TTTTCATTCA 3070 het 3070 ref 86 59 20 7 T 4 5 97125 CASAVA_Build 16 32403435 1D AGTTTTGAAA T/- ACGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 T 1 0 97126 CASAVA_Build 16 32403905 2I ACATTCCTCT --/CA CAGAGTTAAA 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 CA 1 2 97127 CASAVA_Build 16 32405030 1D GCCTATGTTG A/- AAAAAAATTT 2871 het 2871 ref 47 35 8 4 A 8 7 97128 CASAVA_Build 16 32406408 2D AAGGAAACTA CC/-- TGATAAATAA 2089 het 2089 ref 82 73 5 5 C 2 0 97129 CASAVA_Build 16 32409871 1I AAAATTAAAC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 88 22 52 14 T 7 8 97130 CASAVA_Build 16 32410190 1D GCTATCCCTG C/- CCCCTCCACC 1279 het 1279 ref 67 58 3 10 C 5 4 97131 CASAVA_Build 16 32412206 1D AACCTTTTTT A/- TTTTCCATTC 3070 het 3070 hom 69 29 33 7 A 1 0 97132 CASAVA_Build 16 32418455 1I TATCTTCAGA -/T TAAAAACTGG 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 T 1 2 97133 CASAVA_Build 16 32420596 1I ATGGAGGCCA -/G AAGTTAAGTA 3070 het 3070 ref 78 60 8 10 G 0 1 97134 CASAVA_Build 16 32420883 4D GGAAACACTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 17 13 T 17 13 97135 CASAVA_Build 16 32425994 1D GTCTCAGATA G/- CTTCCTTCTA 3070 het 3070 ref 100 58 33 10 G 1 0 97136 CASAVA_Build 16 32427256 1I TCCCTTCGCA -/G ATTCTATAAA 3070 het 3070 ref 73 51 14 9 G 0 1 97137 CASAVA_Build 16 32427612 1D TAAAAAAGAG T/- GTTTCAACAC 3070 het 3070 ref 88 66 20 2 T 1 0 97138 CASAVA_Build 16 32429074 4D CAGATTCTAC AAAA/---- ACAGTGTTTC 1703 het 1703 ref 65 55 5 9 A 5 1 97139 CASAVA_Build 16 32430271 2I TGTAGGTTCT --/AC AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 98 60 27 12 AC 0 1 97140 CASAVA_Build 16 32430508 1I40M1I CACAAAGCAG -TTTTTCTGAAAGCTTCTTTCTAGATTTAATCTGAAGATAA-/TTTTTTCTGAAAGCTTCTTTCTAGCTTTAATCTGAAGATAAT TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 98 78 33 11 N/A 0 0 97141 CASAVA_Build 16 32432003 1D GTGCCGAATC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 86 62 19 5 A 9 8 97142 CASAVA_Build 16 32432517 1I TGCTGAATCC -/A AAAAAAAAAA 2521 het 2521 ref 37 17 8 12 A 13 14 97143 CASAVA_Build 16 32433343 1I CACAGAAAGG -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 62 45 9 8 A 7 8 97144 CASAVA_Build 16 32433419 57D ACAAAGTGGT TTCTCAGACAGTCTCCTTCTAATTTTTATCCTGGGATACTCACTTTTTGCCATTGGC/--------------------------------------------------------- CTCAAGGAAC 3070 het 3070 ref 76 77 10 20 TTCTCAGACAGTCTCCTTCTAATTTTTATCCTGGGATACTCACTTTTTGCCATTGGC 1 0 97145 CASAVA_Build 16 32435952 1I CATCACAAAG -/C CATTTCTCAG 3070 het 3070 ref 98 65 20 16 C 1 2 97146 CASAVA_Build 16 32436176 4I TATTTTTCAC ----/CATA TGTCTCAATG 3070 het 3070 ref 81 50 24 7 CATA 0 1 97147 CASAVA_Build 16 32438787 1D CAGATTTTAC A/- AAAACTGTTT 3070 het 3070 ref 97 62 24 15 A 5 4 97148 CASAVA_Build 16 32439166 2D AAGAAAATTT TA/-- TCACTGCGAG 3070 het 3070 ref 94 66 19 11 TA 1 0 97149 CASAVA_Build 16 32440182 1I GGCTAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 70 28 37 10 A 10 11 97150 CASAVA_Build 16 32441008 1D CAGAGATTCT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 62 39 21 2 A 9 8 97151 CASAVA_Build 16 32442079 1D CTGGTGAATC A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 96 65 17 17 A 8 7 97152 CASAVA_Build 16 32447299 1I AAGATCCTAC -/A AAAAATGCGT 3070 het 3070 ref 92 63 21 11 A 5 6 97153 CASAVA_Build 16 32449010 1I CAGAATGGAG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 101 66 20 15 A 0 1 97154 CASAVA_Build 16 32450181 1D TGGCCTCAAT G/- GGCACCAAAA 3070 het 3070 ref 84 67 10 7 G 3 2 97155 CASAVA_Build 16 32450225 1D AACAGTTTTT C/- CAAACTACTT 3070 het 3070 ref 76 60 12 4 C 2 1 97156 CASAVA_Build 16 32451114 2D GGTATAATTC TG/-- TGTGTTGAAT 3070 het 3070 ref 94 64 22 9 TG 3 2 97157 CASAVA_Build 16 32455885 1D TTGAGAAAAA G/- GTTTGTGATG 3070 het 3070 ref 95 59 24 13 G 2 1 97158 CASAVA_Build 16 32461820 1D ACAAAGGGAC A/- CTTGCAAACA 3070 het 3070 ref 97 64 27 7 A 1 0 97159 CASAVA_Build 16 32462556 12D AGTGTATATT CCGAGATAAAAA/------------ CTAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 94 72 22 7 CCGAGATAAAAA 1 0 97160 CASAVA_Build 16 32466562 1I AGGGTTAAAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 99 30 33 36 T 9 10 97161 CASAVA_Build 16 32471536 1D GAGTTAAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 59 29 26 6 T 10 9 97162 CASAVA_Build 16 32479004 1I ATGCCTATGG -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 65 49 10 6 A 7 8 97163 CASAVA_Build 16 32483765 4I2M9D17M1I CAGACTTAAA ----CCTTTAAAATTTTTTGATTCATAAGGTT-/TGATCC---------TTTTGATTCGGTAGGTTG GAAACACTCT 335 het 335 ref 76 85 3 10 N/A 0 0 97164 CASAVA_Build 16 32487370 1D GAGTTAAACC T/- TTTTTTTTTT 1813 het 1813 ref 72 36 6 30 T 15 14 97165 CASAVA_Build 16 32490502 1I TAAGGCCTAT -/G GGGGAAAAAC 3070 het 3070 ref 56 30 21 5 G 4 5 97166 CASAVA_Build 16 32492494 2I GGGGAAAAAC --/AG AATATCCCCA 3070 het 3070 hom 68 30 30 8 AG 0 1 97167 CASAVA_Build 16 32497666 1I ATGAAAACGG -/A ATATCCCCAG 3070 het 3070 ref 85 74 8 3 A 1 2 97168 CASAVA_Build 16 32498029 1D AACAAGAAAG A/- AACCTATCTG 1652 het 1652 ref 91 75 5 13 A 3 2 97169 CASAVA_Build 16 32498534 1D CCCAAGATAA G/- AACTAGAAAG 2603 het 2603 ref 89 76 6 10 G 1 0 97170 CASAVA_Build 16 32498704 1D ATCTTCAGAT A/- AAAAATAGAA 3070 het 3070 hom 89 25 30 34 A 6 5 97171 CASAVA_Build 16 32498995 1D AAGTTGTAAA G/- GGGGTATTTG 3070 het 3070 ref 92 74 8 12 G 5 4 97172 CASAVA_Build 16 32500657 4D CGAGTTAAAC CTTT/---- CTTTTCATTC 3070 het 3070 ref 74 34 33 11 CTTT 2 1 97173 CASAVA_Build 16 32503063 1I TTGTTAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 87 39 30 18 T 12 13 97174 CASAVA_Build 16 32512337 1D ATTAGGATAG T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 66 27 31 8 T 8 7 97175 CASAVA_Build 16 32518173 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 9 20 13 A 9 10 97176 CASAVA_Build 16 32519338 1D ATTCTGATTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 70 31 32 9 T 7 6 97177 CASAVA_Build 16 32523147 1D ATTCACTACA C/- CTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 65 31 24 10 C 2 1 97178 CASAVA_Build 16 32524374 4I CAGCAAAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 82 44 26 12 AG 6 8 97179 CASAVA_Build 16 32526074 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 70 27 28 17 A 12 10 97180 CASAVA_Build 16 32528921 1D CTGTCCCCCC T/- GAGGCTTGAT 3070 het 3070 ref 82 38 32 12 T 1 0 97181 CASAVA_Build 16 32530080 2D TAAAATATAG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 62 23 35 6 GT 1 0 97182 CASAVA_Build 16 32538928 1I AAGAGGTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 T 9 10 97183 CASAVA_Build 16 32539913 1D AAAATTAAAA G/- GCAAAGACAA 3070 het 3070 ref 60 32 21 7 G 2 1 97184 CASAVA_Build 16 32541796 3D CACCTACTGA AAG/--- AAGTTCTCAA 3070 het 3070 ref 71 38 31 5 AAG 2 1 97185 CASAVA_Build 16 32545018 1D TGGGACTACA G/- GTGCGTCACG 3070 het 3070 ref 46 29 11 6 G 2 1 97186 CASAVA_Build 16 32550381 1I CTTAGGAATC -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 61 43 11 7 T 7 8 97187 CASAVA_Build 16 32551102 1I TCTTCCCGGC -/G GGGGGGGTTC 1955 het 1955 ref 47 20 9 18 G 7 8 97188 CASAVA_Build 16 32553798 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 2468 het 2468 ref 49 36 7 6 T 6 7 97189 CASAVA_Build 16 32560757 1I GCCTCCCAAA -/G TGCTGAGATT 3070 het 3070 hom 67 29 30 8 G 0 1 97190 CASAVA_Build 16 32562170 1I TAATTTTTTT -/C ATCATGGTGA 3070 het 3070 ref 72 55 12 5 C 0 1 97191 CASAVA_Build 16 32562914 1I CTTTGTAACA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 6 7 97192 CASAVA_Build 16 32563130 1D GAGGTGCTGG C/- CCCCCTGCAC 3070 het 3070 hom 48 19 24 7 C 6 5 97193 CASAVA_Build 16 32602195 1D AATAGAAGTG A/- AAAAAAAAGG 2385 hom 15 het 8 0 6 3 A 9 8 97194 CASAVA_Build 16 32623141 18D TGGAGAGTGC TGTGTGTGTGTGTGTGTG/------------------ TGTGTGTGTG 2905 het 1164 hom 13 7 6 0 TG 18 9 97195 CASAVA_Build 16 32691347 2D22M3I TGACTGGGAT TGTGTGTGTGTTAGTGATTGCGAC---/--TGTGTGTGTTAGTGATTGCGACAGT GGTGTGAGTG 3070 het 189 hom 15 1 12 2 N/A 0 0 97196 CASAVA_Build 16 32709428 10D TCCCAGCTGC AGCATTCCAA/---------- AACCCCTTAC 1259 het 1259 ref 14 9 3 9 AGCATTCCAA 1 0 97197 CASAVA_Build 16 32709492 5D ATAATTTACA TAGTG/----- TAGAGTGCAC 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 TAGTG 1 0 97198 CASAVA_Build 16 32716839 3I AGCGTCACAA ---/TTT CTTCTTTTTA 3070 het 858 hom 48 4 43 1 T 0 3 97199 CASAVA_Build 16 32718269 1D TTTTTCTCTT A/- TAGTATAGTT 690 het 690 ref 23 15 2 7 A 1 0 97200 CASAVA_Build 16 32718994 1I5M1I AAGCACATTT -GTTTC-/AATTTCA AAAAATTTTA 2393 het 2393 ref 17 10 5 2 N/A 0 0 97201 CASAVA_Build 16 32723995 1I GGGGTGCTGG -/C CCCCCTGCAC 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 C 5 6 97202 CASAVA_Build 16 32724078 2D CTTACAAATA AC/-- ACAGTCAATT 2669 het 2669 ref 49 26 8 20 AC 2 1 97203 CASAVA_Build 16 32724102 2D CACATATTTA AT/-- ATGTTATATG 3070 het 3070 ref 64 49 8 7 AT 2 1 97204 CASAVA_Build 16 32724466 5D TTTCTTTTCA TCATT/----- TCATTTCATT 3070 het 3070 ref 84 61 15 13 TCATT 3 2 97205 CASAVA_Build 16 32725346 5I TCATCATTTC -----/GTCAT ATCATTTCAT 3070 het 3070 ref 66 17 11 38 GTCAT 0 1 97206 CASAVA_Build 16 32731426 4I ATGTGAAAAC ----/TGAT TGGCTGGGGG 1849 het 1849 ref 90 80 6 4 TGAT 0 1 97207 CASAVA_Build 16 32733188 3I GCTGAGCTGT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 2032 hom 20 6 9 5 A 10 13 97208 CASAVA_Build 16 32735228 1I TTTTGAAAAC -/T GGACATTCTA 3070 het 2105 hom 29 5 14 15 T 0 1 97209 CASAVA_Build 16 32735345 1D TTGTTAAGGA T/- TTTTTTTTTT 1844 het 1844 ref 37 11 5 22 T 12 11 97210 CASAVA_Build 16 32735483 4D TGTCAGGAAC CAAT/---- CAAACAGGCA 2565 het 2565 ref 70 57 6 13 CAAT 1 0 97211 CASAVA_Build 16 32739044 1I TCAACTACAC -/A AAAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 96 53 26 19 A 6 7 97212 CASAVA_Build 16 32739137 1D AAAATTTCAA C/- CCCCCAAAAA 3070 het 3070 ref 64 31 22 14 C 6 5 97213 CASAVA_Build 16 32747329 3D AAATTTTCTC TTG/--- TTATTTTACA 1731 het 1731 ref 51 41 4 6 TTG 1 0 97214 CASAVA_Build 16 32748426 3I ATCAGGCCTC ---/TCT TCTTCTAATG 2071 het 2071 ref 49 16 7 26 TCT 2 3 97215 CASAVA_Build 16 32748510 1D GAATATTGCC T/- TTTAACAAAT 2231 het 2231 ref 53 35 5 16 T 4 3 97216 CASAVA_Build 16 32748567 1D TTAATTTGGG C/- TAATCAATAT 3070 het 3070 ref 72 50 16 6 C 1 0 97217 CASAVA_Build 16 32748647 1D ATTTGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 978 hom 37 3 17 17 T 13 12 97218 CASAVA_Build 16 32748960 3I GCTGTCTTGG ---/GGA GGAGATTTGC 3070 het 3070 ref 68 50 8 10 GGA 1 2 97219 CASAVA_Build 16 32749184 1D TAACCTTTTT C/- TTTCTTTTCC 3070 het 3070 ref 75 53 16 7 C 1 0 97220 CASAVA_Build 16 32751305 1I AGATTAAAAA -/T CACAATATTA 3070 het 3070 hom 89 9 55 25 T 0 1 97221 CASAVA_Build 16 32751525 1I ACTCGGCTAA -/T TTTTTTGCAT 1796 het 1796 ref 27 17 4 7 T 6 7 97222 CASAVA_Build 16 32753126 1D TGACTGGTAA T/- TTCTTCTGAA 2340 het 2340 ref 44 39 5 0 T 3 2 97223 CASAVA_Build 16 32753524 1D CAGAGTGCCC T/- TTTGGTGAGC 2161 het 2161 ref 75 66 5 4 T 4 3 97224 CASAVA_Build 16 32754188 3D TTGAAATTTC CTT/--- CTTTTCTGTC 3059 het 3059 ref 75 60 8 8 CTT 2 1 97225 CASAVA_Build 16 32755368 4I AATTGGTACA ----/TTTG TCTATTTACA 1500 het 1500 ref 42 6 8 29 TTTG 0 1 97226 CASAVA_Build 16 32756516 1D TTAATTAGAT C/- CCCTTTGTCA 1928 het 1928 ref 16 11 4 2 C 4 3 97227 CASAVA_Build 16 32757967 4I TCTAAAATTC ----/TCTT TTTTTGTTGT 3070 het 2719 hom 51 8 42 1 TCTT 0 1 97228 CASAVA_Build 16 32758090 1D ACCAGTTCCT C/- CTTGTACCTC 3070 het 3070 ref 41 34 7 0 C 2 1 97229 CASAVA_Build 16 32761877 3D TAATTTCATG TCA/--- TCATTTCATT 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 TCA 2 1 97230 CASAVA_Build 16 32763713 1I AATCTTCAAG -/A AAATTTTTTT 2876 het 2019 hom 26 9 9 8 A 3 4 97231 CASAVA_Build 16 32770651 4I TACAATAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 het 3070 hom 41 10 28 3 AAAC 1 2 97232 CASAVA_Build 16 32778436 1I TGCCTGGCCC -/T TACCCTGGCC 1995 hom 15 het 9 0 6 3 T 1 2 97233 CASAVA_Build 16 32784861 21D GTGACCACCC TGTATCTGTAGGAGATGCCTT/--------------------- TGCCTCGTAG 3070 het 3070 ref 39 19 17 12 TGTATCTGTAGGAGATGCCTT 1 0 97234 CASAVA_Build 16 32785442 6D TCAAATCTGT CCCCTC/------ ACCTATCAGG 3070 het 2666 hom 27 8 16 5 CCCCTC 1 0 97235 CASAVA_Build 16 32809099 1I CTTCAACACC -/A AATTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 2 3 97236 CASAVA_Build 16 32816802 1I GGACACGGGG -/T GGGGGGCGCT 1332 hom 22 het 12 0 5 7 T 0 1 97237 CASAVA_Build 16 32829403 4D CCATGGCGTG TGTA/---- TGTATACCTA 2328 het 2328 ref 27 21 5 3 TGTA 2 1 97238 CASAVA_Build 16 32834953 1I TTGGTTTCTA -/T TGGTTCATTT 2938 het 2938 ref 16 9 6 1 T 1 2 97239 CASAVA_Build 16 32839413 1D GCTCTGAGAG C/- CTGGGTGACT 2533 het 2155 hom 19 6 7 8 C 2 1 97240 CASAVA_Build 16 32843723 4I GGGTTAAGGC ----/AAGT AAGTTGGGGA 3070 het 2788 hom 35 9 12 14 AAGT 1 2 97241 CASAVA_Build 16 32861273 1I TGCCACACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 A 10 11 97242 CASAVA_Build 16 32944762 2D AAATACAGAC TT/-- ATATAAGTAG 1950 het 1950 ref 26 19 5 3 T 2 0 97243 CASAVA_Build 16 32945036 1D TATGCACAAA C/- CTTTTTTTTT 2108 het 2108 ref 24 13 6 5 C 2 1 97244 CASAVA_Build 16 32948400 1I CAAAGTGCTC -/A AAAAAATCTA 1481 het 1481 ref 71 53 4 14 A 6 7 97245 CASAVA_Build 16 32948416 1D TCTATTAATT A/- AAAAATGTGT 3070 het 3070 ref 90 73 9 10 A 6 5 97246 CASAVA_Build 16 32948733 5I14M5I TTTCTGCATG -----TATATGTCAATAAA-----/TATGATATATGTCAATAAATGTCT TAAATTATAT 3070 het 3070 hom 61 10 26 28 N/A 0 0 97247 CASAVA_Build 16 32949136 1I ATCTTACTTG -/C ATTTGATAGT 3070 het 3070 hom 62 23 25 19 C 0 1 97248 CASAVA_Build 16 32949592 1I TACTAGCTAA -/T TTTTGTAAAG 3070 het 861 hom 33 2 27 4 T 4 5 97249 CASAVA_Build 16 32949753 6I49M8I TTTATCTATG ------TATATCTATCTATAAAATAAACATATGTGTTCCTTATATAAAAATATGT--------/TATATCTATATCTATCTATAAAATAAACATATGTGTTCCTTATATAAAAATATATATTATTAA TATTATATAA 3070 het 3070 hom 43 12 33 13 N/A 0 0 97250 CASAVA_Build 16 32956845 1I AATACTGCTG -/C TTAAAATACT 3070 het 3070 ref 73 60 9 4 C 0 1 97251 CASAVA_Build 16 32958623 3I GATTTGTTAC ---/TAT TTTTTAAGGA 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 TAT 0 1 97252 CASAVA_Build 16 32958942 2I TTTCTAAATA --/GT GTCTTTTTAG 3070 het 3070 hom 69 16 42 11 GT 1 2 97253 CASAVA_Build 16 32959041 3D ATGGAAACTT AAC/--- ATTCAAATTC 2359 het 2359 ref 54 47 6 2 AAC 1 0 97254 CASAVA_Build 16 32959320 1D TCGTGTTGAC T/- TTGCAGCCTA 3070 het 3070 ref 95 76 12 9 T 3 2 97255 CASAVA_Build 16 32959411 1D TTACTATCAT G/- TTTCTTTCTC 1397 het 1397 ref 34 24 4 10 G 1 0 97256 CASAVA_Build 16 32959849 1I8M1I TAGATTTAGC -ATTTTAGC-/AATTTTAGCA CAGTCACGCA 3070 het 3070 ref 81 31 11 51 N/A 0 0 97257 CASAVA_Build 16 32960126 5I AAATATGTAT -----/TATAA TCTCATGGGA 3070 het 3070 ref 71 30 24 17 TATAA 0 1 97258 CASAVA_Build 16 32961908 1I GACTAGTGCC -/A CCGTGGAAAA 3070 het 3070 ref 92 62 19 11 A 0 1 97259 CASAVA_Build 16 32967507 3I GAAGAAAGAA ---/AAG AAGGAGGAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 AAG 1 2 97260 CASAVA_Build 16 32968089 1D TGCCATACTG T/- TTTTTTTTTC 1307 het 1307 ref 15 12 3 0 T 10 9 97261 CASAVA_Build 16 32969776 1I TACCTTTGGA -/T TTTTTTCCCA 1934 het 1040 hom 10 3 5 2 T 6 7 97262 CASAVA_Build 16 32971191 3I CGTCTCAATG ---/ATA ATAATAATAA 1385 het 1385 ref 12 5 3 4 ATA 5 6 97263 CASAVA_Build 16 32971332 1D TAACTCTAGA T/- GGTAAAGTAA 754 het 754 ref 33 28 2 4 T 1 0 97264 CASAVA_Build 16 32971535 3I GGTAAACTTA ---/CAG CAACAACAAA 3070 het 3070 hom 46 15 28 5 CAG 0 1 97265 CASAVA_Build 16 32971831 1I AAAAGATGAC -/A AAAAAATATC 2178 het 100 hom 12 1 5 6 A 6 7 97266 CASAVA_Build 16 32972756 3I AAGGAACAAG ---/AGA AGATCTTACC 3070 het 3070 hom 95 36 49 10 AGA 1 2 97267 CASAVA_Build 16 32972828 2D CATGAAAGGC TT/-- TTTTTTTTCT 1868 het 1868 ref 99 34 4 61 T 10 8 97268 CASAVA_Build 16 32972937 1D AAAATTAAAG T/- TTACACATAT 3070 het 3070 ref 55 45 7 4 T 3 2 97269 CASAVA_Build 16 32974012 1D TATTCTAGAA G/- GATAAATTAT 2553 het 2553 ref 75 58 7 10 G 2 1 97270 CASAVA_Build 16 32976702 3I ACTCTTGTAC ---/TTG TTTTGTTCAG 1347 het 1347 ref 40 35 3 3 TTG 0 1 97271 CASAVA_Build 16 32985870 2D GCCTAATAAA CT/-- CAACCCCTTG 3070 het 3070 ref 42 25 10 8 CT 1 0 97272 CASAVA_Build 16 32989360 2I TTTTTTAAAA --/AT TTTTTGAAAG 3070 het 3070 ref 80 54 8 18 AT 0 1 97273 CASAVA_Build 16 32989686 1D28M4I ATTTAAACAA TTTTTAAATTAATTGCTGTAAATCATTAA----/-TTTTAAATTAGTTGCTGTAAATCATAAACGAT TGATTTTCTT 1658 het 1658 ref 6 5 4 2 N/A 0 0 97274 CASAVA_Build 16 32990190 1D3M1I GTGCTTTTTT GCTA-/-CTAT TTATTTTTTG 561 het 561 ref 35 30 2 4 N/A 0 0 97275 CASAVA_Build 16 32990895 2D AATTTTAATT AA/-- AGTCTGTGTT 2712 het 2712 ref 69 54 6 11 A 3 1 97276 CASAVA_Build 16 32993040 2I TTGTTAAATA --/AT AGTTTATATA 3070 het 3070 ref 95 73 13 9 AT 0 1 97277 CASAVA_Build 16 33016693 2D GCAATCACTA AC/-- ACACACACAA 1766 het 1310 hom 9 5 4 2 AC 5 4 97278 CASAVA_Build 16 33205284 1I AAGGGTGGGG -/C ACCCCTGGCT 281 het 281 ref 18 6 4 8 C 0 1 97279 CASAVA_Build 16 33206629 2I CCGACAACAC --/AG AGTCTCATAG 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 AG 1 2 97280 CASAVA_Build 16 33208210 1D ATGGAAATGG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 58 26 29 6 A 7 6 97281 CASAVA_Build 16 33210035 4I GCTATCAAAT ----/AGAG AGAAATGTGG 3070 het 3070 hom 58 11 33 14 AG 1 3 97282 CASAVA_Build 16 33212156 3D TCCTATATTT AAA/--- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 57 12 24 22 A 11 8 97283 CASAVA_Build 16 33215859 1I AATTTTTTTT -/G TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 G 0 1 97284 CASAVA_Build 16 33224898 2I TCAAAAAAAA --/GG AGAAAAAAAA 1460 het 1460 ref 15 7 4 4 G 0 2 97285 CASAVA_Build 16 33224942 2D AAAAAATCAC AA/-- AGACTACAAA 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 A 3 1 97286 CASAVA_Build 16 33225540 1I ACACGGCATT -/A AAAACAATCA 1408 het 1408 ref 41 31 4 6 A 4 5 97287 CASAVA_Build 16 33231166 4D CTCCCATGAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1482 hom 26 9 13 4 T 15 11 97288 CASAVA_Build 16 33233908 1I TCATATCCAG -/C CCCCTGTATT 2009 het 2009 ref 69 50 7 12 C 4 5 97289 CASAVA_Build 16 33241346 1I CTTGTAGCTT -/A AATCCATGTT 3070 het 1934 hom 13 4 9 0 A 2 3 97290 CASAVA_Build 16 33241619 5I TTTGGAAATA -----/TTATT TTATATGTGC 3070 het 1060 hom 32 4 27 1 TTATT 0 1 97291 CASAVA_Build 16 33248487 3D ATCTCATCAT TTC/--- TTATTTCATC 1680 het 1680 ref 53 35 5 14 TTC 1 0 97292 CASAVA_Build 16 33248547 1I TTCAATTTCC -/T TTCATTATTT 3070 het 3070 ref 54 29 11 14 T 2 3 97293 CASAVA_Build 16 33249392 3D49M4D TCATTTCATC TCATCATTTCAACTCATTGCATCTCATCTCATCATTTCCATTTCATCATTTCATTT/---TCATTTCAACTCATTGCATCTCATCTCATGATTTCCATTTCATCATTCC---- ATTTCATTTC 1181 het 1181 ref 96 120 8 13 N/A 0 0 97294 CASAVA_Build 16 33249751 5I CTCAATTCAA -----/TTTCC TTTCATTATT 3070 het 3070 hom 45 18 22 6 TTTCC 0 1 97295 CASAVA_Build 16 33250745 2I8M2D TCATCTCATT --ATTTCATCTG/TCATGTCATC-- ATTTCATGTC 2539 het 2539 ref 73 49 8 25 N/A 0 0 97296 CASAVA_Build 16 33251058 3I ATTTTATCTC ---/ATT ATATCATCTC 1674 het 1674 ref 94 75 4 15 ATT 0 1 97297 CASAVA_Build 16 33261653 2D ATAACACACT GA/-- GAGACTAAAA 2316 het 2316 ref 51 42 5 5 GA 3 2 97298 CASAVA_Build 16 33263702 1D32M3I ACATGGCATT AAAAACAATCACAAAAGTTGGGAGCTGAGAAAA---/-AAAACAATCACAAAAGTTGGGAGCTGAGAAAAATC ATATACTGTA 3070 het 3070 ref 80 69 14 8 N/A 0 0 97299 CASAVA_Build 16 33263987 4D ACTTGGGAGC TTGT/---- TTAAGTTCCA 2689 het 2689 ref 71 61 7 5 TTGT 1 0 97300 CASAVA_Build 16 33267812 3D31M2D TAGTCTGGTT TTCTTTTTGTTTTGCTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTT/---TTTTTGTTTTGTTTCTTTGTTTTTGTTTTTG-- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 42 20 13 14 N/A 0 0 97301 CASAVA_Build 16 33277574 2D TTTTTGTTGT TC/-- TCAACCTGAG 3070 het 3070 ref 64 38 17 11 TC 2 1 97302 CASAVA_Build 16 33279896 1I CCTAACCCTC -/A AAAAACCTTT 3070 het 3070 ref 64 49 13 2 A 5 6 97303 CASAVA_Build 16 33288156 1I CAAAAAAAAA -/G AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 59 32 19 8 G 0 1 97304 CASAVA_Build 16 33288373 12I ATTTTCCTAA ------------/GAAACATTAAAG GGACATTGTT 3070 het 3070 ref 86 57 20 9 GAAACATTAAAG 0 1 97305 CASAVA_Build 16 33290186 4D GAGCCAAGAT CATG/---- CATGCCACTG 3070 het 2569 hom 55 9 25 24 CATG 2 1 97306 CASAVA_Build 16 33290236 3D ATCCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 10 21 A 15 12 97307 CASAVA_Build 16 33290710 28D GGAGAACACA GGAGAGACCATGCCCCAATGCTGGGGCT/---------------------------- GGGAGACCAT 3070 het 3070 ref 63 41 19 13 GGAGAGACCATGCCCCAATGCTGGGGCT 1 0 97308 CASAVA_Build 16 33292360 3I CCAGCCTGGG ---/CAA CAACAGAATG 2758 het 2758 ref 53 30 9 14 CAA 1 2 97309 CASAVA_Build 16 33292579 1D TATATGTATA T/- TTTTTTGAGA 1663 het 1663 ref 39 28 6 6 T 7 6 97310 CASAVA_Build 16 33292992 2D26M2D TCAGCCACCA TGCACAGTCATCTCTTTCTCTCTCTCTCTT/--CGCAGTCATCTCTTTCTCTCTCTCTC-- TTTTTTTTTT 1143 het 1143 ref 42 31 3 21 N/A 0 0 97311 CASAVA_Build 16 33293348 3I AATGTAAGCA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 68 45 16 8 T 9 12 97312 CASAVA_Build 16 33295794 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTATTA 2020 het 2020 ref 54 41 5 8 T 7 6 97313 CASAVA_Build 16 33298576 4D GACTCCGTCT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2985 hom 44 18 13 18 A 17 13 97314 CASAVA_Build 16 33300009 1D TTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2270 hom 42 6 28 9 A 10 9 97315 CASAVA_Build 16 33301933 1I ACCCAGCGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 62 20 19 23 T 13 14 97316 CASAVA_Build 16 33302162 1D TGGCAACCCC T/- GATCTTTCTT 3070 het 3070 ref 88 53 20 17 T 1 0 97317 CASAVA_Build 16 33303300 1I AATAAATAAA -/T ATAATAATAA 3070 het 2297 hom 18 7 9 3 T 0 1 97318 CASAVA_Build 16 33303631 1I CACCAGGTGA -/C CCCCCCCACT 3070 het 1510 hom 37 4 22 11 C 7 8 97319 CASAVA_Build 16 33304819 5D CTGTCTTTTG TTGTT/----- TTATTTTATT 3070 het 3070 ref 46 32 9 12 TTGTT 1 0 97320 CASAVA_Build 16 33305655 2D AATTTTTTTT AA/-- TTAAAGAAAT 1850 het 1850 ref 48 33 4 12 A 2 0 97321 CASAVA_Build 16 33306057 1D CTCATCTTTC T/- GGGGAATCTT 3070 het 3070 ref 72 50 15 9 T 1 0 97322 CASAVA_Build 16 33306222 9D AGGGCGGGGA TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1891 het 1891 ref 52 24 10 19 T 23 14 97323 CASAVA_Build 16 33312184 3I TCTGGACCAC ---/TAG CAGAAGTGCC 3070 het 3070 hom 101 31 53 17 TAG 0 1 97324 CASAVA_Build 16 33314557 4D CCAAAAATAC AAAA/---- ACTTAGCCAG 3070 het 3070 ref 45 36 9 1 A 5 1 97325 CASAVA_Build 16 33315122 11D GCAACATAGC AATGATAATGA/----------- AATGATAATG 3070 het 3070 ref 54 33 12 15 AATGATAATGA 2 1 97326 CASAVA_Build 16 33322595 2I19M1I ATACATACTC --AGTGAAAAAAACAAAAAAC-/ATAGTGAAAAAAACAAAAAACA AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 41 22 30 1 N/A 0 0 97327 CASAVA_Build 16 33323033 1D13M2I CCAGCCTGGG CCAACAGAGTGAGA--/-CAACAGAGTGAGACT CTGTCTGCAA 3070 het 3070 ref 65 40 17 22 N/A 0 0 97328 CASAVA_Build 16 33324952 1I TTAGGTAGTA -/G TGATGGTCAC 3070 het 3070 ref 68 35 28 5 G 0 1 97329 CASAVA_Build 16 33326349 9I CATCTCTACT ---------/AAAAATACA AAAAATTAGC 3070 het 2274 hom 21 8 13 0 AAAAATACA 0 1 97330 CASAVA_Build 16 33328139 6I TAAAAAATAA ------/TTTATT TTTGTCTATT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 TTTATT 0 1 97331 CASAVA_Build 16 33328830 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1109 het 1109 ref 40 24 3 15 A 12 11 97332 CASAVA_Build 16 33330977 4D CCCAGGTGAC AGGG/---- AGACCTATTG 3070 het 3070 ref 57 27 20 13 AGGG 1 0 97333 CASAVA_Build 16 33331652 1I15M4D TCTTAAAAAA -AAAAACAAAAACAAAAAAC/CAAAAACAAAAACAAA---- AAACAAACAA 1995 het 1995 ref 24 12 5 19 N/A 0 0 97334 CASAVA_Build 16 33337005 1I AGTGCTGAGC -/A AAAGGGAGAG 2742 het 2742 ref 41 32 6 3 A 3 4 97335 CASAVA_Build 16 33338022 1D GTGTGTATCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 58 40 15 4 T 9 8 97336 CASAVA_Build 16 33338699 2I AAGAAACAGA --/TT TTTTTTTTTT 2084 het 1451 hom 22 6 7 10 T 14 16 97337 CASAVA_Build 16 33339437 2D GACTCAACTC TG/-- TGCTAGGTGT 3070 het 3070 ref 53 27 20 8 TG 2 1 97338 CASAVA_Build 16 33340468 20I TTGAGACCAG --------------------/CCTGGCCAACATAGTGAAAC CCTGTCTCTA 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 CCTGGCCAACATAGTGAAAC 0 1 97339 CASAVA_Build 16 33343050 1D CTGGCTAACA T/- TGATGAAACC 916 het 916 ref 19 12 3 4 T 2 1 97340 CASAVA_Build 16 33343240 1I TCTGTCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 A 10 11 97341 CASAVA_Build 16 33349950 14I CCTATTTGTT --------------/TTCTCATATTTGTC TTCTCATATT 3070 het 3070 ref 36 15 9 12 TTCTCATATTTGTC 1 2 97342 CASAVA_Build 16 33350057 4D TTCAGTCCAG AAGT/---- AAGAGTTAGT 3070 het 3070 ref 33 19 10 7 AAGT 1 0 97343 CASAVA_Build 16 33351169 1I25M2D ATAAAAAACA -CAGCAGCACAAGTTTCTAAACCAATAA/CCAACAGCACAAGTTTCTAAACCAAT-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 53 44 9 8 N/A 0 0 97344 CASAVA_Build 16 33351883 2I ATGACAAAAT --/CA CAGTTTGGCC 3070 het 3070 ref 47 34 10 3 CA 1 2 97345 CASAVA_Build 16 33352649 2D AGATTCTTAG TC/-- TCTCTACAGT 3070 het 3070 ref 60 44 9 9 TC 3 2 97346 CASAVA_Build 16 33353063 4I TCACACTTAA ----/CACT CACTCACACA 3070 het 3070 ref 54 35 17 2 CACT 1 2 97347 CASAVA_Build 16 33353241 1I TTTTGGCCCC -/T AGCTGGTTCA 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 T 0 1 97348 CASAVA_Build 16 33354926 4I TGGCTGAAAT ----/TAGC TAGCTAATCT 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 TAGC 1 2 97349 CASAVA_Build 16 33355727 5I ATTTTACTTT -----/TTAAA TTAAATTAAT 3070 het 3070 ref 41 28 8 5 TTAAA 1 2 97350 CASAVA_Build 16 33355969 1D AGGGCTCATC T/- TTGTGTTGTG 2210 het 2210 ref 45 36 5 6 T 3 2 97351 CASAVA_Build 16 33356685 2I GAGAATAAAC --/AG GGTGACAGGA 3070 het 3070 ref 44 28 8 8 AG 0 1 97352 CASAVA_Build 16 33358582 1D TCTGAGGGTG C/- TGTATAGTAA 3070 het 3070 ref 53 32 17 4 C 1 0 97353 CASAVA_Build 16 33359920 3D GGTGGGTAAT AAC/--- AAACTCCTCT 3070 het 3070 ref 18 9 7 4 AAC 1 0 97354 CASAVA_Build 16 33371914 1D AGCCTAGGCT G/- GGTTGATTAG 3070 het 3070 ref 52 35 13 4 G 3 2 97355 CASAVA_Build 16 33373007 1I CTATTCCCTA -/T TTAAAAAACC 1967 het 1967 ref 35 25 7 3 T 2 3 97356 CASAVA_Build 16 33373513 2D TTGGCTGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1410 hom 34 11 8 15 T 12 10 97357 CASAVA_Build 16 33379357 1I AAATAGCAGA -/G TTAATGCAAA 3070 het 3070 ref 46 32 10 4 G 0 1 97358 CASAVA_Build 16 33379453 1I GAAAGAACAG -/A AAAAAAAATT 1976 het 1976 ref 35 24 5 6 A 8 9 97359 CASAVA_Build 16 33379838 2D AACAGCAAAC TA/-- TGCGTTATTT 3070 het 3070 ref 55 30 14 11 TA 1 0 97360 CASAVA_Build 16 33381391 1I TTGGAATAGA -/G GGGTAATTTC 3070 het 3070 ref 62 38 19 5 G 3 4 97361 CASAVA_Build 16 33381662 3D CCCACAGAAT AAA/--- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 22 12 6 A 11 8 97362 CASAVA_Build 16 33382159 4D TACAGTAATC TGAG/---- AACTCAGTAT 1832 het 1832 ref 44 39 4 1 TGAG 1 0 97363 CASAVA_Build 16 33382425 1I TATTTTCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 28 12 9 A 9 10 97364 CASAVA_Build 16 33382540 2I TCAAAATTAA --/TG TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 TG 0 1 97365 CASAVA_Build 16 33382667 5D CTCAGAACTC AACAT/----- AAAATAAATA 3070 het 3070 ref 53 30 15 8 AACAT 1 0 97366 CASAVA_Build 16 33386166 4D CTGTCAGGGG GGGT/---- GGGGGGGGAA 3070 het 772 hom 14 4 9 1 GGGT 1 0 97367 CASAVA_Build 16 33386829 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 35 26 7 2 T 8 7 97368 CASAVA_Build 16 33388082 3D TATATGTGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 1939 het 1317 hom 18 10 5 3 T 17 14 97369 CASAVA_Build 16 33388647 1I GAGATGGTGA -/C CTGCCCTCCA 3070 het 3070 ref 66 41 18 7 C 1 2 97370 CASAVA_Build 16 33391342 2I GAACCACAAC --/AA AACAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 2 4 97371 CASAVA_Build 16 33392218 1I TATCAAAATT -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 55 37 8 10 A 6 7 97372 CASAVA_Build 16 33395121 5I TTAGAGATTC -----/CTTAA CTTTAGTTTT 3070 het 3070 ref 31 19 7 5 CTTAA 0 1 97373 CASAVA_Build 16 33396997 1I CAAAACTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 A 9 10 97374 CASAVA_Build 16 33398057 2I TTCTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 56 25 22 9 T 9 11 97375 CASAVA_Build 16 33398710 3D ATGGAACTAT GAG/--- GTCTCAACAG 3070 het 3070 ref 52 33 13 6 GAG 1 0 97376 CASAVA_Build 16 33400239 1D CACCCAGGGA T/- CCCCCAGCAG 3070 het 3070 ref 46 27 9 11 T 1 0 97377 CASAVA_Build 16 33402794 2I ATGAAAAACC --/CA CAGTCTAATC 3070 het 3070 ref 68 50 14 4 CA 1 2 97378 CASAVA_Build 16 33402915 1I ATCAGATGAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 50 30 9 11 A 8 9 97379 CASAVA_Build 16 33403405 3I2M2D ACAGTGGCTC ---CCAA/ACGCC-- AGTAATTCCA 3070 het 3070 ref 33 16 9 10 N/A 0 0 97380 CASAVA_Build 16 33405148 1D GCGAAGAAAC A/- AAAGAACAAA 3070 het 3070 ref 67 47 12 10 A 4 3 97381 CASAVA_Build 16 33411527 1I CAACACAACC -/T TTTTTCTCTG 3070 het 3070 ref 42 23 11 8 T 5 6 97382 CASAVA_Build 16 33414127 1I CTGCAAAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 49 33 13 3 A 7 8 97383 CASAVA_Build 16 33419335 1D GTTTTATTCC T/- TTGTAGTCAA 1695 het 1695 ref 41 30 5 7 T 3 2 97384 CASAVA_Build 16 33425511 2D ACAATCATGA CT/-- CTTCTGTTCT 3070 het 3070 ref 41 29 9 3 CT 2 1 97385 CASAVA_Build 16 33426834 1D AAATATCTTC T/- CACAGTTTTT 2016 het 2016 ref 41 27 5 10 T 1 0 97386 CASAVA_Build 16 33427237 4D TCCAACAATC TATA/---- TATTTTTCCT 2935 het 2935 ref 44 33 8 4 TA 3 1 97387 CASAVA_Build 16 33427596 2D AATTAATTAT TA/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 49 34 10 5 TA 1 0 97388 CASAVA_Build 16 33428681 1D CATTCAAAAT C/- CTCCTAGAGT 631 het 631 ref 100 74 3 26 C 2 1 97389 CASAVA_Build 16 33430291 1I GGAAAATATC -/A AGATGTTATT 3070 het 3070 ref 86 40 36 12 A 1 2 97390 CASAVA_Build 16 33430886 1D AAATGGGGAT C/- AAATCTTGAG 2582 het 2582 ref 69 48 7 14 C 1 0 97391 CASAVA_Build 16 33431083 1D AAGAATTTTT G/- TCATGTAATT 3070 het 3070 ref 57 40 13 6 G 1 0 97392 CASAVA_Build 16 33431141 4D21M1D TAATTTTATC TTCATTAATAAATAATCATCAGAAGT/----TTAATTAACAATCATCAGAAG- TTAACTAATT 3070 het 3070 ref 51 42 8 9 N/A 0 0 97393 CASAVA_Build 16 33431225 2D ATTTGTAATC AT/-- ATATGCTTAT 3070 het 3070 ref 35 16 9 11 AT 3 2 97394 CASAVA_Build 16 33431700 1D ATGACATCTC A/- AGTCTTTCTA 2835 het 2835 ref 68 50 8 15 A 2 1 97395 CASAVA_Build 16 33432010 4I TCTACTATAT ----/TTAG TTAGTTACAA 3070 het 3070 hom 90 28 42 20 TTAG 1 2 97396 CASAVA_Build 16 33432917 1I GTTTTCTGTC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 77 39 28 10 T 8 9 97397 CASAVA_Build 16 33434071 9D TTGCTGATAC ATTCATTAT/--------- CTAGTAGATA 3070 het 3070 ref 67 48 19 8 ATTCATTAT 1 0 97398 CASAVA_Build 16 33437772 1D47M2D AGAAACCTCC GAATTACCTAGCCAGCTGCTTTCTTAATTTACACCATCCCACCTCACATT/-AAATACCTAGCCAGCTGCTTTCTTAATTTACACAATCCCACCTCACA-- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 49 48 15 7 N/A 0 0 97399 CASAVA_Build 16 33438010 5I AATTTAACAA -----/TTAAT TTAATTTTAA 2889 het 2117 hom 16 5 8 3 TTAAT 1 2 97400 CASAVA_Build 16 33438242 1D ATTCCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 60 11 14 36 A 13 12 97401 CASAVA_Build 16 33438285 4I TATTTACTAC ----/TTAA TCAGTCAGTA 3070 het 3070 hom 94 28 42 25 TTAA 0 1 97402 CASAVA_Build 16 33439005 1I TGGAGTGCAG -/T TTTTTCTGCT 3070 het 3070 ref 95 61 15 19 T 5 6 97403 CASAVA_Build 16 33439203 2D GACCTTACTC AA/-- AAAAAAACCA 1604 het 1604 ref 64 41 5 19 A 9 7 97404 CASAVA_Build 16 33439517 2I ATCTTAAAAG --/TT TTTAACTTGC 3070 het 3070 hom 101 38 49 15 T 3 5 97405 CASAVA_Build 16 33439636 1D GATTCTCCTG T/- AAATTATATA 3070 het 3070 hom 89 34 41 21 T 1 0 97406 CASAVA_Build 16 33439879 3D110M2D TGCAAGGTAT AACAACTATAAATACTAAAGTTAATAATGCTTCCAGAGAATAATACAAAATGTCCCAACTGTAGGAGATAGTTTTAAAAGTAAAAAGTAATATTCCAGAGATAATTCTGTGTACT/---AACTATAAATACTAAAGTTAATAATGCTTCCAGAGAATAATAAAAAACGTCCCAACTGCAGGAGATAGTTTTAAAAGTAAAAAGTAATATTCCAGAGATAATTCTGTGTA-- CTGTTGGCAA 3070 het 3070 ref 88 105 35 73 N/A 0 0 97407 CASAVA_Build 16 33440623 3D TTATTTTCTC TCT/--- TATTATCAAA 3070 het 3070 hom 24 9 10 13 TCT 1 0 97408 CASAVA_Build 16 33442440 1D CCTTTCAACC T/- CAGTTGATTA 3070 het 3070 ref 93 69 9 15 T 1 0 97409 CASAVA_Build 16 33443203 35D9M10D AGAGAGAGAG AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGGAAAAAAAAACACAATAG/-----------------------------------GGAAAAAAA---------- AATTCCAGCA 1710 het 1710 ref 94 124 6 55 N/A 0 0 97410 CASAVA_Build 16 33444524 7D TATGTATTTT CCAACAA/------- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 83 44 17 32 CCAACAA 1 0 97411 CASAVA_Build 16 33445942 1D ATTCCATTAT A/- AAAAAAACCC 1922 het 1922 ref 67 52 10 6 A 8 7 97412 CASAVA_Build 16 33446856 1D59M1D TTTCCAGCAA TTTTTTTTTTCAGATCACACCTCTCAAAGAATTTATCAACTATTTATTATTTGCCAAAGTA/-TTTTTTTTTCAGATCACACCTCTCAAAGAATTTATCAACTATTTATTATTTGCCAAAGT- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 81 62 28 74 N/A 0 0 97413 CASAVA_Build 16 33447248 1D CCCTCCAAAA G/- AAATGGTAAA 3070 het 3070 hom 99 28 45 27 G 1 0 97414 CASAVA_Build 16 33449098 7D19M1D20M3I AAAAGAATAT CTTAAACCCTAAGAAAAGCAGTAGAGAAAGTGAAAAGAAATCAAGAA---/-------CATAAGAAAAGCAGAAGAG-AAGTAAAAAGAAATCAAGAAAGT AATACTAAAA 3070 het 3070 ref 75 74 32 15 N/A 0 0 97415 CASAVA_Build 16 33449223 4I CAGGGTACTC ----/ACTT AAAGAGAAAA 3070 het 3070 hom 94 37 49 8 ACTT 0 1 97416 CASAVA_Build 16 33449352 1I35M1I TAAGGTAATA -TTTTTCAAGGACTGGACTGGTCTTGCTTATGAAAA-/TTTTTTCTAGGACTGACCTGGTCTTGCTTACAAAAAT CTTAGGGTCC 3070 het 3070 ref 91 47 37 23 N/A 0 0 97417 CASAVA_Build 16 33449442 1D TTTGATGGTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 91 60 10 21 A 9 8 97418 CASAVA_Build 16 33450144 1D TCTATCTTTA T/- TTTTAAAAAG 2942 het 2942 ref 87 29 18 41 T 5 4 97419 CASAVA_Build 16 33451115 6D TATCACAATT CTAGCA/------ CTAGCACTCT 3070 het 3070 ref 74 41 28 11 CTAGCA 2 1 97420 CASAVA_Build 16 33453533 1I GAATGCGCAG -/C TTCAATGAGC 3070 het 3070 ref 62 37 13 12 C 0 1 97421 CASAVA_Build 16 33454516 3D ATCAAAAAGT ATA/--- ATAAACCATC 2640 het 2640 ref 64 55 7 4 ATA 2 1 97422 CASAVA_Build 16 33454659 1D16M1I TTCAACATTA TTTTTGTTTCTAAAATA-/-TTTTGTTTCTAAAATAG TCTGGTTTGA 3070 het 3070 ref 68 63 13 9 N/A 0 0 97423 CASAVA_Build 16 33456954 2D TCTTTTGCCA TC/-- TCTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 66 37 22 8 TC 2 1 97424 CASAVA_Build 16 33457249 6D ATCTCTCAGG TCCTTT/------ TATGAAATAA 3070 het 3070 ref 41 25 11 8 TCCTTT 1 0 97425 CASAVA_Build 16 33458329 6I AAAAAAATAC ------/GCACAG ACACACACAC 3070 het 3070 hom 74 21 37 30 GCACAG 0 1 97426 CASAVA_Build 16 33460257 1D TTCTCTTGCC T/- GATTACCCCG 3070 het 3070 ref 60 31 19 11 T 1 0 97427 CASAVA_Build 16 33461038 1D ACAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 2796 het 2796 ref 26 18 6 2 A 10 9 97428 CASAVA_Build 16 33468000 3I TGGGCACATG ---/TAA TCAGAAGTCA 3070 het 3070 ref 56 40 11 5 TAA 0 1 97429 CASAVA_Build 16 33469326 5D CAAACAATAC TGAGA/----- TGAGATTATA 3070 het 3070 ref 48 36 10 2 TGAGA 2 1 97430 CASAVA_Build 16 33470352 3D CTAACTGAAC CAG/--- CAGATGTTTG 3070 het 3070 ref 45 27 12 9 CAG 2 1 97431 CASAVA_Build 16 33473937 1D GCCTCACCAC A/- AGAACTCTGG 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 A 2 1 97432 CASAVA_Build 16 33476933 1D GCCAGCCAGA G/- GCATCAGATG 3070 het 3070 ref 53 34 12 8 G 2 1 97433 CASAVA_Build 16 33483453 1I29M16D CAATAAGGAG -AAAAAAAAGCCACCTGAATGTTCCTACTCATTAGATGCTATCTGG/AAAAAAAAAGCCACCTGAATGTTCCTACTC---------------- AGAGCTCCTA 2128 het 2128 ref 61 74 6 6 N/A 0 0 97434 CASAVA_Build 16 33483778 4D AGAAAGAGAC AAGA/---- AACTGTTGCC 3070 het 3070 ref 45 31 10 4 AAGA 1 0 97435 CASAVA_Build 16 33484739 8D AAATGATGTT ATGAAATG/-------- ATGAAATGAT 3070 het 3070 ref 76 44 15 23 ATGAAATG 3 2 97436 CASAVA_Build 16 33486078 1D CATATAAAGA T/- TTTTTTCCTT 2291 het 2291 ref 78 60 6 12 T 7 6 97437 CASAVA_Build 16 33486436 1I TATTTGACTT -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 55 24 24 8 A 6 7 97438 CASAVA_Build 16 33486769 1D TATGATACAC T/- TTTTTGAGAG 3070 het 3070 ref 43 26 10 7 T 6 5 97439 CASAVA_Build 16 33487502 1D AACAGTTTTC T/- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 T 5 4 97440 CASAVA_Build 16 33487835 5I CTGGAGTGCA -----/GTGGC TTGATCTCTA 1422 het 1422 ref 13 5 3 5 GTGGC 0 1 97441 CASAVA_Build 16 33488397 2D GGAAATATAT TC/-- TGTGTCACGT 1560 het 1560 ref 56 51 4 3 TC 1 0 97442 CASAVA_Build 16 33489108 2D TAATTTGTTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 41 23 10 8 TA 6 5 97443 CASAVA_Build 16 33489792 13I GCATGTTTTC -------------/AGAGTTTCTCTGT AGTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 71 32 29 10 AGAGTTTCTCTGT 0 1 97444 CASAVA_Build 16 33490842 1D AGTCATTTTT A/- TTTGCCATTT 3070 het 3070 ref 60 42 12 9 A 1 0 97445 CASAVA_Build 16 33491120 1D TATATTTTAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 100 67 13 21 T 9 8 97446 CASAVA_Build 16 33491611 3D AACATTTTCT ATA/--- ATATTAATAT 1804 het 1804 ref 57 53 4 0 ATA 2 1 97447 CASAVA_Build 16 33494483 5I TTACAATATA -----/ATATT GTGAACATGT 3070 het 3070 ref 74 47 18 9 ATATT 0 1 97448 CASAVA_Build 16 33495253 11I TATAATTAAG -----------/AATTAAGAATC AATTCACATT 1337 het 1337 ref 59 36 5 18 AATTAAGAATC 0 1 97449 CASAVA_Build 16 33495411 1I TAATAACATC -/T TGATATTTTC 3070 het 3070 ref 76 55 16 5 T 1 2 97450 CASAVA_Build 16 33507668 1I CACATGTGCT -/C CTTATTACGG 3070 het 3070 ref 60 31 20 9 C 1 2 97451 CASAVA_Build 16 33511932 4I AGATTTAGGG ----/ATTA ATTATTCAAG 3070 het 3070 ref 52 33 15 4 ATTA 1 2 97452 CASAVA_Build 16 33513715 2I AGGAAGGGGA --/AC ACACACCAGG 1860 het 1860 ref 16 10 5 1 AC 3 4 97453 CASAVA_Build 16 33516181 2D TATATCTAAG CT/-- CTCTGTATGC 3070 het 3070 ref 78 62 13 4 CT 3 2 97454 CASAVA_Build 16 33516428 2I16M3D AAACCCTGAA --TTTTTTCAAATGTTTTTTC/TTTTTTTTCAAATGTTTT--- TATGTCTGTT 3070 het 3070 ref 60 51 13 8 N/A 0 0 97455 CASAVA_Build 16 33531443 5D TATATATATA TATAT/----- ATATGTACCC 3070 het 3070 hom 25 9 13 5 TATAT 1 0 97456 CASAVA_Build 16 33534965 1D CCGGTGTCCA G/- GGCAGGGGCG 2262 het 2262 ref 25 9 7 9 G 3 2 97457 CASAVA_Build 16 33539901 5D CTGTTGAAAG TTTTT/----- TTTTTTTTTC 1842 het 1842 ref 51 31 4 17 T 14 9 97458 CASAVA_Build 16 33596792 7D AACAAAAACA AACAAAC/------- AAACAAAAAA 64 het 64 ref 26 23 2 4 AACAAAC 1 0 97459 CASAVA_Build 16 33619485 10D GGCATGATCC TAGCTCACTG/---------- TACCCTTGAA 2526 het 2526 ref 40 31 7 5 TAGCTCACTG 1 0 97460 CASAVA_Build 16 33621312 2D ATTTTATGGA TT/-- TTTTTTTGTG 3046 het 3046 ref 29 15 12 2 T 9 7 97461 CASAVA_Build 16 33643247 1D GAGTCACCCA G/- GCTCTCAGAG 3070 het 3070 ref 69 40 16 14 G 2 1 97462 CASAVA_Build 16 33654615 1D TCCAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 2715 het 2118 hom 33 13 8 12 T 17 16 97463 CASAVA_Build 16 33656691 15I ATCATAACAA ---------------/ACAGTCTCTCAGACC ACAGTGCAAT 3070 het 3070 ref 55 38 16 1 ACAGTCTCTCAGACC 0 1 97464 CASAVA_Build 16 33661206 1D GCTCACACAT C/- CCCCCACGTC 3070 het 3070 ref 64 35 11 19 C 6 5 97465 CASAVA_Build 16 33670538 1D GTCTGCAGGA C/- CCTGGAAAAG 3070 het 3070 ref 59 29 23 7 C 3 2 97466 CASAVA_Build 16 33674250 1D ACGGTATCAC A/- ATTTTTTTTT 2383 het 2383 ref 34 26 5 3 A 2 1 97467 CASAVA_Build 16 33674748 1I ATATAATGTC -/A AAAACATCAT 3070 het 3070 ref 65 39 23 3 A 4 5 97468 CASAVA_Build 16 33686715 5D CCTCTCCCTG CCCTC/----- CCCTCCCCTC 736 het 736 ref 22 10 4 8 CCCTC 3 2 97469 CASAVA_Build 16 33696673 1I CCACACCCCC -/T GCCCCAATGT 3070 het 3070 ref 37 22 8 7 T 0 1 97470 CASAVA_Build 16 33722092 1D TTCTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1810 het 793 hom 21 3 5 14 T 13 12 97471 CASAVA_Build 16 33735516 2I GTCTTTTTTT --/TC TGCAAATAGA 1325 het 1325 ref 35 25 5 5 TC 0 1 97472 CASAVA_Build 16 33745052 1I ATGATCCAGT -/A AAGGCATTCT 2368 het 2368 ref 37 30 5 2 A 2 3 97473 CASAVA_Build 16 33749343 1I TGTAGTCCTT -/C CCACAGCTTT 1821 het 1821 ref 18 13 4 1 C 2 3 97474 CASAVA_Build 16 33752106 3I TTTTCAATTC ---/TTA TTTTCTTTAT 3070 het 3070 ref 63 30 17 16 TTA 0 1 97475 CASAVA_Build 16 33752234 1I TGCTTTTTTC -/T TTTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 68 26 40 2 T 5 6 97476 CASAVA_Build 16 33754455 1D AGATAAAATC A/- GATAAGCCTG 3070 het 3070 ref 94 69 9 16 A 1 0 97477 CASAVA_Build 16 33755183 1I GCTTTTCTTT -/C TTCTGTGTTG 3070 het 3070 ref 74 40 16 18 C 0 1 97478 CASAVA_Build 16 33756248 3I TTGCACACAC ---/AGA AGAAGTCATG 3070 het 3070 hom 50 16 23 11 AGA 1 2 97479 CASAVA_Build 16 33756302 12D TGAGAAACAG AAAGAATAAAAA/------------ ATAAAAAATG 1314 het 1314 ref 47 41 3 7 AAAGAATAAAAA 1 0 97480 CASAVA_Build 16 33757275 4D4M8D TGAAAAAAAA GTTGAAGAGATATCTT/----AACA-------- GGAAGTAAAC 2710 het 2710 ref 39 31 6 2 N/A 0 0 97481 CASAVA_Build 16 33759886 4D AACATACAAA AAAC/---- AAATCAGAAC 3070 het 3070 ref 47 28 11 9 AAAC 1 0 97482 CASAVA_Build 16 33759989 1D TACTTACATC T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 52 20 20 12 T 8 7 97483 CASAVA_Build 16 33765768 6D GGTTAATTGA GTGTTT/------ GTGTTATTTG 1813 het 1813 ref 43 36 4 4 GTGTTT 1 0 97484 CASAVA_Build 16 33770278 4D TATTATTCTT AACA/---- AACAAATAAT 3070 het 3070 ref 53 30 16 9 AACA 2 1 97485 CASAVA_Build 16 33770732 1I AATTTAAAAT -/A ACTATATTTT 3070 het 3070 ref 82 43 32 8 A 1 2 97486 CASAVA_Build 16 33770791 1I AGTCTCCTAA -/C AATATATTCT 566 het 566 ref 26 16 5 6 C 0 1 97487 CASAVA_Build 16 33770820 2I AAAATTTTTT --/TG AAAGCAAATG 549 het 549 ref 37 25 2 10 TG 0 1 97488 CASAVA_Build 16 33771556 2I ATTATGAGAA --/AG AGAAAAATTT 3070 het 3070 ref 55 28 24 3 AG 1 2 97489 CASAVA_Build 16 33776299 11D CTGTGGAATG GAACTGGATTA/----------- AATGGAATGG 1226 hom 7 het 3 0 3 0 GAACTGGATTA 1 0 97490 CASAVA_Build 16 33788572 3I ATCGAATGGA ---/ATC AGCAACGAAT 1283 het 1283 ref 78 60 3 15 ATC 0 1 97491 CASAVA_Build 16 33803233 3D CATTTCCATT TGA/--- TGATGATTCC 3070 het 3070 ref 93 58 21 19 TGA 3 2 97492 CASAVA_Build 16 33803855 3D21M3D GTACATTCGA TGGTGATTCCATTCGATGCCATTCGAT/---TGATTCCATTCAAGTCCATTC--- GATGATTCCA 588 het 588 ref 65 67 3 9 N/A 0 0 97493 CASAVA_Build 16 33821055 1I49M1D TTTGGAGCGC -TTGTGGCCTATGGTGGAAAAGGAAATATCTTCACATTAAAACTAGACAGA/TTTGAGGCCCTTGCTGGAAAAGGAAATATCTTCACATAAAATCTAGACAG- AGGATTCTGA 3070 het 3070 hom 76 43 37 2 N/A 0 0 97494 CASAVA_Build 16 33822890 4I29M1D AATATGGAAA ----CTGTTTGTGGAATCTGCAAAGGGATATTTA/CTCTCTTTTTGTAGAATCTGCAAGTGGACATTT- TGAGTGCTTT 1256 het 1256 ref 60 69 3 9 N/A 0 0 97495 CASAVA_Build 16 33823548 2D AGTTGAACTA TT/-- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 59 29 17 16 T 9 7 97496 CASAVA_Build 16 33825576 4D TCTGAGAAAC TTAT/---- TTGTGATGTG 2382 het 2382 ref 50 38 7 8 TTAT 1 0 97497 CASAVA_Build 16 33825776 1I ATCATCTCAC -/A GGGGTAAAGG 3070 het 3070 ref 62 26 28 8 A 0 1 97498 CASAVA_Build 16 33826415 4I TGCTTCCAAA ----/CTTC TGGCTCAAAC 3070 het 3070 ref 91 47 24 29 CTTC 0 1 97499 CASAVA_Build 16 33827459 1D CAAAGAAAGC T/- TTCTACTCTC 3070 het 3070 ref 82 38 40 5 T 3 2 97500 CASAVA_Build 16 33827734 1I AGCCTCAAAG -/T CATCACAAAT 3070 het 3070 ref 89 38 40 12 T 0 1 97501 CASAVA_Build 16 33827981 2D TTCAACTCTG TA/-- AGATAAATGC 2618 het 2618 ref 62 44 6 15 TA 1 0 97502 CASAVA_Build 16 33836389 1D ATGCTTCCAG T/- TTTTGTCCAT 2252 het 2252 ref 21 10 6 5 T 5 4 97503 CASAVA_Build 16 33836439 3I TAGATAGCTC ---/TTA TTATTTTGAG 3070 het 3070 hom 53 13 37 3 TTA 1 2 97504 CASAVA_Build 16 33836743 2D GGTCTAAAAT AC/-- TCTTTTTTTT 1794 het 1794 ref 46 34 4 8 AC 1 0 97505 CASAVA_Build 16 33839207 2D TTTTCTGCTC TG/-- TTTTTTCCCC 1781 het 1781 ref 20 15 4 1 TG 1 0 97506 CASAVA_Build 16 33839374 2I ACTCCAGACC --/CT GTTTGCCTGG 2114 het 2114 ref 26 13 5 9 CT 0 1 97507 CASAVA_Build 16 33839932 1I GTGCTGTTTG -/T GAAGCCGGTT 2528 het 2528 ref 71 53 9 9 T 0 1 97508 CASAVA_Build 16 33844034 1D27M1I GGGGCCTTGC AAGAAGGGCGGCGAGGGATCCAAAACAA-/-AGGAGGGGTGCGAGGGATTCAAAACAAT TTTTTCCGTG 3070 het 3070 ref 49 46 10 23 N/A 0 0 97509 CASAVA_Build 16 33846256 1I4M2I29M1I GTCCTGGTCC -CCTG--GTCTGTTCGGGTGCGGAGGTCACCCAGGT-/TGCTGCCATCTGTTCGGATGCGGAGGTCACCCAGGTG TCTGAGGGTG 3070 het 3070 ref 58 34 26 15 N/A 0 0 97510 CASAVA_Build 16 33854105 1D TATAGAAAGG A/- AAAAACATAA 3070 het 3070 ref 80 32 31 20 A 6 5 97511 CASAVA_Build 16 33854145 1I CTTGTACTTT -/A AACAATTGCT 2451 het 2451 ref 75 25 9 42 A 2 3 97512 CASAVA_Build 16 33854197 2I CCAGCCACTT --/TG GGCCCCAACC 2195 het 2195 ref 46 26 5 15 TG 0 1 97513 CASAVA_Build 16 33854729 2D AGAGAAACAT AA/-- ATCTGGCTTA 3070 het 3070 ref 51 40 7 6 A 3 1 97514 CASAVA_Build 16 33854807 1I TGCTCACATG -/T TTTTTGCTGA 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 T 5 6 97515 CASAVA_Build 16 33855522 13D GCCTGGCTAT ATATATATATATA/------------- TTTTTTTTTT 2273 het 2273 ref 65 23 14 30 ATATATATATATA 1 0 97516 CASAVA_Build 16 33857205 2I GAGGCTTTCT --/TC TTTTTTTTCT 3070 het 1884 hom 32 5 18 9 TC 0 1 97517 CASAVA_Build 16 33858298 8I CTCTATGAAA --------/AATAGAAC AATTAGCCAG 1575 het 1575 ref 33 21 6 6 AATAGAAC 0 1 97518 CASAVA_Build 16 33859194 4I CAAGCTATTG ----/ATTC TCCTGCGTCA 1851 het 1851 ref 59 41 6 12 ATTC 0 1 97519 CASAVA_Build 16 33871829 2I AATTCGTAAC --/AA AGTTTCGGTA 3070 het 3070 hom 77 15 47 16 A 1 3 97520 CASAVA_Build 16 33872825 1I9M1I TCTGGTCTCG -TTGCTGTCT-/TTTGCTGTCTC GACTGGCGGG 1946 het 1946 ref 58 40 10 16 N/A 0 0 97521 CASAVA_Build 16 33873157 1I GTGGCCTGCC -/G GGGGCCCTCC 676 het 676 ref 89 42 8 39 G 4 5 97522 CASAVA_Build 16 33874290 1D CACAAGGACT C/- CCCCATAAGA 3070 het 3070 hom 73 23 38 13 C 5 4 97523 CASAVA_Build 16 33877148 5D TCTGAGAAAC TGCCT/----- TGTAATGTGT 3070 het 3070 ref 86 70 10 10 TGCCT 1 0 97524 CASAVA_Build 16 33878043 1D CAGTGTAAAA G/- TGTTCCTATT 3070 het 3070 ref 91 67 9 15 G 1 0 97525 CASAVA_Build 16 33878266 1I GGGGTTGTTT -/G GTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 101 45 24 32 G 1 2 97526 CASAVA_Build 16 33878445 1D CAATTTTGTC A/- TTTGTTGCCA 3070 het 3070 ref 76 35 30 18 A 1 0 97527 CASAVA_Build 16 33880146 1I43M1I TGGATATTTG -GAGCACTTTGAGGCCTATGGTAAAAAAGGAAATATCATCACAA-/CTGAGCCCATTGAGGCCTATGGTGAAATATGAAATATCTTCCCAT AAAATTAGAC 2192 het 2192 ref 51 54 6 30 N/A 0 0 97528 CASAVA_Build 16 33885503 2I ATGAGGAACT --/TC TTTGTGATGT 3070 het 3070 ref 64 39 19 7 TC 0 1 97529 CASAVA_Build 16 33885570 1I GGAAACACTC -/T TTTTGTAGAA 3070 het 3070 ref 86 47 25 14 T 4 5 97530 CASAVA_Build 16 33885707 1D CAGAGTTGAA C/- CTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 79 45 11 28 C 2 1 97531 CASAVA_Build 16 33885779 1D AACGCTTTGA G/- GCCTATTGTG 2084 het 2084 ref 86 72 5 10 G 2 1 97532 CASAVA_Build 16 33886417 1I16M1D AATTTGGAAA -AGTCTTTTTGTTCAATC/CAGTCTTTTTGTACAAT- TGCAAAGGGA 1162 het 1162 ref 82 73 3 9 N/A 0 0 97533 CASAVA_Build 16 33886565 1I TGAACCTTTG -/T TTTTGATTGA 1789 het 1789 ref 79 55 9 16 T 4 5 97534 CASAVA_Build 16 33886873 1I ATTCTTTGTG -/A TGTGTGCTTT 3070 het 3070 hom 89 37 47 5 A 0 1 97535 CASAVA_Build 16 33887120 1D TAGAATCTGC A/- AAAAGGATAT 3070 het 3070 hom 100 35 54 14 A 5 4 97536 CASAVA_Build 16 33888907 1I AATTCAACAA -/C CCTTCATGCT 3070 het 3070 ref 41 25 13 4 C 2 3 97537 CASAVA_Build 16 33893906 1I CAGATTCTAC -/A AAAAAGATTG 2794 het 2794 ref 81 64 7 10 A 5 6 97538 CASAVA_Build 16 33894235 1I CAAATATCCC -/T TTGCAGATTC 1758 het 1758 ref 75 65 4 6 T 2 3 97539 CASAVA_Build 16 33896041 1D CAGACATCAC A/- AAACTGTTTC 3070 het 3070 ref 55 31 18 6 A 4 3 97540 CASAVA_Build 16 33899608 2D TGTTCAACTC TG/-- TGAGTTGAAT 3070 het 3070 ref 90 63 16 14 TG 2 1 97541 CASAVA_Build 16 33900024 1D28M1D AGATATTTCC TTTTGAACGTAGCCCTCAAAGCACTAAAAT/-TTTGAACGTAGGCCTCAAAGCGCTAAAA- ATACAATTGC 3070 het 3070 ref 76 72 18 7 N/A 0 0 97542 CASAVA_Build 16 33901570 1D TAGAGGCCAC A/- AAAGGGCTCA 3070 het 3070 hom 67 27 30 11 A 4 3 97543 CASAVA_Build 16 33901704 1D TTCTGTCTAG T/- TTTTTATGGA 1203 het 1203 ref 47 26 5 19 T 6 5 97544 CASAVA_Build 16 33902145 1D CTGCTCAATC A/- AAAGAAAGGT 3070 het 3070 ref 96 58 30 10 A 4 3 97545 CASAVA_Build 16 33904271 2I ACTTTTTATT --/TG TGAAGATATT 3070 het 3070 ref 89 66 18 5 TG 1 2 97546 CASAVA_Build 16 33904605 2D TTCTGTGTAG TT/-- TTTTTCTGAA 3070 het 3070 ref 95 61 18 16 T 7 5 97547 CASAVA_Build 16 33906296 2D TGCTTCTGTG TA/-- GTTTTTATTA 1490 het 1490 ref 27 15 4 8 TA 1 0 97548 CASAVA_Build 16 33912126 1D CATAGGTTTC A/- AAATTGCTCC 3070 het 3070 ref 61 43 11 8 A 4 3 97549 CASAVA_Build 16 33912932 1D TCTCAGAATG C/- TTCTGTGTAG 546 het 546 ref 62 48 4 10 C 1 0 97550 CASAVA_Build 16 33913042 1I6M1D ACTGCTCAAT -AAAATGA/CAAAATG- AAGACTCAAC 1309 het 1309 ref 47 44 3 3 N/A 0 0 97551 CASAVA_Build 16 33914213 1I CAGTTTCTAC -/A AAAAGAGTGT 2496 het 2496 ref 39 26 6 8 A 4 5 97552 CASAVA_Build 16 33915244 2I ACAATGAGTG --/TC TTTCAAAACT 1364 het 1364 ref 49 28 3 18 TC 0 1 97553 CASAVA_Build 16 33919686 1D AAGAGGGTTT C/- AAAACTGCTC 3070 het 3070 ref 51 37 10 5 C 1 0 97554 CASAVA_Build 16 33920950 1I GAAGTTTCTC -/A AAATTTTTCT 1588 het 1588 ref 39 30 6 3 A 3 4 97555 CASAVA_Build 16 33921676 1D TCCTTTCCAT C/- GCAGGCCCAA 1560 het 1560 ref 41 31 4 8 C 1 0 97556 CASAVA_Build 16 33922400 1D30M1D CAGATTCTAC AAAAATTGTGTTTCAAAACTGCTCAATCAAAT/-AAAATTGTGTTTCCAAACTGCTCAATCAGA- GAAAGGTTCA 3070 het 3070 ref 62 70 9 8 N/A 0 0 97557 CASAVA_Build 16 33929429 4D AACGGGAATA TCTT/---- CACATAAAAA 3070 het 3070 ref 63 40 21 3 TCTT 1 0 97558 CASAVA_Build 16 33929907 1I GTGGAAATTT -/C TATCACTTTG 3070 het 3070 ref 70 38 26 6 C 0 1 97559 CASAVA_Build 16 34031110 1D AAGTGAAATG A/- AAAGCTAGAT 1913 het 1913 ref 39 30 5 4 A 4 3 97560 CASAVA_Build 16 34032546 1D TCATGCACAT A/- AGAGATCATT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 2 1 97561 CASAVA_Build 16 34034850 1D ATTCTCTGAG T/- TTTCCTAGAT 2371 het 2371 ref 32 23 7 2 T 4 3 97562 CASAVA_Build 16 34036710 1D26M1D AGAAGGAGTT AGGGGTGGGGAGTTAATGATTCTAAGGC/-GGGGTGGAGAGTTAATGATTCTAAGG- AATCCTTAAG 3070 het 3070 ref 91 72 25 15 N/A 0 0 97563 CASAVA_Build 16 34038785 1I TATGATGATT -/A CATTCGATTC 3070 het 3070 ref 90 61 14 15 A 0 1 97564 CASAVA_Build 16 34038991 1D TCGAGTCCAA T/- TTTTCATTCC 2923 het 2923 ref 90 72 8 13 T 5 4 97565 CASAVA_Build 16 34042055 1D GATGATTCCA T/- TTTTATTCCA 3070 het 3070 ref 87 42 30 16 T 5 4 97566 CASAVA_Build 16 34045616 23D AATGATTCCA TTCAAGACCATTGGATGATTCCT/----------------------- TTCAATTCCA 2895 het 2895 ref 94 85 12 15 TTCAAGACCATTGGATGATTCCT 1 0 97567 CASAVA_Build 16 34049576 3D GATTCCATTC GAT/--- GTTGATTCCA 380 het 380 ref 96 69 3 27 GAT 1 0 97568 CASAVA_Build 16 34059607 1D CAGGTCTTTT A/- AAAAAAAAAG 1528 het 1528 ref 44 37 4 3 A 10 9 97569 CASAVA_Build 16 34091747 1I TTTGTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 20 1 16 3 A 14 15 97570 CASAVA_Build 16 34128191 1I TATTTTAAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 6 7 97571 CASAVA_Build 16 34216546 4D GTATGTAGAA AAAG/---- AAAGGTGATA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 AAAG 2 1 97572 CASAVA_Build 16 34220994 6D CCATCACTCT ACTAGA/------ ACAGTTTGAA 3070 hom 126 het 46 0 42 10 ACTAGA 1 0 97573 CASAVA_Build 16 34231481 1I GGGAACCACC -/T GGGTGGGTGT 3070 hom 49 het 22 0 15 7 T 0 1 97574 CASAVA_Build 16 34246377 1D CAGTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 28 1 23 4 A 12 11 97575 CASAVA_Build 16 34261104 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAATGATG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 6 5 97576 CASAVA_Build 16 34272432 1D TTTCTGGTTA T/- TTTTTTCAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 6 97577 CASAVA_Build 16 34275601 2I TGACAGAATC --/TG TCACAGATAG 3070 hom 163 het 58 0 55 3 TG 0 1 97578 CASAVA_Build 16 34281705 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 29 3 17 9 T 15 14 97579 CASAVA_Build 16 34304890 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 17 0 15 2 A 13 12 97580 CASAVA_Build 16 34305081 1I CATTATTTTT -/A TTTATAAATT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 0 1 97581 CASAVA_Build 16 34326687 1I CAAGAGGCCT -/G TGCCTTAATC 3070 hom 63 het 30 0 20 10 G 0 1 97582 CASAVA_Build 16 34338563 1D CCTTTGGGGC A/- AAAAAAAAAA 1789 het 1789 ref 31 15 7 9 A 17 16 97583 CASAVA_Build 16 34339648 1I CATAGTGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 334 hom 23 1 14 8 A 11 12 97584 CASAVA_Build 16 34343454 1I GTAGGCAGAG -/A CAAGCAGAGA 3070 hom 43 het 19 0 12 7 A 0 1 97585 CASAVA_Build 16 34344630 6D TCATATCATC TTTATA/------ TTTATCATAT 1379 het 206 hom 34 2 9 24 TTTATA 1 0 97586 CASAVA_Build 16 34346132 1I2M2I13M2I9M1D TACTCAGTCA -GA--AAGAATAAAATCA--TCTTTTGCAG/TGAAGAAGAATAACATCACGTCTTTTGCA- CCACATGAAT 1327 het 1327 ref 39 45 3 4 N/A 0 0 97587 CASAVA_Build 16 34346864 1I GTAGATAAAT -/G GGCAGCATGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 2 3 97588 CASAVA_Build 16 34349176 1D CAATATGAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 76 het 34 0 26 8 A 10 9 97589 CASAVA_Build 16 34388862 1I TCTTTTGGAT -/G GGGGGGCTGG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 G 6 7 97590 CASAVA_Build 16 34396792 1I TTGGGAATGG -/A GGCCTGGGCA 3070 het 3070 hom 49 18 28 3 A 0 1 97591 CASAVA_Build 16 34406757 2D GTAAATAAGA CT/-- CTCTCTAGCT 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 CT 4 3 97592 CASAVA_Build 16 34503523 1I CATCATCTGT -/G GCCCTTGCAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 G 1 2 97593 CASAVA_Build 16 34504565 1I AAAGCTCCTG -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 7 8 97594 CASAVA_Build 16 34511280 4D TGTGGAATCT GAAA/---- GAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 44 19 23 6 GAAA 2 1 97595 CASAVA_Build 16 34522338 3D CCCAAAGGAG GTT/--- GTTATTTGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 8 GTT 2 1 97596 CASAVA_Build 16 34525871 1D GTTTCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 576 hom 31 4 18 10 T 15 14 97597 CASAVA_Build 16 34534185 2D TCACAGGCTT AC/-- ACAGTCAACT 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 AC 2 1 97598 CASAVA_Build 16 34612558 1I GTATTAGAAT -/G GCTTTTTTTA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 G 1 2 97599 CASAVA_Build 16 34677244 9D ATAAGCATAT AAAAATTAA/--------- AAAAATAAAA 3070 het 2973 hom 22 8 12 2 AAAAATTAA 1 0 97600 CASAVA_Build 16 34679793 1I AACCAAAGTA -/T TTATCCCTTT 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 T 2 3 97601 CASAVA_Build 16 34765622 1D ATTTAACAGG T/- TTGGCAACAC 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 3 2 97602 CASAVA_Build 16 34849825 1D CTCCTGAATC A/- AAAAAAAAAA 1149 het 1149 ref 38 27 3 8 A 11 10 97603 CASAVA_Build 16 34871320 1D TAGATTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1729 het 1729 ref 34 24 5 6 A 13 12 97604 CASAVA_Build 16 34894658 3I TCTGTGTACT ---/AAC AACATAGCTT 1148 het 1148 ref 38 28 3 7 AAC 1 2 97605 CASAVA_Build 16 34917047 1I TGCCTCCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1905 hom 35 10 13 12 T 13 14 97606 CASAVA_Build 16 34925787 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 14 9 T 11 12 97607 CASAVA_Build 16 34958847 1D CATTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 928 hom 40 3 28 9 T 13 12 97608 CASAVA_Build 16 35007962 1D TCAAAACAAA G/- GTTTAACTCA 3070 hom 141 het 49 0 48 2 G 2 1 97609 CASAVA_Build 16 35020048 1D CTACTGATTC A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 8 7 97610 CASAVA_Build 16 35041827 1D TTTAGTTTTT A/- TTGCGGGCTA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 A 1 0 97611 CASAVA_Build 16 35085634 4I44M15D6M12D CACCTAAAAA ----CTAGGCAGAAGCATTCTGAGAAACTTCTTTGTGATGTGTGCATTCTGCTTAAAGAATTGGACCATTCCTGTGATTGA/AACCCTACAGAGAAGCATTCAGAGAAAGTCCTTTGTGATGTGTGCATT---------------GAACAT------------ GCAGTTTTGG 1071 het 1071 ref 36 52 3 3 N/A 0 0 97612 CASAVA_Build 16 35086917 4D CAGTTTTGAA TTTC/---- TCTCTCTTTT 1385 het 1385 ref 42 27 7 9 TTTC 1 0 97613 CASAVA_Build 16 35089276 1I GGAGTTGAAA -/C TTTCTTTTGA 3070 het 3070 ref 56 46 8 2 C 0 1 97614 CASAVA_Build 16 35098262 1I TGAAACACTC -/T ATTTGTAGAA 1810 het 1810 ref 33 26 4 3 T 0 1 97615 CASAVA_Build 16 35110994 2I TTCTTTGTGA --/TG TGTGCATTCG 1724 hom 10 het 4 0 4 0 TG 2 3 97616 CASAVA_Build 16 35119056 1D TTTTGATTGA G/- GCAGTTTTGA 1318 het 1318 ref 47 29 7 11 G 2 1 97617 CASAVA_Build 16 35125371 1I AGACCTAATG -/T GGAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 58 37 12 9 T 0 1 97618 CASAVA_Build 16 35138701 2D5M3I TGTGTATTCA ACTCTCA---/--TCTCACGG GTGTGTTCTT 1307 het 1307 ref 43 39 3 3 N/A 0 0 97619 CASAVA_Build 16 44954547 3D CTATTCTATT CAA/--- TGGTGAATCC 3070 het 3070 hom 59 29 21 10 CAA 1 0 97620 CASAVA_Build 16 44984281 3D ATTGAATAGA ATC/--- ATCATCGAAT 3070 het 3070 ref 79 56 9 15 ATC 3 2 97621 CASAVA_Build 16 44984364 3D ATGGAATCAT CAA/--- TGAATGAAAT 737 het 737 ref 74 68 4 79 CAA 1 0 97622 CASAVA_Build 16 44993126 26D AGGAATTGAA CGGAATCATCGTCAAACGGAATCAAG/-------------------------- TGGAATCATC 2209 het 2209 ref 58 66 6 16 CGGAATCATCGTCAAACGGAATCAAG 1 0 97623 CASAVA_Build 16 44993195 13D8M10D ATCGAATGGA ATCAAAAGCAATTATTGAATGGACTCAAATA/-------------ATTGAATG---------- GAATCATAGA 3070 het 3070 ref 96 100 12 10 N/A 0 0 97624 CASAVA_Build 16 44995251 3I GGAATTTAAT ---/GGA AGAATCATCA 1723 het 1723 ref 89 56 6 27 GGA 0 1 97625 CASAVA_Build 16 44996583 3I AATGGAATCA ---/TCT TCGAATGGAA 134 het 134 ref 91 49 2 40 TCT 0 1 97626 CASAVA_Build 16 45007044 3D3M6D AATCAAATTG AACCATTTGAAC/---CAT------ CATCATCGAA 2873 het 2873 ref 98 76 13 29 N/A 0 0 97627 CASAVA_Build 16 45008153 3D55M3D ATCGATTGGA AGCATCATCGAATGGAATCGAATGAAAACATCATCGAATTGAATCAAATGGAATCATCATG/---ATCATCAAATGACATCGAATGGAATCATCCTCGAATGGAATCTAATGAAATCATC--- GAATTGAATC 1132 het 1132 ref 86 107 3 12 N/A 0 0 97628 CASAVA_Build 16 45014548 2D ACCAATAATG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 80 52 10 18 GT 7 6 97629 CASAVA_Build 16 45015280 2I TAGTTACTGC --/TA TGTGCTCAGT 3070 het 3070 hom 101 35 58 9 TA 0 1 97630 CASAVA_Build 16 45016283 1D TTTAAAAATG T/- TTTTTTGATC 789 het 789 ref 65 25 3 37 T 7 6 97631 CASAVA_Build 16 45016605 1D GATACAGATC A/- GGGGGAGCAG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 1 0 97632 CASAVA_Build 16 45017282 1D AGAACAAAAA G/- AAATAAGAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 G 1 0 97633 CASAVA_Build 16 45017515 3I ATCAATTCTC ---/AAG AAGATGTAAA 2473 het 2473 ref 57 43 6 8 AAG 1 2 97634 CASAVA_Build 16 45017828 4D TCTTCCTTCC TTCT/---- TTCCATCTTC 3070 het 3070 ref 65 28 16 22 TTCT 1 0 97635 CASAVA_Build 16 45017857 5I TCTTCTCTTC -----/CCTTG CCTTCTTCCT 3070 het 3070 ref 46 23 11 12 CCTTG 0 1 97636 CASAVA_Build 16 45018169 2D TTTCTTTCTC TT/-- TCTTTCTTGA 1892 het 1892 ref 30 21 5 5 T 3 1 97637 CASAVA_Build 16 45020540 1I CTTGATGTTA -/G CCTATCAGCT 2762 het 2762 ref 43 31 7 5 G 0 1 97638 CASAVA_Build 16 45020783 6I GAAATAAACA ------/TAGACT TAGAGTAGAT 3070 het 3070 ref 86 54 13 19 TAGACT 0 1 97639 CASAVA_Build 16 45021303 3D38M6D GTAAGTACAT ATAAATAAATGTCTTAAAACTCCTCTTATGTTAGCTAATTAAGAAAT/---AATAAATGTCTTAAAACTCCTCTTATGTTAGCTAATTA------ ATTATTGTAA 1698 het 1698 ref 68 89 4 13 N/A 0 0 97640 CASAVA_Build 16 45021630 1D GTTCTTCGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 23 13 16 T 10 9 97641 CASAVA_Build 16 45022830 1I30M2I AGGCTCACCT -ATGTTGGAAACTGATCTGAGAGCACGGAAG--/CCTGTTGGAAATTGATCTGAGAGCGCGGAAGGA CAGAATTATT 3070 het 3070 hom 92 35 60 24 N/A 0 0 97642 CASAVA_Build 16 45023045 4D GGCATTGTCT CTAA/---- CTACATTGCT 3070 het 3070 ref 85 64 10 13 CTAA 1 0 97643 CASAVA_Build 16 45025798 4D GGTATATAAT AGAC/---- AGATCATCCA 3070 het 3070 ref 72 56 14 3 AGAC 1 0 97644 CASAVA_Build 16 45026144 1I ATTTGCACAT -/C CATGTTTGCA 3070 het 3070 ref 65 34 25 6 C 1 2 97645 CASAVA_Build 16 45033279 2D GGGAACAGGT AG/-- GAGGTAATTG 2257 het 2257 ref 27 20 5 3 AG 1 0 97646 CASAVA_Build 16 45037991 1D TTATATAATC T/- TTTTTAGCTG 1382 het 1382 ref 32 26 3 3 T 6 5 97647 CASAVA_Build 16 45038194 2I GAACAAAATT --/AA AGAGTAGCTA 3070 het 3070 ref 78 36 28 15 A 1 3 97648 CASAVA_Build 16 45040324 1I CTATCTTGAG -/A AAAAAACGCA 3070 het 3070 ref 83 62 12 9 A 6 7 97649 CASAVA_Build 16 45050665 4I AAGATACATA ----/TATT TATATACAGA 1368 het 1368 ref 37 32 3 2 TATT 0 1 97650 CASAVA_Build 16 45052233 5I AATATTTCTC -----/TCTTT TAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 TCTTT 0 1 97651 CASAVA_Build 16 45052280 3D CACTAACAAA TAT/--- TATTATTATA 1472 het 1472 ref 47 21 4 22 TAT 4 3 97652 CASAVA_Build 16 45053066 4I CCTACGAGCT ----/ACAA ACAAACAAGT 3070 het 3070 ref 64 32 23 10 ACAA 2 3 97653 CASAVA_Build 16 45054967 4I ATTTAATATT ----/TTTC TTTATTTAAA 3070 het 3070 hom 83 22 33 28 TTTC 0 1 97654 CASAVA_Build 16 45083913 1I CCTAAGAGAC -/A TCTACAGAAC 1384 het 1384 ref 21 15 3 3 A 0 1 97655 CASAVA_Build 16 45102387 1I AAGTAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 9 10 97656 CASAVA_Build 16 45123826 1I AAGCTCATTA -/G GGGGCTGCCA 3070 hom 63 het 34 0 20 14 G 4 5 97657 CASAVA_Build 16 45148039 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 879 het 586 hom 14 2 6 6 A 17 18 97658 CASAVA_Build 16 45185140 7D TGACAGAACA AGTCCCT/------- AGTCCCTATC 3070 hom 68 het 24 0 21 7 AGTCCCT 2 1 97659 CASAVA_Build 16 45186713 6I TGTGTGAATC ------/TACAAT TACAAAGTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TACAAT 0 1 97660 CASAVA_Build 16 45197378 1I AACAGCTGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 94 hom 30 1 27 2 A 9 10 97661 CASAVA_Build 16 45208919 1D CATGGCAATT A/- GATGTGAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 1 0 97662 CASAVA_Build 16 45226075 1I CCAGAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 A 11 12 97663 CASAVA_Build 16 45227857 1I TCTTTTTAAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 333 hom 19 1 14 4 T 7 8 97664 CASAVA_Build 16 45236713 1I AGGAGAACTA -/C AAATCACTGC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 0 1 97665 CASAVA_Build 16 45236877 1D TCACAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 32 1 27 4 A 12 11 97666 CASAVA_Build 16 45238414 1I AATAAAAAAA -/T AAAAAACAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 97667 CASAVA_Build 16 45244072 1I CACAATATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1028 hom 26 4 17 5 T 11 12 97668 CASAVA_Build 16 45245705 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 54 het 22 0 17 5 AG 1 2 97669 CASAVA_Build 16 45266424 1I CCAGGGTGGT -/A ACTGACCTGG 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 1 2 97670 CASAVA_Build 16 45292351 1D TATTTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 1533 het 1034 hom 24 4 7 14 T 13 12 97671 CASAVA_Build 16 45292396 1D GTGAGGTGTT A/- ATGTCATTAT 3070 hom 63 het 29 0 19 10 A 2 1 97672 CASAVA_Build 16 45292769 1D GTCATGAAGC T/- TTTCCCTTGT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 4 3 97673 CASAVA_Build 16 45308944 1I ACTGTATGTT -/C CCCCCAACCA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 C 5 6 97674 CASAVA_Build 16 45348624 1D CATCCACATT G/- TCTGTCCACC 3070 het 3070 ref 35 17 18 0 G 1 0 97675 CASAVA_Build 16 45359734 1D TGTTTTTTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 10 9 97676 CASAVA_Build 16 45360849 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 263 hom 25 1 13 11 A 15 14 97677 CASAVA_Build 16 45361757 1D TCCATCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 23 1 20 2 A 11 10 97678 CASAVA_Build 16 45362631 1D GGACAGGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 24 11 A 12 11 97679 CASAVA_Build 16 45367632 6D CCTGTCTTGG AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2316 het 875 hom 23 5 10 9 A 19 13 97680 CASAVA_Build 16 45367878 1D CAGAAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 20 1 8 11 T 15 14 97681 CASAVA_Build 16 45391604 1D TTTTTTTTTT C/- TTAAGTATTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 C 1 0 97682 CASAVA_Build 16 45403000 1D GTAGTCTTGT A/- AAAAAAAAAA 2357 het 2357 ref 21 10 7 4 A 13 12 97683 CASAVA_Build 16 45431413 1I AACACATGTA -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 6 7 97684 CASAVA_Build 16 45444961 2D AAAATCCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 491 hom 18 1 10 7 T 13 11 97685 CASAVA_Build 16 45446079 1I AGTTAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 236 hom 38 2 24 12 T 15 16 97686 CASAVA_Build 16 45484536 1D TGAATTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 1 0 97687 CASAVA_Build 16 45521859 1D CCTCTATGCT G/- TGATTTCCAC 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 G 1 0 97688 CASAVA_Build 16 45533251 1D TATTTTTTAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 9 8 97689 CASAVA_Build 16 45533747 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 10 11 97690 CASAVA_Build 16 45534145 5I GCAAGTCCAC -----/AGAGT AAAGTGAAAG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AGAGT 0 1 97691 CASAVA_Build 16 45539040 1D TCTTAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 32 0 22 10 T 12 11 97692 CASAVA_Build 16 45541613 1D AGCAAACAAA G/- GGAAATGAGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 3 2 97693 CASAVA_Build 16 45547851 1D ACAAGATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 29 2 18 9 A 15 14 97694 CASAVA_Build 16 45549016 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 24 1 23 0 A 12 11 97695 CASAVA_Build 16 45549977 1D21M1I ACTCCATCTC AAAAAAAAAAACAAAAACAAAC-/-AAAAAAAAAACAAAAACAAACA AAACAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 N/A 0 0 97696 CASAVA_Build 16 45563662 1I TCCATATTTT -/C CCTATTGTCA 3070 hom 102 het 36 0 32 4 C 2 3 97697 CASAVA_Build 16 45582798 1I GCCTCATCAG -/A AATAATGCAG 3070 hom 126 het 53 0 43 10 A 2 3 97698 CASAVA_Build 16 45610239 1I CAAGATTGTT -/A AAAAAAAAAA 922 het 922 ref 30 20 5 9 A 13 14 97699 CASAVA_Build 16 45621653 1I CCCAGCACTT -/G GGGGGGGCCG 3070 het 31 hom 30 2 22 6 G 7 8 97700 CASAVA_Build 16 45633148 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1267 het 569 hom 24 4 6 15 A 17 18 97701 CASAVA_Build 16 45638021 1D TCTCAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 26 3 T 13 12 97702 CASAVA_Build 16 45642268 2D AGCAGATGAC AA/-- AGGGGGAAAG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 3 1 97703 CASAVA_Build 16 45642997 1I CACTGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 34 0 24 10 A 11 12 97704 CASAVA_Build 16 45643699 1D CCATCTCCAC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 82 het 32 0 26 6 A 7 6 97705 CASAVA_Build 16 45659505 1I GCTGCTTCTC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 10 het 33 1 28 4 T 7 8 97706 CASAVA_Build 16 45678445 1D TATAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 14 10 T 15 14 97707 CASAVA_Build 16 45682332 2D ATGAACTGAA TC/-- TCTCATGCAG 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 TC 3 2 97708 CASAVA_Build 16 45758176 8I5M2I AATGCTTTAG --------TTTGC--/TGAACATCTCTGCAA ACCCAAATTA 3070 hom 84 het 27 0 29 2 N/A 0 0 97709 CASAVA_Build 16 45794000 1I GGTGTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 A 11 12 97710 CASAVA_Build 16 45808557 1I TCATTATATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 328 hom 34 1 28 5 A 9 10 97711 CASAVA_Build 16 45819766 1I GATAAGAAGG -/T TTTTTTTTTT 1122 het 1122 ref 55 37 3 15 T 10 11 97712 CASAVA_Build 16 45826681 1I AGTTAAAGGT -/A ACTGGCAGAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 1 2 97713 CASAVA_Build 16 45856591 1D CAGCCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 24 0 17 8 T 12 11 97714 CASAVA_Build 16 45882433 1D TGTCCTGTGG C/- CTGCTAGATC 3070 hom 87 het 36 0 28 8 C 2 1 97715 CASAVA_Build 16 45894908 1D ATCAGCCTTA G/- GGGGGAAAAG 3070 hom 115 het 45 0 39 6 G 6 5 97716 CASAVA_Build 16 45943144 1D ATACGGAACC A/- AAAAAGAGCC 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 6 5 97717 CASAVA_Build 16 45986048 1D ATCTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 875 het 875 ref 43 32 3 8 A 11 10 97718 CASAVA_Build 16 46019949 2D AGCAGGCAAC AT/-- GTGCTGAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AT 1 0 97719 CASAVA_Build 16 46078826 2D TACAAGAGTT TA/-- TATATATATA 2611 hom 24 het 11 0 9 2 TA 8 7 97720 CASAVA_Build 16 46108668 1D TGTTCAGTAA T/- TTTTTTTTTT 1945 het 1945 ref 39 21 7 11 T 17 16 97721 CASAVA_Build 16 46156371 1D TCTGTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 1436 het 1436 ref 53 34 4 15 T 13 12 97722 CASAVA_Build 16 46242188 4D GTATTAGATT ATTA/---- ATTTACCATT 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 ATTA 1 0 97723 CASAVA_Build 16 46264542 1D CAATCTGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 19 0 17 2 T 14 13 97724 CASAVA_Build 16 46297320 3D TGCTCCTCCT CTC/--- CTCCTAGACA 3070 het 3070 ref 56 25 19 14 CTC 2 1 97725 CASAVA_Build 16 46300471 1I ACACACATAC -/A AAGTACCTGC 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 2 3 97726 CASAVA_Build 16 46430918 1I AGAAAGACAG -/T TTTCCTTTGG 3070 hom 75 het 28 0 24 4 T 3 4 97727 CASAVA_Build 16 46528360 16D TTTTTGCCTT TTTGTATGCTTTGTAA/---------------- TTTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 23 18 3 TTTGTATGCTTTGTAA 1 0 97728 CASAVA_Build 16 46548980 1D AGTGACCAGC T/- TTTTTTTTTC 1331 het 1331 ref 30 20 3 8 T 10 9 97729 CASAVA_Build 16 46604088 1D CCAGGATCCA T/- TTCTTCCTCC 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 T 3 2 97730 CASAVA_Build 16 46631940 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 991 het 991 ref 30 24 3 3 T 12 11 97731 CASAVA_Build 16 46706054 1I ACATGCACTG -/C CCCCCCCTTC 1854 het 1854 ref 37 20 7 10 C 7 8 97732 CASAVA_Build 16 46751092 1I ACTAAAAATA -/C CAAAAAAATT 2623 het 757 hom 11 2 8 1 C 1 2 97733 CASAVA_Build 16 46838813 1I TGACGCTGGC -/T ACAGCCTTCA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 0 1 97734 CASAVA_Build 16 46840298 1D TGTCTATAGG A/- AAAAAAAAAA 2314 het 1176 hom 29 8 7 14 A 19 18 97735 CASAVA_Build 16 46890315 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1302 het 1302 ref 23 14 3 6 T 11 12 97736 CASAVA_Build 16 46940617 1D TAGACTACAA T/- TTTAGTCCAC 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 T 4 3 97737 CASAVA_Build 16 46951814 1I TTTGCTGTGA -/T TTAGAGTTAA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 2 3 97738 CASAVA_Build 16 47007593 1D ATTCATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 121 hom 21 1 17 3 T 15 14 97739 CASAVA_Build 16 47149889 1D GACTAGATTT G/- CAAAACATCC 3070 het 3070 hom 32 11 20 3 G 1 0 97740 CASAVA_Build 16 47231519 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1359 het 1359 ref 27 17 3 7 A 11 12 97741 CASAVA_Build 16 47241628 2D GAATGCACAC TT/-- TGTGCTCCTA 3070 hom 128 het 49 0 41 9 T 3 1 97742 CASAVA_Build 16 47245937 1I AGCATTCTGA -/T TTTTTCACAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 5 6 97743 CASAVA_Build 16 47249072 1D ATTTTATTGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 7 97744 CASAVA_Build 16 47251000 2D TTATATTAGT AA/-- AGTTTGCTTT 3070 hom 66 het 23 0 23 1 A 3 1 97745 CASAVA_Build 16 47255637 2I ATCAGCTTAA --/GG GGAGATTTTG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 2 4 97746 CASAVA_Build 16 47263547 1D TTTGGCCAAG A/- ACCCGGGAAA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 2 1 97747 CASAVA_Build 16 47263861 1I AGAAAAAAGT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 7 8 97748 CASAVA_Build 16 47266930 12I TGGCTTTAAA ------------/GCTGCCAAATTT GGCTATAGCT 3070 hom 83 het 35 0 24 11 GCTGCCAAATTT 0 1 97749 CASAVA_Build 16 47267276 3I ATGGAAACTA ---/CTC CTTGTAATAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 CTC 0 1 97750 CASAVA_Build 16 47268190 1D AACTCCGTCT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 8 7 97751 CASAVA_Build 16 47271845 1I AAAAAAGACT -/G GGGTTTCCCC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 3 4 97752 CASAVA_Build 16 47273398 1I TTCGAATGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 9 10 97753 CASAVA_Build 16 47275002 1D AATTACACAG T/- ATGTTTCTTA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 1 0 97754 CASAVA_Build 16 47275283 2D TTTTTGAGGC AG/-- AGTCTCCCTC 3070 hom 81 het 34 0 26 10 AG 2 1 97755 CASAVA_Build 16 47298931 1I AGTGTTTATG -/T TTCTCCCCAC 3070 hom 144 het 51 0 48 3 T 2 3 97756 CASAVA_Build 16 47322439 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1827 hom 26 9 10 7 T 13 12 97757 CASAVA_Build 16 47369413 1I TTATTAAGCT -/A TTTTTTTATT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 0 1 97758 CASAVA_Build 16 47420023 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 682 hom 31 het 14 0 8 6 A 11 10 97759 CASAVA_Build 16 47421944 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1659 het 1659 ref 44 24 5 15 T 13 12 97760 CASAVA_Build 16 47430560 5D ATTGAGCTTT CTCTC/----- CTCCCACTAC 3070 het 3070 hom 41 17 20 7 CTCTC 1 0 97761 CASAVA_Build 16 47436190 1I TGTCCAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 17 7 T 10 11 97762 CASAVA_Build 16 47437562 3D TCTGGTGACA ACG/--- ACAATGCAAG 3070 het 3070 hom 44 14 23 10 ACG 1 0 97763 CASAVA_Build 16 47439278 1I TAAGTAATGA -/G TAAGTATTCA 3070 het 3070 ref 47 26 20 1 G 0 1 97764 CASAVA_Build 16 47442254 1D CCATTAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 34 2 22 10 A 13 12 97765 CASAVA_Build 16 47443486 3I ACAACAACCT ---/AAA CAAAAAAATA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 0 3 97766 CASAVA_Build 16 47446487 1D AGAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 30 0 25 6 A 12 11 97767 CASAVA_Build 16 47450963 1I CATTAATGTC -/A AGGGCATAAG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 1 2 97768 CASAVA_Build 16 47451883 2D AAGAAGGCAT AC/-- ACACATGGCC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AC 3 2 97769 CASAVA_Build 16 47454955 2D TCCTTGATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 32 0 30 2 T 12 10 97770 CASAVA_Build 16 47490678 4I GGTGACTCAT ----/TGAA TGCTCTGAAG 3070 het 3070 ref 66 31 28 7 TGAA 0 1 97771 CASAVA_Build 16 47490836 3I GATCTGACCC ---/CAG GCAGTTCAAC 3070 het 3070 ref 69 36 25 8 CAG 0 1 97772 CASAVA_Build 16 47503377 1I GAAATAATAG -/C TACAAAGTGT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 C 0 1 97773 CASAVA_Build 16 47515643 1D TGAATTTTGG A/- AGTTCCTGCA 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 A 2 1 97774 CASAVA_Build 16 47522156 1I CCATACTCAC -/A ACCCATACTC 3070 het 3070 ref 75 36 30 9 A 1 2 97775 CASAVA_Build 16 47522583 2I TCACACACAC --/TG TCAGATCCAC 3070 het 3070 hom 56 23 23 10 TG 0 1 97776 CASAVA_Build 16 47522709 2D ACACCCCCCC CA/-- CACTTGCTTA 3070 het 3070 hom 65 24 17 26 CA 2 1 97777 CASAVA_Build 16 47522754 1D ACTTGCTCAG C/- CCCCCACACA 3070 het 3070 hom 57 16 16 26 C 6 5 97778 CASAVA_Build 16 47522966 4D CACACCCACA CACT/---- CACACACATT 3070 het 3070 ref 65 25 27 17 CACT 1 0 97779 CASAVA_Build 16 47523255 2D CACCCATGTT CA/-- CACACAATCA 3070 het 3070 ref 76 42 21 14 CA 4 3 97780 CASAVA_Build 16 47523676 4I CACACACCCA ----/CACT CACACACACC 3070 het 3070 ref 76 35 24 17 CACT 0 1 97781 CASAVA_Build 16 47530383 2I TACCTTCCAG --/CC CCCCCCGCCA 1858 het 1858 ref 30 10 8 12 C 6 8 97782 CASAVA_Build 16 47548790 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 7 8 97783 CASAVA_Build 16 47574982 3I GGAAGACCAT ---/GAA GTCAGCTGAA 3070 het 3070 ref 57 26 24 7 GAA 0 1 97784 CASAVA_Build 16 47584164 8D AGGATTGCTT GAACCTAG/-------- GAGTTCAAGA 3070 het 3070 hom 32 12 19 3 GAACCTAG 1 0 97785 CASAVA_Build 16 47593574 135D AACAGACTCT AGAAAGATAGGCCTCACCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- AGAAAGATAG 3070 hom 33 het 12 0 12 7 AGAAAGATAGGCCTCACCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 97786 CASAVA_Build 16 47607402 1I GTGTGGTTTG -/T GTGTGGGTAT 3070 hom 201 het 75 0 66 9 T 0 1 97787 CASAVA_Build 16 47607477 3D12M3D GCAGGTGTGT GTGGGGGGGGTGTATGTG/---GGGGGGGTGTAT--- GTATGTGTGC 3070 het 698 hom 73 4 39 47 N/A 0 0 97788 CASAVA_Build 16 47614031 1D CAATACTCCA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 45 17 20 9 T 7 6 97789 CASAVA_Build 16 47614420 1I ATGCATAAAC -/A GGGGGAAGCA 2347 het 2347 ref 30 17 7 6 A 0 1 97790 CASAVA_Build 16 47628677 1I TGTGTAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 A 11 12 97791 CASAVA_Build 16 47631479 1D TTCATGTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 10 9 97792 CASAVA_Build 16 47647035 2D GAGGTAAAGC AG/-- AGTCATTCCT 3070 het 3070 hom 55 22 21 13 AG 2 1 97793 CASAVA_Build 16 47651579 1D CAATAGGTAG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 53 20 25 9 T 8 7 97794 CASAVA_Build 16 47657965 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 5 A 13 12 97795 CASAVA_Build 16 47659819 1I AGCTTCTTGT -/G GGGGGTCCAT 3070 hom 116 het 43 0 38 5 G 5 6 97796 CASAVA_Build 16 47661580 3D CACACCCAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 22 0 17 5 T 14 11 97797 CASAVA_Build 16 47669891 1D GTTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 41 0 30 13 T 12 11 97798 CASAVA_Build 16 47694385 1D ACCAGAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 28 1 18 9 T 11 10 97799 CASAVA_Build 16 47710537 1D CTTATTAAAC A/- AGATTAATTG 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 A 2 1 97800 CASAVA_Build 16 47712884 4I ATATATTTAC ----/ATAT ATATATATAT 1751 het 1751 ref 25 12 6 7 AT 5 7 97801 CASAVA_Build 16 47713103 1D ATTTTTATTG T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 45 24 18 6 T 7 6 97802 CASAVA_Build 16 47722176 1D AACCAGGCAG C/- AAGATGAAAC 3070 het 3016 hom 23 8 11 5 C 1 0 97803 CASAVA_Build 16 47725499 1D TGCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 T 12 11 97804 CASAVA_Build 16 47751237 4I CAAAAATAAT ----/AAAC AAGTATCAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAAC 0 1 97805 CASAVA_Build 16 47891024 1D TTGGTCTCTG C/- CCCCCATCAA 3070 het 2588 hom 27 8 13 6 C 6 5 97806 CASAVA_Build 16 47902781 8I ATGTTTTGAT --------/TGCACACA GTATGTGTGC 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 TGCACACA 0 1 97807 CASAVA_Build 16 47904189 6D GCGTGGCACT CGGTGC/------ CGGTGCCGGC 3070 het 3070 hom 38 20 15 6 CGGTGC 2 1 97808 CASAVA_Build 16 47908681 5D ACAATAATAC ATAAG/----- ATTTTATGCC 3070 het 3070 hom 43 18 23 4 ATAAG 1 0 97809 CASAVA_Build 16 47910070 1D TGATTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2521 hom 32 11 14 7 T 13 12 97810 CASAVA_Build 16 47926457 1D GTACAATTTT G/- TTTTATTCCG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 G 1 0 97811 CASAVA_Build 16 47933760 1I GAGGCACTGA -/C CCCCCCGAGG 2079 het 2079 ref 19 10 5 4 C 6 7 97812 CASAVA_Build 16 47954723 1D ATTTCTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 10 9 97813 CASAVA_Build 16 47955263 3D TATCCTTCAT AAC/--- AACACAAAAT 3070 het 3070 hom 54 20 28 7 AAC 2 1 97814 CASAVA_Build 16 48015054 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1368 het 1368 ref 38 30 5 4 A 12 11 97815 CASAVA_Build 16 48018474 9I CACCCTAAAG ---------/TAGTTACAA TAGTAGACAT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 TAGTTACAA 0 1 97816 CASAVA_Build 16 48024229 20D AGTCCTTTGT TCTGTGAATACATTTGCTTG/-------------------- TCTGGATATT 3070 het 3070 ref 57 33 24 5 TCTGTGAATACATTTGCTTG 1 0 97817 CASAVA_Build 16 48035576 6D GTGGAAAGAT AAAAAA/------ GAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 49 27 19 8 A 6 0 97818 CASAVA_Build 16 48053772 1I TGTCTCCAAC -/A AAAAAAAAAA 2120 het 1005 hom 34 8 11 15 A 15 16 97819 CASAVA_Build 16 48065978 1D AGATAGAACC A/- ACTTCTTGCC 3070 het 3070 ref 29 17 9 4 A 2 1 97820 CASAVA_Build 16 48069045 3I GGGAAGAAGG ---/AGA AGAAGAAGAA 3070 hom 57 het 27 0 15 12 AGA 5 6 97821 CASAVA_Build 16 48079784 4I2M2D GGCCTGTGGC ----CCAA/CTGTCC-- GGGTCCTGGT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 N/A 0 0 97822 CASAVA_Build 16 48096019 11D AAAAGTGGGC AGGATCTTAGA/----------- AGGTAAGAGA 3070 het 3070 ref 35 20 12 9 AGGATCTTAGA 1 0 97823 CASAVA_Build 16 48105674 2D ACACACACAC AT/-- GCACATACAC 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 AT 1 0 97824 CASAVA_Build 16 48109090 1I GAGAGAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 11 12 97825 CASAVA_Build 16 48125661 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 23 9 T 13 12 97826 CASAVA_Build 16 48131854 1D GCCCCACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2409 hom 37 9 17 12 T 11 10 97827 CASAVA_Build 16 48246323 1D20M20D TTCGGTTTTG TTTTTTATTTACTTTTAAGGTTACTGTCATCTTACAGTAAA/-TTTTTATTTACTTTTAAGGT-------------------- TGATACTGGT 3070 het 3070 ref 35 28 13 3 N/A 0 0 97828 CASAVA_Build 16 48261478 1I AGAACAGAGG -/A AAAAAAGGCC 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 A 6 7 97829 CASAVA_Build 16 48279507 3D GTTGAGAGGG AAA/--- AAAAAAAAAA 1631 het 241 hom 16 4 7 7 A 16 13 97830 CASAVA_Build 16 48315821 12D ACACCAAGGC CCCGAGTGCATT/------------ CCCTGTGGGC 3070 het 3070 ref 33 20 14 4 CCCGAGTGCATT 1 0 97831 CASAVA_Build 16 48323062 1I CTATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 13 14 97832 CASAVA_Build 16 48324626 1D TTTCCTTAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 10 9 97833 CASAVA_Build 16 48331284 1I AATTTTTTTT -/C CCCCCAAGAC 3070 het 2379 hom 17 7 8 2 C 5 6 97834 CASAVA_Build 16 48344528 7D TGGTGGCGTG AGCCTGT/------- AGTCCCAGCT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 AGCCTGT 1 0 97835 CASAVA_Build 16 48360177 2D CTGTCCCAGC CA/-- CACACTCATG 3070 hom 98 het 38 0 29 10 CA 3 2 97836 CASAVA_Build 16 48366029 5D GATTGGACTC AGATA/----- AGATGAGTAA 3070 het 3070 hom 69 24 26 22 AGATA 1 0 97837 CASAVA_Build 16 48375381 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 2353 het 1139 hom 22 5 8 9 A 15 14 97838 CASAVA_Build 16 48384627 1D TGGCATCACT A/- AGCAGGGGCA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 2 1 97839 CASAVA_Build 16 48385649 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 18 1 12 5 T 13 12 97840 CASAVA_Build 16 48389350 1I GGCCAGGCAC -/A AGTCACTCAC 3070 hom 129 het 52 0 43 9 A 1 2 97841 CASAVA_Build 16 48389899 1D CAGTCTGGGT G/- ACAGAGCAAG 3070 het 3052 hom 32 11 18 3 G 1 0 97842 CASAVA_Build 16 48399473 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2063 hom 29 7 18 4 T 11 10 97843 CASAVA_Build 16 48410001 4D CCATGTCTAA AAAT/---- AAATAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 4 AAAT 2 1 97844 CASAVA_Build 16 48418933 2D AACAGCTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 44 2 14 28 T 13 11 97845 CASAVA_Build 16 48425737 4I CCCTAAACGT ----/AAAC AGTCAGCAGT 3070 het 3070 hom 56 21 30 5 AAAC 0 1 97846 CASAVA_Build 16 48428495 1D TCTGGGGGAT G/- GGGGCAGCTC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 G 5 4 97847 CASAVA_Build 16 48437120 1I ACCCTCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2192 hom 29 7 13 9 T 10 11 97848 CASAVA_Build 16 48455393 1D TATTTATTCA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 92 het 35 0 31 5 T 9 8 97849 CASAVA_Build 16 48455952 11D CATGGAGATT TCAGAAGAACA/----------- TCAGAAGAAC 3070 hom 72 het 36 1 34 3 TCAGAAGAACA 2 1 97850 CASAVA_Build 16 48460908 4I GTGTTAGGTA ----/TCAC TTCATCAAAG 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 TCAC 0 1 97851 CASAVA_Build 16 48469594 1D GAGAGTTAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 10 9 9 T 10 9 97852 CASAVA_Build 16 48469803 1D AGGAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 2339 het 706 hom 22 4 7 11 T 12 11 97853 CASAVA_Build 16 48479753 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 20 0 10 10 A 17 16 97854 CASAVA_Build 16 48483090 1I GCACTGTCAT -/G GGGGGAAGAG 3070 het 3070 hom 46 12 24 10 G 5 6 97855 CASAVA_Build 16 48499702 2D TAATTATTGA AC/-- ACACCTACTA 3070 het 3070 ref 38 21 13 6 AC 3 2 97856 CASAVA_Build 16 48538995 1D TGCTTGACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 16 21 11 T 10 9 97857 CASAVA_Build 16 48554460 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2378 het 2378 ref 15 6 6 4 A 14 13 97858 CASAVA_Build 16 48555381 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 9 9 A 12 10 97859 CASAVA_Build 16 48563779 1D TCAAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1597 het 1597 ref 34 21 4 9 T 13 12 97860 CASAVA_Build 16 48567582 2D AGTATTTTCC AT/-- ATGAGTCCAT 1339 het 1339 ref 20 12 6 2 AT 2 1 97861 CASAVA_Build 16 48586354 1I ATAAATCTAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 8 9 97862 CASAVA_Build 16 48586500 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAATTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 6 7 97863 CASAVA_Build 16 48594234 1I TCTCAAAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 A 8 9 97864 CASAVA_Build 16 48606167 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 1867 het 394 hom 20 2 8 10 A 15 16 97865 CASAVA_Build 16 48623170 1I AACTCAGGAG -/C CAGTGGCTAG 3070 hom 99 het 39 0 32 7 C 1 2 97866 CASAVA_Build 16 48625958 2D TTATTTGTAA AT/-- ATAGAGTCAT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 AT 2 1 97867 CASAVA_Build 16 48628513 5I GGACTTTTTC -----/TTTAG TTTATTGTTA 3070 hom 101 het 39 0 34 5 TTTAG 0 1 97868 CASAVA_Build 16 48632559 1I GCTTTCCAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 53 het 29 0 22 7 T 9 10 97869 CASAVA_Build 16 48635430 32D3M2D TAGCTCTTAG TAGCTCTATCTGATAGTAGCTACTAGCTGATAGTAGC/--------------------------------GTA-- TCTATCAGCA 3070 hom 66 het 20 0 22 5 N/A 0 0 97870 CASAVA_Build 16 48637075 1D AGGCTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 38 1 33 4 T 12 11 97871 CASAVA_Build 16 48637320 25I TGTAGCTTCA -------------------------/TTAAAAACCATCAAGCTGGCCAGGC ACAGTGGATC 3070 hom 69 het 24 0 21 5 TTAAAAACCATCAAGCTGGCCAGGC 0 1 97872 CASAVA_Build 16 48640525 1I TCAGCTTTGT -/A AAAAAAAAAA 858 het 858 ref 17 7 4 6 A 15 16 97873 CASAVA_Build 16 48645844 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3053 het 2582 hom 30 11 9 11 A 17 16 97874 CASAVA_Build 16 48650080 11D CGGCCGTGGG GTGAAGCTACA/----------- GGTGAAGCTG 3070 hom 92 het 33 0 22 13 GTGAAGCTACA 1 0 97875 CASAVA_Build 16 48659028 5D CTGAGGACTT AACTC/----- TAAGCAGGGA 3070 hom 150 het 51 0 50 4 AACTC 1 0 97876 CASAVA_Build 16 48660120 4I CTAAAAATAG ----/AAAT AAATGTGAGA 3070 hom 144 het 54 0 48 6 AAAT 1 2 97877 CASAVA_Build 16 48666394 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 308 hom 11 1 10 0 A 10 11 97878 CASAVA_Build 16 48668152 1D TGCTCTGTCA C/- CCAGGCTGGA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 3 2 97879 CASAVA_Build 16 48668739 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 52 het 26 0 16 10 T 9 10 97880 CASAVA_Build 16 48670473 1D AATACAGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 10 9 97881 CASAVA_Build 16 48671755 1D TGCTCACAGA T/- TTTTTTTTTT 1723 het 1723 ref 34 13 8 13 T 17 16 97882 CASAVA_Build 16 48680812 2D TTGGTAGTCT GA/-- ATTGGCCTTG 3070 hom 108 het 41 0 36 6 GA 1 0 97883 CASAVA_Build 16 48684159 4I CGGCCCAAGG ----/TCAT TCATTCTTTT 3070 hom 69 het 27 0 20 7 TCAT 1 2 97884 CASAVA_Build 16 48688727 3D28M1I TTGTCTTTTC TTTTTTTTTTTTTTACATTTATTAGCTATGA-/---TTTTTTTTTTTACATTTATTAGCTATGAT TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 20 1 17 12 N/A 0 0 97885 CASAVA_Build 16 48689769 1D GACTGGCTTT A/- AAAATAATAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 5 4 97886 CASAVA_Build 16 48691510 1D ATAGTAACTT A/- CCTGCCAGGA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 A 1 0 97887 CASAVA_Build 16 48693329 3D AGCAGATTTT TTG/--- TTGTTGTCGT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 TTG 3 2 97888 CASAVA_Build 16 48699775 1I AACCTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2567 het 126 hom 18 1 11 6 A 15 16 97889 CASAVA_Build 16 48700938 3D GACCTCATGA CCC/--- CCCCCCCCGA 3070 hom 92 het 37 0 30 8 C 11 8 97890 CASAVA_Build 16 48717956 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 7 8 97891 CASAVA_Build 16 48722563 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 20 0 15 5 T 11 12 97892 CASAVA_Build 16 48722944 20I CCGTCTCTAC --------------------/TAAAAATATTAAAAATATTT TAAAAATATT 2042 hom 15 het 8 0 5 3 TAAAAATATTAAAAATATTT 0 1 97893 CASAVA_Build 16 48733756 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGGGTCTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 G 6 7 97894 CASAVA_Build 16 48736782 2D CCATCTAAAA AT/-- ATATATATAT 2497 hom 18 het 9 0 7 2 AT 8 7 97895 CASAVA_Build 16 48738760 1D GTCTACAAAG T/- TTTTATTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 5 4 97896 CASAVA_Build 16 48741769 2I AGAGAGATAG --/AT ATATATATAT 1589 hom 12 het 7 0 5 2 AT 7 8 97897 CASAVA_Build 16 48755724 3D TGTTGTTCTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 41 het 22 0 14 8 TTG 4 3 97898 CASAVA_Build 16 48756471 1D GTCTGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 672 hom 26 3 16 7 T 15 14 97899 CASAVA_Build 16 48756908 1D GGTTTTCATA T/- ATTAGAAGGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 97900 CASAVA_Build 16 48758798 1D ATGCTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 943 het 943 ref 43 28 3 12 T 12 11 97901 CASAVA_Build 16 48762373 1I GTGCCCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 27 2 20 5 T 13 14 97902 CASAVA_Build 16 48762990 11D TTTTCTTGCC CAAGGCATATA/----------- CGGTTGATAT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 CAAGGCATATA 1 0 97903 CASAVA_Build 16 48771524 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 22 8 T 10 11 97904 CASAVA_Build 16 48774439 1I CTTTCTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2277 het 2277 ref 15 10 5 0 T 10 11 97905 CASAVA_Build 16 48783645 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 33 2 16 15 A 17 16 97906 CASAVA_Build 16 48784179 1D ATAATTCTTC T/- TTTGACTTCT 3070 hom 97 het 37 0 32 6 T 4 3 97907 CASAVA_Build 16 48789830 2D GACTCTGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 23 1 16 6 A 16 14 97908 CASAVA_Build 16 48796278 2D ATGCAGAAAC TT/-- TGCAAAATGT 3070 hom 138 het 47 0 46 1 T 3 1 97909 CASAVA_Build 16 48798322 1I CAGAAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 34 1 26 7 T 12 13 97910 CASAVA_Build 16 48808088 4D TGTAGAGATT TTTG/---- TTTGTTTTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TTTG 2 1 97911 CASAVA_Build 16 48811406 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 25 2 14 9 T 13 12 97912 CASAVA_Build 16 48820026 1D GGCCTCTTGG C/- TGTAACCTTG 3070 hom 126 het 45 0 41 4 C 1 0 97913 CASAVA_Build 16 48821533 1D TTTATTTTGT A/- AAAAAAAAAA 1734 het 1734 ref 29 21 4 4 A 13 12 97914 CASAVA_Build 16 48825105 1D TGGTTTTTTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 8 7 97915 CASAVA_Build 16 48825777 1D CCAGCAACTT G/- GTGAAGTTCA 3070 hom 93 het 39 0 32 8 G 2 1 97916 CASAVA_Build 16 48826937 7I CCTAGACAAT -------/GATAACC ATTTGGCCCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GATAACC 0 1 97917 CASAVA_Build 16 48827386 3D GCGCGATGTC TTT/--- TTTTTCCCCC 3070 hom 79 het 32 0 24 8 T 8 5 97918 CASAVA_Build 16 48835259 1D CTGTGGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 21 2 16 4 A 12 11 97919 CASAVA_Build 16 48836347 1D TGCTGCTGCT G/- GGATGTAAGT 3070 hom 80 het 31 0 23 8 G 3 2 97920 CASAVA_Build 16 48842043 4I ATTTTAAAAC ----/AAAT AAATTTTAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAAT 1 2 97921 CASAVA_Build 16 48847434 3I GGTCTGGGCA ---/ATT ATTATTATTA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 ATT 5 6 97922 CASAVA_Build 16 48849943 2I TGGGAGGCAC --/AT GTGGTCTGGT 3070 hom 126 het 46 0 41 5 AT 0 1 97923 CASAVA_Build 16 48853673 1I CTCAGATCTC -/T TTTTTTTTTT 1506 het 1506 ref 24 11 4 9 T 15 16 97924 CASAVA_Build 16 48861419 1D TAGGCAACAT G/- GCACAACCCC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 2 1 97925 CASAVA_Build 16 48874151 3I AGACAGGATT ---/CTG CTCTATCACC 3070 hom 73 het 30 0 22 8 CTG 0 1 97926 CASAVA_Build 16 48888674 4D CCAGGGCCTC CTCT/---- CTCAGAGGCA 3070 hom 93 het 35 0 29 7 CT 3 1 97927 CASAVA_Build 16 48891765 1I ATTACAGGCA -/T TGAGCCACCA 1709 het 1471 hom 11 4 4 3 T 1 2 97928 CASAVA_Build 16 48893561 3D CCCACCTGGT CTC/--- CTCCTGCCCT 1653 het 949 hom 17 3 7 7 CTC 2 1 97929 CASAVA_Build 16 48899643 10D TACCAGGTAG GGTGGGGACA/---------- GGTGGCTGTG 2871 het 2871 ref 31 15 10 8 GGTGGGGACA 1 0 97930 CASAVA_Build 16 48904250 2I TGCCACTCTT --/CC CCTGTCCCCT 3070 hom 68 het 25 0 23 2 C 2 4 97931 CASAVA_Build 16 48911541 4D AAAACAAAAC AAAA/---- AAACTGTCCC 3070 hom 135 het 50 0 44 8 A 7 3 97932 CASAVA_Build 16 48919425 2I ATGAAAATAA --/AT ATTTGTTGAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AT 1 2 97933 CASAVA_Build 16 48925135 1I AATACTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 35 1 31 3 A 10 11 97934 CASAVA_Build 16 48929302 3D AAAAAAGGAA GAC/--- AACAGAGAGA 3070 hom 83 het 32 0 27 6 GAC 1 0 97935 CASAVA_Build 16 48931286 4D ATAACCTGCT AATA/---- AAATAAAATC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AATA 1 0 97936 CASAVA_Build 16 48935553 4I TGGTGATACC ----/CAGA CAAACAGGGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CAGA 0 1 97937 CASAVA_Build 16 48945172 1D TGCCTGGCAA T/- TTTTTTTTTT 1473 het 122 hom 8 1 5 2 T 19 18 97938 CASAVA_Build 16 48948731 4D ACCTAATACA GAAT/---- ATATGGTTGT 3070 het 3070 ref 31 19 11 5 GAAT 1 0 97939 CASAVA_Build 16 48949763 29I ATAGCGAAAT -----------------------------/CCCGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAG CCAGGAGTTT 3070 hom 57 het 19 0 19 4 CCCGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAG 0 1 97940 CASAVA_Build 16 48978812 1D ATAAACTGGG C/- CAGGATCAGG 3070 het 3070 hom 47 16 25 7 C 2 1 97941 CASAVA_Build 16 48986757 1I AGGGAAAGGC -/T TTAAAGTAGA 3070 het 3 hom 50 1 44 5 T 2 3 97942 CASAVA_Build 16 48995376 1D GATTTACACG C/- CCCCCCCACT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 C 8 7 97943 CASAVA_Build 16 49001024 1D GAAACCAGAC A/- AATCAGAAAA 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 A 3 2 97944 CASAVA_Build 16 49003362 8D TTTGAATATC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTG 3070 het 2295 hom 29 8 15 6 T 17 9 97945 CASAVA_Build 16 49005893 7D TTTTTTTTTT TTTTTTC/------- CAAAGAAATG 2690 het 1713 hom 26 14 10 5 TTTTTTC 1 0 97946 CASAVA_Build 16 49010455 2I TTCATTCTTC --/TT TTTTTTTTTT 2534 het 2534 ref 32 10 9 13 T 12 14 97947 CASAVA_Build 16 49010723 3D CATGTTAAAT ATC/--- ATCCCACTGC 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 ATC 2 1 97948 CASAVA_Build 16 49020164 1D GGGCTACCTT A/- GAATTCTGTC 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 A 1 0 97949 CASAVA_Build 16 49042096 3I GCAGTTTCGG ---/GAA GAAGAAGATT 3070 hom 137 het 51 0 46 5 GAA 2 3 97950 CASAVA_Build 16 49046100 1D CTGTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 45 2 25 18 T 13 12 97951 CASAVA_Build 16 49058689 3D AGGCTGAGGT AGG/--- AGGAGGATCA 3070 hom 69 het 24 0 24 2 AGG 3 2 97952 CASAVA_Build 16 49066130 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 28 het 14 0 13 1 T 9 10 97953 CASAVA_Build 16 49106696 7I TGGTCTAACA -------/TATGATC TATCCTGGAG 3070 het 3070 hom 45 23 21 1 TATGATC 0 1 97954 CASAVA_Build 16 49130897 1I AGGGGCTGGA -/G GGGGGGCTCA 3070 hom 67 het 27 0 21 6 G 6 7 97955 CASAVA_Build 16 49158418 1I GTTTTTATGG -/C CCCCCCCCCT 2230 het 1880 hom 25 6 9 10 C 9 10 97956 CASAVA_Build 16 49168159 1I AATAAAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1156 hom 34 4 14 16 T 15 16 97957 CASAVA_Build 16 49217261 1I GTTGGGGGGG -/A GCAGGTGCAG 3070 hom 52 het 26 0 16 10 A 0 1 97958 CASAVA_Build 16 49232250 6D AAAAGAAGTT AAAAAG/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 5 AAAAAG 1 0 97959 CASAVA_Build 16 49258383 1I ATGAGGTGAC -/A AAGTGTGGGT 3070 hom 141 het 52 0 44 8 A 2 3 97960 CASAVA_Build 16 49270483 4D TAGCTGGTAT ACTG/---- ACTGGTTAGG 3070 het 3070 hom 37 14 13 11 ACTG 2 1 97961 CASAVA_Build 16 49282137 1I ATTCCCTGTT -/C CCCTTGGAGC 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 C 3 4 97962 CASAVA_Build 16 49321280 1I CTCCTGCAGG -/C CCCTTGAAAG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 C 3 4 97963 CASAVA_Build 16 49357264 1I TTCAATTCTG -/T AAAGGCTGAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 1 97964 CASAVA_Build 16 49386032 1I ATATGCTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 17 4 T 11 12 97965 CASAVA_Build 16 49399563 1I GCAGAGACCC -/A CCCCCCTCAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 0 1 97966 CASAVA_Build 16 49427822 1D TTGGGGAGGG A/- AAAAAATACT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 7 6 97967 CASAVA_Build 16 49439597 1D AATAAAAGGC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 97 het 40 0 33 7 A 9 8 97968 CASAVA_Build 16 49504546 5D GGTTGGGTCA GGGTC/----- GGGTCAGGAC 3070 het 3070 ref 38 21 11 8 GGGTC 2 1 97969 CASAVA_Build 16 49527502 1I GCTGCCACTC -/T CCAAGTCCAC 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 0 1 97970 CASAVA_Build 16 49555449 1I TCTGCAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3060 het 3060 ref 31 11 9 11 T 13 14 97971 CASAVA_Build 16 49560075 1D CAGCCTGGCC A/- ACATGATGAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 2 1 97972 CASAVA_Build 16 49566816 4D CTGATAAGAG TGTA/---- TGTAACATTG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 TGTA 2 1 97973 CASAVA_Build 16 49578246 2I GCACACACAC --/AT GTACATCCAC 3070 hom 251 het 92 0 82 10 AT 0 1 97974 CASAVA_Build 16 49587339 1D AGCCAAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1689 hom 23 5 13 5 T 11 10 97975 CASAVA_Build 16 49590415 1I TTCCCAACTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 T 7 8 97976 CASAVA_Build 16 49596340 2I CCCATTTGTA --/TT TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 T 7 9 97977 CASAVA_Build 16 49605044 1D ATGGCTCTTA G/- GGGAGGAAAA 3070 hom 141 het 50 0 47 3 G 4 3 97978 CASAVA_Build 16 49611703 1D GGATGTTACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 10 9 97979 CASAVA_Build 16 49635610 4I TCTGGTGAAC ----/TCTT TCTTCCCTTT 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 TCTT 1 2 97980 CASAVA_Build 16 49657000 1I CAGCTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 11 12 97981 CASAVA_Build 16 49658973 1D TGAACAAACA C/- CCGCCCAGCT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 C 3 2 97982 CASAVA_Build 16 49667954 1D TCCTGACACC T/- GTCTACCCTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 1 0 97983 CASAVA_Build 16 49671977 3D GTTTCTTTTT TTA/--- TTTATTTATT 1252 hom 12 het 5 0 5 0 TTA 1 0 97984 CASAVA_Build 16 49697825 2I TGCCAAAGTA --/GG CCAGATACAA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 G 0 2 97985 CASAVA_Build 16 49706628 4I AGGATGCAAC ----/TTTG TTTGGCTTTC 3070 hom 109 het 42 0 35 7 TTTG 1 2 97986 CASAVA_Build 16 49708666 1D TTAGAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 27 1 21 5 A 11 10 97987 CASAVA_Build 16 49721101 4I TCTTTAAATG ----/ATAA ATAATAATTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATAA 1 2 97988 CASAVA_Build 16 49724486 1D TCTTGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 22 0 16 6 A 12 11 97989 CASAVA_Build 16 49727936 1D TTAAATCGAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 9 8 97990 CASAVA_Build 16 49729779 4I CAACGCTAGG ----/CTGT CTTTCTTGGT 3070 hom 119 het 47 0 39 8 CTGT 0 1 97991 CASAVA_Build 16 49735443 1I TTCTGCTTCT -/C CCCCTGCCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 4 5 97992 CASAVA_Build 16 49736511 1D TCTTTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 377 hom 37 2 22 13 A 13 12 97993 CASAVA_Build 16 49737392 1D20M1D TTGATTGGTC TTTTTTTTTTTTTTCTTTTTCT/-TTTTTTTTTTTTTCTTTTTC- TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 39 3 28 11 N/A 0 0 97994 CASAVA_Build 16 49756954 1D AGCACATGGG T/- TTTTGCACCA 3070 hom 91 het 38 0 29 9 T 5 4 97995 CASAVA_Build 16 49774144 1I ATTTTGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 18 15 13 T 13 14 97996 CASAVA_Build 16 49809457 1I TTACTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 32 4 T 11 12 97997 CASAVA_Build 16 49810452 10D TATTGAAAGG ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 hom 58 het 29 0 20 12 AT 13 8 97998 CASAVA_Build 16 49825992 1D GGACGGGGGT G/- GGGGGGTGCA 3070 hom 90 het 35 0 29 6 G 7 6 97999 CASAVA_Build 16 49839696 1I GTGCCCTGGG -/C CTTTCTTTCC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 C 1 2 98000 CASAVA_Build 16 49847673 1D AAGGCTTTGG C/- CCAAGACAGG 3070 het 3070 hom 43 19 21 4 C 3 2 98001 CASAVA_Build 16 49849666 1I CTGAATTGTG -/C CCCCTCAGTG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 C 4 5 98002 CASAVA_Build 16 49865234 2D GAGGCCTGTG GT/-- GTGTATATGA 3070 het 3070 hom 53 23 25 7 GT 3 2 98003 CASAVA_Build 16 49867138 1D GCTGTGTCAC T/- CAGGGTCTGC 3070 het 3070 ref 49 20 20 9 T 1 0 98004 CASAVA_Build 16 49873062 4D TATAAATATT TATC/---- TATTTTGTAT 1658 het 1658 ref 10 6 4 2 TATC 1 0 98005 CASAVA_Build 16 49875552 1I GAGATGAAGC -/A AAAAAAAAAA 2581 het 2268 hom 30 8 9 13 A 16 17 98006 CASAVA_Build 16 49876913 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAACC 3070 het 1363 hom 30 6 17 7 C 0 1 98007 CASAVA_Build 16 49878612 1D GTTTCTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2396 hom 31 9 12 11 A 13 12 98008 CASAVA_Build 16 49891283 1I TCCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 11 12 98009 CASAVA_Build 16 49892237 1I GCTGTATTAG -/A AAGACATGAA 3070 het 3070 ref 64 29 28 7 A 2 3 98010 CASAVA_Build 16 49897795 1I TCTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 T 10 11 98011 CASAVA_Build 16 49899393 1D AACTAAAAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 A 10 9 98012 CASAVA_Build 16 49901008 1I CAAATACAGA -/C CCCCATCACT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 4 5 98013 CASAVA_Build 16 49911926 3D AATGTATTGA ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 2689 hom 21 7 11 3 ATT 7 6 98014 CASAVA_Build 16 49915480 1D ATGTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 40 1 24 15 T 15 14 98015 CASAVA_Build 16 49917353 1I AATCCACATG -/T TTTTTTATTC 3070 hom 99 het 45 0 34 11 T 6 7 98016 CASAVA_Build 16 49919651 5D TAGATGTAAA TATAT/----- TATATATATT 2376 het 1833 hom 9 4 5 0 TATAT 2 1 98017 CASAVA_Build 16 49929022 3D GTCCAAGTAG ACC/--- ACACTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 ACC 1 0 98018 CASAVA_Build 16 49940133 3D GTGACATATA GCT/--- CTTTTATGCC 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 GCT 1 0 98019 CASAVA_Build 16 49945503 1D CTTAATTTGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 9 8 98020 CASAVA_Build 16 49946559 1I GCCCCCCCCC -/G CCAAAATACA 3070 het 18 hom 32 1 18 13 G 0 1 98021 CASAVA_Build 16 49957986 9I TGCCCACACA ---------/GACTCTATT AATCAATCTC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 GACTCTATT 0 1 98022 CASAVA_Build 16 49965858 1D TATTACATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 21 1 13 7 A 15 14 98023 CASAVA_Build 16 49970054 11D AATTACCATC AGATATAATAT/----------- ACATTGATAG 3070 het 3070 ref 32 18 15 5 AGATATAATAT 1 0 98024 CASAVA_Build 16 49979447 3D TGAGCAGGTT GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 3070 hom 43 16 18 11 GAG 7 6 98025 CASAVA_Build 16 49997833 1D CCAGCTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 11 10 98026 CASAVA_Build 16 50002396 7D GCCAGGTGTA GTGGTAT/------- GCACCTGTAA 3070 het 3070 ref 37 23 10 6 GTGGTAT 1 0 98027 CASAVA_Build 16 50006246 4I CACCATGACT ----/CTTA CTTATCCAAG 3070 het 3070 hom 54 20 27 7 CTTA 1 2 98028 CASAVA_Build 16 50006868 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 25 1 16 8 A 15 14 98029 CASAVA_Build 16 50019417 1I GCCTGCCTGC -/T TGCTTGATTG 1113 het 1113 ref 22 15 4 3 T 1 2 98030 CASAVA_Build 16 50026938 1I GTGTTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 1136 het 1136 ref 51 43 3 5 T 10 11 98031 CASAVA_Build 16 50030684 1I TTTGACCTAC -/A AAAAAGACAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 5 6 98032 CASAVA_Build 16 50031422 4D AAACAAATGG CAGA/---- CAAACTGAGA 3070 het 3070 ref 31 14 12 8 CAGA 1 0 98033 CASAVA_Build 16 50033492 1D TATACCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2389 hom 34 8 19 7 A 11 10 98034 CASAVA_Build 16 50037015 1D GGCCAAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 240 hom 30 1 19 10 T 15 14 98035 CASAVA_Build 16 50042849 1I TGATATCCTC -/A ACGTACATGA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 A 1 2 98036 CASAVA_Build 16 50050404 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTTTGGT 3070 het 1238 hom 26 9 11 6 C 0 1 98037 CASAVA_Build 16 50053434 2D TCATGGCTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 13 11 98038 CASAVA_Build 16 50054480 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 A 10 11 98039 CASAVA_Build 16 50056408 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 10 11 98040 CASAVA_Build 16 50083423 1D TCTACTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 11 10 98041 CASAVA_Build 16 50088895 1I CCCATTAAGT -/A ATTTCTCATC 3070 het 3070 hom 55 23 28 4 A 1 2 98042 CASAVA_Build 16 50104327 1I TCCTCAGCCT -/C CCAAAGTGTG 2517 het 1662 hom 21 6 9 6 C 2 3 98043 CASAVA_Build 16 50105627 1I CTATAATCTG -/A AAAACTTGCT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 4 5 98044 CASAVA_Build 16 50115222 4D ATTCCTTGAA TATC/---- TATCCATTAC 3070 het 3070 ref 33 19 11 5 TATC 2 1 98045 CASAVA_Build 16 50121591 7D CTGGCAAGTC CTTCCAT/------- CTTCCATGTG 3070 het 3070 ref 48 28 19 7 CTTCCAT 2 1 98046 CASAVA_Build 16 50122111 1I TCAAGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 T 10 11 98047 CASAVA_Build 16 50134259 1I CAGGATCACC -/T TGCCGCATGG 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 1 2 98048 CASAVA_Build 16 50154141 1I CACATGAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 9 10 98049 CASAVA_Build 16 50176521 1D CCACAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 28 1 23 4 A 12 11 98050 CASAVA_Build 16 50176583 4D ATGCCAAGAT AATC/---- AATAAAAGAC 3070 het 2448 hom 21 6 11 4 AATC 1 0 98051 CASAVA_Build 16 50206166 1I TCAGATCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 10 11 98052 CASAVA_Build 16 50235665 1I CTCTAAGGAT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1024 hom 39 6 20 13 C 0 1 98053 CASAVA_Build 16 50238531 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 27 1 18 8 A 14 13 98054 CASAVA_Build 16 50239891 1D GGTTAAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 T 11 10 98055 CASAVA_Build 16 50244517 4D CCTGTTTCCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 8 AAAC 6 5 98056 CASAVA_Build 16 50250144 1I ACTTGGCTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 A 9 10 98057 CASAVA_Build 16 50280408 1I GAAGACACTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 9 10 98058 CASAVA_Build 16 50284050 1I GCTGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 28 7 A 11 12 98059 CASAVA_Build 16 50291157 1I CCTAAAAAAT -/A ATAAAGCAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 2 98060 CASAVA_Build 16 50294975 1D CTTAAGATTT C/- CAAATATATT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 C 2 1 98061 CASAVA_Build 16 50298902 1I TGCCTGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 913 hom 25 2 15 8 T 10 11 98062 CASAVA_Build 16 50301385 1D CCACTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 28 1 18 9 A 11 10 98063 CASAVA_Build 16 50302952 2D GAGCATCATG CA/-- CACACACACA 900 het 900 ref 60 38 4 19 CA 8 7 98064 CASAVA_Build 16 50313974 4I AGGCAAAGAG ----/GAAA GAAAGAAAGA 2413 het 2413 ref 23 9 6 8 GAAA 3 4 98065 CASAVA_Build 16 50314226 1D AAAGAAAGAA G/- GAAAGAAAAA 3070 het 2825 hom 30 9 18 3 G 2 1 98066 CASAVA_Build 16 50314897 1I CTGCTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 A 0 1 98067 CASAVA_Build 16 50316113 1I CCAGAGTCCA -/T TGATCTGGGC 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 1 2 98068 CASAVA_Build 16 50320310 3I ATGCTATGTA ---/GAT GATGATGTAG 3070 het 3070 ref 59 29 24 6 GAT 2 3 98069 CASAVA_Build 16 50326070 1D AATCTAAGAG C/- ATGATGGCAA 3070 het 3070 hom 46 16 28 2 C 1 0 98070 CASAVA_Build 16 50329657 1D GAAAAACAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 9 8 98071 CASAVA_Build 16 50332012 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 2133 hom 37 11 20 7 A 11 9 98072 CASAVA_Build 16 50336692 1D ATTCAGCCAG A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 A 7 6 98073 CASAVA_Build 16 50337177 1I CTGCAAACAA -/T TTTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 47 27 18 2 T 5 6 98074 CASAVA_Build 16 50343412 1D CTTTTTTAAT G/- GCTTACAGTT 3070 het 3070 hom 33 8 17 8 G 2 1 98075 CASAVA_Build 16 50345011 1I GCATATTACC -/A AGCATCTATA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 1 2 98076 CASAVA_Build 16 50352952 1I AGAAGACAGA -/T TTTTATGGCA 3070 het 3070 ref 64 29 25 10 T 4 5 98077 CASAVA_Build 16 50355076 2D CTTCATACAC TT/-- TTAGAAACAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 4 2 98078 CASAVA_Build 16 50355308 1I TTTTTGTTTT -/A TTTTTTTTCC 3022 het 3022 ref 29 19 8 2 A 0 1 98079 CASAVA_Build 16 50355548 1I GTCTTTGCTT -/C CCCCAGGATA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 C 4 5 98080 CASAVA_Build 16 50363868 2I CAAGAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 10 12 98081 CASAVA_Build 16 50364188 1D CAAGAGAAGA G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 G 1 0 98082 CASAVA_Build 16 50367903 1D AAAATAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 T 12 11 98083 CASAVA_Build 16 50377643 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 9 10 98084 CASAVA_Build 16 50378366 1I TTGGGGTACC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 8 9 98085 CASAVA_Build 16 50379154 2D GTTCTTCATC TA/-- TGAGAAAACA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 TA 1 0 98086 CASAVA_Build 16 50423520 3D GTGCTCAGCC CCT/--- CATTTCCTTC 3070 hom 90 het 35 0 30 6 CCT 1 0 98087 CASAVA_Build 16 50428409 1I TGATCTTTCC -/T TTAGGAAATT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 2 3 98088 CASAVA_Build 16 50432532 1D AAATGATCAC A/- AAAATTTCTT 3070 het 3070 hom 38 13 25 3 A 5 4 98089 CASAVA_Build 16 50434213 2D TCATCAAATT GA/-- GTCTTTAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 GA 1 0 98090 CASAVA_Build 16 50437244 1I TAGAGAGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 28 1 19 8 T 13 14 98091 CASAVA_Build 16 50446234 1D TGCTTTCCAG A/- ACAGCATGAA 3070 het 3070 ref 37 19 11 8 A 2 1 98092 CASAVA_Build 16 50446680 2D GGATAAAAAC AG/-- AGAAGTTTCC 3070 het 3070 ref 54 26 25 5 AG 2 1 98093 CASAVA_Build 16 50447445 1D GTCTCAAACA C/- CTGGCCTCAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 2 1 98094 CASAVA_Build 16 50448783 1D CTGCCAGGCT C/- CCTGTGGGGT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 C 3 2 98095 CASAVA_Build 16 50450945 2I ATATGCACAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AT 6 7 98096 CASAVA_Build 16 50459481 1I GTACCTGTTA -/G GTTCAGGCAT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 G 1 2 98097 CASAVA_Build 16 50465053 1D TAGACTAAGA C/- CCCCCCTGCC 3070 hom 104 het 41 0 37 6 C 7 6 98098 CASAVA_Build 16 50482093 1D CCCTTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 4 A 12 11 98099 CASAVA_Build 16 50496159 1D CGGTGGGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 305 hom 40 2 31 7 T 11 10 98100 CASAVA_Build 16 50497732 1D ACTTAATGAT G/- GGGCCCCTCC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 4 3 98101 CASAVA_Build 16 50497846 56D AATACAATAA CAGAATTGTATTCTCTTGTTTTATAAGGGAAGAGTTACATTAACTCAACAGTGCTT/-------------------------------------------------------- GGCCTCCTTG 3070 het 3070 ref 26 28 8 7 CAGAATTGTATTCTCTTGTTTTATAAGGGAAGAGTTACATTAACTCAACAGTGCTT 1 0 98102 CASAVA_Build 16 50500068 1I CTTGATATTT -/G GAAAATGTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 1 2 98103 CASAVA_Build 16 50519302 1D AGGCTCCATC T/- TTTTTTTTTT 1431 het 1431 ref 48 30 4 14 T 13 12 98104 CASAVA_Build 16 50530281 1I GTTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 828 hom 43 5 30 8 A 11 12 98105 CASAVA_Build 16 50545444 3D AACTCGGCAC AGA/--- AGGTTTTGTC 3070 het 3070 hom 53 22 23 9 AGA 1 0 98106 CASAVA_Build 16 50546003 4D CCCCCGACTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 3070 hom 52 het 28 0 16 13 CCTT 5 4 98107 CASAVA_Build 16 50558366 1I GTGGCTACAC -/G CCCCCCCCAG 3070 hom 16 het 24 1 18 5 G 0 1 98108 CASAVA_Build 16 50558994 1I AGTCTGCAGA -/C CCCCTACAAC 3070 hom 129 het 48 0 40 8 C 4 5 98109 CASAVA_Build 16 50566611 4D TGAGAAACAT AAAG/---- AAAGACAGCT 3070 het 3070 hom 26 11 11 6 AAAG 2 1 98110 CASAVA_Build 16 50577888 1D TTGCCTGCTG T/- TTTTTTCAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 6 98111 CASAVA_Build 16 50582648 1D AATTCCTTGA T/- TTTTTTGCAT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 T 7 6 98112 CASAVA_Build 16 50584939 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 8 9 98113 CASAVA_Build 16 50589234 1D AGCTAAAGGA T/- TGTAAACGCA 3070 het 3070 hom 44 19 19 7 T 2 1 98114 CASAVA_Build 16 50592745 4D TATCAGATAA ACAG/---- CAAATGATAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 7 ACAG 1 0 98115 CASAVA_Build 16 50607313 1D CAACTTATCC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 7 6 98116 CASAVA_Build 16 50619796 1I CCCTACTTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 9 10 98117 CASAVA_Build 16 50627150 1D TTTGGCATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 408 hom 38 1 32 5 T 10 9 98118 CASAVA_Build 16 50647020 2I CACTGATTGA --/AT ATATTGACCT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 AT 2 3 98119 CASAVA_Build 16 50654171 3I AGTAACAGTG ---/TGT TGTTCCCTTG 3070 hom 141 het 53 0 47 7 TGT 1 2 98120 CASAVA_Build 16 50656463 2D TGATGATGTT AA/-- GTCTTCCTAT 3070 hom 123 het 43 0 42 3 A 2 0 98121 CASAVA_Build 16 50657478 2I TCACTAGTGA --/AT ACATGCAGGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AT 0 1 98122 CASAVA_Build 16 50668906 4D AAAGGTCTTC ATAT/---- ATATTTGGTT 3070 hom 60 het 24 0 21 5 AT 4 2 98123 CASAVA_Build 16 50671843 1I ATAAAGAGAC -/A AAAAAAATTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 7 8 98124 CASAVA_Build 16 50673293 1I TGTTAAACTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 423 hom 35 1 27 7 A 7 8 98125 CASAVA_Build 16 50679501 1I AAAAATATTT -/A GACAGAGTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 0 1 98126 CASAVA_Build 16 50682755 2D TTGATAGGGT GG/-- GGGGAGAGAG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 G 6 4 98127 CASAVA_Build 16 50708837 1I ATGTTGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 10 11 98128 CASAVA_Build 16 50711594 2I AGTGCTGAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 12 14 98129 CASAVA_Build 16 50730654 1D GAATGAAAAA G/- AAAATGCACA 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 G 1 0 98130 CASAVA_Build 16 50735221 1I AAAGTCAGTT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 7 8 98131 CASAVA_Build 16 50735646 1I AATTTATCAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 7 8 98132 CASAVA_Build 16 50746252 1D ATTCACTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 51 het 21 0 18 4 T 9 8 98133 CASAVA_Build 16 50748042 1I CACTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 11 98134 CASAVA_Build 16 50754937 3D CCCAATAAGA TGC/--- TAACAAAATG 3070 het 3070 ref 41 22 19 0 TGC 1 0 98135 CASAVA_Build 16 50755353 4D GATAGATGAT AGAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 31 19 9 4 AG 2 0 98136 CASAVA_Build 16 50759134 1I ATTCCATTTA -/T TAACAGAAAT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 T 1 2 98137 CASAVA_Build 16 50767239 1D AGTTAACTCA C/- CCCAAGTAGC 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 C 4 3 98138 CASAVA_Build 16 50767942 2D TTCCTTTGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 45 1 31 13 A 13 11 98139 CASAVA_Build 16 50772028 1I TTTTATTTTT -/A TTTTTTATTT 379 hom 8 het 14 0 3 11 A 0 1 98140 CASAVA_Build 16 50772086 1D TCCTTTAATG A/- AAAAAAACAG 2866 hom 24 het 14 0 9 5 A 8 7 98141 CASAVA_Build 16 50773925 3D TAGCACTGAT AAG/--- AAGAAGTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 15 5 AAG 3 2 98142 CASAVA_Build 16 50774644 13D CATTCATATT CCATTAGCTAGAA/------------- CCATTAGCTA 3070 het 3070 hom 53 22 23 11 CCATTAGCTAGAA 2 1 98143 CASAVA_Build 16 50828777 4D TGAATTGGTG CTAA/---- CTGAGTCAGT 3070 het 3070 ref 38 20 12 7 CTAA 1 0 98144 CASAVA_Build 16 50852444 4I TTTATATAAA ----/AAAC AAGCAATCTG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAAC 0 1 98145 CASAVA_Build 16 50875340 1D TATATTCAAT A/- AAATAACAAT 3070 hom 94 het 36 0 30 6 A 4 3 98146 CASAVA_Build 16 50900031 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 66 het 33 0 22 11 AC 11 10 98147 CASAVA_Build 16 50902472 2D GAAGAGAGTC AT/-- TAGCTCCAGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 1 0 98148 CASAVA_Build 16 50923206 1D TAGTAGAGTG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 8 7 98149 CASAVA_Build 16 50948140 1I GCACAGTCAG -/A AAAATCAGAA 2367 het 2367 ref 25 18 7 0 A 4 5 98150 CASAVA_Build 16 50948265 2D GGATGACTTG AA/-- TACAGGCTAG 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 A 2 0 98151 CASAVA_Build 16 50948628 1D GTTGTAGAAT A/- AAAACCAGGG 3070 hom 120 het 43 0 41 3 A 5 4 98152 CASAVA_Build 16 50952634 5I ACCCATAACA -----/GATTT GATTTAAATA 3070 het 3070 hom 35 14 21 0 GATTT 1 2 98153 CASAVA_Build 16 50961286 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2059 hom 27 7 17 3 A 11 12 98154 CASAVA_Build 16 50963315 1I TAAACAGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 15 0 T 9 10 98155 CASAVA_Build 16 50972062 4I CCCAGCCTGT ----/TTGA TTGTTTTAAT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TTGA 0 1 98156 CASAVA_Build 16 50978076 1I TTTATTTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 56 18 30 8 A 9 10 98157 CASAVA_Build 16 50978994 3D TTTTCATTCA TCC/--- TCTTAAATTT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 TCC 1 0 98158 CASAVA_Build 16 50988028 3I TACGTAATAA ---/TAT TATACTATGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAT 1 2 98159 CASAVA_Build 16 51001029 1I GTTGATCTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 9 10 98160 CASAVA_Build 16 51003958 1D TTTCTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 12 11 98161 CASAVA_Build 16 51020277 3D CTTAGAGAAA AAC/--- AACAACGTTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 AAC 3 2 98162 CASAVA_Build 16 51021003 1D ATAAATATTC A/- AAGGCACCAT 3070 het 3070 hom 55 21 25 9 A 3 2 98163 CASAVA_Build 16 51021994 1I TCTTAAAATA -/T TTTTTATATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 5 6 98164 CASAVA_Build 16 51022958 1I CTTTTTAGCA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 8 9 98165 CASAVA_Build 16 51029923 5I AGTATTCACA -----/TTTCT TTTCTTCTAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 TTTCT 1 2 98166 CASAVA_Build 16 51038093 1D TCTGAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 13 6 T 11 10 98167 CASAVA_Build 16 51044099 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 A 8 9 98168 CASAVA_Build 16 51052133 2I GCCAAATAAG --/AA AAAAAAAAAA 1448 het 1448 ref 33 9 5 19 A 10 12 98169 CASAVA_Build 16 51072343 1I CTGAAGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3021 hom 29 10 13 6 T 12 13 98170 CASAVA_Build 16 51075217 1I CCTGACCTCA -/G GTGATCCTCC 3070 het 1291 hom 15 4 10 1 G 1 2 98171 CASAVA_Build 16 51076559 4D TGTGTGTATA TGTG/---- TGTGTATATA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 TG 4 2 98172 CASAVA_Build 16 51084312 1D ACCCAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2452 hom 28 11 9 8 A 15 14 98173 CASAVA_Build 16 51088327 1D TTTATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 11 10 98174 CASAVA_Build 16 51112108 2D ATAGTCAAAC AT/-- GTGGACATTT 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 AT 1 0 98175 CASAVA_Build 16 51143379 1D ACTCTGCCTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 A 9 8 98176 CASAVA_Build 16 51149366 1I GAAATATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 10 11 98177 CASAVA_Build 16 51170473 2I GGAGAGAGGC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 70 het 33 0 23 10 AG 5 6 98178 CASAVA_Build 16 51178680 2D ATTGAAAAAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 510 hom 29 2 20 7 TG 9 8 98179 CASAVA_Build 16 51187138 3I ATTAAGTTTT ---/AAC ACAAATTTTA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AAC 0 1 98180 CASAVA_Build 16 51188022 1D TAATTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2223 hom 27 9 11 7 A 15 14 98181 CASAVA_Build 16 51198169 1D GTTAAATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 12 11 98182 CASAVA_Build 16 51208131 3D GGTATCAGAG AAC/--- AACAGTGAAA 3070 het 3070 hom 45 20 24 2 AAC 2 1 98183 CASAVA_Build 16 51211273 1I CTCCACTGAC -/T AGTTGTGTGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 1 98184 CASAVA_Build 16 51212651 1I CCCCTTTCAC -/A AAAAAAAATA 2634 het 489 hom 22 1 8 13 A 8 9 98185 CASAVA_Build 16 51220918 2D GTGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 hom 51 16 26 10 GT 5 4 98186 CASAVA_Build 16 51222041 1I CTTAAACCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 60 21 31 8 T 9 10 98187 CASAVA_Build 16 51224928 1D CTTTTTGATT A/- ATGTGAAAGA 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 A 2 1 98188 CASAVA_Build 16 51227247 1D ACCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 9 A 15 14 98189 CASAVA_Build 16 51227668 1D GTCCTGAAAG C/- CAGGTGTCAT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 C 2 1 98190 CASAVA_Build 16 51228839 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 44 0 32 13 T 9 8 98191 CASAVA_Build 16 51229943 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAACAAG 3070 het 2405 hom 17 6 10 1 A 7 6 98192 CASAVA_Build 16 51241660 12I TCTGTGCAGG ------------/GAGACCCGAAAA GAACAACAAG 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 GAGACCCGAAAA 0 1 98193 CASAVA_Build 16 51302611 1D AAAATAATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 10 9 98194 CASAVA_Build 16 51312764 1I TTTTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 989 hom 30 4 20 6 G 0 1 98195 CASAVA_Build 16 51362675 1D CTTCTTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 19 23 6 T 10 9 98196 CASAVA_Build 16 51364125 1I GCAAATCAGA -/C GCATTGCAGG 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 C 0 1 98197 CASAVA_Build 16 51366260 1D AGGACTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 11 10 98198 CASAVA_Build 16 51373022 1I TCCCTTCAGT -/C CCAGCCTGCT 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 C 2 3 98199 CASAVA_Build 16 51387370 1D AGTGGAAGAA G/- GAAGGCAAGA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 G 2 1 98200 CASAVA_Build 16 51395970 2I GATTTTTCAT --/TG TTTTTTTTTT 2330 het 2330 ref 53 25 15 13 TG 0 1 98201 CASAVA_Build 16 51403427 1I GGTCTTCAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 9 10 98202 CASAVA_Build 16 51411645 1D AGAGAGATAC A/- AAAAAAAAAA 2922 het 2922 ref 33 13 9 11 A 13 12 98203 CASAVA_Build 16 51414358 1I AGTTCAAGAG -/A AAAAACCAAG 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 5 6 98204 CASAVA_Build 16 51415286 1I GATACAGGCA -/C ACATATATTC 1511 het 1511 ref 16 10 4 2 C 0 1 98205 CASAVA_Build 16 51424762 2D CTGCCCAGTG CA/-- AGGGTCTGAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 CA 1 0 98206 CASAVA_Build 16 51432890 1I AATGTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 10 11 98207 CASAVA_Build 16 51433719 1D ACACACAACC T/- TTTGTGCCAA 3070 het 3070 hom 57 24 31 2 T 4 3 98208 CASAVA_Build 16 51435664 1I GCAACTGACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 9 10 98209 CASAVA_Build 16 51436605 3I TCACCATACT ---/CTG CTATTTTTCA 3070 hom 113 het 39 0 38 1 CTG 0 1 98210 CASAVA_Build 16 51439839 2I AAAGTATAAT --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 8 10 98211 CASAVA_Build 16 51443243 1I GTTTTACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 27 1 16 10 T 11 12 98212 CASAVA_Build 16 51446930 1D CCCAATGTGA C/- CTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 49 1 43 5 C 2 1 98213 CASAVA_Build 16 51448382 1D TCTCAGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 12 8 T 11 10 98214 CASAVA_Build 16 51448865 1I GTTTCCCAGG -/A AAAAATGTTA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 5 6 98215 CASAVA_Build 16 51450803 2I GAACGGTTAC --/CA GTTATAAGAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 CA 0 1 98216 CASAVA_Build 16 51451230 1I ATATTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 A 10 11 98217 CASAVA_Build 16 51458253 3D ATTCCAAATG TCA/--- TCTTTACTCA 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 TCA 1 0 98218 CASAVA_Build 16 51459738 1D TCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 13 12 98219 CASAVA_Build 16 51469386 1D TTCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 T 12 11 98220 CASAVA_Build 16 51475600 1I42M1I AAAGAACCAA -TGAAAGGGGTTTCCCCTTATAAAACCATCAGATTTCATGAGA-/GTGAAAGGGGTTTCCCCTTATAAAACCATCAGATTTCATGAGAC TTATTCACTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 10 N/A 0 0 98221 CASAVA_Build 16 51475667 2I AGAACAGTAT --/GG GGGGGAAATC 3070 hom 45 het 25 0 16 9 G 5 7 98222 CASAVA_Build 16 51476961 2D TAAATGTGCT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 2914 hom 27 11 11 5 A 11 9 98223 CASAVA_Build 16 51477029 12D GCTGCTAATT GTCATCTGATAG/------------ GTTGGGCATC 3070 het 3070 ref 21 12 8 2 GTCATCTGATAG 1 0 98224 CASAVA_Build 16 51490585 2I CTAATGCTAT --/CC CTCCCCTAGT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 C 1 3 98225 CASAVA_Build 16 51513163 2D ATTTATAATC GT/-- GATATAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 GT 1 0 98226 CASAVA_Build 16 51514535 3D TGGTGTCTCC TTG/--- TTGTCTTAAT 3070 het 3070 hom 59 25 27 8 TTG 2 1 98227 CASAVA_Build 16 51522090 1D TAGGTGCTCA G/- TATTTGCTGA 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 G 1 0 98228 CASAVA_Build 16 51536387 3D ACCCTGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1544 het 1544 ref 24 9 4 11 A 17 14 98229 CASAVA_Build 16 51536813 3D CCTAGTACCC AGA/--- AGGTGTCTTC 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 AGA 1 0 98230 CASAVA_Build 16 51538832 1D AGACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 930 hom 25 7 14 5 A 15 14 98231 CASAVA_Build 16 51545746 1D AAATGTTGGG T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 7 98232 CASAVA_Build 16 51548359 1D TATCTCTTAC A/- AAAAAAGTGA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 7 6 98233 CASAVA_Build 16 51553061 1I TAAAAGCCTA -/T GCTAGAAGCC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 0 1 98234 CASAVA_Build 16 51553833 2I CAACCCCCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 28 0 20 8 T 10 12 98235 CASAVA_Build 16 51555264 1D ATTTCTAAAG C/- AAAGTACATC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 1 0 98236 CASAVA_Build 16 51571277 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 782 het 782 ref 31 21 3 7 A 13 12 98237 CASAVA_Build 16 51574334 1D CACACCAGTA T/- TTCCTAGTTA 3070 hom 69 het 27 0 25 3 T 3 2 98238 CASAVA_Build 16 51576097 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 5 A 13 12 98239 CASAVA_Build 16 51578727 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 21 0 16 5 A 11 12 98240 CASAVA_Build 16 51579365 1D CTGCCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 38 1 32 6 A 11 10 98241 CASAVA_Build 16 51586485 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 376 hom 36 1 29 6 A 10 11 98242 CASAVA_Build 16 51587886 3D GGAATTTGGT AAA/--- AAAAAAAAAA 1680 het 428 hom 27 7 6 15 A 17 14 98243 CASAVA_Build 16 51595432 2I TCCCCTAAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 180 hom 23 1 17 5 T 12 14 98244 CASAVA_Build 16 51597062 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 697 hom 25 4 10 11 A 17 16 98245 CASAVA_Build 16 51598693 1D CATCACCAGG A/- ACAGCAACTG 3070 hom 80 het 31 0 25 7 A 2 1 98246 CASAVA_Build 16 51636132 3D AGATGCTGGG TAC/--- TACTACTCTG 3070 het 3070 ref 39 23 11 7 TAC 3 2 98247 CASAVA_Build 16 51643643 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2254 hom 30 9 12 10 A 10 9 98248 CASAVA_Build 16 51654614 1D GTAGGGACTC T/- TTGCCCCATG 2807 het 2807 ref 24 15 7 2 T 3 2 98249 CASAVA_Build 16 51661337 1I TTGTGTGTGG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 396 hom 42 1 35 6 T 8 9 98250 CASAVA_Build 16 51673179 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 9 8 98251 CASAVA_Build 16 51682345 15I TGCCCACCAT ---------------/GCAGGGATAAGTCTC GCTCTCACAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 GCAGGGATAAGTCTC 0 1 98252 CASAVA_Build 16 51683707 1I CTTCTTCCAC -/T CCATTTCTAG 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 0 1 98253 CASAVA_Build 16 51696409 1I TAAAAAAAAA -/C CAAAAAAACA 3070 hom 40 het 18 0 13 5 C 1 2 98254 CASAVA_Build 16 51699749 9D ACCCCATCTC TACAAAAAA/--------- TACAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TACAAAAAA 2 1 98255 CASAVA_Build 16 51710787 1I ACTGTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 10 11 98256 CASAVA_Build 16 51775665 4I TAATCTTATC ----/TCTA TCAATCACTA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 TCTA 0 1 98257 CASAVA_Build 16 51874820 8D GCAACACCTA ATGTGCTT/-------- ATGGCACTTA 3070 het 3070 ref 58 33 27 3 ATGTGCTT 1 0 98258 CASAVA_Build 16 51876892 5I ATTAAAAAAT -----/AATGA AATGAAATCC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AATGA 1 2 98259 CASAVA_Build 16 51881899 1D TAGAGCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 12 11 98260 CASAVA_Build 16 51891828 1I TGATGGATAC -/A AAAATGCTAC 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 4 5 98261 CASAVA_Build 16 51895911 3D CAGGCTCTAG TTC/--- TTCTTCATCT 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 TTC 3 2 98262 CASAVA_Build 16 51904662 1I GTTACTCATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 9 10 98263 CASAVA_Build 16 51918179 2D AAAGTTTCAA AC/-- ACAGTTATCT 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 AC 2 1 98264 CASAVA_Build 16 51950357 1D CCAGTTTTGT A/- TCAGATGTGT 3070 het 3070 ref 27 9 9 9 A 1 0 98265 CASAVA_Build 16 51950573 1D GTCATCTGCA G/- TGTGGGACAG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 G 1 0 98266 CASAVA_Build 16 51957487 6I GAAAATAAAA ------/TTATAC TTATACTTGT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 TTATAC 1 2 98267 CASAVA_Build 16 51972362 1I ATTCAAAAAT -/A AATTCATATG 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 A 2 3 98268 CASAVA_Build 16 51974538 1I GGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2911 hom 26 9 13 4 T 10 11 98269 CASAVA_Build 16 51978119 1D TTAGTGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2649 hom 32 10 10 12 T 12 11 98270 CASAVA_Build 16 52006374 3I ATAAAAAAAA ---/ATT ATAGGTTTGT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 ATT 0 1 98271 CASAVA_Build 16 52008389 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1183 het 1183 ref 22 11 7 4 A 13 12 98272 CASAVA_Build 16 52008604 2D CAACTGTTCT CA/-- GTTCTTGGGA 3070 het 3070 ref 36 15 14 8 CA 1 0 98273 CASAVA_Build 16 52009722 3D ATTCCCAGAC ACT/--- ACTTTACTTA 3070 het 3070 hom 37 17 15 6 ACT 2 1 98274 CASAVA_Build 16 52037752 2I AGGTGAGCAA --/GT GTACCCTAGC 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 GT 1 2 98275 CASAVA_Build 16 52038714 8I TATCCAAATC --------/TTCTCTTA TTCTCTTATT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 TTCTCTTA 1 2 98276 CASAVA_Build 16 52039579 1D CTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1484 hom 15 7 8 1 T 10 9 98277 CASAVA_Build 16 52047600 3I AAAAAAAAAG ---/AAA AAAAGAAGAA 3070 het 2326 hom 33 9 15 9 A 4 7 98278 CASAVA_Build 16 52053941 1D TTTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 T 11 10 98279 CASAVA_Build 16 52068933 1I GATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 33 8 19 6 T 7 8 98280 CASAVA_Build 16 52074226 1D TCACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1588 hom 23 5 9 9 A 17 16 98281 CASAVA_Build 16 52075393 2D ATGAATTTAT AA/-- AACTTATGAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 8 A 4 2 98282 CASAVA_Build 16 52077266 6D GAGACCATCT AAAAAA/------ AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 A 9 3 98283 CASAVA_Build 16 52080913 1I GTACAGCCAG -/C CCCCAGTCTT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 C 4 5 98284 CASAVA_Build 16 52081449 1D AACTCTTCCA G/- GGTAAACTGC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 G 3 2 98285 CASAVA_Build 16 52083233 4I ATAAAAATAC ----/AGTA AGTAAGTAAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 AGTA 2 3 98286 CASAVA_Build 16 52105098 4I CAGCCTGAGC ----/TATA TATACATTGG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 TA 2 4 98287 CASAVA_Build 16 52126520 1I GAAGAGACAG -/A AGCATGCCAC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 1 2 98288 CASAVA_Build 16 52136724 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 98289 CASAVA_Build 16 52148575 1I AATCTCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 11 12 98290 CASAVA_Build 16 52294101 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2001 het 2001 ref 32 19 5 8 T 14 13 98291 CASAVA_Build 16 52296431 1D ATATGCCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2276 hom 30 6 11 15 T 13 12 98292 CASAVA_Build 16 52314241 1D ACGCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 1586 het 796 hom 16 4 5 7 A 15 14 98293 CASAVA_Build 16 52317589 2I TTTTATAAAC --/AG ACTCTAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 AG 0 1 98294 CASAVA_Build 16 52336248 1I TCCCCCCCCC -/T CATATATGAA 3070 hom 99 het 40 0 30 10 T 0 1 98295 CASAVA_Build 16 52350323 1D TTATACATTT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 8 7 98296 CASAVA_Build 16 52352677 1I ACCCAGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 39 1 25 13 T 12 13 98297 CASAVA_Build 16 52354386 2D10M1I AAAGAACTGA ATATAGCCTGAT-/--ATAGCCTGATA ACGATCTTAC 3070 hom 114 het 37 0 39 4 N/A 0 0 98298 CASAVA_Build 16 52356771 3D6M1I GGAGTTCGAG ACCAGCCTG-/---AGCCTGT GGCAATATGG 1706 het 1706 ref 9 4 4 1 N/A 0 0 98299 CASAVA_Build 16 52364506 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 1386 hom 29 4 22 3 A 1 0 98300 CASAVA_Build 16 52377328 2I TCTCAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 1008 het 79 hom 16 1 6 10 A 16 18 98301 CASAVA_Build 16 52379671 1D ACTCTTAACA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 7 6 98302 CASAVA_Build 16 52381278 2D13M2I TAAATGTATG TATATATATACAAAT--/--TATATATACAAATTA TATATATACA 1103 het 409 hom 12 2 5 5 N/A 0 0 98303 CASAVA_Build 16 52381565 1D TCCTTAGCCA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 1484 hom 17 4 9 4 T 8 7 98304 CASAVA_Build 16 52392263 2I TCTTTACAAA --/TT TCTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 1 3 98305 CASAVA_Build 16 52407050 16D GACTTTCTTG TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 23 4 12 13 T 30 14 98306 CASAVA_Build 16 52407913 1D CCACTCCCCA C/- CCCCCCTCAC 3070 hom 43 het 18 0 15 4 C 7 6 98307 CASAVA_Build 16 52408989 1D AATATTTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 9 98308 CASAVA_Build 16 52409585 2D TTACTTGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 26 1 21 6 T 15 13 98309 CASAVA_Build 16 52422870 1I GAAGACCAAA -/G GGGGGGGAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 7 8 98310 CASAVA_Build 16 52429128 2D GTCCATCAGC TG/-- TGTTTCCTAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 TG 2 1 98311 CASAVA_Build 16 52432771 1I TTATTCTGTT -/A AAAAAAACCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 7 8 98312 CASAVA_Build 16 52436042 1D20M1I CCAGTTAATA TTTTGTATTTTTAGTAGAGAT-/-TTTGTATTTTTAGTAGAGATG GGGTTTCACC 3070 hom 59 het 23 0 20 6 N/A 0 0 98313 CASAVA_Build 16 52436179 6D TTAAAAGTTG TTTTTC/------ TTTTTATTCT 3070 hom 39 het 17 0 14 5 TTTTTC 1 0 98314 CASAVA_Build 16 52436326 3D GTAGTGAGAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 9 T 14 11 98315 CASAVA_Build 16 52438215 9D ACTCAGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 2679 hom 21 het 13 0 9 6 A 21 12 98316 CASAVA_Build 16 52439182 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2457 hom 24 7 11 6 A 13 12 98317 CASAVA_Build 16 52444859 5D AAGTGTTTTG TTTTT/----- TTTTTCATCC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 10 5 98318 CASAVA_Build 16 52447504 1I TGAGCTATAG -/A AAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 4 5 98319 CASAVA_Build 16 52448486 1D TATGGAAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 T 10 9 98320 CASAVA_Build 16 52449413 1D AGTATCAGGG A/- AAAAAGATGC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 6 5 98321 CASAVA_Build 16 52459390 5D TGCTCTGAAA TCTGC/----- TCTGTCTGAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 6 TCTGC 1 0 98322 CASAVA_Build 16 52460955 1D CATAGTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2450 het 2207 hom 24 8 7 9 T 15 14 98323 CASAVA_Build 16 52469144 1D AGCTGTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 A 12 11 98324 CASAVA_Build 16 52486643 1I TGATTATCTT -/A ATGAATTTCA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 1 2 98325 CASAVA_Build 16 52490644 1D ATGGAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 33 1 23 9 T 13 12 98326 CASAVA_Build 16 52503604 1I TCAAATTGTT -/G CAATTTAGAG 3070 hom 166 het 64 0 56 8 G 0 1 98327 CASAVA_Build 16 52532303 5D GTGACCCCAG CCATC/----- CCATCACCAC 3070 hom 84 het 32 0 28 5 CCATC 2 1 98328 CASAVA_Build 16 52540570 1I ACTGGGACTT -/C ATTGCTAGTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 0 1 98329 CASAVA_Build 16 52542947 1D CGTGGCACAC A/- AGATGATTCT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 A 2 1 98330 CASAVA_Build 16 52567871 1I ATGTGTCAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 9 10 98331 CASAVA_Build 16 52581466 1D CTGTTTATGT G/- AATCAGTAAG 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 G 1 0 98332 CASAVA_Build 16 52583557 1D GCTGAACACT C/- CTCCCCTCTC 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 C 2 1 98333 CASAVA_Build 16 52599824 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 T 10 11 98334 CASAVA_Build 16 52601987 1I CAGTCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 A 10 11 98335 CASAVA_Build 16 52604769 1D CAGCAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 57 hom 53 2 21 30 T 15 14 98336 CASAVA_Build 16 52606441 1I GCTAATTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 10 11 98337 CASAVA_Build 16 52606918 15D AAAGCTATCT CCATGGCACAAATGC/--------------- CCATGGCACA 3070 het 3070 ref 37 18 12 13 CCATGGCACAAATGC 2 1 98338 CASAVA_Build 16 52607710 4I GTCATGAAAA ----/AAAC AAAAAAAAAA 3070 het 1647 hom 32 15 13 4 AAAC 0 1 98339 CASAVA_Build 16 52609795 3D TAGATAGATA GAT/--- GATAGATAGA 1618 het 1618 ref 28 12 7 9 GAT 2 1 98340 CASAVA_Build 16 52611045 5D CCTCGGTTTC TAGAT/----- TCCTTTGGCA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 TAGAT 1 0 98341 CASAVA_Build 16 52618907 5D ATTTTTATTC CTTTT/----- CTTAGGAAAG 3070 het 3070 hom 32 11 19 4 CTTTT 1 0 98342 CASAVA_Build 16 52649044 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2346 het 2346 ref 28 10 11 7 T 12 11 98343 CASAVA_Build 16 52658553 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 9 hom 40 1 31 8 T 10 9 98344 CASAVA_Build 16 52676464 1I TGCCTTACTT -/A ACTGCTCCCT 3070 het 3070 hom 58 19 34 5 A 1 2 98345 CASAVA_Build 16 52684506 5D GTTCCTGGAG GGACA/----- GGAACACTGT 3070 het 3070 ref 43 24 13 7 GGACA 1 0 98346 CASAVA_Build 16 52699068 1I AGGAAATAAC -/T TGACAGCAAG 3070 het 3070 ref 69 33 26 10 T 1 2 98347 CASAVA_Build 16 52704708 1D TTAGCCCCCC G/- TCTCCCCAGC 3070 hom 106 het 40 0 32 9 G 1 0 98348 CASAVA_Build 16 52705225 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 17 7 T 15 14 98349 CASAVA_Build 16 52709780 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2322 het 382 hom 33 3 18 12 T 11 12 98350 CASAVA_Build 16 52717865 1D GCTTGAGGGT A/- AAAAAAAAAA 2742 het 2742 ref 37 25 7 5 A 13 12 98351 CASAVA_Build 16 52721780 1D ATCTCAGTCC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 96 het 38 0 32 8 T 8 7 98352 CASAVA_Build 16 52723293 1D AGCTACAGAT G/- GGTTGCCCCA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 G 3 2 98353 CASAVA_Build 16 52728172 1I AAGTCAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 9 10 98354 CASAVA_Build 16 52753733 1D GACTGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 1798 het 1798 ref 31 18 4 9 T 15 14 98355 CASAVA_Build 16 52754191 1D GAGTGGGAGC A/- AGACAGAGAG 3070 het 3070 ref 35 16 14 7 A 2 1 98356 CASAVA_Build 16 52764046 4I TACCAAGCGC ----/GGCA GGCACCTGAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 GGCA 1 2 98357 CASAVA_Build 16 52765430 1I CTATTTTCTT -/C CCCCCTTCTT 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 C 5 6 98358 CASAVA_Build 16 52767210 2I TGCCCCCCCC --/CT CCACCCCGCC 1438 het 817 hom 14 3 4 7 CT 0 1 98359 CASAVA_Build 16 52767761 4D GGCTGGCCAC TTAT/---- TTATTTGTGG 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 TTAT 2 1 98360 CASAVA_Build 16 52789058 2D ATGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 48 het 42 1 29 12 GT 10 9 98361 CASAVA_Build 16 52792357 1I CAGTGCAGAT -/A CCCTTAGCTG 3070 het 3070 ref 55 23 25 7 A 0 1 98362 CASAVA_Build 16 52808241 3I AGTAGAAATT ---/GGA GGAGTTCAGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GGA 1 2 98363 CASAVA_Build 16 52810513 1I TTCTACCTGA -/T TTTTCCATCC 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 T 4 5 98364 CASAVA_Build 16 52825718 6I CTCTGAGTTG ------/ATTCTC ATTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 ATTCTC 1 2 98365 CASAVA_Build 16 52889906 1D TCCTTGGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2784 hom 21 9 9 3 T 12 11 98366 CASAVA_Build 16 52891710 1D CAGCATTTTA G/- GGATGTGCTA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 G 3 2 98367 CASAVA_Build 16 52896123 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 2826 het 2826 ref 27 17 7 4 T 10 9 98368 CASAVA_Build 16 52898743 2I3M4D GAGTCTTTTC --CCTAGAC/TGCCT---- TTGCTCTCTG 3070 het 3070 ref 46 24 21 3 N/A 0 0 98369 CASAVA_Build 16 52909644 1I CCAGGGTCAT -/A ACAGCTAATA 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 A 1 2 98370 CASAVA_Build 16 52914229 2D TCCAAGATTC TT/-- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 9 7 98371 CASAVA_Build 16 52921287 1D CACCTCTGAT A/- ACGGCTCTTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 2 1 98372 CASAVA_Build 16 52945172 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 24 10 A 11 12 98373 CASAVA_Build 16 52951381 1D GGTAGGGGAA G/- GGGGGGGTCC 1700 het 1013 hom 19 4 8 8 G 8 7 98374 CASAVA_Build 16 52961722 1I TGCCTTGGGA -/T TTTTCTGCCC 1744 het 1352 hom 13 4 5 4 T 4 5 98375 CASAVA_Build 16 52968129 1D AGGGGGTGCC G/- GACACATCTA 3070 het 3070 hom 66 23 31 12 G 2 1 98376 CASAVA_Build 16 52968324 2I AACACTTTAC --/CT CTCTGTGTCT 3070 hom 115 het 44 0 39 5 CT 2 3 98377 CASAVA_Build 16 52983673 2D CCTTAATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 28 2 13 13 T 16 14 98378 CASAVA_Build 16 53002198 1D ATTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 28 0 13 15 T 15 14 98379 CASAVA_Build 16 53006588 2D GAGGCTAAGA CT/-- CTGGGTGTTA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 CT 2 1 98380 CASAVA_Build 16 53013943 12I GCCCACAGAG ------------/TCTCCATGACTA TCTGCAAGGC 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 TCTCCATGACTA 0 1 98381 CASAVA_Build 16 53044570 2I AAAAAAAAGA --/TG ATGATGATGA 865 hom 5 het 4 0 2 2 TG 0 1 98382 CASAVA_Build 16 53072285 1D TGCTCCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 819 hom 21 2 16 3 T 13 12 98383 CASAVA_Build 16 53075564 1I ACTTTTGCAA -/T TCAAAAAAAA 3070 het 2705 hom 36 7 18 11 T 1 2 98384 CASAVA_Build 16 53078706 1D TTGTTTGGAA T/- TTTTTTTTTT 1477 het 1477 ref 31 10 4 17 T 17 16 98385 CASAVA_Build 16 53079454 1I GGGATGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 609 hom 30 2 22 6 A 12 13 98386 CASAVA_Build 16 53082012 2I ATAGCTGGAC --/AA AGAGACCCTC 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 A 1 3 98387 CASAVA_Build 16 53085013 1I TGCATAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 A 11 12 98388 CASAVA_Build 16 53086882 1I AAACACACCG -/T TAAGTTTGCT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 1 2 98389 CASAVA_Build 16 53096618 1I TATTTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 11 11 T 13 14 98390 CASAVA_Build 16 53097135 2I CACACACGCG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 13 11 16 CA 8 9 98391 CASAVA_Build 16 53107630 3D ATTGGTGAGA CGG/--- TGGTAACAAG 3070 hom 35 het 25 1 20 5 CGG 1 0 98392 CASAVA_Build 16 53108179 1I TCAATGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 21 9 A 10 11 98393 CASAVA_Build 16 53115272 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 15 1 10 4 A 15 14 98394 CASAVA_Build 16 53118280 2D ACTTTGAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 1927 het 1927 ref 25 11 6 9 T 16 14 98395 CASAVA_Build 16 53123130 1D TGTACTGTGG A/- AAATGGCATG 3070 het 3070 ref 44 24 18 3 A 4 3 98396 CASAVA_Build 16 53130118 2D GCAGAAACTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 12 15 9 AT 7 6 98397 CASAVA_Build 16 53130170 3D TCTGCCTGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3062 hom 37 13 18 7 T 16 13 98398 CASAVA_Build 16 53137297 1I CTCTTTGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 11 10 A 12 13 98399 CASAVA_Build 16 53148790 1D TGCCCCCCTG C/- CCCCCCAAAA 3070 het 2962 hom 29 10 14 5 C 7 6 98400 CASAVA_Build 16 53151154 5D AGACATGGAC TTAAG/----- TTAAGTCTAG 3070 hom 96 het 38 0 29 10 TTAAG 2 1 98401 CASAVA_Build 16 53157326 1D CTATTTTGTT G/- GGACTATTGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 3 2 98402 CASAVA_Build 16 53160599 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 114 het 44 0 37 8 T 8 7 98403 CASAVA_Build 16 53160734 3D ACAAATGAAA AAC/--- AACAAGGCCA 3070 hom 126 het 48 0 42 7 AAC 2 1 98404 CASAVA_Build 16 53162446 20D ATTTGACCTG ATATATATATATATATATAT/-------------------- ATATATATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 7 AT 17 7 98405 CASAVA_Build 16 53169854 1D GAGACTGAGA T/- TTTCTTGGTG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 4 3 98406 CASAVA_Build 16 53180301 1D TCATTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 31 2 15 14 T 16 15 98407 CASAVA_Build 16 53188490 1I GTCTCAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 642 hom 27 2 17 8 A 11 12 98408 CASAVA_Build 16 53235206 1I CTCTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 1763 het 1763 ref 24 16 6 2 A 10 11 98409 CASAVA_Build 16 53240811 2I CATATATATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 49 19 18 12 CA 7 8 98410 CASAVA_Build 16 53264306 2I TGCTACCCCC --/CA CCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 CA 0 1 98411 CASAVA_Build 16 53265031 1I CTGTAATACT -/A ACCACTATAC 3070 het 3070 ref 50 22 18 10 A 1 2 98412 CASAVA_Build 16 53272337 2D TATATATGTG TA/-- TATATATGTG 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 TA 4 3 98413 CASAVA_Build 16 53277234 1I TTCCTCTTCC -/T TTTCCCCCTC 3070 het 1612 hom 27 7 10 10 T 3 4 98414 CASAVA_Build 16 53285063 1I TTCAGGTGGC -/A AAATCACCCC 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 A 3 4 98415 CASAVA_Build 16 53295586 1D CTTTTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2921 hom 30 8 15 8 T 13 12 98416 CASAVA_Build 16 53304886 1I11M1I AACTTCTGGT -CAAATGAACCA-/CCAAATGAACCAG GGTAACGTAC 3070 hom 99 het 35 0 34 4 N/A 0 0 98417 CASAVA_Build 16 53311085 1D TGAATTTGTA T/- TCTGAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 19 16 3 T 2 1 98418 CASAVA_Build 16 53312700 2I AGATGTGTAA --/AC TACTATGAGA 3070 hom 141 het 49 0 48 1 AC 0 1 98419 CASAVA_Build 16 53319706 1D GGTTAAGTAT A/- TTACTAAGTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 A 1 0 98420 CASAVA_Build 16 53321518 1D GGCTCTTTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 9 8 98421 CASAVA_Build 16 53324540 2D ATTTAATGAC TA/-- TGTGAAAACA 3070 het 3070 hom 31 16 15 0 TA 1 0 98422 CASAVA_Build 16 53331353 2D TGGTCCATAC TT/-- TTTTAACTAT 3070 hom 187 het 70 0 63 9 T 6 4 98423 CASAVA_Build 16 53348367 1I GGTCAGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2703 hom 31 8 15 8 T 10 11 98424 CASAVA_Build 16 53348440 4D TACTCTTTAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 13 17 9 AC 10 8 98425 CASAVA_Build 16 53354117 9I GAGATGGGAT ---------/TTCACCACG TTGGCCAGGT 1911 hom 19 het 20 0 5 15 TTCACCACG 0 1 98426 CASAVA_Build 16 53375533 2D TAGTTGTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 902 hom 36 7 13 18 A 14 12 98427 CASAVA_Build 16 53386834 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 35 0 27 8 T 10 11 98428 CASAVA_Build 16 53390860 1D TAGACCAAAC T/- TTTTTTTTTT 776 het 776 ref 29 20 3 6 T 15 14 98429 CASAVA_Build 16 53397782 2I AAAATCTAAC --/TT GGTGGGTGAC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 0 2 98430 CASAVA_Build 16 53407457 18D TAATCCTCAT ACACACACACACACACAC/------------------ ACACACACAC 3070 hom 76 het 29 0 26 10 AC 18 9 98431 CASAVA_Build 16 53409613 1I GGGCCCAGCC -/T GTCTTTCACA 3070 hom 72 het 27 0 23 4 T 0 1 98432 CASAVA_Build 16 53413540 1I44M2D AAGAAGTAGA -CCTAAAGAATTATTCAAACAGACTCTAACCTAGATATTTTTCTTAA/CCCTAAAGAATTATTCAAACAGACTCTAACCTAGATATTTTTCTT-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 23 11 7 N/A 0 0 98433 CASAVA_Build 16 53419036 1I TCTTTGATAC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 7 98434 CASAVA_Build 16 53426255 1D TCGACTCTAC A/- TGTAATGGAG 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 A 1 0 98435 CASAVA_Build 16 53430516 1I AAATGGAATC -/T TTTTTTTTTT 2489 het 2489 ref 42 23 9 10 T 13 14 98436 CASAVA_Build 16 53444397 2I ATTGTTTCTG --/GA GAGAATTCTT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 GA 2 3 98437 CASAVA_Build 16 53459540 8D TCTACCAGCA TGTCTATT/-------- TGTCTATTTG 3070 het 3070 ref 50 26 16 11 TGTCTATT 2 1 98438 CASAVA_Build 16 53475125 1D AGCTATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 A 11 10 98439 CASAVA_Build 16 53475287 4D4M2D ACAAAATTAT GGACTATTCA/----TATT-- GTTATGAAAA 3070 het 3070 ref 41 24 12 7 N/A 0 0 98440 CASAVA_Build 16 53476478 25I AACAAAACTT -------------------------/TTTTTAAAAATTGAAAACATCAATA AAATAAAAGT 2466 het 2466 ref 23 15 7 2 TTTTTAAAAATTGAAAACATCAATA 0 1 98441 CASAVA_Build 16 53478211 1D AGTGTGGTTC T/- TTTTCTGGAG 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 T 5 4 98442 CASAVA_Build 16 53485501 1I AGAGTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 13 14 98443 CASAVA_Build 16 53500169 1D ATTCAGTGCT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 8 7 98444 CASAVA_Build 16 53504115 2I CCTGCTCTCT --/TC TCTCTCTCCC 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 TC 4 5 98445 CASAVA_Build 16 53504219 1D GAGCCCTGTT C/- CTGCCAGGGA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 C 2 1 98446 CASAVA_Build 16 53506429 1I AAGATTACTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 8 9 98447 CASAVA_Build 16 53510630 1D AATCTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 10 9 98448 CASAVA_Build 16 53513296 5D CATTATAGAG AATAA/----- AATTTGGAAT 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 AATAA 1 0 98449 CASAVA_Build 16 53533412 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 3070 het 3070 ref 21 11 10 0 G 2 3 98450 CASAVA_Build 16 53534967 1I TTATTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 10 19 11 T 10 11 98451 CASAVA_Build 16 53535552 1D TTCTTTCTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 10 9 98452 CASAVA_Build 16 53553115 1I AACTAGAGAC -/A ATAAAGCAGG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 1 2 98453 CASAVA_Build 16 53553380 4D TCCCAAGAAG AGGT/---- AGGTACATTT 3070 het 3070 hom 48 21 26 3 AGGT 2 1 98454 CASAVA_Build 16 53570721 1I TTTATATGCA -/C CCCCTGACCC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 4 5 98455 CASAVA_Build 16 53573037 4I TGGGCTGGGA ----/CCCT TCCCTGATAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CCCT 0 1 98456 CASAVA_Build 16 53586974 1D CCCATCCTGA G/- GCCCCAGGCC 3070 hom 114 het 40 0 35 5 G 2 1 98457 CASAVA_Build 16 53588506 1I CATCTGCTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 112 hom 37 1 29 7 A 9 10 98458 CASAVA_Build 16 53598273 1D GTCAATTTCA G/- GGGCAGTACC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 G 4 3 98459 CASAVA_Build 16 53607597 1I TATTTGTTGT -/G GGGGGGGTGT 3070 hom 38 het 26 0 13 13 G 7 8 98460 CASAVA_Build 16 53612974 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 932 hom 24 2 14 8 A 13 14 98461 CASAVA_Build 16 53624041 1I AAATTGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 27 1 23 3 A 11 12 98462 CASAVA_Build 16 53669965 1I CCTGCTAGGG -/A ACCTTCTAGG 212 het 212 ref 34 12 2 20 A 1 2 98463 CASAVA_Build 16 53673549 1D AAAAAAAAAA C/- ACACCTAAAA 2163 het 2163 ref 29 17 7 5 C 1 0 98464 CASAVA_Build 16 53694356 1D TTTTGAGGGG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 85 het 47 1 39 7 A 9 8 98465 CASAVA_Build 16 53703238 4I TATGTGTGAG ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AT 6 8 98466 CASAVA_Build 16 53706776 5D AGCCTGGAAT GGAAG/----- GGAAGGGAAG 3070 hom 75 het 32 0 24 10 GGAAG 3 2 98467 CASAVA_Build 16 53714343 1D ACACAAGCAA G/- GGCTTGAAAG 3070 hom 166 het 61 0 56 6 G 3 2 98468 CASAVA_Build 16 53717544 1D ATTTGAGGCG T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 51 24 18 9 T 7 6 98469 CASAVA_Build 16 53722722 1D TCCCCGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 15 10 A 11 10 98470 CASAVA_Build 16 53726184 1I CTCCCTGGGG -/C CCCCCCTTCC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 C 6 7 98471 CASAVA_Build 16 53751693 1I AGACTTGAAA -/T GTGAGTACCT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 0 1 98472 CASAVA_Build 16 53757821 4I CCTCAAAGTG ----/TAGT TAGTGACTGG 3070 het 3070 ref 55 25 22 8 TAGT 1 2 98473 CASAVA_Build 16 53782231 2I CCAAAAAAAA --/AT AAATAAATAG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 AT 0 1 98474 CASAVA_Build 16 53784293 3D GTGGTTGGAA TGT/--- TGTTGTCTCA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TGT 3 2 98475 CASAVA_Build 16 53785133 5D CCATGTTCTT CTTTA/----- CTTCTACTGG 3070 het 3070 hom 45 18 25 3 CTTTA 1 0 98476 CASAVA_Build 16 53786489 1I CACCCCATAT -/A CAAGAACTAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 0 1 98477 CASAVA_Build 16 53786904 2I AGAGAGAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AG 8 9 98478 CASAVA_Build 16 53793520 2I GCTCACATTC --/GG GAGAGAGGAA 3070 het 2279 hom 26 5 16 5 G 1 3 98479 CASAVA_Build 16 53803221 1I TAATTATTTC -/T TTATTAATAG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 2 3 98480 CASAVA_Build 16 53806218 3D CGAGGAAGAC AAG/--- GAGAGGAAGG 3070 het 3070 ref 50 21 14 17 AAG 1 0 98481 CASAVA_Build 16 53813804 1I AAGAGAAATC -/A AAAAATCTGT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 5 6 98482 CASAVA_Build 16 53817201 1I GAGAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 10 11 98483 CASAVA_Build 16 53818794 2D TCTTTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 49 19 20 13 TC 6 5 98484 CASAVA_Build 16 53820862 1D TACATATAAG A/- AAAAAATGCT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 7 6 98485 CASAVA_Build 16 53821138 1I TATTTACAAA -/G CTATATATCC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 G 0 1 98486 CASAVA_Build 16 53822567 16D CAGTGCAAAA GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 2154 het 2154 ref 23 10 6 7 GT 17 9 98487 CASAVA_Build 16 53825248 1I GCTAACCCAC -/A AAAAAACCCT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 6 7 98488 CASAVA_Build 16 53825409 4D GATGCTAACT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 31 20 7 4 AAAC 4 3 98489 CASAVA_Build 16 53825940 1D TTTCTTTTTC A/- TTTTTTTTTT 1530 het 26 hom 10 1 6 3 A 1 0 98490 CASAVA_Build 16 53827707 1I CCGTCTAGTA -/C CCCCATTTTG 3070 het 3070 hom 51 24 22 5 C 4 5 98491 CASAVA_Build 16 53843704 1D ACACCATTCC A/- AAAAAAAAAA 1532 het 1532 ref 50 34 4 12 A 13 12 98492 CASAVA_Build 16 53844601 1I ATGAAAAGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 9 10 98493 CASAVA_Build 16 53850679 10I TCCAGAGGCT ----------/AAGACAGGCC AAGCCAGGCC 1443 het 992 hom 15 5 6 4 AAGACAGGCC 0 1 98494 CASAVA_Build 16 53853688 2I ATGTCTAAAG --/TA TATATGTTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TA 2 3 98495 CASAVA_Build 16 53860978 1I CATCTACACA -/T TTTACTTATC 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 3 4 98496 CASAVA_Build 16 53866617 1D TAATCTCCTA G/- TCTCCAATTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 G 1 0 98497 CASAVA_Build 16 53877077 5D AGCCTCTCTC AGAAA/----- AGAAAAGGAA 2919 het 2919 ref 25 13 11 1 AGAAA 2 1 98498 CASAVA_Build 16 53878900 1D ATATGCAAAC A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 7 6 98499 CASAVA_Build 16 53910181 1I TCATGAGATC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 8 9 98500 CASAVA_Build 16 53917551 7I GTTTGGTTAA -------/AATGCGT TTTATAATTC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AATGCGT 0 1 98501 CASAVA_Build 16 53921109 1I ACTCGCTGGT -/C CCCTGCTGTG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 C 3 4 98502 CASAVA_Build 16 53926010 1I GCTCTTTTTT -/C CCCCATCCAG 3070 het 3070 hom 55 25 27 3 C 4 5 98503 CASAVA_Build 16 53926365 1D CTGCAAGTAA C/- TTTTGAAAGT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 C 1 0 98504 CASAVA_Build 16 53926778 10D TCCCTTTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 1923 hom 28 9 13 7 A 23 13 98505 CASAVA_Build 16 53933576 1D TACTATAAAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 8 7 98506 CASAVA_Build 16 53935809 2I AAAAGTAAAA --/AC ACACCTCAAT 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 AC 2 3 98507 CASAVA_Build 16 53961297 1D CAAAAAAGGC G/- GGGGGGGGGC 3070 hom 11 het 28 0 17 12 G 10 9 98508 CASAVA_Build 16 54021983 1I AAAAATAGGG -/A AAAAAGTCTC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 5 6 98509 CASAVA_Build 16 54025835 1I AACACCTGGG -/C CAGGCAGGTG 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 C 1 2 98510 CASAVA_Build 16 54032939 1I AAAGGAAGCC -/A AGACCCCTTT 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 A 1 2 98511 CASAVA_Build 16 54033824 12I TGAAATAGCC ------------/TCATGATGCATT TCTCAGAACA 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 TCATGATGCATT 0 1 98512 CASAVA_Build 16 54034065 1D TTTCATTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 T 11 10 98513 CASAVA_Build 16 54038899 1I CACAGCACTC -/T TATTAGCAAG 3070 hom 153 het 56 0 50 6 T 1 2 98514 CASAVA_Build 16 54040136 2D AAGAAAAAAA GG/-- AAGGAAGGAG 1551 het 141 hom 13 2 5 6 G 2 0 98515 CASAVA_Build 16 54040383 37D ACTTTTATTT ATCTCAATTATGATGAAGACTCTTTTCCCTTTGCTAA/------------------------------------- CAAGAACTCT 3070 het 3070 ref 29 23 12 3 ATCTCAATTATGATGAAGACTCTTTTCCCTTTGCTAA 1 0 98516 CASAVA_Build 16 54041496 1I TCATGTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 T 11 12 98517 CASAVA_Build 16 54047004 14D ACACAGGCAC ACATACACAGACAG/-------------- ACATACACAG 3070 het 3070 ref 59 27 18 22 ACATACACAGACAG 2 1 98518 CASAVA_Build 16 54050628 3I TTTAAAAAAA ---/TGT TGTATGAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 TGT 1 2 98519 CASAVA_Build 16 54054495 1I TAAACTCTGG -/C CAACATAAGC 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 C 1 2 98520 CASAVA_Build 16 54055209 1D CTTCAAATAC A/- AAAAAGCTTG 3070 hom 98 het 41 0 31 10 A 6 5 98521 CASAVA_Build 16 54057262 2D ACACATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 126 het 52 0 43 9 AC 7 6 98522 CASAVA_Build 16 54061534 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 25 0 20 6 T 13 11 98523 CASAVA_Build 16 54063558 1D CACAGTTTTT G/- GTTTCCCAAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 G 2 1 98524 CASAVA_Build 16 54065669 1D AACTGGCCTC A/- TTTTGATATT 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 A 1 0 98525 CASAVA_Build 16 54067802 1D TGGTTGCCCA T/- TTTTATGGTT 3070 hom 115 het 42 0 38 5 T 5 4 98526 CASAVA_Build 16 54074980 1D TGGGTTTAGC A/- GCCCAATTGG 3070 het 3070 hom 52 24 23 5 A 1 0 98527 CASAVA_Build 16 54082485 2D CCTCTCCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2734 het 2339 hom 34 8 9 17 T 14 12 98528 CASAVA_Build 16 54088754 1I TTTCTAGAAG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 7 8 98529 CASAVA_Build 16 54096374 1D CACAGTTGAG T/- TTTTTTTTTG 1954 het 102 hom 12 1 9 2 T 10 9 98530 CASAVA_Build 16 54098969 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 9 10 98531 CASAVA_Build 16 54113327 2D ATATTGAATC TG/-- TTTCCTCAAA 3070 het 3070 hom 45 18 23 5 TG 1 0 98532 CASAVA_Build 16 54124059 1I GTTCTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 29 1 25 3 A 12 13 98533 CASAVA_Build 16 54128801 1D AAGACCCTGT C/- CCCAAAAAAA 1332 het 1332 ref 23 10 6 7 C 4 3 98534 CASAVA_Build 16 54135651 1I GTCCATTTGG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 7 8 98535 CASAVA_Build 16 54140641 1D ATATGATTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 10 9 98536 CASAVA_Build 16 54142746 3D ATCATATCAT ATC/--- ATATCATATA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 ATC 1 0 98537 CASAVA_Build 16 54144461 4D5M1I ACAGCTTGAC AGTTGAACA-/----CAACAT GGTGAAACCC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 N/A 0 0 98538 CASAVA_Build 16 54153002 1D AATTGGATTT A/- AACCACAGCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 3 2 98539 CASAVA_Build 16 54159562 1I12M1I TTTCTTTAGT -AAAAAAAAGCAC-/AAAAAAAAAGCACA TAGCAATTTT 3070 hom 105 het 37 0 34 8 N/A 0 0 98540 CASAVA_Build 16 54164038 6I AATGTAGATA ------/TTGACT TTGGCGCTGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTGACT 0 1 98541 CASAVA_Build 16 54167599 1I TATAATTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 628 hom 38 3 25 10 T 13 14 98542 CASAVA_Build 16 54172250 9I TAGGAGCGCA ---------/TTCTCATAG TGAACCCTAT 3070 hom 99 het 39 0 31 12 TTCTCATAG 0 1 98543 CASAVA_Build 16 54176329 4D ATTTTTATCA GAGT/---- GTCTGTCATA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 GAGT 1 0 98544 CASAVA_Build 16 54177539 4D TCAGAGTGAC AAAT/---- AAGTGCTATG 3070 het 3070 ref 46 24 20 5 AAAT 1 0 98545 CASAVA_Build 16 54202179 16D CGTGTCTCGG TCTCTTTCAGTTCAGC/---------------- TCTGATTTTG 3070 het 3070 ref 29 18 16 5 TCTCTTTCAGTTCAGC 1 0 98546 CASAVA_Build 16 54248530 1I GGCTAACGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 9 10 98547 CASAVA_Build 16 54249326 15I GGGGCTTTGC ---------------/TCCTGCGGTGCCCAG TCCTGCCACT 3070 het 1888 hom 25 10 12 3 TCCTGCGGTGCCCAG 0 1 98548 CASAVA_Build 16 54251401 1D TGGCTGCTGA T/- TTTTGTTAAT 3070 het 3070 hom 45 20 23 3 T 5 4 98549 CASAVA_Build 16 54258427 1D TCTCTCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2392 hom 19 6 11 2 T 12 11 98550 CASAVA_Build 16 54267193 1D AAAAGTGTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 9 13 7 A 10 9 98551 CASAVA_Build 16 54311592 1I GCATGGGTGC -/A AAAAAAAAAA 2659 hom 18 het 10 0 7 3 A 10 11 98552 CASAVA_Build 16 54324951 15I ATAGCCCAAA ---------------/CCCTGTAAACTTGGT CCCAGACTTC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 CCCTGTAAACTTGGT 0 1 98553 CASAVA_Build 16 54333631 1D CTTCTCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 28 1 15 12 T 15 14 98554 CASAVA_Build 16 54333830 1D AATGCTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1349 hom 32 7 13 12 T 15 14 98555 CASAVA_Build 16 54337456 1I17M1D AGGAGGGCAG -GCAGAAGGAGAGAGGGCA/AGCAGAAGGAGAGAGGGC- GGGGAGAGGC 3070 hom 88 het 28 0 21 15 N/A 0 0 98556 CASAVA_Build 16 54343660 8D ATATATATAT ACACATAC/-------- ACACATACAC 3070 hom 81 het 32 0 27 8 ACACATAC 2 1 98557 CASAVA_Build 16 54348943 1I GAGGAACCCT -/A AAGCTCAGGT 1304 het 1304 ref 53 43 5 5 A 2 3 98558 CASAVA_Build 16 54349311 5D TCTCTTTTTC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 hom 120 het 51 0 37 16 TTTCT 4 3 98559 CASAVA_Build 16 54353114 2I CCTGAGAGGG --/AC AGTTTCTCCA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 AC 0 1 98560 CASAVA_Build 16 54353405 1D GAAGGGCAGA G/- GAAGAGAGGA 3070 het 3070 hom 31 13 11 9 G 2 1 98561 CASAVA_Build 16 54364034 7I TTCTGATTAC -------/AATACCT AGTCTCAGGA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 AATACCT 0 1 98562 CASAVA_Build 16 54366637 4D CTCTCCTCTG TCTC/---- TCTCTCTGTC 3070 het 3070 ref 39 21 18 1 TC 5 3 98563 CASAVA_Build 16 54370110 4D CACATACAGG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 53 22 21 10 CA 10 8 98564 CASAVA_Build 16 54371754 2I TCAGCAAAGA --/CT TAATAAACAC 1715 het 1715 ref 24 16 5 3 CT 0 1 98565 CASAVA_Build 16 54377404 3D GAAGCCATTG AGA/--- AGTACTTAGG 3070 het 3070 ref 36 16 14 9 AGA 1 0 98566 CASAVA_Build 16 54390079 8I CTCTCTTTCT --------/TTCTTTCC TTCTTTCCTT 2662 het 2662 ref 30 17 8 5 TTCTTTCC 1 2 98567 CASAVA_Build 16 54402428 1I CAACTGCTAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 C 0 1 98568 CASAVA_Build 16 54403172 11D CTTTCTCTGC CCTTTGGGATG/----------- TGAATCTACC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 CCTTTGGGATG 1 0 98569 CASAVA_Build 16 54412652 1D ATGCTGGGCT G/- TGAGTAGGGC 3070 het 3070 ref 35 20 9 7 G 1 0 98570 CASAVA_Build 16 54425224 1D CAAAATGCTT G/- GCACCTGGCC 3070 hom 120 het 43 0 39 5 G 2 1 98571 CASAVA_Build 16 54427641 4D ACTCAGCACA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 114 het 44 0 36 9 AC 11 9 98572 CASAVA_Build 16 54440764 1I CTAGTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 A 11 12 98573 CASAVA_Build 16 54442320 1I TTTTCTTTTT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 32 16 16 0 A 7 8 98574 CASAVA_Build 16 54451568 1I CTGAACAAGC -/T TTTTTTTTTG 2978 het 2978 ref 19 8 7 4 T 9 10 98575 CASAVA_Build 16 54481642 1D AGACAACTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 A 10 9 98576 CASAVA_Build 16 54481786 1I GGCTTGAATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 0 1 98577 CASAVA_Build 16 54492733 1I TTTCCTTTAT -/A AATTACCCAG 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 2 3 98578 CASAVA_Build 16 54506417 1I TAAAAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 16 11 T 12 13 98579 CASAVA_Build 16 54543843 4I AAAATGCAAA ----/AATT AATTAACTAG 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 AATT 1 2 98580 CASAVA_Build 16 54569891 1D ATGTTCTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 30 1 13 16 A 11 10 98581 CASAVA_Build 16 54571866 5D GGTTTATTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 11 20 9 TTTGT 3 2 98582 CASAVA_Build 16 54581565 1I GCTTGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 2439 het 2439 ref 20 8 6 6 A 11 12 98583 CASAVA_Build 16 54590135 10D GTTTATTTTT TCTTTTGTTG/---------- TCTATGCTTT 3070 hom 117 het 41 0 40 2 TCTTTTGTTG 1 0 98584 CASAVA_Build 16 54591751 5I AGCATATAGC -----/TGTTA CATTCATAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TGTTA 0 1 98585 CASAVA_Build 16 54598215 2I TCACTATCTC --/AT ATAATCCTTA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 AT 1 2 98586 CASAVA_Build 16 54604958 1D TCTTGGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 13 12 T 13 12 98587 CASAVA_Build 16 54610421 2I AGTCAGAAGC --/AA AAACTGCTGA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 3 5 98588 CASAVA_Build 16 54619146 1D AGGGAGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 697 hom 34 8 13 13 T 18 17 98589 CASAVA_Build 16 54622302 1I TCAAGAAATC -/A GCATTACAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 98590 CASAVA_Build 16 54626520 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2524 hom 32 het 18 0 9 9 T 16 15 98591 CASAVA_Build 16 54627127 1I TGTTTTCTTG -/T TTTTAATTCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 5 98592 CASAVA_Build 16 54627770 1D TTTCAGTGCC A/- AAGTATTTGG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 3 2 98593 CASAVA_Build 16 54629222 1I GATTTAAGAT -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 25 13 11 1 A 7 8 98594 CASAVA_Build 16 54629538 1I CTGAAACTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 T 11 12 98595 CASAVA_Build 16 54647849 3I GTGACTAATG ---/TCA TCATGTGTTA 3070 het 3070 ref 75 35 32 8 TCA 1 2 98596 CASAVA_Build 16 54650871 1I TGGGAGGAAG -/A AAGGATGAGG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 2 3 98597 CASAVA_Build 16 54700083 1D AATGTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 11 10 98598 CASAVA_Build 16 54718807 1D TTAGATTGGT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 7 98599 CASAVA_Build 16 54719414 1D TGAATAAACC T/- TTTTTTTTTT 1383 het 1383 ref 23 12 5 6 T 13 12 98600 CASAVA_Build 16 54726985 1D GCACTTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 11 10 98601 CASAVA_Build 16 54729572 1I TCATTTCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 1966 hom 22 4 14 4 A 8 9 98602 CASAVA_Build 16 54729737 1D CCCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 19 0 16 4 A 13 12 98603 CASAVA_Build 16 54738918 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2753 het 1214 hom 17 4 9 4 A 13 14 98604 CASAVA_Build 16 54743784 1I AGGAAGCCGC -/A AATACAGCAG 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 A 2 3 98605 CASAVA_Build 16 54753978 3D CAGAATTGAA TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 hom 38 13 19 8 TTC 4 3 98606 CASAVA_Build 16 54756450 1D AAATGATGGG C/- CCTGTTCATA 3070 het 3070 hom 38 10 20 8 C 3 2 98607 CASAVA_Build 16 54759375 1D GCCCCTACTC T/- GTGCTGCTCA 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 T 1 0 98608 CASAVA_Build 16 54763280 4D12M11I TTTGAGAGTT TAACTTACTCCTCCAG-----------/----TTACTCCTCCAGTTTCTTTTCTT TCCTCCTCCT 3070 het 3070 ref 40 23 13 7 N/A 0 0 98609 CASAVA_Build 16 54768593 1D TATTTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 12 11 98610 CASAVA_Build 16 54770062 2I ACTGCCCATT --/CC CCCCCCTCTC 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 C 6 8 98611 CASAVA_Build 16 54770880 2I CTGTTGATAT --/TG TCTTTTGATG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 TG 0 1 98612 CASAVA_Build 16 54774047 1D CGAACCAGAC T/- TTTTTTTTTT 2925 het 631 hom 17 3 8 6 T 13 12 98613 CASAVA_Build 16 54780230 1I ATGCTTTCTG -/T TAAGTCTGGG 3070 het 3070 ref 56 31 22 3 T 1 2 98614 CASAVA_Build 16 54786488 1D TTACTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1441 het 651 hom 40 6 6 28 T 19 18 98615 CASAVA_Build 16 54821217 1D AACCATGACT A/- AACAGAATGC 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 3 2 98616 CASAVA_Build 16 54821537 1D CCATAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 12 11 98617 CASAVA_Build 16 54833621 3I GGAGAAGAAG ---/GAA GAAGATGAAA 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 GAA 1 2 98618 CASAVA_Build 16 54836551 1D TTTTATAGAT A/- AAAAAAAAAA 839 het 839 ref 30 23 3 4 A 11 10 98619 CASAVA_Build 16 54852135 1I GGGCATGACC -/A CGCTATCATG 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 0 1 98620 CASAVA_Build 16 54873783 1D ATTATTCTCA T/- TTATTTGTCT 3070 het 3070 ref 51 31 15 6 T 3 2 98621 CASAVA_Build 16 54880447 2I ATCCAAAAAA --/AG GGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 AG 0 1 98622 CASAVA_Build 16 54886316 3I3M1D GGCCATGCGT ---ATAT/TACATA- CTTCTCTTGT 3070 het 3070 hom 50 23 25 6 N/A 0 0 98623 CASAVA_Build 16 54901212 1I GTGCCTGCTG -/T TGCTGGGTGC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 1 2 98624 CASAVA_Build 16 54901464 1D GTGGCTTATA C/- CTATAATCCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 2 1 98625 CASAVA_Build 16 54921893 1I ATCCATTACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 9 10 98626 CASAVA_Build 16 54931700 2I ACACCAAGGC --/CA CACAGCAAGC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 CA 2 3 98627 CASAVA_Build 16 54939046 1D GGGCTCCCCC T/- GGAACAGAAG 1605 het 1605 ref 11 6 5 0 T 1 0 98628 CASAVA_Build 16 54945763 9D TTGGTGCAAA AGTAATTGC/--------- AGTAATTGCA 2596 het 2596 ref 20 9 7 5 AGTAATTGC 2 1 98629 CASAVA_Build 16 54961416 1I12M4I TATGAAAGGT -GGAAAGGTAGGG----/AGGGAGGGGAGGGGAGT AGGGGAGGGC 706 het 706 ref 23 10 2 14 N/A 0 0 98630 CASAVA_Build 16 54963426 1D TTCCCCCATC T/- TTTTTTTTTA 1683 het 1683 ref 34 26 4 6 T 10 9 98631 CASAVA_Build 16 54971747 1D CTGAGCATGA C/- CCACGAAACC 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 C 3 2 98632 CASAVA_Build 16 54982309 1D TTTTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 919 hom 33 2 21 11 A 15 14 98633 CASAVA_Build 16 54990024 1D TACAGATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 A 11 10 98634 CASAVA_Build 16 54990448 1D GGTAAATTTT A/- TGTTATATTT 2022 het 2022 ref 18 8 5 5 A 1 0 98635 CASAVA_Build 16 54990496 1D AATTATTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 A 11 10 98636 CASAVA_Build 16 55008310 1D GCTAACCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 552 hom 32 3 21 9 A 15 14 98637 CASAVA_Build 16 55010469 2D CAGAGTCTCA CT/-- CTGTCGCCCG 1477 het 1477 ref 23 9 5 9 CT 2 1 98638 CASAVA_Build 16 55020616 2I TTAACCAAAC --/TT TTACTTTACA 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 T 2 4 98639 CASAVA_Build 16 55046067 1D TTGGGGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 10 7 A 10 9 98640 CASAVA_Build 16 55049013 1I CTCCAATGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 10 98641 CASAVA_Build 16 55100093 1D4M1D GTCTTGTTCT CGTTGC/-GTTG- CCCTGGGTGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 N/A 0 0 98642 CASAVA_Build 16 55110170 15D GCCTTGTCTG TTAGCTTCTGGACTA/--------------- TAAGCTTTCT 2804 het 2804 ref 43 33 9 6 TTAGCTTCTGGACTA 1 0 98643 CASAVA_Build 16 55120738 1D CCCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 1300 het 1300 ref 34 23 3 9 A 13 12 98644 CASAVA_Build 16 55125348 1D TCAGCACTCC T/- TTTTTTTTTT 876 het 575 hom 25 5 7 14 T 19 18 98645 CASAVA_Build 16 55126840 1I TTTATTGGAG -/A AAAAAAAAAA 1295 het 1295 ref 40 31 3 6 A 10 11 98646 CASAVA_Build 16 55130083 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2685 het 26 hom 23 0 8 15 A 15 14 98647 CASAVA_Build 16 55132913 1I TGTAATCCCA -/T TTACTCAGGA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 2 3 98648 CASAVA_Build 16 55133169 2I ATCTAAAAGC --/CG CTCTCCCTTT 3070 het 3070 ref 29 21 8 0 CG 0 1 98649 CASAVA_Build 16 55145839 4D AACAAAAGAC AGAT/---- GGAGTGCAAG 3070 het 3070 hom 30 12 18 0 AGAT 1 0 98650 CASAVA_Build 16 55147063 1I CCATTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 15 16 98651 CASAVA_Build 16 55147654 1I CAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1777 hom 46 6 34 6 A 11 12 98652 CASAVA_Build 16 55148253 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1566 hom 17 6 9 2 T 12 13 98653 CASAVA_Build 16 55157477 1I ACCCTTTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 454 hom 29 1 16 12 A 9 10 98654 CASAVA_Build 16 55157939 8D AGAAAGAACG GAAGGAAA/-------- GAAGGAAAGA 2245 hom 18 het 10 0 7 3 GAAGGAAA 3 2 98655 CASAVA_Build 16 55173255 1D ATATGTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 23 16 11 T 11 10 98656 CASAVA_Build 16 55176065 1D GCAATTCCGT A/- AAAGTTTGCT 3070 hom 97 het 38 0 32 7 A 4 3 98657 CASAVA_Build 16 55189307 1I TAAAGTGGTT -/A AACCACTTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 3 98658 CASAVA_Build 16 55194971 4D26M1I ACTCCATCTC AAATAAATAAATAAATAAATAAACAAAATT-/----AAATAAATAAATAAATAAACAAAATTA AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 22 0 24 3 N/A 0 0 98659 CASAVA_Build 16 55211986 1I GGTGAGGCGG -/T GGGGGGTAAG 1771 hom 15 het 6 0 6 0 T 0 1 98660 CASAVA_Build 16 55213298 2D TTTAGCAAAG AC/-- ACTGGTGGCA 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 AC 2 1 98661 CASAVA_Build 16 55215960 8I TCTTTTTTTC --------/TTTTCTTT CTTTCTTTCT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 TTTTCTTT 0 1 98662 CASAVA_Build 16 55222083 4I GCATAGGGGA ----/TATT TATTTATTTA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TATT 3 4 98663 CASAVA_Build 16 55226032 1I TTTAATTTTA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 7 8 98664 CASAVA_Build 16 55226191 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 2409 het 2194 hom 18 7 7 4 T 9 10 98665 CASAVA_Build 16 55228410 1D ACAACCTGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 10 9 98666 CASAVA_Build 16 55230938 2I ACTGAGGCCA --/AG AGAGTGCACC 3070 hom 122 het 45 0 40 5 AG 2 3 98667 CASAVA_Build 16 55231770 1D TTAGTATGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 98668 CASAVA_Build 16 55232270 1D GTGTGGTGGT G/- TTCATTAGGA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 1 0 98669 CASAVA_Build 16 55234519 7D TCTGGCCTGT TGCTGTG/------- TGCTGTGAAA 3070 het 3070 ref 40 18 15 12 TGCTGTG 2 1 98670 CASAVA_Build 16 55237053 1D GAAAGCAGCC T/- TGGGCAAAGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 1 98671 CASAVA_Build 16 55241278 1D TAAAATGGTA T/- TTTTACTGTA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 5 4 98672 CASAVA_Build 16 55241797 4D CTGAGGGAGC TTGT/---- TTAACTCTTT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 TTGT 1 0 98673 CASAVA_Build 16 55241918 2D CTCCAGAACT GA/-- GAGAAATATA 3070 het 3070 hom 43 18 19 8 GA 3 2 98674 CASAVA_Build 16 55247729 1I TATTTTTATG -/A AAAGCAAACT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 3 4 98675 CASAVA_Build 16 55255366 5I ATTGTATGTT -----/AAGTA AAATACAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 AAGTA 0 1 98676 CASAVA_Build 16 55268488 15D CACCAGCTCC TGCAAATGCAGAGAG/--------------- TGCAAATGCA 3070 het 3070 hom 41 15 15 16 TGCAAATGCAGAGAG 1 0 98677 CASAVA_Build 16 55273572 1I ACAGTGGAGC -/G GGGGGCTGGG 3070 hom 55 het 24 0 13 11 G 5 6 98678 CASAVA_Build 16 55276860 2D GGTTTCATAA CT/-- CTGTTTTGGG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CT 2 1 98679 CASAVA_Build 16 55276991 1I GCATCCTGTT -/C CATCCCTCAC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 C 1 2 98680 CASAVA_Build 16 55277090 1D AGTCATTCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 80 het 34 0 26 8 T 10 9 98681 CASAVA_Build 16 55291471 1I TCCTTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 24 1 17 6 A 11 12 98682 CASAVA_Build 16 55293113 1I GAAGAGACAC -/G GGGAGCTCAA 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 G 3 4 98683 CASAVA_Build 16 55309696 1I ACCCTACTTC -/A AAAAAAAATA 2916 het 2916 ref 17 8 8 1 A 8 9 98684 CASAVA_Build 16 55319482 1I GGTTTCACCA -/T TTTGCCCAGG 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 T 3 4 98685 CASAVA_Build 16 55338966 1I CATGAGTATT -/A AAAAAAAAAA 1130 het 1130 ref 39 24 4 11 A 13 14 98686 CASAVA_Build 16 55375417 1D TTACACTGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 9 8 98687 CASAVA_Build 16 55385823 5I TTATAGTAAA -----/TATTT TAAAGACCAG 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 TATTT 0 1 98688 CASAVA_Build 16 55394002 1D ATCACGTGTC A/- TATGTGTATG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 1 0 98689 CASAVA_Build 16 55400828 1I ATTATCTTTT -/A AAAAGCAGTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 4 5 98690 CASAVA_Build 16 55427585 1I TTGCTGTGTG -/T TTTTTTCAGC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 6 7 98691 CASAVA_Build 16 55436216 1I TTTTTTTTTT -/C CTTTGAAATT 3070 het 3055 hom 33 10 16 7 C 1 2 98692 CASAVA_Build 16 55437601 6D AAGGCAGGTG ATCACC/------ TGAGATCAGG 2111 het 2111 ref 14 8 5 1 ATCACC 1 0 98693 CASAVA_Build 16 55438383 20D CAGGGGATGA GGTTCTTTGACCTGTAGATG/-------------------- GGTCCTAAAA 3070 het 3070 hom 30 16 19 2 GGTTCTTTGACCTGTAGATG 1 0 98694 CASAVA_Build 16 55440366 2D ACCCAGGGAA AG/-- AGGATATTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 AG 2 1 98695 CASAVA_Build 16 55447945 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 8 9 98696 CASAVA_Build 16 55473462 1D AGTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 820 hom 18 het 10 0 7 3 A 15 14 98697 CASAVA_Build 16 55486431 1D AGAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2845 hom 18 8 8 2 A 11 10 98698 CASAVA_Build 16 55488505 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 36 1 26 9 A 13 14 98699 CASAVA_Build 16 55490699 3I AGGCCGAGGC ---/AGG AGGATCACCC 3070 hom 51 het 20 0 16 5 AGG 1 2 98700 CASAVA_Build 16 55492468 2D CCACAGAGTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 47 18 18 11 CT 6 5 98701 CASAVA_Build 16 55493103 1I GCACAGAAGA -/C CCCCCAGCAG 3070 het 1421 hom 20 4 10 6 C 5 6 98702 CASAVA_Build 16 55494180 3D CTGCCCGGAG TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 hom 53 het 33 0 20 13 TCC 8 7 98703 CASAVA_Build 16 55495018 8D AGTGCAAGGT CCAGAATC/-------- CCTTACCCAC 3070 het 3070 hom 58 25 29 6 CCAGAATC 1 0 98704 CASAVA_Build 16 55495181 1I CCCACGCAAG -/T TTTGGGGACT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 3 4 98705 CASAVA_Build 16 55498777 3D AGGCTGAGAC AGG/--- AGAATTGCTT 3070 het 581 hom 19 2 15 2 AGG 1 0 98706 CASAVA_Build 16 55500730 1I AAAAGAAAGC -/A AAAAAAAAAA 2769 het 2769 ref 33 12 9 12 A 13 14 98707 CASAVA_Build 16 55501209 1D TGAGGAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2447 hom 31 10 14 9 A 12 11 98708 CASAVA_Build 16 55501676 1I19M1D AACCTCTTTG -TTTTTTTTTGTTGTTGTTGT/TTTTTTTTTTGTTGTTGTTG- TTTTTCTCTT 2188 het 2188 ref 26 15 8 7 N/A 0 0 98709 CASAVA_Build 16 55503097 1D GATGGAACTT C/- CAAGTGTGAC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 2 1 98710 CASAVA_Build 16 55505333 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2370 hom 22 7 11 4 T 10 9 98711 CASAVA_Build 16 55516764 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1636 het 1043 hom 22 5 6 11 T 17 16 98712 CASAVA_Build 16 55519604 1I GGAGGTGGAG -/T TTGCAGTGAG 3070 het 3045 hom 22 9 8 5 T 2 3 98713 CASAVA_Build 16 55521517 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2667 het 2667 ref 21 11 7 3 A 11 12 98714 CASAVA_Build 16 55529031 1D ACCCTTTCCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 T 8 7 98715 CASAVA_Build 16 55529976 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 19 0 14 5 A 15 14 98716 CASAVA_Build 16 55532567 2D AACAGAAAAC TG/-- TATTTGTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 TG 1 0 98717 CASAVA_Build 16 55533277 3I TTTAGTTCGT ---/ATA CATAAGCATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATA 0 1 98718 CASAVA_Build 16 55539002 1I CAAAGTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1084 hom 30 7 11 12 A 12 13 98719 CASAVA_Build 16 55551896 2D AGTTATTTGG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3065 hom 27 9 15 3 T 11 9 98720 CASAVA_Build 16 55563801 1D TGGATTGTGG C/- CCCCCCCCAG 2557 het 2557 ref 22 7 7 8 C 9 8 98721 CASAVA_Build 16 55567153 1D TCACCTCACT C/- CCCCCACCCA 3070 het 1974 hom 36 7 21 8 C 6 5 98722 CASAVA_Build 16 55572837 12D GAATGGAGGG CTGCCAGGAAGA/------------ AGGGCCTGGC 3070 het 393 hom 25 5 14 6 CTGCCAGGAAGA 1 0 98723 CASAVA_Build 16 55585378 1I TGTTTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 1402 het 1402 ref 30 15 6 9 A 16 17 98724 CASAVA_Build 16 55587021 4I GTGGGATGGA ----/CCCT TCCTGTACCA 3070 hom 120 het 44 0 39 5 CCCT 0 1 98725 CASAVA_Build 16 55597333 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2110 het 2110 ref 22 10 5 7 A 10 11 98726 CASAVA_Build 16 55599947 1I ACCAAGCAAG -/A AAAAAATCTC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 6 7 98727 CASAVA_Build 16 55603134 1D ACCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 19 1 15 3 A 15 14 98728 CASAVA_Build 16 55604747 4I AAAACCTCTC ----/ATAG ATAGATTTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATAG 1 2 98729 CASAVA_Build 16 55613797 9D CCAAGCTGGA GGAGGCTGT/--------- GGAGGCTGTG 2117 het 2117 ref 32 15 10 8 GGAGGCTGT 2 1 98730 CASAVA_Build 16 55619060 1D CTCCCATTTT G/- CTCCATTATC 3070 hom 129 het 49 0 42 8 G 1 0 98731 CASAVA_Build 16 55627506 1I TGGGCCCCCC -/T GTCTCAGCCT 3070 hom 110 het 42 0 34 8 T 0 1 98732 CASAVA_Build 16 55629998 10D CTCATTATCT TAAAAGATTA/---------- TAAAAGATTA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TAAAAGATTA 2 1 98733 CASAVA_Build 16 55630353 1D GTCTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 812 het 812 ref 21 9 4 8 A 19 18 98734 CASAVA_Build 16 55632881 1I CAGCACTGTG -/T TTTTTGTCCC 3070 het 3070 ref 39 14 13 12 T 5 6 98735 CASAVA_Build 16 55635297 1D14M1D TCCTTAGAGA TTTTTTTTTTTAGGAT/-TTTTTTTTTTAGGA- TTTTTTTTTA 3070 het 2394 hom 23 8 12 4 N/A 0 0 98736 CASAVA_Build 16 55675910 1D GTTAGGAGGC G/- ATGCTGGGGC 3070 het 3070 hom 43 16 22 7 G 1 0 98737 CASAVA_Build 16 55701638 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2063 het 1673 hom 40 10 10 20 T 18 16 98738 CASAVA_Build 16 55711853 1D AGACCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2316 het 1229 hom 18 4 7 7 A 15 14 98739 CASAVA_Build 16 55726694 1D GCGGGGGATC A/- GGGGGAGGCA 2113 het 1658 hom 18 7 7 4 A 1 0 98740 CASAVA_Build 16 55730066 1I TCCCTGACCA -/C CTATATGAAG 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 C 1 2 98741 CASAVA_Build 16 55759918 1I ATTTTTATTT -/A AAAAAAAAAT 2185 het 2185 ref 17 7 6 4 A 9 10 98742 CASAVA_Build 16 55771765 1D CACTTTGGGA G/- GCTGAGGCAG 3070 het 1402 hom 15 3 10 2 G 2 1 98743 CASAVA_Build 16 55773860 1I AAAATAAAAC -/A AAAAAAACGC 3070 het 2491 hom 26 8 11 7 A 7 8 98744 CASAVA_Build 16 55823183 2D TTTTAGCAGA CT/-- CGGCTTTATT 3070 het 3070 ref 56 30 25 2 CT 1 0 98745 CASAVA_Build 16 55868856 4D TACAAAAATT AGTC/---- AGGCCATGGT 2730 het 2203 hom 12 6 6 3 AGTC 1 0 98746 CASAVA_Build 16 55872715 2I TTTTCTCACC --/TG TAAAATGGGG 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 TG 0 1 98747 CASAVA_Build 16 55873642 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2919 het 1128 hom 30 7 10 13 T 13 11 98748 CASAVA_Build 16 55877089 1I GGCTCCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 20 15 15 T 10 11 98749 CASAVA_Build 16 55877916 1I GCCCAACTAA -/T TTTTTTTTTT 1390 het 770 hom 19 7 4 8 T 15 16 98750 CASAVA_Build 16 55879305 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 A 7 8 98751 CASAVA_Build 16 55883528 1I GAATGGTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 T 9 10 98752 CASAVA_Build 16 55884740 3I ATGCTTTTCT ---/TTC TTTTCTTTCT 1427 hom 14 het 15 0 8 7 TTC 0 1 98753 CASAVA_Build 16 55889458 2D GCCGGTTCCT CA/-- CACGTCACAG 3070 het 3070 ref 57 21 19 17 CA 2 1 98754 CASAVA_Build 16 55894130 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 18 0 13 5 A 13 14 98755 CASAVA_Build 16 55918262 1D ATGTCCTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 A 10 9 98756 CASAVA_Build 16 55920091 1D TCCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1236 het 1236 ref 27 6 4 17 T 17 16 98757 CASAVA_Build 16 55938219 8D AGAGTCCAGA AATAAATG/-------- AATACATTTA 2261 het 2261 ref 19 11 5 6 AATAAATG 1 0 98758 CASAVA_Build 16 55942118 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1680 het 756 hom 18 4 7 7 T 16 15 98759 CASAVA_Build 16 55946212 1I GCCATCCAAG -/T TAGCTGGGAC 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 T 1 2 98760 CASAVA_Build 16 55950009 1D ACAGAGTTGA G/- GGGGGGTCCC 3070 het 3039 hom 29 13 12 4 G 7 6 98761 CASAVA_Build 16 55954278 5D TCAAAAAATA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 AAAAC 4 3 98762 CASAVA_Build 16 55954410 1I CCTCTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 845 het 845 ref 43 29 3 11 T 11 12 98763 CASAVA_Build 16 55961775 5D TAATGAGATA GATGG/----- GGGTGATCAT 3070 het 3070 hom 28 10 14 7 GATGG 1 0 98764 CASAVA_Build 16 55970740 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1822 hom 20 7 10 3 A 13 12 98765 CASAVA_Build 16 55972071 2I GACAGGAAAC --/AG GACCATTTCG 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 AG 0 1 98766 CASAVA_Build 16 55979276 10D CAGGGGAGAC AGAGAGAGAG/---------- AGAGAGAGAA 1133 het 1007 hom 16 5 4 7 AG 9 4 98767 CASAVA_Build 16 56015740 1D CGTCCAGCCT A/- AAGAAATAGA 3070 het 3070 ref 29 17 9 5 A 3 2 98768 CASAVA_Build 16 56051304 6D ACACTTTGCT CATTTG/------ CATTTGTGAT 3070 het 3070 ref 55 31 20 4 CATTTG 2 1 98769 CASAVA_Build 16 56074558 1I CAAAATGGTG -/T GGCAAAGAGG 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 T 0 1 98770 CASAVA_Build 16 56083507 1D TTGTAGCCAG A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 A 7 6 98771 CASAVA_Build 16 56098075 1D CGAAAAAAAA T/- AAAAAGAATG 3070 het 3070 hom 31 10 13 11 T 1 0 98772 CASAVA_Build 16 56098478 1I TTATGAAGGT -/A AAAAATTAAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 5 6 98773 CASAVA_Build 16 56129910 2D CCCAGCTAAC TT/-- GGGAGGCAGA 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 T 2 0 98774 CASAVA_Build 16 56131234 2D TGTGTGCGTG TA/-- TATATATATA 2739 het 2739 ref 27 10 9 9 TA 7 6 98775 CASAVA_Build 16 56133388 1D GCCAGGCCCA G/- GTCCTCTCTG 3070 het 3070 ref 36 19 10 8 G 2 1 98776 CASAVA_Build 16 56137226 1D CTCACATGTG C/- AAGTTCACCA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 C 1 0 98777 CASAVA_Build 16 56141396 1D CATCTATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 8 T 11 10 98778 CASAVA_Build 16 56143442 3I GAAATAAATC ---/TAT TTTTTTTTTT 3070 het 3057 hom 27 13 11 3 TAT 0 1 98779 CASAVA_Build 16 56171677 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 6 A 11 10 98780 CASAVA_Build 16 56178938 4I CCATCCCCCC ----/CTCT CTCTGTTTCT 1424 het 1424 ref 12 5 5 2 CT 2 4 98781 CASAVA_Build 16 56181179 1I TTTATTTTAC -/T TTTTTTTTTT 1019 het 1019 ref 20 9 5 6 T 17 18 98782 CASAVA_Build 16 56189304 1D GATTTCCTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 10 9 98783 CASAVA_Build 16 56189746 12D CATCTGCCTT TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 675 hom 24 4 11 11 TG 14 8 98784 CASAVA_Build 16 56199756 1D GGTGCACCTC T/- TTTTTTTTTT 2291 het 2291 ref 29 11 8 10 T 13 12 98785 CASAVA_Build 16 56219145 3D CTCATTGCTC GGA/--- GGAGGAGGGC 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 GGA 3 2 98786 CASAVA_Build 16 56266493 1I CACAGTAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1019 hom 21 4 13 4 A 10 11 98787 CASAVA_Build 16 56307916 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 33 0 16 17 A 15 14 98788 CASAVA_Build 16 56315203 1D38M2I GTAATATACA TTTTTTTTAAATGATCAACCTCATTTGGAAGTTGATAAT--/-TTTTTTTAAATGATCAACCTCATTTGGAAGTTGATAATAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 11 12 N/A 0 0 98789 CASAVA_Build 16 56322114 2I GTCTTGCCCC --/CT GTTCTGATCT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 CT 0 1 98790 CASAVA_Build 16 56323498 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 8 10 98791 CASAVA_Build 16 56325434 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 1524 het 656 hom 8 2 5 1 T 7 6 98792 CASAVA_Build 16 56355411 2D CTCAGGGCTA AC/-- ACAGATAACT 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 AC 2 1 98793 CASAVA_Build 16 56374887 3I TTTCTTTTCT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 TTC 0 1 98794 CASAVA_Build 16 56405136 8I GCACCACTCA --------/TGCAGGTG CGCTTGGCAT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 TGCAGGTG 0 1 98795 CASAVA_Build 16 56406332 1I TGGCCTATTA -/T TTGCCATTCT 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 T 2 3 98796 CASAVA_Build 16 56414364 1D ATTCTAAGGT C/- CCCCCCAACC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 C 7 6 98797 CASAVA_Build 16 56444163 7D CTGTAAGCTC CCGTGAG/------- CCGTGAGCCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CCGTGAG 2 1 98798 CASAVA_Build 16 56444353 1I GACATAGAAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 T 7 8 98799 CASAVA_Build 16 56446035 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 334 hom 18 1 14 3 A 15 14 98800 CASAVA_Build 16 56448801 1I AAAACCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 30 0 19 11 T 13 14 98801 CASAVA_Build 16 56454965 1D TAAGAAAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 18 hom 35 2 26 7 A 10 9 98802 CASAVA_Build 16 56458993 2D TATGATAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 12 10 98803 CASAVA_Build 16 56459555 6I GGCCTAAAAA ------/AAAAAT ATATATATTT 3070 hom 30 het 11 0 9 2 AAAAAT 0 1 98804 CASAVA_Build 16 56461081 2I AAAAAAAACA --/AC AAAAAAAAAA 3070 het 580 hom 33 3 20 10 AC 0 1 98805 CASAVA_Build 16 56473742 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 19 4 A 10 9 98806 CASAVA_Build 16 56474675 4D TCTTTGTTTT TTTG/---- TTTGTGTACG 3070 hom 143 het 53 0 47 6 TTTG 2 1 98807 CASAVA_Build 16 56492465 1D AGGTGGAGTT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 79 het 36 0 24 13 G 10 9 98808 CASAVA_Build 16 56496767 1D CATTTTCCAG A/- GAGTGAAACT 2961 het 2961 ref 27 11 10 7 A 1 0 98809 CASAVA_Build 16 56506339 1I GGAGACAGAT -/G GACCTGCATT 3070 het 3070 hom 53 20 30 3 G 1 2 98810 CASAVA_Build 16 56512531 1I CTTTTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 13 10 T 11 12 98811 CASAVA_Build 16 56548625 1D ACCCTAACTG C/- CCCCCTGTGT 3070 hom 63 het 26 0 19 8 C 6 5 98812 CASAVA_Build 16 56551011 4D GGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 6 AAAC 5 4 98813 CASAVA_Build 16 56556529 4D ATGTGTGCAT ACTC/---- ACTCTCATGC 3070 het 3070 ref 75 41 31 6 ACTC 2 1 98814 CASAVA_Build 16 56556634 2D ATGCATATAT AC/-- ACACACATGC 3070 hom 233 het 85 0 76 11 AC 4 3 98815 CASAVA_Build 16 56557063 13I ATGTGTATAT -------------/ACACATACACATG ACACATTCAC 3070 het 3070 ref 65 32 25 8 ACACATACACATG 0 1 98816 CASAVA_Build 16 56560012 10D AATGAAAACA CTAATTGTGT/---------- AATATGCATG 2075 het 2075 ref 25 20 5 0 CTAATTGTGT 1 0 98817 CASAVA_Build 16 56597888 1D CATGGCGAAA C/- CCCCATCTCT 1304 hom 7 het 3 0 3 0 C 5 4 98818 CASAVA_Build 16 56611858 4D10M4D CTCTCTTCTC CTCTCTTTCTCTCCTCTG/----CTTTCTCTCC---- TCTCTCTTCC 3070 het 3070 ref 43 23 15 14 N/A 0 0 98819 CASAVA_Build 16 56656024 1D CCTTTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 7 3 4 1 A 12 11 98820 CASAVA_Build 16 56663840 1I AAACCTCTTT -/C CTTTATAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 C 1 2 98821 CASAVA_Build 16 56666114 1D AAAAAAACAA C/- AAAAAAAAAG 2512 het 2512 ref 18 9 7 3 C 1 0 98822 CASAVA_Build 16 56668874 6D TTCATCTGAA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 het 3070 ref 42 22 16 6 AAC 6 4 98823 CASAVA_Build 16 56678912 2D CACACACTCG CA/-- CACACGCACT 3070 het 3070 ref 88 42 31 15 CA 3 2 98824 CASAVA_Build 16 56679088 4D11M2I AGGTACACAT ACACACACTAACATT--/----ACACTAACATTCA CACACACGCA 3070 het 3070 ref 81 49 30 10 N/A 0 0 98825 CASAVA_Build 16 56679229 2I CGCTCATACT --/AA GTCACACCCA 3070 het 3070 ref 84 48 28 8 A 0 2 98826 CASAVA_Build 16 56679339 4I CATGCACACA ----/CAAT CATGCACTCA 1620 het 1620 ref 67 36 7 24 CAAT 0 1 98827 CASAVA_Build 16 56679353 1D CACTCACACA C/- CACACACACA 1617 het 1617 ref 62 38 6 18 C 2 1 98828 CASAVA_Build 16 56679426 6D CACTCTCAAA CACACT/------ CACACATTCA 3070 het 3070 ref 43 23 10 11 CACACT 1 0 98829 CASAVA_Build 16 56683932 10I AAATAGGGAG ----------/ATCAAGTCGA ATTTGTTTTA 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 ATCAAGTCGA 0 1 98830 CASAVA_Build 16 56798274 1I ATTTTCCCCC -/G GGGGGCCTTT 2855 het 2658 hom 20 8 8 4 G 5 6 98831 CASAVA_Build 16 56801086 2D TTTTGTATTT TG/-- TTAGTGGAGA 1474 het 1474 ref 18 7 4 7 TG 1 0 98832 CASAVA_Build 16 56803373 19D CCGATTGTGT GCAAAATTGGTGTCTGTGC/------------------- GCAAAATTGG 3070 hom 102 het 35 0 35 9 GCAAAATTGGTGTCTGTGC 2 1 98833 CASAVA_Build 16 56813193 1I TGATTACTGA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 7 8 98834 CASAVA_Build 16 56822209 1D ATTGACTGTT G/- GGGAAAAAGG 3070 het 2296 hom 33 9 13 11 G 4 3 98835 CASAVA_Build 16 56824081 4D GAGCCAAGAT CGCA/---- CGCACCACTG 3070 hom 36 het 15 0 13 4 CGCA 2 1 98836 CASAVA_Build 16 56824756 7D TTGTGGTGGA GTTTGGC/------- TCACCTGGAT 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 GTTTGGC 1 0 98837 CASAVA_Build 16 56825832 3D GGCCAGATAA TTC/--- TTTGCTGTGG 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 TTC 1 0 98838 CASAVA_Build 16 56833748 1I AATGTAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 10 11 98839 CASAVA_Build 16 56843209 4D TCAAAGCTGT TCTC/---- TCTCTCATAT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 TC 5 3 98840 CASAVA_Build 16 56843429 2I ACTGAAAAAC --/AT AAACCAAAGG 3070 hom 87 het 42 0 30 12 AT 0 1 98841 CASAVA_Build 16 56843611 1D CCACCTCTAC A/- AAAAAAATTA 2816 het 2816 ref 23 13 7 3 A 8 7 98842 CASAVA_Build 16 56857002 1D CCACAGCTCT G/- GGCGGACACC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 3 2 98843 CASAVA_Build 16 56864176 1D TCTTAATGGC T/- TTTTTTTTTT 1189 het 1189 ref 43 25 3 15 T 15 14 98844 CASAVA_Build 16 56869033 1I GTTGACAGCA -/C CCATTCTTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 2 3 98845 CASAVA_Build 16 56871080 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 12 11 98846 CASAVA_Build 16 56873415 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2055 het 10 hom 15 1 10 4 T 17 18 98847 CASAVA_Build 16 56875536 1D CTTCTACACA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 9 8 98848 CASAVA_Build 16 56876223 1D AGAGTGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1366 hom 36 4 20 15 T 15 14 98849 CASAVA_Build 16 56877902 1D CTATGAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 858 hom 36 2 25 10 T 14 13 98850 CASAVA_Build 16 56883972 1I TGATGGAGCA -/T CATATGACCA 3070 hom 177 het 67 0 59 8 T 0 1 98851 CASAVA_Build 16 56890846 1D CTTTCTCATT C/- CATCCTTCAT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 C 2 1 98852 CASAVA_Build 16 56897856 1I ATATACACAA -/T TTTTTTTTTT 1201 het 1201 ref 45 31 5 9 T 15 16 98853 CASAVA_Build 16 56914778 1I CTAATAGGTA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 9 98854 CASAVA_Build 16 56919175 1D ACCTCTGCCT C/- CCCGGGTTCA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 C 4 3 98855 CASAVA_Build 16 56922589 4D ATTCAATCAC TCAT/---- TCATTCATTC 3070 het 3070 hom 48 19 21 11 TCAT 5 4 98856 CASAVA_Build 16 56926355 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 2974 het 2974 ref 28 9 8 11 A 9 10 98857 CASAVA_Build 16 56997533 4I GGTAATACAC ----/AAAT AAATCCATGT 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 AAAT 1 2 98858 CASAVA_Build 16 57021916 1D ACCAGACAGG A/- ACGCTTCTGG 2565 het 2565 ref 34 14 8 12 A 2 1 98859 CASAVA_Build 16 57025387 1D GATGTGCTGT G/- GGGGGACCAT 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 G 6 5 98860 CASAVA_Build 16 57026204 3D CTGCACTGAA TCC/--- TCCTGATCAG 2801 het 2801 ref 23 11 10 2 TCC 2 1 98861 CASAVA_Build 16 57027876 1D AGTGTGAAAC A/- AAATTCTTTG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 4 3 98862 CASAVA_Build 16 57028213 10D CATCTCAGAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 41 20 18 7 AAAAG 5 3 98863 CASAVA_Build 16 57029800 4D GTTTGTTCCC GTGT/---- GTGTACCCTG 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 GT 4 2 98864 CASAVA_Build 16 57045651 4I TAGGATTTGG ----/GGGT GGGGGGGGGG 3070 het 32 hom 23 1 12 10 GGGT 0 1 98865 CASAVA_Build 16 57048957 1I AAATAGTTCA -/T TCCCCGGCCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 98866 CASAVA_Build 16 57088967 1D CATGAGGATT A/- TATGTATTAT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 A 1 0 98867 CASAVA_Build 16 57142248 1I ATAAATACTC -/T TGAATAGTCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 1 2 98868 CASAVA_Build 16 57144930 1I AACTGCATTA -/T CAGGTTAAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 0 1 98869 CASAVA_Build 16 57149421 1D CAAACAAACG A/- AAAAAAACCT 3070 hom 56 het 24 0 19 5 A 8 7 98870 CASAVA_Build 16 57155765 2D AAAAAGAAAC TG/-- TTCCAAAAAG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 TG 1 0 98871 CASAVA_Build 16 57158897 1D ATTTAAAAAA T/- AGGCATGCAT 3070 hom 45 het 17 0 16 4 T 1 0 98872 CASAVA_Build 16 57167204 1D TTCTATCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 9 98873 CASAVA_Build 16 57168497 1D ATTCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 34 1 24 9 T 13 12 98874 CASAVA_Build 16 57180098 1D CAGCTACAAT C/- ACTTCCGGAT 3070 hom 96 het 33 0 33 1 C 1 0 98875 CASAVA_Build 16 57187687 1I AGCATCCAGG -/A AGGCACTCTG 3070 hom 168 het 71 0 55 16 A 1 2 98876 CASAVA_Build 16 57191678 16I GCTTGAACCA ----------------/GGGATGTGGAGGTTGC GGTGAGCCGA 3070 hom 60 het 21 0 20 2 GGGATGTGGAGGTTGC 0 1 98877 CASAVA_Build 16 57197796 1D CCCGTCCCTT A/- AAAAAACAAA 3070 hom 62 het 26 0 21 6 A 7 6 98878 CASAVA_Build 16 57200073 2I ACTTGCACAC --/AT GTTTACAGCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AT 0 1 98879 CASAVA_Build 16 57200777 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 65 het 23 0 18 5 A 9 10 98880 CASAVA_Build 16 57203226 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 32 0 16 16 A 16 14 98881 CASAVA_Build 16 57203456 1D GGCCAACCTC A/- AAACACTCCT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 4 3 98882 CASAVA_Build 16 57210712 3D4M2I GCTAAAGAAC TTGTTAA--/---TTAAAC AACTCAAGTC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 N/A 0 0 98883 CASAVA_Build 16 57212423 1D AAAAGATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 23 3 T 11 10 98884 CASAVA_Build 16 57214596 1D CTCTGCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 11 10 98885 CASAVA_Build 16 57241588 1D GTCTCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 24 0 14 10 T 11 10 98886 CASAVA_Build 16 57278331 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 26 1 20 5 A 14 13 98887 CASAVA_Build 16 57293221 2I CAAATTTCTC --/TT GAGTGTATAC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 0 2 98888 CASAVA_Build 16 57294910 2D TTTTTATGTC TT/-- GTTTAAGAAA 3070 hom 44 het 21 0 16 5 T 2 0 98889 CASAVA_Build 16 57332110 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 588 het 481 hom 7 2 3 2 T 13 14 98890 CASAVA_Build 16 57352919 1D AATTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1248 het 1248 ref 32 28 3 2 T 11 10 98891 CASAVA_Build 16 57391491 1I GATTTGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 10 11 98892 CASAVA_Build 16 57408369 1D TCCAGATCCC A/- GGATGTAGGA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 1 0 98893 CASAVA_Build 16 57424459 1D AATTGCCCCC T/- TTTTTTTTTC 1679 het 1679 ref 31 24 4 4 T 10 9 98894 CASAVA_Build 16 57436691 1D GAGAATTGTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 9 8 98895 CASAVA_Build 16 57440449 1D GGACATTTAT C/- CATAGATTTT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 C 2 1 98896 CASAVA_Build 16 57440771 1I ATTTCTGTAT -/G TTTTTTTGTG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 0 1 98897 CASAVA_Build 16 57440902 5I AAAGACTGAC -----/AAAAG AAAACTAAAA 3070 het 3070 hom 37 18 19 0 AAAAG 0 1 98898 CASAVA_Build 16 57441386 1I GAGTAGGTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 8 98899 CASAVA_Build 16 57443827 1D AAACTGTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 A 10 9 98900 CASAVA_Build 16 57447218 1D TAGCAGAAAC T/- TTTTCACTCC 3070 het 3070 hom 46 19 21 7 T 5 4 98901 CASAVA_Build 16 57452064 1I ACTCATCTGT -/A GGCTGTCAGT 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 A 0 1 98902 CASAVA_Build 16 57453623 1D GGTGGTGGGC A/- AAAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 A 4 3 98903 CASAVA_Build 16 57458016 4I TGTGACTTCT ----/TAAC TAACAGGTGT 3070 het 3070 hom 64 27 31 6 TAAC 1 2 98904 CASAVA_Build 16 57458423 3I ATCTGAAATA ---/AGT AAGGGAGGAA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 AGT 0 1 98905 CASAVA_Build 16 57458657 1I GAATAGGTAA -/C TACGGTAAAC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 C 0 1 98906 CASAVA_Build 16 57460141 1D GTGCACAATA T/- TTTTTTTTTT 1286 het 1286 ref 37 22 4 11 T 13 12 98907 CASAVA_Build 16 57463422 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 1155 hom 14 3 9 2 T 8 9 98908 CASAVA_Build 16 57474658 1I TGGTGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 9 9 20 T 15 16 98909 CASAVA_Build 16 57475509 4D TTTATGGCTG CATA/---- CATAGTATTC 3070 het 3070 ref 44 19 18 12 CATA 2 1 98910 CASAVA_Build 16 57478161 3D ACAGCAGCAG CAA/--- CAACAACAAC 3070 het 3070 ref 55 25 24 7 CAA 5 4 98911 CASAVA_Build 16 57478704 5I AGTGAAAGAA -----/GTTAG GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 GTTAG 0 1 98912 CASAVA_Build 16 57483837 1I ACCACCATCA -/C CCCCCACTAC 2608 het 2608 ref 46 21 11 14 C 5 6 98913 CASAVA_Build 16 57484339 3D CAGCTAGCCC CCA/--- CATCATCACC 3070 het 3070 ref 53 21 20 18 CCA 1 0 98914 CASAVA_Build 16 57484442 1D TAACTATCAC A/- ATCCTCCATC 3070 het 3070 ref 66 37 22 7 A 2 1 98915 CASAVA_Build 16 57485039 2I ATTTTTTGTA --/TT TTTTTTTTTG 2441 het 2441 ref 19 10 7 2 T 9 11 98916 CASAVA_Build 16 57486493 1I AGTTTAGTAC -/A TTTTTTTTTT 2491 het 2491 ref 32 16 8 8 A 0 1 98917 CASAVA_Build 16 57495089 1I GGCATGCTTC -/T TTTTTTTTTT 2809 het 2809 ref 28 14 7 7 T 11 12 98918 CASAVA_Build 16 57496299 1D TAGTATTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 A 10 9 98919 CASAVA_Build 16 57504657 1D GATATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 13 12 98920 CASAVA_Build 16 57504743 1I GCAACCTCCA -/C CCCCCCAGGC 3033 het 2574 hom 14 6 8 0 C 6 7 98921 CASAVA_Build 16 57506783 1D AAGCTCTTTA G/- TTTAATTAGA 3070 het 1972 hom 17 5 9 3 G 1 0 98922 CASAVA_Build 16 57509606 1I GCAACCACTG -/C GTTTTTTTTG 2215 het 2215 ref 20 12 7 1 C 0 1 98923 CASAVA_Build 16 57527070 5D CCTACATAAA GAGTG/----- GCACAACGTG 3070 hom 87 het 30 0 30 2 GAGTG 1 0 98924 CASAVA_Build 16 57529535 5I ATGATTGGCT -----/AAATA AAATACCAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAATA 1 2 98925 CASAVA_Build 16 57531898 4D TTTCTTATAA TCAC/---- TCACTCATTT 3070 hom 60 het 25 0 21 6 TCAC 2 1 98926 CASAVA_Build 16 57533913 1D CAGGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 T 11 10 98927 CASAVA_Build 16 57536078 1D AAAATACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 26 10 T 12 11 98928 CASAVA_Build 16 57543115 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 24 0 14 11 A 17 16 98929 CASAVA_Build 16 57545427 1I TATTTTCTTA -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 T 6 7 98930 CASAVA_Build 16 57546947 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1376 hom 28 5 17 6 T 13 12 98931 CASAVA_Build 16 57549543 1D AGAATCTGAC A/- GACTGGCCAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 5 A 1 0 98932 CASAVA_Build 16 57551234 8D CCGTGTAGGG GTGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 3070 hom 153 het 52 0 51 2 GT 13 9 98933 CASAVA_Build 16 57559211 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTTT 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 GT 5 4 98934 CASAVA_Build 16 57560316 3D GACAGAATTC CTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 25 8 4 CTT 1 0 98935 CASAVA_Build 16 57580176 1I AAAAAGCAAA -/G GAGAAATAAA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 G 1 2 98936 CASAVA_Build 16 57580605 1I TAAAGGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 A 10 11 98937 CASAVA_Build 16 57581586 2D CACAATCAGT AG/-- AGACTATTAT 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 AG 2 1 98938 CASAVA_Build 16 57587499 3D GATCTATTGC ACA/--- ACAACAGGGT 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 ACA 3 2 98939 CASAVA_Build 16 57588265 1D CCAGATTAGT G/- GGAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 G 3 2 98940 CASAVA_Build 16 57590292 1I GAAAGATGAG -/A AAAAAAAAAA 1639 het 250 hom 20 2 9 9 A 11 12 98941 CASAVA_Build 16 57590380 32D CCATTTTACT TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC/-------------------------------- TATCTATCTA 1999 het 1999 ref 21 11 6 6 TATC 12 4 98942 CASAVA_Build 16 57592891 1I TGAATTTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 1540 hom 13 4 7 2 T 8 9 98943 CASAVA_Build 16 57600770 1D AACCCAGGTC T/- TGCTTGATGG 3070 het 3070 ref 52 27 19 7 T 2 1 98944 CASAVA_Build 16 57601708 3D AGATAAAATA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 AAT 7 6 98945 CASAVA_Build 16 57628715 1I CTCTTAGTTG -/T AAACCTGCTC 3070 hom 84 het 30 0 27 3 T 0 1 98946 CASAVA_Build 16 57635197 4D TAAAAATAAA AAAC/---- AAAAGACTTT 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 AAAC 1 0 98947 CASAVA_Build 16 57636970 6D CACAGAGTTT CTATGA/------ CTTACCCAAG 3070 het 3070 ref 56 34 18 8 CTATGA 1 0 98948 CASAVA_Build 16 57645879 56D TTAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------------------------- ATATATATAT 1640 het 47 hom 4 1 4 1 AAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 98949 CASAVA_Build 16 57646632 1I TCACTCAAAG -/C CTACATAACT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 C 1 2 98950 CASAVA_Build 16 57648215 9I TTCTCATTTG ---------/ACTCTCAGA ACAACTCTCA 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 ACTCTCAGA 0 1 98951 CASAVA_Build 16 57650502 22I ATGATTGCAT ----------------------/TGCTTTTGCCAAAATTACCATC TGTGGCTTAG 3070 het 3070 hom 45 21 21 5 TGCTTTTGCCAAAATTACCATC 0 1 98952 CASAVA_Build 16 57656980 1I CCATTATGCC -/A CTGTTACACA 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 A 0 1 98953 CASAVA_Build 16 57657466 2D ATTTTAAGTC TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 T 10 8 98954 CASAVA_Build 16 57671458 1D TACTCTTAGC A/- CAAGCAAGGT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 1 0 98955 CASAVA_Build 16 57716732 1I CCTACCATTC -/T TTTTTTTTTT 1677 het 1336 hom 22 5 6 11 T 12 13 98956 CASAVA_Build 16 57718010 5D ACATTGTCAT AAATC/----- AAAACAGTCT 3070 het 3070 ref 43 21 20 4 AAATC 1 0 98957 CASAVA_Build 16 57723143 1I TGTTGAAGGA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 T 6 7 98958 CASAVA_Build 16 57727383 3D GCACGGTAGC TCA/--- TCATGACTGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TCA 2 1 98959 CASAVA_Build 16 57731540 5D TTGTTTCACT TAATA/----- TAATGACCTC 3070 het 3070 ref 51 27 21 4 TAATA 1 0 98960 CASAVA_Build 16 57737719 1I CTTTTCTAAG -/A AAAGAAGAAA 3070 het 3070 hom 61 23 29 9 A 3 4 98961 CASAVA_Build 16 57741884 1D TATTCTTTCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 2396 hom 23 7 9 7 T 8 7 98962 CASAVA_Build 16 57741932 1D AAACTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 20 1 12 7 T 15 14 98963 CASAVA_Build 16 57751027 1D CTTTGTTGGC A/- GGGGTGAGGG 3070 het 3070 ref 55 25 25 7 A 1 0 98964 CASAVA_Build 16 57754597 1I GTACCTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 17 9 T 13 14 98965 CASAVA_Build 16 57759365 1I TGCTTAAGAC -/T TTAAAATGTC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 2 3 98966 CASAVA_Build 16 57766451 5D AAATCAAGAT ATATC/----- ATGTTATTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 ATATC 1 0 98967 CASAVA_Build 16 57779540 1D GTTGTTGTGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 116 het 45 0 43 3 G 11 10 98968 CASAVA_Build 16 57788562 1D CCTCTCCATT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 46 het 24 0 14 10 C 10 9 98969 CASAVA_Build 16 57793891 1I CCTTTCCACT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 7 8 98970 CASAVA_Build 16 57841650 31D ATATACACAT ATATATGTATACACATAATATATATATACAC/------------------------------- ATATATATGT 3070 hom 63 het 21 0 22 6 ATATATGTATACACATAATATATATATACAC 1 0 98971 CASAVA_Build 16 57848931 1I GAAGGCCTAT -/G AAAGGAGGAA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 0 1 98972 CASAVA_Build 16 57853429 1I TTGCTCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1748 hom 37 5 26 6 T 11 12 98973 CASAVA_Build 16 57879747 5D TTTATTGATC TATGT/----- TATAAGTATA 3070 hom 78 het 27 0 27 2 TATGT 1 0 98974 CASAVA_Build 16 57885582 1I ACATGATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1922 hom 41 4 28 9 T 10 11 98975 CASAVA_Build 16 57891688 1I GTGTATTCAG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 6 7 98976 CASAVA_Build 16 57896698 10D CAGTATAGTC TTTTTTGTTT/---------- TTTTTTGTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 9 TTTTTTGTTT 2 1 98977 CASAVA_Build 16 57899775 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 26 0 18 8 A 14 16 98978 CASAVA_Build 16 57903319 3D GGGGTAGATT CAA/--- CACTGCTTAA 3070 het 2575 hom 18 7 8 3 CAA 1 0 98979 CASAVA_Build 16 57907352 1D TCTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 131 hom 25 2 13 10 T 17 16 98980 CASAVA_Build 16 57927801 2I CATGCAAGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 41 0 29 12 A 12 14 98981 CASAVA_Build 16 57929334 1D GTGTGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 A 13 12 98982 CASAVA_Build 16 57939956 1D AGTGGGCCTT A/- ACTACATCTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 1 98983 CASAVA_Build 16 57959962 2I TGAACACCTT --/GA GAGATTTCAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GA 2 3 98984 CASAVA_Build 16 57982671 1D TCATGGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2535 hom 28 9 11 8 A 13 12 98985 CASAVA_Build 16 57988070 43D ATAAGAGAAG TTGGGTTCTAACTCTAGTTCTGCTCCTTTAAACATGTATGCCT/------------------------------------------- TTGGGTTCTA 3070 hom 36 het 19 0 12 15 TTGGGTTCTAACTCTAGTTCTGCTCCTTTAAACATGTATGCCT 2 1 98986 CASAVA_Build 16 58009233 2I TTATGTATAT --/TA TATATATATA 2665 hom 18 het 9 0 7 2 TA 8 9 98987 CASAVA_Build 16 58014454 1I TATTTGAATA -/T TTTATCTAAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 3 4 98988 CASAVA_Build 16 58014800 1I ATGATCCTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 8 9 98989 CASAVA_Build 16 58015366 6I GATACATCTA ------/TATCTG TATCTATATC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TATCTG 0 1 98990 CASAVA_Build 16 58025905 1I TTCAAAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 26 1 18 7 A 12 13 98991 CASAVA_Build 16 58027075 1I TTTTGGCCTT -/A TTTTTTTCAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 98992 CASAVA_Build 16 58032354 4I TTTCTTTTTC ----/TTCT TTCTTTCTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TTCT 3 4 98993 CASAVA_Build 16 58038763 1D TATTTTGTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 359 hom 25 1 17 7 T 9 8 98994 CASAVA_Build 16 58039081 1I GGCATCCTTG -/T TTTGTGCTGG 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 3 4 98995 CASAVA_Build 16 58040955 1D TCACTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1046 het 1046 ref 34 21 3 10 T 13 12 98996 CASAVA_Build 16 58041379 1I TGTATGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 441 hom 26 1 21 4 T 9 10 98997 CASAVA_Build 16 58045102 1D CATTTTCTTG A/- GTTCATAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 1 0 98998 CASAVA_Build 16 58047347 5I GGAGATGCCT -----/GTTAA GTTTTTTCAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GTTAA 0 1 98999 CASAVA_Build 16 58054921 2D AAACTCTGAG TT/-- TTTCTCTCTC 3070 hom 72 het 33 0 25 9 T 5 3 99000 CASAVA_Build 16 58068786 4D AAATAAAGAG AAAT/---- AAATAAAGTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 AAAT 2 1 99001 CASAVA_Build 16 58070965 1D TTCTAATATC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 T 8 7 99002 CASAVA_Build 16 58082190 1D GCTAAAGAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 9 16 13 T 10 9 99003 CASAVA_Build 16 58082728 3I ATTATTATAC ---/TTA TTATCGTATT 3070 het 2146 hom 17 5 8 4 TTA 1 2 99004 CASAVA_Build 16 58093134 3I TCCACAACAA ---/AAG AAACGATAGA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 AAG 0 1 99005 CASAVA_Build 16 58096284 5I AAGAAAGTCC -----/ACTTT CTTTCCCTTA 3070 het 3070 hom 46 16 26 4 ACTTT 0 1 99006 CASAVA_Build 16 58104281 2I AAAAAAAAAT --/AA AAAAAAAAAT 1389 hom 12 het 5 0 5 0 A 9 11 99007 CASAVA_Build 16 58135621 3D TGCAAATAAA ATT/--- ATATTTCTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 ATT 1 0 99008 CASAVA_Build 16 58137789 1I AACCTGCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 544 hom 27 5 14 8 A 12 13 99009 CASAVA_Build 16 58150640 1D ATCACATTTC T/- TTTTTTTTTT 1831 het 24 hom 12 1 7 4 T 16 15 99010 CASAVA_Build 16 58159258 1D GATCCCCCCC A/- ACATATCCCA 3070 het 2312 hom 28 8 15 5 A 2 1 99011 CASAVA_Build 16 58162975 1D TATGTAGAGA T/- TATATAAATC 3070 het 3070 ref 34 17 17 0 T 2 1 99012 CASAVA_Build 16 58163268 1I TCTGATAAGC -/T GTGTGATTTT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 T 0 1 99013 CASAVA_Build 16 58166591 4I ATTTAAAAAA ----/TATT TAAACTTTAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TATT 0 1 99014 CASAVA_Build 16 58181331 1D CCCTCAGTCT G/- GGTGGGCACA 3070 het 3070 ref 58 31 23 4 G 3 2 99015 CASAVA_Build 16 58183193 3I GCCCATCCTC ---/CTT CTTGTATGCC 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 CTT 1 2 99016 CASAVA_Build 16 58185250 14D GTCTTTCTTC ATATTTCTTTTTTT/-------------- TATTTTCAGA 3070 het 3070 ref 43 28 13 3 ATATTTCTTTTTTT 1 0 99017 CASAVA_Build 16 58189564 10D CTTTCTTTTC TTTCTTTCTT/---------- TTTCTTTCTT 2848 het 2639 hom 32 9 9 16 TTTCTTTCTT 2 1 99018 CASAVA_Build 16 58190176 5D TTTACAAGTA AAGTT/----- AAATCAGTTT 3070 het 2660 hom 14 6 8 1 AAGTT 1 0 99019 CASAVA_Build 16 58190776 4I AAAATATCAT ----/AAAC ATATATAATA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 AAAC 0 1 99020 CASAVA_Build 16 58194604 2I AATTTACCTA --/AC ACAGAGAATC 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 AC 1 2 99021 CASAVA_Build 16 58208798 1I CAGAGGAAGT -/G GGGGGGGGTG 2755 het 2755 ref 29 16 7 6 G 8 9 99022 CASAVA_Build 16 58216331 1D AATGGTCAGA T/- TTTTTAGGTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 6 5 99023 CASAVA_Build 16 58218055 1I ATTTCTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 11 12 99024 CASAVA_Build 16 58222113 1D CTAATCCTTA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 8 7 99025 CASAVA_Build 16 58230846 2I AGTTTTCCCC --/CT GTGGTGAGAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 CT 0 1 99026 CASAVA_Build 16 58235829 5D GATTTCTGCC CTTAT/----- CTTTATTATT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 CTTAT 1 0 99027 CASAVA_Build 16 58248674 1D TTATATAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 9 8 99028 CASAVA_Build 16 58255092 1D TGATGTCCTG T/- TTTTTTTTGG 1241 het 1241 ref 45 35 3 7 T 9 8 99029 CASAVA_Build 16 58264116 16I TTTGCTCTTT ----------------/AAGCTTCTTAAGCTTC AAGCTTCTTA 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 AAGCTTCTTAAGCTTC 0 1 99030 CASAVA_Build 16 58266169 1I TTGCCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 T 10 11 99031 CASAVA_Build 16 58267247 1D CAAACTGTTG T/- TATCAACAGA 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 T 2 1 99032 CASAVA_Build 16 58270623 5I AAATCTCCAC -----/TCTTA TCTTGCTGGT 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 TCTTA 0 1 99033 CASAVA_Build 16 58274125 1I GAAATATAAA -/G GATTTAATTT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 G 1 2 99034 CASAVA_Build 16 58280364 1D AAAAGGCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 T 11 10 99035 CASAVA_Build 16 58288889 1I ACACACACAC -/A CCCCCCCCCC 860 het 161 hom 24 2 5 17 A 0 1 99036 CASAVA_Build 16 58294005 4I TAGTTAGAAA ----/AGGT ACACAGTGGC 3070 het 3070 ref 59 30 21 8 AGGT 0 1 99037 CASAVA_Build 16 58294435 1D TCTGTCCCCC T/- GATACAGCAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 1 0 99038 CASAVA_Build 16 58298177 1D CTTTTTCTAA C/- CTTTCTTCCT 1374 het 1374 ref 21 13 3 5 C 2 1 99039 CASAVA_Build 16 58301987 1I CCCTTGTTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 A 9 10 99040 CASAVA_Build 16 58318596 2I TCTCCTTTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2917 hom 27 8 14 5 A 12 14 99041 CASAVA_Build 16 58335509 1D CCAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 53 het 22 0 17 5 T 1 0 99042 CASAVA_Build 16 58347377 1D CCCGGCCCAG T/- TTTTTTTAAT 2039 het 527 hom 9 3 5 1 T 8 7 99043 CASAVA_Build 16 58356408 1I CTGTAAAAAA -/G GATGAGTTCA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 G 1 2 99044 CASAVA_Build 16 58357699 4D TCAATTTACT TAAA/---- TAAAAAGTAG 3070 het 3070 ref 38 23 15 0 TAAA 2 1 99045 CASAVA_Build 16 58359104 1D CTATCGTCGA G/- GGGCATTTGG 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 G 4 3 99046 CASAVA_Build 16 58362282 1I AGATGATGCT -/A AACATCCTAT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 A 2 3 99047 CASAVA_Build 16 58364460 1I AAATGATGTC -/T GTAGTATTGT 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 T 0 1 99048 CASAVA_Build 16 58371680 1D CTGGCTTAGA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 8 7 99049 CASAVA_Build 16 58376279 11D ATCCCTTTCC AACAGTGAAAA/----------- AACTTGCTTC 3070 het 3070 ref 53 27 25 8 AACAGTGAAAA 1 0 99050 CASAVA_Build 16 58387573 1D ACCAAGTCTT A/- AAAGACAAAG 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 A 4 3 99051 CASAVA_Build 16 58396841 1I TTCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2611 hom 24 6 11 7 T 11 12 99052 CASAVA_Build 16 58400300 1I AGATTGTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 9 10 99053 CASAVA_Build 16 58420072 2I AGGGAAGGAC --/AG AGGATGAAAG 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 AG 1 2 99054 CASAVA_Build 16 58435244 2D CAAAATTTTT TA/-- TCTCTTATAA 2875 het 2875 ref 20 10 8 2 TA 1 0 99055 CASAVA_Build 16 58440723 7I GAAAATGCTT -------/GTGTACC GTGTACCGGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 GTGTACC 1 2 99056 CASAVA_Build 16 58457806 1D TCAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 A 10 9 99057 CASAVA_Build 16 58471706 1D ACATTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 13 12 99058 CASAVA_Build 16 58499477 1I GGAAAACAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 8 9 99059 CASAVA_Build 16 58519494 1I AAGAATAGGA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 T 7 8 99060 CASAVA_Build 16 58535299 12D ATTGGATGGC TTTGTTTGTTTG/------------ TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 63 24 21 18 TTTG 7 4 99061 CASAVA_Build 16 58546193 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 11 10 99062 CASAVA_Build 16 58549188 1I TGGACTCATC -/T CTTTTATATG 1423 het 633 hom 5 2 3 0 T 0 1 99063 CASAVA_Build 16 58559053 1D GCAAAATTCT C/- AGACTCTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 C 1 0 99064 CASAVA_Build 16 58561696 11D CTCCCTAATT AAAGAAAAAAG/----------- AAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 19 11 3 AAAGAAAAAAG 2 1 99065 CASAVA_Build 16 58564302 4I GTGCCTTAAA ----/TATC TATATTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 TATC 0 1 99066 CASAVA_Build 16 58564636 3I CTCTGGTTTT ---/ATG ATTTTGTAAT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 ATG 0 1 99067 CASAVA_Build 16 58565152 4I TTCCTGGTGG ----/AAGT AAGTTGGATA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 AAGT 1 2 99068 CASAVA_Build 16 58565976 1I ACTTTGCTGA -/T TTTTTCCACT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 5 6 99069 CASAVA_Build 16 58574018 1I AAAGTGTAAT -/A AAAAAAATAA 2482 hom 15 het 8 0 6 2 A 7 8 99070 CASAVA_Build 16 58577262 1D AAAAGGGGGC A/- AAGGACTTCA 3070 het 3070 hom 39 12 22 7 A 3 2 99071 CASAVA_Build 16 58579138 4D TTAGTCATTA TTAT/---- TTAAAGGCTA 2434 het 2434 ref 16 9 6 2 TTAT 1 0 99072 CASAVA_Build 16 58580532 1D ATTTTTATGA C/- CCCCCCAGTT 3070 het 3070 hom 58 26 26 6 C 7 6 99073 CASAVA_Build 16 58590550 2D TTTTTCGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1246 het 597 hom 19 6 5 8 T 16 14 99074 CASAVA_Build 16 58592967 5D ATGATATGAT AGAAA/----- AGAAAAGAAA 3070 het 2642 hom 26 7 17 3 AGAAA 3 2 99075 CASAVA_Build 16 58602562 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 A 9 8 99076 CASAVA_Build 16 58603740 5I CATAAGAATA -----/GAAAT AAGAATGGCC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 GAAAT 0 1 99077 CASAVA_Build 16 58604047 1D TCTTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 A 13 12 99078 CASAVA_Build 16 58610383 1I TGTGCAGAAG -/C TTTTAAGTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 0 1 99079 CASAVA_Build 16 58611269 1I AATTTAAGAG -/T TTTTTTGTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 7 99080 CASAVA_Build 16 58612806 1I CAATAGCTAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 8 9 99081 CASAVA_Build 16 58616192 1I TAATCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 T 11 12 99082 CASAVA_Build 16 58626246 11I ACAATTTTTA -----------/GAAAGAGTCTT GAAACATTAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 GAAAGAGTCTT 0 1 99083 CASAVA_Build 16 58626911 2D AAATGGAAAA CT/-- CTGAGCAGAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 CT 2 1 99084 CASAVA_Build 16 58628393 3D CTTCAATCTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 29 3 10 17 A 15 12 99085 CASAVA_Build 16 58628709 5I TTTATTTCTG -----/TTCTT TGTGATCTAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TTCTT 0 1 99086 CASAVA_Build 16 58638550 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1482 het 606 hom 22 6 6 10 T 19 18 99087 CASAVA_Build 16 58648107 3I CTGCCTCAGC ---/TGG CTTCCAAAGT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 TGG 0 1 99088 CASAVA_Build 16 58662256 1D GTTAAAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2235 hom 33 7 14 12 A 13 12 99089 CASAVA_Build 16 58680141 26I CATGCTAAAC --------------------------/TGCCCAAGGAAGCTCTTATGATTGTT TGCTAATAAA 3070 het 3070 ref 45 29 15 3 TGCCCAAGGAAGCTCTTATGATTGTT 0 1 99090 CASAVA_Build 16 58683649 1D TAAATTGGGG A/- TACATGCTTA 3070 het 3070 hom 36 11 24 1 A 1 0 99091 CASAVA_Build 16 58687759 1I TGGTCTCCTC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 T 7 8 99092 CASAVA_Build 16 58695586 1I CTATGACACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 9 10 99093 CASAVA_Build 16 58695727 1D CTACCCCCAA C/- AAATATTAAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 6 C 1 0 99094 CASAVA_Build 16 58699020 1D ATTGGGGAAG T/- TTCTCTTGGA 3070 het 3070 hom 52 19 27 6 T 3 2 99095 CASAVA_Build 16 58703054 2D ACAAAGTAAC AG/-- AAAATATTTC 3070 het 3070 ref 42 26 15 1 AG 1 0 99096 CASAVA_Build 16 58709252 1D TTCTAACCAT A/- AGTTATTTAT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 2 1 99097 CASAVA_Build 16 58717631 2D GTATATTCAC AG/-- AGTTGTACAA 3070 het 3070 ref 48 23 22 6 AG 2 1 99098 CASAVA_Build 16 58732764 4D TTGAAGAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 48 21 22 8 AAAC 4 3 99099 CASAVA_Build 16 58734413 1D TATAATTTTC T/- TTTTTTTTTA 2648 het 2648 ref 29 15 9 7 T 10 9 99100 CASAVA_Build 16 58736857 1I GGAAAAAAAA -/C ACCCTCTCCT 3070 hom 44 het 26 0 18 8 C 0 1 99101 CASAVA_Build 16 58737160 1D GACACTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1566 hom 28 7 11 10 T 13 12 99102 CASAVA_Build 16 58742452 1I CTAGTGCAAT -/A AAATGGTGAT 3070 het 3070 hom 49 15 26 8 A 3 4 99103 CASAVA_Build 16 58754671 1D TGTGAAGCCC A/- ACAAATCTCT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 2 1 99104 CASAVA_Build 16 58755081 6D ACTAGCTATT TTTTAC/------ CTTACAAATT 3070 het 3070 hom 40 16 24 3 TTTTAC 1 0 99105 CASAVA_Build 16 58757257 1I TCACAGACAC -/T ACCAGGAGAG 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 T 0 1 99106 CASAVA_Build 16 58759998 4D TAAAAAGTCA ACAG/---- ACAAACAACA 3070 het 3070 hom 42 16 22 8 ACAG 1 0 99107 CASAVA_Build 16 58774283 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2864 het 2082 hom 25 8 10 7 T 12 11 99108 CASAVA_Build 16 58777061 1D CCTCATCTCT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 A 9 8 99109 CASAVA_Build 16 58790625 1D CCTGCCAATG A/- AAACTAGGAG 3070 hom 42 het 23 0 18 6 A 4 3 99110 CASAVA_Build 16 58790869 10D CTGCCTCCTT GTGAAGAATG/---------- GTGCATAATG 3070 hom 103 het 38 0 34 7 GTGAAGAATG 1 0 99111 CASAVA_Build 16 58797986 3I CTGATTTTGG ---/AGA AGAACAAATC 3070 hom 163 het 63 0 55 8 AGA 1 2 99112 CASAVA_Build 16 58799590 1D ACTGGCATCC A/- CAAAGACTTG 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 A 1 0 99113 CASAVA_Build 16 58803706 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2824 hom 22 8 11 6 A 10 9 99114 CASAVA_Build 16 58809174 1D AGAGAGGAAA C/- CCCCAGTGCA 3070 het 3070 ref 38 17 13 9 C 5 4 99115 CASAVA_Build 16 58809636 1D TGTTTCAAAC A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 27 10 13 6 A 8 7 99116 CASAVA_Build 16 58822872 3D AAAGTAATAT TAA/--- TATTTATTCA 3070 het 3070 ref 37 19 16 5 TAA 1 0 99117 CASAVA_Build 16 58829283 1I AGCATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 339 hom 21 1 14 6 T 11 12 99118 CASAVA_Build 16 58830965 1I CGTAGACAAA -/T TTCACTTTCA 3070 hom 110 het 42 0 37 5 T 2 3 99119 CASAVA_Build 16 58831838 4D AATTTTTGTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1481 het 431 hom 9 3 4 2 T 18 14 99120 CASAVA_Build 16 58834293 1I GTTTCTATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 9 10 99121 CASAVA_Build 16 58836473 1D CTGTCTATAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 A 8 7 99122 CASAVA_Build 16 58837887 2D TGAGCACTGA CT/-- CTCTCTATCA 3070 het 3070 hom 56 19 31 7 CT 4 3 99123 CASAVA_Build 16 58839884 1I ACCTCTCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 9 10 99124 CASAVA_Build 16 58840480 14I30M2D GGGGACTTTC --------------ATATTAATAAATACAAAAAAAAATAAATACAA/CTATTCTCTTGAAAATATTAATAAATACAAAAAAAAATAAATAC-- GAGATATATA 3070 het 3070 hom 27 14 17 6 N/A 0 0 99125 CASAVA_Build 16 58845127 1I AACACTTAGA -/T TCCCCCCAAA 3070 het 2296 hom 22 7 10 5 T 1 2 99126 CASAVA_Build 16 58847126 1D AAACAGAATT A/- AACCAACACA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 3 2 99127 CASAVA_Build 16 58853989 1D TTGCTTTTTA T/- TTTAATAAGG 3070 het 3070 hom 28 9 19 0 T 4 3 99128 CASAVA_Build 16 58854292 1D AGTATTCTAA C/- CTTTTTATAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 1 99129 CASAVA_Build 16 58855978 1I GATCATACCA -/T TTGCACTCCA 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 T 2 3 99130 CASAVA_Build 16 58858028 2I GAGTTTGGAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 141 hom 46 1 34 11 GT 5 6 99131 CASAVA_Build 16 58859842 2I AAAAATAAAG --/AA AAAATATATA 1698 het 1698 ref 20 13 4 3 A 4 6 99132 CASAVA_Build 16 58861425 1I CCTATTTTTT -/C TAAGCCCTAC 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 C 0 1 99133 CASAVA_Build 16 58865037 2I TGTGTATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 50 17 24 9 TG 5 6 99134 CASAVA_Build 16 58868186 1I TGAATTCAAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 A 6 7 99135 CASAVA_Build 16 58868763 1D TTATTTACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 12 11 99136 CASAVA_Build 16 58871368 1I AAAATAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 A 10 11 99137 CASAVA_Build 16 58875002 2D AAAAAAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3008 hom 37 14 10 13 T 18 16 99138 CASAVA_Build 16 58876127 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2585 het 999 hom 23 5 9 9 T 15 14 99139 CASAVA_Build 16 58876557 2D TGTATCGATA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 AT 7 6 99140 CASAVA_Build 16 58882956 1I AAATAAAAAT -/A AAAACGAAAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 4 5 99141 CASAVA_Build 16 58907829 1D TGCGTCCTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 11 10 T 10 9 99142 CASAVA_Build 16 58912821 1D TCTTGCTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 10 9 99143 CASAVA_Build 16 58919333 11I GCTTTCCACA -----------/CCACACTAAAT GTTGTTTATC 3070 het 3070 hom 42 14 24 5 CCACACTAAAT 0 1 99144 CASAVA_Build 16 58927702 1D TTTTTTTTTT A/- TTTTTTGGAG 2902 het 2902 ref 30 16 11 3 A 1 0 99145 CASAVA_Build 16 58929002 3I GTCATTAATC ---/ATT ATTTATCCAG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 ATT 1 2 99146 CASAVA_Build 16 58940493 4D TCAGTATGTG TGTT/---- TGTTTCTATA 3070 het 3070 ref 75 41 32 3 TGTT 2 1 99147 CASAVA_Build 16 58948119 1D ATGCAATAAA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 7 6 99148 CASAVA_Build 16 58952247 1I TTATTTACAA -/G TTCATAGTAG 1735 het 1735 ref 57 43 4 10 G 0 1 99149 CASAVA_Build 16 58957793 2D GACTTTTATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2023 hom 31 9 11 11 T 16 14 99150 CASAVA_Build 16 58971259 1I TGTCATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 T 11 12 99151 CASAVA_Build 16 58972296 1D CTTGGTGGGA C/- CCATTGCAGG 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 C 3 2 99152 CASAVA_Build 16 58972630 3I AGTTCCTTTG ---/TTC TTCTTGTCCC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TTC 1 2 99153 CASAVA_Build 16 58978582 1D TTTGGGTTTT A/- CGTTTAACTC 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 A 1 0 99154 CASAVA_Build 16 58981014 1D ATTACTCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 11 10 99155 CASAVA_Build 16 58991871 1D TCAAAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1649 hom 29 5 12 12 T 15 14 99156 CASAVA_Build 16 58993115 1I GTTCTCTATA -/T TTTTCTCCTA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 4 5 99157 CASAVA_Build 16 58998289 2I ATATGTATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2658 hom 26 8 15 3 AT 5 6 99158 CASAVA_Build 16 59000338 1I AAAATATTTT -/G TGACTGTAAT 3070 het 3070 hom 56 21 33 2 G 0 1 99159 CASAVA_Build 16 59006340 1I GGGAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 11 12 99160 CASAVA_Build 16 59009789 1I TTTTCTGAAG -/T TAGTTTTCTG 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 T 1 2 99161 CASAVA_Build 16 59010749 4D AATTACTTGA TCTG/---- TCTAAGACTG 3070 het 3070 ref 27 14 13 2 TCTG 1 0 99162 CASAVA_Build 16 59012866 1I TTTTGCTTTC -/T TTTTGCTAGT 2696 het 2696 ref 32 20 8 4 T 4 5 99163 CASAVA_Build 16 59022282 3D GGGTCTACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2996 het 2996 ref 26 11 8 8 T 15 12 99164 CASAVA_Build 16 59023184 1I AAATATGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 11 14 T 10 11 99165 CASAVA_Build 16 59023358 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2528 hom 28 7 10 11 T 9 10 99166 CASAVA_Build 16 59025494 2I AAATGTGTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 TG 0 1 99167 CASAVA_Build 16 59026849 1I CGTTTCTATT -/A TTATTATAAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 0 1 99168 CASAVA_Build 16 59029336 1D GTGTATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 T 15 14 99169 CASAVA_Build 16 59033601 1I TATATATATA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 7 8 99170 CASAVA_Build 16 59076074 1D GCTACAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 9 99171 CASAVA_Build 16 59078223 1I GTTAGGTGCA -/T GTTATTTTCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 0 1 99172 CASAVA_Build 16 59078543 9D TTGATTTATT ATATATAAA/--------- ATATATAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 ATATATAAA 2 1 99173 CASAVA_Build 16 59086034 2D CATAGTCATC CT/-- TATAATGGTA 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 CT 1 0 99174 CASAVA_Build 16 59093648 4D TCCATTTTAA TGAT/---- TGATTTATTA 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 TGAT 2 1 99175 CASAVA_Build 16 59095185 4I TTTTCCATAT ----/TCAG TCAAAGATCG 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TCAG 0 1 99176 CASAVA_Build 16 59096648 1I CACTTATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 665 hom 37 3 25 9 A 12 13 99177 CASAVA_Build 16 59098447 6D CTTCACCTCA CTTCTT/------ CTTCTATCTC 3070 het 3070 hom 34 11 14 10 CTT 3 1 99178 CASAVA_Build 16 59102176 4I AATTGCCGAC ----/ACAA ACACCCTTTA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 ACAA 0 1 99179 CASAVA_Build 16 59108898 2D CAAATATTGA AT/-- ATTTTGTGTT 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 AT 2 1 99180 CASAVA_Build 16 59123954 1D ACATCTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 10 9 99181 CASAVA_Build 16 59125554 1D GATGGGGTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 8 99182 CASAVA_Build 16 59128279 2I AATATTGACA --/GT GGGGTGTTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 GT 0 1 99183 CASAVA_Build 16 59136367 1D GCAACTAAGG A/- ATTACATTTT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 A 2 1 99184 CASAVA_Build 16 59138543 4D CCACTTTGAC TTCA/---- TTCAGCATTT 3070 hom 122 het 46 0 41 5 TTCA 2 1 99185 CASAVA_Build 16 59141881 1I TTGAAGAGAC -/T TGTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 T 1 2 99186 CASAVA_Build 16 59147016 1D TCCAGGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 29 1 20 8 T 15 14 99187 CASAVA_Build 16 59149830 1D TTGGTTTTTG T/- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 T 5 4 99188 CASAVA_Build 16 59150254 2D GTAATGGCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 596 hom 39 4 19 16 A 13 11 99189 CASAVA_Build 16 59153133 1D GAGTATGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 15 12 4 T 10 9 99190 CASAVA_Build 16 59154406 1I GGTGACACCC -/A AGCCCATTAT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 A 1 2 99191 CASAVA_Build 16 59161444 1I TTTTATTATT -/A AAAAATAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 5 6 99192 CASAVA_Build 16 59167613 17D ACAATGACCA ATCAAGATTAAAATGTT/----------------- TTACTTTGCA 3070 het 3070 ref 45 22 18 10 ATCAAGATTAAAATGTT 1 0 99193 CASAVA_Build 16 59171274 1D GAGCCTAGGT G/- GACTACTAGG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 G 2 1 99194 CASAVA_Build 16 59171366 1D AGTAGGCAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 405 hom 37 1 33 4 A 10 9 99195 CASAVA_Build 16 59172343 1D TGCCTTAAGT A/- CTTAACTTTT 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 A 1 0 99196 CASAVA_Build 16 59175265 3I AGTGCTGGGG ---/AGA AGGATAGTCA 3070 hom 123 het 50 0 42 8 AGA 0 1 99197 CASAVA_Build 16 59177692 1I AAGAATAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 8 9 99198 CASAVA_Build 16 59178702 3D TTTTCTTGAC CAT/--- ATTTTATAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 CAT 1 0 99199 CASAVA_Build 16 59178814 2I CTCACATCAA --/AC ACATACACAC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 AC 1 2 99200 CASAVA_Build 16 59179606 1D CAACAAGCAA C/- AAAATCATCG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 0 99201 CASAVA_Build 16 59193805 1I AATATCTTAC -/A AAAAAATTTT 3070 hom 42 het 25 0 19 6 A 6 7 99202 CASAVA_Build 16 59198117 2D ACAATGGTCA TT/-- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 T 9 7 99203 CASAVA_Build 16 59212857 1I ATTTTCTTGG -/T CTTTTCTTGT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 0 1 99204 CASAVA_Build 16 59217206 1D AGAGAGGGAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 9 8 99205 CASAVA_Build 16 59218663 1I GGCTCACCCA -/G GGGGGGTTCT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 G 6 7 99206 CASAVA_Build 16 59219491 1D ATTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2326 het 2326 ref 26 9 7 10 A 15 14 99207 CASAVA_Build 16 59221956 14D AAATATCCCC ACATTTCTTTATTA/-------------- ACCTCCCTTA 3070 hom 96 het 31 0 33 2 ACATTTCTTTATTA 1 0 99208 CASAVA_Build 16 59243791 5D AATTACCTTT TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 hom 72 het 32 0 24 10 TTTTC 3 2 99209 CASAVA_Build 16 59256823 1D AGGAATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 38 2 27 9 A 15 14 99210 CASAVA_Build 16 59262814 8I GGAGTCCTTT --------/CTCCTTTG ATTGTTATTG 3070 hom 135 het 47 0 43 4 CTCCTTTG 0 1 99211 CASAVA_Build 16 59263086 1D TCAGAGAGAG A/- AAAATATTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 5 4 99212 CASAVA_Build 16 59263329 1I AAATTACACA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 8 9 99213 CASAVA_Build 16 59273803 1I AGCTGAGCAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 99214 CASAVA_Build 16 59281177 1D TGGACAGCTG T/- CTAGTTGTTG 3070 het 3070 hom 45 13 27 5 T 1 0 99215 CASAVA_Build 16 59281476 1D TTGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 43 1 34 8 T 12 11 99216 CASAVA_Build 16 59283096 18D GTTGATTTTA TATATATATATATATATG/------------------ TATATATATA 3070 hom 57 het 21 0 21 12 TATATATATATATATATG 1 0 99217 CASAVA_Build 16 59286373 1D TTATACTCAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 8 99218 CASAVA_Build 16 59292035 5I CTTTAAATAA -----/AATAT GAGTAACAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AATAT 0 1 99219 CASAVA_Build 16 59303163 1D ATTAGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 T 12 11 99220 CASAVA_Build 16 59304573 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 21 9 9 4 A 10 9 99221 CASAVA_Build 16 59352698 3D AATTTAAAAC AAT/--- AAATGCATAC 3070 het 3070 hom 38 13 20 7 AAT 1 0 99222 CASAVA_Build 16 59363761 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3013 het 825 hom 19 8 8 3 A 17 16 99223 CASAVA_Build 16 59383878 1I CTGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1149 het 1149 ref 36 19 4 13 T 15 16 99224 CASAVA_Build 16 59447153 1D TATGCAAGAA T/- TTTTTTTTGG 1162 het 1162 ref 34 29 3 2 T 9 8 99225 CASAVA_Build 16 59461639 3D TATTTGAAAT ATC/--- ATTTTCTCTA 3070 het 3070 hom 36 14 17 7 ATC 1 0 99226 CASAVA_Build 16 59515149 1I GCATATGTAA -/C TATCCTCGAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 0 1 99227 CASAVA_Build 16 59614530 1I GTTGCTGATC -/T TTATCTATAT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 2 3 99228 CASAVA_Build 16 59660076 3D AGAGAGAGAG AGA/--- AGAAGAGAGA 3070 het 3070 ref 28 14 13 5 AGA 3 2 99229 CASAVA_Build 16 59660931 1D GTTTTAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 9 A 11 10 99230 CASAVA_Build 16 59662716 1D AAGAAAAAAA C/- AATCTCTTTC 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 C 1 0 99231 CASAVA_Build 16 59664930 2D TGGCAAAAAA AG/-- AAAATAGTTT 3070 het 3070 ref 44 22 18 6 AG 1 0 99232 CASAVA_Build 16 59669262 2I ATGAGACCTC --/AA AAAAATAACA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 A 5 7 99233 CASAVA_Build 16 59669362 1D ATTGTAAGAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 4 T 9 8 99234 CASAVA_Build 16 59669666 5I GTTTTAGAAT -----/GTAGA GTAATGTGTC 3000 het 982 hom 20 2 8 10 GTAGA 0 1 99235 CASAVA_Build 16 59670021 4D TATAAATAAA ACTC/---- AACACTAACT 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 ACTC 1 0 99236 CASAVA_Build 16 59674736 1I GGATGCAAGT -/A ATTTATTCAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 1 2 99237 CASAVA_Build 16 59727968 1D GCACCAGGGG A/- AAAAAAAAAA 1276 het 1276 ref 34 26 3 5 A 11 10 99238 CASAVA_Build 16 59797116 1D TTTTTGGACG T/- TTTTTTTTTT 1583 het 1583 ref 32 14 5 13 T 13 12 99239 CASAVA_Build 16 59962322 1D ATGAGTTTTT A/- AAAACTGCAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 A 5 4 99240 CASAVA_Build 16 59995208 2D GTGAGAGTGA AT/-- ATATATATAT 972 het 972 ref 14 6 3 5 AT 10 9 99241 CASAVA_Build 16 60004997 1D TATGGGGGGG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 81 het 40 0 30 10 A 9 8 99242 CASAVA_Build 16 60013188 1I CTCTACATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 646 hom 50 3 40 7 A 11 12 99243 CASAVA_Build 16 60013456 1D TTTTCTTTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 10 9 99244 CASAVA_Build 16 60027285 1D ATTTCAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 31 0 23 8 A 11 10 99245 CASAVA_Build 16 60028559 1I AGCATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 34 0 28 6 T 11 12 99246 CASAVA_Build 16 60063752 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 7 6 99247 CASAVA_Build 16 60064994 2I AAAAAAACAC --/TT AATAAAATGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 2 99248 CASAVA_Build 16 60065160 1I ACAACAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 393 hom 29 1 26 2 T 9 10 99249 CASAVA_Build 16 60066267 1D ATACAGTGAA C/- TTGTTTTTGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 1 0 99250 CASAVA_Build 16 60082317 1I CAACTAACAC -/G TTAGAAAATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 0 1 99251 CASAVA_Build 16 60086774 1D CAAAAACATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 8 99252 CASAVA_Build 16 60087133 4I ACGGCTATCT ----/GTGA GTGTCTTTCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 GTGA 0 1 99253 CASAVA_Build 16 60095921 1D TAAGCAATGT A/- TGGCATCTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 1 0 99254 CASAVA_Build 16 60120591 1I TAGTTTTAAG -/A AAAAAAACAC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 7 8 99255 CASAVA_Build 16 60122253 1I AAAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1986 het 1986 ref 39 24 7 8 A 14 15 99256 CASAVA_Build 16 60126288 1I TTAAGAAAAC -/A GATGTATATA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 0 1 99257 CASAVA_Build 16 60134480 1D ACCATCTGAG T/- TTTTGCTGTC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 5 4 99258 CASAVA_Build 16 60142552 1I GAGCACTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 49 22 20 7 A 9 10 99259 CASAVA_Build 16 60149702 5D TTCTCTATTC TTGCT/----- TTTGAGAATT 3070 het 3070 ref 36 23 10 4 TTGCT 1 0 99260 CASAVA_Build 16 60153934 1D CAAAATACTA C/- ATTGGATTTA 3070 het 3070 ref 46 25 19 3 C 1 0 99261 CASAVA_Build 16 60155433 1D TCACCATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 13 12 99262 CASAVA_Build 16 60161010 1D TTCATTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 30 1 14 15 A 13 12 99263 CASAVA_Build 16 60161677 1I AACACATCTC -/A AAACTCAGTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 3 4 99264 CASAVA_Build 16 60161758 7D2M1D TGAGCCCAGC CATTGGTTCT/-------TC- AGGTCTTTGT 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 N/A 0 0 99265 CASAVA_Build 16 60165526 1D GGCAGAGCAT G/- TGTTCTATTT 3070 het 3070 ref 34 17 9 9 G 1 0 99266 CASAVA_Build 16 60166923 1D TGTAGGGAGC T/- TTTCAGCTCT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 4 3 99267 CASAVA_Build 16 60171655 1D ATTACAAACC T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 8 7 99268 CASAVA_Build 16 60173850 1D GTCTTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 37 1 30 6 T 12 11 99269 CASAVA_Build 16 60174310 1D CATGTTCAAC T/- TTAGTAGTTA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 3 2 99270 CASAVA_Build 16 60174910 1D CTCAGCCCCC G/- CCATTCAGCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 0 99271 CASAVA_Build 16 60175063 1I TTCACACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 30 1 27 2 A 11 12 99272 CASAVA_Build 16 60192327 1I GCCCAGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 11 12 99273 CASAVA_Build 16 60197948 3I TGTTGTGCGG ---/CCA CCACCACCAT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 CCA 3 4 99274 CASAVA_Build 16 60198379 1D TATTCACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 A 10 9 99275 CASAVA_Build 16 60202190 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 41 1 28 12 A 10 11 99276 CASAVA_Build 16 60205192 1I TTATATGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 10 11 99277 CASAVA_Build 16 60210861 1I GGAGACAAAG -/A CTCCAGACCT 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 0 1 99278 CASAVA_Build 16 60222636 4I TGGAGGGAGC ----/GAGA GAGAGAGGGA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 GA 3 5 99279 CASAVA_Build 16 60227950 1I CAGGTCTTTT -/G GGGGGTGGGG 3070 hom 48 het 22 0 16 6 G 5 6 99280 CASAVA_Build 16 60229039 2D ATAATGCTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 TC 10 9 99281 CASAVA_Build 16 60238787 2I CAAAGATGAC --/AT AGCTCTCGAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 AT 0 1 99282 CASAVA_Build 16 60238875 1D TTGGAAAGGT G/- GGGGGGGTGA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 G 8 7 99283 CASAVA_Build 16 60244859 1D TTTTATTATC T/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 T 7 6 99284 CASAVA_Build 16 60245902 1D CCCTTCTATT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 A 9 8 99285 CASAVA_Build 16 60248462 2D TAATTATTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3016 hom 30 9 13 8 T 12 10 99286 CASAVA_Build 16 60258049 1I TGTGCCTTGC -/T GAGAAATGTT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 0 1 99287 CASAVA_Build 16 60267697 3D TTATACTAAT ATC/--- ATAAGGAAGC 3070 het 3070 hom 29 15 13 2 ATC 1 0 99288 CASAVA_Build 16 60274071 1D GAAGTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 32 15 7 A 12 11 99289 CASAVA_Build 16 60282766 1I GTGCATTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 T 11 12 99290 CASAVA_Build 16 60282996 1D GGAGTACGAT C/- TTTAGTAGGA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 C 1 0 99291 CASAVA_Build 16 60293785 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1703 hom 20 7 12 2 A 12 11 99292 CASAVA_Build 16 60316260 1D TGTGAATAAC A/- AATCCAAATT 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 A 3 2 99293 CASAVA_Build 16 60319658 1I AAAATACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 22 11 T 12 13 99294 CASAVA_Build 16 60321401 2I CGTGTGCATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 CA 8 9 99295 CASAVA_Build 16 60410341 1D ACTTGGCTCC T/- TTTTTTTTTT 2321 het 2321 ref 30 14 11 6 T 17 16 99296 CASAVA_Build 16 60457505 7D ACCTGTAGTC CCAGCTA/------- CCAGCTACTT 3070 hom 66 het 26 0 22 6 CCAGCTA 2 1 99297 CASAVA_Build 16 60501744 1I AAGCAGCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1884 hom 31 7 18 6 A 14 15 99298 CASAVA_Build 16 60509484 2I CAACTGTACT --/AA GAGTCATAGA 3070 hom 91 het 34 0 33 1 A 0 2 99299 CASAVA_Build 16 60513433 1D AAGCCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 11 10 99300 CASAVA_Build 16 60557733 2D TCACGATGTC AA/-- GAGATCTAGA 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 A 2 0 99301 CASAVA_Build 16 60570381 1I AAATGAGCCA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 9 99302 CASAVA_Build 16 60571950 1I AAAATTGGGG -/T TCCCCCATCT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 1 2 99303 CASAVA_Build 16 60579645 1D AGCCTAATGC A/- GTGCCCAAGC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 1 0 99304 CASAVA_Build 16 60581238 1I TACAATTTTA -/T TTGTTAAACT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 3 99305 CASAVA_Build 16 60584056 1D AGAAATTAAA T/- TCCCTTGGAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 2 1 99306 CASAVA_Build 16 60586167 1D AACAAATCCT C/- CTACATGATT 3070 het 3070 hom 57 22 29 8 C 2 1 99307 CASAVA_Build 16 60594936 2D AATGCCTGAC TG/-- TGTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 TG 2 1 99308 CASAVA_Build 16 60598318 1D AATCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 14 0 10 4 T 13 12 99309 CASAVA_Build 16 60599007 1I AAGCAAAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 59 27 25 7 A 8 9 99310 CASAVA_Build 16 60600437 1D ATACACACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3023 hom 34 13 17 4 A 14 13 99311 CASAVA_Build 16 60603083 2I TAGTGTTAAA --/AC ACAGATTCTG 3070 het 3070 ref 46 22 16 9 AC 1 2 99312 CASAVA_Build 16 60616785 3D CTTTGTGAAG AGA/--- AGAGCATGTT 3070 het 3070 hom 42 15 22 6 AGA 2 1 99313 CASAVA_Build 16 60617288 3D AATAATATAA TAT/--- TATTATTACT 3070 het 2074 hom 25 6 19 1 TAT 3 2 99314 CASAVA_Build 16 60620145 1D AGATCATCCT A/- AAAAAAAAAA 2249 het 1393 hom 21 5 5 12 A 13 12 99315 CASAVA_Build 16 60623182 2D AATAAAGCTT AA/-- AACTTGATAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 4 2 99316 CASAVA_Build 16 60628857 1I TTCTTACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 9 13 16 A 11 12 99317 CASAVA_Build 16 60631384 4I GGACAGCTTT ----/TTTG TTTGTTTATG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TTTG 1 2 99318 CASAVA_Build 16 60656373 1I TCTATTAAAG -/T TTGGTTTTGT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 2 3 99319 CASAVA_Build 16 60684862 1D CATCCCTAGC A/- AACAGTAAGA 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 A 3 2 99320 CASAVA_Build 16 60689873 2I CCATATTTGA --/TT TTTTTTAAAG 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 6 8 99321 CASAVA_Build 16 60690626 4I TCATTAAAAC ----/ACAG ACAAAGTTAC 3070 hom 144 het 56 0 49 7 ACAG 0 1 99322 CASAVA_Build 16 60690994 1D GCATTAAATG C/- CAAATATTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 C 2 1 99323 CASAVA_Build 16 60706694 1I ATTGATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 35 2 24 9 T 13 14 99324 CASAVA_Build 16 60707567 1D TGTCTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1939 hom 33 6 16 11 T 15 14 99325 CASAVA_Build 16 60708371 1I ATTGAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1038 hom 34 3 27 4 T 13 14 99326 CASAVA_Build 16 60714808 2D CTCTCTCTTT TC/-- TTTCTTTCTT 2381 hom 27 het 24 0 9 15 TC 1 0 99327 CASAVA_Build 16 60714836 1I TTCTTTTTTT -/C TCTTTTTTGA 3070 hom 41 het 27 0 14 13 C 0 1 99328 CASAVA_Build 16 60717723 2I ATGTATTCAG --/TA TATATATATA 2649 hom 15 het 7 0 6 1 TA 6 7 99329 CASAVA_Build 16 60727712 1D GAGTGTTTAT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 9 8 99330 CASAVA_Build 16 60745107 5I TTGTCCACCA -----/CTACT CTACTCTCTT 3070 het 2720 hom 15 6 8 1 CTACT 1 2 99331 CASAVA_Build 16 60746306 3D TCATTAATTT ATA/--- ATGTTATTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 ATA 1 0 99332 CASAVA_Build 16 60749569 2D AAAGTACTAA AT/-- ATAAATATTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 2 1 99333 CASAVA_Build 16 60752627 1I AGAATTCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 928 hom 31 2 25 4 A 9 10 99334 CASAVA_Build 16 60759271 1I TGGCTGGCAA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 99335 CASAVA_Build 16 60763032 5I ACACCATGAC -----/TTTAT TTTATTTATG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 TTTAT 1 2 99336 CASAVA_Build 16 60766429 1I TTGATAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 650 hom 40 2 31 7 T 12 13 99337 CASAVA_Build 16 60766720 4D TGAAGGCACA CTCT/---- CTATTTTATA 3070 hom 135 het 48 0 46 3 CT 3 1 99338 CASAVA_Build 16 60790233 1I ACCCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 968 hom 36 4 25 7 A 13 14 99339 CASAVA_Build 16 60799149 1D ATTGGTTGGG A/- AAAAATCTTC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 A 6 5 99340 CASAVA_Build 16 60802315 2D TGGCCTGATG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 39 0 32 9 T 11 9 99341 CASAVA_Build 16 60807725 2I ACCTAGTTTA --/TT GAGAGTTTTC 3070 hom 63 het 26 0 21 6 T 0 2 99342 CASAVA_Build 16 60809074 1D GGCGGGGTTG T/- GGGGGGAATA 3070 hom 27 het 11 0 9 2 T 1 0 99343 CASAVA_Build 16 60836085 4D GCAAATAAAT AAAC/---- AAAGGCAATA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 AAAC 1 0 99344 CASAVA_Build 16 60884349 2D AACTCAAAAC TT/-- TTCAGCACCT 3070 het 3070 ref 54 32 20 3 T 4 2 99345 CASAVA_Build 16 60924240 1D TTAGGCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 T 13 12 99346 CASAVA_Build 16 60932398 2I TCCATCTCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 953 hom 18 4 11 3 A 11 13 99347 CASAVA_Build 16 60957877 1I TGCCTCCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 T 12 13 99348 CASAVA_Build 16 60980457 1D CTCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 12 11 99349 CASAVA_Build 16 60990317 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTG 700 het 334 hom 7 2 3 3 T 10 9 99350 CASAVA_Build 16 61005286 1I AGTTTTCTTC -/T TTGTTTTTAT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 2 3 99351 CASAVA_Build 16 61023482 1I ATTTTTAAGG -/A AAAAAAACTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 7 8 99352 CASAVA_Build 16 61027120 1D TAAAAAACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 35 0 29 6 A 10 9 99353 CASAVA_Build 16 61029352 7D AAACAAAAAA AATCTCC/------- AAGACTAGAT 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 AATCTCC 1 0 99354 CASAVA_Build 16 61031813 2D CTCAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 AT 8 7 99355 CASAVA_Build 16 61032896 7D TATTTCCTGC AAAGAGG/------- AACCTAAGGA 3070 het 3070 hom 43 20 21 5 AAAGAGG 1 0 99356 CASAVA_Build 16 61033323 1D ATACAAAGTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 20 12 10 T 9 8 99357 CASAVA_Build 16 61040714 1I TATTTTTTTT -/C CAAATTCTTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 C 1 2 99358 CASAVA_Build 16 61050489 1D GCAATTTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 10 9 99359 CASAVA_Build 16 61058621 1D GTTTAATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 516 hom 21 2 15 4 T 12 11 99360 CASAVA_Build 16 61059962 1I TTTTTGAATC -/A TATTGAGATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 0 1 99361 CASAVA_Build 16 61063804 1D AAGAACAGCA G/- GGGATAGAAT 3070 hom 124 het 48 0 38 10 G 4 3 99362 CASAVA_Build 16 61091618 4I TTGATTTCTC ----/TATT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 TATT 0 1 99363 CASAVA_Build 16 61092637 1D CACAATGACC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 61 24 31 7 T 8 7 99364 CASAVA_Build 16 61100411 3I GAAAAAGGAA ---/AGG AGAAAGGAAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AGG 0 1 99365 CASAVA_Build 16 61101482 2D AGAACCTCCA CC/-- TTCTTAGAGG 3070 het 3070 ref 54 28 20 8 C 2 0 99366 CASAVA_Build 16 61102403 2D CATTGGTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 11 9 99367 CASAVA_Build 16 61108997 1I TGCTAAAGGG -/A ATTTGAATTG 3070 het 3070 ref 51 28 23 0 A 1 2 99368 CASAVA_Build 16 61114539 1D AAACATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 11 10 99369 CASAVA_Build 16 61118476 2I TATTGTGTGT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 16 12 14 AC 7 8 99370 CASAVA_Build 16 61124134 3D TTGAAACAAT GAG/--- GAGTCTCAGA 3070 het 3070 hom 47 16 28 4 GAG 2 1 99371 CASAVA_Build 16 61126405 1I TTTTGAAGGA -/T TTTTTTTTTT 2778 het 2778 ref 26 9 8 9 T 12 13 99372 CASAVA_Build 16 61126507 9D TTGTTCTATT TATAGAGCA/--------- TATAGAGCAC 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TATAGAGCA 2 1 99373 CASAVA_Build 16 61131239 1I GGCCTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 2418 het 2418 ref 31 15 8 8 A 13 14 99374 CASAVA_Build 16 61133670 3D AGCAAATCTA AAG/--- AAGAATTAAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 4 AAG 2 1 99375 CASAVA_Build 16 61137619 9D TACTTTATCC CTGAACCTT/--------- CTATATTGTA 3070 het 3070 hom 38 19 18 4 CTGAACCTT 1 0 99376 CASAVA_Build 16 61139490 7D TGTGGATTAT GGGCGTA/------- CCTATTAATT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 GGGCGTA 1 0 99377 CASAVA_Build 16 61139742 1D TCATAGCTGA G/- GGGGGGGGCA 2542 het 2542 ref 24 9 7 8 G 9 8 99378 CASAVA_Build 16 61147936 1I TCTTGCTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 T 8 9 99379 CASAVA_Build 16 61160537 1I AAATCACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 15 11 T 12 13 99380 CASAVA_Build 16 61182271 1D CCCTGATTTC A/- AAGTAGGATG 3070 hom 113 het 41 0 37 4 A 3 2 99381 CASAVA_Build 16 61184491 2D CTTCCTTTGA TC/-- TCTCTCTGAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TC 4 3 99382 CASAVA_Build 16 61187484 2I AGTGATGTGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 10 12 99383 CASAVA_Build 16 61196175 1D CTCTACAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 27 2 19 6 T 14 13 99384 CASAVA_Build 16 61198931 1I TGCCCCTCCT -/A AACCTCACTC 3070 hom 86 het 32 0 28 4 A 2 3 99385 CASAVA_Build 16 61201428 1D TTTGTGTTTC A/- AAAAGAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 5 4 99386 CASAVA_Build 16 61202573 2D TAACATGAGA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 10 8 99387 CASAVA_Build 16 61204442 1I GAGAAATCCA -/T GTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 32 2 27 3 T 0 1 99388 CASAVA_Build 16 61205097 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2592 het 26 hom 23 1 7 15 T 19 18 99389 CASAVA_Build 16 61206561 1I ACTGTTACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 11 99390 CASAVA_Build 16 61207329 1D ATAAGAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 11 10 99391 CASAVA_Build 16 61223703 2D CTTCTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 42 0 33 9 T 11 9 99392 CASAVA_Build 16 61227709 1I TGCTTATCCT -/G GGGGTACTCT 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 G 4 5 99393 CASAVA_Build 16 61228279 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 T 6 5 99394 CASAVA_Build 16 61231890 1I GGACCAGTTT -/A AAGATTTCAG 3070 hom 128 het 53 0 47 6 A 2 3 99395 CASAVA_Build 16 61234195 2I TCTGTTTCTC --/AA AAGTCATCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 4 99396 CASAVA_Build 16 61245368 12D TGTATGTATA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 45 het 19 0 15 5 TG 14 8 99397 CASAVA_Build 16 61246004 1D GACCTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 174 hom 37 1 30 7 A 11 10 99398 CASAVA_Build 16 61246902 4D AAGAAAAAAG AAAT/---- AATCTTCTGT 3070 het 3070 ref 29 16 10 5 AAAT 1 0 99399 CASAVA_Build 16 61247129 2D GTTTAGGGTG TT/-- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 9 7 99400 CASAVA_Build 16 61249218 1I TATTTTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 T 15 16 99401 CASAVA_Build 16 61251899 1D AAAATGAAAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 7 6 99402 CASAVA_Build 16 61252657 2D TATGTATGAG TA/-- TATATATATA 1724 het 1724 ref 13 6 4 4 TA 7 6 99403 CASAVA_Build 16 61265940 6I CTTACTGGAG ------/TTTTGA TTTTGATTTG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 TTTTGA 1 2 99404 CASAVA_Build 16 61283928 1I AGAACACAAA -/T TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 4 5 99405 CASAVA_Build 16 61284460 1D TTACAATACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 21 10 13 T 10 9 99406 CASAVA_Build 16 61285950 6D CTTTTGTTGC ATAAAT/------ ATAAATAGAT 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 ATAAAT 2 1 99407 CASAVA_Build 16 61286230 1D AACCAATAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 13 15 5 A 9 8 99408 CASAVA_Build 16 61290416 2D TGAAACTAAC AT/-- GTGAATAGAG 3070 het 3070 ref 52 25 22 6 AT 1 0 99409 CASAVA_Build 16 61293261 5D CTTTCTTTCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 964 het 964 ref 24 8 6 10 T 21 16 99410 CASAVA_Build 16 61298368 5D ATATCAGCAT ATATA/----- ATATAATATA 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 ATATA 4 3 99411 CASAVA_Build 16 61300152 1D CCTGTCTGAG C/- CCCAGTTCTC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 C 4 3 99412 CASAVA_Build 16 61302739 1I CAGTTGATAA -/G GGAGAGGGGC 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 G 2 3 99413 CASAVA_Build 16 61303377 2D GGTTGGAGCC TA/-- TGTTTCCCAT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 TA 1 0 99414 CASAVA_Build 16 61306130 3D TCTTCTTCTC CTT/--- CTTCTCCTTC 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 CTT 2 1 99415 CASAVA_Build 16 61307996 1D CATTTACTTT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 A 8 7 99416 CASAVA_Build 16 61309954 1I ACGTCTGAGA -/G GATTTTAACA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 G 1 2 99417 CASAVA_Build 16 61317049 1D GCAGGCTGCC T/- TGAGCCAGTA 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 T 2 1 99418 CASAVA_Build 16 61318116 7I CTCTGCCCAG -------/AACTCCA AACTTTGTGT 3070 het 3070 ref 65 34 24 7 AACTCCA 0 1 99419 CASAVA_Build 16 61319008 5I GTAAATCCCT -----/ATTTA ATTCCTTTCT 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 ATTTA 0 1 99420 CASAVA_Build 16 61319696 2D TGCATATATC TG/-- TAATTATAAT 3070 het 3070 hom 43 16 25 5 TG 1 0 99421 CASAVA_Build 16 61321649 1D TATGGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2659 hom 33 12 12 9 T 13 12 99422 CASAVA_Build 16 61322858 2I TCAAGCACTC --/TT TTAAAATTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 2 4 99423 CASAVA_Build 16 61326666 4D AGAAAAACTT TAAC/---- TAATAATAAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 4 TAAC 1 0 99424 CASAVA_Build 16 61326747 1I TTACTGAATC -/T TTTAAAAATT 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 T 3 4 99425 CASAVA_Build 16 61327368 1I63M4I TATGGGGTTA -TTTTTTGATAAACCTCTATTGTAAATTGAAAATATCATTATTGTTTATCTGGACATAACTCTA----/TTTTTTTGATAAACCTCTATTGTAAATTGAAAATATCATTATTGTTTATCTGGACATAACTCTATCTT AGGTGGAGAG 3070 het 3070 hom 39 16 25 17 N/A 0 0 99426 CASAVA_Build 16 61327610 1I ATGTGCATAC -/A AAATCAAACT 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 A 3 4 99427 CASAVA_Build 16 61330399 1D AGCCAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 41 2 22 18 A 12 11 99428 CASAVA_Build 16 61334739 1D TAAAATATTG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 8 7 99429 CASAVA_Build 16 61334825 1D49M2I TAGTTTTTGA TTTTTTTTTTTTAGCTATAAGAGCTGAGTCTACTTACCATGTAGTCTGTA--/-TTTTTTTTTTTAGCTATAAGAGCTGAGTCTACTTACCATGTAGTCTGTACT CTCAGATTTC 3070 hom 59 het 33 0 26 19 N/A 0 0 99430 CASAVA_Build 16 61338063 2I CCATAGAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 A 10 12 99431 CASAVA_Build 16 61341336 8I TTTTTTTTTT --------/TTTGTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 25 9 TTTG 0 2 99432 CASAVA_Build 16 61341927 1I CTATAAAGAT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 99433 CASAVA_Build 16 61342158 1I AAACTGTGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 34 3 19 12 G 0 1 99434 CASAVA_Build 16 61349976 4I ATATGTTTCT ----/TAAA TAAGTGATAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TAAA 0 1 99435 CASAVA_Build 16 61354768 3D TCAGAAAAGA CCC/--- CCCACATTAG 3070 hom 113 het 39 0 36 5 C 6 3 99436 CASAVA_Build 16 61369003 1I TTTATGTGAC -/G GGGGGGGCCC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 G 7 8 99437 CASAVA_Build 16 61369879 3D TTGCTATTAA TTC/--- TTCTTTAATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTC 2 1 99438 CASAVA_Build 16 61380343 6D TGTGTGTGTG TGTGTA/------ TATACACACT 3070 het 1782 hom 26 9 15 2 TGTGTA 1 0 99439 CASAVA_Build 16 61381089 1I TTGGTTTACA -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 6 7 99440 CASAVA_Build 16 61390751 1D ACTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 31 0 23 8 T 12 11 99441 CASAVA_Build 16 61392054 2I GATAACCAGA --/CT CTATTTCAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CT 1 2 99442 CASAVA_Build 16 61392528 6I AATATATAAT ------/TATAAA TATATAAATA 2855 hom 18 het 8 0 7 1 TATAAA 0 1 99443 CASAVA_Build 16 61397029 1D CTCTCAGTTA C/- TGCACCCTGG 3070 hom 126 het 47 0 37 12 C 1 0 99444 CASAVA_Build 16 61397933 1D ATTTTATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 41 1 37 3 T 11 10 99445 CASAVA_Build 16 61401908 11I GATCTCTGGC -----------/ATTTCTATTTA ATTTCTATTT 3070 hom 22 het 9 0 8 1 ATTTCTATTTA 1 2 99446 CASAVA_Build 16 61403101 1I TGTCTTCTGT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 44 0 31 13 A 8 9 99447 CASAVA_Build 16 61404851 2I TTCTTTAATA --/AT AAGCTATTTA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 AT 0 1 99448 CASAVA_Build 16 61415105 1I GACTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 10 11 99449 CASAVA_Build 16 61418687 1I TTTGATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 53 2 42 9 A 11 12 99450 CASAVA_Build 16 61425431 2D TTGCTGTGAT AG/-- AGTCATGGAT 3070 hom 141 het 50 0 45 6 AG 2 1 99451 CASAVA_Build 16 61440498 1I CTCAGAGTTC -/T TTTTAGGGTA 3070 hom 95 het 39 0 31 8 T 4 5 99452 CASAVA_Build 16 61441655 24D GACAAGGAGG GGAGGGAAAGAGGGAGGGAAGGAA/------------------------ GGAGGGAAAG 3070 hom 48 het 17 0 17 3 GGAGGGAAAGAGGGAGGGAAGGAA 1 0 99453 CASAVA_Build 16 61446945 5D GTGCAGGCTA TTTTC/----- TTTGTTAGGA 3070 het 3070 ref 35 23 10 5 TTTTC 1 0 99454 CASAVA_Build 16 61506849 1D GATTTTTCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 10 9 99455 CASAVA_Build 16 61508272 1D GCACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 701 het 701 ref 24 9 5 10 T 17 16 99456 CASAVA_Build 16 61519999 1I TTATCTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 32 1 27 4 T 10 11 99457 CASAVA_Build 16 61583875 1D TGCACCCATC A/- AACTCGTCAT 1340 hom 7 het 3 0 3 0 A 3 2 99458 CASAVA_Build 16 61590081 1I ATTCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 33 3 25 5 A 10 11 99459 CASAVA_Build 16 61593809 6D ACTTACATGG GAAAGC/------ TGCACTTGGG 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 GAAAGC 1 0 99460 CASAVA_Build 16 61600777 3I AAAGAGGGAG ---/AGA AGGAGTATTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 AGA 0 1 99461 CASAVA_Build 16 61603503 27D TTATCAGTGA AAGACATGTGATGTGTTTTATCAGTGT/--------------------------- AAGACTATAA 3070 het 3070 ref 40 35 12 7 AAGACATGTGATGTGTTTTATCAGTGT 1 0 99462 CASAVA_Build 16 61611726 2D ATTTGAAAAA CT/-- CTGTGCAGGT 3070 het 3070 ref 23 11 10 4 CT 2 1 99463 CASAVA_Build 16 61612473 1D9M2I ATTATGTAAG AAAAAAAAGC--/-AAAAAAAGCTT TTTTTTTTTT 3070 het 243 hom 21 1 18 6 N/A 0 0 99464 CASAVA_Build 16 61637484 2I AGAAACTGTG --/AT ATATATATAT 3070 het 2800 hom 24 9 10 5 AT 8 9 99465 CASAVA_Build 16 61644623 3D TCTTAAAATG AGA/--- AGGATGCCTA 3070 het 3070 ref 37 19 15 7 AGA 1 0 99466 CASAVA_Build 16 61649938 3I TTACAATTCA ---/GTT GTCACAAGTA 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 GTT 0 1 99467 CASAVA_Build 16 61662249 4I TGTGGTTGGC ----/TTAT TTCTCATAAC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 TTAT 0 1 99468 CASAVA_Build 16 61663222 1D ACCATTTATT A/- AAGAGACTTT 3070 het 3070 hom 39 15 23 3 A 3 2 99469 CASAVA_Build 16 61666124 1D TAGATGGCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 T 10 9 99470 CASAVA_Build 16 61666683 1I TCTGATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 49 0 37 12 T 10 11 99471 CASAVA_Build 16 61667593 1D GGGAAACGTC T/- TCCTTCAGGC 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 2 1 99472 CASAVA_Build 16 61669424 1I AAGGCACAAA -/T CCATGATTAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 0 1 99473 CASAVA_Build 16 61672654 1D AAAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 13 12 99474 CASAVA_Build 16 61672786 1I CTTGTAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 32 1 20 11 A 13 14 99475 CASAVA_Build 16 61677756 1D GGTAAATTTT A/- AAAAATAGTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 6 5 99476 CASAVA_Build 16 61685676 1I AATTCTATAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 8 9 99477 CASAVA_Build 16 61685789 2I TGTCTCAGTC --/TT TTCCTTTTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 4 99478 CASAVA_Build 16 61691083 1I AACGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 190 hom 18 2 14 2 A 11 12 99479 CASAVA_Build 16 61696988 1I ATGAGATCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 53 15 25 13 T 9 10 99480 CASAVA_Build 16 61718538 2D TATAGTTAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 11 10 A 13 11 99481 CASAVA_Build 16 61720391 1D TCTCTATTTC A/- AAAAAAAAAA 2713 het 2713 ref 25 13 8 4 A 12 11 99482 CASAVA_Build 16 61724510 2D AGAGTGTATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2315 hom 27 7 16 4 TG 8 7 99483 CASAVA_Build 16 61728076 1I AAAATTAACC -/G GGTGTGGTGG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 G 2 3 99484 CASAVA_Build 16 61729268 2D CTGGCTTCTC TT/-- TAAAATTATT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 3 1 99485 CASAVA_Build 16 61733382 4D CTTACCTAAG ACTT/---- ACTATTTACC 3070 hom 119 het 43 0 39 4 ACTT 1 0 99486 CASAVA_Build 16 61735322 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2277 het 400 hom 21 3 11 7 A 17 16 99487 CASAVA_Build 16 61750475 1D TAAAACAAGT A/- AAGTATAATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 2 99488 CASAVA_Build 16 61753793 8D TTTCTTTTTT CTTCTTTC/-------- CTTCTTTCCT 3070 hom 75 het 29 0 26 5 CTTCTTTC 3 2 99489 CASAVA_Build 16 61755019 1D TGTGAAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 45 1 38 6 A 11 10 99490 CASAVA_Build 16 61887471 1I CCAGTGTATA -/T TTTGATAGGC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 3 4 99491 CASAVA_Build 16 61916418 1I ACAATCAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 9 10 99492 CASAVA_Build 16 61943978 5I AAATAATTAG -----/TATAA TATAATTATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TATAA 1 2 99493 CASAVA_Build 16 61945592 1D TTGCAGAAGA C/- CTACATAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 1 99494 CASAVA_Build 16 61952237 8D TAAAAATCAT ATATATAC/-------- ATATATACAT 2773 hom 27 het 10 0 10 3 ATATATAC 3 2 99495 CASAVA_Build 16 61953153 3I CAGAACTCTA ---/TTT TTTATTTGAG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 3 6 99496 CASAVA_Build 16 61965487 1D TATTTGAGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 T 9 8 99497 CASAVA_Build 16 61967499 3D GATGTTTCTC AAA/--- AAAACAAACA 568 het 568 ref 37 22 4 11 A 7 4 99498 CASAVA_Build 16 61967818 2D CCAGGCACAT AA/-- AGAGAAATCC 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 A 3 1 99499 CASAVA_Build 16 61973259 1D TATTTTAATA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 T 7 6 99500 CASAVA_Build 16 61985539 6D TTATTGCTTC TTCGAT/------ ATTATTAACT 3070 het 3070 ref 28 18 9 2 TTCGAT 1 0 99501 CASAVA_Build 16 61990909 1I CCAATAAGGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 8 9 99502 CASAVA_Build 16 61994492 4I CGTTTTTTAC ----/TGTT TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TGTT 2 3 99503 CASAVA_Build 16 61994920 4I TTGGAATGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 1396 hom 22 7 11 4 TTTG 3 4 99504 CASAVA_Build 16 61995495 1D TGTACGAGTT A/- AAACTCTGCC 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 A 4 3 99505 CASAVA_Build 16 61996121 1D ATTTAGATTA T/- TTTTACTTGT 3070 het 3070 hom 47 19 22 7 T 5 4 99506 CASAVA_Build 16 61998256 2D TTTCAGATAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 11 9 99507 CASAVA_Build 16 61999470 1D TAAATTAGGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 9 8 99508 CASAVA_Build 16 62001842 1I ATAAGAAAAA -/G TAACTTAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 G 0 1 99509 CASAVA_Build 16 62003414 1D AGACCTGAAG A/- TCAACTAGTG 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 A 1 0 99510 CASAVA_Build 16 62004796 10D TATATTTTAT ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 AC 10 5 99511 CASAVA_Build 16 62011628 1I TTAAGCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1357 hom 42 4 30 8 T 15 16 99512 CASAVA_Build 16 62013095 3D GAATATCAGG CTA/--- CTACTAGCCA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 CTA 3 2 99513 CASAVA_Build 16 62014413 1I AGAAATCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 30 0 24 6 T 11 12 99514 CASAVA_Build 16 62015038 1D TTAGAAAAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 8 99515 CASAVA_Build 16 62044492 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2588 het 956 hom 22 4 11 8 A 17 16 99516 CASAVA_Build 16 62048867 3I TCACTATCAT ---/AAG AATAGCATGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAG 0 1 99517 CASAVA_Build 16 62065913 2D CATAGTGAGT TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 TA 6 5 99518 CASAVA_Build 16 62068879 1I CATATTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 934 hom 30 2 24 4 T 10 11 99519 CASAVA_Build 16 62073588 1D GAGTTATTTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 7 99520 CASAVA_Build 16 62088487 2D GAAGCAAAGA TT/-- TTTTTTTTGA 3070 het 2714 hom 27 8 15 4 T 10 8 99521 CASAVA_Build 16 62096829 1D TTTTTTTCAC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 8 7 99522 CASAVA_Build 16 62098828 1I TGAAAGTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 10 11 99523 CASAVA_Build 16 62101339 1I TGTGGCAAGT -/A AAATAGTGAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 3 4 99524 CASAVA_Build 16 62106233 1D TGAGGAGTAA G/- GTTCATTCAG 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 G 2 1 99525 CASAVA_Build 16 62112159 1D TCGGATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 15 14 99526 CASAVA_Build 16 62112465 1I TCTATTCCTG -/A AAAAAACTCT 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 6 7 99527 CASAVA_Build 16 62119291 1I ACAAATAGCA -/C TATATTGGTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 C 0 1 99528 CASAVA_Build 16 62128246 5D GCATTCAATC CTTTA/----- CTTTTCAATA 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 CTTTA 1 0 99529 CASAVA_Build 16 62134895 5D AGGATTTTTA TGTTT/----- TGTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 TGTTT 2 1 99530 CASAVA_Build 16 62137852 1D73M4D AAGTCGAGAC TTTTTTTTGTATCATTAATGAATTATCCTTGATTTTATTGTATTCAAACATTTTTAATAGATCTGAAAGAACTCTATT/-TTTTTTTGTATCATTAATGAATTATCCTTGATTTTATTGTATTCAAACATTTTTAATAGATCTGAAAGAACTC---- TATCAGGGTG 3070 het 3070 ref 26 24 13 13 N/A 0 0 99531 CASAVA_Build 16 62138320 2D TAAGTGTCTC CT/-- GTGCTCCACC 3070 het 3070 ref 58 30 22 6 CT 1 0 99532 CASAVA_Build 16 62143047 4D TTATATTCAA TAAT/---- TAATTATTTA 3070 het 3070 ref 32 20 12 4 TAAT 2 1 99533 CASAVA_Build 16 62147157 1D AATGAGAGAC A/- AAAACCGCAA 3070 het 3070 ref 52 26 19 8 A 5 4 99534 CASAVA_Build 16 62164128 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1628 het 1286 hom 16 6 4 6 A 17 16 99535 CASAVA_Build 16 62179594 4I ACAGAAAACT ----/TAAG TAACATATTG 3070 het 3070 hom 50 19 27 4 TAAG 0 1 99536 CASAVA_Build 16 62180768 7D TGATCTGGAA TTCTTCT/------- TTCTTTATTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 TTCTTCT 1 0 99537 CASAVA_Build 16 62180914 1D AGATTGTTAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 9 8 99538 CASAVA_Build 16 62182860 1I CTCTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 13 14 99539 CASAVA_Build 16 62183135 2I AAAATAATGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 57 26 24 7 GT 5 6 99540 CASAVA_Build 16 62199065 1D CGCCAGGATG A/- AACCTTGTTC 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 A 3 2 99541 CASAVA_Build 16 62202192 1D ATTACCTAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 28 0 25 4 T 9 8 99542 CASAVA_Build 16 62253652 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2307 het 2307 ref 24 11 7 6 A 13 12 99543 CASAVA_Build 16 62270256 1I TGAATTTCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 2386 hom 32 10 17 5 A 8 9 99544 CASAVA_Build 16 62273075 1I TTAATAACCA -/G GTTGTTAACC 3070 hom 132 het 52 0 45 7 G 1 2 99545 CASAVA_Build 16 62275048 2D CTTCCTAAAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 11 9 99546 CASAVA_Build 16 62277254 1D AAAGTTGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 10 9 99547 CASAVA_Build 16 62277971 1D GAGAGTTTTG A/- AAAAAGCAGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 6 5 99548 CASAVA_Build 16 62278695 1D AAGGAAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 36 2 23 13 A 15 14 99549 CASAVA_Build 16 62279555 1D TTGAAATCAC A/- ATATACTAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 A 2 1 99550 CASAVA_Build 16 62284452 1D TTTTTTTTTT A/- AAAATTAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 4 A 5 4 99551 CASAVA_Build 16 62296469 1I ATAAATATTC -/T TTTTTTTTTT 2676 hom 15 het 9 0 6 4 T 11 12 99552 CASAVA_Build 16 62297504 1D TCGCACTTCT A/- AAAACCAAGT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 5 4 99553 CASAVA_Build 16 62299445 3I TCTGAACCTT ---/AAA AAATACCCTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 6 99554 CASAVA_Build 16 62299945 1I TAGGTAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 11 12 99555 CASAVA_Build 16 62306115 1D CTACCACCCT A/- AAGGTGACAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 2 99556 CASAVA_Build 16 62309701 1I AGTGTATATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 19 18 10 T 9 10 99557 CASAVA_Build 16 62310698 1D TTCATATTTA T/- TTTTGCTTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 5 4 99558 CASAVA_Build 16 62312185 5I GAGACAAAGT -----/AAAGA AAATAACAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAAGA 0 1 99559 CASAVA_Build 16 62318213 1D TTCTCTTTCT C/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 C 1 0 99560 CASAVA_Build 16 62329480 1D AGAAGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 11 10 99561 CASAVA_Build 16 62331245 2D AGAAAACAAT AA/-- AAGTTAGAGC 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 A 4 2 99562 CASAVA_Build 16 62343550 1I CCTTTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2527 hom 25 8 13 4 A 11 12 99563 CASAVA_Build 16 62344196 1I CTTCCTTTTA -/T TTTTAAGCCA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 T 4 5 99564 CASAVA_Build 16 62347302 1I TTGAGTTTGC -/T TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 T 4 5 99565 CASAVA_Build 16 62356722 5D CCCATAATAC TTCTA/----- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 33 16 13 9 TTCTA 1 0 99566 CASAVA_Build 16 62357039 4I ATTTATGAAG ----/ATTA ATTATAATTA 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 ATTA 1 2 99567 CASAVA_Build 16 62367982 5D AAGACTACAA GTCAT/----- GTCATGTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 GTCAT 2 1 99568 CASAVA_Build 16 62377743 1I ACACAGAGTC -/A AAAGATTTAT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 A 3 4 99569 CASAVA_Build 16 62387521 2I AAAAATATAG --/AA AAAAAAAATC 3049 het 3049 ref 24 12 7 5 A 8 10 99570 CASAVA_Build 16 62388976 3I CTGACAAGGA ---/ATT ATTATTATTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 ATT 3 4 99571 CASAVA_Build 16 62419957 3D TTTTTTGAGA TAT/--- TATTTCAGCT 3070 het 3070 hom 34 12 19 5 TAT 2 1 99572 CASAVA_Build 16 62421407 3D TATAGTACAC TTG/--- TTGTTGTCCA 3070 het 3070 ref 49 25 20 6 TTG 3 2 99573 CASAVA_Build 16 62423571 1D TGCACAGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 T 10 9 99574 CASAVA_Build 16 62435262 1D ACATTTAAAA G/- TTTCACTTAA 3070 het 3070 hom 30 7 17 6 G 1 0 99575 CASAVA_Build 16 62440510 1I48M4I TTTTTGCTTG -AAAAAAAAATCCATTATTGTACTGTATTCATAGAGTTTTGAAACTATT----/AAAAAAAAAATCCATTATTGTACTGTATTCATAGAGTTTTGAAACTATTGTGA GTAATTGGAA 3070 het 3070 hom 35 24 25 3 N/A 0 0 99576 CASAVA_Build 16 62455248 2I TTCTGTTCTG --/TT TTTTTTTTTT 2754 het 1159 hom 22 5 8 9 T 10 12 99577 CASAVA_Build 16 62458419 2I CAAAAGAAAC --/TG TACATAAACA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TG 0 1 99578 CASAVA_Build 16 62471117 1I CTGGGATTAC -/A AGCATGAGCC 2409 het 1692 hom 12 5 6 1 A 1 2 99579 CASAVA_Build 16 62475994 1D AAAGTTAGCA T/- TTTTTTCGCT 3070 het 3070 hom 33 9 21 5 T 7 6 99580 CASAVA_Build 16 62486542 1I CTGGGAGGAC -/T TTATATCTTC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 2 3 99581 CASAVA_Build 16 62487413 2I GTATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2258 hom 24 8 10 6 AT 7 8 99582 CASAVA_Build 16 62487553 1D CCTTGGAAGC A/- AAAAAAAAAA 2583 het 1989 hom 20 6 7 7 A 15 14 99583 CASAVA_Build 16 62503599 5D AGGATTTTTC TTGTT/----- TTGAATTGTT 3070 het 3070 hom 43 13 26 5 TTGTT 1 0 99584 CASAVA_Build 16 62504774 3I GCTTAATTTC ---/TTA TTATTATCTA 3070 het 3070 ref 65 33 28 4 TTA 2 3 99585 CASAVA_Build 16 62559662 1D AGACCAGACC A/- AAAAAAAAAA 1387 het 1387 ref 34 16 5 13 A 17 16 99586 CASAVA_Build 16 62758629 1D TGACTTGTCT C/- TCAGCCCTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 99587 CASAVA_Build 16 62791197 1D GCTAAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 812 hom 33 2 26 5 A 17 16 99588 CASAVA_Build 16 62831257 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1022 het 1022 ref 12 8 3 1 A 15 14 99589 CASAVA_Build 16 62840246 1I TTTCAAGATC -/T TTTTTTTTTT 1863 het 1863 ref 33 19 4 10 T 13 14 99590 CASAVA_Build 16 62854010 2D ATCATAACTT CC/-- CCCCCCCCGC 2743 het 804 hom 24 8 10 6 C 10 8 99591 CASAVA_Build 16 62855207 1I AGACCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 10 11 99592 CASAVA_Build 16 62872932 4D GTGTTACTGC GTCT/---- GTCTTATTTC 3070 het 3070 hom 40 18 21 5 GTCT 2 1 99593 CASAVA_Build 16 62873075 1D GGTCACTGAA C/- ATTTAGTCTA 3070 het 3070 hom 66 29 28 9 C 1 0 99594 CASAVA_Build 16 62878541 1D ATATTGACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 T 10 9 99595 CASAVA_Build 16 62879081 1D GAAAAAAAAA T/- CTCACTATCT 3070 het 3070 hom 25 8 14 6 T 1 0 99596 CASAVA_Build 16 62884873 2D CTTTTAAGAA TT/-- AATACATAGT 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 T 2 0 99597 CASAVA_Build 16 62886795 1D ATTTGTGTTG T/- TTACACATTT 3070 het 3070 hom 48 20 21 8 T 3 2 99598 CASAVA_Build 16 62898671 2I GCAGCCTGTG --/GT GTCCTTACCA 3070 het 2934 hom 29 11 14 4 GT 1 2 99599 CASAVA_Build 16 62900707 5I AAAAAAATAA -----/TAAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 TAAAT 0 1 99600 CASAVA_Build 16 62913139 1I TTATTATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1357 hom 34 4 19 11 T 14 15 99601 CASAVA_Build 16 62915915 24I TCTAAGTATC ------------------------/AAGTTCTACTTGATACTTAGTTGT AAGTTCTACT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 AAGTTCTACTTGATACTTAGTTGT 0 1 99602 CASAVA_Build 16 62942672 1I GTTTCTAAGC -/A AAGGGTTGAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 2 3 99603 CASAVA_Build 16 62963210 1D AATGTCTGTG T/- TTAAGTTATC 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 T 3 2 99604 CASAVA_Build 16 62968896 1I ATTACTAAAT -/A AATTGAATTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 3 99605 CASAVA_Build 16 62971651 1I ACCAGGGACT -/A AGCTGTTCAG 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 1 2 99606 CASAVA_Build 16 62975580 1I ATCTTTAGAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 A 7 8 99607 CASAVA_Build 16 62975690 2D34M2D TTGGAGAAAG AAATGCTCAGTAATTCTGGCTTTGGTACTACCACCCTG/--ATGCTCAGTAATTCTGGCTTTGGTACTACCACCC-- TTTTAATTGT 3070 het 3070 hom 32 18 24 6 N/A 0 0 99608 CASAVA_Build 16 62977960 1I TGGGGCTTGC -/T TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 50 22 23 5 T 8 9 99609 CASAVA_Build 16 62978598 1I CTGCTCTGTG -/A AAAAAAAAAA 2148 het 2148 ref 32 18 7 7 A 10 11 99610 CASAVA_Build 16 62979944 1I TGAATTTTTT -/A AATTTTTTTT 3070 het 2145 hom 17 7 8 2 A 2 3 99611 CASAVA_Build 16 62981940 2D CCATGCATAA CT/-- CAGTGAATCT 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 CT 1 0 99612 CASAVA_Build 16 62983803 4I ATTTACTCAC ----/TATT TATAATACTG 2017 het 2017 ref 12 7 5 0 TATT 0 1 99613 CASAVA_Build 16 62985068 4D TTTCTCTCTC TCTA/---- TATATATAGG 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 TCTA 1 0 99614 CASAVA_Build 16 62986181 1D TGTTGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 8 9 3 T 11 10 99615 CASAVA_Build 16 62988234 1I ATACAGAGAT -/A AGATCTTAGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 2 99616 CASAVA_Build 16 62993865 2I TTGATGTTTA --/AC ACAGTACTGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AC 1 2 99617 CASAVA_Build 16 62995378 2I TTTTAAAAAC --/AT AGGAAATTCT 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 AT 0 1 99618 CASAVA_Build 16 62997739 1D TAGGGAATAA G/- GGTGGTTGAT 3070 het 3070 ref 48 22 18 9 G 3 2 99619 CASAVA_Build 16 63011153 1I TCTAGAGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 9 10 99620 CASAVA_Build 16 63026898 1I TAAATCAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2678 hom 31 8 19 4 A 11 12 99621 CASAVA_Build 16 63050962 1I TGAATAGGTT -/C ATGCTCTCAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 99622 CASAVA_Build 16 63066842 1D CCAAGAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2929 hom 28 11 10 7 A 13 12 99623 CASAVA_Build 16 63067775 1I AGCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 T 12 13 99624 CASAVA_Build 16 63072050 2D CAAAGACTGT GC/-- CTTGCCAGTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 GC 1 0 99625 CASAVA_Build 16 63078635 1D CTCAGCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 10 9 99626 CASAVA_Build 16 63094038 1I AAATATTTTG -/T CCCATTGAAC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 0 1 99627 CASAVA_Build 16 63138970 1I CATAGAATAT -/A GAAATGATCA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 0 1 99628 CASAVA_Build 16 63140898 1D TTTTAAGGCC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 A 8 7 99629 CASAVA_Build 16 63147253 5D ATTAATTTAA TAAAT/----- GGAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 TAAAT 1 0 99630 CASAVA_Build 16 63152637 1I GAATTTCTGC -/A AAATGCACCG 2914 het 2914 ref 20 12 6 2 A 3 4 99631 CASAVA_Build 16 63154116 1D GAATTGGGGG A/- AAAAATGTGC 3070 het 3070 ref 45 21 21 4 A 6 5 99632 CASAVA_Build 16 63164313 1D CTTCATTGAC A/- AATTCCACTC 3070 het 3070 hom 46 17 27 2 A 3 2 99633 CASAVA_Build 16 63168834 8D GACCTCTGCC TACAGGGT/-------- TCAAGTGATT 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 TACAGGGT 1 0 99634 CASAVA_Build 16 63170723 4I CAATATATAT ----/TAAA TAAATAAATA 2597 het 2597 ref 18 6 6 6 TAAA 3 4 99635 CASAVA_Build 16 63195699 2I TTTATATTAA --/AT ATATGTCAAT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 AT 2 3 99636 CASAVA_Build 16 63197965 4D AAAATTAAAT AAAG/---- AATGAAAATA 3070 het 3070 ref 32 20 12 3 AAAG 1 0 99637 CASAVA_Build 16 63212788 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 T 9 8 99638 CASAVA_Build 16 63215613 1I TATTTTTGTC -/T GATCAAGGTA 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 T 0 1 99639 CASAVA_Build 16 63234630 1D GCTGTTCAAA C/- TTTCTGCTGC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 C 1 0 99640 CASAVA_Build 16 63234928 9I14M1D ATTACTTTGT ---------TTGGAAAATATTTTG/TTTTCAATGTTGGAAAATATTTT- TTGCTTTTGG 3070 het 3070 hom 30 17 18 3 N/A 0 0 99641 CASAVA_Build 16 63238029 2D ACTATTATAC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 12 hom 27 1 17 10 A 11 9 99642 CASAVA_Build 16 63246811 1I TTAAACTTAA -/T TTTTTAATTA 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 T 5 6 99643 CASAVA_Build 16 63249848 4D AATACTGACT GATG/---- GAATAAAATC 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 GATG 1 0 99644 CASAVA_Build 16 63270147 5I AGGGTAAAAG -----/TGAGT ACAGTAGCAC 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 TGAGT 0 1 99645 CASAVA_Build 16 63279642 1D TCCCAAGGAG A/- AAAAAGTCCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 6 5 99646 CASAVA_Build 16 63282174 1I TCATAAGTGA -/G GGGGCAAAAA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 G 4 5 99647 CASAVA_Build 16 63286109 1D CCCTTAAATC T/- TTTCCTTGAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 4 3 99648 CASAVA_Build 16 63288052 1I GAGAAAAAAC -/A AAAAAAGCCT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 6 7 99649 CASAVA_Build 16 63289504 1I GGAATTACTG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 7 8 99650 CASAVA_Build 16 63293195 12I GCAAGCCTCT ------------/CCCGGTGGCCTG CCCAGAATTT 3070 hom 72 het 28 0 23 5 CCCGGTGGCCTG 0 1 99651 CASAVA_Build 16 63298775 1D ACAAACAAAT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 42 20 20 3 A 8 7 99652 CASAVA_Build 16 63302373 1D TGAATTTAGT G/- GCATAAGAAG 3070 het 3070 ref 20 8 9 4 G 2 1 99653 CASAVA_Build 16 63312090 1I ATCTTACTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 T 9 10 99654 CASAVA_Build 16 63326769 1D TAAGGCACTG T/- TTTTAAGCAC 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 5 4 99655 CASAVA_Build 16 63328206 16I GTCACCACTG ----------------/CCAGTGATGGTCACCT CCACCTTGTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 CCAGTGATGGTCACCT 0 1 99656 CASAVA_Build 16 63351517 3D GGCCTCCCAG TGC/--- TGCTGGGATC 3070 hom 42 het 16 0 15 2 TGC 2 1 99657 CASAVA_Build 16 63385548 1D GTCATTTATT A/- AAAAAAAAAA 1806 het 1806 ref 37 18 7 12 A 17 16 99658 CASAVA_Build 16 63399228 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 8 7 99659 CASAVA_Build 16 63400137 1D TATGGTGAAG T/- ATAGAGGCAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 1 0 99660 CASAVA_Build 16 63400268 1I TAGAAAAGCC -/T TTATGTTCTC 3070 hom 123 het 43 0 42 2 T 2 3 99661 CASAVA_Build 16 63410310 1D AGAGAGGCCA T/- TTCTTCATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 2 99662 CASAVA_Build 16 63452670 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 25 3 13 9 A 17 16 99663 CASAVA_Build 16 63463556 1D TTTTAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 11 10 99664 CASAVA_Build 16 63469254 1D TGAAGACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 41 1 30 10 T 12 11 99665 CASAVA_Build 16 63474451 1D ACAAACAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 41 1 30 11 A 12 11 99666 CASAVA_Build 16 63498689 1I TACTCAACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 789 hom 48 3 35 10 T 11 12 99667 CASAVA_Build 16 63502749 1I CATCTCAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 226 hom 24 3 14 7 A 17 18 99668 CASAVA_Build 16 63504877 1I TACTTGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 23 0 20 3 T 10 11 99669 CASAVA_Build 16 63505527 1I ATTTGTTTCA -/G GGTATTTCCT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 G 2 3 99670 CASAVA_Build 16 63508026 1D CTTAACAACA T/- GAACTATAAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 1 0 99671 CASAVA_Build 16 63510223 1I GAAAGCAAAG -/C TTGCACTGTA 3070 hom 110 het 44 0 35 9 C 0 1 99672 CASAVA_Build 16 63536706 2D AATAAAAGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 25 1 12 12 A 18 16 99673 CASAVA_Build 16 63537766 1I TGCTCAGTGT -/G GGGGCATAGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 4 5 99674 CASAVA_Build 16 63557853 1I TAATGCGGAG -/A AAAGCATCTG 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 3 4 99675 CASAVA_Build 16 63558108 1D TTGATATCAA T/- TTTGGGTGAG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 4 3 99676 CASAVA_Build 16 63565213 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 10 11 99677 CASAVA_Build 16 63565600 1D GAACTCCAAA C/- CCCTTCCCTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 C 4 3 99678 CASAVA_Build 16 63571281 1D GAAAAATTAC T/- TCAGAGATAA 3070 het 3070 hom 45 22 21 4 T 2 1 99679 CASAVA_Build 16 63574549 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 11 12 99680 CASAVA_Build 16 63586034 1I GCTGGAAGCA -/T TTCTCCTTCA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 T 2 3 99681 CASAVA_Build 16 63595440 2D ATAAATTATG GC/-- TATGTGCATT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 GC 1 0 99682 CASAVA_Build 16 63597483 1D AAACTTATTC T/- TCTCTAAGGA 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 T 2 1 99683 CASAVA_Build 16 63602357 2I TATGTGTGAC --/AT ATATATATAT 1535 het 1535 ref 17 8 7 2 AT 7 8 99684 CASAVA_Build 16 63613649 1D AAACCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 12 11 99685 CASAVA_Build 16 63634896 1D AAGATCATCC T/- TCAAAATAAT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 2 1 99686 CASAVA_Build 16 63642863 2I GGACAGTGGT --/AA AAGACACAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 2 4 99687 CASAVA_Build 16 63658601 1D AGTCAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2739 hom 32 12 9 12 A 13 12 99688 CASAVA_Build 16 63673342 1I AGGGAAGCAG -/A GGGGAGAAAA 3070 hom 96 het 39 0 31 8 A 0 1 99689 CASAVA_Build 16 63675722 1D TAGTTGCACA T/- GGGGGTACAT 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 1 0 99690 CASAVA_Build 16 63691812 1D AAGAAAATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 10 9 99691 CASAVA_Build 16 63696531 1D AGTTACAATA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 8 7 99692 CASAVA_Build 16 63700086 1I CAAATCAATA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 T 3 4 99693 CASAVA_Build 16 63704692 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1013 hom 25 4 10 12 A 15 14 99694 CASAVA_Build 16 63708160 4D TAATAAGGAT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 AG 9 7 99695 CASAVA_Build 16 63709805 4D TTTCTCCAAC TTTA/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 TTTA 1 0 99696 CASAVA_Build 16 63737950 1D GTTCTTCAAT C/- CAATCAAGTT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 C 2 1 99697 CASAVA_Build 16 63741792 1D CTAATTATGT A/- AAGCTTGATT 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 A 3 2 99698 CASAVA_Build 16 63745952 11D GAGCTGAAGG TCACACATCTC/----------- CCACCTCTGG 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 TCACACATCTC 1 0 99699 CASAVA_Build 16 63747306 2I ATTCATTATT --/TA TATATATATA 2600 het 2600 ref 16 8 6 2 TA 6 7 99700 CASAVA_Build 16 63747426 1I CTGAAACTTG -/A AAAAAAAAAC 3007 het 3007 ref 26 17 8 1 A 9 10 99701 CASAVA_Build 16 63751558 1D TATGAGCCCA T/- TGTGAAATGG 3070 het 3070 ref 41 25 16 0 T 2 1 99702 CASAVA_Build 16 63752450 8D ACCTTGTCTC TACAAAAA/-------- TACAAAAATT 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 TACAAAAA 2 1 99703 CASAVA_Build 16 63753858 2D GGTGATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 19 9 T 12 10 99704 CASAVA_Build 16 63765316 1D ACGGTTCGCC A/- ATACTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 A 2 1 99705 CASAVA_Build 16 63766157 1D TCCTTTACCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 10 9 99706 CASAVA_Build 16 63766810 2I GCCTCAGGGG --/CT TCCCAGTCTC 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 CT 0 1 99707 CASAVA_Build 16 63773072 1I AGAGGTTGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 9 10 99708 CASAVA_Build 16 63776832 1D GTCCAATGTC T/- TTTGAAGGTT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 4 3 99709 CASAVA_Build 16 63777254 3D TAGTTGATTC TTT/--- ATTTTCCTTT 3070 het 3070 hom 46 21 24 3 T 3 0 99710 CASAVA_Build 16 63784309 1D CTTCCTCCCA C/- CCACCCTTCT 3070 het 3070 ref 69 31 30 8 C 3 2 99711 CASAVA_Build 16 63791615 1I ATGGGGATGC -/T TTTGGCTCAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 4 99712 CASAVA_Build 16 63814937 1I GCTGATGAGA -/C CCTGAGATGG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 C 2 3 99713 CASAVA_Build 16 63820881 6D GTAGTGATAC TGATGA/------ TGATGATGTT 3070 hom 158 het 59 0 52 10 TGA 4 2 99714 CASAVA_Build 16 63821586 1D TTCTTCAGTT A/- CTTCAGGCCA 1450 hom 7 het 3 0 3 0 A 1 0 99715 CASAVA_Build 16 63840964 1I TTCTCAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1274 hom 29 6 15 8 A 15 16 99716 CASAVA_Build 16 63841097 4D ACAGGAGTTA AAGT/---- AAGAGAGTTA 3070 hom 75 het 32 0 26 8 AAGT 1 0 99717 CASAVA_Build 16 63879546 1I CACAAGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 12 13 99718 CASAVA_Build 16 63889011 1D GTGAAGATAG A/- AAAAAAAAAA 1812 het 1812 ref 41 24 7 11 A 15 14 99719 CASAVA_Build 16 63893123 4I ATTGAATCAA ----/TAAT TAATAACTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TAAT 1 2 99720 CASAVA_Build 16 63917424 1I GATCTATATA -/C CTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 C 1 2 99721 CASAVA_Build 16 63918015 4D CTAACTTGAC ACAG/---- AGAGGCTTGA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 ACAG 1 0 99722 CASAVA_Build 16 63921057 1I TGATTTTAAC -/A GGAGTTAGAG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 0 1 99723 CASAVA_Build 16 63925121 3I TATTGTCACT ---/ATC ATTATTATTA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 ATC 0 1 99724 CASAVA_Build 16 63934373 1D ACTCTAGACA G/- CATGATTTAG 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 G 1 0 99725 CASAVA_Build 16 63985085 4I GTCACCTCCC ----/TAAT TAATTGTCTT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TAAT 1 2 99726 CASAVA_Build 16 63999775 1D ACCAATGTTG T/- TTATTTCTTC 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 T 3 2 99727 CASAVA_Build 16 64006619 1I AAGTCTGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 11 12 99728 CASAVA_Build 16 64007194 5I TCAGATGGAC -----/TAATT TATTCAGATA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 TAATT 0 1 99729 CASAVA_Build 16 64010195 2D CTAGGGCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 33 4 11 18 T 13 11 99730 CASAVA_Build 16 64020260 2I CCTGAATCTC --/CT CTCTCTAAAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 CT 3 4 99731 CASAVA_Build 16 64021676 2D AGAACCTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 14 12 99732 CASAVA_Build 16 64031858 4I TATGTCATCA ----/TTTG TTTAACTTAT 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 TTTG 0 1 99733 CASAVA_Build 16 64033484 1D TAACAGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 45 2 37 6 A 13 12 99734 CASAVA_Build 16 64035032 1D TAATGACTTC T/- TTTTCCTCTG 3070 het 3070 hom 47 21 25 2 T 5 4 99735 CASAVA_Build 16 64035675 3I TAGTCCGAAA ---/AAG AAGTTTATGA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 AAG 1 2 99736 CASAVA_Build 16 64041904 1D CTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 13 12 99737 CASAVA_Build 16 64042945 1I AACAACAACA -/C ACAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 C 0 1 99738 CASAVA_Build 16 64044822 1I TAGCAGGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 630 hom 45 3 19 23 T 12 13 99739 CASAVA_Build 16 64048089 2D TTGAGGGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 25 0 15 11 T 14 12 99740 CASAVA_Build 16 64048242 1D TCTTTTTCTA T/- TTTTTTTTAT 1921 het 1921 ref 18 8 6 4 T 9 8 99741 CASAVA_Build 16 64049046 3D CAACAGTTCT AAG/--- AAGAAGTTAC 3070 het 3070 hom 45 19 22 5 AAG 3 2 99742 CASAVA_Build 16 64049199 4I22M2D TATATGTGTA ----TGTGTGTGTGTGTGTATGTGTCTG/TGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTC-- TGTGTGTGTG 3070 hom 8 het 33 1 16 22 N/A 0 0 99743 CASAVA_Build 16 64050974 1D GTTTGCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 29 4 13 13 A 12 11 99744 CASAVA_Build 16 64053929 1I CTCAACAACC -/T TTTCAATCTG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 3 4 99745 CASAVA_Build 16 64055428 1I CTACACAGCT -/G ATGCTGGCCT 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 G 0 1 99746 CASAVA_Build 16 64055671 2I TTCACAGGCT --/TC TCTGCAGGAG 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 TC 1 2 99747 CASAVA_Build 16 64058265 1D GGACAATTTA G/- GTAGAAAGTA 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 G 2 1 99748 CASAVA_Build 16 64061697 1I CAAATGAGTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 8 9 99749 CASAVA_Build 16 64061928 4D AAGCCAGCTT CAAA/---- CAGCTTTTAG 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 CAAA 1 0 99750 CASAVA_Build 16 64064528 1I GGCACCTGCC -/A ACCACGTCCA 3070 het 1269 hom 18 4 9 5 A 1 2 99751 CASAVA_Build 16 64068295 3I GGAATAATTT ---/AAG AAGAGCCCTT 3070 het 3070 hom 48 19 26 3 AAG 1 2 99752 CASAVA_Build 16 64072431 1D CATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1757 hom 29 9 12 8 T 15 14 99753 CASAVA_Build 16 64074069 1I ACAAAAAATA -/C AAAAATCAGC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 0 1 99754 CASAVA_Build 16 64080577 2D CGCACAGAAA AG/-- AGAGGAAGGT 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 AG 3 2 99755 CASAVA_Build 16 64085653 1I CCTGCTGGGA -/C CCCCCCACTG 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 C 6 7 99756 CASAVA_Build 16 64085800 1I TGTCAGAAGT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 8 9 99757 CASAVA_Build 16 64088085 1D AACTAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 18 8 A 14 13 99758 CASAVA_Build 16 64092054 2D AACAGAAGTT TA/-- TATTTTCTCA 3070 hom 117 het 48 0 40 9 TA 2 1 99759 CASAVA_Build 16 64115030 4D AGTGTGCATG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 55 24 20 12 CA 8 6 99760 CASAVA_Build 16 64124564 1D TTTTGCCTTG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 12 24 5 T 8 7 99761 CASAVA_Build 16 64126912 1D GGGAAAAGAC T/- GACTTGAGTC 3070 het 3070 ref 50 21 23 6 T 1 0 99762 CASAVA_Build 16 64129639 4I ACAGAAAAAT ----/AGAC AGATAAAGGT 3070 hom 153 het 57 0 51 6 AGAC 0 1 99763 CASAVA_Build 16 64131192 1D ACTGTCTCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 10 9 99764 CASAVA_Build 16 64134176 1D AAGTTATGCA T/- TTGAAATTCA 3070 het 3070 hom 57 25 28 4 T 3 2 99765 CASAVA_Build 16 64134256 12D TCTGCAAAAG TGTCATTTCCAA/------------ TGTCATTTCA 2603 het 2603 ref 30 25 8 2 TGTCATTTCCAA 1 0 99766 CASAVA_Build 16 64134378 1I TTTCACATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 35 0 24 11 T 9 10 99767 CASAVA_Build 16 64137238 4D GGAGAGAAAC GAAG/---- GAAGGAAGGC 2755 het 2388 hom 26 10 10 7 GAAG 3 2 99768 CASAVA_Build 16 64169505 2D CACACACACA CG/-- CAAACACATC 3070 het 3070 hom 55 17 26 14 CG 1 0 99769 CASAVA_Build 16 64189441 1I CCATAATAAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 7 8 99770 CASAVA_Build 16 64266874 2D ATTTAGGAGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 TC 10 9 99771 CASAVA_Build 16 64272107 1D AAAAGAAAAA G/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 G 1 0 99772 CASAVA_Build 16 64272880 3D TGTGGGGTAG GGA/--- GGAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 GGA 2 1 99773 CASAVA_Build 16 64274828 1I CCAAGGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 T 10 11 99774 CASAVA_Build 16 64289066 5I GGAATTCACT -----/AGATG CCTTCCATGG 2669 het 1328 hom 17 6 8 3 AGATG 0 1 99775 CASAVA_Build 16 64299395 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTGTTTT 3070 het 1454 hom 22 4 14 4 T 5 6 99776 CASAVA_Build 16 64300925 2I GTTGCAGAGG --/AT GAATAATCCA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 AT 0 1 99777 CASAVA_Build 16 64321848 2I ATTATGGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 10 12 99778 CASAVA_Build 16 64337979 4I AGTGAATTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 TTTG 3 4 99779 CASAVA_Build 16 64351346 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 35 1 29 5 A 13 12 99780 CASAVA_Build 16 64355477 4D AGGCCTAGGC TAAA/---- TAAAGTTCGG 3070 hom 150 het 54 0 50 7 TAAA 2 1 99781 CASAVA_Build 16 64371937 4D CCTCATTCCC TTGG/---- TGGGGGGGGG 119 het 119 ref 24 9 3 13 TTGG 1 0 99782 CASAVA_Build 16 64373386 1D GGGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 30 1 18 11 T 13 12 99783 CASAVA_Build 16 64373827 1D GTAAAATTTC A/- AAGCCTCCTC 3070 hom 96 het 33 0 33 2 A 3 2 99784 CASAVA_Build 16 64377741 4I CCAGTCTTAC ----/TTAT TTTTCATTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTAT 0 1 99785 CASAVA_Build 16 64380778 1I GAGCCCTTAA -/G CTGGCTGGCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 0 1 99786 CASAVA_Build 16 64392299 1I TGATTCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 23 2 18 3 T 10 11 99787 CASAVA_Build 16 64393241 1D ATCTATGTAA C/- CAAAAACTAC 2997 hom 21 het 8 0 8 0 C 2 1 99788 CASAVA_Build 16 64394816 11I ACATGAAGCA -----------/ATAGAGTGTGC ATAAAGTGCT 3070 hom 141 het 54 0 47 7 ATAGAGTGTGC 0 1 99789 CASAVA_Build 16 64398164 2D CTTGGTTGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 17 15 99790 CASAVA_Build 16 64400740 4D TTTGTTTGTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 43 17 12 14 TGTT 6 5 99791 CASAVA_Build 16 64401840 1I TGTCTCCCCC -/T GTTTGAATTC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 0 1 99792 CASAVA_Build 16 64405700 4I GCCACAGATG ----/AACA ACCATCTCCC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 AACA 0 1 99793 CASAVA_Build 16 64409978 4D CTCTTAGAAT AAGG/---- AAGAAAAGAC 3070 het 3070 ref 45 24 18 5 AAGG 1 0 99794 CASAVA_Build 16 64427814 1D TCTTCCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 15 11 5 A 12 11 99795 CASAVA_Build 16 64434138 1D GATTATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 31 1 23 7 A 13 12 99796 CASAVA_Build 16 64444353 2D CAATATCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2547 hom 36 10 16 10 A 14 12 99797 CASAVA_Build 16 64447736 16D ACAGAGTGAC ATGGTGAAACTGAATA/---------------- AGGGCTCTGG 3070 het 3070 ref 60 33 30 9 ATGGTGAAACTGAATA 1 0 99798 CASAVA_Build 16 64448009 1D GGTGTCCTGG C/- CATAGCAGGG 3070 het 3070 ref 32 20 12 0 C 2 1 99799 CASAVA_Build 16 64453341 5I CACTGAAGGC -----/ATGCT ACGCTAAGTT 3070 het 3070 hom 49 21 24 5 ATGCT 0 1 99800 CASAVA_Build 16 64460901 1D CTGGAAGGGG C/- CCATCCTGCC 3070 hom 122 het 46 0 39 7 C 3 2 99801 CASAVA_Build 16 64470721 1D CACGTCATCT A/- GGGGGCTGGA 3070 het 3070 ref 51 28 20 5 A 1 0 99802 CASAVA_Build 16 64472003 1I ATTGAGGGGT -/G GGGGGTAGAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 G 5 6 99803 CASAVA_Build 16 64475735 2D GAAACAAGTC TG/-- GGCATAGAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TG 1 0 99804 CASAVA_Build 16 64481352 8I CCAGGCTCAC --------/GTCTCGTG GTCTCGTGGT 3070 het 3070 hom 51 16 19 16 GTCTCGTG 2 3 99805 CASAVA_Build 16 64482637 1D CCTGCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 T 11 10 99806 CASAVA_Build 16 64485297 2I CAGGTTCCCC --/CT GTGATCTCCA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 CT 0 1 99807 CASAVA_Build 16 64485594 1I GGTCAGGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 A 11 12 99808 CASAVA_Build 16 64485669 1D TAGATGAGGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 9 8 99809 CASAVA_Build 16 64493551 1I ATATCCCAGA -/C ATTTCCAAAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 0 1 99810 CASAVA_Build 16 64494966 8I AGTGTTTCCA --------/GAAGTTAC AAAGCTCACA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 GAAGTTAC 0 1 99811 CASAVA_Build 16 64514233 3I TACCTTCCTC ---/CTT CTATTATAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CTT 0 1 99812 CASAVA_Build 16 64515895 2D CTATTAGTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 27 1 21 7 T 13 11 99813 CASAVA_Build 16 64526307 1D TCATCCATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 79 het 36 0 27 9 T 10 9 99814 CASAVA_Build 16 64535668 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 19 10 A 12 11 99815 CASAVA_Build 16 64536703 1I CTTGAAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2266 hom 35 6 26 3 A 13 14 99816 CASAVA_Build 16 64537382 4I AGTGTATGTG ----/CACA CACACACACA 3070 hom 165 het 63 0 53 10 CA 6 8 99817 CASAVA_Build 16 64540218 1I CCATCTGCCA -/G GGGGATGCCA 3070 hom 126 het 49 0 41 8 G 4 5 99818 CASAVA_Build 16 64542721 1D TGCCAAAATG A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 A 7 6 99819 CASAVA_Build 16 64550571 5D AGGCATGAGC CACCA/----- CACCACACCT 3070 hom 78 het 30 0 27 6 CACCA 2 1 99820 CASAVA_Build 16 64559481 4I ATGTATATAT ----/ATAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 27 11 7 ATAC 0 1 99821 CASAVA_Build 16 64575363 1I TGACTTTGCA -/T TAAGATATTC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 1 2 99822 CASAVA_Build 16 64581292 1D CCTAGGCAAC G/- TAGTGAGACC 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 G 1 0 99823 CASAVA_Build 16 64583718 1I TTAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAT 1411 het 1411 ref 25 15 4 6 A 9 10 99824 CASAVA_Build 16 64598820 2D CTCGGTTGTT AA/-- AAGCATTGAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 A 4 2 99825 CASAVA_Build 16 64606979 12D ATCTCTTCCC AATGCATTTTAA/------------ AATGCATAAT 3070 het 3070 ref 53 28 26 5 AATGCATTTTAA 1 0 99826 CASAVA_Build 16 64607552 1D GTTTCCTTGC T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 T 7 6 99827 CASAVA_Build 16 64608477 2I TTTCAAATAC --/TA TGTCTGATTG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 TA 0 1 99828 CASAVA_Build 16 64609948 1I GGAAAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3064 het 3064 ref 23 10 9 4 A 10 11 99829 CASAVA_Build 16 64637526 3D GAAACCTGAC AAT/--- GTTTTCTGCA 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 AAT 1 0 99830 CASAVA_Build 16 64639146 6I CAAGCATTTG ------/TCTTGC TCTTGCTTTT 3070 hom 88 het 31 0 29 2 TCTTGC 1 2 99831 CASAVA_Build 16 64645789 1D GAGCCACCCC A/- CTCTTTGAGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 1 0 99832 CASAVA_Build 16 64647781 8I TTAGGGGGTA --------/GGGTAAAG GGGTAAAGGG 3070 hom 72 het 26 0 24 4 GGGTAAAG 1 2 99833 CASAVA_Build 16 64651445 2I AGGTCTTTTC --/CT CTGAGATCCC 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 CT 1 2 99834 CASAVA_Build 16 64653749 1D CCCAATTCCA C/- CTGTCCAGAT 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 C 2 1 99835 CASAVA_Build 16 64658598 1D TCGGGGTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 23 19 10 T 10 9 99836 CASAVA_Build 16 64661437 1D ATCTTCATGT G/- GTGGAGCCAT 3070 het 3070 ref 61 30 24 8 G 2 1 99837 CASAVA_Build 16 64681369 1D AAGATGTCCT G/- GGGAGCATAT 3070 het 3070 ref 47 20 15 15 G 4 3 99838 CASAVA_Build 16 64690143 15D TATTTTTGTT AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2429 hom 23 11 9 8 A 25 10 99839 CASAVA_Build 16 64700297 1D CAGAATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 12 11 99840 CASAVA_Build 16 64712015 6D GCATAAAATA GCATGT/------ GCATGTGCAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 9 GCATGT 3 2 99841 CASAVA_Build 16 64718100 9I TGTCACTTCT ---------/CTGTATTAC CTGTATTACC 3070 het 3070 hom 49 16 25 8 CTGTATTAC 1 2 99842 CASAVA_Build 16 64722219 4I ATTAGCTGTT ----/TGTA TGTTGTTGGT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 TGTA 0 1 99843 CASAVA_Build 16 64728038 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 10 9 99844 CASAVA_Build 16 64729361 1I GAAGGACCGG -/A AACTCCTGGG 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 A 2 3 99845 CASAVA_Build 16 64730615 12D TGCATTTTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 2627 hom 43 14 14 17 T 24 12 99846 CASAVA_Build 16 64731603 1D CCTTTCTGGG C/- CACCAAGGGT 3070 het 3070 hom 51 25 22 4 C 2 1 99847 CASAVA_Build 16 64733840 1D TACCATCAGG T/- TTTTTTATCG 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 T 7 6 99848 CASAVA_Build 16 64741023 1I TGTCTTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1632 hom 53 6 37 10 T 13 14 99849 CASAVA_Build 16 64760928 6D GGAAGGAAAG AAAGAA/------ AGAAAAGAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AAAGAA 1 0 99850 CASAVA_Build 16 64760988 3I AAGAAGGAGA ---/AGG AGAAGAAGAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AGG 0 1 99851 CASAVA_Build 16 64779680 1I CCATTCCAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 A 9 10 99852 CASAVA_Build 16 64785758 3D TGGTACATGT TTG/--- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 7 TTG 1 0 99853 CASAVA_Build 16 64787677 1I ATTTCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1337 hom 40 3 29 8 T 12 13 99854 CASAVA_Build 16 64787689 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAGCC 3070 het 1644 hom 40 6 27 7 A 7 8 99855 CASAVA_Build 16 64807732 1D CTGTCAGTGA T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 61 het 24 0 20 5 T 6 5 99856 CASAVA_Build 16 64808234 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2213 het 93 hom 13 1 7 5 A 17 16 99857 CASAVA_Build 16 64811723 1D ATTTCGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 30 2 16 12 T 13 12 99858 CASAVA_Build 16 64821990 1I CCTATCCCCA -/C CCCGACTCCT 3070 het 3070 hom 52 18 23 11 C 3 4 99859 CASAVA_Build 16 64828120 3D GAAGCAAAGA AGG/--- AGAATCCAGA 3070 het 3070 ref 58 30 25 4 AGG 1 0 99860 CASAVA_Build 16 64837353 1I TTGACTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 11 12 99861 CASAVA_Build 16 64840555 1I ACACAATTAG -/C TCAAGGGACT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 0 1 99862 CASAVA_Build 16 64848070 8I GGTGAACGGT --------/TTGTCTGC TTGTCTGCTC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TTGTCTGC 1 2 99863 CASAVA_Build 16 64851891 2D GTGCACACAC AT/-- GTACATGTAC 3070 hom 174 het 66 0 57 9 AT 1 0 99864 CASAVA_Build 16 64854802 1I GGGGGGAATA -/G GGACCTTGGA 3070 hom 75 het 31 0 24 8 G 2 3 99865 CASAVA_Build 16 64875565 1I AATCTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 10 11 99866 CASAVA_Build 16 64894885 1I CTCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 578 hom 34 3 20 11 A 13 14 99867 CASAVA_Build 16 64956803 2D GGACTCACCC CT/-- GTCTCCCCCA 3070 hom 83 het 32 0 26 6 CT 1 0 99868 CASAVA_Build 16 64970552 1D CCTTTCATCC G/- AGTGCATGAC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 G 1 0 99869 CASAVA_Build 16 64975658 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2069 hom 20 het 9 0 7 2 T 12 11 99870 CASAVA_Build 16 64976452 1D TGAGAGCCAC A/- ATGGGATCTG 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 A 2 1 99871 CASAVA_Build 16 64985969 1D TGTTTCTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 10 9 99872 CASAVA_Build 16 64986790 1D CTTGAAATTC G/- TAAGTGTCGT 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 G 1 0 99873 CASAVA_Build 16 64988011 1D TGATTCTTAG T/- TATCATGGCT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 2 1 99874 CASAVA_Build 16 64989805 8D TAAACCTCAG ACCACCCC/-------- ACCACCCCAC 3070 het 2799 hom 37 9 20 11 ACCACCCC 2 1 99875 CASAVA_Build 16 64997133 1I AGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 513 hom 39 3 23 13 A 13 14 99876 CASAVA_Build 16 65000957 1I AACCCAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 19 1 14 4 T 11 12 99877 CASAVA_Build 16 65012782 1D TGCCATATTT G/- TGCTACATGA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 G 1 0 99878 CASAVA_Build 16 65021243 2D AGGATTTGGA AC/-- ACAGCCAGTG 3070 het 3070 hom 38 13 21 5 AC 2 1 99879 CASAVA_Build 16 65023008 1I TATTCCCTAG -/T TTTTTTTTTT 1835 het 1835 ref 29 15 5 9 T 11 12 99880 CASAVA_Build 16 65028733 4I TCCTAATTCC ----/CACT CAAAGATCCA 3070 het 2795 hom 29 7 14 8 CACT 0 1 99881 CASAVA_Build 16 65031017 1I CTCCAGGGTG -/T TGGTCACTGA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 1 2 99882 CASAVA_Build 16 65098334 2D TACTGTTTTC CA/-- CAGTTATTTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 CA 2 1 99883 CASAVA_Build 16 65153496 1I ATTAATTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 35 1 27 7 T 11 12 99884 CASAVA_Build 16 65248490 1D AATTTCCTGA T/- TTTTTTTTTT 1381 het 566 hom 19 3 8 8 T 17 16 99885 CASAVA_Build 16 65299791 1I TCAAAATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 10 11 99886 CASAVA_Build 16 65301118 1D AAATAAATAT A/- AAAAAAAATT 2611 het 1985 hom 14 5 6 3 A 9 8 99887 CASAVA_Build 16 65315230 1D TTTTGTCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 13 12 99888 CASAVA_Build 16 65327411 1I TCAACAGTTT -/C CTCAAACTTT 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 C 1 2 99889 CASAVA_Build 16 65330405 3D ATAAAAACAG AGA/--- AGAACTCCTC 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 AGA 2 1 99890 CASAVA_Build 16 65339970 4D GGGCATTTCT TTCA/---- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 14 14 3 TTCA 1 0 99891 CASAVA_Build 16 65344446 1I TGCAGATTTC -/A AACAGGGCAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 2 3 99892 CASAVA_Build 16 65355488 2I GGAATTTTAA --/CT CTCTTCAAGG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 CT 2 3 99893 CASAVA_Build 16 65363456 1D TCTACTTTTT A/- AAAATCTTTT 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 A 5 4 99894 CASAVA_Build 16 65368328 1D ATTGGTGAAA G/- ATGTTGTGGG 3070 het 3070 ref 45 18 18 10 G 1 0 99895 CASAVA_Build 16 65371806 1I TCTACAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 12 13 99896 CASAVA_Build 16 65372375 6I ACATGACCAC ------/TTTTTA TTTTTAACAT 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 TTTTTA 1 2 99897 CASAVA_Build 16 65375649 3I CGATTTCTAA ---/TCT TCTCTTCATT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 TCT 1 2 99898 CASAVA_Build 16 65378688 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2624 het 2202 hom 25 11 8 6 T 16 15 99899 CASAVA_Build 16 65389587 2I TATTTTTGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 13 15 99900 CASAVA_Build 16 65391952 1D CCACCACACC A/- AGGCCAAGAA 2676 het 2528 hom 16 7 6 4 A 2 1 99901 CASAVA_Build 16 65394015 3I CATATCCAGA ---/AAT AATATCTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AAT 1 2 99902 CASAVA_Build 16 65395651 1I AAAAACAAAA -/C AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 C 0 1 99903 CASAVA_Build 16 65396216 1I TCTCTTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 11 99904 CASAVA_Build 16 65409176 4D ACACCAATCC TAAG/---- TAAGAAAGGA 3070 het 3070 ref 40 19 13 9 TAAG 2 1 99905 CASAVA_Build 16 65423061 15D GATGGAGGAG TGTTTTGTTTTGTTT/--------------- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 10 TGTTT 6 3 99906 CASAVA_Build 16 65426144 1D ATTAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1954 hom 25 7 14 4 A 13 12 99907 CASAVA_Build 16 65454769 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 9 10 99908 CASAVA_Build 16 65467489 1I TTTTGCTTTT -/C CCCCCCCTCA 2318 het 2318 ref 18 12 5 1 C 7 8 99909 CASAVA_Build 16 65559090 1D TTCACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1707 hom 39 10 14 15 T 15 14 99910 CASAVA_Build 16 65571923 1D ATTGTCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 628 hom 25 2 16 7 T 14 13 99911 CASAVA_Build 16 65637201 1D ACTTTCTACA T/- TTTTTTTTTT 1953 het 1953 ref 33 13 7 13 T 17 16 99912 CASAVA_Build 16 65645249 1D TCTTTTATCC T/- TTTTTTTTTT 1026 het 1026 ref 57 35 6 17 T 15 14 99913 CASAVA_Build 16 65657161 1I GGGTTAACTT -/A ACCAGTTTCT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 1 2 99914 CASAVA_Build 16 65674703 1I ATTATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 24 10 4 10 T 15 16 99915 CASAVA_Build 16 65676906 1I TTTTTTGGGT -/G GGGGGTGGGG 2506 hom 29 het 14 0 5 9 G 5 6 99916 CASAVA_Build 16 65690570 1I ATTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2515 hom 35 8 17 10 T 11 12 99917 CASAVA_Build 16 65719510 1D CCCGCCTGTG A/- AGTAGGTACT 3070 hom 129 het 46 0 42 4 A 2 1 99918 CASAVA_Build 16 65777261 2D GAGGAAGGGA GT/-- GTGTGTGTGT 1164 het 1164 ref 47 39 4 4 GT 7 6 99919 CASAVA_Build 16 66070618 1I GTACTGCCGA -/T TTTTTTTTTT 2238 het 2238 ref 28 11 6 11 T 15 16 99920 CASAVA_Build 16 66224059 1I GTGTGCTTTT -/C CCCCCAATTC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 5 6 99921 CASAVA_Build 16 66433194 4D TCCCCAACGC AAAG/---- AAAGGGGCTC 3070 het 3070 ref 30 14 9 8 AAAG 2 1 99922 CASAVA_Build 16 66610349 2D TTGGCCTCCC AA/-- AGTGCTGAGA 3070 het 3070 hom 27 11 14 5 A 3 1 99923 CASAVA_Build 16 66626796 1D TGTGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1104 het 1104 ref 46 29 3 14 T 12 11 99924 CASAVA_Build 16 66644050 1D ATGTATGGAC T/- TTTTTTTTTT 1251 het 1251 ref 25 13 5 7 T 15 14 99925 CASAVA_Build 16 66681700 1D AAACACGCAA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 19 het 27 1 16 10 C 12 11 99926 CASAVA_Build 16 66861158 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 27 2 19 6 A 14 13 99927 CASAVA_Build 16 66861615 1I CCTCAGTCTT -/A AAGCAGGCCC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 2 3 99928 CASAVA_Build 16 66862858 5D TACAGGTGTG TGCCA/----- TGCCACCATG 3070 hom 93 het 33 0 30 6 TGCCA 2 1 99929 CASAVA_Build 16 66863664 1I CAGACAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 11 99930 CASAVA_Build 16 66868320 12I GATCTCTTGA ------------/GCCCGGGAAGTC GCCCGGGAAG 1669 het 1669 ref 17 9 5 3 GCCCGGGAAGTC 1 2 99931 CASAVA_Build 16 66874996 11I AAAAAGGGAA -----------/ATGAAAAAGGG GAACAGATAG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 ATGAAAAAGGG 0 1 99932 CASAVA_Build 16 66903186 1D CTTCCCCAAC T/- TTTATCCCGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 3 99933 CASAVA_Build 16 66914124 1I TGTTCATCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 8 9 99934 CASAVA_Build 16 66919326 1D TAGAGTGAGA C/- CCTTCTCAAA 3070 hom 39 het 16 0 13 4 C 3 2 99935 CASAVA_Build 16 66926765 4D TATGTGACTC ATTG/---- ATTGATTGAG 3070 hom 82 het 32 0 27 7 ATTG 3 2 99936 CASAVA_Build 16 66929108 1I CTCCATTCCT -/G GGGGGGGCTC 3070 hom 109 het 41 0 31 10 G 7 8 99937 CASAVA_Build 16 66931986 1D ACCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 22 0 11 12 A 15 14 99938 CASAVA_Build 16 66937984 3I TAGGCCACCC ---/CCT CCTCTTTTCA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 CCT 1 2 99939 CASAVA_Build 16 66938391 3D CGGGGCCTCT AGG/--- CTGGGTTGAG 3070 hom 95 het 38 0 24 15 AGG 1 0 99940 CASAVA_Build 16 66949078 25I TCTGCTAGGA -------------------------/GGGTGGAGATTTCTGGCCCTCTAGT GGGTGGAGAT 3070 hom 62 het 23 0 20 3 GGGTGGAGATTTCTGGCCCTCTAGT 0 1 99941 CASAVA_Build 16 66951302 3D CAGATCGGGG ACC/--- ACAAGCTGTT 3070 hom 108 het 42 0 35 9 ACC 1 0 99942 CASAVA_Build 16 66951753 1D TTCTTCCTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 21 het 20 0 11 10 A 10 9 99943 CASAVA_Build 16 66954585 1D GGCCTGGCCC G/- GGGGAAATTC 3070 hom 54 het 21 0 16 5 G 5 4 99944 CASAVA_Build 16 66958840 10D TCTGTTTGTC GTGCGCTGCT/---------- GTGCGCTGCT 3070 hom 71 het 27 0 22 8 GTGCGCTGCT 2 1 99945 CASAVA_Build 16 66962023 1I GAACGGGCCC -/A AGATCACCCA 3070 hom 89 het 35 0 28 7 A 1 2 99946 CASAVA_Build 16 66988065 1D TGGAATCAAT A/- AAGTGATTTC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 A 3 2 99947 CASAVA_Build 16 67007209 1D CCTCTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 1621 hom 24 het 24 0 6 18 T 17 16 99948 CASAVA_Build 16 67025275 1D TTCTAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 1975 het 1975 ref 33 23 5 5 T 12 11 99949 CASAVA_Build 16 67026541 1I AAGACAGCCC -/G AGCAGATCTG 3070 hom 108 het 42 0 35 7 G 0 1 99950 CASAVA_Build 16 67026886 1D CACTCTGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 23 0 20 4 T 10 9 99951 CASAVA_Build 16 67035929 1D ACTCCAAGAA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 8 7 99952 CASAVA_Build 16 67041401 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1778 het 262 hom 19 2 10 8 A 19 18 99953 CASAVA_Build 16 67041852 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 475 hom 37 2 24 11 T 14 13 99954 CASAVA_Build 16 67044933 1I GGGGAGGAGA -/G GAGAAAACCA 3070 hom 143 het 50 0 48 2 G 1 2 99955 CASAVA_Build 16 67050758 3D GTGTAGAAGA TAT/--- TGTTGTTTGA 3070 hom 93 het 32 0 30 3 TAT 1 0 99956 CASAVA_Build 16 67052780 1D TTTTGTGTGA T/- TTTTGATTCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 5 4 99957 CASAVA_Build 16 67055034 17I TTACCATTCA -----------------/AGTGCCTACCCCATCAT GCTCTGGTGG 3070 hom 97 het 38 0 30 8 AGTGCCTACCCCATCAT 0 1 99958 CASAVA_Build 16 67057953 7D GTTATAACAG ATAGTGA/------- TCTCTGTTAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ATAGTGA 1 0 99959 CASAVA_Build 16 67077601 1D CATAGATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 23 1 18 4 T 11 10 99960 CASAVA_Build 16 67108207 6D AAATTAAATG ACATAT/------ AAATAATATA 3070 het 3070 ref 28 20 8 1 ACATAT 1 0 99961 CASAVA_Build 16 67112689 3D CATCATCATC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 ATT 7 6 99962 CASAVA_Build 16 67123926 16D ACAAGAAATC TGTGTGTGTGTGTGTG/---------------- TGTGTGTGTG 2812 het 2812 ref 37 12 8 22 TG 17 9 99963 CASAVA_Build 16 67129326 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 8 9 99964 CASAVA_Build 16 67134971 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1471 hom 28 8 13 7 T 13 12 99965 CASAVA_Build 16 67139053 3D AGGATTATTT TTG/--- TTGTTGTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 9 6 TTG 3 2 99966 CASAVA_Build 16 67143479 1I GTTAGTTTTT -/A AAAAGGGGTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 4 5 99967 CASAVA_Build 16 67147712 4D TGGGGCACCT CAGC/---- CAGCCAGCCA 3070 het 3070 ref 46 19 15 14 CAGC 4 3 99968 CASAVA_Build 16 67150966 4I CAGATTTTTA ----/AATT AATTAATTAA 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 AATT 3 4 99969 CASAVA_Build 16 67157138 1I GCAGAAAAGT -/A TAAGTCTAAT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 0 1 99970 CASAVA_Build 16 67157527 2I ACAGAGCAAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 AC 5 6 99971 CASAVA_Build 16 67161456 2D GTGTGTATAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 GT 9 8 99972 CASAVA_Build 16 67163584 1I TGACAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 11 12 99973 CASAVA_Build 16 67168153 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 798 hom 16 2 11 3 A 9 10 99974 CASAVA_Build 16 67181748 1D GGAGGATCCC T/- TGAGGCCAGG 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 2 1 99975 CASAVA_Build 16 67183984 1I GACTAATACA -/C CCCCCTTACC 3070 het 3070 hom 48 23 20 5 C 5 6 99976 CASAVA_Build 16 67228936 1D GCTCTTAATC T/- TTTTTTTTTT 1505 het 754 hom 30 5 7 18 T 15 14 99977 CASAVA_Build 16 67232051 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 22 3 10 9 A 17 16 99978 CASAVA_Build 16 67238078 1I GGTTGAAACC -/T TAGTTCTTAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 1 2 99979 CASAVA_Build 16 67238404 2I CTGCAAATAA --/CT CTGCAGATTG 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 CT 1 2 99980 CASAVA_Build 16 67246443 4D CCATCTCCAA AAAT/---- AAATAAATAC 3070 het 2029 hom 24 5 16 7 AAAT 3 2 99981 CASAVA_Build 16 67263606 1I AAAAAAAAAA -/T AAATAAATAA 2702 het 27 hom 8 1 6 1 T 0 1 99982 CASAVA_Build 16 67263673 5I TTGGGAAAGG -----/TCATT TCATTTCAGT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TCATT 1 2 99983 CASAVA_Build 16 67264878 1I GGTCAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3064 het 892 hom 31 2 13 16 T 12 13 99984 CASAVA_Build 16 67269331 1D CACCCTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3015 het 3015 ref 31 15 10 6 T 14 13 99985 CASAVA_Build 16 67299812 5D AGTTTCACTC CAAAT/----- CAAACCACGT 3070 het 3070 ref 47 22 18 8 CAAAT 1 0 99986 CASAVA_Build 16 67303701 1I TTGACCTCCT -/A AAATCCTGGG 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 A 3 4 99987 CASAVA_Build 16 67306557 1D AGGCCGGGCG C/- CATGACTCAC 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 C 2 1 99988 CASAVA_Build 16 67312023 1D TTATTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 39 2 22 16 T 15 14 99989 CASAVA_Build 16 67319566 4D TATGAGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 66 het 32 0 22 10 TTTG 4 3 99990 CASAVA_Build 16 67319960 2D TCAGCCTCCC AA/-- AGTGATGGGA 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 A 3 1 99991 CASAVA_Build 16 67326268 1D ATTATTTCAC T/- GGGGACAGAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 T 1 0 99992 CASAVA_Build 16 67328200 1I AAGGCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 20 7 A 9 10 99993 CASAVA_Build 16 67328348 1D AAAGAGTGAG A/- CCCCATCTCC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 1 0 99994 CASAVA_Build 16 67331530 2D CCACTTTCTC CT/-- CTCTCATGAT 3070 hom 108 het 41 0 37 6 CT 3 2 99995 CASAVA_Build 16 67341379 1I TATTTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 11 12 T 10 11 99996 CASAVA_Build 16 67343969 4I AACAGATCTC ----/TCTT TCTAGAGGAT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 TCTT 0 1 99997 CASAVA_Build 16 67344748 1I CTTGTAAATC -/T TTTTTTTTTT 1643 het 1643 ref 16 7 7 2 T 10 11 99998 CASAVA_Build 16 67349172 4D TCTCTCTCTC TCCT/---- TCCTTCCTTC 2800 het 2800 ref 25 10 9 6 TCCT 6 5 99999 CASAVA_Build 16 67360871 1D ATGGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 6 T 13 12 100000 CASAVA_Build 16 67366530 2D GCCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1206 hom 29 9 11 10 A 16 14 100001 CASAVA_Build 16 67374817 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 2601 hom 31 11 13 7 A 7 8 100002 CASAVA_Build 16 67375623 1D ATGTTCTCTT A/- AAAAGCCATA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 5 4 100003 CASAVA_Build 16 67376211 1D AGTTCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2859 hom 27 9 16 2 T 13 12 100004 CASAVA_Build 16 67376428 1D GACACCATTG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 9 8 100005 CASAVA_Build 16 67386257 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1572 hom 14 het 8 0 5 3 T 13 12 100006 CASAVA_Build 16 67388169 1I TTTTGTCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 27 14 2 A 10 11 100007 CASAVA_Build 16 67389483 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2609 hom 26 8 11 9 A 12 11 100008 CASAVA_Build 16 67446023 1D AAGGTCAAAG T/- TTTTTTTTTT 2537 het 2537 ref 36 17 8 11 T 17 16 100009 CASAVA_Build 16 67464938 1I GGCTGGTCTC -/A AAACGCCTGA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 A 3 4 100010 CASAVA_Build 16 67499925 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2155 hom 23 8 14 1 A 10 9 100011 CASAVA_Build 16 67510441 1I AGAATTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 T 11 12 100012 CASAVA_Build 16 67515598 1I TCTCTAATTC -/T TTTTGCTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 4 5 100013 CASAVA_Build 16 67517481 1D AGAAGAGAAA T/- TAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 2 1 100014 CASAVA_Build 16 67531409 1I ACTACAAGGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 7 8 100015 CASAVA_Build 16 67533720 1I GAGCAAAACT -/C CCATCTCAAA 3070 het 2049 hom 25 6 13 6 C 2 3 100016 CASAVA_Build 16 67534307 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2123 het 2123 ref 22 9 5 8 T 17 16 100017 CASAVA_Build 16 67545920 1D TGCTCAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 A 9 8 100018 CASAVA_Build 16 67556559 4I ATTTTCTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 2027 hom 32 10 14 8 TTTG 2 3 100019 CASAVA_Build 16 67557283 4D TTTCTTATAG TTTC/---- TTAATAACAA 1944 het 1944 ref 13 7 4 2 TTTC 1 0 100020 CASAVA_Build 16 67568717 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 11 10 100021 CASAVA_Build 16 67578571 1I TATTTTTTTT -/C CTATGATATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 100022 CASAVA_Build 16 67580701 1D CTCTGTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 11 10 100023 CASAVA_Build 16 67588370 5D GTCCATAGAG GAAAT/----- GAAATAAAGA 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 GAAAT 2 1 100024 CASAVA_Build 16 67596674 2D GCATGCAATT TG/-- ACAGTAAGAG 3070 het 3070 hom 40 16 18 9 TG 1 0 100025 CASAVA_Build 16 67605762 1D GTCTTCTAGC A/- GACTTTCCTT 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 A 1 0 100026 CASAVA_Build 16 67609433 1I TCAGCCTCCC -/A AAGTAGCGGG 3070 het 1238 hom 14 3 10 1 A 2 3 100027 CASAVA_Build 16 67614108 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2982 hom 29 8 12 9 A 10 11 100028 CASAVA_Build 16 67617625 1I AGGCTGGTCT -/C AAACTCCTAA 3070 het 3070 ref 19 12 7 1 C 0 1 100029 CASAVA_Build 16 67665684 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2899 het 2899 ref 26 14 8 4 TA 7 8 100030 CASAVA_Build 16 67670980 1D TAATGGACTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 9 8 100031 CASAVA_Build 16 67671646 1I GGGAAAAAAT -/C ATGGTACACA 3070 het 3070 ref 38 24 9 5 C 0 1 100032 CASAVA_Build 16 67682121 13D ACAGGGGCGT GCTACCACGCCTG/------------- GCTAATTTTC 1574 het 1574 ref 19 14 4 5 GCTACCACGCCTG 1 0 100033 CASAVA_Build 16 67693190 2D TATACTTGTA CT/-- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 13 1 CT 2 1 100034 CASAVA_Build 16 67694279 4D ATGTTGCTGC TGAG/---- TGAGGACGGA 3070 het 3070 ref 41 26 12 4 TGAG 2 1 100035 CASAVA_Build 16 67755077 3D TTGTGATTAT AAG/--- GAGATCTTTA 2835 het 2835 ref 28 16 8 5 AAG 1 0 100036 CASAVA_Build 16 67896255 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1578 het 1578 ref 20 12 4 4 T 12 11 100037 CASAVA_Build 16 67935400 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 922 het 922 ref 21 12 4 5 T 15 14 100038 CASAVA_Build 16 67996450 1D TGTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1214 het 11 hom 17 1 7 9 T 18 17 100039 CASAVA_Build 16 68004745 1I AAAACCACTC -/A AGTGTTTTGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 100040 CASAVA_Build 16 68012850 1D GATGAGAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 32 10 A 11 10 100041 CASAVA_Build 16 68016760 1I GCCTCCACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 200 hom 27 1 21 5 T 9 10 100042 CASAVA_Build 16 68030013 1D TTTTCATTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 100043 CASAVA_Build 16 68033550 3I CTTGGATCTC ---/AAG AAAATAGGAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAG 0 1 100044 CASAVA_Build 16 68036070 1D TGCTTCAGTG A/- AAAAAAAAAA 1366 het 1366 ref 26 18 4 4 A 11 10 100045 CASAVA_Build 16 68078751 1D TTTTATTAAG A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 A 8 7 100046 CASAVA_Build 16 68089972 2I ACTCAACTGT --/TC TCTGATGTCT 3070 hom 114 het 43 0 37 6 TC 1 2 100047 CASAVA_Build 16 68094086 1I TATTTTTATT -/A AAAAAAAAAA 2781 het 882 hom 21 5 8 8 A 11 12 100048 CASAVA_Build 16 68116119 1D GGAGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 944 hom 34 3 22 9 T 13 12 100049 CASAVA_Build 16 68117311 5I ACTTTCTTTC -----/TCTTT TCTTTTCTTT 3070 hom 56 het 31 0 19 12 TCTTT 3 4 100050 CASAVA_Build 16 68117832 1I TATTCTATGA -/C CCAGTGAAAC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 2 3 100051 CASAVA_Build 16 68122171 1I ATGCGGGGGT -/G GGGGGGGAAA 3070 hom 63 het 26 0 19 7 G 7 8 100052 CASAVA_Build 16 68122492 1D TTTAAGGAAG A/- ATAGTTTTTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 2 1 100053 CASAVA_Build 16 68123396 1I GTGCAACCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 36 4 23 10 T 15 16 100054 CASAVA_Build 16 68124600 7D ACCACTAGGT GCCCGAA/------- GCACTCCTCC 3070 hom 78 het 29 0 25 5 GCCCGAA 1 0 100055 CASAVA_Build 16 68139519 1D AAATGTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 12 11 100056 CASAVA_Build 16 68141508 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 9 3 A 10 11 100057 CASAVA_Build 16 68169395 1D ACCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 88 het 37 0 29 9 A 10 9 100058 CASAVA_Build 16 68209563 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1333 het 1333 ref 13 5 4 4 A 17 16 100059 CASAVA_Build 16 68214237 2D TTTGTTTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 1653 het 444 hom 25 7 5 13 A 14 12 100060 CASAVA_Build 16 68221345 1D ACCTGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 1248 het 1248 ref 19 12 3 4 T 15 14 100061 CASAVA_Build 16 68297004 2D CCTGTCTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 13 11 100062 CASAVA_Build 16 68308894 16D ACCGCAGGAT TCGCTAACTGAAGGAA/---------------- TCGCTAACTG 3070 hom 149 het 49 0 48 9 TCGCTAACTGAAGGAA 2 1 100063 CASAVA_Build 16 68332624 6D TATTTAAAAA AATAAT/------ AATAATACAG 1912 hom 10 het 4 0 4 1 AAT 4 2 100064 CASAVA_Build 16 68335058 1I CATACTCTTC -/G AAAAGTGTCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 0 1 100065 CASAVA_Build 16 68342769 1I ATTTTTATTC -/T TTTTGCATTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 4 5 100066 CASAVA_Build 16 68349957 5D TCTTTCTTTC TTTCT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 5 TTTCT 1 0 100067 CASAVA_Build 16 68369477 2D CCTGTCTCAA AT/-- ATATATATAT 2649 hom 18 het 14 0 7 7 AT 9 8 100068 CASAVA_Build 16 68376627 2I GTGTGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 86 het 32 0 24 8 CT 1 2 100069 CASAVA_Build 16 68401711 1D AGGGGACATT C/- GCCCTGGCCA 3070 hom 100 het 36 0 28 8 C 1 0 100070 CASAVA_Build 16 68405858 2D CACTATTTAT AA/-- ATATTTACAA 3070 hom 102 het 41 0 33 9 A 3 1 100071 CASAVA_Build 16 68418559 1I GGAAATTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 44 2 29 13 A 12 13 100072 CASAVA_Build 16 68421362 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2522 het 675 hom 25 4 11 10 T 15 16 100073 CASAVA_Build 16 68423757 1I TGAAAATCCC -/A GACATACTTC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 0 1 100074 CASAVA_Build 16 68427697 1D TCCTGCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 44 0 34 10 T 12 11 100075 CASAVA_Build 16 68529447 3D CGTATGGGTT TTG/--- TTGTTGTCGT 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 TTG 3 2 100076 CASAVA_Build 16 68569449 2I CCTGGCAGAC --/TA TGTCCAAAAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TA 0 1 100077 CASAVA_Build 16 68570548 2D GTTTTGTGAA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 36 het 17 0 12 6 CT 8 7 100078 CASAVA_Build 16 68570967 1I ATTGAGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 19 1 14 4 A 10 11 100079 CASAVA_Build 16 68579811 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1120 hom 7 het 4 0 3 1 A 13 14 100080 CASAVA_Build 16 68590511 1D GAATCTATCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 841 hom 27 4 19 4 A 10 9 100081 CASAVA_Build 16 68596323 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 368 hom 19 1 14 4 A 8 9 100082 CASAVA_Build 16 68607267 11I TGTTAATGCC -----------/CAGGTGAGGCA CAGTGGTGAG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 CAGGTGAGGCA 0 1 100083 CASAVA_Build 16 68610207 1D AAGAAATTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 184 hom 17 1 15 1 T 10 9 100084 CASAVA_Build 16 68619151 1D CACCCAGCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 23 het 9 0 8 1 T 8 7 100085 CASAVA_Build 16 68640570 1D21M5D AACCTGTCTC AAAAAAAAAAACAAAAAAAAAATAGAC/-AAAAAAAAAACAAAAAAAAAA----- AAAATACAGC 797 het 797 ref 24 11 9 12 N/A 0 0 100086 CASAVA_Build 16 68649880 1D TCCCATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 29 0 20 10 T 11 10 100087 CASAVA_Build 16 68650189 2I TGAGTGTGTC --/TG TGAGAATATG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 TG 1 2 100088 CASAVA_Build 16 68653085 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 18 1 14 3 A 13 12 100089 CASAVA_Build 16 68660404 2I CTCTACTGAC --/AT ATGGCTTTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 1 2 100090 CASAVA_Build 16 68662779 1I AGTCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 27 2 13 12 A 13 14 100091 CASAVA_Build 16 68667445 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 33 1 22 10 A 14 13 100092 CASAVA_Build 16 68673291 1D ACGGGTGCTC A/- CCACCACGCC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 1 0 100093 CASAVA_Build 16 68674630 1D ATAGTCTTAT G/- GGAATTTTTA 3070 het 3070 ref 42 28 12 2 G 3 2 100094 CASAVA_Build 16 68680322 1I CCCAATTTAG -/C CCTGGTCTCT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 2 3 100095 CASAVA_Build 16 68694326 1I TATAATATAG -/C CATTCATAAT 2187 het 2187 ref 31 21 5 5 C 1 2 100096 CASAVA_Build 16 68711306 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 13 0 9 4 T 10 9 100097 CASAVA_Build 16 68733153 1D CAGGATTGTC T/- TTTCCTTCTG 1555 het 1555 ref 71 57 5 9 T 4 3 100098 CASAVA_Build 16 68746597 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2973 hom 24 11 9 4 A 12 11 100099 CASAVA_Build 16 68746865 1I ACCAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 6 7 100100 CASAVA_Build 16 68749963 2D CTTTAGTGCC TA/-- AACCTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 23 11 11 TA 1 0 100101 CASAVA_Build 16 68754671 1I TTTTGAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 T 13 14 100102 CASAVA_Build 16 68758940 1D ACCCCTATCT A/- AAAAAAAAGA 1527 het 1527 ref 22 11 5 6 A 9 8 100103 CASAVA_Build 16 68790032 1D CTCCCTCCCC G/- AATCGTTGGA 2420 het 2420 ref 37 26 6 5 G 1 0 100104 CASAVA_Build 16 68840460 3D TATTCCAGAC ACA/--- ACAATACCAT 3070 hom 36 het 17 0 12 6 ACA 2 1 100105 CASAVA_Build 16 68857194 17D GGCCCTGTGT GCCCATCAGAAAATCCA/----------------- GCACATCTTT 3070 hom 70 het 22 0 24 1 GCCCATCAGAAAATCCA 1 0 100106 CASAVA_Build 16 68872756 1I CTTGGTGAGA -/C CCCCCATCTC 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 C 5 6 100107 CASAVA_Build 16 68904900 4I ACTGATAGCA ----/AGGG AGGGTGTGGG 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 AGGG 1 2 100108 CASAVA_Build 16 68927039 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGTTTCAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 5 4 100109 CASAVA_Build 16 69049568 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1897 het 1897 ref 21 10 4 7 T 14 13 100110 CASAVA_Build 16 69077302 1I AATGCCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 17 1 12 4 T 11 12 100111 CASAVA_Build 16 69081166 1I GAGGACTGAG -/A GCTCAGAGGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 1 100112 CASAVA_Build 16 69093931 1I CTTGAACCCG -/A AGAGGCGGAG 1428 hom 15 het 6 0 6 0 A 1 2 100113 CASAVA_Build 16 69095000 5D CTACTTACTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 23 0 15 8 T 17 12 100114 CASAVA_Build 16 69102710 2I GTTTTGTGCC --/CT GTTTAACAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CT 0 1 100115 CASAVA_Build 16 69121433 8I AGCTACTTGG --------/GAGGCTGA GGCAGGAGAA 3070 hom 21 het 13 0 7 6 GAGGCTGA 0 1 100116 CASAVA_Build 16 69124142 4I CCTGAATACC ----/TTGT TTATCTTTTG 3070 hom 137 het 52 0 46 6 TTGT 0 1 100117 CASAVA_Build 16 69130953 1I ACTCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 33 0 25 8 A 10 11 100118 CASAVA_Build 16 69131183 1D ATCAAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 28 1 23 4 T 15 14 100119 CASAVA_Build 16 69131788 1D CTTTTTGGGG T/- TTTTTTTGGT 3070 het 6 hom 34 1 24 9 T 8 7 100120 CASAVA_Build 16 69133621 7D ATGTATATGT TTATGTG/------- TTATATCTTT 3070 hom 123 het 42 0 42 0 TTATGTG 1 0 100121 CASAVA_Build 16 69135256 1I TTTTGTGTTT -/C TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 0 1 100122 CASAVA_Build 16 69145102 2I TAGAAGAAAC --/TT TGAGGGTTTC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 1 3 100123 CASAVA_Build 16 69145710 8D TCTGTGTGCA TGTGTATG/-------- TGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 40 23 15 9 TGTGTATG 2 1 100124 CASAVA_Build 16 69149677 1D AATTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 125 hom 33 2 23 8 T 12 11 100125 CASAVA_Build 16 69151173 1I TGAAAACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 13 5 T 13 14 100126 CASAVA_Build 16 69151326 1D TGAGGGGTGC G/- GGGGGGTGGT 3070 hom 46 het 19 0 13 6 G 7 6 100127 CASAVA_Build 16 69154536 1D CATACATGGC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 71 het 31 0 24 9 T 9 8 100128 CASAVA_Build 16 69183487 1D TCCTTCTACT C/- CCCCCACCAC 3070 hom 45 het 20 0 14 6 C 6 5 100129 CASAVA_Build 16 69187415 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1647 het 1647 ref 25 15 4 6 A 15 14 100130 CASAVA_Build 16 69202384 3I TTTCTTCTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 TTG 3 4 100131 CASAVA_Build 16 69212132 1I ATTATTTAGA -/T TTTGCAGGAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 3 4 100132 CASAVA_Build 16 69225697 2I AAGATATGAA --/CT CTGGGGGCAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 CT 1 2 100133 CASAVA_Build 16 69226319 4I CAGATCAGCA ----/GTTT GTTCCTTTTA 3070 hom 128 het 49 0 41 8 GTTT 0 1 100134 CASAVA_Build 16 69232679 3I TTCATCTCAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAC 3 4 100135 CASAVA_Build 16 69233215 1D AAGCAATCCA C/- CCCCCCGCAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 C 7 6 100136 CASAVA_Build 16 69234288 4D CCATAGAGAC AGAA/---- AGAATATTAG 3070 hom 91 het 34 0 30 5 AGAA 2 1 100137 CASAVA_Build 16 69235224 3D TATTAAAGAG TTA/--- TTAATTTGAG 3070 hom 60 het 22 0 21 4 TTA 2 1 100138 CASAVA_Build 16 69236347 3D GGAAGAGGAG GAA/--- GGAGGAAGAG 826 het 67 hom 12 2 2 8 GAA 1 0 100139 CASAVA_Build 16 69243167 1D CTGCTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 18 8 A 15 14 100140 CASAVA_Build 16 69244117 1D TGGTTATATC T/- TTTTTGCTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 6 5 100141 CASAVA_Build 16 69251374 1I TGCTGCAGTC -/T TTTTTTTTTT 2761 het 2137 hom 22 7 8 7 T 11 12 100142 CASAVA_Build 16 69258747 1D AGAATATTAA G/- AAAGAATCTA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 G 1 0 100143 CASAVA_Build 16 69265595 18D CCTTCAGGCC AGTCTCAACAGCTATAGT/------------------ AGTCTCAACA 3070 hom 48 het 21 0 17 7 AGTCTCAACAGCTATAGT 2 1 100144 CASAVA_Build 16 69280882 1I CTTCAGGTGG -/C CCACCAGCCT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 2 3 100145 CASAVA_Build 16 69289396 1I GCCACCACCC -/T CAGCCGGGAC 3070 hom 60 het 23 0 19 4 T 0 1 100146 CASAVA_Build 16 69290567 2I TGAGCAATGG --/CC CCCCCACCCC 2669 hom 26 het 12 0 8 4 C 5 7 100147 CASAVA_Build 16 69305114 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1076 het 113 hom 17 3 6 8 T 15 14 100148 CASAVA_Build 16 69337244 1D CTTCAGCCCT G/- GACCAGGGAA 3070 hom 37 het 14 0 10 4 G 2 1 100149 CASAVA_Build 16 69370857 2D CTTGTTTCTC TT/-- GTTTTATGGC 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 T 2 0 100150 CASAVA_Build 16 69408296 1D CTCTCCCACC T/- CCACACATAC 3070 het 3070 ref 96 73 15 8 T 1 0 100151 CASAVA_Build 16 69409335 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGTTTCAC 2533 het 2533 ref 14 6 6 2 G 4 5 100152 CASAVA_Build 16 69410447 1D CCTCACAAGT A/- AGCTGGGATT 3070 het 3070 hom 57 26 22 10 A 2 1 100153 CASAVA_Build 16 69411221 1I TAACATTCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 48 19 21 9 T 9 10 100154 CASAVA_Build 16 69415474 2D GTTTTTTTTT TA/-- TAGTGGGAGG 1480 het 1480 ref 67 37 6 24 TA 2 1 100155 CASAVA_Build 16 69415937 1I TTTGATTCAC -/T TTTTTTTTTT 1262 het 1262 ref 38 13 7 19 T 13 14 100156 CASAVA_Build 16 69417931 1D TACTCATTTA T/- TGAGTAGGTG 3070 het 3070 ref 64 46 12 7 T 2 1 100157 CASAVA_Build 16 69420189 1I GGCAGTTATT -/A AAAAATAATT 3070 het 3070 ref 74 44 28 2 A 5 6 100158 CASAVA_Build 16 69422511 1D CCTAACAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 61 36 13 12 T 12 11 100159 CASAVA_Build 16 69422937 1I AAAAACCAAA -/C AAAAAAAAAA 901 het 901 ref 26 14 3 9 C 0 1 100160 CASAVA_Build 16 69424483 1I TTTTCCAAGA -/C AAAAGAAGAA 3070 het 3070 ref 92 45 42 5 C 0 1 100161 CASAVA_Build 16 69426567 9D TGCCTGGCTA ATTTTTTGT/--------- ATTTTTAGTA 2486 het 742 hom 9 2 6 1 ATTTTTTGT 1 0 100162 CASAVA_Build 16 69431368 3D CCCATAATCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 59 26 19 14 T 15 12 100163 CASAVA_Build 16 69433111 2D TCTCTCTCTG TC/-- TCTCTCTTCC 3070 het 3070 hom 82 36 34 15 TC 4 3 100164 CASAVA_Build 16 69433714 4D ATGATTGTTG AATT/---- GTTTATTTCT 3070 het 3070 ref 92 54 32 9 AATT 1 0 100165 CASAVA_Build 16 69434149 1D TAAGGTAAAA T/- TTTATGTCTT 3070 het 3070 ref 94 45 44 5 T 4 3 100166 CASAVA_Build 16 69439024 1D TTGTTGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 81 36 34 11 T 11 10 100167 CASAVA_Build 16 69440458 15I TGAACTTCTA ---------------/GACAGGTCAAATAGT GACAACTCTT 3070 het 3070 hom 68 27 36 6 GACAGGTCAAATAGT 0 1 100168 CASAVA_Build 16 69440818 2I ATCACCATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 59 17 24 18 T 10 12 100169 CASAVA_Build 16 69441651 1D CATCTCTCCA C/- CCCCCCCTGA 3070 het 3070 hom 75 32 31 12 C 8 7 100170 CASAVA_Build 16 69443514 1D GGGGATTACT A/- GGGGGAGGGG 3070 het 3070 ref 80 54 11 16 A 1 0 100171 CASAVA_Build 16 69444717 1D GTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 71 28 33 11 T 10 9 100172 CASAVA_Build 16 69448322 1D GATTTACTAT A/- AAGAATATTA 3070 het 3070 ref 80 47 26 8 A 3 2 100173 CASAVA_Build 16 69453517 1D TGAACTTCTG A/- ATCTTCCCCA 3070 het 3070 ref 69 27 22 21 A 2 1 100174 CASAVA_Build 16 69461832 1I GGCCCAGGGA -/C CCCCCCTGCT 3070 het 3070 ref 53 23 14 16 C 6 7 100175 CASAVA_Build 16 69462784 2D TGGGGTGTGC CA/-- GTGCTCTGGG 3070 het 3070 ref 97 54 31 14 CA 1 0 100176 CASAVA_Build 16 69462902 1D TCAGCAATTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 82 37 28 23 A 10 9 100177 CASAVA_Build 16 69463414 1D AAGGGATTCC A/- AAAAATGATG 3070 het 3070 hom 91 43 43 5 A 6 5 100178 CASAVA_Build 16 69463978 3D CCCATCCTGC CAT/--- CATCATCCAT 3070 het 3070 ref 74 30 14 35 CAT 3 2 100179 CASAVA_Build 16 69466461 3I TTTGAATTTC ---/TTA TTAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 63 26 30 7 TTA 1 2 100180 CASAVA_Build 16 69467431 1D AATTTTTTTT A/- AAGCATAACA 3070 het 3070 ref 59 33 19 7 A 3 2 100181 CASAVA_Build 16 69470058 5I ACGTTTTGTT -----/TTGTA TTGTTTTGTT 3070 het 3070 hom 94 41 39 14 TTGTA 0 1 100182 CASAVA_Build 16 69478222 1I GTGTTCAAGA -/C TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 73 33 33 7 C 0 1 100183 CASAVA_Build 16 69478438 8D GACAAGCGCA TTAGATCT/-------- TTAGATCTTT 3070 het 3070 hom 62 25 33 9 TTAGATCT 2 1 100184 CASAVA_Build 16 69482587 8D TTTAAAAAAA AATTTTTT/-------- TATTTTTTAT 1094 het 1094 ref 25 11 7 7 AATTTTTT 1 0 100185 CASAVA_Build 16 69493287 96D TGCACCCGGC CAAGCATATGATTTTTAAAAATTGCAGTTTCTCTTTCATGTGTGGGTGCTGAACAACATTTCTTAACCCTTTTTCGAATTGTTTTATTTAGGTCTA/------------------------------------------------------------------------------------------------ CCATATTTTT 2759 het 2759 ref 48 79 8 5 CAAGCATATGATTTTTAAAAATTGCAGTTTCTCTTTCATGTGTGGGTGCTGAACAACATTTCTTAACCCTTTTTCGAATTGTTTTATTTAGGTCTA 1 0 100186 CASAVA_Build 16 69494365 1D CTCTCTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 12 11 T 13 12 100187 CASAVA_Build 16 69495883 23D CTTGAGTAAC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 59 23 16 23 T 41 18 100188 CASAVA_Build 16 69497555 1D TATATAACTG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 82 44 28 12 A 8 7 100189 CASAVA_Build 16 69500921 1D ATTTGAAGAT A/- CCTTGCAGAC 3070 het 3070 ref 83 59 17 8 A 1 0 100190 CASAVA_Build 16 69501662 1D CCCCCCAAGT C/- CCCAAAGTCC 3070 het 3070 hom 42 11 28 3 C 4 3 100191 CASAVA_Build 16 69505604 1I TGCTTTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 70 39 23 8 T 8 9 100192 CASAVA_Build 16 69510722 4I TCCTTTTTTT ----/AAAA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 71 29 28 14 A 9 13 100193 CASAVA_Build 16 69512795 6D TAATCTAAAT CTAAAA/------ ATCTATTCCA 3070 het 3070 ref 64 42 11 17 CTAAAA 1 0 100194 CASAVA_Build 16 69512840 8D ATCTGGCTGG GTCCTGGC/-------- ATTGTGCATT 3070 het 3070 ref 62 36 19 14 GTCCTGGC 1 0 100195 CASAVA_Build 16 69516395 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 67 33 27 7 A 9 8 100196 CASAVA_Build 16 69516568 1D CCTCAAAACG T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 59 36 17 7 T 7 6 100197 CASAVA_Build 16 69516721 1I CCCTATCTTT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 43 26 8 9 A 7 8 100198 CASAVA_Build 16 69519354 1D ACCTGTACCT A/- AAAAAAAAAA 776 het 776 ref 66 30 8 28 A 12 11 100199 CASAVA_Build 16 69519668 1D GGAGTTTGAG A/- ACAGCTTGGG 3070 het 3070 ref 50 30 10 10 A 2 1 100200 CASAVA_Build 16 69519832 26D AAGCACTCCA GCACCTGGGTGATGGAGTCAGACCCT/-------------------------- GCCTAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 42 11 8 GCACCTGGGTGATGGAGTCAGACCCT 1 0 100201 CASAVA_Build 16 69523256 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAATACT 2293 het 2293 ref 27 20 6 1 A 6 7 100202 CASAVA_Build 16 69523993 1D AAGAAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 65 43 12 11 T 11 10 100203 CASAVA_Build 16 69534955 1D AATTTTTAAC A/- ACATCACTCT 3070 het 3070 ref 83 42 34 8 A 2 1 100204 CASAVA_Build 16 69540883 1D ACAAAAACAA G/- AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 16 28 5 G 1 0 100205 CASAVA_Build 16 69541248 3D TTGGGATGTT CTA/--- CTGCCTTTGA 3070 het 3070 ref 91 57 29 11 CTA 1 0 100206 CASAVA_Build 16 69541348 7D TATGGTAACA GAGAAAT/------- AAGTTTTAGT 3070 het 3070 ref 90 64 20 10 GAGAAAT 1 0 100207 CASAVA_Build 16 69542686 12D GAGAGAGAGG GAGAGAGGGAGA/------------ GAGAGAGAGA 1019 het 1019 ref 49 34 10 23 GAGAGAGGGAGA 1 0 100208 CASAVA_Build 16 69542808 7I GCTTCTATAC -------/ACCATAG TGGAAGCAGT 3070 het 3070 ref 81 38 31 12 ACCATAG 0 1 100209 CASAVA_Build 16 69547232 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 17 25 12 T 9 10 100210 CASAVA_Build 16 69547748 4I GGGATAGTAC ----/AGTT CGTTAGCCTA 3070 het 3070 hom 73 33 30 10 AGTT 0 1 100211 CASAVA_Build 16 69549126 1I2M12I TTCCACCTTT -TG------------/GTGGAATTAATAGCA GCTATTGTGA 3070 het 3070 ref 74 49 16 11 N/A 0 0 100212 CASAVA_Build 16 69553617 1D GCAGAAAAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 68 29 27 13 A 9 8 100213 CASAVA_Build 16 69553953 1D AACTAAGCTT G/- GGGTTATATT 3070 het 3070 ref 82 42 34 6 G 4 3 100214 CASAVA_Build 16 69556654 2D TTCATTCTTA CC/-- AACAATATTG 3070 het 3070 ref 63 37 18 8 C 2 0 100215 CASAVA_Build 16 69558595 1D ATGTGGATTT G/- GGGGGAGCTG 3070 het 3070 ref 60 26 27 8 G 6 5 100216 CASAVA_Build 16 69562702 2D GTATTTTCCC AG/-- AGTTTGGCAG 3070 het 3070 hom 81 33 43 6 AG 2 1 100217 CASAVA_Build 16 69563455 3D AACAAATCTA TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 65 22 29 15 T 12 9 100218 CASAVA_Build 16 69568101 2D AGTTAAAAAG TA/-- TATGTCAAAC 3070 het 3070 hom 57 22 27 11 TA 2 1 100219 CASAVA_Build 16 69571741 1D ATCCTATCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 60 18 27 17 A 13 12 100220 CASAVA_Build 16 69576330 1I ATTATCATGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 76 35 29 12 A 8 9 100221 CASAVA_Build 16 69576450 1I CTTGGATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 62 21 30 11 T 10 11 100222 CASAVA_Build 16 69577780 5I TGCTTCAAAG -----/ACTAT ACTATACTCA 3070 het 3070 hom 88 33 44 11 ACTAT 1 2 100223 CASAVA_Build 16 69580624 2I CGTGCACCAC --/CA CACACCCTGG 3070 het 3070 ref 63 28 19 16 CA 2 3 100224 CASAVA_Build 16 69582330 1I TATCTTTCAT -/T TTTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 68 37 23 8 T 4 5 100225 CASAVA_Build 16 69583639 1D GACAGGGAAT A/- GGGGGAGACA 3070 het 3070 ref 71 45 14 13 A 1 0 100226 CASAVA_Build 16 69587139 4D AAAAGGTGGC AGGG/---- AGGGGTGGGC 3070 het 3070 ref 67 37 27 7 AGGG 2 1 100227 CASAVA_Build 16 69588011 3D GCAAATGTCC AAT/--- AATGAATGTG 3070 het 3070 ref 76 35 34 8 AAT 2 1 100228 CASAVA_Build 16 69588268 1D GTGGGGTGGT G/- GGGGGGATGG 3070 het 3070 hom 43 19 15 9 G 7 6 100229 CASAVA_Build 16 69588458 1D AGTGACAGAT C/- ATCAGGCATT 3070 het 3070 ref 54 36 14 4 C 1 0 100230 CASAVA_Build 16 69593304 11D TCCAATCTGG TGGGTATGTAA/----------- TGGTGTCTAG 3070 het 3070 ref 86 44 42 12 TGGGTATGTAA 1 0 100231 CASAVA_Build 16 69593986 1D TCCTTATTCA G/- AGTCAGAGAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 G 1 0 100232 CASAVA_Build 16 69594857 1D TTCTAAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 61 20 25 16 T 13 12 100233 CASAVA_Build 16 69600791 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 100 51 20 29 T 12 13 100234 CASAVA_Build 16 69602484 12D TAGAGCTCCT GTAGGAGGACCC/------------ GTAGGAGGAC 3070 het 3070 hom 74 22 28 28 GTAGGAGGACCC 2 1 100235 CASAVA_Build 16 69602949 4D TGTCTCTACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 58 24 30 6 AAAC 5 4 100236 CASAVA_Build 16 69603128 1D GACTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 58 25 23 10 A 11 10 100237 CASAVA_Build 16 69603907 1D CAACTTGGGG A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 83 46 28 10 A 7 6 100238 CASAVA_Build 16 69604187 5D CCTTTAGCCA CTTTT/----- ATGTGGTTTA 3070 het 3070 ref 69 40 25 8 CTTTT 1 0 100239 CASAVA_Build 16 69607803 1I AGGGAAATTC -/A AATAAAAACC 3070 het 3070 hom 80 37 37 6 A 2 3 100240 CASAVA_Build 16 69610831 2D TTCAACAGTC AG/-- AGAGAGAGTA 3070 het 3070 ref 100 62 20 19 AG 5 4 100241 CASAVA_Build 16 69611021 2D TTGACTTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 76 25 17 34 T 12 10 100242 CASAVA_Build 16 69612239 5I ATAAATCATG -----/TGGAA TGATGTATAG 3070 het 3070 hom 77 21 45 11 TGGAA 0 1 100243 CASAVA_Build 16 69613847 2I GTACGATAGT --/TA TATAAAGTAG 3070 het 3070 hom 73 29 34 10 TA 2 3 100244 CASAVA_Build 16 69614304 1I CATGCCCCCC -/G CAAAAGGCAT 3070 het 3070 hom 85 37 40 8 G 0 1 100245 CASAVA_Build 16 69619907 1D GCTATTTGCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 A 10 9 100246 CASAVA_Build 16 69620576 1I TAGGCTTTTT -/G GGGCCACACG 3070 het 3070 ref 74 51 15 8 G 3 4 100247 CASAVA_Build 16 69621642 1D TCGTAGAGAT A/- GGGGGGTCTC 3070 het 3070 hom 60 20 32 8 A 1 0 100248 CASAVA_Build 16 69625051 3I GGGGCAGGGG ---/GGC GGAGAGCATC 3070 het 3070 hom 35 18 15 5 GGC 0 1 100249 CASAVA_Build 16 69628319 1D AAATGGAAAA T/- TTGACTAAAA 3070 het 3070 ref 76 56 13 7 T 3 2 100250 CASAVA_Build 16 69630084 3D ATTTCTTTTG AGA/--- AGAAGTCTCA 3070 het 3070 ref 50 30 16 6 AGA 2 1 100251 CASAVA_Build 16 69632275 1I TCCCCATTTC -/T CTGCTTTTTT 3070 het 3070 hom 76 11 56 9 T 0 1 100252 CASAVA_Build 16 69634202 1I AATCTCTCCT -/G GGAGCTGCCT 3070 het 3070 hom 89 35 34 20 G 2 3 100253 CASAVA_Build 16 69635334 3D CTAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 AAG 1 0 100254 CASAVA_Build 16 69638080 1I TAGAATAAAA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 98 47 48 3 T 6 7 100255 CASAVA_Build 16 69638709 3D GGTGCTGACC CAT/--- CATCATGTTA 3070 het 3070 hom 56 20 27 13 CAT 3 2 100256 CASAVA_Build 16 69639610 2I TATTATACTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 56 24 23 9 TA 5 6 100257 CASAVA_Build 16 69640484 1D TAGCTTTACT C/- CAAACCAAGA 3070 het 3070 ref 96 74 12 10 C 2 1 100258 CASAVA_Build 16 69641416 4D TATATAATAT ACAC/---- ACACTGGTTG 2256 het 2256 ref 24 12 9 7 AC 4 2 100259 CASAVA_Build 16 69643844 1D TTTCTTCATG A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 84 28 43 14 A 7 6 100260 CASAVA_Build 16 69645045 2D AATGCATATA AT/-- ATATATATTA 3070 het 3070 hom 74 12 57 7 AT 5 4 100261 CASAVA_Build 16 69645272 1I TATCTCTTGA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 92 43 23 26 T 7 8 100262 CASAVA_Build 16 69645291 3D GTATTAAAAT ATG/--- TTTCATATAC 3070 het 3070 ref 90 45 23 23 ATG 1 0 100263 CASAVA_Build 16 69645684 14D ACATTTCTTT CCTTTTTCCTTATG/-------------- CCTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 98 70 15 20 CCTTTTTCCTTATG 1 0 100264 CASAVA_Build 16 69647732 2I AAAATAAATT --/AA GTTTTAATAG 3070 het 3070 ref 58 26 20 12 A 0 2 100265 CASAVA_Build 16 69648118 3D CCAACAAGAA AAG/--- AGAAGAACTT 3070 het 3070 ref 83 59 18 9 AAG 1 0 100266 CASAVA_Build 16 69649069 1I GAAATTCCTA -/C CAAAATGGGA 3070 het 3070 ref 51 34 15 2 C 1 2 100267 CASAVA_Build 16 69649159 4I TACAAGAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AAAC 1 2 100268 CASAVA_Build 16 69651427 1I GGAAGAGAGG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 79 38 31 10 A 7 8 100269 CASAVA_Build 16 69652944 6D TCCATGAATC CCTCTT/------ CCTCTTCCTC 3070 het 3070 hom 90 31 36 26 CCTCTT 4 3 100270 CASAVA_Build 16 69655665 1D GAAGAGATAA T/- TCCTCCTTTC 3070 het 3070 ref 94 69 19 8 T 2 1 100271 CASAVA_Build 16 69658935 1I TTTTTAGTTG -/A ACAAGTTACA 3070 het 3070 hom 67 13 41 13 A 1 2 100272 CASAVA_Build 16 69661048 6D GCCCTAAATA TTATTT/------ TTATTGTTTC 3070 het 3070 hom 79 38 36 8 TTATTT 1 0 100273 CASAVA_Build 16 69661398 2D AAGACATGAT AG/-- AGTGTGTCCT 3070 het 3070 hom 87 39 44 6 AG 2 1 100274 CASAVA_Build 16 69669920 1I TGTTTATTTG -/T TTTTTTAGAG 3070 het 3070 ref 61 30 26 5 T 6 7 100275 CASAVA_Build 16 69673334 1D TGGGTAATTT A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 71 10 53 9 A 7 6 100276 CASAVA_Build 16 69675122 5D TTGTTAAGTG CCTGC/----- CACTTTGCGT 3070 het 3070 hom 79 38 38 6 CCTGC 1 0 100277 CASAVA_Build 16 69675788 1I TTTAACCCTA -/T TCTTTTTGTT 3070 het 2650 hom 52 8 41 3 T 1 2 100278 CASAVA_Build 16 69676192 1D AGTTTGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 81 52 19 11 T 11 10 100279 CASAVA_Build 16 69676283 1D TCCTTTATTC T/- TATTAATATG 3070 het 3070 ref 81 45 32 6 T 2 1 100280 CASAVA_Build 16 69681151 4D GAAATAGTGG CTGA/---- CTATTTTAGA 3070 het 3070 hom 93 43 43 12 CTGA 1 0 100281 CASAVA_Build 16 69681882 3I TGACAGAGAC ---/TGT TGTTATGTTT 3070 het 3070 hom 60 22 31 8 TGT 1 2 100282 CASAVA_Build 16 69682081 1I TTTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTG 2432 het 2432 ref 41 25 8 8 T 9 10 100283 CASAVA_Build 16 69684434 2I ATTAGAAATC --/AT ACACACACAC 3070 het 3070 ref 78 33 20 25 AT 0 1 100284 CASAVA_Build 16 69684654 1D ACACTGAAGT A/- AACACTGATC 3070 het 3070 hom 92 39 41 13 A 3 2 100285 CASAVA_Build 16 69685154 5D ATAAAAACAT ATAAG/----- ATAAAACAAA 3070 het 3070 hom 97 45 47 7 ATAAG 1 0 100286 CASAVA_Build 16 69687882 2I CTCTGTCTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 72 28 20 24 TG 8 9 100287 CASAVA_Build 16 69694080 1I TGCTTTCCTC -/G TTTAAAATGT 3070 het 3070 ref 80 43 30 7 G 0 1 100288 CASAVA_Build 16 69694647 1D GCCCCACAGA T/- AAACTCACCT 3070 hom 187 het 68 0 63 5 T 1 0 100289 CASAVA_Build 16 69696724 1I ACATATATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 83 44 30 9 A 11 12 100290 CASAVA_Build 16 69701643 2I TGTATGTGTG --/GA TATATATATA 2168 het 942 hom 21 5 9 7 GA 0 1 100291 CASAVA_Build 16 69702491 2I1M9D ATGGGCAATT --CAGAGAACAT/TCC--------- AAGATTTATT 3070 het 3070 ref 79 41 37 10 N/A 0 0 100292 CASAVA_Build 16 69705166 1D CTTGATTAAG T/- TTTTAATTTT 3070 het 3070 ref 62 30 24 15 T 5 4 100293 CASAVA_Build 16 69706380 1D ACTTAAAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 79 34 28 17 A 8 7 100294 CASAVA_Build 16 69709482 1D TCCTCTGTGA C/- CCCCTCTGGG 3070 het 3070 ref 71 37 31 3 C 5 4 100295 CASAVA_Build 16 69711343 1D ATGTCTCTGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 54 31 20 4 A 9 8 100296 CASAVA_Build 16 69712035 4D GAAAATCCTT AAAC/---- AAACATCTTT 3070 het 3070 ref 64 32 26 8 AAAC 2 1 100297 CASAVA_Build 16 69714180 1D GAAATTATCA G/- GGTTTCTCTC 3070 het 3070 hom 59 25 29 7 G 3 2 100298 CASAVA_Build 16 69721535 2I GGTAATCCTG --/TT TTTTCCAGGC 3070 het 3070 ref 67 37 26 4 T 4 6 100299 CASAVA_Build 16 69724141 6I GAAACTCCAA ------/ATCGGT AACAGCCAGT 3070 het 3070 hom 89 36 32 21 ATCGGT 0 1 100300 CASAVA_Build 16 69725314 1I TTATCAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 67 28 28 11 A 11 12 100301 CASAVA_Build 16 69726401 2I AGATAAAACA --/AT ATAGTTTGGA 3070 het 3070 ref 85 43 29 13 AT 1 2 100302 CASAVA_Build 16 69727402 1I TTAAACAAAG -/C TTTGAAGCTT 3070 het 3070 hom 58 28 24 6 C 0 1 100303 CASAVA_Build 16 69731553 1D ATTTTCCAGC T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 67 42 14 11 T 8 7 100304 CASAVA_Build 16 69732825 4I GGAAAAGTTT ----/TCTA CCTATGACTC 3070 het 3070 ref 61 33 22 6 TCTA 0 1 100305 CASAVA_Build 16 69733875 1I GCAAAAGCTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 77 12 55 10 T 8 9 100306 CASAVA_Build 16 69740917 7D AGAATGGTTA TTTTATT/------- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 53 20 15 19 TTTTATT 4 3 100307 CASAVA_Build 16 69745663 1D TTTTTTTAAG T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 64 29 26 10 T 4 3 100308 CASAVA_Build 16 69749527 3I AGGGACACTG ---/AGC AGCAGCGCAG 3070 het 3070 hom 80 33 35 12 AGC 2 3 100309 CASAVA_Build 16 69749818 1D AGATTTTATA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 73 33 35 5 T 9 8 100310 CASAVA_Build 16 69749998 1D TTTTTCATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 59 23 31 5 A 11 10 100311 CASAVA_Build 16 69756796 2D GAGGCCTCCC CT/-- GACTGCCCTA 3070 het 3070 ref 50 29 15 8 CT 1 0 100312 CASAVA_Build 16 69757147 1D CGTGAGGGGG A/- GGGGGGCGGT 2145 het 2145 ref 64 32 10 22 A 1 0 100313 CASAVA_Build 16 69757305 1D AGACACATGG C/- CAACAGGTTG 3070 het 3070 ref 89 53 22 15 C 2 1 100314 CASAVA_Build 16 69772032 4I GATGAAAGAA ----/AGAG AGAGAAAAAA 3070 het 2373 hom 23 8 10 5 AG 2 4 100315 CASAVA_Build 16 69781751 2I ATTTGAGCAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 14 8 A 12 14 100316 CASAVA_Build 16 69806975 1I TAATGCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2881 hom 32 8 14 10 A 11 12 100317 CASAVA_Build 16 69807186 1I AAACAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1996 hom 25 8 11 6 A 11 12 100318 CASAVA_Build 16 69815034 2D AATCAGCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 5 A 13 11 100319 CASAVA_Build 16 69823433 4D TATGTGGGCC AACT/---- AATTGCGTGC 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 AACT 1 0 100320 CASAVA_Build 16 69824303 2D TGGTGGCGGC GG/-- GGGGGGGGGG 2758 het 42 hom 12 0 6 6 G 16 14 100321 CASAVA_Build 16 69827748 1D TGTGTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2120 hom 27 5 15 7 A 11 10 100322 CASAVA_Build 16 69835640 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAGAA 3070 het 2826 hom 34 11 16 8 G 1 0 100323 CASAVA_Build 16 69841291 4I TACTATAAGG ----/AGTA AGTGAGACTC 3070 het 3070 ref 57 27 24 6 AGTA 0 1 100324 CASAVA_Build 16 69842366 1D CAAGAAGACA G/- GTTAAGCTGT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 G 2 1 100325 CASAVA_Build 16 69842902 1I TTTGCAAAAA -/C CCATGAAGGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 C 2 3 100326 CASAVA_Build 16 69848426 13D TTTCAAGAGT TGGAGTAAAGAGA/------------- ACACCAGATA 3070 het 3070 ref 46 30 16 4 TGGAGTAAAGAGA 1 0 100327 CASAVA_Build 16 69853134 1I AGATTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 2608 het 1265 hom 15 4 7 4 A 13 14 100328 CASAVA_Build 16 69854727 1I CTACCTTCTC -/T CTTTCTCTGA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 0 1 100329 CASAVA_Build 16 69861777 4D GGGAGGGACG GAAA/---- GAAAGGAAAG 956 het 508 hom 15 4 5 7 GAAA 2 1 100330 CASAVA_Build 16 69862504 1D GCCAACAGGG A/- GGATGGTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 18 7 A 1 0 100331 CASAVA_Build 16 69866962 2D GTAATTAAAC AT/-- ATATATATAG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AT 5 4 100332 CASAVA_Build 16 69869055 4I AACGATAGTT ----/ATTG AGACGAGTAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 ATTG 0 1 100333 CASAVA_Build 16 69872596 1D TTTATCCAGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 9 8 100334 CASAVA_Build 16 69873363 1I TCCAAGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 871 hom 41 2 30 9 T 11 12 100335 CASAVA_Build 16 69877607 1I TCTTCTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 324 hom 41 2 33 6 A 10 11 100336 CASAVA_Build 16 69887716 1I AAGTACTTAG -/A ACAGATTCTT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 A 1 2 100337 CASAVA_Build 16 69895368 16D CAAATACCAA CCAATCCAGAAGGAGC/---------------- CCAATCCAGA 3070 hom 48 het 17 0 17 1 CCAATCCAGAAGGAGC 2 1 100338 CASAVA_Build 16 69901686 1I GCCAGCATTT -/C CCCCCTCCTT 3070 hom 105 het 45 0 35 10 C 5 6 100339 CASAVA_Build 16 69911478 5D CACAGCCACA GCATG/----- GTATAGAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 GCATG 1 0 100340 CASAVA_Build 16 69930067 1D TAGATGACAT A/- ATAATAATAA 1275 het 1275 ref 34 6 3 25 A 2 1 100341 CASAVA_Build 16 69930176 1I GGAAGCATCA -/C CCCTTTACCT 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 C 3 4 100342 CASAVA_Build 16 69931963 2D GAGGAGGTTC TG/-- TGTTTTGAGG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 TG 2 1 100343 CASAVA_Build 16 69932145 1D GCCTAGATCT A/- ACAGGATCAT 3070 hom 78 het 43 0 34 9 A 2 1 100344 CASAVA_Build 16 69932574 1I CCCTGTCTTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 2724 hom 19 7 11 1 A 8 9 100345 CASAVA_Build 16 69946804 1D ATCTGGCTTC G/- GCCCCCTCTT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 G 2 1 100346 CASAVA_Build 16 69948935 1D TACCTCCTTG C/- CTTTCACTCT 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 C 2 1 100347 CASAVA_Build 16 69954164 2I ATAATAGCGG --/CT CTCTCTCTGA 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 CT 4 5 100348 CASAVA_Build 16 69961183 3I CAAAGCCTCC ---/GAG GAGAAGAATG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 GAG 1 2 100349 CASAVA_Build 16 69979588 1I AGAATAAAAG -/T AAGAACTGGA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 0 1 100350 CASAVA_Build 16 69988506 3D CAAGCAAGCT GTG/--- GAGGGCTGAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 GTG 1 0 100351 CASAVA_Build 16 69990742 2D ATAGCTGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 2648 het 316 hom 19 5 11 3 T 17 15 100352 CASAVA_Build 16 69994338 3D CATATGACAA CTT/--- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 18 9 CTT 2 1 100353 CASAVA_Build 16 70001000 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 1584 het 1584 ref 21 12 5 4 T 10 9 100354 CASAVA_Build 16 70036255 4I GTCATTTGTC ----/TGAG TGAGAAGATA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 TGAG 1 2 100355 CASAVA_Build 16 70188006 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 25 1 23 1 A 9 8 100356 CASAVA_Build 16 70201442 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2062 het 134 hom 19 3 8 8 A 17 16 100357 CASAVA_Build 16 70233931 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1740 het 1699 hom 23 9 6 9 A 15 14 100358 CASAVA_Build 16 70252472 1D TGTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2883 het 1625 hom 28 5 10 13 T 17 16 100359 CASAVA_Build 16 70254284 1D TCTAAAGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 10 9 100360 CASAVA_Build 16 70268522 2I ATAAATAATT --/AC AGTTGATGAA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 AC 0 1 100361 CASAVA_Build 16 70273417 1I AAAAGATAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 57 33 20 4 A 8 9 100362 CASAVA_Build 16 70273623 1D TGTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 763 het 763 ref 31 16 3 13 T 17 16 100363 CASAVA_Build 16 70275351 1I CATGTGCCAC -/T TACACCCCGC 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 T 1 2 100364 CASAVA_Build 16 70284227 2I TTTTTCTTTG --/TT TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 7 9 100365 CASAVA_Build 16 70287117 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2097 het 1707 hom 22 7 7 8 A 15 14 100366 CASAVA_Build 16 70293167 1I TGAAAATAGG -/T AAGTAAAGTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 0 1 100367 CASAVA_Build 16 70294204 6I AATTTTTTAG ------/TATTTT TATTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 TATTTT 1 2 100368 CASAVA_Build 16 70305349 1D AACAACTTTT C/- TTTTTTTTTT 1628 het 1628 ref 24 9 8 7 C 1 0 100369 CASAVA_Build 16 70313076 1D ACTGTTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 12 11 100370 CASAVA_Build 16 70319383 1D CTACCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 A 11 10 100371 CASAVA_Build 16 70330786 1I CTTAGGCAGC -/A ATGACAAAGC 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 A 1 2 100372 CASAVA_Build 16 70335007 7D ACTCTGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 1503 hom 18 6 11 3 A 17 10 100373 CASAVA_Build 16 70337250 9D AATCCCAAAG CATATATTT/--------- CAGTGGTAGA 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 CATATATTT 1 0 100374 CASAVA_Build 16 70348853 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1473 het 1473 ref 32 11 5 16 A 15 14 100375 CASAVA_Build 16 70370087 1D ATTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 896 hom 23 5 13 5 A 13 12 100376 CASAVA_Build 16 70380062 2D TTTAGCAAGC TT/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 35 0 28 9 T 10 8 100377 CASAVA_Build 16 70381505 1D TTTTAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 45 1 31 13 A 13 12 100378 CASAVA_Build 16 70387626 1D CTGGGTTGTG A/- AGTAAGACCG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 2 1 100379 CASAVA_Build 16 70388421 2D AAAAAAAAAT TA/-- TATATATATA 1256 het 1256 ref 12 4 4 5 TA 9 8 100380 CASAVA_Build 16 70392738 1D ATGACATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 A 14 13 100381 CASAVA_Build 16 70398590 6D AGCACTTTGG GAGGCC/------ GAGGCGGGCG 2702 het 1558 hom 17 4 9 6 GAGGCC 1 0 100382 CASAVA_Build 16 70399609 4I ACAAAACAAC ----/AACA AACATATACA 3070 hom 103 het 38 0 33 5 AACA 1 2 100383 CASAVA_Build 16 70417356 1D GTTCTCAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 37 1 17 21 T 13 12 100384 CASAVA_Build 16 70440095 1D GCAAAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 113 het 47 0 35 12 A 11 10 100385 CASAVA_Build 16 70454121 1D GAAGAAATAC T/- TGTCCTCATG 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 T 2 1 100386 CASAVA_Build 16 70460962 2D TAGGGATTAC TA/-- TCTATATTTA 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 TA 1 0 100387 CASAVA_Build 16 70464988 1D TGCCAAAGCA G/- CTGCCCACTG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 G 1 0 100388 CASAVA_Build 16 70473673 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1590 het 248 hom 9 1 6 2 A 16 15 100389 CASAVA_Build 16 70492078 2I GATAAGTATA --/TT TATGTATATA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 1 3 100390 CASAVA_Build 16 70502763 1I ACCTTTTTTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 86 het 34 0 29 5 A 8 9 100391 CASAVA_Build 16 70508708 5I ATCGTAGAAT -----/AGAAC AGAACAGTGT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AGAAC 1 2 100392 CASAVA_Build 16 70510739 5D TGCACTGCTG TTTTC/----- TTTTCCTGGA 3070 het 3070 ref 40 21 15 8 TTTTC 2 1 100393 CASAVA_Build 16 70512928 2I CAAAAAAAAC --/AT ATTCTTTGCA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 AT 1 2 100394 CASAVA_Build 16 70514013 6D AACGGTGCCA ATGCCC/------ ATGCCCATGC 3070 het 3070 hom 48 17 14 18 ATGCCC 3 2 100395 CASAVA_Build 16 70514094 6I AGTAAGTATA ------/AGTGTG TATAAGTGTG 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 AGTGTG 0 1 100396 CASAVA_Build 16 70523888 1I ATTATGTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 10 11 100397 CASAVA_Build 16 70531524 2I CTGAAAGTCA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 AT 5 6 100398 CASAVA_Build 16 70532247 1D TTTTATTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 10 9 100399 CASAVA_Build 16 70536482 2D CCAAATTGTT AA/-- AGTTTTTAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 3 1 100400 CASAVA_Build 16 70536581 1I TATAGTGGTA -/T TTCTCAGATT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 2 3 100401 CASAVA_Build 16 70538916 4I CAAGATCCTC ----/TTTG TTTGTTGTTC 3070 hom 155 het 58 0 50 8 TTTG 1 2 100402 CASAVA_Build 16 70544546 2D AAATAATCGC AA/-- AGTCATTCCT 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 A 3 1 100403 CASAVA_Build 16 70544801 19I TATAAAGAAA -------------------/AGAGGTTTAATTGACTCAC AGTTCTTCAT 3070 hom 123 het 41 0 41 4 AGAGGTTTAATTGACTCAC 0 1 100404 CASAVA_Build 16 70545462 1I AAAAAAAAAA -/C GGATTGCTTA 3070 het 2742 hom 36 12 16 8 C 0 1 100405 CASAVA_Build 16 70551628 5D GAAAGTAGAT AAAGG/----- AAAGAGAATG 3070 hom 78 het 28 0 26 3 AAAGG 1 0 100406 CASAVA_Build 16 70551967 4I CAGAAGAAAT ----/AACA AACATACACT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AACA 1 2 100407 CASAVA_Build 16 70552967 1I GAAGCCATAC -/A ATAGGTGCTT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 A 1 2 100408 CASAVA_Build 16 70553501 1I ATTTTTGTAC -/T TTTGGTAGAG 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 3 4 100409 CASAVA_Build 16 70555518 2I TTTTCCCAAC --/CA CAGTGTTTTA 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 CA 1 2 100410 CASAVA_Build 16 70556923 1D TTCAGTTGCT C/- CCCATCCTCC 2621 het 1912 hom 30 7 8 15 C 4 3 100411 CASAVA_Build 16 70556956 2D TTTGTGAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 1446 het 1446 ref 25 6 5 17 T 18 16 100412 CASAVA_Build 16 70560769 3I GTAAAATGGC ---/ACA ACAATAGCTC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 ACA 1 2 100413 CASAVA_Build 16 70561089 4D AAAAAAAAAT AGAG/---- AGAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 AG 3 1 100414 CASAVA_Build 16 70566327 3D TCTCCATTCA GAT/--- TTTTCCCAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 5 GAT 1 0 100415 CASAVA_Build 16 70567357 1I TGTTTCTGTT -/C CTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 31 1 18 12 C 1 2 100416 CASAVA_Build 16 70579480 2I TGATTTCACT --/TC TGTTTTCACG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TC 0 1 100417 CASAVA_Build 16 70584821 4D CGTATGTGAT AATC/---- AGGAAAACAC 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 AATC 1 0 100418 CASAVA_Build 16 70585186 1D GATAACATTC T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 8 7 100419 CASAVA_Build 16 70592010 1D CTCAGCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 19 2 13 4 T 16 15 100420 CASAVA_Build 16 70592475 1D AGTTACCCAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 13 16 12 T 10 9 100421 CASAVA_Build 16 70593678 1I AAAAAACAAT -/A AAAAAAAAAC 1438 het 1438 ref 21 5 7 9 A 9 10 100422 CASAVA_Build 16 70599352 1D TCTCAAGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 21 0 13 8 T 12 11 100423 CASAVA_Build 16 70609509 1D CCGGCGATGC G/- GGTGTTCTCT 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 G 3 2 100424 CASAVA_Build 16 70619855 7D GGGAACTGTG ATGTAGC/------- GTGGAGACGA 3070 het 3070 ref 39 22 16 3 ATGTAGC 1 0 100425 CASAVA_Build 16 70628076 1I GGAGGGCACC -/A GGGGGTGTGC 2164 het 2003 hom 20 8 6 6 A 0 1 100426 CASAVA_Build 16 70631031 9I ATTACCCTCC ---------/TGTAATTTG TGTAATTTGT 3070 hom 95 het 41 0 31 11 TGTAATTTG 1 2 100427 CASAVA_Build 16 70633058 2I ACCTTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 11 11 12 TG 8 9 100428 CASAVA_Build 16 70636491 1D GAATGTCTTT G/- TTTAATTTTC 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 G 1 0 100429 CASAVA_Build 16 70638852 1I GCAACCTCTG -/C CCCCCAGGTT 2431 het 940 hom 11 4 7 0 C 5 6 100430 CASAVA_Build 16 70654757 1D ACAAAGAAAC A/- GGGCAAATGG 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 1 0 100431 CASAVA_Build 16 70679054 1D TACTTTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2947 hom 39 11 22 7 T 10 9 100432 CASAVA_Build 16 70683820 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 17 11 A 13 14 100433 CASAVA_Build 16 70689242 2D GAGTGAGTGA CT/-- CTCGTCTTCA 3070 het 3070 hom 41 14 19 9 CT 2 1 100434 CASAVA_Build 16 70690965 3D CACTGTGGTT CTC/--- CTCCAGATGG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 CTC 2 1 100435 CASAVA_Build 16 70704973 2D CCTTTCCATG TT/-- TTATAACTCA 3070 het 3070 ref 35 15 14 8 T 4 2 100436 CASAVA_Build 16 70707344 6D TCTTTCTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTGA 1464 het 1464 ref 12 6 4 3 T 14 8 100437 CASAVA_Build 16 70708096 2I AGCTTTATTC --/TT TTTTGCATGC 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 T 4 6 100438 CASAVA_Build 16 70708649 1D TATTTGTTTA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 8 7 100439 CASAVA_Build 16 70709128 3D CATAAAAGAG TGT/--- TGTTGTAACC 3070 het 3070 hom 51 20 28 3 TGT 3 2 100440 CASAVA_Build 16 70710164 1I GGTGGTGGGC -/G GGGGGGGCAG 2217 hom 15 het 17 0 8 9 G 7 8 100441 CASAVA_Build 16 70711708 1D AGCTGGTACT C/- CTGCCCAACT 3070 het 3070 hom 33 12 13 9 C 2 1 100442 CASAVA_Build 16 70727038 1D GCTTTTCCAA G/- AATTTGATTT 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 G 1 0 100443 CASAVA_Build 16 70761436 2D TTTCACAGAC TT/-- TTTTCACTAT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 6 4 100444 CASAVA_Build 16 70770996 1I TATTTTTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 9 10 100445 CASAVA_Build 16 70785125 1D ATCAGTGAGG A/- AAAAAAAAAA 2489 het 2489 ref 32 16 9 7 A 15 14 100446 CASAVA_Build 16 70790697 1D TTGAAGAGCT A/- AAGTGAAGAC 3070 hom 128 het 47 0 42 5 A 3 2 100447 CASAVA_Build 16 70799749 11I GAAGCAGAAA -----------/AATCACAGACT AATCTGAATG 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 AATCACAGACT 0 1 100448 CASAVA_Build 16 70806770 1I GAGAGAGAGA -/G AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 G 0 1 100449 CASAVA_Build 16 70898356 1I ATTTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 A 10 11 100450 CASAVA_Build 16 70976593 2I GTGTGAATAG --/AC ACAGAAACTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AC 1 2 100451 CASAVA_Build 16 70988689 1I AGGTATATAT -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 8 100452 CASAVA_Build 16 70992593 2I GAGAGGGAGG --/GA GGGGGAGAAG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 GA 0 1 100453 CASAVA_Build 16 71060137 1D TACTTAGAGT A/- AAAAAAAAAA 2374 het 2374 ref 36 22 6 9 A 13 12 100454 CASAVA_Build 16 71068373 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 7 6 100455 CASAVA_Build 16 71069979 1D CCTGTATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 146 hom 29 1 21 7 A 11 10 100456 CASAVA_Build 16 71101334 3I TTATATTACT ---/CTC CTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 CTC 0 1 100457 CASAVA_Build 16 71136386 1I AAGATTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2429 hom 21 6 10 5 A 10 11 100458 CASAVA_Build 16 71146754 9I ACCTGTTGGG ---------/ATTTCCTTT ATTTCCTTTT 3070 hom 91 het 41 0 34 8 ATTTCCTTT 1 2 100459 CASAVA_Build 16 71157584 1I ATTGCTCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 37 1 28 8 A 10 11 100460 CASAVA_Build 16 71167390 4D2M5D TGCTTCACTC TATACTACAGA/----CT----- GTGTAGTACT 3070 hom 159 het 56 0 52 6 N/A 0 0 100461 CASAVA_Build 16 71171876 4I TGTTTATTTA ----/TTTT TTAAGAGACA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 6 100462 CASAVA_Build 16 71197487 1D ATATTGTTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 10 9 100463 CASAVA_Build 16 71197893 1I GAGCAAGACT -/C CGTCTCAAAA 791 het 104 hom 11 1 4 6 C 1 2 100464 CASAVA_Build 16 71203347 3I ATTTAAAAAC ---/AGT AGGTTTTTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AGT 0 1 100465 CASAVA_Build 16 71209183 1D ACTAGCCCCC T/- GTTCTGGTTC 3070 hom 99 het 39 0 33 7 T 1 0 100466 CASAVA_Build 16 71214339 1D GGCGCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 13 8 A 11 10 100467 CASAVA_Build 16 71224720 1I CTAATAATAA -/T ATAAATAAAT 803 hom 7 het 6 0 3 4 T 0 1 100468 CASAVA_Build 16 71230610 2I GGCTCACGCC --/TG TGTGGTCCTA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 TG 2 3 100469 CASAVA_Build 16 71238448 5D AAACAAATAA AAGAG/----- AAAACTTTAA 3070 hom 69 het 29 0 24 7 AAGAG 1 0 100470 CASAVA_Build 16 71239104 1I AAAATGCTTA -/C ATTTCAACAA 3070 hom 151 het 57 0 51 6 C 0 1 100471 CASAVA_Build 16 71243773 4D TTGTTGAACA TATT/---- TATGACATTT 3070 hom 108 het 37 0 37 1 TATT 1 0 100472 CASAVA_Build 16 71244298 1D CTACTGGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 9 A 13 12 100473 CASAVA_Build 16 71247170 1I TCTTGAGGCT -/A ATATGACTTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 1 2 100474 CASAVA_Build 16 71248037 1I GACAGGGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 12 het 35 1 29 5 T 9 10 100475 CASAVA_Build 16 71260968 1I TTTTTTTTGG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 432 hom 27 2 21 4 T 8 9 100476 CASAVA_Build 16 71269527 5I TGTGTATCTA -----/AACTT AAACAGAGAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 AACTT 0 1 100477 CASAVA_Build 16 71270240 1I GTAACCAAAG -/C AATTTGATAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 0 1 100478 CASAVA_Build 16 71296629 2D TGGGTCTCTC TT/-- TTCACTAGAC 3070 hom 144 het 52 0 49 4 T 4 2 100479 CASAVA_Build 16 71310091 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1732 het 1732 ref 22 10 7 5 A 19 18 100480 CASAVA_Build 16 71372275 1I CTGACTAGGA -/C ATCCTAAAAA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 C 0 1 100481 CASAVA_Build 16 71374385 4D ACAATCAACT TAAC/---- TATGACAACA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 TAAC 1 0 100482 CASAVA_Build 16 71378335 1D GGGTTAGGGC T/- TTTTTTTTTT 900 het 900 ref 26 19 4 3 T 15 14 100483 CASAVA_Build 16 71429754 1I CAGGCTGCAG -/C CTGCGTGTTC 3070 hom 53 het 20 0 16 4 C 1 2 100484 CASAVA_Build 16 71437869 1I ACCCACTGCA -/G GGCCACGGGC 3070 hom 131 het 49 0 42 7 G 2 3 100485 CASAVA_Build 16 71440325 1I GCAGGCAGAG -/C CGCCGGGCTG 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 1 2 100486 CASAVA_Build 16 71442056 1I GGCCGGGCTC -/G GCCAGGCCCA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 G 1 2 100487 CASAVA_Build 16 71457046 1I GAGGGTACCT -/C CCACTACCTG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 2 3 100488 CASAVA_Build 16 71459124 2D TTGACAGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 31 1 23 7 A 13 11 100489 CASAVA_Build 16 71460251 1I TATTGTACAT -/A ACAGCCTTGG 3070 het 3070 ref 49 27 12 10 A 1 2 100490 CASAVA_Build 16 71460366 1D ATGAAAGGAA G/- AAAAATCAGA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 G 1 0 100491 CASAVA_Build 16 71460782 1D GCTAAAGGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 11 13 3 T 10 9 100492 CASAVA_Build 16 71460988 1D TAGAAAATTC T/- TCCCAGTCTT 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 T 2 1 100493 CASAVA_Build 16 71468767 9D TTTCTGTTGT TGTTGTTGG/--------- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 47 18 26 9 TGTTGTTGG 1 0 100494 CASAVA_Build 16 71483911 1D TATTTATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 11 12 T 15 14 100495 CASAVA_Build 16 71484960 1D TGGATATGAT A/- AAAGATATTC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 4 3 100496 CASAVA_Build 16 71489267 1I AGCATGGAGG -/A AAACAGGACC 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 A 3 4 100497 CASAVA_Build 16 71494483 5I CTCTATGGGG -----/AACCC AACCCATGAG 3070 het 3070 ref 55 26 21 8 AACCC 1 2 100498 CASAVA_Build 16 71507003 1I TACAAAAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 8 9 100499 CASAVA_Build 16 71508293 1D AAGACTAAAA G/- GGGATGGAGT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 G 4 3 100500 CASAVA_Build 16 71510964 1I ATCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 9 10 100501 CASAVA_Build 16 71515133 9D TCTCCTTGGT AGTAGATGA/--------- AGTAGATGAA 3070 het 3070 ref 46 22 14 14 AGTAGATGA 2 1 100502 CASAVA_Build 16 71519387 1I CTGTGCCTTT -/G GGAAGCTGGG 2769 het 2769 ref 24 11 9 4 G 2 3 100503 CASAVA_Build 16 71530416 10I GTCTAGGACA ----------/GTGAGGAAAT CATAGCCCTG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 GTGAGGAAAT 0 1 100504 CASAVA_Build 16 71535983 7I TGTTACATGC -------/AAAAATA AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 AAAAATA 1 2 100505 CASAVA_Build 16 71548172 1I GCCACTGGGG -/C AATTTAATTC 3070 hom 72 het 25 0 24 1 C 0 1 100506 CASAVA_Build 16 71553030 1I CTTCTCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2303 hom 31 7 12 12 T 12 13 100507 CASAVA_Build 16 71556069 1D TGGTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 35 3 26 7 A 15 14 100508 CASAVA_Build 16 71556472 1I ATAGATGGGG -/T TTTCACCATG 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 3 4 100509 CASAVA_Build 16 71562742 1D AAACCAAGTA G/- TAGCTCCATT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 G 1 0 100510 CASAVA_Build 16 71568996 1I CAGTGGGGGG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 7 8 100511 CASAVA_Build 16 71575119 2D AAAAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 1999 het 1999 ref 33 14 11 8 AG 7 6 100512 CASAVA_Build 16 71580542 1D CACTGCACTC T/- TGGCCTGGGC 3070 hom 59 het 26 0 17 10 T 2 1 100513 CASAVA_Build 16 71582493 3I ATAGCAGTCC ---/CTG CTTATCCGAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CTG 0 1 100514 CASAVA_Build 16 71598082 9D GGAAGGAAAG AGGAAAGGA/--------- AGGAAAGGAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 AGGAAAGGA 2 1 100515 CASAVA_Build 16 71603814 1D GGAATCACCA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 8 7 100516 CASAVA_Build 16 71605703 1D GTTTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 T 15 14 100517 CASAVA_Build 16 71611795 1D TTCTCACAAG A/- AATTTCCCAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 A 3 2 100518 CASAVA_Build 16 71620186 1D CCACAGCCCC G/- GGGCACCCAA 3070 het 2482 hom 27 7 13 7 G 4 3 100519 CASAVA_Build 16 71624087 1I AAAGAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 11 12 100520 CASAVA_Build 16 71626563 1D ACAAAAAAAA G/- GGATGTAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 G 3 2 100521 CASAVA_Build 16 71628431 2D CTGCGCAAAT AA/-- AAGACCCTCA 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 A 4 2 100522 CASAVA_Build 16 71630518 1D CTAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 1388 het 695 hom 27 7 8 12 A 17 16 100523 CASAVA_Build 16 71635551 1I CTGACCATAG -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 T 6 7 100524 CASAVA_Build 16 71643618 1I TTGTAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 11 12 100525 CASAVA_Build 16 71646445 1D AAAGGGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 A 12 11 100526 CASAVA_Build 16 71652932 2D TTCAATGGCA AC/-- AGTTAATCTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AC 1 0 100527 CASAVA_Build 16 71654120 1D ACACAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 34 1 26 7 A 12 11 100528 CASAVA_Build 16 71672656 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 251 hom 40 3 21 16 T 14 13 100529 CASAVA_Build 16 71679543 1D TTTCATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 11 10 100530 CASAVA_Build 16 71699734 1D ACCTTACCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 33 0 29 4 A 10 9 100531 CASAVA_Build 16 71700404 1I TGGTTGGGGA -/T TTCTGGCTGG 3070 hom 96 het 34 0 29 6 T 2 3 100532 CASAVA_Build 16 71700904 3I AGCACGACAC ---/AGA AGGTTACGTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AGA 0 1 100533 CASAVA_Build 16 71705705 5D ACTATGGTTG AAGAT/----- AAGTTGGAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 AAGAT 1 0 100534 CASAVA_Build 16 71709910 1D GCCTGGCCTA T/- TTTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 7 6 100535 CASAVA_Build 16 71710515 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 6 T 7 8 100536 CASAVA_Build 16 71717180 2D ATAAACTCCC AT/-- ATATATATAT 2821 het 2821 ref 23 12 9 2 AT 6 5 100537 CASAVA_Build 16 71740644 5D TTACTATATT TTATA/----- TTATATTATA 2458 het 1043 hom 9 3 5 1 TTATA 3 2 100538 CASAVA_Build 16 71742981 1I GCATAGGAAT -/G GGCAGTGATG 3070 hom 147 het 53 0 47 6 G 2 3 100539 CASAVA_Build 16 71743280 1D TGCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 24 0 13 11 A 15 14 100540 CASAVA_Build 16 71744023 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 24 0 20 4 T 11 10 100541 CASAVA_Build 16 71748123 1D GTCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 33 1 27 5 T 13 12 100542 CASAVA_Build 16 71768574 4D AACCAACCAG CCAA/---- CCAACCAACC 3070 hom 96 het 41 0 31 10 CCAA 6 5 100543 CASAVA_Build 16 71780267 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 29 1 15 13 T 15 14 100544 CASAVA_Build 16 71783125 1I GCTGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 23 0 13 10 T 10 11 100545 CASAVA_Build 16 71787982 1D TCCTGGCCAG A/- AAAAAAAAAA 935 het 935 ref 41 29 4 9 A 13 12 100546 CASAVA_Build 16 71789933 1I TTTCGTTGAT -/C TATCGAGAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 0 1 100547 CASAVA_Build 16 71816526 1I TGTTAAAATT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 6 7 100548 CASAVA_Build 16 71827081 1D ATATCAATTG T/- TTTTTTTTTT 1122 het 1122 ref 28 16 3 9 T 11 10 100549 CASAVA_Build 16 71832706 1I TCATTTTTGC -/T TTTTTGCTTA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 T 5 6 100550 CASAVA_Build 16 71845019 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 1454 het 156 hom 6 1 5 0 T 10 9 100551 CASAVA_Build 16 71866828 1D CTGGGGCTCA G/- GGGACAAGAT 3070 het 3070 ref 41 27 7 7 G 4 3 100552 CASAVA_Build 16 71889420 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 8 9 100553 CASAVA_Build 16 71894434 1D CAATGGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2960 hom 26 9 10 7 T 13 12 100554 CASAVA_Build 16 71896479 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2663 hom 14 7 7 0 A 10 9 100555 CASAVA_Build 16 71897895 1D GATTTTTGTA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 8 7 100556 CASAVA_Build 16 71899625 42D ATATGCATGC ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------------ ATATATATAT 2637 hom 27 het 10 0 10 0 AT 27 6 100557 CASAVA_Build 16 71902261 1D ATATTAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 22 12 9 A 10 9 100558 CASAVA_Build 16 71902853 5I AAATTAGCCA -----/GGTGT GGTGGCAGAC 3070 het 2914 hom 25 7 15 3 GGTGT 0 1 100559 CASAVA_Build 16 71913680 1D TCTTCATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 T 12 11 100560 CASAVA_Build 16 71940876 1I TGTAACTGTA -/C CCTTTCATTG 3070 hom 86 het 34 0 28 6 C 2 3 100561 CASAVA_Build 16 71946095 3I CCAGAGACAG ---/CGA CGACCTCATC 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 CGA 1 2 100562 CASAVA_Build 16 71951306 1D TTAGATGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 10 9 100563 CASAVA_Build 16 71953543 1D CTTCCTTGCC A/- ACCCCCACCC 3070 het 3070 hom 39 15 19 7 A 2 1 100564 CASAVA_Build 16 71955576 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 24 2 13 9 A 13 12 100565 CASAVA_Build 16 71961269 1D TGTCTCTCAA C/- TATTACAGTC 3070 het 3070 hom 55 9 30 17 C 1 0 100566 CASAVA_Build 16 71969089 1I CTCCTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 10 11 100567 CASAVA_Build 16 71978752 1I AACATTTTGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 A 8 9 100568 CASAVA_Build 16 71987833 3D TTATTTTTTT TCA/--- TTCATTCATT 1071 het 1071 ref 49 25 6 18 TCA 1 0 100569 CASAVA_Build 16 71994950 1I CCACATGCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 9 10 100570 CASAVA_Build 16 72003727 13D AGACTGTTTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3052 hom 32 14 13 9 A 23 10 100571 CASAVA_Build 16 72003905 5D GTAGACAACT CCCTC/----- CCCTCCCCTC 3070 hom 93 het 37 0 28 12 CCCTC 3 2 100572 CASAVA_Build 16 72009749 2I CTCAACTCCC --/AG AGAAGCTACC 2054 het 2054 ref 24 7 9 8 AG 1 2 100573 CASAVA_Build 16 72012555 1D AAATGAATGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 9 8 100574 CASAVA_Build 16 72013598 1D TTTCAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 34 1 22 11 T 15 14 100575 CASAVA_Build 16 72014636 1I GCTGTTAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 A 9 10 100576 CASAVA_Build 16 72017342 1D CCTTACCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 A 10 9 100577 CASAVA_Build 16 72022641 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1830 het 1538 hom 23 7 5 11 T 12 11 100578 CASAVA_Build 16 72024179 3D CTGTGTGTTT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 18 11 TTC 3 2 100579 CASAVA_Build 16 72026011 1D ATGGATGGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 89 het 40 0 31 9 T 10 9 100580 CASAVA_Build 16 72036681 2I22M6I TATATATGTG --TGTATATATATATGTATATGTA------/TATATATATATATATGTATATGTATGTGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 29 0 29 3 N/A 0 0 100581 CASAVA_Build 16 72045975 1I CAAATTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 29 1 21 7 A 15 16 100582 CASAVA_Build 16 72047131 2D AAAATATTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 41 0 30 11 T 14 12 100583 CASAVA_Build 16 72051639 1D TGAGATTGGC T/- TTTTTTCACT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 7 6 100584 CASAVA_Build 16 72057581 1D CAATCGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 38 1 26 11 A 11 10 100585 CASAVA_Build 16 72071565 1D AAAGCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1667 het 1667 ref 39 24 4 12 T 12 11 100586 CASAVA_Build 16 72072939 1I TCTCAGGTGA -/T TCCCCCCTAC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 1 2 100587 CASAVA_Build 16 72077848 1D GTTTGTGTGT G/- TTTGTTCAAT 3070 het 3070 ref 33 21 8 5 G 1 0 100588 CASAVA_Build 16 72096958 1D ACATTGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 15 10 A 12 11 100589 CASAVA_Build 16 72103927 1D AATTAAAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 15 het 29 1 22 6 T 10 9 100590 CASAVA_Build 16 72137194 2D TGCTGAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3054 hom 38 12 14 13 A 16 14 100591 CASAVA_Build 16 72140020 1I TACATTTTTT -/A TAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 0 1 100592 CASAVA_Build 16 72144125 1D GCATTTTGTT C/- AGTAGCAAAA 3070 het 3070 ref 42 27 10 5 C 1 0 100593 CASAVA_Build 16 72151644 8I AGAGATGCTC --------/AGTTTATT ATTGCTAAGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AGTTTATT 0 1 100594 CASAVA_Build 16 72154117 1I TGAGAGGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 A 11 12 100595 CASAVA_Build 16 72158027 4I CTCAAGCAAT ----/CCTC CCTCCCACCT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 CCTC 1 2 100596 CASAVA_Build 16 72162634 1I TGAAAATGCA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 8 100597 CASAVA_Build 16 72163040 1I ATAGAATTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 9 100598 CASAVA_Build 16 72168098 6D AGAACATTAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 12 11 AAAAAC 4 3 100599 CASAVA_Build 16 72169784 1I ATGTTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1656 hom 25 7 15 3 A 13 14 100600 CASAVA_Build 16 72183470 1D TGTCTCTACT A/- AAAATACAAA 3070 het 3015 hom 21 7 12 2 A 5 4 100601 CASAVA_Build 16 72184142 1D AATAAAAAGG T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 7 6 100602 CASAVA_Build 16 72192414 1D TTTGTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 38 2 32 5 A 14 13 100603 CASAVA_Build 16 72197887 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1818 hom 28 7 11 10 A 17 16 100604 CASAVA_Build 16 72201605 1I ACTTTAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 9 10 100605 CASAVA_Build 16 72204839 1I TAGCTTTTGC -/T TTTTTTTGTT 2954 het 2954 ref 33 14 13 6 T 7 8 100606 CASAVA_Build 16 72207829 1I ACTATGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 13 8 A 13 14 100607 CASAVA_Build 16 72209108 3I CTGAGGAAAC ---/CTT CTTGATAGGC 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 CTT 1 2 100608 CASAVA_Build 16 72214440 1D GCACATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1799 hom 33 6 17 10 T 12 11 100609 CASAVA_Build 16 72215866 1D CCTAGAGTCA G/- GGGGCAGGAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 5 4 100610 CASAVA_Build 16 72216043 1I TATCCCCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 11 12 100611 CASAVA_Build 16 72221676 1D TTAGAGGATC A/- AAAGGAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 4 3 100612 CASAVA_Build 16 72222437 1I CCCTGAGAAT -/G TTTCAACTTG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 G 0 1 100613 CASAVA_Build 16 72231822 1D AATAAACTGC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 35 0 31 6 A 9 8 100614 CASAVA_Build 16 72232127 1D TCTAATTAAT A/- AAAAATCTCC 3070 hom 63 het 29 0 21 9 A 6 5 100615 CASAVA_Build 16 72236086 1I AAAACTAAAC -/A AAAAAAACCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 8 100616 CASAVA_Build 16 72242637 1D ATACGAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 337 hom 36 1 32 3 A 11 10 100617 CASAVA_Build 16 72250875 4I GAAGAAAAAC ----/AAAG GAAGAGAAGT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AAAG 0 1 100618 CASAVA_Build 16 72253895 1D CATACCCCCC T/- AGGATGATGT 3070 hom 76 het 31 0 25 6 T 1 0 100619 CASAVA_Build 16 72255171 1D ATATTAAAAC A/- AAACCAAGAT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 4 3 100620 CASAVA_Build 16 72260451 1I CTATTTATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 20 het 8 0 7 1 T 8 9 100621 CASAVA_Build 16 72264051 2D AAATTGAAAA AC/-- ACATGATGAG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AC 2 1 100622 CASAVA_Build 16 72264144 1I GAGCATATGC -/T TTTTTATACC 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 5 6 100623 CASAVA_Build 16 72264993 1D ATGAGAAACT A/- GACTATTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 1 0 100624 CASAVA_Build 16 72267808 1I ACATAATGAC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 6 7 100625 CASAVA_Build 16 72268635 2I TAATAATAAC --/AG ATGATGTCAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 AG 0 1 100626 CASAVA_Build 16 72270529 1D GAGGGGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 35 9 T 11 10 100627 CASAVA_Build 16 72276096 12D ACAAGGGTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 26 1 20 8 T 22 10 100628 CASAVA_Build 16 72289160 1D CTGTGGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 34 0 24 10 A 11 10 100629 CASAVA_Build 16 72299154 1D AATAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 11 10 100630 CASAVA_Build 16 72299480 1I TGGGTGTGGT -/G GGGGGGGGGA 3070 het 570 hom 30 2 20 8 G 9 10 100631 CASAVA_Build 16 72301428 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTGG 3070 hom 54 het 19 0 19 1 A 7 6 100632 CASAVA_Build 16 72311194 27D CCACCAAGCC CAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGA/--------------------------- CAGGGTTTCT 3070 hom 21 het 8 0 8 2 CAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGA 1 0 100633 CASAVA_Build 16 72323049 1D GTTCGGGGTG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 108 het 43 0 37 7 A 8 7 100634 CASAVA_Build 16 72324509 1I TGAAATAAAA -/T TTTAAGTTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 3 4 100635 CASAVA_Build 16 72351281 1D GTCTTACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 30 1 21 8 A 13 12 100636 CASAVA_Build 16 72351410 3I CCAGGAGCTG ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 9 12 100637 CASAVA_Build 16 72352397 1D CAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 14 13 100638 CASAVA_Build 16 72363048 1D GTCTGATGTT C/- CTTTCATTTC 3070 het 3070 ref 51 27 15 9 C 2 1 100639 CASAVA_Build 16 72370836 3D CTAGTATGGA ATC/--- ATCGAGAAGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 ATC 2 1 100640 CASAVA_Build 16 72371386 18D CAAAGCACTG GATCCCAAGCCTTTCTAA/------------------ GACTTTTTTT 2026 het 2026 ref 13 10 6 1 GATCCCAAGCCTTTCTAA 1 0 100641 CASAVA_Build 16 72376875 1I TTGGGTTTCT -/A AAAAAGGCTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 5 6 100642 CASAVA_Build 16 72406961 1I CTGTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 563 het 563 ref 38 20 5 13 T 13 14 100643 CASAVA_Build 16 72408030 1D TAAAAGAGAT G/- GGGGGGGAGA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 G 8 7 100644 CASAVA_Build 16 72454403 6I AGAAGGTCAG ------/GAGTTC GAGACCAGCC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 GAGTTC 0 1 100645 CASAVA_Build 16 72456197 7D CATTAGGCAT CCCAATA/------- CCCAATAAAG 3070 hom 96 het 36 0 31 6 CCCAATA 2 1 100646 CASAVA_Build 16 72464976 1D TTTTACAGAG A/- AAAAAAACAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 8 7 100647 CASAVA_Build 16 72470341 6D AAAAGATAAG ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 26 het 17 0 9 9 AT 12 9 100648 CASAVA_Build 16 72481641 3D AAAAAAAACC AAA/--- AAAAAAAAAA 2131 het 2131 ref 31 12 10 9 A 14 11 100649 CASAVA_Build 16 72499020 3D GGTAAAATGT CAC/--- CACAACATCT 3070 het 3070 hom 25 9 14 7 CAC 2 1 100650 CASAVA_Build 16 72503106 1D ACATAGTGGG A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 A 8 7 100651 CASAVA_Build 16 72507986 1I ATAAACTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 T 9 10 100652 CASAVA_Build 16 72508236 2D AATCTTAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 25 4 9 13 T 16 14 100653 CASAVA_Build 16 72509341 1I GATTAGTGCC -/T CTATACATGA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 0 1 100654 CASAVA_Build 16 72516155 5D TGTGTATTCT TTTTC/----- TTTTATCAGT 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 TTTTC 1 0 100655 CASAVA_Build 16 72519316 1I GAAGAGACGT -/A AGTAGAAGAT 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 A 1 2 100656 CASAVA_Build 16 72523801 1I AGGAAAGAAG -/T TTAGGCCTGA 3070 het 3070 ref 49 26 22 1 T 2 3 100657 CASAVA_Build 16 72528030 1I GTTTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 15 16 100658 CASAVA_Build 16 72529538 4I TGTTTCTATA ----/AACT AACAGTTGAA 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 AACT 0 1 100659 CASAVA_Build 16 72531626 1I CATCTTAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 12 8 A 13 14 100660 CASAVA_Build 16 72536164 2D AAGTAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 A 14 12 100661 CASAVA_Build 16 72555665 2D TCATAATCCC CT/-- GTCTTACCAA 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 CT 1 0 100662 CASAVA_Build 16 72563196 1D CAAAGGTCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 10 9 100663 CASAVA_Build 16 72572322 1I AACAGTTAAC -/A GGGCCGGGCG 3070 het 3070 ref 23 11 10 3 A 0 1 100664 CASAVA_Build 16 72573221 4D GCAATTTACA AAAG/---- AAAGAGGTTG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 AAAG 2 1 100665 CASAVA_Build 16 72581910 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 2582 het 973 hom 11 3 6 2 A 10 9 100666 CASAVA_Build 16 72614504 4I ACAGTTCTTC ----/TTTG TTTATTTGTT 3070 het 2136 hom 22 7 11 4 TTTG 0 1 100667 CASAVA_Build 16 72616958 2D CGTGCACATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 31 het 52 1 37 14 CA 10 9 100668 CASAVA_Build 16 72627186 2D AAGGGTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 25 3 12 10 T 16 14 100669 CASAVA_Build 16 72651210 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 976 het 237 hom 13 3 4 6 A 19 18 100670 CASAVA_Build 16 72655655 1D AGACTAAAGA G/- GGCACACAGA 3070 het 3070 ref 55 25 23 7 G 3 2 100671 CASAVA_Build 16 72657492 1I CTCTAGAGGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 37 0 29 8 A 8 9 100672 CASAVA_Build 16 72657665 1D AGGACCCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 275 hom 18 2 11 5 T 11 10 100673 CASAVA_Build 16 72664442 4D CGCACACACT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 44 16 16 13 TC 8 6 100674 CASAVA_Build 16 72665414 1D AAATATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1632 hom 26 7 16 3 T 11 10 100675 CASAVA_Build 16 72668185 1I TCCCTCCTAG -/C CCCCCACTCC 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 C 5 6 100676 CASAVA_Build 16 72670201 1D AGAAAAACAC T/- TTTGAGAAAC 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 4 3 100677 CASAVA_Build 16 72680783 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 2374 het 2374 ref 21 10 8 3 A 11 12 100678 CASAVA_Build 16 72698486 1I TAATTTCAAC -/T AAAGGGAAGT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 0 1 100679 CASAVA_Build 16 72705491 1I GTGATGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 11 100680 CASAVA_Build 16 72707572 1D49M4D AAAATTAACT AAAAAAAAAGTATTAAGCTGCAATTACGTTTGCACCAACCTAATAGAGAGAATT/-AAAAAAAAGTATTAAGCTGCAATTACGTTTGCACCAACCTAATAGAGAG---- AATAAAGATT 3070 hom 108 het 32 0 37 7 N/A 0 0 100681 CASAVA_Build 16 72708457 5I AATAACTGGC -----/GATTT GATTTCTCAG 3070 hom 78 het 32 0 27 8 GATTT 1 2 100682 CASAVA_Build 16 72712151 1I TTTGTTGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 46 0 35 11 A 9 10 100683 CASAVA_Build 16 72716039 1D TCTGCATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 28 0 21 8 T 11 10 100684 CASAVA_Build 16 72739026 1I CTGAATTCTG -/T TCTTTTTCAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 1 2 100685 CASAVA_Build 16 72741950 1I TATTCATCTG -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 8 9 100686 CASAVA_Build 16 72746215 1I AAATGATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 13 14 100687 CASAVA_Build 16 72761334 2I ATCAACCCCC --/CA AATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 CA 0 1 100688 CASAVA_Build 16 72762030 3D GAGTGCAATA ATT/--- GTGCGATCTC 1713 het 1713 ref 21 6 5 10 ATT 1 0 100689 CASAVA_Build 16 72765867 1I CTTATAACTC -/T TTTTTTTTTT 1785 het 337 hom 10 2 7 1 T 12 13 100690 CASAVA_Build 16 72779076 1D ATCAAACTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 10 9 100691 CASAVA_Build 16 72789078 1I TCTTTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 11 12 100692 CASAVA_Build 16 72797917 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2959 het 1749 hom 19 6 9 4 T 11 10 100693 CASAVA_Build 16 72806106 1D AGTTCCTAAA T/- TTTTTTAGCA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 7 6 100694 CASAVA_Build 16 72809326 1I TTCTCAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1398 hom 30 4 24 2 T 11 12 100695 CASAVA_Build 16 72842148 1D TTTGAAAACA G/- GAAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 G 2 1 100696 CASAVA_Build 16 72852503 1I CTCTGTGCGG -/C TCTGCTCCAT 3070 hom 68 het 26 0 23 3 C 0 1 100697 CASAVA_Build 16 72853857 3D TTTCATGTTA TGT/--- TATAAAGTAT 2712 het 2712 ref 25 16 7 3 TGT 1 0 100698 CASAVA_Build 16 72855936 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 A 10 11 100699 CASAVA_Build 16 72858798 4D ACTGCAAAGA ATGG/---- ATGGATAAGT 3070 het 3070 ref 40 22 18 2 ATGG 2 1 100700 CASAVA_Build 16 72865517 1I TAATTATCAA -/T TTCCTCTTGA 3070 hom 147 het 55 0 49 6 T 2 3 100701 CASAVA_Build 16 72872874 1D ATGACAATTA C/- ATTCCTCCTG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 C 1 0 100702 CASAVA_Build 16 72877559 15D GGAATGGTGG CACATGCTTGTAGTC/--------------- CCAGCTACTC 3070 het 3070 hom 25 10 16 2 CACATGCTTGTAGTC 1 0 100703 CASAVA_Build 16 72878479 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2117 het 988 hom 19 5 6 8 A 13 12 100704 CASAVA_Build 16 72880980 3D TAAGAGATGA AAC/--- AACGTCTACT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 AAC 2 1 100705 CASAVA_Build 16 72890770 3D TCTCATTCAG TCC/--- TCCTCTATTC 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 TCC 2 1 100706 CASAVA_Build 16 72900495 1I TAGTTTTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 9 10 100707 CASAVA_Build 16 72907919 2D CATGACGTAA CT/-- CTGCCTACGC 3070 het 3070 hom 54 23 23 10 CT 2 1 100708 CASAVA_Build 16 72931716 1D TTCTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1866 het 1866 ref 16 8 5 4 T 12 11 100709 CASAVA_Build 16 72940282 1I GATCCCAGTC -/T CCCTGTAGAT 1391 het 1391 ref 30 24 3 3 T 0 1 100710 CASAVA_Build 16 72950728 9D ACTCCATTTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 1439 hom 19 6 9 4 A 19 10 100711 CASAVA_Build 16 72963871 1I TTTGCACTAT -/G GCCATAGGAC 3070 het 3070 ref 71 42 23 6 G 1 2 100712 CASAVA_Build 16 72972110 3I GTACTCCCAG ---/CTA CTACTCAGGA 1138 het 444 hom 4 1 3 0 CTA 1 2 100713 CASAVA_Build 16 72987571 12I AGCAGTACTT ------------/AAAACCCAGGAG CCTGGGTGCC 2409 hom 24 het 9 0 7 2 AAAACCCAGGAG 0 1 100714 CASAVA_Build 16 72988490 1D TGCAGTCACA C/- CCCAGACGGG 3070 hom 68 het 26 0 22 4 C 4 3 100715 CASAVA_Build 16 73024729 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTAGA 3070 het 2832 hom 24 8 11 6 T 8 7 100716 CASAVA_Build 16 73025844 5I1M3D CCTTACAGGT -----CCCT/AGGGAC--- CCCTCGACAC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 N/A 0 0 100717 CASAVA_Build 16 73027845 1D TTTTAAAAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2845 hom 24 11 8 5 T 9 8 100718 CASAVA_Build 16 73031222 7D AAACCCTCCA CTGTTAG/------- CTGTTAGCAG 2277 het 2277 ref 33 21 6 9 CTGTTAG 2 1 100719 CASAVA_Build 16 73033691 1I ACGCCCAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 21 7 A 12 13 100720 CASAVA_Build 16 73038631 3D CTCTGCTACT AGC/--- AGCATACAGA 3070 hom 105 het 40 0 36 6 AGC 2 1 100721 CASAVA_Build 16 73051422 1D GCCTGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 2634 het 703 hom 17 5 8 4 T 17 16 100722 CASAVA_Build 16 73078835 1I GAAATAAAGG -/A AAAAAACCAC 3070 het 3070 hom 38 12 25 1 A 6 7 100723 CASAVA_Build 16 73085572 1I GACTCCACTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 18 het 29 1 22 6 A 9 10 100724 CASAVA_Build 16 73088693 2D TGTAAAAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 33 het 15 0 12 4 AC 11 10 100725 CASAVA_Build 16 73090620 3D TAAAACTTGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 90 het 41 0 31 12 TTG 4 3 100726 CASAVA_Build 16 73104082 1I TGAAGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 1328 het 1328 ref 27 17 3 7 A 13 14 100727 CASAVA_Build 16 73110965 1I CTGGTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1415 hom 28 3 23 2 A 11 12 100728 CASAVA_Build 16 73136445 1I ATGTAGATTC -/T TGGCTACAGG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 2 100729 CASAVA_Build 16 73140066 1D TCTAAAAATT C/- CCATAAGACT 3070 hom 68 het 24 0 22 3 C 3 2 100730 CASAVA_Build 16 73144188 1I TTATAGACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 356 hom 25 1 21 3 A 9 10 100731 CASAVA_Build 16 73152355 1I GTTTGCTGAG -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 8 100732 CASAVA_Build 16 73158020 1I AGCAGGTCTC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 7 8 100733 CASAVA_Build 16 73159795 11D AAGCAGAAAG AAGTATCAGAA/----------- TAATTTTACT 3070 hom 14 het 20 0 9 13 AAGTATCAGAA 1 0 100734 CASAVA_Build 16 73161918 1I CTGTGATGGA -/T TTTTTTCAAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 6 7 100735 CASAVA_Build 16 73170764 1I GCAGTGAGCC -/G GTGATTGTGC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 G 1 2 100736 CASAVA_Build 16 73175858 2D AGCATGATTA AT/-- ATTATTTATA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 AT 2 1 100737 CASAVA_Build 16 73176531 4D GACCAGGCAC AGTG/---- AGTGACTCAT 3070 hom 57 het 22 0 20 4 AGTG 2 1 100738 CASAVA_Build 16 73178405 4D CATTAATCTC TCTT/---- TCTAACAAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 5 TCTT 1 0 100739 CASAVA_Build 16 73180656 1D TCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 28 1 21 7 A 13 12 100740 CASAVA_Build 16 73181396 3I AACTTCACTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TTG 5 6 100741 CASAVA_Build 16 73190612 5D CCATTTCTGG ACTTT/----- ACTTGGAGAA 3070 het 3070 ref 47 25 17 7 ACTTT 1 0 100742 CASAVA_Build 16 73198766 1I TTGCTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 20 2 16 2 A 11 12 100743 CASAVA_Build 16 73201591 1I GCCCAGCTAA -/T TTATTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 13 5 T 2 3 100744 CASAVA_Build 16 73205757 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 26 5 A 10 11 100745 CASAVA_Build 16 73208005 1I CTAAAAATAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 306 hom 24 1 22 1 A 7 8 100746 CASAVA_Build 16 73208273 1I CTGTCTAGAC -/T GAGAATCTAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 100747 CASAVA_Build 16 73213094 1I GTTTTTTTTT -/G GTTTGTTTGT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 1 2 100748 CASAVA_Build 16 73213862 1D CTATTTCTAC A/- AAAAAATTTA 3070 hom 106 het 39 0 36 3 A 7 6 100749 CASAVA_Build 16 73216914 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3063 het 596 hom 31 2 21 8 A 13 14 100750 CASAVA_Build 16 73218221 4I AAACAATTCT ----/GAGA GTGAGTTGTC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 GA 0 2 100751 CASAVA_Build 16 73226871 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 31 0 23 8 A 12 11 100752 CASAVA_Build 16 73231545 1D GGAAACTTAA T/- TTTTTTTTTT 3013 het 743 hom 28 2 14 12 T 17 16 100753 CASAVA_Build 16 73232869 4D GCCTAAACAG ATTA/---- ATTTTGACTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATTA 1 0 100754 CASAVA_Build 16 73242398 1I TATTTACTAG -/T TTTTTGGAGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 5 6 100755 CASAVA_Build 16 73251001 1I TCTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 23 9 A 10 11 100756 CASAVA_Build 16 73256155 4I CTAAAAAAAG ----/AAAA AAAAAAGAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 10 100757 CASAVA_Build 16 73261409 2D TAATCATATT AA/-- GTTTATATTC 3070 hom 45 het 19 0 16 5 A 2 0 100758 CASAVA_Build 16 73289034 5I GCCAGGAGTT -----/CCAGA CCATTCTGGG 3070 hom 105 het 37 0 33 4 CCAGA 0 1 100759 CASAVA_Build 16 73294709 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2356 hom 15 het 6 0 6 0 A 9 10 100760 CASAVA_Build 16 73295459 1D GCTTGGCTAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 51 het 18 0 18 1 T 9 8 100761 CASAVA_Build 16 73297741 1D9M1D GGTAAAACAT AAATTCTTTGT/-AATTCTTTG- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 4 N/A 0 0 100762 CASAVA_Build 16 73317794 1D TACAGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 34 1 29 4 T 11 10 100763 CASAVA_Build 16 73337777 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 1 0 100764 CASAVA_Build 16 73348295 2I GCAAAAACAA --/AC ACACAAGAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AC 2 3 100765 CASAVA_Build 16 73352858 16D TCTCAAAAAA AAAGAAAGAAAGAAAG/---------------- AAAGAAAGAA 3070 het 1850 hom 17 6 12 6 AAAG 7 3 100766 CASAVA_Build 16 73353476 2I CAGGGTCTCA --/CT CTGTCACCCA 3070 het 1623 hom 29 6 18 5 CT 1 2 100767 CASAVA_Build 16 73355108 1I GAATTCTACT -/C CCCCCTCTTA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 C 5 6 100768 CASAVA_Build 16 73370573 1D GGAGGACTGA T/- TAAATAAACT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 2 1 100769 CASAVA_Build 16 73373019 1I TTCTATATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 11 12 100770 CASAVA_Build 16 73374424 1D TACATGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 20 20 8 T 11 10 100771 CASAVA_Build 16 73388204 1D GAAGTTTGTA T/- TTGTCTGAGA 3070 het 3070 ref 51 28 18 6 T 3 2 100772 CASAVA_Build 16 73389934 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2349 hom 25 9 9 7 A 14 13 100773 CASAVA_Build 16 73414291 1I CCCAGATATT -/A AAAAAAAAAA 1265 het 1265 ref 25 17 3 5 A 11 12 100774 CASAVA_Build 16 73415093 1D TGAGCACCTA G/- GGGACTGGTG 3070 het 3070 hom 58 20 24 15 G 4 3 100775 CASAVA_Build 16 73415965 3D GTGTGCACCT GAG/--- GAGACTTCTT 3070 het 3070 ref 46 23 22 3 GAG 2 1 100776 CASAVA_Build 16 73420837 3D14M2I AGTATTAATG TGTTTTTGTTGTAACTC--/---TATTGTTGTAACTCTT TATCTCTTAT 3070 het 417 hom 35 3 21 14 N/A 0 0 100777 CASAVA_Build 16 73422670 1D CTAATTAATG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 8 7 100778 CASAVA_Build 16 73427529 1D TCCATTTTAA G/- ATCCTTAATT 3070 het 3070 hom 54 22 25 8 G 1 0 100779 CASAVA_Build 16 73433157 4D AAAGAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 AAAG 3 2 100780 CASAVA_Build 16 73435569 2D GCTCTCACTC TG/-- TTGCCCAGGC 1907 het 1907 ref 28 16 6 6 TG 1 0 100781 CASAVA_Build 16 73435742 1D GCTTTCCTCC T/- TTTTTTTTGT 1479 hom 12 het 24 0 5 19 T 9 8 100782 CASAVA_Build 16 73437312 8I AGTATAATCA --------/GCATAGTT GCATAGTTGT 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 GCATAGTT 1 2 100783 CASAVA_Build 16 73438902 1I TTACCACAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 9 10 100784 CASAVA_Build 16 73442489 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAGAAATGA 25 het 25 ref 27 15 2 10 AG 1 0 100785 CASAVA_Build 16 73444710 4D CATTTATATA TATT/---- TAAACATTGA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 TATT 1 0 100786 CASAVA_Build 16 73450277 1D TTGACAGAGG T/- TCTGTAACTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 2 1 100787 CASAVA_Build 16 73450841 1D CCCAGCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 T 13 12 100788 CASAVA_Build 16 73454826 1I TCTTTCTTTG -/T TTTTTTTTTT 2590 het 2590 ref 26 13 7 6 T 10 11 100789 CASAVA_Build 16 73468637 4D ATATCTCAAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 13 16 15 AC 8 6 100790 CASAVA_Build 16 73485009 1D TCCCACACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 13 12 100791 CASAVA_Build 16 73487489 1D GCACTGGATT A/- AAAAAAAAAA 1442 het 1442 ref 35 23 4 9 A 12 11 100792 CASAVA_Build 16 73493051 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1477 het 1477 ref 31 16 6 10 A 17 16 100793 CASAVA_Build 16 73493838 1I TGTTTGTAGT -/A AAAAAAGGCC 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 A 6 7 100794 CASAVA_Build 16 73495073 13D TCAACTCAGG GAGTGGAGATTAC/------------- GAGTGGAGAT 3070 het 3070 ref 42 25 15 7 GAGTGGAGATTAC 2 1 100795 CASAVA_Build 16 73496046 1D ACAAGCAGGC T/- TTTTAGTAGG 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 5 4 100796 CASAVA_Build 16 73498541 1D GGTCACATCT G/- CCCAGGTTAC 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 G 1 0 100797 CASAVA_Build 16 73499584 1D TGAGAGGCTG A/- GGCAGGTGGA 1611 het 1611 ref 18 11 4 3 A 1 0 100798 CASAVA_Build 16 73506977 1D TACAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 981 het 680 hom 13 5 3 5 T 17 16 100799 CASAVA_Build 16 73510899 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2681 hom 24 11 9 4 T 13 14 100800 CASAVA_Build 16 73513174 1D AACAGCAGCC T/- TATATAGTCC 3070 het 3070 ref 48 24 21 4 T 2 1 100801 CASAVA_Build 16 73524869 2D CTCATGAATC AT/-- ATGCCTAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 AT 2 1 100802 CASAVA_Build 16 73538337 1I AAGAGACAGA -/T TAACACATGC 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 T 1 2 100803 CASAVA_Build 16 73545401 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1291 het 788 hom 10 4 3 3 A 11 12 100804 CASAVA_Build 16 73548481 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1900 het 1609 hom 29 11 7 11 T 17 16 100805 CASAVA_Build 16 73552153 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2801 het 2801 ref 30 10 10 10 A 17 16 100806 CASAVA_Build 16 73554174 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 11 10 100807 CASAVA_Build 16 73556666 2I39M1I CTTAATTGCC --AGTCTTAAAAATTTTGAGCCAGAAGATGCTACAGAAACT-/AGAGTCTTAAAAATTTTGAGCCAGAAGATGCTACAGAAACTA TGTCATTCAG 3070 het 3070 ref 30 21 16 8 N/A 0 0 100808 CASAVA_Build 16 73561894 19D ACTCTGTCTC CAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAA 1605 het 1028 hom 10 4 6 1 CAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 100809 CASAVA_Build 16 73564715 1D TGGGGTTGGC G/- GGGGGGCCGG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 7 6 100810 CASAVA_Build 16 73570613 16I GGCGCGGTGG ----------------/CTCATGCCTGTAATAC CAGCATTTTG 3070 hom 42 het 15 0 14 5 CTCATGCCTGTAATAC 0 1 100811 CASAVA_Build 16 73572775 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 10 11 100812 CASAVA_Build 16 73575285 1I GGCTGAGGTG -/A GGAGGATAGC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 0 1 100813 CASAVA_Build 16 73592821 3D GAATTGTTAG GAT/--- GATATTTTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 8 GAT 2 1 100814 CASAVA_Build 16 73601348 1D TTGGAGAAAT A/- ATCTATTTAT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 2 1 100815 CASAVA_Build 16 73608238 1D GCCACCGCGG C/- CGGCCTACTG 3070 hom 12 het 11 0 8 3 C 2 1 100816 CASAVA_Build 16 73621003 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAATAC 3070 hom 41 het 17 0 15 2 A 8 7 100817 CASAVA_Build 16 73623711 2D TTTCACCATG TT/-- GGCCAGGCTG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 2 0 100818 CASAVA_Build 16 73625391 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 13 12 100819 CASAVA_Build 16 73639357 1I CTCATCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2921 hom 46 8 23 15 T 12 13 100820 CASAVA_Build 16 73703322 3D GAGAAGACCT ATC/--- ATCATGTCAC 3070 hom 74 het 26 0 25 1 ATC 2 1 100821 CASAVA_Build 16 73707341 1I ACAGGGTCTT -/A ACTATGTTGC 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 1 2 100822 CASAVA_Build 16 73715335 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 8 100823 CASAVA_Build 16 73726660 27I GAGATCCTTC ---------------------------/AAAAAGTGAATGGATAAACCAACTGTA ACTCATTCAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AAAAAGTGAATGGATAAACCAACTGTA 0 1 100824 CASAVA_Build 16 73731668 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 22 1 19 2 A 13 12 100825 CASAVA_Build 16 73741783 1I AATTTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 9 10 100826 CASAVA_Build 16 73743175 2I AACGATTCTC --/AA GAGATTTTCA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 0 2 100827 CASAVA_Build 16 73745623 2D ACTTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 17 0 13 7 A 13 11 100828 CASAVA_Build 16 73747859 5D CTGTCTCAGA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 hom 60 het 21 0 21 2 AAAAG 4 3 100829 CASAVA_Build 16 73750031 2D TTATTTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 14 7 T 16 14 100830 CASAVA_Build 16 73754317 1I GTAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2635 het 291 hom 17 2 10 5 T 11 12 100831 CASAVA_Build 16 73756212 1I CCATAAGTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 20 6 A 0 1 100832 CASAVA_Build 16 73759947 1I ACTTCAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 10 11 100833 CASAVA_Build 16 73776661 1D GACCAGTGTT A/- AAGGGTGAAG 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 A 3 2 100834 CASAVA_Build 16 73782586 1D TTTTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 1109 het 1109 ref 19 9 5 5 T 11 10 100835 CASAVA_Build 16 73784865 3I CAATGCCAAG ---/AAC AACAAAACCC 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 AAC 1 2 100836 CASAVA_Build 16 73785186 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2597 het 960 hom 21 5 12 4 A 15 14 100837 CASAVA_Build 16 73790153 2D GTTTGAAAGA GT/-- GTAAGAGTGT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 GT 2 1 100838 CASAVA_Build 16 73791516 2D AAAAAAAAAT AC/-- ACACACACAC 2304 het 1187 hom 15 6 7 2 AC 8 7 100839 CASAVA_Build 16 73800083 8D GTGCCCACCA GGCCCACG/-------- GGAACAGCTG 3070 het 3070 hom 45 15 20 11 GGCCCACG 1 0 100840 CASAVA_Build 16 73804086 1I TTTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 T 12 13 100841 CASAVA_Build 16 73804435 2D CGTGTGGGAT GG/-- GGGGGGTGGG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 G 8 6 100842 CASAVA_Build 16 73804839 1D AGAGTTCTGG T/- TTTTTAGGCG 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 6 5 100843 CASAVA_Build 16 73809053 3D GTCTTTCCTC CTT/--- GTTTTGTGAC 3070 het 3070 hom 37 10 20 8 CTT 1 0 100844 CASAVA_Build 16 73834948 4D AACAACAATA AGAC/---- AGAGCTTCCT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 AGAC 1 0 100845 CASAVA_Build 16 73837484 2I ACCTCAGCCA --/CC CCTCCCACCT 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 C 2 4 100846 CASAVA_Build 16 73852157 2D AAAAAATACA TT/-- TGGCATTACA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 3 1 100847 CASAVA_Build 16 73863137 1D CAAAGAATAA T/- TTTTTTTTTT 2195 het 2195 ref 28 15 7 6 T 11 10 100848 CASAVA_Build 16 73865942 12D CCTTCCATCT CAGCCTCCTGAG/------------ TATCTGGGAC 3070 het 3070 ref 25 14 11 5 CAGCCTCCTGAG 1 0 100849 CASAVA_Build 16 73870216 1I AGCTGCAGGT -/G GATAGTGACT 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 G 1 2 100850 CASAVA_Build 16 73870403 1I CCGTTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2912 het 2912 ref 25 14 7 4 A 10 11 100851 CASAVA_Build 16 73870883 3D AGCTCAGGGC TTG/--- TTTTGACAGG 2987 het 2858 hom 29 13 10 6 TTG 1 0 100852 CASAVA_Build 16 73876548 4I GAAGGACACT ----/CTGA CTGTCCTTTT 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 CTGA 0 1 100853 CASAVA_Build 16 73882496 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1741 het 1642 hom 23 7 7 9 A 15 16 100854 CASAVA_Build 16 73884942 2I TTCGGGGCAA --/GG GGCTGGCTGC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 G 2 4 100855 CASAVA_Build 16 73887880 2I AAGCGATCCT --/CC CACCTTGGCC 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 C 1 3 100856 CASAVA_Build 16 73895460 2D TCTTTTCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 32 15 7 10 TC 8 7 100857 CASAVA_Build 16 73903170 1D ACCTTTACAA T/- TTTTTTTTTT 1766 het 1766 ref 42 19 5 18 T 17 16 100858 CASAVA_Build 16 73911843 1I AAAACTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 24 21 8 A 10 11 100859 CASAVA_Build 16 73923102 12I CCATGTTGTG ------------/TGTATCATGGGT TGTTCCTTGT 3070 het 3070 ref 57 31 20 6 TGTATCATGGGT 0 1 100860 CASAVA_Build 16 73926356 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 1326 het 1326 ref 29 20 5 4 A 12 13 100861 CASAVA_Build 16 73946094 1I GGGGAAAGGG -/A AAAAGTGCTG 3070 het 3070 hom 56 22 28 6 A 4 5 100862 CASAVA_Build 16 73949878 1I AAAATGAGGT -/A ATTTATTAAA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 1 2 100863 CASAVA_Build 16 73951677 1D GGCAAAAAAA C/- AATAAAGACC 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 C 1 0 100864 CASAVA_Build 16 73956279 11D ACCAAAGAGT TTGAGAACCAC/----------- TAAACATTTA 3070 het 3070 ref 42 22 21 4 TTGAGAACCAC 1 0 100865 CASAVA_Build 16 73957688 1D AACAAATGGG A/- AATTGGTGAG 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 3 2 100866 CASAVA_Build 16 73962743 4I TACAATTTCA ----/TAAT TAATTATATA 3070 het 3070 ref 49 24 23 2 TAAT 1 2 100867 CASAVA_Build 16 73966456 1I CTATGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 10 11 100868 CASAVA_Build 16 73969684 2I AGCATCTCAC --/AT GTCTCTGCTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 AT 0 1 100869 CASAVA_Build 16 73970490 2I AGCTAAAGCA --/GT GTGTGAGGGA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 GT 2 3 100870 CASAVA_Build 16 73970744 2I CAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 46 13 21 12 AG 7 8 100871 CASAVA_Build 16 73976946 1I TTGAAAAAAA -/T AAATTCTAAT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 0 1 100872 CASAVA_Build 16 73977149 1I AAAAGAAGTT -/A AAAGACCTAT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 3 4 100873 CASAVA_Build 16 73981070 1D TCCCAAAATG A/- AAAAAGTCTG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 6 5 100874 CASAVA_Build 16 73983829 1I ACAAAGCAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 9 10 100875 CASAVA_Build 16 73990188 1I GGCGTGGTGG -/C TCATGCCTGT 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 C 0 1 100876 CASAVA_Build 16 73993170 4D GACAAGCCTG GAAA/---- GAGTCACCTG 3070 het 3070 hom 42 20 21 3 GAAA 1 0 100877 CASAVA_Build 16 73993250 1D TTGAACATAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 A 9 8 100878 CASAVA_Build 16 73998914 1D ACATTGCTAC A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 7 6 100879 CASAVA_Build 16 74008251 6I TGGAAACAAT ------/AAAGCC CAATATCCAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 AAAGCC 0 1 100880 CASAVA_Build 16 74009601 2D GCGATGAGCT GA/-- GATACACCAC 1508 het 1508 ref 14 7 6 1 GA 2 1 100881 CASAVA_Build 16 74019531 1D GGGAAATTTG T/- TTTTTTTTTT 2737 het 1953 hom 34 13 13 8 T 15 14 100882 CASAVA_Build 16 74020425 1I CTGAGGTGGG -/A AGAGTTGCTT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 1 2 100883 CASAVA_Build 16 74023291 1I ATAGGGATGA -/G GGGTGATGGG 2632 het 2429 hom 16 7 7 2 G 3 4 100884 CASAVA_Build 16 74025251 1I AGTTTGAACT -/G GGGAGAAGCG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 G 3 4 100885 CASAVA_Build 16 74026285 2I TTTTGTTTTG --/TT TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 4 6 100886 CASAVA_Build 16 74028699 2D CGCCCGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 1927 het 852 hom 15 7 7 1 T 12 10 100887 CASAVA_Build 16 74042064 1D GCAAGAATTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 9 8 100888 CASAVA_Build 16 74042637 1D TTGGGGGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2212 hom 24 5 13 6 A 10 9 100889 CASAVA_Build 16 74066814 2D CACACAGCAC AG/-- AGTGTCAACA 3070 het 3070 ref 49 27 20 2 AG 2 1 100890 CASAVA_Build 16 74069798 1I CCAGAGGAGG -/C AGGGGCAAGA 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 C 0 1 100891 CASAVA_Build 16 74071970 1I CAGTGTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 13 14 100892 CASAVA_Build 16 74073419 3I CTCTTAGGGC ---/TAT TGTGAGATGC 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 TAT 0 1 100893 CASAVA_Build 16 74084916 1I ACTCCGTATC -/A AAAAAAAAAA 1692 het 1306 hom 26 6 8 12 A 17 18 100894 CASAVA_Build 16 74103204 1D GCCAAGCTAA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 8 7 100895 CASAVA_Build 16 74103389 1I AACATTGGTG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 6 7 100896 CASAVA_Build 16 74111000 1D TCAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 7 T 9 8 100897 CASAVA_Build 16 74114523 2I TATTTGCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2966 hom 26 9 13 4 T 12 14 100898 CASAVA_Build 16 74128656 16D CGAAACCCAT ACATATACCCCATGAG/---------------- TCTACAATAA 3070 het 3070 ref 25 17 9 8 ACATATACCCCATGAG 1 0 100899 CASAVA_Build 16 74143046 3I TTACACAGAT ---/ATC ATGTTTATTT 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 ATC 0 1 100900 CASAVA_Build 16 74143361 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2344 hom 15 7 7 1 A 12 13 100901 CASAVA_Build 16 74175855 1I CACTATGTTG -/C CCAGGTTGGT 3070 hom 77 het 31 0 23 8 C 2 3 100902 CASAVA_Build 16 74187953 9D ACCCCGTCTC TACAAAAAA/--------- TACAAAAAAT 1732 het 1732 ref 11 5 5 2 TACAAAAAA 2 1 100903 CASAVA_Build 16 74192107 3I32M2D GCAGCTCCTC ---ACTTTACTCATGTCAATGAACCTTCTTCAACAAT/ACAACTTTACTCATGTCAATGAACCTTCTTCAACA-- ATGTTACATT 3070 het 3070 hom 49 24 30 7 N/A 0 0 100904 CASAVA_Build 16 74195119 1D AGTGTTGACT A/- CTTTATAAGC 3070 het 3070 ref 53 27 21 5 A 1 0 100905 CASAVA_Build 16 74195350 1D AATCTCCCTT A/- CCTGGCTGGA 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 A 1 0 100906 CASAVA_Build 16 74216233 2D CTCCAAGGCC AA/-- AGACTTTGCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 3 1 100907 CASAVA_Build 16 74220690 1I CTCCTCCAGC -/A AAGCCTATGG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 2 3 100908 CASAVA_Build 16 74222729 1D AGAATAGTGT G/- GGAAATTCTA 3070 het 3070 ref 49 31 14 4 G 3 2 100909 CASAVA_Build 16 74227277 3D ACAGAAAGCT AGG/--- AGGCCACAGC 3070 het 3070 hom 41 14 19 13 AGG 2 1 100910 CASAVA_Build 16 74228031 1D TCCCTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 11 10 100911 CASAVA_Build 16 74229300 1D AAAAGAGACC A/- AAAAAAAAAA 1850 het 1850 ref 28 11 10 7 A 17 16 100912 CASAVA_Build 16 74229617 1D AAAAAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2917 hom 32 11 16 5 T 13 12 100913 CASAVA_Build 16 74232622 1I GGGCATGGAG -/A AGTGGGTTTG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 1 2 100914 CASAVA_Build 16 74250669 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 T 10 9 100915 CASAVA_Build 16 74263518 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1012 hom 15 5 9 2 A 11 10 100916 CASAVA_Build 16 74264853 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2614 hom 22 9 12 1 A 11 10 100917 CASAVA_Build 16 74279548 1D ACTCTTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 13 12 100918 CASAVA_Build 16 74287539 1I AGAAGCTGTT -/A GGGGAATTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 100919 CASAVA_Build 16 74304128 1I GATCTTTTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 9 10 100920 CASAVA_Build 16 74309468 1I ACAAAACATA -/C AAAGCCTGGC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 0 1 100921 CASAVA_Build 16 74317474 3I GGAACAATTG ---/AGA AGGTTAAGAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 AGA 0 1 100922 CASAVA_Build 16 74320912 1D CTCTTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1450 hom 36 5 9 22 T 16 15 100923 CASAVA_Build 16 74321676 1I TTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 8 9 100924 CASAVA_Build 16 74341369 16I GCAAACACAC ----------------/CTATAAATAAACACAT CTATAAATAA 2362 het 2362 ref 28 14 5 9 CTATAAATAAACACAT 0 1 100925 CASAVA_Build 16 74342165 6I ATGAGATAAA ------/ACAGGT GCAGACACCT 3070 het 3070 ref 45 23 12 10 ACAGGT 0 1 100926 CASAVA_Build 16 74362323 1D CTTTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 13 9 T 12 11 100927 CASAVA_Build 16 74385786 21I AGAAGCCACA ---------------------/TTGCTGGTGTTTTCCTCATTC TTAGTGATAT 3070 hom 108 het 36 0 37 1 TTGCTGGTGTTTTCCTCATTC 0 1 100928 CASAVA_Build 16 74409739 1D TACTTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 1881 het 1881 ref 39 24 5 10 T 13 12 100929 CASAVA_Build 16 74449878 3D TATCACAAAT ATA/--- ATAAAATGTA 2017 het 2017 ref 16 10 5 2 ATA 2 1 100930 CASAVA_Build 16 74454271 1D AATATTTAAG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 7 6 100931 CASAVA_Build 16 74454429 1D TTCTTTTTTT C/- TTTGAGATGG 3070 hom 27 het 21 0 17 4 C 1 0 100932 CASAVA_Build 16 74457083 1I ATTTCTAGTT -/C TAGATCCTTG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 C 0 1 100933 CASAVA_Build 16 74460386 1D GCGAACACAG A/- AAAAAAAAAA 1461 het 1461 ref 52 43 4 9 A 11 10 100934 CASAVA_Build 16 74475122 4I TATAATATAA ----/TAAT TAATTACAAT 2637 hom 15 het 6 0 6 0 TAAT 1 2 100935 CASAVA_Build 16 74478728 1D TAAGAACTGC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 7 100936 CASAVA_Build 16 74535818 1I ACTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 11 12 100937 CASAVA_Build 16 74577033 1D TCCCAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 30 1 21 8 T 11 10 100938 CASAVA_Build 16 74579627 2I AGGTCTTTTT --/TG TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 TG 0 1 100939 CASAVA_Build 16 74586432 6D GAGGACTCTG TTACCT/------ ATACCAAGAC 3070 het 3070 ref 42 19 16 8 TTACCT 1 0 100940 CASAVA_Build 16 74586842 2I ACATAAAAGA --/AT AGAGAGTTAA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 AT 0 1 100941 CASAVA_Build 16 74587845 1D TTCTTTTCTA T/- TTATTTCTTC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 3 2 100942 CASAVA_Build 16 74591382 1I ATTAAGGTTG -/C AAGAGCTGTT 3070 hom 110 het 39 0 32 7 C 0 1 100943 CASAVA_Build 16 74596498 1I ATAAACAAAT -/A AATCACAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 A 2 3 100944 CASAVA_Build 16 74598595 1D GACTTCATGT C/- CCTCTTGAAA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 C 3 2 100945 CASAVA_Build 16 74599634 4I CCCATTATTC ----/TATT TATTCTCCAG 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 TATT 1 2 100946 CASAVA_Build 16 74603430 3D TTCAGCAAAC ATT/--- AGGAGAACAT 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 ATT 1 0 100947 CASAVA_Build 16 74604833 1I CTGTTATTTA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 65 het 37 1 33 3 T 7 8 100948 CASAVA_Build 16 74613393 1D CATCAGGTAC A/- AAGAAGAAAG 3070 het 3070 hom 52 21 27 5 A 3 2 100949 CASAVA_Build 16 74617752 2I GCAGAGGGAT --/GA GATCGATTAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 GA 1 2 100950 CASAVA_Build 16 74626087 2I AGAAAATGTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 AT 6 7 100951 CASAVA_Build 16 74626885 1D TGACCCAAAT C/- GATGCCTGGG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 C 1 0 100952 CASAVA_Build 16 74628001 21D AGGGTCCTGA AAAGACCCTTGGTCTTTTTTC/--------------------- CTTGGAAAGG 3070 het 3070 hom 21 12 9 4 AAAGACCCTTGGTCTTTTTTC 1 0 100953 CASAVA_Build 16 74631555 1I TTGTAGGTGC -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 7 8 100954 CASAVA_Build 16 74647684 2I AGCTGTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3063 hom 29 9 15 5 T 13 15 100955 CASAVA_Build 16 74656738 1D TTATGATTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 10 9 100956 CASAVA_Build 16 74667311 2D AACAATACTA AC/-- ACATAAAGAT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 AC 2 1 100957 CASAVA_Build 16 74684342 1D CTTTCTGTAA T/- TTTATGTTAC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 4 3 100958 CASAVA_Build 16 74700559 1I ATTCAGCCAC -/A AAAAAGAAGG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 5 6 100959 CASAVA_Build 16 74720432 1I CGAGCCACTT -/A ACAATAAGAG 3070 het 3070 hom 52 18 25 9 A 1 2 100960 CASAVA_Build 16 74723400 1I TCTTTTAATC -/A AAAAGAGGAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 4 5 100961 CASAVA_Build 16 74740502 4D TTCTATTCAA AAGT/---- AAGTAAGAGT 3070 het 3070 hom 29 13 16 3 AAGT 2 1 100962 CASAVA_Build 16 74749545 1I CTGCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 79 hom 17 1 10 6 T 10 11 100963 CASAVA_Build 16 74757209 1I AAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAGG 1278 het 1278 ref 26 7 12 7 A 8 9 100964 CASAVA_Build 16 74769709 4D AAAAGATATT AAAC/---- AAATTAGTCA 3070 het 3070 ref 27 14 13 4 AAAC 1 0 100965 CASAVA_Build 16 74773703 1I AAGAATGAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 9 10 100966 CASAVA_Build 16 74774398 1I ATTTGGTAGC -/T TTTTTGATGG 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 5 6 100967 CASAVA_Build 16 74799206 1D ATTAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 11 10 100968 CASAVA_Build 16 74815337 2I TTAACCTGTC --/TT TACCTGTTTC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 1 3 100969 CASAVA_Build 16 74818498 1D ATGCTCCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 11 10 100970 CASAVA_Build 16 74819394 1D GCAAAAAAAA C/- CAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 C 2 1 100971 CASAVA_Build 16 74827865 1I ACTATATAAC -/A TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 0 1 100972 CASAVA_Build 16 74836280 4D TCTCAAAATC TCTT/---- TCTCTAATAT 3070 het 3070 ref 34 21 13 1 TCTT 1 0 100973 CASAVA_Build 16 74851309 1D AATAATATAA T/- TTTTTAGTGT 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 T 6 5 100974 CASAVA_Build 16 74869104 1I GCTACTTCTG -/T TATCTACTCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 1 2 100975 CASAVA_Build 16 74888043 2D AGAGAGAGGC AG/-- AGAGAGAGAG 1725 het 1725 ref 41 27 4 11 AG 9 8 100976 CASAVA_Build 16 74894218 7D CTGAGGGGCT CACACAC/------- CACACACCTG 3070 het 3070 ref 41 22 16 5 CACACAC 2 1 100977 CASAVA_Build 16 74899523 1I GCAGGAACAT -/G TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 G 0 1 100978 CASAVA_Build 16 74908509 1I ACAAAATAAT -/A AAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 A 5 6 100979 CASAVA_Build 16 74914243 1I TTATTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 10 11 100980 CASAVA_Build 16 74914686 2I GGTTTTATTT --/AA AATATTTTTA 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 A 2 4 100981 CASAVA_Build 16 74919315 3I GCCTTCCGTC ---/ATT ATTGTTTCAC 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 ATT 1 2 100982 CASAVA_Build 16 74940256 1I AAAAGAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 28 2 17 9 A 11 12 100983 CASAVA_Build 16 74962368 1D GCAAAGCTAG C/- CAAGAACAGT 3070 het 3070 ref 53 24 22 7 C 2 1 100984 CASAVA_Build 16 74964464 2D CTGTACAAAC TG/-- AGACTATGAG 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 TG 1 0 100985 CASAVA_Build 16 74967900 1D ATATAAAGGA C/- CTTTCATATG 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 C 2 1 100986 CASAVA_Build 16 74973547 1I GAAGCTAGAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 8 9 100987 CASAVA_Build 16 74978449 1D TAAAGCCTCC A/- AAAAAAGCAT 3070 hom 144 het 53 0 49 5 A 7 6 100988 CASAVA_Build 16 74985086 1I TTCCTGGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 12 13 100989 CASAVA_Build 16 74999662 3D GTCTGTACCT ATG/--- ATAAGTAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATG 1 0 100990 CASAVA_Build 16 74999777 21D TTAATCTATT AACAATTAACAGTTGTTAATC/--------------------- TATTAACAAT 1978 het 1978 ref 38 17 6 21 AACAATTAACAGTTGTTAATC 1 0 100991 CASAVA_Build 16 75001506 1D TGTCTTATTA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 97 het 39 0 32 7 T 8 7 100992 CASAVA_Build 16 75004068 1I CATTTAAATA -/T CTTTTTTCTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 100993 CASAVA_Build 16 75007040 4I AAACACCTGT ----/TTAA TTAACCCCAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TTAA 1 2 100994 CASAVA_Build 16 75007329 2D ATACTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 34 1 32 1 T 12 10 100995 CASAVA_Build 16 75007908 1I GAAACTTCTA -/T TTTTTAACTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 5 6 100996 CASAVA_Build 16 75009491 1D TTTTTATTTT G/- GTTTTTAATC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 G 2 1 100997 CASAVA_Build 16 75010128 1D GAGTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 T 11 10 100998 CASAVA_Build 16 75011500 2D TTTGTTTGTC TT/-- TTTTCTTGTG 3070 hom 76 het 27 0 26 1 T 6 4 100999 CASAVA_Build 16 75013767 4I ATCATTTATT ----/TTTA TTTGACTCCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTTA 0 1 101000 CASAVA_Build 16 75019818 1D CACGACATCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 860 hom 36 2 27 7 T 12 11 101001 CASAVA_Build 16 75035815 4D ATTTCTTTGC TTTA/---- TTTATTTCCA 3070 het 3070 hom 38 16 18 7 TTTA 2 1 101002 CASAVA_Build 16 75037486 1D GCAAAATGTG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 7 6 101003 CASAVA_Build 16 75038755 2I TATATGAAAT --/TA TATATATATA 1186 het 1186 ref 8 5 3 0 TA 6 7 101004 CASAVA_Build 16 75039798 4I GCACAAAATC ----/TTCA TTCAGTGTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 TTCA 1 2 101005 CASAVA_Build 16 75047510 5I CATTATTCCA -----/TTGAC ATTGGCATTG 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 TTGAC 0 1 101006 CASAVA_Build 16 75048021 3D GATGTTCAAC AGA/--- AGAACACCAA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 AGA 2 1 101007 CASAVA_Build 16 75049200 1I TTACTTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 9 10 101008 CASAVA_Build 16 75050846 1I TTCAGTAATC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 7 8 101009 CASAVA_Build 16 75062442 1D ATAAGTCCTT C/- CCAGACTTCT 3070 het 3070 hom 53 23 24 7 C 3 2 101010 CASAVA_Build 16 75063645 1I TTGCCATAGG -/T TTACTAGTAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 2 3 101011 CASAVA_Build 16 75065248 2D GTTTTTTTTT TG/-- TTTTGTTTTG 332 hom 18 het 18 0 7 11 TG 1 0 101012 CASAVA_Build 16 75073408 2D TATTTTTTTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 23 9 8 8 T 11 9 101013 CASAVA_Build 16 75074450 6D TTTTTTTCCA GCTTGG/------ ATAGGTTGGA 3070 het 3070 ref 26 15 9 7 GCTTGG 1 0 101014 CASAVA_Build 16 75075502 4D TATCTTTGAT AAAC/---- AAATTATTTG 3070 het 3070 ref 25 15 10 1 AAAC 1 0 101015 CASAVA_Build 16 75083253 2D GATATCCCAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 14 32 6 TG 8 7 101016 CASAVA_Build 16 75083916 2D GAGCAAACAC CA/-- CACAGAGTAA 3070 het 3070 hom 30 12 18 0 CA 3 2 101017 CASAVA_Build 16 75084887 1I TTCCTTAGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 9 101018 CASAVA_Build 16 75085483 1I TCCTCCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 43 2 31 10 T 11 12 101019 CASAVA_Build 16 75087025 4D TATGCATGTG TTCT/---- TTGTCTGAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 TTCT 1 0 101020 CASAVA_Build 16 75089772 2D CCTGGGAGAC AG/-- AGTGAGACCC 3070 het 3070 hom 38 10 24 4 AG 2 1 101021 CASAVA_Build 16 75091998 1D TGTAAATCTC T/- TTTTTTTTTT 2940 hom 30 het 22 0 11 11 T 11 10 101022 CASAVA_Build 16 75095814 1D AAGCAGAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 15 22 9 A 10 9 101023 CASAVA_Build 16 75099657 4I TATAAGCAAT ----/TAAA TAAGTAAATA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TAAA 0 1 101024 CASAVA_Build 16 75101586 1D AGTAACCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 T 10 9 101025 CASAVA_Build 16 75101868 2I CCATGTATGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 T 10 12 101026 CASAVA_Build 16 75106062 100D AGCTATAATT ATCTCCAGCCAGATTTTATTTTCTTCATTTTTATTTTGCTTATATTGATTCCTATTGAGGTTAATAAATAGTTGAAAACAATAATAGATGTGCTAAAAAG/---------------------------------------------------------------------------------------------------- AGGAACCAGT 2078 het 2078 ref 19 27 7 4 ATCTCCAGCCAGATTTTATTTTCTTCATTTTTATTTTGCTTATATTGATTCCTATTGAGGTTAATAAATAGTTGAAAACAATAATAGATGTGCTAAAAAG 1 0 101027 CASAVA_Build 16 75110002 14D ATAGAATGTG CATGCATAGAATTA/-------------- CATGCATAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 6 CATGCATAGAATTA 1 0 101028 CASAVA_Build 16 75112517 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 11 10 101029 CASAVA_Build 16 75113213 1D TAGAATACCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 97 het 41 0 33 9 T 9 8 101030 CASAVA_Build 16 75117153 5I ATAATATAGC -----/TTATA TTATATATAA 1978 hom 12 het 6 0 5 1 TTATA 1 2 101031 CASAVA_Build 16 75125076 1I TAAAAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 294 hom 25 1 19 5 A 10 11 101032 CASAVA_Build 16 75128854 2D GTGTGTGTGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 33 13 13 9 GA 7 6 101033 CASAVA_Build 16 75136984 1D TACTTACACT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 9 8 101034 CASAVA_Build 16 75141034 1I33M1D CTCATAAAGC -AAAAAAAAGACCTTGAGGATCTAAAAAATATGAT/AAAAAAAAAGACCTTGAGGATCTAAAAAATATGA- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 31 22 17 3 N/A 0 0 101035 CASAVA_Build 16 75141545 2D AAATAAACAC AT/-- AAATATAACC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 AT 1 0 101036 CASAVA_Build 16 75142077 1I AAGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 10 11 101037 CASAVA_Build 16 75143547 4I GGAGAGAGAA ----/GAAC GAAGGATGAA 3070 hom 94 het 36 0 31 6 GAAC 0 1 101038 CASAVA_Build 16 75150805 1I CTTTCCTTTT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 A 7 8 101039 CASAVA_Build 16 75167596 2I ATAAAAGCCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 18 13 T 10 12 101040 CASAVA_Build 16 75185926 1I TAAGTTATGA -/T TTAAACTATT 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 T 2 3 101041 CASAVA_Build 16 75196540 1D TGAAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 12 11 101042 CASAVA_Build 16 75204494 2I AGTCTCACTC --/TG TGGCTCAGGC 3070 hom 69 het 24 0 23 1 TG 1 2 101043 CASAVA_Build 16 75217900 4I CTGAACAGAA ----/TGTT TGTATAAAAT 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 TGTT 0 1 101044 CASAVA_Build 16 75243036 5I ATAATTACAT -----/ATATA ATATATATGT 2786 het 2786 ref 15 8 6 1 ATATA 1 2 101045 CASAVA_Build 16 75244569 3I AAAAAGGAAA ---/AAG AAGTAGATAC 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 AAG 1 2 101046 CASAVA_Build 16 75245530 5D AAGCTCACAA TTATG/----- TTTCTAAAGG 3070 het 3070 ref 57 32 21 4 TTATG 1 0 101047 CASAVA_Build 16 75260333 3I ATAAAAAAAT ---/TTC TTATTATTTT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 TTC 0 1 101048 CASAVA_Build 16 75277392 1D TCCTAAAACT A/- AAAAAAAAAA 1737 het 1737 ref 40 21 6 15 A 12 11 101049 CASAVA_Build 16 75289591 1D CTTTGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 13 12 101050 CASAVA_Build 16 75291359 1I TTTGGAGGTC -/A GGGGTGAATA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 0 1 101051 CASAVA_Build 16 75291795 1I GACAGAGACT -/G CTTAGTCATC 3070 het 3070 ref 60 25 18 17 G 0 1 101052 CASAVA_Build 16 75292506 1I AATGTAAATG -/T TCTATACCTG 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 T 1 2 101053 CASAVA_Build 16 75293169 2D GTTGCATGGG TA/-- TATTACATGA 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 TA 2 1 101054 CASAVA_Build 16 75294709 4D GACAACAAAC AAAT/---- GACAAACTCT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 AAAT 1 0 101055 CASAVA_Build 16 75297309 1I TAGGACAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 8 9 101056 CASAVA_Build 16 75297629 2I ATTACCAAGC --/AT ATAAAACATC 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 AT 1 2 101057 CASAVA_Build 16 75300519 2D AAATGTCTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 AT 8 7 101058 CASAVA_Build 16 75301517 2D TTCTACTCTC TT/-- AACAAAATTT 3070 het 3070 hom 35 14 21 2 T 2 0 101059 CASAVA_Build 16 75306000 1I TAGAGAAAGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 8 9 101060 CASAVA_Build 16 75309946 2D CAGAGCAGTC AG/-- AGAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 AG 2 1 101061 CASAVA_Build 16 75312455 4I ATAAATAAAA ----/AAAG AAAATAGTGG 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 AAAG 0 1 101062 CASAVA_Build 16 75313709 2I TTAGAATCAA --/TT TTTTTTTTTT 1998 het 1998 ref 19 6 6 7 T 14 16 101063 CASAVA_Build 16 75316349 5D3M6D GCTCAAAGCA AATTTACATAAAAC/-----ACA------ CTTTGAACTT 3070 het 3070 hom 26 9 20 4 N/A 0 0 101064 CASAVA_Build 16 75324272 1I TTTAAAACCC -/A AAGGGGTATA 3070 het 3070 hom 42 10 30 2 A 2 3 101065 CASAVA_Build 16 75325783 4D TTAACTAACA TAGT/---- TAGTGTCTCA 3070 het 3070 ref 38 23 15 4 TAGT 2 1 101066 CASAVA_Build 16 75327075 4D CTCAAAAAAG AAAT/---- AAAGTTCAAT 3070 het 3070 ref 38 23 12 5 AAAT 1 0 101067 CASAVA_Build 16 75339437 2D AATGGATCAA AG/-- AGGTATTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 23 4 AG 2 1 101068 CASAVA_Build 16 75342274 3D CTTGATTCAG TGC/--- TGCTATTTCT 3070 het 3070 ref 29 13 14 4 TGC 2 1 101069 CASAVA_Build 16 75353124 1D ATTACCTTAA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 4 3 101070 CASAVA_Build 16 75354239 2I GTATAAAAAA --/AG AGGTGGTATG 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 AG 1 2 101071 CASAVA_Build 16 75359328 1D TCAATGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 A 11 10 101072 CASAVA_Build 16 75365876 1I TCCATCTCAC -/A AAAAAAAAAA 337 het 337 ref 14 4 4 6 A 11 12 101073 CASAVA_Build 16 75369114 1I ATAAACAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 10 11 101074 CASAVA_Build 16 75378400 1I GAGTTTCGGA -/T TGGCCAAAAC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 1 2 101075 CASAVA_Build 16 75386138 2D TGTTTGAAAC AG/-- GGCATATCTG 3070 het 3070 ref 49 23 21 6 AG 1 0 101076 CASAVA_Build 16 75387288 3I TTTTTCCATT ---/CAC CACAAGTGAC 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 CAC 1 2 101077 CASAVA_Build 16 75387915 1D GATGTGTAGA C/- TAAAGGAAAG 3070 hom 132 het 47 0 44 3 C 1 0 101078 CASAVA_Build 16 75388606 4I26M1D CCATCTGCAG ----GAGGTGACTAACTGCTGTTATTCAAGT/GAGTGAGGTGACTAACTGCTGTTATTCAAG- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 39 17 26 8 N/A 0 0 101079 CASAVA_Build 16 75392064 3I CTTTGGCCAA ---/TCT TCTTAATGAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 TCT 1 2 101080 CASAVA_Build 16 75395015 1I GAGAGTTTAG -/T TTTGTTGTTC 3070 het 3070 ref 45 27 17 1 T 3 4 101081 CASAVA_Build 16 75396406 2D GGGTGACAGA GG/-- GGGGAGACCC 1002 het 1002 ref 16 10 4 2 G 6 4 101082 CASAVA_Build 16 75400416 1I CGCAGCTGAT -/A AAACAGACCA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 A 3 4 101083 CASAVA_Build 16 75408052 2D CATATCACAA GT/-- GTGTACAATC 3070 het 3070 ref 45 24 16 7 GT 3 2 101084 CASAVA_Build 16 75410058 1D ATCTGCCTCC T/- TATAAGACTG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 2 1 101085 CASAVA_Build 16 75439770 1D ACCTGAAGAG C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 9 8 101086 CASAVA_Build 16 75442856 1D CTGAGTAACT A/- AAAAAAAAAA 1013 het 1013 ref 34 17 5 12 A 16 15 101087 CASAVA_Build 16 75461691 2I CTCTTAGATT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 9 11 101088 CASAVA_Build 16 75465914 2I AGCTGAGACC --/AG AGATATCAAC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 AG 1 2 101089 CASAVA_Build 16 75467322 1D13M4I TGGAAAAGTT AAAGTTAAATTAAA----/-AATTTAAATCAAAGTAG AACAAATTAC 3070 het 3070 ref 47 29 19 6 N/A 0 0 101090 CASAVA_Build 16 75468740 2I TTTTTTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 497 het 497 ref 21 10 7 4 TC 0 1 101091 CASAVA_Build 16 75470787 2D TTTTAAAAAG AT/-- AGAAAATAGG 3070 het 3070 ref 36 16 12 9 AT 1 0 101092 CASAVA_Build 16 75474682 1I GCCTCTCCAT -/A ATACTCTCTG 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 A 1 2 101093 CASAVA_Build 16 75491412 1I CAGCCTTGAC -/T TTTTTTTTTT 2729 het 2729 ref 32 16 9 7 T 13 14 101094 CASAVA_Build 16 75491717 1I ATGTTTTCAT -/A AATTTAATAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 2 3 101095 CASAVA_Build 16 75499616 1I ATCTTTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 10 11 101096 CASAVA_Build 16 75508737 1D AGAAGATGCT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 8 7 101097 CASAVA_Build 16 75515705 2D ATTGGGACTA TT/-- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 10 8 101098 CASAVA_Build 16 75516611 1I GACCTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1135 hom 32 10 15 7 A 15 16 101099 CASAVA_Build 16 75517934 4D TTTTAAAAAA AATT/---- AATAATGGAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 7 AATT 1 0 101100 CASAVA_Build 16 75526237 1I TGACACCGAC -/T TGTACGCTAA 3070 het 3070 ref 56 32 20 4 T 1 2 101101 CASAVA_Build 16 75536165 1D TGATACAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 A 9 8 101102 CASAVA_Build 16 75538999 1D CCAACCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 13 12 A 13 12 101103 CASAVA_Build 16 75539998 4D ATGAATACAT GATA/---- GATAGATAGA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 GATA 5 4 101104 CASAVA_Build 16 75546583 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAGAAAAA 2950 het 1129 hom 28 6 14 10 G 1 0 101105 CASAVA_Build 16 75546903 1D TCAGCCATTC T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 37 19 13 6 T 6 5 101106 CASAVA_Build 16 75554047 4I TTATGAATTA ----/GTTT GTTAGTGATT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 GTTT 0 1 101107 CASAVA_Build 16 75556941 1I AATGATTAAA -/T CACATTTTTA 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 T 0 1 101108 CASAVA_Build 16 75563929 1D GTGGAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 21 20 12 A 13 12 101109 CASAVA_Build 16 75565452 2I CATTCTGGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 10 12 101110 CASAVA_Build 16 75569498 1D CTTCCTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 37 1 26 10 A 12 11 101111 CASAVA_Build 16 75569883 1D ATTACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2229 het 41 hom 16 1 10 5 T 17 16 101112 CASAVA_Build 16 75573272 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 TA 5 6 101113 CASAVA_Build 16 75575638 1D TTTTTTTTTT C/- TCTGCAAGTT 2726 het 2726 ref 33 17 7 9 C 1 0 101114 CASAVA_Build 16 75579343 4D CTGTCAATAC ATTT/---- GAAATTTAGG 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 ATTT 1 0 101115 CASAVA_Build 16 75583421 1I CTGTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 10 10 T 13 14 101116 CASAVA_Build 16 75600692 4D TAACTGTTGT CAGA/---- CAGTCCTAAT 3070 het 3070 hom 52 20 28 6 CAGA 1 0 101117 CASAVA_Build 16 75606387 1D TCTGTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1239 hom 30 6 14 10 T 11 10 101118 CASAVA_Build 16 75608328 1I ATGCAATCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 101119 CASAVA_Build 16 75610489 2D TGAAATATGC TA/-- TATATATAAG 3070 hom 135 het 48 0 46 5 TA 5 4 101120 CASAVA_Build 16 75610991 1D CCCAAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 26 7 A 12 11 101121 CASAVA_Build 16 75611467 1I TGCATTGGGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 82 hom 39 1 33 5 A 8 9 101122 CASAVA_Build 16 75629975 5D ATGAATGCTG ACAGA/----- ACAGAACTGG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 ACAGA 2 1 101123 CASAVA_Build 16 75636429 3D GTTGTAGGAC TGT/--- TGTTCTCCCT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 TGT 2 1 101124 CASAVA_Build 16 75673910 22I CACAGCAGCA ----------------------/GGACAAAACAAGCCCCTCTGCT GGATGCCTTT 3070 hom 80 het 34 0 27 9 GGACAAAACAAGCCCCTCTGCT 0 1 101125 CASAVA_Build 16 75689428 1D GACACCAAGA T/- TTTTTTTTTT 2221 het 50 hom 17 2 7 8 T 17 16 101126 CASAVA_Build 16 75689788 1I TTTAAAAAAA -/T ATCAGAAAAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 0 1 101127 CASAVA_Build 16 75699288 1I TCTTTCCTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 9 10 101128 CASAVA_Build 16 75706897 4D GCATTCCCAG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TA 10 8 101129 CASAVA_Build 16 75721431 1D CATTCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 11 10 101130 CASAVA_Build 16 75722432 1D GAGTTTCAAT A/- AAAAAATAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 6 101131 CASAVA_Build 16 75733687 1I ATTAACTAGC -/A AGACCATCCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 1 2 101132 CASAVA_Build 16 75735792 30D AAAATATTAC ATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------ ATATATATAT 3070 hom 27 het 8 0 10 1 AT 21 6 101133 CASAVA_Build 16 75735895 4D GTAGTAAAAC ACTT/---- AATTGGAGAG 3070 hom 45 het 20 0 16 4 ACTT 1 0 101134 CASAVA_Build 16 75737093 1I GGGTGTTGCA -/T TTTTTTGCAG 3070 hom 114 het 48 0 39 9 T 6 7 101135 CASAVA_Build 16 75740515 1D TGCCATGTTG T/- TTGTGAGCAT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 T 3 2 101136 CASAVA_Build 16 75741276 1D TTTCTGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 23 1 18 4 T 15 14 101137 CASAVA_Build 16 75763997 1I AAAAGGTTTT -/C ATCGCACTGA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 0 1 101138 CASAVA_Build 16 75766843 4I TTGGAGACTC ----/AGAA GGAAGAAGGT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 AGAA 0 1 101139 CASAVA_Build 16 75794820 1D44M1D ATTTCAGGCC AAAAAAAAAAGATATAAAGAAGGTGAACATACCACCAAATATTTCA/-AAAAAAAAAGATATAAAGAAGGTGAACATACCACCAAATATTTC- AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 30 0 33 7 N/A 0 0 101140 CASAVA_Build 16 75798225 6D GCATTCATGG ATGTAT/------ ATTTTTTGTC 3070 hom 96 het 37 0 32 6 ATGTAT 1 0 101141 CASAVA_Build 16 75798811 2D GCACTGAAAC AG/-- GGGCTATGAG 3070 hom 129 het 47 0 40 9 AG 1 0 101142 CASAVA_Build 16 75809513 3D GTCTATTTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 21 0 19 2 A 16 13 101143 CASAVA_Build 16 75818600 3I CATAGGGAGA ---/GAG GAGGACTGGT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 GAG 1 2 101144 CASAVA_Build 16 75834661 1D CAATTTTAAG C/- CCCCTGGCAT 3070 hom 93 het 39 0 30 9 C 5 4 101145 CASAVA_Build 16 75839281 2D TGGCTTGAGG TC/-- TCTCATCAGG 3070 hom 129 het 51 0 42 10 TC 3 2 101146 CASAVA_Build 16 75850941 2I CGCCCAGGCT --/CC GGAGTGCAGT 3070 hom 45 het 18 0 16 4 C 0 2 101147 CASAVA_Build 16 75856677 1D TTTGAAATAG T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 7 6 101148 CASAVA_Build 16 75858917 2I TCGTTTTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 10 12 101149 CASAVA_Build 16 75862605 1D TAGGTTTCTT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 8 hom 23 0 17 6 C 10 9 101150 CASAVA_Build 16 75873497 4I TGGACTTTTC ----/ACTA ACTAACTTAT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 ACTA 1 2 101151 CASAVA_Build 16 75873781 1I GTAGAGAAAA -/T TTTTTTTTTT 1027 het 1027 ref 26 20 3 3 T 11 12 101152 CASAVA_Build 16 75885467 2I ACGCTAAAGG --/AA AAAACACAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 4 6 101153 CASAVA_Build 16 75895031 1D TCAAGACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 29 0 22 7 A 11 10 101154 CASAVA_Build 16 75896522 1I AGTACCAAGA -/C CAAATATATA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 2 101155 CASAVA_Build 16 75899890 3D GAGGAGAGAA AGG/--- AGGAGCATGA 3070 hom 144 het 54 0 49 6 AGG 2 1 101156 CASAVA_Build 16 75899977 3D GCTAATCATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 38 5 22 12 A 17 14 101157 CASAVA_Build 16 75904514 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAATGTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 6 7 101158 CASAVA_Build 16 75912037 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 12 11 101159 CASAVA_Build 16 75948027 1I ATAATAAACA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 7 8 101160 CASAVA_Build 16 75950947 5D AGTGTTTTTG GAAAA/----- AAAAAAAAAA 2529 het 11 hom 46 1 12 34 GAAAA 1 0 101161 CASAVA_Build 16 75951980 6I CTCTCTTGAA ------/AACATC AACAATGCAC 3070 hom 132 het 46 0 45 2 AACATC 0 1 101162 CASAVA_Build 16 75952493 1D TCAAAAAAAT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 8 7 101163 CASAVA_Build 16 75953288 4I ATCTCAAATT ----/AAAA AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 8 12 101164 CASAVA_Build 16 75959836 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1790 het 1790 ref 38 18 6 14 T 17 16 101165 CASAVA_Build 16 75974945 3I GACCTCTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 57 het 30 0 19 11 TTG 5 6 101166 CASAVA_Build 16 75976230 2D CAGATTTTTT TA/-- AAAAATCTCA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 TA 1 0 101167 CASAVA_Build 16 75976312 1I GATAAGGTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 G 0 1 101168 CASAVA_Build 16 75982088 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1694 hom 33 12 13 8 A 9 10 101169 CASAVA_Build 16 75994761 1I GTATGAAGAG -/T TAAGCAACTT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 1 2 101170 CASAVA_Build 16 76000415 2I CCTAATTTAT --/AA GTTAAACTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 2 101171 CASAVA_Build 16 76001691 1I CCCAAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1540 hom 41 6 24 11 A 15 16 101172 CASAVA_Build 16 76008544 1D CCTCACATTG A/- AATGTCCAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 7 A 3 2 101173 CASAVA_Build 16 76010553 1I TCTCAGGGGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 119 het 50 0 39 11 A 8 9 101174 CASAVA_Build 16 76025548 1D GCAGTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 35 2 24 10 T 13 12 101175 CASAVA_Build 16 76032886 4D CCTTTCACTC AGAG/---- AGAACCATTA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 AG 3 1 101176 CASAVA_Build 16 76044916 2D35M4I TTTTTGTTTT TGTTTTTTTTTAGACAGTCTCACTCTGCCGCCCAGGC----/--TTTTTTTTTAGACAGTCTCACTCTGCCGCCCAGGCTGGA TGGAGTACAG 3070 het 3070 ref 30 19 14 4 N/A 0 0 101177 CASAVA_Build 16 76046302 1I TAAGGCATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 35 hom 29 1 24 4 T 9 10 101178 CASAVA_Build 16 76047262 1I GTATTGTGTG -/A ACTAGTAGCA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 1 2 101179 CASAVA_Build 16 76051706 1I TGTAGTTCCT -/A ATGTCATAAT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 1 2 101180 CASAVA_Build 16 76052977 4D CCTTATCTAT TTTA/---- TTTATTTACT 1723 het 1723 ref 12 5 6 1 TTTA 3 2 101181 CASAVA_Build 16 76059012 1I TTATTCAAGG -/T TCCATTAAGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 1 2 101182 CASAVA_Build 16 76069290 1D AGCACTTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1555 hom 12 4 8 0 T 10 9 101183 CASAVA_Build 16 76077972 1I TACATACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 32 1 17 14 T 11 12 101184 CASAVA_Build 16 76078288 1D GCTAATTTTT G/- TATTTTTAGT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 G 1 0 101185 CASAVA_Build 16 76089069 1I GAGGGGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 A 12 13 101186 CASAVA_Build 16 76092430 2D CATCAATCTG TC/-- ATCTAGGTTT 3070 het 3070 hom 45 16 26 5 TC 1 0 101187 CASAVA_Build 16 76110402 1D TGTGACTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 16 12 5 T 15 14 101188 CASAVA_Build 16 76111726 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2934 hom 29 10 13 6 A 12 13 101189 CASAVA_Build 16 76113700 1D CCCTTCTGTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 8 7 101190 CASAVA_Build 16 76115169 14D GTTGTGGGGT AGGGGGGAGCGGGG/-------------- GGGGGGAGCG 1414 het 8 hom 4 0 3 2 AGGGGGGAGCGGGG 1 0 101191 CASAVA_Build 16 76117209 1I GATACCCAAA -/C AAACAGGGTC 1838 het 1838 ref 23 15 5 3 C 0 1 101192 CASAVA_Build 16 76117771 1I ACTGAAGATC -/A AAATTAATGA 1444 het 1444 ref 9 6 3 0 A 3 4 101193 CASAVA_Build 16 76122754 4I ATAGGTGAAC ----/AGTG AGTGACATAT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 AGTG 1 2 101194 CASAVA_Build 16 76124326 6D GTATGTCTGT CCATCC/------ CCATCCCCAG 3070 het 3070 hom 28 13 10 6 CCATCC 2 1 101195 CASAVA_Build 16 76124838 1I AATTATCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 A 9 10 101196 CASAVA_Build 16 76124900 1D TGCTTTCCTC T/- AAATCTATCT 2450 het 2450 ref 30 19 6 6 T 1 0 101197 CASAVA_Build 16 76125242 4I11M2D GAGAGAGAGA ----GTGTTGTGGGGGA/GAGTGTGTTGTGGGG-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 26 17 10 3 N/A 0 0 101198 CASAVA_Build 16 76125404 2D TGGGGGGGGG AA/-- AAAACGTATC 1972 het 1972 ref 26 15 7 5 A 6 4 101199 CASAVA_Build 16 76133841 1D ATTGTAGTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 9 101200 CASAVA_Build 16 76134112 1I CCCTTTAATG -/A TAGTGGCAGA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 0 1 101201 CASAVA_Build 16 76141929 1I AATCTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 10 11 101202 CASAVA_Build 16 76158037 1D AGTCCTGACT C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 C 8 7 101203 CASAVA_Build 16 76165476 1D GTTAAAAAAA G/- AAAAAGGTAC 916 het 916 ref 41 21 8 14 G 1 0 101204 CASAVA_Build 16 76173771 9I TCATTTTCTG ---------/AACTGTGGA AATGTATGCT 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 AACTGTGGA 0 1 101205 CASAVA_Build 16 76177138 2D TAATTGGCCC CA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 CA 1 0 101206 CASAVA_Build 16 76183967 14D TTTTCTTTCC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2408 hom 28 9 9 11 T 25 11 101207 CASAVA_Build 16 76190963 1I TTTCTACTCT -/C CCTTTGTTAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 2 3 101208 CASAVA_Build 16 76191899 1I AAAAAAAAAA -/C AACCCTCACT 3070 het 387 hom 29 1 22 6 C 0 1 101209 CASAVA_Build 16 76198556 3I AGAGTGTCTC ---/TTG TTATCGCTTT 3070 hom 169 het 65 0 57 8 TTG 0 1 101210 CASAVA_Build 16 76222062 1I CATGGTTTCT -/G GGGGGGGGTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 G 8 9 101211 CASAVA_Build 16 76224730 2D AGCCAGCACC AT/-- GACACTATAC 2860 het 2647 hom 31 8 9 14 AT 1 0 101212 CASAVA_Build 16 76224769 2D AGTGATGAGT GA/-- GACTCTTTCT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 GA 2 1 101213 CASAVA_Build 16 76233915 3I GGCCGAGGTG ---/GGT GGATCACTTG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 GGT 0 1 101214 CASAVA_Build 16 76237555 2I TAGAGACACT --/TA TAACGTTCAC 3070 hom 102 het 40 0 33 7 TA 1 2 101215 CASAVA_Build 16 76247373 1I CTCCCATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2271 hom 34 9 16 9 A 10 11 101216 CASAVA_Build 16 76254110 1D GCTGAGAAAA T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 6 101217 CASAVA_Build 16 76258914 12I GAATGGATGA ------------/ATACATTTCCTT ATTCATAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 ATACATTTCCTT 0 1 101218 CASAVA_Build 16 76262013 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2202 het 134 hom 26 2 7 18 A 19 18 101219 CASAVA_Build 16 76264379 3D TACAGGTGTG CAC/--- CACCACGCCT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 CAC 3 2 101220 CASAVA_Build 16 76272475 1D TGATTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 12 11 101221 CASAVA_Build 16 76279510 1I AGTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 11 12 101222 CASAVA_Build 16 76289661 1I GTTCAAGACA -/T TTTTCAAAAC 3070 het 3070 hom 61 24 31 6 T 4 5 101223 CASAVA_Build 16 76291712 1D ATAATTTTTG A/- AAAAAAACGG 2987 het 2987 ref 25 11 9 5 A 8 7 101224 CASAVA_Build 16 76312554 3D TTCTTGGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 61 het 26 0 21 5 TTG 7 6 101225 CASAVA_Build 16 76335185 4I AAAGACGAAA ----/AGAC AGACAGACAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AGAC 2 3 101226 CASAVA_Build 16 76336299 1I TGTGTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 11 12 101227 CASAVA_Build 16 76337105 1D TTCCTCTTCT G/- TAATGTAGGA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 G 1 0 101228 CASAVA_Build 16 76341873 1I AACTTGAATC -/T TTGTCTTTAG 3070 hom 122 het 46 0 39 7 T 2 3 101229 CASAVA_Build 16 76346389 1I GTATGAGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 11 12 101230 CASAVA_Build 16 76373620 1D ACTTACATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2525 hom 32 8 13 12 T 13 12 101231 CASAVA_Build 16 76378375 1D GGTCTAGCCC A/- AATGTTCCCT 3070 het 3070 ref 48 29 18 3 A 3 2 101232 CASAVA_Build 16 76392601 3D ATCCCTGTGA TAC/--- CAAGCATCCT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TAC 1 0 101233 CASAVA_Build 16 76400858 1D TTTTTTGATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 88 het 36 0 30 7 T 10 9 101234 CASAVA_Build 16 76403483 1D TCCTTGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 193 hom 28 2 12 14 T 17 16 101235 CASAVA_Build 16 76409791 5D AGTAAATGAG TCTTT/----- TCTTTTCTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 10 TCTTT 3 2 101236 CASAVA_Build 16 76417605 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 18 0 17 2 A 15 14 101237 CASAVA_Build 16 76431423 4I AGCTGCTTCA ----/TCTC TCTAAGACTC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TC 1 3 101238 CASAVA_Build 16 76436259 2I TGTGCATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 TA 6 7 101239 CASAVA_Build 16 76438275 1D TTCTGTGGAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 6 A 8 7 101240 CASAVA_Build 16 76442665 1D TGACAATCAG A/- AATCCCAGAG 2346 het 2346 ref 25 13 6 6 A 3 2 101241 CASAVA_Build 16 76465867 1I CAGCCCAACC -/T CGAAGCAAAC 3070 het 2481 hom 43 10 18 15 T 0 1 101242 CASAVA_Build 16 76470288 1D CATTTTATTC A/- AACGTTGGCC 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 A 3 2 101243 CASAVA_Build 16 76482321 1D GACCCTGTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 21 2 12 8 A 15 14 101244 CASAVA_Build 16 76486749 5D TCCCTAGAAT ATTTG/----- AACATGTTAC 3070 hom 135 het 50 0 46 6 ATTTG 1 0 101245 CASAVA_Build 16 76499019 1I CAAAGATATA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 7 8 101246 CASAVA_Build 16 76504745 1D TTGTCTATGC T/- TTTTGTCTCT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 5 4 101247 CASAVA_Build 16 76510623 1D CTAGGTGTCC A/- GGGGAAAACA 3070 het 3070 ref 55 28 19 8 A 1 0 101248 CASAVA_Build 16 76512326 2D GTCATATGAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 387 hom 67 6 23 40 TG 10 9 101249 CASAVA_Build 16 76513255 6D AATCCTCCCA CCTCAG/------ CCTCCCGAGT 3070 het 3070 hom 23 8 15 1 CCTCAG 1 0 101250 CASAVA_Build 16 76513587 1I CGGGCGGGGG -/T TGGAGGGGCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 1 2 101251 CASAVA_Build 16 76514754 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATAGCTT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 AGG 1 0 101252 CASAVA_Build 16 76520156 1I AGAGTAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 42 1 32 15 T 10 11 101253 CASAVA_Build 16 76543239 1D GTTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 23 1 19 4 A 13 12 101254 CASAVA_Build 16 76556178 20D TTTGTAGCAC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTT 1970 het 1906 hom 26 9 8 13 T 32 12 101255 CASAVA_Build 16 76556496 1D CTGTAGCACA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2809 hom 20 7 12 1 T 9 8 101256 CASAVA_Build 16 76562409 1D CTATTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 39 1 31 8 T 12 11 101257 CASAVA_Build 16 76572584 1D ATTGAAACAC A/- AGGGAGCCTG 3070 het 3070 hom 55 25 25 5 A 2 1 101258 CASAVA_Build 16 76575208 1I TTCTGTCAAC -/T TGTTCTCTTC 3070 het 3070 hom 42 9 29 4 T 1 2 101259 CASAVA_Build 16 76579094 1I CTACACCCAG -/A AAAAAACCCT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 A 6 7 101260 CASAVA_Build 16 76584280 3D GCAAGATAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 560 hom 36 9 12 15 A 15 12 101261 CASAVA_Build 16 76590289 14D CGTGTCTGGG GTTGAATGTTTCCA/-------------- GCTCCCAAAG 3070 het 3070 ref 24 18 9 1 GTTGAATGTTTCCA 1 0 101262 CASAVA_Build 16 76593422 1I TTCTCCAGGA -/G GGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 G 4 5 101263 CASAVA_Build 16 76595875 4I TTTAACAGAT ----/AAAC AAATCTGAAA 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 AAAC 0 1 101264 CASAVA_Build 16 76605057 1I ATGGGTTTTC -/T TTTTTTGGTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 7 101265 CASAVA_Build 16 76614343 1I GCTGGGTTTT -/A AAAAAAAAAC 1836 het 1836 ref 26 15 7 4 A 9 10 101266 CASAVA_Build 16 76628239 2I CATTTTTAAG --/TT GGGAGATGGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 0 2 101267 CASAVA_Build 16 76629115 2I4M10I CAAGTAAATA --AGAC----------/GTGGACTAACTATTTA ATGACTAACA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 N/A 0 0 101268 CASAVA_Build 16 76636063 2D CAAGGTGAGA GG/-- GGATCACTTA 1423 het 1423 ref 40 25 4 12 G 4 2 101269 CASAVA_Build 16 76637875 1I TGTAATGGGG -/A AAAAAAAGCC 3070 hom 84 het 36 0 28 13 A 7 8 101270 CASAVA_Build 16 76639294 2D CAGAAACCTA TC/-- TCTACTAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TC 2 1 101271 CASAVA_Build 16 76640919 3D TGCTGCTGCT GCA/--- GGAGGCTCCA 3070 hom 122 het 46 0 37 11 GCA 1 0 101272 CASAVA_Build 16 76662989 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 28 0 21 7 A 10 11 101273 CASAVA_Build 16 76664102 1D CATATATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 32 10 T 13 12 101274 CASAVA_Build 16 76679563 1D TGGGCAAGTT A/- ACTTAAGTTT 3070 hom 90 het 35 0 27 9 A 2 1 101275 CASAVA_Build 16 76694641 8D GGCTCCGCTG TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 24 3 14 12 T 22 14 101276 CASAVA_Build 16 76760874 6D6M1D GACCTCTGAG ATCTCAGGACCTC/------GGGCAT- TGCATGTAAA 3070 het 3070 hom 34 17 17 6 N/A 0 0 101277 CASAVA_Build 16 76784948 1I17M4D12M1I10M14D5M2I9M11D AATGCCTGCT -TCAATACCAAGAAGCTGGTCTTATTTAGATCTA-GTCTTATATCATTGAAATATCATTAGAAT--TCTTATGGAAAATATGTTTT/CAGAGTCCCTGGAAGAGG----TATCCAGATTTATGGCTCATCCC--------------AGACTTCTCTAATCGA----------- GGCTGTTTAG 1092 het 1092 ref 29 47 3 9 N/A 0 0 101278 CASAVA_Build 16 76791189 1D ACTCCAAGAT C/- CCTCTTCTCT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 C 3 2 101279 CASAVA_Build 16 76794190 1D CAATTTTTTG T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 T 7 6 101280 CASAVA_Build 16 76795914 1I ATTCCTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 7 8 101281 CASAVA_Build 16 76801138 1D TGCGGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2035 hom 34 12 13 9 A 15 14 101282 CASAVA_Build 16 76805739 1I TGTAAAAGGT -/G GTTGGTTTGT 3070 het 3070 ref 51 23 17 11 G 1 2 101283 CASAVA_Build 16 76807945 1D TCCCATGACG C/- TAGAGGCTGA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 C 1 0 101284 CASAVA_Build 16 76811810 1I ACATATAACA -/G ATGCTATTTT 3070 het 3070 hom 33 8 19 6 G 0 1 101285 CASAVA_Build 16 76820657 1I ACAAGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2680 hom 27 8 15 4 A 10 11 101286 CASAVA_Build 16 76821566 6D GCGTGAGCTA CCGTGC/------ CCGTGCCCGG 3070 het 3070 hom 31 12 12 11 CCGTGC 2 1 101287 CASAVA_Build 16 76823297 1D CTAATCTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 14 5 T 10 9 101288 CASAVA_Build 16 76824714 3D ATATTTTATT GTG/--- GTAAAAACAC 2948 het 2948 ref 18 10 7 1 GTG 1 0 101289 CASAVA_Build 16 76824923 2D GATGATTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 2248 het 772 hom 21 8 7 6 T 20 18 101290 CASAVA_Build 16 76825519 1D GTTCATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 T 12 11 101291 CASAVA_Build 16 76831396 2D GTCAGTGTGG GT/-- GTGAGTTGCA 3070 het 3070 ref 47 19 16 13 GT 2 1 101292 CASAVA_Build 16 76849082 1I TGGGAGGCTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 10 10 12 A 8 9 101293 CASAVA_Build 16 76849340 1I TCCTAAAAAA -/C ATCAGAGACT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 C 0 1 101294 CASAVA_Build 16 76853167 28D TCTATCTATC TATGTATCTATCTATCTATCTATATATA/---------------------------- TATATATATA 3070 het 597 hom 10 2 11 4 TATGTATCTATCTATCTATCTATATATA 1 0 101295 CASAVA_Build 16 76855039 1D GAGAGAGAAA G/- AAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 G 1 0 101296 CASAVA_Build 16 76903186 3D AAAGCAGCCT GGC/--- GGGGGGGTAT 2472 het 2472 ref 26 11 8 7 GGC 1 0 101297 CASAVA_Build 16 76908987 2D GTGACTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 736 het 736 ref 59 42 3 14 GT 7 6 101298 CASAVA_Build 16 76944193 5D TGCATGAGTC TTAAA/----- TTTATTTTAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TTAAA 1 0 101299 CASAVA_Build 16 76945178 1I ATCACCTGCA -/G GGCAGGATCT 3070 hom 111 het 45 0 37 8 G 2 3 101300 CASAVA_Build 16 76946110 4I GTAAACTGTT ----/TTAA TTGTTTGTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTAA 0 1 101301 CASAVA_Build 16 76946635 2D21M1D TCATTGCTCC TGTGTGTGTGTGTGTCTGTATATA/--TGTGTGTGTGTGTCTGTATAT- AAAAAAAAGT 3070 hom 54 het 23 0 18 8 N/A 0 0 101302 CASAVA_Build 16 76947727 1I TATTCAAAAT -/A ACTCAACTTG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 1 2 101303 CASAVA_Build 16 76952226 1D CCTTTAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 11 10 101304 CASAVA_Build 16 76954845 1D CTGATTATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 20 0 20 3 A 9 8 101305 CASAVA_Build 16 76955867 1D GGGTGCCCGG A/- ATATCTGATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 101306 CASAVA_Build 16 76955969 1I AATGGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 38 0 32 6 A 10 11 101307 CASAVA_Build 16 76956054 6I TTTGTGGGTG ------/ATGTTT CTCTTTCTCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ATGTTT 0 1 101308 CASAVA_Build 16 76958812 1D TTTTTTGCCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 9 8 101309 CASAVA_Build 16 76961894 1D ATCTACGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 T 11 10 101310 CASAVA_Build 16 76962187 2D TTTTTTTTTT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 13 het 17 0 12 5 G 13 11 101311 CASAVA_Build 16 76972959 1D ATGATGGGTA G/- GTAGAGTCTG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 G 2 1 101312 CASAVA_Build 16 76983394 1D TTTTGTCTCC T/- TTTTTTTTTT 2458 het 2458 ref 33 14 10 9 T 13 12 101313 CASAVA_Build 16 76985838 10D CTGTGAAATA CTTAGTGTAT/---------- CTAGAAACAT 3070 het 3070 ref 42 22 20 4 CTTAGTGTAT 1 0 101314 CASAVA_Build 16 76987151 6D TTTGTTTTGT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 het 2921 hom 25 9 9 11 TTTTTC 4 3 101315 CASAVA_Build 16 77068018 1D AATACATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 18 0 8 11 A 11 10 101316 CASAVA_Build 16 77073034 1I TGGAATTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2784 hom 30 8 11 11 A 11 12 101317 CASAVA_Build 16 77081526 1I CAGATTGGGG -/A AAAAAATTTT 3070 het 510 hom 31 3 21 7 A 6 7 101318 CASAVA_Build 16 77083436 1I GGGAGTGGGG -/A GTGTGGGGGT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 0 1 101319 CASAVA_Build 16 77085882 1I ATACAAACAC -/A AAGCATTAAG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 2 3 101320 CASAVA_Build 16 77086860 1I TTTGATAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 8 9 101321 CASAVA_Build 16 77088631 1D CACATACTCA T/- TTTTTTGCTC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 7 6 101322 CASAVA_Build 16 77088938 4I TCCTACAGAA ----/AGAG AGAGAATATT 3070 hom 148 het 58 0 50 8 AG 2 4 101323 CASAVA_Build 16 77090266 1D TACTGGTCTG T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 88 het 36 0 28 8 T 8 7 101324 CASAVA_Build 16 77097233 2I CTGATTCTGT --/AG AGAGAGAGTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AG 4 5 101325 CASAVA_Build 16 77101323 1D TCATCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2017 hom 10 het 17 0 8 9 A 17 16 101326 CASAVA_Build 16 77104115 1I AAATAATTAA -/T TTTTTTCACA 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 6 7 101327 CASAVA_Build 16 77113182 1D ACATAACTTG T/- TTTTTTTTTT 1362 het 1362 ref 35 23 3 9 T 11 10 101328 CASAVA_Build 16 77119126 19I CTCATGAACA -------------------/GGCTCTTATTTAGTTCAGT GGTTCTTGAT 3070 hom 86 het 39 0 28 12 GGCTCTTATTTAGTTCAGT 0 1 101329 CASAVA_Build 16 77133576 2D TTAAGCTAAC AG/-- AAATTGTTCA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AG 1 0 101330 CASAVA_Build 16 77139741 1I GTTCCTAAAG -/A AAAAAAAAAA 2789 het 2789 ref 24 12 6 6 A 10 11 101331 CASAVA_Build 16 77153378 2I CACCAACCTA --/AC ACAATGGGTT 3070 hom 132 het 55 0 44 11 AC 1 2 101332 CASAVA_Build 16 77164528 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 A 6 7 101333 CASAVA_Build 16 77179529 1D GGTGCAGAGA G/- GGGGTTAGTA 3070 het 3070 ref 42 19 12 11 G 5 4 101334 CASAVA_Build 16 77184606 1I TTGATCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 9 9 T 10 11 101335 CASAVA_Build 16 77185135 2D AAAAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 46 het 42 0 14 28 AG 10 9 101336 CASAVA_Build 16 77186697 1D TTTTTTTTTT C/- CTCCTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 2 1 101337 CASAVA_Build 16 77188215 2I CAGCTGCCCT --/CC CATCTTTCTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 3 101338 CASAVA_Build 16 77192840 1I CAGCAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 31 2 24 5 A 12 13 101339 CASAVA_Build 16 77193247 13D ACTCTGCAGA TCCCTACTCGGAG/------------- TTTTTCAGCC 3070 hom 120 het 40 0 40 5 TCCCTACTCGGAG 1 0 101340 CASAVA_Build 16 77212091 1I GGAAATATGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 9 10 101341 CASAVA_Build 16 77214085 2D TGGGATATGG GA/-- GACTTACTTC 3070 hom 78 het 31 0 26 7 GA 2 1 101342 CASAVA_Build 16 77215133 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 34 2 23 9 A 17 14 101343 CASAVA_Build 16 77222281 1D TCAGCCCCCC T/- CTCTCTGGGT 3070 hom 90 het 35 0 29 7 T 1 0 101344 CASAVA_Build 16 77230986 2I TTTTCCAGAC --/AG AGTTTCACTC 3070 hom 38 het 15 0 13 2 AG 1 2 101345 CASAVA_Build 16 77266228 1I TCATTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 449 hom 24 1 14 9 T 12 13 101346 CASAVA_Build 16 77270598 1D AGATTACAGG T/- GCCCGAGATC 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 1 0 101347 CASAVA_Build 16 77272945 1I CTCCATATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 849 hom 32 2 18 12 A 13 14 101348 CASAVA_Build 16 77274584 1I GTCTTTAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 8 9 101349 CASAVA_Build 16 77274960 1D TAAAAATAAT A/- AAAAAAAAAT 2993 het 145 hom 11 1 8 2 A 10 9 101350 CASAVA_Build 16 77277299 1D GGAAAAAAAA C/- AAAAAAGAAA 3070 het 61 hom 33 1 20 12 C 1 0 101351 CASAVA_Build 16 77277909 1I ACTCCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 A 12 13 101352 CASAVA_Build 16 77278489 1I TTAAAACACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 T 9 10 101353 CASAVA_Build 16 77278998 1D AGACCCCAAT A/- AACATATTTT 3070 het 3070 hom 40 14 23 4 A 3 2 101354 CASAVA_Build 16 77279505 1D ATGGTTATTA T/- TTCTATATAT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 3 2 101355 CASAVA_Build 16 77282060 10D GAAGGATACT CCCAACCTGG/---------- TTCTTTGTCT 3070 het 3070 ref 30 16 13 5 CCCAACCTGG 1 0 101356 CASAVA_Build 16 77309393 4I AAATGTTAAT ----/AAAA AAGCATTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 2 6 101357 CASAVA_Build 16 77311873 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 10 11 101358 CASAVA_Build 16 77312652 1I AAAAAAGTAG -/T CTTTCATGAT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 T 0 1 101359 CASAVA_Build 16 77334885 3D TAAGTGAGGC AGG/--- AGAACAGGAT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 AGG 1 0 101360 CASAVA_Build 16 77343407 3I TTCTTTAAAT ---/AAG AAGGAGGAGG 3070 hom 87 het 39 0 30 9 AAG 1 2 101361 CASAVA_Build 16 77346633 1D AAGTTTCATC A/- AAAAAAAAAA 2281 het 2281 ref 25 12 7 7 A 13 12 101362 CASAVA_Build 16 77348724 8D CTTACCACCT ACCCCAGC/-------- ACCCCAGCAC 3070 het 3070 hom 42 14 15 16 ACCCCAGC 4 3 101363 CASAVA_Build 16 77362199 1D GGGGAAACTC T/- TCTTTCCTCC 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 2 1 101364 CASAVA_Build 16 77375128 3D ATGATGTTGA TGT/--- TGATGATGAT 3070 hom 181 het 66 0 60 8 TGT 1 0 101365 CASAVA_Build 16 77386890 2D TCACAAGATC CT/-- CTACATCAAA 3070 het 3070 ref 45 27 13 6 CT 2 1 101366 CASAVA_Build 16 77389990 1D TGTTGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 23 4 14 5 T 16 15 101367 CASAVA_Build 16 77391024 1I CTTTGGACGG -/C CCCCCTGAAC 3070 hom 53 het 19 0 17 2 C 5 6 101368 CASAVA_Build 16 77391646 1I GTTCCATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 A 11 12 101369 CASAVA_Build 16 77392352 1I CGAAAAACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 A 9 10 101370 CASAVA_Build 16 77396556 1I ATGTTTAAGG -/T AGGCAAAGAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 0 1 101371 CASAVA_Build 16 77406726 1D CTGTCTCGAG A/- AAAAAAAAAA 1451 het 1451 ref 39 23 4 12 A 15 14 101372 CASAVA_Build 16 77413878 1D AGAGACAGAG C/- CGAGACTCTG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 C 2 1 101373 CASAVA_Build 16 77415180 1I AGACTTGTTA -/T TTTTTTTTTT 2890 het 2890 ref 40 15 11 14 T 13 14 101374 CASAVA_Build 16 77419076 1I ACTAAAAATA -/C AAAAAAAAAA 990 het 679 hom 9 3 6 0 C 0 1 101375 CASAVA_Build 16 77421700 3D TTTTCATAAT AAG/--- CATATTTATA 3070 het 3070 hom 23 7 14 3 AAG 1 0 101376 CASAVA_Build 16 77433901 6I ACCCTGTTTC ------/AAAAAA GAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 A 0 6 101377 CASAVA_Build 16 77451237 1D TTAACAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 10 9 101378 CASAVA_Build 16 77459880 4I AATATACTAA ----/CTAT CATCAAACTG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 CTAT 0 1 101379 CASAVA_Build 16 77471276 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 29 1 23 5 A 12 13 101380 CASAVA_Build 16 77476646 1I AGGAACACTG -/A AAAAAAAAAA 2810 het 2810 ref 28 13 6 9 A 10 11 101381 CASAVA_Build 16 77480208 1D AGGATATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 10 9 101382 CASAVA_Build 16 77488153 2D CTTCACAGAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2793 hom 32 9 19 4 GT 7 6 101383 CASAVA_Build 16 77489385 1I28M2D TGTTTATGTA -TTGGCCATTTTCTAAAAATTAGATAGTCTT/TTTGGCCATTTTCTAAAAATTAGATAGTC-- TTTAATATTG 3070 het 3070 hom 47 21 29 3 N/A 0 0 101384 CASAVA_Build 16 77501557 2I TGCTTTTTCT --/CC CCCTTTTTGG 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 C 3 5 101385 CASAVA_Build 16 77501905 3D GGATCTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 918 hom 32 7 18 7 T 15 12 101386 CASAVA_Build 16 77507097 1I AAAGCCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 10 11 101387 CASAVA_Build 16 77514378 8I ATTCTTTCTC --------/TTTTCTTT TTTTCTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TTTTCTTT 1 2 101388 CASAVA_Build 16 77532861 1I AACAAAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 639 hom 37 4 21 12 T 13 14 101389 CASAVA_Build 16 77534007 1I TTTAAAGGTA -/G CTTCATCTCA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 G 0 1 101390 CASAVA_Build 16 77538773 1I TTTTTCTCTT -/C CCCCCCCTTA 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 C 7 8 101391 CASAVA_Build 16 77542743 1D CTATAGCTTC A/- AGCAAGAGTC 3070 hom 87 het 35 0 30 7 A 2 1 101392 CASAVA_Build 16 77542902 10D TGAGGTATGA AGTACCTCAC/---------- AGTAAAGAAG 3070 het 3070 hom 24 9 14 4 AGTACCTCAC 1 0 101393 CASAVA_Build 16 77543783 1I GTTTTTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2669 hom 30 11 15 4 T 15 16 101394 CASAVA_Build 16 77544866 4D TGCCCCACTC TATG/---- TATGCAGTTT 3070 het 3070 ref 44 18 17 11 TATG 2 1 101395 CASAVA_Build 16 77560318 1D TTTCTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 31 2 24 5 A 12 11 101396 CASAVA_Build 16 77569375 4I TAAATACCGC ----/ATCT ATCTATTTCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ATCT 1 2 101397 CASAVA_Build 16 77570483 1D AATTTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2436 hom 39 9 11 19 T 15 14 101398 CASAVA_Build 16 77572840 1D TGAAGCATCA T/- TTTTTTTTTT 2989 het 1950 hom 34 11 11 12 T 15 14 101399 CASAVA_Build 16 77577180 1D AAGAAAAAAA G/- AATAGGCACA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 0 101400 CASAVA_Build 16 77584352 1I TCTCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 11 101401 CASAVA_Build 16 77600289 2D ATAATGAGCA GC/-- GCACACACAC 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 GC 2 1 101402 CASAVA_Build 16 77620297 1I GAACCACTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 9 10 101403 CASAVA_Build 16 77622818 6D3M2D6M6D GTGAAACGCA TTAGACATCTTCAAGTGGGCTGA/------AAC--CAATTG------ AGAAAGGGAC 3070 het 3070 ref 34 20 14 7 N/A 0 0 101404 CASAVA_Build 16 77665399 1I AAGGTCTGAG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 2196 hom 31 6 19 6 A 0 1 101405 CASAVA_Build 16 77666282 1I CAGAACCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 A 9 10 101406 CASAVA_Build 16 77666950 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 35 2 25 8 T 11 10 101407 CASAVA_Build 16 77671351 5I GGGATGCTGA -----/TTAAG TTAAGATTTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TTAAG 1 2 101408 CASAVA_Build 16 77677471 1I CCCCATCTCC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 8 9 101409 CASAVA_Build 16 77682685 1D TTAATGCTGC T/- TTTTTTTTTC 1350 het 1350 ref 35 29 3 3 T 10 9 101410 CASAVA_Build 16 77706851 3D AACCCACAGG TGC/--- TGCTCTTGTT 3070 hom 110 het 40 0 35 5 TGC 2 1 101411 CASAVA_Build 16 77752283 6D GTGTACATAC ACATAT/------ ACATATACAC 3070 het 3070 hom 57 24 25 10 ACATAT 2 1 101412 CASAVA_Build 16 77760670 2D GCACATCAAA TG/-- TCTGAGACTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 8 TG 1 0 101413 CASAVA_Build 16 77762015 4I TTTTTTACTT ----/AAAA AAACCACACA 2880 het 2880 ref 32 17 7 8 A 3 7 101414 CASAVA_Build 16 77776903 1I ACACCTCCTG -/C CCCCCTGGCC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 5 6 101415 CASAVA_Build 16 77792742 6D TTTTCTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 318 het 318 ref 29 12 3 16 T 19 13 101416 CASAVA_Build 16 77793128 1I TTTTTTCCTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 8 9 101417 CASAVA_Build 16 77793206 1I AATTGAAACC -/T TGACAATGTA 3070 het 3070 hom 34 18 14 2 T 1 2 101418 CASAVA_Build 16 77799187 1I ATGTGGGTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 9 10 101419 CASAVA_Build 16 77799780 1I ATTGATTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2680 hom 37 12 18 7 A 12 13 101420 CASAVA_Build 16 77804305 4I ATTTTCTGTT ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 AAAG 2 3 101421 CASAVA_Build 16 77804429 4I AAGTACTTAG ----/TGAT TGATTAGCGG 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 TGAT 1 2 101422 CASAVA_Build 16 77805188 1I ACAGCAATGC -/A AAAAGATAGT 3070 het 3070 ref 53 32 17 4 A 4 5 101423 CASAVA_Build 16 77820536 1D CAAACATAGA C/- CCCCCCCAAC 3070 het 3070 ref 39 15 14 11 C 8 7 101424 CASAVA_Build 16 77839402 1D AGTTTTGGAC A/- GAATTTTACT 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 A 1 0 101425 CASAVA_Build 16 77840197 3D CAAAATTTAC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 12 9 101426 CASAVA_Build 16 77852756 1D TCACCATGTT G/- GCCAGGCTGG 1539 het 634 hom 7 2 4 1 G 2 1 101427 CASAVA_Build 16 77862715 1D ATAACCTCCA T/- TGGGTTACTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 101428 CASAVA_Build 16 77865091 1D TCTTCTGCCT C/- CCTCCCACTG 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 C 3 2 101429 CASAVA_Build 16 77892091 1I AACCCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 11 12 101430 CASAVA_Build 16 77893026 3I CATTTTATTA ---/TGT TATCTATGTG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TGT 0 1 101431 CASAVA_Build 16 77920477 1D CCTTCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 T 13 12 101432 CASAVA_Build 16 77921355 1D AAGTCATCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 10 9 101433 CASAVA_Build 16 77936599 1I TGTCAGTACA -/T TTATATATTA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 2 3 101434 CASAVA_Build 16 77953117 1D4M4I CAGATTTGGT GGTCT----/-ATATAAAC TTCATCTCCC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 N/A 0 0 101435 CASAVA_Build 16 77956980 1D TTTGTGTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 10 9 101436 CASAVA_Build 16 77962528 3D TTCATTCACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 13 10 101437 CASAVA_Build 16 77967509 1D TGTTGGAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 26 9 3 A 10 9 101438 CASAVA_Build 16 77979653 30D GCCCGCGGAT AAATAGCATGAGTTTTATAACCTTTGTAGA/------------------------------ AAGTTCATAT 1324 het 1324 ref 16 16 5 6 AAATAGCATGAGTTTTATAACCTTTGTAGA 1 0 101439 CASAVA_Build 16 78011403 1I TAACACACGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 14 12 T 11 12 101440 CASAVA_Build 16 78017062 1D TCAATTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 11 13 T 15 14 101441 CASAVA_Build 16 78017772 4D CATGAATTCT CTAA/---- CTGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 CTAA 1 0 101442 CASAVA_Build 16 78028532 10D TGGGAGAAAG CTCTCTCTCT/---------- CTCTGTGTGT 890 het 890 ref 33 12 7 16 CT 7 2 101443 CASAVA_Build 16 78038146 1D ACCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 12 11 101444 CASAVA_Build 16 78038474 1I ATACATGAGC -/A AAAATTATTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 4 5 101445 CASAVA_Build 16 78043401 1I AGGTTGACCT -/G GGGGCCAAAT 3070 hom 76 het 29 0 25 4 G 4 5 101446 CASAVA_Build 16 78055370 1I TGAGGCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 27 9 A 11 12 101447 CASAVA_Build 16 78069380 1I TCAGCCTCCC -/A AACGGCTGGG 3070 hom 48 het 17 0 15 2 A 2 3 101448 CASAVA_Build 16 78072633 1I TCCACAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 44 0 34 10 T 12 13 101449 CASAVA_Build 16 78082023 2D GACACACACA CT/-- CACACATGCA 3070 hom 105 het 45 0 39 6 CT 1 0 101450 CASAVA_Build 16 78083882 1I ATAGCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 10 11 101451 CASAVA_Build 16 78084364 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 10 11 101452 CASAVA_Build 16 78084531 1I AATCTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 34 1 25 8 T 10 11 101453 CASAVA_Build 16 78102501 1D CGCGCACAAT G/- GCGGGGTGGT 3070 hom 84 het 33 0 28 7 G 2 1 101454 CASAVA_Build 16 78108243 5D CAGGGCCAAG TTCTT/----- TTCTTAATCT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 TTCTT 2 1 101455 CASAVA_Build 16 78126527 6I AGGTGAAGCT ------/CTCTGA CTCTAACGAA 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 CTCTGA 0 1 101456 CASAVA_Build 16 78137697 1D AATAAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 17 8 3 T 11 10 101457 CASAVA_Build 16 78142177 2D AAATTTCAGG CA/-- CACATAAAAG 3070 het 3070 hom 46 19 17 11 CA 3 2 101458 CASAVA_Build 16 78143619 1D CTCTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 35 0 27 8 T 11 10 101459 CASAVA_Build 16 78148574 9I AGTTTTTTTT ---------/TTTGTTTTA ATTCAATTCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTTGTTTTA 0 1 101460 CASAVA_Build 16 78158719 1D TCCACCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 A 11 10 101461 CASAVA_Build 16 78162510 1I ATTTCCAGTT -/A AAAAAAAAAA 1898 het 1898 ref 45 20 8 17 A 15 16 101462 CASAVA_Build 16 78166421 1I TCACTGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1770 hom 30 8 19 3 T 16 17 101463 CASAVA_Build 16 78167949 1I AGGAGTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 11 12 101464 CASAVA_Build 16 78172215 1D TTAAAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 329 hom 25 1 22 2 A 11 10 101465 CASAVA_Build 16 78172914 1I TTGTCTGTGG -/A AACCCAATTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 A 2 3 101466 CASAVA_Build 16 78177229 3D AAAGAAAAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 32 4 15 13 A 15 12 101467 CASAVA_Build 16 78183354 2D AAAAGGAAAC AT/-- GTGAACATAT 3070 het 3070 ref 51 25 23 4 AT 1 0 101468 CASAVA_Build 16 78185176 1D AAGGAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 13 12 101469 CASAVA_Build 16 78185826 1D AATAATGATG A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 1 0 101470 CASAVA_Build 16 78186038 1D CCTCATATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 13 12 101471 CASAVA_Build 16 78187879 1I GTACAGAATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 A 9 10 101472 CASAVA_Build 16 78189199 1I GCATGCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 11 12 101473 CASAVA_Build 16 78189418 1I TTCATGAGGA -/T TTTTTTTCTC 3064 het 2368 hom 20 5 8 7 T 7 8 101474 CASAVA_Build 16 78193645 1D AGGGTGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2616 hom 30 8 12 10 A 15 14 101475 CASAVA_Build 16 78200069 1I ATAACTTCAC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 43 19 17 7 T 8 9 101476 CASAVA_Build 16 78210844 1D AAATATTTCA T/- TTTGCAAGCT 3070 het 3070 hom 46 20 23 4 T 4 3 101477 CASAVA_Build 16 78212334 1I AGTCCTTTGT -/G GACTGGCCTC 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 G 1 2 101478 CASAVA_Build 16 78220838 1I CAGAACCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 10 11 101479 CASAVA_Build 16 78226640 5D TTGTTTCCTG AGGTT/----- AGGTCACTAT 3070 het 3070 hom 41 16 20 8 AGGTT 1 0 101480 CASAVA_Build 16 78245432 4I TGTACGTTCA ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 65 18 26 21 GT 7 9 101481 CASAVA_Build 16 78248425 2D CTGAATTTCT TC/-- TTTCTTCCTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 TC 1 0 101482 CASAVA_Build 16 78258257 1I TCTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 10 101483 CASAVA_Build 16 78267074 1I ACTTAATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 10 101484 CASAVA_Build 16 78279442 1D ATTTTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 16 1 13 2 T 12 11 101485 CASAVA_Build 16 78279711 4D AAAAAATAAG GTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 22 1 18 3 GTTT 1 0 101486 CASAVA_Build 16 78285472 1I TTTGGAATAA -/T TTTTTTGTGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 6 7 101487 CASAVA_Build 16 78288385 1I CTTGAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 19 0 13 6 A 14 15 101488 CASAVA_Build 16 78289011 16D CTCCTTTTCC TTCCTTCCTTCCTTCT/---------------- TTCCTTCCTT 3070 hom 29 het 20 0 10 14 TTCCTTCCTTCCTTCT 2 1 101489 CASAVA_Build 16 78296249 3I TAATATAAAT ---/AAC AACTAAATAC 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 AAC 1 2 101490 CASAVA_Build 16 78296959 1D GTCCTTTCTG T/- GTCACTAAGT 3070 het 3070 ref 32 19 12 3 T 1 0 101491 CASAVA_Build 16 78298213 1D AGAGACTCTG A/- AAAAAAAAAA 1786 het 1786 ref 27 14 5 8 A 13 12 101492 CASAVA_Build 16 78307683 1I CTGTCTCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 32 0 24 8 A 10 11 101493 CASAVA_Build 16 78307938 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 34 1 16 17 A 17 16 101494 CASAVA_Build 16 78323741 1I CAAATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 11 12 101495 CASAVA_Build 16 78326409 1I TTGTAAAAAA -/C GAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 C 0 1 101496 CASAVA_Build 16 78333805 1D GCTTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 11 10 101497 CASAVA_Build 16 78334940 1D GTACTTTAAC A/- AAATTAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 4 3 101498 CASAVA_Build 16 78341467 2I GTTTAGTAGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 56 26 18 12 GT 7 8 101499 CASAVA_Build 16 78342282 1D TTCTTTGTAG A/- AAAACAGATG 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 5 4 101500 CASAVA_Build 16 78349635 2I CAATACTAGG --/AC AGAGATAGAA 3070 het 3070 hom 63 23 34 6 AC 0 1 101501 CASAVA_Build 16 78352428 2D GGACACACAC AG/-- ACACACAGTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 7 AG 1 0 101502 CASAVA_Build 16 78358448 1D AGATCTGAAA G/- TCAAACTGGC 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 G 1 0 101503 CASAVA_Build 16 78381928 1D TATTTATACT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 15 16 6 A 9 8 101504 CASAVA_Build 16 78384970 3I TCCCACTTCT ---/GGG TAAAGGTGTA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 0 3 101505 CASAVA_Build 16 78385250 4D AATAAATGAA TAAT/---- TATATAATAA 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 TAAT 1 0 101506 CASAVA_Build 16 78386762 1D GAATGAGGAG T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 40 18 17 6 T 8 7 101507 CASAVA_Build 16 78387248 1I TGAATCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 11 12 101508 CASAVA_Build 16 78389448 1I AGTCACATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 13 11 T 13 14 101509 CASAVA_Build 16 78390383 1I GCATTCATTT -/A TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 0 1 101510 CASAVA_Build 16 78483000 1I AAGCACGTGC -/T TTTTATCTGC 3070 het 3070 ref 55 31 18 6 T 4 5 101511 CASAVA_Build 16 78487106 3D GCTGGCCTTG GTA/--- GTATTCCCCA 3070 het 3070 ref 30 15 9 7 GTA 2 1 101512 CASAVA_Build 16 78512710 1D ATATTCTACA C/- TTAATTAATC 3070 hom 135 het 48 0 45 4 C 1 0 101513 CASAVA_Build 16 78526251 1D TCTGTTAACG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 17 18 12 T 10 9 101514 CASAVA_Build 16 78534977 1D TGGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 A 10 9 101515 CASAVA_Build 16 78541130 1I TTAAAAAGTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 9 10 101516 CASAVA_Build 16 78542404 1I TTGCAAATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 47 14 23 10 A 9 10 101517 CASAVA_Build 16 78573460 4I GTACACATGT ----/GTGA GTGTGTGTAC 3070 het 3070 ref 93 44 38 11 GTGA 0 1 101518 CASAVA_Build 16 78586180 1D CTCTGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 20 18 11 T 13 12 101519 CASAVA_Build 16 78586563 1I AGTATCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 11 12 101520 CASAVA_Build 16 78601600 5D AGAAGAGAAG AGAGA/----- AGAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 44 21 15 12 AGAGA 3 2 101521 CASAVA_Build 16 78612775 1I GGAGAACCAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 8 9 101522 CASAVA_Build 16 78614465 1D TCTCTTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 11 10 101523 CASAVA_Build 16 78630486 9D TGGTATTACT GTGAACCTG/--------- GTTTATAGGA 3070 het 3070 ref 49 26 21 5 GTGAACCTG 1 0 101524 CASAVA_Build 16 78633923 1D GGCTTCTCTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 A 9 8 101525 CASAVA_Build 16 78657347 4I TATGATCCAC ----/ATAT ATTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 AT 1 3 101526 CASAVA_Build 16 78665986 1I CCCCTGTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 15 13 A 13 14 101527 CASAVA_Build 16 78667307 1I GAAATCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 11 12 101528 CASAVA_Build 16 78667847 2I AAACACAAAC --/AT ATATGTATAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 AT 2 3 101529 CASAVA_Build 16 78668934 9D ATTATAATAA CAACAATGG/--------- CAACAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 8 CAACAATGG 1 0 101530 CASAVA_Build 16 78669711 1I GTTCATTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 10 11 101531 CASAVA_Build 16 78673602 1D TCAACACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 20 10 A 11 10 101532 CASAVA_Build 16 78698771 4I CAATGGCATA ----/TTAT TTAGCCATAA 3070 het 3070 hom 41 13 26 2 TTAT 0 1 101533 CASAVA_Build 16 78700140 1I TTCCTGGGTT -/C CCCTCCAGAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 C 3 4 101534 CASAVA_Build 16 78713614 1D TCTCTTTTTT A/- AATGTTGGAC 3070 het 2692 hom 22 7 10 5 A 3 2 101535 CASAVA_Build 16 78717775 6I AGAACAGTTG ------/GTTGCA GTTGCAATGA 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 GTTGCA 1 2 101536 CASAVA_Build 16 78718910 1I TTGAAAAAAA -/T ACAGGCTGTT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 0 1 101537 CASAVA_Build 16 78724473 1I AGGAAAAAAA -/T ATACCAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 0 1 101538 CASAVA_Build 16 78737544 1D TATTAAAAAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 2868 hom 20 7 11 2 A 9 8 101539 CASAVA_Build 16 78748932 4D CAGAGGACAT AGTC/---- AGCAAGTGTG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 AGTC 1 0 101540 CASAVA_Build 16 78753555 5D ATTATGTCTC AAATT/----- AAACATACTA 3070 hom 120 het 42 0 41 7 AAATT 1 0 101541 CASAVA_Build 16 78754402 102D TGCAGGGCAT GATAGCAGTTGACTTAAAGAGGAGAATGAAAGAAATTAGAAAAGAGAAAAACCAGCCAATGGTAAAGTGGTTCCTATGCTATTTAAAATAATATTAAATAAA/------------------------------------------------------------------------------------------------------ GAATAAAAGA 3070 hom 54 het 21 0 18 6 GATAGCAGTTGACTTAAAGAGGAGAATGAAAGAAATTAGAAAAGAGAAAAACCAGCCAATGGTAAAGTGGTTCCTATGCTATTTAAAATAATATTAAATAAA 1 0 101542 CASAVA_Build 16 78761310 20D TTTCTTTAAA CATAAAATTATAGCACAATG/-------------------- CACAAAAGGA 3070 hom 66 het 19 0 23 2 CATAAAATTATAGCACAATG 1 0 101543 CASAVA_Build 16 78761512 1I GTTCCCCCCC -/G CGACCCAACC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 0 1 101544 CASAVA_Build 16 78765938 1D ATAGGCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 28 0 23 5 A 13 12 101545 CASAVA_Build 16 78786990 1I CTGTGATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 30 1 22 7 A 13 14 101546 CASAVA_Build 16 78792587 1D AACTCTGCAT A/- ATGGCTAATT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 2 1 101547 CASAVA_Build 16 78801289 1D GCTTTATTTT A/- ATCTTCAGGG 3070 hom 102 het 41 0 34 8 A 2 1 101548 CASAVA_Build 16 78805751 1I AAGAGAGTGA -/T TTAAATGAAA 3070 hom 156 het 60 0 52 8 T 2 3 101549 CASAVA_Build 16 78810269 2D CCAGAACTGT GA/-- GAGAGAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 GA 4 3 101550 CASAVA_Build 16 78818405 2D AACTTGAAAG AT/-- AGAAATTATA 3070 het 3070 hom 43 19 21 4 AT 1 0 101551 CASAVA_Build 16 78820111 1D CACAGATCAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 48 22 16 10 A 8 7 101552 CASAVA_Build 16 78823176 2D CAGAAAAGGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 GA 7 6 101553 CASAVA_Build 16 78823805 1D AGACAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 A 14 13 101554 CASAVA_Build 16 78827697 1I ATCCTGAACC -/A GAGGGGAGGA 3070 het 3070 ref 58 36 18 4 A 0 1 101555 CASAVA_Build 16 78829198 1D AAGTTATAAT A/- TTTTTTTTTC 3070 het 85 hom 19 2 11 6 A 1 0 101556 CASAVA_Build 16 78830341 1I ATAAGATTGA -/T AATACTTCTT 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 T 0 1 101557 CASAVA_Build 16 78839812 4D AAAGGGAAAG AAGT/---- ATGTCCCATC 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 AAGT 1 0 101558 CASAVA_Build 16 78851794 2D CCAGAATTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 756 hom 28 8 15 6 A 18 16 101559 CASAVA_Build 16 78854791 1D CTAGGATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 A 15 14 101560 CASAVA_Build 16 78855553 4I AAAATAAAAT ----/TTTC TTTTTTATTT 3070 het 2473 hom 23 8 12 3 TTTC 0 1 101561 CASAVA_Build 16 78866686 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 AT 8 7 101562 CASAVA_Build 16 78875443 1D TTTGATCTGA C/- CCCCCCCATA 3070 het 3070 hom 46 15 25 7 C 8 7 101563 CASAVA_Build 16 78879781 1D TTATTTTTTT A/- AAAAAATGCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 7 6 101564 CASAVA_Build 16 78884047 1I ATCCCTGTAG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 6 7 101565 CASAVA_Build 16 78889865 2I ACTGGAGCAT --/CA CACTCTCCAA 3070 hom 96 het 37 0 28 9 CA 1 2 101566 CASAVA_Build 16 78892696 1D TAGGCCACAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 9 8 101567 CASAVA_Build 16 78896575 1I CACGTGGATA -/T TTTTTTGTGC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 6 7 101568 CASAVA_Build 16 78901777 1I AAACAAGCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 9 10 101569 CASAVA_Build 16 78904955 2I CATACATGGT --/AC ACACACAGCA 3070 hom 157 het 59 0 52 7 AC 3 4 101570 CASAVA_Build 16 78911866 1I GAAGTATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 788 hom 49 3 37 9 A 11 12 101571 CASAVA_Build 16 78913912 1D GTCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2372 hom 27 8 10 9 A 13 12 101572 CASAVA_Build 16 78935442 1I TCCCTGATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 15 21 13 T 9 10 101573 CASAVA_Build 16 78935947 2I GAACATGAAC --/AA ACCGAGTAGG 3070 hom 123 het 47 0 40 7 A 1 3 101574 CASAVA_Build 16 78936696 4I ATCTTGAAAA ----/AGTG AGTAAGTGGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AGTG 0 1 101575 CASAVA_Build 16 78943776 2I TTTATTGCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 10 12 101576 CASAVA_Build 16 78969075 2D TCACCCCCCC CA/-- CACACACCAT 3070 het 3070 ref 36 14 15 8 CA 4 3 101577 CASAVA_Build 16 78970284 6I GTGTCAGAGG ------/AGAGAC AGAGACCTGG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 AGAGAC 1 2 101578 CASAVA_Build 16 78982780 1D CCATGACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1074 hom 42 3 29 10 A 13 12 101579 CASAVA_Build 16 78985525 1I AGAAGAAGAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 9 101580 CASAVA_Build 16 78988362 1D ATATAGGAAG T/- TAAAATTAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 1 101581 CASAVA_Build 16 78988584 2I CACACCCTGC --/CA CACACATACA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 CA 3 4 101582 CASAVA_Build 16 78995280 3I4M1D ACATTAAACA ---TGTCA/TGGTGTC- TGTTTTTTAT 3070 hom 96 het 33 0 31 4 N/A 0 0 101583 CASAVA_Build 16 79004077 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 13 0 10 4 T 13 12 101584 CASAVA_Build 16 79033980 1D TTACTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1711 het 1711 ref 54 42 5 8 T 11 10 101585 CASAVA_Build 16 79053228 1D ACAAGCAGTA T/- TCTTGCCCAC 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 2 1 101586 CASAVA_Build 16 79073036 4I GGAATTCTGC ----/CAAT CAAAGATATA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 CAAT 0 1 101587 CASAVA_Build 16 79078055 1D GACCCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 931 hom 28 5 14 9 A 12 11 101588 CASAVA_Build 16 79079186 1D GGTAATTTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 10 9 101589 CASAVA_Build 16 79082408 1D ACACAACCAT C/- CTTTTTCCCC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 2 1 101590 CASAVA_Build 16 79086171 1D TCTCAGCTTA C/- CTGCAACCTC 3070 hom 62 het 24 0 20 4 C 2 1 101591 CASAVA_Build 16 79093143 2D GTCAGCAAAC TA/-- TGACCTATGG 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 TA 1 0 101592 CASAVA_Build 16 79113474 3I AGAATCTGTG ---/TCA TCATCATCAT 3070 het 3070 ref 43 23 11 9 TCA 3 4 101593 CASAVA_Build 16 79121715 1I CTTGAAGAGC -/A AAAAGTTTTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 4 5 101594 CASAVA_Build 16 79123359 1I AATGTCAATT -/A AAATTCTGTT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 A 3 4 101595 CASAVA_Build 16 79127961 1D CAAAACCTAG A/- AACAACGAAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 3 2 101596 CASAVA_Build 16 79129896 1I AGAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 37 1 33 3 A 10 11 101597 CASAVA_Build 16 79137248 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1412 het 160 hom 10 1 6 3 T 13 12 101598 CASAVA_Build 16 79138905 3I CCGTGCACAC ---/TTA TTATTCAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTA 1 2 101599 CASAVA_Build 16 79140140 2D AAAAAAAAAA AT/-- AGAGCACCCA 3070 hom 71 het 29 0 20 10 AT 1 0 101600 CASAVA_Build 16 79156750 1D TTCTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 11 10 101601 CASAVA_Build 16 79169486 2D CTTAGGAAAC TG/-- AGAGAGAGCA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TG 1 0 101602 CASAVA_Build 16 79191645 1I TATTCTAATG -/A AAAAAATTGG 3070 het 370 hom 34 1 31 2 A 6 7 101603 CASAVA_Build 16 79192183 1I AATTCCAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 9 10 101604 CASAVA_Build 16 79194308 4D TTCAGGTTTT CCTG/---- AACTTTCTCC 3070 het 3070 ref 42 26 14 4 CCTG 1 0 101605 CASAVA_Build 16 79201987 1I TAAAATTAAC -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 6 7 101606 CASAVA_Build 16 79228624 1D GCACAAACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 29 0 27 3 A 10 9 101607 CASAVA_Build 16 79259856 1I ATGTAATATA -/T ATCACATATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 0 1 101608 CASAVA_Build 16 79261688 1D ACTGGATCAC G/- GGGGGCGGTT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 6 5 101609 CASAVA_Build 16 79270690 4I ATAAATAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 1672 hom 21 het 11 0 7 4 AAAC 2 3 101610 CASAVA_Build 16 79274972 7D AAAGAATTAG TGCAGGA/------- TGAGGTCAAG 3070 hom 144 het 49 0 49 2 TGCAGGA 1 0 101611 CASAVA_Build 16 79285889 1D TCACTGGCTT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 9 8 101612 CASAVA_Build 16 79289434 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 126 het 47 0 43 5 A 9 8 101613 CASAVA_Build 16 79290924 4I TAGCACGAAC ----/CTCT AGAGGATAGG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 CT 0 2 101614 CASAVA_Build 16 79310847 3D ATCATGATCT TCA/--- TCATTTTAAT 3070 hom 111 het 42 0 37 9 TCA 2 1 101615 CASAVA_Build 16 79322647 3D AAACTAAAAA CAT/--- CAGCGCAAAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 CAT 1 0 101616 CASAVA_Build 16 79323311 1I CAGCACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 737 hom 35 6 17 12 A 13 14 101617 CASAVA_Build 16 79324278 1I TCAAGTTGGG -/A AAAGTTGATG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 3 4 101618 CASAVA_Build 16 79329796 1D CCCATGTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 10 9 101619 CASAVA_Build 16 79334213 1I GACAGATGTA -/T AAATGAAAGA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 T 0 1 101620 CASAVA_Build 16 79334888 1D TTCAACCTGG A/- ACTGGGGTGT 3070 hom 79 het 33 0 26 7 A 2 1 101621 CASAVA_Build 16 79335455 1D TAATATGTTC A/- AAACCCCCAG 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 4 3 101622 CASAVA_Build 16 79335890 1I CAAAAGAAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 48 24 14 10 A 7 8 101623 CASAVA_Build 16 79340538 2I GGGAGATTGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 TG 5 6 101624 CASAVA_Build 16 79342061 1D CAGAAATTAG A/- AAAAGTTGCC 3070 het 3070 ref 27 17 9 2 A 5 4 101625 CASAVA_Build 16 79342418 1I ATTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2045 hom 24 6 13 5 A 10 11 101626 CASAVA_Build 16 79343531 1D ACCAAAAAAA C/- ATAGTAACTG 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 C 1 0 101627 CASAVA_Build 16 79348261 1I ATAAATTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 A 11 12 101628 CASAVA_Build 16 79366302 1I GCTAAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 11 12 101629 CASAVA_Build 16 79369361 1I ATACTAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 9 10 101630 CASAVA_Build 16 79390214 4I GTAAGATATG ----/CATA CAAATACATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 CATA 0 1 101631 CASAVA_Build 16 79393440 1D TGTCCTCCTT A/- ACTGAAATTC 3070 het 3070 hom 39 20 18 2 A 2 1 101632 CASAVA_Build 16 79397483 4I GCATGAAGAT ----/AATG AAGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 AATG 0 1 101633 CASAVA_Build 16 79400650 7I GTCATACTTA -------/GTATGAC TTTAGTATCT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 GTATGAC 0 1 101634 CASAVA_Build 16 79400736 2I34M2I TGAACAAAAC --AGTGTCCTTATGGAGCTTACAGTACAGAGGAGAC--/AGAGTGTCCTTATGGAGCTTACAGTACAGAGGAGACAG AGAATAAACC 3070 het 3070 ref 37 25 20 7 N/A 0 0 101635 CASAVA_Build 16 79411060 1I CAATTTGAGT -/A CAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 0 1 101636 CASAVA_Build 16 79417053 1I CTTTAAGGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 10 101637 CASAVA_Build 16 79440604 1I TAAGTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 58 21 25 12 A 12 13 101638 CASAVA_Build 16 79448632 2I AAGGGAAAAC --/TT ATACAAATTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 2 101639 CASAVA_Build 16 79450146 13D TGCATACTCT AAGTATCACTCTC/------------- CTGTTTGCTT 3070 hom 135 het 43 0 46 4 AAGTATCACTCTC 1 0 101640 CASAVA_Build 16 79450428 2D CATCATACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 24 14 T 16 14 101641 CASAVA_Build 16 79452812 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAACAC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 8 7 101642 CASAVA_Build 16 79452935 1I CACGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 1457 hom 7 het 3 0 3 0 C 3 4 101643 CASAVA_Build 16 79453052 1I CGGAGCTTAC -/A AGTGAGCCGA 1997 hom 12 het 5 0 5 0 A 1 2 101644 CASAVA_Build 16 79454934 1I CAAAGCAAAA -/G GGGGGAAATA 3070 hom 30 het 20 0 11 9 G 5 6 101645 CASAVA_Build 16 79457632 8D ACATCTCAAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 AAAC 5 3 101646 CASAVA_Build 16 79460406 1D AAGACATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 11 10 101647 CASAVA_Build 16 79463305 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 10 11 101648 CASAVA_Build 16 79466964 3D ATTCCTTTAA TAT/--- TAGTATAACA 3070 het 3070 ref 41 22 16 8 TAT 1 0 101649 CASAVA_Build 16 79472398 2I AAGGGAGGGA --/GG GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 G 1 3 101650 CASAVA_Build 16 79473356 1D AAAGTATGTT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 63 het 28 0 22 7 A 8 7 101651 CASAVA_Build 16 79480285 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 16 1 13 2 A 10 11 101652 CASAVA_Build 16 79482224 1I CAAATAAATA -/T GCATATACAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 0 1 101653 CASAVA_Build 16 79487848 1D TTCTCCTGTC T/- CAGCCTCCTG 3070 het 313 hom 11 1 9 1 T 1 0 101654 CASAVA_Build 16 79492290 14D CTGTCTAGAA AGAGGCTTCATAAC/-------------- AGAGTCCAGG 3070 het 3070 ref 53 25 21 9 AGAGGCTTCATAAC 1 0 101655 CASAVA_Build 16 79579705 1D CACGTTTCCT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 8 7 101656 CASAVA_Build 16 79579913 2D CTTTTTAGTC TT/-- TTTTTTTTCC 3070 hom 90 het 32 0 30 3 T 10 8 101657 CASAVA_Build 16 79580806 3I AGACACACAT ---/ATC TATCTATTCT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 ATC 0 1 101658 CASAVA_Build 16 79581213 1I ATTCCCTCCC -/T CTTTTTTTGA 3070 het 257 hom 27 1 19 7 T 0 1 101659 CASAVA_Build 16 79583824 2I TTTTTTTTTT --/TG TTTTTGTGTA 3070 hom 51 het 27 0 22 5 TG 0 1 101660 CASAVA_Build 16 79584804 5D AAGCTAACTC TAGAG/----- TAAAGACTAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TAGAG 1 0 101661 CASAVA_Build 16 79585539 3D TAAAGGAAGT AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 12 9 101662 CASAVA_Build 16 79586371 28D ATATCCATAC AATGAACTACTACTCAGAAATAAAAATA/---------------------------- AATGAACTAA 3070 hom 51 het 18 0 18 6 AATGAACTACTACTCAGAAATAAAAATA 1 0 101663 CASAVA_Build 16 79589464 1D GCTACTGCTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 28 0 19 9 A 9 8 101664 CASAVA_Build 16 79594893 3D GACACAAAAA AAG/--- AGAAGAGTAT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 AAG 1 0 101665 CASAVA_Build 16 79595333 3D CATCTCAAAA AAT/--- AATAATTATG 3070 hom 75 het 27 0 26 3 AAT 3 2 101666 CASAVA_Build 16 79596594 4I GGCCCTGGTA ----/TTAG TTAAAGAATT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TTAG 0 1 101667 CASAVA_Build 16 79596697 13I CTTATCACAG -------------/CGACTTATCACAA GACCAGTTCT 3070 hom 82 het 30 0 25 5 CGACTTATCACAA 0 1 101668 CASAVA_Build 16 79597344 6D TACTGATGGG GCTCTT/------ GGTGGGTTCT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 GCTCTT 1 0 101669 CASAVA_Build 16 79608271 1I TATATGAAGT -/A ACTTTAATCC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 2 101670 CASAVA_Build 16 79611184 1D AAATTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 35 1 24 11 T 12 11 101671 CASAVA_Build 16 79616255 2D GGTATGGTAA CT/-- CTCTAGGCAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 CT 3 2 101672 CASAVA_Build 16 79619653 2D TCTTTTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 35 0 31 4 T 14 12 101673 CASAVA_Build 16 79636335 1D TTTTCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 11 10 101674 CASAVA_Build 16 79645388 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 9 8 101675 CASAVA_Build 16 79645611 3I TTTTCTGCAC ---/CTT CTTTTTTGGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 CTT 1 2 101676 CASAVA_Build 16 79655469 1I ATTACATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 28 2 19 7 A 12 13 101677 CASAVA_Build 16 79655853 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2700 het 252 hom 19 2 9 8 A 17 16 101678 CASAVA_Build 16 79656145 1I AAATGCACTT -/G GGCATTTAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 2 3 101679 CASAVA_Build 16 79666375 1I TTTTTTTTTT -/A AACACCTATT 3070 het 399 hom 21 1 19 1 A 2 3 101680 CASAVA_Build 16 79671775 2D CCCATTAAAA AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 22 1 17 4 AT 1 0 101681 CASAVA_Build 16 79674282 4D ATTCCACCAT AATA/---- AATTAAGAAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AATA 1 0 101682 CASAVA_Build 16 79683430 1D AGGCTGTGTA C/- CCACCAAGAA 3070 hom 101 het 38 0 33 5 C 3 2 101683 CASAVA_Build 16 79686484 14D GGCGCTTTAA TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 23 9 101684 CASAVA_Build 16 79686736 27I GATCCGCCCT ---------------------------/CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA CCGGCATGAG 3070 hom 45 het 16 0 15 2 CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 0 1 101685 CASAVA_Build 16 79697913 2D19M1I AGAAGTGTTC TGTGTTAAGTGAGAGTTTAGT-/--TGTTAAGTGAGAGTTTAGTA GAAATAAAAA 3070 hom 114 het 39 0 38 10 N/A 0 0 101686 CASAVA_Build 16 79701114 4D TGTGTGTATA TTTG/---- TTTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 81 36 42 10 TTTG 2 1 101687 CASAVA_Build 16 79706715 2D CTGGTGACAC TA/-- TTGAATCCAC 2885 het 2885 ref 28 19 6 4 TA 1 0 101688 CASAVA_Build 16 79707027 2D CCTCATTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 18 7 A 12 10 101689 CASAVA_Build 16 79707312 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 A 7 6 101690 CASAVA_Build 16 79709552 1I GGAGATCCAG -/A ACCATCCTGG 2040 het 2040 ref 14 6 5 3 A 1 2 101691 CASAVA_Build 16 79718975 22I CTGGCTCTGG ----------------------/TACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC TACTGCCATT 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 TACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0 1 101692 CASAVA_Build 16 79720702 3I GATGGGATTT ---/CAC CACGTTGGCC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 CAC 1 2 101693 CASAVA_Build 16 79726981 6D TCTCTCTCTT ACACAC/------ ACACACACAC 2141 het 2141 ref 30 14 8 8 AC 11 8 101694 CASAVA_Build 16 79730312 1I GCAGACTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 652 hom 24 3 14 7 A 14 15 101695 CASAVA_Build 16 79731130 1D TAAGTTTTCT C/- CCCCCGGGTG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 6 5 101696 CASAVA_Build 16 79740323 2I TTTGTTTATT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TA 0 1 101697 CASAVA_Build 16 79741579 2I GTGTGAGCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 18 0 11 7 T 12 14 101698 CASAVA_Build 16 79742671 5D GTCTCTACTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 35 2 26 8 A 18 13 101699 CASAVA_Build 16 79745671 1D TTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 38 0 26 12 T 12 11 101700 CASAVA_Build 16 79754532 1I ACCAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 12 13 101701 CASAVA_Build 16 79757793 2I GGTCCTGAGC --/AT GTGTGTGGGT 3070 het 3070 hom 71 32 29 10 AT 0 1 101702 CASAVA_Build 16 79758942 1D TCTGCAAGAT G/- GGGGGGGAAA 3070 het 2390 hom 22 8 12 3 G 8 7 101703 CASAVA_Build 16 79760525 5D TTAGGTGTTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2130 hom 26 12 10 5 T 20 15 101704 CASAVA_Build 16 79764510 2I TGTGTGTATA --/TG TGAGTGTGTG 3070 het 3070 hom 87 38 38 11 TG 1 2 101705 CASAVA_Build 16 79765250 1I GGTTGTAACA -/C ATGGAACGGC 3070 het 3070 hom 63 28 27 9 C 0 1 101706 CASAVA_Build 16 79796970 4D AAACCCCACC TCTA/---- TCTACTAAAA 3070 hom 30 het 11 0 10 2 TCTA 2 1 101707 CASAVA_Build 16 79799650 2D CGGACACAGG TT/-- TCCAAAGTAG 3070 het 3070 ref 41 21 11 11 T 3 1 101708 CASAVA_Build 16 79802601 1D CTCCACCATC A/- CGGTTCATAC 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 1 0 101709 CASAVA_Build 16 79802761 1I CCCGTGATCT -/G GGGGGGCCCC 3070 hom 56 het 22 0 16 6 G 6 7 101710 CASAVA_Build 16 79803681 3D CCTCTCTGCG CTC/--- CTCCTCCGAC 2240 het 2240 ref 26 13 9 4 CTC 3 2 101711 CASAVA_Build 16 79807000 2D GCATAGAGAC AG/-- GGAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 34 16 14 6 AG 1 0 101712 CASAVA_Build 16 79816167 19I TTTCTCATTT -------------------/GTTTAGCTTTGCTGTTCTA CTCAACACAA 3070 het 3070 hom 53 24 23 9 GTTTAGCTTTGCTGTTCTA 0 1 101713 CASAVA_Build 16 79837718 1D TCACTTTGGG A/- GGCCAAGGCA 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 A 1 0 101714 CASAVA_Build 16 79853948 1I AAAACAAAAA -/C AAAAAAAAAA 2059 het 745 hom 16 5 8 3 C 0 1 101715 CASAVA_Build 16 79862223 1I TATTTATTTT -/A TTTTTTTATT 2383 het 1482 hom 14 6 6 2 A 0 1 101716 CASAVA_Build 16 79883798 1I TACCCAGTTT -/C CCCCCCCATT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 C 7 8 101717 CASAVA_Build 16 79894085 1I TGGCACACAA -/T TTTAGAAGCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 3 4 101718 CASAVA_Build 16 79904449 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 7 AAAG 2 1 101719 CASAVA_Build 16 79907463 1D CACGCTACAC T/- TTTAACCTTT 3070 het 2790 hom 24 7 13 4 T 4 3 101720 CASAVA_Build 16 79915903 4D AAGAGGAATA TTTG/---- TTTGTGTATT 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 TTTG 2 1 101721 CASAVA_Build 16 79920243 8D TGTCTCATCT CCTGTTCC/-------- CCCACCCTTT 3070 het 3070 hom 42 17 23 5 CCTGTTCC 1 0 101722 CASAVA_Build 16 79937487 19D TGTCTTCTAA GGCCTTAGGACTGGGCCAT/------------------- GGCCTTAGGA 3070 het 3070 ref 42 25 16 7 GGCCTTAGGACTGGGCCAT 1 0 101723 CASAVA_Build 16 79962087 1I TGCTGATATG -/T TTTTATTTTC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 4 5 101724 CASAVA_Build 16 79984281 1I AGAAAATAAA -/T GTTGGCGAGG 3070 hom 65 het 24 0 22 2 T 0 1 101725 CASAVA_Build 16 79984526 8D TATGCATCAG TGGATGAA/-------- TGGATAAGCG 3070 hom 123 het 47 0 42 9 TGGATGAA 1 0 101726 CASAVA_Build 16 79985898 3D GAAGGCAAGT CTC/--- CTACAGCCTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 CTC 1 0 101727 CASAVA_Build 16 79994568 1I AATTCTAAAT -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 23 9 9 5 A 6 7 101728 CASAVA_Build 16 80002474 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2447 hom 32 het 17 0 11 6 T 15 16 101729 CASAVA_Build 16 80040776 1D ACACAGATTT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1347 hom 29 5 13 11 C 11 10 101730 CASAVA_Build 16 80057150 1D TTTTCATTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 202 hom 25 1 18 6 T 10 9 101731 CASAVA_Build 16 80062522 2I GCATACACAC --/AT ATACATGTAC 3070 het 3070 ref 89 47 29 13 AT 1 2 101732 CASAVA_Build 16 80062657 2D ACATACACAC AT/-- GTGCACACAC 3070 het 3070 ref 79 39 32 9 AT 1 0 101733 CASAVA_Build 16 80064594 1D AAAATAGGTC T/- TTTTTTTTTT 1335 het 1335 ref 33 16 5 13 T 15 14 101734 CASAVA_Build 16 80064744 1I GCTTGGACGC -/T TTGTGTTGGA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 2 3 101735 CASAVA_Build 16 80074433 1I ATTTACCTGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 92 het 36 0 27 9 T 8 9 101736 CASAVA_Build 16 80079211 2D4M1D TGAGACTGCT GCATGAC/--ATTA- TTTTATTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 N/A 0 0 101737 CASAVA_Build 16 80080082 1I CTTTCATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 44 2 37 5 T 10 11 101738 CASAVA_Build 16 80105128 1I CTGCTAGTTT -/A AAAAGAAAAA 3070 het 1100 hom 32 5 17 10 A 4 5 101739 CASAVA_Build 16 80105158 2D AAAACAAAAC AA/-- AAACGCCGCC 3070 het 538 hom 23 3 10 11 A 5 3 101740 CASAVA_Build 16 80112484 1D GCATTTGCCA C/- CCCCCCCCGA 2037 het 2037 ref 27 9 6 12 C 9 8 101741 CASAVA_Build 16 80125750 1D CATTCCCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 11 10 101742 CASAVA_Build 16 80139784 1I ATGCCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3057 het 416 hom 26 3 12 11 A 11 12 101743 CASAVA_Build 16 80144617 1I CCAAACAGAG -/C CCCACTGCCT 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 C 3 4 101744 CASAVA_Build 16 80170826 4D TCTGCCACTT AAAA/---- AAAAATGGAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 9 5 101745 CASAVA_Build 16 80182354 2D GGGAGATGTC TT/-- TGAGCAGTTG 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 T 3 1 101746 CASAVA_Build 16 80217317 8D GAGTGAGTGT GTGTGCGC/-------- GTGAGAATGT 753 het 753 ref 46 22 6 23 GTGTGCGC 1 0 101747 CASAVA_Build 16 80217557 4D TATCTTATGA GTGT/---- GTGTGTGTAT 3070 hom 171 het 68 0 47 23 GT 6 4 101748 CASAVA_Build 16 80218753 2I CCCTGTGCTC --/CT CTGAGTCCGG 3070 hom 80 het 30 0 22 8 CT 1 2 101749 CASAVA_Build 16 80227184 4D GTTGTGTGTT TGTG/---- TGTGTGAGTG 3070 hom 149 het 54 0 50 6 TG 5 3 101750 CASAVA_Build 16 80227289 6I TCCTCTGTAT ------/GATTTC GAATTTTTCA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 GATTTC 0 1 101751 CASAVA_Build 16 80228890 3I TGGGGCTGGG ---/CCA ACCTGCCAGC 3070 hom 90 het 32 0 29 3 CCA 0 1 101752 CASAVA_Build 16 80239281 6D AAATCTGATA TCCTCT/------ TCACCCGACC 3070 hom 84 het 30 0 27 3 TCCTCT 1 0 101753 CASAVA_Build 16 80245997 6D ATGAAGAGTG AGAAAC/------ CGTGTTGTAG 3070 het 3070 ref 47 25 20 8 AGAAAC 1 0 101754 CASAVA_Build 16 80258076 2D CAGCTGGTGT GG/-- GGGGGGGGTC 3070 het 1398 hom 37 9 13 17 G 10 8 101755 CASAVA_Build 16 80299547 2D CAGATGCTAC TG/-- TGAGACCAAG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 TG 2 1 101756 CASAVA_Build 16 80302725 1D ATAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 8 7 A 12 11 101757 CASAVA_Build 16 80313478 1D ACTCTGTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 29 1 19 9 A 17 16 101758 CASAVA_Build 16 80317987 2D TTTTTAAAAT AA/-- GAGTATATTC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 2 0 101759 CASAVA_Build 16 80327847 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 59 het 26 0 20 6 T 7 6 101760 CASAVA_Build 16 80329072 2I29M1D AAAGAAAGAA --AAAACCAAGGCATAAGTCCAGCATTTCGCA/AGAAAACCAAGGCATAAGTCCAGCATTTCGC- AATCCTCTCT 3070 hom 66 het 25 0 21 9 N/A 0 0 101761 CASAVA_Build 16 80331100 2D AAAAATTAGC TG/-- TGTGTGGTGG 3070 hom 30 het 14 0 11 4 TG 4 3 101762 CASAVA_Build 16 80333261 2D TTGTGGGGGC GG/-- GGGGGGGGGC 3070 het 168 hom 22 2 13 7 G 11 9 101763 CASAVA_Build 16 80334972 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2962 het 2962 ref 30 13 10 7 T 11 12 101764 CASAVA_Build 16 80335710 1I GGCAAGTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 68 het 27 0 23 4 T 8 9 101765 CASAVA_Build 16 80368230 2D TAGATTAAAC AG/-- AGAAACCTGT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 AG 2 1 101766 CASAVA_Build 16 80369922 4I ATTTTTAATT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TTTA 3 4 101767 CASAVA_Build 16 80372520 1I TTGTTTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 32 0 20 12 T 9 10 101768 CASAVA_Build 16 80374939 1D CTCAGCAGGG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 37 14 19 6 T 9 8 101769 CASAVA_Build 16 80378316 1D CATTGTACTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 T 10 9 101770 CASAVA_Build 16 80401750 1D CAATTTCTTT C/- TTTTTATTTT 3070 hom 22 het 32 1 27 5 C 1 0 101771 CASAVA_Build 16 80411732 1D CATTACCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 35 0 26 9 T 13 12 101772 CASAVA_Build 16 80414799 2I GCCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 26 2 18 6 T 14 16 101773 CASAVA_Build 16 80423211 1D TGATAAATGG A/- GGGGGGGAAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 1 0 101774 CASAVA_Build 16 80426689 3D GGTCTCAAAT ATA/--- ATAATAATAA 3026 het 2747 hom 27 8 7 12 ATA 5 4 101775 CASAVA_Build 16 80429192 1D TACTAATTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 807 hom 26 2 22 2 C 1 0 101776 CASAVA_Build 16 80437342 1I GGAGGACAAG -/A AGGACTGGCC 3070 hom 120 het 46 0 37 9 A 1 2 101777 CASAVA_Build 16 80443123 2I TGCTCACCTC --/TG TGGACTTCGT 3070 hom 144 het 55 0 48 7 TG 1 2 101778 CASAVA_Build 16 80443592 1D ACTGGTTGAG C/- TTGTTGAGCT 3070 het 3070 ref 57 31 21 5 C 1 0 101779 CASAVA_Build 16 80444437 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 17 3 9 5 A 12 11 101780 CASAVA_Build 16 80445203 1I TGGTCTCTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 9 10 101781 CASAVA_Build 16 80448201 2D TTAAGTCACT AA/-- GTTTGTGGTC 3070 het 3070 hom 47 16 26 6 A 2 0 101782 CASAVA_Build 16 80448614 13D GGAATGCCAA GATCAAGATGCTG/------------- GATGGTTGAG 3070 het 3070 ref 30 17 14 4 GATCAAGATGCTG 1 0 101783 CASAVA_Build 16 80448743 4D CTCTAGTCTC TCTT/---- TCTCTTCTCT 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 TCTT 1 0 101784 CASAVA_Build 16 80449196 7D CTCAGACAAA AAGCAGG/------- TCCTAGGGCC 3070 het 2014 hom 44 7 23 16 AAGCAGG 1 0 101785 CASAVA_Build 16 80449224 1D TGACGGTGTG A/- AAGGGGATGC 3070 het 3070 hom 49 11 22 16 A 3 2 101786 CASAVA_Build 16 80449539 2D ATGGGCTACA GG/-- GGGGAAAAAA 1519 het 227 hom 34 3 9 22 G 6 4 101787 CASAVA_Build 16 80449974 1D TTTGGGGATT A/- AATGACTATC 3070 hom 98 het 38 0 36 3 A 3 2 101788 CASAVA_Build 16 80459477 1I GAAACCTTTA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 T 7 8 101789 CASAVA_Build 16 80460231 1D TCATAGAGGG C/- TGCCTGAGGT 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 C 1 0 101790 CASAVA_Build 16 80461876 1I59M1D ATTTCTGAAA -CAAAAATTATTCTATAAATAGCATGGAGCCATTCTTACGGTGGACATCAAAAATCATGTG/TAAAAAATTATTCTATAAATAGCATGGAGCCATTCTTACGGTGGACATCAAAAATCATGT- GTCACTTTTT 3070 het 3070 hom 52 35 46 3 N/A 0 0 101791 CASAVA_Build 16 80462961 2I CATCTGAATG --/TC TCTCAATGGA 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 TC 2 3 101792 CASAVA_Build 16 80471675 2D AAAGCTTGAA AC/-- ACAGCAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 AC 2 1 101793 CASAVA_Build 16 80472268 1D CTGGGAGGAT G/- GTCCAGAAAG 3070 het 3070 hom 43 13 24 6 G 2 1 101794 CASAVA_Build 16 80472353 1I AGGTTAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 11 12 101795 CASAVA_Build 16 80476438 1I CCCCGACTAA -/T TTTTGTATCT 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 T 4 5 101796 CASAVA_Build 16 80476731 1I CAGATAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 T 10 11 101797 CASAVA_Build 16 80479144 2D GGAGCTGAGA CT/-- CTGCAGTTTA 3070 het 3070 hom 57 27 26 5 CT 2 1 101798 CASAVA_Build 16 80479491 1D TGATTTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1276 hom 24 4 17 4 A 10 9 101799 CASAVA_Build 16 80483759 1I ATACAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 10 11 101800 CASAVA_Build 16 80491214 2I GTATGCATGC --/AT ACACATGCAA 3070 hom 41 het 35 1 29 5 AT 0 1 101801 CASAVA_Build 16 80497190 3D CAAATATTAT TAA/--- TAACATCCTA 3070 hom 102 het 41 0 35 7 TAA 2 1 101802 CASAVA_Build 16 80507696 2D ATTTTTTTTT TG/-- TGTGTGGTGA 2087 het 2087 ref 38 23 11 4 TG 4 3 101803 CASAVA_Build 16 80508334 2D CAGGCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 41 3 20 18 T 18 16 101804 CASAVA_Build 16 80510005 1D GACTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 11 10 101805 CASAVA_Build 16 80511861 1D CAGCGGGGTA G/- GGGGAAGGCA 3070 hom 129 het 52 0 43 9 G 5 4 101806 CASAVA_Build 16 80516999 3I CTCAAAAAAA ---/AAG AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 16 0 13 3 AAG 0 1 101807 CASAVA_Build 16 80517196 1I TTAAATTAGT -/G GGGGGGAAGT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 6 7 101808 CASAVA_Build 16 80519141 4D CCACCTCTCC TAAG/---- CCCAGGATAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TAAG 1 0 101809 CASAVA_Build 16 80523365 1I CATCCTGGCA -/G GGGCTGGACC 3070 hom 91 het 36 0 29 7 G 3 4 101810 CASAVA_Build 16 80525911 3I GTTCCACGTG ---/GCT GAGGAGGCCT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 GCT 0 1 101811 CASAVA_Build 16 80537991 21D GTGAGCATGA AGACCCTTTGCTTAGTGAAGC/--------------------- AGACCCTTTG 3070 hom 90 het 30 0 30 4 AGACCCTTTGCTTAGTGAAGC 2 1 101812 CASAVA_Build 16 80553299 12D ACTAAGTGAT GAATTGTATTTG/------------ GAAGCAAAAA 3070 hom 81 het 27 0 27 1 GAATTGTATTTG 1 0 101813 CASAVA_Build 16 80557735 1D AAGAAAATCC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 7 6 101814 CASAVA_Build 16 80562137 8I1M9D CGATGCTGTT --------TTTCCCTTCA/GGGTGGAAT--------- GTTCTGCCGA 788 het 788 ref 36 35 2 4 N/A 0 0 101815 CASAVA_Build 16 80564309 1D TGAATTAGTG T/- TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 47 35 3 9 T 12 11 101816 CASAVA_Build 16 80625472 1I AATGCACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 766 hom 36 3 20 13 T 17 18 101817 CASAVA_Build 16 80626038 2I CACACACACG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 CA 8 9 101818 CASAVA_Build 16 80672382 1D ACTGAAGCTG T/- TCCCGCATGA 3070 het 3070 ref 51 28 18 7 T 2 1 101819 CASAVA_Build 16 80697015 1I GGCCATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 11 12 101820 CASAVA_Build 16 80697434 1D AGAACTTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 166 hom 34 1 24 9 T 10 9 101821 CASAVA_Build 16 80701546 1I GACAACACCA -/C CCCCCCTTCC 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 C 6 7 101822 CASAVA_Build 16 80708114 1D TAAAAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 28 1 18 10 A 15 14 101823 CASAVA_Build 16 80715698 4I GAGGATAAAA ----/AAAG AAAGTTATTC 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 AAAG 1 2 101824 CASAVA_Build 16 80715883 1I TATCCTGAGT -/A AAAAAGAACC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 5 6 101825 CASAVA_Build 16 80717428 2D27M1D TAGCCTATAC ATATATATATGCCTATTATGTAACCCCCCT/--ATATATATGCCTATTATGTAACCCCCC- GACACACAAA 3070 het 3070 hom 42 20 26 4 N/A 0 0 101826 CASAVA_Build 16 80717814 1D TTCTTTTTTT A/- CCCCCCTCCT 3070 het 3070 ref 44 20 18 7 A 1 0 101827 CASAVA_Build 16 80718607 3D CATGACTAAA ATG/--- ATACAATTAA 3070 het 3070 hom 33 11 17 6 ATG 1 0 101828 CASAVA_Build 16 80719090 1D CAGGAGTTTG A/- AACCAGCCTG 1554 het 1023 hom 9 4 4 2 A 3 2 101829 CASAVA_Build 16 80719373 4I TTTTTGTGTA ----/ACTC ATACATATGG 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 ACTC 0 1 101830 CASAVA_Build 16 80722625 1I ACTTAACTAT -/C CAAAATATTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 C 1 2 101831 CASAVA_Build 16 80723233 1D58M5I AGACAGGTAG AAAAAACTACATACCGTAAGATTTCATTTATATAAAATTTTAGAATAGGCAAAGCTAAC-----/-AAAAACTACATACTGTAAGATTTCATTTATATAAAATTTTAGAATAGGCAAAGCTAACATAAT ATAATAGAAG 3070 het 3070 ref 36 22 21 8 N/A 0 0 101832 CASAVA_Build 16 80724028 4D CTTCTTTTTC TTTT/---- TAAGAATAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 T 5 1 101833 CASAVA_Build 16 80724283 2D GGCTTTCTCG TT/-- TTTTTTTTTT 1077 het 967 hom 16 7 4 5 T 16 14 101834 CASAVA_Build 16 80724780 5D TGTTATGTTC TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 het 267 hom 21 2 10 10 TGTTT 3 2 101835 CASAVA_Build 16 80736395 2D ACTCAAACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 15 0 9 6 A 14 12 101836 CASAVA_Build 16 80738674 12D CATAAGACAC GTAGTAAGTCCG/------------ GTAGTAAGTC 3070 het 3070 ref 41 23 10 12 GTAGTAAGTCCG 2 1 101837 CASAVA_Build 16 80740638 2D TGATAAGGGA CT/-- CTCTGTAATA 3070 het 3070 hom 52 21 25 7 CT 3 2 101838 CASAVA_Build 16 80741017 1I TTACCCTCCT -/A AAACTTTAGA 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 A 3 4 101839 CASAVA_Build 16 80748787 3D GGGCAGACTA GAG/--- GAGAGGCGTC 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 GAG 2 1 101840 CASAVA_Build 16 80750056 4D CAGGTAAAAG ATCT/---- ATTTGGAATA 3070 het 3070 ref 48 25 20 4 ATCT 1 0 101841 CASAVA_Build 16 80751232 1I ATTGACACCG -/T TATCTTTAAT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 T 1 2 101842 CASAVA_Build 16 80752077 3I TCCTTATCTC ---/AGA AGAAGAAGGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGA 2 3 101843 CASAVA_Build 16 80754071 2I ATTATAGCTC --/CT CAGCAGCAAA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 CT 0 1 101844 CASAVA_Build 16 80758594 4D TATTGTGCAC TTTG/---- TTTCTATTAT 3070 hom 69 het 25 0 24 5 TTTG 1 0 101845 CASAVA_Build 16 80759235 5I GGGGTGGACA -----/TTTGT TTTAAGTTAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 TTTGT 0 1 101846 CASAVA_Build 16 80759578 3I TACTCTCTCT ---/CTC CTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 CTC 0 1 101847 CASAVA_Build 16 80766338 1D TCCACCTAGC T/- TTTTTTTTTT 2661 het 613 hom 17 4 7 6 T 12 11 101848 CASAVA_Build 16 80768397 1D TTATAGTAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 9 8 101849 CASAVA_Build 16 80768776 1D TCTAGGATTT C/- TAGCCATGAA 3070 het 3070 hom 27 9 18 0 C 1 0 101850 CASAVA_Build 16 80770834 3D CTCCATGTGA TCT/--- TCTTGATTTC 3070 het 3070 ref 46 27 15 5 TCT 2 1 101851 CASAVA_Build 16 80777600 1D AGGAGGCCAA G/- GCGGGCAGAT 1828 het 1681 hom 9 5 4 0 G 2 1 101852 CASAVA_Build 16 80778984 2D GCTTAAGATG TA/-- TATCTGCTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TA 2 1 101853 CASAVA_Build 16 80789347 1I GAAATTTGTG -/A AAAAAAGTTC 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 6 7 101854 CASAVA_Build 16 80813685 4I TCTGTGCCTG ----/GCTC TGTCCGTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 7 7 GCTC 0 1 101855 CASAVA_Build 16 80815234 2I AAGTGAGCTC --/AA GTTTATTAAG 2859 het 2859 ref 29 20 6 3 A 0 2 101856 CASAVA_Build 16 80815915 16I GGATTGGATA ----------------/GTGCCTTCCCACATTG GTGAAGATTG 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 GTGCCTTCCCACATTG 0 1 101857 CASAVA_Build 16 80822244 4D CATGAAGATA ACTG/---- ACAGTTTCAA 3070 het 3070 ref 56 29 24 5 ACTG 1 0 101858 CASAVA_Build 16 80833975 1I GGGGAGATAC -/T TTTTTTTTTT 2036 het 2036 ref 34 18 9 7 T 13 14 101859 CASAVA_Build 16 80838598 1D GTATGTTGTA T/- TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 61 30 21 11 T 8 7 101860 CASAVA_Build 16 80847971 1D GGTGCATCTT G/- TCTACCCAGC 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 G 1 0 101861 CASAVA_Build 16 80858243 7D GACATAATTA ATACCCT/------- ATACCCTTTT 3070 het 3070 hom 47 18 24 8 ATACCCT 2 1 101862 CASAVA_Build 16 80859708 1D AAATGGTGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 57 22 28 7 T 10 9 101863 CASAVA_Build 16 80861472 1D AAAGGAAGAG C/- AACTGGGAGG 3070 hom 141 het 52 0 47 5 C 1 0 101864 CASAVA_Build 16 80863038 1I TTTCAGGGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 94 het 39 0 31 8 T 9 10 101865 CASAVA_Build 16 80903402 1I TTAGACTTAG -/T TTTTGAAGGG 3070 hom 151 het 58 0 50 8 T 4 5 101866 CASAVA_Build 16 80944757 1I CTTCACAGAA -/T TTGAAGAGGT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 2 3 101867 CASAVA_Build 16 80955220 1I TGGGGGGTTT -/G GGGGGTGGAA 1078 hom 18 het 7 0 7 0 G 5 6 101868 CASAVA_Build 16 80967401 4I AAAACATAAT ----/GAAA GAGAGTAGGG 3070 hom 108 het 42 0 35 7 GAAA 0 1 101869 CASAVA_Build 16 80969679 1I CATTATCTGG -/C TTCCTAAAAG 3070 hom 132 het 51 0 44 7 C 0 1 101870 CASAVA_Build 16 80978981 1D GCTTCTGAAA T/- GGTTATCTTC 3070 het 3070 ref 48 20 19 10 T 1 0 101871 CASAVA_Build 16 80983311 2D CAACTCAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 T 14 12 101872 CASAVA_Build 16 81011096 1D TGCAGGCCTA G/- GTTAATGTTT 3070 hom 72 het 27 0 23 5 G 2 1 101873 CASAVA_Build 16 81011335 1I AGAAAGATAA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 2 3 101874 CASAVA_Build 16 81012857 7D GGCAACAAGC ATAGATG/------- ATAGATAGAT 3070 het 3070 hom 57 18 33 8 ATAGATG 1 0 101875 CASAVA_Build 16 81023472 1I TTAAGTCTTC -/A CACTTTTTTT 3070 het 223 hom 37 2 31 4 A 0 1 101876 CASAVA_Build 16 81029147 5D ATAACTCTTT GTTGA/----- GTTATTTTAG 3070 hom 78 het 34 0 26 9 GTTGA 1 0 101877 CASAVA_Build 16 81030867 2I GCACCACCCC --/CT ATCTCCAACA 3070 hom 141 het 52 0 44 8 CT 0 1 101878 CASAVA_Build 16 81042050 1D AATTCTAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 T 10 9 101879 CASAVA_Build 16 81043499 1I TAAGAACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 14 9 A 10 11 101880 CASAVA_Build 16 81050592 1D TTACTGTATT C/- CTGCTTCTAC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 C 2 1 101881 CASAVA_Build 16 81056929 1D ATACTATTTA T/- TTTTATCTAT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 5 4 101882 CASAVA_Build 16 81063530 1I TGTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 0 1 101883 CASAVA_Build 16 81068785 1D CCAATAGGGG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 A 8 7 101884 CASAVA_Build 16 81076338 1D GAATCATGAT A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 8 7 101885 CASAVA_Build 16 81079606 5D CACTGCCGGG TCCTT/----- TCCTTGGGAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 TCCTT 2 1 101886 CASAVA_Build 16 81081703 1I TCTGAAACTA -/T TGAGACATTC 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 1 2 101887 CASAVA_Build 16 81083701 1I TCTCTCTGTC -/A ACATTTCATT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 1 2 101888 CASAVA_Build 16 81093068 1D GAGTCTTTAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 8 7 101889 CASAVA_Build 16 81104443 1I GACTCCATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 9 10 101890 CASAVA_Build 16 81129924 1D GACAGGTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 584 hom 46 8 15 24 A 11 10 101891 CASAVA_Build 16 81132082 1D GTTGGCAATG C/- TAGGGAGATA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 1 0 101892 CASAVA_Build 16 81135357 1I CCCCAAAGGG -/T GACACACAGG 3070 hom 160 het 61 0 54 7 T 0 1 101893 CASAVA_Build 16 81141403 4D GACATTAAGA TAAT/---- TAGTGTGTGT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TAAT 1 0 101894 CASAVA_Build 16 81188962 1D AATCTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 37 0 30 7 T 13 12 101895 CASAVA_Build 16 81203796 4D CACAGACAAT AAAC/---- AAACAGACAC 3070 het 3070 ref 46 26 16 8 AAAC 2 1 101896 CASAVA_Build 16 81208423 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 T 12 11 101897 CASAVA_Build 16 81211931 1D CACAAATGCC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 8 7 101898 CASAVA_Build 16 81212330 1D TATTTATTTA T/- TTTTTCCCTC 3070 het 1294 hom 23 5 14 5 T 6 5 101899 CASAVA_Build 16 81223812 14D CGGACTAGAA TTGGGGGGATGGTT/-------------- TTGGGATGAT 3070 het 3070 ref 38 23 17 2 TTGGGGGGATGGTT 1 0 101900 CASAVA_Build 16 81229930 12I GGCAGTGTGT ------------/GTGTGTGTGCGC GCGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 40 14 13 13 GTGTGTGTGCGC 0 1 101901 CASAVA_Build 16 81283921 4I TGCACAGGCA ----/TTGG TTTTTAGTAT 3070 hom 123 het 49 0 41 8 TTGG 0 1 101902 CASAVA_Build 16 81308973 1D ATCAGTTAGT G/- GGGGGGAAGT 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 G 7 6 101903 CASAVA_Build 16 81316316 1D AATGTTTTCC T/- GCTGTTTCCC 3070 het 3070 ref 50 23 20 8 T 1 0 101904 CASAVA_Build 16 81319552 1D AGGCATACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 T 10 9 101905 CASAVA_Build 16 81325143 1I ATAAGGTGGG -/A AAGAGAACTA 3070 hom 104 het 41 0 34 7 A 2 3 101906 CASAVA_Build 16 81330330 5D GTAATTACAT AAATC/----- AGAGGAAAAA 2231 het 2231 ref 23 15 5 8 AAATC 1 0 101907 CASAVA_Build 16 81338694 1I TTTGGAGAAT -/G GGCACTACTG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 2 3 101908 CASAVA_Build 16 81342810 1D GAAAACAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 17 17 11 A 17 16 101909 CASAVA_Build 16 81349533 1D ACTGTTGATA C/- CCCCCCCCCT 3070 hom 61 het 47 1 34 13 C 10 9 101910 CASAVA_Build 16 81365429 1D CTTCAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2739 hom 26 9 9 8 T 15 14 101911 CASAVA_Build 16 81384488 1D AAAGGGAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 8 A 10 9 101912 CASAVA_Build 16 81398684 1I TGATCTCTGG -/T GCTAAGGACC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 0 1 101913 CASAVA_Build 16 81401983 1D TTGTGAGTCA G/- GGGGAAATGG 3070 het 3070 ref 40 20 10 13 G 5 4 101914 CASAVA_Build 16 81403942 12D CCTCCCTTCC TTCCTCCCTTCT/------------ TTCCTCCCTT 3070 het 3070 ref 35 15 15 10 TTCCTCCCTTCT 2 1 101915 CASAVA_Build 16 81407815 1I CGAAGATGTG -/A AAAAATTGCA 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 A 5 6 101916 CASAVA_Build 16 81409054 2D TAAATGCATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 114 het 50 0 39 11 TA 6 5 101917 CASAVA_Build 16 81412014 1D ATGCCTGCCC T/- TTTCTCTGGT 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 T 4 3 101918 CASAVA_Build 16 81414521 1I GAAAAAAAGT -/C ACATTTAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 0 1 101919 CASAVA_Build 16 81415417 1I AACGGAAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 9 10 101920 CASAVA_Build 16 81423708 1D GATTCCCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 670 hom 39 2 32 5 A 13 12 101921 CASAVA_Build 16 81428560 1I AAGTCCTAGA -/G GTCCCCAAGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 2 101922 CASAVA_Build 16 81432791 1D CCCTTATTAC A/- AAATTTCACT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 4 3 101923 CASAVA_Build 16 81435928 2I ATTTTTATTT --/TA TTTTTTTGTA 3070 hom 53 het 20 0 19 1 TA 0 1 101924 CASAVA_Build 16 81442783 8D ATGTGTGTAC GTGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 3070 hom 59 het 41 1 34 9 GT 12 8 101925 CASAVA_Build 16 81451750 1D TTACTAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 42 0 36 9 A 12 11 101926 CASAVA_Build 16 81453666 1I AGAACTGTAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 9 101927 CASAVA_Build 16 81455004 1I TTTTAAAAAA -/T TTGGTAAGAC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 3 101928 CASAVA_Build 16 81462760 2D ATCAACAGTA AC/-- ACAACTCCAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 AC 2 1 101929 CASAVA_Build 16 81465170 2I GCACACATTG --/TA TATTACACGA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TA 1 2 101930 CASAVA_Build 16 81485803 1D AACATCCCAG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 7 6 101931 CASAVA_Build 16 81486796 1D CGCCTCTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 36 3 18 16 T 13 12 101932 CASAVA_Build 16 81488128 1I ACCTCGTGAT -/C TTCCTGCCTC 3070 hom 49 het 18 0 14 5 C 0 1 101933 CASAVA_Build 16 81491538 3I GAAGTACAGG ---/GAT GATGATACAG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 GAT 2 3 101934 CASAVA_Build 16 81503337 21I TGCATGTTAA ---------------------/TATGTTGCTTTTCACACATCT TATTTTCTTA 3070 hom 116 het 42 0 37 8 TATGTTGCTTTTCACACATCT 0 1 101935 CASAVA_Build 16 81507680 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 1679 hom 17 6 11 0 A 10 8 101936 CASAVA_Build 16 81515381 1I ATGCTGAATA -/G GCAGCCTTGT 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 G 1 2 101937 CASAVA_Build 16 81518127 2I CTTGAAGGCT --/GG GGGGTAACTC 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 G 4 6 101938 CASAVA_Build 16 81519271 8D CAGTCGTGTA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 47 21 17 13 TG 12 8 101939 CASAVA_Build 16 81521580 1I TAACTTTTTC -/T TTGAAGTAAC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 2 3 101940 CASAVA_Build 16 81527947 1I TGGGGGAGGT -/G ACACTTCGCC 3070 hom 141 het 55 0 48 7 G 0 1 101941 CASAVA_Build 16 81530755 1I CTCTTCTATT -/A AGTGTGGTTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 2 101942 CASAVA_Build 16 81545858 1D AATCTCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 22 0 15 7 A 13 12 101943 CASAVA_Build 16 81557456 2I GGGGTTTCAC --/TG TGTTGGCTAG 2590 het 1870 hom 13 6 6 1 TG 1 2 101944 CASAVA_Build 16 81571182 17D CCCCAGGGGC TAGTGATGGCAGGGACA/----------------- GTTATCTGCC 3070 het 3070 ref 27 20 13 3 TAGTGATGGCAGGGACA 1 0 101945 CASAVA_Build 16 81648696 2D TTCTATTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 1167 het 597 hom 34 3 6 26 A 13 11 101946 CASAVA_Build 16 81655466 2I CAAAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 CT 1 2 101947 CASAVA_Build 16 81674094 1D CTAGTAAGAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 347 hom 31 1 29 2 T 8 7 101948 CASAVA_Build 16 81698903 1I TCCTCTTTTC -/T TTTTCTTTTT 3050 het 3050 ref 34 15 9 10 T 4 5 101949 CASAVA_Build 16 81700147 1D TTAAATCCTC A/- ATCTTAGGGT 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 A 2 1 101950 CASAVA_Build 16 81700659 1I TTTCCAAGTG -/A CGGGTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 0 1 101951 CASAVA_Build 16 81702278 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 2666 het 2378 hom 15 7 7 1 A 10 9 101952 CASAVA_Build 16 81707634 12D AATGAAAGAG GGTGAAGTTCAT/------------ GGAAATATTG 3070 het 3070 hom 30 8 19 6 GGTGAAGTTCAT 1 0 101953 CASAVA_Build 16 81708513 1I CCACTGCCAT -/C CTCCTCGGTG 3070 hom 97 het 36 0 30 6 C 1 2 101954 CASAVA_Build 16 81745670 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1599 het 1599 ref 18 11 4 3 A 17 16 101955 CASAVA_Build 16 81763251 1I TGATGCCTAT -/A AAAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 55 25 28 4 A 5 6 101956 CASAVA_Build 16 81765185 1D AAATCTGATG C/- CTTGAGGCTG 3070 het 3070 hom 63 28 29 6 C 2 1 101957 CASAVA_Build 16 81770760 1D TCTCTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 11 10 101958 CASAVA_Build 16 81771441 1D GATGGATGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 10 9 101959 CASAVA_Build 16 81798010 1D TGCATTCAAA C/- CACAGTAGGT 3070 hom 114 het 44 0 39 7 C 2 1 101960 CASAVA_Build 16 81799577 1D GGCAACAGTG T/- TTTTTTTTTT 814 het 814 ref 44 31 4 9 T 11 10 101961 CASAVA_Build 16 81810419 1D CTTCCCATAC T/- TTTTAAAAAC 3070 hom 117 het 41 0 38 3 T 5 4 101962 CASAVA_Build 16 81811762 1I ACAGAGCAAG -/A AAAAAAAAAG 2871 het 270 hom 10 1 9 0 A 9 10 101963 CASAVA_Build 16 81814178 10I AGGGGCAAAA ----------/TTGCTTCCAT TTGAGAACCA 3070 hom 111 het 37 0 37 1 TTGCTTCCAT 0 1 101964 CASAVA_Build 16 81829214 1I GGAGTGGATC -/T CCTTTTTCCT 3070 hom 141 het 55 0 48 8 T 0 1 101965 CASAVA_Build 16 81829330 1I TAATTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 10 11 101966 CASAVA_Build 16 81830646 1I CATTTAACTG -/A AAACCTTTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 3 4 101967 CASAVA_Build 16 81837668 1D CTAGAATGTA T/- TTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 7 6 101968 CASAVA_Build 16 81838603 1I CTGTCACCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 463 hom 43 2 36 5 T 9 10 101969 CASAVA_Build 16 81843378 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 6 T 11 10 101970 CASAVA_Build 16 81851173 1D TATATAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 24 1 15 8 T 12 11 101971 CASAVA_Build 16 81855659 2I TATATATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 231 hom 35 1 29 5 TG 7 8 101972 CASAVA_Build 16 81860036 12I CCACAAGCCA ------------/AACTGCAAGGTC AAGACCAGAG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 AACTGCAAGGTC 0 1 101973 CASAVA_Build 16 81866381 1I GCTATTTTTC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 52 25 26 1 T 6 7 101974 CASAVA_Build 16 81866686 2D AGAAAGCGTG TA/-- TAGGAGGGGC 3070 het 3070 hom 39 17 17 7 TA 2 1 101975 CASAVA_Build 16 81866777 1D TGGAAGATAA G/- GGGGGGCCTG 3070 hom 67 het 30 0 24 6 G 7 6 101976 CASAVA_Build 16 81871803 1I AATGTATTTC -/T GTATCTCATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 101977 CASAVA_Build 16 81885723 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTATATATA 3070 het 31 hom 30 1 27 2 TA 0 1 101978 CASAVA_Build 16 81890414 1D AAAAAAAAAA G/- ATGAATTCCC 3070 het 502 hom 38 5 21 12 G 1 0 101979 CASAVA_Build 16 81914594 1D ACCATGTTTG C/- CAGGCTGCTC 3070 het 3070 hom 18 9 8 1 C 2 1 101980 CASAVA_Build 16 81915135 3I ACAGGTTTAT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 42 het 20 0 14 6 TTC 4 5 101981 CASAVA_Build 16 81919230 2D CAGTATTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 26 0 17 10 A 15 13 101982 CASAVA_Build 16 81926500 2I TGTGAGTCAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 148 het 59 0 49 10 AC 7 8 101983 CASAVA_Build 16 81979390 1D CTCTCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 2913 het 29 hom 26 2 10 14 A 19 18 101984 CASAVA_Build 16 81981169 1D ATTTTCCCAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 A 9 8 101985 CASAVA_Build 16 81989308 3I ACTGTAATGT ---/TGA TGATGTTTAA 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 TGA 1 2 101986 CASAVA_Build 16 81989744 2D TAGACCTGGA AT/-- ATGGGGCCTG 3070 hom 99 het 37 0 32 5 AT 2 1 101987 CASAVA_Build 16 81992766 1I TTTTATGGAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 8 9 101988 CASAVA_Build 16 81996983 1I AATATAGCTG -/C CTTAGTTAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 C 1 2 101989 CASAVA_Build 16 82000335 1I72M1I AAACGCATAA -GCTTCAGAGAAAGATATGGGAGCTGGGGAGTGGATATGCCAATCCCATTCTTGACTGATTGAAGGCTGCTGC-/GGCTTCAGAGAAAGATATGGGAGCTGGGGAGTGGATATGCCAATCCCATTCTTGACTGATTGAGGGCTCCTGCT TAGGGACATT 3070 het 3070 ref 28 30 12 6 N/A 0 0 101990 CASAVA_Build 16 82011034 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 2804 hom 26 9 15 2 A 8 7 101991 CASAVA_Build 16 82014600 1I GACAGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 11 12 101992 CASAVA_Build 16 82033660 1D ACATTGCAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 10 9 101993 CASAVA_Build 16 82035944 87I AGGTATAAAA ---------------------------------------------------------------------------------------/TTCCAACCAGTATTAGCTGCTTTTAAAGTGTAGCAGTTAGAAGCCTGAGTCCCTAGAGATGGAGATAGAAGTCCATGGTGCAAGCAG TTCCCCAAAT 3070 hom 27 het 8 0 10 3 TTCCAACCAGTATTAGCTGCTTTTAAAGTGTAGCAGTTAGAAGCCTGAGTCCCTAGAGATGGAGATAGAAGTCCATGGTGCAAGCAG 0 1 101994 CASAVA_Build 16 82036340 26D GCTGCGAGAG TTTATAATTTATAAAAGCTTTTATAA/-------------------------- TTTATAAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 7 11 TTTATAATTTATAAAAGCTTTTATAA 1 0 101995 CASAVA_Build 16 82043478 4I TTATATTGAT ----/TATC TACTTGGTGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TATC 0 1 101996 CASAVA_Build 16 82044852 13D AAACTCTTTA TCCACCATGTATC/------------- TCCACCATGT 3070 hom 108 het 37 0 37 5 TCCACCATGTATC 2 1 101997 CASAVA_Build 16 82045821 1D GTTCTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 116 hom 27 1 22 4 T 12 11 101998 CASAVA_Build 16 82055318 3D GGCACACACC ACT/--- ATGTCCGGCT 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 ACT 1 0 101999 CASAVA_Build 16 82070764 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 373 hom 23 1 22 0 A 9 10 102000 CASAVA_Build 16 82074573 1D CTGAAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 578 hom 31 3 18 10 T 14 13 102001 CASAVA_Build 16 82078826 3D TGTCCTTGAC CTT/--- CTGTAAGAAC 3070 het 3070 hom 43 18 20 9 CTT 1 0 102002 CASAVA_Build 16 82083315 2I GAACAATGGT --/AA AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 6 8 102003 CASAVA_Build 16 82090917 1I TCTGTTAATC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 10 102004 CASAVA_Build 16 82092566 1I AGTCAAGAGA -/C TTCTCCATTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 0 1 102005 CASAVA_Build 16 82098964 1I CATAGTAAAA -/C CCCGTCTCTA 1038 het 1038 ref 13 9 3 1 C 3 4 102006 CASAVA_Build 16 82102575 1I CTCAAAAAAA -/C AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 C 0 1 102007 CASAVA_Build 16 82128753 1D GTTCTACAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 9 8 102008 CASAVA_Build 16 82137536 1D ATACTACTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 13 12 T 14 13 102009 CASAVA_Build 16 82150068 1I CCAACACCAT -/G GGAGGACCAC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 G 2 3 102010 CASAVA_Build 16 82151915 3D CGCAACCTTA ATC/--- ATATGAGTTG 3070 het 2768 hom 22 7 11 4 ATC 1 0 102011 CASAVA_Build 16 82159298 1D AAACAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 16 23 7 A 10 9 102012 CASAVA_Build 16 82177261 1I CGGATGAACT -/G GGCAAGCGAT 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 G 2 3 102013 CASAVA_Build 16 82204947 1I TCAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 1449 het 1449 ref 11 5 3 3 T 8 9 102014 CASAVA_Build 16 82209852 1I AAGTAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 8 9 102015 CASAVA_Build 16 82222461 3D AGTGTTTGGT TTG/--- TTGTTGTTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTG 3 2 102016 CASAVA_Build 16 82223377 2I8M10D TGTAGAGACG --TGTCCTACAGTGAAATTA/GTTTGGGTAC---------- GAGATGACTC 3070 hom 153 het 53 0 50 7 N/A 0 0 102017 CASAVA_Build 16 82236644 2D TGCACACATG CC/-- CCCCCCCAAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 C 9 7 102018 CASAVA_Build 16 82242877 1D AATTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 5 4 102019 CASAVA_Build 16 82244551 1D TCACAAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 37 1 28 8 T 12 11 102020 CASAVA_Build 16 82252036 1D GAAATTGAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 9 8 102021 CASAVA_Build 16 82253272 3I CTTGTTGAGA ---/TGC TGCTATTCCT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 TGC 1 2 102022 CASAVA_Build 16 82268624 1D CTCAGTTGGG C/- CAGGGCCCAG 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 C 2 1 102023 CASAVA_Build 16 82273001 3I ATGTTACTGC ---/TGT TGTTGTGATG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 TGT 2 3 102024 CASAVA_Build 16 82298037 4D AGTCGGACTC ACTT/---- CATCCCTTCA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 ACTT 1 0 102025 CASAVA_Build 16 82301085 1I ATAGTCCAAA -/C AAATGGCCTA 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 C 0 1 102026 CASAVA_Build 16 82301657 2D GGCAACCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2792 hom 38 12 16 11 A 13 11 102027 CASAVA_Build 16 82308177 1D ACATGTCTGG C/- CAACATGGTG 3070 het 2946 hom 26 11 14 3 C 2 1 102028 CASAVA_Build 16 82310563 1I AGTAAACGGT -/G GGACACAGGA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 G 2 3 102029 CASAVA_Build 16 82315685 1D ATGGATGAAG T/- TGTACAAGCT 3070 het 3070 ref 68 41 25 4 T 2 1 102030 CASAVA_Build 16 82322436 1I GCATCTGTCA -/T TTTTTTGACT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 6 7 102031 CASAVA_Build 16 82330457 1D GAATTAAGCA C/- GTCCGGTGTG 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 C 1 0 102032 CASAVA_Build 16 82342083 1D TTAACTATTT A/- AAAAAAAAAA 2700 het 998 hom 26 5 8 14 A 15 14 102033 CASAVA_Build 16 82342539 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 10 11 102034 CASAVA_Build 16 82345058 1I AAAGAAAACC -/A TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 A 0 1 102035 CASAVA_Build 16 82349192 1D GTGCTTATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2764 hom 30 12 16 2 A 12 11 102036 CASAVA_Build 16 82353495 1D AAGGATAAAA T/- AAAAAAAACT 1908 het 1908 ref 26 15 6 5 T 1 0 102037 CASAVA_Build 16 82354514 1D GCTTAGATTG A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 A 1 0 102038 CASAVA_Build 16 82356444 1D AGTGGAATGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 9 8 102039 CASAVA_Build 16 82359377 1D AGAACCTGTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 9 8 102040 CASAVA_Build 16 82363351 1D AAATCTATAC T/- GGCTAAAGTC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 1 0 102041 CASAVA_Build 16 82368064 10I TTCCGCCAAG ----------/CTGCACACAT CTGCACAGGT 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 CTGCACACAT 0 1 102042 CASAVA_Build 16 82369633 1D GAGACTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 12 11 102043 CASAVA_Build 16 82377694 4D ATTTGTTTAC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 TTAT 3 2 102044 CASAVA_Build 16 82379572 1D15M1D AAACATTGAA TTTTTTTTTTTAGATTA/-TTTTTTTTTTAGATT- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 10 18 8 N/A 0 0 102045 CASAVA_Build 16 82385733 2I TTAAGTCAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 12 10 13 AT 8 9 102046 CASAVA_Build 16 82389975 1I GCTTTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 11 12 102047 CASAVA_Build 16 82390248 4D TGAAACCCTA TCTC/---- TACTAAAAAA 3070 het 1455 hom 15 3 10 2 TC 2 0 102048 CASAVA_Build 16 82391057 3D TATATAATTT AAG/--- AAGAGTCAGT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 AAG 2 1 102049 CASAVA_Build 16 82393004 1D CTCAAAAGCG A/- AAAAAAAAAA 1761 het 1226 hom 27 6 7 14 A 17 16 102050 CASAVA_Build 16 82396333 1D GAAGAGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 18 15 7 A 10 9 102051 CASAVA_Build 16 82401151 3D CCAGCTAATA ATT/--- AAGGTGTCTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATT 1 0 102052 CASAVA_Build 16 82414805 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 11 10 102053 CASAVA_Build 16 82418646 1D ATTTGGAAAC A/- GGTTCTTTGC 3070 hom 140 het 53 0 45 10 A 1 0 102054 CASAVA_Build 16 82434900 5I CCACCAAAAG -----/AAGGA AAGGAAAGGA 2120 hom 30 het 15 0 7 9 AAGGA 3 4 102055 CASAVA_Build 16 82441362 1I GAAGACACTC -/T TGGTGAACGC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 1 2 102056 CASAVA_Build 16 82443970 8D CACACACACG TGCACACA/-------- TGCACGCATG 3070 het 3070 hom 55 21 31 5 TGCACACA 1 0 102057 CASAVA_Build 16 82446864 1I AAAAAAAAAA -/G TTTAATTAGC 3070 het 3070 ref 31 15 13 5 G 0 1 102058 CASAVA_Build 16 82448802 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2442 het 2442 ref 32 17 11 4 A 14 15 102059 CASAVA_Build 16 82453022 1I GATATACCCT -/A AAAAAAATCA 2865 het 2865 ref 27 18 6 3 A 7 8 102060 CASAVA_Build 16 82460357 2I CAAGCATATG --/AA AAGAAAAAAA 1814 het 1814 ref 21 9 7 5 A 2 4 102061 CASAVA_Build 16 82464034 6D TGCTATTATA AATGAG/------ ATTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 AATGAG 1 0 102062 CASAVA_Build 16 82470487 1D CTATTTTCAC T/- GTCTCAGCAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 1 0 102063 CASAVA_Build 16 82475780 1I CCTGCCCTTA -/G GCCAGGCAAC 3070 hom 160 het 59 0 54 5 G 1 2 102064 CASAVA_Build 16 82480146 12D GTTTTTTTCG TTTGTTTTTTTT/------------ TTTGTTTTTT 3070 hom 58 het 22 0 20 4 TTTGTTTTTTTT 2 1 102065 CASAVA_Build 16 82482289 4D ATTCTCTAAG TCTT/---- ACCTGGACTT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 TCTT 1 0 102066 CASAVA_Build 16 82482986 1D GTGTGTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 40 0 33 8 A 10 9 102067 CASAVA_Build 16 82486614 2D ACATACATAC AT/-- ATACACACAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AT 2 1 102068 CASAVA_Build 16 82488749 1D AAACACAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 10 9 102069 CASAVA_Build 16 82525999 2I CTGGGGAGTC --/AG GGGCTTAAAG 3070 hom 53 het 23 0 18 5 AG 0 1 102070 CASAVA_Build 16 82534919 3D GCTGGTGCTC CTG/--- CTGCTGCTGC 2942 het 1708 hom 27 5 12 12 CTG 5 4 102071 CASAVA_Build 16 82587709 2D CGTCAGGTAG AC/-- ACACTGGGTT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 AC 3 2 102072 CASAVA_Build 16 82589908 9I AGTTGCCCTT ---------/CTCCCCCTC CTCCCCCTGA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 CTCCCCCTC 0 1 102073 CASAVA_Build 16 82590375 1D TAGCCAGGAT G/- GGGGGGCAGG 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 G 7 6 102074 CASAVA_Build 16 82591167 2I AAGTTTTATT --/TA TTTTTTTTTT 2877 het 2366 hom 25 10 12 3 TA 0 1 102075 CASAVA_Build 16 82591457 30D GGAACATAGC AAGACCCCATCTCTATTGGGACAGTTTTTG/------------------------------ AATTAGGCCG 3070 het 3070 hom 40 18 21 3 AAGACCCCATCTCTATTGGGACAGTTTTTG 1 0 102076 CASAVA_Build 16 82591936 18D ACAGCAGGTG AGGGAGACAGAGGGAAGT/------------------ GGGGGGGCTG 2104 het 2104 ref 27 16 7 13 AGGGAGACAGAGGGAAGT 1 0 102077 CASAVA_Build 16 82592362 20D CCTTAGGCCT TTGTCCTCTGCTCAGCACAC/-------------------- ATCTGGGAGA 3070 het 3070 ref 28 15 10 9 TTGTCCTCTGCTCAGCACAC 1 0 102078 CASAVA_Build 16 82592770 20D AGTCAGCCTC CCTGGGCACCCCCTCACCTT/-------------------- CCCACAAAGG 3070 het 3070 ref 34 13 12 10 CCTGGGCACCCCCTCACCTT 1 0 102079 CASAVA_Build 16 82593513 2I AGGAAATCCC --/CT GTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 CT 0 1 102080 CASAVA_Build 16 82594106 8D CAAGGTAGGT AGATGACA/-------- GACAGACAGA 3070 het 3070 ref 36 17 12 9 AGATGACA 1 0 102081 CASAVA_Build 16 82606684 1I TGCCCCCGGC -/G GGGGGTTCAG 3070 hom 54 het 22 0 15 7 G 5 6 102082 CASAVA_Build 16 82613827 2D GCTGTTACTC TT/-- GTTTCTACTG 2829 het 2829 ref 31 15 9 8 T 2 0 102083 CASAVA_Build 16 82616265 3I CGGGCGGGGA ---/TGC TGCTTTTTCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TGC 1 2 102084 CASAVA_Build 16 82620822 6I GAAATGGAAA ------/AGGAAG AGGATGCTGG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 AGGAAG 0 1 102085 CASAVA_Build 16 82621981 1I CCCTGCCACT -/G GGGAAATCCG 2622 het 2622 ref 28 18 8 2 G 3 4 102086 CASAVA_Build 16 82622696 1D CTGTGGGGAC A/- AGTCTGCAAT 2843 het 2843 ref 26 11 7 9 A 2 1 102087 CASAVA_Build 16 82622804 2D GCAGCAGAAG GA/-- GAGTGGCCCT 3070 het 1888 hom 29 7 16 6 GA 2 1 102088 CASAVA_Build 16 82626120 1D AGAAGCTTGG C/- CTTCCCTACA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 C 2 1 102089 CASAVA_Build 16 82628505 3D CTTGCAGGGG TGC/--- TGCTATGACA 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 TGC 2 1 102090 CASAVA_Build 16 82630915 4I CTCACTGGTG ----/AGCC AGCCAGCCAT 2175 het 2175 ref 27 11 6 10 AGCC 2 3 102091 CASAVA_Build 16 82633979 1I GCCCGGCCCC -/G GGGGGTGGAG 1846 het 1408 hom 15 6 5 4 G 5 6 102092 CASAVA_Build 16 82635359 3D CTCAGGGGCT TAG/--- AACAATAGAA 3070 het 3070 hom 42 20 18 5 TAG 1 0 102093 CASAVA_Build 16 82646786 1D GTAAGGGACG T/- TAATAGGTGG 3070 het 3070 ref 37 20 11 7 T 2 1 102094 CASAVA_Build 16 82647038 1I CCCGCCTCCT -/G GGGGAGGGAG 3070 hom 71 het 26 0 21 5 G 4 5 102095 CASAVA_Build 16 82650944 4D ATTTTCAAAA TTCT/---- TTCTATTTCT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 TTCT 2 1 102096 CASAVA_Build 16 82651080 2D TAGTTTCATC TG/-- TGTTTCTTTT 2610 het 1775 hom 17 5 6 7 TG 2 1 102097 CASAVA_Build 16 82652260 1I TCTAAAGGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 102098 CASAVA_Build 16 82658742 7I CCCAAAAGTC -------/ACATTTT TTATCCAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ACATTTT 0 1 102099 CASAVA_Build 16 82662842 7D TACATGAAAT GTAAAAC/------- TTTTACAGAA 2173 het 2173 ref 29 21 5 5 GTAAAAC 1 0 102100 CASAVA_Build 16 82664783 1I AAACAATATT -/A AAAAAAAAAA 2950 het 2861 hom 20 8 7 5 A 10 11 102101 CASAVA_Build 16 82667391 1I ACAATAAAAA -/T ATATATACAT 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 T 0 1 102102 CASAVA_Build 16 82669041 1D AAGAAAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 27 22 6 A 11 10 102103 CASAVA_Build 16 82669200 13D GAAACCGGCA CTCACGCACACTG/------------- CTCACGCAAT 3070 het 3070 ref 52 23 20 13 CTCACGCACACTG 1 0 102104 CASAVA_Build 16 82689642 3I CTTGAACCTG ---/GGA GGTGGAGGTT 1923 het 1424 hom 9 3 5 1 GGA 0 1 102105 CASAVA_Build 16 82690130 2I AACAGCAGAG --/AC AGAAATTTGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AC 0 1 102106 CASAVA_Build 16 82691665 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAACAAAA 1901 het 826 hom 9 2 4 3 A 6 5 102107 CASAVA_Build 16 82702647 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1693 hom 17 5 10 3 A 12 11 102108 CASAVA_Build 16 82705238 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2332 het 1566 hom 12 4 7 1 T 7 6 102109 CASAVA_Build 16 82707051 1D CTCCAGATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 679 hom 40 2 34 4 A 13 12 102110 CASAVA_Build 16 82712376 1D CGCCCTCGCA G/- GGGGGCTTGC 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 G 6 5 102111 CASAVA_Build 16 82712482 1D ACACAGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 13 12 102112 CASAVA_Build 16 82739173 1I GACGGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 919 het 919 ref 26 20 3 3 A 11 12 102113 CASAVA_Build 16 82752232 1D TCCCTCACCT C/- CCCTGGGCGC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 4 3 102114 CASAVA_Build 16 82754491 1D TCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1328 het 1328 ref 24 10 5 9 T 15 14 102115 CASAVA_Build 16 82760363 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 47 het 20 0 16 4 T 9 10 102116 CASAVA_Build 16 82761755 2I AGCCTCAGAA --/AT ATACAGAGAC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 AT 1 2 102117 CASAVA_Build 16 82765948 1D AAGCATTGAA T/- TCCCCCATAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 T 2 1 102118 CASAVA_Build 16 82767597 26D ACTTGCTGGT AGCCAGCCTGGGCCAGGAAGCCACCG/-------------------------- AGCCAGCCTC 2986 het 2986 ref 37 18 12 12 AGCCAGCCTGGGCCAGGAAGCCACCG 1 0 102119 CASAVA_Build 16 82771043 1I CACTCCCCCA -/C CCCAGCACAC 1888 het 1888 ref 27 9 7 11 C 3 4 102120 CASAVA_Build 16 82786114 1D GGACCCAGGC T/- TGTAGTGTCG 2682 het 2437 hom 21 8 9 5 T 2 1 102121 CASAVA_Build 16 82794854 1I GGTGAGTGTT -/A ACAGCTTTTA 1884 het 1884 ref 14 7 5 2 A 1 2 102122 CASAVA_Build 16 82804855 1D TAGAAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 15 5 T 11 10 102123 CASAVA_Build 16 82840616 4D TTTATTTAAA AACC/---- AACAAACAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AACC 1 0 102124 CASAVA_Build 16 82843875 3I TGATGGGTAG ---/GGA GGACCCTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 GGA 1 2 102125 CASAVA_Build 16 82859741 1I TGAGAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 339 hom 28 2 23 3 A 15 16 102126 CASAVA_Build 16 82869953 11D CTAGTGCATT CTAGTGCATCC/----------- CTAGTGCAAG 2702 het 2702 ref 30 25 8 0 CTAGTGCATCC 1 0 102127 CASAVA_Build 16 82875213 1I AAAGACGGCC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 7 8 102128 CASAVA_Build 16 82875349 1I AAGAGCAGGC -/T TTTTTGGAGT 2606 het 2606 ref 29 10 9 10 T 5 6 102129 CASAVA_Build 16 82878461 1D GAGGGCTGAT G/- CTGCCCAGTC 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 G 1 0 102130 CASAVA_Build 16 82894586 2D TGTTTACTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 32 6 14 13 A 14 12 102131 CASAVA_Build 16 82895423 1D GCAACTTCTG C/- CTGCGTGGTT 2791 het 2791 ref 24 14 7 3 C 2 1 102132 CASAVA_Build 16 82902357 1I GTACTATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 12 13 102133 CASAVA_Build 16 82911975 1I CCAAAACCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 9 10 102134 CASAVA_Build 16 82915231 1D CGTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2584 hom 24 9 10 6 A 12 11 102135 CASAVA_Build 16 82917929 1I GGTGAGCCAC -/G GGGGGGCATT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 G 6 7 102136 CASAVA_Build 16 82919894 1D CTATCTCTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 9 8 102137 CASAVA_Build 16 82927524 1D27M1D GACTCTGTTT AAAAAAAAAAAACAAAGATTGAGCCATGA/-AAAAAAAAAAACAAAGATTGAGCCATG- AAAAAATCCA 3070 hom 24 het 12 0 9 8 N/A 0 0 102138 CASAVA_Build 16 82930602 5D TGCCTGGCCC GTCTG/----- GTCTGGGAAG 3070 hom 116 het 44 0 36 12 GTCTG 2 1 102139 CASAVA_Build 16 82932388 9D GTCTCAGAAA AATAATAAT/--------- AATAATAATA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 AAT 9 6 102140 CASAVA_Build 16 82933710 1D GACCTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 33 1 28 4 A 12 11 102141 CASAVA_Build 16 82941627 6D AGAATAGGAC CTCTCT/------ CTCTCTCTCT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 CT 9 6 102142 CASAVA_Build 16 82942091 1D TGGTGGCAGG C/- GCCTGTAATC 3070 hom 68 het 28 0 21 7 C 1 0 102143 CASAVA_Build 16 82960612 1D GTCGTTGCAC T/- TTTTTTTTTT 1254 het 1254 ref 38 29 4 5 T 12 11 102144 CASAVA_Build 16 82967643 1D TTTTTGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 38 1 22 15 T 15 14 102145 CASAVA_Build 16 82978244 1D ACTGCGATAA C/- CCCAGACTGA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 4 3 102146 CASAVA_Build 16 82979432 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 A 10 11 102147 CASAVA_Build 16 82986570 1I GCCTTTGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 590 hom 25 5 13 7 T 14 15 102148 CASAVA_Build 16 82987331 2D AGCATCGGGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 42 17 13 13 GT 9 8 102149 CASAVA_Build 16 82999965 1I TGAGCACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 17 10 T 10 11 102150 CASAVA_Build 16 83003409 2I GTGTGTGTGT --/GC GAGCATGTCT 3070 hom 147 het 56 0 46 10 GC 0 1 102151 CASAVA_Build 16 83003655 12D GTGTGTATGC GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGTGT 3070 het 556 hom 41 8 22 17 GT 11 5 102152 CASAVA_Build 16 83008038 2D GGGTCCTAAC AG/-- GGGATGCTCC 3070 het 2772 hom 23 9 12 2 AG 1 0 102153 CASAVA_Build 16 83010754 3I TCCTCCCTTC ---/CTG CCTTGGGGCC 3070 hom 65 het 28 0 20 8 CTG 0 1 102154 CASAVA_Build 16 83013240 1I ATCACCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 10 11 102155 CASAVA_Build 16 83024791 8D CAACAACAAA ACACACAC/-------- ACACACACAC 1368 het 1368 ref 24 12 5 8 AC 11 7 102156 CASAVA_Build 16 83025384 3D TTAGCCAGGT GTG/--- GTGGTGGGCG 1244 het 396 hom 6 1 3 2 GTG 3 2 102157 CASAVA_Build 16 83026827 1I CCGGCTACCA -/G GGGAGGCAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 G 3 4 102158 CASAVA_Build 16 83030506 2I GCAACTTCTC --/TT TTCTATAAAC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 2 4 102159 CASAVA_Build 16 83033067 4I ATGCAAAACT ----/AGTA AGTAATAATA 3070 hom 57 het 24 0 19 6 AGTA 1 2 102160 CASAVA_Build 16 83039010 5D TATATAATTA ATATT/----- ATATTATCTT 2632 het 1894 hom 13 5 6 2 ATATT 2 1 102161 CASAVA_Build 16 83046657 23D TATTTTTTTC TTAATACATTTACCTTCCTAATT/----------------------- TTAATTAGTT 3070 het 3070 ref 23 13 9 6 TTAATACATTTACCTTCCTAATT 1 0 102162 CASAVA_Build 16 83056215 4D AAGGATAAAC TGTT/---- TGTTTTACTT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 TGTT 2 1 102163 CASAVA_Build 16 83056798 25I ACCAGGGTCG -------------------------/ATTGATATTTGCAATAACAACAAAA ATTACTCTGA 3070 hom 89 het 32 0 29 5 ATTGATATTTGCAATAACAACAAAA 0 1 102164 CASAVA_Build 16 83060018 1D CAAAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 11 10 102165 CASAVA_Build 16 83060649 1I TCTCAAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 hom 43 het 17 0 14 3 C 0 1 102166 CASAVA_Build 16 83061379 3D ATGACAAAGT ATC/--- ATTAGAAGTC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 ATC 1 0 102167 CASAVA_Build 16 83061733 1I CTGCACTCCA -/G CCTGGGTGAC 396 het 3 hom 3 0 1 2 G 0 1 102168 CASAVA_Build 16 83061874 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 1736 het 1736 ref 15 7 8 0 AT 6 5 102169 CASAVA_Build 16 83065221 3D CAGCTATAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 22 19 8 A 13 10 102170 CASAVA_Build 16 83072167 1D GTTAAGATAA G/- GGGAGAGGTG 3070 hom 45 het 19 0 14 5 G 4 3 102171 CASAVA_Build 16 83077097 1I CCTTATTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 14 1 12 1 A 0 1 102172 CASAVA_Build 16 83077378 1D GCGTGGCGGT G/- GGGGCAGGGG 3070 hom 99 het 35 0 29 6 G 5 4 102173 CASAVA_Build 16 83082086 4I GCTCTTAAGC ----/TGCT TGCTTTTCTA 3070 hom 64 het 27 0 22 5 TGCT 1 2 102174 CASAVA_Build 16 83082944 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 22 1 17 5 A 14 13 102175 CASAVA_Build 16 83093446 1I GGATACTGCT -/A AAAAATCCTA 3070 hom 149 het 53 0 49 4 A 5 6 102176 CASAVA_Build 16 83094314 1D CATATATGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 147 het 56 0 49 7 A 10 9 102177 CASAVA_Build 16 83098817 1D TTTTGTTTTT G/- AGACAGGATC 3070 het 2282 hom 28 6 16 6 G 1 0 102178 CASAVA_Build 16 83101881 1D TTTCAAATAC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 56 het 26 0 20 8 T 9 8 102179 CASAVA_Build 16 83107625 6I GGTTCAAAGC ------/ATATTA ATATTAATGT 3070 het 3070 ref 40 19 20 3 ATATTA 1 2 102180 CASAVA_Build 16 83124645 1D CAATTTTATA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 8 7 102181 CASAVA_Build 16 83134245 1D TTACAGTGAT A/- GGGGTCTCAT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 1 0 102182 CASAVA_Build 16 83138263 1D CCCTGAGGCA G/- GATGGTGCTG 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 G 2 1 102183 CASAVA_Build 16 83139781 5D TCCACAAAGA GCCTG/----- GCCTGGCAGG 3070 het 3070 hom 30 12 11 8 GCCTG 2 1 102184 CASAVA_Build 16 83139877 5D GCTGTCTCCA CGCCT/----- CGCCTCTCAC 1255 het 1255 ref 18 7 6 8 CGCCT 2 1 102185 CASAVA_Build 16 83143982 1D CATGTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 1469 het 160 hom 11 1 4 6 T 15 14 102186 CASAVA_Build 16 83145252 1D GGGTAATTCA T/- TTTAAGTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 4 3 102187 CASAVA_Build 16 83152509 1D CCAGAACTCC T/- GGGCTCAAGG 3070 het 3070 ref 42 25 10 7 T 1 0 102188 CASAVA_Build 16 83159070 1D CATCCACATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 98 het 42 0 32 10 A 10 9 102189 CASAVA_Build 16 83161591 1I TTCAAACTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 941 hom 35 2 23 10 A 10 11 102190 CASAVA_Build 16 83162062 1D TCATTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 38 3 24 12 T 13 12 102191 CASAVA_Build 16 83164027 1I GCCCGACTAA -/T TTTTTTTTTT 2230 het 2230 ref 32 14 9 9 T 13 14 102192 CASAVA_Build 16 83172614 3I CTCTAATTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 52 20 20 12 TTG 5 6 102193 CASAVA_Build 16 83184602 2I GTCACATAAC --/AT AAAATTCACC 3070 hom 18 het 13 0 8 5 AT 0 1 102194 CASAVA_Build 16 83208289 4D TGGGAAGAGC TGGA/---- TGGACACTGG 3070 het 3070 ref 29 13 12 6 TGGA 2 1 102195 CASAVA_Build 16 83211832 1D GGTATGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 575 hom 31 3 16 12 T 17 16 102196 CASAVA_Build 16 83215102 1D TTATGGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 36 0 23 13 T 15 14 102197 CASAVA_Build 16 83215703 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTCTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 5 6 102198 CASAVA_Build 16 83217285 2D ACATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 AT 8 7 102199 CASAVA_Build 16 83217448 4I TTATGTTTTA ----/TTAT TTATTTATTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TTAT 4 5 102200 CASAVA_Build 16 83222328 2I CTACATGCTG --/GA AAGGAGAAAG 3070 het 3070 hom 50 23 22 5 GA 0 1 102201 CASAVA_Build 16 83226770 1I CCTCCAGCCT -/G GGGTGACAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 G 3 4 102202 CASAVA_Build 16 83233355 1D CGGGTCCAAA G/- GAAACGAGGC 3070 hom 86 het 34 0 27 9 G 2 1 102203 CASAVA_Build 16 83247739 1D GCTCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 2933 het 3 hom 12 0 9 3 A 13 12 102204 CASAVA_Build 16 83253968 3D CATTGGAAAC CTT/--- CTTGAATTCT 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 CTT 2 1 102205 CASAVA_Build 16 83298021 2D AAGGAGAAAC AT/-- ATTTATTACG 3070 het 3070 hom 33 11 18 5 AT 2 1 102206 CASAVA_Build 16 83320089 1D TATTTTTAGT G/- GAGGTGGATT 3070 hom 69 het 26 0 23 4 G 2 1 102207 CASAVA_Build 16 83329207 10I CTCTGCCTTG ----------/TGCTGGCTTT TGAAGTGGAT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 TGCTGGCTTT 0 1 102208 CASAVA_Build 16 83337273 1D TCTTGAAGAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 8 7 102209 CASAVA_Build 16 83340682 2I CCCCATCTTT --/AA AAAAAAAAAA 1551 het 1551 ref 21 9 5 7 A 14 16 102210 CASAVA_Build 16 83358897 1D TTTTTAATTT A/- TTTTTTTATT 3070 het 1726 hom 18 5 12 1 A 1 0 102211 CASAVA_Build 16 83360691 4I AGTTGTGCAT ----/TGGC TGTGGGTGAC 3070 hom 118 het 43 0 31 12 TGGC 0 1 102212 CASAVA_Build 16 83365605 14I TTTGTTTTTT --------------/TCTTCGAGACAGAG TCTTGCTCTG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 TCTTCGAGACAGAG 0 1 102213 CASAVA_Build 16 83367005 2D TCTTTTATGC CT/-- CTGAGTCTTT 3070 hom 130 het 47 0 43 5 CT 2 1 102214 CASAVA_Build 16 83389245 1D GGACATTTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 10 9 102215 CASAVA_Build 16 83389977 1D TCCCAGCAGC T/- TTTTTTTTTT 1979 het 1979 ref 40 27 6 7 T 13 12 102216 CASAVA_Build 16 83440697 3I CCCTGGGGGA ---/TTG TTGTCAAATC 3070 hom 87 het 35 0 27 8 TTG 1 2 102217 CASAVA_Build 16 83442043 1I CATCACATCT -/C CCCCAAGCAC 3070 hom 119 het 46 0 38 8 C 4 5 102218 CASAVA_Build 16 83451200 8I CTTTGGATCC --------/CTTCCTCT ACATTAAACC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 CTTCCTCT 0 1 102219 CASAVA_Build 16 83452432 2D AACTAATAGG AT/-- ATATATATAT 1817 het 1817 ref 34 24 4 6 AT 6 5 102220 CASAVA_Build 16 83461383 1D TCCTTCCAGT C/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 C 1 0 102221 CASAVA_Build 16 83472741 1I CTAGCTAATG -/T TTTTTTATTT 3070 het 2445 hom 21 6 13 2 T 6 7 102222 CASAVA_Build 16 83480693 2I TGGGATTAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 10 12 102223 CASAVA_Build 16 83481448 2D CCTGGGCGAC AG/-- AGTGAGACTC 2341 het 1373 hom 14 4 6 5 AG 2 1 102224 CASAVA_Build 16 83482750 1D AAACAGTCTT C/- CTGAGCAGCG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 2 1 102225 CASAVA_Build 16 83491633 20D AAAAGCAAGA CATCACACAGCGCTGGGAGG/-------------------- CATCACACAG 2845 het 2366 hom 27 9 11 13 CATCACACAGCGCTGGGAGG 2 1 102226 CASAVA_Build 16 83495463 1D AGGCCAAGGA G/- GGGAGGATCA 3070 hom 67 het 24 0 21 3 G 4 3 102227 CASAVA_Build 16 83496774 7D CTGGGATTCC AGGTGTG/------- AGGTGTGAGC 2459 hom 15 het 10 0 6 5 AGGTGTG 2 1 102228 CASAVA_Build 16 83508472 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 36 1 22 13 T 12 11 102229 CASAVA_Build 16 83510702 1I TCATTGTAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 10 T 9 10 102230 CASAVA_Build 16 83513366 1I TTGTTGGGGG -/T TTGCCTGGTA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 2 3 102231 CASAVA_Build 16 83518127 1I AAAAGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 18 8 A 13 14 102232 CASAVA_Build 16 83529553 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 5 6 102233 CASAVA_Build 16 83534600 3I TGGTGAATAG ---/TGC TGCTATGAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TGC 1 2 102234 CASAVA_Build 16 83536979 1D ACTAGTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 12 11 102235 CASAVA_Build 16 83540123 1I GTCTGTGTGG -/T TTTTGTCTGT 3070 het 3070 ref 57 29 27 1 T 4 5 102236 CASAVA_Build 16 83541598 1D GGCCAAGTAG A/- AAAATATATT 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 A 5 4 102237 CASAVA_Build 16 83556822 6D AATCACAATC ACACAA/------ ACACAATCAC 873 hom 45 het 49 0 13 42 ACACAA 2 1 102238 CASAVA_Build 16 83557239 2D CACACACAAT CA/-- CGCACACACA 3070 het 631 hom 70 10 24 38 CA 1 0 102239 CASAVA_Build 16 83561776 3I GATGGGTGAA ---/CTT CTTCCCGCGG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 CTT 1 2 102240 CASAVA_Build 16 83568925 1D AAATAATTGC A/- ATGATTTCCT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 2 1 102241 CASAVA_Build 16 83581978 1I ATACAAAACC -/G TATCTATGGC 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 G 0 1 102242 CASAVA_Build 16 83584587 1D AAACAAAATT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 2188 hom 27 10 12 6 G 1 0 102243 CASAVA_Build 16 83593034 1D GCAAAAAAAA T/- AAATATATAT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 1 0 102244 CASAVA_Build 16 83599619 1D ACCCCCCCCC A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 39 18 13 8 A 8 7 102245 CASAVA_Build 16 83608056 1I TTTCTTTTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 9 10 102246 CASAVA_Build 16 83609589 2D AGTTTTACTC TT/-- GTTGCCCAGG 1111 het 1111 ref 19 5 4 10 T 2 0 102247 CASAVA_Build 16 83616530 1I CCTTTTTTGG -/A GGGGGGGGAC 2480 het 2480 ref 24 10 8 6 A 0 1 102248 CASAVA_Build 16 83636248 1I AATAAATGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 9 10 102249 CASAVA_Build 16 83639638 1D CTCTCCCCCC T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 T 7 6 102250 CASAVA_Build 16 83650352 1I AGTAATGTGC -/T GTCTTGCAGG 3070 het 3070 hom 57 23 26 8 T 0 1 102251 CASAVA_Build 16 83706527 1I CGTCTCTATT -/A AAAAAAAAGA 1943 het 1943 ref 20 9 6 5 A 8 9 102252 CASAVA_Build 16 83713077 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2638 het 1676 hom 18 6 10 3 A 11 10 102253 CASAVA_Build 16 83729028 2I TTTCGGTTGG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 TC 7 8 102254 CASAVA_Build 16 83735974 2D TGGCCCCTTC CT/-- CTTTCTCCAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 CT 2 1 102255 CASAVA_Build 16 83744407 3D AAAAACAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 72 het 33 0 25 9 AAC 6 5 102256 CASAVA_Build 16 83745414 1I TCAGAGGAGA -/C CCCCAAGTGG 3070 het 2046 hom 26 10 10 6 C 4 5 102257 CASAVA_Build 16 83746113 1D CAGAGCATGA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 T 8 7 102258 CASAVA_Build 16 83748177 4D ATCCCTCCAC CAAA/---- CAATCAATTT 3070 het 3070 ref 55 28 24 4 CAAA 1 0 102259 CASAVA_Build 16 83757780 5I TGCACATACA -----/TATAT AACTATGCAC 3070 het 3070 ref 57 30 21 6 TATAT 0 1 102260 CASAVA_Build 16 83766159 10D GACTCCTCAG TTGTTCCCTA/---------- TTGTTCCCTA 3070 het 3070 ref 30 13 10 8 TTGTTCCCTA 2 1 102261 CASAVA_Build 16 83784579 1I TTTGCTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 1668 hom 24 4 16 4 T 8 9 102262 CASAVA_Build 16 83796175 1I CACTGGATCT -/C CCCCGCAGCC 3070 hom 69 het 25 0 24 2 C 4 5 102263 CASAVA_Build 16 83798667 5I CGGCAGGAGA -----/TCTAC TCTTCTCAGA 3070 hom 50 het 23 0 15 8 TCTAC 0 1 102264 CASAVA_Build 16 83836874 1I GGCACCGCCT -/G GGGGGGTGCC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 G 6 7 102265 CASAVA_Build 16 83843563 1D AGGGGGACAA C/- CCCCGGTCCC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 C 5 4 102266 CASAVA_Build 16 83854686 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 18 7 T 12 13 102267 CASAVA_Build 16 83859344 1D2M4I AAGGTGTGGC ACA----/-CAGGTG AGGGTTCTAT 3070 hom 78 het 30 0 26 5 N/A 0 0 102268 CASAVA_Build 16 83864672 2I CAGAGGCCAC --/AT AGTGTATGAG 3070 hom 119 het 44 0 38 6 AT 0 1 102269 CASAVA_Build 16 83867450 2D CTTCAGGAAG GT/-- GTGCCCCAGG 3070 hom 81 het 31 0 25 6 GT 2 1 102270 CASAVA_Build 16 83886018 1I GGTTTTTTAG -/T TTTTTGTTTT 2655 het 2655 ref 24 12 10 2 T 5 6 102271 CASAVA_Build 16 83896574 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1494 hom 20 5 10 5 T 13 12 102272 CASAVA_Build 16 83898721 4I GATGGCACAC ----/ACAG AGCATTGCCA 3070 het 3070 ref 48 22 16 10 ACAG 0 1 102273 CASAVA_Build 16 83928114 4I2M2I TGTACACACA ----CA--/AGTGCATG TATCCACAGG 3070 het 3070 ref 68 34 27 7 N/A 0 0 102274 CASAVA_Build 16 83931209 1I AACAGATGGT -/A ACAAATCGTT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 1 2 102275 CASAVA_Build 16 83937538 4I GATGGACAGG ----/TAGA TGGATGGTGG 3070 hom 110 het 66 0 35 31 TAGA 0 1 102276 CASAVA_Build 16 83952485 1D CAGGCACAGA C/- CCCCCCACAC 3070 het 3070 hom 33 15 11 8 C 7 6 102277 CASAVA_Build 16 83960505 1D TGTATTTTTG T/- AGAGATGGGG 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 1 0 102278 CASAVA_Build 16 83966847 5I ACACAGGCCT -----/TGGGC GCCTGTCTCT 2517 het 2489 hom 24 11 8 5 TGGGC 0 1 102279 CASAVA_Build 16 83994199 1I CATGGTTGCT -/G GGGGGGGGAC 2126 het 415 hom 17 1 11 5 G 8 9 102280 CASAVA_Build 16 84008508 2I8M4I AAGACCCGAG --CTGGAAGA----/TTCAGGCTTAGCTC AGATCCTTGG 3070 het 3070 ref 37 20 13 7 N/A 0 0 102281 CASAVA_Build 16 84011218 1I CAGGCCAGAC -/G GGGTGGTGGC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 G 3 4 102282 CASAVA_Build 16 84014831 2D GCGTGTATCC CT/-- CTCTCTGTCG 3070 het 2510 hom 28 9 12 9 CT 4 3 102283 CASAVA_Build 16 84017547 4D ATGGGTGGGT GGAA/---- GGAAGGAAGG 1046 het 1046 ref 27 10 4 13 GGAA 4 3 102284 CASAVA_Build 16 84026818 15I ATGGGCAGCA ---------------/GAAATTCCCTCTCCT GAAATTCCCT 3070 hom 65 het 32 0 19 13 GAAATTCCCTCTCCT 1 2 102285 CASAVA_Build 16 84039372 1I TAGGGATTCT -/G GGGGTACAGC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 4 5 102286 CASAVA_Build 16 84059304 1D GGGAAAGCCC T/- TAGAGGAACA 3070 hom 60 het 24 0 20 5 T 2 1 102287 CASAVA_Build 16 84062831 1D CTTAATTTAC T/- TTTTTTCGAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 7 6 102288 CASAVA_Build 16 84089671 1I CACGCATACA -/C CCCCATGCAT 3070 hom 177 het 66 0 57 9 C 4 5 102289 CASAVA_Build 16 84096129 3I CACATGTGCA ---/CGC CGCACACACA 3070 het 3070 ref 55 26 23 6 CGC 1 2 102290 CASAVA_Build 16 84105474 1D GTGGGACACC A/- CCCCCCCATC 1006 het 1006 ref 11 6 3 2 A 1 0 102291 CASAVA_Build 16 84128906 1D AATGGTACCC T/- AAAGCCCCGC 3070 het 3070 hom 22 9 10 4 T 1 0 102292 CASAVA_Build 16 84133220 1D ACCTTCTGGG T/- TGGAGGAGGG 1991 het 1991 ref 24 12 5 8 T 2 1 102293 CASAVA_Build 16 84150761 9D TGAAGTCAGG CTCTGCCTC/--------- TCCTGAGCTG 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 CTCTGCCTC 1 0 102294 CASAVA_Build 16 84175290 3I GTTTGGAGAC ---/CTT CTTCCTCCCC 2969 het 897 hom 15 3 8 4 CTT 1 2 102295 CASAVA_Build 16 84227796 1D GGGCCTTCCC G/- GGGGGGGGCT 1517 het 286 hom 18 2 6 10 G 9 8 102296 CASAVA_Build 16 84230601 7D AAGCCTCCTG GGCGCCA/------- GGCCTAGCCT 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 GGCGCCA 1 0 102297 CASAVA_Build 16 84256703 3I TCCTCCTCTT ---/ACA ACAGTTCTGG 3070 het 2223 hom 31 8 13 10 ACA 1 2 102298 CASAVA_Build 16 84259074 9I GACTTTCTCA ---------/CGCTGGGTC AGTGGCCCAG 3070 het 3070 ref 37 12 14 11 CGCTGGGTC 0 1 102299 CASAVA_Build 16 84261798 1D TGAAAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2527 hom 32 8 14 10 T 13 12 102300 CASAVA_Build 16 84287642 3I ATGCAGTGGC ---/ATG ATAATAGCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATG 0 1 102301 CASAVA_Build 16 84294126 1D GATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2905 hom 28 9 16 3 T 10 9 102302 CASAVA_Build 16 84302568 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1994 het 442 hom 10 2 5 3 A 13 14 102303 CASAVA_Build 16 84304881 1D CACTGAAGCC A/- AGGGGCTTCC 3070 hom 33 het 30 1 20 10 A 2 1 102304 CASAVA_Build 16 84315110 1D CTTCCTTCGA T/- TTTTTTTTTC 2006 het 2006 ref 25 15 6 4 T 10 9 102305 CASAVA_Build 16 84316173 1D GGTGACTGAT G/- GGGGGGGGAC 1809 het 1797 hom 19 7 5 7 G 9 8 102306 CASAVA_Build 16 84318764 1D CTAAAAATGC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 22 9 8 6 A 8 7 102307 CASAVA_Build 16 84322799 1D TGTGATGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 23 0 16 7 T 14 13 102308 CASAVA_Build 16 84326858 1I GGACGTGTGG -/C CCCCCCCAGC 3070 hom 71 het 28 0 22 6 C 7 8 102309 CASAVA_Build 16 84330090 2D CTTTGGACTC TA/-- GAGCCCACGC 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 TA 1 0 102310 CASAVA_Build 16 84330277 1I GATCAACCAC -/A AATAAGCCAG 3070 hom 96 het 33 0 32 1 A 2 3 102311 CASAVA_Build 16 84335166 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 726 hom 7 het 4 0 3 2 A 10 11 102312 CASAVA_Build 16 84347980 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 33 0 25 8 A 11 12 102313 CASAVA_Build 16 84351274 1D GGAAAAAAAA C/- CCTCAAAACT 3070 hom 45 het 19 0 12 9 C 3 2 102314 CASAVA_Build 16 84355335 8I AATTAGGCCA --------/GGCGTGGT GGCTCACGCC 3070 hom 32 het 12 0 11 1 GGCGTGGT 0 1 102315 CASAVA_Build 16 84358541 1I CAGAAGTCAC -/A GAGGGAGTGA 3070 hom 92 het 36 0 27 9 A 0 1 102316 CASAVA_Build 16 84363610 2I GGGCAAAGAC --/AG AAGAATCGCT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AG 0 1 102317 CASAVA_Build 16 84370441 2D AGATGTGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 31 1 22 10 T 16 14 102318 CASAVA_Build 16 84372401 4I TCAAAGAAAT ----/AGTC AGGCTACCAC 3070 hom 111 het 44 0 34 10 AGTC 0 1 102319 CASAVA_Build 16 84374408 1D ACTCCACGTC A/- AAAAAAAAAG 2474 hom 32 het 13 0 8 6 A 10 9 102320 CASAVA_Build 16 84382233 1D CCATGCCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 21 1 16 4 T 12 11 102321 CASAVA_Build 16 84386657 1I GGTCTTAAGA -/C CCTCCAGGAG 3070 hom 69 het 28 0 19 9 C 2 3 102322 CASAVA_Build 16 84393658 5D ATGTGTTCTC AACAT/----- AAGATATTAA 3070 hom 141 het 49 0 48 5 AACAT 1 0 102323 CASAVA_Build 16 84395332 1I CTTGAAACGC -/T TTTGAGTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 3 4 102324 CASAVA_Build 16 84396306 1I CTGTCTAGAG -/A GCAGTCTTGC 3070 hom 95 het 39 0 29 10 A 0 1 102325 CASAVA_Build 16 84397537 1D GGTTAATAAC A/- GACCCGAATC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 1 0 102326 CASAVA_Build 16 84412259 1I TTTCAAGGCG -/C CCACCCCAGA 3070 hom 71 het 26 0 19 7 C 2 3 102327 CASAVA_Build 16 84423844 1I CATCTGGAGG -/C CGCCTCGCAC 3070 hom 59 het 25 0 16 9 C 1 2 102328 CASAVA_Build 16 84435363 1D6M1I12M2D TTCTTTCCTT CCTCCTT-CTTCCTTCCTTCAT/-CTCTTTCCTTCCTTCCTTC-- CCTCCTTCCT 2089 het 1311 hom 10 5 5 1 N/A 0 0 102329 CASAVA_Build 16 84438574 2I CATAAAAAAT --/CA AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 11 1 9 1 CA 0 1 102330 CASAVA_Build 16 84441504 1I AAAGGCTCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 9 10 102331 CASAVA_Build 16 84449390 1D CCTGGCCAAC A/- GGTGTCTTTA 3070 hom 51 het 19 0 16 3 A 1 0 102332 CASAVA_Build 16 84453331 4D AAAATAAAAC AAAA/---- GAAAAGCAAA 962 het 962 ref 25 13 6 6 A 4 0 102333 CASAVA_Build 16 84469416 1D CCCCATATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 23 1 17 5 A 13 12 102334 CASAVA_Build 16 84470607 1D GCAGCCAGAG A/- AAACCTTATA 3070 hom 46 het 26 0 21 6 A 4 3 102335 CASAVA_Build 16 84522578 1D TCCATAGAGT G/- GGGGGGGTCA 3070 hom 69 het 27 0 20 7 G 8 7 102336 CASAVA_Build 16 84523434 7I CCCTAAACAC -------/GTGCCTG TTATCTTGAG 3070 hom 131 het 49 0 44 5 GTGCCTG 0 1 102337 CASAVA_Build 16 84527142 1D GGCCCAGAGC G/- TGGGTGCCCG 3070 het 3070 hom 44 21 18 5 G 1 0 102338 CASAVA_Build 16 84528858 2D CAAAAAAATT AA/-- AAAAAAAATT 3070 het 2793 hom 18 7 9 2 A 10 8 102339 CASAVA_Build 16 84551567 1I GGAATGGAAA -/G TGGAAGTAAC 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 G 0 1 102340 CASAVA_Build 16 84554892 1D CTCAAAGTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 37 14 15 9 T 7 6 102341 CASAVA_Build 16 84558092 1D CCTTACTCCT C/- CTTTACTTCT 3070 hom 157 het 59 0 53 6 C 2 1 102342 CASAVA_Build 16 84563136 1D GATATCACTA T/- TTGTAAAACC 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 3 2 102343 CASAVA_Build 16 84563638 1D ACCATTACCA C/- CGTGACTACT 3070 het 3070 ref 47 20 13 15 C 2 1 102344 CASAVA_Build 16 84576741 1D AAACGTTGGA G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 61 het 37 1 31 5 G 5 4 102345 CASAVA_Build 16 84577541 1I AGCCACTGTG -/C CCCGGCCCCC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 C 3 4 102346 CASAVA_Build 16 84595863 1I TTGCCCACTT -/A AAAAAATTGC 3070 hom 33 het 16 0 12 6 A 6 7 102347 CASAVA_Build 16 84622234 1I TTCACATCTG -/A ATCTTGCAGT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 1 2 102348 CASAVA_Build 16 84622838 2D GTTATGTTGC AT/-- ATATATATAT 2205 het 22 hom 16 1 6 9 AT 10 9 102349 CASAVA_Build 16 84623181 1D ATTTTATGAC T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 56 30 17 9 T 8 7 102350 CASAVA_Build 16 84650920 5I CACACTCCCC -----/CAGCA CAGCCCACTG 3070 hom 64 het 24 0 18 6 CAGCA 0 1 102351 CASAVA_Build 16 84672246 1I ATTTTGTGCT -/G GGGGAACTGA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 G 4 5 102352 CASAVA_Build 16 84682127 1D CTGGGTTCAA G/- GGGTGGGCTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 G 4 3 102353 CASAVA_Build 16 84685741 1D CCAACCCGGG T/- GGGTTGGGGA 2685 het 2685 ref 27 9 11 7 T 1 0 102354 CASAVA_Build 16 84694918 3D CAACAACAAC AAT/--- AACACCAGCA 3070 het 3070 ref 47 25 17 6 AAT 1 0 102355 CASAVA_Build 16 84698954 21D13M6D37M3I ATTACTACTA CTACCACCATTACTACTACTGCTACTACTACCATTACTACTACTACTACTACTGTTACTGCTGCTACTCCCATTACT---/---------------------CTGCTACCACCAT------TACTACTACTACTGTTACTGCTACTACTACCATTACTACG ACTACTACCA 1135 het 1135 ref 57 81 3 11 N/A 0 0 102356 CASAVA_Build 16 84706015 2I TTATAAAGAC --/AG AGAAGTATGC 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 AG 1 2 102357 CASAVA_Build 16 84707984 1D AGGACTTGAT G/- GAACAGCATA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 G 2 1 102358 CASAVA_Build 16 84710384 6I TTGTAGCAGG ------/AGGGGC TGGGGGCAGT 3033 het 3033 ref 29 12 10 7 AGGGGC 0 1 102359 CASAVA_Build 16 84714501 1D TTTAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 12 11 102360 CASAVA_Build 16 84719228 4I CATTTTGGTT ----/TCTG TTTGTTTGTT 3070 hom 101 het 40 0 32 8 TCTG 0 1 102361 CASAVA_Build 16 84724282 2D ACAGGTGGAG AA/-- AAGAGTGTGA 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 A 4 2 102362 CASAVA_Build 16 84728045 4D CATCTATCTA ATCT/---- ATCTAATAAT 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 ATCT 2 1 102363 CASAVA_Build 16 84728098 4I CTATTATCTG ----/TCTA TCTATCATCA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 TCTA 1 2 102364 CASAVA_Build 16 84731850 1D AATTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 1354 het 732 hom 9 2 4 3 T 5 4 102365 CASAVA_Build 16 84733501 1I AGAACACCAA -/G GGGTTGTAGG 3070 hom 60 het 40 0 19 21 G 3 4 102366 CASAVA_Build 16 84734693 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 286 hom 22 1 15 6 A 13 14 102367 CASAVA_Build 16 84750254 1D CTGGAAGATC A/- GGGGGGGCTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 A 1 0 102368 CASAVA_Build 16 84754391 1D CTCTGCATCA T/- TAGCTGCAGT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 2 1 102369 CASAVA_Build 16 84758583 4D TCCTGAAGCA ATAG/---- ATAATTAAAA 3070 het 3070 hom 54 23 30 3 ATAG 1 0 102370 CASAVA_Build 16 84760893 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2973 hom 27 11 13 3 A 13 12 102371 CASAVA_Build 16 84762555 2D CCTCCCAGAA CC/-- CCCTACACGC 3070 hom 135 het 50 0 39 12 C 5 3 102372 CASAVA_Build 16 84811719 4I TGTTGTATTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 TTTC 2 3 102373 CASAVA_Build 16 84815788 6D TTGCTGTTGT TGGTGA/------ TGGTGATGGT 3070 het 3070 hom 61 21 27 13 TGGTGA 2 1 102374 CASAVA_Build 16 84823775 1I TGTGAAGATT -/C CCCCCCCAGG 2833 het 602 hom 32 6 11 15 C 7 8 102375 CASAVA_Build 16 84830403 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 12 11 102376 CASAVA_Build 16 84833568 2D CTCACCCACA CT/-- CTGACACACT 3070 het 3070 hom 61 25 30 8 CT 2 1 102377 CASAVA_Build 16 84834595 3I CAAATATCAG ---/TGT TGTTTGTATT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 TGT 1 2 102378 CASAVA_Build 16 84842508 1I GCACAACTAG -/T AAAGGATTCA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 T 0 1 102379 CASAVA_Build 16 84849413 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 8 7 102380 CASAVA_Build 16 84865240 2D CGATCCCAGG AA/-- AGTCAGTGAA 3070 hom 120 het 44 0 40 5 A 3 1 102381 CASAVA_Build 16 84871506 1I ATGACAACAT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 7 8 102382 CASAVA_Build 16 84875617 1D CATTAAAAAA T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 75 het 28 0 25 4 T 7 6 102383 CASAVA_Build 16 84884148 3D AAGGAAAAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 27 0 23 6 A 18 15 102384 CASAVA_Build 16 84893017 1D AGACTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 T 10 9 102385 CASAVA_Build 16 84908344 4I TCAATTTGTT ----/CAAA CAGACATCTC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 CAAA 0 1 102386 CASAVA_Build 16 84909670 4D ACTGGGAAAT AAAC/---- AAAAGATTAG 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 AAAC 1 0 102387 CASAVA_Build 16 84917418 1I TATTTAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 633 hom 30 2 23 5 T 13 14 102388 CASAVA_Build 16 84927002 4D TTGCTGGCCT AATG/---- AATGAATGAA 1847 het 1497 hom 18 6 5 7 AATG 6 5 102389 CASAVA_Build 16 84951537 2D CACGTGATAG CT/-- GTGTAGAATG 3070 hom 134 het 50 0 45 6 CT 1 0 102390 CASAVA_Build 16 84961763 1D GTTTGTTTTT G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 9 8 102391 CASAVA_Build 16 84967969 5D CTTGTATTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2934 hom 28 13 9 6 T 15 10 102392 CASAVA_Build 16 85006058 1D ATAAATGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 31 0 25 6 A 11 10 102393 CASAVA_Build 16 85008974 1I ATTTTAAAAA -/G AAAAACATAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 0 1 102394 CASAVA_Build 16 85009325 1I CACTCTGTGT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 8 9 102395 CASAVA_Build 16 85013590 1I GAATCAAGCC -/T TGCTGGTTGC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 2 102396 CASAVA_Build 16 85030425 5D TTCAAGTTGC TTTAA/----- TTTAATTTCC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTTAA 2 1 102397 CASAVA_Build 16 85034705 2I ATCTCACACT --/CA CACACACATA 3070 hom 217 het 79 0 70 9 CA 4 5 102398 CASAVA_Build 16 85047821 4D TCTTTCTTCG TCTC/---- TCTCTTTCTT 3070 hom 80 het 30 0 26 4 TC 4 2 102399 CASAVA_Build 16 85069211 14I AGAAGGAAAA --------------/TGTCAAGTGAGGAC TGTTCACCAC 3070 hom 132 het 48 0 39 9 TGTCAAGTGAGGAC 0 1 102400 CASAVA_Build 16 85074253 2D CCAGTTGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 41 2 27 12 T 14 12 102401 CASAVA_Build 16 85084717 1D TGATGGTCTG C/- CCCCCCCCCC 1053 het 53 hom 20 1 6 13 C 11 10 102402 CASAVA_Build 16 85087870 1I TTAGCCCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 19 0 12 7 A 12 13 102403 CASAVA_Build 16 85092905 1D CACCGAGAGA T/- TTAAATCATT 3070 hom 54 het 20 0 18 3 T 3 2 102404 CASAVA_Build 16 85100428 4D TTTACACGTC TGTT/---- TGCGTAATTT 3070 hom 96 het 38 0 31 8 TGTT 1 0 102405 CASAVA_Build 16 85104502 1I GGGGAAAGCC -/T CCCGCACCCA 2821 het 2129 hom 18 8 8 2 T 0 1 102406 CASAVA_Build 16 85105357 1D ACTACCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 18 0 14 4 T 12 11 102407 CASAVA_Build 16 85111605 1I TATTCCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 27 1 19 7 A 13 14 102408 CASAVA_Build 16 85115135 3D AATGAAGAGC AGA/--- AGGTTTCCCA 3070 hom 114 het 42 0 39 6 AGA 1 0 102409 CASAVA_Build 16 85117522 13I TGAAATCACT -------------/TCCCCCATTTGAA GTCATGTCCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TCCCCCATTTGAA 0 1 102410 CASAVA_Build 16 85118036 1D TTTCCACCCC T/- ATCCCATTTT 3070 hom 120 het 42 0 40 2 T 1 0 102411 CASAVA_Build 16 85126313 2I GGCATCCGCA --/GG GGGGCCGTTA 3070 hom 84 het 30 0 26 4 G 4 6 102412 CASAVA_Build 16 85129338 1I TCATTCCTGC -/T CCCCAGCTCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 0 1 102413 CASAVA_Build 16 85131170 1I AATTTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 14 11 T 10 11 102414 CASAVA_Build 16 85155964 1D TTGCTAGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 25 0 21 4 T 12 11 102415 CASAVA_Build 16 85160727 1D TTCCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 28 1 21 6 A 15 14 102416 CASAVA_Build 16 85177148 1D ACGGCAGGGG A/- TCTTAGGAAA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 1 0 102417 CASAVA_Build 16 85186477 1D ACTTGCTGGA T/- TTTTTGGTGC 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 6 5 102418 CASAVA_Build 16 85187951 14D AGTCATGCTC TAGAATGTCGCACT/-------------- GGAGTTGTGT 3070 het 3070 ref 50 27 24 6 TAGAATGTCGCACT 1 0 102419 CASAVA_Build 16 85188523 3I ACGGCACCGT ---/CAG GTGTAGTTTT 3070 het 3070 ref 41 27 13 1 CAG 0 1 102420 CASAVA_Build 16 85190076 1D GCTGCCTTGC T/- GCTCCCTGCC 3070 het 3070 ref 41 22 12 9 T 1 0 102421 CASAVA_Build 16 85190589 1D CAGTTAAACG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 43 18 17 9 T 8 7 102422 CASAVA_Build 16 85191196 4D AACTAGGTAC AACT/---- AACTATTAGG 3070 het 3070 hom 33 12 20 3 AACT 2 1 102423 CASAVA_Build 16 85191550 8D AGGGATCCTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2758 het 1641 hom 33 10 13 10 T 24 16 102424 CASAVA_Build 16 85193140 4D CAGGGGGAGA TTTT/---- TTTTTTTTTA 2924 het 2924 ref 26 15 7 5 T 13 9 102425 CASAVA_Build 16 85194893 9D TCCTCCTACT CTTTCCTCC/--------- TTCAGCCCCC 3070 het 121 hom 26 1 20 6 CTTTCCTCC 1 0 102426 CASAVA_Build 16 85235138 4D GAGACTGAAG CCAC/---- CCACTGCCCT 3070 hom 129 het 44 0 44 1 CCAC 2 1 102427 CASAVA_Build 16 85241837 9D TCTTTCTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTG 582 het 582 ref 38 6 6 28 T 18 9 102428 CASAVA_Build 16 85248467 5D ACACCCTCTA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2542 het 74 hom 32 3 13 16 T 21 16 102429 CASAVA_Build 16 85262279 1I GGCATCTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1383 hom 33 5 18 10 T 15 16 102430 CASAVA_Build 16 85267876 1I GCAGAGTGTT -/C CCTGCATGGC 3070 hom 92 het 37 0 28 9 C 2 3 102431 CASAVA_Build 16 85288070 1I AATTATGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 A 11 12 102432 CASAVA_Build 16 85292242 1D ACCCATGGTG T/- TCCCCCCTGT 3070 hom 44 het 18 0 12 6 T 2 1 102433 CASAVA_Build 16 85294239 8D CCCACACACA CACACTCC/-------- CACACCCCCA 1225 het 1225 ref 16 10 4 2 CACACTCC 1 0 102434 CASAVA_Build 16 85294619 3I GGAGACAGAA ---/AGT AGAATGGTGG 3070 het 3070 ref 50 22 16 12 AGT 0 1 102435 CASAVA_Build 16 85306334 1I CCTACTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 T 10 11 102436 CASAVA_Build 16 85309105 3D AGGCAGTGAT GAG/--- GAGATCCAAG 1804 het 1804 ref 25 13 6 7 GAG 2 1 102437 CASAVA_Build 16 85315547 4D CTGCTACAAC ATGG/---- ATGAAGCTTG 3070 het 3070 ref 37 20 12 9 ATGG 1 0 102438 CASAVA_Build 16 85316791 1D CTGATCCCAC G/- GGTGCATGGG 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 G 3 2 102439 CASAVA_Build 16 85325843 1I43M2I CTTCCTGCAT -GGGGGTAGGGAAAGGAAATGCTTTAGTGAGATTGCAAAGCAGG--/GGGGGGTAGGGAAAGGAAATGCTTTAGTGAGATTGCAAAGCAGGAA AAAAAAAAAA 3070 het 754 hom 21 3 19 16 N/A 0 0 102440 CASAVA_Build 16 85330095 1D GCCTTACCTC A/- AGGACCTCCT 3070 hom 51 het 21 0 15 6 A 2 1 102441 CASAVA_Build 16 85330494 4D TCTTTCTCTT TCTC/---- TCTTTCTTTT 3070 hom 108 het 40 0 36 5 TC 3 1 102442 CASAVA_Build 16 85336013 3D GAGGACACAA AGG/--- AGGCTTTGGG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 AGG 2 1 102443 CASAVA_Build 16 85341943 3I AAGAAAAAAA ---/AAT GATGTCAGTC 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 AAT 0 1 102444 CASAVA_Build 16 85345343 1D TTTCTTTTTT C/- CGAGACGGAG 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 C 2 1 102445 CASAVA_Build 16 85351586 3D TTTGTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 2418 het 176 hom 17 2 8 7 T 13 10 102446 CASAVA_Build 16 85356282 4D TCTTTCTCTA TCTT/---- TCTTTATTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 6 TCTT 2 1 102447 CASAVA_Build 16 85359704 1I CGTGGCCTCC -/A GGGGCACCCT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 0 1 102448 CASAVA_Build 16 85368966 2D ATGGCAATGA GT/-- TTATGCATTC 3070 het 3070 hom 45 23 21 1 GT 1 0 102449 CASAVA_Build 16 85371085 6I TTTTAGTTTG ------/TTTAAT TTTAATTTAC 2889 het 2889 ref 18 11 6 1 TTTAAT 1 2 102450 CASAVA_Build 16 85377074 3D TCAAAAGAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AAT 7 6 102451 CASAVA_Build 16 85380240 1I TCAGGAAGAA -/G CCCCCTGCTA 3070 hom 69 het 27 0 21 6 G 0 1 102452 CASAVA_Build 16 85386812 1D GAGGTTGAGA C/- CCCCAAAGGC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 C 5 4 102453 CASAVA_Build 16 85387261 2I TTCCACTTCC --/TT TTTTTTCATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 8 102454 CASAVA_Build 16 85393449 12D GTGGTGATGA TGATGATGGTAG/------------ TGATGATGAT 3070 het 3070 hom 69 32 26 19 TGATGATGGTAG 1 0 102455 CASAVA_Build 16 85427969 1D AATTGGGGGT G/- GGGGGGGGGA 2677 het 981 hom 17 3 8 6 G 10 9 102456 CASAVA_Build 16 85445205 6D ACCATCATTA TCATCT/------ TCATCTTCAT 3070 het 3070 ref 49 31 18 1 TCATCT 2 1 102457 CASAVA_Build 16 85487054 1I ATTCCTGACC -/G GGGGGGGGCC 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 G 8 9 102458 CASAVA_Build 16 85543945 3I GACCCCTATC ---/ATT ATTAACCTTC 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 ATT 1 2 102459 CASAVA_Build 16 85563344 2D GTACAGAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 A 13 11 102460 CASAVA_Build 16 85573199 2D AGAAAGAAAG AA/-- AGAAAGAAAG 416 het 416 ref 9 3 2 5 A 3 1 102461 CASAVA_Build 16 85573627 1D GATTTTAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1977 hom 29 7 15 7 T 11 10 102462 CASAVA_Build 16 85577181 2I TGGGCCCTTT --/TC TTAGTTTAGG 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 TC 0 1 102463 CASAVA_Build 16 85584604 1D GATGGCAGGA G/- ACAGGCCTGT 3070 hom 63 het 22 0 21 2 G 1 0 102464 CASAVA_Build 16 85585114 1I GGCTGCCTTT -/G GGGGAGCCCA 3070 hom 74 het 32 0 21 11 G 4 5 102465 CASAVA_Build 16 85592538 1D TCCATAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 12 11 102466 CASAVA_Build 16 85607732 4D AAAAAAAAAG AGAC/---- AGACTGAAGT 2915 het 2915 ref 28 16 9 6 AGAC 2 1 102467 CASAVA_Build 16 85609393 1I CAATAATGAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 9 102468 CASAVA_Build 16 85610218 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 8 7 102469 CASAVA_Build 16 85612477 2I GAGAACAAAC --/AG AGAAGCAAAG 3070 hom 91 het 34 0 31 3 AG 1 2 102470 CASAVA_Build 16 85614100 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 42 het 24 0 15 9 AG 8 7 102471 CASAVA_Build 16 85625406 1D AAAAAAACCC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 7 6 102472 CASAVA_Build 16 85627159 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1906 hom 12 het 5 0 5 0 A 10 11 102473 CASAVA_Build 16 85629815 6D GAAGGGAGAG AGAGAA/------ AGAGAAAGAG 3070 hom 36 het 14 0 12 3 AGAGAA 4 3 102474 CASAVA_Build 16 85641747 1I GCCTTTATCT -/G GCAGACCTCT 3070 hom 96 het 40 0 31 9 G 1 2 102475 CASAVA_Build 16 85648121 2I TCTGGAGCCA --/TG GGCAGGGGTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TG 0 1 102476 CASAVA_Build 16 85649702 17D TTGCCACACT CATGCCTTCTTCTATCA/----------------- CACTCATGCC 3070 het 3070 ref 44 28 17 3 CATGCCTTCTTCTATCA 1 0 102477 CASAVA_Build 16 85653491 1I AGGAAAACGC -/T TTTTTGAGAA 3070 hom 92 het 45 0 40 5 T 5 6 102478 CASAVA_Build 16 85654622 1I AAGAAAACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 9 10 102479 CASAVA_Build 16 85665080 2I TGAGAAGTTC --/AA GTTTATTTTA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 0 2 102480 CASAVA_Build 16 85668692 4D AGGGGAAAAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 105 het 44 0 34 11 AC 9 7 102481 CASAVA_Build 16 85674207 3I AATTTGTATC ---/ATT ATTAGTCAAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 ATT 1 2 102482 CASAVA_Build 16 85679585 1I TCAAAAAAAA -/C AAAAAGAAAA 559 het 124 hom 30 2 6 22 C 0 1 102483 CASAVA_Build 16 85694969 1D TCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 834 hom 20 6 14 0 T 10 9 102484 CASAVA_Build 16 85697186 1I AAGAAATAAA -/C CTCATCTTGT 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 C 1 2 102485 CASAVA_Build 16 85706393 10D GTATGAGATA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 86 hom 36 2 15 21 TG 15 10 102486 CASAVA_Build 16 85714041 4I ATGTGTCACC ----/TAAA TAAATAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TAAA 2 3 102487 CASAVA_Build 16 85715841 2D CACAACACAT AC/-- ACACAACACG 3070 het 69 hom 63 2 53 8 AC 3 2 102488 CASAVA_Build 16 85715914 2D TGCATGAAAC AT/-- ATACACATGC 3070 het 3070 hom 71 32 30 12 AT 2 1 102489 CASAVA_Build 16 85716223 3I CACATGCAAC ---/ACA ACACACACAT 3070 hom 195 het 72 0 65 7 ACA 1 2 102490 CASAVA_Build 16 85722151 1I GGAGCCTGGC -/A AAAAAACACC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 6 7 102491 CASAVA_Build 16 85740700 1D ACTCCATCTC A/- AAGGGGAAAA 2264 het 2264 ref 27 16 8 5 A 3 2 102492 CASAVA_Build 16 85741223 1D TCTAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2356 hom 35 9 15 11 A 15 14 102493 CASAVA_Build 16 85756365 1I TAATTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 1430 het 1430 ref 35 15 6 14 T 15 16 102494 CASAVA_Build 16 85757847 4D ACATTCTCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 627 hom 24 6 10 8 T 18 14 102495 CASAVA_Build 16 85762945 12I TCATGCATGT ------------/GTGTGTGTGCAA GTGTGTGTGC 3070 hom 153 het 62 0 50 12 GTGTGTGTGCAA 0 1 102496 CASAVA_Build 16 85762960 4D TGTGCATGTG TGTA/---- TGTGTGCATG 294 het 294 ref 69 28 4 41 TGTA 1 0 102497 CASAVA_Build 16 85767731 3D ATTCTTTTTC ATT/--- ATTGAGTTGA 3070 het 3070 hom 41 17 18 10 ATT 2 1 102498 CASAVA_Build 16 85769067 1I GAGGGGCACA -/G GGGGCGCAGC 2923 hom 29 het 13 0 10 3 G 4 5 102499 CASAVA_Build 16 85769285 6D ACAGAGACAG AGAGGC/------ AGAGGCAGAA 3070 hom 72 het 30 0 20 10 AGAGGC 2 1 102500 CASAVA_Build 16 85774215 13D CGTGGACTCA TGCAGTATATGGC/------------- TGACATTGTT 3070 hom 72 het 25 0 24 4 TGCAGTATATGGC 1 0 102501 CASAVA_Build 16 85787324 1I ATGCTGGGTA -/G CAGGGGGCTC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 G 0 1 102502 CASAVA_Build 16 85801495 3D11M6D GTGATGGTGA TGGTGGTGATGGTGATGATA/---TGATGATGGTG------ ATGGTGATGA 3070 het 3070 ref 77 42 23 27 N/A 0 0 102503 CASAVA_Build 16 85806824 1I CATAACTCTT -/A ACGTGTACAC 3070 hom 154 het 57 0 52 5 A 1 2 102504 CASAVA_Build 16 85810309 2D AAAGTGTGAC AG/-- GGAGTGTGCA 3070 hom 129 het 48 0 43 9 AG 1 0 102505 CASAVA_Build 16 85810441 2D18M2D25M23D25M2D TGAGTGCATA TGTGTGTTTGTGTGACTGCATGTGTGTGTGTGAATGTGAGATTGTGCTGTGTGAATGTGAGTTTGTGCATGTGTGTGTGAATTCGTGTGAGTGCATG/--TGTGTTTGTGTGACTGCA--TGTGTGTGTGAATGTGAGATTGTGC-----------------------GTGTGTGTGAATTCGTGTGAGTGCA-- TGTGTGTATG 3070 hom 115 het 41 0 37 39 N/A 0 0 102506 CASAVA_Build 16 85830338 3D CTCAGGATCC GTT/--- GTTAACATTT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 GTT 2 1 102507 CASAVA_Build 16 85830879 1I AAAAGTGTCA -/T TTTTTTACCT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 6 7 102508 CASAVA_Build 16 85865138 1I AGAGCATGTG -/A GGGGCCAGCC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 0 1 102509 CASAVA_Build 16 85885712 2D TTCTGCAGTC TT/-- TGACAAATGT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 3 1 102510 CASAVA_Build 16 85892284 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 24 1 14 9 A 14 15 102511 CASAVA_Build 16 85898577 1D ATTAAAAGAT A/- AAAATAGGCC 3070 hom 111 het 39 0 37 2 A 5 4 102512 CASAVA_Build 16 85904301 1I CATGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 28 1 21 7 A 13 14 102513 CASAVA_Build 16 85941016 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2662 het 330 hom 17 2 8 8 A 15 14 102514 CASAVA_Build 16 85954939 3D ATAACTGGAG CAA/--- CAACATCTTC 3070 hom 96 het 33 0 33 1 CAA 2 1 102515 CASAVA_Build 16 85976610 4I CTGCTATCTA ----/TCTG CCAGGGAGAT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 TCTG 0 1 102516 CASAVA_Build 16 85977253 1D AGATCAGGGA C/- CTCAGGAGGC 3070 hom 75 het 31 0 24 7 C 2 1 102517 CASAVA_Build 16 85985387 1I TTTGGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 38 2 30 6 A 11 12 102518 CASAVA_Build 16 85996872 1I AGGGACACTT -/A AAAAAAAAAA 2467 het 493 hom 20 3 12 5 A 13 14 102519 CASAVA_Build 16 86018919 9D TACTTTTTGT ACTTTTTGC/--------- ACTTTTTGCA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 ACTTTTTGC 2 1 102520 CASAVA_Build 16 86020006 2D CATTACTGCC GG/-- GGGTGGTATT 3070 hom 81 het 30 0 27 5 G 5 3 102521 CASAVA_Build 16 86036178 1D CAAAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 127 hom 29 1 17 11 T 15 14 102522 CASAVA_Build 16 86037591 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 28 2 16 10 A 15 16 102523 CASAVA_Build 16 86049208 1D AATTATACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 597 hom 24 2 17 6 A 14 13 102524 CASAVA_Build 16 86053845 1D TCTATCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 14 13 102525 CASAVA_Build 16 86092048 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 8 9 102526 CASAVA_Build 16 86099354 1I CCATTATCAA -/T TGGACTTGGG 3070 hom 99 het 37 0 31 6 T 1 2 102527 CASAVA_Build 16 86115448 1I CCTACACACC -/A CTCAGGTTCT 2384 het 2384 ref 22 13 7 2 A 0 1 102528 CASAVA_Build 16 86155669 10D ATGTGTGTGT GTGGGTGTGG/---------- GTGTGTGTGT 3070 hom 122 het 48 0 40 17 GTGGGTGTGG 1 0 102529 CASAVA_Build 16 86160973 1I GGTTGCTTCC -/A ACCTTTTGGC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 102530 CASAVA_Build 16 86164832 1I CAGCCACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 16 7 T 10 11 102531 CASAVA_Build 16 86165333 2D GTCCTCAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 2166 het 239 hom 24 6 6 13 T 16 14 102532 CASAVA_Build 16 86170602 1I TCAGCCTCCC -/A AAAGTGCTGG 1764 het 1531 hom 14 5 4 5 A 3 4 102533 CASAVA_Build 16 86171295 1D CCTCCAGCCT G/- GGTGACAGAG 1755 het 256 hom 20 1 6 13 G 3 2 102534 CASAVA_Build 16 86171433 1D CAGGGGTGTT G/- GGGGGGGGGC 1872 het 1872 ref 25 10 7 8 G 10 9 102535 CASAVA_Build 16 86174391 4I ACTAATACAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 64 18 26 20 AC 6 8 102536 CASAVA_Build 16 86183655 1D TATACCCAAG A/- AAATTGAAAA 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 A 4 3 102537 CASAVA_Build 16 86190248 1D AACAATCTTC T/- TTTTTTTTTT 2927 het 46 hom 33 1 14 18 T 20 19 102538 CASAVA_Build 16 86192337 5D GAGGTGACTG TCCTC/----- CTGGCTGCTG 3070 het 3070 ref 33 15 13 8 TCCTC 1 0 102539 CASAVA_Build 16 86213208 1D CCAGGTGTCA G/- GGGGGGGCCC 2972 het 1571 hom 27 6 10 12 G 8 7 102540 CASAVA_Build 16 86221600 6D CTCAGGTCTT CACCCA/------ CACCCACGTT 3070 het 3070 ref 54 30 24 2 CACCCA 2 1 102541 CASAVA_Build 16 86229689 1D GGAGGGGACA G/- GGGCAGGGCT 3070 hom 91 het 35 0 27 8 G 4 3 102542 CASAVA_Build 16 86234957 2I TTTCATCAAG --/GT ATAGCACACC 3070 het 3070 ref 56 30 21 5 GT 0 1 102543 CASAVA_Build 16 86240891 13I CCCAGGGTGA -------------/AGGTTCATGGCCC AGGAGACATC 3070 het 1655 hom 22 5 11 6 AGGTTCATGGCCC 0 1 102544 CASAVA_Build 16 86246445 20D ACAAATAATT TTATTTTTTGTGACAGGGTG/-------------------- TTATTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 15 8 9 TTATTTTTTGTGACAGGGTG 2 1 102545 CASAVA_Build 16 86270413 1I GTCTAAAGAT -/A AAGAGAGGGG 3070 hom 83 het 29 0 28 1 A 2 3 102546 CASAVA_Build 16 86335524 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2004 het 1063 hom 25 7 8 10 A 17 16 102547 CASAVA_Build 16 86342592 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 10 11 102548 CASAVA_Build 16 86350009 1D TTGGCCAGGC G/- CATTGGCTCA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 G 1 0 102549 CASAVA_Build 16 86397304 1I GAGGCCCCTG -/C CCCCTACCTC 586 het 586 ref 24 13 5 6 C 4 5 102550 CASAVA_Build 16 86397315 1D CCCTACCTCG C/- CCCCTCCAAG 239 het 239 ref 17 10 2 7 C 5 4 102551 CASAVA_Build 16 86400266 1D ACTGGTATTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 128 het 50 0 42 8 T 10 9 102552 CASAVA_Build 16 86400989 2I CTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 52 het 22 0 16 6 AG 1 2 102553 CASAVA_Build 16 86402132 6D12M12D CCTGGGCAAC AGAGTGAGACTCCAACTCAAAAAAAAAAAA/------AGACTCCAACTC------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 11 0 10 2 N/A 0 0 102554 CASAVA_Build 16 86402475 1I CCGACTCTTA -/C CCCTATGGAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 3 4 102555 CASAVA_Build 16 86418609 3I CTTGAAAAGG ---/TTA TTGCAGGCCG 3070 hom 78 het 30 0 25 5 TTA 0 1 102556 CASAVA_Build 16 86422773 14D GATCCTGCGG GGTCTTCTTGTTCT/-------------- GGGGGTCCCT 41 het 41 ref 17 3 1 15 GGTCTTCTTGTTCT 1 0 102557 CASAVA_Build 16 86424965 1D TCCTTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 1433 hom 9 het 12 0 5 7 T 15 14 102558 CASAVA_Build 16 86433977 10I AGCACCTCGG ----------/CCAAGACGCC CACAGCCCCT 3070 hom 109 het 41 0 34 7 CCAAGACGCC 0 1 102559 CASAVA_Build 16 86462210 1I ACTGAGTCCT -/C CCCCTAGACA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 C 4 5 102560 CASAVA_Build 16 86469024 3D GTTAATGTGA TGT/--- TATGTGTGAA 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 TGT 1 0 102561 CASAVA_Build 16 86473415 16D TTCTCCTGGG TTTTAAGGTTCAGGAC/---------------- TTTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 8 TTTTAAGGTTCAGGAC 1 0 102562 CASAVA_Build 16 86485681 1D CCAGTTAATT A/- AAAAAAAAAA 2297 het 2297 ref 28 12 9 7 A 13 12 102563 CASAVA_Build 16 86501192 4D AAGCACTCTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 34 11 10 13 AAAC 4 3 102564 CASAVA_Build 16 86508781 2I GAGACACATG --/CA CACACAGTGC 3070 hom 174 het 67 0 57 10 CA 3 4 102565 CASAVA_Build 16 86541548 1D ACGTCATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1588 hom 37 10 15 12 T 13 12 102566 CASAVA_Build 16 86543142 2I CGCTCTCGGG --/GC GACCGCAGAC 3070 hom 43 het 17 0 14 3 GC 0 1 102567 CASAVA_Build 16 86544300 1I CTATGTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 A 10 11 102568 CASAVA_Build 16 86549709 1I AGCGGAAACT -/G GGAGGATCAC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 2 3 102569 CASAVA_Build 16 86555544 11D CCGAGGCGTC CAGGAGGCGTG/----------- CAGGAGGCGT 3070 hom 82 het 33 0 26 8 CAGGAGGCGTG 2 1 102570 CASAVA_Build 16 86555712 1D AGCCCTCGGA G/- GGCTTAGAGC 3070 hom 65 het 24 0 20 5 G 3 2 102571 CASAVA_Build 16 86555827 1I CGTATGTGAG -/C CAGGTCTGAG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 C 1 2 102572 CASAVA_Build 16 86559188 1D TTTTTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3043 het 2567 hom 16 7 7 3 T 11 10 102573 CASAVA_Build 16 86562364 14I TAGCACATAG --------------/CCTTGCATGCTGTT CCTTCATCTC 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 CCTTGCATGCTGTT 0 1 102574 CASAVA_Build 16 86563429 1D ATATTCTGAG T/- TCTAGCACCT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 2 1 102575 CASAVA_Build 16 86563572 1D GGGATATATG T/- TTCTAGAATG 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 3 2 102576 CASAVA_Build 16 86564367 1D TCATCAGCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 10 9 102577 CASAVA_Build 16 86564861 7D ACTCCATCAC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2069 het 652 hom 26 7 11 9 A 21 14 102578 CASAVA_Build 16 86566214 1I GCCACTCTCC -/T GTGCTCTGGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 0 1 102579 CASAVA_Build 16 86569579 2I CAGTGAGAGT --/AA AGAGCCTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 A 1 3 102580 CASAVA_Build 16 86570598 1D GGCTGGACAG A/- AGGTTGTTAG 3070 het 3070 ref 28 10 8 10 A 2 1 102581 CASAVA_Build 16 86577674 5D GTTTCTAGTT TAAGA/----- TAAGAGGAAG 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 TAAGA 2 1 102582 CASAVA_Build 16 86584730 2D CTTTTGAGAC AG/-- AGTTTTGTTC 3070 hom 28 het 19 0 8 11 AG 2 1 102583 CASAVA_Build 16 86586145 1D TTATGGCCTT G/- GGGGTCCTCA 3070 hom 102 het 41 0 34 8 G 5 4 102584 CASAVA_Build 16 86593021 1D CCTAAGTGCT A/- AAAAAAAACA 3070 het 299 hom 40 2 35 3 A 9 8 102585 CASAVA_Build 16 86602022 25I GAAAGGAGAG -------------------------/CATTTAGCTACAAACATGCCTCGAA CATTTATTTA 3070 het 3070 ref 67 33 31 8 CATTTAGCTACAAACATGCCTCGAA 0 1 102586 CASAVA_Build 16 86625580 1I GATTCTTTGA -/T TTTTTTTTGA 2154 het 2154 ref 15 9 5 1 T 8 9 102587 CASAVA_Build 16 86625717 4I AGCCACACAC ----/TGCT TGCGTAGCCT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 TGCT 0 1 102588 CASAVA_Build 16 86631363 1D GTGGAAATCC T/- TTTTTTTTTT 1780 het 1616 hom 26 13 6 7 T 16 15 102589 CASAVA_Build 16 86632802 1I CATCCTCTGG -/C TTCTTTGCCA 3070 hom 48 het 17 0 13 4 C 0 1 102590 CASAVA_Build 16 86644681 3D CCATCATCTC CAT/--- CATCATCATC 3070 het 3070 ref 57 23 12 24 CAT 5 4 102591 CASAVA_Build 16 86647569 1D ATTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1777 hom 40 12 16 12 T 15 14 102592 CASAVA_Build 16 86649834 3D GGTTGTAATT AAG/--- AAGCAACTCG 3070 het 3070 hom 29 13 12 5 AAG 2 1 102593 CASAVA_Build 16 86652778 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2529 het 2529 ref 27 9 8 10 T 11 12 102594 CASAVA_Build 16 86660008 1I GTCCCCAGCC -/T TGTGGTCTGA 3070 hom 77 het 30 0 25 5 T 1 2 102595 CASAVA_Build 16 86663418 1D CGTGACTCTT C/- CTGTGCAGAG 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 C 2 1 102596 CASAVA_Build 16 86665323 1I GAAGCCCCCA -/T CCCCAGTCAT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 0 1 102597 CASAVA_Build 16 86667026 4D CTAATTTTTG TATT/---- TATTGTAGAG 2856 het 2856 ref 31 21 9 3 TATT 2 1 102598 CASAVA_Build 16 86673119 1I TTACATGCAC -/G CATATGTCCA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 0 1 102599 CASAVA_Build 16 86674767 4D GCAAAGAGAG TGTC/---- TGGGCATTGG 2021 het 2021 ref 23 15 6 3 TGTC 1 0 102600 CASAVA_Build 16 86674838 1I AGTGCTGCCT -/G GGGGGGTGTG 3070 hom 39 het 16 0 11 5 G 6 7 102601 CASAVA_Build 16 86676957 1I CTTAAAAAAT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 1721 hom 15 5 9 1 A 8 9 102602 CASAVA_Build 16 86686400 1I GGCACTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 20 3 14 3 T 14 15 102603 CASAVA_Build 16 86698266 1I GGAAAAGGCT -/C CCCCAAATGC 3070 hom 6 het 22 1 15 6 C 4 5 102604 CASAVA_Build 16 86702627 1I TACCCATTAA -/C CATCCCCCCC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 1 2 102605 CASAVA_Build 16 86715700 1D TTGTTTTTGG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 9 8 102606 CASAVA_Build 16 86720542 1I GCACATACCG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 8 9 102607 CASAVA_Build 16 86730287 1I TGCATCCCAC -/A ATGCTGGAAG 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 1 2 102608 CASAVA_Build 16 86736269 1I TAACGATTAC -/A AAAAAAAAAA 2812 het 2812 ref 23 11 8 4 A 11 12 102609 CASAVA_Build 16 86745107 1I GCCTAATTAA -/G GCCTCAAGGT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 G 1 2 102610 CASAVA_Build 16 86746550 2I CAAAAGGAAA --/CT CTGTCCCCAC 2177 het 2177 ref 38 22 5 11 CT 1 2 102611 CASAVA_Build 16 86749668 1I TCTCTGCTGT -/C CCCGGCAGCC 2788 het 1561 hom 19 8 6 5 C 3 4 102612 CASAVA_Build 16 86750335 5I TCACCGTCCT -----/GCTAG GCAGCGTCTG 3070 hom 79 het 32 0 23 9 GCTAG 0 1 102613 CASAVA_Build 16 86753471 1D GACATTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1574 hom 21 5 10 7 A 17 16 102614 CASAVA_Build 16 86754283 4I ATGGGTAGAC ----/AGAT GGATGGATGG 3070 het 1964 hom 50 18 12 20 AGAT 0 1 102615 CASAVA_Build 16 86776052 1D CCCTCACACT C/- ATGTGAACAC 3070 het 3070 hom 56 18 30 8 C 1 0 102616 CASAVA_Build 16 86776252 2I ACCCATGTGC --/AG ACACTCACAC 2679 het 2679 ref 24 11 10 3 AG 0 1 102617 CASAVA_Build 16 86776323 4D CACGCATAGA CACT/---- CACATTCACA 2827 het 2827 ref 40 30 7 3 CACT 1 0 102618 CASAVA_Build 16 86776590 2D CATTTGCACA CT/-- CACATGACTA 3070 het 3070 ref 56 31 20 7 CT 1 0 102619 CASAVA_Build 16 86776984 2D ATAGTATATG CA/-- CACACACACT 3070 het 3070 ref 64 38 13 16 CA 5 4 102620 CASAVA_Build 16 86805580 2I TTCTTTTGAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 10 12 102621 CASAVA_Build 16 86808263 1I ATTGAATACT -/A AACACGGTGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 2 3 102622 CASAVA_Build 16 86816700 1I CTGTGTCTGT -/G GGCCCCCAAA 3070 hom 67 het 30 0 20 10 G 2 3 102623 CASAVA_Build 16 86827238 1D CAAGGCAATA G/- ATGGCAAATG 2738 het 2738 ref 40 32 6 3 G 1 0 102624 CASAVA_Build 16 86835275 4I TGTGTGGATG ----/AACA GACAGATAGG 3070 het 3070 ref 47 24 12 11 AACA 0 1 102625 CASAVA_Build 16 86837294 1D ATGTTCATAA C/- CCCAACTCTA 2736 het 2736 ref 48 35 7 6 C 4 3 102626 CASAVA_Build 16 86839640 1I CCCCTGTCTC -/G AAAAAAACAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 0 1 102627 CASAVA_Build 16 86840334 1I GCTTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 21 12 A 11 12 102628 CASAVA_Build 16 86843156 2D CTGCCAGCTT TG/-- GGCTCTGTCC 3070 het 3070 ref 49 33 9 7 TG 1 0 102629 CASAVA_Build 16 86849767 1D GAGATTTGAG C/- GTTTGGGTGA 3070 hom 60 het 23 0 20 4 C 1 0 102630 CASAVA_Build 16 86879957 2D AGTTTCACAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 102 het 46 0 34 14 GA 8 7 102631 CASAVA_Build 16 86880338 3I GAGGGTGATG ---/ATA ATGATGATGA 3070 hom 177 het 82 0 57 25 ATA 0 1 102632 CASAVA_Build 16 86880550 3D TGATGATGAT ATG/--- ATGATGATGA 3070 hom 150 het 64 0 50 14 ATG 4 3 102633 CASAVA_Build 16 86922325 3I CACAACCGTC ---/ACT ACCACCACCA 3070 het 3070 ref 90 41 29 20 ACT 0 1 102634 CASAVA_Build 16 86945739 1I CCGCGCCCGG -/C CCCCCAGCTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 5 6 102635 CASAVA_Build 16 86971802 1D TGATGCCAGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 11 13 10 A 9 8 102636 CASAVA_Build 16 86974901 2D GCACTCACAC AG/-- ACATGCACTC 3070 het 3070 ref 63 32 19 13 AG 1 0 102637 CASAVA_Build 16 86985414 1I CCCAAGGCAA -/G GGGTGTCCCT 3070 het 2530 hom 22 9 9 4 G 3 4 102638 CASAVA_Build 16 86991393 1I AATTTCAGGA -/T TCTCAGGGGG 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 T 1 2 102639 CASAVA_Build 16 86997411 1I ACAGGGCAGA -/G GGGCTCCAGG 1926 het 187 hom 15 3 7 5 G 3 4 102640 CASAVA_Build 16 86998084 1I CATGTCACAG -/C CCCCACACCC 3056 het 3056 ref 28 10 10 8 C 4 5 102641 CASAVA_Build 16 87034101 1D GCTTCCTTGA T/- TTTTTTTTTT 2357 het 844 hom 14 3 6 5 T 11 10 102642 CASAVA_Build 16 87070982 2D AGCCCTGAAA GT/-- GAGTTCTGGT 2945 het 2945 ref 33 15 9 10 GT 1 0 102643 CASAVA_Build 16 87097852 1I TTCCATTCTT -/A GGGGGTAGCA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 A 0 1 102644 CASAVA_Build 16 87114102 8D GGTGGATGGG TGGGTAGA/-------- TGGGTAGATG 3070 het 3070 hom 54 18 20 19 TGGGTAGA 2 1 102645 CASAVA_Build 16 87120360 8I AGTGGGGAGA --------/ACACAGAT ACACAGATAC 3070 het 3070 ref 38 16 12 11 ACACAGAT 1 2 102646 CASAVA_Build 16 87122655 1D GTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTCG 3070 hom 98 het 40 0 32 8 T 9 8 102647 CASAVA_Build 16 87124624 2I CCCTGCAGCA --/AC AGAGTCCCCC 3070 hom 52 het 19 0 15 4 AC 0 1 102648 CASAVA_Build 16 87139785 2D CTTTGAAGAT GG/-- GGGGGGTGCC 3070 het 3070 hom 38 10 17 13 G 8 6 102649 CASAVA_Build 16 87150380 1D CACTTCCCCC G/- CCCCCCACTT 3049 het 22 hom 22 1 12 9 G 1 0 102650 CASAVA_Build 16 87169077 1D CATTAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 927 hom 18 2 14 2 A 12 11 102651 CASAVA_Build 16 87186798 3D GTATTATTTA TTT/--- TTATTATTCG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 5 2 102652 CASAVA_Build 16 87189715 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2155 hom 21 9 9 4 A 13 12 102653 CASAVA_Build 16 87211194 1D TTGACCAGCT C/- CCCCCTGGAC 3070 het 3070 hom 40 15 13 12 C 6 5 102654 CASAVA_Build 16 87222455 1D CAGGGTGCTT C/- CCCTGGAACG 1808 het 1808 ref 20 9 5 6 C 4 3 102655 CASAVA_Build 16 87236327 1I GATTGGATGT -/G GGGGTGTGGG 3070 het 3065 hom 27 9 10 8 G 4 5 102656 CASAVA_Build 16 87242323 1D CCCAAATGGA C/- CCCCTTGTCA 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 C 5 4 102657 CASAVA_Build 16 87255852 2I TATACAGGTG --/TA TATATATATA 3070 het 752 hom 17 4 12 1 TA 6 7 102658 CASAVA_Build 16 87271132 14D GTACCATGGG TGGACAGAGGCCCA/-------------- GACCCTCTGC 3070 het 3070 ref 37 18 18 3 TGGACAGAGGCCCA 1 0 102659 CASAVA_Build 16 87271736 3D ATCACCAATC GTG/--- GGCTCTCCCA 3070 het 3070 hom 40 12 17 13 GTG 1 0 102660 CASAVA_Build 16 87273491 1D TAACATGGTG A/- AAACCCCATC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 4 3 102661 CASAVA_Build 16 87296063 23I GCTCGCACAC -----------------------/CCTCCTGCTGCTATCTACAACCG CCTCCCGCTC 3070 hom 41 het 16 0 11 5 CCTCCTGCTGCTATCTACAACCG 0 1 102662 CASAVA_Build 16 87305924 15D AGTGCTGATG GTGAGCGGGGGCCCA/--------------- GGGGCCGACT 3070 het 895 hom 22 5 12 8 GTGAGCGGGGGCCCA 1 0 102663 CASAVA_Build 16 87307454 2I GTCCTGCGGC --/CT CTCGGATGGT 3070 hom 65 het 28 0 18 10 CT 1 2 102664 CASAVA_Build 16 87308136 6D ACTGTGTACA GGTGTG/------ GGTGTGTGTG 3070 hom 89 het 32 0 26 7 GGTGTG 2 1 102665 CASAVA_Build 16 87312034 3I CCCCAGAGAA ---/GAT GATACACAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 GAT 1 2 102666 CASAVA_Build 16 87315109 3D CTGGGCCCTC CTT/--- CTTCCTTCTT 1282 het 1282 ref 22 10 6 8 CTT 2 1 102667 CASAVA_Build 16 87332426 1D TCAGGGAACT C/- CCAAGACCCC 3070 hom 54 het 22 0 16 8 C 3 2 102668 CASAVA_Build 16 87333756 6D CCACCCACAG CCTGGC/------ CCTGGCCCTG 2212 hom 21 het 14 0 8 6 CCTGGC 3 2 102669 CASAVA_Build 16 87339243 3I CCTTCAGCCT ---/TTG TTCCTGAACC 3070 hom 39 het 18 0 12 6 TTG 0 1 102670 CASAVA_Build 16 87342384 1I TGGTTCCCAA -/G GGGGGGTCTC 1369 het 23 hom 19 0 6 13 G 6 7 102671 CASAVA_Build 16 87346782 8D TTCACTCATT CATTCATC/-------- CATTCATCCA 3070 hom 36 het 18 0 11 7 CATTCATC 3 2 102672 CASAVA_Build 16 87351457 1D AAGTGGAGCC A/- ATGGGCTGGA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 A 2 1 102673 CASAVA_Build 16 87376754 4D GTCCCGGCCA GCAG/---- GCAGGCAGGC 3070 hom 60 het 25 0 18 7 GCAG 4 3 102674 CASAVA_Build 16 87395315 2I AGAAATACAT --/TA TGTTTGTTTA 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 TA 0 1 102675 CASAVA_Build 16 87408985 1I AACCCCGGAC -/T CCCAACCAAT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 0 1 102676 CASAVA_Build 16 87411158 3D GGCTGGACAA GAC/--- GACGACGCAT 2889 het 2889 ref 34 13 11 11 GAC 3 2 102677 CASAVA_Build 16 87413440 3I GTTGCTTTAA ---/TCT TCTTGTTTAT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 TCT 1 2 102678 CASAVA_Build 16 87427338 1D CCTCCCTCCC T/- TTCTTTCCTT 176 het 176 ref 20 8 1 11 T 3 2 102679 CASAVA_Build 16 87437661 4I29M2D TCCATTTCCG ----CTAAGGCCACCTGGCCTGTGGTAACGTGTTA/CTGTCTGAGGCCACCTGGCCTGTGGTAACGTGT-- TGTCTCAGGA 3070 het 3070 ref 24 16 12 5 N/A 0 0 102680 CASAVA_Build 16 87444974 1D CAGCTCTCAT C/- TGCTGACCCT 3070 het 3070 ref 35 19 10 9 C 1 0 102681 CASAVA_Build 16 87586584 1D AGCCCAGCCA G/- GCCGCCTCCT 1999 hom 34 het 15 0 8 7 G 2 1 102682 CASAVA_Build 16 87601340 1I46M1D CTTCAGAACA -CCACGGGGCAGAAGAAAACCTGACTTCCTACTCCTGTGGCTGAGAAG/CCCACGGGGCAGAAGAAAACCTGACTTCCTACTCCTGTGGCTGAGAA- GCCTCTGGCC 3070 hom 46 het 20 0 18 12 N/A 0 0 102683 CASAVA_Build 16 87601699 1I GGTTCCCAGT -/G GGACACAGGG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 2 3 102684 CASAVA_Build 16 87619000 2D ATCGCAGAGG CA/-- CACACACACA 1020 het 1020 ref 57 40 3 15 CA 8 7 102685 CASAVA_Build 16 87668165 14D ACGTGTGGAC CTGTCACGTGTGGA/-------------- CTGTCACGTG 3070 het 3070 ref 69 30 19 24 CTGTCACGTGTGGA 2 1 102686 CASAVA_Build 16 87676540 1I GAATTAAAGA -/T TTTTAAAAGT 3070 het 2975 hom 21 8 9 5 T 4 5 102687 CASAVA_Build 16 87681303 1I GTCTGGCTAC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3023 hom 24 8 12 4 T 8 9 102688 CASAVA_Build 16 87690146 3I TGAAGCTGGC ---/TGA TGAGGGTGGA 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 TGA 1 2 102689 CASAVA_Build 16 87691683 1D ACAGCTGTGG A/- GGGCTTCTAG 3070 hom 69 het 30 0 23 7 A 1 0 102690 CASAVA_Build 16 87694577 19I CCAGCTCGGC -------------------/CCCAGGAGGCTCCCGGGAG CGCCTGTCAG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 CCCAGGAGGCTCCCGGGAG 0 1 102691 CASAVA_Build 16 87696721 2D CGCCTTTCCC CT/-- GTCGGGGCCA 3070 hom 45 het 18 0 14 4 CT 1 0 102692 CASAVA_Build 16 87704041 1I TTCATTTTAT -/A AAAAAAAATT 2938 het 2938 ref 21 11 8 2 A 8 9 102693 CASAVA_Build 16 87712471 4I CGTGCTCGGA ----/AGAG AGAGAGAGAA 3070 hom 74 het 28 0 23 5 AG 4 6 102694 CASAVA_Build 16 87716408 1D TTCCTGGCTC T/- CAAGTCTGTG 3070 het 2664 hom 27 7 17 3 T 1 0 102695 CASAVA_Build 16 87718313 2D GCACTGCTCA TG/-- TGTGTGTTAC 3070 het 3070 hom 67 30 30 8 TG 4 3 102696 CASAVA_Build 16 87718401 4I71M2D ACACACTGAG ----TGTGTGTTACCTGTGCACATGCTGCATGTATGTGTGTGTGTTACCCATCTGCTCACTGTATGTATGTGTGTGA/TGTATGTGTGTTACCTGTGCACATGCTGCATGTATGTGTGTGTGTTACCCATCTGCTCACTGTGTGTATGTGTGT-- GATACCCATG 3070 het 3070 ref 84 88 54 15 N/A 0 0 102697 CASAVA_Build 16 87718589 2D14M2I CGTGTGTCAC ATATGCACACACTGCA--/--ATGCGCACACTGCATG TGTGTGTGTG 3070 het 2174 hom 71 11 33 36 N/A 0 0 102698 CASAVA_Build 16 87718697 2D CGCACACTGC AT/-- GTGTGTGTGA 3070 het 3070 ref 73 38 24 13 AT 1 0 102699 CASAVA_Build 16 87720909 5D TATTGATGGA CTTTT/----- CTTTATTAGG 3070 het 3070 hom 39 19 18 4 CTTTT 1 0 102700 CASAVA_Build 16 87721040 4D AGCATATTGC TGAG/---- TATTTTTGCA 3070 het 3070 ref 40 23 12 8 TGAG 1 0 102701 CASAVA_Build 16 87722882 1D AAAAAGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 39 1 28 11 A 11 10 102702 CASAVA_Build 16 87737791 1D GTGGTGAGGT G/- GATGGATGGG 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 G 2 1 102703 CASAVA_Build 16 87741432 6D CACAGAGTGA GCGGGG/------ GGGGGGGGAG 1659 hom 10 het 4 0 4 1 GCGGGG 1 0 102704 CASAVA_Build 16 87748475 4I CACAAAAAAC ----/AAAT AAAGACTCCA 3070 hom 47 het 17 0 14 3 AAAT 0 1 102705 CASAVA_Build 16 87749686 2D TACATTTGCA TC/-- TCTCTCCTTT 3070 het 3070 hom 32 7 18 8 TC 4 3 102706 CASAVA_Build 16 87751468 2I GTATGTGTCT --/CA CACGCCTGCA 3070 het 3070 ref 62 25 17 20 CA 1 2 102707 CASAVA_Build 16 87751497 2D TGCATGTGTG TC/-- TCACGCCTGC 1398 het 1398 ref 71 38 6 28 TC 2 1 102708 CASAVA_Build 16 87751777 2I GCATGTCACA --/TG TGTGTCTCAC 3070 het 3070 hom 79 27 35 17 TG 2 3 102709 CASAVA_Build 16 87752300 4I ATGTATGTCT ----/CACA CACGCCTGCA 3070 het 3070 ref 81 63 9 9 CA 1 3 102710 CASAVA_Build 16 87755529 3D AGCAGAGGGG TCT/--- TCTTCTTGCC 3070 het 3070 ref 42 22 12 9 TCT 3 2 102711 CASAVA_Build 16 87757955 1I CCCCACGGAT -/C CCCCGAGGCC 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 C 4 5 102712 CASAVA_Build 16 87759315 28I GATGAGGCAG ----------------------------/AGACCTGGATTGCAGGCCAGGCGGCAGC CCCCTGGACT 3070 het 1362 hom 19 6 10 4 AGACCTGGATTGCAGGCCAGGCGGCAGC 0 1 102713 CASAVA_Build 16 87815115 2D CCTGATACAC AG/-- TGTGTGTATC 3070 hom 110 het 46 0 32 15 AG 1 0 102714 CASAVA_Build 16 87817783 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 2738 hom 26 het 16 0 9 7 A 10 9 102715 CASAVA_Build 16 87818712 4I GTTCTCCAAG ----/GTGA GTAAGTGTGA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 GTGA 0 1 102716 CASAVA_Build 16 87819447 1I TTTTAGGTCA -/T TTCTTCTTTC 3070 het 37 hom 32 1 26 5 T 2 3 102717 CASAVA_Build 16 87826556 1I ATTATGTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 102718 CASAVA_Build 16 87829191 3D CCGTTTTCAC ACA/--- ACGAGTGGGA 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 ACA 1 0 102719 CASAVA_Build 16 87830981 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2774 hom 20 het 9 0 8 3 A 11 10 102720 CASAVA_Build 16 87835601 11D TTTCTTTTTC TTTTCTTTTCT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 1314 hom 35 9 18 10 TTTTCTTTTCT 1 0 102721 CASAVA_Build 16 87850809 1I GACAGCAGGG -/A CAGGCGCGCT 3070 het 2111 hom 23 8 11 4 A 0 1 102722 CASAVA_Build 16 87866730 1I ATTCAGCCAC -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 A 6 7 102723 CASAVA_Build 16 87883196 1I AAAATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 10 11 102724 CASAVA_Build 16 87886481 1D CAAGCCTGCA G/- GAAGGCACAC 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 G 2 1 102725 CASAVA_Build 16 87906552 1I GAGCCCATGT -/G GGGCCCACAG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 G 3 4 102726 CASAVA_Build 16 87908196 2I AACAAAAAAC --/CA CACACATACA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 CA 3 4 102727 CASAVA_Build 16 87912478 1I GACCCATCTG -/T TGAGTGGCAG 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 T 1 2 102728 CASAVA_Build 16 87921619 2I TGAAATAAAG --/AC ACAGTACCAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AC 1 2 102729 CASAVA_Build 16 87922062 2D CCGCAATGAG AT/-- ATTACTGCAC 3070 het 3070 hom 54 20 30 6 AT 2 1 102730 CASAVA_Build 16 87923538 1D GGAATAAAGT A/- AAAAAACAGT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 7 6 102731 CASAVA_Build 16 87957391 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2534 hom 16 6 9 1 A 12 11 102732 CASAVA_Build 16 87968247 1I GTGTTTTTGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 8 9 102733 CASAVA_Build 16 87974469 1I AGCCCCAGGA -/C CCTGCCCGCT 2794 het 2794 ref 21 11 8 2 C 2 3 102734 CASAVA_Build 16 87988539 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2096 hom 29 9 14 6 A 13 12 102735 CASAVA_Build 16 87990868 3D AGCACTGGTG GGA/--- TTATAGGCAT 3070 het 2587 hom 29 6 16 8 GGA 1 0 102736 CASAVA_Build 16 87993719 1D TAAAGTCTAC T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 45 het 20 0 14 6 T 7 6 102737 CASAVA_Build 16 88005234 1I CCCTGCACAC -/A AGCGGTGGGA 2815 het 2815 ref 31 16 10 5 A 1 2 102738 CASAVA_Build 16 88030324 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 11 8 A 11 10 102739 CASAVA_Build 16 88032234 1I ATAGGGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2192 hom 28 7 13 8 T 12 13 102740 CASAVA_Build 16 88037267 2I AATTCGAACA --/AC ACAGAGACGA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 AC 1 2 102741 CASAVA_Build 16 88043791 2I TGATCAAAGT --/CA CATAGACAGG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 CA 1 2 102742 CASAVA_Build 16 88050867 9D TATGTGAGTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1947 het 1947 ref 23 10 8 5 T 20 11 102743 CASAVA_Build 16 88051496 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 1810 het 467 hom 14 5 5 4 A 15 16 102744 CASAVA_Build 16 88057722 3I CAATAGACTG ---/TTA TTAAGTTTAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TTA 1 2 102745 CASAVA_Build 16 88061178 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 473 hom 33 4 22 8 A 12 11 102746 CASAVA_Build 16 88063459 5D TCTTTTGAAC ACCGT/----- ACTGGAGATT 3070 het 3070 ref 19 10 8 2 ACCGT 1 0 102747 CASAVA_Build 16 88063843 1I TTTGACGGAG -/T CTCACTCTGT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 0 1 102748 CASAVA_Build 16 88064432 3D GAAAGGAGGG TAA/--- ATACTAAAGT 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 TAA 1 0 102749 CASAVA_Build 16 88064667 4D GGTAGTACCA GGCG/---- GGTGGATCAC 1968 het 649 hom 9 4 5 0 GGCG 1 0 102750 CASAVA_Build 16 88067089 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2700 het 2700 ref 45 23 12 10 A 12 13 102751 CASAVA_Build 16 88070755 2D TGTGGAAAAG AC/-- ACAGTCCTGA 3070 het 3070 hom 51 18 27 8 AC 2 1 102752 CASAVA_Build 16 88078991 1D AACAGGATTC G/- GTCCTCTAGG 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 G 2 1 102753 CASAVA_Build 16 88081865 4I AGGGTGTGAT ----/GAAA GGCACTGCTG 3070 het 3070 ref 50 29 14 7 GAAA 0 1 102754 CASAVA_Build 16 88089503 1D ACACCCCAAA T/- TTTTTTTTTT 1980 het 211 hom 22 3 6 13 T 19 18 102755 CASAVA_Build 16 88093256 4I GGGATTCTTA ----/TTTT TTTATTTTTT 2180 het 2180 ref 24 15 6 3 T 3 7 102756 CASAVA_Build 16 88095853 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2190 hom 25 9 9 7 A 15 14 102757 CASAVA_Build 16 88099703 3D CCTACAGATC CTT/--- CTTCTTGAAT 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 CTT 3 2 102758 CASAVA_Build 16 88107671 1D ATCAGCGTTG T/- TAAGATGGAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 1 102759 CASAVA_Build 16 88111130 1I AGGGACGTGT -/G GCCCCACTAA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 G 1 2 102760 CASAVA_Build 16 88113504 1D TTGGTCAGGC T/- TGTCTCAGAC 1628 het 1628 ref 14 6 4 4 T 2 1 102761 CASAVA_Build 16 88114620 1D CTACGTTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 10 9 102762 CASAVA_Build 16 88117670 5I GTTTCCTCTT -----/ATCTC AGGTGGGAAC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 ATCTC 0 1 102763 CASAVA_Build 16 88139762 1I TTCTTTTTAA -/T TTTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 28 14 10 4 T 5 6 102764 CASAVA_Build 16 88144975 4D GTCTCTACTT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 CAAA 4 3 102765 CASAVA_Build 16 88151492 4I TCAATGGGGC ----/CACA CAGTCAGGCC 3070 het 3070 hom 40 12 13 15 CA 1 3 102766 CASAVA_Build 16 88161246 1D TATCTTAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 T 9 8 102767 CASAVA_Build 16 88162045 1D CTGTGGGCAG A/- AAAGTCACAT 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 A 4 3 102768 CASAVA_Build 16 88168272 33D GCTTGGTCTG GGGAAAACTGTCCCAGGGCTGCTGGAACCGAGC/--------------------------------- GGGAGGCACG 1530 het 1530 ref 24 17 6 7 GGGAAAACTGTCCCAGGGCTGCTGGAACCGAGC 1 0 102769 CASAVA_Build 16 88168855 1D GCTGAGCGGA G/- GCGCCCGGTC 1538 het 371 hom 8 1 5 2 G 2 1 102770 CASAVA_Build 16 88173199 1D TCTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 40 28 4 8 A 15 14 102771 CASAVA_Build 16 88175424 1I GCGTGACTCA -/T TCCCCCTGCA 2946 het 2946 ref 38 19 11 8 T 1 2 102772 CASAVA_Build 16 88194888 3D TTTCCCAAAT AAG/--- AAGCAGAAAG 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 AAG 2 1 102773 CASAVA_Build 16 88205491 1D TGGTCTAAAT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 27 het 16 0 10 7 G 10 9 102774 CASAVA_Build 16 88207370 14D CTCCCTCCTC CTCTCTCCCTCCTG/-------------- CAGCCCTTCC 2998 het 2739 hom 28 11 16 7 CTCTCTCCCTCCTG 1 0 102775 CASAVA_Build 16 88218447 1I CTGGGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 10 11 102776 CASAVA_Build 16 88223419 1D GCTCCCCCCA C/- CCCCCCCCGA 2109 het 175 hom 18 1 7 10 C 9 8 102777 CASAVA_Build 16 88233833 1I GATCCGCCCA -/C CTCAGCCTCC 3070 hom 65 het 27 0 20 7 C 1 2 102778 CASAVA_Build 16 88248852 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 24 1 19 4 A 11 10 102779 CASAVA_Build 16 88258263 2I GGCAGGACTC --/TT AAGACAGCCC 3070 hom 88 het 36 0 24 12 T 0 2 102780 CASAVA_Build 16 88259390 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1754 hom 23 het 10 0 8 2 T 14 15 102781 CASAVA_Build 16 88262387 1I TCTAACCCTG -/T ACCACACATA 3070 hom 77 het 30 0 23 7 T 0 1 102782 CASAVA_Build 16 88328244 1D TATTTTTTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 9 8 102783 CASAVA_Build 16 88399381 1I TATGTCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 10 11 102784 CASAVA_Build 16 88460049 1I CAGAGCAAGA -/C CCTGTCTGGG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 2 3 102785 CASAVA_Build 16 88483823 2D GTCACCTAGG CT/-- CTGGAGCTCA 3070 hom 53 het 19 0 18 1 CT 2 1 102786 CASAVA_Build 16 88509581 1I CGGGGGTGCT -/C CCTGGGGCAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 C 2 3 102787 CASAVA_Build 16 88525454 3I AAGGGCTTGC ---/TCT TCTCACCCAG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TCT 1 2 102788 CASAVA_Build 16 88533925 1D TGTTTCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 13 3 T 11 10 102789 CASAVA_Build 16 88544696 2D TGAGACCAGC CT/-- GGGCATCAGA 2818 het 2818 ref 26 16 7 4 CT 1 0 102790 CASAVA_Build 16 88566834 1D GAGCTTCCCG C/- CCCCCCGCCT 1468 hom 23 het 13 0 7 6 C 7 6 102791 CASAVA_Build 16 88567650 2D GGAATGAACT CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 61 het 23 0 21 2 C 13 11 102792 CASAVA_Build 16 88569907 1D GTGGTCTTTT A/- TAGGGATATT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 1 0 102793 CASAVA_Build 16 88570000 1D AGCCTCCCCC T/- GAATGTTGAC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 1 0 102794 CASAVA_Build 16 88608908 1D AACGAGACTC T/- TGTTTCAAAA 2342 het 1091 hom 29 7 15 8 T 2 1 102795 CASAVA_Build 16 88620806 1D CTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 31 1 20 10 T 15 14 102796 CASAVA_Build 16 88633392 3D CCTCCTGGGT TCA/--- AGTGATACTC 2851 hom 29 het 11 0 7 4 TCA 1 0 102797 CASAVA_Build 16 88647421 3I GAGTTGTGGG ---/GTT GTTTGTGTGT 3070 hom 85 het 30 0 26 4 GTT 1 2 102798 CASAVA_Build 16 88663965 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 23 4 A 11 10 102799 CASAVA_Build 16 88665521 1I CCTTTTCATC -/A GGAACCCACT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 1 102800 CASAVA_Build 16 88666140 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2575 het 216 hom 12 1 7 4 A 15 16 102801 CASAVA_Build 16 88676565 2I GTGCGCGTGC --/GT GTGTGTGTGT 1403 hom 12 het 19 0 6 13 GT 7 8 102802 CASAVA_Build 16 88678386 1D AGCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2195 het 1139 hom 27 7 7 14 T 17 16 102803 CASAVA_Build 16 88680717 4D ATTTTTCACC TTGA/---- TTGTCAGTTG 3070 het 3070 ref 47 26 12 11 TTGA 1 0 102804 CASAVA_Build 16 88685508 1I CATAAACCCA -/G CTACTTACCT 2397 het 2397 ref 48 36 7 5 G 0 1 102805 CASAVA_Build 16 88685620 1I AATTTATAAA -/G AAAAGAGGTT 3070 het 3070 ref 56 32 19 5 G 0 1 102806 CASAVA_Build 16 88687324 1I40M5I CTTCACTCTG -CTGGAGACCGCAGTCCTCTGGAAAGGTGAAAGGGCTAATC-----/TGTGCAGACTGCAGTCCTCTGGAAAGGTGAAAGGGCTAATCCTACT CTAAAGAAGA 3070 het 3070 ref 65 45 28 22 N/A 0 0 102807 CASAVA_Build 16 88687575 2I AAAGGCACTC --/TG TGAATATGGA 3070 het 3070 hom 87 31 54 4 TG 1 2 102808 CASAVA_Build 16 88698025 1D CTTTTATCCA C/- CTTGTTTCCG 3070 het 3070 ref 55 36 7 13 C 2 1 102809 CASAVA_Build 16 88756758 2I CCATACCCTA --/CG TCACGGCAGC 3070 hom 27 het 10 0 9 1 CG 0 1 102810 CASAVA_Build 16 88794792 1I AGGCCACTGC -/T TTTCCCAGCT 1427 het 1082 hom 6 3 3 0 T 3 4 102811 CASAVA_Build 16 88797872 1D GCCAAACTTT A/- AAAAAAAAAC 2234 het 1073 hom 13 5 7 2 A 10 9 102812 CASAVA_Build 16 88809271 1I AAAGTTGGAG -/A AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 41 25 10 6 A 8 9 102813 CASAVA_Build 16 88818006 1I CTCCATTGGC -/A AAAAAAAAAA 2024 hom 24 het 22 0 9 13 A 11 12 102814 CASAVA_Build 16 88820615 4D AGAAATCGTC AAAA/---- AAAAAAAGCA 2254 het 2254 ref 80 67 6 9 A 11 7 102815 CASAVA_Build 6 35765 4I ATGATTAGAA ----/AAAC AGAGAGAGAA 1836 hom 10 het 5 0 4 1 AAAC 0 1 102816 CASAVA_Build 6 93509 1I CAGGGCCCTC -/A TTGCTCACAG 3070 hom 51 het 20 0 14 6 A 0 1 102817 CASAVA_Build 6 95567 1D GATTATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 192 hom 55 2 45 9 A 11 10 102818 CASAVA_Build 6 102232 1D TTTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 28 0 17 11 A 12 11 102819 CASAVA_Build 6 102808 1D CTCCATTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 10 9 102820 CASAVA_Build 6 107485 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 6 7 102821 CASAVA_Build 6 119191 1I ATGTGACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 807 hom 40 3 31 6 A 11 12 102822 CASAVA_Build 6 120849 4I TTTAATAATA ----/ATTT ATTTATTTAA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 ATTT 2 3 102823 CASAVA_Build 6 125702 11I TAGTCAGTGA -----------/GACCAAGAACC GACCAATTCC 3070 hom 129 het 45 0 39 6 GACCAAGAACC 0 1 102824 CASAVA_Build 6 131516 1D GTGGGTCCCA T/- CACAGCTGCT 3070 hom 143 het 51 0 47 4 T 1 0 102825 CASAVA_Build 6 174449 1D GCTGACCCTT A/- TAGTAATGTG 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 1 0 102826 CASAVA_Build 6 176086 1I CTTATTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1991 hom 27 7 13 7 T 10 11 102827 CASAVA_Build 6 184951 3I GGGAGAAGAC ---/GTG GTGGTTGGCA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 GTG 1 2 102828 CASAVA_Build 6 190364 4D TATAAATGCA AATT/---- AATTGTGTCC 3070 het 3070 ref 37 18 17 4 AATT 2 1 102829 CASAVA_Build 6 193533 1D TTTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 T 11 10 102830 CASAVA_Build 6 199816 10D AATCCTCCCA CCTCGGCCTC/---------- CCAAAATGCT 3070 het 2850 hom 26 11 10 9 CCTCGGCCTC 1 0 102831 CASAVA_Build 6 203666 1D GCAAAGGACA T/- TTTTTTTTTT 2608 het 2608 ref 52 32 6 15 T 15 14 102832 CASAVA_Build 6 206163 4D CTACTCTTTC TTTT/---- GTTTCTTGTG 3070 het 3070 ref 63 28 27 11 T 4 0 102833 CASAVA_Build 6 214348 6D TTTGATTCAT TTAGAG/------ TTAATTTTTG 3070 het 3070 ref 71 47 21 6 TTAGAG 1 0 102834 CASAVA_Build 6 217504 4D ACTGTCTTAC TTTG/---- TTTGAGTTTT 3070 het 3070 ref 93 55 26 16 TTTG 2 1 102835 CASAVA_Build 6 219318 2D GACCTCAGGT TA/-- TATGCCTGAG 3070 het 3070 ref 80 33 34 15 TA 2 1 102836 CASAVA_Build 6 229016 1I CATGACATGG -/A AATCACTTAC 3070 hom 244 het 95 0 82 13 A 2 3 102837 CASAVA_Build 6 230191 1D TAGATGTCTT A/- ACTTCCGCAG 3070 hom 215 het 78 0 69 11 A 2 1 102838 CASAVA_Build 6 236052 3D ATAAGACAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 658 hom 68 10 14 47 T 15 12 102839 CASAVA_Build 6 239361 1I GTGGGGAGGG -/A GGCAAAGGGA 3070 hom 173 het 62 0 56 6 A 0 1 102840 CASAVA_Build 6 243882 9I AGATCAGTCC ---------/GAAAGTAAG GAAAGTAAGG 3070 het 3070 ref 98 39 29 30 GAAAGTAAG 1 2 102841 CASAVA_Build 6 247545 1I TCACCTCCAC -/T TTTCCCTGTG 3070 het 3070 ref 72 48 12 12 T 3 4 102842 CASAVA_Build 6 249900 2D TTTCTGCCTC TA/-- TGAATCTCAC 3070 hom 242 het 87 0 78 9 TA 1 0 102843 CASAVA_Build 6 253480 4D ATGGGAAAGG ATGC/---- ATCAGCGAAC 3070 het 3070 ref 92 68 16 10 ATGC 1 0 102844 CASAVA_Build 6 256680 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 25 0 22 3 A 9 10 102845 CASAVA_Build 6 257030 4D CTACGACGTT AATG/---- AAGGCAACCA 3070 het 3070 hom 99 45 42 17 AATG 1 0 102846 CASAVA_Build 6 262952 1D AAAGTAGAGT G/- GGGTCAAGAG 3070 het 3070 ref 91 48 35 8 G 4 3 102847 CASAVA_Build 6 274919 1D CTTTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 1499 het 1499 ref 58 38 4 16 T 13 12 102848 CASAVA_Build 6 279412 1D TTTTTTTTTT A/- AATAAATCTC 3070 het 3070 hom 87 33 43 12 A 3 2 102849 CASAVA_Build 6 286958 18D CAGGTTCAAC CCCACAATATGTAAGAAG/------------------ CCCGGTTTCA 3070 het 3070 ref 84 70 18 17 CCCACAATATGTAAGAAG 1 0 102850 CASAVA_Build 6 288455 1D GCTGCTGTGG C/- CCCCCAAGGG 3070 het 3070 ref 53 27 12 15 C 6 5 102851 CASAVA_Build 6 289807 2D AGACCAGTTT GA/-- GAGAATGCTT 3070 het 3070 hom 76 24 34 20 GA 3 2 102852 CASAVA_Build 6 291696 2D CTTGAATGAA GT/-- GTGTTATTAA 3070 het 3070 hom 74 32 34 9 GT 3 2 102853 CASAVA_Build 6 291858 2I CCAGGGACCC --/AG AGTGCATGAC 3070 het 3070 ref 90 62 12 16 AG 1 2 102854 CASAVA_Build 6 295941 1I AAAGCAACAT -/A AGAGTTTAAG 3070 het 3070 hom 71 30 40 1 A 1 2 102855 CASAVA_Build 6 304071 1D CCCATGAAGA G/- GGGGTGGCCT 3070 het 3070 ref 79 38 27 14 G 5 4 102856 CASAVA_Build 6 305166 1I ATTTTCTTGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 54 22 22 10 T 8 9 102857 CASAVA_Build 6 305710 1D TTCTACTGCC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 61 39 11 13 A 9 8 102858 CASAVA_Build 6 306559 1I CAGCTGTGTG -/C CGTACCCCCA 3070 het 3070 hom 59 25 25 9 C 1 2 102859 CASAVA_Build 6 307172 1D53M2D TTTCTTAGGG AAAAAAAAAAAGATTCTCTAGATTTTCTGTCCAATAGTTTCTTTCTGAGATTACAA/-AAAAAAAAAAGATTCTCTAGATTTTCTGTCCAATAGTTTCTTTCTGAGATTAC-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 62 35 16 30 N/A 0 0 102860 CASAVA_Build 6 307320 1I TGTTTTCCGC -/T TACAGAGCAC 3070 het 3070 ref 68 45 18 5 T 1 2 102861 CASAVA_Build 6 308278 1I AAACTTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 64 29 20 15 A 10 11 102862 CASAVA_Build 6 313810 1D TTAGTAGAGA G/- GGGGTTTCAC 2703 het 2703 ref 22 8 7 7 G 5 4 102863 CASAVA_Build 6 314456 4D TATTGTCCTT AGAA/---- AGAAGAGGTG 3070 het 3070 ref 103 72 22 13 AGAA 2 1 102864 CASAVA_Build 6 321259 15I CCTCCCATGC ---------------/TCACGGCAGGACTTG TCACAATAGC 3070 het 3070 hom 67 24 38 5 TCACGGCAGGACTTG 0 1 102865 CASAVA_Build 6 325339 76D TTGGGGCTCC CTCCCCACGGTCTTCCTGGATGGGCTTCAAACCTCCTTTCTGGCCTCTACGCCCTGGGTCCCGCCCCCAGCCCAGA/---------------------------------------------------------------------------- CTACCTGCTG 3070 het 3070 ref 58 60 14 14 CTCCCCACGGTCTTCCTGGATGGGCTTCAAACCTCCTTTCTGGCCTCTACGCCCTGGGTCCCGCCCCCAGCCCAGA 1 0 102866 CASAVA_Build 6 329956 2I AGCAAGAAGG --/CC CATGTTGACC 3070 hom 90 het 33 0 28 5 C 1 3 102867 CASAVA_Build 6 332144 1I CAAGAAGTAA -/C CCCCCCCCCC 1606 het 260 hom 30 1 10 19 C 10 11 102868 CASAVA_Build 6 334046 1I CCAATTGTAG -/C CCCCCCCCTT 3070 het 3070 hom 33 8 17 8 C 8 9 102869 CASAVA_Build 6 351553 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 1531 hom 26 6 17 3 A 7 8 102870 CASAVA_Build 6 354827 3D GAGCACCCTG TCT/--- TCTTAATTCT 3070 het 3070 ref 42 20 19 4 TCT 2 1 102871 CASAVA_Build 6 355997 1D TAAAGGTCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 9 8 102872 CASAVA_Build 6 377506 1I TTTAGAGCCA -/G GGGGGTGCAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 G 5 6 102873 CASAVA_Build 6 392559 13D AGCTGAGGCC ATGGGGGCGGGGG/------------- ATGCGGGCTT 3070 hom 49 het 24 0 12 14 ATGGGGGCGGGGG 1 0 102874 CASAVA_Build 6 396127 2I ATTTGAAGCT --/AG AGAGGCCCCG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AG 2 3 102875 CASAVA_Build 6 396841 7D CGCTTGTAAT CAATCTC/------- CAGCCTTCAG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 CAATCTC 1 0 102876 CASAVA_Build 6 403726 2D GATAGGGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 20 1 15 4 T 13 11 102877 CASAVA_Build 6 406450 4I AGGACCCATC ----/TTTA TTAAGGATTT 3070 hom 157 het 53 0 53 0 TTTA 0 1 102878 CASAVA_Build 6 407765 1D TTGTGGGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 115 het 45 0 38 8 A 11 10 102879 CASAVA_Build 6 409508 1I GGACCATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1036 hom 35 3 23 9 T 13 14 102880 CASAVA_Build 6 419505 2D TTATCCGCTC CA/-- CACACACACA 3070 hom 108 het 44 0 34 10 CA 6 5 102881 CASAVA_Build 6 419878 2I AGTGTTCCCA --/CT CTCAAAAGAA 3070 hom 148 het 58 0 50 8 CT 1 2 102882 CASAVA_Build 6 421924 3D AAGTTATTAA TAT/--- TATTAAATGT 3070 hom 60 het 25 0 21 6 TAT 2 1 102883 CASAVA_Build 6 425781 4D AACAAATTGT CTTA/---- GTTTTCTTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 CTTA 1 0 102884 CASAVA_Build 6 428860 4D CAGAACCAAC AGAT/---- AAATGTTCAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AGAT 1 0 102885 CASAVA_Build 6 431927 4I AAAGAAACAC ----/ATCA ATCAAAGAAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 ATCA 1 2 102886 CASAVA_Build 6 432328 1D AGCAGGGTTA G/- GGGCTAATTC 3070 hom 112 het 43 0 36 8 G 4 3 102887 CASAVA_Build 6 440055 1D ATTAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 25 3 21 1 T 15 14 102888 CASAVA_Build 6 462550 4I TGAAAAAAAC ----/TTAT TTAGTGTTCC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TTAT 0 1 102889 CASAVA_Build 6 469892 4I TCCATCGAGT ----/GTGA GTTTCTTTGG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GTGA 0 1 102890 CASAVA_Build 6 472905 1I AAACTTAAAT -/A AATACTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 3 102891 CASAVA_Build 6 474405 5D GAGGGCTGGC AAAGA/----- AAAGTCTTCT 3070 hom 126 het 43 0 41 3 AAAGA 1 0 102892 CASAVA_Build 6 482080 3D ATAAAGCAAC AAT/--- GAGACTGGCT 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 AAT 1 0 102893 CASAVA_Build 6 484073 1D CTGTCTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 27 1 19 7 A 14 13 102894 CASAVA_Build 6 497630 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 9 8 102895 CASAVA_Build 6 499046 1I GTCACATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 35 1 28 6 T 12 13 102896 CASAVA_Build 6 499728 1I CGGATTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 A 10 11 102897 CASAVA_Build 6 527242 2D ATAGTCGGTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 64 het 29 0 22 8 T 11 9 102898 CASAVA_Build 6 539928 2I TTAAGAACAC --/TT TTTAAAAAGG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 3 5 102899 CASAVA_Build 6 552417 1D GTTGTGAGGA C/- TAAATATACC 3070 het 3070 ref 50 24 18 9 C 1 0 102900 CASAVA_Build 6 559949 1I AAAATTACAA -/T TACACATTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 1 2 102901 CASAVA_Build 6 569165 1I TAGAAAAAAC -/A AAAAAATGAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 6 7 102902 CASAVA_Build 6 579072 2D TGACGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2018 hom 29 9 13 8 T 12 10 102903 CASAVA_Build 6 582155 1D TAGAAAAGAT A/- AAAAACATAA 3070 het 3070 hom 34 16 15 4 A 6 5 102904 CASAVA_Build 6 583968 2I TAATAAACCC --/CT GAGAACTCAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 CT 0 1 102905 CASAVA_Build 6 585888 1D GCAGGTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 A 11 10 102906 CASAVA_Build 6 586880 2I AGCAAATGCC --/AG AGTTAGTTCT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 AG 1 2 102907 CASAVA_Build 6 588350 1I ACAGGCAATT -/C CCAAAGACCG 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 C 2 3 102908 CASAVA_Build 6 588610 1D TCCACCTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 10 9 102909 CASAVA_Build 6 590474 4D TATCAAGAGA AAAT/---- AAATAGGCAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 AAAT 2 1 102910 CASAVA_Build 6 590592 1D GAAGCAACCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 25 10 8 T 10 9 102911 CASAVA_Build 6 591317 4D ACAAAAACAT AGAC/---- AGACAGATGG 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 AGAC 2 1 102912 CASAVA_Build 6 591509 2D AAGTTATCAA AT/-- ATAATGCTTT 3070 het 3070 hom 32 7 22 3 AT 2 1 102913 CASAVA_Build 6 625025 1I CGGATGACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 895 hom 36 2 26 8 T 11 12 102914 CASAVA_Build 6 633343 1D CTGTGATTTT C/- CCCAGCTGGC 3070 het 3070 ref 41 21 19 4 C 4 3 102915 CASAVA_Build 6 642080 1D AGACGCTGTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 8 102916 CASAVA_Build 6 644805 10I AGAACACACA ----------/GATTTTCCTG GATTAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 GATTTTCCTG 0 1 102917 CASAVA_Build 6 647012 1I TAAAGCCTGT -/C CTTTATACCT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 1 2 102918 CASAVA_Build 6 651927 1I ACTGTCCTCT -/A AGCACATCCA 3070 hom 138 het 54 0 45 9 A 1 2 102919 CASAVA_Build 6 656587 3I GACAAGACGA ---/GAG GGGGAAAATC 3070 hom 110 het 42 0 33 11 GAG 0 1 102920 CASAVA_Build 6 662982 2I TGTGCATGGG --/AC ACACACACAC 3070 hom 117 het 49 0 39 10 AC 5 6 102921 CASAVA_Build 6 667741 2I TATATTACGG --/CT CTGTTGACCC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 CT 1 2 102922 CASAVA_Build 6 690921 2D CCTGGCTTAA CT/-- CTGTGTTACT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CT 2 1 102923 CASAVA_Build 6 696046 1D TGCGAGTTGC T/- TTTTAAAATC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 5 4 102924 CASAVA_Build 6 697385 4D AGAGAAGGAG AAGA/---- AAGAGGAGAT 3070 hom 90 het 33 0 28 8 AAGA 2 1 102925 CASAVA_Build 6 702752 1I TTCTGTCATT -/A ATGTAAATAA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 1 2 102926 CASAVA_Build 6 703962 8D TGAAAAAATA CATTAAAG/-------- CATTAAAGTG 3070 hom 54 het 21 0 19 3 CATTAAAG 2 1 102927 CASAVA_Build 6 704417 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1608 het 13 hom 14 1 6 8 A 18 16 102928 CASAVA_Build 6 709078 1D GCATCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 13 12 102929 CASAVA_Build 6 733731 2D TTCAAAACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 13 11 102930 CASAVA_Build 6 736018 1I CAGAGTGCCC -/T TTTTTTCAAT 3070 hom 104 het 39 0 33 6 T 6 7 102931 CASAVA_Build 6 738797 2D TTCTCACTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1446 hom 22 6 13 4 T 13 11 102932 CASAVA_Build 6 741799 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTAACC 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 T 7 6 102933 CASAVA_Build 6 747753 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 28 0 21 8 A 11 10 102934 CASAVA_Build 6 752797 1I TATTAATTTA -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 6 7 102935 CASAVA_Build 6 770753 2D CATGATTTGG CT/-- CTCTGTTTCT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CT 3 2 102936 CASAVA_Build 6 789868 2D TGGATTCAGT GA/-- GAGAGAGAGA 1840 het 1840 ref 50 34 5 11 GA 7 6 102937 CASAVA_Build 6 806104 2D AGTAAATGAA AG/-- AGCTCCTTGC 3070 het 3070 ref 44 21 21 7 AG 2 1 102938 CASAVA_Build 6 806665 1D AGCCTCTCAA C/- CCCCTCTTAT 3070 het 2949 hom 26 10 12 4 C 5 4 102939 CASAVA_Build 6 809389 11I CCAGGTGTGG -----------/TGGCTCATGCC TTTACTCCCG 3070 hom 39 het 15 0 14 3 TGGCTCATGCC 0 1 102940 CASAVA_Build 6 811757 1D AGAGGTAAAA G/- GCAGCTGGTA 3070 het 3070 hom 34 10 11 13 G 2 1 102941 CASAVA_Build 6 811809 3I GAATTTTTGA ---/TAT TACTTATCTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TAT 0 1 102942 CASAVA_Build 6 821481 6I ATGGACTTCC ------/TGCAGA TGCAGGAACA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 TGCAGA 0 1 102943 CASAVA_Build 6 827606 1D GCCCCAGAGA G/- TAATTCACTA 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 G 1 0 102944 CASAVA_Build 6 827856 1I AAGGTTTAGG -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 6 7 102945 CASAVA_Build 6 829294 4I TGTTTCAGGA ----/TTAC TTACTTACAC 3070 het 3070 hom 52 19 26 7 TTAC 2 3 102946 CASAVA_Build 6 833586 1I CCCCAGCAAG -/A GGCATGTTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 102947 CASAVA_Build 6 834744 4D GTTATTTTAC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 2003 hom 28 7 20 1 TTAT 5 4 102948 CASAVA_Build 6 837958 1D GGAATGTACT G/- GTGCCAGACC 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 G 2 1 102949 CASAVA_Build 6 847934 1I TCGTGATTGT -/G TTTTATGGAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 102950 CASAVA_Build 6 856100 1I TGAGGCCCCC -/T GTGTGCTCCT 3070 het 3070 hom 41 20 15 6 T 0 1 102951 CASAVA_Build 6 857113 1D AACATTGCAC G/- GTGTTCTACA 3070 het 3070 ref 47 23 17 8 G 2 1 102952 CASAVA_Build 6 862525 4I CTTTTCCCTA ----/ACTT ACTTCATTGT 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 ACTT 1 2 102953 CASAVA_Build 6 872690 8I CGGCCACTGT --------/GGAGCTGA GGAGCTGAGG 3070 het 1657 hom 28 7 12 9 GGAGCTGA 1 2 102954 CASAVA_Build 6 873098 2I TCAAGAACTG --/AA AAGAGTACCT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 2 4 102955 CASAVA_Build 6 877367 1I GAACTCATCC -/T TTTTTATGGC 2019 het 266 hom 6 1 5 0 T 5 6 102956 CASAVA_Build 6 879792 1I GTCATCAAAG -/C CCCTGCATGC 3070 het 3070 hom 50 17 23 10 C 3 4 102957 CASAVA_Build 6 881279 1I ATGCCGTCCA -/G GTCTGCCACA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 G 1 2 102958 CASAVA_Build 6 889418 1I TACAAAAAAA -/G ATTAGCTGGG 3070 het 1294 hom 25 3 19 3 G 0 1 102959 CASAVA_Build 6 891137 4I TTAAAATAAC ----/ATAA ATAAAATATT 3070 het 103 hom 12 1 8 3 ATAA 1 2 102960 CASAVA_Build 6 891654 1I TTGTACATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 T 9 10 102961 CASAVA_Build 6 894064 2I ATGTCATTAC --/AT GAGAGAAAAC 3070 het 3070 ref 55 29 21 5 AT 0 1 102962 CASAVA_Build 6 908358 1I GTGTAAAAGG -/T TTTTATTTAA 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 T 4 5 102963 CASAVA_Build 6 939126 4D ATCATCTACT TATC/---- TATTTACCCA 3070 hom 151 het 58 0 51 9 TATC 1 0 102964 CASAVA_Build 6 951379 1I TCCTATCCAA -/G GATAGAAGGT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 G 1 2 102965 CASAVA_Build 6 952132 1I AAATAAATTT -/A AAAAATTAGC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 5 6 102966 CASAVA_Build 6 966877 1I TTGCCACTGC -/T GGCTGGGGTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 0 1 102967 CASAVA_Build 6 972869 1D CCCTCACGTG C/- CTCCCCCTAA 3070 het 1350 hom 25 5 11 9 C 2 1 102968 CASAVA_Build 6 975888 1D TTTTGTACCA G/- GAAAAAAAGA 1863 het 1863 ref 9 5 4 0 G 2 1 102969 CASAVA_Build 6 985966 1D GGGTGTGTGT C/- GGGGGGGGGG 3070 hom 42 het 18 0 14 4 C 1 0 102970 CASAVA_Build 6 1003714 4D CACGCTAGGC CTAA/---- CTGTGTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 11 11 CTAA 1 0 102971 CASAVA_Build 6 1004307 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2354 hom 15 het 6 0 6 0 A 7 6 102972 CASAVA_Build 6 1005450 2D TATATATCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 AC 8 7 102973 CASAVA_Build 6 1005798 4I AAAATATATA ----/CTAC CTATTACTAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 CTAC 0 1 102974 CASAVA_Build 6 1014297 2D TGTCTGCGTC TG/-- TGTGTGTGCC 3070 het 3070 ref 63 31 24 8 TG 5 4 102975 CASAVA_Build 6 1016289 1I CAGTAAACAG -/T TGAGTATCAC 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 T 1 2 102976 CASAVA_Build 6 1021955 1I AGGGACACAG -/C CCCTACTCCG 2256 het 2140 hom 18 5 9 4 C 3 4 102977 CASAVA_Build 6 1027162 1D TACTTTTCCT A/- AAAAAAAAAA 1455 het 1455 ref 42 27 5 10 A 12 11 102978 CASAVA_Build 6 1085965 1D TACATGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 20 23 10 A 12 11 102979 CASAVA_Build 6 1086051 1I CATAATTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 11 102980 CASAVA_Build 6 1088391 1I ATTACTTGAC -/A GTATACTTCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 0 1 102981 CASAVA_Build 6 1091920 4D AGAGATAGAA AGAG/---- AGAGGAACAG 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 AG 4 2 102982 CASAVA_Build 6 1092078 4D AGAGAAAGAC AGAT/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 42 12 15 16 AGAT 1 0 102983 CASAVA_Build 6 1095983 4I TCTCTTTTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 46 15 13 18 TTTC 4 5 102984 CASAVA_Build 6 1099378 1I AATTGCCTCC -/A AAAGAAAGTA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 3 4 102985 CASAVA_Build 6 1109619 1I AAAACCAAAC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 7 8 102986 CASAVA_Build 6 1118936 3D TGCATAACAG CCA/--- ACTTTTGAGA 1739 hom 12 het 6 0 5 1 CCA 1 0 102987 CASAVA_Build 6 1123201 1I CAGCCGAAAC -/T GTCAACAGGA 3070 het 3070 ref 56 24 24 8 T 0 1 102988 CASAVA_Build 6 1124690 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 A 13 12 102989 CASAVA_Build 6 1125690 2D TTTTGTCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 13 11 102990 CASAVA_Build 6 1127767 1I GGTGGCGGTG -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 6 7 102991 CASAVA_Build 6 1129570 1D TACCTGCCCA C/- CCTCTCCATT 3070 het 3070 ref 62 32 24 7 C 3 2 102992 CASAVA_Build 6 1131660 1I CCCTGAGCTA -/G GGGGCAAGGA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 G 4 5 102993 CASAVA_Build 6 1131859 1D TCTGACTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 11 10 102994 CASAVA_Build 6 1135742 2D GTTGGGAAGC CT/-- CTGTCTTGCA 3070 het 3070 ref 57 26 22 9 CT 2 1 102995 CASAVA_Build 6 1138336 1D TTTTAATCAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 8 7 102996 CASAVA_Build 6 1152532 3D TTCACTCAAC TTG/--- TTGTTGATTA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 TTG 3 2 102997 CASAVA_Build 6 1152854 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 10 11 102998 CASAVA_Build 6 1153777 2D AATGTCCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 12 10 102999 CASAVA_Build 6 1154987 16D ATCTTGCCTA TTATATGCTTTGCCTG/---------------- GCCTCATGCT 3070 het 3070 ref 43 26 16 6 TTATATGCTTTGCCTG 1 0 103000 CASAVA_Build 6 1156985 1D AGCACTTAAA G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 69 het 27 0 24 4 G 8 7 103001 CASAVA_Build 6 1157784 2D TTTAAGTATT AA/-- AAAAAAAGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 7 103002 CASAVA_Build 6 1160050 1I TCATCAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 9 10 103003 CASAVA_Build 6 1160529 4I TGCAAGTGAA ----/AGAC AGAGCATAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 AGAC 0 1 103004 CASAVA_Build 6 1160673 1I CTACAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 A 10 11 103005 CASAVA_Build 6 1164004 4I AGAAAATCAT ----/AAGG AAGAGGAGGA 3070 het 3070 ref 51 22 15 14 AAGG 0 1 103006 CASAVA_Build 6 1164638 1I ATTCTTCTCA -/T TTTAGAACTG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 3 4 103007 CASAVA_Build 6 1165450 16I TTCCAACTTG ----------------/ATATGCCCTTCCAAGC ATATCAGCAT 3070 hom 126 het 39 0 41 5 ATATGCCCTTCCAAGC 0 1 103008 CASAVA_Build 6 1167410 1I TTTTCTTTTG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 6 7 103009 CASAVA_Build 6 1167831 1D CACTCCCCCC T/- GTGAGTGGGA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 1 0 103010 CASAVA_Build 6 1168024 3D AATCTGAAGG AGA/--- AGGTGTGTGG 3070 het 3070 ref 51 26 20 8 AGA 1 0 103011 CASAVA_Build 6 1170848 1I CTACCCCTGA -/G GCAAAAATAA 3070 hom 106 het 41 0 34 7 G 1 2 103012 CASAVA_Build 6 1172471 1D GGTTACAAGC A/- GAGTAAAATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 0 103013 CASAVA_Build 6 1175347 1D TCATTTTTAC T/- TTTTTCATTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 6 5 103014 CASAVA_Build 6 1181990 1D TGTAGAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 39 0 24 15 A 15 14 103015 CASAVA_Build 6 1187404 4I ACAGTGATCT ----/CGGG CTGACTTAGG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 CGGG 0 1 103016 CASAVA_Build 6 1197479 4D TTAGTTTAGT TAGG/---- TAGTTTCAGA 3070 hom 66 het 27 0 23 7 TAGG 1 0 103017 CASAVA_Build 6 1201578 3I AGTATTCTTC ---/ATG ATATCTCTGG 3070 hom 113 het 46 0 38 8 ATG 0 1 103018 CASAVA_Build 6 1218670 1D GGTGAATGGC T/- TCAAACACTC 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 2 1 103019 CASAVA_Build 6 1224307 1I AATTTACAAG -/C CCCCCTCACC 3070 het 3070 ref 52 24 17 11 C 5 6 103020 CASAVA_Build 6 1241244 1D GCTGAAGTAG C/- TTTTAAAACA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 1 0 103021 CASAVA_Build 6 1249660 17D TCGCCTGACT TCGTGATCCGCCCGACC/----------------- TCGTGATCCG 1634 hom 23 het 11 0 8 4 TCGTGATCCGCCCGACC 2 1 103022 CASAVA_Build 6 1250731 1D AATGAGGGGT C/- TTTAGGGTGG 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 C 1 0 103023 CASAVA_Build 6 1251009 2D GGGTAATTTT AA/-- AAGTTTTATC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 4 2 103024 CASAVA_Build 6 1255088 1I TGAGGTAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 9 10 103025 CASAVA_Build 6 1256324 1I TGAACCGGTT -/G TGTTCTTGCC 2327 hom 29 het 12 0 7 5 G 0 1 103026 CASAVA_Build 6 1260020 1I GAGAGATTTT -/G TATGTCTGTC 2723 het 2723 ref 24 16 6 2 G 0 1 103027 CASAVA_Build 6 1278606 1D ACAGCAAAGA T/- TTCTATGTGT 3070 het 3070 hom 49 17 29 3 T 3 2 103028 CASAVA_Build 6 1280438 1D TTGCAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 2274 het 2274 ref 19 12 6 1 T 11 10 103029 CASAVA_Build 6 1288580 1I GGCAACCACT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 7 8 103030 CASAVA_Build 6 1288706 4D AGAAAAGAAA AAAG/---- AAAGAATAAA 3070 het 3070 hom 33 17 13 5 AAAG 2 1 103031 CASAVA_Build 6 1292199 1D ATTCTAACTA G/- GGCAAGACTT 3070 het 3070 ref 53 25 20 9 G 3 2 103032 CASAVA_Build 6 1302282 3D ACTCTATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2069 hom 24 9 11 5 A 14 11 103033 CASAVA_Build 6 1307633 1I AACCCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2943 hom 23 8 9 6 A 11 12 103034 CASAVA_Build 6 1308927 1D ATCCAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 2723 het 308 hom 26 5 10 12 A 17 16 103035 CASAVA_Build 6 1324568 1D GAAAGCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 A 11 10 103036 CASAVA_Build 6 1340805 1D TGTTGTAAAA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 8 7 103037 CASAVA_Build 6 1342586 1D TTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2519 het 557 hom 17 2 9 6 T 17 16 103038 CASAVA_Build 6 1344567 2D AGACAAAGAA AG/-- AAGAGAGACT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 AG 1 0 103039 CASAVA_Build 6 1344676 2D GGAGAGAGAC AG/-- AGGGAGAGAA 3070 het 3070 hom 36 13 13 10 AG 2 1 103040 CASAVA_Build 6 1346051 1I CTCCAGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 43 het 20 0 12 8 A 9 10 103041 CASAVA_Build 6 1347712 1I CCTGCCCAGG -/T GCCTCTTCCA 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 T 0 1 103042 CASAVA_Build 6 1348016 2I AGACACACAT --/GC AGACACAAAC 1654 het 1654 ref 65 30 13 22 GC 0 1 103043 CASAVA_Build 6 1351518 1I ACATCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2643 het 2643 ref 33 14 8 11 A 10 11 103044 CASAVA_Build 6 1351647 1D GAGAGCCCGC G/- GGCCGTGTCT 2740 het 2740 ref 29 15 7 7 G 3 2 103045 CASAVA_Build 6 1353861 7D CACGGTGAAA TCCCGTC/------- TCTACTAAAA 2408 het 1619 hom 10 4 5 1 TCCCGTC 1 0 103046 CASAVA_Build 6 1354604 1I TGCCTCAACC -/T TTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 T 2 3 103047 CASAVA_Build 6 1354676 14D TTTGTTATTT TATGTTTGAAATTG/-------------- TATCCTATTT 3070 het 3070 ref 29 21 10 3 TATGTTTGAAATTG 1 0 103048 CASAVA_Build 6 1354881 1D TATTCTTTCC T/- TTTTTACTCT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 6 5 103049 CASAVA_Build 6 1357337 1D CCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1948 het 1393 hom 17 6 6 6 A 15 14 103050 CASAVA_Build 6 1357509 1I CTACCTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 11 12 103051 CASAVA_Build 6 1358223 1D TAAAATCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 377 hom 27 1 17 9 A 17 16 103052 CASAVA_Build 6 1366343 1D TAAGTTGTTC T/- TTATATATTC 2720 het 2720 ref 30 18 7 5 T 3 2 103053 CASAVA_Build 6 1381962 1I CCAGGAGCCT -/G CTCAAAACTC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 G 0 1 103054 CASAVA_Build 6 1389943 2I TGACCTGTTC --/AT ATTTGAAGGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AT 1 2 103055 CASAVA_Build 6 1390390 1I ATCCCAGTGC -/T TTGCCCTTTC 3070 hom 125 het 46 0 40 6 T 2 3 103056 CASAVA_Build 6 1393057 1I TGTATCAGGG -/T TTTTTTGTTT 1840 het 722 hom 14 5 7 2 T 6 7 103057 CASAVA_Build 6 1393091 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 632 het 381 hom 9 4 3 2 T 10 9 103058 CASAVA_Build 6 1397958 1D GGCTCAAATA G/- CAGAAGTCTG 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 G 1 0 103059 CASAVA_Build 6 1405937 1D TCAAGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 11 10 103060 CASAVA_Build 6 1407534 1D AGTTTTCTCC A/- ATTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 2 1 103061 CASAVA_Build 6 1407844 6D ATAGAGGTGC CTCTTA/------ CTAGAGACCT 3070 het 3070 ref 38 26 11 2 CTCTTA 1 0 103062 CASAVA_Build 6 1411179 4I TCTGTCTCAA ----/AAAT AAATAAAGAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAAT 1 2 103063 CASAVA_Build 6 1419064 1D TCTCCAGGGA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 T 8 7 103064 CASAVA_Build 6 1423447 5I AGTGGTGATG -----/GTGGT GTGGTGGTGG 3070 het 2450 hom 60 10 16 34 GTGGT 1 2 103065 CASAVA_Build 6 1423933 1D AGATGGTGAT G/- GTAGTGGTGA 3070 het 3070 ref 99 47 35 19 G 2 1 103066 CASAVA_Build 6 1429608 4D TTAAATCAAG CTAA/---- CTAACATATC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CTAA 2 1 103067 CASAVA_Build 6 1438513 1D GACAGGGCCT G/- TAGTTCCCGT 3070 hom 117 het 46 0 40 7 G 1 0 103068 CASAVA_Build 6 1444483 4D GCTGATTAGA TCTT/---- TCTAACTAGG 3070 het 3070 ref 35 16 11 11 TCTT 1 0 103069 CASAVA_Build 6 1464104 1I GCCGTGTCTG -/C CCCCACGTGA 3070 het 3070 hom 55 23 25 7 C 4 5 103070 CASAVA_Build 6 1466850 1D CCTCTTATCA T/- TGGCTTTCCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 1 103071 CASAVA_Build 6 1469112 2D AGGAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 A 14 12 103072 CASAVA_Build 6 1473180 8D AATGTGTGTC TTACCAAA/-------- TTTCAACCAG 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 TTACCAAA 1 0 103073 CASAVA_Build 6 1476009 2D TTATACAATT TG/-- TGTTAGAGAC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TG 2 1 103074 CASAVA_Build 6 1476161 3D31M3D CACTTATTAC TTATTATTCACTTTTCACTTATTACCAATATTATTAC/---TTATTCACTTTTCACTTATTACTAATATTAT--- AATATTACTA 3070 het 3070 ref 37 39 13 4 N/A 0 0 103075 CASAVA_Build 6 1477311 1I103M15I ACGCAGCAAT -AAAAAAAATACAAATAAAAAAACTATACAGTATAACCACTATTTACATAGCATTTACATTGTATTAGCTATCATAAGTAACCCAGAGATGATTTAAAGTATAC---------------/AAAAAAAAATACAAATAAAAAAACTATACAGTATAACCACTATGTACATAGCATTTACACTGTATTAGCTATCATAAGTAACCCAGAGATGATTTAAAGTATACAGGAAGACGTACATA AGTTATATGT 3070 het 3070 ref 30 27 18 11 N/A 0 0 103076 CASAVA_Build 6 1480562 2I CTGAGATCCT --/CA CAATAGTAAT 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 CA 1 2 103077 CASAVA_Build 6 1484758 2D ACCACCTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1459 hom 23 7 11 6 T 13 11 103078 CASAVA_Build 6 1492658 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTGGGTAG 2332 het 2332 ref 16 11 5 0 T 4 5 103079 CASAVA_Build 6 1495362 2D ATATATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 43 18 17 9 AC 10 9 103080 CASAVA_Build 6 1508747 1I GATCAGGAAA -/G GGCAGCATTT 3070 hom 78 het 33 0 25 8 G 2 3 103081 CASAVA_Build 6 1508896 1D TCACTGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 T 11 10 103082 CASAVA_Build 6 1513297 1I CTATTTCCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 T 9 10 103083 CASAVA_Build 6 1513402 1D CTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 6 A 11 10 103084 CASAVA_Build 6 1514612 3D TTACAGTGTC TGA/--- TATCAGCAGA 3070 het 3070 ref 39 17 14 14 TGA 1 0 103085 CASAVA_Build 6 1515254 2D TTTATGCTAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TA 8 7 103086 CASAVA_Build 6 1516290 4D CTTTTTTTCT GGCA/---- GTTCAAACCT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 GGCA 1 0 103087 CASAVA_Build 6 1518274 12D CAAGTCATCT CAGCCCACATGC/------------ CAGCCCCAAA 3070 het 3070 ref 32 15 17 4 CAGCCCACATGC 1 0 103088 CASAVA_Build 6 1523315 3I GGACTGCGCG ---/GCA GCAGCCGGCG 3070 het 2936 hom 37 14 13 10 GCA 1 2 103089 CASAVA_Build 6 1528155 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2038 het 158 hom 15 4 6 5 A 19 18 103090 CASAVA_Build 6 1541657 1I GCGCTTCTCC -/G GGGTTGCCAC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 G 3 4 103091 CASAVA_Build 6 1581686 1I TTGGACTCAA -/T TCAAAGTTAC 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 1 2 103092 CASAVA_Build 6 1586049 1D ATTGGGTAAT G/- GGGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 G 8 7 103093 CASAVA_Build 6 1595975 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2007 hom 20 6 13 1 T 9 10 103094 CASAVA_Build 6 1597182 1D CTCCTGCACT G/- GCACGTGCTG 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 G 2 1 103095 CASAVA_Build 6 1613038 1I GCCATTCCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 T 8 9 103096 CASAVA_Build 6 1615604 1D TTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1944 hom 31 11 12 8 T 14 13 103097 CASAVA_Build 6 1619393 1D CAAGAGTTCC T/- GCTGCTCCTC 3070 het 3070 ref 49 24 18 9 T 1 0 103098 CASAVA_Build 6 1625766 1D CACCGTGACC T/- GACTTCTCAC 3070 het 3070 hom 39 13 22 5 T 1 0 103099 CASAVA_Build 6 1630455 1D CATGGTGAGA C/- CCCCGTCTCT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 5 4 103100 CASAVA_Build 6 1632769 25D CATCAGCAAG CTCCTGTGTTCCAGGCACCGTCCTT/------------------------- CTCCTGTGTT 3070 hom 72 het 30 0 22 17 CTCCTGTGTTCCAGGCACCGTCCTT 2 1 103101 CASAVA_Build 6 1635150 2I TGTAGATAAC --/AT ATAAAGCATG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AT 1 2 103102 CASAVA_Build 6 1640306 1I TGAGCAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 9 10 103103 CASAVA_Build 6 1655858 1D AGACCTGGAG C/- TCTCCGAGGA 3070 hom 87 het 31 0 24 8 C 1 0 103104 CASAVA_Build 6 1664856 2I TGATTTGTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2320 hom 35 9 14 12 A 12 14 103105 CASAVA_Build 6 1670365 1I AAATGGTTTC -/A AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 A 6 7 103106 CASAVA_Build 6 1679086 1D CTCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 21 1 15 6 A 13 12 103107 CASAVA_Build 6 1682961 2D61M4D CACACCACAA ACACACACACACATACACATACACATACACACACACCACACACACAGATACACATACATACACACAT/--ACACACACACATACACATACACATACACACACACCACACACACAGATACACATACATACAC---- ACATACACAC 3070 het 3070 hom 67 40 23 39 N/A 0 0 103108 CASAVA_Build 6 1683923 4D GCTTTCTAGC TTAA/---- TTAATGGCAA 3070 het 3070 ref 66 38 23 7 TTAA 2 1 103109 CASAVA_Build 6 1685921 1I AGAAGGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 11 12 103110 CASAVA_Build 6 1688971 1I35M1D ACCTTAAAGA -TTTTTTTTTTTAATACAGATAGGAGATGAAGATTTA/TTTTTTTTTTTTAATACAGATAGGAGATGAAGATTT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 18 10 4 N/A 0 0 103111 CASAVA_Build 6 1689074 1I GAAGCAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2713 hom 25 7 16 2 A 9 10 103112 CASAVA_Build 6 1689808 10D TAGCTCCCTG AACACTGTTA/---------- AACACTGGGG 3070 het 3070 hom 39 20 18 8 AACACTGTTA 1 0 103113 CASAVA_Build 6 1691461 2D GTCTTCTCTC TT/-- TGTCTCTCAA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 T 3 1 103114 CASAVA_Build 6 1700778 1I ATATGGAACC -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 7 8 103115 CASAVA_Build 6 1714943 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2074 het 2074 ref 23 7 7 9 T 11 10 103116 CASAVA_Build 6 1718704 1D GGGGATGCCT G/- GGGACTACAA 3070 het 3070 ref 56 29 23 5 G 4 3 103117 CASAVA_Build 6 1721760 1D GTCTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 2784 het 2425 hom 23 7 11 5 A 15 14 103118 CASAVA_Build 6 1726864 2D ATGGCTCTTC CA/-- CACATGGCCT 3070 het 3070 ref 40 17 17 9 CA 3 2 103119 CASAVA_Build 6 1730232 2D TGATGCAGAA AC/-- AATCTGTGCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AC 1 0 103120 CASAVA_Build 6 1769060 1D GCATTTTTTG T/- TGTTGTTGAG 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 2 1 103121 CASAVA_Build 6 1832521 1I GGCAGTGCTG -/A GCTTCTGAGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 103122 CASAVA_Build 6 1844528 1D TTGATTTGTG T/- TTTTTTTTTT 2069 het 2069 ref 41 30 6 5 T 12 11 103123 CASAVA_Build 6 1849011 1D TGCTTACGGG C/- GCCTCCCTCC 3070 het 3070 hom 45 21 21 4 C 1 0 103124 CASAVA_Build 6 1864094 5D TAGACGTTAC TTCCT/----- TTCATTTATG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 TTCCT 1 0 103125 CASAVA_Build 6 1870189 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 12 11 103126 CASAVA_Build 6 1874897 2I AGCAGAAAGC --/AA AGAGTTCCAT 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 A 1 3 103127 CASAVA_Build 6 1885409 4I ATTGTATATG ----/TGCA TGCATGCATG 3070 het 3070 hom 57 17 26 14 TGCA 4 5 103128 CASAVA_Build 6 1886303 1D TCCCCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 11 10 103129 CASAVA_Build 6 1891742 3D CTATGCTATC ATT/--- ATCATTACTA 3070 het 3070 hom 48 22 24 7 ATT 1 0 103130 CASAVA_Build 6 1896914 1I ACAAGCATGA -/G CCACCATGCC 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 G 0 1 103131 CASAVA_Build 6 1905607 1I CACAATAGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 9 10 103132 CASAVA_Build 6 1910309 3D4M1I TATCGTTGTT CCAGGTC-/---GGACA TTTGGGTTAG 3070 het 3070 ref 22 12 9 2 N/A 0 0 103133 CASAVA_Build 6 1914420 1D GTGTGAACCC G/- GGAGGCGGCG 1662 het 834 hom 7 2 5 1 G 3 2 103134 CASAVA_Build 6 1920271 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2595 hom 20 7 12 1 A 10 11 103135 CASAVA_Build 6 1921430 4D GGGTATACTC TTTG/---- TTTAAGTCTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 TTTG 1 0 103136 CASAVA_Build 6 1921885 5I ACAGATACTA -----/TTCTC TAAGAGGAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 TTCTC 0 1 103137 CASAVA_Build 6 1926494 1I TGGTTTTTGG -/A AAAAAAATTA 3070 het 2407 hom 22 6 14 2 A 7 8 103138 CASAVA_Build 6 1930619 1I TGCAAACCGA -/T TTTTTTTTTA 1803 het 1803 ref 27 11 8 8 T 9 10 103139 CASAVA_Build 6 1932506 13D TTTTAAAACC TTTTTTCAACTTT/------------- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 44 26 17 7 TTTTTTCAACTTT 1 0 103140 CASAVA_Build 6 1933589 1D TATACAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 12 11 103141 CASAVA_Build 6 1937896 2I CACTCCCAAT --/GC CCTTGGCCTA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 GC 0 1 103142 CASAVA_Build 6 1940740 3D GAGAGAACAT CAA/--- CAACAACAAA 3070 het 3070 hom 58 21 26 12 CAA 4 3 103143 CASAVA_Build 6 1941120 3D GTGATCTCTA CTT/--- CTTTGTTTAA 3070 het 3070 ref 50 28 19 4 CTT 2 1 103144 CASAVA_Build 6 1944109 1I AGGAAAACTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 8 9 103145 CASAVA_Build 6 1951500 1D GCAAACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 35 0 29 6 A 13 12 103146 CASAVA_Build 6 1959074 15I GAAAGGAAGA ---------------/AATATTTAAAGTAAT AATGGCTGAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AATATTTAAAGTAAT 0 1 103147 CASAVA_Build 6 1959159 22D GATAAAAACC ATATATATATATATATATATAT/---------------------- ATATATATAT 3070 hom 51 het 17 0 18 2 AT 17 6 103148 CASAVA_Build 6 1959347 1D ACAAAATTAT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 60 het 25 0 20 6 C 11 10 103149 CASAVA_Build 6 1970117 6D ATTAATTGAA AATATT/------ AGTAGAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 AATATT 1 0 103150 CASAVA_Build 6 1983817 1I AAAACACTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 28 0 19 9 A 9 10 103151 CASAVA_Build 6 2069274 1I ACTGTAAAGG -/T TTTTTTTTTT 970 het 970 ref 34 24 3 7 T 13 14 103152 CASAVA_Build 6 2184078 1I TGTACCAGTT -/A AAAAAAAAAA 1271 het 1271 ref 45 33 3 9 A 10 11 103153 CASAVA_Build 6 2244509 2D ATGCCTCTAA TG/-- TAATCCCAGC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 TG 1 0 103154 CASAVA_Build 6 2308503 1I ATAGTTTTAT -/A CGCACTATGT 3070 hom 154 het 62 0 52 10 A 0 1 103155 CASAVA_Build 6 2327162 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 11 A 14 12 103156 CASAVA_Build 6 2376852 4D TATCTACTGA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 AT 9 7 103157 CASAVA_Build 6 2389398 1I ATTCGTCTGC -/T TGGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 60 27 22 11 T 1 2 103158 CASAVA_Build 6 2394105 1D TCCCTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 10 A 11 10 103159 CASAVA_Build 6 2397821 4D TTTTGAGGGT TGTG/---- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 51 24 20 8 TG 6 4 103160 CASAVA_Build 6 2402410 2D15M3D TTTGTTTGTT TGTTTTTTTTGTGTGTGTTT/--GTTTTTTTGTGTGTG--- TTTTTTTGTT 2478 het 2478 ref 30 22 8 6 N/A 0 0 103161 CASAVA_Build 6 2404411 2I GATCTCAAGC --/AG AGTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 AG 1 2 103162 CASAVA_Build 6 2416505 23D CAGCCACAAG TGGCATAAACATCCACGCACTTA/----------------------- TGGCATAAAC 3070 het 3070 ref 47 29 17 11 TGGCATAAACATCCACGCACTTA 1 0 103163 CASAVA_Build 6 2419932 1I TTCCACTTAC -/A GTAACATTCA 3070 het 3070 hom 63 23 35 5 A 0 1 103164 CASAVA_Build 6 2433439 1I CACAAAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 27 0 25 2 A 11 12 103165 CASAVA_Build 6 2457035 1I CCCCATGTCC -/A AGTTTGTCTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 1 2 103166 CASAVA_Build 6 2457543 1D AATGTTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 31 0 25 7 T 10 9 103167 CASAVA_Build 6 2464171 1D ACCATACCCC T/- GTTCTTCATC 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 T 1 0 103168 CASAVA_Build 6 2464336 1D TTGGTTTTTT A/- TTGGGATTAT 3070 het 3070 hom 32 10 18 5 A 1 0 103169 CASAVA_Build 6 2464456 2I CATTATATGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 T 10 12 103170 CASAVA_Build 6 2464497 1D TTTTCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1267 hom 23 4 14 6 T 12 11 103171 CASAVA_Build 6 2465517 1D GACTCCATGA G/- CCATGGGCTG 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 G 1 0 103172 CASAVA_Build 6 2467466 1I GGTTTAGGTC -/T TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 T 2 3 103173 CASAVA_Build 6 2470613 2I CAATCTCAAG --/AA AAAAAAAAAA 2694 het 2694 ref 30 13 10 7 A 12 14 103174 CASAVA_Build 6 2470991 1I AAAACTTTTA -/T ATTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 T 0 1 103175 CASAVA_Build 6 2471181 1I CCTCTTCATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 8 9 103176 CASAVA_Build 6 2471930 1D GTACTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1925 hom 33 6 16 11 T 12 11 103177 CASAVA_Build 6 2478557 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 A 10 11 103178 CASAVA_Build 6 2479163 3D CCATTGTAAG ATA/--- ATAAGTGTTG 3070 het 3070 ref 41 28 11 3 ATA 2 1 103179 CASAVA_Build 6 2480175 1I TCTTCCTCCT -/C CTTCCGGTCT 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 C 1 2 103180 CASAVA_Build 6 2485732 2D TTTCCAGTGA TT/-- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 26 11 14 2 T 9 7 103181 CASAVA_Build 6 2490640 1I GATTTCAGAT -/A AAGAATGAAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 2 3 103182 CASAVA_Build 6 2490894 1I TTTTTTTTTT -/C CCTCTTGATC 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 C 2 3 103183 CASAVA_Build 6 2494217 1I GGAATTTTCC -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 A 1 2 103184 CASAVA_Build 6 2502741 3D TACATCAGCC TCT/--- TCTTGGGTTT 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 TCT 2 1 103185 CASAVA_Build 6 2510014 1I TGCTGTTGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 53 23 24 6 T 9 10 103186 CASAVA_Build 6 2518388 3I CCTTTTTCTG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 11 14 103187 CASAVA_Build 6 2519108 1D GTTTAATGCA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 2239 hom 29 6 18 5 T 8 7 103188 CASAVA_Build 6 2522077 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTCCT 3022 het 1966 hom 27 10 11 6 G 0 1 103189 CASAVA_Build 6 2526157 3D TGTTGTTGCT CTA/--- CTACTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 CTA 2 1 103190 CASAVA_Build 6 2539991 1D TCAGAAACTG C/- CCATCCCCAG 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 C 3 2 103191 CASAVA_Build 6 2543511 1I TCATTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2584 hom 25 7 11 7 A 9 10 103192 CASAVA_Build 6 2548979 4D TGTTTTTGTT TTTA/---- TTTATTTGTT 3070 het 3070 ref 24 10 9 8 TTTA 2 1 103193 CASAVA_Build 6 2550032 1I GGTAAAAGGG -/A AAAACAATAC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 4 5 103194 CASAVA_Build 6 2550520 60D AAGGAAGGAG GGAAGGAATGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAAGGAGGGAAGGGAAGGGAAGGGAAGGAA/------------------------------------------------------------ GGAAGGGAAG 2687 hom 39 het 5 0 11 9 GGAAGGAATGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAAGGAGGGAAGGGAAGGGAAGGGAAGGAA 1 0 103195 CASAVA_Build 6 2558380 2I ATAAAAATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 AT 5 6 103196 CASAVA_Build 6 2560797 2D AAATAACGTG CA/-- TGTGTGTGTG 3070 het 153 hom 28 2 15 13 CA 1 0 103197 CASAVA_Build 6 2571615 1D TCCTAACAGA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 77 het 49 1 40 8 T 7 6 103198 CASAVA_Build 6 2577702 1D TGCAGCCCCC G/- ACCCCAGCCC 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 G 1 0 103199 CASAVA_Build 6 2580682 1D GTGGGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 20 3 10 7 T 17 16 103200 CASAVA_Build 6 2586818 2D CACAGACAGG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 53 20 19 16 CA 9 8 103201 CASAVA_Build 6 2594149 1I CTTAAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 36 1 27 8 A 10 11 103202 CASAVA_Build 6 2605875 3D AATAAAAATG TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 TAA 5 4 103203 CASAVA_Build 6 2613263 1D TGAGCGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3047 het 399 hom 17 4 11 2 A 10 9 103204 CASAVA_Build 6 2613340 1D GTGCAAGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 10 9 103205 CASAVA_Build 6 2627608 3I ATAATGAGAC ---/ATA ATGAGAGAGG 3070 hom 75 het 30 0 23 7 ATA 0 1 103206 CASAVA_Build 6 2635213 1I AGCATCTTGA -/T TAACATTCAC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 1 2 103207 CASAVA_Build 6 2651447 1I ATTGTATACT -/A GTTTTCTGTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 1 103208 CASAVA_Build 6 2658622 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 A 7 6 103209 CASAVA_Build 6 2661255 1D CTGCTGCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 29 0 20 9 T 10 9 103210 CASAVA_Build 6 2662578 1I AAATGAAAAT -/C CTGAAATATA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 C 1 2 103211 CASAVA_Build 6 2663425 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 308 hom 27 1 22 4 G 0 1 103212 CASAVA_Build 6 2665641 2D ATCTAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 12 10 103213 CASAVA_Build 6 2666768 1D TATTTTCTTT C/- CCTTTTCTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 3 2 103214 CASAVA_Build 6 2669920 1D CATTTTGTAA T/- GATGCGGTGA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 1 0 103215 CASAVA_Build 6 2675973 1I TATTCATCTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 7 8 103216 CASAVA_Build 6 2676491 1D TAGGGGTGAC A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 8 7 103217 CASAVA_Build 6 2680621 1I AGCTCTTGGG -/A AAAAATATAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 5 6 103218 CASAVA_Build 6 2686335 3I TTAAATGACT ---/CAA CATATGAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 CAA 0 1 103219 CASAVA_Build 6 2686955 21D ATGAGGACAT GTTGTACACTCTAATTTAGGA/--------------------- GAGATTTTCT 3070 het 3070 ref 56 40 19 9 GTTGTACACTCTAATTTAGGA 1 0 103220 CASAVA_Build 6 2687320 1D TTGCTTACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 19 14 9 A 10 9 103221 CASAVA_Build 6 2689373 6D TCTGCCCTGA GGAGTG/------ GGTGTCACCG 3070 het 3070 ref 50 26 22 5 GGAGTG 1 0 103222 CASAVA_Build 6 2690543 1I CTGACAAAAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 8 9 103223 CASAVA_Build 6 2691342 1I AAAAAAATAT -/A AAAAAAAAAT 2443 het 2443 ref 25 14 6 5 A 9 10 103224 CASAVA_Build 6 2695035 1D CTGCTTCCCC T/- GGCCTCCCTC 3070 het 3070 ref 38 15 17 6 T 1 0 103225 CASAVA_Build 6 2695847 1D GATACAATAA T/- TTTGCAAAGA 3070 het 3070 ref 43 25 11 7 T 4 3 103226 CASAVA_Build 6 2698913 1I CTTAATAATA -/G TATGACAAAA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 G 0 1 103227 CASAVA_Build 6 2699960 3D GCTTGTTAAA AGG/--- AGAGGAAAAA 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 AGG 1 0 103228 CASAVA_Build 6 2700239 1D GAGCAAGAAA G/- ATAATGATGT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 G 1 0 103229 CASAVA_Build 6 2702839 2D ATACTTCCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 11 11 A 13 11 103230 CASAVA_Build 6 2707746 4D CGTTATCTCT ATAA/---- ATGTTTAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 26 6 ATAA 1 0 103231 CASAVA_Build 6 2709806 3I AGCAAAAAAT ---/AAC AACATGGTAA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 AAC 1 2 103232 CASAVA_Build 6 2722342 1I CATTCTGCTG -/T GAAATATCAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 0 1 103233 CASAVA_Build 6 2722563 8I TCCGCATAGT --------/AGGGATGG AGGGATGATG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 AGGGATGG 0 1 103234 CASAVA_Build 6 2728314 1I GAAGACTCGT -/C CCCCCTCCAC 3070 hom 63 het 28 0 19 9 C 5 6 103235 CASAVA_Build 6 2731925 4D AGGTAAGAAA TTAC/---- TTGTGCATTG 3070 hom 129 het 46 0 44 5 TTAC 1 0 103236 CASAVA_Build 6 2743350 2D TTTCTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 21 0 13 8 T 13 11 103237 CASAVA_Build 6 2743643 21D CAACCCCTTT CTCCGGGGACATTTACTCTTC/--------------------- CTCCGGGGAC 3070 hom 84 het 36 0 25 14 CTCCGGGGACATTTACTCTTC 2 1 103238 CASAVA_Build 6 2766223 1D GGTGTGTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 10 9 103239 CASAVA_Build 6 2776220 8I TTCTTTTGCC --------/TTTTGAGG TTTTATCATA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 TTTTGAGG 0 1 103240 CASAVA_Build 6 2779371 1D GTTTTGTGCC A/- AAACAGATTC 3070 het 3070 ref 47 20 21 7 A 4 3 103241 CASAVA_Build 6 2785069 1I CCTGAAGCTG -/C CGGGTCTCCC 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 C 1 2 103242 CASAVA_Build 6 2792821 2D GCTGAGGCTC GA/-- GAGTCGCTTG 2709 hom 21 het 8 0 7 1 GA 2 1 103243 CASAVA_Build 6 2795076 1D AATTAATTAA T/- TAAAAAAAAA 1363 het 931 hom 6 2 3 1 T 2 1 103244 CASAVA_Build 6 2799781 3D GGAGTGCACC ATG/--- ATATCACCAC 3070 het 3070 ref 46 27 14 7 ATG 1 0 103245 CASAVA_Build 6 2804022 1I CCTACCTCTT -/C CCCCACACCC 3070 hom 81 het 30 0 25 5 C 4 5 103246 CASAVA_Build 6 2806224 2D CCAATTGACA CT/-- CTGTATCTAG 3070 het 469 hom 11 1 7 3 CT 2 1 103247 CASAVA_Build 6 2809596 1I GCCAACATGG -/T TGAAACCCCG 3070 hom 66 het 26 0 23 8 T 1 2 103248 CASAVA_Build 6 2809740 6D ACTCTGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 21 0 16 5 A 24 18 103249 CASAVA_Build 6 2813467 1I TGTTTCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 11 12 103250 CASAVA_Build 6 2814599 4D16M3I CCTGAAGAAC GTAAAAAAAAAAAATCAAAA---/----ATAAAAAAAATCAAAAACC ACCCCAACAC 3070 hom 99 het 32 0 32 8 N/A 0 0 103251 CASAVA_Build 6 2814712 24D CTCCTGCTAA TGGTCCATTTTACAGAGAGCTGAT/------------------------ TGGTCCATTT 3070 het 3070 ref 29 13 14 10 TGGTCCATTTTACAGAGAGCTGAT 2 1 103252 CASAVA_Build 6 2816619 2I AAATATATTT --/TA TATATATATT 1657 het 1654 hom 14 4 7 3 TA 4 5 103253 CASAVA_Build 6 2817898 1I AGAACCGCAT -/G GGGGAACCAC 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 G 4 5 103254 CASAVA_Build 6 2819254 5D TTTAAAAATT AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 53 hom 14 1 9 5 AAAAG 3 2 103255 CASAVA_Build 6 2819281 3D AAAAATAAAA AAT/--- AATAATAACA 2023 het 725 hom 21 6 7 9 AAT 3 2 103256 CASAVA_Build 6 2821080 4D AGAGCGGCTC AAAT/---- AAATAAATAA 2616 hom 16 het 10 0 6 5 AAAT 5 4 103257 CASAVA_Build 6 2829932 1D TTTCTTACCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 103258 CASAVA_Build 6 2849165 1I TGTGGTGTAA -/G GCAGCCCCAT 2521 het 2521 ref 40 26 6 8 G 1 2 103259 CASAVA_Build 6 2853188 2I GCTCAAGTAC --/GT GTGTCGAGGT 649 het 649 ref 43 17 3 23 GT 2 3 103260 CASAVA_Build 6 2853629 9D GGCAGGTGGC CCCCTGTGT/--------- CCCCAGTATT 3070 het 3070 ref 30 19 11 4 CCCCTGTGT 1 0 103261 CASAVA_Build 6 2859945 2I ATAAAATCCC --/CT GATTGCTGCT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 CT 0 1 103262 CASAVA_Build 6 2861494 1I TATAAACAGG -/T GTATCATCCC 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 T 0 1 103263 CASAVA_Build 6 2867440 4D AGCAATGTTT CAAA/---- CAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 6 CAAA 3 2 103264 CASAVA_Build 6 2868115 1D AGATACTTGA T/- TATCACAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 T 2 1 103265 CASAVA_Build 6 2875248 3I AGTCTCAGCT ---/TAG ACTAGGGAGG 3070 het 1510 hom 18 4 14 0 TAG 0 1 103266 CASAVA_Build 6 2882585 2I CAGCACAGTG --/TT TTTTTGGTGA 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 T 5 7 103267 CASAVA_Build 6 2884517 1I GACTCCGTCC -/A AAAAAAAAAA 1499 het 1499 ref 28 14 4 10 A 15 16 103268 CASAVA_Build 6 2884662 1D AATTCTTTCC T/- TTTAAAAGTA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 4 3 103269 CASAVA_Build 6 2886338 4D TTCTGAAAGT AAAC/---- AAAGCCCTAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 AAAC 1 0 103270 CASAVA_Build 6 2891364 4I CCTGTCAGAG ----/GTCA GTAACACATA 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 GTCA 0 1 103271 CASAVA_Build 6 2895766 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1669 het 469 hom 19 2 9 9 A 17 16 103272 CASAVA_Build 6 2900429 1I TCTCAAAAAA -/C AAAAAAACAA 267 het 48 hom 17 1 1 15 C 0 1 103273 CASAVA_Build 6 2903796 15D GAAGCATGTG GAAGGCCCCAGCGGA/--------------- GAAGGCCACG 2115 het 2115 ref 26 11 10 7 GAAGGCCCCAGCGGA 1 0 103274 CASAVA_Build 6 2905634 1D GTGAGAGGAC A/- AGGGGCAGCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 2 1 103275 CASAVA_Build 6 2906215 1I TGAAGATGAA -/G GGGCCTCAAG 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 G 3 4 103276 CASAVA_Build 6 2906549 1D TTAAGATTAC T/- AATTTCTAAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 1 0 103277 CASAVA_Build 6 2913215 6D TCATTCTCCC ATAAAG/------ ATACACGCAC 2367 het 2367 ref 24 15 5 7 ATAAAG 1 0 103278 CASAVA_Build 6 2913698 1D TTAAAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 115 het 45 0 38 7 A 11 10 103279 CASAVA_Build 6 2917866 9I TGCTGATGGA ---------/AATGTAAAC TAGTACAACC 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 AATGTAAAC 0 1 103280 CASAVA_Build 6 2933113 3D CTCTGACTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 1987 hom 24 het 18 0 9 10 A 19 16 103281 CASAVA_Build 6 2935007 1I TTAAGAGCAC -/G GGGGGGGAAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 7 8 103282 CASAVA_Build 6 2935118 26I TCATGGCGAC --------------------------/CGTCAGTTGTCACGGCGCTGGTGGGA ATGTTGTTTA 3070 hom 81 het 28 0 27 3 CGTCAGTTGTCACGGCGCTGGTGGGA 0 1 103283 CASAVA_Build 6 2937403 2I AGCTCATAAG --/AT ATTTTAAAGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AT 1 2 103284 CASAVA_Build 6 2957725 1D TGGTTGGGAT G/- GGCTGTGGAT 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 G 3 2 103285 CASAVA_Build 6 2965508 1I CATAGAATGA -/T TTTTTTTTTT 2473 het 2473 ref 27 13 9 5 T 10 11 103286 CASAVA_Build 6 2965698 18D CTCACTGAGA TTTTCTTTTCTTTCTTTC/------------------ TTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 31 22 13 1 TTTTCTTTTCTTTCTTTC 1 0 103287 CASAVA_Build 6 2967940 1D8M4D GAGACCTGTC TCAAAAAACAAAT/-CAAAAAAC---- AAATAAATAA 3070 hom 67 het 27 0 21 8 N/A 0 0 103288 CASAVA_Build 6 2972016 8I4M1I TCGATGCAGC --------CAGT-/AAACACATCACTG GATGTGTTTG 3070 hom 114 het 39 0 38 5 N/A 0 0 103289 CASAVA_Build 6 2973868 1D CAAACCCACC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 10 9 103290 CASAVA_Build 6 2973933 15D AATCAGACCA AGAACCCACCAATTC/--------------- AGAACCCACC 3070 hom 45 het 24 0 16 11 AGAACCCACCAATTC 2 1 103291 CASAVA_Build 6 2974070 5I CCTTTTTCCT -----/TCTCA TCTCGGTAGA 3070 hom 78 het 38 0 27 11 TCTCA 0 1 103292 CASAVA_Build 6 2975127 2I ACAATGGTGG --/AA AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 45 0 33 12 A 8 10 103293 CASAVA_Build 6 2986313 2D TTAATCTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 20 5 T 13 11 103294 CASAVA_Build 6 2986527 1I CCTCCACAGG -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 6 7 103295 CASAVA_Build 6 2990150 5I GATGCAAGAT -----/AAATG AAACAGTAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAATG 0 1 103296 CASAVA_Build 6 2996509 1I GAAAAGAGCG -/T TAACTGTGGC 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 T 1 2 103297 CASAVA_Build 6 3012832 2I TTTAAGAGGG --/TT TTTTTTTTGG 3070 hom 94 het 36 0 32 4 T 8 10 103298 CASAVA_Build 6 3014388 3I ACGCCATTAA ---/TGT TGTTGTTTTG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 TGT 2 3 103299 CASAVA_Build 6 3017624 4D ATCTATTTAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AT 7 5 103300 CASAVA_Build 6 3018456 4D20M5D GTGTATATAT ACACACATATACATTTTTATATCATATAT/----ACATATACATTTTTATATCA----- TATATATTAC 3070 hom 78 het 21 0 27 2 N/A 0 0 103301 CASAVA_Build 6 3019964 4D GCTGGAGTGC AGTG/---- AGTGGCATGC 2906 hom 15 het 6 0 6 1 AGTG 2 1 103302 CASAVA_Build 6 3029703 1I TGCTTCTCTT -/G CCTGGAGTCC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 0 1 103303 CASAVA_Build 6 3031051 2D CTGGGTGCCT TA/-- TATATAAGTG 3070 hom 123 het 43 0 41 3 TA 4 3 103304 CASAVA_Build 6 3031310 11D AGCTGGCATC TTTAGAAAGTA/----------- TTTTGCCGTC 3070 hom 105 het 37 0 34 5 TTTAGAAAGTA 1 0 103305 CASAVA_Build 6 3033038 1I TCCCAAAGTG -/C TGGGATTACA 3070 hom 41 het 16 0 14 2 C 0 1 103306 CASAVA_Build 6 3083418 1D CACAGGCACA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 8 7 103307 CASAVA_Build 6 3094603 1I GCACCAACCC -/A AGCAGCCCGA 3070 hom 100 het 39 0 31 8 A 1 2 103308 CASAVA_Build 6 3101767 1I TCGTGGCAGG -/A CCAAGGACAG 3070 hom 59 het 24 0 17 7 A 0 1 103309 CASAVA_Build 6 3103460 1D GGCGGGGGTT G/- GGGGGGCTAT 1104 hom 16 het 8 0 5 3 G 7 6 103310 CASAVA_Build 6 3106629 1D AAGTTTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1402 hom 24 4 10 10 T 15 14 103311 CASAVA_Build 6 3107471 2I GCCCTCCTGC --/CG CGCGTTCCCT 3070 hom 89 het 36 0 29 7 CG 2 3 103312 CASAVA_Build 6 3113766 1I AGCTTCAAAA -/T CCCCTAAAAC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 0 1 103313 CASAVA_Build 6 3123897 1I TTGCCTATAG -/C CTATGAAGCC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 1 2 103314 CASAVA_Build 6 3125113 1I GCAGCCGCTG -/C TGAGGGGCTT 902 hom 7 het 4 0 3 1 C 0 1 103315 CASAVA_Build 6 3125167 1I TAGACTGAAA -/G GCTGGGAGGG 1540 hom 12 het 5 0 5 0 G 1 2 103316 CASAVA_Build 6 3153327 1D GTATCTAAGG T/- TCCCCAGCAC 3070 hom 147 het 51 0 49 3 T 2 1 103317 CASAVA_Build 6 3154312 27D GCAGCGAAAA GTGTCACCTATGAAACTCTCCAGACAG/--------------------------- GTGGGGTGGG 3070 hom 99 het 32 0 31 6 GTGTCACCTATGAAACTCTCCAGACAG 1 0 103318 CASAVA_Build 6 3159536 1D AAATAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 2621 het 2384 hom 31 11 8 12 T 19 18 103319 CASAVA_Build 6 3169824 1D ACAAAAAAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 8 103320 CASAVA_Build 6 3199685 1I AGTTTTCTGC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 99 het 35 0 32 4 T 7 8 103321 CASAVA_Build 6 3200691 2D CCACCACCTC TT/-- TTATCTTCCC 3070 hom 109 het 43 0 34 9 T 4 2 103322 CASAVA_Build 6 3201103 1D ATGCAAATTG T/- TTTGTCTTCC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 4 3 103323 CASAVA_Build 6 3202187 1I CAGATAATGA -/G GGGGGGTTCC 3070 hom 65 het 25 0 22 3 G 6 7 103324 CASAVA_Build 6 3203307 5D AAATGGGCTG TTTTC/----- TTTTACCACC 3070 hom 114 het 43 0 39 6 TTTTC 1 0 103325 CASAVA_Build 6 3203408 8D TATGACAATG GGATGATT/-------- GGATGATTGT 3070 hom 111 het 37 0 38 1 GGATGATT 2 1 103326 CASAVA_Build 6 3205441 2I AGCCCGACTC --/TT TTCTCATAAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 4 103327 CASAVA_Build 6 3206463 2I TTCTTTTCCT --/TG TTTCCTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 23 5 TG 0 1 103328 CASAVA_Build 6 3207842 4D ACACAGTAGC TGTT/---- TGTTCAGTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TGTT 2 1 103329 CASAVA_Build 6 3208382 1D AGATGCTGGT G/- GCTGGTGCCC 3070 hom 129 het 47 0 43 4 G 2 1 103330 CASAVA_Build 6 3210518 4I TCAAGTTGAA ----/TATT AATGCACTAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TATT 0 1 103331 CASAVA_Build 6 3210889 1D ACACTGCCTG C/- CTTTAGATCA 3070 hom 72 het 27 0 21 6 C 2 1 103332 CASAVA_Build 6 3211153 3D GACACATTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 28 6 T 15 12 103333 CASAVA_Build 6 3212097 5I TTAAATACTT -----/TATTA ATTTTTTTTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TATTA 0 1 103334 CASAVA_Build 6 3212404 1D TGTGTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1764 het 229 hom 13 1 8 5 T 17 16 103335 CASAVA_Build 6 3214409 1I TTACTGATGG -/C CCCCCGTCTC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 5 6 103336 CASAVA_Build 6 3214894 2I CCTCAAGGAC --/AG AGGGAGGGAA 3070 hom 117 het 47 0 38 9 AG 1 2 103337 CASAVA_Build 6 3216472 3I GGAAGGTGAG ---/GAT GAGCTGGACG 3070 hom 110 het 38 0 33 5 GAT 0 1 103338 CASAVA_Build 6 3230845 1D TGTGTGAGCA G/- GAGACTCCCT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 G 2 1 103339 CASAVA_Build 6 3246223 1I CAGGCACTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 8 9 103340 CASAVA_Build 6 3260401 1D GGAAAAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 11 10 103341 CASAVA_Build 6 3266342 7D GTGGCAGAGG TCCAGGC/------- TCTGTGTCCG 3070 het 3070 ref 55 29 23 6 TCCAGGC 1 0 103342 CASAVA_Build 6 3267195 1I CAAAATATTG -/A AAAGTTGCTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 3 4 103343 CASAVA_Build 6 3274493 1D CCAATCTTTG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 9 8 103344 CASAVA_Build 6 3277625 1D TAATACTTCT A/- AATAGAGAAG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 3 2 103345 CASAVA_Build 6 3288762 2D TTTAGACATC TT/-- TTTTTCAATA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 T 7 5 103346 CASAVA_Build 6 3290163 5I CTAGTCTTGA -----/TGAAT TGTTCAAGAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 TGAAT 0 1 103347 CASAVA_Build 6 3292506 1I ATGCATCTGT -/C CCCCCCAACT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 C 6 7 103348 CASAVA_Build 6 3296217 1I TTTTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2408 hom 29 7 15 7 A 11 12 103349 CASAVA_Build 6 3297340 1I CAGAGGCCAT -/G GGCAAAACCA 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 G 2 3 103350 CASAVA_Build 6 3301425 4I AAACATCTCA ----/TAGT TAATCACGAA 3070 het 2506 hom 21 6 11 4 TAGT 0 1 103351 CASAVA_Build 6 3303532 1I GTGTTATCCA -/C CAACAGCCAA 3070 het 3070 hom 64 26 27 11 C 1 2 103352 CASAVA_Build 6 3303765 1D GCAAATTCAG A/- AAATCAAAGA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 A 4 3 103353 CASAVA_Build 6 3307322 1I GAAAAATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 10 11 103354 CASAVA_Build 6 3322906 1D AGATCAGTGA T/- CTCAGGCTGT 3070 hom 132 het 50 0 43 8 T 1 0 103355 CASAVA_Build 6 3326573 1I CAGCCATCTT -/C CAACTTTATA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 C 1 2 103356 CASAVA_Build 6 3348410 1D AATGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 35 0 24 11 T 13 12 103357 CASAVA_Build 6 3349452 1I ACATAGATCT -/A ACCTTCACCA 3070 het 3070 ref 46 29 15 2 A 1 2 103358 CASAVA_Build 6 3350191 1I TTTGAAGCTT -/A AAAAAAAAAA 2125 het 2125 ref 28 10 10 8 A 13 14 103359 CASAVA_Build 6 3356865 1D ATAAAACTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 11 10 103360 CASAVA_Build 6 3375769 4D GTTCCATGAC TATT/---- TATTGGTCAC 3070 hom 118 het 43 0 38 6 TATT 2 1 103361 CASAVA_Build 6 3384595 1I GGCATTTCTG -/A AAAGTTCCCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 103362 CASAVA_Build 6 3410434 1I ACACTCCAAA -/G GTTAAAAGAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 2 103363 CASAVA_Build 6 3417329 1I ATCTACTGAA -/C CCCCCCCATT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 C 7 8 103364 CASAVA_Build 6 3417702 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAGAAAAA 3070 het 617 hom 32 4 19 9 A 4 5 103365 CASAVA_Build 6 3426887 1D TCCCACTGCT G/- CCAGACTCTG 3070 hom 96 het 38 0 28 10 G 1 0 103366 CASAVA_Build 6 3437470 1I CATAGGAGGG -/T TGTTAGGAAG 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 1 2 103367 CASAVA_Build 6 3447687 2D GAATTCTGCA AT/-- ATATTAGCCG 3070 het 3070 hom 52 20 29 5 AT 3 2 103368 CASAVA_Build 6 3452005 1I AGTAATTTCA -/T TTTCCAGGGA 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 T 3 4 103369 CASAVA_Build 6 3453134 1I TTAGGGGACT -/C CCCGGGGGTG 3070 het 3070 hom 40 19 16 5 C 3 4 103370 CASAVA_Build 6 3464860 4D AGCAATTGTC TCTT/---- TCCAAAGAAA 3070 het 3070 ref 36 24 9 3 TCTT 1 0 103371 CASAVA_Build 6 3470246 3D CTATAATTAA ATT/--- ATAGATCCTG 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 ATT 1 0 103372 CASAVA_Build 6 3478991 1D GCATGATGCC T/- TACAGGTGGG 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 2 1 103373 CASAVA_Build 6 3489040 4D TATATCTATC ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 53 23 22 8 ATCT 5 4 103374 CASAVA_Build 6 3505909 1D TTTCTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 966 hom 29 6 12 11 T 11 10 103375 CASAVA_Build 6 3515708 1I GTTACGTTGT -/G GGCAGATTCT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 G 2 3 103376 CASAVA_Build 6 3519478 1I TTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 2899 hom 26 9 13 4 G 0 1 103377 CASAVA_Build 6 3531899 4I ATTAACAAAC ----/AAAG GTAAGGCAAT 3070 het 1512 hom 18 5 11 2 AAAG 0 1 103378 CASAVA_Build 6 3551996 1D ATGGACTGTC T/- TCACCCACCT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 T 2 1 103379 CASAVA_Build 6 3553526 1D CCCAGCGTGG C/- TTCGGCAACT 3070 het 3070 ref 95 58 21 18 C 1 0 103380 CASAVA_Build 6 3566726 5I CACAAAGTGT -----/CTTGC CTTGCCTGGC 3070 hom 87 het 35 0 28 7 CTTGC 1 2 103381 CASAVA_Build 6 3568407 1I TCTTAAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 24 0 14 10 T 12 13 103382 CASAVA_Build 6 3580557 4D ATATTAACTT AAAA/---- AAGAAAGTGA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 A 6 2 103383 CASAVA_Build 6 3580876 1D GCAGCAGCTG C/- CCTGGCAGAG 3070 hom 96 het 42 0 31 12 C 3 2 103384 CASAVA_Build 6 3581622 11D CCCTGCGTCT CAGCTGAGCCC/----------- CATTGCATCC 3070 het 3070 ref 31 19 11 6 CAGCTGAGCCC 1 0 103385 CASAVA_Build 6 3581781 1D TTATCATTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 10 9 103386 CASAVA_Build 6 3584284 36D ATTGGACTCC ACTAAAGTTAACTCTTGTAATGATCATTTAGACTGT/------------------------------------ ATTAAAGTTA 3070 het 3070 ref 38 32 12 5 ACTAAAGTTAACTCTTGTAATGATCATTTAGACTGT 1 0 103387 CASAVA_Build 6 3600122 1D AGTCCATGTC T/- TTTTTTTTTT 1567 het 1567 ref 38 23 5 10 T 15 14 103388 CASAVA_Build 6 3630530 5D TTTTATATAA AATAT/----- ATGTTTAAAT 1691 het 994 hom 6 2 4 1 AATAT 1 0 103389 CASAVA_Build 6 3633378 2I AAAAAGTGTC --/TT TATTTTTGCA 3070 het 3070 hom 43 22 19 2 T 1 3 103390 CASAVA_Build 6 3635330 1D TGGGGCTTCT A/- ATTTCTATCC 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 2 1 103391 CASAVA_Build 6 3636255 7I TTTTTTAGTT -------/GCTTTCA GCCCCTAAAC 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 GCTTTCA 0 1 103392 CASAVA_Build 6 3637490 1I AAAGAAAGGG -/A AAAAGGCTAG 3070 het 2906 hom 27 8 13 6 A 4 5 103393 CASAVA_Build 6 3638056 4I AGAAAAACAC ----/TCTT TTTTTTTCTT 1897 het 1897 ref 26 19 5 2 TCTT 0 1 103394 CASAVA_Build 6 3640317 4D TATGATTTTC TTTG/---- TTTTAGAGGC 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 TTTG 1 0 103395 CASAVA_Build 6 3640484 1D ATTTAGTCCA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 7 6 103396 CASAVA_Build 6 3640613 3I TCCCACCCTT ---/ATC ATTTTCTTAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 ATC 0 1 103397 CASAVA_Build 6 3641363 2I CTGCAAATCC --/CA CAGTCTCCAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 CA 1 2 103398 CASAVA_Build 6 3641620 5I TCTTGCTCTA -----/AATTG AATATTACAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AATTG 0 1 103399 CASAVA_Build 6 3643609 2D CCTACTCTGT AA/-- GAGAGTGCTC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 2 0 103400 CASAVA_Build 6 3644310 1D TGACACACAT G/- GGAAGCCAAT 3070 het 3070 ref 56 25 21 10 G 3 2 103401 CASAVA_Build 6 3644820 2I GGATTCCATG --/AA GAGAGGGCTT 3070 het 3070 hom 56 24 25 7 A 0 2 103402 CASAVA_Build 6 3645117 1D CACTAACTTT A/- AGATAGTATC 3070 het 3070 ref 37 18 8 11 A 2 1 103403 CASAVA_Build 6 3645503 3D AACCCATGGA TTG/--- TTGTTATTTT 3070 het 3070 hom 40 14 18 11 TTG 2 1 103404 CASAVA_Build 6 3645863 3D CTAACCCCTC TTT/--- TTATCATTTT 3070 het 3070 hom 51 22 26 4 T 5 2 103405 CASAVA_Build 6 3646737 3I ATAAACATTA ---/GTT GTTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 GTT 2 3 103406 CASAVA_Build 6 3648009 3I GTGTGTGCTT ---/GTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 55 21 30 4 GTG 0 1 103407 CASAVA_Build 6 3648088 2D66M2D TGTGTATATC TGTGTGTGTGTACATCTGTGTCAGTGTTTGTGCATATCTGTGTGTCTTAGTATGTGTGTCTGAGTGTGTC/--TGTGTGTGTACATCTGTGTCAGTGTTTGTGCATATCTGTGTGTCTTAGTATGTGTGTCTGAGTGTG-- TCTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 36 38 9 N/A 0 0 103408 CASAVA_Build 6 3650375 1I ATTGGTAGAT -/A AAAGGTGCTG 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 A 3 4 103409 CASAVA_Build 6 3662496 2D51M1I TTCACTCGTC CACAGAGAGAAAGAAAAAGCATGGTATAGTCACTTTTTAAAATTGCTTATTGA-/--CAGAGAGAAAGAAAAAGCATGGTATAGTCACTTTTTAAAATTGCTTATTGAT TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 46 1 52 4 N/A 0 0 103410 CASAVA_Build 6 3683268 1D CCCTGCCCAG C/- CCGGGGCCTG 3070 hom 49 het 24 0 16 8 C 3 2 103411 CASAVA_Build 6 3688450 1D GCAGGATGCT G/- GCTCGGGTGC 3070 hom 135 het 51 0 42 10 G 2 1 103412 CASAVA_Build 6 3705461 2D TATCATGAGC AG/-- AGTTAGTGAG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 AG 2 1 103413 CASAVA_Build 6 3708755 3I ACGTGAATAA ---/TTG TTGTATCTAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TTG 1 2 103414 CASAVA_Build 6 3716546 4I CGCCTAAACC ----/TTCA TTCATCCCTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 TTCA 1 2 103415 CASAVA_Build 6 3720973 1I TTCTAAGGTG -/T TAGCTAGGGC 3070 het 3070 ref 39 19 8 12 T 1 2 103416 CASAVA_Build 6 3722016 3I6M1D ATGTGTGTGT ---GTGTGTG/TGGATGTGT- TATGTATGTG 1929 het 1466 hom 20 7 7 9 N/A 0 0 103417 CASAVA_Build 6 3723716 2D CTCTCATAAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 GT 8 7 103418 CASAVA_Build 6 3753307 7D ACTCATGCAG ATACATC/------- TTTGCAAGAA 2941 het 2941 ref 20 15 7 3 ATACATC 1 0 103419 CASAVA_Build 6 3761774 2D CTGGCTTGAA AC/-- ACAGAAGCAG 3070 het 3070 ref 55 33 19 4 AC 2 1 103420 CASAVA_Build 6 3771213 1I CATTTCTCCT -/G GTGCTTCTTG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 G 1 2 103421 CASAVA_Build 6 3783020 2D CTGAACTGGC TT/-- TTATAACAGA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 4 2 103422 CASAVA_Build 6 3785220 1I GTTGTTGTTG -/T TTGTTTGTTT 3070 het 3038 hom 26 12 12 2 T 2 3 103423 CASAVA_Build 6 3785715 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAACAT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 8 7 103424 CASAVA_Build 6 3802036 10I GATTGGGTGA ----------/GATTTTTGAT GACCCATGAA 3070 hom 114 het 40 0 37 4 GATTTTTGAT 0 1 103425 CASAVA_Build 6 3803258 1D GCAAGCCAGC T/- TCCCTGTCAT 3070 het 3070 hom 53 21 22 10 T 2 1 103426 CASAVA_Build 6 3804551 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 A 1 0 103427 CASAVA_Build 6 3805283 10D TGATATATCT TGATATGATA/---------- TGATATGATA 3070 het 522 hom 47 3 19 27 TGATA 5 3 103428 CASAVA_Build 6 3806080 1D CAGGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 2820 het 2820 ref 17 9 8 0 T 11 10 103429 CASAVA_Build 6 3808139 4I CATCTCTAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 64 het 23 0 21 2 AAAC 2 3 103430 CASAVA_Build 6 3814367 4I TTTTTCCTCC ----/CAGT CATTTTTGTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 CAGT 0 1 103431 CASAVA_Build 6 3840924 1D GGACCCATCA G/- GAGCTTGGAA 3070 het 3070 ref 34 19 15 1 G 2 1 103432 CASAVA_Build 6 3842280 1I AAGCTCCAAG -/A CTCAAGTGAT 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 0 1 103433 CASAVA_Build 6 3854982 1D CCAAGGAAAG A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 7 6 103434 CASAVA_Build 6 3865488 1I ACCCAACTAA -/T TTTTGTATTT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 4 5 103435 CASAVA_Build 6 3867491 1D TAGAAATATA T/- TTTTTAAGAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 T 6 5 103436 CASAVA_Build 6 3870766 1D TTCTCAACTT A/- AAAGTGTGGC 3070 het 246 hom 29 1 16 12 A 4 3 103437 CASAVA_Build 6 3890773 1I TATATCCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 10 11 T 11 12 103438 CASAVA_Build 6 3892514 5I CGGGTTTCTC -----/TGATT TATTTATTTT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 TGATT 0 1 103439 CASAVA_Build 6 3923304 1I CAGGGGCAGC -/T AAGGCGGCTG 3070 hom 59 het 22 0 17 5 T 0 1 103440 CASAVA_Build 6 3924663 12I ACACATGCCC ------------/GTGTGTGTTTGT GTGTGTGTTT 3070 hom 129 het 54 0 44 10 GTGTGTGTTTGT 0 1 103441 CASAVA_Build 6 3927861 1D AGTTGTTATG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 8 7 103442 CASAVA_Build 6 3928093 1D ATTTACATAA T/- CTAGTTTAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 0 103443 CASAVA_Build 6 3928301 3D ATATGTAAAA AAT/--- AATTTCACTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 6 AAT 2 1 103444 CASAVA_Build 6 3933541 1I CTGCAATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1118 hom 34 3 24 7 A 11 12 103445 CASAVA_Build 6 3939942 1I TATAAAAGTA -/T TTATAAGAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 2 3 103446 CASAVA_Build 6 3947108 1D GGTAGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 185 hom 23 2 16 5 T 13 12 103447 CASAVA_Build 6 3954755 1D GCTATTACAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 27 hom 44 1 39 4 T 10 9 103448 CASAVA_Build 6 3958632 1I TTTTTCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 717 hom 41 2 27 12 A 14 15 103449 CASAVA_Build 6 3965832 1I CAGCGCCAGG -/C CGAGAAATAT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 C 1 2 103450 CASAVA_Build 6 3967687 4D ATAGCGACCG TTTT/---- TTTTTTTTGT 833 het 4 hom 27 1 10 18 T 12 8 103451 CASAVA_Build 6 3969772 6D AAATAAATTC ACTAAG/------ ACTATTGTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ACTAAG 1 0 103452 CASAVA_Build 6 3974246 12D ACTTGGAATC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 39 0 37 7 T 21 9 103453 CASAVA_Build 6 3979391 1D TATAAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 24 0 23 1 T 11 10 103454 CASAVA_Build 6 3981256 4D GATTATGGAG ACAA/---- ACCTATTTAC 3070 hom 84 het 32 0 29 5 ACAA 1 0 103455 CASAVA_Build 6 3983683 1D CATGCCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2803 hom 35 10 15 10 T 12 11 103456 CASAVA_Build 6 3986917 3I AGGACATTTC ---/TTG TTGTGATTGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TTG 1 2 103457 CASAVA_Build 6 3999694 1I GGTAGGTACA -/T TTAAAAATGA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 2 3 103458 CASAVA_Build 6 4004874 1I TGGAGTTGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 9 10 103459 CASAVA_Build 6 4011314 4D TTTTTCCCCT GTCA/---- GTCTACAGGA 3070 het 3070 hom 59 18 36 8 GTCA 1 0 103460 CASAVA_Build 6 4016229 1I GCCCTGTTGC -/A AAAAAAAAAA 1317 het 1317 ref 44 30 3 11 A 11 12 103461 CASAVA_Build 6 4017676 1D23M2I TGCACATGTA TTCCCAGAACTTAAAAAAGTATTT--/-TCCCAGAACTTAAAAAAGTATTTAA AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 9 3 N/A 0 0 103462 CASAVA_Build 6 4017996 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 33 1 25 7 A 13 12 103463 CASAVA_Build 6 4026536 4D ATTTTTAATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 20 9 10 1 TTTA 3 2 103464 CASAVA_Build 6 4030545 2D GTAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 1658 het 634 hom 9 2 5 3 AT 8 7 103465 CASAVA_Build 6 4033272 1I TAGAGCTGCA -/C CCCCCCCCGC 1759 het 1540 hom 17 6 6 5 C 8 9 103466 CASAVA_Build 6 4061678 1D CTGTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 2878 het 165 hom 12 2 7 3 T 12 11 103467 CASAVA_Build 6 4062314 1I TACAGAATTG -/C CCCTCTGTCC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 C 3 4 103468 CASAVA_Build 6 4090699 1I GTCTGTTTTT -/G TTGCTATAAA 3070 het 3070 hom 38 10 22 6 G 0 1 103469 CASAVA_Build 6 4104532 1D GAAGTGACAT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 47 17 25 6 A 8 7 103470 CASAVA_Build 6 4105243 1D TCCAGTGGAC T/- TGCAAGCCAC 3070 het 3070 hom 36 16 12 9 T 2 1 103471 CASAVA_Build 6 4112567 1I TTTTTTTTTT -/A TTTTTTTTTT 2820 het 221 hom 20 5 9 6 A 0 1 103472 CASAVA_Build 6 4125307 4D AAAGAGAGAC AGAG/---- AGAGAGGGAG 3070 het 3070 ref 47 26 14 9 AG 5 3 103473 CASAVA_Build 6 4125632 1I TTTATATGCT -/C CGTTTATGCT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 C 1 2 103474 CASAVA_Build 6 4143171 3D GGCTCATTGC CTT/--- CTTCTTATCA 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 CTT 3 2 103475 CASAVA_Build 6 4149964 1I TTGCCCATAA -/T TTTTTTTACA 2969 het 2969 ref 25 15 7 3 T 7 8 103476 CASAVA_Build 6 4153219 1D AGTTAAATAC T/- TTTAGGCCAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 4 3 103477 CASAVA_Build 6 4153898 4D TTATCATTAT TTTC/---- TTTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 TTTC 2 1 103478 CASAVA_Build 6 4158569 1D ATGAAAACTT A/- ACTATTATGA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 2 1 103479 CASAVA_Build 6 4165628 2I TATAAATGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 TG 7 8 103480 CASAVA_Build 6 4166247 4D CATGCACGTG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 40 18 15 9 CA 7 5 103481 CASAVA_Build 6 4176804 4I TGTCAATATT ----/AGAC AGATCAAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 AGAC 0 1 103482 CASAVA_Build 6 4180792 2I ATATTTTTGT --/AA AGAGTATTTC 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 1 3 103483 CASAVA_Build 6 4186840 1I CACAGATCAA -/C CCATCACCTA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 C 2 3 103484 CASAVA_Build 6 4188379 1I AGGTGCCACA -/G GCCCCATGCA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 G 1 2 103485 CASAVA_Build 6 4192015 1D TTTTCTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 T 11 10 103486 CASAVA_Build 6 4200763 9D TAAAAACACA GAAGAAAGG/--------- CAGGATGTGG 3070 het 3070 ref 48 25 21 4 GAAGAAAGG 1 0 103487 CASAVA_Build 6 4203032 1D TACAAGACTG T/- GGGTTCCCAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 1 0 103488 CASAVA_Build 6 4206965 5I CAGGAAAATG -----/TGATA TGATACTGTC 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 TGATA 1 2 103489 CASAVA_Build 6 4213385 1I TCCCCAATGA -/G GGGGGGGCCT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 G 7 8 103490 CASAVA_Build 6 4215413 10I CATTGGAACA ----------/GATGGTTGAT GATGGTTGAT 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 GATGGTTGAT 1 2 103491 CASAVA_Build 6 4217773 3I TGGCCTTGAA ---/CTC CTGGGCTCAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 CTC 0 1 103492 CASAVA_Build 6 4220374 1I TTCATTAGAC -/T TTTTTTTTTT 1163 het 1163 ref 39 29 3 7 T 11 12 103493 CASAVA_Build 6 4222982 1I GACAGTGGAG -/A ACCCCCCTTC 2884 het 2884 ref 19 10 7 2 A 1 2 103494 CASAVA_Build 6 4223537 2I AATCTATAAC --/AT GTGGCTTTTG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 AT 0 1 103495 CASAVA_Build 6 4229613 3D CTCTGGAAGT GAA/--- GAAGACAGAA 3070 het 3070 ref 42 21 16 7 GAA 2 1 103496 CASAVA_Build 6 4231355 1D GTTAAGATAC T/- TTAACCTAGG 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 3 2 103497 CASAVA_Build 6 4253604 3I GTCATTGACT ---/TCA TCAAAATAGC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TCA 1 2 103498 CASAVA_Build 6 4258951 1D ATTTGTTTTT G/- GTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 G 2 1 103499 CASAVA_Build 6 4259450 1D TAGACTGTTT C/- TGAAGGATTC 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 C 1 0 103500 CASAVA_Build 6 4280295 2D ACCAGGAAAC AA/-- GACACATTTA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 2 0 103501 CASAVA_Build 6 4300927 4I CAAGGCCTTT ----/AAAC AAACACCACC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AAAC 1 2 103502 CASAVA_Build 6 4301111 4I ACATGTTTCC ----/TTGT TTATTTATTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTGT 0 1 103503 CASAVA_Build 6 4307297 4I ATCATTGAGG ----/AATA AGTAACTCCC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AATA 0 1 103504 CASAVA_Build 6 4310461 1I TCCCCACTGA -/G GGGGTCACCT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 G 4 5 103505 CASAVA_Build 6 4310714 4D9M4I TAGATACAGT GAGAGGTTAGTAA----/----TCTTACTAACCTC GAAAGGTAAT 3070 hom 93 het 32 0 32 2 N/A 0 0 103506 CASAVA_Build 6 4313722 1I TTTGAAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 10 11 103507 CASAVA_Build 6 4320340 1I GACAAGGGTG -/T GACTTGTGGA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 0 1 103508 CASAVA_Build 6 4320927 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 99 hom 25 3 12 10 T 13 12 103509 CASAVA_Build 6 4324175 3I TTCCAACTTA ---/AAG AATAGCCCCC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AAG 0 1 103510 CASAVA_Build 6 4328080 1D GTCAGTAAAT G/- GCTTCATTTT 3070 hom 120 het 45 0 38 7 G 2 1 103511 CASAVA_Build 6 4330127 1I AAGAAATCCC -/T AATATGGGTG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 T 0 1 103512 CASAVA_Build 6 4333946 3I GTTACTCTTG ---/TGC TGCAACAGGC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 TGC 1 2 103513 CASAVA_Build 6 4334718 1I GATATTAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 549 hom 39 3 28 8 A 12 13 103514 CASAVA_Build 6 4337600 2D ATATATTTTA AT/-- ATATACTATG 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 AT 3 2 103515 CASAVA_Build 6 4340568 4D AGTGCAAAAT AGAG/---- AGTCAGAACC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 AG 3 1 103516 CASAVA_Build 6 4341140 2I CTCCTGTGGA --/AT ATATATATAT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 AT 8 9 103517 CASAVA_Build 6 4343336 4I TTCACTGTAT ----/GTAA GTGACTTCTC 3070 hom 140 het 56 0 46 10 GTAA 0 1 103518 CASAVA_Build 6 4345006 15I CAGGCAATCC ---------------/ATTTATCCAACACAG ATTTATCCAA 3070 hom 84 het 38 0 28 10 ATTTATCCAACACAG 0 1 103519 CASAVA_Build 6 4346647 4D TCGCTTCATT AGGC/---- AGGTATTGAT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 AGGC 1 0 103520 CASAVA_Build 6 4346961 1I GATGAATATT -/A AAAAGAAATA 3070 hom 163 het 56 0 55 1 A 4 5 103521 CASAVA_Build 6 4350966 1I CAGCCCCTCA -/G CTGGAATCTG 3070 hom 44 het 23 0 13 10 G 0 1 103522 CASAVA_Build 6 4351150 2I TTTCTATAGT --/TC CAGGCCGCAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TC 0 1 103523 CASAVA_Build 6 4358892 2I TCCCTGCAAT --/CA CAGAGCCCAC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 CA 1 2 103524 CASAVA_Build 6 4360025 29D TGATCAAGCA ACAGACCATCACTCCAAGTGGTTAATCTG/----------------------------- ATTCATTTTA 3070 hom 123 het 38 0 42 5 ACAGACCATCACTCCAAGTGGTTAATCTG 1 0 103525 CASAVA_Build 6 4360752 1I AGTAATTCTT -/G GGGGAGGAGT 3070 hom 138 het 49 0 46 3 G 4 5 103526 CASAVA_Build 6 4361327 1D AAGATGGGGG A/- AGAGGGATGG 3070 hom 120 het 49 0 41 9 A 2 1 103527 CASAVA_Build 6 4363920 3I CATGTGTTAG ---/AGA AGAAGAAAGG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AGA 2 3 103528 CASAVA_Build 6 4364766 1I ACGATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 31 0 24 7 A 11 12 103529 CASAVA_Build 6 4369816 3D TGGTAGGCTA AAG/--- AAGAAAAATC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAG 2 1 103530 CASAVA_Build 6 4372234 3I CCTCCAGAAA ---/CAG CAGGCTGACA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CAG 1 2 103531 CASAVA_Build 6 4372558 1I TATGCATTTG -/T TCCAGGCTAC 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 1 2 103532 CASAVA_Build 6 4377435 3I GAAGTTGAGG ---/GAA GTGTAACTAC 3070 hom 148 het 54 0 50 4 GAA 0 1 103533 CASAVA_Build 6 4381060 1D GCCAAGGGCA T/- TACCCGTAAG 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 2 1 103534 CASAVA_Build 6 4385946 11D ACTCTGTCTT AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 5 A 22 11 103535 CASAVA_Build 6 4386587 1D CTTAAAGCTG T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 129 het 54 0 43 11 T 8 7 103536 CASAVA_Build 6 4390334 4D AAGTTATTTT TTTC/---- TTTTTTTGTT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 TTTC 1 0 103537 CASAVA_Build 6 4391444 1D AGGTTTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 572 hom 29 3 22 5 A 13 12 103538 CASAVA_Build 6 4391985 6I CTCATAGTTT ------/TTATTA TTATTATTAT 3070 hom 68 het 25 0 23 3 TTA 3 5 103539 CASAVA_Build 6 4393503 1D TTTCTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 44 1 29 14 T 13 12 103540 CASAVA_Build 6 4398617 1D TTCTGTCGTA T/- TTTTCTTATT 3070 hom 63 het 22 0 21 1 T 5 4 103541 CASAVA_Build 6 4405696 2I ACCAGCTTTT --/TC TCTGTTCTCC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TC 1 2 103542 CASAVA_Build 6 4407159 4I CATGATCACC ----/CCTT CCTTAAAGAT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 CCTT 1 2 103543 CASAVA_Build 6 4408909 1D GTTGTCTGGG T/- CTTGGAATTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 0 103544 CASAVA_Build 6 4413416 7D ATATTTTAAG TAGAGAC/------- TAGAGACAGG 3070 hom 54 het 19 0 18 1 TAGAGAC 2 1 103545 CASAVA_Build 6 4415941 14D TTTAATAGGC AAGAAAGAAGGAAG/-------------- AAGAAAGAAG 3070 het 46 hom 28 1 21 6 AAGAAAGAAGGAAG 2 1 103546 CASAVA_Build 6 4416555 1I TTATTCTTTG -/A TTCTCCATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 1 103547 CASAVA_Build 6 4418893 1D GTTTATATTT G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 9 8 103548 CASAVA_Build 6 4425385 1I GGTTAGGTGC -/T TTTTTTCCCT 3070 het 362 hom 55 1 44 10 T 6 7 103549 CASAVA_Build 6 4437505 3D GCATTCATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1763 het 27 hom 25 1 7 17 T 21 18 103550 CASAVA_Build 6 4447066 1I GGATAATTGT -/A TGCATCACAT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 0 1 103551 CASAVA_Build 6 4459262 1D TCCCAACAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 32 1 29 2 A 10 9 103552 CASAVA_Build 6 4461986 1D CTTAGTTGTT G/- TTTTTTTTTA 2405 het 2405 ref 52 36 8 9 G 1 0 103553 CASAVA_Build 6 4463446 1D GCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 165 hom 33 1 30 2 T 10 9 103554 CASAVA_Build 6 4467496 1I TTCAAATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 10 11 103555 CASAVA_Build 6 4470892 4D35M24D TTGTAAAGCC CTAACTAAGGCCTTGAGTGAACACAGGTGGTAGCCAGGTAGTGGTAAGAGCAGGCCTTTGGCA/----CTAAGGCCTTGAGTGAACACAGGTGGTAGCCAGGT------------------------ AGTGGTAAGA 3070 hom 128 het 37 0 38 16 N/A 0 0 103556 CASAVA_Build 6 4472088 1I GTGCTTAAGG -/A AAAAAAACTT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 7 8 103557 CASAVA_Build 6 4473192 1D TCAAAAAAAA G/- AAAGAAAGAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 1 0 103558 CASAVA_Build 6 4473289 1I ATTTCAAGAC -/A AAAACTGTAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 5 103559 CASAVA_Build 6 4482958 2I TAAATTTCAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 9 11 103560 CASAVA_Build 6 4483177 1D TGAGCTGATC A/- AAAAAAATTC 3070 hom 39 het 23 0 14 9 A 8 7 103561 CASAVA_Build 6 4488923 1D TTATGGTCCA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 9 8 103562 CASAVA_Build 6 4490688 1D GGAAAGTTAG A/- AAAAAAACTC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 8 7 103563 CASAVA_Build 6 4493290 11I ATGTATGCCC -----------/ATAAATGGAAT ATAAGTCAGC 3070 hom 96 het 36 0 33 5 ATAAATGGAAT 0 1 103564 CASAVA_Build 6 4613911 1I CTAATGCAAA -/G GGGGAGAGAG 3070 hom 119 het 44 0 40 4 G 4 5 103565 CASAVA_Build 6 4616573 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2494 het 428 hom 13 2 9 2 A 15 14 103566 CASAVA_Build 6 4617223 4D CAGCCTGGAC GACG/---- GACGCCTTCC 3070 hom 69 het 27 0 23 5 GACG 2 1 103567 CASAVA_Build 6 4619457 1I TCTTGCACCT -/G GCTCCATCAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 1 2 103568 CASAVA_Build 6 4622735 3D ATGCTTTAGA ACC/--- ACCACATTAC 3070 hom 170 het 61 0 57 8 ACC 2 1 103569 CASAVA_Build 6 4634239 3I CTGGAAAAAC ---/ATT GTGTCTGTAC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ATT 0 1 103570 CASAVA_Build 6 4634500 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 18 2 12 6 A 13 12 103571 CASAVA_Build 6 4647201 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 28 2 18 8 A 14 15 103572 CASAVA_Build 6 4660536 2I CCTTGTCATC --/TG TGTGTCCACC 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 TG 2 3 103573 CASAVA_Build 6 4679085 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 18 3 10 8 T 15 14 103574 CASAVA_Build 6 4681139 1D TGCACGTGAT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 86 het 35 0 28 7 G 9 8 103575 CASAVA_Build 6 4682598 4I AACAAAAATT ----/AAAC AAAAGGGGCC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AAAC 0 1 103576 CASAVA_Build 6 4683629 6I TAGTAATAAG ------/TAAAAA TAAAAATAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TAAAAA 1 2 103577 CASAVA_Build 6 4689729 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 919 hom 37 2 28 7 A 11 10 103578 CASAVA_Build 6 4690826 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 18 8 A 11 10 103579 CASAVA_Build 6 4710629 2D TTCTAATAAC AT/-- GTGGCTCAAA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 AT 1 0 103580 CASAVA_Build 6 4724482 1D TTGTTAGTTG C/- CTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 54 25 24 6 C 2 1 103581 CASAVA_Build 6 4724635 2I CTGCAGTAAC --/TG TGGGAACTTG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 TG 1 2 103582 CASAVA_Build 6 4726214 1I TAATAATTCC -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 T 6 7 103583 CASAVA_Build 6 4728362 12I CTGACTTCAT ------------/AGTTTCTTCACC AGTTTCTTCA 3070 het 3070 ref 30 14 7 9 AGTTTCTTCACC 0 1 103584 CASAVA_Build 6 4728427 5I TTTTTTTCTT -----/TTCTC AAGTGTATCC 2361 het 2361 ref 25 15 6 4 TTCTC 0 1 103585 CASAVA_Build 6 4732489 1I GTGTGTTTGA -/G GGGAGGTGCT 3070 hom 138 het 51 0 46 5 G 3 4 103586 CASAVA_Build 6 4740942 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 11 12 103587 CASAVA_Build 6 4840175 24D TGTGTATATG TGTATGCATGTGTATATATACGTA/------------------------ TGTGTATATG 1335 het 972 hom 28 6 8 17 TGTATGCATGTGTATATATACGTA 1 0 103588 CASAVA_Build 6 4840315 2I62M4D28M4D TATCTATATG --CACATATATGTACATGTGTGTATATGTATCTATATGCATATATATGTGCATGTGTGTATATGTATCTATACACATACATGTACATATGTGTATGTATA/CACACATATATGTACATGTGTGTATATGTATCTATATGCATATATATGTGCATGTGTGTATATG----TATACACATACATGTACATATGTGTATG---- TATGTGTATA 3070 hom 35 het 34 1 35 7 N/A 0 0 103589 CASAVA_Build 6 4840705 2D TACATATATA CG/-- TATATATGTA 1620 hom 18 het 7 0 7 0 CG 1 0 103590 CASAVA_Build 6 4843461 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAACG 3070 hom 106 het 41 0 36 5 A 9 8 103591 CASAVA_Build 6 4847959 14D ATGAGGATCC CCTTGGAGAAGGTG/-------------- CCAGGGAGTC 3070 het 3070 ref 44 21 18 9 CCTTGGAGAAGGTG 1 0 103592 CASAVA_Build 6 4855269 1D CACACATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 629 hom 35 2 27 6 T 12 11 103593 CASAVA_Build 6 4857467 1D AAGTTGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 24 10 T 11 10 103594 CASAVA_Build 6 4861840 1D CAGATGTATC G/- GGGGGGGGCG 3070 hom 58 het 24 0 14 10 G 9 8 103595 CASAVA_Build 6 4863480 1D CACTGCTGGA G/- AATTATACCA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 G 1 0 103596 CASAVA_Build 6 4865185 2I AGCAACCCAA --/GT GTGTCTATCA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 GT 2 3 103597 CASAVA_Build 6 4871728 2I CCTTGAAAAC --/AT ATTAAAACTT 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 AT 1 2 103598 CASAVA_Build 6 4872052 1I TTATCTTTCA -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 49 21 19 9 T 5 6 103599 CASAVA_Build 6 4883467 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2504 hom 39 9 22 8 T 12 11 103600 CASAVA_Build 6 4891952 3D CTCCCCACAT GTG/--- GTCATGTGGG 3070 hom 60 het 26 0 17 9 GTG 1 0 103601 CASAVA_Build 6 4892878 2D GTTTCTAAAC CT/-- CTCTCTTCAC 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 CT 4 3 103602 CASAVA_Build 6 4893770 1I TTTCACCCCC -/T GACCTCACCC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 0 1 103603 CASAVA_Build 6 4901506 2D GTGAAGTGCT TC/-- TGTTTTGTGC 3070 het 3070 ref 50 25 20 8 TC 1 0 103604 CASAVA_Build 6 4902371 1D ACAGCTACAG A/- AAATGAGAAG 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 4 3 103605 CASAVA_Build 6 4918859 1D GATCGGCATC T/- TGCTTTCGAG 3070 het 3070 ref 58 29 21 8 T 2 1 103606 CASAVA_Build 6 4923141 1D TTCCCAGAAT C/- CCCTTTATTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 C 4 3 103607 CASAVA_Build 6 4924947 1I ATGCAGAAAA -/G GCACCTGACA 3070 het 3070 ref 48 24 18 7 G 1 2 103608 CASAVA_Build 6 4925780 5D CAGAATTGTA ACCAC/----- CCAAGGGGTT 2181 het 2181 ref 20 12 6 3 ACCAC 1 0 103609 CASAVA_Build 6 4926289 1I CTTTCATTTG -/T TTTACAAGAA 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 3 4 103610 CASAVA_Build 6 4927237 9I AAAGCTTGTT ---------/GGCGTAAAC GTCTGTGGTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 GGCGTAAAC 0 1 103611 CASAVA_Build 6 4927950 1D AAGAATATAC T/- TTTTTTTTTT 1535 het 129 hom 26 3 9 14 T 17 16 103612 CASAVA_Build 6 4934434 4D TTTCCATTTG GTTT/---- GTTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 45 22 17 10 GTTT 3 2 103613 CASAVA_Build 6 4937417 4I AAAAAAAGAA ----/AAAT AAACAAACAA 2312 het 2312 ref 19 12 5 2 AAAT 0 1 103614 CASAVA_Build 6 4942879 12D AATCTCCTCT CATCCATCCATC/------------ CATCCATCCA 3070 het 3070 ref 36 13 13 13 CATC 7 4 103615 CASAVA_Build 6 4947615 1I GGCAACAAAA -/C CTCTTATGTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 C 1 2 103616 CASAVA_Build 6 4950584 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3055 het 3055 ref 27 14 7 7 A 11 10 103617 CASAVA_Build 6 4952622 2I AAAAAAAAAC --/AA AGAGAAAGAA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 1 3 103618 CASAVA_Build 6 4954918 1I GTCAAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 18 8 T 12 13 103619 CASAVA_Build 6 4957711 1D AATTTTCCAG T/- ATTAATGTTC 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 1 0 103620 CASAVA_Build 6 4959863 1I GTAAATAAGG -/C CAACCCAGAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 C 1 2 103621 CASAVA_Build 6 4966799 2I TCCTGGCCTC --/TG GTAACTACTG 2823 het 2823 ref 31 15 9 7 TG 0 1 103622 CASAVA_Build 6 4979982 19I CCTTTACAGC -------------------/AATGCAAAGACTGACAATA AATGCTTTTT 2463 het 2463 ref 27 10 7 10 AATGCAAAGACTGACAATA 0 1 103623 CASAVA_Build 6 4981303 4D ATGAATTTTT AATA/---- AATAGTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 AATA 2 1 103624 CASAVA_Build 6 4986451 6D AGTGACAAAC TTATAG/------ TTAAAAGCTC 3070 het 3070 ref 28 15 13 4 TTATAG 1 0 103625 CASAVA_Build 6 5005738 1D GATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 11 10 T 13 12 103626 CASAVA_Build 6 5009431 1I CTGCTGGCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2898 hom 29 6 12 11 A 9 10 103627 CASAVA_Build 6 5010497 5I ATGCATTCAT -----/TACTG TACTGAAGGA 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 TACTG 1 2 103628 CASAVA_Build 6 5014293 1D TATTTGGTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 10 9 103629 CASAVA_Build 6 5014604 1D ATGTTAACAT A/- AAAAAAAAAC 2622 het 1880 hom 13 5 6 2 A 10 9 103630 CASAVA_Build 6 5016766 2I TGATAAACTT --/TA TATATATATA 2686 het 2686 ref 32 16 8 8 TA 5 6 103631 CASAVA_Build 6 5026368 6D ACACTTGGGC GGGGGG/------ GGGGGGGGGG 3070 hom 5 het 14 0 11 3 G 16 10 103632 CASAVA_Build 6 5028156 1D CCGAGCTGTT C/- CTTCCACCTC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 C 2 1 103633 CASAVA_Build 6 5037790 1I TAAAAATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 21 1 15 5 A 12 13 103634 CASAVA_Build 6 5042178 4I TGCTAACCAG ----/ACAA ACAAACTGTT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 ACAA 1 2 103635 CASAVA_Build 6 5058969 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 24 1 12 12 T 14 12 103636 CASAVA_Build 6 5077205 1D AGTCGTGGAT C/- CCCAGTTGAC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 4 3 103637 CASAVA_Build 6 5083809 1D ATAATGACTG T/- TTTTTTTATG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 8 7 103638 CASAVA_Build 6 5088452 17I TTCTGTGTGA -----------------/GTGGAGTCTGATGCCGT GTCAGCACAC 3070 hom 108 het 42 0 37 6 GTGGAGTCTGATGCCGT 0 1 103639 CASAVA_Build 6 5093031 1D TAGGCCCTTC T/- GTCTCATCGC 3070 hom 126 het 43 0 41 2 T 1 0 103640 CASAVA_Build 6 5099681 1D GAGAGTGGCA T/- GCAGTATCTA 3070 het 3070 ref 49 21 17 11 T 1 0 103641 CASAVA_Build 6 5101923 1I TATGCAACCG -/A AATCCAGATC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 3 103642 CASAVA_Build 6 5104197 1I GCAACCTTGG -/C CCTCCTCATC 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 C 2 3 103643 CASAVA_Build 6 5152095 17D TCAGTATTCA TAACTGACCAATCCATG/----------------- TAACTGACCA 3070 hom 111 het 41 0 37 9 TAACTGACCAATCCATG 2 1 103644 CASAVA_Build 6 5158221 1I GAATCCCTCA -/G GGTTGCCAGA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 G 2 3 103645 CASAVA_Build 6 5159481 1D GTGTGGTCCC A/- GGGGGGCCCC 3070 hom 77 het 31 0 23 8 A 1 0 103646 CASAVA_Build 6 5168068 4I ACACTGAATT ----/AAAG AAAACAAGAC 3070 hom 39 het 19 0 14 5 AAAG 0 1 103647 CASAVA_Build 6 5170738 4D TTAAATGAAA ATCT/---- ATCTTAGTGA 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 ATCT 2 1 103648 CASAVA_Build 6 5254992 1I ATATCAATTC -/T TTATAAATTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 3 103649 CASAVA_Build 6 5260142 1I TAGCAATCGA -/G TGTTCTTTGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 0 1 103650 CASAVA_Build 6 5266873 1D GTCTTCTATG T/- TTTAATTCAT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 4 3 103651 CASAVA_Build 6 5299173 1I TGTTTGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 646 hom 31 3 19 9 T 14 15 103652 CASAVA_Build 6 5299246 1D TGATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 11 10 103653 CASAVA_Build 6 5302171 1D TGGAGGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 29 2 19 8 T 15 14 103654 CASAVA_Build 6 5330082 4D ACCACAGAAT ACTG/---- ACTGTTTCAC 3070 het 3070 hom 42 17 17 10 ACTG 2 1 103655 CASAVA_Build 6 5333270 1I GGTGAACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 T 10 11 103656 CASAVA_Build 6 5334386 1I TGAAACAGTT -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 20 8 8 4 A 6 7 103657 CASAVA_Build 6 5335088 1I GTTGTTATTG -/T TTGTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 2 3 103658 CASAVA_Build 6 5343032 4D GTTACTCAGT CTTC/---- CTTTGTTTAT 3070 het 3070 ref 48 23 22 8 CTTC 1 0 103659 CASAVA_Build 6 5353308 1D TGATTTGCTG T/- TTGGTGAGGT 3070 het 3070 ref 32 19 10 5 T 3 2 103660 CASAVA_Build 6 5355390 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2611 het 2611 ref 37 15 12 10 T 14 13 103661 CASAVA_Build 6 5364708 10D TTTTTTGTTC TTTACCGTTT/---------- CTCTGTTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 19 5 TTTACCGTTT 1 0 103662 CASAVA_Build 6 5366188 3I GGACGGCGTC ---/CTT CTTCTCACAG 3070 hom 62 het 22 0 21 1 CTT 1 2 103663 CASAVA_Build 6 5368324 1D ACCCGACCAG C/- TTTGTGGAGG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 C 1 0 103664 CASAVA_Build 6 5377210 1D TACTTTTTTG A/- AAGTTACTAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 3 2 103665 CASAVA_Build 6 5379330 1I CTGTACACAT -/A AAAAATGAAT 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 A 5 6 103666 CASAVA_Build 6 5381280 5D ATATCACAGC ATACA/----- ATACACAGAC 3070 het 3070 ref 47 26 19 7 ATACA 2 1 103667 CASAVA_Build 6 5381616 2D GATCTCAGTT GG/-- TGAATCTGTA 3070 het 3070 ref 63 30 28 5 G 2 0 103668 CASAVA_Build 6 5383472 8D CTTCTACCCA CCCCCCGC/-------- CCCCCCCCCC 2404 het 68 hom 18 1 10 8 CCCCCCGC 1 0 103669 CASAVA_Build 6 5386152 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1886 het 719 hom 23 3 7 13 T 13 14 103670 CASAVA_Build 6 5387647 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 2254 hom 26 9 13 4 AC 7 8 103671 CASAVA_Build 6 5390017 1D TAAAATGGGG C/- GGGGGGGAAC 3070 hom 73 het 30 0 24 6 C 1 0 103672 CASAVA_Build 6 5390423 1I AGAGACCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 9 10 103673 CASAVA_Build 6 5395918 15D CTTGGCGTGT GGGAGGTAGTGTGCC/--------------- GCCTGTTAGT 3070 hom 80 het 35 0 17 19 GGGAGGTAGTGTGCC 1 0 103674 CASAVA_Build 6 5400969 1I ACTCAGCATC -/A GGAGGCCTGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 103675 CASAVA_Build 6 5401463 1I AACAAAAAGC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 7 103676 CASAVA_Build 6 5406276 1D TTTTAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3066 het 3066 ref 44 28 8 8 T 13 12 103677 CASAVA_Build 6 5408935 1D TTGTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 26 1 18 8 A 12 11 103678 CASAVA_Build 6 5423328 4I ATAAAACACT ----/TAGG TAGTGCTTGG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TAGG 0 1 103679 CASAVA_Build 6 5426963 3I TTATCCAGCC ---/ATT TTTCCCTGGG 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 ATT 0 1 103680 CASAVA_Build 6 5427043 1I GTTAAAAAGA -/C CCCCCCTTGC 3070 het 3070 hom 60 18 33 9 C 6 7 103681 CASAVA_Build 6 5433112 11D ACACATGCTC CATGTGTGTGG/----------- CATGTGGAAA 3070 het 3070 ref 51 26 27 4 CATGTGTGTGG 1 0 103682 CASAVA_Build 6 5437143 1D ATTGTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 T 12 11 103683 CASAVA_Build 6 5438076 4I TGGCTAGAGT ----/CGGG GTATATAGCC 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 CGGG 0 1 103684 CASAVA_Build 6 5439348 1D TGTTTCCTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 674 hom 32 7 18 7 T 10 9 103685 CASAVA_Build 6 5449974 1D ATTACTATTT A/- TATTACTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 1 0 103686 CASAVA_Build 6 5452619 1D GAAGCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 26 19 7 A 12 11 103687 CASAVA_Build 6 5460181 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2795 het 2795 ref 36 15 9 12 T 10 11 103688 CASAVA_Build 6 5466044 1I TGATTAAAAA -/T TCATGATAAA 3070 het 3070 hom 58 23 32 3 T 1 2 103689 CASAVA_Build 6 5466345 1D TTTTAAATTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 T 8 7 103690 CASAVA_Build 6 5469343 4D GACAATAGAT AATG/---- AATGTACCAC 3070 het 3070 ref 43 26 14 6 AATG 2 1 103691 CASAVA_Build 6 5471658 2I AGAGCAGCTG --/AC ATCCCTTTTA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AC 0 1 103692 CASAVA_Build 6 5472281 4D AGGAAGGAAT CAGA/---- CAGTCTTCTT 3070 het 3070 hom 33 14 18 3 CAGA 1 0 103693 CASAVA_Build 6 5479478 2D AAATATCTAC AT/-- CCTCTGAGAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 AT 1 0 103694 CASAVA_Build 6 5481063 4D AGTATATTAC ATTG/---- ATTGATTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 7 ATTG 2 1 103695 CASAVA_Build 6 5489654 1I TGGAATTATA -/T TCCTTTCATG 3070 hom 154 het 56 0 52 4 T 1 2 103696 CASAVA_Build 6 5508320 1D AGACAGAGGG A/- GGGGGGCTCC 785 het 785 ref 22 11 5 6 A 1 0 103697 CASAVA_Build 6 5511567 1D TACCTAGTTA T/- TACACACCAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 2 1 103698 CASAVA_Build 6 5515191 2D GGTCAGGCAT AC/-- AGTGTTTCTT 3070 het 3070 ref 51 22 23 7 AC 1 0 103699 CASAVA_Build 6 5516030 2I CTCTGGAAAC --/AG GGGGGTAATC 3070 hom 135 het 48 0 42 6 AG 0 1 103700 CASAVA_Build 6 5536086 4I ATACCTACAT ----/CTTA CTTATTTTAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 CTTA 1 2 103701 CASAVA_Build 6 5539378 1D TTGCAGGGAT G/- GGGACCCTTC 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 G 4 3 103702 CASAVA_Build 6 5545813 2D ATTAAAAGTA AG/-- GGCCATCAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 AG 1 0 103703 CASAVA_Build 6 5550003 1D TAAAGTATGA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 T 6 5 103704 CASAVA_Build 6 5550541 1I GCCAGAGCAT -/G TACTCTGCTT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 G 0 1 103705 CASAVA_Build 6 5553856 1D AGATATATTG C/- ATAGGATGGG 3070 hom 78 het 32 0 27 6 C 1 0 103706 CASAVA_Build 6 5554123 1I ACAGCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 22 1 15 6 A 10 11 103707 CASAVA_Build 6 5562351 1I ACACCCCATT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 9 103708 CASAVA_Build 6 5601795 28I CTTTGTTTTT ----------------------------/GGTCTGTATGTATATATTTATTTATTTA TTTTTGGAGA 3070 hom 36 het 12 0 13 3 GGTCTGTATGTATATATTTATTTATTTA 0 1 103709 CASAVA_Build 6 5603489 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 28 1 19 9 A 16 15 103710 CASAVA_Build 6 5607212 1D CCCCACACTT G/- GAAGAGGGTG 3070 hom 117 het 42 0 39 5 G 2 1 103711 CASAVA_Build 6 5612764 5I AAAAAAAAAA -----/AGATT AAGATTATAT 3070 het 1872 hom 28 9 16 3 AGATT 0 1 103712 CASAVA_Build 6 5666749 4I TTTGAATGGA ----/TCAT TCATTCACTC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 TCAT 1 2 103713 CASAVA_Build 6 5675440 1D CAATATCCAT C/- CTGGGACAGC 3070 het 3070 ref 58 29 25 6 C 2 1 103714 CASAVA_Build 6 5675752 1I TACAAAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 11 12 103715 CASAVA_Build 6 5682997 1I TTACCATGTA -/T CCCTTCTTCC 3070 het 3070 ref 59 25 21 13 T 0 1 103716 CASAVA_Build 6 5684007 1I ATACATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 A 10 11 103717 CASAVA_Build 6 5722243 2D TAGGAAGGAC AT/-- AGCACGCTCT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 AT 1 0 103718 CASAVA_Build 6 5749940 1I GGTCATGCCA -/C CCCCCCCTTG 3070 hom 74 het 27 0 23 4 C 7 8 103719 CASAVA_Build 6 5753613 6D ACAGAGACTC AAATTT/------ AAATTATAAG 3070 hom 66 het 27 0 22 7 AAATTT 1 0 103720 CASAVA_Build 6 5768260 1I TGAAGCACCT -/A ACAATTGTGA 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 A 1 2 103721 CASAVA_Build 6 5776924 1D GGAAACTGAC T/- GCCTTCTTGG 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 1 0 103722 CASAVA_Build 6 5798805 2I TTTAGAAAAA --/TC TCTCTGAAAC 1898 het 1898 ref 55 46 5 4 TC 2 3 103723 CASAVA_Build 6 5806762 1I AAATGTCAAA -/C TCATGGAAAC 2495 het 2495 ref 32 18 8 6 C 0 1 103724 CASAVA_Build 6 5815253 1D TGAGAAACTC T/- TTTTTTTTTT 2293 het 2293 ref 57 42 6 9 T 13 12 103725 CASAVA_Build 6 5815737 1I CAAGTTTTGC -/T ATTACAATGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 103726 CASAVA_Build 6 5819407 13I CTTCTGGTGG -------------/TTTGTGGGCAACC TTTGGCATTT 3070 hom 79 het 30 0 27 5 TTTGTGGGCAACC 0 1 103727 CASAVA_Build 6 5830081 1D AAATGAATTA T/- TTTTTCTTGG 3070 hom 110 het 42 0 37 7 T 6 5 103728 CASAVA_Build 6 5847626 1D TGAGGTGGAG A/- GAAGAGATTC 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 A 1 0 103729 CASAVA_Build 6 5863126 1D TTGGGGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 10 4 A 13 12 103730 CASAVA_Build 6 5871470 1D ATTATCAGTA G/- TTTTATTTCT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 G 1 0 103731 CASAVA_Build 6 5882496 1D AATTGGAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 10 9 103732 CASAVA_Build 6 5903022 2D AGAAAATAAC AG/-- GGTAATTCTG 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 AG 1 0 103733 CASAVA_Build 6 5914385 1D AAGGACAGGT A/- AAAATAGCTG 3070 het 3070 ref 55 25 22 8 A 5 4 103734 CASAVA_Build 6 5922142 1D ATGGGACTCT A/- ATTTTCAGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 1 103735 CASAVA_Build 6 5925770 2D TTTTAACTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 8 T 12 10 103736 CASAVA_Build 6 5926944 1I CAACAAAGAC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 9 103737 CASAVA_Build 6 5929399 1I TATAAAGCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 9 10 103738 CASAVA_Build 6 5930644 1I CACTGGAAAG -/T GGTGGGCAAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 1 103739 CASAVA_Build 6 5938607 1I TATACAGTAC -/A AAAAAACCTT 3070 hom 131 het 51 0 44 7 A 6 7 103740 CASAVA_Build 6 5943334 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 176 hom 22 2 11 10 T 10 9 103741 CASAVA_Build 6 5962332 2I TCATGAAGAT --/AA GATACAGAAT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 0 2 103742 CASAVA_Build 6 5972085 5I TGGGAACAAA -----/TGTCT TGTCTTAGCA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 TGTCT 1 2 103743 CASAVA_Build 6 5979570 1D GTAATTGCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 29 1 23 5 T 11 10 103744 CASAVA_Build 6 5980232 10D ATTTCTCTCT TCCCCAAGTA/---------- TCCCTGATAG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TCCCCAAGTA 1 0 103745 CASAVA_Build 6 5989326 2D AATGAAGAGA CC/-- CCCCCCCCAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 10 8 103746 CASAVA_Build 6 5990147 3D AATGTGGCAG AGA/--- AGTAGAGCAA 3070 hom 163 het 62 0 55 8 AGA 1 0 103747 CASAVA_Build 6 5992047 3I CTTTTACAAC ---/ATA ATAATACAGC 3070 hom 48 het 23 0 17 6 ATA 2 3 103748 CASAVA_Build 6 5998276 1I GGTGTTGGCC -/A GGGGCCTGTG 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 0 1 103749 CASAVA_Build 6 6004339 4I GGCTCTGGGC ----/AAAT AAATATGTAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AAAT 1 2 103750 CASAVA_Build 6 6007959 2D ATGTAGCTCT AA/-- AAAAAGAGTT 3070 het 3070 hom 38 12 22 5 A 7 5 103751 CASAVA_Build 6 6008564 4D ATGCAAAAAT AATG/---- AAATATAATA 3070 het 3070 ref 42 23 18 2 AATG 1 0 103752 CASAVA_Build 6 6021254 3D ATACACTGAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 21 2 12 7 A 16 13 103753 CASAVA_Build 6 6030390 2I AGGGAAGAAT --/AG AGTTTTCTGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AG 1 2 103754 CASAVA_Build 6 6033718 1D CCAGTGTTAT A/- AAAAATATGC 3070 het 3070 hom 42 10 23 9 A 6 5 103755 CASAVA_Build 6 6033740 2I TTTATGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 974 hom 43 4 16 23 TG 7 8 103756 CASAVA_Build 6 6034528 4I AACAAAAAAT ----/AATA AATAATATTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AATA 1 2 103757 CASAVA_Build 6 6040276 2I ATATATCCAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AT 6 7 103758 CASAVA_Build 6 6043171 1I GGTATTTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 477 hom 28 2 21 5 T 9 10 103759 CASAVA_Build 6 6045249 1I GAACTCTTCA -/T TTTTTTCTGG 1771 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 7 103760 CASAVA_Build 6 6048662 3D ATTGCTCTTG CTT/--- CTTTAATTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 CTT 2 1 103761 CASAVA_Build 6 6050194 1D TGGTTGAAGA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 T 7 6 103762 CASAVA_Build 6 6059272 1I TGCACAGTTA -/T TTTTTTGCTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 6 7 103763 CASAVA_Build 6 6059420 4D TTTTAATTTG TATT/---- TATTTATTTC 3070 het 2356 hom 26 6 16 5 TATT 3 2 103764 CASAVA_Build 6 6067768 1I GCTCAATGAA -/G CTCCTCTTTG 3070 het 3070 hom 53 20 28 5 G 0 1 103765 CASAVA_Build 6 6079405 1I GAAACAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 9 103766 CASAVA_Build 6 6086157 4D AATGTTTTTT TTTC/---- TCAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 TTTC 1 0 103767 CASAVA_Build 6 6096508 1I AGGCTCAACT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 76 het 34 0 27 7 A 9 10 103768 CASAVA_Build 6 6099376 5D ACTGACGTCC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2703 het 1912 hom 37 13 8 18 A 18 13 103769 CASAVA_Build 6 6102667 2I AAATAGAAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 27 0 17 10 T 10 12 103770 CASAVA_Build 6 6104014 2I CACCTTAATG --/AA AAGTTTGTGA 3070 hom 125 het 45 0 39 6 A 2 4 103771 CASAVA_Build 6 6106087 1D TTTTAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2525 hom 28 7 18 3 T 13 12 103772 CASAVA_Build 6 6107491 1D CCTGCTCCCA G/- CCTCCACCCC 3070 hom 133 het 49 0 39 11 G 1 0 103773 CASAVA_Build 6 6121396 1D ATGGCTAGTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 9 8 103774 CASAVA_Build 6 6123287 3D GGGGGGGGGG GGT/--- GGGGCTTTTA 1702 het 131 hom 18 3 8 7 GGT 1 0 103775 CASAVA_Build 6 6130362 1D AATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1023 het 1023 ref 19 9 3 7 T 13 12 103776 CASAVA_Build 6 6143182 2I CTAACGAAAC --/AG AACTTACTAG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 AG 0 1 103777 CASAVA_Build 6 6172178 106D GGCCTAATAG AGGGAGATGACAGGCAAACTGGCCAGAAAAGGCCATCTACATAGTGGAAACAGTTTTAATAAATGTGTAGTGTCATGAAACAATATGGCAGGCTCTGGGACCTTCT/---------------------------------------------------------------------------------------------------------- AGGAGCTCTG 1715 het 1715 ref 27 33 4 10 AGGGAGATGACAGGCAAACTGGCCAGAAAAGGCCATCTACATAGTGGAAACAGTTTTAATAAATGTGTAGTGTCATGAAACAATATGGCAGGCTCTGGGACCTTCT 1 0 103778 CASAVA_Build 6 6184954 1I CTGAGAGAGA -/G AAACTGAGAT 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 G 0 1 103779 CASAVA_Build 6 6197535 5I CATTGGGAAA -----/ATTAG ATTAAAGATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATTAG 0 1 103780 CASAVA_Build 6 6212973 1I TGATAGATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 9 10 103781 CASAVA_Build 6 6216297 1D TATGGAAGCG T/- TATCAGGGAC 3070 het 3070 ref 54 23 21 12 T 2 1 103782 CASAVA_Build 6 6220593 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 8 7 103783 CASAVA_Build 6 6232721 2I GGAATAGGAA --/AG AGAGGGGAGA 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 AG 2 3 103784 CASAVA_Build 6 6235048 1I AACTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 7 19 5 T 11 12 103785 CASAVA_Build 6 6247936 1I CAGTACATTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 7 8 103786 CASAVA_Build 6 6249454 1I CATTGAGGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 8 9 103787 CASAVA_Build 6 6256273 1I CATCTGTCTT -/C TTTTTTTTTA 3070 het 387 hom 33 2 27 4 C 0 1 103788 CASAVA_Build 6 6257669 1D TTTGGAAGGC T/- GAGGGGGGCG 3070 hom 33 het 13 0 9 4 T 1 0 103789 CASAVA_Build 6 6257885 1D ACTCCAGCCT G/- GGTGACAGAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 3 2 103790 CASAVA_Build 6 6257974 1D TCATAAAAAA T/- AAAATAAAAC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 1 0 103791 CASAVA_Build 6 6258652 1D TAAAGAAAAG A/- AAAAAATCTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 7 6 103792 CASAVA_Build 6 6258908 4I TGAGAAACTG ----/GTTT ATTTATTTAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 GTTT 0 1 103793 CASAVA_Build 6 6260674 1D AAATATTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 10 9 103794 CASAVA_Build 6 6268558 1I CTCCTCAGTA -/T TTTTTAAACC 3070 hom 172 het 62 0 56 6 T 5 6 103795 CASAVA_Build 6 6277983 3D CCTTTTTTTT TTA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 920 hom 36 8 23 6 TTA 1 0 103796 CASAVA_Build 6 6282563 1I ATAACATTAC -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 T 6 7 103797 CASAVA_Build 6 6285877 4I TGAAAATGGC ----/TAAA TAAATGAAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TAAA 1 2 103798 CASAVA_Build 6 6295730 1D TTTTCATTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 A 10 9 103799 CASAVA_Build 6 6309159 2I TATTACATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 AC 6 7 103800 CASAVA_Build 6 6310219 1D AAAAAAAAAA C/- AACCCTGAGG 3070 het 2509 hom 42 16 12 14 C 1 0 103801 CASAVA_Build 6 6323097 9I TTCTTCTTTT ---------/TTATTTTTA TTTTTTCCGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTATTTTTA 0 1 103802 CASAVA_Build 6 6325954 1I CTCAAAACAC -/T TGTTGAAGTT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 1 2 103803 CASAVA_Build 6 6332438 2D AGTGAATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 30 0 19 11 T 16 14 103804 CASAVA_Build 6 6339432 1I TTATTCTTTT -/C CCCCCCCGCT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 C 7 8 103805 CASAVA_Build 6 6351773 1D TTTTCTCTCT G/- TTCCTAAAAC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 G 1 0 103806 CASAVA_Build 6 6351905 1D GTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 52 0 41 11 A 10 9 103807 CASAVA_Build 6 6353893 1D ACAGTCATGT G/- CTACTCCATG 3070 hom 129 het 55 0 44 11 G 1 0 103808 CASAVA_Build 6 6354429 1D TATGGCTGAA G/- CCCCTGTGTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 0 103809 CASAVA_Build 6 6355274 9D TGAAAAGGTG GCACAGGCA/--------- GCACAGGCAG 3070 hom 67 het 33 0 22 15 GCACAGGCA 3 2 103810 CASAVA_Build 6 6360535 1I CTAACAACGG -/A CAGAAAAATA 3070 het 198 hom 40 1 33 6 A 0 1 103811 CASAVA_Build 6 6366702 1D TTTACCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 170 hom 34 1 22 13 A 12 11 103812 CASAVA_Build 6 6376762 5I AGAAACCACA -----/CACAC AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 CACAC 0 1 103813 CASAVA_Build 6 6381726 31I GCTTGAGAAG -------------------------------/TGGTGTCTGATTTACATAGGGCACAGGAGAT TGGTCAGACC 3070 hom 123 het 37 0 40 3 TGGTGTCTGATTTACATAGGGCACAGGAGAT 0 1 103814 CASAVA_Build 6 6386551 1I CAAGATCAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 9 10 103815 CASAVA_Build 6 6389588 1D ATATTTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 30 0 26 4 A 11 10 103816 CASAVA_Build 6 6390396 1I AGCCATTAAG -/T TTATGGTGAT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 2 3 103817 CASAVA_Build 6 6390600 1D TATTTGTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 10 9 103818 CASAVA_Build 6 6395093 2I ACACACACAC --/CA CACACACACA 3070 het 318 hom 44 1 32 11 CA 7 8 103819 CASAVA_Build 6 6397552 1D ACTCCCTCCC A/- AACACTGCAT 3070 hom 126 het 47 0 40 7 A 3 2 103820 CASAVA_Build 6 6398859 3D CTGATGTCAA TTT/--- TTTTTATCTA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 T 8 5 103821 CASAVA_Build 6 6412414 1I GCGCTCTGGG -/A AAGTTAGCCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 3 103822 CASAVA_Build 6 6412521 1D AATAAACAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 103823 CASAVA_Build 6 6414789 5I AATGTGTCCC -----/CACAA CACAAGTGTT 3070 hom 193 het 68 0 64 4 CACAA 1 2 103824 CASAVA_Build 6 6418211 4D AAACAAAACC AATA/---- AATATTTGTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 AATA 2 1 103825 CASAVA_Build 6 6446275 1I GTGCTAAGGG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 8 103826 CASAVA_Build 6 6451292 1I GGAAAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 935 hom 35 2 23 10 A 11 12 103827 CASAVA_Build 6 6452985 4I TTTTAATGGT ----/TTTA TTTATTATTA 3070 hom 27 het 15 0 10 5 TTTA 1 2 103828 CASAVA_Build 6 6460240 1I GATGTTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1545 hom 33 4 24 5 A 12 13 103829 CASAVA_Build 6 6460719 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 10 9 103830 CASAVA_Build 6 6468851 1D AGTATGATTT A/- AAAAAAAAAA 769 het 769 ref 36 26 3 8 A 13 12 103831 CASAVA_Build 6 6482838 4D GGAAGGAAGG AGAA/---- AGAAAGAAAA 1754 hom 12 het 5 0 5 0 AGAA 3 2 103832 CASAVA_Build 6 6485918 1I AATTTTTGTG -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 105 het 37 0 35 4 T 6 7 103833 CASAVA_Build 6 6486423 6D ATTCTTAATC CTTCTT/------ CTTTTCTCAT 3070 hom 120 het 44 0 40 5 CTT 3 1 103834 CASAVA_Build 6 6487211 1I24M1I TGGGTGATGC -TTTTTTTTTGTTTTTAATCAGAAA-/TTTTTTTTTTGTTTTTAATCAGAAAT TTTTTTTTTA 3070 het 1697 hom 34 7 11 20 N/A 0 0 103835 CASAVA_Build 6 6493254 4D TTCCAAATGT TTCC/---- TTCCAATTTT 3070 hom 138 het 49 0 46 4 TTCC 2 1 103836 CASAVA_Build 6 6494523 4D GCCCAGATAA TTTT/---- TTTAATTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 T 7 3 103837 CASAVA_Build 6 6495721 1I CACCTTCTAT -/G GCTGAGCGGG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 1 2 103838 CASAVA_Build 6 6496155 3D TTCTACGGTC ATA/--- ATAATATTAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 ATA 3 2 103839 CASAVA_Build 6 6499168 4D TCTCAAAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 54 het 19 0 18 5 AAAC 5 4 103840 CASAVA_Build 6 6503717 1D ACAGCTTGTC T/- TTTTCATCCT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 5 4 103841 CASAVA_Build 6 6504408 4I ACAGATCCTG ----/TACA TATTTTGTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TACA 0 1 103842 CASAVA_Build 6 6506749 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 31 2 26 3 T 12 10 103843 CASAVA_Build 6 6511749 1I ATATATGCTA -/T TATAATGCTA 3070 het 3070 ref 62 29 21 12 T 1 2 103844 CASAVA_Build 6 6512839 20I TCTATTGTGT --------------------/GATGCTGAGGTTTGGGGTAC AAATAACTCC 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 GATGCTGAGGTTTGGGGTAC 0 1 103845 CASAVA_Build 6 6513029 2I AACTTGAAGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 9 11 103846 CASAVA_Build 6 6514325 2D GTCAGAGCAC TT/-- TGTCCCCGTG 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 T 3 1 103847 CASAVA_Build 6 6517433 1I GTTGTAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 10 11 103848 CASAVA_Build 6 6517954 1I TATGTCTATC -/T TTTATGCCAA 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 T 3 4 103849 CASAVA_Build 6 6519756 2I AACTGAAAAC --/AT ATTATTTACA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 AT 1 2 103850 CASAVA_Build 6 6519835 1I AAATAAGATG -/A AAAAAAAACA 2947 het 2944 ref 16 7 6 3 A 8 9 103851 CASAVA_Build 6 6521238 3D AATTGAATTA TGT/--- TGTTATAATA 1743 het 1743 ref 13 8 4 2 TGT 2 1 103852 CASAVA_Build 6 6521718 2D GAAAAAAAGC AA/-- AGAGTAGATA 3070 het 3070 ref 42 22 13 8 A 3 1 103853 CASAVA_Build 6 6523079 2I TGCCAAAGAC --/AT ATAGTAGTCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AT 1 2 103854 CASAVA_Build 6 6524462 4D ACAGTATGAT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 726 hom 29 5 14 11 TG 11 9 103855 CASAVA_Build 6 6526770 1I TTATGATTGA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 6 7 103856 CASAVA_Build 6 6528530 3D ATGTCCTCAG AAT/--- AATAAAATAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 5 AAT 2 1 103857 CASAVA_Build 6 6529743 4I GGGAGCAGCT ----/ATAA ATAGAGATGA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 ATAA 0 1 103858 CASAVA_Build 6 6531240 1I TGAACTAGAC -/G GGCCATAACT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 3 103859 CASAVA_Build 6 6531402 4D ATTAAGAAGA TTTT/---- TTTTAATTGT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 8 4 103860 CASAVA_Build 6 6534192 2I GTTGGGGTGG --/GA GAGGGGAGAG 1596 het 1596 ref 19 8 8 3 GA 1 2 103861 CASAVA_Build 6 6536132 2I TTTGACCTCA --/CT CTTTTAAAAA 3070 hom 138 het 51 0 45 6 CT 1 2 103862 CASAVA_Build 6 6538650 1I TTTTGCCAAG -/A TAAGATAAGA 3070 hom 163 het 58 0 55 3 A 0 1 103863 CASAVA_Build 6 6539688 2I TATGCTACTC --/TT GTGTTATAAT 3070 hom 110 het 42 0 36 6 T 0 2 103864 CASAVA_Build 6 6540603 2D26M3D GGGAGAAGAA AGAAGAGAGGGGAGAAGAGAAGGAGGAAAAG/--AAGAGAGGGGAGAAGAGAAGGAGGAA--- AAGATGAAAG 3070 hom 39 het 18 0 13 5 N/A 0 0 103865 CASAVA_Build 6 6541645 2I AAAAGAAAAG --/AA AAAAACCTCA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 A 5 7 103866 CASAVA_Build 6 6543965 33D CTACAGGCAT CATTGGAAACTCATGCCTGCCCTTGCCTTCTCC/--------------------------------- CATTGGAAAC 2352 het 2352 ref 38 21 7 17 CATTGGAAACTCATGCCTGCCCTTGCCTTCTCC 2 1 103867 CASAVA_Build 6 6545095 2I CCCAGGCAAA --/CT CTGCTTCTTA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 CT 1 2 103868 CASAVA_Build 6 6545450 2D GGCTGCCTTC CT/-- CTGTGATAGG 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 CT 2 1 103869 CASAVA_Build 6 6546622 4I GCAGATGATG ----/AACA AAGAGGGTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AACA 0 1 103870 CASAVA_Build 6 6546936 10I TGGGAGACAG ----------/AGCGAGACAC AGTGAGACAC 2404 het 1004 hom 11 4 6 1 AGCGAGACAC 0 1 103871 CASAVA_Build 6 6548602 2I GACAGTTCAC --/AA AAAAATTACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 5 7 103872 CASAVA_Build 6 6550071 1I CCACCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 43 2 33 8 A 11 12 103873 CASAVA_Build 6 6550265 1I GACTTTGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 9 10 103874 CASAVA_Build 6 6550515 1I ACCTCACAGT -/C TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 C 0 1 103875 CASAVA_Build 6 6555775 1D ACGGAAGCTT A/- GGGGGGGGCA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 1 0 103876 CASAVA_Build 6 6557033 1D CTCAAAAAGC T/- TTAACAATCG 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 T 3 2 103877 CASAVA_Build 6 6557413 2D CTTGGTCTCA CT/-- GACTTCAAGA 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 CT 1 0 103878 CASAVA_Build 6 6557749 1I TGCAAAAAGC -/A AAAAGAACAA 3070 het 3070 ref 56 33 19 4 A 4 5 103879 CASAVA_Build 6 6557832 1D TTCTCTTATC T/- GGCCCCTCCC 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 1 0 103880 CASAVA_Build 6 6559977 1I AATGAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 10 11 103881 CASAVA_Build 6 6563662 1D ATGAATTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 888 hom 35 5 15 15 T 13 12 103882 CASAVA_Build 6 6582125 3D CTCGAACTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 14 13 A 14 11 103883 CASAVA_Build 6 6583888 1D TACTGCTCTA T/- TTTTTTTTAT 2755 het 2755 ref 23 9 6 8 T 9 8 103884 CASAVA_Build 6 6589883 1D GATCTGGGTC A/- AAAAAAAAAA 2232 het 2232 ref 37 23 7 7 A 11 10 103885 CASAVA_Build 6 6594974 3I GAAGGCTAGA ---/AGG AGGAGGGAAA 3070 hom 87 het 32 0 28 4 AGG 2 3 103886 CASAVA_Build 6 6607575 1D ACCTCGACTT G/- TCACTACCAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 G 1 0 103887 CASAVA_Build 6 6619654 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1684 hom 11 het 6 0 5 1 A 12 13 103888 CASAVA_Build 6 6622506 1D AAATTCCTTC T/- GCGGAAGCCC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 1 0 103889 CASAVA_Build 6 6625172 4I GGTGTTCCTC ----/AGTT AGGGGATGTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AGTT 0 1 103890 CASAVA_Build 6 6628019 1I TTTATAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2321 hom 22 7 11 4 A 10 11 103891 CASAVA_Build 6 6639235 1I TTTGACCAGA -/C CCCCCCCATA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 C 7 8 103892 CASAVA_Build 6 6642675 1D TGGGCCCCCC T/- ATCACTTCCC 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 T 1 0 103893 CASAVA_Build 6 6647522 2I CGCCCACCCC --/CA CACCACGCTC 1280 het 1280 ref 24 12 6 10 CA 1 2 103894 CASAVA_Build 6 6653665 1I TAAAAAAAAA -/T AAAAAAAAAA 1957 het 28 hom 10 1 7 2 T 0 1 103895 CASAVA_Build 6 6653833 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 15 14 103896 CASAVA_Build 6 6656722 10D GGCTTAACCA GAGATGCATC/---------- GTCTCACCAT 3070 hom 126 het 44 0 41 5 GAGATGCATC 1 0 103897 CASAVA_Build 6 6659762 3I TAAATAAAAT ---/GAG GAGAGAAAGA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 GAG 1 2 103898 CASAVA_Build 6 6660789 4D GCAAGACACA AAAT/---- AAATTTATTA 1989 het 1985 hom 13 6 6 3 AAAT 2 1 103899 CASAVA_Build 6 6663024 1I AATTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 2999 het 2999 ref 35 15 10 10 T 15 16 103900 CASAVA_Build 6 6668702 1D AGAACACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 12 15 A 11 10 103901 CASAVA_Build 6 6671360 1D GAGCCTCTAA C/- CCCGGGGGCG 3070 het 3070 hom 52 20 22 10 C 4 3 103902 CASAVA_Build 6 6674033 4I AAAGCAGCCT ----/CAGA CAGAGGAAAG 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 CAGA 1 2 103903 CASAVA_Build 6 6674660 4I TACTCAACTG ----/AAAC AAACATCTTC 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 AAAC 1 2 103904 CASAVA_Build 6 6674871 3D TCTCATTAAA ATG/--- ATAATAAAGG 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 ATG 1 0 103905 CASAVA_Build 6 6675462 1D TATGCAAGAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 8 7 103906 CASAVA_Build 6 6680331 1D GGGCACCCCT G/- GCAAGGTGCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 G 2 1 103907 CASAVA_Build 6 6680965 3I GTTTAGTGAC ---/AAT AATAAGGCTA 3070 het 3070 ref 63 30 28 5 AAT 1 2 103908 CASAVA_Build 6 6681344 2I CTCCCCAGTT --/TC TCTCTTAGCC 3070 hom 113 het 42 0 37 5 TC 2 3 103909 CASAVA_Build 6 6682353 4D TGGTCCCGGC TGAA/---- TGAGAGGCGA 3070 het 3070 hom 29 10 15 5 TGAA 1 0 103910 CASAVA_Build 6 6685180 3I GTGTTTTCTG ---/GAA GAACAGCCTG 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 GAA 1 2 103911 CASAVA_Build 6 6685642 2I GCCTGAAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2569 hom 25 7 14 5 T 10 12 103912 CASAVA_Build 6 6685759 5I AGCCTCCCGA -----/GTAGC GTAGCTGGGA 3006 het 2218 hom 17 7 9 1 GTAGC 1 2 103913 CASAVA_Build 6 6686388 1I GCTCCACAAA -/G GGGGGGAGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 6 7 103914 CASAVA_Build 6 6686866 4D TTCCTTTTTA TATG/---- TATTATATTA 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 TATG 1 0 103915 CASAVA_Build 6 6688162 4I TTGACAGATG ----/CAAA CAAACAGTCT 3070 hom 147 het 53 0 47 6 CAAA 1 2 103916 CASAVA_Build 6 6689685 4D AGGTCTCCTT AGAG/---- AGACAGGTAT 3070 het 3070 ref 43 26 14 4 AG 3 1 103917 CASAVA_Build 6 6689993 1I CCCTAGTTTG -/A TTCTCTAGGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 1 103918 CASAVA_Build 6 6692364 6D ACACAGACAT GCACAG/------ ACACAGACAC 3070 het 3070 ref 88 49 32 12 GCACAG 1 0 103919 CASAVA_Build 6 6693088 2I AGTGTATGTG --/TA TATATGTGTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TA 2 3 103920 CASAVA_Build 6 6701493 1I TGATGAAACC -/T CCATCTCTAC 3070 het 1114 hom 17 3 9 5 T 0 1 103921 CASAVA_Build 6 6704061 1I CCTTCTTTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 9 10 103922 CASAVA_Build 6 6707016 1D AGGTGGGTTT A/- GTGGTCTTGA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 A 1 0 103923 CASAVA_Build 6 6717551 3I GGCATTATGC ---/ATG ATGATGGCCA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 ATG 2 3 103924 CASAVA_Build 6 6722612 1D ACACCTTATA C/- AAAAATTAAT 3070 het 2392 hom 15 5 10 1 C 1 0 103925 CASAVA_Build 6 6724614 1D CTCTTAGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 17 10 T 11 10 103926 CASAVA_Build 6 6727943 4D AAAAGAAAGA AAGG/---- AAGGAAGGAA 3070 het 2954 hom 32 12 15 14 AAGG 5 4 103927 CASAVA_Build 6 6729032 1I GAGCCTTCCA -/G CGGTCTATGG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 G 0 1 103928 CASAVA_Build 6 6731085 6D AGTCAGAACA TGGTCT/------ AGTTCGATCT 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 TGGTCT 1 0 103929 CASAVA_Build 6 6735989 2D TTTGTCAAAA CT/-- CAACCCTAAA 3070 het 3070 hom 46 19 19 9 CT 1 0 103930 CASAVA_Build 6 6741488 1I CTACTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 1805 het 1309 hom 11 4 4 3 A 9 10 103931 CASAVA_Build 6 6748002 1I TGTTGGAGGG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 7 8 103932 CASAVA_Build 6 6749553 6D AGGGCAAGGG GCAGGA/------ GGAGGGTAGG 3070 hom 127 het 46 0 38 12 GCAGGA 1 0 103933 CASAVA_Build 6 6750757 7I GTCTGTTGGG -------/CTGTACA CTGAGATGGG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 CTGTACA 0 1 103934 CASAVA_Build 6 6754821 1D GCAGTAGGAG A/- GGGGTAGCTA 3070 hom 60 het 25 0 18 7 A 1 0 103935 CASAVA_Build 6 6767162 10D TGATGATGGT GGTGATGATG/---------- GTGGTGGTGA 3070 het 3070 ref 43 23 12 21 GGTGATGATG 1 0 103936 CASAVA_Build 6 6774696 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1349 het 1349 ref 12 8 3 1 A 13 14 103937 CASAVA_Build 6 6776521 1I AGCTCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 2339 het 2339 ref 26 17 7 2 T 12 13 103938 CASAVA_Build 6 6789124 1I TGGAGGTCTA -/T TTTTTTTTTT 2382 het 2382 ref 37 18 8 11 T 11 12 103939 CASAVA_Build 6 6793268 9D CAAGGCCCGA GTTTCCATT/--------- GTTTCCATTT 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 GTTTCCATT 2 1 103940 CASAVA_Build 6 6794399 1I CTTCTGTTCT -/G TCCATCATTA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 G 0 1 103941 CASAVA_Build 6 6796143 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 25 0 14 11 A 12 11 103942 CASAVA_Build 6 6825975 3D AAAAAAAAAA AAT/--- AAAAATAAAA 3070 hom 38 het 15 0 12 6 AAT 1 0 103943 CASAVA_Build 6 6846984 1I GGGCCATCTG -/A AAAAAAAAAG 3048 het 3048 ref 23 9 7 7 A 9 10 103944 CASAVA_Build 6 6847256 1I GTGTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3046 het 2971 hom 43 14 14 15 T 15 16 103945 CASAVA_Build 6 6850231 1I TCTTTGTTTT -/C TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 C 0 1 103946 CASAVA_Build 6 6851121 1D GGATTTCATC A/- CAAGAATAGA 3070 het 3070 ref 51 24 20 8 A 1 0 103947 CASAVA_Build 6 6851819 1I CTTTTGACAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 2637 hom 29 7 15 7 A 8 9 103948 CASAVA_Build 6 6857795 1I TTCAATTAAA -/C CACTAGTGCA 3070 het 3070 hom 32 7 20 5 C 1 2 103949 CASAVA_Build 6 6859175 3I GTGTTTTTAA ---/ATT ATTATTCCTG 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 ATT 2 3 103950 CASAVA_Build 6 6859842 1D48M4D AAGCCTTTTT AAAACATTAGTATTGAAACAAGTTTGGGGGGCAGGTACTTTCCTTTTGCATTT/-AAACATTAGTATTGAAACAAGTTTGGGGGACAGGTACTTTCCTTTTGC---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 16 7 8 5 N/A 0 0 103951 CASAVA_Build 6 6894677 1I ATAAATATAA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 6 7 103952 CASAVA_Build 6 6906681 1I TAAGAGAGTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 51 het 24 0 17 7 T 7 8 103953 CASAVA_Build 6 6908385 2D CCATTTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 19 12 T 13 11 103954 CASAVA_Build 6 6912104 1D ATTGATTCCC A/- TTCTGGGCAT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 1 0 103955 CASAVA_Build 6 6913043 3D TTTTTCTGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 19 16 103956 CASAVA_Build 6 6922854 1I AGCTGTTTGG -/A TGAGAAAACT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 0 1 103957 CASAVA_Build 6 6926228 1D ATAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1711 hom 15 4 9 2 A 11 10 103958 CASAVA_Build 6 6931021 1I AGCCTCCTCC -/A AAAAAAAAAA 1699 het 830 hom 27 7 7 13 A 15 16 103959 CASAVA_Build 6 6936235 23I TGTACGTATA -----------------------/CACATATATATGTGTATACACAT CACATATACA 3070 het 3070 hom 43 13 23 8 CACATATATATGTGTATACACAT 0 1 103960 CASAVA_Build 6 6939935 1D ATGTTTAATT A/- AAAAAAAAGA 2213 het 1788 hom 18 7 7 4 A 9 8 103961 CASAVA_Build 6 6942913 3I AACAGTTGAG ---/AAA AAAAAGAAGA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 5 8 103962 CASAVA_Build 6 6956284 2I TTGGGAGGTC --/GA GGTGGATGGA 757 het 757 ref 13 8 2 3 GA 0 1 103963 CASAVA_Build 6 6957277 1D ACTAAAATTT G/- TTTTTAATTA 3070 het 2459 hom 18 7 8 3 G 1 0 103964 CASAVA_Build 6 6958357 3I CACCACAGAA ---/AGG AGGAGGGAAC 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 AGG 2 3 103965 CASAVA_Build 6 6962224 1I GTGTGTATAC -/T TTTTTTTTTT 2711 het 527 hom 15 2 11 2 T 11 12 103966 CASAVA_Build 6 6976756 1I TTTTTAAGGC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 7 8 103967 CASAVA_Build 6 6977590 1D CGGCAGCAAC A/- GGGGCAGGAA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 1 0 103968 CASAVA_Build 6 6979259 3D CTCAGTCTCA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 29 12 12 7 AAC 4 3 103969 CASAVA_Build 6 6981272 1D AAAAAAAAAA C/- AACAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 17 12 6 C 1 0 103970 CASAVA_Build 6 6982168 1D TCCTTTGGTC T/- TTTTTTTTTT 1746 het 1072 hom 25 5 10 11 T 13 12 103971 CASAVA_Build 6 6988760 4D AGTAGGTGAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 14 13 13 AC 9 7 103972 CASAVA_Build 6 6991648 2I CAAAAAATTA --/TG TGTTACATAA 3070 hom 30 het 23 0 11 12 TG 1 2 103973 CASAVA_Build 6 6993035 1D CTAACCCGCC A/- AAAAAAAAAA 1225 het 1225 ref 34 22 5 7 A 11 10 103974 CASAVA_Build 6 6995808 1D TAGAAGGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 10 9 103975 CASAVA_Build 6 6999599 2D TCTCGAACTC AT/-- ATGGGCAGGC 3070 hom 90 het 32 0 30 3 AT 2 1 103976 CASAVA_Build 6 7006102 1D CAGTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 1318 het 1318 ref 44 29 3 12 T 13 12 103977 CASAVA_Build 6 7011059 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 9 8 103978 CASAVA_Build 6 7017963 2I ATATATAGGA --/AT ATATATATAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 AT 4 5 103979 CASAVA_Build 6 7022770 3D GCAATACAGT ACA/--- ACAACTATTT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 ACA 2 1 103980 CASAVA_Build 6 7026363 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1782 hom 23 6 12 5 A 9 10 103981 CASAVA_Build 6 7028265 2I GAGACCTCTC --/TG GACCTGTAAA 3070 hom 120 het 44 0 39 5 TG 0 1 103982 CASAVA_Build 6 7030966 2D TCAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 29 0 24 7 A 12 10 103983 CASAVA_Build 6 7031071 1D GAGAGGTAAA T/- AAAAGCAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 1 0 103984 CASAVA_Build 6 7036254 1D CCTATCTATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 23 hom 12 1 8 3 A 9 8 103985 CASAVA_Build 6 7089847 1D ACATTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 40 0 30 11 T 12 11 103986 CASAVA_Build 6 7105911 11D CTGGATAACT TTTTTTTTTTC/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 TTTTTTTTTTC 2 1 103987 CASAVA_Build 6 7117180 1I ACCATTAGTC -/T TTTTTTTTTT 2121 het 2121 ref 52 14 12 26 T 15 16 103988 CASAVA_Build 6 7151864 1I CGAGTAAAAT -/A ACATGATATC 3070 hom 154 het 59 0 52 7 A 1 2 103989 CASAVA_Build 6 7152061 1D AGCAAGCATC T/- TGAGTCCCAG 3070 hom 42 het 21 0 13 8 T 2 1 103990 CASAVA_Build 6 7161179 3D TCTTGTGTGT GAA/--- GAAGGCCCAA 3070 hom 114 het 41 0 33 10 GAA 2 1 103991 CASAVA_Build 6 7209728 2D TGCTTAGAAT TA/-- TACAAACTGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TA 2 1 103992 CASAVA_Build 6 7209952 1I CTCGCCAAAA -/T CCATACGGTG 3070 hom 132 het 53 0 43 10 T 0 1 103993 CASAVA_Build 6 7213293 2D CCCAGGTCCC CT/-- GTGTCCTTCT 3070 het 3070 hom 30 10 19 2 CT 1 0 103994 CASAVA_Build 6 7220704 3D TTTTTTGTAG AGA/--- TGGGGTCTTA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AGA 1 0 103995 CASAVA_Build 6 7221103 3D CAAATTACTT AAA/--- AAATCCGAGA 3070 hom 132 het 48 0 44 5 A 6 3 103996 CASAVA_Build 6 7230911 1D ACCCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 11 10 103997 CASAVA_Build 6 7235644 4D ATCTCCCATA TGTT/---- TGTTAGATTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TGTT 2 1 103998 CASAVA_Build 6 7240300 1D AAAAACCATT A/- AAAAAATTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 6 103999 CASAVA_Build 6 7253981 1I TAACTGCCCC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 8 9 104000 CASAVA_Build 6 7275194 1I GTGAGCAAGT -/G TGCCATTATT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 0 1 104001 CASAVA_Build 6 7278834 1D AGGAAAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 11 10 104002 CASAVA_Build 6 7279024 1I CCTCAGCCCC -/G CCAGTAGCTG 2450 hom 15 het 6 0 6 0 G 0 1 104003 CASAVA_Build 6 7281748 1I TATTTCTTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 83 het 31 0 28 3 T 7 8 104004 CASAVA_Build 6 7284149 1D TGGTGGGCAG T/- TATCTCATCT 3070 hom 58 het 25 0 18 7 T 2 1 104005 CASAVA_Build 6 7290437 1D AGTTTCACTC T/- TTGAAGTTAG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 T 3 2 104006 CASAVA_Build 6 7290591 8D AACTCTGAAC ACATCAGA/-------- ACATCAGAAG 3070 hom 110 het 45 0 36 11 ACATCAGA 2 1 104007 CASAVA_Build 6 7291988 3D AGGCTGAGGC AGA/--- AGAATTGCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AGA 2 1 104008 CASAVA_Build 6 7292098 6D TCAAAAAAAA AAAAAG/------ AAGAAAGAAA 3070 hom 62 het 23 0 19 7 AAAAAG 1 0 104009 CASAVA_Build 6 7314610 1I AGCATCATTT -/C CCCCATCTTA 3070 hom 92 het 39 0 31 8 C 4 5 104010 CASAVA_Build 6 7315867 1D ACATTTTTTG A/- AACAAAAAAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 3 2 104011 CASAVA_Build 6 7317215 1D CTTCGCTGCC A/- AAAAAGCCTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 6 5 104012 CASAVA_Build 6 7319769 1I AAGTTCTCTC -/T TCTTTTTTTT 3070 het 798 hom 23 2 16 5 T 1 2 104013 CASAVA_Build 6 7328318 1D CTTGCGATAG T/- TGAGTTCTCA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 2 1 104014 CASAVA_Build 6 7330542 1I TGGCCCCCGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 19 0 12 7 T 11 12 104015 CASAVA_Build 6 7330891 2D TTCAATAAGA TT/-- TTTTTGTGGA 3070 hom 102 het 40 0 34 7 T 7 5 104016 CASAVA_Build 6 7331450 3I CATTAAGATG ---/GTT GTTATTTCAG 3070 hom 135 het 49 0 45 4 GTT 1 2 104017 CASAVA_Build 6 7332433 1I AGACTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 775 hom 38 2 28 8 A 10 11 104018 CASAVA_Build 6 7332821 2I CATTGTAACT --/CA GTTTTCCCTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CA 0 1 104019 CASAVA_Build 6 7374808 1I CCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 548 hom 22 2 15 5 A 12 13 104020 CASAVA_Build 6 7376153 1D ATGCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 24 0 19 5 A 12 11 104021 CASAVA_Build 6 7383865 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1060 het 1060 ref 12 6 3 3 T 12 11 104022 CASAVA_Build 6 7389512 1D AACACTGTCC A/- AAAAAAAAAA 1930 hom 15 het 7 0 6 1 A 12 11 104023 CASAVA_Build 6 7402640 1I AAAAGCAGGC -/T GCCCAAACCA 3070 het 158 hom 34 1 31 2 T 0 1 104024 CASAVA_Build 6 7429414 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1478 het 1478 ref 32 14 4 14 T 15 14 104025 CASAVA_Build 6 7436567 1I TTTATTGTAG -/A TAAAATACAT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 0 1 104026 CASAVA_Build 6 7441883 1D TCGAGTACGT G/- GAAGGACGTG 3070 het 3070 hom 42 14 18 11 G 2 1 104027 CASAVA_Build 6 7442277 2D TGGATCAGGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 49 het 26 0 17 10 AT 8 7 104028 CASAVA_Build 6 7446161 1I GTCCTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 654 hom 21 3 12 6 A 10 11 104029 CASAVA_Build 6 7500634 4I AAAAGCCATG ----/TTTA TTCTCAAATG 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 TTTA 0 1 104030 CASAVA_Build 6 7510035 8I AAATATGTAC --------/AACTATAT AACTATATCA 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 AACTATAT 1 2 104031 CASAVA_Build 6 7515067 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 12 11 104032 CASAVA_Build 6 7523392 4D TGGGTTTGAT GAGA/---- GAGACTTCTA 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 GA 4 2 104033 CASAVA_Build 6 7537605 1D AAAGTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 2028 het 2028 ref 42 20 6 17 T 17 16 104034 CASAVA_Build 6 7540619 1I ATTAAAAAAA -/C TTATTATTTA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 C 0 1 104035 CASAVA_Build 6 7543098 2D AACCGTAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 31 0 13 19 T 18 16 104036 CASAVA_Build 6 7549322 1I GAATGTCTGC -/T TATTGACTCT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 T 1 2 104037 CASAVA_Build 6 7555922 12D AAAGGAAGAG ATTGAAAATGTT/------------ ACCAGAGTTC 3070 het 3070 ref 29 14 13 6 ATTGAAAATGTT 1 0 104038 CASAVA_Build 6 7556127 1D ATCAGCGTGA C/- CCCTGTGCCT 3070 het 3070 hom 36 8 22 6 C 4 3 104039 CASAVA_Build 6 7562424 1I ACCAAGACCT -/A AAAGGCCCGC 3070 het 3070 hom 46 12 21 13 A 3 4 104040 CASAVA_Build 6 7570176 1I AACCCTATAC -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 A 6 7 104041 CASAVA_Build 6 7576951 1I CAAGTCCCCG -/C CCTTTGCCTG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 2 3 104042 CASAVA_Build 6 7578676 13I TTTGGCTGTG -------------/AGTATTCACCATA AGTATTCACC 3070 het 3070 ref 42 23 19 0 AGTATTCACCATA 1 2 104043 CASAVA_Build 6 7584660 1D TTAGGCCCAC A/- AAGGATAATC 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 3 2 104044 CASAVA_Build 6 7587356 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 70 het 28 0 22 6 T 7 8 104045 CASAVA_Build 6 7590818 1I ACTTGGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 10 11 104046 CASAVA_Build 6 7590900 1I TATGTGTATG -/T GTGTTCCAGG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 0 1 104047 CASAVA_Build 6 7593924 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTTTTTTTTT 2645 het 1108 hom 20 6 10 4 TG 1 0 104048 CASAVA_Build 6 7601596 4D TCTGTCACTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 5 AAAC 4 3 104049 CASAVA_Build 6 7608307 12D CTATAAGAAT CCTAGAAGAAAA/------------ CCTAGGAAAC 3070 het 2755 hom 17 7 10 4 CCTAGAAGAAAA 1 0 104050 CASAVA_Build 6 7618915 1D GAGTGCATTA C/- TGATATGCTC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 1 0 104051 CASAVA_Build 6 7624155 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2697 het 2477 hom 29 11 7 11 T 12 11 104052 CASAVA_Build 6 7633712 3D AGCAAAACAG GTT/--- GTTATTTCTC 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 GTT 2 1 104053 CASAVA_Build 6 7663141 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2721 hom 22 8 10 4 A 13 14 104054 CASAVA_Build 6 7666729 1I CACCCCAGTT -/G AACTAAGTGT 3070 hom 114 het 43 0 36 7 G 0 1 104055 CASAVA_Build 6 7668358 4I GTTTTAGAAA ----/CACT CACAGAGAAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CACT 0 1 104056 CASAVA_Build 6 7673162 1I CGTTCCGCGC -/T TTTTTTTCAC 2557 het 2122 hom 21 9 9 3 T 7 8 104057 CASAVA_Build 6 7677465 1D AAAACAGTTT G/- GAGAATTTGG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 G 2 1 104058 CASAVA_Build 6 7678132 1D TAGGGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1761 hom 47 10 17 20 T 15 14 104059 CASAVA_Build 6 7678300 1I CTGGCTAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 10 11 104060 CASAVA_Build 6 7680950 1I TGGTATCTTT -/G GTTGCAATTG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 G 1 2 104061 CASAVA_Build 6 7683795 2I ATTAAATCCC --/AT CTCTGTTGTA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 AT 0 1 104062 CASAVA_Build 6 7684905 5I TTTTGTGAAA -----/TAACT TAACTGTCCC 3070 hom 136 het 52 0 44 8 TAACT 1 2 104063 CASAVA_Build 6 7712225 2D AGTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 860 hom 12 het 8 0 4 4 T 12 10 104064 CASAVA_Build 6 7714971 2I AAAGTCAAAC --/AA GACAATCTAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 0 2 104065 CASAVA_Build 6 7715593 2D TAATAGTGAA AG/-- AAAAATCCCT 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 AG 1 0 104066 CASAVA_Build 6 7716926 2I GGTGTTACAC --/AG AGGGTGGTGC 3070 hom 59 het 23 0 17 6 AG 1 2 104067 CASAVA_Build 6 7731167 1D AACCTTTATT A/- AAAAAAAAAA 1160 het 1160 ref 29 21 4 5 A 11 10 104068 CASAVA_Build 6 7735585 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAAATA 2606 het 2606 ref 24 14 6 4 A 8 9 104069 CASAVA_Build 6 7740259 9I AAACATTTAT ---------/GTTTTTCCA GTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 GTTTTTCCA 1 2 104070 CASAVA_Build 6 7750123 1D CTACAACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 18 27 6 T 11 10 104071 CASAVA_Build 6 7755184 4I GAGACCACTT ----/ATTC ATATATTTAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 ATTC 0 1 104072 CASAVA_Build 6 7757351 1D GGCTTGTACA T/- TTTATATACT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 4 3 104073 CASAVA_Build 6 7758425 15D TCATGACACA TAATTTGTATATCTC/--------------- TGATTGTGTT 1448 het 1448 ref 6 5 3 0 TAATTTGTATATCTC 1 0 104074 CASAVA_Build 6 7770459 4I TTACGTGAGC ----/TGTA TGTAATCACA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 TGTA 1 2 104075 CASAVA_Build 6 7793374 1D CTTCATGTTT A/- AAAATTGAAA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 5 4 104076 CASAVA_Build 6 7804558 1I CTTTGAACTG -/T TATTTCTCTG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 1 2 104077 CASAVA_Build 6 7806438 1I AGGGTCTGCC -/T GTGTCGGGGT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 0 1 104078 CASAVA_Build 6 7845268 2I CAGCAGTTGT --/TG TGTCTGTGTT 3070 hom 130 het 47 0 41 6 TG 1 2 104079 CASAVA_Build 6 7859257 2D GTGTATAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2172 hom 35 8 17 10 A 16 14 104080 CASAVA_Build 6 7868974 1I ACTTTAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 13 14 104081 CASAVA_Build 6 7882069 4D CTTTGTTATC TTCT/---- TTATCTTCTC 3070 hom 96 het 33 0 33 2 TTCT 1 0 104082 CASAVA_Build 6 7885746 4D AAAAGAAGAA AGAG/---- AGAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 AG 5 3 104083 CASAVA_Build 6 7886272 4D TGGAATGACT GGGC/---- GGGCGCTGTT 3070 hom 109 het 40 0 34 6 GGGC 2 1 104084 CASAVA_Build 6 7888417 1D ATTAAACCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 21 het 13 0 8 5 T 10 9 104085 CASAVA_Build 6 7898104 1D GGCTGATTTT A/- AAATTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 8 16 8 A 4 3 104086 CASAVA_Build 6 7899439 2D TACTCAAATA TG/-- CTTGGTTATA 3070 het 3070 ref 23 10 8 6 TG 1 0 104087 CASAVA_Build 6 7899502 1I GTGAAAACAA -/T TTGTTTTAAG 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 2 3 104088 CASAVA_Build 6 7899887 4D ACCAACCAAC CAAT/---- CAATCAATCC 3070 het 3070 hom 46 18 17 14 CAAT 3 2 104089 CASAVA_Build 6 7902425 2I57M2D TACACACACA --GATATATAATATATATAAATTATAATGTTTATTAGAAATAAAGTTTCAGAATAGATATT/CTGATATATAATATATATAAATTATAATGTTTATTAGAAATAAAGTTTCAGAATAGATA-- TACCATTTAT 3070 hom 30 het 15 0 11 13 N/A 0 0 104090 CASAVA_Build 6 7908973 1I ACTCTATCCC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 7 8 104091 CASAVA_Build 6 7920071 1I TAATCATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 10 11 104092 CASAVA_Build 6 7933953 1D CCCAACTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1534 hom 28 6 12 10 T 13 12 104093 CASAVA_Build 6 7935385 1D AGAGAAATAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 T 9 8 104094 CASAVA_Build 6 7940863 4D TGAGACAGGA TCTC/---- TCTCTGTTGC 2369 het 2369 ref 28 10 7 11 TC 4 2 104095 CASAVA_Build 6 7944976 2D CGGAGTCTTG CT/-- CTGTTGCCAG 3070 het 1775 hom 24 5 18 1 CT 2 1 104096 CASAVA_Build 6 7947386 24D ACACTGTAAG TGTTAGGAACTTGCAGAGGGAACT/------------------------ TGCTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 29 20 5 TGTTAGGAACTTGCAGAGGGAACT 1 0 104097 CASAVA_Build 6 7947684 4I CAATACAATA ----/TAAC TAGAGAATCT 3070 het 3070 ref 53 28 17 8 TAAC 0 1 104098 CASAVA_Build 6 7948071 5D CCCCAGATAC AGAAG/----- AGAAGAGGGA 3070 hom 129 het 46 0 42 4 AGAAG 2 1 104099 CASAVA_Build 6 7948429 1D CACCTAAGCA C/- TCTTAAAGCT 3070 het 3070 hom 51 19 22 11 C 1 0 104100 CASAVA_Build 6 7950006 1D GCTACTTTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 10 9 104101 CASAVA_Build 6 7950799 4D GGAAAAAAAT ACTG/---- ACAACTAGCT 3070 het 3070 ref 31 17 14 2 ACTG 1 0 104102 CASAVA_Build 6 7951485 2D CAGCAATCCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 24 2 11 11 A 13 11 104103 CASAVA_Build 6 7952473 27D TGAATCATGC ACTGGCCTCTTCCCAGGGTGGCACTTT/--------------------------- ACTGGCCTCT 3070 het 3070 ref 28 18 15 3 ACTGGCCTCTTCCCAGGGTGGCACTTT 2 1 104104 CASAVA_Build 6 7952577 1D TTTTTTCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 65 het 29 0 23 6 T 10 9 104105 CASAVA_Build 6 7953936 1I TTTCCATTCT -/C CCATTCATTC 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 C 2 3 104106 CASAVA_Build 6 7954808 4D TACAGAGAAA TCTG/---- TCTGGCCACT 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 TCTG 2 1 104107 CASAVA_Build 6 7955371 1D ATTCAGGGGA G/- ACAAAATTCA 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 G 1 0 104108 CASAVA_Build 6 7956050 1I AATAAAAAAA -/T ATAATAACTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 0 1 104109 CASAVA_Build 6 7957106 2D AGCCACACAG TT/-- TTTTTTTTTT 1567 het 222 hom 15 4 6 5 T 14 12 104110 CASAVA_Build 6 7957963 1D AGGAAATGGG A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 8 7 104111 CASAVA_Build 6 7960405 1I GACAGCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 10 11 104112 CASAVA_Build 6 7970006 1D ATAGTAAGAT A/- ACAATTTTCA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 2 1 104113 CASAVA_Build 6 7974140 2D TACTGGTTGT AA/-- CTCAGTACGA 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 A 2 0 104114 CASAVA_Build 6 7984863 1D TATTAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 A 11 10 104115 CASAVA_Build 6 7991888 1D TCATGACTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 7 6 104116 CASAVA_Build 6 7991993 1I AACCTGTATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 9 10 104117 CASAVA_Build 6 7996417 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 31 0 23 8 A 14 15 104118 CASAVA_Build 6 8020846 3D AGGAAGTCAA TCT/--- TCTTGCTGGT 3070 hom 95 het 35 0 32 5 TCT 2 1 104119 CASAVA_Build 6 8033040 2D GAAAAGACAC AT/-- GTGAGAGGCA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AT 1 0 104120 CASAVA_Build 6 8033327 3I AAAATGGGGC ---/TGA TATTATTAGT 3070 hom 86 het 34 0 29 5 TGA 0 1 104121 CASAVA_Build 6 8043302 1I AAAAGAATTG -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 T 7 8 104122 CASAVA_Build 6 8045200 1D TTCAATTTTT A/- AACTATGATT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 3 2 104123 CASAVA_Build 6 8055281 6I AGCTACTTGG ------/GGGACT GGGACTGAGG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 GGGACT 1 2 104124 CASAVA_Build 6 8062162 1I TTCCAGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 31 1 24 6 T 12 13 104125 CASAVA_Build 6 8083663 1D TATAGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 840 hom 27 3 22 2 A 12 11 104126 CASAVA_Build 6 8096970 1D CAAACTACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 19 10 T 11 10 104127 CASAVA_Build 6 8099836 1I CTGTCTCCAG -/A AAAAAAACCA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 7 8 104128 CASAVA_Build 6 8104988 1I GTTGATGATT -/C CCCCCCCCCG 3070 het 242 hom 24 1 17 6 C 9 10 104129 CASAVA_Build 6 8116773 1D CGTGAGGACA T/- TTCCAAATCA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 3 2 104130 CASAVA_Build 6 8122685 28D ACCACGGTCT TCAAATACCGTTCATCTTCCCCACTCCA/---------------------------- TCATGGTGCT 3070 hom 84 het 30 0 29 6 TCAAATACCGTTCATCTTCCCCACTCCA 1 0 104131 CASAVA_Build 6 8122814 1D ATACTCATAA C/- TGGACTACCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 104132 CASAVA_Build 6 8132325 1I TCCAGCTTTG -/T TTTTTTTTTT 854 het 854 ref 39 25 3 11 T 11 12 104133 CASAVA_Build 6 8139821 1D AAATCCAGTG T/- GTTGACAAGG 3070 het 3070 ref 45 20 18 8 T 1 0 104134 CASAVA_Build 6 8142595 2I CAACATATGC --/TA TATATATATA 1527 het 1527 ref 13 6 6 1 TA 5 6 104135 CASAVA_Build 6 8146273 1D AGAGGTTGTT G/- GGGGGAGTGA 3070 het 3070 hom 65 26 23 16 G 6 5 104136 CASAVA_Build 6 8162632 1I13M1I CCTAAAACTT -AAAGTATAATAAT-/AAAAGTATAATAATA AAAAAAAAAA 2657 hom 15 het 6 0 6 1 N/A 0 0 104137 CASAVA_Build 6 8164822 11D GAGTTTCCCC AACCCTGTATT/----------- AACCGAATTT 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 AACCCTGTATT 1 0 104138 CASAVA_Build 6 8170813 1I TTGTTTCTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 8 9 104139 CASAVA_Build 6 8171490 1D GCAACGTCCA C/- CTTCTGGGTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 C 2 1 104140 CASAVA_Build 6 8171833 10D ATGTGCTCTA CTTTTCTTTT/---------- CTTTTCTTTT 1157 het 573 hom 14 2 3 10 CTTTT 5 3 104141 CASAVA_Build 6 8176724 2D CCTGTCTCAC AA/-- AAAAAAAAAC 2926 het 961 hom 12 3 7 2 A 11 9 104142 CASAVA_Build 6 8194768 2D CTATCTATCA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 38 het 33 1 25 7 TC 10 9 104143 CASAVA_Build 6 8201207 4I TTTGGTGGCA ----/AAAT AAATAATTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AAAT 1 2 104144 CASAVA_Build 6 8204321 1D TTTAAAATAC A/- AAAAAATTAG 1387 het 1351 hom 8 5 3 0 A 7 6 104145 CASAVA_Build 6 8208799 1D CCAGGCTAGT C/- CTCAAACACC 3070 het 2399 hom 17 8 8 1 C 2 1 104146 CASAVA_Build 6 8209805 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 3070 het 2267 hom 19 5 9 5 G 1 0 104147 CASAVA_Build 6 8213037 1D TATATGCATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 14 27 6 A 10 9 104148 CASAVA_Build 6 8215120 1I TAGCAGCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 A 10 11 104149 CASAVA_Build 6 8220033 4I CTAAAGAAAT ----/TATC TATCCCCAAA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 TATC 1 2 104150 CASAVA_Build 6 8226155 1D TTTCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1724 het 1724 ref 37 24 4 9 T 11 10 104151 CASAVA_Build 6 8228501 1D GGGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 12 11 104152 CASAVA_Build 6 8229634 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 2462 het 2310 hom 18 6 10 2 AT 8 7 104153 CASAVA_Build 6 8230224 1D GTTTTGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 12 11 104154 CASAVA_Build 6 8239804 12D TACCCATGAC TTTTCTTTTTCT/------------ TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 23 4 TTTTCT 3 1 104155 CASAVA_Build 6 8244529 25D TTCTTTCTCC CTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCCT/------------------------- CTCCCCTCCC 2015 het 21 hom 18 1 7 11 CTCCCCTCCCCTCCCCTCCCCTCCT 1 0 104156 CASAVA_Build 6 8248371 4I ATTTAGTAAT ----/AGAC AGGTAATTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AGAC 0 1 104157 CASAVA_Build 6 8251492 1I GCATTTGCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 8 9 104158 CASAVA_Build 6 8251672 4I AAAAATCAGA ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 TTAT 2 3 104159 CASAVA_Build 6 8251881 2D GAGTTCTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 214 hom 29 4 10 16 A 12 10 104160 CASAVA_Build 6 8259762 3I GGCAGCTTTT ---/TTG TTGTTGTTGA 3070 hom 76 het 29 0 24 5 TTG 3 4 104161 CASAVA_Build 6 8262716 5I TAAATAAAAT -----/AAAAG AAAATAAAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AAAAG 0 1 104162 CASAVA_Build 6 8269745 3I GTTGATGGGT ---/TGA TGATATTTAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TGA 1 2 104163 CASAVA_Build 6 8272576 4D CCAGGTCTAA TTAG/---- GGTCAGGACT 3070 hom 111 het 40 0 36 5 TTAG 1 0 104164 CASAVA_Build 6 8272847 1D TATGGTGGGA C/- CCACCCCAGT 3070 hom 99 het 40 0 32 8 C 3 2 104165 CASAVA_Build 6 8275207 2D GTATGCATAA AG/-- AGAGAGATTG 3070 het 3070 hom 52 21 27 5 AG 4 3 104166 CASAVA_Build 6 8276732 2I50M4D AGTGATACTC --TGACACCATGCTAGAAAACATGACCCAATTGAGCATTAATGGCTCAAATAAAAT/TTTGACACCATGCTAGAAAACATGACCCAATTGAGCATTAATGGCTCAAATA---- AAATAAATGA 3070 hom 144 het 30 0 49 3 N/A 0 0 104167 CASAVA_Build 6 8277291 2D ATATATTATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TA 6 5 104168 CASAVA_Build 6 8289324 5D TAGATGAAAA GAAAT/----- GAATAATTCT 3070 het 3070 ref 33 19 13 3 GAAAT 1 0 104169 CASAVA_Build 6 8289909 3D AGAATTCCAC TCA/--- TTCAGAATTC 3070 het 3070 ref 46 25 15 7 TCA 1 0 104170 CASAVA_Build 6 8293696 1I GTATATATAT -/A AAAAAAAGAA 2695 het 2695 ref 17 8 8 4 A 7 8 104171 CASAVA_Build 6 8296101 2D CCCTGCTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 38 3 16 20 T 12 10 104172 CASAVA_Build 6 8298343 3I GAGCAGTAAA ---/TGC TGGGCAAAGC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TGC 0 1 104173 CASAVA_Build 6 8298491 1I TGCAAGCTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 T 7 8 104174 CASAVA_Build 6 8306465 1I CATGATACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 82 het 34 0 28 6 T 9 10 104175 CASAVA_Build 6 8307195 13I AGCCCCTGGC -------------/AAACCACTGGTGT AAGTCCAAGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAACCACTGGTGT 0 1 104176 CASAVA_Build 6 8312724 1I GTTTAATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 10 11 104177 CASAVA_Build 6 8313264 1D ATCCCTAGCC T/- TTCCAGGATT 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 T 3 2 104178 CASAVA_Build 6 8314583 2D CATCTCAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2759 het 1569 hom 19 7 6 7 A 13 11 104179 CASAVA_Build 6 8321250 1D AGCCTGAACT C/- CAGGGCCCCA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 C 2 1 104180 CASAVA_Build 6 8321819 1D TGATTTTCAC A/- AGATGATACA 3070 het 3070 hom 36 10 17 10 A 2 1 104181 CASAVA_Build 6 8330063 3D GTCAATTCTC ATT/--- AATCTATAAT 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 ATT 1 0 104182 CASAVA_Build 6 8331088 2I CTGGAACCCT --/CA CACATGGTTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CA 2 3 104183 CASAVA_Build 6 8335847 1D GCCCAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3048 het 1030 hom 23 7 11 6 T 16 15 104184 CASAVA_Build 6 8340039 1D CACTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 10 9 104185 CASAVA_Build 6 8342618 1I CTGTCACAGG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 8 9 104186 CASAVA_Build 6 8348209 2I TAAGAGTAAA --/TG TGTGATTTTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TG 2 3 104187 CASAVA_Build 6 8349180 1D AACTATCCTT C/- ATACAACTGG 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 C 1 0 104188 CASAVA_Build 6 8362604 1D TAACAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 780 het 780 ref 33 27 3 4 T 11 10 104189 CASAVA_Build 6 8363033 4I CTAAAAAAAA ----/TACT TAAATGAAAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TACT 0 1 104190 CASAVA_Build 6 8363703 2D ATTAATGTAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 AC 10 9 104191 CASAVA_Build 6 8368651 3I ATCTGACTCT ---/CTC CTCATGATTT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 CTC 1 2 104192 CASAVA_Build 6 8372307 1D CAAAGCCTTC A/- AAAGGTAATT 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 A 4 3 104193 CASAVA_Build 6 8373071 2D64M3I TGCCTATCAC ATGTTTTGTTAATAGAAGTATAAATTTCATGCATATTCAGTATGCCAAAAAAATTCAACTAATATA---/--GTTTTGTTAATAGAAGTATAAATTTCATGCATATTCAGTATGCCAAAAAAATTCAACTAATATAAGT GAAATATCAA 3070 het 3070 ref 36 33 18 2 N/A 0 0 104194 CASAVA_Build 6 8374942 9I TTTTGATCTG ---------/TTTTCTGTT TTAAGAAGCT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 TTTTCTGTT 0 1 104195 CASAVA_Build 6 8375665 1I ATCAAAGAAC -/T TAAACATGTC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 1 2 104196 CASAVA_Build 6 8376146 5I ATAAATGAAA -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 AAAAC 2 3 104197 CASAVA_Build 6 8376342 1D TTGTCAGTCT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 A 8 7 104198 CASAVA_Build 6 8377201 1D TGTCCTTTCA G/- CCTGAGGTCT 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 G 1 0 104199 CASAVA_Build 6 8379134 1I ACCATCATCT -/A AAAAAAAAAA 1614 het 1614 ref 33 23 5 5 A 11 12 104200 CASAVA_Build 6 8379773 1D AAGACTATTC T/- TTTTTTTTTC 1393 het 1393 ref 27 21 3 3 T 10 9 104201 CASAVA_Build 6 8386813 2D TCAAGTGCTC AG/-- AGTAGCACAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AG 2 1 104202 CASAVA_Build 6 8387965 2D CTGCTTGTTA GC/-- GACATTGGAT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 GC 1 0 104203 CASAVA_Build 6 8388134 1I GTATCTCTTA -/T TGTGAAATGT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 2 104204 CASAVA_Build 6 8389654 3D GATAATCTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 24 1 17 6 T 16 13 104205 CASAVA_Build 6 8390827 1D TTGACTTTTT A/- ATCCAATATG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 2 1 104206 CASAVA_Build 6 8392637 1I13M1D AATTTTTGCA -TTTTAATAGAGATG/TTTTTAGTAGAGAT- GGGGTTGCAC 1983 hom 12 het 6 0 5 2 N/A 0 0 104207 CASAVA_Build 6 8394345 2D ACTTCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 13 11 104208 CASAVA_Build 6 8395519 4I CTAAAAGTGA ----/TTGT TTGATATTTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TTGT 0 1 104209 CASAVA_Build 6 8396154 2I TATACATAAC --/AT ATATAAATAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AT 2 3 104210 CASAVA_Build 6 8396993 4I TATTGAGTTT ----/AAAG AAACAGTCTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAG 0 1 104211 CASAVA_Build 6 8397804 2D AAGGCCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 34 0 31 4 T 12 10 104212 CASAVA_Build 6 8398384 3D CTAGTACTTA CTT/--- CTTACCTGTC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 CTT 2 1 104213 CASAVA_Build 6 8401120 2D30M3I CCTTGCCAAA TCTCTTGGGGCTATTAATGGCTAAAACTTCTC---/--TCTTGGGGCTATTAATGGCTAAAACTTCTCCTT CTTTGTCACG 3070 hom 178 het 52 0 60 6 N/A 0 0 104214 CASAVA_Build 6 8403774 1D TGAAGTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 15 7 T 12 11 104215 CASAVA_Build 6 8405734 1D CAAGAAGATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 132 het 50 0 46 4 T 10 9 104216 CASAVA_Build 6 8409462 2I AGCGTTAAAA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 9 11 104217 CASAVA_Build 6 8412697 5I AGTAGTTTCT -----/GTGGG GTGGTGGGGG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 GTGGG 0 1 104218 CASAVA_Build 6 8415819 2I GAAGACAAAC --/TG TTTTGAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TG 0 1 104219 CASAVA_Build 6 8416670 1D ACACAAAGTC T/- TATTTCTTGA 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 2 1 104220 CASAVA_Build 6 8418187 2D TTGATTCATC TA/-- TGTTGGTGTA 3070 hom 93 het 35 0 31 5 TA 1 0 104221 CASAVA_Build 6 8418424 2I GGTAGGCACA --/TG TTCAAATTTA 3070 hom 154 het 58 0 52 6 TG 0 1 104222 CASAVA_Build 6 8421886 1D TTCCAAACAT G/- GAAGCTTCTA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 G 2 1 104223 CASAVA_Build 6 8423076 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 8 104224 CASAVA_Build 6 8423797 1I TTGGGTCTTG -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 6 7 104225 CASAVA_Build 6 8423938 4D TTTTTCTGTC TTCT/---- TTCGAGTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TTCT 1 0 104226 CASAVA_Build 6 8425268 2D40M1I CTAATTGTTC CTCTCTATGTAGTGCACCTTTTTTCTCTGCCTGCTTTTAAGA-/--CTCTATGTAGTGCACCTTTTTTCTCTGCCTGCTTTTAAGAT TTTTTTTATT 3070 hom 102 het 30 0 34 7 N/A 0 0 104227 CASAVA_Build 6 8428341 1I TCAAATTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 221 hom 27 1 24 2 T 11 12 104228 CASAVA_Build 6 8430308 1I AAACAAGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 835 hom 33 2 27 4 A 11 12 104229 CASAVA_Build 6 8431031 2I CAATAGCATC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 12 104230 CASAVA_Build 6 8431247 1D AAAATGTCAA T/- TGCCTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 2 1 104231 CASAVA_Build 6 8433293 2I TGAAAATAAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 9 11 104232 CASAVA_Build 6 8436343 1I26M1I AATAGCTGTC -AAAAATATATTTATATGTAAATATAT-/AAAAAATATATTTATATGTAAATATATG TGTATATATT 3070 hom 78 het 26 0 27 3 N/A 0 0 104233 CASAVA_Build 6 8453097 4D GTACTGCTCC ATCT/---- TACCTGCAGA 3070 hom 120 het 42 0 39 3 ATCT 1 0 104234 CASAVA_Build 6 8458316 5D TTAAGGCCTT TTATG/----- TTATGTTTTA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 TTATG 2 1 104235 CASAVA_Build 6 8469270 1D TGATTGTTGA C/- ATTTTGTGTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 1 0 104236 CASAVA_Build 6 8469531 4D CTTAAAATAG TACT/---- TACTTCTTCA 3070 hom 102 het 37 0 34 5 TACT 2 1 104237 CASAVA_Build 6 8471529 1D AAATAGTATT G/- TAGAAAATTC 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 G 1 0 104238 CASAVA_Build 6 8475933 1I AAGGATAGGT -/A AAAAACAGTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 5 6 104239 CASAVA_Build 6 8479845 1I CTTGGCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 10 11 104240 CASAVA_Build 6 8483005 2I CTGGAAAATT --/CA CAGTCATTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CA 1 2 104241 CASAVA_Build 6 8483982 9D CGGAGCTTGC AGTGAGCCG/--------- AGATCGCGCC 1738 hom 12 het 7 0 5 2 AGTGAGCCG 1 0 104242 CASAVA_Build 6 8484915 3D ACTAGAAAAA AGC/--- AGATCACATT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 AGC 1 0 104243 CASAVA_Build 6 8486580 1D ACTTGAAATG A/- AAAATAGAAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 A 5 4 104244 CASAVA_Build 6 8489714 1D CTATATCTCA G/- GGTGCAATAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 3 2 104245 CASAVA_Build 6 8492477 1I TTAATTTTTG -/A ATTTTTTTTT 1558 het 108 hom 19 1 9 9 A 1 2 104246 CASAVA_Build 6 8492647 1I ATTGGTTTCA -/T TAGGAGCTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 1 2 104247 CASAVA_Build 6 8495907 1D TTCCACAACA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 29 14 9 7 T 9 8 104248 CASAVA_Build 6 8498325 1D CCAAATATTG T/- TCATCAAAAG 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 T 2 1 104249 CASAVA_Build 6 8499629 1I GCCATTTTGG -/A AAAACTGATA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 4 5 104250 CASAVA_Build 6 8500618 4D TACAATGCTC TAAT/---- TATTTTTACA 3070 het 3070 ref 45 21 21 4 TAAT 1 0 104251 CASAVA_Build 6 8504731 2D CCTCTGATAT TC/-- TGCCAGATCT 3070 het 3070 ref 45 26 15 6 TC 1 0 104252 CASAVA_Build 6 8505767 1I TACTTACATT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 399 hom 36 1 29 6 A 8 9 104253 CASAVA_Build 6 8506479 1I GTCCTTACCA -/T TTTTCGTACA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 4 5 104254 CASAVA_Build 6 8509365 1I TTTTTGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 56 3 47 6 T 10 11 104255 CASAVA_Build 6 8509614 2I ATGTATAAAA --/CT CTGCAAAAAC 3070 hom 166 het 62 0 56 6 CT 1 2 104256 CASAVA_Build 6 8511793 1D TCCCATGTTC T/- TTTTTTTTTT 1507 hom 10 het 7 0 4 3 T 14 13 104257 CASAVA_Build 6 8514586 10D ATTCCATATC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2346 het 2346 ref 33 13 8 14 T 22 12 104258 CASAVA_Build 6 8514878 2D TGAGCCATTG CA/-- CCCGGCTGAT 3070 het 3070 ref 24 11 11 3 CA 1 0 104259 CASAVA_Build 6 8518355 1I CATCTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 14 18 8 T 14 15 104260 CASAVA_Build 6 8520723 27D TTGGGCTGCT ATAACAAAATACCATAGACTGGGTAGC/--------------------------- TTATAAACAA 3070 het 3070 hom 28 15 15 4 ATAACAAAATACCATAGACTGGGTAGC 1 0 104261 CASAVA_Build 6 8521733 1I TCTTGCTTCC -/T TTTTTTTTTT 1521 het 1521 ref 15 7 5 3 T 12 13 104262 CASAVA_Build 6 8522766 4D TAACATACAC ACAA/---- ACATTTATAT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 ACAA 1 0 104263 CASAVA_Build 6 8523552 1D CAGTCCTAAT A/- ATAGAATCAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 2 1 104264 CASAVA_Build 6 8524152 1I AACACTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2607 hom 30 8 16 6 T 13 14 104265 CASAVA_Build 6 8524877 1I TAGACAATTT -/G GGAACAAGGC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 G 2 3 104266 CASAVA_Build 6 8533434 1D GACACAACAA C/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 C 1 0 104267 CASAVA_Build 6 8536349 1I ATAATATTAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 2433 hom 17 6 10 1 T 6 7 104268 CASAVA_Build 6 8537380 9I AGCATCATGG ---------/CATTGATTT CATTGATGAG 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 CATTGATTT 0 1 104269 CASAVA_Build 6 8541102 1D CTGGTTTTTT A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 A 7 6 104270 CASAVA_Build 6 8541324 5I CTGAGACAAA -----/TATAT TAAACTATCC 2859 het 2859 ref 22 14 6 2 TATAT 0 1 104271 CASAVA_Build 6 8543929 4D TTCCTAAGTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 16 12 104272 CASAVA_Build 6 8544384 1D TTTTGCTGAG A/- GTTTTAATCA 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 A 1 0 104273 CASAVA_Build 6 8544649 2D CAGTCTGTAG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 10 10 6 T 11 9 104274 CASAVA_Build 6 8544825 1D GTCCTGGACA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 8 7 104275 CASAVA_Build 6 8566320 4D9M1D GCATTTTCTT TTTCTTTCTTTTAT/----TTTCTTTTA- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 13 4 N/A 0 0 104276 CASAVA_Build 6 8569775 4I AAACTAGAGT ----/TTTG TTTGTTTGGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 TTTG 2 3 104277 CASAVA_Build 6 8569935 4I GCTGTGAACA ----/CTTT CTTTATTTCT 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 CTTT 1 2 104278 CASAVA_Build 6 8571196 1D TATTTTTTTT A/- ATTATACTTT 3053 het 577 hom 17 4 7 7 A 2 1 104279 CASAVA_Build 6 8573645 4I TCCTTCCTTG ----/CTTC CTTCCTTCCT 3070 het 1660 hom 33 8 12 13 CTTC 4 5 104280 CASAVA_Build 6 8573936 1D GTACATGCCC T/- TACCTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 T 2 1 104281 CASAVA_Build 6 8577138 1I GTATATATCA -/C CTTGAGTCTG 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 C 1 2 104282 CASAVA_Build 6 8578123 6D CGAATAAGAA AAACTT/------ TCTGAAAAGC 3070 het 3070 hom 50 20 25 10 AAACTT 1 0 104283 CASAVA_Build 6 8579814 3I TCAAGTGGTT ---/CTC CTGCTTCAGC 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 CTC 0 1 104284 CASAVA_Build 6 8581192 1I CCTACACTTC -/A AGTCCTGGGA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 1 2 104285 CASAVA_Build 6 8581730 3I CAGTTAACTT ---/AAG AGGAGATCCA 3070 het 3070 hom 52 17 29 6 AAG 0 1 104286 CASAVA_Build 6 8587222 2D GAGTGGGTGG TA/-- AATGAGAATA 3070 het 3070 hom 51 17 27 8 TA 1 0 104287 CASAVA_Build 6 8605380 2D AAATCAGCAC AT/-- GAGGTGGGTA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 AT 1 0 104288 CASAVA_Build 6 8608994 4D ATTAACATGG CTAA/---- CTAAGATGTT 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 CTAA 2 1 104289 CASAVA_Build 6 8613157 1I AGATAGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 A 10 11 104290 CASAVA_Build 6 8619374 1I CCCAAATCCC -/A AAGCCAAATA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 2 3 104291 CASAVA_Build 6 8628925 4D TTGTTCCATA TTTG/---- TTCATTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 15 6 TTTG 1 0 104292 CASAVA_Build 6 8629503 1D TCATATAATG T/- TGAACTACTT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 T 2 1 104293 CASAVA_Build 6 8636596 2I TGTAACCATT --/TG TGTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 TG 1 2 104294 CASAVA_Build 6 8650425 1D ATGGAATCTA T/- TTTTTTTTTT 1771 het 1771 ref 32 15 6 12 T 15 14 104295 CASAVA_Build 6 8691154 1D ACCAGGCCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 9 8 104296 CASAVA_Build 6 8696742 8D TTGAAACACA GTGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 3026 het 1918 hom 32 8 14 13 GT 14 10 104297 CASAVA_Build 6 8699487 8I TACTCCTAGG --------/AGTAACAT AAAAACATAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 AGTAACAT 0 1 104298 CASAVA_Build 6 8709179 1I ATGTAGAAGG -/T TTTTTCCAAG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 5 6 104299 CASAVA_Build 6 8721698 7I CGTCGCTCAC -------/GCTGGGA GCTGTAGACC 3070 hom 42 het 15 0 14 1 GCTGGGA 0 1 104300 CASAVA_Build 6 8722248 1I AACTAACTGA -/T TTATCCATTC 3070 hom 53 het 20 0 18 2 T 2 3 104301 CASAVA_Build 6 8727117 1I GAACAACTCA -/T TTAGATTCCC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 2 3 104302 CASAVA_Build 6 8732530 1D AGCTTAATCA G/- GGCTCTTTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 3 2 104303 CASAVA_Build 6 8737526 1D GCAATAAAGC T/- TTTTTTTTTT 916 het 916 ref 42 27 4 11 T 12 11 104304 CASAVA_Build 6 8745630 2D TTAGATGTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 38 0 31 7 A 12 10 104305 CASAVA_Build 6 8762706 1I CTGGGAAGAG -/T TTGGCCATCA 3070 hom 120 het 42 0 40 2 T 2 3 104306 CASAVA_Build 6 8792590 1D TTCTGCCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 10 9 104307 CASAVA_Build 6 8793543 1I GGTGCTTAAT -/A AAAAACACCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 6 104308 CASAVA_Build 6 8797804 1I AAAATGAATG -/A AAAACATTAG 3070 hom 101 het 40 0 32 8 A 4 5 104309 CASAVA_Build 6 8803608 3D ATAAATGATG GTT/--- GTTGTAAGCC 3070 het 3070 ref 43 21 17 7 GTT 2 1 104310 CASAVA_Build 6 8803800 2D AAGCTGGATG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 54 26 17 12 GT 8 7 104311 CASAVA_Build 6 8805574 1I TTCAAAAATG -/C CTTTTCACCT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 C 1 2 104312 CASAVA_Build 6 8806269 3D CTGGAACATA CTG/--- GAACATTCTG 3070 het 3070 ref 63 34 26 4 CTG 1 0 104313 CASAVA_Build 6 8809315 1I GTTCCTCGCC -/T TTACCCTGCA 3070 het 3070 ref 42 24 11 7 T 2 3 104314 CASAVA_Build 6 8809718 2I AATAAAAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 18 6 A 10 12 104315 CASAVA_Build 6 8814696 2I TGGGTGAAAC --/TG AGTTCAGAGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TG 0 1 104316 CASAVA_Build 6 8817072 1D CTGCAGTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 55 het 27 0 17 10 T 10 9 104317 CASAVA_Build 6 8823729 19D TCTATGCTGG GCAGACAATATCCACTACA/------------------- GTCAGCCTAT 3070 hom 155 het 52 0 48 7 GCAGACAATATCCACTACA 1 0 104318 CASAVA_Build 6 8825662 1I GTCAATAGTA -/T TGTCTATATG 3070 hom 129 het 51 0 42 9 T 1 2 104319 CASAVA_Build 6 8827439 5I AAACAAATGC -----/ATTAT ATTAAAGAAA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 ATTAT 0 1 104320 CASAVA_Build 6 8830526 1D TATCCTTAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 9 8 104321 CASAVA_Build 6 8831579 4I TTTCTTTCTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 26 het 15 0 9 6 TC 5 7 104322 CASAVA_Build 6 8831589 8D TCTCTCTCTC TTTTTCTT/-------- TCTCTTTCTC 288 het 71 hom 19 1 3 19 TTTTTCTT 1 0 104323 CASAVA_Build 6 8831617 2D TCTCTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1509 het 153 hom 18 1 5 12 T 13 11 104324 CASAVA_Build 6 8833394 1I AATATCAGAA -/G GGGACAGACT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 G 3 4 104325 CASAVA_Build 6 8836887 2D AACTAAACAC TT/-- TATTAGATCT 3070 hom 108 het 40 0 37 6 T 3 1 104326 CASAVA_Build 6 8836984 2I GTATTTATAT --/AC ACACACACAG 3070 hom 138 het 54 0 45 9 AC 4 5 104327 CASAVA_Build 6 8837290 4I TGTGCAAAGT ----/GACA GACAGATCAC 3070 hom 120 het 48 0 39 9 GACA 1 2 104328 CASAVA_Build 6 8843096 1D CCTCATTTGG T/- TTTTTAGGTC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 6 5 104329 CASAVA_Build 6 8848759 1I GTAATAGTTT -/A TCTCAATGGG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 0 1 104330 CASAVA_Build 6 8849892 3I CCAACATATC ---/CTT CTATGAGGAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CTT 0 1 104331 CASAVA_Build 6 8860298 2D CTTTGGGGGA TT/-- TCACACAGAG 3070 hom 96 het 35 0 32 5 T 3 1 104332 CASAVA_Build 6 8866565 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 33 0 24 10 T 13 12 104333 CASAVA_Build 6 8871013 3D TTTTATATAA AAT/--- AATTTTTTGT 3070 hom 45 het 18 0 15 5 AAT 2 1 104334 CASAVA_Build 6 8876724 1D TTTATGCTGA T/- TTTTTTAACT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 7 6 104335 CASAVA_Build 6 8880917 3D CATCTCAAAA AAT/--- AAAAAAGAGT 3070 hom 102 het 36 0 35 3 AAT 1 0 104336 CASAVA_Build 6 8882573 1D ATATATAGTA T/- TATATTATGT 1470 hom 7 het 5 0 3 2 T 2 1 104337 CASAVA_Build 6 8883973 1I TTTGGGAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 891 hom 46 3 34 9 A 14 15 104338 CASAVA_Build 6 8886605 3I TTTAAAAATT ---/GTC GTATGTACTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GTC 0 1 104339 CASAVA_Build 6 8888062 1D AGAGCTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 11 10 104340 CASAVA_Build 6 8889035 1I GAATTAGTAA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 6 7 104341 CASAVA_Build 6 8906668 2D TTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 29 0 18 11 T 16 14 104342 CASAVA_Build 6 8908291 8I ATCCTTAAAG --------/TATAGACA TATGCTGAAT 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 TATAGACA 0 1 104343 CASAVA_Build 6 8916095 2D32M1D CATATTTCAC ATAGTTACTCTTTTTTTTTCCCCTGCGAGGGTCAG/--AGTTACTCTTTTTTTTTCCCCTGCGAGGGTCA- TAAGAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 25 5 N/A 0 0 104344 CASAVA_Build 6 8918004 1D GTTAAAAAAA G/- AGAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 34 21 12 2 G 1 0 104345 CASAVA_Build 6 8924097 1I ATTTTGGTGG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 7 8 104346 CASAVA_Build 6 8924500 2D TTTTTCTTGA TT/-- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 T 8 6 104347 CASAVA_Build 6 8927971 1D GTTGTTGAAA G/- TACTCTCAAT 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 G 1 0 104348 CASAVA_Build 6 8935934 1D GCCATTTATG A/- AAACCCCACA 3070 het 3070 ref 55 24 23 8 A 4 3 104349 CASAVA_Build 6 8936787 1D TTTGAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2007 hom 31 7 15 9 A 15 14 104350 CASAVA_Build 6 8938316 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 8 A 13 12 104351 CASAVA_Build 6 8944439 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAATCA 2365 het 956 hom 10 3 6 1 A 8 7 104352 CASAVA_Build 6 8945348 1I GAAGAAAGCC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 7 8 104353 CASAVA_Build 6 8959191 1I AAAAATTACC -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 A 6 7 104354 CASAVA_Build 6 8959307 6I AAAAGTAAAA ------/TAAATT TAAATAGTCA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TAAATT 0 1 104355 CASAVA_Build 6 8959816 108D AGGGCAGGGT AAAAAATGCTCCTCACAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------------------------------------------------------------------------------------------ AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 22 15 11 11 AAAAAATGCTCCTCACAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 104356 CASAVA_Build 6 8994754 1I ATTAGCCAGA -/T CAGGTACAAG 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 T 0 1 104357 CASAVA_Build 6 8997274 1I TTTATAGGGA -/T TTTTTTTTTT 2667 het 2667 ref 35 18 9 8 T 10 11 104358 CASAVA_Build 6 9005045 2I TAAACATAAC --/TT TTAAAAACTG 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 2 4 104359 CASAVA_Build 6 9006886 4D TAAAAAATCG TCTA/---- TCTACTTATG 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 TCTA 2 1 104360 CASAVA_Build 6 9008904 1D GTGAAATAAA G/- GGTAACATAC 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 G 3 2 104361 CASAVA_Build 6 9009703 1I TCTGTAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 10 11 104362 CASAVA_Build 6 9011681 4D TTTTTTGTTT GTTC/---- GTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 GTTC 1 0 104363 CASAVA_Build 6 9013195 4D TATGTGAAAA AAAT/---- AAAGGACTGA 3070 het 3070 hom 37 17 18 5 AAAT 1 0 104364 CASAVA_Build 6 9014572 1I50M4I TTCTTTTTTT -AAAAAATGCTCTTAAAGATTAGTTCAACCAGAGTCACCATTTATAAGAAA----/AAAAAAATGCTCTTAAAGATTAGTTCAACCAGAGTCACCATTTATAAGAAAAAAC AAACAACAGA 3070 het 3070 ref 34 17 17 16 N/A 0 0 104365 CASAVA_Build 6 9015314 1I AGTTTAAGTT -/A GTTTTCTACT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 0 1 104366 CASAVA_Build 6 9015494 1D GAATGGCTAG T/- CTTTCAGGTC 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 1 0 104367 CASAVA_Build 6 9015744 2I TTCAATACAC --/AT TGTGGTTTGA 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 AT 0 1 104368 CASAVA_Build 6 9018539 1I TTTCTGGACC -/T TTTAATTCAT 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 3 4 104369 CASAVA_Build 6 9083819 1I GCATTTCTGC -/T TGGTTGGCTT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 T 1 2 104370 CASAVA_Build 6 9362964 2D AAACATTATT CA/-- CAAAGTATTT 3070 hom 79 het 34 0 31 3 CA 2 1 104371 CASAVA_Build 6 9379690 1D TAAGAGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 10 13 A 12 11 104372 CASAVA_Build 6 9381965 4D GCAGGGAGGA TTGC/---- TTGAGCCCAG 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 TTGC 1 0 104373 CASAVA_Build 6 9388460 10I GAAATAGAAA ----------/AAACTATCCT AAAATATATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AAACTATCCT 0 1 104374 CASAVA_Build 6 9397039 1I GAAGACAGAT -/A ATACTCATGA 3070 hom 151 het 59 0 51 8 A 1 2 104375 CASAVA_Build 6 9406534 1D TAATGCAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 9 8 104376 CASAVA_Build 6 9418657 4I ATAAGTAATA ----/AAAT AAATAATTGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAAT 1 2 104377 CASAVA_Build 6 9422934 1D CAAGTCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 28 0 18 10 T 13 12 104378 CASAVA_Build 6 9423223 1D TAATTCATGT A/- AAAAATTAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 6 5 104379 CASAVA_Build 6 9425937 1D AATTATTTTA T/- TTTTTCATAT 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 T 6 5 104380 CASAVA_Build 6 9427200 1D GTAAAACAGC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 85 het 35 0 28 7 T 8 7 104381 CASAVA_Build 6 9429810 1I CAAAATTTCC -/T TCTCTTTGAT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 1 2 104382 CASAVA_Build 6 9433200 1I ATGTAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 10 11 104383 CASAVA_Build 6 9436304 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 2172 het 102 hom 11 1 6 4 A 10 11 104384 CASAVA_Build 6 9436315 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 166 hom 20 3 13 5 A 9 8 104385 CASAVA_Build 6 9448484 1I CTCGCCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 30 0 22 8 T 13 14 104386 CASAVA_Build 6 9453106 1I AACATTGCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 9 10 104387 CASAVA_Build 6 9458634 1I GTCCCATTAG -/T GGAAGACAGA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 0 1 104388 CASAVA_Build 6 9460108 1D ACTTATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 T 12 11 104389 CASAVA_Build 6 9480898 2I GATTAATAAC --/TT TGATATCAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 3 104390 CASAVA_Build 6 9490782 1D TTTAACTTGA T/- TTTGTTGTTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 4 3 104391 CASAVA_Build 6 9493598 1D ATTTTTTCCG T/- TTTTTTTTTT 1449 het 1449 ref 40 26 4 11 T 12 11 104392 CASAVA_Build 6 9529278 1I TAATTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1436 hom 22 6 11 5 A 10 11 104393 CASAVA_Build 6 9532223 1I TCTAAACTTT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 A 7 8 104394 CASAVA_Build 6 9576594 1I GACGTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 A 11 12 104395 CASAVA_Build 6 9595185 1D AGCTATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1303 hom 42 7 18 19 T 11 10 104396 CASAVA_Build 6 9596029 1D CAGGGGACTG A/- ATCCTGAACA 3070 het 3070 hom 49 15 23 12 A 2 1 104397 CASAVA_Build 6 9605935 1I TCCAAAGTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 9 10 104398 CASAVA_Build 6 9632648 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 21 6 A 11 10 104399 CASAVA_Build 6 9633609 1D AAATTTACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 10 9 104400 CASAVA_Build 6 9638398 2I GATATATATA --/TT AAACATATAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 2 104401 CASAVA_Build 6 9638720 1D CATCTTTATA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 T 8 7 104402 CASAVA_Build 6 9639821 4I TCCAGTGGTT ----/TAAG TGTGTATATA 3070 hom 42 het 35 0 15 20 TAAG 0 1 104403 CASAVA_Build 6 9642984 1D CCTAGCTACC T/- TTTTTTTTTT 732 het 732 ref 18 10 4 4 T 13 12 104404 CASAVA_Build 6 9645147 1I GGAAAGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 14 14 11 A 13 14 104405 CASAVA_Build 6 9648887 1I TTATGTTCAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 8 9 104406 CASAVA_Build 6 9653503 11D CACTTTCTCT TTTTTGTTTTG/----------- TTTTTGTTTT 3070 hom 27 het 18 0 10 8 TTTTTGTTTTG 2 1 104407 CASAVA_Build 6 9654113 2D GCAAGTCTCT AC/-- AAATAGGTTA 3070 hom 105 het 37 0 35 3 AC 1 0 104408 CASAVA_Build 6 9654840 1D ATCTCATGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 21 0 19 3 A 10 9 104409 CASAVA_Build 6 9654912 2I ATTGAAGAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 21 0 14 7 A 10 12 104410 CASAVA_Build 6 9677827 3D ATCTCCAAGG TTT/--- TTTTATTAGT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 7 4 104411 CASAVA_Build 6 9678074 3I GATACACCAA ---/CTT CTTTCACATA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 CTT 1 2 104412 CASAVA_Build 6 9679430 5I AAAATATCAG -----/AAGAT AAGAAGAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AAGAT 0 1 104413 CASAVA_Build 6 9681146 1D AAGTATATAT A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 8 7 104414 CASAVA_Build 6 9686217 1D GCCTCATTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 10 9 104415 CASAVA_Build 6 9693283 4D TACATATGTC TGCA/---- TGCATGTAGA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 TGCA 2 1 104416 CASAVA_Build 6 9693895 4D AATCATAAAT ATTA/---- ATTTATATCC 3070 hom 81 het 30 0 28 3 ATTA 1 0 104417 CASAVA_Build 6 9695544 1I CCCCTATTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 9 10 104418 CASAVA_Build 6 9699722 1D TCCACTACTT A/- ACAGCTTTCT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 2 1 104419 CASAVA_Build 6 9705449 1I TAAATTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 31 1 21 9 T 12 13 104420 CASAVA_Build 6 9723592 2D ACCTTTTTTT TG/-- GGGGGGGGGG 2678 het 1289 hom 29 10 11 8 TG 1 0 104421 CASAVA_Build 6 9755219 1I AACAGAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 30 0 21 9 T 10 11 104422 CASAVA_Build 6 9775425 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 41 16 11 14 AC 6 7 104423 CASAVA_Build 6 9781948 3D TGAACTCATG CTT/--- CTTATTTTTG 3070 het 3070 ref 29 15 11 6 CTT 2 1 104424 CASAVA_Build 6 9804132 2I CCTGCAAACC --/TG TTTCTCTCTG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 TG 0 1 104425 CASAVA_Build 6 9828532 1D ATCTTTCATG T/- TTTTTACATA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 6 5 104426 CASAVA_Build 6 9838763 1I TGTGAATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 9 10 104427 CASAVA_Build 6 9855558 1I AAAAGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 9 18 13 T 13 14 104428 CASAVA_Build 6 9885367 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 1095 het 1095 ref 25 10 6 10 AG 2 1 104429 CASAVA_Build 6 9887069 1I TAACATATTG -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 6 7 104430 CASAVA_Build 6 9888491 5D TTTACATTAC TTATA/----- TTATATATAA 868 het 868 ref 9 5 3 1 TTATA 2 1 104431 CASAVA_Build 6 9893455 5D AACCTATCTA TTATT/----- TTAAGAAGTT 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 TTATT 1 0 104432 CASAVA_Build 6 9901607 1D ACTTGCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 15 14 104433 CASAVA_Build 6 9929326 1D CAGCAGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 T 12 11 104434 CASAVA_Build 6 9930404 1I CATATTCACG -/A AACATTGTTC 3070 hom 93 het 38 0 32 7 A 2 3 104435 CASAVA_Build 6 9943101 1D ATACACCTTT G/- GGCTTACTCA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 G 3 2 104436 CASAVA_Build 6 9946136 2I TAAATAAAGG --/GA AAAAAAAAGG 2721 het 2721 ref 29 14 7 8 GA 0 1 104437 CASAVA_Build 6 9947651 4D ACGATTATAA TTTT/---- TTTTAAGAAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 T 8 4 104438 CASAVA_Build 6 9950877 4I AAAAAAGAAA ----/GAAG GAAGATAAAA 3070 hom 120 het 47 0 39 8 GAAG 1 2 104439 CASAVA_Build 6 9958249 1D CTCCATTTTC A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 7 6 104440 CASAVA_Build 6 9962653 1D TTTAAAAACT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 83 het 46 1 42 3 A 8 7 104441 CASAVA_Build 6 9966447 1D CCATCTCGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2636 hom 24 7 10 7 A 13 12 104442 CASAVA_Build 6 9968501 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 26 1 17 8 A 13 14 104443 CASAVA_Build 6 9974410 1I GGCCTCACTG -/A AATCTCATCT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 2 3 104444 CASAVA_Build 6 9975533 4D TATTTGTGCT ATAG/---- ATAGATAGAT 2633 het 2633 ref 26 16 6 8 ATAG 3 2 104445 CASAVA_Build 6 9981614 1D9M1I CCTAGAACTT AAAAGTATAA-/-AAAGTATAAT TAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 20 0 15 5 N/A 0 0 104446 CASAVA_Build 6 9983114 2I CGGCAATAAC --/TT ATTAAAGAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 0 2 104447 CASAVA_Build 6 9988832 5I GTCAGAGCAG -----/AATAA AATAAAACAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AATAA 1 2 104448 CASAVA_Build 6 9988908 4D TAAACAAAAT AAAC/---- AAACCCTTAG 3070 het 3070 ref 35 22 10 5 AAAC 2 1 104449 CASAVA_Build 6 9989943 4I GTCAGAACAG ----/ACAA ACAATTTCAG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 ACAA 1 2 104450 CASAVA_Build 6 9993567 2I ACAAAAGAAA --/GC GCAGGAAAGA 1948 het 1948 ref 10 6 4 0 GC 1 2 104451 CASAVA_Build 6 9997674 1I GAGGGAGGGG -/A AAAAATAGAG 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 A 5 6 104452 CASAVA_Build 6 9999586 8I CAGAAACTAT --------/ATAAGGGA ATAGAAATAA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 ATAAGGGA 0 1 104453 CASAVA_Build 6 10000384 1D CTGCTGGGAC A/- AGACTCCAGC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 2 1 104454 CASAVA_Build 6 10002147 1I CAATTACCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 9 10 104455 CASAVA_Build 6 10007615 2D AAGATATGAA AC/-- AGTTTTATGG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 AC 1 0 104456 CASAVA_Build 6 10012690 1D TTGTCCTGTG T/- TTTTTTGCAG 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 T 7 6 104457 CASAVA_Build 6 10013690 1D AAATATGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 39 0 25 14 T 15 14 104458 CASAVA_Build 6 10024768 1I TCTTTCCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 11 12 104459 CASAVA_Build 6 10043939 1I TGCATTTTCC -/T CCACCCCCTT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 0 1 104460 CASAVA_Build 6 10048810 2D ACGCTTTGTG TA/-- TATGAGCTTT 3070 het 3070 hom 24 12 12 1 TA 2 1 104461 CASAVA_Build 6 10051565 1I TTTGAAACAC -/A AAAAAACGAC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 6 7 104462 CASAVA_Build 6 10056578 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAAAAC 3070 het 29 hom 22 1 16 5 AC 0 1 104463 CASAVA_Build 6 10062633 1D TTTAAAATAG T/- TTTTTTCTAG 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 7 6 104464 CASAVA_Build 6 10063306 1I AACCCTCGCA -/C CCCCCCACTT 1872 het 1872 ref 31 15 9 7 C 6 7 104465 CASAVA_Build 6 10069890 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 A 12 11 104466 CASAVA_Build 6 10111587 2I TCACAGCACC --/CA CACTTCCCCA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 CA 1 2 104467 CASAVA_Build 6 10112635 1D ATGTATTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 A 11 10 104468 CASAVA_Build 6 10122228 3D AGTAAAACAA AAC/--- AACCTTTGAT 3070 hom 123 het 47 0 42 7 AAC 2 1 104469 CASAVA_Build 6 10124395 1D CCAGAAATCT A/- AAAAAAAAAA 1932 het 1932 ref 44 35 5 4 A 12 11 104470 CASAVA_Build 6 10126152 2D CACGCAAACC CA/-- CACACACACA 3070 hom 70 het 36 0 24 12 CA 7 6 104471 CASAVA_Build 6 10137674 2D GATAATTAAA AT/-- AGAGGTTTAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 5 AT 1 0 104472 CASAVA_Build 6 10150287 2I TACTCTGATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 10 12 104473 CASAVA_Build 6 10153794 3D CACCTGTTTA TTT/--- TTTATTTCCA 3070 het 3070 ref 46 21 19 7 T 6 3 104474 CASAVA_Build 6 10154216 2D CATACACAAA CT/-- CTCTCATTTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 CT 3 2 104475 CASAVA_Build 6 10154988 1I GACGGTGGGA -/G GGGGGGGTGC 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 G 7 8 104476 CASAVA_Build 6 10174346 1D AGACTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1452 hom 34 4 23 7 A 12 11 104477 CASAVA_Build 6 10179637 1D TTTTTCAATC A/- AAAGATAATT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 4 3 104478 CASAVA_Build 6 10180271 1I AACATAACTC -/T TGAGCACGCA 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 T 1 2 104479 CASAVA_Build 6 10185555 1D CTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 17 1 12 4 T 13 12 104480 CASAVA_Build 6 10188899 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAATTA 1217 het 1217 ref 32 22 4 6 C 0 1 104481 CASAVA_Build 6 10189654 1D TCTCCTCGCA T/- TTCCTATAAG 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 3 2 104482 CASAVA_Build 6 10196424 1D ATGTAACAGT A/- AAAAATACGA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 6 5 104483 CASAVA_Build 6 10196778 1D CCAGCCTGGG C/- AACAAGAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 C 1 0 104484 CASAVA_Build 6 10200722 2I TATTATTCCA --/CC CCTGGCCCCT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 C 2 4 104485 CASAVA_Build 6 10207882 1I ATACTCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 33 1 23 9 A 15 16 104486 CASAVA_Build 6 10211448 1I TAGGAAGATA -/T TTTTCCCATA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 4 5 104487 CASAVA_Build 6 10214923 1D AACAAAATCC T/- TTTTTTTTTT 2569 het 330 hom 25 2 12 11 T 17 16 104488 CASAVA_Build 6 10222533 1I AGTCATTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 9 10 104489 CASAVA_Build 6 10237384 1D TCATGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 12 11 104490 CASAVA_Build 6 10239592 1D GAATCCATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 11 10 104491 CASAVA_Build 6 10243512 2I AAACTCACTC --/TA TGAGACCAGC 3070 het 2371 hom 21 5 12 4 TA 0 1 104492 CASAVA_Build 6 10251981 4D ATATATTAAC TAAT/---- TAATTGTGAA 3070 het 3070 ref 25 11 7 8 TAAT 2 1 104493 CASAVA_Build 6 10254851 1D ACAGATTCCT A/- AAAGCTGGAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 4 3 104494 CASAVA_Build 6 10254958 1D GCCCCACCCA C/- CCCCCGCAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 C 6 5 104495 CASAVA_Build 6 10264965 1I ACATTGCACA -/T TTTTTTTCCG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 7 8 104496 CASAVA_Build 6 10276698 1I GTCTTGAACT -/C CTAGCCTCAA 2847 het 2455 hom 17 7 6 4 C 1 2 104497 CASAVA_Build 6 10278484 3D TATTATAATT GTC/--- TTCTTAAGAA 3070 het 3070 hom 24 11 12 3 GTC 1 0 104498 CASAVA_Build 6 10281341 3D TGGGAAATAC GGA/--- GGAGATTTTC 2195 het 2195 ref 17 9 7 1 GGA 2 1 104499 CASAVA_Build 6 10287143 1D GAAAATGATA T/- TTTTTCACAC 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 6 5 104500 CASAVA_Build 6 10288329 2D ATGGGGAAGG TC/-- TTTAAGAAAG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 TC 1 0 104501 CASAVA_Build 6 10291087 1D GGCAAAGGAA T/- TGAGTAGACA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 2 1 104502 CASAVA_Build 6 10291445 3D AACTGTGAGT ATA/--- AATACATTTC 3070 hom 105 het 38 0 35 4 ATA 1 0 104503 CASAVA_Build 6 10296146 1D TGAAATAATT A/- AGACAACTAG 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 2 1 104504 CASAVA_Build 6 10316982 1D TTCCAAGCCG C/- CCCCCCTAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 7 6 104505 CASAVA_Build 6 10320873 1I ACACTTTTGA -/G CACTTACACT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 104506 CASAVA_Build 6 10323245 1D CTTTCATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 8 het 24 0 15 9 T 10 9 104507 CASAVA_Build 6 10323957 1D GCATGACCAG A/- AGCATCCTTT 3070 het 3070 ref 53 22 24 8 A 2 1 104508 CASAVA_Build 6 10326076 12D TAGTAATGGG GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 37 12 16 13 GT 13 7 104509 CASAVA_Build 6 10326550 4D AAAGAGGGAG GAGA/---- GAAAGATGGC 3070 het 3070 ref 40 21 18 3 GA 3 1 104510 CASAVA_Build 6 10334502 4D AAAGAGAGAG AGGA/---- AGGAAGGAAG 2712 het 1345 hom 18 6 7 5 AGGA 5 4 104511 CASAVA_Build 6 10336367 1I34M1I AAGTGCTAAG -AAAAAAAAAATGACTGCCAAACTAAAATTGTAAA-/AAAAAAAAAAATGACTGCCAACCTAAAATTGTAAAG CCTGTATAGA 3070 hom 91 het 35 0 32 12 N/A 0 0 104512 CASAVA_Build 6 10346195 1I AGACTGTGCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 45 0 34 11 T 8 9 104513 CASAVA_Build 6 10348525 1I AGTTCAACTG -/T TTTAGGGAGA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 3 4 104514 CASAVA_Build 6 10360875 1D TCACAGAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 10 9 104515 CASAVA_Build 6 10362256 2D GTGAATATAT AG/-- TTTAAGAAAA 3070 het 3070 ref 32 20 9 4 AG 1 0 104516 CASAVA_Build 6 10362465 2I CAAACACCAC --/AT GTTCTCACTC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 AT 0 1 104517 CASAVA_Build 6 10365018 1D14M1D CATTTATGAT AAAAAAAAAACTCTCA/-AAAAAAAAACTCTC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 27 12 1 N/A 0 0 104518 CASAVA_Build 6 10365457 3I AAAACACATT ---/ACC ACCATTTATA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 ACC 1 2 104519 CASAVA_Build 6 10366027 1D ATACACATGC A/- AAAAAAAAAA 2677 het 2677 ref 56 37 6 13 A 13 12 104520 CASAVA_Build 6 10366338 1D GTCTGATGAA G/- GGCTCTTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 G 3 2 104521 CASAVA_Build 6 10369991 1D ATTTGACCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 T 10 9 104522 CASAVA_Build 6 10375673 1D CAAAGCAGAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 7 104523 CASAVA_Build 6 10377758 1D AAATTTGTCA T/- GTATATCCAC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 1 0 104524 CASAVA_Build 6 10381925 1I AAGAACAGCC -/T TAACAAGACA 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 T 1 2 104525 CASAVA_Build 6 10388919 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1381 hom 10 het 5 0 4 1 A 12 11 104526 CASAVA_Build 6 10396774 1D TAAAATAATG C/- CCCCATAAGG 3070 het 3070 ref 54 22 22 10 C 5 4 104527 CASAVA_Build 6 10398883 2D CAATATTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 515 hom 31 5 16 10 A 19 17 104528 CASAVA_Build 6 10399247 4D ACAAACAAAC AAAA/---- AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 36 15 18 8 A 10 6 104529 CASAVA_Build 6 10403531 19D TCGATGGTCT CGATGGTCACAAGTCAGGA/------------------- GACCTTGTGA 1715 het 1715 ref 14 14 5 4 CGATGGTCACAAGTCAGGA 1 0 104530 CASAVA_Build 6 10409113 1D AACCCTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 21 0 16 5 A 12 11 104531 CASAVA_Build 6 10409803 1D GCTACTCGGG A/- AGGATTCCTT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 2 1 104532 CASAVA_Build 6 10410345 2I ACTGGGCAAC --/AA GAGCGAAACG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 0 2 104533 CASAVA_Build 6 10418905 1I GTTGTGGGGT -/G GGGGGCATTT 2201 het 2201 ref 23 13 7 3 G 5 6 104534 CASAVA_Build 6 10425168 2D AGGAAATATC TT/-- TTTTTTTTTT 2847 het 488 hom 31 3 11 17 T 18 16 104535 CASAVA_Build 6 10428301 4D CTCTGTCTCT CTCC/---- CTCCCTCCCT 2557 het 162 hom 17 3 9 5 CTCC 5 4 104536 CASAVA_Build 6 10428851 2D ATTCGAAAAT TC/-- TAGAAGTAAA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 TC 1 0 104537 CASAVA_Build 6 10431266 1D AGCTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 1750 het 1750 ref 35 27 4 4 A 12 11 104538 CASAVA_Build 6 10442562 2I AGAGTATAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 10 12 104539 CASAVA_Build 6 10477584 3D ACAGACACCT AGA/--- AGAAAGTAAG 3070 hom 102 het 39 0 34 6 AGA 2 1 104540 CASAVA_Build 6 10478674 1D TTTTAAAAGG T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 7 5 T 2 1 104541 CASAVA_Build 6 10499090 16I GGGCGAGGGA ----------------/TGCTGAAACTTCGCGC TGCTTTGGGA 3070 het 25 hom 19 1 10 8 TGCTGAAACTTCGCGC 0 1 104542 CASAVA_Build 6 10499104 1D TTGGGAGTTT G/- GAGCCAGAAA 2882 het 791 hom 20 4 9 7 G 2 1 104543 CASAVA_Build 6 10510425 2I TAAAGGAGAC --/AG AAACTTGGAG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AG 0 1 104544 CASAVA_Build 6 10511837 2I GAGAAGAAAC --/AT ATTATCCGGG 3070 het 3070 hom 53 21 24 8 AT 1 2 104545 CASAVA_Build 6 10513804 1D CCACTGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 A 12 11 104546 CASAVA_Build 6 10521732 2D TGAATTGTCC TA/-- TGAGACTGAG 3070 het 2598 hom 19 8 9 2 TA 1 0 104547 CASAVA_Build 6 10535407 1D GCTCATTCCT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 3 hom 25 1 12 12 C 11 10 104548 CASAVA_Build 6 10540950 1D CTGTTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 15 0 10 5 T 12 11 104549 CASAVA_Build 6 10543419 2D AGCATCTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 34 1 29 6 A 13 11 104550 CASAVA_Build 6 10545101 1D CCCCTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1434 hom 34 5 24 5 T 13 12 104551 CASAVA_Build 6 10546511 1D AGATCAGACG C/- CAGTGGCTCA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 C 2 1 104552 CASAVA_Build 6 10546956 5I ACTAGGGGAA -----/AGGGG AGGAAGAGAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AGGGG 0 1 104553 CASAVA_Build 6 10547316 1D ACATTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 1092 het 568 hom 33 4 6 23 T 19 18 104554 CASAVA_Build 6 10561776 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2655 hom 24 6 15 3 A 10 11 104555 CASAVA_Build 6 10562549 1I ATCATTTTTA -/T TTTTTTTTTG 1919 het 1919 ref 21 12 5 4 T 9 10 104556 CASAVA_Build 6 10567792 1I TTAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 29 het 20 0 13 7 A 8 9 104557 CASAVA_Build 6 10573022 1I CAACTCCAAC -/A AATACTTTGA 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 A 2 3 104558 CASAVA_Build 6 10576102 3I AAAAAAAAAA ---/GAG ATACTGTAAC 2312 het 2312 ref 34 19 10 5 GAG 0 1 104559 CASAVA_Build 6 10576155 2D CAGGAAGCTG AC/-- ACAGAAGTAT 3070 het 3070 hom 39 15 19 8 AC 2 1 104560 CASAVA_Build 6 10576707 3D CCATCTTTAT AAA/--- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 11 8 104561 CASAVA_Build 6 10577947 4I AAATAAGAAC ----/TTGA TTGTGTGGGT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 TTGA 0 1 104562 CASAVA_Build 6 10585911 2I TAGTAGAGAC --/AG AGTTTCACCC 3070 hom 84 het 31 0 26 5 AG 1 2 104563 CASAVA_Build 6 10598732 1D AATTGAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 30 0 19 11 T 13 12 104564 CASAVA_Build 6 10600107 1D AGCTAAAGGA T/- TGTAAACTCA 3070 hom 89 het 33 0 29 4 T 2 1 104565 CASAVA_Build 6 10601746 1D TTTAAATGGA C/- CCGTTTTCTC 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 C 3 2 104566 CASAVA_Build 6 10620120 4I TTCTGATAAC ----/AAAG AAACAATAAA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 AAAG 0 1 104567 CASAVA_Build 6 10624372 2D GGGGTTTCTC TA/-- TGTTGGTCAG 3070 hom 38 het 14 0 13 2 TA 1 0 104568 CASAVA_Build 6 10647859 2D TCATTAAATG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 6 GA 7 6 104569 CASAVA_Build 6 10648297 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 418 hom 43 1 26 16 A 9 10 104570 CASAVA_Build 6 10681388 3I CTAGATATGG ---/ATC ATCTCTGGCA 3070 het 3070 hom 41 13 26 2 ATC 1 2 104571 CASAVA_Build 6 10688835 1D GCATTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2241 hom 29 8 14 7 A 12 11 104572 CASAVA_Build 6 10714707 3D GCAGCCTGCC ACA/--- ACAAATCAAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 ACA 2 1 104573 CASAVA_Build 6 10714962 4I TTTTAAAAAT ----/AAAG AAAATGCAGA 3070 het 3032 hom 18 7 11 0 AAAG 0 1 104574 CASAVA_Build 6 10715903 24D TAGAAAAGCC CTAACTTACAGACATTTGGGGGGT/------------------------ CTTATTGGTA 3070 het 3070 ref 29 20 12 4 CTAACTTACAGACATTTGGGGGGT 1 0 104575 CASAVA_Build 6 10718000 1I GCTGGGTCCA -/G GGGGAACAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 G 4 5 104576 CASAVA_Build 6 10719948 1D TAATTTTCCA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 8 7 104577 CASAVA_Build 6 10721598 1I TAATATTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 T 10 11 104578 CASAVA_Build 6 10723917 16D AAAGAATGGC CACTCCATAGACAGAG/---------------- CAACCCCGAG 2931 het 2931 ref 19 13 8 4 CACTCCATAGACAGAG 1 0 104579 CASAVA_Build 6 10726973 1I GGTAGCTTCC -/T TTTAGATAGG 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 3 4 104580 CASAVA_Build 6 10731512 1D GCCTACATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1385 hom 30 8 16 6 T 15 14 104581 CASAVA_Build 6 10836563 1I AACAGTAGCA -/T TTTTGGAGAA 3070 het 3070 hom 54 25 24 5 T 4 5 104582 CASAVA_Build 6 10848739 3D TTACAGGCTC CCA/--- CCACCACGCC 2080 het 1527 hom 10 4 5 1 CCA 3 2 104583 CASAVA_Build 6 10852211 2I ACTGATCTCT --/GA GAGGTAGTAT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 GA 1 2 104584 CASAVA_Build 6 10856630 6D ATGCCCGATT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 2958 het 498 hom 21 3 8 15 TG 9 6 104585 CASAVA_Build 6 10858658 1D AGAATGGGGT G/- GGGGGGGGGT 2063 het 1117 hom 15 3 6 6 G 10 9 104586 CASAVA_Build 6 10859818 2D TATAAGACAA AT/-- ATGTGTCAAC 3070 het 3070 ref 56 32 22 3 AT 2 1 104587 CASAVA_Build 6 10866210 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1805 het 1280 hom 14 4 5 7 A 15 14 104588 CASAVA_Build 6 10870551 1D AGGGCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 710 hom 24 3 14 7 T 13 12 104589 CASAVA_Build 6 10873316 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 22 1 13 9 A 15 14 104590 CASAVA_Build 6 10881910 1D CTATTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1724 het 411 hom 18 5 4 9 T 19 18 104591 CASAVA_Build 6 10882470 4I TACTGTACAA ----/AGTT AGTTATAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AGTT 1 2 104592 CASAVA_Build 6 10885628 1D AGACTGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 29 1 16 12 A 15 14 104593 CASAVA_Build 6 10885794 5I GCTTTTTTTT -----/TAAGG TAAGTATTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TAAGG 0 1 104594 CASAVA_Build 6 10892998 4I TTTCTGATAC ----/CAGA CAGTATGTGA 3070 hom 120 het 45 0 37 8 CAGA 0 1 104595 CASAVA_Build 6 10893214 3D GAAATGGGGA AAG/--- AAGTGCTAGA 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 AAG 2 1 104596 CASAVA_Build 6 10900368 1I CTTGGCTATG -/T CTCTTTGGGC 3070 hom 155 het 59 0 51 8 T 0 1 104597 CASAVA_Build 6 10901284 3D TTAATAAAGT AGA/--- AGATTTATTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 AGA 2 1 104598 CASAVA_Build 6 10909059 3I AACTCCATCT ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 721 hom 18 2 13 3 CAA 5 6 104599 CASAVA_Build 6 10911764 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1946 hom 26 7 15 4 A 13 14 104600 CASAVA_Build 6 10913290 2D TGTGTGTGTC GG/-- GGGGGGGGTG 3070 hom 39 het 26 0 16 12 G 10 8 104601 CASAVA_Build 6 10914397 2D CCATCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2201 het 299 hom 20 5 7 8 T 14 12 104602 CASAVA_Build 6 10914554 13I CTGGCTAATT -------------/TTTTTTGTTTTTG TTTTTTGTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TTTTTTGTTTTTG 1 2 104603 CASAVA_Build 6 10922189 1D AAATAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 8 6 T 11 10 104604 CASAVA_Build 6 10924653 1I ATGTATTTCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 7 8 104605 CASAVA_Build 6 10932218 1D GGTAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 12 11 104606 CASAVA_Build 6 10942588 1D AATCAACGAT G/- GAGTCAATCC 3070 het 3070 ref 58 25 24 9 G 2 1 104607 CASAVA_Build 6 10952458 1D TCTCTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 2023 het 2023 ref 25 13 6 7 A 13 12 104608 CASAVA_Build 6 10956742 3I TGGTCTCGAA ---/CTC CTGACCTCAA 3070 het 2880 hom 25 7 13 5 CTC 0 1 104609 CASAVA_Build 6 10968247 1I GATTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 710 hom 25 2 18 6 T 11 12 104610 CASAVA_Build 6 10980779 2D CTTCTAGGCA CC/-- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 C 9 7 104611 CASAVA_Build 6 10999985 3I GAAATCTTTA ---/CTT CTTCTCCTTC 3070 hom 107 het 42 0 36 6 CTT 1 2 104612 CASAVA_Build 6 11001177 5I AAGATAAAAA -----/ATCTT ATCTTTTATA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ATCTT 1 2 104613 CASAVA_Build 6 11002928 3D TTCTTTTAAA AAT/--- AATAACCAAG 3070 hom 99 het 34 0 34 1 AAT 2 1 104614 CASAVA_Build 6 11022828 5I GATCATTTTC -----/ACAAT ATTGATTTTA 2231 het 2231 ref 24 17 5 2 ACAAT 0 1 104615 CASAVA_Build 6 11040184 1I ACCGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2197 het 356 hom 24 3 11 10 A 15 16 104616 CASAVA_Build 6 11048307 1D GGTATATGTA C/- TCAACATCAC 3070 het 3070 ref 49 27 16 6 C 1 0 104617 CASAVA_Build 6 11070527 1I ATTCCAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 13 7 A 11 12 104618 CASAVA_Build 6 11074332 3I ACTCTGTCTC ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAT 5 6 104619 CASAVA_Build 6 11080018 9I TTCTCCTGCC ---------/TCAGCCTCT TAAGAGGCTG 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 TCAGCCTCT 0 1 104620 CASAVA_Build 6 11082436 1I GTGGTGTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 9 10 104621 CASAVA_Build 6 11083273 3I ATTTGTCTAA ---/AAC AACGTTTATA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AAC 1 2 104622 CASAVA_Build 6 11099654 1I TTGATTTGAC -/T GTAAATTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 0 1 104623 CASAVA_Build 6 11100933 1I ACTTGAACCC -/G GGAGGCAGAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 2 3 104624 CASAVA_Build 6 11103647 1D ATCCGCAGAA C/- CCAAGTTCAT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 C 3 2 104625 CASAVA_Build 6 11104339 4I TTTTACCACT ----/AACA AACATTAAAC 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 AACA 1 2 104626 CASAVA_Build 6 11128403 1D CTTAAGTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 10 9 104627 CASAVA_Build 6 11135929 5D GCAAGCAGCC TAAGA/----- TAAGGAAATT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 TAAGA 1 0 104628 CASAVA_Build 6 11150221 1I TCCCTGCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 10 11 104629 CASAVA_Build 6 11150620 1I TGAGAAATAC -/T TTATCTAAAC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 2 3 104630 CASAVA_Build 6 11166199 5D GGGAACAGGT CAATA/----- CAATACCCTT 3070 het 3070 ref 29 18 8 6 CAATA 2 1 104631 CASAVA_Build 6 11168849 1D GTCAAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 12 11 104632 CASAVA_Build 6 11180701 2I ACCTCCGCCT --/CC CGGGTTCAAG 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 C 1 3 104633 CASAVA_Build 6 11182400 1I TATACAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2830 hom 31 8 11 12 T 13 14 104634 CASAVA_Build 6 11184367 1D TTTTTGGGGT G/- GGGGGAGGTC 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 G 6 5 104635 CASAVA_Build 6 11193321 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 1665 hom 16 4 9 3 CT 1 2 104636 CASAVA_Build 6 11197222 3D CTGCGAAAAC AAG/--- AAGACATTTG 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 AAG 2 1 104637 CASAVA_Build 6 11221194 5D GCCTGGCTAA TTTAT/----- TTTATTTTAT 2919 het 741 hom 9 2 7 2 TTTAT 3 2 104638 CASAVA_Build 6 11223907 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2704 het 1956 hom 20 7 7 6 T 14 13 104639 CASAVA_Build 6 11256103 2D GCAGTGAGCC AA/-- GAGTGTGCCA 1821 het 1821 ref 26 6 5 15 A 2 0 104640 CASAVA_Build 6 11258166 4D TTACCTCCCA TTCT/---- TTCTTTGTTC 3070 het 3070 ref 53 25 22 8 TTCT 2 1 104641 CASAVA_Build 6 11260249 2D CATAATAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 TG 12 11 104642 CASAVA_Build 6 11268838 1I CTTTTTTATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 9 10 104643 CASAVA_Build 6 11271647 1I AACGTCATCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 9 10 104644 CASAVA_Build 6 11274734 1I TCTGTCTTGG -/A AAAAAAAAAA 2858 het 2858 ref 23 12 7 4 A 13 14 104645 CASAVA_Build 6 11274916 2I AAGGAGACTC --/TT ATGACTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 T 0 2 104646 CASAVA_Build 6 11280523 6D GACTCCGTTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAG 3070 het 1989 hom 22 9 12 6 A 15 9 104647 CASAVA_Build 6 11284620 1I CTGTGTTATA -/G TAACCCGTTA 3070 het 3070 hom 49 13 31 5 G 0 1 104648 CASAVA_Build 6 11284934 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTAGTA 2054 het 840 hom 8 2 6 0 T 6 7 104649 CASAVA_Build 6 11296784 1I TCTCATATAT -/A AATGTTCTTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 2 3 104650 CASAVA_Build 6 11300509 1I TGCACCCCCC -/T GACACACAGA 2811 het 2811 ref 21 12 8 1 T 0 1 104651 CASAVA_Build 6 11303678 1D TATATGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 8 13 T 13 12 104652 CASAVA_Build 6 11312195 2I TCTTTTCTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 A 13 15 104653 CASAVA_Build 6 11315030 1D GAGAAAAGAT A/- ACTTCTCATT 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 A 2 1 104654 CASAVA_Build 6 11316397 1D ACCCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 2011 het 2011 ref 43 21 6 16 A 17 16 104655 CASAVA_Build 6 11320184 13I GCTCTCCACA -------------/GTATCCTGATCTT GGGTCTCTAG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 GTATCCTGATCTT 0 1 104656 CASAVA_Build 6 11324649 2D AGATGAGGAA AT/-- AGATTTGAAG 3070 het 3070 hom 36 17 15 5 AT 1 0 104657 CASAVA_Build 6 11326565 1D CTTCAGCAAC T/- TTTTTTTTTT 1979 het 1979 ref 31 10 7 14 T 17 16 104658 CASAVA_Build 6 11331707 1I TTCCTCTAGG -/A AAAAAAAAAC 2734 het 2734 ref 34 22 8 4 A 9 10 104659 CASAVA_Build 6 11336024 5I GAGTAGGGCA -----/GAGGT GAGGTGAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 GAGGT 1 2 104660 CASAVA_Build 6 11336784 2I58M1D GAGGAAGGTG --TTTTTTTCAGAAGACTGGAGTGAAGGGAGAGACAGGGAACCACTGAATTCTGAGAACAG/TTTTTTTTTCAGAAGACTGGAGTGAAGGGAGAGACAGGGAACCACTGAATTCTGAGAACA- GGACTGACGT 3070 het 3070 ref 23 21 12 13 N/A 0 0 104661 CASAVA_Build 6 11351195 1I ATACATATCA -/C CTCAGGCCAA 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 C 1 2 104662 CASAVA_Build 6 11353858 1I GCGTTGGGGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 7 8 104663 CASAVA_Build 6 11354163 1I CATGGTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 11 12 104664 CASAVA_Build 6 11370032 1D CCAAACAACT A/- AAAGTCTGTG 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 A 4 3 104665 CASAVA_Build 6 11373089 4I TGTTTGTTTG ----/TTTC TTTCTTTTTT 2542 het 2542 ref 25 12 10 3 TTTC 1 2 104666 CASAVA_Build 6 11406131 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2034 hom 37 10 16 11 T 13 14 104667 CASAVA_Build 6 11407416 1I CTCCTGTGCC -/T GGCTCAGTGG 3070 het 3070 ref 31 11 11 9 T 0 1 104668 CASAVA_Build 6 11421768 12D GGTGGATGGA TGGATAGATGGG/------------ TGGATAGATG 2147 het 2147 ref 43 29 6 13 TGGATAGATGGG 1 0 104669 CASAVA_Build 6 11426907 1I TCTTTAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 A 9 10 104670 CASAVA_Build 6 11427606 4D ACAAGTCTCA CACT/---- CACACACACT 3070 het 3070 ref 79 51 24 5 CACT 1 0 104671 CASAVA_Build 6 11428051 6I ACAAGCAAAT ------/ACTCTC ACACTCACGC 3070 het 3070 hom 60 23 31 6 ACTCTC 0 1 104672 CASAVA_Build 6 11428175 5D TGTGAGGATT GAATA/----- GAAGAGAGGA 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 GAATA 1 0 104673 CASAVA_Build 6 11431257 1D TATAGGAGTT A/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 1 0 104674 CASAVA_Build 6 11432990 1I TTGTCTATGA -/C TGAGTTAGCT 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 C 0 1 104675 CASAVA_Build 6 11443346 1D GACTGAAAGT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 8 104676 CASAVA_Build 6 11450629 1I GAAGATAAAG -/A TAGAATGTTA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 0 1 104677 CASAVA_Build 6 11451338 1D ACATTGGCTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1913 hom 34 6 21 7 A 10 9 104678 CASAVA_Build 6 11468777 2D GAGTTCTCAT GA/-- GATCTGGTTG 968 het 968 ref 39 16 4 21 GA 2 1 104679 CASAVA_Build 6 11472030 1D AACCTGAGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 8 104680 CASAVA_Build 6 11472915 2D TCAATAAAAC AT/-- AGTTACTCTA 3070 het 3070 ref 52 24 21 8 AT 1 0 104681 CASAVA_Build 6 11474629 24D TAAAAGAAGA AAGAAAAAAGAAAAAGAAAGGAAG/------------------------ AAAGAAAGAA 419 het 419 ref 25 20 4 13 AAGAAAAAAGAAAAAGAAAGGAAG 1 0 104682 CASAVA_Build 6 11475316 1I AAGCTCAATT -/A AAAATGGAAA 3070 hom 124 het 49 0 42 7 A 4 5 104683 CASAVA_Build 6 11475910 1I ACTTATTTTT -/C AGTGGAAAGT 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 C 0 1 104684 CASAVA_Build 6 11478401 1D GTGGGAACCC A/- AGGAGGCCAG 3070 hom 135 het 47 0 45 3 A 2 1 104685 CASAVA_Build 6 11487497 1D GTCAGCAACG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 7 6 104686 CASAVA_Build 6 11498096 1I GACTCAACTG -/C CAAATTCTGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 1 2 104687 CASAVA_Build 6 11510341 1I AAGGAGACTC -/T CAGCGAGTTA 1964 het 1964 ref 25 14 5 6 T 0 1 104688 CASAVA_Build 6 11512683 1D ACATAACTAC T/- TTTGGGCAAT 2867 het 2867 ref 29 20 7 2 T 4 3 104689 CASAVA_Build 6 11512929 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 10 11 104690 CASAVA_Build 6 11513069 1D AAAAAAAAAA C/- CAACAACTAG 3070 hom 109 het 44 0 32 12 C 2 1 104691 CASAVA_Build 6 11517986 1I TATTGTTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 T 9 10 104692 CASAVA_Build 6 11518188 4D AATTATATTT AAAG/---- ATCTATTAGA 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 AAAG 1 0 104693 CASAVA_Build 6 11519163 3I ATAAAGTGTT ---/TTA TTATTATTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTA 3 4 104694 CASAVA_Build 6 11525200 5I GCCTACCACT -----/GCCGC GCCGCACCGC 3070 hom 57 het 21 0 18 3 GCCGC 1 2 104695 CASAVA_Build 6 11525915 4I TACAATTACC ----/ATCT ATCTATACCT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 ATCT 1 2 104696 CASAVA_Build 6 11529063 1D TTAAAAATGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 104697 CASAVA_Build 6 11529447 1D GCAGCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 23 4 A 12 11 104698 CASAVA_Build 6 11530459 1D CAGACAAAAT A/- ATGCTTTACG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 2 1 104699 CASAVA_Build 6 11535506 2I ATACACACTC --/CA CACACACACA 3070 hom 104 het 46 0 30 16 CA 5 6 104700 CASAVA_Build 6 11535617 1D ATACTCCCTC G/- ACACAAACAC 3070 hom 135 het 49 0 45 5 G 1 0 104701 CASAVA_Build 6 11539502 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 6 5 104702 CASAVA_Build 6 11550588 13D AGAAATTTGC ATAAGTAATGAAG/------------- AGCCAAATGT 3070 het 3070 hom 28 15 17 5 ATAAGTAATGAAG 1 0 104703 CASAVA_Build 6 11553974 1I CTCTTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 10 11 104704 CASAVA_Build 6 11554833 3I TAACTGATGC ---/TCT TCTTCTTGTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 TCT 2 3 104705 CASAVA_Build 6 11557432 1D ATCCTACCCA T/- TTCCACATCT 3070 het 3070 ref 60 29 24 7 T 3 2 104706 CASAVA_Build 6 11576220 1I GTTTCTATCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 8 9 104707 CASAVA_Build 6 11577391 1I CTTATCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 860 hom 33 3 20 10 T 12 13 104708 CASAVA_Build 6 11579645 2I CCATGGACTC --/AT GTGATTTCCC 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 AT 0 1 104709 CASAVA_Build 6 11587924 4D ACCGCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 8 AAAT 5 4 104710 CASAVA_Build 6 11588130 1I TTCCACATGT -/A GGTTACCTGA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 0 1 104711 CASAVA_Build 6 11588459 1I TATGGCTATG -/T TAATAGTTAC 3070 het 3070 ref 65 35 23 7 T 1 2 104712 CASAVA_Build 6 11588636 1I GCCTGACACT -/G GGCTGATGGC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 G 2 3 104713 CASAVA_Build 6 11589280 1D TCACAGAGTG T/- TTGAGTGTGA 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 T 3 2 104714 CASAVA_Build 6 11589997 3D GCACAGTGCA GTT/--- GTTGTTAGTT 3070 het 3070 hom 50 23 24 4 GTT 3 2 104715 CASAVA_Build 6 11590297 3I CATGTGAGAC ---/AAT AAGTTTCTGG 1587 het 1587 ref 30 14 5 11 AAT 0 1 104716 CASAVA_Build 6 11590333 1D AGTCTCACTC T/- TGTCACCCAG 1487 het 1487 ref 18 11 4 4 T 2 1 104717 CASAVA_Build 6 11590898 1I ATATCATTGC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 53 26 24 3 T 6 7 104718 CASAVA_Build 6 11598001 1I AACCCCACTC -/A AGAGTGTCTT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 1 2 104719 CASAVA_Build 6 11599442 2D GATATGTGCA TG/-- TGTGTGTGAT 3070 het 3070 hom 81 32 36 16 TG 5 4 104720 CASAVA_Build 6 11599779 2I TGTATGTGGT --/TG TGTGTGGTGT 3070 hom 98 het 42 0 29 13 TG 3 4 104721 CASAVA_Build 6 11610333 2D GAAAGGAAAC AT/-- GTCTATTTCA 3070 het 3070 ref 40 17 15 9 AT 1 0 104722 CASAVA_Build 6 11610795 1D TATTTCCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1828 hom 20 9 9 3 T 14 13 104723 CASAVA_Build 6 11615179 1D CTAACCCCCC T/- GACATGAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 1 0 104724 CASAVA_Build 6 11619107 1D TAGCTAACCT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 8 7 104725 CASAVA_Build 6 11619437 4D CCATAATGTA GAAT/---- GATATGAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 GAAT 1 0 104726 CASAVA_Build 6 11619544 1I AACTAAATGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 A 9 10 104727 CASAVA_Build 6 11620347 1D39M1I AAAAGCCAAC AATTCATTAAAAAATAATTCTCAAAAAAATTGAATTAAAC-/-ATTCATTAAAAAATAATTCTCAAAAAAATTGAATTAAACA AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 9 20 15 N/A 0 0 104728 CASAVA_Build 6 11622711 2I TAAGATAATT --/GA GTGATAATTA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 GA 0 1 104729 CASAVA_Build 6 11626765 1D CAAAGGAAAA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 123 het 43 0 41 3 T 8 7 104730 CASAVA_Build 6 11635148 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 18 1 12 5 A 13 14 104731 CASAVA_Build 6 11637790 4D GTCATATGTT CTCA/---- CTCATATGTG 3070 hom 93 het 33 0 32 4 CTCA 2 1 104732 CASAVA_Build 6 11653169 1D CAATTAAATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 23 10 9 6 T 10 9 104733 CASAVA_Build 6 11654063 1I TGTGTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2157 hom 13 het 6 0 5 1 A 10 11 104734 CASAVA_Build 6 11655633 1I GCTTAAGTAG -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 6 7 104735 CASAVA_Build 6 11657731 4D AAATACAAAA AGTT/---- AGCCAGGCGT 1588 het 1588 ref 8 4 4 1 AGTT 1 0 104736 CASAVA_Build 6 11668942 4I TATCTCTAAA ----/AGAT AGCCATTGTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AGAT 0 1 104737 CASAVA_Build 6 11673354 1I CTAAGATGAC -/T TAGAGGCAAA 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 T 1 2 104738 CASAVA_Build 6 11676649 2D ATGGTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 36 14 17 7 TA 6 5 104739 CASAVA_Build 6 11686005 1D ATCAAGTTGC T/- TTACATTATC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 3 2 104740 CASAVA_Build 6 11695521 1I GCCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2508 hom 30 9 12 9 A 10 11 104741 CASAVA_Build 6 11695719 1I GACTCATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2665 hom 39 9 19 11 T 10 11 104742 CASAVA_Build 6 11696735 1I CTAACTTCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 8 9 104743 CASAVA_Build 6 11700874 1D TATAAAACCC A/- AGTTTGCAAC 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 A 2 1 104744 CASAVA_Build 6 11719756 5D GGCAAGAAAA AAAAT/----- ATATATTCAT 1626 het 1626 ref 10 5 4 2 AAAAT 1 0 104745 CASAVA_Build 6 11720282 1D AAACAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 11 10 104746 CASAVA_Build 6 11725523 3I ATACATTGTG ---/ATA ATGTTATATA 1435 het 495 hom 4 1 3 0 ATA 0 1 104747 CASAVA_Build 6 11746770 2D TTCTTCTTAT TG/-- TCACCAAAGA 3070 het 3070 ref 46 24 15 9 TG 1 0 104748 CASAVA_Build 6 11765037 2I GGGAAGAGGT --/GA GAGGAAGATT 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 GA 1 2 104749 CASAVA_Build 6 11771591 1I TTTAGAATAG -/T TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 6 7 104750 CASAVA_Build 6 11774943 1D TAGGTGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 12 11 104751 CASAVA_Build 6 11779576 1D TTCTAAAATG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 9 8 104752 CASAVA_Build 6 11779786 3D33M2D AATATCATAA ATGATGAAGTGGTATAAGCATTACTAGAATGTAGACTG/---ATGAAGTGGTATAAGCATTACTAGAATGTAGAC-- TGATAAGTTA 3070 het 3070 hom 54 33 35 10 N/A 0 0 104753 CASAVA_Build 6 11788072 3I ATCATTTTAA ---/TAC TACTAATAAT 3070 het 3070 hom 47 15 28 4 TAC 1 2 104754 CASAVA_Build 6 11788685 1D TAGAGGAATT A/- AAAGACACAC 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 A 4 3 104755 CASAVA_Build 6 11791034 2D TTGCGAAATA TT/-- TTTTTTTTAC 3070 het 72 hom 40 3 16 24 T 10 8 104756 CASAVA_Build 6 11791376 3D ACCAATGGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2904 hom 35 11 16 8 A 13 10 104757 CASAVA_Build 6 11793485 1I CCCACACATA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 7 8 104758 CASAVA_Build 6 11794913 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 10 9 104759 CASAVA_Build 6 11798065 2I GTAATGAAAA --/AG TGTGTACAAC 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 AG 0 1 104760 CASAVA_Build 6 11798132 5I CCCCTGAACT -----/TAAAA TAGAAGTTAA 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 TAAAA 0 1 104761 CASAVA_Build 6 11800244 9D TCTGATGGGT TCAGATTCA/--------- CATCTTCACT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 TCAGATTCA 1 0 104762 CASAVA_Build 6 11801484 6I ACTTCCCCCT ------/TCTCTC TCTCTATGTC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TC 2 5 104763 CASAVA_Build 6 11803045 5D TTCTTAAAGA ATATT/----- ATATTTTCTC 3070 het 3070 hom 40 16 23 3 ATATT 2 1 104764 CASAVA_Build 6 11814870 1D6M2D TGAACCCTAT CCATTAATT/-CATTAA-- TCTTATTGGA 3070 het 3070 ref 53 30 18 8 N/A 0 0 104765 CASAVA_Build 6 11819861 1D ATGCTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2013 hom 23 9 9 5 A 12 11 104766 CASAVA_Build 6 11820363 1I GATCTCTTGA -/C CCACCTTCTT 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 C 2 3 104767 CASAVA_Build 6 11822184 1I16M2D TCTTTTAAAG -AAAGTTGGGATTATTTAA/AAAAGTTGGGATTATTT-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 17 18 4 N/A 0 0 104768 CASAVA_Build 6 11823417 3D TTAAAAACTT CTC/--- CTCCATTCCA 3070 het 3070 ref 57 31 24 4 CTC 2 1 104769 CASAVA_Build 6 11823868 6D TGTTTTTCCC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1668 het 1037 hom 42 11 8 23 T 22 16 104770 CASAVA_Build 6 11826666 1D ATCATCAAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 A 8 7 104771 CASAVA_Build 6 11828115 2I CAGTGACTAA --/CT CTGTATGCCA 3070 het 3070 ref 42 23 11 8 CT 1 2 104772 CASAVA_Build 6 11839858 1I CCTTCTCTCA -/T TTTTTTCTAG 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 T 6 7 104773 CASAVA_Build 6 11839986 1I TGTTTTTTTT -/A ATGAGGTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 1 2 104774 CASAVA_Build 6 11843243 1D ATGAGTATTG C/- CAGGTGGTTG 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 C 2 1 104775 CASAVA_Build 6 11847801 3D TAGCCTTGCA GAT/--- GATAAGTACT 3070 hom 99 het 40 0 34 7 GAT 2 1 104776 CASAVA_Build 6 11872764 1D ATGAGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 T 13 12 104777 CASAVA_Build 6 11873321 4D31M1D CAATCATCAA TAACTGACTGAGCACAAAATTTAAGCTGAAATTAGT/----TGACTGAGCACAAAATTTAAGCTGAAATTAG- TTTTTTCTGG 3070 het 2386 hom 31 7 11 20 N/A 0 0 104778 CASAVA_Build 6 11878321 1D TCGAAAAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 8 7 104779 CASAVA_Build 6 11884274 1I CAGCCCATGA -/G ATCTCAAGAG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 G 0 1 104780 CASAVA_Build 6 11885466 2D CAGGATCAGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 57 22 19 20 TG 10 9 104781 CASAVA_Build 6 11897785 1I GAATTCACTC -/T CAGATGAAGC 2591 het 2591 ref 26 17 7 2 T 0 1 104782 CASAVA_Build 6 11904012 1I GGGAGGTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 856 hom 34 2 24 8 T 13 14 104783 CASAVA_Build 6 11906670 5I TGCTATGCTG -----/CATGT CATGTCAAGG 3070 hom 116 het 49 0 39 10 CATGT 1 2 104784 CASAVA_Build 6 11942180 1D GCATTACCAC A/- AGTGGATACC 3070 het 3070 ref 39 19 12 9 A 2 1 104785 CASAVA_Build 6 11945037 8D TGAACCAGCC ATATTGGA/-------- ATATTGGAAG 3070 hom 45 het 16 0 15 2 ATATTGGA 2 1 104786 CASAVA_Build 6 11961647 4D TTTCTGTGTC TATA/---- TATATATATA 2930 het 491 hom 17 3 9 5 TA 11 9 104787 CASAVA_Build 6 11962646 1D AGTTATTTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 10 9 104788 CASAVA_Build 6 11971348 1I TTTACATTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 339 hom 31 1 26 4 T 9 10 104789 CASAVA_Build 6 11975432 1D CCAAAGAATT A/- AAAATGTAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 5 4 104790 CASAVA_Build 6 11979511 4I CTAGTTTGAT ----/TCTC TATGTCTTCT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 TC 0 2 104791 CASAVA_Build 6 11982557 5D AAAAAAAAAA GAAAG/----- AAAGAAAGAA 702 het 166 hom 22 2 11 10 GAAAG 1 0 104792 CASAVA_Build 6 11984473 2D AACCAAAAAA AG/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 40 het 17 0 13 4 AG 1 0 104793 CASAVA_Build 6 12001411 4D TCTCTTACTG CTTT/---- CTATTTCATT 3070 hom 117 het 40 0 40 2 CTTT 1 0 104794 CASAVA_Build 6 12004960 38I AGCAAGGACT --------------------------------------/TCCAGTACAACGCTGAAAAAGAGTGATGAGAAAGGACA TCCTCACCTT 3070 hom 87 het 30 0 29 7 TCCAGTACAACGCTGAAAAAGAGTGATGAGAAAGGACA 0 1 104795 CASAVA_Build 6 12005458 1D ATATAATTTC T/- TTTTTTAAAT 3070 het 324 hom 34 1 29 4 T 7 6 104796 CASAVA_Build 6 12006955 4I GTAGCCCTTG ----/TTGT TTGTTTCTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TTGT 1 2 104797 CASAVA_Build 6 12007163 4D TTTACAGTGG TAAA/---- TGTGAGTTCC 3070 hom 96 het 38 0 33 7 TAAA 1 0 104798 CASAVA_Build 6 12007326 1I TGTTAGATCA -/G TTAAGAATAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 0 1 104799 CASAVA_Build 6 12008177 1I CCTAAGTGTG -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 8 104800 CASAVA_Build 6 12009718 1D TACATAATGT C/- TTTTTTCTCT 3070 hom 154 het 60 0 52 9 C 1 0 104801 CASAVA_Build 6 12010149 6D TACATATATA TATATG/------ TATATGTGTG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TATATG 2 1 104802 CASAVA_Build 6 12010242 4I GTATATATAT ----/ATAC ACACACACAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 ATAC 0 1 104803 CASAVA_Build 6 12011071 3I ACTGAGAAAT ---/GTA GTTTTTATTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 GTA 0 1 104804 CASAVA_Build 6 12013333 1I CATGATCTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 8 9 104805 CASAVA_Build 6 12013444 1D ATTGTGAACA T/- TGCTGAAATG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 2 1 104806 CASAVA_Build 6 12017361 4D GTGTGCATTA CTTC/---- CTTCATTCTT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 CTTC 2 1 104807 CASAVA_Build 6 12027511 1D ATATATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 18 13 T 11 10 104808 CASAVA_Build 6 12036784 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1418 hom 22 9 9 4 T 10 11 104809 CASAVA_Build 6 12048000 1D AGTCAAGGTA T/- TTAGTAGCGT 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 T 3 2 104810 CASAVA_Build 6 12049494 11D CTTTACAAGG ATACCACTCAT/----------- GTTGCATTAA 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 ATACCACTCAT 1 0 104811 CASAVA_Build 6 12065966 3I TACTCAGGGT ---/TGA TGATTGTATG 3070 het 3070 ref 42 27 12 3 TGA 1 2 104812 CASAVA_Build 6 12072973 1I AGTGGGAGGT -/G TTTGGGTCAT 3070 het 3070 hom 55 20 25 10 G 0 1 104813 CASAVA_Build 6 12077793 1I ACAAGGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3054 het 3054 ref 30 13 10 7 T 10 11 104814 CASAVA_Build 6 12082394 1D TTCTTTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 30 0 20 10 A 12 11 104815 CASAVA_Build 6 12088719 1I CTGTTACATG -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 6 7 104816 CASAVA_Build 6 12089079 1I ACAAAATAGT -/A GTAACTGTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 0 1 104817 CASAVA_Build 6 12092871 1D GTTTCTTATA C/- CTTAATTTCT 3070 hom 81 het 31 0 27 5 C 2 1 104818 CASAVA_Build 6 12107895 1D TCATAATAAT A/- AAAATCCCAC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 5 4 104819 CASAVA_Build 6 12117820 4D CCACGCTGTG TTTA/---- TTTGATACAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 TTTA 1 0 104820 CASAVA_Build 6 12121428 1D CACTTCCATT C/- CCCCCCTCCT 3070 hom 67 het 27 0 18 9 C 7 6 104821 CASAVA_Build 6 12122027 6D GCTAGATGAA ATACTT/------ AGACCATCAT 3070 het 1913 hom 40 7 18 18 ATACTT 1 0 104822 CASAVA_Build 6 12124243 1D GAATTTTATG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 T 9 8 104823 CASAVA_Build 6 12131875 1I GCAAGCCTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 T 9 10 104824 CASAVA_Build 6 12150072 1D TAGAAACGGG T/- TTTCACCGTG 2432 het 2432 ref 20 7 7 7 T 4 3 104825 CASAVA_Build 6 12162704 4D TTACACACAT ATAC/---- ATATGAATAT 3070 het 3070 ref 32 17 14 6 ATAC 1 0 104826 CASAVA_Build 6 12175719 1D TGAGCTTGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 10 9 104827 CASAVA_Build 6 12177097 1I CATATACAAT -/A AAAAAATTGG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 6 7 104828 CASAVA_Build 6 12182922 1D GGTCATGAGA T/- TTTTTTTTTT 2550 het 2550 ref 22 9 7 6 T 11 10 104829 CASAVA_Build 6 12183810 1D AGATTGGGCC T/- TTTTTTTTTT 2040 het 2040 ref 39 25 6 9 T 12 11 104830 CASAVA_Build 6 12184623 1D GAGAGATGCT G/- TTTTAGTCTG 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 G 1 0 104831 CASAVA_Build 6 12196981 1D TTTTCCATCC T/- TTTCTGTCTT 3070 het 3070 ref 50 26 19 8 T 4 3 104832 CASAVA_Build 6 12197824 1I TGCAGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 T 11 12 104833 CASAVA_Build 6 12205535 1D GCACCAGCCA T/- TTTTTTTTTT 2320 het 2311 hom 30 12 9 9 T 15 14 104834 CASAVA_Build 6 12210727 1I CAGCAAACCA -/G AACTTCTGTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 0 1 104835 CASAVA_Build 6 12255796 2I TGGGAATTTA --/TT GACAGTAATG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 0 2 104836 CASAVA_Build 6 12261045 1D AAGCCACCCT G/- GGTGTCTTCT 3070 het 3070 hom 33 14 11 8 G 3 2 104837 CASAVA_Build 6 12275275 4D AAAATGATAA TTAT/---- TTCTTTCGAA 3070 het 3070 ref 57 30 24 3 TTAT 1 0 104838 CASAVA_Build 6 12283106 5D ATTTGTAATG TAATT/----- TAAGTGATTT 3070 het 3070 hom 43 19 23 2 TAATT 1 0 104839 CASAVA_Build 6 12300469 2D TTCATAGAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 11 14 15 TG 8 7 104840 CASAVA_Build 6 12301840 4D CATCTTGCAA TTTG/---- TTTGTTTGTG 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 TTTG 3 2 104841 CASAVA_Build 6 12302276 9I GAATTGAGAT ---------/GTGCAGTAA GTTCAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 GTGCAGTAA 0 1 104842 CASAVA_Build 6 12302802 1D GGTGGGTCAC T/- TTGAGGTCAG 3070 het 1607 hom 17 5 9 3 T 3 2 104843 CASAVA_Build 6 12303880 16I TGGCATACAG ----------------/AATACATCTGACTCCA AATTTAACTA 3070 hom 129 het 44 0 44 2 AATACATCTGACTCCA 0 1 104844 CASAVA_Build 6 12319113 2D AAAAAAATCA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 46 hom 31 2 12 17 T 10 8 104845 CASAVA_Build 6 12319619 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2685 hom 18 het 7 0 7 0 A 15 14 104846 CASAVA_Build 6 12319706 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AC 7 5 104847 CASAVA_Build 6 12320945 1I AGCTACTTAC -/T TTTTAAAAAA 3070 het 48 hom 15 1 13 1 T 4 5 104848 CASAVA_Build 6 12321397 3D TGTGGAAAAC ATT/--- ATGAGATTGG 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 ATT 1 0 104849 CASAVA_Build 6 12324305 2D GATGTGTGTG TC/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 23 23 5 TC 1 0 104850 CASAVA_Build 6 12333290 1I TGAAAATAGC -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 114 het 49 0 36 13 A 7 8 104851 CASAVA_Build 6 12337566 1I AAATGCACTT -/C GGTGTGATTT 3070 hom 193 het 70 0 65 5 C 0 1 104852 CASAVA_Build 6 12344507 1D TGCCAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 714 hom 32 2 23 7 T 13 12 104853 CASAVA_Build 6 12350596 4I AGTGAGTAGT ----/GACC GACCTCTGAA 3070 hom 171 het 64 0 55 9 GACC 1 2 104854 CASAVA_Build 6 12354245 3I ACAAAGGCAG ---/AGA AGAAGATCCT 3070 hom 181 het 64 0 61 4 AGA 2 3 104855 CASAVA_Build 6 12354871 1I49M23I ATCGTTTGCC -TTTTTTTTTCTCCCTCGATCTTGTTGTTTCTAGCTTTATTGTTCTCAGT-----------------------/TTTTTTTTTTCTCCCTCGATCTTGTTGTTTCTAGCTTTATTGTTCTCAGTAAATTCTCAGTAAATTGTTCACA TTAGACTTGT 3070 hom 72 het 21 0 25 5 N/A 0 0 104856 CASAVA_Build 6 12365260 2I AGTATGAAAA --/AG AGAGTAAGAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AG 2 3 104857 CASAVA_Build 6 12366507 1I CTCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 27 1 17 9 A 13 14 104858 CASAVA_Build 6 12377636 1I GATCTTAGAG -/A AAGAGCTTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 2 3 104859 CASAVA_Build 6 12395355 1D TAAAATTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 32 3 22 7 A 12 11 104860 CASAVA_Build 6 12398715 1D TCTCCCCGTT A/- AAAGGGCACT 3070 hom 59 het 26 0 17 9 A 4 3 104861 CASAVA_Build 6 12409607 1I AGTCATCTCT -/G GGCAATGCCC 3070 hom 144 het 53 0 49 4 G 2 3 104862 CASAVA_Build 6 12441395 1I AAGCTAATTT -/A AAAAGAGCAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 4 5 104863 CASAVA_Build 6 12476033 1I TTGAAGCAGG -/T TAGAACACAT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 1 2 104864 CASAVA_Build 6 12504948 1I GTCCTTTTTT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 6 7 104865 CASAVA_Build 6 12513776 2D AGAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAAAA 2791 het 2791 ref 26 15 11 0 AG 4 3 104866 CASAVA_Build 6 12515840 3D GCCTTTAACC CTG/--- CCTCTTAGGG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 CTG 1 0 104867 CASAVA_Build 6 12524266 1D TACTGGAGGC A/- AAGTAATCTC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 3 2 104868 CASAVA_Build 6 12525562 1D GGCTAACAGG A/- GCTGGAAGAG 3070 het 3070 ref 47 20 21 6 A 1 0 104869 CASAVA_Build 6 12528124 14D AAAGTGCTAT TTTATTTGAAAAAC/-------------- TTTATTTGAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 8 TTTATTTGAAAAAC 1 0 104870 CASAVA_Build 6 12554650 4D ATAGATAGAC AGAT/---- AGATAGATGT 3070 het 3070 hom 50 25 20 6 AGAT 3 2 104871 CASAVA_Build 6 12555895 2D GGGAGAGGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 37 0 26 11 A 14 12 104872 CASAVA_Build 6 12556276 3D TTAATTTAAT TAA/--- TTAATTAATT 951 hom 12 het 20 0 4 17 TAA 1 0 104873 CASAVA_Build 6 12590158 1D CTGGCAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1491 hom 36 10 14 14 A 15 14 104874 CASAVA_Build 6 12594693 1I AGAATTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 12 13 104875 CASAVA_Build 6 12595440 1D CTTGGCCTTC T/- GAGTGAAATG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 1 0 104876 CASAVA_Build 6 12620055 1D TATACACATT G/- GAACATTATT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 G 2 1 104877 CASAVA_Build 6 12622993 3D TAGGACAGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1222 hom 29 7 19 4 A 17 14 104878 CASAVA_Build 6 12625514 1I AACTCTATAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 8 9 104879 CASAVA_Build 6 12628156 4D AACGTACAAT TGAG/---- TGTCAGTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 13 9 TGAG 1 0 104880 CASAVA_Build 6 12679911 1D CTATTATTAA T/- TTTTCTGCCC 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 T 5 4 104881 CASAVA_Build 6 12686081 4D AAAATAGGGC TGTT/---- TATTTGCCTG 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 TGTT 1 0 104882 CASAVA_Build 6 12687471 1D GTTCTTAAAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 8 7 104883 CASAVA_Build 6 12691731 1D AGAGACTGTC A/- AAAAAAAAAA 3014 het 2424 hom 17 6 9 2 A 15 14 104884 CASAVA_Build 6 12710334 2I CTTTGTTTCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 62 het 32 0 26 6 T 9 11 104885 CASAVA_Build 6 12710824 1I ATCCTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 1640 het 1640 ref 29 21 5 3 A 11 12 104886 CASAVA_Build 6 12715911 2D ATGCATATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 40 0 28 13 AC 10 9 104887 CASAVA_Build 6 12721140 4D TATATCTCAA TTTC/---- TTTAAGTAGC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 TTTC 1 0 104888 CASAVA_Build 6 12724412 12D AAAGGCACTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2984 het 4 hom 18 1 11 6 T 26 14 104889 CASAVA_Build 6 12727815 1I CATTTTATGA -/T TTTTTTATGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 6 7 104890 CASAVA_Build 6 12727919 3D CAACAGACTA CTT/--- AAGTTCTGTG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 CTT 1 0 104891 CASAVA_Build 6 12731681 2D CATGTATGCA TG/-- TGTGTGCACG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 TG 4 3 104892 CASAVA_Build 6 12733387 1I TGGGATAACA -/G GTGTGCGCCA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 1 2 104893 CASAVA_Build 6 12736126 3D AGATTTTAGG TCC/--- TCAATGGGCT 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 TCC 1 0 104894 CASAVA_Build 6 12746996 2I TTATGGTTTC --/AT ATATATGGAA 3070 het 3070 hom 36 9 21 6 AT 3 4 104895 CASAVA_Build 6 12755365 2I CAACATTTCA --/AT ATATATAATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 3 4 104896 CASAVA_Build 6 12785018 1D GAATCATGGT G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 60 het 25 0 18 8 G 9 8 104897 CASAVA_Build 6 12804554 1I CTTCTACGTC -/T TTTTTTTTTT 2132 het 2132 ref 52 31 7 14 T 13 14 104898 CASAVA_Build 6 12809438 1I CAAAACTAAA -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 31 10 10 11 C 8 9 104899 CASAVA_Build 6 12840527 1I CACACACAGA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3013 hom 19 7 9 3 T 8 9 104900 CASAVA_Build 6 12842127 1D ACTATCAAGT A/- AGATTGGAAA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 A 2 1 104901 CASAVA_Build 6 12843444 1D TGGTGTGTCT C/- CATCACGTTG 3070 het 3070 hom 43 15 18 11 C 2 1 104902 CASAVA_Build 6 12845817 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2411 hom 26 8 12 6 T 12 13 104903 CASAVA_Build 6 12852388 1D ACAAGGTATG A/- GGCCAGTTTT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 1 0 104904 CASAVA_Build 6 12876786 1I AGGGGCAACA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 412 hom 25 1 22 2 T 8 9 104905 CASAVA_Build 6 12933847 1D ACAGAAGCAG T/- GAATCTCAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 1 0 104906 CASAVA_Build 6 12943126 1D CTATCAGTGG T/- GGAAGCATCT 3070 hom 129 het 49 0 42 7 T 1 0 104907 CASAVA_Build 6 12962769 6D AAAAACTTTG CTCAGC/------ CTCAGCTTCT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 CTCAGC 2 1 104908 CASAVA_Build 6 12967026 2D ACACATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 5 het 53 1 32 20 AC 10 9 104909 CASAVA_Build 6 12976038 7I TAGATTACCA -------/GAGGAAT GAAGCAAGGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 GAGGAAT 0 1 104910 CASAVA_Build 6 12976810 3D AGAGAAACAC ATA/--- ATAATAGCAG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 ATA 3 2 104911 CASAVA_Build 6 12980171 1D ATGTGATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 17 16 4 T 10 9 104912 CASAVA_Build 6 12982027 6D TCTGCTTTGT ACAGTA/------ ACAACATATG 3070 het 3070 ref 44 23 17 10 ACAGTA 1 0 104913 CASAVA_Build 6 12989081 10D TCGCGGAACA GGCAAGCTGT/---------- GGCTCAAAAG 3070 het 3070 ref 36 24 10 4 GGCAAGCTGT 1 0 104914 CASAVA_Build 6 12994478 1I TTTGATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 31 3 22 6 A 10 11 104915 CASAVA_Build 6 13001909 2D CAAGAAAAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 114 het 43 0 39 6 TA 6 5 104916 CASAVA_Build 6 13014404 2D AGAATGACTT AA/-- AAATATATTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 5 3 104917 CASAVA_Build 6 13015978 1I AAATAAGAGA -/G GATGAGAGTG 3070 hom 114 het 43 0 37 6 G 1 2 104918 CASAVA_Build 6 13026496 2I AGGAATCATC --/AG AGAGTTCTGG 3070 hom 129 het 49 0 42 7 AG 2 3 104919 CASAVA_Build 6 13038264 1I CAGAAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 555 het 555 ref 42 25 4 13 T 15 16 104920 CASAVA_Build 6 13071673 1I GATTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 661 hom 41 3 31 7 A 12 13 104921 CASAVA_Build 6 13077203 1D GGTCTGAAGT G/- GGGCTCAAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 5 G 4 3 104922 CASAVA_Build 6 13093000 4D TTTGTTTCAT AAGG/---- AAAAAGCAAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 AAGG 1 0 104923 CASAVA_Build 6 13093494 1I TAGGAAAAAT -/A TAAGCCTAAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 104924 CASAVA_Build 6 13095261 2I CACAATTGGA --/AT ATATATATAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AT 5 6 104925 CASAVA_Build 6 13135775 1D TCTGATTACA C/- TGTGAGAAAC 3070 hom 138 het 51 0 47 5 C 1 0 104926 CASAVA_Build 6 13135902 1I ATATGTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 32 0 24 9 T 10 11 104927 CASAVA_Build 6 13139994 1D AACAAGTATT A/- AAAATTGCCA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 5 4 104928 CASAVA_Build 6 13142115 3I TAAGAAATAA ---/TTC TTTTAAAACC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TTC 0 1 104929 CASAVA_Build 6 13143646 1I TTCTATATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 9 10 104930 CASAVA_Build 6 13153158 2D ACATCTATAT TA/-- TATGACATTT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 TA 2 1 104931 CASAVA_Build 6 13162210 3D GCAGGAAAAC AAA/--- GAATACAAAT 3070 hom 122 het 46 0 40 7 A 3 0 104932 CASAVA_Build 6 13169004 1I TACTGGTGAC -/T TTTTTTCATT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 6 7 104933 CASAVA_Build 6 13179029 1I TTGCCTGCTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 388 hom 26 1 24 1 A 8 9 104934 CASAVA_Build 6 13179210 1D CTTAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 24 0 18 6 A 12 11 104935 CASAVA_Build 6 13248410 5I GTTGCTAATC -----/AAAAT AAAATGGTGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAAAT 1 2 104936 CASAVA_Build 6 13251054 1I GAGAAGTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1121 hom 26 3 21 2 A 10 11 104937 CASAVA_Build 6 13256348 1D TTTTGCCTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 35 0 30 5 T 10 9 104938 CASAVA_Build 6 13257285 18D TTTACCAGAA CATTTGAATGTTTACCAG/------------------ AACATTTGAT 3070 hom 96 het 30 0 31 5 CATTTGAATGTTTACCAG 1 0 104939 CASAVA_Build 6 13258050 1I TTTTTTGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 240 hom 39 1 26 12 T 14 15 104940 CASAVA_Build 6 13269755 4I CACATAATAT ----/TCTA TCTACTTTAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TCTA 1 2 104941 CASAVA_Build 6 13273171 1I ATTCAACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1220 hom 41 3 31 7 T 10 11 104942 CASAVA_Build 6 13320696 1D CACACACCCC T/- TTTGCATACT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 T 4 3 104943 CASAVA_Build 6 13341550 27I CCTTATAAGG ---------------------------/ATGCTTAAATACTGCTTGGAATTTGTA ACATCCACTG 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 ATGCTTAAATACTGCTTGGAATTTGTA 0 1 104944 CASAVA_Build 6 13344303 1I ACTATGGGCA -/T TTTTTTTTTT 1318 het 1318 ref 34 14 6 14 T 13 14 104945 CASAVA_Build 6 13346275 1I CTTTGTTTTA -/G GGAATTTAGT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 G 2 3 104946 CASAVA_Build 6 13373578 6I CAGGTCAAAG ------/CAAATA GCACTTATTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 CAAATA 0 1 104947 CASAVA_Build 6 13375691 1I TGCTGAATGG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 T 7 8 104948 CASAVA_Build 6 13377349 1I TGATCTCCAA -/G ATGTAGGCGC 3070 het 3070 ref 54 22 24 8 G 0 1 104949 CASAVA_Build 6 13381806 1I TTGGTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 A 11 12 104950 CASAVA_Build 6 13382114 5D CCTCCCCCGG CCCCC/----- CCGCCCCGCC 1186 het 9 hom 11 0 7 4 C 7 2 104951 CASAVA_Build 6 13384692 4I CTTTAAAGAC ----/CTGT CTGTCCCAAG 3070 het 2495 hom 23 7 8 9 CTGT 1 2 104952 CASAVA_Build 6 13387174 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 118 hom 16 1 9 6 A 15 16 104953 CASAVA_Build 6 13388145 1D AGACACTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 A 11 10 104954 CASAVA_Build 6 13390969 4D CACAAATCCA AAAT/---- AAGACAGAAT 3070 het 3070 hom 28 13 11 6 AAAT 1 0 104955 CASAVA_Build 6 13396659 2D AGTTGCAGAG CT/-- CTCTCACCTT 3070 het 3070 hom 48 16 20 13 CT 3 2 104956 CASAVA_Build 6 13397976 1D27M1I CAGTTGAGCA TTTTTTTCATTTGGATTAGCGTGAGAGG-/-TTTTTTCATTTGGATTAGCGTGAGAGGA AAAAATGTGA 3070 het 3070 ref 30 19 11 3 N/A 0 0 104957 CASAVA_Build 6 13403732 1D CAGTGTGGCA G/- GGGGGTCCCT 3070 hom 44 het 30 1 22 7 G 6 5 104958 CASAVA_Build 6 13404639 1I ACACCCAGAC -/A GACCTTATTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 0 1 104959 CASAVA_Build 6 13404805 1D TCCCTAGTGA C/- CCCCCTCTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 6 5 104960 CASAVA_Build 6 13409563 1D AGACTGAGTG A/- TTGGCTTGGT 3070 hom 141 het 53 0 48 7 A 1 0 104961 CASAVA_Build 6 13416659 2I ACTTGGTAGC --/CT CTCTCTCATG 3070 hom 135 het 50 0 43 7 CT 3 4 104962 CASAVA_Build 6 13416882 1I AAGCAAATGT -/A AATGTTTATT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 2 3 104963 CASAVA_Build 6 13417012 4D AGAGAAAATC CCTG/---- CCTTCAAGGA 3070 hom 135 het 50 0 45 7 CCTG 1 0 104964 CASAVA_Build 6 13420146 6I AGAGATATAG ------/ATATAA ATATAAATAT 3070 hom 60 het 24 0 19 5 ATATAA 2 3 104965 CASAVA_Build 6 13421767 4I CAAGCCTAGA ----/GAGG GAGATACGCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 GAGG 0 1 104966 CASAVA_Build 6 13422416 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 20 0 13 8 A 15 14 104967 CASAVA_Build 6 13432345 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3031 het 3031 ref 22 10 7 5 T 11 10 104968 CASAVA_Build 6 13454295 1D TTTGAATTTG A/- AAAAAAACAA 3070 het 2440 hom 26 11 11 4 A 8 7 104969 CASAVA_Build 6 13464309 2I AGTAATTGTA --/AC AGTCATTTCA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 AC 0 1 104970 CASAVA_Build 6 13478172 3I TATTTTCTTC ---/ACT ACATTTTTCC 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 ACT 0 1 104971 CASAVA_Build 6 13487163 1I GAACCCCATC -/A TGCTGCTGGT 3070 het 3070 hom 52 20 21 11 A 0 1 104972 CASAVA_Build 6 13494409 1D AATTACTTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 8 7 104973 CASAVA_Build 6 13495254 10D AATAGGTGTA CTTCTGTGTG/---------- CTTCTGTTTT 3070 het 3070 hom 53 23 28 7 CTTCTGTGTG 1 0 104974 CASAVA_Build 6 13501104 1D CTGTCCCTAC A/- AAAAAAAAAA 1220 het 1220 ref 18 12 3 3 A 13 12 104975 CASAVA_Build 6 13506516 1I TGGATCTGTT -/A ACGAGGCTCA 3070 het 3070 ref 58 29 25 4 A 1 2 104976 CASAVA_Build 6 13510799 6D GCTCAACATC ATCAGT/------ CTTTAGGGAA 3070 het 3070 ref 38 19 18 2 ATCAGT 1 0 104977 CASAVA_Build 6 13516121 4D CTGTACTCAC CCAA/---- CCAACTGACT 3070 het 3070 ref 46 22 17 8 CCAA 2 1 104978 CASAVA_Build 6 13528339 5D GGCTCGCATG GGATC/----- CGTGCCTTTG 3016 het 3016 ref 30 17 8 8 GGATC 1 0 104979 CASAVA_Build 6 13529765 1D ATCCATATTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 9 8 104980 CASAVA_Build 6 13532071 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 T 8 9 104981 CASAVA_Build 6 13532929 1I GATACAAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 8 9 104982 CASAVA_Build 6 13536718 5D AGGCCCCCAG TGCGA/----- TGCGATGCGC 2021 hom 15 het 16 0 6 12 TGCGA 2 1 104983 CASAVA_Build 6 13536905 1D GGAGTCCAGG C/- CCCCTCCCAG 1007 het 1007 ref 15 9 4 2 C 5 4 104984 CASAVA_Build 6 13540440 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 741 het 741 ref 37 20 5 12 T 15 14 104985 CASAVA_Build 6 13547243 1D ATTTGCATTA T/- TTCATGTCTA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 3 2 104986 CASAVA_Build 6 13547452 1I CAACTGAAAA -/T TTGAAAGAAG 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 T 2 3 104987 CASAVA_Build 6 13551691 4D CTTGAAAGGA AATC/---- AATCAATCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AATC 3 2 104988 CASAVA_Build 6 13573434 3I CTGATGAGCT ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 9 12 104989 CASAVA_Build 6 13611891 3D TAGCACATAT TAG/--- TAGTATTATA 3070 het 3070 ref 28 14 12 4 TAG 2 1 104990 CASAVA_Build 6 13618962 6I CTAGATTAGC ------/TAGATA TAGAGTATCC 3070 hom 62 het 24 0 21 3 TAGATA 0 1 104991 CASAVA_Build 6 13621800 2I GGCTTCATTC --/TT TTTAAGTCGA 3070 het 3070 ref 51 24 19 9 T 3 5 104992 CASAVA_Build 6 13628710 1D GGCTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 17 9 T 12 11 104993 CASAVA_Build 6 13631129 1D AGAACACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 15 14 104994 CASAVA_Build 6 13631683 1I GGATCTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 T 9 10 104995 CASAVA_Build 6 13636362 10D CATATATATG TACATATATA/---------- TGTGTATATA 896 het 896 ref 22 10 3 12 TACATATATA 1 0 104996 CASAVA_Build 6 13642482 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 8 104997 CASAVA_Build 6 13642609 1D AATCGAAGCT C/- CCTAAAAGGC 3070 hom 102 het 37 0 33 4 C 3 2 104998 CASAVA_Build 6 13646411 4I AATTTATTCT ----/TAAA TAAATAAATA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TAAA 2 3 104999 CASAVA_Build 6 13649203 1D GGGGAACATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 A 10 9 105000 CASAVA_Build 6 13650936 2I3M8I GTGAAGGTCC --CAG--------/AGCAGCTTATTTT CTGAGCCACC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 N/A 0 0 105001 CASAVA_Build 6 13651629 4I ACCCTGTCTC ----/AAAG AAAAAAAGTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 AAAG 0 1 105002 CASAVA_Build 6 13652438 1D ATTTTTGTTG T/- TGTTGTTGTA 3070 het 3070 hom 43 12 21 11 T 2 1 105003 CASAVA_Build 6 13655833 9D GTCTTTCTAT TCTTTCTAC/--------- ATAAAATGAT 3070 het 3070 hom 37 17 19 8 TCTTTCTAC 1 0 105004 CASAVA_Build 6 13656734 1D CTAGATCCAT C/- CCCCCCACCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 7 6 105005 CASAVA_Build 6 13677186 2I TGTACAACAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 TA 5 6 105006 CASAVA_Build 6 13681438 1D AGAGACTAGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 A 8 7 105007 CASAVA_Build 6 13686870 13D GTATTAGTTC TGCTTTAAATGTT/------------- TGGTAGAATT 1494 het 1494 ref 17 8 6 5 TGCTTTAAATGTT 1 0 105008 CASAVA_Build 6 13698771 2I TAATTGTGTG --/TA TATGTTTAGT 3070 het 3070 ref 64 29 28 7 TA 1 2 105009 CASAVA_Build 6 13719790 2D AAAATTCCCC CA/-- GTCACAGAGC 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 CA 1 0 105010 CASAVA_Build 6 13737200 1I AGTGGAATAA -/T TTTAAGAAAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 3 4 105011 CASAVA_Build 6 13737327 3D TCATTGAGCC TTT/--- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 5 2 105012 CASAVA_Build 6 13738730 1I AAGAATTCTT -/A AAAAAAAAAA 2032 het 2032 ref 27 9 7 11 A 15 16 105013 CASAVA_Build 6 13742160 1D GGTGGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 185 hom 31 1 24 6 T 11 10 105014 CASAVA_Build 6 13742271 1D TACTGATTAG A/- AATTTGTAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 2 105015 CASAVA_Build 6 13745594 1D CATTTACACC A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 55 30 22 3 A 8 7 105016 CASAVA_Build 6 13749727 1D CGGTCACAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 9 25 11 T 10 9 105017 CASAVA_Build 6 13759614 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 52 het 24 0 18 6 T 10 9 105018 CASAVA_Build 6 13764613 1D TCTATAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 16 0 A 11 10 105019 CASAVA_Build 6 13766489 1D ATATACTATA T/- GTTTTACTAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 3 T 1 0 105020 CASAVA_Build 6 13772669 6I CACAATAGGC ------/TTTTCT TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 TTTTCT 1 2 105021 CASAVA_Build 6 13777348 1I GGAACAGAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 9 10 105022 CASAVA_Build 6 13789542 3I AATTTTAGTT ---/GTG GTGGTTGTTA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 GTG 1 2 105023 CASAVA_Build 6 13792111 3I AAACATGATG ---/TAT GTTATATATC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TAT 0 1 105024 CASAVA_Build 6 13794317 11D TTCTTCCCCC CCCCCCCCCCG/----------- CCCCCCGAAA 1360 het 54 hom 14 1 4 9 CCCCCCCCCCG 1 0 105025 CASAVA_Build 6 13808699 4D CTTAGCCTGA GTAG/---- GTAGGTCCTA 3070 het 3070 hom 47 21 23 6 GTAG 2 1 105026 CASAVA_Build 6 13839934 1I18M6I ACCTGGCTAA -TTTTGTATTTTTAGTAGA------/TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGG GTTTCACTAT 3070 het 3070 hom 18 10 11 2 N/A 0 0 105027 CASAVA_Build 6 13847670 4D ATATACACAC ACAT/---- ATATATACAC 424 hom 10 het 4 0 4 0 ACAT 1 0 105028 CASAVA_Build 6 13848921 1D AACCAAAACC A/- AAAAAAAAAA 2746 het 2544 hom 21 9 8 4 A 13 12 105029 CASAVA_Build 6 13858955 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 13 5 A 16 15 105030 CASAVA_Build 6 13930423 1I TTCACGTAAT -/C TTTAAAAAAA 3017 hom 18 het 8 0 7 1 C 0 1 105031 CASAVA_Build 6 13943810 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAGAAGAAGA 3070 hom 34 het 17 0 11 6 AAAAG 1 0 105032 CASAVA_Build 6 13945298 1D CACATCGCTT C/- CCCTTACATC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 C 4 3 105033 CASAVA_Build 6 13947998 3D GTTTTTTATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 12 8 T 15 12 105034 CASAVA_Build 6 13948707 1D GCTGACATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 21 0 16 6 T 9 8 105035 CASAVA_Build 6 13960158 7D TTTCTTTCTC TCTCTTT/------- TTTTCCTTCT 3070 het 287 hom 31 3 15 16 TCTCTTT 1 0 105036 CASAVA_Build 6 13966069 4D TTGTTCCCTG TTTA/---- TTTAAAAATT 3070 hom 120 het 43 0 41 4 TTTA 2 1 105037 CASAVA_Build 6 13966372 2D AAGATTTTTT TG/-- CACAGTGCCT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 TG 1 0 105038 CASAVA_Build 6 13967449 1I ATATTTTAAA -/T ATATATTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 0 1 105039 CASAVA_Build 6 13967821 2I GGTGAAGCAT --/AA AGCTAATTTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 1 3 105040 CASAVA_Build 6 13969354 23D GTTTGTTGTT TTACAGGGGTTGTTGTTTTACTC/----------------------- TATAATTAAA 3070 hom 78 het 25 0 27 2 TTACAGGGGTTGTTGTTTTACTC 1 0 105041 CASAVA_Build 6 13970036 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 102 het 45 0 35 12 CT 2 1 105042 CASAVA_Build 6 13970401 1I CTGCTTATAA -/T TATTTATGTA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 1 2 105043 CASAVA_Build 6 13970741 2D TATACCCCTC AT/-- AGCTCCTGTA 3070 hom 135 het 54 0 45 9 AT 1 0 105044 CASAVA_Build 6 13971322 1I ACGAGGTTTT -/A ACCATGTTGG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 2 105045 CASAVA_Build 6 13971637 4I ACATGATCAG ----/TTAA TTAAGAAACA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTAA 1 2 105046 CASAVA_Build 6 13973287 4I TAATCAAATT ----/ACTC AGTCAACGGC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 ACTC 0 1 105047 CASAVA_Build 6 13975040 2I GAGTGGTAAC --/AG TACCTACGGC 3070 hom 134 het 52 0 45 7 AG 0 1 105048 CASAVA_Build 6 13975493 4D CTTTTACACA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 57 het 27 0 20 7 AC 10 8 105049 CASAVA_Build 6 13976368 2D CTCAGAATCG TC/-- TCTCTGTTGG 3070 hom 125 het 45 0 42 3 TC 3 2 105050 CASAVA_Build 6 13976775 1D GGAATGGGAC G/- GGGGGGGCAC 3070 hom 57 het 25 0 17 9 G 8 7 105051 CASAVA_Build 6 13976992 4D AAAATGGTGT TTTC/---- TTTATTTTGA 3070 hom 120 het 45 0 40 7 TTTC 1 0 105052 CASAVA_Build 6 13977419 3I ATAGTCCTCA ---/TGT TGTACATTAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TGT 1 2 105053 CASAVA_Build 6 13977600 1I ATTGCAGGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 33 1 27 5 A 10 11 105054 CASAVA_Build 6 13977920 6D AAATAAGAGC TCCCCA/------ TCCCCATACC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TCCCCA 2 1 105055 CASAVA_Build 6 13978129 1D19M4D AACATTCCAT ATATATATATATACATATACATAT/-TATATATATATACATATAC---- ATATACACAC 2602 het 53 hom 11 1 7 6 N/A 0 0 105056 CASAVA_Build 6 13978875 1I TCTGGGGAGT -/G GGGGGGGTGA 3070 het 156 hom 33 1 25 7 G 7 8 105057 CASAVA_Build 6 13979142 4D GTGTTTGGAA TTTC/---- TTCCTTCTGG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TTTC 1 0 105058 CASAVA_Build 6 13980761 1I TTTGGCTTTC -/T ATTTTTTTTT 3070 het 302 hom 35 1 29 5 T 0 1 105059 CASAVA_Build 6 13992050 1I ATAGAACTTA -/C CCCCATCTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 4 5 105060 CASAVA_Build 6 13992722 2D GTGTACATGA GT/-- GTGTGTATGT 3070 hom 181 het 68 0 59 12 GT 4 3 105061 CASAVA_Build 6 13993343 5D GTTACAATCA TATCT/----- TATCAAGAAC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TATCT 1 0 105062 CASAVA_Build 6 13994137 3D TAAAACAAAC AAA/--- GAATCAAATT 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 A 3 0 105063 CASAVA_Build 6 13995853 2D23M7D ATCTTTAGCC AAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAACAAAAGAAAG/--AAAAAAAAAAAAGAAAAAAACAA------- AAAAAGAAAG 3070 het 63 hom 22 2 30 2 N/A 0 0 105064 CASAVA_Build 6 14008330 6D AATAAAAATT AGAAAA/------ AGAGAAAATT 1778 het 1778 ref 12 8 4 1 AGAAAA 1 0 105065 CASAVA_Build 6 14009053 1I TCCAAGCATG -/T TGCTTTTTCA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 1 2 105066 CASAVA_Build 6 14015019 1I CATAACACAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 T 8 9 105067 CASAVA_Build 6 14038339 1I3M5D ATATTTGGAA -AATATTCC/CGAT----- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 35 16 16 5 N/A 0 0 105068 CASAVA_Build 6 14041649 1I GGCAGGAGGA -/T TGCTTGAGCT 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 T 1 2 105069 CASAVA_Build 6 14042998 5I TTGAGATAAT -----/TAAAA TAATGCAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 TAAAA 0 1 105070 CASAVA_Build 6 14043515 1I AAACAATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 29 19 7 T 10 11 105071 CASAVA_Build 6 14055271 4I TGTCTAAAAT ----/AAAC TAAATAAGAG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 AAAC 0 1 105072 CASAVA_Build 6 14078052 1I AGGAATACCA -/G GCTTCATATA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 G 1 2 105073 CASAVA_Build 6 14089710 2D CAATTAACTG AA/-- AAGTCACAAG 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 A 4 2 105074 CASAVA_Build 6 14090273 1I TACGCTGCCT -/A GCCTCTGGTA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 A 0 1 105075 CASAVA_Build 6 14093559 1I CCTGATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 12 13 105076 CASAVA_Build 6 14101896 2I TCTCTCTCTC --/TT TCTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 1 3 105077 CASAVA_Build 6 14102823 1I GTTATCTAGG -/T TTTTCTCATG 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 4 5 105078 CASAVA_Build 6 14103922 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2704 het 2704 ref 29 14 8 7 A 14 13 105079 CASAVA_Build 6 14112036 1D TATTTTTCTC T/- TTTTCTGGAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 5 4 105080 CASAVA_Build 6 14112864 5I CTCAGGACTT -----/AAAAC AAACCCCGAC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 AAAAC 0 1 105081 CASAVA_Build 6 14114289 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1250 het 148 hom 18 2 6 10 T 18 16 105082 CASAVA_Build 6 14116951 5D7M12D TAAATTGCAC ATTATATGTTATTATAAATTGCAC/-----ATGTTAT------------ ATGTTATATG 2633 het 2633 ref 40 16 9 23 N/A 0 0 105083 CASAVA_Build 6 14119966 1D AAAAGCCAGT G/- GGGGTACTTC 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 G 5 4 105084 CASAVA_Build 6 14120084 2D GGTAAATTAT AA/-- AAAAAAAAAA 2022 het 1993 hom 20 8 6 6 A 14 12 105085 CASAVA_Build 6 14127048 10D ACGTGTTGTT TCGTGTTGTG/---------- GAAGCTTTAG 3070 het 3070 hom 39 21 20 3 TCGTGTTGTG 1 0 105086 CASAVA_Build 6 14130143 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1912 het 948 hom 12 3 6 3 T 15 14 105087 CASAVA_Build 6 14141749 1D CTCTCACCCC T/- GGCGCAGAGC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 1 0 105088 CASAVA_Build 6 14146711 1D GGTATATTTA T/- ACCTGTAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 T 1 0 105089 CASAVA_Build 6 14147277 4I GGTCATGGGC ----/AGTA ATTCTGTTAC 3070 het 3070 ref 50 26 22 2 AGTA 0 1 105090 CASAVA_Build 6 14149903 1D GATGATGAGC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 15 16 10 T 9 8 105091 CASAVA_Build 6 14174737 1D AGTAAAATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 14 het 33 1 24 9 T 10 9 105092 CASAVA_Build 6 14177528 2I GGGAGAGAGA --/GT GGTCTGGTAT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 GT 0 1 105093 CASAVA_Build 6 14193011 5I GTGTTCTTTG -----/ATATA ATAGACAATT 3070 hom 86 het 36 0 27 9 ATATA 0 1 105094 CASAVA_Build 6 14226563 2I AGGGCAGAGA --/CT CTCTCATTTG 3070 hom 82 het 33 0 27 6 CT 2 3 105095 CASAVA_Build 6 14262721 1D TATACTCCAG T/- TGACTTTTAC 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 T 2 1 105096 CASAVA_Build 6 14263611 1D GTTTCATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 12 11 105097 CASAVA_Build 6 14268665 5D AGGCCTTTGA GGCCT/----- GGAGCAGAGC 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 GGCCT 1 0 105098 CASAVA_Build 6 14280236 1I GAGGTCAGGA -/G TTCGAGACCA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 0 1 105099 CASAVA_Build 6 14282725 1I CTGAAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 A 13 14 105100 CASAVA_Build 6 14285809 1I GATGGATAAT -/A ACACCTGAGT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 1 2 105101 CASAVA_Build 6 14291042 2I GATTATCATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 T 11 13 105102 CASAVA_Build 6 14313407 1D TTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 32 0 27 5 T 11 10 105103 CASAVA_Build 6 14322285 2I TTGATGGTGG --/AT ATAGGATGTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 1 2 105104 CASAVA_Build 6 14328688 1D GATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 11 10 105105 CASAVA_Build 6 14330024 1D TGATAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 805 hom 31 2 20 9 T 13 12 105106 CASAVA_Build 6 14344816 1D CATTTAAATC A/- ACGTTCTCTG 3070 hom 94 het 39 0 31 9 A 2 1 105107 CASAVA_Build 6 14351667 2I GTTATAAAAC --/AA AGAAAACCAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 3 105108 CASAVA_Build 6 14393959 5I AAACAAGAGA -----/TACTC AGAGTAGATC 3070 hom 157 het 58 0 53 5 TACTC 0 1 105109 CASAVA_Build 6 14397880 1I AGTATAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 10 11 105110 CASAVA_Build 6 14400311 1D AAGCTCTATG C/- CCCCCCAAAA 3070 hom 108 het 39 0 36 4 C 7 6 105111 CASAVA_Build 6 14415571 1D CAGTAAAATC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 95 het 42 0 30 13 T 9 8 105112 CASAVA_Build 6 14417805 1D CCGTCTTCCC T/- TTAGTGTAAT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 3 2 105113 CASAVA_Build 6 14425706 1I GAAAAAAAAA -/T ATACTGATTG 3070 het 334 hom 48 1 41 6 T 0 1 105114 CASAVA_Build 6 14429504 1I ATTTCCTATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 387 hom 44 1 39 4 A 8 9 105115 CASAVA_Build 6 14440223 1D CTGGTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 33 0 30 3 T 12 11 105116 CASAVA_Build 6 14459338 1I AAGGCATTAG -/T TTTCCTGAGG 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 T 3 4 105117 CASAVA_Build 6 14470340 1D ACAATAACAG A/- ATTGCTGATA 3070 het 3070 ref 39 19 13 9 A 2 1 105118 CASAVA_Build 6 14471159 6D CTCTTTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 45 0 30 15 T 20 14 105119 CASAVA_Build 6 14486367 1I ATTGCTGTTA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 8 9 105120 CASAVA_Build 6 14499620 12D TCCTATAGGA TGACACCAGAGG/------------ TGACGGCAGG 3070 het 3070 ref 40 21 16 9 TGACACCAGAGG 1 0 105121 CASAVA_Build 6 14502492 1D CTGTCTGCTC A/- AAAAAGATTC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 6 5 105122 CASAVA_Build 6 14503009 1I GGAAGCTCCG -/C CCCCCCTTCT 3070 hom 69 het 31 0 22 9 C 6 7 105123 CASAVA_Build 6 14503919 1I CAAAGTGACA -/C CCCAGCCTTC 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 C 3 4 105124 CASAVA_Build 6 14521579 1I AAAAATGTTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 41 16 12 13 A 6 7 105125 CASAVA_Build 6 14523206 1I ATTTTAACAA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 T 7 8 105126 CASAVA_Build 6 14534372 1D CCTGGATAGG A/- ACATTCCCAG 3065 het 3065 ref 32 23 8 2 A 2 1 105127 CASAVA_Build 6 14554369 1I CCCCTTTCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 126 het 50 0 42 8 T 9 10 105128 CASAVA_Build 6 14560290 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 112 hom 26 1 18 9 T 12 11 105129 CASAVA_Build 6 14566118 7D AAGACTTTTA CAAGATT/------- TAACAGAGAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 5 CAAGATT 1 0 105130 CASAVA_Build 6 14572259 1I ATTTCCCAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 A 8 9 105131 CASAVA_Build 6 14578801 1I GAGCCTTCCC -/T TTCATGCCAC 2669 het 2669 ref 33 19 10 4 T 2 3 105132 CASAVA_Build 6 14609895 1D GGGGGGAGAA G/- GGGGGGGGGG 2542 het 529 hom 17 5 7 5 G 12 11 105133 CASAVA_Build 6 14630363 1I AAAAAACACA -/C AAAAAAACAC 1019 het 1019 ref 33 15 7 11 C 0 1 105134 CASAVA_Build 6 14633169 1D TGGTTAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 10 9 105135 CASAVA_Build 6 14649244 3I GGAGAAGAGC ---/TCT TTTTTATGAA 2477 het 2477 ref 30 16 9 5 TCT 0 1 105136 CASAVA_Build 6 14656967 4I TTGTATAGAC ----/TATT TAGGTTTCCT 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 TATT 0 1 105137 CASAVA_Build 6 14658940 1D ATCAAGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 19 16 5 T 11 10 105138 CASAVA_Build 6 14662124 1D AAAAAAAAAA G/- GGGTATTGGA 2410 het 2410 ref 40 18 13 9 G 4 3 105139 CASAVA_Build 6 14666326 1I TTTTTTTTTT -/A ACTTGAAGTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 1 2 105140 CASAVA_Build 6 14666981 1D AGCACCTACT A/- GAAAGTTTAG 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 1 0 105141 CASAVA_Build 6 14667608 2D TGGTGAAACC CT/-- GTCTCTACTA 2911 het 1184 hom 13 6 7 0 CT 1 0 105142 CASAVA_Build 6 14670384 2D AAAGAATAAC AA/-- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 A 8 6 105143 CASAVA_Build 6 14673707 1D CCAGCCAAAA C/- AGTGAAATAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 C 1 0 105144 CASAVA_Build 6 14676352 1I TTCAAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 10 11 105145 CASAVA_Build 6 14682298 3D CTCATCCTTT CAG/--- CATCTGCCCC 3070 het 3070 ref 56 28 24 5 CAG 1 0 105146 CASAVA_Build 6 14686039 1D AGATATTATT C/- CCCAGTGCAG 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 C 4 3 105147 CASAVA_Build 6 14691715 1D TTTTTAATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 45 het 17 0 15 3 A 9 8 105148 CASAVA_Build 6 14693666 1D TGAGAGTATG T/- TGAGTTGATA 3070 hom 135 het 51 0 44 7 T 2 1 105149 CASAVA_Build 6 14695836 5D GGTAACTTAT AAAGA/----- AAAGAGGATT 2902 het 2260 hom 22 5 6 11 AAAGA 2 1 105150 CASAVA_Build 6 14703356 1I ATTGAGTTAC -/T TTTGAAAATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 3 4 105151 CASAVA_Build 6 14704110 1I TTGATGGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 734 hom 40 2 31 7 A 10 11 105152 CASAVA_Build 6 14704604 1I TGTACTTAGT -/A AACTTGCTTC 3070 hom 108 het 46 0 36 10 A 2 3 105153 CASAVA_Build 6 14706536 3D TGGTAATTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 131 het 58 0 43 15 TTG 6 5 105154 CASAVA_Build 6 14711326 1D GTCTAAGTGT A/- AATCCCCATT 3070 hom 99 het 41 0 32 9 A 3 2 105155 CASAVA_Build 6 14722343 2D TGAGACTTCC AG/-- AGAGTCAGGA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 AG 3 2 105156 CASAVA_Build 6 14730135 1I CTTCCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1704 hom 25 5 13 7 A 13 14 105157 CASAVA_Build 6 14744453 1I GGCTTCTCCA -/G CCCCCATGGA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 0 1 105158 CASAVA_Build 6 14746776 3I TGGAAAGAGT ---/TAC CGATCAAGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAC 0 1 105159 CASAVA_Build 6 14753571 9I CAGTGGTGAC ---------/GGAGGGCAT GGAGGGCATG 3070 hom 116 het 44 0 38 6 GGAGGGCAT 1 2 105160 CASAVA_Build 6 14758131 2I GTGATTCTAT --/AA GATTCCTATC 3070 hom 129 het 48 0 41 7 A 0 2 105161 CASAVA_Build 6 14767910 1D TCATGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 31 1 23 7 T 11 10 105162 CASAVA_Build 6 14775474 1D TTCAGATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 43 2 25 16 T 16 15 105163 CASAVA_Build 6 14786666 1D GGCAATGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 T 12 11 105164 CASAVA_Build 6 14794769 1D ACAGGTCATC A/- AGGTGTTAGA 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 A 2 1 105165 CASAVA_Build 6 14800781 4D TTAAAAAGTA TTAC/---- TTGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 TTAC 1 0 105166 CASAVA_Build 6 14803536 6I CTCTCGAGTA ------/ATCCCT GTTGGGATTA 3070 het 860 hom 13 2 11 0 ATCCCT 0 1 105167 CASAVA_Build 6 14805100 1D TCAAATCATT A/- AAAAAAAAAA 2986 het 349 hom 20 2 8 11 A 15 14 105168 CASAVA_Build 6 14805261 1I TTAAGAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 2 A 11 12 105169 CASAVA_Build 6 14813098 2D AAAATGCGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 T 12 10 105170 CASAVA_Build 6 14814559 1D CTTTTGGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 7 T 10 9 105171 CASAVA_Build 6 14823009 4I TTTTTTAGAA ----/TATT TATTTATTTA 3070 hom 24 het 17 0 9 8 TATT 4 5 105172 CASAVA_Build 6 14829513 1I GGAAAACTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 10 105173 CASAVA_Build 6 14846951 2D CTCCTGAAAT TC/-- TCTGATAGTT 3070 hom 147 het 55 0 49 6 TC 2 1 105174 CASAVA_Build 6 14847645 1D CCATCTACTC A/- ATCTCTCTGA 3070 hom 111 het 41 0 37 5 A 2 1 105175 CASAVA_Build 6 14847871 1D43M4D GGATATAGTC AGGTATACAGTCAAGGGTTCAGCGACCAGAAGGAAAACGGACACACAA/-GGTATACAGTCAAGGGTTCAGCGACCAGAAGGAAAACGGACAC---- ACAAACACTT 3070 hom 43 het 44 1 47 10 N/A 0 0 105176 CASAVA_Build 6 14848372 10I TCTTTTGAGA ----------/CAGTCTCGCT CTGTCGCCCA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 CAGTCTCGCT 0 1 105177 CASAVA_Build 6 14849935 3I TACACTTCAT ---/TCA TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 TCA 0 1 105178 CASAVA_Build 6 14850699 20D GAGTGAACAA CCCAGGTAATTGTTGTTTTC/-------------------- CCCTGTAAAA 3070 hom 123 het 38 0 42 3 CCCAGGTAATTGTTGTTTTC 1 0 105179 CASAVA_Build 6 14851588 6I GGCTCAATGG ------/TTAGAA TTAGAAGTCT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 TTAGAA 1 2 105180 CASAVA_Build 6 14856008 1D GAGATTCAGT C/- GTGGGCATAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 1 0 105181 CASAVA_Build 6 14858503 1D GGAAGCTCCC A/- TTACAAGAAG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 1 0 105182 CASAVA_Build 6 14859241 1I GGGGCAAGTC -/G GGGGGGGCCA 3070 hom 96 het 34 0 30 4 G 7 8 105183 CASAVA_Build 6 14859610 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 678 hom 12 het 11 0 2 9 A 16 15 105184 CASAVA_Build 6 14860792 11D ATAAGTTGCC AATTACCCACT/----------- AATTACTCAT 3070 hom 81 het 34 0 28 9 AATTACCCACT 1 0 105185 CASAVA_Build 6 14861388 1I CAGAGATGAA -/T TTTTTATTTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 5 6 105186 CASAVA_Build 6 14868659 3D AGGGAACAAG CAT/--- GATGAGGCAA 3070 hom 129 het 50 0 42 8 CAT 1 0 105187 CASAVA_Build 6 14871221 1I CAGTTCCCTT -/C CCCCAAGAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 4 5 105188 CASAVA_Build 6 14872288 1D TATGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 32 1 21 10 T 15 14 105189 CASAVA_Build 6 14889016 1D AATCAAAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 9 8 105190 CASAVA_Build 6 14896721 1I CAGGCGCTGT -/G GCTCATGCCT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 G 1 2 105191 CASAVA_Build 6 14914076 6D AGTGAGTGGG TGACAT/------ TGACATTCCA 3070 hom 114 het 42 0 39 5 TGACAT 2 1 105192 CASAVA_Build 6 14915444 2D AAACACACAT CA/-- CACACACACA 3070 het 264 hom 36 5 23 9 CA 12 11 105193 CASAVA_Build 6 14915782 1I CTTAGAACGT -/A CCATCAAAGC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 0 1 105194 CASAVA_Build 6 14922941 2D TACCAGTGAT AA/-- AAAAACTGAG 3070 hom 59 het 22 0 20 5 A 7 5 105195 CASAVA_Build 6 14923061 4D TACATACAGT AATA/---- AATAAAACTA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 AATA 2 1 105196 CASAVA_Build 6 14925776 4D CCTCCGTCTC TATT/---- ATTTATTTTA 3070 hom 73 het 28 0 21 9 TATT 1 0 105197 CASAVA_Build 6 14944418 1D TATATCCTGA T/- TCACTCTCTT 3070 het 3070 ref 52 26 18 8 T 2 1 105198 CASAVA_Build 6 14951916 3D AATGGGACCC TCT/--- TCTTTTCCCT 3070 hom 123 het 46 0 41 8 TCT 2 1 105199 CASAVA_Build 6 14959495 1I TTAAAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 530 hom 36 2 28 6 A 13 14 105200 CASAVA_Build 6 14965111 1D TGAATTTGAC G/- GGGGGGGAGG 3070 het 2442 hom 28 8 11 9 G 8 7 105201 CASAVA_Build 6 14970913 4I CAAGCAACCA ----/GCCT GCCTTGGCCT 3070 hom 47 het 19 0 15 4 GCCT 1 2 105202 CASAVA_Build 6 14970979 1I ACTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2325 het 1710 hom 22 8 10 4 A 15 16 105203 CASAVA_Build 6 14974648 1D GAGTTCAAGA C/- CAGCCTGGCC 3070 hom 39 het 17 0 13 4 C 2 1 105204 CASAVA_Build 6 14982147 1I GCCTGCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 759 hom 28 5 12 11 T 15 16 105205 CASAVA_Build 6 14983301 1D ATCACATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 13 11 T 12 11 105206 CASAVA_Build 6 14985932 1D TCCAGTAGAC T/- TTTTTTTTTT 904 het 904 ref 29 24 2 3 T 12 11 105207 CASAVA_Build 6 14994467 3D AATAAAATAT AGA/--- AGAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 AGA 3 2 105208 CASAVA_Build 6 15009290 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2496 het 340 hom 24 2 14 8 A 15 16 105209 CASAVA_Build 6 15010698 1D TTTATTGAAC T/- GGACACTTAG 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 1 0 105210 CASAVA_Build 6 15013977 2I TTTGCATTAC --/AA AAACAGAATT 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 A 3 5 105211 CASAVA_Build 6 15017031 2D AGACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 31 3 15 13 A 18 16 105212 CASAVA_Build 6 15026922 1D TACACACAGA G/- GTGTTTCTCC 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 G 2 1 105213 CASAVA_Build 6 15037492 1D TGGGGAAGGG A/- AAAACCAATG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 5 4 105214 CASAVA_Build 6 15045551 1D TTAAATCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 10 9 105215 CASAVA_Build 6 15050218 1D TTTCATCTTC T/- TACATCTCCA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 T 2 1 105216 CASAVA_Build 6 15059830 2D ACTTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 13 3 A 14 12 105217 CASAVA_Build 6 15075078 1D TCGTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 11 10 105218 CASAVA_Build 6 15075786 1D CTGTCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 12 11 105219 CASAVA_Build 6 15095163 2D TTATTTTATT TA/-- TTTATTTATT 3019 hom 21 het 10 0 8 3 TA 1 0 105220 CASAVA_Build 6 15096417 2D ATGATACGTA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 GT 9 8 105221 CASAVA_Build 6 15098635 1I ACCCTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 11 12 105222 CASAVA_Build 6 15109984 1I ACAAGGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 816 hom 44 2 31 11 T 10 11 105223 CASAVA_Build 6 15110710 10D GGACCACAGG CATGCACCAC/---------- CATGCACCAC 3070 het 3070 hom 40 13 22 6 CATGCACCAC 2 1 105224 CASAVA_Build 6 15116244 1D TTGAATTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 721 hom 35 3 26 6 T 12 11 105225 CASAVA_Build 6 15127744 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2763 het 132 hom 20 2 10 8 T 15 16 105226 CASAVA_Build 6 15129715 1I GGCCATACAC -/A GCAAGATTAA 3070 het 3070 hom 41 17 13 11 A 0 1 105227 CASAVA_Build 6 15145610 1I GGCAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1187 hom 33 3 17 13 T 15 16 105228 CASAVA_Build 6 15160594 20D AGACAGACAG ATAGATATAGATAGATAGAT/-------------------- ATAGATATAG 3070 het 187 hom 22 5 16 8 ATAGATATAGATAGATAGAT 2 1 105229 CASAVA_Build 6 15173954 1I AATTAGCAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 36 0 19 17 A 9 10 105230 CASAVA_Build 6 15177096 1D ACCAAAAAAA G/- GTTATGGGCT 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 G 2 1 105231 CASAVA_Build 6 15180505 9I TCTTGTATCC ---------/CTATCCTGG CTATCCTGGG 3070 het 3070 hom 44 13 18 13 CTATCCTGG 1 2 105232 CASAVA_Build 6 15185203 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 46 1 35 10 T 12 11 105233 CASAVA_Build 6 15200139 1I GAAATGGATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 12 3 8 1 A 0 1 105234 CASAVA_Build 6 15205514 1I ATCTCCATCT -/C CCCGGAGCCC 3070 hom 123 het 46 0 40 6 C 3 4 105235 CASAVA_Build 6 15206866 1D TTACAAAAAG T/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 1 0 105236 CASAVA_Build 6 15219478 1I TATATTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 23 2 11 10 A 10 11 105237 CASAVA_Build 6 15221455 7D ATTTTAAAAT ATATCTA/------- TTTTGGTCAG 3070 het 3070 ref 21 11 8 4 ATATCTA 1 0 105238 CASAVA_Build 6 15227070 1I ATTTTTTAAC -/T TTTTCTTTAT 1940 het 1054 hom 8 3 4 1 T 4 5 105239 CASAVA_Build 6 15227377 4D TGCTGGGATT ACAG/---- ACAGGCACTG 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 ACAG 2 1 105240 CASAVA_Build 6 15230306 1I TGGCTTAACC -/T TTTTTTTTTT 2082 het 2082 ref 27 9 9 9 T 14 15 105241 CASAVA_Build 6 15230774 1D TTTGTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 47 het 21 0 16 5 T 10 9 105242 CASAVA_Build 6 15233944 1D GGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2425 hom 30 het 21 0 10 11 T 16 15 105243 CASAVA_Build 6 15242045 3D GTGCTGTGCA TGT/--- TTTTTTTTTT 2130 het 2130 ref 35 16 10 9 TGT 1 0 105244 CASAVA_Build 6 15244973 1D TTATTTAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1324 hom 26 6 11 10 T 12 11 105245 CASAVA_Build 6 15246133 1D TAATAATGAT G/- GGGAGGAAAG 2769 het 2769 ref 24 13 7 4 G 4 3 105246 CASAVA_Build 6 15248212 1D AATTTTACAA T/- TTTTTTTTTT 1479 het 396 hom 20 1 10 9 T 12 11 105247 CASAVA_Build 6 15256910 1D TTAATCCTTT A/- AAAAAAAAAA 1209 het 1209 ref 46 37 3 6 A 11 10 105248 CASAVA_Build 6 15268419 1D ACCCGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 1141 het 168 hom 9 2 4 3 T 15 14 105249 CASAVA_Build 6 15272235 3D ACTCCGTTTC AAA/--- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 19 10 8 3 A 7 4 105250 CASAVA_Build 6 15274820 2D15M2D GAATTTCGTC TTTTTTTTTTTTTTTAATT/--TTTTTTTTTTTTTAA-- TTTTTTATTT 2603 het 2297 hom 21 11 9 3 N/A 0 0 105251 CASAVA_Build 6 15283676 1D TTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2448 het 2448 ref 31 14 7 10 T 16 15 105252 CASAVA_Build 6 15291446 6I AAGCCCAGAC ------/TTTATT TTTATTTTTT 3070 het 2996 hom 15 7 8 0 TTTATT 1 2 105253 CASAVA_Build 6 15294687 1I AGTCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 1921 het 1921 ref 17 8 6 3 A 11 12 105254 CASAVA_Build 6 15325177 3I CTCAATAAAT ---/TGA TGAAACTTCT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 TGA 1 2 105255 CASAVA_Build 6 15334360 3D TCAAGCCATT CTC/--- CTGCCTCAGC 2158 het 1402 hom 15 6 6 4 CTC 1 0 105256 CASAVA_Build 6 15355744 1I TAAATAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 41 2 30 9 T 11 12 105257 CASAVA_Build 6 15359133 1D AAAATGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 18 15 T 14 13 105258 CASAVA_Build 6 15365562 2D ATCACATACT GG/-- ACATTCCTCT 3070 het 3070 ref 42 26 14 3 G 2 0 105259 CASAVA_Build 6 15373577 1D GGTTTGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1837 hom 30 9 12 9 A 13 12 105260 CASAVA_Build 6 15386096 1I AAAGAAATCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 8 9 105261 CASAVA_Build 6 15387302 1D CTGTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1652 het 1652 ref 30 19 4 8 A 13 12 105262 CASAVA_Build 6 15395338 1D CTCTCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 21 11 8 4 A 9 8 105263 CASAVA_Build 6 15396521 3I GGTGGGGGTT ---/GGG GGAGAAAAGG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 G 2 5 105264 CASAVA_Build 6 15406128 1D GTGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 11 10 105265 CASAVA_Build 6 15419946 1D AAGGTAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 T 12 11 105266 CASAVA_Build 6 15422545 1D ACAATAATTT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 8 7 105267 CASAVA_Build 6 15437402 1D TTTTTTTTTT G/- GGGGATTATT 3070 het 788 hom 43 2 33 8 G 5 4 105268 CASAVA_Build 6 15439549 6D CTGCCTCAAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 2792 het 2792 ref 27 10 9 8 AAAAAC 3 2 105269 CASAVA_Build 6 15442542 1I GGAACATGAG -/C CCCTAGAGTT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 C 3 4 105270 CASAVA_Build 6 15450183 10D ATATATTTTT ATCTTAGAAC/---------- ATTTGGGCTT 3070 het 3070 hom 43 16 23 6 ATCTTAGAAC 1 0 105271 CASAVA_Build 6 15460248 1D GTTGATATTT C/- TTCCTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 C 1 0 105272 CASAVA_Build 6 15465172 6D TGCAGTGAGC TGAGAG/------ TGCACCACTG 3070 hom 78 het 30 0 26 5 TGAGAG 1 0 105273 CASAVA_Build 6 15467707 2D ATCTCATGAC TA/-- TATTTTTAGC 3070 het 3070 ref 27 15 10 4 TA 2 1 105274 CASAVA_Build 6 15473831 1I CAGCTGCAGC -/T TTTTTTTTTT 2728 het 2728 ref 24 11 7 6 T 13 14 105275 CASAVA_Build 6 15486048 6D45M3D GAGCCAGGAT GGATAAGTCCATGCAAGATGTATGTTTTTTTTTCAATTTTTTTTCTTCTTCTTT/------GTCCATGCAAGATGTATGTTTTTTTTTCAATTTTTTTTCTTCTTC--- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 21 18 12 11 N/A 0 0 105276 CASAVA_Build 6 15489141 1I AAGTGACCTT -/C CCTCTACGAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 C 2 3 105277 CASAVA_Build 6 15491515 1D CAGGTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 47 3 25 19 T 15 14 105278 CASAVA_Build 6 15496799 2D ATATTATAAA AT/-- ATATATATAT 548 het 548 ref 5 2 3 1 AT 6 5 105279 CASAVA_Build 6 15499356 1I AGTTGGTTTG -/C CCCCCTTCTA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 C 5 6 105280 CASAVA_Build 6 15501415 1I TGACAAAGTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 7 8 105281 CASAVA_Build 6 15508871 5D CCTTTTTCTC ATTTT/----- AATTTATCAG 2247 het 2247 ref 20 9 8 3 ATTTT 1 0 105282 CASAVA_Build 6 15519396 1D GAAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 10 9 105283 CASAVA_Build 6 15522755 6I ACTCAAAACC ------/AAAACT GGTATATTTT 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 AAAACT 0 1 105284 CASAVA_Build 6 15529622 1D GTTAGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1322 het 1322 ref 40 28 3 9 A 13 12 105285 CASAVA_Build 6 15532504 3D TCTTCAAGCC CTT/--- CTTGGCTTAT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CTT 2 1 105286 CASAVA_Build 6 15537477 1D TTTCTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 55 34 3 18 T 12 11 105287 CASAVA_Build 6 15545023 1I TTTCTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 10 11 105288 CASAVA_Build 6 15545254 1I AGCCGTGTGA -/T TTTTACGGTT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 T 4 5 105289 CASAVA_Build 6 15570387 1I AATGCAAGTC -/A ACCTTACAGA 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 A 1 2 105290 CASAVA_Build 6 15581260 4I GTGAATACCC ----/GTAA GTGTTAGGAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 GTAA 0 1 105291 CASAVA_Build 6 15581725 8D GATGTGCGTG CCCCCCCC/-------- CCCCCCCCGC 2368 het 52 hom 12 1 7 6 C 16 8 105292 CASAVA_Build 6 15590132 5D CCTGCCTCCC TCTCG/----- TCTCCGTTTC 3070 het 3070 ref 47 30 16 4 TCTCG 1 0 105293 CASAVA_Build 6 15619409 4I AGAGCCTCTC ----/CCAT GTGTGCTCGG 3070 hom 63 het 26 0 20 6 CCAT 0 1 105294 CASAVA_Build 6 15621379 2D TGTGGGGTGC GT/-- GTGTCCCCTC 3070 hom 39 het 15 0 11 4 GT 3 2 105295 CASAVA_Build 6 15622387 1I ATGGCTGTGG -/C CCTCGCCATG 3070 hom 90 het 34 0 28 6 C 2 3 105296 CASAVA_Build 6 15623258 2D CTCTCTGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 49 1 39 10 T 12 10 105297 CASAVA_Build 6 15633089 1I CCTTTTACAC -/T TTCCTTAATC 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 2 3 105298 CASAVA_Build 6 15653701 2D TCCAACACAG AC/-- ACACACACAC 1385 het 1385 ref 50 40 4 7 AC 7 6 105299 CASAVA_Build 6 15684337 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 752 hom 30 3 21 6 T 10 11 105300 CASAVA_Build 6 15728118 1D GTCTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 1300 het 1300 ref 25 18 6 1 T 12 11 105301 CASAVA_Build 6 15747049 1D TGGCCAGTAC T/- TTTTTTTTTT 2416 het 495 hom 24 2 10 12 T 17 16 105302 CASAVA_Build 6 15754718 1I CCAAAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 31 1 29 1 A 10 11 105303 CASAVA_Build 6 15757205 1I TAGCTATAAT -/A AAAAAACAAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 7 105304 CASAVA_Build 6 15758616 2I CCTCAGCCCC --/CT GAGTAGCTAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CT 0 1 105305 CASAVA_Build 6 15759622 1D TAGCCAACTG A/- AAAAAAAAAA 2847 het 2847 ref 37 20 8 9 A 13 12 105306 CASAVA_Build 6 15760749 1D GATAAGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 25 1 21 3 T 12 11 105307 CASAVA_Build 6 15762120 1D TGCCTCAACT A/- ATGCATGGTA 3070 hom 147 het 51 0 49 2 A 2 1 105308 CASAVA_Build 6 15777021 1I ATTAGTGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 33 1 23 9 A 11 12 105309 CASAVA_Build 6 15792724 1I ATCCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 639 hom 38 3 27 8 A 11 12 105310 CASAVA_Build 6 15808475 8D TCTTTTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 17 9 105311 CASAVA_Build 6 15811326 5D ATGTTTACAA ATTAT/----- ATTATATTAT 3070 hom 66 het 24 0 23 3 ATTAT 3 2 105312 CASAVA_Build 6 15811593 1D AGTTGCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 34 0 27 7 A 15 14 105313 CASAVA_Build 6 15815152 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAACAAC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 7 6 105314 CASAVA_Build 6 15826881 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 35 0 26 9 TG 6 7 105315 CASAVA_Build 6 15827281 1D CTCTTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 551 hom 30 4 15 11 T 17 16 105316 CASAVA_Build 6 15836378 1D AGTTAAGTTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 368 hom 27 1 17 9 G 10 9 105317 CASAVA_Build 6 15837267 1D AAACCTGGAA G/- GGATCACAGA 3070 hom 168 het 60 0 56 4 G 3 2 105318 CASAVA_Build 6 15843359 1D AGAAAAGGCG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 46 hom 33 2 18 13 T 10 9 105319 CASAVA_Build 6 15846219 1D TTTGATCTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 50 het 20 0 17 3 T 10 9 105320 CASAVA_Build 6 15851458 3I GACAAAGAAT ---/CTC CTCTCCTTGA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 CTC 1 2 105321 CASAVA_Build 6 15852571 3D TTTTAATTCT TTG/--- TTCTTTGTTA 3070 het 3070 ref 23 10 10 4 TTG 1 0 105322 CASAVA_Build 6 15858705 3D GGACTGATGA CTT/--- CTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 CTT 2 1 105323 CASAVA_Build 6 15861543 2D GGCAAAACCC CT/-- CTCTCTACAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 9 CT 4 3 105324 CASAVA_Build 6 15861792 1I30M1I ATTAAAAAAC -AAAAAAAAAATTATGCTGTTTCTAGCCCCT-/AAAAAAAAAAATTATGCTGTTTCTAGCCCCTG GATTTAAGGA 3070 het 3070 ref 35 23 11 16 N/A 0 0 105325 CASAVA_Build 6 15869856 1D AAATTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 11 10 105326 CASAVA_Build 6 15879999 1I TGGTGTGGAC -/A GGGGCAAAGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 0 1 105327 CASAVA_Build 6 15882377 1D CATCCTCCTG C/- CTCAGGACCT 3070 het 3070 ref 48 26 18 5 C 2 1 105328 CASAVA_Build 6 15884338 1D GTCTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 A 13 12 105329 CASAVA_Build 6 15886262 1I CCCTGTTTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 19 15 8 A 9 10 105330 CASAVA_Build 6 15890120 1I TGTATTCATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 A 8 9 105331 CASAVA_Build 6 15890499 1I TGTGACTAAC -/A CATATTTTAT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 0 1 105332 CASAVA_Build 6 15892667 2I GTATGCAAAG --/TT TTTATTTTGG 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 3 5 105333 CASAVA_Build 6 15894159 1I GCCCACAGCT -/G GGGGGCGGGG 3070 het 2605 hom 38 13 11 14 G 5 6 105334 CASAVA_Build 6 15899467 11D TTCTTTTAAT ATATAACAGAC/----------- CTATAACAAA 3070 het 3070 ref 24 16 7 2 ATATAACAGAC 1 0 105335 CASAVA_Build 6 15909046 1D AAACTATTAT A/- GAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 A 1 0 105336 CASAVA_Build 6 15919510 1D AGCAACAGGT G/- GGGGGGTGGG 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 G 7 6 105337 CASAVA_Build 6 15923398 1I AGTCGTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 10 11 105338 CASAVA_Build 6 15927167 1D TAAAAAACAA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 56 het 24 0 19 5 C 10 9 105339 CASAVA_Build 6 15932759 1D CAAAACATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 A 11 10 105340 CASAVA_Build 6 15946759 1I AAAATTAGCT -/G GGCATGGTGA 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 G 2 3 105341 CASAVA_Build 6 15957069 2I TTTACCAAAT --/TA TGTCATTACT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TA 0 1 105342 CASAVA_Build 6 15964644 4I CATAGAAAAC ----/AGAT TGAAAAAATA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AGAT 0 1 105343 CASAVA_Build 6 15969503 3I TTAGTTACTT ---/TAG TAGACTGGTG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TAG 1 2 105344 CASAVA_Build 6 15971879 2I ATATAGCTAC --/AT GTGTTGATAT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AT 0 1 105345 CASAVA_Build 6 15981678 12D AATGAGAAAC AGCCCATCAAAA/------------ AGCCCATCAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 9 AGCCCATCAAAA 2 1 105346 CASAVA_Build 6 15985519 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 779 hom 16 3 11 3 A 13 12 105347 CASAVA_Build 6 15995201 1I TTTTTTCTTT -/A AATTTACCCT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 2 3 105348 CASAVA_Build 6 15999947 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 25 0 21 6 A 12 11 105349 CASAVA_Build 6 16000581 2I ACCTTGTCTC --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 11 105350 CASAVA_Build 6 16002063 1D TTGAAGATAA T/- TCACTCTCCC 3070 hom 114 het 41 0 39 3 T 2 1 105351 CASAVA_Build 6 16005450 1D TCCTAGGAAT G/- CCCTCAGTAC 3070 hom 47 het 33 0 24 9 G 1 0 105352 CASAVA_Build 6 16007005 1D6M6D TCTGTCAAAA TGTTTTAAGAGAT/-GCATTA------ TCACCACGAT 3070 het 3070 ref 44 29 17 3 N/A 0 0 105353 CASAVA_Build 6 16007475 1D TCGAGACCAG C/- CTGGGCAACA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 C 2 1 105354 CASAVA_Build 6 16015121 1D TTATCAAGAC A/- GGGGAATTAC 3070 hom 42 het 17 0 14 4 A 1 0 105355 CASAVA_Build 6 16017270 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 102 het 57 0 39 19 GT 10 9 105356 CASAVA_Build 6 16024802 3D CCGATAAAAT AGG/--- AGAGTTCCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AGG 1 0 105357 CASAVA_Build 6 16025457 1I CAAAAGGCAG -/C GTTTGGGCAC 3070 hom 66 het 24 0 19 5 C 0 1 105358 CASAVA_Build 6 16042240 15D TAGAGCTGAA GGCTCTGTGAGGATG/--------------- GGCTCTGTGA 3070 hom 96 het 37 0 31 9 GGCTCTGTGAGGATG 1 0 105359 CASAVA_Build 6 16044242 1D CTGGGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 49 1 30 18 T 14 13 105360 CASAVA_Build 6 16049857 1I AAGACCAGCC -/T GGACAACACG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 0 1 105361 CASAVA_Build 6 16051865 4D TGGCCCACAC GTCT/---- GTCTGTGTGT 3070 hom 115 het 44 0 36 8 GTCT 2 1 105362 CASAVA_Build 6 16054889 1D GCTTGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 34 0 27 8 T 11 10 105363 CASAVA_Build 6 16059916 2I TTGCATAGCG --/CC CCCCCCACCC 3070 hom 47 het 21 0 13 8 C 6 8 105364 CASAVA_Build 6 16062175 1D TGTAATATTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 8 7 105365 CASAVA_Build 6 16093145 1D AAATAAAACC T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 67 het 25 0 23 2 T 7 6 105366 CASAVA_Build 6 16094048 1D AGGAACAAAA G/- TGAGACATCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 0 105367 CASAVA_Build 6 16096548 1I TTTCAGGTAG -/C AGAGAAGGGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 0 1 105368 CASAVA_Build 6 16098236 1I TTGTCACCCT -/A GAAGCCCTAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 105369 CASAVA_Build 6 16117564 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 10 9 105370 CASAVA_Build 6 16131020 1I TTCACAAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 72 hom 32 1 22 9 T 9 10 105371 CASAVA_Build 6 16141524 1I AGTAAGCAAC -/A ATGAGGAAGA 3070 hom 60 het 26 0 19 7 A 1 2 105372 CASAVA_Build 6 16143846 1D AAGAGAGAGA G/- GAAAAAAAAG 3070 hom 44 het 25 0 16 9 G 2 1 105373 CASAVA_Build 6 16143875 4D GAAAGAAAAA GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 hom 42 het 29 0 15 14 GAAG 4 3 105374 CASAVA_Build 6 16143963 1D AGAGAGAAAG A/- AAGAAAGAAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 3 2 105375 CASAVA_Build 6 16145841 1D TGGGAGCAAG C/- CCCCCCAAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 7 6 105376 CASAVA_Build 6 16149908 1D ACTTAAGCTT A/- AAAAATCTTC 3070 hom 134 het 48 0 46 3 A 6 5 105377 CASAVA_Build 6 16151280 1D ATTAAAAAAA C/- TTTCATTATT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 C 1 0 105378 CASAVA_Build 6 16152885 5D CACAGCCCAG ACATA/----- ATGACATAGG 3070 hom 141 het 51 0 47 4 ACATA 1 0 105379 CASAVA_Build 6 16158408 4I TTTATTTTTC ----/ACTT ACTTATTTAT 3070 hom 105 het 38 0 33 5 ACTT 1 2 105380 CASAVA_Build 6 16176417 4I TGCAGAAATT ----/TGAA TGACCAACAT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TGAA 0 1 105381 CASAVA_Build 6 16186278 9I ACGTTCCCCT ---------/CTCATACAG CTAGGAGATA 3070 hom 168 het 58 0 55 4 CTCATACAG 0 1 105382 CASAVA_Build 6 16196538 1D GTAGGTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 34 1 29 5 A 11 10 105383 CASAVA_Build 6 16213753 2I TTAGTGTTGC --/TG TGTTTTATGT 3070 het 1668 hom 15 4 9 2 TG 1 2 105384 CASAVA_Build 6 16217907 2D CCCTGGACAC AT/-- ATTAATTATT 3070 het 3070 ref 37 23 9 7 AT 2 1 105385 CASAVA_Build 6 16224412 1I GTCTCAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 A 10 11 105386 CASAVA_Build 6 16246097 1D TCACTCCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 10 9 105387 CASAVA_Build 6 16247598 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 777 het 777 ref 15 10 2 3 A 15 16 105388 CASAVA_Build 6 16248566 1D AGTGTGACAT A/- ACCTTTTAGT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 2 1 105389 CASAVA_Build 6 16255078 1I ATGCGATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 13 13 A 14 15 105390 CASAVA_Build 6 16259567 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1771 hom 20 5 10 5 A 11 12 105391 CASAVA_Build 6 16325894 1I CTGTGGGCTT -/A CTGGTCTTAC 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 0 1 105392 CASAVA_Build 6 16329932 1I CAGGTGTGAA -/C CATGGCTCAG 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 C 1 2 105393 CASAVA_Build 6 16333619 1I ATCATGCTAC -/T ATAAAGACAC 3070 het 3070 hom 18 7 11 0 T 0 1 105394 CASAVA_Build 6 16334647 17I ACAAAAGAAC -----------------/AAATATTCCACAATATT AAAGGCAAGC 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 AAATATTCCACAATATT 0 1 105395 CASAVA_Build 6 16352309 1D ATGAAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2481 hom 34 7 16 11 T 13 12 105396 CASAVA_Build 6 16359109 3D AGACAATAAA TGT/--- TGTTGAGGAT 3070 het 3070 ref 33 13 12 9 TGT 2 1 105397 CASAVA_Build 6 16361827 1D CACCTCCACT G/- GGGGGGGGTC 2157 het 2157 ref 21 9 6 7 G 9 8 105398 CASAVA_Build 6 16375587 2D CTCAAAAAAC AA/-- AGAGCTGTAA 1967 het 1967 ref 18 9 6 5 A 3 1 105399 CASAVA_Build 6 16383822 1I TTGAAAAGGC -/A AAGAAAGGAT 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 A 2 3 105400 CASAVA_Build 6 16397888 2I CTTGAAGCTG --/TC TCTAGTGTAG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 TC 1 2 105401 CASAVA_Build 6 16397951 2D AGGGAGTGTC AG/-- AGTGTGGAGA 3070 het 3070 ref 34 14 12 10 AG 2 1 105402 CASAVA_Build 6 16407039 2I GTTTAAAGAC --/AA AAGTATACCT 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 A 2 4 105403 CASAVA_Build 6 16411577 1I CCTGAAGGCT -/C CCCCGCCCCA 1997 het 1997 ref 26 11 9 6 C 4 5 105404 CASAVA_Build 6 16413485 1I CTGGAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2670 hom 33 8 14 11 A 13 14 105405 CASAVA_Build 6 16418281 1I AAACTCCATT -/A AAAAAAAAAA 2970 het 2970 ref 26 15 8 3 A 11 12 105406 CASAVA_Build 6 16433329 1D CTTCCATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 28 0 17 11 T 13 12 105407 CASAVA_Build 6 16463771 1D TCACCCACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 26 1 14 11 T 12 11 105408 CASAVA_Build 6 16470956 1D AGGTTCTCTA T/- TCATATAGAT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 T 2 1 105409 CASAVA_Build 6 16473024 1I TTATTCAACA -/T TTTACGTGCC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 3 4 105410 CASAVA_Build 6 16509854 1I GTGGACACAC -/T TTTGAGTCTC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 3 4 105411 CASAVA_Build 6 16510664 1D TTAAAACTTA C/- GAGACAACTG 3070 hom 90 het 37 0 31 7 C 1 0 105412 CASAVA_Build 6 16521556 1I ACTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 T 10 11 105413 CASAVA_Build 6 16529866 1I ACGGGAGGGT -/G GGGGGGGGCG 2560 het 1890 hom 15 5 6 4 G 8 9 105414 CASAVA_Build 6 16534489 1D CTGGTGGGGA G/- GGTGGGGCAC 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 G 3 2 105415 CASAVA_Build 6 16538546 1D GAAGGATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 12 27 7 A 13 12 105416 CASAVA_Build 6 16539251 1D TCAGCACAGT C/- CGGAATGCAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 C 2 1 105417 CASAVA_Build 6 16558526 2D TCTTTTTCAC AT/-- GTTTGGGAGC 3070 het 3070 hom 54 23 27 5 AT 1 0 105418 CASAVA_Build 6 16561398 3D CAGTCTCATC ATT/--- GATAGAGGGG 3070 het 3070 ref 21 9 9 4 ATT 1 0 105419 CASAVA_Build 6 16598345 1D ACAAATGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 681 hom 36 4 17 17 A 17 16 105420 CASAVA_Build 6 16600769 1I AATACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 195 hom 38 3 28 7 T 11 12 105421 CASAVA_Build 6 16626335 2I CACGAAGAAA --/AC ACAACAGGTA 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 AC 1 2 105422 CASAVA_Build 6 16652102 1D AGTAACAGGG T/- TGTCACTTCG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 2 1 105423 CASAVA_Build 6 16659635 1D CTAAAGAAAT A/- AAACAGCTTG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 4 3 105424 CASAVA_Build 6 16676874 1D ACAACCAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 T 10 9 105425 CASAVA_Build 6 16679180 2I TAAGAGAAGT --/GA GACCTGTTTG 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 GA 1 2 105426 CASAVA_Build 6 16696274 1I ATAGATTCTG -/C CCTCACCTAC 3070 hom 120 het 43 0 39 4 C 2 3 105427 CASAVA_Build 6 16700068 1D GGTTAAAGCC A/- AAAAAAATCC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 8 7 105428 CASAVA_Build 6 16702069 4D GTGTGTGTGC ATAT/---- ATATATATAT 1475 hom 15 het 11 0 6 5 AT 11 9 105429 CASAVA_Build 6 16702368 2I TATTAGACTA --/AT ATATATATAT 3070 het 432 hom 25 1 24 0 AT 7 8 105430 CASAVA_Build 6 16714388 5D AATGACAATT AACTC/----- AAAGAGTTAT 3070 hom 111 het 43 0 37 10 AACTC 1 0 105431 CASAVA_Build 6 16714733 1D TGTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 11 10 105432 CASAVA_Build 6 16715299 14I GGTTTCACCA --------------/TGTTGGTCAGGCTG GTTTAAAACT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 TGTTGGTCAGGCTG 0 1 105433 CASAVA_Build 6 16731576 1D AACTTGGACC A/- AAATATTCAT 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 A 4 3 105434 CASAVA_Build 6 16737316 1I AAGTGTTCCC -/T TTTCTCCGCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 3 4 105435 CASAVA_Build 6 16738128 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 23 0 19 4 A 13 14 105436 CASAVA_Build 6 16742682 1D TGTATAACTC A/- AATGTTTTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 3 2 105437 CASAVA_Build 6 16744081 3D AAACACAAAG CGA/--- CGACGCCCAC 3070 hom 111 het 45 0 35 10 CGA 2 1 105438 CASAVA_Build 6 16744568 2I TAGTTTCCAA --/CT CTGGACCTCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CT 1 2 105439 CASAVA_Build 6 16758162 1I TTCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 236 hom 36 2 26 8 T 11 12 105440 CASAVA_Build 6 16766664 8I TGTGTGATTC --------/TTGATAAA TTGATAAATA 3070 hom 181 het 60 0 61 1 TTGATAAA 1 2 105441 CASAVA_Build 6 16770546 1D ATCAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 14 13 105442 CASAVA_Build 6 16775019 1I CAGCCATGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 663 hom 34 2 27 5 T 9 10 105443 CASAVA_Build 6 16781392 2I AGATAAAAAC --/GG AGTTGCTTTA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 0 2 105444 CASAVA_Build 6 16786478 1I TATTTTAATT -/C CTTTTGATTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 1 2 105445 CASAVA_Build 6 16793231 2I TCTACAGACA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 AC 8 9 105446 CASAVA_Build 6 16793367 1I GTCAATCTGT -/G TAAGTGTATT 3070 het 3070 ref 52 34 15 3 G 0 1 105447 CASAVA_Build 6 16794714 14I CATGCAACAC --------------/ACAGTTTTACGTGG ATTATGCCGA 3070 hom 129 het 45 0 44 2 ACAGTTTTACGTGG 0 1 105448 CASAVA_Build 6 16795726 1D CGCAAGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1268 hom 25 5 14 6 A 11 10 105449 CASAVA_Build 6 16800484 1D TTATATGATT A/- ATCTATTTGT 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 A 2 1 105450 CASAVA_Build 6 16800867 6D CACCACCAAC AACAAA/------ AACAATAGCA 3070 het 2885 hom 24 10 13 6 AACAAA 1 0 105451 CASAVA_Build 6 16802463 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1882 het 294 hom 15 4 9 2 T 16 14 105452 CASAVA_Build 6 16812670 15I TTGCCCAGGG ---------------/AAGTAAGCCATAATT ACTGCCATAA 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 AAGTAAGCCATAATT 0 1 105453 CASAVA_Build 6 16816603 2I AATTCCCCAC --/AT GTCTGTGAAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AT 0 1 105454 CASAVA_Build 6 16817236 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 31 4 16 11 A 13 12 105455 CASAVA_Build 6 16820188 4I AAGTACTGAC ----/TGAA TGATTCCATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TGAA 0 1 105456 CASAVA_Build 6 16824440 1I TCTTAGCCCC -/T AGCCCCATCC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 0 1 105457 CASAVA_Build 6 16832003 1D AAAAGCCATT A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 A 7 6 105458 CASAVA_Build 6 16859799 1D ACAACAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 48 1 38 9 A 13 12 105459 CASAVA_Build 6 16861354 2D TCAACAGCCA AC/-- AAAGTAAGGG 3070 het 3070 ref 40 18 17 6 AC 1 0 105460 CASAVA_Build 6 16862098 5D4M2D CACTAAACTT TCCACTAAACT/-----TAAA-- TTATTTAAAT 1493 het 1493 ref 41 11 6 26 N/A 0 0 105461 CASAVA_Build 6 16879797 1I CCAATTTGCC -/A AAAAATCCAG 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 A 5 6 105462 CASAVA_Build 6 16880430 1D AGGGCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2571 hom 25 6 10 9 T 15 14 105463 CASAVA_Build 6 16882305 1I GTGCATCTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 26 11 9 A 9 10 105464 CASAVA_Build 6 16901803 1D GTGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 9 105465 CASAVA_Build 6 16915611 1D ATGAGGAGGG A/- GGAGAACGTG 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 1 0 105466 CASAVA_Build 6 16934939 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2098 het 926 hom 28 4 8 16 A 15 14 105467 CASAVA_Build 6 16963769 2D TTATGCTAGA AT/-- AGAATCAAGG 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 AT 1 0 105468 CASAVA_Build 6 16965836 1D AAGGCACAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 10 9 105469 CASAVA_Build 6 16996415 15I TCCTCCAGAA ---------------/CCTCCTCCTCCAGAT CCTCCTCCTC 1921 het 1522 hom 16 8 5 3 CCTCCTCCTCCAGAT 0 1 105470 CASAVA_Build 6 17008627 2D TCCCAGAAAC TG/-- TGAATATGTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 6 TG 2 1 105471 CASAVA_Build 6 17010399 2D GACTCTTACA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 59 hom 30 2 19 9 T 11 9 105472 CASAVA_Build 6 17012233 2D TATGTACATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 32 8 18 7 TA 8 7 105473 CASAVA_Build 6 17014412 1D TTTAAAAAAG T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 7 6 105474 CASAVA_Build 6 17015523 2I TATTTAAACC --/AG AGTTATTCTA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 AG 1 2 105475 CASAVA_Build 6 17016776 6I GAGAAGGCTG ------/TTTAAC TTTAATTCAT 3070 het 3070 ref 28 11 12 6 TTTAAC 0 1 105476 CASAVA_Build 6 17035409 1D TGTTCCCTTT A/- AAATTGGTCA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 4 3 105477 CASAVA_Build 6 17037982 1I ATACTATTTC -/T TTATGGAGGC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 2 3 105478 CASAVA_Build 6 17042701 36D AAAAAACTAC ATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------ ATATATATAT 3070 hom 30 het 11 0 11 5 AT 26 8 105479 CASAVA_Build 6 17051085 1D AGCTGCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 28 1 20 7 T 13 12 105480 CASAVA_Build 6 17051169 1I AATGACTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 A 9 10 105481 CASAVA_Build 6 17052053 1I TTATCAGGTT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 105482 CASAVA_Build 6 17053266 4D TTTTTTTTCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2434 hom 11 het 23 1 14 8 T 21 17 105483 CASAVA_Build 6 17060037 1I TCCATTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 353 hom 29 1 24 4 T 10 11 105484 CASAVA_Build 6 17061498 9I ATCTAATGAG ---------/TTTTTATTT TTGTTATTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TTTTTATTT 0 1 105485 CASAVA_Build 6 17069011 2D TGACTCCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 45 3 27 17 A 12 10 105486 CASAVA_Build 6 17072128 1I TAGTAACCCT -/G TGCTTAGGTA 3070 het 3070 ref 55 28 22 5 G 0 1 105487 CASAVA_Build 6 17074407 1D TTTAGTAGAT A/- ACGGGGTTTC 682 het 682 ref 14 9 2 3 A 2 1 105488 CASAVA_Build 6 17113290 1I AAAAAAAAGC -/A AACTTCACTT 3070 het 310 hom 36 1 25 10 A 2 3 105489 CASAVA_Build 6 17118791 5I TTAAAAAAAC -----/TTTTA TTTTAGGTTG 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 TTTTA 1 2 105490 CASAVA_Build 6 17122959 2I TATTTGACAT --/AC ATATGCATTG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AC 0 1 105491 CASAVA_Build 6 17125007 1D CATTCATCTA C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 C 1 0 105492 CASAVA_Build 6 17125516 1D CCCAAAGCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 27 3 11 14 A 15 14 105493 CASAVA_Build 6 17127873 1I GAAATAATAC -/A AAACATGCAC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 3 4 105494 CASAVA_Build 6 17136499 4D GACTGGTCTA AGAC/---- AGACAGAAAG 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 AGAC 2 1 105495 CASAVA_Build 6 17145277 1D GGAGTGGATG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 9 8 105496 CASAVA_Build 6 17146861 7I TTAGTTTGAC -------/ACATTCT ATGTAAAACC 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 ACATTCT 0 1 105497 CASAVA_Build 6 17147031 1D AAAGTTTCCT C/- CACGTTCCGC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 C 2 1 105498 CASAVA_Build 6 17152344 3I TGTGAGATAA ---/AAT AATAATTTCG 3070 het 3070 ref 54 26 24 4 AAT 2 3 105499 CASAVA_Build 6 17152566 1I18M2D ACTAAAAGCG -TTTTTTTTTAATTTTCACAT/TTTTTTTTTTAATTTTCAC-- GTTCTCCCCA 3070 het 3070 ref 43 24 19 5 N/A 0 0 105500 CASAVA_Build 6 17161974 1I CTATGAAAGT -/G TAGGGACTTT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 G 0 1 105501 CASAVA_Build 6 17162543 1D TTTTGGTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 336 hom 30 1 25 4 T 10 9 105502 CASAVA_Build 6 17172402 3D AAATTAAGAA AAT/--- AATTTCATGT 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 AAT 2 1 105503 CASAVA_Build 6 17176223 3D GGCAGCAAAA GTG/--- GGGGAATAGG 3070 het 3070 ref 50 25 18 8 GTG 1 0 105504 CASAVA_Build 6 17183977 1I AATGGAAAGC -/A AAAAAAAAAG 2522 het 2522 ref 19 11 6 2 A 9 10 105505 CASAVA_Build 6 17199344 1D TTACTCCCGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 T 10 9 105506 CASAVA_Build 6 17201632 8D CCTGCAGACA CCAGATAC/-------- CCAGATACCC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 CCAGATAC 3 2 105507 CASAVA_Build 6 17209848 1D CTGAGGTCGC T/- TTTGTGCCAC 3070 hom 100 het 41 0 31 11 T 4 3 105508 CASAVA_Build 6 17215622 1I TAAAATTGAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 7 8 105509 CASAVA_Build 6 17216557 2I TCTCAATTCC --/AA CGTGGGCATT 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 A 0 2 105510 CASAVA_Build 6 17225275 1I GGAAATTACC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 8 9 105511 CASAVA_Build 6 17244955 1I AAAAAAAAAA -/C AGAAAAGAAA 3070 het 173 hom 27 4 13 10 C 0 1 105512 CASAVA_Build 6 17255265 1I AGTGGATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 813 hom 45 2 37 6 T 10 11 105513 CASAVA_Build 6 17264326 1I CCTCTGCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 T 9 10 105514 CASAVA_Build 6 17270151 1I ATGGAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 877 hom 37 2 24 11 A 10 11 105515 CASAVA_Build 6 17277634 1D TACTGTATTC A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 8 7 105516 CASAVA_Build 6 17278970 1D TTAATTTACC T/- GCTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 39 23 10 7 T 1 0 105517 CASAVA_Build 6 17285498 1D AAGACCTTTA T/- TTCTTGGACA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 3 2 105518 CASAVA_Build 6 17298221 8D GTCAAATGCT GTTGATAG/-------- GTTAGGTAAG 3070 het 3070 ref 49 23 22 7 GTTGATAG 1 0 105519 CASAVA_Build 6 17347481 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGAAAGAA 702 het 702 ref 37 11 7 19 AAG 0 1 105520 CASAVA_Build 6 17348409 1I GCCCCGTTGG -/C CCAGGCTGGA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 C 2 3 105521 CASAVA_Build 6 17373144 1D AATAGTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 11 10 105522 CASAVA_Build 6 17380147 1D CATAATTTCT A/- AAAAAAAAAA 2122 het 936 hom 35 8 10 18 A 17 16 105523 CASAVA_Build 6 17385280 1D CTCACTGTTT A/- AAAGACTTAA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 A 4 3 105524 CASAVA_Build 6 17403382 3I CCACAATGAT ---/GTG GTAATATCTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GTG 0 1 105525 CASAVA_Build 6 17407162 2I GGATAATTTT --/TG TTTGTGTGTG 3070 het 829 hom 34 2 26 6 TG 0 1 105526 CASAVA_Build 6 17418770 1D TTTATTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1691 hom 29 8 13 8 T 11 10 105527 CASAVA_Build 6 17425907 2D TTTTCTTAGG AA/-- AAAAAAAAGC 3070 hom 57 het 25 0 19 7 A 10 8 105528 CASAVA_Build 6 17434720 15D TTAAGGTTGT GGAGGAGACATCCGA/--------------- GGGGGCCCGT 3070 het 3070 ref 35 22 19 1 GGAGGAGACATCCGA 1 0 105529 CASAVA_Build 6 17440102 3I AAAAAAAGAC ---/AAA AAAAAAAAAA 2498 het 2498 ref 26 12 10 4 A 12 15 105530 CASAVA_Build 6 17461036 1D ATTAACTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 11 5 T 11 10 105531 CASAVA_Build 6 17474867 1I ACTTATAATA -/C CTAATAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 1 2 105532 CASAVA_Build 6 17476588 1D GACCTGAGCA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 84 het 38 0 29 10 T 8 7 105533 CASAVA_Build 6 17486005 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 33 het 19 0 12 7 AC 10 9 105534 CASAVA_Build 6 17491180 1D CACCTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2921 hom 21 8 9 4 T 12 11 105535 CASAVA_Build 6 17496795 2D CCCTTTCCTT AG/-- GATTGTGAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 5 AG 1 0 105536 CASAVA_Build 6 17498088 3D CAAGACAATT CTC/--- CTTCTTCCAC 2246 het 2246 ref 18 9 5 5 CTC 1 0 105537 CASAVA_Build 6 17516398 4D CAGGCTGTAC AAGA/---- AACATCTGTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 AAGA 1 0 105538 CASAVA_Build 6 17540930 4I CCTCCACCCC ----/CTTG CTTGCTTGCT 3070 hom 75 het 44 0 24 20 CTTG 3 4 105539 CASAVA_Build 6 17547466 1I GATCCAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 38 4 24 10 T 12 13 105540 CASAVA_Build 6 17550934 1I CCCATCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1069 hom 26 3 18 5 T 12 13 105541 CASAVA_Build 6 17559442 1D TCTTCTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 12 11 105542 CASAVA_Build 6 17563494 1D ACTGGTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 10 10 A 12 11 105543 CASAVA_Build 6 17569429 1D CTTTGAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 11 10 105544 CASAVA_Build 6 17589663 1I ACAAAAAAAA -/T CTTTTGTTCA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 0 1 105545 CASAVA_Build 6 17614848 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 29 0 20 10 A 12 11 105546 CASAVA_Build 6 17628329 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTGATA 3070 het 3070 ref 37 16 19 2 T 7 6 105547 CASAVA_Build 6 17632285 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 5 A 22 11 105548 CASAVA_Build 6 17649937 1D ACTATATTTA C/- CCTACTCTGC 3070 hom 114 het 41 0 39 5 C 3 2 105549 CASAVA_Build 6 17661587 1D TCACGCCTGT A/- AATGCCAGCA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 3 2 105550 CASAVA_Build 6 17665207 2I AGAGTTTATA --/TT AAGGACCAAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 0 2 105551 CASAVA_Build 6 17665382 1D GAAGAAATCA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 8 7 105552 CASAVA_Build 6 17672663 1I ACCTTAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 9 10 105553 CASAVA_Build 6 17674014 2D CTTTCTTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 23 1 13 9 A 14 12 105554 CASAVA_Build 6 17675386 1D TATGAAAACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 16 12 4 T 10 9 105555 CASAVA_Build 6 17687922 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 940 hom 16 2 12 2 T 11 10 105556 CASAVA_Build 6 17702295 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 34 0 23 12 A 15 13 105557 CASAVA_Build 6 17703824 1I TCTATTTCTT -/C CCCCCCCCCC 1398 het 108 hom 19 2 6 11 C 11 12 105558 CASAVA_Build 6 17704396 2D AGATTATAAC AG/-- AGCTGAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 AG 2 1 105559 CASAVA_Build 6 17710690 3D TAAATATTTT TTA/--- TTAAGTTGTA 3070 het 3070 ref 28 15 10 6 TTA 2 1 105560 CASAVA_Build 6 17713679 1I TACTTTTCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 8 9 105561 CASAVA_Build 6 17724493 1I GGGGTCGGGT -/G GGGGGGGGAG 940 het 940 ref 20 9 6 5 G 8 9 105562 CASAVA_Build 6 17741057 1D TGAACTTCCT A/- AAAAAAAAAA 658 het 658 ref 22 12 3 8 A 17 16 105563 CASAVA_Build 6 17743190 1D ATTAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 32 1 22 9 A 12 11 105564 CASAVA_Build 6 17750053 2I CAGAGCGAGA --/CT CTGTCTCAGA 3070 hom 56 het 23 0 18 5 CT 1 2 105565 CASAVA_Build 6 17753678 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1755 het 1755 ref 33 12 9 12 T 15 14 105566 CASAVA_Build 6 17757013 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 A 13 12 105567 CASAVA_Build 6 17757781 3I ATATACTACA ---/GTT GTTGTACTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 GTT 1 2 105568 CASAVA_Build 6 17763669 1D TTATTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 22 1 10 11 T 13 12 105569 CASAVA_Build 6 17784648 4I TATGCTTTAG ----/AATA AATTTAATGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AATA 0 1 105570 CASAVA_Build 6 17789612 1I CTGGCTAACA -/T GGTGAAACCC 2641 het 121 hom 12 1 8 3 T 0 1 105571 CASAVA_Build 6 17790232 2D AGCCTGGGCA AC/-- ACAGTGAGGC 3070 het 2678 hom 25 8 15 2 AC 2 1 105572 CASAVA_Build 6 17797282 1D TACAAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 2904 het 2904 ref 32 17 7 8 A 12 11 105573 CASAVA_Build 6 17803193 1I TGTCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2325 hom 28 10 10 8 A 11 12 105574 CASAVA_Build 6 17805281 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1135 hom 16 5 10 1 A 13 12 105575 CASAVA_Build 6 17810055 2I GGGGGGGGGG --/AA AAAAAAGCTA 1160 het 146 hom 14 2 10 2 A 6 8 105576 CASAVA_Build 6 17821305 1I CAACATGTAG -/A TTTTTTTTCC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 0 1 105577 CASAVA_Build 6 17828263 1D ATAACTTTTT G/- TATATGTCCT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 G 1 0 105578 CASAVA_Build 6 17830581 1I GGCTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 2792 het 840 hom 37 12 15 10 C 0 1 105579 CASAVA_Build 6 17832762 5I AGCAATATTT -----/CTTGA CTTGACTCAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CTTGA 1 2 105580 CASAVA_Build 6 17838130 1I TATTTTTAGT -/A AGAGTTTTCA 3070 het 3070 hom 65 30 29 6 A 1 2 105581 CASAVA_Build 6 17840805 3D AACTCATGTC CTT/--- CATCAGTTCT 3070 het 3070 ref 43 23 20 1 CTT 1 0 105582 CASAVA_Build 6 17859565 3D GTGCCCGGCC TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 TTG 3 2 105583 CASAVA_Build 6 17868452 1D CATTCTATAA C/- CTTTTCTGCA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 C 2 1 105584 CASAVA_Build 6 17868788 1I TAGTAAGTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 422 hom 38 1 32 5 A 9 10 105585 CASAVA_Build 6 17877898 2D GGCTGTGCAC CA/-- CAGTGATAAG 3070 hom 132 het 47 0 43 5 CA 2 1 105586 CASAVA_Build 6 17878572 7D ATAAACAGGA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 28 0 10 20 T 23 16 105587 CASAVA_Build 6 17881016 1D TGCGAGCCTC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 7 6 105588 CASAVA_Build 6 17886047 1D TATCAAAAAT A/- TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 1 0 105589 CASAVA_Build 6 17887454 29D AGCATATATA TATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTT/----------------------------- TTTTTTTTTT 2686 hom 21 het 10 0 8 2 TATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTT 1 0 105590 CASAVA_Build 6 17903807 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2847 het 485 hom 18 4 11 3 A 15 16 105591 CASAVA_Build 6 17908814 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2181 hom 15 het 10 0 6 4 T 15 16 105592 CASAVA_Build 6 17922789 3I ATTAATTATT ---/ATC ATAACACAGG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 ATC 0 1 105593 CASAVA_Build 6 17923514 4I ACAGGGAGAC ----/AGTT AGGCCTCTGG 3070 het 152 hom 23 1 18 4 AGTT 0 1 105594 CASAVA_Build 6 17969614 8D TCCATTGTAT GAATAATG/-------- GATGCAATCA 3070 hom 111 het 37 0 37 4 GAATAATG 1 0 105595 CASAVA_Build 6 17973546 1I GAAAAAAAAA -/T AAATAAAGGC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 0 1 105596 CASAVA_Build 6 17977849 2D TGCCATTATA CC/-- CCCACTAGAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 5 3 105597 CASAVA_Build 6 17993326 2I GAAGATTCAT --/AA AAAAGAAAAA 2320 het 2320 ref 30 12 8 10 A 4 6 105598 CASAVA_Build 6 17995342 1I AGTGACATAT -/G GCCAGTCTGG 3070 hom 156 het 59 0 50 9 G 1 2 105599 CASAVA_Build 6 18021433 1D GATTACGGGA G/- GAGCAGGGAG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 G 2 1 105600 CASAVA_Build 6 18034867 3D TCGGACTAAT AAG/--- AAGGAGACTG 3070 hom 49 het 19 0 16 4 AAG 2 1 105601 CASAVA_Build 6 18039684 1D AAGGTACCCT A/- AAAACTCACA 3070 het 3070 hom 44 13 27 5 A 5 4 105602 CASAVA_Build 6 18045950 14D ATTTCTTTCC TTTTTTGTTTTTTT/-------------- TTTTTTGTTT 2881 het 1504 hom 27 9 10 13 TTTTTTGTTTTTTT 2 1 105603 CASAVA_Build 6 18046278 1D AATTTTAAAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 47 het 19 0 16 3 T 8 7 105604 CASAVA_Build 6 18049028 1D TGTAAATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 26 25 105605 CASAVA_Build 6 18051611 1D AAAACACAGA T/- TTTTTTTTTT 2664 het 883 hom 22 6 10 6 T 19 18 105606 CASAVA_Build 6 18061139 1D GACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 17 0 10 7 A 13 12 105607 CASAVA_Build 6 18063528 6D TGATTTAAAT ATAACA/------ ATAACAATAA 3070 het 3070 hom 48 19 22 10 ATAACA 3 2 105608 CASAVA_Build 6 18065100 1D TTCAATCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 T 11 10 105609 CASAVA_Build 6 18074654 2D AGACTCTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 1023 het 868 hom 29 5 6 19 T 20 18 105610 CASAVA_Build 6 18078586 2D CCAAGGCGGT GG/-- GGATCACTTG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 4 2 105611 CASAVA_Build 6 18082873 1D AAGCTTTTTT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 A 8 7 105612 CASAVA_Build 6 18092261 1I TAAGTGCCAG -/A TATGCAGGAG 3070 het 3070 hom 60 25 28 7 A 0 1 105613 CASAVA_Build 6 18092676 2I ACAATACTAG --/TT AATTTCAGCA 3070 het 3070 hom 52 23 22 7 T 0 2 105614 CASAVA_Build 6 18106695 1D CCCTGTGAAC T/- TTTTGGATCC 3070 het 3070 hom 53 22 25 6 T 5 4 105615 CASAVA_Build 6 18108393 4I ATCCATTAGT ----/TTGA TTGTTTGTTC 3070 het 3070 ref 50 21 22 7 TTGA 0 1 105616 CASAVA_Build 6 18108638 1D GACCCCATCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 10 9 105617 CASAVA_Build 6 18113075 3D TAAAAAATGG TCT/--- TCTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 TCT 2 1 105618 CASAVA_Build 6 18141960 1I CCACCAATGA -/T TTGGAAGAGT 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 T 2 3 105619 CASAVA_Build 6 18149771 1D TGAATGCTGG T/- TTTTTTTTTT 1134 het 1134 ref 38 28 3 7 T 11 10 105620 CASAVA_Build 6 18170555 4I CCTGTGAGTC ----/TCTT TCTATTGTCT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 TCTT 0 1 105621 CASAVA_Build 6 18212532 1D AATCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2862 het 1824 hom 15 5 8 2 A 15 14 105622 CASAVA_Build 6 18214086 1D AAAATAGATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 18 10 7 1 A 9 8 105623 CASAVA_Build 6 18215170 3D CTCAAAAAAA AAC/--- AACAAAAAAC 227 het 227 ref 39 18 4 17 AAC 2 1 105624 CASAVA_Build 6 18235835 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 19 1 13 5 A 11 12 105625 CASAVA_Build 6 18242672 1I CAAGCAGGCC -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 141 het 49 0 48 1 A 7 8 105626 CASAVA_Build 6 18245337 1I GCCTAACCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 10 11 105627 CASAVA_Build 6 18245906 2D TTTAGAGATG AC/-- AAGGTATTTC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AC 1 0 105628 CASAVA_Build 6 18247944 1D TGAAATAATG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 100 het 40 0 34 6 A 9 8 105629 CASAVA_Build 6 18258230 1D GACATTACCT A/- CCTGGAGATA 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 A 1 0 105630 CASAVA_Build 6 18272167 4D AGTTCAGGTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 116 het 49 0 37 14 AT 8 6 105631 CASAVA_Build 6 18276886 1I CCTCAAACTC -/T TTTTCCATAG 3070 het 3070 ref 58 35 16 7 T 4 5 105632 CASAVA_Build 6 18278214 1I CCACCTCCCA -/G GTTCAAGCGA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 1 2 105633 CASAVA_Build 6 18298363 4D CTGTCTCGAG AAAA/---- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 A 11 7 105634 CASAVA_Build 6 18318553 17D CTTTCTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 2550 het 1515 hom 25 9 7 12 T 30 13 105635 CASAVA_Build 6 18323952 1D CACACTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1772 hom 38 14 11 13 T 15 14 105636 CASAVA_Build 6 18325279 16D CCCTTTTCTT CTTGGGCCAGAGACTC/---------------- CTTTCTGCTA 3070 het 3070 ref 30 16 11 7 CTTGGGCCAGAGACTC 1 0 105637 CASAVA_Build 6 18330082 2I AACTCAACTC --/TT TATGCATGAT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 1 3 105638 CASAVA_Build 6 18348823 4D GAATGAGAAA TTCT/---- TTGATTATGC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 TTCT 1 0 105639 CASAVA_Build 6 18351535 1I ACGTGTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1692 hom 56 5 40 11 T 10 11 105640 CASAVA_Build 6 18357221 2D CTCCTGTACC CA/-- CTCTCCATGA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 CA 1 0 105641 CASAVA_Build 6 18364204 1D ATCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 32 0 21 11 T 13 12 105642 CASAVA_Build 6 18376745 2D TTGAAGTTTT TA/-- TTTCTTTAAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 TA 1 0 105643 CASAVA_Build 6 18384589 4I TATTGATAGG ----/TGAA TGAATGAGTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TGAA 1 2 105644 CASAVA_Build 6 18384711 1I TTTAAATTAC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 7 8 105645 CASAVA_Build 6 18389916 16D CTTCTTTCTC CTTCTTCTTCGTTCTT/---------------- CTTCTTCCTA 3070 hom 83 het 27 0 27 6 CTTCTTCTTCGTTCTT 1 0 105646 CASAVA_Build 6 18395388 1D ACTCTGTTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 10 9 105647 CASAVA_Build 6 18397257 1I CACCTATCTT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 8 9 105648 CASAVA_Build 6 18398251 3D TCCTCCAACC AGG/--- TTAGCTCACT 3070 het 3070 hom 48 23 20 5 AGG 1 0 105649 CASAVA_Build 6 18400126 1D ACTATCTGGG T/- ATCCCATAGT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 T 1 0 105650 CASAVA_Build 6 18403388 2I CCTACTTTAG --/TT TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 6 8 105651 CASAVA_Build 6 18411693 1I ATTGAGGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 10 17 T 11 12 105652 CASAVA_Build 6 18411749 1D TCCACTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 9 10 T 12 11 105653 CASAVA_Build 6 18412498 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 13 12 105654 CASAVA_Build 6 18413676 1D TAAAATTCAA T/- TTTTTTTTTT 2533 het 861 hom 18 4 8 6 T 15 14 105655 CASAVA_Build 6 18419238 4D TTATATAAAT TCAA/---- TCAATCAATT 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 TCAA 3 2 105656 CASAVA_Build 6 18420294 3D AGTTTGAACT AGG/--- AGGTCAGTAG 3070 het 3070 hom 44 19 19 7 AGG 2 1 105657 CASAVA_Build 6 18429514 1D AGGTGTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 8 7 105658 CASAVA_Build 6 18429727 1D GATGCCTTAA T/- TTTTTTTTTT 1702 het 484 hom 20 5 6 9 T 17 16 105659 CASAVA_Build 6 18435987 1I GTAGAAAAGA -/G AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 G 0 1 105660 CASAVA_Build 6 18445687 2D CTGTAGAAAC AG/-- GGTCTCGCTT 3070 het 3070 ref 38 26 11 4 AG 1 0 105661 CASAVA_Build 6 18449001 1D CTAGTCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 22 14 5 T 12 11 105662 CASAVA_Build 6 18457166 4I TATATATCTA ----/GATT ATGTTGTCTA 3070 het 3070 hom 47 21 25 1 GATT 0 1 105663 CASAVA_Build 6 18461480 2I ACTTCATATG --/TA TATATGTGAA 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 TA 2 3 105664 CASAVA_Build 6 18469858 3D17M1I GTTGCTCTTC CCGCCCCCCCCCCCCCATTA-/---CCCACCCCCCCCCATTAT TTTTTTTTTA 3070 het 155 hom 18 2 13 5 N/A 0 0 105665 CASAVA_Build 6 18482500 1I AGAAAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2779 hom 28 7 13 8 T 12 13 105666 CASAVA_Build 6 18497017 1D TTGACTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 11 10 105667 CASAVA_Build 6 18516177 4D AATTTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 812 het 812 ref 27 10 6 11 TTTC 3 2 105668 CASAVA_Build 6 18518757 1D CAGCCACATG T/- GAGAACACAG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 1 0 105669 CASAVA_Build 6 18519545 1I ATAGGACCCT -/G AAAGTACAAA 3070 hom 26 het 14 0 9 5 G 0 1 105670 CASAVA_Build 6 18520770 1D CTTATCACAC A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 7 6 105671 CASAVA_Build 6 18524348 4D TGGAATGGTC AGTT/---- ACTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 AGTT 1 0 105672 CASAVA_Build 6 18531977 1I ACGAACAATC -/T CTTATTATTT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 0 1 105673 CASAVA_Build 6 18532820 1D TGTACCTAGG A/- ACATTACATT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 2 1 105674 CASAVA_Build 6 18532994 3I AAATATTTCT ---/AAG AAGAGCCTTG 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 AAG 1 2 105675 CASAVA_Build 6 18535178 3I CATATTTTTG ---/AGA AGGTCTCATT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 AGA 0 1 105676 CASAVA_Build 6 18535467 2D GGAACTCATA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 37 het 38 0 23 15 T 11 9 105677 CASAVA_Build 6 18536696 2I GCATCTGAAA --/TG TCTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 TG 0 1 105678 CASAVA_Build 6 18538295 1D AAAGTCCATG A/- CATTTATCGG 3070 het 3070 hom 37 10 24 4 A 1 0 105679 CASAVA_Build 6 18538697 2D CTTCTTGCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TC 10 9 105680 CASAVA_Build 6 18543620 4D TTAAAAAATG AATA/---- AATAGAGAAG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 AATA 2 1 105681 CASAVA_Build 6 18545116 1D TGTTGTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 433 hom 33 4 16 13 T 10 9 105682 CASAVA_Build 6 18548480 2I TTGGGGTAAC --/TT ATATAGCTTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 0 2 105683 CASAVA_Build 6 18548874 1D59M3I AGGAAAAAAG AAAAAAAACGTACAGAGCATGAAGAGGGGTAGAGTAGGAATGCTTGTTGGGGATACATAG---/-AAAAAAACGTACAGAGCATGAAGAGGGGTAGAGTAGGAATGCTTGTTGGGGATACATAGGTT GTTAATAGCA 3070 het 2871 hom 20 7 12 13 N/A 0 0 105684 CASAVA_Build 6 18549786 1D CTCAAATGTC T/- TTTTTGTAAT 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 T 6 5 105685 CASAVA_Build 6 18552679 1I AAATAGTTTT -/G TTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 G 0 1 105686 CASAVA_Build 6 18552884 1I30M1D TCCTTCATTT -AAAAAAAAGTGAAATAGGAAGTTGTCTTTCT/AAAAAAAAAGTGAAATAGGAAGTTGTCTTTC- TTTGCTGTCT 3070 het 3070 ref 51 39 25 3 N/A 0 0 105687 CASAVA_Build 6 18553235 1I TCTTTTAGTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 7 8 105688 CASAVA_Build 6 18553295 1I CTCAGTTTGA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 T 7 8 105689 CASAVA_Build 6 18554488 1I ACATTTCCTT -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 6 7 105690 CASAVA_Build 6 18575858 1I CTTATTTTTA -/T TTTTTATTTT 2910 het 2910 ref 32 15 10 7 T 5 6 105691 CASAVA_Build 6 18577424 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 12 11 105692 CASAVA_Build 6 18582688 1D CGACTTTGTT A/- ACAAAATTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 2 1 105693 CASAVA_Build 6 18590503 1D GTGTGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 43 0 29 15 T 11 10 105694 CASAVA_Build 6 18591574 18I TGTGTATGCT ------------------/TCTTCCTACTCCAGACTC TGGAGTAGGA 3070 hom 58 het 28 0 19 10 TCTTCCTACTCCAGACTC 0 1 105695 CASAVA_Build 6 18593895 5I ATGAAAGATA -----/GATTT GATTTTGAGC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GATTT 1 2 105696 CASAVA_Build 6 18595175 1I TTTTGGACCT -/G GGTATAAGTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 2 3 105697 CASAVA_Build 6 18602372 1D CACAGTAAAA G/- CATTCTTTGG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 G 1 0 105698 CASAVA_Build 6 18602921 1D CTAGGTTAGG T/- TATATAGATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 105699 CASAVA_Build 6 18603485 1I GAAAAAAAAA -/G GGGGGAAAGT 3070 het 631 hom 45 2 33 10 G 5 6 105700 CASAVA_Build 6 18606114 11D TCTTGTGCCT CAGCCTCCTGA/----------- GTAGCTGGGA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 CAGCCTCCTGA 1 0 105701 CASAVA_Build 6 18612563 1I TTTTCCCAAA -/G ACACTAGGAT 3070 hom 147 het 54 0 49 5 G 0 1 105702 CASAVA_Build 6 18615840 1I TTAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 25 1 23 1 A 12 13 105703 CASAVA_Build 6 18617115 3I AATCTCTCCT ---/TAC TACACCCTCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TAC 1 2 105704 CASAVA_Build 6 18625575 1I GCTCATTACC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 9 10 105705 CASAVA_Build 6 18632502 1D GTCTCCAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 776 hom 36 2 23 11 A 12 11 105706 CASAVA_Build 6 18635526 1D TATGAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 T 11 10 105707 CASAVA_Build 6 18646823 1I CCTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 28 1 17 10 T 11 12 105708 CASAVA_Build 6 18652041 1I CTTTTCATTC -/A AAGGAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 3 105709 CASAVA_Build 6 18654894 1I ATTTCACTAT -/A AAAAATCAAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 5 6 105710 CASAVA_Build 6 18657857 4I TAAAAAAAAT ----/AAAG AATCAACTAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAAG 0 1 105711 CASAVA_Build 6 18661454 6I CTGGCAGCAG ------/TTCTCT TTATGGAGAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TTCTCT 0 1 105712 CASAVA_Build 6 18664466 2D ATGCTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 47 0 32 16 T 13 11 105713 CASAVA_Build 6 18667833 3D AAGATATCAA AAT/--- AATTTTAATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAT 2 1 105714 CASAVA_Build 6 18670132 1D CCTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2650 hom 21 7 9 5 T 12 11 105715 CASAVA_Build 6 18671194 4D CTGTACAGCA GGTT/---- ACTGTACTGA 3070 hom 141 het 49 0 47 2 GGTT 1 0 105716 CASAVA_Build 6 18672640 1D AAAAAAAAAA C/- ACAAAAGAAT 3070 het 419 hom 14 1 10 3 C 1 0 105717 CASAVA_Build 6 18677818 1D ATAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 77 het 30 0 25 5 A 10 9 105718 CASAVA_Build 6 18682634 4I ATAATAAAAT ----/AAAA AAATAAGTAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 3 7 105719 CASAVA_Build 6 18683170 3D TTGGTTTTCT GAA/--- GAACCTCTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 4 GAA 2 1 105720 CASAVA_Build 6 18685609 1I CCTTAGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 25 1 21 3 T 11 12 105721 CASAVA_Build 6 18702680 1D GTACTTTGAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 10 9 105722 CASAVA_Build 6 18705097 18D TGAACTTGTC AAGGGTAAGTAAGTAAGT/------------------ AAGGGTAAGT 3070 het 3070 ref 52 25 20 11 AAGGGTAAGTAAGTAAGT 1 0 105723 CASAVA_Build 6 18712589 1D TTCTTTTCTG A/- AAAACATTTT 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 A 5 4 105724 CASAVA_Build 6 18717083 10D CGATCTCTGA AATGCCTTCC/---------- AGGTCTTTTC 3070 hom 72 het 26 0 24 4 AATGCCTTCC 1 0 105725 CASAVA_Build 6 18717309 3I ATCCCATATC ---/TGT TGAACATAGG 3070 hom 147 het 53 0 49 4 TGT 0 1 105726 CASAVA_Build 6 18727912 1D GCTGGTTGTT A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 58 het 31 0 25 6 A 8 7 105727 CASAVA_Build 6 18735396 12D AAATCTTGAG CAAAAACAACAA/------------ CAACAACAAC 3070 hom 99 het 35 0 34 5 CAAAAACAACAA 1 0 105728 CASAVA_Build 6 18741167 24D CTAACTGGAG GTTAGTCTTAGCCAAATGGAGACT/------------------------ GACAAACTCA 3070 hom 84 het 29 0 29 3 GTTAGTCTTAGCCAAATGGAGACT 1 0 105729 CASAVA_Build 6 18748295 1D GTCAAGGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 11 10 105730 CASAVA_Build 6 18757909 1I ACCTGGCTAC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 7 8 105731 CASAVA_Build 6 18773717 1I CCTGCCTCAG -/C CCCCCCAAGT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 C 6 7 105732 CASAVA_Build 6 18774237 1I AGTAAGTGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 882 hom 35 2 26 7 T 9 10 105733 CASAVA_Build 6 18777103 1I AATCAGTCAT -/A ATGTCAATTG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 1 2 105734 CASAVA_Build 6 18782387 18I TCATTCACAC ------------------/TTAGAGGTTTATCCCCAA TTATTGCTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTAGAGGTTTATCCCCAA 0 1 105735 CASAVA_Build 6 18785602 21I TGCTGCTGCT ---------------------/GAAAGATGCTCATGAATCCAA GAAACATTGC 3070 hom 120 het 44 0 39 8 GAAAGATGCTCATGAATCCAA 0 1 105736 CASAVA_Build 6 18787108 20I ATGTAAAGTG --------------------/GCTGCAAGTTCTTTATTGCA GCTCTCGTCA 3070 hom 82 het 30 0 26 6 GCTGCAAGTTCTTTATTGCA 0 1 105737 CASAVA_Build 6 18788011 1D TCCATATGCC A/- AAAAAAAAAA 2555 het 83 hom 30 1 16 13 A 19 18 105738 CASAVA_Build 6 18805068 1I TTTCATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 10 11 105739 CASAVA_Build 6 18815266 1I GGATCTGGGC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 8 9 105740 CASAVA_Build 6 18815483 1I TAATTATTTC -/T TTTTTTGTCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 6 7 105741 CASAVA_Build 6 18826633 4D TCTCTCTCTC TCTA/---- TCTGTGTGTG 3070 het 2828 hom 26 11 14 2 TCTA 1 0 105742 CASAVA_Build 6 18830338 4D CTCACCTCTC TCTT/---- TCTGTGCAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 5 TCTT 1 0 105743 CASAVA_Build 6 18830412 1D AATTAATATG A/- AAAAAGGCTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 A 6 5 105744 CASAVA_Build 6 18837581 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 9 8 105745 CASAVA_Build 6 18842871 1I AAAAAACATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 21 14 11 T 9 10 105746 CASAVA_Build 6 18845299 1D AAAAAAGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2754 hom 22 8 12 4 A 13 12 105747 CASAVA_Build 6 18875445 1D ATGTAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 14 13 105748 CASAVA_Build 6 18879660 9D GCAGAATATC CCGAGATTG/--------- CCGAGATTGC 3070 hom 100 het 35 0 32 7 CCGAGATTG 2 1 105749 CASAVA_Build 6 18880003 1I TGGTTCGTGG -/A AAAATTGCCT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 4 5 105750 CASAVA_Build 6 18880352 1I CCCAGATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1355 hom 34 6 18 10 T 14 15 105751 CASAVA_Build 6 18894885 1D GCAATTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 36 5 16 16 T 11 10 105752 CASAVA_Build 6 18898081 4D AGAGGTATTA ATTC/---- ACAATAAACC 3070 het 3070 hom 30 14 14 6 ATTC 1 0 105753 CASAVA_Build 6 18921692 5I ATTTTGAAAA -----/TCACT TCATTTAAAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 TCACT 0 1 105754 CASAVA_Build 6 18922455 1I TTAGGTGTGA -/T TTTTAAATGT 3070 het 3070 ref 53 33 18 2 T 4 5 105755 CASAVA_Build 6 18923296 2I AGTGTCTCTA --/CT CTCAGTGTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 1 2 105756 CASAVA_Build 6 18925705 1D TTGACTGTGC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 9 8 105757 CASAVA_Build 6 18940698 1D AACTGGAGAG A/- AAAACGATGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 5 4 105758 CASAVA_Build 6 18944192 4D CTTTTATCAA AAGT/---- AAGTACGACT 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 AAGT 2 1 105759 CASAVA_Build 6 18944675 2D TCTGTCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 32 0 20 12 A 15 13 105760 CASAVA_Build 6 18947164 3D TAAAAGAATC ATT/--- AGTCCGAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 ATT 1 0 105761 CASAVA_Build 6 18951112 8I ACCAATACTG --------/TTCCTATC TTCCTATCTT 3070 het 3070 hom 51 14 29 8 TTCCTATC 1 2 105762 CASAVA_Build 6 18952991 2D ACTTTAGTCT GA/-- TCCAATAATC 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 GA 1 0 105763 CASAVA_Build 6 18959883 3I TGTTTACTGC ---/TGA TAAGTGTGTC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 TGA 0 1 105764 CASAVA_Build 6 18962755 2D TTTATATGAC TT/-- TAATTCTGTT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 T 3 1 105765 CASAVA_Build 6 18962987 1I TGTATTTGTA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 8 105766 CASAVA_Build 6 18963222 1I AAAAAAAAAA -/T TATTTCTGTC 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 1 2 105767 CASAVA_Build 6 18963915 2I CAGATATTTG --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 10 105768 CASAVA_Build 6 18965174 1I ATGGTATATG -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 48 het 26 0 17 9 T 6 7 105769 CASAVA_Build 6 18965510 1I ACCATCATGG -/T GTGGGGGAGT 3070 hom 107 het 41 0 35 6 T 0 1 105770 CASAVA_Build 6 18970988 11D TAATCCTTTC CTTTTAGAATA/----------- CTTTTAGAAT 3070 het 3070 ref 22 11 10 3 CTTTTAGAATA 1 0 105771 CASAVA_Build 6 18982739 2I AAATCTACTC --/TT TTAGCAATTT 3070 hom 99 het 34 0 33 1 T 2 4 105772 CASAVA_Build 6 18982821 1I AGTTTAACTT -/A TTTTTTTCTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 105773 CASAVA_Build 6 18987729 1I AGTCTATATA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 8 9 105774 CASAVA_Build 6 19000289 1I TCTTTTTCTG -/T TACTGAAAGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 105775 CASAVA_Build 6 19006111 2D CTTTCACTCT TC/-- TCTCTCTCTC 800 het 800 ref 24 8 7 9 TC 7 6 105776 CASAVA_Build 6 19012356 1I CTGTAGCATG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 45 15 19 11 T 8 9 105777 CASAVA_Build 6 19018239 20D CCCCCTTCAA CTTCTGCTATGATTATGTTT/-------------------- CCTCAGGCCT 3070 het 3070 ref 40 24 16 3 CTTCTGCTATGATTATGTTT 1 0 105778 CASAVA_Build 6 19018836 1I GACACACTTC -/T TTTTTTTTTT 2788 het 2183 hom 20 6 7 7 T 11 12 105779 CASAVA_Build 6 19032135 1I GATTATTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 T 9 10 105780 CASAVA_Build 6 19040478 2D TGTTAAGGTA TT/-- TTGTCTGTAC 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 T 4 2 105781 CASAVA_Build 6 19040674 1I GAGAAAACTT -/A ACAATAAATA 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 A 1 2 105782 CASAVA_Build 6 19041235 1I TTCAGGAGGG -/A AAAAATATCT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 5 6 105783 CASAVA_Build 6 19042597 2D TCTATGGAAA AC/-- ACAAGAATGG 3070 het 3070 ref 38 22 16 2 AC 2 1 105784 CASAVA_Build 6 19043378 1D GATGAAATTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 12 11 11 A 9 8 105785 CASAVA_Build 6 19046195 1I AGCTGTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 9 10 105786 CASAVA_Build 6 19049063 2D TTATGATGAC TA/-- TGACTCACCC 3070 het 3070 hom 38 18 19 2 TA 1 0 105787 CASAVA_Build 6 19049643 1D CAAAATTCAG T/- TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 55 30 19 6 T 7 6 105788 CASAVA_Build 6 19050457 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 3070 het 3070 hom 25 8 12 7 AG 2 1 105789 CASAVA_Build 6 19051615 50D AAAAAAAAAA ACAGGGAAACAAAAACTGTAAAAATGGATTTCACTGTGACTCACTGAATT/-------------------------------------------------- CAGAAATAGT 3070 het 3070 ref 33 27 11 5 ACAGGGAAACAAAAACTGTAAAAATGGATTTCACTGTGACTCACTGAATT 1 0 105790 CASAVA_Build 6 19052250 1I CCATTATACC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 8 9 105791 CASAVA_Build 6 19055901 1I AGTGCATGGG -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 5 6 105792 CASAVA_Build 6 19059496 12I TCTCACCACA ------------/AAAAAATGACAC AAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 38 11 23 6 AAAAAATGACAC 0 1 105793 CASAVA_Build 6 19094970 1I AAAGTAAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 8 9 105794 CASAVA_Build 6 19100976 3D TAAAAATATG ACA/--- ACATTAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 ACA 2 1 105795 CASAVA_Build 6 19111320 1D GTCCAACATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 9 8 105796 CASAVA_Build 6 19114584 1I CTGATAACAC -/T TTTTCCTATC 3070 het 3070 hom 48 14 26 8 T 4 5 105797 CASAVA_Build 6 19118171 1I TGATGTGCTA -/C CTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 44 0 35 9 C 1 2 105798 CASAVA_Build 6 19132325 4D CAAAAAACAA AAAC/---- AAACAGAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 AAAC 2 1 105799 CASAVA_Build 6 19135902 1I GAACTCCTGG -/C CCTCAAGTAA 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 C 2 3 105800 CASAVA_Build 6 19139090 6D TCTTTTTTCT TTTTTC/------ TTTTTTTTTT 1668 het 1601 hom 23 7 13 6 TTTTTC 1 0 105801 CASAVA_Build 6 19175182 1D GTCCCTGCTC T/- CACTGCTGCC 3070 hom 129 het 48 0 42 6 T 1 0 105802 CASAVA_Build 6 19180333 3D AGTTATTGAT TAA/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 21 0 10 11 TAA 1 0 105803 CASAVA_Build 6 19183989 4D TTATTGAAAC AAAT/---- AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 AAAT 1 0 105804 CASAVA_Build 6 19186508 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 247 hom 34 2 28 5 A 10 9 105805 CASAVA_Build 6 19195330 4D CCATTAGAGT CAAA/---- CAATACATGT 3070 het 3070 ref 48 22 24 3 CAAA 1 0 105806 CASAVA_Build 6 19196401 1I AGAAAGTTGG -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 49 28 12 9 A 6 7 105807 CASAVA_Build 6 19197693 5D TAAAATCATT ATGAG/----- ATAAGTTATG 3070 het 3070 ref 32 19 11 4 ATGAG 1 0 105808 CASAVA_Build 6 19204496 1I TATTCTTTTT -/C TTTTTACAGA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 C 0 1 105809 CASAVA_Build 6 19213904 4D ATTTCTTTTT TTAA/---- TTAATTAATT 2357 het 132 hom 19 2 8 9 TTAA 3 2 105810 CASAVA_Build 6 19214613 2I TCTAATTCAC --/AT GAGATGGTAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 0 1 105811 CASAVA_Build 6 19221279 4D57M2D CTTTCCTTTC CCTTCCTTCCTTTCTTTCCTTCCTTCCCTCCCTCCCTCTTTCTTCTTCCTTCTTCCTTCTCTT/----CCTTCCTTTCTTTCCTTCCTTCCCTCCCTCCCTCTTTCTTCTTCCTTCTTCCTTCTC-- TTTCTTTTTC 3070 het 25 hom 20 1 19 19 N/A 0 0 105812 CASAVA_Build 6 19232728 1I GCATTGTAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 8 105813 CASAVA_Build 6 19234464 1D CATGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 28 1 17 10 A 13 12 105814 CASAVA_Build 6 19235343 1I AAACTAAAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 9 10 105815 CASAVA_Build 6 19250235 8I TTATGGGCGC --------/ATGAGTTT ATGAGTTTTC 3070 het 3070 hom 53 16 25 12 ATGAGTTT 1 2 105816 CASAVA_Build 6 19259338 1I ATTTCTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 T 10 11 105817 CASAVA_Build 6 19261112 1I GGGGGGGGGG -/A GAAATCCAAT 1884 het 276 hom 25 4 12 9 A 0 1 105818 CASAVA_Build 6 19270725 2D TTTTAATTAC TT/-- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 10 8 105819 CASAVA_Build 6 19276554 1I ATTCATTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 11 12 105820 CASAVA_Build 6 19279408 1D GGGTCTTTCT A/- AAATAGGCCA 3070 hom 114 het 39 0 39 2 A 4 3 105821 CASAVA_Build 6 19283014 1D ACTCAATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 29 2 18 10 A 15 14 105822 CASAVA_Build 6 19284432 1I ACCCATTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 251 hom 20 1 17 2 T 9 10 105823 CASAVA_Build 6 19287136 7D ACATTCTATC TCCAAGG/------- TATAGGATTC 3070 hom 99 het 35 0 33 5 TCCAAGG 1 0 105824 CASAVA_Build 6 19291071 4D GAAAACTAAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 20 1 12 7 T 20 16 105825 CASAVA_Build 6 19292906 1D TCGCCCCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 19 1 12 6 A 15 14 105826 CASAVA_Build 6 19293369 3I TAGCTAACAT ---/TAA TAATAATAAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TAA 3 4 105827 CASAVA_Build 6 19294371 4I CAGCTATATG ----/CTGT CTATGAGACA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CTGT 0 1 105828 CASAVA_Build 6 19294500 1I AAGTCTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 306 hom 35 1 28 6 A 10 11 105829 CASAVA_Build 6 19294721 1D TAAAAATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 20 1 18 2 A 11 10 105830 CASAVA_Build 6 19306771 1D CATTCTGTAG T/- TTGCCTGTTC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 3 2 105831 CASAVA_Build 6 19308362 4D TCTTGGGAGG GTGT/---- GTATGTCCAG 3070 het 3070 ref 46 26 17 5 GT 3 1 105832 CASAVA_Build 6 19315912 1D TTGTTTTTTG T/- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 3 2 105833 CASAVA_Build 6 19336988 1D AATCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 475 hom 37 2 25 10 T 13 12 105834 CASAVA_Build 6 19371347 1I TCTAAAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 30 1 22 7 T 10 11 105835 CASAVA_Build 6 19387283 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 15 6 A 11 10 105836 CASAVA_Build 6 19397006 3I ACGTAGTGGC ---/AAG AAGAAGTGCT 3070 hom 132 het 47 0 42 5 AAG 2 3 105837 CASAVA_Build 6 19401472 1D ACTAATATAT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 3070 hom 28 11 8 10 C 10 9 105838 CASAVA_Build 6 19444601 1I TTAAATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 T 10 11 105839 CASAVA_Build 6 19449839 1D GAAGCTTTTA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 6 5 105840 CASAVA_Build 6 19469097 1D AACCCCCAAG A/- AAAAAAAAAA 1359 het 1359 ref 36 24 3 9 A 11 10 105841 CASAVA_Build 6 19482724 1I ACATACCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 13 10 A 11 12 105842 CASAVA_Build 6 19482861 1I TCCTCTAAAA -/G GGTGTAATCT 3070 het 3070 ref 60 29 24 7 G 2 3 105843 CASAVA_Build 6 19530033 1I TAATATTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3020 hom 17 7 9 1 A 9 10 105844 CASAVA_Build 6 19530831 1D TCCGTGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1849 hom 15 5 8 2 A 15 14 105845 CASAVA_Build 6 19538301 13I GGCTGGAATG -------------/GGTTATGAAATGT GGCATGACTA 3070 het 3070 hom 32 15 17 3 GGTTATGAAATGT 0 1 105846 CASAVA_Build 6 19541621 1I GTTTATACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 32 0 21 11 T 12 13 105847 CASAVA_Build 6 19547206 1D AAACCCTGCG T/- GTGGCACTGT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 1 0 105848 CASAVA_Build 6 19553374 2D GTTCTGAGAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 60 23 33 5 TG 9 8 105849 CASAVA_Build 6 19559138 1D CTGAAGCCAA G/- AGAGGAAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 G 1 0 105850 CASAVA_Build 6 19563421 4I AAACCACCAC ----/AACT AACAAATAGT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 AACT 0 1 105851 CASAVA_Build 6 19575508 4D ATAGATTAAT ATTG/---- ATTCTCATGG 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 ATTG 1 0 105852 CASAVA_Build 6 19578732 4I TATACACATT ----/CACA CACAGTCACA 3070 hom 184 het 71 0 62 9 CA 2 4 105853 CASAVA_Build 6 19579890 1D TTTGGATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 40 0 34 6 T 13 12 105854 CASAVA_Build 6 19580704 4I ATACACTCCA ----/TGGC TGGCCATGGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TGGC 1 2 105855 CASAVA_Build 6 19580875 1D CAAACTTTAC A/- GAAAACTTAC 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 A 1 0 105856 CASAVA_Build 6 19582742 1I TACCTCCCCC -/T GGGTCCTCCC 3070 hom 61 het 23 0 20 3 T 0 1 105857 CASAVA_Build 6 19588146 2I AAAATTAAAC --/TG AAAACTCAAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 TG 0 1 105858 CASAVA_Build 6 19596654 1I CGGGGTTTCA -/C CATGTTGGCC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 C 1 2 105859 CASAVA_Build 6 19600120 1I TAGATGCAGC -/T TTCCCCCCTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 2 3 105860 CASAVA_Build 6 19609445 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 ATA 3 4 105861 CASAVA_Build 6 19619389 1I ATGGATGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1245 hom 25 3 17 5 T 12 13 105862 CASAVA_Build 6 19625787 1I GCTCAGGGCT -/C CAACTGATTC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 C 1 2 105863 CASAVA_Build 6 19627274 4D TGCCTCTGCC CTCT/---- CTAATTGATA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 CT 3 1 105864 CASAVA_Build 6 19630390 1D AGCAGAGTGG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 30 het 30 0 11 19 A 8 7 105865 CASAVA_Build 6 19630877 25D ATGGCTGATA AATTTTTGAGACTGTAATGCCTGAT/------------------------- AATAAATTAA 696 het 696 ref 33 5 4 28 AATTTTTGAGACTGTAATGCCTGAT 1 0 105866 CASAVA_Build 6 19631380 1I GACTTTCATC -/T TTCAGAACTG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 T 2 3 105867 CASAVA_Build 6 19635024 2I GCATTTTTTC --/AT ATGTTTGTTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AT 1 2 105868 CASAVA_Build 6 19636211 11D TTGATAACCA AAAGTCCTAGC/----------- AAAGAGTCAG 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AAAGTCCTAGC 1 0 105869 CASAVA_Build 6 19639248 2D TATGGAGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 6 T 14 12 105870 CASAVA_Build 6 19640200 1D AAGCTACAGT A/- AAAAAATTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 A 7 6 105871 CASAVA_Build 6 19642114 1D GAGCCACAAC T/- TTTAGTTAAA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 T 4 3 105872 CASAVA_Build 6 19658593 1D AGAGAAAAAG A/- GAAATTCTGC 3070 hom 102 het 40 0 33 7 A 1 0 105873 CASAVA_Build 6 19666308 1D TATTTGAAAC A/- AAAAAATAAG 3070 hom 129 het 46 0 43 3 A 7 6 105874 CASAVA_Build 6 19674394 1I GGTGGGGGAT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 91 het 37 0 31 6 A 7 8 105875 CASAVA_Build 6 19685282 1I AAGAAATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 9 10 105876 CASAVA_Build 6 19702087 19D CATATTGAAT GCTTTGTATTAGGCACTAC/------------------- GCTAGGTCAT 3070 het 3070 ref 39 21 17 4 GCTTTGTATTAGGCACTAC 1 0 105877 CASAVA_Build 6 19715494 5I AAACACACTA -----/TAACT TAACAATTGT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 TAACT 0 1 105878 CASAVA_Build 6 19716823 1I ACCTTCATTG -/C CAACATCTAG 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 C 1 2 105879 CASAVA_Build 6 19720946 1I ACCCACCCCT -/C CCCCCAACCC 1518 het 1518 ref 21 13 5 3 C 5 6 105880 CASAVA_Build 6 19724154 1I CAATCAACAG -/A AATCTTCAAA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 2 3 105881 CASAVA_Build 6 19724678 1I AAAAAAAAAG -/C CAGAGGAAAG 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 C 1 2 105882 CASAVA_Build 6 19725516 1I TAAAGGAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 A 9 10 105883 CASAVA_Build 6 19726653 1D AATCAGTAAT A/- AAAAAGTCTC 3070 het 3070 ref 30 13 11 8 A 6 5 105884 CASAVA_Build 6 19727913 1D TAGAAATAAA T/- TTTAACCAAG 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 4 3 105885 CASAVA_Build 6 19737047 1D CACCTGAGTT C/- CCCCGCAGCT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 C 5 4 105886 CASAVA_Build 6 19737681 1I AATAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3012 hom 37 11 15 11 A 12 13 105887 CASAVA_Build 6 19738451 1D TCGAAGAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 T 10 9 105888 CASAVA_Build 6 19740673 2I GTTTCCGGAT --/AG AGAAGATTGC 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 AG 1 2 105889 CASAVA_Build 6 19750113 1I TTTGTTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 A 10 11 105890 CASAVA_Build 6 19761205 1I CCATAATGTT -/A AAATAGAGCA 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 A 3 4 105891 CASAVA_Build 6 19763307 4I TTGCTAATTT ----/AATA AATAATCTGC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AATA 1 2 105892 CASAVA_Build 6 19764782 2D TGTTTGTTTT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 39 het 18 0 13 6 G 12 10 105893 CASAVA_Build 6 19785614 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 102 het 102 ref 8 3 1 4 A 15 14 105894 CASAVA_Build 6 19788633 1D ATGAAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 12 11 105895 CASAVA_Build 6 19791563 1I TTTTGACAAC -/T TTTTTTCGTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 6 7 105896 CASAVA_Build 6 19792493 1I TTAAAATTCC -/A ATTTTAATTT 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 A 1 2 105897 CASAVA_Build 6 19792733 1D GTGGCAGGTG C/- CCTGTAATCC 3070 het 3070 hom 18 7 8 3 C 3 2 105898 CASAVA_Build 6 19793440 4I AGAAGGAAAT ----/AAGG AAGAAAAGAG 2831 het 2831 ref 28 13 10 5 AAGG 0 1 105899 CASAVA_Build 6 19794217 4D AGGGCCACTT AATA/---- AATAATGCTT 3070 het 3070 ref 43 25 17 4 AATA 2 1 105900 CASAVA_Build 6 19813452 1I TTCATTGCAC -/A GCTAAGTTAG 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 A 0 1 105901 CASAVA_Build 6 19818439 1D CAAAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 649 het 649 ref 21 14 3 4 A 14 13 105902 CASAVA_Build 6 19820703 4I CCGCTCCCCA ----/TTGC TTGCTTGCAT 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 TTGC 2 3 105903 CASAVA_Build 6 19839206 1D TGAGCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 11 10 105904 CASAVA_Build 6 19852444 4D CATCAATTTC TTTA/---- TTTAACTGAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 TTTA 2 1 105905 CASAVA_Build 6 19857625 1D AATTGGATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 T 10 9 105906 CASAVA_Build 6 19880931 6D AAAAATAAAA AATAAT/------ AATAATAATA 2884 hom 21 het 11 0 8 3 AAT 7 5 105907 CASAVA_Build 6 19887682 2I TTATATTGAC --/TT TAAGTAGACA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 1 3 105908 CASAVA_Build 6 19888801 1D GTAATATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 11 10 105909 CASAVA_Build 6 19889886 1D AGCGAGAATG T/- TCGCCTTTTT 3070 het 2789 hom 20 6 10 4 T 2 1 105910 CASAVA_Build 6 19894641 8D ATATGTGTGC ATGTGTGT/-------- ATGTGTGTAC 3070 het 526 hom 57 7 27 24 ATGTGTGT 2 1 105911 CASAVA_Build 6 19896929 1D GAGGCATAAT A/- AGAGCATGAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 2 1 105912 CASAVA_Build 6 19897343 4I AAGGTATCTA ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 10 14 105913 CASAVA_Build 6 19898639 1I TCTGTTGTGA -/T TTTCTCAGCT 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 T 3 4 105914 CASAVA_Build 6 19906971 4D GCAACAGAAG CTAA/---- CTGACACTTC 3070 het 3070 ref 51 25 24 4 CTAA 1 0 105915 CASAVA_Build 6 19907149 5D CAGTAACAGA AAGAT/----- AATAGGAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 10 6 AAGAT 1 0 105916 CASAVA_Build 6 19908253 1D AACAAAATTC A/- ACATCCATTC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 2 1 105917 CASAVA_Build 6 19910475 2D TTAAACAAAC TG/-- TGTTACACCC 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 TG 2 1 105918 CASAVA_Build 6 19910800 3D GATTGTGGTA ATG/--- ATTACAAGAG 3070 het 3070 ref 40 24 15 2 ATG 1 0 105919 CASAVA_Build 6 19914466 8I AGTTTGTTCC --------/TTCTGATG TTCTGATGTG 2306 het 2306 ref 34 20 6 8 TTCTGATG 1 2 105920 CASAVA_Build 6 19915938 2I AAAAAAAAAA --/AG AGGGGAGAGA 3070 het 1305 hom 29 9 13 7 AG 1 2 105921 CASAVA_Build 6 19952097 1D GTACCTTCCA T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 8 7 105922 CASAVA_Build 6 19953113 2D CTTCTGGCTG TC/-- TTCAAGCACA 3070 het 3070 hom 58 22 32 4 TC 1 0 105923 CASAVA_Build 6 19967377 1D TGCCAAACAC A/- AAAATTATTT 3070 het 3070 ref 51 31 18 2 A 5 4 105924 CASAVA_Build 6 19972288 1I TTTTTTTTTT -/A TTTATTTTCA 3070 het 3070 hom 46 22 14 10 A 0 1 105925 CASAVA_Build 6 19976382 2D CACACACACA CT/-- CTCTGGATAA 1018 het 1018 ref 56 43 7 7 CT 3 2 105926 CASAVA_Build 6 19978608 1D ACTACTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3004 het 300 hom 22 3 8 11 A 17 16 105927 CASAVA_Build 6 19979227 2D ACTTTCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1043 het 843 hom 26 12 5 9 T 18 16 105928 CASAVA_Build 6 19986213 1I CTAAGAAGAC -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 6 7 105929 CASAVA_Build 6 19989897 4D GTTACTTGGT TCTC/---- TCTCTCAGTT 3070 het 3070 hom 39 17 17 7 TC 5 3 105930 CASAVA_Build 6 19991850 1I TCCACAGACT -/G GAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 1 2 105931 CASAVA_Build 6 20003612 1D GGGTATTTTG A/- AAGGAGGGGT 3070 hom 84 het 32 0 27 5 A 3 2 105932 CASAVA_Build 6 20006819 19I GCTATTCCAG -------------------/GTGACAGCAGTGCAGCACT GAGCAAAACT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 GTGACAGCAGTGCAGCACT 0 1 105933 CASAVA_Build 6 20008372 1I CTTTTGTACT -/G GCATCATTTA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 G 1 2 105934 CASAVA_Build 6 20035796 1D AAGAAAGATA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 50 23 21 7 T 9 8 105935 CASAVA_Build 6 20040457 1I GTTTTTTTTT -/G TGTGTGTGTT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 G 0 1 105936 CASAVA_Build 6 20084504 1D ACAGTATTTT A/- AAATATATGC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 4 3 105937 CASAVA_Build 6 20092831 7D AAAAAAAAAA AAAAAAG/------- AAAAAGTTGG 1381 het 1381 ref 31 13 10 9 AAAAAAG 1 0 105938 CASAVA_Build 6 20153069 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 10 9 105939 CASAVA_Build 6 20160604 1I CCGCCTCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 34 0 28 6 A 9 10 105940 CASAVA_Build 6 20167299 1D GAGAGAGGTT C/- CCCCATGGGT 3070 hom 89 het 36 0 27 9 C 5 4 105941 CASAVA_Build 6 20167924 12D3M14D ATTTCTTTAT CTCATAATAGAGATTATGAGAGTAACTTC/------------ATT-------------- CATTTTCCTG 3070 hom 78 het 25 0 27 4 N/A 0 0 105942 CASAVA_Build 6 20169902 1I ATAAAAGTAA -/T TTTTAAAATA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 4 5 105943 CASAVA_Build 6 20169975 2I CGCCAGAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 26 0 16 10 T 12 14 105944 CASAVA_Build 6 20173003 1D TGCCAATGAC T/- TTGTTTAACC 3070 hom 141 het 51 0 48 4 T 3 2 105945 CASAVA_Build 6 20187033 2D GAATAGCTGC AA/-- AAAAAATATA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 8 6 105946 CASAVA_Build 6 20193807 1D AGATTGAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 324 hom 22 6 10 6 A 10 9 105947 CASAVA_Build 6 20224206 1I TTCTCATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 21 0 17 4 A 11 12 105948 CASAVA_Build 6 20226921 1I AGAAAAACAT -/A ATTCGGCTGT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 A 1 2 105949 CASAVA_Build 6 20228878 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 74 het 27 0 25 2 A 9 8 105950 CASAVA_Build 6 20231038 1D TGCCACAATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 9 8 105951 CASAVA_Build 6 20243113 3D ATTCATGTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 772 hom 37 9 15 16 T 21 18 105952 CASAVA_Build 6 20245721 3D AGCCCACATT CAC/--- CACAGAGAAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 CAC 2 1 105953 CASAVA_Build 6 20250296 1D TTAAAAACAG A/- AGAAGATATA 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 2 1 105954 CASAVA_Build 6 20253445 2I AGAGCACTCA --/CT CTTTGTGCTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 CT 1 2 105955 CASAVA_Build 6 20263621 1D CGATTAACCT A/- AAAGTAATTG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 4 3 105956 CASAVA_Build 6 20272849 1I GGCATCTTTT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 7 8 105957 CASAVA_Build 6 20284495 1I CCCTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 34 1 22 11 A 13 14 105958 CASAVA_Build 6 20288133 1I GATGTTGAGC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 7 8 105959 CASAVA_Build 6 20291808 2D TTGGTATCCA TC/-- TCTCTAAGCC 3070 het 3070 ref 49 24 18 8 TC 3 2 105960 CASAVA_Build 6 20305073 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 11 10 105961 CASAVA_Build 6 20305331 1D TCTTTACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 T 11 10 105962 CASAVA_Build 6 20306438 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 A 15 14 105963 CASAVA_Build 6 20310562 10I CCTGGTTTTC ----------/GTTTTGTTTT GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 GTTTT 2 4 105964 CASAVA_Build 6 20334180 2D GTGTCTGTAA GT/-- GTGTTTCTGG 3070 het 3070 hom 44 20 23 2 GT 3 2 105965 CASAVA_Build 6 20344696 1D AAAATGTGAG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 8 7 105966 CASAVA_Build 6 20348131 1I AAAGTCTGCA -/T GCTTCACTCC 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 0 1 105967 CASAVA_Build 6 20348357 1D TGTCTTAATG T/- TTCAGATGCT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 3 2 105968 CASAVA_Build 6 20348602 2D AACAGAAAAC AT/-- AACCTAGAAT 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 AT 1 0 105969 CASAVA_Build 6 20351764 2D GAAAAAGCCA AT/-- ATACACTGAG 3070 het 3070 ref 49 29 17 5 AT 2 1 105970 CASAVA_Build 6 20357195 1D GTAAAGCCAT G/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 G 1 0 105971 CASAVA_Build 6 20357883 2I TTAAAAAAAA --/TC ATCTGTAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 TC 0 1 105972 CASAVA_Build 6 20362461 1I GCCCAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 11 12 105973 CASAVA_Build 6 20363717 3D ATCACAGATG TAA/--- TGAATCAATG 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 TAA 1 0 105974 CASAVA_Build 6 20369700 2D TTTACTTCAC AT/-- GTTTCTAAGG 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 AT 1 0 105975 CASAVA_Build 6 20376873 6D ACTCCATCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAG 687 het 687 ref 18 5 3 10 A 15 9 105976 CASAVA_Build 6 20377466 1I TTCTAACCCT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 8 9 105977 CASAVA_Build 6 20379152 3D TGTGATCAGG AGA/--- AGAAGAGGAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 AGA 3 2 105978 CASAVA_Build 6 20382089 4I CAAAAAAAAA ----/AAAG AAAAAAGAAA 2945 hom 21 het 11 0 8 3 AAAG 0 1 105979 CASAVA_Build 6 20388858 1I GGAAACCATA -/G TTGTCAACAC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 0 1 105980 CASAVA_Build 6 20390037 1D AAGTGGAAAA G/- GGGAGATTAC 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 G 4 3 105981 CASAVA_Build 6 20396248 1D TTCGAAGTTA C/- AGTGAACTAT 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 C 1 0 105982 CASAVA_Build 6 20402778 4I TCTGATTGAC ----/CTTT CTAAGATTTG 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 CTTT 0 1 105983 CASAVA_Build 6 20408815 5I CTGCATATCA -----/AAAAT AAAATAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 AAAAT 1 2 105984 CASAVA_Build 6 20410823 3D GTATGGTTGC TCA/--- TCTCTTGGAA 3070 het 3070 ref 38 23 11 5 TCA 1 0 105985 CASAVA_Build 6 20414142 1I TAGTAGCCAA -/T TAGCCATATG 3070 het 3070 hom 56 21 33 2 T 1 2 105986 CASAVA_Build 6 20415723 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2631 het 1980 hom 27 9 9 9 A 12 13 105987 CASAVA_Build 6 20428261 2D CAGTGGTAGT GA/-- GAGAGAACGG 3070 het 3070 ref 64 28 24 13 GA 4 3 105988 CASAVA_Build 6 20450477 1D TACTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 28 8 T 11 10 105989 CASAVA_Build 6 20452725 8D TTCCTTTCTT TCTCTTTC/-------- TCTCTTTCTC 3070 hom 85 het 37 0 25 13 TCTCTTTC 3 2 105990 CASAVA_Build 6 20455290 17D ACTTTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 20 1 18 9 A 27 10 105991 CASAVA_Build 6 20457075 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 27 1 26 1 A 12 11 105992 CASAVA_Build 6 20462952 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2396 het 1111 hom 30 5 17 8 A 14 15 105993 CASAVA_Build 6 20467200 2D TATATGTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 28 0 15 13 T 16 14 105994 CASAVA_Build 6 20474248 1I19M2I CAGAAAAAGT -AAAAAAAAAAAAACTCCTC--/AAAAAAAAAAAAAACTCCTCCA AAAATCCACC 3070 hom 91 het 33 0 30 6 N/A 0 0 105995 CASAVA_Build 6 20475326 1I ATCCTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1340 hom 40 5 24 11 A 15 16 105996 CASAVA_Build 6 20490457 1I CAAGCTGGAA -/T CATTTTGGTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 105997 CASAVA_Build 6 20504407 3I ATAAATGATT ---/CTC CTAACAATGA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 CTC 0 1 105998 CASAVA_Build 6 20512325 1I GAAAACCGGA -/G GGGGGCTTCT 1858 hom 17 het 8 0 6 2 G 5 6 105999 CASAVA_Build 6 20534758 1D CTGAAATATC T/- TATTCCATTC 3070 hom 96 het 44 0 35 11 T 2 1 106000 CASAVA_Build 6 20544185 11D AGAATTGTCC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2900 het 35 hom 21 1 11 9 T 22 11 106001 CASAVA_Build 6 20551178 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 15 7 A 13 14 106002 CASAVA_Build 6 20553458 1D ATTTTCTCCC T/- TTTTTTTTTT 367 het 367 ref 23 11 2 10 T 12 11 106003 CASAVA_Build 6 20567162 1D TCCACAGTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 8 7 106004 CASAVA_Build 6 20580370 4D GGTTCATTCA AAAT/---- AAATAAGTCA 3070 hom 90 het 37 0 30 9 AAAT 2 1 106005 CASAVA_Build 6 20582308 1I GGTTTTGTGG -/T TTTTTTTTCG 3070 hom 108 het 45 0 34 11 T 8 9 106006 CASAVA_Build 6 20625526 2D TCCCTTCTGC AT/-- CTTTTTCACG 3070 het 3070 ref 38 16 17 6 AT 1 0 106007 CASAVA_Build 6 20639710 1D CAAAGCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2231 hom 25 7 12 6 T 11 10 106008 CASAVA_Build 6 20640626 4D GGTTTCACCT GTTA/---- GTTAGTTTTT 3070 het 3070 hom 46 21 22 4 GTTA 2 1 106009 CASAVA_Build 6 20642441 1I ATAAATAGTG -/A AATAATATTT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 2 3 106010 CASAVA_Build 6 20646098 8D AACAATTCCC TCTATCAG/-------- TCTATCAGTT 3070 het 3070 hom 29 8 16 6 TCTATCAG 2 1 106011 CASAVA_Build 6 20648669 1I CGACTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 2358 het 2358 ref 35 14 12 9 T 13 14 106012 CASAVA_Build 6 20655408 1D TGTATGTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 10 9 106013 CASAVA_Build 6 20707416 5D ATATACGTAC ATATT/----- ATAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 ATATT 1 0 106014 CASAVA_Build 6 20712211 1I ACAAACAGGA -/T TGTGAAGACT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 1 2 106015 CASAVA_Build 6 20713260 4D CTGAGCAAAT ACTC/---- AGAAAGAGGA 3070 het 3070 hom 35 12 17 9 ACTC 1 0 106016 CASAVA_Build 6 20736874 1I ACTTTCAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 897 hom 35 2 28 5 A 10 11 106017 CASAVA_Build 6 20738712 1D CTTTTTCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 31 1 23 7 T 11 10 106018 CASAVA_Build 6 20743699 1D TGATTTTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 10 9 106019 CASAVA_Build 6 20746826 1D TTAGAGATTC T/- TTTTTTTTTT 1644 het 346 hom 20 3 9 8 T 15 14 106020 CASAVA_Build 6 20748399 1D CAAAACATGC T/- TTTTGGGTTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 5 4 106021 CASAVA_Build 6 20750041 14D TGTGTGTGTG CGTGCGTGTGTGTA/-------------- CACATGTGTA 3070 het 3070 hom 34 17 18 2 CGTGCGTGTGTGTA 1 0 106022 CASAVA_Build 6 20752906 1I AAAACACAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3049 hom 24 13 8 3 A 8 9 106023 CASAVA_Build 6 20756672 2D TTACCAGAAA CT/-- CTGATGTGCT 3070 het 3070 hom 26 8 10 10 CT 2 1 106024 CASAVA_Build 6 20766215 1D CCTTTAACTT G/- GGGGGGTTCT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 G 7 6 106025 CASAVA_Build 6 20766777 5I GAAAATATTG -----/TTTGT TTTATGTAGA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TTTGT 0 1 106026 CASAVA_Build 6 20769807 1I TGGTTTACAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 548 hom 53 3 27 23 A 9 10 106027 CASAVA_Build 6 20771443 2I AAATGTAGTG --/TT TTTTTTTTTC 2792 het 2792 ref 33 19 11 3 T 9 11 106028 CASAVA_Build 6 20772509 3I4M1I ATGATAGAAA ---GTGT-/AATTTGTA TTTGGGAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 16 4 N/A 0 0 106029 CASAVA_Build 6 20773887 6I TTGGAAACTA ------/TAACTT TAATTGAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 TAACTT 0 1 106030 CASAVA_Build 6 20774160 1D GGCAGTTGCA C/- CCCCCCAATT 2101 het 2101 ref 25 11 7 8 C 7 6 106031 CASAVA_Build 6 20775218 1D AAATGTCTAT G/- TTCTCTGGCC 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 G 1 0 106032 CASAVA_Build 6 20775913 1D TAAGGTGGCT G/- CCTGGGTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 26 5 G 1 0 106033 CASAVA_Build 6 20784394 2I ATAGTAAGCT --/AA GTTTAGTTTA 2012 het 2012 ref 17 11 5 1 A 0 2 106034 CASAVA_Build 6 20786302 2I ATCTGTGTTG --/TT TTTTTTTTTT 3018 het 3018 ref 30 10 13 7 T 12 14 106035 CASAVA_Build 6 20809470 1D CATGAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 40 2 14 24 T 17 16 106036 CASAVA_Build 6 20845817 1I AATGGAAAGA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 7 8 106037 CASAVA_Build 6 20847476 1I AAATAATGAA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 7 8 106038 CASAVA_Build 6 20849864 1I CTTGTTTTTG -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 7 8 106039 CASAVA_Build 6 20850587 5I ATTGGAGAAA -----/TAACT TAAGAACACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAACT 0 1 106040 CASAVA_Build 6 20850663 3D ATTTTGCTTA TCT/--- TCTTCAGACT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TCT 2 1 106041 CASAVA_Build 6 20861560 1D ACCACGTAAC A/- AACTTTAATC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 3 2 106042 CASAVA_Build 6 20861965 1D TGTGTACAAG T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 T 7 6 106043 CASAVA_Build 6 20865764 6D ATATTTATTT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 AC 9 6 106044 CASAVA_Build 6 20866302 1I ATTATTTGAC -/T TTTGTATTTC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 3 4 106045 CASAVA_Build 6 20891416 2I TTGGGATTAC --/AG AGGCATGAGC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 AG 1 2 106046 CASAVA_Build 6 20893525 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1208 het 74 hom 17 1 4 12 T 19 18 106047 CASAVA_Build 6 20901971 2I TTTCAGGGAT --/TC TGTTTTTTTT 1879 het 1879 ref 14 7 5 2 TC 0 1 106048 CASAVA_Build 6 20907711 4I AATAATAAAT ----/AAAG AAGAATTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AAAG 0 1 106049 CASAVA_Build 6 20909710 1I GTCCAACTTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 7 8 106050 CASAVA_Build 6 20915437 1D CCAAAATTGA T/- TTTTTTTTTT 940 het 940 ref 17 5 3 9 T 14 13 106051 CASAVA_Build 6 20915835 11D ATTTCCTAAT AAAATTAATCC/----------- AAAATTAATC 3070 hom 75 het 29 0 26 8 AAAATTAATCC 2 1 106052 CASAVA_Build 6 20924331 1D CTTAATATGT C/- CCCCCCCCCG 1978 het 104 hom 39 1 8 30 C 10 9 106053 CASAVA_Build 6 20927432 1D ATTTATAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 15 9 10 T 10 9 106054 CASAVA_Build 6 20929846 1D CAGATGCTTT G/- GAACAGAGCC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 2 1 106055 CASAVA_Build 6 20933026 1D ATTCCAGTCT G/- TTGTTAAGAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 G 1 0 106056 CASAVA_Build 6 20933337 1I TCTTTAACTC -/T TTCCCTTACA 3070 het 3070 ref 32 19 8 5 T 2 3 106057 CASAVA_Build 6 20933543 1I GCCTTAGTAA -/C CCTGAAGTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 C 2 3 106058 CASAVA_Build 6 20939133 1D TGTTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2947 hom 25 7 16 4 T 11 10 106059 CASAVA_Build 6 20939636 3D GTGTTGTTGT GGA/--- GAAGAATTGG 3070 het 3070 hom 49 20 21 10 GGA 1 0 106060 CASAVA_Build 6 20956367 1I TTATGCAAAC -/G GTCTGACTGG 3070 hom 120 het 47 0 40 7 G 1 2 106061 CASAVA_Build 6 20956494 13I AAGTTGTTTT -------------/TTTGGTTTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 6 TTTGGTTTTTTTG 0 1 106062 CASAVA_Build 6 20959231 1D TTTTCTGGCG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 98 het 39 0 33 6 T 10 9 106063 CASAVA_Build 6 20961598 15D TCAAAAAACA AAACAAAAAAAAAAC/--------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 18 0 15 7 AAACAAAAAAAAAAC 1 0 106064 CASAVA_Build 6 20971678 1D TCAATAAATG T/- TTTTTGAATG 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 6 5 106065 CASAVA_Build 6 20972437 36D TTACTTAACT GCAACTGACTTAACTTAACTTACTTAACTTAAAATG/------------------------------------ CAACTGACAT 3070 hom 108 het 35 0 37 5 GCAACTGACTTAACTTAACTTACTTAACTTAAAATG 1 0 106066 CASAVA_Build 6 20976270 4D TCTGTATAAT AAAC/---- AAATCTTATA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AAAC 1 0 106067 CASAVA_Build 6 20980929 1I AGATAATTCA -/G GTTGTAATAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 1 2 106068 CASAVA_Build 6 20982520 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 T 10 9 106069 CASAVA_Build 6 20988466 1D AGAAACTACA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 9 8 106070 CASAVA_Build 6 20996154 1I GCTAATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2762 hom 21 7 10 4 A 10 11 106071 CASAVA_Build 6 21002415 1I ACCTCAACTA -/T TTTAATTCTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 T 3 4 106072 CASAVA_Build 6 21007273 4D CTTCTAATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1500 het 127 hom 15 3 5 7 T 22 18 106073 CASAVA_Build 6 21010295 1D ACTGTCCCCC T/- GACTTCTAAC 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 1 0 106074 CASAVA_Build 6 21013003 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1834 het 1834 ref 21 11 6 5 A 11 10 106075 CASAVA_Build 6 21014103 1I AGACATTCTC -/A GGTAAACAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 1 106076 CASAVA_Build 6 21029194 16D ATATGTAACT GAAAGTTTTCTCTTTA/---------------- GATTTTTATA 3070 hom 57 het 18 0 20 3 GAAAGTTTTCTCTTTA 1 0 106077 CASAVA_Build 6 21034157 1D TTCCAACATA T/- TTTTTCTATA 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 T 6 5 106078 CASAVA_Build 6 21036896 2D TACAATATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1621 het 202 hom 28 4 6 18 T 20 18 106079 CASAVA_Build 6 21038468 1D AACGTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 31 0 25 6 A 13 12 106080 CASAVA_Build 6 21049370 1I TCAGCCACAT -/A ATGGCTTGTG 2126 het 2126 ref 35 19 8 8 A 1 2 106081 CASAVA_Build 6 21051556 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAGAAAAA 2547 het 340 hom 24 5 12 7 A 5 4 106082 CASAVA_Build 6 21052577 6D TGTCCTTTTT GAGACG/------ GAGTCTCACT 3070 het 3070 ref 28 15 11 4 GAGACG 1 0 106083 CASAVA_Build 6 21081289 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 25 0 22 5 A 14 13 106084 CASAVA_Build 6 21088892 1I AGAACTCCTT -/A ATGTTGCTTA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 1 2 106085 CASAVA_Build 6 21093024 1I ACAGTAACGG -/C GGGGGGGTGG 1979 het 1979 ref 29 10 9 10 C 0 1 106086 CASAVA_Build 6 21094861 1D TATATTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 12 11 106087 CASAVA_Build 6 21101116 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 13 11 A 13 14 106088 CASAVA_Build 6 21108744 1I TTTGATGTGG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 T 6 7 106089 CASAVA_Build 6 21149813 1I TCTGAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 T 14 15 106090 CASAVA_Build 6 21165893 2I CTCTTAACAC --/TG TGTTAGCTCA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 TG 1 2 106091 CASAVA_Build 6 21171117 4D AGAACTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1972 hom 21 4 8 9 TTTG 5 4 106092 CASAVA_Build 6 21176252 12D CCATCTACCT GTTGGTTTACCA/------------ GTTGGATTTA 3070 het 3070 hom 40 19 20 5 GTTGGTTTACCA 1 0 106093 CASAVA_Build 6 21176442 1D AATTTATCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 10 9 106094 CASAVA_Build 6 21178334 1I TTACACACCC -/T TTTCTAATCT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 3 4 106095 CASAVA_Build 6 21183326 5D AGAAGAAGAG TACAA/----- TACAATACCA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 TACAA 2 1 106096 CASAVA_Build 6 21185346 2I TTTTCAACCT --/AC ATATATATAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AC 0 1 106097 CASAVA_Build 6 21190476 3I GATAAGAAGT ---/TTC TAGAAGGGCA 3070 het 3070 ref 55 25 21 9 TTC 0 1 106098 CASAVA_Build 6 21198213 1I ATATAGCATG -/C CAGTGTTAGG 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 C 1 2 106099 CASAVA_Build 6 21208279 4I ATTTGTTGCC ----/TAGT TAAAGACCTG 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 TAGT 0 1 106100 CASAVA_Build 6 21208910 1I TTTTGGGGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 8 9 106101 CASAVA_Build 6 21211648 1D TGAGTATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 14 6 A 12 11 106102 CASAVA_Build 6 21240016 1I TTTAAAAATA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 7 8 106103 CASAVA_Build 6 21252207 1I GTTGGATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 10 11 106104 CASAVA_Build 6 21256012 1I TATAAAATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 9 10 106105 CASAVA_Build 6 21263211 1D CACCCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 1673 het 1472 hom 18 8 5 5 A 12 11 106106 CASAVA_Build 6 21282945 2D GCAATTTAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 26 0 22 7 TA 8 7 106107 CASAVA_Build 6 21285072 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTGT 2737 het 940 hom 15 3 8 4 T 9 8 106108 CASAVA_Build 6 21313554 1I GATTGTATGG -/C TCCTCTATTT 3070 hom 60 het 24 0 18 6 C 0 1 106109 CASAVA_Build 6 21315136 1I TTTACTTTAA -/T TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 3 4 106110 CASAVA_Build 6 21316821 1I TTTCTGTTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 8 9 106111 CASAVA_Build 6 21340199 1D14M1D TTGATCCATT GGGGTTTTTTTTTTGT/-GGGTTTTTTTTTTG- TTTTGTTTTT 1229 het 459 hom 23 5 11 9 N/A 0 0 106112 CASAVA_Build 6 21341167 1D ACAAAAAGGA T/- TTTTTCTACC 3070 hom 112 het 46 0 37 9 T 6 5 106113 CASAVA_Build 6 21348463 1I ATTTTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 45 2 39 4 A 10 11 106114 CASAVA_Build 6 21350512 5D TCCATCTTTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 299 het 157 hom 7 2 1 5 A 17 12 106115 CASAVA_Build 6 21354830 1I GGGAAACCTA -/T TATCTCTTGC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 1 2 106116 CASAVA_Build 6 21364926 6I CCATCTTAAA ------/AACAAC AACAACAACA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 AAC 4 6 106117 CASAVA_Build 6 21411171 3I CCAGAAAATA ---/GAG GAGAAGAACA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 GAG 1 2 106118 CASAVA_Build 6 21416671 1I TGAGTTTGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 828 hom 50 2 38 10 A 9 10 106119 CASAVA_Build 6 21417995 1I AGTCTTCCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 9 10 106120 CASAVA_Build 6 21421622 1I GCCAGGCCCT -/G GGGGGGAGAG 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 G 6 7 106121 CASAVA_Build 6 21422139 1I CGGTGGTGTG -/A TCATAGCTCA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 0 1 106122 CASAVA_Build 6 21433784 1D ATATAAAAGA T/- TAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 2 1 106123 CASAVA_Build 6 21433965 4I AAACAAAAAA ----/TTCT TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 50 21 18 11 TTCT 3 4 106124 CASAVA_Build 6 21436498 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1913 hom 10 het 4 0 4 0 T 7 6 106125 CASAVA_Build 6 21439951 1I AAAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 9 10 106126 CASAVA_Build 6 21440480 2I AGAGGTAGCA --/AG AGGTAGCAAT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 AG 1 2 106127 CASAVA_Build 6 21440847 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1914 het 11 hom 9 0 5 4 A 14 13 106128 CASAVA_Build 6 21444166 1D TGTATAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 22 4 10 8 T 13 12 106129 CASAVA_Build 6 21444656 10D TTTCATTTCT TCAAAATCTG/---------- TCAAAATCTG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TCAAAATCTG 2 1 106130 CASAVA_Build 6 21445687 3D CCTCCTCCTC CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 het 1802 hom 29 10 12 9 CTT 5 4 106131 CASAVA_Build 6 21447618 1I AATATCTATT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 0 1 106132 CASAVA_Build 6 21448811 1D TATCAAAACC T/- CTCTTAGGAG 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 1 0 106133 CASAVA_Build 6 21458475 3I TCCAGAGACC ---/AGG AGACTAGGTA 3070 hom 60 het 27 0 19 8 AGG 0 1 106134 CASAVA_Build 6 21466453 4I CACTACTGTC ----/CACA CACATCCTGG 3070 hom 66 het 24 0 21 3 CA 2 4 106135 CASAVA_Build 6 21479566 1I AGAAGGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1931 hom 31 11 12 8 A 15 16 106136 CASAVA_Build 6 21482025 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2646 hom 22 7 11 4 A 10 9 106137 CASAVA_Build 6 21486523 2D GTATATGTAT AC/-- ACACACACAC 1753 het 1263 hom 16 6 8 2 AC 10 9 106138 CASAVA_Build 6 21490966 4D GGAGTGACTG ACAA/---- ACAAGACATT 3070 het 3070 ref 54 32 20 3 ACAA 2 1 106139 CASAVA_Build 6 21494949 4D GAGGGGATTG GAGA/---- GAGAAAGTAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 GA 4 2 106140 CASAVA_Build 6 21496926 2D GAAAGGCAAA CT/-- CTCTTCAAGG 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 CT 3 2 106141 CASAVA_Build 6 21500618 1I AGCTGGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1622 hom 36 5 19 12 A 14 15 106142 CASAVA_Build 6 21505014 10D TCCAGGAAAG GATCAATAAA/---------- GATCAATAAA 3070 hom 141 het 50 0 48 5 GATCAATAAA 2 1 106143 CASAVA_Build 6 21506930 1D CTGTGGAAAC G/- AGAGGTTAGA 3070 hom 108 het 38 0 37 3 G 1 0 106144 CASAVA_Build 6 21519941 2D TCTAATGTTT TA/-- TGTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 TA 1 0 106145 CASAVA_Build 6 21540663 8D AGGAATTGGC AGGGGAAG/-------- AGGGGAAGAG 3070 hom 87 het 31 0 27 6 AGGGGAAG 2 1 106146 CASAVA_Build 6 21542718 1D ACCCCACCTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 49 het 22 0 16 6 A 8 7 106147 CASAVA_Build 6 21595768 1D CATCCTCATT A/- AAAAAAAAAA 1172 het 1172 ref 21 12 3 6 A 15 14 106148 CASAVA_Build 6 21615577 2D CCTGTCTCAA AC/-- ACACACACAC 2442 het 2442 ref 28 16 6 7 AC 10 9 106149 CASAVA_Build 6 21654292 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 11 12 106150 CASAVA_Build 6 21669033 1D TCCACCTCCC A/- AGGTTCAAGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 2 1 106151 CASAVA_Build 6 21684177 1D TAATTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 1158 het 1158 ref 50 35 4 11 T 11 10 106152 CASAVA_Build 6 21709705 1D AAAGGGTTTT A/- AGCCCAACTT 3070 hom 115 het 42 0 39 4 A 2 1 106153 CASAVA_Build 6 21717519 4I GTGAAGCTAC ----/AGAT AGATCTTTGC 3070 hom 52 het 22 0 17 6 AGAT 1 2 106154 CASAVA_Build 6 21721156 2D GTCTTCATTT AA/-- AGTTTTCATG 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 A 3 1 106155 CASAVA_Build 6 21728907 1D GCAGGGAGAT G/- GGGGGGATGT 2489 hom 29 het 20 0 8 13 G 7 6 106156 CASAVA_Build 6 21729149 4D AAAAATCATG TTAA/---- TTTTTAAGAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTAA 1 0 106157 CASAVA_Build 6 21729439 1I CTTTCTCTAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 8 9 106158 CASAVA_Build 6 21729650 4D TAAAATCTCC TTTG/---- TTTATTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTTG 1 0 106159 CASAVA_Build 6 21737231 1I AGCAGCCACC -/A AAAAAAAAAA 915 hom 18 het 15 0 6 9 A 15 16 106160 CASAVA_Build 6 21737451 1D TCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 2834 hom 32 het 14 0 10 4 T 10 9 106161 CASAVA_Build 6 21742729 2I ATAATAAAAC --/TT TTGAGTAGAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 2 4 106162 CASAVA_Build 6 21765674 9D ACCCTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 28 2 15 13 A 24 15 106163 CASAVA_Build 6 21777852 4D AAAGTAAGAA CTTT/---- CTTTCTGTGG 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 CTTT 2 1 106164 CASAVA_Build 6 21784706 1D TCCTGGGCTC A/- AGAGATTCTC 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 2 1 106165 CASAVA_Build 6 21791400 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1667 het 1667 ref 17 9 4 4 T 7 6 106166 CASAVA_Build 6 21797776 1D TTACTGTGAA T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 36 20 4 12 T 17 16 106167 CASAVA_Build 6 21837636 1D GGGATTGCTC T/- TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 36 27 5 4 T 12 11 106168 CASAVA_Build 6 21843564 3D GGCCGAGGCG GGT/--- GGATCACTTG 3070 hom 44 het 16 0 11 5 GGT 1 0 106169 CASAVA_Build 6 21846620 1D GAGTAGTGTG C/- CTGGAGTATG 3070 hom 87 het 30 0 28 2 C 2 1 106170 CASAVA_Build 6 21851976 1D GTTTTACCCT G/- TTAGCTGGGA 947 het 947 ref 8 4 2 2 G 1 0 106171 CASAVA_Build 6 21855415 1D ACCATACTTA C/- CTCACAGGGT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 C 2 1 106172 CASAVA_Build 6 21866591 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 453 het 453 ref 8 3 2 3 T 10 11 106173 CASAVA_Build 6 21867258 1D TCAGTGCTTT A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 A 7 6 106174 CASAVA_Build 6 21886594 1I TTATAAGGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 9 10 106175 CASAVA_Build 6 21888696 1D CAGCACCTTT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 A 8 7 106176 CASAVA_Build 6 21893063 1D21M3D CAGCCAAAAC AAAAAAACATCCTCAAACAGTAGTT/-AAAAAACATCCTCAAACAGTA--- AAGTCCTTCA 3070 het 3070 hom 22 11 14 4 N/A 0 0 106177 CASAVA_Build 6 21898528 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1712 het 648 hom 7 2 4 1 A 11 10 106178 CASAVA_Build 6 21898810 2D CCATTGTATG TA/-- TATATCACAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TA 3 2 106179 CASAVA_Build 6 21901886 1D TTTGCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2528 hom 21 8 9 5 T 12 11 106180 CASAVA_Build 6 21903810 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 32 2 23 7 T 12 13 106181 CASAVA_Build 6 21907244 1D AACACTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 A 13 12 106182 CASAVA_Build 6 21907857 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2834 hom 24 7 13 5 A 11 10 106183 CASAVA_Build 6 21908542 10D ATACTATAAT AGTTCATAAA/---------- AGTGGTTGAG 2375 het 2375 ref 27 19 8 4 AGTTCATAAA 1 0 106184 CASAVA_Build 6 21909697 1D GGAAATCTCT A/- AAGTGAAGAA 3070 het 3070 hom 44 18 23 5 A 3 2 106185 CASAVA_Build 6 21917720 5D CTCCTTTCTT TTCTC/----- TTCCTTCTCT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 TTCTC 1 0 106186 CASAVA_Build 6 21922554 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1096 het 1096 ref 25 13 3 11 A 15 14 106187 CASAVA_Build 6 21924437 2D GTCCCGACAC TG/-- TGCCTGCATT 3070 het 3070 ref 46 21 15 11 TG 2 1 106188 CASAVA_Build 6 21927862 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2921 het 948 hom 35 2 11 22 T 13 14 106189 CASAVA_Build 6 21941185 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 7 8 106190 CASAVA_Build 6 21944014 6I ATGATACGGT ------/AAAAAA TAAAAAAAAA 2035 het 2035 ref 23 11 7 5 A 0 6 106191 CASAVA_Build 6 21947794 1D AAGGACTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 9 11 T 12 11 106192 CASAVA_Build 6 21950185 4I AACAAAAGCC ----/TGAG TGAGATGAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TGAG 1 2 106193 CASAVA_Build 6 21970421 1D GTTTTTTTTG T/- TTTGTTTTGT 295 het 295 ref 17 6 2 9 T 4 3 106194 CASAVA_Build 6 21972226 1I ACAACCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 700 hom 28 5 17 6 A 13 14 106195 CASAVA_Build 6 21978914 8I GCATAGGTTT --------/TTTGTTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 TTTG 2 4 106196 CASAVA_Build 6 21979240 1D ACGTAGTTGT G/- GTTTTAAGAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 G 2 1 106197 CASAVA_Build 6 22001911 3D AAGCAATAAC AGT/--- GGTGTTACTT 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 AGT 1 0 106198 CASAVA_Build 6 22011687 3D AGCAATTAGA AAG/--- AAGAAGATCC 2693 het 2693 ref 30 16 7 8 AAG 3 2 106199 CASAVA_Build 6 22019118 1D GGACACTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 32 1 29 3 A 11 10 106200 CASAVA_Build 6 22022139 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AACACTGAAT 3070 hom 77 het 28 0 26 6 AAAG 1 0 106201 CASAVA_Build 6 22025525 1D TCTGAGGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 33 1 22 10 T 15 14 106202 CASAVA_Build 6 22037363 1D TACACCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 T 12 11 106203 CASAVA_Build 6 22050142 3I TGTTTTTTTT ---/TTA TTTTAATCAC 3070 het 3070 hom 37 20 14 3 TTA 0 1 106204 CASAVA_Build 6 22058395 1I CATTAGAGTG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 6 7 106205 CASAVA_Build 6 22070744 1D ATTTTTCACG T/- TTTTTTTTTT 2126 het 47 hom 14 1 8 5 T 13 12 106206 CASAVA_Build 6 22071305 4D TCACATCTAC TTAA/---- TTAAAAACAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 TTAA 2 1 106207 CASAVA_Build 6 22078269 1I TTATAAATTC -/T TTTTTTGGAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 6 7 106208 CASAVA_Build 6 22083525 2I GAGATTACCA --/TT TGGCAGTCAT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 1 3 106209 CASAVA_Build 6 22098531 1I GAGGGACTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 961 hom 36 3 29 4 T 11 12 106210 CASAVA_Build 6 22102490 5D36M3I AAGCACATCA AATGTGGTTTTAGATTTATATTGAATACAAGAAGAAAGGGA---/-----GGTTTTAGATTTATATTGAATACAAGAAGAAAGGGATAT TATAAGTGTA 3070 het 3070 hom 32 9 10 25 N/A 0 0 106211 CASAVA_Build 6 22104201 1I GATTCCCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 10 11 106212 CASAVA_Build 6 22104471 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 10 11 106213 CASAVA_Build 6 22112221 1D TAACTAAATG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 8 7 106214 CASAVA_Build 6 22124114 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGCCTTTAA 3070 het 2199 hom 24 9 10 6 CT 2 1 106215 CASAVA_Build 6 22132906 1I TTCCAACTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1199 hom 40 4 28 8 T 12 13 106216 CASAVA_Build 6 22141417 1D GTTTCATTCC T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 7 6 106217 CASAVA_Build 6 22142874 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 2818 hom 27 het 10 0 9 1 T 10 9 106218 CASAVA_Build 6 22150405 1I GTTCCTTCTT -/C CATCCCTCTC 3070 het 2067 hom 13 5 8 0 C 1 2 106219 CASAVA_Build 6 22153226 1I TGGAGATTAT -/A TAAGATAATC 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 A 0 1 106220 CASAVA_Build 6 22174819 1I AAAATGAAGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 8 9 106221 CASAVA_Build 6 22180330 4D GAAGGGAAAA CATC/---- CAGTAAATCC 3070 het 3070 ref 26 11 11 6 CATC 1 0 106222 CASAVA_Build 6 22196233 2D TTAAACTTCA TT/-- GTAGGCTCTA 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 T 2 0 106223 CASAVA_Build 6 22199007 1D TATGTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 11 10 106224 CASAVA_Build 6 22201162 1I TCTATTTCTA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 7 8 106225 CASAVA_Build 6 22206178 2I CTTCAGGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 AT 6 7 106226 CASAVA_Build 6 22210403 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 38 15 18 7 T 8 7 106227 CASAVA_Build 6 22212038 1I ACCCTTACAA -/G AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 G 0 1 106228 CASAVA_Build 6 22212376 1I GCAAGAGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 A 10 11 106229 CASAVA_Build 6 22214032 3D TAATGTAATA GAT/--- ACATGTAATA 3070 het 3070 ref 46 21 18 9 GAT 1 0 106230 CASAVA_Build 6 22217381 4I ATAATAATAC ----/CAAT CAATACCTGA 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 CAAT 1 2 106231 CASAVA_Build 6 22220451 1D TAATGGCTAG C/- CTCTTTGTTA 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 C 2 1 106232 CASAVA_Build 6 22222702 1D AAACAAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 T 11 10 106233 CASAVA_Build 6 22233688 1I TCTGATTTTT -/G TTGATGACTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 G 0 1 106234 CASAVA_Build 6 22237613 1I AATGTCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1722 hom 36 8 14 14 T 15 16 106235 CASAVA_Build 6 22246133 1D GTGGGGGCGG A/- GGGGGTGCTG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 1 0 106236 CASAVA_Build 6 22247474 1D TTGGCATATT A/- AAAAAAAAAC 974 het 974 ref 29 24 3 2 A 10 9 106237 CASAVA_Build 6 22267827 4D TTAAGTAGGA AAAT/---- AAATAAATTT 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 AAAT 3 2 106238 CASAVA_Build 6 22269081 12D ACTCTATCAA AATAATAATAAT/------------ AATAATAATA 3070 het 2383 hom 20 5 11 9 AAT 10 6 106239 CASAVA_Build 6 22289171 1D AGTTTTTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 28 2 13 13 G 1 0 106240 CASAVA_Build 6 22290198 1D TAAAGGTTTG T/- TTACATCGGT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 3 2 106241 CASAVA_Build 6 22291940 2D ATTGAGGTTT CC/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 C 3 1 106242 CASAVA_Build 6 22292437 3D AGTTTTCTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 27 1 15 13 T 13 10 106243 CASAVA_Build 6 22293403 11D TTTTGAGGTC AATTACTGGAG/----------- AATTACTGGA 3070 hom 7 het 35 2 30 5 AATTACTGGAG 2 1 106244 CASAVA_Build 6 22294226 4I TATACATGAG ----/AAAT AAATATGTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 AAAT 1 2 106245 CASAVA_Build 6 22296728 2D GTTTGTTTTT TA/-- GACATACATC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 TA 1 0 106246 CASAVA_Build 6 22298107 1D CTGCGTTTTT A/- ACAAATGTTG 3070 het 3070 hom 35 11 16 9 A 2 1 106247 CASAVA_Build 6 22298454 4I AAAGAAAAAC ----/AGAT AGAACTTTAA 3070 hom 63 het 30 0 23 7 AGAT 0 1 106248 CASAVA_Build 6 22303744 1I CTGTAGTTCA -/G GGGTTGGTGT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 G 3 4 106249 CASAVA_Build 6 22304293 2I AGAGCATCTC --/TT TTATGTACTG 3070 het 3070 hom 57 21 27 9 T 2 4 106250 CASAVA_Build 6 22310915 5D TGATTATTTC CTGGA/----- AATTGCATTT 3070 het 3070 hom 54 22 27 6 CTGGA 1 0 106251 CASAVA_Build 6 22313201 3D TATGAAAATC TCA/--- TCATTTTCAA 3070 het 3070 hom 36 15 20 3 TCA 2 1 106252 CASAVA_Build 6 22313538 2D CCTTCCAAAA TC/-- TCTGTTAACC 3070 het 3070 ref 54 26 24 4 TC 2 1 106253 CASAVA_Build 6 22317073 1D CTCTGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 9 22 7 A 13 12 106254 CASAVA_Build 6 22320103 1I ACATGTAGAC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 7 8 106255 CASAVA_Build 6 22320268 1I ATGTAAATAA -/C TTGAGCAGCT 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 C 0 1 106256 CASAVA_Build 6 22327869 4I TGTGTAGAAA ----/ATTG ATTAATTGGC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 ATTG 0 1 106257 CASAVA_Build 6 22334057 3D TGCATGTCCT CTC/--- CTCCCATCTT 3070 het 3070 ref 47 19 19 10 CTC 2 1 106258 CASAVA_Build 6 22337346 2D GACAGAAGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 A 12 10 106259 CASAVA_Build 6 22340609 3D CCTTCCAGAT AGA/--- AGTAAACATT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AGA 1 0 106260 CASAVA_Build 6 22341170 4I GAGAAACTGA ----/ACTG ACTGACAACT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 ACTG 1 2 106261 CASAVA_Build 6 22349208 8I AGCAACACAA --------/TACTAGTG TACTAGTGGG 3070 hom 58 het 25 0 20 5 TACTAGTG 1 2 106262 CASAVA_Build 6 22350277 4D TTCAAAAGAT AGAG/---- AGAGGAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 1 AG 4 2 106263 CASAVA_Build 6 22351487 1I GAATAGAGAA -/C CCAGAAATAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 2 3 106264 CASAVA_Build 6 22352481 2I AAAGAAATGT --/TA TATATATATA 3070 hom 23 het 20 0 14 6 TA 5 6 106265 CASAVA_Build 6 22353991 1D ATTCTTTTTT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 53 het 21 0 17 4 G 10 9 106266 CASAVA_Build 6 22358599 2I CAGTTACATC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 10 12 106267 CASAVA_Build 6 22365106 1D TAAACTCTCA C/- AGAACCAAGT 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 C 1 0 106268 CASAVA_Build 6 22366353 1D TATTTTGTTC T/- TCTGTTTGTC 3070 het 3070 ref 44 26 16 3 T 2 1 106269 CASAVA_Build 6 22367329 1D TTAGTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 10 9 106270 CASAVA_Build 6 22371610 25D CTGTGTATAC TCAAAGTCCTGTTAGTGGCACTGGA/------------------------- TCAAAACTGT 3070 het 3070 ref 29 20 15 1 TCAAAGTCCTGTTAGTGGCACTGGA 1 0 106271 CASAVA_Build 6 22374805 6I GCCAGGATGG ------/TCTCCA TCTCCTACCC 1355 het 1355 ref 18 7 4 7 TCTCCA 0 1 106272 CASAVA_Build 6 22403417 2I AAATTTTTTT --/TC TATATTTGAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TC 0 1 106273 CASAVA_Build 6 22410535 1D CAGAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 11 10 106274 CASAVA_Build 6 22420106 2D CTCCTTTCTT TC/-- TCTGTTTCAT 3070 hom 83 het 29 0 28 2 TC 2 1 106275 CASAVA_Build 6 22421469 1D AGAAATTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 27 1 16 10 A 12 11 106276 CASAVA_Build 6 22422673 2I ATTTTAATTA --/TT TTTTTTTTTT 2831 hom 24 het 16 0 9 7 T 12 14 106277 CASAVA_Build 6 22427509 1I TCTAAGTAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 88 het 37 0 30 7 A 7 8 106278 CASAVA_Build 6 22428507 1I AATCAGGAGA -/T AATTTTAACT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 0 1 106279 CASAVA_Build 6 22447309 2D TGTGACACTC TT/-- TGCATTGCCA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 3 1 106280 CASAVA_Build 6 22447923 4I ATTTGCTTTA ----/CTCT CTCTATGGTA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 CT 2 4 106281 CASAVA_Build 6 22458155 1D CAACAGGTTA T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 6 5 106282 CASAVA_Build 6 22459599 2I ATAAAAGTGA --/CT CTAGATCCAA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 CT 1 2 106283 CASAVA_Build 6 22461802 2D GATTTTAATC TG/-- TATTCTTTAG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TG 1 0 106284 CASAVA_Build 6 22462927 5D ACCCTGTCTC AAAAT/----- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 20 3 AAAAT 1 0 106285 CASAVA_Build 6 22468175 1I AGAGATAAGA -/G TAAGGCTTTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 0 1 106286 CASAVA_Build 6 22468675 3D CTATAGTCAT GTA/--- GTACTCATAC 3070 het 3070 hom 43 21 18 6 GTA 2 1 106287 CASAVA_Build 6 22470387 8D AGGTTGTTGG TAATATTT/-------- TAATATTTTA 3070 hom 117 het 44 0 40 7 TAATATTT 2 1 106288 CASAVA_Build 6 22513314 1D GAATTGTCTA T/- TTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 7 6 106289 CASAVA_Build 6 22514541 3D AGCAGTGTAA TGT/--- TGTTGAGAAA 3070 het 3070 hom 45 20 22 5 TGT 2 1 106290 CASAVA_Build 6 22517701 1I AAAATACAAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 9 10 106291 CASAVA_Build 6 22518017 1I AAACAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 A 10 11 106292 CASAVA_Build 6 22520990 1D TTATTTGCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 9 24 5 T 9 8 106293 CASAVA_Build 6 22522214 1D AAAATACTTA C/- ACTTTCTTAT 3070 het 3070 hom 47 23 23 3 C 1 0 106294 CASAVA_Build 6 22525344 2I TTGGATAATA --/AT ATTTATCACA 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 AT 1 2 106295 CASAVA_Build 6 22539839 2I113M1I TGGGAAGGCC --TGTGGCATATTTCCTAGCATGCAGTGGTGTCCACCGTATTTGTTGCTGATGTGCTCTCGGATGATACCAAAACTAACATTATCAGAGTAAGTCAACCTCCCTTACTTTAGCCT-/TGTGTGGCATATTTCCTAGCATGCAGTGGTGTCCACCGTATTTGTTGCTGATGTGCTCTCGGATGATACCAAAGCTAACATTATCAGAGTAAGTCAACCTCCCTTACTTTAGCCTA AAAGGTATCC 3070 het 3070 ref 50 41 27 42 N/A 0 0 106296 CASAVA_Build 6 22544620 4D CTGCTTTCAT TCTC/---- TCTCTCTCTG 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 TC 6 4 106297 CASAVA_Build 6 22576779 1D TTTCTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 25 1 14 11 T 11 10 106298 CASAVA_Build 6 22585130 13I CAGAACCGAG -------------/CTCTGGGAACTTT CTCTTTAGTA 3070 hom 120 het 42 0 40 3 CTCTGGGAACTTT 0 1 106299 CASAVA_Build 6 22588656 4D CCGCACCTTA CTAT/---- CTATCATATG 3070 het 3070 ref 54 28 19 9 CTAT 2 1 106300 CASAVA_Build 6 22591086 1D GAGGGACATT C/- TATAGTATTG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 1 0 106301 CASAVA_Build 6 22592226 2D ATCATGCCCC CT/-- CTCAGCACTC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 CT 2 1 106302 CASAVA_Build 6 22609501 12I CACGACTCAT ------------/ATTAAGAGAAAA AGACCTGGAC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 ATTAAGAGAAAA 0 1 106303 CASAVA_Build 6 22609786 99D AGGCCTACTA GGTGGTGTGCTTCCTTCTTTATAGTGGGAGGTGCAACATGCAAGAATTTGTCCTTGATATTGGCTTACTTGCAGATTGCTGGGTTCCTAAGAATTTCAT/--------------------------------------------------------------------------------------------------- GGATAGAGCA 3070 het 3070 ref 26 34 10 8 GGTGGTGTGCTTCCTTCTTTATAGTGGGAGGTGCAACATGCAAGAATTTGTCCTTGATATTGGCTTACTTGCAGATTGCTGGGTTCCTAAGAATTTCAT 1 0 106304 CASAVA_Build 6 22611916 2D GTCCCAAGGA AT/-- ATAACAATGA 3070 het 3070 hom 47 15 31 2 AT 2 1 106305 CASAVA_Build 6 22615035 1D TGTTGTTTAA T/- TATATAATTC 3070 het 3070 hom 41 16 23 4 T 2 1 106306 CASAVA_Build 6 22618177 6D TATATAAAAT ATAAAC/------ CATGAACAGA 3070 het 3070 hom 35 17 19 2 ATAAAC 1 0 106307 CASAVA_Build 6 22620850 1D AATTAAAAAG A/- AACACTGTTA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 3 2 106308 CASAVA_Build 6 22622607 3I AAAGAGAGAA ---/AAG AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 AAG 0 1 106309 CASAVA_Build 6 22623148 2I ACATTTTAAA --/AC ACATAATTAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AC 1 2 106310 CASAVA_Build 6 22623734 1I AGACATAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 8 9 106311 CASAVA_Build 6 22624192 1D AAAATGACTC T/- TTAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 T 3 2 106312 CASAVA_Build 6 22624462 1D AAGAAAAAAA C/- GTCCCTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 C 1 0 106313 CASAVA_Build 6 22637527 2D TATTTTAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 29 1 13 16 T 12 10 106314 CASAVA_Build 6 22638585 1D AACCCTCTGA T/- TGCTAAGGGT 3070 het 3070 ref 38 21 16 4 T 2 1 106315 CASAVA_Build 6 22643685 1D TGGTGCCAGG C/- AGCATGCAGT 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 C 1 0 106316 CASAVA_Build 6 22651501 2I GAGCTAACCA --/TT TTTGTGAAAG 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 3 5 106317 CASAVA_Build 6 22653145 2I TTTGTTTCTG --/GA TACACATGGA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 GA 0 1 106318 CASAVA_Build 6 22680170 1D GGGATTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 15 25 9 T 13 12 106319 CASAVA_Build 6 22681756 2I CAAGAAGCTT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 9 11 106320 CASAVA_Build 6 22691098 1I74M1D AACAGGCCAG -TAAGGGCTCTTATTCTTGTGATGGTATGAAACATACATCTTTAACCTCAATAGCCTAATGTTCCTGCTATACTGA/TTAAGGGCTCTTATTCTTGTGATGGTATGAAACATACATCTTTAACCTCAATAGCCTAATGTTCCTGCTATACTG- AAGTATTGAG 3070 het 3070 ref 34 30 25 2 N/A 0 0 106321 CASAVA_Build 6 22691836 1D ATAGATATGC A/- AATGTTGACC 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 A 3 2 106322 CASAVA_Build 6 22695287 2I AATATTTCTT --/TC TCTCTCTCTA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 TC 4 5 106323 CASAVA_Build 6 22699981 1I TGGTGTCTAT -/A ATAATTTACT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 A 1 2 106324 CASAVA_Build 6 22701193 4I TATCAGTAAA ----/TAAT TAATGCTAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TAAT 1 2 106325 CASAVA_Build 6 22704178 3I TCCATATTGT ---/ATG CTCTGATGCT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 ATG 0 1 106326 CASAVA_Build 6 22720714 1I ATCAGGGCAT -/A AAAACAGCAG 3070 het 3070 hom 51 19 27 5 A 4 5 106327 CASAVA_Build 6 22723679 3D CTAGAGAAGG AGC/--- AGAAGGATAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 AGC 1 0 106328 CASAVA_Build 6 22724894 1D TTGTTCCACA T/- TTTTTTTTTA 3040 het 3040 ref 29 13 8 9 T 10 9 106329 CASAVA_Build 6 22727537 1I CATTACTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 10 11 106330 CASAVA_Build 6 22753119 2D ACTTACAAAC TA/-- TCGTATATAC 3070 hom 48 het 17 0 17 1 TA 1 0 106331 CASAVA_Build 6 22757887 1D TTCTCACTCC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 36 3 27 6 A 1 0 106332 CASAVA_Build 6 22759359 1I CCTGGACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 37 2 30 5 T 10 11 106333 CASAVA_Build 6 22761357 4D GAAGTAATGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 18 14 106334 CASAVA_Build 6 22771236 2I GACAACTAGT --/GA GAGGGAAAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GA 1 2 106335 CASAVA_Build 6 22771590 7D CATATTCCCA CTGTTCT/------- CTGTTCTCTC 3070 hom 45 het 22 0 16 7 CTGTTCT 2 1 106336 CASAVA_Build 6 22789444 2D TGCCCAACTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 15 9 T 14 12 106337 CASAVA_Build 6 22791815 19I AAATTAATAA -------------------/ACGCTTAGTTGTTCCATCT ATAGAATTCA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 ACGCTTAGTTGTTCCATCT 0 1 106338 CASAVA_Build 6 22793099 1I AAAATGCTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 74 hom 27 1 16 10 T 9 10 106339 CASAVA_Build 6 22793145 1D80M1D AGGCCTTGAA TTTTTTTTTTAGATGGAGTCTTGCTCTCTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGCTCACTACAACCTCCACCTC/-TTTTTTTTTAGATGGAGTCTTGCTCTCTTGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGCTCACTACAACCTCCACCT- CCAGGTTCAA 3070 het 106 hom 16 1 24 17 N/A 0 0 106340 CASAVA_Build 6 22793489 2I AGAGTGGATT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 30 0 28 2 TC 0 1 106341 CASAVA_Build 6 22795125 4I CAAATAAGAA ----/AAGT AAGAAGGATA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AAGT 0 1 106342 CASAVA_Build 6 22795913 1I TGACCATGAA -/G GTGATGTGAT 3070 hom 141 het 49 0 47 2 G 1 2 106343 CASAVA_Build 6 22799007 1I GTTACTTAAA -/T TTTTTCCCGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 5 6 106344 CASAVA_Build 6 22863960 1D TCTGCAGTAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 8 7 106345 CASAVA_Build 6 22864441 1I TTCTGCAATG -/A ATGCATTCCC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 2 106346 CASAVA_Build 6 22866033 1D ACCTCAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 39 1 32 7 T 12 11 106347 CASAVA_Build 6 22872337 4I TCCTCCTACC ----/CTCT CTCTGACACT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 CT 2 4 106348 CASAVA_Build 6 22874240 2I TTTAAATAAC --/TT TATTGAAGTA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 1 3 106349 CASAVA_Build 6 22936208 3I TGAGGGAAAC ---/AAG AGAGAAACAA 3070 hom 112 het 42 0 38 4 AAG 0 1 106350 CASAVA_Build 6 22947261 1D AATGAATATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 10 9 106351 CASAVA_Build 6 22948544 3I AAAAATCTCC ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 46 12 22 12 CAA 3 4 106352 CASAVA_Build 6 22949659 1I CCAGAATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 9 10 106353 CASAVA_Build 6 22951717 2D TCATAATAGT GA/-- GAGAGTTCTC 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 GA 3 2 106354 CASAVA_Build 6 22952210 1I AACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 2386 het 2386 ref 17 7 6 4 A 13 14 106355 CASAVA_Build 6 22952954 24D TTTAAAGAAA GAAGGAAGGAAGGAAAGAAGGAAG/------------------------ GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 21 12 13 0 GAAGGAAGGAAGGAAAGAAGGAAG 1 0 106356 CASAVA_Build 6 22957405 1D ATTTTTCAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 10 9 106357 CASAVA_Build 6 22960284 1D ATCTAGCCTC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 8 7 106358 CASAVA_Build 6 22966388 1D TTGTAAGGCA T/- TTTTTTTTTG 1645 het 1645 ref 28 23 4 1 T 10 9 106359 CASAVA_Build 6 22966976 6D TTATTTTTTA TTTATT/------ TTTATTTTTA 3070 het 2195 hom 17 7 8 3 TTTATT 3 2 106360 CASAVA_Build 6 22973024 1I ACTAAGAAAC -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 A 6 7 106361 CASAVA_Build 6 22974681 1D AGAGAAGTGG A/- AAAACGTGCC 3070 hom 49 het 23 0 19 5 A 5 4 106362 CASAVA_Build 6 22980358 1D TTCAGCACGA G/- TAACCCCATT 3070 het 3070 ref 52 25 18 10 G 1 0 106363 CASAVA_Build 6 22981214 4D CCAGGACATA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 14 7 T 14 10 106364 CASAVA_Build 6 22994515 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 13 1 11 1 T 12 11 106365 CASAVA_Build 6 23003762 1D ATGTACAAGC T/- TTTTAAATTC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 5 4 106366 CASAVA_Build 6 23010235 1I CCAACTGCCT -/A AAAAATACTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 5 6 106367 CASAVA_Build 6 23011259 1I AAGTTCTTAT -/A AGTTTACTCG 3070 het 3070 hom 24 10 8 6 A 1 2 106368 CASAVA_Build 6 23013463 1I ACACAGATGA -/C CCTTAAGAAG 3070 het 3070 ref 38 21 17 0 C 2 3 106369 CASAVA_Build 6 23016960 8D CTCCCAATTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 18 12 T 19 11 106370 CASAVA_Build 6 23023013 4I TGAGTGTCAG ----/TCTC TCTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 TC 1 3 106371 CASAVA_Build 6 23026217 16D AGTCCTCAAG TATATCAACAATATGT/---------------- CATCAGGCAT 7 het 7 ref 44 25 1 24 TATATCAACAATATGT 1 0 106372 CASAVA_Build 6 23027086 2D TTTTATTGTC AT/-- GTAGTAACTC 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 AT 1 0 106373 CASAVA_Build 6 23037253 1I CAGAAGGCAA -/G GGAGTCACTG 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 G 2 3 106374 CASAVA_Build 6 23037399 1I AATGTTCTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 A 8 9 106375 CASAVA_Build 6 23038740 18D TACACACGTA TATACGTGTGTATATATG/------------------ TATCCTGGAT 1303 het 1303 ref 10 7 3 3 TATACGTGTGTATATATG 1 0 106376 CASAVA_Build 6 23045265 2I AATTTTTTTT --/AA GTTTACCTGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 2 106377 CASAVA_Build 6 23048341 1D TAATGAGGCC T/- TACTACTGGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 1 106378 CASAVA_Build 6 23055572 3I TTTTAAAAGA ---/TGC TGCTATTTCC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TGC 1 2 106379 CASAVA_Build 6 23058331 2I TATAAACATA --/TG TGTTATGTAC 3070 hom 94 het 37 0 32 5 TG 1 2 106380 CASAVA_Build 6 23059729 13D TAAAGTATAA TAATAAAAAAAAT/------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 17 0 18 1 TAATAAAAAAAAT 1 0 106381 CASAVA_Build 6 23062225 1I AATGCTTGGC -/A AGATAATAAA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 1 2 106382 CASAVA_Build 6 23067855 1D TAGAATGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 12 11 106383 CASAVA_Build 6 23081700 1I AGTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 9 10 106384 CASAVA_Build 6 23082800 1D40M3D GACAAGTCAG AAAAAAAAAAATAACCTGATGTCTGATCCCCTTACATGTGCAAA/-AAAAAAAAAATAACCTGATGTCTGATCCCCTTACATGTGC--- AAAAAACACA 3070 het 326 hom 26 1 21 15 N/A 0 0 106385 CASAVA_Build 6 23085313 7I AGCACAATGA -------/TGGTAAC AATAACAATA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 TGGTAAC 0 1 106386 CASAVA_Build 6 23094460 2I TTTTTCCAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 12 106387 CASAVA_Build 6 23101237 1I ATATTTTTTT -/C ATTTGTATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 0 1 106388 CASAVA_Build 6 23120808 1I GAGCTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1650 het 1650 ref 23 6 6 11 A 13 14 106389 CASAVA_Build 6 23131738 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2742 het 1122 hom 33 7 12 14 A 19 18 106390 CASAVA_Build 6 23132536 1I CCAGCTAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 10 106391 CASAVA_Build 6 23136177 1I TGCAGTATAC -/G TTATGATTTG 2758 het 2758 ref 14 7 6 1 G 0 1 106392 CASAVA_Build 6 23136261 4I ACATAAATTG ----/TGTA TGTAATTATA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TGTA 1 2 106393 CASAVA_Build 6 23142060 1I TGGAAATACT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 8 9 106394 CASAVA_Build 6 23144915 1I GCAGACTGGA -/G GGGTAAGAAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 G 3 4 106395 CASAVA_Build 6 23160046 1D TCCTCAGGCC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 70 het 28 0 24 5 T 9 8 106396 CASAVA_Build 6 23161187 5D TTTTACTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 T 18 13 106397 CASAVA_Build 6 23161493 1I GCGCCCGGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 9 10 106398 CASAVA_Build 6 23163330 1D TGTTTAGCAC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 9 8 106399 CASAVA_Build 6 23200113 1I CAATATCAGC -/T TTTTTACTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 5 6 106400 CASAVA_Build 6 23209535 2I ATCTGTAGTG --/AT GTCACTTTTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AT 0 1 106401 CASAVA_Build 6 23212020 3I TAATATTTTC ---/TTA TTATCCTTTT 1902 het 1902 ref 29 21 4 4 TTA 1 2 106402 CASAVA_Build 6 23227737 1I TTAAATTGTA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 7 106403 CASAVA_Build 6 23233980 3I GTTTTGCCTG ---/CAT GCTTGTCATA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 CAT 0 1 106404 CASAVA_Build 6 23237386 1D CATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 28 7 T 11 10 106405 CASAVA_Build 6 23263124 26D TATAACTTAC ATTTTCCAGTAAGTGACTACAAACTT/-------------------------- GACACTTCAT 3070 hom 114 het 38 0 38 5 ATTTTCCAGTAAGTGACTACAAACTT 1 0 106406 CASAVA_Build 6 23267557 1D TATTATTGTC T/- TTATTTGAAG 3070 hom 137 het 53 0 46 7 T 3 2 106407 CASAVA_Build 6 23268525 4D AACTCCCTTT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TA 9 7 106408 CASAVA_Build 6 23268593 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 1942 hom 27 het 15 0 10 6 TA 6 7 106409 CASAVA_Build 6 23279865 1I GTGGCTCATG -/C CTGTAATCCC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 1 2 106410 CASAVA_Build 6 23292104 2I GCTGAAGCAC --/AG ATAGAAAACT 3070 hom 111 het 41 0 37 7 AG 0 1 106411 CASAVA_Build 6 23295530 1D TTAGAACAGG A/- AAAAAAAAAA 674 het 674 ref 50 41 3 7 A 11 10 106412 CASAVA_Build 6 23295965 10I GGGAACTGCT ----------/TTTATGTGTA TTTTTATCTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TTTATGTGTA 0 1 106413 CASAVA_Build 6 23296239 3D CAAGGCATGC AAA/--- AAAAAAAAAA 2414 het 261 hom 33 4 6 25 A 19 16 106414 CASAVA_Build 6 23297671 1I AGACTACAGG -/A AAAAAAAAAA 2741 het 2741 ref 45 25 12 8 A 13 14 106415 CASAVA_Build 6 23304089 4I ATACTTACAC ----/AGAT AGATGTTCTA 3070 het 3070 hom 46 16 26 4 AGAT 1 2 106416 CASAVA_Build 6 23306032 1D TCTTTTTCCT G/- GGACCATACA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 3 2 106417 CASAVA_Build 6 23309195 1D ATTTTGTCAT A/- AAAATTTTCC 3070 hom 123 het 45 0 42 4 A 5 4 106418 CASAVA_Build 6 23314556 1I CCCAAACCAT -/C CCATGCAAGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 2 3 106419 CASAVA_Build 6 23337320 1I GGTGTGTGTT -/G TCTCGGGAGA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 0 1 106420 CASAVA_Build 6 23338140 1D AAATCAATTC A/- AAAAATAAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 6 5 106421 CASAVA_Build 6 23339915 5D TTTCTTACTT AACTC/----- AAGGTAATAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 AACTC 1 0 106422 CASAVA_Build 6 23340935 3I TTAAATTTTC ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 9 12 106423 CASAVA_Build 6 23344468 3I ATTTTAAAGA ---/TCT TCTTTGATTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TCT 1 2 106424 CASAVA_Build 6 23345674 1I TTAATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1810 hom 41 5 28 8 T 12 13 106425 CASAVA_Build 6 23347163 2I CTTATGAATA --/AG AGAGAGAGAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AG 4 5 106426 CASAVA_Build 6 23356543 2I TAGTTTTCAG --/TA TATATATATC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TA 4 5 106427 CASAVA_Build 6 23358020 3I GCTCAATAAT ---/CTC CTGAAAGAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CTC 0 1 106428 CASAVA_Build 6 23375086 3I CTTCTCCCTT ---/CTC CTTCTGATTG 3070 hom 85 het 32 0 23 9 CTC 0 1 106429 CASAVA_Build 6 23395647 1I AAATGAAGAC -/A ATACAAATGA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 1 2 106430 CASAVA_Build 6 23400505 5D TTATACATAG TATAT/----- TATATATTGT 1331 het 1331 ref 9 5 4 0 TATAT 2 1 106431 CASAVA_Build 6 23428484 2I TCTCTTTGTC --/TT TTTCTCTCTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 3 5 106432 CASAVA_Build 6 23431885 3I TTCATCCAAC ---/CTT CTTCTTCATT 3070 hom 94 het 36 0 31 5 CTT 2 3 106433 CASAVA_Build 6 23442861 1D ACACTGCTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 9 8 106434 CASAVA_Build 6 23449517 1I TATCTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 11 106435 CASAVA_Build 6 23451013 1D CCCTTTCCAG C/- CCCCCAACCC 3070 hom 101 het 40 0 34 7 C 6 5 106436 CASAVA_Build 6 23451211 2D TAAAAGAGCA TT/-- AATTGTAACA 3070 hom 111 het 48 0 37 12 T 2 0 106437 CASAVA_Build 6 23454513 1D TTGTACAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 28 0 22 6 A 12 11 106438 CASAVA_Build 6 23459850 1D TTAATGGAAT A/- AAAAAACCAC 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 7 6 106439 CASAVA_Build 6 23460071 17D TTGTGGCAAA ATCTTAAATTATTGTGT/----------------- ATCTTAAATT 3070 hom 42 het 20 0 15 9 ATCTTAAATTATTGTGT 2 1 106440 CASAVA_Build 6 23480964 3I GACATGTTTT ---/TTG TTTTTTTTTT 501 het 501 ref 15 7 5 3 TTG 0 1 106441 CASAVA_Build 6 23481740 2D TAACAAATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 AT 7 6 106442 CASAVA_Build 6 23482682 1D CCAATTTTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 9 8 106443 CASAVA_Build 6 23484679 1I TCTCCATTGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 8 9 106444 CASAVA_Build 6 23491772 1D CAGTCACTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 114 het 44 0 37 8 T 9 8 106445 CASAVA_Build 6 23491920 1D CATATGATCC T/- TTTTTTTTTT 1868 het 1868 ref 39 28 4 7 T 11 10 106446 CASAVA_Build 6 23494094 4D AATTTATCCA TAAT/---- TAATTATTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TAAT 2 1 106447 CASAVA_Build 6 23495315 4D36M1D45M1I GTTAATCAAC TGTTTGTTTATGTTATTGGTGAGGCTTCCAGTGAATAGTAGGTTATTAGTAGTTAAATTTTGGAGTTGTCAAAAGTTACACATAGA-/----TGTTTATGTTATTGGTGAGGCTTCCAGTGAATAGTA-GTTATTAGTAGTTAAATTTTGGAGTTGTCAAAAGTTATACATAGAT TTTTCAGCTG 3070 hom 78 het 19 0 27 19 N/A 0 0 106448 CASAVA_Build 6 23497069 16I TAATGTCCCA ----------------/ATCCTTTGAATAACCC TAGAGGCACG 3070 hom 60 het 20 0 21 1 ATCCTTTGAATAACCC 0 1 106449 CASAVA_Build 6 23498729 3I10M1D GGCAAAAAAC ---AAAACAAAACA/AAAAAAACAAAAC- AAAACAAAAA 1806 het 1806 ref 50 33 10 16 N/A 0 0 106450 CASAVA_Build 6 23503316 3D TGTGCATATC ACA/--- ACAACTGGGA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 ACA 2 1 106451 CASAVA_Build 6 23504981 8I CCTAGCTCAG --------/CTGGTTTT CTGGTTTTCT 3070 hom 100 het 42 0 34 8 CTGGTTTT 1 2 106452 CASAVA_Build 6 23505102 24D ATAACTAAAT TTATCTAAGTAACTCCCTAAACTG/------------------------ TTATCTAAGT 3070 hom 84 het 38 0 28 13 TTATCTAAGTAACTCCCTAAACTG 2 1 106453 CASAVA_Build 6 23511396 1D AATGAATATT A/- ATGTCAACAG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 2 1 106454 CASAVA_Build 6 23515115 10D AGAGAGAGAC AAAGAGAGGG/---------- AGAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 40 16 13 17 AAAGAGAGGG 1 0 106455 CASAVA_Build 6 23517675 1I AGTCAGCCCT -/C CCCTCAGGAT 3070 hom 111 het 40 0 33 7 C 3 4 106456 CASAVA_Build 6 23530079 1I AGAAGGGTTC -/A AATTCAACTT 3070 het 2838 hom 27 9 15 3 A 2 3 106457 CASAVA_Build 6 23533316 10D AAACAAACAA ACAAACAAAC/---------- AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 11 9 5 ACAAACAAAC 1 0 106458 CASAVA_Build 6 23535384 2I ATAAACATAC --/AT TTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 AT 0 1 106459 CASAVA_Build 6 23544414 1I TCAAATCTCT -/C CAGATAGCGT 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 C 1 2 106460 CASAVA_Build 6 23548635 4I CCCCATCACC ----/TACT TACTCCTTGT 3070 het 3070 ref 55 25 21 9 TACT 1 2 106461 CASAVA_Build 6 23548939 1D GGTGTTCTTG C/- CTTCTTCTCC 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 C 2 1 106462 CASAVA_Build 6 23554851 2I AAAGATGATC --/TG TGAGACAATC 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 TG 1 2 106463 CASAVA_Build 6 23559285 1D ATGCGCCACC A/- TGCCTGGATA 3070 het 1661 hom 18 5 10 5 A 1 0 106464 CASAVA_Build 6 23569625 9D AATAATATAT TTATAATAC/--------- TTATTATATA 2857 het 2235 hom 12 5 7 2 TTATAATAC 1 0 106465 CASAVA_Build 6 23573493 1I CCTGGAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 396 hom 45 1 36 8 A 9 10 106466 CASAVA_Build 6 23579386 6I ATGAAACCCA ------/TTCTAC AAATAAGGGG 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 TTCTAC 0 1 106467 CASAVA_Build 6 23581133 1D GACATCTATG A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 A 7 6 106468 CASAVA_Build 6 23582586 4I AATCAGGGTT ----/GAAC GTTCTTCCTC 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 GAAC 0 1 106469 CASAVA_Build 6 23583282 1I AAAACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 41 1 33 7 T 10 11 106470 CASAVA_Build 6 23583734 1I AGTTTCTAAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 T 7 8 106471 CASAVA_Build 6 23592565 1I AGGAATACAG -/A AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 A 6 7 106472 CASAVA_Build 6 23598419 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAACCT 3070 het 392 hom 25 4 14 7 C 0 1 106473 CASAVA_Build 6 23618683 9I AGGTAAAAAG ---------/GCAGAGACC GCAGATTAGG 2614 het 1970 hom 16 6 6 4 GCAGAGACC 0 1 106474 CASAVA_Build 6 23623123 1D CTTTGACTAA G/- GTAATTCTAC 3070 het 3070 ref 48 26 21 2 G 2 1 106475 CASAVA_Build 6 23624126 1D TTCTGTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 11 10 106476 CASAVA_Build 6 23633754 1D TTATTGGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 9 8 106477 CASAVA_Build 6 23636055 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 11 10 106478 CASAVA_Build 6 23636600 1I CATTTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 1877 het 1877 ref 15 5 6 4 A 11 12 106479 CASAVA_Build 6 23637086 10D CTTTATCAAG TAAGTTTATA/---------- TAATATTCGT 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 TAAGTTTATA 1 0 106480 CASAVA_Build 6 23642228 3I GCCTAAAGAC ---/GAA GAAGAGGAGC 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 GAA 1 2 106481 CASAVA_Build 6 23645950 1I ATTTACATTA -/G ATTTTATTCT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 G 0 1 106482 CASAVA_Build 6 23646644 2D TTTTGCATTT GA/-- GTCTATGATT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 GA 1 0 106483 CASAVA_Build 6 23655664 5I CCCCCATTAA -----/TCTCT TCTAACAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 TCTCT 0 1 106484 CASAVA_Build 6 23668810 1D GAACCATAGC A/- AACTCCATCT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 3 2 106485 CASAVA_Build 6 23671623 1I CAATATAAGG -/T TGCTCTAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 1 2 106486 CASAVA_Build 6 23691507 2D TTGTAAGTGA CC/-- CCCCCCCCCA 2769 het 1707 hom 21 10 6 6 C 11 9 106487 CASAVA_Build 6 23696899 11I TGCTTACTAG -----------/GCATAAACATT GAAACATGGG 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 GCATAAACATT 0 1 106488 CASAVA_Build 6 23701083 1D GTGTAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 12 11 106489 CASAVA_Build 6 23705327 1D ATCTCCATAG T/- TTTTTTTTTT 2411 het 2411 ref 21 10 7 4 T 11 10 106490 CASAVA_Build 6 23714687 2I TTATTATTTG --/TT TTTTTCTTGT 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 5 7 106491 CASAVA_Build 6 23731287 1D CTAGCAACAT A/- AATGAGACCT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 A 3 2 106492 CASAVA_Build 6 23760680 8D GCTAAAGCTG GAGGAGGT/-------- GAGGAGGTGA 3070 het 3070 hom 47 20 19 11 GAGGAGGT 3 2 106493 CASAVA_Build 6 23762142 1D GAGAGAATTC T/- TAAAAACACC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 1 106494 CASAVA_Build 6 23766159 4D AACCAAACCA AACC/---- AAAAAAAACC 595 het 595 ref 30 15 3 15 AACC 1 0 106495 CASAVA_Build 6 23771961 1I TGCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 33 1 23 9 A 10 11 106496 CASAVA_Build 6 23775602 2I CATATTTGTC --/TT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 8 10 106497 CASAVA_Build 6 23775682 2D GTCCTCTGAC TT/-- TGTTCCTCTC 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 3 1 106498 CASAVA_Build 6 23778538 1D ATACTTCCTC T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 T 8 7 106499 CASAVA_Build 6 23786980 1I TTGAAAGGCC -/A AAGGCTTTCA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 A 2 3 106500 CASAVA_Build 6 23787975 2D CAAAGCAGTA TC/-- TCTCTGTGTT 3070 het 3070 ref 47 22 21 5 TC 3 2 106501 CASAVA_Build 6 23788411 1I TCAGAGACCA -/T TTATAGGATG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 2 3 106502 CASAVA_Build 6 23788523 5I TGTTTTGCCC -----/CAAAA CAAACTTGAC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 CAAAA 0 1 106503 CASAVA_Build 6 23789536 2D CTGAAAACAC AT/-- AAAGTGTTGC 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 AT 1 0 106504 CASAVA_Build 6 23790364 1D GTATTATTAT C/- GTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 22 15 7 C 1 0 106505 CASAVA_Build 6 23791290 1I TTTAAAAGAG -/T TATCTCTACC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 1 2 106506 CASAVA_Build 6 23798819 1D TCTGGGCAGA G/- AAGTGAGAAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 G 1 0 106507 CASAVA_Build 6 23800646 1D ACAATACTCT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 8 7 106508 CASAVA_Build 6 23805372 1D GTGCCTGGAA G/- GGAAATGCAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 3 2 106509 CASAVA_Build 6 23808251 2D119M2I CAAAAAAAAA ATATATATATATATATATATGTGTATGTGTGTGTATATATATATGCGTATATATACATATGTGTGTATATATGCATATATACATACACATGGGGTGTATATACATGCATATATATATATAT--/--AAAAATATATATATATATGTGTATGTGTGTGTATATATATATGTGTATATATACATATGTGTGTATATATGCATATATACATACACATGGGGTGTATATACATGCATATATATATATATAC ACACACGGGG 2720 het 2720 ref 10 16 10 16 N/A 0 0 106510 CASAVA_Build 6 23810831 4D CATTACTGAT ACTA/---- TATATGAGAG 3070 het 3070 ref 41 25 14 3 ACTA 1 0 106511 CASAVA_Build 6 23813476 1D AAATTAAAAA G/- AAAGAATAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 0 106512 CASAVA_Build 6 23815409 2I CCATAATATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 79 hom 38 1 30 7 TG 8 9 106513 CASAVA_Build 6 23818794 2D3M4I9M4D1M2I TAAACCAGAT TGTGG----AATTAAATTTGGAC--/--TGGTCCAAATTTAATT----CCA CAATCTTACT 3070 hom 90 het 32 0 31 5 N/A 0 0 106514 CASAVA_Build 6 23819080 1D CATTTTGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 10 9 106515 CASAVA_Build 6 23822767 2I CCAGAAAAAA --/GT GTGTCTGTGA 3070 hom 157 het 61 0 53 8 GT 2 3 106516 CASAVA_Build 6 23824285 1D GGTCCTTTTT A/- ATCATTGAGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 2 1 106517 CASAVA_Build 6 23826297 4D TGTTGTAAAT ATAA/---- ATATTTTATA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 ATAA 1 0 106518 CASAVA_Build 6 23827215 1D TTGGATTTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 9 8 106519 CASAVA_Build 6 23827945 1I GATAATTTAT -/A AAAAAAAAAA 2890 het 2890 ref 25 14 7 4 A 10 11 106520 CASAVA_Build 6 23828075 2I GGGATTATGC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 TA 6 7 106521 CASAVA_Build 6 23834084 3D CTCTCTTCTA GGG/--- CATGGCATCT 3070 het 3070 hom 55 25 27 3 G 3 0 106522 CASAVA_Build 6 23835704 3D TTGACAATCT CTC/--- CTAATAAACA 3070 het 3070 hom 46 20 20 7 CTC 1 0 106523 CASAVA_Build 6 23839859 1D GTTAATAGTA T/- TGTACCCTTA 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 T 2 1 106524 CASAVA_Build 6 23840734 1D TAATGGAAAC T/- TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 9 T 7 6 106525 CASAVA_Build 6 23841524 2I CTCAAAATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 10 12 106526 CASAVA_Build 6 23841697 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 55 het 28 0 18 10 T 8 9 106527 CASAVA_Build 6 23843136 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 8 9 106528 CASAVA_Build 6 23845642 2I GTTTGCGTAC --/GT GTGTGTTTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GT 3 4 106529 CASAVA_Build 6 23853807 1D ACACGTTCAC A/- AAAAAAGGAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 7 6 106530 CASAVA_Build 6 23853973 3I AATGCTAAAA ---/AAT ATGATTCTCA 3070 hom 138 het 53 0 47 7 AAT 0 1 106531 CASAVA_Build 6 23855006 3I TAATGACATA ---/AAC ACATTAAATA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 AAC 0 1 106532 CASAVA_Build 6 23855339 1I GAAAGAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 29 0 24 5 A 11 12 106533 CASAVA_Build 6 23857613 1D CTCATTGTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 9 8 106534 CASAVA_Build 6 23858798 1D CTTTTGCCCA T/- TTTTTTATAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 6 106535 CASAVA_Build 6 23860410 1D GAATTGTTCT A/- AAAAAAAAAA 2156 hom 3 het 27 0 7 20 A 11 10 106536 CASAVA_Build 6 23860847 1I GCATTATCTG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 A 8 9 106537 CASAVA_Build 6 23861682 2I CCCTGAACTT --/AA AAGTTACAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 2 4 106538 CASAVA_Build 6 23862797 3I TGAAATCCGT ---/ACA ACATCAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 ACA 1 2 106539 CASAVA_Build 6 23865115 1I AATTTTTAGA -/G TTTTCTACGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 106540 CASAVA_Build 6 23868338 2D CCCAGTGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 30 1 23 7 A 13 11 106541 CASAVA_Build 6 23870193 3I GTAGGTTCAC ---/CTT CTTCTTCTGT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CTT 2 3 106542 CASAVA_Build 6 23870946 1D CATTTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 10 23 11 T 12 11 106543 CASAVA_Build 6 23872776 1I GTGGTCTGTG -/C TGAGAAAGAG 3070 hom 108 het 46 0 37 9 C 0 1 106544 CASAVA_Build 6 23875083 6D CCTCAGCCTC AGACAG/------ ACACAGGCTG 1010 hom 10 het 6 0 4 6 AGACAG 1 0 106545 CASAVA_Build 6 23875103 1D AGGCTGTCTC T/- TTTTTACGCC 2469 hom 18 het 9 0 7 2 T 6 5 106546 CASAVA_Build 6 23875894 2D CACTGCAGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 12 10 106547 CASAVA_Build 6 23877623 1I CCACTGCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 24 1 21 2 A 11 12 106548 CASAVA_Build 6 23879403 12I ATTATTGATA ------------/ATGGTTGTATTT AGGTCCAGCA 3070 hom 96 het 32 0 33 3 ATGGTTGTATTT 0 1 106549 CASAVA_Build 6 23881237 14I TGCCAGAACC --------------/TGGTATTGTCAATA TGTCTGATCT 3070 hom 99 het 40 0 34 7 TGGTATTGTCAATA 0 1 106550 CASAVA_Build 6 23883358 1D ACCAATTGAA T/- TAAGTACATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 106551 CASAVA_Build 6 23890429 1D CTATTTTTTT G/- ACATTTATTT 3070 hom 119 het 45 0 38 7 G 1 0 106552 CASAVA_Build 6 23891695 2D GACTGTATTT TC/-- TCAGTTTAAA 3070 hom 132 het 51 0 45 9 TC 2 1 106553 CASAVA_Build 6 23896311 15I3M13I2M3I TCATAGGGCT ---------------CTG-------------TG---/ATTTTAAAAATATAACTGAAAGAGTATAGTTTGTAA TTCTGCAGAC 3070 het 3070 ref 34 22 13 3 N/A 0 0 106554 CASAVA_Build 6 23913423 1D TTAAAGGAGC T/- GATGGAGCTG 1398 het 1098 hom 8 3 3 2 T 1 0 106555 CASAVA_Build 6 23929491 1I ATACAGCCAT -/A AAAAAAGGGT 3070 het 2933 hom 27 8 13 6 A 6 7 106556 CASAVA_Build 6 23930604 1I CAAAAAAAAA -/T AAAAAAATAA 3070 het 352 hom 22 4 10 8 T 0 1 106557 CASAVA_Build 6 23935731 1D TTCACTACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2872 hom 24 10 13 1 T 10 9 106558 CASAVA_Build 6 23938329 2D ACTGAATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 9 10 T 14 12 106559 CASAVA_Build 6 23946740 3D AGACTTTAAT ATC/--- ATTTATTTGT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATC 1 0 106560 CASAVA_Build 6 23950203 1D AAAGAAAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 432 hom 29 1 23 5 T 9 8 106561 CASAVA_Build 6 23952223 1I GTAACCTTTC -/T TCTCAGCATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 2 106562 CASAVA_Build 6 23954730 1D TCTGATAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 35 1 25 9 T 11 10 106563 CASAVA_Build 6 23957298 1D ACTGGGAGGA T/- TTTTTTTTCG 3070 hom 182 het 66 0 60 6 T 9 8 106564 CASAVA_Build 6 23964908 5I TGTAAGTCTT -----/AGAGA AAAGAAGTCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AGAGA 0 1 106565 CASAVA_Build 6 23967255 1D TGCCTTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 10 9 106566 CASAVA_Build 6 23974301 2D TTCAACATAC TA/-- TACTGGGAGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TA 2 1 106567 CASAVA_Build 6 23974928 1I ACTATACTGT -/A AAGGCCACAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 2 3 106568 CASAVA_Build 6 23976392 1I TACCAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 562 hom 23 2 18 3 A 13 14 106569 CASAVA_Build 6 23980221 2I ACATGGAGCT --/AC AGAGACTGAC 3070 hom 244 het 92 0 82 10 AC 0 1 106570 CASAVA_Build 6 23982136 2D ATGATAAAAT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 het 19 hom 25 1 11 13 G 13 11 106571 CASAVA_Build 6 24020072 1D ACCCAGGAAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 73 het 30 0 25 6 A 8 7 106572 CASAVA_Build 6 24021813 1D TCTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 12 11 106573 CASAVA_Build 6 24022060 2I TTTTCTACCA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 9 11 106574 CASAVA_Build 6 24024211 2I AGACTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 38 0 21 17 A 12 14 106575 CASAVA_Build 6 24040442 2D GAAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 25 10 A 13 11 106576 CASAVA_Build 6 24041458 2D TATTTATATT AA/-- AAAAAAAAAA 1658 het 276 hom 20 3 4 14 A 14 12 106577 CASAVA_Build 6 24044502 2D AAAGAAACAG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 129 het 48 0 44 6 A 10 8 106578 CASAVA_Build 6 24047366 5D GCTCTTAATT TAAAA/----- TAACACTATA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TAAAA 1 0 106579 CASAVA_Build 6 24050748 2I TTTCTACTCT --/TC AAGATTCACA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TC 0 1 106580 CASAVA_Build 6 24051564 3I CTATGTTATT ---/TCA TCATCATCAT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 TCA 3 4 106581 CASAVA_Build 6 24051682 16I CTCTTCTCCA ----------------/CTATAAGTGTAAGAGG CTGCAAAAGA 3070 hom 99 het 34 0 33 2 CTATAAGTGTAAGAGG 0 1 106582 CASAVA_Build 6 24052234 1I TCTACCCCTG -/A AAAAGATTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 4 5 106583 CASAVA_Build 6 24054706 1I CTGTAGTAGT -/A AGTATCAATA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 1 2 106584 CASAVA_Build 6 24055391 1D TCACAGCCTC T/- TTCCAGTGTT 3070 hom 99 het 36 0 31 5 T 3 2 106585 CASAVA_Build 6 24056000 2D TAAAAACTCG AA/-- AAAAAAAAAA 1022 het 553 hom 24 3 3 19 A 12 10 106586 CASAVA_Build 6 24058462 3D GAGTGGGTCA GTT/--- GTTGTCAGAG 3070 hom 114 het 41 0 39 3 GTT 2 1 106587 CASAVA_Build 6 24064324 3I ACCTTGCAGT ---/CTC CTCTTATTTT 3070 hom 107 het 43 0 36 7 CTC 1 2 106588 CASAVA_Build 6 24065646 1D TCTCCTGGGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 42 0 35 8 A 9 8 106589 CASAVA_Build 6 24074016 1I TATATAATGA -/C TTTTTTCCCT 3070 hom 101 het 42 0 32 10 C 0 1 106590 CASAVA_Build 6 24079076 1I TTTGGGATAT -/C CAGGGAATTT 3070 het 630 hom 48 2 40 6 C 1 2 106591 CASAVA_Build 6 24081748 4D AATTAACAGG AAAA/---- AAAAAAAAAC 2450 het 306 hom 18 4 5 12 A 13 9 106592 CASAVA_Build 6 24084631 1D GCCTCGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2522 hom 17 6 8 3 T 13 12 106593 CASAVA_Build 6 24091736 1I AAAACAATTG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3055 hom 30 9 18 3 T 7 8 106594 CASAVA_Build 6 24104494 1D AAGCAAATGC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 9 8 106595 CASAVA_Build 6 24110894 1D TTAATGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 560 hom 25 3 14 8 T 11 10 106596 CASAVA_Build 6 24110963 1I AATAAATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 10 11 106597 CASAVA_Build 6 24117146 1D GATAAAACTC A/- ATACTGAAAA 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 A 2 1 106598 CASAVA_Build 6 24128233 1I TTGGCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 A 12 13 106599 CASAVA_Build 6 24130417 1I TTTTGTTGGC -/A AAAAAAAAAA 2771 het 2771 ref 29 15 9 5 A 10 11 106600 CASAVA_Build 6 24134150 1I AGTTTACTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 A 9 10 106601 CASAVA_Build 6 24141539 1D CATGAAGAAA T/- TTTAAACAGA 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 T 4 3 106602 CASAVA_Build 6 24153001 1D ATCCCCAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 2989 hom 36 12 17 8 T 3 2 106603 CASAVA_Build 6 24160735 1D CAGGGTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 58 23 22 14 A 12 11 106604 CASAVA_Build 6 24176377 5I CTGGAATCTT -----/GAGAG GAGAAACTTA 3070 hom 66 het 32 0 23 9 GAGAG 0 1 106605 CASAVA_Build 6 24188813 1D GAGATAAAAA G/- GGGGGGCGAG 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 G 7 6 106606 CASAVA_Build 6 24204966 4D CCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 14 21 4 AAAC 3 2 106607 CASAVA_Build 6 24217563 2D AAAAACACAC TG/-- TCTTACCAAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 TG 1 0 106608 CASAVA_Build 6 24229412 1I GGTTTCTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 101 het 38 0 34 4 T 7 8 106609 CASAVA_Build 6 24233292 3I AAATGTTAGG ---/TAT TATTATTATT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TAT 5 6 106610 CASAVA_Build 6 24241283 1D GTAACAAAAT C/- CATATAAATG 3070 het 3070 hom 46 13 28 5 C 2 1 106611 CASAVA_Build 6 24244751 1D CCTATTTGTC A/- AAAAAAAAAA 1268 het 1268 ref 46 33 6 7 A 12 11 106612 CASAVA_Build 6 24268016 3I TATGTGAACA ---/CTT TTTTATATTT 3070 hom 113 het 44 0 37 7 CTT 0 1 106613 CASAVA_Build 6 24268230 1D GAGAGTTGGC A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 135 het 50 0 43 7 A 8 7 106614 CASAVA_Build 6 24270195 1I TGCTAGTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 183 hom 36 1 27 8 A 12 13 106615 CASAVA_Build 6 24270791 3I AAAGATCTGA ---/AAT AATTACCCAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AAT 1 2 106616 CASAVA_Build 6 24273447 1D GAGTCACACC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 10 9 106617 CASAVA_Build 6 24284534 1D ATGTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 11 10 106618 CASAVA_Build 6 24292791 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 117 hom 24 1 18 5 A 10 11 106619 CASAVA_Build 6 24304431 1D AATAATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 35 1 26 8 T 11 10 106620 CASAVA_Build 6 24322694 1I ATATGTATAA -/T TAATGCTTAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 2 106621 CASAVA_Build 6 24326295 2I CAAATATGCC --/CA TATATCAGCA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 CA 0 1 106622 CASAVA_Build 6 24330322 3D AGAAAAAGAC AAG/--- AGAATATTCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAG 1 0 106623 CASAVA_Build 6 24351169 1D ATCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 23 1 18 5 A 11 10 106624 CASAVA_Build 6 24357376 3I CAAAGGAATT ---/AGC AGAGTGAAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGC 0 1 106625 CASAVA_Build 6 24363039 1D TTCATACTAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 29 0 29 1 A 9 8 106626 CASAVA_Build 6 24363578 1D CATAGCACTG A/- AAAAAAAAAA 1107 het 1107 ref 34 27 3 4 A 12 11 106627 CASAVA_Build 6 24364483 1I TGCTGGACAT -/G TTTTTTTTTT 2350 het 77 hom 36 3 13 20 G 0 1 106628 CASAVA_Build 6 24367341 1I AAGACATGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 73 het 29 0 25 4 A 9 10 106629 CASAVA_Build 6 24372636 4I AAACTTTTCA ----/AGAC AGACAGTATA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AGAC 1 2 106630 CASAVA_Build 6 24385474 5D CCACGGGTGG GGTGT/----- GGTGGGGTGG 3070 hom 39 het 18 0 14 6 GGTGT 1 0 106631 CASAVA_Build 6 24389787 6D CATAATACAC TATATA/------ TATAAATTAT 3070 hom 84 het 29 0 29 1 TA 5 2 106632 CASAVA_Build 6 24395574 1I TTTTGTTTCA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 78 het 37 0 26 11 T 7 8 106633 CASAVA_Build 6 24410502 1I TGATCTGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 31 1 18 12 A 14 15 106634 CASAVA_Build 6 24417512 2D AGCCCGGGCG AC/-- ACAGTGCAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 4 AC 2 1 106635 CASAVA_Build 6 24427495 1D ATTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 11 10 106636 CASAVA_Build 6 24429450 2I CACAATAGTA --/AC AGTTACTACA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 AC 0 1 106637 CASAVA_Build 6 24432382 6D CAAAGCACCT GATGTA/------ GATACAGAAG 3070 hom 126 het 45 0 43 3 GATGTA 1 0 106638 CASAVA_Build 6 24434678 2D GCTGGGTGAC AT/-- ATATATATTA 3070 hom 78 het 32 0 26 7 AT 5 4 106639 CASAVA_Build 6 24449719 1I GAGACCTACC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 817 hom 39 2 31 6 T 7 8 106640 CASAVA_Build 6 24450155 2D GTGCACGCGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 41 0 32 11 AC 9 8 106641 CASAVA_Build 6 24464859 2I TATTTTTCTA --/AT TGCACATATC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 AT 0 1 106642 CASAVA_Build 6 24468005 2D AATGAGAAAC AG/-- AGCGAAGACT 3070 hom 57 het 23 0 18 5 AG 2 1 106643 CASAVA_Build 6 24468965 3I TACGAATAAA ---/AAG AAGAACTGCC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AAG 1 2 106644 CASAVA_Build 6 24475056 1D AAATCTAAAT C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 1 0 106645 CASAVA_Build 6 24475970 1I AATATACAGT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 7 8 106646 CASAVA_Build 6 24483627 1D TGTGTAAACT C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 66 het 23 0 20 3 C 9 8 106647 CASAVA_Build 6 24484057 4I AGGGAGAGTA ----/AGAT AGAGGAAGAA 3070 hom 67 het 33 0 25 8 AGAT 0 1 106648 CASAVA_Build 6 24485025 1D TTTTTTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 29 0 23 6 A 13 12 106649 CASAVA_Build 6 24515403 4D ATGTTACGTA TATT/---- TATTTTCAAA 3070 het 3070 ref 35 19 15 3 TATT 2 1 106650 CASAVA_Build 6 24520411 1I TATGTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 889 het 889 ref 34 23 3 8 T 13 14 106651 CASAVA_Build 6 24534913 2I GATGTCAGAG --/TC TGCTCTAACT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 TC 0 1 106652 CASAVA_Build 6 24536366 2D CCTCAGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1978 het 906 hom 37 8 6 23 T 16 14 106653 CASAVA_Build 6 24538808 4D GTGAGAGCAC TACT/---- TACTTAAGTA 3070 hom 130 het 49 0 41 10 TACT 2 1 106654 CASAVA_Build 6 24546997 2D CATTCCTTTT TC/-- TTTTTTTATT 3070 het 2265 hom 20 7 10 3 TC 1 0 106655 CASAVA_Build 6 24547405 3D TCCATGGCAA GAG/--- GATACCTGAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 GAG 1 0 106656 CASAVA_Build 6 24547523 4D AGCAAGAATT AGAA/---- AGCCTGAATA 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 AGAA 1 0 106657 CASAVA_Build 6 24548417 1I AATCCCAGCA -/C TTTGGGAGGC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 C 0 1 106658 CASAVA_Build 6 24548931 2D TCCAACTATT AA/-- AAAAAAAAAA 2590 het 1092 hom 22 5 9 9 A 16 14 106659 CASAVA_Build 6 24549365 1I AAAAAAAAAA -/G TAGCTGGGCA 2819 hom 24 het 10 0 8 2 G 0 1 106660 CASAVA_Build 6 24553167 2D AAAATACACT AA/-- GTTACTTTCA 3070 het 3070 hom 20 8 12 0 A 2 0 106661 CASAVA_Build 6 24554557 1I TTTTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 11 12 106662 CASAVA_Build 6 24556534 41D TGTCTATAAT CCCAGTGCTTTGGGAGGCCCAAGTGGGAACATTGCTTGAGG/----------------------------------------- CCAGGAGTTC 2748 het 2748 ref 29 24 9 5 CCCAGTGCTTTGGGAGGCCCAAGTGGGAACATTGCTTGAGG 1 0 106663 CASAVA_Build 6 24559540 5D ATTCTTTCTC TTTTT/----- TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 T 8 3 106664 CASAVA_Build 6 24562685 3D ACTCATGAAG CTT/--- CTTGTCTTAT 3070 het 3070 hom 57 18 29 11 CTT 2 1 106665 CASAVA_Build 6 24566732 1I TCCCCGGTCC -/G GGACCAGCTA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 G 2 3 106666 CASAVA_Build 6 24567085 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2617 het 2617 ref 24 8 9 7 A 13 14 106667 CASAVA_Build 6 24567661 3D ACAGGGTCTC ATT/--- ATGTTACCCA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 ATT 1 0 106668 CASAVA_Build 6 24571399 1I TCATTTCTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 2873 hom 21 7 11 3 A 8 9 106669 CASAVA_Build 6 24575040 1D TGGCAGAGAG A/- AAGAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 19 7 A 3 2 106670 CASAVA_Build 6 24577986 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 1748 het 767 hom 6 2 4 0 A 10 11 106671 CASAVA_Build 6 24583497 4D TAACAATCCT ATTA/---- AAAGTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 ATTA 1 0 106672 CASAVA_Build 6 24585959 1I AAATAACTTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 8 9 106673 CASAVA_Build 6 24586944 3I23M2I GGTCCAGCTC ---TCAAGTGGTCCTCTTCATGCAGC--/TCATCAAGTGGTCCTCTTCATGCAGCTG TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 32 14 17 9 N/A 0 0 106674 CASAVA_Build 6 24588005 2D TTGTACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 AT 6 5 106675 CASAVA_Build 6 24588866 2I TGGGAGGGCT --/AA AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 7 9 106676 CASAVA_Build 6 24593695 1I TTCTCAAGTA -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 6 7 106677 CASAVA_Build 6 24595025 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 311 hom 25 1 21 3 A 11 10 106678 CASAVA_Build 6 24595471 1D TCCACTCAGG C/- CCCTTTATAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 C 4 3 106679 CASAVA_Build 6 24595725 5D AGATGCAATC TGTCT/----- TGTAAATTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 TGTCT 1 0 106680 CASAVA_Build 6 24598959 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 254 hom 24 3 15 6 A 13 12 106681 CASAVA_Build 6 24606223 1I GTTATCCCAT -/A AAAGGATGTA 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 A 3 4 106682 CASAVA_Build 6 24607668 1D AATGAATTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 10 9 106683 CASAVA_Build 6 24607767 1D GATGCTATCA T/- TGGCTCACTG 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 T 2 1 106684 CASAVA_Build 6 24609104 1D ACAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 9 8 106685 CASAVA_Build 6 24609808 3D CCAGCTACTC AGT/--- AGTAGGCTGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 4 AGT 2 1 106686 CASAVA_Build 6 24611232 1D GAAAAAATTA G/- ATGTTTCCTA 3070 het 3070 ref 48 26 19 6 G 1 0 106687 CASAVA_Build 6 24614141 3D TGTCACTGAA CTC/--- CAGCCTGGGC 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 CTC 1 0 106688 CASAVA_Build 6 24615050 5I CAGCTTACAT -----/TAGTA TAGTATATTT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TAGTA 1 2 106689 CASAVA_Build 6 24615133 3D TTCTCAGATT TTA/--- TTAGTCTGTA 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 TTA 2 1 106690 CASAVA_Build 6 24615526 2D TTGGCTCACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 489 hom 31 2 17 14 T 13 11 106691 CASAVA_Build 6 24615678 1I TTTGGTTTGG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 7 8 106692 CASAVA_Build 6 24617321 10D AAAGCTCTTT AGTTTATTTA/---------- AGTCCCAGCT 3070 het 3070 ref 26 14 11 2 AGTTTATTTA 1 0 106693 CASAVA_Build 6 24621303 1D TTTTTTTCTT G/- AGACAGAGGC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 1 0 106694 CASAVA_Build 6 24628032 1D TACTTTAAAA T/- GTTATCAGTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 1 0 106695 CASAVA_Build 6 24628195 1I GTCTCACCCT -/C ACCCCAACCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 0 1 106696 CASAVA_Build 6 24636111 1D TTTGAAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 9 8 106697 CASAVA_Build 6 24646674 1I ATATTTTAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 7 8 106698 CASAVA_Build 6 24649149 4D TGCACTCATT TGTA/---- TGTGAGTGTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 TGTA 1 0 106699 CASAVA_Build 6 24667825 2D CCATAATAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 16 11 A 13 11 106700 CASAVA_Build 6 24675392 1D TCTCTAAGAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 9 8 106701 CASAVA_Build 6 24688165 1I TGGCTGTAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 A 8 9 106702 CASAVA_Build 6 24690678 5D TCAACTCAGC TTTCT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 TTTCT 1 0 106703 CASAVA_Build 6 24690867 1I GTATAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 30 1 26 3 A 13 14 106704 CASAVA_Build 6 24697748 4D TTCTCGTGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 hom 137 het 54 0 44 10 AGTG 2 1 106705 CASAVA_Build 6 24698082 5I GTATAACCGA -----/TAACT TAAAGTTACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAACT 0 1 106706 CASAVA_Build 6 24702852 1I AAAACAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 22 1 17 4 C 0 1 106707 CASAVA_Build 6 24708240 2D CCAACTGCCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 13 11 106708 CASAVA_Build 6 24714150 1I TGGATGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 24 1 17 6 T 11 12 106709 CASAVA_Build 6 24720255 1D ACTTTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 31 1 21 9 A 14 13 106710 CASAVA_Build 6 24735674 3I TCCTTCTTTC ---/CTT CTTTTTTTCC 3070 hom 133 het 58 0 40 18 CTT 1 2 106711 CASAVA_Build 6 24738818 4I AAAAAATTAT ----/AAAC AAATCGTGCC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AAAC 0 1 106712 CASAVA_Build 6 24738914 4D ATATATACAC ATAT/---- ACACACAAAC 1144 het 1144 ref 15 7 7 2 AT 2 0 106713 CASAVA_Build 6 24740604 2D TTCAGAAGTT AA/-- GTTTCCAGTT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 2 0 106714 CASAVA_Build 6 24744050 2D TAAATGGGTG TT/-- TTAAGCAACT 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 T 4 2 106715 CASAVA_Build 6 24746031 1D TCCTTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 30 1 23 6 A 14 13 106716 CASAVA_Build 6 24746967 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 19 1 14 6 A 14 12 106717 CASAVA_Build 6 24748253 5I AAAACATTTA -----/TTAAC TTTAGATTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTAAC 0 1 106718 CASAVA_Build 6 24749851 1I TGTTTAAGAC -/A AAAGAGGTTG 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 3 4 106719 CASAVA_Build 6 24750394 4I AAAGAAAGAA ----/AGAG AGAGAGAAAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AG 3 5 106720 CASAVA_Build 6 24752454 1D ACAGGGGAGA G/- GGGGGGGTTC 3070 hom 86 het 38 0 32 6 G 8 7 106721 CASAVA_Build 6 24755132 1D TAGGAGGTAT A/- AGTGCAGTGC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 2 1 106722 CASAVA_Build 6 24755764 6I GGCTGAGAGG ------/ACAAAT ACAAAGTCAG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 ACAAAT 0 1 106723 CASAVA_Build 6 24757162 1I CTCAGCCTCC -/T TGAGTAGCTT 2548 hom 18 het 7 0 7 0 T 1 2 106724 CASAVA_Build 6 24757205 2I GCCTGGCTAA --/TT TTTTTGTATT 236 het 236 ref 8 4 2 2 T 5 7 106725 CASAVA_Build 6 24759332 1I CCACTAACTT -/A AAAAAAAAAA 2889 het 2862 hom 48 18 17 13 A 17 18 106726 CASAVA_Build 6 24760192 1I TTTTAATCTT -/C CCCCAACTGA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 C 4 5 106727 CASAVA_Build 6 24765708 3D TTGAAAAAGC ATA/--- ATAACCACAA 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 ATA 2 1 106728 CASAVA_Build 6 24765833 6D CTTTTCACAC TATTAA/------ TATTAAGTTG 3070 het 3070 hom 32 13 17 10 TATTAA 2 1 106729 CASAVA_Build 6 24769023 4I TGACTCTGAC ----/GTCA ATTTTTGAAG 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 GTCA 0 1 106730 CASAVA_Build 6 24770032 4I TACTGTGGGG ----/GAAA GAAAGAGAGA 3070 hom 94 het 34 0 32 2 GAAA 1 2 106731 CASAVA_Build 6 24774300 1I GGTGTGCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 14 26 6 A 9 10 106732 CASAVA_Build 6 24775185 2I GAAATGCGCT --/CC GCTCTCGGAA 3070 hom 50 het 21 0 15 6 C 0 2 106733 CASAVA_Build 6 24777015 1I GAAAGAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 8 9 106734 CASAVA_Build 6 24782114 3D TTTACCATAC AGT/--- ATTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 35 14 18 5 AGT 1 0 106735 CASAVA_Build 6 24789391 1D ACCTTTTTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 9 8 106736 CASAVA_Build 6 24789712 2I3M1I CTTTTTTTTT --TTA-/TATTAT TTCTATCTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 N/A 0 0 106737 CASAVA_Build 6 24789786 2D TCTCTCTCCG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 50 het 21 0 15 7 TC 7 6 106738 CASAVA_Build 6 24792757 18I GCCCGTTGAA ------------------/CCAGAAATACAGAGTTTC CCAGAAGTTG 3070 hom 72 het 22 0 25 3 CCAGAAATACAGAGTTTC 0 1 106739 CASAVA_Build 6 24792925 31I TAACAGTATA -------------------------------/TCCAAGGTATTGTTTATCATGTAATCAATGT TAAAAAGTGT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TCCAAGGTATTGTTTATCATGTAATCAATGT 0 1 106740 CASAVA_Build 6 24809123 1I ATCTCCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 11 106741 CASAVA_Build 6 24813281 1I TTAAAAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1312 hom 26 5 11 10 A 13 14 106742 CASAVA_Build 6 24822661 1D TAAAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 12 11 106743 CASAVA_Build 6 24822825 1I GCTCATGATG -/T TAATTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 T 1 2 106744 CASAVA_Build 6 24836432 1I TAATTAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 39 0 28 11 T 10 11 106745 CASAVA_Build 6 24850566 1D ATGAGAAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 20 18 11 T 10 9 106746 CASAVA_Build 6 24855129 1D ATAATCATTG C/- CACATGCTAG 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 C 2 1 106747 CASAVA_Build 6 24863327 1I CAGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 28 0 23 5 A 9 10 106748 CASAVA_Build 6 24872777 2I GTAAGTCTGT --/TG TGTGAAAGAC 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 TG 2 3 106749 CASAVA_Build 6 24873349 1I TCTTGGTCTC -/A ACTGACTTCA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 1 2 106750 CASAVA_Build 6 24912654 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 7 8 106751 CASAVA_Build 6 24913444 2D21M3D CTCATTAATT AAAAAAAAAAAAGCATAAGCTTTGAG/--AAAAAAAAAAGCATAAGCTTT--- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 25 18 9 4 N/A 0 0 106752 CASAVA_Build 6 24913806 1D TTATTTGAAG A/- TATTCTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 1 0 106753 CASAVA_Build 6 24914719 2I CAATTCAAAC --/TT AACGTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 T 0 2 106754 CASAVA_Build 6 24927838 17I CTCCTACCTC -----------------/AGCCTCCCGAGTAGCAG GATTACAGGT 914 het 914 ref 13 4 2 9 AGCCTCCCGAGTAGCAG 0 1 106755 CASAVA_Build 6 24934702 2I TTTATTTAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 12 14 106756 CASAVA_Build 6 24935109 1I TCTGTTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 11 9 T 11 12 106757 CASAVA_Build 6 24952579 1I AGTCAGCTCT -/C CTTGTGCTGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 1 2 106758 CASAVA_Build 6 24965155 2I TGAAGAAAAC --/TG AATGTGAGAA 3070 hom 144 het 55 0 49 6 TG 0 1 106759 CASAVA_Build 6 24968501 3I GACATTCTGT ---/ACA ACAATGGTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 ACA 1 2 106760 CASAVA_Build 6 24971003 1I CCTCCCCCGA -/C CCACTGGCAC 2121 hom 20 het 9 0 7 2 C 2 3 106761 CASAVA_Build 6 24999069 1I TGCTATTTTG -/C CCAGGCTGGT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 C 2 3 106762 CASAVA_Build 6 25011791 1I TTCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 268 hom 37 1 33 3 T 9 10 106763 CASAVA_Build 6 25020738 1I CAGATGCCTA -/G CACCTTCCAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 0 1 106764 CASAVA_Build 6 25054297 1D TTTTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 18 0 12 6 T 11 10 106765 CASAVA_Build 6 25055282 3D GAGCAGAATA TTC/--- TTCTTTTGGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TTC 2 1 106766 CASAVA_Build 6 25061537 1D CAAAACTCTG C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 44 het 18 0 15 4 C 9 8 106767 CASAVA_Build 6 25062115 1I TGTAAAACTT -/A ACGTTCATTA 3070 hom 141 het 54 0 47 7 A 1 2 106768 CASAVA_Build 6 25063718 3D TTTCATTCCT CCC/--- CCCACTATTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 6 3 106769 CASAVA_Build 6 25064897 1I GCAGTCTGCC -/T GCAGAGGCTG 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 0 1 106770 CASAVA_Build 6 25065427 1D AAAGACGTGT A/- ACGACTCTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 1 106771 CASAVA_Build 6 25070843 1D GAAACTTCAT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 126 het 53 0 43 10 G 2 1 106772 CASAVA_Build 6 25071954 2I TGCATGTGAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 109 het 53 0 39 14 TG 7 8 106773 CASAVA_Build 6 25078369 1I AAAGGGGACG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 609 hom 40 2 33 5 A 9 10 106774 CASAVA_Build 6 25079103 1I ATTGCACAAA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 7 8 106775 CASAVA_Build 6 25081290 1I GAAGAGAGGG -/A AAAAAGAAAG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 5 6 106776 CASAVA_Build 6 25085420 4D ACGAGAAAAA ACTC/---- ACTGCATATA 3070 het 3070 hom 41 16 22 6 ACTC 1 0 106777 CASAVA_Build 6 25085614 1D TTTTAAATCA T/- AATAAAGGTA 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 T 1 0 106778 CASAVA_Build 6 25087491 4D AGGGAAATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2952 het 2465 hom 50 15 12 24 T 22 18 106779 CASAVA_Build 6 25093578 2D GACCAAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 24 2 11 14 T 12 10 106780 CASAVA_Build 6 25098919 1I CTGTAGAAGG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 150 het 55 0 50 5 A 6 7 106781 CASAVA_Build 6 25107085 2D TATGCAGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 197 hom 39 5 15 20 T 13 11 106782 CASAVA_Build 6 25109068 1I GTGGAGAAAT -/G GCTTTCTCCA 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 G 1 2 106783 CASAVA_Build 6 25116410 1I AAGTTAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 31 1 20 10 T 10 11 106784 CASAVA_Build 6 25121231 1D CATCTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 35 1 26 8 T 13 12 106785 CASAVA_Build 6 25129543 4I GGAGACCAGC ----/TCTG TCTAAGAAGA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TCTG 0 1 106786 CASAVA_Build 6 25153363 1D CTAACAATAG A/- TTTCTTAGAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 A 1 0 106787 CASAVA_Build 6 25153848 2D CGTGACACCC CT/-- ATGGGTGCAA 3070 het 3070 hom 37 12 19 7 CT 1 0 106788 CASAVA_Build 6 25154519 2I GAAATAAAAC --/AG AGATACAACA 3070 het 3070 ref 39 23 16 0 AG 1 2 106789 CASAVA_Build 6 25155646 3I CTTAATAAAA ---/TAC TACTAGCAAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 TAC 1 2 106790 CASAVA_Build 6 25155947 8D ACCCTGTCTT TAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 2668 hom 34 12 13 13 TAAAAAAA 1 0 106791 CASAVA_Build 6 25157334 1I CAAGCACAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 8 9 106792 CASAVA_Build 6 25160468 1D ATGAGGCTAG A/- AGAGAGGACA 3070 het 3070 ref 58 29 24 5 A 2 1 106793 CASAVA_Build 6 25167376 1D AACTGACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2872 hom 29 9 16 4 A 11 10 106794 CASAVA_Build 6 25176959 1I AACACTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 13 14 106795 CASAVA_Build 6 25179581 2I ATATATGTTT --/AA AGGTAGAACA 3070 het 3070 hom 53 19 26 8 A 1 3 106796 CASAVA_Build 6 25182371 1I GAACTCATCA -/T TTTTTTGTGG 2512 het 2512 ref 22 12 6 4 T 6 7 106797 CASAVA_Build 6 25185027 1I TAAAACAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 501 hom 31 2 23 6 T 13 14 106798 CASAVA_Build 6 25191594 1I GAGGAGACAG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 0 1 106799 CASAVA_Build 6 25194411 1I AATTTCTGCA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 7 8 106800 CASAVA_Build 6 25197154 1D CCCTTCTCTA C/- CCCTATATAT 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 C 4 3 106801 CASAVA_Build 6 25197547 1I TGCAGTCTGC -/A CCCAGCTTCA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 A 0 1 106802 CASAVA_Build 6 25216969 1D ATCTTGAACA C/- CCATAGTTTG 3070 het 3070 hom 41 20 20 1 C 3 2 106803 CASAVA_Build 6 25219243 1D TTTGGGTTTT C/- TGATTCTAAA 3070 het 3070 ref 41 23 17 2 C 1 0 106804 CASAVA_Build 6 25229282 1D AGGTCCAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 A 9 8 106805 CASAVA_Build 6 25238561 6I AGATGCGTGC ------/GTGTGT GTGTGTGCGC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 GT 3 6 106806 CASAVA_Build 6 25243091 1D TATTTACAGC T/- TTTTAACAAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 5 4 106807 CASAVA_Build 6 25250379 2I ATCTCAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1290 hom 19 4 11 4 A 10 12 106808 CASAVA_Build 6 25250428 1D TTTAATCAAG A/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 A 1 0 106809 CASAVA_Build 6 25251973 1D CTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 12 11 106810 CASAVA_Build 6 25269565 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAATCAA 3070 het 2580 hom 17 6 8 3 A 6 7 106811 CASAVA_Build 6 25277472 3D GATCTTAAGT AGC/--- AGAATAATAT 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 AGC 1 0 106812 CASAVA_Build 6 25282367 1D CATTTAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 120 het 43 0 40 5 A 10 9 106813 CASAVA_Build 6 25297021 1D TTTTCTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 12 11 106814 CASAVA_Build 6 25298953 2I ATTCGCACAC --/TT TTAAAAGGGC 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 T 2 4 106815 CASAVA_Build 6 25303568 1D TTATAATGTG A/- AAAAAGATAC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 6 5 106816 CASAVA_Build 6 25320128 1I AATCCTAAGC -/A AAAAAGAACA 3070 het 2339 hom 14 5 9 0 A 5 6 106817 CASAVA_Build 6 25327945 1D TCTGGCTGCT A/- ATACACTTTG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 2 1 106818 CASAVA_Build 6 25341230 1I GAGGGATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 808 hom 33 2 27 4 T 11 12 106819 CASAVA_Build 6 25497501 4D AATTATGACA CTGT/---- CTATTATATG 3070 hom 108 het 38 0 37 2 CTGT 1 0 106820 CASAVA_Build 6 25504377 1D ATTATTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 10 106821 CASAVA_Build 6 25509211 4D ATAGCTAACA TACT/---- TACTTTAGTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TACT 2 1 106822 CASAVA_Build 6 25513062 1I GCAAAGTGCA -/G GGGGAAAGGA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 4 5 106823 CASAVA_Build 6 25513255 2I TTCCTCCTGT --/TG TGTGAAGACT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TG 2 3 106824 CASAVA_Build 6 25515164 3I TGTGACTAGG ---/AAT AATAACCACA 3070 hom 110 het 39 0 37 2 AAT 1 2 106825 CASAVA_Build 6 25515613 1D GGGACGGGCA T/- TTATCTCCAG 3070 hom 116 het 51 0 36 16 T 3 2 106826 CASAVA_Build 6 25516673 9I TAGGGATGCA ---------/AGATTAATG ATGATTTACA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AGATTAATG 0 1 106827 CASAVA_Build 6 25528769 2D4M3D ATTTCCTTCG GTGATCCGA/--GATC--- AGTACTGGCA 3070 hom 155 het 51 0 51 3 N/A 0 0 106828 CASAVA_Build 6 25538639 1D TTTGAGAAGG T/- TTTTTTTTTT 2017 het 2017 ref 24 9 8 7 T 15 14 106829 CASAVA_Build 6 25541114 4I CTTATATCTC ----/TAAT TATTATTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 TAAT 0 1 106830 CASAVA_Build 6 25550102 1D CAAAGCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 36 4 19 13 T 12 11 106831 CASAVA_Build 6 25597379 6D ATCAAACAAT AACAAC/------ AACAACAACA 3070 hom 78 het 29 0 26 7 AAC 6 4 106832 CASAVA_Build 6 25614068 3I CCTTCCAAAT ---/GAG AGACAAAAGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GAG 0 1 106833 CASAVA_Build 6 25615966 2D TTGTGAAGAC TT/-- AACGCATTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 2 0 106834 CASAVA_Build 6 25616095 3I TACACATTTA ---/CTT CTTCAAGTAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTT 1 2 106835 CASAVA_Build 6 25616988 2I TCCTCATTAG --/AT ATAGTAAGTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AT 1 2 106836 CASAVA_Build 6 25617336 1D TCTTTAGTTA G/- CTAATATCTG 3070 het 3070 hom 26 12 14 1 G 1 0 106837 CASAVA_Build 6 25618988 2I TATGTTAAAC --/AT TTTTTACTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AT 0 1 106838 CASAVA_Build 6 25619150 3I TTTAAAAACT ---/TAC TTTTTTACTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TAC 0 1 106839 CASAVA_Build 6 25623566 2I GAGAAATTTT --/TA TGTTATGTTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TA 0 1 106840 CASAVA_Build 6 25624497 7D TCTGCTGGTT CAAAACC/------- CAAAACCAGG 3070 het 3070 ref 50 32 16 4 CAAAACC 2 1 106841 CASAVA_Build 6 25639540 4I GCTTCTTCTT ----/AGAA TGAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 AGAA 0 1 106842 CASAVA_Build 6 25659391 10D CCATATATAA TGTGTTTAGG/---------- CATGTTTAAT 3070 het 3070 ref 54 32 21 3 TGTGTTTAGG 1 0 106843 CASAVA_Build 6 25660249 4D TCAGGTCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 27 12 12 4 TTTG 5 4 106844 CASAVA_Build 6 25667779 1D CAGATGGAGC T/- TACAGCACTG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 2 1 106845 CASAVA_Build 6 25681609 3I TGCCTACACA ---/CCT CCTGTTTCTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 CCT 1 2 106846 CASAVA_Build 6 25685974 1I AAATTCATTA -/T AAAAATTTGA 3070 het 3070 hom 46 21 24 1 T 0 1 106847 CASAVA_Build 6 25687467 2I AAGAGTCAGG --/GA AAAAAAAAAA 1772 het 1772 ref 21 10 9 2 GA 0 1 106848 CASAVA_Build 6 25693743 1I AGATAACCTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 7 8 106849 CASAVA_Build 6 25703477 1I ATGAAGATTC -/T TCACCTTGAG 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 T 1 2 106850 CASAVA_Build 6 25705181 1D GTTGTTATAA C/- AAAATACTTA 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 C 1 0 106851 CASAVA_Build 6 25713566 5D TCTTAGGTAT AATAA/----- AATAAGAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 19 9 AATAA 2 1 106852 CASAVA_Build 6 25735799 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 32 14 16 2 A 7 6 106853 CASAVA_Build 6 25754240 4I TTACATACAG ----/ACAA ACAAACAGCT 3070 het 3070 hom 44 14 20 10 ACAA 1 2 106854 CASAVA_Build 6 25755355 1I TACCTAGAAC -/A CTACATCCCC 3070 het 3070 ref 85 45 34 7 A 0 1 106855 CASAVA_Build 6 25757487 1I TCTTTAGAAG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 6 7 106856 CASAVA_Build 6 25784976 12D CTGTCTTATT TTCCATCCCCTC/------------ TTCCATCCCC 3070 het 3070 ref 50 28 19 8 TTCCATCCCCTC 2 1 106857 CASAVA_Build 6 25787691 2D CCGTGGGCAG GT/-- GTGTGTGTGT 3035 het 3035 ref 37 17 12 8 GT 6 5 106858 CASAVA_Build 6 25788107 3D AAGCAAACCA AAT/--- TCATGATGAG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 AAT 1 0 106859 CASAVA_Build 6 25788253 2D TATTTATTAC AA/-- ACGCAGATTT 3070 het 3070 hom 36 17 19 0 A 3 1 106860 CASAVA_Build 6 25790594 1I CTACTCAGCC -/A GACTCCAGGT 3070 het 3070 hom 63 24 32 7 A 0 1 106861 CASAVA_Build 6 25791838 1I CATTTCAGTG -/T TATAAGTGCT 3070 het 3070 hom 51 18 28 5 T 1 2 106862 CASAVA_Build 6 25797358 1D CTTACGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2698 hom 39 9 19 11 T 13 12 106863 CASAVA_Build 6 25797960 1D AAAAAATGAC T/- TTTTTTTTTG 1641 het 1641 ref 30 23 4 3 T 10 9 106864 CASAVA_Build 6 25801864 3D GATAGGTATG ATT/--- ATGTCAGATG 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 ATT 1 0 106865 CASAVA_Build 6 25809947 1I TCAACATAGA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 7 8 106866 CASAVA_Build 6 25815987 1D TAAATAGAGC A/- AAAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 A 5 4 106867 CASAVA_Build 6 25816990 1I TTAGGATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 17 1 12 4 T 11 12 106868 CASAVA_Build 6 25817950 7D TTCCTGGGAG TAGAGAT/------- TAAAGTATTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 6 TAGAGAT 1 0 106869 CASAVA_Build 6 25819267 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1695 het 886 hom 12 5 6 1 A 16 14 106870 CASAVA_Build 6 25820632 1I AAACCTATAT -/A AAATGCGAGG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 3 4 106871 CASAVA_Build 6 25825565 1D GAAGACAGCC A/- AAAGGGCACC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 4 3 106872 CASAVA_Build 6 25828594 2D TCTAAGATGG GA/-- GGGGGGGAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 GA 1 0 106873 CASAVA_Build 6 25829574 4D CTGGTAGACT GACA/---- GAGACACAGT 3070 het 3070 ref 42 21 21 0 GACA 1 0 106874 CASAVA_Build 6 25830134 1D CACTGGACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 31 1 13 17 T 12 11 106875 CASAVA_Build 6 25830375 1D TTATTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 2523 het 2523 ref 27 10 7 10 T 13 12 106876 CASAVA_Build 6 25833100 10I GGTTAATTCA ----------/AGGGATGACT TACTTTTGTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AGGGATGACT 0 1 106877 CASAVA_Build 6 25833226 4I AACCAAATGA ----/GTTT TTTTTTTTTT 2439 het 616 hom 25 3 10 13 GTTT 0 1 106878 CASAVA_Build 6 25834309 2I TTTCTGACAC --/TT AGAAGTCTTT 3070 het 2872 hom 36 10 17 9 T 0 2 106879 CASAVA_Build 6 25835788 2D TAGTAGAGAC GG/-- GGTTTCACCA 3070 het 851 hom 18 4 14 0 G 4 2 106880 CASAVA_Build 6 25847323 4D CAAGTAGCTT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 AAAC 4 3 106881 CASAVA_Build 6 25847591 1D CCATCACACT G/- GAAGTTAGAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 G 2 1 106882 CASAVA_Build 6 25848591 1I TACAAAGTCA -/T TTTTTTTTTA 2695 het 2695 ref 18 10 7 1 T 9 10 106883 CASAVA_Build 6 25849273 4D AATAGGTAGA AAAT/---- AAAAGGAATA 3070 het 3070 ref 45 25 18 4 AAAT 1 0 106884 CASAVA_Build 6 25851897 1I TTAAGGTCTT -/A AATGTCATCC 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 A 2 3 106885 CASAVA_Build 6 25853205 2D ATTTTCCTTC AT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 24 14 8 AT 1 0 106886 CASAVA_Build 6 25854578 4D GGTAATTAAC TAAA/---- TAAGTCAATA 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 TAAA 1 0 106887 CASAVA_Build 6 25857700 1I GACAAAACCT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 7 8 106888 CASAVA_Build 6 25860065 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 A 9 10 106889 CASAVA_Build 6 25861167 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 581 het 581 ref 17 7 3 7 A 9 8 106890 CASAVA_Build 6 25863318 4I AGGAAGAGAC ----/AGAG AGAAACTAAA 2952 het 2952 ref 24 11 8 5 AG 1 3 106891 CASAVA_Build 6 25863768 1D AGACACAAGC A/- GTCTTGGCAA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 1 0 106892 CASAVA_Build 6 25866950 1D AAGAACCAGC T/- TTTTTGTTTC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 6 5 106893 CASAVA_Build 6 25874390 2D TATACATTTT TA/-- TGTTTCTAAT 1585 het 1585 ref 14 8 4 3 TA 1 0 106894 CASAVA_Build 6 25879786 1D GTCTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 22 1 21 0 A 11 10 106895 CASAVA_Build 6 25884356 1I AGAGCATGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 A 9 10 106896 CASAVA_Build 6 25892207 1I GTTCTAAACT -/G GGGTGTCAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 3 4 106897 CASAVA_Build 6 25896878 9I AGATGAGGAA ---------/GGTTGCCTT GGTCCAGGAG 3070 hom 96 het 37 0 30 7 GGTTGCCTT 0 1 106898 CASAVA_Build 6 25900691 2D CCTTTAAAAT TG/-- TTCTAGCCTG 3070 het 3070 hom 46 17 27 2 TG 1 0 106899 CASAVA_Build 6 25903951 6D AAAATAAGCA CACACC/------ CACACCCACA 3042 het 3042 ref 22 8 8 9 CACACC 3 2 106900 CASAVA_Build 6 25910139 3D TGTAATGGAT GAA/--- GAAGTACATT 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 GAA 2 1 106901 CASAVA_Build 6 25941313 1I GCTTAACAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 9 10 106902 CASAVA_Build 6 25941540 4I TTGTACTGTC ----/TGTT CTGTTTCATG 1829 het 1829 ref 25 15 6 4 TGTT 0 1 106903 CASAVA_Build 6 25943419 1D GGCTCCTTTC A/- GCAGGAAATA 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 1 0 106904 CASAVA_Build 6 25953412 1D GAGCCACAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 A 10 9 106905 CASAVA_Build 6 25984847 1I CTCACAATGT -/C CAGCAGGGAT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 C 1 2 106906 CASAVA_Build 6 25991411 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AC 1 0 106907 CASAVA_Build 6 25991778 2I TACAACATAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 AT 6 7 106908 CASAVA_Build 6 25993647 1I CTCAAAGAAA -/C TTTTACCAAA 3070 het 3070 ref 44 19 21 4 C 0 1 106909 CASAVA_Build 6 25995872 24D TGTTTTGCAT AATAGCAAAAACAGTTTTTTTGCA/------------------------ AATAGCAAAA 3070 het 3070 ref 50 34 20 8 AATAGCAAAAACAGTTTTTTTGCA 1 0 106910 CASAVA_Build 6 25996619 4D ATATTAGCAT CTAC/---- CTACCCATTT 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 CTAC 2 1 106911 CASAVA_Build 6 25996812 1I CTATAGGATG -/A GAGTAAAATA 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 A 0 1 106912 CASAVA_Build 6 26006122 1D GCCGGGCGTA G/- GTGGCGGGCG 738 hom 7 het 3 0 3 0 G 2 1 106913 CASAVA_Build 6 26006179 1I8M1I7M1I GAATGGCGTG -ACCCGGGA-GCGGAGC-/AACCCGGGAGGCGGAGCT TGCAGTGAGC 1902 hom 10 het 4 0 4 0 N/A 0 0 106914 CASAVA_Build 6 26021988 6I CTGTTTTTTT ------/TTTTTG TTGTTGTTGT 3070 het 2960 hom 33 13 12 8 TTTTTG 0 1 106915 CASAVA_Build 6 26029796 3D TTGTCTTAGT AGA/--- AGGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 4 AGA 1 0 106916 CASAVA_Build 6 26033016 2D ACTCAATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2152 het 1783 hom 17 6 7 5 A 16 14 106917 CASAVA_Build 6 26047932 1D TGGAGACCCC T/- ATCCTAAGGT 3070 het 3070 hom 51 17 23 11 T 1 0 106918 CASAVA_Build 6 26049240 1I GCTACAGCCT -/G GGTGACAGAA 3070 het 3034 hom 18 8 8 2 G 2 3 106919 CASAVA_Build 6 26049418 4I CTACCTATCC ----/ATCT ATTTATTTAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 ATCT 0 1 106920 CASAVA_Build 6 26054605 1I AAGAAATGTA -/G GAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 G 1 2 106921 CASAVA_Build 6 26055746 1D GTGGCATGTG C/- CTATAGTCCC 2118 het 2118 ref 16 10 5 1 C 2 1 106922 CASAVA_Build 6 26058640 1I CCTCTAGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 9 10 106923 CASAVA_Build 6 26073023 2I CCAATTATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2940 hom 36 10 15 11 T 14 16 106924 CASAVA_Build 6 26073930 10I CAAGAGATCG ----------/AGACCATCCT AGCCAACCAA 1674 het 1634 hom 13 4 4 5 AGACCATCCT 0 1 106925 CASAVA_Build 6 26095419 2D CCCCGCCCCC CG/-- CCCGCCACAC 3070 het 1260 hom 24 6 16 4 CG 1 0 106926 CASAVA_Build 6 26100002 4I CAGAAGGCGG ----/TATC TTTCAGCTCT 2193 het 2193 ref 14 8 5 1 TATC 0 1 106927 CASAVA_Build 6 26114216 1I GATACGTTTG -/T TCCACTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 1 2 106928 CASAVA_Build 6 26115763 1D TGGCCTCCAG C/- TTTTTGTCAG 3070 het 3070 ref 49 26 21 2 C 1 0 106929 CASAVA_Build 6 26122195 8D TGATCCTATA AAAAACAC/-------- AGAAACACAG 3070 het 3070 hom 47 23 23 3 AAAAACAC 1 0 106930 CASAVA_Build 6 26132857 1D CTGGATAGAG A/- AAAAACTGTA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 6 5 106931 CASAVA_Build 6 26141789 3I TACTTCTGAT ---/AAG AAGGGAAAAT 3070 het 3070 hom 51 23 21 7 AAG 1 2 106932 CASAVA_Build 6 26142341 1I GGAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2140 hom 28 7 16 5 A 10 11 106933 CASAVA_Build 6 26147331 1I AAAAAAAAAA -/C AACAACAACT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 C 0 1 106934 CASAVA_Build 6 26154245 1I TGCCCTTGTT -/A AAAAAATTCC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 6 7 106935 CASAVA_Build 6 26161163 1D TGCTTCCGGC T/- TTTTTTTTTT 2214 het 2214 ref 21 10 5 6 T 11 10 106936 CASAVA_Build 6 26163845 2I ACCCAATTCG --/TC TCTGATACCT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 TC 1 2 106937 CASAVA_Build 6 26179007 2I GACGGGGAGT --/CA CAATTCAGTC 3070 het 3070 ref 47 23 13 11 CA 1 2 106938 CASAVA_Build 6 26180644 1I TGGAGACCTG -/A ATGGGACACT 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 1 2 106939 CASAVA_Build 6 26180829 1D TCTCTCTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 7 hom 38 1 27 10 T 10 9 106940 CASAVA_Build 6 26184426 1D TCATCCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 12 11 106941 CASAVA_Build 6 26186040 7D AGCAGGATAC CAAGATG/------- CAAATGCCCA 3070 het 3070 ref 29 21 12 2 CAAGATG 1 0 106942 CASAVA_Build 6 26209410 1D GAGTGGAGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 A 10 9 106943 CASAVA_Build 6 26214575 1D TGAATAGATG A/- AAAACAACAA 3070 hom 96 het 43 0 33 11 A 5 4 106944 CASAVA_Build 6 26218663 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1985 het 1099 hom 23 5 10 8 A 12 13 106945 CASAVA_Build 6 26222726 2I15M1D TGAATAGCAA --TTTGGCAATGTATATG/TTTTTGGCAATGCATAT- TTAAGAACCT 2783 het 2783 ref 51 48 6 7 N/A 0 0 106946 CASAVA_Build 6 26222862 5D CTATATAATC TATAA/----- TATAATGCAT 2697 het 2697 ref 45 36 8 2 TATAA 2 1 106947 CASAVA_Build 6 26226417 1D GAAGTAGGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 457 hom 38 2 27 9 A 10 9 106948 CASAVA_Build 6 26226517 16D TGAATAGGTC TCAAAGATCAGTTTGG/---------------- TCAAAGATCA 3070 hom 62 het 26 0 21 7 TCAAAGATCAGTTTGG 2 1 106949 CASAVA_Build 6 26228022 1I GTCCAAAAAA -/T AATCTTGATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 0 1 106950 CASAVA_Build 6 26234765 1I ACCGGATTTT -/C CCCCCCCCAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 8 9 106951 CASAVA_Build 6 26234877 15D ATTCCAGCTC CCAATCGGTGTGTGA/--------------- CCTTGGCCTA 3070 hom 87 het 30 0 30 4 CCAATCGGTGTGTGA 1 0 106952 CASAVA_Build 6 26235793 1D AATCAATGAC T/- TAGGCAGCCA 3070 hom 141 het 54 0 48 7 T 2 1 106953 CASAVA_Build 6 26237507 4D CTATTTTATG TATT/---- TATTTATTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TATT 3 2 106954 CASAVA_Build 6 26239772 2I AAGAAAAAAC --/AA AAAAGAGTCA 3070 hom 112 het 45 0 36 9 A 4 6 106955 CASAVA_Build 6 26258721 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 763 het 763 ref 23 13 3 7 T 17 16 106956 CASAVA_Build 6 26306044 2I TATGAAAGCA --/CT CTCTTATCTT 3070 het 2457 hom 31 7 14 10 CT 2 3 106957 CASAVA_Build 6 26317291 4D AGTTTTACAA TTTC/---- TTTCTCCAGT 3070 het 3070 ref 36 23 11 3 TTTC 2 1 106958 CASAVA_Build 6 26369028 1D TTTTGTCCCT A/- ATGCCTAATG 2503 het 2503 ref 20 6 7 7 A 2 1 106959 CASAVA_Build 6 26372568 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2024 hom 26 6 18 2 A 11 10 106960 CASAVA_Build 6 26377125 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 A 11 10 106961 CASAVA_Build 6 26378663 10I TATTGAATTA ----------/ACTATCAGCC AAAAATGGAT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 ACTATCAGCC 0 1 106962 CASAVA_Build 6 26391846 2D TAAACCAGAC AT/-- ATGTCTCTGT 3070 het 3070 hom 52 20 23 10 AT 2 1 106963 CASAVA_Build 6 26394818 4D28M1D CCTTTTTTTT TCTCCCCCCCCGTCTATTTTCCTGAGGATCCCT/----CCCCCCCGTCTATTTTCCTGAGGATCCC- TTTTTTTAAG 3070 het 2088 hom 22 10 14 7 N/A 0 0 106964 CASAVA_Build 6 26412650 1D CCACATGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 A 13 12 106965 CASAVA_Build 6 26413767 16I TTAACCACTC ----------------/GGCCACCTCGTCACAT GGCCAGGCCT 3070 het 3070 ref 27 11 10 7 GGCCACCTCGTCACAT 0 1 106966 CASAVA_Build 6 26425157 2I TGCCTGTAAT --/CA CAGCACATTG 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 CA 1 2 106967 CASAVA_Build 6 26427218 1D CACGTCCTTT A/- ATGTCAACGT 3070 het 3070 hom 38 17 20 2 A 2 1 106968 CASAVA_Build 6 26435249 1I CTATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 10 11 106969 CASAVA_Build 6 26436590 1D TACATAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2930 hom 25 10 10 5 T 12 11 106970 CASAVA_Build 6 26442090 1D AGATTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2260 het 2260 ref 35 13 7 15 A 13 12 106971 CASAVA_Build 6 26459484 1D AATGCTTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2795 hom 30 9 17 5 A 10 9 106972 CASAVA_Build 6 26474423 4I TTTTTAAAAC ----/TCTT TCTTTATTTT 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 TCTT 1 2 106973 CASAVA_Build 6 26479505 1I GAAACCAAGT -/A AAAAAAAATG 2723 het 2723 ref 17 9 7 1 A 8 9 106974 CASAVA_Build 6 26507717 1D TCTTGTGACA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 165 het 62 0 55 7 T 9 8 106975 CASAVA_Build 6 26521144 2D TGGGTTAGGC AG/-- AGATGCTGAG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AG 2 1 106976 CASAVA_Build 6 26522268 13D AGCAATAACT AACATTAATGGAG/------------- AACTTAAAAT 3070 het 3070 ref 44 30 16 1 AACATTAATGGAG 1 0 106977 CASAVA_Build 6 26530507 1D GTTGACTTAT C/- CTTTCATTCT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 C 2 1 106978 CASAVA_Build 6 26530607 1I CAAATTTTCC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 23 12 9 2 A 7 8 106979 CASAVA_Build 6 26532015 1I AAGCAATATT -/A TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 A 0 1 106980 CASAVA_Build 6 26544814 29D CCATTTTCAG AGCAGACCCCCACTGGCACCTATCCCATA/----------------------------- AGCAGACCCC 3070 het 3070 ref 36 19 14 12 AGCAGACCCCCACTGGCACCTATCCCATA 1 0 106981 CASAVA_Build 6 26561790 1D TGTATAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2815 hom 29 8 14 7 T 13 12 106982 CASAVA_Build 6 26570237 2I AAAAAAAAAA --/AT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 AT 0 1 106983 CASAVA_Build 6 26585469 20I TGGAGTCTCG --------------------/CTATGTTCCCTAAGGCTGGT CTCGAACTCC 3070 het 3070 hom 23 9 11 4 CTATGTTCCCTAAGGCTGGT 0 1 106984 CASAVA_Build 6 26608396 1I TTCATCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 15 13 T 10 11 106985 CASAVA_Build 6 26625079 1D GTTTGTCTCG C/- CCCCCATTTC 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 C 6 5 106986 CASAVA_Build 6 26650398 1D AAAATGCGTA T/- TTTTTTTTTA 1356 het 1356 ref 27 21 3 3 T 10 9 106987 CASAVA_Build 6 26674867 5D CTGCAGTGCA GTGAC/----- GTGACACAAT 3070 het 3070 ref 40 24 10 9 GTGAC 2 1 106988 CASAVA_Build 6 26678656 10D ACCCAGCCAG AAAACAAAAC/---------- AAAACAAAAC 3053 het 3053 ref 24 12 8 5 AAAAC 5 3 106989 CASAVA_Build 6 26697742 1D ATTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 928 het 928 ref 18 11 2 5 A 11 10 106990 CASAVA_Build 6 26703227 1I GGAGAACGCA -/G TGTGCAGCTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 G 0 1 106991 CASAVA_Build 6 26725448 1I TTAACAGATT -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 6 7 106992 CASAVA_Build 6 26743164 1D TTCACCAGAG A/- AAAAAAATAC 1948 hom 12 het 5 0 4 1 A 8 7 106993 CASAVA_Build 6 26757810 1I AAATAAAAAC -/T TTTTTTTAAA 1907 hom 10 het 4 0 4 0 T 7 8 106994 CASAVA_Build 6 26760898 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1732 het 1706 hom 19 6 7 6 A 16 17 106995 CASAVA_Build 6 26775874 1D GCATTGGACC T/- GTGTAAGTCT 2355 het 2355 ref 26 16 5 6 T 1 0 106996 CASAVA_Build 6 26776182 2D TCCTGAGACA TG/-- TGGGGGTTGT 2032 het 2032 ref 21 13 5 3 TG 2 1 106997 CASAVA_Build 6 26778350 4I CACGTATACA ----/ACAT ACATACATCC 3070 het 3070 ref 59 44 8 7 ACAT 2 3 106998 CASAVA_Build 6 26783833 2D TGCTATACAC TT/-- ATATATAAGA 3070 het 3070 ref 64 36 24 6 T 2 0 106999 CASAVA_Build 6 26790328 13D CACTTTTATA AACACACACACAC/------------- AACACACACA 3013 het 3013 ref 49 34 7 11 AACACACACACAC 2 1 107000 CASAVA_Build 6 26793551 2D TGGAAATGAC AG/-- AAAGACTGAA 3070 het 3070 ref 92 51 37 5 AG 1 0 107001 CASAVA_Build 6 26805322 1D TGAACTCTAA T/- AAACGTCAAA 3070 hom 274 het 100 0 90 11 T 1 0 107002 CASAVA_Build 6 26813213 18D ACACACACAA ACACACACACACACACAC/------------------ ACACACACAC 3070 hom 72 het 33 0 25 10 AC 18 9 107003 CASAVA_Build 6 26817362 1I CTCAAAAAAA -/G TTTTTAAAAA 3070 hom 57 het 28 0 20 8 G 0 1 107004 CASAVA_Build 6 26835706 1D TATGGCCAAT A/- AGGCACACTA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 A 2 1 107005 CASAVA_Build 6 26849615 1I10M2D TGTTAAAAAA -AACAAAAAAAAC/CAACAAAAAAA-- AGCAAGTAGT 3070 het 3070 hom 74 34 42 6 N/A 0 0 107006 CASAVA_Build 6 26849746 4I16M1D GATCAAAAAG ----AAGTGCTCAGTAAACAT/AAGTAAGTGCTCAGTAAACA- TTACCTACTG 3070 het 3070 hom 69 29 37 7 N/A 0 0 107007 CASAVA_Build 6 26850920 1I ATCCAGTCCT -/G GGGGGCATAT 3070 het 3070 ref 48 32 11 5 G 5 6 107008 CASAVA_Build 6 26851857 1D AACAAGCATT A/- AAAGTCTGTG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 4 3 107009 CASAVA_Build 6 26851904 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 10 9 107010 CASAVA_Build 6 26853221 2I GATGAACATT --/AA AAAAAGTCAC 3017 het 3017 ref 41 23 8 10 A 5 7 107011 CASAVA_Build 6 26859491 6D CACAGATATT AGATAA/------ AGATAAGTTA 950 het 950 ref 40 31 3 10 AGATAA 2 1 107012 CASAVA_Build 6 26860645 1D CTCGCTTAGC T/- ATGCGAGAGG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 1 0 107013 CASAVA_Build 6 26861837 4I TGTGTATCAT ----/TTTA TTTATCAACA 2397 het 2397 ref 29 23 5 2 TTTA 1 2 107014 CASAVA_Build 6 26862245 1D TATACATTTG T/- TTAAAAAAAA 2507 het 1365 hom 27 6 7 14 T 3 2 107015 CASAVA_Build 6 26862615 1D TTAAGAGAAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 1459 hom 13 3 7 4 T 8 7 107016 CASAVA_Build 6 26867883 2D TCTTGCATGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 90 het 37 0 31 7 TC 6 5 107017 CASAVA_Build 6 26870163 4I TACATAAACA ----/TGCG TGCATGCATG 3070 het 3070 ref 99 78 15 6 TGCG 0 1 107018 CASAVA_Build 6 26870301 2D ATACATAAAC AT/-- GTGTGCAATC 3070 hom 139 het 68 0 55 15 AT 1 0 107019 CASAVA_Build 6 26906875 9D TGTTTGTATG TTTGTGTGT/--------- TTTGTGTGTA 3070 hom 132 het 49 0 41 12 TTTGTGTGT 2 1 107020 CASAVA_Build 6 26907251 2D GTATGGACAC GT/-- GTATTCTTGC 3070 hom 114 het 50 0 36 15 GT 2 1 107021 CASAVA_Build 6 26907410 4D AGAAGGACAG AACT/---- AACAGGATAG 3070 het 581 hom 43 2 40 1 AACT 1 0 107022 CASAVA_Build 6 26909222 1D TCTCGAACCA T/- ATCCCTGTTT 3070 het 199 hom 20 1 18 1 T 1 0 107023 CASAVA_Build 6 26921127 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 81 hom 15 1 11 3 A 13 12 107024 CASAVA_Build 6 26935165 8I GAGTTTAGCC --------/GTATCAAT ATATAATTTT 1393 het 1393 ref 29 23 3 3 GTATCAAT 0 1 107025 CASAVA_Build 6 26937054 1D GAAATAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 15 0 12 3 T 11 10 107026 CASAVA_Build 6 26947160 2I TGTGCATGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 68 het 31 0 22 9 TG 7 8 107027 CASAVA_Build 6 26958441 2D GAAAACCCAG GA/-- GAGAGAGCAG 985 het 985 ref 30 19 4 8 GA 4 3 107028 CASAVA_Build 6 26960210 1D CTCTATCTTT A/- AAAAAAAAAA 1242 hom 12 het 5 0 5 0 A 13 12 107029 CASAVA_Build 6 26965814 4I TACTACTTTC ----/AAGT AATAGTAGTT 1714 hom 12 het 6 0 4 2 AAGT 0 1 107030 CASAVA_Build 6 26966468 1D ATACCATCTC A/- ACACCAGTCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 2 1 107031 CASAVA_Build 6 26971484 1D TATTGCACGA C/- CCCCCCACGT 3070 hom 49 het 21 0 16 5 C 7 6 107032 CASAVA_Build 6 26975938 1D CCTTCCCAGC T/- GCAAGCAGGG 3070 hom 33 het 13 0 10 3 T 1 0 107033 CASAVA_Build 6 26985283 1D TACAGTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 10 9 107034 CASAVA_Build 6 26986166 1D ATCTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 19 3 10 6 A 15 14 107035 CASAVA_Build 6 26987283 4D ATTCAGCACT TTAC/---- TTAAATTTTC 3070 hom 51 het 20 0 18 5 TTAC 1 0 107036 CASAVA_Build 6 26988650 4I GATAAGAGAG ----/GTAA GTAAATCTCC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 GTAA 1 2 107037 CASAVA_Build 6 26990807 2I CTACTTGCCC --/CT GTTATAACAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 CT 0 1 107038 CASAVA_Build 6 26991507 1I GTTTAGAGAC -/A ATTTTAGTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 1 2 107039 CASAVA_Build 6 26993048 1D GCTCACAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 22 1 12 9 T 13 12 107040 CASAVA_Build 6 26995796 2D CTATCACCAT TA/-- TAGATTGATC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TA 2 1 107041 CASAVA_Build 6 27003296 2I CAACCAATAA --/AC ATATATATGA 3070 het 301 hom 21 1 18 2 AC 0 1 107042 CASAVA_Build 6 27005529 3I TCCCTCCTTC ---/TTA TTAACAGTGT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 TTA 1 2 107043 CASAVA_Build 6 27009740 2D CACTTTTTAC TG/-- TGTTAATTTA 3070 hom 129 het 45 0 43 3 TG 2 1 107044 CASAVA_Build 6 27010578 1D GAGAAAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 16 0 10 6 T 15 14 107045 CASAVA_Build 6 27013414 5D TTATCTTATT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 84 het 40 0 29 12 AAAAC 4 3 107046 CASAVA_Build 6 27018742 11D GTATATTTAA AAGGAAAGCAG/----------- AGCATACAAG 3070 het 1370 hom 17 5 11 3 AAGGAAAGCAG 1 0 107047 CASAVA_Build 6 27028545 1I GTCCCTTCAT -/G GAAAAAACAA 3070 hom 11 het 12 0 9 3 G 1 2 107048 CASAVA_Build 6 27032874 1D GAGCCAGCGA G/- GGGATGCCAG 1611 het 1611 ref 23 17 4 2 G 4 3 107049 CASAVA_Build 6 27046901 1D AATGCATGAT A/- AAAAAAATTA 1881 het 1881 ref 35 28 4 3 A 8 7 107050 CASAVA_Build 6 27059952 4D AAGAAGAAAT AAAG/---- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAG 1 0 107051 CASAVA_Build 6 27064921 1D CCATAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 177 hom 31 1 25 7 A 11 10 107052 CASAVA_Build 6 27068219 1I TGATGAATCC -/T TATGTGTCCA 540 het 540 ref 46 33 3 10 T 1 2 107053 CASAVA_Build 6 27069606 2I AATTATACAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 53 het 29 0 24 5 AC 8 9 107054 CASAVA_Build 6 27075150 1I AAATCAGTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 9 107055 CASAVA_Build 6 27077375 1I CCTGCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 480 hom 12 1 8 3 A 11 12 107056 CASAVA_Build 6 27079873 1D TCATAGTGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 8 107057 CASAVA_Build 6 27090368 1I TGGACAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 201 hom 17 2 12 3 A 15 16 107058 CASAVA_Build 6 27091402 3D TAAATAAAAT AAA/--- AAAATGAAAG 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 7 4 107059 CASAVA_Build 6 27099854 1D TTTTAGTTCA T/- TTTGTGTTGC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 T 4 3 107060 CASAVA_Build 6 27105040 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TGTGTATATA 1132 hom 26 het 20 0 9 12 TA 2 0 107061 CASAVA_Build 6 27242569 1D TTTTACAGAT G/- GGGGTATCAC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 5 4 107062 CASAVA_Build 6 27247104 1D CCATTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 31 9 A 11 10 107063 CASAVA_Build 6 27250581 1D AAGCTCCCTC T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 114 het 52 0 38 15 T 8 7 107064 CASAVA_Build 6 27251762 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1381 hom 21 het 8 0 7 1 A 11 12 107065 CASAVA_Build 6 27252945 2D GAAAAAGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 19 0 12 7 A 14 12 107066 CASAVA_Build 6 27261846 2D CAAGAAGAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 19 1 13 5 A 14 12 107067 CASAVA_Build 6 27263300 5I GCTTATGGGG -----/TACCT CCATAAACTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TACCT 0 1 107068 CASAVA_Build 6 27264011 1D ACACCACGTA T/- TTGAGCTTGC 3070 hom 81 het 30 0 26 6 T 3 2 107069 CASAVA_Build 6 27265908 4I4M1I TGGGTCTAGT ----AAAC-/GAAGAAACA ATTAAAAAAA 1055 het 1055 ref 46 39 3 6 N/A 0 0 107070 CASAVA_Build 6 27285076 1D TTTTACCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 630 hom 36 2 26 8 T 13 12 107071 CASAVA_Build 6 27288100 1I GGGCGGGGGA -/G GGGGTGGGGA 3070 hom 42 het 16 0 12 4 G 4 5 107072 CASAVA_Build 6 27289578 1D ATTCGTGTGT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 53 het 23 0 19 4 G 9 8 107073 CASAVA_Build 6 27404776 1I TGACCAATAA -/T TTTTTTTTTT 2230 het 2230 ref 42 20 9 13 T 15 16 107074 CASAVA_Build 6 27408117 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1639 het 289 hom 39 6 5 28 T 20 18 107075 CASAVA_Build 6 27408735 1I ATTTAGCTGT -/A AAAACTCATA 3070 hom 123 het 53 0 40 13 A 4 5 107076 CASAVA_Build 6 27414860 2D CTCAATACAT AA/-- GTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 56 26 24 6 A 2 0 107077 CASAVA_Build 6 27417742 1D CCCGCCTCGG C/- CCCCCCAAAG 3070 het 116 hom 25 1 13 11 C 7 6 107078 CASAVA_Build 6 27435587 1D ATTTACAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 48 1 35 12 T 11 10 107079 CASAVA_Build 6 27545405 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1718 het 1718 ref 43 33 4 7 A 12 11 107080 CASAVA_Build 6 27564256 4I TTCTCTGATT ----/CTTA CTCTCTTGCC 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 CTTA 0 1 107081 CASAVA_Build 6 27601102 2D ACGACAGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2535 het 761 hom 30 5 11 14 T 16 14 107082 CASAVA_Build 6 27613694 1D ACATGCCCCC T/- GATACAAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 1 0 107083 CASAVA_Build 6 27627570 1I AGAAAGAAGT -/G GAAGGAAAAG 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 G 1 2 107084 CASAVA_Build 6 27650550 1I CGGGAGTGGT -/G GCGGGCGCCT 2806 hom 24 het 9 0 8 1 G 1 2 107085 CASAVA_Build 6 27658806 1I GGCGCGGTAG -/C TCACGCCTGT 3070 hom 42 het 17 0 13 4 C 0 1 107086 CASAVA_Build 6 27672509 18D CCACACCTGT GGGTATATCTCAACAGGC/------------------ GGGACGAGAG 3070 het 3070 ref 21 15 10 2 GGGTATATCTCAACAGGC 1 0 107087 CASAVA_Build 6 27715290 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 2547 hom 29 9 16 4 A 9 8 107088 CASAVA_Build 6 27719561 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 55 28 13 14 A 12 11 107089 CASAVA_Build 6 27722931 1I AACTTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 509 het 509 ref 22 7 5 10 T 10 11 107090 CASAVA_Build 6 27725472 1I TATATCAAGC -/T TTTTTTTTTT 2610 het 2610 ref 35 19 6 10 T 13 14 107091 CASAVA_Build 6 27741614 3I GCTTTGCTTG ---/TTT TTTTGTACAG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 4 7 107092 CASAVA_Build 6 27748650 2D ATTTCCCTGC CT/-- CTCTCACTTT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 CT 3 2 107093 CASAVA_Build 6 27788198 1I ATAGGCGTGA -/G CCACCATGTC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 0 1 107094 CASAVA_Build 6 27854887 1D AATGTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1701 het 1701 ref 36 25 4 7 T 13 12 107095 CASAVA_Build 6 27860931 1D TCATTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 A 12 11 107096 CASAVA_Build 6 27866937 1I AATGCCTTAC -/A AAAAAAAAAA 2884 hom 27 het 11 0 10 1 A 13 14 107097 CASAVA_Build 6 27874025 1I GGGCTAAGAG -/C CAAGAAGGTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 2 107098 CASAVA_Build 6 27899363 1D ACTGTACTGG T/- TTTTTTTTTT 1481 het 1481 ref 34 25 4 6 T 11 10 107099 CASAVA_Build 6 27912994 4D GTGTGCGTGC GTGT/---- GTGTATGTTT 3070 het 3070 hom 51 24 20 8 GT 4 2 107100 CASAVA_Build 6 27915920 1I ATGTTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 427 hom 31 1 24 6 A 9 10 107101 CASAVA_Build 6 28073789 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1245 het 1245 ref 39 23 3 13 A 13 12 107102 CASAVA_Build 6 28082314 2I AAATTGAGTT --/TG TGTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 TG 1 2 107103 CASAVA_Build 6 28168259 1D GACAGTTAAA G/- CAGAGGACTA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 G 1 0 107104 CASAVA_Build 6 28273919 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 1006 het 1006 ref 44 33 4 7 T 10 9 107105 CASAVA_Build 6 28323250 1I AAATTAGGGG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 A 7 8 107106 CASAVA_Build 6 28326304 4I CTAAATTCTC ----/AAAG AATACTAATA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 AAAG 0 1 107107 CASAVA_Build 6 28332927 5D CTTTTTCTTT TGTTA/----- TAAGTATGTA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 TGTTA 1 0 107108 CASAVA_Build 6 28337441 1I CAAGAGAAAG -/A AAAAAATGAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 107109 CASAVA_Build 6 28344874 1D CATTTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 A 12 11 107110 CASAVA_Build 6 28347912 1I TGTCAACAGT -/G GCTACAGCCC 3070 hom 54 het 23 0 17 6 G 1 2 107111 CASAVA_Build 6 28360179 1D GAAGTGCATT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2115 hom 35 9 17 9 C 10 9 107112 CASAVA_Build 6 28366843 4D AGAAGGAAAC AAAT/---- AAAGATTAGA 3070 het 3070 ref 42 16 15 14 AAAT 1 0 107113 CASAVA_Build 6 28411150 1I GCCTGACACA -/G TAATGCCTTT 1710 het 1710 ref 46 39 4 3 G 0 1 107114 CASAVA_Build 6 28427765 3D TCTTTTTACA GTT/--- GTTGTTTTCA 3070 het 3070 hom 30 8 18 6 GTT 3 2 107115 CASAVA_Build 6 28428721 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1382 het 1108 hom 26 10 5 11 T 17 16 107116 CASAVA_Build 6 28443642 1I CGCCGGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 11 1 9 1 T 12 13 107117 CASAVA_Build 6 28451420 1I GTATGATTTC -/A ATCTTGCAAA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 A 1 2 107118 CASAVA_Build 6 28452321 1D AATAATTATA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 39 het 14 0 14 1 T 8 7 107119 CASAVA_Build 6 28453543 1I ACAAGCAAGA -/C CCCCCCCGGA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 7 8 107120 CASAVA_Build 6 28496319 1I AAGCAGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 10 11 107121 CASAVA_Build 6 28509363 1D AAATGCTGAG A/- AAATGTGGAG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 4 3 107122 CASAVA_Build 6 28525085 1D GAAGAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 34 4 20 11 A 15 14 107123 CASAVA_Build 6 28543188 1D GACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1573 het 1573 ref 29 13 9 8 A 17 16 107124 CASAVA_Build 6 28562511 1I GTTCCTAGGT -/G GGGGCCACAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 4 5 107125 CASAVA_Build 6 28652672 1I GGTCTCAGAC -/T TTTTTTTTTT 2322 het 2322 ref 14 6 6 2 T 10 11 107126 CASAVA_Build 6 28683276 2I TTATTCACTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 26 11 T 10 12 107127 CASAVA_Build 6 28688822 2D ATAAAATTTA AT/-- ATATAGAGAC 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 AT 3 2 107128 CASAVA_Build 6 28694593 4I TTTATAGATA ----/TGTG TGTGTGTGTG 1797 hom 15 het 12 0 5 7 TG 6 8 107129 CASAVA_Build 6 28694644 2I TATTATGTTC --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 36 het 16 0 11 5 GT 6 7 107130 CASAVA_Build 6 28695918 7I AGGCGTGGTG -------/TAATCCC GTGCATGCCT 3070 hom 66 het 23 0 23 1 TAATCCC 0 1 107131 CASAVA_Build 6 28713740 1D TCTCCAATTT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 19 het 32 1 18 13 G 10 9 107132 CASAVA_Build 6 28719133 2D TTTTGGGGGG AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 10 8 107133 CASAVA_Build 6 28726321 1I ACTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 46 0 34 12 A 10 11 107134 CASAVA_Build 6 28747184 3D CTGCCTGCCT CGG/--- CCTTTCAAAG 3070 hom 72 het 29 0 22 8 CGG 1 0 107135 CASAVA_Build 6 28771683 1I TGGCTGAAGG -/A AAAAATGGAG 3070 hom 72 het 28 0 22 6 A 5 6 107136 CASAVA_Build 6 28787645 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 8 9 107137 CASAVA_Build 6 28793311 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 17 16 107138 CASAVA_Build 6 28795685 1D CTATGTAACA T/- TTTTTATTTG 3070 hom 96 het 33 0 33 1 T 6 5 107139 CASAVA_Build 6 28798933 1I ATTATAGATT -/A TAATAATGTA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 0 1 107140 CASAVA_Build 6 28801689 1I AATGAACAAC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 T 7 8 107141 CASAVA_Build 6 28822182 4D ATAGATTGAA ATAG/---- AGATTTCTCC 155 het 155 ref 48 39 2 8 ATAG 1 0 107142 CASAVA_Build 6 29122954 2D TAGCATTAGC TT/-- TTCAAAAATT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 T 4 2 107143 CASAVA_Build 6 29175752 7I CCAGAAATAC -------/AAATTAT AAGTTGTGAC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AAATTAT 0 1 107144 CASAVA_Build 6 29183058 1I CACGATGTGC -/T TTTTTTTTTT 1273 het 1273 ref 37 26 3 8 T 10 11 107145 CASAVA_Build 6 29216549 5I TCATTGTGTG -----/AATAT AATAGAGTGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AATAT 0 1 107146 CASAVA_Build 6 29218613 1I ATATGGTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 34 1 30 4 T 10 11 107147 CASAVA_Build 6 29224326 1D ATTAAAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 23 9 T 15 14 107148 CASAVA_Build 6 29227473 1I AGTGAGGTTC -/T TTTTTTTCTT 1735 hom 27 het 14 0 10 4 T 7 8 107149 CASAVA_Build 6 29229542 1I TAAATATAAT -/G ACTTCATTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 G 0 1 107150 CASAVA_Build 6 29244474 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 7 8 107151 CASAVA_Build 6 29251222 4D ATTGTATAAA TCTT/---- TCTTTCACTT 3070 hom 90 het 31 0 31 1 TCTT 2 1 107152 CASAVA_Build 6 29266202 1D GCCCTTAACA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 444 hom 30 4 22 6 T 8 7 107153 CASAVA_Build 6 29269254 5I GGAAAAAAAA -----/AAAAC AAAAAAAAAC 3070 hom 6 het 34 1 30 3 AAAAC 0 1 107154 CASAVA_Build 6 29280373 4I GCCCTTTGTC ----/AGAT GGATGGATTG 1471 hom 7 het 3 0 3 0 AGAT 0 1 107155 CASAVA_Build 6 29281352 3D TTATCAATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 27 1 14 13 T 19 16 107156 CASAVA_Build 6 29284761 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 1385 het 749 hom 34 6 6 24 TA 9 7 107157 CASAVA_Build 6 29289079 1D ATCCAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 11 10 107158 CASAVA_Build 6 29290496 2I AGAGGGGAAG --/CA GAAAAGAGAG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 CA 0 1 107159 CASAVA_Build 6 29313439 1I AGCCATACTG -/T TTTCCACATT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 3 4 107160 CASAVA_Build 6 29313621 1I GATATTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 26 4 17 5 T 12 13 107161 CASAVA_Build 6 29336311 1D TGGTAGGTTA C/- CCAAATATTG 3070 hom 144 het 52 0 48 4 C 3 2 107162 CASAVA_Build 6 29338080 1I TTTTATTTTT -/A TTTTTTGTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 0 1 107163 CASAVA_Build 6 29347321 1D TTCCAGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 40 1 31 9 T 12 11 107164 CASAVA_Build 6 29347362 1D CATTTATCTC T/- TTTTTTTTTC 934 het 934 ref 38 11 3 24 T 10 9 107165 CASAVA_Build 6 29350438 1D AAAAACCTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 10 9 107166 CASAVA_Build 6 29355478 1D TTATATCAAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 8 7 107167 CASAVA_Build 6 29372075 1I AACCTTGCAA -/T GAGCAAATCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 0 1 107168 CASAVA_Build 6 29374124 1I AATCAATCTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 8 9 107169 CASAVA_Build 6 29384601 1I CCTTAGTAAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 8 9 107170 CASAVA_Build 6 29396969 2D TGTGTATGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1218 het 1218 ref 37 26 3 8 TG 7 6 107171 CASAVA_Build 6 29403788 1D AGAGCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 750 het 750 ref 29 21 3 6 A 12 11 107172 CASAVA_Build 6 29417003 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 33 2 22 9 T 10 11 107173 CASAVA_Build 6 29417676 2D TTTCATGGAG TT/-- TTTTTTTTTT 1802 het 1802 ref 29 14 6 10 T 21 19 107174 CASAVA_Build 6 29437710 3D AATGTAAATG GGC/--- GGCTGAATGT 3070 hom 93 het 32 0 32 2 GGC 2 1 107175 CASAVA_Build 6 29442394 4I GCATAAAAGT ----/AGAA AGAAATTCAA 3070 hom 135 het 52 0 45 7 AGAA 1 2 107176 CASAVA_Build 6 29446542 3I TTGTTGACTT ---/AAA GTTTAAGTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 3 107177 CASAVA_Build 6 29447945 1D CTACCTTAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 10 9 107178 CASAVA_Build 6 29455281 4D AGAGAAACAT ACAG/---- ACAATTTATA 3070 het 3070 hom 31 14 15 4 ACAG 1 0 107179 CASAVA_Build 6 29456233 2D CTTTGTCCTC AT/-- AGTCTTGATA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 AT 1 0 107180 CASAVA_Build 6 29458445 1D ACCTAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 29 1 24 4 A 12 11 107181 CASAVA_Build 6 29459465 2D ATTGTGAAAC TG/-- TGCTGCAATT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 TG 2 1 107182 CASAVA_Build 6 29460565 4D TTTTTTTTTT TTTC/---- TCAAGACTGT 3070 hom 105 het 38 0 36 7 TTTC 1 0 107183 CASAVA_Build 6 29487244 1D CTTATTTTCC A/- AGGACAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 2 1 107184 CASAVA_Build 6 29519729 1D ATCAGTAATT A/- AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 28 23 3 2 A 13 12 107185 CASAVA_Build 6 29531672 6D ATATCCTAAG CATATA/------ CATATACAAC 3070 hom 46 het 19 0 12 7 CATATA 2 1 107186 CASAVA_Build 6 29573985 1D CAGCAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 37 0 31 6 T 11 10 107187 CASAVA_Build 6 29591188 6I TGGTTTTTGG ------/TTTTGT TTTTGTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTTTGT 1 2 107188 CASAVA_Build 6 29596837 1I GGAGGGTCCC -/A GGGGAGACGG 3070 hom 101 het 40 0 32 8 A 0 1 107189 CASAVA_Build 6 29617596 1I CCCTCTGTGA -/T TTTTTTGTCT 3070 hom 83 het 32 0 29 3 T 6 7 107190 CASAVA_Build 6 29622643 1I CAGAGACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 36 1 31 4 A 11 12 107191 CASAVA_Build 6 29624194 2I GCACAGCAGG --/GA GAGGAGGAGA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 GA 1 2 107192 CASAVA_Build 6 29628341 22I GAGCAGTGAT ----------------------/CCATGAATTGGGCAGCTCCAAG CCAGAAGTGG 3070 hom 96 het 36 0 32 6 CCATGAATTGGGCAGCTCCAAG 0 1 107193 CASAVA_Build 6 29630098 1I TTCTTGAGGG -/A AAAATCCCTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 4 5 107194 CASAVA_Build 6 29633542 1I AATTGTGTGA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 8 9 107195 CASAVA_Build 6 29711554 1D AGAATCAGTA T/- TTTTCCGCCC 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 5 4 107196 CASAVA_Build 6 29727242 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1246 hom 18 4 13 1 A 12 13 107197 CASAVA_Build 6 29729465 21D14M1I CTGGCTGAGA TTTATTTTCAAAGCATGTTACTTTATAAGAATCAA-/---------------------TTTATAAGAATCAAT TTTTTATTTA 3070 het 3070 ref 30 19 14 6 N/A 0 0 107198 CASAVA_Build 6 29743079 1I TTAGATAAAC -/A AAAGTGGCAA 3070 het 3070 ref 46 18 17 11 A 3 4 107199 CASAVA_Build 6 29756710 1D CTCCAAGATT A/- GGGGCGCAGT 1302 het 1302 ref 24 11 3 10 A 1 0 107200 CASAVA_Build 6 29767653 1I TTCTTAGTAA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 6 7 107201 CASAVA_Build 6 29770170 2I CATAACACTC --/TA TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 TA 0 1 107202 CASAVA_Build 6 29770336 1D TTGGGCAGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 44 18 21 5 T 9 8 107203 CASAVA_Build 6 29771170 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2015 hom 30 7 17 6 T 11 12 107204 CASAVA_Build 6 29777895 2I CTCCTGATCT --/AC ACACACACAC 3070 het 1809 hom 23 6 10 7 AC 8 9 107205 CASAVA_Build 6 29779862 3D4M2D TGCACTCCCG TCCTGGGAT/---TGGG-- GCCCTTCACT 3070 het 3070 ref 39 23 14 8 N/A 0 0 107206 CASAVA_Build 6 29780054 11I TGCCCTTTCA -----------/ACGATTTTCTC ATTTAGAAGT 3070 het 3070 ref 52 27 17 8 ACGATTTTCTC 0 1 107207 CASAVA_Build 6 29782303 3D ATAAAAATAG ATA/--- ATAATTTGAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 ATA 2 1 107208 CASAVA_Build 6 29785341 1I TCACCTGTGT -/C CCCCCACCTG 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 C 5 6 107209 CASAVA_Build 6 29786852 1D TGGATAAATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 9 8 107210 CASAVA_Build 6 29792388 10D AACAATAATT TTAATTTTGC/---------- TTAATTTTGC 3070 het 3070 ref 31 16 8 9 TTAATTTTGC 2 1 107211 CASAVA_Build 6 29807888 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1585 hom 27 5 14 8 T 9 10 107212 CASAVA_Build 6 29809117 2I GTGTATTTTA --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 8 10 107213 CASAVA_Build 6 29809632 2I ATACTATAAT --/TA TATATATATA 2205 het 566 hom 8 2 5 1 TA 5 6 107214 CASAVA_Build 6 29812517 1I GTGGTCACTA -/T TCACTCCCGT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 1 2 107215 CASAVA_Build 6 29816927 1D GCTGTGAATC T/- GTCCATCACC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 1 0 107216 CASAVA_Build 6 29824904 1D ACACTCAGAA G/- GGGAAGGTTC 1552 het 1520 hom 19 6 5 8 G 4 3 107217 CASAVA_Build 6 29826309 2D GACCAGTACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 9 T 13 11 107218 CASAVA_Build 6 29826731 1I AGTCAGACAC -/A GGAGGTCTCG 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 0 1 107219 CASAVA_Build 6 29829344 2I TAATATATAT --/AC ACACGTAAGC 2320 het 2320 ref 27 8 8 11 AC 2 3 107220 CASAVA_Build 6 29829646 1D TTATAGGGTC A/- ATAAAAGAGG 3070 het 3070 hom 27 13 13 3 A 2 1 107221 CASAVA_Build 6 29831408 2D AAGGACACTC AG/-- GGAATAAATG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 AG 1 0 107222 CASAVA_Build 6 29832663 1I TTGGGGGAGG -/T TTTTATACTT 3070 het 3070 ref 44 18 20 6 T 4 5 107223 CASAVA_Build 6 29832971 1D CTTGGTGTTG T/- TTTTAAAATA 3070 het 3070 hom 55 24 29 4 T 5 4 107224 CASAVA_Build 6 29833820 32D GACAGTAGAG GCCAGAGGTTGCAGACCCTGGGAGTCAGCTGT/-------------------------------- GCTGTTCACT 3070 het 3070 ref 39 32 11 8 GCCAGAGGTTGCAGACCCTGGGAGTCAGCTGT 1 0 107225 CASAVA_Build 6 29834552 3D CAAATACAGT CTC/--- CTCCTGCAGG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 CTC 2 1 107226 CASAVA_Build 6 29837681 1I CAAAAGGGAC -/A CCAGTGCTCT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 0 1 107227 CASAVA_Build 6 29837972 1I ACCATGCCTG -/A AATGGGTCAG 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 2 3 107228 CASAVA_Build 6 29841568 7D TCTGTACTCC CTGGAAT/------- CTGGAATCCT 3070 het 3070 hom 44 19 24 6 CTGGAAT 2 1 107229 CASAVA_Build 6 29843528 1D AATTAATACC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 8 7 107230 CASAVA_Build 6 29845640 1D GGCAGAACTA G/- GGGGGATCAT 3070 het 3070 ref 50 24 20 7 G 6 5 107231 CASAVA_Build 6 29846591 1D TAGGGGAATG C/- CAGGGGTGTC 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 C 2 1 107232 CASAVA_Build 6 29848801 3I GTTTGTTCAA ---/CTT CTTCTACCTG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 CTT 1 2 107233 CASAVA_Build 6 29852388 1I GAAGACAATA -/T TGACGATTCC 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 T 1 2 107234 CASAVA_Build 6 29852789 1D GTGTCCTTTT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 2629 hom 42 11 24 9 G 10 9 107235 CASAVA_Build 6 29855127 2I ATCTCTACAA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 9 11 107236 CASAVA_Build 6 29863372 1I AATTTACATG -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 A 7 8 107237 CASAVA_Build 6 29866374 3D AATAAAATAT TTC/--- TTAACTTTTT 3070 het 3070 ref 29 18 10 4 TTC 1 0 107238 CASAVA_Build 6 29869062 3I AGCGTGGTCC ---/ATG ATGACCATGG 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 ATG 1 2 107239 CASAVA_Build 6 29869998 1D CCGCCTTTTC T/- CAGGGATTTC 3070 het 3070 ref 52 28 17 7 T 1 0 107240 CASAVA_Build 6 29870420 1I TGAACATTTT -/C AAATTTTGTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 0 1 107241 CASAVA_Build 6 29870492 1I CCTCCCTCCA -/T TTTTTTTCAT 2687 het 2687 ref 24 14 7 3 T 7 8 107242 CASAVA_Build 6 29871094 4D TGTGATTTGG ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 AT 7 5 107243 CASAVA_Build 6 29872168 1D TTTACACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 21 10 A 11 10 107244 CASAVA_Build 6 29873651 1I ATCCAGGCTA -/T GCTAGGCTGA 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 T 0 1 107245 CASAVA_Build 6 29874765 4D GTAAAGGAAC AGAG/---- AGAAAGAATT 3070 het 3070 hom 32 11 19 4 AG 3 1 107246 CASAVA_Build 6 29875068 1I AAAAAATTAC -/A AAAAAAATTA 1550 het 379 hom 7 2 4 1 A 7 8 107247 CASAVA_Build 6 29876495 1D TCCAAAAGAA G/- GGGAGGAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 15 1 G 4 3 107248 CASAVA_Build 6 29884245 4I AGACAGCAGA ----/GTTT GTTTGTTGAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 GTTT 1 2 107249 CASAVA_Build 6 29885126 1D ACCACAGTGG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 A 8 7 107250 CASAVA_Build 6 29885604 4D AAATTTTAAA ACTC/---- AACAATAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 13 5 ACTC 1 0 107251 CASAVA_Build 6 29886338 1I TTGCAGCACT -/A ATGGAAAAGT 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 A 1 2 107252 CASAVA_Build 6 29889552 1I AATTTTCATG -/C CCTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 2 3 107253 CASAVA_Build 6 29898314 4I3M2D TGAACAGACA ----TCCTA/TTTCTCC-- CAGAATGGGA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 N/A 0 0 107254 CASAVA_Build 6 29899839 1D CTGCATAATA T/- TCCATGGTGT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 2 1 107255 CASAVA_Build 6 29906561 14I GAGTGGCAAG --------------/ATTTGTTCATGCCT TCCCTTTGTG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 ATTTGTTCATGCCT 0 1 107256 CASAVA_Build 6 29940971 1D TTTGAACTTG T/- TTCTTGTCCT 3070 het 3070 ref 59 34 22 5 T 3 2 107257 CASAVA_Build 6 29941774 1I CAACCTTTGT -/A AAATTTAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 A 3 4 107258 CASAVA_Build 6 29942001 5D AGTGAGCACA TCCCC/----- TCCCTCAGGG 3070 het 3070 hom 48 21 25 4 TCCCC 1 0 107259 CASAVA_Build 6 29943487 1I CCATACTCTC -/T AACTCACACT 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 T 0 1 107260 CASAVA_Build 6 29949196 1D GAAGTTTTGA T/- TAGTATGTGC 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 T 2 1 107261 CASAVA_Build 6 29950914 1D TCATCAACAT C/- AAGTATTACA 3070 het 3070 ref 46 20 19 8 C 1 0 107262 CASAVA_Build 6 29960084 4D GCTTCCACCT TCTC/---- TCTCTCTGTC 3070 het 1985 hom 27 6 19 4 TC 5 3 107263 CASAVA_Build 6 29961782 1I TTCCATCCAC -/A ATTTTGCCCA 3070 het 3070 ref 46 25 13 8 A 1 2 107264 CASAVA_Build 6 29968357 3D CCCAAAGGGA ATC/--- ATCATCTAAA 3070 het 3070 ref 47 24 20 6 ATC 3 2 107265 CASAVA_Build 6 29969400 3D TCTCAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 10 11 4 A 12 9 107266 CASAVA_Build 6 29969498 1D32M9D TGGGGAAGTT AAAAAAAAAACAGGTCAAACTGTGATTTGGGTATATATATAC/-AAAAAAATACAGGTCAAACTGTGATTTGGGTA--------- TTATTGTAAA 3070 het 3070 ref 34 21 14 4 N/A 0 0 107267 CASAVA_Build 6 29973427 1D GGGGAGCACA G/- CCACCCCAAA 3070 het 3010 hom 28 9 16 3 G 1 0 107268 CASAVA_Build 6 29974644 1D AACATTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 2107 hom 16 5 8 3 A 8 7 107269 CASAVA_Build 6 29975325 2I TCTAAAGACA --/CT CTTATCACTC 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 CT 1 2 107270 CASAVA_Build 6 29975934 1D46M1D GGGGGCTATC AAGACCACCAGGCTATATAACTCTACTTACTGTTAATCCTAACTTTTC/-AGACCACCAGGCTATATAACTCTACTTACTGTTAATCCTAACTTTT- CAGATGAAAT 3070 het 3070 ref 33 29 21 5 N/A 0 0 107271 CASAVA_Build 6 29976771 2D TGTGAACAAA AG/-- AGAGATTATC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AG 3 2 107272 CASAVA_Build 6 29978407 1D ACACAAATTT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 15 6 G 2 1 107273 CASAVA_Build 6 29978737 2I ATCTACAAAT --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 A 8 10 107274 CASAVA_Build 6 29978917 2I TTAAACTCAA --/TG TGTAAGAAGA 3070 het 3070 ref 47 29 14 4 TG 1 2 107275 CASAVA_Build 6 29979224 1I AGGAGACTGA -/G GTGGGAGGAT 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 G 1 2 107276 CASAVA_Build 6 29980250 1D AGCCACTGCC T/- TGGTTCTGCT 1531 het 1531 ref 33 28 4 5 T 2 1 107277 CASAVA_Build 6 29981310 2I ACCACCCATC --/TG TGTGCCCCAA 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 TG 2 3 107278 CASAVA_Build 6 29985859 1I CACTCAGTGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 38 16 19 3 A 8 9 107279 CASAVA_Build 6 29986123 1D AGCCTTTTAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 9 8 107280 CASAVA_Build 6 29993525 8D GATTTGATTT CCAAGGGC/-------- CCAGACCCAT 3070 het 3070 hom 32 15 14 5 CCAAGGGC 1 0 107281 CASAVA_Build 6 29994371 4I TTCTATCTCT ----/CGCC CACCCTCCTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 CGCC 0 1 107282 CASAVA_Build 6 29995109 2D ATATATGTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 31 15 11 5 AT 7 6 107283 CASAVA_Build 6 29995185 2D CAGGATGGAG TC/-- TCTCTCTCTG 2885 het 2885 ref 24 12 8 4 TC 5 4 107284 CASAVA_Build 6 29995341 1I AAAATGAAAG -/A GAAAAGAATA 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 A 0 1 107285 CASAVA_Build 6 29996096 1I TGTGTGTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 9 10 107286 CASAVA_Build 6 29997328 1D TCTGGCGAGG T/- TGTAAAGAAA 1931 het 1931 ref 19 11 4 4 T 2 1 107287 CASAVA_Build 6 30001462 1D CAAAGTTACA T/- TTTTTTACCG 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 7 6 107288 CASAVA_Build 6 30003644 1D TTCCACGGAA T/- TCGGAGATTA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 2 1 107289 CASAVA_Build 6 30003808 1I TCCTGTTAGA -/C CCTCTCCCCC 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 C 2 3 107290 CASAVA_Build 6 30004125 1I ATGTCTCTTA -/G GGAAAGCAGG 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 G 2 3 107291 CASAVA_Build 6 30007069 1D CATAAGCCTA G/- GGTTATCTTT 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 G 3 2 107292 CASAVA_Build 6 30010470 1I GCCACACATA -/G GGTTTCTAGT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 G 2 3 107293 CASAVA_Build 6 30011075 2D TATAAAATAA CT/-- CTATGTGATT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 CT 2 1 107294 CASAVA_Build 6 30011303 4D TGTAAAAGTT TAAG/---- TAGCCACAAT 2442 het 2442 ref 30 19 8 4 TAAG 1 0 107295 CASAVA_Build 6 30012975 1I TGCTAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 22 7 0 A 8 9 107296 CASAVA_Build 6 30013257 2I GATTAGGCAA --/TT TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 T 7 9 107297 CASAVA_Build 6 30013470 1D9M1I13M1I ATGTGGCCAA CAAAAATATG-AAAAAGAAAGCTC-/-AAAAATATGAAAAAAAAAAGCTCA CCATCACTGA 3070 het 3070 ref 31 28 9 6 N/A 0 0 107298 CASAVA_Build 6 30014227 2I20M2D TGCACATCCT --ACACATGTACCCTGGAACTTAA/ACACACATGTACCCTGGAACTT-- AAAAAAATTA 2859 het 2859 ref 30 21 9 4 N/A 0 0 107299 CASAVA_Build 6 30014336 2D ACCTGAAACA AT/-- AGTTATAATT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 AT 1 0 107300 CASAVA_Build 6 30014911 2I GCTTCCACCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 34 10 12 12 TC 5 6 107301 CASAVA_Build 6 30017231 1I CCTAAAAACT -/A ATTTTTTATG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 1 2 107302 CASAVA_Build 6 30019563 4I GTTCCCTTTG ----/ACAC ACACCGGCAG 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 AC 2 4 107303 CASAVA_Build 6 30022836 1I ATAAGCATGT -/A GGAATTGAGG 2725 het 2725 ref 52 40 7 5 A 0 1 107304 CASAVA_Build 6 30027648 2I TGGCCCACAA --/AT ATATTTATAG 2353 het 2353 ref 25 16 6 3 AT 2 3 107305 CASAVA_Build 6 30028315 1I CAAATCTTTG -/T TCGTGATGCT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 1 2 107306 CASAVA_Build 6 30028467 4D TTCTGAGGAA AAAG/---- AAAGATAGTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 6 AAAG 2 1 107307 CASAVA_Build 6 30028885 4D AAATAACTAA CTAG/---- CTAACTAACT 3070 het 3070 ref 39 20 16 5 CTAG 1 0 107308 CASAVA_Build 6 30029483 21D18M1D ACAAACAAAC AAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACTCACTGCAGCTTC/---------------------AAAAACTCACTGCAGCTT- CTACTTTGGT 3070 het 3070 ref 26 15 13 7 N/A 0 0 107309 CASAVA_Build 6 30029938 1D AATCATTGAA T/- TTTTCATTTG 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 T 5 4 107310 CASAVA_Build 6 30030886 8D TTAACTTAGT GCCTACTA/-------- TGTGCCAGAT 3070 het 3070 ref 32 18 12 7 GCCTACTA 1 0 107311 CASAVA_Build 6 30030961 2I CCCCTGTGCT --/CA TGTGCCTTCC 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 CA 0 1 107312 CASAVA_Build 6 30031776 4I ACTAACTAAC ----/TAAA TAAATAAATG 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 TAAA 2 3 107313 CASAVA_Build 6 30036139 1I ATTTACCCCC -/T GATACCTCAT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 0 1 107314 CASAVA_Build 6 30041313 3D CATTAAGGTT TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 17 11 TTG 3 2 107315 CASAVA_Build 6 30041921 1D TTTGAAGCAC A/- AAAAAAAAAA 2341 het 1764 hom 28 10 10 8 A 16 15 107316 CASAVA_Build 6 30042110 1I CCTCCCCAAG -/T ACCTCCTGGG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 0 1 107317 CASAVA_Build 6 30049766 4D TACAACAATT AAAC/---- AACAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 9 17 0 AAAC 1 0 107318 CASAVA_Build 6 30051316 2D AGTGCAGGGG GT/-- GGGGGTGATG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 GT 1 0 107319 CASAVA_Build 6 30052081 3I ACGATGATAC ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 TAA 3 4 107320 CASAVA_Build 6 30054570 4D4M1D GCCAAAGTCT AAAACTCAG/----TTCA- AAGCAAGTCT 3070 het 3070 ref 29 18 12 2 N/A 0 0 107321 CASAVA_Build 6 30063764 1I ATATGCAATA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 3 4 107322 CASAVA_Build 6 30066235 2D AACTAGACCC CT/-- GTCTCTCACC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 CT 1 0 107323 CASAVA_Build 6 30066338 10I GGGAAACATT ----------/ACAGGACATG AGTCTAGGCA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 ACAGGACATG 0 1 107324 CASAVA_Build 6 30066815 1I GAAAGGGGAA -/C TGTTATACAC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 C 0 1 107325 CASAVA_Build 6 30067037 1I TGAAATCAAT -/G GGTGAATTTA 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 G 2 3 107326 CASAVA_Build 6 30067344 1D ACAGTTATAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 10 9 107327 CASAVA_Build 6 30069038 1D CAGGTGAACA C/- TGCCTTTACC 3070 het 3070 hom 70 26 37 7 C 1 0 107328 CASAVA_Build 6 30072050 1I CCAGCAGTGC -/T GTCTCCTTGA 2843 het 2843 ref 35 21 7 7 T 0 1 107329 CASAVA_Build 6 30074982 1D TCTCAAGGCA T/- GGGTTTGTCA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 1 0 107330 CASAVA_Build 6 30077310 1I ATCCCTCAGA -/C CCCCTGGGGC 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 C 4 5 107331 CASAVA_Build 6 30079186 1I TTTGTTATGC -/A ATAGTAAATA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 A 1 2 107332 CASAVA_Build 6 30079344 2D CATGCACTGC AG/-- TGTCGACCTC 2804 het 2804 ref 30 17 8 7 AG 1 0 107333 CASAVA_Build 6 30081167 1I CACTTTTTTT -/A AATGGTATTT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 2 3 107334 CASAVA_Build 6 30083946 1D30M2I TCCTTTCAGA CCCCCCCCAAGACACACGTGACCCACCCCCC--/-CCCCCCCAAGACACACGTGACCCACCACCCTG TCTCTGAACA 2637 het 2637 ref 18 15 8 3 N/A 0 0 107335 CASAVA_Build 6 30084399 15D TGGTTCTCCT TGGAGCTGTGGTCAC/--------------- TGGAGCTGTG 3070 het 3070 ref 33 16 10 10 TGGAGCTGTGGTCAC 2 1 107336 CASAVA_Build 6 30088132 4I AAGGATAGAG ----/AATA AATACCAGAC 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 AATA 1 2 107337 CASAVA_Build 6 30089257 19I GCTGCACGGT -------------------/GCCTTCATGGTCTGTGGGC GCCTTCATGG 3070 het 2588 hom 31 7 11 13 GCCTTCATGGTCTGTGGGC 0 1 107338 CASAVA_Build 6 30089353 1D GTAGGGGGAT A/- CTCTTTCAGG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 1 0 107339 CASAVA_Build 6 30089995 2D AAATAACATC AA/-- AAAAAACCAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 A 8 6 107340 CASAVA_Build 6 30092282 1I GTGGAGGGGA -/G GGGGTCCTTG 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 G 4 5 107341 CASAVA_Build 6 30095513 1I CTTTACTGAC -/A AACTAGATTT 3070 het 3070 ref 56 25 24 7 A 2 3 107342 CASAVA_Build 6 30099117 1D CTCTCCTCCT C/- CCCAGCCCCT 3070 het 3070 ref 41 17 20 4 C 4 3 107343 CASAVA_Build 6 30102274 1I ACAGAACTAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 8 9 107344 CASAVA_Build 6 30103980 3D TCCTTTTAAA ATG/--- ATACTATTAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 ATG 1 0 107345 CASAVA_Build 6 30106086 1D CAGCGTGTAG T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 7 6 107346 CASAVA_Build 6 30106795 1I TAAACATTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 9 10 107347 CASAVA_Build 6 30109868 4I GGCAATCTAC ----/TTTA TTTATTCTGC 2251 het 2251 ref 34 21 7 6 TTTA 1 2 107348 CASAVA_Build 6 30113741 2D AGCAAGAAGC AA/-- AGAGTTCTAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 A 3 1 107349 CASAVA_Build 6 30114502 7I CTAGATAAGC -------/ACTATCA AAAATGGTAA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 ACTATCA 0 1 107350 CASAVA_Build 6 30117701 1I ATGCAGAGAT -/C CTGAAACCAA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 C 1 2 107351 CASAVA_Build 6 30121373 1I CACCACCCAC -/T TCTGGGCTTC 3005 het 3005 ref 34 16 10 8 T 1 2 107352 CASAVA_Build 6 30122274 13I AAAAAAGTAT -------------/CCTAGGTTTGTCA CCATGCTACT 3070 het 3070 hom 38 14 16 9 CCTAGGTTTGTCA 0 1 107353 CASAVA_Build 6 30123482 1I TCTTTTATAT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 A 7 8 107354 CASAVA_Build 6 30125907 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCT 3070 het 1905 hom 16 5 11 0 A 4 5 107355 CASAVA_Build 6 30126004 1I GGGTTGCAGT -/A AAGCCAAGAT 2219 het 2219 ref 24 15 5 4 A 2 3 107356 CASAVA_Build 6 30129959 21I TATTTTGGGC ---------------------/CTGGCTCTGCCTGACACAGTT CTGTCTCCAG 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 CTGGCTCTGCCTGACACAGTT 0 1 107357 CASAVA_Build 6 30130182 1I ATGTTAATGT -/A TTATCTAAGT 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 0 1 107358 CASAVA_Build 6 30132577 1I CAACTAAAAA -/T AGTTAAGCTA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 0 1 107359 CASAVA_Build 6 30132666 1I CGAGCATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 A 10 11 107360 CASAVA_Build 6 30134402 3I TGAAATTCTG ---/TTC TTATTTGACT 3070 het 3070 hom 47 12 28 7 TTC 0 1 107361 CASAVA_Build 6 30136212 1I AACGGATGAC -/G ATAATGAATT 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 G 0 1 107362 CASAVA_Build 6 30137152 1I AGAGGCAGGA -/G GGCGTGCGTG 3070 het 2538 hom 27 9 12 6 G 2 3 107363 CASAVA_Build 6 30138907 2I TGAGAGTGGA --/TT CTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 0 2 107364 CASAVA_Build 6 30140049 1I28M3D TCATTTTACC -AAAAAAAAAAAAATTTTTTTTAAATAAAAAG/AAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTAAATAAA--- AAGATTTTTT 1397 het 1397 ref 20 8 6 8 N/A 0 0 107365 CASAVA_Build 6 30141337 3I GTCAACAGTA ---/GTT AAGTTTTGGG 3070 het 3070 ref 51 30 12 9 GTT 0 1 107366 CASAVA_Build 6 30142323 4D TCATATTTTT GTTA/---- GTTTTCAGCA 3070 het 3070 hom 53 22 27 6 GTTA 1 0 107367 CASAVA_Build 6 30146222 4D GTTCCTTTCC GTGA/---- GTATGTGCGG 3070 het 3070 hom 49 22 23 6 GTGA 1 0 107368 CASAVA_Build 6 30146346 1D CTGCAAAAGA G/- GTACAAAGCT 3070 het 3070 hom 44 13 21 10 G 2 1 107369 CASAVA_Build 6 30170999 1D AAAACTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2834 hom 30 9 14 8 A 12 11 107370 CASAVA_Build 6 30182354 1D AAAATAAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2594 hom 32 8 13 11 A 10 9 107371 CASAVA_Build 6 30183298 1I AAATATCTGG -/C CGAACATCTA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 1 2 107372 CASAVA_Build 6 30185089 1I AACAAGGGAG -/C CCTGCTAGCC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 C 2 3 107373 CASAVA_Build 6 30210973 10D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAG 1042 het 1042 ref 17 10 4 5 A 19 9 107374 CASAVA_Build 6 30258727 1I TGCTAATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 T 11 12 107375 CASAVA_Build 6 30299806 4D TGTTTCTCTC TCTT/---- TATGTCATCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 6 TCTT 1 0 107376 CASAVA_Build 6 30332495 1I AAAAAACAAT -/A GATAGGAAAG 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 0 1 107377 CASAVA_Build 6 30362850 2I AAATGGTAGT --/TC TGTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TC 0 1 107378 CASAVA_Build 6 30395751 1I ACCTAGTGAC -/G TATGTATAAA 3070 het 3070 ref 35 20 8 7 G 0 1 107379 CASAVA_Build 6 30404630 1I TTTTTATGAC -/A TTTTTTACTT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 0 1 107380 CASAVA_Build 6 30407054 3I ACAAAAAAAA ---/AAG AAAGAACAAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 AAG 0 1 107381 CASAVA_Build 6 30410064 4I GCTTGGGGAA ----/TTCT TTCTTTAGGG 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 TTCT 1 2 107382 CASAVA_Build 6 30416964 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1067 het 1067 ref 26 15 4 7 A 15 14 107383 CASAVA_Build 6 30430088 1D GTCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 816 hom 26 5 14 7 A 13 12 107384 CASAVA_Build 6 30434502 1I AAGCAGAGTC -/A AAAAATCACA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 5 6 107385 CASAVA_Build 6 30449460 1D TTCTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 11 10 107386 CASAVA_Build 6 30475962 1D CTTTTCTGTT A/- AAAAAAAAAG 2966 het 2966 ref 25 9 7 9 A 10 9 107387 CASAVA_Build 6 30484321 1D ACTGCTACGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 10 9 107388 CASAVA_Build 6 30493504 1I GTGCAGGGGA -/C CAGTGAGAGG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 C 1 2 107389 CASAVA_Build 6 30500402 2D CACACAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 66 26 24 17 AC 10 9 107390 CASAVA_Build 6 30504150 2D GTCAAAAAAC AA/-- GAGATGCTGG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 2 0 107391 CASAVA_Build 6 30512642 1D ATGAAAAAAG A/- GACATTACAA 3070 het 3070 ref 40 25 15 0 A 1 0 107392 CASAVA_Build 6 30513331 2I TTAACATAAT --/AA AAGCCATTAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 2 4 107393 CASAVA_Build 6 30528972 1I CAAAGGGGAA -/G GAAGGGGCGG 3070 het 2587 hom 23 8 10 5 G 1 2 107394 CASAVA_Build 6 30532308 1D CTAAAAACAC A/- AAAAAATTAG 2318 het 841 hom 12 2 6 4 A 7 6 107395 CASAVA_Build 6 30543841 1D TTAAATAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2675 hom 29 8 11 10 A 13 12 107396 CASAVA_Build 6 30548450 1D ATCACACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 10 A 15 14 107397 CASAVA_Build 6 30554562 1D CAAACATATG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 8 7 107398 CASAVA_Build 6 30571190 10I TAAGGAGTAT ----------/CCCAGAAAGA AGAACTATTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 CCCAGAAAGA 0 1 107399 CASAVA_Build 6 30572109 1D GGTTATTACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 10 9 107400 CASAVA_Build 6 30579144 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 2189 hom 19 5 13 1 T 7 6 107401 CASAVA_Build 6 30583283 5D AAAAAGAAAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 13 12 8 AAAGA 4 3 107402 CASAVA_Build 6 30587913 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1510 hom 26 5 12 10 A 17 16 107403 CASAVA_Build 6 30590714 1D TGTGCCCTGA C/- CAACTTGGGC 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 C 2 1 107404 CASAVA_Build 6 30595491 1D CTGATCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2999 hom 47 16 12 19 T 15 14 107405 CASAVA_Build 6 30603822 2I CCTCAGCTAC --/TA TATTTCTGTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TA 1 2 107406 CASAVA_Build 6 30604675 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 10 107407 CASAVA_Build 6 30605418 3D AAGAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAACT 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 AAG 3 2 107408 CASAVA_Build 6 30611156 1I TGTTTCCCAA -/T TTTTTTTTTT 1806 het 1806 ref 34 11 9 14 T 15 16 107409 CASAVA_Build 6 30614997 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 1843 het 1843 ref 20 14 4 2 A 9 10 107410 CASAVA_Build 6 30624756 5D TCCTTGTTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 794 het 794 ref 45 20 8 20 TTTTG 1 0 107411 CASAVA_Build 6 30666457 1I CCCGAGAGTG -/A AGCTTTCCTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 1 2 107412 CASAVA_Build 6 30674221 1D GTATCCTTTC T/- TTTTTTTTTC 2768 het 2658 hom 26 10 10 6 T 10 9 107413 CASAVA_Build 6 30769838 1D AAAATTAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 13 12 107414 CASAVA_Build 6 30800273 1I TTTTTCTTCT -/G GGGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 G 8 9 107415 CASAVA_Build 6 30804545 1I TTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 1702 het 1702 ref 24 8 6 10 T 11 12 107416 CASAVA_Build 6 30831615 1I AAACTAAGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 8 9 107417 CASAVA_Build 6 30835591 1I TTTTGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 T 11 12 107418 CASAVA_Build 6 30837889 1I TATGTATCTA -/T TTTTTAGAAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 5 6 107419 CASAVA_Build 6 30842021 1D GCTAGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 2981 het 2981 ref 28 15 7 6 T 10 9 107420 CASAVA_Build 6 30849505 1I AAAGCTCATC -/G GGTTTGTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 G 2 3 107421 CASAVA_Build 6 30852118 1I CACCACCTCG -/C CCAGCTAATT 1989 het 1989 ref 16 10 5 1 C 2 3 107422 CASAVA_Build 6 30858983 1I ACCATGTTGG -/C CCAGGATGTA 2304 het 2304 ref 20 11 5 4 C 2 3 107423 CASAVA_Build 6 30862391 1I AATTTAATAG -/T TTTTATCTCT 3070 het 3070 ref 39 27 11 1 T 4 5 107424 CASAVA_Build 6 30863586 11D5M1D CTCAAAAAAA TAAAATAAAATAAAATA/-----------AAAAT- AAATAAAATA 717 het 301 hom 4 1 2 3 N/A 0 0 107425 CASAVA_Build 6 30865744 9I ATGGGGTTAT ---------/GCCATCTGG TCCAGGCTGG 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 GCCATCTGG 0 1 107426 CASAVA_Build 6 30884114 3I TTTCTCAATC ---/TCT TCTTCTTCTT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 TCT 3 4 107427 CASAVA_Build 6 30887194 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 892 het 612 hom 21 9 6 6 G 0 1 107428 CASAVA_Build 6 30894293 4I ACCATTACTC ----/TTTG TTTATTGTGC 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 TTTG 0 1 107429 CASAVA_Build 6 30897944 1D CTGAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 15 19 16 A 11 10 107430 CASAVA_Build 6 30906123 2D TCCCCACTGT TG/-- TGTGTGTGGG 3070 hom 72 het 30 0 19 11 TG 5 4 107431 CASAVA_Build 6 30906453 1I AACAAAAAAA -/C CACATGTTAA 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 C 1 2 107432 CASAVA_Build 6 30908849 4D GATCTATCTA ATCT/---- ATCTATCTAC 1510 het 1510 ref 23 7 7 9 ATCT 3 2 107433 CASAVA_Build 6 30919291 1I TGCTGAGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 9 10 107434 CASAVA_Build 6 30923497 2I CAAGGAAATG --/AC AGGAATGTAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 AC 0 1 107435 CASAVA_Build 6 30928992 1D AAGAAACCAG A/- AAAAAAAAAA 2902 het 949 hom 19 6 10 3 A 17 16 107436 CASAVA_Build 6 30929964 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2960 het 1738 hom 25 6 10 9 T 15 16 107437 CASAVA_Build 6 30934368 1D GATGTGGCCA G/- GCATGCTGGC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 G 2 1 107438 CASAVA_Build 6 30941923 7I CTTGGAGATA -------/TTGCGGG TTGCGGGCCC 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 TTGCGGG 1 2 107439 CASAVA_Build 6 30944166 1D TTAAGGTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 T 9 8 107440 CASAVA_Build 6 30991858 8D TCTTCCCCCA AAGCAACC/-------- AAGCAACCTG 3070 het 3070 ref 34 16 13 7 AAGCAACC 2 1 107441 CASAVA_Build 6 31017362 4D ATTACAGGCA CCTG/---- CCACCACGCC 3070 het 945 hom 15 2 13 1 CCTG 1 0 107442 CASAVA_Build 6 31029397 1D TTTTTTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2486 hom 26 11 11 5 A 11 10 107443 CASAVA_Build 6 31032098 2I TTGAACGTCC --/AG AGAGTCTTCT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 AG 2 3 107444 CASAVA_Build 6 31086959 1I TCCTTCTTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 8 9 107445 CASAVA_Build 6 31098934 2D AAAAAAAAAA AG/-- GCGAAAAATG 3070 het 3070 ref 27 15 8 6 AG 1 0 107446 CASAVA_Build 6 31100154 25I TAATGAGACA -------------------------/TCAGGTTACCAAGTAACTCCCAAAT GATTCAGGGA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 TCAGGTTACCAAGTAACTCCCAAAT 0 1 107447 CASAVA_Build 6 31117722 4D TGTTTTCTGT TTTG/---- TTTGTTTGTC 1265 het 1265 ref 12 9 3 2 TTTG 3 2 107448 CASAVA_Build 6 31122521 6D GCAACTTGCT CTCGCA/------ CTCGCACACG 3070 het 3070 ref 36 15 13 9 CTCGCA 2 1 107449 CASAVA_Build 6 31126996 2I AATTCCATCT --/CA CACACAAAAA 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 CA 3 4 107450 CASAVA_Build 6 31128601 10D GAAAGAGAAA GAGAAAGAAG/---------- GAAAGAAAGA 2221 het 2221 ref 27 16 7 7 GAGAAAGAAG 1 0 107451 CASAVA_Build 6 31130644 2I TTGAGGCCAG --/GA GAGGCCAAGG 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 GA 1 2 107452 CASAVA_Build 6 31130717 2I ACCCTGTGTC --/CA AAAAGAGAGA 2326 het 2326 ref 27 15 6 6 CA 0 1 107453 CASAVA_Build 6 31131041 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2645 het 1586 hom 32 10 10 12 A 14 13 107454 CASAVA_Build 6 31131793 1I AAGAGGATTC -/T TTGTGGAATA 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 T 2 3 107455 CASAVA_Build 6 31136092 1I AAGGGTCACA -/T TTTACAGGAT 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 T 3 4 107456 CASAVA_Build 6 31138974 1I TCGTCTCTAC -/A AAAAAAATTA 2492 het 2492 ref 15 8 6 1 A 7 8 107457 CASAVA_Build 6 31144796 1I AATGTCTGGT -/A AGCCCCCTAG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 1 2 107458 CASAVA_Build 6 31144845 2D AGATGGGCGC CT/-- CTCTGGAGAT 2802 het 2802 ref 33 16 7 10 CT 3 2 107459 CASAVA_Build 6 31145297 1D CTCTGTATTT A/- AAAAATATAT 2121 het 2121 ref 16 7 5 4 A 6 5 107460 CASAVA_Build 6 31145394 4I TTGTTCCCTC ----/ACTT ACAAACTAAA 3070 het 3070 hom 35 8 22 5 ACTT 0 1 107461 CASAVA_Build 6 31145948 4I CCTAAAAAAA ----/TTTT ATTTTAAGTT 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 0 4 107462 CASAVA_Build 6 31150874 4D GTATATCTGC TTTG/---- TTTATTTCTT 326 het 326 ref 17 9 4 5 TTTG 1 0 107463 CASAVA_Build 6 31151794 1I AACCTGATAA -/T TTTTTTTTTC 2710 het 2710 ref 30 16 7 7 T 9 10 107464 CASAVA_Build 6 31156663 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 5 A 11 10 107465 CASAVA_Build 6 31159166 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 13 14 107466 CASAVA_Build 6 31159244 1D ACAGTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 2940 het 2940 ref 27 15 6 6 T 11 10 107467 CASAVA_Build 6 31169058 6I TTACAGTAGT ------/TATAAC TATAATTATT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TATAAC 0 1 107468 CASAVA_Build 6 31169287 1D CCGCCGAAAT A/- ATATCTCATC 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 2 1 107469 CASAVA_Build 6 31173498 3I TCGTTGTCTC ---/CTT CTGCCTTATG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 CTT 0 1 107470 CASAVA_Build 6 31173892 2I ATAATGGTCA --/AG AGAGATTATT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 AG 2 3 107471 CASAVA_Build 6 31174716 1D AATGAATTTG A/- AAATAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 20 17 3 A 4 3 107472 CASAVA_Build 6 31175972 1I TTTCTAACTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 52 26 19 7 T 8 9 107473 CASAVA_Build 6 31178251 2D AAACATACAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 47 16 20 12 TC 6 5 107474 CASAVA_Build 6 31179399 2I TTTGGCCCAG --/GT GTATCTAAAA 1280 het 1280 ref 30 18 4 8 GT 1 2 107475 CASAVA_Build 6 31179994 1D GGCCCAGATG C/- CCCCCTCCAC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 C 6 5 107476 CASAVA_Build 6 31180378 5D GAGGATCATT TGAGG/----- CCAGGAGTTC 2327 het 2327 ref 28 18 6 6 TGAGG 1 0 107477 CASAVA_Build 6 31181757 3I AATAGAAGAA ---/TAT TATTTAATGC 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 TAT 1 2 107478 CASAVA_Build 6 31191777 3D CAACAGTTGA CTT/--- CTTATGGACT 3070 het 3070 hom 37 11 23 4 CTT 2 1 107479 CASAVA_Build 6 31195500 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAGA 2465 het 2465 ref 20 12 6 2 A 8 9 107480 CASAVA_Build 6 31195664 1D TCCATCTCAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 21 9 7 5 A 9 8 107481 CASAVA_Build 6 31197392 1I GCCCTCTCCT -/C CCCCCAGGCC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 C 5 6 107482 CASAVA_Build 6 31202293 1D CTCCTGGTCC A/- ATGGCTCTCT 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 A 2 1 107483 CASAVA_Build 6 31202612 1I GTCGCTCCCT -/G GGCCGAAGCC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 G 2 3 107484 CASAVA_Build 6 31213336 1D AAGCAGCAGC T/- GTCTACTGAT 3070 het 2525 hom 21 9 9 3 T 1 0 107485 CASAVA_Build 6 31229854 2D TAGAGATGGC AA/-- AGAGTAAGTA 3070 het 3070 ref 44 23 20 2 A 3 1 107486 CASAVA_Build 6 31233047 4I GAACCCAAGC ----/AACT AACTATCAAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AACT 1 2 107487 CASAVA_Build 6 31236921 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAGAA 2082 het 2082 ref 28 11 11 6 AAAAG 1 0 107488 CASAVA_Build 6 31239583 1I TGAGCCCAAG -/T TTTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 5 6 107489 CASAVA_Build 6 31240669 2I ACAATGAGCT --/GA GAGACGGGCC 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 GA 2 3 107490 CASAVA_Build 6 31241600 2I GGGTGAGGGT --/AG AGTCTGCCCC 3070 het 3070 ref 39 14 12 13 AG 1 2 107491 CASAVA_Build 6 31242098 3I CCCTGGCCTC ---/GAG GAGAACACCT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 GAG 1 2 107492 CASAVA_Build 6 31242701 3I TGTGTACTTA ---/CTC CTCATTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 CTC 1 2 107493 CASAVA_Build 6 31243710 1I CCCTTTTTCT -/C CCCCACCAAG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 4 5 107494 CASAVA_Build 6 31252343 2D TGGTGGTGGC GA/-- GAGAGGTGAA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 GA 3 2 107495 CASAVA_Build 6 31253264 4I TATCTGAGTG ----/CCTA CCTAGCACAG 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 CCTA 1 2 107496 CASAVA_Build 6 31254295 4I TGGGTGGAAT ----/GATC GATCACACCA 3070 het 3070 hom 56 23 30 3 GATC 1 2 107497 CASAVA_Build 6 31257833 1D TATTATATAA T/- TTTTTTAGGA 2706 het 2706 ref 15 6 7 2 T 7 6 107498 CASAVA_Build 6 31258139 2I ACCATGTAAC --/TG TTTTTGTGGT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TG 0 1 107499 CASAVA_Build 6 31260955 1D19M1I CCTCCCCCGC TTTTTTTTTTTAAAGTGAAC-/-TTTTTTTTTTAAAGTGAACT TTTTTTTTTG 2266 het 2266 ref 14 10 6 8 N/A 0 0 107500 CASAVA_Build 6 31261464 1D TGAAAAAAAA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 T 8 7 107501 CASAVA_Build 6 31261573 8I ACAAAAAAAC --------/AGGTAAAA AGGGCACACA 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 AGGTAAAA 0 1 107502 CASAVA_Build 6 31268571 5D AAGATTCTTA TTTAT/----- TTATTTATTT 1310 het 1310 ref 22 12 8 2 TTTAT 1 0 107503 CASAVA_Build 6 31268767 1I TTTGCAGAGA -/C CAGGGTTTCA 3070 het 2856 hom 26 9 14 3 C 1 2 107504 CASAVA_Build 6 31273550 9I ATCCGTCGTG ---------/GTGTTTCAA GTGTTTCAAG 2137 het 2137 ref 24 11 6 7 GTGTTTCAA 1 2 107505 CASAVA_Build 6 31278097 2D CTCTGCTCTC TG/-- TCTCCTACAT 3070 het 3070 ref 41 15 14 12 TG 1 0 107506 CASAVA_Build 6 31279890 1I CAGCCAGAGA -/C CCCCTGATTG 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 C 4 5 107507 CASAVA_Build 6 31282457 1D TACTAACCTG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 8 7 107508 CASAVA_Build 6 31285767 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 106 het 106 ref 21 8 1 12 CT 1 2 107509 CASAVA_Build 6 31288336 14D GTCTCAAAAA AACAAAAAACAAAC/-------------- AAACAAAAAA 1724 het 1724 ref 10 9 5 1 AACAAAAAACAAAC 1 0 107510 CASAVA_Build 6 31290703 1I CATGGTGAAA -/G GAGGTAGGGC 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 G 1 2 107511 CASAVA_Build 6 31293629 1I CCAAGCTTAA -/C TTTCTTGCAT 3070 het 3070 ref 35 22 9 4 C 0 1 107512 CASAVA_Build 6 31294602 1D CAATAGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 12 11 107513 CASAVA_Build 6 31296868 2I AATCAGCCCA --/CT CTCTGTGATC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 CT 2 3 107514 CASAVA_Build 6 31299622 1D TTCGTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 2998 het 2998 ref 30 15 7 8 T 15 14 107515 CASAVA_Build 6 31300692 1I AAGGAATGGG -/A AGAGTAGGTG 3070 het 3070 ref 63 32 22 9 A 1 2 107516 CASAVA_Build 6 31301219 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2432 het 1868 hom 28 10 13 5 T 11 12 107517 CASAVA_Build 6 31311058 6I CTCCTTTGCC ------/GCTTTA GCTTTAGCTT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 GCTTTA 2 3 107518 CASAVA_Build 6 31315635 2D CAACAACAAC AA/-- AAAGGAAATA 1926 het 1926 ref 35 19 7 9 A 5 3 107519 CASAVA_Build 6 31315946 1D TAGTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1859 hom 26 7 10 10 T 15 14 107520 CASAVA_Build 6 31316269 3D TTTAAGAAAC ATG/--- ATCCTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 6 ATG 1 0 107521 CASAVA_Build 6 31317461 1D ATTGCGTTTT C/- TAAAGAGTAA 1933 het 1933 ref 21 13 5 4 C 1 0 107522 CASAVA_Build 6 31319073 1D GTTTAGTCGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 8 7 107523 CASAVA_Build 6 31322652 4I CACTAAGATG ----/AGAA AGAATCAGCA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 AGAA 1 2 107524 CASAVA_Build 6 31324710 1D AAGAAATAAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 34 15 12 8 A 9 8 107525 CASAVA_Build 6 31326357 2D TGAAGGACTG AA/-- AAACATTTAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 A 5 3 107526 CASAVA_Build 6 31328034 4D TTTCTTTAAC AAAA/---- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 49 25 19 5 A 12 8 107527 CASAVA_Build 6 31328528 1D AGATAGAGAT A/- AAAGATTCTC 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 A 4 3 107528 CASAVA_Build 6 31337709 3I ACCGCACAGC ---/AGG AGGTCACTAG 2521 het 2521 ref 40 15 7 18 AGG 1 2 107529 CASAVA_Build 6 31339945 1D GCCAGTCCCT C/- CGTTCAGGGT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 C 2 1 107530 CASAVA_Build 6 31340277 1I GAGATCTTAC -/A AAACCTGGGT 1537 het 1537 ref 26 14 5 7 A 3 4 107531 CASAVA_Build 6 31340317 29I CAATGCCAAG -----------------------------/GGAAGATGTGTGAATAATCATTTCACCAT CACACAATGC 2570 het 2570 ref 34 20 8 6 GGAAGATGTGTGAATAATCATTTCACCAT 0 1 107532 CASAVA_Build 6 31342496 2D TGATGCAGAC AT/-- GTGGGATCCT 2802 het 2802 ref 31 21 9 2 AT 1 0 107533 CASAVA_Build 6 31343210 3I CACTCGATTC ---/CTA CTGTTTTCCC 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 CTA 0 1 107534 CASAVA_Build 6 31343352 1D CACTCAGAGC A/- AAGGTCAGAT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 3 2 107535 CASAVA_Build 6 31345506 1I TGCTGGAATC -/A AGGACCCCAA 2075 het 2075 ref 37 23 6 9 A 1 2 107536 CASAVA_Build 6 31345555 2D CCTTCATTGT CA/-- CATGTGCTTC 3070 het 3070 ref 40 21 13 7 CA 2 1 107537 CASAVA_Build 6 31347990 3I GCAGGTTGGG ---/AGA AGAAGTGAAA 3054 het 2898 hom 22 9 9 4 AGA 1 2 107538 CASAVA_Build 6 31348226 3D CCCTTCACTT CTC/--- CTCCTGGAAT 2799 het 2731 hom 29 8 11 10 CTC 2 1 107539 CASAVA_Build 6 31348287 5D GCCTTACCTT ACCTC/----- ACCTCAGGTA 2484 het 2484 ref 22 11 7 6 ACCTC 2 1 107540 CASAVA_Build 6 31348919 1D ACCCCTTTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 1658 hom 24 6 13 6 A 9 8 107541 CASAVA_Build 6 31350114 3D TCCCTCAGAC CTT/--- CTTCTCCCCT 3070 het 3070 ref 28 11 10 8 CTT 2 1 107542 CASAVA_Build 6 31352026 1I GGGCCTTGGG -/C CTTTGGTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 C 1 2 107543 CASAVA_Build 6 31353339 11D CCAGGCTATT AAAGAGGAAGA/----------- GAAGAGGAAG 3070 het 3070 ref 53 24 26 10 AAAGAGGAAGA 1 0 107544 CASAVA_Build 6 31354984 7D CGTGAAACTT AGAACTC/------- AGAGGATTGC 3070 het 3070 ref 35 18 14 5 AGAACTC 1 0 107545 CASAVA_Build 6 31372042 5I AACAATAAAT -----/AATAA AATAATAATA 1870 het 1536 hom 10 4 4 2 AATAA 1 2 107546 CASAVA_Build 6 31372341 1I CCCTCCTATG -/T ATACAGTATA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 0 1 107547 CASAVA_Build 6 31372579 1D AAAAGAAGAC A/- GACACAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 1 0 107548 CASAVA_Build 6 31373412 17D TCAGGGACAG TGTCCCGAATCAGATTC/----------------- TGTCCCGAAT 3070 het 3070 ref 49 25 18 10 TGTCCCGAATCAGATTC 1 0 107549 CASAVA_Build 6 31378083 2D CAGTGTACTC TG/-- TACCCAGTGT 3070 het 3070 ref 52 28 21 4 TG 1 0 107550 CASAVA_Build 6 31397289 3I TTATAAATAC ---/TTT TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 41 21 18 2 T 6 9 107551 CASAVA_Build 6 31398000 1I AAAAGAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 9 10 107552 CASAVA_Build 6 31399573 8I GAAATCATAA --------/CAAATAGT CACTTGGACC 2885 het 2885 ref 24 11 9 4 CAAATAGT 0 1 107553 CASAVA_Build 6 31402625 4D AAGACCACAC ACCT/---- ACAACTATGA 2086 het 2086 ref 20 12 5 4 ACCT 1 0 107554 CASAVA_Build 6 31404193 3I9M4I TGTTTCTCTT ---GTTTCTGAT----/TTCTTTTCTGATTTTG TTTGAGTCTG 2747 het 2747 ref 21 15 6 2 N/A 0 0 107555 CASAVA_Build 6 31404785 3I CTTAACACTT ---/ATC ATGTTAAACC 1416 het 1416 ref 20 15 4 1 ATC 0 1 107556 CASAVA_Build 6 31406155 2D2M5I GGGGCTGACC TACG-----/--CGCAGGA TGCTGGACCA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 N/A 0 0 107557 CASAVA_Build 6 31406520 31I GAAGGGGCAA -------------------------------/TAAAGCAAATTTCAAAAATTCCCCTAGGATC CTTTCCCGAG 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 TAAAGCAAATTTCAAAAATTCCCCTAGGATC 0 1 107558 CASAVA_Build 6 31406906 2I GGCAGTAAGC --/TG TCTTTGGTCC 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 TG 0 1 107559 CASAVA_Build 6 31407032 3D AAGAAGAAAA AAG/--- ATAGATATAT 641 het 641 ref 28 19 2 10 AAG 1 0 107560 CASAVA_Build 6 31407251 2I TGATAAGGAC --/GT GTGATCTCTG 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 GT 1 2 107561 CASAVA_Build 6 31409207 2I29M1D CTAGTAACTC --TTAATTTTTTTACCTGCTGTATTTCTGGTA/TTTTAATTTTTTTATCTGCTGTATTTCTTGT- AAAACCATAT 3070 het 3070 ref 27 21 9 4 N/A 0 0 107562 CASAVA_Build 6 31409377 4I6M1D TTGTCTCAGG ----CAGAGGT/ATATCATATG- AAGGATATGA 3070 het 3070 ref 32 20 10 3 N/A 0 0 107563 CASAVA_Build 6 31410407 1D AGTTACACCA G/- GGGGAAGATA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 G 5 4 107564 CASAVA_Build 6 31410558 1I39M1I GATCATAAGT -GGGTGATTTCTTTTTCTTTTTTCCATTCAGGGCATTCTC-/GGGGTGATTTCTTTTTCTTTTTTCCATTCAGGGCATTCTCT TTTAAAGTGA 3070 het 3070 ref 28 26 12 9 N/A 0 0 107565 CASAVA_Build 6 31411933 1I AAAAGCTGGC -/A AGTCCAATCC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 1 2 107566 CASAVA_Build 6 31412525 2I GTCTGTGCAC --/AG AGTTACCTGG 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 AG 1 2 107567 CASAVA_Build 6 31413850 2I AAGATATTTA --/AT ATGATTTCAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 AT 1 2 107568 CASAVA_Build 6 31414152 1D TATGAGTCTA G/- GTTCTCCAGT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 G 2 1 107569 CASAVA_Build 6 31415336 1D AGATAATTTC T/- TTTTTCAATT 934 het 934 ref 26 16 5 6 T 6 5 107570 CASAVA_Build 6 31416536 2D AACAGTCAGT TC/-- TTCCTATTTT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 TC 1 0 107571 CASAVA_Build 6 31417959 1I53M13I TTTCACTTTC -GCTTTTTCAATTTTCTCTTCTTCTGTGGTTTTCAACAAATACGTGCTTTTTTT-------------/TGCTTTTTCAATTTTCTCTTCTTCTGTGGTTTTCAACAAATACATGTATTTGTTGAAAATTATAGAA TTAACCCAGA 3070 het 3070 ref 25 20 14 4 N/A 0 0 107572 CASAVA_Build 6 31419940 11D TGGATGTTGT TCTTGTGCAGA/----------- TCTCATGTCG 3070 het 3070 ref 38 19 10 12 TCTTGTGCAGA 1 0 107573 CASAVA_Build 6 31420751 1D TAAGACCCAA C/- CTTTTTGATG 3070 het 3070 ref 48 29 13 6 C 2 1 107574 CASAVA_Build 6 31421249 1I25M1D AGCTATCATT -CCTTCTTGCTTATAAGGTCACTCACT/ACCATCTTGCTTATAAGGTCACTCAC- TACTTTTTAG 3070 het 3070 ref 24 18 8 4 N/A 0 0 107575 CASAVA_Build 6 31421511 2D CAACAATGGT CA/-- CAGAGAGATA 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 CA 2 1 107576 CASAVA_Build 6 31421987 1D CAGTTCTCTA C/- CTGCATAACC 3070 het 3070 ref 27 16 10 4 C 2 1 107577 CASAVA_Build 6 31423079 16I GGGTTTCGGA ----------------/GAGCTTCCCAATTGCT GAGCACATCT 3070 het 3070 ref 37 25 10 3 GAGCTTCCCAATTGCT 0 1 107578 CASAVA_Build 6 31423371 2D14M1I GACCTGAGGC TGTGAGTTTGACTTCC-/--TGAGTTTGACTTCCT TTTCCCCCCA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 N/A 0 0 107579 CASAVA_Build 6 31423559 1D GGGTCCTTAA C/- CCCCGGGCTG 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 C 5 4 107580 CASAVA_Build 6 31427123 1D CCCAATACCA G/- ATATACGACT 3070 het 3070 ref 39 27 12 0 G 1 0 107581 CASAVA_Build 6 31427206 2D GTCTGCGGGC GA/-- GTGTCAGAGA 3070 het 2798 hom 22 9 11 4 GA 1 0 107582 CASAVA_Build 6 31431504 3D CTGGGATAAT CTC/--- CTATTCATTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 CTC 1 0 107583 CASAVA_Build 6 31431756 1I CCTTAATTGT -/C CTAGAGAGAA 2170 het 2170 ref 36 20 6 10 C 1 2 107584 CASAVA_Build 6 31433946 2D TTTGTAACTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 11 9 107585 CASAVA_Build 6 31437210 1I ATACAGCCAT -/A AAAAAAGAAT 2246 het 2246 ref 24 17 6 1 A 6 7 107586 CASAVA_Build 6 31439122 3D CAGGCAGGTG AGA/--- AGGAGACAGT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 AGA 1 0 107587 CASAVA_Build 6 31439426 1I CAAATTATTA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 T 7 8 107588 CASAVA_Build 6 31440011 1D AGCCAACCTC T/- TTGCTTAGCC 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 3 2 107589 CASAVA_Build 6 31442054 1I AAATATAAAC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 7 8 107590 CASAVA_Build 6 31444906 2I AGTCACAAAC --/TT GAGGAAAATA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 0 2 107591 CASAVA_Build 6 31447916 1D AATCAACTGT C/- TTAAACATAG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 C 1 0 107592 CASAVA_Build 6 31451288 3D TATTATTATT ATA/--- ATAGAGATAA 2418 het 2418 ref 24 13 9 2 ATA 2 1 107593 CASAVA_Build 6 31452837 5D CCCCCCCCCC CCCCG/----- CACCAAATTC 3070 het 455 hom 15 3 9 4 CCCCG 1 0 107594 CASAVA_Build 6 31453751 1I TGACAAAGAC -/G GGGAGGACAA 3070 het 3070 ref 70 35 22 13 G 3 4 107595 CASAVA_Build 6 31454448 3I GACCTCACGG ---/AGA AGTTCTGAAG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 AGA 0 1 107596 CASAVA_Build 6 31456247 1I TGTCTCTCTC -/T TTTCAGCTAC 3067 het 3067 ref 47 24 9 14 T 3 4 107597 CASAVA_Build 6 31456372 2D GATGGTTGCA AG/-- GTGATCCAGC 3070 het 3070 ref 50 33 15 2 AG 1 0 107598 CASAVA_Build 6 31456619 1D TTCATAACCA T/- TTGAATCACA 3070 het 3070 ref 40 26 13 2 T 3 2 107599 CASAVA_Build 6 31457082 1D TTTTCACTCC A/- AAAACACAAG 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 5 4 107600 CASAVA_Build 6 31457225 1D TTCTTAATTT G/- CTAATTTGTA 3070 het 3070 ref 43 21 20 4 G 1 0 107601 CASAVA_Build 6 31458462 1I ATGAAGAATA -/C CAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 C 1 2 107602 CASAVA_Build 6 31469759 1D GGATGAGGGG C/- TGTAAAACAT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 C 1 0 107603 CASAVA_Build 6 31470320 1D CCAGGGAGGG T/- GGTGGCAGTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 1 0 107604 CASAVA_Build 6 31471438 2D AAAAATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 AC 6 5 107605 CASAVA_Build 6 31473250 2D TCCTCTTGAA AG/-- AGAGTTTCTG 2883 het 2883 ref 27 17 6 5 AG 3 2 107606 CASAVA_Build 6 31476933 3I GAGCTAGGTC ---/CGA CATCTCCCTC 2499 het 2499 ref 19 9 8 2 CGA 0 1 107607 CASAVA_Build 6 31482165 1I GATTATTATA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 8 9 107608 CASAVA_Build 6 31485066 2I AACCTTGCTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 50 26 21 3 TG 6 7 107609 CASAVA_Build 6 31486205 3I GCATTTCCTG ---/CCT CCCCAGGAAG 2266 het 2266 ref 27 14 5 8 CCT 0 1 107610 CASAVA_Build 6 31488071 1I AACAAGTCCC -/T TTTTTTTCAG 2396 het 2396 ref 27 20 6 1 T 7 8 107611 CASAVA_Build 6 31492336 4D TGAAGAATCC CAGT/---- CAGTCAGGTT 3070 het 3070 ref 45 23 16 8 CAGT 2 1 107612 CASAVA_Build 6 31494276 2D CTCCTGGTTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 11 15 16 GT 9 8 107613 CASAVA_Build 6 31494926 4D GTACTTGGAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 16 12 107614 CASAVA_Build 6 31495204 1D TTCTAGTAGC T/- TTTCCTGAAA 3070 het 3070 ref 49 32 14 3 T 4 3 107615 CASAVA_Build 6 31495683 1I GGGAATAGCA -/G GGGACATAGT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 G 3 4 107616 CASAVA_Build 6 31496128 3D TTTGAATGGC GTT/--- GTTTTTTTAA 593 het 593 ref 46 30 5 12 GTT 2 1 107617 CASAVA_Build 6 31496155 1D TGAGTTGTAG T/- TTTTTTATGT 1910 het 1910 ref 52 30 5 17 T 7 6 107618 CASAVA_Build 6 31498119 1I ACCAAGTTAT -/A AAAAATGTAC 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 A 5 6 107619 CASAVA_Build 6 31499096 1D ATTTGATTCT A/- AAAATGGAGG 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 A 5 4 107620 CASAVA_Build 6 31501731 1I ATGCTGAGCA -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 7 8 107621 CASAVA_Build 6 31507758 13D CACTTAATGC ATTTTCCCAATTA/------------- ATTTTCCCAA 3070 het 3070 ref 42 22 18 5 ATTTTCCCAATTA 2 1 107622 CASAVA_Build 6 31513240 2D CCTCTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 18 8 9 T 11 9 107623 CASAVA_Build 6 31514819 1I TCCTTAAGTG -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 6 7 107624 CASAVA_Build 6 31518971 9D GTTATTTTAT TTTATTTTA/--------- TTTATTTTAT 3070 het 2630 hom 25 6 17 3 TTTATTTTA 2 1 107625 CASAVA_Build 6 31519972 2D ATGGAATATC TT/-- TCCATTTGTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 T 3 1 107626 CASAVA_Build 6 31521349 1D TATTTCCTGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 9 8 107627 CASAVA_Build 6 31524350 1I CATGGAGCTG -/C CATCTCCTAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 C 1 2 107628 CASAVA_Build 6 31524918 8D GAGGCTTAGA GGTCTTCG/-------- GGTTCAAACC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 GGTCTTCG 1 0 107629 CASAVA_Build 6 31534150 2D AAAATTATAC AT/-- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 AT 5 4 107630 CASAVA_Build 6 31551045 2D GTGTGAGTGT GA/-- GAGTGGAGCA 3070 het 3070 ref 71 31 28 15 GA 2 1 107631 CASAVA_Build 6 31561001 1D AAATGTGTCC A/- AAAATAGACC 1831 het 1831 ref 33 27 4 2 A 5 4 107632 CASAVA_Build 6 31561427 1I67M3I AAGGGACAAA -GAGATATATATACACATTTATATTTGCTTGCATATGCATAAAATATATTTGGAAGAATAAGCAAGAA---/GGATATATATGTACACATTTATATTTGCTTGCATATGCATAAAATATATTTGGAAGAATAAGCAAAAAGTT GATATCCCTG 3070 het 3070 ref 46 46 13 5 N/A 0 0 107633 CASAVA_Build 6 31571666 1I AAAGTAAATG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 A 7 8 107634 CASAVA_Build 6 31571962 4I TTCTCTTAGT ----/AGAA AGAGGCTTTC 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 AGAA 0 1 107635 CASAVA_Build 6 31574578 1I TTTCTGGTCT -/C CTCCTGCACT 3070 het 2524 hom 22 9 11 2 C 1 2 107636 CASAVA_Build 6 31576839 1D GCTACATCCT C/- GCCAGGATTC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 1 0 107637 CASAVA_Build 6 31585747 2D CCTATGAAAC AG/-- AGAAAATAAC 3070 het 3070 ref 49 22 17 12 AG 2 1 107638 CASAVA_Build 6 31587830 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2113 hom 22 5 9 8 T 11 12 107639 CASAVA_Build 6 31594138 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2076 hom 24 5 14 5 T 10 9 107640 CASAVA_Build 6 31594586 4I AGACATATAT ----/TAAA TAAATTAAAT 2338 het 2338 ref 23 15 6 2 TAAA 1 2 107641 CASAVA_Build 6 31598965 1D TAAAGACAGG C/- CCCTTCTGCG 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 C 4 3 107642 CASAVA_Build 6 31603490 2D11M6I GTGAGAAAAG ACAGTGTTAAGAA------/--AGTGTTAAGAAAAAGGC ATGCCGGGTG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 N/A 0 0 107643 CASAVA_Build 6 31606018 1D TAGTTTTGTT A/- AAAAAAAATT 2976 het 1451 hom 16 4 8 4 A 9 8 107644 CASAVA_Build 6 31606361 3D GAGAAGACAA GAC/--- ACCCCACATA 3070 het 3070 ref 78 36 35 8 GAC 1 0 107645 CASAVA_Build 6 31613245 1I AAAGTACCAC -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 A 6 7 107646 CASAVA_Build 6 31615742 2D TACTTATCCC CT/-- GATTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 CT 1 0 107647 CASAVA_Build 6 31616841 1I CCACCGTTAT -/G GGATGCCTAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 G 2 3 107648 CASAVA_Build 6 31618793 3D TGGATTTTTT TCC/--- TGAATGAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TCC 1 0 107649 CASAVA_Build 6 31622133 4D CAGACCCTAG CTGT/---- CTGTCTTCCC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 CTGT 2 1 107650 CASAVA_Build 6 31622952 1D GTATTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 9 8 107651 CASAVA_Build 6 31625957 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1653 hom 28 10 14 4 A 14 13 107652 CASAVA_Build 6 31630992 1D23M1D ATTTTTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATG/-TTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGAT- GGAGTCTCCC 3070 het 1735 hom 21 9 13 2 N/A 0 0 107653 CASAVA_Build 6 31631984 1D GGGAGAAGTG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 2819 hom 30 10 13 7 C 9 8 107654 CASAVA_Build 6 31670379 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAATTT 3070 het 2825 hom 25 7 16 2 A 7 8 107655 CASAVA_Build 6 31713956 1D CTTAGTTGAT A/- AGAGCACTAA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 2 1 107656 CASAVA_Build 6 31718169 4D CCTGGCAAAT AAAG/---- AAAGAACAAA 2458 het 2458 ref 18 8 8 4 AAAG 2 1 107657 CASAVA_Build 6 31750485 1D GACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1357 het 993 hom 13 7 6 0 A 15 14 107658 CASAVA_Build 6 31774266 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTTTTGCTC 2793 het 2793 ref 15 6 6 3 AG 1 2 107659 CASAVA_Build 6 31823759 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 15 14 107660 CASAVA_Build 6 31831803 1D AGGTTCAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 12 11 107661 CASAVA_Build 6 31846486 1D GTGCGTATAT A/- AAAAAAAAAA 3005 het 3005 ref 26 14 8 6 A 11 10 107662 CASAVA_Build 6 31909238 6D TAGTAAGCCG AGATCA/------ TGCCACTGCA 921 het 921 ref 12 10 2 1 AGATCA 1 0 107663 CASAVA_Build 6 31911043 1D CAGGTAACTC T/- TGAGTGTGTC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 2 1 107664 CASAVA_Build 6 31914779 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 A 12 11 107665 CASAVA_Build 6 31980574 1I GGGGGCCTAA -/T CTCAGCCCAT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 0 1 107666 CASAVA_Build 6 31981196 1D CCTGTCTTTT A/- AAAAAAAAAT 2334 het 2334 ref 27 12 7 8 A 10 9 107667 CASAVA_Build 6 31981364 5D TCTCAAAAAT AATAA/----- AATAATAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 AATAA 2 1 107668 CASAVA_Build 6 31989695 1I TGCCTGGCCC -/T TTTTTTTTTT 1335 het 1335 ref 20 9 5 6 T 10 11 107669 CASAVA_Build 6 32114740 1D GGAAGCTCTT G/- GGGGGGCATA 2830 het 2246 hom 20 9 8 3 G 7 6 107670 CASAVA_Build 6 32155973 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 31 1 25 5 T 11 10 107671 CASAVA_Build 6 32164329 3D GGCTAACCTG TAA/--- TAACCTTCCT 3070 het 2378 hom 25 8 10 9 TAA 2 1 107672 CASAVA_Build 6 32168446 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1237 hom 20 6 9 5 A 15 14 107673 CASAVA_Build 6 32178326 7D TGAGCTACCA AAAAAAG/------- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 AAAAAAG 3 2 107674 CASAVA_Build 6 32283384 1D AAGACTCTAT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 18 het 19 0 12 7 C 11 10 107675 CASAVA_Build 6 32309510 2D TTAAATGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2279 hom 24 8 8 8 T 14 12 107676 CASAVA_Build 6 32320434 2D ATTTCTTTTC TT/-- TTTTCTTTTT 379 het 379 ref 19 8 6 5 T 6 4 107677 CASAVA_Build 6 32320684 1I CACTGCGCCC -/G GCCTCGTTTT 3070 het 2513 hom 25 9 10 7 G 1 2 107678 CASAVA_Build 6 32324960 1I GTGGTACTGC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 T 8 9 107679 CASAVA_Build 6 32327843 5D GAGTTGTGAG TTGAT/----- TAATTTAATT 3070 het 3070 ref 37 13 15 11 TTGAT 1 0 107680 CASAVA_Build 6 32329322 1I GTTTCAGAAT -/A AAGAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 16 9 0 A 2 3 107681 CASAVA_Build 6 32332866 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2680 het 2680 ref 26 11 9 6 T 12 13 107682 CASAVA_Build 6 32339874 1D GTCAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 10 4 T 12 11 107683 CASAVA_Build 6 32361079 1I CAGAATGCTA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 47 20 21 6 T 7 8 107684 CASAVA_Build 6 32363215 1I ACTAACAAAC -/A AAGGAACAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 2 3 107685 CASAVA_Build 6 32363691 4D TTAAAGAAAC AGTT/---- AGATACCACT 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 AGTT 1 0 107686 CASAVA_Build 6 32365422 1I TTTCTCCCTT -/C GTTTGTTTGG 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 C 0 1 107687 CASAVA_Build 6 32367761 1I TCTTCTTTGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 T 7 8 107688 CASAVA_Build 6 32374334 1D AACTTTGTCC A/- AAAAAAAAAA 1766 het 1766 ref 39 28 6 5 A 13 12 107689 CASAVA_Build 6 32379070 1D CTAGTACGTG T/- TTTTTTTTTT 1780 het 1780 ref 39 29 4 6 T 11 10 107690 CASAVA_Build 6 32390601 21D AGTGAGATGC TTTGACAACTCTAGATGTGAA/--------------------- TTCTTGCATG 3070 het 3070 ref 38 21 13 7 TTTGACAACTCTAGATGTGAA 1 0 107691 CASAVA_Build 6 32395093 1D CACACTCACC T/- TTAGTTTCAG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 3 2 107692 CASAVA_Build 6 32398673 6I TCCTCCTACT ------/ATGAAA TGTTATTTCG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 ATGAAA 0 1 107693 CASAVA_Build 6 32399249 2D AGCTGCACAC AG/-- AGTTAGAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 AG 2 1 107694 CASAVA_Build 6 32400371 4I ACTAGAGACC ----/AACT GAGTCCTAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 AACT 0 1 107695 CASAVA_Build 6 32400539 1D TGCTTGAACA T/- TTTTTTTTTT 2410 het 2410 ref 23 11 5 8 T 11 10 107696 CASAVA_Build 6 32403407 5I AATTTTCTTT -----/CTTTC TTCTTTTTTT 161 het 161 ref 27 15 1 11 CTTTC 0 1 107697 CASAVA_Build 6 32404994 1D GGAGTCAAGC A/- GGGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 1 0 107698 CASAVA_Build 6 32405620 13D TCGATGCCCT AGATTTTAACACC/------------- AGTTTCTCCC 3070 het 3070 ref 42 22 19 5 AGATTTTAACACC 1 0 107699 CASAVA_Build 6 32405777 4D TTTTCCTCTC TCTT/---- TGTCGTGCGT 3070 het 3070 hom 39 14 19 8 TCTT 1 0 107700 CASAVA_Build 6 32406958 2I GTATTCCTTT --/CC CCATATTCCC 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 C 2 4 107701 CASAVA_Build 6 32409350 1D CTATGTGGAC A/- CCTGCATAGA 3070 het 3070 ref 65 34 28 3 A 1 0 107702 CASAVA_Build 6 32412729 1D GGTGTCAGAA G/- ATTTGAATAC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 G 1 0 107703 CASAVA_Build 6 32414636 5D ACAATTTGTG AAAGA/----- AATAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 23 1 AAAGA 1 0 107704 CASAVA_Build 6 32414985 1I TCCTTCTAAA -/G GTTATAGATA 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 G 1 2 107705 CASAVA_Build 6 32416560 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 11 12 107706 CASAVA_Build 6 32417816 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTGACAA 3070 het 2780 hom 35 11 16 8 C 0 1 107707 CASAVA_Build 6 32420939 17D TTTCTTTTTC CTCTACTTGCTTTTAGG/----------------- AGGTGGAGGA 2350 het 2350 ref 25 15 8 7 CTCTACTTGCTTTTAGG 1 0 107708 CASAVA_Build 6 32422610 1D AAAAAATACT G/- TATCTCAGAT 3070 het 3070 ref 36 24 12 1 G 1 0 107709 CASAVA_Build 6 32425901 4D TCTCCTTAAT TTTC/---- TTTCTGTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 12 6 TTTC 2 1 107710 CASAVA_Build 6 32429400 4D TATTTTTTGT AATA/---- AATGTTATAA 3070 het 3070 ref 35 18 17 2 AATA 1 0 107711 CASAVA_Build 6 32436138 2D AATATTTCAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 51 22 16 13 TG 9 8 107712 CASAVA_Build 6 32436639 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1621 hom 17 7 8 2 T 9 10 107713 CASAVA_Build 6 32439444 1D ATTTACATTT A/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 A 7 6 107714 CASAVA_Build 6 32440211 1D AATTTTAAAT G/- ATTGGTCTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 G 1 0 107715 CASAVA_Build 6 32440663 1I ATTTTTTCCC -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 T 6 7 107716 CASAVA_Build 6 32441816 3I CTACTTTGAT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 TTC 3 4 107717 CASAVA_Build 6 32443537 4I TTCTTGAGAA ----/AGAG AGAGAGGAGT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 AG 3 5 107718 CASAVA_Build 6 32443756 1D CTTGATTATT A/- AATGAGGCTT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 A 3 2 107719 CASAVA_Build 6 32444499 1D AATTCTATAA G/- TACTATATTT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 G 1 0 107720 CASAVA_Build 6 32445833 1I CCAGATAGAC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 7 8 107721 CASAVA_Build 6 32446163 12D AGATTTTCTG TATATATATATA/------------ TATATATATA 2994 het 776 hom 9 2 7 1 TA 18 12 107722 CASAVA_Build 6 32446599 1I12M2I ATCGGGGGAG -AAAAAAAAGAAA--/AAAAAAAAAGAAAAC AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 38 16 17 10 N/A 0 0 107723 CASAVA_Build 6 32489247 1I ACAATCTCTG -/C CATTCTGACT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 C 1 2 107724 CASAVA_Build 6 32490251 8I TGATTGGCAA --------/AAAGAAGG AAAGAAGGAA 3070 het 1754 hom 23 8 9 6 AAAGAAGG 1 2 107725 CASAVA_Build 6 32504087 1D CATTCCCCCA C/- CCCCCACCAT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 C 6 5 107726 CASAVA_Build 6 32504660 8D AACAACAGAC ATTTACTG/-------- AAAGTCCTCA 3070 het 3070 ref 48 24 22 5 ATTTACTG 1 0 107727 CASAVA_Build 6 32506769 5D GTATCCTTAG AGTTA/----- AGTTAATTTG 3070 het 3070 ref 25 14 11 5 AGTTA 2 1 107728 CASAVA_Build 6 32506927 1I ATATACACAT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 7 8 107729 CASAVA_Build 6 32508812 1D ATGACTTCTA T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 7 6 107730 CASAVA_Build 6 32513671 1D GGTATTCCTG A/- AAAATTGCAG 3070 het 3070 ref 50 27 17 7 A 5 4 107731 CASAVA_Build 6 32514224 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 9 8 107732 CASAVA_Build 6 32516186 2D GAATTAAATG AA/-- AAAAAAAAAG 2895 het 2895 ref 15 9 6 1 A 11 9 107733 CASAVA_Build 6 32520258 8I GGAGAGTAGG --------/AACTAACT GTATACAGTT 3070 het 3070 hom 54 20 25 9 AACT 0 2 107734 CASAVA_Build 6 32523756 2D AGTTTTATGC AT/-- ATGTCTTATC 3070 het 3070 ref 45 22 18 7 AT 2 1 107735 CASAVA_Build 6 32524037 1D ATCAACAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 T 12 11 107736 CASAVA_Build 6 32531507 1D ACTGCAATCT C/- CGCTTCCCAG 1167 het 1167 ref 17 9 3 6 C 2 1 107737 CASAVA_Build 6 32537132 1I AAAATAATAA -/T TTTTTTTTTT 2760 het 2034 hom 22 7 8 7 T 10 11 107738 CASAVA_Build 6 32539523 3I CTATTCACTA ---/ATG GTGGTTGTAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 ATG 0 1 107739 CASAVA_Build 6 32555605 1D TAAAAAAATA C/- AAAAAAATTA 2042 het 2042 ref 19 11 5 3 C 1 0 107740 CASAVA_Build 6 32561570 1D CCAGCCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1280 hom 23 7 12 6 T 12 11 107741 CASAVA_Build 6 32561810 1I GTGCATGAGA -/T GTCCTTTCTC 2237 het 2237 ref 23 17 5 1 T 0 1 107742 CASAVA_Build 6 32565327 4I TAGAATAGGC ----/ATAA GTGTTTTGTA 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 ATAA 0 1 107743 CASAVA_Build 6 32568894 1I AAAAAATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1721 hom 17 6 10 1 T 10 11 107744 CASAVA_Build 6 32570681 1I GAGTTGTTCA -/T TTCTCCCGGT 1186 het 1186 ref 19 13 3 4 T 2 3 107745 CASAVA_Build 6 32573898 1I CAATCACTGG -/A AGGTGCACTG 2671 het 1113 hom 12 4 6 2 A 1 2 107746 CASAVA_Build 6 32580018 1I TTTTTAAGGA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 7 8 107747 CASAVA_Build 6 32583141 1D GACCAATAAC T/- TTTTTTTTTC 963 het 963 ref 35 22 8 5 T 10 9 107748 CASAVA_Build 6 32583386 13I CCACCTATGA -------------/GTGAGAACATGCG GTGTTTGGTT 3070 het 3070 ref 26 14 7 5 GTGAGAACATGCG 0 1 107749 CASAVA_Build 6 32588071 1I CTCCTGTTAC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 7 8 107750 CASAVA_Build 6 32589607 3I19M1D TGCAATTATC ---ACAATCCAGTTTTATAACAT/ACAACAATCCAGTTTTATAACA- TTCTGTCATG 3070 het 3070 hom 23 12 15 3 N/A 0 0 107751 CASAVA_Build 6 32590895 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 11 8 4 A 12 11 107752 CASAVA_Build 6 32591053 11D AAAAACAATC CTTTTTGCTTG/----------- CTTTTTGGTT 2368 het 2368 ref 14 7 7 0 CTTTTTGCTTG 1 0 107753 CASAVA_Build 6 32598454 1I GTAAAAGTGA -/T GGCCAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 0 1 107754 CASAVA_Build 6 32598641 2D GGAGTGGAGA CT/-- CTGTGTCTGT 3070 het 3070 ref 49 28 13 10 CT 2 1 107755 CASAVA_Build 6 32600306 4D ACGTTCTCAT ACAG/---- ACAGTTTACA 3070 het 3070 ref 35 17 12 11 ACAG 2 1 107756 CASAVA_Build 6 32601061 1I TCACAGGATT -/A TTTGTAAGTG 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 A 0 1 107757 CASAVA_Build 6 32602048 1I CCTTCTCCTT -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 G 1 2 107758 CASAVA_Build 6 32604088 3I TCTTGTGTAA ---/CCT CCTTGAGAGT 3070 het 2893 hom 26 9 14 3 CCT 1 2 107759 CASAVA_Build 6 32612246 1D CCATAGGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 14 13 107760 CASAVA_Build 6 32612868 1I TGGTATATAG -/T TTTTTCAGAC 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 T 5 6 107761 CASAVA_Build 6 32617080 4I GATTTTTTTA ----/TTTC TTTATCAGCA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 TTTC 0 1 107762 CASAVA_Build 6 32621019 1D CATTCTATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 11 17 8 T 10 9 107763 CASAVA_Build 6 32621885 4D ACTGAATATT ATGA/---- ATAACTTTAC 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 ATGA 1 0 107764 CASAVA_Build 6 32625336 4D GATTTTAGTT AGTG/---- AATGGATTTG 3070 het 3070 ref 34 19 14 4 AGTG 1 0 107765 CASAVA_Build 6 32625643 10D CTTTCATTTG TGTGAATTTA/---------- TAAGGTACAA 3070 het 3070 ref 54 31 22 7 TGTGAATTTA 1 0 107766 CASAVA_Build 6 32627317 1I AAAGACACAC -/A GGAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 0 1 107767 CASAVA_Build 6 32627884 2I AAATAAAATA --/AC AGTTGTCTCT 3070 het 3070 hom 27 7 17 3 AC 0 1 107768 CASAVA_Build 6 32629843 22D CTAAAATAAC TATTTTTTCTGGGGAAAAAATT/---------------------- TATTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 22 12 5 TATTTTTTCTGGGGAAAAAATT 1 0 107769 CASAVA_Build 6 32633452 3D GATAAGAAGA AGC/--- CCCCTCCTGC 3070 het 3070 ref 24 13 8 6 AGC 1 0 107770 CASAVA_Build 6 32648756 1I CTTAATTTTG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 6 7 107771 CASAVA_Build 6 32649572 1I ACCTCTTTGC -/T TTTTTCTTCT 3070 het 2863 hom 20 7 9 4 T 5 6 107772 CASAVA_Build 6 32652663 6D ATCTCAGCTC TTTCTG/------ TTTCTATTTC 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 TTTCTG 1 0 107773 CASAVA_Build 6 32655008 2I GCAGAGCACA --/GG CCTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 G 0 2 107774 CASAVA_Build 6 32667829 1D TATAGACTTT G/- GGGGTAGATA 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 G 5 4 107775 CASAVA_Build 6 32675612 1I TCATATGCAG -/A AGAATAAAAT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 A 1 2 107776 CASAVA_Build 6 32681323 1D TAAATATTTA T/- TTGTTTATTA 3070 het 2244 hom 20 6 11 4 T 3 2 107777 CASAVA_Build 6 32681780 1I ATCCTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 A 10 11 107778 CASAVA_Build 6 32681905 1D AGAGAATATC T/- TCCTAACCTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 T 2 1 107779 CASAVA_Build 6 32689087 2I AGAAAAATAA --/AT TTCCCCAATA 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 AT 0 1 107780 CASAVA_Build 6 32691588 1D TCAGTATTTT C/- ATCAGGATTC 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 C 1 0 107781 CASAVA_Build 6 32691864 4I GTAGAAGTAG ----/ATGT ATGTCCCAGC 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 ATGT 1 2 107782 CASAVA_Build 6 32692171 2I ATGTTTCATC --/AA AGAGAGAATA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 1 3 107783 CASAVA_Build 6 32693247 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCTCACC 1051 het 788 hom 8 4 3 1 C 6 5 107784 CASAVA_Build 6 32698341 1D TGCTCTTCCT C/- CATGGCCCAG 3070 het 3070 hom 48 16 29 3 C 2 1 107785 CASAVA_Build 6 32702835 5D TTGTTTTTGG TTTTA/----- TTTTAACTAC 3070 het 3070 ref 47 25 21 2 TTTTA 2 1 107786 CASAVA_Build 6 32704053 2D28M2D TGGTGTTCAC AGAGAGAGAAATATAGTAGATAGAATTAATAC/--AGAGAGAAATATAGTAGATAGAATTAAT-- AGTTTCAAAT 3070 het 3070 ref 41 32 22 10 N/A 0 0 107787 CASAVA_Build 6 32718927 1D TACCTACAAA G/- ACATGCCTGG 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 G 1 0 107788 CASAVA_Build 6 32732687 3D TGGAAGAAAG AGA/--- AGAAGATTTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 AGA 3 2 107789 CASAVA_Build 6 32734561 2D CACTGTGAGG AC/-- AGGCTCTGGA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 AC 1 0 107790 CASAVA_Build 6 32734978 4D24M2I TTAGAAAAAT AGAAAGAAAGGCAACAATGTAGTGAAAG--/----AGAAAGGCAACAATGTAGTGAAAGAC ACAACAAGGG 3070 het 3070 ref 49 30 22 6 N/A 0 0 107791 CASAVA_Build 6 32735470 1I CAATTGAATT -/G ATTTTCTACC 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 G 0 1 107792 CASAVA_Build 6 32736038 3D ATCAGCACAG GGT/--- ATCCTGGTGG 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 GGT 1 0 107793 CASAVA_Build 6 32737226 1I AAGAGCAGAA -/C CTGAGTGTCT 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 C 1 2 107794 CASAVA_Build 6 32737687 1I TTTGTCTTGT -/G GGGCCCATAG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 G 3 4 107795 CASAVA_Build 6 32738538 1D33M1D TTAATGTGTG CTTTCTTTATTTAGTAATATGTTCTCTCATTTTCT/-TTTCTTTATTTAGTAATATGTTCTCTTATTTTC- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 31 21 14 4 N/A 0 0 107796 CASAVA_Build 6 32738960 1D GACTGGGAGT A/- AAAATAGAGG 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 A 5 4 107797 CASAVA_Build 6 32739155 1I TGATTAATCA -/G TGAATTTTCA 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 G 0 1 107798 CASAVA_Build 6 32739528 1D GGATAGTGAT G/- GGGGGGAGGG 3070 het 3070 ref 45 22 18 7 G 7 6 107799 CASAVA_Build 6 32739714 1I TAGCAAACAC -/T ATTTTCCTCA 3070 het 3070 ref 27 16 8 5 T 0 1 107800 CASAVA_Build 6 32742021 1I TCTCCTCTTT -/C CTCTCCTCTC 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 C 1 2 107801 CASAVA_Build 6 32742685 2D GAGGCAAAAG AA/-- AAAAATGCGA 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 A 7 5 107802 CASAVA_Build 6 32743499 1D TATCAATGTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 T 9 8 107803 CASAVA_Build 6 32744640 3I TTGTGGACTC ---/CTT CTTTGTGAAA 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 CTT 1 2 107804 CASAVA_Build 6 32745666 2D AATTTAAATA TT/-- TCTCTGTGAG 3070 het 3070 ref 53 25 24 8 T 3 1 107805 CASAVA_Build 6 32745985 2D AAGATAACAA GT/-- GTTAAGGATG 3070 het 3070 hom 54 15 33 6 GT 2 1 107806 CASAVA_Build 6 32758828 2I CAGATTATAA --/CC CCACTGGAAA 3070 het 3070 ref 53 29 24 1 C 2 4 107807 CASAVA_Build 6 32759391 1D TTTGTGGCTC T/- TGTCTGACCT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 2 1 107808 CASAVA_Build 6 32759479 4I TGAAGGTGTC ----/AGTT AGGTAAGATA 3070 het 3070 ref 38 25 12 1 AGTT 0 1 107809 CASAVA_Build 6 32759913 1D15M1I TTTTGGACTG ACTACATCTAGGTAAT-/-CTACATCTAGGTAATG GGGTATATAT 3070 het 3070 ref 40 35 9 3 N/A 0 0 107810 CASAVA_Build 6 32760382 1I54M2I ATACAACGAT -ATCTTTTAGTACTTTTATGCATGGTAATGACCATCAGTAGACACTAAAACAATC--/AATCTTTTAGTACTTTTATGCACGGTAATGACTATCAGTAGACACTAAAACAATCAT AATCCAGCAA 3070 het 3070 ref 38 35 10 8 N/A 0 0 107811 CASAVA_Build 6 32760499 2I TCTGTCACTC --/AA AAACAGAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 A 3 5 107812 CASAVA_Build 6 32761437 1I47M1I GAAACTAGCA -ACCAAACACTCAAAGCAAGAAGAATAATAACTAAGTGACCACAAAGG-/GCCCAAACACTCAAAGCAAGAAGAATAATAACTAAGTGACCACAAAGGA AAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 25 14 3 N/A 0 0 107813 CASAVA_Build 6 32761987 1I AATAAATATA -/T AAAATAGCTA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 0 1 107814 CASAVA_Build 6 32762261 2I CTATACGTAC --/TG TATGTTTTCA 2216 het 2216 ref 27 17 6 4 TG 0 1 107815 CASAVA_Build 6 32762398 1I ATGGGGTCCC -/T CTCTCTTTCT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 T 0 1 107816 CASAVA_Build 6 32763291 1I ATGATTTAAA -/G TAAAACAAAA 1518 het 1518 ref 20 11 4 5 G 0 1 107817 CASAVA_Build 6 32763316 1D AAACCATATA G/- AAAAATATTG 1253 het 1253 ref 19 11 3 5 G 1 0 107818 CASAVA_Build 6 32764807 1I GATTACAGAC -/A ACGCGCCACC 1854 het 1854 ref 19 14 5 0 A 1 2 107819 CASAVA_Build 6 32765262 1I GATGTGTGGA -/C CTTTATATTA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 C 1 2 107820 CASAVA_Build 6 32765352 2I CCATTCTAAC --/AT GTGTATCAGG 3070 het 3070 hom 43 16 19 9 AT 0 1 107821 CASAVA_Build 6 32765460 1I TCTGGCATCC -/T CCTTCACACA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 T 0 1 107822 CASAVA_Build 6 32765609 8I TTAATATGGA --------/CTGCCTGT CTGCTTGTAT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 CTGCCTGT 0 1 107823 CASAVA_Build 6 32765704 5D TAATCTGTTG AAAAA/----- AAAATTATAT 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 A 9 4 107824 CASAVA_Build 6 32765849 2D TCAAAATTTA CT/-- CTGAGAGCTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 CT 2 1 107825 CASAVA_Build 6 32766553 4D CTTAGGAAAT ACAC/---- ACTGAAGTAC 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 AC 3 1 107826 CASAVA_Build 6 32766959 1D CTCATTGTTC T/- TTTTTACAAA 3070 het 3070 hom 32 8 24 0 T 6 5 107827 CASAVA_Build 6 32767757 8D GTCACCCAAG GTTCTAAA/-------- ATACAATAAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 8 GTTCTAAA 1 0 107828 CASAVA_Build 6 32768787 4I GATCAATAAC ----/AAGT AACAAGATCA 3070 het 3070 ref 39 25 9 5 AAGT 0 1 107829 CASAVA_Build 6 32770758 8I ATGTTTCTCA --------/AGACATAC AAATAAGACA 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 AGACATAC 0 1 107830 CASAVA_Build 6 32771784 1I ATCCAAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 8 9 107831 CASAVA_Build 6 32773819 1I GAACAGCTTT -/C CCCAACACCC 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 C 3 4 107832 CASAVA_Build 6 32776033 1I ATTGTAAAGT -/A AAATATCATT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 3 4 107833 CASAVA_Build 6 32777283 1D CACCCTCCTA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 8 7 107834 CASAVA_Build 6 32780211 1I TATTAATAAC -/A AAAAAAAATC 2418 het 2418 ref 29 15 5 9 A 8 9 107835 CASAVA_Build 6 32780260 2D AAAATAAAAC TT/-- GAGTCATAAT 2642 het 2642 ref 25 14 7 6 T 2 0 107836 CASAVA_Build 6 32780442 1D AGAAATGAAC A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 7 6 107837 CASAVA_Build 6 32782988 1D GATTACCAAG T/- TATCACCTGA 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 T 2 1 107838 CASAVA_Build 6 32785869 4D TTTCTGTCTC TGTT/---- TGATCACTCA 3070 het 3070 ref 41 20 18 6 TGTT 1 0 107839 CASAVA_Build 6 32786402 1D CATAAAAAAA G/- TGGTGAATCT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 G 1 0 107840 CASAVA_Build 6 32786623 1D GTCATTAATT A/- TTTATTAAAC 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 A 1 0 107841 CASAVA_Build 6 32786951 9I TGTTGTTAAG ---------/GATTATGGT AATTATGGTG 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 GATTATGGT 0 1 107842 CASAVA_Build 6 32787282 1D GAGAAGAAAA T/- AAAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 1 0 107843 CASAVA_Build 6 32787722 1I7M1I CCTACACTAA -ATTACAG-/GCTTACAGA AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 N/A 0 0 107844 CASAVA_Build 6 32787896 1D TATATCTTTA T/- TGTTTAAACT 2924 het 2924 ref 33 21 9 3 T 2 1 107845 CASAVA_Build 6 32788228 4I GTCCTCCGAA ----/ACAG ACAAAGACTA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 ACAG 0 1 107846 CASAVA_Build 6 32788840 2I CTGTCCCCCT --/AA CGTGCGGCTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 0 2 107847 CASAVA_Build 6 32789910 1I GACATCGTTA -/T ATCAGTTTTG 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 T 0 1 107848 CASAVA_Build 6 32790092 2I GCTTTCTATT --/TC AAACTGTCTT 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 TC 0 1 107849 CASAVA_Build 6 32794552 4I ATATTCTAAT ----/AAGA AAGATATTCC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 AAGA 1 2 107850 CASAVA_Build 6 32795973 1I CTCTGAGGAG -/A AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 5 6 107851 CASAVA_Build 6 32796215 1D ATTGAGAGAC A/- AAAAGAATGT 3070 het 3070 hom 35 16 19 1 A 5 4 107852 CASAVA_Build 6 32796364 1I CTCTAGACTG -/A AACCAAAGCC 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 2 3 107853 CASAVA_Build 6 32797354 4I TGGATTCTGG ----/GGTC GTGTCTGTTT 1831 het 1831 ref 37 21 9 7 GGTC 0 1 107854 CASAVA_Build 6 32797710 2I7M2D52M3D CTTGTTTCTG --CTTAAAAAGACCTAAGACAAAGCCTTAGAATAAGAACTTCAATATTGGCAGATCTGGTAGGCTC/GCATTAAAA--ACCTAAGACAAAGTCTTAGAATAAGAACTTCAATATTGGCATATCTGGTGGG--- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 18 19 17 2 N/A 0 0 107855 CASAVA_Build 6 32798405 8D AAGCACCTAC TTAATATT/-------- TATTTATTAA 3070 het 3070 ref 21 12 9 1 TTAATATT 1 0 107856 CASAVA_Build 6 32798516 2D4M1D ATAAATGATA ATGATAG/--GATA- ATAATTGTAG 1942 het 1942 ref 24 17 5 4 N/A 0 0 107857 CASAVA_Build 6 32798994 1I24M1I AAATGGGGTG -AAATCTAAAAGGTTTCTAAATTCA-/AAAATCTAAAGGGTTTCTAAATTCAT GAATTCTTTG 2183 het 2183 ref 18 17 5 3 N/A 0 0 107858 CASAVA_Build 6 32799631 3I ACTCCTCCTC ---/CTG CTGCTTAGCA 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 CTG 1 2 107859 CASAVA_Build 6 32800427 1I GAATGTGGAA -/G TTGAGAATGT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 G 0 1 107860 CASAVA_Build 6 32801284 2I16M2I GAAAAGGAAC --AGAGAAACAGAGAGAG--/AGAGAGAAACAGAGAGAGAA AGAGAGAGAG 3068 het 3068 ref 25 17 8 4 N/A 0 0 107861 CASAVA_Build 6 32801758 2I AAAGAGAAAC --/AG AGACTGAAAG 3070 het 3070 ref 30 19 9 3 AG 1 2 107862 CASAVA_Build 6 32802067 3D CGAAGAAAGA CAG/--- AAAACTATCA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 CAG 1 0 107863 CASAVA_Build 6 32802329 2D CTAGAAACTT TC/-- TGATTGCATG 1301 het 1301 ref 28 21 4 4 TC 1 0 107864 CASAVA_Build 6 32803857 1I CATTAAAATT -/G GGCCAATTAG 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 G 2 3 107865 CASAVA_Build 6 32805289 1D ACCCCTGGTG A/- AGATGCTGTG 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 A 2 1 107866 CASAVA_Build 6 32805443 1D CACATGCTAC A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 A 7 6 107867 CASAVA_Build 6 32806097 2D TTTTCCAGAA TT/-- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 T 8 6 107868 CASAVA_Build 6 32807609 11I AATTAGCTAA -----------/GTATTAAGTAG CTTGTTAGCC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GTATTAAGTAG 0 1 107869 CASAVA_Build 6 32808090 2D AATAATATCC CT/-- CTTTATCCCT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 CT 2 1 107870 CASAVA_Build 6 32808138 2I CTTTGTCTAG --/TA ATGACATAAT 3070 het 3070 hom 22 7 9 6 TA 0 1 107871 CASAVA_Build 6 32808494 6D8M1D TGATGTTGTA ATCATGAAGTCTTTG/------AAGTCTTT- CCCATGCCTA 3070 het 3070 ref 25 15 10 4 N/A 0 0 107872 CASAVA_Build 6 32809518 2I ATTCTGAGAC --/TT TGCTGAAATT 2041 het 2041 ref 27 20 5 2 T 1 3 107873 CASAVA_Build 6 32813130 2I CATGGAATAC --/AT GTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 AT 0 1 107874 CASAVA_Build 6 32813832 7D CTATTTCTAC AAGACAA/------- AAGTAAGAAA 2875 het 2875 ref 23 15 6 6 AAGACAA 1 0 107875 CASAVA_Build 6 32815687 1I ATCAGGACAC -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 T 5 6 107876 CASAVA_Build 6 32818151 3D GCAGGCACAG ATA/--- ATTATTTGGT 3070 het 3070 ref 40 25 14 2 ATA 1 0 107877 CASAVA_Build 6 32820438 2I TAAAAAAAAA --/AG AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 AG 0 1 107878 CASAVA_Build 6 32822161 1D TCCCATCCTG A/- AAAGGAAGGT 3070 het 3070 ref 39 17 12 11 A 4 3 107879 CASAVA_Build 6 32826499 1I AATACAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 31 9 15 7 T 10 11 107880 CASAVA_Build 6 32827331 1I TTTAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 24 8 5 A 10 11 107881 CASAVA_Build 6 32828407 1I TTAGAGCAGG -/C TTGTATACTC 3070 het 3070 hom 35 17 15 4 C 0 1 107882 CASAVA_Build 6 32829388 2D TATACTGTAT TG/-- TCTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 TG 1 0 107883 CASAVA_Build 6 32831338 2I CAGAAAGAGA --/AG AGAGAGATGA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 AG 3 4 107884 CASAVA_Build 6 32832781 2I CATGCTCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2745 hom 39 9 18 12 T 12 14 107885 CASAVA_Build 6 32833502 1I AGCTCATCTT -/C CCCCATTTCC 2746 het 2746 ref 36 21 9 6 C 4 5 107886 CASAVA_Build 6 32841724 1I AACAAAACAA -/C AACAAAAAAA 3070 het 3038 hom 30 9 13 8 C 0 1 107887 CASAVA_Build 6 32841934 1I CCGGCCTCTG -/A TGGGGACAGA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 0 1 107888 CASAVA_Build 6 32842032 2D ACTAGGGAGA CT/-- CTCCCCAGGG 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 CT 2 1 107889 CASAVA_Build 6 32842291 6D CAGTGGTAAC ATAATT/------ AGAAATACGG 2290 het 2290 ref 22 14 5 6 ATAATT 1 0 107890 CASAVA_Build 6 32843915 3D AAGAGAGAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 11 10 A 15 12 107891 CASAVA_Build 6 32844761 3D CCTATTTTTT TTC/--- TAAGAGTTTT 3070 het 3070 ref 48 24 23 3 TTC 1 0 107892 CASAVA_Build 6 32844926 1D CATTTAATGG C/- CCTGGCACTC 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 C 3 2 107893 CASAVA_Build 6 32850896 1D ACACCCATTT A/- TTATCTCAGT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 1 0 107894 CASAVA_Build 6 32851414 1I GCCATAAACT -/G GGCCATAAAT 2200 het 2200 ref 25 13 5 10 G 2 3 107895 CASAVA_Build 6 32854682 1D ATTAACAGCA T/- CTCAAGGCAG 1795 het 1795 ref 20 15 4 2 T 1 0 107896 CASAVA_Build 6 32858376 1I AAAATGAAAG -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 6 7 107897 CASAVA_Build 6 32859411 3I ATTTCTGGCA ---/TCC TCCTTCACAT 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 TCC 1 2 107898 CASAVA_Build 6 32861099 1I GTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 T 10 11 107899 CASAVA_Build 6 32862584 1I GACTGTAGCT -/G GGGGAGGGTA 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 G 4 5 107900 CASAVA_Build 6 32864732 3I GCTGGAGGCC ---/ATT ATCCTTAGCA 3070 het 3070 ref 38 24 8 7 ATT 0 1 107901 CASAVA_Build 6 32866586 1D TTTTTTCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 T 10 9 107902 CASAVA_Build 6 32867025 2I AGACCCTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 11 11 12 A 11 13 107903 CASAVA_Build 6 32868644 4I TCAGGGAAAC ----/ACTT ACTTACATAC 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 ACTT 1 2 107904 CASAVA_Build 6 32873537 5D AGTAAGGACT TGTAG/----- TGAGCTGCAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 10 TGTAG 1 0 107905 CASAVA_Build 6 32874866 3I GCAAGAGAAT ---/AGA AGAAGGAGAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AGA 1 2 107906 CASAVA_Build 6 32880305 1D TTATTTGAAT C/- CTTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 44 31 11 2 C 2 1 107907 CASAVA_Build 6 32880485 1I TTGGTTGGCT -/C GTGATACTCT 2379 het 2379 ref 37 24 6 7 C 0 1 107908 CASAVA_Build 6 32881325 2D TCACTGCATG AC/-- ACACATGAGT 2927 het 2927 ref 27 18 7 3 AC 3 2 107909 CASAVA_Build 6 32881748 1I TAAATGTTGG -/C CCCCAGTCTC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 4 5 107910 CASAVA_Build 6 32882780 7D GCCCTGACTT TGTTCTC/------- TGTTTCCTCA 1928 het 1928 ref 11 5 4 2 TGTTCTC 1 0 107911 CASAVA_Build 6 32885342 6I AATGGATCTT ------/TTCCTC TATGCATGAC 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 TTCCTC 0 1 107912 CASAVA_Build 6 32885697 1D ATGACCCACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 A 10 9 107913 CASAVA_Build 6 32886396 1I TGGTGGTTGT -/A GTATGAGTGT 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 A 0 1 107914 CASAVA_Build 6 32886550 1I AGAAGACTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 9 10 107915 CASAVA_Build 6 32901230 4D CAGTGAACTT AGAC/---- AGCTGCTGTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 AGAC 1 0 107916 CASAVA_Build 6 32909726 1I CGCCATGATT -/G TGAGGTCTTC 1831 het 1831 ref 16 9 5 2 G 0 1 107917 CASAVA_Build 6 32935540 3D GAATGATTTT GAA/--- GTAGTACAAA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 GAA 1 0 107918 CASAVA_Build 6 32936198 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 8 9 107919 CASAVA_Build 6 32939521 1D AAACTCAAGG A/- AAAAAAAATA 2689 het 2689 ref 34 21 8 5 A 9 8 107920 CASAVA_Build 6 32939680 10D GTCAACATAC TGAGATCCTG/---------- TGAGATCCTG 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 TGAGATCCTG 2 1 107921 CASAVA_Build 6 32941786 1D CATACAAAGG A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 7 6 107922 CASAVA_Build 6 32944089 1I AGCTTCCTTC -/A ACAGTAGGCG 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 A 1 2 107923 CASAVA_Build 6 32944580 1I TTTCTCTGTC -/T TTAAGTGTAG 3070 het 3070 hom 50 23 22 5 T 2 3 107924 CASAVA_Build 6 32946062 1D TCCCCACTCA G/- TAATAATGGG 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 G 1 0 107925 CASAVA_Build 6 32950433 1I AAACAAAAGC -/A AAAAAAAAAT 2486 het 2486 ref 23 14 6 3 A 9 10 107926 CASAVA_Build 6 32954647 3I TAAATTAGTT ---/CCC CCCCCCCAAA 2642 het 2642 ref 23 10 8 5 C 7 10 107927 CASAVA_Build 6 32955288 1D AAGTTCTTAG C/- CAAGCTATCT 3070 het 3070 ref 57 29 20 9 C 2 1 107928 CASAVA_Build 6 32955860 1D ATAAAGTGAG T/- TGAAAATCAG 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 T 2 1 107929 CASAVA_Build 6 32958238 1D TCAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 2373 het 2373 ref 21 9 8 5 T 1 0 107930 CASAVA_Build 6 32959542 7D AGAAATAGAC CTGGTAT/------- GGCTGATGCT 3070 het 3070 hom 51 24 25 7 CTGGTAT 1 0 107931 CASAVA_Build 6 32961200 1I GAACTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 499 hom 16 2 11 3 T 10 11 107932 CASAVA_Build 6 32964075 5I AAATATTTGA -----/TAACT TAAGATCATT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TAACT 0 1 107933 CASAVA_Build 6 32965168 2D AATAGCAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 AC 9 8 107934 CASAVA_Build 6 32982026 1I AGTAAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 10 11 107935 CASAVA_Build 6 32995467 5D ATCTCAAAAA AAAAT/----- AAAAATAAAA 32 het 32 ref 26 14 1 11 AAAAT 1 0 107936 CASAVA_Build 6 32998887 4D CTACAAAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 AAAC 3 2 107937 CASAVA_Build 6 33007674 1D CACTCAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 12 11 107938 CASAVA_Build 6 33007903 1D TCCCTCAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2849 hom 34 9 16 9 A 10 9 107939 CASAVA_Build 6 33024519 3I GTCCCAGAGA ---/CTT CTTCTACCCT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 CTT 1 2 107940 CASAVA_Build 6 33027212 2D CAGCGAGACC CT/-- GTCTCTACAA 3070 het 2876 hom 19 9 9 1 CT 1 0 107941 CASAVA_Build 6 33049764 1D TTTTATGGAA T/- TTTTTATAGC 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 T 6 5 107942 CASAVA_Build 6 33051640 1D GCCTGGAGTA G/- GAAATTTTCT 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 G 2 1 107943 CASAVA_Build 6 33051958 1I AATGGACAAC -/T TAAAGATGGG 3070 het 3070 ref 59 26 25 8 T 1 2 107944 CASAVA_Build 6 33055404 2I ACTTACAGTC --/AA GAGCAAAATG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 0 2 107945 CASAVA_Build 6 33058562 4D TAGAATATTT TGTC/---- TGACTGCAGC 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 TGTC 1 0 107946 CASAVA_Build 6 33065106 7I TTTCATCCTT -------/CACCCCA CACCCCACTC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 CACCCCA 1 2 107947 CASAVA_Build 6 33065381 1D GTTCAAATAA G/- ACAAATGCCA 3070 het 3070 ref 60 35 22 3 G 1 0 107948 CASAVA_Build 6 33066475 1D8M2I AATGGGATTA TTTATTTGG--/-TTATTTGGTT TTTTTTTTTT 2485 het 2485 ref 23 15 9 2 N/A 0 0 107949 CASAVA_Build 6 33067432 2I CTATCCAGGC --/TT TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 T 7 9 107950 CASAVA_Build 6 33075916 1D GACGGAAGTG C/- CGGGGAGTCC 2610 het 2610 ref 38 23 10 6 C 2 1 107951 CASAVA_Build 6 33077768 2D GAACTATAAG AC/-- ACAGCCTTCT 950 het 950 ref 43 28 4 12 AC 2 1 107952 CASAVA_Build 6 33078377 2D ACTCTACCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2098 hom 21 het 14 0 8 6 A 16 14 107953 CASAVA_Build 6 33078399 1I AAAAGGAAAG -/A AAAAAAAGAA 1220 het 729 hom 13 4 6 3 A 7 8 107954 CASAVA_Build 6 33081964 1D GACTCTAGGG A/- AAAGTAGAAA 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 A 4 3 107955 CASAVA_Build 6 33086766 1I GTATCGGGTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 8 9 107956 CASAVA_Build 6 33088180 4D AAGCGATTCT CCTG/---- CCTCAGCTTC 2463 het 2409 hom 15 7 7 1 CCTG 1 0 107957 CASAVA_Build 6 33094884 25D TCGGTTCTGC TTTCACTTTCCCGTCTCATGCAAAG/------------------------- TGGCCCAGAA 3070 het 3070 ref 34 28 10 6 TTTCACTTTCCCGTCTCATGCAAAG 1 0 107958 CASAVA_Build 6 33095977 9I AAATGGTTTG ---------/AAAGGTGTA AAGGGGAAAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 AAAGGTGTA 0 1 107959 CASAVA_Build 6 33096710 8D CAGGGAGAGT CTTTTAAA/-------- CTTTGAAGAT 3070 het 3070 ref 46 27 19 2 CTTTTAAA 1 0 107960 CASAVA_Build 6 33099323 2I CTGCATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 AT 7 8 107961 CASAVA_Build 6 33099680 3I TGGCTGTGAG ---/ATA ATATCTATCT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 ATA 1 2 107962 CASAVA_Build 6 33102920 5D TGAGGGTCTA TTCTT/----- AGAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 51 27 21 5 TTCTT 1 0 107963 CASAVA_Build 6 33105462 1D20M1I TAAATCCTTT CCCCTGATATTTTCCCTCCAT-/-CCCTGATATTTTCCCTCCATC CCCCCTCCTC 3070 het 3070 ref 46 25 22 11 N/A 0 0 107964 CASAVA_Build 6 33105957 1D TCAAGGGAGA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 T 8 7 107965 CASAVA_Build 6 33110354 6D TCTCTCTCTC TTTCTT/------ TTTATCTTCC 3070 het 2074 hom 23 9 14 1 TTTCTT 1 0 107966 CASAVA_Build 6 33131275 1I CACCTGGCAT -/G GGACATATCA 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 G 2 3 107967 CASAVA_Build 6 33208672 1D AGTGACTCCA T/- TTTGGTTTGG 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 T 4 3 107968 CASAVA_Build 6 33244654 1I ACACAGAGGA -/C CCCCCCCATA 1033 het 1033 ref 14 4 5 5 C 7 8 107969 CASAVA_Build 6 33349138 1D CATAACGTTC T/- TTTTTTTTCC 1312 het 1312 ref 60 51 3 7 T 9 8 107970 CASAVA_Build 6 33360947 3I TTACACAAAT ---/ATC ATATTTGATT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 ATC 0 1 107971 CASAVA_Build 6 33362535 1I ACACCTCACC -/G CCACCAGTGA 3070 hom 119 het 45 0 36 9 G 0 1 107972 CASAVA_Build 6 33377668 2I CTCCAGACAC --/TG TGCTGAGTGC 3070 hom 92 het 38 0 29 9 TG 1 2 107973 CASAVA_Build 6 33384845 1D TTGAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 24 0 18 6 A 15 14 107974 CASAVA_Build 6 33385141 1I ACTTGATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 A 11 12 107975 CASAVA_Build 6 33388774 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2870 het 232 hom 26 2 10 15 T 12 11 107976 CASAVA_Build 6 33404642 13D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 23 0 22 3 A 23 10 107977 CASAVA_Build 6 33410972 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 18 1 11 6 T 15 14 107978 CASAVA_Build 6 33416072 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2858 hom 21 het 11 0 8 3 A 15 14 107979 CASAVA_Build 6 33417657 7D AGACTCTGTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 15 1 9 5 A 19 12 107980 CASAVA_Build 6 33420811 1I GCTTGGAGGA -/T TTTTTTTTTT 644 het 644 ref 39 32 3 4 T 11 12 107981 CASAVA_Build 6 33437812 1I CCATGGTCTG -/C CCCCCAGGAG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 5 6 107982 CASAVA_Build 6 33442977 2D AAATAAATAA AT/-- AAAGTGGTAA 1646 het 83 hom 15 1 5 9 AT 1 0 107983 CASAVA_Build 6 33460380 1I ATACAGTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 31 1 27 3 T 11 12 107984 CASAVA_Build 6 33468442 3I CAGGAAAGGT ---/CTC CTGCCTGAAT 3070 hom 156 het 58 0 51 7 CTC 0 1 107985 CASAVA_Build 6 33477460 1D CTGGATTGCC T/- TTTTTTTTTT 2170 het 185 hom 20 2 9 9 T 15 14 107986 CASAVA_Build 6 33480035 1I CCTCTCTCTT -/C GACCTGTCTG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 0 1 107987 CASAVA_Build 6 33482846 1D AAAGCTGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 10 9 107988 CASAVA_Build 6 33510155 1D TGTTCTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 5 T 12 11 107989 CASAVA_Build 6 33510266 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2709 het 205 hom 20 1 10 9 T 13 12 107990 CASAVA_Build 6 33521233 1I TTTTGAATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 73 het 39 0 29 10 T 9 10 107991 CASAVA_Build 6 33548784 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 A 10 11 107992 CASAVA_Build 6 33549240 1I TATTGATGTA -/G AAGGATCTCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 0 1 107993 CASAVA_Build 6 33551438 8D TACATAATAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AC 12 8 107994 CASAVA_Build 6 33551980 3D AGAAAAAAAA AAG/--- AAGAATGAAA 1940 hom 35 het 21 0 14 7 AAG 2 1 107995 CASAVA_Build 6 33552671 1I TGTTATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 337 hom 21 1 13 7 T 12 13 107996 CASAVA_Build 6 33556885 2D CATACACACA CC/-- CCCCCCCACA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 C 9 7 107997 CASAVA_Build 6 33557373 1I ATAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 32 1 27 4 G 0 1 107998 CASAVA_Build 6 33565746 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 11 12 107999 CASAVA_Build 6 33572160 4I GGTGATAAAC ----/TCTT TGTTTTCTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TCTT 0 1 108000 CASAVA_Build 6 33580858 5I CTTCTCTACA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 3070 hom 90 het 43 0 31 12 AAAAG 3 4 108001 CASAVA_Build 6 33582558 1I CAACATGGTG -/A AAACCCCGTC 3070 hom 63 het 22 0 21 1 A 3 4 108002 CASAVA_Build 6 33583382 1D ATATCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 5 T 11 10 108003 CASAVA_Build 6 33593777 1D ACAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1401 het 673 hom 12 3 4 7 A 12 11 108004 CASAVA_Build 6 33610085 1I ACTTGATGCT -/G GGGGGGGGAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 G 8 9 108005 CASAVA_Build 6 33616427 4I TCCATCTCAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 1982 hom 19 5 11 3 AAAG 3 4 108006 CASAVA_Build 6 33618883 4D CTCTTCAGGA AGTT/---- AGTTGCACAG 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 AGTT 2 1 108007 CASAVA_Build 6 33622879 1I TTTGTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 194 hom 20 3 11 6 G 0 1 108008 CASAVA_Build 6 33671529 3D TCTTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTTTT 675 het 675 ref 24 9 9 6 TTG 1 0 108009 CASAVA_Build 6 33672058 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2261 het 2261 ref 14 8 6 0 T 11 10 108010 CASAVA_Build 6 33672956 1D CATAATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 11 10 108011 CASAVA_Build 6 33675082 1D AAAATTTGTG T/- GTTTTTTTTT 3070 het 1656 hom 23 7 10 7 T 1 0 108012 CASAVA_Build 6 33675779 1I TCTGTCTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 36 1 25 10 T 11 12 108013 CASAVA_Build 6 33678070 3D GAAGTACTAT TAA/--- TAATAAGAGA 3070 het 3070 ref 47 26 17 6 TAA 3 2 108014 CASAVA_Build 6 33678119 2I GACCTGACTC --/TT TTAAGCACTG 3070 het 3070 ref 31 15 8 8 T 2 4 108015 CASAVA_Build 6 33679037 7D AATCAATCAA AAGTCCC/------- AAGTCCCAAG 3070 het 3070 ref 37 16 8 17 AAGTCCC 3 2 108016 CASAVA_Build 6 33690649 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 10 9 108017 CASAVA_Build 6 33701427 1I CTTGGAGCCT -/C ATTTGGAGCT 3070 hom 102 het 39 0 32 7 C 0 1 108018 CASAVA_Build 6 33703000 1I ATTAAAAAAA -/T AATATACATT 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 0 1 108019 CASAVA_Build 6 33704971 1I TGATAAATTA -/T CATACATTGC 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 T 0 1 108020 CASAVA_Build 6 33705211 2I GGCCCAGGTT --/CA GTCTGTGTTT 2641 het 1492 hom 16 5 8 3 CA 0 1 108021 CASAVA_Build 6 33719945 2D ACTCTGTCTC AG/-- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 AG 1 0 108022 CASAVA_Build 6 33724293 1D TCAGTTACCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 17 12 7 T 9 8 108023 CASAVA_Build 6 33729343 1D AGTGTTTGCT A/- AATCCATGCA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 3 2 108024 CASAVA_Build 6 33732283 1D GTCTGACCAT C/- CTGTAAGTCT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 C 2 1 108025 CASAVA_Build 6 33733579 1D ACTGTGTGTG T/- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 41 17 19 6 T 1 0 108026 CASAVA_Build 6 33737621 1D CGTGGTGGCA G/- GCACCTGTGG 2317 het 877 hom 12 2 8 2 G 2 1 108027 CASAVA_Build 6 33738143 1D CAGCTTGCAT C/- CCCCTCTCTG 2978 het 2978 ref 26 14 8 4 C 5 4 108028 CASAVA_Build 6 33739134 6D GGGCACCCCT GGGAGG/------ GTGCAGCCTG 3070 het 3070 hom 30 14 15 3 GGGAGG 1 0 108029 CASAVA_Build 6 33749175 1I TTGTTTTCTT -/G GCTGTGACAT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 1 2 108030 CASAVA_Build 6 33767529 1I CAGGCAGCCC -/G GGGCCTCAGC 3070 het 3070 hom 38 17 14 7 G 3 4 108031 CASAVA_Build 6 33779084 1D ACGCCCAGCT A/- ATTTTGTGTA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 2 1 108032 CASAVA_Build 6 33779389 1D AAATACACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 39 1 31 7 A 13 12 108033 CASAVA_Build 6 33781106 2I CTGAAACTTC --/CT CTGTGTGAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 CT 1 2 108034 CASAVA_Build 6 33784166 2I GTTTTTCTGA --/TT TGTTTCCTCA 3070 hom 105 het 42 0 32 10 T 1 3 108035 CASAVA_Build 6 33785193 1I32M1I CCAAGAACTA -GCTAGACACTCGTAGGGGAGAGAGGGAAAGAT-/TGCTAGACACTGGTAGGGGAGGGAGGGAAAGATA AAAAATGGCA 3070 hom 114 het 36 0 38 10 N/A 0 0 108036 CASAVA_Build 6 33788249 4D GCCTTAACCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTTA 5 4 108037 CASAVA_Build 6 33789354 3D TTTAATCGGG TTT/--- TTTTTTTGTT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 10 7 108038 CASAVA_Build 6 33796199 11D ACTCTTGCTG ACTGCCAGATT/----------- ATTTAGGGCT 3070 hom 127 het 42 0 42 4 ACTGCCAGATT 1 0 108039 CASAVA_Build 6 33796480 1D TTCCCCCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 29 0 23 6 T 12 11 108040 CASAVA_Build 6 33813536 1D TGGGTGAACC G/- GGGCTGCTCG 3070 hom 71 het 32 0 19 14 G 4 3 108041 CASAVA_Build 6 33829553 1I TGCTTGGCCT -/A TTACTTTATT 3070 hom 57 het 23 0 17 6 A 0 1 108042 CASAVA_Build 6 33839343 1I GGAACTTCAG -/C CCTGGCTGCT 3070 hom 89 het 36 0 29 7 C 2 3 108043 CASAVA_Build 6 33845484 5D AGCAAAGGGA TTTTT/----- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 20 11 8 T 14 9 108044 CASAVA_Build 6 33856341 1D CAGGCCTCAG T/- TTCTTCATCT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 3 2 108045 CASAVA_Build 6 33856916 1I TACCTAGGAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 8 9 108046 CASAVA_Build 6 33861966 24I GCTGCTCGCC ------------------------/TTCCCCAAATATTATTTGTAGGGA ATATTAGAGC 3070 het 3070 hom 25 12 12 3 TTCCCCAAATATTATTTGTAGGGA 0 1 108047 CASAVA_Build 6 33863095 2D ACAAACTATT CA/-- CATAGTTGAT 3070 het 3070 ref 64 37 23 7 CA 2 1 108048 CASAVA_Build 6 33867423 1I TTGCTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 15 10 T 10 11 108049 CASAVA_Build 6 33869214 1I GTGCTGGGCT -/C CCCCCCCAAC 3070 hom 54 het 23 0 17 6 C 7 8 108050 CASAVA_Build 6 33885009 1D TTCTATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 21 6 T 12 11 108051 CASAVA_Build 6 33885211 24D CAGGGCAGGC AGCGCTCCTGGCTCCCTGACCTGA/------------------------ GGGCACCAGG 3070 hom 84 het 24 0 27 4 AGCGCTCCTGGCTCCCTGACCTGA 1 0 108052 CASAVA_Build 6 33906604 1I ACGGACAGAC -/A GGGGAGCAGG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 0 1 108053 CASAVA_Build 6 33914255 2I CGCCTCCCCA --/CG CGCCTGCCGG 3070 hom 59 het 26 0 19 7 CG 1 2 108054 CASAVA_Build 6 33914960 1D TACACAGCTT C/- CCCCCAGGCG 3070 hom 99 het 39 0 28 11 C 6 5 108055 CASAVA_Build 6 33940280 1I TCCTGATTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 41 1 32 8 T 11 12 108056 CASAVA_Build 6 33941502 4I TCTACTTGTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TC 7 9 108057 CASAVA_Build 6 33948796 1D CTTTGTCAGA C/- CTCTTAGAAC 3070 hom 44 het 20 0 13 7 C 2 1 108058 CASAVA_Build 6 33949777 1I AGGAACAATC -/T TCACCAGGGC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 1 2 108059 CASAVA_Build 6 33956762 2I GTTCGGTGTA --/CT CTCGTGGCAA 3070 hom 107 het 38 0 34 4 CT 1 2 108060 CASAVA_Build 6 33962127 1D TCCGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2835 het 9 hom 18 1 10 7 A 15 14 108061 CASAVA_Build 6 33974611 1D TTATTCCACA C/- TTTCAGAGCC 3070 het 3070 hom 50 23 23 5 C 1 0 108062 CASAVA_Build 6 33978956 2I CCGTGAGGAG --/CC CCAGACATGG 3070 hom 126 het 45 0 40 5 C 2 4 108063 CASAVA_Build 6 33985371 3D25M3I TGAAAACTCT ATATTTGAGGACGCTGCCAGGTGTCTTA---/---GTTAAGACACCTGGCAGCGTCCTCAAAT ACAAAGAGCC 3070 het 3070 ref 21 12 10 5 N/A 0 0 108064 CASAVA_Build 6 33994861 9D GTTCCTCAAG GCCCCATGC/--------- CCAGAGGAAA 3070 hom 81 het 27 0 27 2 GCCCCATGC 1 0 108065 CASAVA_Build 6 34005231 1I ATAAAAAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 9 10 108066 CASAVA_Build 6 34013874 1I TGCTGCACCA -/T TTTGCATTCT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 3 4 108067 CASAVA_Build 6 34025713 1D CAGTGGAGAG T/- TGGTGGAGAG 3070 hom 54 het 23 0 16 7 T 2 1 108068 CASAVA_Build 6 34028742 38D GAGCAGGACA CGTGCCTCTCCTTTCCTCATCCTGCACCTTCGACCCAT/-------------------------------------- CAGAAATCCT 3070 het 3070 ref 36 28 9 10 CGTGCCTCTCCTTTCCTCATCCTGCACCTTCGACCCAT 1 0 108069 CASAVA_Build 6 34035315 1I TCTGAGCTAT -/G GGGGGGGCCT 3070 het 2271 hom 25 7 14 4 G 7 8 108070 CASAVA_Build 6 34079528 15D AGCATTTCTC CTAGGGTCCCCTTCA/--------------- CTAGGTCATT 3070 hom 87 het 30 0 30 2 CTAGGGTCCCCTTCA 1 0 108071 CASAVA_Build 6 34133044 1I CAGACGCCCC -/T CCTGCCATAC 2729 het 1367 hom 33 6 9 18 T 0 1 108072 CASAVA_Build 6 34172448 1I GGTTGTATGG -/C CCCCTGGAGT 3070 hom 75 het 28 0 23 5 C 4 5 108073 CASAVA_Build 6 34173194 14D CTGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGC/-------------- GCGCGCATGT 3070 hom 106 het 38 0 33 8 GTGTGTGTGTGTGC 1 0 108074 CASAVA_Build 6 34182233 1I AAAACCACAG -/T CTTTCAATGG 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 0 1 108075 CASAVA_Build 6 34185690 1D ATGTACACCA C/- CCCCCAGCAG 3070 hom 75 het 28 0 24 4 C 6 5 108076 CASAVA_Build 6 34195159 4I AAAGAAAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 85 het 36 0 28 8 AG 5 7 108077 CASAVA_Build 6 34213338 1I TCTAAGTCCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 26 0 22 4 T 8 9 108078 CASAVA_Build 6 34216093 1I TTGATGCGAT -/G GAAGTCAGAG 3070 hom 125 het 44 0 41 3 G 1 2 108079 CASAVA_Build 6 34232714 14D GGGGCTTCTT CCTTCACCTGGGTG/-------------- CTGTTCTGTC 3070 hom 63 het 21 0 20 5 CCTTCACCTGGGTG 1 0 108080 CASAVA_Build 6 34234901 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 23 0 12 11 A 15 14 108081 CASAVA_Build 6 34237039 1D AACCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2894 het 454 hom 15 2 8 5 A 15 14 108082 CASAVA_Build 6 34240316 1I ATATTATTTG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 5 T 7 8 108083 CASAVA_Build 6 34241877 4D TCCAAGAGAC TGTA/---- TGTTCTTGGC 3070 hom 45 het 21 0 16 7 TGTA 1 0 108084 CASAVA_Build 6 34242122 1D ATCTTAGGAA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 8 7 108085 CASAVA_Build 6 34242480 4I CTCTACTGAA ----/TTTG TTTATCAGTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTG 0 1 108086 CASAVA_Build 6 34243678 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 12 1 9 4 A 13 12 108087 CASAVA_Build 6 34278946 1D GGCGCTCCTG C/- CCCCAACTCA 2446 hom 13 het 13 0 8 5 C 5 4 108088 CASAVA_Build 6 34283415 1D TGCCCAGGCT G/- CTCTTGAACT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 1 0 108089 CASAVA_Build 6 34293303 1D AACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 1726 het 491 hom 8 2 4 2 A 13 12 108090 CASAVA_Build 6 34300713 1I TTAACTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 40 2 33 5 T 11 12 108091 CASAVA_Build 6 34305198 1I GCAGATCCTG -/T TAACATTGGA 3070 hom 210 het 79 0 70 9 T 1 2 108092 CASAVA_Build 6 34305920 1I ATTCAACGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1260 hom 35 3 18 14 T 12 13 108093 CASAVA_Build 6 34315453 2I GGACTAGGAT --/AA GAAGATGTGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 2 108094 CASAVA_Build 6 34319320 1D CTCTTTTGAG T/- TGAGGGTGTT 3070 hom 86 het 33 0 27 6 T 2 1 108095 CASAVA_Build 6 34329237 15D CTCAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAG/--------------- AAAGAAACAC 3070 hom 30 het 9 0 10 1 AAAAAAAAAAAAAAG 1 0 108096 CASAVA_Build 6 34332614 3D AAAAAAAAAT AGC/--- AGGATGATAA 3070 hom 43 het 17 0 15 4 AGC 1 0 108097 CASAVA_Build 6 34335660 1I GAGAAAAATG -/A GGAAGAAGCA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 0 1 108098 CASAVA_Build 6 34340639 3D GGCAGGTGAT CTC/--- CTGAGGTCGG 3070 hom 77 het 28 0 26 2 CTC 1 0 108099 CASAVA_Build 6 34340843 1D AAACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1304 het 1304 ref 25 17 3 5 A 15 14 108100 CASAVA_Build 6 34345349 2D TGCACCAATC GA/-- CACTCTGTAT 1688 hom 10 het 5 0 4 1 GA 1 0 108101 CASAVA_Build 6 34351620 2I AACGTTATGA --/CT CTTTTTTCTT 3070 het 558 hom 42 3 25 14 CT 1 2 108102 CASAVA_Build 6 34351792 3D AAATGGTGTG AAT/--- GGAGGTAGGA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 AAT 1 0 108103 CASAVA_Build 6 34357261 3D ACTTATTCTA ACC/--- ACCAACCTTT 3070 hom 105 het 36 0 36 2 ACC 2 1 108104 CASAVA_Build 6 34374412 1I ATGTTGCCCA -/G GCCGGCCTCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 1 2 108105 CASAVA_Build 6 34380590 1D AATTAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 1886 het 1448 hom 23 10 5 8 T 17 16 108106 CASAVA_Build 6 34453895 1D GCTCCTACCC A/- AAAAAAAAAA 1675 het 1675 ref 25 12 4 9 A 15 14 108107 CASAVA_Build 6 34462991 4I TAGAGTGTAT ----/TCTC TCTATTTTTT 3070 hom 74 het 28 0 24 4 TC 1 3 108108 CASAVA_Build 6 34471442 1D AAATTAAGTA G/- GGGAAGAAGT 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 G 4 3 108109 CASAVA_Build 6 34471976 2D AGAGGAGGAA AG/-- AATACTTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 AG 1 0 108110 CASAVA_Build 6 34487944 1D ATTCCTTTCA T/- TTCCCCCCCT 3070 hom 96 het 38 0 31 7 T 3 2 108111 CASAVA_Build 6 34495338 1D TATTTACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 12 11 108112 CASAVA_Build 6 34497775 1D TGCAAATCTG A/- AAAAAAAAAA 1270 het 1270 ref 41 28 4 9 A 14 13 108113 CASAVA_Build 6 34506180 2I CCCAGCTAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 32 0 23 9 T 14 16 108114 CASAVA_Build 6 34512307 4I GGTTCTTGGT ----/CTCA CTGACTTCAA 3070 hom 76 het 27 0 24 3 CTCA 0 1 108115 CASAVA_Build 6 34520266 1I AGGCCAAGGC -/G GGTGGATCAC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 G 2 3 108116 CASAVA_Build 6 34528376 1I GTCTGGCTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 8 9 108117 CASAVA_Build 6 34529799 4D TAAATTTCCT CTAA/---- CTGTGAGTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 CTAA 1 0 108118 CASAVA_Build 6 34535202 2D TTTTCTCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 28 0 23 5 A 13 11 108119 CASAVA_Build 6 34536662 13D CTGAGGGCCT TGTCAAGGTGAGA/------------- TGTCATCTTC 3070 hom 68 het 24 0 22 4 TGTCAAGGTGAGA 1 0 108120 CASAVA_Build 6 34544650 4I CTGGCTTGTG ----/GAGT GAGTGAGTGA 3070 hom 104 het 41 0 33 8 GAGT 2 3 108121 CASAVA_Build 6 34546383 1I GATCCTCCCA -/C TTCAGCCTCC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 0 1 108122 CASAVA_Build 6 34569512 2D AAATCCTGGC AG/-- ACACATTAGA 3070 hom 123 het 45 0 39 11 AG 1 0 108123 CASAVA_Build 6 34581283 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2676 hom 31 10 14 7 T 13 14 108124 CASAVA_Build 6 34603440 1D AGGTTGAATT A/- AAAAAAAAAA 1342 het 1342 ref 35 21 4 10 A 13 12 108125 CASAVA_Build 6 34611864 36D AGATGGAGAT TGAATCTATTTGCCACCCCATCTTCCTTACTCCTCC/------------------------------------ TGAATCTATT 1878 het 1878 ref 27 14 5 20 TGAATCTATTTGCCACCCCATCTTCCTTACTCCTCC 2 1 108126 CASAVA_Build 6 34632474 1I GGGAAATCAG -/T TGAGGGCTTC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 1 2 108127 CASAVA_Build 6 34633843 1I AGCGAAGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 245 hom 20 1 18 1 A 10 11 108128 CASAVA_Build 6 34639197 3I CATCACTGCC ---/AGG TGGGCACTTC 3070 hom 39 het 18 0 12 6 AGG 0 1 108129 CASAVA_Build 6 34639428 1I CACTCCAGGC -/A GGGGGGGCAC 3070 het 363 hom 25 1 21 3 A 0 1 108130 CASAVA_Build 6 34654755 3D CAAACATCAC CTT/--- CTCAGTGAGG 3070 het 3070 hom 46 16 22 11 CTT 1 0 108131 CASAVA_Build 6 34659323 1I CCTCTGCTGG -/C CATAAACACA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 C 1 2 108132 CASAVA_Build 6 34677232 1D GTGCCCTCTT A/- ATGCCTCACA 3070 het 3070 hom 55 18 30 8 A 2 1 108133 CASAVA_Build 6 34683405 1D TAGAGTGTAC A/- AAACCTAGAT 3070 het 3070 hom 70 28 31 12 A 4 3 108134 CASAVA_Build 6 34687970 16D GGAGTTTGCG ACCAGCCTATGGCAAC/---------------- ACCAGCCTAG 3070 het 3070 hom 30 12 12 13 ACCAGCCTATGGCAAC 1 0 108135 CASAVA_Build 6 34697617 1I ACTCCAGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 10 11 108136 CASAVA_Build 6 34701602 2D ATTGAAAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 1323 het 150 hom 22 2 6 14 T 20 18 108137 CASAVA_Build 6 34707717 1I GGAATGGTAT -/G GAATTACTGA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 G 1 2 108138 CASAVA_Build 6 34709010 2D GTACCTAACA AC/-- AGAGCTTCAA 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 AC 1 0 108139 CASAVA_Build 6 34710633 1I TTTCTTACAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 8 9 108140 CASAVA_Build 6 34710826 3I AAATAAGGCT ---/CAG GTCAGAAATA 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 CAG 0 1 108141 CASAVA_Build 6 34712164 1I TAAAGAAAGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 8 9 108142 CASAVA_Build 6 34722801 3I GTTCCTCAAG ---/ACA ACAAGTATTT 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 ACA 1 2 108143 CASAVA_Build 6 34725848 1D GAGAAACACT A/- GGGTTATCAT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 1 0 108144 CASAVA_Build 6 34730540 1D GGTTCCTATA G/- AAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 G 1 0 108145 CASAVA_Build 6 34758720 1I CCCATCTCTA -/C AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 C 0 1 108146 CASAVA_Build 6 34758913 2D AAATACACAC GT/-- GTGTTTATGT 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 GT 3 2 108147 CASAVA_Build 6 34766544 5I GGAAGGTTTA -----/GTTTT AACATAATTC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 GTTTT 0 1 108148 CASAVA_Build 6 34773657 2I TCCCACTACC --/AA AAGAGAGTAA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 2 4 108149 CASAVA_Build 6 34787416 9D TACCACTTCT TTTCTTTTC/--------- TTTCTTTCTT 2659 het 2659 ref 20 10 7 3 TTTCTTTTC 1 0 108150 CASAVA_Build 6 34801039 1I TTTTTTGCAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 8 9 108151 CASAVA_Build 6 34809155 11D TGAGCACCTG TAAACCCAGCT/----------- ACTCAGGAGG 3070 het 3070 ref 23 14 8 2 TAAACCCAGCT 1 0 108152 CASAVA_Build 6 34814322 1D ACCAGCACAA T/- TTTTTTTTTT 2128 het 2128 ref 23 9 6 8 T 12 11 108153 CASAVA_Build 6 34815864 1D ACTTTTTATG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 9 8 108154 CASAVA_Build 6 34816187 3I AAGGACATCC ---/AAG AAGGTTAGGA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 AAG 1 2 108155 CASAVA_Build 6 34817775 4I ATAATATAAA ----/TAGT TAGTATCTCT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 TAGT 1 2 108156 CASAVA_Build 6 34819569 1D AGGAGGCTGA G/- GGTAGGGGAA 3070 het 2962 hom 26 8 12 7 G 3 2 108157 CASAVA_Build 6 34833634 3I TCAGTGGTTG ---/TCA TCGTCTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 TCA 0 1 108158 CASAVA_Build 6 34849679 1I TTCTTAGCTA -/T ATGGTAAATC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 0 1 108159 CASAVA_Build 6 34851411 4D TCTCGAGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 AAAC 3 2 108160 CASAVA_Build 6 34851596 2D AATGACTGAC AT/-- ATGTGTATTA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 AT 2 1 108161 CASAVA_Build 6 34851837 1D TACGGCAACC T/- TTTTTTTTTT 547 het 547 ref 16 5 2 9 T 17 16 108162 CASAVA_Build 6 34857505 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 5 6 108163 CASAVA_Build 6 34863288 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAAATAC 2370 het 1564 hom 13 6 6 1 A 8 7 108164 CASAVA_Build 6 34867481 4D CAACAAATAC TGAG/---- TGAATGTGTG 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 TGAG 1 0 108165 CASAVA_Build 6 34869913 2I AGACTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2604 hom 34 11 9 14 A 12 14 108166 CASAVA_Build 6 34869983 2D ATAAATGCTT GA/-- GAGGATGGAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 GA 2 1 108167 CASAVA_Build 6 34870546 2D AGTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1072 hom 35 6 18 11 T 13 11 108168 CASAVA_Build 6 34875247 1D CCTGTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 1174 het 1174 ref 15 7 3 5 A 13 12 108169 CASAVA_Build 6 34888390 1I AGCTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 1311 het 1311 ref 27 12 4 11 T 15 16 108170 CASAVA_Build 6 34890180 1I GCAGTATCCA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 6 7 108171 CASAVA_Build 6 34892144 5D AGGATTGCTT GAGCC/----- GAGCCCAGAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 GAGCC 2 1 108172 CASAVA_Build 6 34892271 1D GAGGCTGAGA T/- TGGGAGGGTC 2848 het 2848 ref 21 13 7 1 T 2 1 108173 CASAVA_Build 6 34894237 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAACGA 3070 het 1283 hom 21 7 13 1 A 7 8 108174 CASAVA_Build 6 34894912 1D TTTTTTTTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 652 hom 14 2 9 3 T 10 9 108175 CASAVA_Build 6 34903376 4D AAATACTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 13 20 5 TTTG 3 2 108176 CASAVA_Build 6 34913275 1I TCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 A 9 10 108177 CASAVA_Build 6 34913521 1I GCAAAGATTG -/T TTTTTGCCAC 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 T 5 6 108178 CASAVA_Build 6 34914252 1I CTCAAGCCAC -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 6 7 108179 CASAVA_Build 6 34915094 4D TTCTTGTAAC TCTT/---- TCTCTGGGAT 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 TCTT 1 0 108180 CASAVA_Build 6 34919668 1I TTCATTTTTG -/C GTGTCTTTTG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 C 0 1 108181 CASAVA_Build 6 34925853 2I AGCCAAGATC --/GT GTGCCACTGC 2137 het 1981 hom 13 5 5 3 GT 1 2 108182 CASAVA_Build 6 34928534 1D CAAATTTCTT A/- AAGGATCCTA 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 3 2 108183 CASAVA_Build 6 35047167 2I CCTCTTACAA --/AT ATACAACTCC 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 AT 1 2 108184 CASAVA_Build 6 35067610 1D GGAGGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 585 hom 20 2 16 2 A 12 11 108185 CASAVA_Build 6 35074110 1I CAATGTGTGA -/G GGGTGGTGAG 3070 hom 59 het 24 0 20 4 G 3 4 108186 CASAVA_Build 6 35076217 1D AAGTTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 13 1 8 4 A 13 12 108187 CASAVA_Build 6 35077184 1I TGTCCCTCTT -/C CCACTAAGGT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 C 2 3 108188 CASAVA_Build 6 35079903 1I CTCACACGGA -/C CCCCCCCTTA 3070 hom 36 het 16 0 12 4 C 7 8 108189 CASAVA_Build 6 35080444 3I AGGCCAAGGA ---/AGG AGGCTTACTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AGG 1 2 108190 CASAVA_Build 6 35083993 1I TTAAATAGAC -/A GGGGTCTCGC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 0 1 108191 CASAVA_Build 6 35092535 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAGAGAG 3070 het 226 hom 30 1 27 2 G 0 1 108192 CASAVA_Build 6 35102272 3D AGTATGTAGT TGA/--- TGATGGGAGT 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 TGA 2 1 108193 CASAVA_Build 6 35103738 1D AGGCAGCCTG T/- TTTATTTGCC 3070 hom 92 het 40 0 30 12 T 4 3 108194 CASAVA_Build 6 35161362 9D AACAGAGACC TAGGAAGAG/--------- TAAAGGAGGG 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 TAGGAAGAG 1 0 108195 CASAVA_Build 6 35162962 14D TGGGCGGGCG GCAGCGTAGACGCT/-------------- GTACACTTGC 3070 het 3070 ref 42 25 14 9 GCAGCGTAGACGCT 1 0 108196 CASAVA_Build 6 35170591 4I GAAGAGGGAA ----/AAAG AAAGAGGCTA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 AAAG 1 2 108197 CASAVA_Build 6 35172660 1I TCTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 A 10 11 108198 CASAVA_Build 6 35172791 2D TTCCAGCCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 32 0 16 16 T 13 11 108199 CASAVA_Build 6 35173007 16I GGGCCAGGTT ----------------/CGGTGACTCACACCTG TAATCCCAGC 3070 hom 39 het 13 0 14 0 CGGTGACTCACACCTG 0 1 108200 CASAVA_Build 6 35173264 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 A 13 14 108201 CASAVA_Build 6 35173419 4D AAAAACACAT ACAC/---- ACACACACAC 1462 het 1462 ref 31 11 11 11 AC 7 5 108202 CASAVA_Build 6 35175295 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 18 7 9 3 A 11 10 108203 CASAVA_Build 6 35175999 6D TAGGTTACTA ATAACT/------ ATAAGATCAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 ATAACT 1 0 108204 CASAVA_Build 6 35176675 1D AAATTTGCTC T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 8 7 108205 CASAVA_Build 6 35179321 1I CCAAGGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 10 11 108206 CASAVA_Build 6 35183336 5I TGCTCTTTTT -----/TTTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 TTTTG 0 1 108207 CASAVA_Build 6 35186830 3D TAATAAACTA AAG/--- AAGAATAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 23 4 AAG 2 1 108208 CASAVA_Build 6 35187935 1I AGAAAATTCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 9 10 108209 CASAVA_Build 6 35189488 5D GATAACCTAG ATAAA/----- ATAGACAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 13 4 ATAAA 1 0 108210 CASAVA_Build 6 35197577 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2109 hom 23 7 16 1 A 11 10 108211 CASAVA_Build 6 35199207 1I ACCCACCATT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 8 9 108212 CASAVA_Build 6 35204359 1D AAAGGCAAGA G/- CTTTTATTCC 3070 het 3070 ref 48 25 21 3 G 1 0 108213 CASAVA_Build 6 35214957 1I GCTAGTTTAT -/A AAAAAAAAAA 1818 het 1818 ref 21 10 6 5 A 13 14 108214 CASAVA_Build 6 35217655 5I AGTGTACAGT -----/AACAA AACAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 AACAA 3 4 108215 CASAVA_Build 6 35218249 12I GTCTCAAAAA ------------/AAACAAACAAAC AAAAAAAACA 2338 het 2338 ref 25 14 6 5 AAAC 0 3 108216 CASAVA_Build 6 35219916 2D AAGACCCTGT AA/-- AAAAAAAAAA 176 het 176 ref 17 4 2 13 A 16 14 108217 CASAVA_Build 6 35220309 1I CCTTCCTCAA -/T TTTTTTTTTT 1813 het 385 hom 28 1 6 21 T 15 16 108218 CASAVA_Build 6 35222202 1D GTTTTTTCTC T/- TTCTGTGTCT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 3 2 108219 CASAVA_Build 6 35226029 1D AATTTTTGGT C/- CCCCCGAGGC 3070 het 3070 ref 56 27 26 3 C 6 5 108220 CASAVA_Build 6 35229523 1D TAGTAAAGAC G/- GGGGGGTCTC 1371 hom 10 het 4 0 4 0 G 7 6 108221 CASAVA_Build 6 35231198 1D TTTGGATTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 T 9 8 108222 CASAVA_Build 6 35232001 1I GATTGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 10 11 108223 CASAVA_Build 6 35233492 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2238 hom 24 8 9 8 A 13 12 108224 CASAVA_Build 6 35274618 1I TTATAGCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 2661 hom 26 11 13 2 C 0 1 108225 CASAVA_Build 6 35277907 1I GCAGAAGCCA -/C CCTGCTGTAT 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 C 2 3 108226 CASAVA_Build 6 35281290 1D TGCCTGTAAT C/- CCAGCTACTT 3070 het 448 hom 13 1 7 6 C 3 2 108227 CASAVA_Build 6 35286008 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2859 hom 29 10 14 5 T 10 9 108228 CASAVA_Build 6 35305552 1I AAAAGGATTT -/G GAAATTTGAA 3070 het 3070 hom 47 17 19 11 G 1 2 108229 CASAVA_Build 6 35323933 3I GGACAAAGGT ---/AGA AGCATGGAGA 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 AGA 0 1 108230 CASAVA_Build 6 35326485 4D TTTTTTTTTC TTTT/---- TAACTCTCCT 520 het 520 ref 29 9 4 17 T 5 1 108231 CASAVA_Build 6 35332579 2I AATGTGAGAC --/AG AGTCTCACTC 1998 het 1998 ref 23 11 8 4 AG 1 2 108232 CASAVA_Build 6 35337270 4D ATATTTTTGT TTGG/---- TTGGTTGGTT 3070 het 3070 hom 43 16 16 15 TTGG 4 3 108233 CASAVA_Build 6 35338014 3D ACCTCTTTAT GAG/--- GAGGGTATTA 3070 het 3070 hom 36 16 17 6 GAG 2 1 108234 CASAVA_Build 6 35341915 1I GTGGCTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 13 14 108235 CASAVA_Build 6 35346762 1D GCACTGTTTT A/- TACCTAGCCA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 1 0 108236 CASAVA_Build 6 35349619 1D TAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 10 9 108237 CASAVA_Build 6 35352547 5D TATTTATGGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1509 het 1194 hom 21 8 4 9 T 21 16 108238 CASAVA_Build 6 35355145 1I AAATAGAATT -/C AGTTTCATTT 3070 het 3070 ref 17 8 8 1 C 0 1 108239 CASAVA_Build 6 35361681 1I GTGATGGGTT -/C CGGCAAGGCA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 C 1 2 108240 CASAVA_Build 6 35390583 1I GGTCTTCCAC -/A AAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 6 7 108241 CASAVA_Build 6 35391219 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 23 14 10 T 8 9 108242 CASAVA_Build 6 35392877 3I CTTACCAACA ---/GTT GTTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 GTT 2 3 108243 CASAVA_Build 6 35426432 5D ATGGAGTGCA GTGGC/----- GTGGCGTGAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 GTGGC 2 1 108244 CASAVA_Build 6 35449429 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 14 12 T 12 13 108245 CASAVA_Build 6 35485320 3D TTTGTGGTGG TGT/--- TTTATTTTAG 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 TGT 1 0 108246 CASAVA_Build 6 35490116 3D GATCCTGCAT ACC/--- CTTCTGTGTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 ACC 1 0 108247 CASAVA_Build 6 35494095 1D TCCCTGTTAT A/- AATGCCTCCA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 3 2 108248 CASAVA_Build 6 35494466 1D GAACAGTTAC A/- ACACCTTGGA 3070 het 3070 ref 54 26 20 8 A 2 1 108249 CASAVA_Build 6 35503927 4D GGGAATTAAA TATT/---- TAAGAGCTGA 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 TATT 1 0 108250 CASAVA_Build 6 35507855 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 965 hom 19 5 10 4 A 17 16 108251 CASAVA_Build 6 35508410 3D TCCTTACAGG TGT/--- TGTTCTAAAG 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 TGT 2 1 108252 CASAVA_Build 6 35515607 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1121 het 1121 ref 25 10 4 11 T 15 14 108253 CASAVA_Build 6 35569083 2I GATGCCACAC --/AT GTCAGGGACC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AT 0 1 108254 CASAVA_Build 6 35592969 1D ATGATAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 939 hom 30 4 15 11 T 15 14 108255 CASAVA_Build 6 35600145 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1347 hom 18 het 8 0 6 2 A 13 14 108256 CASAVA_Build 6 35612033 6D TCCGTCTCAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 5 AAAAAC 4 3 108257 CASAVA_Build 6 35622968 1D TAAGGTGTAG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 8 7 108258 CASAVA_Build 6 35625232 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTTTAAA 3070 het 1374 hom 34 5 27 2 A 3 2 108259 CASAVA_Build 6 35627292 1I AGACTGTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 456 hom 22 1 15 6 A 9 10 108260 CASAVA_Build 6 35627832 1D TCTCTGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 32 2 20 10 A 13 12 108261 CASAVA_Build 6 35628710 1I TTGCTGCAAA -/T AAGATTTTAT 3070 het 104 hom 32 1 27 5 T 0 1 108262 CASAVA_Build 6 35630407 6I CCTGGGCAAC ------/AGAGTG AGGCTCCATC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AGAGTG 0 1 108263 CASAVA_Build 6 35646510 1D GGTGGCAGAC A/- CCTGTAATCC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 1 0 108264 CASAVA_Build 6 35654524 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 2644 het 9 hom 24 1 14 9 A 14 15 108265 CASAVA_Build 6 35654730 2I AATTAGCAGG --/GT GTGTGGTGGC 3070 hom 59 het 31 0 17 14 GT 2 3 108266 CASAVA_Build 6 35674862 5D CTGGCTGATC TACTT/----- TACTTTAGAT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 TACTT 2 1 108267 CASAVA_Build 6 35676299 1I CACTTTTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 35 1 24 10 A 12 13 108268 CASAVA_Build 6 35700253 1D AGAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 10 9 108269 CASAVA_Build 6 35710469 3D AGGGGGAATA CTT/--- CTTTTTTCCC 3070 hom 123 het 45 0 42 4 CTT 2 1 108270 CASAVA_Build 6 35726055 1D GATATTGTCC A/- AAAAAAAAAA 2008 het 139 hom 28 3 12 14 A 17 16 108271 CASAVA_Build 6 35738032 2D TTTACGTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 22 0 11 11 T 16 14 108272 CASAVA_Build 6 35769411 1D AGTAGCTGGG A/- TTACAAGGCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 0 108273 CASAVA_Build 6 35778124 1I AATAAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 33 2 23 8 A 11 12 108274 CASAVA_Build 6 35780348 1D TGTCAACATG T/- TTTTTTGGGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 7 6 108275 CASAVA_Build 6 35780465 1D GACAATATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 32 0 26 6 T 11 10 108276 CASAVA_Build 6 35782180 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2778 hom 35 het 13 0 11 2 A 18 16 108277 CASAVA_Build 6 35784332 1D CTATATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 6 T 11 10 108278 CASAVA_Build 6 35796661 1D ATTGGAATGA T/- TACAATTACT 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 T 2 1 108279 CASAVA_Build 6 35797848 1D ACTCAGCAGA C/- CCCCCATCAC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 C 6 5 108280 CASAVA_Build 6 35805789 2I AATGTTCCTC --/AA GTGACCCATT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 0 2 108281 CASAVA_Build 6 35815267 1I TCCTTCAGAT -/C CCCAATAAAC 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 C 3 4 108282 CASAVA_Build 6 35817174 1I CACATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 35 1 20 14 T 14 15 108283 CASAVA_Build 6 35821828 5I AAAATTAAAT -----/TAAAA TAAAAAACAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TAAAA 1 2 108284 CASAVA_Build 6 35824839 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 143 hom 18 3 8 7 T 13 12 108285 CASAVA_Build 6 35832008 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2503 het 2503 ref 23 12 8 3 T 11 12 108286 CASAVA_Build 6 35851626 1D CTTACAGAAG A/- GGAGAATGGG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 1 0 108287 CASAVA_Build 6 35865649 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1607 het 1355 hom 11 4 4 3 A 11 12 108288 CASAVA_Build 6 35866813 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAGAAAGAA 1179 het 1179 ref 31 16 8 8 AG 1 0 108289 CASAVA_Build 6 35867364 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2633 hom 23 8 11 4 A 13 12 108290 CASAVA_Build 6 35870312 2I GTCAGCTAGC --/TG TGTCATATTT 3070 het 3070 hom 68 18 41 9 TG 1 2 108291 CASAVA_Build 6 35872704 1I AAAAAAAAGA -/G AAAAAAAGGT 3070 het 1693 hom 40 7 29 4 G 0 1 108292 CASAVA_Build 6 35873433 2I AATACACATT --/TA TATGTGTTAC 1752 het 1752 ref 22 13 6 3 TA 1 2 108293 CASAVA_Build 6 35874296 2I TGAGACAAGG --/TC TCTCACTCTG 1669 het 1669 ref 35 23 5 7 TC 2 3 108294 CASAVA_Build 6 35899387 1I GCTGCTCAGA -/G GGGGGGTAAG 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 6 7 108295 CASAVA_Build 6 35899614 1D ATAGATGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 11 10 108296 CASAVA_Build 6 35900427 1D GGACCAGCTA C/- TAAATGGTGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 C 1 0 108297 CASAVA_Build 6 35902372 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 7 5 A 12 11 108298 CASAVA_Build 6 35907730 3I AGCAAAAAAT ---/AAC AAATTATCTC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 AAC 0 1 108299 CASAVA_Build 6 35909712 4D52M1D CTCTTCAGTA TTACTTACTGGAGGAATATGTAATATTCTAGGTCAAGTCTAGGAGAGGCTCATCCTA/----TTACTGGAGGAATATGTAATATTCTAGGTCAAGTCTAGGAGAGGCTCATCCT- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 34 21 7 N/A 0 0 108300 CASAVA_Build 6 35909902 4D CTTAAAAAAT AACG/---- AACCAACCAA 3070 het 3070 ref 36 21 10 6 AACG 1 0 108301 CASAVA_Build 6 35919715 4D TACATAAATC CTCA/---- CTGATTACAA 3032 het 3032 ref 24 14 9 2 CTCA 1 0 108302 CASAVA_Build 6 35921034 2D GATGTGCCAA TG/-- TAGGTTCATT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 TG 1 0 108303 CASAVA_Build 6 35922019 1D ATCTCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 A 12 11 108304 CASAVA_Build 6 35926424 2D TCCAAAATGC AT/-- ATGTCTACTG 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 AT 2 1 108305 CASAVA_Build 6 35926935 1I TGGTATTGGA -/T TTTTTTTTTT 2257 het 1753 hom 17 6 7 4 T 10 11 108306 CASAVA_Build 6 35930300 1I CAGGTAAGTA -/C CTTCCATTCC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 1 2 108307 CASAVA_Build 6 35934241 1I TGGGGGAAAA -/G GTTTCATATA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 G 1 2 108308 CASAVA_Build 6 35940102 1D ACTCTATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 12 11 108309 CASAVA_Build 6 35958025 1D CTGGTCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 13 12 108310 CASAVA_Build 6 35959220 2D CAGATTACTT AA/-- AAAGACTAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 A 5 3 108311 CASAVA_Build 6 35973908 1D ACAGATAAAG A/- AAAATGTCGC 3070 het 3070 hom 45 21 20 5 A 5 4 108312 CASAVA_Build 6 35983467 1D TCTCAAAAAA T/- AAAAAATAAA 3070 het 1447 hom 12 4 7 1 T 1 0 108313 CASAVA_Build 6 35987690 5D AAAATCTTTG GGTAA/----- GGGAGGGTCA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 GGTAA 1 0 108314 CASAVA_Build 6 35993964 6I AAAAAGGAAG ------/AAAGAA AAAGAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 AAAGAA 1 2 108315 CASAVA_Build 6 35999208 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2049 het 2049 ref 18 10 6 2 A 10 11 108316 CASAVA_Build 6 36005317 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 42 het 21 0 13 10 AC 9 8 108317 CASAVA_Build 6 36009082 1I CGCCTATAAT -/C CCCAGCTACT 3070 het 2358 hom 21 6 13 2 C 3 4 108318 CASAVA_Build 6 36011875 1I TTCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 10 11 108319 CASAVA_Build 6 36068944 1D TAGAGATTGG A/- GGGGGGGGTC 1091 hom 21 het 16 0 4 12 A 1 0 108320 CASAVA_Build 6 36090339 1I CATTTACATT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 A 7 8 108321 CASAVA_Build 6 36101871 1D TTGTAACAAG C/- TTTAGCATAG 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 C 1 0 108322 CASAVA_Build 6 36108740 1D TTTAAATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2984 hom 30 10 14 6 T 15 14 108323 CASAVA_Build 6 36110519 1I AGATAATTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 7 13 8 T 9 10 108324 CASAVA_Build 6 36112300 2I AATGCAGCAA --/GC TTCACCGTTG 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 GC 0 1 108325 CASAVA_Build 6 36115226 2D ATGAAGGAAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 46 19 16 11 GT 7 6 108326 CASAVA_Build 6 36118879 1I ACCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2691 hom 20 6 10 4 A 11 12 108327 CASAVA_Build 6 36143238 1I TTGTGCTGTC -/A ACTGTTTATA 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 A 1 2 108328 CASAVA_Build 6 36148621 1D TTTTCACTAA T/- TTCTAGGTAT 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 T 3 2 108329 CASAVA_Build 6 36167270 3D TTGTCATGAT GTG/--- GTGAGTTTTG 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 GTG 2 1 108330 CASAVA_Build 6 36177245 1I AGCAACCAGA -/T TTTTTTTTTT 2329 het 2329 ref 24 12 8 4 T 13 14 108331 CASAVA_Build 6 36178098 74D GAGCATTCTC GTTCACTTGAAATGCAACTGTGAGAGATAGCAGGAATAAAGAAGGTGATGATCATAACTAGGGAAGTTAGGATG/-------------------------------------------------------------------------- GCAGTAAGGG 3070 het 3070 ref 59 67 19 4 GTTCACTTGAAATGCAACTGTGAGAGATAGCAGGAATAAAGAAGGTGATGATCATAACTAGGGAAGTTAGGATG 1 0 108332 CASAVA_Build 6 36182124 20D GAACAGGGCT TAGAAGTAAGAAGATTATTC/-------------------- TAGACTAAGA 3070 het 3070 ref 44 22 20 8 TAGAAGTAAGAAGATTATTC 1 0 108333 CASAVA_Build 6 36183025 4D AAATACAGAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 202 hom 33 5 17 11 AC 11 9 108334 CASAVA_Build 6 36186899 1I GTTGGGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 208 hom 34 1 27 6 A 9 10 108335 CASAVA_Build 6 36190998 2I AAATAGAAAC --/TG TGCCACCACC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TG 1 2 108336 CASAVA_Build 6 36194670 1I GAGTCAGGTG -/C CCCCCCTCCA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 C 6 7 108337 CASAVA_Build 6 36203046 3D TTGTCATACT TTA/--- TTATTATCCC 3070 hom 126 het 55 0 43 14 TTA 3 2 108338 CASAVA_Build 6 36205492 2I GTCTCAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 20 0 12 8 AT 6 7 108339 CASAVA_Build 6 36220133 4D CAATATTTTA AGAT/---- AGATACCTGT 3070 hom 114 het 42 0 39 6 AGAT 2 1 108340 CASAVA_Build 6 36234888 1D AGGAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 844 hom 37 4 21 12 T 15 14 108341 CASAVA_Build 6 36248894 2I TGTGGAAATC --/TT TTAAAAATTT 3070 hom 90 het 32 0 28 4 T 2 4 108342 CASAVA_Build 6 36260005 1D AACTCCTTAA C/- CCCCCCCCCC 1221 het 322 hom 31 6 5 20 C 12 11 108343 CASAVA_Build 6 36263386 1D CTTTTCTTGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 T 9 8 108344 CASAVA_Build 6 36270792 2D ATCAAGAAAT AA/-- AAGTTACTAG 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 A 4 2 108345 CASAVA_Build 6 36272091 2D TCAGGGACCC CT/-- GTCTCTCCCA 3070 het 1828 hom 18 6 9 4 CT 1 0 108346 CASAVA_Build 6 36294217 1I TGGAATTGCC -/T TTTTTTTTTT 1457 het 1457 ref 23 9 6 8 T 17 18 108347 CASAVA_Build 6 36298189 1D AATCATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 34 0 23 11 T 13 12 108348 CASAVA_Build 6 36306375 1D GGGCAGGGCT G/- GGCCTGCATC 1825 het 1825 ref 24 9 8 8 G 3 2 108349 CASAVA_Build 6 36312290 1I TGCCCAGCGA -/G GGGGGATAAG 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 G 5 6 108350 CASAVA_Build 6 36318065 1I TCACTTTTTC -/T TTTCTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 3 4 108351 CASAVA_Build 6 36330338 1D TCAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 11 10 108352 CASAVA_Build 6 36331442 1D AACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 27 1 18 10 A 15 14 108353 CASAVA_Build 6 36338041 1I ATCCTCCACT -/G CTCCCACTCT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 G 0 1 108354 CASAVA_Build 6 36365368 1D TGAAGGTTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 31 9 A 11 10 108355 CASAVA_Build 6 36365557 3I GGTGCTGAAG ---/CTT CTTTTCTTAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CTT 1 2 108356 CASAVA_Build 6 36389965 1I CCTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 27 3 18 6 T 11 12 108357 CASAVA_Build 6 36396858 9I TGGAACCCAG ---------/GTCTCAGCT GTGGGTAGAT 3070 het 3070 hom 39 18 13 8 GTCTCAGCT 0 1 108358 CASAVA_Build 6 36416097 4I GATTTTGTTG ----/TTGT TTGTTTTTTC 3070 hom 58 het 24 0 18 6 TTGT 1 2 108359 CASAVA_Build 6 36420518 3D TAATGCTAGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TTG 7 6 108360 CASAVA_Build 6 36424045 1D AAGACAATTA T/- TTTTTTTTTT 2751 hom 38 het 20 0 12 8 T 12 11 108361 CASAVA_Build 6 36424949 1D TCCAAGTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 50 2 39 9 T 11 10 108362 CASAVA_Build 6 36458752 1I TGTCACTGAA -/T GAGGCCATGG 3070 hom 115 het 46 0 37 9 T 0 1 108363 CASAVA_Build 6 36463473 8D AGGCGTGTGC GCCCGGGT/-------- CCTCCGCAGG 1506 het 1506 ref 16 8 7 1 GCCCGGGT 1 0 108364 CASAVA_Build 6 36465337 1I AGCCATGTCA -/T TTTACTGGCT 3070 het 3070 hom 41 22 18 1 T 3 4 108365 CASAVA_Build 6 36465457 3D ATCCCATAAG GTT/--- GTTATGAATA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 GTT 2 1 108366 CASAVA_Build 6 36470481 1I TCCCGGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 11 108367 CASAVA_Build 6 36472747 2I TACTCTCTCC --/TG AGGGCCTCCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 TG 0 1 108368 CASAVA_Build 6 36474887 10D ATTTTATTTT ATTTCATTTC/---------- ATTTCATTTC 1825 het 1825 ref 19 9 5 8 ATTTC 5 3 108369 CASAVA_Build 6 36477371 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2198 het 876 hom 21 7 6 8 A 18 16 108370 CASAVA_Build 6 36478707 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 20 1 10 10 T 14 13 108371 CASAVA_Build 6 36481133 1D AGAAAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2533 hom 24 8 8 8 T 13 12 108372 CASAVA_Build 6 36483334 2D ATGGTTAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 11 7 T 14 12 108373 CASAVA_Build 6 36483713 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2991 het 2268 hom 24 11 8 5 T 15 14 108374 CASAVA_Build 6 36484347 1I GAAAAAAAAA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 6 7 108375 CASAVA_Build 6 36489915 1I CTAAATTAAG -/A AAGAAAAAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 2 3 108376 CASAVA_Build 6 36498783 2I CCCTCAACTC --/AG TTCTAAGAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 AG 0 1 108377 CASAVA_Build 6 36501561 4D AAAACAAAAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 339 hom 16 3 11 4 AT 12 10 108378 CASAVA_Build 6 36502587 2D CTATTTCCTC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 AT 1 0 108379 CASAVA_Build 6 36503084 1D TTCCTGGGCA T/- TTAATTCTTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 3 2 108380 CASAVA_Build 6 36504502 1D CATCTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1701 hom 24 7 13 4 T 13 12 108381 CASAVA_Build 6 36505617 1I AATAATTTAT -/C TTCTTTGTGG 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 C 0 1 108382 CASAVA_Build 6 36513043 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 AAAC 3 2 108383 CASAVA_Build 6 36515892 1I AATTTAATTA -/C TTCGAGAGAG 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 C 0 1 108384 CASAVA_Build 6 36517624 5I TGAAACCTAC -----/TGAAA TGAGTCAAAC 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 TGAAA 0 1 108385 CASAVA_Build 6 36526760 1I GTTTTGACTT -/G GCCTGTTTCC 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 G 1 2 108386 CASAVA_Build 6 36529273 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 27 17 3 7 T 14 13 108387 CASAVA_Build 6 36530103 1I TTTATGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 19 0 11 9 T 12 13 108388 CASAVA_Build 6 36536083 3I TTTTTTTCCC ---/CCT GAGACTGAGC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 CCT 0 1 108389 CASAVA_Build 6 36541297 2D TACAGGCTGT TG/-- TGTGGATTCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TG 3 2 108390 CASAVA_Build 6 36545270 4D ACAAAGTGAA AGAG/---- AGAAAAGGGG 3070 het 3070 hom 37 12 17 10 AG 3 1 108391 CASAVA_Build 6 36551517 4I AAAAAAAAAT ----/AAAA AACAGTATTA 3070 het 3070 ref 27 11 13 3 A 2 6 108392 CASAVA_Build 6 36552184 1D CAGTGAACCA T/- TTTTTTTTTT 880 het 880 ref 23 5 4 14 T 19 18 108393 CASAVA_Build 6 36556857 1I ATGTTGCATG -/A AAAGCCCCTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 3 4 108394 CASAVA_Build 6 36557050 4I TAGGATTAAC ----/ATTT ATGGTCTGAC 3070 het 3070 hom 53 22 25 6 ATTT 0 1 108395 CASAVA_Build 6 36558404 5D GCCATTATTG GACGT/----- TTAAACTATT 1775 het 1775 ref 23 17 5 1 GACGT 1 0 108396 CASAVA_Build 6 36565974 5I GATTTTTGTT -----/AAGTC AAGTGTCAAT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 AAGTC 0 1 108397 CASAVA_Build 6 36567532 3D ATTAAGCCAC TTG/--- TTGTTGGGAA 3070 het 3070 ref 63 32 28 5 TTG 3 2 108398 CASAVA_Build 6 36579564 1I ATTGCTCTTA -/T TTCCAGAAAC 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 T 2 3 108399 CASAVA_Build 6 36582601 2D TTAAAAGACT CA/-- CACAGAGTTG 3070 het 3070 ref 35 21 10 5 CA 3 2 108400 CASAVA_Build 6 36586413 1D CATAAATCTC T/- TAACTTTATA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 2 1 108401 CASAVA_Build 6 36590067 1I AGACCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2125 het 2125 ref 32 16 8 8 A 13 14 108402 CASAVA_Build 6 36592868 2D GTTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 29 8 16 7 T 9 7 108403 CASAVA_Build 6 36601082 1D TCTTTTAAAA T/- TTAATTTGAT 3070 het 3070 hom 33 14 14 7 T 3 2 108404 CASAVA_Build 6 36603064 14D TGTATATACG TATATATACACACA/-------------- TATATATACA 3070 het 3070 ref 20 11 8 3 TATATATACACACA 2 1 108405 CASAVA_Build 6 36603312 1I TGCCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 11 108406 CASAVA_Build 6 36607128 1D ATTCATGAAG A/- AAAGAAACAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 4 3 108407 CASAVA_Build 6 36610565 1I CAACATTTTA -/C TGGAATTCCC 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 C 0 1 108408 CASAVA_Build 6 36611169 1I ACACCGTTGC -/A ACTCCAGCCT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 A 1 2 108409 CASAVA_Build 6 36614868 2I TACAGCCAAG --/CA CAGTGGCTCA 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 CA 1 2 108410 CASAVA_Build 6 36615141 1D ATTCGATCTC A/- AAAAAAAAAA 3018 het 2076 hom 24 11 8 6 A 15 14 108411 CASAVA_Build 6 36617153 1D AGTGAGACCT A/- AAAAAAAATA 1262 het 1262 ref 29 23 3 3 A 9 8 108412 CASAVA_Build 6 36617587 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1538 hom 30 7 14 9 T 15 14 108413 CASAVA_Build 6 36633828 1I TCATCAAAAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 8 9 108414 CASAVA_Build 6 36658259 2I CTGTCTCAAA --/AG AAAAAAGAAG 1852 het 1852 ref 12 6 5 1 AG 0 1 108415 CASAVA_Build 6 36660990 1D TGACTATCTA T/- TGTAATTGTG 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 2 1 108416 CASAVA_Build 6 36672330 1D GCGGGGTGGC G/- GGGGGGGGGA 2283 hom 27 het 14 0 8 6 G 10 9 108417 CASAVA_Build 6 36679683 2I GCTAAGAGAA --/AT ATAATACAGA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AT 1 2 108418 CASAVA_Build 6 36691208 6D ATTAACAAAG ATAATC/------ ATAACAGTAA 3070 het 3070 hom 51 21 26 6 ATAATC 1 0 108419 CASAVA_Build 6 36692353 2D TCATAAAGAC AA/-- GAGAAATCCA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 2 0 108420 CASAVA_Build 6 36700965 2D TTCTCTGCCT CA/-- CACTGGGAGC 3070 het 3070 ref 44 21 16 8 CA 2 1 108421 CASAVA_Build 6 36714465 3D GCACTTCCTA GTT/--- GTTTTGCTGC 3070 het 3070 hom 32 15 14 6 GTT 2 1 108422 CASAVA_Build 6 36741685 1I CATCTCCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 192 hom 26 2 19 5 A 13 14 108423 CASAVA_Build 6 36751609 1I CTTTTTGTGC -/A AAAAAAAAAA 1646 het 1646 ref 25 16 6 3 A 11 12 108424 CASAVA_Build 6 36772095 1I TCTTTCTTCC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 7 8 108425 CASAVA_Build 6 36777597 1D GGGGGTGCAT G/- GGGACTGGAA 3070 het 3070 hom 46 21 17 8 G 4 3 108426 CASAVA_Build 6 36778149 1I TGCTTCATCC -/A AGTTCTGTGC 2667 het 2667 ref 31 16 9 6 A 1 2 108427 CASAVA_Build 6 36808181 3I ATGTGGGGGG ---/GGT GGGGTGTTAC 1881 het 1793 hom 22 7 7 8 GGT 0 1 108428 CASAVA_Build 6 36814792 2D ACACTGACTC TG/-- TGATACAAAG 3070 hom 126 het 46 0 42 5 TG 2 1 108429 CASAVA_Build 6 36821873 6D AGGGATGGGT CAGCCA/------ CAGCTCGCCT 3070 het 3070 ref 29 12 12 6 CAGCCA 1 0 108430 CASAVA_Build 6 36822730 1I GAGCCCGCAA -/G GCACTCATGA 3070 hom 82 het 30 0 24 6 G 1 2 108431 CASAVA_Build 6 36823010 1I CTTGATTTCC -/A CCCCCCAGAG 2626 het 2626 ref 31 16 8 7 A 0 1 108432 CASAVA_Build 6 36834095 1I GTGCAGTGGT -/G GGGGTCATAG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 G 4 5 108433 CASAVA_Build 6 36838060 2D CACATACATG CA/-- CACACACACA 2457 het 2457 ref 29 14 8 8 CA 8 7 108434 CASAVA_Build 6 36840730 1D TGAAGTTCAC T/- GGTGTCTGTG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 T 1 0 108435 CASAVA_Build 6 36850512 2I GTGAAGAGGC --/AG AGACATTGCC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AG 1 2 108436 CASAVA_Build 6 36852925 1D TCCACTGCCA G/- GGAGAGGGCT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 3 2 108437 CASAVA_Build 6 36859278 2D TCAGACAGGT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 45 het 25 0 16 9 TC 8 7 108438 CASAVA_Build 6 36875899 1I GGAGAGCACT -/G GGCTCAGAGC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 2 3 108439 CASAVA_Build 6 36878350 3D GGCATTAATC CTT/--- CTTAATAATC 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 CTT 2 1 108440 CASAVA_Build 6 36883853 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2537 hom 22 9 12 1 T 10 11 108441 CASAVA_Build 6 36897919 1I CGCACACTGC -/G GGGGGGAGGA 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 G 6 7 108442 CASAVA_Build 6 36903627 1D GAAAAACGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2804 hom 25 10 11 4 T 12 11 108443 CASAVA_Build 6 36904204 3I GCCAGAAAGG ---/AGA CATATTTGCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AGA 0 1 108444 CASAVA_Build 6 36931481 1I AGCCAAAATG -/A AATTTAGCAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 2 3 108445 CASAVA_Build 6 36937435 1D ATGATCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1511 hom 21 7 12 2 T 15 14 108446 CASAVA_Build 6 36953638 2I TCTATTTGGC --/TA TGTTTTCTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TA 0 1 108447 CASAVA_Build 6 36954432 5D CAAATTTGAA AACTT/----- AACTTAATAG 3070 het 3070 ref 50 30 19 1 AACTT 2 1 108448 CASAVA_Build 6 36956348 5I AATATTATTG -----/ATAAA ATAAAGACAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 ATAAA 1 2 108449 CASAVA_Build 6 36961664 1I CAAGGCCTCG -/C CCCAGGAGTG 3070 hom 71 het 27 0 22 5 C 3 4 108450 CASAVA_Build 6 36961765 1I AGGAGCCCGA -/G GGGGCGCGAG 1082 hom 21 het 11 0 5 6 G 4 5 108451 CASAVA_Build 6 36966744 6D CTAAGAAGCA CTTTTT/------ CTTTTTATTA 2211 het 2211 ref 18 9 7 2 CTTTTT 2 1 108452 CASAVA_Build 6 36984936 1I TTGTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 14 15 108453 CASAVA_Build 6 37029090 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 527 het 527 ref 15 5 2 8 A 15 16 108454 CASAVA_Build 6 37033377 1D AGAGTCTTAC A/- AACTCCACAG 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 A 3 2 108455 CASAVA_Build 6 37057986 1D AACTGTTACC T/- CAAATTCCAG 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 T 1 0 108456 CASAVA_Build 6 37059961 10I ACTTCTCAGG ----------/TCCCACCAGT TCCAAAGCAC 3070 het 3070 hom 60 26 24 10 TCCCACCAGT 0 1 108457 CASAVA_Build 6 37090288 1I GGGCTGCTCC -/T TGGGGGCTGT 1888 het 1888 ref 26 8 10 8 T 1 2 108458 CASAVA_Build 6 37093560 1D AAGAGCCCCA C/- CCCTGCTCCT 1038 het 1038 ref 18 5 3 10 C 4 3 108459 CASAVA_Build 6 37095610 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2151 het 677 hom 28 7 7 14 T 15 14 108460 CASAVA_Build 6 37096077 1D TGCTAAAATT C/- CAGGAGCCAT 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 C 2 1 108461 CASAVA_Build 6 37102288 1D GCTCCCCTGT G/- GGGGTACAAC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 G 5 4 108462 CASAVA_Build 6 37109938 1D CTTACTGCCT G/- GGGGAGCTGA 3070 het 3070 ref 65 30 27 8 G 5 4 108463 CASAVA_Build 6 37111630 1I AAATTATTTT -/G GGGGGGTGGG 1689 het 1689 ref 26 16 5 5 G 6 7 108464 CASAVA_Build 6 37111987 1I ACTTTAAATC -/G GGGGGGGGGT 2040 hom 41 het 21 0 11 10 G 9 10 108465 CASAVA_Build 6 37145797 1I TAGCAAAGAT -/A ATGTAAACGA 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 A 1 2 108466 CASAVA_Build 6 37146386 5D GTGATTGCTT CACCA/----- CACTCCACGG 3070 het 3070 ref 30 13 14 4 CACCA 1 0 108467 CASAVA_Build 6 37155545 10I CAACACTGTA ----------/ATGAACATCC ATGAACAACT 3070 het 3070 hom 53 16 28 9 ATGAACATCC 0 1 108468 CASAVA_Build 6 37164409 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 714 het 714 ref 19 10 3 6 G 1 0 108469 CASAVA_Build 6 37174912 1D GATACAGGCC T/- TAAGCCATGG 3070 het 3070 ref 50 26 15 9 T 2 1 108470 CASAVA_Build 6 37176741 1I GATCAAAAAA -/G TGCTGGTGAC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 0 1 108471 CASAVA_Build 6 37177741 1I TAAATGATGA -/G GCAGCTCTCT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 1 2 108472 CASAVA_Build 6 37190631 1I CCCCATCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 A 9 10 108473 CASAVA_Build 6 37200703 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAATTTA 1916 het 1916 ref 26 13 5 8 A 6 7 108474 CASAVA_Build 6 37202590 8D TCCATAGTAA AAAAAAAC/-------- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 6 AAAAAAAC 3 2 108475 CASAVA_Build 6 37213100 2I AAAGCAGAAA --/CT CTGATTGTGC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 CT 1 2 108476 CASAVA_Build 6 37239544 5D TATTTCCTCT GAAAA/----- ACAAAACAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 6 GAAAA 1 0 108477 CASAVA_Build 6 37262480 1D GTGCAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 751 het 539 hom 18 6 4 8 T 17 16 108478 CASAVA_Build 6 37265880 1D CTGGACTCAA G/- TGATCCTCTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 G 1 0 108479 CASAVA_Build 6 37269921 5D TTCTTTCTCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2116 hom 28 9 16 3 T 28 23 108480 CASAVA_Build 6 37269945 5D TTTTTTTTTT TTTTG/----- AGTAGGAGTC 2805 het 1972 hom 18 9 8 7 TTTTG 1 0 108481 CASAVA_Build 6 37270753 1I AAAGGGGTGG -/A AAAAAGATAT 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 A 5 6 108482 CASAVA_Build 6 37274922 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1293 hom 21 5 12 4 A 12 11 108483 CASAVA_Build 6 37275674 10D ATGTTGGTCA GGCTGTTCTC/---------- GAACTCCTGA 1620 het 1620 ref 20 15 6 2 GGCTGTTCTC 1 0 108484 CASAVA_Build 6 37279659 1D GTAAAGTCTG A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 7 6 108485 CASAVA_Build 6 37283335 4I GGCGACAGAG ----/ACTC ACTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 ACTC 1 2 108486 CASAVA_Build 6 37283574 2I CACATGGGAT --/GG GGTAGGGAGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 2 4 108487 CASAVA_Build 6 37284637 1D TAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 11 10 108488 CASAVA_Build 6 37287006 4D TTGTTTTGTC TGTT/---- TGTTTGAGAC 3070 hom 87 het 30 0 29 1 TGTT 2 1 108489 CASAVA_Build 6 37300370 1I CAAACAAACG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 9 10 108490 CASAVA_Build 6 37302545 7D GAACTTCTGA CCTCATG/------- CCTCATGATC 3070 hom 61 het 25 0 19 8 CCTCATG 2 1 108491 CASAVA_Build 6 37309857 1D ATTAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 1726 het 979 hom 23 5 6 12 T 17 16 108492 CASAVA_Build 6 37311372 1D CGTCCACCTT G/- GCCTCCCAAA 2990 het 377 hom 14 4 8 2 G 2 1 108493 CASAVA_Build 6 37312417 1I GCCAGTACTA -/T TTTTTTTTTT 2662 het 2662 ref 28 14 6 8 T 11 12 108494 CASAVA_Build 6 37313922 1I AAAAACACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 11 12 108495 CASAVA_Build 6 37339797 1D ATGTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 12 11 108496 CASAVA_Build 6 37342221 1D TGCCTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2585 hom 31 9 15 8 T 13 12 108497 CASAVA_Build 6 37353274 1I AGGCTGGAGT -/G CAGTGGTGTG 3070 hom 88 het 35 0 25 10 G 0 1 108498 CASAVA_Build 6 37361844 1I TACATGCCAG -/C CCCAGAGTGA 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 C 3 4 108499 CASAVA_Build 6 37366583 1D TATAATGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1802 hom 18 6 10 3 A 13 12 108500 CASAVA_Build 6 37368003 1I ATGATTGTGG -/T TTTTTGGAGG 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 5 6 108501 CASAVA_Build 6 37372591 1D AATTTTTTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2303 hom 18 5 11 2 T 10 9 108502 CASAVA_Build 6 37384736 1D GTGGCTTAAA T/- AAGGTAGAAG 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 T 1 0 108503 CASAVA_Build 6 37386938 1D TCAAGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 13 12 108504 CASAVA_Build 6 37404797 1D AGTTATTACT A/- AAAAAAAAAG 3007 het 3007 ref 17 9 7 1 A 10 9 108505 CASAVA_Build 6 37409585 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 769 hom 17 2 12 3 A 7 8 108506 CASAVA_Build 6 37428340 4I AGAAAGAGAG ----/AGAA AGAAAGAAGA 1779 het 70 hom 13 1 4 8 AGAA 2 3 108507 CASAVA_Build 6 37428381 4I GAAAGAAAGA ----/GAAG GAAGGAAGGA 1141 het 1141 ref 23 12 5 6 GAAG 3 4 108508 CASAVA_Build 6 37438271 4D GATAACTGAT TTAA/---- TTTTAAGAGA 3070 het 3070 ref 41 20 18 5 TTAA 1 0 108509 CASAVA_Build 6 37446456 1I TCCTTCACAC -/T TTTTTTTTTT 2647 het 2647 ref 33 10 8 15 T 15 16 108510 CASAVA_Build 6 37478539 2D GTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 22 0 11 11 T 13 11 108511 CASAVA_Build 6 37479208 2D TGGGGTTATT TA/-- TGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 TA 1 0 108512 CASAVA_Build 6 37488173 1D GTTTCACCAT G/- TTGGCTAGGC 3070 het 2000 hom 23 7 10 6 G 1 0 108513 CASAVA_Build 6 37496230 2I AAAATCACAT --/AA CATGAAACTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 0 2 108514 CASAVA_Build 6 37498711 1I AATTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 2573 het 1990 hom 15 6 8 1 T 10 11 108515 CASAVA_Build 6 37505702 1D AAAAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 13 12 108516 CASAVA_Build 6 37529400 10I ATGAGAGGGG ----------/AGTACTGGGA AATATGGTTT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 AGTACTGGGA 0 1 108517 CASAVA_Build 6 37541683 1D ATTCTGTAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 10 9 108518 CASAVA_Build 6 37552385 3I GGAGGCCAGG ---/GTT GTTGTAATGT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 GTT 1 2 108519 CASAVA_Build 6 37554040 2D CTGTGTGCCT CA/-- GTTTCATCTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 CA 1 0 108520 CASAVA_Build 6 37574579 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 A 12 11 108521 CASAVA_Build 6 37576470 1I CTATTTAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 9 10 108522 CASAVA_Build 6 37579135 1D GAACCTCCTA T/- TGGGGGTTTT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 T 2 1 108523 CASAVA_Build 6 37587658 4D GGCGAGGGCC CCCA/---- CTGATGCTCA 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 CCCA 1 0 108524 CASAVA_Build 6 37588170 1D TCGGTGTTTG T/- TATCAGTGGC 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 2 1 108525 CASAVA_Build 6 37591214 11D CTTCCCTTGC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2559 het 1510 hom 23 6 8 9 T 22 11 108526 CASAVA_Build 6 37592995 1D GGCACTGGAG A/- GACTGAGGGC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 1 0 108527 CASAVA_Build 6 37594527 1I CCCCCCCGCC -/T GAACTCCCCA 3070 het 505 hom 17 3 12 2 T 0 1 108528 CASAVA_Build 6 37602357 7I TGCACACCCT -------/GCACACA GCTCTGCCAG 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 GCACACA 0 1 108529 CASAVA_Build 6 37602837 9I ACACAATGGG ---------/CTTTTCTCC CTTTTCTCCC 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 CTTTTCTCC 1 2 108530 CASAVA_Build 6 37625008 1I CTCTGTATGT -/G GGGGGTCTGT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 5 6 108531 CASAVA_Build 6 37627945 1D CATTGCCTTC A/- ACTATCTTCC 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 A 2 1 108532 CASAVA_Build 6 37655445 1D TTCCAGTTGG A/- AAAAAAAAAA 1057 het 1057 ref 47 39 3 5 A 12 11 108533 CASAVA_Build 6 37661773 1I TGAGTCTCCT -/C CTTTGGCATA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 C 1 2 108534 CASAVA_Build 6 37664720 8D ACACAAATAG TCATTCAT/-------- TCATTCATTC 3070 hom 78 het 35 0 26 13 TCAT 6 4 108535 CASAVA_Build 6 37681150 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTGTGTA 1900 het 953 hom 8 2 5 1 T 5 6 108536 CASAVA_Build 6 37683958 2I TGGTCCAAAA --/AG AGAGAGTTTT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AG 3 4 108537 CASAVA_Build 6 37687487 7I AAGGCATTAG -------/AGAGACA ACTGTCAAAA 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 AGAGACA 0 1 108538 CASAVA_Build 6 37689031 1I ATGCATGGCA -/G GGGGGGCTTG 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 G 6 7 108539 CASAVA_Build 6 37692410 2I CAGCCTACCA --/AG AGTCCTGGCA 3070 het 3070 ref 52 22 22 8 AG 1 2 108540 CASAVA_Build 6 37693274 1D TAAATCATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 T 10 9 108541 CASAVA_Build 6 37693865 1I GATTACAGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 9 10 108542 CASAVA_Build 6 37697758 1D TCCCCCTAGA C/- CATGAGGAAC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 C 2 1 108543 CASAVA_Build 6 37702541 3I GGATTACAGG ---/CAC CACCCACTAC 2124 het 2124 ref 17 8 6 3 CAC 1 2 108544 CASAVA_Build 6 37704467 1D TCTTTCGGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 A 10 9 108545 CASAVA_Build 6 37717902 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 1966 hom 18 het 13 0 6 7 TA 8 9 108546 CASAVA_Build 6 37721295 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 724 hom 34 2 27 5 A 9 10 108547 CASAVA_Build 6 37727371 3D TGCTCTAGTT CTA/--- CTAAGACATT 3070 hom 99 het 34 0 33 2 CTA 2 1 108548 CASAVA_Build 6 37732914 1I TCCTCACTTT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 8 108549 CASAVA_Build 6 37737745 1D CCTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 31 2 22 7 A 12 11 108550 CASAVA_Build 6 37737917 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 15 10 A 15 14 108551 CASAVA_Build 6 37740738 1I TCTTCTCCAA -/G GGACAGAAAT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 G 2 3 108552 CASAVA_Build 6 37753430 1I ATTGGGCTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 8 9 108553 CASAVA_Build 6 37757508 2D ATACACAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 132 het 56 0 42 15 AC 7 6 108554 CASAVA_Build 6 37759275 1D TGCGGGCACC T/- CTCTGCCTGA 2490 het 2490 ref 34 16 7 12 T 1 0 108555 CASAVA_Build 6 37762111 1I ACGTAGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 10 11 108556 CASAVA_Build 6 37762187 2I CAACCTGGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1184 hom 27 6 18 3 T 11 13 108557 CASAVA_Build 6 37763734 1D CTGGGCTCTT G/- GCCTGGACCC 3070 het 3070 hom 28 13 12 4 G 2 1 108558 CASAVA_Build 6 37770420 3D CCTCCTGTCA TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 3070 hom 39 15 17 9 TCC 6 5 108559 CASAVA_Build 6 37782090 2D CTCCAGAGTC AG/-- AGTCTATACT 3070 het 3070 ref 63 39 20 4 AG 2 1 108560 CASAVA_Build 6 37784303 1I ATGTGACTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 11 12 108561 CASAVA_Build 6 37784833 1I AGAACACACA -/T TACAGATTCT 3070 het 3070 ref 58 29 26 3 T 1 2 108562 CASAVA_Build 6 37785300 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1182 het 1182 ref 27 12 4 13 A 17 16 108563 CASAVA_Build 6 37788697 1I TTGGTAATTG -/T TTGGCGATGA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 2 3 108564 CASAVA_Build 6 37790808 5D TCCACGAGGA CTGGT/----- CTGCACTTCC 3070 het 3070 hom 51 19 26 11 CTGGT 1 0 108565 CASAVA_Build 6 37793174 3D AGATGAAGAC AAG/--- AAGAGAGCTA 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 AAG 2 1 108566 CASAVA_Build 6 37806782 12D ATTAAACCCA TGTTTTTGTCTT/------------ TGTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 37 12 15 12 TGTTTTTGTCTT 2 1 108567 CASAVA_Build 6 37819255 1D ATGTATGCGA G/- GGGGGGTGGG 3070 hom 89 het 35 0 28 7 G 7 6 108568 CASAVA_Build 6 37819703 1D GATGTGACGT C/- CTGTGTGTAG 3070 hom 87 het 38 0 26 12 C 2 1 108569 CASAVA_Build 6 37856525 1I AGGAGCACCC -/A CCCTGAGCTA 3070 hom 78 het 29 0 24 5 A 0 1 108570 CASAVA_Build 6 37863737 3D GGACACAGAA AAG/--- AAGGAAAGCT 3070 hom 81 het 30 0 27 6 AAG 2 1 108571 CASAVA_Build 6 37876489 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 2222 het 1460 hom 23 9 6 8 A 13 12 108572 CASAVA_Build 6 37877938 1I TTTTTTTTTT -/C TTTAGACGGA 3070 het 2573 hom 27 13 12 2 C 0 1 108573 CASAVA_Build 6 37884283 15I GGTTTTGCAC ---------------/AGTCCCCACAGCTGT AGTCACTCCC 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 AGTCCCCACAGCTGT 0 1 108574 CASAVA_Build 6 37885400 1I GTGCCCATGT -/A AGGCAATTCA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 1 2 108575 CASAVA_Build 6 37891942 1D ATGAGGTCAG A/- AAAAAAAAAA 2036 het 2036 ref 26 16 5 5 A 12 11 108576 CASAVA_Build 6 37892973 2I GGAAAGCAAG --/GT GTATTTGAGG 3070 het 3070 ref 61 31 22 8 GT 1 2 108577 CASAVA_Build 6 37902507 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1591 het 1591 ref 37 18 4 15 A 15 16 108578 CASAVA_Build 6 37904411 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2741 het 2392 hom 19 8 8 3 T 10 11 108579 CASAVA_Build 6 37910609 1I TGTATGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 A 11 12 108580 CASAVA_Build 6 37912062 1I GTGTCACTTT -/C CTTTTGAGAC 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 C 1 2 108581 CASAVA_Build 6 37914168 26D TCTTAATTCC AGACAATTTCATCACTTTGTAATTCA/-------------------------- AGACAATTTC 3070 het 3070 ref 48 29 17 11 AGACAATTTCATCACTTTGTAATTCA 1 0 108582 CASAVA_Build 6 37916567 2D CCAGAAACTC TT/-- TTTTAAGTTG 3070 het 3070 ref 48 28 15 7 T 6 4 108583 CASAVA_Build 6 37917125 1D TATCCATCTA T/- TAATCTTATT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 2 1 108584 CASAVA_Build 6 37930519 2D GGCTAAAATG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 739 hom 30 6 8 17 C 12 10 108585 CASAVA_Build 6 37932705 1D ACTCTTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 11 10 108586 CASAVA_Build 6 37939363 1D GTTTCACAGG T/- TTTTTTTTTT 1980 het 1980 ref 47 30 7 10 T 13 12 108587 CASAVA_Build 6 37953299 3D GGTGAAAGAA GAG/--- GAGTCAGAGA 3070 het 3070 hom 46 20 25 3 GAG 2 1 108588 CASAVA_Build 6 37960925 1I GATTAACATG -/T TTTTTTAGAG 3070 het 2160 hom 27 7 15 5 T 6 7 108589 CASAVA_Build 6 37969302 4D ATCTTCTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2462 het 2462 ref 40 21 7 12 TTTG 4 3 108590 CASAVA_Build 6 37970142 1I TTCCTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2583 het 2583 ref 40 14 12 14 T 11 12 108591 CASAVA_Build 6 37972437 2I TGTGTGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 TG 8 9 108592 CASAVA_Build 6 37982808 1I TTTTAATGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 9 10 108593 CASAVA_Build 6 37983418 2D AGTTTTTGAC TA/-- TTATGCATAA 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 TA 1 0 108594 CASAVA_Build 6 37992256 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 2704 het 2704 ref 16 10 6 0 A 9 10 108595 CASAVA_Build 6 38000023 8D TTCTAGCTGG TGTTTGAC/-------- CTCTACAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 7 TGTTTGAC 1 0 108596 CASAVA_Build 6 38018042 3D TTTCTTTGAA AAG/--- AAGGGTAAAG 3070 het 3070 hom 31 14 13 6 AAG 2 1 108597 CASAVA_Build 6 38023488 1D GTTGTACACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 24 het 34 1 30 3 T 10 9 108598 CASAVA_Build 6 38026010 1D AGTCTTTAAT C/- CATCTTGAGT 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 C 2 1 108599 CASAVA_Build 6 38026116 1I TTTTTCCATT -/G AATGTTTTTG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 0 1 108600 CASAVA_Build 6 38029988 1D TTCATTGAGA T/- TTTTTGGACC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 6 5 108601 CASAVA_Build 6 38041325 1D GTTGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 115 het 50 0 38 12 T 12 11 108602 CASAVA_Build 6 38046502 1D CTAAAAATAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 8 7 108603 CASAVA_Build 6 38048174 3D ACCTCCAGAT ATA/--- ATATTCACAC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 ATA 2 1 108604 CASAVA_Build 6 38069873 4D AGTGTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 30 10 15 7 TG 9 7 108605 CASAVA_Build 6 38079257 1D ATCCATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2002 hom 24 6 9 10 T 13 12 108606 CASAVA_Build 6 38091859 3I TTCCTTAGAC ---/AGT AGTAGTTCAG 3070 het 3070 hom 49 25 22 2 AGT 2 3 108607 CASAVA_Build 6 38104186 1D TCACATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 T 11 10 108608 CASAVA_Build 6 38105806 34D GTTCTGCTGG ATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------- ATATATATAT 3070 het 444 hom 14 1 8 5 AT 25 8 108609 CASAVA_Build 6 38147891 4D ATTTTCTGTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 187 hom 41 5 28 9 TC 12 10 108610 CASAVA_Build 6 38151954 1I ATCATTAGCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 8 9 108611 CASAVA_Build 6 38204433 4D CATTTATGGC TGAG/---- TATTACTCCA 3070 het 3070 hom 36 16 19 6 TGAG 1 0 108612 CASAVA_Build 6 38205558 1D ATATGTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 12 11 108613 CASAVA_Build 6 38221918 2D GTTCCATGTG CC/-- CCCTCGCGAT 3070 het 3070 ref 49 26 13 10 C 5 3 108614 CASAVA_Build 6 38235882 3I ATTCGCTCTT ---/GTC AGGAACACGC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 GTC 0 1 108615 CASAVA_Build 6 38245238 4I GGCAGCAGAC ----/AGAT GGACTAATAT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 AGAT 0 1 108616 CASAVA_Build 6 38251311 6D AGGAGTTGAC TGGTGG/------ TGGTGGTGGT 2989 het 2989 ref 33 19 10 10 TGG 7 5 108617 CASAVA_Build 6 38256312 2I AAGTCCTGAG --/TC TCTCTTTGCT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 TC 2 3 108618 CASAVA_Build 6 38258672 1I TTTTCCTCTC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 T 7 8 108619 CASAVA_Build 6 38265428 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 12 11 108620 CASAVA_Build 6 38269496 1I GCCAGCTGCT -/G GGAAGCTGTT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 G 2 3 108621 CASAVA_Build 6 38284240 3I GGAATTACTG ---/TGT TTTAACAGCC 3070 het 3070 hom 54 22 23 9 TGT 0 1 108622 CASAVA_Build 6 38287498 1I ATTCTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 13 21 11 A 10 11 108623 CASAVA_Build 6 38319200 1D AGCAACAGAC G/- TAGAGTATAG 3070 het 3070 ref 52 28 22 3 G 1 0 108624 CASAVA_Build 6 38322910 1D AAGAAGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 13 12 108625 CASAVA_Build 6 38354915 3D GAGGCAAGAA GAG/--- GAGATGAAAG 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 GAG 2 1 108626 CASAVA_Build 6 38355212 2D CTTAAATGAC TG/-- TGACCCTTCA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 TG 2 1 108627 CASAVA_Build 6 38364015 1I AATGAGGAGG -/A AATCTTCTTA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 2 3 108628 CASAVA_Build 6 38397577 2D CTTGTTTTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 83 het 40 0 27 14 AC 10 9 108629 CASAVA_Build 6 38405808 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 49 hom 20 2 17 1 T 9 10 108630 CASAVA_Build 6 38428131 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1799 het 1799 ref 30 18 4 8 A 12 11 108631 CASAVA_Build 6 38433441 6D GGGTACAACC ACTGAG/------ ACTGTCTGGT 3070 het 3070 ref 27 15 10 4 ACTGAG 1 0 108632 CASAVA_Build 6 38436570 3D AACAGGATGG AAC/--- AACAAGATAA 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 AAC 2 1 108633 CASAVA_Build 6 38466620 4D AGTCAACATC TTTA/---- CTTAGCAAAA 3070 het 3070 ref 52 28 18 10 TTTA 1 0 108634 CASAVA_Build 6 38468296 1D TGTTAGGCAG T/- TTACATAAGC 3070 het 3070 hom 53 19 32 3 T 3 2 108635 CASAVA_Build 6 38496824 14I AATAAAAATG --------------/TTTTAGAAAACAGT TATAGGGCTG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 TTTTAGAAAACAGT 0 1 108636 CASAVA_Build 6 38504111 2D TACACAACTC TA/-- TGTTAGCATG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 TA 1 0 108637 CASAVA_Build 6 38533235 1I GAAGAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 13 17 10 T 13 14 108638 CASAVA_Build 6 38577561 3I CCAGACATTA ---/AGG AGATTTGCAA 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 AGG 0 1 108639 CASAVA_Build 6 38586292 1I CTTCAGTAGT -/A AATTAAACTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 2 3 108640 CASAVA_Build 6 38589202 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1838 het 1838 ref 24 16 4 5 A 12 11 108641 CASAVA_Build 6 38590270 1I TATGAGAATG -/A AACATGAACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 2 3 108642 CASAVA_Build 6 38591880 12D CACCTTAATC AGCCCTACAAGT/------------ AGCCTCACCT 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 AGCCCTACAAGT 1 0 108643 CASAVA_Build 6 38596544 1D AAATAAAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 2048 hom 17 6 9 2 T 3 2 108644 CASAVA_Build 6 38598117 14I CAAATTAAAG --------------/TCCCACAACATGGT TCCCTATACT 3070 het 3070 ref 46 22 22 3 TCCCACAACATGGT 0 1 108645 CASAVA_Build 6 38600407 6D TATCCATTTA GAAACT/------ GAAACTGGTT 3070 het 3070 ref 43 22 18 5 GAAACT 2 1 108646 CASAVA_Build 6 38611798 7D AACAATCAAC AAAGTGA/------- AGAAACAACT 3070 het 3070 hom 34 15 17 6 AAAGTGA 1 0 108647 CASAVA_Build 6 38614538 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 25 1 13 11 T 12 11 108648 CASAVA_Build 6 38616065 2I AACACACACG --/GT GTGGAGGTAT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 GT 1 2 108649 CASAVA_Build 6 38618987 1D CTCTGACCAC A/- GAGGTATTCC 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 1 0 108650 CASAVA_Build 6 38623187 5I CTGTCTCAAA -----/AAAAT AAAATAAGAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 AAAAT 1 2 108651 CASAVA_Build 6 38624351 1I AAAATATCTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 53 28 21 4 T 8 9 108652 CASAVA_Build 6 38626077 2I TTCTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2471 hom 22 het 20 0 11 9 T 12 14 108653 CASAVA_Build 6 38626880 4I TCTTCCCTGC ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 TTTA 2 3 108654 CASAVA_Build 6 38633538 1I TTACAAATAA -/G GGGGGGTAAA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 G 6 7 108655 CASAVA_Build 6 38647242 2D GTATCTATTG AC/-- ACCAGGAATG 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 AC 2 1 108656 CASAVA_Build 6 38648519 1D TATAAGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 14 8 A 12 11 108657 CASAVA_Build 6 38652107 9D GCTAGACCTG AGACACTTT/--------- AGTCTGTCTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 8 AGACACTTT 1 0 108658 CASAVA_Build 6 38664029 4D ACTGCCTGCT CAGC/---- TGCCACACAG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 CAGC 1 0 108659 CASAVA_Build 6 38678183 4D AAAAAAATCT TAAG/---- TATGTGTATT 3070 het 2190 hom 26 7 15 7 TAAG 1 0 108660 CASAVA_Build 6 38682246 4D AAAGTGACCT TTGA/---- TTATTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 4 TTGA 1 0 108661 CASAVA_Build 6 38683524 1I CTCCCAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 32 0 23 9 A 11 12 108662 CASAVA_Build 6 38731861 1I CTCTTACTCG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 60 het 21 0 20 1 T 7 8 108663 CASAVA_Build 6 38740730 2D TTTAAATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 19 10 T 14 12 108664 CASAVA_Build 6 38742192 4D CTGTCTCATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 33 1 15 21 A 20 16 108665 CASAVA_Build 6 38744877 1I TAAAATAGAG -/A AAAAATTCCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 5 6 108666 CASAVA_Build 6 38747987 2D GAGCATAACT CC/-- CCCCAGCCAG 3070 hom 114 het 46 0 43 8 C 6 4 108667 CASAVA_Build 6 38749955 1D ATGACAGGAT G/- GGAAAGATGG 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 G 3 2 108668 CASAVA_Build 6 38754775 1D GCTCAGAGGC A/- AAAAATAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 6 5 108669 CASAVA_Build 6 38766483 2I TATACGTGGC --/AA AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 A 7 9 108670 CASAVA_Build 6 38767499 1D AGTAAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 13 12 108671 CASAVA_Build 6 38767843 1I GTCTCTGTCT -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 6 7 108672 CASAVA_Build 6 38777121 12I ATTTTATGTC ------------/TCCACGTGGTAT TCCCATGGCC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TCCACGTGGTAT 0 1 108673 CASAVA_Build 6 38781638 1D AGACAGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 35 1 18 16 A 14 13 108674 CASAVA_Build 6 38784593 1I TCACCGCACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2652 hom 23 9 10 4 T 8 9 108675 CASAVA_Build 6 38796603 1D GATAACACAC A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 A 8 7 108676 CASAVA_Build 6 38799307 3D TCATAAACAG CAA/--- CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 CAA 5 4 108677 CASAVA_Build 6 38808995 11D5M3I11M1I GCTGCAAATA GAAGGCTGTTGATTTT---TGCAAATTAAT-/-----------ATTTTTAATGCACAGTCATG ATTGTGACCA 3070 het 3070 ref 28 20 15 0 N/A 0 0 108678 CASAVA_Build 6 38809874 1I CGTCTCTAAG -/A AAAAAATAAA 2232 het 2232 ref 13 7 6 0 A 6 7 108679 CASAVA_Build 6 38810081 1D TTCTAGTAGA C/- CCCCCCCCAA 2268 het 82 hom 14 2 5 7 C 9 8 108680 CASAVA_Build 6 38812468 1D TTTTCACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 12 11 108681 CASAVA_Build 6 38817217 1D CCCCCCGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2953 hom 37 13 16 9 A 11 10 108682 CASAVA_Build 6 38818545 1I TTCTATTTTA -/C TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 0 1 108683 CASAVA_Build 6 38823139 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1862 hom 29 13 11 5 T 20 18 108684 CASAVA_Build 6 38828365 29D TAGGTTTCAT CCCAGAGGCAGGGAGAAGGAAAGAGGTTA/----------------------------- TGGCCTATAT 3070 het 3070 hom 32 12 21 4 CCCAGAGGCAGGGAGAAGGAAAGAGGTTA 1 0 108685 CASAVA_Build 6 38836215 1I AATCTCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 11 12 108686 CASAVA_Build 6 38836820 1I TTGCTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 1408 het 1277 hom 11 4 3 4 T 10 11 108687 CASAVA_Build 6 38839130 1D AATACAGAAG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 A 8 7 108688 CASAVA_Build 6 38840548 1I TATTTGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 9 9 7 T 10 11 108689 CASAVA_Build 6 38843195 1I CCATCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 25 0 12 13 A 13 14 108690 CASAVA_Build 6 38844327 1D CCTGTTTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2827 hom 23 7 14 4 A 10 9 108691 CASAVA_Build 6 38845256 3D CTGAATATTT ATA/--- GGAATCACTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 ATA 1 0 108692 CASAVA_Build 6 38845929 1D TAATTGTCAT G/- AAAATGTAAA 3034 het 3034 ref 41 27 7 7 G 1 0 108693 CASAVA_Build 6 38846044 1I TGGTATAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 9 10 108694 CASAVA_Build 6 38847521 2I CGGATAATAT --/CA CAGTTTATTT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 CA 1 2 108695 CASAVA_Build 6 38848607 1D TGGGGTCCTG T/- TTGTGTTACT 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 T 3 2 108696 CASAVA_Build 6 38849009 6D GGGTCTCAGT TACCCC/------ TACCCCTATT 1843 het 1843 ref 26 11 6 11 TACCCC 2 1 108697 CASAVA_Build 6 38853059 1D TTTATGATTT A/- TTAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 1 0 108698 CASAVA_Build 6 38857179 14D TTTAATATAA CAAATATATCATAT/-------------- CCTATAATAT 2619 het 2619 ref 28 22 7 5 CAAATATATCATAT 1 0 108699 CASAVA_Build 6 38862766 2D AAAAAATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TA 8 7 108700 CASAVA_Build 6 38869156 4I CTCTATCATT ----/ATTG ATTAAGTTTT 3070 het 3070 ref 44 26 15 4 ATTG 0 1 108701 CASAVA_Build 6 38870623 2I TTCTTGTAAA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 9 11 108702 CASAVA_Build 6 38871270 1D GGAGGCGGAG C/- TTGCAGTGAG 1482 hom 10 het 5 0 4 1 C 1 0 108703 CASAVA_Build 6 38875489 1D CAAAAGAAAC T/- TCGTCCTCAT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 2 1 108704 CASAVA_Build 6 38876172 1D ATTATTTGTC T/- TTTTGGTGAC 3070 het 3070 ref 42 21 19 3 T 5 4 108705 CASAVA_Build 6 38883546 1D AATTTATTAA T/- TAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 T 2 1 108706 CASAVA_Build 6 38888493 1D CTTGAAGATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 53 19 30 5 A 10 9 108707 CASAVA_Build 6 38892340 1D TTTATATTCC T/- TCGGGTATAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 2 1 108708 CASAVA_Build 6 38897971 1D TGGATCTGCC T/- AGTTTTCAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 0 108709 CASAVA_Build 6 38914161 1D CCTTGCCTTC T/- TTTTTTTTTG 2732 het 2732 ref 27 10 9 9 T 10 9 108710 CASAVA_Build 6 38921853 5I TTTGTTCCTC -----/TGATT TGACATCATT 3070 hom 87 het 30 0 26 4 TGATT 0 1 108711 CASAVA_Build 6 38925863 1I AATTCAAATG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 9 108712 CASAVA_Build 6 38929971 14D TGCAACTAAT GTTTAGAAAGTGAA/-------------- GACCTCAAAG 3070 hom 135 het 47 0 46 5 GTTTAGAAAGTGAA 1 0 108713 CASAVA_Build 6 38936403 1I CCAGTTTTCG -/T TTTTTTATTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 6 7 108714 CASAVA_Build 6 38938985 2I CGGGAGTTCA --/AG ACCATCCTGG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AG 0 1 108715 CASAVA_Build 6 38939090 3I AGGCTGAGCT ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 AGG 0 1 108716 CASAVA_Build 6 38940000 1D TTTTTCAATT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 A 8 7 108717 CASAVA_Build 6 38952114 1D AGAGCCCAGG C/- CCTGATTCTT 3070 hom 86 het 31 0 26 5 C 3 2 108718 CASAVA_Build 6 38953156 1D GACAATGATG T/- TTTCTTATTT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 4 3 108719 CASAVA_Build 6 38955479 1I CCAGTGCAGT -/G GGGGGGCAAA 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 G 6 7 108720 CASAVA_Build 6 38956885 1D GCCGTAATAG A/- GCACCTAGAG 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 A 1 0 108721 CASAVA_Build 6 38957927 1D GAACTTAAAC T/- TAGACCTACC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 2 1 108722 CASAVA_Build 6 38965652 1D TATTCATATT C/- CTCTGAGAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 2 1 108723 CASAVA_Build 6 38991608 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 84 het 34 0 28 7 AC 7 6 108724 CASAVA_Build 6 38992989 1D AATCCCAAAT A/- TAGACTATCA 3070 het 3070 hom 43 14 24 6 A 1 0 108725 CASAVA_Build 6 39006176 6I TCATTAAATA ------/TTTAAT AAGACAGATT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 TTTAAT 0 1 108726 CASAVA_Build 6 39012972 1D GTAGGGGTCT G/- GGGGGAGGGA 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 G 6 5 108727 CASAVA_Build 6 39013109 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 36 1 30 5 A 11 10 108728 CASAVA_Build 6 39022569 1D GTCTTGGGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 13 11 9 A 9 8 108729 CASAVA_Build 6 39036174 1D ACTCAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 39 1 29 9 A 14 13 108730 CASAVA_Build 6 39047227 1I ACAGCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 2642 het 2642 ref 38 17 10 11 T 15 16 108731 CASAVA_Build 6 39048348 2I GGTGCAAAAC --/TT TTTAATTTAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 3 5 108732 CASAVA_Build 6 39056506 3D GAGCTACTCC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 TAT 6 5 108733 CASAVA_Build 6 39062329 1D TTCAAAGGAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 9 8 108734 CASAVA_Build 6 39069440 1D ATCTATTGTG T/- TGTGTCTTGC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 2 1 108735 CASAVA_Build 6 39072442 1D CAGGTCTCAA G/- GGGGGACTGA 3070 het 3070 ref 51 25 14 13 G 6 5 108736 CASAVA_Build 6 39075689 4I ACACACACAA ----/ACAC ACACACACAC 2232 hom 26 het 24 0 10 14 AC 7 9 108737 CASAVA_Build 6 39085905 2I CAGCAGAAAC --/TG AGCATCAGGG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 TG 0 1 108738 CASAVA_Build 6 39092005 1I AAATGGCTTT -/A AAATAAAAAA 2609 het 1398 hom 17 5 7 5 A 3 4 108739 CASAVA_Build 6 39092305 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1706 het 334 hom 13 2 7 5 A 15 14 108740 CASAVA_Build 6 39097090 1D CTTTTAGTAC A/- TCCCCCTCCT 3070 het 3070 hom 28 13 10 6 A 1 0 108741 CASAVA_Build 6 39101614 1D GTTTAGGATA T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 7 6 108742 CASAVA_Build 6 39119003 19D ACCCGCAGCA GGGAAGATAGAGGGCTGTG/------------------- GGGAATAACA 3070 hom 93 het 31 0 30 9 GGGAAGATAGAGGGCTGTG 1 0 108743 CASAVA_Build 6 39120415 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 27 3 A 10 9 108744 CASAVA_Build 6 39124074 1I TAATCCTGGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 69 het 25 0 22 3 A 8 9 108745 CASAVA_Build 6 39139948 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGTTTCAC 3070 het 1192 hom 14 3 9 3 G 4 5 108746 CASAVA_Build 6 39145323 2I1M7D GGAGGCGGAG --TGAGCAGA/CTT------- GCAGTGAGCA 1323 het 1323 ref 11 8 3 3 N/A 0 0 108747 CASAVA_Build 6 39146733 1I AGCAGTTGAT -/A AACAGTTAAT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 2 3 108748 CASAVA_Build 6 39155937 4D AAAACTGGTC CCTG/---- CCTGCCCCTC 3070 het 3070 ref 35 18 14 7 CCTG 2 1 108749 CASAVA_Build 6 39156894 1D CACATCCCTC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 9 8 108750 CASAVA_Build 6 39167158 1I CCAGCCAAGG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 A 7 8 108751 CASAVA_Build 6 39168100 2I CAGACTCATT --/CA CATCCTCACA 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 CA 1 2 108752 CASAVA_Build 6 39182304 1I AACCACTGTT -/A ACAGCCATTA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 1 2 108753 CASAVA_Build 6 39239292 3I AGACGGAGGC ---/AGA AGGAGATTTG 3070 hom 111 het 46 0 37 9 AGA 0 1 108754 CASAVA_Build 6 39241175 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 T 10 9 108755 CASAVA_Build 6 39241356 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 16 10 T 12 11 108756 CASAVA_Build 6 39268875 18D AGAAGAGAAA GCTGAGGCAGGGTTTGGT/------------------ GTCTTGCTGG 3070 hom 99 het 30 0 33 3 GCTGAGGCAGGGTTTGGT 1 0 108757 CASAVA_Build 6 39299841 2I AGACTAAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 14 16 108758 CASAVA_Build 6 39308372 1I ACATGGCTCC -/T TTTTTTTTTT 1865 het 1827 hom 31 9 9 13 T 13 14 108759 CASAVA_Build 6 39309220 1I TAAGAACCTT -/G GTCTTTACAA 3070 hom 81 het 28 0 27 1 G 1 2 108760 CASAVA_Build 6 39321935 1I GCGTGAGCCA -/C CGTGCCCGGC 3070 hom 32 het 14 0 11 3 C 1 2 108761 CASAVA_Build 6 39324474 1I TATTATGGGA -/G GGGGACTGGT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 G 4 5 108762 CASAVA_Build 6 39330233 1D CTACTATAAG A/- AAAAACCTTC 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 A 6 5 108763 CASAVA_Build 6 39344925 1D TTTTTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2049 hom 26 7 17 2 A 12 11 108764 CASAVA_Build 6 39347215 1I ATGGCAGTTT -/G GGGAACTGCA 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 G 3 4 108765 CASAVA_Build 6 39349913 1I GATTGCCTGG -/T CGTGAGGTGT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 0 1 108766 CASAVA_Build 6 39351751 2I CAGGAAGATG --/CC CACAGACCAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 C 1 3 108767 CASAVA_Build 6 39353225 1D TGTCAAGAGT G/- GGACCTGGTG 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 G 3 2 108768 CASAVA_Build 6 39354279 4I GGCTGAATGT ----/CATC CATCATCTTA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 CATC 1 2 108769 CASAVA_Build 6 39367473 1I GTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1396 hom 20 7 8 5 T 10 11 108770 CASAVA_Build 6 39480177 1D TTGCTTGTTG A/- AAAAAACCCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 6 108771 CASAVA_Build 6 39486803 2D CCAGTCAAAT TC/-- TCTTTCTCAT 3070 hom 124 het 47 0 42 6 TC 2 1 108772 CASAVA_Build 6 39488726 1I CTTATTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 10 11 108773 CASAVA_Build 6 39493497 1D ACTCAGAGTG A/- AAAAACTAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 6 5 108774 CASAVA_Build 6 39493756 1I CTTCCTCTTT -/C CCCTCCTTCT 3070 hom 66 het 31 0 20 11 C 3 4 108775 CASAVA_Build 6 39501428 1D TTTGAGTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 26 1 17 9 T 13 12 108776 CASAVA_Build 6 39507712 1D TATAGAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 45 2 27 17 T 13 12 108777 CASAVA_Build 6 39513716 4D TTTACTATAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TTTA 4 3 108778 CASAVA_Build 6 39527973 3D ATGACAGGAA GAG/--- GAGAAGGAAG 3070 hom 116 het 44 0 36 11 GAG 2 1 108779 CASAVA_Build 6 39548636 26D TTTTTTGAGA TGGAGTTTCACTCTTGCTGCCCAGGC/-------------------------- TGGAGTTTCA 3070 hom 32 het 16 0 10 14 TGGAGTTTCACTCTTGCTGCCCAGGC 1 0 108780 CASAVA_Build 6 39573357 3D AAACCTGGTC CAT/--- ACATTACAAC 3070 het 3070 ref 54 29 23 3 CAT 1 0 108781 CASAVA_Build 6 39590529 1I GGCTTTTTTT -/C CCCCCCCGGG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 C 7 8 108782 CASAVA_Build 6 39602544 1D GAGAAGTCAA T/- GGTCCATTTA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 T 1 0 108783 CASAVA_Build 6 39619374 1I TTGGTAATTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 A 7 8 108784 CASAVA_Build 6 39632422 1I GGAAGGTGGG -/A AAAGGTGGGA 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 A 3 4 108785 CASAVA_Build 6 39635584 1D GTGGTACTTT A/- AAAAAAAAAA 1244 het 1244 ref 40 27 3 11 A 13 12 108786 CASAVA_Build 6 39640874 1D GTAGGCTTGC T/- TTGACATTGC 3070 het 3070 ref 42 27 10 6 T 3 2 108787 CASAVA_Build 6 39640969 3I GATAATTTTG ---/TTT CAGTAAGTTC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 0 3 108788 CASAVA_Build 6 39669964 1D TTATAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2473 hom 23 9 9 5 A 13 12 108789 CASAVA_Build 6 39685242 9D TACAGCTGCC AGTACACAG/--------- TACAACAAAC 3070 het 3070 ref 46 29 14 6 AGTACACAG 1 0 108790 CASAVA_Build 6 39707937 1D AATGTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 10 9 108791 CASAVA_Build 6 39719915 1D TGGCTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 19 18 15 A 11 10 108792 CASAVA_Build 6 39721935 1I TCAGAGAGGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1569 hom 11 4 7 0 A 9 10 108793 CASAVA_Build 6 39728282 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 A 12 11 108794 CASAVA_Build 6 39743865 1I CTCACCAAAA -/G GCAGATGCCG 3070 het 3070 hom 51 20 22 9 G 1 2 108795 CASAVA_Build 6 39751368 1D AAGAACACAA T/- TCCACCATAA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 T 2 1 108796 CASAVA_Build 6 39751817 2I GGAAATATGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 26 1 20 5 A 12 14 108797 CASAVA_Build 6 39752074 1D GATGGAATCG T/- TATCTTCAAC 3070 hom 117 het 43 0 40 5 T 2 1 108798 CASAVA_Build 6 39757732 1I AATGCTCATC -/G GGGGGAAATA 3070 hom 95 het 39 0 32 7 G 5 6 108799 CASAVA_Build 6 39758629 1I ACCGCGCCAG -/C CGTGACTAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 1 2 108800 CASAVA_Build 6 39762239 9I TAAGTCTTAA ---------/ATACAACCC ATACAACCCA 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 ATACAACCC 1 2 108801 CASAVA_Build 6 39769880 1I CCTTCATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 856 hom 25 2 17 6 A 11 12 108802 CASAVA_Build 6 39778652 3I AAATGTCATT ---/TAG TGCATGCAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TAG 0 1 108803 CASAVA_Build 6 39790735 1D TTTGACAAGA T/- CTGCACAATA 3070 het 3070 hom 41 15 18 10 T 1 0 108804 CASAVA_Build 6 39792040 20I TTAAATTAAA --------------------/CTAAAATGTAATTTTAGTAT AATATCTATA 3070 hom 102 het 36 0 35 3 CTAAAATGTAATTTTAGTAT 0 1 108805 CASAVA_Build 6 39794337 2I AGTCTCTACC --/AA AAAAAAAAAA 1692 hom 25 het 17 0 8 9 A 13 15 108806 CASAVA_Build 6 39803881 1I TCCATATATA -/T ATTGAATTAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 0 1 108807 CASAVA_Build 6 39805074 1I GCAATTGCAC -/T TTACCAAGAG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 2 3 108808 CASAVA_Build 6 39806190 1D TGTTTTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 10 9 108809 CASAVA_Build 6 39808639 1I GCACGCCGTG -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 64 22 26 16 T 6 7 108810 CASAVA_Build 6 39826539 2D TTTTGATATG GC/-- ATATAAAGAG 3070 het 3070 hom 51 23 27 1 GC 1 0 108811 CASAVA_Build 6 39832253 1D CTCATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 46 1 30 15 T 15 14 108812 CASAVA_Build 6 39836605 1D AGAATGCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 T 11 10 108813 CASAVA_Build 6 39836880 1I TCTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2373 hom 30 5 19 6 T 12 13 108814 CASAVA_Build 6 39839078 2D ACTTCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1248 het 110 hom 24 2 8 14 A 18 16 108815 CASAVA_Build 6 39842019 1I GCGGCTTTTT -/A CTTCATTACA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 0 1 108816 CASAVA_Build 6 39858563 4I ATACACAAAT ----/GTTA GTTGTGTCAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 GTTA 0 1 108817 CASAVA_Build 6 39859077 1D CGTTTTGCTA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 6 108818 CASAVA_Build 6 39872401 1D AAAAACCTGT A/- AAAAAAAAAT 1908 hom 27 het 25 0 10 15 A 10 9 108819 CASAVA_Build 6 39874626 1D TCTGTCATCA C/- ATTGAACACA 3070 hom 150 het 57 0 49 8 C 1 0 108820 CASAVA_Build 6 39881312 1D CCTAAGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 616 hom 36 2 22 12 T 15 14 108821 CASAVA_Build 6 39883830 2D GTTTTTGACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 32 2 18 12 T 16 14 108822 CASAVA_Build 6 39888372 3D CAGCCTTCTA TTC/--- TTAGTGTGGA 3070 hom 50 het 28 0 15 16 TTC 1 0 108823 CASAVA_Build 6 39889943 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 540 hom 22 2 16 4 T 13 12 108824 CASAVA_Build 6 39903018 1I TGGGCCTCAG -/C TTTCTCGCCT 3070 hom 114 het 46 0 37 9 C 0 1 108825 CASAVA_Build 6 39903599 3I CTTGGGTCAT ---/CTC CTTGCCAGCT 3070 hom 63 het 25 0 18 7 CTC 0 1 108826 CASAVA_Build 6 39921109 6D7M2D4M3D11M4D TCCCATACAC ATCACACATGCACAAACATACACATATACACACACCA/------CACGCAC--ACAT---CACATACACAC---- CACATACACA 814 het 814 ref 34 42 3 13 N/A 0 0 108827 CASAVA_Build 6 39948588 1I TCCCTTCCCT -/G AGTTTGGATC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 G 0 1 108828 CASAVA_Build 6 39956994 1D AGACTGGAGA G/- TGTGGGTTTG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 1 0 108829 CASAVA_Build 6 39958458 10D TCTGTGAGCG CACACACACA/---------- CACACGCACA 3070 hom 100 het 35 0 28 10 CA 7 2 108830 CASAVA_Build 6 39961101 1I AGGAACTCTT -/A TGAGCACTGG 2931 hom 23 het 25 0 11 15 A 0 1 108831 CASAVA_Build 6 39961137 1D CTCCACGAGT G/- GGGTTGAGGA 3070 hom 22 het 20 0 16 4 G 4 3 108832 CASAVA_Build 6 39965880 1I AGACTCCATC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 9 10 108833 CASAVA_Build 6 39974784 9I GGGGCAAAAA ---------/ACAATGGGC ACAATGGGTA 3070 hom 129 het 52 0 39 13 ACAATGGGC 0 1 108834 CASAVA_Build 6 39976501 1D TGAAGCACAC T/- TTTGAGTAGT 3070 hom 132 het 48 0 44 5 T 4 3 108835 CASAVA_Build 6 39995240 1D AAACAGCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 14 13 108836 CASAVA_Build 6 39997120 1D GACTACGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 40 0 34 6 A 15 14 108837 CASAVA_Build 6 40006263 1I GTAATCATTT -/C CCCGGCTGGT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 C 3 4 108838 CASAVA_Build 6 40007115 1I TCTAAGTATC -/A GTGGCCCTGA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 0 1 108839 CASAVA_Build 6 40038856 4I GTTTTGAGAA ----/AGTT AGCCAAGCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AGTT 0 1 108840 CASAVA_Build 6 40061520 4I ATGGGCAAAT ----/GTAA GTGTTTCCCT 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 GTAA 0 1 108841 CASAVA_Build 6 40063926 1D CCTGGAGTGC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 8 7 108842 CASAVA_Build 6 40088467 7D4M7I ATAGATGTAC TCCCCAAATAT-------/-------ATATTTGGGGA GTACATGTGA 3070 het 3070 ref 59 28 28 8 N/A 0 0 108843 CASAVA_Build 6 40092106 4I CCTGCACAAG ----/CTCT CTCTTTGCCT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 CT 2 4 108844 CASAVA_Build 6 40097700 4I AATATACTTA ----/AAAT ATAGTTACAC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 AAAT 0 1 108845 CASAVA_Build 6 40107860 1I CAAGCACCTT -/C CCCGCCTCCA 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 C 3 4 108846 CASAVA_Build 6 40108554 1D CTTGGTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 13 12 108847 CASAVA_Build 6 40120919 4I AAAAATAAGT ----/TGTG TTTCCATACA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 TG 0 2 108848 CASAVA_Build 6 40127503 5D CACTTTCCTA CAGGT/----- CAGGTTGAAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CAGGT 2 1 108849 CASAVA_Build 6 40144049 2D AGTGAGACCC CT/-- GTCTCAGAAA 3070 het 3070 hom 48 15 21 13 CT 1 0 108850 CASAVA_Build 6 40146056 1I ACCCAGGAGC -/A ATACAATCTC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 1 2 108851 CASAVA_Build 6 40149758 1I GCTCATATCC -/A ATATTCCCTG 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 A 1 2 108852 CASAVA_Build 6 40162012 1D CAAGAAATTA T/- TGGGGCCAAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 T 2 1 108853 CASAVA_Build 6 40172559 2D ATTGACTAAC AT/-- ATTCTGTTCT 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 AT 2 1 108854 CASAVA_Build 6 40173239 1D GACACTTCAC T/- GGTCTAATCC 3070 het 3070 ref 55 23 21 12 T 1 0 108855 CASAVA_Build 6 40173442 4D AAGGCAACTG TCTT/---- TCTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 53 25 25 6 TCTT 2 1 108856 CASAVA_Build 6 40177528 6D TAGTTCTCTC TCTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 2915 hom 32 14 11 7 TCTTTT 1 0 108857 CASAVA_Build 6 40180213 1D CCCTTAGGAT A/- ATGGTACCAG 3070 het 3070 hom 59 21 36 2 A 2 1 108858 CASAVA_Build 6 40181059 4D TTACCAAGGC CAGT/---- AAGTATGTGC 3070 het 3070 hom 43 15 27 2 CAGT 1 0 108859 CASAVA_Build 6 40186337 2I GCTACCCTAT --/GC GCCCTAGGTA 3070 het 3070 ref 58 35 20 3 GC 1 2 108860 CASAVA_Build 6 40194875 21I CCTTGTGATA ---------------------/AACTACCATCCATGACAGATG AAACAAGAAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AACTACCATCCATGACAGATG 0 1 108861 CASAVA_Build 6 40201584 7D TGCTGTTGCT ACATTAC/------- AGCTCCGTTA 3070 het 3070 hom 64 31 34 6 ACATTAC 1 0 108862 CASAVA_Build 6 40209638 2D GGTGCAGAAA AG/-- AGAGGAGTCC 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 AG 3 2 108863 CASAVA_Build 6 40217862 1I GAAAGTGTAC -/A AAGTAGACTA 3070 het 3070 hom 57 22 24 11 A 2 3 108864 CASAVA_Build 6 40218186 1D ATCAAGACAG T/- TTTTATCATG 3070 het 3070 ref 46 28 16 2 T 5 4 108865 CASAVA_Build 6 40220125 1I GAACACTTCT -/G GGAAAGGACA 3070 het 3070 hom 59 25 27 7 G 2 3 108866 CASAVA_Build 6 40224101 1I ATGACCCCTA -/G GTCCATCCCT 3070 het 3070 hom 58 23 30 5 G 1 2 108867 CASAVA_Build 6 40226879 5I CTTGAATCTG -----/TTTTA TAAGCTTCCT 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 TTTTA 0 1 108868 CASAVA_Build 6 40229293 2D GGGAACTAAG AT/-- AACCATCCTA 3070 het 3070 ref 54 27 22 9 AT 1 0 108869 CASAVA_Build 6 40229972 1D TTCCACTTAT A/- AGCTTTGTCT 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 A 2 1 108870 CASAVA_Build 6 40232570 2D TAGACTTGAG CA/-- CACAGACATA 3070 het 3070 hom 63 28 31 4 CA 3 2 108871 CASAVA_Build 6 40233585 2D AAGTAAAAAG AA/-- AAAAACTGAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 4 A 7 5 108872 CASAVA_Build 6 40235458 1I AGAAGTCAGT -/A AAGGTTGATG 3070 het 3070 hom 52 25 24 3 A 2 3 108873 CASAVA_Build 6 40236497 1I GCCATATAAG -/C CCCCCTTTTC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 C 5 6 108874 CASAVA_Build 6 40237278 2D TGTGAGCTTC AT/-- ATTTGAGCTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 AT 2 1 108875 CASAVA_Build 6 40237777 1D TCCATGCCTT A/- AAGAAAGGAC 3070 het 3070 hom 67 26 34 8 A 3 2 108876 CASAVA_Build 6 40239125 1D GTTTAAGAGA T/- TTTTGGCAGA 3070 hom 81 het 30 0 27 5 T 5 4 108877 CASAVA_Build 6 40239734 4I AAGTAAGGAG ----/ACAA ACAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 ACAA 1 2 108878 CASAVA_Build 6 40240033 1D CCCCGCCCTG C/- CCCCCACCTC 2230 het 2230 ref 16 9 6 1 C 6 5 108879 CASAVA_Build 6 40250099 2D GCCTTACCCA AG/-- AGAATAAGGC 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 AG 2 1 108880 CASAVA_Build 6 40254518 1D ACTGCCTTGG A/- AAAGTTACTC 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 A 4 3 108881 CASAVA_Build 6 40254888 5D CAGTTGTTAA TAAAT/----- TAAACATTGA 3070 het 3070 hom 43 16 24 7 TAAAT 1 0 108882 CASAVA_Build 6 40257437 1D AGTAGGATTA G/- GGATAACTGA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 G 3 2 108883 CASAVA_Build 6 40285929 1I CCTTAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 10 11 108884 CASAVA_Build 6 40288792 1I CTATACTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 35 0 22 13 T 13 14 108885 CASAVA_Build 6 40308684 1I GCAGATTGAA -/G GGGGTTTCTG 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 G 4 5 108886 CASAVA_Build 6 40309418 1D GTCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2313 het 957 hom 15 4 7 4 T 11 10 108887 CASAVA_Build 6 40314486 1D ATCCATGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 19 5 T 12 11 108888 CASAVA_Build 6 40315975 1D AAGCAAGAAG A/- AAAAAAGCTG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 7 6 108889 CASAVA_Build 6 40327610 13I CAGCTTCCCC -------------/AACCGTAAAGTGA AACCCATGAT 3070 hom 190 het 67 0 64 3 AACCGTAAAGTGA 0 1 108890 CASAVA_Build 6 40341549 4I CTGCAGATCT ----/GGTG GGTGGGGGTC 3070 het 3070 hom 43 15 16 12 GGTG 1 2 108891 CASAVA_Build 6 40354780 1D AACAAAATTA T/- TTTTACCATC 3070 het 3070 hom 30 10 15 6 T 5 4 108892 CASAVA_Build 6 40356489 1I AAAAATACGC -/A AAAATTAGCT 3070 het 2030 hom 25 7 14 4 A 4 5 108893 CASAVA_Build 6 40361663 1D TGACTGGGAC G/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 G 1 0 108894 CASAVA_Build 6 40363147 5D TGATGCCCTT ATAAG/----- AGAGGAAGAT 3070 het 3070 hom 49 24 22 5 ATAAG 1 0 108895 CASAVA_Build 6 40365070 2I ATACACACAC --/AT ACACACACAT 3070 hom 229 het 88 0 75 13 AT 0 1 108896 CASAVA_Build 6 40365216 2I ACACACAAAC --/AT GTGCATGCAC 3070 hom 252 het 93 0 84 9 AT 0 1 108897 CASAVA_Build 6 40374635 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1496 het 282 hom 7 1 5 1 A 15 16 108898 CASAVA_Build 6 40383892 4D CAGGGAAGAT AATC/---- AATCTTCAAG 3070 het 3070 hom 35 11 21 4 AATC 2 1 108899 CASAVA_Build 6 40409601 4D TTGTCTGACA CTCT/---- CTCTGTCTGT 2683 het 2683 ref 30 14 11 7 CT 4 2 108900 CASAVA_Build 6 40426057 2D ACTTACACAC AT/-- ATGCACTGAC 3070 het 3070 hom 94 35 52 11 AT 2 1 108901 CASAVA_Build 6 40426151 2D CACTGACACA CT/-- CTCACATACC 3070 het 3070 hom 85 36 40 11 CT 2 1 108902 CASAVA_Build 6 40426556 2D GCACACACTG AC/-- ACACACAGGC 3070 het 3070 ref 101 50 25 26 AC 4 3 108903 CASAVA_Build 6 40426592 1I TGACACACAT -/A ATGCATATGC 2894 het 2894 ref 87 38 12 37 A 1 2 108904 CASAVA_Build 6 40426636 2D ATACACACTG AC/-- ACACACACAC 3070 het 1081 hom 83 5 30 48 AC 8 7 108905 CASAVA_Build 6 40426651 2I CACACACACA --/CC CCCATGGATA 3070 het 1172 hom 83 9 36 38 C 3 5 108906 CASAVA_Build 6 40426762 2I CACACATTCT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 80 32 31 17 CA 5 6 108907 CASAVA_Build 6 40427174 1D CAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1871 hom 20 7 12 2 A 13 12 108908 CASAVA_Build 6 40437628 1D AAATCGTACA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 8 7 108909 CASAVA_Build 6 40438027 1D AACAAAATGC T/- ATTAAACAAG 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 1 0 108910 CASAVA_Build 6 40440832 1D TGGAGTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 19 4 A 12 11 108911 CASAVA_Build 6 40442571 1I AATTTCTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 25 2 21 2 A 11 12 108912 CASAVA_Build 6 40445691 1I CTACTATTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 7 8 108913 CASAVA_Build 6 40449022 1D TCCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 13 12 108914 CASAVA_Build 6 40451781 11D TGTGAATATA TAAAGAACTCT/----------- TAAAATTTGA 3070 het 3070 ref 43 22 16 9 TAAAGAACTCT 1 0 108915 CASAVA_Build 6 40465104 1D CATAAGAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2055 hom 40 8 22 10 T 10 9 108916 CASAVA_Build 6 40476892 21I CTGGTCCTCA ---------------------/GCCTCCAGGAAGAGCCTATGG GCCTCCAGGA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 GCCTCCAGGAAGAGCCTATGG 0 1 108917 CASAVA_Build 6 40479038 1I AATGGGGGAA -/G GCACATGTCT 3070 hom 144 het 55 0 48 7 G 1 2 108918 CASAVA_Build 6 40482959 8D AAGTCTTCTC TATTTAAT/-------- TGTATTTAAT 3070 het 3070 ref 42 19 18 8 TATTTAAT 1 0 108919 CASAVA_Build 6 40489103 6I CCACTCAGCA ------/CTGGGC CTGGGCCTGG 2414 het 725 hom 25 3 8 14 CTGGGC 2 3 108920 CASAVA_Build 6 40500300 1I CAACAGCGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 11 16 13 A 9 10 108921 CASAVA_Build 6 40511265 1D TTGTTTCCTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 9 8 108922 CASAVA_Build 6 40518733 3D ATAACCCCTC TTA/--- TTATTAAAAC 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 TTA 3 2 108923 CASAVA_Build 6 40520620 1I TTCTTCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 492 hom 20 2 12 6 T 11 12 108924 CASAVA_Build 6 40577203 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1496 het 1496 ref 26 18 4 4 T 15 14 108925 CASAVA_Build 6 40599686 22D TGTCTGCATA GAAGGGCAGGGGGAGGGGCTGG/---------------------- GAAGGGCAGG 3070 hom 69 het 26 0 16 15 GAAGGGCAGGGGGAGGGGCTGG 2 1 108926 CASAVA_Build 6 40631713 2D AGAATAATCT CA/-- ACAATAATGA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 CA 1 0 108927 CASAVA_Build 6 40634280 3D AGAGAAGGCT GGA/--- GGAGATGTCC 3070 hom 105 het 43 0 35 9 GGA 2 1 108928 CASAVA_Build 6 40642800 2D AAACAGTTTT AA/-- AGAGAGGAGA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 3 1 108929 CASAVA_Build 6 40653678 1D ACCAGGCCAG T/- CTGAATCAGA 3070 hom 72 het 25 0 25 1 T 1 0 108930 CASAVA_Build 6 40655257 3I CATCACCACC ---/ACT ATCAGCTTTA 3070 hom 138 het 48 0 47 1 ACT 0 1 108931 CASAVA_Build 6 40655575 1I GCATTCAATT -/A AATGCTTGCT 3070 hom 132 het 53 0 43 10 A 2 3 108932 CASAVA_Build 6 40674878 1I GAAGACGTGA -/C AGAGTAGGCC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 0 1 108933 CASAVA_Build 6 40684743 2I ACCTTGAAAC --/AT AACCCCTGAA 3070 hom 126 het 43 0 42 1 AT 0 1 108934 CASAVA_Build 6 40693170 1D AATTTGTATC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 9 8 108935 CASAVA_Build 6 40695933 4D ACAGGTTTGA TTGC/---- TGTAGAGTGC 3070 hom 126 het 43 0 43 3 TTGC 1 0 108936 CASAVA_Build 6 40700192 1I TTACCTCCCC -/A GCCTCCACCC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 0 1 108937 CASAVA_Build 6 40701095 1I ACACTGAGAG -/A AACCTGGAAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 2 3 108938 CASAVA_Build 6 40723886 18D GAGGGCACAA GAGCTGAGATGTTGTTGG/------------------ GAGCTGAGAT 3070 hom 108 het 47 0 36 14 GAGCTGAGATGTTGTTGG 2 1 108939 CASAVA_Build 6 40726092 2I ACATTCACTA --/TC TCTATGTCTT 3070 hom 128 het 48 0 40 8 TC 1 2 108940 CASAVA_Build 6 40730851 3D21M6I GATGGTGAAG ATCATGATGATGTTAATAGTGATG------/---ATGATGATAGTAATAATGATGGTTACA GTGATGGTGA 3070 het 3070 ref 82 64 16 12 N/A 0 0 108941 CASAVA_Build 6 40731984 4D ACTTGTTGGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 30 1 18 12 A 18 14 108942 CASAVA_Build 6 40743614 1D TGATAGTGAT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 117 het 46 0 38 9 G 9 8 108943 CASAVA_Build 6 40751503 1I ACTTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 20 1 16 3 A 13 14 108944 CASAVA_Build 6 40752936 1I TAAACACACC -/T TTGCCACCAG 3070 het 3070 hom 52 20 24 8 T 2 3 108945 CASAVA_Build 6 40754774 13I TAAGAGCCGG -------------/ACTCCCCACAGAC CCTCCTGCAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 ACTCCCCACAGAC 0 1 108946 CASAVA_Build 6 40757661 1D ACCTCCTGAC A/- ATCTAGGCTT 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 A 2 1 108947 CASAVA_Build 6 40759532 1I CCAAACACCA -/C ATGTTCTCAC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 0 1 108948 CASAVA_Build 6 40760619 3D3M11I TAAATCCATA GGGGGA-----------/---GTAACTATTTACTT TCATACCTGA 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 N/A 0 0 108949 CASAVA_Build 6 40761894 3D CCCCTTGTAA TTC/--- TTCTTATCTC 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 TTC 2 1 108950 CASAVA_Build 6 40764482 3D TAATGTCCCT TCC/--- TCCCTTGCCC 3070 het 3070 hom 40 17 20 5 TCC 2 1 108951 CASAVA_Build 6 40792082 1D TCTGGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 475 hom 22 2 9 12 A 15 14 108952 CASAVA_Build 6 40801990 2D AACTCATTCC CT/-- CTCCCCTTAT 3070 hom 122 het 49 0 37 14 CT 2 1 108953 CASAVA_Build 6 40805283 1I TCAAATTGTC -/T TCACATCTAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 1 2 108954 CASAVA_Build 6 40828382 1I CCAGAGTCCA -/C CCCTAGAGAT 3070 hom 98 het 35 0 30 5 C 3 4 108955 CASAVA_Build 6 40836214 1I TTGTGTTATG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 9 10 108956 CASAVA_Build 6 40837182 4D GGGAGTGGGC CTGT/---- CTGTCTTAGC 3070 hom 102 het 43 0 33 13 CTGT 2 1 108957 CASAVA_Build 6 40837831 1I GGGAGGCAGA -/G GTTGCAGTGA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 G 1 2 108958 CASAVA_Build 6 40852194 16I TGTATGTGTC ----------------/TGTGTGTTTGTGTGTA TGTGTGGATA 3070 hom 126 het 56 0 37 19 TGTGTGTTTGTGTGTA 0 1 108959 CASAVA_Build 6 40852220 14D TGTATGTTTG TGTGTATATGTGTA/-------------- TGTGTATATG 3070 het 3070 ref 70 32 13 38 TGTGTATATGTGTA 1 0 108960 CASAVA_Build 6 40855735 1D AGTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 778 hom 40 5 21 14 T 13 12 108961 CASAVA_Build 6 40864269 1I AGCTGGATCT -/G GGTCTACCAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 2 3 108962 CASAVA_Build 6 40873072 1I TGGCCCTCCT -/A ACCAGTTCTC 3070 hom 73 het 28 0 22 6 A 1 2 108963 CASAVA_Build 6 40914471 1D GTATAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 1285 het 1285 ref 41 32 3 7 A 11 10 108964 CASAVA_Build 6 40915623 1D TACTTAAAAA T/- AATATAGATC 3070 het 3070 ref 35 15 13 8 T 1 0 108965 CASAVA_Build 6 40922427 1I AGATTAGGCC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 A 8 9 108966 CASAVA_Build 6 40928468 1I TGTATGTCAA -/T TTATTTTGAC 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 T 2 3 108967 CASAVA_Build 6 40932668 1D CCTCCAAGGG A/- AAAAAAAAAA 2313 het 2313 ref 31 14 8 9 A 17 16 108968 CASAVA_Build 6 40952670 1D TTTACTTTGC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 157 het 63 0 53 10 T 9 8 108969 CASAVA_Build 6 40959280 1I CTCGAGCTGC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 80 het 34 0 27 7 A 7 8 108970 CASAVA_Build 6 40961852 2D TTTTTATAAC AG/-- AGAAAGAAGA 3070 hom 52 het 25 0 16 9 AG 2 1 108971 CASAVA_Build 6 40963110 1D CCTCATCTGC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 8 7 108972 CASAVA_Build 6 40964339 1I GTTTCCCAGG -/C CCCCCCGGCA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 C 6 7 108973 CASAVA_Build 6 40994354 1D TCCAAGACCA C/- CCTGGCCCGC 2613 het 1866 hom 23 9 7 8 C 3 2 108974 CASAVA_Build 6 41056000 1I ATTTGGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 25 0 18 7 T 11 12 108975 CASAVA_Build 6 41057591 28D CAGGTGTGGT GGTGGGCACCTGCAATCCCAGCTACTCA/---------------------------- GGACGCTGAG 3070 hom 84 het 26 0 28 3 GGTGGGCACCTGCAATCCCAGCTACTCA 1 0 108976 CASAVA_Build 6 41083736 1D AGAGAGTGGG A/- AGGACTCTGT 3070 hom 80 het 36 0 25 11 A 2 1 108977 CASAVA_Build 6 41087982 3I CTTCCTCCTC ---/CTT AGCCATTGTC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 CTT 0 1 108978 CASAVA_Build 6 41098527 2I TTATTTTGGG --/GA GAGGAAAATC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GA 1 2 108979 CASAVA_Build 6 41139502 3I ATTTTACATA ---/CTT CTTATTTCAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 CTT 1 2 108980 CASAVA_Build 6 41151451 1I AAGTAGTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 28 1 24 3 T 11 12 108981 CASAVA_Build 6 41153258 5D TAGCCATAAA TGTAT/----- TGTGTATTAG 3070 hom 96 het 37 0 33 6 TGTAT 1 0 108982 CASAVA_Build 6 41154198 2D GATTGCTAAC TT/-- ATATCATTTT 3070 hom 129 het 44 0 44 0 T 2 0 108983 CASAVA_Build 6 41178274 1D AAAAAACTCA T/- TTATGTAGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 3 2 108984 CASAVA_Build 6 41196963 1D ATCCTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 693 hom 42 4 27 11 T 15 14 108985 CASAVA_Build 6 41211556 1I GTGGAGGCAA -/G GGGATATGGG 3070 hom 92 het 36 0 29 7 G 3 4 108986 CASAVA_Build 6 41277000 1I GCCCCAAGCC -/A GGGAGGACTC 3070 hom 50 het 20 0 17 3 A 0 1 108987 CASAVA_Build 6 41278561 4D TCACTCACTC ATTA/---- ATTCATTCAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 ATTA 1 0 108988 CASAVA_Build 6 41280069 1D TTTGTTTTTT G/- CCATATAAGG 3070 hom 138 het 51 0 47 6 G 1 0 108989 CASAVA_Build 6 41294672 3I CAATAATAAT ---/AAG AAGAAGAATA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 AAG 2 3 108990 CASAVA_Build 6 41298267 1D CCCACACTTA C/- CTTTGACTTG 3070 hom 85 het 34 0 23 13 C 2 1 108991 CASAVA_Build 6 41300328 3D TCATTCCTCA AAG/--- AAGGTTTCAA 3070 hom 98 het 37 0 33 6 AAG 2 1 108992 CASAVA_Build 6 41301170 4D GAAGAAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAAG 5 4 108993 CASAVA_Build 6 41303273 1I ATTCCCCCCC -/G CCAGTTCTTT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 G 0 1 108994 CASAVA_Build 6 41304083 3I CGTCTGACTC ---/CTT CTCCTGAGAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 CTT 0 1 108995 CASAVA_Build 6 41309342 1D TCAGAAATGC A/- AGGAGAAATA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 2 1 108996 CASAVA_Build 6 41310249 3I ATAATAAATA ---/AAC AACAAATCAA 1312 het 80 hom 28 2 6 20 AAC 1 2 108997 CASAVA_Build 6 41311877 4I GATTCCTAAG ----/AGGC GTCGGATGGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AGGC 0 1 108998 CASAVA_Build 6 41318242 3I TCAACCAATC ---/AGA AGAAGCCAAC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 AGA 1 2 108999 CASAVA_Build 6 41326950 3D ATCCTAGAAA TCT/--- TCTCCTTCCA 3070 hom 123 het 50 0 42 8 TCT 2 1 109000 CASAVA_Build 6 41329325 1I CTTTTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 10 11 109001 CASAVA_Build 6 41346163 24D ATATTATATA ATATATATATATATATATATATAT/------------------------ ATATATATAT 3070 hom 54 het 18 0 19 2 AT 18 6 109002 CASAVA_Build 6 41352789 1I TAAATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 A 10 11 109003 CASAVA_Build 6 41353816 1I TTTTTTATTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 7 8 109004 CASAVA_Build 6 41358674 4I TTTACTATAA ----/GAGT GAGACTGCAT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 GAGT 0 1 109005 CASAVA_Build 6 41366279 2D TGCCATTGTG AA/-- AAGAGAACAT 3070 het 3070 hom 43 21 20 4 A 4 2 109006 CASAVA_Build 6 41383823 1I GATGTGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2508 hom 38 12 12 14 T 15 16 109007 CASAVA_Build 6 41384538 1I GCCATGCCTC -/A AAGTCTAGAA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 2 3 109008 CASAVA_Build 6 41386730 1D CCATCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 A 11 10 109009 CASAVA_Build 6 41391813 2I AGAAACAATA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 11 109010 CASAVA_Build 6 41398888 2I TTGTAGCTCA --/AC AAATTAAGTA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 AC 0 1 109011 CASAVA_Build 6 41405722 1I CCGTCTCAAA -/C AAAAAAAAAA 1031 het 418 hom 12 4 3 5 C 0 1 109012 CASAVA_Build 6 41406048 2D AGAAAATTTC TG/-- TGTTTGTACA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 TG 2 1 109013 CASAVA_Build 6 41406333 2I CTTTTGTGCC --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 TG 4 5 109014 CASAVA_Build 6 41419524 1D GATAAACAAC T/- TGGTTTTGGC 3070 hom 82 het 33 0 26 7 T 2 1 109015 CASAVA_Build 6 41424182 1I AGGGGGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 103 het 46 0 35 11 A 10 11 109016 CASAVA_Build 6 41446238 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 473 het 473 ref 23 6 3 15 A 17 16 109017 CASAVA_Build 6 41446976 3D GGAACCCCCA CCC/--- CCCCCCCACA 654 hom 16 het 13 0 7 7 C 10 7 109018 CASAVA_Build 6 41458484 5D TTTAAAAAAG AAAAT/----- AAAAAGAGAA 2384 het 2384 ref 12 7 5 0 AAAAT 1 0 109019 CASAVA_Build 6 41461732 1D ATTTTTTTTT C/- TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 C 1 0 109020 CASAVA_Build 6 41468035 1I GCAAGGACTA -/C TGGAAAGCAA 3070 het 3070 ref 45 26 12 7 C 0 1 109021 CASAVA_Build 6 41470646 4D AAAGTTGTTG AAGA/---- ATGAGAAGAT 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 AAGA 1 0 109022 CASAVA_Build 6 41482201 2D ATTTGCTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2417 het 1050 hom 17 4 7 6 T 14 12 109023 CASAVA_Build 6 41486783 1D TCAGCCACAG T/- TTGTGTCTCA 3070 het 3070 ref 44 23 18 5 T 3 2 109024 CASAVA_Build 6 41507779 1I CTTCTCTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 85 het 36 0 26 10 T 9 10 109025 CASAVA_Build 6 41509920 1D TGTGGATATT A/- AACACTTAAT 1924 hom 30 het 18 0 10 8 A 3 2 109026 CASAVA_Build 6 41512335 5D4M1D10M8I4M9I GTGCTGGGAT TACAGGCGTGAGCCACCGCG--------CCCG---------/-----GCGT-AGGGACTGTGTATACTGTTCTGTCTACTTTA GCCTATGCTT 1750 hom 10 het 3 0 4 2 N/A 0 0 109027 CASAVA_Build 6 41514323 1D ACGGTCAGGG C/- TATACACTTC 3070 hom 114 het 40 0 37 4 C 1 0 109028 CASAVA_Build 6 41528316 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 12 109029 CASAVA_Build 6 41529397 5D CTAAATTCCC TGTAA/----- TGTACAATAT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 TGTAA 1 0 109030 CASAVA_Build 6 41537021 1I TTGCAGGATC -/T TCTGGCCATT 3070 hom 105 het 42 0 34 8 T 1 2 109031 CASAVA_Build 6 41544547 1D AAGTGGGAAT G/- CTGGAAAGGC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 G 1 0 109032 CASAVA_Build 6 41553629 1I AAGGTGAGCA -/G GATCACTTGA 3070 hom 66 het 25 0 22 4 G 1 2 109033 CASAVA_Build 6 41609184 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 25 2 14 9 A 11 12 109034 CASAVA_Build 6 41613927 1D AAGCCGTATA C/- TAGAGCAATG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 C 1 0 109035 CASAVA_Build 6 41615392 2D ATCACTGAAG AC/-- ACAGTTATTA 3070 het 3070 hom 45 16 24 7 AC 2 1 109036 CASAVA_Build 6 41618842 2D TAATAGAAAC AT/-- AAACTGTCTG 3070 het 3070 hom 38 17 20 2 AT 1 0 109037 CASAVA_Build 6 41637039 1D GGTGCTATCT C/- CCATTTGCCC 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 C 3 2 109038 CASAVA_Build 6 41658445 1D CCCCAGGCCC A/- CCACATCCAC 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 1 0 109039 CASAVA_Build 6 41681464 1D CCCTAGGACT C/- CCTGACTACT 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 C 3 2 109040 CASAVA_Build 6 41682266 1D AAATTTGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 A 13 12 109041 CASAVA_Build 6 41682666 1I ACCTGAGGTC -/A GGAGTTCGGG 3070 het 2285 hom 17 6 10 1 A 0 1 109042 CASAVA_Build 6 41686971 1D CAGCAACACA T/- TCTGGAACCC 3070 het 3070 ref 53 25 21 8 T 2 1 109043 CASAVA_Build 6 41687929 4I AAGTAGCTGG ----/GATT GATTACAGGC 3070 het 1622 hom 12 4 8 0 GATT 1 2 109044 CASAVA_Build 6 41688110 1D ATTTTTTTTT A/- AAAGAAAAAA 2337 het 2208 hom 17 7 7 4 A 4 3 109045 CASAVA_Build 6 41691292 2I CTCACCCACC --/AG AGAGAGCGTC 3070 hom 89 het 33 0 28 5 AG 3 4 109046 CASAVA_Build 6 41721538 2D TCTCCCGTGT TG/-- TGTTTCTGCC 3070 het 2848 hom 37 13 17 8 TG 2 1 109047 CASAVA_Build 6 41747610 12I CCGCCAACAC ------------/CTGGCAGGAGGT CTGGCAGGAG 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 CTGGCAGGAGGT 1 2 109048 CASAVA_Build 6 41755175 12I CACCCTGAAA ------------/GAGCCTCTTTTG GAGATGGAGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 GAGCCTCTTTTG 0 1 109049 CASAVA_Build 6 41755421 23D GGCCACCATG GCATGAGGCTTGGTGACATGGCA/----------------------- GCAGGAGGGC 2503 het 2503 ref 26 19 8 6 GCATGAGGCTTGGTGACATGGCA 1 0 109050 CASAVA_Build 6 41756932 2D TTGGCTAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 37 4 17 16 A 14 12 109051 CASAVA_Build 6 41758204 1D GATCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 17 0 11 6 T 15 14 109052 CASAVA_Build 6 41762192 1I CCTCCTTCCC -/A AGACTACCAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 1 2 109053 CASAVA_Build 6 41773220 1I CTTCTCCAAA -/C CCCCCCCCCT 2986 het 427 hom 19 1 11 7 C 9 10 109054 CASAVA_Build 6 41789857 2D GCATGTGTGC GT/-- GTGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 58 22 18 19 GT 4 3 109055 CASAVA_Build 6 41789884 2D TGCGTGTGCA TG/-- TGTGCGTGTG 3070 het 3070 ref 59 19 15 25 TG 3 2 109056 CASAVA_Build 6 41794100 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 7 8 109057 CASAVA_Build 6 41820960 1D GGATATGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 12 11 109058 CASAVA_Build 6 41821879 1I GTTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2799 hom 19 7 8 4 A 11 12 109059 CASAVA_Build 6 41826083 1D ATCCCAGTGA C/- TTGCCCAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 C 1 0 109060 CASAVA_Build 6 41829661 1I GGAAAGGAGG -/T TGTACTGGAT 3070 hom 128 het 48 0 39 9 T 1 2 109061 CASAVA_Build 6 41833906 1D GTATTATGAG A/- AGAGGGGTCA 3070 hom 114 het 40 0 39 3 A 2 1 109062 CASAVA_Build 6 41842016 4D AAGAAAGAAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 GAAA 3 2 109063 CASAVA_Build 6 41868243 1I GAAGGGGTAG -/C CCCCCCAGCC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 C 6 7 109064 CASAVA_Build 6 41907832 1I GTCTGTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 16 11 T 10 11 109065 CASAVA_Build 6 41915281 1D AAATTGAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 9 8 109066 CASAVA_Build 6 41920478 1D TCTTTATGAA T/- TATGGTTCAT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 T 2 1 109067 CASAVA_Build 6 41921469 1D TTTTTAAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 10 9 109068 CASAVA_Build 6 41922486 1I TTGGAGGAAA -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 46 17 17 12 C 8 9 109069 CASAVA_Build 6 41929551 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAATA 2467 het 2354 hom 11 5 6 0 A 8 9 109070 CASAVA_Build 6 41936391 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 2477 hom 12 het 5 0 5 0 T 10 9 109071 CASAVA_Build 6 41952060 1I ACAAAGTCTA -/T TAAGAATGAC 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 T 1 2 109072 CASAVA_Build 6 41955858 1D ACATTCACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 10 9 109073 CASAVA_Build 6 41958343 3I TTCGGTAAAG ---/AAC AACAAGGCAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAC 1 2 109074 CASAVA_Build 6 41972179 1D GCAATTTATT A/- ACAACTTGCA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 2 1 109075 CASAVA_Build 6 41975033 1D CCCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2358 hom 28 10 8 12 A 11 10 109076 CASAVA_Build 6 41984890 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1993 het 1361 hom 17 6 8 3 A 13 14 109077 CASAVA_Build 6 41990340 3I TCCAAAGAGT ---/CTC CTCTCTCATT 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 CTC 1 2 109078 CASAVA_Build 6 41991215 4I TCTCTTAAAA ----/ACAC ACACACACGC 1790 het 1790 ref 21 12 4 5 AC 4 6 109079 CASAVA_Build 6 41998860 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 9 109080 CASAVA_Build 6 42010487 3D CATAGGTCAC ATT/--- ATAAAGCAGA 3070 het 3070 ref 54 34 19 2 ATT 1 0 109081 CASAVA_Build 6 42014498 8D AGGTTCTACA CTCATCTG/-------- CTCAGTGCGA 3070 het 3070 ref 50 23 23 8 CTCATCTG 1 0 109082 CASAVA_Build 6 42019116 1I TTTTTTCATT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 7 8 109083 CASAVA_Build 6 42021232 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 14 12 9 A 10 9 109084 CASAVA_Build 6 42023850 4D TCCTGGCCAT CCTA/---- CCTAAATTTT 3070 het 3070 ref 36 16 16 6 CCTA 2 1 109085 CASAVA_Build 6 42024060 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2784 hom 29 9 13 7 T 11 10 109086 CASAVA_Build 6 42027154 8D CCTGTAGTCC CAGCTACT/-------- CAGCTACTCG 1873 hom 18 het 7 0 7 1 CAGCTACT 2 1 109087 CASAVA_Build 6 42031227 1D CATTCATAAG A/- AAAAACTCTT 3070 het 3070 hom 45 16 28 2 A 6 5 109088 CASAVA_Build 6 42035672 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1424 het 1424 ref 17 8 8 1 A 14 15 109089 CASAVA_Build 6 42038476 1I AAAAAAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1464 hom 25 5 13 7 T 9 10 109090 CASAVA_Build 6 42040502 1I AGTGCTAAGC -/A ATTAAGGTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 1 2 109091 CASAVA_Build 6 42051568 1I TTTTTGTCTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 8 9 109092 CASAVA_Build 6 42055848 8D TTTACTGGAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 5 T 22 14 109093 CASAVA_Build 6 42056238 3I AGAGGAAATC ---/CTT CTTAACTCAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CTT 1 2 109094 CASAVA_Build 6 42056854 1I AAGAATTGAC -/A AAAAAAATCC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 8 109095 CASAVA_Build 6 42057990 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 32 0 22 10 A 16 14 109096 CASAVA_Build 6 42062100 2I TAATTTAAAC --/AT ATTAATTCTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AT 1 2 109097 CASAVA_Build 6 42062322 1I ATGTTACTAC -/T TTTGGTATGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 3 4 109098 CASAVA_Build 6 42074934 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 23 0 16 7 A 11 10 109099 CASAVA_Build 6 42075765 2I GGCCTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TG 5 6 109100 CASAVA_Build 6 42077177 4I TACCACATAT ----/ACTA ACTAAGTGAA 3070 hom 147 het 54 0 49 5 ACTA 1 2 109101 CASAVA_Build 6 42077652 1D CTAACATGGT G/- AAACCCCTTC 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 G 1 0 109102 CASAVA_Build 6 42078939 2D TTATGAAGTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 35 het 19 0 11 9 A 11 9 109103 CASAVA_Build 6 42082021 1I TTAGAGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 10 11 109104 CASAVA_Build 6 42092299 4D GCTGCTATTA CTAT/---- CTATTACTTT 2557 het 140 hom 28 2 15 11 CTAT 2 1 109105 CASAVA_Build 6 42099436 4I ATCTATTAAA ----/CACC CACTAAGTAC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CACC 0 1 109106 CASAVA_Build 6 42103156 10D GCTCCATCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAGA 2651 het 1599 hom 18 6 7 7 A 18 8 109107 CASAVA_Build 6 42104866 2D TATTTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2220 het 940 hom 14 5 7 2 T 14 12 109108 CASAVA_Build 6 42109174 1I TAAAAAAAAA -/T ATATATATAT 2339 het 2012 hom 13 5 5 3 T 0 1 109109 CASAVA_Build 6 42133493 1I ATAAATAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 10 11 109110 CASAVA_Build 6 42139972 1I AGTTTTGGGG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 T 7 8 109111 CASAVA_Build 6 42155712 1I GGACGCTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 27 0 19 8 A 13 14 109112 CASAVA_Build 6 42156090 4D TTTTCTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 236 het 192 hom 21 2 3 16 T 16 12 109113 CASAVA_Build 6 42157042 3D ATAGGTATCT ACC/--- ACCACCACCA 3070 hom 33 het 19 0 11 9 ACC 4 3 109114 CASAVA_Build 6 42160329 5I CAGGCACATG -----/CCACC CCACCGCACC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CCACC 1 2 109115 CASAVA_Build 6 42163116 5D ATATTAACTC ATATA/----- ATAAATGGAC 3070 het 3070 hom 35 15 18 6 ATATA 1 0 109116 CASAVA_Build 6 42203886 1I TCATGATCTG -/C CCCCCTTGGC 1241 het 1241 ref 15 5 4 6 C 5 6 109117 CASAVA_Build 6 42206517 1I AGATGGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 10 11 109118 CASAVA_Build 6 42212603 1I AATGGCGCCG -/C CCCCCCCAGC 1449 het 1449 ref 31 15 7 9 C 7 8 109119 CASAVA_Build 6 42221641 3D AGTTCGAGAC CAG/--- CCTGGCAAAC 1413 hom 8 het 5 0 3 2 CAG 1 0 109120 CASAVA_Build 6 42222329 1I TGCTTTGGGA -/G GCTGAGGTGG 3070 hom 51 het 21 0 17 4 G 1 2 109121 CASAVA_Build 6 42223807 2D CAAGAGGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 1059 hom 26 het 27 0 8 21 CT 2 1 109122 CASAVA_Build 6 42226839 1I GCCCATTTTG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 7 8 109123 CASAVA_Build 6 42235876 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 16 6 T 10 11 109124 CASAVA_Build 6 42238018 1D TAATCCCAGC T/- TACTCAGGAG 1034 het 665 hom 6 2 3 1 T 2 1 109125 CASAVA_Build 6 42241480 1D TTTTTGAGAT A/- AGAGTTTCAC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 2 1 109126 CASAVA_Build 6 42242898 4D AGGGAGCAAG CTCT/---- CTGTCAATGG 3070 hom 75 het 30 0 24 6 CT 3 1 109127 CASAVA_Build 6 42246731 1D TTATGAACAA T/- TTTTTTTTTT 2201 het 170 hom 19 1 7 11 T 17 16 109128 CASAVA_Build 6 42262819 5D TATCTTTCGA TTTAT/----- TTTATTTTAT 2611 het 2611 ref 21 8 10 3 TTTAT 3 2 109129 CASAVA_Build 6 42266164 1D AACAATGAAC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 9 8 109130 CASAVA_Build 6 42269106 1I TTTAAAAAAA -/T CATCAATTAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 0 1 109131 CASAVA_Build 6 42275439 23D CCTTCAGATG ACTCCAGCCCCAGCTTCTGAGCT/----------------------- ACTCCAGCCC 3070 hom 54 het 28 0 16 14 ACTCCAGCCCCAGCTTCTGAGCT 2 1 109132 CASAVA_Build 6 42284722 1D ACGGTTTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 157 hom 21 2 14 5 G 1 0 109133 CASAVA_Build 6 42284934 1I GGCTGGCCTC -/A AAACTCCTGA 2461 het 458 hom 8 1 6 1 A 3 4 109134 CASAVA_Build 6 42290200 1D AATTAGATTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 A 10 9 109135 CASAVA_Build 6 42290301 1D AAACTTTTTC A/- AAAAAAACAA 2990 het 2990 ref 27 14 7 6 A 8 7 109136 CASAVA_Build 6 42290354 1D GGACATCAAG A/- AAAAATGTGA 3070 het 3070 hom 28 11 14 5 A 6 5 109137 CASAVA_Build 6 42293807 2D GTGTGTGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 10 11 13 AC 10 9 109138 CASAVA_Build 6 42294011 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 11 10 109139 CASAVA_Build 6 42296062 1D TATAAAGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 10 9 109140 CASAVA_Build 6 42300862 2D GATAATTAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 11 9 109141 CASAVA_Build 6 42302257 1I GCAAATGAAA -/C CTTTTTTCCC 3070 hom 113 het 43 0 37 6 C 1 2 109142 CASAVA_Build 6 42306076 1I GTAAGACTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 25 15 12 A 11 12 109143 CASAVA_Build 6 42317184 1D ATGAGTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 11 10 109144 CASAVA_Build 6 42318915 1I ACCTGGGCCT -/G GGGGTGGGAG 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 G 4 5 109145 CASAVA_Build 6 42384677 1D TTTTTACGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 10 9 109146 CASAVA_Build 6 42391423 1D AGGAACACCA C/- CCCCCCCCCC 2234 hom 16 het 18 0 9 9 C 11 10 109147 CASAVA_Build 6 42394867 1D TTTTTAGACA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 104 het 40 0 35 5 T 8 7 109148 CASAVA_Build 6 42397124 1I AGTTTGAGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 A 8 9 109149 CASAVA_Build 6 42397535 1D CTGTAAGCCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 A 9 8 109150 CASAVA_Build 6 42409878 5D ATCTAAAAAT AAAAC/----- AAAGAAAACT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 AAAAC 1 0 109151 CASAVA_Build 6 42414025 7I ATGGGCAACC -------/ATTTCTT GGTCTTCTGA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 ATTTCTT 0 1 109152 CASAVA_Build 6 42430103 1I GTTGTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 24 12 12 T 11 12 109153 CASAVA_Build 6 42431593 7D GGCTTTGGTT CCAAGAG/------- CCTCCTTTTA 3070 het 3070 ref 56 34 20 4 CCAAGAG 1 0 109154 CASAVA_Build 6 42437131 7I TTGTTTTATG -------/TTGTTTT TTGTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 TTGTTTT 1 2 109155 CASAVA_Build 6 42493045 16I TACCCCACGG ----------------/CTGAAGCCAGCAGCCC ACCCCACTCC 3070 hom 68 het 27 0 19 8 CTGAAGCCAGCAGCCC 0 1 109156 CASAVA_Build 6 42500238 1I TCCAAAATCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 9 10 109157 CASAVA_Build 6 42512085 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 11 10 109158 CASAVA_Build 6 42514344 1D AAAAGAAAAA G/- GAAAAAAGAA 3070 het 2662 hom 19 10 9 1 G 2 1 109159 CASAVA_Build 6 42535231 3I ATGAGTGGCT ---/TTG TTAGCTGTGA 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 TTG 0 1 109160 CASAVA_Build 6 42545954 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2200 het 2200 ref 14 6 5 3 A 11 12 109161 CASAVA_Build 6 42546880 1I AAGCCAGCCC -/A AACTCACCAA 3070 het 3070 ref 42 24 17 1 A 2 3 109162 CASAVA_Build 6 42547775 1D TGTAGTTTAC A/- AAAGGTGTTT 3070 het 3070 ref 44 19 21 4 A 4 3 109163 CASAVA_Build 6 42548696 1I TGCTAAAAGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 7 8 109164 CASAVA_Build 6 42550216 1I TACTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2382 het 2382 ref 27 9 11 7 T 10 11 109165 CASAVA_Build 6 42550743 1I CAAAAATAAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 8 9 109166 CASAVA_Build 6 42557317 1D CTATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2083 het 2083 ref 26 11 8 7 T 13 12 109167 CASAVA_Build 6 42558900 1I TGCCTGGCCC -/T TTTAAATACA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 3 4 109168 CASAVA_Build 6 42559422 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2184 hom 25 6 11 9 A 13 12 109169 CASAVA_Build 6 42567148 1I GCAGATTTGG -/T TTCTCACTGA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 2 3 109170 CASAVA_Build 6 42576015 1D CAGTTCCCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 10 9 109171 CASAVA_Build 6 42583586 1D ACTGCGCCCG C/- CCCCCTCCCT 3070 hom 47 het 18 0 16 2 C 6 5 109172 CASAVA_Build 6 42600840 3D TTATTTTAAA TCT/--- TCTTCATTGT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TCT 2 1 109173 CASAVA_Build 6 42602703 7D AAAAACAAAT GTTTGTA/------- GTTTGTAGCC 3070 het 3070 hom 37 14 13 15 GTTTGTA 2 1 109174 CASAVA_Build 6 42603034 1I TCTGAATGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 A 11 12 109175 CASAVA_Build 6 42605127 1D ATAAACATTT C/- CCTAATTGAC 3070 het 3039 hom 27 7 15 5 C 3 2 109176 CASAVA_Build 6 42618058 1D CAAGCCCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 T 10 9 109177 CASAVA_Build 6 42619348 1I GAGAGTTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 A 9 10 109178 CASAVA_Build 6 42619719 1I TTTGGACCAG -/A AATTTCGCTT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 2 3 109179 CASAVA_Build 6 42621557 2I GTGTGTATGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 TG 7 8 109180 CASAVA_Build 6 42637692 1I AGGGAAACAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 8 22 8 T 9 10 109181 CASAVA_Build 6 42638383 2D GTTTTATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 12 16 2 TA 7 6 109182 CASAVA_Build 6 42645773 4I AGCATATGTT ----/AGTG AGAACTAATA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 AGTG 0 1 109183 CASAVA_Build 6 42648209 1I GTAACTGGAA -/T TTAGGTAGTA 3070 het 3070 hom 35 12 12 11 T 2 3 109184 CASAVA_Build 6 42655760 1I GATTTCTAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 9 10 109185 CASAVA_Build 6 42656264 1D TAATTGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 12 11 109186 CASAVA_Build 6 42663585 1D TTTGCACTTA T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 7 6 109187 CASAVA_Build 6 42675335 3D GGGGTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 TTG 5 4 109188 CASAVA_Build 6 42676061 2D AAATATAATC AA/-- AGAGCTAAAA 3070 het 3070 ref 52 30 17 6 A 3 1 109189 CASAVA_Build 6 42687176 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2867 hom 22 9 8 5 A 15 14 109190 CASAVA_Build 6 42687631 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2722 het 563 hom 24 3 13 8 A 16 17 109191 CASAVA_Build 6 42690532 1D ATTCATTAAA G/- CACAAGAGGT 3070 het 3070 hom 47 18 24 7 G 1 0 109192 CASAVA_Build 6 42699860 1D TTTTGTTTTG T/- TTTGTTTGTT 2238 het 2238 ref 21 13 6 2 T 4 3 109193 CASAVA_Build 6 42702047 1I CAGTCTTGTT -/A TGTGGCAAAT 3070 het 3070 ref 47 32 12 3 A 0 1 109194 CASAVA_Build 6 42711899 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 30 1 19 10 T 14 13 109195 CASAVA_Build 6 42713235 2I CAGATACCAC --/AT GTTTTATCAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 0 1 109196 CASAVA_Build 6 42725520 2I TCTTCCAGTC --/TG TCCCTTGTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TG 0 1 109197 CASAVA_Build 6 42734126 4D GTTGCCAGTT ACTC/---- ACAACATTTA 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 ACTC 1 0 109198 CASAVA_Build 6 42738772 1I CATGGCAGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 9 10 109199 CASAVA_Build 6 42757301 4D TTTTTTAAAA AAAG/---- AAAATTACAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 AAAG 1 0 109200 CASAVA_Build 6 42758745 1I GTGTTTTGTG -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 5 6 109201 CASAVA_Build 6 42761119 3D GAATGGGAGT AGG/--- AGAAGCAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 AGG 1 0 109202 CASAVA_Build 6 42763698 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 8 109203 CASAVA_Build 6 42768864 1D GGTCCGACTT C/- CTAGGAGCCT 3070 het 3070 ref 33 20 13 1 C 2 1 109204 CASAVA_Build 6 42769609 4D CTGTTGGAGG TTTT/---- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 56 20 25 11 T 10 6 109205 CASAVA_Build 6 42776704 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2654 hom 38 11 12 15 T 15 14 109206 CASAVA_Build 6 42782297 1I27M1I ACTCTGTCTC -AAAAAACAAAAAAAAAAGAAAGAAAGG-/AAAAAAACAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGA AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 20 9 11 6 N/A 0 0 109207 CASAVA_Build 6 42782610 5D TTTCCTGTTC TTTTT/----- TTATTACTGC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 7 2 109208 CASAVA_Build 6 42792112 1I CCTATCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 898 hom 29 3 18 8 T 12 13 109209 CASAVA_Build 6 42801407 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2986 hom 41 het 19 0 13 6 A 14 15 109210 CASAVA_Build 6 42809500 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 18 1 14 3 T 13 12 109211 CASAVA_Build 6 42836899 1D ATAGGGCACC G/- GTGGCTCACG 3070 het 2220 hom 18 7 8 3 G 2 1 109212 CASAVA_Build 6 42838644 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1505 het 1505 ref 25 13 5 7 A 15 14 109213 CASAVA_Build 6 42843726 1I CTTGGGGACC -/T TGTCAGATGG 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 T 1 2 109214 CASAVA_Build 6 42847941 1D GGTTTAGATA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 9 8 109215 CASAVA_Build 6 42850351 6I GAGTATAAGA ------/GTACTT GTACCTTTGC 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 GTACTT 0 1 109216 CASAVA_Build 6 42850547 1D ACTCCCGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 11 10 109217 CASAVA_Build 6 42856456 2I8M1I GTTGTTGTTG --TTGTTTTG-/TTTTGTTTTGT TTTTGTTTTT 730 het 730 ref 38 25 4 11 N/A 0 0 109218 CASAVA_Build 6 42862211 5I AAATCTAAAA -----/TAAAC CTGCTTAGAG 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 TAAAC 0 1 109219 CASAVA_Build 6 42862648 1D ATTACTCCAT A/- GGGGGATTTT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 1 0 109220 CASAVA_Build 6 42865754 2D GATCTGTGAG AA/-- AAAGAATCAA 3070 het 3070 ref 49 29 19 2 A 5 3 109221 CASAVA_Build 6 42868380 1I TTGTAATCCC -/G GCACTTTGGG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 G 1 2 109222 CASAVA_Build 6 42874651 2D AAATTTGTAT TA/-- TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 TA 1 0 109223 CASAVA_Build 6 42876274 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1849 hom 20 5 9 6 T 10 11 109224 CASAVA_Build 6 42876642 1D TCATAATAAC T/- TTTAATCAGA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 4 3 109225 CASAVA_Build 6 42881728 2I AAAAAAAAAA --/AC AACGAAGGAA 3070 het 1743 hom 31 11 15 5 AC 0 1 109226 CASAVA_Build 6 42890145 2I ACATATATAT --/AC ACACATACAT 2459 het 2459 ref 15 8 6 1 AC 2 3 109227 CASAVA_Build 6 42899966 7D AAAAAATAAA AATAAAT/------- AATAAATAAT 2827 het 1812 hom 13 5 7 2 AATAAAT 2 1 109228 CASAVA_Build 6 42901545 9I GTGGCTCACA ---------/CCTGTAATC CCAACACTTG 1260 het 1260 ref 20 15 4 1 CCTGTAATC 0 1 109229 CASAVA_Build 6 42907462 1I TTTCAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2783 hom 30 7 14 9 T 13 14 109230 CASAVA_Build 6 42957454 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2571 hom 18 7 9 3 T 10 9 109231 CASAVA_Build 6 42961617 3I TCTCCAACCT ---/CTC CTCAGCCAGG 3070 het 3070 ref 62 34 26 2 CTC 1 2 109232 CASAVA_Build 6 42972267 1I TTCTTTAGGC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 T 7 8 109233 CASAVA_Build 6 42972742 2D CTGTCTTTTT TC/-- CTTTTTTTGT 2327 het 2327 ref 34 28 5 1 TC 1 0 109234 CASAVA_Build 6 42975370 2I AGCACCATCA --/GC CCCAGTATCC 3070 het 3070 ref 34 23 8 3 GC 0 1 109235 CASAVA_Build 6 42980686 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2532 het 1767 hom 18 8 8 4 A 15 14 109236 CASAVA_Build 6 42990912 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1842 hom 26 5 10 13 A 11 10 109237 CASAVA_Build 6 42990957 1I AACAACATGG -/C CAAAAAGTTT 3070 het 1112 hom 25 3 13 9 C 1 2 109238 CASAVA_Build 6 43004927 3I CAGGCTTCTT ---/CTC CTCGGGTCTT 1708 het 1708 ref 25 9 7 9 CTC 1 2 109239 CASAVA_Build 6 43015076 1D GGGGAAGGCT A/- AAACCCACCC 2656 het 2656 ref 23 13 7 4 A 4 3 109240 CASAVA_Build 6 43025042 1D CAGACATACC A/- AAAAAAAAAA 2328 het 2328 ref 20 12 6 2 A 12 11 109241 CASAVA_Build 6 43028395 1I TAAAAAATTA -/C CCCTTTTTGG 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 C 3 4 109242 CASAVA_Build 6 43029652 1D AAAGTATAAA G/- TTATCCATAT 2596 het 2596 ref 14 7 7 0 G 1 0 109243 CASAVA_Build 6 43030339 1I AGTTACTTCC -/T CCTTCCTTTG 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 T 0 1 109244 CASAVA_Build 6 43032873 5I TGGTGTGATC -----/TCGGT TCGGTTCACC 2430 het 2430 ref 24 12 7 5 TCGGT 1 2 109245 CASAVA_Build 6 43034456 4D CCAAAGTAGT TTGA/---- TTGATTGATT 1312 het 1312 ref 20 11 3 8 TTGA 4 3 109246 CASAVA_Build 6 43035518 4I CCCTGTTACA ----/GAGT TTTTGTGAGT 3070 het 3070 ref 45 30 14 1 GAGT 0 1 109247 CASAVA_Build 6 43037267 7D TATTTTTCTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1319 het 1319 ref 25 9 4 12 T 21 14 109248 CASAVA_Build 6 43039606 4D ATGCATTGTG TTTA/---- TTTATGTCAG 2218 het 2218 ref 15 8 6 2 TTTA 2 1 109249 CASAVA_Build 6 43047823 2D CCAGGGATGA AC/-- ATCAGGCACT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 AC 1 0 109250 CASAVA_Build 6 43185121 1D GCTTGTTTCC T/- TGTATGATAA 3070 het 3070 hom 37 11 21 7 T 2 1 109251 CASAVA_Build 6 43213897 1D GGGGGGTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 50 het 25 0 20 5 T 8 7 109252 CASAVA_Build 6 43222190 1I CCCAGTGAAC -/T TTCCCCCTGG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 2 3 109253 CASAVA_Build 6 43235061 2I AGCTTGCTCT --/AG AGACAGCCTA 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 AG 1 2 109254 CASAVA_Build 6 43237803 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 690 het 690 ref 32 17 3 12 A 11 12 109255 CASAVA_Build 6 43288165 4D AAACCCTTTC ACTA/---- ACTGTTTATC 3070 het 3070 hom 31 11 17 5 ACTA 1 0 109256 CASAVA_Build 6 43295242 4I TTCCCAACTT ----/TGTC TGGGTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 TGTC 0 1 109257 CASAVA_Build 6 43317321 3D TAAAATCTAA TCT/--- TCTTAGCACT 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 TCT 2 1 109258 CASAVA_Build 6 43367280 1D CTGAAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 11 10 109259 CASAVA_Build 6 43367990 1I CTAGGAGAAA -/C ACCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 C 0 1 109260 CASAVA_Build 6 43386120 1D CAACTGGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 A 12 11 109261 CASAVA_Build 6 43389465 25D GCAAATTACA GTAGTCCACTTTTCTTCTTTGCCTG/------------------------- GTTTCCATTA 3070 het 3070 ref 40 22 22 6 GTAGTCCACTTTTCTTCTTTGCCTG 1 0 109262 CASAVA_Build 6 43389780 2I CTGCACAGAC --/CT CTCTGTTACA 3070 hom 100 het 39 0 31 8 CT 2 3 109263 CASAVA_Build 6 43396623 4D TTTCTTAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 167 het 167 ref 19 10 2 7 AAAT 4 3 109264 CASAVA_Build 6 43396814 1I ATATGGTTGT -/C CCTTCTGTAT 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 C 2 3 109265 CASAVA_Build 6 43407940 4D TGCGACAGAC TTTT/---- TTTATCTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 7 3 109266 CASAVA_Build 6 43408270 1D TTAAAAAAAA T/- AATTTTAATA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 1 0 109267 CASAVA_Build 6 43412658 1I TATATATATA -/T TATATATAAG 3070 het 1985 hom 18 5 7 6 T 1 2 109268 CASAVA_Build 6 43428403 4D TCCAGAAAGG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 TTGT 3 2 109269 CASAVA_Build 6 43440626 2D ACACCATTTT AA/-- AAAGACTTCC 3070 het 3070 hom 35 8 19 8 A 5 3 109270 CASAVA_Build 6 43447989 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 1978 hom 16 6 9 1 T 8 9 109271 CASAVA_Build 6 43450422 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 376 hom 25 1 17 7 A 12 11 109272 CASAVA_Build 6 43456946 1D ATCATTTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 11 10 109273 CASAVA_Build 6 43459281 1D GATTGTTGAT A/- ACCCTCTTCT 3070 hom 114 het 47 0 42 6 A 2 1 109274 CASAVA_Build 6 43459763 2D TTGTGTAAGC CA/-- CACGTGATCC 3070 hom 140 het 53 0 46 9 CA 2 1 109275 CASAVA_Build 6 43502214 2I CCTGACAAAC --/AG ATAATAAAAT 3070 het 3070 ref 46 29 14 3 AG 0 1 109276 CASAVA_Build 6 43504959 1D GTGATGAGGC T/- GGTTGATGGC 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 T 1 0 109277 CASAVA_Build 6 43516635 1D TCTTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 14 0 9 5 A 12 11 109278 CASAVA_Build 6 43528434 4I TCTCAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 AAAC 2 3 109279 CASAVA_Build 6 43540995 1I GCTTGAACCC -/G GGAGGCAGAG 2144 het 2144 ref 22 6 9 7 G 2 3 109280 CASAVA_Build 6 43541738 30I TTGACACTCC ------------------------------/TCCCATTGAGAGGTAGGGTCTACATTCCCA TCCCTTTAGG 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 TCCCATTGAGAGGTAGGGTCTACATTCCCA 0 1 109281 CASAVA_Build 6 43606960 2D TACACTAGAA AC/-- ACAGACAAGT 3070 het 3070 ref 47 24 18 7 AC 2 1 109282 CASAVA_Build 6 43609559 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAGGGG 3070 hom 138 het 48 0 45 3 A 6 7 109283 CASAVA_Build 6 43616636 1I ATTCAGCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 A 11 12 109284 CASAVA_Build 6 43664062 16D TAGATGTCTG TCTTTCCTTCCTTCCT/---------------- TCTTTCCTTC 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 TCTTTCCTTCCTTCCT 2 1 109285 CASAVA_Build 6 43673917 1I GACTGTCACC -/A AAAAAAAAAA 1160 het 1160 ref 37 17 4 16 A 17 18 109286 CASAVA_Build 6 43678390 1D GAATTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 1215 het 1215 ref 18 12 3 3 T 12 11 109287 CASAVA_Build 6 43722825 65D AGCCTGGTGA CAGAGCGAGACCCTGTCTCAAAACAAATAAATAAATAAATAAACAAACTTTAAAAATAAATAGGC/----------------------------------------------------------------- CAGCAACGGC 3070 het 3070 ref 27 29 11 1 CAGAGCGAGACCCTGTCTCAAAACAAATAAATAAATAAATAAACAAACTTTAAAAATAAATAGGC 1 0 109288 CASAVA_Build 6 43751851 1I CAGGTGTGCG -/C CCCCTACACC 2838 het 2838 ref 24 10 8 6 C 4 5 109289 CASAVA_Build 6 43754653 4I TTCCGTCCTC ----/AAAA GAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 0 4 109290 CASAVA_Build 6 43755957 2I TAAGGGGATT --/GG GGGGGGGGTC 2507 het 2507 ref 29 11 9 9 G 8 10 109291 CASAVA_Build 6 43764823 1I AATACAACTG -/C CCAGTTTTTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 2 3 109292 CASAVA_Build 6 43788875 1I CGTGGTGGAA -/C CCCCATCTCT 966 het 387 hom 6 3 3 0 C 4 5 109293 CASAVA_Build 6 43817659 2I TTTGTCTTGG --/AC ACATAGTGTC 3070 hom 159 het 56 0 53 3 AC 1 2 109294 CASAVA_Build 6 43818099 4D TATGAGTCAG TCAA/---- TCAATCAATC 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TCAA 3 2 109295 CASAVA_Build 6 43829636 4D ATGTGGGTGT GTAG/---- GTGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 67 30 30 8 GTAG 1 0 109296 CASAVA_Build 6 43844516 1I AGAATGGGAT -/G GGGGCCTTTG 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 G 4 5 109297 CASAVA_Build 6 43855949 2I AAGGCACAAG --/GT GCCTGATACA 3070 hom 108 het 40 0 32 8 GT 0 1 109298 CASAVA_Build 6 43862762 2D CACTGATGGG AC/-- ACTCCCTGCC 3070 hom 99 het 34 0 33 3 AC 2 1 109299 CASAVA_Build 6 43866547 10I TTTCAGGTCT ----------/AGGCCTTAAG AGGCATTGTA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AGGCCTTAAG 0 1 109300 CASAVA_Build 6 43891277 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 2320 het 2265 hom 19 11 6 3 A 12 11 109301 CASAVA_Build 6 43896681 1D CAATAGAAAA G/- GAAAGAGGTC 3070 het 3070 hom 25 10 11 5 G 2 1 109302 CASAVA_Build 6 43901051 1D CCCATCCTCA G/- GGGGGTCCCA 3070 het 2391 hom 30 14 11 6 G 6 5 109303 CASAVA_Build 6 43904183 1D AAGAGGATTC A/- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 5 4 109304 CASAVA_Build 6 43904340 2I TCTGCAAACA --/TG TGCAACCAAG 3070 het 3070 hom 56 23 28 5 TG 1 2 109305 CASAVA_Build 6 43908593 1D TATATACATG T/- TAGGGGCATA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 2 1 109306 CASAVA_Build 6 43909884 1D ATTTCTGCTC T/- AATGGAAGGC 3070 hom 91 het 34 0 30 4 T 1 0 109307 CASAVA_Build 6 43914294 4I GAGGGCAGTC ----/TAAG TAAGTCCTGA 3070 hom 54 het 21 0 16 5 TAAG 1 2 109308 CASAVA_Build 6 43918505 1I CCCACCTCAG -/C CCCCCCCAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 7 8 109309 CASAVA_Build 6 43918565 2I AAATTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 20 1 12 7 TC 0 1 109310 CASAVA_Build 6 43923389 7D AAGCCAGGTA TGCTGCT/------- TGCTGCTTGC 3070 het 3070 ref 47 21 21 8 TGCTGCT 3 2 109311 CASAVA_Build 6 43934302 2D GAAAGTTCTT GG/-- GGGCCCAGGA 3070 het 2391 hom 24 9 11 4 G 5 3 109312 CASAVA_Build 6 43954343 4I GAGGAGAAGG ----/AGAA AGAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 48 16 19 13 AGAA 0 1 109313 CASAVA_Build 6 43961519 4I CCACCACTGT ----/CTAA CTGTGTGACC 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 CTAA 0 1 109314 CASAVA_Build 6 43966912 2I CTTTTCTGCT --/TC TCTCTGCTCC 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 TC 2 3 109315 CASAVA_Build 6 43969567 1I AGAACCAGAA -/T TGCTGGGCCC 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 T 1 2 109316 CASAVA_Build 6 43980750 4I TTTTTCTTTC ----/TTCT TTCTTTCTTT 3070 hom 25 het 11 0 9 2 TTCT 4 5 109317 CASAVA_Build 6 43996479 1I ATTATTTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 A 9 10 109318 CASAVA_Build 6 44032985 1I TGTCAATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 A 10 11 109319 CASAVA_Build 6 44043756 1I AGAAGAATAA -/T ATTATTAAGA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 0 1 109320 CASAVA_Build 6 44050880 1I GAAAAGATTA -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 T 6 7 109321 CASAVA_Build 6 44052400 1I TTCTCCTCTT -/G GGGGGCTTGA 3070 hom 114 het 46 0 38 8 G 5 6 109322 CASAVA_Build 6 44056331 1D TGCTGTGTCC T/- CCCCACTGCA 3070 het 3070 ref 45 24 13 9 T 1 0 109323 CASAVA_Build 6 44059593 1I TGAGCAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 35 0 27 8 A 9 10 109324 CASAVA_Build 6 44120900 8D7M2D18M1I ATATACACAC ACTCACATACACATTCACACACACATTCATATACA-/--------ACACATT--CACACACATTCATATACAT TTTTACACAC 1142 het 1142 ref 75 86 4 14 N/A 0 0 109325 CASAVA_Build 6 44151428 1D CCAGGGACTT A/- ACCTCCAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 2 1 109326 CASAVA_Build 6 44153944 4D TTCATTTAGT GTGA/---- GTGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 16 6 GTGA 1 0 109327 CASAVA_Build 6 44157566 2D CCCAGCCTCA CT/-- CTGACTCATC 3070 het 3070 ref 36 17 15 6 CT 2 1 109328 CASAVA_Build 6 44164836 4I TGCTTTTTTT ----/TTTG TTTGTTTTCC 3070 het 2133 hom 23 6 11 6 TTTG 1 2 109329 CASAVA_Build 6 44165465 1D CTAGAACCGG A/- AAAAGCTAGA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 A 5 4 109330 CASAVA_Build 6 44167308 1D TGTAGATACA G/- GGTCTCCCCA 3070 het 1464 hom 16 3 10 3 G 3 2 109331 CASAVA_Build 6 44180002 5I5M4D CAGAACTTCA -----CTGATGAGA/GGGTTCTGTT---- CACCCTGAGC 3070 het 3070 ref 47 27 16 9 N/A 0 0 109332 CASAVA_Build 6 44190905 1I TCTTCTCTCG -/T TTTTTTATGC 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 6 7 109333 CASAVA_Build 6 44192940 3I CAGTCTCCCA ---/AAC AACACTGTAA 3070 het 3070 ref 47 26 13 8 AAC 1 2 109334 CASAVA_Build 6 44198437 2I GGGAAAAGAG --/AC ACTGAGAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 AC 1 2 109335 CASAVA_Build 6 44202367 1I GTTCATTTAT -/C CGTCGGCTGT 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 C 1 2 109336 CASAVA_Build 6 44207450 1I TACACAACAA -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 C 7 8 109337 CASAVA_Build 6 44210551 1I CACCTGCCCC -/T GGTTTCCCAG 2045 het 2045 ref 31 15 5 11 T 0 1 109338 CASAVA_Build 6 44231175 3I TGTTTTTTTT ---/TGG TTGGTTTTTT 2740 het 1216 hom 14 5 6 3 TGG 0 1 109339 CASAVA_Build 6 44232012 3I AAAAAATCAC ---/CTT CTCGAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 CTT 0 1 109340 CASAVA_Build 6 44236893 1D TTCTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2234 het 2234 ref 24 10 8 6 T 14 13 109341 CASAVA_Build 6 44242589 3D CCCTTTTTCT TCC/--- TCCTCCTTCA 3070 het 3070 hom 24 11 12 2 TCC 3 2 109342 CASAVA_Build 6 44243632 1I CTCTGTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 31 1 26 4 A 10 11 109343 CASAVA_Build 6 44249286 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 4 het 18 0 9 9 T 9 10 109344 CASAVA_Build 6 44261486 1D AAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 12 11 109345 CASAVA_Build 6 44266836 2I TATATATAAC --/AT ATGGTATATA 2161 het 287 hom 9 2 5 2 AT 1 2 109346 CASAVA_Build 6 44271188 1I TTTTTTTTTT -/A ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 1 2 109347 CASAVA_Build 6 44271346 2D TATACCTGGC TA/-- TGTTTCTACT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 TA 1 0 109348 CASAVA_Build 6 44277711 2D ACCCAGACAC AT/-- GTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 AT 1 0 109349 CASAVA_Build 6 44292774 1D AAGAAAAATT G/- AGAATTGCCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 1 0 109350 CASAVA_Build 6 44312911 1I TAAGGAAATA -/G GCCTGTTTGT 3070 hom 92 het 39 0 28 11 G 1 2 109351 CASAVA_Build 6 44324523 1D TTTGGCATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 11 10 109352 CASAVA_Build 6 44324856 9D AGGATTTCGA GGGCAGCCT/--------- GGGCAACCGC 3070 het 3070 hom 41 17 23 7 GGGCAGCCT 1 0 109353 CASAVA_Build 6 44330140 2I GAAGAGTAAC --/TG TGGAACCTAC 3070 het 3070 hom 45 14 26 5 TG 1 2 109354 CASAVA_Build 6 44347039 1I AGATGTGTAC -/A GGGGGGTCCC 1443 het 1443 ref 24 7 7 10 A 0 1 109355 CASAVA_Build 6 44372352 30D CTCCTCCCTT CCTCTTAGTGGAGAAGTGGAGACACCCGGC/------------------------------ CCTCTTTGGG 2527 het 2527 ref 24 18 7 4 CCTCTTAGTGGAGAAGTGGAGACACCCGGC 1 0 109356 CASAVA_Build 6 44372650 2D AACTGAGCCT CG/-- GCCCGTGTGC 3070 hom 76 het 28 0 24 4 CG 1 0 109357 CASAVA_Build 6 44373719 2D AGTGCTTGTG CT/-- CTCTTGGTAG 3070 hom 51 het 20 0 16 4 CT 3 2 109358 CASAVA_Build 6 44374066 1D GACGGCTAGT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2786 hom 35 8 18 9 A 9 8 109359 CASAVA_Build 6 44374627 2I CCTCCATCTC --/TT TGCTTCCTCC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 3 109360 CASAVA_Build 6 44374978 1D TTCTCCCTTC T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 71 het 29 0 26 3 T 8 7 109361 CASAVA_Build 6 44375629 14I GACTGGTCTT --------------/AGGGCACCCATACC AGGTTGCTGG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AGGGCACCCATACC 0 1 109362 CASAVA_Build 6 44375708 5I GTGAAATAAT -----/TTTAT TATTTGAGAC 3070 hom 21 het 18 0 8 10 TTTAT 0 1 109363 CASAVA_Build 6 44376785 4I TTGGCCCCTT ----/TGTC TGGGAGGAAT 3070 hom 75 het 27 0 23 4 TGTC 0 1 109364 CASAVA_Build 6 44377643 3D CTCAGCTGGC AGG/--- AGAAGGAAGC 3070 het 2541 hom 36 10 19 8 AGG 1 0 109365 CASAVA_Build 6 44393232 2I TAATACGTGG --/CC CTTTTCAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 C 1 3 109366 CASAVA_Build 6 44393499 1D AATCACTGCA T/- TTTTTTTTTT 2070 het 2070 ref 24 11 7 6 T 13 12 109367 CASAVA_Build 6 44401418 1I GCTAAGCAGC -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 6 7 109368 CASAVA_Build 6 44403825 1D CGAGAGACTT G/- GAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 G 2 1 109369 CASAVA_Build 6 44417028 1D TATCTATCTA T/- AATATGTTAA 2020 het 2020 ref 22 9 6 7 T 1 0 109370 CASAVA_Build 6 44419709 1I GGAGAAAGGA -/G GGGAGGTACA 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 G 3 4 109371 CASAVA_Build 6 44420416 1I ATTCCTGCCT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 7 8 109372 CASAVA_Build 6 44423086 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 9 8 109373 CASAVA_Build 6 44440273 2D TTCGTTTTAG TA/-- TATGATTACT 3070 het 3070 ref 46 20 19 9 TA 2 1 109374 CASAVA_Build 6 44458019 1I CAAAGGTGAA -/C CCCTGAGAAA 3070 hom 120 het 41 0 39 2 C 3 4 109375 CASAVA_Build 6 44464391 1D TTATGGCTTC T/- TTTTTTTTTT 2566 het 1832 hom 42 14 8 20 T 17 16 109376 CASAVA_Build 6 44464656 1D AATAATACTT A/- ACCTCTCTTG 3070 hom 108 het 45 0 37 9 A 2 1 109377 CASAVA_Build 6 44467716 3D AGAAATTGGC TGT/--- TAAGAGGAAG 3070 hom 105 het 43 0 35 10 TGT 1 0 109378 CASAVA_Build 6 44470429 39D AAAATTAGCC AGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAGATCCAGCTACTGGGG/--------------------------------------- AGGCTGAGGT 2660 hom 15 het 8 0 6 2 AGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAGATCCAGCTACTGGGG 1 0 109379 CASAVA_Build 6 44477031 4D CCCCGTCCGT CCGC/---- CCGCAGCGTG 3070 hom 83 het 30 0 25 6 CCGC 2 1 109380 CASAVA_Build 6 44487181 1D CAATCTAAAA T/- TAAAAACTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 2 1 109381 CASAVA_Build 6 44488024 1D TGTCCCCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 30 3 23 5 T 13 12 109382 CASAVA_Build 6 44488318 1I AAAAAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 72 hom 37 1 31 5 T 10 11 109383 CASAVA_Build 6 44518725 1D TGGTTGGCAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 T 9 8 109384 CASAVA_Build 6 44530405 3D GAGATGAAAA TGG/--- TGGTTATCAG 3070 het 3070 hom 58 24 27 8 TGG 2 1 109385 CASAVA_Build 6 44532307 1I TTAAAAAAAA -/T ATTTATTTTG 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 0 1 109386 CASAVA_Build 6 44563387 1I CATAAACTCA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 7 8 109387 CASAVA_Build 6 44595322 1D TCTATTGTGG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 9 8 109388 CASAVA_Build 6 44603641 1I GCTTCCTGTC -/A AGACTCCTGG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 A 1 2 109389 CASAVA_Build 6 44606053 1I AGAAAAAGGT -/C CCTATTGCCC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 C 2 3 109390 CASAVA_Build 6 44610882 13D GGCATGCTGC AGCTGTAAGCCAA/------------- AGAATGCCAA 3070 het 3070 ref 44 26 22 6 AGCTGTAAGCCAA 1 0 109391 CASAVA_Build 6 44621094 1I TACCAAGAAG -/C CTGACTGGTA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 C 1 2 109392 CASAVA_Build 6 44629495 1I CCTTAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 696 hom 38 3 19 16 T 15 16 109393 CASAVA_Build 6 44631647 1I ATCTGGGCAA -/G GAGGGGGTAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 G 1 2 109394 CASAVA_Build 6 44635152 1I GCTTTTTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 A 10 11 109395 CASAVA_Build 6 44637206 1D TGGAGAGGAA G/- GGGGGAAACC 3070 het 814 hom 22 6 11 5 G 6 5 109396 CASAVA_Build 6 44639094 1I TGCAGGCATT -/G TAAGACCCTG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 G 0 1 109397 CASAVA_Build 6 44658102 1I TTTTCTATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 8 9 109398 CASAVA_Build 6 44658965 1D TAGAATTGTC A/- AGCCTCCCTG 3070 hom 101 het 39 0 32 7 A 2 1 109399 CASAVA_Build 6 44669489 1I AAAAACAAAC -/A AAAACCCTCC 3070 hom 82 het 31 0 28 3 A 4 5 109400 CASAVA_Build 6 44673845 1I AATAATTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 42 0 40 2 T 10 11 109401 CASAVA_Build 6 44678273 1D CTCTCCCCAG A/- AAAAGTCAGA 3070 hom 127 het 49 0 41 8 A 5 4 109402 CASAVA_Build 6 44686432 1D CATGTACACT C/- CAGGCCAAGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 2 1 109403 CASAVA_Build 6 44687303 11D GGACCTCTTC CTTCTCTCTTT/----------- CTTGCTCCAT 3070 hom 78 het 27 0 26 2 CTTCTCTCTTT 1 0 109404 CASAVA_Build 6 44693825 13D TACATGATTT AGTCCCTGGGCTA/------------- AGTCCCAAGT 3070 hom 110 het 40 0 37 3 AGTCCCTGGGCTA 1 0 109405 CASAVA_Build 6 44695589 2I CACACACGTG --/CA CACACACACA 3070 het 897 hom 38 2 25 11 CA 8 9 109406 CASAVA_Build 6 44696404 1D TATGGCTATA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 128 het 48 0 43 6 T 8 7 109407 CASAVA_Build 6 44702761 3I CCCACCAAGG ---/CCT CCTCCTGTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CCT 2 3 109408 CASAVA_Build 6 44708124 1I ACAGGGGCCT -/A ACCTTGTATT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 1 2 109409 CASAVA_Build 6 44715415 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 25 0 19 6 T 12 11 109410 CASAVA_Build 6 44720780 1I GTGGTATCCT -/G GGGGTCATCT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 G 4 5 109411 CASAVA_Build 6 44723897 1I AGATCCTTCT -/G CCTGCATCCC 3070 hom 132 het 51 0 44 7 G 0 1 109412 CASAVA_Build 6 44727741 2D AACAGCTTCA GT/-- GCAGGTGAGC 3070 het 3070 hom 40 15 22 5 GT 1 0 109413 CASAVA_Build 6 44729927 2D CCCCTAAGAG AA/-- TGCCTCAGCT 3070 het 2765 hom 23 7 10 6 A 2 0 109414 CASAVA_Build 6 44745872 2D AGCCAGAGTT AC/-- CTGCTAATGG 3070 hom 123 het 44 0 37 8 AC 1 0 109415 CASAVA_Build 6 44780939 1D CCTAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 11 10 109416 CASAVA_Build 6 44781646 1I AGGCCAGGGT -/G GGGTGGCATG 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 G 3 4 109417 CASAVA_Build 6 44786225 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 18 8 8 2 A 9 10 109418 CASAVA_Build 6 44794099 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2941 het 1002 hom 16 4 10 2 T 13 14 109419 CASAVA_Build 6 44810658 1D CTGGTCTGAT G/- TTCTCACTGT 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 G 1 0 109420 CASAVA_Build 6 44812766 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1559 het 1559 ref 16 6 5 5 T 13 14 109421 CASAVA_Build 6 44840018 1I TTTGAAGTAG -/T TTTTTTTTCC 2318 het 2318 ref 23 15 6 2 T 8 9 109422 CASAVA_Build 6 44851647 1D AGCAGTGAAC A/- ATTTGTCATT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 2 1 109423 CASAVA_Build 6 44858731 2I GTTAAAACAT --/AA AGTTAGTCTT 3070 het 3070 hom 46 21 23 3 A 1 3 109424 CASAVA_Build 6 44859648 23I AGACAAAAGG -----------------------/TGCTAAAGTGTTTTAGCACCTTT TGCTAAAGTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 TGCTAAAGTGTTTTAGCACCTTT 0 1 109425 CASAVA_Build 6 44861520 1I AAAGTTGGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 22 11 10 T 9 10 109426 CASAVA_Build 6 44863173 4I CTTTAGCGCC ----/CTGT CTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 CTGT 0 1 109427 CASAVA_Build 6 44881241 1I TTCTATAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 62 27 22 13 T 10 11 109428 CASAVA_Build 6 44881423 1D GTCAAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 11 10 109429 CASAVA_Build 6 44895233 3I ATAGATAAGA ---/GTG GTGGTGATTC 3070 het 3032 hom 22 8 9 5 GTG 2 3 109430 CASAVA_Build 6 44901382 4D ATGGTGTGCT GTAA/---- TTATTATGTC 3070 het 3070 hom 49 22 24 4 GTAA 1 0 109431 CASAVA_Build 6 44903563 1I ATGAAAGGTT -/A TTATATGAAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 0 1 109432 CASAVA_Build 6 44903899 5D TATCGTTTAA AAGTT/----- AAGTTAAGTT 3070 het 3070 ref 25 14 11 1 AAGTT 3 2 109433 CASAVA_Build 6 44907055 4I GGATTGAAGA ----/AAAC AAACATTCTA 3070 het 3070 ref 54 28 19 7 AAAC 1 2 109434 CASAVA_Build 6 44907871 1D ACGTCCCAAC T/- TTGGCATGCT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 T 3 2 109435 CASAVA_Build 6 44915037 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 2122 hom 32 9 17 6 A 1 0 109436 CASAVA_Build 6 44923848 1I ACTCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2781 het 1193 hom 16 5 8 3 T 9 10 109437 CASAVA_Build 6 44928720 1D TAATGTCCTA G/- TGGCTGTAGA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 G 1 0 109438 CASAVA_Build 6 44938393 2I ACTCTGTATC --/AA AAAAAAAAAA 2848 hom 24 het 15 0 8 7 A 14 16 109439 CASAVA_Build 6 44941146 4D TTATGCTGCT GATA/---- AAGACATACC 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 GATA 1 0 109440 CASAVA_Build 6 44942526 3D CTGGTAAAAC ATT/--- AGCTTGCAGT 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 ATT 1 0 109441 CASAVA_Build 6 44943281 1I AAGTTTTCAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 53 25 19 9 T 8 9 109442 CASAVA_Build 6 44944277 2D CTATGGACTC TG/-- TTCAGCTGCT 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 TG 1 0 109443 CASAVA_Build 6 44984518 1D AAAAAAAAAA T/- ATTGAAATAT 3070 het 3070 hom 28 15 13 0 T 1 0 109444 CASAVA_Build 6 44986412 1D CTTTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 32 1 21 10 A 12 11 109445 CASAVA_Build 6 44986992 4D GCATTCCCAC CACA/---- TGTTTGACAG 3070 het 3070 hom 29 14 14 4 CA 2 0 109446 CASAVA_Build 6 44995178 1I CTATAGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 38 1 30 7 T 13 14 109447 CASAVA_Build 6 44996281 1D TGTTTCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1570 hom 32 8 15 9 A 18 17 109448 CASAVA_Build 6 45009022 1D ACGAAACCAA C/- AACTTTCTGT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 C 1 0 109449 CASAVA_Build 6 45011814 6D AGTCTAGTAC TACTAT/------ TACTAACATT 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 TACTAT 1 0 109450 CASAVA_Build 6 45015063 1D CCTTCATTCT G/- TTTATGTAAT 3070 het 3070 hom 55 26 27 2 G 1 0 109451 CASAVA_Build 6 45015619 1I TGTAATATCT -/C CTTGTTCAAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 1 2 109452 CASAVA_Build 6 45017141 1D TGGCTGACAG T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 7 6 109453 CASAVA_Build 6 45018904 1I TGGAAACTAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 6 7 109454 CASAVA_Build 6 45036189 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 hom 21 10 8 3 A 7 6 109455 CASAVA_Build 6 45038297 1I TGAGATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 37 2 26 9 T 10 11 109456 CASAVA_Build 6 45050014 3D ACATATATGT ATA/--- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 ATA 1 0 109457 CASAVA_Build 6 45051362 1I TCGGGTTACA -/G GTGCACCAAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 G 1 2 109458 CASAVA_Build 6 45058395 3D TCTCCTATCT CTC/--- CTCTATCTTG 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 CTC 2 1 109459 CASAVA_Build 6 45060695 1D GATGAAAGAG T/- TTTGGGGGAT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 4 3 109460 CASAVA_Build 6 45066609 1I GTTATTTATT -/A AAAATAATTA 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 A 4 5 109461 CASAVA_Build 6 45070879 1D TAAAACATTT A/- AAGGACTAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 3 2 109462 CASAVA_Build 6 45074739 1D GCCTCTGTGA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 8 7 109463 CASAVA_Build 6 45078594 1I CACTTAGCAC -/A ATCTTTTGCA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 1 2 109464 CASAVA_Build 6 45081416 1I AACTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2593 het 1973 hom 22 7 10 5 A 17 18 109465 CASAVA_Build 6 45085698 2D GAACGTAGGA TG/-- TCTTTCCATT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 TG 1 0 109466 CASAVA_Build 6 45091511 4D CACACGCGCG CGCA/---- CACACACACA 3070 het 883 hom 18 3 10 7 CGCA 1 0 109467 CASAVA_Build 6 45098131 2D GGAATCACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 34 1 19 14 T 18 16 109468 CASAVA_Build 6 45099454 2D AAAAGGAAAC AT/-- AGACACTGGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AT 1 0 109469 CASAVA_Build 6 45102147 3I AATTACTAGT ---/AGG AGAATTATAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AGG 0 1 109470 CASAVA_Build 6 45104166 1D25M1D AGCTTTCAGA TTTTTTTTTTTTTGACAGTTCTCACCT/-TTTTTTTTTTTTGACAGTTCTCACC- GCTATTTAGT 3070 het 3070 hom 38 21 21 8 N/A 0 0 109471 CASAVA_Build 6 45110352 5D ATTCAGAGAC TTAAT/----- TTAAGAAAGG 3070 het 3070 ref 42 23 17 4 TTAAT 1 0 109472 CASAVA_Build 6 45115573 2I AAAAAAAAAA --/AT TTTTGCTAGA 3070 het 925 hom 39 2 18 19 AT 0 1 109473 CASAVA_Build 6 45118544 2I TCACAATAGC --/AA AGACTTGGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 3 109474 CASAVA_Build 6 45123937 16D CTCTCTACTC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 13 11 11 T 25 9 109475 CASAVA_Build 6 45126166 1D AAAGGCAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2907 hom 31 10 18 3 A 10 9 109476 CASAVA_Build 6 45137444 2I TAAAATCCAT --/TA TATGACTATA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TA 1 2 109477 CASAVA_Build 6 45145578 1D GACACAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 10 9 109478 CASAVA_Build 6 45148361 1I ACTTCAGCAT -/A AAAAAGGAGG 3070 hom 80 het 30 0 28 2 A 5 6 109479 CASAVA_Build 6 45151522 1D CAATTAAGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 9 8 109480 CASAVA_Build 6 45156748 2I CATATATCCC --/AT ATATATATAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AT 5 6 109481 CASAVA_Build 6 45158214 2I CAACATATAT --/AA GTCAATAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 2 109482 CASAVA_Build 6 45165400 1I CAGCTCTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 132 het 53 0 45 8 T 9 10 109483 CASAVA_Build 6 45171175 6D GTGCATTTTA ATCCAG/------ ATCGGAGATT 3070 het 3070 hom 49 22 24 4 ATCCAG 1 0 109484 CASAVA_Build 6 45175067 1D TGTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2932 het 2452 hom 34 9 15 10 A 15 14 109485 CASAVA_Build 6 45185247 1I GAGCATACAC -/A TGTAAAGTAA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 0 1 109486 CASAVA_Build 6 45186285 1D AGCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 A 12 11 109487 CASAVA_Build 6 45188706 1I TTAGTTCTGG -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 47 17 12 18 T 7 8 109488 CASAVA_Build 6 45188820 1D AAAAGAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1745 hom 46 6 24 16 T 12 11 109489 CASAVA_Build 6 45190090 1I AAGATGAGAG -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 7 8 109490 CASAVA_Build 6 45197754 1I ATTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 A 10 11 109491 CASAVA_Build 6 45200352 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2463 hom 25 6 8 11 A 13 12 109492 CASAVA_Build 6 45215277 2D GGAGAAAAAC TG/-- TGAGTTCCCA 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 TG 2 1 109493 CASAVA_Build 6 45217370 1I AGACAAAGAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 8 9 109494 CASAVA_Build 6 45237748 1I GAACATGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 50 29 15 6 A 9 10 109495 CASAVA_Build 6 45248309 3D GATAGATATA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 523 hom 27 8 11 9 T 17 14 109496 CASAVA_Build 6 45251428 1I AAGTGATATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 9 10 109497 CASAVA_Build 6 45260491 16D CAGGCAGAGG AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 2647 het 2647 ref 35 18 7 13 A 28 12 109498 CASAVA_Build 6 45267393 1D TAACTGCTCT A/- AAAAATACAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 6 5 109499 CASAVA_Build 6 45270798 3D AATAAAAAAC AAT/--- GAATTGGCAC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AAT 1 0 109500 CASAVA_Build 6 45273910 1D AACAAAAAAA T/- ATTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 1 0 109501 CASAVA_Build 6 45274449 19I GCTATATCTT -------------------/TTTAATTCTATATACACAG TCCTTGAGTT 3070 het 3070 hom 24 12 13 0 TTTAATTCTATATACACAG 0 1 109502 CASAVA_Build 6 45284567 35D AGACAGGCTG ACCCTCTTGTTAGGGGCTCATGAGGCTGATGACTT/----------------------------------- ACCCTCTTGT 1696 het 1696 ref 39 19 5 24 ACCCTCTTGTTAGGGGCTCATGAGGCTGATGACTT 2 1 109503 CASAVA_Build 6 45287567 1D CGTCTCAACT A/- AAAAAAAAAA 2545 het 652 hom 20 4 10 7 A 13 12 109504 CASAVA_Build 6 45293621 1D AAAAGAAAAC A/- AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 A 4 3 109505 CASAVA_Build 6 45306281 9I ACTATCCTTA ---------/TCCATCCCT TCCATCCCTT 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 TCCATCCCT 1 2 109506 CASAVA_Build 6 45311857 2I TGTGAGTCCC --/CT GATTTCCCAC 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 CT 0 1 109507 CASAVA_Build 6 45316922 1I TGGGAACAGG -/C CCCCCCCCCA 2374 het 1989 hom 21 8 7 6 C 9 10 109508 CASAVA_Build 6 45336137 1D TATTCCTATC A/- AAAAAAATCA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 8 7 109509 CASAVA_Build 6 45337186 1D ACAAAATCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 17 17 9 A 10 9 109510 CASAVA_Build 6 45341878 1I AACCTGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 40 1 29 10 T 10 11 109511 CASAVA_Build 6 45348513 3I TCTAATAATA ---/AGC AGATGTTATC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AGC 0 1 109512 CASAVA_Build 6 45369644 3D GGTACCAATC TTA/--- TTGACACTAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TTA 1 0 109513 CASAVA_Build 6 45374907 1I CTGAAAGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2435 hom 26 9 12 5 A 12 13 109514 CASAVA_Build 6 45375051 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 212 hom 22 2 14 6 A 14 15 109515 CASAVA_Build 6 45375585 1D TTTTATGTTC T/- TTTTATTGTC 3070 het 3070 hom 21 8 12 2 T 5 4 109516 CASAVA_Build 6 45376553 5I GGCAAAACCT -----/AAGAC AAGAACTCTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAGAC 0 1 109517 CASAVA_Build 6 45380467 1I AAAGTAACCA -/T TTTAATGGGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 3 4 109518 CASAVA_Build 6 45382493 14D AGGCTTGTCA GACAGTGGGTGCAG/-------------- GACAGTGGGT 1945 het 1945 ref 18 8 5 10 GACAGTGGGTGCAG 2 1 109519 CASAVA_Build 6 45392131 1D TATAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 25 6 A 12 11 109520 CASAVA_Build 6 45393594 3D GAACAAAGAA AAC/--- AATCAACAGA 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 AAC 1 0 109521 CASAVA_Build 6 45399954 1D ATAATCAAAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 36 9 20 7 A 8 7 109522 CASAVA_Build 6 45401359 6D TTTAAAAAGC AAAAAT/------ AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 15 2 AAAAAT 3 2 109523 CASAVA_Build 6 45403448 1D TAAGGTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 13 12 109524 CASAVA_Build 6 45411899 1I GAAGGAAAAC -/T TTAACATTTT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 T 2 3 109525 CASAVA_Build 6 45414060 1D TAGCTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 9 7 A 12 11 109526 CASAVA_Build 6 45417781 1D AAGAAACTAA C/- AGAAGAATTT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 C 1 0 109527 CASAVA_Build 6 45418456 3D TAGTTTGCGT TAA/--- TGTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 TAA 1 0 109528 CASAVA_Build 6 45428471 2D TTAGATCATG TA/-- TTTACAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 TA 1 0 109529 CASAVA_Build 6 45431133 1D AATGTTGATA T/- AACAGTTCCC 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 1 0 109530 CASAVA_Build 6 45439830 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 953 hom 12 2 10 0 A 13 12 109531 CASAVA_Build 6 45441600 3I CAAAAGCATT ---/ATG ATATTTTATA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 ATG 0 1 109532 CASAVA_Build 6 45443805 2D ACTAATAAAT AC/-- AGTTACTGTG 3070 het 3070 ref 30 16 12 4 AC 1 0 109533 CASAVA_Build 6 45444702 4D TACCAAATGG TCAA/---- TCACTGAGAA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 TCAA 1 0 109534 CASAVA_Build 6 45464544 1I CAAATACTAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 8 9 109535 CASAVA_Build 6 45468423 1D CCTAGATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 T 14 13 109536 CASAVA_Build 6 45491400 1I ACTGCAGAAA -/C CTGCTGTGTG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 C 1 2 109537 CASAVA_Build 6 45493889 3I TTTTCATCAT ---/AAC AAGTATATAT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 AAC 0 1 109538 CASAVA_Build 6 45501609 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 20 20 5 AC 8 7 109539 CASAVA_Build 6 45516368 1I CGGATTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 38 1 29 8 T 11 12 109540 CASAVA_Build 6 45560908 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2704 hom 31 9 11 11 T 15 14 109541 CASAVA_Build 6 45575032 2I GAGCAGGGAA --/TC TCTGTACAGG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 TC 1 2 109542 CASAVA_Build 6 45582685 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1140 het 1140 ref 28 22 5 1 T 13 12 109543 CASAVA_Build 6 45592663 1D CTTACACAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 T 10 9 109544 CASAVA_Build 6 45593525 5D CAGTGGAAAA ACCCC/----- ACCCCATTTG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 ACCCC 2 1 109545 CASAVA_Build 6 45593993 1D GGACCCTAAA C/- AAAGGCAAGC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 C 1 0 109546 CASAVA_Build 6 45609142 1D GTCCATTGTT A/- AAAAGAGAGT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 5 4 109547 CASAVA_Build 6 45610967 1I AAGTTAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 A 9 10 109548 CASAVA_Build 6 45614927 1I AATTGCCAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 9 10 109549 CASAVA_Build 6 45616882 1I TGCACTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 T 10 11 109550 CASAVA_Build 6 45625718 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1179 hom 25 7 11 7 T 15 14 109551 CASAVA_Build 6 45627361 1I AGTTTGGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2868 hom 29 12 12 5 T 9 10 109552 CASAVA_Build 6 45631926 1I CCTGTTTCAG -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 7 8 109553 CASAVA_Build 6 45639371 1D TACTTTCTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 10 9 109554 CASAVA_Build 6 45654775 1D TTCTCCTCTA T/- TTTTTCTCTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 6 5 109555 CASAVA_Build 6 45655369 1I CAAAAGAGGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 265 hom 49 1 41 7 T 8 9 109556 CASAVA_Build 6 45657127 3I TATATGTTTT ---/TTC TTTTTTCTCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTC 0 1 109557 CASAVA_Build 6 45657600 1I ACCATCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 716 hom 52 4 33 15 T 15 16 109558 CASAVA_Build 6 45670205 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 16 2 13 1 A 13 14 109559 CASAVA_Build 6 45678193 1D AAAGAAAAAA T/- TTTTAAATAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 5 4 109560 CASAVA_Build 6 45680243 1D GAGAGATAAG A/- CACAAATTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 0 109561 CASAVA_Build 6 45680707 1I AACCAACTTC -/T TTAGAGAAGA 3070 hom 62 het 26 0 18 8 T 2 3 109562 CASAVA_Build 6 45682502 4I TGTCTCTCTC ----/TCTT TGTCTGTCTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TCTT 0 1 109563 CASAVA_Build 6 45684765 2D TTTTTTTTTT TA/-- ACCCATCTTT 3070 het 124 hom 33 3 21 9 TA 1 0 109564 CASAVA_Build 6 45686656 2D GCACCTGGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 20 8 T 14 12 109565 CASAVA_Build 6 45688377 3D TACTGCTGAG TAT/--- TATTCCACTG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TAT 2 1 109566 CASAVA_Build 6 45693926 1D ATGCAGGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 30 1 22 8 T 14 13 109567 CASAVA_Build 6 45697842 9D CAAAAAAATA GTGTTTTTT/--------- GTGTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 GTGTTTTTT 2 1 109568 CASAVA_Build 6 45699427 1I GGAATAATTC -/A AAAAAACATG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 6 7 109569 CASAVA_Build 6 45714501 3D TTTGGGGAGA AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 hom 95 het 37 0 31 7 AGG 7 6 109570 CASAVA_Build 6 45723759 1I AGAAGAAGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 8 9 109571 CASAVA_Build 6 45739919 1D TGGAAAAATA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 9 8 109572 CASAVA_Build 6 45756264 3D ACTCAGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1061 hom 26 het 19 0 5 15 A 19 16 109573 CASAVA_Build 6 45780694 1D AGTAGACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 11 10 109574 CASAVA_Build 6 45794986 1D GGGTTGGTTT C/- CATAGAAAGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 2 1 109575 CASAVA_Build 6 45798013 1D AGAACTTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 32 1 26 6 A 13 12 109576 CASAVA_Build 6 45800353 1I TTAAGCAATG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 8 109577 CASAVA_Build 6 45809343 4D TAAAATTTAT TTTA/---- TTTATTTTTA 3070 het 2457 hom 22 7 13 4 TTTA 2 1 109578 CASAVA_Build 6 45827219 3D CCTCTATCAC CCA/--- CCACCACCAC 3070 het 3070 ref 42 17 12 13 CCA 4 3 109579 CASAVA_Build 6 45828572 21D AGCGCCTTGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/--------------------- TTTTTTTTGG 2895 het 646 hom 16 5 8 4 T 29 8 109580 CASAVA_Build 6 45833809 1I GGAGAAGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 47 het 19 0 15 4 T 9 10 109581 CASAVA_Build 6 45841765 2D AGACTAACCC CT/-- GAGTGGTGCA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 CT 1 0 109582 CASAVA_Build 6 45858722 2D TTTCAAATTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 13 11 109583 CASAVA_Build 6 45869806 1D TACTTATTAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 59 het 28 0 18 10 T 9 8 109584 CASAVA_Build 6 45872935 10D GAGTGAGGGA CAGGGCAGCT/---------- CAGGGCAGCT 3070 hom 69 het 33 0 24 13 CAGGGCAGCT 2 1 109585 CASAVA_Build 6 45875568 1I TTATATCAGG -/A AAAGGTTCTA 3070 hom 33 het 18 0 12 6 A 3 4 109586 CASAVA_Build 6 45876775 1I ATAAACTCAT -/C TTGCTAGCGT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 C 0 1 109587 CASAVA_Build 6 45878266 2I TGGAAGTAAA --/AG GGAATTTCAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AG 0 1 109588 CASAVA_Build 6 45885935 1D CCAACGGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 13 8 T 13 12 109589 CASAVA_Build 6 45890475 1D TGATACCATC A/- AAATATCATC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 4 3 109590 CASAVA_Build 6 45892043 1I TCTTTCAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 T 11 12 109591 CASAVA_Build 6 45905494 1I CAACTTTTTT -/C CTGAGGAGCT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 C 1 2 109592 CASAVA_Build 6 45928213 4D CTCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AAAC 5 4 109593 CASAVA_Build 6 45947120 1I TTTATTCCTT -/G TTGGTTGTGA 3070 hom 172 het 65 0 58 7 G 0 1 109594 CASAVA_Build 6 45964947 1I TTATTTCTGG -/T TTGCAGACAG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 2 3 109595 CASAVA_Build 6 45967349 1I ATTTCATTTC -/A AAAAAAAAAA 1952 het 1314 hom 19 7 6 6 A 15 16 109596 CASAVA_Build 6 45978978 2D AATCTAAAAC AG/-- AGATGGCAGG 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 AG 2 1 109597 CASAVA_Build 6 45996555 3D GAAATGTAGA TGC/--- TGCTATAACG 3070 het 3070 ref 45 17 21 8 TGC 2 1 109598 CASAVA_Build 6 45997339 1I GAGAAGAGAT -/C AGCTCAAGGC 3070 het 3070 ref 60 32 22 6 C 0 1 109599 CASAVA_Build 6 46002879 1I GTTTGTATAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 8 9 109600 CASAVA_Build 6 46010136 1D GAAAAGTGGA C/- TTGAAGGGGG 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 C 1 0 109601 CASAVA_Build 6 46023790 2D CTGTCCTGAC TG/-- TGAAATGAGG 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 TG 2 1 109602 CASAVA_Build 6 46033667 1I TCCAGAGAGA -/T TTTTGAGCAC 3070 hom 102 het 41 0 33 8 T 4 5 109603 CASAVA_Build 6 46046005 1I ACAATTACAG -/A AAAAAACCAA 3070 hom 99 het 43 0 33 10 A 6 7 109604 CASAVA_Build 6 46054645 2D AAACTCCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 25 0 23 8 A 14 12 109605 CASAVA_Build 6 46062470 5D TAAGGATACA ATCTC/----- CCCTGCATTC 3070 hom 120 het 43 0 39 5 ATCTC 1 0 109606 CASAVA_Build 6 46073209 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2398 het 110 hom 11 1 8 2 A 15 14 109607 CASAVA_Build 6 46077944 2D TAATTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 TG 1 0 109608 CASAVA_Build 6 46104338 5I4M1I TCTCTCTCTA -----TTAG-/TTTTTTTAGA ACTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 23 14 4 N/A 0 0 109609 CASAVA_Build 6 46108567 2I CAGAGGAAGC --/AG AGTTTCCAAG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 AG 1 2 109610 CASAVA_Build 6 46111449 1D TTTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2701 het 2328 hom 20 9 9 2 T 11 10 109611 CASAVA_Build 6 46115087 1D TTATTACATT A/- AAAAAACCAG 2802 het 2802 ref 23 14 6 4 A 7 6 109612 CASAVA_Build 6 46118064 1D GTTCTGTAGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 T 8 7 109613 CASAVA_Build 6 46118254 2D CATCATCAGT AC/-- AGTCATGCCT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 AC 1 0 109614 CASAVA_Build 6 46119472 1I CTATGTCTCC -/A ATTCACCAAT 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 A 1 2 109615 CASAVA_Build 6 46121617 1I AGGAACGCAC -/A ATGAACATAA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 1 2 109616 CASAVA_Build 6 46123539 2I TTCAAAAAAA --/TT ACAGAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 0 2 109617 CASAVA_Build 6 46127822 1D GATTTCCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 14 13 A 13 12 109618 CASAVA_Build 6 46135526 1D TAATCACCCC T/- CTCACATAAG 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 T 1 0 109619 CASAVA_Build 6 46154063 2D CTCAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 9 A 12 10 109620 CASAVA_Build 6 46158497 1D CTTACCCTAC T/- TTCCCCCCCT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 3 2 109621 CASAVA_Build 6 46166099 1D TCAACTTGAT G/- GGTTTTTTTT 3070 het 2937 hom 35 12 14 9 G 3 2 109622 CASAVA_Build 6 46168330 2D TATTCCCTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 48 21 19 9 TG 9 8 109623 CASAVA_Build 6 46177657 1I GAATATTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2091 hom 25 6 15 4 A 10 11 109624 CASAVA_Build 6 46178760 1I TTCACTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 10 11 109625 CASAVA_Build 6 46180361 1I TCCTATGTTT -/A AAAAAAAAAA 1432 het 1432 ref 31 18 4 9 A 17 18 109626 CASAVA_Build 6 46193507 1D TCTAAAATAG A/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 1 0 109627 CASAVA_Build 6 46206817 1D TTGGAAGACA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 T 9 8 109628 CASAVA_Build 6 46208848 4D AAGGAGTAAT GGAG/---- GGAGGTATTT 3070 het 3070 ref 37 19 17 4 GGAG 2 1 109629 CASAVA_Build 6 46215075 1I GACAAGACAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 8 9 109630 CASAVA_Build 6 46218057 4D AATATATATA ATAT/---- ATATAATGTA 617 het 495 hom 4 1 3 0 AT 4 2 109631 CASAVA_Build 6 46223308 2D GTACAGGCAC AT/-- GTGTGTATAG 3070 het 3070 ref 50 23 26 2 AT 1 0 109632 CASAVA_Build 6 46226012 1I AAGATGACCT -/A AAGAAAAAAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 2 3 109633 CASAVA_Build 6 46226207 2I TTATATCTAT --/CA CAGACATTAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 CA 1 2 109634 CASAVA_Build 6 46230250 1I TGCTAAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 10 11 109635 CASAVA_Build 6 46233976 3D CATTTTAAAA CGT/--- CTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 CGT 1 0 109636 CASAVA_Build 6 46235296 1I CTATTCTATT -/A AAGAGGTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 2 3 109637 CASAVA_Build 6 46238913 2D TTTGCATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 T 12 10 109638 CASAVA_Build 6 46240426 3I AACTGTTTAT ---/TTA TTTTTTTTTT 1837 het 650 hom 12 3 7 2 TTA 0 1 109639 CASAVA_Build 6 46242372 3I TCATATGATT ---/CTC CTAATTCCCC 3070 hom 87 het 34 0 27 7 CTC 0 1 109640 CASAVA_Build 6 46244664 4D TTCGTTGAAC TAAA/---- TAATTAGATT 3070 het 3070 ref 33 19 14 1 TAAA 1 0 109641 CASAVA_Build 6 46246087 1I ACAATCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 T 13 14 109642 CASAVA_Build 6 46256738 1D TATATTTTCA T/- TTTTAATGAT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 5 4 109643 CASAVA_Build 6 46257218 4I AAATTTTTTA ----/ATAG ATAGCCAATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ATAG 1 2 109644 CASAVA_Build 6 46267464 2D CTATATTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 570 hom 27 3 15 9 T 18 16 109645 CASAVA_Build 6 46285392 4D AGAAAGAAAC AAAT/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 6 AAAT 1 0 109646 CASAVA_Build 6 46312137 1D TCTGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1374 het 1374 ref 38 26 3 9 T 13 12 109647 CASAVA_Build 6 46327725 1D ATGTCCTCTC T/- TTTCAGGCCT 3070 hom 135 het 51 0 45 8 T 4 3 109648 CASAVA_Build 6 46342639 1D TCCACCGACA T/- TTAAAATCAA 3070 hom 54 het 24 0 19 6 T 3 2 109649 CASAVA_Build 6 46353286 1I TTTTTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 542 hom 33 2 24 7 T 11 12 109650 CASAVA_Build 6 46357557 1D TAAGGCTTAT A/- AGTGGCTAGG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 A 2 1 109651 CASAVA_Build 6 46389698 1D AACAAATAGT G/- GGGGGCTTTT 3070 hom 102 het 38 0 32 6 G 6 5 109652 CASAVA_Build 6 46391598 23D GTTTGGAAGA GTTTGGAAGAGACAAGAAAAGAG/----------------------- GTTTGGAAGA 3070 hom 60 het 35 0 20 17 GTTTGGAAGAGACAAGAAAAGAG 2 1 109653 CASAVA_Build 6 46412850 1I TCTCCATGTT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 8 9 109654 CASAVA_Build 6 46414646 6I AGGAGGTGGA ------/GGTTGC GGTTGCAGTG 2751 het 2346 hom 17 6 6 5 GGTTGC 1 2 109655 CASAVA_Build 6 46416028 1I TTATGCATAT -/A AAGAGAGATA 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 A 2 3 109656 CASAVA_Build 6 46417100 1I TGAACTAAAA -/G AATAAAAATC 2994 het 2994 ref 20 11 8 1 G 0 1 109657 CASAVA_Build 6 46417720 1I TTGGGGTGCC -/T TTTGGTTATG 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 3 4 109658 CASAVA_Build 6 46420199 3I AAAGCAAAAA ---/AAT AATGAATTAT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 AAT 1 2 109659 CASAVA_Build 6 46420545 1I AGATGACAGA -/C TTAAACTCAA 3070 het 3070 ref 34 20 14 0 C 0 1 109660 CASAVA_Build 6 46420723 2I ATACATAAAC --/AT ATATTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 AT 2 3 109661 CASAVA_Build 6 46423451 4D ACAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 2914 het 2914 ref 32 18 9 8 AAAC 4 3 109662 CASAVA_Build 6 46427370 1I TTCAATGGAT -/C CCAGATAATA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 C 2 3 109663 CASAVA_Build 6 46436754 1D CACAAAGTGG T/- TTAAGGCTAG 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 T 3 2 109664 CASAVA_Build 6 46439503 1I TCATGCAAAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 9 109665 CASAVA_Build 6 46450583 4D AACTCACAGC TATT/---- TATTTATTTA 2574 het 2574 ref 28 11 8 10 TATT 4 3 109666 CASAVA_Build 6 46465716 3D ATTCGAGACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2717 hom 29 10 9 11 A 17 14 109667 CASAVA_Build 6 46479107 1I TGTCTCTGCT -/A AAAAAAACAA 3070 het 1936 hom 12 5 7 0 A 7 8 109668 CASAVA_Build 6 46479918 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 A 11 10 109669 CASAVA_Build 6 46521533 6D GTGAACTTGA AGACAG/------ AGACAGGTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 7 AGACAG 2 1 109670 CASAVA_Build 6 46528931 2D AAGATCACAG TT/-- TTAAATGTGT 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 T 4 2 109671 CASAVA_Build 6 46534593 8I GCGCGCGCAC --------/ACGCGCGT GTGTGTGTGT 3070 het 2065 hom 26 10 12 4 ACGCGCGT 0 1 109672 CASAVA_Build 6 46536284 1I TCCCTGAGCA -/C CCTGCACAGC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 2 3 109673 CASAVA_Build 6 46537281 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2604 het 2604 ref 29 13 10 6 T 13 12 109674 CASAVA_Build 6 46537818 14D CCAGTGTATG AAACCTCCAGCTTC/-------------- AAACCTCCAG 3070 het 3070 ref 46 26 17 6 AAACCTCCAGCTTC 1 0 109675 CASAVA_Build 6 46538324 1D AGTGAAAAAA T/- TTCTTTTCCC 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 3 2 109676 CASAVA_Build 6 46540610 2D TATGAAGTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 29 2 16 12 A 14 12 109677 CASAVA_Build 6 46542227 3D TTTCAACTCA AGG/--- AGGAAAGGCA 3070 het 3070 ref 39 16 16 9 AGG 2 1 109678 CASAVA_Build 6 46556328 1I GAGTTACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 T 11 12 109679 CASAVA_Build 6 46557472 1I TGCAACTAGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 7 8 109680 CASAVA_Build 6 46557697 1I AGAAGAGGCA -/T TAATTTTGAT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 1 2 109681 CASAVA_Build 6 46566474 1I TCTCTTCTAG -/C ACCCTCTCTA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 C 0 1 109682 CASAVA_Build 6 46596263 5D TTTATTTTTA TTTAT/----- TTTTTTTTTA 975 het 468 hom 23 3 5 15 TTTAT 1 0 109683 CASAVA_Build 6 46602415 1I ATCAATATCT -/C CCATTGGCCA 3070 hom 138 het 52 0 44 8 C 2 3 109684 CASAVA_Build 6 46604314 15I ATGTCTCAGA ---------------/TGATAGCACCTCTTT TGGGTTCTGG 3070 hom 75 het 30 0 26 5 TGATAGCACCTCTTT 0 1 109685 CASAVA_Build 6 46610018 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 1875 het 1492 hom 13 3 5 5 ATA 4 5 109686 CASAVA_Build 6 46623191 1D CTTGCTCATG C/- CTATATCCCC 3070 hom 61 het 24 0 21 4 C 2 1 109687 CASAVA_Build 6 46630292 4D TTTCTAAGAC ACAT/---- ACAAATAGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ACAT 1 0 109688 CASAVA_Build 6 46636475 1I AAACTTGATT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 9 109689 CASAVA_Build 6 46643692 3D CATTTTTTTT TAA/--- AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TAA 1 0 109690 CASAVA_Build 6 46644197 1D GCTTGTGCTC T/- GTTTTTCTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 0 109691 CASAVA_Build 6 46644617 1I TATTTCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 28 1 22 5 A 10 11 109692 CASAVA_Build 6 46647359 1D TTTTGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 39 31 4 4 T 11 10 109693 CASAVA_Build 6 46647884 1D TTCGGGAGTT A/- AAAACATATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 5 4 109694 CASAVA_Build 6 46653472 1D CCAGATTCAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 88 het 38 0 30 8 A 9 8 109695 CASAVA_Build 6 46676904 1D GCAAAATTTG T/- TTTTATTTGC 3070 het 3070 ref 57 27 26 4 T 5 4 109696 CASAVA_Build 6 46689636 1D ACAAAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1207 hom 13 5 8 0 A 13 12 109697 CASAVA_Build 6 46690414 1D CAAGCAGCAG A/- AACTAAACCT 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 A 3 2 109698 CASAVA_Build 6 46696365 1D TTGAGGCTCT G/- GCACAGGTAG 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 G 2 1 109699 CASAVA_Build 6 46696602 4D AATAACTAAA CAAT/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 CAAT 1 0 109700 CASAVA_Build 6 46696913 2I TGAAGAAACT --/CA GTTGCTGGAC 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 CA 0 1 109701 CASAVA_Build 6 46698884 1I TGACTGGATC -/A GGGGGTGCCC 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 A 0 1 109702 CASAVA_Build 6 46699681 1I CGAAGGAGCA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 6 7 109703 CASAVA_Build 6 46701758 1I TTTTTTTGGC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 45 19 22 4 T 7 8 109704 CASAVA_Build 6 46739435 1I GGGGACAAGT -/C TATATACTAC 3070 hom 141 het 51 0 48 3 C 0 1 109705 CASAVA_Build 6 46753727 24D TGTAAAATAT TATATATATATATATATATATATA/------------------------ TATATATATA 3070 hom 81 het 29 0 28 6 TA 17 5 109706 CASAVA_Build 6 46755265 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 13 0 10 3 A 17 16 109707 CASAVA_Build 6 46759432 1D TTATTACATG T/- TTCCTGTGGT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 3 2 109708 CASAVA_Build 6 46762173 1D AGAAGTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 32 1 24 7 A 17 16 109709 CASAVA_Build 6 46793406 8D TTCTTTTTTC TTTTTCTT/-------- TTTTTTTTTT 2829 het 274 hom 23 3 15 5 TTTTTCTT 1 0 109710 CASAVA_Build 6 46809151 3D CTGGCTGTAC AGT/--- AGGCAGTCAC 3070 hom 186 het 71 0 60 14 AGT 1 0 109711 CASAVA_Build 6 46815778 4D AGGACTAGAG CGCC/---- CGCCAGTCCA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 CGCC 2 1 109712 CASAVA_Build 6 46837475 11D GGATTCCTTA TTTTTATTATT/----------- ATAATTATTA 3070 het 3070 hom 24 9 10 6 TTTTTATTATT 1 0 109713 CASAVA_Build 6 46914908 12I GTCAATGCAG ------------/TTTGGGGCAGCT TTTTTATCAG 3070 het 3070 ref 35 14 10 11 TTTGGGGCAGCT 0 1 109714 CASAVA_Build 6 46916997 24D TCACTTTTGA TGATTAATGGAAACCTCTGTTGAT/------------------------ TGATTAATGG 2964 het 2964 ref 32 14 8 13 TGATTAATGGAAACCTCTGTTGAT 2 1 109715 CASAVA_Build 6 46920625 4D TTCTTGTGAT AGTA/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 AGTA 1 0 109716 CASAVA_Build 6 46926640 2D CGTGACTTCC CA/-- CAGTCTTTCT 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 CA 2 1 109717 CASAVA_Build 6 46930597 1I ATTGAAGCAG -/A AAAAAACCCA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 6 7 109718 CASAVA_Build 6 46931765 1I CTAGAAGAGA -/G GAAAAAAAGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 1 2 109719 CASAVA_Build 6 46933484 1I GGGCAATCCC -/T TGTCCTCACA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 1 2 109720 CASAVA_Build 6 46941702 1D TGTTTTGAGA T/- TTTTGGGTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 4 109721 CASAVA_Build 6 46942013 2D GCTTAGTCTC TT/-- ACTGAATGTG 3070 hom 128 het 48 0 43 5 T 2 0 109722 CASAVA_Build 6 46942866 1D GAGATGGAAT G/- GAAATAATCG 3070 hom 105 het 41 0 36 6 G 2 1 109723 CASAVA_Build 6 46943491 2D AATTCCTGCT GC/-- GGGGGGGAAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GC 1 0 109724 CASAVA_Build 6 46946619 2I CACAACTCTT --/TG TGTTAAAACT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TG 1 2 109725 CASAVA_Build 6 46952596 1D CCACCGCCCC T/- GTTCTGATAA 2365 het 1336 hom 18 6 7 5 T 1 0 109726 CASAVA_Build 6 46956634 1D AAAAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1909 hom 25 7 13 6 A 11 10 109727 CASAVA_Build 6 46966234 1I GCCAACATGG -/T GAAACCCCGT 1616 hom 12 het 5 0 5 0 T 0 1 109728 CASAVA_Build 6 46975358 7D AGAAGTTTTT TTTTTTG/------- TTTGTTTTGT 102 het 102 ref 30 16 2 13 TTTTTTG 1 0 109729 CASAVA_Build 6 46975858 1D AGATACCCCT A/- AATGTTGGAG 3070 het 3070 ref 61 29 22 11 A 3 2 109730 CASAVA_Build 6 46976218 1I TGCTGTATTA -/G GGGCTCTTTA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 G 3 4 109731 CASAVA_Build 6 46985704 10D CCTATCTCTC AATAAAATAA/---------- AATAAAATAA 3070 het 2888 hom 27 7 11 10 AATAA 6 4 109732 CASAVA_Build 6 46989196 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 28 3 14 11 A 12 11 109733 CASAVA_Build 6 46994734 2I CTAGACATTG --/TT TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 T 4 6 109734 CASAVA_Build 6 46997123 1I AACTTGTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 11 12 109735 CASAVA_Build 6 47001259 1I TCGAAACCAG -/C CTGGCCAACA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 C 1 2 109736 CASAVA_Build 6 47002179 1D TCTCGGGTGA G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 77 het 30 0 26 5 G 9 8 109737 CASAVA_Build 6 47048451 1D CTTCTGTTTG A/- AAACTCTCAA 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 A 4 3 109738 CASAVA_Build 6 47052310 1D TTTGACCATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 36 0 28 10 A 9 8 109739 CASAVA_Build 6 47053071 1I GCCCTTTGTT -/A AAAAATTATT 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 A 5 6 109740 CASAVA_Build 6 47055615 1D GTTCTGTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 T 10 9 109741 CASAVA_Build 6 47065250 1I CCTTGCCCAT -/G CCGTGTTCAG 3070 hom 141 het 56 0 47 9 G 0 1 109742 CASAVA_Build 6 47082158 5D TTCACTGGGA ATTTT/----- ATTTAATGTG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 ATTTT 1 0 109743 CASAVA_Build 6 47083659 1I GAGAACCAAC -/T TTTAGGAAAC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 3 4 109744 CASAVA_Build 6 47095379 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 18 3 10 5 A 16 15 109745 CASAVA_Build 6 47107487 3D AGTGGTGTAG TCA/--- TGGCTCACTG 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 TCA 1 0 109746 CASAVA_Build 6 47111150 1D CTACCTAATT A/- AAAGAAATAA 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 A 4 3 109747 CASAVA_Build 6 47119196 1D ATCAGGAAAG A/- GGAAGCATCT 3070 het 3070 ref 38 25 13 0 A 1 0 109748 CASAVA_Build 6 47122250 3I18M1I ATTCTTTTTT ---TTGTTGTTGGTTTCTTTC-/TTGTTGTTGTTGGTTTCTTTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 8 N/A 0 0 109749 CASAVA_Build 6 47124587 1D TGGAAAAAAA G/- AAGCTATTTT 3070 het 3070 hom 32 16 15 2 G 1 0 109750 CASAVA_Build 6 47127640 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 25 1 20 4 A 15 14 109751 CASAVA_Build 6 47135643 1I CTATTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 33 0 23 10 A 10 11 109752 CASAVA_Build 6 47136460 1I GTTCGAATCC -/A ATTATACCTG 3070 hom 173 het 65 0 58 7 A 1 2 109753 CASAVA_Build 6 47144264 7I GGGATCAAAG -------/GGATGCA CCACCATGCC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 GGATGCA 0 1 109754 CASAVA_Build 6 47150891 1I GAACTGAGCA -/T TTTTTATAGC 3070 hom 30 het 14 0 10 4 T 5 6 109755 CASAVA_Build 6 47179347 2D CCTCAGGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 23 0 17 7 A 12 10 109756 CASAVA_Build 6 47182888 9I TGCCTTTAGA ---------/TCAATGTTC CCAACCTTCC 3070 hom 131 het 47 0 44 3 TCAATGTTC 0 1 109757 CASAVA_Build 6 47184336 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 19 3 11 5 A 17 16 109758 CASAVA_Build 6 47187842 1D TCCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 28 4 7 17 T 11 10 109759 CASAVA_Build 6 47188267 1D TCAAGCACAC T/- TGTAAACATT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 2 1 109760 CASAVA_Build 6 47190989 1D AGACTAGCAG A/- AAAATCTCTA 3070 het 3070 ref 50 24 16 10 A 5 4 109761 CASAVA_Build 6 47194466 1I CAAGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 16 10 A 11 12 109762 CASAVA_Build 6 47200050 3D ATTGTTTTTT TCA/--- AGTATTATGC 1824 het 1824 ref 26 19 4 3 TCA 1 0 109763 CASAVA_Build 6 47203901 1D ACTTCCTTTG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 T 8 7 109764 CASAVA_Build 6 47204060 2D AAGATGAAAA CT/-- CTTTTCTGGT 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 CT 2 1 109765 CASAVA_Build 6 47206894 3D CCACATTGAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 T 16 13 109766 CASAVA_Build 6 47214497 4D TCCATTTTAT TTAA/---- TTAATTAATT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 TTAA 3 2 109767 CASAVA_Build 6 47219649 1D GGTATGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2123 hom 31 7 12 12 T 13 12 109768 CASAVA_Build 6 47223159 1D AAAAAAGAGG A/- AAAAATTCGA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 A 6 5 109769 CASAVA_Build 6 47223367 1D TTTTTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 T 12 11 109770 CASAVA_Build 6 47239955 1I AATTAACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 11 12 109771 CASAVA_Build 6 47242386 1D ACAGGTACCC T/- TTTTTTTTTT 2452 het 2452 ref 24 9 7 8 T 13 12 109772 CASAVA_Build 6 47258534 1D ATTTACCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 A 12 11 109773 CASAVA_Build 6 47289045 1I GGATATCACC -/A CTGACCCCAC 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 0 1 109774 CASAVA_Build 6 47300024 2I AATAAAAGTT --/AA GTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 0 2 109775 CASAVA_Build 6 47309372 1I AATATAAATA -/T TTTTATGTAA 3070 het 3070 hom 18 7 10 1 T 4 5 109776 CASAVA_Build 6 47317177 1D ATGTACCCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 10 9 109777 CASAVA_Build 6 47371500 1I TCTCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 42 1 33 8 A 12 13 109778 CASAVA_Build 6 47416489 1D AAATCACTTC T/- TTTTTTTTTT 2083 het 1925 hom 24 10 5 9 T 15 14 109779 CASAVA_Build 6 47426360 1I CTCTGGGGAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 8 9 109780 CASAVA_Build 6 47428545 2D CCACTCTCTC TT/-- GGCCTTGAAA 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 T 2 0 109781 CASAVA_Build 6 47431040 1D GATTTTGTTC A/- GGGGCAGAGG 2552 het 2552 ref 25 12 8 5 A 1 0 109782 CASAVA_Build 6 47434125 3I TCGTGTCTCT ---/ATC ATACTTTCAT 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 ATC 0 1 109783 CASAVA_Build 6 47440907 13I TTAATTGTAT -------------/ATAACAATTATAA ATAACAATTA 3070 hom 11 het 20 1 18 1 ATAACAATTATAA 0 1 109784 CASAVA_Build 6 47448659 1D CACCCCTTTT C/- TTTATAAATT 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 C 1 0 109785 CASAVA_Build 6 47455056 1I ACAAGATATA -/T TTTTTTAAGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 6 7 109786 CASAVA_Build 6 47463621 1I TCTTCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3034 het 3034 ref 25 12 7 6 T 13 14 109787 CASAVA_Build 6 47469044 1D AAGTACAAAC A/- ATTTGGAGAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 1 109788 CASAVA_Build 6 47487073 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 17 5 A 11 12 109789 CASAVA_Build 6 47489626 4D GGGGCTTGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 63 het 32 0 21 13 AG 7 5 109790 CASAVA_Build 6 47493448 2D TAGGGGTTTG TT/-- TTGTTGTTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 4 2 109791 CASAVA_Build 6 47501785 6I TATAGAAGAA ------/AGATTT ATAATCCTTT 2921 het 2921 ref 24 15 6 3 AGATTT 0 1 109792 CASAVA_Build 6 47502013 1D AGATCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 11 8 A 15 14 109793 CASAVA_Build 6 47503947 2D AAATAGAGAT GG/-- GGGGGGTCTC 2993 het 2993 ref 20 10 7 4 G 8 6 109794 CASAVA_Build 6 47508090 5D CAAATGAAAA ATCTT/----- ATAAGTCTAT 3070 het 3070 ref 57 34 20 3 ATCTT 1 0 109795 CASAVA_Build 6 47509746 2I GTCACATACT --/TA TATAGTTTTA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 TA 2 3 109796 CASAVA_Build 6 47510597 1D GTTTATCAGC T/- TTTTTCCTCC 3070 het 3070 hom 32 10 22 0 T 6 5 109797 CASAVA_Build 6 47522945 1D GAGGCATTGG T/- TAGTAAGAGA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 2 1 109798 CASAVA_Build 6 47539421 2I AGTGGTCACA --/CT CTGTCACTCA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CT 1 2 109799 CASAVA_Build 6 47545657 1D ATGATAAAAA C/- CCCCCAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 C 6 5 109800 CASAVA_Build 6 47546223 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 2664 hom 25 7 9 9 AC 9 8 109801 CASAVA_Build 6 47550072 4I GAGAATAAAG ----/AAAC AAAAAATAAT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 AAAC 0 1 109802 CASAVA_Build 6 47556429 1I CCAACTTGGG -/A AAAAAAAAAA 2356 het 2356 ref 32 17 6 9 A 10 11 109803 CASAVA_Build 6 47564860 9D ACTCAACTAG TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1904 het 1050 hom 22 6 4 12 T 23 14 109804 CASAVA_Build 6 47565668 1I GAGACTTTTT -/G TTTTTTTTTT 687 het 687 ref 28 11 5 12 G 0 1 109805 CASAVA_Build 6 47580383 3I GGTACCTTGG ---/AGA AGATACTGCA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AGA 1 2 109806 CASAVA_Build 6 47580707 11D TGGCAGTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1045 het 651 hom 16 6 5 5 T 25 14 109807 CASAVA_Build 6 47585133 1I TTCAATTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1718 hom 29 8 13 8 A 15 16 109808 CASAVA_Build 6 47587582 3I ATTGGCCGGG ---/GGT GGTGGCTCAC 1906 het 105 hom 7 1 5 1 GGT 1 2 109809 CASAVA_Build 6 47595057 6D TAGGCTGCAT GTGATG/------ GTTTGGGTTT 3070 het 3070 hom 42 16 24 7 GTGATG 1 0 109810 CASAVA_Build 6 47597711 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 11 12 109811 CASAVA_Build 6 47600306 1I TTCTTAAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 9 10 109812 CASAVA_Build 6 47602802 1I ATAAAAGACT -/C CCCCCCCGAT 3070 hom 45 het 28 0 15 13 C 7 8 109813 CASAVA_Build 6 47607769 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2468 hom 23 6 13 4 A 11 12 109814 CASAVA_Build 6 47611922 1I TTAAACTTGA -/T TTTTTTTTTT 925 het 925 ref 36 24 3 9 T 13 14 109815 CASAVA_Build 6 47623182 2I ATCACAATTC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 TA 6 7 109816 CASAVA_Build 6 47628686 1I GGGGGGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 17 7 T 10 11 109817 CASAVA_Build 6 47631500 1I ACAGGAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 10 11 109818 CASAVA_Build 6 47632085 1D GAACTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 11 10 109819 CASAVA_Build 6 47645837 1D ATCAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 10 8 T 12 11 109820 CASAVA_Build 6 47646236 1D CCTTATCCTC T/- TTTCTTCTTT 3070 hom 85 het 33 0 26 7 T 4 3 109821 CASAVA_Build 6 47646311 1D TCTGTCACTT A/- ATGGTTCTCA 3070 het 3070 ref 31 13 13 6 A 2 1 109822 CASAVA_Build 6 47656162 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2396 hom 35 13 18 4 A 11 10 109823 CASAVA_Build 6 47658476 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 494 het 494 ref 19 10 3 7 T 9 10 109824 CASAVA_Build 6 47660115 1D TCTAGATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 12 14 T 15 14 109825 CASAVA_Build 6 47678424 1D GTCTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1934 hom 39 9 17 13 A 14 13 109826 CASAVA_Build 6 47687083 1I AGAGGGGGGG -/A AATAGGATTA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 2 3 109827 CASAVA_Build 6 47695009 4D GTCCATGAGA ACAT/---- ACAATGTTTG 3070 het 3070 hom 36 14 16 9 ACAT 1 0 109828 CASAVA_Build 6 47695254 3D CGAATAATGA CTT/--- CTTTTCCTCT 3070 het 3070 ref 23 13 10 1 CTT 2 1 109829 CASAVA_Build 6 47700288 1D AAGTAATCTG T/- TAAGATATAC 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 T 2 1 109830 CASAVA_Build 6 47708340 1I TGACAAAACT -/A AGTGATTATG 3070 het 3070 hom 55 19 29 7 A 1 2 109831 CASAVA_Build 6 47710211 2D GTGGACAAAG AA/-- GAGAAAATAT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 2 0 109832 CASAVA_Build 6 47710437 4D ATTCTGAATA AAAC/---- AAAATAGCTT 3070 het 3070 ref 40 19 18 5 AAAC 1 0 109833 CASAVA_Build 6 47717632 11D ACAAACAAAC AAAAAAAACCA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 10 AAAAAAAACCA 1 0 109834 CASAVA_Build 6 47721345 1I AACTCATCGT -/G GGGCTCATTT 2456 het 2456 ref 39 27 7 5 G 3 4 109835 CASAVA_Build 6 47721408 2I TCCTCAGACT --/GA GAGGACTGTT 2085 het 2085 ref 38 24 5 9 GA 1 2 109836 CASAVA_Build 6 47721962 4D5M2I AACCCCTGAG TTATTACTA--/----AACTAGT AATAACCAAC 2534 het 2534 ref 25 18 6 4 N/A 0 0 109837 CASAVA_Build 6 47731512 1D TCATAAATAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 A 9 8 109838 CASAVA_Build 6 47731696 4I GTTAGCAGGG ----/ACCT ACCTCTTCTT 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 ACCT 1 2 109839 CASAVA_Build 6 47738662 1I CTCATGTAAT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 A 7 8 109840 CASAVA_Build 6 47741335 1I TGGGATTGCA -/G GCATGAACCA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 G 1 2 109841 CASAVA_Build 6 47742730 1D CCTGTTGGCT G/- GGTCCAGGTA 3070 het 3070 ref 54 31 20 3 G 3 2 109842 CASAVA_Build 6 47744115 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1147 het 1147 ref 23 12 7 4 T 10 11 109843 CASAVA_Build 6 47748119 1I TGATTGGGCT -/A AGAGTTCTTC 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 A 1 2 109844 CASAVA_Build 6 47751374 1D TCCCCATAAG T/- TCTTATTTGG 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 T 2 1 109845 CASAVA_Build 6 47755553 1D ATTCGGAGAG A/- GGGGAGTTAA 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 A 1 0 109846 CASAVA_Build 6 47760799 4D TACTGGTGAA TTGT/---- TTGTTAGGTA 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 TTGT 2 1 109847 CASAVA_Build 6 47761772 1D ATTCCTAAAT A/- AAAGGTCATG 3070 het 3070 ref 44 17 16 12 A 4 3 109848 CASAVA_Build 6 47762039 1I TTATATGGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 T 7 8 109849 CASAVA_Build 6 47763606 6D TCTCAGATAT AAAAGC/------ AAAAGCAAAC 3070 het 3070 ref 22 15 7 4 AAAAGC 2 1 109850 CASAVA_Build 6 47763899 1I GACATGTTAA -/T TTTTTTTTTT 814 het 814 ref 15 10 5 0 T 14 15 109851 CASAVA_Build 6 47765934 2I GAATCTCAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2933 hom 29 10 15 4 A 10 12 109852 CASAVA_Build 6 47769209 2D CTGTCTCAAG GA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 16 0 14 2 GA 1 0 109853 CASAVA_Build 6 47770870 2I ACATAGCTAC --/AT ATATGTCATG 3070 hom 129 het 54 0 42 12 AT 2 3 109854 CASAVA_Build 6 47771146 1I TGCCAGTATA -/T TCCACTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 2 109855 CASAVA_Build 6 47771589 1D CTCTTTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 47 1 38 9 A 12 11 109856 CASAVA_Build 6 47773727 1D GACAACAGTA G/- AACTAGGATG 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 G 1 0 109857 CASAVA_Build 6 47785545 4I AGCATCACAG ----/TTTT TTTTTTTTTT 2942 het 2942 ref 39 15 10 14 T 10 14 109858 CASAVA_Build 6 47786415 1D TCTCTTTCTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 7 6 109859 CASAVA_Build 6 47786808 2D AACTTTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1671 hom 27 7 17 4 A 17 15 109860 CASAVA_Build 6 47787596 1D TTTATACAAA G/- CACATTCTGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 G 1 0 109861 CASAVA_Build 6 47788971 1I TTCTGAGAAA -/T GTTAATGGAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 0 1 109862 CASAVA_Build 6 47791679 2D ACATGAGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 11 14 T 16 14 109863 CASAVA_Build 6 47794357 1D TCAGCTTACA T/- GACCAAACCC 3070 het 3070 ref 60 31 26 4 T 1 0 109864 CASAVA_Build 6 47803619 5D GCTACAATTC AAGAT/----- GAGATTTGGG 3070 het 3070 hom 51 17 30 6 AAGAT 1 0 109865 CASAVA_Build 6 47809131 5D TTTTAAAACT TTTTG/----- TTTTAAGTTT 3070 het 3070 ref 22 12 10 2 TTTTG 1 0 109866 CASAVA_Build 6 47812868 1D ATTGTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1779 hom 34 12 11 11 A 15 14 109867 CASAVA_Build 6 47813428 2D CCTTTTCTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 30 3 9 18 T 14 12 109868 CASAVA_Build 6 47814642 2D GTAAAATCTC CT/-- GTACTGACAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 CT 1 0 109869 CASAVA_Build 6 47819098 1I GTGCAGATTA -/T TTTTTCTCTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 5 6 109870 CASAVA_Build 6 47820820 1I ATCTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 26 0 22 4 T 11 12 109871 CASAVA_Build 6 47822195 1I AGAAGACAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 8 9 109872 CASAVA_Build 6 47822537 1D CTGCAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 41 1 30 12 T 13 12 109873 CASAVA_Build 6 47827989 1D26M1D GTGGTGGGGG CGGGGGGCTTTTGAAAGGAGCATATGAT/-GGGGGGCTTTTGAAAGGAGCATATGA- TTTTTTTTCC 3070 het 136 hom 25 3 15 16 N/A 0 0 109874 CASAVA_Build 6 47831101 2I TGTCTAAAAC --/TA TATATATATA 1950 het 1832 hom 14 5 4 5 TA 7 8 109875 CASAVA_Build 6 47832149 1D AACTTACACA T/- TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 T 7 6 109876 CASAVA_Build 6 47833587 2I TCAGTGCATT --/AA ATGTGTAAGT 3070 hom 120 het 45 0 39 6 A 1 3 109877 CASAVA_Build 6 47841708 1D AATCGTGTCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 8 7 109878 CASAVA_Build 6 47846133 2D TTTTATTTTC TG/-- TGAGTGGCTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 TG 2 1 109879 CASAVA_Build 6 47852868 1I ACATCTCTCT -/A AGTTCGTGGG 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 A 1 2 109880 CASAVA_Build 6 47856913 3D AAACAGTACT AAG/--- ACCTGTGTAT 3070 het 3070 hom 47 18 22 8 AAG 1 0 109881 CASAVA_Build 6 47859999 1I GCAAGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2922 hom 27 10 11 6 T 10 11 109882 CASAVA_Build 6 47865594 1D TCCTCAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 929 hom 26 3 14 9 T 15 14 109883 CASAVA_Build 6 47877508 1I AACAACCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 10 11 109884 CASAVA_Build 6 47895194 5D GTGTTCTCAG AATTT/----- AATTTAATTT 2124 het 2124 ref 21 8 6 8 AATTT 4 3 109885 CASAVA_Build 6 47900519 1D CCTGAATCAA T/- TTTTTTTTTT 1881 het 1881 ref 39 25 6 8 T 13 12 109886 CASAVA_Build 6 47910502 1D CAATTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 11 10 109887 CASAVA_Build 6 47915570 4D TGTAATGAAA AAAC/---- AAACAAACAT 3070 het 3070 ref 37 23 10 5 AAAC 3 2 109888 CASAVA_Build 6 47917875 1I ATTTCTTATC -/G GGGACATAGA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 G 3 4 109889 CASAVA_Build 6 47918114 2D AATTTGGTAC CA/-- CCTGCCTTTT 3070 het 3070 hom 24 11 11 3 CA 1 0 109890 CASAVA_Build 6 47923093 1D AACGATCAGT A/- AAATGGAACT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 4 3 109891 CASAVA_Build 6 47923143 1D GAGATAATCC T/- TTTTTTTTTT 2836 het 2836 ref 28 13 7 8 T 12 11 109892 CASAVA_Build 6 47925024 3I ATGAAAAAAA ---/TAG TAGTAATAAT 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 TAG 1 2 109893 CASAVA_Build 6 47925537 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 10 9 109894 CASAVA_Build 6 47929213 4I TGTGACCAGA ----/GAAG GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 GAAG 2 3 109895 CASAVA_Build 6 47931415 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 19 7 T 11 10 109896 CASAVA_Build 6 47935334 1I TACAGAGCAG -/A AAAAATATCT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 5 6 109897 CASAVA_Build 6 47937049 1I CCTGACTGTT -/C TACTTACTAG 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 C 0 1 109898 CASAVA_Build 6 47937936 1I GCATTATGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 9 10 109899 CASAVA_Build 6 47940381 2D GTTCTATGAC TG/-- TAGAAGAATA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 TG 1 0 109900 CASAVA_Build 6 47940621 11D CTACATCTTT ATGGTAGAATA/----------- AAAGCATGTG 3070 het 3070 ref 33 22 14 1 ATGGTAGAATA 1 0 109901 CASAVA_Build 6 47950439 3I CTTACATGAT ---/ACA ACAACAACAG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 ACA 3 4 109902 CASAVA_Build 6 47956226 1I TGTGAGTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 0 1 109903 CASAVA_Build 6 47963897 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 737 hom 18 4 13 2 A 6 7 109904 CASAVA_Build 6 47965781 1D CAGATATACA C/- CCATATCACA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 C 3 2 109905 CASAVA_Build 6 47970837 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 9 10 109906 CASAVA_Build 6 47979011 1I CATTCTTTCA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 36 17 19 0 T 6 7 109907 CASAVA_Build 6 47990957 2I AGAAAATGAC --/AT ATTTATTTTG 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 AT 1 2 109908 CASAVA_Build 6 47992666 1D TCATTGAATT A/- AAATCAAGTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 4 3 109909 CASAVA_Build 6 47993931 3I TGTATTTCTA ---/AGG AGAACAAGAA 3070 het 3070 hom 41 14 25 2 AGG 0 1 109910 CASAVA_Build 6 48033269 1D ACAAGACAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 11 10 109911 CASAVA_Build 6 48047031 1I ATTGCTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 10 11 109912 CASAVA_Build 6 48056070 2I GCTTCTTCAT --/AC ACCTTTCTTC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 AC 1 2 109913 CASAVA_Build 6 48057652 1D TAGATAAGGC T/- CTCTTGGGAC 3070 het 3070 ref 57 31 24 2 T 1 0 109914 CASAVA_Build 6 48061448 1D AATGCATTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 10 9 109915 CASAVA_Build 6 48061682 5D AATAGTATTG ATATA/----- ATATATTAAT 3070 het 3070 ref 30 16 14 2 ATATA 2 1 109916 CASAVA_Build 6 48066758 2D ATTGGAGGAC AA/-- GAGGGAAGGG 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 A 2 0 109917 CASAVA_Build 6 48072134 3D TGCAGCACTG CTC/--- CCCAGCCTGG 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 CTC 1 0 109918 CASAVA_Build 6 48073678 1D TTTTCTTCAG A/- AAAACAATGG 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 A 5 4 109919 CASAVA_Build 6 48091729 3D ACAGAAAAGA AAC/--- AACAACATCT 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 AAC 3 2 109920 CASAVA_Build 6 48097308 1D AGCTAGCTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 10 9 109921 CASAVA_Build 6 48102613 2I ATTTGTCCCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 17 10 T 11 13 109922 CASAVA_Build 6 48103956 1I TTCTCTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 8 9 109923 CASAVA_Build 6 48107762 1D TCTCCACAAA C/- CCCAGGCATT 3070 hom 66 het 41 0 23 18 C 4 3 109924 CASAVA_Build 6 48113614 1I AAAAAAAAAA -/T AAGTTCCTTT 3070 het 438 hom 25 1 21 3 T 0 1 109925 CASAVA_Build 6 48113900 1I GTGTCTCCTG -/A ACCGGGGTTA 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 1 2 109926 CASAVA_Build 6 48116168 1D GAAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 25 1 21 3 A 11 10 109927 CASAVA_Build 6 48125029 2D GAACTTACAC AT/-- GTTTCGAGTT 3070 hom 120 het 47 0 39 10 AT 1 0 109928 CASAVA_Build 6 48129213 2D AATAAAAATC AA/-- AAGTCTATAG 3070 hom 78 het 29 0 27 4 A 4 2 109929 CASAVA_Build 6 48204617 1D TTCTGTGTTG C/- TTTTATACAA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 C 1 0 109930 CASAVA_Build 6 48205213 1I GTTTTAGTGG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 6 7 109931 CASAVA_Build 6 48212096 1D ATAAATTATG T/- ATTCATTACT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 1 0 109932 CASAVA_Build 6 48221536 3D CTAGGAGATG ATT/--- AGTGGAATTA 3070 het 3070 ref 59 24 22 13 ATT 1 0 109933 CASAVA_Build 6 48228337 1D CTGAGTGCCT G/- GGGGTTGGGC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 5 4 109934 CASAVA_Build 6 48235191 1I AGATAGTTTG -/A AAAGGGCTTT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 A 3 4 109935 CASAVA_Build 6 48245674 1D AATTTTTCTG T/- TTTTTATTTT 3070 het 3007 hom 22 7 10 5 T 6 5 109936 CASAVA_Build 6 48247251 1D TTATAGCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 6 T 12 11 109937 CASAVA_Build 6 48252041 1I CAATGAACAT -/C CCCTGCTCTG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 C 3 4 109938 CASAVA_Build 6 48272505 1D ATGTTTGCTT C/- TTATGGAGGT 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 C 1 0 109939 CASAVA_Build 6 48280058 4I GTTGTGGGTG ----/GGGA GGGGGGGGGG 1335 het 831 hom 14 3 6 5 GGGA 0 1 109940 CASAVA_Build 6 48281208 1I CCCTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 17 12 A 12 13 109941 CASAVA_Build 6 48304336 2D TCCTAAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 2056 het 1932 hom 36 13 9 15 T 18 16 109942 CASAVA_Build 6 48305446 1D CCCTTGTGCC T/- TTCTCTACTT 3070 het 3070 ref 40 26 13 2 T 3 2 109943 CASAVA_Build 6 48308655 1I CCTAACAATA -/T CAAAACATAT 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 T 0 1 109944 CASAVA_Build 6 48310947 1D GCTTCAACAC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 A 7 6 109945 CASAVA_Build 6 48323189 1I GTCGATGCAG -/T GTTCTTAATA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 0 1 109946 CASAVA_Build 6 48324638 2D ACTTACGTGC AG/-- AGTGTTAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 9 AG 2 1 109947 CASAVA_Build 6 48324773 1D AGTAATTCAA C/- GGATCTATTG 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 C 1 0 109948 CASAVA_Build 6 48341428 1I CTGATGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 11 12 109949 CASAVA_Build 6 48357468 1D ATCAACGCCA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 T 8 7 109950 CASAVA_Build 6 48372179 1I TTATGTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 10 11 109951 CASAVA_Build 6 48374505 1I ACTCCCTACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 9 10 109952 CASAVA_Build 6 48384602 4D TTTACACACG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 39 14 16 11 CA 9 7 109953 CASAVA_Build 6 48389598 1D TAGCAGTATT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 31 8 21 2 A 8 7 109954 CASAVA_Build 6 48389810 1I TTTCTTTATG -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 6 7 109955 CASAVA_Build 6 48392543 1D AGCTTAATGC A/- AAAAAAAAAT 2863 hom 27 het 21 0 9 12 A 10 9 109956 CASAVA_Build 6 48394264 4I CTGATAGTAT ----/GTCA GTATCAGTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GTCA 0 1 109957 CASAVA_Build 6 48394485 11D TGCCCCAGCC ATGCACATAGG/----------- ATGCATCGTC 3070 het 3070 ref 54 37 19 7 ATGCACATAGG 1 0 109958 CASAVA_Build 6 48396245 1D GTGTTTGGGT G/- GGGGGGGCGC 2476 hom 3 het 15 0 7 8 G 8 7 109959 CASAVA_Build 6 48399743 1D AAAAGCCAAG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 7 6 109960 CASAVA_Build 6 48413173 1I TTTCTTATAC -/T TTTTTTAATC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 6 7 109961 CASAVA_Build 6 48414923 1D ACATGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 1921 hom 17 5 10 2 T 8 7 109962 CASAVA_Build 6 48417372 1D ATGGCTTAGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 9 8 109963 CASAVA_Build 6 48424297 1D TACACTAAGC A/- AAAAATTCTT 3070 het 1650 hom 25 4 15 6 A 6 5 109964 CASAVA_Build 6 48432536 1D GGTCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 11 10 109965 CASAVA_Build 6 48456477 1D GCCCGATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 31 1 13 17 A 15 14 109966 CASAVA_Build 6 48456700 4D30M1I AAAAAAATAA AAATAAATAAATAAATAAGCATTGCTGAGCCTCT-/----AAATAAATAAATAAGCATTGCTGAGCCTCTA AAAAAAAAGA 2552 hom 15 het 7 0 6 7 N/A 0 0 109967 CASAVA_Build 6 48459713 1D TGCTGGTAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 T 10 9 109968 CASAVA_Build 6 48477011 1I TTCTGAAAAG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 1315 hom 27 4 18 5 A 7 8 109969 CASAVA_Build 6 48478992 1D ATTCAGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 T 11 10 109970 CASAVA_Build 6 48488465 1I AATTCAACAG -/A AAAAAATTGG 3070 het 3070 ref 59 26 23 10 A 6 7 109971 CASAVA_Build 6 48494605 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 AC 9 8 109972 CASAVA_Build 6 48529505 14D TGTGTGTGTG TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 het 2038 hom 29 7 14 8 TA 15 8 109973 CASAVA_Build 6 48536534 1D CCTTATTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 11 9 A 12 11 109974 CASAVA_Build 6 48541000 1D CATAGGACAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 50 24 22 5 T 9 8 109975 CASAVA_Build 6 48544833 1I TAAATAATGA -/T TAAGGGAAGT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 1 2 109976 CASAVA_Build 6 48545174 5D TAAACACTTG TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 43 19 16 10 TTTTA 3 2 109977 CASAVA_Build 6 48547608 5I TGAGTAATAT -----/AAGAC AAGTATTTAA 3070 het 3070 hom 25 7 14 4 AAGAC 0 1 109978 CASAVA_Build 6 48548676 4D TCTCATAGCT GTTG/---- GTTGCACTTA 3070 het 3070 ref 30 20 9 3 GTTG 2 1 109979 CASAVA_Build 6 48549997 4I TACCCCAGGC ----/ATTT GAAACTTCGT 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 ATTT 0 1 109980 CASAVA_Build 6 48553630 1D CAATGGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 17 10 A 12 11 109981 CASAVA_Build 6 48561189 4D AAAAATGGAT TGAG/---- TAACTGTTAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 4 TGAG 1 0 109982 CASAVA_Build 6 48564027 44D GAAACGTTTC AGTCTTGAAGACAAAATGCTAACATGTAATAAGAAAATATTTGA/-------------------------------------------- AGATATAAAA 3070 het 3070 ref 25 27 8 4 AGTCTTGAAGACAAAATGCTAACATGTAATAAGAAAATATTTGA 1 0 109983 CASAVA_Build 6 48572453 1I CAAAACAAAC -/A AAAAGAAATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 4 5 109984 CASAVA_Build 6 48575024 1D TTTAATTTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 8 7 109985 CASAVA_Build 6 48576391 2D ATGTGTGTGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 33 16 12 5 AC 9 8 109986 CASAVA_Build 6 48579731 1D TTAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 1243 het 1243 ref 45 35 4 8 A 10 9 109987 CASAVA_Build 6 48586812 1I TTTGTTTTTA -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 6 7 109988 CASAVA_Build 6 48589613 1D CTTTTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 12 11 109989 CASAVA_Build 6 48594154 1I CCACACAAAA -/G AAAATTACTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 G 0 1 109990 CASAVA_Build 6 48595796 1I GGTATGTTTA -/T TAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 1 2 109991 CASAVA_Build 6 48599368 1D CAACTTTCCA T/- TTTCTGCATA 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 T 4 3 109992 CASAVA_Build 6 48603251 1I ACCTTATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 10 11 109993 CASAVA_Build 6 48603726 1D AAAGACTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 21 0 11 10 T 12 11 109994 CASAVA_Build 6 48604549 4I ATTTTGTTGC ----/TTAA TTAAACTGTT 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 TTAA 1 2 109995 CASAVA_Build 6 48608472 13I TTTTGATGAA -------------/ATTGTTTATTTTC TGCCACTTCC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 ATTGTTTATTTTC 0 1 109996 CASAVA_Build 6 48614587 1D GAGGGTTATC T/- TTTAGGAGAT 2142 hom 18 het 7 0 6 1 T 4 3 109997 CASAVA_Build 6 48615176 4D AGAAGGCCTT CCCC/---- CCCCCCCCCC 3070 hom 25 het 20 0 12 8 C 14 10 109998 CASAVA_Build 6 48616569 2I5M1D CAGAGTGAGA --CTGTCA/CTCTGTC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 19 8 9 4 N/A 0 0 109999 CASAVA_Build 6 48618591 1I TTAAAAAACA -/C CTTTCTTTGC 3070 het 3070 ref 27 18 9 0 C 1 2 110000 CASAVA_Build 6 48693714 1I CTATTCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 10 11 110001 CASAVA_Build 6 48720765 2I ACCACAGGGG --/TA TATGCCCCTT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TA 1 2 110002 CASAVA_Build 6 48721814 1I CATTTTCCAA -/T TTTTTTACAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 6 7 110003 CASAVA_Build 6 48722497 1I GAAATTATTC -/T TTTTTAATTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 5 6 110004 CASAVA_Build 6 48722680 1D TATAGCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 11 10 110005 CASAVA_Build 6 48776213 1I TGAGAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 10 11 110006 CASAVA_Build 6 48783161 1D TTATTCCCCT G/- CTAAGTGGTG 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 G 1 0 110007 CASAVA_Build 6 48793280 4D TGTTGAATAG AAGT/---- AATTAAATAC 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 AAGT 1 0 110008 CASAVA_Build 6 48803117 1I AGGCTGAGAG -/T TCAAAACCAG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 1 2 110009 CASAVA_Build 6 48807940 1I TCTCTTTATC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 9 110010 CASAVA_Build 6 48809900 1I AATGCAAAAA -/T TATACAGAAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 1 2 110011 CASAVA_Build 6 48819331 1I AATACAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 27 1 23 3 A 11 12 110012 CASAVA_Build 6 48819779 4D AGGAATAGAT AAAG/---- AAAGAATCAG 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 AAAG 2 1 110013 CASAVA_Build 6 48834832 3I ACTTAAAATC ---/TGT TGTTAGCAAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TGT 1 2 110014 CASAVA_Build 6 48841185 1I CAGTATGGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 8 9 110015 CASAVA_Build 6 48844724 2I ATAAATGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 2613 hom 24 9 10 5 AT 6 7 110016 CASAVA_Build 6 48868368 6D TTTGTTTTCT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 1993 het 1993 ref 28 10 5 13 TTTTTC 4 3 110017 CASAVA_Build 6 48874977 1I CTTTCAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 42 1 37 4 T 9 10 110018 CASAVA_Build 6 48875698 26D CAGTTCTCAC ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 2998 het 947 hom 15 3 9 5 AT 22 9 110019 CASAVA_Build 6 48881013 2D AAGATGCATT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 TA 1 0 110020 CASAVA_Build 6 48887937 1D TGATCATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 11 10 110021 CASAVA_Build 6 48888102 2I CTGATTTGGA --/TT TTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 6 8 110022 CASAVA_Build 6 48888933 1D CAACTTCAAG C/- CCATTTTTGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 3 2 110023 CASAVA_Build 6 48891420 1I AAATTCAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 9 10 110024 CASAVA_Build 6 48903797 1D AAAATATGTC A/- AATAAACATC 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 A 3 2 110025 CASAVA_Build 6 48915680 1I CTTATTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 10 11 110026 CASAVA_Build 6 48917436 1D TGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 332 hom 34 1 24 10 T 10 9 110027 CASAVA_Build 6 48922898 1I AAGTGTTTTA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 60 het 30 0 21 10 T 8 9 110028 CASAVA_Build 6 48923046 35I CTAGGAGCTT -----------------------------------/TCTGGAGGAGTCCTTAGGGGTTTCTAGGTATACAA TCATATTGTC 3070 hom 33 het 11 0 12 0 TCTGGAGGAGTCCTTAGGGGTTTCTAGGTATACAA 0 1 110029 CASAVA_Build 6 48924342 1D AAAAGCAACC T/- ACAAATTCAA 3070 het 3070 hom 43 14 19 11 T 1 0 110030 CASAVA_Build 6 48925119 2I ACTAATAAAC --/AT ATGAAAAAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AT 1 2 110031 CASAVA_Build 6 48927378 1D ATGGGAGAAA T/- TTGGCCAAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 3 2 110032 CASAVA_Build 6 48931437 1D AGTTTCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 596 hom 24 4 11 9 T 12 11 110033 CASAVA_Build 6 48932649 1I TCTTATCCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 9 10 110034 CASAVA_Build 6 48934364 1I CCTTAGCCTA -/T TTTTTCTGTA 3070 het 3070 ref 50 30 14 6 T 5 6 110035 CASAVA_Build 6 48968586 1D ATGTCCCCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 10 9 110036 CASAVA_Build 6 48976097 1I GGTGTTTCCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 10 11 110037 CASAVA_Build 6 48978821 1D TAACAAGGGC A/- TGGTATTACT 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 A 1 0 110038 CASAVA_Build 6 48981845 4I GACATGAACT ----/CATC CATCCTTTTT 2376 het 2376 ref 22 10 6 6 CATC 1 2 110039 CASAVA_Build 6 48983882 1I TTTAATATAT -/A TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 20 17 3 A 0 1 110040 CASAVA_Build 6 48988728 3D AACGTGTTGT AGA/--- AGAAGGATTA 3070 het 3070 ref 39 23 12 6 AGA 2 1 110041 CASAVA_Build 6 48991768 2I CATGGATGCT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 30 14 7 9 TA 6 7 110042 CASAVA_Build 6 48997470 1D CCTAATTACT A/- ATATTTTGAT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 2 1 110043 CASAVA_Build 6 48999464 3I GTTATTAAAT ---/TTA TTATCAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 TTA 1 2 110044 CASAVA_Build 6 49001266 1I21M1I AAATTTTGCC -AAAAAAAATGCAAAACACTTT-/AAAAAAAAATGCAAAACACTTTA AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 28 13 14 6 N/A 0 0 110045 CASAVA_Build 6 49001669 1D TGAATGCTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 10 9 110046 CASAVA_Build 6 49002187 2D TCTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 15 13 11 TG 7 6 110047 CASAVA_Build 6 49005498 1I TTTTGACATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 8 9 110048 CASAVA_Build 6 49007022 4I CTCCATTATG ----/TATA TATATGTACC 3070 het 3070 ref 54 29 15 10 TA 2 4 110049 CASAVA_Build 6 49008252 1I ACATGGAATA -/T CCTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 55 28 22 5 T 0 1 110050 CASAVA_Build 6 49009067 1D CATAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 12 11 110051 CASAVA_Build 6 49009912 2I TATATTGTAC --/TG TCTTTGTCTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 TG 0 1 110052 CASAVA_Build 6 49010637 4I TTATCTTCTT ----/TGAC TGTGTATTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 TGAC 0 1 110053 CASAVA_Build 6 49011427 7I CACTACCTGG -------/TTACTGC CTATGTTCAC 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 TTACTGC 0 1 110054 CASAVA_Build 6 49019910 3D GAAAAAATGC TCA/--- TCATCATTGG 3070 het 1674 hom 25 4 20 2 TCA 3 2 110055 CASAVA_Build 6 49049644 1D AGAATGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 36 10 13 13 T 12 11 110056 CASAVA_Build 6 49093350 1I30M3I ATAAAGTGGG -TTTTTTTTTTTTGCACATGCTAGGGGTAAA---/TTTTTTTTTTTTTGCACATGCTAGGGGTAAAGTG GGAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 14 N/A 0 0 110057 CASAVA_Build 6 49094361 2I AAAGAATTGT --/AA GTTTTCATCT 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 A 0 2 110058 CASAVA_Build 6 49097064 1I TTTAATGGAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 7 8 110059 CASAVA_Build 6 49099977 2D ACTCCTGATG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 56 26 22 10 T 11 9 110060 CASAVA_Build 6 49100093 1D34M1I GATGCATGAG TTTTTTTTTTTTTTAATCTAACTTACCATTCTACC-/-TTTTTTTTTTTTTAATCTAACTTACCATTCTACCT TTTATGTTGG 3070 het 3070 ref 43 21 18 14 N/A 0 0 110061 CASAVA_Build 6 49105143 1D AAATTGCTTA C/- CAAAATGCCT 3070 het 3070 hom 33 8 25 0 C 2 1 110062 CASAVA_Build 6 49106261 1D AAGTGAAGAT A/- CAGATCTAAC 3070 het 3070 ref 54 24 23 7 A 1 0 110063 CASAVA_Build 6 49108947 1D AGTTAAGCAT A/- AAATTACCAT 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 A 4 3 110064 CASAVA_Build 6 49110722 2D TATAACAGAC TA/-- TGTTAGAATA 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 TA 1 0 110065 CASAVA_Build 6 49119646 1I AACTTTTCAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 8 9 110066 CASAVA_Build 6 49130669 4D CTGCTCTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 14 16 T 18 14 110067 CASAVA_Build 6 49142663 3I GGAAAAAAAA ---/AAC AAAAAACTGA 3070 het 2095 hom 42 10 24 8 AAC 0 1 110068 CASAVA_Build 6 49146624 1D AAGTACCAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 T 9 8 110069 CASAVA_Build 6 49147063 1D ACATTTATCA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 18 16 1 T 8 7 110070 CASAVA_Build 6 49153831 1I CAGTATACTA -/G GGGGCCATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 4 5 110071 CASAVA_Build 6 49155256 2D ATTGTACATG GC/-- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 GC 1 0 110072 CASAVA_Build 6 49216872 1D TATCCTCAAA T/- TTAACATCCA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 3 2 110073 CASAVA_Build 6 49228726 3I AAATTTAATA ---/CCT ATATATTAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CCT 0 1 110074 CASAVA_Build 6 49243819 1I TAAATCATCA -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 7 8 110075 CASAVA_Build 6 49243943 2D ATCCCACCTG AT/-- TATATTAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 AT 1 0 110076 CASAVA_Build 6 49247314 1I TCACTGCAAG -/C TCCGCCTCCT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 C 0 1 110077 CASAVA_Build 6 49267902 1I GTTTAAAAAG -/A AAAACTTATC 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 A 4 5 110078 CASAVA_Build 6 49277145 4I CCGTCTTGTC ----/TTCT TTCTTTCCTT 3070 hom 96 het 34 0 30 4 TTCT 1 2 110079 CASAVA_Build 6 49281998 1I TATAGGGCAG -/A AAATAAAGTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 4 110080 CASAVA_Build 6 49300317 1D TTTCTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 5 A 12 11 110081 CASAVA_Build 6 49309086 1I TTTCTACAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 9 10 110082 CASAVA_Build 6 49326053 1I GAATAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2864 hom 23 9 9 5 T 10 11 110083 CASAVA_Build 6 49349466 1D GAAATCACCA T/- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 4 3 110084 CASAVA_Build 6 49360485 1I CTCATATTAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 8 9 110085 CASAVA_Build 6 49387694 1D TGCAGGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 18 21 15 A 12 11 110086 CASAVA_Build 6 49391631 1I AGAACAGAGC -/A AAAATACCAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 A 4 5 110087 CASAVA_Build 6 49391796 1D AGTTTCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 12 11 110088 CASAVA_Build 6 49392238 1I ACAGAAATGG -/A AAAAAATTTG 2773 het 2773 ref 15 8 6 1 A 6 7 110089 CASAVA_Build 6 49409987 1D TGATAATCTT A/- TACATGAATC 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 1 0 110090 CASAVA_Build 6 49413934 1I AAAATGGATC -/A CAGGCATAAA 3070 het 3070 ref 54 28 23 3 A 0 1 110091 CASAVA_Build 6 49422697 1D TCTATTAGTT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 8 7 110092 CASAVA_Build 6 49433645 1D ACCACACATT A/- AAAAAAAAAA 1304 het 1304 ref 30 23 3 5 A 11 10 110093 CASAVA_Build 6 49439563 1I ATGAAGATTA -/C CCCCAGCAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 C 4 5 110094 CASAVA_Build 6 49468572 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 25 1 19 5 A 12 11 110095 CASAVA_Build 6 49480762 8I TTGGTTACTA --------/TAGCCTTG TAGCCTTGTA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 TAGCCTTG 1 2 110096 CASAVA_Build 6 49482649 3D AAGAAAAATA GAG/--- AAGAAGGCTC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 GAG 1 0 110097 CASAVA_Build 6 49484641 3D TTGTTTTTCA GCT/--- GTTTGTTTGT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 GCT 1 0 110098 CASAVA_Build 6 49485613 4D TTATAATATA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AT 8 6 110099 CASAVA_Build 6 49513109 1D CCTAAAAAGC A/- GATAATAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 A 1 0 110100 CASAVA_Build 6 49558328 7D GTCTCACTGC TCGGCGA/------- TTGGCGATGG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TCGGCGA 1 0 110101 CASAVA_Build 6 49575572 1D GTGTGGGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 331 hom 46 1 37 8 T 12 11 110102 CASAVA_Build 6 49576920 1I CTAAAAATAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 44 het 22 0 15 7 A 8 9 110103 CASAVA_Build 6 49579885 1D AGCATGGTTA T/- TTTTTTTCTT 1320 hom 18 het 15 0 6 10 T 8 7 110104 CASAVA_Build 6 49584680 1D AATAATAAAT A/- AAAATAAGCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 5 4 110105 CASAVA_Build 6 49594613 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 10 11 110106 CASAVA_Build 6 49599866 17I TATTTCTGCC -----------------/TGAAGCTTCTTTGCCCT TGCTTTAAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TGAAGCTTCTTTGCCCT 0 1 110107 CASAVA_Build 6 49629456 2D TCATAGAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 41 1 32 9 T 12 10 110108 CASAVA_Build 6 49630087 12D GAGTCTTGCT CTGTCGCCCAGG/------------ CTGGAGTGCA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 CTGTCGCCCAGG 1 0 110109 CASAVA_Build 6 49630220 1D GCCTGGCTAG T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 7 6 110110 CASAVA_Build 6 49634077 1D CCTGAGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 554 hom 22 2 13 7 A 16 15 110111 CASAVA_Build 6 49638435 1D GCTTGCACCA C/- CCATGCCTGG 3070 hom 90 het 31 0 30 1 C 3 2 110112 CASAVA_Build 6 49641134 1D TTAACCATTG T/- TTTTTTAGTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 7 6 110113 CASAVA_Build 6 49642572 1D GAGAATGGTA T/- TTTTTTTCAG 1104 het 1104 ref 39 33 3 3 T 8 7 110114 CASAVA_Build 6 49644911 1I ATTAAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 26 1 19 6 A 10 11 110115 CASAVA_Build 6 49645911 1I CAACAACAAC -/A AAAATCTTCT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 A 4 5 110116 CASAVA_Build 6 49647238 1D ACTCAGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 314 hom 25 1 17 7 T 12 11 110117 CASAVA_Build 6 49684146 2D CCTCCCCGCG TT/-- CAAGCAATTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 2 0 110118 CASAVA_Build 6 49688742 1D GAGGAACTGA T/- TTTTTTTTTT 1205 het 1205 ref 26 11 5 10 T 17 16 110119 CASAVA_Build 6 49693163 1D GTCATTGAGT C/- CCCAACATCT 3070 hom 102 het 36 0 35 2 C 4 3 110120 CASAVA_Build 6 49713093 1D TAAAACAGAT A/- AGAGGGAATG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 1 110121 CASAVA_Build 6 49720381 1I TTCACCAATA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 9 110122 CASAVA_Build 6 49721095 7I ACACACTTGT -------/GGTCTCA GTTACTTAGG 3070 hom 96 het 35 0 30 5 GGTCTCA 0 1 110123 CASAVA_Build 6 49725118 1I ATAGATGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 10 11 110124 CASAVA_Build 6 49728335 8I ACAGAGCATA --------/AGGTAAGT AGTTCTTGAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AGGTAAGT 0 1 110125 CASAVA_Build 6 49740372 1D GTGTCCATCA T/- TTATAAGAAT 3070 hom 87 het 38 0 30 9 T 3 2 110126 CASAVA_Build 6 49747359 4D TCAATAACAG ACAA/---- ACAGAGAGCC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 ACAA 1 0 110127 CASAVA_Build 6 49748302 4I AATTTACAAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AAAC 2 3 110128 CASAVA_Build 6 49751007 2D ATTAGTAGAC AG/-- GGAATACAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 AG 1 0 110129 CASAVA_Build 6 49761014 1I AGTGACTGGA -/G GATGTCTATG 3070 hom 138 het 55 0 46 9 G 1 2 110130 CASAVA_Build 6 49807372 1D AATTAAAAAT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 80 het 30 0 27 3 A 9 8 110131 CASAVA_Build 6 49811748 2I TCTTAAAAGG --/AA AAAAGGTCTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 4 6 110132 CASAVA_Build 6 49814674 1I TTGAAGTCTG -/A AAAAAAAAAA 1420 het 1420 ref 29 16 4 9 A 11 12 110133 CASAVA_Build 6 49816387 3I CAAAACAATC ---/ATT GATTCCTCTT 3070 hom 117 het 40 0 40 0 ATT 0 1 110134 CASAVA_Build 6 49837437 2I ACTTTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 38 0 24 14 T 14 16 110135 CASAVA_Build 6 49846716 1I TGTTGGCTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 9 10 110136 CASAVA_Build 6 49849983 1D AACCCATGTG A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 7 6 110137 CASAVA_Build 6 49854041 1I AAGGTTCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 9 10 110138 CASAVA_Build 6 49858921 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 11 12 110139 CASAVA_Build 6 49866333 7D TGTCTTCTTG ACTAAAT/------- CCAGTTTTCA 3070 hom 111 het 42 0 38 6 ACTAAAT 1 0 110140 CASAVA_Build 6 49880782 2D AGGAAACCAC AT/-- GTTTCTCATG 3070 hom 105 het 38 0 35 4 AT 1 0 110141 CASAVA_Build 6 49888286 1I TTAATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 548 hom 40 2 29 9 A 12 13 110142 CASAVA_Build 6 49888643 1I AGTGAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 10 11 110143 CASAVA_Build 6 49890821 1D AAAGAAAGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 9 8 110144 CASAVA_Build 6 49892345 1D CTCTGGAGAG T/- TTTGAGCACA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 4 3 110145 CASAVA_Build 6 49895275 1I GATGTTGCTG -/T TTTTTTAGGT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 6 7 110146 CASAVA_Build 6 49921380 1I CACAATAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2478 hom 48 6 35 7 A 11 12 110147 CASAVA_Build 6 49938071 3I ATATTACTGA ---/TAT TATTAGAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TAT 1 2 110148 CASAVA_Build 6 49955087 2D GACTCCATTG TA/-- TATATATATG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TA 5 4 110149 CASAVA_Build 6 49959080 1I TTTCTTTTTA -/T TTTTTTGTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 110150 CASAVA_Build 6 49983057 1I TTAAAATAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 8 9 110151 CASAVA_Build 6 49986701 1D CCCAGTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 8 T 13 12 110152 CASAVA_Build 6 49993285 3I AAGCTTTTAG ---/TTA TTATTATTAT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 TTA 5 6 110153 CASAVA_Build 6 49995897 4D AAAGAAAGAA AGAG/---- AGAGAGAAAG 3070 hom 111 het 44 0 38 8 AG 5 3 110154 CASAVA_Build 6 49997006 1I TGGAAACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 11 12 110155 CASAVA_Build 6 50008906 3I TTCATTATTG ---/ATA ATGATACAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 ATA 0 1 110156 CASAVA_Build 6 50022383 1I CTCCAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 10 11 110157 CASAVA_Build 6 50029368 1D GCAATGAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 10 9 110158 CASAVA_Build 6 50070183 1D GAGTAAATCG T/- TTTTTTTTTT 1116 het 1116 ref 27 20 3 5 T 11 10 110159 CASAVA_Build 6 50086305 1I ATATATATAT -/A TTTTTTAGTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 110160 CASAVA_Build 6 50171807 1D TTTCCTGAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 9 8 110161 CASAVA_Build 6 50176565 18D ATTTATATGT TAAATGCAAGTGAATTTA/------------------ CAAATGAAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 1 TAAATGCAAGTGAATTTA 1 0 110162 CASAVA_Build 6 50187397 1D TATATCCAAT A/- TTGTATTCCA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 1 0 110163 CASAVA_Build 6 50188616 1D GGAAAGAATA T/- TAGGTTTCTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 1 110164 CASAVA_Build 6 50206067 1I AAAACTCTTT -/C TTTCTAAATC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 0 1 110165 CASAVA_Build 6 50211310 1D CCTCAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 263 hom 36 1 22 14 T 11 10 110166 CASAVA_Build 6 50212411 1I GTAAATTTGC -/T TTTAATGGAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 3 4 110167 CASAVA_Build 6 50222834 19D ATAGACTTGC TACAACAAGAGAACTAGAT/------------------- TACAACAAGA 3070 hom 105 het 44 0 36 11 TACAACAAGAGAACTAGAT 2 1 110168 CASAVA_Build 6 50229252 1I TGCTTTTTAA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 6 7 110169 CASAVA_Build 6 50233026 1I TTCAGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 41 1 36 4 A 11 12 110170 CASAVA_Build 6 50234132 1D ATGACATTGA C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 20 3 C 1 0 110171 CASAVA_Build 6 50236864 1D GAGGGTGAGG A/- AAAAAAAAAA 2464 hom 27 het 14 0 9 5 A 13 12 110172 CASAVA_Build 6 50244703 1I AGACTCCACC -/A AAAAAACTAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 7 110173 CASAVA_Build 6 50249294 2D AAATAACCCA TT/-- TTTTTTAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 T 8 6 110174 CASAVA_Build 6 50251063 1D CAAGGCGGGA G/- GGATAGCTTG 3070 hom 107 het 38 0 34 4 G 3 2 110175 CASAVA_Build 6 50255532 1I GTTTCATTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 9 10 110176 CASAVA_Build 6 50269788 8I TGCTACTGAG --------/CTTTCATC CAAACAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 37 7 CTTTCATC 0 1 110177 CASAVA_Build 6 50270631 1I GAAACAAGAG -/T TTTTTTTATG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 7 8 110178 CASAVA_Build 6 50279709 2D CCATTTTTCT AA/-- GAGATGTGTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 0 110179 CASAVA_Build 6 50283751 1I GAGAAACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 10 11 110180 CASAVA_Build 6 50297179 1D CCTAAATCAC T/- TCTGTCATGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 2 1 110181 CASAVA_Build 6 50306471 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 21 1 16 5 A 13 12 110182 CASAVA_Build 6 50307686 1I CTTTCTCAGT -/A AACAGCACCA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 2 3 110183 CASAVA_Build 6 50311010 1D TTCAGCCTGA T/- TTTTTTATGT 3070 hom 99 het 40 0 34 7 T 7 6 110184 CASAVA_Build 6 50313146 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 26 3 14 9 A 15 14 110185 CASAVA_Build 6 50322406 1D CATTGGCTCC T/- TACAAGCATA 3070 hom 126 het 49 0 42 7 T 2 1 110186 CASAVA_Build 6 50327763 1D ACAGAAGTAG A/- TTAGGGTCTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 1 0 110187 CASAVA_Build 6 50331581 3D ATGTTGAGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 2045 het 58 hom 34 1 12 21 T 15 12 110188 CASAVA_Build 6 50340042 1D GGTTTTTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 9 8 110189 CASAVA_Build 6 50347534 1I GGGAAATGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 9 10 110190 CASAVA_Build 6 50352405 2I TGTGCTTTAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 11 13 110191 CASAVA_Build 6 50358483 1D TTCTGTACAC A/- AAACCACTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 4 3 110192 CASAVA_Build 6 50367398 1D ATTAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 37 2 30 5 A 11 10 110193 CASAVA_Build 6 50367409 1D AAAAAAAAAA C/- ATACAAACAG 3070 het 391 hom 34 4 27 3 C 1 0 110194 CASAVA_Build 6 50389319 1D ATTCTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2392 hom 31 10 14 7 T 17 16 110195 CASAVA_Build 6 50390854 2I ATTATTATAA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 9 11 110196 CASAVA_Build 6 50391649 1D AATATTTCAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 9 8 110197 CASAVA_Build 6 50392324 3I TTGTGTCATC ---/TCA TCAAGGTATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TCA 1 2 110198 CASAVA_Build 6 50393301 1D AAGTTCATAC A/- GGGTGGGGAA 3070 hom 81 het 31 0 25 6 A 1 0 110199 CASAVA_Build 6 50395286 24D TGTGTGTGTG TGTATATATATATATATATATATA/------------------------ TATATATATA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TGTATATATATATATATATATATA 1 0 110200 CASAVA_Build 6 50398939 1I ATTTTTAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 302 hom 54 1 43 10 A 9 10 110201 CASAVA_Build 6 50399367 3D CAGCATGGCT GAG/--- GAGGCCAAAG 3070 hom 78 het 27 0 26 1 GAG 2 1 110202 CASAVA_Build 6 50402955 5I TATTATTAAA -----/TAATT TAATTATATT 3070 hom 62 het 24 0 21 3 TAATT 1 2 110203 CASAVA_Build 6 50404449 1D GACCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 39 2 30 8 A 15 14 110204 CASAVA_Build 6 50406125 1D TAGAAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 898 hom 39 4 24 11 A 17 16 110205 CASAVA_Build 6 50410124 1D AGCTGAAATT A/- AAAAAAAAAC 984 het 984 ref 44 33 3 10 A 10 9 110206 CASAVA_Build 6 50420713 1D GCTGAAAACC A/- CGGCATGAGA 2833 hom 17 het 8 0 6 2 A 1 0 110207 CASAVA_Build 6 50443018 1D TGATTTGAAA C/- CACACTGCTA 3070 hom 117 het 44 0 38 7 C 2 1 110208 CASAVA_Build 6 50452811 1I GTTCTAATTC -/T TTTTTTTATA 2653 het 2653 ref 33 21 8 4 T 7 8 110209 CASAVA_Build 6 50468027 6I AATACAATGC ------/TTTAAG TTTATCTTCC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TTTAAG 0 1 110210 CASAVA_Build 6 50473360 1I ATAGGAAACA -/G GGTCAGCCTC 3070 het 3070 hom 52 24 25 3 G 2 3 110211 CASAVA_Build 6 50474761 1I TCTTCTAACT -/G GGGTTTAGTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 3 4 110212 CASAVA_Build 6 50482305 1D TACTTTCTTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 9 8 110213 CASAVA_Build 6 50502256 1D TGGTCCAAAG A/- AAAATCTTTG 3070 het 3070 ref 42 24 9 9 A 5 4 110214 CASAVA_Build 6 50503096 4D AAGTTCTTCA ACTT/---- ACTTAGTTCA 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 ACTT 2 1 110215 CASAVA_Build 6 50577871 6D AAGTTTCAAT TAAAAA/------ TAAAAATAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 6 TAAAAA 3 2 110216 CASAVA_Build 6 50608875 1I ACATTTAAGG -/T TTTTTTTTTT 1760 het 27 hom 12 1 7 4 T 13 14 110217 CASAVA_Build 6 50637085 8D TATATGTGTG TATATATA/-------- TATATATATA 1248 het 195 hom 6 1 4 2 TA 13 9 110218 CASAVA_Build 6 50670079 1I GGCCTAGAAT -/A ACAGCTCACA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 1 2 110219 CASAVA_Build 6 50749275 1I TAATATGTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 10 110220 CASAVA_Build 6 50765190 1D TGCTCTTCCA G/- CATACAAAGA 3070 het 3070 hom 46 19 21 7 G 1 0 110221 CASAVA_Build 6 50881297 1D GCCAAAGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 12 13 T 10 9 110222 CASAVA_Build 6 50897649 1I TTGTTGGGGT -/C GGGGGGCGGG 2238 hom 37 het 15 0 11 4 C 0 1 110223 CASAVA_Build 6 50897752 1D GACTCCTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2903 hom 20 7 10 4 T 10 9 110224 CASAVA_Build 6 50899544 4D CCAGGTAACC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 hom 75 het 29 0 21 8 ACAA 6 5 110225 CASAVA_Build 6 50900968 1D TATTTAATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 T 10 9 110226 CASAVA_Build 6 50908413 1I CAAAGTTCTC -/A AAAACTATAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 4 5 110227 CASAVA_Build 6 50909450 2D AGCTTCTGGG AC/-- AGGGAGAAGC 3070 het 3070 ref 29 14 14 2 AC 1 0 110228 CASAVA_Build 6 50913451 1D ACACTCAGTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 A 8 7 110229 CASAVA_Build 6 50919975 1I AAAAAAAAAA -/C ACACACACAC 3070 het 448 hom 24 2 13 9 C 0 1 110230 CASAVA_Build 6 50921860 1D CGAGATAGAA C/- CTTTTGCGCC 3070 het 3070 ref 27 13 9 6 C 2 1 110231 CASAVA_Build 6 50930069 1I TTTTCAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 266 hom 42 1 39 2 T 10 11 110232 CASAVA_Build 6 50931307 3D GGCTGTGTCC CCA/--- CCACCCAAAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CCA 2 1 110233 CASAVA_Build 6 50936043 1D ACAAATTGCT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 8 110234 CASAVA_Build 6 50940329 1D TCATCCATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 19 22 9 T 10 9 110235 CASAVA_Build 6 50941020 2I GGTGACCTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 29 0 16 13 T 14 16 110236 CASAVA_Build 6 50945559 1I GAGCCACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 893 hom 45 2 36 7 A 9 10 110237 CASAVA_Build 6 50948145 6I GTCAGCTCTT ------/TAACTC TATGCCTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TAACTC 0 1 110238 CASAVA_Build 6 50950298 2D ATCTCCAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 110 hom 48 4 17 27 T 16 14 110239 CASAVA_Build 6 50956481 1I AAATTTTTTT -/A TAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 A 0 1 110240 CASAVA_Build 6 50966843 1I ATGTAGAATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 8 9 110241 CASAVA_Build 6 50971178 2I GTAACATAAT --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TA 4 5 110242 CASAVA_Build 6 50973454 1I AACCATTGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 55 16 26 13 A 9 10 110243 CASAVA_Build 6 50985163 1D TCAATTAAAA T/- AAAAAATCAG 3070 het 2409 hom 35 11 12 12 T 1 0 110244 CASAVA_Build 6 50988216 1I ATTCTTTTTT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 2932 hom 29 9 13 7 G 9 10 110245 CASAVA_Build 6 51001101 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 31 1 25 5 A 14 13 110246 CASAVA_Build 6 51013222 5D GAACATATGT AAAGA/----- AAAGTCAATA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 AAAGA 1 0 110247 CASAVA_Build 6 51016929 1D ACTGGATTTT G/- GGGGTTTTAA 3070 het 3070 ref 49 24 21 5 G 5 4 110248 CASAVA_Build 6 51031077 6D GACTTAGAAA TTTATT/------ ATATTTCTAC 3070 hom 63 het 22 0 22 2 TTTATT 1 0 110249 CASAVA_Build 6 51033795 2I GTGAGTATAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 AT 6 7 110250 CASAVA_Build 6 51035611 1D CCCTGCCAAT G/- TGTGATCAGA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 G 1 0 110251 CASAVA_Build 6 51037322 1D TTTAAAAGAT A/- AGGTTTATTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 2 1 110252 CASAVA_Build 6 51038794 1D GGTGGTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 921 hom 30 6 9 15 T 13 12 110253 CASAVA_Build 6 51043247 2I GTATAATTGA --/AC AGTTATAGAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AC 0 1 110254 CASAVA_Build 6 51045507 1I TTATAACTCA -/T TTAACTCACT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 2 3 110255 CASAVA_Build 6 51050910 1I AGATGTAGGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 55 24 25 6 A 8 9 110256 CASAVA_Build 6 51051852 1I GTTATTACAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 9 10 110257 CASAVA_Build 6 51058690 2I GATTTTATAA --/TC TTGAACATCT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 TC 0 1 110258 CASAVA_Build 6 51059825 1D GCACTGAGAG T/- TTTGATCAGT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 4 3 110259 CASAVA_Build 6 51060654 1I ACAATTCAGA -/T TTTTTTTTTT 2236 het 2236 ref 30 16 6 8 T 11 12 110260 CASAVA_Build 6 51062639 1I AGAGATTTTT -/C CCAGAGACCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 2 3 110261 CASAVA_Build 6 51063445 2D TTTGTAGAGT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 TC 8 7 110262 CASAVA_Build 6 51064175 1I TGTAGAAGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 9 10 110263 CASAVA_Build 6 51065167 2I GTCATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 49 18 13 18 TG 8 9 110264 CASAVA_Build 6 51071070 1D AATGCTTTCA T/- TTTTTCCCAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 5 110265 CASAVA_Build 6 51079954 1D GCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1528 hom 30 9 15 6 A 13 12 110266 CASAVA_Build 6 51088294 3I ATTTCCAGAG ---/TTA TTACTTAGGT 1854 het 1854 ref 48 37 4 7 TTA 1 2 110267 CASAVA_Build 6 51106401 1I CTAAAACTTA -/T TTTTTTAACA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 6 7 110268 CASAVA_Build 6 51106445 1D CTAAAACTTA T/- TTTTTAACAA 3070 het 1635 hom 25 4 12 9 T 6 5 110269 CASAVA_Build 6 51107067 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 15 2 10 3 T 13 12 110270 CASAVA_Build 6 51116275 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1667 het 819 hom 23 4 7 12 T 17 16 110271 CASAVA_Build 6 51121933 1I TATATATTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 8 9 110272 CASAVA_Build 6 51126373 3D ATTTGCGGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1167 het 122 hom 27 3 3 21 T 14 11 110273 CASAVA_Build 6 51133027 1D ACTCCACTAT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 9 8 110274 CASAVA_Build 6 51133537 1I GCACATACGA -/T TTTTTTTTTT 2849 hom 30 het 17 0 11 6 T 13 14 110275 CASAVA_Build 6 51141084 1D ATCTATTCCT C/- TTCGTCCCCA 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 C 1 0 110276 CASAVA_Build 6 51145480 2D GACAGCGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 783 hom 29 6 10 13 T 16 14 110277 CASAVA_Build 6 51150713 1D TATAGTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 10 9 110278 CASAVA_Build 6 51152284 1I TAAATACCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 11 12 110279 CASAVA_Build 6 51158037 1D TTGTCTGAGC T/- TTGGACTCAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 5 T 3 2 110280 CASAVA_Build 6 51167052 3I TAAATTGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTG 5 6 110281 CASAVA_Build 6 51167067 1D GTTGTTGTTG T/- TTGTTTGTTT 902 het 902 ref 47 13 6 28 T 3 2 110282 CASAVA_Build 6 51171093 1D CACTTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 42 0 19 23 T 13 12 110283 CASAVA_Build 6 51179994 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1909 hom 25 5 17 3 A 10 9 110284 CASAVA_Build 6 51189584 2I TGTATATATA --/TG TGATGTGAAT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 TG 1 2 110285 CASAVA_Build 6 51205101 1I CAGCAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 8 9 110286 CASAVA_Build 6 51208733 12I AGCAATTATG ------------/AATAAAACTGCC ATCAACAGTT 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 AATAAAACTGCC 0 1 110287 CASAVA_Build 6 51216993 4D ATAAAAAATT TATA/---- TATATATATA 2529 het 1472 hom 10 3 7 1 TA 9 7 110288 CASAVA_Build 6 51223749 6I TATTTATTTT ------/GAGACG GAGTCTCACT 1272 het 1272 ref 8 4 3 1 GAGACG 0 1 110289 CASAVA_Build 6 51227648 1I ATTTATACTG -/T TTTTACCACC 3070 het 3070 hom 32 8 23 1 T 4 5 110290 CASAVA_Build 6 51231026 4I AAAGAAAGCT ----/TTTA TTTATTTATT 1957 het 1957 ref 32 16 7 9 TTTA 2 3 110291 CASAVA_Build 6 51234537 1D ACTGATGTAG A/- AAAAATCTGA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 6 5 110292 CASAVA_Build 6 51240885 1D GGACACTCAA T/- TTACCATACA 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 3 2 110293 CASAVA_Build 6 51241473 1D CTCCCCTCTT C/- CCCCTGTTCC 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 C 5 4 110294 CASAVA_Build 6 51251877 2D AAGTGAAGGG GA/-- GGGGGGGGAA 1483 het 1483 ref 27 11 7 10 GA 1 0 110295 CASAVA_Build 6 51259121 2D ATAAAAATCA GC/-- CAACACATAT 2164 het 2164 ref 36 24 5 8 GC 1 0 110296 CASAVA_Build 6 51269502 1D CACTTATCAA G/- GAGGAAAGAG 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 G 2 1 110297 CASAVA_Build 6 51275121 1D AATAATAAAA G/- AAAGCCTGGG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 1 0 110298 CASAVA_Build 6 51275693 1D AATATGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 25 10 T 12 11 110299 CASAVA_Build 6 51279250 1D ATCTATTTAG T/- ATAGCACCTC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 1 0 110300 CASAVA_Build 6 51287160 1D ATGCCTAATT A/- AAAAAAAAAA 2022 het 1482 hom 37 10 6 22 A 17 16 110301 CASAVA_Build 6 51313771 4I GCGCATACAC ----/ACAT ACACATGGGT 3070 hom 223 het 83 0 75 8 ACAT 0 1 110302 CASAVA_Build 6 51314355 4D CTTTGCAAAA CTCT/---- CTCTGGATCA 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 CT 4 2 110303 CASAVA_Build 6 51315154 1D ACTGTGTTAT A/- AAAAATCAAG 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 A 6 5 110304 CASAVA_Build 6 51319191 1D CATTTCCCTG T/- TAAACACTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 2 T 2 1 110305 CASAVA_Build 6 51322989 3D GCTAAGCTGG AAT/--- AATTCCTCAC 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 AAT 2 1 110306 CASAVA_Build 6 51323111 20D TACATTGTAT ACATAAAAGAGTAAAAGAAA/-------------------- AGAAATCAGC 3070 het 3070 ref 34 22 14 7 ACATAAAAGAGTAAAAGAAA 1 0 110307 CASAVA_Build 6 51336188 12D ATTAATGTGA TGATAACTAATG/------------ TGATAATGCA 124 het 124 ref 37 21 1 17 TGATAACTAATG 1 0 110308 CASAVA_Build 6 51338571 1D ATATGCAAGC A/- AAAAAGTGGG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 6 5 110309 CASAVA_Build 6 51340132 1D GAGGGGCAAA G/- GGATGGTCTA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 3 2 110310 CASAVA_Build 6 51354138 2D TTTGAAACTC TT/-- TTCATATTTA 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 T 4 2 110311 CASAVA_Build 6 51356597 1I AGTATGTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 9 10 110312 CASAVA_Build 6 51360581 1I GGTTCGTTGC -/T TTTTTTTTTA 2296 het 2296 ref 30 12 9 9 T 9 10 110313 CASAVA_Build 6 51368167 2D TCTATGTGAC AT/-- ATCACATATC 3070 het 3070 ref 53 31 19 3 AT 2 1 110314 CASAVA_Build 6 51390103 4D CCTTGTATAA ACTG/---- ACTGATTAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 ACTG 2 1 110315 CASAVA_Build 6 51390209 6D TGAGAATGAA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 1629 hom 21 5 12 5 TG 12 9 110316 CASAVA_Build 6 51399655 1D TCCAATTTTT A/- TTTTAAGTTC 2801 het 2801 ref 20 13 7 1 A 1 0 110317 CASAVA_Build 6 51405331 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 29 3 11 15 T 13 12 110318 CASAVA_Build 6 51411389 1D AGTTGTTGGC T/- GTACCATCTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 1 0 110319 CASAVA_Build 6 51415473 1I TCTGCTGCTG -/T TGGATGGAAT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 T 1 2 110320 CASAVA_Build 6 51419633 1D GGGAGCTTGT C/- ATAAATGTAG 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 C 1 0 110321 CASAVA_Build 6 51421537 1I GATCCAAGCT -/A TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 0 1 110322 CASAVA_Build 6 51426540 1I GCACACAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 37 2 17 18 A 13 14 110323 CASAVA_Build 6 51440053 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 903 hom 38 5 15 18 T 17 16 110324 CASAVA_Build 6 51442291 1D GATCACTGGG A/- TGAATGTGTT 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 A 1 0 110325 CASAVA_Build 6 51446494 1D AGGGGAACAC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 9 8 110326 CASAVA_Build 6 51447678 1D GTCTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 12 11 110327 CASAVA_Build 6 51467513 1I AATTTTGAGG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 A 7 8 110328 CASAVA_Build 6 51469769 1I AATAAAATTT -/C CCTTGTTAGT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 C 2 3 110329 CASAVA_Build 6 51478092 1D TTAACACTTA T/- GTGCCTGTGC 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 T 1 0 110330 CASAVA_Build 6 51487875 1D TAAAATTAAA T/- TTTTTTTTAT 2920 het 1569 hom 17 5 7 5 T 9 8 110331 CASAVA_Build 6 51511061 1I GTTCCTCGTC -/T GTAAAATGGG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 0 1 110332 CASAVA_Build 6 51524388 7I GCTCTAATGA -------/AGAATAC AGTCTAATTG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AGAATAC 0 1 110333 CASAVA_Build 6 51550226 5I GATGGCCCCT -----/TGTCA TGTCATTAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TGTCA 1 2 110334 CASAVA_Build 6 51557983 5D AACTATCACA GTTAT/----- AATATATTTT 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 GTTAT 1 0 110335 CASAVA_Build 6 51558759 3I TCTATCACTA ---/TTG TTCTGCCTTT 3070 het 3070 hom 57 22 27 8 TTG 0 1 110336 CASAVA_Build 6 51559319 1I GAGAGTGCAA -/G GGGGGGAAGT 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 G 6 7 110337 CASAVA_Build 6 51559598 3I CTCATTCCAA ---/CAT CATTAACTCA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 CAT 1 2 110338 CASAVA_Build 6 51561836 1I TTATATGGTA -/G GTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 1 2 110339 CASAVA_Build 6 51562154 4D TTTAATTCAG TTTA/---- TTTGTGGGGT 3070 het 1062 hom 24 5 12 8 TTTA 1 0 110340 CASAVA_Build 6 51564246 1D CTGTAGTTCG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 10 9 110341 CASAVA_Build 6 51568629 2I GTGGGAGCTT --/CA GAGTCCCTCC 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 CA 0 1 110342 CASAVA_Build 6 51578049 9D5M1D GAGAAGAGCT GACAGAAGAGATTCA/---------GATTC- TTCTAGGATC 3070 het 3070 hom 35 12 18 7 N/A 0 0 110343 CASAVA_Build 6 51581715 26I TTCTCTATGC --------------------------/ACAGACACCACTTATCAAAACCCCAG ACAAGTCAGC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 ACAGACACCACTTATCAAAACCCCAG 0 1 110344 CASAVA_Build 6 51585513 1D TTGGATGGGT G/- AGACTGCATT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 G 1 0 110345 CASAVA_Build 6 51587652 1D TGAGATTTGC T/- TTTTTTTTTA 1348 het 1348 ref 44 35 3 6 T 10 9 110346 CASAVA_Build 6 51592512 1D GGATTTTTCA T/- TGTAAGCGCT 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 T 2 1 110347 CASAVA_Build 6 51616152 1D TTAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 11 10 110348 CASAVA_Build 6 51663936 1D AGTTGTGGAG A/- AAAAAGGAAT 3070 hom 72 het 25 0 23 2 A 6 5 110349 CASAVA_Build 6 51667706 1D CACTGACTAT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 8 7 110350 CASAVA_Build 6 51687127 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2349 hom 24 6 15 3 A 12 11 110351 CASAVA_Build 6 51691865 5I TTAAGTGCAT -----/ATATA ATATAAATAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 ATATA 1 2 110352 CASAVA_Build 6 51716975 2I CACATAATGA --/TT CTCAGCATTC 3070 het 3070 hom 60 21 29 10 T 0 2 110353 CASAVA_Build 6 51734594 1D AAGAAATGAG A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 A 7 6 110354 CASAVA_Build 6 51736720 1I TTTTTTTTTT -/A ATTATACTTT 1911 het 489 hom 6 1 5 0 A 1 2 110355 CASAVA_Build 6 51743233 6D GGTAAAAAAG TTATAA/------ TTATATTTTG 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 TTATAA 1 0 110356 CASAVA_Build 6 51750877 1I TTTTCTTCTC -/A AATCTAGCAA 3070 het 3070 hom 54 14 28 12 A 2 3 110357 CASAVA_Build 6 51752547 1I AACTGTTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 A 11 12 110358 CASAVA_Build 6 51754720 1D TTTTCTAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1941 hom 16 4 8 5 A 11 10 110359 CASAVA_Build 6 51754806 3I TATAATAAAT ---/TTA TTATATGATT 2501 het 2501 ref 17 11 6 0 TTA 1 2 110360 CASAVA_Build 6 51757022 1I GTAATTGTGG -/T TTTTTGCCAT 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 T 5 6 110361 CASAVA_Build 6 51761189 1D TTCTCCTTTA T/- TCTGACTTCT 3070 het 3070 hom 58 24 30 7 T 2 1 110362 CASAVA_Build 6 51762339 1I TATGTGTAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 8 9 110363 CASAVA_Build 6 51768971 1I AGGGATTCAA -/T TTCTTCCTCG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 2 3 110364 CASAVA_Build 6 51769190 2I ATTTAATTAG --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 T 9 11 110365 CASAVA_Build 6 51771135 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 A 8 9 110366 CASAVA_Build 6 51771878 3D GACCTAGAAG AAT/--- AATATTTAAC 3070 het 3070 ref 37 18 13 10 AAT 2 1 110367 CASAVA_Build 6 51772079 4D CCATTTTTTC TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 35 15 19 2 TTCT 4 3 110368 CASAVA_Build 6 51775738 5D TAAATATACA TATAT/----- TATATCAATT 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 TATAT 2 1 110369 CASAVA_Build 6 51777360 4I CAATTGCAAA ----/ATTT ACTTCATAAG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 ATTT 0 1 110370 CASAVA_Build 6 51777716 1I GCCACTGTGG -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 39 10 19 10 A 6 7 110371 CASAVA_Build 6 51778116 2I TGAAAATAAC --/AG ACACTAGAGA 3070 hom 101 het 37 0 33 4 AG 0 1 110372 CASAVA_Build 6 51778985 1I TATAATAAAA -/T AAAAAAGAGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 110373 CASAVA_Build 6 51779453 1D TAGATGAGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 T 9 8 110374 CASAVA_Build 6 51781270 2D AAGAATCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 26 13 11 3 CA 8 7 110375 CASAVA_Build 6 51789913 1D TTTTGAGGGG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 105 het 37 0 35 3 T 8 7 110376 CASAVA_Build 6 51790092 1I ATTTAGTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 104 het 42 0 38 4 A 9 10 110377 CASAVA_Build 6 51790597 4D CCATTTGCAC CCCT/---- TGCTGACCAC 3070 hom 108 het 37 0 35 4 CCCT 1 0 110378 CASAVA_Build 6 51792951 1D TATGTGTTCC A/- AAAGGAAACA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 4 3 110379 CASAVA_Build 6 51814127 5I AGTTTCCTTC -----/CCTTT CCTTTCCTTT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 CCTTT 2 3 110380 CASAVA_Build 6 51821697 1D ATTTCTTCTG A/- AAAAAAAAAA 1495 het 317 hom 20 3 6 11 A 13 12 110381 CASAVA_Build 6 51836009 2I ACATGTACTG --/TA TATATATGTC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 TA 3 4 110382 CASAVA_Build 6 51838788 1I CTGCATTTCT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 9 110383 CASAVA_Build 6 51842543 1I CCTACATAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 9 110384 CASAVA_Build 6 51844770 1D TTATTTTTAG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 8 7 110385 CASAVA_Build 6 51845173 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 11 10 110386 CASAVA_Build 6 51845964 1D ATAGAATAAT G/- CTTATAGCAT 3070 hom 84 het 34 0 28 7 G 1 0 110387 CASAVA_Build 6 51847039 1D AAATTAGACA T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 7 T 8 7 110388 CASAVA_Build 6 51857622 4D TACCCCTATA GGGT/---- ATATTTATAG 3070 hom 105 het 37 0 36 3 GGGT 1 0 110389 CASAVA_Build 6 51874448 1D AAAAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 488 hom 23 2 21 0 A 15 14 110390 CASAVA_Build 6 51890940 2I AAATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AT 5 6 110391 CASAVA_Build 6 51901385 1I TAACTCTAGC -/A GGACTTTGGG 3070 hom 70 het 30 0 22 8 A 0 1 110392 CASAVA_Build 6 51902273 1I AAACATTTGG -/T ATTTTGTGGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 110393 CASAVA_Build 6 51903105 4I CATCTACTCT ----/CAAA CAAACAGAAA 3070 hom 117 het 44 0 37 7 CAAA 1 2 110394 CASAVA_Build 6 51907412 1D TAAAATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 35 0 21 14 A 11 10 110395 CASAVA_Build 6 51907449 3D AAATAGGGCT AGA/--- AGAAGATGTG 3070 het 2643 hom 24 6 10 11 AGA 3 2 110396 CASAVA_Build 6 51909552 2D29M2D AAATAGACTC TGTAGCAATAAGACACCAAATTCCAACCTGACT/--TAGCAATAAGACACCAAATTCCAACCTGA-- CTAGTACAGC 3070 hom 126 het 40 0 42 6 N/A 0 0 110397 CASAVA_Build 6 51910892 3I TGCCAAAATT ---/CTG CTAAGATGTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTG 0 1 110398 CASAVA_Build 6 51927502 2D TCTTTTGTGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 105 het 39 0 36 7 TG 6 5 110399 CASAVA_Build 6 51927955 1D CTAAAAAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2219 hom 27 9 14 4 T 10 9 110400 CASAVA_Build 6 51962797 4D GCGTTTATTG TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 44 17 24 5 TTAT 3 2 110401 CASAVA_Build 6 51974954 1D TGAACTTTTA G/- GTTTCTCCTA 3070 het 3070 hom 59 24 28 7 G 2 1 110402 CASAVA_Build 6 51993672 1D CTTCCTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 35 1 28 6 A 12 11 110403 CASAVA_Build 6 52001277 1I CTAACAACTA -/T TTTTTTTTTT 1639 het 1639 ref 32 12 8 13 T 15 16 110404 CASAVA_Build 6 52001987 1I ACTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 9 10 110405 CASAVA_Build 6 52006937 1D ACTCTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3045 hom 25 11 12 2 A 14 13 110406 CASAVA_Build 6 52018695 1I ATAATTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 11 12 110407 CASAVA_Build 6 52035637 1D GGAGTTAGCC T/- TTTTTAGCAA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 T 6 5 110408 CASAVA_Build 6 52054320 1D TGTAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 48 0 40 8 A 12 11 110409 CASAVA_Build 6 52058478 2I CAGTCTTCTA --/TT TTTCCACAGC 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 3 5 110410 CASAVA_Build 6 52063701 1D GGTATGGTTC T/- TTTTTTTTTT 2840 het 140 hom 14 1 7 6 T 15 14 110411 CASAVA_Build 6 52072650 1I ACCCTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 2477 het 2477 ref 30 17 9 4 A 15 16 110412 CASAVA_Build 6 52077608 1I GGCAAAAAAA -/T ATCTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 16 24 9 T 0 1 110413 CASAVA_Build 6 52080946 1I CCCTTTGGAG -/C CTTCTGATCC 3070 het 2075 hom 28 6 14 8 C 1 2 110414 CASAVA_Build 6 52090597 1I ATGAATTCTT -/A AAAAAAAAAA 2014 het 2014 ref 32 13 10 9 A 15 16 110415 CASAVA_Build 6 52093177 6D TGTTTTTTGT TTTTTG/------ TTTTTTTTAG 1914 het 1187 hom 41 6 11 26 TTTTTG 1 0 110416 CASAVA_Build 6 52098325 1D GTTTTGGGGG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 8 7 110417 CASAVA_Build 6 52103981 4D AAGCAATTTT ATTG/---- ATTGATTGAT 3070 hom 66 het 30 0 23 8 ATTG 6 5 110418 CASAVA_Build 6 52106431 12I TCAGTGGCTG ------------/AGCCCACTATAA AGCATTAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AGCCCACTATAA 0 1 110419 CASAVA_Build 6 52107578 2D AAGAAATTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 26 1 11 14 A 13 11 110420 CASAVA_Build 6 52122466 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 T 8 7 110421 CASAVA_Build 6 52122955 1D GACAATGATA C/- CAACCTCAGT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 C 2 1 110422 CASAVA_Build 6 52124453 1I AAGGAGTGTT -/A AAAAAAGGGT 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 A 6 7 110423 CASAVA_Build 6 52125863 1I TTAGAAAACA -/G GCAGCTCATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 2 110424 CASAVA_Build 6 52131058 4D TCATCTATAT TTGG/---- TTGGTTGTTA 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 TTGG 2 1 110425 CASAVA_Build 6 52131829 5I TAAAATCTGT -----/TAAAG TAATCTACCA 3070 het 3070 ref 39 19 20 1 TAAAG 0 1 110426 CASAVA_Build 6 52146632 1I ATATGAAAGC -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 A 7 8 110427 CASAVA_Build 6 52153202 1I GCATTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 1214 het 1214 ref 50 33 4 13 T 13 14 110428 CASAVA_Build 6 52154399 1I ACCAATAGTA -/G AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 G 0 1 110429 CASAVA_Build 6 52158144 1D TGGCCAGCCT C/- CCCCCGAGTT 3070 het 3070 ref 42 19 10 13 C 6 5 110430 CASAVA_Build 6 52165460 2I TTGGTTAAAC --/AT ATTAAATTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 1 2 110431 CASAVA_Build 6 52169040 24I AAAACAAATT ------------------------/GGAATTCCTATAAATCTCAACACA GGATTTAAAG 3070 hom 36 het 17 0 13 4 GGAATTCCTATAAATCTCAACACA 0 1 110432 CASAVA_Build 6 52172419 1I GGCAAGAGAA -/T TGCTTGAGCC 2928 hom 24 het 9 0 7 2 T 1 2 110433 CASAVA_Build 6 52173756 1I TATCAAAAAT -/A AAAAAAAGAT 2562 het 2562 ref 27 19 7 1 A 7 8 110434 CASAVA_Build 6 52174268 2D AAAACTCCAA AC/-- ACATCATGAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AC 2 1 110435 CASAVA_Build 6 52181008 1I CATAAAGAGC -/A AAATGGTTAC 3070 hom 92 het 34 0 30 4 A 3 4 110436 CASAVA_Build 6 52183038 1D TGTTACCGTG T/- TTTTTTATTG 3070 hom 140 het 49 0 45 4 T 7 6 110437 CASAVA_Build 6 52203675 1I CCATTCACAG -/A AAAAAGTGAT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 5 6 110438 CASAVA_Build 6 52208242 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 40 14 17 11 GT 7 6 110439 CASAVA_Build 6 52215622 4D ATGGCCAAAT TAAC/---- TGAAAATTAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 8 TAAC 1 0 110440 CASAVA_Build 6 52217368 1D AATGCAGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 19 12 T 11 10 110441 CASAVA_Build 6 52220675 1D TGATTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 36 1 32 3 T 12 11 110442 CASAVA_Build 6 52228085 1D GGCAAAGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 46 0 37 9 A 10 9 110443 CASAVA_Build 6 52230431 3D TGAAAAACTG ATA/--- ATATCCAACT 3070 het 3070 hom 40 16 22 5 ATA 2 1 110444 CASAVA_Build 6 52230579 1D GAAAAAAAAA T/- ATTTGAATTG 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 T 1 0 110445 CASAVA_Build 6 52232132 1I TCTCAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 2681 het 2681 ref 23 12 8 3 A 10 11 110446 CASAVA_Build 6 52234956 2I TTGTGGCTGC --/TA TATAGTCTTC 3070 hom 135 het 51 0 44 7 TA 2 3 110447 CASAVA_Build 6 52235286 1I TCATACTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 129 hom 38 1 27 10 T 9 10 110448 CASAVA_Build 6 52251299 6D GGTAGCAGGT ATTAAA/------ ATTGTTTAAT 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 ATTAAA 1 0 110449 CASAVA_Build 6 52255896 5D CCACTTTTTG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 184 hom 39 4 24 11 A 19 14 110450 CASAVA_Build 6 52268111 1I ATCTAACATT -/A TTATTAATGC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 0 1 110451 CASAVA_Build 6 52275228 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3025 het 2325 hom 32 12 9 11 A 13 12 110452 CASAVA_Build 6 52281795 3D TACAAAAATT ATA/--- ATAAGTTCTA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 ATA 2 1 110453 CASAVA_Build 6 52294232 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 A 6 7 110454 CASAVA_Build 6 52296682 1I CATAAAGCAG -/A AAAAAAATAC 3070 het 2937 hom 26 8 11 7 A 7 8 110455 CASAVA_Build 6 52315656 3D ATGACCTGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 31 1 15 15 T 19 16 110456 CASAVA_Build 6 52328651 1D GTTGCATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 T 10 9 110457 CASAVA_Build 6 52329039 1I GGGTGAGTTC -/A ATATGGCTTT 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 A 1 2 110458 CASAVA_Build 6 52357291 1D TTATGAGACA C/- CCAAAAAGTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 3 2 110459 CASAVA_Build 6 52358942 1D TATTTAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 23 het 30 1 25 4 A 9 8 110460 CASAVA_Build 6 52371315 3I AAGTCCTTTC ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 TTG 3 4 110461 CASAVA_Build 6 52383819 6I CATGTGTAGG ------/CCGGGC CCAGCAAACT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CCGGGC 0 1 110462 CASAVA_Build 6 52393020 2D TGTGATGCCT GC/-- GCCTCCTGGC 3070 het 3070 ref 29 10 9 11 GC 2 1 110463 CASAVA_Build 6 52400312 2D CTTCCCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 40 6 15 20 T 12 10 110464 CASAVA_Build 6 52407642 2D ACCTGAGACC AT/-- ATATATATAT 2922 het 2922 ref 38 24 7 11 AT 9 8 110465 CASAVA_Build 6 52422725 1D GTCTTAATAC T/- GCCTTAGCTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 1 0 110466 CASAVA_Build 6 52428411 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2781 het 2158 hom 18 6 10 2 A 11 12 110467 CASAVA_Build 6 52431420 1I GAATGCTTAT -/A CACTGTTGGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 1 110468 CASAVA_Build 6 52441797 1D TGGGGTGGGA C/- TAGGTCCTGC 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 C 1 0 110469 CASAVA_Build 6 52444886 5D CCCCTGAACC TAAAA/----- TAAAAGTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TAAAA 2 1 110470 CASAVA_Build 6 52452182 2D AATTAAACTC TT/-- AAGTTGATTG 3070 het 3070 hom 51 23 25 5 T 2 0 110471 CASAVA_Build 6 52457796 1I GTTAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 A 11 12 110472 CASAVA_Build 6 52466847 2I AACAGTATCT --/CA CTTTCAAGTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CA 0 1 110473 CASAVA_Build 6 52469893 3I TAAGAAAACC ---/TCT TCTTTTCCAC 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 TCT 1 2 110474 CASAVA_Build 6 52475198 1D GAAGACGTGT C/- CCCCCCCACA 3070 hom 89 het 38 0 29 9 C 8 7 110475 CASAVA_Build 6 52492568 1I ATTCAGCCTT -/A AAAAAAAAAA 2585 het 2585 ref 30 9 12 9 A 13 14 110476 CASAVA_Build 6 52496184 2I GAAAAAAGAA --/AC ACAGAAAAGA 3070 hom 101 het 42 0 33 9 AC 1 2 110477 CASAVA_Build 6 52499961 1I CATGGTGAAA -/C CCCATCCCTA 2762 het 1105 hom 10 3 7 0 C 3 4 110478 CASAVA_Build 6 52501644 12D TGTACATGAC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2003 het 697 hom 17 3 6 8 T 22 10 110479 CASAVA_Build 6 52502161 4I ATTTGAAAGC ----/CTAA CTAGAGATTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CTAA 0 1 110480 CASAVA_Build 6 52505566 1D ATTATAAAAA C/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 C 1 0 110481 CASAVA_Build 6 52507813 4D TACCCCAACC CAGT/---- CAGAGTGCAG 3070 het 3070 ref 41 18 16 13 CAGT 1 0 110482 CASAVA_Build 6 52510488 1D TGCCGTCCCG T/- TCCCATTTAT 3070 hom 69 het 37 0 24 13 T 2 1 110483 CASAVA_Build 6 52512300 1I TACACAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 C 0 1 110484 CASAVA_Build 6 52523550 17D CTCAAGAGAT CCACCTGCCTTGGCCTC/----------------- CCACCTGCCT 3070 het 3070 hom 30 14 16 5 CCACCTGCCTTGGCCTC 2 1 110485 CASAVA_Build 6 52529043 2D TTTGTTTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 37 0 22 15 T 13 11 110486 CASAVA_Build 6 52534741 24D GTGAATACAC TAAAAATCACTGTATCATACACTT/------------------------ TAAAAATCAC 2398 het 2398 ref 37 22 6 12 TAAAAATCACTGTATCATACACTT 2 1 110487 CASAVA_Build 6 52536609 1D AAAACACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 830 hom 30 5 13 12 T 14 13 110488 CASAVA_Build 6 52552001 1I GCAATTCGTT -/C CCCCCACCTT 3070 het 3070 hom 59 25 24 10 C 5 6 110489 CASAVA_Build 6 52556307 1I TGTTTTTATT -/A AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 18 7 7 4 A 11 12 110490 CASAVA_Build 6 52584000 14I AGCAAACAGT --------------/GGTATACTTCAAAG GGGCACAGGA 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 GGTATACTTCAAAG 0 1 110491 CASAVA_Build 6 52590521 1I CCAGTTGAGT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 7 8 110492 CASAVA_Build 6 52593745 2I CTGTGAATGA --/CT CAGTCTGGAC 3070 het 3070 hom 42 21 17 4 CT 0 1 110493 CASAVA_Build 6 52594116 6D GCAAGGAGTT CTCCAA/------ CTATAACAGC 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 CTCCAA 1 0 110494 CASAVA_Build 6 52595892 1D ATGAGGATTT G/- TACATGCATT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 G 1 0 110495 CASAVA_Build 6 52596925 4D AGCCAGGCAT GGTG/---- GGTGGCATGC 3070 het 2078 hom 16 6 10 0 GGTG 2 1 110496 CASAVA_Build 6 52621398 4D ATTTTTCTAC AACA/---- AACATGTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 AACA 2 1 110497 CASAVA_Build 6 52655354 1D AGATTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2802 hom 35 10 11 14 T 15 14 110498 CASAVA_Build 6 52670967 2D TTTAGAATAT GA/-- GAGAGAGAGA 841 het 841 ref 41 30 3 8 GA 10 9 110499 CASAVA_Build 6 52683305 2I GGGGCTTAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 AC 8 9 110500 CASAVA_Build 6 52703666 1I CTCATTAATT -/G TTTTTAAGCC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 G 0 1 110501 CASAVA_Build 6 52704629 3D GTGTAGAACA TTG/--- TGGTGGTGCC 3070 hom 49 het 19 0 15 5 TTG 1 0 110502 CASAVA_Build 6 52726405 1I AGTTACAACC -/A GTGCAAACTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 0 1 110503 CASAVA_Build 6 52727973 1I TTGAAACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2563 hom 35 7 16 12 T 17 18 110504 CASAVA_Build 6 52742598 1I AGATATCCCT -/A AAAAATATAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 5 6 110505 CASAVA_Build 6 52756796 1D TTACAATCAT G/- GTGGAAAGTG 3070 hom 66 het 29 0 23 8 G 2 1 110506 CASAVA_Build 6 52763109 2D TATGAGTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 18 16 110507 CASAVA_Build 6 52767868 3I ATTAGCAGTA ---/TTC TTCTTTTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTC 1 2 110508 CASAVA_Build 6 52779877 6I GCTCTACACA ------/CTCTCT CTCTCTCTCC 3070 hom 82 het 31 0 24 7 CT 4 7 110509 CASAVA_Build 6 52782971 1D TTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 10 9 110510 CASAVA_Build 6 52785190 1I TAGAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1491 hom 24 4 11 9 A 13 14 110511 CASAVA_Build 6 52816789 1I TGCCATGGGT -/C CACACACACA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 C 1 2 110512 CASAVA_Build 6 52832369 7D TGATCTTACC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 21 0 13 9 T 18 11 110513 CASAVA_Build 6 52840087 1D ATGCCACCAT A/- AAAAAATGAT 1975 hom 10 het 4 0 4 0 A 7 6 110514 CASAVA_Build 6 52840910 4D TTAAAACTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAAT 6 5 110515 CASAVA_Build 6 52853769 15D CTGCCTCAAC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 2128 het 18 hom 10 1 6 7 A 31 16 110516 CASAVA_Build 6 52859754 1I AAGACTGGCT -/G GGCGCAGTGG 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 G 2 3 110517 CASAVA_Build 6 52885172 1I GTCCCTAATT -/C CCCATTCCTA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 C 3 4 110518 CASAVA_Build 6 52896529 9D GTTAAACTTT AGGAAAAAG/--------- AGGAAAAAGA 2677 het 2677 ref 21 13 7 3 AGGAAAAAG 2 1 110519 CASAVA_Build 6 52897144 1D AAGTTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 2506 het 1806 hom 24 10 9 5 A 13 12 110520 CASAVA_Build 6 52899994 1I AGAGAGAAAG -/C AAAAAGTTGG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 C 0 1 110521 CASAVA_Build 6 52900245 1D TTCACATGGA C/- CCCTTAGAGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 4 3 110522 CASAVA_Build 6 52902188 2I1M3D ATGGCCAAGG --GCCA/AAG--- GCCATGTAGC 3070 het 3070 ref 40 19 20 3 N/A 0 0 110523 CASAVA_Build 6 52914298 1D TAGCTCTCAA T/- TTTTTTTTTT 1602 het 1602 ref 46 33 4 9 T 12 11 110524 CASAVA_Build 6 52917889 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAACCAA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 7 6 110525 CASAVA_Build 6 52922902 2I CTACAAAATA --/TG TGTTAATCCA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 TG 1 2 110526 CASAVA_Build 6 52923222 3I TGAACATCTA ---/CTT CTTATAAAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 CTT 1 2 110527 CASAVA_Build 6 52929275 3D AACTTTAAAG TCC/--- TCAAGAAAAC 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 TCC 1 0 110528 CASAVA_Build 6 52950963 20D GAACTGGCTA CAGGACATGAGTAGCCCAAT/-------------------- CAGATCTAAC 3070 het 3070 ref 36 22 12 4 CAGGACATGAGTAGCCCAAT 1 0 110529 CASAVA_Build 6 52953069 1D TTTCACTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2972 hom 21 7 12 2 T 11 10 110530 CASAVA_Build 6 52954482 1D AAGGTTCTAG A/- TAAAACTCAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 1 0 110531 CASAVA_Build 6 52955110 2I ATCCCACCTT --/AA AAAAAAAAAA 1159 het 1159 ref 24 14 3 7 A 12 14 110532 CASAVA_Build 6 52961041 1D TGATGATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 31 0 24 7 A 13 12 110533 CASAVA_Build 6 53006307 1D AGAATCTGAT A/- AGACTGTCTC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 2 1 110534 CASAVA_Build 6 53010149 6I GCACAAAAGA ------/TGTGCC AGGACCTCAG 3070 hom 156 het 54 0 51 3 TGTGCC 0 1 110535 CASAVA_Build 6 53016577 16I TATTTCAAGT ----------------/ATGCTTAGGGCACAGG ATGTGGAGGG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 ATGCTTAGGGCACAGG 0 1 110536 CASAVA_Build 6 53021433 1I AAAGAAGGGA -/G CCATGGTAGG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 G 0 1 110537 CASAVA_Build 6 53030357 1D GAGCTTATTT A/- AAGATAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 3 2 110538 CASAVA_Build 6 53040856 1D CTCCCCCCCC T/- GGCCGCCCTG 3070 hom 60 het 23 0 16 9 T 1 0 110539 CASAVA_Build 6 53046428 1D ACAAATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 40 1 26 13 T 13 12 110540 CASAVA_Build 6 53046984 3D TCATTTCTTA TTC/--- TTCTTCCATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTC 3 2 110541 CASAVA_Build 6 53049557 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTGTATT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 3 2 110542 CASAVA_Build 6 53082725 13D GAGATTGGGC CCACCTGGACAAT/------------- CCGGGCTAGC 3070 hom 96 het 35 0 33 4 CCACCTGGACAAT 1 0 110543 CASAVA_Build 6 53088432 4I ACCTTCTCAC ----/CTCT CACTCTGTCT 3070 hom 166 het 60 0 56 4 CT 0 2 110544 CASAVA_Build 6 53117325 1I AGAAGCGAGT -/G GATTGCTTGA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 G 1 2 110545 CASAVA_Build 6 53117384 2D CCCTGACTCT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 56 het 26 0 17 9 AC 8 7 110546 CASAVA_Build 6 53130576 1D CTGAAATTCC A/- GCTACTTCGG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 1 0 110547 CASAVA_Build 6 53133132 8D TTAGTAGAGA CGGGGTTT/-------- CGCCATGTTG 3070 het 1267 hom 15 3 11 1 CGGGGTTT 1 0 110548 CASAVA_Build 6 53145838 64D4M3D TGGCTCAGAC AGAAGTCTGAGCTCCATACTCAGCTCAGACAGAAGTCTGAGCCCCATACTCAGCTCAGACAGAAGTCTGAG/----------------------------------------------------------------TTCT--- CCCCTGAGCT 3070 hom 39 het 14 0 14 3 N/A 0 0 110549 CASAVA_Build 6 53153457 1D TGGTAGAGAC G/- GGGGTCTCAC 2463 hom 25 het 12 0 7 5 G 5 4 110550 CASAVA_Build 6 53157813 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 7 T 13 12 110551 CASAVA_Build 6 53159540 1D TGTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 2694 het 405 hom 20 1 9 10 T 15 14 110552 CASAVA_Build 6 53163618 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2757 het 163 hom 21 3 8 12 A 20 16 110553 CASAVA_Build 6 53164072 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 24 2 15 7 T 12 11 110554 CASAVA_Build 6 53165197 5D CTAGTGAGAT AGGAA/----- AGGAAATGCA 3070 hom 92 het 34 0 31 8 AGGAA 2 1 110555 CASAVA_Build 6 53166292 1I CTCATCTCTC -/A AAAAAAAAAA 2363 hom 18 het 16 0 7 9 A 13 14 110556 CASAVA_Build 6 53168058 1D GGAGGATCCC T/- CGAGTCCAGG 3070 hom 54 het 20 0 16 4 T 1 0 110557 CASAVA_Build 6 53215339 4I CTATATACTC ----/TAAT TATCCAGTGA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 TAAT 0 1 110558 CASAVA_Build 6 53257059 1D CAAGACCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 13 12 110559 CASAVA_Build 6 53297010 1D ACTCTACCTC A/- AAAAAAAAAA 1462 het 66 hom 16 1 7 8 A 23 22 110560 CASAVA_Build 6 53298128 1I TCCAAATGTC -/G ATTTTTTAAA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 G 0 1 110561 CASAVA_Build 6 53301522 1D GGGATGAATT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 123 het 48 0 42 8 A 8 7 110562 CASAVA_Build 6 53395329 1I ATTCCATTGA -/T TGTCTATCCT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 1 2 110563 CASAVA_Build 6 53400730 1D TGCTTTTTTT A/- AAAAACAAAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 6 5 110564 CASAVA_Build 6 53414586 1D CAAATACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 T 11 10 110565 CASAVA_Build 6 53419558 11D TTCTCTTCAG CAGGTAGGCCT/----------- CATGAAGATG 3070 hom 151 het 52 0 51 2 CAGGTAGGCCT 1 0 110566 CASAVA_Build 6 53442279 1D TTTTTAGTGA T/- TTTTTTTTTA 1183 het 1183 ref 45 35 3 7 T 10 9 110567 CASAVA_Build 6 53444837 1I GCTTACTATT -/A ACCAGTGAGT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 1 2 110568 CASAVA_Build 6 53453001 1I GCAGGGAGTC -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 34 8 22 4 T 7 8 110569 CASAVA_Build 6 53458406 5I TTTTCTTTTC -----/TTTCT TTTTTTTTTT 2778 het 2778 ref 34 16 13 5 TTTCT 0 1 110570 CASAVA_Build 6 53464744 5I CAAGATATTA -----/TTAAG TTAATAGAGG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TTAAG 0 1 110571 CASAVA_Build 6 53468262 1I ATTAGGTCAT -/G AGGGTGGAAC 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 G 0 1 110572 CASAVA_Build 6 53503617 4D CCTTTCTCTA TTCT/---- TTCTTCTCTT 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 TTCT 2 1 110573 CASAVA_Build 6 53506505 1D ATTAGTCTTA C/- CAAATGAGGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 2 1 110574 CASAVA_Build 6 53512378 1D TCTTTTTTTT A/- ATCCAAGTCC 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 A 2 1 110575 CASAVA_Build 6 53513974 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 8 9 110576 CASAVA_Build 6 53515551 7I GGCGGGTGAA -------/TCACCTG AAGTCAGGAG 2406 hom 26 het 10 0 7 3 TCACCTG 0 1 110577 CASAVA_Build 6 53524767 1I GTTAAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2883 hom 27 10 9 8 T 10 11 110578 CASAVA_Build 6 53543663 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1003 hom 7 het 4 0 3 1 T 13 12 110579 CASAVA_Build 6 53543787 2I AGGTGTGAGC --/CA CCGCACCCGG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 CA 0 1 110580 CASAVA_Build 6 53545526 1I AGGGTGGGAT -/G GGGGTGGGAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 4 5 110581 CASAVA_Build 6 53546961 3D CAGGGATAAA GGG/--- GGGGGTCGTG 3070 hom 123 het 46 0 40 6 G 8 5 110582 CASAVA_Build 6 53551679 1I GAACATATGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 8 9 110583 CASAVA_Build 6 53552875 1D ACATATGCTC T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 T 7 6 110584 CASAVA_Build 6 53571136 2D GTCCTTAAAC AT/-- ATTTACAATG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 AT 2 1 110585 CASAVA_Build 6 53572064 1D TTGTTTATGG A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 49 21 25 4 A 7 6 110586 CASAVA_Build 6 53572302 2I AATGTCTTTT --/AC ACACAACTCT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 AC 2 3 110587 CASAVA_Build 6 53575172 2D TTTCAAATGT AG/-- AGATTCAATC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 AG 2 1 110588 CASAVA_Build 6 53579471 2D TATATGTATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TA 7 6 110589 CASAVA_Build 6 53593211 1I TTTGAAATTA -/T TTTCAAAATA 2367 het 2367 ref 26 20 5 1 T 3 4 110590 CASAVA_Build 6 53609318 4I ACTGAGACTT ----/AAAG AAACTAAATG 3070 het 3070 hom 48 14 29 5 AAAG 0 1 110591 CASAVA_Build 6 53617969 4D CATATATTTT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 102 het 43 0 35 11 AC 9 7 110592 CASAVA_Build 6 53625800 1I AAATATATAT -/A TTTTTTCAGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 110593 CASAVA_Build 6 53630656 1D CACATTTATA T/- TTTTTACAAG 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 T 6 5 110594 CASAVA_Build 6 53631037 1I CCTGTGGCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 30 0 20 10 T 9 10 110595 CASAVA_Build 6 53635842 1I CAGAAAGAGT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 8 9 110596 CASAVA_Build 6 53637802 2D CAAATAACAA AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 13 10 AT 1 0 110597 CASAVA_Build 6 53639680 3D CCTTAAAATA AAG/--- AAGAAGAGTG 3070 het 3070 hom 38 9 25 4 AAG 3 2 110598 CASAVA_Build 6 53639990 1I ACTATTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 T 10 11 110599 CASAVA_Build 6 53642054 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2311 hom 20 6 13 1 A 9 10 110600 CASAVA_Build 6 53644339 1I ACACAGAGGT -/C CCCCCATGGC 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 C 5 6 110601 CASAVA_Build 6 53644413 4I TTACACCAGT ----/ATTA ATTTATCCAT 3070 hom 77 het 29 0 25 4 ATTA 0 1 110602 CASAVA_Build 6 53644743 26D45M1D GGATTACAGG TGCCCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGCGTTTCACCGTGTTGGCAAGGCTG/--------------------------ATTGTATTTTTAGTAGAGACAGCGTTTCACCGTGTTGGCAAGGCT- GTCTTGAACT 1919 het 997 hom 6 3 4 5 N/A 0 0 110603 CASAVA_Build 6 53645339 1D AAACATGTCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 A 9 8 110604 CASAVA_Build 6 53645979 8I GAAGTGCCTT --------/CTTCTGTG CTTCTGTAAT 3070 het 2470 hom 30 7 20 3 CTTCTGTG 0 1 110605 CASAVA_Build 6 53647578 1D TCTTCTTGCC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 8 7 110606 CASAVA_Build 6 53648328 4D TTATTTTCAT AAAG/---- AGCCTTTCAC 3070 het 3070 hom 47 22 23 5 AAAG 1 0 110607 CASAVA_Build 6 53648765 1I ACTTAAAAAA -/G TTTACTAGAA 2775 het 2775 ref 19 9 7 3 G 0 1 110608 CASAVA_Build 6 53650437 2D GAGCAAGAGT GA/-- GAGACCAGGG 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 GA 3 2 110609 CASAVA_Build 6 53652885 1D GTTGCTTCTC T/- TTAACATCTG 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 T 3 2 110610 CASAVA_Build 6 53654500 1D TCCTTAGGGG A/- AAAAAACCTA 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 7 6 110611 CASAVA_Build 6 53662479 1D AAAATGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 10 9 110612 CASAVA_Build 6 53671271 1I CCTGAATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 13 14 110613 CASAVA_Build 6 53671350 1I GTGTCGGGGT -/G GGGGGGGCGC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 7 8 110614 CASAVA_Build 6 53686411 5D AACAAAAACA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 27 13 12 5 AAAAC 3 2 110615 CASAVA_Build 6 53687573 4D CGTTACTTAA TAAG/---- TAATAAGAAA 3070 het 3070 hom 40 12 25 5 TAAG 1 0 110616 CASAVA_Build 6 53688540 1I CTTTGTGACC -/A AAAAAAAAAA 2934 het 2934 ref 39 18 12 9 A 10 11 110617 CASAVA_Build 6 53688898 1D ACATCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 1522 het 187 hom 29 2 8 19 T 19 18 110618 CASAVA_Build 6 53696353 1I ACCCAGACAT -/C ACAGCATTCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 110619 CASAVA_Build 6 53700949 3D CTCGGTTATA TAT/--- TATTATACAG 3070 het 3070 hom 37 11 25 1 TAT 3 2 110620 CASAVA_Build 6 53701465 1D CTCATCCTTC A/- AAGGAAACTT 3070 hom 135 het 50 0 45 5 A 3 2 110621 CASAVA_Build 6 53701888 3D GGCCACATTG GAA/--- GAAGAATTGT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 GAA 3 2 110622 CASAVA_Build 6 53705484 1I TAAAATGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 T 10 11 110623 CASAVA_Build 6 53705900 3D TTTGTATTAG TGA/--- TGATACTTAC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 TGA 2 1 110624 CASAVA_Build 6 53706072 18D AATCACTATC ATGATGTTGCTGCTTATA/------------------ ATCAAGATCT 3070 het 3070 ref 40 26 12 4 ATGATGTTGCTGCTTATA 1 0 110625 CASAVA_Build 6 53710506 7D TTGATTAACC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2799 het 842 hom 32 11 9 14 T 23 16 110626 CASAVA_Build 6 53712513 1I AGGTTGTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 9 10 110627 CASAVA_Build 6 53716211 15D CTGGTTGGCA TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2278 hom 6 het 18 0 9 9 T 27 12 110628 CASAVA_Build 6 53720760 1D TGAGATCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 11 25 7 A 11 10 110629 CASAVA_Build 6 53720829 1D GGCATTGTTA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 T 7 6 110630 CASAVA_Build 6 53730331 5I AAAAAAAACT -----/CAAAC CAAACCAAGA 3070 hom 89 het 31 0 28 3 CAAAC 1 2 110631 CASAVA_Build 6 53731650 3D AGTCATGATT TTC/--- TTCTTCTATT 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 TTC 3 2 110632 CASAVA_Build 6 53740632 2I CTATTATACA --/TT TTTATGTAAG 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 T 3 5 110633 CASAVA_Build 6 53743340 1D CTCTGTCTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 9 8 110634 CASAVA_Build 6 53745722 1I AGTAATAGAG -/T TTCAACACAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 T 2 3 110635 CASAVA_Build 6 53755139 4D ACAGAAAATG AAGA/---- AAGAAATATT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 AAGA 2 1 110636 CASAVA_Build 6 53755749 1D AAAAGTTGCG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 2990 hom 17 8 9 0 T 9 8 110637 CASAVA_Build 6 53763174 1D CTAGATCAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 29 8 17 5 A 9 8 110638 CASAVA_Build 6 53776346 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 12 12 14 TG 8 9 110639 CASAVA_Build 6 53779752 23D TCAAGCAATT CAGAGGGTGTTGTTTGAAACTTC/----------------------- CCTTTATGTT 3070 het 3070 ref 31 28 12 2 CAGAGGGTGTTGTTTGAAACTTC 1 0 110640 CASAVA_Build 6 53781451 1I TTCCTTATCA -/C TGGACCTTCC 3070 hom 125 het 51 0 41 10 C 0 1 110641 CASAVA_Build 6 53788219 1D TCTCTTTTCT C/- CCTCCACTTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 3 2 110642 CASAVA_Build 6 53789486 1I CATGGAGGGC -/T AGAGGGAAGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 110643 CASAVA_Build 6 53794637 3D GTAATGCTAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 38 2 25 11 T 16 13 110644 CASAVA_Build 6 53798955 4D CATATCTGCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 35 0 21 14 T 18 14 110645 CASAVA_Build 6 53803702 5I4M2D AGTTATTATA -----ATTTTA/TAGTTATTT-- TATATATATA 2981 hom 15 het 6 0 6 0 N/A 0 0 110646 CASAVA_Build 6 53807879 1I CAATTCACCC -/A AAGTGCGCAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 2 3 110647 CASAVA_Build 6 53809956 1D TATATTCTGG A/- AAAAATATAT 3070 het 187 hom 22 2 15 5 A 6 5 110648 CASAVA_Build 6 53821520 1I TCTTTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 30 1 24 5 T 10 11 110649 CASAVA_Build 6 53833289 2I TCTGGTTTAA --/TC TCTTTTTTAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TC 1 2 110650 CASAVA_Build 6 53838487 1I TCAGTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 11 12 110651 CASAVA_Build 6 53842502 4D ATCATCAAAC AATT/---- AATTAATTAA 3070 hom 123 het 47 0 42 10 AATT 3 2 110652 CASAVA_Build 6 53870253 1D GCACATTTGG A/- AAAAACATAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 5 110653 CASAVA_Build 6 53873822 1I GGCTCTATGC -/A GAGATGTTCA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 0 1 110654 CASAVA_Build 6 53903678 2I CTTAGAGAAC --/CA CACTGCTCTA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 CA 1 2 110655 CASAVA_Build 6 53905432 1I TATTCCCTGC -/T TACCCTCACC 3070 het 3070 ref 44 20 22 2 T 1 2 110656 CASAVA_Build 6 53905741 1D TTCATTACAA T/- TTTTGAATTA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 5 4 110657 CASAVA_Build 6 53930732 1D TCTGTTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1571 hom 26 6 10 10 T 13 12 110658 CASAVA_Build 6 53960256 1I ATGTTAAATG -/T TTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 6 7 110659 CASAVA_Build 6 53964109 4D CTCTGTTCTG TTTC/---- TTTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 22 18 1 TTTC 2 1 110660 CASAVA_Build 6 53965635 1D TAAAAGCCCC T/- TTTGGTGGGG 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 T 4 3 110661 CASAVA_Build 6 53967699 1D GCTAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 1005 het 925 hom 13 4 4 6 T 12 11 110662 CASAVA_Build 6 53973296 1D TTTACATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 22 1 13 9 A 12 11 110663 CASAVA_Build 6 53976538 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2207 het 2207 ref 35 18 8 10 T 14 13 110664 CASAVA_Build 6 53998513 1I CTAAGCTGCC -/G GGCTCATGTT 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 G 2 3 110665 CASAVA_Build 6 54003333 1I ACAGCAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 854 hom 28 2 23 3 T 11 12 110666 CASAVA_Build 6 54003972 1I CTCAGAGTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 105 hom 53 1 49 3 T 9 10 110667 CASAVA_Build 6 54004331 1D TTGTTATGAC G/- GGGATCCCAA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 G 4 3 110668 CASAVA_Build 6 54006025 1D GAGGAACTAA T/- TTTTTTTTTT 2579 het 2579 ref 31 15 9 7 T 17 16 110669 CASAVA_Build 6 54008999 1D GTCACCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 27 1 14 12 T 17 16 110670 CASAVA_Build 6 54016101 2I TGAATAAGAG --/CA CTGCTTACCT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 CA 0 1 110671 CASAVA_Build 6 54017394 1D GTGGTAGACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 10 10 T 13 12 110672 CASAVA_Build 6 54018104 1D ACTCCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1085 hom 32 6 16 10 A 15 14 110673 CASAVA_Build 6 54030907 1I GGGGGAATAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 9 110674 CASAVA_Build 6 54035962 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1412 het 1412 ref 31 13 7 12 A 15 14 110675 CASAVA_Build 6 54038659 1D GTATGTAGTC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 T 8 7 110676 CASAVA_Build 6 54039041 3D GCCAGGTGTC CTT/--- CTCAAAATAA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 CTT 1 0 110677 CASAVA_Build 6 54039310 3I GGCAAGTGAA ---/CTT CTTCTGGTAT 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 CTT 1 2 110678 CASAVA_Build 6 54039595 1D TAACACATGA C/- CACAAATCAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 C 2 1 110679 CASAVA_Build 6 54039732 1D TATCCAGAGG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 A 8 7 110680 CASAVA_Build 6 54053238 1D CATGTCCTTA T/- TTTTACAATC 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 5 4 110681 CASAVA_Build 6 54055516 2D ATATCTTTCA TT/-- TTTTTTTTGG 3070 het 507 hom 28 2 12 14 T 10 8 110682 CASAVA_Build 6 54063112 1I GAAGATACTT -/A ACTTTGTTAG 3070 het 3070 hom 64 28 33 3 A 1 2 110683 CASAVA_Build 6 54071088 1I TTTTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 1643 het 4 hom 15 0 6 9 T 17 18 110684 CASAVA_Build 6 54073063 1I CATAAAGTGC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 110685 CASAVA_Build 6 54074174 5D TATATGTCAC TTAAT/----- TTAATTTTTA 3070 het 3070 hom 36 12 22 6 TTAAT 2 1 110686 CASAVA_Build 6 54080758 1I TCAGGAAGAG -/A GATTATTTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 110687 CASAVA_Build 6 54081804 2I TTATGTCTTC --/AT ATATATATAT 2453 het 766 hom 21 4 6 11 AT 6 7 110688 CASAVA_Build 6 54081982 1I TTTAACCTAC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 110689 CASAVA_Build 6 54082749 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1050 het 1050 ref 13 4 3 6 T 11 12 110690 CASAVA_Build 6 54085424 1I CAACTAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 9 10 110691 CASAVA_Build 6 54091843 1I CTTACACACA -/G TTGGTGAGAG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 G 0 1 110692 CASAVA_Build 6 54093159 1I GCCCGGCTCA -/T TTTTTTTTTG 2109 hom 12 het 7 0 5 2 T 9 10 110693 CASAVA_Build 6 54095858 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 1193 het 1193 ref 10 6 4 0 T 8 9 110694 CASAVA_Build 6 54097725 1D CAGACAAAAC T/- TTCAAAGAAA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 T 3 2 110695 CASAVA_Build 6 54099985 1D TTAGTGGGGG A/- AAAAATTCTC 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 A 6 5 110696 CASAVA_Build 6 54131629 1D GAAGTATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 12 11 110697 CASAVA_Build 6 54140097 4I TCACTCCATC ----/CCAG CCTGGTAGCC 3070 hom 117 het 42 0 38 4 CCAG 0 1 110698 CASAVA_Build 6 54151061 1D GTTTCTTCCC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 7 6 110699 CASAVA_Build 6 54154166 1I TCACCCTTCA -/G GGCAATGGGC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 2 3 110700 CASAVA_Build 6 54156405 1D AATCAAACTT A/- AAAAAATTTC 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 7 6 110701 CASAVA_Build 6 54164983 2D GTTTTAAATT AA/-- GTTTTAATCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 2 0 110702 CASAVA_Build 6 54166956 4D CCAGCTTTAG CGGT/---- GGGTGCATGA 3070 hom 132 het 48 0 45 7 CGGT 1 0 110703 CASAVA_Build 6 54173149 2I CTTGTAGCCC --/CT GAGTCCTGGA 3070 hom 123 het 46 0 40 6 CT 0 1 110704 CASAVA_Build 6 54175048 1D ATATATAAAA T/- ATATATAAAT 1645 hom 10 het 4 0 4 0 T 1 0 110705 CASAVA_Build 6 54178323 2D GAGACCTGAC AG/-- AAATGTATTT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 AG 1 0 110706 CASAVA_Build 6 54182761 4D TTAAAAAAAT TAAC/---- TATACAGTTA 2529 het 2529 ref 24 17 7 0 TAAC 1 0 110707 CASAVA_Build 6 54186550 1D CAAAAAAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 T 9 8 110708 CASAVA_Build 6 54194309 1D CCCCTTATAA T/- GCTAAAAGAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 0 110709 CASAVA_Build 6 54194480 1I TAGATCAAAT -/A AAAAATAGGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 110710 CASAVA_Build 6 54201357 1I CACAAAACAC -/A AGAGTAGCAC 3070 hom 157 het 60 0 53 7 A 1 2 110711 CASAVA_Build 6 54204239 4D TGTGTGCGTG TGTC/---- TGTCTGTCTG 3070 hom 68 het 26 0 23 5 TGTC 3 2 110712 CASAVA_Build 6 54209364 1D AGTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 28 0 27 1 A 11 10 110713 CASAVA_Build 6 54263896 1I CCCATCCCTA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 114 hom 28 1 24 3 T 7 8 110714 CASAVA_Build 6 54264329 1I ATACAAATGA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 8 110715 CASAVA_Build 6 54264753 4I TGGAGAGCAG ----/CTTC CTATGACTCA 3070 hom 71 het 27 0 22 5 CTTC 0 1 110716 CASAVA_Build 6 54265763 2I TGTTCCTATG --/TT ATTTTGAATT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 0 2 110717 CASAVA_Build 6 54268343 1D AAATTGCTGT G/- GGGGGTGACT 3070 hom 71 het 27 0 23 6 G 6 5 110718 CASAVA_Build 6 54269671 1D ATTGTTTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 9 8 110719 CASAVA_Build 6 54273736 1D TTCTCACAAC T/- TTTTTCTGTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 6 5 110720 CASAVA_Build 6 54275477 1D AAGATCTTAT G/- TCAGGAAGGT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 1 0 110721 CASAVA_Build 6 54280937 1D CTGGGCCATG T/- ATATTCTAAG 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 T 1 0 110722 CASAVA_Build 6 54288451 1I AAAAAAAAGT -/A AAAAAAATTC 3070 het 456 hom 34 2 26 6 A 7 8 110723 CASAVA_Build 6 54289999 4D CGCTTTCTTG CTCT/---- CTCTTTCTTC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 CT 4 2 110724 CASAVA_Build 6 54302553 1D AAGTAAATGG A/- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 3 2 110725 CASAVA_Build 6 54314317 1I AAACTGAACT -/C CCCCTATTAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 4 5 110726 CASAVA_Build 6 54316291 1I AGTCTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 25 3 19 3 T 12 13 110727 CASAVA_Build 6 54329676 1I CCCTCAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 11 12 110728 CASAVA_Build 6 54331292 1D GTTATTCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 28 1 16 11 A 17 16 110729 CASAVA_Build 6 54334233 1D GTGCTACACA C/- TTTTTAAACA 3070 hom 122 het 43 0 41 2 C 1 0 110730 CASAVA_Build 6 54345485 26D AAATACATAC ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 1545 het 355 hom 13 6 7 6 AT 22 9 110731 CASAVA_Build 6 54345968 3I ACTTTTCCAT ---/TTA TTAATATATC 3070 hom 144 het 53 0 48 5 TTA 1 2 110732 CASAVA_Build 6 54354116 1D TATTATATAC T/- TTTTTTATAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 6 110733 CASAVA_Build 6 54358238 1D GAACAATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 91 het 38 0 33 5 A 10 9 110734 CASAVA_Build 6 54367538 4I AAACAGACTA ----/ATAC ATACACTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATAC 1 2 110735 CASAVA_Build 6 54378404 1D AAAAAAAAAA G/- CTTAGAAGAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 G 1 0 110736 CASAVA_Build 6 54406101 1I TTCATGGTTC -/G TTTTTTTTTA 3070 het 2028 hom 28 6 19 3 G 0 1 110737 CASAVA_Build 6 54443756 1D TTCATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 11 10 110738 CASAVA_Build 6 54451688 1I TAAGCCTGGT -/A ATACGTAGGT 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 A 1 2 110739 CASAVA_Build 6 54460168 2D TATGTGCCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 14 12 110740 CASAVA_Build 6 54460709 1D AATCTTTAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 10 9 110741 CASAVA_Build 6 54460816 1I TTTGTTCTAG -/C TAGAACTTTC 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 C 0 1 110742 CASAVA_Build 6 54469656 1I AAAAGTACTG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 8 9 110743 CASAVA_Build 6 54483160 5I TTGTAATACT -----/TGACA TGACAATTTT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 TGACA 1 2 110744 CASAVA_Build 6 54486996 1I CTTCTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1945 hom 25 5 11 9 T 10 11 110745 CASAVA_Build 6 54489798 1I ATATCTGTTT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 7 8 110746 CASAVA_Build 6 54490688 1I TCCATTTCAA -/T ATCCTATTTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 0 1 110747 CASAVA_Build 6 54491346 1D20M1D TATTTTGAGT AACAATGCAATTTCAAAAATGA/-ACAATGCAATTTCAAAAATG- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 39 24 20 1 N/A 0 0 110748 CASAVA_Build 6 54494305 1I ATGGAATTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 A 9 10 110749 CASAVA_Build 6 54495350 1D AGTAGATCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 A 10 9 110750 CASAVA_Build 6 54500644 2D TTTTTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 T 12 10 110751 CASAVA_Build 6 54507688 1D TGTGAATAGA T/- TCCAGATCCC 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 T 2 1 110752 CASAVA_Build 6 54518340 1D CCTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2351 het 2351 ref 16 7 6 3 T 12 11 110753 CASAVA_Build 6 54522279 3D TATCTGCTGT ACC/--- ACCCATTGAA 3070 het 3070 ref 45 23 13 10 ACC 2 1 110754 CASAVA_Build 6 54532233 1D AATACAGATC T/- TTTGTGTTGA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 T 4 3 110755 CASAVA_Build 6 54535575 1I ATTCTGGCTC -/T TTTGTCACAT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 3 4 110756 CASAVA_Build 6 54544478 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 28 10 14 6 AC 7 6 110757 CASAVA_Build 6 54544945 1I TCTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 T 11 12 110758 CASAVA_Build 6 54547708 1D CAAATTTAAC T/- TTAATGTCAT 3070 het 3070 hom 44 15 28 2 T 3 2 110759 CASAVA_Build 6 54555832 1D ATTATTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 10 9 110760 CASAVA_Build 6 54556659 1D CTCTTTTTCA G/- GGCTCAGTTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 G 3 2 110761 CASAVA_Build 6 54571728 2D TGCGCACGTG CT/-- CTCTCTCTCT 1113 het 1113 ref 61 44 4 15 CT 8 7 110762 CASAVA_Build 6 54585834 1I CTGGTCTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 29 1 24 4 A 12 13 110763 CASAVA_Build 6 54587187 1D TTTAACACCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 10 9 110764 CASAVA_Build 6 54600881 1D AGAAGACATA G/- AAGAAGCAGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 1 0 110765 CASAVA_Build 6 54602964 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 54 het 25 0 19 7 A 9 8 110766 CASAVA_Build 6 54611980 1D TTGTAGCAAG C/- CCTTTTTCTT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 C 3 2 110767 CASAVA_Build 6 54615923 1D AGAGTCCTTA T/- TTATTTTTAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 3 2 110768 CASAVA_Build 6 54619737 1D GAAGTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1454 het 1454 ref 25 18 4 3 A 11 10 110769 CASAVA_Build 6 54625228 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 A 10 11 110770 CASAVA_Build 6 54626872 1D TTGATCCTTG C/- CTTTCAGAAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 C 2 1 110771 CASAVA_Build 6 54641894 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 8 7 110772 CASAVA_Build 6 54656741 4I CAAATAGGAC ----/ATTA ATTAAGATAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATTA 1 2 110773 CASAVA_Build 6 54662846 1D AAAAGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 974 het 974 ref 51 42 3 6 T 12 11 110774 CASAVA_Build 6 54667591 1D TTGAGACCAG C/- CTGGCCAAAA 3070 hom 45 het 19 0 15 5 C 2 1 110775 CASAVA_Build 6 54670403 2I AGAGAGCAGA --/TT TTTCGTGAAG 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 3 5 110776 CASAVA_Build 6 54701226 1D AATTTACAAG A/- AAAAAATCAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 7 6 110777 CASAVA_Build 6 54703246 2I AAGAAACAAG --/AC AATGTGACTA 3070 hom 152 het 59 0 51 8 AC 0 1 110778 CASAVA_Build 6 54704837 4D TGAAAACACA AACT/---- AACTATACGC 3070 hom 69 het 24 0 24 1 AACT 2 1 110779 CASAVA_Build 6 54708993 4D TCTATGCCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 33 3 19 13 T 21 17 110780 CASAVA_Build 6 54715971 1D TCATCTTTTC A/- AAAAAAACTA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 A 8 7 110781 CASAVA_Build 6 54719194 1D CTTTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1235 het 1235 ref 38 17 4 17 T 13 12 110782 CASAVA_Build 6 54728030 1D CATTAAAAAG T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 8 7 110783 CASAVA_Build 6 54733413 5D GTGCAGTAGC CTGAT/----- CTCGGCTCAC 3070 het 12 hom 19 1 10 9 CTGAT 1 0 110784 CASAVA_Build 6 54738693 3D TGAAAATTGT CTA/--- CTTCTTGCAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CTA 1 0 110785 CASAVA_Build 6 54743358 1I ATATAAACTT -/G GCGGTAGTTG 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 G 1 2 110786 CASAVA_Build 6 54765262 1D TGTTCCCCTA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 8 7 110787 CASAVA_Build 6 54765746 1I CTATTTTTTT -/A AATCTTCAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 2 3 110788 CASAVA_Build 6 54769741 5D CAAGCCAGCT GCAGA/----- AATTTGCATA 3070 het 3070 ref 19 11 7 1 GCAGA 1 0 110789 CASAVA_Build 6 54771045 1I GCTATGATTA -/T TGAGACCTCC 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 1 2 110790 CASAVA_Build 6 54771529 12I TGAATCCCTA ------------/AATGTTCCATTT AATCAGCTTT 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 AATGTTCCATTT 0 1 110791 CASAVA_Build 6 54771856 1D TAGAGACAGC T/- TTTGATTGGC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 T 4 3 110792 CASAVA_Build 6 54784144 1I TTTTTTTTTT -/A ACCATAGCTA 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 A 1 2 110793 CASAVA_Build 6 54790336 1I CTGAATATAC -/T TTTTATTTAG 3070 het 3070 ref 39 22 17 0 T 4 5 110794 CASAVA_Build 6 54791770 1D GAGGAGACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 T 10 9 110795 CASAVA_Build 6 54801776 1I GAAATGACTC -/T AATAGAGGCA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 0 1 110796 CASAVA_Build 6 54804117 3D AAAGCAGCAT ATG/--- ATAAGATTTC 3070 het 3070 ref 48 27 17 6 ATG 1 0 110797 CASAVA_Build 6 54806844 1I CATAGGAAGC -/T TTAGCTGTGT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 2 3 110798 CASAVA_Build 6 54813596 2D GTTGTTGTTT TC/-- TCTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 38 15 18 7 TC 2 1 110799 CASAVA_Build 6 54820187 2D GGTAGCGACC TG/-- TGTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TG 2 1 110800 CASAVA_Build 6 54825696 1I TTTGTTGCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2458 hom 25 7 13 5 T 9 10 110801 CASAVA_Build 6 54836313 26I CCAACCTGTG --------------------------/ACTTTTGTCATTTGGTCCTTAATTCT ACTTCTCCAC 3070 het 3070 hom 52 22 23 8 ACTTTTGTCATTTGGTCCTTAATTCT 0 1 110802 CASAVA_Build 6 54846448 1I ATGGATAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1999 hom 30 9 12 9 T 15 16 110803 CASAVA_Build 6 54851604 1D TAAGAATGAG C/- ATATCAGATA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 C 1 0 110804 CASAVA_Build 6 54854845 2I GCAAAGGACA --/TG TGAACTCATC 2373 het 315 hom 9 1 8 0 TG 1 2 110805 CASAVA_Build 6 54857533 1D TCCTCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 1106 het 1106 ref 16 4 6 6 T 15 14 110806 CASAVA_Build 6 54859061 1D CACATAATGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 9 8 110807 CASAVA_Build 6 54859940 1D ACATGACTTT A/- GAACTTCATG 3070 het 3070 ref 42 25 15 3 A 1 0 110808 CASAVA_Build 6 54862998 1D ACCAAGTACA C/- CAACCTTTTG 3070 het 3070 ref 34 22 12 1 C 2 1 110809 CASAVA_Build 6 54864100 1I TTTAATTCTC -/T TTACCATTGG 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 T 2 3 110810 CASAVA_Build 6 54867070 1D TCCTAGGAAC T/- TTTTTTTTTT 1009 het 1009 ref 47 36 4 7 T 11 10 110811 CASAVA_Build 6 54878570 3D GATCACAATC ATA/--- ATATAAAGGA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 ATA 2 1 110812 CASAVA_Build 6 54880170 2I AAAAATTCAG --/TA TGAGTAAGTT 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 TA 0 1 110813 CASAVA_Build 6 54880889 2D GATTTCATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1637 hom 41 13 12 17 A 18 16 110814 CASAVA_Build 6 54881904 1I AAGATTCATG -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 hom 52 20 28 4 T 6 7 110815 CASAVA_Build 6 54883635 1I TGAAGAACTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 8 9 110816 CASAVA_Build 6 54905434 7I GTGAACTCCC -------/TCAGATT TCATTTATCT 3070 het 3070 hom 42 17 18 8 TCAGATT 0 1 110817 CASAVA_Build 6 54906319 1D CATATGCCTT G/- TAATTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 15 17 6 G 1 0 110818 CASAVA_Build 6 54915662 1D ATTCTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 1273 het 1273 ref 20 10 3 7 T 11 10 110819 CASAVA_Build 6 54917972 1D TTTTTAAATG T/- TTTTTCCATG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 T 6 5 110820 CASAVA_Build 6 54920127 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 916 het 916 ref 21 11 3 7 A 11 10 110821 CASAVA_Build 6 54920213 5D CAGTGTATAT TTTAA/----- TTTTAGTATA 3070 het 3070 hom 24 7 14 8 TTTAA 1 0 110822 CASAVA_Build 6 54923173 1D ATAGAGTCAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 59 21 30 8 A 8 7 110823 CASAVA_Build 6 54925623 2I TGGAAACTGC --/AT AGTCTCCTTA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 AT 0 1 110824 CASAVA_Build 6 54928481 1D GAAACCTATC A/- AAGACAATTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 3 2 110825 CASAVA_Build 6 54943268 1I4M9D5M12D AAGTCCTGTG -TCATAAACAGAAGATGCCATGAGTCATAAA/TTCCT---------CTCCC------------ CTAGAAAACA 3070 het 3070 ref 49 33 22 3 N/A 0 0 110826 CASAVA_Build 6 54944816 1D GTGGTAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2399 hom 38 12 14 12 A 15 14 110827 CASAVA_Build 6 54946717 1I GACACGCCAC -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 A 6 7 110828 CASAVA_Build 6 54948573 1I CATATGTGCA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 7 8 110829 CASAVA_Build 6 54950255 4I AAAAAAAGGG ----/TGAT TGATAGATCT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TGAT 1 2 110830 CASAVA_Build 6 54963351 1I TTAGGTGAAA -/T TTTTTTTTTA 2528 het 2528 ref 24 15 7 2 T 9 10 110831 CASAVA_Build 6 54966179 1D TAGGTATCGG A/- AAAAACAAAC 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 6 5 110832 CASAVA_Build 6 54968791 1D TTTTATACTA T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 7 6 110833 CASAVA_Build 6 54971778 1D CAGGATACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 628 hom 41 2 32 7 A 11 10 110834 CASAVA_Build 6 54980469 2I TGAATATTGG --/CC CCCCCCATCT 2542 het 2542 ref 19 10 8 1 C 6 8 110835 CASAVA_Build 6 54982597 1I CCGAAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 1623 het 1623 ref 19 9 4 6 T 10 11 110836 CASAVA_Build 6 54983520 1D AAATATCAAT C/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 51 25 21 6 C 1 0 110837 CASAVA_Build 6 54985169 4I GTTAGCATAA ----/TTCT TTATTTTGTC 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 TTCT 0 1 110838 CASAVA_Build 6 54988417 3I AATTTAAGTG ---/ATT ATTATTTTAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 ATT 2 3 110839 CASAVA_Build 6 54991893 1I TTCCTACATT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 A 7 8 110840 CASAVA_Build 6 54992701 1D CCTCCTTTTT A/- AAATTGATTT 3070 het 3070 hom 29 10 15 5 A 4 3 110841 CASAVA_Build 6 54998706 1I GGCAAAGCAG -/A ACTTTTGCAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 1 2 110842 CASAVA_Build 6 55007923 2I ATACACACAG --/AT ATATATATAT 3070 het 607 hom 19 4 12 3 AT 6 7 110843 CASAVA_Build 6 55012007 1I CCTAAAGTGG -/T GAGACATCTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 110844 CASAVA_Build 6 55012474 1I AAATTCGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2961 hom 29 9 13 7 T 13 14 110845 CASAVA_Build 6 55014531 2D TCAAGGAAAC TT/-- TGATGAAATA 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 T 3 1 110846 CASAVA_Build 6 55019951 2D ACACACAAGA AG/-- AGTTTTCGAC 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 AG 2 1 110847 CASAVA_Build 6 55027822 1I GCAAAATAGA -/C CTTTTTTTTT 2449 het 2449 ref 26 17 7 2 C 1 2 110848 CASAVA_Build 6 55030457 1I TAATATGTAG -/C TTTTTGGTTG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 C 0 1 110849 CASAVA_Build 6 55030737 1D TCTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 11 2 T 12 11 110850 CASAVA_Build 6 55043747 4D ATTTGGCACA TTCT/---- TTGTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 20 16 7 TTCT 1 0 110851 CASAVA_Build 6 55044250 1D CTACTTCAGG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 7 6 110852 CASAVA_Build 6 55044645 4I TATGTAATTT ----/AATA TTTAATCAGC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 AATA 0 1 110853 CASAVA_Build 6 55053341 1I ATTCAGTGCT -/A AAAAAAAAAC 2597 het 2597 ref 34 17 10 7 A 9 10 110854 CASAVA_Build 6 55053797 1I AAAATTTCTG -/T TCTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 24 19 4 T 1 2 110855 CASAVA_Build 6 55061963 13D ATTGAGGACC AAATTTCAATATG/------------- AAATTTGGGA 3070 het 3070 hom 33 14 19 4 AAATTTCAATATG 1 0 110856 CASAVA_Build 6 55069002 1D TATTTCCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 10 9 110857 CASAVA_Build 6 55069693 1D TGTCCTTTCA T/- TTTTGAATTA 3070 hom 69 het 30 0 22 9 T 5 4 110858 CASAVA_Build 6 55072034 1I ATTCCTTGCG -/T TTTTTTTTTT 1205 het 472 hom 23 2 10 11 T 13 14 110859 CASAVA_Build 6 55072058 1I AGCTTGTTAA -/T TTTGGAATTT 3070 hom 48 het 24 0 16 8 T 3 4 110860 CASAVA_Build 6 55072972 3D ATTTTTTTTT ATA/--- ATAAGACATA 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 ATA 2 1 110861 CASAVA_Build 6 55078366 1D CAATATTAAA C/- CCCCCTGTAT 3070 het 3070 ref 52 28 23 1 C 6 5 110862 CASAVA_Build 6 55083608 4I ACAATGGACT ----/TAAA TAAAGTATAC 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 TAAA 1 2 110863 CASAVA_Build 6 55084111 1D AACAAAAAAC A/- TAAGATAAAT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 1 0 110864 CASAVA_Build 6 55087058 1I CATTCAAATT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 110865 CASAVA_Build 6 55088604 2D TAAAATTTAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AT 7 6 110866 CASAVA_Build 6 55090631 9D CTGTTTGTTT TTTTTTCTG/--------- TTTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 4 TTTTTTCTG 1 0 110867 CASAVA_Build 6 55098579 1D CTTTTTATTC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 T 9 8 110868 CASAVA_Build 6 55099467 6D TCTGTCCCAG GGAGAT/------ GGCGTTTTAT 2758 het 2758 ref 24 14 7 5 GGAGAT 1 0 110869 CASAVA_Build 6 55100570 1I CAAAAGGAGA -/C CTTGCCTACA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 1 2 110870 CASAVA_Build 6 55104555 2D TTATTTACTC TT/-- TAAGTATTTG 3070 het 3070 hom 51 19 26 9 T 3 1 110871 CASAVA_Build 6 55105509 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 28 2 18 8 T 15 14 110872 CASAVA_Build 6 55106142 1I ACACACACAC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 7 8 110873 CASAVA_Build 6 55112196 1I GAAGATTGAT -/A ATACTAAATT 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 A 1 2 110874 CASAVA_Build 6 55112912 4D AGAATTTAAT CTGA/---- CCCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 21 1 CTGA 1 0 110875 CASAVA_Build 6 55115615 1I TGGTCAACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 394 hom 36 1 32 3 A 9 10 110876 CASAVA_Build 6 55115730 4I GGCAGATTAT ----/GATA GATAGAAAGA 3070 het 204 hom 32 2 22 12 GATA 1 2 110877 CASAVA_Build 6 55116502 1I TAATACATAG -/A AAAAATGAGG 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 A 5 6 110878 CASAVA_Build 6 55127457 4D AAATAAATAG ATAA/---- ATAAATAAAT 2699 hom 24 het 10 0 9 1 ATAA 4 3 110879 CASAVA_Build 6 55137980 2D AAAAAGGAAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 530 hom 35 6 14 15 GA 8 7 110880 CASAVA_Build 6 55139156 3I AGTTTGAGAA ---/TTG TTGTTAGTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTG 1 2 110881 CASAVA_Build 6 55139714 13I AAAACCCAAC -------------/ATGTTATGATTCA ATTTAAAGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 ATGTTATGATTCA 0 1 110882 CASAVA_Build 6 55141490 1D GCCTGGGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 T 10 9 110883 CASAVA_Build 6 55142807 1I AACCACCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 453 hom 19 1 14 4 A 9 10 110884 CASAVA_Build 6 55160169 20D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------- AAAAAAAAAA 2506 het 261 hom 15 3 13 3 A 38 18 110885 CASAVA_Build 6 55197211 1I CATCTCCACT -/A AAAAAAAAAT 1371 het 1165 hom 9 4 4 1 A 9 10 110886 CASAVA_Build 6 55197384 1I CGTCTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 1778 het 1778 ref 26 9 7 10 A 13 14 110887 CASAVA_Build 6 55199890 1D TATTCTATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 9 8 110888 CASAVA_Build 6 55200976 1D ATAGACAAAA G/- TTTTGAAATT 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 G 1 0 110889 CASAVA_Build 6 55201098 1I AAAAAAAATT -/A AAATATTAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 3 4 110890 CASAVA_Build 6 55203458 2D ATTTTAAAAC AT/-- GTGTAAGGCA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 AT 1 0 110891 CASAVA_Build 6 55211503 2D TAGATGAGAC AT/-- AAAGTTGTGA 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 AT 1 0 110892 CASAVA_Build 6 55213705 1I TTTATCCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2780 hom 19 7 10 2 T 9 10 110893 CASAVA_Build 6 55215145 1D CCCCTGGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 A 9 8 110894 CASAVA_Build 6 55217094 2D TTTATGACAC TT/-- ATCCATTAAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 3 T 2 0 110895 CASAVA_Build 6 55226994 1D AACAATCTGT A/- AAAAAAAATG 2384 het 2384 ref 31 14 7 10 A 9 8 110896 CASAVA_Build 6 55229454 1D TAGTGCAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 10 9 110897 CASAVA_Build 6 55230355 1I ATGGATTCCT -/G GTTCAGTTAT 3070 het 1954 hom 25 4 18 3 G 1 2 110898 CASAVA_Build 6 55231980 1D TTGGTAGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 38 2 26 10 A 13 12 110899 CASAVA_Build 6 55232415 2D AGTTAGTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3029 hom 17 7 7 4 AT 7 6 110900 CASAVA_Build 6 55239403 3D TTATAATTTC TTA/--- TTCATTTATT 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 TTA 1 0 110901 CASAVA_Build 6 55245355 1I AATTGAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 13 14 110902 CASAVA_Build 6 55248314 1D CATCACTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 10 9 110903 CASAVA_Build 6 55248728 4I ATCATTTAGA ----/AGAC AGACAGTTCA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 AGAC 1 2 110904 CASAVA_Build 6 55255468 2I TGTATTAAAA --/TG TGTGTCAATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TG 2 3 110905 CASAVA_Build 6 55257499 8D AGGCACTGGT TTAAGGCA/-------- CTGCTTTATG 3070 het 3070 ref 43 19 21 6 TTAAGGCA 1 0 110906 CASAVA_Build 6 55261080 2I CAAGAATATA --/TT TTTCTTTTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 3 5 110907 CASAVA_Build 6 55263173 1I AATCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 A 8 9 110908 CASAVA_Build 6 55264411 1D AATATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 28 1 25 3 A 11 10 110909 CASAVA_Build 6 55271538 1D GTTAATGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 A 10 9 110910 CASAVA_Build 6 55288904 1D GTAGTTTCTT G/- TTTTTTTATT 3070 het 2198 hom 20 8 10 2 G 1 0 110911 CASAVA_Build 6 55291657 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 10 9 110912 CASAVA_Build 6 55296083 1D GGCAATCTTA T/- TTTTTGGAGC 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 T 6 5 110913 CASAVA_Build 6 55297474 1D CAGAGCCTTT G/- GGATGCTTCA 2329 het 2329 ref 22 14 5 3 G 3 2 110914 CASAVA_Build 6 55297652 1D TAATTAGAAA C/- TATCAAAATT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 C 1 0 110915 CASAVA_Build 6 55307448 5D GGTCTCATCG TCCAA/----- TCCAACCCAT 3070 hom 114 het 43 0 39 9 TCCAA 2 1 110916 CASAVA_Build 6 55324661 1I AGCTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 10 11 110917 CASAVA_Build 6 55335890 1D ATAGCAATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2915 hom 35 9 18 9 A 10 9 110918 CASAVA_Build 6 55342453 1D GTAGACACTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 123 het 42 0 42 2 A 9 8 110919 CASAVA_Build 6 55346506 1I TTTCTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 11 12 110920 CASAVA_Build 6 55352273 1I ATTTATATAT -/A TTTTTAAATT 2496 het 2496 ref 21 11 6 4 A 0 1 110921 CASAVA_Build 6 55365896 1I CCTGCACACA -/T TTTTATAAAT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 4 5 110922 CASAVA_Build 6 55367278 3I TGTTTGGAAA ---/TGT TGTAAAGTGA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 TGT 1 2 110923 CASAVA_Build 6 55372911 1D GCCTTTAATT A/- AAAAAAACTC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 8 7 110924 CASAVA_Build 6 55373420 1D TTTTCTCCAA G/- GCCTTAAAAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 2 1 110925 CASAVA_Build 6 55374855 1D TGCCTCAGCC T/- TCCCGAGTAG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 2 1 110926 CASAVA_Build 6 55375590 1I CCTTGATATC -/T TCATTTTATT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 1 2 110927 CASAVA_Build 6 55385226 1D TGTGGAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 31 0 22 9 A 13 12 110928 CASAVA_Build 6 55391157 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 A 12 11 110929 CASAVA_Build 6 55401653 1I AGAACAATAT -/A AAAAAATGAC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 6 7 110930 CASAVA_Build 6 55403188 25I CTTTAGATGA -------------------------/TACAGGATATAGAGTCCAAGCCTAC TGTGATATTT 3070 hom 117 het 38 0 40 4 TACAGGATATAGAGTCCAAGCCTAC 0 1 110931 CASAVA_Build 6 55407672 1D ACATCAGGAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 9 8 110932 CASAVA_Build 6 55413840 4D TGCAATGCAG GAGA/---- GAGAGACTGT 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 GA 5 3 110933 CASAVA_Build 6 55415766 67D CATTATTCTC AATCCTGTCAACCCATTGGAATCACCTGGAGCCCTTTTCAAATGACTAATGTCTAAGCTTCTCCCTA/------------------------------------------------------------------- AATTAATCAA 3070 het 3070 ref 28 28 10 4 AATCCTGTCAACCCATTGGAATCACCTGGAGCCCTTTTCAAATGACTAATGTCTAAGCTTCTCCCTA 1 0 110934 CASAVA_Build 6 55415897 5D CTCAAATCCC TAAAG/----- TAGAGTTTCT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TAAAG 1 0 110935 CASAVA_Build 6 55416435 1D CAGTGAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 43 0 33 11 A 12 11 110936 CASAVA_Build 6 55422678 1D ATTGCTACTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 27 0 15 12 T 10 9 110937 CASAVA_Build 6 55427768 3I TGGGGAGACT ---/GAG GAGAGAAGAT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 GAG 1 2 110938 CASAVA_Build 6 55428123 1D TATAAAATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 10 9 110939 CASAVA_Build 6 55450845 1I TGAGGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 2780 het 2780 ref 26 9 9 8 T 11 12 110940 CASAVA_Build 6 55451611 1D TTTCACATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 T 10 9 110941 CASAVA_Build 6 55454430 1D TTCCAACCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 110942 CASAVA_Build 6 55458237 5D AAATATAAAT GTAAA/----- GTACATATGC 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 GTAAA 1 0 110943 CASAVA_Build 6 55463577 2D TGCCAAAATC AG/-- AGAGATGCTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AG 3 2 110944 CASAVA_Build 6 55463651 1D TGTATACCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 T 10 9 110945 CASAVA_Build 6 55467102 1I CCTTCAGAAA -/C AATAACTTCC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 C 0 1 110946 CASAVA_Build 6 55469098 4I AACTCAGCAC ----/ACAA ACAGACTGTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ACAA 0 1 110947 CASAVA_Build 6 55471720 1I TTATAGCCAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 2648 hom 36 9 25 2 A 7 8 110948 CASAVA_Build 6 55473870 2I GATCTTCACA --/CT CTGTCTCATT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 CT 1 2 110949 CASAVA_Build 6 55475471 3D AAAGATCTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 13 10 110950 CASAVA_Build 6 55475746 1I AGTTTTTTTC -/T GTTGTCTCCT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 0 1 110951 CASAVA_Build 6 55476238 1D AACCTGAGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 34 0 26 9 T 9 8 110952 CASAVA_Build 6 55477442 2D ATTTTTAAAA AT/-- ATTTTTGATT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AT 2 1 110953 CASAVA_Build 6 55479162 1D AGCCACGTGG A/- AAAAGTGTTA 3070 hom 90 het 39 0 31 9 A 5 4 110954 CASAVA_Build 6 55479599 2D ACTTAAAAAG AA/-- AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 10 8 110955 CASAVA_Build 6 55480259 1I TCATGTTCCA -/T TTTATGATGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 4 110956 CASAVA_Build 6 55484299 2I TGTGTACTGC --/TT TATGGCCTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 1 3 110957 CASAVA_Build 6 55491013 1D ACAATTCAAA G/- AAATATACTG 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 G 1 0 110958 CASAVA_Build 6 55493636 2D ATCTCTAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 43 3 16 25 A 12 10 110959 CASAVA_Build 6 55495910 1I AGCCATTGTC -/T CTGTCTCCAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 0 1 110960 CASAVA_Build 6 55497965 1D TCAGAAAACT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 7 6 110961 CASAVA_Build 6 55502257 1D CTGGCTGTGG A/- AAAAAAAGGG 3070 het 52 hom 48 1 34 14 A 8 7 110962 CASAVA_Build 6 55502836 3D GGGGTTGGGG GGC/--- GGGGTGTGGA 3070 hom 86 het 30 0 28 3 GGC 1 0 110963 CASAVA_Build 6 55509419 1D CTAAGGAAAG C/- TTTTCCCAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 0 110964 CASAVA_Build 6 55509856 1I28M1D CTTCATAAGA -TTTTTTTTCCAAAATAAGAGAGTAATATA/TTTTTTTTTCCAAAATAAGAGAGTAATAT- AAACTTCAAA 3070 hom 114 het 35 0 39 2 N/A 0 0 110965 CASAVA_Build 6 55520338 2D ATTGAAATAT TC/-- TGTTTCATAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TC 1 0 110966 CASAVA_Build 6 55521909 1I CATTACAATT -/A ACAATCATTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 2 110967 CASAVA_Build 6 55537598 1D GAAAGTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 A 13 12 110968 CASAVA_Build 6 55540036 1I ATCAAATTTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 8 9 110969 CASAVA_Build 6 55550102 1D GGGCTGGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 39 1 25 13 A 15 14 110970 CASAVA_Build 6 55576228 4I CTCATTGCTC ----/AGTT AGGGAGAACA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 AGTT 0 1 110971 CASAVA_Build 6 55577677 5I TTTAAATGAG -----/TAAAC TAAAGTGCAT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 TAAAC 0 1 110972 CASAVA_Build 6 55578171 3D TCAACCTAGA ATG/--- ATATTTCTGC 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 ATG 1 0 110973 CASAVA_Build 6 55582396 1D AAGTGGGTTT C/- CCCCCAGGGC 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 C 6 5 110974 CASAVA_Build 6 55591877 2I TGGGAAGAGG --/GA GAGAGGTCAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 GA 2 3 110975 CASAVA_Build 6 55603530 1D TCTTTGCCTG C/- CCCGCTCCAT 3070 het 3070 hom 31 11 13 9 C 4 3 110976 CASAVA_Build 6 55610197 1I ACGAAAAATT -/G GGTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 G 2 3 110977 CASAVA_Build 6 55616034 1D AAGTGTCCCC T/- TTTCTCCGCA 3070 het 3070 ref 48 25 19 5 T 4 3 110978 CASAVA_Build 6 55620319 1D CAATTGTATG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 8 7 110979 CASAVA_Build 6 55622132 1D GGGTAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 2936 het 2428 hom 26 12 10 4 T 14 13 110980 CASAVA_Build 6 55623678 2D AGGCCTGAGA CT/-- CACACTTAAG 3070 het 2292 hom 26 7 14 5 CT 1 0 110981 CASAVA_Build 6 55626286 1I TTTATATCAT -/A AAACCAGGAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 4 110982 CASAVA_Build 6 55626657 1I CTGGGGACTT -/A AAAAACAGTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 A 5 6 110983 CASAVA_Build 6 55638892 1I ATAAACCCTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 49 16 20 13 T 8 9 110984 CASAVA_Build 6 55667463 1I TTTATTTGGC -/T TTTGGCGACA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 3 4 110985 CASAVA_Build 6 55672477 1I CATAGCTGCA -/T TTTTTCCTCC 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 T 5 6 110986 CASAVA_Build 6 55680535 2D AAATAATCTC TT/-- GTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 T 2 0 110987 CASAVA_Build 6 55684155 1I TCACTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 10 11 110988 CASAVA_Build 6 55688504 1D AGATTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 2701 het 1768 hom 21 7 8 7 T 17 16 110989 CASAVA_Build 6 55707745 1I TAAACTCTCC -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 5 6 110990 CASAVA_Build 6 55716796 1D CTCTCTCCCT C/- CCCCCCGCTT 1920 het 1920 ref 22 10 5 8 C 7 6 110991 CASAVA_Build 6 55722517 1D GGATGTGTGT G/- GGGGGGGATG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 G 8 7 110992 CASAVA_Build 6 55726502 4D CATGTGATCC ACAA/---- ACAGTTTACA 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 ACAA 1 0 110993 CASAVA_Build 6 55748677 1D GTATTGGTTG A/- AAAAAAAAAA 1595 het 1595 ref 35 23 4 8 A 13 12 110994 CASAVA_Build 6 55749209 1I TTAGCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 18 1 15 2 A 10 11 110995 CASAVA_Build 6 55752978 1D AGTAAAGGGG A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 7 110996 CASAVA_Build 6 55850833 1I AATCAACCAA -/T TTTTTTTTTT 2985 het 2637 hom 28 8 13 7 T 13 14 110997 CASAVA_Build 6 55932899 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 30 1 18 11 A 16 15 110998 CASAVA_Build 6 55934015 1D TAATATATAT A/- AAAATAGATT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 5 4 110999 CASAVA_Build 6 55950370 7I GTGATAGTTA -------/GAGTGTT AAGTATAGAT 3070 hom 114 het 43 0 37 6 GAGTGTT 0 1 111000 CASAVA_Build 6 55950973 12D GAACTGAACC CCACGTAAGGAG/------------ ACACTGGGAA 3070 hom 135 het 51 0 46 8 CCACGTAAGGAG 1 0 111001 CASAVA_Build 6 55955669 1D TCAAAAAAAA T/- GTAGGCTGAC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 0 111002 CASAVA_Build 6 55961513 1I TTAGGATAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 9 10 111003 CASAVA_Build 6 55962537 3I AGAAGTAGTC ---/CCT CCTCTATTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CCT 1 2 111004 CASAVA_Build 6 55964494 1D TTTTAATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 36 0 29 7 T 10 9 111005 CASAVA_Build 6 56026835 1D ATCCTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 13 12 111006 CASAVA_Build 6 56030860 10D ACTGATTAAA ACATTTAGCT/---------- AACATTATAA 3070 het 3070 ref 35 24 11 5 ACATTTAGCT 1 0 111007 CASAVA_Build 6 56032174 1D CTAAAATGAT C/- AGTGGTTTAG 3070 het 3070 hom 44 19 18 8 C 1 0 111008 CASAVA_Build 6 56036220 1I TTGGGGAATA -/G GGATGGAGTT 3070 het 3070 ref 56 25 23 8 G 2 3 111009 CASAVA_Build 6 56047739 1I GTTAAAATTT -/G GGGGGGGGAT 2754 het 2754 ref 28 13 8 7 G 8 9 111010 CASAVA_Build 6 56055752 4I TGAAACAATT ----/GATA GACAAGCATT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 GATA 0 1 111011 CASAVA_Build 6 56080398 1I AGAAATTCAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 8 9 111012 CASAVA_Build 6 56090902 1I CAAAAAGTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 8 9 111013 CASAVA_Build 6 56112258 2D TTGTGCACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 20 18 17 AC 8 7 111014 CASAVA_Build 6 56118428 2I TTCAGAACAC --/AT GTTTCATGTC 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 AT 0 1 111015 CASAVA_Build 6 56118615 1D AAATGAGTCA T/- TTTTTTTTTT 1309 het 1309 ref 34 22 3 10 T 12 11 111016 CASAVA_Build 6 56123825 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2330 het 593 hom 9 2 6 1 A 9 8 111017 CASAVA_Build 6 56129413 2D TGCTTAAGCC TA/-- TACTGATCAA 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 TA 2 1 111018 CASAVA_Build 6 56132092 1I CTGAATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 580 hom 34 3 21 10 T 16 17 111019 CASAVA_Build 6 56136464 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 3 A 15 14 111020 CASAVA_Build 6 56137792 1D AAAGGATATA T/- TTTTTTAAGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 7 6 111021 CASAVA_Build 6 56149180 1I ACTCAGCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 894 hom 25 2 18 5 A 10 11 111022 CASAVA_Build 6 56149359 4I TTACCAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 31 het 24 0 10 14 AAAG 4 5 111023 CASAVA_Build 6 56151801 4D AGTAGGAAAT TGTC/---- TGCTATCCTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TGTC 1 0 111024 CASAVA_Build 6 56157198 1D ACAAAAAATG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 8 7 111025 CASAVA_Build 6 56160498 2D AAAAAACATA AG/-- AGAGTATCTT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 AG 3 2 111026 CASAVA_Build 6 56164449 1I CTTACAAGGG -/A AAGGACCTCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 2 3 111027 CASAVA_Build 6 56165250 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 9 10 111028 CASAVA_Build 6 56167595 1I TTTGTCCCCT -/C CAAAATTCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 2 111029 CASAVA_Build 6 56195532 1I CCTATTCTTT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 71 het 36 0 32 4 A 8 9 111030 CASAVA_Build 6 56195800 2D TATTCAGAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 32 0 26 6 A 13 11 111031 CASAVA_Build 6 56199626 1D GGTCACTGAG A/- AGAATTAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 1 111032 CASAVA_Build 6 56206558 4I AGAATAGAGC ----/AAAA AAAAAAATCC 3070 hom 60 het 31 0 20 11 A 7 11 111033 CASAVA_Build 6 56207678 3I AAACACAACA ---/TCT TCTTCCCCTG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TCT 1 2 111034 CASAVA_Build 6 56209897 1I ATTCGAAAGG -/A AAAAAAAGCC 3070 hom 76 het 31 0 24 7 A 7 8 111035 CASAVA_Build 6 56218864 1I CTATAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 31 0 27 4 A 10 11 111036 CASAVA_Build 6 56219228 1D CCCAGTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 T 11 10 111037 CASAVA_Build 6 56230178 1I GAAAATACCC -/A AATAGAATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 3 111038 CASAVA_Build 6 56233809 9I TTTCTTGACA ---------/CTTCTTTGC CTTCACTTTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 CTTCTTTGC 0 1 111039 CASAVA_Build 6 56238336 1D GCAAATGCTG T/- AGGTGTCATC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 1 0 111040 CASAVA_Build 6 56245164 1D ATCTTGGGAG T/- TAACTAACTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 2 1 111041 CASAVA_Build 6 56246129 5I CAGAAGAAAT -----/AACTA AAATTAGAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AACTA 0 1 111042 CASAVA_Build 6 56255125 1D ATACGCATGG T/- TTTTTCATAA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 T 6 5 111043 CASAVA_Build 6 56255995 1D TTGTAAAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 10 9 111044 CASAVA_Build 6 56256984 3D TTTGTATTTT CTA/--- CTTTTGGTAG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CTA 1 0 111045 CASAVA_Build 6 56259453 1I ACTTAATATC -/T TGTTTTTTCC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 2 111046 CASAVA_Build 6 56261012 1D AAAATAAAAG A/- AAAAAAAAAG 1224 het 1224 ref 31 16 12 3 A 10 9 111047 CASAVA_Build 6 56268388 2I GAGTTTTGTA --/CT CTTTTCCTCA 3070 hom 72 het 33 0 24 9 CT 1 2 111048 CASAVA_Build 6 56268526 1D AAAAATTGAC T/- TTTTATTAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 5 4 111049 CASAVA_Build 6 56274616 3I ATTTCTCCCC ---/CCT CCCCCAATCC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 CCT 0 1 111050 CASAVA_Build 6 56281500 3D ACTACAAAAA AAC/--- AAATAAGATT 3070 hom 113 het 48 0 38 12 AAC 1 0 111051 CASAVA_Build 6 56283566 3D ATGAATATCC ATA/--- ATATTGTTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 4 ATA 2 1 111052 CASAVA_Build 6 56285480 1I AGTGAAAAAG -/A AAAACATTAT 3070 hom 144 het 51 0 48 3 A 4 5 111053 CASAVA_Build 6 56297999 1D GAGGAAAAGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 8 7 111054 CASAVA_Build 6 56299916 2D TGCTCTAAAA CT/-- CTAATTATTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CT 2 1 111055 CASAVA_Build 6 56300313 12D AGCAAAAGGA GAAATATCAGGT/------------ ATCAGGTTAG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 GAAATATCAGGT 1 0 111056 CASAVA_Build 6 56304309 1I CCCCAGTGTA -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 111057 CASAVA_Build 6 56305233 1I TGGGTAAAAC -/T ATTTTTTTTT 3070 het 827 hom 25 3 19 3 T 0 1 111058 CASAVA_Build 6 56305963 3D GTGAAACAAT CAC/--- CACATCAACA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 CAC 2 1 111059 CASAVA_Build 6 56312131 1I ACAGTGTCTG -/A AAAGTAGTAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 4 111060 CASAVA_Build 6 56312324 2D TCTTTGGTTT TC/-- TCTCTGTTAG 3070 hom 87 het 36 0 29 8 TC 3 2 111061 CASAVA_Build 6 56312814 1D CCCAGAGAGG A/- AAAAAAACGC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 7 111062 CASAVA_Build 6 56313167 1I CAAAACAGAT -/A ACAGAGGTTG 3070 hom 107 het 44 0 34 10 A 1 2 111063 CASAVA_Build 6 56313380 2D CTTTAAATTC AG/-- AGATTCTCTG 3070 hom 161 het 57 0 54 3 AG 2 1 111064 CASAVA_Build 6 56313961 1I AAGAAAAGAA -/T TATCGGTATA 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 1 2 111065 CASAVA_Build 6 56317589 26D AGCTATGTAG GACGTGCCTGCTTCCCCTTTGCCTTC/-------------------------- CACCGTGATT 3070 het 3070 ref 30 18 8 7 GACGTGCCTGCTTCCCCTTTGCCTTC 1 0 111066 CASAVA_Build 6 56318123 2I AGGGTCTATC --/AT ATATACCAAG 3070 het 3070 hom 58 24 32 2 AT 2 3 111067 CASAVA_Build 6 56322104 2D CGCCCCCCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 880 hom 30 4 8 20 A 14 12 111068 CASAVA_Build 6 56324929 1I CATGATGAAC -/A AAAATATCAC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 4 5 111069 CASAVA_Build 6 56329630 1D GGAGACAATG A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 48 28 18 2 A 7 6 111070 CASAVA_Build 6 56331812 4D CATAGAATTT AGTA/---- AGTATTTAAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 AGTA 2 1 111071 CASAVA_Build 6 56334452 1D ATCCAAGCAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 43 23 14 8 A 9 8 111072 CASAVA_Build 6 56336543 1D AATACCCCCC G/- ACACATTCCC 3070 hom 135 het 53 0 46 7 G 1 0 111073 CASAVA_Build 6 56339235 1D AATAAATATG T/- TTTTTAGAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 6 5 111074 CASAVA_Build 6 56341910 1D AATTCAATTC A/- AAACACTTAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 4 3 111075 CASAVA_Build 6 56342365 1D TTGTGAAAAC T/- TTTTTTATAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 7 6 111076 CASAVA_Build 6 56356748 1D TATAGATTAA T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 7 6 111077 CASAVA_Build 6 56359346 3D TTGATAAAAC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 TTG 4 3 111078 CASAVA_Build 6 56362945 6I GGTAGGAGAC ------/AAAGTT AAAGTGCAGA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 AAAGTT 0 1 111079 CASAVA_Build 6 56365808 1D AATCCTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 12 8 A 13 12 111080 CASAVA_Build 6 56369952 1D AACAGACTTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 430 hom 41 1 23 18 A 9 8 111081 CASAVA_Build 6 56371842 1D AGTTCCTAAA C/- CCAATCATAA 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 C 3 2 111082 CASAVA_Build 6 56373023 1I TCCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 A 10 11 111083 CASAVA_Build 6 56373299 3I AGCCCCAAAC ---/TTG TTGTCAACTG 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 TTG 1 2 111084 CASAVA_Build 6 56373392 1D GTCCTTTAAC T/- TGTGGGATCT 3070 het 3070 hom 52 19 26 8 T 2 1 111085 CASAVA_Build 6 56378365 4D TGGAGGGAGT GTGA/---- GTCAAAGAGG 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 GTGA 1 0 111086 CASAVA_Build 6 56382756 1I GGTAGAAGGA -/G TAGAATATAT 3070 het 3070 hom 60 24 28 8 G 0 1 111087 CASAVA_Build 6 56385656 1D TGTGCTACAG A/- AAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 31 18 9 5 A 7 6 111088 CASAVA_Build 6 56404133 1I GCGGATCTGC -/A AAAAAAAAGC 2211 het 1692 hom 19 5 6 8 A 8 9 111089 CASAVA_Build 6 56404376 1D GAAAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 13 12 111090 CASAVA_Build 6 56410596 1D ATTAATGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 10 9 111091 CASAVA_Build 6 56411176 1D GTACACAGCA T/- TTTTCCAAGG 3070 het 3070 ref 48 27 20 1 T 5 4 111092 CASAVA_Build 6 56419630 4D AAATACAAAT TGAC/---- TGGGTATGGT 3070 het 3070 hom 32 14 15 5 TGAC 1 0 111093 CASAVA_Build 6 56423760 1D TCAGTAACTT C/- CCAGTGCCTC 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 C 3 2 111094 CASAVA_Build 6 56438625 2D CAGAAAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1183 hom 33 9 14 10 A 18 16 111095 CASAVA_Build 6 56441058 5D ACATTTTATA TTGAC/----- TTAAGTGCCA 3070 het 3070 ref 38 19 18 4 TTGAC 1 0 111096 CASAVA_Build 6 56463149 1D TAAATTATTT G/- TCACAATAAG 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 G 1 0 111097 CASAVA_Build 6 56478239 1I GTTACAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 17 0 14 3 A 13 14 111098 CASAVA_Build 6 56488024 2D GTATATCCAC AT/-- GAGTCTTCTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 AT 1 0 111099 CASAVA_Build 6 56491237 1I TTAAATGTGA -/T TTTTCAAATA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 4 5 111100 CASAVA_Build 6 56494237 1D TTCCCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 239 hom 29 1 21 7 A 15 14 111101 CASAVA_Build 6 56497680 1I ATTCTATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 35 1 33 1 A 10 11 111102 CASAVA_Build 6 56504654 1D TCCCTGCCCC T/- AGGCTAGGTT 3070 hom 123 het 45 0 40 6 T 1 0 111103 CASAVA_Build 6 56506373 3D TGATACATTT TAA/--- TAATAAAGCT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 TAA 3 2 111104 CASAVA_Build 6 56511156 2D AGTTTGAGAT TC/-- TGAGTCATTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TC 1 0 111105 CASAVA_Build 6 56517443 1D GGAAAATATT C/- CCTAGTTAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 3 2 111106 CASAVA_Build 6 56565637 1D TTTTCTTAGA T/- TTTTTTTTTT 2535 het 2535 ref 29 21 7 1 T 11 10 111107 CASAVA_Build 6 56598495 1I CTACTTATTT -/A AAAAAAAAAA 1530 het 1530 ref 33 12 4 17 A 15 16 111108 CASAVA_Build 6 56708809 4D TTTTGTTTGC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 TTGT 3 2 111109 CASAVA_Build 6 56709740 20D AGACTAGCCT GGGCAACATGATGAAATCCG/-------------------- GGGCAACATG 3070 het 3070 hom 32 8 11 13 GGGCAACATGATGAAATCCG 2 1 111110 CASAVA_Build 6 56724216 1I TTAACAATTA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 7 8 111111 CASAVA_Build 6 56725079 1D GATTTTATGC T/- TTTTTTTTTT 1185 het 1185 ref 40 29 4 7 T 11 10 111112 CASAVA_Build 6 56731202 6I GTTCCAGTTA ------/CTATTG CTATGTGACA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 CTATTG 0 1 111113 CASAVA_Build 6 56731536 1I GTCAAACTAC -/T TTTGTGGTAA 3070 het 3070 ref 56 31 14 11 T 3 4 111114 CASAVA_Build 6 56734785 1I TCCAGAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 10 11 111115 CASAVA_Build 6 56770672 2I TCTAGACAGA --/GG AATTCCCTTA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 G 0 2 111116 CASAVA_Build 6 56771139 1D AGAATTACGC A/- AAACTACTCT 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 A 4 3 111117 CASAVA_Build 6 56772334 1D ACCTTCAGCA T/- TTTTTTTTTT 2539 het 2539 ref 35 11 6 18 T 12 11 111118 CASAVA_Build 6 56773887 6D5M8D CCAAAGAATT TTTAACCTTTGCCACATTT/------CTTGG-------- TTTAAAACAT 3070 het 3070 ref 31 21 14 1 N/A 0 0 111119 CASAVA_Build 6 56779811 1I ATTTCTCCCC -/A ACTGACCTTT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 1 2 111120 CASAVA_Build 6 56786148 4D TAATAATAAT AAAA/---- AAAAAAATAA 3000 het 2505 hom 13 6 7 0 A 11 7 111121 CASAVA_Build 6 56788107 4D CAAGGTATAC GTAT/---- AAACACAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 GTAT 1 0 111122 CASAVA_Build 6 56788575 1D ATATTAAATG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 120 het 42 0 41 2 A 8 7 111123 CASAVA_Build 6 56792481 16I ACATTTATAG ----------------/AGCCCTGCTATGTGTC AGGCACTCTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 AGCCCTGCTATGTGTC 0 1 111124 CASAVA_Build 6 56794734 2I CTTTATCCAC --/AT GTTTATTAAG 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 AT 0 1 111125 CASAVA_Build 6 56814600 2D CCACCCACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 AC 9 8 111126 CASAVA_Build 6 56814841 1I TTTAGTTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 9 10 111127 CASAVA_Build 6 56821711 1I GCAGGAGAAA -/C ACTTGAACCC 892 het 626 hom 5 2 2 1 C 0 1 111128 CASAVA_Build 6 56831114 4I GAACACAAAC ----/TCTT TCTAGGGTGT 3070 het 3070 ref 56 35 18 3 TCTT 0 1 111129 CASAVA_Build 6 56854081 1D AATACAAAAA T/- TAGCCGGGCT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 2 1 111130 CASAVA_Build 6 56872985 4D TTTTTGTCAA CTAT/---- CTATCCATCC 3070 het 3070 ref 50 26 17 10 CTAT 2 1 111131 CASAVA_Build 6 56875840 1I TCTCCCATAG -/C CCCTGCATTC 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 C 3 4 111132 CASAVA_Build 6 56880856 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 2067 hom 19 7 11 1 AC 9 7 111133 CASAVA_Build 6 56888372 2I GGAAAAAAAC --/AT GTGCTAATTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 AT 0 1 111134 CASAVA_Build 6 56890891 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2888 hom 30 9 15 6 T 11 10 111135 CASAVA_Build 6 56895353 1I AAACCCTCTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 8 9 111136 CASAVA_Build 6 56897156 4D CAGCTCACCA ATGG/---- ATGGAGACTG 3070 het 3070 ref 31 14 15 4 ATGG 2 1 111137 CASAVA_Build 6 56897992 1D TGTTTTTTTT C/- ATAGGGATTA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 C 1 0 111138 CASAVA_Build 6 56898895 3I AGGTGGATTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 A 10 13 111139 CASAVA_Build 6 56899523 1I TTATTAAATC -/T GTGTAACTAA 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 T 0 1 111140 CASAVA_Build 6 56900959 1I ATACCCCTAC -/T TGGGGCACCT 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 T 1 2 111141 CASAVA_Build 6 56906362 1D GAAGAAAATG A/- TGTTTAATCC 3070 het 3070 hom 35 9 22 4 A 1 0 111142 CASAVA_Build 6 56916365 1I TGATTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 5 6 111143 CASAVA_Build 6 56924410 1I AGTCCCATAA -/T TTTTCACTTA 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 T 4 5 111144 CASAVA_Build 6 56963890 4D TTTAAAAATA AATT/---- AATTAAGCCT 3070 het 3070 ref 31 18 10 5 AATT 2 1 111145 CASAVA_Build 6 56971469 1D TGGGAAAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 T 9 8 111146 CASAVA_Build 6 56975371 2I CCTGAATGAC --/TT TGAGTAAACA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 3 111147 CASAVA_Build 6 56982747 3I GCTAATAAAT ---/GAA GAAGAAAATA 3070 hom 90 het 39 0 29 10 GAA 2 3 111148 CASAVA_Build 6 57000606 2D TGTATGTGTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TA 7 6 111149 CASAVA_Build 6 57001938 1D GTCTGAACCT C/- CCCCAAATTC 3070 hom 11 het 15 0 12 3 C 5 4 111150 CASAVA_Build 6 57002900 1D CAAGGCGGGC G/- GGATCACCTG 3070 hom 50 het 19 0 16 3 G 3 2 111151 CASAVA_Build 6 57004467 2D GCTTAAAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 31 0 24 8 A 15 13 111152 CASAVA_Build 6 57006447 60D TTTTTACTGT TGTTGTCCTGTTTTTATTTCTCTGTGTTGTTTTTTTCTTATTTCTTAGAGGAGCAAAAAG/------------------------------------------------------------ GTAAGAAAGT 3070 hom 57 het 18 0 19 1 TGTTGTCCTGTTTTTATTTCTCTGTGTTGTTTTTTTCTTATTTCTTAGAGGAGCAAAAAG 1 0 111153 CASAVA_Build 6 57030904 1D GCTAGATGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 10 9 111154 CASAVA_Build 6 57057532 2I CCAGCTACTC --/AG GGGGCTGAGG 3070 hom 33 het 13 0 11 3 AG 0 1 111155 CASAVA_Build 6 57086074 1D GATGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 1184 het 1184 ref 37 23 4 10 T 13 12 111156 CASAVA_Build 6 57090084 1I TTTTAGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 26 2 16 8 T 12 13 111157 CASAVA_Build 6 57143687 2D CTGAGATAAC AT/-- GTACATGAGA 3070 het 3070 hom 38 12 21 6 AT 1 0 111158 CASAVA_Build 6 57174205 3D TTCTGAAGAG AGA/--- AGGATACCAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 AGA 1 0 111159 CASAVA_Build 6 57201026 3D TGAAAATAAC ATT/--- GTTGTAGAGC 3070 het 3070 hom 58 25 28 7 ATT 1 0 111160 CASAVA_Build 6 57202253 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 A 0 1 111161 CASAVA_Build 6 57202643 3I TGACTCTCCC ---/TCA TCATGCCTCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TCA 1 2 111162 CASAVA_Build 6 57204621 2I GAAAAAAAAA --/AC AAACCACTAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AC 0 1 111163 CASAVA_Build 6 57207377 9D GCCTCCCAGG TTCAAGCGA/--------- TTCTCTTGCC 3070 het 452 hom 13 2 11 0 TTCAAGCGA 1 0 111164 CASAVA_Build 6 57214273 1D TGGCAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 12 11 111165 CASAVA_Build 6 57218366 2D TCCATCTCTT AG/-- AGCACAACCT 3070 het 3070 hom 55 20 31 7 AG 2 1 111166 CASAVA_Build 6 57219615 1D ACTTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 2837 het 499 hom 17 2 9 6 T 15 14 111167 CASAVA_Build 6 57225951 1D CATGCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 11 10 111168 CASAVA_Build 6 57228516 1D GAATGATCAT A/- AAAAAACTTC 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 7 6 111169 CASAVA_Build 6 57230028 2D TCTGTAGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 1364 het 170 hom 16 4 4 8 T 16 14 111170 CASAVA_Build 6 57232110 1D TCCTGGGACC A/- GTAGGTTGCC 3070 hom 108 het 42 0 35 9 A 1 0 111171 CASAVA_Build 6 57249204 4D TACCATTTAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AT 8 6 111172 CASAVA_Build 6 57260534 1D AAGTAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 13 12 111173 CASAVA_Build 6 57269186 1D ACTGTTGGAG A/- AAAAAAGTCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 6 111174 CASAVA_Build 6 57271848 2D TCTCTTTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 TG 8 7 111175 CASAVA_Build 6 57277940 1D TCATATTTAC A/- ACCTACTTCA 3070 het 3070 hom 44 14 26 5 A 2 1 111176 CASAVA_Build 6 57280894 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 10 9 T 11 10 111177 CASAVA_Build 6 57313619 2D ATAATAATAA TT/-- TAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 3 1 111178 CASAVA_Build 6 57314996 2I CAAAAAGGAA --/AC ACTGATATTT 3070 het 3070 ref 87 47 35 6 AC 1 2 111179 CASAVA_Build 6 57315216 1I GGAAAGGTCA -/G GCTTTGGCAG 3070 het 3070 ref 71 33 29 10 G 1 2 111180 CASAVA_Build 6 57315659 2D ACATCTAAAA TT/-- TGTTTCTCAT 3070 het 3070 ref 71 36 32 3 T 3 1 111181 CASAVA_Build 6 57316243 5D76M2D CAGAATGAAC TTTGATACAGCCAATAAGGAGTCTGGTGGAACAGCTGAGACAGGACACACAGATGTAACAGTAGAACAGGCTAGAGAACACAT/-----TACAGCCAATAAGGAGTGTGGTGGAACAGCTGAGACAGGACACACAGATGTAACAGTAGAACGGGCTAGAGAACAC-- GTGTTTGATA 3070 het 3070 ref 97 79 38 28 N/A 0 0 111182 CASAVA_Build 6 57316514 1D AGTGTTAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 62 33 21 10 A 8 7 111183 CASAVA_Build 6 57317825 1D TTTGCCCTTG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 56 21 26 9 A 9 8 111184 CASAVA_Build 6 57317923 2D ATTTTATTAA TT/-- TTTTTTTTTG 2383 het 2383 ref 42 14 11 17 T 11 9 111185 CASAVA_Build 6 57317960 1I CCATTGCCTA -/G GCTTGAGTGC 2344 het 2344 ref 39 16 7 17 G 1 2 111186 CASAVA_Build 6 57319775 4D TGCTTGCTTC TGTT/---- TGTTTATCTC 3070 het 3070 ref 96 45 42 11 TGTT 2 1 111187 CASAVA_Build 6 57320371 14I GCCTGGCTAA --------------/TTTTTTCTTTTTCT TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 63 23 32 16 TTTTTTCTTTTTCT 0 1 111188 CASAVA_Build 6 57320643 3D ATGAGTAGAT TTC/--- TTCACAGCTT 3070 het 3070 hom 70 28 40 3 TTC 2 1 111189 CASAVA_Build 6 57322470 3I56M5D ATATTTCTTA ---TTTTTTTTGTCTTTTTGGAAGATTTAAAGTAGTTTTGGCTTACAGTTCTACTTTTCTTTTT/TTTTTTTTTTTGTCTTTTTGGAAGATTTAAAGTAGTTTTGGCTTACTGTTGTACTTTTC----- TAACACTTTT 3070 het 3070 ref 60 45 37 12 N/A 0 0 111190 CASAVA_Build 6 57322657 2I TTGTAAAAAC --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 64 23 39 2 A 8 10 111191 CASAVA_Build 6 57323136 4I ATTAATTTTA ----/TTTG TTTATTTACA 3070 het 3070 ref 55 28 22 5 TTTG 0 1 111192 CASAVA_Build 6 57324098 1I TTTCAGGTTT -/G GGATGTTCAA 3070 het 3070 hom 101 43 50 8 G 2 3 111193 CASAVA_Build 6 57324987 1D48M5D ATTTTTATTT AAAAGTGTTCACTTTTCTTTTCTTTTTTTGAGCCAGAGTCTCGCTCTGTTGCCC/-AAAGTGTTCACTTTTCTTTTCTTTTTTTGAGCCAGAGTCTAGCTCTGT----- AGGCTGGAGT 3070 het 3070 ref 66 42 32 9 N/A 0 0 111194 CASAVA_Build 6 57325358 3I GGTTGAATAT ---/ATA ATGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 61 35 22 4 ATA 0 1 111195 CASAVA_Build 6 57325592 1I GTAGAAGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 67 31 26 10 A 8 9 111196 CASAVA_Build 6 57325741 2D AGAATTTTAA TT/-- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 53 20 28 5 T 9 7 111197 CASAVA_Build 6 57325897 7D GTGAAATCCC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 15 21 16 A 21 14 111198 CASAVA_Build 6 57326333 1I ACACATACAT -/A AAAGAAGATC 3070 het 3070 ref 74 39 27 9 A 3 4 111199 CASAVA_Build 6 57327097 5I ATTTTTCTTC -----/TCTTA TGAGTATTGT 3070 het 3070 hom 96 36 55 5 TCTTA 0 1 111200 CASAVA_Build 6 57332495 1D CTATTAACAA T/- TAAATAATAT 3070 het 3070 ref 80 41 32 9 T 2 1 111201 CASAVA_Build 6 57332646 1D54M2D CTGCTTAAAA GTTAGCTGAGAAGTTTGTGGCTTTTTCATTTTGAAGAAGAGATTTGCCAGGAGTCTG/-TTAGCTGAGAAGTTTGTGGCTTTTTCATTTTGAAGAAGAGATTTGCCAGGAGTC-- AGAATCCTTT 3070 het 3070 ref 73 65 33 20 N/A 0 0 111202 CASAVA_Build 6 57333291 3D AGTTGAGGCC TAA/--- TAATACCCTT 3070 het 3070 ref 90 43 40 8 TAA 2 1 111203 CASAVA_Build 6 57333701 1I GTGTTTTCTC -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 67 35 26 6 T 7 8 111204 CASAVA_Build 6 57333932 4I AAGGAAAGCT ----/ATGG ATGGATGGGG 3070 het 3070 ref 88 37 35 16 ATGG 2 3 111205 CASAVA_Build 6 57334659 1I TTATAGGGGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 75 26 37 12 A 8 9 111206 CASAVA_Build 6 57335053 4I ACTTATTAAA ----/ACTT AATTGCCAAA 3070 het 3070 hom 65 28 33 4 ACTT 0 1 111207 CASAVA_Build 6 57335437 1D AATTACTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 67 23 29 15 T 11 10 111208 CASAVA_Build 6 57335980 15D GAGTGTGTAG AGGGGAGACCCAAGA/--------------- AAACATAGAA 3070 het 3070 ref 79 45 30 10 AGGGGAGACCCAAGA 1 0 111209 CASAVA_Build 6 57336187 1D GTGAAATGTG T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 66 36 26 4 T 7 6 111210 CASAVA_Build 6 57336831 1D AATTTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 59 23 26 10 T 12 11 111211 CASAVA_Build 6 57337393 1D TGAAGATGTT C/- TTCGTTTGGG 3070 het 3070 ref 80 37 32 12 C 1 0 111212 CASAVA_Build 6 57338831 1D TAAATAATAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 63 29 26 8 A 9 8 111213 CASAVA_Build 6 57339318 2I TGCTGACGAC --/TG TGTGAAACTA 3070 het 3070 ref 103 55 38 10 TG 2 3 111214 CASAVA_Build 6 57339808 3I GCTATTAAAA ---/AAG AAACAGTAAT 3070 het 3070 ref 88 49 33 6 AAG 0 1 111215 CASAVA_Build 6 57339952 1I TATAAATGAC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 55 25 19 11 A 7 8 111216 CASAVA_Build 6 57340167 6D AAAAAATGTT TAAAAC/------ TAACTTATTT 3070 het 3070 ref 51 30 21 1 TAAAAC 1 0 111217 CASAVA_Build 6 57340405 16D TGGGCTTTCT TAGTTGACAACTAGTC/---------------- TGGTCTAGGA 3070 het 3070 ref 73 46 36 5 TAGTTGACAACTAGTC 1 0 111218 CASAVA_Build 6 57340896 2I ATCTATTCAC --/AA AGTTTTAATT 1823 het 1823 ref 31 25 4 2 A 1 3 111219 CASAVA_Build 6 57341184 1I ATTCAAATAG -/A AAACTATCCA 3070 het 3070 ref 61 33 21 7 A 3 4 111220 CASAVA_Build 6 57342193 10D TATACCGTTA TACCATGTGC/---------- TACCATTTGA 3070 het 3070 ref 60 35 25 3 TACCATGTGC 1 0 111221 CASAVA_Build 6 57343370 1I TTAGATCGAA -/T GTGCATGATT 3070 het 3070 ref 75 38 33 4 T 0 1 111222 CASAVA_Build 6 57346062 1D CTTTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 T 11 10 111223 CASAVA_Build 6 57346771 1I GGGATTAGCA -/T CTGAATCTAT 3070 het 3070 ref 62 38 16 8 T 0 1 111224 CASAVA_Build 6 57346994 1D TTCTTGATTT G/- GCTGTTGGCT 2565 het 2565 ref 32 23 6 3 G 2 1 111225 CASAVA_Build 6 57348285 1D CTGATGTTTT C/- CTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 61 30 29 2 C 2 1 111226 CASAVA_Build 6 57348959 1D TGTTAGAGAT G/- GGGGTCTCAC 3070 het 3070 ref 42 26 15 1 G 5 4 111227 CASAVA_Build 6 57349638 14I AGTTTTTCTA --------------/TATTTTTTTATTTC TATTTTTTAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 TATTTTTTTATTTC 0 1 111228 CASAVA_Build 6 57349702 1I TGGCACAATC -/T TGGCTCACCG 835 het 835 ref 23 14 3 6 T 1 2 111229 CASAVA_Build 6 57349733 1I TTCCAGGTTC -/A AAGCAATTCT 874 het 874 ref 17 11 2 7 A 2 3 111230 CASAVA_Build 6 57350466 1D22M1I TGTGCCTAAA TTTTTTTTGTCTATTTCTAGAAA-/-TTTTTTTGTCTATTTCTAGAAAT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 59 27 38 7 N/A 0 0 111231 CASAVA_Build 6 57353002 1D TAATGGAATA C/- CCTCCTTGCA 3070 het 3070 ref 91 47 25 22 C 3 2 111232 CASAVA_Build 6 57353873 1I TCACACAATT -/C TACCCTGTAG 3070 het 3070 ref 88 45 31 12 C 0 1 111233 CASAVA_Build 6 57354104 1I TTTAACCTCG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 58 30 22 6 T 6 7 111234 CASAVA_Build 6 57354733 3I ATGAAGACTT ---/AGG AGGATTTCTT 3070 het 3070 ref 84 40 38 6 AGG 1 2 111235 CASAVA_Build 6 57356332 11D TTTTCTTGCT AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 53 22 14 22 A 19 8 111236 CASAVA_Build 6 57356780 1D GAAGTCTAGA T/- TATAGTATGG 3070 het 3070 ref 71 39 22 11 T 2 1 111237 CASAVA_Build 6 57357710 4I AAGTTTTGAC ----/TGTT TGTTTTATAA 3070 het 3070 ref 43 25 9 9 TGTT 1 2 111238 CASAVA_Build 6 57357883 1I AATTTTACAA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 58 35 16 7 T 7 8 111239 CASAVA_Build 6 57358013 2D GTTAAGAAAT AA/-- GAGTATTTAT 3070 het 3070 ref 62 31 22 13 A 2 0 111240 CASAVA_Build 6 57359829 11I12M1D CTCTGTGGCC -----------CAGAACCTTCCCT/CTACTTCCTCTCAGAACCTTCCC- TTAAGTCCCA 3070 het 3070 hom 92 46 46 12 N/A 0 0 111241 CASAVA_Build 6 57361211 3D AAGAATCAGC ATA/--- ATGATGATGA 3070 het 3070 ref 73 41 24 9 ATA 1 0 111242 CASAVA_Build 6 57362497 2D TTCTAAAGAG TT/-- TGGAATCCTC 3070 het 3070 ref 72 36 31 8 T 3 1 111243 CASAVA_Build 6 57362910 1I GCAAAAGTAA -/T TGTGGTTTTT 3070 het 3070 ref 80 36 37 8 T 1 2 111244 CASAVA_Build 6 57363529 4D ACACTTTCTT TATC/---- TAGTCTGTCA 3070 het 3070 ref 80 47 26 10 TATC 1 0 111245 CASAVA_Build 6 57363893 1D TCTAATGATC A/- ATTGATACTG 3070 het 3070 ref 59 34 17 8 A 2 1 111246 CASAVA_Build 6 57364398 28D ATTGCTTGTT TTTGTCAGCTTTGTTGAAGATCATATGG/---------------------------- TTGTAGGTGT 3070 het 3070 ref 43 39 11 6 TTTGTCAGCTTTGTTGAAGATCATATGG 1 0 111247 CASAVA_Build 6 57364654 1I119M2I ATTTATTTTT -TAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGATAGTTTGATAGGAATAGGACTGAATTATATAAATTGCTTTGGGCAGTATGACCATTTTAATGATATTGACTTTTCCTGTCCATGAGCATGGGATG--/GTAGTTCTGTGAAGAATGTCATTGATAGTTTGATAGGAATAGGACTGAATTATATAAACGGCTTTGGGCAGTATGACCATTTTAATGATATTGACTTTTCCTGTCCATGAGCATGGGATGTT TTTTTCCATT 3070 het 3070 ref 40 68 18 19 N/A 0 0 111248 CASAVA_Build 6 57364963 1I ATGCTAGCGA -/T TTTCGTTCAT 3070 het 3070 ref 69 40 23 8 T 3 4 111249 CASAVA_Build 6 57365395 1D GAAAATATTC G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 33 17 5 G 1 0 111250 CASAVA_Build 6 57365590 1D GTCCATTGTA T/- CATTCTTATG 3070 het 3070 ref 69 42 18 9 T 1 0 111251 CASAVA_Build 6 57365775 2D ATATATACAT AG/-- ACACACACAC 20 het 20 ref 66 49 2 19 AG 1 0 111252 CASAVA_Build 6 57365933 3I ATACCCAGTA ---/GTG GTGTTGCTGG 3070 het 3070 ref 63 34 21 8 GTG 1 2 111253 CASAVA_Build 6 57368018 1I TTGAATGTCT -/G GTAGAATTCT 3070 het 3070 ref 60 34 19 7 G 1 2 111254 CASAVA_Build 6 57369038 4I TTTTGTCTTG ----/CTGT CTATCTCATT 3070 het 3070 ref 42 24 17 1 CTGT 0 1 111255 CASAVA_Build 6 57370215 1D TTCAGTTCTA T/- TTGCTGAGAC 2622 het 2622 ref 32 23 6 4 T 3 2 111256 CASAVA_Build 6 57370283 1I ATTTTTGATT -/G TTTTTTCTTT 2915 het 2915 ref 28 17 6 6 G 0 1 111257 CASAVA_Build 6 57370475 1D ACTAGTTTGC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 64 29 28 10 A 8 7 111258 CASAVA_Build 6 57373050 1I GTAAGGCAGG -/T CTGGTGGTAA 3070 het 3070 ref 55 30 23 2 T 0 1 111259 CASAVA_Build 6 57373534 30D GTTCATTGCA TTGTAGGAATGGACAAAAAAGTAGGTCTAC/------------------------------ TTTTATTCTT 3070 het 3070 ref 61 43 28 6 TTGTAGGAATGGACAAAAAAGTAGGTCTAC 1 0 111260 CASAVA_Build 6 57373958 8D GGAGTTCTTG CTTTGGTT/-------- CTTTCTCATC 3070 het 3070 ref 52 32 19 3 CTTTGGTT 1 0 111261 CASAVA_Build 6 57375590 1D TGGGGGTTTT A/- AAAAGGAGAA 3070 het 3070 hom 65 28 32 5 A 5 4 111262 CASAVA_Build 6 57376181 2D ACCCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTG 2876 het 1388 hom 18 5 8 6 T 11 9 111263 CASAVA_Build 6 57377771 1I TTATTTATCC -/T TTTTTTTTTT 1263 het 1263 ref 61 42 3 16 T 10 11 111264 CASAVA_Build 6 57377907 1D ACTGAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 62 28 21 14 T 11 10 111265 CASAVA_Build 6 57378681 9D ATCATCATCA CCCAGCAAG/--------- CCAATTCTTC 3070 het 3070 ref 76 41 33 6 CCCAGCAAG 1 0 111266 CASAVA_Build 6 57379948 1D ATCTTTGAGG A/- AAAAATGAAT 3070 het 3070 hom 76 35 34 8 A 6 5 111267 CASAVA_Build 6 57381202 11D TAGCCACCCA CATAATAAATG/----------- CATAATAAAT 3070 het 3070 ref 83 40 38 15 CATAATAAATG 2 1 111268 CASAVA_Build 6 57381775 1I ATTTAAAACA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 64 26 31 7 T 6 7 111269 CASAVA_Build 6 57382547 2D TTGAAGAGCA AC/-- AAAGTTTTAC 3070 het 3070 ref 88 50 31 10 AC 1 0 111270 CASAVA_Build 6 57382926 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAATTAA 3070 het 2775 hom 26 9 15 4 A 6 7 111271 CASAVA_Build 6 57383089 4D ACGCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2857 hom 46 16 29 1 A 18 14 111272 CASAVA_Build 6 57386576 8I ATGTGATTTG --------/ACCTCTCA ACTGTGTATC 3070 het 3070 ref 86 42 37 10 ACCTCTCA 0 1 111273 CASAVA_Build 6 57387317 5I4M2D ATCTTAGGAA -----TTTTTA/GGAAGTTTT-- TGTACTTACA 3070 het 3070 ref 83 41 40 8 N/A 0 0 111274 CASAVA_Build 6 57389733 2I TTTTTTCTTT --/TC TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 64 26 29 9 TC 0 1 111275 CASAVA_Build 6 57390739 1D6M4D ACAAAGATTA TAAATCATTAT/-AAATCA---- TTTAACAGGA 3070 het 3070 ref 74 39 30 15 N/A 0 0 111276 CASAVA_Build 6 57397620 4I ACTAAAATAT ----/ATTA ATTATTAAAT 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 ATTA 1 2 111277 CASAVA_Build 6 57399410 4I AAGTTGTATT ----/CTCA TGCATTGCCG 3070 het 3070 hom 88 31 37 20 CTCA 0 1 111278 CASAVA_Build 6 57399818 3I ACTGAAATTT ---/CTC CTCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 CTC 1 2 111279 CASAVA_Build 6 57400220 1I GGATTCCAGG -/T CATGCGCCAC 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 0 1 111280 CASAVA_Build 6 57400928 7I GTGTTTTTTT -------/TTTTTTG GTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 62 32 19 11 TTTTTTG 0 1 111281 CASAVA_Build 6 57401377 1I AATATAATTG -/T TTCTTTTGAT 3070 het 3070 ref 67 34 22 11 T 2 3 111282 CASAVA_Build 6 57402260 1D32M1D CCTGACTCAA GGTTTGATAAAAGAGTCTTTATCAGTCTTAAGGT/-GTTTGATAAAGGAGTCTTTATCAGTCTTATGG- GCTGAATTGT 3070 het 3070 ref 69 40 33 13 N/A 0 0 111283 CASAVA_Build 6 57405068 2I ATTTCAAAAC --/TT AGGATATGTA 3070 het 3070 ref 53 33 18 3 T 0 2 111284 CASAVA_Build 6 57409226 2I CAACTATTTT --/AG AGTCACAAAC 1467 het 1467 ref 53 43 6 4 AG 1 2 111285 CASAVA_Build 6 57409915 8D CAGGCACTGG ACACTTAA/-------- ACAACTAGAT 3070 het 3070 ref 89 54 29 15 ACACTTAA 1 0 111286 CASAVA_Build 6 57410828 1D ATTATGGTTT A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 45 24 19 4 A 7 6 111287 CASAVA_Build 6 57410939 1I TTCTTTTAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 69 28 33 8 T 7 8 111288 CASAVA_Build 6 57411762 1D ACCGTGCCTG T/- TCCTAGTGTT 3070 het 3070 ref 47 24 20 4 T 2 1 111289 CASAVA_Build 6 57413541 4I CCCAGGAGTC ----/TTGT TTGTTCTCTG 3070 het 3070 ref 83 39 33 11 TTGT 1 2 111290 CASAVA_Build 6 57413921 2D13M2D TTCACAACTC TGTGCATTCTTTCATTG/--TGCATTCTTTCAT-- TCAAGCATAA 3070 het 3070 ref 81 46 32 17 N/A 0 0 111291 CASAVA_Build 6 57414189 1I TGGTCTTTTT -/C CTAAGGGAGG 3070 het 3070 ref 64 37 18 9 C 1 2 111292 CASAVA_Build 6 57414747 1I GCAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 A 9 10 111293 CASAVA_Build 6 57415636 2I ACTCAAAGAA --/AG AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 93 46 30 17 AG 0 1 111294 CASAVA_Build 6 57416277 1I AACATTTTTT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 81 39 37 6 A 6 7 111295 CASAVA_Build 6 57416360 1I TTAAACTGGA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 75 36 35 4 T 8 9 111296 CASAVA_Build 6 57416577 1I GGGTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 97 47 41 9 A 10 11 111297 CASAVA_Build 6 57417925 1D CAGAAAGGCA G/- GTATCTTTGT 3070 het 3070 ref 88 47 34 9 G 2 1 111298 CASAVA_Build 6 57419198 2I TTTGAGACAG --/AA TCTTGCTCTG 809 het 809 ref 32 16 5 11 A 0 2 111299 CASAVA_Build 6 57419880 1D TTCTGCCAAA T/- TCTGTGATGT 3070 het 3070 ref 60 31 25 6 T 2 1 111300 CASAVA_Build 6 57421163 1I TTAATGGAAT -/A ACCAAACTCT 3070 het 3070 ref 74 34 34 6 A 1 2 111301 CASAVA_Build 6 57421872 1I TTGTATGAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 71 27 33 11 T 7 8 111302 CASAVA_Build 6 57422113 3I AATTACTTTA ---/TTG TTGTTCTTAG 3070 het 3070 ref 68 31 24 13 TTG 1 2 111303 CASAVA_Build 6 57422410 1I CTCTAAGTGC -/T TTTCAAGCAT 3070 het 3070 hom 84 38 42 4 T 3 4 111304 CASAVA_Build 6 57423580 5I GCATATACTA -----/TACTT TAGTATACTG 3070 het 3070 ref 84 42 35 7 TACTT 0 1 111305 CASAVA_Build 6 57423897 2D ATTTTTTTTA AT/-- TTTTTTTTTT 1842 het 1842 ref 52 41 4 10 AT 1 0 111306 CASAVA_Build 6 57424245 1I TTCGATAATT -/G GATTCACCAT 3070 het 3070 ref 61 31 24 6 G 1 2 111307 CASAVA_Build 6 57424467 2I GATGTATCTG --/TT TTCTGTGTGT 3070 het 3070 ref 59 43 8 9 T 2 4 111308 CASAVA_Build 6 57429632 1I AGAGGCACTC -/T GATTTTTAGA 2430 hom 12 het 6 0 5 1 T 0 1 111309 CASAVA_Build 6 57430745 27D GCTTCTGCTT ACTCATATTTAGGTTGTGGCATATCAC/--------------------------- AAAGTGTCTT 3070 het 3070 ref 61 57 13 8 ACTCATATTTAGGTTGTGGCATATCAC 1 0 111310 CASAVA_Build 6 57431036 1D AAGCATTGCA G/- GAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 100 45 42 13 G 2 1 111311 CASAVA_Build 6 57432507 3D GGCAGAATTC CTT/--- CTTCTTCAAA 3070 het 3070 ref 72 38 27 9 CTT 3 2 111312 CASAVA_Build 6 57432953 2I CAGGGGTCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1255 hom 78 10 28 41 T 12 14 111313 CASAVA_Build 6 57433062 9D AAATGTTCTA CTGTTGGCC/--------- AGTTGCCACC 3070 het 3070 ref 62 28 28 17 CTGTTGGCC 1 0 111314 CASAVA_Build 6 57433168 1I TTTACTAGGA -/T TTTAGGAATA 3070 het 3070 hom 75 30 37 8 T 3 4 111315 CASAVA_Build 6 57433817 1I CAAGACAGAT -/A AAAGTCTATA 3070 het 3070 hom 92 39 43 10 A 3 4 111316 CASAVA_Build 6 57435710 1I GAGAGCTGTT -/A AAACAAATGT 3070 het 3070 ref 63 35 20 8 A 3 4 111317 CASAVA_Build 6 57438618 1I20M1I ATAATGATTC -TTTTTTTTATTATTATACTT-/TTTTTTTTTATAATTATACTTA TAAGTTCCGG 3070 het 3070 ref 35 19 12 6 N/A 0 0 111318 CASAVA_Build 6 57440992 1I GGGTTTGTCA -/T AAATAGCTCT 3070 het 3070 ref 48 24 11 13 T 0 1 111319 CASAVA_Build 6 57442864 1D3M10D ATGTAAGTAG TATTTGAGTAAGTA/-ATT---------- AGTATTTGAG 3070 het 3070 ref 82 50 36 10 N/A 0 0 111320 CASAVA_Build 6 57443616 4I ACTACCTTCT ----/CTAC TTACATATAC 3070 het 3070 ref 64 30 25 10 CTAC 0 1 111321 CASAVA_Build 6 57443818 1I GGGATACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 72 30 33 9 T 10 11 111322 CASAVA_Build 6 57444509 1I TTTTCCTCTG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 85 38 38 9 A 7 8 111323 CASAVA_Build 6 57444722 10D TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG/---------- GAGAACTGTT 3070 het 3070 ref 49 29 12 12 TTTTTTTTTG 1 0 111324 CASAVA_Build 6 57446634 6I CTCTACTGTT ------/TGTTTG TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 64 30 29 5 TGTTTG 0 1 111325 CASAVA_Build 6 57447086 2D48M1D TAATTTTTTG TTTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCTA/--TTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCT- ATCTCCTGAC 2813 het 2813 ref 16 11 7 9 N/A 0 0 111326 CASAVA_Build 6 57447758 3D TCTGGGCATC CGA/--- TTTTATTTGC 3070 het 3070 hom 90 36 33 24 CGA 1 0 111327 CASAVA_Build 6 57448757 3I CCTAGGTCAG ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 104 48 44 17 TGT 5 6 111328 CASAVA_Build 6 57448933 1I ATTGTAGTTT -/A TAACTAATAA 1670 het 1670 ref 64 33 4 28 A 0 1 111329 CASAVA_Build 6 57448952 2D AATAGTAAAA TT/-- TTATTGGACT 1228 het 1228 ref 69 38 4 28 T 4 2 111330 CASAVA_Build 6 57449331 1D AAAAAGTATT A/- ACAACGTAAC 3070 het 3070 ref 67 34 29 5 A 2 1 111331 CASAVA_Build 6 57452103 1I GTAGACTACT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 78 37 34 8 A 8 9 111332 CASAVA_Build 6 57452224 5D16M1I GGTCTTAACT GAGTAGAGAGAGAACTAATTA-/-----GAGAGAGAACTAATTAT TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 83 59 26 12 N/A 0 0 111333 CASAVA_Build 6 57452963 5I GTACATTTGT -----/ATTTA ATTTAGTAAG 3070 het 3070 ref 92 40 31 21 ATTTA 1 2 111334 CASAVA_Build 6 57453155 1I TAGGTGTAAT -/A TAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 87 45 33 11 A 0 1 111335 CASAVA_Build 6 57453803 6D GTCCTTCTCA TATATC/------ CTTCACTCAG 3070 het 3070 ref 52 32 17 5 TATATC 1 0 111336 CASAVA_Build 6 57454221 4D CTGCATAGTA TTAG/---- TTTGTTTAAC 3070 het 3070 hom 79 29 42 10 TTAG 1 0 111337 CASAVA_Build 6 57454351 4D GTTTTTTTTT TTTC/---- TTCATTTCCT 3070 het 3070 hom 74 29 34 18 TTTC 1 0 111338 CASAVA_Build 6 57454673 1I TTCGGGATGA -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 83 42 34 7 T 6 7 111339 CASAVA_Build 6 57455168 1D AAAACCTGGT G/- GGGGGGGACC 3070 het 3070 ref 48 28 16 9 G 8 7 111340 CASAVA_Build 6 57455346 2D GGGATTTTTT TG/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 75 43 26 7 TG 1 0 111341 CASAVA_Build 6 57455669 2I GGAAAGTAGA --/TT TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 T 7 9 111342 CASAVA_Build 6 57455967 1I GCCTGGATGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 8 9 111343 CASAVA_Build 6 57460161 1D TATTCTCCTG C/- CTCAGGCTCC 1854 het 1508 hom 13 4 6 3 C 2 1 111344 CASAVA_Build 6 57460791 5D TAATACAGTA AAGTT/----- TAGTTTACAG 3070 het 3070 hom 76 35 37 8 AAGTT 1 0 111345 CASAVA_Build 6 57461561 1D ATGGAACAAT A/- CTTTACTCAC 3070 het 3070 ref 99 48 41 10 A 1 0 111346 CASAVA_Build 6 57461847 2I GTGAGAACTC --/TT TATCTCTTTA 3070 het 3070 ref 79 42 29 8 T 1 3 111347 CASAVA_Build 6 57462232 1I ACGAAAAACT -/A AGCTGGGCGT 3070 het 979 hom 10 3 7 0 A 1 2 111348 CASAVA_Build 6 57462383 6D CCCCGTCTCC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1970 het 1970 ref 25 18 5 6 A 19 13 111349 CASAVA_Build 6 57462754 1I AATTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 829 hom 63 4 33 26 T 11 12 111350 CASAVA_Build 6 57465387 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2753 hom 56 het 24 0 19 5 A 9 10 111351 CASAVA_Build 6 57465767 3I TGTAATAAAA ---/AGG AGCATTAATA 3070 het 3070 ref 90 44 34 12 AGG 0 1 111352 CASAVA_Build 6 57465859 4D17M3I TTCTGAGATT GATCGATTGATTTCTACAGCT---/----GATTGATTTCTACAGCTTTA TTTTCTTAAG 3070 het 3070 ref 90 58 32 10 N/A 0 0 111353 CASAVA_Build 6 57465951 4I CAAAACTGAA ----/TCTC TCTTAGTTTT 3070 het 3070 ref 79 49 22 8 TC 1 3 111354 CASAVA_Build 6 57466035 2I CAAAAAATCA --/TC TGTCTTGACC 3070 het 3070 ref 89 46 36 7 TC 0 1 111355 CASAVA_Build 6 57466242 3I84M1I3M12D TGACTTTAAA ---ATGTGAACTCTTTGATAGTTCAAATGAGAGCACTGTTGAAGCATCTTAGTAGGACAGATTTTAATTCATGCTGGCATTAATTTG-ATTAAATAAAATTGA/ATTATGTGAACTCTTTGATAGTTCACATGAGAGCACTGTTGAAGCATCTTAGTAGGATAGATTTTAGTTCATGCTGGCATTAATTTGCATT------------ TGATTAAAAG 3070 het 3070 ref 93 90 39 38 N/A 0 0 111356 CASAVA_Build 6 57466848 1I AACTGTATGT -/C CAAGGTCACT 3070 het 3070 ref 79 40 33 6 C 1 2 111357 CASAVA_Build 6 57467629 7I CATCCTCAAT -------/AATATTA AATGAGTTTT 3070 het 3070 hom 75 34 34 7 AATATTA 0 1 111358 CASAVA_Build 6 57467700 1I GTTGGATCAG -/A AGGCTGAGGT 3070 het 3070 ref 68 32 24 12 A 1 2 111359 CASAVA_Build 6 57467827 5I29M1D AAATTATTTA -----CTTCTTCTGTTTTGTTTTAAATATAATTAG/CTTTTCTTGTTCTGTTTTGTTTTAAATATAATTA- GAAAGTTTTA 3070 het 3070 ref 46 37 14 14 N/A 0 0 111360 CASAVA_Build 6 57468133 2D ATAAATAAAC TG/-- TGAGTGAGAT 3070 het 3070 ref 88 40 39 10 TG 2 1 111361 CASAVA_Build 6 57468527 2D ATTAGTAATA AT/-- ATCTTGTCCA 3070 het 3070 ref 82 61 11 10 AT 2 1 111362 CASAVA_Build 6 57468746 3D GCTGATTTTT TTA/--- TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 43 30 12 6 TTA 1 0 111363 CASAVA_Build 6 57469262 1D GAAACCCACT A/- ATTCAGTCTG 3070 het 3070 ref 80 43 29 9 A 2 1 111364 CASAVA_Build 6 57469669 1I ATTTTTGGCT -/G AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 80 38 40 2 G 0 1 111365 CASAVA_Build 6 57470842 3I CAGGATTTTC ---/TGT TGTTAAAATC 3070 het 3070 ref 68 43 18 7 TGT 1 2 111366 CASAVA_Build 6 57470898 7I TTTTATTTGA -------/CATCTGC CTTGGTCCCA 3070 het 3070 ref 71 40 18 13 CATCTGC 0 1 111367 CASAVA_Build 6 57471416 3I TGGGATTTCT ---/TGA TGACAATTCC 3070 hom 11 het 58 2 35 21 TGA 1 2 111368 CASAVA_Build 6 57472178 7I20M3D GACATACTTC -------TTGAGGGAACAACAGAAACAAGG/TTGGCATTTGAGGGAACAACAGAAACA--- AGGTCATTTT 3070 het 3070 ref 87 58 38 8 N/A 0 0 111369 CASAVA_Build 6 57472276 1I CTCCTGAGGT -/A GGTTATAAAA 3070 het 3070 ref 72 45 20 7 A 0 1 111370 CASAVA_Build 6 57472630 2D AACCCTCAAC AT/-- ACTGCTCTAA 3070 het 3070 ref 96 55 32 13 AT 1 0 111371 CASAVA_Build 6 57474075 13D AAGATATGAC AAGCATGCTTTAT/------------- ATCCAGATTT 3070 het 3070 ref 43 33 9 2 AAGCATGCTTTAT 1 0 111372 CASAVA_Build 6 57474144 12D TGGATTTCAG TTTTGTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 20 10 8 TTTTGTTTTTTT 1 0 111373 CASAVA_Build 6 57474635 1D TTTAAATAAC A/- AAGGCTATTT 3070 het 3070 ref 81 47 26 8 A 3 2 111374 CASAVA_Build 6 57476614 3D GCTCTGTCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 29 19 5 A 14 11 111375 CASAVA_Build 6 57477191 1D ATTAGTTGGT A/- AAAATGCATT 3070 het 3070 hom 94 37 43 15 A 5 4 111376 CASAVA_Build 6 57479060 4D8M4I ATTGCAGCAG ATTAATTGTCTC----/----ATCGTCTCACTT TATTGTATTT 3070 het 3070 ref 93 40 30 27 N/A 0 0 111377 CASAVA_Build 6 57479244 1D TTGATGAATT A/- AATGTTTTCC 3070 het 3070 ref 93 38 22 40 A 3 2 111378 CASAVA_Build 6 57479457 5D TGTTTTGATG TTTTA/----- TTAAGTTTAC 3070 het 3070 ref 103 66 29 11 TTTTA 1 0 111379 CASAVA_Build 6 57480416 1D TAAAAACTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 87 47 21 19 T 9 8 111380 CASAVA_Build 6 57480483 1D2M4I TGTTACCCTT GAC----/-ACTTTA TTTAGGGCAC 3070 het 3070 ref 93 67 20 10 N/A 0 0 111381 CASAVA_Build 6 57480786 6D TTTCTATGTT TTTTAA/------ TTTTAATTTT 3070 het 3070 ref 54 37 12 5 TTTTAA 3 2 111382 CASAVA_Build 6 57481040 1I CTCAGGTGAT -/C CACCTGCCTC 3070 het 1814 hom 32 5 22 6 C 1 2 111383 CASAVA_Build 6 57481172 1I TATGTGACTA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 68 31 14 23 T 6 7 111384 CASAVA_Build 6 57481200 1D ATATTGTAAT A/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 80 34 25 23 A 1 0 111385 CASAVA_Build 6 57482226 1I TCAGAAATTA -/T TTTTTGAGTC 3070 het 3070 ref 101 61 29 11 T 5 6 111386 CASAVA_Build 6 57482638 2D TAGATATATA AT/-- ATATATATAA 3070 het 3070 hom 29 9 17 5 AT 5 4 111387 CASAVA_Build 6 57483163 1I AATTTTCTTG -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 hom 96 27 61 8 T 6 7 111388 CASAVA_Build 6 57483508 3I TGCTGTTGCT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 100 31 50 19 TTA 5 6 111389 CASAVA_Build 6 57483626 1I AGTAACCTTG -/T TATAACGCCT 3070 het 3070 hom 89 38 41 10 T 1 2 111390 CASAVA_Build 6 57485463 7D TTTCTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 2832 hom 58 26 17 22 T 21 14 111391 CASAVA_Build 6 57486724 29D GCTGGGCAAC AGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAA/----------------------------- AATTGTTATT 2145 het 2145 ref 33 24 5 26 AGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 1 0 111392 CASAVA_Build 6 57490557 1D CATATTTTTT A/- AAAATCATAG 3070 het 3070 ref 72 38 25 9 A 5 4 111393 CASAVA_Build 6 57493810 6I ACCCGTATGG ------/TCCTGA TTTCCATGGA 3070 het 3070 hom 78 36 37 5 TCCTGA 0 1 111394 CASAVA_Build 6 57493875 1D AAAATAGATC A/- TTATACTGCA 3070 het 3070 ref 80 46 15 21 A 1 0 111395 CASAVA_Build 6 57494083 1D TTAGCTGGAG A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 89 60 18 12 A 8 7 111396 CASAVA_Build 6 57494272 5D GTGGATAGGG TTTGT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 98 22 38 40 TTTGT 1 0 111397 CASAVA_Build 6 57495392 4D CAAAATATCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 63 40 20 11 TTTA 3 2 111398 CASAVA_Build 6 57497221 1D AGAGGGAAAA G/- TTCCTCAGGT 3070 het 3070 ref 102 66 29 8 G 1 0 111399 CASAVA_Build 6 57497586 18D GTCTCAAATT TAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 24 8 7 TAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 111400 CASAVA_Build 6 57498030 1D TACTTTTTAG A/- AATTTTCTTG 3070 het 3070 ref 73 46 14 14 A 3 2 111401 CASAVA_Build 6 57498067 7D CTGCCCCTCC ATCTGTT/------- ATGTGATAAG 3070 het 3070 ref 77 59 9 14 ATCTGTT 1 0 111402 CASAVA_Build 6 57498444 3I CAAGATCACC ---/CCT TCCCCTTGTG 3070 het 3070 ref 103 59 32 14 CCT 0 1 111403 CASAVA_Build 6 57498837 4D GTGGTGTTTT TTTA/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 97 51 36 24 TTTA 1 0 111404 CASAVA_Build 6 57499493 1I TTCTATATTG -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 ref 91 63 19 9 A 6 7 111405 CASAVA_Build 6 57501297 1I AGATGATTTT -/A TAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 102 60 38 4 A 0 1 111406 CASAVA_Build 6 57504267 20D CATGCCATCT GTAATCCTAGCACTTTGAGA/-------------------- GGCCAAGGTG 3070 het 3070 ref 71 56 12 10 GTAATCCTAGCACTTTGAGA 1 0 111407 CASAVA_Build 6 57504533 1D11M1I TCAAAAAAAT AAAAAAAAGAAG-/-AAAAAAAGAAGA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 63 32 27 12 N/A 0 0 111408 CASAVA_Build 6 57505826 1I TAATTAAATT -/A AAAAAACAGG 3070 het 3070 hom 85 25 54 6 A 6 7 111409 CASAVA_Build 6 57505988 1D TATGGTGTTT G/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 98 69 18 12 G 1 0 111410 CASAVA_Build 6 57506146 1I GCCTTGCGGG -/A AAAATCACCA 3070 het 3070 ref 100 52 29 19 A 4 5 111411 CASAVA_Build 6 57506345 1I AAACGGTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 80 45 25 10 T 9 10 111412 CASAVA_Build 6 57506666 1D AGAAACTTTT G/- GTTTTTTTTT 1150 het 1150 ref 67 28 14 27 G 2 1 111413 CASAVA_Build 6 57507593 1I TTTGGAGTTA -/G GGGGTTCAAC 3070 het 3070 ref 95 66 14 15 G 4 5 111414 CASAVA_Build 6 57507817 1D TTTTATATTT C/- TTTTAAAGGT 3070 het 3070 ref 85 54 26 5 C 1 0 111415 CASAVA_Build 6 57508563 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 57 23 27 8 A 13 12 111416 CASAVA_Build 6 57509982 1I CTTTGTTAAT -/G TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 79 53 22 6 G 0 1 111417 CASAVA_Build 6 57511074 4D ATCAGTAGTC TTTT/---- TTTTAACTTG 3070 het 3070 ref 78 45 24 10 T 8 4 111418 CASAVA_Build 6 57511135 1I56M2I CAATGCAAAC -TTTTTTCAAAAATTCTTATAAAAGAAAATAAATAATTTTTTAGTTTTCTAGATAAC--/TTTTTTTCAAAAATTCTTATAAAAGAAAATAAATAATTTTTTAGTTTTCTAGATAACAT ATAGTCTATA 3070 het 3070 hom 54 45 39 22 N/A 0 0 111419 CASAVA_Build 6 57512330 1I AAGAAACACG -/A AAAAGCAGCT 3070 het 3070 ref 96 57 23 17 A 4 5 111420 CASAVA_Build 6 57513580 4D CTTGGCATAG ATCA/---- TTCAGCCGAT 3070 het 3070 ref 96 74 16 9 ATCA 1 0 111421 CASAVA_Build 6 57513859 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 2648 hom 19 9 9 1 T 8 7 111422 CASAVA_Build 6 57514614 1I AAAAGGAAAG -/T TATTATTAAG 3070 het 3070 ref 101 66 29 7 T 1 2 111423 CASAVA_Build 6 57514948 1D CAGACTTTTT G/- TAATTTACCT 3070 het 3070 ref 87 55 24 9 G 1 0 111424 CASAVA_Build 6 57515508 5D36M1I TTTATTTATT TTTTATTTTATTTTAAAAATTTCAACTTTTATTTTAGATAT-/-----TTTTATTTTTAAAATTTCAACTTTTATTTTAGATATA GGGGGTACAT 3070 het 3070 hom 63 18 59 13 N/A 0 0 111425 CASAVA_Build 6 57518416 3I TCTAATCTTT ---/GTC CTTATTATTT 3070 hom 13 het 52 2 46 4 GTC 0 1 111426 CASAVA_Build 6 57518961 1D86M1D22M3D AAATGAGATT AAAAAAATAAAATGACATTTTATTCAACATTTTAAAAGGTGGGTCAAATTTTTGTTGCTAATATATGTGGTACTTTTAGGGGAAAATGACAATAAAATATGTATCTTCTTAAA/-AAAAAATAAAATGACATTTTATTCAACATTTTAAAAGGTGGGTCAAATTTTTGTTGCTAATATATGTGGTACTCTTAGGGGAAAAT-ACAATAAAATATGTATCTTCTT--- AAGATGCCAG 3070 het 3070 ref 86 132 40 18 N/A 0 0 111427 CASAVA_Build 6 57519332 1D GTTTTTACTT A/- AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 85 46 29 12 A 7 6 111428 CASAVA_Build 6 57519400 1I TATTTTATTT -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 76 41 22 13 A 6 7 111429 CASAVA_Build 6 57519947 3I AACAATATAG ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 98 56 30 15 A 9 12 111430 CASAVA_Build 6 57520989 2I GGTTGAGACA --/TT TTTTTTAAGC 3070 het 3070 ref 102 61 26 15 T 6 8 111431 CASAVA_Build 6 57521572 4I CAAAGGAAAG ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 91 58 14 19 AT 6 8 111432 CASAVA_Build 6 57521789 2D TCATGAAGTC TT/-- TGTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 104 54 28 27 T 3 1 111433 CASAVA_Build 6 57521813 1I AAATTTCCAA -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 103 43 17 43 T 6 7 111434 CASAVA_Build 6 57523309 1I ATTTGTAGGG -/A AAGAATGTGT 3070 het 3070 hom 83 29 31 23 A 2 3 111435 CASAVA_Build 6 57523363 1I CAAATGGACT -/A AAAAATAATG 3070 het 3070 ref 94 41 36 17 A 5 6 111436 CASAVA_Build 6 57523873 1I TTATTTAAGC -/T TTAGAAATTC 3070 het 3070 hom 99 26 61 13 T 2 3 111437 CASAVA_Build 6 57524798 1I AGCAATGGGG -/A AAAGGACTGC 3070 het 3070 ref 77 40 22 15 A 3 4 111438 CASAVA_Build 6 57525041 10D AAAGCAAATA TTGGCAAATG/---------- GGATCTAATT 3070 het 3070 ref 87 71 13 9 TTGGCAAATG 1 0 111439 CASAVA_Build 6 57525207 1I AAAGAAAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 88 55 23 10 A 8 9 111440 CASAVA_Build 6 57525692 7I3M3I CACATATACC -------ATG---/ACATTTTATGGCT GAATACTCTT 3070 het 3070 ref 82 62 14 9 N/A 0 0 111441 CASAVA_Build 6 57526045 1D CTTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 87 1 67 20 A 13 12 111442 CASAVA_Build 6 57526935 4I ATCTTTCTTA ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 97 58 23 16 AT 5 7 111443 CASAVA_Build 6 57527051 1D GCTCTTTTCA G/- GGGTTCAATT 3070 het 3070 hom 78 19 53 8 G 4 3 111444 CASAVA_Build 6 57527260 8I AAATTAGCTG --------/GTGATACA GGTGTGGTGA 3070 het 3070 ref 88 49 29 10 GTGATACA 0 1 111445 CASAVA_Build 6 57527401 1I CATCTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1728 hom 93 12 43 38 A 14 15 111446 CASAVA_Build 6 57527741 1D TCAGGTCAAG A/- TTCCATCTGA 3070 het 3070 ref 97 61 23 13 A 1 0 111447 CASAVA_Build 6 57529832 2D GTTCCCTCAC CT/-- CTCTCAGCCT 3070 het 3070 ref 56 37 15 5 CT 3 2 111448 CASAVA_Build 6 57530026 1I CTTGAAAAAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 101 37 55 9 T 8 9 111449 CASAVA_Build 6 57537485 1D GAATATCTGA T/- TTTTGGGAAT 3070 hom 269 het 104 0 90 14 T 5 4 111450 CASAVA_Build 6 57538833 17D GTTTCCTTTC TTTTTTTTACCTTTTTA/----------------- CTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 73 60 16 12 TTTTTTTTACCTTTTTA 1 0 111451 CASAVA_Build 6 57539382 1D32M3I23M3I ATTAAAACAC ACTGACATTAAAACACACTGATATGTGTTTTCG---CTTTTATATACTTTTTCTCAATG---/-CTGACATTAAAACACACTGATATGTGTTTTAGCTACTTTTATATACTTTTTCTCAATGATC ATCATAATAG 3070 het 3070 ref 94 74 28 38 N/A 0 0 111452 CASAVA_Build 6 57539572 4I TTTTCCATAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 100 74 17 9 TTTA 3 4 111453 CASAVA_Build 6 57539634 2D GTTTCAGACT AA/-- GTCATATGCC 3070 het 3070 ref 93 75 12 6 A 2 0 111454 CASAVA_Build 6 57540364 2I58M8I TTTGTTTTTG --TTTTTTTCAGCCCATTAACTTGAAGAAATGAGCCAGTTCTATATGTTTCACATTTTGG--------/TTTTTTTTTCAGCCCATTAACTTGAAGAAATGAGCCAGTTCTATATGTTTCACATTTTGGGTTTATTT GTTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 83 65 12 54 N/A 0 0 111455 CASAVA_Build 6 57540619 10D TGAAGTCTCT GTTTTGTTAA/---------- GTTCTTCAAC 3070 het 3070 ref 95 77 20 6 GTTTTGTTAA 1 0 111456 CASAVA_Build 6 57543201 2I CTCTCTGGGC --/CT CTGTTTTCCC 3070 het 3070 hom 93 31 50 12 CT 1 2 111457 CASAVA_Build 6 57543552 2I ATAGGCACTC --/TG TAAGTTGTAG 3070 het 3070 hom 97 38 41 18 TG 0 1 111458 CASAVA_Build 6 57543767 4D AAAATTAAGT AAAC/---- AATATTGATT 3070 het 3070 ref 97 66 25 14 AAAC 1 0 111459 CASAVA_Build 6 57544306 2D GGATTACAGG CT/-- TGAGCCACCA 3070 het 3070 hom 43 18 21 6 CT 1 0 111460 CASAVA_Build 6 57544875 5I AAAGGATGGA -----/TTCTT TTCTTTTCTG 3070 het 3070 ref 100 41 33 26 TTCTT 1 2 111461 CASAVA_Build 6 57545738 1I GTCAGGAGTT -/C AAGACCAGCC 3070 het 3070 ref 40 14 12 14 C 0 1 111462 CASAVA_Build 6 57545757 2I CTGGCCAACA --/GG TGGTGAGACC 1434 het 1434 ref 28 16 4 8 G 0 2 111463 CASAVA_Build 6 57545983 3D AAAAAAACAC AAT/--- AACAGTGAAT 3070 het 3070 ref 75 52 16 10 AAT 1 0 111464 CASAVA_Build 6 57547707 3D ATCCTCAGCT TTC/--- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 78 45 24 12 TTC 1 0 111465 CASAVA_Build 6 57548758 1I TGAACAACTC -/A ACGATCAGAA 3070 het 3070 ref 104 70 22 12 A 1 2 111466 CASAVA_Build 6 57548842 1D AATTTGCAAG T/- TGGCAACTTT 3070 het 3070 hom 97 37 56 5 T 2 1 111467 CASAVA_Build 6 57549942 3I ATTTACTCTT ---/GAG GGGTGATAAT 3070 het 3070 hom 93 35 48 10 GAG 0 1 111468 CASAVA_Build 6 57549999 1I AATTAATCTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 86 42 23 24 T 7 8 111469 CASAVA_Build 6 57550422 22I2M4I AACTGTTGTT ----------------------TT----/GGGAAAACATGTTCCCAACATGTTGGGA AGGCATGTTC 3070 het 3070 ref 71 50 16 9 N/A 0 0 111470 CASAVA_Build 6 57551053 1D9M1D36M2I TTAATGTTGC AAAATTTCAAGGAAAAAAAAACACTAAGACATCTTAAAATTCCCCTC--/-AAATTGCAA-GAAAAAAAAACACTAAGACATCTGAAAATTCCCCTCTT ATCTGTTTTA 3070 het 3070 hom 62 13 21 49 N/A 0 0 111471 CASAVA_Build 6 57551367 7D ACTAGATTCT GAATATA/------- GCCTCTGCTG 3070 het 3070 ref 84 44 36 10 GAATATA 1 0 111472 CASAVA_Build 6 57551693 9D GGTATATAAA TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 2923 hom 40 15 13 15 T 20 11 111473 CASAVA_Build 6 57552032 1D AGATTAATGG A/- AAAGTTACAA 3070 het 3070 ref 71 48 18 6 A 4 3 111474 CASAVA_Build 6 57553102 1D CTTGATACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 69 10 25 34 T 12 11 111475 CASAVA_Build 6 57553582 1D AAAGATCTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 95 33 54 10 T 9 8 111476 CASAVA_Build 6 57554054 19D AGACTTTGCC AGGTGCAGTGGCTCATGCT/------------------- TGTAATCTCA 3070 het 3070 ref 78 63 17 10 AGGTGCAGTGGCTCATGCT 1 0 111477 CASAVA_Build 6 57554900 1D ACTATGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 76 36 25 16 A 10 9 111478 CASAVA_Build 6 57558305 5I GTTACCCTGG -----/TTTTT TTTGTTTTTG 3070 het 3070 hom 82 22 34 26 T 3 8 111479 CASAVA_Build 6 57558413 5I TATCTGACTG -----/AATAT AATAGATATA 3070 het 3070 hom 68 20 45 17 AATAT 0 1 111480 CASAVA_Build 6 57560347 5I3M1D ACTGGAGGGA -----TAAC/GTGGGTGA- TTGTTTTAGA 3070 het 3070 ref 104 42 50 16 N/A 0 0 111481 CASAVA_Build 6 57561617 1D ATTCTTTATG A/- AGGGGAATAT 3070 het 3070 ref 102 63 22 19 A 2 1 111482 CASAVA_Build 6 57561908 1I CCTGGGCAAC -/A AGAGTGAGAC 3070 het 3070 ref 37 15 11 15 A 1 2 111483 CASAVA_Build 6 57563810 4I CTCAGTAGTT ----/TGAC TGAGATTTGA 3070 het 3070 hom 101 31 61 9 TGAC 0 1 111484 CASAVA_Build 6 57566898 1D TTAGCTGGGC G/- TGGTGGAGGG 3070 het 3070 ref 52 26 19 8 G 1 0 111485 CASAVA_Build 6 57567047 6D AAAAAAAAAA AAAAAG/------ AAAATAGGAG 2110 het 2003 hom 38 14 10 20 AAAAAG 1 0 111486 CASAVA_Build 6 57567075 1D ATATTTAGTC T/- TGTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 26 11 12 T 2 1 111487 CASAVA_Build 6 57567559 1I TTCCTACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 57 0 31 26 T 11 12 111488 CASAVA_Build 6 57568004 4I GAGATGACAA ----/TTTG TTTGGCAAAT 3070 het 3070 hom 88 26 51 11 TTTG 1 2 111489 CASAVA_Build 6 57569168 8D TTATTCAATT ATGGAATA/-------- ATTAAAAGAA 3070 het 3070 ref 93 68 25 10 ATGGAATA 1 0 111490 CASAVA_Build 6 57569932 1I TTATAAAGGA -/T TGTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 99 52 25 22 T 1 2 111491 CASAVA_Build 6 57572019 1D AGCAAGCCAA G/- GGCAACTCTG 3070 het 3070 ref 91 61 20 17 G 3 2 111492 CASAVA_Build 6 57572280 9I GCAGTAAAAA ---------/CTATAAGCT CTTTATAGCC 3070 het 3070 hom 91 26 56 10 CTATAAGCT 0 1 111493 CASAVA_Build 6 57572541 2D TAAACAAACA TG/-- TATTTTTTTC 3070 het 3070 ref 104 68 22 17 TG 1 0 111494 CASAVA_Build 6 57573698 1D21M1I GCATTAGGAA GGCTATCAACCCATTATTCTGC-/-GCTATCAACCCATTATTCTGCT TCCATTAAAT 3070 het 3070 ref 96 60 37 20 N/A 0 0 111495 CASAVA_Build 6 57574277 15D AGAGGAAGGG ATTATTATTATTATT/--------------- ATTATTATTA 3070 het 338 hom 41 4 26 13 ATT 13 8 111496 CASAVA_Build 6 57574478 1D TAATATTTAA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 58 38 15 5 T 7 6 111497 CASAVA_Build 6 57574619 1D25M1I TAACTATTTT AATAGGCATTTAGGAAGTAGAATGGG-/-ATAGGCATTTAGGAAGTAGAATGGGT TAGATATGGG 3070 het 3070 ref 84 62 38 10 N/A 0 0 111498 CASAVA_Build 6 57574796 1I GTATAGGTAA -/C ATTAGCTGTC 3070 het 3070 ref 99 37 48 14 C 0 1 111499 CASAVA_Build 6 57576007 2I TAGACATAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 23 13 14 T 12 14 111500 CASAVA_Build 6 57578222 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 71 34 20 17 A 7 8 111501 CASAVA_Build 6 57579125 1I TTGTTGAGGA -/T TTTTGATTCT 3070 het 3070 hom 73 33 36 6 T 4 5 111502 CASAVA_Build 6 57579249 1D GAGTCCCCCC T/- CCTCAGTTTT 3070 het 3070 ref 63 45 14 10 T 1 0 111503 CASAVA_Build 6 57579360 1D GGTTGTTAGG T/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 76 32 35 11 T 7 6 111504 CASAVA_Build 6 57579623 1D ATTTTCTAGA T/- TTTTGTCCTA 3070 het 3070 hom 84 32 47 6 T 5 4 111505 CASAVA_Build 6 57579970 1D AGAAGATTGT A/- TAAAGTTTTA 3070 het 3070 ref 103 73 22 11 A 1 0 111506 CASAVA_Build 6 57580304 1I TGCTGGCTTA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 103 58 31 16 T 6 7 111507 CASAVA_Build 6 57581960 1D TTTTTTTTTT C/- CCCTGAACTC 3070 het 3070 ref 99 52 32 16 C 4 3 111508 CASAVA_Build 6 57582043 1D AAGCTGTTTT A/- TGAAAATGTA 3070 het 3070 hom 88 36 45 10 A 1 0 111509 CASAVA_Build 6 57582240 1I TTTCATGGAG -/A GAACTAAGAA 3070 het 3070 hom 103 41 51 11 A 0 1 111510 CASAVA_Build 6 57582575 11D CAGAGGTGGA AGAATCACCTG/----------- AGCCCAAGAA 3070 het 3070 ref 88 61 25 8 AGAATCACCTG 1 0 111511 CASAVA_Build 6 57582669 6D54M5D CTGTCTCAAG AAAAAAAAAAAAAAAAAGTGCCAGTAAAGGGGATGCTAGAGTGGTATTAGCTTAAGCATCATAGG/------AAAAAAAAAAAGTGCCAGTAAAGGGGATGCTATAGTGGTATTAGCTTAAGCATC----- ATTGTTCATT 3070 het 3070 ref 90 110 16 42 N/A 0 0 111512 CASAVA_Build 6 57584021 1D AGGAAATAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 271 hom 62 5 24 33 T 10 9 111513 CASAVA_Build 6 57584458 1D AACCTTAATA G/- TGTTACAAAA 3070 het 3070 ref 97 77 18 2 G 1 0 111514 CASAVA_Build 6 57584772 1I GAAAGTCAGG -/A AGGATATAGA 3070 het 3070 hom 87 37 44 6 A 1 2 111515 CASAVA_Build 6 57585629 1I TGTGAAACTT -/A ACAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 103 62 24 17 A 1 2 111516 CASAVA_Build 6 57586118 4D AAAAGGAGTG TGAA/---- TGGCAATCAT 2610 het 2610 ref 62 34 15 14 TGAA 1 0 111517 CASAVA_Build 6 57586802 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAAAA 1465 het 262 hom 9 1 7 1 A 17 18 111518 CASAVA_Build 6 57588487 2I23M1I TCTACTCTTT --CTTTATTTTTAATTAATTAATTA-/TAATTTATTTTTAATTAATTAATTAT ATTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 54 32 12 15 N/A 0 0 111519 CASAVA_Build 6 57589616 54D TATATATATA TATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/------------------------------------------------------ TGTGTGTGTG 2699 het 429 hom 6 1 7 4 TATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 1 0 111520 CASAVA_Build 6 57589844 6D CTAAAAACAC TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 3070 hom 111 het 46 0 36 15 TTTTGT 2 1 111521 CASAVA_Build 6 57590523 11D AGACCACCCT GGGCAACATAG/----------- GTAGACCCTG 3070 het 3070 ref 77 58 19 8 GGGCAACATAG 1 0 111522 CASAVA_Build 6 57593349 1D GTGAAAGCCT C/- TGGCAAGTTT 3070 het 3070 ref 69 50 10 9 C 1 0 111523 CASAVA_Build 6 57593632 1I CCTAGCCCCG -/C CCCCCACCTG 1661 het 1661 ref 49 37 6 9 C 5 6 111524 CASAVA_Build 6 57594253 1I GATATAACTG -/A AAAAGGAATT 3070 het 3070 ref 81 57 12 12 A 4 5 111525 CASAVA_Build 6 57595890 1D TTTGCATTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 95 51 15 41 T 10 9 111526 CASAVA_Build 6 57595941 1I TAACAGGATA -/C TACAGATCAG 3070 het 3070 hom 83 20 52 11 C 0 1 111527 CASAVA_Build 6 57596282 1I TTCCCATCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 101 67 27 7 T 9 10 111528 CASAVA_Build 6 57597018 1D CTCAGTAATA T/- TTTTATATTG 3070 het 3070 ref 90 57 22 12 T 5 4 111529 CASAVA_Build 6 57597253 1I ATGTTTGCTT -/C TGCTGTACAG 3070 het 3070 hom 103 32 63 8 C 0 1 111530 CASAVA_Build 6 57597404 2D GTTTTTAAAA CT/-- CTCTTTTTAT 3070 het 3070 ref 95 66 25 6 CT 3 2 111531 CASAVA_Build 6 57597711 4D TAAAAGTAAC TCTT/---- TGTCAAGAAG 3070 het 3070 ref 94 75 14 9 TCTT 1 0 111532 CASAVA_Build 6 57598507 2D CCCAGAGGCA TC/-- CCGGCTTCTT 3070 het 3070 ref 83 58 16 11 TC 1 0 111533 CASAVA_Build 6 57601328 2I TGTCTTACAG --/AA AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 92 33 46 13 A 6 8 111534 CASAVA_Build 6 57603272 3D TTTCAGTTTT TTC/--- TTAATACGTT 3070 het 3070 ref 96 50 40 10 TTC 1 0 111535 CASAVA_Build 6 57605050 1I ATAGATTTGC -/A AGCAGATTTT 3070 het 3070 ref 90 47 32 11 A 1 2 111536 CASAVA_Build 6 57605673 1I TAAAAATGAA -/G AAAATCTCAT 3070 het 3070 hom 60 18 35 7 G 0 1 111537 CASAVA_Build 6 57605855 2I TAAGACAATC --/AG AGAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 91 40 40 11 AG 1 2 111538 CASAVA_Build 6 57605925 1D TAATTTTTTT G/- TGTGTATCTG 3070 het 3070 ref 102 50 23 29 G 1 0 111539 CASAVA_Build 6 57609657 5I AAAAATAGTC -----/TAACT AACTTAAACC 3070 het 3070 ref 71 25 25 21 TAACT 0 1 111540 CASAVA_Build 6 57610929 2D CAAAACACAA TT/-- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 100 41 41 22 T 8 6 111541 CASAVA_Build 6 57610960 3D CAAAGAAAAA CAT/--- CAGCAATAGT 3070 het 3070 ref 98 48 12 41 CAT 1 0 111542 CASAVA_Build 6 57611221 1D TACAAAAAAA C/- CCCCTAAGTT 3070 het 3070 ref 90 51 26 14 C 5 4 111543 CASAVA_Build 6 57611404 1D AAGAGCTTCA C/- AAAATGAGTT 3070 het 3070 ref 87 55 18 17 C 1 0 111544 CASAVA_Build 6 57611534 1I ATTATCTCTG -/A AAAAAAAGGC 2899 het 2899 ref 69 54 10 5 A 7 8 111545 CASAVA_Build 6 57612082 1D GTAGATAAAT C/- CACAAAGACT 3070 het 3070 ref 85 65 16 5 C 2 1 111546 CASAVA_Build 6 57612432 1D GCCAAATTGA T/- CAAGTGGAAG 2795 het 2795 ref 52 44 6 3 T 1 0 111547 CASAVA_Build 6 57615113 1D CTGAATGGGC A/- AAAACTGGAA 3070 het 3070 ref 39 26 8 6 A 5 4 111548 CASAVA_Build 6 57615414 4D CACCACTAAT AGAC/---- AGAGACCCAA 3070 het 3070 ref 76 60 10 9 AGAC 1 0 111549 CASAVA_Build 6 57617263 3D ATACCTTAAA TAT/--- TATATCTTAA 3070 het 3070 ref 63 28 30 10 TAT 2 1 111550 CASAVA_Build 6 57617550 3D CATAGAACAA CTC/--- TTTTTATTTA 3070 het 3070 ref 81 33 21 28 CTC 1 0 111551 CASAVA_Build 6 57617654 8I10M21I2M1I CTTTAAAAAG --------ATTTTGTGCA---------------------CA-/ATGACCCTATTTTGTGCAATATATGAATTATAATTGATTCAT TTGAAGTCTA 3070 het 3070 ref 77 47 19 20 N/A 0 0 111552 CASAVA_Build 6 57618138 1I GCAAAATGCA -/T AAATTATATT 3070 het 3070 hom 85 22 51 12 T 0 1 111553 CASAVA_Build 6 57618188 15D41M6D AAATTGAATG TAATAAAAAAGTTCATAATAAAAAAGTTCATAAATGATTCCATTGTTAATAAAAATTATAAA/---------------TAATAAAAAAGTTCACAAATGATTCCATTGTTAATAAAAAT------ TATAAAACAT 3070 het 3070 ref 77 61 16 52 N/A 0 0 111554 CASAVA_Build 6 57618306 1D AAAATAAAGC A/- AAGATAAAAA 3070 het 3070 ref 87 43 29 17 A 3 2 111555 CASAVA_Build 6 57619008 2I GGTTTTTAAG --/TA TCTGACTTAC 3070 het 3070 ref 93 42 45 6 TA 0 1 111556 CASAVA_Build 6 57619777 1D TAGGCCTTTT G/- CTTGGAACTG 3070 het 3070 ref 93 63 16 15 G 1 0 111557 CASAVA_Build 6 57619854 2D TCACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 93 hom 68 3 28 39 AC 9 8 111558 CASAVA_Build 6 57620746 11I7M3D TTGCACTCTG -----------TTGTGTAATT/TCACCAAGGCTTAGTGCA--- GTGACACAAT 3070 het 3070 ref 85 43 38 7 N/A 0 0 111559 CASAVA_Build 6 57620876 1I14M2I TTTTTTTCAA -TTTTTTTTGTAGAG--/TTTTTTTTTGTAGAGGT GGGGGGTCTC 2306 het 2306 ref 39 23 10 14 N/A 0 0 111560 CASAVA_Build 6 57621003 3I GTGCCTGGCC ---/TTT TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 68 46 13 9 T 3 6 111561 CASAVA_Build 6 57623188 5D TCTTGACAAT TTTGA/----- TTTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 91 56 29 15 TTTGA 1 0 111562 CASAVA_Build 6 57623295 5I TAGCCAGTGA -----/AAAAG AAAAGATTAT 3070 het 3070 ref 91 51 34 8 AAAAG 1 2 111563 CASAVA_Build 6 57624821 3I AAGGTAGTGA ---/AAC AACACTGCTA 3070 het 3070 hom 99 34 58 7 AAC 1 2 111564 CASAVA_Build 6 57625205 6D GTTCTCTTCT TACTTC/------ TACTTCATGA 3070 het 3070 hom 98 41 51 9 TACTTC 2 1 111565 CASAVA_Build 6 57627447 4D GGTGGCACTC ACCT/---- ATAGACCCAG 3070 het 3070 ref 100 72 16 13 ACCT 1 0 111566 CASAVA_Build 6 57628095 4D23M4D TCAGAATTAT AAAGAATTTCTACTACCAGGATTTCTCCTAA/----AATTTCTACTACCAGGATTTCTC---- CTGTGTTTTG 3070 het 3070 ref 96 89 16 6 N/A 0 0 111567 CASAVA_Build 6 57628738 7I AATAAATATT -------/TAAAAAA AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 33 3 10 20 TAAAAAA 0 1 111568 CASAVA_Build 6 57628867 14D GACTACCCTC AATTTCCTTCTCTA/-------------- AATTTCCTTC 3070 het 3070 ref 77 33 27 23 AATTTCCTTCTCTA 2 1 111569 CASAVA_Build 6 57628931 1D AAAAAAAAAA T/- TTCCTCTTGC 3070 het 3070 ref 66 27 27 13 T 3 2 111570 CASAVA_Build 6 57629877 5I TTACTAATAA -----/TGTAT TGTATTTTAA 3070 het 3070 ref 93 37 24 32 TGTAT 1 2 111571 CASAVA_Build 6 57629992 5I TCCTTTTTTC -----/ATATA ATATACTTTT 3070 het 3070 ref 79 52 16 11 ATATA 1 2 111572 CASAVA_Build 6 57630554 1D CAACTTCCTT C/- CCTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 71 37 14 23 C 3 2 111573 CASAVA_Build 6 57630980 5D TTTTGTATTG TATTT/----- TAACTATTAT 3070 het 3070 ref 53 29 19 7 TATTT 1 0 111574 CASAVA_Build 6 57631576 6D TAAGCAATAC ATTATT/------ ATTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 98 59 35 5 ATT 3 1 111575 CASAVA_Build 6 57631847 4D ACATTAATAG ATAA/---- ATAGTTTAAA 3070 het 3070 ref 82 44 31 11 ATAA 1 0 111576 CASAVA_Build 6 57632615 1I TTCTCACAAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 95 43 37 15 T 7 8 111577 CASAVA_Build 6 57632750 3D45M2I GTAATACATC TTTTGTTTCACACTGCTTTTATGTTGTTCTCTTTGTCTTTAGTTTTCA--/---TGTTTCGCACTGCTTTTATGTTGTTCTCTTTGTCTTTAGTTTTCAGT AGTTTATTAT 3070 het 3070 ref 88 72 32 30 N/A 0 0 111578 CASAVA_Build 6 57633709 1I TGATTTTTTT -/C TGATGGGCTT 3070 het 3070 ref 92 63 20 9 C 0 1 111579 CASAVA_Build 6 57637699 2I17M6D ACATATATAT --TTATATATGTATACACATATATG/ACACAGACATATATACACA------ TATATATACA 1966 het 1398 hom 14 3 10 4 N/A 0 0 111580 CASAVA_Build 6 57637956 6D TATACATGTG TGTATA/------ TGTGTATACA 733 het 733 ref 33 9 4 21 TGTATA 1 0 111581 CASAVA_Build 6 57638588 4D CATGTGTATT ATAC/---- ATACATATAT 3070 het 3070 hom 66 15 45 7 ATAC 2 1 111582 CASAVA_Build 6 57638795 5I GGACAGCAGT -----/GAAGA GAAATCTTCC 3070 het 3070 ref 63 30 26 8 GAAGA 0 1 111583 CASAVA_Build 6 57639945 3I ACCAGGAGGC ---/ACA ACAACAATTC 3070 het 3070 ref 65 35 24 6 ACA 2 3 111584 CASAVA_Build 6 57644308 4I CAACATAGTG ----/AAAC GCCATCTCTA 3070 het 3070 hom 61 20 40 4 AAAC 0 1 111585 CASAVA_Build 6 57644473 2D CAGAGTGATA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 42 28 13 3 CT 2 1 111586 CASAVA_Build 6 57645187 3D TGTAAATGAA AAC/--- AATTTTATTG 3070 het 3070 ref 85 66 13 10 AAC 1 0 111587 CASAVA_Build 6 57645294 6D GGACCAAAAA TATATT/------ TATATATCAC 3070 het 3070 ref 96 57 31 13 TATATT 1 0 111588 CASAVA_Build 6 57645393 4I TCCTCTGGTT ----/AAAA AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 78 27 43 8 A 3 7 111589 CASAVA_Build 6 57645522 3D ATGTACAGAC TGT/--- TGTTTCTAAA 3070 het 3070 ref 93 45 31 19 TGT 2 1 111590 CASAVA_Build 6 57645572 5D ATTTGTAAGT GTAAG/----- GTGTTTGCCT 3070 het 3070 ref 82 51 22 15 GTAAG 1 0 111591 CASAVA_Build 6 57646610 2D7M6D TCACCAGTGG GCTATTGAATTATTG/--TATTGAA------ TTATTGTTAT 3070 het 3070 ref 92 48 28 34 N/A 0 0 111592 CASAVA_Build 6 57647420 1D CTTCAGGAAA T/- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 94 36 50 8 T 7 6 111593 CASAVA_Build 6 57647937 1I32M1D GCTGGGATTA -TAGGTGTGAACCACTGTGCCCAGCGCTTTTCAC/TTAGGTGTGAGCCACTGTGCCCAGCACTTTTCA- TGTCTTACCC 3070 het 3070 ref 51 42 11 23 N/A 0 0 111594 CASAVA_Build 6 57647987 1D CCCCCACCTC T/- TTAATCCTAG 3070 het 3070 ref 77 37 19 24 T 3 2 111595 CASAVA_Build 6 57648832 10D GGATTTAATA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 97 25 52 33 TG 13 8 111596 CASAVA_Build 6 57649167 1I ATCCAGTAGG -/A AAAAAGCCTA 3070 het 3070 ref 96 53 31 16 A 5 6 111597 CASAVA_Build 6 57649854 1D GGTTAAAAAA T/- ATCTTAAAAT 3070 het 3070 ref 67 53 8 6 T 1 0 111598 CASAVA_Build 6 57650005 4I GAATGAAAAA ----/CTCT CTCAAGTGTA 3070 het 3070 hom 70 23 42 6 CT 1 3 111599 CASAVA_Build 6 57650068 1D TCTTTCTTTT C/- TTTTTTTTTT 1677 het 1677 ref 48 20 6 25 C 1 0 111600 CASAVA_Build 6 57650421 1D CCCCCTTTCA T/- TTCTCAACAG 3070 het 3070 ref 102 70 24 17 T 3 2 111601 CASAVA_Build 6 57650491 1D TTGTAGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 95 3 49 43 A 11 10 111602 CASAVA_Build 6 57650890 1D AGACCTGTAA G/- ATAATAAATG 3070 het 3070 ref 104 67 25 13 G 1 0 111603 CASAVA_Build 6 57651085 1D ACCTCTACAT C/- CTGCTCCAGT 1710 het 1710 ref 46 39 4 4 C 2 1 111604 CASAVA_Build 6 57651354 6D10M1I CTAAAAGAAA AAGAATAAGAAGGAAT-/------AAGAAGGAATA AAAAAAGCCT 3070 het 3070 ref 91 66 21 12 N/A 0 0 111605 CASAVA_Build 6 57651438 3I GAATTAAAGA ---/AGG AGAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 79 25 46 8 AGG 0 1 111606 CASAVA_Build 6 57651996 4D TAAAGCTAGC AACA/---- AACAGACTTC 3070 het 3070 hom 80 27 45 11 AACA 2 1 111607 CASAVA_Build 6 57652445 3I AAAAGAGAGC ---/AGG AGTAGTTATA 3070 het 3070 hom 92 35 50 7 AGG 0 1 111608 CASAVA_Build 6 57652620 4D ATAGATCTGA AGGG/---- AGAGAGAGAT 3070 het 3070 ref 76 52 23 4 AGGG 1 0 111609 CASAVA_Build 6 57653025 1D10M2I AAGGGAAATT AAAAAAACATC--/-AAAAAACATCTT GAGATAAGTG 3070 het 3070 hom 85 41 48 9 N/A 0 0 111610 CASAVA_Build 6 57653399 4I ATATCTTGCT ----/TTTA TTGTTATTTT 3070 het 3070 hom 96 36 48 29 TTTA 0 1 111611 CASAVA_Build 6 57653828 1D CAAGATTAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 91 34 24 33 A 9 8 111612 CASAVA_Build 6 57655520 1D GAGACCCCAT C/- CAAAGGTCAC 3070 het 3070 ref 87 60 21 6 C 2 1 111613 CASAVA_Build 6 57656128 3D TCCAGGAGAA GGG/--- CTTCCCCAAC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 3 0 111614 CASAVA_Build 6 57657438 2I ACATGGAAAC --/TG AACAACCTGC 1308 het 1308 ref 43 37 3 3 TG 0 1 111615 CASAVA_Build 6 57657773 1D GAACTAGGAG C/- TGGTTTTTTG 3070 het 3070 hom 54 25 20 9 C 1 0 111616 CASAVA_Build 6 57657840 7I16M1D AGAGAGAAGA -------ATCAAATAGATGCAATA/ATCAAATATCAAATAGATGCAAT- AAAAAAAGAT 2620 het 2620 ref 51 32 6 20 N/A 0 0 111617 CASAVA_Build 6 57657906 1I AATACAAGGT -/A ACCATCAGAG 2928 het 2928 ref 47 28 7 12 A 1 2 111618 CASAVA_Build 6 57660322 3I CCCATCAATG ---/TTA TACTGGATAA 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 TTA 0 1 111619 CASAVA_Build 6 57661299 1I AAGGAAAAAG -/A AAAAAAATCC 3070 het 774 hom 85 9 30 46 A 7 8 111620 CASAVA_Build 6 57661409 1D GTGAAATAAA T/- TGATGAATAC 3070 het 3070 ref 98 70 23 7 T 2 1 111621 CASAVA_Build 6 57661500 2D AGTGACCTAC AG/-- AGTCAATGCA 3070 het 3070 ref 92 45 22 34 AG 2 1 111622 CASAVA_Build 6 57661524 4D TTCTATCACA ATTC/---- CAATAACATT 3070 het 3070 ref 95 52 24 23 ATTC 1 0 111623 CASAVA_Build 6 57662358 1I GCTGCAGGCA -/T TTTCTTGTAT 3070 het 3070 hom 63 22 29 12 T 3 4 111624 CASAVA_Build 6 57662938 2I TGCTATGGGT --/AC AGTTTCTCCC 3070 het 3070 ref 92 41 44 8 AC 0 1 111625 CASAVA_Build 6 57663175 2D TACAGAAAAC AT/-- GGCTGGGAAG 3070 het 3070 ref 99 67 21 12 AT 1 0 111626 CASAVA_Build 6 57665054 1D ATTTACAAAG T/- AAAGAGGTTT 3070 het 3070 ref 71 51 16 5 T 1 0 111627 CASAVA_Build 6 57665398 1I GTATGCTCCA -/C CCCCCAGGTA 3070 het 3070 ref 92 67 15 10 C 5 6 111628 CASAVA_Build 6 57666017 1D TATGACAAAG T/- TCTAATATCC 3070 het 3070 ref 84 48 30 15 T 2 1 111629 CASAVA_Build 6 57666259 2D TGAAAAAACA AC/-- AGATTCTGGG 3070 het 3070 ref 86 64 15 8 AC 1 0 111630 CASAVA_Build 6 57666491 4D TGGATTGGAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 85 20 42 26 A 14 10 111631 CASAVA_Build 6 57667012 4I GTCTTGGTGA ----/TGTT TTTTTTTTTT 596 het 596 ref 56 21 4 31 TGTT 0 1 111632 CASAVA_Build 6 57667076 1D TGGCATTACA T/- CAAACTAAAA 3070 het 3070 ref 65 41 18 11 T 1 0 111633 CASAVA_Build 6 57667466 3D AGTTAGAGTC ATT/--- ATGAAAAACA 3070 het 3070 ref 102 72 22 12 ATT 1 0 111634 CASAVA_Build 6 57667672 2I TGAATGGATT --/TA AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 84 32 36 16 TA 0 1 111635 CASAVA_Build 6 57667881 1D GGTGGTTACC A/- GGGGCTGGGG 3070 het 3070 ref 70 43 10 21 A 1 0 111636 CASAVA_Build 6 57668076 1I54M1D AATGCATATG -TATATTTATTTACCCTATGAGATATACACATTTCAGAACCTCACATTGAACACAC/TTATATTTATTTACCCTATGACATATACACATTTCAGAACCTTAGATTGAACACA- AATATATGCA 3070 het 3070 ref 64 44 24 15 N/A 0 0 111637 CASAVA_Build 6 57668318 1D TAAATAGCTG A/- AAAAATCTCC 3070 het 3070 hom 71 17 44 11 A 6 5 111638 CASAVA_Build 6 57668412 5D TATGTTTAAA TATAT/----- TATATATCAT 3070 het 3070 ref 76 47 21 12 TATAT 2 1 111639 CASAVA_Build 6 57668677 4D54M1D CATTAACTAT ATTCTTTTTTATATAGTAAATGAGAAATATTTATTTACATAGTAAATAAAGAATATAAT/----TTTTTTATATAGTAAATGAGAAATATTTATTTACATAGTAAATAAAGAATATAA- TTTTTATAAC 3070 het 3070 ref 70 73 19 27 N/A 0 0 111640 CASAVA_Build 6 57668872 1D TGTTGAAGAC A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 78 23 48 7 A 7 6 111641 CASAVA_Build 6 57668984 5D TATCAATGCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2387 hom 65 22 16 27 T 21 16 111642 CASAVA_Build 6 57669103 1D GAGATGAAAG T/- CCCCTTATAC 3070 het 3070 ref 55 33 14 9 T 1 0 111643 CASAVA_Build 6 57669784 4D TGAGCAGAGA AGGG/---- AGTGACAAGA 3070 het 3070 ref 89 51 18 22 AGGG 1 0 111644 CASAVA_Build 6 57670050 2I TCTTTTCATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2126 hom 77 15 17 45 A 16 18 111645 CASAVA_Build 6 57670188 1D27M1D TTTGTTGCTT GGGTAAAATAAGGCACTGAAGCTTCCACG/-GGTAAAATAAGGCACTGAAACTTCCGC- TTTTTCCTGT 3070 het 3070 ref 101 52 35 33 N/A 0 0 111646 CASAVA_Build 6 57671871 4D TCTTCCTTCC TTCT/---- TTCTTCCTTC 1196 het 1196 ref 58 25 15 18 TTCT 2 1 111647 CASAVA_Build 6 57671902 11D TTCTTATTTT TTATTTATTTA/----------- TTTTTTTTTT 1242 het 1242 ref 30 18 3 11 TTATTTATTTA 1 0 111648 CASAVA_Build 6 57672425 2I TTAAAATTCA --/AT GACTTTCAAG 3070 het 3070 ref 104 31 12 61 AT 0 1 111649 CASAVA_Build 6 57672600 1I27M1D13M1D GTGTTGAGGG -ACTGTTTATCTGGTTATCCTCAATTTTGGGGGGAATGGAGTC/AACTGTTTATCTGGTTATCCTCAATTTT-GGGGGAATGGAGT- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 79 45 40 44 N/A 0 0 111650 CASAVA_Build 6 57673331 3I AATCTGGACC ---/CTA CTACTAGTCA 3070 het 3070 ref 99 61 18 20 CTA 2 3 111651 CASAVA_Build 6 57673395 2D TAAGAAGATG TT/-- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 104 39 33 32 T 9 7 111652 CASAVA_Build 6 57673766 1D GAGCCTTTTC T/- TTTCTTTTTT 244 het 244 ref 38 22 2 14 T 4 3 111653 CASAVA_Build 6 57674055 1D GTTCCGCCCA C/- CTCAGCCTCC 3070 het 3070 hom 50 22 24 5 C 2 1 111654 CASAVA_Build 6 57674342 1D GTTCGAGTCA G/- GGGGGAGAGT 3070 het 3070 ref 80 49 24 20 G 6 5 111655 CASAVA_Build 6 57675331 3D TTAGAGATTG GAA/--- GAGAAGCAAG 3070 het 3070 ref 103 70 23 14 GAA 1 0 111656 CASAVA_Build 6 57675687 1I ATTGTCAGAC -/A CGGGGTGCAG 3041 het 3041 ref 45 36 8 1 A 0 1 111657 CASAVA_Build 6 57677096 1D AAAACACTCT G/- CAGGATATTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 1 0 111658 CASAVA_Build 6 57681666 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 28 1 15 12 A 10 11 111659 CASAVA_Build 6 57681706 2D TTACACACTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 55 28 19 9 A 11 9 111660 CASAVA_Build 6 57683481 1D AAAGCCTATA G/- GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 89 62 20 11 G 2 1 111661 CASAVA_Build 6 57683680 1I GTAAAAATCT -/A TCAATTTGAT 3070 het 3070 ref 89 39 39 12 A 0 1 111662 CASAVA_Build 6 57684356 1D TTAATATGGG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 62 32 24 16 T 8 7 111663 CASAVA_Build 6 57684591 3I45M1I GTCCATTTTG ---TGTTGTAACAGAATACTACAGACTGGGTAATTTACAAAGAACAGA-/TGTTGTTGTAACAGAATACTACAGACTGGGTAATTTACAAAGAACATAT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 68 49 37 14 N/A 0 0 111664 CASAVA_Build 6 57684885 2D ATCACATCTT AA/-- AGTTTCCTCC 3070 het 3070 ref 66 35 25 7 A 3 1 111665 CASAVA_Build 6 57685626 5D ATGCCTGATA ATTTT/----- ATTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 72 38 30 9 ATTTT 2 1 111666 CASAVA_Build 6 57685888 11I TTCTCATCAT -----------/TTAGCTCCCAC TTATAAGTCA 3070 het 3070 ref 65 43 16 6 TTAGCTCCCAC 0 1 111667 CASAVA_Build 6 57685963 1I TCCAGCTCCA -/T CCATGTCCCT 3070 het 3070 ref 60 36 19 5 T 0 1 111668 CASAVA_Build 6 57686529 1I ATTCCTTATT -/A AATCCTGGAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 A 2 3 111669 CASAVA_Build 6 57687158 1I TTTAAAATAG -/T TTTTATTCTA 2581 het 2581 ref 56 35 6 17 T 4 5 111670 CASAVA_Build 6 57688174 1I TTCTAAGCCA -/C CCAGCCATGG 3070 het 3070 ref 54 29 15 11 C 2 3 111671 CASAVA_Build 6 57688318 1I87M1D GACTGTGATC -GAAAACTGTTTGAAGGCATTAACTTAGAGTTCACTGATAATCTTGTTTCCCTTTTCTCAGGGATCACATTCTGTTGCCCAGAATCTGA/TGAAAACTGTTTGAAGGCATTAACTTAGAGTTCACTGATAATCTTGTTTCCCTTTTCTCAGGGATCACATTCTGTTGCCCAGAATCTG- AAAACTTTGT 3070 het 3070 ref 68 80 27 3 N/A 0 0 111672 CASAVA_Build 6 57688471 1D6M1I TCCTATGGCA GGCTAAC-/-GCTAACA CCTCATAGGC 3070 het 3070 ref 43 25 16 6 N/A 0 0 111673 CASAVA_Build 6 57688620 1I TAGTTCTGTA -/G TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 60 23 31 6 G 0 1 111674 CASAVA_Build 6 57690046 1D ATACATGATC T/- TCATCAAACT 3070 het 3070 ref 69 36 26 7 T 2 1 111675 CASAVA_Build 6 57690218 1I AAGGAGATAG -/A AAAAAGAAGC 3070 het 3070 ref 52 32 14 10 A 5 6 111676 CASAVA_Build 6 57690289 2I ACGTACACAC --/AT GTGCCCACAC 3070 het 3070 ref 85 45 27 13 AT 0 1 111677 CASAVA_Build 6 57690895 2D ATCATTTTAC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 69 30 17 28 A 10 8 111678 CASAVA_Build 6 57691002 2I GTAAAGAAAC --/TG TGGTACATAT 3070 het 3070 ref 71 37 20 16 TG 1 2 111679 CASAVA_Build 6 57691380 1I TGAAATTATT -/A AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 69 35 26 9 A 6 7 111680 CASAVA_Build 6 57691661 1D TTTAATTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 10 9 111681 CASAVA_Build 6 57699593 3D AATATAGTCT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 79 38 35 7 TTG 5 4 111682 CASAVA_Build 6 57700278 2D53M1D TTTCTGATAG TTTTTTTTTTCCCCTTAGAGTGTATTTGATTTATCATTTAGTTTAGTGGTTAAAGA/--TTTTTTTTCCCCTTAGAGTGTCTTTGATTTATCATTTAGTTTAGTGGTTAAAG- AATGAGACAG 3070 het 3070 ref 46 47 14 20 N/A 0 0 111683 CASAVA_Build 6 57700790 4D CACCAGAAGC CAAA/---- CAGATGTCGG 3070 het 3070 ref 62 37 19 17 CAAA 1 0 111684 CASAVA_Build 6 57701154 6D TGGCATTATC ATTATT/------ ATTAATTCAA 3070 het 3070 ref 52 37 15 5 ATT 3 1 111685 CASAVA_Build 6 57701344 1I AAAAAAGGAG -/A GAAGACGAAA 3070 het 3070 ref 72 39 23 18 A 0 1 111686 CASAVA_Build 6 57701731 1D CTTAAGAGTC A/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 79 39 34 6 A 1 0 111687 CASAVA_Build 6 57701828 13I ATGAAAGATG -------------/GTGGTGGCTAATA GTAGGTTGGC 3070 het 3070 hom 76 35 39 2 GTGGTGGCTAATA 0 1 111688 CASAVA_Build 6 57702650 2D ATTAATATAA AG/-- AGAGGGATGA 3070 het 3070 ref 68 40 19 11 AG 3 2 111689 CASAVA_Build 6 57703514 2D GGCAGGTTTT AG/-- AGTGTAAAGA 3070 het 3070 ref 60 26 28 11 AG 2 1 111690 CASAVA_Build 6 57704067 1I TTCTTGCTCT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 88 39 41 8 A 7 8 111691 CASAVA_Build 6 57704438 5D CACAGGAGTG TGCAA/----- TCTTCCTCAC 3070 het 3070 hom 67 31 34 11 TGCAA 1 0 111692 CASAVA_Build 6 57704598 1D TAACTTGAAT A/- TTATAATAGG 3070 het 3070 hom 68 25 34 11 A 1 0 111693 CASAVA_Build 6 57704999 1D GAGACTCCAA T/- TTCTGCACAT 3070 het 3070 ref 94 40 41 13 T 3 2 111694 CASAVA_Build 6 57705354 3D TCCATTTTTT GTG/--- TGTGTGGTGA 3070 het 3070 ref 65 41 19 8 GTG 1 0 111695 CASAVA_Build 6 57711539 1I CAGTTGGAAA -/T TGCAGAAATC 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 T 1 2 111696 CASAVA_Build 6 57711799 1I CTAAGCATAA -/T TTCTTCTAAG 3070 het 3070 ref 61 32 25 4 T 2 3 111697 CASAVA_Build 6 57711952 3D TTATGAATAA TGC/--- TGCAGTAAAT 3070 het 3070 ref 69 45 16 13 TGC 2 1 111698 CASAVA_Build 6 57712234 1I GATTTGCATT -/C CCCAATGATT 3070 het 3070 ref 104 53 41 10 C 3 4 111699 CASAVA_Build 6 57712354 1I71M1I TTGTTTTTTT -CAGTATTGAATTTATGAGTTCTTTATAAATCTTGATTATTAATTCCTTATCAAATTTATGGTTTGCAAATA-/CCAGTATTGACTATATGAGTTCTTTATAAATTTTGATTATTAATTCCTTATCAGATTTATGGTTTGCAAATAT TATTTTCCAA 3070 het 3070 ref 59 58 29 11 N/A 0 0 111700 CASAVA_Build 6 57712782 1I GCATAAAAAA -/T TCCTAGGAAT 3070 het 3070 ref 68 36 27 5 T 1 2 111701 CASAVA_Build 6 57712971 1I CCTATCCAAA -/T CCTAACGGCA 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 T 0 1 111702 CASAVA_Build 6 57714468 3I GTGGGAATCC ---/CTA CTTTCACCAA 3070 het 3070 ref 73 40 23 10 CTA 0 1 111703 CASAVA_Build 6 57714517 1D TTTGCAAATA T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 68 37 15 16 T 7 6 111704 CASAVA_Build 6 57715156 1I CTTTGATGGG -/C GCCATGGAAG 3070 het 3070 ref 58 16 13 29 C 0 1 111705 CASAVA_Build 6 57715272 1D TTATCATATG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 196 het 79 0 66 14 T 7 6 111706 CASAVA_Build 6 57716362 3I TGGGGTGGAT ---/GGA GGAGGAGATT 3070 het 3070 ref 66 32 28 6 GGA 2 3 111707 CASAVA_Build 6 57724864 1I AAGTTCTTAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 7 8 111708 CASAVA_Build 6 57726255 1I AGCACTTAAG -/A AAAAAACACT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 7 111709 CASAVA_Build 6 57731225 1D TGCCTGCCCC T/- GGGAACTGAA 1438 het 1438 ref 15 6 3 7 T 1 0 111710 CASAVA_Build 6 57734089 1I AACAAACTGT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 8 9 111711 CASAVA_Build 6 57752098 43I TTGGTTTTAA -------------------------------------------/CCAATAGAATGCAGCAGAAGTGATGCTGTGTGATTTTGCAAGC TAGGTCAGAA 3070 hom 60 het 20 0 19 5 CCAATAGAATGCAGCAGAAGTGATGCTGTGTGATTTTGCAAGC 0 1 111712 CASAVA_Build 6 57761081 2D TCTCTCTAGA CT/-- CTCTGTTGAG 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 CT 3 2 111713 CASAVA_Build 6 57763159 1I CTGGGTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 T 10 11 111714 CASAVA_Build 6 57763779 1D GATTACATAC T/- TTTTTTGCCA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 7 6 111715 CASAVA_Build 6 57766969 1D AGTCCTGCAG A/- TACCTGGAGG 3070 het 3070 ref 52 24 21 8 A 1 0 111716 CASAVA_Build 6 57767768 1D CTTTCTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 T 10 9 111717 CASAVA_Build 6 57770976 5I GGCAATCATG -----/GCTCA GCTCAATGCA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 GCTCA 1 2 111718 CASAVA_Build 6 57775856 4I GTATATATAT ----/ACAC ACATACATAT 1914 hom 12 het 8 0 5 3 AC 1 3 111719 CASAVA_Build 6 57776101 2I TATGTATGTG --/TA TATATATGTG 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 TA 3 4 111720 CASAVA_Build 6 57779367 1D AGGAAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1937 hom 18 5 10 3 T 11 10 111721 CASAVA_Build 6 57782017 1D TTCTTCGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 13 12 111722 CASAVA_Build 6 57783383 1I GTGCAGATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 11 12 111723 CASAVA_Build 6 57789589 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 32 2 25 5 T 12 11 111724 CASAVA_Build 6 57790045 1D CATTGGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 52 0 40 12 A 11 10 111725 CASAVA_Build 6 57812737 1I TGTTAATTTT -/G TTAAATATTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 0 1 111726 CASAVA_Build 6 57817419 1I CAACTTGGCA -/T TTGTCATATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 3 111727 CASAVA_Build 6 57824306 1D ATTTATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 11 10 111728 CASAVA_Build 6 57829965 1D ACAAAGGAAC A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 A 7 6 111729 CASAVA_Build 6 57831414 5D TTGAGAAACA AAGTT/----- ATGTTATCAA 3070 het 3070 hom 23 10 13 1 AAGTT 1 0 111730 CASAVA_Build 6 57842369 4D ATATTGAATG TCTA/---- TCTAGTGTTT 2723 het 2723 ref 16 10 6 2 TCTA 2 1 111731 CASAVA_Build 6 57856184 1I CCTACCTCCT -/A AAAAAACACA 3070 hom 97 het 39 0 33 6 A 6 7 111732 CASAVA_Build 6 57863211 9D TTTGAAGAAA GAGGGAGCG/--------- GAGCCCACGT 2025 het 2025 ref 26 21 5 4 GAGGGAGCG 1 0 111733 CASAVA_Build 6 57865166 1I TAAGTGACTG -/A AATAACTATG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 2 3 111734 CASAVA_Build 6 57866319 1D CTTTAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 13 12 111735 CASAVA_Build 6 57867852 1I GATATGAGGA -/T TTTTTTTAGG 1657 het 1657 ref 24 16 4 4 T 7 8 111736 CASAVA_Build 6 57868131 2I TAAAAGCTCT --/GG GGATGGTTTC 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 G 2 4 111737 CASAVA_Build 6 57868358 1D AAGATTTAGT A/- AAATCCAGCC 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 4 3 111738 CASAVA_Build 6 57887911 1D AACAAGTTAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 8 7 111739 CASAVA_Build 6 57889635 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 12 10 111740 CASAVA_Build 6 57890930 1D TATACAAAAA G/- TTACATATTT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 G 1 0 111741 CASAVA_Build 6 57898948 1I GCTTATGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 24 1 15 8 T 12 13 111742 CASAVA_Build 6 57902770 15D AGTACCCAGA GCCTTGGGTCCAGAT/--------------- GCCTTCTAGT 2266 het 2266 ref 21 14 6 5 GCCTTGGGTCCAGAT 1 0 111743 CASAVA_Build 6 57904913 1I AAAGCTTTTT -/A GAAAGATCTA 1329 het 1329 ref 51 43 3 5 A 0 1 111744 CASAVA_Build 6 57906094 1I TTAAACTTTC -/A ACTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 1 2 111745 CASAVA_Build 6 57909388 4I TGGGTGAAAT ----/GACA GACATAGAAT 2195 het 2195 ref 38 28 5 5 GACA 1 2 111746 CASAVA_Build 6 57912835 1I CCCAAATAGC -/T CAAAGCAAGC 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 0 1 111747 CASAVA_Build 6 57916533 5D CATGTCTATT TCTTA/----- TCTTAAGTGC 3070 het 3070 ref 28 15 12 5 TCTTA 2 1 111748 CASAVA_Build 6 57922488 1D CCATCCTTCA T/- TCTATGGGTA 3070 hom 69 het 24 0 23 4 T 2 1 111749 CASAVA_Build 6 57924374 1I ACAGAATCTC -/T TGTTAGTATC 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 1 2 111750 CASAVA_Build 6 57929610 4D AAAAAAAGAA AAAG/---- AAAAAAAGAA 2407 het 2407 ref 18 10 6 4 AAAG 1 0 111751 CASAVA_Build 6 57929691 5I AAGAAATGTT -----/AAAAG AAGTTATTCA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 AAAAG 0 1 111752 CASAVA_Build 6 57931764 4I TGAGTAATTG ----/TCTT TCTTTGCATG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TCTT 1 2 111753 CASAVA_Build 6 57933650 2D AATGTCATGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 241 hom 24 4 9 11 AC 12 11 111754 CASAVA_Build 6 57941854 24D GAAATATCAC TTCACACCCATTAGGATGGTTATA/------------------------ TTAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 26 8 2 TTCACACCCATTAGGATGGTTATA 1 0 111755 CASAVA_Build 6 57947538 1I ATTCTAAAGG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 27 7 14 6 T 7 8 111756 CASAVA_Build 6 57947941 2I GTGATATATC --/AA AAGTTCAGAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 2 4 111757 CASAVA_Build 6 57950810 4I ACCCCTAGCC ----/ACCT ACCTACCCTT 1777 hom 10 het 5 0 4 1 ACCT 1 2 111758 CASAVA_Build 6 57952826 1I GTAAACATAA -/C ATTTATATGC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 0 1 111759 CASAVA_Build 6 57954590 3I AAAGGGCAGG ---/AGA AGGTCAGAGA 3070 het 3070 ref 42 32 8 2 AGA 0 1 111760 CASAVA_Build 6 57957390 1I CATCACCCCC -/T CTCTATGATT 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 T 0 1 111761 CASAVA_Build 6 57959276 1D TTCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2588 het 2588 ref 21 12 7 2 T 11 10 111762 CASAVA_Build 6 57959673 1I ATGTGCCACA -/T TTTTTTTTTT 2218 het 2218 ref 11 5 5 1 T 10 11 111763 CASAVA_Build 6 57963130 1I TCAAGGACCT -/G GAGGCCATCC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 G 1 2 111764 CASAVA_Build 6 57973398 2I42M4D CCATTTTTTT --TGGTTTGTTTATAGCAGCTCTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG/AATCGTTTGTTTATAGCAGCTCTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTT---- TTGTTTTTGG 3070 hom 111 het 34 0 38 9 N/A 0 0 111765 CASAVA_Build 6 57975326 1D CAGAAAAGGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 8 111766 CASAVA_Build 6 57975880 2I AGGTTCTTTT --/TA TATGTTTTCC 2786 het 2786 ref 33 23 6 4 TA 1 2 111767 CASAVA_Build 6 57979580 2I TCTCTTTCTC --/TG TCTCTCTCCT 3070 hom 24 het 10 0 8 2 TG 0 1 111768 CASAVA_Build 6 57994705 1I TCCTGCTACT -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 6 7 111769 CASAVA_Build 6 58004229 3I TAAGGAACTC ---/CTT TTTTTTTGCT 3070 hom 72 het 35 0 25 10 CTT 0 1 111770 CASAVA_Build 6 58011159 1D AAGGATTACC T/- TTTTTTTTTT 2895 het 2895 ref 29 15 8 6 T 12 11 111771 CASAVA_Build 6 58021385 1D AAAAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 15 1 11 3 A 15 14 111772 CASAVA_Build 6 58026196 1D AAGCTGGACT C/- CGGACAAGCA 2844 het 2844 ref 46 33 8 5 C 2 1 111773 CASAVA_Build 6 58031755 4D TGCTGATAAA GCGC/---- TTAACAAAAT 3070 het 3070 ref 23 13 9 4 GC 2 0 111774 CASAVA_Build 6 58032235 3D TGAAATATTC TAT/--- TATTATATAG 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TAT 3 2 111775 CASAVA_Build 6 58035674 1D TCTCCTGTGA C/- CTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 21 0 20 2 C 2 1 111776 CASAVA_Build 6 58040913 3D TTTTTTTAAT AAG/--- AAGTTATTGA 3070 hom 39 het 14 0 13 4 AAG 2 1 111777 CASAVA_Build 6 58046123 1I CCATTTCCTC -/A AAAAAAAAAT 2640 het 2640 ref 21 9 8 4 A 9 10 111778 CASAVA_Build 6 58052006 5I TAACCTAGAT -----/AACTC AATTTCTACT 1272 het 1272 ref 36 26 3 7 AACTC 0 1 111779 CASAVA_Build 6 58061318 1D CATATTTCTT G/- GAGGCTTTGT 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 G 2 1 111780 CASAVA_Build 6 58065999 3I GGAATTTCTT ---/CTC TTTAAGAATG 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 CTC 0 1 111781 CASAVA_Build 6 58077697 1I TATGCGGGGT -/G GGGGGGGGAG 1970 het 1654 hom 19 7 6 6 G 8 9 111782 CASAVA_Build 6 58080266 1D GGCGTGGGGT G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 79 het 32 0 25 8 G 8 7 111783 CASAVA_Build 6 58081476 2I ATTCAGGGGG --/GT GAGGATGATA 3070 hom 48 het 23 0 16 7 GT 0 1 111784 CASAVA_Build 6 58084529 1I ACATCCCCCC -/G TTATATTGTT 3070 hom 81 het 35 0 25 10 G 0 1 111785 CASAVA_Build 6 58087901 1I CCTGCATATT -/A AAAAAAAAAT 2707 het 2707 ref 29 17 6 6 A 9 10 111786 CASAVA_Build 6 58095566 1I ATCATTTTCT -/C CCCCCCCCCT 3070 hom 55 het 31 0 20 11 C 9 10 111787 CASAVA_Build 6 58096271 1D AAAATATCAA G/- GGGGGGGTTT 3070 het 3070 hom 37 10 16 12 G 8 7 111788 CASAVA_Build 6 58096848 4I AATCATCCTC ----/TCTT TCCTTGGATA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 TCTT 0 1 111789 CASAVA_Build 6 58104960 1D AGTAATATCA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 2530 hom 31 7 15 9 T 6 5 111790 CASAVA_Build 6 58105970 1I CAATATCACC -/G GGGGGGGGGG 2475 hom 4 het 26 0 12 14 G 10 11 111791 CASAVA_Build 6 58107295 2D ATCATCCTCT CC/-- CCCCCCCCGG 3070 het 103 hom 20 2 10 8 C 10 8 111792 CASAVA_Build 6 58109502 1D TATCACTCTT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 13 12 111793 CASAVA_Build 6 58109629 1I GGGTTGTACA -/C CCCATGATAT 634 hom 13 het 12 0 2 10 C 3 4 111794 CASAVA_Build 6 58113284 1I TGCACACCCT -/C CAGTGATATT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 1 2 111795 CASAVA_Build 6 58118528 1D GGATGTTAAG A/- AACCATATCA 3070 het 3070 ref 33 14 12 8 A 3 2 111796 CASAVA_Build 6 58121107 1D CTAAAATAAC A/- AATGCCCTTG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 3 2 111797 CASAVA_Build 6 58123104 1D ATGTTTTTTT A/- AATTTTATTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 3 2 111798 CASAVA_Build 6 58131703 1D GTTTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1790 hom 32 7 17 8 T 11 10 111799 CASAVA_Build 6 58132089 1D ATCTGGGCTC T/- TTTTTTGGTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 7 6 111800 CASAVA_Build 6 58133655 1D TTGGAAATTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 9 8 111801 CASAVA_Build 6 58133790 1I TCCTTAACTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 2046 hom 27 12 11 4 C 0 1 111802 CASAVA_Build 6 58139249 1D TTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 16 0 9 7 A 11 10 111803 CASAVA_Build 6 58145545 11I7M2D TAAGATTCCA -----------CATATGAGT/TTTTGGAGATCCATTTAA-- GAGATCATTT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 N/A 0 0 111804 CASAVA_Build 6 58151345 1I ATTTCTCCGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 967 hom 19 3 10 6 T 15 16 111805 CASAVA_Build 6 58151972 3D TATATAGCAA GTT/--- GTTTATAGTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 GTT 2 1 111806 CASAVA_Build 6 58154235 1D TTTCATCTTT C/- TCTTCTCCTT 3070 het 3070 hom 18 7 9 3 C 1 0 111807 CASAVA_Build 6 58157516 1I ATCCGGTAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 9 111808 CASAVA_Build 6 58160652 4I CCTTTGATGC ----/ACAA ACATTTTTAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 ACAA 0 1 111809 CASAVA_Build 6 58168547 1D TTAAAGGTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 9 8 111810 CASAVA_Build 6 58185908 1D GAACATGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 10 9 111811 CASAVA_Build 6 58195262 1I CATGTATAGG -/T TTTAGCTGCA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 3 4 111812 CASAVA_Build 6 58253249 1D CAATAGAAAA G/- AATGCATTCC 3070 het 3070 ref 46 29 14 3 G 1 0 111813 CASAVA_Build 6 58253367 2D4M1D TATTTTCTTA ATTCTAT/--TGTA- TTTAAGTAAA 2275 het 2275 ref 34 27 5 4 N/A 0 0 111814 CASAVA_Build 6 58253660 40D AAACTAACCA TTCTTCAATCTACCTTTATCACTTTTCTCCCAGGACCTCC/---------------------------------------- TAGTGGAAGA 2615 het 2615 ref 32 35 7 6 TTCTTCAATCTACCTTTATCACTTTTCTCCCAGGACCTCC 1 0 111815 CASAVA_Build 6 58255015 2I CACATTGAGC --/TT TAAAGACAGA 3070 het 3070 ref 70 54 10 6 T 1 3 111816 CASAVA_Build 6 58258343 1I TTGCTGAGGC -/T GAGAGACAGG 3070 het 3070 ref 59 39 13 7 T 0 1 111817 CASAVA_Build 6 58281591 1I TGATTTTTTT -/G TGGGGGGGCT 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 G 0 1 111818 CASAVA_Build 6 58283499 1D AGTCTTTGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 9 8 111819 CASAVA_Build 6 58299716 4D AAAAAGAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 1117 hom 7 het 9 0 4 5 AAAG 5 4 111820 CASAVA_Build 6 58302286 1I CTTTGCCTGA -/T TTTTTTATAT 1903 het 1903 ref 27 20 4 3 T 6 7 111821 CASAVA_Build 6 58307465 4D GTGTGTGTGC ATGT/---- ATGCATGTGT 3070 het 3070 ref 80 58 8 19 ATGT 1 0 111822 CASAVA_Build 6 58307585 4D CACATGTATA CATG/---- TGTGTGTATG 2191 het 2191 ref 85 22 7 60 CATG 1 0 111823 CASAVA_Build 6 58307740 4D TGTATGCACA TATG/---- TATGTGCACG 1362 het 1362 ref 67 21 3 45 TATG 2 1 111824 CASAVA_Build 6 58316678 1D TTTGAACTTG C/- TTATGGATAA 3070 het 3070 ref 51 36 10 5 C 1 0 111825 CASAVA_Build 6 58321280 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 11 10 111826 CASAVA_Build 6 58322586 1D TGAGTATTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 10 9 111827 CASAVA_Build 6 58325848 1I AAGAGGGTGG -/T GTCAGTCAAA 1948 het 1948 ref 40 32 5 3 T 0 1 111828 CASAVA_Build 6 58343884 1I ATCTTTTTTT -/A AAAAAAAAGA 2145 het 2145 ref 30 23 5 2 A 8 9 111829 CASAVA_Build 6 58345511 2D CTACATGCTG CT/-- CTCTTTCTCT 912 het 912 ref 56 48 3 6 CT 3 2 111830 CASAVA_Build 6 58380215 6I CATTAATTAA ------/AATTTC ATATGTAAAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AATTTC 0 1 111831 CASAVA_Build 6 58382043 1I TATTCGTTTA -/G AAATTTTTTA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 0 1 111832 CASAVA_Build 6 58385846 1D CCATGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 530 hom 21 2 12 8 A 17 16 111833 CASAVA_Build 6 58411691 1I AGGTTGTTGT -/G GGATACAAAA 1894 het 1894 ref 27 18 4 5 G 2 3 111834 CASAVA_Build 6 58412594 1I AGTCTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 14 0 9 5 T 13 14 111835 CASAVA_Build 6 58418114 1D TGTGCTGCCT A/- AGTAACTTAA 3070 hom 75 het 30 0 25 6 A 2 1 111836 CASAVA_Build 6 58424595 1D ATACATCCAA T/- TAGGTTACAG 1841 het 1841 ref 47 40 4 3 T 2 1 111837 CASAVA_Build 6 58424771 1D TGTTGTGCTA T/- TTTTTTTGGC 3070 hom 83 het 44 0 31 13 T 8 7 111838 CASAVA_Build 6 58426341 20D ACCAGCATCA AACTTGCTATCAGTTGATAT/-------------------- AACCTACGGT 3070 hom 96 het 29 0 32 3 AACTTGCTATCAGTTGATAT 1 0 111839 CASAVA_Build 6 58445056 2I ACACTATTTT --/AA AAGTTATAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 4 111840 CASAVA_Build 6 58461445 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 46 het 20 0 16 4 T 9 8 111841 CASAVA_Build 6 58461872 1I GGTCTTAATG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 72 het 25 0 24 1 T 8 9 111842 CASAVA_Build 6 58463111 1D AGGGAAAGAC A/- AAAGACGAAG 1919 hom 10 het 5 0 4 1 A 4 3 111843 CASAVA_Build 6 58473466 1I ATCACTTTTT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 110 hom 26 1 24 1 A 0 1 111844 CASAVA_Build 6 58474992 1D GATATGAGGA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 33 het 17 0 12 5 T 9 8 111845 CASAVA_Build 6 58477724 1D CAAGGAGCAC T/- GGGGGCCCTC 3070 hom 38 het 18 0 13 5 T 1 0 111846 CASAVA_Build 6 58481907 2D TCTCTGTTCC AG/-- AGGAAAAAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 2 1 111847 CASAVA_Build 6 58485328 3I CTGAGTACAT ---/GTG GTAATTTTAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 GTG 0 1 111848 CASAVA_Build 6 58498754 2I GGTTGAATTC --/CT CTCTCTCTCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CT 4 5 111849 CASAVA_Build 6 58503917 1I TCAAGCTCTC -/A AAAATGTAAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 4 5 111850 CASAVA_Build 6 58505909 4D TCTCTATTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2092 het 75 hom 19 1 7 12 T 22 18 111851 CASAVA_Build 6 58509059 1I TATGACCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 438 hom 31 1 22 8 A 9 10 111852 CASAVA_Build 6 58522089 1I CAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 746 hom 22 2 14 6 A 13 14 111853 CASAVA_Build 6 58536918 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3052 hom 33 het 13 0 10 4 A 13 12 111854 CASAVA_Build 6 58558614 4I GCATATATAA ----/TTTG TTTGTAAACA 1359 het 1359 ref 42 35 3 4 TTTG 1 2 111855 CASAVA_Build 6 58561847 1I TTAGCAATTA -/T TTTTGAATTG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 4 5 111856 CASAVA_Build 6 58567905 2D GGGACCTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 1896 hom 15 het 6 0 6 1 T 16 14 111857 CASAVA_Build 6 58570684 1D CTACAAGCAG A/- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 57 39 11 8 A 4 3 111858 CASAVA_Build 6 58586697 1D CAGATGGATA G/- GTTTGTAAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 G 2 1 111859 CASAVA_Build 6 58594311 1I AATGAATGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 A 10 11 111860 CASAVA_Build 6 58608226 1I AAGGTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 32 1 25 6 T 10 11 111861 CASAVA_Build 6 58611724 4I CACTTAGGTG ----/TTAT TTAAATGCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TTAT 0 1 111862 CASAVA_Build 6 58620267 3I TGTATAAGAC ---/ATT GTTGTTGACT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 ATT 0 1 111863 CASAVA_Build 6 58622519 1D ATCATGTGAT A/- TTTTTTGAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 1 0 111864 CASAVA_Build 6 58623774 1I CAGATTACAC -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 8 111865 CASAVA_Build 6 58625258 2I TGGGGAAAAG --/AA AGAGAGATCA 1409 hom 17 het 8 0 6 2 A 1 3 111866 CASAVA_Build 6 58625681 1I ACTAAAAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 34 het 16 0 14 2 T 2 3 111867 CASAVA_Build 6 58627181 2I AAATATACTC --/TT TATAAAATTA 3070 hom 30 het 17 0 11 6 T 1 3 111868 CASAVA_Build 6 58630429 4I CTTCAGTGCT ----/CCCA CTGCATTTTC 3070 hom 69 het 35 0 22 13 CCCA 0 1 111869 CASAVA_Build 6 58636737 4D3M3I AATTACAGGA TGCCCTA---/----CTATTT AAAATTCCTC 1842 hom 10 het 6 0 4 2 N/A 0 0 111870 CASAVA_Build 6 58637613 1I TTGAATCAGG -/A AAAAAAAAAG 2254 het 2254 ref 36 30 5 1 A 9 10 111871 CASAVA_Build 6 58640841 1D GCTCTACACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 146 hom 27 1 19 7 A 10 9 111872 CASAVA_Build 6 58641844 1I GACAACCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 26 1 19 6 A 15 16 111873 CASAVA_Build 6 58651017 1D ACAGTCAGGG T/- GCTTACCTTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 1 0 111874 CASAVA_Build 6 58652927 1I ACTTCTGGCA -/T TTATCATTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 3 111875 CASAVA_Build 6 58672718 1D TTGGGATCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 752 hom 32 2 25 5 T 10 9 111876 CASAVA_Build 6 58673144 1D AACGACATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 32 1 26 7 A 12 11 111877 CASAVA_Build 6 58679907 3D GATGTTATCA CTC/--- CTCCCAATAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 CTC 2 1 111878 CASAVA_Build 6 58683831 1I TACACCCCCC -/T GTGATATGGT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 0 1 111879 CASAVA_Build 6 58689816 1D GAACAACAAC G/- GGGGGGGGCG 2142 hom 9 het 15 0 10 6 G 9 8 111880 CASAVA_Build 6 58702785 6I AATATTAATT ------/ATATGA CTATTCAATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ATATGA 0 1 111881 CASAVA_Build 6 58714588 1D TGGTATGAGA T/- TTTTTTTTTT 1871 het 1871 ref 45 30 4 11 T 13 12 111882 CASAVA_Build 6 58718911 24I CAGAAATGAA ------------------------/AGAGGGTACATCAGTAAAAATTTT AGAGATATAA 3070 hom 111 het 37 0 38 3 AGAGGGTACATCAGTAAAAATTTT 0 1 111883 CASAVA_Build 6 58726333 1I ACTGATAAAA -/G CTACCCCCAC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 0 1 111884 CASAVA_Build 6 58728879 12I TGTGAGTCAG ------------/TTAAACCTGTTC TGTTTATAAA 2153 hom 12 het 5 0 5 2 TTAAACCTGTTC 0 1 111885 CASAVA_Build 6 58730926 1I ACTTATTAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 7 8 111886 CASAVA_Build 6 58735069 1D TAAAAACAAG A/- AAAGTTTGAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 4 3 111887 CASAVA_Build 6 58758166 1D TTGTTGACTC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 8 7 111888 CASAVA_Build 6 58768085 2D GAGAACTAAA AT/-- ATTTTGCTCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AT 2 1 111889 CASAVA_Build 6 58773412 3D GAAAATGAAA AAT/--- AATGTATAGA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 AAT 2 1 111890 CASAVA_Build 6 58780274 3D CTGTAACATT TTC/--- TTTTCTCCAG 1735 het 1735 ref 37 30 4 3 TTC 1 0 111891 CASAVA_Build 6 58800020 3D AGAAAGCTAT AAC/--- TGTATTTTAA 3070 het 3070 ref 40 28 10 3 AAC 1 0 111892 CASAVA_Build 6 58820234 4I ACCTTTAATC ----/AGAT AGATATATAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AGAT 1 2 111893 CASAVA_Build 6 58823278 1I AGACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1498 hom 22 5 14 3 A 15 16 111894 CASAVA_Build 6 58825248 1D GCAAAAAGAA T/- AAAGTCAGAG 2823 het 2823 ref 54 41 6 7 T 1 0 111895 CASAVA_Build 6 58825587 1I AGAATCCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2076 hom 23 8 11 4 A 10 11 111896 CASAVA_Build 6 58825597 1I AAAAAAAAAA -/C CCCAGAAAAT 3070 het 2172 hom 25 8 12 5 C 3 4 111897 CASAVA_Build 6 58830720 1I AGCATATACA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 7 8 111898 CASAVA_Build 6 58853122 1D AGGGGGTGCC A/- AAGGTTAGGG 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 3 2 111899 CASAVA_Build 6 58861831 1I ATGAGCTCCC -/A AATGTCCATT 3070 hom 54 het 21 0 15 6 A 2 3 111900 CASAVA_Build 6 61946544 1D CTATGAGATG A/- AAGAACACAT 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 A 3 2 111901 CASAVA_Build 6 61964052 1D TGCACTCATC A/- CAAAGAAGTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 1 0 111902 CASAVA_Build 6 61976451 2I ATTCGCTTTT --/TC TCTCTTGGCC 3070 hom 94 het 40 0 31 9 TC 2 3 111903 CASAVA_Build 6 61978466 1I CTTCCTTGAA -/C TTTTTATCCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 0 1 111904 CASAVA_Build 6 61979277 1I TTAACTCAGC -/T TTTTTTTTTT 1876 het 1876 ref 38 22 4 12 T 13 14 111905 CASAVA_Build 6 61991758 2I TTGGAAACAC --/TA TTTTTGTAGA 3070 hom 52 het 24 0 18 6 TA 0 1 111906 CASAVA_Build 6 61995333 2I ACGCTGTTGT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 27 2 12 13 TG 0 1 111907 CASAVA_Build 6 61995343 3I TTTTTTTTTT ---/TTC AATTTTTCTG 3070 hom 13 het 24 1 16 7 TTC 0 1 111908 CASAVA_Build 6 61999140 2D TCTGGAAACA CT/-- GTTTTTGTAC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 CT 1 0 111909 CASAVA_Build 6 62004544 3D CCAGGATTGC CTT/--- CTTCTGCTGT 3070 het 3070 ref 41 24 15 4 CTT 2 1 111910 CASAVA_Build 6 62009456 1D AAAAGAAAAA T/- CTTCAAATAA 2630 het 2630 ref 28 14 6 8 T 1 0 111911 CASAVA_Build 6 62010661 1I ATATATTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 879 hom 19 2 11 6 A 13 14 111912 CASAVA_Build 6 62011382 1D ATCTGAGAAA C/- CGTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 40 23 12 7 C 2 1 111913 CASAVA_Build 6 62019569 1I GTTCCGTGGT -/A AGAGCATCAA 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 A 1 2 111914 CASAVA_Build 6 62019779 1I TGACCTCTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 9 10 111915 CASAVA_Build 6 62028767 30D TATACATATG TATGTATACACATACATACGTACATATGTA/------------------------------ TATGTATACA 3070 het 3070 ref 29 17 13 7 TATGTATACACATACATACGTACATATGTA 1 0 111916 CASAVA_Build 6 62045058 1I AGACAGAAAG -/T TAAAAAGGAT 2770 het 2770 ref 28 15 6 7 T 1 2 111917 CASAVA_Build 6 62046146 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 9 8 111918 CASAVA_Build 6 62050015 1D GAAAACCAAA G/- CACAAATAAT 3070 het 3070 ref 43 17 19 7 G 1 0 111919 CASAVA_Build 6 62062172 4D TCTCGGAAAG TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TCTT 3 2 111920 CASAVA_Build 6 62065171 1I TTGTGTTGTT -/A CACAGTTGTT 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 A 0 1 111921 CASAVA_Build 6 62066456 1D CATTCTAGGG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 8 7 111922 CASAVA_Build 6 62066546 4D TTAAGTAGAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 3 TTTG 4 3 111923 CASAVA_Build 6 62069353 4D ATCTACCTTT TATA/---- TATATATATA 1740 het 1740 ref 12 4 7 1 TA 9 7 111924 CASAVA_Build 6 62070124 2D GGCAGAAGAC AT/-- AAACTATTTT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 AT 1 0 111925 CASAVA_Build 6 62082616 1D AGTACTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 12 11 111926 CASAVA_Build 6 62084633 1I TTTAAAAAAA -/T ATATATTATA 3070 het 3070 hom 18 7 8 3 T 0 1 111927 CASAVA_Build 6 62084862 4I ATAAAATGAC ----/TGTT TATTTAAGAA 3070 het 2537 hom 29 8 15 6 TGTT 0 1 111928 CASAVA_Build 6 62092434 16I CTTTCTTTTC ----------------/TTTTTCTTTCTTTCTT TTTTTCTTTC 3070 het 2399 hom 19 6 9 5 TTTTTCTTTCTTTCTT 0 1 111929 CASAVA_Build 6 62101835 1I AGCCCCCCTT -/C CCCCACAGGC 2442 het 1446 hom 37 9 10 18 C 4 5 111930 CASAVA_Build 6 62103043 1I GCAGCCCACC -/A GGCTGAGTGG 3070 hom 119 het 45 0 34 11 A 0 1 111931 CASAVA_Build 6 62104509 2I TTAGGATAGC --/TT TTTTTTTTTT 2413 het 2413 ref 31 13 7 11 T 12 14 111932 CASAVA_Build 6 62116996 1I CTCAACTAGC -/A TTTGATTTGC 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 A 0 1 111933 CASAVA_Build 6 62117857 1D GTTATTTTGA T/- TTCATCTCCC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 3 2 111934 CASAVA_Build 6 62121031 1D CTGACTTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 12 11 111935 CASAVA_Build 6 62139248 1I GATCATTAAC -/A AAAAGAAATA 1368 het 1368 ref 36 32 3 1 A 4 5 111936 CASAVA_Build 6 62139582 2I TCCCCCTTTG --/CT CTCTCTCTCC 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 CT 4 5 111937 CASAVA_Build 6 62141990 1D AGAAAAAAAA C/- CCACCAAAGC 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 C 3 2 111938 CASAVA_Build 6 62236956 1I TATGTTAAGA -/C TAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 C 0 1 111939 CASAVA_Build 6 62241805 1I GAGTTAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 12 11 T 10 11 111940 CASAVA_Build 6 62252251 1I CTGCTGATTG -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 7 8 111941 CASAVA_Build 6 62264464 1D CTGCTGAGTC A/- AAAGAAATAT 1400 het 1400 ref 19 13 3 3 A 4 3 111942 CASAVA_Build 6 62269845 1I GAATATCCCC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 T 8 9 111943 CASAVA_Build 6 62284124 2D GGAAACACTG TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 59 29 26 5 T 10 8 111944 CASAVA_Build 6 62284866 1D GCCAATGGGG A/- AAAAGTGAAT 3070 het 3070 ref 33 20 9 6 A 5 4 111945 CASAVA_Build 6 62286423 1I10M1D GGATAAAAAC -AAAAAGAAGCT/TAGAAAGAAGC- ATCTGAGAAA 3070 het 2657 hom 28 10 17 4 N/A 0 0 111946 CASAVA_Build 6 62293073 1I GACACAGGAA -/G GGGAACATCA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 G 3 4 111947 CASAVA_Build 6 62297398 1D TTTAAACTGT A/- ACTACAGGGC 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 A 2 1 111948 CASAVA_Build 6 62299335 1I TCCTGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 11 12 111949 CASAVA_Build 6 62308834 5I GTATCTTTTG -----/TATTA TATTATATTC 2444 het 2444 ref 20 10 6 4 TATTA 1 2 111950 CASAVA_Build 6 62310148 1D AGGGAATCAG A/- ATGAGAGTAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 2 1 111951 CASAVA_Build 6 62310436 2D ATTAACTTTA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 AC 6 5 111952 CASAVA_Build 6 62319712 1I TACTCAGGCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 8 9 111953 CASAVA_Build 6 62328382 4D TTCATTTCCT CTGA/---- CTGTGTTATT 3070 het 3070 ref 43 24 18 3 CTGA 1 0 111954 CASAVA_Build 6 62332234 3D TTTTCAACTT TTC/--- TTGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 23 14 2 TTC 1 0 111955 CASAVA_Build 6 62335511 4D TCTTAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 32 16 9 9 AAAC 3 2 111956 CASAVA_Build 6 62336496 1I CATACATCTC -/A ACTGGAGAAT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 A 1 2 111957 CASAVA_Build 6 62341762 6I AACTATACTA ------/CAAGGC ACTAGTTTAC 3070 hom 60 het 26 0 21 6 CAAGGC 0 1 111958 CASAVA_Build 6 62342316 1D CAATGCAAAC A/- ACACCCAATA 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 A 2 1 111959 CASAVA_Build 6 62350276 1D TATAAAAATT C/- CTAAATTTAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 2 1 111960 CASAVA_Build 6 62351762 1D TGTTTCATAG T/- TTTTAATGTA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 5 4 111961 CASAVA_Build 6 62352745 1D TAAAGCGTAA T/- TTTTGAAAGC 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 T 5 4 111962 CASAVA_Build 6 62355764 3I TTAGAAAACT ---/AAC AACGGTAGAC 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 AAC 1 2 111963 CASAVA_Build 6 62372165 1I GGCATCAGAT -/C CCATTGCTCA 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 C 2 3 111964 CASAVA_Build 6 62376197 4D TATATACATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3044 het 3044 ref 26 12 13 1 TG 10 8 111965 CASAVA_Build 6 62378077 2I AAAACAAAAC --/TT TTGAAAAAAC 3070 het 2881 hom 15 7 7 1 T 2 4 111966 CASAVA_Build 6 62381671 1I ACAGCAATCT -/G TAGTATAAAT 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 G 0 1 111967 CASAVA_Build 6 62384442 4D TTTAATTAAT TTGA/---- TTGATTGATT 2876 het 2876 ref 17 7 9 3 TTGA 3 2 111968 CASAVA_Build 6 62402132 1I AGATCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 13 16 14 A 12 13 111969 CASAVA_Build 6 62410998 2D TGTATATTTT TA/-- TTTCCCTAGT 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 TA 1 0 111970 CASAVA_Build 6 62414979 1D CACTGTGCCT G/- GCCCATATGG 3070 het 2044 hom 18 6 11 1 G 2 1 111971 CASAVA_Build 6 62421762 1D GCAAGATCGC A/- ATGTTTCAAC 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 A 2 1 111972 CASAVA_Build 6 62472626 1I ACACATAGTA -/G GTGCTCTACA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 G 1 2 111973 CASAVA_Build 6 62481446 2D TACCTTTAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 9 9 T 14 12 111974 CASAVA_Build 6 62483658 1D GTATACTGAG T/- TTTTTTTTTT 1954 het 1468 hom 16 4 6 6 T 12 11 111975 CASAVA_Build 6 62483845 3I TAAAATGGCT ---/ACA ACATTTTTTT 2747 het 2747 ref 25 14 8 3 ACA 1 2 111976 CASAVA_Build 6 62502937 1D GTATTTTGGA G/- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 28 17 10 2 G 1 0 111977 CASAVA_Build 6 62503006 1I TTTGTTTTCA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 7 8 111978 CASAVA_Build 6 62503133 1I ATATATATAT -/A TTTTTAAGAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 0 1 111979 CASAVA_Build 6 62519767 1I TGCCTTCTCA -/T TTGTGTCATC 3070 het 3070 hom 44 12 25 7 T 2 3 111980 CASAVA_Build 6 62520536 10D TGTGGTATAC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 2690 hom 31 13 14 8 A 22 12 111981 CASAVA_Build 6 62522430 1D TGTTTTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 916 hom 40 4 20 16 T 16 15 111982 CASAVA_Build 6 62524129 1D AATTAATTTA T/- TTTTTTTTTG 1876 het 1876 ref 25 17 4 4 T 10 9 111983 CASAVA_Build 6 62533810 1I GTTTTCTTTT -/G TTTAGATATT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 G 0 1 111984 CASAVA_Build 6 62547535 2I AGAAATGACG --/TC TGTTATAATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TC 0 1 111985 CASAVA_Build 6 62548406 1I AACAAACAGC -/A AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 6 7 111986 CASAVA_Build 6 62548673 1I CCCACTGTTG -/C CTATGTGAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 1 2 111987 CASAVA_Build 6 62552288 1D AAATTCTATA C/- AAATGTAATA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 C 1 0 111988 CASAVA_Build 6 62553018 4D TGTCCTAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 AAAC 4 3 111989 CASAVA_Build 6 62554431 2D AAATTAAAAC AA/-- AGTAACTATG 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 A 3 1 111990 CASAVA_Build 6 62555049 4I TATTAGATAC ----/TTAG TTTGTTTTCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TTAG 0 1 111991 CASAVA_Build 6 62563343 1I TGCACATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 11 12 111992 CASAVA_Build 6 62574500 9D TACGGGTCTG ATTTCCCAA/--------- ATTTCCCAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 5 ATTTCCCAA 2 1 111993 CASAVA_Build 6 62581847 1I CCATGCCAGT -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 A 7 8 111994 CASAVA_Build 6 62582391 1I GAATCGCTTG -/A ACCAGGGAGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 2 111995 CASAVA_Build 6 62589657 1I GTTAAGATTT -/A TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 0 1 111996 CASAVA_Build 6 62604618 12I ATTAGGTAGA ------------/AATTCAAGATGG AATATACACA 3070 hom 126 het 46 0 43 4 AATTCAAGATGG 0 1 111997 CASAVA_Build 6 62612617 3D GTTCACTGTC CTT/--- CTTCTGAAAT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 CTT 2 1 111998 CASAVA_Build 6 62614649 4D TTGTAAGTAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 189 hom 26 3 11 14 AT 9 7 111999 CASAVA_Build 6 62615773 1D TTTAAAATGA T/- TTTTTCTGCT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 T 6 5 112000 CASAVA_Build 6 62620159 1I CAAATAAAGA -/T TTTTTTCACG 2607 het 2607 ref 23 12 6 5 T 6 7 112001 CASAVA_Build 6 62622011 1I TTGAAAAATC -/A GTGTAGAATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 0 1 112002 CASAVA_Build 6 62623355 2D TGTGTATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 99 het 43 0 34 10 TA 6 5 112003 CASAVA_Build 6 62625455 9I CTTCATATTT ---------/AAAAAATAA ATTTTTCATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAAAATAA 0 1 112004 CASAVA_Build 6 62626115 2D GCAATTTAAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 A 11 9 112005 CASAVA_Build 6 62629442 2D TCTATGTGTC TT/-- TTTTTTGTAC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 8 6 112006 CASAVA_Build 6 62629525 1D TCCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 T 11 10 112007 CASAVA_Build 6 62633423 3D GGTTCTTCCC ACA/--- ACATGTGGGA 3070 het 3070 hom 27 13 13 2 ACA 2 1 112008 CASAVA_Build 6 62654966 4D ACAATGTATC AGAT/---- AGAGAATTTG 3070 het 3070 ref 35 16 18 4 AGAT 1 0 112009 CASAVA_Build 6 62658649 1I AGTCCCTGAG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 T 8 9 112010 CASAVA_Build 6 62661768 1I ATAATAATAA -/T AAAAAAAAAC 2913 het 2208 hom 15 7 6 2 T 0 1 112011 CASAVA_Build 6 62667596 1D ATTGTTTTAA T/- GCCCCCCCCC 1967 het 1967 ref 22 10 10 2 T 1 0 112012 CASAVA_Build 6 62676935 2I CATATATAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 T 14 16 112013 CASAVA_Build 6 62677537 3I TGGATGTTCC ---/CAG AAAGGACTTA 3070 hom 132 het 46 0 44 2 CAG 0 1 112014 CASAVA_Build 6 62684289 2D ATATTTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AT 6 5 112015 CASAVA_Build 6 62687786 1D TTTAGTACTC T/- TTTTTTCCTC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 7 6 112016 CASAVA_Build 6 62692358 3D69M2D ATTTTAGTTA CTTCTTTTTATCATGAATATTAATCTTTAAACTGTGATGAACACTATAATTTTTAAAAGTCTAACAGTAGTCTT/---CTTTTTATCATGAATATTAATCTTTAAACTGTGATGAACCCTATAATTTTTAAAAGTCTAACAGTAGTC-- TTGATTTTAT 3070 het 3070 ref 25 30 14 6 N/A 0 0 112017 CASAVA_Build 6 62694685 6I TATCACCCAG ------/AAATGA AAACTTCAAA 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 AAATGA 0 1 112018 CASAVA_Build 6 62698598 10D GCTAATCAAT ATAAGTCAAC/---------- ATAAGTCAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 ATAAGTCAAC 1 0 112019 CASAVA_Build 6 62708107 1D ATAAAAGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 16 8 4 A 12 11 112020 CASAVA_Build 6 62723597 4I CATATATAGA ----/CACT CAGAGAGAGA 3070 het 994 hom 31 6 23 2 CACT 0 1 112021 CASAVA_Build 6 62725372 1I TGGCTGCTTT -/G GGGGGTGGCT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 5 6 112022 CASAVA_Build 6 62725791 2D TTTAAAATTT TC/-- TCTCTTTTGT 2806 het 2806 ref 23 14 8 1 TC 3 2 112023 CASAVA_Build 6 62727959 1I CTTTTCAGGC -/A CCTTGCTTGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 0 1 112024 CASAVA_Build 6 62729842 2I TTATGTGGAG --/AT ATATATATAT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 AT 6 7 112025 CASAVA_Build 6 62735266 4D GAAGATAGAT GATA/---- GATAGATAGA 3070 hom 129 het 47 0 44 5 GATA 3 2 112026 CASAVA_Build 6 62735720 8D ATACATACAT ACATACAC/-------- ACATACACAC 3070 hom 42 het 17 0 14 4 ACATACAC 2 1 112027 CASAVA_Build 6 62741794 1I TGGAAGATGT -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 6 7 112028 CASAVA_Build 6 62742257 7D CTTACCTCTT TATAGAA/------- TATAAAGAGA 3070 het 3070 hom 31 14 17 1 TATAGAA 1 0 112029 CASAVA_Build 6 62742489 2D CTTGACACTC TA/-- TTTGTTTTGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 1 0 112030 CASAVA_Build 6 62749315 1D CCTCTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 34 1 24 9 A 12 11 112031 CASAVA_Build 6 62750088 2I AATATATATA --/TG TATATCTTAC 3070 het 803 hom 35 2 30 3 TG 0 1 112032 CASAVA_Build 6 62770053 1D CACAGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 11 10 112033 CASAVA_Build 6 62770187 3D TATTGCTTGA AAT/--- AATAAAATAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AAT 2 1 112034 CASAVA_Build 6 62775267 2I CATTTTGATG --/TT TTTTTTTTTT 3026 het 3026 ref 39 18 10 11 T 11 13 112035 CASAVA_Build 6 62781363 6I TTATTATTTG ------/ATAATA ATTTTAGCAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ATA 0 2 112036 CASAVA_Build 6 62788446 9D TTTATTAATG CACTTTTGA/--------- CAGTTTTTGC 3070 het 3070 hom 42 18 21 6 CACTTTTGA 1 0 112037 CASAVA_Build 6 62789789 2D GTTTTTTGTG TA/-- TATATATATA 2149 het 2086 hom 26 8 9 9 TA 8 7 112038 CASAVA_Build 6 62813814 1D CAAGTGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2558 hom 27 9 14 4 A 12 11 112039 CASAVA_Build 6 62825004 5D AAGTAAGCAA CTTTT/----- CTTTTAATGT 3070 het 3070 ref 35 18 16 3 CTTTT 2 1 112040 CASAVA_Build 6 62838200 1D TGTTCACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2211 hom 28 7 11 10 T 11 10 112041 CASAVA_Build 6 62858424 1D AGGAAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 12 11 112042 CASAVA_Build 6 62859152 1I GTATTTTTTA -/T TTTTTCATTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 5 6 112043 CASAVA_Build 6 62866370 1I CTGATAAGTC -/A AGCTGCCAGG 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 A 1 2 112044 CASAVA_Build 6 62866791 5D TGATGCTCTC TATTA/----- TATTTTTTAT 3070 het 3070 hom 36 14 20 5 TATTA 1 0 112045 CASAVA_Build 6 62867946 1D GGGAAAGGTC A/- AAATATCAAC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 4 3 112046 CASAVA_Build 6 62869089 1D TCCTAAAATC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 9 8 112047 CASAVA_Build 6 62872158 1D TAAATAAGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 9 26 4 T 10 9 112048 CASAVA_Build 6 62895431 1D CTACACTAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 9 8 112049 CASAVA_Build 6 62896534 1I ACTGCTTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 T 9 10 112050 CASAVA_Build 6 62898428 1I AACATAATTG -/T TTTTTACTAT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 5 6 112051 CASAVA_Build 6 62907427 1D AAAAAAAAAA T/- AAAAAGAAAT 3070 het 258 hom 22 2 17 4 T 1 0 112052 CASAVA_Build 6 62911559 1I CAGATTATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 112053 CASAVA_Build 6 62913125 1I CTCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 10 112054 CASAVA_Build 6 62913407 13I GGACCAATGT -------------/AAAGTAATTGGAC GATGTTAAAG 3070 het 3070 ref 33 22 11 1 AAAGTAATTGGAC 0 1 112055 CASAVA_Build 6 62914654 1D AAGGGTTGAG A/- AAAAAATGGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 6 112056 CASAVA_Build 6 62919578 2D TATGGTATGT AC/-- ACACACACAC 1664 het 1664 ref 55 41 4 12 AC 8 7 112057 CASAVA_Build 6 62921359 1I AGCCTTTATA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 8 9 112058 CASAVA_Build 6 62945412 2D AAGATGTGAC TG/-- TGTCTTCTGT 3070 het 3070 hom 38 12 26 3 TG 2 1 112059 CASAVA_Build 6 62954479 1I AATGAAGGAG -/A AAAATGCAGC 3070 het 3070 hom 59 25 25 9 A 4 5 112060 CASAVA_Build 6 62957644 4D GTTTTTGGCT TGAG/---- TAAGTAGGTG 3070 het 3070 hom 42 18 21 6 TGAG 1 0 112061 CASAVA_Build 6 62964460 1D GGGAAGATGG A/- ACACTCAACC 3070 hom 147 het 51 0 48 4 A 2 1 112062 CASAVA_Build 6 62970362 4D AGAGAAAAAC AGAG/---- AGAGAGATTT 3070 het 3070 hom 37 16 19 5 AG 5 3 112063 CASAVA_Build 6 62972738 1D GTATTTTGTT A/- AAAAAAAAAT 1449 het 1449 ref 52 43 4 5 A 10 9 112064 CASAVA_Build 6 62977388 24D AATTGAGAAT GCTACACAGATTGCCATTTAGAAC/------------------------ TAATATGCCC 3070 het 3070 ref 41 28 18 4 GCTACACAGATTGCCATTTAGAAC 1 0 112065 CASAVA_Build 6 62979142 4I TTGCCTAAAT ----/TTAG TTAGTTTCCA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 TTAG 1 2 112066 CASAVA_Build 6 63007446 4D CAATTAAATA AATG/---- AATGAATAAA 3070 hom 46 het 21 0 15 7 AATG 2 1 112067 CASAVA_Build 6 63019714 1D TGCTATTATT A/- AAAAATAGTA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 6 5 112068 CASAVA_Build 6 63023384 10D AGTCGAACTC TCACAGTTCA/---------- AAGGAAGTAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 5 TCACAGTTCA 1 0 112069 CASAVA_Build 6 63031172 2D TTTTTAAAAA AC/-- ACAGTGGTAT 3070 het 3070 hom 29 15 14 1 AC 2 1 112070 CASAVA_Build 6 63037133 3D TTAATAACTT CTC/--- CTCTCTGAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 CTC 2 1 112071 CASAVA_Build 6 63049022 5I TAAAACCCTC -----/AATCT AATCTAATCC 3070 het 3070 ref 44 27 12 5 AATCT 1 2 112072 CASAVA_Build 6 63052417 1D TTAATTTATA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 T 8 7 112073 CASAVA_Build 6 63067756 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 10 112074 CASAVA_Build 6 63067870 4I AAGAAAATGG ----/ACAA ACAATGATTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 ACAA 1 2 112075 CASAVA_Build 6 63070906 1D GTAAATATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 9 112076 CASAVA_Build 6 63097898 1I TAAAAACTTC -/A AGTGCAGATC 3070 het 3070 ref 39 14 15 10 A 1 2 112077 CASAVA_Build 6 63098274 1I GGAAGCCCAC -/T AGGTTAGCTT 2872 het 2872 ref 18 9 7 2 T 0 1 112078 CASAVA_Build 6 63101194 1D CAGATCTTTT C/- TCAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 C 1 0 112079 CASAVA_Build 6 63103334 3I AACATCGCAG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 18 2 T 11 14 112080 CASAVA_Build 6 63108078 1I AAATCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 10 11 112081 CASAVA_Build 6 63109719 3I GCTAGCAGAA ---/GAG GAAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 GAG 0 1 112082 CASAVA_Build 6 63112319 2D AAATGGCTGT CA/-- TTAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 CA 1 0 112083 CASAVA_Build 6 63112784 5D ATCAAGGAAA CAACT/----- CAACCTATGG 3070 het 3070 hom 54 23 26 7 CAACT 1 0 112084 CASAVA_Build 6 63116907 1I TGCTGAGCTT -/C CCTGGTTAGG 3070 hom 126 het 51 0 42 9 C 2 3 112085 CASAVA_Build 6 63118330 1D ATGCTAAGTG A/- AAAAGCCATA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 5 4 112086 CASAVA_Build 6 63121309 1D ATTTATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 710 hom 24 4 14 6 A 13 12 112087 CASAVA_Build 6 63122656 6D AAGGAGATCT TTAAGA/------ TAAAGATCAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 9 TTAAGA 1 0 112088 CASAVA_Build 6 63122885 1I CATTTCTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 10 11 112089 CASAVA_Build 6 63123739 1D AAAAAAAAAA T/- TTAAATTTTT 2752 het 2698 hom 22 11 9 2 T 3 2 112090 CASAVA_Build 6 63129145 1D GCACTTCTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 15 15 7 A 10 9 112091 CASAVA_Build 6 63133185 6I CAAATAATCA ------/GAATCC AATTACCAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 GAATCC 0 1 112092 CASAVA_Build 6 63134838 2D4M5D ATGGTAGGTG GTCTATATGTA/--CTAT----- TTTATTATTT 3070 het 3070 hom 26 9 18 5 N/A 0 0 112093 CASAVA_Build 6 63142558 10D CAATACAGCA ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 het 877 hom 32 6 12 15 AC 14 9 112094 CASAVA_Build 6 63143025 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2984 het 732 hom 22 4 8 12 T 13 11 112095 CASAVA_Build 6 63145712 1I11M2D ACTTTCTGTA -TTTTTTTTTCATT/TTTTTTTTTTCA-- TTTTTTTTTT 3070 het 1189 hom 37 11 18 11 N/A 0 0 112096 CASAVA_Build 6 63149608 1D TGTTTTATAC A/- AAAAAAAAAA 878 het 878 ref 38 21 4 13 A 15 14 112097 CASAVA_Build 6 63150050 1D AAGAAACTAC T/- GATAAAATAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 1 0 112098 CASAVA_Build 6 63155176 4I ATATCGTGTC ----/TTTT TATTTTTAGG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 1 5 112099 CASAVA_Build 6 63164507 1I AATTGTTTGC -/T TTTGGCATGT 3070 het 3070 ref 48 28 17 3 T 3 4 112100 CASAVA_Build 6 63164838 2I TGGTTCTGTC --/AT ATATGGCTTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 AT 2 3 112101 CASAVA_Build 6 63165713 1D TCCCGGGTAA T/- TTTTTGTATT 1303 het 1008 hom 7 3 3 1 T 6 5 112102 CASAVA_Build 6 63169956 1D TTATCTCTAG T/- TATAACTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 T 2 1 112103 CASAVA_Build 6 63175709 4I AACATATAAC ----/TAAA TAAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 TAAA 1 2 112104 CASAVA_Build 6 63177192 1D AGGCCAGGGA T/- TCGAGACCAG 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 T 2 1 112105 CASAVA_Build 6 63181235 1I AGACCCAACC -/A AAAAAAAAAA 2439 het 2439 ref 32 15 7 10 A 11 12 112106 CASAVA_Build 6 63193804 1I TGTAATTTTA -/C ATATGAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 0 1 112107 CASAVA_Build 6 63195096 1I TATAATCTCT -/G GGATCGAAAT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 G 2 3 112108 CASAVA_Build 6 63195339 1I CAGGGAAGTC -/A TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 56 24 25 7 A 0 1 112109 CASAVA_Build 6 63197332 1D AAATAATGTG A/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 A 1 0 112110 CASAVA_Build 6 63201991 1I TGGGCCTAAT -/A AGACACCTAC 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 A 1 2 112111 CASAVA_Build 6 63205154 4D TTGATTTATC TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 TATT 5 4 112112 CASAVA_Build 6 63205762 22I TCTGCATCCC ----------------------/TGGTATTAGACCCACTTGATCA TGGTGGATCA 3070 het 3070 ref 35 19 17 1 TGGTATTAGACCCACTTGATCA 0 1 112113 CASAVA_Build 6 63211271 1I CTAGTATTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 27 20 2 T 9 10 112114 CASAVA_Build 6 63241443 1I AACTTTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 10 9 A 11 12 112115 CASAVA_Build 6 63279514 1D TCTAAGTAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 A 10 9 112116 CASAVA_Build 6 63282318 4D CTGATCTCTG ATAA/---- ATAAACATGT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 ATAA 2 1 112117 CASAVA_Build 6 63299427 1I AAATTAAATA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 2216 hom 19 7 10 3 T 7 8 112118 CASAVA_Build 6 63300008 4D TATTCTTTTT TTTG/---- TTTTTTTGTA 3070 het 2922 hom 23 8 12 4 TTTG 1 0 112119 CASAVA_Build 6 63303571 2D ACTTGGACTC TT/-- TATGCCCCTT 3070 het 3070 ref 58 30 24 5 T 3 1 112120 CASAVA_Build 6 63305429 1D ACTTAATAAA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 T 8 7 112121 CASAVA_Build 6 63306330 3I TAGCAGCTAC ---/CCT CCCCAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CCT 0 1 112122 CASAVA_Build 6 63307275 1I AAAAAGGATG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 31 11 11 9 T 7 8 112123 CASAVA_Build 6 63308076 6I TATAAGGACT ------/TAAAAA TAAAAGTATT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TAAAAA 0 1 112124 CASAVA_Build 6 63313048 2D TCGATAACTC TT/-- TGGTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 3 1 112125 CASAVA_Build 6 63316193 1D GGGCAACACC A/- AAAAAAAAAA 1204 het 1204 ref 37 25 4 9 A 15 14 112126 CASAVA_Build 6 63340776 1I AGGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 10 11 112127 CASAVA_Build 6 63343077 3D TTTTTGTACA ATC/--- ATCATAGAGG 3070 het 3070 hom 65 29 32 5 ATC 2 1 112128 CASAVA_Build 6 63344540 4I TTAGAATGAC ----/AAAT AGTCTGCTAA 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 AAAT 0 1 112129 CASAVA_Build 6 63387822 2D GTAAATAAGG TT/-- TTATATATAT 2972 het 1187 hom 14 4 8 2 T 4 2 112130 CASAVA_Build 6 63392133 1D GAAATTTTCT A/- TTTTTTTTTT 1160 het 1160 ref 41 34 3 4 A 1 0 112131 CASAVA_Build 6 63397237 1D CAATCTACTA T/- TTTTTCAAAC 3070 het 3070 hom 56 23 25 9 T 6 5 112132 CASAVA_Build 6 63398111 22D GAAAAAAATT ATATATTATTATATATATAATG/---------------------- ATATATTATT 3070 het 2374 hom 12 5 8 2 ATATATTATTATATATATAATG 1 0 112133 CASAVA_Build 6 63399856 3D AAACCGCAAC ACA/--- ACAACAGTAA 3070 het 3070 ref 49 26 19 6 ACA 3 2 112134 CASAVA_Build 6 63407742 1D CTATTTAGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 T 10 9 112135 CASAVA_Build 6 63415694 2D TCAAATTCTC TT/-- TGACAATTTG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 3 1 112136 CASAVA_Build 6 63417452 1D CATGTGACAT A/- AGATTTATTG 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 A 2 1 112137 CASAVA_Build 6 63418056 6D45M10D TAAAAAGGTG ATATATATATATATATATACACACACAAATATATATGTGTGTGTGTATGCGTATATATATA/------ATATATATATATACACACACAAATATATATGTGTGTGTGTATGCG---------- TATATATATA 3070 het 89 hom 21 1 21 7 N/A 0 0 112138 CASAVA_Build 6 63418721 2I33M1I CATGAACTAT --GTCATTATAGCTTTTATTTTTTCTTTAAAAATA-/AAGTCATTATAGCTTTTATTTTTTCTTTAAAAATAT TTGATTTAAG 3070 hom 75 het 21 0 26 6 N/A 0 0 112139 CASAVA_Build 6 63421468 1D TCTTACATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 95 het 39 0 30 9 A 10 9 112140 CASAVA_Build 6 63426449 4D ATTAACTTAG TTAC/---- TTAATTATTA 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 TTAC 1 0 112141 CASAVA_Build 6 63430414 1I TATTCTTTTT -/C TTTTTTCTTT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 C 0 1 112142 CASAVA_Build 6 63430983 1I CTACATTTTT -/A AAAAGTTATC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 4 5 112143 CASAVA_Build 6 63431817 1D ATCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 32 4 11 18 A 12 11 112144 CASAVA_Build 6 63432585 1I TATTCAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 23 1 19 3 A 10 11 112145 CASAVA_Build 6 63434900 5D ATCATTGCCT AATAA/----- AATAAACTGG 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 AATAA 2 1 112146 CASAVA_Build 6 63437686 1D TCTGGTATGT C/- CCCTCCTACA 3070 het 3070 hom 45 13 25 8 C 4 3 112147 CASAVA_Build 6 63439839 1I AATTGTATGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 157 hom 36 2 32 2 A 9 10 112148 CASAVA_Build 6 63445052 3D GATTTTTGAC AGT/--- TTAATTGTAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AGT 1 0 112149 CASAVA_Build 6 63445268 1D GTCTCTTATG T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 T 7 6 112150 CASAVA_Build 6 63452394 4D CTTTACTATC TGAT/---- TGATTGGGTG 3070 het 3070 ref 41 27 10 5 TGAT 2 1 112151 CASAVA_Build 6 63452698 2I AAGATTAGAA --/AG AGGGGGAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AG 1 2 112152 CASAVA_Build 6 63458073 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 9 8 112153 CASAVA_Build 6 63486220 2I ACTTCTAACC --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 A 8 10 112154 CASAVA_Build 6 63497548 1I AGGTCAATTT -/C CCCCACATAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 C 4 5 112155 CASAVA_Build 6 63503774 1D CAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 17 13 A 11 10 112156 CASAVA_Build 6 63518997 1D AGACCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 13 12 112157 CASAVA_Build 6 63523284 2D TATTACTGAC TG/-- TGTGCTGGTG 3070 het 3070 ref 50 24 22 5 TG 3 2 112158 CASAVA_Build 6 63527621 6I TAAAACAGAG ------/CACTTC AAGTGTGCAG 3070 het 3070 hom 35 16 19 1 CACTTC 0 1 112159 CASAVA_Build 6 63531214 1I TTTGATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 14 12 T 14 15 112160 CASAVA_Build 6 63562933 1D CAGAATTCTT A/- CACAAGAGCC 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 1 0 112161 CASAVA_Build 6 63566387 4D TCAGCAGTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 TTTG 5 4 112162 CASAVA_Build 6 63570093 1D TAGTGGAATC T/- TTTGGGGGTG 3070 het 3070 ref 36 24 11 2 T 4 3 112163 CASAVA_Build 6 63576063 1D AATTGACTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 10 9 112164 CASAVA_Build 6 63577618 1D AGGAGTGCAG A/- AGTAGAAAAT 3070 het 3070 hom 46 15 28 3 A 2 1 112165 CASAVA_Build 6 63581982 4I AGAACAGAAT ----/TTTG TTTGTTTTCA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 TTTG 1 2 112166 CASAVA_Build 6 63583547 1I TATTATAAAG -/T TTTTTTTTTA 1304 het 1304 ref 22 15 5 2 T 9 10 112167 CASAVA_Build 6 63588479 1D AGGGTCTCCA C/- CCCCTTGACA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 5 4 112168 CASAVA_Build 6 63589200 1D ATTTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 12 11 112169 CASAVA_Build 6 63594242 4D ATAGACAAAT AGAG/---- AGCCAAATCA 3070 het 3070 hom 50 21 27 2 AG 3 1 112170 CASAVA_Build 6 63597929 9I CAGAACAGGT ---------/TCTATTGTA GCCTCAGAAA 3070 het 3070 ref 32 22 9 1 TCTATTGTA 0 1 112171 CASAVA_Build 6 63606285 1I TCTAATATAC -/A GGGGGGAGAG 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 A 0 1 112172 CASAVA_Build 6 63625650 1D CCCCTATGAC T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 7 6 112173 CASAVA_Build 6 63626119 3D GGGAAAGAGG ATA/--- ATAATACTTT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 ATA 3 2 112174 CASAVA_Build 6 63628902 1D GCAGGGGAGA G/- GGGGGTGCTC 1921 het 1346 hom 27 7 9 11 G 6 5 112175 CASAVA_Build 6 63630068 1D TTTCCCCCCC A/- AAAAAATTAC 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 A 7 6 112176 CASAVA_Build 6 63637872 1D ATCCAGGTGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 A 9 8 112177 CASAVA_Build 6 63639428 1I CCTCCCCCCC -/T AGATATTGTT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 T 0 1 112178 CASAVA_Build 6 63640849 2D CACAAAGTGT AC/-- ACACACTATG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 AC 4 3 112179 CASAVA_Build 6 63644364 1D AAGATAGGAT G/- ATATAACCCC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 G 1 0 112180 CASAVA_Build 6 63645802 1I CGGGAAAAAA -/T AATACTACTC 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 0 1 112181 CASAVA_Build 6 63652231 4I TCACAATCAT ----/TGTC TGTGAGTTGA 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 TGTC 0 1 112182 CASAVA_Build 6 63653573 1I AGTTTGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1333 hom 22 4 12 6 A 10 11 112183 CASAVA_Build 6 63654508 1D CAAACAAACC A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 7 6 112184 CASAVA_Build 6 63658039 1D TAAGGCCCTG T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 8 7 112185 CASAVA_Build 6 63658584 12D TGGTAAGGAA GCATTTAATTCC/------------ TATAATAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 17 1 GCATTTAATTCC 1 0 112186 CASAVA_Build 6 63660295 1D AATTTAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 T 11 10 112187 CASAVA_Build 6 63664829 4D ATTTTTTTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2006 het 1151 hom 18 5 6 9 T 18 14 112188 CASAVA_Build 6 63667669 32D TCTTCCTCAA AGACTCTGTAACTTGAGATTTTTCTAGTCCTT/-------------------------------- AGTTCTGATT 3070 het 3070 ref 38 22 19 3 AGACTCTGTAACTTGAGATTTTTCTAGTCCTT 1 0 112189 CASAVA_Build 6 63671852 1D AAGAAAGGCA T/- TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 38 24 12 4 T 6 5 112190 CASAVA_Build 6 63674769 1D TAAACAAAAG A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 7 6 112191 CASAVA_Build 6 63687316 1D GTCCTTATGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 A 9 8 112192 CASAVA_Build 6 63701070 1I GGTGTATGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 8 9 112193 CASAVA_Build 6 63705135 1I ATTTTTGTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 T 7 8 112194 CASAVA_Build 6 63725445 1D ATTTATTTGC A/- ACTATTATAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 6 A 2 1 112195 CASAVA_Build 6 63728813 1I GTCCCCTTTA -/C TTTTTCCTCT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 C 0 1 112196 CASAVA_Build 6 63761654 1D ATTCTGCCCC T/- GGCCCCTGTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 1 0 112197 CASAVA_Build 6 63766608 1I ACTTTTAAAA -/G AAATGGCATG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 G 0 1 112198 CASAVA_Build 6 63767560 2I AGTTTTTGGA --/TC TCTTACAGGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TC 1 2 112199 CASAVA_Build 6 63769031 1D ATTATGCATA C/- TTTAAATACA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 1 0 112200 CASAVA_Build 6 63771831 1D GGTTTATGCT A/- AAAAAAGTCA 3070 hom 81 het 36 0 28 9 A 7 6 112201 CASAVA_Build 6 63774545 5I CTTGATAATG -----/ACTCT ACTCTAAATG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 ACTCT 1 2 112202 CASAVA_Build 6 63775476 1I GGCCACTGGA -/C CAAGGAATGC 3070 hom 75 het 34 0 22 12 C 1 2 112203 CASAVA_Build 6 63780152 2D AACATGCTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 47 2 31 14 T 16 14 112204 CASAVA_Build 6 63781000 1D ATCATTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 11 10 112205 CASAVA_Build 6 63781512 1D TTAAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 28 1 20 7 T 11 10 112206 CASAVA_Build 6 63781877 1D TTCAGAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 10 9 112207 CASAVA_Build 6 63786657 1D CCTTGATAAT A/- AAATTTAAGT 3070 het 85 hom 32 1 29 2 A 4 3 112208 CASAVA_Build 6 63787206 1D GGGACAGTTA T/- TTTAGTCATA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 4 3 112209 CASAVA_Build 6 63791141 1I ACTGCACACC -/T TTGCCTTAAT 3070 hom 132 het 53 0 45 8 T 2 3 112210 CASAVA_Build 6 63798519 1D TCCCCATTGC T/- TTTTTTTTTG 2749 het 267 hom 15 2 7 6 T 10 9 112211 CASAVA_Build 6 63799950 2D TTTTGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 33 0 17 16 T 16 14 112212 CASAVA_Build 6 63801006 1I TATACAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 18 14 5 T 9 10 112213 CASAVA_Build 6 63803264 1I CTCCTGAGTA -/G ATGGGATTAC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 0 1 112214 CASAVA_Build 6 63806669 2I ATTACAAAAC --/AT ATACTACACA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AT 1 2 112215 CASAVA_Build 6 63807180 1I TCTGATGATA -/C TTGCTCCACA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 112216 CASAVA_Build 6 63817823 1D CTGAAAATGC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 7 6 112217 CASAVA_Build 6 63818945 1I GTTTTTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 99 hom 41 1 38 2 T 9 10 112218 CASAVA_Build 6 63820167 2D34M1D GTATCTGTTT TGTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTAC/--GTGGTTTTGATTTAAATTTCTCTAAAGATCAGTA- ATGTTGCACT 943 het 943 ref 21 17 3 5 N/A 0 0 112219 CASAVA_Build 6 63825940 1I GGTGGGGGGA -/G GGGGGAAGGA 2206 hom 25 het 11 0 7 4 G 5 6 112220 CASAVA_Build 6 63829108 5D4M3I TTAAATGGGC TGTGGTACA---/-----TACATAT CTACATATTG 3070 het 3070 ref 38 20 18 4 N/A 0 0 112221 CASAVA_Build 6 63832240 5D GATTCTGCTA CTTTG/----- CTGTAGCCTA 3070 hom 90 het 35 0 30 8 CTTTG 1 0 112222 CASAVA_Build 6 63835869 1I GGATTTTTTC -/T TGCCTTTGAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 112223 CASAVA_Build 6 63837756 1D ATTGTTAATT A/- ACTGAGGTTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 A 2 1 112224 CASAVA_Build 6 63838183 1D GGGTACATGT G/- CACAACGTGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 1 0 112225 CASAVA_Build 6 63839234 5I TATGTCCTGA -----/ATGGT ATGGTATTGC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 ATGGT 1 2 112226 CASAVA_Build 6 63841067 1D TGATCTTTTC A/- AAAAAACCAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 7 6 112227 CASAVA_Build 6 63855950 1I GATCTCTATT -/A AAAAAAACAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 8 112228 CASAVA_Build 6 63878731 1D AAATGAATAA C/- CTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 59 27 25 8 C 2 1 112229 CASAVA_Build 6 63882790 1I CTGCTCCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 677 hom 37 2 33 2 A 12 13 112230 CASAVA_Build 6 63890026 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 2363 het 2351 hom 12 6 5 1 A 11 10 112231 CASAVA_Build 6 63909960 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1546 het 177 hom 15 3 6 6 A 20 18 112232 CASAVA_Build 6 63951533 1D CTTTTACTTT A/- AATTCCACTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 3 2 112233 CASAVA_Build 6 63963083 2I GTATTTTATC --/TT TTTTTTTTGC 3070 hom 13 het 23 0 14 9 T 8 10 112234 CASAVA_Build 6 63979210 2D CCAGTACGGG AA/-- AAAAAAAAAA 1782 het 859 hom 12 4 5 3 A 15 13 112235 CASAVA_Build 6 63983876 2I GGTAAGAAAC --/AT AGAATGAACT 3070 hom 101 het 36 0 33 3 AT 0 1 112236 CASAVA_Build 6 63984622 1D AAGCTCATTG A/- AAAAAAAAAA 2780 het 50 hom 29 2 9 18 A 15 14 112237 CASAVA_Build 6 63985568 4D TTTTGTAGAG ACAC/---- AGTATTGCCG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 AC 2 0 112238 CASAVA_Build 6 63985687 3D AGCCTTGAGG TCT/--- TCTTTTTAAT 3070 hom 84 het 30 0 28 5 TCT 2 1 112239 CASAVA_Build 6 63986971 1I GGCTATAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 10 11 112240 CASAVA_Build 6 63991623 1D TCCATAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 11 10 112241 CASAVA_Build 6 63991939 2I TTTATATTTT --/TA TGAGACACAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 TA 0 1 112242 CASAVA_Build 6 63999623 1D AACTTCTGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 10 9 112243 CASAVA_Build 6 64009702 1D AAGAAGACTG A/- AAAAAAAAAA 1830 het 1830 ref 18 10 5 3 A 13 12 112244 CASAVA_Build 6 64013249 1D GTAGAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 A 11 10 112245 CASAVA_Build 6 64015090 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATCAG 2351 het 897 hom 9 3 6 0 A 6 7 112246 CASAVA_Build 6 64018485 1I TTTCCTTATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 681 hom 30 2 22 6 A 8 9 112247 CASAVA_Build 6 64025125 3I ACAGCTTGTA ---/ATT ATTAGGGTGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 ATT 1 2 112248 CASAVA_Build 6 64026118 2D GTGAGAAAAC AT/-- ATGTGTATAA 3070 hom 126 het 50 0 42 9 AT 2 1 112249 CASAVA_Build 6 64031431 1I GTTGGTAAAA -/G CTTTAAATTG 3070 hom 105 het 46 0 35 11 G 0 1 112250 CASAVA_Build 6 64037151 1D ATTTTTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 12 11 112251 CASAVA_Build 6 64040242 2D TTCCCCCCCC CT/-- CTGATATTGA 3070 hom 31 het 32 0 19 14 CT 2 1 112252 CASAVA_Build 6 64044882 1I AAACTGCCAC -/A ACCAACTTAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 112253 CASAVA_Build 6 64045524 1D TATTACTGTA C/- CCTGTGGAGC 3070 hom 128 het 46 0 43 3 C 3 2 112254 CASAVA_Build 6 64145899 1D CAGATTTTTG A/- AAAAAAAAAA 1658 het 1658 ref 32 18 5 9 A 17 16 112255 CASAVA_Build 6 64147710 1I AATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 9 10 112256 CASAVA_Build 6 64188911 1I TGAGTCAGGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 8 9 112257 CASAVA_Build 6 64192846 1D TGGATAAAAG A/- CATAAGACAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 0 112258 CASAVA_Build 6 64195778 1D TTATTGATTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 68 het 26 0 23 3 A 9 8 112259 CASAVA_Build 6 64199545 4I TGATTAGTTT ----/TAAC TAACTAAATG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TAAC 1 2 112260 CASAVA_Build 6 64200825 9D AAAATCTATG CTCTTTACC/--------- CTTCTATTCC 3070 het 3070 ref 46 24 19 5 CTCTTTACC 1 0 112261 CASAVA_Build 6 64203773 3D CATCCAAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 274 hom 32 2 17 13 A 19 16 112262 CASAVA_Build 6 64204746 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 7 8 112263 CASAVA_Build 6 64210325 1D GGTCCTGATT G/- GTGCATTTAC 3070 hom 39 het 18 0 13 5 G 2 1 112264 CASAVA_Build 6 64211779 1I AGCTGTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 A 14 15 112265 CASAVA_Build 6 64218415 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 4 A 11 10 112266 CASAVA_Build 6 64230658 1I ATCTTGCTTC -/T GTCTACATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 112267 CASAVA_Build 6 64232011 1D TTCCCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 679 hom 30 2 23 5 A 11 10 112268 CASAVA_Build 6 64235143 1I AGTGAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 35 1 30 4 A 10 11 112269 CASAVA_Build 6 64235557 4D ATTTAATCTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 43 het 23 0 13 10 TTTG 3 2 112270 CASAVA_Build 6 64239161 1I CCTTTTCAAT -/C CAGGTGGCAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 1 2 112271 CASAVA_Build 6 64242752 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 31 1 21 9 A 16 15 112272 CASAVA_Build 6 64246351 1D GGACGTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 11 10 112273 CASAVA_Build 6 64247258 1D TAACAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1369 hom 29 5 17 7 T 13 12 112274 CASAVA_Build 6 64333044 1D GCCCAGATAA T/- TTTTTTTTTT 1463 het 1463 ref 32 23 4 5 T 13 12 112275 CASAVA_Build 6 64370782 3D TAATTTTCTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 59 het 23 0 20 3 TTG 4 3 112276 CASAVA_Build 6 64380582 1D AAGATGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 29 2 22 6 T 12 11 112277 CASAVA_Build 6 64386742 1D AGATTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1282 het 158 hom 12 3 7 2 A 17 16 112278 CASAVA_Build 6 64405502 3I ATTCTTTCCT ---/TCA TCATCATCGT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 TCA 2 3 112279 CASAVA_Build 6 64442183 3I CATATATATG ---/TAT GTGTATATAT 2601 het 2601 ref 28 15 6 7 TAT 0 1 112280 CASAVA_Build 6 64533230 11I TGAATTACTT -----------/AGGGAAGGCTA AGGGAAGGCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AGGGAAGGCTA 0 1 112281 CASAVA_Build 6 64540020 1I AAAAGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2070 hom 26 8 12 6 T 11 12 112282 CASAVA_Build 6 64630687 2I ATAACCCTGC --/CA CACACACAGA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 CA 4 5 112283 CASAVA_Build 6 64632352 2I TTTCTCCCTC --/TT TTTTCTGTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 4 6 112284 CASAVA_Build 6 64634083 2D AATATTTCTG GT/-- GTGACCTAAA 3070 hom 132 het 49 0 45 6 GT 2 1 112285 CASAVA_Build 6 64637257 1D TTCACTTTAC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 A 7 6 112286 CASAVA_Build 6 64655615 1D GATGCAGAAG T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 52 het 22 0 16 6 T 8 7 112287 CASAVA_Build 6 64663001 1D TGTGAGCGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 4 A 12 11 112288 CASAVA_Build 6 64663099 2D AATGATTTCA TT/-- TTTTTTTCAG 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 9 7 112289 CASAVA_Build 6 64666357 1I TAATAATAAT -/A AAAAATAAAT 3070 het 68 hom 9 1 8 0 A 5 6 112290 CASAVA_Build 6 64666650 1D TCAGAGAAAA G/- AATGTAAGAT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 G 1 0 112291 CASAVA_Build 6 64673118 1I TGGAAAGGCC -/T TTTAAATAAA 3070 hom 72 het 26 0 23 3 T 3 4 112292 CASAVA_Build 6 64688010 1I TTCCAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 43 0 33 10 T 10 11 112293 CASAVA_Build 6 64698133 1D AAGAAACCCA C/- CCCCCCCACC 1459 hom 17 het 7 0 6 1 C 8 7 112294 CASAVA_Build 6 64699156 4D TCTTTCTGTT ACTC/---- ACTCACTCAC 3070 hom 126 het 47 0 42 7 ACTC 4 3 112295 CASAVA_Build 6 64714183 4I TATCTGAATG ----/GATT ATCATATTCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 GATT 0 1 112296 CASAVA_Build 6 64716471 4D TTCCTTTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 63 het 28 0 22 8 TCTT 3 2 112297 CASAVA_Build 6 64719624 1I GTTAATGCTT -/C TTTTTCTTTA 3070 hom 56 het 21 0 18 3 C 0 1 112298 CASAVA_Build 6 64734370 1D GAAAAAAAAA C/- TGGTTGCTGC 3070 het 3070 hom 54 17 28 10 C 1 0 112299 CASAVA_Build 6 64741822 1D AGGAAAAAAA T/- GTAAGGCTTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 0 112300 CASAVA_Build 6 64745239 1I ATATTTACCC -/T ATTGTGCTAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 0 1 112301 CASAVA_Build 6 64754796 1I GTTAAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 119 het 47 0 40 7 A 8 9 112302 CASAVA_Build 6 64757500 1D TTTTATACAC T/- TTTTTTTACA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 8 7 112303 CASAVA_Build 6 64763883 8D CAAAGTATAC ATGTATCA/-------- AAACACTACA 3070 hom 72 het 24 0 25 3 ATGTATCA 1 0 112304 CASAVA_Build 6 64766644 1D TGGAGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 337 hom 36 1 29 6 T 16 15 112305 CASAVA_Build 6 64772311 1D TTTGAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 33 1 26 6 T 11 10 112306 CASAVA_Build 6 64777303 1D GCAAGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2518 hom 18 het 10 0 7 3 T 7 6 112307 CASAVA_Build 6 64778229 2I TGGCATTGGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 74 hom 24 1 16 7 TG 5 6 112308 CASAVA_Build 6 64782632 2D TCTTTTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 T 14 12 112309 CASAVA_Build 6 64789010 1I TTTTCAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1457 hom 34 4 26 4 A 11 12 112310 CASAVA_Build 6 64790447 1I CAGAGTTCAG -/A AGCCAGAAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 112311 CASAVA_Build 6 64793046 15D TGCCAGGCTT TCTGGGAAAGGGCTC/--------------- TCTAACAACC 3070 hom 71 het 30 0 20 10 TCTGGGAAAGGGCTC 1 0 112312 CASAVA_Build 6 64801535 1I AGATCAGATA -/C GGTTGCTACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 0 1 112313 CASAVA_Build 6 64814053 1I AGTTGAGAAC -/A ATTAGCTTCT 3070 het 2667 hom 21 7 8 6 A 1 2 112314 CASAVA_Build 6 64814399 1D AGCTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 14 9 T 12 11 112315 CASAVA_Build 6 64815034 1I TCATTAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 17 12 A 10 11 112316 CASAVA_Build 6 64816545 1D CATCTAGTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 9 8 112317 CASAVA_Build 6 64816756 1D CCTGCCATTC T/- TTTCCCCCCC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 4 3 112318 CASAVA_Build 6 64826780 4I AATCTGGAGT ----/CTTC CTTAGCATAC 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 CTTC 0 1 112319 CASAVA_Build 6 64837367 1I ATTGTTTTTG -/T TACTCAAGCA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 1 2 112320 CASAVA_Build 6 64850765 1I ATGCAACTTC -/T TTTTTTTTTT 2050 het 2050 ref 35 15 6 14 T 14 15 112321 CASAVA_Build 6 64857398 1I TATACTAAAC -/T TTTTTTACCA 1902 het 1902 ref 12 7 4 1 T 6 7 112322 CASAVA_Build 6 64869058 1I TTTTAATAGA -/T TTTTTTTTTT 2670 het 2670 ref 33 10 6 17 T 11 12 112323 CASAVA_Build 6 64869412 1D ACTTGGCAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 A 10 9 112324 CASAVA_Build 6 64885181 1D AGAGGAACAA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 C 10 9 112325 CASAVA_Build 6 64898962 1D TCGTGATCCT C/- CCCCCCTTGG 3070 het 1912 hom 18 7 9 2 C 7 6 112326 CASAVA_Build 6 64923197 1D CAGCACATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 17 11 T 15 14 112327 CASAVA_Build 6 64939004 3I AACATTAAAC ---/ATT ATTTTATGGT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 ATT 1 2 112328 CASAVA_Build 6 64939477 3D GATTATTGAT ATA/--- ACAGTCTTCC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 ATA 1 0 112329 CASAVA_Build 6 64944862 2I TGTTGTTGTT --/AC GCTATCAATG 2298 het 2298 ref 40 13 6 21 AC 0 1 112330 CASAVA_Build 6 64945187 2I TCACACACTG --/TA TATATATATA 3002 het 3002 ref 25 14 7 4 TA 7 8 112331 CASAVA_Build 6 64949809 12D TGTCCATTTC TATTTATGATTG/------------ TATTTACAGG 3070 het 3070 hom 39 17 20 6 TATTTATGATTG 1 0 112332 CASAVA_Build 6 64952482 1D CTTGAAACTA C/- TTGAAGAGAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 C 1 0 112333 CASAVA_Build 6 64952750 1D GGTCTGAATG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 8 7 112334 CASAVA_Build 6 64953047 5I ATAAATATGT -----/CATAG CATAGCAGTC 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 CATAG 1 2 112335 CASAVA_Build 6 64953224 2I GTATTCACTT --/AA GATTATTTTT 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 A 0 2 112336 CASAVA_Build 6 64956998 1I GCTGTCATCA -/G GCACCAGTTA 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 G 1 2 112337 CASAVA_Build 6 64962139 1D TTAATTATTA C/- CTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 C 2 1 112338 CASAVA_Build 6 64965623 1D TTAGGATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 11 10 112339 CASAVA_Build 6 64967584 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 984 hom 15 3 9 3 A 9 8 112340 CASAVA_Build 6 64975523 5I TTATGCCAAC -----/TTTAT TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 TTTAT 1 2 112341 CASAVA_Build 6 64981135 1I AAATACATAT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 7 8 112342 CASAVA_Build 6 64986221 2D AAAGACAGAC AG/-- AGACATTCCT 3070 het 3070 hom 42 19 21 5 AG 2 1 112343 CASAVA_Build 6 64987769 1D CATTCTCAGC A/- AACTACTGCA 2689 het 2689 ref 19 11 6 2 A 3 2 112344 CASAVA_Build 6 64990146 5D ATATAAATTC TTAAA/----- TTAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 52 20 28 6 TTAAA 1 0 112345 CASAVA_Build 6 64992688 1D TTGTGAATGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 10 9 112346 CASAVA_Build 6 65000195 1D AATTTTGAAT C/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 19 16 2 C 1 0 112347 CASAVA_Build 6 65002111 1I GAAAACTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 T 10 11 112348 CASAVA_Build 6 65002285 2D CTGCAGAGTG TT/-- TTTATTGTTT 3070 het 3070 hom 35 15 19 3 T 5 3 112349 CASAVA_Build 6 65002733 1D AACTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 879 hom 22 5 12 5 T 11 10 112350 CASAVA_Build 6 65004572 1I TTTTTCTTCC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 8 9 112351 CASAVA_Build 6 65010290 1D AAATTCTAAG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 T 8 7 112352 CASAVA_Build 6 65014030 1D TTAGGCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 14 9 T 11 10 112353 CASAVA_Build 6 65016148 1D GTGAAGTCAT C/- AATGTCTCTT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 C 1 0 112354 CASAVA_Build 6 65021603 1I77M1D ACTTAGTGCA -GGGGGGTTTATTCTCAAGGGGACAGGCTTTAGCCGTTATGAATCAAGGGCTAGAACTGGGCCATAAATTCATCTTTTC/GGGGGGGTTTATTCTCAAGGGGACAGGCTTTAGCCATTATGAATCAAGGGCTAGAACTGGGCCATAAATTCATCTTTT- TTCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 59 51 21 29 N/A 0 0 112355 CASAVA_Build 6 65026650 1D TCCTTTACAG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 8 7 112356 CASAVA_Build 6 65027655 2D51M1D CAGTCCCCTC TTTTGCAGATATAGAGTTATATTTCTAACTTTTATTATTGTTTTATCAAAAACA/--TTGCAGATATAGAGTTATATTTCTAACTTTTATTATTGTTTTATCAAAAAC- AAACTTATTT 3070 het 3070 ref 43 40 12 17 N/A 0 0 112357 CASAVA_Build 6 65027997 1I GCAGGGGGTA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 6 7 112358 CASAVA_Build 6 65028843 4I20M1D GTAACTAGAG ----TATCACTTTCAGCACTTATCA/TATCTATCACTTTCAGCACTTATC- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 30 18 15 2 N/A 0 0 112359 CASAVA_Build 6 65030926 3D GTGTGTAAGG TGA/--- TGATAGTAAA 3070 het 3070 ref 32 16 15 3 TGA 2 1 112360 CASAVA_Build 6 65031955 3I CTAAAAGAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 AAC 3 4 112361 CASAVA_Build 6 65032944 8I GAGAGTTATG --------/TTTACCCC TTTACCCCCA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 TTTACCCC 1 2 112362 CASAVA_Build 6 65039566 1D ATTTTGTGGG T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 T 8 7 112363 CASAVA_Build 6 65054775 4D TTTTCTGTAC TTTA/---- TTTAATAGTA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 TTTA 2 1 112364 CASAVA_Build 6 65055507 8D CAGTGAGTAT AATTCTTC/-------- AAAATCCCAC 3070 het 3070 hom 47 20 22 6 AATTCTTC 1 0 112365 CASAVA_Build 6 65061950 9I TAATCCAAAG ---------/GTGAAAGTA TTTGTCATAT 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 GTGAAAGTA 0 1 112366 CASAVA_Build 6 65065088 1D TGTCACACTT C/- CCCCCCATTG 3070 het 3070 ref 53 20 18 15 C 7 6 112367 CASAVA_Build 6 65065240 1I ATCCATGCCC -/A AGGAAAGGGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 1 2 112368 CASAVA_Build 6 65066204 1D ATTACTAGTT G/- GGGGGGGCAC 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 G 8 7 112369 CASAVA_Build 6 65073206 1D ATCCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 23 1 T 11 10 112370 CASAVA_Build 6 65075653 17D TACTACCCAT ATGTATCTCATAACATC/----------------- ATGTATCTCA 3070 het 3070 ref 43 18 14 16 ATGTATCTCATAACATC 2 1 112371 CASAVA_Build 6 65077444 3D TACAAACAAC CTT/--- CTTATAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 CTT 2 1 112372 CASAVA_Build 6 65077814 1D AGACTCCATG A/- AAAAAAAAAA 2889 het 1049 hom 21 6 8 7 A 15 14 112373 CASAVA_Build 6 65078626 5D GGTGAAAAAA AAGAG/----- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 44 14 28 7 AAGAG 1 0 112374 CASAVA_Build 6 65085191 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 1425 het 1425 ref 23 13 3 7 A 12 11 112375 CASAVA_Build 6 65085276 1D CAAACAGATG A/- AAAAAAGCTC 3070 het 3070 ref 38 22 10 7 A 7 6 112376 CASAVA_Build 6 65091003 3D83M2D TTAATTTTAG AATAATTTGTCACCCCAAAAAGAAACACCTTACCTGTTAGTAGTTTGTCTCTATTATTTCTTCAATGCTAGGGAATTACTAATATTAC/---AATTTGTCACCCCAAAAAGAAACACCTTACCTGTTAGTAGTTTGTCTCTATTATTTCTTCAATGCTAGGGAATTACTAATATT-- ATTCTATCCT 3070 het 3070 ref 35 41 14 15 N/A 0 0 112377 CASAVA_Build 6 65094020 5I AAATTTAAAA -----/ATCCT CTTAAAGTTT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 ATCCT 0 1 112378 CASAVA_Build 6 65094673 3I TGGTCACGGG ---/AGC AGCATGTGCA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 AGC 1 2 112379 CASAVA_Build 6 65099451 3D AATAGCCCCC CCG/--- CCCGCCCAGT 2140 het 569 hom 14 3 7 4 CCG 1 0 112380 CASAVA_Build 6 65106825 1D CACATTATAC A/- AAAAATCAGC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 6 5 112381 CASAVA_Build 6 65107898 1D ATAATCTATG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 8 7 112382 CASAVA_Build 6 65115447 1I ATACGCAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 A 9 10 112383 CASAVA_Build 6 65116281 4I5M1I2M4I18M1I TTTCTTTCTC ----CCATG-GA----AGCCACTCCCATGGAAGT-/TTTATTATGAGAAGTCAGCCACTCCCATGGAAGTA AACTTTCAGA 3070 het 3070 ref 32 22 17 4 N/A 0 0 112384 CASAVA_Build 6 65117299 1D TAAATTAAGA T/- GCAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 1 0 112385 CASAVA_Build 6 65118186 1I GCCCTTGCTT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 2964 hom 31 9 15 7 A 7 8 112386 CASAVA_Build 6 65118314 2D AATAATTTTG AT/-- AGCATTTTCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 AT 1 0 112387 CASAVA_Build 6 65118919 1D ATGAAACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 T 14 13 112388 CASAVA_Build 6 65125179 5I ATGAGCAGCC -----/TCTTG TCTTATTTCC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 TCTTG 0 1 112389 CASAVA_Build 6 65129064 1I GAAAATATGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 9 10 112390 CASAVA_Build 6 65130854 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 10 9 112391 CASAVA_Build 6 65131434 1D CTGTGATAAG T/- TAAGTTACTT 3070 het 3070 ref 44 19 19 7 T 2 1 112392 CASAVA_Build 6 65144645 1D ATAAAATTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 43 19 23 1 T 8 7 112393 CASAVA_Build 6 65146018 7D AGGAATGGTT AACAGAC/------- AACATCAGTG 3070 het 3070 ref 22 10 11 4 AACAGAC 1 0 112394 CASAVA_Build 6 65147966 1I GCAACTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 10 11 112395 CASAVA_Build 6 65153655 1D TTTGTTAACA T/- TTTTTCTCCA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 6 5 112396 CASAVA_Build 6 65164628 1I TACACAGGTA -/T TTTTTCTGGT 3070 het 3070 ref 22 11 11 0 T 5 6 112397 CASAVA_Build 6 65165120 2D GTCAGGTTTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 19 24 8 AC 9 8 112398 CASAVA_Build 6 65170987 18D GTAATATAGA GTGTGAGAGTGTGTGTGT/------------------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 30 10 18 4 GTGTGAGAGTGTGTGTGT 1 0 112399 CASAVA_Build 6 65185397 1I TGTCCCATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 10 11 112400 CASAVA_Build 6 65189580 4D ATATAAAATA CTTT/---- CTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 30 12 14 6 CTTT 2 1 112401 CASAVA_Build 6 65197753 1D AAGGAATACA C/- ATTCAGGCTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 C 1 0 112402 CASAVA_Build 6 65202053 2D TTCTTCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3020 het 2353 hom 24 6 8 10 T 15 13 112403 CASAVA_Build 6 65203722 1D TATGATATTT G/- GGCCATTGCA 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 G 3 2 112404 CASAVA_Build 6 65204362 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 T 10 11 112405 CASAVA_Build 6 65205270 1D AAATAAGGAG A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 ref 42 27 14 1 A 7 6 112406 CASAVA_Build 6 65206608 1I TATTAAATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 T 9 10 112407 CASAVA_Build 6 65210719 2D CATGAAATTA GG/-- GGTAATTTCT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 G 4 2 112408 CASAVA_Build 6 65213173 1D GCATTTTTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 9 8 112409 CASAVA_Build 6 65214074 2I GAAATTCTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 10 12 112410 CASAVA_Build 6 65222407 1I GTTTTCAGTT -/C TTTTATAAGT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 C 0 1 112411 CASAVA_Build 6 65224409 1D CATTTTTTTT C/- CCCCCCATTT 3070 het 3070 hom 51 23 24 5 C 7 6 112412 CASAVA_Build 6 65225015 1D TAGAAAAGTC T/- TATTTCTCCT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 2 1 112413 CASAVA_Build 6 65225203 1I GCTTCTTTTC -/T TTTGATGGTC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 3 4 112414 CASAVA_Build 6 65232347 1I CCAAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 12 13 112415 CASAVA_Build 6 65232630 4I2M1I AGAGCACTAA ----TC-/ATACTCA AGTAGAAAAA 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 N/A 0 0 112416 CASAVA_Build 6 65237180 9D CTTGGGCCAC ACATAAAAT/--------- ACACTAACTA 3070 het 3070 hom 30 13 16 4 ACATAAAAT 1 0 112417 CASAVA_Build 6 65238173 1D GGGAAACAAC A/- AAACACTGAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 A 4 3 112418 CASAVA_Build 6 65238594 1I TTCCCAACAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 A 8 9 112419 CASAVA_Build 6 65242357 1D TAAAAGGAAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 9 8 112420 CASAVA_Build 6 65248035 1I AAATACAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1477 hom 19 4 11 4 T 9 10 112421 CASAVA_Build 6 65248315 1D TGAATTAATG T/- GATCAAAGAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 1 0 112422 CASAVA_Build 6 65258437 3D AAGTAAATTA TTC/--- TTCTCTCTGT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TTC 2 1 112423 CASAVA_Build 6 65262988 1I TAGTTGTCTG -/C AAATGAATAG 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 C 0 1 112424 CASAVA_Build 6 65270399 2I CCTAAATATC --/AT ATCAAATTGT 3070 het 3070 hom 55 20 21 14 AT 1 2 112425 CASAVA_Build 6 65274368 3D CCCACATTTA TTT/--- AAAAATTCCA 3070 het 3066 hom 16 7 9 2 T 3 0 112426 CASAVA_Build 6 65274927 6I AAGCTAAATA ------/AAATAT AAATATAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 AAATAT 1 2 112427 CASAVA_Build 6 65277726 1D CTTTATAAAT A/- AAAAAAATCA 2680 het 2680 ref 17 9 7 1 A 8 7 112428 CASAVA_Build 6 65278441 1I TTGGGGGGGG -/T GTGTTAAAAT 3070 het 1962 hom 31 7 19 5 T 0 1 112429 CASAVA_Build 6 65283193 12D ATACTTCACT TGAAGTTGAGTC/------------ TGAAGTTGAG 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 TGAAGTTGAGTC 2 1 112430 CASAVA_Build 6 65296210 7I CTATAAGAAT -------/TAAATGA TGAATGATGC 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 TAAATGA 0 1 112431 CASAVA_Build 6 65296445 8I GAACACGTTA --------/AGTACTAT AAATAAAGTT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 AGTACTAT 0 1 112432 CASAVA_Build 6 65298008 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 23 0 10 13 T 12 11 112433 CASAVA_Build 6 65359637 1D TGTATCTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 A 10 9 112434 CASAVA_Build 6 65362861 1D CATGAGATTT G/- GGCAGGGTCA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 G 3 2 112435 CASAVA_Build 6 65366873 18I AATTCTCTCT ------------------/ATTATTTAAGTGTTAAAA ATGGTTTCTG 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 ATTATTTAAGTGTTAAAA 0 1 112436 CASAVA_Build 6 65368052 1I TTTATTATCA -/T TTACTCTATT 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 T 2 3 112437 CASAVA_Build 6 65394861 1D CATAGCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1314 hom 38 4 25 9 T 14 13 112438 CASAVA_Build 6 65398681 5I GAACGATGTT -----/ATAAC ATGACTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ATAAC 0 1 112439 CASAVA_Build 6 65398932 1I CAAAAAATTA -/T AAGTATATAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 112440 CASAVA_Build 6 65399227 48I ATCTAACTGG ------------------------------------------------/ATCAGAAATTGTCATCTAGGTCATAGGAATTCACATATTTCTATTTAT ATTCATCCTT 3070 hom 75 het 21 0 27 3 ATCAGAAATTGTCATCTAGGTCATAGGAATTCACATATTTCTATTTAT 0 1 112441 CASAVA_Build 6 65410935 1I GCAGAGTTAA -/T TTTTTTTACT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 8 112442 CASAVA_Build 6 65412321 1I TAATAATAAA -/T TGAAAAAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 112443 CASAVA_Build 6 65415920 1I39M1I TAATATGCTT -ACATATAATATTAGGACTCCATATATTTCTATAACTGCC-/CACATATAATATTAGGACTCCATATATTTCTATAACTGCCT TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 33 1 45 1 N/A 0 0 112444 CASAVA_Build 6 65419717 1I GTATCCCTAA -/T TTAAAATCAG 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 2 3 112445 CASAVA_Build 6 65421974 2D TTTTCTGCTC AA/-- AGTCTAATAA 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 3 1 112446 CASAVA_Build 6 65422807 1D AGTATCACAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 187 het 66 0 63 4 A 9 8 112447 CASAVA_Build 6 65424933 2I TTAGCTCGGA --/GT AGTTTGATCG 3070 hom 24 het 10 0 8 2 GT 0 1 112448 CASAVA_Build 6 65429513 1D CTCCACCCCA T/- TTTTGAGAAT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 5 4 112449 CASAVA_Build 6 65429735 1D TGATTTTCCT A/- AAAAATAATA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 5 112450 CASAVA_Build 6 65429987 3D TTGGACAGTT AAC/--- AACTTTTTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 AAC 2 1 112451 CASAVA_Build 6 65432549 1I TGGCTGGAGG -/C CCAGGAACTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 2 3 112452 CASAVA_Build 6 65445812 1D CTGATGGTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 8 112453 CASAVA_Build 6 65451207 1I AGGAAAAAAA -/T ATATATAGAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 0 1 112454 CASAVA_Build 6 65451918 1D TACTTGATTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 53 het 21 0 18 5 A 8 7 112455 CASAVA_Build 6 65468650 1I ATAAAATGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 9 10 112456 CASAVA_Build 6 65472633 2D AAAATTATTC AA/-- AAAAAAAAAA 2884 hom 15 het 6 0 6 1 A 12 10 112457 CASAVA_Build 6 65472986 25D GAAGATGACA TCAGAAAAACCTTTCTAGACATTGG/------------------------- CTTAGTCAAA 3004 hom 18 het 5 0 7 0 TCAGAAAAACCTTTCTAGACATTGG 1 0 112458 CASAVA_Build 6 65475634 2D ATGCACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 129 het 50 0 44 9 AC 9 8 112459 CASAVA_Build 6 65481910 14D GTGTGTTGCT TACGTCCAGTCTAC/-------------- TCCAAAATTG 3070 hom 110 het 41 0 36 10 TACGTCCAGTCTAC 1 0 112460 CASAVA_Build 6 65487627 8D AGGTGTTTTT ATATTCTC/-------- TAAGCCAAAT 3070 hom 126 het 42 0 41 3 ATATTCTC 1 0 112461 CASAVA_Build 6 65492759 1D CAAAATTCAA C/- CAACCCTCGA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 2 1 112462 CASAVA_Build 6 65499363 1I TGAAACAGGC -/A AAAAAAGAGT 3070 hom 141 het 56 0 48 8 A 6 7 112463 CASAVA_Build 6 65500739 1D ATTTTAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 11 10 112464 CASAVA_Build 6 65504673 1I CTATCGAGAA -/G TGAAATAAAA 3070 hom 156 het 59 0 52 7 G 0 1 112465 CASAVA_Build 6 65521009 1I TTCACAGCTG -/A ATGCCACCAG 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 1 2 112466 CASAVA_Build 6 65556499 2D AAGTTGTATG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 83 het 37 0 28 10 AT 9 8 112467 CASAVA_Build 6 65561850 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 31 1 25 6 A 14 13 112468 CASAVA_Build 6 65561968 4D ATGAAGTGGG TGGT/---- TGGTTGAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TGGT 2 1 112469 CASAVA_Build 6 65567182 1D CAAAGGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 28 1 21 6 T 13 12 112470 CASAVA_Build 6 65568159 3D TACTCTGGGT TGA/--- TGATAACTGA 3070 hom 105 het 39 0 36 6 TGA 2 1 112471 CASAVA_Build 6 65571526 4D TGCTAAAATC TATT/---- TATAAGAACT 3070 hom 69 het 24 0 24 1 TATT 1 0 112472 CASAVA_Build 6 65576719 3D ATCAGTATCA ATC/--- ATCTGCATAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 ATC 2 1 112473 CASAVA_Build 6 65579400 1I TATTATTTTA -/C AAGTTGAACA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 0 1 112474 CASAVA_Build 6 65602096 1I CTGAGAATTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 8 9 112475 CASAVA_Build 6 65602803 1I ACATGTCATG -/A TTTTTTTTCA 3070 het 104 hom 26 1 20 5 A 0 1 112476 CASAVA_Build 6 65603821 2D TGTACATGTA TT/-- GTTTTTAATG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 0 112477 CASAVA_Build 6 65613628 4D CTCCCCAGTG TGAA/---- TGAATGCCCA 3070 hom 126 het 46 0 43 4 TGAA 2 1 112478 CASAVA_Build 6 65618761 4I TATGCTGTGA ----/TGGT TGGTTAGTAC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TGGT 1 2 112479 CASAVA_Build 6 65633271 2I CCATTGAATT --/AA GTTATTAGAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 2 112480 CASAVA_Build 6 65633844 4I AATTTGTTCA ----/TTTG TTTGTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTTG 1 2 112481 CASAVA_Build 6 65650465 4I AAATTTGGAC ----/TCTA TCTGTGATAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TCTA 0 1 112482 CASAVA_Build 6 65656660 2D CCTATAAATG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 29 het 12 0 9 3 C 12 10 112483 CASAVA_Build 6 65663162 1I AGTTGTTGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 242 hom 46 1 40 5 G 0 1 112484 CASAVA_Build 6 65667670 1I AAATACTATG -/C AGCTATAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 0 1 112485 CASAVA_Build 6 65668674 4I TGCTCACTTT ----/ATTA CTTGTTGAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATTA 0 1 112486 CASAVA_Build 6 65678844 1D CTTCTGAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 9 8 112487 CASAVA_Build 6 65690521 4I AGGCTGGCAT ----/TGAG TGTCTGTGGC 3070 het 99 hom 23 1 11 11 TGAG 0 1 112488 CASAVA_Build 6 65692049 1I ATGTGGTGGC -/T TTCTCAAATG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 3 112489 CASAVA_Build 6 65720624 1D CATTAGTAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 35 0 32 5 A 10 9 112490 CASAVA_Build 6 65723238 4D GCAAGGGAAA CAAT/---- CAACAAAGTA 3070 het 3070 ref 33 22 9 4 CAAT 1 0 112491 CASAVA_Build 6 65728067 2D CCAATATATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 11 8 8 AT 8 7 112492 CASAVA_Build 6 65728915 4D TATTTTAAAC TTTA/---- TTTATCTAGT 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 TTTA 2 1 112493 CASAVA_Build 6 65735445 6I TTGCCTAGGA ------/CCTTTG CCTGTCCTTA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 CCTTTG 0 1 112494 CASAVA_Build 6 65737914 1D CCTATTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 32 2 27 4 A 11 10 112495 CASAVA_Build 6 65753377 14I5M6I AGTTAAAATT --------------GATGT------/TAAAATTTTAACTACATTTAAAAAC ATTTTAGAAA 3070 het 3070 ref 24 14 10 1 N/A 0 0 112496 CASAVA_Build 6 65754746 1D CTGAGAGGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 10 9 112497 CASAVA_Build 6 65762330 1I CTTTCTGCTT -/C CCCCCCCGCC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 C 7 8 112498 CASAVA_Build 6 65768672 5I AAAAGTCAAA -----/TATAT TATAATACAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TATAT 0 1 112499 CASAVA_Build 6 65769534 1D TTCCTATGCC T/- GTCTTTACTT 2871 het 2871 ref 19 9 7 3 T 1 0 112500 CASAVA_Build 6 65775078 1D CAAATGGGAT A/- AAAAAAAAGG 2451 het 2451 ref 26 17 7 2 A 9 8 112501 CASAVA_Build 6 65783088 1D TAAAATCTGC T/- GTTTAAAATG 3070 het 3070 hom 31 11 20 1 T 1 0 112502 CASAVA_Build 6 65798473 1D AAGTTAGCAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 16 14 7 A 9 8 112503 CASAVA_Build 6 65820071 1D TACAATGGGG T/- AAGAGTCATC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 1 0 112504 CASAVA_Build 6 65822909 1I AGTCCTAAAA -/T TAGCTAGATC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 1 2 112505 CASAVA_Build 6 65827397 4D TATATATGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 2594 hom 26 7 12 7 TA 10 8 112506 CASAVA_Build 6 65832163 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 13 1 11 1 T 11 12 112507 CASAVA_Build 6 65852561 5I TCCCAAAATT -----/AAATA AATCTCTCCC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AAATA 0 1 112508 CASAVA_Build 6 65874011 1I TTATATAACA -/T CCTACAATAT 3070 hom 78 het 28 0 25 3 T 0 1 112509 CASAVA_Build 6 65874109 1I AAATGGCTGC -/A GATCTAACTT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 0 1 112510 CASAVA_Build 6 65874291 1I ACAGTGGGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 683 hom 32 2 24 6 T 9 10 112511 CASAVA_Build 6 65874806 1D TGCAGGTCCG T/- TTAGAGATAA 3070 hom 78 het 31 0 26 7 T 3 2 112512 CASAVA_Build 6 65874921 1D ACGCACTTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 7 112513 CASAVA_Build 6 65880007 2D ATTGAGATCT AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 10 8 112514 CASAVA_Build 6 65880326 7I TTAGCTGTGT -------/TCCCTAC AGGGAATTAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TCCCTAC 0 1 112515 CASAVA_Build 6 65880935 1D41M5D GAATATCATA TTTTTTTCTTATTAAAACTCATAAGTAGATTTGAAAAAAAAAAAAGC/-TTTTTTCTTATTAAAACTCATAAGTAGATTTGAAAAAAAAA----- AGCAGCAGCA 3070 hom 108 het 40 0 37 14 N/A 0 0 112516 CASAVA_Build 6 65881077 3D TCCAAACTAA TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 15 T 12 9 112517 CASAVA_Build 6 65882391 8I AAAAGACATA --------/TATTTGTT GATTAGATTT 3070 hom 102 het 35 0 35 2 TATTTGTT 0 1 112518 CASAVA_Build 6 65883495 6D AAAAGGAGAA TATTTC/------ CTGCCACCCT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TATTTC 1 0 112519 CASAVA_Build 6 65884968 1I TGAACTACTA -/G TCCAAATACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 112520 CASAVA_Build 6 65888134 1D GGAAATTTGT G/- AAAAAACATG 3070 hom 101 het 39 0 34 5 G 1 0 112521 CASAVA_Build 6 65890618 5I TCATGGTGAA -----/ATCTC ATCTCTACGA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 ATCTC 1 2 112522 CASAVA_Build 6 65900537 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 9 8 112523 CASAVA_Build 6 65902277 1I ATCTCATTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 21 18 2 T 9 10 112524 CASAVA_Build 6 65903279 1D GTTACTAGAC A/- AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 A 7 6 112525 CASAVA_Build 6 65908110 2D GTATAATAAT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 25 14 9 5 A 10 8 112526 CASAVA_Build 6 65908380 1I TCAGAAGTTC -/A GGGGGCAAGA 3070 het 3070 ref 38 22 16 0 A 0 1 112527 CASAVA_Build 6 65908925 1D TGGTTAAGAC A/- ATTACATTAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 A 2 1 112528 CASAVA_Build 6 65909877 1D GACTGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 11 10 112529 CASAVA_Build 6 65912865 7D TTTTTCCCCC AAGGCCA/------- AAGTTCAAAA 3070 het 3070 ref 35 22 14 4 AAGGCCA 1 0 112530 CASAVA_Build 6 65917326 4I GAGCATTTTG ----/TTCT TTCTAATAGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TTCT 1 2 112531 CASAVA_Build 6 65934685 1I GTATTCTCTA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 7 8 112532 CASAVA_Build 6 65939597 1D CTGGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 13 12 112533 CASAVA_Build 6 65951652 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 A 10 9 112534 CASAVA_Build 6 65952608 7I TTGCCAAGCA -------/AATAAGT CTTTACAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 AATAAGT 0 1 112535 CASAVA_Build 6 65958563 1D TCATTTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 12 11 112536 CASAVA_Build 6 65961468 1I TTGCCAGTTG -/T TTTTTTTTTT 1876 het 1876 ref 30 16 5 9 T 13 14 112537 CASAVA_Build 6 65978700 1D TTTATGCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 15 19 11 A 10 9 112538 CASAVA_Build 6 65982660 4I TAAGTCTTCA ----/CAAT CAGTGTTCTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 CAAT 0 1 112539 CASAVA_Build 6 65991222 2D GAGAATCAAC AA/-- AACTAAAAGT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 4 2 112540 CASAVA_Build 6 65995886 1D CTAGATAAAC A/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 6 5 112541 CASAVA_Build 6 65996991 1I GCAACCATCT -/A ATGAGGTCAA 3070 het 3070 ref 46 25 21 0 A 1 2 112542 CASAVA_Build 6 66002024 3I GATAAACTGC ---/ATA ATAAGACACA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 ATA 1 2 112543 CASAVA_Build 6 66003226 1D TGTCTCAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 10 9 112544 CASAVA_Build 6 66005482 1D AACATAACTG A/- AGATGAACAA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 2 1 112545 CASAVA_Build 6 66009685 22D TATAACAATA TGATTTGCAACAAAAAATAAAC/---------------------- TGATTTGCAA 3070 het 3070 hom 43 19 19 13 TGATTTGCAACAAAAAATAAAC 2 1 112546 CASAVA_Build 6 66018071 1I ATTTCCAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 A 9 10 112547 CASAVA_Build 6 66035420 1I TCAACATAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 9 10 112548 CASAVA_Build 6 66044044 1I AGATTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 323 het 31 hom 13 1 5 7 A 13 14 112549 CASAVA_Build 6 66062331 1D AGTGAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 11 10 112550 CASAVA_Build 6 66063554 4D TTCTGGAGTT AGAG/---- AGACAAAGAT 3070 het 3070 hom 33 16 16 2 AG 3 1 112551 CASAVA_Build 6 66066235 1D TAAATATTCC T/- ATAATAATGC 3070 het 3070 hom 25 8 16 2 T 1 0 112552 CASAVA_Build 6 66068619 1I AAAAACTGAT -/G TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 59 33 17 9 G 0 1 112553 CASAVA_Build 6 66075819 1D TGGTTCCATC A/- AGACAGTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 18 0 A 2 1 112554 CASAVA_Build 6 66078752 1D TAAGGTGGTT A/- GAAGATGGTA 2940 het 2940 ref 16 9 6 2 A 1 0 112555 CASAVA_Build 6 66080750 2D TGTATGTGCA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 TG 5 4 112556 CASAVA_Build 6 66083081 1I TTTCTTTTTT -/A AATCGTCAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 3 112557 CASAVA_Build 6 66086851 1D GCTGCGAGTC A/- GCCAATGAGA 3070 het 3070 ref 32 18 9 6 A 1 0 112558 CASAVA_Build 6 66095364 2I TAATTATTAG --/TT TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 6 8 112559 CASAVA_Build 6 66100345 2I GTGTATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 AT 5 6 112560 CASAVA_Build 6 66108850 5D AATTAGCCTG ATTTA/----- ATTTAACTTT 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 ATTTA 2 1 112561 CASAVA_Build 6 66114175 2D TCCCCATCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 12 10 112562 CASAVA_Build 6 66121928 1I ACCACTAAAG -/A ACTTATTCAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 1 2 112563 CASAVA_Build 6 66122029 1D GGCCTAGGAA G/- AGAACTCATG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 0 112564 CASAVA_Build 6 66127734 1D GACAAAAAAA C/- AAACACCGCA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 1 0 112565 CASAVA_Build 6 66127978 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 125 hom 19 1 17 3 A 9 8 112566 CASAVA_Build 6 66128679 2D TTCATTTATT TC/-- CTTTTAAAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TC 1 0 112567 CASAVA_Build 6 66129755 1I57M1D TGTGATCATC -AGGGCTACAAAAGAAGATAAATGATTATCTTACTCATTTAAAATGATATTAAAACTCT/GTGGGCTACAAAAGAAGATAAATGATTACCTTACTCATTTAAAATGATATTAAAACTC- TTTTTTTTGC 3070 hom 63 het 27 0 22 20 N/A 0 0 112568 CASAVA_Build 6 66130862 1I CAACTAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 10 11 112569 CASAVA_Build 6 66131152 2I GGACTATATT --/AA AAAAATATTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 5 7 112570 CASAVA_Build 6 66132139 7I GTTAGGTTTC -------/TCTTTTA TCTTTTATTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TCTTTTA 1 2 112571 CASAVA_Build 6 66137039 1D CACACTAATT A/- AAAAAAAAAA 2274 het 2274 ref 22 10 8 4 A 12 11 112572 CASAVA_Build 6 66138608 2D GGATAATTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 26 3 11 15 A 14 12 112573 CASAVA_Build 6 66145400 1D ACACAGGAAC A/- TAATACCGAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 1 0 112574 CASAVA_Build 6 66162465 1I CCTTTGAACA -/C CCCCCCATTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 C 6 7 112575 CASAVA_Build 6 66172003 3I CACACACAAG ---/AGA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 15 12 4 AGA 0 1 112576 CASAVA_Build 6 66178430 1D CCAATACGTC T/- TTTTTTTTTT 2700 het 2700 ref 46 31 7 8 T 13 12 112577 CASAVA_Build 6 66185731 1D AAGGCAGTCA T/- TTTTTTTTCA 2104 het 2104 ref 22 11 5 7 T 9 8 112578 CASAVA_Build 6 66196447 4I AACACTTGAT ----/AGAC AGAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 AGAC 0 1 112579 CASAVA_Build 6 66203921 1I TATATTAGTG -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 6 7 112580 CASAVA_Build 6 66206992 1I AACCTTCAAT -/A AAAAAAAAAA 2981 het 2981 ref 25 10 9 6 A 13 14 112581 CASAVA_Build 6 66208227 2D TGGAAAATAT TC/-- TGAGGAACAC 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 TC 1 0 112582 CASAVA_Build 6 66232950 2D TAGACCTAGA AT/-- ATAAAATACG 3070 het 3070 hom 32 11 20 2 AT 2 1 112583 CASAVA_Build 6 66254423 1I GGACCTGGAC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 7 8 112584 CASAVA_Build 6 66258947 4I AGAAAGAAAG ----/AAAC AAACAAACAA 2027 het 2027 ref 32 13 9 10 AAAC 3 4 112585 CASAVA_Build 6 66278599 12D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2860 het 2667 hom 23 10 8 6 A 24 12 112586 CASAVA_Build 6 66307702 1I TTGCTGACAC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 7 8 112587 CASAVA_Build 6 66308022 1D GTAAGTTGTA T/- TTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 T 7 6 112588 CASAVA_Build 6 66312936 1D CAGCCTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 13 12 112589 CASAVA_Build 6 66313188 1I CAACTTGATC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 T 8 9 112590 CASAVA_Build 6 66314837 4D ATTTATTGAT AAAG/---- AAAGATACTT 3070 het 3070 hom 33 12 19 6 AAAG 2 1 112591 CASAVA_Build 6 66315942 3D AACTGGAGAT GCA/--- GTATGTTTCC 3070 het 3070 hom 32 11 18 5 GCA 1 0 112592 CASAVA_Build 6 66321624 1D TTACACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 A 11 10 112593 CASAVA_Build 6 66336746 1D AAAAATAAAA T/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 1 0 112594 CASAVA_Build 6 66340421 1D ACCTGCACAC A/- CCTGCATTCC 3070 het 3070 ref 81 45 31 5 A 1 0 112595 CASAVA_Build 6 66344823 2I GATAATGAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 AT 6 7 112596 CASAVA_Build 6 66348032 2I CTATTAATAA --/AT ATATATATCT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 AT 4 5 112597 CASAVA_Build 6 66350582 1D TACTTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2695 het 2695 ref 27 13 8 6 A 12 11 112598 CASAVA_Build 6 66355519 4I AAAGTGAAAT ----/AAAC ATATATGATC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 AAAC 0 1 112599 CASAVA_Build 6 66362957 1I TAACTAATAA -/T TTATATTTTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 3 112600 CASAVA_Build 6 66373499 1D TTCCAAAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 541 hom 28 3 15 10 T 10 9 112601 CASAVA_Build 6 66374258 2I18M2I CAAATATGCA --GTTATCTGAGATAATTAA--/TTGTTATCTGAGATAATTAATC TGTTTTAATA 3070 het 3070 ref 29 21 14 4 N/A 0 0 112602 CASAVA_Build 6 66377793 1I TAGAATATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 11 12 112603 CASAVA_Build 6 66379386 1I ATTATAACTT -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 6 7 112604 CASAVA_Build 6 66381498 1I ATCAATAAAG -/A TTATAGACAT 3070 het 3070 ref 53 29 20 4 A 0 1 112605 CASAVA_Build 6 66382686 6D CATTAAACAT TTACTC/------ TTACAGTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 TTACTC 1 0 112606 CASAVA_Build 6 66383020 1D TGCTTCAAAC A/- ACAAACCCAC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 2 1 112607 CASAVA_Build 6 66389370 2D ATAATCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 7 11 T 14 12 112608 CASAVA_Build 6 66393520 1D GTAAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 het 1946 hom 27 5 14 9 C 1 0 112609 CASAVA_Build 6 66393579 4D CAGGTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 1849 het 1849 ref 32 14 9 11 TTTC 4 3 112610 CASAVA_Build 6 66393629 4D TCTCTCTGCC CTTT/---- CTTTCTTTCT 2698 het 2698 ref 34 18 8 8 CTTT 3 2 112611 CASAVA_Build 6 66407035 1D TTAAAAAGAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 10 9 112612 CASAVA_Build 6 66409148 1D AATCATTTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 9 8 112613 CASAVA_Build 6 66411771 1I GAAACAATGG -/A ACTTAGACTA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 1 2 112614 CASAVA_Build 6 66415322 1I CTATTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 10 11 112615 CASAVA_Build 6 66436615 3D GCCTCTCTGA CTC/--- CTCCTCCTCC 3070 het 3070 ref 42 23 14 6 CTC 5 4 112616 CASAVA_Build 6 66441569 3I ATAATTGTGA ---/CAT CAGTAACAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CAT 0 1 112617 CASAVA_Build 6 66445431 1I ATACATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 699 hom 34 3 27 4 A 12 13 112618 CASAVA_Build 6 66445844 1D CTTTATTCAC A/- AAAACCAAGA 3070 het 3070 hom 57 24 28 7 A 5 4 112619 CASAVA_Build 6 66458121 1I GATAGATTGC -/A AAAAATATTC 2234 het 2234 ref 20 11 5 4 A 5 6 112620 CASAVA_Build 6 66462250 1D ATCATTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 T 11 10 112621 CASAVA_Build 6 66464310 2I ACTAATCTAA --/AT ATAGAAAGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 1 2 112622 CASAVA_Build 6 66472826 2D ATATATACAC AT/-- GAGTATATAT 3070 het 3070 ref 39 20 13 7 AT 1 0 112623 CASAVA_Build 6 66473127 4D TTCTTTTTAA AAAT/---- AAATAATCAC 3070 het 3070 hom 37 17 18 5 AAAT 2 1 112624 CASAVA_Build 6 66476905 1I ATTAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 2781 het 2565 hom 35 13 11 11 A 14 15 112625 CASAVA_Build 6 66479277 3I GAGAGAATAC ---/ATT ATTATAAAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATT 1 2 112626 CASAVA_Build 6 66479800 1I24M2D ATCACAAATC -ATGCATGTGACACACATGCATGCATG/AATGCATGTGACACACATGCATGCA-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 37 27 10 11 N/A 0 0 112627 CASAVA_Build 6 66480568 1D TGACACTGTT A/- AATCCCTTGA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 3 2 112628 CASAVA_Build 6 66481579 2D TTCCACATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 201 hom 27 2 11 15 A 13 11 112629 CASAVA_Build 6 66482703 2D ATTTACATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 18 het 23 1 18 4 AC 14 13 112630 CASAVA_Build 6 66483327 4D GAAATGATTA GAGT/---- AAGTTATCAG 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 GAGT 1 0 112631 CASAVA_Build 6 66484133 1I TTGCCTTGTC -/T CAGGTGAAAC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 0 1 112632 CASAVA_Build 6 66484208 1I GTTGGGAAGG -/A AATGATTTGT 3070 het 2924 hom 22 7 11 4 A 2 3 112633 CASAVA_Build 6 66485901 2I CCTTTAAACA --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 50 22 17 11 CT 7 8 112634 CASAVA_Build 6 66494854 2I GCCTAAGTAT --/CA CTTCCCTTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CA 0 1 112635 CASAVA_Build 6 66500697 2D CTGTTTGTTC TA/-- TGAGATATAA 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 TA 1 0 112636 CASAVA_Build 6 66502818 1I CATCACACAA -/T AACATGGAAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 0 1 112637 CASAVA_Build 6 66504707 1I GACTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2126 hom 21 7 13 1 A 12 13 112638 CASAVA_Build 6 66509661 4D TTATATAAAT TAGA/---- TAATTAAGAC 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 TAGA 1 0 112639 CASAVA_Build 6 66512673 40I TGCTGGCCTC ----------------------------------------/TCCTGGGGCCTCAGCCTGGCCATCCTTGCTTACAGAACAG TCCTGGGTGC 2991 het 2991 ref 33 14 8 14 TCCTGGGGCCTCAGCCTGGCCATCCTTGCTTACAGAACAG 0 1 112640 CASAVA_Build 6 66515155 2D ACTGAATATC TA/-- TATATATATA 3070 het 806 hom 24 3 16 5 TA 8 7 112641 CASAVA_Build 6 66517886 1I GAGAGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3019 het 3019 ref 24 13 8 3 A 11 12 112642 CASAVA_Build 6 66528960 1D TTCAAAGGTA G/- GGGCAGACTT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 G 4 3 112643 CASAVA_Build 6 66534318 3D CTTCGCCTGT CTA/--- TACATATCTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 6 CTA 1 0 112644 CASAVA_Build 6 66534661 1I AAGGGAAGTA -/G GGGTGAGGAG 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 G 3 4 112645 CASAVA_Build 6 66542299 1I GTTCACAGCC -/A AAAATCATAT 3070 het 3070 ref 53 25 24 4 A 4 5 112646 CASAVA_Build 6 66546968 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 845 hom 10 2 8 0 A 10 11 112647 CASAVA_Build 6 66550834 1D CAAATAAACC A/- TACCACTAGT 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 A 1 0 112648 CASAVA_Build 6 66552645 1I TCCTTGTCAC -/T TTTTGTTTTG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 4 5 112649 CASAVA_Build 6 66556939 1D GCAATCCCAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 8 7 112650 CASAVA_Build 6 66557696 1I GGTAAGGATT -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 A 6 7 112651 CASAVA_Build 6 66559634 2I CCCTCAAAAG --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 8 10 112652 CASAVA_Build 6 66560623 1I TGAAGGCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 28 15 8 A 10 11 112653 CASAVA_Build 6 66561282 1D AATGGGAATG A/- AAGGGATAGT 3070 het 3070 ref 49 24 21 5 A 3 2 112654 CASAVA_Build 6 66563761 4D AACATCGAGC ATAA/---- ATAAAATATT 3070 het 3070 ref 28 18 8 4 ATAA 2 1 112655 CASAVA_Build 6 66570854 1D TGATTGTAAT G/- TTTTTGGTGT 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 G 1 0 112656 CASAVA_Build 6 66578160 1I AGCTGGGATT -/A ACAGGCACAT 1646 het 1646 ref 17 8 5 4 A 1 2 112657 CASAVA_Build 6 66579039 9I TGATACCTTG ---------/CCCCCTAAC CCCTGCCCTG 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 CCCCCTAAC 0 1 112658 CASAVA_Build 6 66579144 7I CCTAACCAAT -------/AGAATAC AGGGGAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AGAATAC 0 1 112659 CASAVA_Build 6 66582084 4D AAAACGCAGG TATA/---- GCCGAGCATG 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 TA 2 0 112660 CASAVA_Build 6 66583907 1I ACTGTTAAGG -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 54 22 19 13 A 6 7 112661 CASAVA_Build 6 66588589 3D CAACAGTAAT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 44 14 18 12 TTG 7 6 112662 CASAVA_Build 6 66595359 1D TTCTTTACAG A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 A 7 6 112663 CASAVA_Build 6 66598704 2I GCAAAGATTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 11 13 112664 CASAVA_Build 6 66600888 1D AGATTAAAAA C/- TTTTTCATCT 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 C 1 0 112665 CASAVA_Build 6 66612233 1D ACTCTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3057 hom 38 8 15 15 T 12 11 112666 CASAVA_Build 6 66613156 4I CTCTTTTTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 TTTC 3 4 112667 CASAVA_Build 6 66627126 1I TTTACCAGAC -/T TTCACATCTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 2 3 112668 CASAVA_Build 6 66643745 2D CTCAGTTTTA TG/-- TGTCTGTATT 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 TG 2 1 112669 CASAVA_Build 6 66645984 2I TATCTACATT --/TC TCTCTTTTAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 TC 2 3 112670 CASAVA_Build 6 66649317 1D AGACTTTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 10 9 112671 CASAVA_Build 6 66656793 1D ACAAATTTTA T/- TTTTTTGTCA 3070 het 2938 hom 24 9 13 2 T 7 6 112672 CASAVA_Build 6 66656846 3D AGTAATCATC ATT/--- GACAAAAATT 3070 het 3070 hom 25 7 13 7 ATT 1 0 112673 CASAVA_Build 6 66657831 1D TATATGGTGA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 39 het 20 0 17 3 C 10 9 112674 CASAVA_Build 6 66670758 1I ACTGCAGTAG -/T TTTCCCAGCG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 3 4 112675 CASAVA_Build 6 66680343 1I TTATTTAATT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 7 8 112676 CASAVA_Build 6 66682976 1D CTTTTTTTTT G/- AGCAACTTTA 3070 het 404 hom 34 2 31 2 G 1 0 112677 CASAVA_Build 6 66686901 1I TCTCTTCAAT -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 0 1 112678 CASAVA_Build 6 66691114 1I CACTTTCCAC -/A AATTTCAATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 2 3 112679 CASAVA_Build 6 66691840 1I AGATTGTACT -/A AAATATAACA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 3 4 112680 CASAVA_Build 6 66693442 1I GCTGGAGTGC -/A ATGGCGCAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 2 112681 CASAVA_Build 6 66694569 1I TGAGCCACTG -/C ACTGGGACAA 3070 hom 93 het 37 0 30 7 C 0 1 112682 CASAVA_Build 6 66698098 19I ACTGCAGGGA -------------------/TGACTGGGTCTGCAGCTGC TGATTTGGGT 3070 hom 82 het 32 0 24 8 TGACTGGGTCTGCAGCTGC 0 1 112683 CASAVA_Build 6 66698215 1I GGGTGGGGCT -/C CCACCTGCCC 3070 hom 68 het 26 0 16 10 C 2 3 112684 CASAVA_Build 6 66705867 4D CTAGCCAAAG AACA/---- AACAGACAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 8 AACA 2 1 112685 CASAVA_Build 6 66711734 1I AACTTTCTTA -/T TTTTTTGACT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 6 7 112686 CASAVA_Build 6 66711835 2D ATTTTGTAAC AT/-- ATAAATATAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AT 2 1 112687 CASAVA_Build 6 66714857 4I GCCTTCTCAC ----/TGAT TGATTGATTG 3070 hom 102 het 44 0 34 10 TGAT 2 3 112688 CASAVA_Build 6 66719280 2I TGTAAATATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 10 12 112689 CASAVA_Build 6 66719791 1D GTTTTTTTTT A/- AATAATATAA 3070 hom 99 het 40 0 34 8 A 3 2 112690 CASAVA_Build 6 66734299 1I TACATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2967 het 10 hom 18 1 10 7 T 14 15 112691 CASAVA_Build 6 66749139 4I AACCCCTGCC ----/TTTT TTTGTTTTCC 3070 hom 56 het 24 0 19 6 T 3 7 112692 CASAVA_Build 6 66754572 5D TTTAGGGGAC TTTTA/----- TTTTAAGAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 TTTTA 2 1 112693 CASAVA_Build 6 66755817 1D CTGTAGACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 41 het 31 1 28 2 A 10 9 112694 CASAVA_Build 6 66764661 5D ATGTTCCTCA TTCAG/----- TTAAGATTTT 3070 hom 129 het 47 0 43 6 TTCAG 1 0 112695 CASAVA_Build 6 66776750 1D TTTCATTGTC T/- CAGTTTCCAG 3070 hom 99 het 42 0 33 10 T 1 0 112696 CASAVA_Build 6 66784826 1I TGCCAAGCAT -/G GCCTGCAGGC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 G 1 2 112697 CASAVA_Build 6 66807551 1D ATATTTATAT A/- TTTTTATGTG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 1 0 112698 CASAVA_Build 6 66809676 1I CTTTTATTAG -/T TTTTTTGCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 7 112699 CASAVA_Build 6 66810594 10D TCTTTGTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 26 6 T 21 11 112700 CASAVA_Build 6 66813551 1D ATATAAATTT G/- GGGGAGCCAG 3070 hom 95 het 36 0 32 4 G 5 4 112701 CASAVA_Build 6 66814182 1D TTTTTTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 10 9 112702 CASAVA_Build 6 66945681 4D TGTAATACTC TCTT/---- TATAATCGTA 3070 het 3070 ref 38 21 17 0 TCTT 1 0 112703 CASAVA_Build 6 66961004 4D GTTTTAGAGT TTAA/---- TTATTTTCTA 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 TTAA 1 0 112704 CASAVA_Build 6 66962013 4I AAACATTTCA ----/CACG CACACACACA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 CACG 0 1 112705 CASAVA_Build 6 66965631 3D CTCAGCACTT AAC/--- AACATTATAA 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 AAC 2 1 112706 CASAVA_Build 6 66966832 1D AACATCACTT A/- CCTAAAGTTG 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 A 1 0 112707 CASAVA_Build 6 66967572 1D TGAGTTAATT A/- AAAGTTGCTA 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 A 4 3 112708 CASAVA_Build 6 66969858 2D GAAGCCAAAC AG/-- AGTTCTGGCT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 AG 2 1 112709 CASAVA_Build 6 66971040 1D AACATTTACC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 A 9 8 112710 CASAVA_Build 6 66972126 1I GATATGTAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 9 10 112711 CASAVA_Build 6 66984694 4D TCTTTCAAAT AAAC/---- AAACATTTAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 AAAC 2 1 112712 CASAVA_Build 6 66993617 1D AATGGTTTTT G/- TTTTCTTATT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 G 1 0 112713 CASAVA_Build 6 66994085 23D TTTGTGCATC TTGAGGTCAATATCACACTGTAT/----------------------- TAATTACTGT 3070 het 3070 ref 35 20 18 4 TTGAGGTCAATATCACACTGTAT 1 0 112714 CASAVA_Build 6 66994240 1D CTGATTATAC A/- AAAAAAGGGC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 7 6 112715 CASAVA_Build 6 66995096 8D TTTTTATTGT TTTCATTG/-------- TTTTATTGTT 3070 het 3070 ref 26 13 12 4 TTTCATTG 1 0 112716 CASAVA_Build 6 66998186 1D CTACAGTAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 9 8 112717 CASAVA_Build 6 67000325 1D TAATTAGCTT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 8 7 112718 CASAVA_Build 6 67007366 2I GTGTTCCATA --/TT TATGCCTTTA 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 T 1 3 112719 CASAVA_Build 6 67010937 4I TCTCCAGAAC ----/ATAT ATATATATAT 2337 het 2337 ref 24 14 7 3 AT 7 9 112720 CASAVA_Build 6 67014379 1I GACAGAAAGG -/A AAAAAATAGG 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 A 6 7 112721 CASAVA_Build 6 67018487 3I AAAGAAAGAT ---/AAC AAATAAAATC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AAC 0 1 112722 CASAVA_Build 6 67018714 1D TCCCAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2891 hom 30 10 13 7 A 11 10 112723 CASAVA_Build 6 67019989 1I TGGTGTGGCT -/G GGAAGCAAGG 3070 hom 86 het 33 0 28 5 G 2 3 112724 CASAVA_Build 6 67022519 1I TCACCATATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 9 10 112725 CASAVA_Build 6 67026702 2D14M2D TCAGAAAGAA AGAGAGAGAAAAAGTCAG/--AGAGAGAAAAAGTC-- AGAGTCGAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 10 N/A 0 0 112726 CASAVA_Build 6 67037000 1I AAGTACAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 A 9 10 112727 CASAVA_Build 6 67038056 1I ATATACTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 8 9 112728 CASAVA_Build 6 67038409 1I ATTACTTATT -/A AAAAATATAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 5 6 112729 CASAVA_Build 6 67043706 1D ATTAATGAAT A/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 A 1 0 112730 CASAVA_Build 6 67049653 2I GATACATTAT --/AG AGTTACAGAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AG 1 2 112731 CASAVA_Build 6 67056605 1D AGAGTAGTGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 8 7 112732 CASAVA_Build 6 67057709 2D TTGATCACTC AG/-- AGCAACAAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 AG 2 1 112733 CASAVA_Build 6 67062744 1I TTCATGCTTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 T 7 8 112734 CASAVA_Build 6 67069820 1D GCATGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 10 T 14 13 112735 CASAVA_Build 6 67072916 1D TGATAAACAC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 8 7 112736 CASAVA_Build 6 67073832 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAACTGCTT 3070 het 2429 hom 23 6 15 2 AGG 0 1 112737 CASAVA_Build 6 67074665 1I TATTTTTTAA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 T 6 7 112738 CASAVA_Build 6 67076992 2I AAAAATGCTC --/CA GTTTCATTCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 CA 0 1 112739 CASAVA_Build 6 67077533 4D CTTTAAAGAG AAGT/---- AAGTGATATT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 AAGT 2 1 112740 CASAVA_Build 6 67077991 1D AAATACAAAT A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 7 6 112741 CASAVA_Build 6 67078631 1I TCCTTAAATG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 7 8 112742 CASAVA_Build 6 67081747 4I ACAGAAGAAT ----/CAAA CAGACTTGTA 3070 het 3070 ref 47 22 23 2 CAAA 0 1 112743 CASAVA_Build 6 67091072 1D TTCTCGTACC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 8 7 112744 CASAVA_Build 6 67093454 1D GGATAATGGT G/- GGGCCCTGTA 3070 het 1303 hom 18 4 14 0 G 4 3 112745 CASAVA_Build 6 67100017 3D AAATACAAAT AAC/--- AACAATAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 AAC 2 1 112746 CASAVA_Build 6 67101056 5I AACAATGTAA -----/AAGAC AAAAATAAGT 3070 het 3070 ref 32 19 13 0 AAGAC 0 1 112747 CASAVA_Build 6 67101846 1I TACGCATGGA -/C CACACACATA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 C 1 2 112748 CASAVA_Build 6 67102556 3I ATTGGTTACA ---/ATG ATACACTTGC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 ATG 0 1 112749 CASAVA_Build 6 67103993 1D TCTGGAGGAT G/- GAAGTCCGTG 3070 hom 66 het 27 0 21 7 G 2 1 112750 CASAVA_Build 6 67105288 1I CAGATGAGTT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 7 8 112751 CASAVA_Build 6 67105761 12I AGATGCCAAC ------------/AAAAAAGAAAAA TAAATTTAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAAAAAGAAAAA 0 1 112752 CASAVA_Build 6 67105890 2I TTTTCCTAAA --/AC ACAGTGTAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AC 1 2 112753 CASAVA_Build 6 67107421 1D TTGAGGTCAT G/- GGTACAGTAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 3 2 112754 CASAVA_Build 6 67110742 2D TAATAGCAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 T 13 11 112755 CASAVA_Build 6 67114753 1D TAAAATATTC T/- TCCTTTTTGA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 2 1 112756 CASAVA_Build 6 67122153 2I GTATATATAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 2740 hom 16 8 7 1 A 9 11 112757 CASAVA_Build 6 67124205 1I GAGGCAAAGG -/C CCCTTTGGGG 3070 hom 87 het 33 0 28 5 C 3 4 112758 CASAVA_Build 6 67133320 2D GAAAACAAAC AT/-- AAGAGAAGAT 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 AT 1 0 112759 CASAVA_Build 6 67138286 1I TTGGCTGGAT -/A ACGAAAATTC 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 1 2 112760 CASAVA_Build 6 67138452 1D AACTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 32 1 18 13 T 15 14 112761 CASAVA_Build 6 67143517 3D TATAACAAAA TAT/--- TATAATAATT 2879 hom 18 het 9 0 7 2 TAT 2 1 112762 CASAVA_Build 6 67162646 21D TCACCCTCCA TTTGTCCATGCAACCTTATTC/--------------------- TTAACGGACA 3070 het 3070 ref 43 24 19 8 TTTGTCCATGCAACCTTATTC 1 0 112763 CASAVA_Build 6 67163928 1D ATTTGACTTC A/- ATATCTCATA 3070 het 3070 hom 28 8 15 5 A 2 1 112764 CASAVA_Build 6 67164090 3I ATGAATGACT ---/TAA TAATTTCAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAA 1 2 112765 CASAVA_Build 6 67182932 1I TTTACCCAAG -/A GAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 0 1 112766 CASAVA_Build 6 67186719 1D GAAAATTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 12 11 112767 CASAVA_Build 6 67198003 1I AGTGTGAACC -/A AAAAAAAAAA 2170 het 2170 ref 25 9 8 8 A 14 15 112768 CASAVA_Build 6 67199066 2I AATTCCCATA --/AC AGTTATTAAC 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 AC 0 1 112769 CASAVA_Build 6 67199987 6I TAAATGCATG ------/ATTGAA ATTGAAATTA 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 ATTGAA 1 2 112770 CASAVA_Build 6 67210433 2I CAGCCATGTT --/AA ACTGTGAGTC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 1 3 112771 CASAVA_Build 6 67211874 2D AATAATATTC AT/-- ATATATATAT 1666 het 1666 ref 18 11 5 3 AT 7 6 112772 CASAVA_Build 6 67212939 1I CAGCAAATAT -/A AAAAAAACGG 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 A 7 8 112773 CASAVA_Build 6 67214393 3D AAATAGGAAG AGA/--- AGAAGTCAAA 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 AGA 2 1 112774 CASAVA_Build 6 67215254 1I CAGAATCAAC -/A AGAAACTTAA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 1 2 112775 CASAVA_Build 6 67218318 1I ATGGTTCAGC -/A ACCATCCCTT 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 A 1 2 112776 CASAVA_Build 6 67219692 1I CTAGCTCATG -/C CCCCTAATTA 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 C 4 5 112777 CASAVA_Build 6 67221170 1I TAGCAAATAT -/A AAACAGGAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 3 4 112778 CASAVA_Build 6 67223819 1I CTGGGGCATG -/C TTTGGGGTGG 1356 het 1252 hom 13 4 4 5 C 0 1 112779 CASAVA_Build 6 67223984 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2641 hom 20 7 13 0 A 10 9 112780 CASAVA_Build 6 67225910 1I ACAAGAGAGT -/A AAAAACACAT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 5 6 112781 CASAVA_Build 6 67228138 9D AGTGACTTGA ACAGTGAAC/--------- AAGTCTTGAA 3070 het 3070 ref 51 26 21 5 ACAGTGAAC 1 0 112782 CASAVA_Build 6 67233379 2I TGGGCTCACT --/GC ACAGTAGTAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 GC 0 1 112783 CASAVA_Build 6 67233481 8I TGTCGACTGA --------/TCCAATAG TCCAATAGTC 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 TCCAATAG 1 2 112784 CASAVA_Build 6 67241190 6I CAGGCTGGAG ------/TGCAGT TGCAGTAGTG 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 TGCAGT 1 2 112785 CASAVA_Build 6 67249088 1D GCTGGGTCCA G/- GGGGGTCACT 1450 het 747 hom 12 4 3 5 G 6 5 112786 CASAVA_Build 6 67257967 1D ATGGAAAGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 68 het 27 0 22 5 A 10 9 112787 CASAVA_Build 6 67260291 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 7 8 112788 CASAVA_Build 6 67262716 1I CAATGTTTGT -/A AACCATGATA 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 A 2 3 112789 CASAVA_Build 6 67264271 1D TGGGTATCTG C/- AGAAATTCCT 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 C 1 0 112790 CASAVA_Build 6 67265585 2D TATATATATG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 14 het 23 0 13 10 AT 6 5 112791 CASAVA_Build 6 67267846 9D TGGCACCATC TTGGCTCAT/--------- TACAGCCTCC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TTGGCTCAT 1 0 112792 CASAVA_Build 6 67268771 2I GAAAGAAAGA --/GG TAATTTGTGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 G 0 2 112793 CASAVA_Build 6 67269428 1I TAAAATCCAC -/A GAGAATATTG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 0 1 112794 CASAVA_Build 6 67269600 1D ATAAAACTTT A/- AATCTACCAG 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 3 2 112795 CASAVA_Build 6 67269692 1I CAAAAACTCA -/C GTATTATCAG 3070 het 3070 ref 34 17 10 11 C 0 1 112796 CASAVA_Build 6 67270296 3D CAACTTAGTA CTT/--- CTTTAACTAG 3070 het 3070 ref 36 22 13 2 CTT 2 1 112797 CASAVA_Build 6 67271480 1D AATTTACTGG T/- TTTGTGGCAT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 T 4 3 112798 CASAVA_Build 6 67278510 12D AATTATGAGC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAG 3070 hom 76 het 29 0 26 8 A 21 9 112799 CASAVA_Build 6 67281853 1D TTCACTGTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 9 8 112800 CASAVA_Build 6 67282792 1I CATTAAAAAA -/G TGCTTAGAGG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 0 1 112801 CASAVA_Build 6 67288466 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTGTTT 1419 het 1419 ref 9 4 4 1 A 1 0 112802 CASAVA_Build 6 67290625 1D GGCACACTTC T/- GTTGTCCCAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 1 0 112803 CASAVA_Build 6 67291803 1D TTTGTTCATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 9 8 112804 CASAVA_Build 6 67293885 1D ACAGAGTGAG A/- GGGGAACTGA 3070 het 3070 hom 46 16 22 9 A 1 0 112805 CASAVA_Build 6 67301639 1I AACTATAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 8 9 112806 CASAVA_Build 6 67320265 1D ACATATGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 15 14 7 T 10 9 112807 CASAVA_Build 6 67322577 1I TGCTTTGATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 9 10 112808 CASAVA_Build 6 67322766 1D ATTGTTTCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 9 8 112809 CASAVA_Build 6 67327465 1D CAATAGATCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 8 7 112810 CASAVA_Build 6 67328540 1I GGTATATACC -/T TGGGGTTTAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 1 2 112811 CASAVA_Build 6 67331893 1I CCTTCACCCC -/T GGGCAAAATG 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 0 1 112812 CASAVA_Build 6 67332981 1D GAAAAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 11 10 112813 CASAVA_Build 6 67334252 1D AACAAACAAC A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 A 8 7 112814 CASAVA_Build 6 67334361 1D AAGATAAGTG A/- CAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 47 25 20 6 A 1 0 112815 CASAVA_Build 6 67339207 1I AGATATGTTT -/A GATGTCACCT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 0 1 112816 CASAVA_Build 6 67340129 1I GTTACATTTC -/A AAAAAAAATC 2976 het 2976 ref 28 18 7 3 A 8 9 112817 CASAVA_Build 6 67342722 1I ATAGACTAGG -/A AAATTTGTCA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 3 4 112818 CASAVA_Build 6 67346976 1D AAGCAATCAA G/- GGCAATGGTT 3070 het 3070 ref 52 26 20 7 G 3 2 112819 CASAVA_Build 6 67348035 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2762 het 1328 hom 20 7 10 5 A 18 16 112820 CASAVA_Build 6 67349534 3D ACTCTCCTGT TTA/--- TTATTATAAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TTA 3 2 112821 CASAVA_Build 6 67351355 3D CATTTTAAAA GAT/--- GAAGTTCTTA 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 GAT 1 0 112822 CASAVA_Build 6 67352403 1I TTGTTTGAAG -/T TTTCTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 3 4 112823 CASAVA_Build 6 67356003 1D TTTCCAAAAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 16 10 1 T 9 8 112824 CASAVA_Build 6 67361470 1I TGTTAAAAAA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 6 7 112825 CASAVA_Build 6 67361605 1D GTGCAAGCAA C/- TAGAAAGTCT 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 C 1 0 112826 CASAVA_Build 6 67368884 1D AATGTACATT A/- TAAAATATTT 1746 het 1746 ref 13 6 5 2 A 1 0 112827 CASAVA_Build 6 67374644 5D AAATTAGAAA TAAAG/----- TATATGACAC 3070 het 3070 hom 38 15 20 8 TAAAG 1 0 112828 CASAVA_Build 6 67380893 2D CTCTAGAAAC AT/-- AACTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 AT 1 0 112829 CASAVA_Build 6 67383355 1D GTTACAAAAC A/- ATCAATATCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 2 1 112830 CASAVA_Build 6 67385386 3I TGCTAAGTGA ---/AAG AAGAAAGAAG 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 AAG 1 2 112831 CASAVA_Build 6 67386608 1D TTTTTCTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1199 hom 18 5 11 2 T 9 8 112832 CASAVA_Build 6 67403588 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2408 het 271 hom 11 1 8 2 A 10 11 112833 CASAVA_Build 6 67406656 17D TCATTCTGTG CACTCTAGGAGAGAGTC/----------------- CACTTTCTTG 3070 hom 82 het 30 0 28 6 CACTCTAGGAGAGAGTC 1 0 112834 CASAVA_Build 6 67418024 1I ATTTAATCAC -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 A 6 7 112835 CASAVA_Build 6 67424714 3I TCGTGATTTT ---/TTA TTATTTTTAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TTA 1 2 112836 CASAVA_Build 6 67449224 9D TTCTGATATG GGAAGATGT/--------- GATGAAAAGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 7 GGAAGATGT 1 0 112837 CASAVA_Build 6 67479303 1I ACAGAAAACC -/A AACACTGCAT 3070 het 3070 ref 43 25 18 0 A 2 3 112838 CASAVA_Build 6 67502043 1D AAAGTAGGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 20 12 9 A 10 9 112839 CASAVA_Build 6 67503199 1D GAATCCACCA T/- GTTCCTTGAC 3070 het 3070 ref 46 23 14 9 T 1 0 112840 CASAVA_Build 6 67507604 7I CAGTTCAGCT -------/ACTGAGC ACTGAGCAAG 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 ACTGAGC 1 2 112841 CASAVA_Build 6 67508977 1D TATTTAATAG T/- TTTTGTTTCC 3070 het 3070 hom 22 10 10 3 T 5 4 112842 CASAVA_Build 6 67511048 1I AATTCATTAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 7 8 112843 CASAVA_Build 6 67511753 1D TATATATGAC A/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 1 0 112844 CASAVA_Build 6 67514364 1D CATTGTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3062 hom 33 8 15 10 T 13 12 112845 CASAVA_Build 6 67528263 2D ACACACACAC AT/-- ACATATATAT 406 het 27 hom 13 1 4 8 AT 1 0 112846 CASAVA_Build 6 67535996 3D GTAAAGTCTC TGT/--- TGTTAGAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 TGT 2 1 112847 CASAVA_Build 6 67538522 1D CTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 9 9 A 11 10 112848 CASAVA_Build 6 67546702 1D CTGTCTATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 A 11 10 112849 CASAVA_Build 6 67552013 1D GTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 11 10 112850 CASAVA_Build 6 67561350 1I TCGTTTTACC -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 7 8 112851 CASAVA_Build 6 67582728 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 32 1 19 12 A 13 14 112852 CASAVA_Build 6 67600444 1I ACTACTTTTT -/C CTATCTCTTC 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 C 1 2 112853 CASAVA_Build 6 67613913 3D GAAAAAATGG ATT/--- ATATCTGCAT 3070 het 3070 hom 50 23 25 3 ATT 1 0 112854 CASAVA_Build 6 67616692 10I GCTATTGAAA ----------/AAATGCCTAT AAATCTGACT 3070 hom 133 het 50 0 44 8 AAATGCCTAT 0 1 112855 CASAVA_Build 6 67620550 1I TTTGTTTATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 8 9 112856 CASAVA_Build 6 67621920 1I GCACACTGAC -/A CTTCTCCTTT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 A 0 1 112857 CASAVA_Build 6 67622229 2D TTTAGATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 2019 hom 20 6 11 4 TA 8 7 112858 CASAVA_Build 6 67623215 1I TATGGCTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 9 10 112859 CASAVA_Build 6 67623943 1I TCCTTAGAAG -/C CCTACACTCG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 2 3 112860 CASAVA_Build 6 67629181 3D TATTTCCTTA TCT/--- TGGTAATTAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 TCT 1 0 112861 CASAVA_Build 6 67630531 1D AAAGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 T 12 11 112862 CASAVA_Build 6 67652120 1D AATCAAGGAC G/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 G 1 0 112863 CASAVA_Build 6 67655052 3I ATAAATCAGT ---/ATA TATTTGAGTA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 ATA 0 1 112864 CASAVA_Build 6 67663057 3D AGGGGCTTCA AAT/--- TTTATTTTTG 3070 het 3070 ref 36 20 11 6 AAT 1 0 112865 CASAVA_Build 6 67663372 2D TGCCCATACC GA/-- GAGAGAGAGA 1492 het 1492 ref 47 37 5 8 GA 7 6 112866 CASAVA_Build 6 67666579 2D CTTGCCTTCC CA/-- TTAGTCAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 CA 1 0 112867 CASAVA_Build 6 67673336 39D ACTATCAATA GAACATATGAAACCAATAGAAACCAATAGAAACCAACAT/--------------------------------------- ATAAACCAAT 3070 het 3070 ref 26 19 11 2 GAACATATGAAACCAATAGAAACCAATAGAAACCAACAT 1 0 112868 CASAVA_Build 6 67677366 1I GAATAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 11 12 112869 CASAVA_Build 6 67681143 3I ACAAACATTA ---/GTT GTTATTATTA 3070 het 3070 hom 32 9 22 1 GTT 1 2 112870 CASAVA_Build 6 67690450 1I CTGGTTAGAG -/T TTTTTCCTGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 5 6 112871 CASAVA_Build 6 67695120 1D ACCTGTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 T 11 10 112872 CASAVA_Build 6 67700128 2I GAAGATAGGC --/TT TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 T 8 10 112873 CASAVA_Build 6 67702719 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 734 hom 34 3 22 9 A 12 13 112874 CASAVA_Build 6 67706074 1D TGTATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 T 11 10 112875 CASAVA_Build 6 67708692 2D AGGAATCCTC TT/-- GTCTTGGAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 T 2 0 112876 CASAVA_Build 6 67709403 1D ATGTACCCCC T/- GATTCTAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 1 0 112877 CASAVA_Build 6 67710395 1I GTAATTTATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 8 9 112878 CASAVA_Build 6 67719576 1I TCATTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 2551 het 2551 ref 31 18 10 3 T 10 11 112879 CASAVA_Build 6 67720239 1D AGTAAAAGCA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 5 T 8 7 112880 CASAVA_Build 6 67727783 2I AAAGGGCATC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 GT 8 9 112881 CASAVA_Build 6 67733957 1D AATAAAAAAA C/- AAACAAATTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 1 0 112882 CASAVA_Build 6 67742285 1I ATAACAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 17 10 T 10 11 112883 CASAVA_Build 6 67747393 1I CCCTTACATC -/A GAAATTTTAG 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 0 1 112884 CASAVA_Build 6 67747874 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 1519 het 1519 ref 20 8 5 7 TA 5 6 112885 CASAVA_Build 6 67749756 1D CTCAATTTGG T/- TTTTCTCTTG 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 T 5 4 112886 CASAVA_Build 6 67768764 4D TAAATAATAG ACAA/---- ACAAATTAAG 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 ACAA 2 1 112887 CASAVA_Build 6 67772167 1D TGAGTTTTTA C/- TCAGCTAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 C 1 0 112888 CASAVA_Build 6 67782013 4D TTTTTCTTTT TCTC/---- TCTCTCTGAC 3070 het 3070 hom 42 20 21 2 TC 5 3 112889 CASAVA_Build 6 67782694 2D GTACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 77 het 50 1 39 11 AC 9 8 112890 CASAVA_Build 6 67791229 1I AGACCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 11 12 112891 CASAVA_Build 6 67804307 1D GTTTTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 12 11 112892 CASAVA_Build 6 67809964 1D GTCTCTTTCA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 8 7 112893 CASAVA_Build 6 67811765 1D TGTTAATGAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 A 9 8 112894 CASAVA_Build 6 67818504 1D GTCTCTTGTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 1373 hom 41 11 23 7 G 1 0 112895 CASAVA_Build 6 67819404 2D ATTGCATTGA CT/-- CTGCAGATTG 3070 het 3070 hom 27 14 13 3 CT 2 1 112896 CASAVA_Build 6 67822022 2I GTGGCATCTC --/AT GTGCTTCTGA 3070 hom 72 het 37 0 25 12 AT 0 1 112897 CASAVA_Build 6 67822697 1D ATCTCTACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 12 10 A 10 9 112898 CASAVA_Build 6 67828160 1D TTATTTTATG T/- TTTTTTAGAA 1120 hom 12 het 17 0 5 13 T 7 6 112899 CASAVA_Build 6 67834908 2I CCCGCACAAG --/CT CTCTTTCTTT 3070 hom 35 het 14 0 12 2 CT 2 3 112900 CASAVA_Build 6 67838109 1I TTTCTCACAA -/T GTAGAACTTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 0 1 112901 CASAVA_Build 6 67840001 1D ATTCAAAAGT A/- AAAAAAAACA 2741 het 2741 ref 19 9 7 3 A 9 8 112902 CASAVA_Build 6 67842254 2D GGAATTTAAT AA/-- GTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 A 2 0 112903 CASAVA_Build 6 67842868 4I AAAGAAAAAA ----/AAAG AAAGGAAGGA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 AAAG 1 2 112904 CASAVA_Build 6 67845003 3D GTACATGACT TTA/--- TTATTGTTAA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TTA 2 1 112905 CASAVA_Build 6 67845395 4D TATTATTAAT AAAC/---- AAAATTATGA 2477 het 2477 ref 20 9 7 5 AAAC 1 0 112906 CASAVA_Build 6 67846272 1I GGAAGGAAGG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 42 het 34 0 14 20 A 7 8 112907 CASAVA_Build 6 67848568 1I CTCAAAAACA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 T 7 8 112908 CASAVA_Build 6 67850408 1I ATAATGAGAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 8 9 112909 CASAVA_Build 6 67851317 3D ATCAATCTAC TAA/--- TAATATTATT 3070 het 1456 hom 20 4 13 3 TAA 2 1 112910 CASAVA_Build 6 67851413 4I TATATCCCCT ----/TTGA ATAAATACAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TTGA 0 1 112911 CASAVA_Build 6 67852273 1I GTGCATATGT -/A CCATATTGTC 3070 hom 129 het 52 0 42 10 A 0 1 112912 CASAVA_Build 6 67853494 2I GGGTTGAATC --/TG TAAATTCCTT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 TG 0 1 112913 CASAVA_Build 6 67854862 4D AACTTTCTTC TGAG/---- TATTTTTTTT 665 het 645 hom 19 3 6 11 TGAG 1 0 112914 CASAVA_Build 6 67855291 2D TAAGAAGACA CT/-- CTGGCTTTTT 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 CT 2 1 112915 CASAVA_Build 6 67856780 1D ATGTTTTTTT G/- CCTTAGTATA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 G 1 0 112916 CASAVA_Build 6 67857782 1I AGTTTTCCCA -/T TTGTCAAGTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 2 3 112917 CASAVA_Build 6 67859242 1I AACCAGAACT -/A AAAAATGTAT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 5 6 112918 CASAVA_Build 6 67862271 1D AGTCAAAGAC A/- GGGGTGACAG 2145 het 2145 ref 25 12 5 9 A 1 0 112919 CASAVA_Build 6 67868456 2D AAATCCAGAC AG/-- AGATTATTTC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AG 2 1 112920 CASAVA_Build 6 67869127 1D CCCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 15 7 A 10 9 112921 CASAVA_Build 6 67870686 5I GTTTTAATCA -----/TATAT TATATTATTT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 TATAT 1 2 112922 CASAVA_Build 6 67870853 1D ACAGGTAAGA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 T 8 7 112923 CASAVA_Build 6 67871628 1D CTCTTCCCCA C/- TTACACACAT 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 C 1 0 112924 CASAVA_Build 6 67871751 1I22M1I GGTTTGTTTT -TTTTTGTTTTTGATTTCCAGGT-/GTTTTTGTTTTTGATTTCCAGGTG GCATTAAAGA 3070 hom 105 het 30 0 36 5 N/A 0 0 112925 CASAVA_Build 6 67873125 2D GGAGAAGGGA AT/-- ATATTTCTAC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AT 3 2 112926 CASAVA_Build 6 67874081 1D TGCAATCCTT A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 A 7 6 112927 CASAVA_Build 6 67878435 11D GTTGCAGTAA GCCGAGATCAT/----------- GCCACTGCAC 3070 het 3070 ref 30 17 14 1 GCCGAGATCAT 1 0 112928 CASAVA_Build 6 67878682 4I TCTAGATTCT ----/TAAA TAAAGTTTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TAAA 1 2 112929 CASAVA_Build 6 67880908 4D CTGGAGTTAC CTAA/---- CTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 39 15 22 3 CTAA 1 0 112930 CASAVA_Build 6 67886643 1D AACATTTCCT A/- AAAAGTATGG 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 A 5 4 112931 CASAVA_Build 6 67888390 1D TTGTCTAACA G/- AACTCCATTT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 G 1 0 112932 CASAVA_Build 6 67891509 1I CTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 9 10 112933 CASAVA_Build 6 67892787 1D ATTGTATATT G/- ATTAAATATA 1872 het 1872 ref 11 7 4 0 G 1 0 112934 CASAVA_Build 6 67892850 2D TAAAACATAA AT/-- ATATATATAC 2289 hom 21 het 11 0 8 5 AT 5 4 112935 CASAVA_Build 6 67894526 2I GGTAGCAGAC --/AG AACTCCTCAC 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 AG 0 1 112936 CASAVA_Build 6 67894853 45D TGATTTTAAT TTTCTAAATTTTACTTTTATGTTTGTACTATACTATAAGAATTTA/--------------------------------------------- TTTCTAAAGT 3070 het 3070 ref 26 20 8 9 TTTCTAAATTTTACTTTTATGTTTGTACTATACTATAAGAATTTA 1 0 112937 CASAVA_Build 6 67895876 1I AAGCTCTTCT -/A AAAATCTGTT 3070 het 2995 hom 21 7 12 2 A 4 5 112938 CASAVA_Build 6 67901549 1D CTCAAATAAA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 8 7 112939 CASAVA_Build 6 67902546 2I CAGAACTGGC --/TA TGTGTCTGAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TA 0 1 112940 CASAVA_Build 6 67903439 2D ACATCCACAC AT/-- GTGTATGCAT 3070 het 3070 ref 86 47 34 6 AT 1 0 112941 CASAVA_Build 6 67903942 1D ATTAAAATTT A/- AAACATATGC 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 A 4 3 112942 CASAVA_Build 6 67904575 4I TGTGTGTGTG ----/TATA TATATATATA 1426 het 1426 ref 10 6 3 1 TA 6 8 112943 CASAVA_Build 6 67909782 4D TCCATATCAC TGAT/---- TACATATTCT 3070 het 3070 ref 55 32 15 10 TGAT 1 0 112944 CASAVA_Build 6 67916852 1I AAATTTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 963 hom 21 2 14 5 T 11 12 112945 CASAVA_Build 6 67919805 8D GGTTATTTGA ACACAGGC/-------- ACTGCAATAC 3070 het 3070 ref 37 23 13 4 ACACAGGC 1 0 112946 CASAVA_Build 6 67924837 1I TTCTATTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 9 10 112947 CASAVA_Build 6 67929485 6I CTATTACATG ------/TTAATA TTAATACATT 3070 hom 45 het 24 0 16 8 TTAATA 1 2 112948 CASAVA_Build 6 67931631 3D AAACACAGAA GAC/--- AATATCTCTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 GAC 1 0 112949 CASAVA_Build 6 67934777 1D AGATTCTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 17 16 112950 CASAVA_Build 6 67942279 1D AGTTACTATC T/- TTTTTTGAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 7 6 112951 CASAVA_Build 6 67953169 5D GTTTCAGAAC AAAAG/----- TTTTTTTAAT 3070 het 443 hom 9 1 7 2 AAAAG 1 0 112952 CASAVA_Build 6 67954086 3D TTCATGAGTA AAC/--- AAGTATGCCA 3070 het 2602 hom 32 6 13 14 AAC 1 0 112953 CASAVA_Build 6 67954111 3D CCTGACAAAT ATC/--- ATAATAAAAT 3070 het 1890 hom 31 5 13 14 ATC 1 0 112954 CASAVA_Build 6 67955641 3I ACATTGTGTG ---/TGA TGGTTAGAAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 TGA 0 1 112955 CASAVA_Build 6 67956221 2I TTGACAAAGT --/TA TATATATATA 3070 het 2943 hom 23 9 12 2 TA 6 7 112956 CASAVA_Build 6 67956438 2I TATATTTTAC --/AT ATATATATAC 2282 het 2282 ref 15 7 5 3 AT 4 5 112957 CASAVA_Build 6 67956962 1I TAATTTTAGG -/A AAAAGTTTAG 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 4 5 112958 CASAVA_Build 6 67962803 4I CATTTTATAA ----/ATAT ATATATATAT 1909 hom 18 het 9 0 6 3 AT 7 9 112959 CASAVA_Build 6 67969109 1I TCTCAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1271 hom 26 4 12 10 A 11 12 112960 CASAVA_Build 6 67975923 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 2920 het 2920 ref 18 9 8 1 A 11 10 112961 CASAVA_Build 6 67985036 1D ATGTATAGAC A/- TTAATTATTA 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 A 1 0 112962 CASAVA_Build 6 67985547 2I TAAAATAAAA --/AT ACTATAATTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AT 0 1 112963 CASAVA_Build 6 67993897 1I AAAAATGTTT -/A AAAAATAAGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 5 6 112964 CASAVA_Build 6 68001641 2D TTAGGTCAAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TA 8 7 112965 CASAVA_Build 6 68001739 4D TATGTGTGTG TGTA/---- TATATATATA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TGTA 1 0 112966 CASAVA_Build 6 68012665 1D TAATTATAAT A/- ATAATATTGT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 A 2 1 112967 CASAVA_Build 6 68015440 1D AGGTGACTGG C/- TAAGGATCGC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 C 1 0 112968 CASAVA_Build 6 68015981 1D CACAACAATC A/- AACAGCATTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 3 2 112969 CASAVA_Build 6 68021011 4I ATTATGAGGA ----/GAAT GAATGTACAA 3070 het 3070 hom 35 18 15 2 GAAT 1 2 112970 CASAVA_Build 6 68021709 1D ATTGTGTCAT A/- AAAAAATTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 6 112971 CASAVA_Build 6 68022508 2I TATATCGGTT --/AA TTGCCTGTGA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 0 2 112972 CASAVA_Build 6 68030094 1D CCCTTTATCA T/- TTTTTTATTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 7 6 112973 CASAVA_Build 6 68032644 1D CCACTGTTGA G/- GGGTCTTATC 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 G 4 3 112974 CASAVA_Build 6 68033053 1I GCAGCAGGGG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 7 8 112975 CASAVA_Build 6 68034315 1I TATGTCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 10 11 112976 CASAVA_Build 6 68040356 4D ATGACTGTAC CAAA/---- CAAACTAATT 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 CAAA 2 1 112977 CASAVA_Build 6 68043834 2D CTGGGAGGTG CA/-- GAGGTTGCAG 2746 het 2555 hom 15 7 6 2 CA 1 0 112978 CASAVA_Build 6 68046944 9I CTTTTTTCAT ---------/AGAAATGAA AAAAGCAATC 3070 hom 79 het 29 0 25 4 AGAAATGAA 0 1 112979 CASAVA_Build 6 68050386 1I CAAACATATG -/A AAAAAAGTCT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 6 7 112980 CASAVA_Build 6 68051186 2I TTTTTGTTGA --/AT AGAACACCAA 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 AT 0 1 112981 CASAVA_Build 6 68051915 1D TTCAAACCAC T/- AGCAACTACT 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 T 1 0 112982 CASAVA_Build 6 68052983 1D AACTGCATAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 9 8 112983 CASAVA_Build 6 68053818 1D ACACTGAAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 2921 hom 32 8 19 7 A 9 8 112984 CASAVA_Build 6 68056430 1D CAGAATCTAC A/- AAGAACTTAA 2418 het 2418 ref 11 6 5 0 A 3 2 112985 CASAVA_Build 6 68058528 1D CTGAGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 11 10 112986 CASAVA_Build 6 68067504 1I GAAGAAAACT -/C CCCAACCCCT 3070 hom 81 het 34 0 25 9 C 3 4 112987 CASAVA_Build 6 68067724 1I TCTTTTCTTT -/A ATTGAAACAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 1 2 112988 CASAVA_Build 6 68068658 1D CAGAAAATAG A/- AAAAATGTAC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 6 5 112989 CASAVA_Build 6 68070847 1D AGATTTACAT A/- AAAAAATCAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 6 112990 CASAVA_Build 6 68073140 2D TGATGTCTAC TT/-- TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 30 15 14 2 T 8 6 112991 CASAVA_Build 6 68075559 1D CGAAAAGCCA C/- CAGGGTTGGA 3070 het 3070 ref 46 30 14 4 C 2 1 112992 CASAVA_Build 6 68076812 1I TTCCTGGGCA -/T TTTTTTTTTT 2071 het 2071 ref 26 11 9 6 T 13 14 112993 CASAVA_Build 6 68077050 2D AATCTAGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 13 11 112994 CASAVA_Build 6 68079569 1D TCCTTTGTGC A/- AATGACTCTC 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 A 3 2 112995 CASAVA_Build 6 68085130 2D TTTTCTAAAG TT/-- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 43 0 22 21 T 10 8 112996 CASAVA_Build 6 68089827 2I ATAAATACAC --/TA TATATTCTAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TA 2 3 112997 CASAVA_Build 6 68095645 2D CACGCATGCT CA/-- CGCGCGCGCG 3070 het 1939 hom 34 9 18 9 CA 1 0 112998 CASAVA_Build 6 68100548 1D AGATTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 16 9 0 A 10 9 112999 CASAVA_Build 6 68108621 3I TATCAATATC ---/AAA AAAAAAAAAC 3070 hom 82 het 33 0 28 5 A 9 12 113000 CASAVA_Build 6 68125704 1D TCTGGTCATT A/- AAAAAAACTC 3070 hom 99 het 37 0 34 5 A 8 7 113001 CASAVA_Build 6 68133390 1I TGGGCTGAGT -/A AATGAATTGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 2 3 113002 CASAVA_Build 6 68136150 1D TACTTTAGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 88 het 35 0 30 5 T 10 9 113003 CASAVA_Build 6 68138675 1D TAAACTATCA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 66 het 30 0 23 8 T 8 7 113004 CASAVA_Build 6 68143465 1D TTTACAAAAC A/- ATTGCCGACC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 2 1 113005 CASAVA_Build 6 68144295 1D GCCTGGCAGG A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 8 7 113006 CASAVA_Build 6 68145746 1D CCTCAGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 38 1 32 5 T 12 11 113007 CASAVA_Build 6 68147245 1I TGTGGTAGCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 384 hom 42 1 34 7 A 8 9 113008 CASAVA_Build 6 68156967 6I GCTAAAACTT ------/TAAATA TAAATTTTTA 3070 hom 135 het 53 0 45 8 TAAATA 0 1 113009 CASAVA_Build 6 68157129 1D TAATTAAGAA G/- TCTTCAAAAT 3070 het 3070 ref 44 24 17 6 G 1 0 113010 CASAVA_Build 6 68157286 4I TGAAAGTATC ----/TCTT TCTATTGTTA 3070 hom 196 het 74 0 66 8 TCTT 0 1 113011 CASAVA_Build 6 68161694 1I ATGAACAAAA -/C AGTGAGAAAA 3070 het 40 hom 48 1 45 2 C 0 1 113012 CASAVA_Build 6 68162090 1D AAACATGCTA C/- TATAGGCTGG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 0 113013 CASAVA_Build 6 68162433 1D TTAGTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 408 het 408 ref 25 8 3 14 A 16 15 113014 CASAVA_Build 6 68162469 1I GATATCAAGG -/A AGATTCCGAA 3070 hom 58 het 30 0 20 10 A 1 2 113015 CASAVA_Build 6 68165145 5I TCAAAATTAA -----/TTTAT TTTAAGGTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TTTAT 0 1 113016 CASAVA_Build 6 68177455 2I TTCAGGCCTC --/TT ATAACTTTAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 2 113017 CASAVA_Build 6 68177734 2D TAAAAGCAAT AA/-- GAGTCTGTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 2 0 113018 CASAVA_Build 6 68178171 1D CATTTTATGC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 8 113019 CASAVA_Build 6 68195042 1D TGGGGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 8 10 A 12 11 113020 CASAVA_Build 6 68207835 1D TTGGTCCATA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2300 hom 26 7 10 9 C 10 9 113021 CASAVA_Build 6 68222214 12D CAATCACAGT TGTGTTCTAGGG/------------ TGTGTTCTAG 3070 het 3070 ref 36 17 16 9 TGTGTTCTAGGG 2 1 113022 CASAVA_Build 6 68228387 1D ATATGAAACC A/- AAAAAGAGCC 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 A 6 5 113023 CASAVA_Build 6 68245250 1D AAATTTGAGG A/- AAAAAACGCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 6 113024 CASAVA_Build 6 68264104 4D ATTGACTAAT AGTC/---- AGTGCTCAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 AGTC 1 0 113025 CASAVA_Build 6 68264871 4I TCTATCTATC ----/TATT TATTATCTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TATT 1 2 113026 CASAVA_Build 6 68266779 1I TGCATAATCT -/C ATTTTTTATT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 0 1 113027 CASAVA_Build 6 68267635 5I CGAGAACATT -----/TTCAC GAGTTATTTT 3070 hom 144 het 50 0 48 2 TTCAC 0 1 113028 CASAVA_Build 6 68271463 1I AAAGTATGTA -/C CTTTTTTCAG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 1 2 113029 CASAVA_Build 6 68272793 1D GTTCTGGGGG A/- GGGTGGCTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 1 0 113030 CASAVA_Build 6 68273211 1I GGCTGCCAAG -/A AAAATCTCGT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 4 5 113031 CASAVA_Build 6 68273523 5D ATCATCTCTC TTAAG/----- TTAAAAGTTC 3070 hom 99 het 35 0 34 3 TTAAG 1 0 113032 CASAVA_Build 6 68276128 1D TAAAATTCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 9 8 113033 CASAVA_Build 6 68279591 2D TAAGAGAAAC TA/-- GAGTCAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 TA 1 0 113034 CASAVA_Build 6 68285568 2I AGGGAAATAT --/CA CAAATAATTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CA 1 2 113035 CASAVA_Build 6 68290973 1I CAATTCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 T 10 11 113036 CASAVA_Build 6 68296510 4I GTGAGATAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AAAC 2 3 113037 CASAVA_Build 6 68303736 1D CTGGAGGCTT A/- AGGAGACAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 6 A 2 1 113038 CASAVA_Build 6 68305998 4I GGTAATAAAA ----/TAGG TAGAAAATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAGG 0 1 113039 CASAVA_Build 6 68333106 4I TCTTAAAGAA ----/AAAC AAAGCAATGC 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 AAAC 0 1 113040 CASAVA_Build 6 68335607 4I CAGACAAATT ----/ATAA ATATTAAAGT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 ATAA 0 1 113041 CASAVA_Build 6 68342680 7D TATTTTTAAG TTCATTT/------- AACATATTAT 3070 het 3070 ref 29 19 9 2 TTCATTT 1 0 113042 CASAVA_Build 6 68343292 2I TATAATTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 T 12 14 113043 CASAVA_Build 6 68344642 3I TTGGATATAA ---/TTG TTATTGCAAA 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 TTG 0 1 113044 CASAVA_Build 6 68346146 2I CTGGAAAAGC --/CA CAGTCACTCA 3070 het 3070 ref 42 21 11 10 CA 1 2 113045 CASAVA_Build 6 68349570 1D ACACCATGAC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 7 6 113046 CASAVA_Build 6 68350601 1I CGTTTGCAAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 8 9 113047 CASAVA_Build 6 68353368 1D TAGTGACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 17 11 T 12 11 113048 CASAVA_Build 6 68354918 1I CTTGCCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2447 hom 32 9 15 8 A 11 12 113049 CASAVA_Build 6 68355196 4I GAACTATGTC ----/TTTA TTTATATCTT 3070 het 3070 hom 31 8 20 3 TTTA 1 2 113050 CASAVA_Build 6 68355702 1I TATTGTTATA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 T 7 8 113051 CASAVA_Build 6 68366296 1I GTAAATATAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 8 9 113052 CASAVA_Build 6 68372778 4D CATGAATTGT TTAC/---- TTAAACTGTA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 TTAC 1 0 113053 CASAVA_Build 6 68373681 1D CTTTTTCCTT A/- AAATAAATAT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 A 4 3 113054 CASAVA_Build 6 68382485 4I CAAAAAAAAA ----/AAAC AAAAAACTAC 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 AAAC 0 1 113055 CASAVA_Build 6 68385123 1I GGATCCTCTT -/G CCAAGTGTAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 0 1 113056 CASAVA_Build 6 68390882 1I TGTCTGACTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 8 9 113057 CASAVA_Build 6 68395635 1D TAATGATAGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 56 20 29 9 A 9 8 113058 CASAVA_Build 6 68399600 1I AAACAATTAG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 7 8 113059 CASAVA_Build 6 68403648 4I AAACACCGAG ----/ATAT ATATTTGTTG 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 AT 2 4 113060 CASAVA_Build 6 68405240 2I TTTCCTCCTA --/TC TAACTATAAT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 TC 0 1 113061 CASAVA_Build 6 68408784 2I GCATTATATA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 10 13 T 10 12 113062 CASAVA_Build 6 68418109 1D TGAGAAAAGG T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 T 7 6 113063 CASAVA_Build 6 68422260 4I TTCTGTTTGC ----/TTGT TTGTTTGCTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TTGT 1 2 113064 CASAVA_Build 6 68426161 4I ACAACATCTG ----/GTTT TTTTTAATAT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 GTTT 0 1 113065 CASAVA_Build 6 68440162 1I ACTGAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 9 10 113066 CASAVA_Build 6 68451037 4D CAGTTCAGTT CCTC/---- ATGCAAATGT 3070 het 3070 hom 51 18 28 7 CCTC 1 0 113067 CASAVA_Build 6 68452687 1I AAAATAAGTT -/A AAAAAAAATT 1619 het 556 hom 8 2 5 1 A 8 9 113068 CASAVA_Build 6 68463173 1D CAAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 1 0 113069 CASAVA_Build 6 68463372 3I GGGCATATTG ---/GAA GAAGAATTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 GAA 2 3 113070 CASAVA_Build 6 68463430 1I CTGACGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 9 13 A 12 13 113071 CASAVA_Build 6 68464948 2D AACTATCCAA CT/-- CTCTCTCTCT 1727 het 1727 ref 17 7 5 5 CT 6 5 113072 CASAVA_Build 6 68465018 2D ACATATATAT AC/-- ACACACACAC 2607 het 159 hom 16 1 11 5 AC 7 6 113073 CASAVA_Build 6 68471660 1D15M1D GAGAGAGAGA GGAAAAAAAAAAATGAG/-GAAAAAAAAAAATGA- GGGGGGGGAG 2304 het 1887 hom 30 10 11 11 N/A 0 0 113074 CASAVA_Build 6 68476601 1I AGGTTTTCAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 7 8 113075 CASAVA_Build 6 68477634 1I TATTTGAAGG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 T 6 7 113076 CASAVA_Build 6 68482128 2D TACATAAAAC AT/-- ATATATGCAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 AT 4 3 113077 CASAVA_Build 6 68482564 1I GATTAGGTGG -/T TTAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 2 3 113078 CASAVA_Build 6 68483675 1I ACACACAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 11 12 113079 CASAVA_Build 6 68484184 1D AGAAGAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 10 9 113080 CASAVA_Build 6 68487504 1D ATACGCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 11 10 113081 CASAVA_Build 6 68488541 1D AGATATTTTT A/- AAATTTTTGA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 4 3 113082 CASAVA_Build 6 68491253 1D ACCTGGGGAC A/- AAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 A 6 5 113083 CASAVA_Build 6 68498585 1I ATGATTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 10 11 113084 CASAVA_Build 6 68502956 2I TAATTGCAAA --/CT CTCTGCCATG 3070 hom 132 het 52 0 45 7 CT 2 3 113085 CASAVA_Build 6 68506017 1D CAAATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2301 hom 32 10 13 9 T 15 14 113086 CASAVA_Build 6 68506695 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 2472 hom 28 7 13 9 AC 10 9 113087 CASAVA_Build 6 68511204 1I TCATTTTGAA -/T TATGATTATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 2 113088 CASAVA_Build 6 68511772 2D TCCTTGAGAC AT/-- ATGAACCCAA 3070 het 3070 hom 53 20 28 6 AT 2 1 113089 CASAVA_Build 6 68527603 1D TTAAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 801 hom 36 2 24 10 A 12 11 113090 CASAVA_Build 6 68536078 3I AGCAATGATG ---/ACT TCTAGTGCTT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 ACT 0 1 113091 CASAVA_Build 6 68537021 1D CATATGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 12 13 T 12 11 113092 CASAVA_Build 6 68544214 3I AAGGAATTTA ---/AAC AACACATAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAC 1 2 113093 CASAVA_Build 6 68544345 2D TCTCTCTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 2687 het 1771 hom 25 7 12 7 CT 12 11 113094 CASAVA_Build 6 68546122 1I TTAATTTGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 8 9 113095 CASAVA_Build 6 68548066 1D AAAGAGCTTT A/- AAAAAATAGG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 7 6 113096 CASAVA_Build 6 68550761 6I ATGCAGTCTC ------/TCTCTT TCTCTTTTTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TCTCTT 1 2 113097 CASAVA_Build 6 68556326 88D CATTATTTTA TAATAAAAAATGTGATTGTGAAGAGATTAAAATATGTTTAAATTCACTTACCTCATTTCATATTGACAGAAGTGTCAAGATTTCCATG/---------------------------------------------------------------------------------------- AATATAAGTT 2452 het 2452 ref 12 24 6 0 TAATAAAAAATGTGATTGTGAAGAGATTAAAATATGTTTAAATTCACTTACCTCATTTCATATTGACAGAAGTGTCAAGATTTCCATG 1 0 113098 CASAVA_Build 6 68558386 1D AATTACCTGA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 7 113099 CASAVA_Build 6 68561419 4I TTTGGACCTC ----/CTGT CTGTCTTTAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 CTGT 1 2 113100 CASAVA_Build 6 68561646 1I GCTTAGGTTA -/T TTTTTTCCCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 7 113101 CASAVA_Build 6 68563349 1I CCTTATAAAA -/G GGACCCCAGA 3070 hom 84 het 33 0 26 7 G 2 3 113102 CASAVA_Build 6 68564791 4D20M1D CTCGTTGACT GAGCGAGACTCTATCTTGAAAAAGA/----GAGACTCTATCTTGAAAAAG- AAAAAAAAAA 3004 het 1926 hom 27 10 9 13 N/A 0 0 113103 CASAVA_Build 6 68566100 3D GACTCCAGAC CCT/--- GGCTCCCAGA 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 CCT 1 0 113104 CASAVA_Build 6 68566940 1I AAATGCTATT -/G ACATACCAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 0 1 113105 CASAVA_Build 6 68567744 1D GTATATCCAG C/- AAAAATACCT 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 C 1 0 113106 CASAVA_Build 6 68571603 1I GAACTCATCC -/T TTTTTTATGG 3070 het 2510 hom 19 6 12 1 T 6 7 113107 CASAVA_Build 6 68573505 10D CATGCACGTG ATGGAGTACT/---------- ATTCAGCCAT 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 ATGGAGTACT 1 0 113108 CASAVA_Build 6 68576628 1D ATGGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1674 het 1674 ref 42 33 4 6 T 11 10 113109 CASAVA_Build 6 68579190 1D CTGTAAAATG T/- TTTTCATACT 3070 het 3070 ref 38 20 11 8 T 5 4 113110 CASAVA_Build 6 68580439 6I ATTTGGCTGT ------/AAGTGC ATAGATTTTT 3070 hom 102 het 39 0 32 7 AAGTGC 0 1 113111 CASAVA_Build 6 68581958 1I AAAATCTCAG -/T TTTGAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 3 4 113112 CASAVA_Build 6 68584672 1D CATGAAATCA C/- TATGTCTCCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 0 113113 CASAVA_Build 6 68586089 2D TCATTCTTAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 22 het 41 1 22 19 TC 7 6 113114 CASAVA_Build 6 68586810 1D CTTAAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 1189 het 1189 ref 24 15 3 6 T 12 11 113115 CASAVA_Build 6 68586881 1I AAATATGGAG -/T TTTTTTATCT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 6 7 113116 CASAVA_Build 6 68595890 1D TTAAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 2978 het 4 hom 21 0 7 14 A 11 10 113117 CASAVA_Build 6 68597084 1D TCCTTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 10 9 113118 CASAVA_Build 6 68597166 1I TATGTGATTG -/T TGTCCATGAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 1 2 113119 CASAVA_Build 6 68649438 1I GATGGGAGGT -/A ACCCAAGGGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 113120 CASAVA_Build 6 68765758 1D TTAATTTGCT A/- AAACTTGTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 3 113121 CASAVA_Build 6 68771279 26D TAGGAAAAGT ACGACTTTTCATGTAAATTAAAAATG/-------------------------- ACCATGGTTC 3070 hom 87 het 28 0 30 3 ACGACTTTTCATGTAAATTAAAAATG 1 0 113122 CASAVA_Build 6 68776174 42D TGTGTGTGTA TATATATATATGTATATATATATATATGTATATATATATATG/------------------------------------------ TATATATATA 2247 hom 18 het 5 0 7 0 TATATATATATGTATATATATATATATGTATATATATATATG 1 0 113123 CASAVA_Build 6 68795316 1I AAGTTCTTCG -/C CTGATACTGG 3070 hom 142 het 54 0 46 8 C 1 2 113124 CASAVA_Build 6 68803171 1I TCTTTTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 372 hom 41 1 35 5 T 9 10 113125 CASAVA_Build 6 68803418 1D GAACTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 31 2 16 13 T 17 16 113126 CASAVA_Build 6 68806349 2I ATTTTTCCAC --/AT GTTTCTGTCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 0 1 113127 CASAVA_Build 6 68810096 1D33M1I AATTGCTATT AAAAAAAAAAAAGCCCCTCTACTATATTCTGAAG-/-AAAAAAAAAAAGCCCCTCTACTATATTCTGAAGA ATATCTGATT 3070 hom 3 het 27 1 31 8 N/A 0 0 113128 CASAVA_Build 6 68813679 1I CCTTGCCCAC -/T TTTTTTATGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 6 7 113129 CASAVA_Build 6 68817083 4D AAATGAATGA TATT/---- TATTTGTTAG 3070 hom 114 het 42 0 38 5 TATT 2 1 113130 CASAVA_Build 6 68822348 1I AAATTCAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 511 hom 34 2 28 4 T 10 11 113131 CASAVA_Build 6 68826428 1D TTCACAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 45 0 35 10 A 13 12 113132 CASAVA_Build 6 68840978 1D GGCATGCTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 10 9 113133 CASAVA_Build 6 68843320 3I ACTGATGTCT ---/GAA GAAGAAGAAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 GAA 3 4 113134 CASAVA_Build 6 68846504 1I GCCGGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 12 0 8 4 T 10 11 113135 CASAVA_Build 6 68847453 2I TCCTCCAGTG --/TT ACCCACCACT 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 0 2 113136 CASAVA_Build 6 68848364 1I CTGTGCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 774 hom 38 2 30 6 T 10 11 113137 CASAVA_Build 6 68854324 1I GCATCAGAAT -/A AAAAAAAGAA 2465 hom 12 het 7 0 5 2 A 7 8 113138 CASAVA_Build 6 68859054 1D TCTCACCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 11 10 113139 CASAVA_Build 6 68871374 1D AATACTCTGA T/- TTTTTTTTTT 1201 het 1201 ref 23 14 3 6 T 15 14 113140 CASAVA_Build 6 68875515 4I CTTAGCTTCT ----/TCTA TCTGAAAGTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TCTA 0 1 113141 CASAVA_Build 6 68894362 1I ATTTAGTCAA -/T TTTTTTTTTC 2261 het 2261 ref 28 18 6 4 T 9 10 113142 CASAVA_Build 6 68913478 1I GATATTGAGC -/T TTTTTTCATA 3070 hom 120 het 43 0 39 4 T 6 7 113143 CASAVA_Build 6 68914096 1I TTATATCCTA -/T TTTATCTTAT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 3 4 113144 CASAVA_Build 6 68915656 1I CTTTTATTAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 8 9 113145 CASAVA_Build 6 68918324 1D AACACAAAGA G/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 39 19 18 3 G 1 0 113146 CASAVA_Build 6 68920508 2D TGTGTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 33 1 19 13 T 16 14 113147 CASAVA_Build 6 68923134 3I CCCCCAATCC ---/TGG TGGTCTCACC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 TGG 1 2 113148 CASAVA_Build 6 68923722 9D CATTTTACAG TGGTTAGTA/--------- TGATTTTAAA 3070 het 3070 hom 60 24 33 6 TGGTTAGTA 1 0 113149 CASAVA_Build 6 68928999 4D AAACATACAC ACAA/---- ATACACATAA 1835 het 1835 ref 14 9 4 2 ACAA 1 0 113150 CASAVA_Build 6 68932670 1D AGCGAAATAA G/- TAGAGGACAT 3070 het 3070 hom 49 18 28 4 G 1 0 113151 CASAVA_Build 6 68946540 2I TAAGGAACTC --/TT AACGTCAATA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 0 2 113152 CASAVA_Build 6 68947459 1I CCACGAGGAA -/G GGGGCTCGAT 3070 het 2460 hom 22 8 10 4 G 4 5 113153 CASAVA_Build 6 68968942 3D AATATTGTCC TTG/--- TTTAATATAG 3070 het 3070 hom 18 7 10 2 TTG 1 0 113154 CASAVA_Build 6 68985634 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAACT 2686 het 1718 hom 18 6 7 6 A 9 8 113155 CASAVA_Build 6 68988774 4I CTTAAATTTT ----/TTTG TTTATTTTTC 3070 het 2276 hom 24 6 11 7 TTTG 0 1 113156 CASAVA_Build 6 68988977 3I ATGTCTATCT ---/ATC ATCTATCATC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 ATC 1 2 113157 CASAVA_Build 6 68989104 3I GTATTATCTC ---/TCT TATTTATTAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TCT 0 1 113158 CASAVA_Build 6 68989258 3D TTAACTATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 29 10 17 6 TTG 4 3 113159 CASAVA_Build 6 68996228 1I ATAACTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 10 21 10 T 10 11 113160 CASAVA_Build 6 69015839 1I ATGACTGATG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 8 9 113161 CASAVA_Build 6 69024116 1D24M1D CCCAGGAAGG AAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGA/-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAG- AAAAAAAAAA 2183 het 2183 ref 31 13 10 14 N/A 0 0 113162 CASAVA_Build 6 69034463 1D GAGAATCCTC A/- AAAAAAATAA 2232 het 1570 hom 13 5 6 2 A 8 7 113163 CASAVA_Build 6 69034934 2I CCCTTTTGGA --/GT GAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 50 28 19 3 GT 0 1 113164 CASAVA_Build 6 69035137 1I ATAATTTCCC -/T TTGGATCATT 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 T 2 3 113165 CASAVA_Build 6 69037418 5I AAAAGAAACA -----/AGAAG AGAAGAGGAA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 AGAAG 1 2 113166 CASAVA_Build 6 69039212 1D TGCTTCTATT A/- GGGGCAAATG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 1 0 113167 CASAVA_Build 6 69057621 1I AAAAGCATGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 7 8 113168 CASAVA_Build 6 69071278 1D AAAAACACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 10 9 113169 CASAVA_Build 6 69072073 1I GAAGAAGACA -/C CAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 C 1 2 113170 CASAVA_Build 6 69074803 1D CTCTTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 22 1 13 8 A 12 11 113171 CASAVA_Build 6 69084094 1D TTTAATGGTC T/- CATATCTTCC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 1 0 113172 CASAVA_Build 6 69085469 1I AGTTTAGTGG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 T 6 7 113173 CASAVA_Build 6 69090826 1D CAATAGAGAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3005 hom 23 7 14 4 A 7 6 113174 CASAVA_Build 6 69090902 4D TTTACAAATC TATT/---- TAATAAATGA 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 TATT 1 0 113175 CASAVA_Build 6 69091678 3D ATCTTATAAT GTG/--- GTGATAATAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 GTG 2 1 113176 CASAVA_Build 6 69092241 1I AGAATAACAG -/A AAACCCAGAG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 3 4 113177 CASAVA_Build 6 69095540 1D TACCAGGTAT G/- GGATAATTAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 G 3 2 113178 CASAVA_Build 6 69096235 1D AGAATAGGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 11 18 6 A 10 9 113179 CASAVA_Build 6 69101616 1D AAAAACCAGC A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 43 25 17 1 A 7 6 113180 CASAVA_Build 6 69105896 2D TTTCACTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 12 10 113181 CASAVA_Build 6 69110242 16D TTAGACTGTG AATATATTTAGCCCTA/---------------- AATATATTAT 3070 het 3070 ref 43 26 12 6 AATATATTTAGCCCTA 1 0 113182 CASAVA_Build 6 69116193 1D ATAAACTTTT G/- GGGGGGGGTA 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 G 9 8 113183 CASAVA_Build 6 69119612 1D GGTTTTATGG T/- ACGGTATGTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 T 1 0 113184 CASAVA_Build 6 69124289 1I TAGATGTCTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 8 9 113185 CASAVA_Build 6 69129730 1D AAAGGAACTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 37 16 12 10 A 8 7 113186 CASAVA_Build 6 69134740 1I ATATGCAGAT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 7 8 113187 CASAVA_Build 6 69142014 2I CCCATTTTTG --/TC TCTGTTATTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TC 1 2 113188 CASAVA_Build 6 69148635 1I TTTTTTTTTT -/G ATGTAGGTAC 2984 het 2984 ref 25 11 10 4 G 0 1 113189 CASAVA_Build 6 69157831 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 T 11 12 113190 CASAVA_Build 6 69162655 1I ATCTCAAGGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 1795 hom 22 4 15 3 T 8 9 113191 CASAVA_Build 6 69174249 2D GAAAGAATAT TA/-- TATAATTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TA 3 2 113192 CASAVA_Build 6 69179185 1I CAATTTGTGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 7 8 113193 CASAVA_Build 6 69186417 3D CTGAATGTTA ATC/--- ATCAAGACAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 6 ATC 2 1 113194 CASAVA_Build 6 69210079 1D GAATATGTTG A/- ATATGCATTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 2 1 113195 CASAVA_Build 6 69210316 5D TATTTAATGC TTTTA/----- TTTTAATTTT 3070 het 3070 ref 41 23 16 4 TTTTA 2 1 113196 CASAVA_Build 6 69213723 2D TAACCAAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 15 13 113197 CASAVA_Build 6 69214314 3I ATTTATGTAA ---/TAT TTTTAAATAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 TAT 0 1 113198 CASAVA_Build 6 69215792 1D GTCCCCGCAT C/- CCCCCGTCCT 3070 het 3070 hom 28 9 13 7 C 6 5 113199 CASAVA_Build 6 69223567 4D AGAATAAAAT AGTC/---- AGGTATGTTT 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 AGTC 1 0 113200 CASAVA_Build 6 69226391 1D TTTTCTGAGG T/- TTTTTTTTTT 2920 het 2920 ref 28 14 7 7 T 13 12 113201 CASAVA_Build 6 69228313 1D TCCCTCCCCC T/- TCTCCCAACC 1510 het 1510 ref 18 13 4 1 T 2 1 113202 CASAVA_Build 6 69232339 2I TACCAAACTC --/TG TGTTCATTGT 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 TG 1 2 113203 CASAVA_Build 6 69232466 1I GTGTTTGGGC -/A TAGCTTACGT 3070 het 3070 hom 46 13 28 5 A 0 1 113204 CASAVA_Build 6 69238450 2D AAAAATGAAA CT/-- CTGCATACTA 3070 het 3070 hom 22 8 9 6 CT 2 1 113205 CASAVA_Build 6 69239930 1D CCAAATGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 9 113206 CASAVA_Build 6 69240890 1I AACTAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 30 1 20 9 A 12 13 113207 CASAVA_Build 6 69243747 5D AAGAGCAAAA TAGTT/----- TATGCTACAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 TAGTT 1 0 113208 CASAVA_Build 6 69245293 1D CTTTTTTTTA T/- TTTAAAATCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 4 3 113209 CASAVA_Build 6 69254144 4D CTCTTCACAG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 75 het 41 0 25 17 GT 11 9 113210 CASAVA_Build 6 69256883 3I AGAATGATAC ---/AAT AATAGTATCT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AAT 1 2 113211 CASAVA_Build 6 69257007 1I CTTTCATATG -/T TAACACTTAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 113212 CASAVA_Build 6 69257718 1I ATACATATTT -/A TTTTTTTATT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 0 1 113213 CASAVA_Build 6 69258894 1I ATATAAAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 61 het 27 0 21 6 A 9 10 113214 CASAVA_Build 6 69273476 6D GTGTAGTAAC CAGACT/------ CAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 38 15 22 2 CAGACT 1 0 113215 CASAVA_Build 6 69278163 1D TGTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2687 het 2045 hom 37 8 9 20 T 15 14 113216 CASAVA_Build 6 69280815 1I AACCAATGAC -/A AAAACCACAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 4 5 113217 CASAVA_Build 6 69285748 3D AGCCTACATA AAG/--- AAGATGTTTT 2753 het 2701 hom 14 6 6 3 AAG 2 1 113218 CASAVA_Build 6 69292800 1D GTTTTGTTTT G/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 52 19 28 5 G 1 0 113219 CASAVA_Build 6 69295693 1I AAATTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 10 11 113220 CASAVA_Build 6 69346101 1I CTGTTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3028 het 3028 ref 35 15 8 12 A 15 16 113221 CASAVA_Build 6 69347301 2D TGTAATTATT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 A 11 9 113222 CASAVA_Build 6 69352036 1I TTATTATATA -/T TTGTATGCTT 3070 hom 66 het 26 0 23 7 T 2 3 113223 CASAVA_Build 6 69358880 1I TCGAGACTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 44 0 34 10 T 10 11 113224 CASAVA_Build 6 69376097 2D TAAAGCAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 1601 het 401 hom 22 3 8 12 A 16 14 113225 CASAVA_Build 6 69378242 1I ACCTAGTTTG -/C TTTTCCTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 C 0 1 113226 CASAVA_Build 6 69383383 1D TGACAATTTG A/- AAAAAAACTC 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 8 7 113227 CASAVA_Build 6 69409342 1D AAATGAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 12 11 113228 CASAVA_Build 6 69452847 1D TTCCTGGATA T/- TTTTTCTGCT 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 6 5 113229 CASAVA_Build 6 69458456 2D GAAGGACAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2178 hom 26 5 15 6 TA 9 8 113230 CASAVA_Build 6 69467775 1D AAAGTTGCCA C/- TATGAAACTG 3070 het 3070 ref 40 19 17 6 C 1 0 113231 CASAVA_Build 6 69479535 1D ATTTTTTTTA T/- AAATTCATTT 2288 het 2288 ref 16 8 5 3 T 1 0 113232 CASAVA_Build 6 69500277 1I GAAGGCTAGT -/G GGGGTTTGGA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 G 4 5 113233 CASAVA_Build 6 69509028 1D GACAGAGGGG A/- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 5 4 113234 CASAVA_Build 6 69521353 1D AAGGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 11 10 113235 CASAVA_Build 6 69540768 1D TAAAATGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 11 10 113236 CASAVA_Build 6 69549694 1I TAATAATTAT -/A ATGGCAGGAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 1 2 113237 CASAVA_Build 6 69557664 1I ACATCTCTTA -/C AAAAAAAAAA 2760 het 1025 hom 29 6 12 11 C 0 1 113238 CASAVA_Build 6 69575689 1D GTGCTGGTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3043 hom 30 8 22 1 A 8 7 113239 CASAVA_Build 6 69578945 1I TTAATATATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 T 9 10 113240 CASAVA_Build 6 69585560 2I TTCACTGTGT --/AA AACATTTGAA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 A 2 4 113241 CASAVA_Build 6 69590837 6I CTTAAACTTT ------/TATTTC TATTTCTATT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TATTTC 2 3 113242 CASAVA_Build 6 69595278 4I AACAATGTGG ----/CTGA CTAATATTTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 CTGA 0 1 113243 CASAVA_Build 6 69598348 9D CAAAAGGATT AGATTCTCC/--------- AGAAAGTCAA 3070 het 3070 hom 59 27 29 8 AGATTCTCC 1 0 113244 CASAVA_Build 6 69601350 1I GAAGAATATA -/T TTATGGATGG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 2 3 113245 CASAVA_Build 6 69607720 3I AGAAAACAAA ---/TAT TATTATTAGA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 TAT 2 3 113246 CASAVA_Build 6 69608531 1D TAATTGGTAC A/- AAAAATAGGA 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 A 6 5 113247 CASAVA_Build 6 69610275 1D ATAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 16 9 A 10 9 113248 CASAVA_Build 6 69617857 2I CCTCCTTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 TC 5 6 113249 CASAVA_Build 6 69618637 1D ATATTATTCA T/- TTCAACGTTG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 3 2 113250 CASAVA_Build 6 69627490 1D TTAAATATGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 9 8 113251 CASAVA_Build 6 69628745 2D GGAGGAGGGA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 40 het 23 0 15 8 C 11 9 113252 CASAVA_Build 6 69631136 1I CTTGGATAGG -/A AAGAGAATGA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 3 113253 CASAVA_Build 6 69631505 2D GTATCTGAAT AG/-- ATTGTTGATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AG 1 0 113254 CASAVA_Build 6 69631858 1D ATAATATACA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 7 113255 CASAVA_Build 6 69632731 1D ATTTGGCACT A/- AGTCCCACTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 2 1 113256 CASAVA_Build 6 69638654 2I TTGTGATTAA --/GT GTTATAAATT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 GT 1 2 113257 CASAVA_Build 6 69639009 1I AAAAATTGTC -/A AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 6 7 113258 CASAVA_Build 6 69639898 1D CAAAAGCAAT G/- GATGACACTC 3070 het 3070 ref 51 27 17 9 G 2 1 113259 CASAVA_Build 6 69641996 1D TGGTAAGGTT A/- AAAGGGAAGC 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 A 4 3 113260 CASAVA_Build 6 69642509 6D ATTTCCCCCA TATGAT/------ TATAAGTGCT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 TATGAT 1 0 113261 CASAVA_Build 6 69643995 1D GAATTTAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 11 26 6 T 10 9 113262 CASAVA_Build 6 69646192 1I AACTGGTAGC -/A AAAAAAGGTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 A 6 7 113263 CASAVA_Build 6 69647389 4D AAACAAATTA ATAT/---- ATATAGTTCA 3070 hom 96 het 37 0 32 7 AT 4 2 113264 CASAVA_Build 6 69647791 1I CCTTATAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 14 9 T 11 12 113265 CASAVA_Build 6 69649498 1D CTATTACTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 596 hom 24 2 17 5 T 10 9 113266 CASAVA_Build 6 69650636 3I ATTTTAAAAA ---/AAG ATGATTTGAC 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 AAG 0 1 113267 CASAVA_Build 6 69654266 2D GACTTAACTC TT/-- TGTTTAATAT 3070 het 3070 hom 37 12 22 4 T 3 1 113268 CASAVA_Build 6 69656121 2D TTCTCTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 20 11 T 13 11 113269 CASAVA_Build 6 69661835 1D CTGAGACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1083 hom 40 3 25 12 T 15 14 113270 CASAVA_Build 6 69664375 1I AGGGAGGAAA -/G AGGGAGGGAG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 G 0 1 113271 CASAVA_Build 6 69678033 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2843 hom 24 8 9 7 A 10 11 113272 CASAVA_Build 6 69681911 4I1M2D ACTCATCCAG ----TTA/AAGAT-- GGCACTTAAA 3070 hom 90 het 34 0 29 7 N/A 0 0 113273 CASAVA_Build 6 69684097 1D ATAATTACTA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 34 15 14 6 T 8 7 113274 CASAVA_Build 6 69689735 2I GTTTGATACT --/TC TTTCATTAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TC 0 1 113275 CASAVA_Build 6 69694681 3D ATTTCTAGGA TAT/--- TGAAATTTAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 TAT 1 0 113276 CASAVA_Build 6 69705054 12D TATTTTGAGG TATATATATATA/------------ TATATATATA 3070 het 53 hom 20 1 10 10 TA 15 9 113277 CASAVA_Build 6 69716009 1I TTACAAACTC -/T TAAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 1 2 113278 CASAVA_Build 6 69723469 1D TCATAACGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2041 hom 30 5 15 11 A 10 9 113279 CASAVA_Build 6 69727268 3I TTCAGTAGGA ---/AAG AAGAAGAACA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 AAG 2 3 113280 CASAVA_Build 6 69734738 1I TATTTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 A 10 11 113281 CASAVA_Build 6 69745757 1I ATTGCTATAG -/T TCCTAACATA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 1 2 113282 CASAVA_Build 6 69751514 1D ATCTGATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 10 9 113283 CASAVA_Build 6 69757994 1I CAGAAAAATG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 A 7 8 113284 CASAVA_Build 6 69759525 1I TTATTTCATT -/A TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 A 0 1 113285 CASAVA_Build 6 69759805 1D GTTTTTGCTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 9 8 113286 CASAVA_Build 6 69760687 3D ATAATGCTCA TCC/--- AAGTTATGCT 3070 het 3070 hom 48 22 21 7 TCC 1 0 113287 CASAVA_Build 6 69772721 1D TTACTTACTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 9 8 113288 CASAVA_Build 6 69801269 4D GGTGAGAGAC AGAG/---- AGAGAGACAG 3070 het 2636 hom 19 8 10 2 AG 5 3 113289 CASAVA_Build 6 69801986 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTGTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 5 6 113290 CASAVA_Build 6 69804104 1I TAGAGCATGA -/T TTTAAACCTA 3070 het 3070 ref 36 22 14 0 T 3 4 113291 CASAVA_Build 6 69804259 2D GTGTTGTTGT TC/-- TCTCTCTCTC 1790 het 1790 ref 45 31 5 9 TC 10 9 113292 CASAVA_Build 6 69805056 1I CAGGAATGCT -/G GTTCTTAGTC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 G 1 2 113293 CASAVA_Build 6 69807959 2I TAAACTGAGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 AT 5 6 113294 CASAVA_Build 6 69816855 1I AAAATCACCC -/A AAGGAAGCAG 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 2 3 113295 CASAVA_Build 6 69818364 1I ACAAGGGTGA -/T TTCTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 2 3 113296 CASAVA_Build 6 69826626 1D TGGAAAAAGA C/- ATGCGTAGAA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 C 1 0 113297 CASAVA_Build 6 69828393 56I TTAAAATTAA --------------------------------------------------------/AAGTCTATGTACTGTATGCTTCTATTAAAATGAAATTTTAGAAAAGGCAGAATTAT AACAGCAGCA 3070 het 3070 ref 32 20 14 1 AAGTCTATGTACTGTATGCTTCTATTAAAATGAAATTTTAGAAAAGGCAGAATTAT 0 1 113298 CASAVA_Build 6 69831259 2I GTAGTAAGAG --/AT ATTAATTCTC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AT 1 2 113299 CASAVA_Build 6 69837976 2I GTTCAACAAA --/AG AGAGAACTAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AG 2 3 113300 CASAVA_Build 6 69840767 1D CTGATTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 37 1 31 5 A 11 10 113301 CASAVA_Build 6 69842768 1I GCATTCAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 894 hom 44 2 36 6 A 9 10 113302 CASAVA_Build 6 69862977 1I TTGTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 2554 het 2554 ref 45 21 13 11 T 15 16 113303 CASAVA_Build 6 69873815 4D GTGATTTCTT ATTA/---- ATTAGCCTTT 3070 het 3070 hom 26 12 12 5 ATTA 2 1 113304 CASAVA_Build 6 69874816 1I ACGAGACTTC -/T TTCAGTTTCA 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 T 2 3 113305 CASAVA_Build 6 69875794 4I AAATTAAGAA ----/TTTG TTTGATGACA 3070 het 3070 hom 49 15 27 7 TTTG 1 2 113306 CASAVA_Build 6 69885070 2D AGTAAAGGCC CA/-- GGTACACCAG 3070 het 3070 hom 41 18 20 5 CA 1 0 113307 CASAVA_Build 6 69885363 1D TGCTTTACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 10 9 113308 CASAVA_Build 6 69886207 2D CTTTTGTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 63 het 30 0 22 9 TG 6 5 113309 CASAVA_Build 6 69891500 1I AGTTTTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 10 11 113310 CASAVA_Build 6 69893343 4D ACTTTATCAG CTAT/---- CTGAGTATCC 3070 het 3070 ref 45 25 17 8 CTAT 1 0 113311 CASAVA_Build 6 69894515 3I5M1I ATAGTTTTTT ---TTTTG-/TTGTTTTGT TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 27 3 14 12 N/A 0 0 113312 CASAVA_Build 6 69898012 1D AGCACAAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 T 9 8 113313 CASAVA_Build 6 69900292 2I AGAAAATTTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 9 11 113314 CASAVA_Build 6 69903248 1D CAACCCACCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 9 8 113315 CASAVA_Build 6 69908140 2D ACAGTTATCT AG/-- AGAGAGAAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 AG 4 3 113316 CASAVA_Build 6 69920776 1I CACAATTTCA -/T GCTTATATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 1 113317 CASAVA_Build 6 69925049 2I AAGTTCAGCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 11 13 113318 CASAVA_Build 6 69937759 3D TCTCTTTTTC ATA/--- ATGTCTTTGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 ATA 1 0 113319 CASAVA_Build 6 69940682 4I CTCATGTACT ----/TTTA TTTTTCTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTTA 0 1 113320 CASAVA_Build 6 69998156 12D AATGCTTTTC ATTTGGCCTTAA/------------ CTGTTTGTCA 3070 het 3070 ref 57 34 24 2 ATTTGGCCTTAA 1 0 113321 CASAVA_Build 6 70000140 1I TTGCAGGGTA -/G CAAAATTGGG 3070 het 3070 hom 58 20 27 11 G 0 1 113322 CASAVA_Build 6 70016946 5I TTTTTGTTTA -----/TTTTC TTTTTATTAG 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TTTTC 0 1 113323 CASAVA_Build 6 70036847 3D AAGTACATTT ATC/--- ATCAGTTAAA 3070 het 3070 ref 58 31 24 3 ATC 2 1 113324 CASAVA_Build 6 70060793 1D GCTTGTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 T 10 9 113325 CASAVA_Build 6 70116912 1I CTCGCCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 11 12 113326 CASAVA_Build 6 70128418 4I ATGGGAACTA ----/AGTT AGGCACTCAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AGTT 0 1 113327 CASAVA_Build 6 70154724 4I ATTTTATCTC ----/ATAA ATAATTATTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATAA 1 2 113328 CASAVA_Build 6 70158036 3D CCACTAGAAG TTC/--- TTCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TTC 2 1 113329 CASAVA_Build 6 70168802 5D GACTCTGTCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 hom 52 het 22 0 18 4 CAAAA 5 4 113330 CASAVA_Build 6 70169881 1D GTCGGTTAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 10 9 113331 CASAVA_Build 6 70178596 1I TTTTTTTGGC -/A AAAAAATGCC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 6 7 113332 CASAVA_Build 6 70184578 1I TTATCTTCAG -/T GCATTCTTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 0 1 113333 CASAVA_Build 6 70196136 1I CTCCAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 10 113334 CASAVA_Build 6 70202111 1I AGAAAAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 515 hom 36 2 25 9 T 12 13 113335 CASAVA_Build 6 70203913 1D ATTCTGAGGT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 8 7 113336 CASAVA_Build 6 70205944 1D CCACTAAATA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 9 8 113337 CASAVA_Build 6 70216942 1D CTCCTTCTCT C/- TTCTCTCCAT 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 C 1 0 113338 CASAVA_Build 6 70218092 1I AAGGTGGGGC -/T TTGGCTGGGA 3070 het 2885 hom 28 10 10 8 T 2 3 113339 CASAVA_Build 6 70222077 4I AACATTAAAA ----/TTTT GAGCAAAGGA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 0 4 113340 CASAVA_Build 6 70224287 1I CTATAAAATT -/A TTTTTTCAAC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 0 1 113341 CASAVA_Build 6 70226397 1D TTAATATGTT A/- TATTTTTGAC 3070 het 3070 ref 28 13 14 1 A 1 0 113342 CASAVA_Build 6 70228942 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 3070 het 116 hom 26 3 15 8 G 1 0 113343 CASAVA_Build 6 70231910 3I AATTACTAAA ---/TAT TATTTAGCAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 TAT 1 2 113344 CASAVA_Build 6 70243995 1D TGGGACCAGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 169 hom 26 1 20 6 A 9 8 113345 CASAVA_Build 6 70252955 1I AAAGTAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 29 het 12 0 10 2 A 9 10 113346 CASAVA_Build 6 70254461 1I TTTAGTGGGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 31 hom 42 1 33 8 T 8 9 113347 CASAVA_Build 6 70268051 3I GAAAAAAAAA ---/AAC AAAGAATTAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 AAC 0 1 113348 CASAVA_Build 6 70269148 1I ACCAAATGTT -/G GGTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 2 3 113349 CASAVA_Build 6 70272529 1D TGAGAGGACA G/- GGTTTTAATC 3070 hom 129 het 49 0 44 6 G 3 2 113350 CASAVA_Build 6 70274194 1D ACATAGACTA G/- GAAGTAGATG 3070 het 3070 ref 45 22 19 6 G 2 1 113351 CASAVA_Build 6 70276354 1I GCAAACCCTA -/T TAATTTTTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 2 113352 CASAVA_Build 6 70280907 1D AATCAGTTAC A/- AAAGGCCTAC 936 het 936 ref 14 7 4 3 A 4 3 113353 CASAVA_Build 6 70288293 1I AGAATAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 11 12 113354 CASAVA_Build 6 70290896 1I ATCCTCATAC -/A ACATCTCCTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 1 2 113355 CASAVA_Build 6 70293608 1I TTGGTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 T 10 11 113356 CASAVA_Build 6 70294597 1D AAACGAAAGC A/- AAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 7 6 113357 CASAVA_Build 6 70295442 4I TGTTCTTACG ----/TTAA TTGTTTTCTG 3070 het 3070 hom 51 21 30 0 TTAA 0 1 113358 CASAVA_Build 6 70295690 1D TCTTCCATTT C/- ATTTTCAAGG 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 C 1 0 113359 CASAVA_Build 6 70302780 4D TGAATCAGAG AACT/---- AACTATAGAC 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 AACT 2 1 113360 CASAVA_Build 6 70304362 1I ACTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1673 het 1673 ref 25 9 10 6 T 13 14 113361 CASAVA_Build 6 70306401 22I AAATAAAAAG ----------------------/AAAAGGCAGTGCCTTTTCTTCT TAGGTGTCTT 3070 het 3070 ref 46 27 13 7 AAAAGGCAGTGCCTTTTCTTCT 0 1 113362 CASAVA_Build 6 70306528 10I TTCTCTTACT ----------/TATAGTAAAC TATAGTAAAC 3070 het 3070 hom 38 12 23 4 TATAGTAAAC 1 2 113363 CASAVA_Build 6 70314176 1D TAGGAGTATA T/- CCCCATCCTA 3070 het 3070 ref 33 19 11 5 T 1 0 113364 CASAVA_Build 6 70315362 6D TAAATCTTTC TTTTAT/------ TAAGATCTAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 5 TTTTAT 1 0 113365 CASAVA_Build 6 70336332 1D CAGCACTTTT A/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 A 1 0 113366 CASAVA_Build 6 70345023 1D TTCCACCTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 42 0 36 7 T 9 8 113367 CASAVA_Build 6 70348567 1D AGGCTCAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 33 3 22 10 A 13 12 113368 CASAVA_Build 6 70357549 1I TTAATTGTAT -/G AAAAAAAGAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 113369 CASAVA_Build 6 70358829 1I GATATATATA -/C CCAAAGGAAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 C 2 3 113370 CASAVA_Build 6 70370781 1I7M1I GGAGGGTACC -ATAAGAT-/AATAAGATA AAAAGAGGTA 3070 het 3070 ref 41 26 15 4 N/A 0 0 113371 CASAVA_Build 6 70396990 1I GCATCAGAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 9 10 113372 CASAVA_Build 6 70419435 1I TCAAGTTTTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 8 9 113373 CASAVA_Build 6 70420119 1D TGTATCAACT A/- AAAAATACAA 3070 het 1653 hom 22 7 13 2 A 6 5 113374 CASAVA_Build 6 70426003 4D ACTCTCAACC CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 46 22 19 5 CAAA 4 3 113375 CASAVA_Build 6 70428433 4I CACTTGTAAT ----/TTAA TTGATTTTAA 1916 het 1916 ref 15 8 4 3 TTAA 0 1 113376 CASAVA_Build 6 70428740 7D TCCTTCTTTC TTCACTT/------- TTCACTTTTC 3070 het 3070 ref 44 23 15 8 TTCACTT 2 1 113377 CASAVA_Build 6 70435295 1I GTGGCAAGTT -/A AAAATCAGAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 4 5 113378 CASAVA_Build 6 70448234 2I CTTATTTTAC --/AT GTGTATATAT 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 AT 0 1 113379 CASAVA_Build 6 70453247 4D CTCTCTCAAA CTCT/---- CTATCAAGCA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 CT 3 1 113380 CASAVA_Build 6 70458887 2I TTAAGGTGCG --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 63 het 32 0 21 11 CT 7 8 113381 CASAVA_Build 6 70462424 1I CAACTAATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 59 het 26 0 19 7 T 9 10 113382 CASAVA_Build 6 70470069 2D CCATTTTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 A 15 13 113383 CASAVA_Build 6 70476714 4I TTTATACTAC ----/CTAA CTAACTTCAT 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 CTAA 1 2 113384 CASAVA_Build 6 70479054 1D AGTTCCTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 12 11 113385 CASAVA_Build 6 70484735 1I GGACTTGCTA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 7 8 113386 CASAVA_Build 6 70495606 1I TGTTTTGCTA -/T TTTTTTTTTT 2903 het 2903 ref 36 22 8 6 T 10 11 113387 CASAVA_Build 6 70501011 1D ACAAAACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 21 0 13 8 T 15 14 113388 CASAVA_Build 6 70506017 1D ATGATCTGGC T/- GCATATATCT 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 T 1 0 113389 CASAVA_Build 6 70520898 1D TTAAGATGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 10 9 113390 CASAVA_Build 6 70528417 4I AATCCCCAAT ----/CCCA CCCCTAGCTT 3070 hom 93 het 41 0 32 9 CCCA 0 1 113391 CASAVA_Build 6 70529070 1I ACCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1807 het 1807 ref 36 13 10 13 A 13 14 113392 CASAVA_Build 6 70529671 1D CACTGGACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 10 9 113393 CASAVA_Build 6 70530665 1D ATGCTGCAAC A/- AACTTAACAC 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 A 3 2 113394 CASAVA_Build 6 70549301 1D CTCAAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 11 10 113395 CASAVA_Build 6 70550335 1D GCCAGAGAAT A/- ATAACAACTA 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 A 2 1 113396 CASAVA_Build 6 70599881 1I CTTGTCTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2505 hom 19 6 11 2 T 8 9 113397 CASAVA_Build 6 70605846 1I GGGATTAATC -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 6 7 113398 CASAVA_Build 6 70610805 1I ATTTTTATAC -/T AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 T 0 1 113399 CASAVA_Build 6 70614368 1D GTTTAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 A 11 10 113400 CASAVA_Build 6 70616026 1D CAAAGATTAT G/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 6 G 1 0 113401 CASAVA_Build 6 70619527 1I CTTGAAAAAA -/T ATTGGCCATT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 T 0 1 113402 CASAVA_Build 6 70619649 3I TGTCTTCTAT ---/TTA TTATTGGTCT 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 TTA 1 2 113403 CASAVA_Build 6 70620908 1I TCTTCTTCAT -/A AATCCATAAC 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 A 2 3 113404 CASAVA_Build 6 70624115 3I TCATGAAAAG ---/CAA AAAAGTTCTT 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 CAA 0 1 113405 CASAVA_Build 6 70624270 23D CCCTACCTTC TGTGGGAAAAATCTGGTTTCACT/----------------------- TGTGGGAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 16 17 TGTGGGAAAAATCTGGTTTCACT 2 1 113406 CASAVA_Build 6 70629756 1I TCTATGTGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 8 9 113407 CASAVA_Build 6 70635650 1D AAGATGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 12 11 113408 CASAVA_Build 6 70652477 1D ATGTAATCAC A/- AAAACCGTAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 5 4 113409 CASAVA_Build 6 70665779 1D TTCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2527 het 1561 hom 22 9 7 7 T 17 16 113410 CASAVA_Build 6 70699037 1D TTTTCTCCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 10 9 113411 CASAVA_Build 6 70739291 7D AAAAGACAAT ATATAAA/------- ATATAAAACA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 ATATAAA 2 1 113412 CASAVA_Build 6 70740247 2D TAAGAAAAAC AG/-- AATAGATTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AG 1 0 113413 CASAVA_Build 6 70744737 5D CCTGATTCCT GAGAA/----- GAGGAGTAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GAGAA 1 0 113414 CASAVA_Build 6 70763628 2I TTATATATAC --/AT ATATATATAT 2895 het 121 hom 17 1 11 5 AT 6 7 113415 CASAVA_Build 6 70809807 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 23 3 13 7 T 16 15 113416 CASAVA_Build 6 70813301 2I AAATTAAAAT --/AA GTCTTTAATC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 0 2 113417 CASAVA_Build 6 70837888 2I TCTTTTTCTC --/TT TAACTCTTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 3 113418 CASAVA_Build 6 70843656 1I AACAGATAAA -/T TTTTCAGAAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 4 5 113419 CASAVA_Build 6 70848861 1D ATTAATTTTC A/- AAATACAGCA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 4 3 113420 CASAVA_Build 6 70852363 1D AACGTATACT C/- TTATTTCAAA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 C 1 0 113421 CASAVA_Build 6 70853608 1D GTACCATGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 9 8 113422 CASAVA_Build 6 70858173 2I GTGAACAAAT --/AA AGAGTTTAAA 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 A 1 3 113423 CASAVA_Build 6 70862698 1I GGTAACTCTA -/T TTTTTTTTTT 2980 het 1510 hom 31 7 11 13 T 15 16 113424 CASAVA_Build 6 70864131 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 13 14 113425 CASAVA_Build 6 70882439 3D TGGTGTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 25 1 15 9 T 17 14 113426 CASAVA_Build 6 70889027 1D TTCCCCACGG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 8 7 113427 CASAVA_Build 6 70915539 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 13 12 113428 CASAVA_Build 6 70918633 1D TTGCTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 38 0 31 7 T 12 11 113429 CASAVA_Build 6 70925761 1I TAAAAGTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 31 3 27 1 A 12 13 113430 CASAVA_Build 6 70928932 1I TTTCTAAAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 9 113431 CASAVA_Build 6 70935687 1I TCTCCCCAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 449 hom 32 2 24 6 A 9 10 113432 CASAVA_Build 6 70937176 1I TGCTACTTTC -/A AACAAATGTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 2 3 113433 CASAVA_Build 6 70941173 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2570 hom 29 10 13 6 A 12 11 113434 CASAVA_Build 6 70953946 14I TCAACGTGCA --------------/CACACACAAACATG CACACACATG 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 CACACACAAACATG 0 1 113435 CASAVA_Build 6 70955119 3D TGAATATCAG AAC/--- AACAAATCTG 3070 het 3070 hom 46 23 20 4 AAC 2 1 113436 CASAVA_Build 6 70958474 3D ATGGGGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 34 10 18 7 TTG 4 3 113437 CASAVA_Build 6 70958907 2I TTTCTTTATT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3046 hom 21 9 11 1 TC 6 7 113438 CASAVA_Build 6 70959015 1I AGGAAGTTTG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 A 7 8 113439 CASAVA_Build 6 70965974 1D TATTTTGAAA T/- TTTTTGACAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 5 113440 CASAVA_Build 6 70973552 1D TGCATTGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 10 9 113441 CASAVA_Build 6 70974281 1I TTACAATTTA -/T GTTTTCAAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 0 1 113442 CASAVA_Build 6 70991868 4D AGTTTTGTAT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 18 11 9 TTTC 4 3 113443 CASAVA_Build 6 70999591 1D TAACATATGT G/- GAAGCAGATG 3070 het 3070 hom 40 20 20 1 G 2 1 113444 CASAVA_Build 6 71002148 1D CCCTTACAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 10 9 113445 CASAVA_Build 6 71007003 2D GAAAATAAGA AT/-- ATATATATAT 2120 het 2120 ref 14 6 7 3 AT 8 7 113446 CASAVA_Build 6 71019441 1D TCAGTATGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 10 9 113447 CASAVA_Build 6 71022250 9D TAGCTAATGT TGATATACG/--------- TGATATACGC 3070 het 3070 ref 39 22 18 5 TGATATACG 2 1 113448 CASAVA_Build 6 71023143 1D CATACATAGC A/- AAAAAAAAAA 1004 het 1004 ref 31 23 3 5 A 13 12 113449 CASAVA_Build 6 71027802 1D GACTCTCTGG C/- CCCCATACTA 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 C 5 4 113450 CASAVA_Build 6 71031853 1D TACACACTTG T/- TTTTTGTAGT 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 T 6 5 113451 CASAVA_Build 6 71047725 1D GTCCTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 2099 het 2099 ref 27 9 7 12 A 13 12 113452 CASAVA_Build 6 71057063 2I TAAGTGACTC --/TT TTAGCATCAG 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 T 2 4 113453 CASAVA_Build 6 71064313 1D TAAGTCTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 A 10 9 113454 CASAVA_Build 6 71070610 1D TGGTTACTCC A/- AAAACCAAGA 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 A 5 4 113455 CASAVA_Build 6 71091299 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 988 hom 22 3 14 5 A 13 14 113456 CASAVA_Build 6 71095217 1D TTTACAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 34 1 25 8 T 13 12 113457 CASAVA_Build 6 71096519 2D GAAAAAAAAA AG/-- GAAAAAGAAA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 AG 1 0 113458 CASAVA_Build 6 71097906 4I TTTGATGGGG ----/TTGT TTATTTCTTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTGT 0 1 113459 CASAVA_Build 6 71099006 1I AACAGAGACA -/G ATTTGAACTC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 0 1 113460 CASAVA_Build 6 71099236 7D TGTCAATACC TAGTTTA/------- TAGAGAGTTT 3070 hom 24 het 11 0 8 4 TAGTTTA 1 0 113461 CASAVA_Build 6 71101338 1I ATGAAATTCT -/G GGTTGAAAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 2 3 113462 CASAVA_Build 6 71102354 2I ACTCCAGACC --/CT GTTTGCCTGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CT 0 1 113463 CASAVA_Build 6 71103985 7D TGAACTACTT GCTCGTA/------- GCCCCAGATC 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 GCTCGTA 1 0 113464 CASAVA_Build 6 71105326 1I CCTGCATTAG -/T TTGCTAAGGA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 T 2 3 113465 CASAVA_Build 6 71108160 1D GCTTGCACCC T/- TTTAAAGCAA 3070 hom 90 het 35 0 29 7 T 4 3 113466 CASAVA_Build 6 71110500 1D ATCTTCGCTC T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 7 6 113467 CASAVA_Build 6 71113870 1D AGTTGAGGGT G/- GGGGTTCACA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 G 5 4 113468 CASAVA_Build 6 71117124 1I AATGATTTAT -/A AGGTGAGCAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 1 2 113469 CASAVA_Build 6 71127871 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAAGAAAA 3070 het 792 hom 23 5 16 2 G 1 0 113470 CASAVA_Build 6 71133882 2D AGGCTTTACA AT/-- ATGCTGGTCA 3070 hom 110 het 41 0 35 6 AT 2 1 113471 CASAVA_Build 6 71135855 1I TAACACTCAC -/T TGGGAGGCTT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 1 2 113472 CASAVA_Build 6 71136374 1D CATTTTTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 T 10 9 113473 CASAVA_Build 6 71137701 4I AATTATACTC ----/AATT AAAGTTTAAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AATT 0 1 113474 CASAVA_Build 6 71139654 1I GCAAACTTTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 45 24 12 9 A 7 8 113475 CASAVA_Build 6 71145591 8D TTCTTTGTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 TTTG 6 4 113476 CASAVA_Build 6 71148879 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCCAGAG 3070 hom 51 het 29 0 20 9 C 7 6 113477 CASAVA_Build 6 71227213 4D TTATCTATCG ATCT/---- ATCTATCTAT 2980 het 2822 hom 25 9 8 9 ATCT 5 4 113478 CASAVA_Build 6 71254890 1D AAGAGCCAAG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1180 hom 31 8 18 5 C 11 10 113479 CASAVA_Build 6 71260814 2D AGCTACTCAG GA/-- GACTGAGGTG 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 GA 2 1 113480 CASAVA_Build 6 71295127 1I TAATTTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 10 11 113481 CASAVA_Build 6 71337438 1D ATGGAACATG A/- AAAAAAAAAT 1399 het 1399 ref 25 18 3 4 A 10 9 113482 CASAVA_Build 6 71356662 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 10 1 A 11 10 113483 CASAVA_Build 6 71379325 14I ACAAATTGTT --------------/CCCCCTCTGAGATA TTTTAAGGCA 3070 het 3070 hom 22 7 12 5 CCCCCTCTGAGATA 0 1 113484 CASAVA_Build 6 71383778 1D GTGCATTGGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3018 hom 23 8 13 3 A 9 8 113485 CASAVA_Build 6 71395562 25D AATCAGCTGG GTAATCCTAGGATTACAGCATGCTT/------------------------- GTAATCCTAG 3070 het 2024 hom 21 6 8 8 GTAATCCTAGGATTACAGCATGCTT 2 1 113486 CASAVA_Build 6 71406525 1D CAGATGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 13 12 113487 CASAVA_Build 6 71426679 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 8 9 113488 CASAVA_Build 6 71432045 4D AACAAGAATG GAAA/---- GAAAATATGC 3070 het 3070 ref 35 18 17 2 GAAA 2 1 113489 CASAVA_Build 6 71437609 1D TTGATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 T 11 10 113490 CASAVA_Build 6 71441566 1D GGAGAATGTT A/- AAAAAAAAAA 1288 het 1288 ref 26 18 3 5 A 15 14 113491 CASAVA_Build 6 71451129 1D TTTTGAACTT G/- TTTACATTTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 G 1 0 113492 CASAVA_Build 6 71455226 1D AATTTATTAA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 T 8 7 113493 CASAVA_Build 6 71465180 1I TTTCAATCTC -/T TTGTTAAATT 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 T 2 3 113494 CASAVA_Build 6 71468677 1I ATGGGTTTAT -/A AGTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 1 2 113495 CASAVA_Build 6 71468818 1D TTTTTTGGGG A/- GGGGGTCTGT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 A 1 0 113496 CASAVA_Build 6 71471677 1D TTCATTATGA T/- TTTTTTTTTT 1851 het 1851 ref 29 10 6 13 T 17 16 113497 CASAVA_Build 6 71482147 1D TTATTGTGCA C/- TTTATTTCTA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 C 1 0 113498 CASAVA_Build 6 71482322 1D CCACCCTTTT C/- CCCCAGTCCC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 C 5 4 113499 CASAVA_Build 6 71496741 1I TTGGCTTCCC -/G AAGTGCAGGG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 0 1 113500 CASAVA_Build 6 71500428 1D ATATATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1199 hom 29 3 12 14 T 13 12 113501 CASAVA_Build 6 71506904 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 41 het 29 0 23 6 A 10 9 113502 CASAVA_Build 6 71510377 1I AATTTTTAAT -/G TTGAATGTGC 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 G 0 1 113503 CASAVA_Build 6 71510598 1I CTCCTAATTC -/T TTTTTTTTTT 2404 het 1147 hom 21 4 9 8 T 13 14 113504 CASAVA_Build 6 71555857 2D GTGGTTTCAT AC/-- ACACTGTGTA 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 AC 3 2 113505 CASAVA_Build 6 71558866 1I AGATGTGTGG -/T TATACAAAGG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 1 2 113506 CASAVA_Build 6 71580149 1I TAACATTTTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 7 8 113507 CASAVA_Build 6 71585344 1D ATGTATAGTT C/- AGTGGCTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 12 10 C 1 0 113508 CASAVA_Build 6 71585753 1D TGTAAGGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 12 11 113509 CASAVA_Build 6 71588849 2D CTATTGAGTA GT/-- GGCTGTGCTG 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 GT 1 0 113510 CASAVA_Build 6 71600796 1I AAAATACACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 15 16 113511 CASAVA_Build 6 71607917 1D AGGGGTGTAC A/- TCATGTGTTT 3070 het 3070 hom 37 11 20 7 A 1 0 113512 CASAVA_Build 6 71615855 2D TAATAATAAT AA/-- AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 33 9 17 10 A 8 6 113513 CASAVA_Build 6 71637647 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1968 het 1011 hom 20 8 7 5 T 12 11 113514 CASAVA_Build 6 71662258 1I CTTTTACAAC -/T TTTTTTTTTT 2911 het 2911 ref 37 15 8 14 T 13 14 113515 CASAVA_Build 6 71672310 2D CTCCTGGCAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 65 het 34 0 22 13 TG 9 8 113516 CASAVA_Build 6 71681185 1I ATTGAATAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 10 113517 CASAVA_Build 6 71709588 1I AGTTTTCTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 8 9 113518 CASAVA_Build 6 71727930 2D AAACATGCAT AA/-- AGACATACTG 3070 het 3070 hom 54 25 25 4 A 3 1 113519 CASAVA_Build 6 71729611 3D AACAAAACAA AAC/--- AAAACAAAAC 3070 het 1833 hom 42 12 16 14 AAC 1 0 113520 CASAVA_Build 6 71730198 1D ACCAAATCTT A/- TAACCAGTTG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 1 0 113521 CASAVA_Build 6 71731709 4D GAACAGGAAG CAAA/---- CATGTTCTTC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 CAAA 1 0 113522 CASAVA_Build 6 71737506 1D GCCTCCCAAA G/- TGCTGGGATT 1501 het 526 hom 13 2 5 6 G 1 0 113523 CASAVA_Build 6 71740424 1I CAACTAAGGG -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 7 8 113524 CASAVA_Build 6 71754830 1I AAGAGGATAG -/A AAAAAGAATC 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 A 5 6 113525 CASAVA_Build 6 71755797 1D TTTACTATTG T/- TTTAATGTTT 3070 het 3070 ref 45 22 21 3 T 4 3 113526 CASAVA_Build 6 71758597 21D TGTATATTGG GTTATATAACTAACTTGTTAT/--------------------- ATATAACTAA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 GTTATATAACTAACTTGTTAT 1 0 113527 CASAVA_Build 6 71760010 1D GCTTGGGCAA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 T 8 7 113528 CASAVA_Build 6 71762518 1I TTAGTTTTGG -/T TGCTCATTCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 113529 CASAVA_Build 6 71773300 5D CTTTACTGAA TTCTT/----- TAATTAGTTC 3070 het 3070 hom 36 15 19 5 TTCTT 1 0 113530 CASAVA_Build 6 71775161 1D TTGTTGACTT A/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 1 0 113531 CASAVA_Build 6 71787983 3I ATTTTCTTTC ---/TTT TTTTCTTCAT 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 T 4 7 113532 CASAVA_Build 6 71789584 1I AATCCCGGAG -/T TTATCAGTTT 3070 het 3070 hom 50 18 26 6 T 2 3 113533 CASAVA_Build 6 71789875 1I ACATTAGACC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 8 9 113534 CASAVA_Build 6 71798998 5D ACAGAGACTC AAGAG/----- GAGAATGAAT 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 AAGAG 1 0 113535 CASAVA_Build 6 71801902 3D CTGTTCCTCA TCT/--- TTCATGGTTT 3070 het 3070 ref 54 24 21 10 TCT 1 0 113536 CASAVA_Build 6 71818108 13D TCAAAGAAGA GGCTATAAAAAGT/------------- GGCAGTAAGG 2623 het 2623 ref 27 18 9 3 GGCTATAAAAAGT 1 0 113537 CASAVA_Build 6 71828290 3I GCCTGATATT ---/ACA ACTTCTTATA 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 ACA 0 1 113538 CASAVA_Build 6 71831538 1I TTTTAGAGAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 7 8 113539 CASAVA_Build 6 71834684 1D CTCTGCCCCC T/- GAGTTTGAGC 1405 het 1405 ref 14 5 6 3 T 1 0 113540 CASAVA_Build 6 71834767 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 1422 het 1422 ref 12 5 4 3 T 8 7 113541 CASAVA_Build 6 71845453 1I TGTTTGACTC -/T TAAGAGTCAG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 1 2 113542 CASAVA_Build 6 71854058 1D GTTAATTCAG T/- TGCTTTAGAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 1 113543 CASAVA_Build 6 71854560 1D GGCCTGGGTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 9 8 113544 CASAVA_Build 6 71854656 4D GGGCTCACTT AGTC/---- AGAACCTTTT 3070 het 3070 ref 46 31 14 2 AGTC 1 0 113545 CASAVA_Build 6 71854926 1D CAGATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 97 hom 32 3 18 11 T 15 14 113546 CASAVA_Build 6 71855492 1D GTTTCTATTG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 84 het 35 0 28 8 T 8 7 113547 CASAVA_Build 6 71855579 1I TTTTAAGGCT -/G GGGGAACCAT 3070 het 3070 ref 42 27 14 1 G 4 5 113548 CASAVA_Build 6 71856000 1D AAGTCTTCTA T/- TTCTTAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 3 2 113549 CASAVA_Build 6 71859857 1D GGGATGGAGA G/- GAGCAAGGCC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 G 2 1 113550 CASAVA_Build 6 71863047 1I TGTGTGCCTA -/T TTTTTATACC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 5 6 113551 CASAVA_Build 6 71863411 2I AATTTTAGGA --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 8 10 113552 CASAVA_Build 6 71868503 1I AAATATCTTT -/G TATATTTGTC 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 G 0 1 113553 CASAVA_Build 6 71868935 3D TCTCTTAAAC TTA/--- TTATTATTTT 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 TTA 3 2 113554 CASAVA_Build 6 71869844 1D TCTTTTTTTT C/- CCCCCAGATA 3070 het 3070 hom 39 13 23 5 C 6 5 113555 CASAVA_Build 6 71871295 1I CACTTCAGCG -/T TGCCCTCACA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 1 2 113556 CASAVA_Build 6 71871916 1I TCCCCGGTAG -/C CAACTTGCCA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 C 1 2 113557 CASAVA_Build 6 71875608 1I CTTGTCTTAC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 7 8 113558 CASAVA_Build 6 71883941 1I TCAAGACTGG -/C AGGGTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 C 0 1 113559 CASAVA_Build 6 71886797 1I TCCTAAATAG -/T TTTTTTTTTT 1889 het 1889 ref 29 10 7 12 T 13 14 113560 CASAVA_Build 6 71891648 1D AAACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 A 11 10 113561 CASAVA_Build 6 71896579 4D AACATTAAAA AGTT/---- AGTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 48 24 23 2 AGTT 2 1 113562 CASAVA_Build 6 71897508 1D TGAAATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 T 11 10 113563 CASAVA_Build 6 71906219 1D GAGCCCTTGA C/- CCCCTGCTCC 3070 het 3070 hom 54 22 19 13 C 5 4 113564 CASAVA_Build 6 71906998 1D AACACTCCAC T/- TGACAGTATT 2164 het 2164 ref 21 13 5 4 T 2 1 113565 CASAVA_Build 6 71912731 1D ACGTATGTAA C/- TAACCTGCAC 2464 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 0 113566 CASAVA_Build 6 71913572 1I ACAAATCAAT -/A AATGTGATTC 3070 het 3070 ref 56 31 18 7 A 2 3 113567 CASAVA_Build 6 71916053 1I TTAACTAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 2224 hom 26 7 11 8 A 8 9 113568 CASAVA_Build 6 71919833 6I AAGCTGAGTC ------/TTTATT TTTATTAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 TTTATT 1 2 113569 CASAVA_Build 6 71927769 1I TCCTGCTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 20 22 6 T 9 10 113570 CASAVA_Build 6 71930425 1D GATTGGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 A 11 10 113571 CASAVA_Build 6 71932847 1I TTCTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 18 1 15 2 A 10 11 113572 CASAVA_Build 6 71935608 2D TTGAAATGTT AA/-- AAAAAAATAG 3070 hom 108 het 37 0 37 1 A 9 7 113573 CASAVA_Build 6 71941438 2I GTGTGTGTGT --/GC GCGCGCGCAT 3004 het 3004 ref 27 13 10 4 GC 4 5 113574 CASAVA_Build 6 71954686 1I TCTTTCAGAG -/C TATTTTAATG 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 C 0 1 113575 CASAVA_Build 6 71954941 1D AGATAACTAG A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 A 8 7 113576 CASAVA_Build 6 71955486 2D GAAAGTTAAG AA/-- AAAAAAAACC 3070 het 2822 hom 21 7 11 5 A 10 8 113577 CASAVA_Build 6 71956920 6D TTGAGGTCAG GAGTTT/------ GAGACCAGCC 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 GAGTTT 1 0 113578 CASAVA_Build 6 71957633 1D TGTTCTCACA C/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 C 1 0 113579 CASAVA_Build 6 71960805 2I TATATGTATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 TG 6 7 113580 CASAVA_Build 6 71961184 2I CATGTAACTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 13 15 113581 CASAVA_Build 6 71961823 9I3M3I TTGGGAAGGG ---------CAC---/TGTGCCTCCCTCTGT AGAGGACTTC 3070 het 3070 hom 45 20 26 1 N/A 0 0 113582 CASAVA_Build 6 71965705 1I AAAGGAAGTG -/A AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 A 6 7 113583 CASAVA_Build 6 71966303 1D TAGAGTTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2223 hom 29 7 14 9 T 10 9 113584 CASAVA_Build 6 71968054 1D GTACATAGTA G/- ATACTCAATA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 G 1 0 113585 CASAVA_Build 6 71988592 1D GATGGATATG A/- AAAGTACTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 4 3 113586 CASAVA_Build 6 71992646 1D AGAATATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 5 A 13 12 113587 CASAVA_Build 6 71997707 1D ACAGACAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 100 het 38 0 33 5 A 9 8 113588 CASAVA_Build 6 71998267 2D ATAGGGTTGA AT/-- ATGTTTGTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AT 2 1 113589 CASAVA_Build 6 72015315 1D TGACCTTGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 10 9 113590 CASAVA_Build 6 72025713 13D TATGATGCCC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 17 1 10 6 T 23 10 113591 CASAVA_Build 6 72051594 1D AATAATACTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 T 9 8 113592 CASAVA_Build 6 72053308 1I TCAAAAAGTA -/T TTTTTTTTGG 2633 het 2633 ref 30 12 11 7 T 8 9 113593 CASAVA_Build 6 72063501 1D TATTGCCCAC A/- GCCAAATGTT 3070 het 3070 hom 42 16 19 9 A 1 0 113594 CASAVA_Build 6 72115199 3D AATTTGACAG AAC/--- AATATACAAA 3070 het 2236 hom 23 6 11 7 AAC 1 0 113595 CASAVA_Build 6 72115244 3D TAGAGTCTCA TCG/--- TCAAGTATGG 3070 het 3070 hom 33 9 17 9 TCG 1 0 113596 CASAVA_Build 6 72115760 2D AATTGATTTA TG/-- TGAATTGCTT 3070 hom 154 het 57 0 52 7 TG 2 1 113597 CASAVA_Build 6 72121791 1I ATATATATAC -/T TTTAAGTTCT 2166 hom 15 het 11 0 6 5 T 3 4 113598 CASAVA_Build 6 72125591 1I TTGCAACCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 11 12 113599 CASAVA_Build 6 72131736 1I AAGGTCAATA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 8 9 113600 CASAVA_Build 6 72137605 1D TAATACAGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 11 10 113601 CASAVA_Build 6 72138031 1I CTGTTCAGCG -/T TAAGTAGAGA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 T 1 2 113602 CASAVA_Build 6 72139043 1I TTCCCCTTGG -/T GCATTTGATA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 0 1 113603 CASAVA_Build 6 72149141 1I TTAATCTGCA -/C ATGCTAATAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 C 0 1 113604 CASAVA_Build 6 72150250 1I CCTAACTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 9 10 113605 CASAVA_Build 6 72169714 1I TTTTAAAAAA -/T AATAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 0 1 113606 CASAVA_Build 6 72196187 1D TAAGACTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 13 7 T 12 11 113607 CASAVA_Build 6 72197450 2I CGCACCCAGC --/TT TTTTTTTTTT 1598 het 1598 ref 25 8 8 9 T 12 14 113608 CASAVA_Build 6 72197924 4D CTTTTGATAA CTGT/---- CTAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 44 21 22 1 CTGT 1 0 113609 CASAVA_Build 6 72203558 2I ATGACATAGG --/AA ATAAGGAGAG 3002 het 3002 ref 26 16 7 3 A 1 3 113610 CASAVA_Build 6 72245970 5D TGGTTTTGTC TTGTT/----- TTGTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 21 17 7 TTGTT 2 1 113611 CASAVA_Build 6 72249415 1I AGTCACAGCA -/C CATGCAGGTC 3070 het 3070 ref 68 36 22 10 C 1 2 113612 CASAVA_Build 6 72255869 31D CCCCGTGTTG TCTGTATATCTGGATATTGTATTTCTAGATA/------------------------------- TCTGTATATC 3070 het 3070 ref 33 21 12 8 TCTGTATATCTGGATATTGTATTTCTAGATA 1 0 113613 CASAVA_Build 6 72269359 1I ACATTCTCTA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 7 8 113614 CASAVA_Build 6 72289135 1D GTTTTAGCCA T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 7 6 113615 CASAVA_Build 6 72295721 1D TCGTGTCAAG A/- AAAAGAGTGT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 5 4 113616 CASAVA_Build 6 72298228 1D AATAACAGTG T/- TAAGGAGAGA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 2 1 113617 CASAVA_Build 6 72307404 1I TTTGAAAAAA -/T AAAATTTCTT 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 T 0 1 113618 CASAVA_Build 6 72311348 3D GAATTCAGAA CTC/--- CTTTGTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 24 4 CTC 1 0 113619 CASAVA_Build 6 72315674 1I AACTCTATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 T 11 12 113620 CASAVA_Build 6 72325409 1I TATTTGTCCA -/T TTATAGGCTT 3070 hom 93 het 37 0 30 7 T 2 3 113621 CASAVA_Build 6 72333266 1D TAAGAGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 20 1 17 3 A 12 11 113622 CASAVA_Build 6 72337267 1D TTTTGTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 29 0 17 12 T 15 14 113623 CASAVA_Build 6 72339225 4D47M2I ACATATATAC ATATATACATATATATACACATATATATACCCACACACATATACATATATA--/----ATACATATATATACACATATATATACCCACACACATATACATATATATG TATACACTCA 3070 hom 58 het 9 0 22 6 N/A 0 0 113624 CASAVA_Build 6 72339996 1I GTTTCAGCTT -/A AAAAAATAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 6 7 113625 CASAVA_Build 6 72341658 1D TTCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 33 1 27 6 T 11 10 113626 CASAVA_Build 6 72342167 1I TATTACAGTA -/C TATATAATTA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 0 1 113627 CASAVA_Build 6 72343007 1D TTTACTCTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 39 hom 32 1 28 4 T 9 8 113628 CASAVA_Build 6 72344557 26I TTCAGTTATC --------------------------/TGTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGGTTT TGTTTTTTTG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TGTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGGTTT 0 1 113629 CASAVA_Build 6 72346912 4D ATTACTTCCA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 35 0 29 7 T 14 10 113630 CASAVA_Build 6 72356709 1D CTACATTTGT A/- AAATGGCAAT 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 A 4 3 113631 CASAVA_Build 6 72365589 2D ACTTACAGGA AC/-- ACATTTTTTT 1212 hom 43 het 40 0 13 28 AC 2 1 113632 CASAVA_Build 6 72378608 1I ACTATAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 10 11 113633 CASAVA_Build 6 72397215 1I TCTATGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 769 hom 46 2 31 13 T 11 12 113634 CASAVA_Build 6 72404958 3D AGTATCATCA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 121 het 53 0 40 14 AAC 7 6 113635 CASAVA_Build 6 72414136 2I AGAAAGACAA --/AC ACTGCATATT 3070 hom 163 het 64 0 55 9 AC 1 2 113636 CASAVA_Build 6 72416105 3I GCAGGAATTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 TTG 3 4 113637 CASAVA_Build 6 72417374 1D CATTACATTA T/- TTTTCAAATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 5 4 113638 CASAVA_Build 6 72429799 1I GGGTGAATCA -/T TTTACTCAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 3 4 113639 CASAVA_Build 6 72430704 1I CGTGCTGTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 10 113640 CASAVA_Build 6 72435310 4I TTAAAAAAAC ----/AAAT AAACTATTTT 3070 het 3070 hom 53 22 26 5 AAAT 0 1 113641 CASAVA_Build 6 72438783 1I AAAAAAAAAA -/T TGATTTCTGT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 1 2 113642 CASAVA_Build 6 72454001 1I TCTCGAGGGA -/T TTTTGCAAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 4 5 113643 CASAVA_Build 6 72455698 1I GTTTTGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2055 hom 28 8 11 9 T 10 11 113644 CASAVA_Build 6 72457377 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 738 hom 21 4 10 7 A 11 12 113645 CASAVA_Build 6 72479144 4I AGAGAAAAGA ----/GAGT GAGATTATTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 GAGT 0 1 113646 CASAVA_Build 6 72480289 1D AATATGTAAT G/- GGGTTTATTA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 G 4 3 113647 CASAVA_Build 6 72480497 1I AAAAAATTGG -/A GAATGACTTG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 0 1 113648 CASAVA_Build 6 72501235 1I TACAGCAAAA -/T TTATCACCAG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 3 113649 CASAVA_Build 6 72510526 1D GATGACCTTT A/- AAAAATGAAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 A 6 5 113650 CASAVA_Build 6 72511021 1D TCTTTATGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 10 9 113651 CASAVA_Build 6 72512289 1D CTATTTTCAG A/- TATTTGCTTG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 1 0 113652 CASAVA_Build 6 72514325 1D CACAATGCTT A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 A 7 6 113653 CASAVA_Build 6 72521660 1I TAGAAGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1061 hom 46 3 39 4 T 10 11 113654 CASAVA_Build 6 72521830 1I GAAGTACACT -/A AAATTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 3 4 113655 CASAVA_Build 6 72522150 1D TTGAAAACCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 9 8 113656 CASAVA_Build 6 72524970 4I CTCTATCTGT ----/ACTC ACTCTGTTGT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 ACTC 1 2 113657 CASAVA_Build 6 72528732 3D GGTTCATAGG TCA/--- TGCTAGAGAG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 TCA 1 0 113658 CASAVA_Build 6 72528832 1I GAGACCAAAC -/T TCTGATTTCC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 113659 CASAVA_Build 6 72530411 1D TATAAATGTC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 96 het 33 0 33 1 T 9 8 113660 CASAVA_Build 6 72540007 1D GGTTTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 16 8 A 13 12 113661 CASAVA_Build 6 72540579 1D GTATAAGACT G/- AAGAGGTAGG 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 G 1 0 113662 CASAVA_Build 6 72541642 3D ATAATTATGA TGT/--- TGAATATTTT 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 TGT 1 0 113663 CASAVA_Build 6 72543175 1I CATTGGTTTT -/G AATTGATATC 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 G 0 1 113664 CASAVA_Build 6 72543318 1D CTTCTTTACA T/- TTTTTCTGAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 6 5 113665 CASAVA_Build 6 72546455 5I CATTTTGCCC -----/TATAT TATATATTTA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 TATAT 1 2 113666 CASAVA_Build 6 72551097 2I TTATTATTAT --/TA TTTTTTTTTG 3070 het 2437 hom 23 8 11 4 TA 0 1 113667 CASAVA_Build 6 72556512 2D AGAGAGAGAC AA/-- AGTCAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 3 1 113668 CASAVA_Build 6 72557353 13I AACAGCAAAG -------------/ACCTCCAAACAGC AATAATTGGA 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 ACCTCCAAACAGC 0 1 113669 CASAVA_Build 6 72560491 24D TTTAACTAAT GGTAAAGGGACCAGGCTGACTTCA/------------------------ GCCAGATCTA 3070 het 3070 ref 43 25 19 2 GGTAAAGGGACCAGGCTGACTTCA 1 0 113670 CASAVA_Build 6 72561678 1I TTAACAGATG -/C ATATTGAGAA 3070 het 2499 hom 21 7 12 2 C 0 1 113671 CASAVA_Build 6 72562827 1D TATAGGAGTG T/- TAAGTCCAGG 3070 het 3070 hom 43 13 24 6 T 2 1 113672 CASAVA_Build 6 72563232 5D ATTTTATAAT ATACA/----- ATACATTATT 3070 het 3070 ref 31 15 15 2 ATACA 2 1 113673 CASAVA_Build 6 72567048 1I ATAAATTTTA -/T TTATCTTTTC 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 T 2 3 113674 CASAVA_Build 6 72568525 1I GATAGATTTT -/C CTTTATAGGT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 C 1 2 113675 CASAVA_Build 6 72572571 1D TGTTTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 A 12 11 113676 CASAVA_Build 6 72574300 1I TTGACAAAAA -/C GTATATTTGA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 C 0 1 113677 CASAVA_Build 6 72576116 3D TTATTATTAT TAA/--- ACTTTAAGTT 3070 het 471 hom 12 1 11 0 TAA 1 0 113678 CASAVA_Build 6 72578814 2D AAACTATTAT AA/-- AAGAGTCAAA 3070 het 3070 hom 29 10 18 2 A 4 2 113679 CASAVA_Build 6 72579317 1D CCAATGAGCC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 24 7 12 5 A 8 7 113680 CASAVA_Build 6 72582228 1I ATCAGGATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 11 12 113681 CASAVA_Build 6 72585115 1I TTTTTCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2474 hom 38 13 10 15 A 15 16 113682 CASAVA_Build 6 72585639 1I TCCAGCAAAA -/G GAACTATCAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 G 1 2 113683 CASAVA_Build 6 72591056 1D ACTCAGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2648 hom 27 9 15 3 A 12 11 113684 CASAVA_Build 6 72617409 5I AACACACGTG -----/TGTTA TGTTATGTAA 3070 het 3070 ref 34 17 7 10 TGTTA 1 2 113685 CASAVA_Build 6 72617968 11D TTCTGTTTCT ATAGATTTGCC/----------- TTTTTTGGAC 3070 het 3070 ref 45 26 23 0 ATAGATTTGCC 1 0 113686 CASAVA_Build 6 72619177 2I ATATGAGAGT --/AA AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 7 9 113687 CASAVA_Build 6 72621432 3I GTGGCAGGCA ---/GAG GAGGAGCCCA 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 GAG 2 3 113688 CASAVA_Build 6 72622321 1I TAGTTAAGCA -/T TTTAATATTA 3070 het 3070 ref 70 36 27 7 T 3 4 113689 CASAVA_Build 6 72625647 1D TACAAAGAAC T/- TTAAACAAAT 3070 het 1804 hom 16 5 10 1 T 3 2 113690 CASAVA_Build 6 72632762 7I GATATCTATC -------/ATTTTTT ATTTTTTATT 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 ATTTTTT 1 2 113691 CASAVA_Build 6 72637116 2D ATTGTAGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 14 21 13 A 14 12 113692 CASAVA_Build 6 72647344 1D ATCTGGCAAG T/- TTTTTCTGGA 3070 het 3070 hom 33 11 14 9 T 6 5 113693 CASAVA_Build 6 72655061 2D ACTGACACTC AG/-- ATAGGGGAGG 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 AG 1 0 113694 CASAVA_Build 6 72657318 1I CAGAGAATTT -/C AGTAATATCC 3070 hom 138 het 55 0 47 8 C 0 1 113695 CASAVA_Build 6 72657568 2D ACCTATACTC TT/-- TCATAGAGTG 3070 het 3070 ref 39 26 10 4 T 3 1 113696 CASAVA_Build 6 72672013 4D ATCAATTAAG CTAC/---- CTGTTTCCAA 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 CTAC 1 0 113697 CASAVA_Build 6 72680863 4D ATTTCTAATT CTAA/---- CTAACAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 CTAA 2 1 113698 CASAVA_Build 6 72713193 1D CAACGAAAGC A/- AAAAAAAAAT 1328 het 1328 ref 38 32 3 3 A 10 9 113699 CASAVA_Build 6 72718086 1D GCTTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2169 het 77 hom 26 2 9 15 T 17 16 113700 CASAVA_Build 6 72733265 1I TTTTAGTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2686 hom 22 7 11 4 A 9 10 113701 CASAVA_Build 6 72737446 1D TCTTTTAATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 T 8 7 113702 CASAVA_Build 6 72742269 1I TATATCTGGC -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 6 7 113703 CASAVA_Build 6 72748365 1I TATAAATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 44 2 33 9 T 10 11 113704 CASAVA_Build 6 72749615 7I CATTATGTTC -------/TACCTCT TATTTGTGTG 3070 hom 122 het 48 0 41 7 TACCTCT 0 1 113705 CASAVA_Build 6 72752615 1D TTGGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 762 hom 42 8 23 11 T 18 17 113706 CASAVA_Build 6 72767448 1I AAACACCTGT -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 7 8 113707 CASAVA_Build 6 72785711 3I GGCATTAAAC ---/TGT TGTTATATCT 3070 het 3070 ref 50 25 20 6 TGT 1 2 113708 CASAVA_Build 6 72805583 3I GGCTTTCCAA ---/AAG AAGAAGTACC 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 AAG 2 3 113709 CASAVA_Build 6 72822508 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAAAAG 2564 het 2556 hom 23 8 9 6 A 9 10 113710 CASAVA_Build 6 72830756 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 AG 10 9 113711 CASAVA_Build 6 72831122 1D GATGAAGTTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 9 8 113712 CASAVA_Build 6 72834789 1D TTTTGTCCAC A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 A 7 6 113713 CASAVA_Build 6 72835430 3D CTCCAGAAAT AAC/--- AAACTGAGGG 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 AAC 1 0 113714 CASAVA_Build 6 72860533 1I33M5I AACTTGTTTG -TAAGTTGTATGGACTTTTTTCTCAAAACAGACT-----/TTAAGTTGTATGGACTTTTTTCTCAAAACAGACTAAGAA AATTTATACC 3070 het 3070 ref 40 31 18 6 N/A 0 0 113715 CASAVA_Build 6 72864714 1D TCAATATATC T/- TTTTTTTTTT 2461 het 1106 hom 26 8 8 10 T 15 14 113716 CASAVA_Build 6 72880087 1D TACTTTAGTA C/- TTTTATTTTC 3070 het 3070 hom 36 17 17 4 C 1 0 113717 CASAVA_Build 6 72892599 1I ATTGGAGAAA -/G GGCACCCTGT 3070 hom 72 het 27 0 21 6 G 2 3 113718 CASAVA_Build 6 72916620 1D GTGAGTATGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1172 hom 40 5 15 20 A 10 9 113719 CASAVA_Build 6 72919703 1I GACTGGTTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 8 9 113720 CASAVA_Build 6 72934328 2D CTAGGTTTTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 40 het 31 0 18 13 T 11 9 113721 CASAVA_Build 6 72935978 1D AAATGAGGGA T/- GGTTAGGAAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 1 0 113722 CASAVA_Build 6 72936641 1I ATGAAGTTTT -/C TTTGACTAGC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 C 0 1 113723 CASAVA_Build 6 72937772 2I TATATATTAC --/AT GTGTGTGTGT 1117 het 1117 ref 15 9 6 0 AT 0 1 113724 CASAVA_Build 6 72940410 1D AAATAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 109 het 52 0 42 10 A 12 11 113725 CASAVA_Build 6 72943160 2I TGTTAAAAAC --/AG AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 AG 0 1 113726 CASAVA_Build 6 72949994 1D GCAAAGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 505 hom 21 2 9 11 T 13 12 113727 CASAVA_Build 6 72951185 1I GCTTTATTCT -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 G 3 4 113728 CASAVA_Build 6 72951727 1D GTTGTTATAG A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 45 19 21 6 A 8 7 113729 CASAVA_Build 6 72960739 1I AAAAGGACAG -/T TTTATCAGTT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 3 4 113730 CASAVA_Build 6 72963277 1D ATAAAGCATC T/- TTGTGAAGAC 3070 hom 132 het 50 0 44 6 T 3 2 113731 CASAVA_Build 6 72969261 4I TACTTAACCC ----/CTCT CTAAGTCTCA 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 CT 1 3 113732 CASAVA_Build 6 72972989 2I TCAGGGCATG --/TC CTTTGTTAAT 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 TC 0 1 113733 CASAVA_Build 6 72978298 1I AGTAGAAGCC -/T TTAGGTTAGT 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 T 2 3 113734 CASAVA_Build 6 72979128 1D GGCGATAAGT A/- AACAGAAGGA 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 A 3 2 113735 CASAVA_Build 6 72986096 1I GCTTTGAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 33 0 21 12 T 9 10 113736 CASAVA_Build 6 72991657 1D ACTTTTCTAC T/- TTTTTGTAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 5 113737 CASAVA_Build 6 72993188 1D AGCCCATTTC A/- AAGCATGTTT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 3 2 113738 CASAVA_Build 6 72993852 4D GTTCTATGAG AGTT/---- AGTTACCTTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AGTT 2 1 113739 CASAVA_Build 6 72995690 2D TAAAATTAAC AG/-- AAAGTATTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AG 1 0 113740 CASAVA_Build 6 73002325 5I AACTAATGTA -----/TTTTC TTCTGACTAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTTTC 0 1 113741 CASAVA_Build 6 73021444 3D TTTCAAAGAT CTC/--- CTCATAAATT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 CTC 2 1 113742 CASAVA_Build 6 73023113 1I ATAGTCACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 33 1 25 7 T 10 11 113743 CASAVA_Build 6 73023622 1I GTAAATATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 35 1 27 7 T 11 12 113744 CASAVA_Build 6 73026046 1I TATAGAATAC -/A AATTATTGAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 3 113745 CASAVA_Build 6 73051111 1D ATATTGACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 360 hom 54 1 48 5 T 10 9 113746 CASAVA_Build 6 73091414 1D AAGAATAAAC T/- AAAAAGCTGA 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 T 1 0 113747 CASAVA_Build 6 73110886 1I AGGCCCTTCC -/A AAGTTTCAGA 3070 hom 132 het 53 0 45 8 A 2 3 113748 CASAVA_Build 6 73161177 1D AGAACAAAAG A/- CTTCTAGGAA 3070 het 3070 hom 43 15 21 9 A 1 0 113749 CASAVA_Build 6 73164216 4D CATGATTGCT GATA/---- GATAGATAAA 3070 het 3070 ref 34 14 17 6 GATA 3 2 113750 CASAVA_Build 6 73164986 1D ATGTTATAAT A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 1 0 113751 CASAVA_Build 6 73166077 6D GTGCAATAAG TATCAT/------ TATCCCCATT 3070 het 3070 hom 42 18 23 3 TATCAT 1 0 113752 CASAVA_Build 6 73170753 1D TTAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 10 9 113753 CASAVA_Build 6 73176435 2D CACACAAATT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 11 9 113754 CASAVA_Build 6 73181003 1I ACATTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 2933 het 2784 hom 31 12 11 8 A 13 14 113755 CASAVA_Build 6 73197282 1I GTGAGACCCC -/A TCTCTAGAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 0 1 113756 CASAVA_Build 6 73198030 4I GAGGTTTTCT ----/TCTA TCTGTTTTGT 3070 hom 123 het 46 0 41 6 TCTA 0 1 113757 CASAVA_Build 6 73208759 117D AGACCTGCGA TCTCCTTTGTATCTGCCTTTTTCCCTTTGCTTCTGTAAGGTTCTGCTTCCTCTGGTCCACATAGTCTTTCTCTTAACATGTTAACACCTTCAGAGGTTGCAGTAAAGCCTGCCAGCC/--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TGGAAAACTC 1745 het 1745 ref 29 41 4 13 TCTCCTTTGTATCTGCCTTTTTCCCTTTGCTTCTGTAAGGTTCTGCTTCCTCTGGTCCACATAGTCTTTCTCTTAACATGTTAACACCTTCAGAGGTTGCAGTAAAGCCTGCCAGCC 1 0 113758 CASAVA_Build 6 73209942 7D CTTGTCGAAC ATAAAAT/------- ATAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 47 12 32 4 ATAAAAT 1 0 113759 CASAVA_Build 6 73219395 2D AAAATTTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 14 14 A 12 10 113760 CASAVA_Build 6 73222250 1I GCTAAATGAA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 7 8 113761 CASAVA_Build 6 73232376 1I CTGTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 2988 het 2988 ref 30 19 7 4 A 11 12 113762 CASAVA_Build 6 73263498 1D AATTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 20 16 11 T 11 10 113763 CASAVA_Build 6 73265857 4D ATGGAGTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 6 AAAC 5 4 113764 CASAVA_Build 6 73274280 1D AATACCAAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 10 9 113765 CASAVA_Build 6 73285865 4I GAGTAATTAC ----/TAAA TAATTATTAA 3070 het 3070 ref 35 21 14 0 TAAA 0 1 113766 CASAVA_Build 6 73287957 6D ACACATGTGA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 15 24 12 AC 12 9 113767 CASAVA_Build 6 73292290 1D GTGGGAGGGC T/- TTAAACAACT 3070 het 3070 ref 53 28 23 3 T 3 2 113768 CASAVA_Build 6 73305062 1I ATGGCAAAAA -/C CGCAATTACT 3070 het 243 hom 27 1 19 7 C 1 2 113769 CASAVA_Build 6 73324903 1D AGTGATTATT C/- CTCGACTTTG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 2 1 113770 CASAVA_Build 6 73328835 4I TTTTTCCCAA ----/TTAC TTAGTTATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTAC 0 1 113771 CASAVA_Build 6 73329020 1D TATATTATTA G/- TTATTTAAAA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 G 1 0 113772 CASAVA_Build 6 73330947 12I CTGGTTATAA ------------/AATGGAAACTAT AATGCCTAAT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 AATGGAAACTAT 0 1 113773 CASAVA_Build 6 73335729 1I AAAATCCAAC -/A CCCATTTATG 3070 hom 57 het 27 0 24 3 A 0 1 113774 CASAVA_Build 6 73343109 1D GGTACTTTGG A/- AGATAGTTTG 3070 het 3070 ref 62 29 27 9 A 2 1 113775 CASAVA_Build 6 73343835 16D ACCATACTCA TACTCATACTCATACT/---------------- ACCTATGAGG 3070 hom 90 het 30 0 31 5 TACTCATACTCATACT 1 0 113776 CASAVA_Build 6 73344307 1D ACTGCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 12 11 113777 CASAVA_Build 6 73345398 1D CTTTCATAAT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 81 het 35 0 28 8 A 8 7 113778 CASAVA_Build 6 73354361 1I16M1I CATCTCCCTA -TACAGTCTCCTGGCTC-/CTACAGTCTCCTGGCTCT AAGGGGACAA 3070 hom 160 het 53 0 54 6 N/A 0 0 113779 CASAVA_Build 6 73359662 2D CAACTACTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 35 1 20 16 T 12 10 113780 CASAVA_Build 6 73360807 1I CTTATTTCGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 20 0 T 8 9 113781 CASAVA_Build 6 73361716 1D ATCAACAACC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 9 8 113782 CASAVA_Build 6 73363930 1I AGTGGTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2771 hom 22 9 7 6 T 11 12 113783 CASAVA_Build 6 73364676 1D ATTCACACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 35 1 28 6 T 12 11 113784 CASAVA_Build 6 73377768 1D AAAATGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1476 hom 33 6 18 9 A 11 10 113785 CASAVA_Build 6 73379568 8D ATTGCTCCAC TTTCGATT/-------- TTTCGATTTT 2301 het 2301 ref 15 7 5 3 TTTCGATT 2 1 113786 CASAVA_Build 6 73385506 4D CATCTTAAGA GAAT/---- GAATGAGTAA 3070 hom 94 het 35 0 31 4 GAAT 2 1 113787 CASAVA_Build 6 73386164 1D TCTAGAAGAC A/- TAAGTGAAAG 3070 hom 132 het 47 0 41 6 A 1 0 113788 CASAVA_Build 6 73395852 2D CTCTTCTAAT CA/-- GTCTTTAGAA 3070 hom 144 het 52 0 49 4 CA 1 0 113789 CASAVA_Build 6 73403704 1I AAAAGTTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 54 hom 35 2 26 7 T 9 10 113790 CASAVA_Build 6 73406813 1D2M12I TTTATACTTT GTA------------/-TATACTATATATAG ACCATATATA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 N/A 0 0 113791 CASAVA_Build 6 73432668 4D AATGATAAAT AAAG/---- AGAGATATAC 3070 hom 87 het 30 0 30 3 AAAG 1 0 113792 CASAVA_Build 6 73488842 1I ATCTGTGCAA -/T TTATTGTGCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 3 113793 CASAVA_Build 6 73516176 1I ATTTAAAAAA -/T ATATATTTTT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 0 1 113794 CASAVA_Build 6 73542022 11D GACAGGAGGG GAGAAAAATAA/----------- CTTTACAGTG 3070 hom 105 het 40 0 31 13 GAGAAAAATAA 1 0 113795 CASAVA_Build 6 73548527 1I CCATTTTCTT -/G TTGACATGTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 G 0 1 113796 CASAVA_Build 6 73552095 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 24 1 20 4 A 12 11 113797 CASAVA_Build 6 73592878 1I TAATGAATAG -/A AAGAAATATG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 2 3 113798 CASAVA_Build 6 73605616 1I GACTAACAAC -/A CATACAGTTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 0 1 113799 CASAVA_Build 6 73609180 3D62M1D CTAATGACTA GTGATGCTGACCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCAGTATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGT/---ATGATGAGCAATTTTTCATATGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCCTTTGAAAAGTGTCTG- TTATATCTTT 1194 het 1194 ref 40 54 3 1 N/A 0 0 113800 CASAVA_Build 6 73613977 1I GAGTAAAGGA -/T TTTAATTGAG 3070 het 3070 ref 50 32 15 3 T 3 4 113801 CASAVA_Build 6 73614635 1D CAGGACAGCC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 2516 hom 28 9 14 5 A 1 0 113802 CASAVA_Build 6 73619159 1D TTACCTCAAT A/- AAAAAAAGAT 2905 het 2905 ref 14 7 6 1 A 8 7 113803 CASAVA_Build 6 73620715 1D TATAAATAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 27 0 22 7 T 9 8 113804 CASAVA_Build 6 73620876 1D GCTTTATTAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 8 7 113805 CASAVA_Build 6 73621748 1D CTAGATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 21 7 A 12 11 113806 CASAVA_Build 6 73625881 1D GTATTTTTTT C/- AATTTGCCTA 3070 het 3070 ref 41 21 14 8 C 1 0 113807 CASAVA_Build 6 73626054 4I AGGGTCTCAC ----/TCTG TCTGTCTGTC 1918 het 1918 ref 28 18 5 5 TCTG 2 3 113808 CASAVA_Build 6 73627769 2I GATTATTTAA --/AC ACACAAACAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AC 2 3 113809 CASAVA_Build 6 73651066 2D AATAAAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 12 11 19 T 13 11 113810 CASAVA_Build 6 73704999 1D AATTCTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 26 0 22 4 T 10 9 113811 CASAVA_Build 6 73717972 1D AGGTGATCCA C/- CCCCTTGGCC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 5 4 113812 CASAVA_Build 6 73731387 1D TGCTTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 9 8 113813 CASAVA_Build 6 73739755 1I CTGTGAACAT -/A AAACTTCTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 3 4 113814 CASAVA_Build 6 73750231 1I TTTTCTGTTC -/T TTGTTTCTCC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 2 3 113815 CASAVA_Build 6 73754038 12D CGGCCGACAG CCTGCAGCAGAA/------------ CCTGCAGCAG 3070 hom 38 het 27 0 10 20 CCTGCAGCAGAA 2 1 113816 CASAVA_Build 6 73765272 1I TGGAACACTT -/A ACAGTCTGCC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 1 2 113817 CASAVA_Build 6 73768457 1I AGTCCCAGCT -/A CTCAGGAGGC 3070 hom 87 het 31 0 28 3 A 0 1 113818 CASAVA_Build 6 73790841 3D ATAGATAGAT AGA/--- TAGATAGATA 2590 het 1232 hom 27 3 7 18 AGA 1 0 113819 CASAVA_Build 6 73793296 1I AATTTTATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 10 11 113820 CASAVA_Build 6 73804795 1D AAACTGCATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 10 9 113821 CASAVA_Build 6 73805270 4D TTATTGTCTT TGTC/---- TGGTTTTGGT 3070 het 3070 ref 34 18 15 3 TGTC 1 0 113822 CASAVA_Build 6 73822846 1D ACTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 12 11 113823 CASAVA_Build 6 73823786 1D GTGGGGGGAA G/- GGGGGGAGGG 1400 het 213 hom 11 4 4 3 G 7 6 113824 CASAVA_Build 6 73834308 24D TGGACAAAAG ATATATATATATATATATATATAT/------------------------ ATATATATAT 3059 hom 24 het 14 0 8 8 AT 21 9 113825 CASAVA_Build 6 73841200 1D AATGTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1436 hom 42 6 20 17 A 15 14 113826 CASAVA_Build 6 73853897 2D GTTAAATGAC TG/-- TGTGACATCT 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 TG 3 2 113827 CASAVA_Build 6 73856564 1D GGACTAAGGT G/- GTATCACATT 3070 het 3070 ref 50 26 19 5 G 2 1 113828 CASAVA_Build 6 73858168 1I GGGTTTGTTT -/G TTGTTGTTGT 2715 het 2715 ref 30 15 7 8 G 0 1 113829 CASAVA_Build 6 73858210 4I TTTTTTGTTG ----/TTTT GTTTATTTGT 2870 het 2870 ref 37 16 8 13 T 0 4 113830 CASAVA_Build 6 73858524 1D GTTTTGTGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2796 hom 29 10 14 6 T 10 9 113831 CASAVA_Build 6 73863742 1D GTTTCAGATT C/- CCCATGTAGT 3070 het 3070 ref 44 28 14 3 C 4 3 113832 CASAVA_Build 6 73865574 1I ATAGTAACCT -/A AAAATCAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 A 4 5 113833 CASAVA_Build 6 73866956 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 1441 het 1441 ref 10 6 4 0 A 9 10 113834 CASAVA_Build 6 73870200 1D AATGGACACC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 A 9 8 113835 CASAVA_Build 6 73873415 2D CAGGAGAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 A 13 11 113836 CASAVA_Build 6 73889569 1D CAGTTGGAGT A/- AAAAAAAAAA 1070 het 1070 ref 29 20 5 4 A 15 14 113837 CASAVA_Build 6 73892277 12D3M7I ATTTGGTAGC TCTAACTACCAAATA-------/------------ATAGAGTTAG AGCCAAGGGC 3070 het 3070 ref 45 27 20 5 N/A 0 0 113838 CASAVA_Build 6 73895771 4I GAACATATAT ----/TCTA TCTGACAATT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 TCTA 0 1 113839 CASAVA_Build 6 73898043 1D TTTACAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 13 12 113840 CASAVA_Build 6 73903278 3D TATTTCTAAA ATC/--- ATCTACTTAC 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 ATC 2 1 113841 CASAVA_Build 6 73911312 1I TTGATATCTG -/A AAGGCCTCTT 3070 het 3070 ref 57 25 23 9 A 2 3 113842 CASAVA_Build 6 73920349 2I CAATTCCACT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 37 1 25 11 A 12 14 113843 CASAVA_Build 6 73920443 4I ATTAGCTCTT ----/TAAC TAGAATATTG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 TAAC 0 1 113844 CASAVA_Build 6 73927322 1D ATTATTGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 10 9 113845 CASAVA_Build 6 73929682 6I CAAAGAATTA ------/AAAAAT AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 AAAAAT 1 2 113846 CASAVA_Build 6 73935644 1I TCTGAAAATC -/T GCCCTCAGCT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 0 1 113847 CASAVA_Build 6 73936535 1D TCATATTAGA G/- AGATTACACG 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 G 1 0 113848 CASAVA_Build 6 73937011 1D ACTATATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 21 0 16 5 A 14 13 113849 CASAVA_Build 6 73952501 1D AGACCCCCCC T/- ATCTCTGCAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 1 0 113850 CASAVA_Build 6 73953880 3D ACTGCACATA CTC/--- CTCTTTTCTA 3070 het 3070 hom 42 13 26 3 CTC 2 1 113851 CASAVA_Build 6 73956440 1I ACCTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 A 15 16 113852 CASAVA_Build 6 73956526 1D AATTTATGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 10 9 113853 CASAVA_Build 6 73966578 4D ACTCCATCTC AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 6 AATA 3 2 113854 CASAVA_Build 6 73970348 1D CCCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 11 10 113855 CASAVA_Build 6 73974852 3I CAATTGCCTC ---/ATT ATAAGACATA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 ATT 0 1 113856 CASAVA_Build 6 73976023 1I AACCCTCCAC -/A ACCACAGTTC 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 A 1 2 113857 CASAVA_Build 6 73976168 1I TGTGAACCAA -/C CTCTCCAGCT 3070 het 3070 hom 54 24 23 7 C 1 2 113858 CASAVA_Build 6 73977446 1D GTTCAGATCT A/- ACACCATTGC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 2 1 113859 CASAVA_Build 6 73979104 1I CCCATCTCCA -/C TAAAAATACA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 C 0 1 113860 CASAVA_Build 6 73980452 1I ACAACCTCTG -/C CTCCTGGGTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 1 2 113861 CASAVA_Build 6 73989966 5I ATTTCATCCT -----/AAGGA AAGAGGACAG 1865 het 1865 ref 18 9 4 5 AAGGA 0 1 113862 CASAVA_Build 6 74030056 2D GTGTCGCGGT GG/-- GGGGGGGGGT 2647 hom 42 het 19 0 9 11 G 11 9 113863 CASAVA_Build 6 74034541 1I GAGAATGAAG -/C CGCGGACCCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 1 2 113864 CASAVA_Build 6 74071784 2D TCAATGAAAC TG/-- TTATCTATTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TG 1 0 113865 CASAVA_Build 6 74081157 1I CTGCCTCCGG -/C TCCGCGCTCC 1892 hom 27 het 12 0 9 3 C 0 1 113866 CASAVA_Build 6 74082101 1I TATTTGAGTG -/C TACTAGGCAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 113867 CASAVA_Build 6 74094551 4D CAACAGAAAG ACAA/---- ACAGTCTTAC 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 ACAA 1 0 113868 CASAVA_Build 6 74105148 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 23 1 19 3 A 10 11 113869 CASAVA_Build 6 74111205 1D GCGGTGGCTC A/- ACGCCTGTAA 3070 hom 53 het 35 0 28 7 A 2 1 113870 CASAVA_Build 6 74117310 2I AAAAGCAAAA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 47 het 26 0 17 9 CT 1 2 113871 CASAVA_Build 6 74122598 1I ATTACAGGCA -/C CCCCCCACCA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 6 7 113872 CASAVA_Build 6 74126167 1D TCGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 28 3 18 7 T 14 13 113873 CASAVA_Build 6 74126400 1I TTAGTAGAAA -/C GGGATTTCGC 3070 hom 38 het 15 0 11 4 C 0 1 113874 CASAVA_Build 6 74128571 1D TTTCTATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 22 0 16 6 T 12 11 113875 CASAVA_Build 6 74143877 2I CATGCATGCA --/AG AGTCACCACA 3070 hom 114 het 46 0 37 9 AG 1 2 113876 CASAVA_Build 6 74144557 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 9 113877 CASAVA_Build 6 74150743 3D ATTAGTAATG ACA/--- ACATTTCCGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ACA 2 1 113878 CASAVA_Build 6 74152880 1I GGAATCCACC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 6 7 113879 CASAVA_Build 6 74154757 3I AACAACATGG ---/ATA ATGTTTATTA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 ATA 0 1 113880 CASAVA_Build 6 74155468 5I TGCAAATGCG -----/AAGGA AAGCCGCGAC 2245 hom 26 het 16 0 7 9 AAGGA 0 1 113881 CASAVA_Build 6 74157026 1D ACCCAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2353 het 956 hom 25 7 8 10 T 17 16 113882 CASAVA_Build 6 74172657 2I TAGTAGAGAC --/GG GGTTTCTCTA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 2 4 113883 CASAVA_Build 6 74196108 3I GCCTCTACCA ---/AAC AAAATACAAA 3070 het 171 hom 9 1 8 0 AAC 0 1 113884 CASAVA_Build 6 74203235 1I CCAAAGTACT -/G GGATTATAGG 3070 het 1752 hom 26 6 11 9 G 2 3 113885 CASAVA_Build 6 74205671 1D AGCTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 10 10 T 11 10 113886 CASAVA_Build 6 74222189 2D GACTCTGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 286 het 286 ref 13 5 1 7 A 12 10 113887 CASAVA_Build 6 74225445 1I AGATCCTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 9 10 113888 CASAVA_Build 6 74236095 1D GCTAAAACAC T/- TAACTGGAAG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 2 1 113889 CASAVA_Build 6 74237651 1I GAGGCCATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 948 hom 24 2 18 4 T 11 12 113890 CASAVA_Build 6 74238454 1D AGAGCTATCT G/- AGGACAAAAC 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 G 1 0 113891 CASAVA_Build 6 74239161 1I AAGTGTTCTC -/A ACCACACAAA 3070 het 3070 hom 56 19 26 11 A 1 2 113892 CASAVA_Build 6 74240166 1I GTACTGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3044 het 1459 hom 46 6 22 18 T 17 18 113893 CASAVA_Build 6 74247913 1D GGTGGGTTTT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 41 het 21 0 15 6 A 8 7 113894 CASAVA_Build 6 74251491 1D TCTCTGTATC A/- AAAAAAAAAA 3054 het 2908 hom 31 10 9 13 A 17 16 113895 CASAVA_Build 6 74255723 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1175 het 1175 ref 12 5 4 3 T 12 13 113896 CASAVA_Build 6 74258548 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 42 2 18 22 A 15 14 113897 CASAVA_Build 6 74271996 12D AGTTTTTTTG TTTTGTTTTTGT/------------ TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 8 8 TTTTGT 3 1 113898 CASAVA_Build 6 74295110 1D ATAGTAAACA G/- GTAACTCCAG 3070 het 3070 ref 50 24 23 4 G 2 1 113899 CASAVA_Build 6 74298414 5D CAAGTTTGTT TGATA/----- AAAAAAACAT 3070 hom 40 het 17 0 13 4 TGATA 1 0 113900 CASAVA_Build 6 74310270 1I ACCCCGTCTG -/A AAAAAAAAAA 1861 het 1861 ref 20 10 5 5 A 10 11 113901 CASAVA_Build 6 74310817 5D GTGAGACTCT GTCTA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 630 hom 16 2 10 5 GTCTA 1 0 113902 CASAVA_Build 6 74317673 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2448 hom 22 8 10 4 A 10 9 113903 CASAVA_Build 6 74327791 1D TGAAACCCCG T/- TCTCTACTAA 3070 het 2899 hom 21 8 11 2 T 2 1 113904 CASAVA_Build 6 74334653 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1151 het 1151 ref 10 6 3 1 A 12 11 113905 CASAVA_Build 6 74339982 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1927 het 1927 ref 31 13 10 8 A 15 16 113906 CASAVA_Build 6 74347056 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 9 8 113907 CASAVA_Build 6 74352989 1I GTCTTCAGCG -/T TTTGTCTCAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 3 4 113908 CASAVA_Build 6 74353407 1I AGCCTTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2442 hom 29 8 15 6 A 10 11 113909 CASAVA_Build 6 74355286 1D TGAGAGTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 14 16 9 T 10 9 113910 CASAVA_Build 6 74366249 1D CCTGAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1816 hom 28 7 14 7 T 13 12 113911 CASAVA_Build 6 74372180 1D CTAGCACTTT G/- GGAGGTTGAG 1807 het 1807 ref 16 7 6 3 G 3 2 113912 CASAVA_Build 6 74377136 1D ATTTCATGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 10 9 113913 CASAVA_Build 6 74378245 1D GAGGAACTTT A/- AAAAAAGTTC 3070 het 3070 hom 22 9 8 6 A 7 6 113914 CASAVA_Build 6 74379486 3D ACCCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 5 A 14 11 113915 CASAVA_Build 6 74385974 1I TCTACTATTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 8 9 113916 CASAVA_Build 6 74405250 1I ACCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 11 12 113917 CASAVA_Build 6 74418441 2I AATTGATAAC --/TG TTTAATCTGG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TG 0 1 113918 CASAVA_Build 6 74419183 25D AAATAAGCTC CCGGCTGCCAGATGGAGCTATAAGG/------------------------- TTGCCACCTC 3070 het 3070 ref 37 24 17 6 CCGGCTGCCAGATGGAGCTATAAGG 1 0 113919 CASAVA_Build 6 74423214 1I TAACTCTTTT -/C CCCCCGGCCT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 C 5 6 113920 CASAVA_Build 6 74430555 10I TGAAGAATGG ----------/AGAGCTGTGT AGAAATGTGA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 AGAGCTGTGT 0 1 113921 CASAVA_Build 6 74446073 1I TTCTTTTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 9 10 113922 CASAVA_Build 6 74454638 5I TTGCTTTTAC -----/TGTGA TATTTATGAT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 TGTGA 0 1 113923 CASAVA_Build 6 74456070 1D TGTAGACACA T/- TTTTTTTTTT 1870 het 1870 ref 38 30 4 5 T 12 11 113924 CASAVA_Build 6 74458488 1I CAAAAGAGGT -/G GGGGGGAGGT 3070 het 3070 ref 32 12 13 7 G 6 7 113925 CASAVA_Build 6 74459598 1I GTAATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 A 10 11 113926 CASAVA_Build 6 74461522 1D TAGCACATAG C/- TTTGTCATGA 3070 het 3070 ref 59 28 25 7 C 1 0 113927 CASAVA_Build 6 74461985 1D TCTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 11 10 113928 CASAVA_Build 6 74478653 4D ACTCCGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAT 3070 hom 22 het 17 0 11 7 A 13 9 113929 CASAVA_Build 6 74483664 1I TGATTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 1591 het 1591 ref 32 21 5 6 T 11 12 113930 CASAVA_Build 6 74500371 2I TGAGGCATCT --/CA CAGAGATCCA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 CA 1 2 113931 CASAVA_Build 6 74503912 4D AAGCTCTACC GAAT/---- GAATGTATGA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 GAAT 2 1 113932 CASAVA_Build 6 74507062 1D TTTTTTTTTT C/- GAGACAGAGT 2401 het 2304 hom 22 10 9 3 C 1 0 113933 CASAVA_Build 6 74517403 4I TTTCATATAC ----/ACAA ACAGTCTACA 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 ACAA 0 1 113934 CASAVA_Build 6 74532980 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1793 het 472 hom 15 4 7 4 TA 9 8 113935 CASAVA_Build 6 74543724 1D CTTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 18 9 8 1 T 10 9 113936 CASAVA_Build 6 74546461 1D GCCTCTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 15 14 113937 CASAVA_Build 6 74548106 11D AAGGAGCAAC ATATTTTTGAA/----------- ATATTTTTGT 2797 het 2797 ref 31 26 6 3 ATATTTTTGAA 1 0 113938 CASAVA_Build 6 74550337 1D AGCTCCTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 16 17 11 T 10 9 113939 CASAVA_Build 6 74552510 10I CGGGTCTTGA ----------/ACTCCTGGCC TCAAGTGATC 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 ACTCCTGGCC 0 1 113940 CASAVA_Build 6 74553959 1I AAGCAGAAGG -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 41 13 26 2 T 6 7 113941 CASAVA_Build 6 74555154 3D GAGTCCTAAT AAG/--- AAGAGATGGC 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 AAG 2 1 113942 CASAVA_Build 6 74555861 1D TACTTAACTG T/- TTTTTTTTGT 1980 het 1980 ref 30 21 6 4 T 9 8 113943 CASAVA_Build 6 74557715 9D CCAGGCTGGA CTTGAACTT/--------- CTTGAACTTC 1294 het 1294 ref 9 6 3 1 CTTGAACTT 2 1 113944 CASAVA_Build 6 74561682 2D AAAATGCCAC AT/-- ATAACTCCAT 3070 het 3070 ref 44 25 18 2 AT 2 1 113945 CASAVA_Build 6 74562249 1I CAAGGCTTGG -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 7 8 113946 CASAVA_Build 6 74564018 1D ATACAGAGAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 8 7 113947 CASAVA_Build 6 74566293 1I TTTCTCATTT -/C CCCCCCGCAA 1846 het 1846 ref 23 10 12 1 C 6 7 113948 CASAVA_Build 6 74577122 1D TATAAAAAAA T/- CATTGTACAG 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 1 0 113949 CASAVA_Build 6 74586409 1I ATGAGTGTTG -/T TTGCCAAATT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 T 2 3 113950 CASAVA_Build 6 74593946 1D ATATCTTATG T/- TACACTGGGA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 2 1 113951 CASAVA_Build 6 74610564 1D TTGCTTCCTG C/- CATGATTCTG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 C 2 1 113952 CASAVA_Build 6 74614749 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 2980 het 2980 ref 23 11 7 5 A 10 11 113953 CASAVA_Build 6 74614880 2D ATTATTTCAG TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 T 10 8 113954 CASAVA_Build 6 74616627 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2894 het 2114 hom 28 13 7 8 T 16 14 113955 CASAVA_Build 6 74619902 2I TGCATTTTCT --/CA GTTTCCTTTG 3070 het 3070 ref 36 23 13 0 CA 0 1 113956 CASAVA_Build 6 74627285 1D TGTCATATAC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 A 8 7 113957 CASAVA_Build 6 74635463 1D AAAAGAGTGA T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 T 7 6 113958 CASAVA_Build 6 74639617 4D ATTCTATGAG TAGT/---- TAAACATTTT 3070 het 3070 ref 41 17 20 5 TAGT 1 0 113959 CASAVA_Build 6 74639760 1D ATTTTAAATG T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 7 6 113960 CASAVA_Build 6 74645185 1I CTGCATAAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 9 10 113961 CASAVA_Build 6 74650278 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 3 A 15 14 113962 CASAVA_Build 6 74661364 1D TATAAATCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 10 9 113963 CASAVA_Build 6 74661800 1D AGAATTGGCC T/- TTTTTAATGT 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 T 6 5 113964 CASAVA_Build 6 74663185 2D TTTATTTTTC AA/-- AAGACATCTA 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 A 4 2 113965 CASAVA_Build 6 74665770 2I GTTTATATCA --/TT GTCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 0 2 113966 CASAVA_Build 6 74672669 1D AAACCTTCAA C/- TTTGCTTACC 3070 het 3070 hom 27 13 13 2 C 1 0 113967 CASAVA_Build 6 74677733 1I AGAAAAAATG -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 A 6 7 113968 CASAVA_Build 6 74683804 1I TCTCCTAAAG -/T TTTTTGCATA 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 T 5 6 113969 CASAVA_Build 6 74714343 1D TAGTCTCTGA C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 C 1 0 113970 CASAVA_Build 6 74724001 1D GATCGCTCTC A/- TTGGCTTGCA 3001 het 3001 ref 26 15 7 4 A 1 0 113971 CASAVA_Build 6 74724237 2D TTTAGGAGAG AC/-- ACAATTCAGC 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 AC 2 1 113972 CASAVA_Build 6 74733710 9D GCTGATGGTT AAAAAAAAA/--------- GAAAAAAAAA 1443 het 1443 ref 28 14 7 8 A 9 0 113973 CASAVA_Build 6 74736664 1D TTATGATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1074 hom 33 7 13 13 T 13 12 113974 CASAVA_Build 6 74737028 1I TTTCAGAATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 0 1 113975 CASAVA_Build 6 74737666 2I AAATTTTGAC --/AG AATTACTAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 AG 0 1 113976 CASAVA_Build 6 74740717 3I ATATGAATAG ---/ATA AATCATATAG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 ATA 0 1 113977 CASAVA_Build 6 74744688 1I CCTAAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 A 11 12 113978 CASAVA_Build 6 74746272 1D TTGGTGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 13 12 113979 CASAVA_Build 6 74755058 1D TGCCACCATG C/- CCGGCTAATT 2230 het 600 hom 8 2 6 1 C 3 2 113980 CASAVA_Build 6 74761796 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 1355 het 1355 ref 13 8 4 1 TA 6 7 113981 CASAVA_Build 6 74763682 1D TTAATCCAGT C/- CCACCAGTGA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 C 3 2 113982 CASAVA_Build 6 74769445 6D ACTTGAAAGA AGTTTG/------ AGTTTGGGAT 2740 het 2740 ref 33 25 7 3 AGTTTG 2 1 113983 CASAVA_Build 6 74809056 1I TAGAGTAGAG -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 6 7 113984 CASAVA_Build 6 74810248 3D TCTGTTTTCT TAA/--- TAATATGGGT 3070 het 3070 ref 37 18 19 1 TAA 2 1 113985 CASAVA_Build 6 74813699 4I ATATATATGA ----/ACAT ACATATGCAG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 ACAT 1 2 113986 CASAVA_Build 6 74816068 1I GGGCATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 T 10 11 113987 CASAVA_Build 6 74818436 1I ATGAGTAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 12 11 A 10 11 113988 CASAVA_Build 6 74819406 1D TTCAACATCT G/- GGGGTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 G 5 4 113989 CASAVA_Build 6 74828688 4I ATTGAAAAAA ----/TAAT TATAGATTCC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 TAAT 0 1 113990 CASAVA_Build 6 74840587 3D AGAGAGGGAG AGA/--- AGGTTGGCTG 3070 het 3070 hom 35 14 15 8 AGA 1 0 113991 CASAVA_Build 6 74856543 3D TCGCTGTTTC TAT/--- TATTATTTCC 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 TAT 3 2 113992 CASAVA_Build 6 74876599 1D TGATTATACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 10 9 113993 CASAVA_Build 6 74878190 1I AGATGTCGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 547 hom 24 4 14 6 T 15 16 113994 CASAVA_Build 6 74879722 3I CGTGATTCAC ---/AGG AGGAGGTAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AGG 2 3 113995 CASAVA_Build 6 74899213 1I AAGTCCTAGG -/T TAAGGGAAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 1 2 113996 CASAVA_Build 6 74909415 1D GTGGGGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 47 1 34 12 T 13 12 113997 CASAVA_Build 6 74916833 1I AGTATGATAC -/T GGCTGTGGGT 956 hom 5 het 3 0 2 1 T 0 1 113998 CASAVA_Build 6 74917864 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 2396 hom 12 het 6 0 5 2 A 10 9 113999 CASAVA_Build 6 74918392 2I GCTTTATTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 341 hom 41 1 31 9 T 12 14 114000 CASAVA_Build 6 74923340 1I AACCTTAGAA -/T TTCCTGATCT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 2 3 114001 CASAVA_Build 6 74925081 1D ACAAAGAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 33 3 20 10 A 13 12 114002 CASAVA_Build 6 74925997 8D ACACACACAC AGAGAGAG/-------- AGAGAGAGAG 1817 hom 30 het 12 0 11 1 AG 9 5 114003 CASAVA_Build 6 74926199 1I ACAGAACTAT -/A AAAAAACAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 6 7 114004 CASAVA_Build 6 74927072 2D GTGGGAATAT AA/-- AAAGTAGTTC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 5 3 114005 CASAVA_Build 6 74928957 1I ACCACCTGTT -/C CCCCAAAAAC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 4 5 114006 CASAVA_Build 6 74944983 18D AAGAAAAGTC TATATATATATATATATA/------------------ TATATATATA 3070 hom 40 het 17 0 14 5 TA 18 9 114007 CASAVA_Build 6 74953579 5I GGAGGACAGG -----/ATATA ATATAACACA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 ATATA 1 2 114008 CASAVA_Build 6 74955953 1I ATTTTGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1427 hom 34 4 20 10 T 12 13 114009 CASAVA_Build 6 74966075 1I AAGATTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 28 1 18 9 T 16 17 114010 CASAVA_Build 6 74968471 1D CTTTACTAAA C/- TTTGTTTATC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 C 1 0 114011 CASAVA_Build 6 74973175 8I AGCATGAGTA --------/TCTATATC CCATTCTTTC 3070 hom 123 het 43 0 40 3 TCTATATC 0 1 114012 CASAVA_Build 6 74973414 1I CACCTTTCAG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 83 het 32 0 28 4 A 7 8 114013 CASAVA_Build 6 74979704 3I CAAATCATCT ---/AAA ATATGGTAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 1 4 114014 CASAVA_Build 6 74981502 1D ATTACTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 26 1 20 5 T 13 12 114015 CASAVA_Build 6 74981714 1D AAATGTTGGA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 81 het 38 0 27 11 T 8 7 114016 CASAVA_Build 6 74982352 3D AAAAAGTGTT AAC/--- TACAAATTTA 3070 hom 102 het 35 0 35 1 AAC 1 0 114017 CASAVA_Build 6 74982504 1D19M4I ATATATATAT ATTTTTTTTTGAGATGGAGT----/-TTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCA CTCTGTTGCC 2922 hom 30 het 17 0 9 9 N/A 0 0 114018 CASAVA_Build 6 74983171 1D TGGGATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 127 het 49 0 43 7 T 11 10 114019 CASAVA_Build 6 74990088 1D AAACCCTGCT A/- ATCCCTAGAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 1 114020 CASAVA_Build 6 74992976 2I TATACATAAC --/TT ATCACTATCT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 2 114021 CASAVA_Build 6 74993656 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2199 hom 12 het 5 0 5 0 T 13 12 114022 CASAVA_Build 6 74993864 2D TTCTTGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 16 10 T 14 12 114023 CASAVA_Build 6 75002455 3I TAATATTATT ---/ATC AGGCAGTTAT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 ATC 0 1 114024 CASAVA_Build 6 75004538 1D GATTGTTCCA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 8 7 114025 CASAVA_Build 6 75007933 2D CTAATAAAAA CT/-- CTGCACCTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 CT 2 1 114026 CASAVA_Build 6 75008535 1I TTTCTGGGGG -/A GGGGTTAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 1 114027 CASAVA_Build 6 75015419 1D TGTGGTGTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 8 114028 CASAVA_Build 6 75016672 1D AGTATAAAGT G/- GTAACTGTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 2 1 114029 CASAVA_Build 6 75017511 1I TCACCAAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 79 het 33 0 26 7 T 9 10 114030 CASAVA_Build 6 75020334 3D ACTTCTTTTC TAT/--- TATTAATAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 6 TAT 2 1 114031 CASAVA_Build 6 75020461 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 9 10 114032 CASAVA_Build 6 75090704 2D ACTATCAAAG TT/-- GACTAAACAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 0 114033 CASAVA_Build 6 75122852 1I GCTAGACATC -/T TTTTTTTACT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 114034 CASAVA_Build 6 75124617 3D47M3I ATAATTAAAT ATAATAACTATCAAAAGTAATAAAATTATCAGTGTTATGAATTGATTAAA---/---ATAACTATCAAAAGTAATAAAATTATCAGTGTTATGAATTGATTAAAAAG AAGGGGTTTA 3070 het 3070 ref 32 26 9 2 N/A 0 0 114035 CASAVA_Build 6 75125096 1D GAGAAAGCAG T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 T 7 6 114036 CASAVA_Build 6 75135895 1D TATTGGAAAA T/- TTAAGTTTAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 3 2 114037 CASAVA_Build 6 75159187 1D TTCAATGACT C/- CCTGTTAAGT 3070 het 3070 ref 58 33 21 5 C 3 2 114038 CASAVA_Build 6 75179056 2I TGAATTACTG --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 24 18 9 T 9 11 114039 CASAVA_Build 6 75184602 1D ATAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 11 10 114040 CASAVA_Build 6 75190240 1I TATAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2171 hom 18 6 9 3 A 11 12 114041 CASAVA_Build 6 75190580 1I AAACAACCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 16 19 6 A 9 10 114042 CASAVA_Build 6 75193060 1I ACAGAAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 A 9 10 114043 CASAVA_Build 6 75202848 1D CTTTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2643 het 2643 ref 26 12 8 6 T 12 11 114044 CASAVA_Build 6 75215321 5I TTTTACAAAT -----/TAAGA TAAGGGCATT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TAAGA 0 1 114045 CASAVA_Build 6 75216332 10D ATTGTTTTTG TTGCATAAAC/---------- TCTTTGCCTA 3070 het 3070 ref 47 30 13 5 TTGCATAAAC 1 0 114046 CASAVA_Build 6 75221506 4D TAATGTATTC TTAA/---- TTATATTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 16 2 TTAA 1 0 114047 CASAVA_Build 6 75228025 1I ATAATTAACA -/T TTTTTGTACC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 5 6 114048 CASAVA_Build 6 75234168 8I GTGCCATTAC --------/ATACCACA ATACCACAAT 3070 het 3070 hom 46 13 18 15 ATACCACA 1 2 114049 CASAVA_Build 6 75245198 1D CACAATCATG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 9 8 114050 CASAVA_Build 6 75249096 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2349 het 2349 ref 43 29 7 7 T 11 10 114051 CASAVA_Build 6 75285482 4I GAAGAAAAAA ----/CAGT CAGTCAGTCA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 CAGT 2 3 114052 CASAVA_Build 6 75286941 4D ATAAACAATC TAAT/---- TATACTTTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAAT 1 0 114053 CASAVA_Build 6 75301180 4I GCATTTGTGG ----/ACTC ACTCATGTCC 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 ACTC 1 2 114054 CASAVA_Build 6 75304761 1I TCGGGGAATT -/A AAAAAAAAAA 1529 het 1529 ref 25 12 6 7 A 10 11 114055 CASAVA_Build 6 75336359 1I CCCTCTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 29 1 26 2 A 10 11 114056 CASAVA_Build 6 75338961 5I AGAAAAAAGT -----/CTTCA CTTCACACAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CTTCA 1 2 114057 CASAVA_Build 6 75361281 4D AGCATATATA TAAT/---- TAATAAAATT 2884 het 2884 ref 22 12 9 3 TAAT 2 1 114058 CASAVA_Build 6 75396462 11I TTTCTCTTTT -----------/CTTTTTCTTTC CTTTCTTTCT 2606 het 2606 ref 27 13 7 7 CTTTTTCTTTC 0 1 114059 CASAVA_Build 6 75402229 3I CTGAAAAATG ---/CCC CCCCCCCACC 2752 het 2752 ref 31 16 6 9 C 7 10 114060 CASAVA_Build 6 75406726 1I ATAGCTAGCT -/C TAGTAAGCAC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 C 0 1 114061 CASAVA_Build 6 75409243 4D TGTGTGTGTG TGTT/---- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 TGTT 1 0 114062 CASAVA_Build 6 75411031 4I62M2D TAAATATGAC ----TATTTATAATCCTCACTCCTTGGTTGGCATAGTACAGAATTATTAAATATGCAGACTTAATGTT/TGAGTATTTATAATCCTCACTCCTTGGTTGGCATAGTACAGAATTATTAAATATGCAGACTTAATG-- TTTCCATTAT 3070 het 3070 ref 44 31 19 18 N/A 0 0 114063 CASAVA_Build 6 75419381 3D CTTAACTCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 14 11 114064 CASAVA_Build 6 75420101 2I TTTTCGTAAC --/AG AGTCATTAAG 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 AG 1 2 114065 CASAVA_Build 6 75423256 1D ATGTTAGACA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 8 7 114066 CASAVA_Build 6 75434358 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2319 het 1078 hom 8 3 5 0 T 11 10 114067 CASAVA_Build 6 75435178 1D AAATGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 11 10 114068 CASAVA_Build 6 75435415 6D TCATCACACT TTCTAA/------ TTCTATTTGA 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 TTCTAA 1 0 114069 CASAVA_Build 6 75440079 1D ATATCTTTCC T/- TTTCTACTCA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 4 3 114070 CASAVA_Build 6 75467766 1D CTGAATAAAC A/- AATGAGTACT 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 A 3 2 114071 CASAVA_Build 6 75472241 1I TCAATATATG -/T TTAACTGTCA 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 T 2 3 114072 CASAVA_Build 6 75474651 1I CCTCATCCAC -/A ATTCCAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 1 2 114073 CASAVA_Build 6 75476121 5D TGATTTTTGC TTATT/----- TTAATTTTTG 1519 het 1519 ref 19 13 4 3 TTATT 1 0 114074 CASAVA_Build 6 75484422 1D TCATTCTAGT A/- AATAAAGCCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 3 2 114075 CASAVA_Build 6 75487257 6I TTTTGCACCA ------/TTCCTC TTCCCCTATT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 TTCCTC 0 1 114076 CASAVA_Build 6 75488128 1D22M4I TTTTTTTGGA TTTTTTTTTTTTACTTTCTCCAC----/-TTTTTTTTTTTACTTTCTCCACATCT GTCTTTAGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 6 N/A 0 0 114077 CASAVA_Build 6 75488247 2D ATTTTTATTT AA/-- AAAAAAATGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 7 114078 CASAVA_Build 6 75488496 3D TGATGGCCAG TGA/--- TGATGAGCAT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TGA 3 2 114079 CASAVA_Build 6 75490605 1I ATGAATTTTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 8 114080 CASAVA_Build 6 75495028 1I TATAAATATA -/T TTTTTCTCTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 5 6 114081 CASAVA_Build 6 75495307 1D TTCTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 114 hom 37 1 26 10 A 11 10 114082 CASAVA_Build 6 75496808 1I AATTATTTGG -/C CAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 C 1 2 114083 CASAVA_Build 6 75497007 3D AAATATTACC TAG/--- TCACTACCTA 3070 het 3070 ref 35 21 14 2 TAG 1 0 114084 CASAVA_Build 6 75500181 2I AGATTCTAAT --/TA CACCTGAAGG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TA 0 1 114085 CASAVA_Build 6 75505923 4I TCAAAAAAGG ----/AATA AATAAATACA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AATA 2 3 114086 CASAVA_Build 6 75508592 3D AGGACAGAAT TTA/--- TTATGTTTTC 3070 het 3070 ref 31 19 11 4 TTA 2 1 114087 CASAVA_Build 6 75514077 1D TTGTTACTAT G/- ATGTTACTTA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 1 0 114088 CASAVA_Build 6 75518693 1I ACTACCCAAG -/A GTGGATAATT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 0 1 114089 CASAVA_Build 6 75525339 1D CTTTCTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2209 het 2209 ref 27 15 6 7 T 13 12 114090 CASAVA_Build 6 75534137 1I TGGAAGTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 12 11 A 13 14 114091 CASAVA_Build 6 75534391 1I TTCTTCATGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 8 9 114092 CASAVA_Build 6 75536237 1I ACCTTTCAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 T 9 10 114093 CASAVA_Build 6 75549237 1D TGGCATACTG A/- AAAAATGCAC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 6 5 114094 CASAVA_Build 6 75550129 2D AAAAAAATAA CT/-- CTTCAATACA 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 CT 2 1 114095 CASAVA_Build 6 75560017 1I CCAGTGGAAA -/C CCCCTGCCAT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 C 4 5 114096 CASAVA_Build 6 75574612 1D GTATTAATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 10 9 114097 CASAVA_Build 6 75583284 1I TATAGCTAAA -/G CATTCAATTA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 G 0 1 114098 CASAVA_Build 6 75583501 1I AGAAGGCAAA -/G TGACTAGAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 G 0 1 114099 CASAVA_Build 6 75591425 1I ACTTTGGGTA -/C CAGCATATTG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 C 1 2 114100 CASAVA_Build 6 75594487 4I AGTTCACTAT ----/ATAA ATAATCATTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 ATAA 1 2 114101 CASAVA_Build 6 75595225 1I AAGAGCACAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 8 9 114102 CASAVA_Build 6 75666576 1D TTTCTGTGGT G/- GGGGGAGTGT 3070 het 3070 hom 49 21 21 8 G 6 5 114103 CASAVA_Build 6 75727077 1D GATGGGATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 10 9 114104 CASAVA_Build 6 75791312 1D TTTGAAATGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 9 8 114105 CASAVA_Build 6 75793755 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 16 1 14 1 A 11 12 114106 CASAVA_Build 6 75803908 1D ACCTTATATA T/- AATACATTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 0 114107 CASAVA_Build 6 75811112 1I ACTCTGAGTT -/A AAAAAAAAAA 2334 het 1311 hom 25 3 10 12 A 15 16 114108 CASAVA_Build 6 75816094 2I TTCTCCTGTG --/TA TATATATATC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TA 4 5 114109 CASAVA_Build 6 75830966 2D GCAGAATGAA TC/-- TCTCTCACTC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TC 4 3 114110 CASAVA_Build 6 75843355 1D GCTTGGGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 502 hom 29 4 18 7 A 14 13 114111 CASAVA_Build 6 75853718 1D TGGGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 A 11 10 114112 CASAVA_Build 6 75854895 1D CTATGAGGCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2736 hom 27 10 9 9 A 10 9 114113 CASAVA_Build 6 75858260 1I TTTACAATGC -/A AATTCATGAT 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 A 2 3 114114 CASAVA_Build 6 75859020 22I ATTGACAAAT ----------------------/CAGGTAATGTCCCATACCAAAC CACTTCTCAC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 CAGGTAATGTCCCATACCAAAC 0 1 114115 CASAVA_Build 6 75860552 3D ATCAGGAGTC CTT/--- CTATCTTTAT 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 CTT 1 0 114116 CASAVA_Build 6 75860797 1D CTATTTGGAC A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 8 7 114117 CASAVA_Build 6 75926495 1D TTTTAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 1612 het 1612 ref 45 28 4 13 A 12 11 114118 CASAVA_Build 6 75945979 1I TAAACCATGC -/A AAAAAAAAAA 3006 het 3006 ref 36 14 11 11 A 13 14 114119 CASAVA_Build 6 75947654 1D TAAGCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 184 hom 37 3 13 21 A 13 12 114120 CASAVA_Build 6 75948693 3D CATGTGCAGA ACG/--- TGCAGTTTTG 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 ACG 1 0 114121 CASAVA_Build 6 75950178 1D GTGCTTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 A 10 9 114122 CASAVA_Build 6 75969643 1D ATTTGACTGC T/- TTTTTCCTAG 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 T 6 5 114123 CASAVA_Build 6 75978204 1D AAAGGAAGAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 2672 hom 26 8 15 3 A 9 8 114124 CASAVA_Build 6 75987582 1I TACCTAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3025 hom 34 11 16 7 T 11 12 114125 CASAVA_Build 6 76007192 1D CATAGGAAAC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 7 6 114126 CASAVA_Build 6 76007309 1D AAGTATTGTA T/- TTTTAGGTAT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 5 4 114127 CASAVA_Build 6 76014033 3I CATTAAACTT ---/AAG TAGTTAGACT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AAG 0 1 114128 CASAVA_Build 6 76015156 5D CATCAACATG AACAT/----- GAGTCATTCC 3070 het 3070 hom 31 15 16 2 AACAT 1 0 114129 CASAVA_Build 6 76016477 1D AAGAGAGCTA G/- GGTTTCTGGC 3070 het 3070 hom 50 16 31 5 G 3 2 114130 CASAVA_Build 6 76029081 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1549 hom 25 5 9 11 A 11 10 114131 CASAVA_Build 6 76032159 1D AACTTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 10 9 114132 CASAVA_Build 6 76042985 2D GTGTGTAGGG AA/-- AAATTTCCAC 3070 het 3070 ref 54 27 22 6 A 5 3 114133 CASAVA_Build 6 76052695 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2309 het 815 hom 9 3 6 0 A 17 16 114134 CASAVA_Build 6 76075573 1I GCACTAACTT -/A ACCTCCTCTG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 1 2 114135 CASAVA_Build 6 76090287 3I CCACGCTGTT ---/CTC ATAATAGTGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CTC 0 1 114136 CASAVA_Build 6 76092175 1I AATAAAAAAA -/T AATAGATGTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 0 1 114137 CASAVA_Build 6 76094033 4I TAAAATAAAA ----/AGAC AGGTCAATGC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AGAC 0 1 114138 CASAVA_Build 6 76094924 4D TAATAATGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TTTG 4 3 114139 CASAVA_Build 6 76098193 14D AGTCAGGCAC CCTTGTACACTACA/-------------- CCTTGTAAGC 3070 hom 135 het 48 0 44 6 CCTTGTACACTACA 1 0 114140 CASAVA_Build 6 76101933 4I TTTCTTCCTC ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 hom 92 het 38 0 31 7 CCTT 2 3 114141 CASAVA_Build 6 76102944 1D AACCCATGTG A/- AAAAAAAAAG 1279 het 1279 ref 38 28 4 7 A 10 9 114142 CASAVA_Build 6 76107594 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 12 11 114143 CASAVA_Build 6 76113445 3D TTATGACCAA GTG/--- AAGGTCTGTG 3070 hom 90 het 36 0 28 9 GTG 1 0 114144 CASAVA_Build 6 76114135 1I TTTCAAAAAC -/A GTTGATTCTG 3070 hom 138 het 55 0 47 8 A 0 1 114145 CASAVA_Build 6 76129980 4D TCAGACTGTC AGTT/---- AGATGAGTCA 3070 hom 126 het 47 0 43 8 AGTT 1 0 114146 CASAVA_Build 6 76131801 4D TGTTTTTCTG TTTT/---- TTGTTTTTGT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 6 2 114147 CASAVA_Build 6 76136022 1D TCTTTGAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 9 8 114148 CASAVA_Build 6 76140146 1I TATGTTTTTG -/A AAAAAACTAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 6 7 114149 CASAVA_Build 6 76144657 2I CCTGACACAC --/AT GTTTTCTCCT 3070 hom 151 het 53 0 51 2 AT 0 1 114150 CASAVA_Build 6 76146644 1I ATTAAAAGGC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 10 114151 CASAVA_Build 6 76165287 1I GAAATTTATC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 8 9 114152 CASAVA_Build 6 76167453 1D TGTCCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 11 10 114153 CASAVA_Build 6 76193197 3D CAAGCTGAGA GAC/--- GACAACAGAG 3070 het 3070 ref 49 29 17 6 GAC 2 1 114154 CASAVA_Build 6 76194867 2I CACCACCTCC --/AG AGTTTCTGAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AG 1 2 114155 CASAVA_Build 6 76210991 1I TTACAACATC -/A AAAAAAGGAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 6 7 114156 CASAVA_Build 6 76216167 1D CTGCTATGGC A/- AAAATCCTCA 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 A 5 4 114157 CASAVA_Build 6 76221792 1D CTTGAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 12 11 114158 CASAVA_Build 6 76222978 1I ACACTCATAC -/A AAAAGAGTAT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 4 5 114159 CASAVA_Build 6 76232008 1D CACAGCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 11 10 114160 CASAVA_Build 6 76262689 2I CACACACACT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 43 21 13 9 CA 6 7 114161 CASAVA_Build 6 76288171 1I TGAAATATAC -/T TAGAGACGAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 1 2 114162 CASAVA_Build 6 76307999 1D GACTAGCAAA G/- TTCACGAACA 3070 het 3070 ref 43 27 14 2 G 1 0 114163 CASAVA_Build 6 76313043 1I ACCAAGTGGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 A 8 9 114164 CASAVA_Build 6 76316846 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1200 het 35 hom 8 1 3 4 A 20 18 114165 CASAVA_Build 6 76318286 3I AAAGAGCTAA ---/TTT ATGATGAACA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 T 0 3 114166 CASAVA_Build 6 76324532 2I ATATATGTAC --/AT ATATATATAT 2104 hom 5 het 12 0 5 7 AT 6 7 114167 CASAVA_Build 6 76346401 2I TTTCCTTCTT --/CA CAGTTTCACA 3070 hom 154 het 54 0 52 2 CA 1 2 114168 CASAVA_Build 6 76346974 2D GATGCTTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 2380 het 1608 hom 25 10 9 6 T 18 16 114169 CASAVA_Build 6 76353720 5I TTTTCTCTTC -----/TCTTT TCTTTTCTTT 2585 hom 33 het 14 0 12 2 TCTTT 3 4 114170 CASAVA_Build 6 76361918 1D ATATATATAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 2583 hom 16 8 8 0 T 8 7 114171 CASAVA_Build 6 76363216 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2469 het 415 hom 8 1 7 0 A 9 8 114172 CASAVA_Build 6 76365554 1I ATTTACATTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 8 9 114173 CASAVA_Build 6 76367738 1D AAAAGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 23 1 20 2 A 12 11 114174 CASAVA_Build 6 76371062 1I TTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1756 het 1756 ref 23 8 7 8 A 11 12 114175 CASAVA_Build 6 76373228 7D ATCCAAAAAA AAAATCT/------- GAAATCTGAA 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 AAAATCT 1 0 114176 CASAVA_Build 6 76374349 1I ACTAGAGCAC -/A AGCTTCTCCC 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 1 2 114177 CASAVA_Build 6 76375116 5D TGGATAGATT ACTTA/----- ACTTCTCTGT 3070 het 3070 ref 46 24 22 1 ACTTA 1 0 114178 CASAVA_Build 6 76375563 1I TTAAGTTATT -/G GGGGAAGTCA 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 G 4 5 114179 CASAVA_Build 6 76388178 2D AAACATATAA CT/-- CTTTCACAGT 3070 het 3070 hom 39 14 23 5 CT 2 1 114180 CASAVA_Build 6 76404679 2D TTTTCTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2482 hom 42 10 20 12 T 14 12 114181 CASAVA_Build 6 76430242 1D TGCTGATAGT G/- GGTTTTTTTT 1068 het 1068 ref 22 8 8 6 G 3 2 114182 CASAVA_Build 6 76436375 1D CAAGATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 9 10 T 12 11 114183 CASAVA_Build 6 76443433 1D TTCTTTTGTG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 126 het 47 0 43 5 T 9 8 114184 CASAVA_Build 6 76448842 1I GATTATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 12 13 114185 CASAVA_Build 6 76466608 1I CAGCCTCCCA -/T TAGCACCAGG 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 1 2 114186 CASAVA_Build 6 76468026 1D TAGAATGTTG A/- AAAAATCATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 6 5 114187 CASAVA_Build 6 76485388 1I AAAATCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 T 11 12 114188 CASAVA_Build 6 76486105 10I AAATTATAAA ----------/GTAGTTCTTG GTAGTTCTTG 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 GTAGTTCTTG 1 2 114189 CASAVA_Build 6 76486978 3I GAAGTTTAAT ---/AAG GAGAATTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 AAG 0 1 114190 CASAVA_Build 6 76487810 3D CTAGAAATTA TTG/--- TTATTAATTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 TTG 1 0 114191 CASAVA_Build 6 76488021 4I ACAAAACAGC ----/CAAA CAGATACCAT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 CAAA 0 1 114192 CASAVA_Build 6 76495398 1D CAGTGAATAC T/- TTTTTTTTTC 2457 het 2457 ref 30 16 6 8 T 10 9 114193 CASAVA_Build 6 76503137 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2374 hom 17 7 9 1 A 13 12 114194 CASAVA_Build 6 76507005 4I CAGACTAGCT ----/GGGA GTTTAAATTT 3070 het 3061 hom 18 8 9 1 GGGA 0 1 114195 CASAVA_Build 6 76511343 1D TGTCCGGGAA C/- CCAGTTTCAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 3 2 114196 CASAVA_Build 6 76522666 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2359 hom 22 6 12 4 A 12 11 114197 CASAVA_Build 6 76537440 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1611 het 1611 ref 30 16 5 9 T 13 12 114198 CASAVA_Build 6 76591200 1I TCGGTCTAAA -/T TTTTTTTTTT 822 het 822 ref 24 7 4 13 T 17 18 114199 CASAVA_Build 6 76598327 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 436 het 436 ref 27 20 3 5 A 15 14 114200 CASAVA_Build 6 76601186 4D ATTATGTAAA TATG/---- TATGCTGTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TATG 2 1 114201 CASAVA_Build 6 76607560 1I TAGACAAATG -/T GTATTAGAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 0 1 114202 CASAVA_Build 6 76617334 1D ATTTAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 11 10 114203 CASAVA_Build 6 76624533 2D CTTTTCTACA AC/-- AGTTTTAGCA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 AC 1 0 114204 CASAVA_Build 6 76632160 2I CTTGTAAGTG --/AA AAAACATTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 4 6 114205 CASAVA_Build 6 76644683 3D CTCTGCTTTA TTC/--- TTTTAAATAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 TTC 1 0 114206 CASAVA_Build 6 76647861 1D TAAAAGTCAT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 41 hom 29 1 19 9 C 11 10 114207 CASAVA_Build 6 76649153 3I TAAAATAGGC ---/AAT AATAACATAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AAT 1 2 114208 CASAVA_Build 6 76649771 1I GATAGTCCAT -/A AGAGCTGGCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 1 2 114209 CASAVA_Build 6 76652888 1I AATATGTTTA -/C CATAATTTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 2 114210 CASAVA_Build 6 76672605 1D TGTTCTTTAA T/- AGTTAGTTAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 0 114211 CASAVA_Build 6 76684321 1D AGATCATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 35 1 28 6 T 11 10 114212 CASAVA_Build 6 76695605 4I TTTTATAGAT ----/AATG AATGACAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 24 1 AATG 1 2 114213 CASAVA_Build 6 76707555 1I GGGCAGAGAT -/G GGGGTCGATT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 G 4 5 114214 CASAVA_Build 6 76711353 2D TTTCCCCTAC TT/-- TTTTCCACCA 3070 hom 159 het 59 0 51 8 T 6 4 114215 CASAVA_Build 6 76714295 1D TTCAGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2974 hom 37 13 16 9 A 13 12 114216 CASAVA_Build 6 76718381 3D TCTGTCTCAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AAT 7 6 114217 CASAVA_Build 6 76731113 1D GACTAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1491 het 661 hom 19 4 6 9 A 19 18 114218 CASAVA_Build 6 76790833 5I AAAAGTATTC -----/TTAGA TTTTATGTGA 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 TTAGA 0 1 114219 CASAVA_Build 6 76798747 1D TTTCTTTGTA T/- TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 2 T 7 6 114220 CASAVA_Build 6 76803225 79D GTAAATATTG AGTGGCTATGGTAGATTCTACTAGATACATGAGAAAGATCCAATTCTAGTTTTATTTTAAATATCAATATTTACAACTC/------------------------------------------------------------------------------- ACCAAAAATT 3070 het 3070 ref 25 32 10 4 AGTGGCTATGGTAGATTCTACTAGATACATGAGAAAGATCCAATTCTAGTTTTATTTTAAATATCAATATTTACAACTC 1 0 114221 CASAVA_Build 6 76809919 1D GAGTGCCCTG T/- GTTCCTCTTG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 1 0 114222 CASAVA_Build 6 76825840 1I ACGTTACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 10 11 114223 CASAVA_Build 6 76836183 1D TTGGTTGATC A/- AAAAAAAAAA 2780 het 2780 ref 28 12 8 8 A 13 12 114224 CASAVA_Build 6 76918404 1I GGAAAGAATC -/A TATAAAAATA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 0 1 114225 CASAVA_Build 6 76922714 1I ATGAAAACTG -/T TTATTGGTGG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 2 3 114226 CASAVA_Build 6 76925339 1I AAATTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 13 14 114227 CASAVA_Build 6 76940896 1D GAGAAGCCAT A/- ACCAAACAAC 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 A 2 1 114228 CASAVA_Build 6 76951777 23I GTTTTTATAA -----------------------/GCTAGAAGAATATGTGGGGATGC CTCTTGCAGA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 GCTAGAAGAATATGTGGGGATGC 0 1 114229 CASAVA_Build 6 76952426 1D TTAAAATTAA T/- TTTTTTTCTT 2843 het 2843 ref 20 9 7 4 T 8 7 114230 CASAVA_Build 6 76954106 3D TTCTGGACTT GTG/--- GTCTCTTCTG 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 GTG 1 0 114231 CASAVA_Build 6 76961423 4I TTATCCATTC ----/ATTT GTCAATGGAC 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 ATTT 0 1 114232 CASAVA_Build 6 76965157 1I TTAAGGGTGT -/A GTGAGGTATG 3070 het 3070 hom 22 8 9 5 A 0 1 114233 CASAVA_Build 6 76966997 1D ATTGTCTCTG T/- TTGCAGATGA 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 T 3 2 114234 CASAVA_Build 6 76968923 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 1891 hom 16 6 7 3 A 7 8 114235 CASAVA_Build 6 76970842 1D ATGGAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 15 9 T 13 12 114236 CASAVA_Build 6 76973765 1D AGAAAACTAC T/- TTGCCTCTGA 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 T 3 2 114237 CASAVA_Build 6 76981356 1I GTCATTTCTT -/C TAGACAGAAA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 C 0 1 114238 CASAVA_Build 6 76982504 1D CAGTTGATTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 A 9 8 114239 CASAVA_Build 6 76986618 3I TCAAACACTT ---/CTC CTCTCACAGT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 CTC 1 2 114240 CASAVA_Build 6 76990285 4I CTGGTGAGGC ----/TATG TATGCCCGTC 3070 hom 120 het 47 0 40 7 TATG 1 2 114241 CASAVA_Build 6 76992158 1D TCAAATATTA T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 53 het 22 0 19 3 T 7 6 114242 CASAVA_Build 6 76993597 1D GAGATAACAG A/- AAAAATGTGA 3070 hom 138 het 49 0 47 4 A 6 5 114243 CASAVA_Build 6 76994009 1D ACACCATGGC T/- TGTGGAAGCC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 1 114244 CASAVA_Build 6 76994219 3I CATATGATAC ---/TAT TAAGAGGAGG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 TAT 0 1 114245 CASAVA_Build 6 77000986 1I GCCTCACAGT -/A AAAAAAAAAA 2866 het 2866 ref 27 11 7 9 A 10 11 114246 CASAVA_Build 6 77003128 1I CTGTTCTTTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 35 9 22 4 A 6 7 114247 CASAVA_Build 6 77005901 1D AAAAAAAAAA C/- CAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 C 2 1 114248 CASAVA_Build 6 77009946 2D AAACTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 13 11 114249 CASAVA_Build 6 77019248 1D TTTACATAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 16 17 10 T 9 8 114250 CASAVA_Build 6 77030752 1I AAACAAAATG -/A AAAAAATACT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 6 7 114251 CASAVA_Build 6 77034826 1I CTATCTAAAT -/G TTTTTTTCTT 3070 het 367 hom 34 1 31 2 G 0 1 114252 CASAVA_Build 6 77040113 1I19M4I TGCTTTATTC -TTTTTTTTTTAAATCTCCT----/TTTTTTTTTTTAAATCTCCTCTGA CTATGTATTT 3070 het 252 hom 13 2 9 8 N/A 0 0 114253 CASAVA_Build 6 77044899 1I AAAAAAAAAA -/T CTTTGCTCAG 3070 het 564 hom 27 2 18 7 T 0 1 114254 CASAVA_Build 6 77045472 1I AAATCTTTCC -/T TTTTTTGTTC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 6 7 114255 CASAVA_Build 6 77054109 2D TTTCTGACTC TG/-- TGAATTTAAC 3070 het 3070 ref 31 19 9 4 TG 2 1 114256 CASAVA_Build 6 77054588 1I TATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 9 10 114257 CASAVA_Build 6 77064888 1I AATTTTTTTT -/C TCAGTTTTTT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 C 0 1 114258 CASAVA_Build 6 77073573 3D50M11D CTGGCATGTC ATAATAAAAATATCTCAGCAATTTGTACATAATACTGTAAATCCCAGCAGTAAAAGTGTTTGAC/---ATAAAAATATCTCAGCAATTTGTACATAATACTGTAAATCCCAGCAGTAA----------- AGTCTCATTA 3070 het 3070 hom 28 9 26 12 N/A 0 0 114259 CASAVA_Build 6 77078494 4D GGGGAGAGAT AGAG/---- AGAGGTTGGT 3070 het 3070 hom 42 17 23 7 AG 4 2 114260 CASAVA_Build 6 77091127 2I AAGGAGACTC --/TT ATATAATTTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 0 2 114261 CASAVA_Build 6 77094442 1D CTAATTTTTC A/- AACTCTTCTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 A 3 2 114262 CASAVA_Build 6 77096044 3D CTTTTTCTCA TTC/--- TTATCCTCGT 3070 het 3070 ref 52 24 19 13 TTC 1 0 114263 CASAVA_Build 6 77101092 2D TGTTTTTAAT TC/-- TGTTTATGTG 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TC 1 0 114264 CASAVA_Build 6 77101449 1I GGTCCCGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 10 11 114265 CASAVA_Build 6 77109164 1I TGAGGTGGTC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 T 7 8 114266 CASAVA_Build 6 77110932 1I TGTCCCCACC -/T CAAATCTCAT 3070 het 1742 hom 20 4 13 3 T 0 1 114267 CASAVA_Build 6 77125054 3D CCATCTCAAA AAT/--- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 21 10 9 3 AAT 1 0 114268 CASAVA_Build 6 77125203 1I TATCACCCCC -/T GGTGGAGTTG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 0 1 114269 CASAVA_Build 6 77125445 1D CCTCTGTGAG T/- TTTATTTCCC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 4 3 114270 CASAVA_Build 6 77143568 1D TCTAAGTCTC T/- TTGTAGGTCT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 T 3 2 114271 CASAVA_Build 6 77147881 4D TTCTGCCTGA TTCT/---- TTCTAATTAT 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 TTCT 2 1 114272 CASAVA_Build 6 77151952 1D CTATTTAGCC A/- AGAACTATCA 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 A 2 1 114273 CASAVA_Build 6 77159754 4I ACCACTGCAC ----/TCTA TCTAGCCTGG 2614 het 2614 ref 20 6 8 6 TCTA 1 2 114274 CASAVA_Build 6 77159785 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAACCA 714 het 714 ref 24 15 2 7 A 8 7 114275 CASAVA_Build 6 77162636 1I TGCTCAACAT -/C ACTAATCACC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 C 0 1 114276 CASAVA_Build 6 77168026 4I ACAGACACTC ----/AGTA AGTATTTATT 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 AGTA 1 2 114277 CASAVA_Build 6 77169129 1D18M1I GTATAATAAT AAAAAAAAAAGCAGAGTAA-/-AAAAAAAAAGCAGAGTAAT TTTTTTTTTT 3070 het 2808 hom 19 9 10 2 N/A 0 0 114278 CASAVA_Build 6 77171382 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 T 9 8 114279 CASAVA_Build 6 77172759 23D AGCTATTGTA AATAGCTTTTTCAATCCTATTGT/----------------------- AATAGGATTA 3070 het 3070 ref 30 24 8 2 AATAGCTTTTTCAATCCTATTGT 1 0 114280 CASAVA_Build 6 77174968 1D AACTTCTTCC T/- TTTTTTTTTC 1416 het 1416 ref 45 33 4 10 T 10 9 114281 CASAVA_Build 6 77175663 10I ATTAGTTTTA ----------/GCAGTGTTTT GCAGTGTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 9 5 GCAGTGTTTT 1 2 114282 CASAVA_Build 6 77178167 1I ACTAGCCTTC -/T TTTTTTGCCA 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 T 6 7 114283 CASAVA_Build 6 77180176 1I CTTTCTGATT -/A AAAGCATGCC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 3 4 114284 CASAVA_Build 6 77187258 6D TTGGAGGAGG TATGAT/------ TATAAGTACA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 TATGAT 1 0 114285 CASAVA_Build 6 77197072 2I TGATAGTGTC --/AG GGGACATCTG 3070 het 3070 hom 66 29 31 6 AG 0 1 114286 CASAVA_Build 6 77202730 6D ACACCGTTGG TGGGAC/------ TGTAAACTAG 1950 het 1950 ref 16 10 5 1 TGGGAC 1 0 114287 CASAVA_Build 6 77207606 1I AACTTTCCAT -/A AAAAGAGTTT 2385 het 2385 ref 23 14 7 2 A 4 5 114288 CASAVA_Build 6 77210321 1D TTCCCAACAT C/- ATTTATTGAA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 C 1 0 114289 CASAVA_Build 6 77213970 1I ATTGTCTCTT -/C CTTTTCAATA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 C 1 2 114290 CASAVA_Build 6 77216608 6D TTAAGAGCTT AAGTAA/------ AAGAGGAGAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 7 AAGTAA 1 0 114291 CASAVA_Build 6 77226465 1I AACTCTCTTT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 7 8 114292 CASAVA_Build 6 77230819 1I ATTGGTTAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 8 9 114293 CASAVA_Build 6 77232840 1I CCTACACTGT -/C ATGTCCACCT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 C 0 1 114294 CASAVA_Build 6 77235689 1I TTCATCCCTC -/A AAGACTATAG 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 2 3 114295 CASAVA_Build 6 77240333 1I GCTGAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 11 12 114296 CASAVA_Build 6 77245689 4D ATAAAATAAT AGTG/---- AGCAACAGAT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 AGTG 1 0 114297 CASAVA_Build 6 77255011 1I CTCTTGCATC -/T TTTTAGAATT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 4 5 114298 CASAVA_Build 6 77259804 1D GACCACCCTG C/- CCCCCTACTG 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 C 6 5 114299 CASAVA_Build 6 77278714 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 9 10 114300 CASAVA_Build 6 77288339 1D TATTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 11 10 114301 CASAVA_Build 6 77290400 3I TAGTATGACA ---/TAT CTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 TAT 0 1 114302 CASAVA_Build 6 77312965 1D TTCTCTGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2361 hom 28 7 17 5 T 13 12 114303 CASAVA_Build 6 77335721 1I AATAGATCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 8 9 114304 CASAVA_Build 6 77342656 1D TTGTTTGACA T/- GCTTTACTAC 3070 het 3070 ref 42 24 12 7 T 1 0 114305 CASAVA_Build 6 77343885 3I GAAAACAAAG ---/TTC TTATTAACTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTC 0 1 114306 CASAVA_Build 6 77350716 1I CCAGACCTCC -/T TGTTAAGAGG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 1 2 114307 CASAVA_Build 6 77355450 4I CTATATCTTA ----/TTAG TTCACTCATT 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 TTAG 0 1 114308 CASAVA_Build 6 77359224 1I ATTCACCTAG -/T TTTTCTGGTA 3070 het 3070 ref 45 24 20 1 T 4 5 114309 CASAVA_Build 6 77363983 1D TTTCTACGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3001 hom 30 9 11 10 T 11 10 114310 CASAVA_Build 6 77366715 3D AAGGGGAAAT CAC/--- CACTGACCCT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 CAC 2 1 114311 CASAVA_Build 6 77373800 11D ATACTAAACA AAACAATTTAC/----------- AAAGTCAATG 3070 het 3070 hom 52 23 26 5 AAACAATTTAC 1 0 114312 CASAVA_Build 6 77384163 1I TTTTAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 9 11 A 10 11 114313 CASAVA_Build 6 77397459 1D ACTCCATTAC A/- AAAAAAAAAA 1902 het 1654 hom 21 8 5 8 A 15 14 114314 CASAVA_Build 6 77404815 1D AATATATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 T 11 10 114315 CASAVA_Build 6 77406705 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 10 11 114316 CASAVA_Build 6 77420107 4D TACATAATTA TTTG/---- TTTGTCTCAC 3070 hom 96 het 33 0 33 2 TTTG 2 1 114317 CASAVA_Build 6 77422592 1D CTCTCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 12 11 114318 CASAVA_Build 6 77427265 1D ATGGAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 863 hom 36 4 15 17 A 12 11 114319 CASAVA_Build 6 77436948 1D AAAATATTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 T 9 8 114320 CASAVA_Build 6 77441118 2D AAAAAAAAAA AC/-- CAAAACAAAA 2047 het 446 hom 9 3 6 0 AC 1 0 114321 CASAVA_Build 6 77442924 4D CCAAAAAACA AAAC/---- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 30 12 17 2 AAAC 2 1 114322 CASAVA_Build 6 77443010 2I CTCTATCTAG --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 CT 5 6 114323 CASAVA_Build 6 77443280 4I ATATATTCTT ----/AGAA GGAAAATTGT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AGAA 0 1 114324 CASAVA_Build 6 77447165 1D GGAGACACCC T/- AATGACTTGG 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 1 0 114325 CASAVA_Build 6 77447982 2I GTTGAAGAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 10 12 114326 CASAVA_Build 6 77466165 1D GATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 10 9 114327 CASAVA_Build 6 77482438 1D ATTGTGAGAA T/- TTTTTTGGCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 6 114328 CASAVA_Build 6 77485230 2D GTTCACAAAT CA/-- CACACAAACA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 CA 4 3 114329 CASAVA_Build 6 77491838 1I TTATTGTGGT -/A AAAACCACAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 4 5 114330 CASAVA_Build 6 77517275 4I ATGTCCTTTC ----/TGTT TGTTAGTTTT 3070 hom 27 het 10 0 9 1 TGTT 1 2 114331 CASAVA_Build 6 77518783 2D CAGGAACACT AA/-- ATTGAACAAC 3070 hom 108 het 39 0 37 5 A 3 1 114332 CASAVA_Build 6 77523407 1I CACCTACAAC -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 6 7 114333 CASAVA_Build 6 77537421 1I CTTTAAAAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 76 het 35 0 25 10 T 9 10 114334 CASAVA_Build 6 77546057 28D TATATATATA TATATATATATATATATATATATATATG/---------------------------- GCAAATTGTT 3070 hom 23 het 24 1 22 3 TATATATATATATATATATATATATATG 1 0 114335 CASAVA_Build 6 77568030 1I GAATACTTTG -/T TTTTTTTTTT 2071 het 2071 ref 52 36 5 11 T 11 12 114336 CASAVA_Build 6 77574434 2I TCAGTAGGTA --/TC TCACACTGGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TC 1 2 114337 CASAVA_Build 6 77577842 1D TATTGATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 15 1 10 4 T 15 14 114338 CASAVA_Build 6 77582816 5D TTTGCACATC TAACA/----- GCATTTAGTC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 TAACA 1 0 114339 CASAVA_Build 6 77587723 27D TGTTGTTTGC TGCACAGGTCATTCCATCACCTGCATA/--------------------------- TTAAGTGCAG 3070 hom 93 het 30 0 32 3 TGCACAGGTCATTCCATCACCTGCATA 1 0 114340 CASAVA_Build 6 77594177 3D TTAAAGTGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 13 10 114341 CASAVA_Build 6 77597861 1D AGCAGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 207 hom 33 1 21 11 T 12 11 114342 CASAVA_Build 6 77599596 2D TATTTTCAAC TT/-- TTCCCAGGTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 4 2 114343 CASAVA_Build 6 77604917 1D CAGAGCACGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 8 114344 CASAVA_Build 6 77605417 14D CTATGATCTT AACATGTCCCCCAA/-------------- AATTCATGTG 3070 het 3070 ref 50 25 23 4 AACATGTCCCCCAA 1 0 114345 CASAVA_Build 6 77618646 1D GAAAAGAAGA T/- TTTTTTATGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 6 114346 CASAVA_Build 6 77620136 3D TTTTGCTTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 31 8 T 15 12 114347 CASAVA_Build 6 77620377 5D TTCTCTCTCC TAATA/----- TATTTTTTCT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 TAATA 1 0 114348 CASAVA_Build 6 77625082 4D GAAAAAGAAA AGAT/---- TATAATTATG 3070 hom 72 het 27 0 25 4 AGAT 1 0 114349 CASAVA_Build 6 77627857 3D CATTATGAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 15 0 11 7 T 15 12 114350 CASAVA_Build 6 77629507 1D TCTGCCAGAG T/- TTTTAAAAAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 5 4 114351 CASAVA_Build 6 77631183 1D TGAACCATGC T/- AATCAACTGA 3070 hom 108 het 39 0 36 4 T 1 0 114352 CASAVA_Build 6 77635830 1I GTAAAAGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 438 hom 25 1 20 4 A 9 10 114353 CASAVA_Build 6 77636461 4I GATGTAGATA ----/TATT TATTTGTCTT 3070 hom 59 het 22 0 20 2 TATT 1 2 114354 CASAVA_Build 6 77637390 1D TGATACTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 30 0 23 7 A 11 10 114355 CASAVA_Build 6 77637900 1D AGGCTAAATA T/- TTTTTTGAAA 3070 hom 86 het 40 0 29 11 T 7 6 114356 CASAVA_Build 6 77646956 1D ATAAATGGAA G/- TTGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 G 1 0 114357 CASAVA_Build 6 77649177 1D TGCTTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 1437 het 1437 ref 21 10 6 5 A 13 12 114358 CASAVA_Build 6 77657252 4D TTTTGCATAT TTTA/---- TTTGTTTGGT 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 TTTA 1 0 114359 CASAVA_Build 6 77663779 13D TCCTTGATTT TCCCTTTGATTTA/------------- TCCCTTGGCC 3070 het 3070 ref 40 27 13 4 TCCCTTTGATTTA 1 0 114360 CASAVA_Build 6 77666653 1D TATTTATTTA T/- TTATTATACT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 3 2 114361 CASAVA_Build 6 77677345 1I CTAGCAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 29 2 16 12 T 14 15 114362 CASAVA_Build 6 77680656 2D CAAAATGTGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 TA 7 6 114363 CASAVA_Build 6 77681985 1I GAGATCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 10 11 114364 CASAVA_Build 6 77685008 4I CAAGTAAAGC ----/TTGA TTAAGAGTGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TTGA 0 1 114365 CASAVA_Build 6 77685874 1I TACAAGAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 10 114366 CASAVA_Build 6 77697075 2I TGTGTGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 2226 het 1861 hom 22 5 8 9 TG 7 8 114367 CASAVA_Build 6 77702476 1I TTAAAATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 725 hom 32 2 27 3 T 10 11 114368 CASAVA_Build 6 77707647 9D CCTTCATAAG AACAAAAAA/--------- TCAGATGAAC 3070 het 3070 ref 43 23 18 7 AACAAAAAA 1 0 114369 CASAVA_Build 6 77715653 4D TCACAAAAAT AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 AATA 3 2 114370 CASAVA_Build 6 77738871 3D GGGAAATAAA CTT/--- CTCTACCATT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 CTT 1 0 114371 CASAVA_Build 6 77746201 1D TTCTTTTTTT G/- TTGGGTCTCT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 0 114372 CASAVA_Build 6 77759205 1I TTGGGGCCAG -/A AACCCAAACG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 2 3 114373 CASAVA_Build 6 77761555 7D ATAGTTTCAT CTTTTTC/------- ATTGATCATC 3070 het 3070 hom 44 22 23 3 CTTTTTC 1 0 114374 CASAVA_Build 6 77765774 1D TAAATACACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 8 T 9 8 114375 CASAVA_Build 6 77767344 15I CCTAGCATGG ---------------/TTTTAATGTATAGAA TTTGACAAAC 3070 hom 72 het 28 0 25 5 TTTTAATGTATAGAA 0 1 114376 CASAVA_Build 6 77772392 1D TTAAATTAGT A/- AAAAAAAAAA 2749 het 2026 hom 23 7 7 10 A 14 13 114377 CASAVA_Build 6 77774500 1D TGTAATCCCA G/- CACTTTAGGA 3043 het 3043 ref 25 15 7 3 G 1 0 114378 CASAVA_Build 6 77781613 4I TTTTTGTCCC ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 AAAG 3 4 114379 CASAVA_Build 6 77784337 1I AGGTAGCTAG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 7 8 114380 CASAVA_Build 6 77786853 1D ACTTTTGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 595 hom 37 3 28 6 A 12 11 114381 CASAVA_Build 6 77787293 3D TTTCAGAAAA ATT/--- ATTTACAATA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 ATT 2 1 114382 CASAVA_Build 6 77788632 3D TGTACACTGT TGG/--- TGGGAATAAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 4 TGG 2 1 114383 CASAVA_Build 6 77789789 1D TTTGGCAATT A/- AAAATAATAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 A 5 4 114384 CASAVA_Build 6 77789983 13I TGATATATGC -------------/AGTAAATAAGCAT AGTAAAATGT 3070 het 3070 hom 29 8 15 7 AGTAAATAAGCAT 0 1 114385 CASAVA_Build 6 77791671 1I AGGGTACCCC -/T GGGAGTTCAG 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 T 0 1 114386 CASAVA_Build 6 77792577 1D TCTGAGTTTT G/- GGGGGGGGAC 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 G 9 8 114387 CASAVA_Build 6 77794277 2D AAGAAACCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 35 6 10 19 A 14 12 114388 CASAVA_Build 6 77794523 2I CATATATATA --/AT ATATATATAT 3070 het 2511 hom 21 8 10 3 AT 5 6 114389 CASAVA_Build 6 77795798 32D TGGTTTCCAG CTTCATCCATGTCCCTGCAAAGGACATGAACT/-------------------------------- CATCATTTTT 2701 het 2701 ref 17 10 7 0 CTTCATCCATGTCCCTGCAAAGGACATGAACT 1 0 114390 CASAVA_Build 6 77798727 1D TCTGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 1821 het 641 hom 10 3 5 2 A 16 15 114391 CASAVA_Build 6 77800104 1D GCTAAGGGTG T/- GGGGGAGAAA 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 T 1 0 114392 CASAVA_Build 6 77801644 1D ATTTTAACAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 A 8 7 114393 CASAVA_Build 6 77807243 13D CTCAGTTCAG ACTCAGTTCATGA/------------- ACTCCACTGA 3070 het 3070 hom 30 13 20 4 ACTCAGTTCATGA 1 0 114394 CASAVA_Build 6 77811543 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAC 2671 het 90 hom 16 1 12 3 A 9 10 114395 CASAVA_Build 6 77820459 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 7 8 114396 CASAVA_Build 6 77823079 1D TTTTTTCATG T/- GTTTTTTGGC 3070 het 978 hom 19 3 15 1 T 1 0 114397 CASAVA_Build 6 77823850 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1589 het 1490 hom 14 4 5 5 A 13 12 114398 CASAVA_Build 6 77824280 1I GCTATATAAC -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 6 7 114399 CASAVA_Build 6 77828890 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATT 954 hom 10 het 5 0 4 1 A 8 9 114400 CASAVA_Build 6 77831144 1I GATGTACTAT -/A ATTTGTTTAA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 1 2 114401 CASAVA_Build 6 77831538 1D3M1I ATAGATAGAT GATA-/-ATAT GATAGATAGA 3070 het 2287 hom 51 15 22 16 N/A 0 0 114402 CASAVA_Build 6 77839499 1I TTACAAAATC -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 6 7 114403 CASAVA_Build 6 77856744 1I TTCTGCTACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 9 10 114404 CASAVA_Build 6 77861834 1I TGTGAGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 10 11 114405 CASAVA_Build 6 77864834 1I CCTATTATGA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 T 7 8 114406 CASAVA_Build 6 77866027 1I ACAGTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 32 3 19 10 T 15 16 114407 CASAVA_Build 6 77867130 4I ATAGATACAC ----/ATAT ATATATATAT 2474 het 2474 ref 23 13 6 4 AT 7 9 114408 CASAVA_Build 6 77872736 33D AAAGACACCC TTGGGTTCTAAAATTAACAAGAGGCTGGAAGAT/--------------------------------- TTATGTACAT 3070 het 3070 ref 38 23 16 7 TTGGGTTCTAAAATTAACAAGAGGCTGGAAGAT 1 0 114409 CASAVA_Build 6 77879067 3I TACTGCATAA ---/CTG CAGTATTGCC 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 CTG 0 1 114410 CASAVA_Build 6 77889175 1D ACAAGCAATA T/- CTCAGTCAGG 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 T 1 0 114411 CASAVA_Build 6 77894087 1D ATTAATAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 19 18 13 A 9 8 114412 CASAVA_Build 6 77901928 4I ATAAAAATGT ----/GTGA GTGAGTCTAC 3070 hom 157 het 56 0 53 3 GTGA 1 2 114413 CASAVA_Build 6 77917512 1D TATATATTTG A/- AAAAAATTGA 3070 hom 45 het 29 0 25 4 A 7 6 114414 CASAVA_Build 6 77920132 1D GGATATTCAT C/- CTTTCAAGCA 3070 het 3070 hom 35 13 20 3 C 2 1 114415 CASAVA_Build 6 77922171 12D ACACTTCTTT GGTTAATTCCTA/------------ GGTATTTAAT 3070 hom 111 het 36 0 38 1 GGTTAATTCCTA 1 0 114416 CASAVA_Build 6 77930593 1D AATAAATAAT A/- AAAAAAATTA 613 het 613 ref 7 3 2 2 A 8 7 114417 CASAVA_Build 6 77931380 1I CCTGTACGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 39 3 28 8 T 11 12 114418 CASAVA_Build 6 77933054 1I CGTTTCCTCA -/T TATTTTGTTA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 T 1 2 114419 CASAVA_Build 6 77935752 1D TCCAAAAGAC T/- TTTCTTCAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 4 3 114420 CASAVA_Build 6 77947125 1I GCTGGTGAAT -/C TGGAAGGAGG 3070 hom 105 het 44 0 35 9 C 0 1 114421 CASAVA_Build 6 77953179 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 20 1 13 6 A 13 14 114422 CASAVA_Build 6 77958806 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 CT 2 1 114423 CASAVA_Build 6 77959893 3I ATGGAAGTGC ---/TGT TGTTTATTAA 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 TGT 1 2 114424 CASAVA_Build 6 77963467 6D GATATATAAA ATATCT/------ ATATCTATAA 3070 het 3070 hom 22 11 10 2 ATATCT 2 1 114425 CASAVA_Build 6 77993134 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 19 7 A 10 11 114426 CASAVA_Build 6 78000930 1D GCTAGCTCTT C/- CACCTTGGGA 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 C 2 1 114427 CASAVA_Build 6 78001819 1D ATAAAAAAAA T/- ATATATATAT 2557 hom 15 het 10 0 6 4 T 1 0 114428 CASAVA_Build 6 78010102 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1889 hom 19 5 9 5 A 14 15 114429 CASAVA_Build 6 78024095 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1726 hom 23 7 12 4 A 14 15 114430 CASAVA_Build 6 78025216 4D35M2I TCTTTCTTTC TCTTTCTTTCTTTCTCTTTTCTTTCTCCTTCCTTCCTTC--/----TCTTTCTTTCTCTTTTCTTTCTCCTTCCTTCCTTCCT CTCTCTTTCT 1790 het 1790 ref 29 24 4 8 N/A 0 0 114431 CASAVA_Build 6 78025973 1D TTCCAAAGTC A/- CTCCACATTT 3070 het 3070 ref 53 32 16 5 A 1 0 114432 CASAVA_Build 6 78027137 3I ATTCATAAAA ---/TGT ATGTTTAATT 3070 het 2100 hom 18 5 12 1 TGT 0 1 114433 CASAVA_Build 6 78036098 1D CACTTGAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 10 9 114434 CASAVA_Build 6 78041084 1D GAGAATAAAA G/- TTCAGAAAAT 3070 het 2452 hom 28 7 18 3 G 1 0 114435 CASAVA_Build 6 78047889 1D TACCATATAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 9 8 114436 CASAVA_Build 6 78050902 3I AGCTAATAAA ---/CTC CTATTTTTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CTC 0 1 114437 CASAVA_Build 6 78056819 3D CCTAACATTC TCT/--- TCTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 TCT 3 2 114438 CASAVA_Build 6 78058816 4D AGAAGGCAGT CTAA/---- CTAAGTGGAG 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 CTAA 2 1 114439 CASAVA_Build 6 78071177 3I TTTTATAAAA ---/AAC AATTTATTTC 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 AAC 0 1 114440 CASAVA_Build 6 78103354 1I GTTTTTATTC -/T TTTTTTATTT 2095 hom 12 het 8 0 5 3 T 6 7 114441 CASAVA_Build 6 78105148 3D GTTGTTGTAG TTA/--- TTATTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 TTA 2 1 114442 CASAVA_Build 6 78120862 1I TGTCTGCCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 8 9 114443 CASAVA_Build 6 78132260 1D TTTTTAAAAA G/- GAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 G 2 1 114444 CASAVA_Build 6 78137743 3D CACTCATATT TTG/--- TTATCTTCTT 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 TTG 1 0 114445 CASAVA_Build 6 78142645 3D AGTTTTTAAA TTG/--- TTAAGATTCA 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 TTG 1 0 114446 CASAVA_Build 6 78146547 1D TATGCAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 A 10 9 114447 CASAVA_Build 6 78147008 1I ATGCCAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 122 hom 37 1 27 9 T 10 11 114448 CASAVA_Build 6 78149300 1I TAATGGGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 33 0 22 11 A 11 12 114449 CASAVA_Build 6 78149624 1I TGGAATGTTT -/C CGTGTGGGGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 C 1 2 114450 CASAVA_Build 6 78155888 1I AATTATTTGA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 46 29 9 8 T 7 8 114451 CASAVA_Build 6 78156552 1I CAATTTTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 20 hom 29 1 21 7 T 9 10 114452 CASAVA_Build 6 78157306 1D TTTATAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 T 11 10 114453 CASAVA_Build 6 78159165 1I AAACTAGTAT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 45 het 24 0 16 8 A 6 7 114454 CASAVA_Build 6 78164583 2D TAGTATACTC TT/-- TGTTAGCCTA 3070 het 3070 hom 30 10 16 5 T 3 1 114455 CASAVA_Build 6 78172213 8I2M6I TGGAAGAGAC --------CT------/TGCTCTCACTAGGTAA GCTTCAAGTC 3070 het 3070 ref 44 25 19 5 N/A 0 0 114456 CASAVA_Build 6 78174369 2I AATTAATAAA --/AG AGTAAAATTA 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 AG 1 2 114457 CASAVA_Build 6 78176315 1I GGGATTAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 8 9 114458 CASAVA_Build 6 78177366 1I GCTATGTGTC -/A ATTTAGAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 A 1 2 114459 CASAVA_Build 6 78177622 6D CTGTATATGC CTCTCT/------ CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 27 13 9 8 CT 8 5 114460 CASAVA_Build 6 78179972 2D AAGAAAACTC TT/-- GTTAGTATCT 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 T 2 0 114461 CASAVA_Build 6 78185245 1D ACTTAAAATG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 8 7 114462 CASAVA_Build 6 78187470 1D ACCATTCCAT A/- ATGTGTATGT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 2 1 114463 CASAVA_Build 6 78189290 1I GATGCAAATT -/A ATAAACTCTA 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 A 1 2 114464 CASAVA_Build 6 78193145 1D AAGTGAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 10 9 114465 CASAVA_Build 6 78193474 1I TTCCAAGCAT -/G GGTCATTTCT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 G 2 3 114466 CASAVA_Build 6 78195141 4I ACTTTTTTAC ----/TTTA TTTCTCTGTG 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 TTTA 0 1 114467 CASAVA_Build 6 78197708 1I ATTCCAAGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 8 9 114468 CASAVA_Build 6 78223832 1D GCAAAAAAAA C/- AAACAAAAAA 1457 het 71 hom 27 1 11 15 C 1 0 114469 CASAVA_Build 6 78228207 2D ACAAAGTTCT CC/-- CCCCAAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 6 4 114470 CASAVA_Build 6 78238581 1D CTAAAATACA T/- GCACAGCAAG 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 T 1 0 114471 CASAVA_Build 6 78296883 1D ACTGTGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 34 1 27 7 A 11 10 114472 CASAVA_Build 6 78339620 1I GTCTCCAAGG -/A AAAAAAAAAA 1370 het 1370 ref 32 16 5 11 A 15 16 114473 CASAVA_Build 6 78368717 2I TAATGTGATC --/AA GAGTGACTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 0 2 114474 CASAVA_Build 6 78441531 2I CATTTTTATT --/AC AGACAGTGAA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AC 0 1 114475 CASAVA_Build 6 78573584 1I GCTTCATAAG -/T TTTTTTTTTT 2829 het 2567 hom 32 11 11 10 T 15 16 114476 CASAVA_Build 6 78591091 1D CATTCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 35 0 32 3 A 12 11 114477 CASAVA_Build 6 78652866 5I AGATTTTCCA -----/GTTTT GTTTTGTTTT 3070 hom 78 het 36 0 24 12 GTTTT 2 3 114478 CASAVA_Build 6 78653463 1I TTCTTTTTTA -/G TTCCTTGGGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 114479 CASAVA_Build 6 78736167 1D GGCATAACTT A/- AACTGAACAG 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 A 3 2 114480 CASAVA_Build 6 78739750 1D ATGCAAAAAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 7 6 114481 CASAVA_Build 6 78804366 3D TTATAATGAT AAC/--- AATAATGTAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 AAC 1 0 114482 CASAVA_Build 6 78907466 1D GAAGGCAGGC T/- GTTTGAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 0 114483 CASAVA_Build 6 78916181 2I ATGAATACTC --/TT TGTAATAAAG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 1 3 114484 CASAVA_Build 6 78916863 1D TATCCAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 41 0 38 4 A 10 9 114485 CASAVA_Build 6 78923727 1D AGAAATCAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 9 114486 CASAVA_Build 6 78929071 1I TTTTTTTTTC -/A AAATCCATTT 3070 hom 107 het 40 0 36 4 A 3 4 114487 CASAVA_Build 6 78940597 1I GTCCTATGTG -/T CTCCTCCACG 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 0 1 114488 CASAVA_Build 6 78943256 3I CTACTATACA ---/AAC AACATCTCTA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AAC 1 2 114489 CASAVA_Build 6 78949470 4D GTCTCCCAAA ACAG/---- ACAGCCAACA 3070 hom 99 het 40 0 33 8 ACAG 2 1 114490 CASAVA_Build 6 78961871 2D TTATCTTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 13 11 114491 CASAVA_Build 6 78963140 1D GAGTATATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 5 A 10 9 114492 CASAVA_Build 6 78964036 6I TAAAATGAAA ------/AAGATT ACCCTCTACC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AAGATT 0 1 114493 CASAVA_Build 6 78967795 1D ACATATGTAA C/- AAACCTGCAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 0 114494 CASAVA_Build 6 78969217 1D ACACTGTGCA G/- GGGGGGGATG 3070 hom 121 het 45 0 39 6 G 8 7 114495 CASAVA_Build 6 78972068 3I AAAATTGGAG ---/ATA ATATTTTCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ATA 1 2 114496 CASAVA_Build 6 78972426 4D TAATAAAGTT TGTC/---- TGGTTGTATT 3070 hom 87 het 31 0 29 4 TGTC 1 0 114497 CASAVA_Build 6 78976988 1D CCACTCAGCA T/- TTTTATTCTC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 5 4 114498 CASAVA_Build 6 78986773 1D ATCATGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 614 hom 28 3 18 7 T 15 14 114499 CASAVA_Build 6 78989261 1D TGGAACATTC T/- TTTTTTTTTT 1224 het 874 hom 41 6 6 29 T 19 18 114500 CASAVA_Build 6 78992674 3I GAGTTCTTTT ---/TTA TTATTATTAT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TTA 3 4 114501 CASAVA_Build 6 78998741 1D CCTATCCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 736 hom 34 8 10 16 T 17 16 114502 CASAVA_Build 6 79003360 1I TGTAATCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 29 1 25 3 T 11 12 114503 CASAVA_Build 6 79008867 7I GCAATAACTT -------/TAAGATA TATTATTTGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TAAGATA 0 1 114504 CASAVA_Build 6 79021763 1D TTTCATTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 39 1 30 8 T 11 10 114505 CASAVA_Build 6 79024231 1D TCGACTGTAC T/- TTTCCTTCAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 4 3 114506 CASAVA_Build 6 79028750 1I TAAGTAGATT -/A AAAAGTTTGT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 A 4 5 114507 CASAVA_Build 6 79031702 1I TCTCTAGTAA -/G GGGGTCTATC 3070 hom 84 het 35 0 27 8 G 4 5 114508 CASAVA_Build 6 79033225 4D GTGAATAGAC ACTT/---- ATCTATATAA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 ACTT 1 0 114509 CASAVA_Build 6 79034042 1D CAAAATGCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 12 11 114510 CASAVA_Build 6 79034114 1I ATTAGAAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 9 10 114511 CASAVA_Build 6 79045327 35I GTCTTGACTT -----------------------------------/TGTTTTGTTTAAAGTTTTGTCAAGACTTGTCTTGA TATTGTTAAC 3070 hom 60 het 19 0 21 3 TGTTTTGTTTAAAGTTTTGTCAAGACTTGTCTTGA 0 1 114512 CASAVA_Build 6 79048339 4D AAGCAGGTGG ATAA/---- ATAAAGTCCC 3070 hom 102 het 38 0 34 5 ATAA 2 1 114513 CASAVA_Build 6 79049426 1D TGTAGGCAAT G/- GTGATAGCTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 2 1 114514 CASAVA_Build 6 79064526 3D TAACATGGAA TAC/--- TATTCAGCCA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 TAC 1 0 114515 CASAVA_Build 6 79069428 1D TTTCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 42 0 37 5 T 12 11 114516 CASAVA_Build 6 79073445 3D GAAATTTATT TTG/--- TCTGATGTAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTG 1 0 114517 CASAVA_Build 6 79080932 6I GAGCTCTACA ------/GTCAGG GTCAGGTAGA 3070 hom 95 het 38 0 31 7 GTCAGG 1 2 114518 CASAVA_Build 6 79083773 1I AACAGAGGCC -/A AAAAAAATAT 3070 hom 27 het 27 1 23 3 A 7 8 114519 CASAVA_Build 6 79085860 2D GTCTTAAAAA AG/-- AGTCTTTAAT 3070 hom 72 het 27 0 24 4 AG 2 1 114520 CASAVA_Build 6 79092327 2D ATGCTACAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 8 A 13 11 114521 CASAVA_Build 6 79103990 2D CTAAACAAAC AT/-- GTGTAAAATA 3070 hom 78 het 35 0 25 12 AT 1 0 114522 CASAVA_Build 6 79108835 2I AAGAGGCACA --/TG GATAATCTAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TG 0 1 114523 CASAVA_Build 6 79116352 4I TATGTACATA ----/TATG TATGTATTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TATG 1 2 114524 CASAVA_Build 6 79121386 1D GTCTCCACTG A/- AAAAAAAAAA 1112 het 1112 ref 25 19 3 3 A 11 10 114525 CASAVA_Build 6 79122709 1I AAGAAGCAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 44 0 34 10 T 8 9 114526 CASAVA_Build 6 79127861 1D GTGGTGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 11 10 114527 CASAVA_Build 6 79133543 1D TCCCCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 1043 het 1043 ref 26 13 3 10 T 15 14 114528 CASAVA_Build 6 79143229 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 14 13 114529 CASAVA_Build 6 79149767 7D CGCTATCACC ATAAAAT/------- ATAAGTATGT 3070 hom 105 het 38 0 36 7 ATAAAAT 1 0 114530 CASAVA_Build 6 79230981 4D GAATCTGTAG CCTT/---- CCTTCCATGT 3070 het 3070 hom 30 11 19 0 CCTT 2 1 114531 CASAVA_Build 6 79248351 1I AAATTGTTAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 7 8 114532 CASAVA_Build 6 79249947 1I GGTGCATGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 A 9 10 114533 CASAVA_Build 6 79250809 4D CTCAGCTAAT AGAC/---- AGAGAATGAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 AGAC 1 0 114534 CASAVA_Build 6 79250968 1I AAGGGTCCTC -/A AAGAAGCATA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 2 3 114535 CASAVA_Build 6 79251347 1I ACTTAATGTG -/C CCCCCATGTA 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 C 5 6 114536 CASAVA_Build 6 79252194 1I AATAAAAGAT -/A AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 6 7 114537 CASAVA_Build 6 79252841 20D TGTTTGGCTC ATGTCTTTGTGTTATGGCCT/-------------------- ATGGTAGGGA 3070 het 3070 ref 40 24 16 9 ATGTCTTTGTGTTATGGCCT 1 0 114538 CASAVA_Build 6 79252967 1D TAATACAAAA C/- ATGATGATAG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 C 1 0 114539 CASAVA_Build 6 79260849 1I ATCAAGGTAC -/T GGTAGGTTCA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 0 1 114540 CASAVA_Build 6 79261075 5D CATAGCAGAG ATTTA/----- ATTTATGTAT 3070 het 3070 ref 48 28 17 5 ATTTA 2 1 114541 CASAVA_Build 6 79261679 1I TTATAATGAT -/C TTGAACATAT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 C 0 1 114542 CASAVA_Build 6 79262217 1I CCTTTATACC -/A GGGGGGGCTG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 0 1 114543 CASAVA_Build 6 79262648 2I AATGCTTCTC --/TT GTTTCCTCAG 3070 hom 123 het 42 0 41 1 T 0 2 114544 CASAVA_Build 6 79263848 1I TTGCTTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 T 9 10 114545 CASAVA_Build 6 79270775 2I AATAGAGGTT --/AA ACTTCAGATT 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 A 1 3 114546 CASAVA_Build 6 79274553 1I GGCCAACCTC -/T TGCATCAGCA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 T 1 2 114547 CASAVA_Build 6 79288593 5D GGTTTTTTCT TTTTC/----- TTTTTTTTTT 23 het 23 ref 38 26 4 8 TTTTC 1 0 114548 CASAVA_Build 6 79290375 1D TTAGTAGCAT G/- GAACATGTCC 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 G 2 1 114549 CASAVA_Build 6 79303785 1I GACAAGTATC -/A GGGGTAAAAC 3070 hom 117 het 49 0 40 9 A 0 1 114550 CASAVA_Build 6 79309386 1I AAGTGATCTA -/T TTTTTTTTTT 1847 het 1847 ref 15 7 6 2 T 10 11 114551 CASAVA_Build 6 79314272 3I CATCTGTTGT ---/TTC TTGACTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TTC 0 1 114552 CASAVA_Build 6 79316503 1D TTTTCAAATA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 T 9 8 114553 CASAVA_Build 6 79316801 1I TTTTTATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 20 7 9 4 T 10 11 114554 CASAVA_Build 6 79317363 1D TCTACATAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 9 8 114555 CASAVA_Build 6 79319002 3D CCTGGGTTAA TTT/--- GCTTAGGATA 3070 het 3070 ref 54 25 22 9 T 3 0 114556 CASAVA_Build 6 79321083 4D TGAATGAATG GATA/---- AAGAAAATGA 3070 het 3070 hom 40 19 20 3 GATA 1 0 114557 CASAVA_Build 6 79321658 4D CACCTAAATA ATGT/---- ATGTACACTG 3070 het 3070 ref 52 30 20 6 ATGT 2 1 114558 CASAVA_Build 6 79328540 1D ACAGAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 12 11 114559 CASAVA_Build 6 79329488 2I ATAAGTGGAA --/AG AGAGATTAAA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 AG 2 3 114560 CASAVA_Build 6 79330606 2D AAATAATAAT AA/-- AAAAAAAAGC 3070 hom 27 het 19 0 10 9 A 10 8 114561 CASAVA_Build 6 79339514 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAACGAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 7 A 6 5 114562 CASAVA_Build 6 79340405 1I ACTTTTCATG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 A 7 8 114563 CASAVA_Build 6 79345300 1D AGGAAAAGGG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 8 7 114564 CASAVA_Build 6 79346943 1D AGAAAGGGAA G/- GGGGGGAATG 3070 het 2065 hom 22 7 10 7 G 7 6 114565 CASAVA_Build 6 79361055 1I GTCGACATAT -/A AATCTCTAAT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 2 3 114566 CASAVA_Build 6 79367216 1D CTGACTCCTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 A 8 7 114567 CASAVA_Build 6 79382984 1I TATATCCAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 8 9 114568 CASAVA_Build 6 79392771 1I TTCTGTTCAA -/T TTTTCCAGAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 4 5 114569 CASAVA_Build 6 79393171 1I CAAGTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 23 0 16 7 A 10 11 114570 CASAVA_Build 6 79397991 2D TTAGGTTCTT TC/-- TCTCTCAGTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TC 4 3 114571 CASAVA_Build 6 79400028 2I TCTAAGAGAC --/AG AGGTGGGTAG 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 AG 1 2 114572 CASAVA_Build 6 79458723 3I TGACACAAGG ---/GAA GTAGCTAGAG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 GAA 0 1 114573 CASAVA_Build 6 79459128 1I TTCCTGTGGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 8 9 114574 CASAVA_Build 6 79482414 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2746 het 869 hom 25 7 9 9 A 14 13 114575 CASAVA_Build 6 79491367 1D TTAAAGTTTT A/- AAAAAGACAG 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 A 6 5 114576 CASAVA_Build 6 79494338 1D TCCTTACAAG A/- AGAGGAAAAC 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 A 2 1 114577 CASAVA_Build 6 79512916 1D TTAAGGGAGT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 97 het 42 0 33 9 A 8 7 114578 CASAVA_Build 6 79513544 1D ATGAAATAGT G/- GTGATGTTTG 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 G 2 1 114579 CASAVA_Build 6 79532664 1I TCACAGAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 A 8 9 114580 CASAVA_Build 6 79549003 3D TCTATATATA TAT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 TAT 1 0 114581 CASAVA_Build 6 79596352 4I GACAGAGAGT ----/GAGA GAGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 GA 4 6 114582 CASAVA_Build 6 79607338 1I GTAGAACTAC -/A AAAACTGATC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 4 5 114583 CASAVA_Build 6 79609385 1I TTTTCCTTGC -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 6 7 114584 CASAVA_Build 6 79610356 1D AGGTGACAAC A/- ACAGAGGGCT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 2 1 114585 CASAVA_Build 6 79622255 1I15M1I CATAACTGAT -AAAATAGCTCAAGAT-/AAAAACAGCTCAAGATG TTGTAATGCA 1845 het 1845 ref 45 40 4 8 N/A 0 0 114586 CASAVA_Build 6 79624760 1I AAAAAGAGAA -/G GGGGGCATGT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 G 5 6 114587 CASAVA_Build 6 79636930 1D GTGTACTCAG A/- AAATGCCTTC 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 4 3 114588 CASAVA_Build 6 79651887 5I GAGGTATGTA -----/CTTAT CTTAACAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 CTTAT 0 1 114589 CASAVA_Build 6 79654223 1D TTATGGAAAA C/- AGTATACAGG 3070 het 3070 ref 38 22 13 5 C 1 0 114590 CASAVA_Build 6 79654461 1I ATTTAGCCTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 8 9 114591 CASAVA_Build 6 79654957 1I ACAGCTCCAA -/T TTTTTTTTTT 2411 het 2411 ref 26 10 9 7 T 15 16 114592 CASAVA_Build 6 79662768 1D ACCTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 2293 het 2293 ref 42 21 7 14 A 17 16 114593 CASAVA_Build 6 79667622 1D CTAAAGACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 10 9 114594 CASAVA_Build 6 79681440 1D ATTTTTAGTA G/- AGACAGGGTT 3070 het 474 hom 11 1 10 0 G 1 0 114595 CASAVA_Build 6 79706513 2I ATTTTCTCTT --/AA GTTTGGCAGA 3070 het 3070 hom 36 18 18 0 A 0 2 114596 CASAVA_Build 6 79717255 3D ATTTTCTTTA TTG/--- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 TTG 1 0 114597 CASAVA_Build 6 79718854 13D ACTCTGTCCC AAAAAAAAAAGAA/------------- AAAAAAAAAA 2132 het 2132 ref 18 11 6 6 AAAAAAAAAAGAA 2 1 114598 CASAVA_Build 6 79735168 4D TTTTCCCTAA AATT/---- AATAATTGCT 3070 het 3070 ref 35 15 14 8 AATT 1 0 114599 CASAVA_Build 6 79744024 10I AATAATGAAG ----------/ACCTTCAAGC ACCTTCAAGC 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 ACCTTCAAGC 1 2 114600 CASAVA_Build 6 79751723 1I GTTGCTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 11 12 114601 CASAVA_Build 6 79753385 3D AAAGAAACAG AAT/--- TATTCCTACA 3070 het 3070 hom 31 11 16 6 AAT 1 0 114602 CASAVA_Build 6 79755172 1D AAAAATGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 15 11 T 12 11 114603 CASAVA_Build 6 79755531 1I TAAAAAACAC -/A AAAAAACTTA 3070 het 3070 ref 46 27 11 8 A 6 7 114604 CASAVA_Build 6 79757789 3D GATAATCTTC TGT/--- TCCATATAGA 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 TGT 1 0 114605 CASAVA_Build 6 79775021 1D ACACACCCTC T/- TAAGGATTGT 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 T 2 1 114606 CASAVA_Build 6 79776345 4I CTTAAAACCT ----/GAAA GAAAGTGATA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 GAAA 1 2 114607 CASAVA_Build 6 79776942 1I ATGAAACAAC -/A AAAGTAAAGC 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 A 3 4 114608 CASAVA_Build 6 79791743 1I GGATAAAGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 8 9 114609 CASAVA_Build 6 79792904 1D CTTCTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 34 1 32 2 A 13 12 114610 CASAVA_Build 6 79802842 2D AATGACCATA CT/-- CTGCCTCTTT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 CT 2 1 114611 CASAVA_Build 6 79805103 3D TTTTGTCTGC TTT/--- TTTAAAAGCT 3070 hom 93 het 33 0 32 3 T 6 3 114612 CASAVA_Build 6 79805886 2D ATTAGGTATC TT/-- TATCTCCTAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 3 1 114613 CASAVA_Build 6 79807333 1I ATCTTTAGAC -/T TTTGGTAAGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 4 114614 CASAVA_Build 6 79810266 1I TAATACAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 T 14 15 114615 CASAVA_Build 6 79818357 1I AGTTAGGTGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 8 9 114616 CASAVA_Build 6 79821380 1D GATTTAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1813 het 1813 ref 31 21 4 6 T 13 12 114617 CASAVA_Build 6 79838918 1I CTTCCGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 T 10 11 114618 CASAVA_Build 6 79851752 1D GTTAATTTAT A/- ACAGATTATT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 2 1 114619 CASAVA_Build 6 79878720 1I TATAATTACA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 106 hom 44 1 40 3 T 8 9 114620 CASAVA_Build 6 79887586 1I AATGGAAAAC -/A AAAAATGTTT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 5 6 114621 CASAVA_Build 6 79937564 1D TTGTAAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 45 1 19 26 T 13 12 114622 CASAVA_Build 6 79964604 3D ACATGTAAAT ATA/--- ATTTTAAAAT 3070 hom 72 het 25 0 25 3 ATA 1 0 114623 CASAVA_Build 6 79970113 1D AAAAAAAAAA C/- TATCAGCACC 3070 het 765 hom 47 5 32 10 C 1 0 114624 CASAVA_Build 6 79979929 1D CTTAAAAACA T/- TTAAGGTTAG 3070 hom 81 het 39 0 28 11 T 3 2 114625 CASAVA_Build 6 79990176 1I TAGAGTTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 31 1 20 10 T 13 14 114626 CASAVA_Build 6 80000816 2I TAGGGGGGAC --/AG AGAGAGAGGA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 AG 4 5 114627 CASAVA_Build 6 80016264 1I TACTGATGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 200 hom 40 1 33 6 A 9 10 114628 CASAVA_Build 6 80017735 1I AAAAGCTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 9 10 114629 CASAVA_Build 6 80026380 13D TTATGTGTGA ATTTGATCCTGTT/------------- ATTTGATCCT 3070 hom 69 het 30 0 24 9 ATTTGATCCTGTT 2 1 114630 CASAVA_Build 6 80029232 1I TAGCACTCTT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 7 8 114631 CASAVA_Build 6 80029918 1I TAGTTTACAC -/A AAAGTAAGAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 3 4 114632 CASAVA_Build 6 80031637 22D4M2I AAAATTGATT GTTGATGCCCTTAACAAAACTCAACA--/----------------------AACATT AAACTAGACT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 N/A 0 0 114633 CASAVA_Build 6 80032312 1D AAGGAAAAAA C/- TCCACATGAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 0 114634 CASAVA_Build 6 80039976 3D GAATTTTTTT AAA/--- TAAAGAAAGT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 3 0 114635 CASAVA_Build 6 80044512 3D GAAGAAAAAA AAG/--- AAAGAAGAAA 3070 hom 86 het 31 0 29 3 AAG 1 0 114636 CASAVA_Build 6 80048392 1D AGAATAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 36 1 31 4 T 11 10 114637 CASAVA_Build 6 80049947 1D CTGAATCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 26 1 13 12 T 12 11 114638 CASAVA_Build 6 80050123 3I GTATTTTTTT ---/GTA GAGACAATTT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 GTA 0 1 114639 CASAVA_Build 6 80059466 1I42M1D TGTAGCCAGG -AAAAAAAAAATGAGAATTCGGTCCAAATCATAGGCAAATAATA/AAAAAAAAAAATGAGAATTCGGTCCAAATCATAGGCAAATAAT- AAAACTCAAA 3070 het 177 hom 34 2 32 9 N/A 0 0 114640 CASAVA_Build 6 80079121 1D TTACGGTGGG T/- GGGGGGGGGT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 1 0 114641 CASAVA_Build 6 80105625 2I GTCTATGGTA --/CT CTGTTATGGT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 CT 1 2 114642 CASAVA_Build 6 80112254 1I TATTTCAACA -/T TTTTTTCTTG 3070 hom 117 het 49 0 40 9 T 6 7 114643 CASAVA_Build 6 80127550 2D CAACAGGCCC CT/-- GTGTGTGATG 3070 hom 74 het 28 0 24 4 CT 1 0 114644 CASAVA_Build 6 80141052 1D AATAATTATA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 8 114645 CASAVA_Build 6 80145280 4D TTTAAAAGCA AAAC/---- AAACAGAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 12 5 AAAC 2 1 114646 CASAVA_Build 6 80147702 1D TACTTATAGT A/- CCTAAAGGTC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 1 0 114647 CASAVA_Build 6 80154907 1D TTCTATTGTT A/- AAAAAACCTG 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 A 7 6 114648 CASAVA_Build 6 80159779 2D TGAACTAATT AA/-- AAACCTCTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 5 3 114649 CASAVA_Build 6 80179921 10D TACACAATAG TACACAATAA/---------- TACACAATAA 3070 hom 69 het 25 0 24 4 TACACAATAA 2 1 114650 CASAVA_Build 6 80180169 1D AGGAGAAGGA T/- TTTTTAACAT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 6 5 114651 CASAVA_Build 6 80180796 1I AATAAATGGA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 114652 CASAVA_Build 6 80185649 1I TGAATGACTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 9 10 114653 CASAVA_Build 6 80191429 4I CTAGGGTGCA ----/CTGT CTAATTCAGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CTGT 0 1 114654 CASAVA_Build 6 80197740 8I CTTCTATTTC --------/AAAAAAAA AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 33 1 17 15 A 10 18 114655 CASAVA_Build 6 80217330 1D AAAAGGCAGA G/- GGCCCACTGA 3070 hom 126 het 48 0 42 7 G 3 2 114656 CASAVA_Build 6 80221631 1I TTCCAATTCA -/G ACGTGACCTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 0 1 114657 CASAVA_Build 6 80236502 1D CACCCAGAAG C/- CCAATGTAGA 3070 het 3070 hom 44 12 22 10 C 3 2 114658 CASAVA_Build 6 80237404 1D CAATAGACAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 7 6 114659 CASAVA_Build 6 80238475 1D TTTCATTTTT A/- TTTGTAAATA 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 A 1 0 114660 CASAVA_Build 6 80251179 1D ATCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 25 7 A 11 10 114661 CASAVA_Build 6 80266043 4D AACAATCAAT AAGG/---- AAGAAAATGC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AAGG 1 0 114662 CASAVA_Build 6 80289341 1D TGATACTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 950 hom 20 2 17 3 T 13 12 114663 CASAVA_Build 6 80322526 2I AATTCAAAAC --/AT AAAAAGGAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 114664 CASAVA_Build 6 80330849 1I CAGTTTGTGC -/T TTTTTCCTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 5 6 114665 CASAVA_Build 6 80331977 3I GTTATTTGGT ---/ATC ATCACAATGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATC 1 2 114666 CASAVA_Build 6 80351491 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 2551 het 2551 ref 24 11 8 5 A 11 12 114667 CASAVA_Build 6 80352203 1D ACTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 11 10 114668 CASAVA_Build 6 80381490 1I GCGACTGATA -/C AGGCACTAAG 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 C 0 1 114669 CASAVA_Build 6 80383037 1D AGGTAACACA G/- ACAGGCTCCG 3070 het 3070 ref 65 31 26 10 G 1 0 114670 CASAVA_Build 6 80383636 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 10 9 114671 CASAVA_Build 6 80395885 1D GGGGACCCTT A/- CAACCTCTAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 1 0 114672 CASAVA_Build 6 80404342 1I ATTCTGGAAT -/G ATACTTCAAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 G 0 1 114673 CASAVA_Build 6 80418039 2I TACATCAAAC --/AG GGGAATAAAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 AG 0 1 114674 CASAVA_Build 6 80421848 1D GCAAATTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 44 1 33 10 T 11 10 114675 CASAVA_Build 6 80433884 1I TTAGGCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 345 hom 32 1 20 11 T 13 14 114676 CASAVA_Build 6 80434427 1I TCTCAATGTT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 7 8 114677 CASAVA_Build 6 80437414 6I GTCATGTGAT ------/TACCTC TAACAATAGA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 TACCTC 0 1 114678 CASAVA_Build 6 80442261 5D TCTTCTGTTA GTTGT/----- GTTGTTCCTG 3070 het 3070 ref 34 17 17 2 GTTGT 2 1 114679 CASAVA_Build 6 80449900 1I AACATCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2147 hom 39 8 17 14 T 13 14 114680 CASAVA_Build 6 80470171 1D ATTATGAATA T/- ATCACATGTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 1 0 114681 CASAVA_Build 6 80472584 1D ATATTTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 12 11 114682 CASAVA_Build 6 80479959 1D AAAATACCGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 10 9 114683 CASAVA_Build 6 80490675 1D TCTCTTGTAA G/- GACTAAGTTG 3070 het 3070 ref 59 31 24 5 G 2 1 114684 CASAVA_Build 6 80505645 29D GTATTATATT GTGTTATTATTGTGTTACTTAATACAGTA/----------------------------- TTATTGTGTT 3070 het 3070 ref 40 26 19 4 GTGTTATTATTGTGTTACTTAATACAGTA 1 0 114685 CASAVA_Build 6 80511518 1I CTCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2044 hom 41 10 11 20 A 14 15 114686 CASAVA_Build 6 80514910 1D AAAAAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 T 12 11 114687 CASAVA_Build 6 80524775 1I GCCTCTGCTG -/T TAACAACATC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 1 2 114688 CASAVA_Build 6 80545067 1I AAATCCTCTA -/T TTTTTTCGCA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 6 7 114689 CASAVA_Build 6 80545879 2D CAGCCAGCAT AA/-- AGGCTATGTA 3070 het 3070 ref 56 31 20 6 A 3 1 114690 CASAVA_Build 6 80570285 17I CCATCCTGAG -----------------/CTCTCTGATATGCCATC CTGCAGGGCA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 CTCTCTGATATGCCATC 0 1 114691 CASAVA_Build 6 80577994 1D TTTCTGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 25 14 8 A 11 10 114692 CASAVA_Build 6 80583960 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2440 het 2440 ref 20 9 7 4 A 11 12 114693 CASAVA_Build 6 80593165 2I CAACCTTCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 32 0 22 10 A 11 13 114694 CASAVA_Build 6 80595784 1I TGTAATTCAT -/C ATTTTGTTTA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 C 0 1 114695 CASAVA_Build 6 80602423 1D CAGGAATTTT G/- TAAGCCAATT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 1 0 114696 CASAVA_Build 6 80620861 2D GTCATGGAGT GG/-- GGCAGGGAGG 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 G 4 2 114697 CASAVA_Build 6 80626099 12D GGCTAGGCCA CAGTATCCAGAT/------------ ATTTGGTCAA 3070 het 3070 ref 43 24 19 1 CAGTATCCAGAT 1 0 114698 CASAVA_Build 6 80635278 3D CTGGACAATA TTG/--- TTGTTAACCA 3070 het 3070 hom 40 17 15 9 TTG 2 1 114699 CASAVA_Build 6 80635462 1D GTCAACGGAC T/- TTTTTTTTTT 1848 het 1592 hom 30 9 7 14 T 19 18 114700 CASAVA_Build 6 80647091 1D GTTCTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 45 1 38 6 A 11 10 114701 CASAVA_Build 6 80652115 1I GTACTGGCTT -/A AAAACAGACA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 4 5 114702 CASAVA_Build 6 80656146 12I GTGATTGTAG ------------/GACCCAGTCCTA CAGTGAGTAT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 GACCCAGTCCTA 0 1 114703 CASAVA_Build 6 80656350 1I CTCCTATCTA -/C AAAAAATTAG 3070 hom 51 het 20 0 17 11 C 0 1 114704 CASAVA_Build 6 80659234 3D AGTAGAACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 30 0 28 2 T 13 10 114705 CASAVA_Build 6 80663134 1I ATTCTCATTT -/C TAAGGATTGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 114706 CASAVA_Build 6 80663601 1D TAATGTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 11 10 114707 CASAVA_Build 6 80663895 1I GTACTCAATA -/G AAGTAATAAT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 G 0 1 114708 CASAVA_Build 6 80665386 1I AAAAAATAAA -/T AAATAAATAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 0 1 114709 CASAVA_Build 6 80665576 2D AAAACTAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 22 1 18 3 A 13 11 114710 CASAVA_Build 6 80670779 9D TGCCTCAGTT ATTATTTAA/--------- ACTGGAGAGG 3070 hom 96 het 33 0 33 3 ATTATTTAA 1 0 114711 CASAVA_Build 6 80678909 1I71M1I CAATCTTGTA -TTAAATTGAGAAATAATAATTTCAAGATCCTATGTTTTTAGAAATAGCCATATTATTTAAACCTTTCAAGA-/TTTAAATTGAGAAATAATAATTTCAAGATCCTATGTTTTTAGAAATAGCCATATTATTTAAACCTTTCAAGAT TTTTTTGTAT 3070 hom 154 het 39 0 52 4 N/A 0 0 114712 CASAVA_Build 6 80685547 7I TCTATTCATA -------/CATAAAT CTACGTACTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CATAAAT 0 1 114713 CASAVA_Build 6 80707449 1D AAAAAGAACT A/- AATAAGAATC 3070 hom 90 het 38 0 31 8 A 3 2 114714 CASAVA_Build 6 80716132 2D ATCTGCAAAC TT/-- TGAGAACAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 3 1 114715 CASAVA_Build 6 80728043 1D GTTAGAAAAG A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 8 7 114716 CASAVA_Build 6 80735843 1I AGATTGGGAG -/A AAATATTAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 3 4 114717 CASAVA_Build 6 80737154 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 10 9 114718 CASAVA_Build 6 80737449 2D GCCCAGCTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 62 het 26 0 21 6 TG 10 9 114719 CASAVA_Build 6 80738112 2I TTACATGTAG --/AT ATGTTTACAG 3070 hom 149 het 56 0 50 6 AT 1 2 114720 CASAVA_Build 6 80738905 1I CAGAGAAACC -/A CCCCCCCCCA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 0 1 114721 CASAVA_Build 6 80741133 2I CGACTCAAAC --/AT GTGTGTCCAA 3070 hom 108 het 41 0 34 7 AT 0 1 114722 CASAVA_Build 6 80757917 4D AGAAAGAAAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 885 het 885 ref 21 7 10 4 AGAA 5 4 114723 CASAVA_Build 6 80758623 4I3M1D GCTCAGAATG ----CCAC/GAGTGCA- TTGGCATGAT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 N/A 0 0 114724 CASAVA_Build 6 80767198 2D CTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 CA 11 10 114725 CASAVA_Build 6 80771993 1D CTCTATCATA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 56 24 25 7 T 8 7 114726 CASAVA_Build 6 80777207 2I GGGTGGTGGG --/TA CATTTTACTG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 TA 0 1 114727 CASAVA_Build 6 80781626 3I GGATTTAAAT ---/GGG GGGAAATAAT 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 G 3 6 114728 CASAVA_Build 6 80792428 3D GTCTACATTT GAG/--- GAGAAGGGAA 3070 het 3070 ref 43 23 20 0 GAG 2 1 114729 CASAVA_Build 6 80805828 4I TGGGGAAAAC ----/AAGT AAACTTAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 AAGT 0 1 114730 CASAVA_Build 6 80812555 5I ATTTTTGCAA -----/TTAAC TTCATCAGGG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 TTAAC 0 1 114731 CASAVA_Build 6 80812901 4D TAAGAAAGTG TCTT/---- TCTATTTTAC 3070 het 3070 hom 46 16 28 3 TCTT 1 0 114732 CASAVA_Build 6 80814374 1D TCAAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 1792 het 1792 ref 26 8 5 13 T 15 14 114733 CASAVA_Build 6 80821609 3D GCCCAGAGTT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 TTC 4 3 114734 CASAVA_Build 6 80822722 1D CGTCCCAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 10 9 114735 CASAVA_Build 6 80823931 1D TTTGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3009 het 3009 ref 29 18 8 3 A 11 10 114736 CASAVA_Build 6 80825490 4I CAAATTTTTC ----/TTTA TTTATTTATG 3070 het 3070 hom 43 14 25 4 TTTA 2 3 114737 CASAVA_Build 6 80828647 2I AGACACTGAG --/TT TGTGACTTCT 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 T 1 3 114738 CASAVA_Build 6 80829924 1D GTATTAGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 10 9 114739 CASAVA_Build 6 80850423 1D AATTAGTTAC A/- AGGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 18 5 A 2 1 114740 CASAVA_Build 6 80851721 2D CACGAGGTCA GG/-- AGATCGAGAC 1205 hom 7 het 5 0 3 2 G 2 0 114741 CASAVA_Build 6 80857285 1I AAATACAAGT -/A AAATATAGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 3 4 114742 CASAVA_Build 6 80860699 1I TAATTGTGAC -/T TTTTTTGGGC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 6 7 114743 CASAVA_Build 6 80861495 1D ATTTATTTTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 T 7 6 114744 CASAVA_Build 6 80865976 1D TGCCTGTCTG C/- CCCTTTGCTC 3070 het 3070 hom 53 24 24 8 C 4 3 114745 CASAVA_Build 6 80867868 1I TTTTAGCATA -/T GAGCAAAGTT 3070 het 3070 hom 20 7 11 2 T 0 1 114746 CASAVA_Build 6 80882354 3I TCTAAGGAAT ---/ATG ATGAGGATGT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 ATG 1 2 114747 CASAVA_Build 6 80885213 1D AAGGATCCAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 10 9 114748 CASAVA_Build 6 80886304 1D TTTTTTCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 10 9 114749 CASAVA_Build 6 80916421 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 340 hom 20 1 15 4 A 9 10 114750 CASAVA_Build 6 80917856 1D TAAAACTAAC T/- TTTTTTTTTT 2662 het 566 hom 24 5 7 12 T 13 12 114751 CASAVA_Build 6 80920190 4D AGATCAGCTC TGAT/---- TGATAGCCAG 3070 het 3070 hom 51 19 30 3 TGAT 2 1 114752 CASAVA_Build 6 80927712 5D4M7D ATTATATATT TTAGGAATATTAATTT/-----AAAA------- TTTATACTAC 3070 het 3070 ref 30 21 11 2 N/A 0 0 114753 CASAVA_Build 6 80961600 1I ATTCTACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 10 11 114754 CASAVA_Build 6 80963827 1I TTTCTTATTG -/T TAAGTATGGT 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 T 1 2 114755 CASAVA_Build 6 80967342 1D AAAAATGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 8 7 T 12 11 114756 CASAVA_Build 6 80970402 5I CTAGCTACAT -----/GTATA GTAAATTATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 GTATA 0 1 114757 CASAVA_Build 6 80972734 1D CGCAGCAGAG C/- CAAGGAGTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 C 2 1 114758 CASAVA_Build 6 80976677 4I GGATCAATAA ----/TAAG TAAGTATAAT 3070 hom 26 het 39 2 36 1 TAAG 1 2 114759 CASAVA_Build 6 80990837 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 10 11 114760 CASAVA_Build 6 80999117 4I TAAATATAAA ----/TATT TATAAATGTA 1960 het 664 hom 6 2 4 0 TATT 0 1 114761 CASAVA_Build 6 80999206 2I TAGATATAAC --/AT ATCTATATCT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 AT 1 2 114762 CASAVA_Build 6 81001266 2I GACAATGTTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 TA 7 8 114763 CASAVA_Build 6 81002605 5D GAATTATTGC CTCTT/----- CTCTTTAACT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 CTCTT 2 1 114764 CASAVA_Build 6 81011523 1I TCTTCTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 T 10 11 114765 CASAVA_Build 6 81016705 1D ATCTTTACTT C/- TGGCATTTAC 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 C 1 0 114766 CASAVA_Build 6 81029969 1I ACCCAAAAGA -/T TTTTAAGCCT 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 T 4 5 114767 CASAVA_Build 6 81038287 1I TTGTCAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2406 hom 26 6 15 5 T 10 11 114768 CASAVA_Build 6 81043475 1D CTTATCTTAC A/- TTCCCATCTG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 1 0 114769 CASAVA_Build 6 81043960 1I CTGCATAATG -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 6 7 114770 CASAVA_Build 6 81047083 1I GTATATAAAT -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 5 6 114771 CASAVA_Build 6 81054529 1D ACTTAAAAGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 9 8 114772 CASAVA_Build 6 81065512 1D TGAAAGGGTC T/- TTCTAACTCC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 3 2 114773 CASAVA_Build 6 81071868 1D TGACTTAATT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 A 8 7 114774 CASAVA_Build 6 81088675 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 700 het 445 hom 24 5 3 16 T 17 16 114775 CASAVA_Build 6 81096547 1D GTGATCTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1569 hom 24 5 16 3 A 12 11 114776 CASAVA_Build 6 81098392 1I ATGCTCATTT -/G GGGGGGGACT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 G 7 8 114777 CASAVA_Build 6 81101640 1D TGGTGGTGTT A/- AGACTGCTAG 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 A 2 1 114778 CASAVA_Build 6 81107201 1D GGATTCGGTA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 T 8 7 114779 CASAVA_Build 6 81113370 1D AAGGTCTCTA C/- CCCCATAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 5 4 114780 CASAVA_Build 6 81116829 1D AAATAGTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 31 0 22 9 T 10 9 114781 CASAVA_Build 6 81117102 3D AAAAGTCCTT TTG/--- TTTCTTGCTG 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 TTG 1 0 114782 CASAVA_Build 6 81119976 2D CTAAAATGTG TT/-- TTTTTTTGTC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 T 9 7 114783 CASAVA_Build 6 81120314 4D AGTAAAATAA TAGT/---- AGCCATTCTG 3070 hom 24 het 11 0 9 5 TAGT 1 0 114784 CASAVA_Build 6 81122092 1D GTATTTTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 7 114785 CASAVA_Build 6 81123415 6I ACGATTTGTT ------/AAACTC AGAAGGGAAG 1315 hom 7 het 3 0 3 0 AAACTC 0 1 114786 CASAVA_Build 6 81126026 3D TTGTTTCTTA TTG/--- TTGTTGTTTG 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 TTG 3 2 114787 CASAVA_Build 6 81132189 5D ATTAAGAGAT TAAAG/----- TAAAGAGAGA 3070 het 3070 ref 25 16 9 2 TAAAG 2 1 114788 CASAVA_Build 6 81134271 1D CAGGAATGGT G/- GGGCATGCAC 3070 hom 151 het 55 0 51 4 G 4 3 114789 CASAVA_Build 6 81135455 1I9M1I TCTCAAAAAA -AAAAAAAAC-/GAAAAAAAACG AAAAGAAAAG 3070 het 46 hom 14 2 12 2 N/A 0 0 114790 CASAVA_Build 6 81135560 10D CTTTGTTGTA ATTTGATGTT/---------- GAAATTGTAA 3070 hom 69 het 25 0 23 5 ATTTGATGTT 1 0 114791 CASAVA_Build 6 81136369 5D TTATTTATGA TATGT/----- TATAGTAATC 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 TATGT 1 0 114792 CASAVA_Build 6 81139772 5D ATCTTCTCTC TTCTT/----- TTCTTGGTTA 3070 het 3046 hom 35 11 19 7 TTCTT 2 1 114793 CASAVA_Build 6 81144495 1I TACTGCAAAA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 6 7 114794 CASAVA_Build 6 81146208 1I ATCAATTTAC -/A ATAATTAGTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 1 2 114795 CASAVA_Build 6 81148346 13D AACCTGATTA AAACCTAAAACCT/------------- AAAACGGTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 6 AAACCTAAAACCT 1 0 114796 CASAVA_Build 6 81150487 3I AAGTTAACAT ---/AGA AGGAGTGATG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AGA 0 1 114797 CASAVA_Build 6 81153815 1I AAAATAGTAA -/G TCAAAAACAA 3070 hom 33 het 19 0 11 8 G 0 1 114798 CASAVA_Build 6 81156763 1I CTCCGCCAGG -/A AAAAAAACTC 3070 hom 48 het 20 0 15 5 A 7 8 114799 CASAVA_Build 6 81159956 4D TTTCACCAGA CACT/---- CAATCTGCTG 3070 het 3070 hom 41 19 20 4 CACT 1 0 114800 CASAVA_Build 6 81164695 1I ATTGAGAAAC -/A AAAAATCACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 5 6 114801 CASAVA_Build 6 81169490 1I TATAGCTTCG -/T TTTTTTCTCG 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 6 7 114802 CASAVA_Build 6 81172075 1I GATTTAATAA -/T TTTTTTGCAG 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 T 6 7 114803 CASAVA_Build 6 81175240 1D TTTTTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 11 10 114804 CASAVA_Build 6 81198422 1I TTCTGGGTTG -/A AAAATTATAT 3070 het 2497 hom 14 6 8 0 A 4 5 114805 CASAVA_Build 6 81199669 1D TCAGGCGGGG A/- CGTATAAGTC 2231 het 2231 ref 22 14 5 6 A 1 0 114806 CASAVA_Build 6 81256183 1I TCATGATTTT -/A GTATTATTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 0 1 114807 CASAVA_Build 6 81258273 4I GCACAGAAGA ----/TTGT TTGGGCAGTG 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 TTGT 0 1 114808 CASAVA_Build 6 81265090 6D ATGATCCTGG TAAGGA/------ TAAGGATAAG 3070 het 3070 ref 51 23 23 6 TAAGGA 2 1 114809 CASAVA_Build 6 81266332 1D ACGGAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 15 5 A 12 11 114810 CASAVA_Build 6 81266678 3D TGAAAATACT AGA/--- AGGACACTAA 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 AGA 1 0 114811 CASAVA_Build 6 81267209 4I AAGATTTCTC ----/AAAG AACTAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 AAAG 0 1 114812 CASAVA_Build 6 81271963 4I TTACAAAAAT ----/AGAC AGATCCAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 AGAC 0 1 114813 CASAVA_Build 6 81273110 1I ATTAAATGCC -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 T 6 7 114814 CASAVA_Build 6 81273315 1I TTTTAAAAAG -/T TTTAGCACAG 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 T 3 4 114815 CASAVA_Build 6 81274729 1D TGCATTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 12 11 114816 CASAVA_Build 6 81275206 1I CCTGGAAAAA -/C CCAACTGAGA 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 C 2 3 114817 CASAVA_Build 6 81280363 2D GCCTCTACTC TA/-- TTATTGTACA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 TA 1 0 114818 CASAVA_Build 6 81286133 4D TCTTTGAAAC AAAT/---- AAAATTAGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 6 AAAT 1 0 114819 CASAVA_Build 6 81291552 1I ATCCTCAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 114820 CASAVA_Build 6 81304759 1D TCGTTTTATC T/- TTTTTTTATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 7 114821 CASAVA_Build 6 81327023 1D CCTATTAGTT G/- ATTGGAAATT 3070 hom 99 het 39 0 33 8 G 1 0 114822 CASAVA_Build 6 81327274 1D ATACTTTTTT C/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 C 1 0 114823 CASAVA_Build 6 81327741 1D TGAAATTCCT A/- AAGATTACTT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 3 2 114824 CASAVA_Build 6 81328181 1I CATTGAACAT -/A AAATATTTTG 3070 hom 120 het 49 0 41 8 A 3 4 114825 CASAVA_Build 6 81332738 4D GAGCTAAGTT TGAC/---- TGTAGTTCAG 3070 hom 90 het 32 0 31 3 TGAC 1 0 114826 CASAVA_Build 6 81342735 1I TGAGAATGGG -/A AAAAAATTGG 3070 het 404 hom 26 1 24 1 A 6 7 114827 CASAVA_Build 6 81362184 2D TTTATGAGAC TT/-- TGTATCTGAA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 3 1 114828 CASAVA_Build 6 81369098 1D AAGGCTTTCA G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 17 9 G 1 0 114829 CASAVA_Build 6 81376007 4D TTGTCTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2919 het 2919 ref 33 19 8 8 TTTG 3 2 114830 CASAVA_Build 6 81382931 1I CAACTTACAA -/G GGTTTGTGAA 2988 het 2988 ref 23 14 7 2 G 2 3 114831 CASAVA_Build 6 81388610 4D ATGCCATTAA TAAT/---- TAATAATTTT 3070 het 3070 ref 43 27 14 2 TAAT 2 1 114832 CASAVA_Build 6 81394500 1D ATTAACTTAA T/- TAAAGAAGTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 2 1 114833 CASAVA_Build 6 81394805 3D CAAAAAAACT GGA/--- GGAGGTATCA 3070 hom 84 het 29 0 29 2 GGA 2 1 114834 CASAVA_Build 6 81396483 1D TAATAGGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 16 5 A 12 11 114835 CASAVA_Build 6 81399694 1D CAGATACACA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 8 7 114836 CASAVA_Build 6 81411215 1D TTATGCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 48 0 35 13 T 12 11 114837 CASAVA_Build 6 81420735 1I AAGAAAAAAA -/T ATGATGGTAG 2336 het 2336 ref 32 15 9 8 T 0 1 114838 CASAVA_Build 6 81421193 1D GATGTGGTGT G/- GGGTTTTATG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 G 4 3 114839 CASAVA_Build 6 81421538 1D AGGGATGGTA T/- TTATAATTAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 3 2 114840 CASAVA_Build 6 81424939 2I AAATTCTAAC --/TG TGTTGTTGTG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 TG 1 2 114841 CASAVA_Build 6 81429518 1D TATATTTTAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 2643 hom 17 7 10 0 A 8 7 114842 CASAVA_Build 6 81429945 1D TTGTGATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 948 hom 14 3 7 4 T 11 10 114843 CASAVA_Build 6 81430838 3I AAAAAAAGAA ---/TTC TTCTTTTCAC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TTC 1 2 114844 CASAVA_Build 6 81434442 1D CATGGTCAGT G/- GTACATGGAC 3070 het 3070 ref 36 16 18 3 G 2 1 114845 CASAVA_Build 6 81437975 1I ACCTCTAAAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 8 9 114846 CASAVA_Build 6 81438733 1D CGAATTTTAT A/- GTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 A 1 0 114847 CASAVA_Build 6 81440236 2D ATTCTCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 12 10 114848 CASAVA_Build 6 81443858 4D ACTGTGAGTT AAAA/---- AAAAACCCAG 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 9 5 114849 CASAVA_Build 6 81465382 1D TCACGACAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1830 hom 16 4 12 0 T 10 9 114850 CASAVA_Build 6 81471293 3I TTCTCAACAA ---/TTT TATAGAAGAT 3070 het 3070 ref 67 34 27 6 T 1 4 114851 CASAVA_Build 6 81475634 6D TCATCTCTTG ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 40 het 31 0 17 15 AT 12 9 114852 CASAVA_Build 6 81478361 2D ACACACACAC AT/-- ACATATATAT 186 hom 7 het 4 0 3 2 AT 1 0 114853 CASAVA_Build 6 81482313 2D GTGGCATGCA AG/-- AGAGAAAGAG 3070 hom 120 het 45 0 40 6 AG 3 2 114854 CASAVA_Build 6 81482569 2I GAAATAAAAC --/AT ATGCTATGAG 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 AT 1 2 114855 CASAVA_Build 6 81484469 1D TTACTACTAG T/- TTTTTTATTA 3070 hom 63 het 26 0 21 6 T 7 6 114856 CASAVA_Build 6 81488544 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 39 1 33 5 T 13 12 114857 CASAVA_Build 6 81489597 1I GTTTTATCTC -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 6 7 114858 CASAVA_Build 6 81493325 4I TTAAAATGAC ----/AAAA TAACAGGGCA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 0 4 114859 CASAVA_Build 6 81494288 1D TAAAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 794 het 794 ref 24 15 4 5 A 13 12 114860 CASAVA_Build 6 81495200 1I TAGCCTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 34 1 22 11 A 11 12 114861 CASAVA_Build 6 81504907 1I CCTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 2491 het 2491 ref 39 12 12 15 T 14 15 114862 CASAVA_Build 6 81506411 11D TTTCGAGGTC TTATTAATAAA/----------- ATGTTTTCCC 3070 het 3070 ref 36 20 17 2 TTATTAATAAA 1 0 114863 CASAVA_Build 6 81510800 1D TTTTGATAGG T/- TTAAGAGAAT 3070 het 2032 hom 31 6 19 6 T 3 2 114864 CASAVA_Build 6 81510822 1D CAGTTTTATT A/- AAAAAAAACT 3070 het 1082 hom 31 4 16 11 A 9 8 114865 CASAVA_Build 6 81516804 4D ATATAATAAT AATA/---- AAAAAAAAGG 3070 het 1892 hom 18 5 12 2 AATA 1 0 114866 CASAVA_Build 6 81517266 1D TTTATTCTCC T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 52 25 22 5 T 7 6 114867 CASAVA_Build 6 81518507 6D CCTGCTTCTC TCCCAT/------ TTCCTCGTTT 3070 het 3070 ref 45 20 21 6 TCCCAT 1 0 114868 CASAVA_Build 6 81521326 1D ATGAATTTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 8 7 114869 CASAVA_Build 6 81524172 1D TATTTTGTAG T/- TTTTTAGTCT 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 T 6 5 114870 CASAVA_Build 6 81525481 1D TAACTCCACT C/- CCCCCCAAAT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 C 7 6 114871 CASAVA_Build 6 81525616 1I GTTATTTACA -/C ACCACCATTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 0 1 114872 CASAVA_Build 6 81531485 3D GCCAAAACTA ATT/--- ATTCAATTTA 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 ATT 2 1 114873 CASAVA_Build 6 81536800 1I AAATGAGCTA -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 7 8 114874 CASAVA_Build 6 81537852 1I TGTTGGTCAA -/G TTTTTAGTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 114875 CASAVA_Build 6 81538750 6I CATCAACACT ------/TATTAA TATTATCTGG 3070 hom 78 het 31 0 24 7 TATTAA 0 1 114876 CASAVA_Build 6 81540575 1I CCAGGTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2750 hom 31 12 11 8 T 11 12 114877 CASAVA_Build 6 81552118 1D CCTGAAGAAC T/- GTAAGTCAAT 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 T 1 0 114878 CASAVA_Build 6 81553799 8I ATATTTTAAT --------/ATAAGCAA ATAAGCAAAT 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 ATAAGCAA 1 2 114879 CASAVA_Build 6 81553866 4I TGTTTTTGTC ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TGTT 3 4 114880 CASAVA_Build 6 81555361 2I AGATATTATT --/AA AAGATTTTAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 4 114881 CASAVA_Build 6 81560543 5D TTACCCAACT TAACC/----- TAACCTTTAA 3070 hom 93 het 33 0 32 6 TAACC 2 1 114882 CASAVA_Build 6 81573041 2D TCTCTCTCTC TG/-- TGTGTGTGTC 498 het 498 ref 32 14 2 16 TG 5 4 114883 CASAVA_Build 6 81574375 2D AAGTTTTAAC AA/-- AGAGAGATGG 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 3 1 114884 CASAVA_Build 6 81584986 1D GGTATTACTG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 9 8 114885 CASAVA_Build 6 81586793 1D GGTCTCCTCA G/- TGACTGCCCT 3070 het 3070 hom 27 12 14 4 G 1 0 114886 CASAVA_Build 6 81594348 1D TATAGAATTT A/- AAAAAAGATC 3070 hom 76 het 41 1 36 4 A 7 6 114887 CASAVA_Build 6 81594741 1I TAATAAGTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 T 8 9 114888 CASAVA_Build 6 81600253 1D ACCACAGCAC T/- TTTCCTCAAA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 4 3 114889 CASAVA_Build 6 81601685 1I AAGATACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 T 10 11 114890 CASAVA_Build 6 81601812 1I AGAATTCAGA -/T TTTTTTTTTT 1931 het 1931 ref 26 17 8 2 T 11 12 114891 CASAVA_Build 6 81608182 4I TACAAAATGG ----/AAAC AAACATTGGT 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 AAAC 1 2 114892 CASAVA_Build 6 81608391 4I TGATATAACC ----/AAAG AAAGAATGTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AAAG 1 2 114893 CASAVA_Build 6 81608952 4D GCCTTATAAA AGTC/---- AGTCATCGAC 3070 hom 69 het 27 0 24 7 AGTC 2 1 114894 CASAVA_Build 6 81610851 2D TAGCTGTGGA CT/-- CTGAAGTGGT 3070 het 3070 hom 55 23 25 8 CT 2 1 114895 CASAVA_Build 6 81622355 7D CCAATGGAAC AGAATAG/------- AGAGCCTAGA 3070 het 3070 ref 41 19 17 8 AGAATAG 1 0 114896 CASAVA_Build 6 81624128 1D ACCATTTTGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 40 17 17 8 A 8 7 114897 CASAVA_Build 6 81626329 3D AAACACAGGT CTC/--- CTCCTACTGT 3070 het 3070 hom 59 27 28 5 CTC 2 1 114898 CASAVA_Build 6 81631060 2I AAGATAGAAC --/AT ATATATATAT 2720 het 2720 ref 25 12 8 5 AT 7 8 114899 CASAVA_Build 6 81631153 1D AACAAATTAT A/- AAAAATTGAA 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 A 6 5 114900 CASAVA_Build 6 81634718 1D CATGCTTGTA T/- TTTTTTTGGG 2773 het 87 hom 25 3 10 12 T 8 7 114901 CASAVA_Build 6 81637049 1I GATCTTTGAC -/A AACCAAACAA 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 A 2 3 114902 CASAVA_Build 6 81637479 1D AATCACCAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 9 8 114903 CASAVA_Build 6 81637656 2I TGACCATAAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 9 11 114904 CASAVA_Build 6 81640659 5D TTATTTTTTC TTATA/----- TTATGCTAAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 4 TTATA 1 0 114905 CASAVA_Build 6 81641088 5D CAGTTTTTCA CTTTT/----- CTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 38 17 18 7 CTTTT 2 1 114906 CASAVA_Build 6 81641608 2D TGTGTATGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TG 8 7 114907 CASAVA_Build 6 81642145 1D GATTCTGTTG T/- TAACAGCATG 3070 het 3070 ref 44 22 21 1 T 2 1 114908 CASAVA_Build 6 81642429 1I TTATTTTATT -/A ATTATACTTT 3070 het 3070 hom 29 9 19 1 A 1 2 114909 CASAVA_Build 6 81645450 8I TTTTATGTAT --------/TTATGTAC TTATGTATTT 1646 het 393 hom 20 5 6 9 TTATGTAC 0 1 114910 CASAVA_Build 6 81646920 1I GCATTTATTA -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 6 7 114911 CASAVA_Build 6 81650031 1D TTTGGTATGA G/- GTAAAAGTTC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 G 2 1 114912 CASAVA_Build 6 81652075 1D ATTCTCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 11 10 114913 CASAVA_Build 6 81653056 1I AGTGAAGGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 8 9 114914 CASAVA_Build 6 81653663 1D TGAGGTTTTG T/- TTTGGAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 T 4 3 114915 CASAVA_Build 6 81662218 1I CTGATCTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 A 10 11 114916 CASAVA_Build 6 81663228 4I TTGCTTTGTG ----/TTTC TTTCTAATTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TTTC 1 2 114917 CASAVA_Build 6 81669059 5I AATGACAAAT -----/ATATA ATATCACTCA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 ATATA 0 1 114918 CASAVA_Build 6 81673951 1I GTGGAAGCAC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 0 1 114919 CASAVA_Build 6 81680160 1D TAGTTTTTGA T/- TTTTTAAATT 2893 het 2893 ref 24 12 11 1 T 6 5 114920 CASAVA_Build 6 81680473 1I ATTTCATTGA -/T TTTTCTCAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 4 5 114921 CASAVA_Build 6 81682700 1D GACAGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1418 het 1418 ref 30 15 6 9 T 11 10 114922 CASAVA_Build 6 81689366 7D TATTTTTATC TGAAATG/------- TGGCTTACAT 3070 het 3070 ref 44 26 15 6 TGAAATG 1 0 114923 CASAVA_Build 6 81691352 3D CCAGCCTTAA AAT/--- AATACTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 12 6 AAT 2 1 114924 CASAVA_Build 6 81693995 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 12 11 114925 CASAVA_Build 6 81694760 2D TCAGCTAAAC AG/-- AGAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 AG 4 3 114926 CASAVA_Build 6 81711095 1I TTTTCTTCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 10 11 114927 CASAVA_Build 6 81719113 4D TGAGACTTAC TCAG/---- AAGATCTTAC 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 TCAG 1 0 114928 CASAVA_Build 6 81719263 2I CAGCCAAACC --/AT ATCACTGTGC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AT 1 2 114929 CASAVA_Build 6 81719962 1D TAGATTGCCG T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 T 7 6 114930 CASAVA_Build 6 81721869 3I ATAAAATAAG ---/TGT TGTTACAGTA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 TGT 1 2 114931 CASAVA_Build 6 81724011 1I CAGGAACTCT -/C CCGTACTATT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 C 2 3 114932 CASAVA_Build 6 81724775 3D TTAAAAAAAT AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 AAG 4 3 114933 CASAVA_Build 6 81728125 2I CATTTGATTT --/TA TATATATATA 1778 hom 17 het 13 0 6 7 TA 8 9 114934 CASAVA_Build 6 81734958 4I CCTCTTACTT ----/TGTC TGTCTCACCA 3070 hom 102 het 39 0 33 6 TGTC 1 2 114935 CASAVA_Build 6 81740966 5D AGCATAGAAA TAACT/----- TAAAGTTGGA 3070 het 3070 ref 33 17 12 7 TAACT 1 0 114936 CASAVA_Build 6 81743132 3I GGAAAAGAGG ---/TCT TCTTACTCGT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 TCT 1 2 114937 CASAVA_Build 6 81744761 2D TGTCACCCCT TC/-- TCTCAATCCT 3070 het 3070 hom 53 22 25 7 TC 3 2 114938 CASAVA_Build 6 81746201 2D GAAAAAGCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2950 het 2807 hom 32 12 10 10 A 12 10 114939 CASAVA_Build 6 81746503 1D AAAATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 24 2 20 2 A 11 10 114940 CASAVA_Build 6 81747682 4D AAGTGAAAAT AGTC/---- AGTTCCTGCC 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 AGTC 1 0 114941 CASAVA_Build 6 81752560 1D GTACCCTGTA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 1975 hom 21 5 12 4 T 9 8 114942 CASAVA_Build 6 81753871 4D GAAAGATCTC AAAT/---- AAATAACCAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 AAAT 2 1 114943 CASAVA_Build 6 81754491 1D TTAAATGTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 9 8 114944 CASAVA_Build 6 81757680 1I GGCAAACCCC -/A CAAGCAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 0 1 114945 CASAVA_Build 6 81774428 1D TCTTTACTAT G/- GGTGACTCAA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 G 3 2 114946 CASAVA_Build 6 81786722 1D TAAAGGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 37 1 33 3 T 11 10 114947 CASAVA_Build 6 81787909 1D TTAAGCCACT A/- AGAGGTATAA 3070 hom 150 het 57 0 50 7 A 2 1 114948 CASAVA_Build 6 81792149 1D TCCCAAGACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 A 10 9 114949 CASAVA_Build 6 81797547 7I CAGAGAGAAT -------/GAAAAAC CATATTTATC 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 GAAAAAC 0 1 114950 CASAVA_Build 6 81800742 5I AATTGGGATA -----/ATTAC ATTGATCATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 ATTAC 0 1 114951 CASAVA_Build 6 81803067 11D ACCTATGTAA GGATTTACATG/----------- GGAGAAATAA 3070 het 3070 ref 35 19 17 6 GGATTTACATG 1 0 114952 CASAVA_Build 6 81806816 3D TGGTCATTAC ACT/--- AATGATCATT 3069 het 3040 hom 15 8 7 0 ACT 1 0 114953 CASAVA_Build 6 81813135 1I TATTTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 10 11 114954 CASAVA_Build 6 81823781 1I GTAAAATATA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 T 6 7 114955 CASAVA_Build 6 81828779 1I GTTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 24 0 17 7 T 12 13 114956 CASAVA_Build 6 81832643 3D GTTATTAAAA GAT/--- GAACTGTTTT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 GAT 1 0 114957 CASAVA_Build 6 81846832 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCCCAGC 3070 het 3070 hom 35 12 11 12 C 8 7 114958 CASAVA_Build 6 81852712 4I TCACTTTAAT ----/TAAG TATGTTTAGG 2325 het 980 hom 12 2 7 3 TAAG 0 1 114959 CASAVA_Build 6 81852805 1I GACAAGTATA -/T TTTATCAGTC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 3 4 114960 CASAVA_Build 6 81858183 1I AAAGAATTCT -/A ATTGCTCCAC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 1 2 114961 CASAVA_Build 6 81858767 2I ATCCGGCTAA --/TT TTTTGTATTT 3070 het 1267 hom 17 5 10 2 T 4 6 114962 CASAVA_Build 6 81862901 1D CTATTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 1534 het 1534 ref 33 23 4 7 A 15 14 114963 CASAVA_Build 6 81870779 2I GTGTTGATAC --/TT TTTTTTTATT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 7 9 114964 CASAVA_Build 6 81870892 2D TTTATTTTTT TA/-- AAAAAAACAG 3070 hom 138 het 49 0 47 4 TA 1 0 114965 CASAVA_Build 6 81872145 2I TTCATCTTTC --/CT CTTTCACTTT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 CT 1 2 114966 CASAVA_Build 6 81873637 5D60M5D TTAATATATT TAAAATAAAAGACTTTTTATTCACATTCTTATACGTTTGGTATGTTTGCTTTGTATGTACATGTTTTTAC/-----TAAAAGACTTTTTATTCACATTCTTATACGTTTGGTATGTTTGCTTTGTATGTACATGTT----- TTTACTGAAA 3070 het 3070 hom 37 11 37 5 N/A 0 0 114967 CASAVA_Build 6 81874887 1I90M1D TTTTGATTCT -AAAAAAAATCCAGCTCTGCAAGTCTCTGACTGTAAATTAAGAGAAATTTGATTGATCTCAGAAATATAATACTTTTTTTGTTTAATAAAAG/AAAAAAAAATTCAGCTCTGCAAGTCTCTGACTGTAAATTAAGAGAAATTTGATTGATCTCAGTAATATAATACTTTTTTTGTTTAATAAAA- TTTTTTGGTT 3070 het 466 hom 25 3 31 18 N/A 0 0 114968 CASAVA_Build 6 81876439 3I TTCGCGGTCA ---/TTG TTGTTGATTC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TTG 2 3 114969 CASAVA_Build 6 81878486 1I15M1D AGCTACTCTG -TTTTTTTATATATATA/TTTTTTTTATATATAT- TTTTTTATTA 3070 hom 30 het 10 0 11 2 N/A 0 0 114970 CASAVA_Build 6 81880597 1I TTTTTGCCCA -/T TCAGAATGAT 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 1 2 114971 CASAVA_Build 6 81885287 1I TACAAAAAAA -/T AGTAGAACAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 114972 CASAVA_Build 6 81886159 4D ACAAACTCTG TTGT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 26 8 TTGT 1 0 114973 CASAVA_Build 6 81886496 1D TTCAGATTGT G/- GTTTTTTTTG 3070 hom 113 het 51 0 44 7 G 2 1 114974 CASAVA_Build 6 81889374 1D TTTATTATTC T/- TTGATAATTA 3070 hom 87 het 37 0 30 9 T 3 2 114975 CASAVA_Build 6 81889982 2D ATGGAAAAAA CT/-- CTTTTTGGTA 3070 hom 57 het 26 0 20 7 CT 2 1 114976 CASAVA_Build 6 81890275 4D TTTGATGGGG TTGT/---- TTGTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TTGT 2 1 114977 CASAVA_Build 6 81896185 2I ATTCTGGTGA --/CT CTGATAAATT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 CT 1 2 114978 CASAVA_Build 6 81899255 1I AGACAAAAAA -/G GTCCTATTCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 1 2 114979 CASAVA_Build 6 81901230 1I TTATATCAAG -/A AAAAAAGTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 6 7 114980 CASAVA_Build 6 81910768 1I AAAAGGGGGG -/A AAATAGCTTG 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 A 3 4 114981 CASAVA_Build 6 81913143 1D GATTATGTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 9 8 114982 CASAVA_Build 6 81914235 1I AATATTATTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 81 hom 33 1 15 17 T 9 10 114983 CASAVA_Build 6 81923200 1D AGGACATAAC A/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 A 6 5 114984 CASAVA_Build 6 81924177 1I ATATGGGGCC -/A AAAAAAGAGC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 6 7 114985 CASAVA_Build 6 81927438 1I AATTATCCCC -/A AAAAAAGACT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 6 7 114986 CASAVA_Build 6 81927642 1D AGAGCAGCTT A/- AAAAATTTGT 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 A 6 5 114987 CASAVA_Build 6 81930999 2I CCCTATGAGT --/TG TGTTTATGTA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TG 1 2 114988 CASAVA_Build 6 81934266 1D AAATAAAGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 9 8 114989 CASAVA_Build 6 81938395 4D AAGCAGTATC TCTT/---- TCTTCTGTTT 3070 het 3070 ref 54 29 21 5 TCTT 2 1 114990 CASAVA_Build 6 81940969 1I TTACGTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 17 7 T 13 14 114991 CASAVA_Build 6 81942079 1I TTATTTTGAA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 7 8 114992 CASAVA_Build 6 81942502 4I TATAAATTGT ----/TTAA TTGATTATTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTAA 0 1 114993 CASAVA_Build 6 81945498 3D ACTCCGTGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 734 het 27 hom 14 1 4 9 A 16 13 114994 CASAVA_Build 6 81945538 1D AAGAAAGAAA G/- AAAGAATGAA 1392 het 669 hom 16 4 5 7 G 1 0 114995 CASAVA_Build 6 81948906 2D AATGTCATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TA 8 7 114996 CASAVA_Build 6 81953002 2D AGAATACCAC TA/-- TGTTATTCAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 TA 1 0 114997 CASAVA_Build 6 81954364 1I ACATCTGTTA -/T ATACTCTATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 114998 CASAVA_Build 6 81955012 1D GAATTAACAG A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 37 19 12 8 A 7 6 114999 CASAVA_Build 6 81962315 1D TCTATTATTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2353 hom 17 6 9 2 A 9 8 115000 CASAVA_Build 6 81966839 1D TCCATTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2260 hom 23 7 12 5 T 11 10 115001 CASAVA_Build 6 82101742 1I TCGTCATTTA -/G CATTAGGTAT 2776 hom 18 het 8 0 7 1 G 0 1 115002 CASAVA_Build 6 82127838 3D AGAGTGAAAA AAG/--- AAGATGAACC 3070 het 3070 hom 31 11 20 3 AAG 2 1 115003 CASAVA_Build 6 82133760 1I CCTGCTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 13 14 115004 CASAVA_Build 6 82144328 1I TTTGAAAAAA -/T TTATCAGCTT 3070 het 3070 ref 43 24 10 9 T 2 3 115005 CASAVA_Build 6 82147996 1D ACCACCACCC A/- AAAAAACTCA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 A 7 6 115006 CASAVA_Build 6 82182256 1D ATCCCCATAA G/- TTAACTACCA 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 G 1 0 115007 CASAVA_Build 6 82183747 1I TGGTGCAGTG -/C TAAAAAACAC 3070 hom 130 het 48 0 44 4 C 0 1 115008 CASAVA_Build 6 82186597 1I CACTCACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 279 hom 32 1 21 10 T 10 11 115009 CASAVA_Build 6 82206052 1I TGGCTGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 20 23 9 T 11 12 115010 CASAVA_Build 6 82206730 1D ATATCAGTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 11 7 T 10 9 115011 CASAVA_Build 6 82207459 1I ACGGACACAT -/G GGGGGGCGCC 2119 het 2119 ref 21 11 5 5 G 6 7 115012 CASAVA_Build 6 82211664 7D TTGAATACTC AAACATG/------- AGAAAGATTA 3070 het 3070 ref 35 19 10 8 AAACATG 1 0 115013 CASAVA_Build 6 82216464 2D TGCTACAATT AA/-- TAGGGGTCAT 3070 hom 126 het 48 0 42 9 A 2 0 115014 CASAVA_Build 6 82224982 2I AACACTGGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 TA 5 6 115015 CASAVA_Build 6 82226786 1I CCTCAGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 11 12 115016 CASAVA_Build 6 82236299 18D TTCTTGAAGT AAAGAATTTTCAACCCAG/------------------ AATTTCATAT 1358 het 1358 ref 7 4 3 0 AAAGAATTTTCAACCCAG 1 0 115017 CASAVA_Build 6 82245284 1D TATCTTGGCT G/- GGGTAGGAAA 3070 het 3070 hom 36 10 22 5 G 4 3 115018 CASAVA_Build 6 82262162 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1870 hom 25 5 18 3 A 10 9 115019 CASAVA_Build 6 82264366 1I AGTAAAAAAT -/A AAAAAAGTAG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 6 7 115020 CASAVA_Build 6 82270221 1D TAGGAAAAGG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 48 19 20 10 A 7 6 115021 CASAVA_Build 6 82276353 1I CTCCTAATTT -/C CCCCCACCCC 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 C 5 6 115022 CASAVA_Build 6 82281650 1I ACACAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 A 10 11 115023 CASAVA_Build 6 82282766 1I GAAACAAACG -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 6 7 115024 CASAVA_Build 6 82285716 2I AAAAATACAT --/AC ACACACATAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AC 3 4 115025 CASAVA_Build 6 82289872 1D CAATGTGGGG A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 7 6 115026 CASAVA_Build 6 82302763 4D GGGCTGGCAT TGAG/---- TGTCTGCAGC 3070 hom 101 het 38 0 32 9 TGAG 1 0 115027 CASAVA_Build 6 82311093 1I TAATCTAATA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 7 8 115028 CASAVA_Build 6 82322339 5D TAATTTTCTC TTAAG/----- TTAACATTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 TTAAG 1 0 115029 CASAVA_Build 6 82330018 1D TCTTTAAACA T/- CTGTTCTGCA 3070 het 3070 hom 23 10 10 5 T 1 0 115030 CASAVA_Build 6 82334710 1I CATTTTCTGG -/T TGTGAGCTCC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 1 2 115031 CASAVA_Build 6 82353609 1I AGAAATATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 9 10 115032 CASAVA_Build 6 82359801 1I AAAAACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 28 0 18 10 A 15 16 115033 CASAVA_Build 6 82372708 2D13M1I GTAAAGTCTT AATAAGTGTTCTATG-/--TAAGTGTTCTATGA AAAAAAACTG 3070 het 2086 hom 27 6 12 12 N/A 0 0 115034 CASAVA_Build 6 82375719 2I TCTTCAGAAC --/AG AGTGGTGGTC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 AG 1 2 115035 CASAVA_Build 6 82380491 1D TACCCCACCA C/- CCCCCAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 C 6 5 115036 CASAVA_Build 6 82384028 1D ATGCTGCAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 10 9 115037 CASAVA_Build 6 82389321 1I GAAGAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 A 10 11 115038 CASAVA_Build 6 82404221 1D CCTTTGCCCC T/- ATTGCTTCTG 3070 het 3070 hom 54 19 28 8 T 1 0 115039 CASAVA_Build 6 82409962 1I CATCCATACC -/A AAAACCTGCA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 A 4 5 115040 CASAVA_Build 6 82415034 1I TTGTTATGGC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 44 0 38 6 A 8 9 115041 CASAVA_Build 6 82419131 1I GTGACAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 53 20 22 11 A 9 10 115042 CASAVA_Build 6 82421283 1I GACCCACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 16 2 A 11 12 115043 CASAVA_Build 6 82426424 2I AAGATATAGT --/AC ACACTTTAAA 3070 het 3070 ref 42 20 21 1 AC 2 3 115044 CASAVA_Build 6 82437923 3D ATGCATTCAC ATT/--- ATGTCTAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 21 3 ATT 1 0 115045 CASAVA_Build 6 82453745 1I CCACAGAGGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 419 hom 30 1 28 1 T 8 9 115046 CASAVA_Build 6 82457638 1D AAGTAGGTAG C/- CTAGGGTGGG 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 C 2 1 115047 CASAVA_Build 6 82459657 1D AAAATATTTA T/- TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 T 7 6 115048 CASAVA_Build 6 82473541 1I TTCTTCTCTG -/T ACATCTTCCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 0 1 115049 CASAVA_Build 6 82476524 4I GATATATGTG ----/TATA TATATATATA 2910 het 2910 ref 20 9 8 3 TA 6 8 115050 CASAVA_Build 6 82477499 1I TGGAACAGGA -/T AAAGAACCCA 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 T 0 1 115051 CASAVA_Build 6 82479194 1D CTCCCTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 12 11 115052 CASAVA_Build 6 82479281 1D TTTCCAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 T 13 12 115053 CASAVA_Build 6 82487210 1D TTCTGAGATG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 46 23 14 11 T 8 7 115054 CASAVA_Build 6 82489199 1D ATGTGTGTGT G/- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 G 1 0 115055 CASAVA_Build 6 82489587 1I TGTGAAGACC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 8 9 115056 CASAVA_Build 6 82490681 2D ACACGCAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 AT 6 5 115057 CASAVA_Build 6 82493798 2D GGGAAGAGAC TT/-- TTGTTAAAAT 3070 het 3070 ref 56 36 16 6 T 4 2 115058 CASAVA_Build 6 82496618 1D ATCTAAGAGG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 30 17 9 5 T 8 7 115059 CASAVA_Build 6 82498137 3D CTCCCAACCC ATA/--- TCATTGGCCT 3070 het 3070 ref 51 23 22 7 ATA 1 0 115060 CASAVA_Build 6 82500651 1I TATTTACTGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 A 8 9 115061 CASAVA_Build 6 82520197 2D ACCACCACTC TT/-- TGCTAGAAAG 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 3 1 115062 CASAVA_Build 6 82586501 6D GCACATGAGG AAAAAA/------ AAAAAAAACA 581 het 231 hom 37 2 5 33 A 14 8 115063 CASAVA_Build 6 82657892 1I TGAACAACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 33 1 24 8 A 10 11 115064 CASAVA_Build 6 82661075 3D TGTTTGGAGA AAG/--- AAGAAGTATA 3070 hom 84 het 45 1 42 2 AAG 3 2 115065 CASAVA_Build 6 82661168 1I AGAAGGGCAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 8 9 115066 CASAVA_Build 6 82666235 1D CACACATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 222 hom 21 1 16 4 T 12 11 115067 CASAVA_Build 6 82676026 1D CCATAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 12 11 115068 CASAVA_Build 6 82679282 1I GCCTGTCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 10 115069 CASAVA_Build 6 82679481 4D TTTTGTCATT AATA/---- TTTTATCATT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 AATA 1 0 115070 CASAVA_Build 6 82681781 1I TAGGAGATTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 T 9 10 115071 CASAVA_Build 6 82689553 2D TATATATATA AT/-- ATATATATAT 1728 hom 12 het 6 0 5 1 AT 6 5 115072 CASAVA_Build 6 82692313 2D TTTGCCAGGG GT/-- TAAGGAGAAG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 GT 1 0 115073 CASAVA_Build 6 82695976 1I TTTAGGTTCA -/G GGTACATGTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 3 115074 CASAVA_Build 6 82712199 1D TTTTGTTTTC T/- TTTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 7 6 115075 CASAVA_Build 6 82726531 3I ATGCTTAAGC ---/AAA AATTCTGTCA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 2 5 115076 CASAVA_Build 6 82787621 1I GAATTATCTG -/A AAGAATGAGA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 2 3 115077 CASAVA_Build 6 82798859 1D TCTCAAGTAC T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 30 9 15 7 T 8 7 115078 CASAVA_Build 6 82818054 4I TTACTTATAA ----/TACT TAATACAATG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TACT 0 1 115079 CASAVA_Build 6 82842727 2D CTCAGGTACT AC/-- ACACTTACTA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AC 3 2 115080 CASAVA_Build 6 82846272 8D AGAAAAATCT ATTCTAAA/-------- ATTCATATGG 3070 het 3070 hom 41 14 22 7 ATTCTAAA 1 0 115081 CASAVA_Build 6 82846847 2I GCAGGCTACC --/TG TAATCCTGGC 3070 hom 29 het 15 0 9 6 TG 0 1 115082 CASAVA_Build 6 82866954 1I GATATTTTTT -/A AAAAAAGCTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 6 7 115083 CASAVA_Build 6 82874839 2D TCATCTAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 25 1 19 5 A 15 13 115084 CASAVA_Build 6 82878085 1I TCAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 9 10 115085 CASAVA_Build 6 82878710 7I TATAGTCACA -------/GAAGCGT GACTATAGTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 GAAGCGT 0 1 115086 CASAVA_Build 6 82881355 1D AAATGACAGA C/- TTAACCTCCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 1 0 115087 CASAVA_Build 6 82897521 4D TGTATATATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 16 15 7 TG 10 8 115088 CASAVA_Build 6 82897637 2D TATATGTGTA TG/-- TGTGTGTATA 2092 het 2092 ref 24 12 7 5 TG 4 3 115089 CASAVA_Build 6 82898730 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAATA 3070 het 863 hom 11 2 9 0 A 8 9 115090 CASAVA_Build 6 82913767 1I CTTTGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 A 11 12 115091 CASAVA_Build 6 82920002 1D AATGGAACGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 4 A 11 10 115092 CASAVA_Build 6 82923805 11I ACCCTAGAAC -----------/GTGTTATTATA TTAAAATATA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GTGTTATTATA 0 1 115093 CASAVA_Build 6 82924766 2I TATATGTAGT --/TA TATATATATA 2399 het 2399 ref 24 11 6 7 TA 6 7 115094 CASAVA_Build 6 82934762 1I GTAATTTAGT -/A AAAAGACTAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 4 5 115095 CASAVA_Build 6 82940111 2I CTAATAATAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AT 5 6 115096 CASAVA_Build 6 82943634 6D TCTTTTTGTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 2657 hom 33 8 11 14 TTG 8 6 115097 CASAVA_Build 6 82948097 4I ATGTATACTT ----/TAAA TAAATATACG 3070 het 3070 ref 52 21 20 11 TAAA 1 2 115098 CASAVA_Build 6 82954057 2D GTGGACAAAA AG/-- AAATACTAGC 3070 het 3070 hom 43 13 25 5 AG 1 0 115099 CASAVA_Build 6 82956789 4D TCCTTGTGAG AGAA/---- AGAGAGTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 AGAA 1 0 115100 CASAVA_Build 6 82957173 4I TAAAAAATAA ----/AAAT AAATAAATTT 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 AAAT 2 3 115101 CASAVA_Build 6 82959526 2D AGAGCAAGAC TG/-- TCTCAAAAAA 2290 hom 21 het 10 0 7 3 TG 1 0 115102 CASAVA_Build 6 82959857 4I CAATTTGTGT ----/AGGC ACTTATGCAA 3070 het 3070 hom 41 12 25 4 AGGC 0 1 115103 CASAVA_Build 6 82969530 5D ATAAAATATA TTGAG/----- TTATCTATCA 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 TTGAG 1 0 115104 CASAVA_Build 6 82972837 14D ATTAGCAATA AGTAAAGTAAAGAT/-------------- ATTGAATTAG 3070 het 3070 ref 26 14 12 4 AGTAAAGTAAAGAT 1 0 115105 CASAVA_Build 6 82978354 2D CTGGGCCAAG CA/-- CAGTTGAAAC 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 CA 2 1 115106 CASAVA_Build 6 82979470 1D AAGTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 12 11 115107 CASAVA_Build 6 82992688 1I TTAAGGTAAT -/A ATTATATATG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 1 2 115108 CASAVA_Build 6 82992937 1I TAATGAAAAT -/A ACTGGCTCAA 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 A 1 2 115109 CASAVA_Build 6 82993544 1I CTTACAGTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 7 15 7 A 9 10 115110 CASAVA_Build 6 83000078 1I TCCCCACTAC -/T TTTAAGAAGA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 T 3 4 115111 CASAVA_Build 6 83006159 1I CTGCATCGGC -/T CTATAAAAGC 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 T 0 1 115112 CASAVA_Build 6 83012365 3D AACAAAATTA AAC/--- AACGGAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 AAC 2 1 115113 CASAVA_Build 6 83023545 2I AAAGAAAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 2450 hom 30 9 10 11 AG 8 9 115114 CASAVA_Build 6 83043335 1D TTAGATGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 476 hom 26 2 18 6 A 15 14 115115 CASAVA_Build 6 83051361 1D TCAGAGAAGC A/- ATGGAAGGCT 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 A 2 1 115116 CASAVA_Build 6 83055833 12I3M2I AGCAGTGAAT ------------AAT--/ACATGTAATACAAATTA ATTACATGAA 3070 het 2155 hom 21 7 11 4 N/A 0 0 115117 CASAVA_Build 6 83056403 1D GACTAACAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 10 9 115118 CASAVA_Build 6 83063479 1I ATAAATACCT -/G AGATTGGGTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 0 1 115119 CASAVA_Build 6 83065403 1I CCTTTATGTA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 6 7 115120 CASAVA_Build 6 83066771 1I AGTTTACTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 9 10 115121 CASAVA_Build 6 83067920 4D CACCAATAGG AAAC/---- AAACAGAGCC 3070 hom 42 het 16 0 15 3 AAAC 2 1 115122 CASAVA_Build 6 83076224 1D CTTCTTTGTC T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 6 115123 CASAVA_Build 6 83083768 1I GAATCAAAAC -/A AGACAAGGAT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 1 2 115124 CASAVA_Build 6 83084405 1D ATACTTATAG C/- CAACTGATCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 C 2 1 115125 CASAVA_Build 6 83085555 1D GGGGAAAGAT G/- GGAAGTGGGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 3 2 115126 CASAVA_Build 6 83089170 1I ATTTAAGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 139 hom 30 1 22 7 A 9 10 115127 CASAVA_Build 6 83091219 2D TACACACACT TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TA 6 5 115128 CASAVA_Build 6 83096759 1D TCTACTGGAT A/- AAATAAGTTA 3070 hom 101 het 40 0 33 7 A 4 3 115129 CASAVA_Build 6 83098548 1D GGAATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 16 2 10 4 T 13 12 115130 CASAVA_Build 6 83105542 1D TTCTTTCTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 19 1 16 2 C 1 0 115131 CASAVA_Build 6 83119869 1I GAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 1041 het 1041 ref 25 17 3 5 A 10 11 115132 CASAVA_Build 6 83137106 4I TAGATTTTAC ----/TTTG TTTGTTAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TTTG 1 2 115133 CASAVA_Build 6 83138808 1I CACCACTATG -/A AAAACTATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 5 115134 CASAVA_Build 6 83139807 1D ATCCAAGCTC T/- TAACTCCTGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 1 115135 CASAVA_Build 6 83162516 1I ATACTGACAG -/A AAAAAAAAAA 1040 het 1040 ref 35 24 3 8 A 11 12 115136 CASAVA_Build 6 83174841 6D AACAAGAACA TAGAGT/------ TAGAGTTTAC 3070 het 3070 ref 49 24 22 8 TAGAGT 2 1 115137 CASAVA_Build 6 83186568 1D3M4D5M5I7M5I CATCAAAGGA GACACTTTAAAGG-----AGACACT-----/-ACA----AGAAGATATCAGAAACTAGCAC TTCTTTAAAA 3070 het 3070 ref 60 31 27 5 N/A 0 0 115138 CASAVA_Build 6 83231250 1D AGGTTATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 493 hom 26 3 16 7 A 17 16 115139 CASAVA_Build 6 83272847 1D AGATTCCATC A/- AAAAAAAAAA 1487 het 1487 ref 32 20 6 7 A 15 14 115140 CASAVA_Build 6 83288344 1I TAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 43 1 37 5 A 9 10 115141 CASAVA_Build 6 83289759 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 17 1 15 1 A 14 13 115142 CASAVA_Build 6 83291952 1D CCTTCTCTCT A/- GCCTCTCTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 1 0 115143 CASAVA_Build 6 83294193 2D CTGATTGGTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 48 het 25 0 17 8 TC 6 5 115144 CASAVA_Build 6 83295296 1D CCTAGGTAAC A/- AGGGTGAGAC 3070 hom 56 het 22 0 19 4 A 2 1 115145 CASAVA_Build 6 83305986 2I CCTGAACCAC --/TG TGCCCAGCCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TG 1 2 115146 CASAVA_Build 6 83307749 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAACTGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 7 6 115147 CASAVA_Build 6 83316386 1D CATGTACCCT A/- AGACTTAAAG 3070 hom 21 het 12 0 8 4 A 2 1 115148 CASAVA_Build 6 83319333 1I TGGGAGTTAG -/C CCAGCAAACA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 2 3 115149 CASAVA_Build 6 83321672 1I TCGGAGGAAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 7 8 115150 CASAVA_Build 6 83323396 2I TCTTTTTTTT --/TC TAACACATTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TC 0 1 115151 CASAVA_Build 6 83331424 1D CGAACCCTTA C/- CCCAAAGCAT 2682 het 2682 ref 102 94 6 2 C 4 3 115152 CASAVA_Build 6 83335091 13D TCTGCCTTCT GGTCTCCCACCAG/------------- GGTCTCCCAC 2670 het 2670 ref 31 11 7 18 GGTCTCCCACCAG 3 2 115153 CASAVA_Build 6 83335807 1I AACAGTCAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 8 9 115154 CASAVA_Build 6 83361420 1I TGTGAAACTT -/C CAGAGTGTAT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 1 2 115155 CASAVA_Build 6 83362320 1D ATTCAAGAGA T/- TTCCTCTAGA 3070 het 3070 hom 42 16 20 7 T 3 2 115156 CASAVA_Build 6 83374493 5D ATTTCAAGAG TCTTT/----- TCTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 TCTTT 2 1 115157 CASAVA_Build 6 83387053 1I GAAGAGCTGT -/G AGAATGAATG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 G 0 1 115158 CASAVA_Build 6 83395454 1D GCAAACTGCT A/- CACTGACACA 3070 het 3070 hom 47 22 23 3 A 1 0 115159 CASAVA_Build 6 83424552 1I TATCTTTAAA -/T GTTGAAGGCT 3070 het 3070 hom 54 22 29 3 T 0 1 115160 CASAVA_Build 6 83429126 9I TACCAGAAGC ---------/AGAACAGTA AGGAAACAGT 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 AGAACAGTA 0 1 115161 CASAVA_Build 6 83433108 3I TCTCTGTCTC ---/ATT ATTAGTGACA 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 ATT 1 2 115162 CASAVA_Build 6 83435194 7I AAATGAGAAA -------/GAATGAC CCCTGCCCTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 GAATGAC 0 1 115163 CASAVA_Build 6 83435974 1D GTCTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1979 hom 38 11 14 13 T 17 16 115164 CASAVA_Build 6 83465492 8D GTGAGATGGA AGCAAAAC/-------- AGACAATCAA 3070 het 3070 ref 59 28 26 14 AGCAAAAC 1 0 115165 CASAVA_Build 6 83487340 1D AAACAAGGCT G/- GGGGAAGCAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 G 5 4 115166 CASAVA_Build 6 83488734 1I AGTAGGGAAC -/A AAAGCCATAC 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 A 3 4 115167 CASAVA_Build 6 83489918 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 9 8 115168 CASAVA_Build 6 83514704 23D GGAAGATGTG TTTGAATTCTGGCTCTACCAGAA/----------------------- TTTGAATTCT 3070 hom 120 het 39 0 40 6 TTTGAATTCTGGCTCTACCAGAA 1 0 115169 CASAVA_Build 6 83519841 13D ACGCAAAAAT ATTAAAAATATTA/------------- AATATTAAAA 706 het 706 ref 11 4 3 5 ATTAAAAATATTA 1 0 115170 CASAVA_Build 6 83528078 1D AGGAAGGAAG A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 8 7 115171 CASAVA_Build 6 83533363 1I ATTTTTCCTG -/A AAAAAAGTCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 6 7 115172 CASAVA_Build 6 83554448 13D CTTTGTCTCC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 17 0 15 6 A 24 11 115173 CASAVA_Build 6 83559142 1I CTTTATGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 9 10 115174 CASAVA_Build 6 83561342 4D TCTGTAACAC AAAG/---- AAAGGATAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 AAAG 2 1 115175 CASAVA_Build 6 83606719 1D AAATTACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 26 2 18 6 A 13 12 115176 CASAVA_Build 6 83633207 1D GTTCTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 9 10 T 11 10 115177 CASAVA_Build 6 83681355 1I TGGAAATTAC -/T TTTTTCCATT 3070 hom 90 het 36 0 32 4 T 5 6 115178 CASAVA_Build 6 83688570 1I TTCTGAACAA -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 115179 CASAVA_Build 6 83689104 15I AGGACATAGG ---------------/CACGGGTAAAAACTT CATGTCTAAA 2767 hom 15 het 7 0 6 1 CACGGGTAAAAACTT 0 1 115180 CASAVA_Build 6 83692471 2I CCCTTACTCA --/AT AGAGGATATA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AT 0 1 115181 CASAVA_Build 6 83694193 1D TTTGGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 128 hom 18 1 13 4 T 13 12 115182 CASAVA_Build 6 83707967 4D CAGGCCTCTG TCTA/---- TCTATTTCTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TCTA 2 1 115183 CASAVA_Build 6 83729629 1D AGTTTTCATC T/- TTTTTTTTTT 2216 het 2216 ref 39 15 7 17 T 19 18 115184 CASAVA_Build 6 83740012 2I ATTCTTAGCT --/TC TCTTTCCTTG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TC 1 2 115185 CASAVA_Build 6 83741222 1I AAAAGACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 26 0 23 3 A 12 13 115186 CASAVA_Build 6 83744581 1D TCTTGTACCA G/- GCAACACAGT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 2 1 115187 CASAVA_Build 6 83749594 1D TGGCTGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 4 T 17 16 115188 CASAVA_Build 6 83759790 2I ATCAGCCGAC --/AT AGAAAATGGT 3070 hom 114 het 43 0 36 7 AT 0 1 115189 CASAVA_Build 6 83761835 2I ATTTAAAACT --/TC TGTTTGTCAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TC 0 1 115190 CASAVA_Build 6 83764405 1D GAATGATTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 9 8 115191 CASAVA_Build 6 83767151 2D TATGCCTGTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 TC 6 5 115192 CASAVA_Build 6 83774392 1I CAAAAAAAGT -/A AAAAAATATA 3070 hom 32 het 34 1 31 2 A 6 7 115193 CASAVA_Build 6 83789300 1D AGTCAATACT C/- CATTTGTGCT 3070 hom 96 het 38 0 33 7 C 2 1 115194 CASAVA_Build 6 83791875 1D CAAAATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 35 1 28 6 T 12 11 115195 CASAVA_Build 6 83815772 1D TATGGCTGCT G/- GAATTAGATA 3070 hom 90 het 44 0 32 13 G 2 1 115196 CASAVA_Build 6 83816685 1I TTTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2469 het 385 hom 14 1 8 5 A 13 14 115197 CASAVA_Build 6 83819630 30I AGCCCAAGAC ------------------------------/AGTTCTTCATCTTCCAGTGTGGCTCAGGGA AGCCGAAGGC 3070 hom 102 het 38 0 33 6 AGTTCTTCATCTTCCAGTGTGGCTCAGGGA 0 1 115198 CASAVA_Build 6 83821582 1I AGCTGTGGGG -/A AAAAATGTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 6 115199 CASAVA_Build 6 83823828 1I CCTTGTTCAC -/T TCTGTATCCC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 115200 CASAVA_Build 6 83835088 3D TCTGTTTTGA TGT/--- TGTTGGCCAT 3070 het 3070 hom 45 18 22 10 TGT 2 1 115201 CASAVA_Build 6 83837164 1D CCTTTTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 35 1 31 4 T 11 10 115202 CASAVA_Build 6 83846547 1D CTTAGGCTGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 7 115203 CASAVA_Build 6 83854294 4D TGTTTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 TTTG 5 4 115204 CASAVA_Build 6 83857297 5D CTTTTCTGAT ATATA/----- ATGACAATTT 3070 het 3070 ref 46 29 14 4 ATATA 1 0 115205 CASAVA_Build 6 83858692 4I TACCAGTCTT ----/TAAC TATTATGTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TAAC 0 1 115206 CASAVA_Build 6 83885453 1D GTGGTCATGA T/- TGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 T 2 1 115207 CASAVA_Build 6 83887328 10I ATTTTGAGGT ----------/GGCCTTTAAA GGCCTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 GGCCTTTAAA 1 2 115208 CASAVA_Build 6 83889696 3I TCCAGTTTTT ---/TTG TTGTTGTAGA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TTG 2 3 115209 CASAVA_Build 6 83900076 5D TTTTACCCAT TATTA/----- TATTAATCTT 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 TATTA 2 1 115210 CASAVA_Build 6 83914852 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 2637 het 2637 ref 21 11 7 3 A 9 10 115211 CASAVA_Build 6 83970036 2I ATTGACTTAA --/TT TTTTTTTTTT 2473 het 2473 ref 28 12 7 9 T 10 12 115212 CASAVA_Build 6 83977965 1I CATTTCTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 40 0 27 13 T 11 12 115213 CASAVA_Build 6 83979155 1D TGGTGCTATA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 8 7 115214 CASAVA_Build 6 83986179 1D GCCCAACTAA T/- TTTTTTTTTT 1770 het 682 hom 22 5 8 11 T 19 18 115215 CASAVA_Build 6 84001210 4D CCCTGCACAG GTTT/---- GTTTAATTGC 3070 het 3070 ref 33 15 16 3 GTTT 2 1 115216 CASAVA_Build 6 84003472 2D AGCTGTACAG TT/-- TTTTTTTTTT 1738 het 682 hom 13 3 5 5 T 14 12 115217 CASAVA_Build 6 84011852 1I GGCAAAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 9 10 115218 CASAVA_Build 6 84026615 1I AGCAAGGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 10 11 9 A 11 12 115219 CASAVA_Build 6 84027353 1D TCCAATAAAC A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 8 7 115220 CASAVA_Build 6 84032944 2I CAAATTAATA --/GT GTTTCTTATG 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 GT 1 2 115221 CASAVA_Build 6 84064038 6I TTAAATATTA ------/TTTTAT TTTAAGTTCC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 TTTTAT 0 1 115222 CASAVA_Build 6 84070132 1D CAAAATACGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 T 10 9 115223 CASAVA_Build 6 84073665 1D TGTTCACTTG A/- AAAAAAAAAG 1274 het 1274 ref 46 38 3 5 A 10 9 115224 CASAVA_Build 6 84074916 1I CTGATTCTGT -/A AAAAAAAAAA 2820 het 2820 ref 27 12 8 7 A 13 14 115225 CASAVA_Build 6 84080204 4I TATGTGATCT ----/CAAA CAAACTGCAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 CAAA 1 2 115226 CASAVA_Build 6 84089949 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1580 hom 16 5 10 2 A 10 9 115227 CASAVA_Build 6 84092978 1I AATTTACAAG -/A AAAAAACCAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 6 7 115228 CASAVA_Build 6 84107120 1I TTATGTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 17 11 T 13 14 115229 CASAVA_Build 6 84107900 18D TGAGGGCAGT CTTGAAGAGTACGTATAC/------------------ CTGTAAACTC 3070 het 3070 ref 39 24 17 4 CTTGAAGAGTACGTATAC 1 0 115230 CASAVA_Build 6 84115891 2D TTTTTCAAAA AT/-- TAAATCTTCA 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 AT 1 0 115231 CASAVA_Build 6 84118813 1D TCTCTTAGAT A/- TTTTAAAATA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 1 0 115232 CASAVA_Build 6 84123187 1D CATAAAATTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 47 26 18 4 T 9 8 115233 CASAVA_Build 6 84134817 1I TATAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 A 9 10 115234 CASAVA_Build 6 84139681 1I CATGTATTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 9 10 115235 CASAVA_Build 6 84144288 1D TTTTCCATTT A/- AACTAAAATA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 3 2 115236 CASAVA_Build 6 84157320 4D ATATATATAC ATAT/---- ATACATACAT 2533 het 2533 ref 26 11 10 8 AT 3 1 115237 CASAVA_Build 6 84170705 1D TGATGATGAG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 T 8 7 115238 CASAVA_Build 6 84176515 1I TGCCATTTAC -/T TTTTTTACTT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 6 7 115239 CASAVA_Build 6 84177805 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1742 het 1742 ref 23 13 4 6 A 13 12 115240 CASAVA_Build 6 84179111 1D GTAAAAAAAC A/- AAACTATTGA 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 A 4 3 115241 CASAVA_Build 6 84185570 3I TTATCCTAAG ---/AGT TATGGGAAGC 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 AGT 0 1 115242 CASAVA_Build 6 84192354 1I CCATGTGTTG -/T TTAATCCCCA 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 T 2 3 115243 CASAVA_Build 6 84196146 4D ACAAAAAAAA TCAC/---- TCACACTGAC 3070 het 3070 ref 27 18 8 3 TCAC 2 1 115244 CASAVA_Build 6 84203147 2D TTTTTCTGTT TG/-- TGTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 23 12 11 0 TG 2 1 115245 CASAVA_Build 6 84204786 7I GATCACTTAA -------/CAGTTGG CAGTTGGAAC 3070 het 3070 ref 29 12 8 9 CAGTTGG 1 2 115246 CASAVA_Build 6 84206057 1I CACTTTGGGG -/T TTTTGACAAT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 T 4 5 115247 CASAVA_Build 6 84220699 1I TAATGAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1458 hom 34 7 12 15 T 13 14 115248 CASAVA_Build 6 84222679 3I AATTTTGCTT ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 CAA 3 4 115249 CASAVA_Build 6 84224558 4D ACAATTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 TTTG 5 4 115250 CASAVA_Build 6 84248620 1D CATTAATATC A/- AAAATAGACT 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 A 5 4 115251 CASAVA_Build 6 84257985 1D TCTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2789 het 2789 ref 33 10 10 13 T 13 12 115252 CASAVA_Build 6 84258808 1D TTACAGACAT A/- AAGCCACTGC 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 A 3 2 115253 CASAVA_Build 6 84268732 1D TTATTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 11 10 115254 CASAVA_Build 6 84271396 17I ATTTAGAAAT -----------------/AAAACAGAGAACTCAGC AAATCAAATG 3070 het 3070 hom 40 17 18 7 AAAACAGAGAACTCAGC 0 1 115255 CASAVA_Build 6 84281936 4I TTCTACTGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 99 het 44 0 33 11 TTTG 3 4 115256 CASAVA_Build 6 84283100 5D TATTTTTCTT AAAAC/----- AACACATTTT 3070 het 3070 hom 27 12 14 3 AAAAC 1 0 115257 CASAVA_Build 6 84286493 1D GGTGACAGAG C/- CAGACTGACT 3070 het 3070 hom 31 12 19 0 C 2 1 115258 CASAVA_Build 6 84298902 1D CTTTTAAATT A/- AAAAATTTTT 1954 het 1954 ref 24 12 8 5 A 6 5 115259 CASAVA_Build 6 84303418 4I TCTTTCTTTC ----/TCTT TCTTTCTTCT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 TCTT 2 3 115260 CASAVA_Build 6 84303482 4D GACTTTCCGA CTTT/---- CTAACTTTCC 3070 het 3070 hom 26 10 15 3 CTTT 1 0 115261 CASAVA_Build 6 84304424 1D TAAATCTTAA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 8 7 115262 CASAVA_Build 6 84305608 5I AATATTTTAT -----/TTATG TTAATATATA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TTATG 0 1 115263 CASAVA_Build 6 84307212 1I GGAGAGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 10 11 115264 CASAVA_Build 6 84316319 1D CTAGAAAATC T/- AGAAGAAATG 2392 het 2392 ref 18 12 5 1 T 1 0 115265 CASAVA_Build 6 84317737 1I CCATGGAACA -/G GAACAGAGGC 2571 het 2571 ref 17 8 6 3 G 1 2 115266 CASAVA_Build 6 84318152 4I AAAATTTTTG ----/CTAT CTATCTGACA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 CTAT 1 2 115267 CASAVA_Build 6 84326138 2D TTTGGCAAAC TT/-- ATTGCAGTTA 3070 het 3070 ref 49 26 19 6 T 2 0 115268 CASAVA_Build 6 84330774 1I TTCTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1395 hom 19 5 12 2 T 11 12 115269 CASAVA_Build 6 84341283 27D TTCATACCTA AGAATGGAGGGCAGCCCCCTGGGCTGG/--------------------------- AGTGCTACTT 3070 het 3070 ref 17 20 9 1 AGAATGGAGGGCAGCCCCCTGGGCTGG 1 0 115270 CASAVA_Build 6 84341755 1I AAAGCATTTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 A 8 9 115271 CASAVA_Build 6 84346857 4D TGCTTCAGTT AAAG/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 6 AAAG 1 0 115272 CASAVA_Build 6 84351980 4I AAAAAAAAAA ----/AAAC AAAAAGAAAG 3070 hom 55 het 33 0 20 13 AAAC 0 1 115273 CASAVA_Build 6 84354507 1D TTCAAGTGAT C/- CTGCCCATCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 2 1 115274 CASAVA_Build 6 84363119 1I ATTAGCTCAA -/C TTAGCCATTC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 C 0 1 115275 CASAVA_Build 6 84363203 1I ATTAAAGATT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 0 1 115276 CASAVA_Build 6 84371602 1D CAATCAGTTT A/- AAGTATGGAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 3 2 115277 CASAVA_Build 6 84385552 1I TAGAAGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 10 11 115278 CASAVA_Build 6 84387507 1D GGGGATACTT G/- GCGCAGGTTT 3070 hom 51 het 22 0 17 6 G 2 1 115279 CASAVA_Build 6 84388890 1I ATTATGACAA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 6 7 115280 CASAVA_Build 6 84397214 1D ATTTTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 617 hom 29 2 23 4 A 12 11 115281 CASAVA_Build 6 84402113 1I ACCATTTACA -/T TCAAGGTTAG 3070 hom 138 het 47 0 47 0 T 1 2 115282 CASAVA_Build 6 84408603 1I AAATATGCTA -/T TTTTTTCAGT 2302 het 2231 hom 15 6 6 3 T 6 7 115283 CASAVA_Build 6 84415193 1I CCATTTTATA -/T TCTTCTTTTG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 1 2 115284 CASAVA_Build 6 84421080 3D AGTAGATATA CTT/--- CAAAACTAGC 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 CTT 1 0 115285 CASAVA_Build 6 84423105 3I ATTGCCCACC ---/AAG AAGTGAGACA 3070 hom 138 het 56 0 47 9 AAG 1 2 115286 CASAVA_Build 6 84424209 1D AGATTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 26 1 19 6 T 14 13 115287 CASAVA_Build 6 84425864 1D TGTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1631 het 1186 hom 36 10 8 18 T 19 18 115288 CASAVA_Build 6 84428934 1D ACTAAAGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 11 10 115289 CASAVA_Build 6 84433753 1D TCTGAAAAGG T/- TATTAAAACA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 T 2 1 115290 CASAVA_Build 6 84436022 5D AAAACCAAAA ATAAG/----- ATAATGAACA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 ATAAG 1 0 115291 CASAVA_Build 6 84436683 2D GATATGGTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 9 14 T 14 12 115292 CASAVA_Build 6 84437285 1D CTCTTTATTC T/- GTTCTGTTGA 3070 het 3070 ref 36 15 14 8 T 1 0 115293 CASAVA_Build 6 84442336 1I TGCCAATGTC -/A AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 40 15 10 15 A 6 7 115294 CASAVA_Build 6 84442549 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 9 13 A 15 14 115295 CASAVA_Build 6 84445388 1I AAGTGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 11 12 115296 CASAVA_Build 6 84467592 1D AAGAATGACA G/- GTTGGTTGTT 3070 hom 157 het 58 0 53 5 G 2 1 115297 CASAVA_Build 6 84467886 1D TCAAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 1180 het 1180 ref 30 14 3 13 T 15 14 115298 CASAVA_Build 6 84470565 1I TACAAAATAG -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 A 6 7 115299 CASAVA_Build 6 84477254 4I ATAATCTGAT ----/AGAA AGAGTTGGGA 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 AGAA 0 1 115300 CASAVA_Build 6 84482040 1D ATTCTTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 A 11 10 115301 CASAVA_Build 6 84511200 4I GTATGTATGA ----/TGTG TGTGTGTGTG 1643 het 1643 ref 33 8 9 16 TG 7 9 115302 CASAVA_Build 6 84513114 1I CATATGGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 784 hom 26 2 20 4 A 11 12 115303 CASAVA_Build 6 84515866 4D ATATCCAAAA TATT/---- TATTATTTCA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 TATT 2 1 115304 CASAVA_Build 6 84523164 1I GGTTGACAGC -/T TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 4 5 115305 CASAVA_Build 6 84533098 4I GACTAAAGAA ----/ATGG ATGGGGAAAG 3070 het 3070 ref 62 29 29 4 ATGG 1 2 115306 CASAVA_Build 6 84535489 1I AGACTATACT -/A GAGATATTGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 0 1 115307 CASAVA_Build 6 84545394 2D ATATAATATA AT/-- ATATGACATA 2879 het 2079 hom 13 6 7 0 AT 3 2 115308 CASAVA_Build 6 84560958 2D TAATGAATTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 11 14 6 AT 6 5 115309 CASAVA_Build 6 84561939 2I GTGTATGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 2922 hom 33 10 15 8 GT 7 8 115310 CASAVA_Build 6 84563993 1D TATATTAAGA T/- TCCTGTCTAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 2 1 115311 CASAVA_Build 6 84576534 1I TTCTATATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 9 10 115312 CASAVA_Build 6 84636882 1D TATCTAACCG T/- TTTTTTTTTT 1365 het 1365 ref 31 22 3 6 T 13 12 115313 CASAVA_Build 6 84681277 2D CCGGCCTAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 15 1 8 6 T 18 16 115314 CASAVA_Build 6 84697222 1D TTACTATGTG A/- AAAAAAAAAA 1222 het 1222 ref 50 36 4 10 A 13 12 115315 CASAVA_Build 6 84720522 1I TTACTGTGTG -/C CCCCCCACAT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 C 6 7 115316 CASAVA_Build 6 84721354 1I TGTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 11 12 115317 CASAVA_Build 6 84767454 1I GAAAATCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 34 1 26 7 T 12 13 115318 CASAVA_Build 6 84786884 1I AAACTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 10 11 115319 CASAVA_Build 6 84787047 1I GCTTTGTCAC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 7 8 115320 CASAVA_Build 6 84792161 1D CAGTTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 32 1 29 2 A 13 12 115321 CASAVA_Build 6 84794785 1I ATAATTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1896 hom 43 4 33 6 T 10 11 115322 CASAVA_Build 6 84816421 4I CGTGCATTCA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TG 7 9 115323 CASAVA_Build 6 84834811 1I ATGCAAGCTC -/T TTTTTTGTTC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 6 7 115324 CASAVA_Build 6 84850728 1I GGTTTTTTTT -/C CCAGCTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 C 2 3 115325 CASAVA_Build 6 84852297 1I GCATTCTTCA -/T TTTAAGGTAG 3070 het 3070 ref 47 28 15 4 T 3 4 115326 CASAVA_Build 6 84858545 3D CTGTGGCTCC TCT/--- TCTTCCACTT 3070 het 3070 ref 45 21 13 13 TCT 2 1 115327 CASAVA_Build 6 84859707 4I CAAGAAAAAT ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 AG 5 7 115328 CASAVA_Build 6 84870204 6D TTGTTATTGT AATACC/------ AATACCATTA 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 AATACC 2 1 115329 CASAVA_Build 6 84945102 1I TCTCCTTTTC -/T TTTTTAAATT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 5 6 115330 CASAVA_Build 6 84963689 1D TGAGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 920 het 920 ref 40 36 3 1 A 11 10 115331 CASAVA_Build 6 84978333 1D TCAAATTGCC A/- AAAAAAAAAA 2382 het 2382 ref 35 21 5 9 A 12 11 115332 CASAVA_Build 6 84994734 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 T 7 6 115333 CASAVA_Build 6 84998954 1I CCTAATGAAG -/A AAAATGATTA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 4 5 115334 CASAVA_Build 6 85006605 1D GGCACAGCAG A/- AAATCCACTC 3070 het 3070 ref 44 21 20 5 A 4 3 115335 CASAVA_Build 6 85009048 4I TGAGCTTCTC ----/ACTT CCTTCCTTGG 3070 het 3070 hom 73 23 40 10 ACTT 0 1 115336 CASAVA_Build 6 85010212 1D AAGTATTCTA T/- TTTTTTTTTA 2807 het 2807 ref 17 11 6 0 T 10 9 115337 CASAVA_Build 6 85054056 2D TACCTACAAA AT/-- ATATCTTTCA 3070 het 3070 hom 43 17 24 4 AT 3 2 115338 CASAVA_Build 6 85116679 1I CTTTAAACTA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 33 18 14 1 T 6 7 115339 CASAVA_Build 6 85117404 1I TCCCATGAGG -/T TTTTTTACCA 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 T 6 7 115340 CASAVA_Build 6 85118507 4D CAAGGGAGAG AGGA/---- AGGGAGGGAG 1744 het 1744 ref 15 7 4 7 AGGA 1 0 115341 CASAVA_Build 6 85135881 1I TTCGTCTAAA -/T TTTTTTTCAA 2224 het 2224 ref 12 7 5 0 T 7 8 115342 CASAVA_Build 6 85136486 1I TTTTAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 28 0 16 12 A 11 12 115343 CASAVA_Build 6 85142694 1D CTCCTAGGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 39 0 31 9 T 9 8 115344 CASAVA_Build 6 85143654 1D CTGTTGATGT G/- GATATATAAT 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 G 2 1 115345 CASAVA_Build 6 85149161 1D CTTTGCCCAG T/- TTTTTGATGG 3070 het 123 hom 34 1 26 7 T 6 5 115346 CASAVA_Build 6 85174677 2D CCATCACCAC AT/-- GTTATTGACG 3070 het 3070 hom 59 28 28 5 AT 1 0 115347 CASAVA_Build 6 85180346 2D ATTTATCTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 12 10 115348 CASAVA_Build 6 85186000 3D GCTAACTCTC ATT/--- ATCTGTAGGA 3070 het 3070 hom 40 15 21 6 ATT 1 0 115349 CASAVA_Build 6 85186394 1I GGATTATAGG -/T TTTCTTTTTG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 3 4 115350 CASAVA_Build 6 85190946 1I TGAAGAAAAA -/T TTTTCCAGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 5 115351 CASAVA_Build 6 85191841 1I TTCTCTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 11 12 115352 CASAVA_Build 6 85201581 1I TTGGGCATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 9 10 115353 CASAVA_Build 6 85204302 3I ATGGAGTCTC ---/CTT CTGTCACCCA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 CTT 0 1 115354 CASAVA_Build 6 85204875 1D TTTCTTCAAC A/- AAAAGTCCTT 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 A 5 4 115355 CASAVA_Build 6 85226988 1D TAATAGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1368 het 1368 ref 41 32 3 6 A 11 10 115356 CASAVA_Build 6 85228369 1I ATCTCTTAAC -/T TTTGCTGCAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 3 4 115357 CASAVA_Build 6 85232175 3D CTCTGGTCTC CTT/--- TGATCCAAGA 3070 het 3070 ref 38 25 11 3 CTT 1 0 115358 CASAVA_Build 6 85232819 1I GGCATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 10 11 115359 CASAVA_Build 6 85233407 1D TTAATGTGGC A/- AAAAATACCA 3070 het 3070 hom 44 14 24 8 A 6 5 115360 CASAVA_Build 6 85236550 1I GTGCTAAAGA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 T 7 8 115361 CASAVA_Build 6 85238381 2I CCTGGAAGCA --/TG TGTCAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 TG 1 2 115362 CASAVA_Build 6 85239181 3D CTAAATAGAG AAT/--- AATAATAAAT 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 AAT 3 2 115363 CASAVA_Build 6 85251245 2D GTGTATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 AC 7 6 115364 CASAVA_Build 6 85267913 1I GCTGGGGAAT -/C CCCCCCTGCA 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 C 6 7 115365 CASAVA_Build 6 85269215 2D AATCTGGTGG GA/-- GGTGATTGAA 3002 het 3002 ref 27 15 7 7 GA 1 0 115366 CASAVA_Build 6 85273636 1D AGTAACAAAC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 8 A 7 6 115367 CASAVA_Build 6 85273997 4I CTTTCAAGAG ----/TCTT TCTTTGTCTT 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 TCTT 1 2 115368 CASAVA_Build 6 85274152 1I TTAAATACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 T 9 10 115369 CASAVA_Build 6 85285256 1D TAATGGATTT A/- ATCTTCCTTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 2 1 115370 CASAVA_Build 6 85288883 1I CACATTTATC -/A AAGCACTTGA 3070 hom 147 het 55 0 49 6 A 2 3 115371 CASAVA_Build 6 85289427 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1158 hom 48 3 23 22 T 12 11 115372 CASAVA_Build 6 85294113 1D CCCCCAGATG C/- CTGACTTTTC 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 C 2 1 115373 CASAVA_Build 6 85297432 1I GAAGCCTCAT -/G GGTGTGAGGG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 2 3 115374 CASAVA_Build 6 85297650 1D AAAAATATAT A/- AACTCCCTGA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 3 2 115375 CASAVA_Build 6 85297829 8I AGAAAAGATC --------/AGGAAAAT AGGAAAATAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AGGAAAAT 1 2 115376 CASAVA_Build 6 85300434 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 29 0 18 11 A 18 16 115377 CASAVA_Build 6 85310518 1I GATGTGAAGG -/T ACCTCTTCAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 0 1 115378 CASAVA_Build 6 85314895 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1009 hom 31 3 23 5 T 11 12 115379 CASAVA_Build 6 85319899 1D GTGAGATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 11 10 115380 CASAVA_Build 6 85340879 3D TGAATCACTA AAG/--- AAGTTTAGGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AAG 2 1 115381 CASAVA_Build 6 85342590 1I TCAAAATAAC -/A AAAAGTAAAT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 4 5 115382 CASAVA_Build 6 85344164 5I TGGGCCCTCT -----/TAACA TGACATTACC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAACA 0 1 115383 CASAVA_Build 6 85345045 1I ATGGAATAAT -/G GGGTAATTTG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 G 3 4 115384 CASAVA_Build 6 85345636 1I AAATAGCTCC -/A AAATGTGTAC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 3 4 115385 CASAVA_Build 6 85347912 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 T 9 8 115386 CASAVA_Build 6 85351012 1D ATTTATAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 9 8 115387 CASAVA_Build 6 85355281 1I TGCAGGTACT -/G GGTCCCTAGC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 2 3 115388 CASAVA_Build 6 85356611 1D GATGCTCACA T/- TTTTTCTGAC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 6 5 115389 CASAVA_Build 6 85360277 3I CATAGCACAT ---/ATA ATAACGTCTG 3070 hom 120 het 50 0 41 10 ATA 1 2 115390 CASAVA_Build 6 85360978 1D AATTATTCAC T/- TTGAAGGTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 T 3 2 115391 CASAVA_Build 6 85362584 15I GGCTGATTTT ---------------/TTTGTTTGTTTTTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TTTGTTTGTTTTTTG 1 2 115392 CASAVA_Build 6 85365838 2I48M4I ATATTTAACT --AGAGTCTACAACTAATGTTGTATATGTAGCACAACACATTTTTAGTGC----/ACAGAGTCTACAACTAATGTTGTATATGTAGCACAACACATTTTTAGTGCTAAA TAGTGATTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 18 N/A 0 0 115393 CASAVA_Build 6 85366953 1D AATATATAAA T/- AACATATAAT 1556 hom 10 het 4 0 4 0 T 1 0 115394 CASAVA_Build 6 85371413 20D ATATATATAT TTATATATATATATATATAA/-------------------- AATGCTTAGA 1811 hom 10 het 5 0 4 2 TTATATATATATATATATAA 1 0 115395 CASAVA_Build 6 85371836 1I TTCTAATTTT -/A AAACATTTCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 3 4 115396 CASAVA_Build 6 85373183 1D GAAAGTTTTA T/- TCAAGATGAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 1 115397 CASAVA_Build 6 85373566 1I TGGGAACCTA -/G TGGGACTTCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 0 1 115398 CASAVA_Build 6 85373804 14D AATGAACCTA ACTGCAAGTCTCTT/-------------- GTCTTCTTTG 3070 het 3070 ref 41 24 20 3 ACTGCAAGTCTCTT 1 0 115399 CASAVA_Build 6 85381964 1I ATCTTCCTCA -/G GGTTCATGAA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 G 2 3 115400 CASAVA_Build 6 85384172 4D TTGAGAAATA TTGT/---- TTGTTTGGCA 3070 hom 108 het 38 0 37 3 TTGT 2 1 115401 CASAVA_Build 6 85398791 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 70 het 26 0 24 4 A 10 9 115402 CASAVA_Build 6 85402974 1I AGCTATCCCT -/C CCCCCTCCCC 2349 hom 22 het 12 0 6 6 C 5 6 115403 CASAVA_Build 6 85410825 1D AGGGCAAGGT G/- GGAATGGCAG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 G 3 2 115404 CASAVA_Build 6 85426065 2D GGAAGTTGAC TT/-- TCCTCTAAGG 3070 hom 99 het 34 0 31 3 T 3 1 115405 CASAVA_Build 6 85427036 1I GAATCCTAGG -/A AAAAAAATCC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 7 8 115406 CASAVA_Build 6 85439435 1D AATCAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 26 11 T 11 10 115407 CASAVA_Build 6 85444055 1I AAGAAGGTGA -/T TTTTTCCCCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 5 6 115408 CASAVA_Build 6 85444975 1I GTTGGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 39 1 33 5 A 10 11 115409 CASAVA_Build 6 85445907 1I TTTTATTTAT -/A TTTTTTATAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 0 1 115410 CASAVA_Build 6 85446931 1I CAGAGGGGGT -/G GGGGCGTGGG 3070 hom 74 het 28 0 22 6 G 4 5 115411 CASAVA_Build 6 85448398 7D CAAGTGTGCA GTTTGAC/------- GTTTGACGTT 3070 het 2670 hom 31 8 18 7 GTTTGAC 3 2 115412 CASAVA_Build 6 85464652 2D AATTTTAAAC TT/-- ATATTTACTA 3070 het 3070 ref 38 19 18 2 T 2 0 115413 CASAVA_Build 6 85465019 2D TTTTGGTAAC AG/-- AAATTATACA 3070 het 3070 hom 33 14 17 4 AG 1 0 115414 CASAVA_Build 6 85471955 1I TTTAAAAATG -/A AAAAAAGTCT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 6 7 115415 CASAVA_Build 6 85472860 1I CCATTTGCTA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 63 30 26 7 T 7 8 115416 CASAVA_Build 6 85475318 1D GGGAAAAGCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 14 12 5 T 8 7 115417 CASAVA_Build 6 85485095 3D GAGCAGACCA ATT/--- ATTAGGCAAT 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 ATT 2 1 115418 CASAVA_Build 6 85486453 1D GTCGGGACCC A/- GGAGGTAAGG 3070 het 3070 ref 54 29 15 10 A 1 0 115419 CASAVA_Build 6 85489876 1I GTACTCAAGT -/C CCCTTATAAA 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 C 3 4 115420 CASAVA_Build 6 85497707 1I AACAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 A 11 12 115421 CASAVA_Build 6 85498030 1D AGACATCACA C/- CCACTAGGCT 3070 het 2260 hom 39 8 17 14 C 3 2 115422 CASAVA_Build 6 85498050 2I TGGCTGTAAT --/AA AAAAGACTGA 3070 het 1917 hom 40 8 16 16 A 4 6 115423 CASAVA_Build 6 85499258 2D ACAGATACAG TA/-- TATATATATA 3070 het 979 hom 29 5 12 12 TA 8 7 115424 CASAVA_Build 6 85513623 1D ACTGAAATTG A/- AAAAAAAAAA 2339 het 2339 ref 47 32 5 10 A 13 12 115425 CASAVA_Build 6 85514101 3I TAATTAAGAT ---/ATC ATAATTCAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATC 0 1 115426 CASAVA_Build 6 85515925 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 27 0 21 7 T 13 12 115427 CASAVA_Build 6 85518624 1D GATTTGAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 A 11 10 115428 CASAVA_Build 6 85521530 4D28M3I AATGCTGCTT TAAATAAAGTCTATTGAAATCATAAAGTTAAT---/----TAAAGTCTATTGAAATCATAAAGTTAATATC ATATAGATTG 3070 het 1119 hom 24 3 10 16 N/A 0 0 115429 CASAVA_Build 6 85528600 1I AAGAGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2594 hom 31 9 16 6 A 10 11 115430 CASAVA_Build 6 85532419 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 77 het 31 0 24 9 TA 10 8 115431 CASAVA_Build 6 85537947 1D CAAAGTGATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 9 8 115432 CASAVA_Build 6 85538544 1I CCATCTGCCT -/A CGGAAAGGTG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 0 1 115433 CASAVA_Build 6 85541647 2I ACGAGATAGA --/CT CTAAGTCTCC 3070 hom 86 het 31 0 24 7 CT 1 2 115434 CASAVA_Build 6 85542418 1I TTTCATCATA -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 156 het 59 0 52 7 T 6 7 115435 CASAVA_Build 6 85545474 3D AAAGACACAT GGG/--- GGGAAATTTT 3070 het 3070 hom 48 23 22 5 G 6 3 115436 CASAVA_Build 6 85555340 2D TGGCTATGAT AA/-- AAAAAAAAGT 3070 het 60 hom 35 3 18 14 A 10 8 115437 CASAVA_Build 6 85568001 1D GCCACCTCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 80 het 32 0 27 5 T 10 9 115438 CASAVA_Build 6 85570783 12D TAATTGTGTT TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 749 hom 26 5 12 15 TG 14 8 115439 CASAVA_Build 6 85577461 1D ATGTATGTTG A/- AAAAAATATT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 7 6 115440 CASAVA_Build 6 85579804 1I TTTGAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 10 11 115441 CASAVA_Build 6 85583235 1I CTTTGTCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 11 12 115442 CASAVA_Build 6 85590760 1D AAGTTCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 11 12 T 13 12 115443 CASAVA_Build 6 85592848 1I AAAATGGTAA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 T 7 8 115444 CASAVA_Build 6 85618115 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2932 het 2678 hom 22 8 9 5 A 15 14 115445 CASAVA_Build 6 85630198 1I CTTACTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 9 10 115446 CASAVA_Build 6 85630269 1D TTTGATTAAC A/- AAAAAGCCTA 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 A 6 5 115447 CASAVA_Build 6 85631974 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAGGAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 6 7 115448 CASAVA_Build 6 85639718 1D GCCCCACTGA T/- TTTTTTTTTT 1436 het 1436 ref 38 27 5 6 T 13 12 115449 CASAVA_Build 6 85659418 1D GGGGACTATC T/- GGGAACAGGA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 1 0 115450 CASAVA_Build 6 85664173 1I AGTAAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 A 13 14 115451 CASAVA_Build 6 85664622 6D TGGAAACTAT CAAAAC/------ CAGAAGATTT 3070 het 3070 ref 34 20 14 4 CAAAAC 1 0 115452 CASAVA_Build 6 85666329 1D TCACATTTCC T/- TAATGATTAA 3070 het 3070 ref 23 12 11 1 T 2 1 115453 CASAVA_Build 6 85666706 1D TTAGGTGTTA C/- ATTTAGATAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 C 1 0 115454 CASAVA_Build 6 85667425 1I CCTATGTCAT -/C TGTAAGTAGA 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 C 0 1 115455 CASAVA_Build 6 85672571 1I TTCATAATAA -/T TAACAACAGA 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 T 1 2 115456 CASAVA_Build 6 85673587 1D TTTCAGGGGG A/- AAAAAAAAAC 1189 het 1189 ref 46 32 4 10 A 10 9 115457 CASAVA_Build 6 85673709 1I AGGAATATGA -/G GGTAGAGAGG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 G 2 3 115458 CASAVA_Build 6 85675764 1I GTTAACATAC -/A GCATGCATTA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 0 1 115459 CASAVA_Build 6 85696340 1D GAGGATACAC T/- TTGGACATTA 3070 het 3070 hom 43 18 20 6 T 3 2 115460 CASAVA_Build 6 85704756 1D AAAGGAAAGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 2636 hom 20 8 8 4 A 9 8 115461 CASAVA_Build 6 85720293 2D AGCTTTATGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 9 T 16 14 115462 CASAVA_Build 6 85727562 5I TCTTTTCTTT -----/TCCTC TCCTCTCTCT 3070 het 2059 hom 23 6 11 6 TCCTC 1 2 115463 CASAVA_Build 6 85728781 3D TCAAGGCAAC CAT/--- CATACTTGAA 3070 het 3070 ref 45 19 21 5 CAT 2 1 115464 CASAVA_Build 6 85729220 1I GTGAAGTTAA -/T TTAGAATAGT 3070 het 3070 hom 62 23 30 9 T 2 3 115465 CASAVA_Build 6 85732742 4I ATAGGTTAAG ----/TGAA TTCTTAGTAG 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 TGAA 0 1 115466 CASAVA_Build 6 85733920 1I TGGCCTATTT -/G GGGGGGTTCC 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 G 6 7 115467 CASAVA_Build 6 85739860 10D TATATAAGGA ACAGAAATGT/---------- ATTGGTTCAC 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 ACAGAAATGT 1 0 115468 CASAVA_Build 6 85761664 7I AAGAAGAAAG -------/AAGAAGT AAGAAGAAAG 3070 het 2276 hom 28 9 13 6 AAGAAGT 0 1 115469 CASAVA_Build 6 85765305 5I AAATTGAAAA -----/ATGTG ATGTCAGCCA 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 ATGTG 0 1 115470 CASAVA_Build 6 85770469 1I TTTCCAGGTT -/A AAAATTGAAT 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 A 4 5 115471 CASAVA_Build 6 85839017 2D AGGGCACTGT CA/-- CAGTGGGATT 3070 het 3070 ref 31 20 9 4 CA 2 1 115472 CASAVA_Build 6 85847541 2D AGCTTCAGAA AG/-- AGAAAATGAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 AG 2 1 115473 CASAVA_Build 6 85849796 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2480 het 1537 hom 20 8 7 5 A 16 14 115474 CASAVA_Build 6 85892818 3D TTGAAATGAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 22 7 9 6 A 17 14 115475 CASAVA_Build 6 85895209 2D ATATATATAC GT/-- GTGTGTGTGT 2670 hom 27 het 13 0 10 3 GT 6 5 115476 CASAVA_Build 6 85902985 1I CCCCACTGCA -/C AGCCCTGACC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 C 0 1 115477 CASAVA_Build 6 85903493 1I GTAGAGGATT -/G GGGTAAATGT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 G 3 4 115478 CASAVA_Build 6 85903635 3D7M2D5M6I12M6I CTTAGCCAGA TTTTATACCAAGGCAAC------CATCACAAATCA------/---CATATCA--GCATCTTTGTTTCTCAGAAATGAATTTTG CCTCTGTCTA 3070 hom 69 het 24 0 24 5 N/A 0 0 115479 CASAVA_Build 6 85905935 2D ACTGGAAGTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 11 9 115480 CASAVA_Build 6 85909102 3I AAAGGATAAC ---/CTT CTTCATACAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 CTT 1 2 115481 CASAVA_Build 6 85924724 1D ATTATCTTTG T/- TATGTAGTGA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 2 1 115482 CASAVA_Build 6 85925759 2I TTATTAACTC --/TT TATATATTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 1 3 115483 CASAVA_Build 6 85926515 3D ATTGATTAGT TAA/--- TTATTTAATT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 TAA 1 0 115484 CASAVA_Build 6 85932896 1D AAAAGAAGGC A/- AAAAATAAAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 6 5 115485 CASAVA_Build 6 85935054 1I TTTTCATAGA -/G ATGTCCACAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 0 1 115486 CASAVA_Build 6 85939788 6D ATCCTTTTAC TCTATG/------ TCTATGAGTT 3070 hom 69 het 24 0 22 2 TCTATG 2 1 115487 CASAVA_Build 6 85942057 1D GTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 10 9 115488 CASAVA_Build 6 85942527 1I TAACTTTTTT -/A AAAAAACCAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 6 7 115489 CASAVA_Build 6 85944387 2D ATGTTATTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 28 1 17 10 T 16 14 115490 CASAVA_Build 6 85944788 2I TTCCTGCAGA --/CT CATAGAGGTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 CT 0 1 115491 CASAVA_Build 6 85949076 16D ACGTGGAAGG GAAAGCAATAAGATGA/---------------- GAAAGCAATA 3070 hom 69 het 31 0 24 9 GAAAGCAATAAGATGA 2 1 115492 CASAVA_Build 6 85952399 1D ATACCAAGAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 78 het 47 1 43 4 A 8 7 115493 CASAVA_Build 6 85960564 1I AGATTCATAG -/A AAAAAATGTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 6 7 115494 CASAVA_Build 6 85960667 10I ACGGCTTTAT ----------/AAAATTCCTC ACCAACGGTG 3070 hom 84 het 29 0 29 1 AAAATTCCTC 0 1 115495 CASAVA_Build 6 85961556 1I GGGTAAAGGG -/A AGGGCTGTTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 1 2 115496 CASAVA_Build 6 85961717 1D AATGTATGAT A/- AAAAAATAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 6 115497 CASAVA_Build 6 85962695 1D AAAGTATCAC A/- ACTATGTCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 1 115498 CASAVA_Build 6 85965729 2D GTGAAATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 116 het 47 0 38 11 A 13 11 115499 CASAVA_Build 6 85973731 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 26 0 18 8 A 11 10 115500 CASAVA_Build 6 85979350 3I TTGCTGAGCT ---/GCA GTAGGCTTTG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 GCA 0 1 115501 CASAVA_Build 6 86000450 1D TGGAATTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 727 hom 35 3 22 10 A 14 13 115502 CASAVA_Build 6 86015033 1D ATGCCACTGA T/- TTTTTTACAT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 7 6 115503 CASAVA_Build 6 86047524 1D TTTTTTTTTT C/- TAAATAAAGG 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 C 1 0 115504 CASAVA_Build 6 86055519 1D ACACCTTATA C/- AAAAATTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 C 1 0 115505 CASAVA_Build 6 86056675 1D ATGCAGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 27 0 22 8 A 13 12 115506 CASAVA_Build 6 86064221 2D ATAACTAAAC AG/-- TAAGTCTGGA 3070 het 3070 hom 45 20 21 5 AG 1 0 115507 CASAVA_Build 6 86068640 2D ATATATATAT GA/-- GTGTGTATAT 326 het 326 ref 27 15 1 11 GA 1 0 115508 CASAVA_Build 6 86079723 1D CAGGCACAGA T/- AAGACAAATA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 1 0 115509 CASAVA_Build 6 86082528 4D AGTGATCTCT TAGG/---- TAAGTGATTC 3070 het 3070 ref 48 25 21 3 TAGG 1 0 115510 CASAVA_Build 6 86083754 1I ACATTGCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 10 11 115511 CASAVA_Build 6 86084748 1I AGAACCTCTA -/C TATGGAAGTG 3070 hom 29 het 21 0 18 3 C 0 1 115512 CASAVA_Build 6 86092006 3D18M1D CTCCATCCCA CACCACGTCACAGCACTCTAGA/---CACGTCACAGCACTCTAG- AAAAAATGGT 3070 het 3070 ref 30 19 10 8 N/A 0 0 115513 CASAVA_Build 6 86094020 4I CACCTGCATT ----/TCCC TCCCTCCCTC 3070 het 3070 ref 52 22 20 10 TCCC 2 3 115514 CASAVA_Build 6 86097843 3I TCATGCCATT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 CTC 0 1 115515 CASAVA_Build 6 86106247 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 2102 hom 12 het 10 0 5 5 TA 5 6 115516 CASAVA_Build 6 86109549 1I GATTGTTAGA -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 5 6 115517 CASAVA_Build 6 86114303 1I CAGCAGATTC -/T CTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 14 19 7 T 0 1 115518 CASAVA_Build 6 86114807 5D TATTTTGTAC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 T 15 10 115519 CASAVA_Build 6 86114894 9D GCCTTGTACT TTTTCTTTA/--------- TTTTCTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 8 TTTTCTTTA 2 1 115520 CASAVA_Build 6 86126756 4I AGAAGTTGGC ----/CAGA CAGACAGGTG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 CAGA 1 2 115521 CASAVA_Build 6 86129952 2D TGACATAGAC TT/-- AACAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 T 2 0 115522 CASAVA_Build 6 86139749 1D CATTATTTTC T/- TTTTTTTCAA 1740 het 1740 ref 21 15 5 2 T 8 7 115523 CASAVA_Build 6 86141663 1I CTTTTCCACG -/C CCCAGAGCCC 3070 hom 108 het 42 0 35 7 C 3 4 115524 CASAVA_Build 6 86143384 1I CTAAAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 10 11 115525 CASAVA_Build 6 86154165 1D TAAAAACTGT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 14 11 9 A 9 8 115526 CASAVA_Build 6 86156336 2I TGCCAGGAAC --/AT AGTCCCTGAA 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 AT 0 1 115527 CASAVA_Build 6 86162249 1D TTCTTTTCTT G/- GCAGTTTCTG 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 G 2 1 115528 CASAVA_Build 6 86170598 1I GCATGGCTTA -/T TGTTACCCTT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 T 1 2 115529 CASAVA_Build 6 86184070 1D TTTCTGGGTG T/- TTTTTTTTCC 3049 het 3049 ref 20 10 7 3 T 9 8 115530 CASAVA_Build 6 86207729 5D TAAACAAAAT TAAAA/----- TTTGTATTCT 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 TAAAA 1 0 115531 CASAVA_Build 6 86209486 1I TCCTGAGTAG -/C TGGGAATACG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 0 1 115532 CASAVA_Build 6 86210217 1D GTGGCCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 13 12 115533 CASAVA_Build 6 86215146 5D TCGTATCACT GTTAA/----- GTTTTTAGTT 3070 hom 126 het 46 0 43 4 GTTAA 1 0 115534 CASAVA_Build 6 86244464 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2067 het 1079 hom 27 6 9 12 A 17 16 115535 CASAVA_Build 6 86264667 1D CCAATTTACT G/- TATTAGTCCA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 G 1 0 115536 CASAVA_Build 6 86266187 1I TGCAATCAAA -/G AAGGAGCTTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 G 0 1 115537 CASAVA_Build 6 86275932 4I TCTCTAAGGT ----/TCTG TCTGTCCTAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TCTG 1 2 115538 CASAVA_Build 6 86277627 1D GCAAATAGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 T 8 7 115539 CASAVA_Build 6 86293835 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 83 het 34 0 28 6 T 9 10 115540 CASAVA_Build 6 86295352 1D AGCCAGGCGT G/- GTGGTAAATG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 G 2 1 115541 CASAVA_Build 6 86298471 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 115542 CASAVA_Build 6 86303436 1I AACCATTATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 115543 CASAVA_Build 6 86322433 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1024 het 1024 ref 36 30 3 5 A 12 11 115544 CASAVA_Build 6 86325374 1D AGAAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 37 2 28 7 A 12 11 115545 CASAVA_Build 6 86331549 4I AAAAGTAACT ----/AACA GAGTATATTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AACA 0 1 115546 CASAVA_Build 6 86336771 1D TTTTATGAAT G/- AATGACATGT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 G 1 0 115547 CASAVA_Build 6 86338998 7I TCAGAGAAAA -------/AAATACC AAATACCACA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AAATACC 1 2 115548 CASAVA_Build 6 86354566 1I GTCTGTACAC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 7 8 115549 CASAVA_Build 6 86363461 1D GACTGTAATC T/- TTTTTTTTTT 2967 het 2967 ref 33 18 9 6 T 15 14 115550 CASAVA_Build 6 86434679 1D GCATGTAAAG T/- ATCTCTAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 10 10 T 1 0 115551 CASAVA_Build 6 86435359 2I CATTCATCTC --/TT GTTTGGTTGG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 2 115552 CASAVA_Build 6 86437258 4I CCTTCCTTTC ----/TCTT TCTTTTTCTC 3070 hom 76 het 31 0 25 6 TCTT 1 2 115553 CASAVA_Build 6 86446121 2D ATATGTCTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1382 het 1382 ref 38 27 3 8 GT 6 5 115554 CASAVA_Build 6 86459406 2D AATTGTCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 41 1 21 21 T 16 14 115555 CASAVA_Build 6 86461243 3D TTCCTTTTTT TTA/--- TTATTATACT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTA 3 2 115556 CASAVA_Build 6 86468641 1I TATTTTCCCT -/C CCTGCCTGCC 2784 hom 6 het 13 0 8 5 C 2 3 115557 CASAVA_Build 6 86469295 5D GAGATCGTGC CACTG/----- CACTCCAGCC 3070 hom 99 het 34 0 32 3 CACTG 1 0 115558 CASAVA_Build 6 86485814 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 4 het 16 1 13 2 A 9 10 115559 CASAVA_Build 6 86485944 1D AGCCTGGGCT G/- GTATCTCATT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 G 2 1 115560 CASAVA_Build 6 86486916 1D TTAATTAATT A/- ATTATTATTA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 2 1 115561 CASAVA_Build 6 86494201 1D TAAGACTTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 38 0 32 7 T 9 8 115562 CASAVA_Build 6 86500118 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 31 1 16 14 T 12 11 115563 CASAVA_Build 6 86513962 1D TCTTTTTAAA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 8 7 115564 CASAVA_Build 6 86531823 3D CACTCCACAC CTT/--- CTTCGCAGGG 3070 hom 134 het 50 0 41 9 CTT 2 1 115565 CASAVA_Build 6 86535058 1D ATAGTGATGA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 132 het 52 0 45 7 T 9 8 115566 CASAVA_Build 6 86547317 1D CAAAAATATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 423 hom 30 1 27 3 A 10 9 115567 CASAVA_Build 6 86676726 1D AAGTATATTG A/- AAAAAAAAAA 960 het 960 ref 26 18 3 5 A 15 14 115568 CASAVA_Build 6 86695912 1D ATATCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1306 het 1306 ref 42 36 4 2 T 13 12 115569 CASAVA_Build 6 86708681 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 6 7 115570 CASAVA_Build 6 86731788 1I ACAAACAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 10 11 115571 CASAVA_Build 6 86746882 1I TCTGTGAAAT -/A AATGAAAACA 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 A 2 3 115572 CASAVA_Build 6 86764941 1I GTTCCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 19 0 14 5 A 10 11 115573 CASAVA_Build 6 86778482 1I GCAAAGAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1485 hom 23 4 16 3 A 13 14 115574 CASAVA_Build 6 86781389 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 9 8 115575 CASAVA_Build 6 86787926 1D TTTTTCTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 10 9 115576 CASAVA_Build 6 86802814 5D TAGGGAAGTT ATGCA/----- ATGCAATGAA 3070 hom 51 het 20 0 17 4 ATGCA 2 1 115577 CASAVA_Build 6 86814884 2I TCAGTATTTT --/AC AGTTTTTCTA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 AC 0 1 115578 CASAVA_Build 6 86829210 1D TTTTGAAGTG T/- TTTTCGAGTC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 5 4 115579 CASAVA_Build 6 86831337 1D ATTTTTATCC T/- TTTTTGTGGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 5 115580 CASAVA_Build 6 86845635 1D TCTGATAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 11 10 115581 CASAVA_Build 6 86902116 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 9 10 115582 CASAVA_Build 6 86917843 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 G 1 0 115583 CASAVA_Build 6 86920745 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 94 het 49 0 39 10 AC 8 9 115584 CASAVA_Build 6 86933823 2D AATTATATAT TA/-- TATATATATA 1356 hom 10 het 4 0 4 0 TA 6 5 115585 CASAVA_Build 6 86955392 1D GGTTTTTCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 138 het 52 0 47 6 T 9 8 115586 CASAVA_Build 6 86971808 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 12 10 115587 CASAVA_Build 6 86972976 1D CCACAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 485 hom 52 3 30 19 T 15 14 115588 CASAVA_Build 6 86975294 1D CCAAAAAGAG C/- TGATGTTGGG 3070 het 1918 hom 16 6 9 2 C 1 0 115589 CASAVA_Build 6 86980599 1D CAATAATATG A/- ACACACTCTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 2 1 115590 CASAVA_Build 6 86981694 1D ATCTGGAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 115591 CASAVA_Build 6 86987170 1I TCTTTCATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 9 10 115592 CASAVA_Build 6 86988470 1I TTATTGTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 65 het 40 1 34 5 T 8 9 115593 CASAVA_Build 6 87023078 1D CTGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 82 het 36 0 28 8 A 10 9 115594 CASAVA_Build 6 87039696 1I CATGCCCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2871 hom 32 8 18 6 T 9 10 115595 CASAVA_Build 6 87063727 1I TAATAGTTTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 19 9 8 A 8 9 115596 CASAVA_Build 6 87071129 1I ACTGCTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 21 8 9 4 T 8 9 115597 CASAVA_Build 6 87073927 1D TTATCACCAT A/- AGAAGTCTTT 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 A 2 1 115598 CASAVA_Build 6 87080153 1D GTCATGAGGA C/- CCCATTTCAG 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 C 4 3 115599 CASAVA_Build 6 87082026 1D CAATGACACA T/- TTAAAGTGAT 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 T 3 2 115600 CASAVA_Build 6 87083341 1I TACATGTGCA -/G GGTTTTTATT 2328 het 2328 ref 19 7 5 7 G 2 3 115601 CASAVA_Build 6 87108076 7D GAGAGACAGA GAGGTGT/------- GACATTTCAG 3070 het 3070 ref 52 29 23 4 GAGGTGT 1 0 115602 CASAVA_Build 6 87116870 1D GGATTTGAAG T/- AAATGTAATA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 1 0 115603 CASAVA_Build 6 87123978 1D TAAAGCCAAA G/- TTTGAGTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 G 1 0 115604 CASAVA_Build 6 87127212 1I CCTCTGGAAG -/T GTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 0 1 115605 CASAVA_Build 6 87131420 1D AAAATGCCTC T/- TTTTTTTTTT 2464 het 2464 ref 25 9 7 9 T 11 10 115606 CASAVA_Build 6 87149730 1I ATCTCACTTT -/A ACATTTTTTT 2144 het 2144 ref 27 10 6 11 A 1 2 115607 CASAVA_Build 6 87149768 1I CCCGGTAACA -/T TTTTTTTTAA 2551 het 2551 ref 29 15 6 8 T 8 9 115608 CASAVA_Build 6 87158147 1D TACAAATATA T/- TCCCTAAGGA 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 T 2 1 115609 CASAVA_Build 6 87159289 4I3M4D ACCTGGAACA ----GACAGTA/TCGGGAC---- CCTCCCACCC 3070 hom 81 het 28 0 27 4 N/A 0 0 115610 CASAVA_Build 6 87170481 1I ATTAAATATT -/A AAAAAAAAAC 1785 het 1785 ref 23 10 5 8 A 9 10 115611 CASAVA_Build 6 87172080 1D AGAAAAAGAG C/- CCTCACCAGG 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 C 3 2 115612 CASAVA_Build 6 87173572 1D TCAAGAGAAC T/- TTCCCACTCA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 3 2 115613 CASAVA_Build 6 87174853 1D ATACCTGAGA G/- TAGAAGGAAA 3070 het 3070 ref 52 27 17 9 G 1 0 115614 CASAVA_Build 6 87192611 4D ATCATTATTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 62 26 26 11 TTGT 5 4 115615 CASAVA_Build 6 87194031 2I CCACCTCAGC --/CT TCTGAGTAAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CT 0 1 115616 CASAVA_Build 6 87197358 1I TCCCCTACTT -/A ACACCACAGA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 1 2 115617 CASAVA_Build 6 87199610 5D ACACCCTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1251 hom 27 7 12 8 T 17 12 115618 CASAVA_Build 6 87203994 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 13 12 115619 CASAVA_Build 6 87213786 2D CTAGAAATAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 13 24 10 AC 8 7 115620 CASAVA_Build 6 87228180 3D GGAGAATGAG GAA/--- GAAGAAGAGA 3070 het 3070 hom 34 11 18 7 GAA 3 2 115621 CASAVA_Build 6 87230411 1D TCCATGGTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 8 7 115622 CASAVA_Build 6 87232600 4I CAGGCCCAGG ----/CCCT CCCTCCCTAT 3070 het 3070 ref 47 22 14 11 CCCT 2 3 115623 CASAVA_Build 6 87248165 6I ATATGGTTTT ------/CATCCA CATCCACAAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 CATCCA 1 2 115624 CASAVA_Build 6 87256035 2D CTGTAAAATT TC/-- TCTCTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 TC 3 2 115625 CASAVA_Build 6 87257701 5I ACACATTTAT -----/TGGCC TGGCCTACCA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 TGGCC 1 2 115626 CASAVA_Build 6 87260344 2I CATGATTTAG --/CT CTCTGTTTGT 1881 het 1881 ref 21 16 4 1 CT 2 3 115627 CASAVA_Build 6 87270282 1I CATTTATCCT -/A AAAAGCATGT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 4 5 115628 CASAVA_Build 6 87273395 4I CTCTGGTTGT ----/TTTA TTTGTTTCTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TTTA 0 1 115629 CASAVA_Build 6 87274474 2D TGAATTGGAG TC/-- TCTCTCTCTC 1372 het 1372 ref 34 20 3 13 TC 9 8 115630 CASAVA_Build 6 87275541 1I TATTCTAAGA -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 29 1 25 3 T 1 2 115631 CASAVA_Build 6 87280011 1D ATTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 27 0 16 11 A 15 14 115632 CASAVA_Build 6 87282584 1I GGAAATATGA -/C TTAGACATAC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 C 0 1 115633 CASAVA_Build 6 87292805 1I GAGGTCTGGC -/A GGGGCCAGTT 3070 hom 98 het 36 0 30 6 A 0 1 115634 CASAVA_Build 6 87294235 1I GTACATTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 8 9 115635 CASAVA_Build 6 87296192 1I AATGTATCTA -/C CATAATAGCT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 C 1 2 115636 CASAVA_Build 6 87296788 1I TACCAGTAAT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 7 8 115637 CASAVA_Build 6 87296968 1I CATATAATAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 7 8 115638 CASAVA_Build 6 87298577 1D ATAACAGAGT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 50 22 23 6 A 9 8 115639 CASAVA_Build 6 87309985 1D AGTTAGAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 9 115640 CASAVA_Build 6 87316192 1I TAAACTCTGA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 7 8 115641 CASAVA_Build 6 87320921 1I CCACCCCTCC -/A AAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 6 7 115642 CASAVA_Build 6 87320994 2D CATCCACACG CA/-- CACACACACA 1370 het 1370 ref 44 31 3 10 CA 9 8 115643 CASAVA_Build 6 87322902 4D TCTCTTTTTT TCTC/---- TCTCTCTCTG 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 TC 6 4 115644 CASAVA_Build 6 87335915 4D TCACACAGAT AGTC/---- AGTTGCACAA 3070 het 3070 ref 43 22 17 6 AGTC 1 0 115645 CASAVA_Build 6 87337059 2D GGGAAAAAAC AG/-- AGCAGAAAAA 3070 het 1304 hom 15 4 11 0 AG 2 1 115646 CASAVA_Build 6 87359067 6D TAAAATAGGC TTTGAG/------ TTAGATGACT 3070 hom 151 het 55 0 51 8 TTTGAG 1 0 115647 CASAVA_Build 6 87361439 1D TCAGAATCAA G/- GGGGGGCACT 3070 hom 92 het 34 0 31 4 G 7 6 115648 CASAVA_Build 6 87363875 1I ATTATACATC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 9 115649 CASAVA_Build 6 87376437 23D ATACAACGTC TGGAATCTATAGATAACATCAGT/----------------------- TGCTAGGTCA 3070 hom 75 het 28 0 26 8 TGGAATCTATAGATAACATCAGT 1 0 115650 CASAVA_Build 6 87377712 4D TGGCTCACTT TTTA/---- TTTAAATAAA 3070 hom 91 het 34 0 31 4 TTTA 2 1 115651 CASAVA_Build 6 87387386 1I ATTAGAGAGT -/C AACAATATTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 0 1 115652 CASAVA_Build 6 87388734 1D TTATTGAAGA C/- ACTGTTCTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 C 1 0 115653 CASAVA_Build 6 87393963 2D ATGAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 33 0 27 7 A 12 10 115654 CASAVA_Build 6 87421457 1I GCTTAAAGAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 115655 CASAVA_Build 6 87442213 11D TAAGTACCTT TCCTTCTTCTG/----------- TCCTTAACCA 349 het 349 ref 30 3 4 26 TCCTTCTTCTG 1 0 115656 CASAVA_Build 6 87442772 1D CCTGCCCTTC A/- ATATCCAATT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 2 1 115657 CASAVA_Build 6 87444942 2I TTGCTTTTCA --/TT TTGGGCCTGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 2 4 115658 CASAVA_Build 6 87460108 1D AAATTCTGGG T/- TGAAAATTCT 2775 hom 18 het 7 0 7 0 T 2 1 115659 CASAVA_Build 6 87461397 1D TTGGCTATGG C/- CTGCCCCCAG 2663 hom 19 het 11 0 6 5 C 2 1 115660 CASAVA_Build 6 87479086 3D CACCTACAAG ATC/--- ATCACCACAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 ATC 2 1 115661 CASAVA_Build 6 87482837 1D ATGATGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 6 T 11 10 115662 CASAVA_Build 6 87489777 4I ATGATAAATA ----/AAAC AAACAAAGAG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AAAC 1 2 115663 CASAVA_Build 6 87512000 1I TTAGAAAAAA -/C TATTTTTTCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 115664 CASAVA_Build 6 87512413 4I TCCATTTCTC ----/ACTT ACAGTTTCCC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 ACTT 0 1 115665 CASAVA_Build 6 87512880 14D AGACAAACCT CCTGCCTCGCTTAG/-------------- CCTGCCTCGC 3070 hom 89 het 33 0 28 8 CCTGCCTCGCTTAG 1 0 115666 CASAVA_Build 6 87521460 1D CTGAGCACAG T/- GCCTGGCACA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 T 1 0 115667 CASAVA_Build 6 87523941 1I GAATTCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 894 hom 42 4 32 6 T 11 12 115668 CASAVA_Build 6 87527373 4I TTCTTGTGAT ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 hom 68 het 25 0 22 3 AGTG 1 2 115669 CASAVA_Build 6 87527655 1D CTTTTATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 27 0 19 8 A 15 14 115670 CASAVA_Build 6 87534630 1D TTGTTTTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 33 3 15 15 T 15 14 115671 CASAVA_Build 6 87538940 4D GCTATCTCAC TAAT/---- TAAGATTCAG 3070 hom 84 het 30 0 28 4 TAAT 1 0 115672 CASAVA_Build 6 87557528 6I ACAGCATCAG ------/CATCAC CATCACCTGG 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 CATCAC 1 2 115673 CASAVA_Build 6 87562092 4D ATGAGAACTT ACTC/---- ACTATCACAA 3070 het 3070 ref 48 28 19 2 ACTC 1 0 115674 CASAVA_Build 6 87564541 1I AAAAATGAAC -/T TTTTTGTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 5 6 115675 CASAVA_Build 6 87592303 2I TGTATGTGTG --/TA TATATATATA 1918 het 1918 ref 24 9 7 8 TA 8 9 115676 CASAVA_Build 6 87594858 2I GTTTAAAAAC --/AA AGATATTTGT 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 A 1 3 115677 CASAVA_Build 6 87604729 1D CCCCATCTGG T/- GAAGGGGCCC 3070 hom 68 het 26 0 23 3 T 1 0 115678 CASAVA_Build 6 87670573 2I TTAGAATGAT --/TG TGTAAGTACA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TG 1 2 115679 CASAVA_Build 6 87710162 11D AAACCTCAGT TTCCTCATTTG/----------- TTGGGGCTCA 3070 hom 102 het 36 0 35 4 TTCCTCATTTG 1 0 115680 CASAVA_Build 6 87762929 2I AATAAAAGAT --/TA TGTTATTTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TA 0 1 115681 CASAVA_Build 6 87769976 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 13 0 11 2 A 13 12 115682 CASAVA_Build 6 87783168 1I CTTTTATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1349 hom 33 3 20 10 T 12 13 115683 CASAVA_Build 6 87804705 1I ATAGGTGCTC -/T GATTTTTAGA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 0 1 115684 CASAVA_Build 6 87807037 1I TTTTAACCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 9 10 115685 CASAVA_Build 6 87831355 9D GAGGCAGGAG AATCACTTT/--------- AATCCGGGAG 3070 het 3070 hom 28 10 18 3 AATCACTTT 1 0 115686 CASAVA_Build 6 87832104 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2146 het 1773 hom 17 4 8 5 A 13 14 115687 CASAVA_Build 6 87841865 1I TCATGTGAAC -/A GGTCAAAGCC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 0 1 115688 CASAVA_Build 6 87842409 1D ATGTATATAA G/- CATTAAAATG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 1 0 115689 CASAVA_Build 6 87842548 1I CCTGTCTCTA -/C CTAAAAGTAC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 C 1 2 115690 CASAVA_Build 6 87844322 1D GCATGATTCC G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 74 het 37 0 24 13 G 9 8 115691 CASAVA_Build 6 87855811 2D ACTAGTATTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 TG 8 7 115692 CASAVA_Build 6 87857713 1D GCTGTAGCAG A/- AACTATTACC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 3 2 115693 CASAVA_Build 6 87858522 3I TTTAAAAGGA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 11 14 115694 CASAVA_Build 6 87858961 4D AAAACAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 2486 het 1445 hom 25 7 10 9 AG 9 7 115695 CASAVA_Build 6 87866739 3I TATTAAGGGA ---/AGG AGATTTCCTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AGG 0 1 115696 CASAVA_Build 6 87876376 1D ACACTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 A 13 12 115697 CASAVA_Build 6 87878547 1D AAAAAAAAAA C/- ACAAATATTT 3070 het 3070 hom 32 16 16 2 C 1 0 115698 CASAVA_Build 6 87894164 4D AACTTATATG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 hom 27 9 12 7 TA 8 6 115699 CASAVA_Build 6 87894932 14D TATATCATAC ATATGATATATTAT/-------------- ATATGATATA 2395 het 1610 hom 9 5 6 2 ATATGATATATTAT 2 1 115700 CASAVA_Build 6 87901991 4D TTTACCATTT TACC/---- ATTTTCATTT 1154 het 1154 ref 19 10 3 7 TACC 1 0 115701 CASAVA_Build 6 87907035 4D CCTGACTCTT AGAA/---- AGAAAACTAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 4 AGAA 2 1 115702 CASAVA_Build 6 87914299 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1762 het 1762 ref 32 18 4 10 A 13 12 115703 CASAVA_Build 6 87917827 1D TATGCTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3053 het 3053 ref 34 13 12 10 T 12 11 115704 CASAVA_Build 6 87931277 1D TCGACTCACT G/- GCAACCTCTG 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 G 2 1 115705 CASAVA_Build 6 87935474 1I TTTTTATTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1116 hom 22 4 16 2 T 9 10 115706 CASAVA_Build 6 87936526 2D ACATTAACTC AA/-- AAGCATTGTC 3070 het 3070 ref 33 24 9 0 A 4 2 115707 CASAVA_Build 6 87940825 1D TAGGGAAACT C/- CCTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 C 3 2 115708 CASAVA_Build 6 87944660 4D TATGATTGTG TTTC/---- TTTCTTCTAC 3070 het 3070 ref 40 22 16 5 TTTC 2 1 115709 CASAVA_Build 6 87946876 1D AGCAGACAGA C/- CCTTGTCTAG 3070 het 3070 hom 55 23 29 3 C 3 2 115710 CASAVA_Build 6 87947124 2I CCCCAGCAAC --/CA CACAGGGAGA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 CA 2 3 115711 CASAVA_Build 6 87953852 2D GAACCCACTC TG/-- TGGTCAAATG 3070 het 3070 ref 32 18 13 3 TG 2 1 115712 CASAVA_Build 6 87957724 1D TGATGAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 A 11 10 115713 CASAVA_Build 6 87961370 1D AGCTCATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 11 10 115714 CASAVA_Build 6 87963523 4D AGATTCATTA TTAG/---- TTAAAGAAGT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 TTAG 1 0 115715 CASAVA_Build 6 87963859 1D AACATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2105 het 817 hom 24 3 7 14 T 17 16 115716 CASAVA_Build 6 87972785 1I CTTTGCTTTT -/C CAAACTCTTC 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 C 1 2 115717 CASAVA_Build 6 87975035 1D TCAAAGTTGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 9 8 115718 CASAVA_Build 6 87975542 1D CCCACTTTCA C/- CCCCCCCTCC 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 C 8 7 115719 CASAVA_Build 6 87999155 18D AAAACCCACA GAAGTTTTATCCTTTGGC/------------------ GAAGTTTTAT 2828 het 2828 ref 19 11 7 7 GAAGTTTTATCCTTTGGC 2 1 115720 CASAVA_Build 6 88001672 2I CACCTTTGAC --/AT GTGTTGTAAC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 AT 0 1 115721 CASAVA_Build 6 88010490 5D CTGCCTTAAA TTAGC/----- TTAGCTAACA 3070 het 3070 ref 51 25 24 6 TTAGC 2 1 115722 CASAVA_Build 6 88016731 3I AAGCCAAACA ---/TAG TGGTGTGTGC 3070 het 1728 hom 27 6 14 7 TAG 0 1 115723 CASAVA_Build 6 88028372 1I AACAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 16 12 A 10 11 115724 CASAVA_Build 6 88036738 1I TTTTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 T 10 11 115725 CASAVA_Build 6 88044744 5D AACATAAATC ATATT/----- ATAACCAGTT 3070 het 3070 ref 39 20 19 0 ATATT 1 0 115726 CASAVA_Build 6 88045357 4I ATCTTAAATC ----/TTGG TGCAGAATGA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TTGG 0 1 115727 CASAVA_Build 6 88065792 1D TCACAGTAAA G/- GATGGAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 G 2 1 115728 CASAVA_Build 6 88084318 1I AAACTTATGC -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 6 7 115729 CASAVA_Build 6 88084557 1I CCCCATTCTA -/T TTTTTTTTTT 1120 het 1120 ref 20 8 3 9 T 15 16 115730 CASAVA_Build 6 88088846 4I ACGTCCCTTG ----/CACA CACACTTCAG 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 CA 2 4 115731 CASAVA_Build 6 88089704 4D TTTGTTTTGT TTTG/---- TTTATTTATT 3070 het 2850 hom 28 8 13 8 TTTG 1 0 115732 CASAVA_Build 6 88107377 1D GTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2302 hom 29 6 12 11 A 15 14 115733 CASAVA_Build 6 88107824 1D CACCTGGCCC A/- GGGGCCTAGG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 1 0 115734 CASAVA_Build 6 88112487 1I TACTGTACAT -/A ACGTATGTAT 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 1 2 115735 CASAVA_Build 6 88113256 1I CACGTTTAAA -/T TAACCTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 1 2 115736 CASAVA_Build 6 88118538 1I GGGGATCGAC -/G CTTCCTGAAA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 G 0 1 115737 CASAVA_Build 6 88126715 1D CTCTTTCGAT A/- AAAAAAATAC 1197 het 1197 ref 31 22 5 4 A 8 7 115738 CASAVA_Build 6 88126979 4D GATTGCAGGT ACTC/---- ACTCACCACC 3070 het 2587 hom 17 6 10 1 ACTC 2 1 115739 CASAVA_Build 6 88129763 1I AACTATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 21 0 17 4 T 11 12 115740 CASAVA_Build 6 88130720 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 468 hom 25 1 15 9 A 9 10 115741 CASAVA_Build 6 88142919 4D AGAAAGAAAA AAAG/---- AAAGAAAGGG 3070 hom 110 het 40 0 37 3 AAAG 3 2 115742 CASAVA_Build 6 88145730 1D TTCCACTTTC T/- GCCACAAGTT 3070 hom 118 het 43 0 36 7 T 1 0 115743 CASAVA_Build 6 88145823 1I AAGGAACCTC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 103 het 38 0 32 6 T 6 7 115744 CASAVA_Build 6 88146758 2I TGAGCCAGAA --/AG AGAGCATGAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 AG 2 3 115745 CASAVA_Build 6 88148317 1I AGATACTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 19 1 16 2 T 11 12 115746 CASAVA_Build 6 88148871 1D ATTAAATATC T/- TATAAGGGTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 2 1 115747 CASAVA_Build 6 88157817 1I GGGTCAAAAA -/T ATTTATTTTG 3070 hom 108 het 42 0 35 7 T 0 1 115748 CASAVA_Build 6 88159617 1I AGTTGGGGGT -/G GGGCAGTGGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 3 4 115749 CASAVA_Build 6 88164768 3D ACAGAGAGAA GAT/--- GAGTGTTAGA 3070 hom 102 het 42 0 32 10 GAT 1 0 115750 CASAVA_Build 6 88167386 1I TCACTGATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 361 hom 38 1 29 8 T 9 10 115751 CASAVA_Build 6 88198994 1D CAGAGGAAGC A/- ATGATATGGT 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 A 2 1 115752 CASAVA_Build 6 88203814 1I ACTTTTGCCG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 T 9 10 115753 CASAVA_Build 6 88217009 2I TACTTATGGC --/AA AAAAAAAAAA 2049 het 2049 ref 33 12 9 12 A 14 16 115754 CASAVA_Build 6 88224955 2I TTGCAAAAAC --/AT GGATGGAACT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 AT 0 1 115755 CASAVA_Build 6 88228127 1D36M2I TCATTTTAAA CAACAAATATTTATAGTATGGAAAAAATAAAATATTT--/-AACAAATATTTATAGTATGGAAAAAATAAAATATTTTA TGTCTGTAGC 3070 het 3070 ref 24 15 12 4 N/A 0 0 115756 CASAVA_Build 6 88240055 17I ATGCTGTATG -----------------/CAGTTAGAAGGAACACT CTGCTATTTG 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 CAGTTAGAAGGAACACT 0 1 115757 CASAVA_Build 6 88247195 1I TTAGGAAAGG -/A AAGGAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 22 22 5 A 2 3 115758 CASAVA_Build 6 88249286 1D CTTCTGAACT G/- GGTGAGGTGT 1439 het 1439 ref 15 8 3 4 G 3 2 115759 CASAVA_Build 6 88249932 1I TTTTCACCTC -/T TTTTGAGGTT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 4 5 115760 CASAVA_Build 6 88255717 1I TTTAGGTTGT -/G GGGGGCAAAT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 G 5 6 115761 CASAVA_Build 6 88258983 1D TTTATCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 247 hom 33 4 15 14 T 19 18 115762 CASAVA_Build 6 88260291 1I CTTGAGATTC -/T CCCCATCCTT 3070 het 3070 hom 39 16 22 1 T 0 1 115763 CASAVA_Build 6 88263634 3I GCATCCTCTG ---/CTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 CTT 0 1 115764 CASAVA_Build 6 88264332 1D CTCCTGGCAG T/- TTTTTTTTTT 1583 het 1583 ref 28 10 9 9 T 16 15 115765 CASAVA_Build 6 88266038 2D TACATTAGAG AT/-- ATAGTTTACT 3070 het 3070 ref 39 25 13 1 AT 2 1 115766 CASAVA_Build 6 88275320 4I TAGGAACTAC ----/CACT CAATTTTAGT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 CACT 0 1 115767 CASAVA_Build 6 88278483 4I4M4I ATAAACAAAC ----TGTG----/TGAATGTGTAAC TAACTTCTCA 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 N/A 0 0 115768 CASAVA_Build 6 88282102 8I TGGGTAGAAA --------/CTAAGTAT CTATCCACTC 2112 het 2112 ref 39 22 9 8 CTAAGTAT 0 1 115769 CASAVA_Build 6 88292953 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 A 11 12 115770 CASAVA_Build 6 88293051 1I AAAAACATAG -/A GACCAATGGA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 0 1 115771 CASAVA_Build 6 88294501 1D CTGGGAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2954 hom 36 13 12 11 A 15 14 115772 CASAVA_Build 6 88296336 1D ATTTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1028 het 1028 ref 31 23 3 6 A 15 14 115773 CASAVA_Build 6 88299727 2I CCCTTAAAAC --/AT GTGAATATTC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 AT 0 1 115774 CASAVA_Build 6 88301490 5I GGTGGGAAAT -----/TCTTA TCAATGACTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TCTTA 0 1 115775 CASAVA_Build 6 88302600 1D CTTCTATAGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 A 9 8 115776 CASAVA_Build 6 88307514 1I TGTTTATTCT -/A AAAAGATTCT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 4 5 115777 CASAVA_Build 6 88311227 1I CACTCCTCTC -/T TTTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 T 5 6 115778 CASAVA_Build 6 88320839 1I TCTGGTAATT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 7 8 115779 CASAVA_Build 6 88331373 1I CATGTGCCCG -/T TAAGCCCAGC 2443 het 847 hom 10 2 6 2 T 1 2 115780 CASAVA_Build 6 88333693 4I CGCCTCAAAA ----/AAAC AAACAAAGAA 3070 het 2213 hom 27 9 14 4 AAAC 1 2 115781 CASAVA_Build 6 88337608 1D CATGGGGTGG T/- TTCCCCCATT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 3 2 115782 CASAVA_Build 6 88341510 2I TCATAAGGAT --/AG AGAGACAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 AG 2 3 115783 CASAVA_Build 6 88347029 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2468 hom 20 7 9 4 A 13 14 115784 CASAVA_Build 6 88357827 1D AAAACGGTTT A/- TGAGAAGCAG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 1 0 115785 CASAVA_Build 6 88367241 4I GGACTATGAG ----/TATT TATAAAACAG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TATT 0 1 115786 CASAVA_Build 6 88372461 1D TTGTCCAGGT A/- AAAATATAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 5 4 115787 CASAVA_Build 6 88374012 1D ACATTCTACC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 9 115788 CASAVA_Build 6 88378219 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 884 het 884 ref 17 11 2 5 A 12 11 115789 CASAVA_Build 6 88388054 1D TGTGGGATTT C/- CCTTGTTGGA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 C 3 2 115790 CASAVA_Build 6 88398832 1I TGGGATGGTC -/A AAAATTACTC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 4 5 115791 CASAVA_Build 6 88401178 3I TAGTTTTGAA ---/TCT TCTTGTCAGT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 TCT 1 2 115792 CASAVA_Build 6 88406577 4D TCCCCTTCTT CAGC/---- CAGCCTCTAG 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 CAGC 2 1 115793 CASAVA_Build 6 88413375 1I CTACTGTCTC -/T TTATCATTCT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 2 3 115794 CASAVA_Build 6 88426378 3I AAAAATTACA ---/TTT TAGAACCCAC 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 T 1 4 115795 CASAVA_Build 6 88434365 1I ACTCCGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2998 hom 38 11 20 7 A 10 11 115796 CASAVA_Build 6 88441433 1I GATACACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 11 12 115797 CASAVA_Build 6 88442609 4I ATTTCCTAAC ----/AATT AAAAAGGCTG 3070 het 2654 hom 22 8 11 3 AATT 0 1 115798 CASAVA_Build 6 88444783 1I AAAAATACAT -/A AAAAAAATTA 1707 het 1388 hom 11 3 5 3 A 7 8 115799 CASAVA_Build 6 88461760 3D AATGTTACAC ATT/--- ATGACAATGT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 ATT 1 0 115800 CASAVA_Build 6 88462325 1I CACTTAGCAG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 6 7 115801 CASAVA_Build 6 88465890 2D CAAATTAGTT TG/-- GAAATAACTT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TG 1 0 115802 CASAVA_Build 6 88476324 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1767 hom 16 6 8 2 A 13 12 115803 CASAVA_Build 6 88489538 1D AAATGGCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 T 10 9 115804 CASAVA_Build 6 88497791 1I CATGCCCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 T 10 11 115805 CASAVA_Build 6 88508056 2D TAATTTTTTT CC/-- CCCAAAGTGC 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 C 5 3 115806 CASAVA_Build 6 88516808 1I TTCGAACTGT -/G TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 21 0 14 7 G 0 1 115807 CASAVA_Build 6 88520685 1D CTGATTTGTC T/- TAATAGCAGC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 2 1 115808 CASAVA_Build 6 88526593 1I CACCTCAACA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 8 9 115809 CASAVA_Build 6 88531192 12D TGTCATCGCG AAACAAACAAAC/------------ AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 24 14 9 8 AAAC 6 3 115810 CASAVA_Build 6 88533457 12D ATTAAAGGCA CCCACCACCACG/------------ CCCGGCTAAT 2446 hom 15 het 7 0 6 3 CCCACCACCACG 1 0 115811 CASAVA_Build 6 88534478 1I ACACCATCTC -/A AAAAAGAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 5 6 115812 CASAVA_Build 6 88535329 1I TAATTATTAA -/G AAAAAAATAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 115813 CASAVA_Build 6 88544882 1D CTCCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1620 het 44 hom 6 1 5 0 T 12 11 115814 CASAVA_Build 6 88545338 2D CTTTTTTTTT TG/-- GGGGGGGGTG 3070 hom 47 het 27 0 22 6 TG 1 0 115815 CASAVA_Build 6 88555521 1D AAGTATGTGA T/- TAGGTGCTAA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 T 2 1 115816 CASAVA_Build 6 88558211 1D CTAATTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1153 hom 31 6 14 11 T 15 14 115817 CASAVA_Build 6 88563519 2D TTCTTCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 35 0 19 16 T 14 12 115818 CASAVA_Build 6 88575320 11D GAGTTTCACT CTTGTTGCCCA/----------- GGCTGGAGTG 3070 hom 70 het 26 0 23 5 CTTGTTGCCCA 1 0 115819 CASAVA_Build 6 88577352 2D ATGCTCGAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 373 hom 36 1 29 6 TA 8 7 115820 CASAVA_Build 6 88579131 1D TGGCCAAAAA G/- ATTTTCTTCT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 G 1 0 115821 CASAVA_Build 6 88584237 1D TGCATAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1083 hom 58 5 35 19 T 13 12 115822 CASAVA_Build 6 88606332 3D TTCCTCCAGA TAC/--- TATAGGGTAA 3070 het 3070 ref 43 24 14 6 TAC 1 0 115823 CASAVA_Build 6 88612387 1I CCATCTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1794 hom 28 8 12 8 A 15 16 115824 CASAVA_Build 6 88613788 1I TGAAAATTAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 T 7 8 115825 CASAVA_Build 6 88619002 3D CCTTGGCCTT AAC/--- AACAGTCTCT 3070 het 3070 ref 27 11 8 8 AAC 2 1 115826 CASAVA_Build 6 88621324 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1613 hom 18 5 9 4 T 9 10 115827 CASAVA_Build 6 88626037 1D GCATATTATC T/- AACAGGGTGG 3070 het 3070 ref 58 29 21 8 T 1 0 115828 CASAVA_Build 6 88632837 1D CAGGCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 19 13 T 12 11 115829 CASAVA_Build 6 88641430 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 3 A 14 11 115830 CASAVA_Build 6 88652092 1I GTACAAGGAA -/G GAAATCTATA 3070 hom 138 het 50 0 44 6 G 1 2 115831 CASAVA_Build 6 88658745 1I ACAAAGAAAA -/C AAGGAGATTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 115832 CASAVA_Build 6 88665306 1D TATTTTTGAA C/- CACCTGAATG 3070 hom 84 het 35 0 26 9 C 2 1 115833 CASAVA_Build 6 88666653 1I CCAAAGTTGC -/T TTGCCACTTT 3070 hom 174 het 66 0 57 9 T 2 3 115834 CASAVA_Build 6 88682880 1I TGTGGTTTAA -/T TGTGGAGAAA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 1 2 115835 CASAVA_Build 6 88682954 1D CCTGCTCCAT C/- CCCCTTTCAG 3070 het 3070 hom 44 18 21 6 C 5 4 115836 CASAVA_Build 6 88686256 1I TACCACAAAC -/G GGGGGTTTCA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 5 6 115837 CASAVA_Build 6 88688316 1I TCCATCTAAG -/A AAAAAAAAAA 2496 het 1831 hom 28 9 9 10 A 13 14 115838 CASAVA_Build 6 88695227 1D AAATAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 146 hom 37 1 22 14 T 12 11 115839 CASAVA_Build 6 88698648 1I CTCCCTTCTG -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 6 7 115840 CASAVA_Build 6 88701875 3I CAGAAAAAGG ---/ATC ATCTTCAAAG 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 ATC 1 2 115841 CASAVA_Build 6 88708028 72D AAAATATGTT TTTTTGGCACTGCCTTGAGTAGATGTAATCTCTACCCTTTGCTAGAAAACAGAAATGGAAATAATATGAAGA/------------------------------------------------------------------------ TTCCTAGAGA 2005 het 2005 ref 38 44 7 6 TTTTTGGCACTGCCTTGAGTAGATGTAATCTCTACCCTTTGCTAGAAAACAGAAATGGAAATAATATGAAGA 1 0 115842 CASAVA_Build 6 88721701 2D TTTCTAGAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 29 0 22 8 TA 7 6 115843 CASAVA_Build 6 88724152 1D GTATACATTT C/- CCCCAATAAG 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 C 5 4 115844 CASAVA_Build 6 88725414 2I ATATGCTCAC --/AT AGTTTTCTAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AT 0 1 115845 CASAVA_Build 6 88727207 1D AAGATATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2246 hom 31 10 11 11 T 11 10 115846 CASAVA_Build 6 88727715 2D GGCAATTATC AA/-- AGACTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 3 1 115847 CASAVA_Build 6 88729770 3I TACAATGACA ---/TAT TATTTTTCAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TAT 1 2 115848 CASAVA_Build 6 88730204 1D CATTTATGTT A/- AAAAAAAATC 2698 het 2698 ref 17 7 6 4 A 9 8 115849 CASAVA_Build 6 88733247 2D GAGCCCCATT GC/-- ACAGGCAGTC 3070 het 3070 ref 60 31 24 8 GC 1 0 115850 CASAVA_Build 6 88736044 2D CTCCATCTAC GT/-- GTGTTTTCTC 3070 het 3070 ref 42 19 17 8 GT 3 2 115851 CASAVA_Build 6 88749475 1D AAAATAATGG C/- TGAAAATTCC 3070 het 3070 hom 30 12 18 0 C 1 0 115852 CASAVA_Build 6 88752306 1D CAACAACATG T/- TAAAAGAATC 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 T 2 1 115853 CASAVA_Build 6 88755969 1D TAAAAGTTAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 T 8 7 115854 CASAVA_Build 6 88759165 1I GCTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 1599 het 1599 ref 22 13 5 4 A 11 12 115855 CASAVA_Build 6 88759871 1D GCATATTTTT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 30 14 16 1 A 7 6 115856 CASAVA_Build 6 88766902 1I ACACTGCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 9 10 115857 CASAVA_Build 6 88769510 1D ATTTATGCCC T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 8 7 115858 CASAVA_Build 6 88771506 3D GATCTGTGGT AGG/--- AGGGAGTAGG 3070 het 3070 hom 56 22 26 10 AGG 2 1 115859 CASAVA_Build 6 88772164 2I AGTCACAAGC --/AA GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 0 2 115860 CASAVA_Build 6 88776940 1D TCTCAATAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 A 10 9 115861 CASAVA_Build 6 88780488 3D CAACAATGAT CAC/--- CACCACCACC 3070 hom 126 het 47 0 41 7 CAC 5 4 115862 CASAVA_Build 6 88793644 1D CAGTTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 48 0 39 9 T 10 9 115863 CASAVA_Build 6 88797507 1I AGCTGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 11 115864 CASAVA_Build 6 88799121 1I ATTGGTTGAG -/T TTCTCTAAAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 2 3 115865 CASAVA_Build 6 88814905 1D TCATAGTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 112 het 47 0 36 13 T 10 9 115866 CASAVA_Build 6 88815221 1D ATACATTTGC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 138 het 50 0 45 5 T 8 7 115867 CASAVA_Build 6 88835892 1D TTGCCTCTTG T/- TATTGATTTC 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 T 2 1 115868 CASAVA_Build 6 88842411 1I CTCAAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 16 25 15 T 10 11 115869 CASAVA_Build 6 88858485 6D ACATGCACAG TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 56 het 23 0 16 8 TC 12 9 115870 CASAVA_Build 6 88862473 1I AATTAAACCC -/A GCGTAAATAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 0 1 115871 CASAVA_Build 6 88878200 1D AGGAGGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 19 13 5 A 11 10 115872 CASAVA_Build 6 88879936 4I AGCACAACTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 TTTG 2 3 115873 CASAVA_Build 6 88883792 1D TATCACATGA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 8 7 115874 CASAVA_Build 6 88886444 1I AGGAACATTT -/G GTGACTTGCT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 1 2 115875 CASAVA_Build 6 88886577 1D GCAGAGTCAC G/- GGAAAAAAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 G 3 2 115876 CASAVA_Build 6 88899581 1I CCCATTTAGC -/T TTTTTATGAA 3070 het 3070 ref 50 28 18 4 T 5 6 115877 CASAVA_Build 6 88907412 1I TGACTCTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1253 hom 38 3 28 7 A 10 11 115878 CASAVA_Build 6 88908814 1I AATGTTACCA -/T TTGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 58 28 20 10 T 2 3 115879 CASAVA_Build 6 88943868 1D GACTTAAAGG A/- GAAAAGTGTG 3070 het 3070 ref 48 21 20 8 A 1 0 115880 CASAVA_Build 6 88943971 5D GACTTAAGGA CTTAT/----- CTTATCATAT 3070 het 3070 hom 45 21 24 1 CTTAT 2 1 115881 CASAVA_Build 6 88950588 17D ACCTTCTGCC ATGATTTTAAGCTTCCT/----------------- AAGCCCCCAG 3070 het 3070 ref 43 31 16 3 ATGATTTTAAGCTTCCT 1 0 115882 CASAVA_Build 6 88956487 1D TATTTTCTTA T/- TGTTGAGTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 2 1 115883 CASAVA_Build 6 88956908 1D GAGGAGTTTT A/- AAAGCTTTTA 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 A 4 3 115884 CASAVA_Build 6 88957494 1D GTACCTTGTA C/- CCAGATTGCA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 3 2 115885 CASAVA_Build 6 88969286 1D TGCCCACATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 235 hom 22 1 17 4 A 12 11 115886 CASAVA_Build 6 88974148 1I TTTTTGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 10 11 115887 CASAVA_Build 6 88984876 1D CAGAGGAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 10 9 115888 CASAVA_Build 6 88995990 1I ATTGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 11 12 115889 CASAVA_Build 6 89011430 2D CTATTATCAA AC/-- ACAGAATTCT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 AC 2 1 115890 CASAVA_Build 6 89066033 1D TTTGACACTT A/- ACATTAGTTT 3070 hom 148 het 52 0 50 3 A 2 1 115891 CASAVA_Build 6 89066536 1I AATTCAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 T 11 12 115892 CASAVA_Build 6 89085404 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 6 7 115893 CASAVA_Build 6 89089822 1D ATCATCCTTG A/- AAAAAAAAAC 864 het 864 ref 45 34 3 8 A 10 9 115894 CASAVA_Build 6 89101824 7D3M2D GCCAGAGTAT TGGCAAGTTTAC/-------TTT-- AAGACGGTCT 3070 hom 54 het 23 0 18 6 N/A 0 0 115895 CASAVA_Build 6 89113172 1I ATAATGTTAG -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 A 6 7 115896 CASAVA_Build 6 89116162 1D CCAGTGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 33 3 21 9 T 11 10 115897 CASAVA_Build 6 89131204 1D TTAAATACTG C/- CAAACATATA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 C 2 1 115898 CASAVA_Build 6 89131436 1D AGATGCTGTG A/- ATGCAGCAGA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 A 2 1 115899 CASAVA_Build 6 89134628 1I TCATTATTCT -/G GGTTAAGAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 2 3 115900 CASAVA_Build 6 89159468 1I AATGGAAAGC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 8 9 115901 CASAVA_Build 6 89167375 3D GTTTTTGCTT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 2706 hom 23 7 13 4 TTC 3 2 115902 CASAVA_Build 6 89187653 1D CTCGATTAGG A/- CGAACCCAGG 3070 hom 27 het 11 0 10 2 A 1 0 115903 CASAVA_Build 6 89188685 1I GAGGCTTCCA -/G GGGGGCTTCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 5 6 115904 CASAVA_Build 6 89188776 1I GGTGTCCTTT -/G TTTTATACAA 3070 hom 78 het 28 0 26 3 G 0 1 115905 CASAVA_Build 6 89191159 3D AGCATAAGTC AAT/--- TAAACCTCTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAT 1 0 115906 CASAVA_Build 6 89195242 4D AAATTAGTGT TTGA/---- TTGAATAGCT 3070 hom 105 het 38 0 36 5 TTGA 2 1 115907 CASAVA_Build 6 89197203 4D GAAGATGCAC AAAT/---- AAACACAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 6 AAAT 1 0 115908 CASAVA_Build 6 89228375 4D ATTAAAACTT AGAA/---- AGAATCAAGA 3070 hom 96 het 33 0 33 2 AGAA 2 1 115909 CASAVA_Build 6 89229086 1D GTTGAAATTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 9 8 115910 CASAVA_Build 6 89244913 1D GATGTCCATG A/- AAAAAAAAAA 1847 het 1847 ref 33 20 4 9 A 12 11 115911 CASAVA_Build 6 89246155 2I TTCTTCAATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 TA 6 7 115912 CASAVA_Build 6 89262173 2D TGTTATACTC TA/-- TTGTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 TA 1 0 115913 CASAVA_Build 6 89267386 8D TGTCTCCACA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 3070 hom 21 het 14 0 8 6 AAAT 7 5 115914 CASAVA_Build 6 89273843 4D CTATTTATTC TATT/---- TATCATTCAC 3070 het 3070 ref 42 24 14 6 TATT 1 0 115915 CASAVA_Build 6 89279174 3D TTAACACCTG GTA/--- GTTTTCAGAG 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 GTA 1 0 115916 CASAVA_Build 6 89301019 2D GCAGCAGGAA AG/-- AGAGAATGAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 6 AG 3 2 115917 CASAVA_Build 6 89301469 1I TGGTAGCGTA -/G CAGACAGGCC 3070 hom 105 het 41 0 34 7 G 0 1 115918 CASAVA_Build 6 89397153 1D CATCTGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 20 6 T 13 12 115919 CASAVA_Build 6 89398266 1I TTGTTTCAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 9 10 115920 CASAVA_Build 6 89421064 1I AGATCTCATC -/T TTTTCTTCCC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 4 5 115921 CASAVA_Build 6 89442144 1I ACATGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 11 115922 CASAVA_Build 6 89456987 1I TCTACAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 T 11 12 115923 CASAVA_Build 6 89458892 1I AATACTCAGC -/A AAAAAAAAAA 1170 het 1170 ref 36 23 3 10 A 11 12 115924 CASAVA_Build 6 89475744 1I CTCAGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 33 0 25 8 A 12 13 115925 CASAVA_Build 6 89504644 2D TGAGAAAAAC AA/-- GAGACAAATT 3070 hom 144 het 51 0 49 3 A 2 0 115926 CASAVA_Build 6 89506164 42D TGAAAAAAAT TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------------------ TATATATATA 3070 hom 42 het 20 0 15 6 TA 26 5 115927 CASAVA_Build 6 89530669 4D GTTCTTTCGT AACA/---- GACAATTCTT 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 AACA 1 0 115928 CASAVA_Build 6 89535786 1I TTTGGTAGAG -/A GGGGGTTTCG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 0 1 115929 CASAVA_Build 6 89542760 1D CCTTTTGACC T/- TTTTTTTTTT 1115 het 1115 ref 35 17 4 14 T 15 14 115930 CASAVA_Build 6 89544865 1I TGCTAAGTGT -/C CCAATACTAG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 2 3 115931 CASAVA_Build 6 89574261 1D AAAGATTACA G/- GCAGAGGAAC 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 G 2 1 115932 CASAVA_Build 6 89580510 5D ACATAGGCTG TATTA/----- TCACAAGAGG 3070 hom 105 het 36 0 35 1 TATTA 1 0 115933 CASAVA_Build 6 89589885 1D AGGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 30 0 24 6 A 11 10 115934 CASAVA_Build 6 89601295 4I AATGAAATAC ----/ATAA ATAAACATAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 ATAA 1 2 115935 CASAVA_Build 6 89621937 1D AATCAGTTCC A/- AAAAAAAAAA 1328 het 1328 ref 29 21 3 5 A 13 12 115936 CASAVA_Build 6 89641096 1D ACAGAATCGT A/- AAAAAAAAAA 1740 het 1740 ref 39 33 4 2 A 12 11 115937 CASAVA_Build 6 89666572 1D TCAAATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 827 hom 46 3 38 5 A 13 12 115938 CASAVA_Build 6 89736922 1I CCCCTTGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 467 hom 15 1 12 2 A 9 10 115939 CASAVA_Build 6 89741007 1D CAAAAAAAAA T/- AATAATAATA 3070 het 270 hom 14 1 12 1 T 1 0 115940 CASAVA_Build 6 89742304 10D AAAAACAAAA ACAAATCCTG/---------- ACAAATAGAG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 ACAAATCCTG 1 0 115941 CASAVA_Build 6 89743628 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 12 11 115942 CASAVA_Build 6 89745083 1I TTTAAAAAAA -/T AATGGCCTCC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 0 1 115943 CASAVA_Build 6 89746999 2I TCAATTTCCT --/AA ATCTAAAAGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 3 115944 CASAVA_Build 6 89752426 2D GAATGGGAAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 86 het 42 0 26 16 TG 8 7 115945 CASAVA_Build 6 89753391 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1961 het 489 hom 9 1 7 1 A 15 14 115946 CASAVA_Build 6 89754815 1D TTTATTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 24 het 35 1 29 5 T 10 9 115947 CASAVA_Build 6 89756472 1D CTTGCAAAAA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 8 7 115948 CASAVA_Build 6 89756636 1I TTTTGTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 33 0 26 7 T 10 11 115949 CASAVA_Build 6 89757771 1D CAGATCGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 34 0 27 8 T 12 11 115950 CASAVA_Build 6 89762658 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 25 0 22 3 T 12 11 115951 CASAVA_Build 6 89764759 1I ACTTTGGTGT -/C CATGTTTAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 2 115952 CASAVA_Build 6 89767012 2D TAATAAAAAC AG/-- AAAGATTGGT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AG 1 0 115953 CASAVA_Build 6 89785185 1I TGTTTGTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 10 11 115954 CASAVA_Build 6 89787025 1D ATATCCTTAC A/- ATACCAAATA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 2 1 115955 CASAVA_Build 6 89798352 1I TGTCTTATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 10 115956 CASAVA_Build 6 89806686 2D TTCTCTTTTT CG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 CG 1 0 115957 CASAVA_Build 6 89808093 1I AGCGGTGAAC -/A AAAAAGACAA 3070 hom 162 het 61 0 54 7 A 5 6 115958 CASAVA_Build 6 89808923 2D AGAGAGAGAG AT/-- ATATATATAT 2732 het 229 hom 16 1 10 5 AT 10 9 115959 CASAVA_Build 6 89812351 1I TTCTGTAAGT -/C CAAATAATCA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 1 2 115960 CASAVA_Build 6 89817849 3D CTTGTTTAAC ACA/--- ACAATTCCCA 3070 hom 99 het 35 0 34 3 ACA 2 1 115961 CASAVA_Build 6 89842587 1D GACACCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 26 0 20 6 A 15 14 115962 CASAVA_Build 6 89843029 1I TATAAAGAGG -/A AAAAAAGACA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 6 7 115963 CASAVA_Build 6 89847279 4D CTTCACTGGC TTCA/---- TTCACCTTCT 3070 hom 51 het 19 0 16 4 TTCA 2 1 115964 CASAVA_Build 6 89849441 1I AAGTTTTTTG -/T TTGTTTTTTT 3070 het 45 hom 30 1 27 2 T 2 3 115965 CASAVA_Build 6 89866961 2D ATGTTATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 28 0 19 11 A 14 12 115966 CASAVA_Build 6 89868136 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 9 8 115967 CASAVA_Build 6 89871492 1D AGACCCTATC A/- AAAAAATATA 3070 hom 84 het 30 0 27 3 A 7 6 115968 CASAVA_Build 6 89872557 2D TTTAAATGTT TA/-- TGTTTTTTTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TA 1 0 115969 CASAVA_Build 6 89872723 1D GCTAATTTTT G/- TATTTTTAGT 3070 hom 32 het 12 0 11 1 G 1 0 115970 CASAVA_Build 6 89876529 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 12 11 115971 CASAVA_Build 6 89882248 1I CTAATTTTTT -/G TATTTTTAGT 3070 het 70 hom 12 1 11 0 G 0 1 115972 CASAVA_Build 6 89887713 1I ACGTATGTTC -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 115973 CASAVA_Build 6 89892832 1D GACCTGTCTT A/- AAAAAAAAAG 3033 hom 24 het 12 0 8 4 A 10 9 115974 CASAVA_Build 6 89896489 1D CTTCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 29 0 18 12 A 11 10 115975 CASAVA_Build 6 89897897 2I AGACTGAGGC --/TG GGGAAGATAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TG 0 1 115976 CASAVA_Build 6 89905682 1D AGTTTTTAAA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 8 7 115977 CASAVA_Build 6 89918532 1D GATGAGTACC A/- AAAAAAAAAA 1493 het 1493 ref 43 33 4 7 A 13 12 115978 CASAVA_Build 6 89949594 4I GAAAAAAAAA ----/AGAC AAGACAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 AGAC 0 1 115979 CASAVA_Build 6 89949942 2I GCAAGTTTTA --/GC CATAGAAACT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GC 0 1 115980 CASAVA_Build 6 89950119 1I CTCTTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 94 hom 39 1 29 9 A 10 11 115981 CASAVA_Build 6 89950766 1I GTGTCCCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 217 hom 24 1 22 1 T 10 11 115982 CASAVA_Build 6 89950855 2D AGCATGCCCC CG/-- CAGGCAACAG 3070 hom 84 het 32 0 27 6 CG 1 0 115983 CASAVA_Build 6 89967023 1I AAAATGAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 9 10 115984 CASAVA_Build 6 89967405 2I TTCCTGAGAC --/TG TGTTCAGCAG 3070 hom 80 het 33 0 25 8 TG 1 2 115985 CASAVA_Build 6 89972685 3I TATGTCACTT ---/CCC CTCTTAAAAC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 1 4 115986 CASAVA_Build 6 89973224 1I CAGCTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 11 12 115987 CASAVA_Build 6 89977359 1D CTTGAGAGGC A/- GGGGGTGAGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 0 115988 CASAVA_Build 6 89980291 1I GTTTTTAAAA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 7 8 115989 CASAVA_Build 6 90016174 2I GCCAGAATTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 12 12 15 TG 5 6 115990 CASAVA_Build 6 90034042 1I CATATTTTCC -/T TGGGGTTAAG 3070 hom 108 het 40 0 35 5 T 1 2 115991 CASAVA_Build 6 90035095 1D TTTGGGGGAC G/- GGGGGGGGCT 1948 het 365 hom 18 4 8 6 G 9 8 115992 CASAVA_Build 6 90044071 3I ACACATGTAC ---/CTG CTGAATCTAA 3070 hom 47 het 24 0 15 9 CTG 1 2 115993 CASAVA_Build 6 90046135 1I AAAAAAAAAA -/C CCCCACTGAT 3070 hom 15 het 38 1 27 10 C 4 5 115994 CASAVA_Build 6 90046650 30D CTAAAAACAA ATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------ ATATATATAT 2961 het 229 hom 11 2 8 3 AT 21 6 115995 CASAVA_Build 6 90052465 4D CACCCCCAAC AACA/---- AACAAACTCT 3070 hom 41 het 18 0 15 4 AACA 2 1 115996 CASAVA_Build 6 90054716 1I GGGCAAAGAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3056 hom 24 8 10 6 A 8 9 115997 CASAVA_Build 6 90060593 3I ATAATTTTTC ---/GTT GTTGTTTTTG 3070 hom 45 het 20 0 14 6 GTT 2 3 115998 CASAVA_Build 6 90069855 1D GCTGTCAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 28 1 24 4 A 11 10 115999 CASAVA_Build 6 90071027 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 9 het 14 0 12 2 A 8 7 116000 CASAVA_Build 6 90072513 1I AAGATCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 586 hom 26 2 16 8 T 12 13 116001 CASAVA_Build 6 90087195 1I ATTACCTATT -/G GAGGCCAGGC 2650 het 2650 ref 19 9 7 3 G 1 2 116002 CASAVA_Build 6 90088802 4D AAATAAAATA AAAT/---- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 AAAT 1 0 116003 CASAVA_Build 6 90089390 5D TATACAAAAA TCAAC/----- TCAAGATGGA 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 TCAAC 1 0 116004 CASAVA_Build 6 90089581 1D CAGGGACATA T/- TAAGAGGTCA 3070 het 3070 ref 40 28 10 2 T 2 1 116005 CASAVA_Build 6 90089819 5D TTATACAAAT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 51 26 18 8 CAAAA 4 3 116006 CASAVA_Build 6 90093632 1D AGATTACGTA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 9 8 116007 CASAVA_Build 6 90103665 1D ACTCCAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1948 hom 31 8 10 13 T 16 15 116008 CASAVA_Build 6 90106459 1I ATCTCAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2694 het 2484 hom 28 9 11 8 A 13 14 116009 CASAVA_Build 6 90123346 1D AATGCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1973 het 1973 ref 33 25 5 3 T 13 12 116010 CASAVA_Build 6 90141209 2I GTATTTTTTG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 8 10 116011 CASAVA_Build 6 90141911 10D ATATATGTGC GTGTGCATGT/---------- GTGTGCATGA 3070 het 3070 ref 44 22 17 10 GTGTGCATGT 1 0 116012 CASAVA_Build 6 90143175 1I TGTTAACAGA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 34 13 16 5 T 7 8 116013 CASAVA_Build 6 90145295 4D TCCTGGGCTC AAGT/---- AAGTACTCCT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AAGT 2 1 116014 CASAVA_Build 6 90158408 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAG AAAAAAATCC 2402 het 115 hom 17 2 8 7 AAAAG 0 1 116015 CASAVA_Build 6 90163667 1I AAGAATCAGA -/G GTAACAAGTG 3070 het 3070 hom 62 25 31 6 G 1 2 116016 CASAVA_Build 6 90167700 1D CCCACAATAT A/- TTTTTTTTTT 3038 het 2033 hom 21 9 9 3 A 1 0 116017 CASAVA_Build 6 90191003 3D CTCACAATCA TGG/--- TGGAAGGCAA 3070 het 2821 hom 28 8 16 7 TGG 2 1 116018 CASAVA_Build 6 90195449 1I TTTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 9 10 116019 CASAVA_Build 6 90198795 1D AGCAAGAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 9 8 116020 CASAVA_Build 6 90210100 5I ATTTTTTGTA -----/GAGAT GAGATTTTGC 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 GAGAT 1 2 116021 CASAVA_Build 6 90231559 1D ATTGCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1747 het 1747 ref 27 13 5 9 T 17 16 116022 CASAVA_Build 6 90231865 1D GGCCTAATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 T 10 9 116023 CASAVA_Build 6 90237122 1D TTTCTGTTTT G/- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 G 1 0 116024 CASAVA_Build 6 90313636 1D CTTGTTATTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 2948 hom 40 11 19 10 G 10 9 116025 CASAVA_Build 6 90316689 1D AGCACCACTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 17 18 8 T 9 8 116026 CASAVA_Build 6 90327198 16D GAGGCCGAGG TTGCAGTGAGCCGAGA/---------------- TTGCGCTATT 2721 het 2522 hom 17 8 8 6 TTGCAGTGAGCCGAGA 1 0 116027 CASAVA_Build 6 90337489 4D GCCTTCTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 TTTG 3 2 116028 CASAVA_Build 6 90340753 1D GGATTTTGAC A/- ACCAAAAATG 3070 het 3070 ref 53 23 18 13 A 2 1 116029 CASAVA_Build 6 90343961 1I ATCCTCTACA -/T TGCTCCTTAG 3070 het 3070 ref 46 29 13 4 T 1 2 116030 CASAVA_Build 6 90348098 1I AGGGAAAAGT -/G GGGGGAGTGA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 G 5 6 116031 CASAVA_Build 6 90354615 7D GCCAGAATTC CACCTTG/------- CAGTTCTTGC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 CACCTTG 1 0 116032 CASAVA_Build 6 90360896 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 28 1 22 5 A 11 10 116033 CASAVA_Build 6 90366092 4D AGGTACTAAA TTGT/---- TTGTGTTGTA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TTGT 2 1 116034 CASAVA_Build 6 90367302 6D GGTGACACCT TATGTC/------ TACTAAAAAT 3070 hom 59 het 26 0 23 3 TATGTC 1 0 116035 CASAVA_Build 6 90373773 1D AGTAGTTATA T/- TTTTTTAACT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 6 116036 CASAVA_Build 6 90377612 1I TATTCCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 14 10 T 14 15 116037 CASAVA_Build 6 90381279 1I TCTTTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2496 het 1559 hom 31 9 10 12 A 13 14 116038 CASAVA_Build 6 90398809 4I CCTAAAAGAA ----/AAAT AAATAATTCA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 AAAT 1 2 116039 CASAVA_Build 6 90401501 1I TACCTGCTTT -/A AAAAAACAAA 2386 het 2386 ref 23 9 5 9 A 6 7 116040 CASAVA_Build 6 90407745 5D AGAGAAGTTA CTGGC/----- CTGGCCAGGA 1812 het 1812 ref 25 16 6 4 CTGGC 2 1 116041 CASAVA_Build 6 90418371 1D CACAACTATT A/- ACATCCATTA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 A 2 1 116042 CASAVA_Build 6 90423051 1D GGAGTATAGC T/- TTTTTTTTTT 2109 het 2109 ref 35 13 7 16 T 17 16 116043 CASAVA_Build 6 90427085 4D GGTAATTGAC TTTG/---- TTTGCAACTA 3070 het 2476 hom 18 5 11 2 TTTG 2 1 116044 CASAVA_Build 6 90430670 10I TTTCAGGCTT ----------/CCCTGAAGGG CACTACTGAG 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 CCCTGAAGGG 0 1 116045 CASAVA_Build 6 90447621 1D ATTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1242 het 1242 ref 44 33 3 8 T 11 10 116046 CASAVA_Build 6 90450101 3D CTTTGCTTGG AGA/--- AGAAGGGGGT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 AGA 2 1 116047 CASAVA_Build 6 90469379 1D GTAAAGGCCC T/- TTTTTTTTTT 1748 het 1384 hom 22 7 9 6 T 15 14 116048 CASAVA_Build 6 90481853 1I CTGCTTCCCA -/C CCTTCGTCAC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 C 2 3 116049 CASAVA_Build 6 90503067 1D CCCATCTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 A 10 9 116050 CASAVA_Build 6 90508887 1I CAAATTTTTA -/G GGAAGCTGAT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 G 2 3 116051 CASAVA_Build 6 90510214 1D TCCATAAACA C/- CCCCCCTCAG 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 C 7 6 116052 CASAVA_Build 6 90515337 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 23 1 20 2 A 10 11 116053 CASAVA_Build 6 90517411 1I TAAAAGAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 33 het 22 0 12 10 T 9 10 116054 CASAVA_Build 6 90519871 1D AAGTTATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 34 0 24 10 A 12 11 116055 CASAVA_Build 6 90521153 1D CCACACTTTA G/- AAGTCCAGAT 3070 het 3070 ref 55 28 23 4 G 1 0 116056 CASAVA_Build 6 90531697 2D ACTATGCCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 42 het 22 0 14 9 AC 7 6 116057 CASAVA_Build 6 90548225 1I GAATTCAGGA -/G TTTGAGATCA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 G 0 1 116058 CASAVA_Build 6 90554098 1D ATTTTTAAGT C/- GGGGGGGGGA 2392 het 2262 hom 19 9 8 2 C 1 0 116059 CASAVA_Build 6 90555566 1D TCTGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 31 1 26 4 A 12 11 116060 CASAVA_Build 6 90562133 1D GTGGCTCACA C/- CCGTAATCCC 3070 het 2681 hom 23 10 10 3 C 3 2 116061 CASAVA_Build 6 90582877 2D CATTTGGGGG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 11 9 116062 CASAVA_Build 6 90584281 2I CGACGGATAA --/CT CTGTTGTAAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 CT 1 2 116063 CASAVA_Build 6 90602407 3D ATAGACAGAT GTG/--- GTGGGGAACA 3070 het 3070 hom 44 17 22 7 GTG 2 1 116064 CASAVA_Build 6 90609309 1I AACAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 2389 het 1280 hom 18 6 8 4 C 0 1 116065 CASAVA_Build 6 90612060 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 11 12 116066 CASAVA_Build 6 90641930 1I AGCGAGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2918 hom 34 10 13 11 A 12 13 116067 CASAVA_Build 6 90648879 1I GCATTGCACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 9 10 116068 CASAVA_Build 6 90666414 1D CCTCCCTCAA G/- CCCTGGCAAC 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 G 1 0 116069 CASAVA_Build 6 90671037 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1075 het 1075 ref 29 13 5 11 T 16 15 116070 CASAVA_Build 6 90676650 1I CCAAGCTGGG -/A GGATGGCTTG 1893 het 1893 ref 24 16 5 3 A 0 1 116071 CASAVA_Build 6 90703153 3I AAACCCACAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 49 14 20 15 AAC 5 6 116072 CASAVA_Build 6 90707293 1D TAGTTTACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 141 hom 37 2 28 7 T 14 13 116073 CASAVA_Build 6 90708489 1D AAAAGGTAAT G/- GGTCAACTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 3 2 116074 CASAVA_Build 6 90712374 1I GACTTGTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 T 9 10 116075 CASAVA_Build 6 90715881 12D GGAGGTGGGT CCTCTGCAGGGG/------------ CCTCTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 7 CCTCTGCAGGGG 1 0 116076 CASAVA_Build 6 90728620 4I ATCATAATCA ----/TATC TATTATTCCC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 TATC 0 1 116077 CASAVA_Build 6 90730719 1I ATCAGGGGCT -/A GGGGGAAGAA 3070 hom 26 het 21 0 14 7 A 0 1 116078 CASAVA_Build 6 90739725 1I AGGTGATTGG -/A AAAATAGATG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 4 5 116079 CASAVA_Build 6 90764609 1D AATCCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 20 10 T 11 10 116080 CASAVA_Build 6 90775590 9D TTTAAAACAT TTAAAACAC/--------- ATTGGTATTT 2895 het 2895 ref 32 23 8 2 TTAAAACAC 1 0 116081 CASAVA_Build 6 90778305 1I AGGTTGCAGT -/G GGCCGAGATC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 G 2 3 116082 CASAVA_Build 6 90779951 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1629 het 94 hom 12 1 6 5 T 14 13 116083 CASAVA_Build 6 90802603 1I TCTCATCAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 9 10 116084 CASAVA_Build 6 90828863 1I AAGAGGTCTT -/A AGAGGACTTC 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 A 1 2 116085 CASAVA_Build 6 90835494 2D TTACTCCCAC AT/-- TTACTGAACT 3070 het 3070 ref 56 25 22 13 AT 1 0 116086 CASAVA_Build 6 90854168 1I CATGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 T 10 11 116087 CASAVA_Build 6 90863712 1D GTTCTATAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 77 het 44 1 38 6 T 8 7 116088 CASAVA_Build 6 90864714 1D GATTTCTTTG C/- CCCCCCCGCA 3070 hom 62 het 26 0 19 7 C 8 7 116089 CASAVA_Build 6 90866282 2D TTAGTATATT CA/-- CAGAGTTGTG 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 CA 2 1 116090 CASAVA_Build 6 90875021 11D GCTTGGGAAA CAGCCTGAGAT/----------- CAGCCTGAGA 3070 het 3070 hom 41 16 25 5 CAGCCTGAGAT 2 1 116091 CASAVA_Build 6 90887360 2I GTGTGAAAAT --/AA AGTTATTTGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 3 116092 CASAVA_Build 6 90925206 1I TTCTTTTGGT -/G GGGGGGGGGG 1979 het 914 hom 23 3 12 8 G 10 11 116093 CASAVA_Build 6 90956391 1I ACTCTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 T 10 11 116094 CASAVA_Build 6 90958746 1D TCTCGATTCC T/- TTTTTTTTTT 1209 het 1209 ref 39 31 4 4 T 13 12 116095 CASAVA_Build 6 90975704 4I TGTACAACAC ----/AGAG AGATCTTGGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 1 3 116096 CASAVA_Build 6 90977679 4D GGGCGGCAAG CAAA/---- CAAAGACACT 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 CAAA 2 1 116097 CASAVA_Build 6 90978663 1I TTTATTACAG -/A AAAGCTAATC 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 A 3 4 116098 CASAVA_Build 6 90995900 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 24 1 18 5 A 11 10 116099 CASAVA_Build 6 91004062 1D AAACCAATAG T/- TTACTTTCTC 3070 het 3070 hom 31 10 17 6 T 3 2 116100 CASAVA_Build 6 91008243 1I AAGATAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2933 hom 21 7 10 4 A 9 10 116101 CASAVA_Build 6 91017923 84D7M14D AAAATAGCCA CTCAGTACTCTGAAAACCATTAGTTTAGCACATACCCAGCACCTGCTTGACACATCTTAATCAACACTCTTTTGCTAGTCATATTAAAAAAAGAGAGAACCCTTT/------------------------------------------------------------------------------------TAAAAAA-------------- TGCTTTCAGA 3070 het 3070 ref 20 28 10 5 N/A 0 0 116102 CASAVA_Build 6 91020336 1I TGCCGAACTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 8 9 116103 CASAVA_Build 6 91039655 1I AAAATTAGCC -/A AGGCATGGTG 3070 het 3070 hom 46 17 19 10 A 1 2 116104 CASAVA_Build 6 91041881 2D AACCAAAATT TG/-- TTTTTACTTT 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 TG 1 0 116105 CASAVA_Build 6 91042409 1D ATTTCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1762 hom 31 9 15 7 A 13 12 116106 CASAVA_Build 6 91058054 1D CATCACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2687 hom 33 9 11 14 A 11 10 116107 CASAVA_Build 6 91067546 4I TTGTATTTGA ----/TTAC TTTTATTACT 2443 het 2443 ref 16 7 6 3 TTAC 0 1 116108 CASAVA_Build 6 91097199 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 2058 het 2058 ref 20 11 7 2 TA 6 7 116109 CASAVA_Build 6 91099029 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 11 10 116110 CASAVA_Build 6 91110463 1I TTTGTGGGGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 T 8 9 116111 CASAVA_Build 6 91117222 4D TTCTTGTGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 55 31 20 6 AGTG 2 1 116112 CASAVA_Build 6 91119441 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 15 1 11 3 T 15 14 116113 CASAVA_Build 6 91130614 1D GGTGTCATTT A/- GGGGTGGGGG 3070 het 2603 hom 29 7 18 5 A 1 0 116114 CASAVA_Build 6 91133536 2D GAGAGAGGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TA 6 5 116115 CASAVA_Build 6 91134281 1I TGTGTCCACA -/C TGTTTTGATT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 C 0 1 116116 CASAVA_Build 6 91153245 1I AGCTTTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 13 14 116117 CASAVA_Build 6 91178303 10D CTTTACTTAA ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 AT 10 5 116118 CASAVA_Build 6 91179272 1I TCAGTATCAT -/G GGGGAGGGCC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 G 4 5 116119 CASAVA_Build 6 91182026 1I TTACTTCAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 8 9 116120 CASAVA_Build 6 91191717 1D CTTCATGTAG C/- CCAAACAAGA 3070 hom 140 het 56 0 47 9 C 3 2 116121 CASAVA_Build 6 91194014 1I ATAATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 11 12 116122 CASAVA_Build 6 91196767 1I GATTTATTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 24 9 1 T 9 10 116123 CASAVA_Build 6 91197532 1I GGCTTTGTCT -/C CTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 C 1 2 116124 CASAVA_Build 6 91202600 8D TATATCTAGT CACGTTTC/-------- CACTTAGTAA 3070 het 3070 hom 36 18 19 3 CACGTTTC 1 0 116125 CASAVA_Build 6 91203750 10D ACATGCAAAT ATATTTGCAC/---------- ATATATGTGC 3070 het 3070 ref 35 20 14 5 ATATTTGCAC 1 0 116126 CASAVA_Build 6 91214592 1I TAAGTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 908 het 908 ref 37 18 3 16 T 15 16 116127 CASAVA_Build 6 91222114 1D CACTCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 785 hom 25 3 14 8 T 13 12 116128 CASAVA_Build 6 91231671 2D CTTACTAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 24 2 9 14 A 12 10 116129 CASAVA_Build 6 91238547 1D TATTTAGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 19 16 1 T 11 10 116130 CASAVA_Build 6 91246256 1I TTTCTCTAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 8 9 116131 CASAVA_Build 6 91251275 1I ACCCAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 11 12 116132 CASAVA_Build 6 91256018 1I GTTGTTATAA -/T TTTTTTTTTT 2740 het 2740 ref 34 21 6 7 T 10 11 116133 CASAVA_Build 6 91258242 5I CACAATAAAC -----/ATAAT ATTCAGAATT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 ATAAT 0 1 116134 CASAVA_Build 6 91259708 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 18 0 A 10 9 116135 CASAVA_Build 6 91262359 7D GTGGAAAATT TCTGGAA/------- TCAGAAATAA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 TCTGGAA 1 0 116136 CASAVA_Build 6 91262552 2D ATATTATTAT CA/-- GTTATTGCTG 3070 het 3070 hom 24 11 12 3 CA 1 0 116137 CASAVA_Build 6 91267716 9D TTCTCCCAAC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 2447 hom 25 8 11 6 T 20 11 116138 CASAVA_Build 6 91270335 4D TTCCCCTACT GATA/---- GACATTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 12 5 GATA 1 0 116139 CASAVA_Build 6 91270588 3I ATAATAATAG ---/ATA ATATTATATA 2459 het 1025 hom 9 3 6 0 ATA 1 2 116140 CASAVA_Build 6 91272027 4D AATAGGTGAC TAGA/---- TAAACAAAAT 3070 het 3070 ref 46 29 14 5 TAGA 1 0 116141 CASAVA_Build 6 91272775 2I TTTATCAAAT --/TC TCTTATTAAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 TC 1 2 116142 CASAVA_Build 6 91272840 1I TCCTGCAAAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 A 7 8 116143 CASAVA_Build 6 91280500 9D TCAAGAGTAA AATGTAATT/--------- AATGTAATTA 3070 het 3070 ref 31 20 10 4 AATGTAATT 2 1 116144 CASAVA_Build 6 91280993 1I AAAATTTCCC -/T TTAAATGTGT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 2 3 116145 CASAVA_Build 6 91281301 1D TTGGGAACAA T/- TAACACTCCT 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 T 2 1 116146 CASAVA_Build 6 91285655 3D TAAACTCTCT AAG/--- AAGAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 AAG 2 1 116147 CASAVA_Build 6 91287115 6D ACTTAAGGCA CTTACC/------ CTTACCCTTA 3070 het 3070 ref 45 23 18 7 CTTACC 2 1 116148 CASAVA_Build 6 91291550 1I TAAGATATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 9 10 116149 CASAVA_Build 6 91295076 3D TGTGTGTACA TAG/--- TAGGTACATA 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 TAG 2 1 116150 CASAVA_Build 6 91313399 1D GCAGAATTTC A/- ATTTCTCACT 3070 het 3070 ref 53 30 17 6 A 2 1 116151 CASAVA_Build 6 91323464 5I TAACACTATA -----/TAATT TAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 TAATT 0 1 116152 CASAVA_Build 6 91325824 1D GTGGGAGCTT G/- GGGGGAGGGT 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 G 6 5 116153 CASAVA_Build 6 91334528 1D TGGGAGGGAT A/- AGCATTAGGA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 2 1 116154 CASAVA_Build 6 91339010 2I TGAAATTATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 13 8 A 12 14 116155 CASAVA_Build 6 91351726 4D ATGAGGATAT TCTC/---- AATAATCTCT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 TC 2 0 116156 CASAVA_Build 6 91375905 3D ACTTTCTAGT ATA/--- ATCTTAAAAG 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 ATA 1 0 116157 CASAVA_Build 6 91379226 4I14M2D CCTCCCCGAG ----GAAAAAACCTGATTAA/GAAAGAAAAAACCTGATT-- AAAATTAAAA 3070 hom 87 het 27 0 30 3 N/A 0 0 116158 CASAVA_Build 6 91384646 2D GGGGCCTAAG AA/-- AGAGAGAATG 3070 het 3070 ref 57 30 22 6 A 3 1 116159 CASAVA_Build 6 91385780 1D TACTTTCTTT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 43 20 15 8 C 10 9 116160 CASAVA_Build 6 91387597 1I CCTTGATTAT -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 6 7 116161 CASAVA_Build 6 91389659 1I GCTACAGGAG -/T TTTTTTCATA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 6 7 116162 CASAVA_Build 6 91390998 10D AAGATTAGAG GAAAAAGAAT/---------- GAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 37 21 11 7 GAAAAAGAAT 2 1 116163 CASAVA_Build 6 91401005 1D TTTAACTACT A/- GTGAATAATC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 1 0 116164 CASAVA_Build 6 91402243 2I AGCATATTCT --/TA TATGTTTCCT 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 TA 1 2 116165 CASAVA_Build 6 91403282 1D TTAAAAAAAA T/- GTTCATATAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 T 1 0 116166 CASAVA_Build 6 91408987 2D TGGAATTCTG GA/-- GAGAGTCCTG 3070 het 3070 hom 48 20 23 7 GA 3 2 116167 CASAVA_Build 6 91413474 1I TTTCCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 A 12 13 116168 CASAVA_Build 6 91423348 4D TTGGCTTAAC ACTT/---- AGTGATGCAG 3070 het 3070 hom 36 10 23 3 ACTT 1 0 116169 CASAVA_Build 6 91425545 1D AATCAACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 A 10 9 116170 CASAVA_Build 6 91431914 2I14M4D TTTCTCTCTC --TCTCTTTCTTTCTATCTT/TTTCTCTTTCTTTCTA---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 31 19 10 13 N/A 0 0 116171 CASAVA_Build 6 91433076 1D GAAAGGACAC A/- AGGAGGACAC 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 A 2 1 116172 CASAVA_Build 6 91433224 1I TCACTTTTTT -/C TGCAGTCTTC 3070 het 3070 hom 60 27 22 11 C 0 1 116173 CASAVA_Build 6 91434035 2D AGACAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 51 18 23 12 AG 6 5 116174 CASAVA_Build 6 91434829 1I CAATGTGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 9 10 116175 CASAVA_Build 6 91461418 1D ACCAAAAGGA T/- TAAGTGCAGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 2 1 116176 CASAVA_Build 6 91468886 2D CATTTCTCAT GA/-- GAGATCTACT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 GA 3 2 116177 CASAVA_Build 6 91477664 1I AAACAGAAAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 48 15 26 7 A 8 9 116178 CASAVA_Build 6 91481922 2I CGCGCGCGCG --/CA CACACACACG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 CA 4 5 116179 CASAVA_Build 6 91487882 13D TGGGAACACA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 20 15 7 T 24 11 116180 CASAVA_Build 6 91504750 1D TAGGTTGGGG A/- AAATTCTCCT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 4 3 116181 CASAVA_Build 6 91508310 1I GGGCCTGGGA -/T TTTCTTCTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 3 4 116182 CASAVA_Build 6 91519286 1I AATACACTGT -/A ATTAAGGAAT 3070 hom 111 het 45 0 37 8 A 1 2 116183 CASAVA_Build 6 91525679 3I TCTCCTAGAG ---/AGA AGGTGTCCAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AGA 0 1 116184 CASAVA_Build 6 91570412 1I GTTGATTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 12 25 7 T 9 10 116185 CASAVA_Build 6 91586582 1I TATCTGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 10 11 116186 CASAVA_Build 6 91596583 4I ATACACACAC ----/ATAT ATATATATAT 1254 het 1254 ref 21 12 5 4 AT 5 7 116187 CASAVA_Build 6 91603536 1I GTATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 11 12 116188 CASAVA_Build 6 91604587 2I AGCGATTCTC --/GT GTCTCAGCCT 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 GT 1 2 116189 CASAVA_Build 6 91612533 1I CGACTTGGGC -/T TCATTATACC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 1 2 116190 CASAVA_Build 6 91612787 1D ATCTGATGTA G/- GGGCATTTGC 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 G 4 3 116191 CASAVA_Build 6 91613219 3I CTATACTTAA ---/TTG TTGTTATTTG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TTG 1 2 116192 CASAVA_Build 6 91619027 1I AGTGTCTTTT -/A AAGTATCTGT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 2 3 116193 CASAVA_Build 6 91619517 1I GTAATTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 403 hom 21 1 17 3 T 9 10 116194 CASAVA_Build 6 91629649 1D TGAATAAGGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 58 hom 37 3 20 14 T 9 8 116195 CASAVA_Build 6 91641370 1D AATTGTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 11 10 116196 CASAVA_Build 6 91645843 4I GAAACTCAAG ----/TCTC TCTTTCTTTT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 TC 1 3 116197 CASAVA_Build 6 91648232 1I TTGGATGCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 8 9 116198 CASAVA_Build 6 91649192 1I TTTCAAAGAA -/C CAGCTTTTTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 1 2 116199 CASAVA_Build 6 91650938 3D TTATTCTTTT TTC/--- TTTGTCTTTA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 TTC 1 0 116200 CASAVA_Build 6 91651574 3I TACTGGGATG ---/TTC TGAACCGCCT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TTC 0 1 116201 CASAVA_Build 6 91653303 25I AGATTTATGG -------------------------/GTCTGAGAAACCCTGACATTCTTTA GTCACTCTGA 3070 het 3070 ref 32 18 15 0 GTCTGAGAAACCCTGACATTCTTTA 0 1 116202 CASAVA_Build 6 91663976 10I TGCTCCTTAT ----------/TAATAACAAG AATACCTGTG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 TAATAACAAG 0 1 116203 CASAVA_Build 6 91675001 1I TGAATCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 A 10 11 116204 CASAVA_Build 6 91675826 4D TCTTTTCCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1160 het 1160 ref 25 12 4 11 T 20 16 116205 CASAVA_Build 6 91685997 1D GCATTAACAT A/- AAACACTCAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 3 116206 CASAVA_Build 6 91689979 1I AACAGCATTA -/T TTTGTTAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 3 4 116207 CASAVA_Build 6 91701447 1I AGCTTGGGTA -/G AAAATACTCA 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 G 0 1 116208 CASAVA_Build 6 91708378 1I ATACCCCATT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 8 9 116209 CASAVA_Build 6 91717473 1I AAAAATGAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 8 9 116210 CASAVA_Build 6 91721758 1D TTTGATGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 17 22 10 T 10 9 116211 CASAVA_Build 6 91724298 1I TAGTGCTATC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 7 8 116212 CASAVA_Build 6 91737362 1I CTTAATACAT -/C AGAGAACTTT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 C 0 1 116213 CASAVA_Build 6 91762277 1I TGATACTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 9 10 116214 CASAVA_Build 6 91774787 5I GCTGAATTTT -----/TTTAA TTTAATTTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTTAA 1 2 116215 CASAVA_Build 6 91775011 2D GTCTGACATC TT/-- TTTTTGTCTC 3070 hom 68 het 27 0 22 5 T 7 5 116216 CASAVA_Build 6 91776335 1I TGTTTCCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 32 1 23 8 T 12 13 116217 CASAVA_Build 6 91791872 2I ATTAAAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 AT 5 6 116218 CASAVA_Build 6 91792330 10D TTAAACTTCC ACTATAGTTA/---------- ACTATAGTTA 3070 hom 24 het 13 0 9 6 ACTATAGTTA 2 1 116219 CASAVA_Build 6 91792537 1I TGCCTTTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 9 10 116220 CASAVA_Build 6 91800003 1I AGCAAAAATA -/T TATTTAAAAT 3070 het 3070 hom 38 19 14 5 T 1 2 116221 CASAVA_Build 6 91800245 2I CTCATATTGT --/TC TGACTCCTCC 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 TC 0 1 116222 CASAVA_Build 6 91803800 1I GAAAATTCTC -/A AGAGATTAGT 3070 het 3070 hom 44 22 21 1 A 1 2 116223 CASAVA_Build 6 91804249 1D GACAGTTTGG A/- TGTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 A 1 0 116224 CASAVA_Build 6 91808186 3D CATTGGTCTT CTC/--- CTCTACCCCC 3070 het 3070 ref 33 17 14 4 CTC 2 1 116225 CASAVA_Build 6 91808827 1I AATAATAATG -/A AAAAAAAAAG 1819 het 1594 hom 12 4 5 3 A 9 10 116226 CASAVA_Build 6 91811886 1D CTTCTAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 41 0 31 11 A 13 12 116227 CASAVA_Build 6 91823365 1I ATTGTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 10 11 116228 CASAVA_Build 6 91827178 1D TGGCAGATGA T/- TTTTTGCTGC 3070 het 3070 hom 55 20 28 7 T 6 5 116229 CASAVA_Build 6 91828057 1I ATCCCAAATC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 T 8 9 116230 CASAVA_Build 6 91828276 3D GAGGGAGCTG TCT/--- TCTTCTTTTT 2407 het 2407 ref 28 11 10 11 TCT 3 2 116231 CASAVA_Build 6 91831636 1D GTAGTTTTCT C/- ACACACAGGC 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 C 1 0 116232 CASAVA_Build 6 91833702 1D28M1I TTTTTATGTT GTTTTTTTTTAACACAGGAAATATTTTCT-/-TTTTTTTTTAACACAGGAAATATTTTCTA TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 31 18 19 6 N/A 0 0 116233 CASAVA_Build 6 91835590 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2459 hom 23 7 11 5 A 9 8 116234 CASAVA_Build 6 91836438 1D AACAGCAAGA G/- GGCCAGTGCA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 3 2 116235 CASAVA_Build 6 91837873 1D CTAAATTAAA G/- CCCATGGTTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 G 1 0 116236 CASAVA_Build 6 91851012 1D CTTTTTTTTT C/- CTCCCTTGAT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 C 2 1 116237 CASAVA_Build 6 91858468 1D CCTTGAAAAC A/- TTCTGCTAAG 3070 het 3070 ref 46 24 19 5 A 1 0 116238 CASAVA_Build 6 91869743 1D TCCATTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1829 hom 33 10 19 4 T 15 14 116239 CASAVA_Build 6 91874313 1I GGGCAGTCTT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 A 7 8 116240 CASAVA_Build 6 91885104 2D GACTCATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 13 11 116241 CASAVA_Build 6 91886645 1I TTTCCTTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 T 8 9 116242 CASAVA_Build 6 91888228 1I AAGGAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 32 3 15 14 T 11 12 116243 CASAVA_Build 6 91888239 1D TTTTTTTTTT C/- CTGCTTCTGT 3070 het 594 hom 37 3 13 24 C 2 1 116244 CASAVA_Build 6 91890816 1I AATTTTTTTT -/A AAAATCAAAC 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 A 4 5 116245 CASAVA_Build 6 91892767 2D TTAAATAAAT TA/-- TATATATATA 2806 het 1756 hom 15 6 9 1 TA 7 6 116246 CASAVA_Build 6 91896450 2D CATATCAAAT AA/-- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 A 9 7 116247 CASAVA_Build 6 91898361 1D TTGTATGTAC A/- GAAGTAAGGA 3070 het 3070 hom 56 26 26 6 A 1 0 116248 CASAVA_Build 6 91907357 6D ACCCTTACTT TATTAC/------ TATATTTCTT 3070 hom 99 het 34 0 34 1 TATTAC 1 0 116249 CASAVA_Build 6 91913238 1D GAAGTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 13 12 116250 CASAVA_Build 6 91917960 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 271 hom 24 3 13 8 A 13 14 116251 CASAVA_Build 6 91934311 1D TTCCACTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 A 11 10 116252 CASAVA_Build 6 91934480 1D TCTTACCACC A/- GGGGCATGAG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 1 0 116253 CASAVA_Build 6 91938477 3D CCTTAAAGAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 40 1 17 22 T 17 14 116254 CASAVA_Build 6 91940959 1D ATTCTCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1661 hom 29 5 11 13 T 15 14 116255 CASAVA_Build 6 91955598 12D GATCTTTTCA AAAAACCAGCTC/------------ CTGGTATCAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AAAAACCAGCTC 1 0 116256 CASAVA_Build 6 91958846 2D ACTATGTGTG TA/-- GAGCATGAGG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 TA 1 0 116257 CASAVA_Build 6 91965320 2D ACCTGAGAAC TA/-- TATTATTTGA 3070 het 3070 hom 50 25 24 2 TA 2 1 116258 CASAVA_Build 6 91970369 4D AGATACCACT TAAA/---- TATTTTATTG 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 TAAA 1 0 116259 CASAVA_Build 6 91992655 5D CTATAATGAA AATAT/----- AATATAAGTT 3070 het 3070 hom 45 13 26 6 AATAT 2 1 116260 CASAVA_Build 6 91996776 1I TTCAAATGCA -/C CAGTAAAATC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 C 1 2 116261 CASAVA_Build 6 92009433 1I TCCCCTAAAA -/C TTTTGTAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 C 0 1 116262 CASAVA_Build 6 92013243 4D AGTAACCAAA TTAG/---- TTAAAGTCAT 3070 het 3070 ref 45 20 18 9 TTAG 1 0 116263 CASAVA_Build 6 92015961 1D TCCATAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 15 14 116264 CASAVA_Build 6 92032025 1D TGGTGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2954 hom 34 12 9 13 T 13 12 116265 CASAVA_Build 6 92032248 4I TTTAGGAAAG ----/TGTT TGAGCAATAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TGTT 0 1 116266 CASAVA_Build 6 92032818 2D CATATATATC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 27 10 10 8 TA 7 6 116267 CASAVA_Build 6 92038959 1I TCTTTAACAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 T 8 9 116268 CASAVA_Build 6 92039170 3D15M1I TAAATGTAGG AGAAGAAGCAAAGGAAAC-/---AGAAGCAAAGGAAACT TTGCAATGAT 3070 het 1795 hom 29 5 12 24 N/A 0 0 116269 CASAVA_Build 6 92039416 1I TTTGTTTTTA -/T TTAATATATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 3 116270 CASAVA_Build 6 92040791 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 52 16 27 9 A 8 9 116271 CASAVA_Build 6 92073956 1D CTACTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2959 het 2392 hom 21 8 8 5 A 12 11 116272 CASAVA_Build 6 92077657 1I GTACAAGTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 8 9 116273 CASAVA_Build 6 92077719 2D GCATTTGTTT AG/-- GGGGTGTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 10 7 AG 1 0 116274 CASAVA_Build 6 92078677 3D ATTATAACAC AAT/--- AATAGGAAGA 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 AAT 2 1 116275 CASAVA_Build 6 92078847 3D ATACAAGAAC ACA/--- ACATTACATT 3070 het 3070 hom 49 20 27 3 ACA 2 1 116276 CASAVA_Build 6 92086749 4D CATTCATCTA TTAC/---- TTTTTCATTC 3070 het 3070 hom 28 10 14 7 TTAC 1 0 116277 CASAVA_Build 6 92088259 4D AACAGTTTAA AAAT/---- AAATAATTAC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 AAAT 2 1 116278 CASAVA_Build 6 92090424 1I TTTCTATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 11 9 A 11 12 116279 CASAVA_Build 6 92109638 1I TTTCTGAGTG -/T AAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 T 0 1 116280 CASAVA_Build 6 92116076 2D GGAGCTGCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 17 12 4 A 13 11 116281 CASAVA_Build 6 92133025 1I ATAGATTTTC -/A AAAAATTATC 3070 het 3070 ref 49 26 23 0 A 5 6 116282 CASAVA_Build 6 92150977 1D GTTCTCATGA G/- GGATGCCAGT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 G 3 2 116283 CASAVA_Build 6 92153112 1D ACTAATGCTT G/- GCTATGAAAA 3070 het 3070 hom 48 18 26 6 G 2 1 116284 CASAVA_Build 6 92154886 1D AGTCCAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 A 12 11 116285 CASAVA_Build 6 92159556 1D TCAGAGAGCT G/- GTGCTGACAT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 G 2 1 116286 CASAVA_Build 6 92171735 1I GTAAGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 10 11 116287 CASAVA_Build 6 92177993 1D GTTTTCTTGA T/- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 51 29 19 4 T 2 1 116288 CASAVA_Build 6 92180073 1D TTCATTCATG T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 T 7 6 116289 CASAVA_Build 6 92181639 1I TTCAAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 12 13 10 A 11 12 116290 CASAVA_Build 6 92182845 1I AGTCAGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2869 hom 31 10 13 8 T 13 14 116291 CASAVA_Build 6 92184267 1I AAGAATTGTC -/A AAAAAAAAAA 2659 het 801 hom 20 2 12 6 A 15 16 116292 CASAVA_Build 6 92194003 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 27 1 16 11 A 15 14 116293 CASAVA_Build 6 92201558 1I TTAGGCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 22 8 T 10 11 116294 CASAVA_Build 6 92202489 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 27 1 16 10 T 15 14 116295 CASAVA_Build 6 92204976 2I ATCTACCATG --/AT GTGAAAGGAC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 AT 0 1 116296 CASAVA_Build 6 92219063 1I TTTAATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1425 hom 27 3 18 6 T 12 13 116297 CASAVA_Build 6 92219759 1I GTTCCATTAG -/A CCAAAAACCA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 0 1 116298 CASAVA_Build 6 92228238 14D AGCTGTCATT AGCTGTCATTAGCA/-------------- CATTAGATGA 3070 hom 114 het 39 0 39 2 AGCTGTCATTAGCA 1 0 116299 CASAVA_Build 6 92239438 1D GGTGATTTTT A/- AGGGGAATCC 3070 hom 126 het 48 0 42 7 A 2 1 116300 CASAVA_Build 6 92253886 1I AGATGGGGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 173 hom 31 1 30 0 T 9 10 116301 CASAVA_Build 6 92265808 1D TTGGAAAATA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 9 8 116302 CASAVA_Build 6 92266207 1I AGCAGCATTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 C 0 1 116303 CASAVA_Build 6 92269171 1D ATAAGGAGTC A/- AAAAAAAAAA 2653 hom 15 het 8 0 6 2 A 11 10 116304 CASAVA_Build 6 92274302 2D AAACAAACGC TT/-- TTTTTTTTTT 2735 hom 29 het 15 0 9 6 T 16 14 116305 CASAVA_Build 6 92286170 10I CTTTGGGTAT ----------/AGAGATGGCA GTCATTTCGT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AGAGATGGCA 0 1 116306 CASAVA_Build 6 92300327 35D CTAAGGTGAG TGGTCTTTCTAGTCTTTTACCCTTCCTTTCACCTC/----------------------------------- TGGTCTTTCT 3070 hom 78 het 39 0 26 20 TGGTCTTTCTAGTCTTTTACCCTTCCTTTCACCTC 2 1 116307 CASAVA_Build 6 92305579 1D ACTTTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1141 hom 33 4 18 11 A 15 14 116308 CASAVA_Build 6 92305952 1I GCTAAGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 10 116309 CASAVA_Build 6 92324550 1I CCTTCCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 11 116310 CASAVA_Build 6 92325358 1I TTGTGATGAA -/G GTTTAACATG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 G 1 2 116311 CASAVA_Build 6 92328933 1D AAGCAAAGCC T/- AAAAGACCCT 3070 hom 107 het 38 0 34 5 T 1 0 116312 CASAVA_Build 6 92330019 1I ATTCCTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 116313 CASAVA_Build 6 92341214 1I AAGCATCTGA -/G GGAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 2 3 116314 CASAVA_Build 6 92344397 4I TGTCTGTCTC ----/CAAA CAGTTACCTG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 CAAA 0 1 116315 CASAVA_Build 6 92351423 1I GATGAATGAT -/A AATTAGGAAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 2 3 116316 CASAVA_Build 6 92362542 1D TAAAGTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 28 1 22 5 T 11 10 116317 CASAVA_Build 6 92373250 1I AAGAATAGAA -/T ACAAAGAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 0 1 116318 CASAVA_Build 6 92374237 1I TCAAATATCC -/A AAATATGGTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 4 116319 CASAVA_Build 6 92377212 5I AAAACAAAGA -----/ACAGG GTCCCAAGGA 3070 hom 110 het 43 0 37 6 ACAGG 0 1 116320 CASAVA_Build 6 92380129 1I ACAATTCACC -/A TATGACCATC 3070 hom 66 het 32 0 23 9 A 0 1 116321 CASAVA_Build 6 92387639 1I AGTTGATGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 423 hom 34 1 27 6 T 9 10 116322 CASAVA_Build 6 92417592 1D CTATCTACAC A/- TTTTCCCTCT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 1 0 116323 CASAVA_Build 6 92422271 1D AGTCTGGCTT A/- AAAAAATTAT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 7 6 116324 CASAVA_Build 6 92424609 2D CACTTAAAAC AG/-- ATATCATTTT 3070 hom 112 het 44 0 37 7 AG 1 0 116325 CASAVA_Build 6 92442222 1D GTAATATGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 10 9 116326 CASAVA_Build 6 92446328 1D CTGTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1411 hom 45 4 32 9 T 12 11 116327 CASAVA_Build 6 92448059 1I TGCCACCCCC -/A ACATGCCATC 3070 hom 141 het 55 0 48 7 A 1 2 116328 CASAVA_Build 6 92464100 4I TGAATTCAGT ----/TCCA TCCAAACTAC 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 TCCA 1 2 116329 CASAVA_Build 6 92483649 12D AAAGGGGAAG GAAGGAAGAAAA/------------ GAAGGAAGAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 GAAGGAAGAAAA 2 1 116330 CASAVA_Build 6 92486594 1I TGGCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2286 het 2286 ref 28 9 8 11 A 10 11 116331 CASAVA_Build 6 92511006 1D TAATAATTCC T/- TTTTTTTTTT 2613 het 2613 ref 27 13 9 5 T 13 12 116332 CASAVA_Build 6 92516349 2I GGGAAGGACG --/AT ATTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 AT 1 2 116333 CASAVA_Build 6 92520637 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 10 9 116334 CASAVA_Build 6 92527606 1D CTTTTCTGTG C/- CAGAGAGATG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 C 2 1 116335 CASAVA_Build 6 92528415 1D TTAAGAATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 13 9 8 A 10 9 116336 CASAVA_Build 6 92529346 2D TCTCCTATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 7 A 14 12 116337 CASAVA_Build 6 92529462 2I CTAAAGTTAC --/AA AAAAAAAAAA 1709 het 1709 ref 24 6 6 12 A 14 16 116338 CASAVA_Build 6 92534548 4D AGTCTCAATG AAGT/---- AAGTATTGGT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 AAGT 2 1 116339 CASAVA_Build 6 92557577 1I TTTTCTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1475 hom 20 5 12 3 T 11 12 116340 CASAVA_Build 6 92578288 1D GATATTTTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 9 20 8 A 10 9 116341 CASAVA_Build 6 92582988 2I AAGCTGGGAA --/GC AGCAGGGCTG 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 GC 0 1 116342 CASAVA_Build 6 92583250 4I TTTCAGTTTT ----/ACTC ACGCTCATTT 3070 het 1959 hom 28 7 10 11 ACTC 0 1 116343 CASAVA_Build 6 92590443 8D CATAATTCTG ATATATAA/-------- ATACTCAATT 3070 hom 75 het 26 0 26 2 ATATATAA 1 0 116344 CASAVA_Build 6 92594925 3D AGAAAAGTTA TCT/--- TAAGTCATAT 3070 het 3070 ref 28 19 9 2 TCT 1 0 116345 CASAVA_Build 6 92598517 2I TTGTTGAAAC --/TT TTTTTGTTTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 5 7 116346 CASAVA_Build 6 92610693 1D TCAATAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 7 hom 23 1 13 9 A 10 9 116347 CASAVA_Build 6 92610968 1D CAGGGTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 33 0 26 8 A 11 10 116348 CASAVA_Build 6 92614247 1D GAGTTGTTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 10 9 116349 CASAVA_Build 6 92619016 4D CTAAGAAAAA TAAC/---- ACAATAACAA 3070 het 3070 hom 41 21 18 3 TAAC 1 0 116350 CASAVA_Build 6 92623115 1D CTTAAAATGC A/- TTTGTTTAAG 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 1 0 116351 CASAVA_Build 6 92624780 5D AAAAGCAAAT CAAAA/----- CAAAACAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 CAAAA 2 1 116352 CASAVA_Build 6 92635273 1I TAAAGTGAGA -/C CCCCCCCACT 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 C 7 8 116353 CASAVA_Build 6 92639645 1I CCTCCAATAA -/C AAAAAATTCT 3070 het 3070 hom 55 16 32 7 C 0 1 116354 CASAVA_Build 6 92650542 1I GCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 9 10 116355 CASAVA_Build 6 92651385 1I TTTTTTTCTT -/C CTCAACAGGA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 C 1 2 116356 CASAVA_Build 6 92669604 1D AGAGATGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1849 hom 42 11 17 14 A 15 14 116357 CASAVA_Build 6 92683907 1D ATTTCTTAAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 8 7 116358 CASAVA_Build 6 92689611 1I AACTCAACAG -/A AAAAAAAAAT 2848 het 2848 ref 28 15 6 7 A 9 10 116359 CASAVA_Build 6 92695742 1I GCATAGTGCT -/C CCTGAGAAAG 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 C 2 3 116360 CASAVA_Build 6 92699470 1I TATTTCTTCC -/A AAAAAAAAAA 687 het 687 ref 44 33 3 8 A 13 14 116361 CASAVA_Build 6 92700462 2I AGAGAAAACA --/CT GTTTTCTGAT 3070 het 3070 hom 57 23 26 8 CT 0 1 116362 CASAVA_Build 6 92700788 1D GAAGAAGAGA G/- GGTTCAGAAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 4 G 3 2 116363 CASAVA_Build 6 92700943 4D GGATGTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1049 hom 32 8 9 16 T 18 14 116364 CASAVA_Build 6 92707821 3D CCAAGAACTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2152 hom 25 7 13 6 A 17 14 116365 CASAVA_Build 6 92718883 2D TTTCCTGTTT CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 1758 hom 42 10 21 11 C 11 9 116366 CASAVA_Build 6 92732355 1D TGCTTCAGCT C/- CAGCCATGAC 3070 het 3070 ref 47 19 15 13 C 2 1 116367 CASAVA_Build 6 92735519 1D CTTTCTCCCG T/- TTTTGAGGAA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 5 4 116368 CASAVA_Build 6 92755083 1I74M1I TAATGGGCAC -AAAAATTAGAAAGAATGAATAAGAGCTACTATTTGATAGCACAGTAGGGTGACTGTGGTCAATAATGACTGTAT-/AAAAAAATAGAAAGAATGAATAAGAGCTACTATTTGATAGCACAGTAGGGTGACTGTGGTCAATAATGACTGTATA TTTTTAAATA 3070 hom 169 het 38 0 57 3 N/A 0 0 116369 CASAVA_Build 6 92761204 4I AACCTACCAC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TG 6 8 116370 CASAVA_Build 6 92761702 6I TCATGGACGA ------/ATAAGT ATAACTGCAC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 ATAAGT 0 1 116371 CASAVA_Build 6 92762920 3I AGATCATCAG ---/AAA AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 A 6 9 116372 CASAVA_Build 6 92764482 1D CCGAAACAGA C/- CCAAGACTCT 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 C 3 2 116373 CASAVA_Build 6 92768515 1I GAACACATCA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 8 9 116374 CASAVA_Build 6 92770893 1I TATTTTATAG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 A 7 8 116375 CASAVA_Build 6 92771239 2D TACATCAGAC TT/-- TGGTACTCCC 3070 het 3070 ref 30 19 8 4 T 3 1 116376 CASAVA_Build 6 92772789 2D GTGGAAAATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TA 8 7 116377 CASAVA_Build 6 92782187 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 32 1 19 12 A 15 14 116378 CASAVA_Build 6 92784999 1D CCTAAAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 116 het 48 0 39 9 A 11 10 116379 CASAVA_Build 6 92792192 1D TTGATAATGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 8 7 116380 CASAVA_Build 6 92792796 3I AATTCCACAC ---/CTT CTCCTTTTTT 3070 hom 92 het 38 0 30 8 CTT 0 1 116381 CASAVA_Build 6 92797540 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 9 8 116382 CASAVA_Build 6 92800346 3D TAAAGAAAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 29 3 16 12 A 13 10 116383 CASAVA_Build 6 92811024 4I6M2D ACTCATATCT ----AGAATCTT/AGAAAGAATC-- TCTGACCTGA 3070 het 3070 hom 46 19 25 3 N/A 0 0 116384 CASAVA_Build 6 92820440 1D ATCAGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 14 8 T 11 10 116385 CASAVA_Build 6 92853603 1D GGAAGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 A 14 13 116386 CASAVA_Build 6 92871524 1I ATAATACGGA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 6 7 116387 CASAVA_Build 6 92908512 4I GACATTAAAC ----/TATT TATTATTAAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TATT 1 2 116388 CASAVA_Build 6 92925083 1I ATATTGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 11 12 116389 CASAVA_Build 6 92925542 1D TGACAATGGT G/- GGGGGGGCAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 8 7 116390 CASAVA_Build 6 92926380 1D CCTTGGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2333 hom 23 8 11 4 T 12 11 116391 CASAVA_Build 6 92929082 1D TATTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 25 12 7 G 1 0 116392 CASAVA_Build 6 92931167 1D AATGGGGTTG T/- TTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 7 6 116393 CASAVA_Build 6 92933170 10D GAACAGTTCT GTTGATGAGA/---------- GTTAAGAAGA 3070 het 3070 ref 42 25 18 3 GTTGATGAGA 1 0 116394 CASAVA_Build 6 92948774 1D CAAAAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 13 12 116395 CASAVA_Build 6 92950516 4D AAAGAAATGT AACA/---- AACAGACAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 7 AACA 2 1 116396 CASAVA_Build 6 92951407 1D AATATATAAA T/- GTCTTTAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 1 0 116397 CASAVA_Build 6 92952262 2I AATTATACAC --/TT AATATTATAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 0 2 116398 CASAVA_Build 6 92965035 6D GGGATTATAG GCATGA/------ GCCACCACAC 1502 het 1502 ref 16 10 5 3 GCATGA 1 0 116399 CASAVA_Build 6 92966957 1I CCTACTATGA -/T TTTTTCCTTG 3070 het 3070 hom 47 15 21 11 T 5 6 116400 CASAVA_Build 6 92968981 1D TGCTGTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 23 15 12 A 12 11 116401 CASAVA_Build 6 92970476 1D TGGGAAACGG T/- TTAAACAGGA 3070 het 3070 hom 52 25 22 6 T 3 2 116402 CASAVA_Build 6 92972372 1D ATATATATAT A/- ATTTGTTTAT 1551 hom 10 het 11 0 4 7 A 2 1 116403 CASAVA_Build 6 92973123 1D CTTTGTTACA T/- GTATCTTTGC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 1 0 116404 CASAVA_Build 6 92973962 4D AATTTTACCC TTTA/---- TTTATTTCCT 3070 het 3070 ref 30 17 12 3 TTTA 2 1 116405 CASAVA_Build 6 92975292 4I TAAGCCTCTC ----/AATT AATCACAGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AATT 0 1 116406 CASAVA_Build 6 92975897 1I TATTCAACTA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 6 7 116407 CASAVA_Build 6 92976537 4D ATTGATGCTC TGTT/---- TGTTTATTTA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 TGTT 2 1 116408 CASAVA_Build 6 92979116 1I TGATATTTAT -/A AGCAGCTTTA 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 A 1 2 116409 CASAVA_Build 6 92979727 2D AAATTAAAAC TG/-- TTCTTAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 16 2 TG 1 0 116410 CASAVA_Build 6 93021218 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2025 hom 16 6 9 1 A 12 10 116411 CASAVA_Build 6 93025658 2D ATGTTGAAAG AA/-- AGACTATCAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 3 1 116412 CASAVA_Build 6 93030482 1I CAGCTGGTCC -/A GGCTGTAGTG 3070 hom 138 het 51 0 45 6 A 0 1 116413 CASAVA_Build 6 93032355 2I AGGAATCACC --/AT GTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 AT 0 1 116414 CASAVA_Build 6 93032625 4I TTGAGGGTTC ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 TTTG 1 2 116415 CASAVA_Build 6 93033275 1I TAATTTTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 179 hom 29 1 25 3 T 9 10 116416 CASAVA_Build 6 93033646 1I ATAGTTTTGA -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 3 4 116417 CASAVA_Build 6 93036428 1I ATACTAGGTA -/C ATTTCTTATC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 0 1 116418 CASAVA_Build 6 93038784 1I TCGCCTCCCC -/T TCCCCTCTGT 3070 hom 115 het 41 0 39 2 T 1 2 116419 CASAVA_Build 6 93039521 4D ACAAAAGTCG TTAT/---- TTAATTAATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTAT 1 0 116420 CASAVA_Build 6 93056812 1D AAGAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 2578 het 1639 hom 23 9 11 3 A 15 14 116421 CASAVA_Build 6 93062363 2D GCTCTGAAAT AA/-- AAAGATTATT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 A 5 3 116422 CASAVA_Build 6 93073672 1I ATTGAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 9 10 116423 CASAVA_Build 6 93076697 1I GGGAAATACG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 111 het 48 0 38 10 A 8 9 116424 CASAVA_Build 6 93082667 1I ACTTCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 A 11 12 116425 CASAVA_Build 6 93083915 2D TGGGAAAAGG AA/-- AAGTCTTTTA 3070 het 2097 hom 30 6 19 6 A 4 2 116426 CASAVA_Build 6 93085619 1I CCCTGAATGA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 116427 CASAVA_Build 6 93088866 1I ATGCAAGATG -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 6 7 116428 CASAVA_Build 6 93089677 2I AAATGAAGAC --/TA TATATATATA 3070 het 1152 hom 36 3 28 5 TA 6 7 116429 CASAVA_Build 6 93102278 5D ACATGGTAGT ATAAC/----- AAATAATGTG 3070 het 3070 ref 50 29 17 7 ATAAC 1 0 116430 CASAVA_Build 6 93104621 1D AGAGATGAGG A/- AATGCTTCAT 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 3 2 116431 CASAVA_Build 6 93109415 1D CTAAAGACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 79 het 35 0 27 8 T 10 9 116432 CASAVA_Build 6 93109834 1D TATTTTTCTC T/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 27 14 12 1 T 1 0 116433 CASAVA_Build 6 93118029 3D AGAGTAGAAC AAA/--- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 A 10 7 116434 CASAVA_Build 6 93120574 1D CAGAACAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 10 9 116435 CASAVA_Build 6 93125244 2D TGTTTTATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TA 8 7 116436 CASAVA_Build 6 93130715 1D TCATGCCTGT A/- AATCCCAGCA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 3 2 116437 CASAVA_Build 6 93133937 2D TTGAAAGAAT AG/-- AGTGACAAAA 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 AG 2 1 116438 CASAVA_Build 6 93137758 1I GAGCTCTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 25 1 10 14 A 16 17 116439 CASAVA_Build 6 93137772 3D AAAAAAAAAA AAC/--- TATGCATACA 3070 het 732 hom 27 4 15 9 AAC 1 0 116440 CASAVA_Build 6 93142734 1I CTAATCAGGC -/T TTTGTCTGGC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 3 4 116441 CASAVA_Build 6 93143614 4I ATTTAGAAAC ----/AGTT AGGTAGCTCT 3070 het 3070 hom 47 15 31 1 AGTT 0 1 116442 CASAVA_Build 6 93145698 1I CATTGTTCTA -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 6 7 116443 CASAVA_Build 6 93147619 1I TTACATGAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 T 8 9 116444 CASAVA_Build 6 93156713 2I TTTAAAATCC --/AT ATGTGTGAAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 AT 1 2 116445 CASAVA_Build 6 93162044 1D AAAGTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 T 13 12 116446 CASAVA_Build 6 93164077 1D AAATATTCGT A/- AGCCTAAACT 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 A 2 1 116447 CASAVA_Build 6 93165576 4I GTTTTCTATT ----/TTAA TTAAAGTTAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TTAA 1 2 116448 CASAVA_Build 6 93183812 1D AGAGAAATAC A/- AACACTTTGA 3070 het 3070 hom 41 13 23 6 A 3 2 116449 CASAVA_Build 6 93185133 1D TAGCACACAA C/- TGGTTGTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 19 5 C 1 0 116450 CASAVA_Build 6 93185359 1D AAAACTGAAT A/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 A 1 0 116451 CASAVA_Build 6 93186323 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATG 3070 hom 4 het 18 1 14 4 TA 6 4 116452 CASAVA_Build 6 93200052 1I CTGAGTTATT -/A AAAATGCTAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 4 5 116453 CASAVA_Build 6 93200243 2D ACTATGCAAA TC/-- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 TC 4 3 116454 CASAVA_Build 6 93200713 1D TTATTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 1331 het 1331 ref 48 36 3 10 T 13 12 116455 CASAVA_Build 6 93201957 2I TTGTTATAAT --/TA TATATATATA 889 het 889 ref 26 12 8 6 TA 5 6 116456 CASAVA_Build 6 93205598 1I GCTTGAACTG -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 7 8 116457 CASAVA_Build 6 93207065 1I CATTGTGCCA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 6 7 116458 CASAVA_Build 6 93213106 1D TTATGTCTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 10 9 116459 CASAVA_Build 6 93218231 1D CAGGCCTTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 A 9 8 116460 CASAVA_Build 6 93226014 6D TATGTGTGTA TATATG/------ TATATGTATA 1826 het 33 hom 22 1 9 12 TATATG 3 2 116461 CASAVA_Build 6 93227115 1I CCGAGTTCCA -/T TCCCATTTCC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 1 2 116462 CASAVA_Build 6 93233346 1D CTGTCAGCTT A/- AAAAAATGCT 3070 hom 156 het 57 0 52 5 A 7 6 116463 CASAVA_Build 6 93234225 1D ATGACTGATG T/- TTGATGTGGT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 3 2 116464 CASAVA_Build 6 93239660 20D AAAATGCCAA AAATAAATAAATAAATAAAT/-------------------- AAATAAATAA 3070 het 2323 hom 33 11 9 16 AAAT 9 4 116465 CASAVA_Build 6 93243401 1I AACCTGTCTC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 23 8 15 0 A 7 8 116466 CASAVA_Build 6 93247685 5D ACCTGTCTTC TCTTT/----- TATTTCTTAC 3070 het 3070 ref 33 17 14 5 TCTTT 1 0 116467 CASAVA_Build 6 93251573 2I CACGTGATTT --/TA TAGTTTCCAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TA 1 2 116468 CASAVA_Build 6 93252509 1I ACAAACAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 A 11 12 116469 CASAVA_Build 6 93257025 1D TTGTTTTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 10 9 116470 CASAVA_Build 6 93261542 2I TATTGTTGAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 AC 7 8 116471 CASAVA_Build 6 93262482 1D TCTTAGCAGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 35 0 29 6 T 9 8 116472 CASAVA_Build 6 93265342 2D CGGGAAAAAC TT/-- AGATAAAATT 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 T 2 0 116473 CASAVA_Build 6 93267014 1D AGTTCAGCAA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 9 8 116474 CASAVA_Build 6 93273095 1I TCTTGGCCAC -/A AAAACAACTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 4 5 116475 CASAVA_Build 6 93273573 1I TCTCCTATTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 8 9 116476 CASAVA_Build 6 93275498 1D CCTGACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 18 8 A 12 11 116477 CASAVA_Build 6 93278006 4D AGCCTTGGAG CTTC/---- CACATGGTGT 3070 het 3070 hom 30 15 13 5 CTTC 1 0 116478 CASAVA_Build 6 93282837 1D CAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 A 11 10 116479 CASAVA_Build 6 93283635 1D GTGTCCCATC A/- AAAGTTTGAC 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 4 3 116480 CASAVA_Build 6 93292535 1D CCTGAAAAAC A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 8 7 116481 CASAVA_Build 6 93299551 1I ATAACATTAA -/T TTTTTACTAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 5 6 116482 CASAVA_Build 6 93305845 2I TGCTATACTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 AT 6 7 116483 CASAVA_Build 6 93306106 2I TTTTATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2840 hom 24 7 8 9 AT 6 7 116484 CASAVA_Build 6 93309120 1D ATGGGACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 21 12 A 13 12 116485 CASAVA_Build 6 93309319 4I GTTTTATTAG ----/TTTA TTTATTTATA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 TTTA 2 3 116486 CASAVA_Build 6 93311572 5I AATTAAAAAT -----/TAAAA TAAACTGAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAAAA 0 1 116487 CASAVA_Build 6 93326725 1D ATTTTTGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 624 hom 37 5 20 12 T 10 9 116488 CASAVA_Build 6 93329528 1I ACTTTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 T 10 11 116489 CASAVA_Build 6 93336061 2D20M2D TGTGAGAGAC TTAGTGGTTTTATTAGAGACTCTT/--AGTGGTTTTATTAGAGACTC-- TTATAAACTG 3070 het 3070 ref 35 23 17 2 N/A 0 0 116490 CASAVA_Build 6 93336328 1I CTGTCATAAT -/G TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 0 1 116491 CASAVA_Build 6 93339072 2I TATTTACATC --/TA TATGTCTTTA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TA 1 2 116492 CASAVA_Build 6 93342049 1D AATTCACAGC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 52 19 26 7 T 8 7 116493 CASAVA_Build 6 93353071 1D CAACTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 A 11 10 116494 CASAVA_Build 6 93354701 2D GTTAAAAAAA AT/-- GTTTTCACTA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 AT 1 0 116495 CASAVA_Build 6 93360842 2I CTCTGGTCTA --/AG AGAAAGAAGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AG 1 2 116496 CASAVA_Build 6 93367379 3I TCCTATATAC ---/CAA CAACATCCAG 3070 hom 72 het 25 0 24 1 CAA 1 2 116497 CASAVA_Build 6 93367973 2D CAACATATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 118 hom 34 4 17 14 A 12 10 116498 CASAVA_Build 6 93369327 1I AGACAGCTTG -/A AACAACAATA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 2 3 116499 CASAVA_Build 6 93370565 1I TGAATGGATG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 8 9 116500 CASAVA_Build 6 93375249 1I CAGCCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2700 hom 27 9 14 4 T 10 11 116501 CASAVA_Build 6 93377604 5I TTGCTAGAGG -----/CTTAT CTTGTCAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 CTTAT 0 1 116502 CASAVA_Build 6 93377845 2D AAAAGATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 32 2 13 19 T 13 11 116503 CASAVA_Build 6 93384080 1I TGGGTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 A 10 11 116504 CASAVA_Build 6 93384612 2D GGCAGGTCTG GA/-- GAAGTGCTCT 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 GA 2 1 116505 CASAVA_Build 6 93389635 1D GGCCTATTCA T/- CCCTCCTACC 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 1 0 116506 CASAVA_Build 6 93389957 8D TGTGCAAGTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 TTTG 5 3 116507 CASAVA_Build 6 93390737 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTATT 1634 het 398 hom 8 1 4 3 T 8 7 116508 CASAVA_Build 6 93394053 2D AAAGAAAAAA AG/-- AGAGAAGAAT 1245 het 56 hom 5 1 3 1 AG 3 2 116509 CASAVA_Build 6 93395877 1D TTTTTTTTTA G/- GGGGGGGAGC 3070 het 3070 ref 35 18 10 10 G 8 7 116510 CASAVA_Build 6 93396300 2D TTATCACTTT CA/-- TCATAAATTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 CA 1 0 116511 CASAVA_Build 6 93396429 4I TATAAGAAAT ----/TGAC TGACTTTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TGAC 1 2 116512 CASAVA_Build 6 93398872 1I TCATTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 1445 het 1445 ref 37 23 4 10 A 13 14 116513 CASAVA_Build 6 93399934 1D GCCAGGCACA G/- TGACTCATAC 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 G 1 0 116514 CASAVA_Build 6 93401113 1D CTCCTTAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 9 8 116515 CASAVA_Build 6 93403064 1I TATCTGCATT -/A AAAAAACCAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 6 7 116516 CASAVA_Build 6 93405948 2D ATATCTCTGT AC/-- ATATATGCGC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AC 1 0 116517 CASAVA_Build 6 93413006 3I CTTAAAAATA ---/ATC ATGTTTACTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 ATC 0 1 116518 CASAVA_Build 6 93413773 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 16 2 9 5 A 17 16 116519 CASAVA_Build 6 93428264 11D AGAAGTAGTT GTTGATACTAG/----------- GGAGGCACCT 3070 het 3070 ref 47 28 19 4 GTTGATACTAG 1 0 116520 CASAVA_Build 6 93432441 1I AATTTGAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 9 10 116521 CASAVA_Build 6 93437287 1D CCTCCCAAGC T/- GTAAGAAATA 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 T 1 0 116522 CASAVA_Build 6 93439672 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 322 hom 38 1 32 5 AC 9 8 116523 CASAVA_Build 6 93450090 2D ATTTAAAAAA AC/-- AGTTCTTAAA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 AC 1 0 116524 CASAVA_Build 6 93454288 4I AACATTTACA ----/TTGT TTATGTATCA 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 TTGT 0 1 116525 CASAVA_Build 6 93477484 4I AATCTCTCTC ----/TCTT TTTCTGTCTC 2882 het 2882 ref 27 16 8 3 TCTT 0 1 116526 CASAVA_Build 6 93482444 14D CTGGTTTTAG ATATACCTCAAAAA/-------------- ATAAACTAAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 6 ATATACCTCAAAAA 1 0 116527 CASAVA_Build 6 93483817 1I TCTTGCTTCT -/A AATTGTCATT 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 A 2 3 116528 CASAVA_Build 6 93508694 1I AGTGCATATC -/A AAAAAAAAAA 2155 het 2155 ref 26 11 6 9 A 13 14 116529 CASAVA_Build 6 93552060 2I AGAGAGAAAA --/AG AGGAGGGGGA 3070 hom 72 het 31 0 23 8 AG 1 2 116530 CASAVA_Build 6 93554810 1D GACAAACACA T/- TACTGGGCAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 2 1 116531 CASAVA_Build 6 93560065 2I GACTTCACTT --/TA TATATATATA 2704 het 1516 hom 12 4 7 1 TA 6 7 116532 CASAVA_Build 6 93564858 1D CCTTCTAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1003 hom 29 3 14 12 T 10 9 116533 CASAVA_Build 6 93569899 4D CCCAGAAGTA TAAG/---- TAACTTATAA 3070 het 3070 hom 35 16 19 4 TAAG 1 0 116534 CASAVA_Build 6 93575615 4I TTCACACACG ----/TGTA TATATATATA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 TGTA 0 1 116535 CASAVA_Build 6 93578829 2D AGCCTTTAAA AT/-- ATACAGTCAC 3070 het 3070 ref 28 14 13 3 AT 2 1 116536 CASAVA_Build 6 93578896 2I ACAACAGGCA --/TT TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 6 8 116537 CASAVA_Build 6 93589269 1D CAAAAGGGCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 8 7 116538 CASAVA_Build 6 93593887 1I TCATTTTAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 9 10 116539 CASAVA_Build 6 93594245 20D AGGATCTTAT AGGATCCTATAGGATCTTAC/-------------------- AGGATTTTAT 3070 het 3070 ref 28 20 11 4 AGGATCCTATAGGATCTTAC 1 0 116540 CASAVA_Build 6 93603998 1D TCCCACTTTG C/- CCCCGTCCAT 3070 het 3070 ref 45 23 15 8 C 5 4 116541 CASAVA_Build 6 93605732 1I ATTTATTGAG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 6 7 116542 CASAVA_Build 6 93609492 2D TCTCTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 81 het 31 0 27 5 TC 7 6 116543 CASAVA_Build 6 93620696 3I AAAGCATAAT ---/AAG AAGAAGCTGG 3070 het 3070 hom 61 22 32 7 AAG 2 3 116544 CASAVA_Build 6 93621676 1D AATTTCATTT A/- GGGGAGAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 1 0 116545 CASAVA_Build 6 93625341 6I AGAGAGAGAG ------/AGAGAT AGAGAGAGAG 3070 het 141 hom 34 5 20 9 AGAGAT 0 1 116546 CASAVA_Build 6 93626129 1D TACACTTAGA T/- ATGTTAAATA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 1 0 116547 CASAVA_Build 6 93627971 11I TAGTAGGCTT -----------/ATAAATCCACC ATAAAAACAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 ATAAATCCACC 0 1 116548 CASAVA_Build 6 93634944 1D TATTTCCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 50 8 29 13 A 13 12 116549 CASAVA_Build 6 93641079 1I GTGAACACTG -/A AAAAAATTAA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 6 7 116550 CASAVA_Build 6 93641808 1D ATTCTTATTC A/- TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 1 0 116551 CASAVA_Build 6 93643024 4D AAGAAAGAGA AAGC/---- AAGCAAGCAA 3070 hom 51 het 27 0 17 10 AAGC 5 4 116552 CASAVA_Build 6 93643071 4I40M4D CCAGAAAGAA ----AAATAAAGAAAGGAAAGGAAGAAAGAAAAAAGGAAAGAAAGAAG/AAAGAAAGAAAGAAAGGAAAGGAAGAAAGAAAAAAGGAAAGAAA---- GAAGGAAAGA 2828 het 2828 ref 26 15 9 14 N/A 0 0 116553 CASAVA_Build 6 93645527 5I CTTTACTTCT -----/TATAA TATAAAAATG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TATAA 1 2 116554 CASAVA_Build 6 93646858 1D CCTTTATCAA T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 7 6 116555 CASAVA_Build 6 93647440 1D CTTGCAACAA G/- TTAGGCCCCA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 G 1 0 116556 CASAVA_Build 6 93649763 2D CAGGAGCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 24 0 21 3 T 14 12 116557 CASAVA_Build 6 93650944 1D CAATTTCCAC A/- AAAAGAATAA 3070 het 3070 ref 49 29 18 2 A 5 4 116558 CASAVA_Build 6 93653728 3D AGTTTTTAAC TCT/--- TCTATTAGAG 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 TCT 2 1 116559 CASAVA_Build 6 93660959 5D AATAGAAGAG ATAAA/----- ATAAAATTAT 1917 het 1917 ref 24 17 5 2 ATAAA 2 1 116560 CASAVA_Build 6 93661849 1D AACAAGAAAT G/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 15 7 G 1 0 116561 CASAVA_Build 6 93663747 4D36M2D AGTTACAGCT TTTATTTCTTTTATTACTAGTTATAGATTTTTTTGGTGACAT/----TTTCTTTTATTACTAGTTATAGATTTTTTTGGTGAC-- ATATTTCTCT 3070 het 3070 hom 23 14 18 3 N/A 0 0 116562 CASAVA_Build 6 93664673 4I AGTCAAAATA ----/CTAT CTCTTTCATT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 CTAT 0 1 116563 CASAVA_Build 6 93666209 1D ATAGATTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 8 7 116564 CASAVA_Build 6 93690976 1I TATTTGTCCG -/T TTTTTACCTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 5 6 116565 CASAVA_Build 6 93694745 1I CTTTTGTTTG -/C CCCCCCTCAT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 C 6 7 116566 CASAVA_Build 6 93696050 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 A 10 11 116567 CASAVA_Build 6 93704128 1D CAGGACAATT C/- AGCCATGAAA 3070 het 3070 hom 58 23 29 6 C 1 0 116568 CASAVA_Build 6 93731830 1I AGTTGATGAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 8 9 116569 CASAVA_Build 6 93733337 1I GCAAGTATGT -/A AAAACAAAAA 2861 het 2861 ref 27 16 8 3 A 4 5 116570 CASAVA_Build 6 93743852 1D TTTCAAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 A 10 9 116571 CASAVA_Build 6 93745986 1I AGCTGTATAA -/T TATCAGCAAT 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 T 1 2 116572 CASAVA_Build 6 93778541 2D ACACAAATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 1825 hom 18 6 10 2 TA 6 5 116573 CASAVA_Build 6 93805464 4D CACTGAACTT AAAG/---- AAGTTTTATA 3070 het 3070 ref 49 27 19 6 AAAG 1 0 116574 CASAVA_Build 6 93810148 1D TCTGCAAGAT A/- AAAAAAAAAA 1824 het 1824 ref 40 30 4 6 A 12 11 116575 CASAVA_Build 6 93810961 1D GTCTGAAGGC T/- TTTTTTTTTT 809 het 809 ref 35 27 3 5 T 11 10 116576 CASAVA_Build 6 93821217 1D TTTTGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1347 hom 32 7 12 14 T 15 14 116577 CASAVA_Build 6 93824263 1D GAGAGAAGAG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 A 7 6 116578 CASAVA_Build 6 93830340 1D TACCAGAAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 34 0 34 1 T 9 8 116579 CASAVA_Build 6 93868962 1I TCCTTTTATT -/A AAAAAAAAAA 2632 het 2632 ref 34 14 10 10 A 13 14 116580 CASAVA_Build 6 93880956 1D ATGAATATAA C/- AACTGGATAA 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 C 1 0 116581 CASAVA_Build 6 93881891 3D AATACAGTGG TGT/--- TGTGAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 TGT 2 1 116582 CASAVA_Build 6 93888949 1I AGCATATCAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 2893 hom 35 9 21 5 T 8 9 116583 CASAVA_Build 6 93892523 1D AAACTAATTT A/- TGTTGCATTA 3070 het 3070 hom 22 7 12 4 A 1 0 116584 CASAVA_Build 6 93895373 1D TTTTGCAGAG A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 7 6 116585 CASAVA_Build 6 93897339 1D CTCTAGGATC T/- TTTTTTTTTT 2868 het 22 hom 13 1 10 2 T 16 15 116586 CASAVA_Build 6 93898287 1I GAGTATACAC -/A AAATATGAAA 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 A 3 4 116587 CASAVA_Build 6 93898483 2I TTATGTGTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 AT 5 6 116588 CASAVA_Build 6 93906374 1I TACTTTACTA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 T 7 8 116589 CASAVA_Build 6 93906618 1I TAAAAGATCA -/T TTCCTTTCAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 2 3 116590 CASAVA_Build 6 93907872 4I AGTCAGAAAC ----/AGAT AGAGTCACAT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 AGAT 0 1 116591 CASAVA_Build 6 93908884 1I TTGCTGTGTC -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 A 6 7 116592 CASAVA_Build 6 93911959 2I CAATAAACAG --/TA TGTAATTAGT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 TA 0 1 116593 CASAVA_Build 6 93916630 1I GACAGGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 24 1 18 5 T 10 11 116594 CASAVA_Build 6 93918516 1D TTCAGGATCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 9 8 116595 CASAVA_Build 6 93923485 1I TCCCTATTGA -/G GAAAGCAAGC 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 G 1 2 116596 CASAVA_Build 6 93936795 4D AATTATTGAC TAAT/---- TATAGTATCA 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 TAAT 1 0 116597 CASAVA_Build 6 93940791 1D AAAATCAACC T/- TGTCAATGCC 2736 het 2736 ref 25 13 10 2 T 2 1 116598 CASAVA_Build 6 93942892 2I CTTTTGTGAA --/AT AGTTTATACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 0 1 116599 CASAVA_Build 6 93944274 4I AGTAAGGGGC ----/AAGT AAGTGCTCAT 3070 het 3070 hom 56 24 26 6 AAGT 1 2 116600 CASAVA_Build 6 93955331 12I TTAGGATAAT ------------/ATTTTAGGAATA ATTTTAGGAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 ATTTTAGGAATA 0 1 116601 CASAVA_Build 6 93956242 2D CACTTTCAGA AT/-- ATATAGTCTG 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 AT 3 2 116602 CASAVA_Build 6 93961080 6D TAATACTTTT ACAATC/------ ACAATTACAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 ACAATC 1 0 116603 CASAVA_Build 6 93963140 1D GTAATAGGGG A/- AAATTAGACT 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 A 4 3 116604 CASAVA_Build 6 93969949 1D ATTCTCACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 A 11 10 116605 CASAVA_Build 6 93970700 1D AAGTAACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 25 4 11 10 T 15 14 116606 CASAVA_Build 6 93972757 1D CACTATGACC A/- AGTGGAATTC 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 A 2 1 116607 CASAVA_Build 6 93974643 4D GCCTGATTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 7 AAAC 4 3 116608 CASAVA_Build 6 93975016 2D TAGCCACAGG CC/-- AACTGGTAGA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 C 2 0 116609 CASAVA_Build 6 93975706 2I TCTCCAATAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 9 10 A 10 12 116610 CASAVA_Build 6 93979936 1I GGCCTAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 8 16 10 T 10 11 116611 CASAVA_Build 6 93997221 1I TTTTTTTTAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 8 9 116612 CASAVA_Build 6 94008065 1I ATTTAAAACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2485 hom 30 10 11 9 A 9 10 116613 CASAVA_Build 6 94012498 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1525 het 1525 ref 22 9 7 6 T 10 11 116614 CASAVA_Build 6 94014555 1D CCCTCTGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 10 9 116615 CASAVA_Build 6 94017961 1I ATTAGGATAC -/T TAATTTACTA 2748 het 2748 ref 19 12 6 1 T 1 2 116616 CASAVA_Build 6 94018063 4I TAGAAGAAAA ----/AAAT AAAATCTATA 2492 het 2492 ref 30 18 7 5 AAAT 0 1 116617 CASAVA_Build 6 94018567 3I CACTCATTAG ---/CTT CTTCTACACC 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 CTT 1 2 116618 CASAVA_Build 6 94018873 1D ACCTTCCCAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 9 8 116619 CASAVA_Build 6 94019904 1D AGTCTAAATG T/- TAGTTGTCTA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 2 1 116620 CASAVA_Build 6 94021629 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 A 9 8 116621 CASAVA_Build 6 94028863 1I CAGGGGTATA -/T TTAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 29 2 T 2 3 116622 CASAVA_Build 6 94042044 1D TGACAATGAC A/- AGAAGACCTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 2 1 116623 CASAVA_Build 6 94068414 11D TTGTTCTAAC ATCCTCACAGA/----------- ATCTTGCTTA 3070 het 3070 ref 53 32 21 5 ATCCTCACAGA 1 0 116624 CASAVA_Build 6 94069261 1D CTGGAGTCAT G/- GAAGAGAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 G 2 1 116625 CASAVA_Build 6 94078846 1I AGATGGCTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 T 9 10 116626 CASAVA_Build 6 94093174 2I GAATCTTGTC --/TT TATTTCATAC 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 1 3 116627 CASAVA_Build 6 94106265 11D GTAAAATAAC TTTGGGGAATG/----------- TTTCTGGTTA 3070 het 3070 ref 30 17 14 3 TTTGGGGAATG 1 0 116628 CASAVA_Build 6 94108739 1D ACCATAAGAC A/- AAAAAGTAGA 3070 het 3070 ref 40 18 17 7 A 6 5 116629 CASAVA_Build 6 94110564 3D CTATCTATCT ATC/--- ATCTATCATC 1354 het 1354 ref 36 19 4 13 ATC 2 1 116630 CASAVA_Build 6 94115334 2I TTTTCCCCTA --/AC ATGAAGCCTA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AC 0 1 116631 CASAVA_Build 6 94121450 18D AAATCATAAA CCTAAAAACGTTTCAAAT/------------------ CCACTCACTG 3070 het 3070 ref 40 24 12 8 CCTAAAAACGTTTCAAAT 1 0 116632 CASAVA_Build 6 94125833 1D TGAAGACATT C/- AATCTATTCT 1428 het 1428 ref 14 11 3 0 C 1 0 116633 CASAVA_Build 6 94126731 1D ATATTCATTG T/- ATCTTGCTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 0 116634 CASAVA_Build 6 94129249 2D CTTCCTGAAT GA/-- GGGCACAGAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GA 1 0 116635 CASAVA_Build 6 94143478 1I ACTTTACAAA -/T TTTTCTTATC 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 4 5 116636 CASAVA_Build 6 94143990 1I TTGAAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 930 hom 32 2 24 6 A 11 12 116637 CASAVA_Build 6 94144493 8I AAACATGGAC --------/AGTTGGTG TCTTTGGTAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AGTTGGTG 0 1 116638 CASAVA_Build 6 94148171 1I TTTTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 10 11 116639 CASAVA_Build 6 94165029 1D ATGGAGAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 A 10 9 116640 CASAVA_Build 6 94171060 2D ACATATAATC AT/-- ATATATATAT 1068 het 1068 ref 24 14 6 12 AT 8 7 116641 CASAVA_Build 6 94175410 11D CATATGTTAC TTTTTTTTCTT/----------- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 25 18 5 TTTTTTTTCTT 2 1 116642 CASAVA_Build 6 94178755 1I AAAAATCATG -/T GGTAAATACT 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 0 1 116643 CASAVA_Build 6 94182531 1D GACTGACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 8 15 9 A 11 10 116644 CASAVA_Build 6 94198186 1I CTCACAAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 9 10 116645 CASAVA_Build 6 94203953 2D GCATGTGTGG AT/-- ATATATATAT 1809 het 1809 ref 19 10 5 5 AT 8 7 116646 CASAVA_Build 6 94204816 1D CTGGGGTGTA T/- TTTTTATGAT 3070 het 3070 hom 51 17 27 7 T 6 5 116647 CASAVA_Build 6 94214862 2D TAAATTTTTG CC/-- CCCCCCCCAA 3013 het 519 hom 20 7 8 5 C 10 8 116648 CASAVA_Build 6 94221887 1I ATTTAGACAA -/T TTAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 T 2 3 116649 CASAVA_Build 6 94222616 1I ATTTTAATAC -/A AAAAAATTAA 3070 het 2294 hom 26 5 15 6 A 6 7 116650 CASAVA_Build 6 94226682 1I TTCTCACGTT -/C CCCCCCAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 6 7 116651 CASAVA_Build 6 94228854 4I TACTGAACAT ----/GTAC GTACACACAC 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 GTAC 1 2 116652 CASAVA_Build 6 94229524 4I CTCATTTGAT ----/CAGA CAGTGATACT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 CAGA 0 1 116653 CASAVA_Build 6 94236166 1D GGAGTAGGTT C/- CCCAGTAAGG 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 C 4 3 116654 CASAVA_Build 6 94239682 2I AGTTCTTAAC --/AT GTGCAATGAA 3070 het 3070 hom 32 8 18 6 AT 0 1 116655 CASAVA_Build 6 94253138 5D GTAATCCCAG CTACT/----- CTACTCGGGA 1390 het 631 hom 8 3 4 1 CTACT 2 1 116656 CASAVA_Build 6 94260673 2D TTGTCAGTTC AG/-- AGTTTCATTA 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 AG 2 1 116657 CASAVA_Build 6 94273131 7D GCGATCTGCA TGTACAC/------- ATTAACCACA 3070 het 3070 ref 50 26 21 5 TGTACAC 1 0 116658 CASAVA_Build 6 94288088 1I GCCATTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 995 hom 33 4 23 6 A 14 15 116659 CASAVA_Build 6 94293823 4I GTTATATTTC ----/TTTA TTTGATGTAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TTTA 0 1 116660 CASAVA_Build 6 94304881 20D ATTACAGTTT TTTAAATTAATTACAATTAA/-------------------- TTTAAATTAA 3070 het 3070 ref 26 16 12 5 TTTAAATTAATTACAATTAA 1 0 116661 CASAVA_Build 6 94309050 2D TGTTGACCTC TA/-- TGTTGATTCT 3070 het 3070 ref 40 21 13 7 TA 1 0 116662 CASAVA_Build 6 94333411 4I ACATGTGGAG ----/AAAC AAACTCATGC 3070 het 3070 hom 48 23 25 0 AAAC 1 2 116663 CASAVA_Build 6 94354662 1D TTGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 11 10 116664 CASAVA_Build 6 94354756 10D AAAGGTAATA GAGAATTCCT/---------- GTATAACTAA 3070 het 3070 ref 34 19 15 2 GAGAATTCCT 1 0 116665 CASAVA_Build 6 94368232 1D TTGCTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 13 12 116666 CASAVA_Build 6 94371196 1I ACTGGACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 11 12 116667 CASAVA_Build 6 94372372 1I TTATTTTGTA -/T TGGTGGCATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 2 116668 CASAVA_Build 6 94372658 2I TCTTTTAATC --/TT TTTTTTTTTT 2226 het 2226 ref 27 10 10 7 T 14 16 116669 CASAVA_Build 6 94373094 1D AATGCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 9 T 12 11 116670 CASAVA_Build 6 94381032 2D TAATGCTAAA AT/-- ATATTTGTTC 3070 het 3070 hom 36 10 23 4 AT 3 2 116671 CASAVA_Build 6 94388383 3I CTGACCTCTT ---/CTC CTGCTCTTGT 3070 hom 132 het 47 0 44 3 CTC 0 1 116672 CASAVA_Build 6 94389108 4I CTCCTGATTT ----/CTAC CTACCTGGAG 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 CTAC 1 2 116673 CASAVA_Build 6 94398004 1D ATTTATTATT A/- TTTTTTTTTA 2517 het 1975 hom 13 5 7 2 A 1 0 116674 CASAVA_Build 6 94417841 1I CATTTTGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 11 12 116675 CASAVA_Build 6 94418353 1I TCTTTTTTTT -/G GGGGGGGGCA 3070 het 2424 hom 28 8 13 7 G 8 9 116676 CASAVA_Build 6 94420174 1I GAGTGTTTTA -/C CACCAACCGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 116677 CASAVA_Build 6 94432078 1D TCACCAAAGG A/- TGGCCTCAGC 3070 het 3070 ref 66 48 16 3 A 1 0 116678 CASAVA_Build 6 94454227 61D CAATACATTA AAAAAATAATTATGCTCAACTAGGATTTATCCCAGAGACGCAAGAACAGTTCAACATATGC/------------------------------------------------------------- AAATCAATCA 1991 het 1991 ref 33 41 5 7 AAAAAATAATTATGCTCAACTAGGATTTATCCCAGAGACGCAAGAACAGTTCAACATATGC 1 0 116679 CASAVA_Build 6 94471563 1D CTGGAAAACA T/- TTTTTTTCGG 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 8 7 116680 CASAVA_Build 6 94498439 3D AAAAGAAGGT AGA/--- AGAATTTGGA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 AGA 2 1 116681 CASAVA_Build 6 94500150 1I TATGTGTTCC -/A AAAAAAAAAA 2529 het 2003 hom 25 8 8 9 A 14 15 116682 CASAVA_Build 6 94508011 1I CTCATAGAAG -/C AGAGAGTGTC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 C 0 1 116683 CASAVA_Build 6 94511558 1I CTGAATCTAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 41 19 11 11 A 8 9 116684 CASAVA_Build 6 94524400 2D TTATTGTGGT AA/-- AGTGTGCTAT 3070 het 2786 hom 19 6 12 2 A 3 1 116685 CASAVA_Build 6 94527473 1D TTGTTCTTAA T/- CTCCTAGCTG 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 T 1 0 116686 CASAVA_Build 6 94541357 1I AATTTATCAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 116687 CASAVA_Build 6 94543141 4I ATTTAATAAA ----/TATT TATTCACCTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TATT 1 2 116688 CASAVA_Build 6 94544508 3D AAATGTTTGT CTC/--- CTCTTCAATC 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 CTC 2 1 116689 CASAVA_Build 6 94544697 1I CATTCGAATA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 T 7 8 116690 CASAVA_Build 6 94552360 1I GTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2400 hom 16 6 8 2 T 10 11 116691 CASAVA_Build 6 94567464 1D TCAAATTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 95 het 41 0 31 11 A 10 9 116692 CASAVA_Build 6 94578585 1D AAGTATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 10 12 A 14 13 116693 CASAVA_Build 6 94586887 1I TTTGCTGTGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 8 9 116694 CASAVA_Build 6 94593193 13D AAGGGATTAA AATGTGCATTTGC/------------- AATTATCACA 3070 het 3070 hom 26 10 16 2 AATGTGCATTTGC 1 0 116695 CASAVA_Build 6 94594591 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 10 9 116696 CASAVA_Build 6 94596666 1I GAAGGGAGAT -/A GGGGTGGGGC 2581 hom 18 het 7 0 6 1 A 0 1 116697 CASAVA_Build 6 94606736 2I CCACTAGAGA --/AT ATATATATAT 1822 het 48 hom 15 1 11 3 AT 6 7 116698 CASAVA_Build 6 94610534 1D AAAATAACAG A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 ref 35 14 16 5 A 7 6 116699 CASAVA_Build 6 94612613 1I TAGGAAATGA -/T TTGCAAGATT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 2 3 116700 CASAVA_Build 6 94614485 1I ATTCCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 10 11 116701 CASAVA_Build 6 94616336 1D GAGATAGAAC T/- TTTATGAGGT 3070 het 3070 hom 56 22 30 5 T 4 3 116702 CASAVA_Build 6 94618009 2I TGTACTTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2447 hom 40 7 23 10 T 10 12 116703 CASAVA_Build 6 94621075 4I TACTGTGTTG ----/CTGT CTATCTGTAT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 CTGT 0 1 116704 CASAVA_Build 6 94624540 4D TATAAATGTC TGTG/---- TGTGTATACA 3070 het 3070 ref 28 13 13 4 TG 4 2 116705 CASAVA_Build 6 94625864 1D TGTAAGAAAA G/- AATTATAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 G 1 0 116706 CASAVA_Build 6 94628258 1D TATCTATGCA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 8 7 116707 CASAVA_Build 6 94642830 1I TTTTTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 28 1 21 6 T 11 12 116708 CASAVA_Build 6 94644925 2D TGGCTAATTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 11 9 116709 CASAVA_Build 6 94655824 2I AAAATAAAAA --/GT GTTTGTTGAT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 GT 1 2 116710 CASAVA_Build 6 94657946 5I ATTAACTAAT -----/TAAAC TAAATTAATA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TAAAC 0 1 116711 CASAVA_Build 6 94666166 4D ATTCTTTAAA ATTT/---- ATTTATTAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 ATTT 2 1 116712 CASAVA_Build 6 94672324 1I CACATCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 886 hom 42 4 28 10 T 11 12 116713 CASAVA_Build 6 94675891 11I AAATTAAAAT -----------/AAAATTAAAGA AAAGAAAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAATTAAAGA 0 1 116714 CASAVA_Build 6 94678070 15D TAAAATTTTA TTAATGTCTAGATTT/--------------- AAAAAGTATT 3070 hom 72 het 23 0 25 1 TTAATGTCTAGATTT 1 0 116715 CASAVA_Build 6 94686581 4D TGTGTTATAG ACAA/---- ACAAAAGTTT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 ACAA 2 1 116716 CASAVA_Build 6 94687110 3I GATACTAAAT ---/GAA GAAGAAATAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 GAA 2 3 116717 CASAVA_Build 6 94690619 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAATATA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 6 7 116718 CASAVA_Build 6 94704468 2D ATTTTGAATA TG/-- TGTGTGTGTG 1234 het 1234 ref 42 37 3 3 TG 8 7 116719 CASAVA_Build 6 94709259 1I TTTCAGACAG -/T TAAAATGGCC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 1 2 116720 CASAVA_Build 6 94734451 6I ATCAAGACTC ------/AAACTT AAATGAGGTC 3070 hom 78 het 40 0 29 11 AAACTT 0 1 116721 CASAVA_Build 6 94753367 1D AGACTGGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 27 1 22 4 A 12 11 116722 CASAVA_Build 6 94770571 4D GTAGTTTAAC AATT/---- AAATATTATC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 AATT 1 0 116723 CASAVA_Build 6 94808471 1I TCTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 43 2 37 4 T 10 11 116724 CASAVA_Build 6 94820259 1I TTGAAAGGAC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 8 9 116725 CASAVA_Build 6 94824158 2D TTAAAGTAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 23 1 18 4 A 13 11 116726 CASAVA_Build 6 94824591 1D ACCCTACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 24 2 16 6 A 13 12 116727 CASAVA_Build 6 94827113 1I TCTGAGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 688 hom 37 2 30 5 A 10 11 116728 CASAVA_Build 6 94834976 2I GAGATAAATG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 12 hom 31 1 26 4 A 9 11 116729 CASAVA_Build 6 94839393 13I ATTCCACTGA -------------/GTATACCTCTTTT GTTAGGATTT 3070 hom 81 het 30 0 27 5 GTATACCTCTTTT 0 1 116730 CASAVA_Build 6 94844067 48I ATCTTTTGCC ------------------------------------------------/TCTCAAAAAAAATATGTATTTCTCTGGAATAACCTCCACAGAGTGTTA TGCTTAGTTA 3070 hom 90 het 27 0 31 3 TCTCAAAAAAAATATGTATTTCTCTGGAATAACCTCCACAGAGTGTTA 0 1 116731 CASAVA_Build 6 94847168 4I CCACCCTAGA ----/TCAG TTAGATGTAA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 TCAG 0 1 116732 CASAVA_Build 6 94853536 2D ACGAAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 36 0 24 12 A 17 15 116733 CASAVA_Build 6 94860333 1D ACTCAAAGTG A/- AGATTATGAG 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 A 2 1 116734 CASAVA_Build 6 94861721 1D CTACTGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 T 11 10 116735 CASAVA_Build 6 94862901 4D AGGAAAAAAA AAAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 15 9 3 AAAT 1 0 116736 CASAVA_Build 6 94863489 1D GGTTATTTTT A/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 1 0 116737 CASAVA_Build 6 94863877 1D TGTAAGTCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 10 9 116738 CASAVA_Build 6 94864676 2I TGTGTGCTCT --/AA GAAGGAGACC 3070 het 3070 ref 38 25 11 2 A 0 2 116739 CASAVA_Build 6 94878607 3I TGTATAAATC ---/TTA TTATATACAT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 TTA 1 2 116740 CASAVA_Build 6 94882610 1D CTCATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 12 11 116741 CASAVA_Build 6 94884023 1I AAATTATCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 9 10 116742 CASAVA_Build 6 94889298 4I GCACTTACTG ----/CCTT CCTTAGTCTG 3070 het 3070 ref 35 24 9 2 CCTT 1 2 116743 CASAVA_Build 6 94889736 1D ATTTTTTACA T/- TTTTTAATAT 3070 het 3070 hom 29 9 17 4 T 6 5 116744 CASAVA_Build 6 94892871 1D TATAGATAAT A/- AAAAGACAGA 3070 het 3070 hom 32 11 14 8 A 5 4 116745 CASAVA_Build 6 94893506 3I AAGAACAGAG ---/AGA AGAAGAAGCC 3070 het 3070 hom 29 7 18 4 AGA 2 3 116746 CASAVA_Build 6 94894696 91D AGAATACCCC TGGCAAAATGTGAGAGGCAATAACAATTTACATGGTGAGATAACACAAGGAAGCTTATTTTAATCACCAGCAAGTACAGCCAGCCATTCTT/------------------------------------------------------------------------------------------- TGAGTAATAA 3001 het 3001 ref 24 29 9 2 TGGCAAAATGTGAGAGGCAATAACAATTTACATGGTGAGATAACACAAGGAAGCTTATTTTAATCACCAGCAAGTACAGCCAGCCATTCTT 1 0 116747 CASAVA_Build 6 94895698 4D AGTATAATTA AAAT/---- AAATAAATAA 2035 het 2035 ref 16 9 5 4 AAAT 6 5 116748 CASAVA_Build 6 94906754 2D TTCTAAAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 34 1 13 20 T 12 10 116749 CASAVA_Build 6 94907910 2D CATCAACTAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 11 9 116750 CASAVA_Build 6 94918870 1I AGACATTATC -/A AAAAAAAAAA 1139 het 1139 ref 28 22 3 3 A 11 12 116751 CASAVA_Build 6 94959177 1I GTATTTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 A 12 13 116752 CASAVA_Build 6 94977160 1I AAAGTATCAT -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 30 10 10 10 A 7 8 116753 CASAVA_Build 6 94987365 1D TCAGTTGTAA T/- TTTTTTAGTC 2777 het 2777 ref 25 15 7 3 T 7 6 116754 CASAVA_Build 6 94998084 1D GCAAAAATAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 114 het 41 0 38 4 A 8 7 116755 CASAVA_Build 6 94999941 1I AGCGTAGTTT -/A AAAATACAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 4 5 116756 CASAVA_Build 6 95006729 4D TAGCAAGACA GACT/---- AACACTCAAA 3070 het 3070 ref 34 18 10 7 GACT 1 0 116757 CASAVA_Build 6 95007154 1D GAAAACCTAG A/- AAAAAATCGA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 7 6 116758 CASAVA_Build 6 95013997 1I ACTGTTTTTC -/G TTGAAAATCT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 G 0 1 116759 CASAVA_Build 6 95023876 2I TCTGGAATGA --/AT ATAGTTTATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 1 2 116760 CASAVA_Build 6 95032619 1I GTACAACAAA -/C CTCCCATGAC 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 C 1 2 116761 CASAVA_Build 6 95033278 1I TTGTTTTATC -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 6 7 116762 CASAVA_Build 6 95035342 1I ATTTCCTTTG -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 6 7 116763 CASAVA_Build 6 95040751 1I ATTTCAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 10 11 116764 CASAVA_Build 6 95044501 1I GGATGTTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 8 9 116765 CASAVA_Build 6 95053010 1D TCCATATCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1129 hom 19 3 11 5 A 13 12 116766 CASAVA_Build 6 95055846 1D TGACGGGAGA G/- GGTAGGAAGC 3070 hom 87 het 38 0 30 9 G 3 2 116767 CASAVA_Build 6 95057171 1I GGCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 10 11 116768 CASAVA_Build 6 95060456 1I CTAGCTCTCA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 6 7 116769 CASAVA_Build 6 95063925 1I TTGAATAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 10 116770 CASAVA_Build 6 95064356 1I AAAGTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 18 12 A 10 11 116771 CASAVA_Build 6 95065180 3D AAAGCACAAA TAT/--- TATATATGTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAT 2 1 116772 CASAVA_Build 6 95069504 1I ACATTTTTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 8 9 116773 CASAVA_Build 6 95069597 27I AATAAGTAGT ---------------------------/TAATATATTTGGCAAATAAATTAATAA AGCAAGCCTA 3070 het 3070 ref 28 15 7 6 TAATATATTTGGCAAATAAATTAATAA 0 1 116774 CASAVA_Build 6 95070619 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 G 3 4 116775 CASAVA_Build 6 95085579 2D TTACAAAGTG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 34 hom 28 1 12 16 T 10 8 116776 CASAVA_Build 6 95097033 2D AATAGTAAGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 110 het 47 0 38 9 AC 9 8 116777 CASAVA_Build 6 95098503 2D CCGAACAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 11 9 116778 CASAVA_Build 6 95103388 1I ACATTATGTA -/T TTTTTATATT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 5 6 116779 CASAVA_Build 6 95103516 2I CTCAGTGTAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 AT 6 7 116780 CASAVA_Build 6 95108179 4I TCCAGTAAGA ----/GTCC GTCCGCTGAG 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 GTCC 1 2 116781 CASAVA_Build 6 95115049 1D TATTTTACAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 9 8 116782 CASAVA_Build 6 95117084 1I GAGTCTCAGA -/T TTCACAGGAT 3070 hom 132 het 52 0 44 8 T 2 3 116783 CASAVA_Build 6 95118604 1D TATCAAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 10 9 116784 CASAVA_Build 6 95119544 1D TGAGCATATC A/- AGAAATTAAT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 A 2 1 116785 CASAVA_Build 6 95119945 4D TCACATAGAT AGTA/---- AGTGATGATC 3070 het 3070 ref 52 29 21 4 AGTA 1 0 116786 CASAVA_Build 6 95122515 1D GAATCTCAGG A/- AAAAAGATAT 3070 het 3070 hom 44 15 23 7 A 6 5 116787 CASAVA_Build 6 95126288 1D TCTCAAATAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 4 T 9 8 116788 CASAVA_Build 6 95128202 1D GGTCAGGGAT G/- GGGGGGGGTC 3070 het 622 hom 22 6 11 6 G 9 8 116789 CASAVA_Build 6 95129699 24D AATCCCAGTA TCTTCTTCCCAATCTTCTTATTTC/------------------------ TCTTCTTCGT 3070 het 3070 ref 39 27 14 4 TCTTCTTCCCAATCTTCTTATTTC 1 0 116790 CASAVA_Build 6 95132613 2D TGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 6 TG 5 4 116791 CASAVA_Build 6 95136290 1D TAACCTGAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 10 9 116792 CASAVA_Build 6 95136485 1I GAAGATAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 10 11 116793 CASAVA_Build 6 95138540 1I CACTGAGCAC -/A GGGGGTCCTC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 A 0 1 116794 CASAVA_Build 6 95138828 4D ACCAAGCACA CAAG/---- CAAGCAAGCA 3070 het 3070 ref 46 20 11 17 CAAG 4 3 116795 CASAVA_Build 6 95139743 2D TAAGAAAGAC AT/-- GTGGATACAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 AT 1 0 116796 CASAVA_Build 6 95144044 4D TTACTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 9 het 28 1 21 6 TA 12 10 116797 CASAVA_Build 6 95144277 7D TTCAATTTCC TCATTTT/------- TATCACATAT 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 TCATTTT 1 0 116798 CASAVA_Build 6 95144996 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3065 het 2163 hom 19 7 7 5 T 15 13 116799 CASAVA_Build 6 95146116 12D TATTTATGTG TGTATATATATA/------------ TATATATATA 2623 het 2393 hom 15 7 7 2 TGTATATATATA 1 0 116800 CASAVA_Build 6 95146971 3D ATAATTAATA AAG/--- AAGAAGTCCT 3070 het 3070 ref 34 19 15 3 AAG 3 2 116801 CASAVA_Build 6 95157404 3D GCAGAATTCA TAT/--- TATTGTCTTA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TAT 2 1 116802 CASAVA_Build 6 95161885 1D TTAAGAAAAT G/- AGGCAGAATA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 G 1 0 116803 CASAVA_Build 6 95168064 1D2M1D AAACACCTAG AGAT/-GA- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 N/A 0 0 116804 CASAVA_Build 6 95170977 2I GACTGGACTC --/AT AGTATACTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 0 1 116805 CASAVA_Build 6 95183652 3D TACAAATGAC AAA/--- GAATTGAAAA 3070 het 3070 hom 49 20 27 3 A 3 0 116806 CASAVA_Build 6 95187963 1I AGCTGGGACT -/A CAGGCGCCCG 2697 hom 18 het 8 0 7 1 A 0 1 116807 CASAVA_Build 6 95188141 1I TGTGTATGAT -/G ACAGCTGTGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 0 1 116808 CASAVA_Build 6 95206631 1D TTTCCTTTGT A/- AAAAAAAAAA 2862 het 2862 ref 25 15 7 3 A 13 12 116809 CASAVA_Build 6 95215532 1D ATAGAGAATG A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 8 7 116810 CASAVA_Build 6 95215928 1D TCCCTCCCAC A/- ACATATGGGA 3070 het 3070 ref 34 18 16 1 A 2 1 116811 CASAVA_Build 6 95216152 2I AAAGCAAACT --/AC CAGGCAACGA 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 AC 0 1 116812 CASAVA_Build 6 95223312 2D AAATGATGCA AT/-- CATTAAAACT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 1 0 116813 CASAVA_Build 6 95227738 7D CTTTCAGTTT TTCTCCA/------- TTCACTATAA 3070 het 3070 hom 38 17 22 1 TTCTCCA 1 0 116814 CASAVA_Build 6 95230954 1I GGGATTGTTA -/C CGCCTGATTG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 C 1 2 116815 CASAVA_Build 6 95244929 1D GTTTGGGGGG A/- GGTGGGGGGT 3070 het 3070 ref 39 16 14 10 A 1 0 116816 CASAVA_Build 6 95255182 1I TTTAAAGCTA -/T TTTTAAGTGC 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 4 5 116817 CASAVA_Build 6 95261325 1D TACCAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 A 13 12 116818 CASAVA_Build 6 95266550 3I ATTTCAAAAA ---/CGC ATTGGACCAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 CGC 0 1 116819 CASAVA_Build 6 95285864 1D AAGTGACATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 8 116820 CASAVA_Build 6 95290999 1D TGCAGGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2233 hom 29 10 12 8 T 15 14 116821 CASAVA_Build 6 95292027 4D ACTCTCTCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 6 T 14 10 116822 CASAVA_Build 6 95292291 2I GCAAATATCA --/AC AGTGTTATCT 3070 hom 121 het 49 0 41 8 AC 0 1 116823 CASAVA_Build 6 95295850 8D GGGCTTTCTA TTACATTT/-------- TTACATTTTT 3070 hom 111 het 42 0 37 7 TTACATTT 2 1 116824 CASAVA_Build 6 95299915 2I GAGAGTAAAC --/TG AGATTTAGCA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 TG 0 1 116825 CASAVA_Build 6 95330400 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 2347 het 2347 ref 31 18 8 5 TA 6 7 116826 CASAVA_Build 6 95378961 1D AATTGGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 13 12 116827 CASAVA_Build 6 95383923 1D CTTCTGCACC A/- AAAAAAAAAA 1264 het 1264 ref 40 30 4 6 A 13 12 116828 CASAVA_Build 6 95386774 1D TTTCTGGCAA T/- TGATCAAAAC 3070 het 3070 hom 24 7 13 4 T 2 1 116829 CASAVA_Build 6 95403876 1D TTCTAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 1699 het 1699 ref 32 17 9 6 T 17 16 116830 CASAVA_Build 6 95406770 1I ACATAGTCTG -/A AAAAAGACTC 3070 het 318 hom 53 1 44 8 A 5 6 116831 CASAVA_Build 6 95409474 3D GTTTGGAAGC AAG/--- AAGAATTCCC 3070 het 3070 hom 46 17 24 6 AAG 2 1 116832 CASAVA_Build 6 95410540 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2109 het 2109 ref 28 11 7 10 A 16 15 116833 CASAVA_Build 6 95414881 1I GAATGAAAAA -/G ATGGATAGAC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 0 1 116834 CASAVA_Build 6 95415774 1D TGGTCCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 T 11 10 116835 CASAVA_Build 6 95417555 4D CATAGTAGTC ATTT/---- AAAGTAATTA 3070 het 3070 ref 31 20 11 0 ATTT 1 0 116836 CASAVA_Build 6 95419363 1D TACAGATCAC T/- TTTTATTGCT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 T 5 4 116837 CASAVA_Build 6 95422209 1D TTTTTCCTTC T/- TTTTTTTATT 2755 het 2755 ref 36 24 7 5 T 8 7 116838 CASAVA_Build 6 95433823 1I TGGTTTCTAT -/C CCACTGTGTA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 C 2 3 116839 CASAVA_Build 6 95442344 1D ATATAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 26 8 11 A 12 11 116840 CASAVA_Build 6 95443862 1I GATGATGATC -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 6 7 116841 CASAVA_Build 6 95445083 2D GTGTATGTGC AT/-- ATATATATAT 2453 het 2453 ref 20 7 10 3 AT 6 5 116842 CASAVA_Build 6 95446772 1D TTGACAAACT A/- AATTTTACAT 3070 het 3070 hom 48 18 28 2 A 3 2 116843 CASAVA_Build 6 95449194 1D CATACAGACA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 6 116844 CASAVA_Build 6 95450811 2D CTGAATTTTT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 TG 1 0 116845 CASAVA_Build 6 95465024 12I TTTTGAGACC ------------/CCAAAATTTTGG CCAAGAATTC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 CCAAAATTTTGG 0 1 116846 CASAVA_Build 6 95465972 5I CTCCCTCAAG -----/AGTAA AGTAGAGAAA 3070 het 3070 hom 53 22 26 5 AGTAA 0 1 116847 CASAVA_Build 6 95492537 4D AAAGAATACC ATTT/---- ATTATAGCAT 3070 het 3070 ref 31 19 11 2 ATTT 1 0 116848 CASAVA_Build 6 95509734 2I CAAACAAAAC --/TT AACATGTCTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 0 2 116849 CASAVA_Build 6 95512530 5D AAAAACAACA TAAAG/----- TAAAGAATCT 3070 het 3070 hom 35 12 20 7 TAAAG 2 1 116850 CASAVA_Build 6 95514461 1D ATTTTATCCA T/- AGTAGAACTT 3070 het 3070 ref 49 26 20 4 T 1 0 116851 CASAVA_Build 6 95562444 1I TTAACGTACC -/A AAAAAAAAAA 2536 het 2168 hom 24 9 7 8 A 13 14 116852 CASAVA_Build 6 95603882 1D CATCTTGAGG A/- AAAAAAAAAA 1634 het 1634 ref 22 15 6 3 A 13 12 116853 CASAVA_Build 6 95604551 3I TATGCATGTA ---/AAC AACCACATTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAC 1 2 116854 CASAVA_Build 6 95630297 1D TATATCCCAC A/- AAAAAACTTG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 7 6 116855 CASAVA_Build 6 95652080 11D AATTCTTAAG GGATATTGAAC/----------- AGAAATGGTG 3070 het 3070 ref 37 22 16 6 GGATATTGAAC 1 0 116856 CASAVA_Build 6 95693927 4D TTTTCATGAT ATTC/---- ATTCTTTCTA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 ATTC 2 1 116857 CASAVA_Build 6 95707031 4I2M6I CAGTCAGAGT ----TG------/AAAGTGACAACC TTTATCCATC 3070 het 3070 ref 33 21 14 2 N/A 0 0 116858 CASAVA_Build 6 95715447 1I TGTGGAATAT -/A AAAATGTCAA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 4 5 116859 CASAVA_Build 6 95722023 1I ACATCCTTGT -/A ACTCTCACTG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 1 2 116860 CASAVA_Build 6 95731190 1I AGGCCCTGGT -/G TGTGTTGTTC 3070 hom 78 het 31 0 25 6 G 0 1 116861 CASAVA_Build 6 95940137 1D AATTGACATA T/- AATAAACTGC 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 T 1 0 116862 CASAVA_Build 6 95940213 1I CATCACTAAT -/A AATGCATTCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 3 116863 CASAVA_Build 6 95940337 1D TCATTTATTG A/- GTTTATTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 A 1 0 116864 CASAVA_Build 6 95940834 2I AGAAATTGTC --/TT TGGCTGATTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 1 3 116865 CASAVA_Build 6 95949236 1D CCTTACAGAT A/- TTTTTTTTAT 3070 het 1551 hom 16 4 11 1 A 1 0 116866 CASAVA_Build 6 95957412 4I ATGAGAAAAA ----/AAAT AAAAAAAAAA 2889 het 98 hom 26 3 16 7 AAAT 0 1 116867 CASAVA_Build 6 95959840 1I TTATTGTGGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 9 10 116868 CASAVA_Build 6 95981933 2D TAATTTAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 16 0 10 7 T 14 12 116869 CASAVA_Build 6 95985018 1I CTTTGCTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 736 hom 27 2 18 7 A 11 12 116870 CASAVA_Build 6 95999068 1D GCAATTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 11 10 116871 CASAVA_Build 6 96005163 1I GCATTCTGCT -/G GGCCCATTCC 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 G 2 3 116872 CASAVA_Build 6 96009954 1I TAACATCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1212 hom 32 3 20 9 T 13 14 116873 CASAVA_Build 6 96034494 3D GTTTCCTTTG AGT/--- AGTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 AGT 2 1 116874 CASAVA_Build 6 96037977 1I ATATGGACTC -/A ACGATTAAAG 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 A 1 2 116875 CASAVA_Build 6 96044572 2D GATGTGTATT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 12 19 7 TA 7 6 116876 CASAVA_Build 6 96075886 1I AGTGAAGGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 8 9 116877 CASAVA_Build 6 96076734 2I ATCTGTTTTT --/AA AAAAATCTTC 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 A 5 7 116878 CASAVA_Build 6 96077401 1I TCCTCTTTGG -/T TGAGAGATCT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 1 2 116879 CASAVA_Build 6 96077962 1D TAATAATAAA T/- TTTTTTTAAA 3025 het 2492 hom 22 7 8 7 T 8 7 116880 CASAVA_Build 6 96090530 4I TCCCAGCACC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 ATTT 2 3 116881 CASAVA_Build 6 96102549 19D ATATGTAATT ATTAATGTAATATATGTAA/------------------- TCAATTACAT 3070 het 3070 hom 30 15 16 5 ATTAATGTAATATATGTAA 1 0 116882 CASAVA_Build 6 96106973 1D TCATGCAAAA T/- TTTTTTTTTT 394 het 394 ref 15 7 4 4 T 17 16 116883 CASAVA_Build 6 96114108 2D95M1I ATAAGTTCCC CTGTGATTAGAAATGCCACAGTTTTCACGTGCCCATAGAAATATAATAATCAATTTCTTGCTTTTCTATGCAATTTCATTGATCTAACTTACTGATC-/--GTGATTAGAAATGCCACAGTTTTCACGTGCCCATAGAAATATAATAAGCAATTTCTTGCTTTTCTATGCAATTTCATTGATCTAACTTACTGATCT TTCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 30 22 19 20 N/A 0 0 116884 CASAVA_Build 6 96136704 9D ATGTTTGTTG TGATGTCAA/--------- TGATTTGAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 TGATGTCAA 1 0 116885 CASAVA_Build 6 96138357 1D TTTTTGAATG T/- TTACTTTATA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 3 2 116886 CASAVA_Build 6 96139733 2D ACTTATACTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 10 16 9 AT 8 7 116887 CASAVA_Build 6 96140891 4D TGAAATCAGT ATTA/---- ATTATTCAAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 ATTA 2 1 116888 CASAVA_Build 6 96141603 6I TATATATATA ------/TATATG TGTGTGTTTG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TATATG 0 1 116889 CASAVA_Build 6 96143731 4D ATTTATAAAT AAAG/---- AAATAATTTC 2844 het 2844 ref 23 13 8 3 AAAG 1 0 116890 CASAVA_Build 6 96154014 1D AGTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2109 hom 33 10 14 9 A 16 15 116891 CASAVA_Build 6 96164443 11I TTTAAACATG -----------/ACTGTTCCTAA ACTCTACAGT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 ACTGTTCCTAA 0 1 116892 CASAVA_Build 6 96166132 5I AAAAAGTAGT -----/TACTC TAATATTAAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 TACTC 0 1 116893 CASAVA_Build 6 96171896 1I CTAAAATTAA -/C ACCGCTATTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 116894 CASAVA_Build 6 96201608 1I TAAGGCAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 A 11 12 116895 CASAVA_Build 6 96248886 1D ACTCAATCTC T/- TTTTTTTTTT 1840 het 1840 ref 31 13 4 14 T 17 16 116896 CASAVA_Build 6 96277885 1I AGTTTCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 737 hom 35 2 26 7 T 10 11 116897 CASAVA_Build 6 96288377 4D AAAAAGTTAT TTGA/---- TTGACAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 14 2 TTGA 2 1 116898 CASAVA_Build 6 96290645 3D TGAAAATTAG TTT/--- CATTCTTCTT 3070 hom 99 het 34 0 34 1 T 3 0 116899 CASAVA_Build 6 96303440 1I TTTTTATATA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 116900 CASAVA_Build 6 96385795 1I AATAGCTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 9 10 116901 CASAVA_Build 6 96385927 4I GACACTGAAT ----/GCCC GCCCACTCAC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 GCCC 1 2 116902 CASAVA_Build 6 96388354 1I TTTTTTTTTT -/A ATTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 1 2 116903 CASAVA_Build 6 96401016 3D TGAAATAACC CAA/--- CATTAGAAAC 3070 het 3070 hom 45 19 24 3 CAA 1 0 116904 CASAVA_Build 6 96414439 1I ATTAAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 11 12 116905 CASAVA_Build 6 96440939 1I CAGGCAATTC -/T TTTTTTTTTT 2105 het 2017 hom 22 7 5 10 T 11 12 116906 CASAVA_Build 6 96450428 1I TTCTTTTTTT -/A AATGATGCCA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 2 3 116907 CASAVA_Build 6 96450523 1I TATTTAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 11 12 116908 CASAVA_Build 6 96452665 1D ATATTCCATT G/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 G 1 0 116909 CASAVA_Build 6 96459042 1I CTACCTTTAG -/A AAAATATTGC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 4 5 116910 CASAVA_Build 6 96460703 1D CTTTTATGTG T/- TTTTTTCTGC 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 T 7 6 116911 CASAVA_Build 6 96461084 1I TATTCAATTC -/A AAAAAAAATT 2185 het 2185 ref 19 11 7 1 A 8 9 116912 CASAVA_Build 6 96462366 3D GATCCACCCA CCT/--- CCTCGGCTTC 2005 het 1673 hom 12 4 5 4 CCT 2 1 116913 CASAVA_Build 6 96466293 1I TCTCTATATA -/T TTTTTAATGA 2984 het 2984 ref 28 15 7 6 T 5 6 116914 CASAVA_Build 6 96467763 1D ACCCAAATGC A/- AAAATCCAGC 3070 hom 141 het 54 0 48 8 A 5 4 116915 CASAVA_Build 6 96468189 2I TAAAACAAAC --/TT AGGTTAATAA 981 het 981 ref 30 15 5 10 T 0 2 116916 CASAVA_Build 6 96470931 1D TTCTTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2122 hom 23 8 10 5 T 13 12 116917 CASAVA_Build 6 96472428 1D ATATTATTTG A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 A 1 0 116918 CASAVA_Build 6 96477483 1D TTAAATATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 8 4 A 11 10 116919 CASAVA_Build 6 96489795 1D TTTTCTACGA T/- TTTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 52 22 23 8 T 6 5 116920 CASAVA_Build 6 96490069 5D GAGGGCCAGG AAGCA/----- AAGTTTTCAG 3070 het 3070 ref 36 19 11 8 AAGCA 1 0 116921 CASAVA_Build 6 96492453 1D CATTCCTGTT A/- ACTCAGAAGG 3070 hom 123 het 47 0 40 8 A 2 1 116922 CASAVA_Build 6 96495532 1D GAAAACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 32 1 19 13 A 13 12 116923 CASAVA_Build 6 96495830 1D TTAATTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 T 11 10 116924 CASAVA_Build 6 96498875 1D ACAGAAAAAT G/- TAATCCAGGA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 G 1 0 116925 CASAVA_Build 6 96499698 1D CTTCCCTTTC T/- TTTTTCACTT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 T 6 5 116926 CASAVA_Build 6 96503643 1D CAATTTTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 A 10 9 116927 CASAVA_Build 6 96507120 2D CTTTTTATAG AA/-- AAAAAAAAAA 2787 het 2787 ref 23 12 7 5 A 13 11 116928 CASAVA_Build 6 96508299 1D AGCATAGGCT A/- TTTCGAATTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 A 1 0 116929 CASAVA_Build 6 96508651 1I AATCTCTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 9 10 116930 CASAVA_Build 6 96509919 4D CCATGGCACA TACT/---- TACCTATGTA 3070 het 3070 ref 40 26 13 3 TACT 1 0 116931 CASAVA_Build 6 96521092 1I AGTAAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 26 3 T 10 11 116932 CASAVA_Build 6 96523575 1D TTATGGGAGG A/- AAAAAATAGC 3070 hom 78 het 30 0 27 5 A 7 6 116933 CASAVA_Build 6 96532754 5D ATATTTAAGC TTTAA/----- TTTATGTCTT 2205 het 2205 ref 23 13 6 5 TTTAA 1 0 116934 CASAVA_Build 6 96552350 2D ACACACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 58 hom 22 1 12 10 AT 8 7 116935 CASAVA_Build 6 96565129 1I CACCATGTCA -/C CCAGGCTAGT 3070 hom 101 het 39 0 32 7 C 2 3 116936 CASAVA_Build 6 96585992 1D ATTAGTAGAT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 A 8 7 116937 CASAVA_Build 6 96592275 1D CATTAGTGTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 37 0 32 6 A 9 8 116938 CASAVA_Build 6 96592594 2I CCTGAAACAT --/AC ACACCTAATC 3070 het 3070 hom 63 27 32 4 AC 2 3 116939 CASAVA_Build 6 96594547 1I ATTCAAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 85 het 36 0 29 7 T 9 10 116940 CASAVA_Build 6 96597902 1I CTCGCCTCGG -/A GTCCCAAAGT 2757 het 2315 hom 17 8 6 3 A 0 1 116941 CASAVA_Build 6 96600749 1D TTCAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 14 10 T 12 11 116942 CASAVA_Build 6 96616964 1I AATGATATTC -/A AAGTTGATAA 3070 het 3070 hom 26 7 13 6 A 2 3 116943 CASAVA_Build 6 96620939 1I AAATTTAAAT -/A AAAAATCTAG 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 5 6 116944 CASAVA_Build 6 96621491 1I CACTCAATTT -/C TTTCAGTTGT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 C 0 1 116945 CASAVA_Build 6 96622007 1I AACAGAAAGA -/T TTTTAAACAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 4 5 116946 CASAVA_Build 6 96623176 1I ATCCTTCCTC -/T TATCGCATTG 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 1 2 116947 CASAVA_Build 6 96634819 1D TTGTGTTTCT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 91 het 39 0 31 8 A 9 8 116948 CASAVA_Build 6 96652214 2D CTTTCAATGA AC/-- ATTACAAAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 AC 1 0 116949 CASAVA_Build 6 96652708 1I GAAAACAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 9 10 116950 CASAVA_Build 6 96667673 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 7 6 116951 CASAVA_Build 6 96675311 1I ATTAAGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 143 hom 30 1 24 5 T 10 11 116952 CASAVA_Build 6 96676452 4D TTAAAATAAA TCTC/---- TATGTTGCTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TC 2 0 116953 CASAVA_Build 6 96689619 1D ATTTCAAAAA G/- GTGCAGGTTG 3070 het 3070 ref 30 16 12 4 G 2 1 116954 CASAVA_Build 6 96692604 1D ACCTGTCTCT A/- ATGTGCTTAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 2 1 116955 CASAVA_Build 6 96693081 1D TGTTCCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 36 2 21 13 T 15 14 116956 CASAVA_Build 6 96698823 1D TCCTTAGTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 9 8 116957 CASAVA_Build 6 96700551 3I CTCCCAGGTT ---/CAA GAGGTCCTCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 CAA 0 1 116958 CASAVA_Build 6 96702649 1D AAAAAAAAAA T/- ATTGAAACTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 0 116959 CASAVA_Build 6 96703938 1D TAAGGCAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 10 9 116960 CASAVA_Build 6 96720034 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 9 8 116961 CASAVA_Build 6 96727252 1D CCCGTTATTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 142 hom 45 1 39 6 A 10 9 116962 CASAVA_Build 6 96727419 1I TAAAGAGATA -/G GGTTCTCAAT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 G 2 3 116963 CASAVA_Build 6 96728373 1I ATCACACAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 8 9 116964 CASAVA_Build 6 96734354 1I AGAACACCTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 899 hom 35 2 31 2 A 8 9 116965 CASAVA_Build 6 96735533 1I TAAGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 46 1 36 9 A 10 11 116966 CASAVA_Build 6 96736035 1I TTCATAGTTC -/T TTTTTTAATT 3070 hom 46 het 36 1 29 6 T 6 7 116967 CASAVA_Build 6 96736181 11I TTTATCCCTC -----------/ATCCCTTCCCT TCCTTTCTCC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 ATCCCTTCCCT 0 1 116968 CASAVA_Build 6 96739748 1I ATTTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 36 2 30 4 T 11 12 116969 CASAVA_Build 6 96743230 2I ATAGAAAGAA --/AT ATATATATAT 3070 het 86 hom 21 1 19 1 AT 6 7 116970 CASAVA_Build 6 96743963 2D ACTTTTAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 42 1 32 12 T 12 10 116971 CASAVA_Build 6 96749301 3D GAGTTTTGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 38 0 25 15 T 14 11 116972 CASAVA_Build 6 96752043 1I CATGCCAAAA -/G GTAAATGGCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 1 2 116973 CASAVA_Build 6 96752678 1D ATCTTCCATT C/- TTTAACATTC 3070 het 50 hom 29 1 25 4 C 1 0 116974 CASAVA_Build 6 96762810 1D59M1I GCCTCTGATA TTTTTTTTGTCAGCCTATTTTTAAACTAGATTCCATGAGTCTTAAGGTAATATCCTAGAA-/-TTTTTTTGTCAGCCTATTTTTAAACTAGATTCCATGAGTGTTAAGGTAATATCCTAGAAT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 17 N/A 0 0 116975 CASAVA_Build 6 96763497 1I ATTAAGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 42 1 41 0 T 10 11 116976 CASAVA_Build 6 96796219 1D AAATGATTTG A/- AAAGATTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 20 8 A 4 3 116977 CASAVA_Build 6 96850328 1D ATATAGAACC A/- AAAAAAAAAC 1729 het 1729 ref 58 45 5 9 A 10 9 116978 CASAVA_Build 6 96950685 3D CAGCCACCAC CAT/--- GCTTGACCAA 3070 hom 129 het 47 0 41 8 CAT 1 0 116979 CASAVA_Build 6 96952279 1D CAACTGCAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 9 8 116980 CASAVA_Build 6 96954911 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1057 het 549 hom 13 3 4 6 A 17 16 116981 CASAVA_Build 6 96954975 1D ACCAACACCC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 9 8 116982 CASAVA_Build 6 96958699 1I TAACTCAGAG -/A ACCCTCCTTA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 1 2 116983 CASAVA_Build 6 96960428 1D TTTAAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 11 10 116984 CASAVA_Build 6 96961262 1I ATAGCTAGGT -/A AAAAAAAACA 3070 het 252 hom 34 1 28 5 A 8 9 116985 CASAVA_Build 6 96962450 1I TTGATCTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 25 1 17 7 A 13 14 116986 CASAVA_Build 6 96967818 7D ACAGTTACAG CAACATA/------- CAAAATCAAT 3070 het 3070 hom 41 19 19 7 CAACATA 1 0 116987 CASAVA_Build 6 96970000 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAACCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 8 7 116988 CASAVA_Build 6 96970893 5D CTAAAAATAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 22 0 16 9 A 15 10 116989 CASAVA_Build 6 96973221 1I CCACTCCCCC -/T ATCACAGTTT 3070 hom 122 het 47 0 40 7 T 0 1 116990 CASAVA_Build 6 96979550 1I ACCCAGTTCC -/A AAGTCGCTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 3 116991 CASAVA_Build 6 96987143 1D ATGAAGCTTA G/- TTTTGCTAGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 1 0 116992 CASAVA_Build 6 97016092 5D GGAAAAATAT TATGA/----- TATATATAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TATGA 1 0 116993 CASAVA_Build 6 97039551 3I ATCCACTGTC ---/CTT CTCCTACATG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 CTT 0 1 116994 CASAVA_Build 6 97045284 2D GGCACTTTTA TT/-- TTTATTTTTT 665 hom 31 het 19 0 9 10 T 5 3 116995 CASAVA_Build 6 97055965 1I AAGACTCTAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 9 116996 CASAVA_Build 6 97058314 4I ATGACAGAAT ----/TTTA TTTATTGACC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TTTA 1 2 116997 CASAVA_Build 6 97069595 1I TCCTTAAGAG -/T TAAGTCTTGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 1 2 116998 CASAVA_Build 6 97077576 1I CTCTGAAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 9 10 116999 CASAVA_Build 6 97082091 5D TGCATGAGAT TAATG/----- TATAATACAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 TAATG 1 0 117000 CASAVA_Build 6 97177472 1I TAAAGCTGGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 T 8 9 117001 CASAVA_Build 6 97180381 3D AACCTTTCCA GCT/--- GGAAATATTC 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 GCT 1 0 117002 CASAVA_Build 6 97181481 1D GCGATTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 10 9 117003 CASAVA_Build 6 97181807 1D GAAGGGCTGA G/- AGCCCACATA 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 G 1 0 117004 CASAVA_Build 6 97184796 1I CCAAGTAGCT -/G GGATTACAGG 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 G 2 3 117005 CASAVA_Build 6 97188206 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 17 19 2 T 9 8 117006 CASAVA_Build 6 97200984 1D CTATTTTTTT C/- CCTCTCTCTC 3070 hom 89 het 35 0 29 7 C 3 2 117007 CASAVA_Build 6 97205449 1I AACCAACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1027 hom 16 5 9 2 T 11 12 117008 CASAVA_Build 6 97207297 15I TCTGTGGATT ---------------/TGCACCGACTGTACA TACACCGACT 3070 hom 39 het 34 1 27 6 TGCACCGACTGTACA 0 1 117009 CASAVA_Build 6 97219837 4D AATTAAACAC AGAA/---- AGAGTTTACA 3070 hom 72 het 28 0 25 7 AGAA 1 0 117010 CASAVA_Build 6 97225623 2D CTAATAGAAA AC/-- AGTTACAAAT 3070 het 3070 ref 48 28 17 4 AC 1 0 117011 CASAVA_Build 6 97235023 1I GATGTGATAC -/T TCACATATGG 3070 hom 184 het 64 0 62 2 T 1 2 117012 CASAVA_Build 6 97245894 4D TTTTCTAAAT AGAA/---- AGAGTACAAG 3070 het 3070 hom 43 21 21 6 AGAA 1 0 117013 CASAVA_Build 6 97252508 1I GTACCCAAAA -/G AAAGGAAATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 0 1 117014 CASAVA_Build 6 97254119 2D GACCAGCTAA TT/-- TTTTGTAGAG 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 T 6 4 117015 CASAVA_Build 6 97260270 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 12 11 117016 CASAVA_Build 6 97266973 1I TATTACATTA -/T TATTTCTTAA 1807 hom 14 het 22 0 5 17 T 1 2 117017 CASAVA_Build 6 97274035 1I GTTTGTGGTA -/T TTTTTTAACA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 7 117018 CASAVA_Build 6 97281394 1I ACAAACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 A 11 12 117019 CASAVA_Build 6 97282665 1D TTTGAGATGG A/- AAAAAAGTAG 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 A 7 6 117020 CASAVA_Build 6 97289565 1D AATAAAAAGC T/- TTGTGACCAT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 3 2 117021 CASAVA_Build 6 97290278 1D TGCGGAGCTG T/- TTTTTTTTTT 2342 het 2342 ref 40 30 5 5 T 12 11 117022 CASAVA_Build 6 97290974 1I AGACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2477 hom 26 9 14 3 A 11 12 117023 CASAVA_Build 6 97295402 1D AAGAGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 13 12 117024 CASAVA_Build 6 97300905 1D AGCTCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1473 hom 53 9 15 31 A 13 12 117025 CASAVA_Build 6 97304417 2I TGCCCAGCTA --/TT TTTTTTTTTT 1680 hom 12 het 8 0 5 3 T 10 12 117026 CASAVA_Build 6 97304529 1I CTGGGATTAC -/A AGGCGTGAGC 3070 het 1164 hom 21 3 8 10 A 1 2 117027 CASAVA_Build 6 97313975 4D ATCTATAATT TATC/---- TATTAGTAAA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 TATC 1 0 117028 CASAVA_Build 6 97316156 1D TTCATGTGAT A/- AGGTGAAAAG 3070 het 3070 ref 43 24 18 2 A 2 1 117029 CASAVA_Build 6 97327055 1I TTACACTGTT -/G GTGGGACTGT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 1 2 117030 CASAVA_Build 6 97328203 1D CATCATGCTA T/- TGGACTTCAA 3070 het 3070 ref 41 25 10 6 T 2 1 117031 CASAVA_Build 6 97333345 4D GATTCAATTC AGTA/---- AGTATTTGTT 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 AGTA 2 1 117032 CASAVA_Build 6 97333699 1D ACTCATTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 A 11 10 117033 CASAVA_Build 6 97335226 3D TAATAATAAT AAG/--- AAGAAAGAAT 3070 het 2843 hom 30 8 17 8 AAG 2 1 117034 CASAVA_Build 6 97339918 2D GAGGGAAACC CA/-- CAGTCTCAGG 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 CA 2 1 117035 CASAVA_Build 6 97340708 3I GCACATGGTA ---/TAT TATAGAACAA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 TAT 1 2 117036 CASAVA_Build 6 97373479 3D CAATTGTCAA AAG/--- AAGACATTTA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 AAG 2 1 117037 CASAVA_Build 6 97379248 1D TAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1877 hom 41 9 19 13 A 14 13 117038 CASAVA_Build 6 97386503 1I ACTCTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 1103 het 1103 ref 19 9 3 7 A 10 11 117039 CASAVA_Build 6 97387647 4D TGCTAGTGAT AGAC/---- AGTGTGAAAC 3070 het 3070 hom 54 21 31 3 AGAC 1 0 117040 CASAVA_Build 6 97389165 1D TCATAGTTGC A/- AAAAAAAAAA 1812 het 1812 ref 41 35 4 2 A 11 10 117041 CASAVA_Build 6 97394778 1I TAGTTGCTAA -/T AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 0 1 117042 CASAVA_Build 6 97399118 2I TTATTATCTC --/TT TGACTTACCA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 1 3 117043 CASAVA_Build 6 97404764 1I AAATAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2808 hom 40 9 18 13 T 14 15 117044 CASAVA_Build 6 97431417 1I TGTAAGAGTC -/T TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 6 7 117045 CASAVA_Build 6 97442460 5I TGAGACAAAA -----/TAGAG TAGTTATCAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TAGAG 0 1 117046 CASAVA_Build 6 97445997 1I ACCTAGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 20 17 14 A 10 11 117047 CASAVA_Build 6 97449548 2D AGAAATATCA AC/-- ACACATTATA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 AC 3 2 117048 CASAVA_Build 6 97470251 1D TCCATGGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 34 0 28 6 A 11 10 117049 CASAVA_Build 6 97470965 2I ATAGAAGTAC --/AG AGTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 AG 1 2 117050 CASAVA_Build 6 97477103 1D CTCACACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 218 hom 32 1 24 8 A 12 11 117051 CASAVA_Build 6 97480556 1I TTGCTTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 T 8 9 117052 CASAVA_Build 6 97485707 4D CCAGGATAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 AAAC 4 3 117053 CASAVA_Build 6 97486478 1D AATCATTATG A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 8 7 117054 CASAVA_Build 6 97486854 1D GGAATCAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 9 11 T 10 9 117055 CASAVA_Build 6 97489057 1D CAACAACAAC A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 7 6 117056 CASAVA_Build 6 97492870 1I TCCATAGTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 9 10 117057 CASAVA_Build 6 97500778 1D AGGAAAAAAA T/- ATTTTAAATA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 T 1 0 117058 CASAVA_Build 6 97504828 1I CATTTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 A 11 12 117059 CASAVA_Build 6 97505210 8D GTTGAGTGAG TGAGTGAA/-------- TGAGTGAATG 3070 het 3070 hom 34 10 19 8 TGAGTGAA 3 2 117060 CASAVA_Build 6 97505733 1I TTAATAATGG -/A AAAAATATAC 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 5 6 117061 CASAVA_Build 6 97508452 1D AATAGTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 43 0 33 10 T 13 12 117062 CASAVA_Build 6 97513343 30I TTTCCCCACC ------------------------------/CCTCTGTGGGTGGATCCAGCAGCAGGACTG CATTGGAAAG 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 CCTCTGTGGGTGGATCCAGCAGCAGGACTG 0 1 117063 CASAVA_Build 6 97513427 1D AGTGCCAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 9 8 117064 CASAVA_Build 6 97534599 1D ATATTCGTAC A/- ATTGATTTTG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 2 1 117065 CASAVA_Build 6 97540342 1D GGACTTCTCT A/- GAATTGGTTA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 0 117066 CASAVA_Build 6 97553869 1I CACACGTGCC -/T TGTAGTCCTC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 1 2 117067 CASAVA_Build 6 97585939 1D GTTTTTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 T 12 11 117068 CASAVA_Build 6 97620583 1D TGGTTAATGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 T 9 8 117069 CASAVA_Build 6 97627162 1I TCTCTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 31 1 20 10 T 12 13 117070 CASAVA_Build 6 97647760 1D TATTGCTGCT A/- ACCTGGGTTA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 A 2 1 117071 CASAVA_Build 6 97658373 1D GACAAAAAAA T/- GTCACCTTGT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 1 0 117072 CASAVA_Build 6 97660363 1I AGACCAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 17 15 15 A 10 11 117073 CASAVA_Build 6 97700694 1I CCTGATATGA -/T TTTTTTTTTT 2931 het 2931 ref 20 9 7 4 T 10 11 117074 CASAVA_Build 6 97737393 4D ATTCTCCCCT CTTC/---- CTCCCTAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 CTTC 1 0 117075 CASAVA_Build 6 97769709 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 1197 het 581 hom 8 3 4 2 A 1 0 117076 CASAVA_Build 6 97776149 4D ATACTCAGCT GAAA/---- GATATAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 21 4 GAAA 1 0 117077 CASAVA_Build 6 97777935 1D ATGGCTAAGG T/- TTAAGTATTT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 3 2 117078 CASAVA_Build 6 97781774 1D ACCTATGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 10 9 117079 CASAVA_Build 6 97786262 1D AAAAGGGGGG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 A 8 7 117080 CASAVA_Build 6 97801304 3I AGGGAGAAAA ---/TAG TAGTGCATCA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 TAG 1 2 117081 CASAVA_Build 6 97801585 1D ATCCAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 A 12 11 117082 CASAVA_Build 6 97802997 4D AGTGTGAGAT AATA/---- AATGTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 AATA 1 0 117083 CASAVA_Build 6 97803645 1I GGTCACACCC -/A AAAGAGCAAC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 3 4 117084 CASAVA_Build 6 97809035 4D TACATAAATA ATTT/---- ATCTCTGTGA 2995 het 2995 ref 24 14 10 0 ATTT 1 0 117085 CASAVA_Build 6 97810378 2I CTCCTTGAAA --/TC ATCTGTCCAT 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 TC 0 1 117086 CASAVA_Build 6 97814295 2D TAATAAATCT TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TA 8 7 117087 CASAVA_Build 6 97831039 6D GTTATTCTAC GTAAAG/------ GTAAAGGTAT 3070 het 3070 ref 40 22 14 8 GTAAAG 2 1 117088 CASAVA_Build 6 97837278 1I CCCCCTCGCC -/G CTCCGTCCAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 G 0 1 117089 CASAVA_Build 6 97846870 1I AAATTGGATC -/A AACCTCTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 2 3 117090 CASAVA_Build 6 97850938 1I CATCTCCACC -/A AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 5 6 117091 CASAVA_Build 6 97856777 1I4M3I GGTGGAAACT -TAGG---/ATAAGACT TCTTACCTTG 3070 het 3070 ref 43 22 20 2 N/A 0 0 117092 CASAVA_Build 6 97858217 1D CAGCCCACAC T/- TTAGGAGTGG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 3 2 117093 CASAVA_Build 6 97864051 1I CTAAAAAGAC -/A AAAAAAAATT 1799 het 557 hom 8 2 6 0 A 8 9 117094 CASAVA_Build 6 97868319 1I CAGAATTCCT -/C CCCCCCTACC 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 C 6 7 117095 CASAVA_Build 6 97868604 9I AGTGTTAGAA ---------/AAAAGGAAG ATAAAGAACT 3070 het 3070 hom 43 18 21 6 AAAAGGAAG 0 1 117096 CASAVA_Build 6 97871875 1D GTTACCATTA G/- GGGTTTTATG 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 G 4 3 117097 CASAVA_Build 6 97881111 3I CTGAAATTTT ---/TTA TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 TTA 1 2 117098 CASAVA_Build 6 97885419 1I TTACTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2766 hom 35 9 12 14 T 13 14 117099 CASAVA_Build 6 97889883 1I GTAAGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 14 13 16 T 15 16 117100 CASAVA_Build 6 97894213 1D TGAATGTTTG T/- TGTTCTCTCT 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 T 2 1 117101 CASAVA_Build 6 97898725 2D GGGGGTGAGA CT/-- CTCTCTCAAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 4 CT 4 3 117102 CASAVA_Build 6 97929753 1D TTTAATGGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 8 117103 CASAVA_Build 6 97944469 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 13 14 117104 CASAVA_Build 6 97956742 1D CTTGACATTC T/- TTTTTTTTTT 1834 het 336 hom 15 3 6 6 T 17 16 117105 CASAVA_Build 6 97960683 1I TAGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1051 het 1051 ref 49 39 3 7 A 13 14 117106 CASAVA_Build 6 97974209 1D ACAGGGGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1497 hom 21 7 11 3 A 16 15 117107 CASAVA_Build 6 97980959 1I AGATAATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1876 hom 27 7 15 5 T 13 14 117108 CASAVA_Build 6 97984191 17D TATATCTTCT GACCTTTCTTAACTCAC/----------------- TTATTCATTC 2557 het 2556 ref 32 7 7 21 GACCTTTCTTAACTCAC 1 0 117109 CASAVA_Build 6 97984220 1D ATTCATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 29 2 16 12 T 12 11 117110 CASAVA_Build 6 97986527 1D TCTGTGTCTG T/- TTAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 T 3 2 117111 CASAVA_Build 6 97999087 2D TCTTATCACT AA/-- ATTAGGTCAT 3070 het 3070 hom 29 15 14 0 A 3 1 117112 CASAVA_Build 6 98019278 2D AAACATTCTC TT/-- TTGAGAACTA 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 T 4 2 117113 CASAVA_Build 6 98030985 1I ATTCCCATAT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 A 0 1 117114 CASAVA_Build 6 98049095 1D TGAAATAATC T/- TTTTTTTTTT 1642 het 1642 ref 36 26 4 7 T 13 12 117115 CASAVA_Build 6 98053093 1D CAACTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2279 het 2279 ref 26 16 8 3 T 11 10 117116 CASAVA_Build 6 98056932 6I TTGTATAAAA ------/TATAAG TATATTTTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TATAAG 0 1 117117 CASAVA_Build 6 98064296 1D TATATTCTAT A/- AAAAATTAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 6 5 117118 CASAVA_Build 6 98066434 1D AGTTTGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 T 11 10 117119 CASAVA_Build 6 98069263 1I CTGTAAAGAC -/A TGCAAGTGGT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 0 1 117120 CASAVA_Build 6 98069922 8D TGTGTGTGTG TATGTATA/-------- TATGTATATA 3070 het 2389 hom 29 7 19 6 TATGTATA 2 1 117121 CASAVA_Build 6 98077345 1D TGTGTATACA T/- TTTTTCAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 17 5 T 6 5 117122 CASAVA_Build 6 98096529 1D CTCAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 12 11 117123 CASAVA_Build 6 98120451 1D ATGTATGCAT G/- AGTAGAAACA 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 G 1 0 117124 CASAVA_Build 6 98130031 5D CTTTCCTGTC TTCTT/----- TTCTTTCCTG 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 TTCTT 2 1 117125 CASAVA_Build 6 98143827 1D GGTTGGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 27 1 20 6 T 12 11 117126 CASAVA_Build 6 98160409 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1355 hom 35 5 21 10 T 12 13 117127 CASAVA_Build 6 98174516 1D TAGTTTTGGT A/- AAAATTTTAA 3070 hom 80 het 32 0 26 7 A 5 4 117128 CASAVA_Build 6 98183643 1D AATTCATTGA G/- GCCACATTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 2 1 117129 CASAVA_Build 6 98203685 1I TAAGAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 10 11 117130 CASAVA_Build 6 98206154 1D GTAAACTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 10 9 117131 CASAVA_Build 6 98206654 1D AACCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 32 0 28 4 A 11 10 117132 CASAVA_Build 6 98213783 1D GTGAGCCAAG T/- TTTTTTTTTT 1411 het 1411 ref 32 24 4 4 T 12 11 117133 CASAVA_Build 6 98218928 1D CATTTAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 34 1 20 13 A 15 14 117134 CASAVA_Build 6 98228379 1D ACATGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 12 11 117135 CASAVA_Build 6 98247797 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 117136 CASAVA_Build 6 98298414 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 47 het 19 0 14 5 A 10 9 117137 CASAVA_Build 6 98309757 1I ACACAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1355 hom 23 4 11 8 T 13 14 117138 CASAVA_Build 6 98318834 2D TTATAGACTC TT/-- TGAAATGTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 3 1 117139 CASAVA_Build 6 98323169 5I ATATGAACTT -----/TAAAG TAGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 TAAAG 0 1 117140 CASAVA_Build 6 98333239 1I AGAAACTGTA -/G TGTTTTACCC 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 G 0 1 117141 CASAVA_Build 6 98340172 2D TACTTATAAA GT/-- GTTACAGTGA 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 GT 2 1 117142 CASAVA_Build 6 98355539 4D GGTGGGGGGA GGTG/---- GGAGGGATAG 1800 het 1800 ref 10 5 4 1 GGTG 1 0 117143 CASAVA_Build 6 98365433 1I AACAGAATGC -/T TTTGAGGACA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 3 4 117144 CASAVA_Build 6 98373238 1D CATGTCTCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 10 9 117145 CASAVA_Build 6 98382285 1I ATTCATGGAA -/G ATTTGGGGAT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 G 0 1 117146 CASAVA_Build 6 98390948 1D TGAATAAAAC A/- AAGGTGAAAT 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 A 3 2 117147 CASAVA_Build 6 98392772 1D GATCCAGCAA C/- CCCACTACTG 2566 het 2566 ref 14 7 6 1 C 4 3 117148 CASAVA_Build 6 98408870 1D AGTCAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 10 117149 CASAVA_Build 6 98411190 1D ATTATTTCTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 8 117150 CASAVA_Build 6 98421893 5I CTGTTGTAAT -----/AAATA AAATAAAGAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AAATA 1 2 117151 CASAVA_Build 6 98425081 3I AGTTTTACTG ---/AGA AGATCTTTTG 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 AGA 1 2 117152 CASAVA_Build 6 98425321 2I TACATGGTAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 AT 6 7 117153 CASAVA_Build 6 98441441 2D TTATAAAAAC TT/-- AGTTCATGAG 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 T 2 0 117154 CASAVA_Build 6 98444018 1D ATATGCTTTC T/- TTTTATTCAA 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 T 5 4 117155 CASAVA_Build 6 98446456 3D GAAAAATAAA AAC/--- AACAATTCCT 3070 het 3070 ref 30 21 8 2 AAC 2 1 117156 CASAVA_Build 6 98449200 3D GTTTTTGCTC TTG/--- TTGTTTAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TTG 2 1 117157 CASAVA_Build 6 98449741 4D AAGGATTATT TTTA/---- TTTATTATTA 3070 het 3070 ref 29 16 13 2 TTTA 2 1 117158 CASAVA_Build 6 98464782 3I CTCCTTTTTC ---/TTT TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 8 11 117159 CASAVA_Build 6 98465782 1I TACTTTTACA -/T TTTTTTTTTT 2485 het 2485 ref 25 15 8 2 T 11 12 117160 CASAVA_Build 6 98467419 2D TATTTTAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 13 11 117161 CASAVA_Build 6 98481947 2I TGAGGGCTCA --/CT CTCTGCCTCA 3070 hom 102 het 35 0 34 1 CT 2 3 117162 CASAVA_Build 6 98486038 1I GGAATTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 A 12 13 117163 CASAVA_Build 6 98497854 1I TTTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 539 hom 25 3 19 3 G 0 1 117164 CASAVA_Build 6 98505565 1D TTACTTTTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 8 117165 CASAVA_Build 6 98516558 9I CCTCCTATGA ---------/AACAATGAC AACAATGACT 3070 het 2370 hom 26 7 13 6 AACAATGAC 1 2 117166 CASAVA_Build 6 98519021 1D ATGCAGGTAT A/- AAAAATCCAG 3070 hom 9 het 34 1 15 18 A 6 5 117167 CASAVA_Build 6 98523974 1D TGGGATTCAA T/- TTTTTTTTTC 2929 het 2929 ref 27 15 7 5 T 10 9 117168 CASAVA_Build 6 98525692 4D CACATGAAAC AGTT/---- AGTGAAAATG 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 AGTT 1 0 117169 CASAVA_Build 6 98533316 3I AAATCAAGGA ---/ATT ATTATTCGAT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 ATT 2 3 117170 CASAVA_Build 6 98536794 1D TCAAATGACA G/- GATTTTCTTT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 G 2 1 117171 CASAVA_Build 6 98543917 1I GTTTTAACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 512 hom 42 2 34 6 A 9 10 117172 CASAVA_Build 6 98544377 1D CCTTATTTCA C/- TTTTACTTGG 3070 het 3070 ref 41 20 19 3 C 1 0 117173 CASAVA_Build 6 98547565 1I TTAGGTTACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 793 hom 30 2 25 3 T 13 14 117174 CASAVA_Build 6 98569346 1D TAAGCTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 27 11 T 14 13 117175 CASAVA_Build 6 98588319 2D TGCGCCAAGC GT/-- GTGTGTTTCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 GT 4 3 117176 CASAVA_Build 6 98601778 1I CCCTTGTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 9 10 117177 CASAVA_Build 6 98603604 1I TTAATTAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 10 11 117178 CASAVA_Build 6 98619066 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAATTTGA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 6 5 117179 CASAVA_Build 6 98621876 1I AAGATCCTGA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 8 117180 CASAVA_Build 6 98624860 22D TCCCATCACC CAGGTACTGAAAATAGTACCCA/---------------------- CCAGTTAGTT 3070 het 3070 ref 43 29 17 3 CAGGTACTGAAAATAGTACCCA 1 0 117181 CASAVA_Build 6 98642257 1D75M9D CCATTCTCCC GGTCACTTTCAGGTACACCAATCAGATGTAGATTTGGTCTTTTCACGTAGTCCTATATTTCTTGGAGGCTTTTTTTCTTTTTCTC/-GTCACTTTCAGGTACACCAATCAGATGTAGATTTGGTCTTTTCACATAGTCCCATATTTCTTGGAGGCTTTGTTT--------- GTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 23 20 10 1 N/A 0 0 117182 CASAVA_Build 6 98644590 1I CTATCCAAAA -/G AAATGAAATC 3070 hom 123 het 48 0 40 8 G 0 1 117183 CASAVA_Build 6 98649379 1I TATGCTTCTA -/G TTCAGCTGCC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 G 0 1 117184 CASAVA_Build 6 98654027 4D CAGGTTGGAG ACTT/---- ACTTACTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 ACTT 3 2 117185 CASAVA_Build 6 98655623 1D ATATTCGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 36 4 12 20 T 17 16 117186 CASAVA_Build 6 98657050 1I GAATCTTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 9 10 117187 CASAVA_Build 6 98666610 1D ACAGTAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 A 11 10 117188 CASAVA_Build 6 98671528 1I TTTGTGATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 9 10 117189 CASAVA_Build 6 98673228 1D TTAATTTGTC T/- GCTTGAATGG 3070 het 3070 ref 59 28 27 4 T 1 0 117190 CASAVA_Build 6 98676418 1I CAAACAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2358 het 2358 ref 27 15 8 4 A 11 12 117191 CASAVA_Build 6 98687877 1D GTCATTAAAA C/- AGTTGTTCTT 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 C 1 0 117192 CASAVA_Build 6 98689554 2I CCTTTTCAGA --/TC TCTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TC 1 2 117193 CASAVA_Build 6 98690209 2D GCACGTGTGC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 50 22 24 5 AT 1 0 117194 CASAVA_Build 6 98695431 2D GTCAATAAAT AA/-- AAGTGTTTTC 3070 het 3070 ref 31 18 9 6 A 4 2 117195 CASAVA_Build 6 98696921 1D TTATTCAATC A/- CCTTGAACTG 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 A 1 0 117196 CASAVA_Build 6 98697796 1D GGAAGCCACC A/- AGGGCTTGGG 3070 het 2990 hom 39 12 17 10 A 2 1 117197 CASAVA_Build 6 98705007 1D ACTAGTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 39 2 20 17 A 13 12 117198 CASAVA_Build 6 98712143 36I TCACCCACCT ------------------------------------/TCTGTGTTAGTCTCGCTGGGAGCTGTAGACCAGAGC TATTCCTATT 3070 hom 69 het 20 0 24 1 TCTGTGTTAGTCTCGCTGGGAGCTGTAGACCAGAGC 0 1 117199 CASAVA_Build 6 98728895 1D ACAGACATGG A/- AAGCACATTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 3 2 117200 CASAVA_Build 6 98729207 1I AGATTTATAG -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 A 6 7 117201 CASAVA_Build 6 98729887 1D TATTCAATCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 21 18 6 T 9 8 117202 CASAVA_Build 6 98730623 1D ATTGAAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 7 A 12 11 117203 CASAVA_Build 6 98738124 1I GTAGTATAGC -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 6 7 117204 CASAVA_Build 6 98739352 1D GGGCTATTGA T/- TAAGACTTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 1 117205 CASAVA_Build 6 98740393 1I ACTCTAAAAG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 76 het 28 0 26 2 A 7 8 117206 CASAVA_Build 6 98756708 1I CCCCTCTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 874 hom 32 3 21 8 A 12 13 117207 CASAVA_Build 6 98756898 1I AATGATCTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 14 18 11 T 9 10 117208 CASAVA_Build 6 98771024 1I AAACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2559 het 2559 ref 32 9 9 14 A 13 14 117209 CASAVA_Build 6 98773003 4I TGGCAATTGC ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 AT 5 7 117210 CASAVA_Build 6 98775176 1D GTATCACTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 9 8 117211 CASAVA_Build 6 98779780 1I TTGAAATTAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 8 9 117212 CASAVA_Build 6 98781754 1I ATGAAAGGAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 8 9 117213 CASAVA_Build 6 98785717 9I TTGAGATGCC ---------/ATATTCCTT ATATTCCTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATATTCCTT 1 2 117214 CASAVA_Build 6 98798476 1D GGAGTCACGA T/- TCCCCTACCC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 2 1 117215 CASAVA_Build 6 98801741 1I TTCCTTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 T 10 11 117216 CASAVA_Build 6 98808871 5I AAGTATATGA -----/CAGAT CAGATTATTT 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 CAGAT 1 2 117217 CASAVA_Build 6 98811795 1I AAATCCCCCC -/T GACACTGTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 117218 CASAVA_Build 6 98812488 1D CCCCCACAGC T/- TGCAGATGGC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 2 1 117219 CASAVA_Build 6 98818108 1I CTCTCCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 T 10 11 117220 CASAVA_Build 6 98821910 1D AAATTGTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 10 9 117221 CASAVA_Build 6 98849830 1I TAGGTTTAAT -/A GAACATTGTG 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 A 0 1 117222 CASAVA_Build 6 98859269 1I TTCCCATGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 T 9 10 117223 CASAVA_Build 6 98865792 1I AATAATTGTT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 7 117224 CASAVA_Build 6 98867329 12D CAGGCACATG CACACACACACA/------------ CACACACACA 3070 hom 78 het 31 0 27 10 CA 13 7 117225 CASAVA_Build 6 98879008 1I CCATTTAATG -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 7 8 117226 CASAVA_Build 6 98883760 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 T 12 11 117227 CASAVA_Build 6 98884486 1D TGGTCTGCAG T/- TTTCTTGAAG 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 4 3 117228 CASAVA_Build 6 98890457 1I GCACACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 T 11 12 117229 CASAVA_Build 6 98893964 1I GTCCTTGGTA -/G GGGAGCATGC 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 G 3 4 117230 CASAVA_Build 6 98894119 1I AAATACTGGC -/T TTTTTTTTTT 2935 het 2417 hom 24 6 11 7 T 10 11 117231 CASAVA_Build 6 98898167 2D TTTTATCAAT AA/-- AAAAAAAAAA 2006 het 1904 hom 24 10 6 9 A 16 14 117232 CASAVA_Build 6 98903802 1I CATTATTCCC -/T TTTTTTTTTC 1732 het 1732 ref 28 16 8 4 T 9 10 117233 CASAVA_Build 6 98928332 7D AACATAAAAG CAGCTTT/------- CAGACAGGAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 CAGCTTT 1 0 117234 CASAVA_Build 6 98954960 1D TTTGTTAAAT A/- AATAAAATTA 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 A 3 2 117235 CASAVA_Build 6 98958146 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 14 12 117236 CASAVA_Build 6 98958500 2D CCAGAGAAAC AG/-- ACTCAATAGG 3070 het 3070 ref 46 23 21 3 AG 1 0 117237 CASAVA_Build 6 98985645 1D CCATTTGATT A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 7 6 117238 CASAVA_Build 6 99005607 1D TCTTGGCATC T/- TTGTGGAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 T 3 2 117239 CASAVA_Build 6 99012222 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 2331 het 640 hom 32 4 16 12 A 10 9 117240 CASAVA_Build 6 99012427 1I TAAGACTGAC -/A AAATATCACA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 3 4 117241 CASAVA_Build 6 99015659 1I TCACTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 12 13 117242 CASAVA_Build 6 99017590 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 32 3 20 9 T 12 13 117243 CASAVA_Build 6 99022194 1D TGTATGTTAA T/- TTGTAGAAAG 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 3 2 117244 CASAVA_Build 6 99024343 1D TCAGATTGAG A/- GAGAGAGGGA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 1 0 117245 CASAVA_Build 6 99025884 1D GATGTTTACC T/- TCTTCAAACG 3070 het 3070 hom 49 16 26 7 T 2 1 117246 CASAVA_Build 6 99032610 1I AATCTTTTTT -/A ACTTATTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 117247 CASAVA_Build 6 99040029 2I GGACCAACAC --/AA ACACACACAC 3070 het 3070 hom 54 19 28 7 A 1 3 117248 CASAVA_Build 6 99057942 3I GCCTTTCTTC ---/CTT TTTTCCCTTC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 CTT 0 1 117249 CASAVA_Build 6 99115032 11I TAGATTACTT -----------/AGCCTGGGGAC AGCCTGGGGA 3070 hom 111 het 42 0 38 6 AGCCTGGGGAC 0 1 117250 CASAVA_Build 6 99121366 1D CACTTATTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 95 het 35 0 31 4 A 10 9 117251 CASAVA_Build 6 99123082 1I GGGGAATCAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 7 8 117252 CASAVA_Build 6 99125074 2I ATTCTTAGCT --/CA CACGCCGAAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 CA 1 2 117253 CASAVA_Build 6 99127568 1I AGTACAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 12 13 117254 CASAVA_Build 6 99132859 2D GATGTGACAC AG/-- ACAAGAAAAG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 AG 1 0 117255 CASAVA_Build 6 99138827 1I CTTGCTGTGA -/T TTTTAGACTC 3070 het 3070 hom 56 25 25 6 T 4 5 117256 CASAVA_Build 6 99139451 1D GATCCAGGTG A/- AAAATCCCAC 3070 het 3070 hom 51 21 29 1 A 5 4 117257 CASAVA_Build 6 99149744 1I TAGTAAAAAG -/A AAGTTTGAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 3 117258 CASAVA_Build 6 99151406 3D AGAATATTGA AGG/--- AGAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 AGG 1 0 117259 CASAVA_Build 6 99174742 1I TGATCCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 10 11 117260 CASAVA_Build 6 99184652 1I ACCCCAACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 10 11 117261 CASAVA_Build 6 99222851 1D AAAAGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1632 het 1632 ref 31 24 5 2 A 13 12 117262 CASAVA_Build 6 99278381 1I ACCCACATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 11 11 A 11 12 117263 CASAVA_Build 6 99286734 1I ATTTGACCCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 56 27 22 7 A 9 10 117264 CASAVA_Build 6 99301060 1D TGTAAAAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 9 8 117265 CASAVA_Build 6 99324734 24I CCTTACCCTG ------------------------/GAGGTTCTCGCTCTGGAGTATTTT GTATAAATCT 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 GAGGTTCTCGCTCTGGAGTATTTT 0 1 117266 CASAVA_Build 6 99381337 1D CTTTCAAGCA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 96 het 35 0 32 4 T 7 6 117267 CASAVA_Build 6 99392280 1D AAATGAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 A 11 10 117268 CASAVA_Build 6 99404231 1I TTTACTGAAA -/C TACCTCTAAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 0 1 117269 CASAVA_Build 6 99407534 1D TTCATATTTT A/- AAAAAAAAAA 2388 het 2388 ref 16 8 6 2 A 11 10 117270 CASAVA_Build 6 99416251 4I ATACAAACAC ----/CAAA CAATGAGACA 3070 hom 99 het 44 0 34 10 CAAA 0 1 117271 CASAVA_Build 6 99429721 1I AATAGAGAGC -/T GCAGCTCATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 117272 CASAVA_Build 6 99448391 1I TAAGAAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 533 hom 29 3 21 5 T 10 11 117273 CASAVA_Build 6 99463606 2I TTAGGCAAAC --/TT TTCAATTTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 4 117274 CASAVA_Build 6 99465631 15D ATATCCCGCA CCTGGCTCGGAGGGT/--------------- CCTACGCCCA 2829 hom 18 het 6 0 7 0 CCTGGCTCGGAGGGT 1 0 117275 CASAVA_Build 6 99489856 1D TGAAGGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 20 8 T 14 13 117276 CASAVA_Build 6 99515487 5D AAGTAGGAGC TATAG/----- TAAAGTATTG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TATAG 1 0 117277 CASAVA_Build 6 99516253 1I AACTGAGCTT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 7 8 117278 CASAVA_Build 6 99523028 1I ATTACTTTTT -/A AAAAAATAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 6 7 117279 CASAVA_Build 6 99524667 13D TCCGTCTCAC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 3 A 25 12 117280 CASAVA_Build 6 99548575 1D ATACACACTT G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 81 het 32 0 27 6 G 9 8 117281 CASAVA_Build 6 99559846 1D TCATGCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 42 1 34 7 T 12 11 117282 CASAVA_Build 6 99569520 1D CTTTACCAAC T/- TCATCCCCCA 3070 hom 114 het 44 0 39 7 T 2 1 117283 CASAVA_Build 6 99577033 1I GTGCCAACTC -/T TAATCATCAA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 1 2 117284 CASAVA_Build 6 99585444 5I CTTAAAATTT -----/ATAAG ATATGTTCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATAAG 0 1 117285 CASAVA_Build 6 99612871 1I AAAGTCCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 38 2 31 5 A 11 12 117286 CASAVA_Build 6 99629559 1D AAGACCCAGC A/- GAAAGATTTC 3070 hom 99 het 37 0 33 5 A 1 0 117287 CASAVA_Build 6 99647371 1I CTTTTTAATA -/C TTTCCTCTTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 0 1 117288 CASAVA_Build 6 99649745 1D AGCTTTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 25 7 A 11 10 117289 CASAVA_Build 6 99652753 1I ATGAGTAGAT -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 7 8 117290 CASAVA_Build 6 99660199 4D GGAAATAAAC AAAT/---- AACCCAATTA 3070 het 3070 ref 37 24 13 1 AAAT 1 0 117291 CASAVA_Build 6 99662812 1I TTTTTGTATG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 7 8 117292 CASAVA_Build 6 99678602 1D GGAAAAGCAG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 17 hom 28 1 12 15 C 11 10 117293 CASAVA_Build 6 99683681 4I GGCTCTGCAG ----/AGCC CTGGCAGAGT 3070 het 3070 hom 31 13 11 8 AGCC 0 1 117294 CASAVA_Build 6 99692489 1D ACTTTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 11 10 117295 CASAVA_Build 6 99694392 4I AGAATAAGCA ----/CTCT CTCTCTCTCT 2615 het 602 hom 27 6 14 7 CT 6 8 117296 CASAVA_Build 6 99704067 1I AAATATGGTT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 106 het 55 0 45 10 A 7 8 117297 CASAVA_Build 6 99718631 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1539 het 1539 ref 16 6 4 6 A 11 10 117298 CASAVA_Build 6 99718875 1D ATGTCATATA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 8 7 117299 CASAVA_Build 6 99719592 1D TCTCTGACGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 12 11 117300 CASAVA_Build 6 99720041 1I CTCAATCCCT -/A AAGGCTAAGT 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 A 2 3 117301 CASAVA_Build 6 99724248 2D TTATGATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2154 hom 36 6 21 11 A 13 11 117302 CASAVA_Build 6 99725426 1D TCTAAATACT G/- AGCCAAGGAC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 G 1 0 117303 CASAVA_Build 6 99729254 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 23 2 14 7 A 13 14 117304 CASAVA_Build 6 99731007 3D CCTGTACCTA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 32 het 16 0 11 9 AAT 7 6 117305 CASAVA_Build 6 99732179 1D AATGAATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 11 10 117306 CASAVA_Build 6 99744929 6D ACGCACACAT ACTCAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 25 14 7 ACTCAC 1 0 117307 CASAVA_Build 6 99747158 1D CACACACACA C/- ATCACACACA 3070 hom 91 het 42 0 28 15 C 1 0 117308 CASAVA_Build 6 99752998 2I AAAAAGAAAC --/TG AGACTTTAAA 3070 hom 42 het 25 0 15 10 TG 0 1 117309 CASAVA_Build 6 99754348 1I6M3I4M2I7M6D GAGGTCTCTG -TCTGTT---TTGG--TATCAGTACCATG/TTCTGTTCCATTGGTCTATATGT------ CTGTTTTGGT 3070 het 373 hom 16 1 13 3 N/A 0 0 117310 CASAVA_Build 6 99769061 8I CACATGTACC --------/CCCTGAGT CCCTGAGTCT 3057 het 2231 hom 19 8 7 4 CCCTGAGT 1 2 117311 CASAVA_Build 6 99772701 5D AGAGTGAAGG CTCTA/----- CTCTACAGTG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 CTCTA 2 1 117312 CASAVA_Build 6 99787354 1I CCCTTAAACC -/A AATAATTTTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 2 3 117313 CASAVA_Build 6 99800606 1D CGCTGTCCCC A/- AAAAAAAAAA 2724 het 1295 hom 15 4 8 5 A 12 11 117314 CASAVA_Build 6 99802234 1I AGCAAGAGAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 8 9 117315 CASAVA_Build 6 99811865 8D TAAATAAATA AATAAAAT/-------- AAGTTAACCT 2146 het 2146 ref 25 13 7 8 AATAAAAT 1 0 117316 CASAVA_Build 6 99817268 5D CTTTTAGCAA ACTTT/----- ACTTTAGTTG 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 ACTTT 2 1 117317 CASAVA_Build 6 99836193 4I TTAAGAGGTG ----/GTTC GTTCGTTCAT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 GTTC 2 3 117318 CASAVA_Build 6 99839512 1D CCTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1566 het 1566 ref 21 13 4 4 A 13 12 117319 CASAVA_Build 6 99860313 2I ATATTATAAC --/AT ATATATATAT 1470 het 1470 ref 18 11 5 2 AT 5 6 117320 CASAVA_Build 6 99870755 1D AACCCACTCG C/- CCCCCCCCAC 1569 het 1569 ref 19 9 7 3 C 9 8 117321 CASAVA_Build 6 99878795 1I TAAAAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2540 hom 24 10 12 2 A 11 12 117322 CASAVA_Build 6 99879702 1I TTAAGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 2335 het 2335 ref 25 10 8 7 T 11 12 117323 CASAVA_Build 6 99891854 1D GCAGCTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2880 hom 39 12 16 11 A 11 10 117324 CASAVA_Build 6 99895802 4D AATATCTATT AGAA/---- AGCAGGAAAT 2336 het 2336 ref 17 10 5 3 AGAA 1 0 117325 CASAVA_Build 6 99896496 3D CAAATTAAAA ATG/--- ATAACAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 ATG 1 0 117326 CASAVA_Build 6 99910464 1I TGAGACAAGA -/C CGCTCTGTCA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 1 2 117327 CASAVA_Build 6 99918704 2D ATAGATAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 30 0 25 5 AC 9 8 117328 CASAVA_Build 6 99920301 1D TTTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 9 117329 CASAVA_Build 6 99924141 1I TTGTACATTT -/C TTGTATTTGA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 0 1 117330 CASAVA_Build 6 99928030 1D CCTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 1020 het 1020 ref 31 17 4 10 A 15 14 117331 CASAVA_Build 6 99937572 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 2384 hom 22 het 12 0 8 4 A 9 10 117332 CASAVA_Build 6 99946201 1I ACAATATCTG -/C CTTTTACGGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 2 117333 CASAVA_Build 6 99946596 1I ACCTTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 2986 het 2986 ref 27 16 7 4 A 11 12 117334 CASAVA_Build 6 99949752 10D TTTTTTTTTC TTTTTTTTTT/---------- GAGACAGCCT 3070 het 3070 hom 35 17 18 4 T 10 0 117335 CASAVA_Build 6 99951702 2D AATCCAATGA CT/-- CTACTACTAC 438 het 438 ref 26 12 3 11 CT 2 1 117336 CASAVA_Build 6 99957072 4D ATATTTTTAG GTTA/---- GTTAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 GTTA 2 1 117337 CASAVA_Build 6 99958821 1I CTGTAAGAGA -/T TAAGTGGTAA 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 T 1 2 117338 CASAVA_Build 6 99961619 1D CATGTAAAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 9 8 117339 CASAVA_Build 6 99967575 1D TAAACTACTT A/- CACTTTCAGG 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 A 1 0 117340 CASAVA_Build 6 99967692 1D TCACCTTTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 10 9 117341 CASAVA_Build 6 99968388 4I TAGGTATTCT ----/CATA CAGTTTGAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CATA 0 1 117342 CASAVA_Build 6 99979009 1I TTAGTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 11 12 117343 CASAVA_Build 6 99987200 2I TCTTTTAAAC --/AG ATTTGAATTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AG 0 1 117344 CASAVA_Build 6 99994633 1I TTGTTACTGC -/A AAAGATTATT 3070 het 3070 ref 54 29 20 5 A 3 4 117345 CASAVA_Build 6 99995771 2I TTTGTGTATA --/TC TCTATTTCCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TC 1 2 117346 CASAVA_Build 6 99998117 2D CTTAATGCTC TG/-- TAAAACACAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 7 TG 1 0 117347 CASAVA_Build 6 100001082 5D CAGTGTTTTC AAAGA/----- AAAGAGTCTT 3070 het 3070 ref 36 21 13 7 AAAGA 2 1 117348 CASAVA_Build 6 100003735 3D AACCAGCTAA CAT/--- CATGACAGGA 3070 het 3070 ref 29 18 10 3 CAT 2 1 117349 CASAVA_Build 6 100010925 1I AGTTAACAAC -/A ATAGATTACA 3070 het 3070 hom 26 7 17 2 A 1 2 117350 CASAVA_Build 6 100014806 3I TTTAGCAAAG ---/AGA AGAAGTGAAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AGA 1 2 117351 CASAVA_Build 6 100017795 1D TTCATGGAAT A/- ATTTTCCATT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 2 1 117352 CASAVA_Build 6 100019930 1D ATCAGTGAAT G/- GTGATCCAAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 G 2 1 117353 CASAVA_Build 6 100022523 4D CATGCTAACA TTAG/---- TTAGTATCTC 3070 het 3070 ref 31 17 13 3 TTAG 2 1 117354 CASAVA_Build 6 100024720 2D AGATATGAGA GG/-- TAAAGAACCC 3070 het 3070 hom 43 19 23 2 G 2 0 117355 CASAVA_Build 6 100027625 1D TATAAATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 T 11 10 117356 CASAVA_Build 6 100030415 1D TACTTAGTTG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 T 7 6 117357 CASAVA_Build 6 100034270 1D TTAATAAGAA C/- TCTCAGAAAA 3070 het 2414 hom 23 6 14 3 C 1 0 117358 CASAVA_Build 6 100039454 1D ATAAAGTCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 9 8 117359 CASAVA_Build 6 100041223 2D AGGAGGTTAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 12 12 3 TA 6 5 117360 CASAVA_Build 6 100046998 1D ACACAAGTGG C/- CAAGGGTCTG 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 C 2 1 117361 CASAVA_Build 6 100047264 1I ACTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 2469 hom 24 7 14 3 T 5 6 117362 CASAVA_Build 6 100061965 1I AAGCTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 2442 het 2442 ref 19 8 6 5 A 11 12 117363 CASAVA_Build 6 100062798 1D TAATTTCATT A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 hom 23 9 13 2 A 7 6 117364 CASAVA_Build 6 100064245 1I GAAAGAGACC -/A AAAAAAAAAA 1292 het 1292 ref 36 17 5 14 A 15 16 117365 CASAVA_Build 6 100067430 1D CATCTACTCT C/- CCCTACAGTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 C 4 3 117366 CASAVA_Build 6 100069267 1D TATCCTTAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 A 9 8 117367 CASAVA_Build 6 100071821 4D AATATTACTC AGTA/---- AGTATGTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 20 4 AGTA 2 1 117368 CASAVA_Build 6 100073619 1D37M2I AAAAGAAAAG AAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTCTTCTTTCCAATAGCC--/-AAAAAAAAAAAGAAAAAAAGTCTTCTTTCCAATAGCCTT TTTCACTAAC 2196 het 2196 ref 24 21 5 12 N/A 0 0 117369 CASAVA_Build 6 100080801 1D GACTAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 9 8 A 11 10 117370 CASAVA_Build 6 100093563 1I TAAAACAACC -/A AAAAAACCTA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 6 7 117371 CASAVA_Build 6 100094412 1I AATTAAAAAG -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 6 7 117372 CASAVA_Build 6 100107637 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 A 13 12 117373 CASAVA_Build 6 100110034 1D TGTGGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 T 11 10 117374 CASAVA_Build 6 100110602 3D GGCTTGTTTG TTC/--- TTCTTGCTGG 2511 het 2511 ref 27 15 7 5 TTC 2 1 117375 CASAVA_Build 6 100114250 1D TCACAGAGAT A/- AAAAAAAAAT 2727 het 2727 ref 18 10 6 2 A 10 9 117376 CASAVA_Build 6 100114318 1D GGAATAATTC T/- TTTTTTTTTT 2755 het 1193 hom 24 6 8 10 T 17 16 117377 CASAVA_Build 6 100120866 4D CTATTTTAAG TCTT/---- TCTGTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 17 16 6 TCTT 1 0 117378 CASAVA_Build 6 100122026 2I ACATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 AC 6 7 117379 CASAVA_Build 6 100131894 1D TTTTTGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 11 10 117380 CASAVA_Build 6 100132674 1D GTTTCACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 7 A 11 10 117381 CASAVA_Build 6 100149193 1D TACCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2700 het 1244 hom 26 10 8 8 T 13 12 117382 CASAVA_Build 6 100151670 2D CAGAAGTACC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 T 11 9 117383 CASAVA_Build 6 100153765 1I AAAAAGTTAT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 28 17 11 0 A 6 7 117384 CASAVA_Build 6 100156859 1I TTCAACATAC -/A AAAAAAAAAA 2787 het 2787 ref 23 10 6 7 A 11 12 117385 CASAVA_Build 6 100174686 1D TTGTTTAAAT C/- CCTGGAAAAA 3070 het 3070 ref 59 27 28 5 C 3 2 117386 CASAVA_Build 6 100183125 4I TGTTTCACTA ----/AAAT AAATCCTCAG 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 AAAT 1 2 117387 CASAVA_Build 6 100187154 1D TCCTCTTAAC T/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 1 0 117388 CASAVA_Build 6 100188973 15D CAAAGCTAAT GCAGCAATGCTTATG/--------------- GCAGCAATGC 3070 het 3070 hom 50 15 18 22 GCAGCAATGCTTATG 2 1 117389 CASAVA_Build 6 100220553 1I AGAAGAGGTG -/C GGGGGAGCTG 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 C 0 1 117390 CASAVA_Build 6 100224058 1I TATAACAAAT -/A AAAAAAGATT 3070 het 2935 hom 22 9 9 4 A 6 7 117391 CASAVA_Build 6 100230812 1I TGCCCCTACT -/G GGGGGGTGCC 3070 het 2180 hom 17 7 7 3 G 6 7 117392 CASAVA_Build 6 100232406 1I TTTATGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 9 10 117393 CASAVA_Build 6 100233816 2D AGGATTGAGA AG/-- AGTTTCCCAC 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 AG 2 1 117394 CASAVA_Build 6 100255493 1I TCAACTTCAA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 7 8 117395 CASAVA_Build 6 100259784 2D TCTAAAATCG AC/-- ACCCTAACAT 3070 het 3070 hom 18 7 10 1 AC 2 1 117396 CASAVA_Build 6 100262465 1D ACAGAAAACC A/- AAAAACTGCA 2701 het 2701 ref 33 24 6 4 A 6 5 117397 CASAVA_Build 6 100266469 3D CAACCTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 47 22 22 5 TTG 4 3 117398 CASAVA_Build 6 100267925 3I ACTTTTCTGC ---/CTT CTTCTCTTCT 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 CTT 1 2 117399 CASAVA_Build 6 100270836 1I GATTATTAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 7 8 117400 CASAVA_Build 6 100284264 2D TGCATAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 1467 het 1467 ref 10 6 4 0 T 12 10 117401 CASAVA_Build 6 100290654 1I ATGCCTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 587 hom 35 2 25 8 T 11 12 117402 CASAVA_Build 6 100295155 3I TTTTTTCCAC ---/TTA TTAAGGAAGA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 TTA 1 2 117403 CASAVA_Build 6 100305365 1D ATATATATAT A/- TTTTTTAATG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 117404 CASAVA_Build 6 100306144 1I TCATGATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 10 11 117405 CASAVA_Build 6 100311129 1D AAATAGAGAT A/- AAAATAACAG 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 A 5 4 117406 CASAVA_Build 6 100312337 1I GGCTGAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 10 11 117407 CASAVA_Build 6 100324801 1I TTTCTCTTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 8 9 117408 CASAVA_Build 6 100328176 4D CTTGATTTTC CTGT/---- CTACTTGTTC 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 CTGT 1 0 117409 CASAVA_Build 6 100334840 1I CAGGGAAGGC -/A AAAATCCACC 3070 hom 97 het 40 0 30 10 A 4 5 117410 CASAVA_Build 6 100338845 4I AGGGAAAAAA ----/GAAG GAGCAGGAGC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GAAG 0 1 117411 CASAVA_Build 6 100339139 7D CAATAACAAA TAAACAT/------- TAAACATTTT 3070 het 3070 hom 51 25 23 7 TAAACAT 2 1 117412 CASAVA_Build 6 100343426 1D CTCAGCCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 29 1 16 12 T 13 12 117413 CASAVA_Build 6 100356126 3D TTTTTAAAAA ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 ATT 7 6 117414 CASAVA_Build 6 100363884 1D AGACATCAAT A/- AAAAAAAAAA 1316 het 1316 ref 44 35 3 6 A 11 10 117415 CASAVA_Build 6 100368664 1D GCTGTTTTCG A/- AAAAAAAAAA 1385 het 1385 ref 25 19 3 3 A 13 12 117416 CASAVA_Build 6 100369713 1D ATATAGGTGA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 45 18 24 5 T 6 5 117417 CASAVA_Build 6 100370798 4D CTTCTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 19 3 9 8 T 15 11 117418 CASAVA_Build 6 100372209 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 333 hom 50 2 32 16 AC 6 7 117419 CASAVA_Build 6 100373856 1I TATCTATATC -/T TTTTTTTTTT 1992 het 646 hom 23 2 7 14 T 15 16 117420 CASAVA_Build 6 100375465 1I TTTGTGATGG -/A AAAACCTATA 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 A 4 5 117421 CASAVA_Build 6 100375807 1D GGAATATGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 28 het 28 1 24 3 T 9 8 117422 CASAVA_Build 6 100384114 1D GCACCAGCAT G/- GCACATGTAT 1454 hom 7 het 3 0 3 0 G 2 1 117423 CASAVA_Build 6 100387733 1I AACCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 10 11 117424 CASAVA_Build 6 100388634 1I GTCTCCTCTT -/C CCAGGACTAT 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 C 2 3 117425 CASAVA_Build 6 100397733 4I TGAAGAAAAT ----/AGTC AGTTCTGGTT 3070 het 3070 hom 53 18 27 8 AGTC 0 1 117426 CASAVA_Build 6 100398377 1I GTACTTAGGG -/A AATACAGAGT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 2 3 117427 CASAVA_Build 6 100398597 1D TAGCAATAAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 A 9 8 117428 CASAVA_Build 6 100404246 50D TCCCAAAAGT TTCTTTGTGTCCTTTTGAAGACAGCCTGCCCTTTGTGTCTGGTTCCACGA/-------------------------------------------------- AACTACTCGT 3070 het 3070 ref 27 22 13 3 TTCTTTGTGTCCTTTTGAAGACAGCCTGCCCTTTGTGTCTGGTTCCACGA 1 0 117429 CASAVA_Build 6 100406910 1D TTTTAACTTA C/- AGTAATTTAA 3070 hom 162 het 58 0 54 4 C 1 0 117430 CASAVA_Build 6 100408611 1D TCAGTAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 9 117431 CASAVA_Build 6 100412746 1D TGAAACCAAT G/- AGAACAAAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 1 0 117432 CASAVA_Build 6 100433206 2I TGAAGCACAC --/AT GTTTTGCACA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AT 0 1 117433 CASAVA_Build 6 100446022 4I TATTACTTTG ----/AACA AACAGTTATC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AACA 1 2 117434 CASAVA_Build 6 100459835 4D TAAATTAGAA TCTG/---- TCTGTCTATT 1969 het 1969 ref 19 10 6 3 TCTG 2 1 117435 CASAVA_Build 6 100488232 1D GTTGCTCACA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 7 6 117436 CASAVA_Build 6 100504517 1I GCTCCAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 40 0 32 8 A 14 15 117437 CASAVA_Build 6 100514432 3D AATAATAATG ATA/--- ATAATAATAA 2891 het 2258 hom 17 5 9 3 ATA 7 6 117438 CASAVA_Build 6 100514769 1D CAGGAGAGAG T/- GGGATGATAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 1 0 117439 CASAVA_Build 6 100517707 1I AATGACAATT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 8 9 117440 CASAVA_Build 6 100521757 1I TGTTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 11 12 117441 CASAVA_Build 6 100531257 3D CCCAGCTACC TCA/--- TGTTTGCCAA 3070 het 3070 ref 52 25 19 9 TCA 1 0 117442 CASAVA_Build 6 100534717 4I TTTTATAGTT ----/TATC TATAAAGTAA 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 TATC 0 1 117443 CASAVA_Build 6 100536049 2I TGGGAAAATC --/CT CTTTCTCTGT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 CT 1 2 117444 CASAVA_Build 6 100537731 1I CTAATTTTTG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 2043 hom 24 7 13 4 T 0 1 117445 CASAVA_Build 6 100538326 1D CTCACTTGTT A/- TTAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 A 1 0 117446 CASAVA_Build 6 100544657 1D TTTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 10 9 117447 CASAVA_Build 6 100550754 1I CCTTTTTTTT -/C CTCAGCTGGA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 C 1 2 117448 CASAVA_Build 6 100552295 2D ACTTTAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 13 11 117449 CASAVA_Build 6 100556058 1I CCAATCACCA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 8 9 117450 CASAVA_Build 6 100565379 1I TTCTATTTTT -/C CTTTGTTTTA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 1 2 117451 CASAVA_Build 6 100568807 1I CTCAGATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 10 11 117452 CASAVA_Build 6 100570985 1I AGAAACAGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 9 10 117453 CASAVA_Build 6 100574360 1I TCACCATATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 9 10 117454 CASAVA_Build 6 100605809 1D TTCACAATTG A/- AAAAGATAGT 3070 hom 137 het 52 0 46 8 A 5 4 117455 CASAVA_Build 6 100609177 1I TGTGGAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 36 1 32 3 A 12 13 117456 CASAVA_Build 6 100612347 1I TCTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2094 hom 36 5 16 15 T 9 10 117457 CASAVA_Build 6 100613419 1I ATTCTTGGTG -/C CGTTGGGCCC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 C 1 2 117458 CASAVA_Build 6 100623450 1I GGTTCGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 36 1 18 17 T 10 11 117459 CASAVA_Build 6 100642516 1D GATCTTTTAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 T 9 8 117460 CASAVA_Build 6 100649378 1D TAAAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2783 hom 28 9 15 5 A 12 11 117461 CASAVA_Build 6 100656426 1I CAACCACATC -/T TTTAGTATAG 3070 hom 151 het 56 0 51 5 T 3 4 117462 CASAVA_Build 6 100657201 1D TTGGGTCAGT G/- GCTCTCTGTG 3070 het 3070 hom 37 9 18 10 G 2 1 117463 CASAVA_Build 6 100657245 1I GTTCTCCTTT -/A AAAAAATCTC 3070 het 2033 hom 22 5 8 9 A 6 7 117464 CASAVA_Build 6 100659844 1I TAAATTTGCA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 7 8 117465 CASAVA_Build 6 100662971 1I TTTGGCCTGC -/T TCTGGCTTTC 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 1 2 117466 CASAVA_Build 6 100667564 1D ACTGTGCTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 9 8 117467 CASAVA_Build 6 100669821 3I CTTAATCAAT ---/AAG AAGTATTTCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAG 1 2 117468 CASAVA_Build 6 100675439 1I TTCTACAGAT -/G GCACCTGAGC 3070 hom 175 het 64 0 59 5 G 1 2 117469 CASAVA_Build 6 100704224 11I ACATGAAGTA -----------/GTACATAATAT GTTTCTTTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GTACATAATAT 0 1 117470 CASAVA_Build 6 100707305 1D ATAGTCTACA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 8 7 117471 CASAVA_Build 6 100708235 1D AAATGTGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 36 1 24 11 T 11 10 117472 CASAVA_Build 6 100713971 2D CTCCATCTCA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AT 11 10 117473 CASAVA_Build 6 100725454 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 618 hom 36 2 22 14 T 13 12 117474 CASAVA_Build 6 100759564 1I TCCAAAAACA -/C CTTTAAAAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 117475 CASAVA_Build 6 100764693 1D CTACATGTGA G/- GGGGGGTAGC 3070 hom 94 het 35 0 31 4 G 7 6 117476 CASAVA_Build 6 100767150 1I GATTCCCCCA -/C CCCCCCACTG 3070 hom 100 het 36 0 34 2 C 6 7 117477 CASAVA_Build 6 100769166 1D GTTGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 35 1 28 6 A 15 14 117478 CASAVA_Build 6 100773700 1I TCTACAATTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 83 het 33 0 28 5 A 8 9 117479 CASAVA_Build 6 100786389 2I TTCATGTTAA --/AC ACACACACAC 3070 het 1222 hom 27 3 24 0 AC 8 9 117480 CASAVA_Build 6 100788485 5I ATATTCCTTA -----/TATTT TGAAATGACA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TATTT 0 1 117481 CASAVA_Build 6 100803962 3D ATTATTATTA TTT/--- TTTTTTTTTT 2763 het 93 hom 18 2 11 6 T 16 13 117482 CASAVA_Build 6 100807366 1D ATACTCCAGG T/- TTTAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 31 9 T 4 3 117483 CASAVA_Build 6 100833837 1I TTGATTTAAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 9 117484 CASAVA_Build 6 100837095 1D TATTTCTTTC A/- ACTCCGTAGT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 2 1 117485 CASAVA_Build 6 100848478 1I CTTAGCTCAA -/T TGGAGAAGTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 1 2 117486 CASAVA_Build 6 100850800 1D AAAGCACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 37 0 27 10 T 12 11 117487 CASAVA_Build 6 100853563 2D GTACAGAAAT TG/-- TGTGTGCGTG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TG 4 3 117488 CASAVA_Build 6 100863815 8D5M6D ACTTCACCAA TGATGAATAAAACTTCACT/--------AAGAC------ TCTGATGAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 6 N/A 0 0 117489 CASAVA_Build 6 100869890 1I TGGTCCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 11 12 117490 CASAVA_Build 6 100870195 1I GACATCTAGA -/T AATATTCAAC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 0 1 117491 CASAVA_Build 6 100873215 1D CCAATGCAAG A/- ATTACAGTCC 3070 hom 111 het 46 0 38 10 A 2 1 117492 CASAVA_Build 6 100876597 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 61 het 35 0 21 14 TG 10 9 117493 CASAVA_Build 6 100882069 2D TAAAGGTGTG TT/-- TTTGTAATAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 5 3 117494 CASAVA_Build 6 100885947 1D TAAATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 12 11 117495 CASAVA_Build 6 100906276 1D CATTTGAATT G/- GGGGGGTCAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 7 6 117496 CASAVA_Build 6 100922119 1I TTTCTCTAGC -/T TGGTGGCAGA 3070 het 3070 hom 47 15 20 12 T 1 2 117497 CASAVA_Build 6 100930243 21I TTCAAATGAA ---------------------/CTATCCTAAAGGATATTGCAT CTATCCTAAA 3070 het 3070 hom 47 17 21 10 CTATCCTAAAGGATATTGCAT 0 1 117498 CASAVA_Build 6 100930530 5D CTTTTGTGTT ACCCC/----- ACACCCTAGG 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 ACCCC 1 0 117499 CASAVA_Build 6 100932013 1D ATCATATTTT A/- ACAAATGAAG 3070 het 3070 ref 32 18 14 1 A 2 1 117500 CASAVA_Build 6 100955578 1D AATTAGAAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 43 20 22 2 A 9 8 117501 CASAVA_Build 6 100973520 9D ATCCCAGACT TTGGGAGGC/--------- TGAGGCGAGC 2405 het 2405 ref 20 10 8 2 TTGGGAGGC 1 0 117502 CASAVA_Build 6 100976604 1I AATCAAAAGT -/C CCCCAAGCCC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 C 4 5 117503 CASAVA_Build 6 100983966 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 31 2 17 12 A 15 14 117504 CASAVA_Build 6 100992185 2D AGAAAAAAAA AC/-- ATATTTATTA 3070 het 3070 hom 28 12 9 7 AC 1 0 117505 CASAVA_Build 6 100998709 7I GGTGTTCTAC -------/ATTTTCA ATTTTCTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 ATTTTCA 0 1 117506 CASAVA_Build 6 101017794 5D TATATGTAAA TATGT/----- ATGCATTTCT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 TATGT 1 0 117507 CASAVA_Build 6 101029331 1D CATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1217 hom 24 3 14 7 T 15 14 117508 CASAVA_Build 6 101034498 1I TTTTATTATA -/T TTTCCTGTCT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 3 4 117509 CASAVA_Build 6 101057149 6D CTGGAAAAAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 AAAAAG 4 3 117510 CASAVA_Build 6 101057627 1D ATTTTTTTTT C/- TCTCACTTCA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 C 1 0 117511 CASAVA_Build 6 101059769 1I GGAAAAAAAA -/C CAAACAAGAG 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 C 1 2 117512 CASAVA_Build 6 101086167 1I TTGGGGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 10 10 T 11 12 117513 CASAVA_Build 6 101097826 1D AATACAACGT A/- AATGCTATGT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 3 2 117514 CASAVA_Build 6 101110518 3D GCTTGAGCCC AGG/--- AGATGGAGGC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 AGG 1 0 117515 CASAVA_Build 6 101133784 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 T 13 14 117516 CASAVA_Build 6 101153082 1I AATAAACCTC -/T TTAAGATTTC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 2 3 117517 CASAVA_Build 6 101166464 1D CTATAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2411 hom 31 8 13 10 A 11 10 117518 CASAVA_Build 6 101167534 1D TATATAAGTG A/- AATATAAATT 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 A 3 2 117519 CASAVA_Build 6 101205719 1D ATTTTTATAT G/- GTATAATACA 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 G 2 1 117520 CASAVA_Build 6 101214553 1D TGCAAACACC T/- TGTCCTTGGA 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 T 2 1 117521 CASAVA_Build 6 101220344 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2097 hom 24 11 13 0 A 10 11 117522 CASAVA_Build 6 101238409 1I TTTTATATAC -/T TATTTTTAGT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 1 2 117523 CASAVA_Build 6 101239228 4D AACTATGCAC TTGT/---- TTATTACTCG 3070 het 3070 hom 48 22 25 1 TTGT 1 0 117524 CASAVA_Build 6 101242875 1I AAAAAAAAAA -/C AACAACAACA 3070 het 3070 hom 39 19 15 5 C 0 1 117525 CASAVA_Build 6 101252014 1D TGAGACACAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 9 8 117526 CASAVA_Build 6 101252143 1D TAACTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 A 11 10 117527 CASAVA_Build 6 101258647 1D CCAAGAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2688 hom 29 8 14 8 T 12 11 117528 CASAVA_Build 6 101260794 1I AGATAACGTG -/A AAAAACTGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 5 6 117529 CASAVA_Build 6 101269267 1D TATACAACTT A/- AAATACTTGT 3070 het 3070 ref 44 22 20 4 A 4 3 117530 CASAVA_Build 6 101287280 6I CAAAGATAAC ------/TAGAAG TAGAAGTTAT 3070 hom 132 het 53 0 44 9 TAGAAG 1 2 117531 CASAVA_Build 6 101287388 1I GTACAGCTGT -/C CCAATTCGAG 3070 hom 159 het 59 0 52 7 C 2 3 117532 CASAVA_Build 6 101290054 3D TAACATCTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 47 1 41 5 T 13 10 117533 CASAVA_Build 6 101290760 1D ATAACTATTC T/- TGTCTAATGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 117534 CASAVA_Build 6 101291747 1D CCGTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 1498 hom 5 het 14 0 7 8 A 11 10 117535 CASAVA_Build 6 101291827 1D GGACTCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 773 hom 28 2 22 5 T 13 12 117536 CASAVA_Build 6 101300102 2D AAACCTAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 38 2 26 11 A 12 10 117537 CASAVA_Build 6 101305144 3D CACAAGCTGT ATC/--- ATAAGACTCA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 ATC 1 0 117538 CASAVA_Build 6 101306386 1D AATTTAACAG T/- TAAGAACCTT 3070 hom 114 het 42 0 38 5 T 2 1 117539 CASAVA_Build 6 101308106 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 32 3 18 11 A 11 10 117540 CASAVA_Build 6 101312182 3D CACAAACCAC AGA/--- AGAAGTTTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 AGA 2 1 117541 CASAVA_Build 6 101316881 1I AAGAGAACAA -/T TTCAGAACTC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 2 3 117542 CASAVA_Build 6 101321945 1D TGTCCGATCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 38 0 27 11 A 10 9 117543 CASAVA_Build 6 101322214 1D GTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 10 9 117544 CASAVA_Build 6 101322808 1D GCAACATGTG C/- AGGTGTAGAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 C 1 0 117545 CASAVA_Build 6 101325100 1D GGGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 117546 CASAVA_Build 6 101326138 5I TACGTAGAAT -----/ATATA AAAAAAACTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATATA 0 1 117547 CASAVA_Build 6 101328610 4D AACCTATTAC ATAT/---- ATAGAGGTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 3 1 117548 CASAVA_Build 6 101333004 5D AAATTCTGTC TAAAA/----- TAAGAAGTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 TAAAA 1 0 117549 CASAVA_Build 6 101337316 1I ATGCCTCCAT -/A AAACAGAATA 3070 hom 101 het 38 0 34 4 A 3 4 117550 CASAVA_Build 6 101348331 20D TGTGTTGCAG AAAGGTTAAGTAACTTGCCT/-------------------- AAAGGTTAAG 3070 hom 83 het 32 0 27 12 AAAGGTTAAGTAACTTGCCT 2 1 117551 CASAVA_Build 6 101353594 2D TAAATAAAAC AA/-- AAACAAATGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 5 3 117552 CASAVA_Build 6 101362884 1I ATACATGGGT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 117553 CASAVA_Build 6 101375313 1I ACAGAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 10 11 117554 CASAVA_Build 6 101382690 1I AGTATTTTCT -/A AAAAAAAAAA 2319 het 2319 ref 40 13 11 16 A 16 17 117555 CASAVA_Build 6 101389680 1D GCCTTCGAGG A/- AAAAAAAAAA 1191 het 1191 ref 36 25 3 8 A 13 12 117556 CASAVA_Build 6 101441108 2D AAAGAAAAAC AT/-- AGAAAAACTA 3070 het 3070 hom 27 11 13 6 AT 1 0 117557 CASAVA_Build 6 101441466 1D AAATTATAAG T/- TTTTTTTTTT 1760 het 1760 ref 35 25 5 5 T 12 11 117558 CASAVA_Build 6 101523894 16I AACTTCTTCA ----------------/GACTTAAACGTCCCTG GCTGACAGCT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 GACTTAAACGTCCCTG 0 1 117559 CASAVA_Build 6 101568198 2D AACCCATACC TA/-- TATATATATT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TA 5 4 117560 CASAVA_Build 6 101573199 1D TGACTTCGAA T/- TCTTTCATCA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 2 1 117561 CASAVA_Build 6 101613133 1I TGTCTGTCTG -/T TTTCTCAAGG 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 3 4 117562 CASAVA_Build 6 101615763 1D TTGTGTGATT A/- GATATCATTT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 1 0 117563 CASAVA_Build 6 101618919 1D AATGGAAAGC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 9 8 117564 CASAVA_Build 6 101619291 3I AGAATATACA ---/TTC TTCTTCTCAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TTC 2 3 117565 CASAVA_Build 6 101641262 1D AGCTACTGCT A/- ACCTGCACTT 3070 hom 85 het 36 0 30 6 A 2 1 117566 CASAVA_Build 6 101649247 2D ATTTGAGGAA AC/-- AGGCCAACTT 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 AC 1 0 117567 CASAVA_Build 6 101659959 6I AATTGTACTG ------/TGATTT CATAAACGTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TGATTT 0 1 117568 CASAVA_Build 6 101666406 2I ACTTTTTGAA --/AG AGAGTTGTAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 AG 2 3 117569 CASAVA_Build 6 101671049 1D AGTTGTTGGC T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 7 6 117570 CASAVA_Build 6 101721649 1D TCAGTTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 10 9 117571 CASAVA_Build 6 101722062 1I CACATTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 29 1 26 2 T 10 11 117572 CASAVA_Build 6 101727887 1D ATGGTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 45 2 34 9 T 13 12 117573 CASAVA_Build 6 101730469 1D TCCCTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 49 1 41 7 T 12 11 117574 CASAVA_Build 6 101731138 4I ACTAGCAAGT ----/TTAG TTTTTCTTTT 3070 hom 126 het 44 0 42 2 TTAG 0 1 117575 CASAVA_Build 6 101750733 1D TGAAGGGGGG A/- AAGTGGATAA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 3 2 117576 CASAVA_Build 6 101778521 1I GTCTCCTTTT -/A AGTAATGTCA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 1 2 117577 CASAVA_Build 6 101821191 1I TTGTGTGTGT -/G GGGGGGGGGA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 G 9 10 117578 CASAVA_Build 6 101921443 1I AAAAAAAACA -/T TTTTTAAAAA 2179 het 2179 ref 27 19 7 1 T 5 6 117579 CASAVA_Build 6 101930319 1D TTATTTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 31 1 26 4 T 11 10 117580 CASAVA_Build 6 101952283 1D TGTTTGGAGG A/- AAAAATAGCA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 6 5 117581 CASAVA_Build 6 101968651 3D TCTCTGCATC AAG/--- AAGGATATCA 3070 het 3070 ref 44 25 15 5 AAG 2 1 117582 CASAVA_Build 6 101977605 1I ACATGGGATG -/C AGATGGGCTG 3070 hom 117 het 48 0 39 9 C 0 1 117583 CASAVA_Build 6 101978369 1D TTTTGATACT A/- ATCCCATATT 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 A 2 1 117584 CASAVA_Build 6 101983281 1D ATATTAGTTT A/- AAAAATATGT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 6 5 117585 CASAVA_Build 6 101989560 1I AGGAGAAAAG -/A AAATTCTATC 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 A 3 4 117586 CASAVA_Build 6 101990963 1I AAGATAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 10 11 117587 CASAVA_Build 6 101995485 1D TGCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2323 hom 31 10 18 3 T 12 11 117588 CASAVA_Build 6 101997023 4D CCCATCCTGC CAGT/---- CAGTGCGCCG 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 CAGT 2 1 117589 CASAVA_Build 6 102004321 1I CACTGTATTT -/A AAAATCTATA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 4 5 117590 CASAVA_Build 6 102006289 6D TTATCTCTGA GGGGGG/------ GGGGGGGTGC 3070 het 425 hom 20 3 11 8 G 13 7 117591 CASAVA_Build 6 102007044 1I AATTTTTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 20 17 12 T 9 10 117592 CASAVA_Build 6 102012705 4D CTGTAAGTAG TAGA/---- TAGTTTATTA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 TAGA 1 0 117593 CASAVA_Build 6 102018430 1I ATTGGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 13 14 117594 CASAVA_Build 6 102021181 2D GCTTTTTTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 A 14 12 117595 CASAVA_Build 6 102022474 2D TCCTTCCTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 24 0 12 15 T 16 14 117596 CASAVA_Build 6 102026572 1D TAAAGAATGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 9 8 117597 CASAVA_Build 6 102027783 1D TCCTTGTTTA T/- TTTTTTAAAG 2933 het 2921 hom 22 7 10 8 T 7 6 117598 CASAVA_Build 6 102052428 4D TTTTACAACC TTAT/---- TTATTATTAT 3070 het 546 hom 11 2 8 1 TTAT 2 1 117599 CASAVA_Build 6 102055523 3I GTCTTATTAA ---/TAT TATTAACAGT 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 TAT 1 2 117600 CASAVA_Build 6 102058778 4D CTTTCCTGAG ACAT/---- ACACAACACA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 ACAT 1 0 117601 CASAVA_Build 6 102059630 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 11 10 117602 CASAVA_Build 6 102063027 5D AAAATGTGAT AAAGC/----- AAAGCTTAAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 7 AAAGC 2 1 117603 CASAVA_Build 6 102066336 3D AATTTAGATA ATC/--- ATATATGATT 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 ATC 1 0 117604 CASAVA_Build 6 102066627 2D AGATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1234 hom 19 4 11 4 AT 9 8 117605 CASAVA_Build 6 102068414 2D CTTAAAACAT TA/-- TATTAATTGA 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 TA 2 1 117606 CASAVA_Build 6 102071448 17D ATCTTTTTAC TATGTTGGAAAAATTCA/----------------- TATGCTGAAA 3070 het 3070 ref 26 17 13 2 TATGTTGGAAAAATTCA 1 0 117607 CASAVA_Build 6 102072667 1I TGTTTTGAGA -/C CCCCAAGTGT 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 C 4 5 117608 CASAVA_Build 6 102078290 1D CTCCTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 2154 het 962 hom 34 9 10 15 T 19 18 117609 CASAVA_Build 6 102078956 2D TGCCCCATTT TA/-- TATATATATA 1221 het 1221 ref 30 20 3 7 TA 9 8 117610 CASAVA_Build 6 102085131 3D TTGGAAACTA GTT/--- GTTGGCAGAT 3070 hom 123 het 47 0 42 7 GTT 2 1 117611 CASAVA_Build 6 102087983 1I TATATCAGAG -/A AAAAAAATAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 7 8 117612 CASAVA_Build 6 102088707 2D CATAGTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 12 10 117613 CASAVA_Build 6 102095919 1D27M1D GACCGGGTAA CAGATGTTACACCCCAGCGCACACAACCA/-AGATGTTACACCCCACCGCACACAACC- CACACACACA 3070 hom 40 het 14 0 14 1 N/A 0 0 117614 CASAVA_Build 6 102097058 1I AGCAAGAAGG -/T TGTTTTGATG 3070 hom 114 het 41 0 37 4 T 1 2 117615 CASAVA_Build 6 102100516 1D GTTCTCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 T 12 11 117616 CASAVA_Build 6 102101893 1I TTTTTTTGGA -/T TTTTTTTTAT 2960 het 2242 hom 22 9 9 4 T 8 9 117617 CASAVA_Build 6 102110678 1I CGTCTCTAAA -/T TGCAAATATC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 1 2 117618 CASAVA_Build 6 102113238 3I CCTTTGCTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 16 12 T 12 15 117619 CASAVA_Build 6 102115285 1I TATCAGTAAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2996 hom 28 7 16 5 T 8 9 117620 CASAVA_Build 6 102116788 1I ATCATTCCCT -/A AAAAAAAAAA 1018 het 1018 ref 45 37 3 5 A 10 11 117621 CASAVA_Build 6 102123495 1I TCCTTTTCAC -/A ATGAAAATAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 1 2 117622 CASAVA_Build 6 102125631 1I9M1I ATGTGCAGTA -TTTTGTGTA-/TTTTTGTGTAT TGTGAGATTT 3070 hom 114 het 39 0 39 7 N/A 0 0 117623 CASAVA_Build 6 102139414 1I ACATCAAAAA -/T TGCAAAAATG 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 1 2 117624 CASAVA_Build 6 102143029 1D28M2D TGTTCATATC AAAAAGCCACAGAATTGTTCTAAGATAAGGT/-AAAAGCCACAGAATTGTTCTAAGATAAG-- TGGAGTAGCA 3070 hom 114 het 34 0 39 5 N/A 0 0 117625 CASAVA_Build 6 102150524 1D TTCATTAAAA T/- TTTTTTTTTT 1272 het 1272 ref 25 19 3 3 T 15 14 117626 CASAVA_Build 6 102213163 1I GATCAAATGG -/T TATTTCTGTT 3070 hom 30 het 23 0 20 3 T 1 2 117627 CASAVA_Build 6 102223139 1D TTCTCAACTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 37 0 31 9 A 10 9 117628 CASAVA_Build 6 102225961 1D GTTCCAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 82 het 36 0 28 8 A 10 9 117629 CASAVA_Build 6 102252061 1D CTATTACAAT A/- ACATATCCCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 1 117630 CASAVA_Build 6 102252738 1D TTGTTGATGC T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 7 117631 CASAVA_Build 6 102256631 17I GGTATTCTTA -----------------/GAAAAGGTCAGTAGTAT TTTTTCTATA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 GAAAAGGTCAGTAGTAT 0 1 117632 CASAVA_Build 6 102266384 1D GCACACAAAT C/- AGCTACAATT 3070 het 3070 ref 68 33 29 6 C 1 0 117633 CASAVA_Build 6 102308735 3D GATTGATTTA TCT/--- TCTTTTATTA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 TCT 2 1 117634 CASAVA_Build 6 102330120 1D TGTGTGTGAG A/- TATATATATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 0 117635 CASAVA_Build 6 102340831 1D ACAATTTGAC T/- TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 45 36 3 6 T 11 10 117636 CASAVA_Build 6 102352254 1I CCATTATATA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 8 9 117637 CASAVA_Build 6 102361195 1D CTACAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2803 hom 30 7 15 8 T 13 12 117638 CASAVA_Build 6 102387966 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2467 hom 20 8 12 0 T 9 10 117639 CASAVA_Build 6 102410393 1D AATGGACTGA G/- GGGGGGCAGA 3070 hom 79 het 34 0 29 5 G 7 6 117640 CASAVA_Build 6 102412945 1I TCTCTCTCTA -/T TTTTTTTTTC 1131 het 124 hom 21 1 11 9 T 9 10 117641 CASAVA_Build 6 102421948 4I AGGGCTAATA ----/TAGT TATTTTTAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TAGT 0 1 117642 CASAVA_Build 6 102425833 5I ACTCTTTGAA -----/ACTGC AGGACAGTGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ACTGC 0 1 117643 CASAVA_Build 6 102429301 1I CCATGAGCAT -/G GGAGTGTTCT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 2 3 117644 CASAVA_Build 6 102432911 1I AAGTGTCAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 9 10 117645 CASAVA_Build 6 102434247 1I TCTCACTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 972 hom 44 3 26 15 T 13 14 117646 CASAVA_Build 6 102442061 3I TACTACTTTA ---/TGT TGTTCATTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TGT 1 2 117647 CASAVA_Build 6 102447509 1D CTGAACATCC A/- AAAATCAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 5 4 117648 CASAVA_Build 6 102455192 2I ATAGAGTGTC --/TA TATTTTCAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TA 1 2 117649 CASAVA_Build 6 102456054 3I ATAGATGATT ---/ATA ATAATAATTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ATA 2 3 117650 CASAVA_Build 6 102456604 5I CTTAAAAATT -----/TAATA TAAATGATAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TAATA 0 1 117651 CASAVA_Build 6 102458353 1I AAGTTGGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 29 0 20 9 A 11 12 117652 CASAVA_Build 6 102458741 1D TTCACTTCAA T/- TTTTTTATCT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 7 6 117653 CASAVA_Build 6 102461825 3D GTGGAATAAC AAG/--- AATAGTTTAT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 AAG 1 0 117654 CASAVA_Build 6 102461960 1D GATTTAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 10 9 117655 CASAVA_Build 6 102467480 6D ATTTAAAAAT TCTTTA/------ TCTTTATAGG 3070 hom 66 het 26 0 23 5 TCTTTA 2 1 117656 CASAVA_Build 6 102470125 6I TTTAGGAAAT ------/TATCTC TATTTCTTAG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 TATCTC 0 1 117657 CASAVA_Build 6 102471014 1I TCTTCTATTC -/T GAGTGAAAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 0 1 117658 CASAVA_Build 6 102472155 1D GTCACTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 11 10 117659 CASAVA_Build 6 102472754 3I GATTGTTATG ---/TAA TAATAATGAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TAA 2 3 117660 CASAVA_Build 6 102475300 2I AATACAGGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 11 13 117661 CASAVA_Build 6 102484042 1I GGAAATAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 9 10 117662 CASAVA_Build 6 102486233 1I TTCTTCCTTC -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 117663 CASAVA_Build 6 102500479 1I CTATCTACTG -/T TTTTTTTTTT 2772 het 2173 hom 25 9 10 6 T 15 16 117664 CASAVA_Build 6 102511838 1D TTTTGTCATG T/- TTTTTTGGCT 3070 hom 85 het 32 0 27 5 T 7 6 117665 CASAVA_Build 6 102516904 1D AGCCATCTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 178 hom 35 1 27 8 A 10 9 117666 CASAVA_Build 6 102517548 1I GGCAGTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 31 1 29 1 T 10 11 117667 CASAVA_Build 6 102537223 1D CCCCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 47 33 3 11 T 13 12 117668 CASAVA_Build 6 102553381 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1010 het 624 hom 22 8 3 11 T 19 18 117669 CASAVA_Build 6 102555754 1D TTCTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 36 1 23 12 T 15 14 117670 CASAVA_Build 6 102557467 1D TTCATCTATG T/- TTAAATATTG 3070 hom 72 het 25 0 25 1 T 3 2 117671 CASAVA_Build 6 102559835 2D CAATATGAGA CT/-- CTGTGAAAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CT 2 1 117672 CASAVA_Build 6 102568458 1D TAAAGTTTTC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 8 7 117673 CASAVA_Build 6 102586027 5I TTTTATTTTA -----/TTTTT AAAATTTTTA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 0 5 117674 CASAVA_Build 6 102598362 44I TTGATGGATC --------------------------------------------/ATATGCTAATTTTACTTTTAGTTTTCTGAGGAGCCTCCACACTG TTTCCCATGA 3070 hom 108 het 36 0 37 6 ATATGCTAATTTTACTTTTAGTTTTCTGAGGAGCCTCCACACTG 0 1 117675 CASAVA_Build 6 102602637 1I GAACCCACAC -/A TGTATGGTCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 1 117676 CASAVA_Build 6 102616594 1I TCAGACCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 28 0 25 3 T 11 12 117677 CASAVA_Build 6 102617077 4I AAAACTACAG ----/TGAT TGATCAGTAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TGAT 1 2 117678 CASAVA_Build 6 102631283 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1150 hom 33 4 17 12 A 14 15 117679 CASAVA_Build 6 102702363 1D TGGCTCATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 42 0 32 10 A 11 10 117680 CASAVA_Build 6 102730268 1D AAAAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 1010 het 691 hom 15 5 4 6 A 15 14 117681 CASAVA_Build 6 102746338 1I TTAGATTGTA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 63 het 40 0 22 18 T 7 8 117682 CASAVA_Build 6 102749393 2D TACACACACT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 CA 7 6 117683 CASAVA_Build 6 102749892 4D CTCCCCTGCA CTCT/---- CTCTCTCCTA 3070 het 3070 hom 49 18 21 12 CT 5 3 117684 CASAVA_Build 6 102750020 1I TCTTTCTTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 37 0 29 8 T 8 9 117685 CASAVA_Build 6 102752235 2D TCACACACAC AT/-- GTTTTACAAA 3070 het 3070 hom 23 9 13 2 AT 1 0 117686 CASAVA_Build 6 102758373 1D AAAGGTACGT A/- AGCTGATGAT 3070 hom 132 het 51 0 45 7 A 2 1 117687 CASAVA_Build 6 102759864 1I TATCTGTACA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 8 9 117688 CASAVA_Build 6 102761676 1D TAATGCCAAG A/- AAAGTAAAGA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 4 3 117689 CASAVA_Build 6 102761916 1I TTTCTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 11 12 117690 CASAVA_Build 6 102762992 1I TTGACTTTGT -/C CCCCCCCCCA 2284 het 2284 ref 42 15 10 17 C 9 10 117691 CASAVA_Build 6 102765774 1D TCAGTGGTTT C/- CAAATGGTGG 2979 het 2979 ref 21 11 7 5 C 2 1 117692 CASAVA_Build 6 102782509 1D AAAAAGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 10 9 4 T 11 10 117693 CASAVA_Build 6 102783308 1D ATTTTTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 27 1 23 4 T 12 11 117694 CASAVA_Build 6 102785115 2D AGAAAGATAA AT/-- GGGAACTTCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AT 1 0 117695 CASAVA_Build 6 102795072 2D TCTCTGTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2307 hom 42 10 22 10 A 14 12 117696 CASAVA_Build 6 102803507 1D AAGATTGATA C/- TAAAACATAA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 C 1 0 117697 CASAVA_Build 6 102804948 2I TAAAAAATAA --/GT CTGTTAGAAA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 GT 0 1 117698 CASAVA_Build 6 102806920 1I AAAAGAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 A 7 8 117699 CASAVA_Build 6 102809921 1D TGGATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 10 9 117700 CASAVA_Build 6 102815341 1D TCATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 26 1 15 10 T 11 10 117701 CASAVA_Build 6 102817987 1D CAAGTAACAT A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 A 7 6 117702 CASAVA_Build 6 102819294 1I TAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 9 10 117703 CASAVA_Build 6 102819461 3I TAATATTTTT ---/ATG ATGAGATTCT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 ATG 1 2 117704 CASAVA_Build 6 102828294 7D ACTCCGTTAC AAATAAA/------- AAATAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 7 AAATAAA 2 1 117705 CASAVA_Build 6 102828803 5D TTTTTTTGTC TATAA/----- TATAATAATG 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 TATAA 2 1 117706 CASAVA_Build 6 102829274 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCTCCCC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 6 5 117707 CASAVA_Build 6 102836232 2D CATAGTTATA AT/-- AGTCTACTTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 AT 1 0 117708 CASAVA_Build 6 102839862 2I GAGCAGTGTT --/AA GAGGGAAATT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 0 2 117709 CASAVA_Build 6 102844897 1D CTAGCTATTT G/- GCAATACAGA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 G 2 1 117710 CASAVA_Build 6 102851771 3D CTATAAAATG CCC/--- CCCCCCCCCA 3070 hom 54 het 19 0 16 3 C 12 9 117711 CASAVA_Build 6 102855944 1I CGAGAACTAG -/A AAATATGCTA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 3 4 117712 CASAVA_Build 6 102857286 5D GCAAGAAACA TACTT/----- TACTTATATA 3070 hom 90 het 31 0 31 2 TACTT 2 1 117713 CASAVA_Build 6 102871184 1D GTTCTGTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 10 9 117714 CASAVA_Build 6 102871345 7I GTTAGATTCC -------/TAAACAA TAGGTCATAG 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 TAAACAA 0 1 117715 CASAVA_Build 6 102871975 1D TTTTGTTGCC T/- TTAATTGATC 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 T 3 2 117716 CASAVA_Build 6 102894569 1I GTGGACAAAG -/C CCCTAGGTAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 C 3 4 117717 CASAVA_Build 6 102913444 1D TTTAATAGAT A/- AAAAATTACT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 6 5 117718 CASAVA_Build 6 102919497 1D TATGAAAAAA G/- GATGTGTGGA 3070 het 3070 ref 46 30 14 2 G 2 1 117719 CASAVA_Build 6 102929440 1D CCTATATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 A 13 12 117720 CASAVA_Build 6 102938633 1D TACTTAAATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 8 7 117721 CASAVA_Build 6 102954779 2D ATTTGCTGAC TT/-- AACATGGTAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 2 0 117722 CASAVA_Build 6 102969816 1D TATTTATACA T/- TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 40 23 13 6 T 7 6 117723 CASAVA_Build 6 102975456 1I TGAATGAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 9 10 117724 CASAVA_Build 6 102976606 1I TTTACAGAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 A 9 10 117725 CASAVA_Build 6 102976864 1I AAATCAATGG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 39 13 26 0 A 7 8 117726 CASAVA_Build 6 102996475 10D ATTTTATTTT ATTTTATTTA/---------- CTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 ATTTTATTTA 1 0 117727 CASAVA_Build 6 102997860 1D GGTCCTCTGT C/- CCCCCCCAAT 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 C 8 7 117728 CASAVA_Build 6 103006062 1D CATGGTCAGA G/- CTGTACCTTA 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 G 1 0 117729 CASAVA_Build 6 103017262 1D ATTAACATGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 9 8 117730 CASAVA_Build 6 103019768 3D ATAACTGTTA AAG/--- AAGAATTCAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 AAG 2 1 117731 CASAVA_Build 6 103023611 1D CTGTGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 35 0 27 8 T 12 11 117732 CASAVA_Build 6 103031737 1I GCCTCATGAG -/C CCCAGGGCAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 3 4 117733 CASAVA_Build 6 103036989 1D ATAATTGAGC A/- AAAGATTCAG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 4 3 117734 CASAVA_Build 6 103039647 1D CCAAATGAGC T/- TTTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 21 23 3 T 5 4 117735 CASAVA_Build 6 103040368 1D CAAGGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 T 13 12 117736 CASAVA_Build 6 103042039 1D ATGAACCACC A/- AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 7 6 117737 CASAVA_Build 6 103051851 2D TATTCCATGG TA/-- TATATATATC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 TA 5 4 117738 CASAVA_Build 6 103055343 1I GGTTATCTGG -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 6 7 117739 CASAVA_Build 6 103060481 1D CAAGGAAACT A/- GAAAGCACGG 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 A 1 0 117740 CASAVA_Build 6 103072082 1D AAAATAAAAC A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 A 7 6 117741 CASAVA_Build 6 103076571 1D GTATGCCTAA C/- CTTGCTTTGA 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 C 2 1 117742 CASAVA_Build 6 103089663 1D AAAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 11 10 117743 CASAVA_Build 6 103092646 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2577 het 2577 ref 21 10 7 4 T 10 11 117744 CASAVA_Build 6 103102420 1D CACAACCTTC T/- TTTTTTTTTT 2374 het 18 hom 35 1 10 24 T 15 14 117745 CASAVA_Build 6 103103808 1I TTACTAATAA -/T TTTTTATCAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 5 6 117746 CASAVA_Build 6 103108665 1D GATGTGAAAT G/- AATTATTTCT 3070 het 3070 hom 47 13 26 9 G 1 0 117747 CASAVA_Build 6 103110504 1I AAGATTCATT -/A AAAAATAGCA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 5 6 117748 CASAVA_Build 6 103116907 1D TTTTTAGAAC T/- GAAAGCAATG 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 T 1 0 117749 CASAVA_Build 6 103134584 1D AAAGACATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2651 hom 30 9 17 4 T 13 12 117750 CASAVA_Build 6 103134932 2I CATGCCACAC --/TG TTATAGATAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TG 0 1 117751 CASAVA_Build 6 103135693 7D TGGACATGTG TTTATTT/------- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 9 TTTATTT 3 2 117752 CASAVA_Build 6 103137627 4I CCCCCAAGTC ----/TTTG TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 TTTG 0 1 117753 CASAVA_Build 6 103138003 1D GTAATCTTTG A/- ATTTCCACAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 2 1 117754 CASAVA_Build 6 103138798 1I GTTAGATTAA -/C CCCCCCAGGT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 C 6 7 117755 CASAVA_Build 6 103140365 1I CACTATTTCA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 7 8 117756 CASAVA_Build 6 103140515 3I ATTTTTTTAC ---/TTG TTGGGGTTCA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 TTG 1 2 117757 CASAVA_Build 6 103143673 4D TATTTTTTTG TTTA/---- TTTGTGTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 16 3 TTTA 1 0 117758 CASAVA_Build 6 103143858 1I TATCTAGGAC -/T TACAGGCATA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 1 2 117759 CASAVA_Build 6 103144186 6D TATGTATATA CTTCCT/------ CTTATGCCAA 3070 het 3070 ref 40 24 13 5 CTTCCT 1 0 117760 CASAVA_Build 6 103148996 1D GATTCGTCCA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 8 7 117761 CASAVA_Build 6 103150220 1I AAGCATAAAC -/A GCTATTTCCA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 0 1 117762 CASAVA_Build 6 103157312 1I ATTTCAGAGC -/A AAATGTTCAG 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 A 3 4 117763 CASAVA_Build 6 103158560 1I AAATGCCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 T 11 12 117764 CASAVA_Build 6 103159901 3I TTAAAAAGAT ---/AAA GAAGTTGATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 3 117765 CASAVA_Build 6 103161792 6I CATATATATG ------/TGTATA TATATATATA 3042 het 2534 hom 20 6 11 3 TGTATA 0 1 117766 CASAVA_Build 6 103165591 2I CCTCTGAAAC --/TA TAATACTTTC 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 TA 1 2 117767 CASAVA_Build 6 103167533 1I AAGTACCATC -/A AAAAATTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 5 6 117768 CASAVA_Build 6 103168894 1D TTAATCTAGA T/- TAAACAGTTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 2 1 117769 CASAVA_Build 6 103171274 2D ACAAGAAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 13 11 117770 CASAVA_Build 6 103171664 19I GGGACTAGAT -------------------/CTCCTACCTGCTAAAAAAG CTGGCTTATG 3070 het 3070 ref 43 28 11 4 CTCCTACCTGCTAAAAAAG 0 1 117771 CASAVA_Build 6 103172157 1D ATGTCTCTCA G/- GGGGGAAATG 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 G 6 5 117772 CASAVA_Build 6 103173601 5D GGCTGAGAGC AAGAG/----- AAGAGCCTGT 3070 het 3070 hom 46 18 25 5 AAGAG 2 1 117773 CASAVA_Build 6 103173874 2D TTAAAATAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 32 2 8 25 A 12 10 117774 CASAVA_Build 6 103174331 1D GGTGGGGGGG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 7 6 117775 CASAVA_Build 6 103175919 1D ATATATATAT A/- ATCACAATTT 817 het 817 ref 28 11 2 15 A 2 1 117776 CASAVA_Build 6 103177686 1D TGTTTTAACC A/- AATGTTTAAT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 A 3 2 117777 CASAVA_Build 6 103186575 2I CCCAAGGCCA --/CT CTCTGGTGAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 CT 2 3 117778 CASAVA_Build 6 103186650 1D ACCTTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1995 hom 32 7 18 7 T 11 10 117779 CASAVA_Build 6 103188891 1D TGTATGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 26 1 18 8 T 15 14 117780 CASAVA_Build 6 103198894 1I TCAAGTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 T 11 12 117781 CASAVA_Build 6 103225384 4D ACAAACACTA TCTG/---- TCTAACTATT 3070 het 3070 ref 47 26 19 4 TCTG 1 0 117782 CASAVA_Build 6 103247495 2I TACCTTGGTA --/TT TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 T 7 9 117783 CASAVA_Build 6 103249113 5D TCTTTCTCTT ATCTG/----- ATTTCTCTAG 3070 het 3070 hom 37 15 21 6 ATCTG 1 0 117784 CASAVA_Build 6 103250961 1D GGTTATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 T 11 10 117785 CASAVA_Build 6 103254317 4D TGCACATGGG TTAA/---- TTTTCTATTG 3070 het 3070 hom 34 11 21 3 TTAA 1 0 117786 CASAVA_Build 6 103259655 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 974 hom 23 7 9 7 T 17 16 117787 CASAVA_Build 6 103266131 1D AAGGGGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 107 hom 21 2 13 6 T 15 14 117788 CASAVA_Build 6 103273744 1I TGTTTATACA -/T GTTACCATAT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 0 1 117789 CASAVA_Build 6 103293063 2I ATGCACTTCC --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 8 10 117790 CASAVA_Build 6 103294893 1I GAGAACTCAG -/A AAAAAAAAAA 1712 het 1712 ref 24 5 9 10 A 14 15 117791 CASAVA_Build 6 103299254 1D TAAATTCTCA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 T 8 7 117792 CASAVA_Build 6 103307425 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1739 het 1739 ref 16 8 5 3 T 15 14 117793 CASAVA_Build 6 103315633 2D GTTAAATAAT AC/-- AGATATAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 AC 1 0 117794 CASAVA_Build 6 103318690 1D AGCAGAATGC G/- GGAGCTTTGA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 G 3 2 117795 CASAVA_Build 6 103326995 1I AAATCATGTT -/C TTTGCAGCAA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 C 0 1 117796 CASAVA_Build 6 103328950 4D TTGTTTTTTA AAGT/---- AAGTAGGCTC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AAGT 2 1 117797 CASAVA_Build 6 103332413 4I AATTAAGAAG ----/CAAA CAAAGCCCTA 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 CAAA 1 2 117798 CASAVA_Build 6 103335006 1D TTACAATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 7 A 12 11 117799 CASAVA_Build 6 103348787 1D TAAAAAAAAA C/- ATTATCCTTC 3070 het 160 hom 44 1 39 4 C 1 0 117800 CASAVA_Build 6 103350573 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 9 10 117801 CASAVA_Build 6 103356161 1D CCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1619 het 1619 ref 21 11 4 6 T 13 12 117802 CASAVA_Build 6 103383312 5D TACAAACCTT AAATA/----- AAAACTTTAA 3070 hom 87 het 31 0 30 4 AAATA 1 0 117803 CASAVA_Build 6 103385526 2D AGAGGGAGCT AA/-- AAGCAGCGAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 4 2 117804 CASAVA_Build 6 103385778 1D TAATCTAGTA T/- TTTTTTAAGA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 T 7 6 117805 CASAVA_Build 6 103389817 1D TACTTGTGAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 9 8 117806 CASAVA_Build 6 103393006 1D CAATGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 49 0 40 11 T 11 10 117807 CASAVA_Build 6 103394288 4D TATCACTGAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 TTTG 4 3 117808 CASAVA_Build 6 103394919 1D TATTTAATGG T/- AGTATAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 0 117809 CASAVA_Build 6 103397572 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 9 10 117810 CASAVA_Build 6 103412801 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTATA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TG 4 3 117811 CASAVA_Build 6 103414795 1D TTTTTTTGGT A/- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 48 37 6 5 A 15 14 117812 CASAVA_Build 6 103424644 2D TATATATATG TA/-- TATATATATG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TA 5 4 117813 CASAVA_Build 6 103436101 1I CTTTTTATTT -/A AAAAAAACTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 7 8 117814 CASAVA_Build 6 103436868 2I CAAATTAAAA --/AC AGTGACCCAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AC 0 1 117815 CASAVA_Build 6 103440714 1I AAGACTGAAC -/A ACTCAACCCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 1 2 117816 CASAVA_Build 6 103449935 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 150 hom 34 1 28 5 T 9 8 117817 CASAVA_Build 6 103456270 1I AATAATTCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 11 12 117818 CASAVA_Build 6 103472358 1D AGATGTATTC T/- GTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 1 0 117819 CASAVA_Build 6 103484367 1D ATTTAGTATA C/- CTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 55 19 27 9 C 2 1 117820 CASAVA_Build 6 103484728 1D AGAGCCTTGT A/- AAATTCATCA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 4 3 117821 CASAVA_Build 6 103485365 1I CTATTTTTTT -/C AAAAAAGTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 117822 CASAVA_Build 6 103487125 1I CATCTATACA -/T ATTTATCAAT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 0 1 117823 CASAVA_Build 6 103490111 2I CTCAAGATTA --/CT CTGTCTTTAG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 CT 1 2 117824 CASAVA_Build 6 103491346 1I AATCCATACT -/C CCAACAATTA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 C 2 3 117825 CASAVA_Build 6 103491555 1D AATAAAACTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 T 10 9 117826 CASAVA_Build 6 103499606 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 A 9 10 117827 CASAVA_Build 6 103500666 5D CTATATAGAT ATATA/----- GTATAGATAT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 ATATA 1 0 117828 CASAVA_Build 6 103505481 1D TTGCTTTCAG T/- TTTTGGTGAT 3070 het 3070 hom 54 20 25 9 T 5 4 117829 CASAVA_Build 6 103511527 2I AAATTATTTA --/AT AGTCTTTATA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 AT 0 1 117830 CASAVA_Build 6 103516738 1D ACCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 12 11 117831 CASAVA_Build 6 103527042 4D CCATACTTAT TCTG/---- TCTATCTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 TCTG 1 0 117832 CASAVA_Build 6 103529102 1I TAACATAAAG -/A AAAAAAAAAC 1955 het 1955 ref 23 13 5 5 A 9 10 117833 CASAVA_Build 6 103529980 5D AAGCAGAAAC AACAA/----- AACAAAACAA 3070 het 3070 hom 22 7 10 6 AACAA 3 2 117834 CASAVA_Build 6 103532324 1I CAATAGGTGC -/A AAAAAAAAAA 2489 het 2489 ref 30 15 7 8 A 10 11 117835 CASAVA_Build 6 103532375 1I AAGACCTCTA -/C AAGGAAAGCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 0 1 117836 CASAVA_Build 6 103535749 1I CTCTATTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 A 10 11 117837 CASAVA_Build 6 103538289 2I TCTCTGTTCA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 9 11 117838 CASAVA_Build 6 103545375 5D ATTTGTGTGG TTTCT/----- TTTGAGAAAT 3070 het 3070 ref 33 20 13 1 TTTCT 1 0 117839 CASAVA_Build 6 103564630 2D CATCTAAACG TA/-- TATATATATA 3070 het 2786 hom 29 7 16 6 TA 9 8 117840 CASAVA_Build 6 103565934 4D AGGGGTCATT AAGC/---- AAGCTTTCTG 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 AAGC 2 1 117841 CASAVA_Build 6 103571985 1D TAGTTAGCAG C/- TTCTGTAACC 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 C 1 0 117842 CASAVA_Build 6 103577907 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 12 9 117843 CASAVA_Build 6 103580510 1D AGAATGCACA T/- TTTTCCTTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 5 T 5 4 117844 CASAVA_Build 6 103586530 1D TAAGATCAGC A/- AAAAATCTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 5 117845 CASAVA_Build 6 103589545 2D GAGCATATGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 93 het 45 0 32 14 GA 10 9 117846 CASAVA_Build 6 103590410 1D TTAAATAAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 28 0 20 9 T 10 9 117847 CASAVA_Build 6 103594785 1I CAGTATGTGG -/T CTGCAACCGA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 0 1 117848 CASAVA_Build 6 103600664 1D ACTCCACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 29 1 16 12 A 15 14 117849 CASAVA_Build 6 103609884 1I GAGGTTCTCA -/T TTTAGGGCTG 3070 hom 138 het 52 0 45 7 T 3 4 117850 CASAVA_Build 6 103613723 1I TGCTGGTGGG -/A ATGTAATTAG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 1 2 117851 CASAVA_Build 6 103615613 2I20M1I21M1D CATGTGTATG --TATATATATATTTCTTTTTC-TTTTTTGTTTTTTATTTTTTAT/TATATATATATATTTCTTTTTCTTTTTTTGTTTTTTATTTTTTA- TTTTTTCTTT 3070 hom 75 het 22 0 26 4 N/A 0 0 117852 CASAVA_Build 6 103616505 1D TATGCATTTA T/- TTAACAAATA 3070 hom 97 het 39 0 31 10 T 3 2 117853 CASAVA_Build 6 103620378 1I TTGAATCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 T 9 10 117854 CASAVA_Build 6 103620861 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAATTA 2889 hom 15 het 7 0 6 2 A 7 8 117855 CASAVA_Build 6 103621118 4D TGTCATCTCA ATTT/---- ATTTCTTTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 5 ATTT 2 1 117856 CASAVA_Build 6 103621928 1I TTTTTTTCCT -/C TGTTTTATCC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 0 1 117857 CASAVA_Build 6 103635357 1D GACCAGGAAA T/- TTTTTTTTTT 1725 het 1725 ref 41 31 4 6 T 12 11 117858 CASAVA_Build 6 103641093 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAATTCA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 7 6 117859 CASAVA_Build 6 103647933 1D TATAGTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 21 6 T 11 10 117860 CASAVA_Build 6 103648551 1I AGATCAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 707 hom 27 2 17 8 T 10 11 117861 CASAVA_Build 6 103650530 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 26 5 T 12 11 117862 CASAVA_Build 6 103651700 1I GGGCATTTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 405 hom 41 1 33 7 T 9 10 117863 CASAVA_Build 6 103667050 1I AATCCTTTAG -/C AAACTTCTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 117864 CASAVA_Build 6 103672542 2D TTCTTAGATA CT/-- CTGTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 CT 2 1 117865 CASAVA_Build 6 103680715 1D TAAATTTTAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 8 117866 CASAVA_Build 6 103684442 1I TATCGTGTCC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 8 9 117867 CASAVA_Build 6 103684607 4D TATGTATCTG TCTT/---- TCTATTATCT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TCTT 1 0 117868 CASAVA_Build 6 103719966 4I ACTTTTAATT ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 TG 7 9 117869 CASAVA_Build 6 103722989 2I CCAAAGAGAC --/TG TACTCTGCAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 TG 0 1 117870 CASAVA_Build 6 103726344 1I CATGACTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 T 11 12 117871 CASAVA_Build 6 103733098 8I ATAGAGACCA --------/GCAGTATT GCAGTATTTC 3070 het 3070 ref 63 27 26 10 GCAGTATT 1 2 117872 CASAVA_Build 6 103740150 4I AGGAAAGAAG ----/GAAA GAAAGAAAGA 1859 het 1859 ref 24 9 9 6 GAAA 3 4 117873 CASAVA_Build 6 103763544 1I AATTAAAAGA -/G GCTGAGAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 1 2 117874 CASAVA_Build 6 103765538 1D TATTCTCTAA T/- TTTTTAGTCA 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 T 6 5 117875 CASAVA_Build 6 103771412 1I AGACAAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 11 12 117876 CASAVA_Build 6 103795283 1D AAAAGCTGCA G/- ACACTCAATG 3070 hom 87 het 32 0 28 4 G 1 0 117877 CASAVA_Build 6 103801817 18D AATTAATATC GTGTGTGTGTGTGTGTGT/------------------ GTGTGTGTGT 3070 het 1945 hom 25 6 11 10 GT 18 9 117878 CASAVA_Build 6 103807127 1I AAACGCAAAT -/C AAAACCACAA 2659 hom 15 het 6 0 6 0 C 0 1 117879 CASAVA_Build 6 103809482 1D AAAGTGTGCA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 8 7 117880 CASAVA_Build 6 103812717 1D ATAAATAAAT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 8 7 117881 CASAVA_Build 6 103813451 1I CACTCAACAC -/T TTTCCAAAGT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 3 4 117882 CASAVA_Build 6 103819445 7D TTGCTCAAAA TTTCCAC/------- TTTCCAAGGT 3070 het 3070 ref 55 30 24 5 TTTCCAC 1 0 117883 CASAVA_Build 6 103820140 3I TCTATCTGAT ---/GAA GACAACTGCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GAA 0 1 117884 CASAVA_Build 6 103828278 1I TAATCTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 10 11 117885 CASAVA_Build 6 103829890 4D ATTAACAACC TTAA/---- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 31 15 14 3 TTAA 1 0 117886 CASAVA_Build 6 103831202 1I GACATTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 10 11 117887 CASAVA_Build 6 103831691 1D ACTCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 21 1 13 7 A 15 14 117888 CASAVA_Build 6 103832000 8I TGGGCATCTT --------/GTAATGAG GTAATGAGGC 3070 het 3070 hom 52 20 23 9 GTAATGAG 1 2 117889 CASAVA_Build 6 103836082 5D ATCCTAAATT AAGTA/----- AGTCTCTGAC 3070 het 3070 ref 36 23 12 3 AAGTA 1 0 117890 CASAVA_Build 6 103836639 1I AATTCCTCAT -/G TTTTAGCTCC 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 G 0 1 117891 CASAVA_Build 6 103840671 1I ACAATTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 10 11 117892 CASAVA_Build 6 103845518 1I TATGTTCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 10 11 117893 CASAVA_Build 6 103850125 1D GACCAGGTGG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 8 7 117894 CASAVA_Build 6 103853020 4I AATCATTTGT ----/CAAA CAAAGAATTT 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 CAAA 1 2 117895 CASAVA_Build 6 103856335 1I ATTTCTCCTC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 7 8 117896 CASAVA_Build 6 103861314 1D GTAACTCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 10 9 117897 CASAVA_Build 6 103868303 3I GTTATACTTT ---/CAG TCATTTACCT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 CAG 0 1 117898 CASAVA_Build 6 103880994 1I AATCATGTTT -/A AAGGTAATAA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 A 2 3 117899 CASAVA_Build 6 103883032 1I AAGATGATAG -/A AAAAAAGTTG 2120 het 2120 ref 19 13 5 1 A 6 7 117900 CASAVA_Build 6 103885969 1D ACTGAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 9 23 4 T 12 11 117901 CASAVA_Build 6 103888584 1I ATTTAGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 10 11 117902 CASAVA_Build 6 103888866 1D TATCGTGCAT G/- GGTACAGACA 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 G 3 2 117903 CASAVA_Build 6 103889755 1D CCAGATTAAC A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 8 7 117904 CASAVA_Build 6 103894645 2I CCTGATGACG --/CT CTCTTTCATT 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 CT 2 3 117905 CASAVA_Build 6 103895093 2D ATGTGAACTA TG/-- TGAGCATGGT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 TG 2 1 117906 CASAVA_Build 6 103896317 3I CCCAGGCTGG ---/TCT TCATCTCCTG 3070 het 3070 ref 44 23 12 9 TCT 0 1 117907 CASAVA_Build 6 103899359 2I TTAACAACAC --/AG AGGAATGAAA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 AG 1 2 117908 CASAVA_Build 6 103900292 2D48M3I ATTTTGCTGC ATATATATATATATAAGCAGCAATATCATTTTAAAATCATAAATCTGTAA---/--ATATATATATATAAGCAGCAATATCATTTTAAAATCATAAATCTGCAATCT TCTTATGATA 3070 het 3070 hom 43 18 29 12 N/A 0 0 117909 CASAVA_Build 6 103901135 1I TTATTGAGTC -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 A 6 7 117910 CASAVA_Build 6 103901300 3I TTTGAATAAC ---/ATT ATATTTAAAT 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 ATT 0 1 117911 CASAVA_Build 6 103903921 1D AAATTTTCTA T/- TTTTTTACAG 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 T 7 6 117912 CASAVA_Build 6 103909326 1D TTCTCCACTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 T 9 8 117913 CASAVA_Build 6 103913293 1I AAACCAAAAC -/A CAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 A 0 1 117914 CASAVA_Build 6 103913777 2I AATGAGAAAT --/AA CAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 34 0 29 5 A 0 2 117915 CASAVA_Build 6 103923276 1D CTTATGTATC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 9 8 117916 CASAVA_Build 6 103934855 5D AAATCATATA TTAAT/----- TTATTTCTAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 5 TTAAT 1 0 117917 CASAVA_Build 6 103936669 2I GGGGAAACTC --/AT ATATATGTGA 3070 het 3070 ref 51 23 24 4 AT 3 4 117918 CASAVA_Build 6 103936763 2I AATGAAAGTG --/AA AAAACACAAC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 4 6 117919 CASAVA_Build 6 103937697 1D GTAAGAACTT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 C 10 9 117920 CASAVA_Build 6 103976934 1D AAGCAGAGGT A/- AAAAAAAAAA 2003 het 2003 ref 36 12 7 17 A 17 16 117921 CASAVA_Build 6 104020927 2I GAGAAGCGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 TG 8 9 117922 CASAVA_Build 6 104022054 3I AAAGCACATG ---/TAT TATGCATATC 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 TAT 1 2 117923 CASAVA_Build 6 104032339 1D AATGTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 1447 het 1447 ref 30 24 4 3 T 15 14 117924 CASAVA_Build 6 104101260 1I9M2I5M4D7M2D GAGTGCTCCT -CCATGGAGC--ACTCCTGGATGTCTGGAA/CCCATGCAGCAGACTTC----TGCCTGG-- ACATCCAGAC 3070 het 3070 ref 19 12 8 6 N/A 0 0 117925 CASAVA_Build 6 104102749 42D ATATGGATAT GTATCTATCTATCTGTCTATCTAAAACCTGTTTATTTTTACA/------------------------------------------ TATGTTAATG 3070 het 3070 ref 31 27 13 3 GTATCTATCTATCTGTCTATCTAAAACCTGTTTATTTTTACA 1 0 117926 CASAVA_Build 6 104107136 2D AGAATAACAC AT/-- GTCTCCATTC 3070 het 3070 ref 53 26 19 9 AT 1 0 117927 CASAVA_Build 6 104108601 1I AAGTTCATAG -/C CCCCCCCGCC 3070 het 2888 hom 21 9 9 3 C 7 8 117928 CASAVA_Build 6 104110369 1I TGATGATCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 T 9 10 117929 CASAVA_Build 6 104110637 1I TCTAAAATGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 54 19 32 3 T 7 8 117930 CASAVA_Build 6 104115780 2D TGAATAATAG TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 10 8 117931 CASAVA_Build 6 104116792 1I TTTCAAGTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 T 9 10 117932 CASAVA_Build 6 104119523 2D CACAGCAAAC AG/-- AGTGATATTC 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 AG 2 1 117933 CASAVA_Build 6 104123844 3D AGGAGGCATA TGT/--- TGTTATTTTG 3070 het 3070 hom 35 11 20 5 TGT 2 1 117934 CASAVA_Build 6 104125091 2D TGTTGCTGAG TT/-- TTATATATAT 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 T 4 2 117935 CASAVA_Build 6 104125838 1D ACCCCAAATA T/- TTTTCCATAT 2748 het 2748 ref 26 16 7 3 T 5 4 117936 CASAVA_Build 6 104128890 1I CATTAATTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 8 9 117937 CASAVA_Build 6 104133603 4I GCGTGTGTGT ----/GTGC GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 GTGC 0 1 117938 CASAVA_Build 6 104136194 1D TTGGCTCTCT G/- TCTGTTATTG 2260 het 2260 ref 16 8 5 3 G 1 0 117939 CASAVA_Build 6 104141927 2D TGAAATAATC AT/-- ATGATTTTTG 3070 het 3070 ref 38 25 11 3 AT 2 1 117940 CASAVA_Build 6 104148059 1I TGTTTGTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 25 24 4 T 10 11 117941 CASAVA_Build 6 104149973 2D TTGTTTATGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 737 hom 46 6 23 19 A 11 9 117942 CASAVA_Build 6 104151021 3I AACTGGAATT ---/ACA ACAACTTATT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 ACA 1 2 117943 CASAVA_Build 6 104156405 1I GACTTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 16 10 T 10 11 117944 CASAVA_Build 6 104161005 1I ATAAAAAAAA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 6 7 117945 CASAVA_Build 6 104161273 3D TTAAACGTTC CTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2477 hom 27 9 13 5 CTT 1 0 117946 CASAVA_Build 6 104164930 1D AAGATACCTG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 A 8 7 117947 CASAVA_Build 6 104172787 4I CAAGTCATGT ----/TTTC TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 TTTC 1 2 117948 CASAVA_Build 6 104176060 1I CTCTCTTTCC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 7 8 117949 CASAVA_Build 6 104184817 1D TATGAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 12 11 117950 CASAVA_Build 6 104203526 4D TGGTACATTT CTCA/---- CTATTTTATA 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 CTCA 1 0 117951 CASAVA_Build 6 104209204 1D TTTTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 1629 het 838 hom 16 5 7 4 T 11 10 117952 CASAVA_Build 6 104223100 2I TTTCTTTTAT --/AG CTAAACTAGT 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 AG 0 1 117953 CASAVA_Build 6 104225290 4D CTTGGTCAGT CTAG/---- CTAATGGTTT 3070 het 3070 ref 22 13 8 2 CTAG 1 0 117954 CASAVA_Build 6 104233139 1D AATCCATCAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 9 8 117955 CASAVA_Build 6 104233399 1D CAAGTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 A 13 12 117956 CASAVA_Build 6 104237606 4D ATATCAAGAT AAGA/---- AAGAAACATT 3070 het 3070 ref 37 19 18 3 AAGA 2 1 117957 CASAVA_Build 6 104238919 4I AAGAAATGTG ----/ACAA ACAGAATTTT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 ACAA 0 1 117958 CASAVA_Build 6 104243479 9D AGGAAACTCA CTTATTCGT/--------- CTTATTCGTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 6 CTTATTCGT 2 1 117959 CASAVA_Build 6 104248956 21I ACCAACATAT ---------------------/TTTGAAAACTTTGACAAAAAA TGTTGCTACC 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 TTTGAAAACTTTGACAAAAAA 0 1 117960 CASAVA_Build 6 104249303 1I GTTTTAACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 21 21 10 A 10 11 117961 CASAVA_Build 6 104252154 2D CAAATGCAAG AT/-- ATGTGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 AT 2 1 117962 CASAVA_Build 6 104253131 4D AGCCTTACAT GAGA/---- GAGAGATAAA 3070 het 3070 ref 47 24 22 3 GA 5 3 117963 CASAVA_Build 6 104269619 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2723 hom 15 het 7 0 6 1 A 12 11 117964 CASAVA_Build 6 104275242 1I TAAAAGCTCC -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 6 7 117965 CASAVA_Build 6 104278931 1I CATTTGCACA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 T 1 2 117966 CASAVA_Build 6 104286317 2I GAAAATTTCA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 8 12 9 AT 7 8 117967 CASAVA_Build 6 104287583 1D GTAATCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 19 11 A 11 10 117968 CASAVA_Build 6 104287770 2I TAAGATATTT --/AC ACAGTTTCCA 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 AC 1 2 117969 CASAVA_Build 6 104298708 5D AATAAATAAT AATAA/----- AATAAAATTC 1929 het 1929 ref 16 12 4 1 AATAA 2 1 117970 CASAVA_Build 6 104305273 2I TCTCTCTCTG --/TC TCTGTCTCCC 3070 het 3070 ref 37 11 15 11 TC 1 2 117971 CASAVA_Build 6 104306506 1I TTATTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 T 15 16 117972 CASAVA_Build 6 104307522 1D CTAGGGAAGT A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 7 6 117973 CASAVA_Build 6 104309471 1I GCTGAAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 T 9 10 117974 CASAVA_Build 6 104310628 2I GAATAAAAAC --/AT ATAACTAAAG 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 AT 1 2 117975 CASAVA_Build 6 104316740 1I AATAAAGGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 9 10 117976 CASAVA_Build 6 104318158 4I TAACAATAAT ----/AACA AATAACCTGA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 AACA 0 1 117977 CASAVA_Build 6 104325245 1D TTGTGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2748 hom 37 11 18 8 T 17 16 117978 CASAVA_Build 6 104333289 2I TTTTTGAGGC --/AG AGTCTCACTC 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 AG 1 2 117979 CASAVA_Build 6 104337759 1D ACTCTTGCTG A/- AGGCATTTTC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 2 1 117980 CASAVA_Build 6 104338889 1I AATTCTGGGG -/C CCCCACCCCT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 C 4 5 117981 CASAVA_Build 6 104341208 3I TAATTTTTTC ---/TTG TTGTCTTTCT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 TTG 1 2 117982 CASAVA_Build 6 104342351 1I TGTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 9 10 117983 CASAVA_Build 6 104345318 1D TTGACCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 32 0 27 5 T 11 10 117984 CASAVA_Build 6 104364901 2I CGCACCAAAC --/AG AGAGAGAAGA 3070 het 3070 hom 52 19 25 8 AG 3 4 117985 CASAVA_Build 6 104381410 1I TTGGCTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1645 het 307 hom 14 1 10 3 A 15 16 117986 CASAVA_Build 6 104381568 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 31 1 26 4 A 11 12 117987 CASAVA_Build 6 104382307 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 10 9 117988 CASAVA_Build 6 104389186 2D TTCATTTCTC TA/-- TGAGTTCAAC 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 TA 1 0 117989 CASAVA_Build 6 104389973 1D AATTTGTCTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 T 7 6 117990 CASAVA_Build 6 104395110 2D AATCGTACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 123 het 53 0 42 15 AC 10 9 117991 CASAVA_Build 6 104395834 1I AAGGATTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1157 hom 42 3 33 6 T 10 11 117992 CASAVA_Build 6 104396387 4I ATATATATAT ----/ATAC ACACACACAC 3070 hom 23 het 27 0 19 8 ATAC 0 1 117993 CASAVA_Build 6 104401388 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCT 1954 het 1954 ref 14 6 6 2 A 5 4 117994 CASAVA_Build 6 104402727 1D CAGTGTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 11 10 117995 CASAVA_Build 6 104406306 1D AAAAGTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2860 hom 44 12 18 15 T 11 10 117996 CASAVA_Build 6 104412568 1I AATTAATGAT -/C CCCCCCACCC 3070 hom 60 het 24 0 19 5 C 6 7 117997 CASAVA_Build 6 104420176 1D CATAAAAAAA T/- TCTAACAACG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 1 117998 CASAVA_Build 6 104421755 3I CTCCAGCCTG ---/GGT GACAGAGCAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 GGT 0 1 117999 CASAVA_Build 6 104427794 1I AGTTATTATA -/T TTAATTTGGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 3 118000 CASAVA_Build 6 104431519 1I TCTCTTTCTG -/T TGTTAATTCC 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 T 1 2 118001 CASAVA_Build 6 104436797 1D GACACTCATA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 8 7 118002 CASAVA_Build 6 104478744 2D CACTAGACAC AA/-- ACAGTTGTAG 3070 hom 123 het 43 0 42 2 A 3 1 118003 CASAVA_Build 6 104482447 4D TTTGAGAATC AAAT/---- AATTATTGTA 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 AAAT 1 0 118004 CASAVA_Build 6 104492524 1D GCCGAGGGGG A/- TGGATCATGA 3070 het 1014 hom 14 3 10 1 A 1 0 118005 CASAVA_Build 6 104492886 2D ATTTATAAAG AA/-- AAGAGTTTCA 3070 hom 87 het 33 0 28 8 A 4 2 118006 CASAVA_Build 6 104498782 1D CTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1161 het 1161 ref 17 5 4 8 T 15 14 118007 CASAVA_Build 6 104507093 1D TTGTACCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 7 A 11 10 118008 CASAVA_Build 6 104507234 1I CTTATTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 A 13 14 118009 CASAVA_Build 6 104512863 1I CATAAATTAA -/T TTGTAAAATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 3 118010 CASAVA_Build 6 104519763 1I AGAAAAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 99 hom 32 1 26 5 T 10 11 118011 CASAVA_Build 6 104532871 2I GTTAAAAGTA --/CT TTAAGTATTT 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 CT 0 1 118012 CASAVA_Build 6 104544996 2D CATGTGGCAC AG/-- AGAGTCCTGT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AG 3 2 118013 CASAVA_Build 6 104568602 3D ATTTAACATG ATC/--- ATCATCTTTC 3070 hom 117 het 49 0 40 9 ATC 3 2 118014 CASAVA_Build 6 104573575 4D ACCTGGAACT GTTG/---- GTTGAGAAGG 3070 hom 78 het 33 0 25 8 GTTG 2 1 118015 CASAVA_Build 6 104575024 5D AGTATATGAT ATGAC/----- ATCACTCATT 3070 hom 48 het 17 0 17 2 ATGAC 1 0 118016 CASAVA_Build 6 104577846 3D GAAAAAAGAA AAG/--- AAATATATCA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 AAG 1 0 118017 CASAVA_Build 6 104581003 1D CGCCCGGCTA T/- TTTTTTTTGT 2896 hom 23 het 10 0 8 3 T 9 8 118018 CASAVA_Build 6 104581739 1D AAAATATAGG A/- AAAAAAATAC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 8 7 118019 CASAVA_Build 6 104591657 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 31 1 25 5 T 13 11 118020 CASAVA_Build 6 104591669 2D TTTTTTTTTT TG/-- TCCACTTCTA 3070 het 140 hom 34 5 26 6 TG 1 0 118021 CASAVA_Build 6 104592297 2D TTACTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 38 2 22 16 T 16 14 118022 CASAVA_Build 6 104594688 4I ACCTTAACAT ----/AGAA AGAAAGAGAG 3070 hom 111 het 39 0 37 3 AGAA 1 2 118023 CASAVA_Build 6 104597659 1I AGAACTACCA -/T TTTGACCCAG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 3 4 118024 CASAVA_Build 6 104599502 1D CATAAATGAC A/- AATAAAGCTA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 3 2 118025 CASAVA_Build 6 104599674 1I CAAGGAACAT -/G TGTATTTCAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 0 1 118026 CASAVA_Build 6 104599888 1D CCTGTCGCTT A/- ACCTGGATAT 3070 hom 138 het 52 0 47 6 A 2 1 118027 CASAVA_Build 6 104603135 1I CTCTCCCGTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 8 9 118028 CASAVA_Build 6 104608209 1D CCAGCAAAAA G/- GGGGGAAAAG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 G 6 5 118029 CASAVA_Build 6 104610047 1I CAACACAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 9 118030 CASAVA_Build 6 104618817 1I CTAACATAAC -/A AATTTGGTAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 2 3 118031 CASAVA_Build 6 104619927 1I ATGTATCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 558 hom 44 2 35 7 T 10 11 118032 CASAVA_Build 6 104621861 4D ATATATATAT ATAC/---- ATATGCTTCA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 ATAC 1 0 118033 CASAVA_Build 6 104626365 2D AGTGATTAAT AA/-- AGACAGAAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 3 1 118034 CASAVA_Build 6 104633177 1D TTTATAGTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 9 8 118035 CASAVA_Build 6 104639256 1D GTCCACCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1295 hom 30 7 19 5 A 15 14 118036 CASAVA_Build 6 104642162 1D AAGTCTGGCA C/- ATGGGAATGG 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 C 1 0 118037 CASAVA_Build 6 104646151 1D AATAAAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 10 12 2 A 10 9 118038 CASAVA_Build 6 104648388 1I11M1I TAATAATAAT -AAAAAAAATGC-/AAAAAAAAATGCA AAAAAAAAAG 3070 het 1647 hom 17 5 9 6 N/A 0 0 118039 CASAVA_Build 6 104653918 1I GAAAATCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 15 16 118040 CASAVA_Build 6 104654908 1I CTGAAAATAC -/A AAAAATACTA 651 het 651 ref 14 5 3 6 A 5 6 118041 CASAVA_Build 6 104655084 3I GCCGTCTCGG ---/AAA AAAAAAAAAA 2675 het 1662 hom 17 4 9 4 A 11 14 118042 CASAVA_Build 6 104657748 1D GCATTGTAGG T/- TCATCAGCTG 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 T 2 1 118043 CASAVA_Build 6 104660521 1D ATGCGTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 11 10 118044 CASAVA_Build 6 104664522 5D TAGAGAAAGT AAAGA/----- ATAGTTAAGT 3070 het 3070 hom 43 16 22 8 AAAGA 1 0 118045 CASAVA_Build 6 104665575 1I CTCATCTTGA -/C CAAAATGCAC 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 C 1 2 118046 CASAVA_Build 6 104670134 1I AATAACAGAT -/A TTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 0 1 118047 CASAVA_Build 6 104678972 2I TTTATAAGAT --/TC TGTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 TC 0 1 118048 CASAVA_Build 6 104690788 1I TTATAATGAG -/A AAAACCCAAT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 4 5 118049 CASAVA_Build 6 104692321 1D GTGGTTTTGA T/- TTGTATTTCT 3070 het 3070 ref 44 28 14 3 T 3 2 118050 CASAVA_Build 6 104692914 2D GGTGGCAGAC AA/-- GAGAGAGTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 A 2 0 118051 CASAVA_Build 6 104696416 1D TCTGAAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 8 8 T 12 11 118052 CASAVA_Build 6 104702213 4D CATCTTAATT TTTA/---- TTTATATCCC 3070 het 3021 hom 27 7 16 5 TTTA 2 1 118053 CASAVA_Build 6 104707464 1I TTGTAGAGAT -/C TTTTGCCTCC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 C 0 1 118054 CASAVA_Build 6 104709248 2I CTATGATTAA --/TG TGTGTCCTAT 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 TG 2 3 118055 CASAVA_Build 6 104710145 3I TTCTCAACAC ---/TCA TCATACTTAC 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 TCA 1 2 118056 CASAVA_Build 6 104761427 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2979 het 2979 ref 22 8 9 5 A 12 13 118057 CASAVA_Build 6 104792632 4D GAAATTGAAA ATCT/---- ATCAAAAACC 3070 het 3070 hom 35 13 20 3 ATCT 1 0 118058 CASAVA_Build 6 104844896 2I TCATATTTTT --/TC TTTTTCAATT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TC 0 1 118059 CASAVA_Build 6 104845401 1D CTAATCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 42 0 35 7 A 11 10 118060 CASAVA_Build 6 104849897 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 7 8 118061 CASAVA_Build 6 104858699 3I CAAGAACATA ---/AGT AGATTATATA 3070 hom 115 het 44 0 35 9 AGT 0 1 118062 CASAVA_Build 6 104859614 1D TCCTCCAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 62 het 38 1 32 5 A 10 9 118063 CASAVA_Build 6 104871009 1I GTGGTCTGCC -/A GAGGCAGAGC 3070 hom 135 het 46 0 46 0 A 0 1 118064 CASAVA_Build 6 104872201 1D TGATTTTTTT A/- AAAACCAAAT 3070 hom 120 het 41 0 41 0 A 5 4 118065 CASAVA_Build 6 104872971 1I GGACTACAGG -/C ACGTGCCACC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 118066 CASAVA_Build 6 104878977 4D CACCCTGCCT ATAC/---- ATACATACAC 3070 hom 126 het 48 0 42 7 ATAC 3 2 118067 CASAVA_Build 6 104884955 1I TTTCCTACTG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 111 het 47 0 38 9 A 8 9 118068 CASAVA_Build 6 104885359 1D TCTAATGGGT A/- AGAGGCCTTG 3070 hom 120 het 46 0 39 7 A 2 1 118069 CASAVA_Build 6 104893263 7I CTTTAAAAAA -------/AAAAAAG AAAAAAAGAA 3070 hom 31 het 32 1 28 3 AAAAAAG 0 1 118070 CASAVA_Build 6 104894427 26D AGTGAATAAC TATTAGCAATTATAATTGCTAATAAA/-------------------------- TATTAGCAAT 3070 hom 99 het 34 0 34 2 TATTAGCAATTATAATTGCTAATAAA 2 1 118071 CASAVA_Build 6 104896145 1I TGGTCCTTTG -/T TTTTTCCTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 5 6 118072 CASAVA_Build 6 104897612 2D GTAATATATA AT/-- ATATATATAA 3070 hom 36 het 13 0 12 2 AT 5 4 118073 CASAVA_Build 6 104907539 1D ACTAAGATTG T/- TTAGCATAAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 3 2 118074 CASAVA_Build 6 104913393 1D GGAGAGCTTT C/- CTTAATTACA 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 C 2 1 118075 CASAVA_Build 6 104938192 1I TCTAAAACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 10 118076 CASAVA_Build 6 104938914 1D ATGCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 11 10 118077 CASAVA_Build 6 104951950 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACTC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AG 2 1 118078 CASAVA_Build 6 104954514 5D TATATTTGCA TTTAT/----- ATTTTCTTTT 257 het 257 ref 42 34 3 5 TTTAT 1 0 118079 CASAVA_Build 6 104956169 1D77M1D AGAAAAAAAT GGTTTTTTTTTCAACAACAGAAGTTTGTGTCTAGGAGGAAACTCATCTAATTGGTCCAAGACCAGGCTGCTAAAATGCA/-GTTTTTTTTTCAACAACAGAAGTTTGTGTCTAGGAGGAAACTCATCTAATTGGTCCAAGACCAGGCTGCTAAAATGC- ATGTTTATTT 3070 hom 75 het 27 1 44 5 N/A 0 0 118080 CASAVA_Build 6 104962989 1D TTTTAAAGTT G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 G 5 4 118081 CASAVA_Build 6 104963853 2I AATCAATGTT --/AC AGTTTGTATG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AC 0 1 118082 CASAVA_Build 6 104965156 1I CATTTCTACT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 47 het 18 0 15 3 A 9 10 118083 CASAVA_Build 6 104971455 1D ACACTAAATT G/- CCTTAAGAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 1 0 118084 CASAVA_Build 6 104973527 3I TTTATTTATT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 69 het 29 0 20 9 TTG 3 4 118085 CASAVA_Build 6 104976255 3I AATTGTTTTT ---/AGG AGGAGAGTCT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 AGG 1 2 118086 CASAVA_Build 6 104977676 1D AACAAAAAAA C/- AGAAAGAAAA 3070 hom 69 het 24 0 23 1 C 1 0 118087 CASAVA_Build 6 104977955 3D AATTAGCAAG AGA/--- AGAAGAATAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AGA 3 2 118088 CASAVA_Build 6 104978985 4I GGAAGGAGGA ----/AGGG AGGGAGGGAG 3070 hom 76 het 35 0 25 10 AGGG 2 3 118089 CASAVA_Build 6 104981206 3I AGAAGATACT ---/TGA TGATTTTAAG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TGA 1 2 118090 CASAVA_Build 6 104984734 2D ACTCTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 10 0 8 2 A 16 14 118091 CASAVA_Build 6 104984991 2D AGATGTTGAG CA/-- CACAGCTTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CA 3 2 118092 CASAVA_Build 6 104990135 2I ATCTCTCTCT --/CA GTTGTCTTTA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 CA 0 1 118093 CASAVA_Build 6 104990782 1I GATGTTGAGA -/T TTTTTTCATA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 T 6 7 118094 CASAVA_Build 6 104995303 1I CTGTTCCTGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 100 hom 42 1 34 7 T 8 9 118095 CASAVA_Build 6 105000355 2D AAGCACAATA AC/-- AATAAAAATT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AC 1 0 118096 CASAVA_Build 6 105006148 2I TTAATATAAT --/TA TATATATAAA 1554 hom 10 het 4 0 4 0 TA 4 5 118097 CASAVA_Build 6 105012121 1D TAATGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 15 14 118098 CASAVA_Build 6 105036464 1D GCAAAATGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 38 0 31 8 A 10 9 118099 CASAVA_Build 6 105049980 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 17 0 14 4 A 13 12 118100 CASAVA_Build 6 105078132 1D ACCTGGGACC A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 8 7 118101 CASAVA_Build 6 105083120 1I GAATGATCCT -/A GGGGCAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 118102 CASAVA_Build 6 105161918 1I CTGGGCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 12 13 118103 CASAVA_Build 6 105248199 1I GTTATATCAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 9 10 118104 CASAVA_Build 6 105271164 6D AAGCTGAGGT AGGAGA/------ AGGAGAATTG 3070 het 1650 hom 16 5 11 1 AGGAGA 2 1 118105 CASAVA_Build 6 105274112 4D AATAATAAAG AGAC/---- AGCAGGAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 AGAC 1 0 118106 CASAVA_Build 6 105276180 2D GACTTCTCCC CT/-- TTTAGCCTCT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 CT 1 0 118107 CASAVA_Build 6 105278204 3D AAAGTGAATT TTG/--- TTGTCTAAGA 3070 het 3070 hom 52 24 24 4 TTG 2 1 118108 CASAVA_Build 6 105279810 2I TTTATATATA --/TG TGTATGTGTA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 TG 1 2 118109 CASAVA_Build 6 105286438 1D ATTCCCATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 A 13 12 118110 CASAVA_Build 6 105291690 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1815 het 1220 hom 11 3 6 2 A 13 12 118111 CASAVA_Build 6 105298405 5D ATTAAAATAT TAAAA/----- TAATATACAA 3070 het 2891 hom 18 7 11 1 TAAAA 1 0 118112 CASAVA_Build 6 105302817 1I CAGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 9 10 118113 CASAVA_Build 6 105319176 3D TCTATAGGCA CTT/--- CTTCTTCAGT 3070 het 3070 ref 48 32 14 2 CTT 3 2 118114 CASAVA_Build 6 105323194 1I TTATTGTGAG -/A AAATGTTTAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 3 4 118115 CASAVA_Build 6 105326274 1I ACAAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 15 16 118116 CASAVA_Build 6 105326442 1I CCTCAAACTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 A 9 10 118117 CASAVA_Build 6 105332197 1I TTATTCTCAA -/T TTCTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 2 3 118118 CASAVA_Build 6 105333199 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 802 het 802 ref 26 20 2 4 A 13 12 118119 CASAVA_Build 6 105340976 1I CCTTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 14 3 A 12 13 118120 CASAVA_Build 6 105351743 1I TCACAAAAAC -/T TTTCTCAATG 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 T 3 4 118121 CASAVA_Build 6 105352638 1D CCCCGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2374 hom 23 6 9 8 A 14 13 118122 CASAVA_Build 6 105354478 19I GGAGGGTGAG -------------------/CCAAAGTAGGGCGGGGCAT CACCTCACTT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 CCAAAGTAGGGCGGGGCAT 0 1 118123 CASAVA_Build 6 105366689 1D GAAAACCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2656 hom 24 9 12 3 A 11 10 118124 CASAVA_Build 6 105378073 1I TACTTTTCTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 7 8 118125 CASAVA_Build 6 105379645 1D GCAAGACTCC G/- TCTCAAAAAA 1518 het 28 hom 8 0 5 3 G 1 0 118126 CASAVA_Build 6 105390111 15D AAGTACAAAG AAAAGAAATGAGAAA/--------------- AAGTAGGAAA 3070 het 3070 hom 34 17 18 2 AAAAGAAATGAGAAA 1 0 118127 CASAVA_Build 6 105398673 4D CGGATCTTTG CTCA/---- CTCACTGCAA 3070 hom 41 het 21 0 14 7 CTCA 2 1 118128 CASAVA_Build 6 105406299 1D AATTTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 A 11 10 118129 CASAVA_Build 6 105406956 2I AAAAAAAAAC --/AG AAAGAGTTCA 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 AG 0 1 118130 CASAVA_Build 6 105421531 1I TAATTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 33 1 28 4 T 11 12 118131 CASAVA_Build 6 105422079 1I GAAGTAACAA -/G GGCCCCGCAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 2 3 118132 CASAVA_Build 6 105448708 1I TATTTCTCTT -/C TTTTAGGGAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 118133 CASAVA_Build 6 105454679 1D TTGAAATCCT G/- GACTCAAGGG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 2 1 118134 CASAVA_Build 6 105457935 1I AAATTGGGTT -/A TTTTTTCTCT 3070 hom 74 het 31 0 21 10 A 0 1 118135 CASAVA_Build 6 105458257 1D ATGATCCCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 53 hom 34 1 26 7 T 10 9 118136 CASAVA_Build 6 105468947 1D AATGATATAA T/- CTTACATTTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 1 0 118137 CASAVA_Build 6 105469087 1D AACAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 13 12 118138 CASAVA_Build 6 105483180 1I AAATATAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 35 1 25 9 T 10 11 118139 CASAVA_Build 6 105486862 1D ATGGAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 27 2 13 12 T 17 16 118140 CASAVA_Build 6 105493210 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 914 hom 33 2 21 10 A 13 12 118141 CASAVA_Build 6 105497476 4I GGTGCTTCTC ----/AATT AATAGATCTG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 AATT 0 1 118142 CASAVA_Build 6 105498698 1D ATTTCATAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 49 0 36 13 T 10 9 118143 CASAVA_Build 6 105521903 1I ATCCCAGCAC -/T TTTGGGAGGC 3070 hom 67 het 27 0 23 4 T 3 4 118144 CASAVA_Build 6 105540938 4D TTGGCCTTTT TATC/---- TATCCTTGCT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TATC 2 1 118145 CASAVA_Build 6 105544274 6D CAATTCTCAT GCCTCA/------ GCCTGAGTAG 3070 hom 36 het 15 0 13 3 GCCTCA 1 0 118146 CASAVA_Build 6 105554257 1D AAGGAAGTTC T/- TTTTTTTTGG 959 het 959 ref 58 44 3 11 T 9 8 118147 CASAVA_Build 6 105554734 2D GGTCTTAAAA TG/-- TTCAATTCTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TG 1 0 118148 CASAVA_Build 6 105591221 2I CCAAGATGCC --/TT ATTGGAATGG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 0 2 118149 CASAVA_Build 6 105591527 4D CCTCTAATAT TAAG/---- TATGTAGATG 3070 het 3070 hom 38 15 18 8 TAAG 1 0 118150 CASAVA_Build 6 105595429 1D ATTTTCTTAT A/- TCTTTAAATT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 1 0 118151 CASAVA_Build 6 105604454 2D ATTTTGAGCC TA/-- TGTGTGTCTC 3070 hom 20 het 18 0 14 4 TA 1 0 118152 CASAVA_Build 6 105606303 1I TCAGTTTCTC -/A TCTGTAAATT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 0 1 118153 CASAVA_Build 6 105608615 4D CCCAGCCTAC TGTT/---- TGTTTGTTTC 3070 hom 45 het 19 0 16 4 TGTT 3 2 118154 CASAVA_Build 6 105610830 4I TGCGTAGTAA ----/TTTT TTTTTTTATT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 7 11 118155 CASAVA_Build 6 105613788 1D TATATATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 35 1 29 6 T 11 10 118156 CASAVA_Build 6 105637370 1I GTACTGTGAG -/A AAGTATTATG 3070 het 3070 ref 44 33 9 2 A 2 3 118157 CASAVA_Build 6 105645605 2I GCTTTTTAAA --/AT ATATATATAC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 AT 4 5 118158 CASAVA_Build 6 105648603 1D ACCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1479 het 1479 ref 29 14 4 11 A 16 15 118159 CASAVA_Build 6 105651191 1D CTTCTGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 26 1 18 8 T 11 10 118160 CASAVA_Build 6 105654922 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 1134 het 419 hom 6 1 3 4 A 7 6 118161 CASAVA_Build 6 105660313 1D TTTTCATTAA T/- TTTACGTACT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 4 3 118162 CASAVA_Build 6 105661361 1I AGAAGGCCTT -/A AAAAACCTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 5 6 118163 CASAVA_Build 6 105664821 1I AGCTGAATAT -/C CCCAAACAAG 3070 hom 129 het 49 0 42 7 C 3 4 118164 CASAVA_Build 6 105665257 1I CACAACAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 125 het 46 0 42 4 T 9 10 118165 CASAVA_Build 6 105667054 1I TGTAATTCTG -/T AAGTAATCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 118166 CASAVA_Build 6 105667508 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 26 10 T 10 11 118167 CASAVA_Build 6 105669062 1I AAAGTTACAA -/G ATCATTTACA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 118168 CASAVA_Build 6 105683804 1D TTTCAGGCAT A/- ATGTAAACAG 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 2 1 118169 CASAVA_Build 6 105691964 1D CTTGTTTGGG C/- ATGAGTGGGG 3070 hom 48 het 17 0 15 2 C 1 0 118170 CASAVA_Build 6 105694109 3D TGAATTAGTT ATC/--- ATAAGATTTG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 ATC 1 0 118171 CASAVA_Build 6 105704354 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 83 het 34 0 25 9 A 7 8 118172 CASAVA_Build 6 105707079 9D TCTCTAACAG TGAAGAAGA/--------- TATAGACTAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TGAAGAAGA 1 0 118173 CASAVA_Build 6 105709908 1D AGGTTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 16 9 T 11 10 118174 CASAVA_Build 6 105712580 4D TGCACATTTA AAAT/---- AAATAATTGC 3070 hom 117 het 42 0 40 3 AAAT 2 1 118175 CASAVA_Build 6 105715020 4I GACCTCAAGT ----/GACC GACCCACTAG 3070 hom 25 het 15 0 9 6 GACC 1 2 118176 CASAVA_Build 6 105726740 1D CAATGAACTC A/- AAACAAATTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 4 3 118177 CASAVA_Build 6 105728425 1D TCATAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 11 10 118178 CASAVA_Build 6 105731132 1D TTGACATATC G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 G 1 0 118179 CASAVA_Build 6 105740707 8D ATTTTGTATC TATATTTA/-------- TATATTTATA 3070 het 3070 ref 30 15 13 4 TATATTTA 2 1 118180 CASAVA_Build 6 105756092 1D CACCTCTACC T/- TATCACTCAG 3070 hom 54 het 22 0 19 4 T 2 1 118181 CASAVA_Build 6 105812625 5I TCAGATTATT -----/TAATC TAACTTCCTT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 TAATC 0 1 118182 CASAVA_Build 6 105819118 1I CTGAGCTTGA -/G GATATATCAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 1 2 118183 CASAVA_Build 6 105848170 2D TTCAATTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 2981 het 2058 hom 34 10 8 17 A 18 16 118184 CASAVA_Build 6 105921290 2I TAAACTGTGG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 53 21 21 11 CA 5 6 118185 CASAVA_Build 6 105922515 1D GTGGCAGCAG T/- TTTTTTTACT 3070 het 2564 hom 31 8 17 7 T 8 7 118186 CASAVA_Build 6 105929294 2D AAATAAAACA TT/-- TTGATTTGAA 3070 het 1455 hom 20 3 11 7 T 4 2 118187 CASAVA_Build 6 105936425 1D AAAATCTGTT A/- CAAGGGTAGC 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 A 1 0 118188 CASAVA_Build 6 105941785 1I CCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2915 het 2915 ref 20 11 7 2 A 10 11 118189 CASAVA_Build 6 105942753 1D CTCTTCTCTT A/- ACTGCTGCAA 3070 het 3070 ref 52 27 17 8 A 2 1 118190 CASAVA_Build 6 105945716 3D AGGGCTGAGG CCT/--- CAAGTGGATC 1516 het 1516 ref 13 8 5 0 CCT 1 0 118191 CASAVA_Build 6 105948492 2I GGTATTTTAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 12 14 118192 CASAVA_Build 6 105949511 9D AAAGTGCTTG TTTGGGACA/--------- TTTGGGACAT 3070 het 3070 ref 41 26 13 3 TTTGGGACA 2 1 118193 CASAVA_Build 6 105950153 6D ATACTCCAAT GTCTTA/------ GTTTCTATCA 3070 het 3070 hom 47 21 22 7 GTCTTA 1 0 118194 CASAVA_Build 6 105955537 1I ACCTTAATGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 A 9 10 118195 CASAVA_Build 6 105967026 6D TAATGATAAA GAGGTT/------ GATCATTTAT 3070 het 3070 ref 40 25 12 4 GAGGTT 1 0 118196 CASAVA_Build 6 105980392 5D CCCCAGAACC TAAAA/----- TAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 13 TAAAA 4 3 118197 CASAVA_Build 6 106029608 1I AAGGCATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1852 hom 36 5 26 5 A 12 13 118198 CASAVA_Build 6 106033626 4I AAAATTTTTT ----/TTTG TTTTTTGTTT 3070 het 3045 hom 36 15 12 9 TTTG 0 1 118199 CASAVA_Build 6 106045141 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 865 het 865 ref 16 5 4 7 A 19 18 118200 CASAVA_Build 6 106048333 1I AAAGCAAAAC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 A 7 8 118201 CASAVA_Build 6 106048696 1D ACATTGATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 23 8 T 11 10 118202 CASAVA_Build 6 106054177 1I TAGTTGTGTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 7 8 118203 CASAVA_Build 6 106067608 1D AGAATCACCT G/- GGAAGTTTGG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 G 3 2 118204 CASAVA_Build 6 106080334 2D AATTAATGAC TT/-- ATTGTTTATT 3070 het 3070 ref 41 22 12 8 T 2 0 118205 CASAVA_Build 6 106081631 1D ATTTTCATTC T/- TATAGGAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 T 2 1 118206 CASAVA_Build 6 106083763 2D TTTCTGATGG AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 A 10 8 118207 CASAVA_Build 6 106093875 1D AGTAAAATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 A 10 9 118208 CASAVA_Build 6 106103922 3D CCCAGTCCAT CTC/--- CTCCACTCTG 3070 hom 87 het 32 0 27 7 CTC 2 1 118209 CASAVA_Build 6 106173242 1D GTTTTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 16 15 118210 CASAVA_Build 6 106174617 1I AATTTAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 10 11 118211 CASAVA_Build 6 106176569 2I GGTCCTGAAC --/AG AGTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 AG 1 2 118212 CASAVA_Build 6 106214920 1I CCCACCAGGT -/C CCCCCCCCTC 2866 het 2866 ref 27 11 10 6 C 8 9 118213 CASAVA_Build 6 106220316 1D GGAGTACCAT G/- AAGCAGTTAG 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 G 1 0 118214 CASAVA_Build 6 106236119 4I TCAAGCATAT ----/AAAG AAACAGGAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 AAAG 0 1 118215 CASAVA_Build 6 106255527 4D AATCCAAATC TGTT/---- TGACTCAATA 3070 hom 108 het 39 0 37 7 TGTT 1 0 118216 CASAVA_Build 6 106256892 3I ATTTATGATG ---/GAT GATGATGATG 3070 hom 140 het 55 0 46 9 GAT 3 4 118217 CASAVA_Build 6 106263177 1I AACCAGTGTG -/C CTAGAGTAAG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 C 1 2 118218 CASAVA_Build 6 106263944 1I GATACATATC -/T TTTTTTGGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 118219 CASAVA_Build 6 106264311 5I ACGTACACAA -----/ATCAT AAGTATACAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATCAT 0 1 118220 CASAVA_Build 6 106267777 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 538 hom 22 2 13 7 A 14 13 118221 CASAVA_Build 6 106267949 1D CAAAAAAAAA C/- ACAAAAAACC 3070 het 320 hom 30 1 28 1 C 1 0 118222 CASAVA_Build 6 106278459 1D ATGCAAATGC A/- AAAATAGAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 4 118223 CASAVA_Build 6 106280302 1D GATGTGAGGT G/- TTATATGTAT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 G 1 0 118224 CASAVA_Build 6 106280778 1D TAAAGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 956 hom 23 6 11 6 A 17 16 118225 CASAVA_Build 6 106285352 2I AAACTGAGAC --/AG GGGAACTGCT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AG 0 1 118226 CASAVA_Build 6 106285779 1D13M4D ATAAATACAG AAAAAAAATCCAACTTGA/-AAAAAAATCCAAC---- TTATTTAAAA 3070 hom 117 het 38 0 40 2 N/A 0 0 118227 CASAVA_Build 6 106292337 1I TAGCCTGAAG -/C CTCAGGAAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 2 118228 CASAVA_Build 6 106296244 1I TGAAAAAAAA -/C GACACAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 C 0 1 118229 CASAVA_Build 6 106296560 1I TTTCTTTTCA -/T TTTTTGAGAA 3070 het 71 hom 46 1 41 4 T 5 6 118230 CASAVA_Build 6 106299281 2D CTCAAAATGA CT/-- CTTTCATGTG 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 CT 2 1 118231 CASAVA_Build 6 106301831 1D ACATATATAG T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 40 18 18 5 T 7 6 118232 CASAVA_Build 6 106305350 1D ACACATCTTT G/- GGGGGGACAC 3070 hom 129 het 52 0 44 9 G 7 6 118233 CASAVA_Build 6 106320556 1D AAGTCTCAAG T/- TTAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 3 2 118234 CASAVA_Build 6 106327643 1I CCCTTTATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 10 11 118235 CASAVA_Build 6 106328817 1D TGTATACATA C/- ATATGATAAA 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 C 1 0 118236 CASAVA_Build 6 106343820 2I GACACTGAGA --/CT CTCCCAGGGA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 CT 1 2 118237 CASAVA_Build 6 106346561 1I AGGGTAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 9 10 118238 CASAVA_Build 6 106354255 3D GTATATGCTC CTG/--- CTGATTAACC 3070 hom 126 het 48 0 43 6 CTG 2 1 118239 CASAVA_Build 6 106365109 1I TACCATGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 11 12 118240 CASAVA_Build 6 106365506 1I ATGGCACATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 25 2 12 11 A 0 1 118241 CASAVA_Build 6 106379971 4I TTTATCTGAC ----/TTGT TTGTCTGATG 3070 het 3070 hom 50 17 26 7 TTGT 1 2 118242 CASAVA_Build 6 106411780 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 7 A 11 10 118243 CASAVA_Build 6 106429907 3D CTCAAGCAAC AAG/--- AAGAGCCAGG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 AAG 2 1 118244 CASAVA_Build 6 106430338 1I TTGAAGAAAA -/G AAAAATCACT 3070 het 3070 hom 46 12 27 7 G 0 1 118245 CASAVA_Build 6 106441330 2D TTTTGTTCAT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 33 3 18 12 TA 1 0 118246 CASAVA_Build 6 106444596 1D GTATCTATGG C/- TATGTGCTCA 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 C 1 0 118247 CASAVA_Build 6 106454627 1D AAGCACATTG T/- TAAGTAATGC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 2 1 118248 CASAVA_Build 6 106455744 3I TGTTTCTATT ---/TTG TTATTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTG 0 1 118249 CASAVA_Build 6 106455864 1D TTGATCCTGA T/- TTTTTCATCC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 6 5 118250 CASAVA_Build 6 106464176 55D TTATATGAAT GAATGTGCATGGCTGTGTTTCAATAAAACTTTATTTGCAAAAATGGTAGGCCAGA/------------------------------------------------------- TCTGGCCCAC 3070 het 3070 ref 28 26 9 5 GAATGTGCATGGCTGTGTTTCAATAAAACTTTATTTGCAAAAATGGTAGGCCAGA 1 0 118251 CASAVA_Build 6 106472162 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 28 3 21 5 A 11 10 118252 CASAVA_Build 6 106473143 2D GCTAATTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 24 0 20 5 T 11 9 118253 CASAVA_Build 6 106504138 1I GTCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1003 hom 20 5 12 3 T 11 12 118254 CASAVA_Build 6 106513553 1I TACTGATGGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 7 8 118255 CASAVA_Build 6 106538051 1D GGATGCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1188 hom 31 4 20 7 T 13 12 118256 CASAVA_Build 6 106542415 1I ATAGCTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 33 1 22 10 T 14 15 118257 CASAVA_Build 6 106548940 1D TTGCGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 14 7 A 12 11 118258 CASAVA_Build 6 106557586 1I GTTCTTTTTC -/T TTTTTTGTAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 6 7 118259 CASAVA_Build 6 106563054 10D GGGCACCAGA TCCCCACCCT/---------- TTCACACTCT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 TCCCCACCCT 1 0 118260 CASAVA_Build 6 106578042 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 21 2 A 15 14 118261 CASAVA_Build 6 106578710 1I ACCGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 39 1 33 5 A 10 11 118262 CASAVA_Build 6 106585565 1D GTATTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 19 1 13 5 T 15 14 118263 CASAVA_Build 6 106587640 1D ACATGGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 34 1 27 6 T 11 10 118264 CASAVA_Build 6 106590403 1D AATCTTTGTC T/- TTTGATTGGA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 4 3 118265 CASAVA_Build 6 106595796 1I GTCATTGTTC -/T TTTGAGAGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 3 4 118266 CASAVA_Build 6 106605626 1I AATAAAAAAA -/T ATTACTAGAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 1 118267 CASAVA_Build 6 106606777 18I TAAAGAAATA ------------------/TCAGTTATTATAATATTG TTCAAAGACA 3070 hom 99 het 34 0 32 5 TCAGTTATTATAATATTG 0 1 118268 CASAVA_Build 6 106611443 1D TGTTATTTGG C/- TTGGGAAGGT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 C 1 0 118269 CASAVA_Build 6 106625164 1D CAAAGGTTAT A/- AATCTCTAAG 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 3 2 118270 CASAVA_Build 6 106645774 1I GACTGCTTGC -/A ACTCAAGAGG 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 A 1 2 118271 CASAVA_Build 6 106675609 4D ACATTTATTA CCTG/---- CCTATTATAC 3070 het 3070 hom 39 14 21 5 CCTG 1 0 118272 CASAVA_Build 6 106676500 1D AAACTCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 36 1 27 8 T 14 13 118273 CASAVA_Build 6 106680141 1I TTTATGTGGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 8 9 118274 CASAVA_Build 6 106694123 1I ATTTTTCACG -/T AGTGATAATC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 0 1 118275 CASAVA_Build 6 106702166 13D ACAAAGACTT AAGAACAACAACG/------------- ACTTAAGAAC 3070 hom 114 het 38 0 38 3 AAGAACAACAACG 1 0 118276 CASAVA_Build 6 106704932 1D TTTGGCTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 56 het 21 0 19 2 A 10 9 118277 CASAVA_Build 6 106705964 3D TGCACATATT CAA/--- CAACAATAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CAA 3 2 118278 CASAVA_Build 6 106780309 1I AAAACCTCCC -/T TCATAGGACA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 1 2 118279 CASAVA_Build 6 106804624 1D AAGCAACTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 9 8 118280 CASAVA_Build 6 106831275 1D CCTACTTAAC T/- GTCTAATTAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 1 0 118281 CASAVA_Build 6 106875194 1D GGCTGTTCTG A/- AAAAAAAAAA 2079 het 2079 ref 41 26 5 10 A 13 12 118282 CASAVA_Build 6 106885932 1I GCCCTTCCCC -/T GTCTCTTTCC 3070 hom 77 het 30 0 25 5 T 0 1 118283 CASAVA_Build 6 106891806 1D AAAATAGAAC A/- AAAAGTAGAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 5 4 118284 CASAVA_Build 6 106901824 2D TTGCTTTGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 22 0 15 9 A 13 11 118285 CASAVA_Build 6 106910834 1I TTCCAAACTA -/C CAGACTAAGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 1 2 118286 CASAVA_Build 6 106912116 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2949 het 518 hom 10 2 8 0 A 11 12 118287 CASAVA_Build 6 106914024 2I GCCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 21 0 16 5 T 10 12 118288 CASAVA_Build 6 106918710 1D TTGGCCAACA T/- AGTGAAACCT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 1 0 118289 CASAVA_Build 6 106918903 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 5 A 11 10 118290 CASAVA_Build 6 106920249 1D AGAACCTGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 32 0 25 8 T 9 8 118291 CASAVA_Build 6 106922368 2D CTGCTTATCC AA/-- AAAAAAAAAA 1416 het 10 hom 17 1 7 9 A 18 16 118292 CASAVA_Build 6 106941204 21I AGATTCTCAT ---------------------/AAGGAGCATGCAAATTCTCAC AAGGAGCATG 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 AAGGAGCATGCAAATTCTCAC 0 1 118293 CASAVA_Build 6 106945169 1I CCTACGCCCC -/T GTCATGAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 0 1 118294 CASAVA_Build 6 106946138 1I ACCATCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 37 1 31 5 T 10 11 118295 CASAVA_Build 6 106947990 1D TAAGTTCCCT G/- GGGCATTCCT 3070 hom 125 het 49 0 41 9 G 4 3 118296 CASAVA_Build 6 106948249 3D TTCCTCTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 28 1 15 12 T 17 14 118297 CASAVA_Build 6 106955978 2D TTTTTAATTT TC/-- TTTTTTTATT 741 hom 12 het 11 0 5 6 TC 1 0 118298 CASAVA_Build 6 106961780 1D TATGGAAAGC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 9 8 118299 CASAVA_Build 6 106961968 1D TTCTTAGACA C/- CTACAAAGAG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 2 1 118300 CASAVA_Build 6 106976540 1D AGAACAGCAT G/- GGAAAGACCC 3070 hom 93 het 32 0 31 1 G 3 2 118301 CASAVA_Build 6 106977152 1I CCACCCCCCT -/C CCCAGCCTCC 3070 hom 67 het 25 0 17 8 C 3 4 118302 CASAVA_Build 6 106983687 1I CATTTTAACC -/T TTTGGCAAAA 3070 hom 144 het 52 0 48 4 T 3 4 118303 CASAVA_Build 6 106983963 2D TCCCACATCC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AT 7 6 118304 CASAVA_Build 6 106987085 1I CCTACCCCCC -/G AGGGAGTTAA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 G 0 1 118305 CASAVA_Build 6 106990749 4D TTCGGAAAAT ACAG/---- AAAGAACAGA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 ACAG 1 0 118306 CASAVA_Build 6 106991165 2I CCGGCCGCAA --/TC TCTTATTCTA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TC 1 2 118307 CASAVA_Build 6 106991245 2I TCCATAATAT --/AG GGACATGCAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AG 0 1 118308 CASAVA_Build 6 106991477 1D ATTAATATAA C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 28 8 16 5 C 8 7 118309 CASAVA_Build 6 107004639 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 7 6 118310 CASAVA_Build 6 107015665 1D TGATCCCTTT G/- GTTAAAGTAA 3070 hom 101 het 39 0 34 5 G 2 1 118311 CASAVA_Build 6 107019061 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 588 hom 18 2 11 5 A 16 17 118312 CASAVA_Build 6 107026372 1D CCAGACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 13 12 118313 CASAVA_Build 6 107027308 1D ACAAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 17 1 12 4 A 15 14 118314 CASAVA_Build 6 107028622 1D ACTTAGAGTA G/- GATTGGAAAA 3070 hom 151 het 53 0 50 3 G 2 1 118315 CASAVA_Build 6 107037349 1D TCTCAAAAAA T/- AATAATCATA 2225 het 2225 ref 19 9 7 3 T 1 0 118316 CASAVA_Build 6 107039038 2D GGCATGTGCC CA/-- CCCACACCCA 3070 hom 66 het 23 0 22 1 CA 1 0 118317 CASAVA_Build 6 107045466 1D CTTGTACTTC A/- AAAAAATGTG 3070 hom 126 het 45 0 42 3 A 7 6 118318 CASAVA_Build 6 107054084 4D TTTAATTGAC AAAT/---- AATTTTATAT 3070 hom 57 het 20 0 20 1 AAAT 1 0 118319 CASAVA_Build 6 107057389 1I AAGAAGGGCT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 91 het 35 0 31 4 A 8 9 118320 CASAVA_Build 6 107059220 14D TGTGTGTGTT TGTGTGTGTGTATA/-------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TGTGTGTGTGTATA 1 0 118321 CASAVA_Build 6 107062875 1I TCCCAGGGGG -/A AAAACTCTGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 4 5 118322 CASAVA_Build 6 107063558 2I ATCAAGCGTC --/TT TGCTGCATGG 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 1 3 118323 CASAVA_Build 6 107072733 4D CTATTCAAAA TATT/---- TAATTATGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 6 TATT 1 0 118324 CASAVA_Build 6 107076919 1D TAGGGAAATA T/- TTTTTTTACC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 7 118325 CASAVA_Build 6 107078294 1I GGGGGCCCTT -/A ATGGCCTTTT 3070 het 405 hom 17 3 13 1 A 1 2 118326 CASAVA_Build 6 107080393 1I AACAATAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 8 9 118327 CASAVA_Build 6 107085101 1D13M1D TATAGGAAAT GGGGGGGGATTGAAT/-GGGGGGGATTGAA- TTTTTAATGT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 N/A 0 0 118328 CASAVA_Build 6 107085236 1D TGATATTTCT G/- GGGGGGGATG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 8 7 118329 CASAVA_Build 6 107088919 15I CATTTCTGTT ---------------/GTCATTAGGACAGTG GAACACTGCC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 GTCATTAGGACAGTG 0 1 118330 CASAVA_Build 6 107090797 4D AGGTTCAGGC CAAA/---- CAGTTTTGGC 3070 hom 138 het 49 0 46 3 CAAA 1 0 118331 CASAVA_Build 6 107092730 6D CTATGTTTGT TTATGA/------ AGCAGGTACA 3070 hom 93 het 37 0 32 12 TTATGA 1 0 118332 CASAVA_Build 6 107093461 1I AGACTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 837 hom 29 2 20 7 A 14 15 118333 CASAVA_Build 6 107094272 1D GCTATAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 33 2 15 18 A 17 16 118334 CASAVA_Build 6 107095259 1D TCCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1110 het 1110 ref 33 24 3 6 T 11 10 118335 CASAVA_Build 6 107100256 1I CTCCTAACTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 22 0 16 6 T 9 10 118336 CASAVA_Build 6 107109761 2D GAAAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 16 1 12 3 A 14 12 118337 CASAVA_Build 6 107109866 4I AAGTCAATAT ----/AGTA AGTATTTTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AGTA 1 2 118338 CASAVA_Build 6 107112730 1D CCTTGTCCCA G/- TGAAAATGGC 3070 hom 102 het 36 0 33 3 G 1 0 118339 CASAVA_Build 6 107112809 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCTGTTTT 3070 het 327 hom 36 1 30 5 C 5 4 118340 CASAVA_Build 6 107117062 5I AATAATATAC -----/TTTAT TTTAATTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTTAT 0 1 118341 CASAVA_Build 6 107119182 1D TGGGGTGGGG C/- CTGATAATTC 3070 hom 98 het 35 0 32 3 C 2 1 118342 CASAVA_Build 6 107119889 2I ACTTCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 12 14 118343 CASAVA_Build 6 107143847 3I AAGAAGAAGG ---/AGA AGAAGAAGAA 2736 hom 18 het 10 0 7 3 AGA 3 4 118344 CASAVA_Build 6 107150069 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2440 het 584 hom 26 4 9 13 T 15 14 118345 CASAVA_Build 6 107150607 3D TGTAATGGTC ATT/--- ATTATTACTG 3070 hom 120 het 48 0 41 8 ATT 3 2 118346 CASAVA_Build 6 107150775 3D CTACTTCTCT AAG/--- AAGCCCTGCC 3070 hom 138 het 50 0 47 4 AAG 2 1 118347 CASAVA_Build 6 107162098 1D CAACAACAAC A/- AAAAAACTAG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 7 6 118348 CASAVA_Build 6 107181710 1I AAGGTAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 750 hom 28 3 19 6 A 11 12 118349 CASAVA_Build 6 107192874 1I TTTACATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 9 10 118350 CASAVA_Build 6 107203817 2D CCAAATACAA AC/-- AGTCATAAAC 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 AC 1 0 118351 CASAVA_Build 6 107209036 9D TTTAACAAAT ATTTTCCCC/--------- AACCAGATCT 3070 het 3070 ref 29 19 10 6 ATTTTCCCC 1 0 118352 CASAVA_Build 6 107220985 2D TCTTGTTAAT AC/-- AGTCATTCCA 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 AC 1 0 118353 CASAVA_Build 6 107222525 1D TAATGAATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 9 8 118354 CASAVA_Build 6 107224025 1D GGGTCCAGGC A/- ATCCTCCCAC 1888 het 1888 ref 15 8 4 3 A 2 1 118355 CASAVA_Build 6 107236879 5I ATCTTTTTTT -----/ATTTA TTTTTTTTTT 3070 het 1527 hom 26 8 13 5 ATTTA 0 1 118356 CASAVA_Build 6 107237447 1I TAGTCAGCCT -/C CTGCCTGCCA 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 C 1 2 118357 CASAVA_Build 6 107237667 3I CGGTGGCTCA ---/CGC CGCCTGTAAT 2480 het 2480 ref 21 9 8 4 CGC 1 2 118358 CASAVA_Build 6 107245475 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTGTATT 704 hom 7 het 4 0 3 1 T 6 5 118359 CASAVA_Build 6 107249593 1I CTCCCAGTTT -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 6 7 118360 CASAVA_Build 6 107253169 2D AAATAAAATG TA/-- TTGAGCATTC 3070 het 3070 ref 31 19 12 1 TA 1 0 118361 CASAVA_Build 6 107264026 1D AATTTGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 23 0 9 14 T 12 11 118362 CASAVA_Build 6 107267241 1D TACTTCTTTC T/- TTTTGTTTGC 3070 het 10 hom 26 1 23 2 T 5 4 118363 CASAVA_Build 6 107267767 1I ATTTTTAGTG -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 7 8 118364 CASAVA_Build 6 107275300 2I CTTTGGCCTC --/TT GCCTTGGCCT 3070 hom 41 het 17 0 14 3 T 0 2 118365 CASAVA_Build 6 107297073 2D ATAATTTTGA GT/-- GTGTGTGTGT 1215 het 1215 ref 29 21 3 6 GT 8 7 118366 CASAVA_Build 6 107313454 7I CATGCCTGGC -------/TAATTTT TAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 TAATTTT 0 1 118367 CASAVA_Build 6 107313717 1D ATCCCAGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 A 10 9 118368 CASAVA_Build 6 107320292 8I ATGGAAGAGG --------/TAACAAGA TAACAAGATC 3070 het 3070 hom 53 20 24 9 TAACAAGA 1 2 118369 CASAVA_Build 6 107345826 1I GATTAAACAG -/A GAAAAAAAAG 1435 het 1435 ref 13 6 4 3 A 0 1 118370 CASAVA_Build 6 107359815 3D CTGTGAACTC CTT/--- CTGAGAAATG 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 CTT 1 0 118371 CASAVA_Build 6 107368376 2I CAGTCAAGCT --/AA GAGTCAAATC 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 A 0 2 118372 CASAVA_Build 6 107371828 2I CCAAAGTGGG --/AC AGCCCAGGCA 2690 het 1042 hom 16 3 8 5 AC 0 1 118373 CASAVA_Build 6 107384938 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 A 12 13 118374 CASAVA_Build 6 107387736 1I CAGCCAAGAT -/G GCTAGACACT 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 G 1 2 118375 CASAVA_Build 6 107388105 1I ATATTGATGA -/G TCTTGGCTAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 G 0 1 118376 CASAVA_Build 6 107391349 1I TTGGGTTTAG -/T TTTCTCTTGC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 3 4 118377 CASAVA_Build 6 107392432 3D GTATTTAACT TTA/--- AAGTTTCTGC 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 TTA 1 0 118378 CASAVA_Build 6 107394354 1D ATTGCGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 12 11 118379 CASAVA_Build 6 107399792 1I AACTTCAGCA -/T TTATATTCTG 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 2 3 118380 CASAVA_Build 6 107421677 2I GTTTTTTTTT --/TG GTTTTTTTTG 3070 hom 47 het 19 0 16 3 TG 0 1 118381 CASAVA_Build 6 107421784 2D ATTCTCCTGC CT/-- CTCAGCCTCC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CT 2 1 118382 CASAVA_Build 6 107426959 2I TGTCTCTACT --/AA AAATACAAAC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 3 5 118383 CASAVA_Build 6 107429143 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 367 hom 16 1 14 1 A 10 9 118384 CASAVA_Build 6 107432409 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAGAAAA 1477 het 28 hom 7 1 6 0 A 6 5 118385 CASAVA_Build 6 107441531 4D GAGACAAGAG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 42 het 16 0 15 2 TC 12 10 118386 CASAVA_Build 6 107449263 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 7 8 118387 CASAVA_Build 6 107462366 2I GAAAAAAAAA --/AG AGGAAAATAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AG 1 2 118388 CASAVA_Build 6 107469122 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1313 het 13 hom 11 0 4 7 A 18 16 118389 CASAVA_Build 6 107469264 1D CAGAACCTAG T/- TTAGAGAGTG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 3 2 118390 CASAVA_Build 6 107471494 4D AGAAAATCAT AAGG/---- AAGTGAAAAT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 AAGG 1 0 118391 CASAVA_Build 6 107479342 3D GCTCCTTTGA CCT/--- CCTCGTGTGA 3070 hom 78 het 31 0 23 8 CCT 2 1 118392 CASAVA_Build 6 107480074 2I GTTCTCGCTC --/TG TTGCCCAGGC 3070 hom 69 het 26 0 21 5 TG 0 1 118393 CASAVA_Build 6 107488384 2D TCCTGGTTTT GG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 40 het 23 0 18 7 G 11 9 118394 CASAVA_Build 6 107490130 1I TCACATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 540 hom 26 2 19 5 A 13 14 118395 CASAVA_Build 6 107499288 4I AGGGACAGAG ----/ATTC ATTCCTACCT 3070 hom 84 het 33 0 25 8 ATTC 1 2 118396 CASAVA_Build 6 107517035 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1846 hom 29 4 15 11 A 14 13 118397 CASAVA_Build 6 107520561 1I AAGGTATACT -/G ATCGCGAAGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 0 1 118398 CASAVA_Build 6 107527134 1I AAAAAGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 10 11 118399 CASAVA_Build 6 107527770 1I TCACTAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 35 3 19 13 T 13 14 118400 CASAVA_Build 6 107535322 1I ATAAAGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 T 13 14 118401 CASAVA_Build 6 107539410 1D TGCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 25 0 22 3 A 11 10 118402 CASAVA_Build 6 107539879 11D ACTCCGTTTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2215 hom 21 het 12 0 7 8 A 25 14 118403 CASAVA_Build 6 107548573 2I GCCTGTAAAC --/TT TAGAAAGAGG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 1 3 118404 CASAVA_Build 6 107552210 1D AGGTGGAACA G/- GTCCACCCCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 2 1 118405 CASAVA_Build 6 107552366 1D TTATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 21 0 16 5 T 11 10 118406 CASAVA_Build 6 107555480 1D TATAGCTCAC T/- TGTAGCCTCA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 2 1 118407 CASAVA_Build 6 107557845 1I CAGTCTTATA -/C CCCCCACATG 3070 het 3070 hom 40 11 23 6 C 5 6 118408 CASAVA_Build 6 107560095 3I AAACAACAAC ---/AAA AAAGAAAACA 2952 het 2952 ref 26 17 7 2 A 3 6 118409 CASAVA_Build 6 107565061 1I CATGAGAAAT -/C CCACCCCCAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 C 2 3 118410 CASAVA_Build 6 107567594 1I AGAAGGCATT -/A AACTTATCCT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 2 3 118411 CASAVA_Build 6 107572464 1D GAGGCTGCCT G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 G 2 1 118412 CASAVA_Build 6 107574020 1I TGTATAAACT -/A TACTTCAATA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 0 1 118413 CASAVA_Build 6 107574882 1D CTTTATCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 19 9 A 13 12 118414 CASAVA_Build 6 107576026 1D CTGGAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 17 0 10 7 A 13 12 118415 CASAVA_Build 6 107581972 1I AACTACATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 7 16 0 A 10 11 118416 CASAVA_Build 6 107585204 1D ACCTCAGCCA C/- CCGGGTAGCT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 C 3 2 118417 CASAVA_Build 6 107588418 2D CTAATTTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 12 10 118418 CASAVA_Build 6 107592065 1I CTTAAAAAAA -/T ATTTTTTTTT 2743 het 11 hom 9 1 7 1 T 0 1 118419 CASAVA_Build 6 107607417 9D GCCTCGTGAT TCGCCCGCC/--------- TCGGCCTTCT 3070 het 3070 hom 26 15 9 4 TCGCCCGCC 1 0 118420 CASAVA_Build 6 107611105 1D AAGACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1475 het 1475 ref 26 9 7 11 A 17 16 118421 CASAVA_Build 6 107612730 1D CTGGAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 13 12 118422 CASAVA_Build 6 107614374 1I AATTATATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 10 11 118423 CASAVA_Build 6 107648042 2I AAAAATGATT --/TA TGGTAATGAC 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 TA 0 1 118424 CASAVA_Build 6 107649371 1D CGGGATTTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 18 14 8 T 9 8 118425 CASAVA_Build 6 107664365 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2399 het 2399 ref 25 9 8 8 A 15 16 118426 CASAVA_Build 6 107674116 1I AGGCTGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 19 15 13 T 11 12 118427 CASAVA_Build 6 107676414 3D GGGAACTGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 1389 het 1389 ref 29 13 6 10 A 21 18 118428 CASAVA_Build 6 107678078 1D AAAATACTGA C/- CCCCCCCCGC 3070 het 2574 hom 27 9 15 3 C 9 8 118429 CASAVA_Build 6 107680757 7I AAATATGAAG -------/TTTGAGA TTTAATTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 TTTGAGA 0 1 118430 CASAVA_Build 6 107682767 1D TAAAACTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 13 13 T 13 12 118431 CASAVA_Build 6 107686289 1D TACAACATTT G/- GAACCATAGA 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 G 2 1 118432 CASAVA_Build 6 107686363 1D TTAGAAAACT A/- AAAAAAAAAA 1706 het 1706 ref 33 22 6 5 A 17 16 118433 CASAVA_Build 6 107691077 1I TGGCCAGGCG -/C CGGTGGCTTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 1 2 118434 CASAVA_Build 6 107694284 1I CCCTGAGGCA -/T TTTTTTTTTT 1929 het 1929 ref 29 9 8 12 T 15 16 118435 CASAVA_Build 6 107696840 1I ACAAATAGTA -/T TTTTTTTTTT 2831 het 2831 ref 19 9 7 3 T 13 14 118436 CASAVA_Build 6 107714407 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAATAA 2406 het 1786 hom 11 5 5 1 A 7 8 118437 CASAVA_Build 6 107714953 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 18 het 31 1 29 2 A 8 7 118438 CASAVA_Build 6 107718906 1D TCAAACCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 A 13 12 118439 CASAVA_Build 6 107729367 2I TTGCAAAAAC --/AA AAAACAAGCA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 4 6 118440 CASAVA_Build 6 107730338 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 T 8 7 118441 CASAVA_Build 6 107730744 1I ACTTACTACC -/A AAAAAAAAAA 2339 het 1903 hom 27 7 9 11 A 13 14 118442 CASAVA_Build 6 107766790 1I TAAGTATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 10 11 118443 CASAVA_Build 6 107778285 5D TAGCTCAATA AAAAC/----- AAAACAAATC 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 AAAAC 2 1 118444 CASAVA_Build 6 107785395 1I ATTTGAATGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 9 10 118445 CASAVA_Build 6 107788484 1I ACAAAAAACA -/G TCTGGATAAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 0 1 118446 CASAVA_Build 6 107819020 1D TTTGCTCACA T/- TTTTATATTT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 5 4 118447 CASAVA_Build 6 107819388 1I AGCAGGGGAT -/G GGGGGGATTA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 G 6 7 118448 CASAVA_Build 6 107819752 1I TACATGCTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 9 10 118449 CASAVA_Build 6 107841887 1I AAAATGAATT -/G CTACAAAGTT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 G 0 1 118450 CASAVA_Build 6 107848723 1I TCTATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2251 het 2251 ref 31 14 8 9 A 12 13 118451 CASAVA_Build 6 107853218 3D TGGAGGGCTC AGA/--- AGAAGACAGG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 AGA 3 2 118452 CASAVA_Build 6 107861157 1I ACAGAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 11 12 118453 CASAVA_Build 6 107863847 1I AAAAATTGCG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 9 10 118454 CASAVA_Build 6 107906749 1D TAAAATGGGA G/- TAAAACCAAT 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 G 1 0 118455 CASAVA_Build 6 107911696 1I AAGCTACTGA -/C CAGGGAGTTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 1 2 118456 CASAVA_Build 6 107977347 1I GAAACTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 32 0 23 9 A 10 11 118457 CASAVA_Build 6 107983095 1D TAAGAGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 9 11 A 15 14 118458 CASAVA_Build 6 108012692 1I GATAATGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 10 11 118459 CASAVA_Build 6 108014416 2D AAATTAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2798 hom 27 11 9 7 T 15 13 118460 CASAVA_Build 6 108025941 1D TCGACATGCA T/- TTATTAGGTA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 3 2 118461 CASAVA_Build 6 108031836 1I GGGCTGTACT -/G GGGGGCATCC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 G 5 6 118462 CASAVA_Build 6 108073429 1I ACTGAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 20 9 A 10 11 118463 CASAVA_Build 6 108076319 5I TGCTCCTGTA -----/ACAGG GTCACAGTGG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 ACAGG 0 1 118464 CASAVA_Build 6 108076427 1D AAATGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 1056 het 1056 ref 52 38 3 12 T 12 11 118465 CASAVA_Build 6 108098680 1D TGGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 670 hom 49 2 34 14 T 12 11 118466 CASAVA_Build 6 108104496 1D GCTCTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 33 0 26 8 A 15 14 118467 CASAVA_Build 6 108128591 1D CCCTCTCCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 5 het 30 1 23 6 A 10 9 118468 CASAVA_Build 6 108135273 1I TCTTATCTTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 7 8 118469 CASAVA_Build 6 108145188 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2071 het 386 hom 16 2 9 5 A 17 18 118470 CASAVA_Build 6 108170717 1D AATGTGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 10 9 118471 CASAVA_Build 6 108188792 1D ATTTAAAAAA C/- ACAGTAAATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 0 118472 CASAVA_Build 6 108189341 1I TATCTTTGGT -/G TTTTTTTTTT 618 het 75 hom 23 2 7 14 G 0 1 118473 CASAVA_Build 6 108189706 1D AAAAAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 29 1 22 6 T 11 10 118474 CASAVA_Build 6 108216622 1I AGGAAGGCTA -/G GGGTACTGGT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 G 3 4 118475 CASAVA_Build 6 108229680 1D TATTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 11 10 118476 CASAVA_Build 6 108232530 3D ATCTTCTCCT AGC/--- AGCAGAGAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 AGC 2 1 118477 CASAVA_Build 6 108234093 1I TCCCCCCCCC -/G CAATAAACAA 3070 hom 49 het 23 0 16 7 G 0 1 118478 CASAVA_Build 6 108236955 1I GGAGATGATT -/A AGTCATGAGA 3070 hom 135 het 51 0 44 7 A 1 2 118479 CASAVA_Build 6 108259793 2I ACTAAAAAAT --/AC ACACACACAC 2561 hom 21 het 11 0 8 3 AC 7 8 118480 CASAVA_Build 6 108262835 1D ACCCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1340 hom 22 6 14 2 A 12 11 118481 CASAVA_Build 6 108266860 1D ATGTCCACAA C/- AAAAAATCGT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 C 1 0 118482 CASAVA_Build 6 108268123 2D CTAATTCACT AA/-- ACACTTGTGA 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 A 3 1 118483 CASAVA_Build 6 108269054 1D ATAAACTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 29 2 12 15 A 15 14 118484 CASAVA_Build 6 108271829 4D ACTGAGAGGA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 96 het 42 0 32 13 AG 11 9 118485 CASAVA_Build 6 108272833 4D TATGTATATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 18 14 118486 CASAVA_Build 6 108293768 18D CAGTTGCAAC ATAAAACTATCTTTGACA/------------------ ATAAAACTAT 3070 hom 120 het 55 0 41 16 ATAAAACTATCTTTGACA 2 1 118487 CASAVA_Build 6 108295107 2D AAGTTAACTC TT/-- AATGGAATCT 3070 hom 157 het 54 0 51 5 T 2 0 118488 CASAVA_Build 6 108295642 1I CCCAAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 40 3 27 10 A 11 12 118489 CASAVA_Build 6 108296027 3I CTGGCAAAAT ---/GTC GTTATGGTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 GTC 0 1 118490 CASAVA_Build 6 108296121 1D ATTGTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 31 0 21 10 A 13 12 118491 CASAVA_Build 6 108296570 1D TAGATAGACT A/- AAAAAAAAAA 2017 het 2017 ref 33 15 5 14 A 13 12 118492 CASAVA_Build 6 108297808 4D AGAAAAAAAA AAAC/---- AACTTTTCTT 3070 hom 72 het 29 0 20 10 AAAC 1 0 118493 CASAVA_Build 6 108301530 1I AGAAACTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 9 10 118494 CASAVA_Build 6 108304967 4D TATATGTGTG TGTA/---- TATATATATA 3070 hom 91 het 38 0 31 10 TGTA 1 0 118495 CASAVA_Build 6 108306849 1I TGAAACAGAT -/A TTCTATGAGT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 0 1 118496 CASAVA_Build 6 108312827 1D AAAAAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 26 9 A 13 12 118497 CASAVA_Build 6 108314599 4D TTTGATGGAA TTGT/---- TTGTTTTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTGT 2 1 118498 CASAVA_Build 6 108322418 2I AAAAAAAAAA --/AT CACCATGAAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 AT 0 1 118499 CASAVA_Build 6 108326154 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 17 9 A 15 14 118500 CASAVA_Build 6 108333756 4D AAAACGTCTG ACTT/---- ACTTAGATCT 3070 hom 57 het 23 0 20 5 ACTT 2 1 118501 CASAVA_Build 6 108336234 1D GAAAATAGTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 7 118502 CASAVA_Build 6 108346143 1D AGACCTGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 862 hom 42 2 33 8 A 13 12 118503 CASAVA_Build 6 108349813 2D CTCCCTGGGG AA/-- AAACAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 5 3 118504 CASAVA_Build 6 108349980 2I ATCCCATATA --/TT TTAAATAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 2 4 118505 CASAVA_Build 6 108352564 3D AGCTTAAATT ATA/--- ATAACAGAGG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 ATA 2 1 118506 CASAVA_Build 6 108359647 1D94M1D CCGTCTCAAC AAAAAAAAAAAAAATCAAGTTTTGAAACAAAAATCTGCCTTTTTAAGAAGATGGCACCAAAAACAAAGGAGGAAGCCCTTGCCCACCCCAAAGCCA/-AAAAAAAAAAAAATCAAGTTTTGAAATAAAAATCTGCCTTTTTAAGAAGATGGCACCAAAAACAAAGGAGGAAGCCCTTGCCCACCCCAAAGCC- AAGTCAAAGC 3070 het 2561 hom 22 9 21 25 N/A 0 0 118507 CASAVA_Build 6 108363511 1I AGAGTCATCA -/C CACTCCCTAA 3070 het 424 hom 8 1 7 0 C 1 2 118508 CASAVA_Build 6 108364443 1I AACTTGTATT -/A TTTTTAAAGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 118509 CASAVA_Build 6 108365921 5D TGCAGAATCT TTTAG/----- TTTAATTAGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 TTTAG 1 0 118510 CASAVA_Build 6 108368690 1I AAGTATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 31 0 17 14 A 15 16 118511 CASAVA_Build 6 108389742 1D TAAGTCATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 18 0 13 5 T 10 9 118512 CASAVA_Build 6 108401421 1D AAAACAAGAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 33 het 21 0 9 12 T 9 8 118513 CASAVA_Build 6 108423155 2I TGTGTATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 TA 5 6 118514 CASAVA_Build 6 108430095 1D GCAGGACAGA T/- TTTGAATTTC 3070 het 3070 hom 57 25 29 3 T 4 3 118515 CASAVA_Build 6 108440426 1D CAATAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 12 11 118516 CASAVA_Build 6 108448202 3I AGGAGGCTGA ---/GGC GGCATGAGAA 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 GGC 1 2 118517 CASAVA_Build 6 108451027 1I GAGGTGTCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2649 hom 25 6 10 9 A 11 12 118518 CASAVA_Build 6 108454255 1D CTGCAGCCTC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 T 8 7 118519 CASAVA_Build 6 108456727 1D CATAAGGCCC A/- GCGATAAATA 3070 het 3070 hom 42 15 25 3 A 1 0 118520 CASAVA_Build 6 108463296 1D CTTTCAGCAC T/- TTGAAAATAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 3 2 118521 CASAVA_Build 6 108464956 1D CCCCAACCAT A/- AAGCCTTGCA 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 A 3 2 118522 CASAVA_Build 6 108466509 1I ACCCTGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2768 hom 21 8 9 4 A 11 12 118523 CASAVA_Build 6 108467829 1D CTTGCTTACT C/- CTCCTTCTTT 3070 het 3070 hom 42 17 20 6 C 2 1 118524 CASAVA_Build 6 108468913 2D CTGAGATGGA TT/-- TTTTTTTTTT 1185 het 1185 ref 28 12 4 13 T 18 16 118525 CASAVA_Build 6 108470312 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1327 hom 26 9 14 3 T 19 17 118526 CASAVA_Build 6 108474767 1I AGCTTCTGAC -/T AAAATTCAAA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 0 1 118527 CASAVA_Build 6 108483217 1I TCTATTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 T 11 12 118528 CASAVA_Build 6 108490883 14I TACCTCTGTG --------------/CCTCTGCCCATGAC ACTACCTGCA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 CCTCTGCCCATGAC 0 1 118529 CASAVA_Build 6 108493870 2D AACTAAGCCC TA/-- TATTGAGGAA 3070 het 3070 ref 53 26 22 6 TA 2 1 118530 CASAVA_Build 6 108494272 5I ATGTTCCAAC -----/TTCAT TTCCTTATTT 3070 het 3070 ref 52 27 24 1 TTCAT 0 1 118531 CASAVA_Build 6 108495074 1D CAGAAACTCT G/- ATCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 G 1 0 118532 CASAVA_Build 6 108495418 2D ATGGAGGGAC AG/-- GGGAATGGAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 AG 1 0 118533 CASAVA_Build 6 108505312 3I AATTAGAAAT ---/ATC AGTGCAAATT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 ATC 0 1 118534 CASAVA_Build 6 108515991 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1298 het 1298 ref 13 7 3 3 A 17 16 118535 CASAVA_Build 6 108525853 4I GGCAAAAGAC ----/ACAA ACAGACATTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 ACAA 0 1 118536 CASAVA_Build 6 108531491 1D AAGAAAAAAA G/- AAACAAGTTC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 1 0 118537 CASAVA_Build 6 108535452 1I AAGAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2407 hom 24 8 15 1 T 8 9 118538 CASAVA_Build 6 108549106 1I CCGCAGCCCC -/G GGGTGCTGCA 3070 het 3070 ref 44 18 14 12 G 3 4 118539 CASAVA_Build 6 108571075 1D GTGCAGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 12 11 118540 CASAVA_Build 6 108585234 1D CCCAGCCGGG T/- GCCCCAGCCT 1427 het 1427 ref 16 6 6 4 T 1 0 118541 CASAVA_Build 6 108604708 2D TCTTCTGAGC TG/-- TGTGATTGGG 2200 het 2200 ref 27 16 6 5 TG 3 2 118542 CASAVA_Build 6 108614231 4D CAGAGCTAAA TATT/---- TAGACAAGCA 3070 het 3070 hom 30 12 16 4 TATT 1 0 118543 CASAVA_Build 6 108682028 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1865 het 541 hom 23 9 8 6 A 13 12 118544 CASAVA_Build 6 108696489 1D TTAATTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 22 5 11 6 T 24 23 118545 CASAVA_Build 6 108746193 1I CTGTGCTGAG -/A CTTGAATGCG 3070 het 3070 hom 63 29 28 6 A 0 1 118546 CASAVA_Build 6 108753336 1I CTGTTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1733 hom 31 7 13 11 T 14 15 118547 CASAVA_Build 6 108762494 1D GCACAGTCCT C/- CAGAAAGGCA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 C 2 1 118548 CASAVA_Build 6 108771255 1I AACCTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 T 9 10 118549 CASAVA_Build 6 108785099 4I CCCGCCTCAG ----/CTTC CTGAGTAGCT 3070 hom 90 het 33 0 29 4 CTTC 0 1 118550 CASAVA_Build 6 108798036 1I GTACAAGTTG -/A ATCTGTAGAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 118551 CASAVA_Build 6 108801659 1D GTTTTAGTAG A/- AGATGGGGTT 3070 hom 25 het 10 0 9 1 A 2 1 118552 CASAVA_Build 6 108822360 1I CGTTTTTTTT -/A ATCTGTCACT 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 1 2 118553 CASAVA_Build 6 108830251 1D TCCCAGCTAC T/- TGGGGAGGCT 1305 het 1305 ref 8 3 3 2 T 2 1 118554 CASAVA_Build 6 108859007 1I TTATAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1367 hom 23 3 11 9 T 10 11 118555 CASAVA_Build 6 108871160 2D CCAGGGCCTC CT/-- CTCTCTGTAT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 CT 4 3 118556 CASAVA_Build 6 108871275 1I TAAGAAGCTG -/C CTCAAGTGTC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 1 2 118557 CASAVA_Build 6 108879605 1I GTTTCTTTTT -/A TTTTATTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 1 118558 CASAVA_Build 6 108881202 1D CTAATATAAT G/- TATTTACCCA 3070 het 3070 ref 33 19 9 7 G 1 0 118559 CASAVA_Build 6 108892685 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 8 9 118560 CASAVA_Build 6 108898474 1D TTACAGAACT G/- CTTACTCTTC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 G 1 0 118561 CASAVA_Build 6 108911115 1D TTCAAAAAAA C/- AGAAGTATTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 C 1 0 118562 CASAVA_Build 6 108920630 1I CTTGCCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 T 10 11 118563 CASAVA_Build 6 108957493 1D TTACAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 11 10 118564 CASAVA_Build 6 108958914 3I TTCCTTGGGA ---/ATT ATTGACACTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 ATT 1 2 118565 CASAVA_Build 6 108962123 8D AAAAAGAGAG AGAGAGAA/-------- AGAAAGAGGA 3070 het 3070 ref 36 17 12 9 AGAGAGAA 1 0 118566 CASAVA_Build 6 108982014 1D ACTAAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 35 1 17 17 T 15 14 118567 CASAVA_Build 6 108992687 1D TTGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 35 1 29 5 T 11 10 118568 CASAVA_Build 6 109005099 1I TAACTCTTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 9 10 118569 CASAVA_Build 6 109019783 2D CTTTTTAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 35 4 11 20 A 14 12 118570 CASAVA_Build 6 109038995 1D TGTAGAGTCA T/- TACTGTATGT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 2 1 118571 CASAVA_Build 6 109041258 1D GAGCCTGGAG T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 T 7 6 118572 CASAVA_Build 6 109048568 5D GTAATAACAA TTTTC/----- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 TTTTC 1 0 118573 CASAVA_Build 6 109049438 1D CATGTTAGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 9 8 118574 CASAVA_Build 6 109054514 1I ATTATATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 29 1 21 7 T 10 11 118575 CASAVA_Build 6 109056020 1I CCTGGCAGAG -/A ACCAAGTGCT 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 A 1 2 118576 CASAVA_Build 6 109064091 1D GATCCTTGTG C/- CCAGGTCCCA 3070 het 3070 ref 53 23 21 9 C 3 2 118577 CASAVA_Build 6 109073355 1D CCAGAATTGC T/- TTTTTTTTTT 688 het 688 ref 26 19 3 4 T 15 14 118578 CASAVA_Build 6 109089286 1I TAGCATCAGG -/C AGTATCTTTT 3070 hom 90 het 31 0 30 1 C 0 1 118579 CASAVA_Build 6 109093921 3I GCAGTGTGAT ---/GTG GTAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 GTG 0 1 118580 CASAVA_Build 6 109107194 1I AAAGTGGCCA -/T TTTCATCTCC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 3 4 118581 CASAVA_Build 6 109115488 4I TCTCACTGAC ----/AAAT GAATAGTATT 3070 het 3070 hom 46 23 19 4 AAAT 0 1 118582 CASAVA_Build 6 109122012 1I GGGCTGATGG -/C CTTATATTCA 3070 het 2300 hom 22 7 10 5 C 1 2 118583 CASAVA_Build 6 109123563 1I CATTGATCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1643 hom 27 6 14 7 T 9 10 118584 CASAVA_Build 6 109123600 1I TATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1087 hom 28 4 13 11 T 10 11 118585 CASAVA_Build 6 109124986 6D ACTCCATCTC AAAAAA/------ AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 21 11 11 0 A 12 6 118586 CASAVA_Build 6 109141897 7I23M1D CTAAAGAGAC -------TATGACCAAATGCCAAACTCATGT/TATGGCGTATGACCAAATGCCAAACTCATG- TTCCCTTTTC 3070 het 3070 hom 43 22 24 5 N/A 0 0 118587 CASAVA_Build 6 109170966 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 5 6 118588 CASAVA_Build 6 109185787 1I ACCCCCCCCC -/T GCCCCCCGCC 2992 het 392 hom 17 1 10 6 T 0 1 118589 CASAVA_Build 6 109186148 3I12M1D TCCTCCTTTT ---TTTTTTTCATTTA/TTATTTTTTTCATTT- AAAAATCTCT 3070 hom 60 het 22 0 20 3 N/A 0 0 118590 CASAVA_Build 6 109186373 1D AGGCCATGTC T/- TTCTAGAAAG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 T 3 2 118591 CASAVA_Build 6 109186640 1D AGGTTTGCTT C/- TTTTTTTTTC 3070 het 2927 hom 31 10 13 8 C 1 0 118592 CASAVA_Build 6 109212050 2D ATCTTTAACG TA/-- TATTAGTAAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 TA 2 1 118593 CASAVA_Build 6 109223840 1I TTTAAATGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 35 0 27 8 A 9 10 118594 CASAVA_Build 6 109235386 1I CACACACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 728 hom 34 3 23 8 A 13 14 118595 CASAVA_Build 6 109238217 2I TTAGAAAACC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2980 hom 28 11 12 5 T 12 14 118596 CASAVA_Build 6 109240008 1I AAAACAGCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 8 9 118597 CASAVA_Build 6 109249805 1D GAATATAAAA G/- GCTAGTAGAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 G 2 1 118598 CASAVA_Build 6 109271457 1D CGGTGATGGT G/- GGGGTTGGTG 1517 het 1517 ref 21 12 5 5 G 5 4 118599 CASAVA_Build 6 109298794 4D GGAGAACAAA TAAG/---- TAAGAGAATT 3070 het 3070 hom 48 19 26 4 TAAG 2 1 118600 CASAVA_Build 6 109308674 4I CCCTTCCCTC ----/TCCT TCCTTCCTTC 3070 hom 70 het 30 0 22 8 TCCT 4 5 118601 CASAVA_Build 6 109314804 1I GTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2184 het 1308 hom 14 5 5 5 T 11 12 118602 CASAVA_Build 6 109331152 1I AATACTCTCC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 8 118603 CASAVA_Build 6 109332543 2D CAACTAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 14 12 118604 CASAVA_Build 6 109335355 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1825 het 1227 hom 26 7 8 11 T 19 18 118605 CASAVA_Build 6 109335718 2D GCAGCTCCCC CA/-- GTTTGACCTC 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 CA 1 0 118606 CASAVA_Build 6 109336035 1D CGGTAGTGCT G/- GGGGGGGCCT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 G 8 7 118607 CASAVA_Build 6 109338683 2I TTAGAACTTT --/TC TTCATGTTTA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 TC 0 1 118608 CASAVA_Build 6 109343977 1D TGCTTAGAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 54 28 23 5 A 9 8 118609 CASAVA_Build 6 109346379 2I ATATACTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 7 11 5 T 14 16 118610 CASAVA_Build 6 109347040 1D AGAGGCCTTC A/- ACTGAAGTCT 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 2 1 118611 CASAVA_Build 6 109347414 1I TTACAGATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 9 10 118612 CASAVA_Build 6 109355446 1I CTTTCCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 10 11 118613 CASAVA_Build 6 109465685 1I GCGCTATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 10 11 118614 CASAVA_Build 6 109476001 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 1429 het 1429 ref 17 10 4 3 A 13 12 118615 CASAVA_Build 6 109531937 1D TTAGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2388 het 2388 ref 45 32 7 7 T 13 12 118616 CASAVA_Build 6 109595102 1D TTCGTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 10 9 118617 CASAVA_Build 6 109601996 1D TCTTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2117 het 2117 ref 38 23 6 10 A 15 14 118618 CASAVA_Build 6 109613819 4D AACATTTCCG CCCC/---- CCCCCCCCCG 3070 het 105 hom 30 1 11 19 C 13 9 118619 CASAVA_Build 6 109618350 1D ATTTAAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 126 het 50 0 42 8 T 10 9 118620 CASAVA_Build 6 109786154 4I AAACAGAAGC ----/AGGT AATACCATAA 3070 het 3070 hom 42 20 17 5 AGGT 0 1 118621 CASAVA_Build 6 109787569 1D GGTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 10 9 118622 CASAVA_Build 6 109792142 1D TCTGCACAGC A/- AAAGAAACTA 3070 het 3070 hom 21 7 14 0 A 4 3 118623 CASAVA_Build 6 109797442 5D GTATTATCAA GTAAT/----- AAGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 19 2 GTAAT 1 0 118624 CASAVA_Build 6 109800897 3D CTCTGTTGAC CTA/--- CTGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 CTA 1 0 118625 CASAVA_Build 6 109806341 1I TGTCTCAGGG -/A AAAAAAAAAA 2804 het 2804 ref 29 10 9 10 A 11 12 118626 CASAVA_Build 6 109806785 1I GTTTTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 A 10 11 118627 CASAVA_Build 6 109820092 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AG 1 2 118628 CASAVA_Build 6 109825105 8D CATACTTGAG GCAGAATA/-------- GCAGAATAGA 3070 het 3070 ref 39 18 17 10 GCAGAATA 2 1 118629 CASAVA_Build 6 109829711 2I AGCTGCGCCT --/CC CGGGTTCATG 1852 het 1852 ref 18 12 6 0 C 1 3 118630 CASAVA_Build 6 109832956 1I TCAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 11 12 118631 CASAVA_Build 6 109845280 2D CCTGTCTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2514 hom 29 8 12 9 T 16 14 118632 CASAVA_Build 6 109874325 26I AAGCCACCAT --------------------------/GTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG GTGGAGTGAG 2629 het 2629 ref 23 12 8 3 GTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG 0 1 118633 CASAVA_Build 6 109875918 4D TACTCTCAGA ACAG/---- ACAGTCACTC 3070 het 3070 ref 26 12 12 3 ACAG 2 1 118634 CASAVA_Build 6 109879049 1D AGGGGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 1221 het 568 hom 24 5 4 15 T 19 18 118635 CASAVA_Build 6 109885426 18D TGCTGTCCTT GAGATCCAGAGACCATAA/------------------ GAGATCCAGA 3070 het 3070 hom 43 15 16 16 GAGATCCAGAGACCATAA 2 1 118636 CASAVA_Build 6 109886492 1D AACTCCGTCC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 7 6 118637 CASAVA_Build 6 109887995 2I TTTTCAGACT --/CA CATAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 CA 1 2 118638 CASAVA_Build 6 109911834 1D CTATTACTTA C/- CTCCTAAATG 3070 het 3070 ref 67 33 25 9 C 2 1 118639 CASAVA_Build 6 109928894 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTCAAACAAA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 CT 2 1 118640 CASAVA_Build 6 109935241 1D GCCAATATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 11 10 118641 CASAVA_Build 6 109940621 3D CCCACTGTTC TTG/--- TTGTTATCAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 6 TTG 2 1 118642 CASAVA_Build 6 109942340 1D TTAGCTGCAA C/- ATATACACAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 C 1 0 118643 CASAVA_Build 6 109947671 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3026 hom 38 het 24 0 9 16 A 15 14 118644 CASAVA_Build 6 109949356 3D ATTCCCCATC AAG/--- AAGATGTCCT 3070 hom 117 het 47 0 40 9 AAG 2 1 118645 CASAVA_Build 6 109949919 1I TTCCATTTCA -/T TTTCTCTCAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 3 4 118646 CASAVA_Build 6 109951140 2D AGATCATCTA AG/-- AGACTCTCAG 3070 het 3070 ref 32 19 11 5 AG 2 1 118647 CASAVA_Build 6 109960713 3D TTATGGAATA CTC/--- CTCAGAATGT 3070 het 3070 ref 53 28 23 3 CTC 2 1 118648 CASAVA_Build 6 109979678 1I AAAAAAAAAA -/G GGGGGGTACA 2702 het 11 hom 14 1 10 3 G 6 7 118649 CASAVA_Build 6 109990647 1D ATTGGGAGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 77 het 34 0 26 8 T 9 8 118650 CASAVA_Build 6 109992473 3D AAAACCAGTG TTA/--- TAATCTAGTT 3070 het 3070 ref 36 18 18 2 TTA 1 0 118651 CASAVA_Build 6 109993373 1I CCATCTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 803 hom 36 3 26 7 A 9 10 118652 CASAVA_Build 6 110001158 15D GGCAGAGCAG CCTCTGCTTTCCTAC/--------------- CACACTTCAA 3070 hom 90 het 33 0 31 7 CCTCTGCTTTCCTAC 1 0 118653 CASAVA_Build 6 110004232 1D GTTTGTGTCA T/- TCATGATTTC 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 T 2 1 118654 CASAVA_Build 6 110005801 8I TCTCTTTCTC --------/TCTTTCTG TCTTTCTTTC 3070 hom 50 het 25 0 18 7 TCTTTCTG 0 1 118655 CASAVA_Build 6 110006744 14I ATTCGTATAG --------------/TTTTGAGTGTTCCT TTTGGAATTT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 TTTTGAGTGTTCCT 0 1 118656 CASAVA_Build 6 110006986 5I CTCCAATCTT -----/AAAAG AAACTGTTAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AAAAG 0 1 118657 CASAVA_Build 6 110013023 3D TTTTACCTTG CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 CTT 5 4 118658 CASAVA_Build 6 110019758 1I TCCTATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 28 1 21 6 A 11 12 118659 CASAVA_Build 6 110020692 1I GATTTTAGGA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 67 het 30 0 23 7 T 7 8 118660 CASAVA_Build 6 110025577 1I TCAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 9 10 118661 CASAVA_Build 6 110032891 1D ATTATTAGCT C/- CATTGTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 C 2 1 118662 CASAVA_Build 6 110043825 1I AAACAAAAGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 8 9 118663 CASAVA_Build 6 110044441 1D ACCCAACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 692 hom 25 2 21 2 T 12 11 118664 CASAVA_Build 6 110045353 1I ATTAAAAGTT -/G TACTATAAAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 0 1 118665 CASAVA_Build 6 110045746 2D CACTTGAGAG AC/-- ACAGTAAAGA 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 AC 2 1 118666 CASAVA_Build 6 110046785 1I TTCTGATTCA -/T TTCCTTAGAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 2 3 118667 CASAVA_Build 6 110050423 3I AGGATAATAC ---/ATT AATAATATAT 2650 hom 15 het 6 0 6 0 ATT 0 1 118668 CASAVA_Build 6 110053813 1I TCTTCAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 32 1 28 3 T 10 11 118669 CASAVA_Build 6 110054130 1I TATAAAGACC -/T TTAAGCATTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 2 3 118670 CASAVA_Build 6 110055563 1I CTGTTTTTTG -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 16 het 22 1 19 2 T 7 8 118671 CASAVA_Build 6 110056810 1D CGTTTCATTT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 7 118672 CASAVA_Build 6 110057527 1I ACAGTATTTG -/A AAAAATTTTT 580 het 580 ref 15 6 7 2 A 5 6 118673 CASAVA_Build 6 110068474 3D TCCACCCCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 16 0 14 2 T 15 12 118674 CASAVA_Build 6 110069039 2D ATATGAATAA AT/-- ATATATATAT 1487 hom 12 het 8 0 5 3 AT 8 7 118675 CASAVA_Build 6 110080251 1I AATTCAACAG -/C CCTTCATGCT 3070 het 1281 hom 16 3 11 3 C 2 3 118676 CASAVA_Build 6 110081579 3I TTTTTTTTTT ---/CTC TTTCTCTCTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CTC 0 1 118677 CASAVA_Build 6 110081898 4I GATGGCTGAG ----/AAGT AAGACCCACC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AAGT 0 1 118678 CASAVA_Build 6 110089342 1I GTAAGCATTT -/G GGGGTCTTCT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 G 4 5 118679 CASAVA_Build 6 110093363 3D CTGCCTCTTC TTG/--- TTGTTCTCTT 3070 het 3070 hom 49 22 25 2 TTG 2 1 118680 CASAVA_Build 6 110095045 1D ATAGTGATGG A/- AACACCAATT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 3 2 118681 CASAVA_Build 6 110095198 1D ACTCAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 23 4 T 11 10 118682 CASAVA_Build 6 110099634 1D TAAAACAAAT G/- TACAATCTGA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 G 1 0 118683 CASAVA_Build 6 110121042 1I TCCCTTAGTT -/G GGCATTCAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 G 2 3 118684 CASAVA_Build 6 110121895 1I GCTATGAATT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 A 7 8 118685 CASAVA_Build 6 110130569 3I TCCTTCCCTA ---/TTC TTCTTGGATA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 TTC 1 2 118686 CASAVA_Build 6 110130996 1I TAGAAGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 10 11 118687 CASAVA_Build 6 110150632 1D GAGCTGGGCA G/- GGATGGGACC 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 G 3 2 118688 CASAVA_Build 6 110150893 1D ATATCCTGTC A/- ACGCTGAACT 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 A 2 1 118689 CASAVA_Build 6 110155183 1I GGTAACTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 11 12 118690 CASAVA_Build 6 110242210 1I AATTTTTTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 T 8 9 118691 CASAVA_Build 6 110242344 1D GGCCTAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2990 hom 29 9 11 9 T 10 9 118692 CASAVA_Build 6 110245465 1D GAGAGTGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2552 hom 28 9 10 9 A 15 14 118693 CASAVA_Build 6 110250261 1D ATTTTGCAAT A/- AAAAAGTGAA 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 A 6 5 118694 CASAVA_Build 6 110254258 1D GATCACAGCA C/- GTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 C 1 0 118695 CASAVA_Build 6 110254888 1D TGTAAAATGA G/- GATAATAATC 3070 het 3070 hom 59 25 25 9 G 2 1 118696 CASAVA_Build 6 110263044 5D GAGCATCTTG AGAGC/----- AGAGCAGAGA 3070 het 3070 ref 48 30 14 6 AGAGC 2 1 118697 CASAVA_Build 6 110273555 1I GTATAACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2379 hom 30 8 13 9 A 11 12 118698 CASAVA_Build 6 110291022 1D CCTGACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 14 2 A 11 10 118699 CASAVA_Build 6 110295938 1D CAGTAACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 266 hom 35 3 16 16 A 15 14 118700 CASAVA_Build 6 110334568 5D TTATATGTCT TTAAA/----- TTATATTATT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TTAAA 1 0 118701 CASAVA_Build 6 110341124 28D4M7D CAAAGGGAGT GGAGAGGGAGGAGAGGGCTTCAGGGAGGTTAGTCTTCCT/----------------------------TTGG------- CCCCATTCCC 2717 hom 34 het 7 0 10 9 N/A 0 0 118702 CASAVA_Build 6 110356229 1I AATAAGTAAC -/A ACTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 1 2 118703 CASAVA_Build 6 110369252 34D CTGCACAGCA AGATTCCCACTGACCATTTATCCCCAGGACCCTG/---------------------------------- AGGAAAAGAG 3070 het 3070 ref 28 22 9 9 AGATTCCCACTGACCATTTATCCCCAGGACCCTG 1 0 118704 CASAVA_Build 6 110369696 4I AAAATGCTCA ----/GAGT GAGTTAGTGC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 GAGT 1 2 118705 CASAVA_Build 6 110395636 1I AATCCTTCTC -/A AAAGCTCAGA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 3 4 118706 CASAVA_Build 6 110402714 2I GAAATTACAC --/TG AATGATTTAG 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 TG 0 1 118707 CASAVA_Build 6 110409228 1I TCCAGCTTCA -/T TCCAGGTTGC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 1 2 118708 CASAVA_Build 6 110433335 22D ATTCCATTTC CAGGAGCCCAGTGGGCTTCACA/---------------------- CAGAGCCATA 1244 het 1244 ref 37 21 7 16 CAGGAGCCCAGTGGGCTTCACA 1 0 118709 CASAVA_Build 6 110493586 1I TAATTACTGA -/G GAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 G 1 2 118710 CASAVA_Build 6 110495428 3D TAGAAAAAGC ACA/--- ACAATGGGTC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 ACA 2 1 118711 CASAVA_Build 6 110508528 14I CCTCCCACCC --------------/CTGGCTGGCCCTAG CTGGTGATTC 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 CTGGCTGGCCCTAG 0 1 118712 CASAVA_Build 6 110530267 1D CAGTATTTAG A/- AAAAAAAAAA 1391 het 1391 ref 32 23 3 6 A 11 10 118713 CASAVA_Build 6 110537449 1D CTAACAATTC T/- TTTTTTTTTT 2242 het 852 hom 24 2 10 12 T 17 16 118714 CASAVA_Build 6 110541770 4I ATATACAGAA ----/ATCT ATTATAAAAA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 ATCT 0 1 118715 CASAVA_Build 6 110544976 1D TGAAAATTCG A/- AAAAAAAAAC 2168 het 2168 ref 29 17 8 7 A 10 9 118716 CASAVA_Build 6 110561247 1I GTACAATGAC -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 6 7 118717 CASAVA_Build 6 110561625 1I TCTGATGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 9 10 118718 CASAVA_Build 6 110562319 1D CTATGTGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 T 11 10 118719 CASAVA_Build 6 110574412 1D ACTGTACATT A/- AAAATATATC 1924 het 1924 ref 13 7 4 2 A 5 4 118720 CASAVA_Build 6 110595055 1I GTGATACTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 9 10 118721 CASAVA_Build 6 110610946 1I CCTCTGAAGA -/T TTTTGCCCAC 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 T 4 5 118722 CASAVA_Build 6 110624739 4I TTGCAGGAAA ----/TAAT TAACAGACTC 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 TAAT 0 1 118723 CASAVA_Build 6 110651370 1I AATAGGAAGC -/A AAAACCAACT 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 4 5 118724 CASAVA_Build 6 110668230 1D CACACGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2539 hom 28 8 12 8 T 12 11 118725 CASAVA_Build 6 110674847 1I TAGCATTCTT -/A AAAAAAAAAA 2610 het 2610 ref 28 11 9 8 A 13 14 118726 CASAVA_Build 6 110677331 13I TGCAGCCCAG -------------/GGGGGTGCCCCCT GGGGAGCACA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 GGGGGTGCCCCCT 0 1 118727 CASAVA_Build 6 110679737 1D AAAGGCCACA C/- CCCTTCATAC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 C 4 3 118728 CASAVA_Build 6 110694103 1I GTCTGGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 25 15 13 A 10 11 118729 CASAVA_Build 6 110706936 1I TCTGTAACAA -/G GGTTATGACC 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 G 2 3 118730 CASAVA_Build 6 110730580 2I TACACGTGTG --/TA TATATATATA 2763 het 2763 ref 32 19 10 3 TA 5 6 118731 CASAVA_Build 6 110741992 1D TGTCTGCCCC T/- AACCCTGACC 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 T 1 0 118732 CASAVA_Build 6 110750806 1I GTGTAAGGAA -/G GAGGAACTGG 3070 hom 131 het 49 0 40 9 G 1 2 118733 CASAVA_Build 6 110756157 3D AAGGAAGCAG CCT/--- CCTTTCAGTT 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 CCT 2 1 118734 CASAVA_Build 6 110780490 1D TTTTCATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 22 1 15 6 T 15 14 118735 CASAVA_Build 6 110781308 1D TGGACATATC A/- GGGGGCATCC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 1 0 118736 CASAVA_Build 6 110813433 1D ACACTGCCTG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 7 118737 CASAVA_Build 6 110822005 1D CTTCAGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3019 hom 27 9 10 8 T 12 11 118738 CASAVA_Build 6 110837891 1D AATGCTGATA T/- AGCACTTACT 3070 het 3070 hom 53 19 25 10 T 1 0 118739 CASAVA_Build 6 110839799 1I TTTTCTTCCT -/C CCCCCATTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 5 6 118740 CASAVA_Build 6 110844596 1I TGACATCATA -/T TATCACAACC 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 1 2 118741 CASAVA_Build 6 110846774 1D TAATAAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 34 1 25 8 T 13 12 118742 CASAVA_Build 6 110851573 1I GAGCAACAAC -/A AATAAAAAAT 3070 het 7 hom 37 1 12 24 A 2 3 118743 CASAVA_Build 6 110852308 1I TGGCACTGGC -/G GGGATAGAAA 3070 hom 50 het 20 0 16 4 G 3 4 118744 CASAVA_Build 6 110856247 1I TGTGGCCAGA -/G GCTGTCTTAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 1 2 118745 CASAVA_Build 6 110915113 1D TACCTTGGCT C/- CCCCACTGCC 3003 het 3003 ref 20 9 8 3 C 5 4 118746 CASAVA_Build 6 110921831 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 1273 het 1273 ref 20 9 4 7 A 17 16 118747 CASAVA_Build 6 110945463 1I GCACATTAAC -/T GTTTCCTAAA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 0 1 118748 CASAVA_Build 6 110995415 11I CTTCCTGAGG -----------/GCGAGATCAGT GCTTCTTTGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GCGAGATCAGT 0 1 118749 CASAVA_Build 6 110998513 4D AAAACAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 57 het 21 0 20 13 AG 9 7 118750 CASAVA_Build 6 111003052 1D ACAAGGAAAT C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 90 het 38 0 31 9 C 9 8 118751 CASAVA_Build 6 111004522 11I GTTTACATGA -----------/CTTGGGTAAAC CTTTGGTAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CTTGGGTAAAC 0 1 118752 CASAVA_Build 6 111005570 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 24 0 14 12 A 15 14 118753 CASAVA_Build 6 111009007 1D TCTCTAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 28 0 23 6 A 10 9 118754 CASAVA_Build 6 111009454 1D CATATGAGAT A/- AAATTCACTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 4 3 118755 CASAVA_Build 6 111010316 1D CAATGTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 34 0 31 4 T 11 10 118756 CASAVA_Build 6 111022701 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1210 het 1210 ref 21 12 3 6 A 13 12 118757 CASAVA_Build 6 111024551 1I CCAAGGGCAA -/C CGGAATGGTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 C 1 2 118758 CASAVA_Build 6 111037139 3D GTCCAGTCAT CTG/--- CTTTGTCTTA 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 CTG 1 0 118759 CASAVA_Build 6 111041121 2D AAATATTCAC TT/-- TGTCTAGTAT 3070 het 3070 hom 51 18 26 8 T 3 1 118760 CASAVA_Build 6 111046722 1D GACAGCCCCT C/- CCTCTGCTAT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 C 3 2 118761 CASAVA_Build 6 111059856 3D TCAAGTAGCT TTA/--- TTATTATACC 3070 het 3070 hom 48 19 21 9 TTA 3 2 118762 CASAVA_Build 6 111065954 1D ATGATGCTGA T/- TTTTTTTTTT 2505 het 2505 ref 25 10 8 8 T 11 10 118763 CASAVA_Build 6 111088524 1D GGATGGAGCA G/- GAAGCTAATC 3070 het 3070 ref 48 25 19 5 G 2 1 118764 CASAVA_Build 6 111110736 2D ACAAACATAA AC/-- AGTTTCCACA 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 AC 1 0 118765 CASAVA_Build 6 111130347 1D CAGCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 306 hom 19 1 15 3 A 11 10 118766 CASAVA_Build 6 111137403 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2409 hom 28 7 16 5 A 15 14 118767 CASAVA_Build 6 111143958 1D CATTAAGAGG A/- ATCACATAAC 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 A 2 1 118768 CASAVA_Build 6 111145127 4D TATATATCAC ATAT/---- ATAGATACAT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 AT 3 1 118769 CASAVA_Build 6 111146535 2D TTCAAAGTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 36 2 18 16 A 18 16 118770 CASAVA_Build 6 111155527 4D AAAGAAAATC TCTG/---- TCTGCCCTCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 7 TCTG 2 1 118771 CASAVA_Build 6 111157323 4D TGTTATTTTG TTGT/---- TTGTTTATTT 3070 het 3031 hom 19 8 10 3 TTGT 2 1 118772 CASAVA_Build 6 111162698 3D AAACTATAAA CTT/--- CTTGAGGGAA 3070 het 3070 hom 48 22 26 1 CTT 2 1 118773 CASAVA_Build 6 111163008 1D TTTAATCTTC T/- TTTTTTTTTT 2829 het 2409 hom 20 8 8 4 T 12 11 118774 CASAVA_Build 6 111166252 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 725 het 585 hom 6 2 3 1 A 15 14 118775 CASAVA_Build 6 111166732 3D CAGCCTGCTA CAC/--- CACCATGGTG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 CAC 2 1 118776 CASAVA_Build 6 111168017 1D AAGAATATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 318 hom 27 1 22 4 A 10 9 118777 CASAVA_Build 6 111177306 6I TGTGTCCCCC ------/AGGCTG AAGTACAGTA 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 AGGCTG 0 1 118778 CASAVA_Build 6 111189533 1I GACTAGAGAT -/A AGAGATGTGA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 A 1 2 118779 CASAVA_Build 6 111198189 1D GATTGGGAAG A/- AAAAGAGGTT 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 A 5 4 118780 CASAVA_Build 6 111208381 1D TCAGAATTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 T 9 8 118781 CASAVA_Build 6 111215269 4I GGCTCTGTCT ----/AAAA AAAACAAACA 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 A 4 8 118782 CASAVA_Build 6 111218529 8I TCCACAGATT --------/TACTTTGA CACTTTGAAA 2555 het 2555 ref 21 11 6 4 TACTTTGA 0 1 118783 CASAVA_Build 6 111219067 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1876 het 758 hom 14 3 5 6 A 13 14 118784 CASAVA_Build 6 111227120 4I CCACACATAG ----/AATA AATACAAAGA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 AATA 1 2 118785 CASAVA_Build 6 111230311 4D CTAAGTGAAA TAAG/---- TAAGAAAACA 3070 het 3070 hom 39 14 22 6 TAAG 2 1 118786 CASAVA_Build 6 111231314 1I CTATACTAAG -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 7 8 118787 CASAVA_Build 6 111240943 1I TCCTGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 T 14 15 118788 CASAVA_Build 6 111241607 3D AAAACACTTT ATA/--- ATAGAGTTGT 3070 het 3070 hom 50 15 28 9 ATA 2 1 118789 CASAVA_Build 6 111244593 2D TATTCACCTT AG/-- ACATTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 AG 1 0 118790 CASAVA_Build 6 111254585 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2503 het 806 hom 31 5 10 17 T 17 16 118791 CASAVA_Build 6 111255187 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 11 12 118792 CASAVA_Build 6 111255662 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1998 het 917 hom 19 4 10 5 A 17 16 118793 CASAVA_Build 6 111264525 4D TAATAAAACA TAAG/---- TAAGACACAA 3070 het 3070 ref 26 15 7 6 TAAG 2 1 118794 CASAVA_Build 6 111277918 1I AAACACTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 13 14 118795 CASAVA_Build 6 111295039 1D TTACTTTTTC T/- TTTCTTTTTT 2734 het 2734 ref 17 10 7 0 T 4 3 118796 CASAVA_Build 6 111309721 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 14 15 118797 CASAVA_Build 6 111313315 3I GGCCAAGTTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 het 2970 hom 32 11 14 7 TTG 2 3 118798 CASAVA_Build 6 111320621 1I CGGTCTTTTT -/C CCCCCCCCAG 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 C 8 9 118799 CASAVA_Build 6 111325321 5D ATTTGTAAAC ATCTT/----- AATATGGAGG 3070 het 3070 ref 38 24 13 2 ATCTT 1 0 118800 CASAVA_Build 6 111349965 13D TGTACTATGT TCAGCTGGTGTGA/------------- TCAGCTGGTG 3070 hom 44 het 22 0 15 7 TCAGCTGGTGTGA 2 1 118801 CASAVA_Build 6 111354895 3I GATGTGGTGG ---/TGT GCACCTGTCT 3070 het 3070 hom 25 13 12 1 TGT 0 1 118802 CASAVA_Build 6 111355349 2D TCTGCTATTT AG/-- AAGCAATGGG 3070 het 3070 hom 57 26 26 5 AG 1 0 118803 CASAVA_Build 6 111359139 1I CAACTCTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1239 hom 12 4 8 0 A 11 12 118804 CASAVA_Build 6 111359933 1D23M2I TTGTTTTTTT GTGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTC--/-TGTGTGTTTTTTGTTTTTGTTTCTT TGAGATGGAG 3070 het 3070 ref 26 18 11 2 N/A 0 0 118805 CASAVA_Build 6 111372867 1I TCTTTTTCTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 7 8 118806 CASAVA_Build 6 111388278 1D TCTAATTATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 10 9 118807 CASAVA_Build 6 111388574 7I TTAAGCATAA -------/TAAATAT TAAATATCTC 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 TAAATAT 1 2 118808 CASAVA_Build 6 111389802 3D18M2I TGTTAACGTA TTTTTTTTTTTTTCTTGAGAC--/---TTTTTTTTTTCTTGAGACAG AGTTTTGCTT 3070 het 2690 hom 23 9 15 5 N/A 0 0 118809 CASAVA_Build 6 111392130 1D TGGCTATTTC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 8 7 118810 CASAVA_Build 6 111393345 4I TCATGATGAG ----/TATT TATAGCTTAA 3070 het 3070 ref 39 23 16 0 TATT 0 1 118811 CASAVA_Build 6 111394729 4D AAAATATGAA TATC/---- TATAGTTGAA 3070 het 3070 ref 44 21 22 1 TATC 1 0 118812 CASAVA_Build 6 111397046 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCACGC 1830 het 1830 ref 19 8 6 5 AG 1 2 118813 CASAVA_Build 6 111398394 1D AGTCTACAAC A/- AAGTATTTTA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 3 2 118814 CASAVA_Build 6 111403194 3I TTTTAGAATC ---/TCT TCTTATTTCC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 TCT 1 2 118815 CASAVA_Build 6 111406107 2I ATCTGAACAC --/TT TGGGAGGCTG 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 T 1 3 118816 CASAVA_Build 6 111406344 1D29M1I ACTGTATCTC AAAAAAAAAAATCAATTGATAAAATAACAT-/-AAAAAAAAAATCAATTGATAAAATAACATA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 16 16 2 N/A 0 0 118817 CASAVA_Build 6 111407157 5D TCACCATCAT TTGCC/----- TTGCCATCAA 3070 het 3070 hom 44 20 22 3 TTGCC 2 1 118818 CASAVA_Build 6 111407500 3I TGACAATGGA ---/AGG AGAAGTTCAA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AGG 0 1 118819 CASAVA_Build 6 111407985 1D TGATTTCAGA C/- TTCTGACTTC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 C 1 0 118820 CASAVA_Build 6 111408857 3I GATCCACGCT ---/ACA ACATGTATGA 3070 het 3070 ref 37 21 13 5 ACA 1 2 118821 CASAVA_Build 6 111408961 5D CCATTGAACA TAAAG/----- TAGATTATTG 3070 het 3070 ref 44 26 18 4 TAAAG 1 0 118822 CASAVA_Build 6 111411252 1D AAAAAATTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 9 8 118823 CASAVA_Build 6 111412778 1I GAAAGTGAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 T 8 9 118824 CASAVA_Build 6 111413798 2I TGTGCCACTG --/CA CTCCAGCCTG 1885 het 1885 ref 17 7 5 5 CA 0 1 118825 CASAVA_Build 6 111417076 2D21M1I AAAATTCCTT ACAGTTATTAATATTTTAATTTC-/--AGTTATTAATATTTTAATTTCT TTTCTTTTGG 3070 het 3070 ref 25 13 12 3 N/A 0 0 118826 CASAVA_Build 6 111418165 1I TTTTTCTCTT -/C CAGGATCCCA 3070 het 2331 hom 24 5 14 5 C 1 2 118827 CASAVA_Build 6 111421197 1D CTTTTTAATG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 23 16 3 T 9 8 118828 CASAVA_Build 6 111425796 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2216 het 2216 ref 33 12 7 14 T 15 14 118829 CASAVA_Build 6 111427943 4I TAGGCCATAG ----/TTTA TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 TTTA 0 1 118830 CASAVA_Build 6 111450513 2I TTAGGACGCT --/TG TGTGAATAAA 3070 het 3070 hom 33 8 20 5 TG 2 3 118831 CASAVA_Build 6 111453914 5I TTATTTTCTA -----/CTTTT CTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 CTTTT 1 2 118832 CASAVA_Build 6 111481566 1I AACGTGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 22 1 14 7 T 10 11 118833 CASAVA_Build 6 111483598 1D CTACTCCATT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 7 118834 CASAVA_Build 6 111485384 3D CACTAGGGGG AGA/--- AGAAGGAAGA 3070 hom 148 het 51 0 50 2 AGA 2 1 118835 CASAVA_Build 6 111553963 2D TGTTTATATC TG/-- TGTAATACTC 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 TG 2 1 118836 CASAVA_Build 6 111581430 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2236 hom 24 6 15 3 A 12 11 118837 CASAVA_Build 6 111594064 2I TAATCAAAAC --/TT TACAGAAGAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 1 3 118838 CASAVA_Build 6 111607025 1I ACCCAGCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 9 10 118839 CASAVA_Build 6 111610414 1I TGTATTCTAC -/T GGTGGTTTCA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 0 1 118840 CASAVA_Build 6 111612381 1I TTGGAAATGA -/T TTTTTTTTTT 1389 het 1389 ref 31 17 3 11 T 15 16 118841 CASAVA_Build 6 111622544 1D TTATGAAGCA T/- TATAATATCC 3070 het 3070 hom 43 16 22 7 T 2 1 118842 CASAVA_Build 6 111623952 1D CCATCTCTAC A/- AAAAACATTA 3070 het 2937 hom 16 7 9 0 A 6 5 118843 CASAVA_Build 6 111650353 2I ATATGAAAAC --/AT GTCTGAAAGT 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 AT 0 1 118844 CASAVA_Build 6 111650982 4I CCTGATATTT ----/AAAC AAAGTCTTAC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 AAAC 0 1 118845 CASAVA_Build 6 111652063 1I GCTTGAGCCT -/A TGAGATGGAG 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 0 1 118846 CASAVA_Build 6 111659447 1D ACCAGGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 A 11 10 118847 CASAVA_Build 6 111660753 2I CAATTTCCCC --/CT CTCTATTGGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 CT 2 3 118848 CASAVA_Build 6 111662715 2I AAACAAAAAC --/AT AAAGTGAGGA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 AT 0 1 118849 CASAVA_Build 6 111667091 1D TGCATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 27 1 25 1 T 11 10 118850 CASAVA_Build 6 111667730 1D GTGTTTTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 9 8 118851 CASAVA_Build 6 111671368 1D TTAGTTGGTT G/- GGGGGCTTAG 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 G 6 5 118852 CASAVA_Build 6 111675084 2D TTCATAAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2473 het 1475 hom 26 12 8 6 T 16 14 118853 CASAVA_Build 6 111680929 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 8 9 118854 CASAVA_Build 6 111681228 1D TTTGGAAAGT C/- CTGGCTAAAT 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 C 2 1 118855 CASAVA_Build 6 111692324 1I TTTCTTTTTC -/T TTTCTGTCCT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 3 4 118856 CASAVA_Build 6 111698914 2D GAGTTATCGC AG/-- AGTTATGCCT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 AG 2 1 118857 CASAVA_Build 6 111702501 2I TTTTCCTCTC --/TT AATGTTTATC 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 0 2 118858 CASAVA_Build 6 111716450 5D TCTTTACAAT TAACA/----- TTTTAAAACT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TAACA 1 0 118859 CASAVA_Build 6 111716816 1I GCCTCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 306 hom 12 1 8 3 T 10 11 118860 CASAVA_Build 6 111722999 7D TCTTTTTCTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTGA 2575 het 113 hom 10 1 7 4 T 15 8 118861 CASAVA_Build 6 111725535 2I TTTAAAACTG --/CT CTCTTCACAT 3070 hom 141 het 53 0 46 7 CT 2 3 118862 CASAVA_Build 6 111726683 4D AAGATCTACT AACA/---- AACAAGTACA 3070 hom 42 het 23 0 14 9 AACA 2 1 118863 CASAVA_Build 6 111727299 3D AGCATTTTTT AAA/--- AAAAAATAAT 3070 hom 94 het 35 0 32 4 A 9 6 118864 CASAVA_Build 6 111734928 2D GCTCAAAAAC TT/-- TCAGTTTTGG 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 T 3 1 118865 CASAVA_Build 6 111736286 1I TAGTAACATA -/T TAGGTGGGCA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 1 2 118866 CASAVA_Build 6 111747006 1D ACATGTTGTT A/- AAAATTATAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 5 4 118867 CASAVA_Build 6 111749858 1I CACAGCAAGC -/A AGGAAGCATG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 2 118868 CASAVA_Build 6 111752763 1D CTCAAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 31 1 17 13 T 13 12 118869 CASAVA_Build 6 111754502 1I TGGGTATATA -/C CCCCCCCCAA 2078 het 2078 ref 21 8 5 8 C 8 9 118870 CASAVA_Build 6 111763959 1I TGTTCATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 A 10 11 118871 CASAVA_Build 6 111769879 1D GTGAGCCCAG A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 A 7 6 118872 CASAVA_Build 6 111772250 4I TATACATATT ----/GACA GACAGAAGCA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 GACA 1 2 118873 CASAVA_Build 6 111792380 1I TACAAAATTA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 6 7 118874 CASAVA_Build 6 111794538 1I TACAAGAGCT -/A ATAATGTAGA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 1 2 118875 CASAVA_Build 6 111817926 1I CACCACACCC -/G GCCGGTCATT 3070 het 1316 hom 16 5 9 2 G 1 2 118876 CASAVA_Build 6 111826524 6I AGTAAAACTC ------/CATTAA CATGTATTAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 CATTAA 0 1 118877 CASAVA_Build 6 111847318 5D AAAATTTGTA GTTCT/----- GTAATTTGCT 2218 het 2218 ref 31 22 7 4 GTTCT 1 0 118878 CASAVA_Build 6 111851151 4I GAAGCACAAA ----/AAGG ATCCTATGGC 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AAGG 0 1 118879 CASAVA_Build 6 111857432 2D CCATTTGTAA CT/-- CTGTTTGGTA 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 CT 2 1 118880 CASAVA_Build 6 111866824 1I ATTAAAAGAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 8 9 118881 CASAVA_Build 6 111870886 2I GCTATGTTGT --/TA ATTATAAGTT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 TA 0 1 118882 CASAVA_Build 6 111877298 2I AGAGAACTGC --/AA AGAGACAGAC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 1 3 118883 CASAVA_Build 6 111888324 1D GCGGAAAAAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 7 118884 CASAVA_Build 6 111896650 1D CATGTAAGAT A/- ATATTTAGCC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 2 1 118885 CASAVA_Build 6 111900276 1D ATAAATGGAA G/- AAAAATAGTA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 G 1 0 118886 CASAVA_Build 6 111901136 1I TTTTTTTTTT -/C TTAAAGAGAC 3070 het 216 hom 32 1 28 3 C 0 1 118887 CASAVA_Build 6 111903038 1D TGCCTCTTGC T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 T 7 6 118888 CASAVA_Build 6 111906526 1D CCAATTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2483 hom 24 7 9 8 A 15 14 118889 CASAVA_Build 6 111925250 1I AGATCGTGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2333 hom 28 7 16 5 A 9 10 118890 CASAVA_Build 6 111925513 3D AGAATATGTA CTT/--- CTCATAATTA 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 CTT 1 0 118891 CASAVA_Build 6 111926055 1I GTCCACCATT -/C CAGATCCTCA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 1 2 118892 CASAVA_Build 6 111930852 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1342 hom 26 4 12 10 A 19 18 118893 CASAVA_Build 6 111943849 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 31 2 12 17 T 15 14 118894 CASAVA_Build 6 111944523 1I CATTCATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 10 11 118895 CASAVA_Build 6 111946908 4D CAATTCTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 38 0 30 9 TTTG 5 4 118896 CASAVA_Build 6 111949105 1D CATTTTGATA T/- GTTGTCTTTT 2762 het 2762 ref 16 7 6 4 T 1 0 118897 CASAVA_Build 6 111950549 3I CTGAGAGTTG ---/TTC TTCTAATAGT 3070 hom 144 het 56 0 48 8 TTC 1 2 118898 CASAVA_Build 6 111954631 1I CTAAAAATGC -/A AAAAAAAAAT 2644 hom 18 het 7 0 7 0 A 9 10 118899 CASAVA_Build 6 111956041 4I AAGAAGCAGC ----/TTCA TTCATTCTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TTCA 1 2 118900 CASAVA_Build 6 111961528 2D CACCCCCCCT CC/-- CCCCCCCCGC 2202 hom 21 het 13 0 7 8 C 10 8 118901 CASAVA_Build 6 111962776 1D CCAAACCCTT A/- AAAAAAAAAA 2509 hom 18 het 9 0 6 3 A 12 11 118902 CASAVA_Build 6 111963554 1D GAATCTCTGC A/- AGTGGGACCC 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 A 2 1 118903 CASAVA_Build 6 111967168 1D AACAAAGGTC T/- TTTGAGAGGA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 4 3 118904 CASAVA_Build 6 111971825 1I GACTTACACA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 6 7 118905 CASAVA_Build 6 111972492 1D AAAAAAAAAA C/- ATTCCATCAT 3070 het 3070 ref 22 11 9 3 C 1 0 118906 CASAVA_Build 6 111976600 1D AAAATGAAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 9 118907 CASAVA_Build 6 111976789 4D TTACCTTATT CTAA/---- CTATCTCCAT 3070 het 3070 hom 34 12 19 5 CTAA 1 0 118908 CASAVA_Build 6 112001560 14D CCTGGGTCAG CTTAGAGCAGCAGA/-------------- CAGTACAGTT 3070 hom 111 het 38 0 37 2 CTTAGAGCAGCAGA 1 0 118909 CASAVA_Build 6 112009623 5I CCTGTAATCC -----/CAGCA CAGCACTTTG 3070 hom 56 het 21 0 19 3 CAGCA 1 2 118910 CASAVA_Build 6 112048478 1I GAGGTGGGGG -/T TGGTTATATT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 1 2 118911 CASAVA_Build 6 112051542 1I ATCTGGAAAG -/C CCCGAGTCCT 3070 hom 96 het 34 0 30 4 C 3 4 118912 CASAVA_Build 6 112055839 2D GTTCTTGCCT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 11 9 118913 CASAVA_Build 6 112074211 1I TGCATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 15 8 T 10 11 118914 CASAVA_Build 6 112080340 1I AGTATCTAAT -/A AATCTTCAGC 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 2 3 118915 CASAVA_Build 6 112082550 6D TATGAGAATG TGAATA/------ TGAATATATT 3070 het 3070 ref 33 20 13 7 TGAATA 2 1 118916 CASAVA_Build 6 112082773 4D TTGAGATGCT TGTG/---- TGTGTGTACT 3070 het 3070 ref 44 24 14 8 TG 5 3 118917 CASAVA_Build 6 112082987 5D CTCCGCTGTA CCCCC/----- CCCCCCCATT 3070 het 765 hom 21 5 11 6 C 12 7 118918 CASAVA_Build 6 112093515 4D CCTTTTATTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2157 hom 14 5 8 2 TTTA 3 2 118919 CASAVA_Build 6 112111624 1D GTAATAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 A 12 11 118920 CASAVA_Build 6 112114054 1D GCCAATTTGA C/- CTGCTCCCCC 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 C 2 1 118921 CASAVA_Build 6 112116519 19D CCGTGCCCAC GCAGCGTGTGTGTGCTCAT/------------------- GCAGCGTGTG 3070 het 3070 ref 35 24 9 11 GCAGCGTGTGTGTGCTCAT 2 1 118922 CASAVA_Build 6 112152945 12D TTCAGTCAGC AGGAATAGCATT/------------ AGGAAAAGGA 3070 het 3070 hom 39 18 19 8 AGGAATAGCATT 1 0 118923 CASAVA_Build 6 112169421 3I CATTTTTTAT ---/AAC AACAGTGTGT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AAC 1 2 118924 CASAVA_Build 6 112258410 2I ACAGTGCTGG --/GA GAGAGAGTCC 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 GA 3 4 118925 CASAVA_Build 6 112462533 1D GCTCCCAAGT A/- AAAACTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 5 4 118926 CASAVA_Build 6 112466625 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 A 8 9 118927 CASAVA_Build 6 112477678 2D GATTTCTCTC TG/-- TTTCCCAGGC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 TG 1 0 118928 CASAVA_Build 6 112480550 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3008 het 471 hom 14 1 10 3 A 13 14 118929 CASAVA_Build 6 112500908 1D TTACACTAAC A/- AAATATTAGA 3070 het 3070 hom 20 7 11 2 A 4 3 118930 CASAVA_Build 6 112501020 1I TTTCTGGGGG -/A AAAAGGCTTC 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 4 5 118931 CASAVA_Build 6 112505369 5I ATTAGTACTG -----/TTTTC TTTTCTTAAA 3070 het 3070 ref 32 16 16 0 TTTTC 1 2 118932 CASAVA_Build 6 112517285 1I AAGAGGGGAG -/A AAAAGAAAAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 4 5 118933 CASAVA_Build 6 112518104 4I TTGTGGGTGG ----/TCTA TCTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 TCTA 0 1 118934 CASAVA_Build 6 112518951 8D CATTCTACTC TCTACTTT/-------- TATGAGCTTG 3070 het 3070 ref 40 24 13 7 TCTACTTT 1 0 118935 CASAVA_Build 6 112519775 2D AGGGACAAAG AA/-- ATATGAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 20 8 A 3 1 118936 CASAVA_Build 6 112524371 1I AGAGTGGTGT -/G GAACAGGTGA 3070 het 477 hom 8 1 7 0 G 1 2 118937 CASAVA_Build 6 112530381 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 9 10 118938 CASAVA_Build 6 112532197 2I GACAATAGAC --/TG TGATGAAGTA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 TG 1 2 118939 CASAVA_Build 6 112538099 5I AACTTTCTCC -----/TCTTA TCTTAATTAG 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 TCTTA 1 2 118940 CASAVA_Build 6 112540559 3I CAGGAGACAA ---/AGG AGGAGAAGAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AGG 1 2 118941 CASAVA_Build 6 112542138 3I TGGAGTGATG ---/AAT AATTTTTAAC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 AAT 1 2 118942 CASAVA_Build 6 112552995 1I TGTCCCAGCA -/G GGGCTAGAAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 3 4 118943 CASAVA_Build 6 112557068 16D AATTAAAATG TGTGTGTGTGTGTGCA/---------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 30 13 17 5 TGTGTGTGTGTGTGCA 1 0 118944 CASAVA_Build 6 112574511 1I CCTAAGGGCA -/G GGGCCATGGT 3070 het 3070 hom 51 16 26 9 G 3 4 118945 CASAVA_Build 6 112576603 1D AAGAAAGATA T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 7 6 118946 CASAVA_Build 6 112579020 1D CGGCATCCAA G/- TCAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 G 1 0 118947 CASAVA_Build 6 112587224 5I AAAAGAGAAG -----/TTAAC TTAATTACAT 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 TTAAC 0 1 118948 CASAVA_Build 6 112591063 1I TTTGTAGAGA -/G GGGGGTCTCA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 5 6 118949 CASAVA_Build 6 112599573 2D TTCATTTAGC AA/-- AAAAAAAAAA 1885 het 42 hom 24 2 8 14 A 17 15 118950 CASAVA_Build 6 112628929 1I AATATAATTG -/A AAAAAAATAA 3070 het 740 hom 18 2 15 1 A 7 8 118951 CASAVA_Build 6 112635609 1D AGTAAGGAGG T/- TTTTTTTTTG 1342 het 1342 ref 51 38 3 10 T 10 9 118952 CASAVA_Build 6 112643425 1I GGAAAACCTC -/T TTTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 5 6 118953 CASAVA_Build 6 112669181 1D TACTCCTCCT C/- ATGTTTAAGG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 0 118954 CASAVA_Build 6 112673565 1I TCTACTCTGC -/A AAAGACTTGT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 3 4 118955 CASAVA_Build 6 112685580 1I CAAGAACCTT -/C CTCTTGGGGT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 C 1 2 118956 CASAVA_Build 6 112690480 2D ATTCCATCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 9 3 T 13 11 118957 CASAVA_Build 6 112693796 2I AGACCCTGTT --/AA AAAAAAAAAA 700 het 700 ref 37 14 6 17 A 14 16 118958 CASAVA_Build 6 112694055 4D TTGCTGCTAG AAGA/---- AAGAGAGAAG 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 AAGA 2 1 118959 CASAVA_Build 6 112696353 4I AAGGATCATA ----/TGAT TGGAAGGAGG 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 TGAT 0 1 118960 CASAVA_Build 6 112719266 1D TATTCTTATG C/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 20 21 9 C 1 0 118961 CASAVA_Build 6 112722971 1D GTGAAAAGAT C/- ACTTGAGGCC 3070 hom 66 het 26 0 21 5 C 1 0 118962 CASAVA_Build 6 112741144 1I TTATTGTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 9 10 118963 CASAVA_Build 6 112750099 1I CAGGGAGAAA -/G AACCTCACCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 118964 CASAVA_Build 6 112752841 1D ATGGCATAAC T/- TTTGATGTAA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 T 4 3 118965 CASAVA_Build 6 112753735 1I GCTTTGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 30 1 21 8 T 10 11 118966 CASAVA_Build 6 112759011 1I CGGAAACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 33 1 23 9 A 13 14 118967 CASAVA_Build 6 112760198 1D TGAAGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 11 10 118968 CASAVA_Build 6 112816437 1D GGAGTTCACT G/- TATGATGTGA 3070 het 3070 hom 47 21 22 6 G 1 0 118969 CASAVA_Build 6 112829243 1I ATCTGCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 16 13 T 16 17 118970 CASAVA_Build 6 112858303 3I GAACATGCAT ---/AGA AGGAGAGACT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AGA 0 1 118971 CASAVA_Build 6 112863853 1I AGTCTTTCAC -/A AGTTTAGGCC 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 A 1 2 118972 CASAVA_Build 6 112868114 13D CATTGGTTTG GTTTGAAACCAAT/------------- GAAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 44 20 24 2 GTTTGAAACCAAT 1 0 118973 CASAVA_Build 6 112906909 1D ACCATATTTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 11 9 7 A 10 9 118974 CASAVA_Build 6 112920876 1I AATTAATGAT -/A AAAAATTATA 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 A 5 6 118975 CASAVA_Build 6 112921029 8I AATTTCAAAT --------/TATACTAC TAATTAATCT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 TATACTAC 0 1 118976 CASAVA_Build 6 112937176 1D CACTTTCTTC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 37 17 15 6 T 8 7 118977 CASAVA_Build 6 112953566 1D ATTGGAATTA T/- TAATATTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 T 2 1 118978 CASAVA_Build 6 112959174 1D TGATACATTT A/- TTTTTTTTGG 2123 het 2123 ref 18 11 5 2 A 1 0 118979 CASAVA_Build 6 112976477 1I GCCTTACACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 T 8 9 118980 CASAVA_Build 6 112982374 1I AAATTTTTTT -/C TTCATAATAT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 C 0 1 118981 CASAVA_Build 6 113010395 1I TATTTTTTTT -/C TGCTCTTATT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 C 0 1 118982 CASAVA_Build 6 113015420 3D TGGTTGGTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 47 1 30 18 T 15 12 118983 CASAVA_Build 6 113022624 5I ATGATGGTTG -----/TTCAT TTCAAGTTAT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TTCAT 0 1 118984 CASAVA_Build 6 113038901 1I GAAATTGAAA -/C TTTTTTGGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 118985 CASAVA_Build 6 113039787 1I CTTTGAAGGG -/A AAAAAATAGG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 6 7 118986 CASAVA_Build 6 113055566 2I TTTCCATAGC --/AG AGCTATTAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AG 1 2 118987 CASAVA_Build 6 113062819 1I AAATCCATAA -/C TCCTGAGAAA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 C 0 1 118988 CASAVA_Build 6 113070637 5D TTCATTTCCC TTGGG/----- TAGGAGTGAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTGGG 1 0 118989 CASAVA_Build 6 113070903 3D TTTATGTGTT TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 TAA 6 5 118990 CASAVA_Build 6 113071151 1I ATTAAAAACA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 29 hom 21 2 15 4 T 8 9 118991 CASAVA_Build 6 113071920 1D ATTCAAATTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 9 8 118992 CASAVA_Build 6 113073665 11D TAAACTCATA AATAATAATGT/----------- AATAATAATG 3070 hom 126 het 53 0 43 12 AATAATAATGT 2 1 118993 CASAVA_Build 6 113077288 1I AGTGATTCAC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 8 118994 CASAVA_Build 6 113080855 1I ATCTAGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 T 11 12 118995 CASAVA_Build 6 113081012 16D TCAGTGCAGT TTCCTCCCTCTCTCCC/---------------- TTCCTCCCTC 3070 het 3070 ref 47 22 16 15 TTCCTCCCTCTCTCCC 2 1 118996 CASAVA_Build 6 113081472 1D AAGAGATATT A/- ATAAAAATGC 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 2 1 118997 CASAVA_Build 6 113083311 6I CTGACCAGTA ------/GATAGT TTAGTCTTGT 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 GATAGT 0 1 118998 CASAVA_Build 6 113087696 1I AAATATTAAA -/T TTGTTGAGGG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 2 3 118999 CASAVA_Build 6 113093491 1I CTTGTCTGGC -/A AAGTTGTTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 3 119000 CASAVA_Build 6 113099595 1D TAACTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 39 3 24 13 A 14 13 119001 CASAVA_Build 6 113101886 10I CACAACATGT ----------/GGAAATTACG GGAGCTACAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 GGAAATTACG 0 1 119002 CASAVA_Build 6 113102673 1I AGGAGGGCAG -/A AGAAGGTGAT 3070 hom 84 het 36 0 27 9 A 1 2 119003 CASAVA_Build 6 113103995 2I ATAGACCAAT --/GG AACAGAACAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 0 2 119004 CASAVA_Build 6 113106839 2D TGATGAACAC TT/-- GATATGATCA 3070 hom 126 het 46 0 43 4 T 2 0 119005 CASAVA_Build 6 113109668 18I ATCCAGGAGT ------------------/AGGGGATAAGACCTTAGC ACCAAGGCCT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AGGGGATAAGACCTTAGC 0 1 119006 CASAVA_Build 6 113114444 1I AACTTTTGGA -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 50 het 35 1 29 5 T 6 7 119007 CASAVA_Build 6 113116094 1I TCATAGAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 10 119008 CASAVA_Build 6 113117990 3I CAAATATATC ---/ATT ATTATTATTA 3070 hom 63 het 31 0 21 10 ATT 4 5 119009 CASAVA_Build 6 113118396 1D TCAATAAGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 10 9 119010 CASAVA_Build 6 113118629 1D TAATGAAGAG A/- AAAAAACAGC 3070 hom 117 het 48 0 39 9 A 7 6 119011 CASAVA_Build 6 113120514 4D TGAGACCTAG GAAA/---- GAAAACTAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 GAAA 2 1 119012 CASAVA_Build 6 113126926 1I ACTCCAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 15 11 A 11 12 119013 CASAVA_Build 6 113127064 1D AGTGTTAGTG T/- TAGTGTGTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 2 1 119014 CASAVA_Build 6 113137518 1D TGGTTGGGTC G/- GGGGAGGGGG 2221 het 246 hom 7 2 5 0 G 5 4 119015 CASAVA_Build 6 113137673 2D AAAAAAAAAA AT/-- AAATAAAGAG 2625 het 92 hom 18 1 11 8 AT 1 0 119016 CASAVA_Build 6 113145103 3I GTTTTCTTGG ---/TCA TCATTTTTAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TCA 1 2 119017 CASAVA_Build 6 113155783 1I CTCTATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 569 hom 27 2 21 4 T 10 11 119018 CASAVA_Build 6 113177109 2D TCAATTTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 39 0 24 15 T 13 11 119019 CASAVA_Build 6 113184375 1D TAAAAAAAAA T/- ACCTGCCAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 1 0 119020 CASAVA_Build 6 113188349 1D CTTCTGTATC T/- TTTAATTTTT 3070 het 3070 hom 38 18 19 2 T 4 3 119021 CASAVA_Build 6 113205679 9I GATATAGGTA ---------/TTGTTGTTT TTGTTGTTAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTGTTGTTT 0 1 119022 CASAVA_Build 6 113208963 1D AGAGTAATCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 10 9 119023 CASAVA_Build 6 113219940 1I GTATTTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 9 10 119024 CASAVA_Build 6 113226263 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AATTAAGATA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAG 0 1 119025 CASAVA_Build 6 113226836 2D CTAATTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 1973 het 31 hom 12 1 7 5 T 18 16 119026 CASAVA_Build 6 113232431 1D ACGAATATTC T/- TTCTACAGTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 3 2 119027 CASAVA_Build 6 113232689 1D TACTCAGAAC A/- AGCCCATGAT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 2 1 119028 CASAVA_Build 6 113234099 4D16M1D TTTGTATCCA TTTCTTTCTATTATATTTACA/----TTTCTATTATATTTAC- AAAAAAAATA 3070 hom 132 het 38 0 45 6 N/A 0 0 119029 CASAVA_Build 6 113235688 2D CAGAAAAAAT AC/-- AGTTTGGAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 AC 1 0 119030 CASAVA_Build 6 113239048 1D TTTGAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 37 0 27 12 A 11 10 119031 CASAVA_Build 6 113246873 1I61M1I GCATGGCACA -TGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAAT-/CTGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATA AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 20 0 20 8 N/A 0 0 119032 CASAVA_Build 6 113248702 4I ATAACGTCAT ----/AGTC AGCCAATTGT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 AGTC 0 1 119033 CASAVA_Build 6 113250702 2D TCACAACTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 41 1 25 15 T 15 13 119034 CASAVA_Build 6 113256026 2D GGCAAAGTAA TC/-- TCTCTTTGCA 3070 hom 135 het 48 0 46 5 TC 3 2 119035 CASAVA_Build 6 113330188 4I TAACCGTCTC ----/TCTT TCTATCTCTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TCTT 0 1 119036 CASAVA_Build 6 113333742 4I TTTGTCAATC ----/TGTA TGTGCATGTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TGTA 0 1 119037 CASAVA_Build 6 113337746 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 4 A 11 10 119038 CASAVA_Build 6 113340271 7I AATTGACCAC -------/ATAATTT ATCTATTACT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATAATTT 0 1 119039 CASAVA_Build 6 113351255 1I TGGCTTAGAA -/T TTTACGTAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 3 4 119040 CASAVA_Build 6 113372624 4D CTGTCTCAGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 19 0 12 7 A 15 11 119041 CASAVA_Build 6 113378595 5D TATTTAATTG ATTAA/----- ATTATATAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 6 ATTAA 1 0 119042 CASAVA_Build 6 113379851 1I TGTTGACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 40 0 33 7 A 10 11 119043 CASAVA_Build 6 113382129 2D GTTAGGTGTT TG/-- TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TG 1 0 119044 CASAVA_Build 6 113382401 1I GTTGAAACCT -/A ATCCCTGATG 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 1 2 119045 CASAVA_Build 6 113387708 1D TTACAAGAAT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 8 7 119046 CASAVA_Build 6 113388406 1D GTGGGGTGCT A/- GTGGAGGGAT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 1 0 119047 CASAVA_Build 6 113391696 1D GACAACACTG A/- AAAGATAGAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 4 3 119048 CASAVA_Build 6 113415592 1I ACACACAGCA -/T AGTAGCCAAT 3070 hom 117 het 41 0 36 5 T 0 1 119049 CASAVA_Build 6 113421580 8D CCAGATAGCT GGTCAGGA/-------- ATTGTCTCAA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 GGTCAGGA 1 0 119050 CASAVA_Build 6 113437894 1I TATTTGTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 89 hom 31 1 29 1 A 9 10 119051 CASAVA_Build 6 113448122 1I AAACCAAAAA -/G TCCTGATAGA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 G 0 1 119052 CASAVA_Build 6 113457927 6I TGAATTAGCA ------/GCATTT GCATTTGCAG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 GCATTT 1 2 119053 CASAVA_Build 6 113458784 1D AGCCTCAGAT A/- AAACACACCA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 4 3 119054 CASAVA_Build 6 113461682 1I GGATTTCTAA -/T TGCTCTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 2 119055 CASAVA_Build 6 113466523 10I ACCCAGTCTA ----------/TATACTTTTT TATGGCAGAC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TATACTTTTT 0 1 119056 CASAVA_Build 6 113469770 5D TAAAGTAGTT TTCTC/----- TAATTCTGTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TTCTC 1 0 119057 CASAVA_Build 6 113473094 2I ACAAAAACAC --/AG AGGAAACAGC 3070 hom 94 het 37 0 30 7 AG 1 2 119058 CASAVA_Build 6 113473822 3D ATCAGCTGTT GAG/--- GATGAACCCT 3070 hom 102 het 41 0 34 8 GAG 1 0 119059 CASAVA_Build 6 113477732 23D TCCATGTGTT TGTTTATTTGTCACTTTTCCATG/----------------------- TGTTTATTTG 1748 het 230 hom 40 6 6 31 TGTTTATTTGTCACTTTTCCATG 1 0 119060 CASAVA_Build 6 113482540 10D GTTCTTAAAA AAGAAACAAG/---------- AAGAAACATA 3070 hom 78 het 30 0 27 6 AAGAAACAAG 1 0 119061 CASAVA_Build 6 113496923 1D TATGAAAAGC A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 6 5 119062 CASAVA_Build 6 113497254 1I ATCACAGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 A 13 14 119063 CASAVA_Build 6 113497629 1I TGGCAGCAAG -/A AATGCCAAGC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 2 3 119064 CASAVA_Build 6 113500754 3D ATTGTATAAC ATT/--- ATTGTTTATA 3070 het 1315 hom 24 4 13 7 ATT 2 1 119065 CASAVA_Build 6 113500777 1I TTAAAAACTT -/A AAAAATTCTA 3070 het 1485 hom 28 5 13 10 A 5 6 119066 CASAVA_Build 6 113501729 4D AATTTCAAAA AAAC/---- AAACTGTATA 3070 het 3070 hom 24 11 11 7 AAAC 2 1 119067 CASAVA_Build 6 113502185 4I CATTTTTCCC ----/AGAT AGTTATTCAG 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 AGAT 0 1 119068 CASAVA_Build 6 113507869 3I TTATTGAGTG ---/TTC TTATTTTAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTC 0 1 119069 CASAVA_Build 6 113509931 1I TAAAAAAAAT -/A AAGAAAGAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 2 3 119070 CASAVA_Build 6 113514941 1D CTTCCAAGAC A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 24 9 10 6 A 8 7 119071 CASAVA_Build 6 113516378 1D GCCTGGAAGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 8 119072 CASAVA_Build 6 113517920 2I GCACACACAC --/AT ATACATAAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 AT 1 2 119073 CASAVA_Build 6 113521821 1I CTTGTATCAA -/G GAAAAATGAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 G 1 2 119074 CASAVA_Build 6 113522954 1I AAGTGCCCTT -/A AAAAAATATT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 A 6 7 119075 CASAVA_Build 6 113523078 2D TTCAAACTAT TA/-- TATATATATA 2686 hom 33 het 14 0 10 4 TA 9 8 119076 CASAVA_Build 6 113523151 1I TATATATATG -/T ATATACCCAA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 0 1 119077 CASAVA_Build 6 113524629 1D ATCATAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 12 11 119078 CASAVA_Build 6 113530701 3I TAAGAGGAAC ---/ATT ATTATTTACA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 ATT 2 3 119079 CASAVA_Build 6 113541655 1D ACTCCAGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 11 10 119080 CASAVA_Build 6 113544293 1I GAAAAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 539 hom 42 2 34 6 A 10 11 119081 CASAVA_Build 6 113544566 1D AAATTATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 33 1 24 9 A 12 11 119082 CASAVA_Build 6 113547135 1D AAAGTTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 39 1 31 8 A 13 12 119083 CASAVA_Build 6 113559662 2I TGGAAGTACA --/TT TATATTAATG 3070 hom 102 het 37 0 33 4 T 1 3 119084 CASAVA_Build 6 113602451 1D TTTTTATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 21 9 A 14 13 119085 CASAVA_Build 6 113634281 10D TTGATTATCT TCTTATTGTA/---------- TGTTGTATCA 3070 het 3070 hom 41 17 20 7 TCTTATTGTA 1 0 119086 CASAVA_Build 6 113635732 1D TTTTTGAGAC A/- AGAGTCTCGC 2571 het 2571 ref 14 7 6 1 A 2 1 119087 CASAVA_Build 6 113635822 6D CCATTCTCCT GCCTCA/------ GCCTCCCGAG 858 hom 5 het 2 0 2 1 GCCTCA 1 0 119088 CASAVA_Build 6 113647703 8I CTCTTTTGAT --------/TCCAGGAG TCAACATGTA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 TCCAGGAG 0 1 119089 CASAVA_Build 6 113662713 24D AAGAACCATA TTATTTTATTTTATTTATTTTATT/------------------------ TTATTTTATT 3070 het 39 hom 18 1 10 9 TTATTTTATTTTATTTATTTTATT 1 0 119090 CASAVA_Build 6 113664204 1I AAATGTACAC -/A AACGTATACA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 2 3 119091 CASAVA_Build 6 113665321 2I TAAGAAAGCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 18 8 A 12 14 119092 CASAVA_Build 6 113678257 1D GGTCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 13 12 119093 CASAVA_Build 6 113699453 1I TACAGGAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 T 9 10 119094 CASAVA_Build 6 113704823 1D TAAAATGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 12 11 119095 CASAVA_Build 6 113707712 3D AGAGACAAAT CTC/--- CTGTACAGAA 3070 het 3070 hom 33 9 22 5 CTC 1 0 119096 CASAVA_Build 6 113736892 3I GTTGCTGTCT ---/AAG AAGATTATTC 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 AAG 1 2 119097 CASAVA_Build 6 113739163 3D TGTATACATA TAT/--- TATATGTACA 3070 het 3070 ref 42 24 13 7 TAT 2 1 119098 CASAVA_Build 6 113741730 1I AATTTTCGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 9 10 119099 CASAVA_Build 6 113762879 1I CCCCTAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 A 10 11 119100 CASAVA_Build 6 113766448 2I AAATAATATT --/TC TCTCTCTCTA 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 TC 4 5 119101 CASAVA_Build 6 113768727 4D TAAAATTAAG ATAT/---- ATATATATAT 2956 het 1872 hom 12 4 6 3 AT 10 8 119102 CASAVA_Build 6 113783284 3I TATCATTATC ---/ATT ATTATTATTA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 ATT 5 6 119103 CASAVA_Build 6 113785438 1D CCTTCATTTT G/- GGGTATTGTT 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 G 4 3 119104 CASAVA_Build 6 113791363 1I TCTTTTTGTT -/A ATAGTTTTAC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 1 2 119105 CASAVA_Build 6 113794738 2I ACAGGATACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 10 12 119106 CASAVA_Build 6 113803741 1I GTTTTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 32 1 27 4 G 0 1 119107 CASAVA_Build 6 113804285 1I TAGATTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 33 1 24 8 T 10 11 119108 CASAVA_Build 6 113807003 2D AAAAAATCCC CT/-- GATAGGTGAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 CT 1 0 119109 CASAVA_Build 6 113808410 8D ATATAATTTG TATATATA/-------- TATATATATA 1698 hom 10 het 5 0 4 2 TA 11 7 119110 CASAVA_Build 6 113808505 6I CGTGAAAGTC ------/TTGTTT ACTCAATTTG 3070 hom 72 het 26 0 23 3 TTGTTT 0 1 119111 CASAVA_Build 6 113811909 1I AATGCTAGAA -/T TTTTTTTTTT 2855 het 2855 ref 15 7 6 2 T 10 11 119112 CASAVA_Build 6 113812784 5D TATATTTGAC AAAAT/----- AAGAGAATTG 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 AAAAT 1 0 119113 CASAVA_Build 6 113813651 1D AATAATTGCA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 T 8 7 119114 CASAVA_Build 6 113816290 1D TCTAGTGACT A/- ACAACAACTA 3070 hom 123 het 50 0 42 9 A 2 1 119115 CASAVA_Build 6 113820226 1D GTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 10 9 119116 CASAVA_Build 6 113821083 1D AGACATCAAG T/- TGCACTTCAG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 2 1 119117 CASAVA_Build 6 113822164 3D GGGATTAGTG TTA/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 40 20 18 3 TTA 1 0 119118 CASAVA_Build 6 113824153 1D TATAGAGGGG C/- GGGGGTGCCA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 C 1 0 119119 CASAVA_Build 6 113829900 4D GTACCTGTAG CATT/---- TTTATCTATC 1723 het 1723 ref 40 15 7 18 CATT 1 0 119120 CASAVA_Build 6 113831402 1D AATTGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 30 1 22 8 T 12 11 119121 CASAVA_Build 6 113834766 1D TTTTATAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 19 19 10 T 11 10 119122 CASAVA_Build 6 113858325 1I AATAATTCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 T 8 9 119123 CASAVA_Build 6 113866438 2D ATAATTTGGT TA/-- TGTTTTATTC 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 TA 1 0 119124 CASAVA_Build 6 113866531 1D ACATAACAGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 9 8 119125 CASAVA_Build 6 113887307 1D TTTCCCCCAA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2322 hom 29 9 12 8 C 10 9 119126 CASAVA_Build 6 113903946 15D CCTGTTTTGT TTTTGTTTTGTTATG/--------------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 45 30 12 9 TTTTGTTTTGTTATG 1 0 119127 CASAVA_Build 6 113906731 1D AACGCCTCTG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 8 7 119128 CASAVA_Build 6 113938705 1D ACCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 13 12 119129 CASAVA_Build 6 113997489 1D38M1I TTATTCTCAG TTTGTTATTTAGAAAATTTTATCCCATTATAGATTTTTC-/-TTGTTATTTAGAAAATTTTATCCCATTATAGATTTTTCT TTTTTTCTGA 3070 hom 120 het 36 0 40 5 N/A 0 0 119130 CASAVA_Build 6 113998862 1D ACATTAGATA G/- AACTATTTTA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 G 1 0 119131 CASAVA_Build 6 114002091 1D CTTCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 9 A 11 10 119132 CASAVA_Build 6 114002768 1D TAGGTCATAA G/- ACTAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 G 1 0 119133 CASAVA_Build 6 114004249 1I AAGAAGAAAA -/C AAATCATATG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 0 1 119134 CASAVA_Build 6 114007551 4I TTCTATCTTT ----/TTTC TTTCTTTATT 3070 het 3070 ref 26 10 12 4 TTTC 1 2 119135 CASAVA_Build 6 114008373 1I TGTCCAAATA -/G GGCCAATTGT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 G 2 3 119136 CASAVA_Build 6 114016128 1D TTGTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 507 het 507 ref 36 31 2 3 G 1 0 119137 CASAVA_Build 6 114048827 2I TGACCAACCC --/TA TGTCTTGTCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TA 0 1 119138 CASAVA_Build 6 114053217 1D GAAAGAACTT A/- ACATTAACAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 2 1 119139 CASAVA_Build 6 114059809 1D TCTCTGTCAC T/- AGCCAGTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 1 0 119140 CASAVA_Build 6 114063515 3D AAGTGTACCG AGA/--- AGAAGTACAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 AGA 2 1 119141 CASAVA_Build 6 114064198 1D TTTTAAAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 10 9 119142 CASAVA_Build 6 114068458 1I ACTATTAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 9 10 119143 CASAVA_Build 6 114070589 1D AAAGGTCTAC T/- TAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 63 28 29 7 T 2 1 119144 CASAVA_Build 6 114070939 3D GCTAAGCTAG TAA/--- TTCTTGAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 TAA 1 0 119145 CASAVA_Build 6 114096731 1D TTAAATACTC T/- TTTTTCCCCT 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 T 6 5 119146 CASAVA_Build 6 114099631 8D AGAGCTGTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 666 hom 34 8 16 13 TTTG 7 5 119147 CASAVA_Build 6 114111087 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 1588 het 1588 ref 30 11 5 14 A 15 14 119148 CASAVA_Build 6 114111676 1D AAAAAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 13 12 119149 CASAVA_Build 6 114113425 1D AGTTGACTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 10 9 119150 CASAVA_Build 6 114117143 1D TGAGATTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 11 10 119151 CASAVA_Build 6 114138566 9D ACCTTTAGGA AATGTGAGC/--------- AATTGTCTAA 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 AATGTGAGC 1 0 119152 CASAVA_Build 6 114138759 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 10 119153 CASAVA_Build 6 114143999 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2646 het 2616 hom 17 7 7 3 A 13 14 119154 CASAVA_Build 6 114148995 1I AAAAGTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 211 hom 22 1 19 2 A 11 12 119155 CASAVA_Build 6 114152847 4I TCCTAGTGCC ----/TCAT TCATTGTTAG 3070 het 3070 hom 44 13 26 5 TCAT 1 2 119156 CASAVA_Build 6 114155169 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2622 het 53 hom 24 2 13 9 T 15 16 119157 CASAVA_Build 6 114162869 2I CTCTTCCTCC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 39 12 14 13 GT 7 8 119158 CASAVA_Build 6 114172141 4I TATATATAGT ----/AATA AATAAAAATA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AATA 1 2 119159 CASAVA_Build 6 114176008 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 101 hom 22 1 19 2 A 10 9 119160 CASAVA_Build 6 114180457 10D TCAGTCTCAG AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 1959 het 117 hom 9 2 6 1 A 22 12 119161 CASAVA_Build 6 114181897 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 9 10 119162 CASAVA_Build 6 114189729 1I AATCTAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 10 11 119163 CASAVA_Build 6 114190013 1I CTCCATATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 9 10 119164 CASAVA_Build 6 114190159 1D AAAATTAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 16 8 A 12 11 119165 CASAVA_Build 6 114196324 8D TATCTCTACT AAAAATAC/-------- AAAAATTAGC 3070 het 810 hom 14 2 12 1 AAAAATAC 1 0 119166 CASAVA_Build 6 114196498 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2869 hom 26 11 12 3 T 9 8 119167 CASAVA_Build 6 114197613 1I ATAAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 11 12 119168 CASAVA_Build 6 114230794 3D GAAAGAAAGA AAG/--- AAGAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AAG 2 1 119169 CASAVA_Build 6 114238783 1I CTGACCTACT -/A ATGTATTCAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 1 2 119170 CASAVA_Build 6 114241259 1D TGCAGGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 932 hom 32 2 24 6 A 12 11 119171 CASAVA_Build 6 114247300 1I ATCCTGGTTG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 7 8 119172 CASAVA_Build 6 114251462 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 9 10 119173 CASAVA_Build 6 114252073 2I GCTATCCCAG --/AC ACACACACAC 3070 het 453 hom 38 2 30 6 AC 8 9 119174 CASAVA_Build 6 114253024 1D CTCATGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 37 0 30 9 A 11 10 119175 CASAVA_Build 6 114259379 1I TACAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 765 hom 35 3 21 11 A 10 11 119176 CASAVA_Build 6 114279162 1I GGCATAGGTT -/A AAAGAGTGAA 3070 hom 85 het 32 0 29 3 A 3 4 119177 CASAVA_Build 6 114288608 2D AATTTTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 28 1 21 6 T 12 10 119178 CASAVA_Build 6 114289476 1D AGAATAAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 9 8 119179 CASAVA_Build 6 114291705 5I TGTTTGTTTA -----/TTTAC TTATAGGCAG 896 hom 5 het 3 0 2 2 TTTAC 0 1 119180 CASAVA_Build 6 114295034 1D ACTAGCCATA T/- TTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 7 6 119181 CASAVA_Build 6 114302186 4D TTTGTCTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AAAC 3 2 119182 CASAVA_Build 6 114306915 1I TATGAACTCC -/G TGTGTTTCAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 0 1 119183 CASAVA_Build 6 114307942 5D ATATTTTTAG TACAT/----- TACATTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 18 2 TACAT 2 1 119184 CASAVA_Build 6 114308617 2D CTTTCTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 32 2 13 18 T 12 10 119185 CASAVA_Build 6 114312737 1D CAGAATGTGT A/- AATTGCGGTT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 A 3 2 119186 CASAVA_Build 6 114320140 1D TGCTCAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 15 3 A 10 9 119187 CASAVA_Build 6 114329681 1I GAGCAGGAGC -/A AAGAGGAATT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 2 3 119188 CASAVA_Build 6 114333273 2D GGACTTCTGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 54 26 14 14 TC 10 9 119189 CASAVA_Build 6 114340443 3I ACACAATGAA ---/ACC ACCACAATCT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 ACC 1 2 119190 CASAVA_Build 6 114340965 1I ACCGTACATA -/T TTAGGTCTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 3 119191 CASAVA_Build 6 114341722 1I CAGGAAAAAG -/A GAGCTTGTGA 3070 hom 105 het 42 0 36 7 A 0 1 119192 CASAVA_Build 6 114342324 1I ACTGACTGGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 7 8 119193 CASAVA_Build 6 114342455 1I AATCTTAAGC -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 6 7 119194 CASAVA_Build 6 114345191 2D TTATATTTAT TA/-- TATATATATT 1295 het 1210 hom 6 3 3 0 TA 5 4 119195 CASAVA_Build 6 114346662 11I GTCAACAGAA -----------/CATGACCCTGC CTCAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 CATGACCCTGC 0 1 119196 CASAVA_Build 6 114358029 1D ATTGTCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 13 12 119197 CASAVA_Build 6 114358099 5D TCTTTCTTTC TTCCT/----- TTCCTTTCCT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 TTCCT 3 2 119198 CASAVA_Build 6 114361465 4D TAATTGAGGC TTTA/---- TTTATGTGTT 3070 hom 100 het 37 0 34 3 TTTA 2 1 119199 CASAVA_Build 6 114364246 3D GTAAATAGCC AAT/--- AATAACAATA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 AAT 2 1 119200 CASAVA_Build 6 114373055 1D ATTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1040 hom 19 5 8 6 A 15 14 119201 CASAVA_Build 6 114377393 3I AATTTAACAC ---/AAG AAGTTAAAGG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AAG 1 2 119202 CASAVA_Build 6 114379328 1D CTGTAAAATC T/- TTTTTTTTTT 2665 het 138 hom 21 1 12 8 T 17 16 119203 CASAVA_Build 6 114382708 4D TGGCAAAAAA TAAC/---- TAACATTGCG 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 TAAC 2 1 119204 CASAVA_Build 6 114409358 1D TCACACACAC T/- TTTTTTTTTT 1706 het 1706 ref 26 13 5 8 T 15 14 119205 CASAVA_Build 6 114410561 1D GCTCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 het 1086 hom 21 4 12 5 T 6 5 119206 CASAVA_Build 6 114411230 4D GGCCACAGTT AGAA/---- AGACTGATCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 5 AGAA 1 0 119207 CASAVA_Build 6 114415122 1I TGTGGTCCAT -/A AACACCAATT 3070 het 3070 hom 44 20 18 6 A 2 3 119208 CASAVA_Build 6 114423991 4I ATCAGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TTTG 2 3 119209 CASAVA_Build 6 114424311 1I TCAGCCTCCC -/A AAGTGCTGGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 2 3 119210 CASAVA_Build 6 114430604 1D ATCATTCTCT A/- ACTCTGTAGA 3070 hom 120 het 45 0 40 6 A 2 1 119211 CASAVA_Build 6 114438585 1I GAAAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 14 15 119212 CASAVA_Build 6 114443764 1I AACTCAGAAA -/T TACGTTGCTA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 T 1 2 119213 CASAVA_Build 6 114444468 1I TGTTGGGCAG -/A GTGGGGGAGA 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 A 0 1 119214 CASAVA_Build 6 114451177 1D GCTGGAGTGC A/- AATGGCGTGA 3070 het 2667 hom 23 7 12 4 A 3 2 119215 CASAVA_Build 6 114459175 1D ATATTAGAAC T/- TTTTTTAGGC 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 7 6 119216 CASAVA_Build 6 114461076 1I CATGGTGAAA -/C CCCCATCTAT 2447 hom 15 het 8 0 6 2 C 4 5 119217 CASAVA_Build 6 114463017 1D ATATAGGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 11 10 119218 CASAVA_Build 6 114466609 1I TCTGCCTCCT -/G GGTTTACGTG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 2 3 119219 CASAVA_Build 6 114468922 17I CCAGATAAAG -----------------/ACAGGACAAAGAAAACC ACAGACCAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 ACAGGACAAAGAAAACC 0 1 119220 CASAVA_Build 6 114479454 1I TCCTGGCTTT -/A TTTTTTTTTT 2556 het 1781 hom 41 15 12 14 A 0 1 119221 CASAVA_Build 6 114479788 1D AATCATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 594 hom 43 2 31 10 T 12 11 119222 CASAVA_Build 6 114498137 1D TGGGGAGATG A/- AAAAAAAAAA 1837 het 1837 ref 42 19 6 17 A 15 14 119223 CASAVA_Build 6 114508743 7D AGGGTACAAT GTACCCA/------- GGTAACAAAC 3070 het 3070 hom 29 14 15 3 GTACCCA 1 0 119224 CASAVA_Build 6 114520341 2D TGGCACAATG TA/-- TGAGGCAGGT 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 TA 1 0 119225 CASAVA_Build 6 114525567 1I AATGAGAAAA -/G GAAGGTAATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 2 119226 CASAVA_Build 6 114529476 1I AATCAGTTCT -/G GCCATTGTGG 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 G 1 2 119227 CASAVA_Build 6 114537130 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2281 het 2281 ref 31 17 6 8 TA 7 8 119228 CASAVA_Build 6 114545774 2D CAAATGTCTC TA/-- TAGTGTCTCA 3070 het 3070 hom 49 17 27 6 TA 2 1 119229 CASAVA_Build 6 114548552 2I GCTTTTCAGC --/AA AGAGTCTAAA 2417 het 2417 ref 27 17 7 3 A 1 3 119230 CASAVA_Build 6 114551696 1D TCCAAGATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 9 8 119231 CASAVA_Build 6 114589643 1D CTTTCTCTAT G/- GCTGCATTTT 3070 het 3070 ref 29 19 10 0 G 2 1 119232 CASAVA_Build 6 114592011 5I TTTTTTTTGC -----/TATAA TATTTCACTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TATAA 0 1 119233 CASAVA_Build 6 114616461 1D TATTGTGGCA T/- TTTTTTATTA 3070 hom 129 het 48 0 41 7 T 7 6 119234 CASAVA_Build 6 114624735 1I TTGTAAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 187 hom 40 2 30 8 A 9 10 119235 CASAVA_Build 6 114627453 4I TAAAAATAAG ----/AGTC AGAATCCTCC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AGTC 0 1 119236 CASAVA_Build 6 114649850 1D TATGAATATC A/- AATGTAGAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 2 119237 CASAVA_Build 6 114660917 1D ACAGACACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 37 2 21 14 T 14 13 119238 CASAVA_Build 6 114688042 2D GCAAAATTGA GT/-- ATTATTTGGT 3070 het 3070 ref 29 13 13 4 GT 1 0 119239 CASAVA_Build 6 114688793 5I GACATTAGTG -----/TTTTA CATCTCCACT 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 TTTTA 0 1 119240 CASAVA_Build 6 114692393 2I GAGGTTGAAT --/AG AGATGTTCAT 3070 het 3070 hom 53 20 24 9 AG 1 2 119241 CASAVA_Build 6 114704469 1I AGAGTGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 867 hom 37 2 26 9 A 11 12 119242 CASAVA_Build 6 114706434 1D GGACCATGAA C/- TCATAATAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 C 1 0 119243 CASAVA_Build 6 114712553 2I ATTACAACAT --/AA GAGTTTACAG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 0 2 119244 CASAVA_Build 6 114716513 11I TGTGAGGTAC -----------/AGTGATTATCT TTGACCAATC 3070 het 3070 ref 54 28 17 9 AGTGATTATCT 0 1 119245 CASAVA_Build 6 114718694 1I TGTGTTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 T 10 11 119246 CASAVA_Build 6 114719960 4D TTTAATTGTT AGTA/---- AGTTTCATAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 AGTA 1 0 119247 CASAVA_Build 6 114731320 1D TGTGTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 11 10 119248 CASAVA_Build 6 114741782 4D TAACCCCCAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 42 17 24 2 TTTG 4 3 119249 CASAVA_Build 6 114805406 1D AATTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 39 2 26 11 T 12 11 119250 CASAVA_Build 6 114806949 1D TATCTGGCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 10 9 119251 CASAVA_Build 6 114808224 1D CTCTGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 2422 het 2422 ref 37 16 6 15 T 15 14 119252 CASAVA_Build 6 114814109 2D GTGAAATCAC TT/-- TTGTTTTTAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 4 2 119253 CASAVA_Build 6 114816555 1I ATTTCATTGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 8 9 119254 CASAVA_Build 6 114821120 1I TCTCCCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 32 1 24 7 T 14 15 119255 CASAVA_Build 6 114826764 1I AGAAAACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 24 1 20 3 A 11 12 119256 CASAVA_Build 6 114828452 1D TTTATGTTTA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 7 6 119257 CASAVA_Build 6 114894658 3D AATAAATAAT CTC/--- CTGATACTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CTC 1 0 119258 CASAVA_Build 6 114895631 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 12 11 119259 CASAVA_Build 6 114898800 1I TATTTTATCT -/C CCATGGATGA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 C 2 3 119260 CASAVA_Build 6 114902591 1I TTTAAGAATT -/A CTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 1 119261 CASAVA_Build 6 114916118 3D TTGTAGCCTT GTA/--- GTATATTTTG 3070 hom 105 het 37 0 35 3 GTA 2 1 119262 CASAVA_Build 6 114931656 1D ATAGATTAAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 8 7 119263 CASAVA_Build 6 114931956 4I CTATGTGAAG ----/TTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TTTC 0 1 119264 CASAVA_Build 6 114968352 5I ATTCCACCTC -----/TCATA TCAGGCTGTG 3070 het 3070 ref 51 29 15 7 TCATA 0 1 119265 CASAVA_Build 6 114968654 2I AGCTGTGTTC --/AG AGTTTCTTCC 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 AG 1 2 119266 CASAVA_Build 6 114978579 1D GAGAAATAAT A/- ATAAGAAATT 3070 het 3070 hom 48 23 24 1 A 2 1 119267 CASAVA_Build 6 114990472 1I GAGCTGGGCC -/A AAAAAAAAGA 2947 het 2947 ref 30 14 7 9 A 8 9 119268 CASAVA_Build 6 114993664 5D AGGCATGCGT GTGGC/----- TCACAGCTTC 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 GTGGC 1 0 119269 CASAVA_Build 6 115003312 1D GAATTCTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 10 9 119270 CASAVA_Build 6 115025482 4D CCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2680 hom 25 8 14 3 T 16 12 119271 CASAVA_Build 6 115032195 2D AAATGTAGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 45 21 21 4 TA 7 6 119272 CASAVA_Build 6 115037119 1I AGTACCTATC -/A TGGCAGCCAT 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 A 0 1 119273 CASAVA_Build 6 115041503 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAGTTTCAGA 2089 het 642 hom 14 4 5 6 AC 1 0 119274 CASAVA_Build 6 115041880 1D CACCTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 805 hom 38 4 21 13 T 15 14 119275 CASAVA_Build 6 115045637 1I CAGGAGAGCA -/T TTTTTCACTT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 5 6 119276 CASAVA_Build 6 115074860 1I CTAAAGACTC -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 7 8 119277 CASAVA_Build 6 115082607 1D ATTCAAAATT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 8 7 119278 CASAVA_Build 6 115087867 1D ATTTTGCCCC T/- GTCCTAGAGA 3001 het 3001 ref 33 23 7 3 T 1 0 119279 CASAVA_Build 6 115090480 1D TTTCTTCCAC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 8 7 119280 CASAVA_Build 6 115101065 1I CTAGAAGGGG -/C CTGGAGCTAG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 C 1 2 119281 CASAVA_Build 6 115101623 1D GACTGGCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 10 9 119282 CASAVA_Build 6 115104556 4D TATCAGAGAG GTGA/---- GTAAGTCTTA 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 GTGA 1 0 119283 CASAVA_Build 6 115114751 1D TCATGTCATG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 8 7 119284 CASAVA_Build 6 115119923 1I TACAGCCTTT -/A AGTCTCACAT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 1 2 119285 CASAVA_Build 6 115124160 1I TGATTGACTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 8 9 119286 CASAVA_Build 6 115127753 1D AAATAATATT A/- AAAAATAAAA 2238 het 2238 ref 18 8 9 1 A 6 5 119287 CASAVA_Build 6 115130115 2I TCTCTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 TC 6 7 119288 CASAVA_Build 6 115131944 1I AATATAGTGA -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 8 119289 CASAVA_Build 6 115133926 1D CCTTACTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 A 12 11 119290 CASAVA_Build 6 115135099 1D AATACATTTA G/- GGGTGATACG 3070 het 3070 hom 45 18 22 6 G 4 3 119291 CASAVA_Build 6 115136086 6I AATCTCAGGA ------/TTTGGG TGAGCAGTCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TTTGGG 0 1 119292 CASAVA_Build 6 115136547 1D CTGCAGACCC A/- TTGGATTTGC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 1 0 119293 CASAVA_Build 6 115137047 2D CCTTCATCCC CT/-- GATTCTTTCT 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 CT 1 0 119294 CASAVA_Build 6 115137752 1D TTCAAAACTT A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 29 14 10 7 A 7 6 119295 CASAVA_Build 6 115138145 4I ATAGATAGAA ----/GCTT GCTTGCTAAG 3070 het 3070 hom 37 10 24 3 GCTT 1 2 119296 CASAVA_Build 6 115138929 2I TGCCTGATTC --/AT ATGAGTGGAG 3070 het 3070 ref 32 16 8 8 AT 1 2 119297 CASAVA_Build 6 115141888 1I CAGACTATGG -/T TTTTTTTTTT 2573 het 732 hom 28 3 13 12 T 14 15 119298 CASAVA_Build 6 115154549 1D GTCTTCTGCG T/- CGCTCACGCT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 T 1 0 119299 CASAVA_Build 6 115162363 2I ACCCTATACA --/TC TTTTGTAAAT 2898 het 2898 ref 25 17 6 2 TC 0 1 119300 CASAVA_Build 6 115164519 1I CAAGTGAATG -/A AAAATGGTAA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 A 4 5 119301 CASAVA_Build 6 115166095 1I TTATTATGTA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 6 7 119302 CASAVA_Build 6 115167227 1I CCTCATGAAT -/G GGATTAATGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 2 3 119303 CASAVA_Build 6 115172719 16D CATGAAGAAA TGTGTGTGTGTGTGTG/---------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 28 0 25 10 TG 15 7 119304 CASAVA_Build 6 115172940 1D AATTAAATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 10 9 119305 CASAVA_Build 6 115173418 2I AATTTGGTGT --/TA TATGTTTCAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TA 1 2 119306 CASAVA_Build 6 115180935 1D TCAACCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 35 7 T 11 10 119307 CASAVA_Build 6 115181204 2I AGTAGACAAA --/CT CTGTTATGCA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CT 1 2 119308 CASAVA_Build 6 115184780 1D AAACTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 36 1 29 7 T 11 10 119309 CASAVA_Build 6 115189244 1I AATTGCGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 11 12 119310 CASAVA_Build 6 115190369 1D CAGTCAGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 49 3 29 17 T 15 14 119311 CASAVA_Build 6 115213994 2I AAAGATGGTG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 35 0 26 9 A 9 11 119312 CASAVA_Build 6 115214565 4D TGCTAGAAAC TCTT/---- TATAACTTTA 3070 hom 160 het 60 0 54 9 TCTT 1 0 119313 CASAVA_Build 6 115215966 1I CAGTGACTGC -/T CATGATTATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 119314 CASAVA_Build 6 115218477 1I TTTCTCGCTA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 8 119315 CASAVA_Build 6 115235029 5I ATAGGAAATG -----/ACAAA ACAAAACAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 ACAAA 3 4 119316 CASAVA_Build 6 115237168 2D AATAAAAAAT TG/-- TCTCATTAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 TG 1 0 119317 CASAVA_Build 6 115241080 1D GTATTTTTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 8 7 119318 CASAVA_Build 6 115241422 3I AGACTTTAGG ---/ACA ACATTAATTT 3070 hom 88 het 33 0 30 3 ACA 1 2 119319 CASAVA_Build 6 115246729 1I TGAAATAGAG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 8 119320 CASAVA_Build 6 115254742 1D AAAACCACAT A/- AAAAAATGAA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 7 6 119321 CASAVA_Build 6 115258041 4I AACTGGTCTA ----/TCTC TCTCTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TC 2 4 119322 CASAVA_Build 6 115261934 1D ACCCTCCCCC T/- GTCTTCTCTC 3070 hom 105 het 40 0 30 10 T 1 0 119323 CASAVA_Build 6 115268903 1I AGTAAAGTGC -/T TGGAGAAAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 2 119324 CASAVA_Build 6 115269528 1I CCAGAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 37 1 32 4 A 10 11 119325 CASAVA_Build 6 115270778 17I GCACACTGTC -----------------/TTTCTTCACTTACAGTA TAATTTGATA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TTTCTTCACTTACAGTA 0 1 119326 CASAVA_Build 6 115324329 1D GATGGCACAC T/- TTTTTTTACT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 7 119327 CASAVA_Build 6 115326395 1D AGCAGCACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 44 1 36 8 A 11 10 119328 CASAVA_Build 6 115341205 1D AAAGACTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 41 0 28 13 T 10 9 119329 CASAVA_Build 6 115349695 4I TCTTTTTGAT ----/AGAA AGATTTATTT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AGAA 0 1 119330 CASAVA_Build 6 115351324 3D TTTGCTCAGA ATG/--- ATGATTTCCA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 ATG 2 1 119331 CASAVA_Build 6 115356032 1I CTCAGAGAAG -/T TTTTTTATCA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 7 119332 CASAVA_Build 6 115360333 1D TCTCTTTCCT A/- TTTATGGCTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 1 0 119333 CASAVA_Build 6 115363311 4I AAACTGACTA ----/AAAT AAGACATATC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 AAAT 0 1 119334 CASAVA_Build 6 115371075 1I TTTGAGGTTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 8 9 119335 CASAVA_Build 6 115374609 30D ATGGTGAGGA GGAGCAAGTCGCATCTTACATGGATGGCAG/------------------------------ GGAGCAAGTC 2712 het 2712 ref 49 33 10 17 GGAGCAAGTCGCATCTTACATGGATGGCAG 2 1 119336 CASAVA_Build 6 115382024 1D GCCTATAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 28 1 18 9 T 13 12 119337 CASAVA_Build 6 115388612 4I CTAAAGAAAA ----/TAAG TAAGTTTCTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TAAG 1 2 119338 CASAVA_Build 6 115390058 4D GGCATATAAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 135 het 56 0 45 11 TG 11 9 119339 CASAVA_Build 6 115391076 1D GCGATATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1029 hom 47 4 34 9 T 12 11 119340 CASAVA_Build 6 115392649 1D AACTTACTTA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 8 7 119341 CASAVA_Build 6 115396704 4I GGGTTGACAG ----/TGTT TGTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 TGTT 1 2 119342 CASAVA_Build 6 115411057 1D ACAAGAAAAT G/- TAGAAAAAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 0 119343 CASAVA_Build 6 115432552 1D TAACTTAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 10 9 119344 CASAVA_Build 6 115457427 2I AAAGAGAGAA --/AG AGAGAGACAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 AG 3 4 119345 CASAVA_Build 6 115465916 1D AGAAAAAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 8 7 119346 CASAVA_Build 6 115469278 1D ACAACCACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 10 9 119347 CASAVA_Build 6 115475398 1I TTTATCTGGG -/T TATTTCACTG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 1 2 119348 CASAVA_Build 6 115483674 2D ATGAAAGTCA GT/-- GTTTTGAAGA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 GT 2 1 119349 CASAVA_Build 6 115485853 16I14M1D TAGGTTCAAA ----------------TGTTACTAGGTGAAT/TGTACATGTGCACATTTGTTACTAGGTGAA- TTGCATGCCA 3070 het 3070 hom 36 19 18 6 N/A 0 0 119350 CASAVA_Build 6 115488325 1I GAAAAAAAAC -/G AGAGAGAGAG 2192 het 2192 ref 30 14 6 10 G 0 1 119351 CASAVA_Build 6 115493765 1D ATTATTTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 A 10 9 119352 CASAVA_Build 6 115495601 1D TTTTGTCTAT C/- GACTCTCACC 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 C 1 0 119353 CASAVA_Build 6 115498484 1I TAACATTGCA -/T AATATTTTAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 0 1 119354 CASAVA_Build 6 115499689 1D CACAATAAAG A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 A 7 6 119355 CASAVA_Build 6 115505736 1D TAATAATCTG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 42 14 20 9 A 8 7 119356 CASAVA_Build 6 115506382 1D AAATCGGTGA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 29 13 12 6 T 7 6 119357 CASAVA_Build 6 115520443 1I GCAACAGAGG -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 18 14 4 T 2 3 119358 CASAVA_Build 6 115525298 1I TTGTGATGTT -/C CCCTCCCTGT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 3 4 119359 CASAVA_Build 6 115526773 1I TTCCTAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 20 2 9 9 T 13 14 119360 CASAVA_Build 6 115527937 5I CTCTCTTTTC -----/TTTTA TATTAGTCTA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 TTTTA 0 1 119361 CASAVA_Build 6 115528308 3D TTACCTAAGA GTC/--- GTCGTTCAGG 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 GTC 2 1 119362 CASAVA_Build 6 115530990 3D GCAGTCATTT GGA/--- GGAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 GGA 2 1 119363 CASAVA_Build 6 115536935 1D ACATAGTCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 10 9 119364 CASAVA_Build 6 115537161 1D ACCCACTGAA T/- TTGTACACTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 3 2 119365 CASAVA_Build 6 115570116 4I GGAGTAAAAG ----/ATTA ATTAGCAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATTA 1 2 119366 CASAVA_Build 6 115596345 1I AACATAGCCA -/C CAAAAGCAAC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 C 1 2 119367 CASAVA_Build 6 115599937 1D TGTAAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1893 hom 35 11 11 14 A 15 14 119368 CASAVA_Build 6 115600232 1I AAGATAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3065 hom 30 9 13 8 A 11 12 119369 CASAVA_Build 6 115609075 1D TAAAGTATAT A/- AAAAAAAAAA 2407 het 72 hom 7 1 5 1 A 11 10 119370 CASAVA_Build 6 115611053 1D TCCAGTAGCC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 44 13 26 5 A 8 7 119371 CASAVA_Build 6 115611566 1I AGCAAGCCCC -/T CTTAGGAAAC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 0 1 119372 CASAVA_Build 6 115619203 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAAAAACCTA 3070 het 3070 hom 30 14 14 4 TA 1 0 119373 CASAVA_Build 6 115620330 1D TTTCACAGGA G/- GGGAAATGAC 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 G 4 3 119374 CASAVA_Build 6 115621521 1I TTTTACTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 10 11 119375 CASAVA_Build 6 115642685 1I ATGTAAAATT -/G CAAAAATGTC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 G 0 1 119376 CASAVA_Build 6 115646436 1D TTATGATGGG N/- AGTCTATCCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 N 1 0 119377 CASAVA_Build 6 115670694 4D TTTGGATTTA ATTC/---- ATTTTTTCTT 3070 het 2747 hom 19 6 12 2 ATTC 1 0 119378 CASAVA_Build 6 115678117 1D GGGCGAGGCA C/- TGCGTCACTT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 C 1 0 119379 CASAVA_Build 6 115694651 1I AAAATGTGGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 7 8 119380 CASAVA_Build 6 115698757 1I GGTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 T 9 10 119381 CASAVA_Build 6 115701371 1D GCGACAATTA C/- CCCCCTATAG 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 C 6 5 119382 CASAVA_Build 6 115714230 1I ACCTCTTCCC -/T TTTCCCTTAA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 3 4 119383 CASAVA_Build 6 115717882 1D GATTTCTGGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 8 7 119384 CASAVA_Build 6 115722868 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 ATA 3 4 119385 CASAVA_Build 6 115723838 1D AGAGGCTATT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 34 14 20 0 A 9 8 119386 CASAVA_Build 6 115736422 2D CTGCAGCCAT AA/-- AAAAAAAAAT 1862 hom 11 het 10 0 5 5 A 11 9 119387 CASAVA_Build 6 115745862 1I ATCCTCCCAC -/G TTAGCCTCTT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 G 0 1 119388 CASAVA_Build 6 115750213 1D TAAACATGAT A/- AATGACATCT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 3 2 119389 CASAVA_Build 6 115757302 1D CCATCTCAGT A/- AAAAAACACC 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 A 7 6 119390 CASAVA_Build 6 115762908 1D AATGTTACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 10 9 119391 CASAVA_Build 6 115768255 1D AATGAGCCTG A/- AAAAATGTAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 6 5 119392 CASAVA_Build 6 115773664 3D TTTTAGCCTC ATT/--- GTTGTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 6 ATT 1 0 119393 CASAVA_Build 6 115776609 4I AACATGACAC ----/TAAT TAGTTTGCAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 TAAT 0 1 119394 CASAVA_Build 6 115778807 1D TAAACTGCGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 37 1 28 10 T 11 10 119395 CASAVA_Build 6 115788499 1D CCCTTACCCC T/- GATATCTGCT 3070 hom 117 het 50 0 39 11 T 1 0 119396 CASAVA_Build 6 115795135 1D TGTTTTGGTC A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 A 1 0 119397 CASAVA_Build 6 115808782 4D ACTCCCATGC ACAA/---- ACAGATATAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 ACAA 1 0 119398 CASAVA_Build 6 115813197 1I AATGTAAAAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 7 8 119399 CASAVA_Build 6 115814722 1D AGGCTATGAA T/- TTAGAAGCAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 3 2 119400 CASAVA_Build 6 115816771 4D TCCCCATTGC TTGT/---- TTTTGTCAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTGT 1 0 119401 CASAVA_Build 6 115827947 2D CATATTACTC TT/-- TTATTACTTA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 4 2 119402 CASAVA_Build 6 115828155 1D AATCCAAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 9 8 119403 CASAVA_Build 6 115833582 1D ATCATTTGCA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 8 7 119404 CASAVA_Build 6 115834541 1I TATTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1030 hom 24 3 14 7 T 12 13 119405 CASAVA_Build 6 115838994 1D TAAGTTGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 47 0 37 10 A 11 10 119406 CASAVA_Build 6 115870202 1D TCAGTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 1064 het 1064 ref 41 31 3 7 T 11 10 119407 CASAVA_Build 6 115871458 1D TGGAAAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 24 9 T 11 10 119408 CASAVA_Build 6 115885504 1D TCATCACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 11 10 119409 CASAVA_Build 6 115887548 4D CTCATGAGGA AATT/---- AATTTCAGGA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 AATT 2 1 119410 CASAVA_Build 6 115889240 5D AAACAAACAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 108 het 41 0 37 5 AAAAC 3 2 119411 CASAVA_Build 6 115898390 1I AATTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 40 1 30 9 A 11 12 119412 CASAVA_Build 6 115909751 2D GTGGTGATGG GC/-- GCGCCTGTAG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 GC 3 2 119413 CASAVA_Build 6 115909882 1I ACTACATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 81 hom 30 1 24 5 A 12 13 119414 CASAVA_Build 6 115920539 1I TATCATTCCG -/C CCCCCTGCCC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 5 6 119415 CASAVA_Build 6 115930573 1D CTAAAAGAGG C/- CCAACGTACA 3070 hom 96 het 41 0 32 12 C 3 2 119416 CASAVA_Build 6 115932183 1D ATCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 32 1 28 3 A 14 13 119417 CASAVA_Build 6 115937633 1D ATTGTTGAGA T/- TTACAGGTAT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 T 3 2 119418 CASAVA_Build 6 115939957 2D CAAAATTGTG CA/-- CAGTTGTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 CA 2 1 119419 CASAVA_Build 6 115947218 1D ATTAATAAAG A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 7 6 119420 CASAVA_Build 6 115947523 1D ACCAGAGGTA C/- AAAGAGGAGC 3070 hom 24 het 9 0 9 1 C 1 0 119421 CASAVA_Build 6 115947646 2D GAGACACAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 29 0 26 4 A 12 10 119422 CASAVA_Build 6 115950114 1I AGGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 33 2 18 13 A 13 14 119423 CASAVA_Build 6 115972536 1D TCAAATATAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 8 119424 CASAVA_Build 6 116007498 1D GATGCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1170 hom 25 4 18 4 A 13 12 119425 CASAVA_Build 6 116034039 1D CTGCATGTAC T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 6 119426 CASAVA_Build 6 116038410 1I CCATTAATAC -/A AAACTTACTT 3070 hom 95 het 38 0 30 8 A 3 4 119427 CASAVA_Build 6 116040425 1D TTACCAGAAC T/- TTTTTTCTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 6 119428 CASAVA_Build 6 116044091 1D GCCTCCTCAC A/- ATTCCTGCCT 3070 hom 86 het 34 0 27 7 A 2 1 119429 CASAVA_Build 6 116052746 6D TTTCTTCATC ATTTTA/------ ATTTTATTTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 ATTTTA 2 1 119430 CASAVA_Build 6 116053273 1D TAATTTTGTG A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 7 6 119431 CASAVA_Build 6 116053358 3I CTTTCAAGAT ---/ATC ATTCTATTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATC 0 1 119432 CASAVA_Build 6 116055760 1I CTCCAAAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 9 10 119433 CASAVA_Build 6 116061119 1D TAAATGGAAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 9 8 119434 CASAVA_Build 6 116075332 3I ATATTTACCA ---/AGC AGCAAATCAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 AGC 1 2 119435 CASAVA_Build 6 116080916 1D ACCCCTTAGT G/- GTTGTGATGC 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 G 2 1 119436 CASAVA_Build 6 116082363 1D TCTGACCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 11 10 119437 CASAVA_Build 6 116082799 4D GTTAATTGAC TATT/---- TATGTTATTG 1939 het 1939 ref 13 9 4 1 TATT 1 0 119438 CASAVA_Build 6 116083616 1I ACAAACAAGG -/A AAAACCTTAA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 4 5 119439 CASAVA_Build 6 116086555 1D TCTGTCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 15 14 119440 CASAVA_Build 6 116087089 1D ATCTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 11 10 119441 CASAVA_Build 6 116090202 1I CTACCTCTAC -/A AACTCTTATT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 2 3 119442 CASAVA_Build 6 116096054 3I GAAAAACAAC ---/AAT GTCATCCTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 AAT 0 1 119443 CASAVA_Build 6 116109190 1D AAAATGATCC A/- AATGACCTTT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 3 2 119444 CASAVA_Build 6 116112430 1I AGTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 10 11 119445 CASAVA_Build 6 116115045 1D AAGAAAAAAA T/- AATCAACTGT 3070 het 3070 ref 29 12 13 5 T 1 0 119446 CASAVA_Build 6 116115429 1D AAATCCTGCT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 9 8 119447 CASAVA_Build 6 116118042 4D TGTTCTCTCT TCTC/---- TCTTTCTGCA 3070 het 3070 ref 47 20 21 8 TC 3 1 119448 CASAVA_Build 6 116119953 1D AGTAACAGTG C/- ACTTGATAAT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 C 1 0 119449 CASAVA_Build 6 116123428 1D GTTAACCAAG C/- TGCAAATGCA 3070 het 3070 hom 38 16 16 7 C 1 0 119450 CASAVA_Build 6 116124116 4I CCAATAATAG ----/ACAA ACAGAGAGCC 3070 het 3070 ref 34 22 12 0 ACAA 0 1 119451 CASAVA_Build 6 116125883 1I AAAGCATAAT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 19 7 9 3 A 6 7 119452 CASAVA_Build 6 116134461 1D GCCCACTGCC A/- AAAAAAAAAA 2828 het 43 hom 30 2 14 14 A 15 14 119453 CASAVA_Build 6 116140762 5I ACTACTACTC -----/TAAGA TAATATTTAT 3070 het 3070 hom 47 14 29 4 TAAGA 0 1 119454 CASAVA_Build 6 116145633 5D ATTACAATTC AAGAT/----- GAGATTTGGG 3070 het 3070 ref 40 23 14 5 AAGAT 1 0 119455 CASAVA_Build 6 116145796 1D GGAACCAGAC A/- GCTTCTGGGT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 A 1 0 119456 CASAVA_Build 6 116150379 1I ATGTGTTTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 49 21 26 2 T 8 9 119457 CASAVA_Build 6 116155034 2D GTTTTCCAAA CT/-- TTTTAATTTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 CT 1 0 119458 CASAVA_Build 6 116169588 2D ACAATCATTG GA/-- AAAAAAAAAA 2927 het 394 hom 19 2 12 6 GA 1 0 119459 CASAVA_Build 6 116177582 1I CCCCCGCCCC -/G CTTATGTACC 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 G 0 1 119460 CASAVA_Build 6 116179048 17D TACATAAAGT ATGGGGTTAACAAAAAA/----------------- ACAATAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 24 3 ATGGGGTTAACAAAAAA 1 0 119461 CASAVA_Build 6 116182168 5D CTTCTCACAC TATAT/----- TATAATTGTT 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 TATAT 1 0 119462 CASAVA_Build 6 116191943 3D TACACATATA AAT/--- AATATAAATT 3070 hom 75 het 27 0 25 3 AAT 2 1 119463 CASAVA_Build 6 116207943 1D CTTTTTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1648 hom 28 5 16 7 A 14 13 119464 CASAVA_Build 6 116217448 1I TTCAATCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 A 11 12 119465 CASAVA_Build 6 116226515 1D AAAGATGATA G/- AATGTCTCCT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 G 1 0 119466 CASAVA_Build 6 116252174 1I AAAGAATGTA -/G AACAGGGCCT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 G 0 1 119467 CASAVA_Build 6 116254949 1D TGTTTTGGTC A/- AGAGTGTAAT 3070 het 3070 ref 58 32 19 7 A 2 1 119468 CASAVA_Build 6 116265744 3D ATTATAAAAG ATT/--- ATTTATTAAC 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 ATT 2 1 119469 CASAVA_Build 6 116267254 3I3M8I TATCCCTGCC ---CCA--------/TATCCAATGTTGCC TATATCCAAT 3070 hom 90 het 31 0 30 3 N/A 0 0 119470 CASAVA_Build 6 116270564 1D CTGTAAACCT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 8 7 119471 CASAVA_Build 6 116287953 1I TTTATAAAAA -/T AAAAAAAAAA 3070 het 2616 hom 43 11 20 12 T 0 1 119472 CASAVA_Build 6 116310892 1D TGAATCATGC A/- CATATTAGCC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 1 0 119473 CASAVA_Build 6 116311882 2D ACAAATTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1494 hom 35 12 13 11 A 17 15 119474 CASAVA_Build 6 116318950 1D GACAGTGAAG T/- TAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 T 2 1 119475 CASAVA_Build 6 116338458 1I AGCATCAGGA -/C CTAGCGGCTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 1 2 119476 CASAVA_Build 6 116342547 3I AATTTGACTA ---/ATC ATGTTTTTAG 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 ATC 0 1 119477 CASAVA_Build 6 116360025 4D ATTCAGGGTT TATA/---- TACTACTTTG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 TA 3 1 119478 CASAVA_Build 6 116362809 1I AAAAAAAAAA -/G AAAACTTTCA 3070 het 1565 hom 41 16 13 12 G 0 1 119479 CASAVA_Build 6 116369166 3D ATATGGACAC AAG/--- GAGGGGAACA 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 AAG 1 0 119480 CASAVA_Build 6 116371080 1D GTTAAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 T 13 12 119481 CASAVA_Build 6 116377124 1I TATTTGAATA -/C CCTTTATTTC 3070 het 1841 hom 17 5 10 2 C 2 3 119482 CASAVA_Build 6 116386140 1D CCCACTACCA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 73 het 33 0 27 6 C 8 7 119483 CASAVA_Build 6 116387821 1I AAGTGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2767 het 2767 ref 32 14 9 10 A 11 12 119484 CASAVA_Build 6 116393907 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 1275 hom 15 het 7 0 6 1 A 10 11 119485 CASAVA_Build 6 116393917 3I AAAAAAAAAA ---/AAT TTAAAAAAAA 1898 hom 12 het 7 0 5 2 AAT 0 1 119486 CASAVA_Build 6 116394831 1I TGACCAGAAA -/G TATTTGGAAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 G 0 1 119487 CASAVA_Build 6 116395606 2I AGCAATTGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 A 12 14 119488 CASAVA_Build 6 116397988 1I TAGCTAGGAA -/T TTTTTTTTTT 612 het 612 ref 52 31 4 17 T 13 14 119489 CASAVA_Build 6 116429713 2I TACAAAACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 AC 6 7 119490 CASAVA_Build 6 116435708 2I GTTCAGAAAC --/AT AATACAGCAT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 AT 0 1 119491 CASAVA_Build 6 116438947 1D AGTGAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 11 10 119492 CASAVA_Build 6 116451819 1I AAAATAACTA -/G GTTGGCTTTT 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 G 1 2 119493 CASAVA_Build 6 116461037 1I TGCCAGGCAG -/A GATGAAACAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 0 1 119494 CASAVA_Build 6 116465677 4I TCTTTTTCTT ----/TGTC TTGATTGTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TGTC 0 1 119495 CASAVA_Build 6 116476832 3D CCTGCACTTC TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 T 12 9 119496 CASAVA_Build 6 116489411 4I GCTAGTTCTT ----/ACTA ACTAACTTGG 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 ACTA 1 2 119497 CASAVA_Build 6 116501928 2I CTTGGTGTCT --/CA CAGAGTTAGG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 CA 1 2 119498 CASAVA_Build 6 116503102 4D TTATGTGACT GTGA/---- GTAAGTATTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 GTGA 1 0 119499 CASAVA_Build 6 116511683 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2435 het 1579 hom 35 9 11 15 T 15 16 119500 CASAVA_Build 6 116529303 1D GGTACTTGCA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 56 22 25 10 T 8 7 119501 CASAVA_Build 6 116543091 6I TATACTGAAA ------/TTTGTC TTAAATGGCA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TTTGTC 0 1 119502 CASAVA_Build 6 116546438 2I TGTGATTGAC --/AT AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 AT 0 1 119503 CASAVA_Build 6 116547923 3I TTAGCTCTGT ---/GGG GTGTACTCAC 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 G 1 4 119504 CASAVA_Build 6 116558306 1I ATCCCAGTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 48 18 19 11 T 8 9 119505 CASAVA_Build 6 116581197 2D GCTCTAAAAG TT/-- TTTCACAAAC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 5 3 119506 CASAVA_Build 6 116582515 1D ATTAATTTAA T/- TATGAAAGGG 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 2 1 119507 CASAVA_Build 6 116598102 1D TATCTTGTGT C/- CCCACCAGTG 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 C 4 3 119508 CASAVA_Build 6 116616563 1I AATTTTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 11 12 T 13 14 119509 CASAVA_Build 6 116621622 6D ATTATACTGT TAAAAA/------ TAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 19 16 5 TAAAAA 2 1 119510 CASAVA_Build 6 116627855 1D GTATGGAAAG T/- GGGGGGGGAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 1 0 119511 CASAVA_Build 6 116635227 1I GAGAGAAAGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 8 9 119512 CASAVA_Build 6 116638223 1D GTACCATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 11 10 119513 CASAVA_Build 6 116638602 4D AAATGTTTTA AAAT/---- AAATGTTAAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 7 AAAT 2 1 119514 CASAVA_Build 6 116660016 2I AAAAGGAGAC --/TG TATTGGATTA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 TG 0 1 119515 CASAVA_Build 6 116670349 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 2990 hom 36 17 17 7 AAAG 1 0 119516 CASAVA_Build 6 116672890 4D TAGTTAAAAC TATT/---- TAATGTAATT 3070 het 3070 hom 27 9 18 1 TATT 1 0 119517 CASAVA_Build 6 116673330 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 A 8 9 119518 CASAVA_Build 6 116673659 1D TTTGGGCCAC T/- TGAGTAGTGG 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 T 2 1 119519 CASAVA_Build 6 116675678 2D AAATATTCTC TT/-- AACAGAAATG 3070 het 3070 hom 30 10 17 5 T 2 0 119520 CASAVA_Build 6 116677030 4D GAAAACCTAG CTCT/---- CTAATACTTA 3070 het 3070 ref 34 15 17 3 CT 3 1 119521 CASAVA_Build 6 116732222 1I GAAATTCAGA -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 109 het 42 0 37 5 T 7 8 119522 CASAVA_Build 6 116749960 4D GAGAGGGACG TGAT/---- TGATTGAGCA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TGAT 2 1 119523 CASAVA_Build 6 116752973 1D CCCCGAATCA T/- GTCTGGTGGC 3070 hom 131 het 50 0 44 6 T 1 0 119524 CASAVA_Build 6 116822295 1I AACAGCGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 35 0 22 13 T 14 15 119525 CASAVA_Build 6 116825209 1I AATACAGGCA -/C CCCCCCACCA 3070 hom 38 het 15 0 13 2 C 6 7 119526 CASAVA_Build 6 116825942 1D TTAATAATTG A/- AAACCACTGT 3070 het 3070 hom 37 16 15 7 A 4 3 119527 CASAVA_Build 6 116842276 1D TGTTTGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 44 0 31 13 T 11 10 119528 CASAVA_Build 6 116842743 2I ACTCTCACTC --/AG TTGTGTAAGT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AG 0 1 119529 CASAVA_Build 6 116843166 1D AGATGTCTGA C/- CCCACTATTC 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 C 4 3 119530 CASAVA_Build 6 116843403 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2358 hom 31 9 12 10 T 10 11 119531 CASAVA_Build 6 116851230 1D TTCCCTCACA G/- GTATCTTTAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 G 2 1 119532 CASAVA_Build 6 116858644 1I GGACTGTCAC -/A AACCTGGATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 3 119533 CASAVA_Build 6 116862339 2D ATCCTTGAGT TC/-- TCTCAGGAGT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 TC 3 2 119534 CASAVA_Build 6 116865934 5I TGATTACAGA -----/TAACT TAATACTGTA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TAACT 0 1 119535 CASAVA_Build 6 116867287 1D AAATTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 33 1 31 1 T 12 11 119536 CASAVA_Build 6 116870792 1I TATGCCCCCC -/T ATATTCCATA 3070 hom 77 het 32 0 25 7 T 0 1 119537 CASAVA_Build 6 116872310 4I ATGAATTGAC ----/TGAT TGACTGCCTG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TGAT 0 1 119538 CASAVA_Build 6 116873432 5I AATGAAAGAA -----/TATTT TATAATTCTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TATTT 0 1 119539 CASAVA_Build 6 116876911 2D CACCAGAGTG AT/-- ATGTTTGTTG 3070 het 3070 ref 39 14 16 9 AT 2 1 119540 CASAVA_Build 6 116880495 1D ATACACACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 12 7 5 A 10 9 119541 CASAVA_Build 6 116881156 1I TTTTCTTTTT -/G TACCATCTTT 2291 het 2291 ref 40 30 6 4 G 0 1 119542 CASAVA_Build 6 116883337 6D TGGCTCTCTC TCTCTT/------ TCTATGTCTG 3070 het 3070 ref 40 27 13 3 TCTCTT 1 0 119543 CASAVA_Build 6 116896058 3I TTCTTTTTGC ---/TAA TGTTTTACCA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 TAA 0 1 119544 CASAVA_Build 6 116901642 2D TCCCAGCTAC GG/-- GGGGGGGGTC 3070 het 186 hom 18 2 11 6 G 10 8 119545 CASAVA_Build 6 116903967 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 2319 hom 25 9 12 4 A 9 8 119546 CASAVA_Build 6 116905593 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 8 9 119547 CASAVA_Build 6 116908109 1I TTCTCATGCC -/A AAAATCCCAG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 4 5 119548 CASAVA_Build 6 116908618 1I AATTTTTCAG -/T TTTTGTAGAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 4 5 119549 CASAVA_Build 6 116910353 1D GGTCAGAAAT A/- AATAGAATGT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 3 2 119550 CASAVA_Build 6 116911898 2D AAAAAATGTA CT/-- GTTTTGACAT 3070 het 3070 hom 35 11 17 8 CT 1 0 119551 CASAVA_Build 6 116912397 1I TCTCCTTGGA -/G ACACAAGAAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 G 0 1 119552 CASAVA_Build 6 116912926 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAC 819 het 819 ref 37 20 3 16 A 11 9 119553 CASAVA_Build 6 116914610 12D AGAGAGACAG AGAGAGAGAGAC/------------ AGAGAGAGAG 2466 het 2466 ref 27 17 8 7 AGAGAGAGAGAC 1 0 119554 CASAVA_Build 6 116922406 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 7 6 119555 CASAVA_Build 6 116923725 6D AATTGGATTA TTAATT/------ TTAATTTTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 3 TTAATT 2 1 119556 CASAVA_Build 6 116934964 5I TTTGTAAAAA -----/ATTAC ATTAAATCAT 3070 hom 33 het 16 0 11 5 ATTAC 0 1 119557 CASAVA_Build 6 116935401 1D TCAGTGTATT A/- CACACTGTTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 1 0 119558 CASAVA_Build 6 116935665 1D CAAAAACATC T/- GCTGTTTTAC 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 1 0 119559 CASAVA_Build 6 116938305 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 10 119560 CASAVA_Build 6 116944517 28D GTAGTAACAA ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 2365 het 147 hom 13 1 9 4 AT 24 10 119561 CASAVA_Build 6 116947191 1D CTTGACCTAT G/- GGGGGGCTCT 3070 hom 83 het 35 0 28 8 G 7 6 119562 CASAVA_Build 6 116947801 1I TAAAGTGGGA -/G GAAAAAAAGG 3070 hom 114 het 47 0 38 9 G 1 2 119563 CASAVA_Build 6 116952034 2I TAGAAAAAAG --/AA AGTTTAGGGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 3 119564 CASAVA_Build 6 116961965 1D CTGTAGTGCG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 10 9 119565 CASAVA_Build 6 116962646 1I TACTATAAAA -/G GAAAAGTTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 1 2 119566 CASAVA_Build 6 116983411 1I TATCTTAATT -/C TAGTCCTGAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 0 1 119567 CASAVA_Build 6 116988507 3D TTAGTATTTT GGG/--- GGGGGGGGGG 2429 hom 44 het 24 0 11 13 G 14 11 119568 CASAVA_Build 6 116998004 1I GAGACTCCAC -/T TTTTTCATTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 5 6 119569 CASAVA_Build 6 117000020 1D TTTTCTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 579 hom 31 3 16 12 A 13 12 119570 CASAVA_Build 6 117013120 1D GCAGTCTGGG A/- AAAGGACTGG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 4 3 119571 CASAVA_Build 6 117020062 1I CTTTCAGGTA -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 6 7 119572 CASAVA_Build 6 117025579 1I ATACTAAAAT -/A AAACTTCACA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 4 119573 CASAVA_Build 6 117037552 1D AAGCAATCCT C/- CCCCCTCAGC 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 C 6 5 119574 CASAVA_Build 6 117052907 19D CTTTCCAAGC CTTAAGGATAATCAAGTGG/------------------- CTTAAGGATA 3070 het 3070 ref 50 23 17 13 CTTAAGGATAATCAAGTGG 2 1 119575 CASAVA_Build 6 117058135 3D CCTCCTGATT TTG/--- TTAAGTTGCT 3070 het 3070 hom 41 17 21 7 TTG 1 0 119576 CASAVA_Build 6 117098283 1I TTATAGAGAT -/A ACGAATGTTT 3070 het 3070 ref 31 11 9 11 A 1 2 119577 CASAVA_Build 6 117139112 2D TTTTTGTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 12 11 T 15 13 119578 CASAVA_Build 6 117148270 1D TTTTTTTTTT C/- CTGAGAAGAT 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 C 2 1 119579 CASAVA_Build 6 117176968 2D CTCTATTTTT TC/-- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 TC 1 0 119580 CASAVA_Build 6 117190356 1D TTTTTTTTTT A/- AAACTCATTT 3070 hom 89 het 34 0 30 4 A 4 3 119581 CASAVA_Build 6 117200248 2I AGAAGGTTGT --/TC TCTCATAATC 3070 hom 135 het 50 0 43 7 TC 2 3 119582 CASAVA_Build 6 117210841 4I TACTGTTGGG ----/TAAA CACTCTGCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAAA 0 1 119583 CASAVA_Build 6 117216362 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2806 het 1723 hom 30 9 11 10 A 17 18 119584 CASAVA_Build 6 117219882 1D AAAACTTGGT A/- AAGATGGTGG 3070 het 3070 hom 52 18 31 4 A 3 2 119585 CASAVA_Build 6 117220455 3I4M3I GTAATTCTCA ---TATT---/GGTAATTTCC TGCCTTTGAA 3070 het 3070 hom 52 23 27 4 N/A 0 0 119586 CASAVA_Build 6 117226096 1I TTTTAAATAA -/G GTGTCCAGGG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 G 1 2 119587 CASAVA_Build 6 117233478 1I TTGAGAAAGC -/A ACAATGGAAA 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 A 1 2 119588 CASAVA_Build 6 117259682 1D CAAGATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 12 11 119589 CASAVA_Build 6 117264023 1D CACATAAATA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 8 7 119590 CASAVA_Build 6 117265146 1D TAGAACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 11 10 119591 CASAVA_Build 6 117280442 1D AATTAAGGAA T/- AAATCAAGAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 1 0 119592 CASAVA_Build 6 117290139 1I TTATAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1100 hom 22 4 13 5 T 15 16 119593 CASAVA_Build 6 117306757 1D GAACCCTTTC A/- AAATATTTGA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 A 4 3 119594 CASAVA_Build 6 117310426 1I GTGAGAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2905 hom 20 7 8 5 A 13 14 119595 CASAVA_Build 6 117312831 1I TACATATGGT -/A AAAAATATAG 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 A 5 6 119596 CASAVA_Build 6 117313577 1D TTTTATTAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 9 8 119597 CASAVA_Build 6 117317900 2I ACAAGAATAA --/AG AGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 49 14 27 8 AG 1 2 119598 CASAVA_Build 6 117322514 2I TGAAACCAGT --/GA GATAACACAT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 GA 1 2 119599 CASAVA_Build 6 117324454 1D CCAGCTACTC A/- AGGAGGCTGA 3070 het 3070 ref 29 16 7 6 A 2 1 119600 CASAVA_Build 6 117324564 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 20 10 A 12 11 119601 CASAVA_Build 6 117329221 6I AAGTAAAAAA ------/TTTAGT TGCTCAGTCA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TTTAGT 0 1 119602 CASAVA_Build 6 117329675 1D AAGTTGAAGA T/- TTACACACTT 3070 het 3070 hom 60 22 33 5 T 3 2 119603 CASAVA_Build 6 117343134 1D TGTTTGAAAC T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 43 26 17 0 T 8 7 119604 CASAVA_Build 6 117346415 1D AAGATTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 A 12 11 119605 CASAVA_Build 6 117350093 1D TGGGGGGAGA G/- GGGTGGAAGG 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 G 4 3 119606 CASAVA_Build 6 117370879 5I ACTAGAATTG -----/CACAA CACAAAGTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CACAA 1 2 119607 CASAVA_Build 6 117370935 1I TTACCAATCT -/A AAAACTCCTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 A 4 5 119608 CASAVA_Build 6 117371246 7I GTTCACTGTA -------/GCATTAT TTCTCAAAGC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GCATTAT 0 1 119609 CASAVA_Build 6 117371456 5D AAATAAAACC ATAAA/----- ATAAAACTAT 3070 het 3070 hom 29 12 16 7 ATAAA 2 1 119610 CASAVA_Build 6 117372748 3D CTCTAGTCCT TAC/--- AACAACTCTA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 TAC 1 0 119611 CASAVA_Build 6 117374596 1D GCCTTCCCAT G/- GCACTCTCTA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 G 2 1 119612 CASAVA_Build 6 117376398 1D TTTCTGTAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 9 8 119613 CASAVA_Build 6 117378150 1D ATTCATTAAC T/- TTTAAGAGAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 4 3 119614 CASAVA_Build 6 117380617 5I GTTATACACA -----/TGACT TGAGTAAACC 3070 hom 163 het 59 0 55 4 TGACT 0 1 119615 CASAVA_Build 6 117382466 1I GAACCAGCCT -/G GGGATGCACA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 3 4 119616 CASAVA_Build 6 117382785 1D ACGTTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 27 0 17 11 A 11 10 119617 CASAVA_Build 6 117388374 14I CTTCACATAC --------------/AAAGAAACCCTACT AAAGAGATTC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 AAAGAAACCCTACT 0 1 119618 CASAVA_Build 6 117392410 1D AAGAAATGTG A/- AAAAGAATAT 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 A 5 4 119619 CASAVA_Build 6 117407212 1I ACATGGAGAG -/T TTTCAAAGAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 3 4 119620 CASAVA_Build 6 117410822 1I ATTCCAGCTC -/T TTTTTTTTTT 2351 het 2306 hom 23 8 6 9 T 11 12 119621 CASAVA_Build 6 117411337 1D CATGTACCCC T/- GACACTAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 1 0 119622 CASAVA_Build 6 117415251 1I ATTTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1004 hom 32 3 23 6 A 11 12 119623 CASAVA_Build 6 117416971 1D TCATGGTAAT C/- CCTATGTATC 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 C 3 2 119624 CASAVA_Build 6 117424495 1D TTACTTACTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 T 7 6 119625 CASAVA_Build 6 117431369 4I ATGGTTCTCT ----/CAGC CATGCTATAG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 CAGC 0 1 119626 CASAVA_Build 6 117433614 1D AATGTTTAAT G/- GCTCTTTCAT 3070 het 3070 ref 55 33 18 5 G 2 1 119627 CASAVA_Build 6 117434653 1D GATACAAAAC A/- AAAAAAGTCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 7 6 119628 CASAVA_Build 6 117437350 1D TAGGCATTAA G/- AATGCACAGT 3070 het 3070 hom 50 21 22 8 G 1 0 119629 CASAVA_Build 6 117454200 1D CATTCTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 14 13 A 17 16 119630 CASAVA_Build 6 117459469 1D AACTATCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 10 9 119631 CASAVA_Build 6 117465732 1I GGATGGTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 9 119632 CASAVA_Build 6 117468903 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 8 7 119633 CASAVA_Build 6 117469769 1I CAACCCTTGC -/T AACCTTTGCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 0 1 119634 CASAVA_Build 6 117472603 2D AGGATGTGGG GC/-- GGGGTGGTTC 3070 hom 81 het 37 0 27 12 GC 1 0 119635 CASAVA_Build 6 117476215 1I AAAATGCTGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 8 9 119636 CASAVA_Build 6 117479318 1I TGAAAATGAA -/C TTACTGCCTC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 0 1 119637 CASAVA_Build 6 117484917 1I ATTCTTAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 21 hom 25 1 20 4 T 8 9 119638 CASAVA_Build 6 117486377 1D TTTCATTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 412 hom 32 1 29 2 T 10 9 119639 CASAVA_Build 6 117490492 3D TCAGTTTCAG AAT/--- AATTTCCATT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AAT 2 1 119640 CASAVA_Build 6 117495108 4I GGAACCCATG ----/CACA CCCACTTGTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CA 0 2 119641 CASAVA_Build 6 117504517 1D GTATGTTATT A/- TTATATATAT 1847 het 1847 ref 11 7 4 0 A 1 0 119642 CASAVA_Build 6 117507376 6D TAAAGCACTC AAGTAT/------ GAGTGTGTAT 3070 het 3070 ref 45 23 19 4 AAGTAT 1 0 119643 CASAVA_Build 6 117513174 11I CATCCTCACC -----------/AGACTATAAAG AGATGCCCAA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 AGACTATAAAG 0 1 119644 CASAVA_Build 6 117515626 1D AAAGCTAAAG A/- AAAAAAATCG 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 8 7 119645 CASAVA_Build 6 117515807 1D ACTGGTGGAA G/- GACTGAATGC 3070 het 3070 ref 53 27 21 5 G 2 1 119646 CASAVA_Build 6 117521509 1D ACAAATTTAC A/- AAAAAAAAAC 2490 het 841 hom 10 2 6 2 A 10 9 119647 CASAVA_Build 6 117522795 1I TTGTTTGGCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 T 7 8 119648 CASAVA_Build 6 117537880 1I AAATCCTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 9 10 119649 CASAVA_Build 6 117543719 4D TACAAGAAAA AAAC/---- AAACCCTGTC 3070 het 3070 ref 35 21 14 1 AAAC 2 1 119650 CASAVA_Build 6 117545966 1I GCCATAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 248 hom 40 2 28 10 A 11 12 119651 CASAVA_Build 6 117555112 2I CTTTCTCTCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TC 7 8 119652 CASAVA_Build 6 117563511 32D CTCGCACACG CGCGCGCGCGCGCACACACACACACACACACA/-------------------------------- CACACACACA 3070 het 2498 hom 24 12 17 6 CGCGCGCGCGCGCACACACACACACACACACA 1 0 119653 CASAVA_Build 6 117572129 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 A 7 6 119654 CASAVA_Build 6 117576365 1I CATTCTGCAG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 6 7 119655 CASAVA_Build 6 117585930 20I GGCAGCAAAT --------------------/GTTAGTCACTGAGGGCACAA GTGAACTTCC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 GTTAGTCACTGAGGGCACAA 0 1 119656 CASAVA_Build 6 117603397 1D GGACAGACTG C/- CCCCTCATGT 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 C 5 4 119657 CASAVA_Build 6 117609372 1I TTGAAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 11 12 119658 CASAVA_Build 6 117627403 5D CCATTTATGG TAATA/----- CCCATAAAGT 3070 het 3070 hom 46 21 23 3 TAATA 1 0 119659 CASAVA_Build 6 117627561 4D TATAAGATAC CAGT/---- CAAATGAAAG 3070 het 3070 ref 45 24 20 2 CAGT 1 0 119660 CASAVA_Build 6 117630750 2D GTAAATTGCA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 3 AT 9 8 119661 CASAVA_Build 6 117633837 22I GCTCTTCTAT ----------------------/TAAGGTAATAGAATTAAGGTAA TACCTACCAC 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 TAAGGTAATAGAATTAAGGTAA 0 1 119662 CASAVA_Build 6 117641048 4D TGATTGCATG AACA/---- AACAAACAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 AACA 3 2 119663 CASAVA_Build 6 117647611 2D ATAAAAAAAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 11 9 119664 CASAVA_Build 6 117648339 1I ATTTTAGGAC -/T TTCAAAGGAC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 3 119665 CASAVA_Build 6 117649792 1D AATAAAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 13 16 T 13 12 119666 CASAVA_Build 6 117652380 2I AGTGTACTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 T 10 12 119667 CASAVA_Build 6 117652804 1D ACCCAGTCTA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 36 12 21 4 T 8 7 119668 CASAVA_Build 6 117662729 1D GCAGAAAGAG C/- CAAAAAGCCA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 2 1 119669 CASAVA_Build 6 117663126 4I ATGCCATAAA ----/AACC AACTCACAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AACC 0 1 119670 CASAVA_Build 6 117663384 1I AAAGGAGTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 10 9 A 9 10 119671 CASAVA_Build 6 117664251 10I GATCTTGTGT ----------/CCAGTAAGAA CCTCTTTGAG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 CCAGTAAGAA 0 1 119672 CASAVA_Build 6 117664520 1D TCTGGCACTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 9 8 119673 CASAVA_Build 6 117669309 2D TACTGCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 40 5 22 13 A 16 14 119674 CASAVA_Build 6 117670759 3D TGAGGGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 69 het 36 0 24 12 TTG 7 6 119675 CASAVA_Build 6 117685123 5I AGCCCCAGAA -----/AAGCC AAGCCTTTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAGCC 1 2 119676 CASAVA_Build 6 117708737 1I TGAAACCTTT -/A AGATCTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 1 2 119677 CASAVA_Build 6 117710463 2I CTTCACAGCA --/GT GTGAGAAGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GT 1 2 119678 CASAVA_Build 6 117713059 1D TTGCAGATTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 20 0 14 7 A 9 8 119679 CASAVA_Build 6 117713399 1I CTTATGCTAA -/T TTTTTTGTGA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 6 7 119680 CASAVA_Build 6 117724255 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 24 0 17 7 A 11 12 119681 CASAVA_Build 6 117726035 1I ACACATAGAC -/G TAGAGTATGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 0 1 119682 CASAVA_Build 6 117726863 2D GTATATATAT AG/-- AGAGCCCCCC 3070 hom 105 het 43 0 36 8 AG 3 2 119683 CASAVA_Build 6 117727268 1D CTGATCACCA G/- GGTTGATTCA 3070 hom 138 het 49 0 46 3 G 3 2 119684 CASAVA_Build 6 117766396 1I ACTCCTGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 11 12 119685 CASAVA_Build 6 117782209 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1698 het 1698 ref 32 22 4 6 A 13 12 119686 CASAVA_Build 6 117860243 1D CAATTAACAG A/- AAAAACTCCA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 5 119687 CASAVA_Build 6 117885484 1D CCAATACCTC T/- TTTTTTTTTC 1780 het 1780 ref 37 29 4 6 T 10 9 119688 CASAVA_Build 6 117905635 1D CATAGCACTC T/- TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 33 25 3 5 T 11 10 119689 CASAVA_Build 6 117942877 1D AGTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 2264 het 2264 ref 37 22 6 9 T 17 16 119690 CASAVA_Build 6 117964133 1D GGGGCATCTA C/- CTTTTGGTGT 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 C 2 1 119691 CASAVA_Build 6 117968064 1I ATACTTGTGA -/T TTTTCTTGGG 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 T 4 5 119692 CASAVA_Build 6 117982748 1D ACTCAGTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1422 hom 26 8 12 7 A 16 15 119693 CASAVA_Build 6 117984835 1I GATGTTGAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 T 9 10 119694 CASAVA_Build 6 117988012 3D CCTCATAGAT AAC/--- AACAGCTGGC 3070 het 3070 hom 43 17 19 8 AAC 2 1 119695 CASAVA_Build 6 118003534 1D CCCTTTTGAG A/- GTTAAATAAG 3070 het 3070 ref 57 36 18 3 A 1 0 119696 CASAVA_Build 6 118004886 4I AAGTTGTAAC ----/ACAT GCAGTAGATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ACAT 0 1 119697 CASAVA_Build 6 118019124 3D CATGGAAGCA AAG/--- AATACAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 17 6 AAG 1 0 119698 CASAVA_Build 6 118035067 1I TCACCTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 11 12 119699 CASAVA_Build 6 118038178 4D AGAGAATCTG AACA/---- AACAATCTAC 3070 het 3070 ref 40 24 15 6 AACA 2 1 119700 CASAVA_Build 6 118046509 1D TCCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 18 0 13 5 T 15 14 119701 CASAVA_Build 6 118053515 1D TTGCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 21 1 15 5 T 12 11 119702 CASAVA_Build 6 118059446 1D GACCCTGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 34 1 24 9 A 11 10 119703 CASAVA_Build 6 118064996 1I AACCCTCATG -/A AAAACATAAC 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 A 4 5 119704 CASAVA_Build 6 118087597 1D TATACAGAGT C/- CCCCCCCCCT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 C 10 9 119705 CASAVA_Build 6 118093975 2D GGTTGGTGTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 8 7 119706 CASAVA_Build 6 118116306 1D GAAGGAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 13 12 119707 CASAVA_Build 6 118135649 2I AAATGCAGAC --/TT TTAAAAATTT 2401 het 2401 ref 26 17 5 4 T 2 4 119708 CASAVA_Build 6 118135766 1I AGAAAGTTTT -/G ATTTCCTTTT 3070 het 3070 ref 70 36 27 7 G 0 1 119709 CASAVA_Build 6 118164953 1D GTACTATAAC T/- TTGATGAGAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 3 2 119710 CASAVA_Build 6 118191041 1I TGAAACTATT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 7 8 119711 CASAVA_Build 6 118191291 3I46M1D CAAATCAATA ---GTGATTTATCACAAAAACAGAATTAAAGACAAAAACCACATGATTAT/AATGTGATTTATCACAAAAACAGAATTAAAGACAAAAACCACATGATTA- CTCAATAGAA 3070 het 3070 ref 32 27 26 1 N/A 0 0 119712 CASAVA_Build 6 118194023 1D AAAAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 T 11 10 119713 CASAVA_Build 6 118195033 4I CCTGAATAGC ----/TCAG TCAATCTTCA 3070 het 3070 ref 47 28 11 8 TCAG 0 1 119714 CASAVA_Build 6 118215170 1D TTGAAGTGGG A/- AAAAAATCTC 3070 het 3070 hom 41 14 26 2 A 7 6 119715 CASAVA_Build 6 118239358 1D AGGCTCATTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 10 9 119716 CASAVA_Build 6 118255349 3I AAAGTAGATA ---/CTT CTTTTTTGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTT 1 2 119717 CASAVA_Build 6 118259021 1D AATCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 21 18 5 A 11 10 119718 CASAVA_Build 6 118263517 2D ACTACTAGTG TA/-- TATATTCAAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 TA 3 2 119719 CASAVA_Build 6 118300229 1D TAAGAATCTG A/- AAAAAAAAAA 1391 het 1391 ref 17 9 3 5 A 15 14 119720 CASAVA_Build 6 118312567 1D ACCCAGTTCC A/- AAGTCACTTC 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 A 3 2 119721 CASAVA_Build 6 118319814 1D AAAAATATTT A/- AAAATTAGCC 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 A 5 4 119722 CASAVA_Build 6 118326802 11I TCCATGAAAC -----------/CAATCCCCGGT GCCAAAAAAG 3070 het 1768 hom 17 5 11 2 CAATCCCCGGT 0 1 119723 CASAVA_Build 6 118333948 5D CATCTTATTT ATATC/----- CTTCCATATT 3070 het 3070 ref 37 23 13 3 ATATC 1 0 119724 CASAVA_Build 6 118342116 1D TCTGAGGATT A/- AAAAAAAAAA 2188 het 2188 ref 26 18 5 3 A 12 11 119725 CASAVA_Build 6 118345358 1D GTGGTTTGCA C/- TGGGAGGTGG 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 C 1 0 119726 CASAVA_Build 6 118345828 1I AAGCCAAGAG -/A AGAAGATGTT 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 A 1 2 119727 CASAVA_Build 6 118351363 4I ATATATATAT ----/ACAC ACACATACAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AC 2 4 119728 CASAVA_Build 6 118387639 1D CATAAAGAAT G/- CTACTTATAA 3070 het 3070 hom 31 14 16 3 G 1 0 119729 CASAVA_Build 6 118397573 1D CCTGTTTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 16 8 A 10 9 119730 CASAVA_Build 6 118404383 3I TTTAGATGAT ---/AAC AAATAAAGAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAC 0 1 119731 CASAVA_Build 6 118405058 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 819 hom 18 3 9 6 T 13 14 119732 CASAVA_Build 6 118413475 4I CATAACTATC ----/TATA TATACACACT 3070 hom 126 het 48 0 41 7 TA 2 4 119733 CASAVA_Build 6 118415155 1D CTTTCCCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 10 9 119734 CASAVA_Build 6 118419147 1I GTTCTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2598 hom 32 8 16 8 A 10 11 119735 CASAVA_Build 6 118422223 1D ATAACCTCCC A/- ATTTTAAGAT 3070 het 3070 ref 50 22 23 5 A 2 1 119736 CASAVA_Build 6 118434887 1D ACACATGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 12 11 119737 CASAVA_Build 6 118436137 1D AGCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 475 hom 39 2 33 5 A 11 10 119738 CASAVA_Build 6 118440773 1D ATAGATGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 29 het 52 1 42 10 T 10 9 119739 CASAVA_Build 6 118456985 2I CAGATGAAGA --/TT AGCTTCAGGA 3070 hom 138 het 54 0 46 8 T 0 2 119740 CASAVA_Build 6 118461470 1D TTCACACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 34 3 21 10 T 14 13 119741 CASAVA_Build 6 118468648 6D ATATTTTCCC ATAAGT/------ ATATGTCCTG 3070 hom 123 het 49 0 41 10 ATAAGT 1 0 119742 CASAVA_Build 6 118471209 4I TTCTGGAGTT ----/AGAA AGAATGTCTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AGAA 1 2 119743 CASAVA_Build 6 118474819 1I TTTGAGATAT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 7 8 119744 CASAVA_Build 6 118478236 1I ATAAAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1409 hom 21 4 16 1 A 12 13 119745 CASAVA_Build 6 118482644 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 9 10 119746 CASAVA_Build 6 118512955 1D AGTATGTTCC T/- TACTGCCATC 3070 hom 139 het 56 0 46 10 T 2 1 119747 CASAVA_Build 6 118531118 1I CATTTATTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 T 7 8 119748 CASAVA_Build 6 118546798 2D GCTTGTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 31 0 17 15 T 15 13 119749 CASAVA_Build 6 118548781 1D CATGATCATC T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 6 119750 CASAVA_Build 6 118551285 2D CAAATGATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 48 0 35 13 T 12 10 119751 CASAVA_Build 6 118558536 1D CTTAAGGTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 80 het 36 0 27 9 T 10 9 119752 CASAVA_Build 6 118559103 1I AGCATAAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 8 9 119753 CASAVA_Build 6 118559636 5I CATTATACTA -----/ATTAT ATTATATTAT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 ATTAT 3 4 119754 CASAVA_Build 6 118562163 1D TTATAGTCCA T/- TTATCTCATT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 T 3 2 119755 CASAVA_Build 6 118566164 1D CTCCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 28 1 16 11 A 15 14 119756 CASAVA_Build 6 118566567 1D TTTTATTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 138 het 52 0 46 6 T 10 9 119757 CASAVA_Build 6 118568739 4D ATAGAATAAG TATA/---- TAAAGAAAAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TA 3 1 119758 CASAVA_Build 6 118570422 1D TATTTATTCA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 8 7 119759 CASAVA_Build 6 118588948 1D TAATTAGAAG A/- AATAGAGAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 3 2 119760 CASAVA_Build 6 118644480 1D CCCTACATTA T/- AAGAATTGAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 0 119761 CASAVA_Build 6 118649832 1I TTTTTTATAG -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 8 119762 CASAVA_Build 6 118653582 1D ACAAAAAAAA T/- TTAGCTGGGT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 3 2 119763 CASAVA_Build 6 118653818 1I TATTTGGAAA -/C TATTTATTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 0 1 119764 CASAVA_Build 6 118655529 4D TTACATTGAG TAAT/---- TAATTTGTCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAT 2 1 119765 CASAVA_Build 6 118656168 7I7M6I ATACTAAATG -------GAATAGT------/TTCATACTAAAAGTTTAGGA TTTAAACTCT 3070 hom 75 het 25 0 26 3 N/A 0 0 119766 CASAVA_Build 6 118658196 1D CTCCATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 32 2 26 5 A 12 11 119767 CASAVA_Build 6 118660829 1I ACTTTTCTGG -/T TTTTTTTTTT 1475 het 261 hom 23 2 8 13 T 13 14 119768 CASAVA_Build 6 118662743 1D CTACCAGTTT A/- AAAATGCAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 A 5 4 119769 CASAVA_Build 6 118670236 1I ATCTGAAGCT -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 6 7 119770 CASAVA_Build 6 118710285 1D TGCAACATTT A/- AAAATAGGTT 3070 hom 138 het 51 0 46 5 A 5 4 119771 CASAVA_Build 6 118712853 1I TCACACTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 8 9 119772 CASAVA_Build 6 118715870 2I GATTTGGGTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 29 0 18 11 TG 0 1 119773 CASAVA_Build 6 118720544 1D TATTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 46 2 34 12 T 13 12 119774 CASAVA_Build 6 118722677 1D AATAATTACT A/- AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 43 34 4 5 A 11 10 119775 CASAVA_Build 6 118724817 2D AAACTCATAG AA/-- ATCAGAGTAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 A 3 1 119776 CASAVA_Build 6 118732254 2I AGAAAAGAAA --/AG AGAAGAAGAA 3070 hom 67 het 31 0 25 6 AG 1 2 119777 CASAVA_Build 6 118734065 1D GCATGGAACC T/- TTGTTCTGTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 3 2 119778 CASAVA_Build 6 118747154 1D ATTTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 27 1 17 9 T 13 12 119779 CASAVA_Build 6 118748962 2D TAGAGGATAA CT/-- CAACGTGGGG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 CT 1 0 119780 CASAVA_Build 6 118749428 2I AAGAAAAAAC --/AT GTGGTACATG 3070 hom 120 het 48 0 40 8 AT 0 1 119781 CASAVA_Build 6 118778334 1D TTCTTGGGGG A/- AAAAAAAACA 1288 het 1288 ref 44 35 3 8 A 9 8 119782 CASAVA_Build 6 118784255 4I GAAATCAAAA ----/TTAG TTAGATACAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 TTAG 1 2 119783 CASAVA_Build 6 118785687 2I CAAAAAAGAA --/AG AACCATGGCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AG 0 1 119784 CASAVA_Build 6 118799454 1D AACCTATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 41 2 30 9 A 12 11 119785 CASAVA_Build 6 118809123 2D ATACAAAGTC CA/-- CACACACACA 3070 hom 58 het 46 1 31 16 CA 10 9 119786 CASAVA_Build 6 118809612 1D CTACTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 33 0 27 7 A 12 11 119787 CASAVA_Build 6 118812089 2D TTCTAGCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 47 1 40 7 T 13 11 119788 CASAVA_Build 6 118830016 1I AAAATTGTTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 7 8 119789 CASAVA_Build 6 118837321 1I CCAGAGTGCC -/T TCTTTCCTCC 3070 hom 87 het 30 0 29 1 T 1 2 119790 CASAVA_Build 6 118843450 17D CTTATTTTTA ATGCTTTTTAAATGTTT/----------------- ATGCTTTTTA 3070 hom 57 het 25 0 20 6 ATGCTTTTTAAATGTTT 2 1 119791 CASAVA_Build 6 118846838 1D ACCATTCCTT A/- AGATGAATAC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 2 1 119792 CASAVA_Build 6 118847189 1D AATGAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 39 0 30 9 T 11 10 119793 CASAVA_Build 6 118847463 10I AAAAGCATGG ----------/AGCAAATCAT ACATTTCCAC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 AGCAAATCAT 0 1 119794 CASAVA_Build 6 118875686 1D AATTTATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 22 0 21 1 A 11 10 119795 CASAVA_Build 6 118878447 2I CTTCCATGAT --/TA TATGTTTCCT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TA 1 2 119796 CASAVA_Build 6 118878900 2I TCTAAGTGCA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 9 11 119797 CASAVA_Build 6 118892659 1I GCTCAACCAC -/A AAACATCCTA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 A 3 4 119798 CASAVA_Build 6 118896543 1D ACTGGAAAGC A/- AAAATATTTC 3070 hom 132 het 49 0 43 8 A 5 4 119799 CASAVA_Build 6 118907926 2D TGATTTGGGT CA/-- CACACGTATA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 CA 3 2 119800 CASAVA_Build 6 118911158 2I TATAAGAAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AT 6 7 119801 CASAVA_Build 6 118912628 2D ATTTTGTTAC GT/-- TAACAGACTT 3070 hom 111 het 47 0 38 12 GT 1 0 119802 CASAVA_Build 6 118913256 1D AATGTATAAC A/- ATTTTTAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 1 119803 CASAVA_Build 6 118928001 1I TACTAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 26 2 15 9 T 11 12 119804 CASAVA_Build 6 118944886 2D TTGTTTTCAT CA/-- GGTTTGTCAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 CA 1 0 119805 CASAVA_Build 6 118950731 1D TGAGACTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 850 hom 31 5 15 11 A 15 14 119806 CASAVA_Build 6 118952299 4D GACTCTGTCT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 1411 hom 16 3 12 2 AAAC 5 4 119807 CASAVA_Build 6 118958717 1D AGATGATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 28 0 19 10 A 12 11 119808 CASAVA_Build 6 118961337 1D AAAAGCTCCC A/- AAAAAATCTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 6 119809 CASAVA_Build 6 118966552 4D CAGTAACTTA CTTT/---- CTTTAAGCAA 3070 hom 111 het 41 0 38 5 CTTT 2 1 119810 CASAVA_Build 6 118970449 1I AGAAAGATTC -/A ATTTTCTGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 2 119811 CASAVA_Build 6 118971035 2I TTTGTTGAAA --/TT TTGTTTTTTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 2 4 119812 CASAVA_Build 6 118973896 2D TTGAGGAACA CT/-- CTACTGATAA 3070 hom 72 het 28 0 25 5 CT 2 1 119813 CASAVA_Build 6 118979254 3D CATTCATTTT AAA/--- TCCTTAAGAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 3 0 119814 CASAVA_Build 6 118992890 1D AAACCTAAAT A/- ACATCATGTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 2 1 119815 CASAVA_Build 6 119002608 1D GCAGGAGTAC T/- TCCTTGGTGG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 2 1 119816 CASAVA_Build 6 119017901 12D CTCTGCATTT ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 83 het 35 0 27 12 AC 12 6 119817 CASAVA_Build 6 119023131 6I ACATCTATCC ------/TCATTG TCATTGTCGT 3070 hom 138 het 56 0 46 10 TCATTG 1 2 119818 CASAVA_Build 6 119024909 1I CATAAGGAAA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 7 8 119819 CASAVA_Build 6 119031097 1D GGACCTGATA T/- GAAAGTGACA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 1 0 119820 CASAVA_Build 6 119032779 8I GAACAAAAAG --------/GCATTAAA GCATTAAAGT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 GCATTAAA 1 2 119821 CASAVA_Build 6 119039758 1D TATATTTGTA G/- ACTTTCAAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 1 0 119822 CASAVA_Build 6 119040533 7D AAAAAAAAGC GGGGGGG/------- GGGGGGGGGG 1142 het 90 hom 12 1 4 7 G 17 10 119823 CASAVA_Build 6 119043295 1I AGTAAATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 44 0 33 11 A 11 12 119824 CASAVA_Build 6 119053782 1I ATTTAACTCA -/C AGCTTCTACC 3070 hom 90 het 42 0 34 8 C 0 1 119825 CASAVA_Build 6 119062109 1I ATTATACCAG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 8 119826 CASAVA_Build 6 119065396 1D TCTACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 29 3 15 11 A 15 14 119827 CASAVA_Build 6 119068199 9I TATAGCTCAG ---------/TGGAAAAGA TGTGCACTGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TGGAAAAGA 0 1 119828 CASAVA_Build 6 119069261 2I GAAAAAAACT --/TC TGTTTATACT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TC 0 1 119829 CASAVA_Build 6 119069685 1D TTTGCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 44 0 36 10 A 12 11 119830 CASAVA_Build 6 119077593 1I TACAATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 10 11 119831 CASAVA_Build 6 119085589 1D GGAGCTACTG C/- CCCCCAATTA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 C 6 5 119832 CASAVA_Build 6 119088742 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 51 2 38 11 T 10 11 119833 CASAVA_Build 6 119090392 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 15 6 A 14 13 119834 CASAVA_Build 6 119103456 1D TGCTAGAATT A/- AAAAAAAAAA 1265 het 1265 ref 28 22 3 3 A 12 11 119835 CASAVA_Build 6 119106778 4I CAGAGTGAGA ----/CTGT CTAAGAAAAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CTGT 0 1 119836 CASAVA_Build 6 119108279 2I CAAAATTCCA --/CC ACCAGTGAAC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 C 0 2 119837 CASAVA_Build 6 119113205 3D AACTCTAACC ATT/--- ATTTCTTGGA 3070 hom 66 het 23 0 23 1 ATT 2 1 119838 CASAVA_Build 6 119114053 1D GCAACACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 50 1 43 6 T 13 12 119839 CASAVA_Build 6 119126395 1I GCTGAAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 183 hom 43 2 33 8 A 13 14 119840 CASAVA_Build 6 119140043 1D TCTCAAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 945 hom 33 5 12 16 T 16 15 119841 CASAVA_Build 6 119149694 1D TACCTAATGG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 7 6 119842 CASAVA_Build 6 119157918 1D AAATGAAAAT A/- AATAAAATAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 3 2 119843 CASAVA_Build 6 119185155 1D TCTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1430 het 1430 ref 31 24 5 2 A 12 11 119844 CASAVA_Build 6 119220237 6I ACATGGGGAG ------/AGCAGA AGCAAGGGGA 3070 hom 91 het 33 0 27 6 AGCAGA 0 1 119845 CASAVA_Build 6 119244712 1I GAGTCAAGAG -/T TCTGTGATAC 3070 hom 147 het 55 0 49 6 T 1 2 119846 CASAVA_Build 6 119260691 1I AAGCTGGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 A 11 12 119847 CASAVA_Build 6 119266965 1I CAAAGAGAAA -/G GAACATATCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 1 2 119848 CASAVA_Build 6 119268233 1D TGTATAATCC T/- TTCATGAACC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 3 2 119849 CASAVA_Build 6 119304238 10D AAATACCTAA TTCTTTAATG/---------- TTCAGACACT 3070 hom 78 het 30 0 27 5 TTCTTTAATG 1 0 119850 CASAVA_Build 6 119306097 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2311 het 202 hom 27 2 12 13 A 12 10 119851 CASAVA_Build 6 119308354 3D AAGACAAAGG AAA/--- AAAATGAATC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 4 119852 CASAVA_Build 6 119310803 1D CTCTTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 27 1 19 7 T 14 13 119853 CASAVA_Build 6 119315606 1D GACAACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 50 1 45 4 T 11 10 119854 CASAVA_Build 6 119316507 2D GAAATACAGC AA/-- AGAGGGCTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 3 1 119855 CASAVA_Build 6 119322689 3I AAATAAAAAG ---/CAT CATTGTTTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CAT 1 2 119856 CASAVA_Build 6 119328073 1I TTGTTTGTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 34 1 24 9 G 0 1 119857 CASAVA_Build 6 119331701 2D TTTTTGCATA AT/-- AAAGGTCTAT 3070 hom 75 het 31 0 25 7 AT 1 0 119858 CASAVA_Build 6 119332670 1I CTGCCCCCCA -/C CCCCGTGACA 2258 hom 15 het 6 0 6 0 C 4 5 119859 CASAVA_Build 6 119334413 1I TCATTCAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 9 10 119860 CASAVA_Build 6 119334725 3I GGGCAGGAGC ---/AGA AGAAGCAAGA 3070 hom 84 het 29 0 24 5 AGA 1 2 119861 CASAVA_Build 6 119375972 1D TTACTCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 756 hom 35 2 29 5 A 11 10 119862 CASAVA_Build 6 119381758 4D GCAACTAGAT AGAC/---- AGTGGTGCTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AGAC 1 0 119863 CASAVA_Build 6 119399081 1I GTCCAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 25 2 23 0 T 11 12 119864 CASAVA_Build 6 119403034 4D TGCCTCAGTC TGTT/---- TTTCTGCTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TGTT 1 0 119865 CASAVA_Build 6 119416950 1D TCCTTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 A 11 10 119866 CASAVA_Build 6 119473860 4D AGCAAATGAA AAGG/---- AAGGTTGCGA 3070 het 3070 hom 55 21 31 3 AAGG 2 1 119867 CASAVA_Build 6 119487620 1D ATGGCCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 22 5 T 12 11 119868 CASAVA_Build 6 119491752 1D CCCTTACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 31 1 23 7 T 11 10 119869 CASAVA_Build 6 119492587 1D TGTGTGTGTG T/- GGGGGGTTGT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 T 1 0 119870 CASAVA_Build 6 119494211 1I AGTAATAAGT -/G TGGAATAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 G 0 1 119871 CASAVA_Build 6 119500125 2D GTCTTTCTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 TG 6 5 119872 CASAVA_Build 6 119500185 4D AGAGAGAGAC AGAG/---- AGAGAGAAGA 3070 het 2719 hom 33 8 17 9 AG 5 3 119873 CASAVA_Build 6 119509775 2I GAGATGTGCA --/CC CCCCCAGGCT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 5 7 119874 CASAVA_Build 6 119509944 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 162 hom 27 1 17 9 T 7 8 119875 CASAVA_Build 6 119514125 2I CCTTGGTGGC --/TA TGCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 TA 0 1 119876 CASAVA_Build 6 119514220 11D ATGACAACTG TGCAGAAGTCT/----------- TGCAGAACCT 3070 het 3070 ref 39 28 9 3 TGCAGAAGTCT 1 0 119877 CASAVA_Build 6 119515888 1I AGTTTAAGTC -/T TTTTTTTTTC 522 het 522 ref 22 14 5 3 T 9 10 119878 CASAVA_Build 6 119521908 1I GTCTTTTGTC -/A GTCTTTTCTC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 0 1 119879 CASAVA_Build 6 119533786 1I TCTTTGATCA -/T TTATGTCAGC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 T 2 3 119880 CASAVA_Build 6 119546271 1I TCTTTCCTCC -/T TTTTTTTTTG 1753 het 1753 ref 27 16 7 4 T 9 10 119881 CASAVA_Build 6 119554307 1D GACCTTCAAA G/- CAATAATTTT 3070 hom 93 het 41 0 32 9 G 1 0 119882 CASAVA_Build 6 119554858 1I CAGTGGATTG -/A AAAATTAGCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 4 5 119883 CASAVA_Build 6 119557659 3D22M1I TACACGTATT ATCAACAATCTCACAACTGTAGGAT-/---AACAATCTCACAACTGTAGGATA AGGTATCTTC 3070 hom 39 het 17 0 12 10 N/A 0 0 119884 CASAVA_Build 6 119559190 1D ATTTCACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 17 8 A 13 12 119885 CASAVA_Build 6 119572862 2D AATAATGTTT AA/-- AATTAGTCAT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 4 2 119886 CASAVA_Build 6 119573538 1I GTCTAGTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 420 hom 42 1 31 10 T 9 10 119887 CASAVA_Build 6 119574709 1D ATAGTAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3023 het 2106 hom 19 7 8 4 T 15 14 119888 CASAVA_Build 6 119577810 5I TAAAATAAAA -----/ATCTC AGAATAGCAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 ATCTC 0 1 119889 CASAVA_Build 6 119582799 1D TGTCTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 13 12 119890 CASAVA_Build 6 119583203 1D TTTACTTGGT G/- AGTTTAAAGA 3049 het 3049 ref 25 16 7 3 G 1 0 119891 CASAVA_Build 6 119584289 12I AAACTAAACA ------------/TACCATTAAGAT CATATTCTTG 3070 het 3070 hom 24 8 9 7 TACCATTAAGAT 0 1 119892 CASAVA_Build 6 119588290 9I AAAGAGAAGG ---------/AGGAGGAGA AGGAGGAGAA 3070 hom 78 het 34 0 25 9 AGGAGGAGA 1 2 119893 CASAVA_Build 6 119589710 1D AATTTATATA T/- TTTTTAGTAG 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 T 6 5 119894 CASAVA_Build 6 119592079 2D GTTCTGAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 31 0 22 10 A 14 12 119895 CASAVA_Build 6 119629404 1I ATACACATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 9 10 119896 CASAVA_Build 6 119631965 1I GCAGGCCAGG -/C CAATCATAAG 3070 hom 63 het 29 0 19 10 C 1 2 119897 CASAVA_Build 6 119642471 2D TCCTCTTCCC CT/-- GAGTCTCAGC 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 CT 1 0 119898 CASAVA_Build 6 119644766 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2266 hom 17 7 10 0 A 11 10 119899 CASAVA_Build 6 119647921 3D CAATCATGGC AGA/--- AGGTGAAGAG 3070 het 3058 hom 31 8 18 5 AGA 1 0 119900 CASAVA_Build 6 119648004 12I TAGCAGACTT ------------/TTTTTTCTTTTC TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 28 5 18 5 TTTTTTCTTTTC 0 1 119901 CASAVA_Build 6 119648473 1D TTTTCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 16 8 T 13 12 119902 CASAVA_Build 6 119651930 4D GTATTATAAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 22 het 37 0 15 24 TA 8 6 119903 CASAVA_Build 6 119654392 1D GGCCAGGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 10 9 119904 CASAVA_Build 6 119655154 10I GGGCCTACTG ----------/AGTAGTTGTT CACTTTTGCC 3070 het 3070 hom 45 22 23 0 AGTAGTTGTT 0 1 119905 CASAVA_Build 6 119655857 1D TAAACTTAAA C/- CCTCAAATCA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 C 3 2 119906 CASAVA_Build 6 119658306 5I10M3D GATGCAAGCT -----CGAGGAACAGATA/TTCCCTGAGGAACAG--- ATAAATTGTT 3070 het 3070 ref 34 25 10 3 N/A 0 0 119907 CASAVA_Build 6 119659581 1D AACATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 A 11 10 119908 CASAVA_Build 6 119662472 4I AAATTTAAAT ----/AAAC AAAGAAAACT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 AAAC 0 1 119909 CASAVA_Build 6 119666953 1D ATAAATATAA G/- TGAAAATTAT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 G 1 0 119910 CASAVA_Build 6 119667810 10I AAAGAAATCA ----------/TTTAAAAGAT TTTCTCATCC 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 TTTAAAAGAT 0 1 119911 CASAVA_Build 6 119668344 1I CCATGTTAAC -/T TGGTAGCTGG 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 1 2 119912 CASAVA_Build 6 119670179 1D GAACCATGTC T/- ACATTTATCT 3070 het 3070 ref 48 25 18 7 T 1 0 119913 CASAVA_Build 6 119672747 1D TGATTTGTAC T/- TTCTTCTTAA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 3 2 119914 CASAVA_Build 6 119676526 1I TACTTATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2505 hom 31 11 9 11 A 13 14 119915 CASAVA_Build 6 119688156 4D GTTTTTGCTC CTAA/---- CTTTTACACT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 CTAA 1 0 119916 CASAVA_Build 6 119695719 1D AATTCTTTTT A/- AAAGAGAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 4 3 119917 CASAVA_Build 6 119708063 2D TGAGGGGGGG GC/-- GGAGCGGGGG 3070 het 2219 hom 24 10 9 5 GC 1 0 119918 CASAVA_Build 6 119717441 3D CCATGCTGTG TGA/--- TGATAGAACT 3070 het 3070 hom 46 19 21 7 TGA 2 1 119919 CASAVA_Build 6 119718988 1D CTAGGACTAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 8 119920 CASAVA_Build 6 119735282 1I TGACAGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 10 11 119921 CASAVA_Build 6 119752165 6D ATGTAATATT AAAGTA/------ AAAGAAAATT 3070 het 3070 ref 43 21 20 5 AAAGTA 1 0 119922 CASAVA_Build 6 119762652 8I GTCTTACTGC --------/AGGATGGT ATAGAAATGA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 AGGATGGT 0 1 119923 CASAVA_Build 6 119774766 2D ATGCATAGTT TG/-- TGAAGATTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 TG 2 1 119924 CASAVA_Build 6 119785961 1I CAGTCTAATC -/A AAACTGAAGA 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 A 3 4 119925 CASAVA_Build 6 119786936 1I CTAAAAGTTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 8 9 119926 CASAVA_Build 6 119790917 1I TTACATATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 10 11 119927 CASAVA_Build 6 119797452 1I TACATGGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 T 9 10 119928 CASAVA_Build 6 119798466 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 A 10 11 119929 CASAVA_Build 6 119810896 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2525 het 2525 ref 24 10 9 5 A 14 15 119930 CASAVA_Build 6 119814740 7I AAAGCTGAGG -------/ACAGTCA ACAGTCAACA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 ACAGTCA 1 2 119931 CASAVA_Build 6 119815253 1I GATAAATGTC -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 7 8 119932 CASAVA_Build 6 119818062 1I TAACGTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 11 12 119933 CASAVA_Build 6 119827305 1I CAACCCTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 10 11 119934 CASAVA_Build 6 119832324 6I TAGCAGTGAA ------/TATACT TATGATCACT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TATACT 0 1 119935 CASAVA_Build 6 119835840 1I AACTAGAACA -/T CCCCAAATGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 0 1 119936 CASAVA_Build 6 119846592 1D AAGAGATATA C/- ATGAAAATGC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 C 1 0 119937 CASAVA_Build 6 119862689 3D AAAAAAGAAA CTT/--- TAAAGTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 20 3 CTT 1 0 119938 CASAVA_Build 6 119866675 3D TCTCTGTCTC CTT/--- CTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 21 9 12 1 CTT 2 1 119939 CASAVA_Build 6 119892356 1I CAGGCAGCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 29 0 16 13 T 9 10 119940 CASAVA_Build 6 119924274 5I GTATGGTACA -----/ATAAG ATAATTGAGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATAAG 0 1 119941 CASAVA_Build 6 119953741 4I TTTATTTTGA ----/GCTG GCTCTACCAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 GCTG 0 1 119942 CASAVA_Build 6 119956770 1I GGGAAGTCAT -/A AAAATTAGGG 3070 hom 166 het 58 0 56 2 A 4 5 119943 CASAVA_Build 6 119967967 1I GGTGACCTTT -/C TTTACTATGT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 C 0 1 119944 CASAVA_Build 6 119975781 2D CATTTCTCTA AC/-- ACAGTCATTG 3070 het 3070 ref 52 24 19 10 AC 2 1 119945 CASAVA_Build 6 119988659 2D AAAAATTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 15 10 T 17 15 119946 CASAVA_Build 6 119990310 1I GTCCAAGCGT -/G GGGTATAAGG 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 G 3 4 119947 CASAVA_Build 6 119991221 1I TACTGCCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 10 11 119948 CASAVA_Build 6 119991812 3I TACTACATTC ---/ATA AATCTCCTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATA 0 1 119949 CASAVA_Build 6 119992082 2D CACGCGCGCG CA/-- CACACACACA 3070 hom 80 het 37 0 27 12 CA 9 8 119950 CASAVA_Build 6 119994590 1I AGGTTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 11 12 119951 CASAVA_Build 6 120013588 3D GAAAAAAAAT TCC/--- TCCTATTTTG 3070 het 3070 ref 41 22 18 3 TCC 2 1 119952 CASAVA_Build 6 120023887 5I AGTAACTGTC -----/AGGTG AATACCTTGA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 AGGTG 0 1 119953 CASAVA_Build 6 120041466 1I GCTAAGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 10 11 119954 CASAVA_Build 6 120050664 1D AATTTAATAA T/- TTTCCCCCAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 4 3 119955 CASAVA_Build 6 120052765 1D TTGCAATAGA T/- TTTTTTTTTG 1160 het 1160 ref 42 37 3 2 T 10 9 119956 CASAVA_Build 6 120060006 2D AGTAATATAA TT/-- TTTTTTTTGA 2324 het 2324 ref 25 16 8 1 T 10 8 119957 CASAVA_Build 6 120065895 1I TTATATAAAC -/A AATTGAACAT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 2 3 119958 CASAVA_Build 6 120070656 3D ATCCCTTCCC CTA/--- CTAAGACAAC 3070 het 3070 hom 50 23 23 7 CTA 2 1 119959 CASAVA_Build 6 120094768 1D GTTTACCTCT C/- CTAGTAGAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 C 2 1 119960 CASAVA_Build 6 120118620 3D TAAAGGGGAT ATC/--- ACCACTGATC 2208 het 790 hom 8 2 5 1 ATC 1 0 119961 CASAVA_Build 6 120123380 1I AGGGCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 11 12 119962 CASAVA_Build 6 120129096 2I TCCCGTTAAG --/GC TCCTAGGAAC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 GC 0 1 119963 CASAVA_Build 6 120129854 1D ACTTAGTGGT C/- CACCAAACAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 C 2 1 119964 CASAVA_Build 6 120132593 1D TGAATGGGGG A/- CTTCTTACTC 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 1 0 119965 CASAVA_Build 6 120133592 1D CTTAGGGGTT A/- GGGGGGGCTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 A 1 0 119966 CASAVA_Build 6 120144088 1D TGATGAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 13 12 119967 CASAVA_Build 6 120144159 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1166 hom 26 8 10 8 T 15 14 119968 CASAVA_Build 6 120148206 6I GTGTGTGTGT ------/GTGTGC GTGTGTGTGT 3070 het 362 hom 32 3 17 12 GTGTGC 0 1 119969 CASAVA_Build 6 120150355 1D TTTGCTTTAG A/- AAAAAGGCAC 3070 het 3070 hom 57 23 26 8 A 6 5 119970 CASAVA_Build 6 120151502 3I TTATAAGTTG ---/ATA ATAATAATTT 3070 hom 157 het 61 0 53 8 ATA 2 3 119971 CASAVA_Build 6 120155907 1I AGGTACACCA -/T TATAATTTCA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 1 2 119972 CASAVA_Build 6 120159107 1I CTTGGAATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 31 0 15 16 T 9 10 119973 CASAVA_Build 6 120176218 1I ATCTGGCCAC -/T TTTTTCAGTC 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 5 6 119974 CASAVA_Build 6 120218811 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 13 12 2 A 10 9 119975 CASAVA_Build 6 120240999 1D AGGTATACGG A/- AGAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 35 16 16 5 A 2 1 119976 CASAVA_Build 6 120248652 27I TGCTTATGGA ---------------------------/ACTTAAATAAGTAAGACTTAGCAGCAG CTCTCTTTAA 3070 het 3070 ref 48 22 20 8 ACTTAAATAAGTAAGACTTAGCAGCAG 0 1 119977 CASAVA_Build 6 120250961 4D TGCAACTATG AGTT/---- AGTTAGTACA 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 AGTT 2 1 119978 CASAVA_Build 6 120251688 1D GGCAAAAAAT A/- AAGTGTTTGT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 3 2 119979 CASAVA_Build 6 120252659 1I CAGAACTGTG -/A AAAAATACAT 3070 het 3070 ref 51 29 17 5 A 5 6 119980 CASAVA_Build 6 120255265 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 21 9 9 4 AAAC 4 3 119981 CASAVA_Build 6 120260924 1I TACTGTTAAA -/T TTTCACTTTC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 3 4 119982 CASAVA_Build 6 120263934 1D CACCATGTGG T/- TTCAGTCTAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 3 2 119983 CASAVA_Build 6 120266476 1I ATAATCAACC -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 T 7 8 119984 CASAVA_Build 6 120282252 3D AAAGAGAATA ATG/--- ATATCAGAAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 ATG 1 0 119985 CASAVA_Build 6 120285085 1D AGTTTTTAGT A/- TTGCTAATAG 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 A 1 0 119986 CASAVA_Build 6 120297292 2I AAATCACAAA --/AG AGAAAATATA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 AG 1 2 119987 CASAVA_Build 6 120303457 1I CCTTTTAACT -/G CTGTGTTTGG 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 G 0 1 119988 CASAVA_Build 6 120307399 1D TCTTAAACTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 9 8 119989 CASAVA_Build 6 120314850 2I TAGGGGAAAA --/CT CTGCAACCTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CT 1 2 119990 CASAVA_Build 6 120316895 1I TCCATGTGCA -/G GTTTCTGTGT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 G 1 2 119991 CASAVA_Build 6 120318041 2D GAATAATTTG TA/-- TCTTATTACA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 TA 1 0 119992 CASAVA_Build 6 120333687 1I AGAAGAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 9 10 119993 CASAVA_Build 6 120334289 2D AATATCAAAG AT/-- ATGATTTATG 3070 het 3070 hom 35 15 19 3 AT 2 1 119994 CASAVA_Build 6 120350954 3D TTCTTTCTTC TTA/--- TTTTAATTTT 2293 het 2293 ref 30 14 6 10 TTA 1 0 119995 CASAVA_Build 6 120351630 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 83 het 83 ref 24 14 2 10 AAAG 1 0 119996 CASAVA_Build 6 120352249 4I GTAAAGGCAC ----/AGAT AGATGCCTTC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 AGAT 1 2 119997 CASAVA_Build 6 120352391 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2714 het 2714 ref 18 8 8 2 T 13 12 119998 CASAVA_Build 6 120354211 3I AATTAATAAG ---/AAC AACAACTGTG 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 AAC 2 3 119999 CASAVA_Build 6 120354808 1D TAAAACAGGT A/- AATTAGAGGT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 A 3 2 120000 CASAVA_Build 6 120356103 1I TAGTGGGTAA -/G GGGTTACTTT 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 G 3 4 120001 CASAVA_Build 6 120357247 6D CATGTAAATT CATTGA/------ CATTTTATCC 3070 het 3070 hom 42 13 27 3 CATTGA 1 0 120002 CASAVA_Build 6 120358071 4I ACAGGAAAAT ----/AAAC AAATCATTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 AAAC 0 1 120003 CASAVA_Build 6 120358225 2I ACATTTTAAG --/AA AAATTTTTTT 3070 het 220 hom 24 4 16 4 A 3 5 120004 CASAVA_Build 6 120359404 1D CAACACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 139 hom 40 2 14 24 T 15 14 120005 CASAVA_Build 6 120360076 10I ATACTATTCT ----------/AAGTGACTAA TTAATCAGTT 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 AAGTGACTAA 0 1 120006 CASAVA_Build 6 120360886 4I AACCTGTGTA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 AAAC 2 3 120007 CASAVA_Build 6 120363317 1D GAAAAATGAC A/- TTGAACCATA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 1 0 120008 CASAVA_Build 6 120363810 1I ACAGAAGGGG -/A AAGATATCTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 2 3 120009 CASAVA_Build 6 120369003 1I ACTGAGATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 9 10 120010 CASAVA_Build 6 120369176 2I GGCTAAAATT --/GA GAGACTAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 GA 2 3 120011 CASAVA_Build 6 120369469 4D GAGCACCAAT TAGA/---- TAGGTATTAA 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 TAGA 1 0 120012 CASAVA_Build 6 120373167 1D TGCATATGTA C/- CCCCTGAATT 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 C 5 4 120013 CASAVA_Build 6 120374777 2D TCTTTAGCTG TA/-- TAACACAAGT 3070 het 3070 ref 37 18 16 5 TA 2 1 120014 CASAVA_Build 6 120374949 2D TATTGAATAA CC/-- TTACTGTGAC 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 C 2 0 120015 CASAVA_Build 6 120375745 1D CCTCAAGCTT A/- CTATCCTTTG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 1 0 120016 CASAVA_Build 6 120377257 1D CAAAGCTACT A/- AAAATAATAG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 5 4 120017 CASAVA_Build 6 120379816 1D ATAATAAAAA T/- ATATATATGT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 1 0 120018 CASAVA_Build 6 120383631 1I ATGCTGACAT -/A AAAAACAAAC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 5 6 120019 CASAVA_Build 6 120385490 2D TTCTGAACAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 5 4 120020 CASAVA_Build 6 120389664 12D CAGGGATTCA CAAGACTGAAAT/------------ CAAGATATCA 3070 hom 126 het 46 0 43 5 CAAGACTGAAAT 1 0 120021 CASAVA_Build 6 120396687 2I TTTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 8 10 120022 CASAVA_Build 6 120397601 1I TATATATATA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 6 7 120023 CASAVA_Build 6 120398417 3I CTAAAATAAA ---/AGC AGACAGAGGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AGC 0 1 120024 CASAVA_Build 6 120398880 1I CATGTAAATC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 9 10 120025 CASAVA_Build 6 120408602 1I ATTAAGGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 110 het 40 0 36 4 A 10 11 120026 CASAVA_Build 6 120412100 1D ATGTCCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 25 1 12 12 T 16 15 120027 CASAVA_Build 6 120444577 1I TTAGCTGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 13 14 120028 CASAVA_Build 6 120446710 1I CTGCTTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 30 1 16 13 A 13 14 120029 CASAVA_Build 6 120465252 1I CTCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 11 12 120030 CASAVA_Build 6 120468757 1D TGGCAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 35 1 26 8 T 12 11 120031 CASAVA_Build 6 120471891 5D TAACATATAA CTCAT/----- CTCATATAGT 3070 hom 105 het 39 0 35 6 CTCAT 2 1 120032 CASAVA_Build 6 120472667 1D GAGAAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 719 het 719 ref 37 26 2 9 T 13 12 120033 CASAVA_Build 6 120500471 1D CGAGAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 922 hom 34 7 13 14 A 15 14 120034 CASAVA_Build 6 120515892 1D GGATAGAAGA C/- TACAAATATG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 1 0 120035 CASAVA_Build 6 120516425 1I AAGGCAGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 12 13 120036 CASAVA_Build 6 120519393 1D ATATGTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1825 hom 30 11 10 9 A 15 14 120037 CASAVA_Build 6 120524975 1D AAAAAATATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 10 9 120038 CASAVA_Build 6 120527328 1I TAGCAAGCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 9 10 120039 CASAVA_Build 6 120527938 2I CATCAATAAC --/TG TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TG 0 1 120040 CASAVA_Build 6 120529324 1D TTAGAACACT G/- GGATAGTATG 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 G 3 2 120041 CASAVA_Build 6 120533980 2I ATACACACAT --/AC ACACACACAC 2570 het 2570 ref 37 14 12 11 AC 8 9 120042 CASAVA_Build 6 120539265 1D TACTGAGTAT A/- AACCCTAAGG 3070 het 3070 ref 33 23 9 1 A 3 2 120043 CASAVA_Build 6 120545236 2I TGGATGTTTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 TA 6 7 120044 CASAVA_Build 6 120545976 5D ATAATCCATT TTCAG/----- TTGATTTTTG 3070 het 3070 ref 31 19 10 4 TTCAG 1 0 120045 CASAVA_Build 6 120547336 1D TTCCTCTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 10 9 120046 CASAVA_Build 6 120554297 3D TCATTCCTAT ACA/--- ACAACAACAG 2686 het 2686 ref 28 18 6 5 ACA 4 3 120047 CASAVA_Build 6 120558229 2D AGTAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 2618 het 2618 ref 28 9 7 12 A 14 12 120048 CASAVA_Build 6 120564093 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2978 hom 24 9 14 3 A 10 9 120049 CASAVA_Build 6 120567482 16I GGATTGCCTA ----------------/AAGAGAGAGCACCTGT AACTCATTGG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 AAGAGAGAGCACCTGT 0 1 120050 CASAVA_Build 6 120597759 1I AATCAAATAA -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 8 120051 CASAVA_Build 6 120601459 1I TGCAAATCTA -/T GTAAACAATA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 0 1 120052 CASAVA_Build 6 120611529 6I GAAAATCAGT ------/ATATTG ATATTGAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 ATATTG 1 2 120053 CASAVA_Build 6 120613597 1D AAGCCCAACC A/- AAAAAAGCCC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 7 6 120054 CASAVA_Build 6 120614425 4I ATAGACAAAC ----/AGAG AGCCAAATCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AG 1 3 120055 CASAVA_Build 6 120620505 1D AATGTCATGG T/- TTTTCAACCA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 5 4 120056 CASAVA_Build 6 120621539 1D CCAACTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 26 0 17 9 A 14 13 120057 CASAVA_Build 6 120626228 1I TATGATGTGG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 T 7 8 120058 CASAVA_Build 6 120633217 1I CTGCAATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 10 11 A 14 15 120059 CASAVA_Build 6 120634036 4D TTCTGATCCC CAAA/---- CAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 CAAA 2 1 120060 CASAVA_Build 6 120651958 4D TCATAAATCT ATCA/---- ATCAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 12 6 ATCA 2 1 120061 CASAVA_Build 6 120671117 4I CATTAAAAAA ----/TAAC TAAGACAGTA 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 TAAC 0 1 120062 CASAVA_Build 6 120671899 1I ATATTTTTTA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 7 8 120063 CASAVA_Build 6 120674239 1I ATGAGTTGGC -/T TGCAGGTATG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 1 2 120064 CASAVA_Build 6 120674759 4I ATGAATGTTT ----/ATCC ATCCCATGGC 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 ATCC 1 2 120065 CASAVA_Build 6 120675256 7I TGAAATTAGG -------/AAAACTA ACTTCGTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 AAAACTA 0 1 120066 CASAVA_Build 6 120676222 6D TCCGTTCTCA GGCTGC/------ TATAGAGAAC 3070 het 3070 ref 42 29 9 5 GGCTGC 1 0 120067 CASAVA_Build 6 120676609 1I TATTGCATAA -/G GTAGTGTTTA 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 G 1 2 120068 CASAVA_Build 6 120676872 1I CTCTACATGG -/A AAGCTAAATT 3070 het 3070 ref 62 26 25 11 A 2 3 120069 CASAVA_Build 6 120677124 1D GGTCAGTTTC T/- GCAGAGACAA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 1 0 120070 CASAVA_Build 6 120677644 1D TTTAAAAAGT C/- AAATTTAACA 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 C 1 0 120071 CASAVA_Build 6 120682166 1D TTGATCTGGA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 T 7 6 120072 CASAVA_Build 6 120682304 1I TTTACAGAGA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 T 7 8 120073 CASAVA_Build 6 120684135 1D TAAAACATGT A/- AAAAAAAAAA 1896 het 1896 ref 29 16 6 9 A 13 12 120074 CASAVA_Build 6 120685106 4I GGTAACTAAA ----/TAAG TAAATATAAA 2867 het 1838 hom 13 4 8 1 TAAG 0 1 120075 CASAVA_Build 6 120685814 1I AAACCACTAA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 7 8 120076 CASAVA_Build 6 120686074 1I ACTTGAAAGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 T 8 9 120077 CASAVA_Build 6 120693912 1I AGTTGACTCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 49 15 22 12 T 8 9 120078 CASAVA_Build 6 120695733 2D AGAAGATAAC AT/-- AGGGAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AT 1 0 120079 CASAVA_Build 6 120699266 1I AACATTCCCC -/A AAATTGGAGA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 3 4 120080 CASAVA_Build 6 120703630 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTACT 3070 het 2471 hom 14 5 9 0 A 0 1 120081 CASAVA_Build 6 120715611 4D AAGAAAGAAA AAAG/---- AAAGAGGAGG 3070 het 3070 ref 28 12 11 7 AAAG 2 1 120082 CASAVA_Build 6 120719968 1D TGCCCACATA G/- TGATTCAATA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 1 0 120083 CASAVA_Build 6 120724162 2D TAGTAGAGAC AG/-- GGGTTCACCA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AG 1 0 120084 CASAVA_Build 6 120727852 2I TGGGAAGAGG --/TA TATTTCACCA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 TA 1 2 120085 CASAVA_Build 6 120734703 2D TCATAGAATC AG/-- AGAGTGGAAT 3070 het 3070 hom 39 12 20 9 AG 3 2 120086 CASAVA_Build 6 120742995 2I TGCTTAAAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 24 7 11 6 AT 7 8 120087 CASAVA_Build 6 120746086 1D ATTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 14 15 25 T 17 16 120088 CASAVA_Build 6 120751381 1I TGATCACCAT -/A ACATTCTCTA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 1 2 120089 CASAVA_Build 6 120751906 1I TATTTTCTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 16 18 2 T 8 9 120090 CASAVA_Build 6 120773558 1D AGTGAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 12 11 120091 CASAVA_Build 6 120774692 1D CTTAAAAAAA T/- ATCTTCTATT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 1 0 120092 CASAVA_Build 6 120777288 1D AGTCTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 8 9 A 12 11 120093 CASAVA_Build 6 120784130 1D CTCCAATATT C/- ACATTTTATT 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 C 1 0 120094 CASAVA_Build 6 120784388 4D AAAAATTGAT ATGA/---- ATAATATTTA 3070 het 3070 hom 33 9 23 3 ATGA 1 0 120095 CASAVA_Build 6 120789189 2I AACCTAAAAC --/TG TGAATATCCT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 TG 1 2 120096 CASAVA_Build 6 120802544 3I ATGCTTGACA ---/GTT GTTAAAGTGA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 GTT 1 2 120097 CASAVA_Build 6 120802801 6D AATTATAAAA TAAAGT/------ TAAAGTCACA 3070 het 3070 ref 50 28 20 5 TAAAGT 2 1 120098 CASAVA_Build 6 120810601 1D CTGAACACTC T/- TGTGTCTAAC 3070 hom 129 het 45 0 41 6 T 2 1 120099 CASAVA_Build 6 120813527 3D TCATAGTGTT ATC/--- ATGAGGCCTA 3070 het 3070 ref 50 32 15 5 ATC 1 0 120100 CASAVA_Build 6 120813648 1I CTACCTTTGA -/T TTTTGAAACG 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 T 4 5 120101 CASAVA_Build 6 120813788 3D TTTTCTTGGC CAT/--- CACTAATTAA 3070 het 3070 hom 46 24 21 3 CAT 1 0 120102 CASAVA_Build 6 120815926 5I ACACCATGTC -----/CTTTG TAGCTCCATG 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 CTTTG 0 1 120103 CASAVA_Build 6 120819122 1D CATTGTAATC T/- TATGGGACCA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 2 1 120104 CASAVA_Build 6 120819828 2D46M2D CTAAACTATA ATATATATATATATATACACACTTATGCACATATATATATACATGTATTA/--ATATATATATATATACACACTTATGCACATATATATATACATGTAT-- TATATATATA 3070 het 443 hom 21 4 11 15 N/A 0 0 120105 CASAVA_Build 6 120820534 4D ATAATATCTA ACAT/---- ACAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 7 ACAT 1 0 120106 CASAVA_Build 6 120821567 1I ACAAATTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 10 120107 CASAVA_Build 6 120824179 1D AGATAGTGAC A/- CATTTACTTT 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 A 1 0 120108 CASAVA_Build 6 120832096 3D TGCTTATACG ATT/--- ATTATTTATG 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 ATT 3 2 120109 CASAVA_Build 6 120834364 2I AACCCCCAAC --/AG TGGCTGTGAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 AG 0 1 120110 CASAVA_Build 6 120839443 1I TCTTGTTTTG -/T TCCGGATCTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 1 2 120111 CASAVA_Build 6 120840452 1D TGTCTCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 11 10 120112 CASAVA_Build 6 120844905 1I TTTCTTTTTA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 6 7 120113 CASAVA_Build 6 120846670 1I AAGTTCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 10 11 120114 CASAVA_Build 6 120854532 1I ATAAAAATTA -/T TTTAAATTAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 3 4 120115 CASAVA_Build 6 120857547 1D CAGCCAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 969 hom 23 5 12 6 A 11 10 120116 CASAVA_Build 6 120877823 2I3M4D ACTGGTTGTG --TGACCTT/TTTGA---- GGTCATCTTT 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 N/A 0 0 120117 CASAVA_Build 6 120893221 5I TAATATCACT -----/TTAAA TTAATGAGAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TTAAA 0 1 120118 CASAVA_Build 6 120907275 1I CAAAGCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 35 0 31 4 T 10 11 120119 CASAVA_Build 6 120908570 1D TTTACATGCA T/- TGAAGATCAG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 1 120120 CASAVA_Build 6 120913725 4D ATATAAAAAC TATT/---- TATTATCTTC 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TATT 2 1 120121 CASAVA_Build 6 120914754 2D GGTGGCAAAA CC/-- CCCCGTCTCT 3070 hom 65 het 23 0 21 2 C 6 4 120122 CASAVA_Build 6 120925716 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 8 9 120123 CASAVA_Build 6 120926642 2D ACAGAATTAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 15 11 10 A 11 9 120124 CASAVA_Build 6 120929134 1D CTTGAGCTTT C/- CCCCCCCATC 3070 het 3070 hom 28 10 13 7 C 8 7 120125 CASAVA_Build 6 120949048 1D ATCATAGAAA T/- GTGGAAACTA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 1 0 120126 CASAVA_Build 6 120951254 19D TCTTCTCTGT TTTGCTGTAAAAAGAGAGC/------------------- TTTCCTGTTT 3070 het 3070 ref 34 24 10 4 TTTGCTGTAAAAAGAGAGC 1 0 120127 CASAVA_Build 6 120962332 1D ACTAGGAAAA T/- TGGAGAAGAA 3070 het 3070 hom 47 21 24 3 T 2 1 120128 CASAVA_Build 6 120969819 1I GATGCCAGGG -/A GGGGCAGGGC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 0 1 120129 CASAVA_Build 6 120972783 3D TCTGAAACAG ATC/--- AACAACAGAG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 ATC 1 0 120130 CASAVA_Build 6 120976181 1D GGCTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2093 het 2093 ref 40 23 6 12 A 14 13 120131 CASAVA_Build 6 120978252 1I TAACATGTCA -/T TCAAAGCTTC 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 1 2 120132 CASAVA_Build 6 120978333 1D TCACTTATCC A/- AATTCTCCAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 2 120133 CASAVA_Build 6 120983721 4I AGAATTACAA ----/AGTT AGTTATTTCA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 AGTT 1 2 120134 CASAVA_Build 6 120990830 1I TCAGCAGTAG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 7 8 120135 CASAVA_Build 6 120996238 1D AAGTAAACGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 27 1 23 3 T 11 10 120136 CASAVA_Build 6 120999081 5I CTCATTTACA -----/TATTT TATTTATATT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TATTT 1 2 120137 CASAVA_Build 6 120999523 1I ATCTCAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 11 12 120138 CASAVA_Build 6 121007305 1I CTCTGCATCA -/C TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 C 0 1 120139 CASAVA_Build 6 121007627 6I TCTCTCACAC ------/ACACAT ACACACACAT 3070 hom 123 het 52 0 42 10 ACACAT 0 1 120140 CASAVA_Build 6 121010834 2D CAAATGTGGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 81 het 39 0 27 15 AT 7 6 120141 CASAVA_Build 6 121012329 10D ATGAAATACC TAGGAATACA/---------- GCCAACCAAG 3070 hom 102 het 34 0 35 3 TAGGAATACA 1 0 120142 CASAVA_Build 6 121012679 4I ACTGGTACGA ----/AAAC AAACAAACAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AAAC 2 3 120143 CASAVA_Build 6 121013389 2I CTAAAAAGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 27 0 21 6 A 13 15 120144 CASAVA_Build 6 121015301 1I AATTCAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 666 hom 35 4 30 1 A 10 11 120145 CASAVA_Build 6 121019128 4I AAATTAAAAC ----/ACAA ACAATTCATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ACAA 1 2 120146 CASAVA_Build 6 121020514 1D CACATCTCTC T/- TGTTTTTACT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 2 1 120147 CASAVA_Build 6 121024000 4D CAGTTGTCTA TTTC/---- TTTCTCCCCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTTC 2 1 120148 CASAVA_Build 6 121024458 1D ATATCAGTTG C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 9 8 120149 CASAVA_Build 6 121028466 1D CTTTGCCTAC T/- TTTTTTATAA 1484 het 1484 ref 21 13 4 4 T 7 6 120150 CASAVA_Build 6 121028960 2D ATTACTTGTG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 10 8 120151 CASAVA_Build 6 121033507 3D TCTTTTAAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 1236 het 221 hom 33 4 4 25 T 13 10 120152 CASAVA_Build 6 121033682 2D TTAAATAAAG AT/-- ATAGTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 15 15 12 AT 2 1 120153 CASAVA_Build 6 121034099 4I AGTTGATTTA ----/TAAG TAAGTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 TAAG 1 2 120154 CASAVA_Build 6 121038348 1I ATGTTACAAT -/A AATAAGTCAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 3 120155 CASAVA_Build 6 121041065 15D TTATAAAATG TTTCCTTTCCTTTCC/--------------- TTTCCTTTCC 3070 het 3070 hom 43 18 22 6 TTTCC 5 2 120156 CASAVA_Build 6 121041182 4D AATCTTGCTT TTTC/---- TTTCTTTTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTTC 2 1 120157 CASAVA_Build 6 121043213 4I AGAAATGACA ----/TGTT TGTTAGTTGA 3070 het 3070 ref 51 21 24 6 TGTT 1 2 120158 CASAVA_Build 6 121046969 2D GATCATTTTT TA/-- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 TA 1 0 120159 CASAVA_Build 6 121063896 4I ACAATAAAGG ----/CATC CTTCTATATA 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 CATC 0 1 120160 CASAVA_Build 6 121065341 1D TCTCTCCAAA G/- AAGATGTTCT 2950 het 2950 ref 29 18 7 4 G 1 0 120161 CASAVA_Build 6 121070617 2D GATATAAGAC TA/-- TGTTTTATGT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 TA 1 0 120162 CASAVA_Build 6 121074580 2D CAGAATCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 18 0 11 7 A 15 13 120163 CASAVA_Build 6 121078201 2D CAACCTGGCC AA/-- CATGGTGAAA 3070 het 2118 hom 13 5 8 0 A 2 0 120164 CASAVA_Build 6 121080532 1D AATCAACATA C/- AAAAATCAGT 2579 het 2579 ref 29 19 7 3 C 1 0 120165 CASAVA_Build 6 121082129 1I TTTCCTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3025 het 3025 ref 33 15 10 8 T 10 11 120166 CASAVA_Build 6 121082480 4D ATTCTTAATG TTGT/---- TTATTTATAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 TTGT 1 0 120167 CASAVA_Build 6 121083188 1D GAAAAAAAAA C/- CCCTTCCTGA 1021 het 1021 ref 25 15 3 7 C 4 3 120168 CASAVA_Build 6 121083236 5I AGCATACAAG -----/AAAAT AAAATGACTA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 AAAAT 1 2 120169 CASAVA_Build 6 121092310 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2403 hom 21 8 11 3 A 9 8 120170 CASAVA_Build 6 121100609 1D CCACTGATTT A/- AAGGTTTGCT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 3 2 120171 CASAVA_Build 6 121107783 5D TTTGTTTATG TTTTA/----- TTTTATTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 13 7 TTTTA 2 1 120172 CASAVA_Build 6 121110420 1I ATTTTTAATT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 7 8 120173 CASAVA_Build 6 121111193 1D CTAAAAACTT G/- GGGGGGGAGG 2225 het 2225 ref 19 8 7 4 G 8 7 120174 CASAVA_Build 6 121120521 2I ACAACTTGTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 29 0 13 16 T 9 11 120175 CASAVA_Build 6 121121326 1I TGTGCACAGG -/A AAAAATGTGG 3070 het 3070 hom 44 23 20 1 A 5 6 120176 CASAVA_Build 6 121123474 4D GTTTAAATTG ATTT/---- ATTTAATACA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 ATTT 2 1 120177 CASAVA_Build 6 121130666 1D TTATTTCTAA T/- TTTTTTACTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 T 7 6 120178 CASAVA_Build 6 121131674 5D CAAATGCATC CCTCA/----- CCACACCATT 3070 het 3070 ref 25 13 8 6 CCTCA 1 0 120179 CASAVA_Build 6 121133703 1D TTCTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 10 10 T 12 11 120180 CASAVA_Build 6 121135271 1D TTGAAATGGC T/- TTTTTTTATT 3070 het 1685 hom 16 5 10 1 T 8 7 120181 CASAVA_Build 6 121138019 1I ATATCTGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 10 11 120182 CASAVA_Build 6 121140079 1I CCAACATCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 8 9 120183 CASAVA_Build 6 121142355 1D CCCAAGGGAT A/- GGGGGTTGGG 3070 hom 87 het 37 0 26 11 A 1 0 120184 CASAVA_Build 6 121142920 2I TCTGTGTTGC --/CT CTCTGTCAAT 3070 hom 147 het 52 0 49 3 CT 2 3 120185 CASAVA_Build 6 121145053 1I ACTGTTACTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 8 9 120186 CASAVA_Build 6 121150571 1D GATACTCTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 10 9 120187 CASAVA_Build 6 121161162 1D GTCCTGGGCC T/- TTTTTTTTTT 2429 hom 27 het 15 0 9 6 T 11 10 120188 CASAVA_Build 6 121187016 1I TAATGAGATA -/C CATCTCACAC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 1 2 120189 CASAVA_Build 6 121193064 1I CAGTAATCTC -/T TATTAGGGGA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 1 2 120190 CASAVA_Build 6 121195059 1I TTGTCTCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 868 hom 26 2 17 7 A 15 16 120191 CASAVA_Build 6 121199542 1D ACAGATGGTG T/- TTTTTTTAGG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 8 7 120192 CASAVA_Build 6 121200946 1I TATATTCCTC -/A AAGGAAGCAC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 2 3 120193 CASAVA_Build 6 121202694 1I AAAAACATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 368 hom 35 1 31 3 A 9 10 120194 CASAVA_Build 6 121203319 1I CGTGTTCAAG -/C CATTCTCCTG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 1 2 120195 CASAVA_Build 6 121205329 1D ATTCTGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 15 14 120196 CASAVA_Build 6 121205493 7D CACCCCGCTA ATTTTGT/------- ATTTTTAGTA 3070 hom 46 het 21 0 16 7 ATTTTGT 1 0 120197 CASAVA_Build 6 121206065 2D CAGAAACTTT GG/-- GGGTGGAACT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 5 3 120198 CASAVA_Build 6 121208608 4D CCAAAACATT TTTC/---- TTTTTCTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 4 TTTC 1 0 120199 CASAVA_Build 6 121222589 1D CTGAATAGTA T/- TTTTTGTGTA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 6 5 120200 CASAVA_Build 6 121229139 1I GTGGATTAGA -/C AGGCTATTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 0 1 120201 CASAVA_Build 6 121230442 1D CTAAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 11 10 120202 CASAVA_Build 6 121239259 1D AACTATTCAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 8 120203 CASAVA_Build 6 121240750 1D AAAAAAAAAA C/- AAACAAACAA 3070 het 162 hom 32 1 27 5 C 1 0 120204 CASAVA_Build 6 121252178 1D CCACGTACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 39 0 28 11 A 13 12 120205 CASAVA_Build 6 121267092 1D TGCTTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 1309 het 1309 ref 27 20 4 3 A 11 10 120206 CASAVA_Build 6 121271784 8D ACACACACAC AGAGAGAG/-------- AGAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 33 20 15 4 AG 7 3 120207 CASAVA_Build 6 121311237 2D18M4I CCATCTTAAA ACACACACACACACAAACAC----/--ACACACACACACAAACACAAAT AAATACTTAT 3070 het 3070 ref 34 17 19 5 N/A 0 0 120208 CASAVA_Build 6 121311872 3I CCAAAATCTA ---/CTT CTCCTAACAG 3070 het 3070 hom 55 23 27 5 CTT 0 1 120209 CASAVA_Build 6 121315520 1D CAGTGGACAA T/- AATTAGGAAA 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 T 1 0 120210 CASAVA_Build 6 121316620 1I TCAATTTTAC -/A AAAAACGATA 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 A 5 6 120211 CASAVA_Build 6 121316949 1D TTTTCATAGG A/- AAAAACCCTA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 6 5 120212 CASAVA_Build 6 121325012 1I TTTTTTTTTT -/C AATAGTGCCC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 C 0 1 120213 CASAVA_Build 6 121325456 1I TGCACAAATC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 28 12 7 9 A 7 8 120214 CASAVA_Build 6 121326337 2D ACATTAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 13 11 120215 CASAVA_Build 6 121331052 1D AGGCAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 2724 het 2724 ref 32 20 8 5 T 11 10 120216 CASAVA_Build 6 121331460 1I AAAAACTCTC -/A ATGGATTAGC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 1 2 120217 CASAVA_Build 6 121333944 2D4M3I ACTATGACTT GGGCCT---/--GACTATG ACTAAATTCC 3070 het 3070 hom 25 12 12 4 N/A 0 0 120218 CASAVA_Build 6 121343357 1D TTTGATCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 39 1 30 9 T 12 11 120219 CASAVA_Build 6 121344319 1I GGGTGACAGC -/T ATGTGCACAT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 T 0 1 120220 CASAVA_Build 6 121345354 3D AAAAAAAAAA GAG/--- AGAGAGAAAA 575 het 575 ref 42 29 6 9 GAG 1 0 120221 CASAVA_Build 6 121354682 1I TTGGGACTAT -/G TAAATACATG 3070 hom 87 het 38 0 30 8 G 0 1 120222 CASAVA_Build 6 121354845 1I TTCTCAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 987 hom 37 3 29 5 A 11 12 120223 CASAVA_Build 6 121358310 1D CACCTGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 711 hom 38 2 24 12 T 13 12 120224 CASAVA_Build 6 121361731 3I GTTTCTCTCT ---/AAG AAGACTATTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AAG 1 2 120225 CASAVA_Build 6 121365372 1D ACTCAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 27 2 11 14 A 11 10 120226 CASAVA_Build 6 121365544 1I CAGTGAAAAT -/G ACTTTTATCA 3070 het 3070 hom 50 17 28 5 G 0 1 120227 CASAVA_Build 6 121369133 1I GTTAAACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 32 1 20 11 T 14 15 120228 CASAVA_Build 6 121371985 2D AAAATAAGAC AT/-- GTGAGGATTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AT 1 0 120229 CASAVA_Build 6 121372254 4D CTTTTATCTT AATA/---- AATAGAGTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 AATA 2 1 120230 CASAVA_Build 6 121376589 2D CCATATCTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 21 4 A 13 11 120231 CASAVA_Build 6 121377785 1D TTTAATTTTT A/- TTTTTTTATT 1696 het 1696 ref 21 11 7 4 A 1 0 120232 CASAVA_Build 6 121380733 2D TGAAAAAAAA AC/-- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 45 22 17 8 AC 1 0 120233 CASAVA_Build 6 121382214 1I TAATGCGCTC -/A AAGCTGTTCT 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 A 2 3 120234 CASAVA_Build 6 121399060 1I GAGACTGCGA -/T TTTTTTTTTT 3017 het 3017 ref 38 14 10 14 T 14 15 120235 CASAVA_Build 6 121400901 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 20 4 13 3 A 12 11 120236 CASAVA_Build 6 121401728 3I GTCCATCAAT ---/AGG AGAATGGATA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 AGG 0 1 120237 CASAVA_Build 6 121409750 9I TAAGCCTTTA ---------/GGACCTGCG TGTTGGCTCA 3070 het 3070 ref 30 19 8 4 GGACCTGCG 0 1 120238 CASAVA_Build 6 121415496 8D TTGTTGTTTG TTGTTTGT/-------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 19 20 5 TTGT 2 0 120239 CASAVA_Build 6 121422548 3D TCAATATATT AGA/--- AGGATTATTA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 AGA 1 0 120240 CASAVA_Build 6 121424988 1I26M1I TCCCCAAACT -AAATATTTTCTTGAAATTAAAAAAAG-/AAAATATTTTCTTGAAATTAAAAAAAGA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 21 8 6 N/A 0 0 120241 CASAVA_Build 6 121428941 2I TGTCAAAATG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 A 9 11 120242 CASAVA_Build 6 121433349 14I TAAAGTTGCA --------------/GCATACAAAAATCT GCATACAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 15 7 GCATACAAAAATCT 0 1 120243 CASAVA_Build 6 121434035 1I AAACCAAGTC -/A AAATAGATTA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 3 4 120244 CASAVA_Build 6 121439690 1D ACAATTTTTC T/- TTTGTGGCTT 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 T 4 3 120245 CASAVA_Build 6 121446096 3I ATAAGGTAAT ---/AAC AACACTATTC 3070 het 1727 hom 30 4 19 7 AAC 1 2 120246 CASAVA_Build 6 121453891 1I GCAAATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 26 10 5 A 11 12 120247 CASAVA_Build 6 121485402 1I GAAGTGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 A 10 11 120248 CASAVA_Build 6 121487617 1D AGCTCACTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 9 8 120249 CASAVA_Build 6 121497806 1I GAGACAAAGG -/C CCCCCCTGAC 3070 het 3070 ref 43 22 11 10 C 6 7 120250 CASAVA_Build 6 121503152 1I AATTTGTAGT -/A AAAAAAAATT 2914 het 2914 ref 25 8 8 9 A 8 9 120251 CASAVA_Build 6 121503981 4D CTATACATAA ATAC/---- ATAAACTCAC 3070 het 3070 ref 38 14 17 9 ATAC 1 0 120252 CASAVA_Build 6 121519583 4D GTTTCAAAGA AAGT/---- TTTTATTTCT 3070 het 3070 ref 34 18 15 3 AAGT 1 0 120253 CASAVA_Build 6 121521008 1D TTTACATAAT C/- TCATATTTCT 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 C 1 0 120254 CASAVA_Build 6 121523224 1D ATTTACTGTG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 247 hom 38 3 19 16 T 8 7 120255 CASAVA_Build 6 121531911 1D AGAAAAAAAA T/- ATTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 1 0 120256 CASAVA_Build 6 121536998 2D TAAAACTGTC AT/-- AGAAATGAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 AT 1 0 120257 CASAVA_Build 6 121545882 2I AGAGACAGAC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 58 het 25 0 20 5 TG 7 8 120258 CASAVA_Build 6 121549772 2D CAAAATATTC AA/-- AGAGCTTAGA 3070 het 3070 ref 45 27 13 6 A 3 1 120259 CASAVA_Build 6 121564093 1I AATTGTAAAT -/C TTACTGTGTA 3070 het 3070 hom 56 25 27 4 C 0 1 120260 CASAVA_Build 6 121566947 4I GAAATTCTAC ----/TGAA TGTAGTTTTT 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 TGAA 0 1 120261 CASAVA_Build 6 121571986 2D AGCTCTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 31 1 15 15 A 14 12 120262 CASAVA_Build 6 121573841 1D ATAAAAAAAA T/- ATAGACACAC 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 1 0 120263 CASAVA_Build 6 121575296 11D TCAATATCTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 1405 hom 27 7 10 10 T 21 10 120264 CASAVA_Build 6 121578504 1I AGAAATTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 24 1 18 5 A 10 11 120265 CASAVA_Build 6 121583849 4D AGGATTTTCA TAGC/---- TAGAAAGGAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 TAGC 1 0 120266 CASAVA_Build 6 121585037 1I AGCAATAAAC -/T TTTTTTAGAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 7 120267 CASAVA_Build 6 121585434 1D GAAAAAAAAA T/- ATCACATAGG 3070 het 3070 ref 33 14 16 3 T 1 0 120268 CASAVA_Build 6 121585529 4I GCATATACAC ----/ATAT GTTTCTATGT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AT 0 2 120269 CASAVA_Build 6 121586684 6D AAAAGCCATG CCTTTT/------ CCTATCAAAG 3070 het 3070 ref 39 22 16 3 CCTTTT 1 0 120270 CASAVA_Build 6 121590447 1D TTTAATATGG T/- TAAGTCGTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 1 120271 CASAVA_Build 6 121598976 1D TTTATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 12 11 120272 CASAVA_Build 6 121606341 1I GGCATCATGA -/C CTTTGGATCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 2 120273 CASAVA_Build 6 121617463 4I CAGAAGGCTT ----/TTTG TTTGATTGTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TTTG 1 2 120274 CASAVA_Build 6 121618347 19D TATTTTATAA TTATATTTATAATTATATT/------------------- TTATATTTCT 1017 hom 7 het 8 0 3 6 TTATATTTATAATTATATT 1 0 120275 CASAVA_Build 6 121620916 5I ATTTCTATTA -----/TGAAT TGAAGATTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TGAAT 0 1 120276 CASAVA_Build 6 121624780 3D GAGAGGAACA TTT/--- TAAATGACCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 4 1 120277 CASAVA_Build 6 121626069 1I AAAAAACAAA -/C ACAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 C 0 1 120278 CASAVA_Build 6 121628438 1D ACCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1630 hom 19 4 12 3 A 10 9 120279 CASAVA_Build 6 121629924 1D AAGTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1271 hom 24 6 9 10 A 16 15 120280 CASAVA_Build 6 121643047 2I CTTCTTTCAC --/AT GAGACTATAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AT 0 1 120281 CASAVA_Build 6 121653827 2I AGGGGAGCAT --/CA CACACTGGGG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 CA 2 3 120282 CASAVA_Build 6 121686160 5D CCCTCTCTCC TCTCA/----- TATTTTCTTC 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 TCTCA 1 0 120283 CASAVA_Build 6 121688224 2D TCAAACTATA AG/-- ATACAAGGCT 1730 het 1730 ref 20 13 5 2 AG 1 0 120284 CASAVA_Build 6 121689996 1D AGCAAGAGTT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 8 7 120285 CASAVA_Build 6 121699874 1D ATACTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2563 hom 24 6 14 4 A 10 9 120286 CASAVA_Build 6 121708508 1I ACTACAGGCG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2933 hom 34 9 12 13 T 9 10 120287 CASAVA_Build 6 121715856 3I53M2D TGAGTTACTT ---CTGCATGCCACATCAAAAACCAATAATGTCTTCAGAAACAGTGCCAAATAAACAG/CTCCTGCATGCCACATCAAAAACCAATAATGTCTTCAGAAACAGTGCCAAATAAAC-- AGTTAAGATT 3070 het 3070 hom 35 18 26 4 N/A 0 0 120288 CASAVA_Build 6 121721875 1I CTCATGAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 10 11 120289 CASAVA_Build 6 121722295 1I CTCATTTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 9 10 120290 CASAVA_Build 6 121723763 9I CTTTCTGAAT ---------/TTTTAGGCA TGTTATGTTT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 TTTTAGGCA 0 1 120291 CASAVA_Build 6 121729961 1I TCTCTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2661 het 2661 ref 27 10 9 8 A 13 14 120292 CASAVA_Build 6 121733398 1D AATGGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 12 11 120293 CASAVA_Build 6 121742035 1I ATACTGAGCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 11 25 4 T 8 9 120294 CASAVA_Build 6 121747052 1I TAGTCATGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 9 10 120295 CASAVA_Build 6 121758365 2D TACTTGAACG TA/-- TATATATATA 1243 het 1243 ref 20 13 3 8 TA 9 8 120296 CASAVA_Build 6 121784448 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 18 0 14 4 A 14 15 120297 CASAVA_Build 6 121808428 1I TATAACAATG -/A AAAGATGAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 3 4 120298 CASAVA_Build 6 121809141 1I ACACCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 31 0 25 6 A 10 11 120299 CASAVA_Build 6 121811605 1I TCACTTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 10 11 120300 CASAVA_Build 6 121811854 4D TAAAGCACAC TTTT/---- TTTTTCTCCT 3070 het 3070 ref 30 21 8 1 T 9 5 120301 CASAVA_Build 6 121814565 2D TGTACATCTC AT/-- ATATATATCT 3070 het 2785 hom 29 8 15 7 AT 5 4 120302 CASAVA_Build 6 121815152 5I TCCTTTTTTC -----/ATCTT ATCTTAATTG 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 ATCTT 1 2 120303 CASAVA_Build 6 121827919 8D TTATTTCACA TTTGACTT/-------- TTTGTTACCT 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 TTTGACTT 1 0 120304 CASAVA_Build 6 121830998 1I TATTTTTTAA -/T TTTTTTAAAA 1953 het 1614 hom 9 4 4 1 T 6 7 120305 CASAVA_Build 6 121831891 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2824 het 1904 hom 24 6 8 10 T 13 14 120306 CASAVA_Build 6 121843843 4D ATCTACTTAA TGAG/---- TGAGTACAAT 3070 het 3070 hom 46 17 23 8 TGAG 2 1 120307 CASAVA_Build 6 121843943 1I TGGAGTAGAA -/T GTAAAAAATA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 0 1 120308 CASAVA_Build 6 121845701 1I TTTTCCTAAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 8 9 120309 CASAVA_Build 6 121848075 3I AGGGAAAAGC ---/GGT GGTGGTGGGG 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 GGT 2 3 120310 CASAVA_Build 6 121856522 1I TAAGCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 10 11 120311 CASAVA_Build 6 121857035 1I TGTCAGCCAG -/A AAAATCAGAA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 4 5 120312 CASAVA_Build 6 121864534 1I ACAGATATAC -/T TTGGACATTT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 2 3 120313 CASAVA_Build 6 121865748 1D ATAAGAACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 A 10 9 120314 CASAVA_Build 6 121870360 1D ATCTATTACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 T 10 9 120315 CASAVA_Build 6 121870532 2I AAATTTTGTG --/TA TATATATATA 1974 het 1938 hom 18 9 5 4 TA 7 8 120316 CASAVA_Build 6 121879472 8D CTTTAGGTAA GGAGACTT/-------- TAGAAGTCAA 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 GGAGACTT 1 0 120317 CASAVA_Build 6 121881323 1D GTGACAGAGG A/- AAAAAAAAAG 999 het 999 ref 41 33 3 5 A 10 9 120318 CASAVA_Build 6 121883895 2D TCCTCAACTC TT/-- TGTTTTGCTA 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 T 3 1 120319 CASAVA_Build 6 121900895 1D GAAAATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 49 0 31 18 T 15 14 120320 CASAVA_Build 6 121942630 2I42M1I CCAGGTAATC --TTTTTTTTTTTCACACTAATTGTGTAATTTTCTAAGGCGATC-/TTTTTTTTTTTTTCACACTAATTGTGTAATTTTCTAAGGCGATCT ATTAGTTTTA 3070 het 22 hom 33 1 24 18 N/A 0 0 120321 CASAVA_Build 6 121943023 1I CCCTATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 10 11 120322 CASAVA_Build 6 121948111 1D GATAAGGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 39 0 28 12 T 11 10 120323 CASAVA_Build 6 121959672 1I TCCACCCAAG -/T TATTTTAATG 3070 hom 34 het 18 0 12 6 T 1 2 120324 CASAVA_Build 6 121977650 2I GTGTGCAGAC --/AA TGCACCTGTA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 A 0 2 120325 CASAVA_Build 6 121991489 1D TGCTAGCAGA T/- TTCTTAAGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 2 120326 CASAVA_Build 6 121993669 1D TATTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 31 1 18 12 T 15 14 120327 CASAVA_Build 6 122002707 1I CTCATGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 26 1 21 4 T 13 14 120328 CASAVA_Build 6 122017393 14D CATGCTTGAC TACTGATGGAAGAG/-------------- TGCTAGAGAA 1725 het 1725 ref 68 65 4 12 TACTGATGGAAGAG 1 0 120329 CASAVA_Build 6 122018769 1D CACATCTACC A/- AAACTTCTTC 3070 hom 61 het 25 0 21 4 A 4 3 120330 CASAVA_Build 6 122021212 1D ATGGACAAAA G/- ATGGCAACAT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 G 1 0 120331 CASAVA_Build 6 122024937 1I ATATGTGTGC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 7 8 120332 CASAVA_Build 6 122026814 1D CTATATACAT A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 1 0 120333 CASAVA_Build 6 122028723 1D CCTCTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 29 4 15 10 A 15 14 120334 CASAVA_Build 6 122039197 1D TAGAGAGGAT A/- AAAAAATTAT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 A 7 6 120335 CASAVA_Build 6 122039968 2I CCTCTCACAA --/AT CACTGTGAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AT 0 1 120336 CASAVA_Build 6 122041995 1D CTCTGTCCGC A/- AAAAAAAAAA 2450 hom 18 het 12 0 7 5 A 17 16 120337 CASAVA_Build 6 122044034 6I TTTTATCAAT ------/AAGCAG AAGCTTTCTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAGCAG 0 1 120338 CASAVA_Build 6 122048354 1I TCTTTTTTTT -/A TTTTTTTTTG 1766 hom 12 het 9 0 5 4 A 0 1 120339 CASAVA_Build 6 122056007 1D TTGCATTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 26 5 A 11 10 120340 CASAVA_Build 6 122065178 1I AGAGCCCCCC -/A AAATGCATGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 3 4 120341 CASAVA_Build 6 122073317 1I GAAAACAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 9 120342 CASAVA_Build 6 122074675 1I CACAGGAAAC -/T TTTTTTACCC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 6 7 120343 CASAVA_Build 6 122076675 1D GTTATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 A 10 9 120344 CASAVA_Build 6 122077688 2I52M12D TATGGACATC --ATATATATATATATATGATATATATACACACACATATACACATATATATGTGTATATATACACA/ATATATATATATATATATGATATATATACACACACATATACACATATATATGTG------------ TATATATATA 3070 het 22 hom 23 2 31 6 N/A 0 0 120345 CASAVA_Build 6 122085646 1D TGCAAAAAAA G/- AAAACAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 0 120346 CASAVA_Build 6 122088962 4I GCACTATTTC ----/TTTT TTTAAGTCGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 3 7 120347 CASAVA_Build 6 122103540 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2673 het 246 hom 25 1 8 16 A 19 18 120348 CASAVA_Build 6 122105723 4I TTTTTCTTTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 hom 36 het 18 0 13 5 TCTT 3 4 120349 CASAVA_Build 6 122108658 1D GTAATCAGCA T/- TTAAGTAGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 3 2 120350 CASAVA_Build 6 122111486 1I GCAAATGTTT -/A AAAGCTGACT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 A 3 4 120351 CASAVA_Build 6 122113474 1D AAGTGTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 26 1 17 9 T 12 11 120352 CASAVA_Build 6 122123871 1D CATCCCCCCC T/- GGGACAGAGC 2746 het 2746 ref 21 12 7 2 T 1 0 120353 CASAVA_Build 6 122147402 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1066 het 1066 ref 27 20 3 4 A 12 11 120354 CASAVA_Build 6 122238093 1I GTATATATAT -/A TTTTTTACTT 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 A 0 1 120355 CASAVA_Build 6 122243903 1I TGTTGGTGGA -/G GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 G 6 7 120356 CASAVA_Build 6 122259092 1D AGTTGATGGA T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 23 9 13 3 T 7 6 120357 CASAVA_Build 6 122265523 3I AAACAACGAC ---/ATT ATTATCCCTC 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 ATT 1 2 120358 CASAVA_Build 6 122269018 1I CTTTCTTTAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 T 7 8 120359 CASAVA_Build 6 122270897 5I TTATCTCCTG -----/GTTAA GTTTATTCCT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 GTTAA 0 1 120360 CASAVA_Build 6 122274726 2D TGTTAGCTTC CT/-- CTCTGTGAAG 3070 het 3070 hom 50 22 24 5 CT 3 2 120361 CASAVA_Build 6 122284020 2D AAGTCTTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 13 11 120362 CASAVA_Build 6 122292941 1D TTCCTAGAAC T/- TTTTTTTTTT 968 het 968 ref 39 29 3 7 T 15 14 120363 CASAVA_Build 6 122300430 1I7M30D TGATTGTGGC -GGATAAGCTTTTTGATGTCCTGCTGGATTCAGTTTGC/TGGATAAG------------------------------ CAGTATTTTA 704 het 704 ref 30 27 3 10 N/A 0 0 120364 CASAVA_Build 6 122301229 1I TTTGCTCATT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 7 8 120365 CASAVA_Build 6 122303376 4I TATTTTCATT ----/TTTC TTTGTCTGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTTC 0 1 120366 CASAVA_Build 6 122303763 3I AATCTTCTGA ---/TAT TATTGCGTCA 3070 het 3070 ref 53 29 21 3 TAT 1 2 120367 CASAVA_Build 6 122304936 4D TTGTCTTCTC TCTT/---- ATAATTTTTT 3070 het 3070 hom 45 11 27 7 TCTT 1 0 120368 CASAVA_Build 6 122304990 1I GTTTCATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2380 hom 32 7 10 15 T 13 14 120369 CASAVA_Build 6 122305559 1D GGCTGGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 T 12 11 120370 CASAVA_Build 6 122320976 1D TTATCTGCAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 9 8 120371 CASAVA_Build 6 122323867 1I TTCTAATTGG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 7 8 120372 CASAVA_Build 6 122326419 1I ACTCGTTCAT -/A ACTTTAAGGC 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 1 2 120373 CASAVA_Build 6 122330067 1D TTATTTTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 9 8 120374 CASAVA_Build 6 122332587 4I TTTTCAGTCT ----/TTTC TTTCTAAGTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 TTTC 1 2 120375 CASAVA_Build 6 122332945 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 11 10 120376 CASAVA_Build 6 122334274 1I CATTTGGCCT -/A CTTGTTTTAC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 0 1 120377 CASAVA_Build 6 122334367 1D AAAAACACTT A/- ACCTCCTGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 2 1 120378 CASAVA_Build 6 122341755 2D TTTAGTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 45 0 33 12 T 13 11 120379 CASAVA_Build 6 122344189 1I TGCCCATTTA -/G TATGATATTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 120380 CASAVA_Build 6 122348873 1D ATGTATAGAT A/- AAAAAATTAA 2958 het 2958 ref 16 8 7 2 A 7 6 120381 CASAVA_Build 6 122350795 2I AATTTTAATG --/AA GTCTAAATTA 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 A 0 2 120382 CASAVA_Build 6 122352188 1D TGATGATTTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 7 6 120383 CASAVA_Build 6 122353605 2I TGCCTACTTT --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 8 10 120384 CASAVA_Build 6 122353902 1D AATATTAATT A/- AAATATATTT 3070 het 3070 ref 36 18 10 9 A 4 3 120385 CASAVA_Build 6 122361264 1I TAAAATTCTC -/T TTTTTTTGTT 3004 het 353 hom 10 1 7 2 T 7 8 120386 CASAVA_Build 6 122361575 3D AGCACAAGGC TTT/--- TTTTATTCTT 3070 hom 102 het 36 0 34 3 T 7 4 120387 CASAVA_Build 6 122372909 1I CAAGTGACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 27 11 8 T 11 12 120388 CASAVA_Build 6 122373303 1D AGCATGGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 25 20 9 A 10 9 120389 CASAVA_Build 6 122385594 1D CCTTAGAGGG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 8 7 120390 CASAVA_Build 6 122411437 1D CAAACAATTA T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 114 het 44 0 39 7 T 7 6 120391 CASAVA_Build 6 122422373 2D GCAACCTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1390 hom 28 8 16 5 T 18 16 120392 CASAVA_Build 6 122429666 1I AGGTTTTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 18 9 8 1 A 9 10 120393 CASAVA_Build 6 122433001 2I CCCTCACATA --/AC ACATTGCTGT 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 AC 1 2 120394 CASAVA_Build 6 122439474 1I TTCAGGCTCT -/A AAAGTTAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 3 4 120395 CASAVA_Build 6 122445657 1I AGGAGTGCAT -/G TCCTCGCTTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 0 1 120396 CASAVA_Build 6 122449885 3I AACTCTTTCT ---/ATG ATATCAGCCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATG 0 1 120397 CASAVA_Build 6 122453421 2D CTCTGTCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 19 0 15 5 A 14 12 120398 CASAVA_Build 6 122459553 2D TTATTTGGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 13 11 120399 CASAVA_Build 6 122464508 9D GTAGGTGGAT CACTTGAAC/--------- CACTTGAACC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 CACTTGAAC 2 1 120400 CASAVA_Build 6 122464598 3D GTGAGACTCT AAA/--- AAAAAAAAAA 1334 het 58 hom 7 1 5 1 A 17 14 120401 CASAVA_Build 6 122464745 1D AAGAGGAAAA G/- TATATCAATT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 1 0 120402 CASAVA_Build 6 122465758 1D TATGTTCATA T/- CAAAATATCA 3070 het 3070 hom 38 12 22 5 T 1 0 120403 CASAVA_Build 6 122473993 2D TTTCCAACAC AT/-- AGTTACATTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 AT 1 0 120404 CASAVA_Build 6 122484729 1D AGATCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1003 hom 26 4 15 7 T 15 14 120405 CASAVA_Build 6 122488841 2D AAATATTTAC AA/-- AGTTTGTTTT 2658 het 2658 ref 21 14 6 2 A 3 1 120406 CASAVA_Build 6 122498592 4D ATCCATTTAT TCAA/---- TCATTCAAGT 3070 het 3070 ref 39 16 17 7 TCAA 1 0 120407 CASAVA_Build 6 122528906 1D ATACTACACC A/- AAAAAAAAAA 2077 het 1292 hom 34 6 10 18 A 15 14 120408 CASAVA_Build 6 122532737 1I CCCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1194 het 1194 ref 47 36 3 8 T 10 11 120409 CASAVA_Build 6 122547881 2I CACCAACAAA --/AT ATGTTTTTTG 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 AT 1 2 120410 CASAVA_Build 6 122559052 1I TCCAAATGGG -/T TTTTTTAAGC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 6 7 120411 CASAVA_Build 6 122562158 1I GATGAGATTC -/A CGTTATAGCT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 0 1 120412 CASAVA_Build 6 122599008 1I GAAAGCTTCT -/A AAAATAGTAA 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 4 5 120413 CASAVA_Build 6 122626022 1D TGGGCATAGA T/- TTTTTTTTAA 644 het 644 ref 36 26 2 8 T 9 8 120414 CASAVA_Build 6 122626252 1D TAAATAGATA T/- TTTTCAAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 5 4 120415 CASAVA_Build 6 122644528 1D TTTATGAGCT G/- TAACACTCAC 2982 het 2982 ref 19 8 8 3 G 1 0 120416 CASAVA_Build 6 122644972 2I TATTTATACC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 18 0 10 9 T 9 11 120417 CASAVA_Build 6 122646519 1D CTGCTATTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 A 10 9 120418 CASAVA_Build 6 122656955 3D GGACTGTAAG ATA/--- ATAAGTGTGT 3070 het 3070 hom 47 19 21 10 ATA 2 1 120419 CASAVA_Build 6 122663866 1I GTTTTCTCTT -/G AAGGGAGATC 3070 hom 123 het 44 0 39 5 G 0 1 120420 CASAVA_Build 6 122700613 3D CACTCACATG AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 16 13 7 A 12 9 120421 CASAVA_Build 6 122701366 2I CATACACAAG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 CA 5 6 120422 CASAVA_Build 6 122715010 3D TGAGTTAATG AGA/--- AGAAGATATT 3070 het 3070 hom 38 16 19 6 AGA 3 2 120423 CASAVA_Build 6 122722195 3D GTTTTTTAAA AAG/--- AAGATTAATA 3070 het 3070 ref 30 15 13 6 AAG 2 1 120424 CASAVA_Build 6 122737981 2D23M12D GTGCTCACAC AAAAGTGGGACAGAAAGGAAGAAGAAAGGAAGGAAAG/--ATGTGGGACAGAAAGGAAGAAGA------------ AAGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 39 24 18 10 N/A 0 0 120425 CASAVA_Build 6 122738084 2D CTGTATAAAA CT/-- CTGAATATAC 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 CT 2 1 120426 CASAVA_Build 6 122738337 1I CAACATGGAT -/G GAGAAAAGCC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 G 1 2 120427 CASAVA_Build 6 122739886 1D TAAAGAATAT C/- AAAAATTGAT 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 C 1 0 120428 CASAVA_Build 6 122749143 2I TTTAGCATTC --/AG AGTTATTCAA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 AG 1 2 120429 CASAVA_Build 6 122749331 1D AATCCCAGTG C/- TTTGGGAGGT 3070 het 3070 ref 44 20 19 6 C 1 0 120430 CASAVA_Build 6 122749532 1I GTATGATCAT -/G TCACTGCACT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 G 0 1 120431 CASAVA_Build 6 122756027 1D AAGTAGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 15 14 120432 CASAVA_Build 6 122767443 2I AGTGCCAAAA --/GG TTAATTTGGA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 G 0 2 120433 CASAVA_Build 6 122769620 1D ATCTCTAGTA G/- TATTTGAAAC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 G 1 0 120434 CASAVA_Build 6 122770436 1D CATTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 113 het 44 0 38 6 T 11 10 120435 CASAVA_Build 6 122775935 1D CAGTAATATA T/- TTTTTAATGC 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 6 5 120436 CASAVA_Build 6 122776168 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 9 120437 CASAVA_Build 6 122779993 1D ATTTACTGTG T/- TTTTTTTTTT 1191 het 1191 ref 33 21 3 9 T 15 14 120438 CASAVA_Build 6 122790856 2I TACAAAAACG --/TC TCCTAATAAG 3070 het 3070 hom 47 9 30 8 TC 1 2 120439 CASAVA_Build 6 122794250 2I AACAAGTACT --/TA TATATATATA 2885 het 2885 ref 24 9 8 7 TA 5 6 120440 CASAVA_Build 6 122798057 1D CAAAAAAAAG T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 8 7 120441 CASAVA_Build 6 122802121 7D CAGAGTCCCC ACTGGGG/------- TGCTCCTCAG 3070 het 3070 ref 34 19 11 7 ACTGGGG 1 0 120442 CASAVA_Build 6 122811358 2D TCCTTTCAAC AT/-- ATGTTTCTAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 7 AT 2 1 120443 CASAVA_Build 6 122824503 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 717 hom 13 2 10 1 A 12 11 120444 CASAVA_Build 6 122838529 1D ACTCAAGAGG C/- CGAGGCAGGA 2787 het 1767 hom 14 5 7 2 C 2 1 120445 CASAVA_Build 6 122843769 3I AAATAATCTT ---/TTG TTGTTCTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTG 1 2 120446 CASAVA_Build 6 122846370 1I AAATAAGGGG -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 7 8 120447 CASAVA_Build 6 122848503 2I CAAAACTAGA --/AG AGAGTAGAAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 AG 2 3 120448 CASAVA_Build 6 122849780 4D TTGCTGTCTG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 252 hom 35 4 12 20 TCTA 4 3 120449 CASAVA_Build 6 122849796 3D TATCTATCTA ACT/--- ACTATTTTCT 3070 het 3070 hom 40 10 23 9 ACT 2 1 120450 CASAVA_Build 6 122857169 1D TGGACTTCTA T/- TTACCCTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 3 2 120451 CASAVA_Build 6 122863085 1I AAATAGTGGG -/A AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 6 7 120452 CASAVA_Build 6 122863140 1I TATCACATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 9 10 120453 CASAVA_Build 6 122863220 5D CTGAGGAAGG GAAGA/----- GAAGATTGCT 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 GAAGA 2 1 120454 CASAVA_Build 6 122884993 1D AGTCATTAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 A 10 9 120455 CASAVA_Build 6 122887904 1D AGGTTGTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 10 9 120456 CASAVA_Build 6 122899635 4D AAAAAATAAA AGAG/---- AGAAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 AG 3 1 120457 CASAVA_Build 6 122907229 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 9 10 120458 CASAVA_Build 6 122907702 4D TTAAAAGAAG ACAT/---- ACATGTGGCA 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 ACAT 2 1 120459 CASAVA_Build 6 122910587 19I TACAGGGTCA -------------------/GCAGCTTCACTCTCTCTCT CTGGACACGA 2678 het 2678 ref 39 24 9 6 GCAGCTTCACTCTCTCTCT 0 1 120460 CASAVA_Build 6 122910742 1D AAACTCACCG A/- AGTCACTTTG 3070 hom 152 het 61 0 48 14 A 2 1 120461 CASAVA_Build 6 122922401 1D TTTTAGAATT G/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 1 0 120462 CASAVA_Build 6 122924981 3D AGCAGTTCTT GTC/--- GTGGTGGCTT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 GTC 1 0 120463 CASAVA_Build 6 122954864 1D CTCTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1537 het 1537 ref 38 26 7 5 T 12 11 120464 CASAVA_Build 6 122978040 1I GTAGTGAAAA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 G 1 2 120465 CASAVA_Build 6 122985149 1D GCCTTCTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 10 9 120466 CASAVA_Build 6 122997974 2I TAAAACTAAC --/AT ATAAAATAAT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AT 1 2 120467 CASAVA_Build 6 122998344 1D TTTGAAAGAG A/- AAACATTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 4 3 120468 CASAVA_Build 6 123016391 1I CTGGTGGGGC -/G GGGATGAGGT 3070 hom 55 het 20 0 18 2 G 3 4 120469 CASAVA_Build 6 123030372 2I CAAAGCAAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 CT 1 2 120470 CASAVA_Build 6 123036017 1I GGATTTCTGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 9 120471 CASAVA_Build 6 123037902 1I TTCTTCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 21 8 T 11 12 120472 CASAVA_Build 6 123051342 1I TTTTCTTCTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 8 9 120473 CASAVA_Build 6 123052888 1I TTGAAGTACA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 T 8 9 120474 CASAVA_Build 6 123053774 3D ATATATATAT ATA/--- TTTTTTTTTT 1111 het 709 hom 19 3 6 10 ATA 1 0 120475 CASAVA_Build 6 123054451 1D GTTATCTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 10 9 120476 CASAVA_Build 6 123055495 1I AGAATTGGGG -/A CCTCACAAGG 3070 het 3070 ref 46 16 14 16 A 0 1 120477 CASAVA_Build 6 123056042 1D CAGAACACAA G/- GCTTCAAGGT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 G 2 1 120478 CASAVA_Build 6 123058272 3D GAGAACAAAA AAT/--- AAGTTTTTTC 2640 het 2640 ref 23 15 7 2 AAT 1 0 120479 CASAVA_Build 6 123062098 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 1138 het 1120 hom 11 4 3 4 A 10 9 120480 CASAVA_Build 6 123062126 4I TTTGTGAACT ----/AAAA AAAATATATA 1082 hom 12 het 10 0 3 7 A 4 8 120481 CASAVA_Build 6 123062334 3D CATTAAGGTT GCA/--- GCAGTCTACT 3070 hom 95 het 34 0 32 2 GCA 2 1 120482 CASAVA_Build 6 123064911 1D AGGAAGACAG T/- AAGGAGACTT 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 T 1 0 120483 CASAVA_Build 6 123070819 5I AATTCATGTT -----/AAAAA GAAAAGTGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 5 120484 CASAVA_Build 6 123072330 1D CAAGTGGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 11 10 120485 CASAVA_Build 6 123079480 2I CCAAAAATAT --/TG TGTTTCTAAT 3070 hom 199 het 72 0 67 5 TG 1 2 120486 CASAVA_Build 6 123080060 1I TCCTACTCTT -/C CAACCATTAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 1 2 120487 CASAVA_Build 6 123083551 1D TTTGAGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 T 12 11 120488 CASAVA_Build 6 123088652 1I CCTACTGTGA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 T 7 8 120489 CASAVA_Build 6 123097606 12D AAGGCTGTGC GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGTGT 3070 het 911 hom 32 6 14 15 GT 15 9 120490 CASAVA_Build 6 123117853 1D TAACAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 T 12 11 120491 CASAVA_Build 6 123138192 1I GAGTACACAG -/A AAAAAGTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 5 6 120492 CASAVA_Build 6 123138548 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAACA 2394 het 274 hom 37 4 7 26 C 1 0 120493 CASAVA_Build 6 123146826 1D AAAGTTTTGT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 162 hom 29 1 15 13 C 11 10 120494 CASAVA_Build 6 123146921 3D ACGTGAAATT TTG/--- TTGTTGTTTC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TTG 3 2 120495 CASAVA_Build 6 123156817 1D51M2I AAAAGTGTGG AAAAAAATCTCTTTATTAAAACAATTTGAACATGGTTTATAAGGATCATTGA--/-AAAAAATCTCTTTATTAAAACAATTTGAACATGGTTTATAAGGATCATTGAAT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 25 14 6 N/A 0 0 120496 CASAVA_Build 6 123160259 1I AAACAAAAAC -/A TTACAAATTG 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 0 1 120497 CASAVA_Build 6 123165749 1I GGACATGAAA -/G GCAGCTTCTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 1 2 120498 CASAVA_Build 6 123165997 3D CCCACCACCA GTG/--- GTTCAGAGGC 3070 hom 84 het 32 0 28 6 GTG 1 0 120499 CASAVA_Build 6 123170554 1I GTATAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 10 11 120500 CASAVA_Build 6 123172373 1D CTTTGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2516 hom 25 7 12 7 T 11 10 120501 CASAVA_Build 6 123172787 3D AACTTTTAAG GAT/--- GAGAATGTCA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 GAT 1 0 120502 CASAVA_Build 6 123181159 1D AGGATTATAA T/- ATCACCTAAT 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 1 0 120503 CASAVA_Build 6 123189525 5I GAGGATGAAG -----/ATCTT ATGACAATCC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 ATCTT 0 1 120504 CASAVA_Build 6 123190956 1I TTCATAACCA -/T TTTTTTTCTC 2772 het 2772 ref 26 16 6 4 T 7 8 120505 CASAVA_Build 6 123197395 2I TTCAAATCTT --/TC TGTCACTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 TC 0 1 120506 CASAVA_Build 6 123198389 5I TCTTGGGTTG -----/TTCTT TTCAAGCTAC 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 TTCTT 0 1 120507 CASAVA_Build 6 123199953 1D CTTGTCCTTC A/- AAGTCGCTTG 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 3 2 120508 CASAVA_Build 6 123202726 1I GGACAGGCAT -/A AGTGGCTGGA 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 A 1 2 120509 CASAVA_Build 6 123209743 1I TTTTTAAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 8 9 120510 CASAVA_Build 6 123210621 11D TTTTGTATTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTAAATTT 820 het 820 ref 11 5 4 2 T 15 4 120511 CASAVA_Build 6 123215695 4D TCTCTTGAGA ACTC/---- ACTCACTATC 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 ACTC 2 1 120512 CASAVA_Build 6 123216589 8D TGTGGCCCAA AAGTCTGT/-------- GGCCCAAAAG 2808 het 2808 ref 27 17 8 4 AAGTCTGT 1 0 120513 CASAVA_Build 6 123216715 2I CAGGAAGAAC --/AA AGAGAGCCAG 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 A 1 3 120514 CASAVA_Build 6 123217930 1I CCAGCACTTC -/G GGGGGGCTGA 2127 het 2127 ref 33 17 7 9 G 6 7 120515 CASAVA_Build 6 123220916 1I TTCTGCCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 A 9 10 120516 CASAVA_Build 6 123221403 2D ACTTTGTGAT AA/-- AAAAAGTCAT 3070 het 3070 hom 43 17 17 10 A 7 5 120517 CASAVA_Build 6 123225197 1D TATTGGGGGG C/- GGGGTGGTGG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 C 1 0 120518 CASAVA_Build 6 123225305 3D CTGCCACTCA GGT/--- GTGCTTCAAA 3070 het 3070 ref 45 27 15 5 GGT 1 0 120519 CASAVA_Build 6 123226040 2I AATCCCAACA --/TT TTTTTTTTTT 1182 het 1182 ref 25 11 5 9 T 10 12 120520 CASAVA_Build 6 123229075 1D TAGTTGATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 10 9 120521 CASAVA_Build 6 123230846 1D CTAAATATTA G/- GGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 25 2 G 3 2 120522 CASAVA_Build 6 123232955 27D TGTTAACAGG TCTCTGTCTCTGTCTGATCTAACAGAC/--------------------------- TTGTTAGATC 3070 het 3070 ref 30 23 9 9 TCTCTGTCTCTGTCTGATCTAACAGAC 1 0 120523 CASAVA_Build 6 123236574 1I TCCCATGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 10 11 120524 CASAVA_Build 6 123263055 1I CTATTTAACA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 T 8 9 120525 CASAVA_Build 6 123277971 1D TGCTTTATAT A/- TTTATGTGTT 3070 het 3070 hom 39 20 19 0 A 1 0 120526 CASAVA_Build 6 123284016 1I ACTCTATTGG -/C GTCACAACAC 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 C 0 1 120527 CASAVA_Build 6 123284474 1D GTGGAAGAGT A/- AAGCCAACAT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 3 2 120528 CASAVA_Build 6 123313447 1D CAACGAATTG A/- AAAAGCTTTA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 5 4 120529 CASAVA_Build 6 123315631 1I TTTAAAGGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 T 9 10 120530 CASAVA_Build 6 123318125 7D GGCAAGTTAG ACAAAGA/------- AGAAAGACCC 3070 het 3070 ref 36 19 16 4 ACAAAGA 1 0 120531 CASAVA_Build 6 123320021 1I AACTTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 A 13 14 120532 CASAVA_Build 6 123323172 1D CAATAGCTGC A/- AAAAAAAAAC 2296 het 2296 ref 59 46 5 8 A 10 9 120533 CASAVA_Build 6 123323273 2I ATCATAGATG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 56 21 22 13 AC 7 8 120534 CASAVA_Build 6 123327736 1D ACAGTAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 11 10 120535 CASAVA_Build 6 123327917 1D TACTATACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 11 10 120536 CASAVA_Build 6 123333057 2D3M5D22M7I GCTGGCCACT AAGTAAATGGAGGGGTGTGTGTGTACAGGCCT-------/--GTA-----GGGGGTGTGTGTGTACAGGCCTGTGTCTA GTGTCTAGTG 3070 het 3070 ref 38 34 10 7 N/A 0 0 120537 CASAVA_Build 6 123333827 2I GCTTACAAAG --/AT ATTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 AT 1 2 120538 CASAVA_Build 6 123336930 1D AAATAAATGT G/- TAGCACGTAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 G 1 0 120539 CASAVA_Build 6 123341260 1I ATTGAGTCCA -/C CTGTGGGTCA 3070 het 3070 hom 46 17 18 11 C 1 2 120540 CASAVA_Build 6 123344701 1D TTTATGAAAG C/- CCTTATTAAA 3070 het 3070 ref 38 17 18 4 C 3 2 120541 CASAVA_Build 6 123345124 1D64M3D CCTAGATATG AAAAAAAAGGAAGAAGAAACTGACGTAAACATCTGGAGGTAAGCACTTTGCCTATTAAATACAACAAT/-AAAAAAAGGAAGAAGAAACTGACGTAAACATCTGGAGGTAAGCACTTTGCCTATTAAATACAAC--- GACAATGGTG 3070 het 3070 hom 43 29 42 6 N/A 0 0 120542 CASAVA_Build 6 123351370 1I AGATGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 2602 het 2602 ref 22 10 8 4 A 10 11 120543 CASAVA_Build 6 123366438 4I AAAATACACT ----/TTGG TTGAGAATTT 3070 hom 129 het 49 0 43 6 TTGG 0 1 120544 CASAVA_Build 6 123371530 1I AAATTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 553 hom 29 3 19 7 T 11 12 120545 CASAVA_Build 6 123377180 1D GTTTCCTGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 8 120546 CASAVA_Build 6 123377880 1D TTGAGTGAAA G/- TTTGCTAAGT 3070 hom 114 het 43 0 38 6 G 1 0 120547 CASAVA_Build 6 123379184 2I TGCTTTTTTT --/GG GGGGGGGAGG 3070 hom 67 het 27 0 20 7 G 7 9 120548 CASAVA_Build 6 123382814 1D TTACTCTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 104 het 48 0 35 13 T 10 9 120549 CASAVA_Build 6 123383896 1I GAAAGAGTAT -/G GGGGGGGGTA 3070 hom 43 het 25 0 21 4 G 8 9 120550 CASAVA_Build 6 123391088 1I ATACAGATCT -/A AATCAGTTTT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 A 2 3 120551 CASAVA_Build 6 123410590 1I AGTAGGCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 35 1 31 3 T 10 11 120552 CASAVA_Build 6 123414947 1I AAGACAATAT -/A ATGCATGATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 120553 CASAVA_Build 6 123418164 1D AATATTCTTA T/- TTTTATTGAT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 T 5 4 120554 CASAVA_Build 6 123469043 1I CCCTCCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1199 hom 30 4 20 6 T 14 15 120555 CASAVA_Build 6 123472025 2I AGCAGGAGCA --/AG AGAGAGAGTG 3070 hom 57 het 20 0 18 2 AG 4 5 120556 CASAVA_Build 6 123472341 1I TCTTCTTTTT -/C ATAACTTGTT 3070 hom 62 het 26 0 21 5 C 0 1 120557 CASAVA_Build 6 123473224 1D AGACAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 11 10 120558 CASAVA_Build 6 123492734 1D GGGGTCGGGG T/- GGGGCGGAGG 3070 hom 38 het 14 0 13 1 T 1 0 120559 CASAVA_Build 6 123494422 2I ACTAAATGAC --/AT GTTATCATTC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AT 0 1 120560 CASAVA_Build 6 123502008 1D CTCTCCCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 29 1 19 9 T 15 14 120561 CASAVA_Build 6 123504916 1D AGATTATATC A/- CCCCCCCTTT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 A 1 0 120562 CASAVA_Build 6 123514826 4I ACATCTAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 114 het 46 0 38 8 AAAC 2 3 120563 CASAVA_Build 6 123519003 4D ACACAGCCTT ATTA/---- ATTATCAATT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 ATTA 2 1 120564 CASAVA_Build 6 123521335 2I TTGCAAAACG --/CA CACACACACA 3070 het 345 hom 36 2 28 6 CA 8 9 120565 CASAVA_Build 6 123524230 1I CTTGTATTTT -/A GGTATCCCAC 3070 hom 118 het 48 0 39 9 A 0 1 120566 CASAVA_Build 6 123529698 1I ATGGAACCAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 9 120567 CASAVA_Build 6 123529909 1D TATACTGAGG A/- AAAGACAGTC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 4 3 120568 CASAVA_Build 6 123530771 1I CCATCAGCAG -/A ACGAAGGGAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 120569 CASAVA_Build 6 123546845 25D TGATTGGGGT ACCTGAAGGTGATGGGGTGAATGGA/------------------------- ACCAAGTTGG 3070 hom 48 het 18 0 17 2 ACCTGAAGGTGATGGGGTGAATGGA 1 0 120570 CASAVA_Build 6 123548895 2D CTTCTGAAAC TA/-- TTTCAAACAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TA 1 0 120571 CASAVA_Build 6 123566786 1I AGAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 28 9 A 9 10 120572 CASAVA_Build 6 123571436 1I CATATTCTTC -/A AAAAAAGGAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 6 7 120573 CASAVA_Build 6 123585334 2D TAATTCAATT TA/-- AAAAATATAT 3070 het 1985 hom 23 6 15 2 TA 1 0 120574 CASAVA_Build 6 123587949 2I25M1D TTCCAAAGAC --ATACAAATGACCAACAGGCACGTGGA/ATATACAAATGACCAACAGGCACGTGG- AAGATGCCTT 3070 het 3070 ref 46 33 24 4 N/A 0 0 120575 CASAVA_Build 6 123588370 10D ACACACACAC ACACACACAT/---------- ACACACACAT 3070 het 2678 hom 26 9 14 7 ACACACACAT 2 1 120576 CASAVA_Build 6 123600019 1D CACGAACTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 8 7 120577 CASAVA_Build 6 123627520 4I ATCTTTTGTC ----/AAAG AGTCAATCAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 AAAG 0 1 120578 CASAVA_Build 6 123636210 1I AGATATAGCT -/A AAAATAAATA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 4 5 120579 CASAVA_Build 6 123645571 3I GAAACTGCTC ---/TAT TATTAGATCA 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 TAT 1 2 120580 CASAVA_Build 6 123650874 1I TCCATTTATA -/C CCCTATTATG 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 C 3 4 120581 CASAVA_Build 6 123651503 5D GTGGGAAATA TAAAT/----- TAAACTACAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 TAAAT 1 0 120582 CASAVA_Build 6 123656653 1D CCTGTACATC A/- AAAACTTGGA 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 A 5 4 120583 CASAVA_Build 6 123659416 5D AAATATATAA AATAT/----- AATATAAGAC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 AATAT 2 1 120584 CASAVA_Build 6 123659519 1I ATTCTCATAT -/A AAGGCAGTCT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 2 3 120585 CASAVA_Build 6 123669740 1I AGGGGTAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 8 16 6 A 9 10 120586 CASAVA_Build 6 123671183 1D CACGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 34 3 19 13 T 15 14 120587 CASAVA_Build 6 123683056 3D TAAAATAATA ATC/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 ATC 1 0 120588 CASAVA_Build 6 123695159 1I ACATTTTGTC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 A 6 7 120589 CASAVA_Build 6 123698965 1I GCCAAATAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 T 9 10 120590 CASAVA_Build 6 123704096 2I CTGTAGACAC --/TG TTCATTAACT 3070 het 3070 hom 28 8 19 1 TG 0 1 120591 CASAVA_Build 6 123709834 1D TTTCAAACAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 10 9 120592 CASAVA_Build 6 123713897 1I GTGTTTTATA -/T TCTAGTCAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 1 2 120593 CASAVA_Build 6 123735856 1D CCACACCACA C/- CCTGACACAT 3070 het 3070 ref 73 31 29 14 C 3 2 120594 CASAVA_Build 6 123759892 1I CCCATCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 10 11 120595 CASAVA_Build 6 123777025 1I TTAGCATTCC -/T TTTAAGTTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 3 4 120596 CASAVA_Build 6 123781152 2I TGTTTCATGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 57 20 26 11 TG 6 7 120597 CASAVA_Build 6 123783236 1D GGATTTTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 10 9 120598 CASAVA_Build 6 123795988 27D CACATCATAA ATATATATATATATATATAATATATAT/--------------------------- ATATATATAT 3070 hom 24 het 11 0 9 5 ATATATATATATATATATAATATATAT 1 0 120599 CASAVA_Build 6 123798341 4D AATCTCTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 37 16 13 11 TC 11 9 120600 CASAVA_Build 6 123809758 1D TCTTCTTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 10 9 120601 CASAVA_Build 6 123815349 1D CAATAGTTGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 83 het 32 0 28 4 A 10 9 120602 CASAVA_Build 6 123815828 1D AAAAGCAAAC A/- AAAACATAAA 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 A 5 4 120603 CASAVA_Build 6 123820096 1D CCCGCATCAT G/- GGGGAACATT 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 G 5 4 120604 CASAVA_Build 6 123820408 1D TTCATTTTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 9 8 120605 CASAVA_Build 6 123820535 5I TTAACATATT -----/AACTG AACTGAAAGA 3070 het 3070 hom 38 15 22 1 AACTG 1 2 120606 CASAVA_Build 6 123821707 1D TTCTGTGATT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 9 8 120607 CASAVA_Build 6 123825356 4D CTAATGAAGT TTTA/---- TTTGTTTCTA 3070 het 3070 ref 40 19 15 9 TTTA 1 0 120608 CASAVA_Build 6 123827961 1D ATTATTATGC A/- AAAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 6 5 120609 CASAVA_Build 6 123840929 1D AATGTTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 13 12 120610 CASAVA_Build 6 123851554 2D TCCAATCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 32 1 18 13 T 16 14 120611 CASAVA_Build 6 123860826 1D CAGGAGTTGG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 99 het 41 0 33 9 T 8 7 120612 CASAVA_Build 6 123864236 26D TTGCCCAAAA AGCTAACTCAACAGTTAGCTTAGTTG/-------------------------- AGCTAACTCA 3070 het 3070 hom 30 11 15 12 AGCTAACTCAACAGTTAGCTTAGTTG 1 0 120613 CASAVA_Build 6 123870837 2I TCTTTGCGTT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 11 120614 CASAVA_Build 6 123874658 8D TGGAGGCAGA ATTCATAT/-------- TCTTCTCACG 3070 het 3070 ref 40 21 18 3 ATTCATAT 1 0 120615 CASAVA_Build 6 123885282 1D ACAACTACAT G/- GGGGGGGAAA 3070 hom 57 het 20 0 19 3 G 8 7 120616 CASAVA_Build 6 123893171 27D TTATGTTATT TATACATTTATAACTGAAATTAACTGA/--------------------------- TATACATTTA 2829 het 2829 ref 24 17 6 9 TATACATTTATAACTGAAATTAACTGA 2 1 120617 CASAVA_Build 6 123905807 4I AGGGAATTAA ----/AATT AATTTATATT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 AATT 1 2 120618 CASAVA_Build 6 123935329 1D CTCATTATCT G/- GGCTACACTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 3 2 120619 CASAVA_Build 6 123940901 1D CATAGTTTGC A/- AAAATTTTCT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 5 4 120620 CASAVA_Build 6 123945971 4D CCAGCAAAGA TTAT/---- TTATTTACTT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 TTAT 2 1 120621 CASAVA_Build 6 123952233 1D ACTTTACCTA G/- CCCCAGCATT 3070 hom 114 het 45 0 39 7 G 1 0 120622 CASAVA_Build 6 123957478 3I AATTCTGGTT ---/ATA ATGTTTGTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATA 0 1 120623 CASAVA_Build 6 123957596 1D ATGAAATGCC A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 42 21 20 1 A 7 6 120624 CASAVA_Build 6 123963297 1I AGGGGAAAGA -/T TTTAGCTTCG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 3 4 120625 CASAVA_Build 6 123965283 1D AAGGGTTGTA G/- GGGGGAACGA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 G 6 5 120626 CASAVA_Build 6 123987911 1I TTCCTGTCTC -/T TTTTTTTTTT 2489 het 2007 hom 39 8 11 20 T 14 15 120627 CASAVA_Build 6 124049930 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 39 1 32 6 A 11 10 120628 CASAVA_Build 6 124058424 4D ATTGAAACCA CTCT/---- CTAAGAAAGT 3070 het 3070 ref 35 18 17 1 CT 3 1 120629 CASAVA_Build 6 124065131 1I CCAAGTAATT -/A AGTAGGCAAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 1 2 120630 CASAVA_Build 6 124074837 2D CCTAGCAAGA AC/-- ACCCATAAGA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 AC 2 1 120631 CASAVA_Build 6 124081460 1D CTGTAACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 12 11 120632 CASAVA_Build 6 124083208 1I TACACTGATA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 8 120633 CASAVA_Build 6 124085793 4D ACTAACTCTA ATAC/---- ATATATATCA 3070 hom 132 het 48 0 45 4 ATAC 1 0 120634 CASAVA_Build 6 124088105 1D GATTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 11 10 120635 CASAVA_Build 6 124089583 1I TGTGAGAGAA -/T TTTTTATAAT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 5 6 120636 CASAVA_Build 6 124090980 3I AGAGGCAATC ---/CTT CTGTGATTCT 3070 hom 157 het 59 0 53 6 CTT 0 1 120637 CASAVA_Build 6 124091451 1D TCACTATTTT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 8 7 120638 CASAVA_Build 6 124103617 10D TAATAACTTA TTTCTTTTTC/---------- TTTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 39 16 21 5 TTTCTTTTTC 1 0 120639 CASAVA_Build 6 124115151 4I ATAAAAGTGG ----/TTGT TTAATTCACC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 TTGT 0 1 120640 CASAVA_Build 6 124116679 9I CACCCACTGA ---------/GAAATATTT GATCTGTTTC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 GAAATATTT 0 1 120641 CASAVA_Build 6 124117094 1D TAACTGCTTG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 T 8 7 120642 CASAVA_Build 6 124118954 1I TATTATACTA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 T 6 7 120643 CASAVA_Build 6 124120879 1I TTTAAAGTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 9 10 120644 CASAVA_Build 6 124121890 1I AATCTTCATT -/A TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 0 1 120645 CASAVA_Build 6 124122261 3D AACATTTGAT CCA/--- TCTCAGTGTT 3070 het 3070 ref 38 17 19 6 CCA 1 0 120646 CASAVA_Build 6 124132115 1I TCTAAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 10 11 120647 CASAVA_Build 6 124137754 1I TCTCGGGGGG -/A AAAAAACCTC 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 6 7 120648 CASAVA_Build 6 124141742 4D TCCTCTTCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 42 0 33 9 T 15 11 120649 CASAVA_Build 6 124157368 2I AGACACAAAC --/TG TTATCATGTG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TG 0 1 120650 CASAVA_Build 6 124172195 1I CTTTTTTCAT -/A ACAATGATAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 2 120651 CASAVA_Build 6 124199487 1I ATCCTGGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 49 2 37 10 A 10 11 120652 CASAVA_Build 6 124275727 1D23M1D TCATTGCAAA TTCTATTAAAGAATCCATTAAATAT/-ACTATTAAAGAATCCATTAAATA- TGTGATTTAG 3070 het 3070 hom 38 17 26 3 N/A 0 0 120653 CASAVA_Build 6 124277059 2I TGTGTATGAC --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 GA 7 8 120654 CASAVA_Build 6 124354328 1I GCGGGGAGTT -/C CAAAGCAACA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 C 1 2 120655 CASAVA_Build 6 124359160 74D GGTCTCACAA TTTGCTCATTAATGTTGTCTGCAGCCCACCATTCCCAAAACATTTCAAATACTATAAATAATATGTGATTGTAC/-------------------------------------------------------------------------- TCCCAAATAA 2254 het 2254 ref 19 23 5 2 TTTGCTCATTAATGTTGTCTGCAGCCCACCATTCCCAAAACATTTCAAATACTATAAATAATATGTGATTGTAC 1 0 120656 CASAVA_Build 6 124371350 1I ACCCTTGGTA -/G AAAGGAAATG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 0 1 120657 CASAVA_Build 6 124382248 1D CATAGGAGTG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 9 8 120658 CASAVA_Build 6 124384059 2D AAAGTTTGAT TA/-- GTGGGTGCAC 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 TA 1 0 120659 CASAVA_Build 6 124388304 1D AATGGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 56 20 31 6 A 12 11 120660 CASAVA_Build 6 124390565 6I AGTTCCAAAT ------/TAACTC TAAATAGTTC 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 TAACTC 0 1 120661 CASAVA_Build 6 124421049 2D TTAAGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 35 1 23 12 T 16 14 120662 CASAVA_Build 6 124440837 2D GGCTGATTTT TC/-- TTTTATTTTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 TC 1 0 120663 CASAVA_Build 6 124472850 1I TTTGCTAGTA -/T TTTTTTGAAA 3070 hom 117 het 47 0 42 5 T 6 7 120664 CASAVA_Build 6 124478163 1I GCAACCAAAG -/T TAAGAAAGGC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 1 2 120665 CASAVA_Build 6 124486861 1I TCCATGTGCA -/T TTACTTTATT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 2 3 120666 CASAVA_Build 6 124487211 1I CTTCCAGTTA -/C AACACAGCAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 120667 CASAVA_Build 6 124489431 2D CTACTGGAGG AC/-- ACTGATTTAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AC 2 1 120668 CASAVA_Build 6 124493457 1D TTTGCCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 846 hom 42 2 32 8 T 14 13 120669 CASAVA_Build 6 124496969 1I AAAAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 22 10 A 13 14 120670 CASAVA_Build 6 124498061 1D TTACACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 29 1 24 4 A 11 10 120671 CASAVA_Build 6 124511149 1D AATTTGGTGG T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 102 het 43 0 35 9 T 7 6 120672 CASAVA_Build 6 124516779 2I TATCTATTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 10 12 120673 CASAVA_Build 6 124526377 1D AAAGTATCCC A/- TCATTAGAAT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 1 0 120674 CASAVA_Build 6 124539563 2D ATTATATGTC TG/-- TGCTGCTAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TG 2 1 120675 CASAVA_Build 6 124548714 2D TAGGGGAAAC AT/-- GTGGAAATGG 3070 hom 99 het 42 0 34 9 AT 1 0 120676 CASAVA_Build 6 124549811 1D GTACTGATGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 T 8 7 120677 CASAVA_Build 6 124558169 9I CAGGTTTAAA ---------/CATAGCAAG ATTATTTTCT 3070 hom 92 het 34 0 31 3 CATAGCAAG 0 1 120678 CASAVA_Build 6 124567830 1D AAAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 10 9 120679 CASAVA_Build 6 124568212 1I GTGCTAAAAA -/G AAAATCTCTT 3070 hom 151 het 57 0 51 6 G 0 1 120680 CASAVA_Build 6 124571611 4D TGCAGAAAAA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TATT 3 2 120681 CASAVA_Build 6 124580631 2I ATATATATGT --/AC ACACACACAC 3070 het 112 hom 40 1 33 6 AC 6 7 120682 CASAVA_Build 6 124582128 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 274 hom 20 1 13 6 T 12 11 120683 CASAVA_Build 6 124583306 1D TTTTTTTCCC T/- TTTTTTGGGG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 7 6 120684 CASAVA_Build 6 124583382 4I CATACATATG ----/TATA TATATATATA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 TA 7 9 120685 CASAVA_Build 6 124583831 1D TTTTTTCAAG A/- AAATTATAAC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 4 3 120686 CASAVA_Build 6 124594708 2I ATAAATATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AT 5 6 120687 CASAVA_Build 6 124595598 1D ATTTTTGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 10 9 120688 CASAVA_Build 6 124598448 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 31 1 25 5 T 11 10 120689 CASAVA_Build 6 124697398 1D CGGTTCCTGG T/- GGGGGGCACT 3070 het 2775 hom 26 10 12 4 T 1 0 120690 CASAVA_Build 6 124697579 1I ATGACTCCTC -/A GCCAGAACTT 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 A 0 1 120691 CASAVA_Build 6 124735674 1I GATATTTGTT -/A AAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 17 0 A 5 6 120692 CASAVA_Build 6 124744111 2D TTAACATAGC AG/-- AGTTATTACT 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 AG 2 1 120693 CASAVA_Build 6 124744965 1I CAATTACCCA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 8 9 120694 CASAVA_Build 6 124750140 1D TAATTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 16 15 120695 CASAVA_Build 6 124767467 1D GTCTTAATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 T 9 8 120696 CASAVA_Build 6 124767624 2D AGAATTTAAG AT/-- ATGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 AT 2 1 120697 CASAVA_Build 6 124776867 1I TGTTCGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 T 11 12 120698 CASAVA_Build 6 124777819 1I GTTTTGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 10 11 120699 CASAVA_Build 6 124780335 4D CTAATCTTGC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 96 het 41 0 33 9 TTAT 6 5 120700 CASAVA_Build 6 124784379 2I AGGACTTAAC --/TA TATAACATTT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 TA 2 3 120701 CASAVA_Build 6 124787306 3I TACAACACAG ---/TAT TATTAACTGT 3070 hom 121 het 49 0 40 9 TAT 1 2 120702 CASAVA_Build 6 124787556 1D AGCATAATGA C/- CCCCCCACCA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 7 6 120703 CASAVA_Build 6 124792844 1D TAAAAAAGTC A/- AGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 2 1 120704 CASAVA_Build 6 124793515 1D TGTATATTTC A/- AAAAAAAAAA 3050 het 3050 ref 42 26 10 6 A 12 11 120705 CASAVA_Build 6 124798758 5D ATTCTAAAAT AAAAA/----- TACCAGATTA 3070 het 3070 ref 36 22 13 4 A 5 0 120706 CASAVA_Build 6 124802204 1D CCACTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 12 11 120707 CASAVA_Build 6 124805210 1I ATCAATGCCC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 6 7 120708 CASAVA_Build 6 124808633 1I CAAAACAAAA -/C AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 C 0 1 120709 CASAVA_Build 6 124816396 12D ATGTTTCAAA AATATCCTTTCC/------------ AATATGCAGC 3070 het 3070 ref 38 23 14 4 AATATCCTTTCC 1 0 120710 CASAVA_Build 6 124816952 1D TTTTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 94 hom 29 3 16 10 G 11 10 120711 CASAVA_Build 6 124823338 7I AATGCTAGTT -------/GTGCAGG GTATGGAATT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 GTGCAGG 0 1 120712 CASAVA_Build 6 124827274 1I AATTATAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 18 11 T 11 12 120713 CASAVA_Build 6 124829596 1D GTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 512 hom 36 2 29 6 A 13 12 120714 CASAVA_Build 6 124834857 3D TGATCAGTAG ACA/--- ACAACAAGGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 ACA 3 2 120715 CASAVA_Build 6 124835564 1D GTAGGCAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 A 12 11 120716 CASAVA_Build 6 124836953 1I TAGGACTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 10 11 120717 CASAVA_Build 6 124842626 1D TGTTAGTGTA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 T 8 7 120718 CASAVA_Build 6 124869025 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 10 11 120719 CASAVA_Build 6 124871353 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 9 8 120720 CASAVA_Build 6 124872997 1I GTGCTTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 564 hom 30 2 25 3 A 10 11 120721 CASAVA_Build 6 124874389 1D TAACTCTTCC T/- TCAGTCAACC 3070 hom 112 het 46 0 35 12 T 2 1 120722 CASAVA_Build 6 124878559 1D6M75D4M35D TCGCTTTCTC TCCGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG/-CCTTCT---------------------------------------------------------------------------TTCT----------------------------------- CTGTTCTCGT 3070 hom 39 het 13 0 14 4 N/A 0 0 120723 CASAVA_Build 6 124886001 2I AAAAAAAAAA --/AG GAAAAAAGAT 3070 hom 39 het 18 0 14 11 AG 0 1 120724 CASAVA_Build 6 124886355 1I CAATGGAAAG -/T TAGGAGAGAA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 1 2 120725 CASAVA_Build 6 124888544 3I TTCAGAATTG ---/TAT TATTGTTGTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TAT 1 2 120726 CASAVA_Build 6 124902055 2D GTTTAGAGGT TA/-- TATGTAGTTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TA 2 1 120727 CASAVA_Build 6 124918182 4I TGACAGCCTC ----/CTGA CTGACTGTGT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 CTGA 1 2 120728 CASAVA_Build 6 124921255 1I TTCTACTCCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 8 9 120729 CASAVA_Build 6 124934878 1D CAGTGACTAT C/- CCATCACCAA 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 C 3 2 120730 CASAVA_Build 6 124937159 2D AGAAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2620 hom 27 10 13 4 A 13 11 120731 CASAVA_Build 6 124947690 3I AACCCTCATA ---/CTC CTCTATTGTT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 CTC 1 2 120732 CASAVA_Build 6 124948573 3D AAAGCATAAG TTA/--- TTATTACACA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 TTA 3 2 120733 CASAVA_Build 6 124950859 3D TCTGCAAGAA ATC/--- ATCAAATGAG 3070 het 3070 ref 48 22 20 11 ATC 2 1 120734 CASAVA_Build 6 124958523 1I ATTAAAAACC -/A ATAGGGAACT 3070 hom 104 het 38 0 34 4 A 1 2 120735 CASAVA_Build 6 124968468 1D TGAATATTAT G/- GGGTATCTCC 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 G 4 3 120736 CASAVA_Build 6 124972263 6I CGGGATGAAG ------/AGAAAT TGTAGCATCT 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 AGAAAT 0 1 120737 CASAVA_Build 6 124974856 2I TAGGTATTTC --/CA CAGTTTTTTT 3070 het 3053 hom 26 7 15 4 CA 1 2 120738 CASAVA_Build 6 124977535 2I GTCCCAAAGA --/CC CCCCCCCAAT 2217 het 2217 ref 25 10 8 7 C 7 9 120739 CASAVA_Build 6 124978543 2D CCTTTCTGTC TT/-- TCCTCTTCTT 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 T 3 1 120740 CASAVA_Build 6 124982954 2I ACATAGAACA --/GG GAAACAGATG 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 G 1 3 120741 CASAVA_Build 6 124986869 4I TCATGTGGAA ----/AGAT AGATAGCTCC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AGAT 1 2 120742 CASAVA_Build 6 124987753 1D19M1I TGGTTCTTTT AAATAGACTAAAGTGTCTCA-/-AATAGACTAAAGTGTCTCAT TTTTTTCTTG 3070 het 2059 hom 22 6 10 12 N/A 0 0 120743 CASAVA_Build 6 124988025 4D AATAATTATC AAAG/---- AAAGAATATG 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 AAAG 2 1 120744 CASAVA_Build 6 124988172 3I TTACATGTCA ---/GTT GTTTCTTAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 GTT 1 2 120745 CASAVA_Build 6 124988737 2I TCTAACAAAC --/AA AAACATATTG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 3 5 120746 CASAVA_Build 6 124989289 2D CTGTTATTAT CA/-- GCTTTATACA 3070 het 3070 hom 58 23 31 5 CA 1 0 120747 CASAVA_Build 6 125007254 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 26 2 17 7 T 14 13 120748 CASAVA_Build 6 125022347 2I TGTGTGCTTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 426 hom 30 1 26 3 TG 8 9 120749 CASAVA_Build 6 125024744 4I CGGATCCTTT ----/CAAA CAATGTGTGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 CAAA 0 1 120750 CASAVA_Build 6 125025149 2D AAGAATAATT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 TA 8 7 120751 CASAVA_Build 6 125067489 4D AGAAAGAGAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 37 14 18 7 AG 9 7 120752 CASAVA_Build 6 125069346 5I GTCCTCAAAA -----/AAAAC AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 AAAAC 1 2 120753 CASAVA_Build 6 125074152 12I CAATTATGTG ------------/TCTTGGAGTTGC TCTTCTCGAG 1456 hom 7 het 3 0 3 0 TCTTGGAGTTGC 0 1 120754 CASAVA_Build 6 125081630 1I GCAGAATACT -/A AAAAAATCTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 6 7 120755 CASAVA_Build 6 125082572 1D CCTGCTAATC A/- AAAAAAAAAA 2163 het 2163 ref 34 18 7 11 A 13 12 120756 CASAVA_Build 6 125106288 1I ATTATTAACA -/T TTTTTAAATC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 5 6 120757 CASAVA_Build 6 125111699 1I CTTCTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 138 hom 31 2 24 5 A 11 12 120758 CASAVA_Build 6 125119499 1D TGCAATTTTT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 8 7 120759 CASAVA_Build 6 125119943 1D TTCTATTCCC T/- CCACTGTCGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 0 120760 CASAVA_Build 6 125120482 1D ATGTGTTATG T/- TTTCCAAAGC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 4 3 120761 CASAVA_Build 6 125135861 1D TAGGTGGGAG A/- AAAAAACATA 3070 hom 101 het 40 0 33 7 A 7 6 120762 CASAVA_Build 6 125141104 1I AAGTTAAGGG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 7 8 120763 CASAVA_Build 6 125145607 4D TGTAGACAGT ATTA/---- ATTGTGTACA 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 ATTA 1 0 120764 CASAVA_Build 6 125166351 1I GATAATATAC -/A AAGGCCATTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 2 3 120765 CASAVA_Build 6 125175579 1D CCTTTTGACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 T 10 9 120766 CASAVA_Build 6 125175872 1D TCATAACTTT A/- AAAAAACATC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 7 6 120767 CASAVA_Build 6 125212826 1D ATGAATCATA G/- GGGGCAGTTT 3070 hom 58 het 25 0 20 5 G 5 4 120768 CASAVA_Build 6 125214706 1D TTTTGAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 A 12 11 120769 CASAVA_Build 6 125216287 1I AAGCTATGTG -/A AACAAAAATG 2934 het 2934 ref 33 19 8 6 A 2 3 120770 CASAVA_Build 6 125233114 4D TGAGTGACTG AATA/---- AATAAATAAG 3070 het 3070 ref 39 19 19 2 AATA 3 2 120771 CASAVA_Build 6 125244401 1I ATGCAAACCC -/T TACTAGTTGA 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 T 1 2 120772 CASAVA_Build 6 125247368 4D TTTTTTTTTT TAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 18 0 8 10 TAAA 1 0 120773 CASAVA_Build 6 125247400 1I AGAGATTTTT -/A AAAAAACATC 2320 het 923 hom 18 2 6 10 A 6 7 120774 CASAVA_Build 6 125274342 1D GTGGCATGCA C/- CTGTAATCCA 3070 het 3070 hom 29 13 16 0 C 2 1 120775 CASAVA_Build 6 125274466 1I AATCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2865 hom 37 8 14 15 A 13 14 120776 CASAVA_Build 6 125275708 1I TGTAAGCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 A 9 10 120777 CASAVA_Build 6 125280452 1I ATTTTGTAGT -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 6 7 120778 CASAVA_Build 6 125284131 1I TAAAACTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 9 10 120779 CASAVA_Build 6 125285649 19D AGTCTCTGGG ATTACAGGCATGTAATCCC/------------------- ATTGCCACCA 3070 het 3070 hom 36 19 21 2 ATTACAGGCATGTAATCCC 1 0 120780 CASAVA_Build 6 125293734 3I TAAACCTCTT ---/TTC TTATAAATTA 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 TTC 0 1 120781 CASAVA_Build 6 125293806 1D TTCTATAAGC T/- TTTTTCTATT 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 T 6 5 120782 CASAVA_Build 6 125316512 1I TTATATATAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 T 8 9 120783 CASAVA_Build 6 125324068 5D CAGGAGAAAA AAAAC/----- AAAACAAGGG 3070 het 3070 ref 47 27 20 1 AAAAC 2 1 120784 CASAVA_Build 6 125343540 5D TGTTTTTGGT TAGAG/----- TAGAGTGATA 3070 het 3070 hom 34 14 16 7 TAGAG 2 1 120785 CASAVA_Build 6 125352483 6I AACACTTAAA ------/TTTGAG TTTGATATAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TTTGAG 0 1 120786 CASAVA_Build 6 125360307 2I CACACAACTC --/AA GAGTTAATAT 3070 het 3070 hom 62 28 30 4 A 0 2 120787 CASAVA_Build 6 125366910 1I GGGGTTACAG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 7 8 120788 CASAVA_Build 6 125372319 1D AAGAAGGCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 10 9 120789 CASAVA_Build 6 125386447 1D GAAATTAGTA T/- GTTGAAGAGA 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 T 1 0 120790 CASAVA_Build 6 125406904 1D ATGAATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 33 1 26 6 T 11 10 120791 CASAVA_Build 6 125407989 1D TACTGTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 11 10 120792 CASAVA_Build 6 125426523 5D CACAATAATT ATAAC/----- ATAACAGGAT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 ATAAC 2 1 120793 CASAVA_Build 6 125429841 1I GAATGTTGCA -/G GGAGTATTAT 3070 hom 163 het 60 0 55 5 G 2 3 120794 CASAVA_Build 6 125435700 2I ATAAAGAAAC --/AG ACATGGATTC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 AG 0 1 120795 CASAVA_Build 6 125457708 1D CACTCAACGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 13 25 7 T 9 8 120796 CASAVA_Build 6 125459212 3D TTTTATTTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 1681 het 7 hom 12 0 5 7 T 15 12 120797 CASAVA_Build 6 125465629 2I TGTACATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1439 hom 22 8 9 5 TG 5 6 120798 CASAVA_Build 6 125466686 1I CTGGTTTCTG -/T TGCCTCCTCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 120799 CASAVA_Build 6 125467033 1I ATAATTGTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 55 hom 31 2 15 14 T 7 8 120800 CASAVA_Build 6 125472767 3I TTGAAGTCCC ---/CTA CTATTACTGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTA 1 2 120801 CASAVA_Build 6 125473523 1I GTAGCTGTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 8 9 120802 CASAVA_Build 6 125499614 1D ATCTTTCCAT G/- GGTCTGCAGG 3070 het 2119 hom 25 5 15 6 G 3 2 120803 CASAVA_Build 6 125510935 1D TGTCTAAATC T/- TTCATACTTC 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 T 3 2 120804 CASAVA_Build 6 125512047 4I GAAAAGACAA ----/AGAC AGAAAAGACA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 AGAC 0 1 120805 CASAVA_Build 6 125547822 5I ACAAAAACTA -----/TACTT TAAGCAATAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TACTT 0 1 120806 CASAVA_Build 6 125565433 6I GAGGAGAAGG ------/AGAAGA AGAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 AGA 4 6 120807 CASAVA_Build 6 125715409 2D GAAGGAAAGT GA/-- GAGAGAGAGA 1643 het 1643 ref 41 24 4 16 GA 9 8 120808 CASAVA_Build 6 125728445 1D ATTCTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 A 12 11 120809 CASAVA_Build 6 125738093 4D TTCCTCTCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 3070 het 2590 hom 28 10 11 7 CCTT 5 4 120810 CASAVA_Build 6 125744698 1D GCCTTCTGCA G/- CACTCCACAA 3070 het 3070 ref 56 27 25 4 G 1 0 120811 CASAVA_Build 6 125748403 6D TCTGTTTCTA TGAGTT/------ TGACACTTTT 3070 het 3070 ref 51 24 19 9 TGAGTT 1 0 120812 CASAVA_Build 6 125748849 2I ATTTACATAT --/AA AATGCAGTAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 2 4 120813 CASAVA_Build 6 125753372 1I GTTCACAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 T 12 13 120814 CASAVA_Build 6 125766852 1D TTTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 27 1 12 14 T 14 13 120815 CASAVA_Build 6 125767423 5I AATAATTGAT -----/TTAAG TTGATAAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTAAG 0 1 120816 CASAVA_Build 6 125768104 1I AAGAACACAC -/A AAAAAATGAC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 A 6 7 120817 CASAVA_Build 6 125771549 1D TCCTGGAAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 T 9 8 120818 CASAVA_Build 6 125771848 1I CTTTATTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 T 8 9 120819 CASAVA_Build 6 125782844 9D AACAATTATC CATGGGTAG/--------- CAGAAAATCA 3070 het 3070 ref 45 25 18 5 CATGGGTAG 1 0 120820 CASAVA_Build 6 125799073 1D GAGTTTTGTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 1711 hom 30 6 20 4 T 7 6 120821 CASAVA_Build 6 125800464 1D AAAAAAAAAA G/- ATTAGATGAG 3070 het 297 hom 32 1 22 9 G 1 0 120822 CASAVA_Build 6 125801110 2D ACAAACAAAA AC/-- AACAACAACA 3070 het 581 hom 37 4 11 23 AC 1 0 120823 CASAVA_Build 6 125802272 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1556 het 1556 ref 16 5 4 7 A 16 17 120824 CASAVA_Build 6 125803157 1D TGAAGCTAGA T/- TTTTTTATGA 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 7 6 120825 CASAVA_Build 6 125815392 1I CCCCACCACA -/C CTGGCTAATT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 1 2 120826 CASAVA_Build 6 125816460 1I GCTACCCACT -/G GGGGGGGGTC 3070 hom 36 het 25 0 16 9 G 8 9 120827 CASAVA_Build 6 125817905 3D ACTATAATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 44 0 33 11 T 14 11 120828 CASAVA_Build 6 125818843 4D AGTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 27 1 22 8 A 17 13 120829 CASAVA_Build 6 125824340 5D TGTTTATAAT TATTC/----- TTTATTCCTT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 TATTC 1 0 120830 CASAVA_Build 6 125825353 1D TTTTTTAGTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 8 7 120831 CASAVA_Build 6 125827210 1D TTTTGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 11 10 120832 CASAVA_Build 6 125828137 1I AGCAGTGTAC -/A AAATTTCAGA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 3 4 120833 CASAVA_Build 6 125837808 1I CCGCACCCGG -/T TGCCGGTAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 1 2 120834 CASAVA_Build 6 125838292 1D CATTTAAGTG A/- AAAGTTTAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 A 4 3 120835 CASAVA_Build 6 125850235 1D TGTCAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1387 hom 35 4 23 8 T 15 14 120836 CASAVA_Build 6 125851159 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 17 1 14 2 A 15 14 120837 CASAVA_Build 6 125863353 2I GGAGGCCAGA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 AG 6 7 120838 CASAVA_Build 6 125896413 5I CTCCAGAGCT -----/AGCCG AGTCTTAATC 3070 hom 79 het 29 0 21 8 AGCCG 0 1 120839 CASAVA_Build 6 125911359 1I TATATATATA -/T TATTTTTTCC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 1 2 120840 CASAVA_Build 6 126020085 1D GCACACCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 899 hom 43 3 29 11 T 14 13 120841 CASAVA_Build 6 126043354 1I TATCTGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 37 1 28 8 T 10 11 120842 CASAVA_Build 6 126046168 1D GACCATGTAT C/- CTATTTAAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 2 1 120843 CASAVA_Build 6 126047265 4I GGTAAATTTT ----/AAGA AAGAGGAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAGA 1 2 120844 CASAVA_Build 6 126047509 1D CAATAAGTTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 9 8 120845 CASAVA_Build 6 126049335 4I CTGATAATTT ----/TCTA TCTGATATAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TCTA 0 1 120846 CASAVA_Build 6 126050068 4D TTTGATGAGA TTAT/---- TTGTTTTGTC 3070 hom 60 het 22 0 21 3 TTAT 1 0 120847 CASAVA_Build 6 126051780 1D ATTTGTTCAA T/- TTTTGAAGTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 5 4 120848 CASAVA_Build 6 126052598 1D CGTCACTAGC A/- AAAAAATCAT 3070 hom 83 het 36 0 31 5 A 7 6 120849 CASAVA_Build 6 126057679 1D CGATCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 29 1 21 7 A 12 11 120850 CASAVA_Build 6 126061678 1I AAAATAAATA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 8 120851 CASAVA_Build 6 126071974 2D AAAGAAAAAA AG/-- AGAAAAGAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 4 AG 2 1 120852 CASAVA_Build 6 126088158 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 20 0 16 4 A 13 14 120853 CASAVA_Build 6 126107371 5I TCCAGGAATC -----/TTTGA TTTAATTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTTGA 0 1 120854 CASAVA_Build 6 126127880 1D AGGGAAATTA T/- TTTTGGCAGT 3070 hom 126 het 44 0 43 2 T 5 4 120855 CASAVA_Build 6 126159215 1D CCTCAGTATC G/- TGCAGGGGAT 3070 hom 46 het 22 0 13 9 G 1 0 120856 CASAVA_Build 6 126220281 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 11 10 120857 CASAVA_Build 6 126234121 13D CTAGGGTTGG AGCACCATTCTAA/------------- AGCACAATGG 3070 hom 146 het 48 0 47 3 AGCACCATTCTAA 1 0 120858 CASAVA_Build 6 126239441 1D TAGTGACAGT A/- AAAAAAAAAA 1732 het 1732 ref 36 23 4 9 A 17 16 120859 CASAVA_Build 6 126251370 4D AAAAGGAAAA TGTT/---- TGCACATTTA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TGTT 1 0 120860 CASAVA_Build 6 126275200 7D TCCCTTTCTC TCCATAT/------- TGCTGCGTGG 3070 hom 33 het 12 0 11 2 TCCATAT 1 0 120861 CASAVA_Build 6 126282504 2D CTTGTGATAA AC/-- ACAGAGTTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 AC 2 1 120862 CASAVA_Build 6 126292090 1I TTTTTTTTTT -/A TTAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 20 2 A 0 1 120863 CASAVA_Build 6 126292276 12D TTTAGGGTGA TAGGTCTTAAGC/------------ AGCATATATC 3070 hom 60 het 21 0 21 4 TAGGTCTTAAGC 1 0 120864 CASAVA_Build 6 126432695 1D TAGATGAAGG T/- TTTTTTTTTT 1720 het 1720 ref 40 22 6 12 T 17 16 120865 CASAVA_Build 6 126488693 1I ATGAAATGTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 A 8 9 120866 CASAVA_Build 6 126493419 1D TGTTTTACTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 9 8 120867 CASAVA_Build 6 126499785 1I TAGAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 11 13 A 10 11 120868 CASAVA_Build 6 126510271 1D GGGAGCTGTG T/- TTGCAGAAGT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 3 2 120869 CASAVA_Build 6 126512581 1I ACTGAGTTAA -/G GGGGCTGCTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 4 5 120870 CASAVA_Build 6 126588816 1I CAGGCGTGAG -/C TACCGCGCCT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 C 0 1 120871 CASAVA_Build 6 126819107 1D CAAAACATAC A/- AAGATGGAAG 3070 het 3070 hom 55 23 24 9 A 3 2 120872 CASAVA_Build 6 126863624 1D ATTTTTACTT A/- AAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 39 27 11 1 A 6 5 120873 CASAVA_Build 6 126938576 2I TAAGTCATGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 1353 hom 30 3 21 6 GT 8 9 120874 CASAVA_Build 6 126940626 3I TTCAAATCAA ---/TTG TTAAGTGTTA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 TTG 0 1 120875 CASAVA_Build 6 126944345 4D CTTTCTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 1558 het 1558 ref 27 17 8 2 TTTC 3 2 120876 CASAVA_Build 6 126993487 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2320 het 2320 ref 35 21 6 8 T 11 10 120877 CASAVA_Build 6 127049640 1D GCTATGAGAC A/- AAAGCATCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 4 3 120878 CASAVA_Build 6 127054535 3D AACCCCTAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 78 het 39 0 27 13 AAC 7 6 120879 CASAVA_Build 6 127058808 1D GTAAAATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 12 11 120880 CASAVA_Build 6 127058913 1D GTATGGCCTT G/- GGGGAAGTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 5 4 120881 CASAVA_Build 6 127133494 2I TTTTGAAATC --/TG TGTTTTTCTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TG 1 2 120882 CASAVA_Build 6 127156942 2I TTCATTTACC --/CT GTCAACTCTT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 CT 0 1 120883 CASAVA_Build 6 127163182 1I GGTGACTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 49 24 13 12 A 9 10 120884 CASAVA_Build 6 127164233 1I ACTTTGAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 9 10 120885 CASAVA_Build 6 127173979 1I TAAACAAACC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 8 9 120886 CASAVA_Build 6 127181732 3D GTCTAGGACT AAG/--- AAGAGTTTCC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 AAG 2 1 120887 CASAVA_Build 6 127190599 1D CTAATAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 14 6 T 12 11 120888 CASAVA_Build 6 127193270 1I TCCCCAGGTT -/G GGAGTACCTG 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 G 2 3 120889 CASAVA_Build 6 127196174 1I TATAAGCATT -/C CTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 C 1 2 120890 CASAVA_Build 6 127205430 2D AAACTCACCA CT/-- CTAGGAACAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 CT 2 1 120891 CASAVA_Build 6 127205611 5D ACCTTTTTCC TTTTA/----- TTTTGTCACA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 TTTTA 1 0 120892 CASAVA_Build 6 127207777 1D CTCTCACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 184 hom 27 1 26 0 A 11 10 120893 CASAVA_Build 6 127208814 4D AGAGATAGAT TAGA/---- TAGATAGGTA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TAGA 2 1 120894 CASAVA_Build 6 127209370 1D AGTAGAAAAC A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 8 7 120895 CASAVA_Build 6 127211819 1D ACCATTGTGA T/- TTGTTCCTGC 1993 hom 12 het 6 0 5 1 T 3 2 120896 CASAVA_Build 6 127212802 1D GGGCAAGAAG C/- CCCCACCCCT 3070 het 655 hom 12 2 7 3 C 5 4 120897 CASAVA_Build 6 127217928 5D AGCAGTTCTT GTAAA/----- GTAATCAACT 3070 het 3070 ref 57 27 25 5 GTAAA 1 0 120898 CASAVA_Build 6 127221425 5I ACAGTTAGTT -----/ATCTC ATTAGGTTAT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 ATCTC 0 1 120899 CASAVA_Build 6 127227630 1I TACCCAGTAG -/T CATTCAGGAG 2907 het 2907 ref 23 14 6 3 T 0 1 120900 CASAVA_Build 6 127228941 1I TTATAACATC -/A AAAAAACTGG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 6 7 120901 CASAVA_Build 6 127229615 1I CAAATAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 8 9 120902 CASAVA_Build 6 127229789 1D AAAAAAAAAA G/- GAATAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 17 14 5 G 2 1 120903 CASAVA_Build 6 127240020 1D GCCATTGTGT A/- AATATACAAT 3070 het 3070 ref 50 25 21 6 A 3 2 120904 CASAVA_Build 6 127245479 1I GAGGCTGCAG -/A AAAAAGCATA 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 A 5 6 120905 CASAVA_Build 6 127247229 10D ATCATCACAA AAACAGATAC/---------- TTTAATTTCA 3070 het 3070 ref 30 21 9 2 AAACAGATAC 1 0 120906 CASAVA_Build 6 127255309 1D CCCATTTTCT G/- GGGGAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 G 5 4 120907 CASAVA_Build 6 127257236 1D GCAATCCCCC A/- AAAAAAAAAA 1354 het 1354 ref 40 26 4 11 A 13 12 120908 CASAVA_Build 6 127286676 1D ATATTGACCT A/- AAAAAAAAAA 1176 het 1176 ref 45 37 3 6 A 13 12 120909 CASAVA_Build 6 127288280 1D GCAGGGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 A 10 9 120910 CASAVA_Build 6 127302297 1D ATTCTATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 T 15 14 120911 CASAVA_Build 6 127307939 2D CCTGTATGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 61 25 28 9 TG 7 6 120912 CASAVA_Build 6 127339702 3D ATATTTAATA CTG/--- CTATGTAAAC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 CTG 1 0 120913 CASAVA_Build 6 127353046 1D TGGATGAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 18 20 5 A 9 8 120914 CASAVA_Build 6 127373645 12I ATCCTAGAGA ------------/AAGACATAGAGT CAAGAAAGTA 3070 het 2468 hom 17 7 8 2 AAGACATAGAGT 0 1 120915 CASAVA_Build 6 127425430 1I TTCCAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 37 1 28 8 T 11 12 120916 CASAVA_Build 6 127431474 1I AGAAAAAAAA -/T ATATAAAAAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 0 1 120917 CASAVA_Build 6 127436633 1D CATCACCAAC A/- CTCAGAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 1 0 120918 CASAVA_Build 6 127437163 2I TATACATATC --/AT ATATATATAT 1001 het 17 hom 9 1 7 1 AT 6 7 120919 CASAVA_Build 6 127454446 1I ACATATGGAC -/A AAAAATGGAA 3070 het 3070 hom 56 22 29 5 A 5 6 120920 CASAVA_Build 6 127487401 1D AATTGCACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 T 11 10 120921 CASAVA_Build 6 127498765 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 36 2 16 18 A 17 16 120922 CASAVA_Build 6 127509138 1D TCATTATATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 A 10 9 120923 CASAVA_Build 6 127513002 2D AATATTCTTG GA/-- GATATATATA 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 GA 2 1 120924 CASAVA_Build 6 127520279 6I ACTTGACTTA ------/AACATT AACATTGAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 AACATT 1 2 120925 CASAVA_Build 6 127520984 6D TAGTAGAGGA CTTTAT/------ CTTTATATTT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 CTTTAT 2 1 120926 CASAVA_Build 6 127524224 3I TGCAGAAAAT ---/AAG AAGACTTTAT 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 AAG 1 2 120927 CASAVA_Build 6 127526545 2I AATTATTTAC --/AT GACATACTTA 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 AT 0 1 120928 CASAVA_Build 6 127532692 1I GCTTCTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 T 8 9 120929 CASAVA_Build 6 127534973 6I TGAAACTCTA ------/TACCTT TACACTGAAA 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 TACCTT 0 1 120930 CASAVA_Build 6 127535080 4D TACACAAACA CACT/---- CACACATACA 3070 het 1796 hom 22 8 10 5 CACT 1 0 120931 CASAVA_Build 6 127536937 2I ATTTCTAATA --/AC ATGTGTGTTT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 AC 0 1 120932 CASAVA_Build 6 127537474 7D ACTAGAATGG AACTAGT/------- CTTACTCTGT 3070 het 3070 ref 45 27 17 3 AACTAGT 1 0 120933 CASAVA_Build 6 127576519 1D TTTCATAGAG A/- AAAATCTCAT 3070 hom 36 het 16 0 13 4 A 5 4 120934 CASAVA_Build 6 127598483 1D TTGATATTAG T/- TTAATAGTAG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 3 2 120935 CASAVA_Build 6 127602660 2I AAAGACTCAA --/GG GGGGCCCCTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 G 4 6 120936 CASAVA_Build 6 127603318 1I20M4D GGCAATAGAT -TGGGTAAAATCTGGTCCCTATTAG/GTGGGTAAAATCTGGTCCCTA---- TTAATCTTGA 3070 hom 84 het 26 0 29 3 N/A 0 0 120937 CASAVA_Build 6 127614328 3I AAAATTCTTC ---/TTA TTTTTAGTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTA 0 1 120938 CASAVA_Build 6 127626143 2I ATTTAAAAAT --/AA GACTCATTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 0 2 120939 CASAVA_Build 6 127626502 2I AACTAGCCAC --/AT GAGTGGTTTC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 AT 0 1 120940 CASAVA_Build 6 127626582 1I TTAAGTAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 398 hom 39 1 33 5 A 9 10 120941 CASAVA_Build 6 127635908 2I ATGGCATGAC --/TT TTCTTGGCTT 3070 hom 135 het 48 0 44 4 T 2 4 120942 CASAVA_Build 6 127636424 1I ATATTTATTG -/A AAAAAACTGT 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 A 6 7 120943 CASAVA_Build 6 127637291 1D GGAATAAATT A/- GATTGGTTAC 3070 hom 78 het 30 0 27 5 A 1 0 120944 CASAVA_Build 6 127661164 1I GTGTACATGC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 411 hom 36 1 31 4 T 8 9 120945 CASAVA_Build 6 127661880 3I TGCCTGGCTA ---/TTT TTTTTTTTAT 3070 het 79 hom 22 1 12 9 T 8 11 120946 CASAVA_Build 6 127663835 3D AGGCTATATT ACC/--- ACATTTCTAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ACC 1 0 120947 CASAVA_Build 6 127666102 1D TTATAGAATA T/- TTAGCTTATA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 3 2 120948 CASAVA_Build 6 127670598 2I ACTAACAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 11 13 120949 CASAVA_Build 6 127674628 1D CCTGGACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 29 1 24 4 A 13 12 120950 CASAVA_Build 6 127674897 1D TACTACTGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 9 120951 CASAVA_Build 6 127688550 1I AGTTTCACTA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 7 8 120952 CASAVA_Build 6 127692212 2I CAAAATAATA --/TT TGTTTCTAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 3 120953 CASAVA_Build 6 127695688 1D GTAATGCAGT G/- GGCACTATCT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 G 3 2 120954 CASAVA_Build 6 127702613 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 25 1 18 6 A 15 13 120955 CASAVA_Build 6 127711124 1I ACCACTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 36 1 24 11 T 12 13 120956 CASAVA_Build 6 127712319 1I GATAGGGTGA -/C TGTGAGCAGC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 0 1 120957 CASAVA_Build 6 127714316 1I CCCACCCCCC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 8 9 120958 CASAVA_Build 6 127722073 2D GATCCAGCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 T 18 16 120959 CASAVA_Build 6 127722446 9D ATGTATTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTGACG 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 15 6 120960 CASAVA_Build 6 127725607 3D CTGCCAAAAT ATG/--- GTGTGAATGT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 ATG 1 0 120961 CASAVA_Build 6 127734247 1D TGATTCAATC T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 7 6 120962 CASAVA_Build 6 127749320 4D TTCTTGCAAG TTAT/---- TTAATTTATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTAT 1 0 120963 CASAVA_Build 6 127749478 3I AAGATTCAGT ---/AGA AGAAGAAAAT 3070 hom 93 het 41 0 32 9 AGA 2 3 120964 CASAVA_Build 6 127751571 1D AATTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 35 1 27 7 T 13 12 120965 CASAVA_Build 6 127756363 1D TAAATGCAGT G/- ACAGATACTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 1 0 120966 CASAVA_Build 6 127765744 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 AAAC 6 5 120967 CASAVA_Build 6 127776818 1D TTTTTCCAAA T/- TTCATTAGGT 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 T 3 2 120968 CASAVA_Build 6 127782334 1I AGGTGATGCA -/C CCGCCTTGGC 3070 hom 53 het 22 0 15 7 C 2 3 120969 CASAVA_Build 6 127788491 1I TGATAAAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 32 0 22 10 A 9 10 120970 CASAVA_Build 6 127791123 1D TTTCTTCCTT C/- CCGTGGGTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 6 C 3 2 120971 CASAVA_Build 6 127793665 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAGAAAAG 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 6 4 120972 CASAVA_Build 6 127799056 1D AACAAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 10 9 120973 CASAVA_Build 6 127802453 1D CTGTTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 451 hom 33 2 19 12 T 13 12 120974 CASAVA_Build 6 127803536 1I GTACTGTAAT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 7 8 120975 CASAVA_Build 6 127819623 2D ATAAAGTGGT GG/-- GGGGGGGGCA 3070 het 2867 hom 37 9 20 8 G 10 8 120976 CASAVA_Build 6 127834522 4D GGTTTTAAAG TGTT/---- TGTTATCTCT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 TGTT 2 1 120977 CASAVA_Build 6 127836994 1I AACTTATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 841 hom 40 3 24 13 A 12 13 120978 CASAVA_Build 6 127855157 1I TCTTCACCCC -/T GGGATTAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 0 1 120979 CASAVA_Build 6 127991552 6I CGCTCGCGCG ------/CGCGCA CGCGCACACA 1856 hom 43 het 20 0 13 7 CGCGCA 1 2 120980 CASAVA_Build 6 128019120 1I TAGCTACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 23 0 15 8 A 12 13 120981 CASAVA_Build 6 128019630 1D CTGATGCAAA T/- TTTTTTTTTT 2623 het 610 hom 22 3 14 5 T 15 14 120982 CASAVA_Build 6 128029257 5I ATTAAGTGTT -----/TACTC TATTTTCCAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TACTC 0 1 120983 CASAVA_Build 6 128043100 1D TAGTTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 13 12 120984 CASAVA_Build 6 128058946 1D CACTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 36 0 23 13 T 15 14 120985 CASAVA_Build 6 128061679 1I TGTATGGCTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 9 120986 CASAVA_Build 6 128061894 2D TATTTCTAGG AT/-- ATTCCTTCCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AT 2 1 120987 CASAVA_Build 6 128080661 1D TTAATTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 44 3 26 16 T 13 12 120988 CASAVA_Build 6 128122922 1I ATCGAATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 11 12 14 T 13 14 120989 CASAVA_Build 6 128141670 1D TCAAGTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2759 hom 34 11 12 11 T 17 16 120990 CASAVA_Build 6 128150878 1D CTGCACAGAC A/- AGAGTTGAGT 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 A 2 1 120991 CASAVA_Build 6 128161830 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1318 het 183 hom 10 2 4 4 A 17 18 120992 CASAVA_Build 6 128170024 1D GATGGTGAAA C/- CCCATCTCTA 3070 het 2187 hom 14 5 8 1 C 4 3 120993 CASAVA_Build 6 128187437 1I ACCAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2138 hom 27 8 17 2 A 10 11 120994 CASAVA_Build 6 128204559 1I AAAGCAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 9 10 120995 CASAVA_Build 6 128219913 1I AACTTTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 31 3 23 5 A 11 12 120996 CASAVA_Build 6 128234834 1I AGCACACATC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 7 8 120997 CASAVA_Build 6 128237508 2D TTCACATTAT AC/-- ACACACAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AC 4 3 120998 CASAVA_Build 6 128241289 2I ATCTATTTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 15 11 A 10 12 120999 CASAVA_Build 6 128248419 3I GAAGAAAGAA ---/AAG AAGGAAGAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 AAG 1 2 121000 CASAVA_Build 6 128261145 2I ATAGAGGGAC --/AT ACTACATTCT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 AT 0 1 121001 CASAVA_Build 6 128278027 1I58M3D TCCCCTTTGG -AAAAAAAACAAAATTGAAAACAGACATAGAAGCAAAATGATGACAGTATAGTATCATTTTG/AAAAAAAAACAAAATTGAAAACAGACATAGAAGCAAAATGATGACAGTATAGTATCATT--- TTGTTGTTTG 3070 hom 232 het 59 0 78 10 N/A 0 0 121002 CASAVA_Build 6 128284344 1I AGACTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1112 hom 38 3 23 12 T 11 12 121003 CASAVA_Build 6 128304581 1I ATAAGGCTTA -/G GTTACCTGTT 3070 het 3070 ref 50 30 19 1 G 1 2 121004 CASAVA_Build 6 128310542 1I GGACATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 43 1 32 10 A 11 12 121005 CASAVA_Build 6 128323831 1I ATTTGCTCTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 8 9 121006 CASAVA_Build 6 128327749 15I TCTAAATGCA ---------------/TGGACTTTGCCTATC TGTACGTTCT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 TGGACTTTGCCTATC 0 1 121007 CASAVA_Build 6 128328415 2D TAGTTTCAAC AT/-- AGTCTTAACA 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 AT 1 0 121008 CASAVA_Build 6 128343675 4D TTTCTGAAAA TAAT/---- TAAGATGAAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 TAAT 1 0 121009 CASAVA_Build 6 128346052 1I AAAATAAAAA -/C AAAGTCCACT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 0 1 121010 CASAVA_Build 6 128346787 3D GGAGGAGAGT AAC/--- AGTGTAAAGA 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 AAC 1 0 121011 CASAVA_Build 6 128348849 1I GCCTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 29 1 22 6 A 10 11 121012 CASAVA_Build 6 128350114 1I AAATAACAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 9 10 121013 CASAVA_Build 6 128352222 1I TATAATGCTA -/T TTTCAACTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 4 121014 CASAVA_Build 6 128352653 1D GAGATTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 589 hom 38 4 28 7 T 13 12 121015 CASAVA_Build 6 128353808 2I ATAACTCCTT --/AG GTCACAATTA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 AG 0 1 121016 CASAVA_Build 6 128363012 1I TTAGGGGAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 10 24 4 T 9 10 121017 CASAVA_Build 6 128371172 1D GCTTATAAAT A/- TTTTTTTTAA 3070 het 79 hom 39 3 31 5 A 1 0 121018 CASAVA_Build 6 128371187 1D TTTTAAAAGT C/- CTTCCAAATT 3070 het 147 hom 35 2 31 2 C 2 1 121019 CASAVA_Build 6 128377292 1I CTTCATCTAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 9 121020 CASAVA_Build 6 128382379 1D AAGCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 A 12 11 121021 CASAVA_Build 6 128406374 1D GACCAATATC A/- TACTATAAAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 0 121022 CASAVA_Build 6 128406482 2D TTGAAGGGGC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 10 8 121023 CASAVA_Build 6 128406644 1I AGAAGAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 9 10 121024 CASAVA_Build 6 128407487 1D GACAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 11 10 121025 CASAVA_Build 6 128425256 1I TCATATGTGG -/A AAAAATGCTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 5 6 121026 CASAVA_Build 6 128429348 1I TTAAACTCTT -/C TAAGATATAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 121027 CASAVA_Build 6 128438214 2D CCTTTGCTCC CT/-- GTTTTGTCTC 3070 hom 147 het 56 0 48 9 CT 1 0 121028 CASAVA_Build 6 128469363 1D AACTAACTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 10 9 121029 CASAVA_Build 6 128502726 1I ACTAGCAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 9 10 121030 CASAVA_Build 6 128546641 1D TTAATTTTCA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 114 het 45 0 39 7 T 8 7 121031 CASAVA_Build 6 128573207 1I ACTCCGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 A 12 13 121032 CASAVA_Build 6 128591498 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 14 13 121033 CASAVA_Build 6 128641628 1I AACTTACTAT -/A AAAAAATTCT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 6 7 121034 CASAVA_Build 6 128642051 1D AGGTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1216 hom 39 4 26 12 A 15 14 121035 CASAVA_Build 6 128677847 4D TGAAAGAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 AAAC 4 3 121036 CASAVA_Build 6 128679548 2D AAGCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1658 het 614 hom 26 4 9 13 T 20 18 121037 CASAVA_Build 6 128683451 2D TGGAGGCTGA CT/-- CTGTTGAATC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 CT 2 1 121038 CASAVA_Build 6 128694606 5I CCCCAAACTT -----/CAAAA CAAATTAACT 3070 hom 98 het 36 0 31 5 CAAAA 0 1 121039 CASAVA_Build 6 128694845 1I CAGGCAACAC -/A AAAAAAACTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 7 8 121040 CASAVA_Build 6 128696383 1I GTTTATTGCT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 8 9 121041 CASAVA_Build 6 128699030 1D CAACAGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 11 10 121042 CASAVA_Build 6 128701511 2I TATGCTTCCC --/CT CTCTGCAGAA 3070 hom 127 het 49 0 42 7 CT 2 3 121043 CASAVA_Build 6 128701720 3I CGTAAACAAA ---/AAC AACAAATACT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AAC 1 2 121044 CASAVA_Build 6 128711386 1I ATAAGTTTAC -/A AAAATTTTCT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 4 5 121045 CASAVA_Build 6 128715249 4D3M4D TCTGCAACTA CCTCTAGTTGC/----GAG---- AGATCACTGT 3070 hom 75 het 27 0 25 7 N/A 0 0 121046 CASAVA_Build 6 128725219 1D CACCAAGACT G/- GGGATTGCAA 3070 hom 78 het 34 0 26 9 G 4 3 121047 CASAVA_Build 6 128731978 27I GGAAAGAGGT ---------------------------/TATCCTGAAAGTACATTTATACACTGA TATTTCCCCA 3070 hom 78 het 30 0 25 7 TATCCTGAAAGTACATTTATACACTGA 0 1 121048 CASAVA_Build 6 128747224 1I AATATTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 561 hom 26 2 22 2 T 10 11 121049 CASAVA_Build 6 128753958 1D GAAAATATTA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 7 6 121050 CASAVA_Build 6 128755592 4D AAAAACAAAA AGAG/---- AGAAAGAAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 AG 3 1 121051 CASAVA_Build 6 128765092 2D TGTTTGTTTG TT/-- TTTGTTTTTG 1926 het 526 hom 34 3 15 16 T 5 3 121052 CASAVA_Build 6 128782295 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 1345 hom 10 het 5 0 4 1 A 9 8 121053 CASAVA_Build 6 128787785 1I CCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 10 11 121054 CASAVA_Build 6 128798839 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 1 0 121055 CASAVA_Build 6 128833237 2D TTAACCTCTA AT/-- GCGTTTTTTT 2468 het 2468 ref 29 18 9 4 AT 1 0 121056 CASAVA_Build 6 128843237 6I CCTAGGCTCA ------/TAAATT TAAAGTTATT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 TAAATT 0 1 121057 CASAVA_Build 6 128854563 2D TTTTTTTCTC TT/-- GTTACCTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 6 T 2 0 121058 CASAVA_Build 6 128878551 1D TGCACACACA C/- AGAATCCCTG 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 C 1 0 121059 CASAVA_Build 6 128878775 1I GCCAACACAC -/T TTTTTCTATA 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 5 6 121060 CASAVA_Build 6 128879340 1D AATCAAAACC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 A 8 7 121061 CASAVA_Build 6 128885636 1I22M2D TAACTAATGC -GACCAGTATGGATTGAAATCACTT/TGACCAGTATGGATTGAAATCAC-- GAGTAGAAAT 3070 het 3070 ref 43 25 22 4 N/A 0 0 121062 CASAVA_Build 6 128886110 1D GTTCTGGAGA G/- GGATGGTGGT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 G 3 2 121063 CASAVA_Build 6 128890182 1I TGAATTGATC -/A AAACATAGTT 3070 het 3070 hom 50 19 25 6 A 3 4 121064 CASAVA_Build 6 128891985 1I TGAAGACTTA -/T TTTTCATAAA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 T 4 5 121065 CASAVA_Build 6 128892368 4D CTGTCTCCAT AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 8 AATA 4 3 121066 CASAVA_Build 6 128902243 1I TATTTCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2471 hom 30 7 13 10 T 10 11 121067 CASAVA_Build 6 128916816 4D TAAAAACCTT AACA/---- AACAGTAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 18 6 AACA 2 1 121068 CASAVA_Build 6 128916931 1I CCTCTCTTCC -/T TTTTTTTTGA 3020 het 3020 ref 30 11 9 10 T 8 9 121069 CASAVA_Build 6 128917933 2I AATTCATCAC --/TG TGATTTCAAA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 TG 1 2 121070 CASAVA_Build 6 128919636 1D TTAGCAGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 A 10 9 121071 CASAVA_Build 6 128921884 1I TATCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 T 11 12 121072 CASAVA_Build 6 128926909 1I GGGAGGCTGA -/G GGGGGGTGGA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 G 6 7 121073 CASAVA_Build 6 128927346 1I GAATTATGGG -/A AAAAAGAAAC 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 5 6 121074 CASAVA_Build 6 128927883 10D ATTATATGAA GCAAAAGTCC/---------- GCAAAAGTCC 3070 het 3070 ref 38 20 12 8 GCAAAAGTCC 2 1 121075 CASAVA_Build 6 128930984 1I TAGGTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 2541 hom 28 het 14 0 10 4 T 11 12 121076 CASAVA_Build 6 128941730 2I GCTAGTTCGT --/TG TGTGTGTGTG 2406 het 2406 ref 45 22 12 11 TG 8 9 121077 CASAVA_Build 6 128954238 1I TTTCCATATA -/C TAACAGTGAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 C 0 1 121078 CASAVA_Build 6 128958360 1I ATATTCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 10 11 121079 CASAVA_Build 6 128964469 2I TCTGGCATCC --/AG AGTTTATTTC 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 AG 1 2 121080 CASAVA_Build 6 128965601 30I ACAGTGAGAA ------------------------------/GGTAGTCAGAGACCTCAGGACAAACCAAAC TTGTTGACAT 3070 het 3070 hom 27 12 16 1 GGTAGTCAGAGACCTCAGGACAAACCAAAC 0 1 121081 CASAVA_Build 6 128975281 1D ATCTTAGAAT G/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 G 1 0 121082 CASAVA_Build 6 128996522 1I GTCCTTTTTT -/C TTTTAGGCTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 0 1 121083 CASAVA_Build 6 129009364 4D TTAAAAAAAT AAAC/---- AAGTGCTGTA 3070 het 3070 hom 43 19 21 4 AAAC 1 0 121084 CASAVA_Build 6 129015556 1I TCCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 43 1 37 5 A 10 11 121085 CASAVA_Build 6 129042285 1I GGAATCAGGC -/A AAAAAAAAAA 1756 het 1756 ref 15 7 5 3 A 13 14 121086 CASAVA_Build 6 129042888 1D TAAGACATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 9 8 121087 CASAVA_Build 6 129057386 1D CCCATTAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 177 hom 29 2 15 13 A 17 16 121088 CASAVA_Build 6 129068112 3D CGTTCTCTTA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 87 het 35 0 30 8 AAC 4 3 121089 CASAVA_Build 6 129071017 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 7 121090 CASAVA_Build 6 129078154 1I TCTTAATTTA -/T TTTCTGATTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 3 4 121091 CASAVA_Build 6 129081110 2I AATCTCCCCC --/TA CTCTTAATGT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 TA 0 1 121092 CASAVA_Build 6 129081833 4I ATTGCAAATC ----/AATT GAAATTACAG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 AATT 0 1 121093 CASAVA_Build 6 129082538 2D GATTTTGTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 10 25 6 T 11 9 121094 CASAVA_Build 6 129084126 10D TTAAATTAAT ACAGTGCCTG/---------- ACATAGAGAT 3070 het 3070 ref 32 18 16 3 ACAGTGCCTG 1 0 121095 CASAVA_Build 6 129086039 9D ATATCTATCA TCTATCATC/--------- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 47 23 19 10 TCTATCATC 1 0 121096 CASAVA_Build 6 129091705 1I TACCTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 A 9 10 121097 CASAVA_Build 6 129098887 2I TGAGAAAAAC --/AT AGACTAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 AT 0 1 121098 CASAVA_Build 6 129102067 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2334 het 2334 ref 31 13 7 13 T 16 12 121099 CASAVA_Build 6 129103189 1D TATCTGCTGG T/- TATCATGGAG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 2 1 121100 CASAVA_Build 6 129105063 4D TTTTGTAGAC ACTT/---- ACCTGGATCA 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 ACTT 1 0 121101 CASAVA_Build 6 129108784 1D CCTCAGTAAA T/- ATTCTCAATT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 1 0 121102 CASAVA_Build 6 129110457 1I GAATGTTATA -/G AATTACAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 121103 CASAVA_Build 6 129117998 4I CTTTAATGAC ----/ACTT ACCATGTTCT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ACTT 0 1 121104 CASAVA_Build 6 129140713 1D TTATGAATCT G/- GGTGCTCCTG 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 G 3 2 121105 CASAVA_Build 6 129164979 2D GTAATATGAC AT/-- ATATAATATT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 AT 3 2 121106 CASAVA_Build 6 129182333 2D CTTATGAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 19 4 T 14 12 121107 CASAVA_Build 6 129183500 1I AATTCATAAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 8 121108 CASAVA_Build 6 129187312 1D ATCTAACTTA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 8 7 121109 CASAVA_Build 6 129198522 1I CAGACTTACC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 7 8 121110 CASAVA_Build 6 129237408 1I ACAGGTAAAT -/G GGGGGGACGT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 G 6 7 121111 CASAVA_Build 6 129255453 1D ATGTGGCGTG T/- TTGACACACA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 3 2 121112 CASAVA_Build 6 129256623 2D TGTTTACTAA TT/-- AATTTAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 2 0 121113 CASAVA_Build 6 129275164 1D GTAATGGATA T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 T 7 6 121114 CASAVA_Build 6 129280015 1D AGCCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 973 hom 30 3 21 6 A 14 13 121115 CASAVA_Build 6 129284083 4D TGATGACTAA AAGT/---- AAGGGTTGTT 3070 het 3070 hom 33 15 18 2 AAGT 1 0 121116 CASAVA_Build 6 129284545 11I GTTTTTTTTT -----------/TTATTTATTTA TTTTTTTATT 1304 het 1304 ref 11 5 4 2 TTATTTATTTA 0 1 121117 CASAVA_Build 6 129287384 1D ATATCCCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 9 13 5 A 10 9 121118 CASAVA_Build 6 129289099 1D GACTTCTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 9 8 121119 CASAVA_Build 6 129297326 12D TTTTTCTACA TTTTCTTTCTTT/------------ TTTTCTTTCT 2851 het 2851 ref 28 13 8 7 TTTTCTTTCTTT 2 1 121120 CASAVA_Build 6 129317895 1D GTTTCATGCA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 T 8 7 121121 CASAVA_Build 6 129320526 3D AGTGTTTCAC TGA/--- TGATCTTGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 TGA 2 1 121122 CASAVA_Build 6 129326367 4I TTCCACAGAG ----/TGCT TTGTTTACTG 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 TGCT 0 1 121123 CASAVA_Build 6 129329477 1I ATTCTTATTA -/T TTTGAGAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 4 121124 CASAVA_Build 6 129329862 10D AGTCCTCACA AACTTTACGC/---------- AAATTGTTAG 3070 het 3070 ref 45 23 21 1 AACTTTACGC 1 0 121125 CASAVA_Build 6 129339973 3I TTTCAGCCTC ---/TCT TCTTTTTTAT 3070 hom 96 het 43 0 31 12 TCT 1 2 121126 CASAVA_Build 6 129347494 1D ATTTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 494 hom 29 3 19 8 T 15 14 121127 CASAVA_Build 6 129380331 2D CATCTCTGTC AG/-- ATACGACAGG 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 AG 1 0 121128 CASAVA_Build 6 129387221 10D CTTTTCTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 979 hom 26 7 14 7 T 21 11 121129 CASAVA_Build 6 129389071 1D GTGTTTTGAC A/- AGATATAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 A 2 1 121130 CASAVA_Build 6 129391179 1I TCTTCAGTAC -/T TTTTTTGGGT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 6 7 121131 CASAVA_Build 6 129396734 2I CAGCTATGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 9 11 10 T 12 14 121132 CASAVA_Build 6 129406556 5D GTCATGAATA ATAGC/----- ACATTGTAGA 3070 het 3070 ref 45 27 18 3 ATAGC 1 0 121133 CASAVA_Build 6 129414391 1I CTCAAGTGAT -/C CACCCGCTTC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 2 121134 CASAVA_Build 6 129419736 1D GCCTGTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 16 1 10 5 T 15 14 121135 CASAVA_Build 6 129420766 1I ATTCGAAACA -/T TCTTCCCAGA 3070 het 3070 hom 49 19 28 2 T 1 2 121136 CASAVA_Build 6 129429451 8I CACAAAAGGT --------/GCTGAATA GCTAAAGCAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 GCTGAATA 0 1 121137 CASAVA_Build 6 129430093 4I TGAGTATACC ----/TTGT TTAAGTACAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTGT 0 1 121138 CASAVA_Build 6 129432689 4D ATACAATTAT ATTA/---- ATTATATGTA 2432 het 2432 ref 12 6 5 1 ATTA 2 1 121139 CASAVA_Build 6 129433402 3D TTCTGTTGTT GTC/--- ATGATATCCT 3070 het 3070 hom 49 19 28 3 GTC 1 0 121140 CASAVA_Build 6 129440971 1D AATCTCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 36 1 33 3 T 13 12 121141 CASAVA_Build 6 129442237 1I TAGGATGTAT -/C CCCCTGAGGA 3070 het 3070 hom 42 21 20 1 C 4 5 121142 CASAVA_Build 6 129445915 6D CTCCTCTGCT CACACA/------ CACACACACA 3070 het 1167 hom 30 9 13 8 CA 12 9 121143 CASAVA_Build 6 129447268 3D ATTTCTAAAA TGT/--- TGTTCATGTC 3070 hom 90 het 31 0 31 3 TGT 2 1 121144 CASAVA_Build 6 129467035 2D AGGGTCTTGC TA/-- TGTTGCCCAG 3070 het 3070 hom 29 12 15 4 TA 1 0 121145 CASAVA_Build 6 129470917 1D ATATCTAATA G/- GTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 G 2 1 121146 CASAVA_Build 6 129472362 1I TGAAGTCTTT -/A AAAATTGGCT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 4 5 121147 CASAVA_Build 6 129472449 1D GAAACTAGGG T/- TTTTAAATGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 5 4 121148 CASAVA_Build 6 129472948 2I ACCTTATTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 12 14 121149 CASAVA_Build 6 129473762 1I ATCAGTCTTA -/C ACAGGAAAGA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 C 0 1 121150 CASAVA_Build 6 129479499 2I ATGAATTAAC --/AG AGTTTCAGAG 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 AG 1 2 121151 CASAVA_Build 6 129483687 1D ATGTAGAAGT G/- GGCATTATAG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 G 3 2 121152 CASAVA_Build 6 129506161 1D ATTAATTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 11 10 121153 CASAVA_Build 6 129510795 1I TTTAAATCCT -/G GGATACTCGT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 G 2 3 121154 CASAVA_Build 6 129544183 1I CTGAAATAAA -/T TTTGTATTCA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 3 4 121155 CASAVA_Build 6 129548505 4D AAAAAATGAC TATA/---- TAGGCTCCAT 3070 het 3070 hom 42 18 19 7 TA 3 1 121156 CASAVA_Build 6 129552082 1D GGAATTTTTT A/- AAAAGCCTCA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 5 4 121157 CASAVA_Build 6 129568064 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAATA 2295 het 132 hom 8 1 6 1 A 8 9 121158 CASAVA_Build 6 129568232 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1699 hom 16 4 9 3 A 10 11 121159 CASAVA_Build 6 129571397 6D AGAGAAAGAA AGAAAG/------ AGAAAGAAAG 2175 het 2175 ref 18 9 6 4 AGAAAG 2 1 121160 CASAVA_Build 6 129571515 4D32M3D AAGAGAAAGA GAAGGAAAGAAAGAAAAAGGAAGGAAGGAAGGAAAAGGG/----GAAAGAAAGAAAAAGGAAGGAAGGAAGGAAAA--- AGGGAGGGAG 3070 het 3070 hom 20 9 11 9 N/A 0 0 121161 CASAVA_Build 6 129573241 2D CATGTGCACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 54 24 14 17 CA 9 8 121162 CASAVA_Build 6 129579651 2D ATGATCAGAA AC/-- ACATATTATA 3070 het 3070 ref 26 14 12 1 AC 2 1 121163 CASAVA_Build 6 129585188 1D GTACATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 11 10 121164 CASAVA_Build 6 129592497 1D CTGTGAAGTC T/- TGGACCACAG 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 T 2 1 121165 CASAVA_Build 6 129594571 4D TGATTAAAAT AGTG/---- AGCCTGAATT 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 AGTG 1 0 121166 CASAVA_Build 6 129636959 17D TTATAATGTC TTTTACATTTAAAACAA/----------------- TTTTACATTT 3070 hom 48 het 23 0 16 9 TTTTACATTTAAAACAA 3 2 121167 CASAVA_Build 6 129647082 1D TTGCCAATAC T/- GTTCCCTCTG 3070 hom 150 het 56 0 50 6 T 1 0 121168 CASAVA_Build 6 129649806 4I6M2I AAAGAAAGAA ----AGAAAC--/AGAGAGAAACAG AGAGAGGAAG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 N/A 0 0 121169 CASAVA_Build 6 129656528 20D AGGGAAGAAG AGGTCCCAGGCTGAGCTGCA/-------------------- GAAGAGTAGG 3070 hom 84 het 27 0 29 2 AGGTCCCAGGCTGAGCTGCA 1 0 121170 CASAVA_Build 6 129658122 8I TTGTAAAGGG --------/TTTAGAAT TTTAGAATTG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TTTAGAAT 1 2 121171 CASAVA_Build 6 129671122 2D TATGACTGAC TT/-- TTGCATTTTC 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 T 4 2 121172 CASAVA_Build 6 129674991 1D AAGTTGATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 12 11 121173 CASAVA_Build 6 129693440 1I GTTTTTGTTT -/G TTTTTTTTTT 706 het 346 hom 25 3 8 14 G 0 1 121174 CASAVA_Build 6 129701948 4I ATGATCACTC ----/TGAT TGCAGTGTGG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 TGAT 0 1 121175 CASAVA_Build 6 129717390 4D CTTTCAAGTC AAAT/---- AAATTATTAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 AAAT 2 1 121176 CASAVA_Build 6 129722124 1I TTTAATATAT -/A AAAAATATAT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 5 6 121177 CASAVA_Build 6 129744636 1I AATTATACAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 7 8 121178 CASAVA_Build 6 129760777 7D TCCGTCTCAG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1812 het 39 hom 12 1 9 4 A 25 18 121179 CASAVA_Build 6 129764680 3I TTTCCTAGTC ---/TAT TATTCCATTA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TAT 1 2 121180 CASAVA_Build 6 129766099 5D ATGAACTATC ATTTT/----- ATTTTATGTC 3070 hom 84 het 30 0 29 3 ATTTT 2 1 121181 CASAVA_Build 6 129767130 1I AGTAAAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 8 9 121182 CASAVA_Build 6 129773165 1D ATGCTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 29 0 23 6 A 12 11 121183 CASAVA_Build 6 129776832 4I AACAATTAAG ----/CAAA CAAAGAGAGA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CAAA 1 2 121184 CASAVA_Build 6 129779619 4I ATCCCACACC ----/AGGG TGCCAAGGGT 3070 hom 114 het 43 0 28 15 AGGG 0 1 121185 CASAVA_Build 6 129783294 1D TTTAAAATCA T/- TTTAAGTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 4 3 121186 CASAVA_Build 6 129789304 1D TTTGACACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 11 10 15 T 12 11 121187 CASAVA_Build 6 129796087 1D ATTGGAGGGA T/- TTTTTCTAAG 3070 hom 132 het 48 0 43 5 T 6 5 121188 CASAVA_Build 6 129824657 2D GTTTACAACT TC/-- TCCTGATGCT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 TC 2 1 121189 CASAVA_Build 6 129839645 4D TAACAACCAG CTGA/---- CTGACTGAAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 CTGA 3 2 121190 CASAVA_Build 6 129840842 5D CCTCAGGCTG GTCTT/----- GTCTTGAACT 3070 hom 85 het 33 0 28 9 GTCTT 2 1 121191 CASAVA_Build 6 129841093 4D17M1D ATCTTTTTCA AAATAAATAAACGTTTTCAGAT/----AAATAAACGTTTTCAGA- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 29 0 29 9 N/A 0 0 121192 CASAVA_Build 6 129843515 2D GAAATGTAAC TG/-- TTTTAATTTT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 TG 1 0 121193 CASAVA_Build 6 129851299 8D CACTATTGTA CCACTATG/-------- CCACTATGTC 3070 hom 108 het 38 0 37 4 CCACTATG 2 1 121194 CASAVA_Build 6 129851785 1D AACATCCTTT C/- ATCACAGATG 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 C 1 0 121195 CASAVA_Build 6 129852768 1D CTGAAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 33 1 26 6 A 12 11 121196 CASAVA_Build 6 129870831 5I GATTTTTTTC -----/TTCTT TTCAATTCCC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TTCTT 0 1 121197 CASAVA_Build 6 129871073 5D TCCTTTAATT TTTAA/----- TTTTTGTGGG 3070 hom 78 het 30 0 27 5 TTTAA 1 0 121198 CASAVA_Build 6 129874564 1I45M4I CTCAAAGATT -AAAAAAAAAATCAAAGAGTCAAATATGGAAAATCATAGAGGAAAG----/AAAAAAAAAAATCAAAGAGTCAAATATGGAAAATCATAGAGGAAAGAATT AATTAACTGG 3070 het 461 hom 30 2 41 5 N/A 0 0 121199 CASAVA_Build 6 129877786 4D ATACCAGAGG AATC/---- AATCATAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 AATC 2 1 121200 CASAVA_Build 6 129878465 4D CAAAAAGTTC TAAG/---- TAAGTCAGTA 3070 hom 117 het 43 0 40 5 TAAG 2 1 121201 CASAVA_Build 6 129878861 4I TTTAAGTTGA ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 TCTT 2 3 121202 CASAVA_Build 6 129879374 3D CAAGTCTATA AAT/--- AATATTAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 4 AAT 2 1 121203 CASAVA_Build 6 129879523 1I11M2I15M3I ATGGAGGCAA -TTTTTTTTAAC--TTATTCCTATCAATA---/TTTTTTTTTAACTTTTATTCCTATCAATACTT CTTCTTCTTT 3070 het 3070 hom 38 15 22 6 N/A 0 0 121204 CASAVA_Build 6 129880561 1I AGCATAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 T 14 15 121205 CASAVA_Build 6 129882064 4D TAGCATTAGG AGAT/---- AGATATACCT 2848 hom 15 het 8 0 6 2 AGAT 2 1 121206 CASAVA_Build 6 129884129 2D TATGAAAGGG AA/-- AAGTTTCTTC 3070 het 3070 ref 29 16 9 6 A 4 2 121207 CASAVA_Build 6 129887307 1I CTAAGGAGGG -/A AAAAAGCTTA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 5 6 121208 CASAVA_Build 6 129892446 1I TGCAAATATG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 A 7 8 121209 CASAVA_Build 6 129894623 1D ATGGAGGAAA C/- CTAAACGTAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 C 2 1 121210 CASAVA_Build 6 129915794 1I ATGGTCTTTA -/T TTTTTTTTTC 2010 het 2010 ref 22 13 5 4 T 9 10 121211 CASAVA_Build 6 129923173 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAAAAC 1834 het 1362 hom 13 4 6 3 A 10 9 121212 CASAVA_Build 6 129930099 1I CTTAAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 10 11 121213 CASAVA_Build 6 129931918 1D CTAGCTGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 23 1 13 9 T 12 11 121214 CASAVA_Build 6 129934516 3I TTCTTCTCAG ---/CAC CACATTGCAC 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 CAC 1 2 121215 CASAVA_Build 6 129937943 3I AAACTATATT ---/AAA AAAAAAAAAA 2828 het 2828 ref 23 11 9 3 A 13 16 121216 CASAVA_Build 6 129947999 1D TGTGGTGGTG C/- CCCACCTGTA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 4 3 121217 CASAVA_Build 6 129954939 1D AGTTCTAATA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 9 8 121218 CASAVA_Build 6 129957977 2I TAAATATTAC --/AT GAGACAATAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AT 0 1 121219 CASAVA_Build 6 129960569 1I ATAAGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 2915 het 2915 ref 34 17 11 6 A 11 12 121220 CASAVA_Build 6 129964470 1I AGAATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2318 het 2318 ref 26 10 9 7 T 14 15 121221 CASAVA_Build 6 129965334 1I GAATTTCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 9 10 121222 CASAVA_Build 6 129967041 1D AAATAGTACT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 1364 hom 27 6 13 8 C 10 9 121223 CASAVA_Build 6 129969704 1I CAATTTATTC -/T TTTTTTTTTT 2017 het 2017 ref 28 12 7 9 T 13 14 121224 CASAVA_Build 6 129984770 1I TCCTAAATCG -/T TAAGTTTTGT 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 T 1 2 121225 CASAVA_Build 6 129985555 3I TAAAGAAAAT ---/AAG AAGACTGGGC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 AAG 1 2 121226 CASAVA_Build 6 129989511 8D ACACACACAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 989 hom 31 6 13 18 AC 13 9 121227 CASAVA_Build 6 129990221 1I CTACATTGAC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 6 7 121228 CASAVA_Build 6 129994231 2I AAAGCAATGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 A 10 12 121229 CASAVA_Build 6 129994321 1I GGGTTGAAGA -/G GGGGTACTGC 3070 het 3070 hom 56 19 32 5 G 4 5 121230 CASAVA_Build 6 129994780 4I TATTACAGTG ----/AATT AATTAATTTG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 AATT 2 3 121231 CASAVA_Build 6 130002031 1D TTTTACAATG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 T 7 6 121232 CASAVA_Build 6 130036192 1D TAGTCATGCC A/- AAAAAAAAAA 1363 het 1363 ref 32 17 5 10 A 15 14 121233 CASAVA_Build 6 130045894 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2347 hom 28 10 13 5 T 13 12 121234 CASAVA_Build 6 130048441 4I CTGTATAAAG ----/GTTA GTTATTGTTA 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 GTTA 1 2 121235 CASAVA_Build 6 130048589 1D ACAAGGCAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 T 10 9 121236 CASAVA_Build 6 130050628 1D TAACCAAACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 672 hom 51 7 23 21 T 9 8 121237 CASAVA_Build 6 130051198 2I AAAAATGATG --/TT TAACATTATA 3070 het 3070 hom 33 8 18 7 T 1 3 121238 CASAVA_Build 6 130051631 1I ACTCCAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 12 13 121239 CASAVA_Build 6 130056608 1I ATTTCATGTA -/C CCTGAGTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 2 3 121240 CASAVA_Build 6 130056747 10D TTATACGAAC AGCTGACCAT/---------- GAAATGCCAG 3070 het 3070 hom 34 14 19 5 AGCTGACCAT 1 0 121241 CASAVA_Build 6 130059564 8D TAAGAGATAA ATGCACAT/-------- AGGATACGCA 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 ATGCACAT 1 0 121242 CASAVA_Build 6 130060281 1D GCAGATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 533 hom 41 3 20 18 T 15 14 121243 CASAVA_Build 6 130065842 1D TCTCCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 32 0 26 7 A 11 10 121244 CASAVA_Build 6 130066835 3D TATGATCAGG TAA/--- TAATACACTA 3070 hom 42 het 20 0 15 6 TAA 2 1 121245 CASAVA_Build 6 130074052 1D TCTCCCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 39 1 30 8 A 11 10 121246 CASAVA_Build 6 130074133 1D TGGTGATTGT A/- ACTCACTGCA 3070 het 3070 hom 33 8 21 4 A 2 1 121247 CASAVA_Build 6 130075093 1I CTCTACTAAA -/T TTTTTTTTTT 1340 het 1340 ref 19 8 4 7 T 15 16 121248 CASAVA_Build 6 130078591 1D TGACCCTAAA T/- TTTCTTTTGG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 T 4 3 121249 CASAVA_Build 6 130083511 3D GATTAATAAC AAT/--- AAACATAATA 3070 het 3070 ref 35 17 17 2 AAT 1 0 121250 CASAVA_Build 6 130083619 1I TATATTCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 A 11 12 121251 CASAVA_Build 6 130091099 4I TTGTCCCAGA ----/ATAT ATATACACAC 3070 het 3070 hom 51 25 22 4 AT 2 4 121252 CASAVA_Build 6 130093041 2I TGGAGTTTAC --/AG AGAGTTCTTC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 AG 2 3 121253 CASAVA_Build 6 130098608 1D TTATTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 26 0 22 4 T 11 10 121254 CASAVA_Build 6 130100283 1I CAGCGTTCTA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 57 het 27 0 21 6 T 6 7 121255 CASAVA_Build 6 130103999 1I TATTCATTGT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 6 7 121256 CASAVA_Build 6 130105892 1D TCAAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 13 12 121257 CASAVA_Build 6 130107728 1I CTTACAACTT -/A AGCTAACTTT 3070 het 3070 ref 48 32 8 8 A 1 2 121258 CASAVA_Build 6 130115352 1I GGGTTATTAT -/G GGGGGGGGGG 3070 hom 34 het 28 0 16 12 G 10 11 121259 CASAVA_Build 6 130116170 2D TGTCTCTCTG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 2555 hom 25 10 9 8 A 11 9 121260 CASAVA_Build 6 130116474 1D AGCCTGACCA T/- TTTTCCAGAC 3070 het 3070 hom 37 12 22 4 T 5 4 121261 CASAVA_Build 6 130121070 1I ATGAGCCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 42 0 31 11 A 10 11 121262 CASAVA_Build 6 130150185 1D TGGCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1878 het 1878 ref 36 26 4 6 T 12 11 121263 CASAVA_Build 6 130178720 1I GAATTTTTTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 8 9 121264 CASAVA_Build 6 130182412 1D CCCAGCCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 112 het 44 0 39 6 T 10 9 121265 CASAVA_Build 6 130185194 1I TCTTTTTGCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 242 hom 42 1 33 8 T 8 9 121266 CASAVA_Build 6 130197321 4I TAAATCTAAG ----/CAGA CAAACTCTAT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 CAGA 0 1 121267 CASAVA_Build 6 130206933 1I TGTAATGTTG -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 6 7 121268 CASAVA_Build 6 130225459 1D TATTTTTCTC T/- TTTGAGGAAC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 4 3 121269 CASAVA_Build 6 130239522 1I TTTAAAAAAA -/T AGAGGTCATA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 0 1 121270 CASAVA_Build 6 130244201 16D CAACCCCTGC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 2597 hom 27 het 18 0 9 11 T 30 14 121271 CASAVA_Build 6 130247357 1D TGTAAAAAAA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 T 7 6 121272 CASAVA_Build 6 130254602 1I GTGGCGGTTA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 33 0 18 15 G 1 2 121273 CASAVA_Build 6 130259285 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 27 2 18 7 TC 0 1 121274 CASAVA_Build 6 130267566 1I ATAATCTTAA -/T ATGTATATTA 3070 hom 100 het 38 0 34 4 T 0 1 121275 CASAVA_Build 6 130276486 2D ACTTCACCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 595 hom 29 5 15 9 A 18 16 121276 CASAVA_Build 6 130285663 3D CTAGAAATCT AGA/--- AGAAAAATGG 3070 het 3070 ref 34 21 11 5 AGA 2 1 121277 CASAVA_Build 6 130293803 1I ATTAATCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2593 hom 23 8 14 1 T 10 11 121278 CASAVA_Build 6 130295210 4D AGAAAGAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 2671 hom 21 het 14 0 9 5 AG 8 6 121279 CASAVA_Build 6 130303506 2I ACCTAGAGTC --/TG GGAGATTGAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 TG 0 1 121280 CASAVA_Build 6 130323299 1I GAGCCACCGC -/G GCTGGCCTTA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 G 1 2 121281 CASAVA_Build 6 130324019 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1508 hom 27 15 11 2 T 17 16 121282 CASAVA_Build 6 130327221 1D TCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2469 hom 31 10 13 8 A 12 11 121283 CASAVA_Build 6 130331439 1D TTGAAAGGAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 10 9 121284 CASAVA_Build 6 130350382 3I GCCAATACTG ---/GAA GAAGAAGAAT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 GAA 3 4 121285 CASAVA_Build 6 130353098 1I AAACAATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 104 het 41 0 35 6 A 9 10 121286 CASAVA_Build 6 130353614 1D CTGGGGGTTC A/- AAATTCTGTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 4 3 121287 CASAVA_Build 6 130361977 1I GATGCTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 30 1 25 4 T 10 11 121288 CASAVA_Build 6 130367149 4I TGTCTTATAA ----/CTGT CTGTTTATTG 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 CTGT 1 2 121289 CASAVA_Build 6 130369397 15I AAAAAAAAAG ---------------/CAGAATTTGTTGGAA CAAAATTAGA 3070 het 3070 ref 51 31 16 4 CAGAATTTGTTGGAA 0 1 121290 CASAVA_Build 6 130369943 2I CAATTTGATA --/AG AGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 20 9 AG 1 2 121291 CASAVA_Build 6 130377874 1I AATTAAAAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 8 9 121292 CASAVA_Build 6 130380415 4I ATTAGATGCA ----/AAAT AAATAGTCTA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 AAAT 1 2 121293 CASAVA_Build 6 130390912 1D TCTGTGTACC T/- TTTTTTTTTT 2097 het 2097 ref 52 31 6 15 T 15 14 121294 CASAVA_Build 6 130393719 1I AAAAGTAGTT -/A TGAGGGTCAA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 0 1 121295 CASAVA_Build 6 130402440 4I TTTTATAGTT ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 TA 6 8 121296 CASAVA_Build 6 130405296 3D ACCATAACAC TTT/--- TTAACTAAGA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 5 2 121297 CASAVA_Build 6 130409557 1I GCAAGTTTTT -/A TACATATTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 0 1 121298 CASAVA_Build 6 130412098 2I TAAATTTTGC --/CT CTTTCTGCTG 3070 het 3070 ref 54 29 20 5 CT 1 2 121299 CASAVA_Build 6 130412425 2D CTGTCTTCTT TG/-- TCCTAATGCC 3070 het 3070 ref 48 30 14 6 TG 1 0 121300 CASAVA_Build 6 130416028 2D ATAGTATCCT TC/-- TCTCAGGGTG 3070 het 3070 hom 45 18 25 4 TC 3 2 121301 CASAVA_Build 6 130425845 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTCG 2764 het 96 hom 27 2 14 12 T 9 8 121302 CASAVA_Build 6 130427906 4D CAGCTGTATG GAGA/---- GACTCTGTTC 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 GA 3 1 121303 CASAVA_Build 6 130431401 1D ATTAAAGTTT A/- AAATTAGCTT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 4 3 121304 CASAVA_Build 6 130444261 1I ATTAACTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2510 hom 39 10 13 16 T 14 15 121305 CASAVA_Build 6 130453036 2I TTTTAAGCAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 AT 7 8 121306 CASAVA_Build 6 130463485 1D ATCTATTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2559 hom 37 15 13 9 A 15 14 121307 CASAVA_Build 6 130470056 4D TATCTTCTTG ACTC/---- ACTCACTTTC 3070 hom 77 het 30 0 26 5 ACTC 2 1 121308 CASAVA_Build 6 130471519 3D TTTTATTTGG TAT/--- TTATTTATTT 225 het 225 ref 19 8 2 9 TAT 1 0 121309 CASAVA_Build 6 130475574 3I GAATCCACCT ---/GTA GGTATGCCGA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 GTA 0 1 121310 CASAVA_Build 6 130485615 3D GGTCTCAGCT CTA/--- CTACTTCCTA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 CTA 2 1 121311 CASAVA_Build 6 130489130 2D TGGGTGGCTC AT/-- GTGTGGAGAG 3070 het 3070 hom 30 11 17 4 AT 1 0 121312 CASAVA_Build 6 130492989 2I2M4D ATGCAGAGGC --AACCAC/TTAA---- AGACATAAGG 3070 het 3070 hom 48 21 25 4 N/A 0 0 121313 CASAVA_Build 6 130500453 1I TCTCTGGATG -/T TTTTTTTTTT 1269 het 1269 ref 37 28 4 5 T 11 12 121314 CASAVA_Build 6 130501607 1D AAAGGGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 18 20 12 T 11 10 121315 CASAVA_Build 6 130501938 1D GTGTAAAGAC T/- TAACTGTGGC 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 T 2 1 121316 CASAVA_Build 6 130511691 2I GGACAACAGA --/GT GAGACTTTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 GT 0 1 121317 CASAVA_Build 6 130514108 2I ATGTCTTTCC --/CT GTTACCAAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CT 0 1 121318 CASAVA_Build 6 130517074 1D ACTGAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 26 1 16 10 T 15 14 121319 CASAVA_Build 6 130520183 1I AGCTAACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 29 1 20 8 T 12 13 121320 CASAVA_Build 6 130525339 1D AATGGAATAA T/- TCTCTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 2 1 121321 CASAVA_Build 6 130532837 2D GAAAAGTAAC TT/-- ATGCATAATG 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 T 2 0 121322 CASAVA_Build 6 130545100 1D CCTTCGCTTT G/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 G 1 0 121323 CASAVA_Build 6 130551942 1D TAAAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1508 hom 43 11 19 13 A 15 14 121324 CASAVA_Build 6 130552975 1D CATAACTGGA C/- TAAAGATAAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 C 1 0 121325 CASAVA_Build 6 130553154 2I TGTAACGTAC --/AA AAAAAAAAAA 1499 het 1138 hom 37 3 9 25 A 10 12 121326 CASAVA_Build 6 130565744 1D GTCTTTGATG C/- CCCCCCTCCT 3070 het 3070 hom 39 19 15 5 C 7 6 121327 CASAVA_Build 6 130566107 1D CTCCTAAGCA T/- TTTTTTCATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 6 121328 CASAVA_Build 6 130578188 1D TGTGCCTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 10 9 121329 CASAVA_Build 6 130578935 1I AAGCGTAGGC -/A AAGTTTGCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 3 121330 CASAVA_Build 6 130582168 1D CAGGGATTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2229 hom 29 6 16 7 T 9 8 121331 CASAVA_Build 6 130599227 2I ATTGACTTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 1241 hom 34 8 19 7 TC 0 1 121332 CASAVA_Build 6 130616587 2I AAAATTATTA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 8 15 6 T 9 11 121333 CASAVA_Build 6 130617009 4D TTTTTGTATT TTTA/---- TTTATTTATT 1167 het 1167 ref 13 5 4 4 TTTA 5 4 121334 CASAVA_Build 6 130617494 1I GCCAGCCTGA -/T TTTTTCCTCC 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 5 6 121335 CASAVA_Build 6 130620054 3D GCAAGACAGA AAG/--- AAGGCCCTCA 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 AAG 2 1 121336 CASAVA_Build 6 130625423 1I CAGGTAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 A 11 12 121337 CASAVA_Build 6 130628609 1I GCCAAAACAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 8 9 121338 CASAVA_Build 6 130632553 1I ATTTTAAATG -/A TTTCTGTTCT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 0 1 121339 CASAVA_Build 6 130633835 1D TGTTTTTTTT G/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 G 1 0 121340 CASAVA_Build 6 130635902 2D GTATTGAAGT TC/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 TC 1 0 121341 CASAVA_Build 6 130636442 2I ATTTTATTGA --/TT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 8 10 121342 CASAVA_Build 6 130636793 4I AGTATTATTC ----/TGTT TGTTTATATA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 TGTT 1 2 121343 CASAVA_Build 6 130637479 2D AAAGTGAAAC TG/-- TTTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 48 22 20 7 TG 1 0 121344 CASAVA_Build 6 130642869 3I AAAAATAAAA ---/CTG AACCACTCAA 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 CTG 0 1 121345 CASAVA_Build 6 130643890 3D CTAAGAGATT AAC/--- AACAATAGCT 3070 het 3070 ref 38 26 9 3 AAC 2 1 121346 CASAVA_Build 6 130644727 1D CTCCTTGACT C/- CTTAACATTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 C 2 1 121347 CASAVA_Build 6 130644963 2I TCACACAAGC --/CA CACACACACA 3070 het 2855 hom 35 9 21 5 CA 5 6 121348 CASAVA_Build 6 130645207 1D TATATATTAT A/- TACATAGGCA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 A 1 0 121349 CASAVA_Build 6 130645913 1I AAGGCACTAC -/A AAAAAACGGC 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 A 6 7 121350 CASAVA_Build 6 130649528 1I TCCAAAATTA -/G ATTTATCCCT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 G 0 1 121351 CASAVA_Build 6 130651296 1I ATCACATCTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 8 9 121352 CASAVA_Build 6 130652335 1I AAAGAAAAAA -/T AAATATATAT 3070 het 3070 hom 23 10 9 5 T 0 1 121353 CASAVA_Build 6 130652807 1D CGTACTAGAG C/- TTTGATTTGG 3070 het 3070 ref 23 13 7 4 C 1 0 121354 CASAVA_Build 6 130657465 2D CAAGGATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 8 8 11 T 14 12 121355 CASAVA_Build 6 130677963 1I CACAGCAATA -/T TTTTTGGCTT 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 T 5 6 121356 CASAVA_Build 6 130682299 1I TGATGAAAAC -/A AATGCAAACT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 2 3 121357 CASAVA_Build 6 130684552 2I4M4I CCCAATAAAA --TAAG----/TGTCAGTTCC ATGAGAACAG 3070 het 2870 hom 20 7 12 2 N/A 0 0 121358 CASAVA_Build 6 130686283 2D AAATTTCCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 278 hom 24 2 11 12 T 14 12 121359 CASAVA_Build 6 130687611 1I TTGGAGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 T 13 14 121360 CASAVA_Build 6 130687899 4D GAAGAACTAT ATCC/---- ATCCATTCAT 3070 het 3045 hom 29 9 16 7 ATCC 2 1 121361 CASAVA_Build 6 130697250 1D TCCTTTCCTG A/- AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 26 10 13 4 A 7 6 121362 CASAVA_Build 6 130702731 7D CAATTTGAAT ATTCTCC/------- ATTCATTTCC 3070 het 3070 ref 52 28 19 7 ATTCTCC 1 0 121363 CASAVA_Build 6 130736870 4I AATTTACTTA ----/TAAG TGTTTCTGAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 TAAG 0 1 121364 CASAVA_Build 6 130761282 1D TGCATGTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 10 9 121365 CASAVA_Build 6 130762473 3D CTATTTTTAT TTC/--- TTCTTTTATT 1982 het 1982 ref 19 14 5 0 TTC 2 1 121366 CASAVA_Build 6 130763355 1D GCTCCTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 T 14 13 121367 CASAVA_Build 6 130764912 1I TGCCTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 12 14 A 12 13 121368 CASAVA_Build 6 130766382 3I TGAAAAATTT ---/ATA ATATTTGATA 1002 het 1002 ref 24 14 4 6 ATA 1 2 121369 CASAVA_Build 6 130767602 11I TGTCCTGAAT -----------/GGTATTGCCTA GGTTGTCTTC 2171 het 2171 ref 22 15 6 1 GGTATTGCCTA 0 1 121370 CASAVA_Build 6 130789239 3D CAGTCTCGCT TCA/--- TCATCTTTAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 TCA 2 1 121371 CASAVA_Build 6 130790377 3I ATCTTTTGAA ---/AGG AGAATTCATA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AGG 0 1 121372 CASAVA_Build 6 130797075 1D GGACAGCATG A/- AAAAACAATA 3070 het 3070 ref 42 21 13 9 A 6 5 121373 CASAVA_Build 6 130797893 2D ACTGGGAATG AA/-- AAAAAAAAAA 1994 het 1994 ref 30 10 5 15 A 14 12 121374 CASAVA_Build 6 130801828 1I CATTGTTAAC -/A AAAATCTCAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 4 5 121375 CASAVA_Build 6 130829245 5D ACCAAATCAG AAGAA/----- AATAAAGATC 3070 het 3070 ref 51 32 19 3 AAGAA 1 0 121376 CASAVA_Build 6 130861697 1I CAATGTGAGA -/G GTGCCATTTA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 1 2 121377 CASAVA_Build 6 130874238 1D GAAAAAAAAA G/- AAAAAGAAAT 2176 het 2176 ref 25 12 9 4 G 1 0 121378 CASAVA_Build 6 130884701 2D ACTACATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 898 het 328 hom 9 3 4 2 A 16 14 121379 CASAVA_Build 6 130893604 1D ACTCTGTCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 A 10 9 121380 CASAVA_Build 6 130911198 2I ATACATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 AT 5 6 121381 CASAVA_Build 6 130911624 1I AAGGTCAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 A 10 11 121382 CASAVA_Build 6 130918528 1D ATTATCCATG T/- GACCAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 1 0 121383 CASAVA_Build 6 130918801 1D TGAAACATAC A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 7 6 121384 CASAVA_Build 6 130918914 1D GCAGCAACTA C/- CCCATGCCTT 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 C 4 3 121385 CASAVA_Build 6 130930574 2I ATTATTTTTT --/AA AGAGTTCAAA 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 A 1 3 121386 CASAVA_Build 6 130932585 2D ACACGCAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 33 0 17 17 T 12 10 121387 CASAVA_Build 6 130935807 1D CTCCTATTAG A/- AAAAGTACGG 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 A 5 4 121388 CASAVA_Build 6 130945297 1D CGTAAAAAAA T/- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 1 0 121389 CASAVA_Build 6 130947299 1I AAATGGGGGG -/A ATTGTGACCT 3070 hom 114 het 42 0 36 6 A 1 2 121390 CASAVA_Build 6 130948444 3I ATATGCCTAG ---/ACT ACTATCCTAG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 ACT 1 2 121391 CASAVA_Build 6 130968763 42D ATCTCAGATA GGAAACGATAAATGATGGAAAGTCAGGAAATATAATAAATAG/------------------------------------------ GGAAACAAAA 3070 hom 123 het 38 0 42 1 GGAAACGATAAATGATGGAAAGTCAGGAAATATAATAAATAG 1 0 121392 CASAVA_Build 6 131006633 1I CCTTTTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 9 121393 CASAVA_Build 6 131142997 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1357 het 1357 ref 45 31 5 9 T 13 12 121394 CASAVA_Build 6 131153689 1I TGGTGTGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1170 hom 39 5 25 9 A 13 14 121395 CASAVA_Build 6 131153997 1D GGATGGCCCC T/- TTTTTTTTTT 2137 hom 14 het 20 0 8 12 T 17 16 121396 CASAVA_Build 6 131166766 1D TTATTGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 23 1 18 6 T 12 11 121397 CASAVA_Build 6 131184581 7D GCCAAGGCAG GAGACTT/------- GAGACTTGCT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 GAGACTT 2 1 121398 CASAVA_Build 6 131184683 1D TCTGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 2788 het 93 hom 13 1 7 8 A 15 14 121399 CASAVA_Build 6 131186341 2D GGCTAAAATT AA/-- AAAGAGTCAC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 5 3 121400 CASAVA_Build 6 131190897 2I GTATGCGCCC --/AT GTGTGTGCAC 3070 hom 155 het 62 0 50 12 AT 0 1 121401 CASAVA_Build 6 131205130 1D AGGCTGGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 104 het 41 0 35 7 A 9 8 121402 CASAVA_Build 6 131205860 1I ACTCTGAGTT -/A ATTAGATATT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 A 1 2 121403 CASAVA_Build 6 131208218 1D AACCTTATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 28 0 20 8 T 10 9 121404 CASAVA_Build 6 131210326 1I ATTTGTAACG -/T TAAGACTGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 121405 CASAVA_Build 6 131217499 1D GAGAAAAAAA C/- ATCCAGTGCT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 1 0 121406 CASAVA_Build 6 131217988 20D TTAAGACCAG CCTGGCCAACATGGCGAAAC/-------------------- CCTGTCTCTA 3070 hom 26 het 12 0 9 3 CCTGGCCAACATGGCGAAAC 1 0 121407 CASAVA_Build 6 131221430 2D TGTAACGATC AT/-- TTTAAGGTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AT 1 0 121408 CASAVA_Build 6 131227609 1I TACAAATTAC -/T TTTTGCTGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 4 5 121409 CASAVA_Build 6 131237198 1I TTATGCATAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 7 8 121410 CASAVA_Build 6 131240679 4I TTCATTACTA ----/CTAC CAATTTACCT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 CTAC 0 1 121411 CASAVA_Build 6 131242535 1D GATTTTAACC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 8 7 121412 CASAVA_Build 6 131253310 1D CTATGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1058 hom 27 4 12 11 A 15 14 121413 CASAVA_Build 6 131255149 3I CGAGAAATAG ---/ACT ACCACGATAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ACT 0 1 121414 CASAVA_Build 6 131255498 1I ATAGATATTA -/G TCAATTTAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 121415 CASAVA_Build 6 131260935 1D CCAGGGGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 24 1 15 9 A 13 12 121416 CASAVA_Build 6 131262626 4I CATGGAGGTA ----/TACC TACCTCCACT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TACC 1 2 121417 CASAVA_Build 6 131266510 1I ATCATCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1831 hom 43 4 34 5 A 11 12 121418 CASAVA_Build 6 131269184 1I ATGGTATACA -/T TTTTGGTACA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 4 5 121419 CASAVA_Build 6 131282341 8D CCATGTATCC CCACTGTA/-------- CCACTGTACC 3070 hom 135 het 54 0 45 10 CCACTGTA 2 1 121420 CASAVA_Build 6 131287218 1I CATGGAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 30 1 24 5 T 11 12 121421 CASAVA_Build 6 131293651 2D AAAACACAAA AT/-- ATATATGTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 8 AT 4 3 121422 CASAVA_Build 6 131295154 1I CATTGCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 38 1 30 7 A 13 14 121423 CASAVA_Build 6 131295494 1I AAGAGCATTA -/T TTCACATCTA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 T 2 3 121424 CASAVA_Build 6 131296398 5I TAAAAACCTA -----/TATAC TATATTATAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TATAC 0 1 121425 CASAVA_Build 6 131299418 4I CTAAGCCAAA ----/TAGT TAGTGATAAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TAGT 1 2 121426 CASAVA_Build 6 131316818 9D CAACAGCAAA AACTAAGAC/--------- AACTAAGACA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 AACTAAGAC 2 1 121427 CASAVA_Build 6 131325943 1I GAGGACCAGC -/T TCCTTGATCG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 121428 CASAVA_Build 6 131328478 3D AACAGTTATC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 31 3 20 10 A 17 14 121429 CASAVA_Build 6 131328862 1I14M1D GATGAGCTTT -AAAAAAAAAATTGCA/AAAAAAAAAAATTGC- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 38 0 38 4 N/A 0 0 121430 CASAVA_Build 6 131336106 1D GACACAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 20 0 16 5 T 13 12 121431 CASAVA_Build 6 131368012 1D TTTTACAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 49 2 28 19 T 15 14 121432 CASAVA_Build 6 131369472 2I CACTGAACCC --/CT GACTGGGTGA 3070 hom 50 het 23 0 16 7 CT 0 1 121433 CASAVA_Build 6 131376073 2D TTAACTAAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 33 0 31 4 A 11 9 121434 CASAVA_Build 6 131384497 1D TCCGTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 11 10 121435 CASAVA_Build 6 131390246 1I GCAAATAAGC -/T TCCTTTCCAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 121436 CASAVA_Build 6 131392728 1D GGATTTTTCT C/- TTTTTTTCTT 3070 hom 83 het 34 0 28 6 C 1 0 121437 CASAVA_Build 6 131392921 1I AGGACCCCGT -/G GCTCTATGCT 3070 hom 77 het 30 0 25 5 G 1 2 121438 CASAVA_Build 6 131403694 2D TACAGAAAAT AC/-- AGAGTTTAGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AC 1 0 121439 CASAVA_Build 6 131405504 1I GAAGAGGGGG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 100 het 44 0 38 6 A 7 8 121440 CASAVA_Build 6 131416075 1I CTGAAACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 25 1 21 3 A 10 11 121441 CASAVA_Build 6 131417164 10D CCTGTCTCTA TCTGTCCCTG/---------- TCTGTCCCTG 3070 hom 117 het 41 0 37 9 TCTGTCCCTG 2 1 121442 CASAVA_Build 6 131433531 3D GGGTTTTGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 64 het 33 0 22 11 TTG 7 6 121443 CASAVA_Build 6 131444010 1D AATCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2279 het 2279 ref 32 16 10 6 A 14 13 121444 CASAVA_Build 6 131456589 34D TCTTACTATC ATATATATATATATATATATATATGTGTATATAT/---------------------------------- ATATATATAT 3070 het 96 hom 15 1 13 5 ATATATATATATATATATATATATGTGTATATAT 1 0 121445 CASAVA_Build 6 131457498 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1418 hom 21 7 11 3 A 11 12 121446 CASAVA_Build 6 131471832 1D AATAACAGTT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 28 7 G 2 1 121447 CASAVA_Build 6 131478614 3I CTAATCCCAT ---/GCG GTGGAATCTT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 GCG 0 1 121448 CASAVA_Build 6 131479899 2I GCTCACAATG --/AA AAAAAAAAAA 2910 het 2910 ref 30 11 9 10 A 12 14 121449 CASAVA_Build 6 131483893 1D TTACCTACGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 10 9 121450 CASAVA_Build 6 131484309 4I ATATTTTCTT ----/TCTC TCTTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TC 1 3 121451 CASAVA_Build 6 131485826 1D GACAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 142 hom 43 1 40 2 A 12 11 121452 CASAVA_Build 6 131489879 1D TTTTGCTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 10 9 121453 CASAVA_Build 6 131491656 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 11 6 A 16 14 121454 CASAVA_Build 6 131517853 1D AAAGATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 43 0 29 15 T 12 11 121455 CASAVA_Build 6 131521921 7D GTTTATTTTA TTTTATT/------- TTTTATTTTT 3070 hom 45 het 23 0 16 8 TTTTATT 3 2 121456 CASAVA_Build 6 131523088 1D TTTAAAGTAC A/- ACTAAATGCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 2 1 121457 CASAVA_Build 6 131523830 1I TTTGGCCCAA -/T TTACGAGCCA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 2 3 121458 CASAVA_Build 6 131529787 1I GCAGATACTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 7 8 121459 CASAVA_Build 6 131533144 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 443 hom 11 1 10 1 A 10 9 121460 CASAVA_Build 6 131542002 1D GTCTATTCGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 10 9 121461 CASAVA_Build 6 131543882 1I AATTCTCCTG -/C CCTCAGCCTC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 C 2 3 121462 CASAVA_Build 6 131544959 1I AGTCCGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 10 11 121463 CASAVA_Build 6 131547144 1I TCGGGGAGCA -/G GGGGGGTGGC 3070 het 3070 ref 43 19 12 12 G 6 7 121464 CASAVA_Build 6 131549638 1D CCCATTAATG A/- AGGCAGACCT 3070 het 3070 ref 36 16 17 4 A 2 1 121465 CASAVA_Build 6 131551071 2I ATATTGAAAC --/AT ATAGTTCAAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AT 1 2 121466 CASAVA_Build 6 131552329 2D TCTTGCAAAA AG/-- GGTATATAAG 3070 het 3070 ref 37 21 11 6 AG 1 0 121467 CASAVA_Build 6 131553479 1D TTCTGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 1507 het 1507 ref 34 22 5 7 A 12 11 121468 CASAVA_Build 6 131581287 1D GTTGGCAAGG A/- AAAACTAAAC 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 A 5 4 121469 CASAVA_Build 6 131595803 2I TGCTTTCCTT --/AA ATTGGCGTGT 2179 het 2179 ref 13 6 5 2 A 1 3 121470 CASAVA_Build 6 131608246 1D CCCAGCTACG T/- TTTTTTTTTT 1012 het 950 hom 13 4 5 4 T 11 10 121471 CASAVA_Build 6 131609796 1I CTTATTGTCA -/C ATACTCTCCA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 C 0 1 121472 CASAVA_Build 6 131614402 1I AGGGACTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 A 10 11 121473 CASAVA_Build 6 131622783 1I TACTCTCTTG -/C CCCCTCATCC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 4 5 121474 CASAVA_Build 6 131629898 1I TCACTCATCC -/A AAAAAGCATT 3070 het 2859 hom 33 8 21 4 A 5 6 121475 CASAVA_Build 6 131658923 1I AGGAGACACG -/T TTTTATCCGT 2447 het 2447 ref 22 9 8 5 T 4 5 121476 CASAVA_Build 6 131662025 1D CCAAAATCTA T/- TTTCTTCCTC 2791 het 2148 hom 11 5 6 0 T 4 3 121477 CASAVA_Build 6 131668833 2I CAGCTCTCCT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 57 21 20 16 AC 8 9 121478 CASAVA_Build 6 131707927 4I GATGAAAGAA ----/ATAG ATAGTTGTGG 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 ATAG 1 2 121479 CASAVA_Build 6 131718759 1I ATAAGATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 10 11 121480 CASAVA_Build 6 131720464 1D CCCTGGGTAC T/- TTTTACTTTC 3070 het 3070 hom 25 13 12 0 T 5 4 121481 CASAVA_Build 6 131721985 1I AAGTATATAT -/A GGATATATAA 1917 het 1917 ref 8 4 4 0 A 0 1 121482 CASAVA_Build 6 131723780 1D AAGATGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 T 11 10 121483 CASAVA_Build 6 131732139 2I ACACAAAAGC --/AT CCCTGTGAGA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AT 0 1 121484 CASAVA_Build 6 131738465 1I TTTCTGGTAA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 7 8 121485 CASAVA_Build 6 131746944 2I CAAGGACGCT --/CC CCCATTCAGC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 C 3 5 121486 CASAVA_Build 6 131749854 3D GCGTGGTGGC CTG/--- CTAACACGTG 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 CTG 1 0 121487 CASAVA_Build 6 131750944 1D CCTTCCCCTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 2019 hom 19 6 11 2 A 8 7 121488 CASAVA_Build 6 131756820 1D TTCTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 11 10 121489 CASAVA_Build 6 131780137 1D CATGGCTTAT C/- TTATTCTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 C 1 0 121490 CASAVA_Build 6 131808789 3I AATGGTAAAA ---/AAT AATATGAGTA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 AAT 1 2 121491 CASAVA_Build 6 131823504 1I TTTTATTTGC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 8 121492 CASAVA_Build 6 131824704 7D AGGATTGTTG TTTTTTT/------- TCCCTCAATT 3070 hom 105 het 37 0 36 4 T 8 1 121493 CASAVA_Build 6 131832895 3D TAAGCTAAAT ATG/--- ATGATAGAAC 3070 het 3070 hom 42 15 24 6 ATG 2 1 121494 CASAVA_Build 6 131835570 1I ATTTAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 11 121495 CASAVA_Build 6 131843231 1I TTTGGCAACA -/T CTTTTTTGAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 0 1 121496 CASAVA_Build 6 131844438 1D CCCTTCCCCC T/- ATCCTTCTTA 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 T 1 0 121497 CASAVA_Build 6 131845994 3D TCTATTTTGA GTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 GTT 1 0 121498 CASAVA_Build 6 131849897 3D CAAACTGCAC AAG/--- AAGCATGACA 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 AAG 2 1 121499 CASAVA_Build 6 131850512 1D GAACAAGTGA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 8 7 121500 CASAVA_Build 6 131852676 4D TCTTGCATGA ACTC/---- ACTCACTATC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 ACTC 2 1 121501 CASAVA_Build 6 131853595 3I AAAAACTCTT ---/CAA CAACAAGGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CAA 2 3 121502 CASAVA_Build 6 131857131 1D GTCTGATAAT A/- AAGGAGATTA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 3 2 121503 CASAVA_Build 6 131865991 2D AATACATATC TT/-- GTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 9 T 2 0 121504 CASAVA_Build 6 131867357 1I AGGCAGGAGT -/G GGGGGTCACA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 G 5 6 121505 CASAVA_Build 6 131870371 2I GGATCGGGCA --/GT GTCAGTCTTC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 GT 1 2 121506 CASAVA_Build 6 131872868 1D21M2D TTATTGGTAC TCAAACTTGTTAGTAAAAGGTCTA/-CAAACTTGTTAGTAAAAGGTC-- TACTTTTGTT 3070 het 3070 ref 37 20 16 5 N/A 0 0 121507 CASAVA_Build 6 131875657 19I GAAGCCTGCT -------------------/ATCTGGAGGCTTCATCTGC ATGATGAAAC 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 ATCTGGAGGCTTCATCTGC 0 1 121508 CASAVA_Build 6 131882208 1I TAACACTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 19 10 T 11 12 121509 CASAVA_Build 6 131899115 1I TGGGATAACA -/G GCATGAGCCA 3070 hom 60 het 27 0 24 3 G 1 2 121510 CASAVA_Build 6 131899253 1I CATTTTACTA -/T TATCAGTTGC 3070 hom 60 het 30 0 21 9 T 1 2 121511 CASAVA_Build 6 131904572 1I ATAGACACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 9 10 121512 CASAVA_Build 6 131927560 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 1351 het 1351 ref 23 12 5 6 T 13 14 121513 CASAVA_Build 6 131946398 1I CCTTGACCTG -/A AAACCAAGTC 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 3 4 121514 CASAVA_Build 6 131949233 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1070 het 1070 ref 17 11 3 3 A 15 14 121515 CASAVA_Build 6 131988806 1I ATACAAAAAA -/T TGAGCCGGGC 1667 het 1667 ref 15 8 5 2 T 1 2 121516 CASAVA_Build 6 132026527 1D TTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1928 het 1928 ref 47 32 5 10 A 15 14 121517 CASAVA_Build 6 132080503 3D AATTTATTCA AAT/--- AATAAAGCTA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 AAT 2 1 121518 CASAVA_Build 6 132102742 1I CATCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 A 11 12 121519 CASAVA_Build 6 132102775 2D TTAGAAGTAA AT/-- ATATATATAT 2228 het 2228 ref 32 18 5 10 AT 7 6 121520 CASAVA_Build 6 132105536 1D CTTACAGGCT A/- TAAGTTCCAG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 A 1 0 121521 CASAVA_Build 6 132106122 8D TATGAGAAAT AGTATAAA/-------- ACAGAACTTA 3070 hom 123 het 43 0 42 2 AGTATAAA 1 0 121522 CASAVA_Build 6 132128560 1I CCAGGCTGAG -/C CTGCGGCCCT 3070 hom 75 het 31 0 23 8 C 1 2 121523 CASAVA_Build 6 132131414 2D AAACAAAAAT AA/-- AACAACAACA 43 het 43 ref 10 1 1 9 A 4 2 121524 CASAVA_Build 6 132131486 17I TCTTCCTGCT -----------------/CCAGCAATGTGAAGTGC CTGCTCCCAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 CCAGCAATGTGAAGTGC 0 1 121525 CASAVA_Build 6 132143591 1I TGCCCAGCGA -/G AACCACCAGT 3070 hom 48 het 22 0 16 6 G 0 1 121526 CASAVA_Build 6 132155627 4I GTTAATTAAT ----/TAAA TATATTAATA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 TAAA 0 1 121527 CASAVA_Build 6 132156331 1D TATGTCTTTT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 59 het 32 0 26 6 A 9 8 121528 CASAVA_Build 6 132157185 2D TGGGTGAATG AC/-- ACTTGAGCCC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AC 2 1 121529 CASAVA_Build 6 132222436 15I CGGACCTAGG ---------------/GGGACTGAACAAAGT GGCGGATGGG 2707 hom 21 het 9 0 8 1 GGGACTGAACAAAGT 0 1 121530 CASAVA_Build 6 132251069 1I CTACATTTCC -/T TTTTTTTTTT 1953 het 1953 ref 49 24 7 18 T 15 16 121531 CASAVA_Build 6 132287468 1D TGTCTCAACC A/- AAAAAAAAAA 1214 het 1214 ref 34 20 4 10 A 17 16 121532 CASAVA_Build 6 132312422 1D AAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 17 16 11 A 11 10 121533 CASAVA_Build 6 132316609 2I ATTTTCTTGA --/TT TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 8 10 121534 CASAVA_Build 6 132316886 5I TTGAAGGAGT -----/TAAAA TAAAAGACTA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 TAAAA 1 2 121535 CASAVA_Build 6 132319923 4D TGCAAATGAT AAAG/---- AAACAACCAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AAAG 1 0 121536 CASAVA_Build 6 132322863 1D TCAGGAGAGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 8 7 121537 CASAVA_Build 6 132323231 8D GTATTATGCA GATTACAC/-------- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 GATTACAC 1 0 121538 CASAVA_Build 6 132324605 1I TTAAAAGTGT -/C CCCCCTTTGT 3070 hom 120 het 42 0 40 2 C 5 6 121539 CASAVA_Build 6 132331306 1I ATTGTATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 10 11 121540 CASAVA_Build 6 132342102 1D TGTGTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 1928 het 1928 ref 19 9 5 5 T 11 10 121541 CASAVA_Build 6 132349488 1I AGGAAGTAAC -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 T 6 7 121542 CASAVA_Build 6 132356868 1I CGTAATAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 9 10 121543 CASAVA_Build 6 132362646 1D AAAAAAAAAA G/- CACAGGAGTC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 1 0 121544 CASAVA_Build 6 132364145 4D CTGTTACAGA TTTT/---- TTAAGAGACT 3070 het 3070 ref 37 18 16 5 T 6 2 121545 CASAVA_Build 6 132364952 6D ACCCTCTTTT GGGGTC/------ GGGGTCTGGA 3070 hom 78 het 27 0 27 2 GGGGTC 2 1 121546 CASAVA_Build 6 132375525 1D AGAGTTGGCC A/- AAAAAAAAAA 1616 het 1616 ref 31 19 4 8 A 13 12 121547 CASAVA_Build 6 132378389 5I AGAAATGGAA -----/TTTTG TTTGGTATTG 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 TTTTG 0 1 121548 CASAVA_Build 6 132378704 52D ATATGTATAC ATATATACACACATATATGTGTGTATATATACACACATATATATGTGTGTGT/---------------------------------------------------- ATATATACAC 3070 het 3070 ref 35 31 14 5 ATATATACACACATATATGTGTGTATATATACACACATATATATGTGTGTGT 1 0 121549 CASAVA_Build 6 132379303 1I CATTTGGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 11 12 121550 CASAVA_Build 6 132380533 3D AATTTTTTGA TTC/--- TTATGAATTT 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 TTC 1 0 121551 CASAVA_Build 6 132394792 1I TTAAAAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 11 121552 CASAVA_Build 6 132398483 1D CTCCATCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 992 hom 13 3 7 3 A 13 12 121553 CASAVA_Build 6 132401126 1I AAATATAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 13 10 2 A 9 10 121554 CASAVA_Build 6 132409882 1D CCCAAACATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 92 het 37 0 30 7 T 10 9 121555 CASAVA_Build 6 132412662 4I AGATGATCTC ----/AAAT AAAAATTTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AAAT 0 1 121556 CASAVA_Build 6 132416275 4I ATGTTCCAGT ----/GTCC GTCCAACCAA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 GTCC 1 2 121557 CASAVA_Build 6 132416857 1D TGAAATATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 33 0 21 12 T 13 12 121558 CASAVA_Build 6 132419168 1I AATTTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 36 1 28 7 A 11 12 121559 CASAVA_Build 6 132423291 1I TGTTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 34 0 28 6 T 12 13 121560 CASAVA_Build 6 132428274 1D ACAATTTTTG C/- CCTTGTCATT 3070 hom 101 het 39 0 33 7 C 3 2 121561 CASAVA_Build 6 132431425 1I GGCTAGGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 9 10 121562 CASAVA_Build 6 132474285 13I AATGCTGTTG -------------/GTACTAACAGTTA GTACATATTT 3070 hom 120 het 51 0 40 11 GTACTAACAGTTA 0 1 121563 CASAVA_Build 6 132508289 2I TATCAGACTT --/GA GAGTGTAATT 3070 het 3070 hom 61 28 27 6 GA 1 2 121564 CASAVA_Build 6 132556790 1D AACAAAATAC A/- AACCACAATA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 3 2 121565 CASAVA_Build 6 132563738 1I TCTATACCCC -/T ATCCACGCTA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 0 1 121566 CASAVA_Build 6 132564484 1I TCAAGTTTGA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 6 7 121567 CASAVA_Build 6 132569549 1I GGTCTGGGTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 8 9 121568 CASAVA_Build 6 132576824 1D ATTCTCCCAC A/- AAAAATGATA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 6 5 121569 CASAVA_Build 6 132578038 1I TATGAATTTT -/A ATGATTGACT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 1 2 121570 CASAVA_Build 6 132582161 1D CCAGATTAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 9 8 121571 CASAVA_Build 6 132588259 1I AGGAAAAAAT -/G GTTTCATGGG 2667 het 2667 ref 31 10 10 11 G 1 2 121572 CASAVA_Build 6 132595584 15D4M5D CTATGTCTAC CAGTAGTAGTAGTAGTAGACATAG/---------------TGGA----- TAACTTATTC 3070 het 3070 ref 34 27 12 2 N/A 0 0 121573 CASAVA_Build 6 132624008 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1593 het 478 hom 20 4 7 9 T 12 13 121574 CASAVA_Build 6 132630476 2D AGACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2298 het 2298 ref 16 9 5 2 A 12 10 121575 CASAVA_Build 6 132665312 1I ACTAAAACTT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 7 8 121576 CASAVA_Build 6 132665927 1I TTTCAGGGGG -/A AAAACAAGAG 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 4 5 121577 CASAVA_Build 6 132674564 2I AATCTTGTAA --/GG CAGTATTTAA 3070 het 3070 ref 51 29 20 2 G 0 2 121578 CASAVA_Build 6 132675431 1D GGTTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 11 10 121579 CASAVA_Build 6 132675897 5D TTTTTGTTGT TTTAA/----- TTTGTTTACA 3070 het 3070 hom 38 15 19 7 TTTAA 1 0 121580 CASAVA_Build 6 132679007 1I TGCATACGAC -/A GGGGAGAAAG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 0 1 121581 CASAVA_Build 6 132684096 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 11 12 121582 CASAVA_Build 6 132704838 1D ACAAATCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2151 hom 25 6 14 5 T 11 10 121583 CASAVA_Build 6 132710509 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1150 hom 31 3 26 2 A 12 13 121584 CASAVA_Build 6 132720392 1D TATACCATAT A/- AAAATCTAGT 3070 het 3070 hom 36 16 20 1 A 5 4 121585 CASAVA_Build 6 132723413 4D GGACTGTGCC CAAA/---- CAATCACTGC 3070 het 3070 hom 46 17 23 7 CAAA 1 0 121586 CASAVA_Build 6 132726055 2D AATAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 12 10 121587 CASAVA_Build 6 132726739 4D TAAAGTGCTG TTAA/---- TTAAATTATT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 TTAA 2 1 121588 CASAVA_Build 6 132727959 3I AAAAAGTGAG ---/TGT TGTTGTATAG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 TGT 2 3 121589 CASAVA_Build 6 132729334 1I CCATCGGGGG -/A AAAAACTGCA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 5 6 121590 CASAVA_Build 6 132737311 1D7M2D AGTAAAAAAG AAAAAACTAA/-AAAAACT-- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 27 14 14 5 N/A 0 0 121591 CASAVA_Build 6 132747513 2I GTTTCCAGGA --/AG AGAGATTAGC 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 AG 2 3 121592 CASAVA_Build 6 132757464 1I AAAAAAAGAG -/A ACCAAACAGA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 1 2 121593 CASAVA_Build 6 132807299 1I GGATGGGCAT -/G GGGGGGCAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 G 6 7 121594 CASAVA_Build 6 132817057 1D TATTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 1386 het 1386 ref 36 25 3 8 A 13 12 121595 CASAVA_Build 6 132831548 1I CCAAGTGAGC -/T GAGGCAGGAT 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 T 0 1 121596 CASAVA_Build 6 132838615 12I AAAGATGAAA ------------/ACTTTGTTTTCC ATAGAAAATA 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 ACTTTGTTTTCC 0 1 121597 CASAVA_Build 6 132844396 2D CTCCTTGTCA CT/-- CTGAAACAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 6 CT 2 1 121598 CASAVA_Build 6 132853953 1I ATTGAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 2578 het 2578 ref 22 10 8 4 A 9 10 121599 CASAVA_Build 6 132861297 4I TTTATAAGTG ----/TTTA TTTATTTCAT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 TTTA 1 2 121600 CASAVA_Build 6 132865456 2D ATTTGGCCGG GC/-- GCGGTGGCTC 3070 het 3051 hom 19 8 9 2 GC 2 1 121601 CASAVA_Build 6 132875116 1I CAAACAAATG -/T TAAGAAATTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 1 2 121602 CASAVA_Build 6 132888917 1I CCTCCCCAGA -/G GGGGAAACTT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 G 4 5 121603 CASAVA_Build 6 132895502 1I GCATGAAAAT -/G GACTAATACA 3070 het 3070 hom 23 12 11 0 G 1 2 121604 CASAVA_Build 6 132898006 1I CACATACTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 9 16 9 T 9 10 121605 CASAVA_Build 6 132899488 3I AGTGGACCTT ---/ATC AGGAGACCTG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 ATC 0 1 121606 CASAVA_Build 6 132908008 13D ACATCATTTG AGATATCATATCA/------------- AGATATCATA 3070 het 3070 hom 77 33 34 18 AGATATCATATCA 2 1 121607 CASAVA_Build 6 132918803 1D CTTAAGATGC A/- AAATGTACTC 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 A 4 3 121608 CASAVA_Build 6 132922884 5D TAAGCATCTT GTCTC/----- ATATCATTTA 3070 het 3070 ref 44 22 19 5 GTCTC 1 0 121609 CASAVA_Build 6 132925282 1I GAAGGCAATA -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 6 7 121610 CASAVA_Build 6 132927698 5D TTATACTTAT TAAAA/----- TAATATATAT 1759 het 994 hom 6 2 4 1 TAAAA 1 0 121611 CASAVA_Build 6 132935417 1I AACTTTATCG -/A GGAATATTCT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 0 1 121612 CASAVA_Build 6 132936797 5D GATTCAACAA TGTTT/----- TGGAACTGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 7 TGTTT 1 0 121613 CASAVA_Build 6 132942153 1I TCTATGAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 8 9 121614 CASAVA_Build 6 132960142 1D CCACATATAT G/- TTTAAAATTA 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 G 1 0 121615 CASAVA_Build 6 132963119 1D ACAATAATGT A/- AAACATTTAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 4 3 121616 CASAVA_Build 6 132965680 1I GCTATGGATT -/A AAAAAAAAAA 2863 het 2863 ref 24 11 7 6 A 10 11 121617 CASAVA_Build 6 132968798 1I CAACATGTAT -/G TAGCTGGAAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 G 0 1 121618 CASAVA_Build 6 132983736 1I AGACAGAAAG -/A AAAAAAGAAG 3070 het 295 hom 29 1 25 4 A 6 7 121619 CASAVA_Build 6 132983989 1D AAGTAAAGCT A/- AAAAAAAAAA 1004 het 1004 ref 36 30 3 4 A 13 12 121620 CASAVA_Build 6 132984449 1I TCATCTTGCA -/C CCCACTCTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 3 4 121621 CASAVA_Build 6 132986539 1I TCTGAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1175 hom 38 4 29 5 A 14 15 121622 CASAVA_Build 6 132988759 1I TATCGTTTTT -/G CTATTTATTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 G 0 1 121623 CASAVA_Build 6 132993536 1D CCATTTTGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 17 16 121624 CASAVA_Build 6 132997082 1I ATTTGTTAGG -/A AAGGAGGATA 3070 hom 154 het 52 0 52 0 A 2 3 121625 CASAVA_Build 6 133003290 1I ATTTCCAAGA -/G AAAAAAAAAC 2523 hom 18 het 10 0 7 3 G 0 1 121626 CASAVA_Build 6 133005782 5D AAAGTAAATG TAAGA/----- TAAGACAAAG 3070 hom 126 het 44 0 43 3 TAAGA 2 1 121627 CASAVA_Build 6 133022566 1D TTCAAACTAC T/- TTTGAACCAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 4 3 121628 CASAVA_Build 6 133024593 1I TAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 11 12 121629 CASAVA_Build 6 133066198 2I AGACATAGAC --/AT AGTATAAGAT 1044 het 217 hom 29 1 5 23 AT 0 1 121630 CASAVA_Build 6 133068026 1D TATTATACTA T/- ACCAAAACCA 3070 hom 69 het 32 0 23 10 T 1 0 121631 CASAVA_Build 6 133082230 3D GCTAATTTGC TGT/--- TGTTGTTATT 3070 het 3070 hom 25 10 11 9 TGT 3 2 121632 CASAVA_Build 6 133095531 1D ATTTATAAAC A/- AAATTTCTAA 3070 het 3070 hom 31 11 20 2 A 4 3 121633 CASAVA_Build 6 133096791 4I TAATAGAGGG ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 55 36 13 6 GA 6 8 121634 CASAVA_Build 6 133101014 1I TTTCTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 14 13 13 A 10 11 121635 CASAVA_Build 6 133105940 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 24 1 21 4 A 13 12 121636 CASAVA_Build 6 133109378 1I GTTATTGGAC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 8 9 121637 CASAVA_Build 6 133150457 1D GCTGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1547 het 1547 ref 34 24 4 6 T 13 12 121638 CASAVA_Build 6 133176163 2I CACAGCGCTG --/GC GCACGTGCCA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 GC 1 2 121639 CASAVA_Build 6 133178679 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1055 het 1055 ref 31 18 4 9 T 12 11 121640 CASAVA_Build 6 133180814 3D ATTCGTTTGA CTT/--- CTTTGGTTGG 3070 het 3070 hom 56 25 24 7 CTT 2 1 121641 CASAVA_Build 6 133181699 3D CCAAGTTTTT TTG/--- TTGTTTTTGT 541 het 541 ref 42 20 7 16 TTG 2 1 121642 CASAVA_Build 6 133183148 4D TGCTTTAAAA AATG/---- AATGAGAGGC 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 AATG 2 1 121643 CASAVA_Build 6 133183277 2I TGTCTCTACT --/AA AAATACAAAA 3070 het 739 hom 16 2 9 5 A 3 5 121644 CASAVA_Build 6 133189378 1D CTCTGTTTCG A/- AAAAAAAAAA 1830 het 1830 ref 29 18 6 5 A 13 12 121645 CASAVA_Build 6 133190343 1D ACATATAAAT A/- ATATGTAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 2 1 121646 CASAVA_Build 6 133205620 1I TGAGGCAATC -/T GAGTATAGTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 1 121647 CASAVA_Build 6 133247630 1I AAAAAAAAGC -/A AAACAGGCCA 3070 hom 91 het 35 0 31 4 A 3 4 121648 CASAVA_Build 6 133255646 1D GACTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 12 11 121649 CASAVA_Build 6 133268455 4D ATATTTTTAG TAAT/---- TATTTATTAG 1497 het 1497 ref 11 6 4 1 TAAT 1 0 121650 CASAVA_Build 6 133275134 3D AGAAAAGGAT AAG/--- AAGACTTGTT 3070 het 3070 ref 54 25 21 10 AAG 2 1 121651 CASAVA_Build 6 133280924 1D TGGTATGTCA T/- TAAGTCCTCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 1 121652 CASAVA_Build 6 133281113 1D TGGAAGTTCT G/- GGGGAAAGGA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 G 5 4 121653 CASAVA_Build 6 133288766 1D ATTTGGTATC A/- AAAAAAAAAA 2013 het 2013 ref 30 19 6 5 A 13 12 121654 CASAVA_Build 6 133325034 1D TTCCTATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 11 10 121655 CASAVA_Build 6 133340890 1D ATTTGGATCT A/- AAAAAAAAAA 1365 het 1365 ref 41 32 4 5 A 12 11 121656 CASAVA_Build 6 133346813 5D TCTTCTTTAT TAGTC/----- TAGTCTTGCT 2409 het 2409 ref 21 16 5 0 TAGTC 2 1 121657 CASAVA_Build 6 133361263 1D AAACATAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 49 19 23 8 A 8 7 121658 CASAVA_Build 6 133369769 1I ATGAAATTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 9 10 121659 CASAVA_Build 6 133373502 1I TATCTCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 12 13 121660 CASAVA_Build 6 133380460 1D CAGAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2876 hom 42 13 19 10 A 13 12 121661 CASAVA_Build 6 133381179 1D TTGTAGCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 A 11 10 121662 CASAVA_Build 6 133389596 1D ATGTTTTAAG A/- AAAAAAAATT 1926 hom 12 het 5 0 4 1 A 9 8 121663 CASAVA_Build 6 133389800 1I TCTCCTTCTC -/T TTTTCTCCCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 5 121664 CASAVA_Build 6 133391262 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 559 hom 26 5 13 8 A 9 8 121665 CASAVA_Build 6 133393729 1I ATGAGATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 T 14 15 121666 CASAVA_Build 6 133403635 1I TCTCCCAACA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 59 22 30 7 T 6 7 121667 CASAVA_Build 6 133421367 1I GGGACTTAAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 8 9 121668 CASAVA_Build 6 133423503 2D TGCATGACAC TG/-- TGTGTGTGTG 1007 het 1007 ref 43 26 4 13 TG 10 9 121669 CASAVA_Build 6 133427538 5D GAGTGTAGAG AAAAT/----- AAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 17 5 AAAAT 1 0 121670 CASAVA_Build 6 133428392 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2363 hom 37 12 11 15 T 17 16 121671 CASAVA_Build 6 133457769 1I AAATAAGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 10 11 121672 CASAVA_Build 6 133461087 2D ATTTGAACTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 11 9 121673 CASAVA_Build 6 133465178 4D AGATAGATAT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 ATAG 4 3 121674 CASAVA_Build 6 133467359 1I ATCAGAGGTT -/A AAAAAGGTTC 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 5 6 121675 CASAVA_Build 6 133492129 8I GCAGCCACGC --------/ACAGGGTG ACCAACTCCT 3070 hom 120 het 43 0 40 5 ACAGGGTG 0 1 121676 CASAVA_Build 6 133493803 1D GGTGGGCCCC T/- TGAGCATAAG 3070 het 3070 ref 33 17 10 7 T 2 1 121677 CASAVA_Build 6 133496156 2D ACGCTCACAC TT/-- GCGTGCAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 2 0 121678 CASAVA_Build 6 133498309 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 A 11 10 121679 CASAVA_Build 6 133498623 1I CACACTTAGG -/A ACCCATAACA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 1 2 121680 CASAVA_Build 6 133501083 2D CTATTTATTA TT/-- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 20 2 T 8 6 121681 CASAVA_Build 6 133511912 1I TGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 2146 het 1450 hom 13 4 7 2 A 11 12 121682 CASAVA_Build 6 133526059 6I TCTCTCAAGA ------/TATACT TATTAAATTT 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 TATACT 0 1 121683 CASAVA_Build 6 133538704 1D TTCCCAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 12 11 121684 CASAVA_Build 6 133543733 3I GAAAGTAAAG ---/ATT ATTAAAATGA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ATT 1 2 121685 CASAVA_Build 6 133546380 1I CATTTTGATG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 94 het 37 0 32 5 A 8 9 121686 CASAVA_Build 6 133546642 1I GTAATTTGAT -/A ATATGTACAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 121687 CASAVA_Build 6 133547734 1D CTCAATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 12 11 121688 CASAVA_Build 6 133548675 1D TTTTTGGCCA T/- TTTTTCCTTG 3070 hom 86 het 32 0 29 4 T 6 5 121689 CASAVA_Build 6 133549836 1I CCTTCACTTA -/T CTTTTTTAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 121690 CASAVA_Build 6 133550346 4I GTGTAGATGG ----/GTAT GTATTTGGAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 GTAT 1 2 121691 CASAVA_Build 6 133569099 1I GAAAAGGGGG -/A AAAAAAGGCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 6 7 121692 CASAVA_Build 6 133576197 1I TCATGTTCCT -/A AAAACATCAT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 4 5 121693 CASAVA_Build 6 133578430 2D CCCCTCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 44 3 20 21 T 13 11 121694 CASAVA_Build 6 133583360 3D GAGGAGGTAC GTG/--- GTGTCTTCTT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 GTG 2 1 121695 CASAVA_Build 6 133598862 2D AGAAAAAAAC AA/-- AAAAACAGGT 3070 hom 17 het 26 1 22 3 A 7 5 121696 CASAVA_Build 6 133607429 1I CTATAATTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 67 het 26 0 22 4 T 7 8 121697 CASAVA_Build 6 133611703 1D TTTTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 293 hom 41 1 36 5 T 11 10 121698 CASAVA_Build 6 133620721 4D CACTATTGAC TATT/---- TATGCACTCA 3070 hom 144 het 51 0 49 3 TATT 1 0 121699 CASAVA_Build 6 133623071 1D TAGCTTATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 40 het 33 1 23 9 T 10 9 121700 CASAVA_Build 6 133632349 1I TGTGTCTCTG -/T TTATATATGC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 2 3 121701 CASAVA_Build 6 133639733 5D TAGAAATGTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 43 1 30 13 A 17 12 121702 CASAVA_Build 6 133645430 4I TATATATATA ----/TATG TATGTATATA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TATG 1 2 121703 CASAVA_Build 6 133650355 10D GGAAATCTGG CTGAGAAGCA/---------- CTGAGACTAG 3070 hom 81 het 32 0 25 8 CTGAGAAGCA 1 0 121704 CASAVA_Build 6 133654768 1I GCTAGACTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 890 hom 35 2 28 5 T 9 10 121705 CASAVA_Build 6 133656855 28D AGGGTGATTT TATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATA 2724 hom 15 het 7 0 6 1 TA 20 6 121706 CASAVA_Build 6 133657340 2I TGTGTCACCA --/CT CTCTGCTCAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CT 2 3 121707 CASAVA_Build 6 133660860 1I ATTAGTTGCC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 7 8 121708 CASAVA_Build 6 133666719 11D GGCACTAAAT TTAATATGAGA/----------- TTATTAGCTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTAATATGAGA 1 0 121709 CASAVA_Build 6 133667645 2I TGTTCCAGGA --/CT CTCTAGGCCT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 CT 2 3 121710 CASAVA_Build 6 133668819 4I TAGATGTCAT ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 135 het 54 0 46 8 TG 5 7 121711 CASAVA_Build 6 133682554 2I TCTTTTCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 12 14 121712 CASAVA_Build 6 133683312 1I ATTTTACTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 501 hom 33 2 24 7 T 9 10 121713 CASAVA_Build 6 133686417 1I ATAGCTCAGC -/A AAAAATGTTT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 5 6 121714 CASAVA_Build 6 133691546 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACCA 3070 hom 58 het 22 0 19 3 A 7 8 121715 CASAVA_Build 6 133695543 9D CCCAGCTAAA TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1681 hom 14 het 9 0 5 6 T 25 16 121716 CASAVA_Build 6 133699794 2I GGCCGAAAAC --/AG AGTTTCTGGT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AG 1 2 121717 CASAVA_Build 6 133701681 1D CAATTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 36 2 28 6 T 12 11 121718 CASAVA_Build 6 133726472 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTGT 1689 het 333 hom 5 1 4 0 T 8 9 121719 CASAVA_Build 6 133729571 1I TTTATATTCT -/A ATGTAGATAA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 A 1 2 121720 CASAVA_Build 6 133732760 6I AGACAGGAGC ------/TGCTGA TGCTGATGAG 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 TGCTGA 1 2 121721 CASAVA_Build 6 133735304 7D AGAGAGATTT AATATAA/------- AATATAAAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 5 AATATAA 2 1 121722 CASAVA_Build 6 133740464 22D GATATCTGGA TAATTTTTTCAAAACTACTATT/---------------------- TATTTTGCTT 1416 het 1416 ref 20 17 6 5 TAATTTTTTCAAAACTACTATT 1 0 121723 CASAVA_Build 6 133740806 2D ATATTATGTT CA/-- CACACACACA 3070 hom 117 het 44 0 38 6 CA 10 9 121724 CASAVA_Build 6 133764221 2D AATCTCTAAA AG/-- AGAATAATTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AG 2 1 121725 CASAVA_Build 6 133768853 4D ATCTATCTAT CTAC/---- CTACCTACCT 3070 hom 69 het 35 0 24 12 CTAC 5 4 121726 CASAVA_Build 6 133770083 2D GAGTCTAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 174 hom 24 1 12 12 T 18 16 121727 CASAVA_Build 6 133781650 1I TGTATATTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 8 9 121728 CASAVA_Build 6 133790730 1D AGCCTGCTGG A/- AAAAATTTAG 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 6 5 121729 CASAVA_Build 6 133792843 1I TCAACCCTTG -/C CCCCTCCCTC 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 C 4 5 121730 CASAVA_Build 6 133794781 1D ATTTTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 33 2 24 7 T 15 14 121731 CASAVA_Build 6 133803070 4D AAAATGTACA TAAT/---- TAATTAGCAC 3070 het 3070 ref 41 22 17 4 TAAT 2 1 121732 CASAVA_Build 6 133841268 12D ACAGTGTAAT AGATACAGTGTA/------------ ATATATATAT 323 het 323 ref 42 26 2 20 AGATACAGTGTA 1 0 121733 CASAVA_Build 6 133851493 2D AGGGCATCTC TA/-- TGAGTCTGCA 3070 het 3070 ref 44 29 15 0 TA 1 0 121734 CASAVA_Build 6 133859478 4I AAGGGCAAAC ----/TGTT TGACCTCTGA 3070 hom 126 het 49 0 41 8 TGTT 0 1 121735 CASAVA_Build 6 133869845 6D AGATGGCATG TTTAAA/------ TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 15 6 TTTAAA 1 0 121736 CASAVA_Build 6 133870212 1I CTTAAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 44 2 35 7 T 10 11 121737 CASAVA_Build 6 133871175 2I AGAATGATTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 TA 6 7 121738 CASAVA_Build 6 133874811 1I GATTCCATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3009 hom 22 8 12 2 A 14 15 121739 CASAVA_Build 6 133878920 8D ATAGCTGGTA AGGTAGAG/-------- TTGAATCTCT 3070 het 3070 ref 40 27 13 3 AGGTAGAG 1 0 121740 CASAVA_Build 6 133880146 1I TGTACAACAA -/C CCCCCCATGA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 C 6 7 121741 CASAVA_Build 6 133885095 4I TGTTGGTGTG ----/CTGC CTATTTGTTT 2769 het 2511 hom 12 6 6 0 CTGC 0 1 121742 CASAVA_Build 6 133901037 1D GTGGAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 11 10 121743 CASAVA_Build 6 133905252 2I CAATAAAAAC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 9 11 121744 CASAVA_Build 6 133906650 3D ACACACCCTC CTT/--- GACAGAGCAA 3070 het 3070 ref 44 26 13 8 CTT 1 0 121745 CASAVA_Build 6 133906918 1D TTGTAGAGAC A/- GGGTTTTGCT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 1 0 121746 CASAVA_Build 6 133912912 1D TATTTTTTTT G/- CCAGAATCCT 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 G 1 0 121747 CASAVA_Build 6 133916808 1D GCGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 12 11 121748 CASAVA_Build 6 133930364 12I GCCTCTGGTT ------------/ATTACTTTGTCC ATTACTTTGT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 ATTACTTTGTCC 1 2 121749 CASAVA_Build 6 133931667 3D TCCGTCTCAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 AAC 3 2 121750 CASAVA_Build 6 133933362 4D TTAATGTATC AGAA/---- AGAGATTTGA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 AGAA 1 0 121751 CASAVA_Build 6 133934578 1D TCTTGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 13 12 121752 CASAVA_Build 6 133937556 1D GTGCTTCAAC A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 A 7 6 121753 CASAVA_Build 6 133938405 3D GCTAATATAA TAT/--- TATTTTCTCT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 TAT 2 1 121754 CASAVA_Build 6 133952616 3I ATTTATCTGT ---/TGA TGAACACTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TGA 1 2 121755 CASAVA_Build 6 133968369 1D AATGTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 1362 het 1362 ref 50 38 4 8 T 12 11 121756 CASAVA_Build 6 133973134 1D TTCCTTCTAC T/- TTAGTCATTA 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 T 3 2 121757 CASAVA_Build 6 133985142 2I AACATGCCTC --/TG TGAAAGGTGG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TG 1 2 121758 CASAVA_Build 6 133985234 10D GCACTTCATC CTTGTTCTTT/---------- CATATTCAAA 3070 het 3070 hom 33 16 18 4 CTTGTTCTTT 1 0 121759 CASAVA_Build 6 133998243 1I ATTTGAGATA -/C GTCTAAGAGG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 C 0 1 121760 CASAVA_Build 6 134002589 1D TAATTCTTAT C/- TCTGACTACA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 C 1 0 121761 CASAVA_Build 6 134004211 1I GAAAGGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 33 0 21 12 T 11 12 121762 CASAVA_Build 6 134005066 4I AATTTTAAAT ----/TTTC TTTTAGTGTA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 TTTC 0 1 121763 CASAVA_Build 6 134005381 1D TATCAGTAAG T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 T 6 5 121764 CASAVA_Build 6 134009672 1I ACTTCAAAAC -/A AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 A 6 7 121765 CASAVA_Build 6 134012707 6D TATAGGGAAT TATATA/------ TATATATATA 2324 het 1975 hom 15 5 6 6 TA 10 7 121766 CASAVA_Build 6 134020989 2I TATCAAAAAC --/TG TGACAATATT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 TG 1 2 121767 CASAVA_Build 6 134022632 1I TACTTATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 11 121768 CASAVA_Build 6 134024156 2D CATAAGAAAT TC/-- TTCTTATCTC 3070 het 3070 hom 39 19 17 4 TC 1 0 121769 CASAVA_Build 6 134032529 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCACTC 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 AG 1 2 121770 CASAVA_Build 6 134032837 1D AATTATTTGG T/- TTTAATGGTT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 4 3 121771 CASAVA_Build 6 134101481 1I TTTTATTTGT -/C AATTTTAAAA 3070 hom 77 het 30 0 26 4 C 0 1 121772 CASAVA_Build 6 134218226 1D TTTAGAAGTC T/- TTTTTTTTTA 1075 het 1075 ref 36 28 3 5 T 10 9 121773 CASAVA_Build 6 134240360 5I TCTCAGTCGA -----/GTTTG GTTGTGGAGT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 GTTTG 0 1 121774 CASAVA_Build 6 134246509 2I CAAGCAAACC --/AG AGTCATACAA 3070 hom 122 het 51 0 33 18 AG 1 2 121775 CASAVA_Build 6 134251216 1D TCTAGAAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 32 het 33 1 23 9 A 9 8 121776 CASAVA_Build 6 134251879 1I GCAGGCCCCT -/C CCCTGGGCTG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 3 4 121777 CASAVA_Build 6 134260145 1D GCACCTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 21 0 17 4 T 12 11 121778 CASAVA_Build 6 134262450 2D TTATTATGTA AC/-- AGTTTTTGTC 3070 hom 57 het 25 0 20 7 AC 1 0 121779 CASAVA_Build 6 134300695 4D CTTAATCAGT CAAG/---- CTTGATAAGC 3070 hom 87 het 31 0 30 3 CAAG 1 0 121780 CASAVA_Build 6 134303152 1I TTGCTATACG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 9 10 121781 CASAVA_Build 6 134319394 3D TATGAGTAGC CAT/--- CATCATATTG 3070 het 3070 hom 50 18 24 10 CAT 3 2 121782 CASAVA_Build 6 134329649 3D GCATTTTCAA ACC/--- ACAGTACTAC 3070 hom 129 het 50 0 43 10 ACC 1 0 121783 CASAVA_Build 6 134338214 4D TAAAACTCTT AAAG/---- AAATTGAATT 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 AAAG 1 0 121784 CASAVA_Build 6 134340613 1I GCGTCAGGGG -/C CCAGGCTGCT 3070 het 3070 hom 49 20 28 1 C 2 3 121785 CASAVA_Build 6 134369886 3I TTGGGAAGCA ---/GGG CCATTTCCTA 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 G 0 3 121786 CASAVA_Build 6 134375524 1D AACAGGCCAG C/- GCAGTGGCCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 C 1 0 121787 CASAVA_Build 6 134376511 2D TTCTTTAAGT AA/-- AACAGAAGTT 3070 het 3070 ref 20 13 7 0 A 4 2 121788 CASAVA_Build 6 134379827 5I TTTTGGTAAA -----/GAGTC AAGTTTAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 GAGTC 0 1 121789 CASAVA_Build 6 134394258 1I AACAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 8 9 121790 CASAVA_Build 6 134404428 1D AGAAAGCAGC T/- CTGAGGGTCT 3070 het 3070 ref 62 38 19 5 T 1 0 121791 CASAVA_Build 6 134459289 1D ATTTAAGGGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 T 8 7 121792 CASAVA_Build 6 134459817 4D AAAAAGAAAG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2616 hom 28 10 15 4 A 14 10 121793 CASAVA_Build 6 134459895 4D AAAATGAGTC CAAT/---- CAAAGTGTTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 CAAT 1 0 121794 CASAVA_Build 6 134462017 1D GTATTCGCAC T/- TGCTGTTTTA 3070 het 3070 ref 48 28 13 8 T 2 1 121795 CASAVA_Build 6 134463940 2D AAAAAATGCT CA/-- GTGTCACTAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 CA 1 0 121796 CASAVA_Build 6 134464300 1D CTCCATCTTG C/- CCCCCCATGA 3070 hom 104 het 40 0 32 9 C 7 6 121797 CASAVA_Build 6 134473952 1I ACTTTTCCTC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 8 9 121798 CASAVA_Build 6 134514131 1D TATGTGATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 34 het 16 0 12 4 A 10 9 121799 CASAVA_Build 6 134514408 4I GCCAATGTAC ----/AGAT AGATAGGGCT 3070 hom 56 het 24 0 17 7 AGAT 1 2 121800 CASAVA_Build 6 134514965 1D CTGTAACACC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 8 121801 CASAVA_Build 6 134518016 1D GGGCTGAGGC G/- GGGGGTTCAC 3070 hom 50 het 30 0 25 5 G 6 5 121802 CASAVA_Build 6 134525614 1D GACACCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 23 2 11 10 A 17 16 121803 CASAVA_Build 6 134529217 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 A 8 9 121804 CASAVA_Build 6 134530231 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 het 2531 hom 18 6 12 0 AG 2 1 121805 CASAVA_Build 6 134532307 1D TCAGGAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 10 23 6 A 11 10 121806 CASAVA_Build 6 134532649 1I CACACTCACA -/C CGACGGTTCA 3070 het 3070 hom 46 11 22 13 C 1 2 121807 CASAVA_Build 6 134535160 5D GTAAAAAAGT GAATA/----- GAAAAGTAGT 3070 het 3070 ref 48 24 22 3 GAATA 1 0 121808 CASAVA_Build 6 134536985 1I AAGTGAGTTT -/C CTGGCTCTAC 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 C 1 2 121809 CASAVA_Build 6 134540071 1D AAAAACAAAA C/- AAAAACAAAA 3070 het 319 hom 11 1 10 0 C 1 0 121810 CASAVA_Build 6 134552667 1I GTAAGTACTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 8 9 121811 CASAVA_Build 6 134556736 1I TTCCACTTGA -/G GGTGGTAGAC 2387 het 2387 ref 21 15 5 1 G 2 3 121812 CASAVA_Build 6 134571577 2I21M8D CCATGTATGC --GTATATATATATATACACATATATATGTG/GTGTATATATATATATACACATA-------- TATATATAGA 3070 hom 105 het 34 0 36 2 N/A 0 0 121813 CASAVA_Build 6 134577411 2D29M5D ACGCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAATTAATGAAAGTAATTAAAGTTT/--AAAAAAAAAAAATTAATGAAAGTAATTAA----- AGTTATTTAA 3070 hom 23 het 13 0 9 7 N/A 0 0 121814 CASAVA_Build 6 134577490 4I AAAAACAGAA ----/TGAG TATGTGCAGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TGAG 0 1 121815 CASAVA_Build 6 134586200 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 12 11 121816 CASAVA_Build 6 134589188 1I CAAAAAGGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 9 10 121817 CASAVA_Build 6 134593415 1I GGGAAAACCG -/C CCCCCCCATG 2889 het 2889 ref 29 16 8 5 C 7 8 121818 CASAVA_Build 6 134595903 6D TTTTTTAACC CTCTAT/------ CTCTATACTT 1272 het 1272 ref 12 6 4 3 CTCTAT 2 1 121819 CASAVA_Build 6 134601414 1D AAAGTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 T 11 10 121820 CASAVA_Build 6 134623009 1I CTGTTTCTAC -/A AAAAAAAATT 2803 het 48 hom 15 2 9 4 A 8 9 121821 CASAVA_Build 6 134623605 5I ATGTCTTCAG -----/TCTTT TCTTTTAGCA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 TCTTT 1 2 121822 CASAVA_Build 6 134625353 1I GGACCAGCCT -/G GCCAACATGA 3070 hom 39 het 19 0 12 7 G 1 2 121823 CASAVA_Build 6 134626233 1I ACACTACTAA -/T TTTTTTTTTT 2930 het 1956 hom 31 8 13 10 T 15 16 121824 CASAVA_Build 6 134632109 1D CAAACAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 12 11 121825 CASAVA_Build 6 134651544 1I TTCTAAATAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 8 9 121826 CASAVA_Build 6 134658536 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2000 het 835 hom 28 6 10 12 A 15 16 121827 CASAVA_Build 6 134672437 1D GATGTGGATC T/- CTATAGAGAC 3070 het 3070 ref 53 24 22 8 T 1 0 121828 CASAVA_Build 6 134680991 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 480 hom 27 2 13 12 T 15 14 121829 CASAVA_Build 6 134700068 1I TCCAGTTCAG -/T TTTTTTTTTT 848 het 848 ref 29 18 4 7 T 13 14 121830 CASAVA_Build 6 134726879 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 13 11 121831 CASAVA_Build 6 134733387 10D GTGTGTGTGG ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 het 1842 hom 25 6 10 11 AT 12 7 121832 CASAVA_Build 6 134737165 4I CTACGTCAAG ----/ACAA ACAGTTATGT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 ACAA 0 1 121833 CASAVA_Build 6 134750440 1I ATATGTATAG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 7 8 121834 CASAVA_Build 6 134764341 5D GTACTTTTTC TTCTT/----- TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 5 TTCTT 3 2 121835 CASAVA_Build 6 134764954 1I AATAGAAAAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 8 9 121836 CASAVA_Build 6 134770370 1I TTGCATTGAC -/T TTTAAAAAGA 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 T 3 4 121837 CASAVA_Build 6 134784864 1I CTCAATCTAG -/A AAAAAATCAA 2921 het 2921 ref 22 15 6 1 A 6 7 121838 CASAVA_Build 6 134788287 3D GGCTAATTTT AAA/--- AAAATTTTTC 3070 hom 81 het 34 0 26 10 A 7 4 121839 CASAVA_Build 6 134790128 5I CTTCTAGCTT -----/TGCTC TGCTCTTTTA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 TGCTC 1 2 121840 CASAVA_Build 6 134791052 5D TTGCACAAGT AAAAC/----- AAAACAAGTA 3070 het 3070 hom 56 17 34 7 AAAAC 2 1 121841 CASAVA_Build 6 134795929 1I TTAAATTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 9 10 121842 CASAVA_Build 6 134810856 1D TAAAAGATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 10 9 121843 CASAVA_Build 6 134818885 1I GAAAACAAAA -/G GAGCTTTCTA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 1 2 121844 CASAVA_Build 6 134826871 3I GGAAGAAAAA ---/AAG AAAAAACATT 3070 het 27 hom 36 1 21 14 AAG 0 1 121845 CASAVA_Build 6 134845488 1D GAACTAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 39 0 28 11 T 15 14 121846 CASAVA_Build 6 134848478 5I CAATGAAGTC -----/TTATG TTATATGCAA 3070 hom 157 het 56 0 53 3 TTATG 0 1 121847 CASAVA_Build 6 134849368 1I ATGTACCACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 8 9 121848 CASAVA_Build 6 134851305 1I TTTTTTTTTT -/C TCTCTTTTTT 1066 het 274 hom 18 4 6 8 C 0 1 121849 CASAVA_Build 6 134852888 20D AATCTATAGG TAGATCTTTTTCTTTCTTCT/-------------------- TAGATCTTTT 3070 hom 78 het 27 0 27 8 TAGATCTTTTTCTTTCTTCT 1 0 121850 CASAVA_Build 6 134860759 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 17 0 12 5 A 17 15 121851 CASAVA_Build 6 134861731 3D29M14D CAAAAAAAAT TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAATAAATAAATATATATAT/---AAAAAATTAAAAAAAAAAAAAATAAACAA-------------- ATATATATAT 2226 hom 8 het 5 0 6 1 N/A 0 0 121852 CASAVA_Build 6 134867413 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2127 het 2127 ref 20 9 8 3 A 13 12 121853 CASAVA_Build 6 134870915 3D ATTATGGATG TTC/--- TTCTTTGATA 3070 het 3070 hom 38 13 24 3 TTC 2 1 121854 CASAVA_Build 6 134872498 6I TGTAACAGAA ------/ATTAAT ATTATTATTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 ATTAAT 0 1 121855 CASAVA_Build 6 134875015 1D CCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1473 hom 31 8 14 9 T 12 11 121856 CASAVA_Build 6 134881410 1D TATTACTCTG T/- TAACCTATGT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 T 2 1 121857 CASAVA_Build 6 134882994 2D ATTCATCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 648 hom 36 8 17 12 T 16 14 121858 CASAVA_Build 6 134888995 1D AGGAAACAAA C/- TTACAAATCA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 C 1 0 121859 CASAVA_Build 6 134893219 1D GTGCTTAATC T/- TTTTTTTTTT 1517 het 887 hom 28 10 4 14 T 19 18 121860 CASAVA_Build 6 134913391 1I TTCATGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 36 1 30 5 A 11 12 121861 CASAVA_Build 6 134914608 1I CCACACACAC -/A ACAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 A 1 2 121862 CASAVA_Build 6 134920960 1D GTTTCAAAGC T/- TTATAGGGTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 3 2 121863 CASAVA_Build 6 134924461 1I TGTTCCTGAG -/T TACTTCACTT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 T 1 2 121864 CASAVA_Build 6 134925219 1I GCTCACTCCA -/T TTTTTTAGAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 6 7 121865 CASAVA_Build 6 134928345 1D AAGAAATTCA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 8 7 121866 CASAVA_Build 6 134939876 1D AAAAGATATT C/- CTCATTATAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 C 2 1 121867 CASAVA_Build 6 134989235 1I CCGGAGATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 557 hom 29 3 21 5 T 12 13 121868 CASAVA_Build 6 134990732 1I TTAACTACGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 35 1 23 11 A 15 16 121869 CASAVA_Build 6 134994954 1D TCTTCTGCTA T/- TTTCCCAATA 3070 hom 149 het 58 0 49 9 T 4 3 121870 CASAVA_Build 6 134995655 1I ACTTTTAGAA -/T TTTTTTTGAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 8 121871 CASAVA_Build 6 135009321 4I GAAATTGCTT ----/GTTG ATTACATTTT 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 GTTG 0 1 121872 CASAVA_Build 6 135024057 2I TGGGAGGCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 A 11 13 121873 CASAVA_Build 6 135027738 1D AATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 17 1 10 6 T 11 10 121874 CASAVA_Build 6 135036867 1I AGAAAGGTGA -/G AAAAAGTATA 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 G 0 1 121875 CASAVA_Build 6 135037091 3I TCAACAGATG ---/AAT AATAGATAAA 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 AAT 1 2 121876 CASAVA_Build 6 135038619 1D TAAAAGCAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 79 het 30 0 27 4 A 10 9 121877 CASAVA_Build 6 135044311 4D CTATTGTAAA CAGT/---- CAGGTTGGCT 3070 het 3070 ref 22 14 7 3 CAGT 1 0 121878 CASAVA_Build 6 135044418 4D TCTGTTCTCT GAAA/---- GAGTTTAAGT 3070 het 3070 hom 28 13 15 1 GAAA 1 0 121879 CASAVA_Build 6 135045351 4D44M2D TGTTTGTGAC TTCTTTTTCATCTTAATAAATCTTCACAGAAATGCACCATTTTTATTACT/----TTTTCATCTTAATAAATCTTCACAGAAATGCACCATTTTTATTA-- CTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 39 35 21 3 N/A 0 0 121880 CASAVA_Build 6 135050201 2D TTTCTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 126 hom 22 1 15 7 TG 7 6 121881 CASAVA_Build 6 135053139 20D CCACAGCCTT CCCGGATGGAATGTGCACTC/-------------------- CCTCATTTGT 3070 het 3070 ref 44 26 20 6 CCCGGATGGAATGTGCACTC 1 0 121882 CASAVA_Build 6 135054868 2D GGTTTTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2169 het 2169 ref 29 13 7 9 T 13 11 121883 CASAVA_Build 6 135055129 1I CCATGTTCCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 7 8 121884 CASAVA_Build 6 135061764 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2604 het 1472 hom 23 5 11 7 T 15 14 121885 CASAVA_Build 6 135062922 4D TGCTTCATTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 TTTA 3 2 121886 CASAVA_Build 6 135063347 2D TTGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2424 het 1442 hom 19 8 6 5 T 13 11 121887 CASAVA_Build 6 135064086 7D AGGCCCTAGG TAGCAAA/------- ACCCATCACT 3070 het 3070 ref 45 29 13 7 TAGCAAA 1 0 121888 CASAVA_Build 6 135066421 4D AAGGTCAGGG GAAT/---- GAATGATTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 GAAT 2 1 121889 CASAVA_Build 6 135067422 1D CAGCCAACAG C/- AGGGGGAGAG 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 C 1 0 121890 CASAVA_Build 6 135076472 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1139 het 905 hom 12 3 4 5 A 17 16 121891 CASAVA_Build 6 135079104 1I CAAAAAAAAA -/T ATATATATAT 2477 het 2477 ref 20 11 6 3 T 0 1 121892 CASAVA_Build 6 135085760 1I GAACTTTTTG -/T TTATTTTAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 2 3 121893 CASAVA_Build 6 135085862 1I CCTTACCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 A 10 11 121894 CASAVA_Build 6 135086336 2D ATCTTCAAAA TC/-- TCTTTCATTT 3070 het 3070 ref 42 19 19 6 TC 2 1 121895 CASAVA_Build 6 135094818 1I ACCTGAAGAA -/G GATTAGAGAT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 G 1 2 121896 CASAVA_Build 6 135095029 1I TGAAAAAACT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 8 9 121897 CASAVA_Build 6 135104890 4D AAAAACAAAA AAAC/---- CAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 11 21 2 AAAC 1 0 121898 CASAVA_Build 6 135106573 1D GCTATTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 10 9 121899 CASAVA_Build 6 135159404 1D TACAATTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 10 9 121900 CASAVA_Build 6 135178691 1D AGAGAGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 T 10 9 121901 CASAVA_Build 6 135181216 1D CCGTCCCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 33 2 20 12 A 15 14 121902 CASAVA_Build 6 135185863 7D TCACGCCTCT GTGGTCC/------- GTGGTCCGTG 3070 hom 75 het 33 0 20 15 GTGGTCC 3 2 121903 CASAVA_Build 6 135199823 1I AACCTTCACT -/C CCTCTTCTTC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 C 2 3 121904 CASAVA_Build 6 135201059 7D CTTCTTTTTT TTTTAAC/------- TTTTAAGTTC 3070 het 3070 ref 29 17 9 4 TTTTAAC 1 0 121905 CASAVA_Build 6 135201459 3D CACATATACA CAC/--- CACATTTTCT 3070 hom 51 het 23 0 16 8 CAC 2 1 121906 CASAVA_Build 6 135223710 1D ACCCTGTCCC A/- AAAAAAAAAA 1523 het 1523 ref 24 15 4 5 A 15 14 121907 CASAVA_Build 6 135289640 2D ACTCTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2973 het 1000 hom 16 5 8 4 A 14 12 121908 CASAVA_Build 6 135301447 5D GTGATTCAAG ATTTT/----- ATTTTATTAT 2215 het 1565 hom 11 5 6 0 ATTTT 2 1 121909 CASAVA_Build 6 135313774 2I TGGCTAATGA --/AT ATATATTAAC 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 AT 3 4 121910 CASAVA_Build 6 135314076 1I ACAACCTAAA -/T GTCCATCAAT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 0 1 121911 CASAVA_Build 6 135315090 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACTC 708 het 708 ref 10 4 3 3 AG 2 1 121912 CASAVA_Build 6 135326749 2D GTCACATATA TC/-- TGTTAAATTC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TC 1 0 121913 CASAVA_Build 6 135328132 1D CTGTTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 33 0 23 10 A 12 11 121914 CASAVA_Build 6 135333936 1I TCATTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 314 hom 38 2 22 14 A 13 14 121915 CASAVA_Build 6 135343588 1D TTAATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 23 1 16 6 A 12 11 121916 CASAVA_Build 6 135353896 2D TCACAGACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 38 0 29 9 AC 9 8 121917 CASAVA_Build 6 135354002 1I TCAGTGAGGG -/A ATTGGTTCCA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 1 2 121918 CASAVA_Build 6 135357928 1D AAATACTCTA G/- GGACCACAGA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 G 3 2 121919 CASAVA_Build 6 135361256 2I AGTGCAACTC --/TG TGAATAGCTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TG 1 2 121920 CASAVA_Build 6 135364897 13I ATTTATAAGT -------------/AACAGATTTATTG AACAATTGAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AACAGATTTATTG 0 1 121921 CASAVA_Build 6 135365746 5D ACATAGTATT TTAAA/----- TTATAGATTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTAAA 1 0 121922 CASAVA_Build 6 135367350 1I GTGAGAGCAG -/A AGGGGAGCTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 1 2 121923 CASAVA_Build 6 135372632 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1023 hom 8 het 6 0 3 3 T 15 14 121924 CASAVA_Build 6 135379747 2I CCTTGCTCCT --/CC CCCTTTTAAA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 C 3 5 121925 CASAVA_Build 6 135382993 2D AAAACCCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 34 1 22 11 A 14 12 121926 CASAVA_Build 6 135387381 1D CTTGGGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 29 0 24 5 T 12 11 121927 CASAVA_Build 6 135388333 2I GTTTTGCCTC --/AA AGAGACAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 3 121928 CASAVA_Build 6 135389708 1I TTGCCAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 22 0 17 5 A 11 12 121929 CASAVA_Build 6 135390608 2I TAAAAACTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 11 13 121930 CASAVA_Build 6 135391329 2D AAATCCTATC AT/-- AAAACAAATC 3070 hom 105 het 39 0 35 5 AT 1 0 121931 CASAVA_Build 6 135392179 4I TAAATATGCA ----/TATG TATGTGGATC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TATG 1 2 121932 CASAVA_Build 6 135395766 15I AGTAACTAGG ---------------/AAAAAGGAAAAGTTT AAAAAGGAAA 3070 hom 90 het 43 0 31 14 AAAAAGGAAAAGTTT 1 2 121933 CASAVA_Build 6 135401202 1I AAACTTCTTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 7 8 121934 CASAVA_Build 6 135403979 1I CCCTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 11 121935 CASAVA_Build 6 135405656 15D AAAAAAAAAA ACAAAAAAAAAAAAC/--------------- AGAAAAGAAA 3070 hom 69 het 24 0 23 6 ACAAAAAAAAAAAAC 1 0 121936 CASAVA_Build 6 135409083 1D GTCAGGGTTA T/- TTTCTTTACC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 4 3 121937 CASAVA_Build 6 135409191 1D TTTTTCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 22 10 A 12 11 121938 CASAVA_Build 6 135418337 1D ACCTTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 33 0 27 7 A 11 10 121939 CASAVA_Build 6 135419947 1I CACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 10 121940 CASAVA_Build 6 135424912 3D AAAAACACTT AAA/--- AAACTGTACA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 6 3 121941 CASAVA_Build 6 135457492 1I GGGTATTCTT -/A AAAAAAAAAA 1384 het 1384 ref 19 11 3 5 A 15 16 121942 CASAVA_Build 6 135460326 3D CAGCAGATGT TAC/--- TATATCAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 6 TAC 1 0 121943 CASAVA_Build 6 135460731 1D TCACAAGCAA C/- CCTGCTGTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 3 2 121944 CASAVA_Build 6 135461174 1D TTGTCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 27 1 18 8 T 12 11 121945 CASAVA_Build 6 135465911 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTA 1013 het 1013 ref 29 14 3 12 T 10 9 121946 CASAVA_Build 6 135483026 1D AGTTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2755 hom 32 9 12 11 T 15 14 121947 CASAVA_Build 6 135491044 1I AGAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 14 11 A 9 10 121948 CASAVA_Build 6 135500885 1D CTCAATAGTC T/- TATCAAAACC 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 T 2 1 121949 CASAVA_Build 6 135510522 1I AGAACTTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 9 10 121950 CASAVA_Build 6 135560336 4D TGTCTGCAGG CTAA/---- CTGTTGATTT 3070 het 3070 ref 52 27 19 8 CTAA 1 0 121951 CASAVA_Build 6 135580201 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 18 8 A 10 11 121952 CASAVA_Build 6 135663157 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 887 het 887 ref 12 7 3 2 A 15 14 121953 CASAVA_Build 6 135665446 3D TGAATCCTAA GTT/--- AGAAGGGGGT 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 GTT 1 0 121954 CASAVA_Build 6 135673105 2I ATATTTGAAA --/AT AGTGTTATAC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 AT 0 1 121955 CASAVA_Build 6 135678889 1D TTGAGAAAAC A/- AAAAAACATC 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 A 7 6 121956 CASAVA_Build 6 135685309 1D TCCCTAGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 10 9 121957 CASAVA_Build 6 135686530 1D GATGCATCTG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 39 17 18 6 A 8 7 121958 CASAVA_Build 6 135687859 1D CAAATTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1579 hom 25 8 8 9 T 17 16 121959 CASAVA_Build 6 135689606 1I TGGCCAGGCT -/G GTCTCAAACT 2731 het 2731 ref 24 10 8 6 G 1 2 121960 CASAVA_Build 6 135691314 21D TTCTTTTGGG GTGCCATAAACCATAGCCATA/--------------------- GAAGACAATA 3070 het 3070 ref 30 20 15 4 GTGCCATAAACCATAGCCATA 1 0 121961 CASAVA_Build 6 135696346 1I TCTTATCTGG -/A ATAATAATAG 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 A 1 2 121962 CASAVA_Build 6 135713976 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1323 het 1323 ref 39 27 4 8 A 13 14 121963 CASAVA_Build 6 135746307 1D GGCTCAAGTG A/- ATCACCTGAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 2 1 121964 CASAVA_Build 6 135752843 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTAT 2835 het 2835 ref 20 10 8 2 T 8 9 121965 CASAVA_Build 6 135758692 1I CCCTTTCCCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 7 8 121966 CASAVA_Build 6 135776570 1D AATTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 23 9 A 11 10 121967 CASAVA_Build 6 135780863 2I TAAATAACTC --/TA TTTCTTCATT 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TA 0 1 121968 CASAVA_Build 6 135794831 2D ACCAATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 27 1 14 13 T 16 14 121969 CASAVA_Build 6 135804208 3D CGGGACTCCC AGA/--- AGAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 AGA 3 2 121970 CASAVA_Build 6 135813837 1I GCCACTTCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 14 24 8 T 9 10 121971 CASAVA_Build 6 135834500 1D ATGATTCAGG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 62 het 23 0 19 4 T 9 8 121972 CASAVA_Build 6 135835631 1D TCCTTTCGTT A/- AGTGTCCAAA 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 A 2 1 121973 CASAVA_Build 6 135836590 4I TTCTATTATA ----/AATT ATTTTAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AATT 0 1 121974 CASAVA_Build 6 135837325 1D CTGTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 1412 het 1412 ref 44 28 4 13 T 13 12 121975 CASAVA_Build 6 135855816 1I GAAGAGTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 9 10 121976 CASAVA_Build 6 135858014 1I CCTTTCCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 A 10 11 121977 CASAVA_Build 6 135862637 1D GAACTGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 13 12 121978 CASAVA_Build 6 135889869 3I TTCTATCAAT ---/AAA CAGAGTCTGG 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 0 3 121979 CASAVA_Build 6 135908994 2I TTATTCTGTC --/TG TATTTTCTGA 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 TG 0 1 121980 CASAVA_Build 6 135939927 1D TAAAATTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 36 1 17 18 T 13 12 121981 CASAVA_Build 6 135941295 2D TTCATAACTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 11 9 121982 CASAVA_Build 6 135942483 1I AATTTATGTC -/A AAAAAAGCCT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 6 7 121983 CASAVA_Build 6 135948393 1I CAAATCGTTT -/C TCTCTGGGGA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 C 0 1 121984 CASAVA_Build 6 135952277 25I AAGGAGCAGA -------------------------/GTCCCAAGGCTGTGCAGGGCAGCAG GTCCCTGGGC 3070 hom 78 het 28 0 25 4 GTCCCAAGGCTGTGCAGGGCAGCAG 0 1 121985 CASAVA_Build 6 135952287 4I9M19D GTCCCTGGGC ----CTGGCCCACATAACCGTTCTTCCCTTCT/TGTGCAGGGCAGC------------------- AGGTCTCTGG 1699 het 1699 ref 26 10 7 12 N/A 0 0 121986 CASAVA_Build 6 135956965 1D GAGAATCAAT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 8 7 121987 CASAVA_Build 6 135958728 1D TTTAGAATAG T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 22 10 7 5 T 7 6 121988 CASAVA_Build 6 135964408 1I TTCAGCAAAT -/G GTATTGGAAT 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 G 1 2 121989 CASAVA_Build 6 135971225 1I GCAAGATAAA -/T TTTTTTATGC 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 T 6 7 121990 CASAVA_Build 6 135971517 1I CACATTTACC -/A AATTTCAGTT 3070 het 3070 ref 48 26 22 0 A 2 3 121991 CASAVA_Build 6 135971686 1I AGGGAATAGT -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 A 6 7 121992 CASAVA_Build 6 135973781 1I TCTTCTGCTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 12 26 2 T 8 9 121993 CASAVA_Build 6 135974625 2I ATAATAGACA --/CT CTAATGGGAT 3070 het 3070 ref 51 21 20 10 CT 1 2 121994 CASAVA_Build 6 135977672 4D CATTAAAAAC ATTT/---- ATAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 40 16 19 8 ATTT 1 0 121995 CASAVA_Build 6 135978362 3I GCCATCCCAA ---/GGG GGGGAGCTCT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 G 4 7 121996 CASAVA_Build 6 135978926 4D ACTGTGAAAA TAAC/---- TATAGTATTA 3070 het 3070 ref 38 18 16 7 TAAC 1 0 121997 CASAVA_Build 6 135987880 1I AGGGATAAGA -/G GTTTAGCTTA 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 G 1 2 121998 CASAVA_Build 6 135988019 1D TGTGTTGCTT G/- GGATCCCGAA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 G 3 2 121999 CASAVA_Build 6 135994139 2I GCAAACATTA --/TT TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 7 9 122000 CASAVA_Build 6 135998497 1D GCTGCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 13 12 122001 CASAVA_Build 6 136010541 1I CCAAGTGAAA -/G GGGTTTCCCC 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 G 3 4 122002 CASAVA_Build 6 136012948 6I TAAGCTTAAA ------/TATATC TATATCTATA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 TATATC 2 3 122003 CASAVA_Build 6 136019703 1I TGTGAAAGTT -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 6 7 122004 CASAVA_Build 6 136020459 3D GTCCCAAACA CTT/--- CTTGATGATT 3070 het 3070 ref 55 24 21 11 CTT 2 1 122005 CASAVA_Build 6 136033900 1D ATTCAATAGC A/- AAAAAACCAC 3070 het 3070 hom 43 15 20 9 A 7 6 122006 CASAVA_Build 6 136043010 4D TGTTTGTTTG TTTT/---- AAACAACGTT 3070 het 3070 ref 25 12 11 5 T 4 0 122007 CASAVA_Build 6 136052485 1I CCTCTTCTTC -/T CCCCCAACTT 3070 hom 141 het 56 0 48 8 T 0 1 122008 CASAVA_Build 6 136057176 1I AACGAATTAG -/C CAAGTACGCG 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 C 1 2 122009 CASAVA_Build 6 136057298 1D AATGGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 13 12 122010 CASAVA_Build 6 136069898 1D AACACTCCTG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 9 8 122011 CASAVA_Build 6 136219856 12D TACTCCTTTT CCTCCCTCCCTC/------------ CCTCCCTCCC 2712 hom 31 het 21 0 10 14 CCTC 7 4 122012 CASAVA_Build 6 136249368 2I TCAACCTACC --/CT CTGAGTCCCC 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 CT 1 2 122013 CASAVA_Build 6 136262720 1D GGATATATGA T/- TTTTTGTTAA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 T 6 5 122014 CASAVA_Build 6 136287828 1D TATTTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1102 hom 31 7 14 11 T 15 14 122015 CASAVA_Build 6 136304084 1D TTAGGTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 10 9 122016 CASAVA_Build 6 136307189 4D CAGCGAAGGC TGGA/---- TAAACACTGG 3070 het 3070 hom 37 15 15 11 TGGA 1 0 122017 CASAVA_Build 6 136308314 3I AACTGTCCAT ---/CTC CTCCACATAA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 CTC 1 2 122018 CASAVA_Build 6 136310265 4D ATGAAATCTT AAAA/---- TAACCTTGGC 3070 het 3070 ref 38 19 15 6 A 4 0 122019 CASAVA_Build 6 136338651 1I TGCCAAATTT -/G GTGTCACAGT 3070 het 3070 ref 56 29 19 8 G 1 2 122020 CASAVA_Build 6 136354248 4I GTATACAATT ----/TTTG TTTGTCAATT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 TTTG 1 2 122021 CASAVA_Build 6 136361613 1D AAAAATAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2540 hom 18 7 11 1 A 10 9 122022 CASAVA_Build 6 136397822 4D TTTTGACTTT GTTA/---- GTTCTCATTA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 GTTA 1 0 122023 CASAVA_Build 6 136407755 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTCTTTCCCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 4 2 122024 CASAVA_Build 6 136409064 1D GAAGTGTAAT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 7 6 122025 CASAVA_Build 6 136410921 4D ATAGATAGAT AGAC/---- AGACAGACAG 3070 hom 64 het 34 0 22 13 AGAC 5 4 122026 CASAVA_Build 6 136412774 1I AATCACTGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 55 22 24 9 T 9 10 122027 CASAVA_Build 6 136428878 5D TTTTTGTTTG TTTGT/----- TTTAAGTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 18 6 TTTGT 1 0 122028 CASAVA_Build 6 136433378 1D TCTAATCTGC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 T 7 6 122029 CASAVA_Build 6 136437062 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2160 het 976 hom 14 3 7 4 A 13 12 122030 CASAVA_Build 6 136441417 1D AAAAATCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 A 11 10 122031 CASAVA_Build 6 136485926 9I7M1I GTGCGGTGGC ---------TAATCCC-/TAAGGCCTGTAATCCCA GCACTTTGGG 3070 hom 69 het 25 0 24 5 N/A 0 0 122032 CASAVA_Build 6 136507534 1I TAAGGCTGTC -/T TTTGTCTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 3 4 122033 CASAVA_Build 6 136509995 1I AGTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2119 hom 20 9 10 1 A 10 11 122034 CASAVA_Build 6 136513879 1I TCTAAAGGGG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 A 6 7 122035 CASAVA_Build 6 136640589 1I AGTCAAGAGT -/A AAAAACCGCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 122036 CASAVA_Build 6 136640687 4I TCTGTATTTT ----/AAAA AGTTTTTACC 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 1 5 122037 CASAVA_Build 6 136704376 4D GAATTTATTG CTGA/---- CTGTTACTTA 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 CTGA 1 0 122038 CASAVA_Build 6 136705377 1D AATGATGACT A/- AAGTTTAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 3 2 122039 CASAVA_Build 6 136709559 2I TTCATCTGAT --/AA AGAGTACCAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 3 122040 CASAVA_Build 6 136719356 1I ATGACTTGAG -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 A 6 7 122041 CASAVA_Build 6 136729682 1D AATTCTTCAA C/- ATTTTCCCCC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 1 0 122042 CASAVA_Build 6 136730713 1I GTAGCCCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 32 0 26 6 T 9 10 122043 CASAVA_Build 6 136733737 2D CGTTACATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 23 0 18 5 T 14 12 122044 CASAVA_Build 6 136748102 1D TTTTATTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 38 0 28 10 A 10 9 122045 CASAVA_Build 6 136781805 1I AACAGACACA -/G GGATGCTCAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 2 3 122046 CASAVA_Build 6 136783648 1D TTTCCACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 50 0 37 14 A 12 11 122047 CASAVA_Build 6 136786614 1I GGGAGTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 19 1 13 5 T 12 13 122048 CASAVA_Build 6 136810323 1D TGCATTATGC T/- TTAACTGTTC 3070 hom 68 het 30 0 26 4 T 3 2 122049 CASAVA_Build 6 136819856 1I TGAAACAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 T 10 11 122050 CASAVA_Build 6 136883031 1D AGTTTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1891 het 1295 hom 34 11 11 12 A 17 16 122051 CASAVA_Build 6 136967599 1D AATTATGCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 10 9 122052 CASAVA_Build 6 137026009 1I CCCAGAGAGG -/T ATTGCAACAT 3070 hom 132 het 50 0 43 7 T 0 1 122053 CASAVA_Build 6 137026365 1I TCTCTTATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 9 10 122054 CASAVA_Build 6 137028180 1I AAGAGCTGTA -/T TTTTTTTTTT 2015 het 2015 ref 23 8 5 10 T 15 16 122055 CASAVA_Build 6 137032465 1I CCTAGTCTTT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 7 8 122056 CASAVA_Build 6 137092985 1D TGTTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 T 13 12 122057 CASAVA_Build 6 137140646 1I56M2I TGGCCCAGCC -TTCGAATGCTTGGCATTCAGGTTGACAATTTTCTGTCAGCCAAGAACCACACACTC--/ATTCGAATGCTTGGCATTCAGGTTGACAATTTTCTGTCAGCCAAGAACCACACACTCTA CACATCATCA 3070 hom 66 het 21 0 22 11 N/A 0 0 122058 CASAVA_Build 6 137146165 5D CCAATGGATT TTTAA/----- TTTATCATTT 3070 hom 75 het 31 0 25 10 TTTAA 1 0 122059 CASAVA_Build 6 137146726 2I TCCCGGACTT --/TG TGTGCTTGTC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TG 2 3 122060 CASAVA_Build 6 137159809 2D GATTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 GT 10 9 122061 CASAVA_Build 6 137171661 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2259 het 285 hom 9 1 7 1 A 17 16 122062 CASAVA_Build 6 137175125 1I TCCTAAGCAC -/A AGGCCTGTGT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 A 1 2 122063 CASAVA_Build 6 137183580 1I CTTTCTCCCT -/C CCCAGAGATA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 C 3 4 122064 CASAVA_Build 6 137199065 2D TTTTACATAA AG/-- AGAGGAATAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AG 3 2 122065 CASAVA_Build 6 137203340 3I ATGCTAAGTT ---/GTA GGAGCTACAT 3070 hom 132 het 52 0 44 8 GTA 0 1 122066 CASAVA_Build 6 137216306 1I CCTTTCTTGC -/T TAATAAACTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 122067 CASAVA_Build 6 137216912 10D ATAGTTAACC TTTACGGTTA/---------- GTAAGGCTGA 3070 hom 48 het 16 0 17 0 TTTACGGTTA 1 0 122068 CASAVA_Build 6 137220518 1D TTTAAACCTC T/- TGTCTCCTCA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 2 1 122069 CASAVA_Build 6 137223509 3D TAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGTG 3070 hom 87 het 31 0 30 3 AAG 1 0 122070 CASAVA_Build 6 137225098 1D TAGTAGAGAC A/- GGGTTTTGCC 3070 hom 30 het 11 0 9 2 A 1 0 122071 CASAVA_Build 6 137227072 3I GGAAGCACTC ---/AAT AAATATTAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAT 0 1 122072 CASAVA_Build 6 137227147 1D TTTTTCTCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 86 het 32 0 29 6 A 10 9 122073 CASAVA_Build 6 137230609 3D TCCATCTCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 AAC 7 6 122074 CASAVA_Build 6 137237991 1I AAAAAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 28 1 24 3 T 11 12 122075 CASAVA_Build 6 137238874 1D TTTCATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 24 1 13 10 T 13 12 122076 CASAVA_Build 6 137247458 6D ATATTTCTAT TTGAAA/------ TTCATGTTGC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TTGAAA 1 0 122077 CASAVA_Build 6 137249567 4D AAGTTGAATA TGTC/---- TGGGCATTTG 3070 hom 108 het 41 0 37 6 TGTC 1 0 122078 CASAVA_Build 6 137250457 5D AGAGAAAGAT AAAAC/----- AAATGTGGCA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 AAAAC 1 0 122079 CASAVA_Build 6 137293228 7I GGTGGCAATT -------/TGCCCCA GGACCTCAGT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 TGCCCCA 0 1 122080 CASAVA_Build 6 137314393 1D TAACAGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 32 0 21 12 T 12 11 122081 CASAVA_Build 6 137329587 4I CTTTTCTTTC ----/TTTT CTTTTCTTTT 1764 hom 29 het 15 0 10 5 T 0 4 122082 CASAVA_Build 6 137330055 1D CACTACCTTC T/- TTTTTTGCAC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 7 6 122083 CASAVA_Build 6 137331562 1D TAATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 16 0 11 5 T 11 10 122084 CASAVA_Build 6 137333451 1I GCTAAAAAAA -/T TAGTTAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 2 122085 CASAVA_Build 6 137335550 1I TCACTGTAAA -/T TTTTTATTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 5 6 122086 CASAVA_Build 6 137336460 1I TCTCTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 136 hom 32 1 25 6 T 11 12 122087 CASAVA_Build 6 137339701 1I CCTCAGAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 12 hom 38 1 32 5 T 9 10 122088 CASAVA_Build 6 137345610 1D TTTTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 32 0 23 9 A 12 11 122089 CASAVA_Build 6 137350940 1I GGCGAGGGAG -/A AAAAAAGAGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 6 7 122090 CASAVA_Build 6 137351038 1I TACAGCTGAC -/A ATTTTAAATG 3070 het 3070 ref 53 23 22 8 A 1 2 122091 CASAVA_Build 6 137361986 2D ACTTTGTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 13 13 T 13 11 122092 CASAVA_Build 6 137362285 2I CATGTTTGAA --/TG TGTGTGTATA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TG 3 4 122093 CASAVA_Build 6 137373335 1D TGTTGTTGGA T/- TTGTCCCAAG 3070 hom 114 het 41 0 38 4 T 3 2 122094 CASAVA_Build 6 137384656 4D GCTAATACTT ACTA/---- AATCCTTACC 3070 hom 93 het 33 0 32 3 ACTA 1 0 122095 CASAVA_Build 6 137386097 7I GTTCTAGGCA -------/GAGACCC CTGAGATGGG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GAGACCC 0 1 122096 CASAVA_Build 6 137387551 2I TTTTGGAACT --/AA GAGACCCCTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 0 2 122097 CASAVA_Build 6 137391685 1I TAGAAACATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 A 9 10 122098 CASAVA_Build 6 137392772 1I TAGAAAAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1273 hom 39 3 31 5 A 9 10 122099 CASAVA_Build 6 137403131 2I GAAATATAGA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 50 18 21 11 TG 4 5 122100 CASAVA_Build 6 137404646 2I TTTTTTTTAA --/AT ATATATATAT 1809 het 941 hom 15 2 5 8 AT 8 9 122101 CASAVA_Build 6 137405046 1I CTTTGGCTTG -/C TCTGGGAAGT 3070 hom 75 het 33 0 24 9 C 0 1 122102 CASAVA_Build 6 137405502 1I ACATGCTGAG -/T TTTTTTTTTT 993 het 993 ref 45 30 3 12 T 10 11 122103 CASAVA_Build 6 137414287 6D TGTGTGTGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 2976 het 2976 ref 32 15 11 8 TG 11 8 122104 CASAVA_Build 6 137414572 1I AACAGTGACA -/T GACTCTTCAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 0 1 122105 CASAVA_Build 6 137415355 1I GTGATTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 11 12 122106 CASAVA_Build 6 137432920 2D ATGAGGGATG GT/-- GCTATCTAGC 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 GT 1 0 122107 CASAVA_Build 6 137442515 1D TTTACATTCT C/- CCTAGCAGTG 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 C 3 2 122108 CASAVA_Build 6 137459092 1I CACCAGGAAA -/T TTTTCTTGGT 3070 het 3070 hom 54 26 27 1 T 4 5 122109 CASAVA_Build 6 137469310 1D AGCCCCACCG A/- AGAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 2 1 122110 CASAVA_Build 6 137477452 1D ATCAATTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1117 hom 25 3 12 10 T 12 11 122111 CASAVA_Build 6 137480122 1D3M1D5M1D TGAAGTGTGT ATGTAGTGTGT/-TGT-GTGTG- TTTCTGTGTG 3070 het 3070 ref 47 25 21 9 N/A 0 0 122112 CASAVA_Build 6 137504811 1D GTGTGCAAAC T/- GAGGAGCAGG 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 T 1 0 122113 CASAVA_Build 6 137562105 2I AACTCCCCTT --/TA TATATATATA 1455 het 1370 hom 9 3 3 3 TA 7 8 122114 CASAVA_Build 6 137563519 1D CCCTGAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 11 10 122115 CASAVA_Build 6 137581117 5D CATAATAAAA AAAAG/----- AAAACTGAAT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 AAAAG 1 0 122116 CASAVA_Build 6 137584525 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1596 het 1583 hom 25 7 5 13 T 17 16 122117 CASAVA_Build 6 137600217 3D TAACAGAGAC TGG/--- TGGATCAGTC 3070 hom 68 het 26 0 23 3 TGG 2 1 122118 CASAVA_Build 6 137603375 1I CTGGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 2209 het 380 hom 11 1 6 4 A 13 14 122119 CASAVA_Build 6 137603504 1D AGCCACTGAG C/- CCAGCTGGAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 3 2 122120 CASAVA_Build 6 137617849 10D TATTTCTCAG ACTGGCCGAC/---------- ACTTAGGGAA 3070 hom 93 het 31 0 32 1 ACTGGCCGAC 1 0 122121 CASAVA_Build 6 137619379 1D CCTTAAGGAT G/- GGGGTGGCCA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 G 5 4 122122 CASAVA_Build 6 137634452 1I TTTACATGTC -/T TTTATAATGC 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 T 3 4 122123 CASAVA_Build 6 137641572 1I CTGATACATA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 30 0 21 9 T 8 9 122124 CASAVA_Build 6 137648460 1D CCCCAACTCT A/- AAAAAAAAAA 2828 het 2530 hom 22 8 8 8 A 12 11 122125 CASAVA_Build 6 137655528 1I CATCTGATAT -/G GGTTTGGCTG 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 G 2 3 122126 CASAVA_Build 6 137661236 1D TACCATCCAA C/- TTTTATTTCT 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 C 1 0 122127 CASAVA_Build 6 137670020 4D TCTTGCTAAC CAGT/---- CAGTCTTTTG 3070 het 3070 ref 38 21 15 5 CAGT 2 1 122128 CASAVA_Build 6 137671440 1D ACACTGCTAG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 42 24 10 8 A 8 7 122129 CASAVA_Build 6 137673700 1D ATTATTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 T 11 10 122130 CASAVA_Build 6 137676401 6I ATTTGTCTTT ------/TTCTTA TTCTAGCTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTCTTA 0 1 122131 CASAVA_Build 6 137685849 1D AAATGACAGC A/- AAGAAAAGAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 5 A 3 2 122132 CASAVA_Build 6 137686289 1D GATTATGGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 22 22 5 T 9 8 122133 CASAVA_Build 6 137692887 1I AATTTTCCTG -/T TTTTTTTTTT 1516 het 1516 ref 16 6 4 6 T 10 11 122134 CASAVA_Build 6 137696522 1I AGACTTGGGG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 8 9 122135 CASAVA_Build 6 137698734 1I GACACATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 11 12 122136 CASAVA_Build 6 137704036 1I GCGTTGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 T 10 11 122137 CASAVA_Build 6 137704331 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 95 het 43 0 31 13 TG 9 8 122138 CASAVA_Build 6 137711278 3D ATTTCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3003 het 121 hom 15 3 7 5 A 17 14 122139 CASAVA_Build 6 137716127 1I ATGCAAAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2903 hom 30 9 15 6 T 9 10 122140 CASAVA_Build 6 137724097 2I CGTAGGAGAC --/TT TTAAAAATCA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 T 2 4 122141 CASAVA_Build 6 137743076 1I ACAAAACAAC -/A ACAAATAATT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 1 2 122142 CASAVA_Build 6 137756603 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2403 het 2403 ref 41 30 7 4 A 13 12 122143 CASAVA_Build 6 137792180 1I CTATTAACAG -/A AAAAAAAAAA 1357 het 1357 ref 45 35 3 7 A 10 11 122144 CASAVA_Build 6 137884359 1D AGATTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 1178 het 1178 ref 42 32 3 8 T 11 10 122145 CASAVA_Build 6 137887084 1D ATTTTAGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 31 1 25 5 T 11 10 122146 CASAVA_Build 6 137893578 1D TCTGCTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 28 0 16 12 T 12 11 122147 CASAVA_Build 6 137896464 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2725 het 1946 hom 20 6 8 6 A 15 14 122148 CASAVA_Build 6 137896747 1D TACTTCAGTC T/- TCTGCCACGG 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 2 1 122149 CASAVA_Build 6 137911359 2D AGGATAGGAA AG/-- AGAGGGAGAA 3070 hom 142 het 53 0 47 6 AG 3 2 122150 CASAVA_Build 6 137912598 2I CAAGGCGGGC --/GG CTGACCTGAG 3070 hom 78 het 27 0 25 2 G 0 2 122151 CASAVA_Build 6 137945023 1D GTTTCTCCCA T/- TTTTTTTTTG 603 het 603 ref 33 25 3 5 T 10 9 122152 CASAVA_Build 6 137967280 9D ACAGCAGGCT ACTCTAGGG/--------- ACTCTTCAAG 3070 het 3070 hom 49 18 22 12 ACTCTAGGG 1 0 122153 CASAVA_Build 6 137985609 1I CCTCATGATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 51 20 21 10 T 9 10 122154 CASAVA_Build 6 137990404 2D ACATACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 1290 hom 17 6 9 2 AC 7 6 122155 CASAVA_Build 6 137992161 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 11 15 6 TA 6 5 122156 CASAVA_Build 6 138019866 1I TTCCTTTCCA -/T CCAAAAAAAC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 0 1 122157 CASAVA_Build 6 138021934 3D AAAACCAGGA AGG/--- TGTAACTTAA 3070 het 3070 ref 55 28 24 5 AGG 1 0 122158 CASAVA_Build 6 138035227 2D AAAAATTAAA TG/-- TAGTTTTCCA 1916 het 1916 ref 24 16 4 4 TG 1 0 122159 CASAVA_Build 6 138037441 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTGGTG 3070 het 3070 hom 49 18 23 10 T 7 6 122160 CASAVA_Build 6 138038350 1I GTCGGCAGGT -/G GGGCCTAGTT 3070 hom 69 het 28 0 22 6 G 3 4 122161 CASAVA_Build 6 138041256 1D TACTCTAGGG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 7 6 122162 CASAVA_Build 6 138041546 2D GACAAGCCTT TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 43 23 19 2 TG 5 4 122163 CASAVA_Build 6 138044773 1I TGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 T 10 11 122164 CASAVA_Build 6 138053417 1D AGGAATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 16 9 T 11 10 122165 CASAVA_Build 6 138064121 1D ACCATCATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 29 1 21 8 A 11 10 122166 CASAVA_Build 6 138066871 1I CAATATAAGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 319 hom 27 1 24 2 T 8 9 122167 CASAVA_Build 6 138067046 1D ATGTTTTTGA T/- TTTTTGTAGA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 6 5 122168 CASAVA_Build 6 138094818 1D GTTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 9 122169 CASAVA_Build 6 138138411 1I CCTATTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 13 14 122170 CASAVA_Build 6 138159288 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 9 8 122171 CASAVA_Build 6 138183446 1D GCAAAGAAAT A/- AAACTGTATA 3070 hom 141 het 50 0 48 4 A 4 3 122172 CASAVA_Build 6 138186479 1D GCACAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 36 2 28 6 A 13 12 122173 CASAVA_Build 6 138205764 1D ACCATGAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2275 hom 31 7 13 11 A 14 13 122174 CASAVA_Build 6 138231812 2D AGAGAAAAAT AA/-- AAGAGTCAGG 3070 hom 117 het 43 0 40 4 A 4 2 122175 CASAVA_Build 6 138237655 3D TCCTTCTCTT CTC/--- CTCCTTTCTG 3070 hom 96 het 37 0 33 7 CTC 2 1 122176 CASAVA_Build 6 138243477 4D CTTCCCAGGG GCCT/---- GCCTCCACCT 3070 hom 81 het 28 0 25 4 GCCT 2 1 122177 CASAVA_Build 6 138254989 1D GCCAAGGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 10 9 122178 CASAVA_Build 6 138271839 2I ATACCCTCAT --/GA GGAGGTTTTT 3070 hom 101 het 38 0 32 6 GA 0 1 122179 CASAVA_Build 6 138298479 3I TGTACCAGAG ---/TTC TTCTTCTCCA 3070 hom 86 het 36 0 29 7 TTC 2 3 122180 CASAVA_Build 6 138299696 2D GTTTTTGGGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 24 0 21 4 T 11 9 122181 CASAVA_Build 6 138318202 1I CATAGCCCGT -/G GGAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 G 2 3 122182 CASAVA_Build 6 138330029 2D GCTTACCCTG GC/-- AATGACATTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 GC 1 0 122183 CASAVA_Build 6 138338627 2I GGGCTTTAAA --/AG AGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 AG 1 2 122184 CASAVA_Build 6 138340042 4I CACCAGACCC ----/AGCG AGCCTGGGGC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 AGCG 0 1 122185 CASAVA_Build 6 138356266 1D CCAATGTTGA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 9 8 122186 CASAVA_Build 6 138371997 1I TTTAACAAAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 7 8 122187 CASAVA_Build 6 138373947 2I TATGGTGCTA --/TG TTCCCCCATA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TG 0 1 122188 CASAVA_Build 6 138377921 1D TTTCTAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 37 1 25 11 T 15 14 122189 CASAVA_Build 6 138390416 1D AGTTCTACGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 15 11 T 13 12 122190 CASAVA_Build 6 138406077 1D CATCTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 14 11 T 13 12 122191 CASAVA_Build 6 138406685 4I AAGTTTACTC ----/CTAA CTATTGTAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 CTAA 0 1 122192 CASAVA_Build 6 138408358 1D TGTCATGACA T/- CATGCTCATC 3070 het 3070 ref 44 23 18 5 T 1 0 122193 CASAVA_Build 6 138415254 1D TGCATTTACC T/- CTCAGGTGGG 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 T 1 0 122194 CASAVA_Build 6 138421491 1D GAAACACATG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 A 7 6 122195 CASAVA_Build 6 138422249 1D ACTATTGTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 38 het 34 1 25 8 T 10 9 122196 CASAVA_Build 6 138446445 26D GATAAATAGA AAGAGCTGGATAATATATCCAGCAGG/-------------------------- AAGAGCTGGA 3070 hom 86 het 33 0 26 15 AAGAGCTGGATAATATATCCAGCAGG 2 1 122197 CASAVA_Build 6 138459870 1D AAGTAGCTCT G/- ATCTTATAAC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 1 0 122198 CASAVA_Build 6 138475527 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2226 het 2226 ref 32 11 9 12 A 13 14 122199 CASAVA_Build 6 138477498 1I CTGCCAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 15 18 12 T 10 11 122200 CASAVA_Build 6 138481260 1D ACAAAAAAAA C/- AAAAAATTAG 2601 het 1995 hom 17 6 10 1 C 1 0 122201 CASAVA_Build 6 138482544 1I CCAACGGAGT -/A AAAGCATTCC 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 A 3 4 122202 CASAVA_Build 6 138482885 1I ACCTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 2875 het 2875 ref 31 12 6 13 A 10 11 122203 CASAVA_Build 6 138503836 1D TTATAGTTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 10 9 122204 CASAVA_Build 6 138510375 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2030 het 272 hom 18 3 6 9 A 17 16 122205 CASAVA_Build 6 138511288 1I AAGTAAGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 29 2 12 15 T 14 15 122206 CASAVA_Build 6 138513894 1D CCTTTTTATC A/- CTTAGAATTC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 1 0 122207 CASAVA_Build 6 138517466 3I TAAAAATGCT ---/GAA GATCATAAAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 GAA 0 1 122208 CASAVA_Build 6 138519830 6I GGATCTGTGG ------/CTGAGA CTAATGATTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CTGAGA 0 1 122209 CASAVA_Build 6 138599830 1I GAAGACTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 272 hom 35 2 24 9 T 12 13 122210 CASAVA_Build 6 138629956 1I AATGATGGCC -/T TTGAGCCATC 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 T 2 3 122211 CASAVA_Build 6 138658458 1I AGACTCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 14 2 10 2 A 13 14 122212 CASAVA_Build 6 138667904 1D TTCATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 25 1 18 6 A 14 13 122213 CASAVA_Build 6 138669437 1D AGACCTATAG T/- TCAGTGGAAC 3070 hom 69 het 29 0 24 7 T 2 1 122214 CASAVA_Build 6 138669601 1D TCACCATGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 A 10 9 122215 CASAVA_Build 6 138670292 3D TCATGCTATT AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 119 het 49 0 40 11 A 12 9 122216 CASAVA_Build 6 138673386 1I ATGTTTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 T 8 9 122217 CASAVA_Build 6 138678680 2I ACTGCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 19 1 12 6 A 13 15 122218 CASAVA_Build 6 138683776 1D GGGTTTTGGC G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 144 het 51 0 49 2 G 9 8 122219 CASAVA_Build 6 138704459 1D ATTATGCCTC A/- AAAAAAAAAG 1180 het 1180 ref 45 38 3 4 A 10 9 122220 CASAVA_Build 6 138725516 1D ACCCAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 1856 het 1856 ref 25 10 6 9 T 15 14 122221 CASAVA_Build 6 138736941 1D AACCATCATG C/- CCCCCCCCCA 1540 het 1540 ref 37 23 4 10 C 10 9 122222 CASAVA_Build 6 138743618 1I ATACATAAAT -/A AAATGCAGGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 3 4 122223 CASAVA_Build 6 138818592 2I CTAGCAATAG --/TT CATAAACACT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 0 2 122224 CASAVA_Build 6 138825403 4D CATCCATATC CAAA/---- CCACAGCAGG 3070 het 3070 hom 43 13 26 5 CAAA 1 0 122225 CASAVA_Build 6 138881224 1I TTACAGCAGG -/T TTTTTTTTTT 830 het 830 ref 35 20 4 11 T 13 14 122226 CASAVA_Build 6 139024326 1D CCCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2132 het 2002 hom 19 10 5 4 A 15 14 122227 CASAVA_Build 6 139096202 1D GGAGGCTGAT G/- CATGAGAATG 3070 hom 42 het 19 0 15 6 G 1 0 122228 CASAVA_Build 6 139101751 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 19 0 11 8 A 17 14 122229 CASAVA_Build 6 139105171 1D13M10I AACCACCTGG TTAAATTTAACCAC----------/-TAGCTTCAACTGCAGTTGAGGGG CTGAATGTAG 3070 hom 99 het 34 0 34 6 N/A 0 0 122230 CASAVA_Build 6 139112567 1D AGCTGAACAC G/- GGGGGAGAAG 3070 hom 100 het 38 0 34 4 G 6 5 122231 CASAVA_Build 6 139113668 1D TTTATATTAC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 T 8 7 122232 CASAVA_Build 6 139114355 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1569 het 140 hom 16 2 8 6 T 15 14 122233 CASAVA_Build 6 139124761 1I CATTGTGGCA -/G GCACCTGCAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 G 1 2 122234 CASAVA_Build 6 139129531 1I CTCTGACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 11 12 122235 CASAVA_Build 6 139133120 1I GAAGAGGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 11 12 122236 CASAVA_Build 6 139154077 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 11 10 122237 CASAVA_Build 6 139155389 1D AATTCTAGAC A/- AGAGTATAAT 3070 het 3070 ref 36 16 12 10 A 2 1 122238 CASAVA_Build 6 139155563 4I AAAATCTTCT ----/TAAC TAACTGATTA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TAAC 1 2 122239 CASAVA_Build 6 139156991 4I CATCACCGTG ----/ATCT ATCTAATTCT 3070 het 3070 hom 44 23 21 0 ATCT 1 2 122240 CASAVA_Build 6 139157543 1D AGGGATTTAA G/- GGGGAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 11 25 7 G 5 4 122241 CASAVA_Build 6 139158394 1D TGAAGAAGGG T/- TTTTTGGTTT 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 T 6 5 122242 CASAVA_Build 6 139160475 1I TTCTGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 13 9 A 10 11 122243 CASAVA_Build 6 139182077 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAAGGAAA 3070 het 1681 hom 39 16 16 7 AG 0 1 122244 CASAVA_Build 6 139190773 1I TAAAGGACTA -/T TTTTTTTTTT 2395 het 2395 ref 15 7 5 3 T 10 11 122245 CASAVA_Build 6 139197976 1D TTAGCCACTT A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 8 7 122246 CASAVA_Build 6 139203212 1I TGTGACCATA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 7 8 122247 CASAVA_Build 6 139203419 1D TGGCAGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 9 8 122248 CASAVA_Build 6 139205137 1I AAAAATACAC -/A AAAAACTAGG 3070 het 2944 hom 20 8 11 1 A 5 6 122249 CASAVA_Build 6 139212775 2D CAGTTCAGTA TT/-- GTTTGTTCAC 3070 het 3070 ref 41 27 11 4 T 2 0 122250 CASAVA_Build 6 139212980 1D TGACTTTTTT C/- TTTTTTCGAG 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 C 1 0 122251 CASAVA_Build 6 139213365 4I TATAGTATGT ----/TTTG TTTATCTGTT 3070 het 3070 ref 56 25 22 9 TTTG 0 1 122252 CASAVA_Build 6 139219022 27D TACTCAAATA CCCCCACCACAGCAATTCTTTTTGTCT/--------------------------- CCCCCACCCC 3070 hom 45 het 15 0 16 5 CCCCCACCACAGCAATTCTTTTTGTCT 1 0 122253 CASAVA_Build 6 139223347 4D TATAGACATC AGTA/---- AGTGAGAGAC 3070 het 3070 ref 46 24 22 3 AGTA 1 0 122254 CASAVA_Build 6 139233435 6I TTGACATTTA ------/TGCAAT TGAGCCCTGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TGCAAT 0 1 122255 CASAVA_Build 6 139236060 1I AAATTTGATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 8 9 122256 CASAVA_Build 6 139239501 1D TTGGGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 24 0 21 3 A 12 11 122257 CASAVA_Build 6 139248954 1D ACTAAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 11 10 122258 CASAVA_Build 6 139250055 5I TTTTCTTTTC -----/TTTTT TTTAATTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 3 8 122259 CASAVA_Build 6 139251308 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 8 7 122260 CASAVA_Build 6 139253680 1I AGGTTGGTGG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 83 het 32 0 28 4 T 6 7 122261 CASAVA_Build 6 139254419 1D TCTTTTGAAT C/- CCCCCCATGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 7 6 122262 CASAVA_Build 6 139254638 4I AGAATAAATC ----/TCTT TATTTTACAC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TCTT 0 1 122263 CASAVA_Build 6 139262270 2D GTACATAGAT TG/-- TGTGTGTGTG 2276 het 2276 ref 50 32 5 13 TG 10 9 122264 CASAVA_Build 6 139270128 1I GTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1089 het 242 hom 21 2 5 14 A 16 17 122265 CASAVA_Build 6 139272633 2D ATTAAATCTC TT/-- TTGTTTATAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 4 2 122266 CASAVA_Build 6 139287378 11D ATCATAATAC TATGAGTGATT/----------- ATTGTCACTA 3070 hom 114 het 42 0 39 5 TATGAGTGATT 1 0 122267 CASAVA_Build 6 139288490 1D TCCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 9 7 A 15 14 122268 CASAVA_Build 6 139295137 4I CCACAGACCC ----/CTTT CTAAGAGTCC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CTTT 0 1 122269 CASAVA_Build 6 139297648 3D TTCCAATCTC ATT/--- AATAACTTTA 3070 hom 114 het 42 0 39 5 ATT 1 0 122270 CASAVA_Build 6 139301681 2D ATTTTTATAA TT/-- TTTTTTTTTT 1226 het 44 hom 20 1 3 16 T 16 14 122271 CASAVA_Build 6 139309105 2I AAAATATGGT --/AC AGAGTATTCT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AC 0 1 122272 CASAVA_Build 6 139312558 1D TCCATCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 27 1 20 7 A 12 11 122273 CASAVA_Build 6 139353168 1I TACTACTAGG -/T TTTTTTTTTT 1206 het 1206 ref 38 24 4 10 T 15 16 122274 CASAVA_Build 6 139399859 1D CAATTATCCG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 10 9 122275 CASAVA_Build 6 139405104 1I TGGCTGATGA -/T TTATACATTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 2 3 122276 CASAVA_Build 6 139409382 1D GAAGGTTGGG A/- ACATTATTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 A 2 1 122277 CASAVA_Build 6 139410279 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2878 het 51 hom 14 1 8 5 A 15 16 122278 CASAVA_Build 6 139420482 15D CCAAAGCAAC TTACTAGCCTCTCTT/--------------- TTAGGATCTG 3070 hom 107 het 39 0 33 11 TTACTAGCCTCTCTT 1 0 122279 CASAVA_Build 6 139421442 3D CTTTACAAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 193 hom 41 3 23 15 T 17 14 122280 CASAVA_Build 6 139464766 1D AGAGCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1392 het 1392 ref 24 11 5 8 A 16 15 122281 CASAVA_Build 6 139480927 1I TGCTCAACAT -/C ACTAATCATC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 0 1 122282 CASAVA_Build 6 139506690 7D ACTCTGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 14 0 10 4 A 19 12 122283 CASAVA_Build 6 139508871 1I ATATATTGCC -/A ACTCAAATCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 122284 CASAVA_Build 6 139513305 1D GAGTGGGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 19 1 15 3 A 13 12 122285 CASAVA_Build 6 139514298 4D TGAACTTCTG TTTC/---- TTCCGGCCGT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 TTTC 1 0 122286 CASAVA_Build 6 139516034 4D TGAAGGTATT AATC/---- AATCAAACTT 3070 hom 101 het 40 0 34 8 AATC 2 1 122287 CASAVA_Build 6 139517176 2D ACCTGGAGAA TG/-- TGTGCTGCAC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 TG 3 2 122288 CASAVA_Build 6 139518982 3I GTGACGTTTG ---/TAT TATTATTATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TAT 3 4 122289 CASAVA_Build 6 139526183 11D TTCTCCATTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 37 3 31 8 T 21 10 122290 CASAVA_Build 6 139528636 7D TTGCACAGTG TGGGACA/------- TGTGTGGGAC 3070 hom 90 het 34 0 29 6 TGGGACA 1 0 122291 CASAVA_Build 6 139541439 1D AGTCTCACTC T/- TGTCACCCAG 3070 hom 70 het 28 0 24 4 T 2 1 122292 CASAVA_Build 6 139543956 1D ATTAGATAGA C/- CCCCAAGGTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 5 4 122293 CASAVA_Build 6 139547442 3D CACCACGAAT TCA/--- TCATTTTACT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 TCA 2 1 122294 CASAVA_Build 6 139550263 1I ATCTTTTGCT -/G TTTTTTTCCC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 122295 CASAVA_Build 6 139553935 1D TGAAGTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 12 11 122296 CASAVA_Build 6 139556489 1D ATCTTCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 25 1 18 6 T 13 12 122297 CASAVA_Build 6 139559440 1I TCCTGACTTC -/A GGCGATCCAC 3070 hom 44 het 16 0 14 3 A 0 1 122298 CASAVA_Build 6 139560197 4I AGACAGTGAT ----/TTTG TTTATTTGTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTTG 0 1 122299 CASAVA_Build 6 139565185 2D TGGTCTCTTT TA/-- TATTTTATTT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TA 2 1 122300 CASAVA_Build 6 139584165 1D CCTAAAAAGT C/- TGAAGCCCAA 3070 het 3070 hom 41 13 25 3 C 1 0 122301 CASAVA_Build 6 139592153 4I ATTTTAAAAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 2662 hom 24 7 10 7 TTTA 3 4 122302 CASAVA_Build 6 139606825 1D GACCTTTTTT C/- CCCCACTCGT 3070 het 3070 hom 49 19 26 6 C 5 4 122303 CASAVA_Build 6 139608690 1D TCCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 2161 hom 23 7 12 4 T 7 6 122304 CASAVA_Build 6 139608915 1D ATGTGCATCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 14 17 8 T 9 8 122305 CASAVA_Build 6 139620555 1I TCCCTATTGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 8 9 122306 CASAVA_Build 6 139626512 6I TTTGCGATTG ------/TTATTC TTATTCTTTT 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 TTATTC 1 2 122307 CASAVA_Build 6 139639755 1D TCTTTGCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 58 30 19 11 A 10 9 122308 CASAVA_Build 6 139641460 2I GTCAAGAGAC --/TG TACTCTTGAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TG 0 1 122309 CASAVA_Build 6 139643378 1I GGGAAACTGA -/G GCAGGAGACT 3023 het 3023 ref 23 10 8 5 G 1 2 122310 CASAVA_Build 6 139643507 1I TCTTCCAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 10 11 122311 CASAVA_Build 6 139650706 1I ATGTCTTCTG -/T TTTTCTCTAT 3070 het 3070 ref 50 24 15 11 T 4 5 122312 CASAVA_Build 6 139651863 4D TCTAACGTAG AGAA/---- AGGCAATGTC 3070 het 3070 ref 49 28 19 3 AGAA 1 0 122313 CASAVA_Build 6 139652165 1D ACGTACCCCC T/- GCTTGCTCAA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 1 0 122314 CASAVA_Build 6 139658410 1I GATATTTTTT -/G GGGGGGGGGA 1647 het 1647 ref 34 19 6 9 G 9 10 122315 CASAVA_Build 6 139665151 1D GAGAGAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1570 hom 38 9 14 15 A 15 14 122316 CASAVA_Build 6 139675511 1I AAACATCCCT -/C TGGATAAGGA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 C 0 1 122317 CASAVA_Build 6 139690547 2I TTGTTGTTGT --/TG TTTGTTTTTT 3070 het 836 hom 23 3 12 8 TG 0 1 122318 CASAVA_Build 6 139697377 1I TGTTTTACAG -/C CAATATTTAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 1 2 122319 CASAVA_Build 6 139700551 1I AAAAATATAT -/G TTTTTTTCGC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 0 1 122320 CASAVA_Build 6 139706522 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1079 het 1079 ref 34 14 10 10 T 14 15 122321 CASAVA_Build 6 139711005 1D GATAAGGGAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 2141 hom 30 5 20 5 A 8 7 122322 CASAVA_Build 6 139719843 2D AATAATAATT AA/-- AAAAAAAAGG 3070 het 827 hom 12 2 8 2 A 10 8 122323 CASAVA_Build 6 139723339 1I GAAGATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 12 13 122324 CASAVA_Build 6 139729143 5I TTAATCACTT -----/ATTAA ATTGATCATT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 ATTAA 0 1 122325 CASAVA_Build 6 139730367 3I ACGAGAATAA ---/ACC ACCACCACCA 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 ACC 3 4 122326 CASAVA_Build 6 139733633 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 1051 het 1051 ref 19 16 3 1 G 1 0 122327 CASAVA_Build 6 139734202 5I GAAAACATGA -----/AAGAG AAAACAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 AAGAG 0 1 122328 CASAVA_Build 6 139739014 2D CGCCTCCCCG CC/-- CCCCCCTCGT 1965 het 1965 ref 25 9 7 9 C 8 6 122329 CASAVA_Build 6 139745911 2D CACATACGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2264 het 2264 ref 18 7 7 4 T 13 11 122330 CASAVA_Build 6 139756853 2I CTGCCATAAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2697 hom 27 11 12 4 T 10 12 122331 CASAVA_Build 6 139758035 1I TTACAGCTGA -/T TTGTAACAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 2 3 122332 CASAVA_Build 6 139763177 1I ATTAGTAGTT -/C TGGCTCTGTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 122333 CASAVA_Build 6 139771701 1I GCTGGAAGCT -/A GGTGAATTTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 0 1 122334 CASAVA_Build 6 139786760 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTGTATTT 2347 het 826 hom 11 3 7 1 T 4 5 122335 CASAVA_Build 6 139787982 1D TCTGTAAAAT G/- GGAGGAAAAG 3070 het 3070 hom 40 20 16 4 G 3 2 122336 CASAVA_Build 6 139788095 1D CATCTTTCCT C/- CCCCCCCTTC 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 C 8 7 122337 CASAVA_Build 6 139793308 1D AAAAAAAAAA G/- ATAAAAAGAA 1530 het 1144 hom 20 11 5 4 G 1 0 122338 CASAVA_Build 6 139799430 1D ACAGCAAAAC A/- AAACCCAACC 3070 het 3070 ref 50 25 20 6 A 4 3 122339 CASAVA_Build 6 139806275 1I ATGTTTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 T 10 11 122340 CASAVA_Build 6 139814804 1I AATTCATTGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 A 8 9 122341 CASAVA_Build 6 139818307 1D ATACACTACC T/- TTTTTTTTTT 2057 het 2057 ref 27 10 5 12 T 13 12 122342 CASAVA_Build 6 139827791 1D ATAAATTAAA G/- GAGAATTCTT 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 G 2 1 122343 CASAVA_Build 6 139841373 1D TAATTTATTT A/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 1 0 122344 CASAVA_Build 6 139843149 3I CTAAATACTC ---/CTT CTTTCTTTCC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 CTT 1 2 122345 CASAVA_Build 6 139846638 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1694 hom 26 8 11 7 A 15 14 122346 CASAVA_Build 6 139847537 1I AAAGGAATAC -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 6 7 122347 CASAVA_Build 6 139850214 1I TGGAGAAGAT -/G GGAATAGAAG 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 G 2 3 122348 CASAVA_Build 6 139861574 2I GCCAAACAAA --/TC TTAGATCATA 3070 het 3070 ref 42 26 15 1 TC 0 1 122349 CASAVA_Build 6 139871389 4I AGAAATAAAT ----/TGAA TGATATATCA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 TGAA 0 1 122350 CASAVA_Build 6 139876048 1D AGAGAAAAGA G/- AAGGTCAGGC 2978 het 2384 hom 19 7 8 4 G 1 0 122351 CASAVA_Build 6 139877101 1I CCAAACTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 485 hom 25 6 15 4 T 10 11 122352 CASAVA_Build 6 139884270 3I ATGTTGAGAA ---/ATT GCTCTTGAGT 3070 het 3070 hom 55 19 25 11 ATT 0 1 122353 CASAVA_Build 6 139909600 2D AGTTATTTTT TG/-- TTTGTTTACT 3070 hom 92 het 36 0 31 6 TG 1 0 122354 CASAVA_Build 6 139912903 1I CTGTCTGGAC -/T TTTTTTTTTT 1851 het 793 hom 28 5 11 12 T 16 17 122355 CASAVA_Build 6 139914571 4D AGCTGGGAGA TGGT/---- TGGGATTTTG 3070 hom 84 het 30 0 27 9 TGGT 1 0 122356 CASAVA_Build 6 139915079 1D CCTAAAAAAA T/- ATTAAGAGAG 3070 hom 65 het 28 0 22 6 T 1 0 122357 CASAVA_Build 6 139917457 3D TTGGGAGGCC GAG/--- GAGGGCAGAT 3070 hom 54 het 20 0 18 5 GAG 2 1 122358 CASAVA_Build 6 139921428 1D CCTTTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 38 1 32 5 T 13 12 122359 CASAVA_Build 6 139925885 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 9 8 122360 CASAVA_Build 6 139927125 1D TTGTATATTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 T 9 8 122361 CASAVA_Build 6 139941198 1I AGCTTTTATA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 7 8 122362 CASAVA_Build 6 139944683 1D AGAAGTCTAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 24 het 13 0 9 5 T 9 8 122363 CASAVA_Build 6 139952212 1I ACCAGCAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 A 8 9 122364 CASAVA_Build 6 139959986 7D AGTAGCTGGA GCTACTG/------- GCTGGATTCA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 GCTACTG 1 0 122365 CASAVA_Build 6 139969062 14D ACACATATTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 20 9 T 24 10 122366 CASAVA_Build 6 139970017 1D TAGGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 30 1 24 5 A 11 10 122367 CASAVA_Build 6 139989212 3I TATTGTATCC ---/TCT TCTTCTTTTG 3070 hom 74 het 31 0 25 6 TCT 2 3 122368 CASAVA_Build 6 140004193 11I TCTGCCTATA -----------/GAAATCTTTGT GAAATTCTCA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 GAAATCTTTGT 0 1 122369 CASAVA_Build 6 140011212 1I GAAGGATTGG -/C TGTGAGTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 C 0 1 122370 CASAVA_Build 6 140046863 6D CACCAATTCC TAGGAA/------ TTTGAAGGAC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 TAGGAA 1 0 122371 CASAVA_Build 6 140058916 1D CTTCTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 2169 het 2169 ref 40 31 5 5 A 11 10 122372 CASAVA_Build 6 140064842 1I TTGGAAGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 A 10 11 122373 CASAVA_Build 6 140076301 1D CCTAGTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 13 12 122374 CASAVA_Build 6 140077614 1D ATACCCCCCC T/- CAATGGAAAG 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 T 1 0 122375 CASAVA_Build 6 140084093 1D TGCCTTCAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 T 9 8 122376 CASAVA_Build 6 140084565 2I TGCCTGTACG --/TA TATATATATA 3070 het 1309 hom 39 7 22 10 TA 8 9 122377 CASAVA_Build 6 140098348 1D TGGTTTTTGC A/- AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 46 27 16 4 A 6 5 122378 CASAVA_Build 6 140099780 1D AATATTTAAC T/- TCTCTAATAA 3070 het 3070 hom 45 21 20 5 T 2 1 122379 CASAVA_Build 6 140101056 1D GAATGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 13 12 122380 CASAVA_Build 6 140113943 2D GAGTGTAAAT CA/-- CACACACACC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 CA 5 4 122381 CASAVA_Build 6 140120748 1D TCCTACCCTG A/- AACAAAATAG 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 A 3 2 122382 CASAVA_Build 6 140126621 1D CCAGAAATGA T/- TTTTTTTTTT 2740 het 2740 ref 28 10 10 8 T 15 14 122383 CASAVA_Build 6 140131489 1D TCATAAACAG T/- TTTAACCACT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 4 3 122384 CASAVA_Build 6 140146577 1D TAATGATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2952 hom 27 11 10 6 T 12 11 122385 CASAVA_Build 6 140158109 1I ATGCTAATGA -/T TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 5 6 122386 CASAVA_Build 6 140165175 1I AGGAGCAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 10 11 122387 CASAVA_Build 6 140166799 1D GGACATGAGG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 49 27 22 1 A 7 6 122388 CASAVA_Build 6 140175335 6I AACAATTTTA ------/TTAAAG TTAATGTGTT 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 TTAAAG 0 1 122389 CASAVA_Build 6 140184187 1D CAGAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 A 11 10 122390 CASAVA_Build 6 140193245 1D CTCCAAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 10 9 122391 CASAVA_Build 6 140215990 1D TTCAACATCG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 42 0 32 10 T 9 8 122392 CASAVA_Build 6 140219080 1D GTATGTGTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 132 het 54 0 45 9 T 10 9 122393 CASAVA_Build 6 140220688 1I TGTTATGTGA -/T TGTTATGACA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 2 122394 CASAVA_Build 6 140220933 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 9 8 122395 CASAVA_Build 6 140222022 1D CAAAAATTAC T/- TTTTTGCTTA 3070 hom 112 het 43 0 37 6 T 6 5 122396 CASAVA_Build 6 140223212 1I GACTGTGTAC -/T TTCATTGAAC 3070 hom 131 het 47 0 43 4 T 2 3 122397 CASAVA_Build 6 140224561 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1215 hom 9 het 5 0 3 2 A 6 7 122398 CASAVA_Build 6 140225039 2D ACCCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2115 het 161 hom 19 3 8 8 A 18 16 122399 CASAVA_Build 6 140242005 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1512 het 360 hom 13 4 5 4 T 16 15 122400 CASAVA_Build 6 140250188 6D AACTTTTATT TATTTA/------ TATTTATGTT 3070 het 3070 ref 31 20 12 1 TATTTA 2 1 122401 CASAVA_Build 6 140268234 1D ACAGCTTTTT G/- GGGGAGAATA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 G 5 4 122402 CASAVA_Build 6 140277539 1I TTAACTTTAT -/A AAAAACTATC 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 A 5 6 122403 CASAVA_Build 6 140291888 1D TAAAAAAAAA T/- ATTTTGGTCC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 1 0 122404 CASAVA_Build 6 140298129 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTATAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 0 1 122405 CASAVA_Build 6 140299084 2D AAAAACACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 12 10 122406 CASAVA_Build 6 140299363 1I ACACTTGGGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 8 9 122407 CASAVA_Build 6 140301724 1D TCCTCACACA T/- TTTTTATATG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 6 5 122408 CASAVA_Build 6 140302411 4D CTTCTAAAAT TATC/---- TGTGAGCTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 4 TATC 1 0 122409 CASAVA_Build 6 140308285 3D TCCTTACACT GAG/--- GAATATTACA 3070 het 3070 ref 40 20 17 6 GAG 1 0 122410 CASAVA_Build 6 140317437 1D AGTATTTTTA T/- TTTTCCTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 5 4 122411 CASAVA_Build 6 140321728 3D AGAACTTGTG AAT/--- AATATTTTTG 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 AAT 2 1 122412 CASAVA_Build 6 140326277 1I TGGGCAACAA -/G CCCATTGATT 3070 hom 150 het 55 0 49 6 G 0 1 122413 CASAVA_Build 6 140333306 1I ACTTAAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 32 hom 32 1 30 1 A 9 10 122414 CASAVA_Build 6 140348331 16D CCCTTCCTTC CTTCCTTCATTCCTTT/---------------- CTTCCTTCCT 1664 het 283 hom 10 3 7 4 CTTCCTTCATTCCTTT 1 0 122415 CASAVA_Build 6 140462643 2D GAGGCAAGAC TT/-- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 T 4 2 122416 CASAVA_Build 6 140468177 4D TTCCTCTCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 2859 het 2859 ref 39 16 11 14 CCTT 5 4 122417 CASAVA_Build 6 140471866 4I TCTAAGTTAA ----/CTAT CTGTCATTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 CTAT 0 1 122418 CASAVA_Build 6 140475005 1I TACTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 31 1 28 2 T 11 12 122419 CASAVA_Build 6 140475265 1D CCATCCTCAA G/- TAATGGCAGT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 G 1 0 122420 CASAVA_Build 6 140499429 1D CGTGGGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 11 10 122421 CASAVA_Build 6 140532491 1D GAGAATATAT A/- TTTCTCACCA 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 A 1 0 122422 CASAVA_Build 6 140540665 4I ATCTCCTCAA ----/AAAT AAATAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 AAAT 1 2 122423 CASAVA_Build 6 140597131 3D AGGAAGTCAA ATT/--- ATTATCCATT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 ATT 2 1 122424 CASAVA_Build 6 140627855 5D ATCCTGTCTC AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 25 8 12 6 AAAAT 3 2 122425 CASAVA_Build 6 140673860 1D TCAACTGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 31 0 21 10 A 13 12 122426 CASAVA_Build 6 140686454 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 19 0 16 4 T 9 8 122427 CASAVA_Build 6 140691504 1I ATAATAGTCA -/G GTTAATTTCC 3070 het 3070 ref 53 25 19 9 G 1 2 122428 CASAVA_Build 6 140728969 4D GAGGTTTTTG TTTA/---- TTTGTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 18 21 4 TTTA 1 0 122429 CASAVA_Build 6 140732919 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGGAGGG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 7 6 122430 CASAVA_Build 6 140734630 3I ACAAGCAACA ---/CCT CCTTTGTAAA 3070 hom 114 het 39 0 38 1 CCT 1 2 122431 CASAVA_Build 6 140739334 1D CTTTCTTTCT C/- CCCCCCCTTT 3070 hom 24 het 11 0 8 4 C 8 7 122432 CASAVA_Build 6 140749758 1I ACTCAGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1102 hom 38 3 26 9 A 12 13 122433 CASAVA_Build 6 140752724 4I TGAGAGAGAA ----/AGAC AGAGAGAAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AGAC 0 1 122434 CASAVA_Build 6 140764413 1I TATTTTTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 490 hom 42 2 31 9 A 9 10 122435 CASAVA_Build 6 140777982 2D GAGATGACAC AT/-- GTGCAAATAA 3070 het 3070 hom 42 18 18 8 AT 1 0 122436 CASAVA_Build 6 140795864 2I CATTTCTTCC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 39 13 13 13 CT 8 9 122437 CASAVA_Build 6 140798261 1I ATGTTTTTTT -/C ATCTGAAGTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 C 0 1 122438 CASAVA_Build 6 140817544 1D TTTTTAAAAC T/- TTTTTATTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 6 5 122439 CASAVA_Build 6 140821544 10D AACACCGTAT GTAAATACAC/---------- AAACTACTTA 3070 hom 126 het 45 0 43 5 GTAAATACAC 1 0 122440 CASAVA_Build 6 140834641 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 30 1 26 3 A 10 11 122441 CASAVA_Build 6 140844874 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2088 hom 23 7 13 3 A 16 17 122442 CASAVA_Build 6 140855315 3D CCTAGCCTTT ATG/--- CTGTTATTGT 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 ATG 1 0 122443 CASAVA_Build 6 140862930 2D ATAACTACAC AG/-- AGTTATTATT 3070 het 3070 hom 49 20 25 5 AG 2 1 122444 CASAVA_Build 6 140926921 4I AATGTTTACA ----/ATTT ATTCTGATAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 ATTT 0 1 122445 CASAVA_Build 6 140927596 1D ATTGGACTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 T 10 9 122446 CASAVA_Build 6 140936645 2I AAATGAATTG --/CT CTGCTCTGGG 3070 hom 141 het 57 0 48 9 CT 1 2 122447 CASAVA_Build 6 140953024 5I TTCACATGTT -----/ATCTC ATTTAATATG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 ATCTC 0 1 122448 CASAVA_Build 6 140954994 1I CAGGAAACCA -/T TTTTCCACAG 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 4 5 122449 CASAVA_Build 6 140959734 5D CTACATATAC ATTAT/----- ATTATATTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATTAT 2 1 122450 CASAVA_Build 6 140960361 1I GATGGGGTTG -/T TTTTTTTTTT 2563 het 2563 ref 26 16 6 4 T 11 12 122451 CASAVA_Build 6 140971932 1I CCCTTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 11 122452 CASAVA_Build 6 140992332 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3045 hom 21 het 8 0 8 0 T 5 6 122453 CASAVA_Build 6 141001681 1I AAGAGGAGAG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 7 8 122454 CASAVA_Build 6 141013406 1I AACAGAAAGC -/A CTTAAGTAGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 122455 CASAVA_Build 6 141018003 1I AAGTGTTACA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3023 hom 26 7 13 6 T 6 7 122456 CASAVA_Build 6 141020164 2D CAAGAAAAAT AA/-- AAGTTATCAG 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 4 2 122457 CASAVA_Build 6 141027614 1D CACTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 9 8 122458 CASAVA_Build 6 141030301 7I CTCATTTTTC -------/TAATTTT TTATCTAATC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAATTTT 0 1 122459 CASAVA_Build 6 141040640 1I TCTTGAATGC -/G GGAATCCCAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 2 3 122460 CASAVA_Build 6 141042633 10I TTTTGTCTAA ----------/AAAGTAAACC AAACTCTTTG 3070 hom 57 het 23 0 20 4 AAAGTAAACC 0 1 122461 CASAVA_Build 6 141043250 1D AAAATGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 34 1 25 8 T 12 11 122462 CASAVA_Build 6 141046230 3D CGACATTTTA TTG/--- TTATTAGATA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 TTG 1 0 122463 CASAVA_Build 6 141046658 1I TGTCCCCTGG -/T CACGCTATTT 3070 hom 65 het 27 0 20 7 T 0 1 122464 CASAVA_Build 6 141064127 1I TGAGGATGAG -/T TTTTTTTTTT 2735 het 628 hom 14 2 7 5 T 15 16 122465 CASAVA_Build 6 141065992 1D TCCACATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 24 1 17 6 A 13 12 122466 CASAVA_Build 6 141079525 2D CATATTTTGT TG/-- TGTTACTAGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TG 2 1 122467 CASAVA_Build 6 141092645 1D ACATATGCAT A/- GGTGTTTATA 3070 hom 129 het 51 0 44 8 A 1 0 122468 CASAVA_Build 6 141094920 2I28M29D GAATAAAAAC --ATAATCATAAATATACTTGGTTCGAATCTATTTTTATTCAGAATAATAAATATGAAA/ATATAATCATAAATATACTTGGTTCGAATC----------------------------- TATTTTTATT 3070 hom 87 het 26 0 30 5 N/A 0 0 122469 CASAVA_Build 6 141102008 6D GTATAACTTG AATTCA/------ AGTAATGTGA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 AATTCA 1 0 122470 CASAVA_Build 6 141102790 6D CTGAGAAATC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 63 het 36 0 22 15 AT 11 8 122471 CASAVA_Build 6 141112313 4D TGAAAATACA CAGT/---- CAGAAGAGAC 3070 hom 75 het 29 0 26 6 CAGT 1 0 122472 CASAVA_Build 6 141112452 1D4M1D CTCAAAGGGA TTAATA/-TAAT- ACAGAGAACG 3070 hom 84 het 29 0 28 5 N/A 0 0 122473 CASAVA_Build 6 141112993 1D TGTAGTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 33 2 20 11 T 13 12 122474 CASAVA_Build 6 141114578 1D GTGATTAGCA T/- TTAGGTTGGT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 T 3 2 122475 CASAVA_Build 6 141121346 1D TAGGGTGTTT G/- AAACCTATGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 0 122476 CASAVA_Build 6 141127242 1I TATACTCTAC -/A AAAAAATATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 7 122477 CASAVA_Build 6 141140637 1D AACGAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 31 0 25 6 A 12 11 122478 CASAVA_Build 6 141141660 2I TAATACAAAA --/AG AGAGGATGTT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 AG 2 3 122479 CASAVA_Build 6 141227449 1I TTAATTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 9 10 122480 CASAVA_Build 6 141229275 4I TTTTATATTG ----/TTTC TTTCTTTCCC 3070 hom 75 het 38 0 26 12 TTTC 2 3 122481 CASAVA_Build 6 141229309 1I AACTTCACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 32 1 13 18 A 12 13 122482 CASAVA_Build 6 141237013 1D CACAGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 33 0 15 19 T 15 14 122483 CASAVA_Build 6 141237067 1D ACCCAATGGC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 28 0 21 8 A 9 8 122484 CASAVA_Build 6 141246246 4I TGCTGTACTC ----/TATT TATTAGAAGT 3070 hom 108 het 45 0 36 9 TATT 1 2 122485 CASAVA_Build 6 141260024 2I GGCAAGACAG --/AC AGTTCTCAAA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 AC 0 1 122486 CASAVA_Build 6 141276734 4D AAAACAAACA AACC/---- AAAAAACCCA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 AACC 1 0 122487 CASAVA_Build 6 141295345 1D TATGTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 36 0 24 12 T 15 14 122488 CASAVA_Build 6 141301812 1D CAGAGGACAA C/- CCCCCCTTCT 3070 hom 60 het 25 0 22 3 C 7 6 122489 CASAVA_Build 6 141334891 1I TTCTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 16 1 11 4 T 13 14 122490 CASAVA_Build 6 141346290 1I ATTTTCTCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 428 hom 29 1 22 6 A 9 10 122491 CASAVA_Build 6 141348829 1D TCTTCAAAAA G/- CTTAATATAT 3070 hom 96 het 37 0 33 6 G 1 0 122492 CASAVA_Build 6 141356714 1D GAATAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 10 9 122493 CASAVA_Build 6 141361664 1I CACTTTGGAT -/A AAGTAGCAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 3 122494 CASAVA_Build 6 141368986 1D GTAGCAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 822 hom 36 2 33 1 A 10 9 122495 CASAVA_Build 6 141373062 1D AAAATAAACC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 10 9 122496 CASAVA_Build 6 141373984 4I TGCAATAGAC ----/TGTT TGAAGAAAAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TGTT 0 1 122497 CASAVA_Build 6 141383769 1D CCCACCACCT A/- AAAAAAAAAA 1356 het 1356 ref 30 20 3 9 A 13 12 122498 CASAVA_Build 6 141385019 1D TTCTTTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 34 0 28 6 A 13 12 122499 CASAVA_Build 6 141387850 3I AAAAAGAGAG ---/ACA AAAACATGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ACA 0 1 122500 CASAVA_Build 6 141393101 4D TTTTAAATGA CTAT/---- CTGTTTATAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 CTAT 1 0 122501 CASAVA_Build 6 141402600 4I ATATATATAT ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 51 het 26 0 18 9 AG 5 7 122502 CASAVA_Build 6 141402915 2D ATTTTATAAC TG/-- TGATTAATGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TG 2 1 122503 CASAVA_Build 6 141409817 1I CATTTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 23 1 15 7 T 11 12 122504 CASAVA_Build 6 141413460 1D AACTAATCAC A/- ACAAAATTTA 3070 hom 108 het 45 0 37 10 A 2 1 122505 CASAVA_Build 6 141419684 1D AGCAAAGAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 9 8 122506 CASAVA_Build 6 141430501 1D TTGTTTTTAC A/- AAAAAAACAC 3070 hom 107 het 40 0 36 5 A 8 7 122507 CASAVA_Build 6 141451359 1I CTTCTGCTTC -/A ATTACATTAG 3070 hom 99 het 44 0 34 10 A 1 2 122508 CASAVA_Build 6 141453557 1I CAATTTCAAC -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 8 122509 CASAVA_Build 6 141456149 1I TGTGTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 859 hom 46 7 33 6 T 13 14 122510 CASAVA_Build 6 141459882 2I TATACAACAC --/AT GTTTTTGTGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AT 0 1 122511 CASAVA_Build 6 141468863 1D TCCTCTGTTG T/- TCTCTTTATT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 2 1 122512 CASAVA_Build 6 141479820 4D ATGTTGATAT TTTG/---- TTTATTTTAA 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TTTG 1 0 122513 CASAVA_Build 6 141507623 1I ATGCCCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 10 11 122514 CASAVA_Build 6 141527918 1D TATGTTCTTC T/- TTTGAAAATG 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 T 4 3 122515 CASAVA_Build 6 141530187 1I ATTACAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 A 10 11 122516 CASAVA_Build 6 141552682 1I GTTATCAATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 9 10 122517 CASAVA_Build 6 141554896 2I AACGTTTATG --/CT CTGTTTCCCT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 CT 1 2 122518 CASAVA_Build 6 141562736 4I TATTCTGATT ----/GTTG AAGTTATTAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 GTTG 0 1 122519 CASAVA_Build 6 141573788 2I AATATTGCAT --/GA GGTGTATTTA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 GA 0 1 122520 CASAVA_Build 6 141575319 1D CCAGGCTCCT C/- CCCACTGCAA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 C 4 3 122521 CASAVA_Build 6 141575875 14D TTACAGAAAC TAGCCTAACCAAGT/-------------- TAGCCTAACC 3070 het 3070 ref 37 19 12 9 TAGCCTAACCAAGT 2 1 122522 CASAVA_Build 6 141576747 1I TCTATTAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 8 9 122523 CASAVA_Build 6 141576958 1I GAAGAGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 33 1 25 7 T 11 12 122524 CASAVA_Build 6 141587958 1D GATGTCATTT C/- CCCCAGATTG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 C 5 4 122525 CASAVA_Build 6 141588968 4I AGAAAGAAAC ----/AAAT AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 AAAT 0 1 122526 CASAVA_Build 6 141591850 58D GAGTGAAAAT GTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTTAATA/---------------------------------------------------------- GTTCATTTTT 3067 het 3067 ref 19 23 7 3 GTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTTAATA 1 0 122527 CASAVA_Build 6 141594641 1D ATTTAAATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 9 22 5 T 9 8 122528 CASAVA_Build 6 141596965 1I GTCCTGTGTC -/T GGCCATTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 0 1 122529 CASAVA_Build 6 141597716 19I AGTGCTTTTC -------------------/TTTTCCATTATGGGAGACT GCAGTTATCT 3070 het 3070 ref 26 15 11 1 TTTTCCATTATGGGAGACT 0 1 122530 CASAVA_Build 6 141607720 1D AAATTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 18 14 5 T 12 11 122531 CASAVA_Build 6 141612074 1D CTAAAAAAAA T/- ATATATGTCA 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 T 1 0 122532 CASAVA_Build 6 141620438 1I TCAGATAAAA -/T AGCCTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 0 1 122533 CASAVA_Build 6 141629161 1D GGGCTTAATC A/- AAGGAAAATT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 A 3 2 122534 CASAVA_Build 6 141661530 1D TGGGAAAACC A/- AAAAAAAAAA 1985 het 1985 ref 26 15 8 3 A 11 10 122535 CASAVA_Build 6 141666001 2D AAATATATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 26 1 15 12 A 13 11 122536 CASAVA_Build 6 141674658 11D ACATTTAAAT AGTAAATAGTA/----------- AACAGTAAAT 3070 het 3070 ref 23 15 7 5 AGTAAATAGTA 1 0 122537 CASAVA_Build 6 141683852 2D CACTAAAATT TC/-- TGTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 TC 1 0 122538 CASAVA_Build 6 141706689 1D CTTGGCCTGG T/- TTTTTTTTTT 1493 het 1493 ref 42 25 5 12 T 13 12 122539 CASAVA_Build 6 141720379 3D TATTCGTAAG TTT/--- TTTTTTTTTT 2406 het 858 hom 27 7 9 12 T 19 16 122540 CASAVA_Build 6 141731424 1D TTTCTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2663 hom 25 9 10 6 T 12 11 122541 CASAVA_Build 6 141733235 6I TGACTATAGT ------/CTTTGA CTTTAATTGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 CTTTGA 0 1 122542 CASAVA_Build 6 141738331 2D ATATATATTT TA/-- TATATATATA 2353 het 2353 ref 16 9 5 2 TA 7 6 122543 CASAVA_Build 6 141739195 4I TAACACTTAC ----/TGAG TAACAATTAT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 TGAG 0 1 122544 CASAVA_Build 6 141742132 4D ATAATAATAG AATA/---- AATAAATAAA 1984 het 1984 ref 14 6 6 2 AATA 3 2 122545 CASAVA_Build 6 141745147 1D ATAATTCTAT C/- TTCTTTTATA 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 C 1 0 122546 CASAVA_Build 6 141745835 6D TTTAAATATT TATAAA/------ TATATGTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 7 TATAAA 1 0 122547 CASAVA_Build 6 141753789 3D TGAGGCTGTG TTT/--- TTTTTGACTG 3070 het 3070 hom 50 23 25 3 T 8 5 122548 CASAVA_Build 6 141754051 3D TGTAAGGGAC CCA/--- GTGGGAGATA 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 CCA 1 0 122549 CASAVA_Build 6 141759723 2D GTAAATGGAT AC/-- AGTCTAACTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 AC 1 0 122550 CASAVA_Build 6 141763631 1I AAAAACACAT -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 A 6 7 122551 CASAVA_Build 6 141777972 1D TTTGTTTCTC A/- AAAAAAAATT 2427 het 2427 ref 12 6 6 0 A 9 8 122552 CASAVA_Build 6 141778587 1I GTTCTTTGTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 8 9 122553 CASAVA_Build 6 141780096 1D AGACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2797 hom 25 9 12 4 A 13 12 122554 CASAVA_Build 6 141780634 4D AGTTTGAAAT AACA/---- AACAATTTCA 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 AACA 2 1 122555 CASAVA_Build 6 141784219 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCCTCCC 1064 het 942 hom 9 4 4 1 C 7 6 122556 CASAVA_Build 6 141787470 2D TTGAATACAT AG/-- AGTTAGGTTC 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 AG 2 1 122557 CASAVA_Build 6 141794727 1D TAAAGTTATC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 A 7 6 122558 CASAVA_Build 6 141795733 1D TGTTGATAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 10 9 122559 CASAVA_Build 6 141798547 5D AAATCCTCTT TTATC/----- TTAAGTTGGA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 TTATC 1 0 122560 CASAVA_Build 6 141800766 1D TCTAGGAGTT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 8 7 122561 CASAVA_Build 6 141801150 4D TGAATAATAG AACA/---- AATAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 17 20 0 AACA 1 0 122562 CASAVA_Build 6 141802769 4D ATAAGATGTG ATTA/---- ATTAAATTCA 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 ATTA 2 1 122563 CASAVA_Build 6 141803640 2D TATGATACAG TT/-- TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 36 15 20 3 T 7 5 122564 CASAVA_Build 6 141804155 21D TTGTTTGTTT GTTTTTTGTTTTGTTTTTGTA/--------------------- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 20 18 6 GTTTTTTGTTTTGTTTTTGTA 1 0 122565 CASAVA_Build 6 141805286 2I TATTCATAAC --/TG TTTTAGTATC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TG 0 1 122566 CASAVA_Build 6 141805775 4D AAATATTGCC TTAA/---- TTGTTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 11 22 7 TTAA 1 0 122567 CASAVA_Build 6 141808033 5D GATAAAATGT GTAAA/----- GTATTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 GTAAA 1 0 122568 CASAVA_Build 6 141809443 1I AGTTTTTAGA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3058 hom 21 8 9 5 T 7 8 122569 CASAVA_Build 6 141809624 1I AATTTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 10 11 122570 CASAVA_Build 6 141809987 1D TGAGAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 1 0 122571 CASAVA_Build 6 141811271 3I ATAATGTCAA ---/GAG GAGTTTATTA 3070 het 3070 hom 56 22 30 4 GAG 1 2 122572 CASAVA_Build 6 141812035 1I ACATTTCTTG -/C CCCAATGTAC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 3 4 122573 CASAVA_Build 6 141812791 18D AAGTCCTCAA AAGTATTGCTTATGTAAG/------------------ TGTTTTAGCA 3070 het 3070 ref 39 21 21 1 AAGTATTGCTTATGTAAG 1 0 122574 CASAVA_Build 6 141813635 4I TATGTTTACT ----/ATTC ATTAAGTGGA 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 ATTC 0 1 122575 CASAVA_Build 6 141858002 1D GCTGAAAGAG T/- TTTTTTTTTT 960 het 960 ref 45 31 3 11 T 13 12 122576 CASAVA_Build 6 141872052 2D AAATTCATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 80 het 34 0 26 8 AT 8 7 122577 CASAVA_Build 6 141875765 1I ATATCTTCGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 11 12 122578 CASAVA_Build 6 141876066 1I TATTTAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 12 13 122579 CASAVA_Build 6 141897764 1D TCTGGAATTG T/- TAATTGTTAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 2 1 122580 CASAVA_Build 6 141909447 1I GATTTAACCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 8 9 122581 CASAVA_Build 6 141912932 4I AAAGGCTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TTTG 2 3 122582 CASAVA_Build 6 141921987 4D TTATAATGAA GGTT/---- AGACTGGTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GGTT 1 0 122583 CASAVA_Build 6 141928099 1D ATAAAGGAAA T/- GTTTAGTTTT 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 T 1 0 122584 CASAVA_Build 6 141936554 1I AGACAACTGT -/C CCCCCCCCAG 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 C 8 9 122585 CASAVA_Build 6 141941164 1D GTAGTATATT A/- ATATCTGCTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 2 1 122586 CASAVA_Build 6 141942098 1D GTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 15 0 12 3 A 15 14 122587 CASAVA_Build 6 141968799 2D TATTTAGGAT TG/-- TGATATTTTC 3070 het 3070 hom 24 8 12 5 TG 2 1 122588 CASAVA_Build 6 141972667 1I CATTTATTCC -/T TATGTCTCCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 122589 CASAVA_Build 6 141973542 3D CTGGAGAAAT AAG/--- AAGTACTTAG 3070 het 3070 hom 47 19 24 7 AAG 2 1 122590 CASAVA_Build 6 141985005 6D ATATTTATGA TTATAT/------ TTATAAAGAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 TTATAT 1 0 122591 CASAVA_Build 6 141988919 1I AAAGATCCTG -/T TTTCACATAA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 T 3 4 122592 CASAVA_Build 6 141993647 1I CAATTTGTGC -/A AGACATAGGA 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 A 1 2 122593 CASAVA_Build 6 142016103 1I AGAATCAAAA -/T TTTTTTAGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 7 122594 CASAVA_Build 6 142017592 10D AAAAAAAAAC AAAAAACAAA/---------- AAAAAACAAA 3070 het 975 hom 34 4 12 22 AAAAAACAAA 2 1 122595 CASAVA_Build 6 142020065 1D CAGAAAGATA T/- CTGAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 25 15 1 T 1 0 122596 CASAVA_Build 6 142038064 1I23M1I TTAATATAGA -TGAAATGATTAAGGAAAAGAAAT-/TTGAAATGATTAAGGAAAAGAAATA ATAATAAAAA 3070 hom 108 het 30 0 37 4 N/A 0 0 122597 CASAVA_Build 6 142039758 1I TTTTTTCTTG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 7 8 122598 CASAVA_Build 6 142041057 1D TTCCTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 813 het 813 ref 28 19 3 6 T 11 10 122599 CASAVA_Build 6 142052303 2D GCTATCTTCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 402 hom 34 1 26 7 CT 8 7 122600 CASAVA_Build 6 142055488 3I CCAAAGATCT ---/TAA TAACAGCCAC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 TAA 1 2 122601 CASAVA_Build 6 142066664 2D CAAAAATCAT AG/-- AGTCAGGGCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AG 2 1 122602 CASAVA_Build 6 142068974 1D CTTAGTATCT C/- CCCCTTGGAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 5 4 122603 CASAVA_Build 6 142072076 15D ATGTGAAAGG TAAGTATTTGTTATT/--------------- TAAGCCATCT 3070 hom 117 het 41 0 39 10 TAAGTATTTGTTATT 1 0 122604 CASAVA_Build 6 142106236 1D GCTAATACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 T 13 12 122605 CASAVA_Build 6 142133330 2D TTGTCCTTGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 552 hom 37 3 28 6 AT 9 8 122606 CASAVA_Build 6 142183662 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2390 het 632 hom 11 2 6 3 A 11 12 122607 CASAVA_Build 6 142215631 2I TTTAGAGAGG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 AC 6 7 122608 CASAVA_Build 6 142221432 1I TTAAATATCT -/G TGAAACTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 G 0 1 122609 CASAVA_Build 6 142225822 1D CTCCCACGGC A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 8 7 122610 CASAVA_Build 6 142233599 1I ATCAGTAAAA -/T TAAATATAAA 3070 het 3070 hom 28 12 16 0 T 1 2 122611 CASAVA_Build 6 142248393 1D ACAAGAAAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 15 21 4 T 8 7 122612 CASAVA_Build 6 142273788 1D GGTGCAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2325 hom 31 9 15 8 A 12 11 122613 CASAVA_Build 6 142279383 9I GAAAACCACA ---------/GCGCAAAGG TCCTTGAGAT 2992 het 2992 ref 23 13 7 3 GCGCAAAGG 0 1 122614 CASAVA_Build 6 142289309 1I ATTTTCTCTC -/A GGGGTAGCCC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 0 1 122615 CASAVA_Build 6 142289514 1D AGTCAGCCTC T/- GTACTCATAC 3070 het 1970 hom 14 4 9 1 T 1 0 122616 CASAVA_Build 6 142295372 1I TTCTCTCAAG -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 T 7 8 122617 CASAVA_Build 6 142298424 1D AAAATAAAAC G/- TTTGTTTCCC 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 G 1 0 122618 CASAVA_Build 6 142321461 11I GCCTCTGTCC -----------/ATAAATAAGAA ACTAGGGAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 ATAAATAAGAA 0 1 122619 CASAVA_Build 6 142326613 1D ACCCTGACTC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 7 6 122620 CASAVA_Build 6 142329072 1I GGTTTCCCCC -/T ATCAAACCAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 0 1 122621 CASAVA_Build 6 142376574 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 933 het 933 ref 12 8 3 1 AT 6 7 122622 CASAVA_Build 6 142381203 1D CGTCCCCTTC T/- TAATCAATAC 2617 het 1652 hom 24 7 9 8 T 2 1 122623 CASAVA_Build 6 142381327 1D CCCCAACTCT G/- GTGCCAAATT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 G 2 1 122624 CASAVA_Build 6 142385470 2D CTGCAGTGAG AT/-- ATATTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 12 14 3 AT 3 2 122625 CASAVA_Build 6 142413337 1D CACAGAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 710 hom 40 3 33 4 A 10 9 122626 CASAVA_Build 6 142423311 1D GATCTAGGCC A/- AAAAAAAAAA 1693 het 1693 ref 35 25 4 6 A 13 12 122627 CASAVA_Build 6 142430264 3I CCAATGTAGT ---/TGG ATACTAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 TGG 0 1 122628 CASAVA_Build 6 142433651 1D GTACCAGGTG A/- GAGGAAATTG 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 1 0 122629 CASAVA_Build 6 142434715 7D AGAGGGTGGG AGCCTAA/------- AGCCTTGGCT 1801 het 1801 ref 24 13 6 6 AGCCTAA 1 0 122630 CASAVA_Build 6 142440288 4D TATATAAAAT AGAA/---- AGCACAGTGA 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 AGAA 1 0 122631 CASAVA_Build 6 142451733 1D AATTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 2941 het 20 hom 17 1 10 6 A 15 14 122632 CASAVA_Build 6 142463134 1D AAGTTGGAAG A/- AAGATGTCCT 3070 het 3070 hom 47 21 24 3 A 3 2 122633 CASAVA_Build 6 142470699 1D AGAGACTATC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 94 het 37 0 32 5 A 9 8 122634 CASAVA_Build 6 142484563 2D TACTTTAAAA CT/-- CTGTTTCCCT 3070 het 3070 ref 50 28 18 6 CT 2 1 122635 CASAVA_Build 6 142506617 1I AAAGCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 12 13 122636 CASAVA_Build 6 142508449 1D ATTACTTTAA G/- TTGTGGTAGA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 G 1 0 122637 CASAVA_Build 6 142520701 1D CTATTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 T 12 11 122638 CASAVA_Build 6 142533157 1I AAACTAGACC -/G GCTCTCTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 1 2 122639 CASAVA_Build 6 142544286 2D TTTTATATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TA 9 8 122640 CASAVA_Build 6 142545399 1D GCTGACAAAA T/- TTTAACAGTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 4 3 122641 CASAVA_Build 6 142551578 1I GATTTTTATA -/T TTTTTAATGC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 5 6 122642 CASAVA_Build 6 142567474 32D TCAGATGATA TTTAATCCTTTTATATTTAAAAGGATTTAAAT/-------------------------------- TTTAATCCTT 3070 hom 36 het 22 0 13 12 TTTAATCCTTTTATATTTAAAAGGATTTAAAT 2 1 122643 CASAVA_Build 6 142601589 1I TAAATAAAAA -/C AAGGCATCAC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 C 0 1 122644 CASAVA_Build 6 142603258 2I AATCATTTAG --/AT ATGTTAGAGG 3070 hom 151 het 51 0 51 0 AT 1 2 122645 CASAVA_Build 6 142605319 1I TTCAGTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 A 15 16 122646 CASAVA_Build 6 142608829 1D CTTCCCAGCC T/- TTTTACTCGT 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 T 5 4 122647 CASAVA_Build 6 142608987 1I ACACCTCAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 9 10 122648 CASAVA_Build 6 142620284 1I GCACAAGTGG -/T TAAGATGTGA 3070 het 3070 hom 56 21 25 10 T 1 2 122649 CASAVA_Build 6 142626915 1D ATCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 502 het 502 ref 21 14 2 5 A 15 14 122650 CASAVA_Build 6 142633151 1I TCAACTGGCC -/T TATAGACATC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 1 2 122651 CASAVA_Build 6 142662492 3I TTCCACATGG ---/AAT AATAAAAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAT 1 2 122652 CASAVA_Build 6 142719522 1D CCAAAAGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 10 9 122653 CASAVA_Build 6 142792255 1I AGACATTACA -/C GCTGCAAGGA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 C 0 1 122654 CASAVA_Build 6 142812220 1D TGATATTCTC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 9 8 122655 CASAVA_Build 6 142920140 1I ATCCAGTCAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 A 9 10 122656 CASAVA_Build 6 142951059 2I AAAAAAAATG --/AC ACAGTGCACA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 AC 1 2 122657 CASAVA_Build 6 142952696 2I ATAAGGAAAG --/AT ATTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 AT 1 2 122658 CASAVA_Build 6 142954523 5D GTTGTCTGTT TACTC/----- TATTGATAGT 3070 het 2366 hom 15 5 10 2 TACTC 1 0 122659 CASAVA_Build 6 142960703 4I TTCTATTCTG ----/AAAT AAATAGTCAC 3070 het 3070 ref 57 35 20 2 AAAT 1 2 122660 CASAVA_Build 6 142997306 3D GGCAAATAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1513 hom 41 11 25 6 T 20 17 122661 CASAVA_Build 6 142997796 8I CAGAAGAGAG --------/CATGCTCT CATGCTCTGG 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 CATGCTCT 1 2 122662 CASAVA_Build 6 143010922 2I TAAATGGTAC --/CA GCAGCAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 CA 0 1 122663 CASAVA_Build 6 143014329 3D ACAAACAAAC AAA/--- AAAAAAAGAT 745 het 745 ref 44 20 4 22 A 10 7 122664 CASAVA_Build 6 143015052 1D GGATTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1652 het 1652 ref 28 19 4 5 T 12 11 122665 CASAVA_Build 6 143019443 19I TGCAGAATGC -------------------/ACTGCTAATTAGCATTTTA AATGCTCTTA 3070 het 3070 hom 46 15 26 6 ACTGCTAATTAGCATTTTA 0 1 122666 CASAVA_Build 6 143023028 1D CTAGTTAATC T/- TTTTTTTTTT 2956 het 2956 ref 41 15 8 18 T 13 12 122667 CASAVA_Build 6 143042487 2I ACACCATCAC --/AG AGAGGGTGAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 AG 2 3 122668 CASAVA_Build 6 143050526 1I TATCATTTAC -/A AGAAAATTTT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 1 2 122669 CASAVA_Build 6 143089098 1D TCTCACCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 13 12 122670 CASAVA_Build 6 143089410 8D TCTCCCCACT ACACAAGG/-------- ACCCTGTGAC 3070 hom 93 het 32 0 32 4 ACACAAGG 1 0 122671 CASAVA_Build 6 143098431 1I TTTTACAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 514 hom 47 3 36 8 A 12 13 122672 CASAVA_Build 6 143120862 2D ATCTAACACA CT/-- CTGCCAGCAT 3070 het 3070 ref 43 21 12 10 CT 2 1 122673 CASAVA_Build 6 143122133 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 1714 hom 19 4 8 7 A 8 9 122674 CASAVA_Build 6 143138010 2D ATAAGAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 525 hom 28 3 16 9 A 14 12 122675 CASAVA_Build 6 143138664 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 9 10 122676 CASAVA_Build 6 143139371 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 8 9 122677 CASAVA_Build 6 143150078 4D CCCGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 63 het 31 0 22 10 AAAT 5 4 122678 CASAVA_Build 6 143151148 1I AAAAAAAAAT -/C CCCCCCCTCA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 7 8 122679 CASAVA_Build 6 143153769 4I TCAGTCTCTC ----/TATA GTAGGTCTAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TA 0 2 122680 CASAVA_Build 6 143158906 1I TAGTAGATAT -/G ATTGCTGTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 122681 CASAVA_Build 6 143168400 1D AGTTTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 29 2 25 2 A 13 12 122682 CASAVA_Build 6 143203128 80D3M3D TTATTTATTT TTTTTTTTTTAATATTTTTTTATTTATTTTAATATTAAATATTTTAATATTTAATATTTTATTAAAATATTATTATTTTAATATTT/--------------------------------------------------------------------------------ATA--- TTAATATTAT 2906 hom 27 het 10 0 9 2 N/A 0 0 122683 CASAVA_Build 6 143206174 1I TAACAGGTGA -/C CTGAGCTAAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 C 1 2 122684 CASAVA_Build 6 143211553 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 33 1 21 11 A 13 14 122685 CASAVA_Build 6 143218723 2I5M4D TGAAAGTATT --CTTTCACTT/AAGATCC---- ATTTCTTATT 3070 het 3070 ref 37 22 15 2 N/A 0 0 122686 CASAVA_Build 6 143219035 2I GCAAGGGGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 A 11 13 122687 CASAVA_Build 6 143219083 15I CCACCTACTG ---------------/CACCACTTTAATATC CACCACTTTA 2737 het 1569 hom 36 5 8 23 CACCACTTTAATATC 1 2 122688 CASAVA_Build 6 143219211 4I GACTTCAATG ----/TACA TACAATACAT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 TACA 1 2 122689 CASAVA_Build 6 143228266 1D AACTGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 177 hom 41 2 34 5 A 11 10 122690 CASAVA_Build 6 143228949 1D AGCATGCTGC A/- ACTGGTGAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 1 122691 CASAVA_Build 6 143229355 1I CTCCTTTATT -/A ACCTCTTTCT 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 A 1 2 122692 CASAVA_Build 6 143238750 1D TTGAAAATTA T/- TTAGCATATT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 3 2 122693 CASAVA_Build 6 143240458 1D AAGTAAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 10 9 122694 CASAVA_Build 6 143250790 1I GCGATGCAGC -/A AAAAAAAAAA 1699 het 1699 ref 22 7 7 8 A 15 16 122695 CASAVA_Build 6 143259068 1D TTCTTCAACC T/- TATGGAGACA 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 T 2 1 122696 CASAVA_Build 6 143284335 1I ACTGCACTCC -/A AGCCTTGGTC 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 1 2 122697 CASAVA_Build 6 143284914 1D CAGGATCTGG C/- CTCATCTTAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 C 2 1 122698 CASAVA_Build 6 143305128 1D CCCTGCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 11 10 122699 CASAVA_Build 6 143320452 1I AGGCTGCTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 8 9 122700 CASAVA_Build 6 143332249 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 2046 hom 19 5 7 7 A 9 8 122701 CASAVA_Build 6 143365597 1I GCAAAAACCC -/T AGAGGGGAAT 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 T 0 1 122702 CASAVA_Build 6 143371703 1D TTTGGCTTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 264 hom 33 1 29 3 A 10 9 122703 CASAVA_Build 6 143519163 3D2M2I TAAGAACCAT GGAGT--/---GTTC ATCTTCTTAA 3070 het 3070 hom 58 25 31 5 N/A 0 0 122704 CASAVA_Build 6 143528367 3D ATCTACACAG CCA/--- CCACCAGCCC 3070 het 3070 ref 33 13 16 8 CCA 3 2 122705 CASAVA_Build 6 143533418 4D AAAAAACAAG TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 11 14 4 T 13 9 122706 CASAVA_Build 6 143533707 2I CTATTGAAAT --/AA AAAAAAAAAT 2178 het 2178 ref 17 9 6 2 A 9 11 122707 CASAVA_Build 6 143554759 1I AAGTTTTGTT -/A ATATAAGTGG 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 1 2 122708 CASAVA_Build 6 143555459 1I AAAAGCCTTA -/T TTTTTTTCCT 2965 het 1596 hom 28 8 13 7 T 7 8 122709 CASAVA_Build 6 143563764 2I CGAGTATCTC --/AT GTGGATTTCC 3070 hom 132 het 48 0 43 5 AT 0 1 122710 CASAVA_Build 6 143585228 2D GTTTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 1625 het 555 hom 34 3 10 22 TG 1 0 122711 CASAVA_Build 6 143585533 1D CCCCTTTCTC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 86 het 32 0 29 3 T 9 8 122712 CASAVA_Build 6 143598459 1D GTAGGGGAAG A/- AGAAAAGTCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 1 122713 CASAVA_Build 6 143634697 1I ATTGCATTCA -/G GAACTTATTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 G 1 2 122714 CASAVA_Build 6 143635660 5D ACTTCACCTG AAAAT/----- AGTGGGAAGA 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 AAAAT 1 0 122715 CASAVA_Build 6 143640284 1I ACAGTAACAC -/A AAAGATATGC 3070 het 3070 ref 59 31 23 5 A 3 4 122716 CASAVA_Build 6 143648856 1D CCCACCCCCA C/- CCCAAATACG 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 C 4 3 122717 CASAVA_Build 6 143698361 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1853 het 219 hom 17 3 6 9 A 20 18 122718 CASAVA_Build 6 143711279 2D CTGGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 AG 6 5 122719 CASAVA_Build 6 143714074 1D TTGTATCACA C/- AACTTTACAG 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 C 1 0 122720 CASAVA_Build 6 143721379 1D TAAGGAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 11 10 122721 CASAVA_Build 6 143723884 1D TAAGAGCAAG A/- ATTAATAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 7 5 A 2 1 122722 CASAVA_Build 6 143726449 1I CCAGCAATAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 9 10 122723 CASAVA_Build 6 143727490 1D GCTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 10 9 122724 CASAVA_Build 6 143736475 1D GCTTTATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 15 7 A 11 10 122725 CASAVA_Build 6 143736986 1D GGTCAACTTC G/- GGTATGCCTC 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 G 3 2 122726 CASAVA_Build 6 143737241 1D TAACTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 18 9 A 11 10 122727 CASAVA_Build 6 143737397 2I GACTCCCTAG --/AA AAAGTATATG 3070 het 3070 hom 39 19 20 0 A 3 5 122728 CASAVA_Build 6 143738743 48D GAAGGAAGGA AGGAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGG/------------------------------------------------ AGGGAGGGAG 2745 hom 27 het 7 0 9 2 AGGAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGG 1 0 122729 CASAVA_Build 6 143739059 10D TCTCTTTCTG TCTGTCTCTC/---------- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 23 19 4 TCTGTCTCTC 1 0 122730 CASAVA_Build 6 143744041 1D GTGCCCAGTA T/- TGTGCTAGAT 3070 het 3070 hom 53 22 28 5 T 2 1 122731 CASAVA_Build 6 143746028 1D AAATACCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 11 10 122732 CASAVA_Build 6 143766521 1I CATATTCCAC -/T TTTTACCTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 4 5 122733 CASAVA_Build 6 143775212 1I TCTTCTCCAT -/C TTTGCCACTT 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 C 0 1 122734 CASAVA_Build 6 143780868 2D CAAAGTTCTG CT/-- CTCTACCCTT 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 CT 3 2 122735 CASAVA_Build 6 143786950 2I CAGCAGAACT --/TA CACCAGTCTA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 TA 0 1 122736 CASAVA_Build 6 143791855 1I CTTACTTCAG -/A GGGATTTTGT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 0 1 122737 CASAVA_Build 6 143792295 3I AAGGAGTGTT ---/ATC ATATGAAATA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 ATC 0 1 122738 CASAVA_Build 6 143793401 2D TTCATAATAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 8 20 6 T 11 9 122739 CASAVA_Build 6 143795073 2D GTGTTGGTGA AG/-- AGTGTTCGGA 3070 het 3070 ref 57 27 26 6 AG 2 1 122740 CASAVA_Build 6 143796518 1D AAAGCTTTTC T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 8 7 122741 CASAVA_Build 6 143799897 1I GCAAATTGAT -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 6 7 122742 CASAVA_Build 6 143805184 2I ATAAAATTAT --/AG AGACAGAGAA 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 AG 1 2 122743 CASAVA_Build 6 143811363 18D AAATTCAGCT CCTCCCAACCAACAAACA/------------------ CCTCAAACAT 3070 het 3070 ref 19 13 7 3 CCTCCCAACCAACAAACA 1 0 122744 CASAVA_Build 6 143811520 4D TTTGCTGGCT ACTC/---- ACTCGTCACT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 ACTC 2 1 122745 CASAVA_Build 6 143816858 1I TAAAATGAAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 6 7 122746 CASAVA_Build 6 143825725 1D ACCTTTTTTA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 8 7 122747 CASAVA_Build 6 143834612 2D TTTCTTTATC TT/-- TTTTTTTATA 3070 het 2894 hom 32 10 20 2 T 9 7 122748 CASAVA_Build 6 143835351 1D CACTTAACAA T/- TTTAGATATT 3070 het 3070 hom 56 24 28 5 T 4 3 122749 CASAVA_Build 6 143840267 1I GTAGAAAAGC -/A TCATTAATTT 3070 het 3070 hom 43 21 21 1 A 0 1 122750 CASAVA_Build 6 143859164 13D CTAGGGTTAT TTTGAACCAAAAA/------------- CTTTGCTTCT 3070 het 3070 ref 29 17 14 3 TTTGAACCAAAAA 1 0 122751 CASAVA_Build 6 143861001 1I TGCTGTGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 10 11 122752 CASAVA_Build 6 143861102 13D ATATACAACA TTGAACAAAGTCC/------------- TTGTCCTCAT 3070 het 3070 ref 44 27 14 6 TTGAACAAAGTCC 1 0 122753 CASAVA_Build 6 143867705 1I ACCCCTACTA -/T TTCCCAATAG 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 2 3 122754 CASAVA_Build 6 143878448 2I GGCGTTCAAC --/CT CTCTGTGCCT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 CT 2 3 122755 CASAVA_Build 6 143879978 1D GAATGGAGCT G/- GGGGGGAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 7 6 122756 CASAVA_Build 6 143885319 1I GCCTGCCTCT -/G GGGGGTCTCG 3070 hom 122 het 44 0 40 4 G 5 6 122757 CASAVA_Build 6 143907777 1D GAGATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2938 hom 23 9 7 7 T 12 11 122758 CASAVA_Build 6 143909188 1D CTTGTGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 11 13 A 15 14 122759 CASAVA_Build 6 143909690 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 20 7 A 14 13 122760 CASAVA_Build 6 143914096 1I ATACACTGTA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 53 21 20 12 T 7 8 122761 CASAVA_Build 6 143918754 1D GACATTTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3014 hom 33 8 13 12 T 15 14 122762 CASAVA_Build 6 143926227 9I ACCGCATCTC ---------/TACTAAAAA TACGAAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TACTAAAAA 0 1 122763 CASAVA_Build 6 143926663 3D CTGTCTCTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 25 0 22 4 A 13 10 122764 CASAVA_Build 6 143926879 2D GTCTATGGAA TT/-- TTTTACTTCA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 T 6 4 122765 CASAVA_Build 6 143927741 1I GATCACAAGT -/A AGAGATGCTC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 1 2 122766 CASAVA_Build 6 143933036 3I GAATTTAAAA ---/TGT TGTGTGCATG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TGT 1 2 122767 CASAVA_Build 6 143936407 1D CTTTCCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 30 0 28 3 T 13 12 122768 CASAVA_Build 6 143937523 1D TGATGGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 36 0 29 7 A 12 11 122769 CASAVA_Build 6 143937957 4I TTTCAGCCAG ----/TTAA TTATTTTCTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTAA 0 1 122770 CASAVA_Build 6 143938716 1D TTCAATTTAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 9 8 122771 CASAVA_Build 6 143939884 1D AATATATTTT G/- GGGGTTGTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 G 5 4 122772 CASAVA_Build 6 143940603 1I TCGTCGATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 11 12 122773 CASAVA_Build 6 143941736 2D CCCCCAAAAC TT/-- TTTTTTTTGT 524 het 524 ref 26 12 4 10 T 10 8 122774 CASAVA_Build 6 143942595 3I TGTATGAAAA ---/ACT ACTACCCTAC 3070 het 3070 ref 58 33 21 4 ACT 1 2 122775 CASAVA_Build 6 143949040 4D GTGTAGAAAA AGAG/---- AGAGAGAAGG 3070 het 3070 hom 52 22 28 4 AG 5 3 122776 CASAVA_Build 6 143951284 1I ATTCTCAAAG -/C GTATGAGTGG 3070 hom 93 het 38 0 30 8 C 0 1 122777 CASAVA_Build 6 143956159 2D CAAGGAGGAA AC/-- ACAGGGGGTG 3070 het 3070 hom 39 9 25 6 AC 2 1 122778 CASAVA_Build 6 143969093 3I ACTTACAAAA ---/AAC AACAATATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAC 1 2 122779 CASAVA_Build 6 143970406 1I GGTGAAAATA -/C TTTGAATTTC 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 C 0 1 122780 CASAVA_Build 6 143971391 5I AGACTACTGC -----/TATTT TATTTAGGCT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 TATTT 1 2 122781 CASAVA_Build 6 143972235 2D AGTGGAACAG TA/-- TAATATCAGG 3070 het 3070 ref 51 25 22 6 TA 2 1 122782 CASAVA_Build 6 143973115 1D GGTAAGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 11 10 122783 CASAVA_Build 6 143975441 2D TGTTATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AC 7 6 122784 CASAVA_Build 6 143975650 1I CTCTGAAATG -/C CCTTTATGTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 2 3 122785 CASAVA_Build 6 143981437 1D AGGGGAGGCT G/- GGGGGGGATA 3070 hom 59 het 26 0 15 12 G 8 7 122786 CASAVA_Build 6 143982796 1I GGGTGGGGGG -/C TCAGTTCATT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 0 1 122787 CASAVA_Build 6 143997607 8I CACAAATATT --------/TGCTCACC TGCTCACCGT 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 TGCTCACC 1 2 122788 CASAVA_Build 6 143998959 1I GCAGGAGAAT -/C CTTTGAACCC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 1 2 122789 CASAVA_Build 6 144034805 1I TTAAAAAAAA -/G CTGTACATAA 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 G 0 1 122790 CASAVA_Build 6 144036159 1D TATTCCCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 14 10 T 11 10 122791 CASAVA_Build 6 144041284 1I CTCGCTGTGG -/T TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 6 7 122792 CASAVA_Build 6 144042598 1I TTAGTACAGC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 40 25 9 6 A 7 8 122793 CASAVA_Build 6 144051008 1D CCACTGACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 57 25 21 11 T 12 11 122794 CASAVA_Build 6 144127351 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1041 hom 33 8 11 14 A 17 16 122795 CASAVA_Build 6 144136361 1D TGCATGGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 15 14 122796 CASAVA_Build 6 144146867 1I TAGAACAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 11 12 122797 CASAVA_Build 6 144154523 1D ACTATGTGGA T/- TTTTTTTTTT 1393 het 1393 ref 34 25 3 6 T 11 10 122798 CASAVA_Build 6 144156894 1D ATGCAAAAAT A/- AAAAAAGAAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 7 6 122799 CASAVA_Build 6 144178725 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 27 4 12 11 A 16 15 122800 CASAVA_Build 6 144271123 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 6 7 122801 CASAVA_Build 6 144282220 1I ATATATGTAG -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 6 7 122802 CASAVA_Build 6 144287996 14D ATCTCATTCC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 1922 het 9 hom 13 1 9 6 T 28 14 122803 CASAVA_Build 6 144288367 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2671 het 442 hom 26 2 8 16 T 17 16 122804 CASAVA_Build 6 144289324 1I ATGATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 746 hom 40 2 35 3 T 10 11 122805 CASAVA_Build 6 144297971 9I TGCTGGTGGT ---------/GGTGGGCAG GGTGGGTCAA 3070 hom 96 het 33 0 30 3 GGTGGGCAG 0 1 122806 CASAVA_Build 6 144300364 1I ACCTCCCACC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 394 hom 33 1 28 4 A 8 9 122807 CASAVA_Build 6 144303560 1I TACACAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 781 hom 22 2 11 9 T 14 15 122808 CASAVA_Build 6 144307546 2D TATCCATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TA 7 6 122809 CASAVA_Build 6 144320130 1D GGAGTCTGGT G/- GGGGGGTGAG 3070 hom 113 het 44 0 40 4 G 7 6 122810 CASAVA_Build 6 144343219 1D TTTTTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 33 1 19 14 T 17 16 122811 CASAVA_Build 6 144348813 10D TATATAAAAT TATATATATA/---------- TATATATATA 1099 hom 7 het 4 0 3 1 TA 14 9 122812 CASAVA_Build 6 144357975 4I GGAGATAAAA ----/CTAT CTATTCTCAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTAT 1 2 122813 CASAVA_Build 6 144380204 1D CCATCTAGGT A/- TCACTTCCCC 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 A 1 0 122814 CASAVA_Build 6 144382621 1I AAAGTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 28 2 19 7 A 13 14 122815 CASAVA_Build 6 144400534 3I ATTATGAACT ---/ATA ATGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 ATA 0 1 122816 CASAVA_Build 6 144431513 1D TCTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 19 6 T 11 10 122817 CASAVA_Build 6 144460004 1I TCCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 11 12 122818 CASAVA_Build 6 144463537 34D TCAGGAGCTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------------------- TTTTTTGAGA 3070 het 2942 hom 24 10 17 2 T 40 6 122819 CASAVA_Build 6 144473822 7D ACATAATTTC AAATTTT/------- AAAAAGTAAG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 AAATTTT 1 0 122820 CASAVA_Build 6 144522347 2D AAATTGACTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 77 hom 35 1 26 8 TG 10 9 122821 CASAVA_Build 6 144533422 3D GCTCAATCTG TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TAT 5 4 122822 CASAVA_Build 6 144534550 1D TTTTAGCATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 122823 CASAVA_Build 6 144549156 4D TAAAATATAT ATAA/---- ATAAATAAAT 2419 het 489 hom 6 1 5 0 ATAA 6 5 122824 CASAVA_Build 6 144554365 1I TGTACAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 884 hom 37 2 26 9 A 11 12 122825 CASAVA_Build 6 144559573 3I GTCAGAAAGC ---/AAG AAAAACTTGT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AAG 0 1 122826 CASAVA_Build 6 144588645 1I TATTTGCAGC -/T GAAAGGGTCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 122827 CASAVA_Build 6 144630558 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 44 2 30 12 A 13 12 122828 CASAVA_Build 6 144636946 1D CTTCTTACAT G/- GCTGCAGCAA 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 G 2 1 122829 CASAVA_Build 6 144639561 1I AGATTCCTGG -/T GCTGAATTAC 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 T 0 1 122830 CASAVA_Build 6 144640593 1D AAGCTGCCTA T/- TGGAAGAAGG 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 2 1 122831 CASAVA_Build 6 144643144 3D CTTCAATATC ATA/--- ATGAGTACTT 3070 het 3070 ref 49 29 15 5 ATA 1 0 122832 CASAVA_Build 6 144649517 1I GTTGTTCAAA -/G GGATTTTTTC 3070 het 1826 hom 26 5 17 4 G 2 3 122833 CASAVA_Build 6 144681973 1D TTTAGTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 8 T 11 10 122834 CASAVA_Build 6 144684041 2D CTATTTACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 45 18 18 10 AC 9 8 122835 CASAVA_Build 6 144691403 4D ATTTATTAAT TTTG/---- TTTATTTTGC 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 TTTG 1 0 122836 CASAVA_Build 6 144719770 2I AGGATTTCTT --/TA TATAGTTAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TA 2 3 122837 CASAVA_Build 6 144742064 1I CACCCCAACA -/T TTGGTGCTTT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 2 3 122838 CASAVA_Build 6 144753819 2D8M16D AACTAATTGT TATATTTAATAACAATTAGTCATTTA/--TATTAAAT---------------- GACTAGAAAA 3070 het 3070 ref 33 24 13 6 N/A 0 0 122839 CASAVA_Build 6 144769186 9D TTTTCTTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2839 het 2006 hom 32 8 12 14 T 21 12 122840 CASAVA_Build 6 144826439 4I GACTCCTTAC ----/CTTG CTTGGTCTTT 3070 het 2768 hom 46 16 16 14 CTTG 1 2 122841 CASAVA_Build 6 144879490 1D AAATATATTT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 8 7 122842 CASAVA_Build 6 144890862 9D GCTAGTGTGA TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 1107 hom 20 6 8 6 T 21 12 122843 CASAVA_Build 6 144901341 1I ATAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 28 het 11 0 10 1 A 9 10 122844 CASAVA_Build 6 144919213 1D TGAAGCCCCT G/- GCCCCTTAAC 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 G 2 1 122845 CASAVA_Build 6 144920259 5I TATTATTATG -----/TATTT TATTTTTATA 3070 hom 86 het 32 0 28 4 TATTT 1 2 122846 CASAVA_Build 6 144921939 2D CTTCTTCTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 T 12 10 122847 CASAVA_Build 6 144932042 2D TTCAAAAATC AG/-- AATATAAAAT 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 AG 1 0 122848 CASAVA_Build 6 144934050 1I ATTCTTAATG -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 6 7 122849 CASAVA_Build 6 144942218 1I TATGCAATGG -/T TTTAATTTCA 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 T 3 4 122850 CASAVA_Build 6 144957100 1D CTTTAATATA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 8 7 122851 CASAVA_Build 6 144967776 1I AATAAACGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 A 9 10 122852 CASAVA_Build 6 144968507 1D GTGGGTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 26 2 12 13 T 15 14 122853 CASAVA_Build 6 144971611 4I CACACACGAC ----/CTCT CTCTCTATGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CT 3 5 122854 CASAVA_Build 6 144978603 5D TGAAGCAAAT ACATA/----- ACATAAGTTA 3070 het 3070 ref 49 28 18 4 ACATA 2 1 122855 CASAVA_Build 6 144979364 1D TGTCTGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 487 hom 25 2 15 8 T 14 13 122856 CASAVA_Build 6 144982631 1D TTAATATCTG C/- CCCCATTTTG 3070 het 3070 hom 51 25 24 2 C 5 4 122857 CASAVA_Build 6 144984276 1I ATATCAAATG -/T TATCTTATCA 3070 hom 128 het 51 0 43 8 T 1 2 122858 CASAVA_Build 6 144992859 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 9 8 122859 CASAVA_Build 6 144996057 1I CTACTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 1669 het 350 hom 11 1 6 4 T 17 18 122860 CASAVA_Build 6 145002888 12I AGAGAGAGAG ------------/AGATTGAGAGAC AGATTGAGAG 3070 hom 104 het 50 0 35 15 AGATTGAGAGAC 1 2 122861 CASAVA_Build 6 145006624 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 20 1 14 5 A 15 14 122862 CASAVA_Build 6 145015868 2D GAAAATAGAA AC/-- ACAGGCTGTG 3070 het 3070 hom 32 11 17 7 AC 2 1 122863 CASAVA_Build 6 145022602 1I AATACTTGGC -/T TTTTTTTTTT 886 het 886 ref 27 18 3 6 T 11 12 122864 CASAVA_Build 6 145033286 1I GTCCTTAATC -/T AAGTTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 T 0 1 122865 CASAVA_Build 6 145033978 1D AATTTTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 21 9 T 12 11 122866 CASAVA_Build 6 145034752 1I GACCATGTGA -/T TTTTTTGTTT 2462 het 2462 ref 20 9 6 5 T 6 7 122867 CASAVA_Build 6 145037049 1D TTTTCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 11 10 122868 CASAVA_Build 6 145054323 1I CATTTATTCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 8 9 122869 CASAVA_Build 6 145063183 1I CAGGATTCCC -/G CCCCCCACCA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 G 0 1 122870 CASAVA_Build 6 145069055 1I TCAGGGCAGC -/T TTTTTTTTTT 2348 het 2348 ref 20 8 8 4 T 13 14 122871 CASAVA_Build 6 145070882 1I TTTTACAGTA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 1231 hom 28 6 18 4 T 7 8 122872 CASAVA_Build 6 145070899 1I GAAAATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1105 hom 28 5 17 6 T 13 14 122873 CASAVA_Build 6 145074795 2I AAATTTAGGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 TG 8 9 122874 CASAVA_Build 6 145076273 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1818 het 634 hom 14 3 6 5 A 12 11 122875 CASAVA_Build 6 145090930 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 31 0 18 13 A 18 16 122876 CASAVA_Build 6 145091304 1D GTATATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 13 12 122877 CASAVA_Build 6 145094700 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 8 122878 CASAVA_Build 6 145096337 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 20 18 122879 CASAVA_Build 6 145100659 2D AATTGAACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 50 0 39 12 T 12 10 122880 CASAVA_Build 6 145104916 1I CTCTTTTCTT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 7 8 122881 CASAVA_Build 6 145116947 2I CTCACTCCCC --/AT ATATATATAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AT 6 7 122882 CASAVA_Build 6 145131087 4D ATGAATAATA ATAG/---- ATAGGTGGAA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 ATAG 2 1 122883 CASAVA_Build 6 145135809 1D TGTGTGAGTG T/- TTTTTTTTTT 826 het 826 ref 25 19 3 3 T 11 10 122884 CASAVA_Build 6 145137239 1I TTGAATTGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1680 hom 37 5 25 7 T 12 13 122885 CASAVA_Build 6 145162412 6D CAAGGTCAGT CTACTA/------ CTGGGAAGAT 3070 hom 147 het 52 0 49 7 CTA 2 0 122886 CASAVA_Build 6 145171110 1I GAGTAGTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 201 hom 27 1 25 1 T 9 10 122887 CASAVA_Build 6 145173686 1I CAACAACAGG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 A 7 8 122888 CASAVA_Build 6 145179487 2I TATACCAAAC --/AT GTGTTATATA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AT 0 1 122889 CASAVA_Build 6 145181194 1D GAATTCACTG A/- AAACCACTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 5 A 4 3 122890 CASAVA_Build 6 145183314 4D TTAAAACCAT TGTG/---- GTTAAAACCA 3070 hom 92 het 33 0 30 3 TG 2 0 122891 CASAVA_Build 6 145187276 26I ATATATATAC --------------------------/ACTATGTATATATATTGTATATATAT ACATATACAA 1947 hom 10 het 6 0 4 2 ACTATGTATATATATTGTATATATAT 0 1 122892 CASAVA_Build 6 145187328 9D39M2D ACAATAAATA TGTATATATTGTATATATATGTATATATACACAAATATAATACATATGTA/---------TGTATATATATGTATATATACACAAATATAATACATATG-- TATATATTAA 1471 hom 7 het 6 0 3 3 N/A 0 0 122893 CASAVA_Build 6 145217963 3D CCATTAGGTT TCA/--- TTATGTAAAC 3070 hom 117 het 45 0 40 6 TCA 1 0 122894 CASAVA_Build 6 145223480 1D GCAAAAAAAA T/- ATATTAGAAA 3070 het 53 hom 37 1 33 3 T 1 0 122895 CASAVA_Build 6 145226812 1D TCTTGGGCCT G/- TGGGTGTGCA 3070 hom 78 het 28 0 24 4 G 1 0 122896 CASAVA_Build 6 145229057 3D AGTTAGAGTA TTG/--- TTGTTTTTTC 3070 hom 137 het 49 0 46 5 TTG 2 1 122897 CASAVA_Build 6 145229643 4I TCAAAAGCCT ----/AAGA GAGAAAGGAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAGA 0 1 122898 CASAVA_Build 6 145230183 1D TCTAGATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 353 hom 26 1 21 4 T 11 10 122899 CASAVA_Build 6 145233496 1I TATTTTTCTT -/C CCCCTCCTTG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 4 5 122900 CASAVA_Build 6 145244703 1D GATAGATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2256 hom 26 9 14 3 A 11 10 122901 CASAVA_Build 6 145251489 1I GGGTTAAATG -/A ATGGGTTCTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 1 2 122902 CASAVA_Build 6 145253149 1I CACTGTAAAT -/A AAAAATTAAC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 5 6 122903 CASAVA_Build 6 145257932 2D AGCCTCTCCC TA/-- TCTCATCGTC 3070 het 3070 hom 51 17 22 13 TA 1 0 122904 CASAVA_Build 6 145258408 1I AGAAGAATGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 A 8 9 122905 CASAVA_Build 6 145298563 2D CACACACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 TG 6 5 122906 CASAVA_Build 6 145304386 1D TATTAAGAAG C/- AAACTGTTTG 3070 het 3070 hom 42 10 28 5 C 1 0 122907 CASAVA_Build 6 145316080 1D ATATAATAGC T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 T 8 7 122908 CASAVA_Build 6 145317819 1I GGGGGCCAAA -/G GGTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 2 3 122909 CASAVA_Build 6 145326764 1I AATGTAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 18 13 17 A 12 13 122910 CASAVA_Build 6 145329848 1D TACCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 13 12 122911 CASAVA_Build 6 145369006 1I GCCTCCTGAA -/T TTTTTTTTTT 1782 het 1782 ref 39 23 6 10 T 13 14 122912 CASAVA_Build 6 145375496 1D ATTTTGTGAT A/- AAAAAATGTA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 7 6 122913 CASAVA_Build 6 145375637 4D AGCAGTGCTT TCTC/---- TCTAAGTTAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 TC 3 1 122914 CASAVA_Build 6 145380698 1I TCCTCTTCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 9 122915 CASAVA_Build 6 145385782 1I AACCACCACC -/A AAAAAAAAAA 2940 het 212 hom 17 1 11 5 A 10 11 122916 CASAVA_Build 6 145397201 1D AGGAACTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 32 0 31 2 T 10 9 122917 CASAVA_Build 6 145402641 1D TGTCTCTGCT A/- AAAAAAAAAA 2596 hom 23 het 14 0 8 6 A 12 11 122918 CASAVA_Build 6 145403367 1D AGAAATCTTT G/- GGGGGGGGGT 2249 het 9 hom 10 0 6 4 G 10 9 122919 CASAVA_Build 6 145406349 2D TAATTTTCCT AC/-- ACAGACTTCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AC 2 1 122920 CASAVA_Build 6 145408789 1D CAAAAAAAAA C/- CAGGTTAATG 3070 het 103 hom 58 1 52 5 C 2 1 122921 CASAVA_Build 6 145477144 1I TTTCTTTGAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 122922 CASAVA_Build 6 145479983 1I TTGTAGCATA -/C AAGGTGACAA 3070 hom 160 het 60 0 54 6 C 0 1 122923 CASAVA_Build 6 145486820 1D AAAGCACAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 18 17 9 T 9 8 122924 CASAVA_Build 6 145509284 1D AGGAATAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 22 1 16 5 A 14 13 122925 CASAVA_Build 6 145516954 3D ACTCAGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1421 hom 12 het 6 0 5 1 A 14 11 122926 CASAVA_Build 6 145527639 3D TTTTTCACTT AAC/--- AATATATCCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AAC 1 0 122927 CASAVA_Build 6 145530382 3D TTTGGGGCTG ACA/--- ACAAGTTATG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ACA 2 1 122928 CASAVA_Build 6 145549765 4I TTAAAGTGAC ----/AAAG AATATCAACT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAAG 0 1 122929 CASAVA_Build 6 145554998 1D AACTACACTG T/- TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 34 27 3 4 T 11 10 122930 CASAVA_Build 6 145559271 1D ATCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 27 1 14 12 T 14 13 122931 CASAVA_Build 6 145563851 1D TTATTAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 621 hom 38 4 19 15 T 15 14 122932 CASAVA_Build 6 145575023 1D GAGGATACAA T/- TTTTTTTTTT 2615 het 2615 ref 34 12 9 13 T 15 14 122933 CASAVA_Build 6 145582843 6I ATAAGCAAAG ------/AATAAT AATATGTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 AAT 1 3 122934 CASAVA_Build 6 145592837 19D TAATGTCCTT TGCTGATATTCATGCCCTC/------------------- TGCTGATATT 3070 het 3070 ref 54 25 18 14 TGCTGATATTCATGCCCTC 2 1 122935 CASAVA_Build 6 145597899 1D ACTTTTTTTT A/- AAATAGATGC 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 A 4 3 122936 CASAVA_Build 6 145598499 3D ATGTATGTGT CTG/--- CTGTATGGTC 3070 het 2621 hom 14 6 8 1 CTG 2 1 122937 CASAVA_Build 6 145598679 1D AGATATTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 18 11 T 12 11 122938 CASAVA_Build 6 145600290 1D GTGTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 11 10 122939 CASAVA_Build 6 145600612 2D CCCTGCAACA TC/-- TCTTAGAAAA 3070 het 3070 hom 36 18 14 6 TC 2 1 122940 CASAVA_Build 6 145610190 15I5M1I CACACCTTTT ---------------ATGGA-/ACTACAGTTATTTTAATGGAT TTGATAAATT 3070 het 3070 ref 42 26 16 3 N/A 0 0 122941 CASAVA_Build 6 145627398 2I AGTTAAAGTT --/AA AAGAGTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 2 4 122942 CASAVA_Build 6 145629536 4D ATGCACTTTA CTCT/---- CTCTCTGTCA 3070 het 3070 ref 47 22 21 7 CT 5 3 122943 CASAVA_Build 6 145633570 3D AAGCTCAGTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2179 hom 37 13 14 10 A 17 14 122944 CASAVA_Build 6 145637978 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 T 6 7 122945 CASAVA_Build 6 145638948 4I TAAGTGTGTT ----/GTGA GTATTAAGAT 3070 het 3070 hom 50 16 30 4 GTGA 0 1 122946 CASAVA_Build 6 145650391 1D TGCGACTTAG A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 7 6 122947 CASAVA_Build 6 145651531 1I TTGCTCATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 10 122948 CASAVA_Build 6 145666870 1D TCCACATTTC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 A 9 8 122949 CASAVA_Build 6 145704990 4I AAATAAATAA ----/ATAT GATAAAAGAC 3070 het 1297 hom 22 3 17 2 AT 0 2 122950 CASAVA_Build 6 145709468 1I CATGCTATGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 438 hom 29 1 21 7 A 9 10 122951 CASAVA_Build 6 145721105 1D AAATTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 425 hom 32 1 25 9 A 11 10 122952 CASAVA_Build 6 145723443 1I TGGGCAAGAT -/A AAAAAAAAAA 2768 het 2768 ref 28 11 11 6 A 15 16 122953 CASAVA_Build 6 145723683 1I TGAAAAGCAG -/C CCCAAATCAC 3070 hom 105 het 43 0 34 9 C 3 4 122954 CASAVA_Build 6 145727470 1I GCATTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2889 hom 24 9 11 4 A 9 10 122955 CASAVA_Build 6 145730570 1D CAGACTCTCA G/- GGGGTGAGGA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 G 5 4 122956 CASAVA_Build 6 145730814 2I TATGCATGTG --/TA TGTGTGTGTA 897 het 897 ref 18 7 4 7 TA 0 1 122957 CASAVA_Build 6 145731425 1I AGTCTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 30 1 15 14 A 10 11 122958 CASAVA_Build 6 145739518 1I TCTATGAAAT -/G TTTTTTTATG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 0 1 122959 CASAVA_Build 6 145743876 1I ACAATGTAAA -/T TGTCCTTCAA 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 T 1 2 122960 CASAVA_Build 6 145744684 1D ATTTGGTCAG A/- AAAAAAACTC 1490 het 1490 ref 25 21 4 0 A 8 7 122961 CASAVA_Build 6 145744810 1D CATTACAAAA G/- ATAGTTAACA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 G 1 0 122962 CASAVA_Build 6 145746930 1D ATCTGGCCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 10 9 122963 CASAVA_Build 6 145753157 1D AATTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 12 11 122964 CASAVA_Build 6 145753659 2I ACTTAAATGT --/TC TCTCACTAGT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 TC 2 3 122965 CASAVA_Build 6 145757943 1D CTTTAAGGCA T/- TTTTTCCTCC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 6 5 122966 CASAVA_Build 6 145759381 30D GGAGACTTTC TCAGGTACATAAACTTTGCAATGTCTGCCT/------------------------------ TCAGGTACAT 3070 het 3070 ref 36 26 9 14 TCAGGTACATAAACTTTGCAATGTCTGCCT 1 0 122967 CASAVA_Build 6 145761215 1D TGTTTGTCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 9 8 122968 CASAVA_Build 6 145763618 11D AGCCAAACTG TTCACCATAAA/----------- TTCTTGTCTC 3070 het 3070 ref 50 24 23 7 TTCACCATAAA 1 0 122969 CASAVA_Build 6 145764030 1D CCAATATGAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 8 7 122970 CASAVA_Build 6 145767280 1I TGTCTAAAGC -/T TTTTTTTACC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 7 8 122971 CASAVA_Build 6 145774395 1I TGAGAATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 11 12 122972 CASAVA_Build 6 145778697 1D CCTAAGCCCA T/- TTGCTTATGC 3070 het 3070 ref 37 14 13 11 T 3 2 122973 CASAVA_Build 6 145780644 1D CCATGGTCAC A/- ACCTTCTAGG 3070 het 3070 ref 32 16 11 7 A 2 1 122974 CASAVA_Build 6 145782009 1D CTGTTAAATG T/- CCCCCCCCCC 1173 het 1173 ref 25 11 7 8 T 1 0 122975 CASAVA_Build 6 145785308 1I AATCTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 10 11 122976 CASAVA_Build 6 145787816 4I CATATCTATC ----/TATT TATTTATCTA 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 TATT 1 2 122977 CASAVA_Build 6 145798239 4D GTGAAGAATT TATA/---- TATATATATA 2080 het 674 hom 9 3 5 1 TA 11 9 122978 CASAVA_Build 6 145801746 1I TACCCAATAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 7 8 122979 CASAVA_Build 6 145807758 1I AAAATTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 10 11 122980 CASAVA_Build 6 145812688 1I AATAGGAAAT -/G GGTTTTTATT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 G 2 3 122981 CASAVA_Build 6 145814179 1D AAAATGCATT G/- GTAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 20 29 1 G 2 1 122982 CASAVA_Build 6 145814716 1D TCGCCATTGA T/- TTTTAAGGAG 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 T 5 4 122983 CASAVA_Build 6 145815509 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 1997 het 724 hom 16 2 7 7 CT 2 1 122984 CASAVA_Build 6 145818143 4I AAAAAACAAC ----/TATT TACTTATATG 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 TATT 0 1 122985 CASAVA_Build 6 145826034 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 10 9 122986 CASAVA_Build 6 145831462 1I AAATCAAATC -/A AAAAAGATTG 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 A 5 6 122987 CASAVA_Build 6 145843011 1D14M4I TAATTTATTT AAAAAAAAAAGAGGT----/-AAAAAAAAAGAGGTTTAA TTGACTCACA 3070 het 3070 ref 35 19 16 7 N/A 0 0 122988 CASAVA_Build 6 145844749 1D ATGAATACAT A/- AATAAGGACC 3070 het 3070 ref 54 27 21 7 A 3 2 122989 CASAVA_Build 6 145846258 2I AAACTTACTC --/AA AGTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 1 3 122990 CASAVA_Build 6 145850908 1D TAGGGAATTC T/- TTCCCCATTG 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 3 2 122991 CASAVA_Build 6 145862782 1D TGATGATTGC T/- TTTCCACTCA 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 T 4 3 122992 CASAVA_Build 6 145862840 1I AAAGATGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 716 hom 28 2 20 6 T 10 11 122993 CASAVA_Build 6 145868361 13D AGATGTTAAC AATATTATTCAGT/------------- AATATTATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 AATATTATTCAGT 1 0 122994 CASAVA_Build 6 145871403 1D AAATAACAAT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 7 6 122995 CASAVA_Build 6 145873693 1D AGATTAACAG A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 A 7 6 122996 CASAVA_Build 6 145881773 4D GAGAAGCAGT GAGA/---- GAGAAAGAGT 3070 hom 135 het 48 0 46 7 GA 4 2 122997 CASAVA_Build 6 145885673 1I AGACACTCTC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 7 8 122998 CASAVA_Build 6 145886736 6D ACACCCAATA GGTAGT/------ TTTTCAGCCC 3070 het 3070 ref 52 29 21 5 GGTAGT 1 0 122999 CASAVA_Build 6 145891958 1D AGCAAAAAAA G/- TAGTTTCTTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 G 1 0 123000 CASAVA_Build 6 145893303 8I AAATGTAGCA --------/AGGGAAAG AGGGAAAGCT 3070 het 3070 ref 58 29 22 7 AGGGAAAG 1 2 123001 CASAVA_Build 6 145896920 1D ATTCCAATAA T/- AAATATAATT 3070 hom 63 het 22 0 22 1 T 1 0 123002 CASAVA_Build 6 145904176 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2596 hom 28 11 12 5 TA 7 8 123003 CASAVA_Build 6 145905858 7D AAAGTGCTGG GATTACA/------- GATTACAGGT 3070 hom 54 het 18 0 18 4 GATTACA 2 1 123004 CASAVA_Build 6 145908028 1D GAGCTGCAGT G/- AAATCTCAGT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 G 1 0 123005 CASAVA_Build 6 145914691 1D GTACTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 12 11 123006 CASAVA_Build 6 145924924 1I AAAAAAATGC -/A AAAAAAAACT 1472 het 1472 ref 23 12 5 6 A 8 9 123007 CASAVA_Build 6 145927601 2D TGGGTATATG GT/-- GGGGGGGGGC 779 het 660 hom 13 5 2 6 GT 1 0 123008 CASAVA_Build 6 145928050 1I3M13D GTAGCACCCT -TGGTTTTTGACCTTAC/GTGG------------- CTGCTGTTTG 2826 het 2826 ref 49 31 9 18 N/A 0 0 123009 CASAVA_Build 6 145931152 1D GACATCTGAC T/- TTTTTTTTTT 1885 het 1433 hom 26 8 10 8 T 17 16 123010 CASAVA_Build 6 145932684 2I TGGAATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 AT 6 7 123011 CASAVA_Build 6 145934016 2D TGGGAGAAAC TG/-- TTCCATATAT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 TG 1 0 123012 CASAVA_Build 6 145939201 1D67M1I GGAAATGAGG CCTTAGGGGCAAGAAATTTTCTTATCAAGACATCACAGTAACTGTAATCAGTTAACAGTAATTTATGC-/-CTTAGGGGCAAGAAATTTTCTTATCAAGACATCACAGTAACTGTAATCAGTTAACAGTAATTTATGCA ATATCACAAA 3070 het 3070 ref 45 36 19 19 N/A 0 0 123013 CASAVA_Build 6 145940169 1D GAAGGAATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 A 10 9 123014 CASAVA_Build 6 145958319 4I ATTTATATTG ----/ATTT ATTTTAAATT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 ATTT 1 2 123015 CASAVA_Build 6 145971431 1D GGTACTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 10 9 123016 CASAVA_Build 6 145975469 1D AGTCACACAA T/- TTTTTTTCAT 2437 het 2437 ref 16 10 5 1 T 8 7 123017 CASAVA_Build 6 145978681 1D GGTATCTGGC A/- GAAGAAATTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 A 1 0 123018 CASAVA_Build 6 146006673 1D TAATTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 11 10 123019 CASAVA_Build 6 146017024 1I GACTATGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2720 hom 33 9 12 12 T 13 14 123020 CASAVA_Build 6 146018016 1D TTTTGCTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2762 hom 36 12 11 14 A 15 14 123021 CASAVA_Build 6 146025276 1I AAAATTGTTC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 7 8 123022 CASAVA_Build 6 146047636 3I AACACCATTA ---/ATT CAGTAGCTCA 3070 het 3070 hom 51 22 25 4 ATT 0 1 123023 CASAVA_Build 6 146049484 3I CCCTGTATTA ---/ATG TACACTTCTA 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 ATG 0 1 123024 CASAVA_Build 6 146061440 1D AACATAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 12 11 123025 CASAVA_Build 6 146082781 1I AAATTTGAGG -/T TTAATAAAGT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 T 2 3 123026 CASAVA_Build 6 146087977 4D AAAAGATCTG AACA/---- GACACCCAAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 4 AACA 1 0 123027 CASAVA_Build 6 146090337 1I AGCCCATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1134 hom 44 4 31 9 A 12 13 123028 CASAVA_Build 6 146092455 1D AATGTCTGTA C/- CCCCATTGTA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 C 5 4 123029 CASAVA_Build 6 146096136 1D AAATAATAGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 38 8 24 8 A 9 8 123030 CASAVA_Build 6 146104628 4D TTGAGATAAT TGTG/---- TGGTTTTAGT 2662 het 2265 hom 15 7 6 3 TG 3 1 123031 CASAVA_Build 6 146113082 1I CCTGAGCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 10 11 123032 CASAVA_Build 6 146114115 1I TTTTTCCAAG -/T TTTAAAATTA 3070 het 2581 hom 27 10 14 3 T 3 4 123033 CASAVA_Build 6 146118495 1D AAAAGACAAA G/- GAATGAACAT 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 G 2 1 123034 CASAVA_Build 6 146141240 5D TAAAGCCTCC TATAT/----- TATTGTGTAG 3070 het 3070 hom 35 17 17 3 TATAT 1 0 123035 CASAVA_Build 6 146148810 2I ACAGAATGCT --/TA TATATATATA 2382 het 2382 ref 19 7 5 7 TA 8 9 123036 CASAVA_Build 6 146149707 1D GCAGATCATG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 9 8 123037 CASAVA_Build 6 146171068 1I GAAAACCACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 9 10 123038 CASAVA_Build 6 146171860 1D TGATGTCAAA G/- AAAAGACAAG 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 G 1 0 123039 CASAVA_Build 6 146173102 1D GTCAATACTC A/- AGAGTATTCT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 2 1 123040 CASAVA_Build 6 146176524 1I TATTAAAAGA -/G TTTTAAATTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 0 1 123041 CASAVA_Build 6 146187582 10I AATGCATTTA ----------/AAATGATTTC AAACCATTTT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 AAATGATTTC 0 1 123042 CASAVA_Build 6 146188811 1I ACCCAAATCT -/C ACGTTCAGTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 123043 CASAVA_Build 6 146194018 1I GTAATTCACA -/T TTTTCTAATA 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 T 4 5 123044 CASAVA_Build 6 146195913 1D AAATGCATAC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 8 7 123045 CASAVA_Build 6 146198207 1I TCTTTTTTCT -/C ACTTTGTCAA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 C 0 1 123046 CASAVA_Build 6 146198755 4I TATGTTGCCC ----/TTTA AAGATCTTAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 TTTA 0 1 123047 CASAVA_Build 6 146203424 2D ATAAAATGAA AG/-- ACATTTATTG 1297 het 1297 ref 7 4 3 0 AG 1 0 123048 CASAVA_Build 6 146212380 1I CCCCATTCTC -/T TTTTTTTTTT 1957 het 1957 ref 30 12 6 12 T 13 14 123049 CASAVA_Build 6 146215473 2D GTCTGCAAAC AG/-- GGACAATTTG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 AG 1 0 123050 CASAVA_Build 6 146224270 2D AAAAAAAAAA GG/-- AGAACAAGTG 1412 het 1412 ref 36 19 5 13 G 2 0 123051 CASAVA_Build 6 146225279 3I AAAAAACAAA ---/AAC AACAACAACA 1605 het 1605 ref 22 7 7 8 AAC 4 5 123052 CASAVA_Build 6 146239089 3I GTAGTCCCAG ---/CTA CTACTTGAGG 2622 het 2622 ref 23 13 7 3 CTA 1 2 123053 CASAVA_Build 6 146247001 2I AGTATTAGTA --/CT GTTGCATGTT 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 CT 0 1 123054 CASAVA_Build 6 146249196 1I ATTCCAACTG -/T TTTTATGAGT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 T 4 5 123055 CASAVA_Build 6 146261277 2D TCTGATGACA TT/-- TTTCACAGAA 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 T 5 3 123056 CASAVA_Build 6 146265470 1I ATTATTGGGG -/A AAAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 A 6 7 123057 CASAVA_Build 6 146266257 2D GTAGAGATAC AG/-- AGTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 AG 2 1 123058 CASAVA_Build 6 146272599 1D GTTTGGTTAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 A 8 7 123059 CASAVA_Build 6 146280425 1I GCAAAATATG -/A ATTCCTGCAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 1 2 123060 CASAVA_Build 6 146283405 1I TCATTATAAA -/T AAAACACTTC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 0 1 123061 CASAVA_Build 6 146284370 1D ATTTGGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 T 13 12 123062 CASAVA_Build 6 146287122 2D GAAAATAAAA GT/-- GTATTTGTGT 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 GT 2 1 123063 CASAVA_Build 6 146294720 1D AATATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2203 hom 30 6 10 14 T 14 13 123064 CASAVA_Build 6 146295794 1I GGGGAAAAAT -/C CCCCCCCCCA 1887 het 1887 ref 32 11 10 11 C 9 10 123065 CASAVA_Build 6 146298009 1D AAAGGAGCAG A/- AAAAAAAAAA 1341 het 1341 ref 36 25 4 7 A 13 12 123066 CASAVA_Build 6 146313677 11D GCCCCTCAGA GAAGCTGACAC/----------- GTAGCTGACA 3070 het 3070 ref 50 28 20 6 GAAGCTGACAC 1 0 123067 CASAVA_Build 6 146322343 1D AAGTATACTC T/- TAAGATGTTC 3070 het 3070 ref 51 26 21 5 T 2 1 123068 CASAVA_Build 6 146323040 7D TTCTTTATGG CAATGGT/------- TGAGGTGTAT 3070 het 3070 hom 55 26 26 9 CAATGGT 1 0 123069 CASAVA_Build 6 146332925 1D TCAAGAAATC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1666 hom 21 5 11 5 T 10 9 123070 CASAVA_Build 6 146337346 7D ACTCCGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2160 het 1106 hom 20 5 7 8 A 23 16 123071 CASAVA_Build 6 146360303 4I GTAGAGAGGA ----/AGGG AGGGAGGGAG 2369 het 2369 ref 30 13 10 7 AGGG 3 4 123072 CASAVA_Build 6 146362768 1I CTGTATGGCT -/G GGGGAGGTAT 3070 het 3070 ref 48 28 11 9 G 4 5 123073 CASAVA_Build 6 146366540 1I AACAAGTCTT -/A AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 A 6 7 123074 CASAVA_Build 6 146381719 2I TGATGTCCCC --/TA TAATAAGTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TA 1 2 123075 CASAVA_Build 6 146383033 1D TTGATTACTT G/- TAACTTATTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 1 0 123076 CASAVA_Build 6 146383384 1D CTGTAATTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 21 10 4 T 9 8 123077 CASAVA_Build 6 146384608 2I GAAAAATGTG --/TT TTTGTCTTAT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 3 5 123078 CASAVA_Build 6 146385921 4D GTTTCCCCTG CTCT/---- CTCTATCTCC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 CT 4 2 123079 CASAVA_Build 6 146388348 1I ATTCTTTTGA -/T TTTTGATCTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 4 5 123080 CASAVA_Build 6 146409594 1D TAAAATAATA T/- TTTTTATGTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 6 5 123081 CASAVA_Build 6 146410137 9D CCTCCTTGTA GCATTTGTG/--------- TTAGAAAGCG 3070 het 3070 ref 38 21 14 5 GCATTTGTG 1 0 123082 CASAVA_Build 6 146425186 1D GTAGGGGGCT A/- GGGGAGGGAT 1196 het 1196 ref 11 8 3 0 A 1 0 123083 CASAVA_Build 6 146461786 1D GTTTCAGGCA T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 34 16 15 4 T 7 6 123084 CASAVA_Build 6 146474303 12I ATATTAAATG ------------/ATTTTAAAAATA ATTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 ATTTTAAAAATA 1 2 123085 CASAVA_Build 6 146620817 1I GTTCTTCCGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 40 1 30 9 A 13 14 123086 CASAVA_Build 6 146658220 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2484 hom 21 het 8 0 8 0 T 13 14 123087 CASAVA_Build 6 146707650 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 1672 hom 22 7 11 4 T 8 7 123088 CASAVA_Build 6 146713298 1D AATTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 T 11 10 123089 CASAVA_Build 6 146714255 1D TTTCAGCAAA C/- CCAGTTGGTC 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 C 3 2 123090 CASAVA_Build 6 146717178 1I GGCTCAATAA -/G GGGTCAGAAT 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 G 3 4 123091 CASAVA_Build 6 146717300 2I CTTCTCTCTC --/TT TACAAGTTAT 3070 het 3070 hom 46 15 27 4 T 1 3 123092 CASAVA_Build 6 146717798 1I ATATTGTGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 49 20 21 8 T 8 9 123093 CASAVA_Build 6 146719250 1D TGTGGTGGAA G/- GGGGCTAGAA 3070 het 3070 hom 49 23 26 1 G 5 4 123094 CASAVA_Build 6 146719992 5I AAATTTGGAT -----/TAAAG TAATCAAATA 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 TAAAG 0 1 123095 CASAVA_Build 6 146720647 1I AGGCTTACAG -/T TTTTGGCTCT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 4 5 123096 CASAVA_Build 6 146721069 1I TTTGGAGGGT -/G GGGTGGGGCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 G 3 4 123097 CASAVA_Build 6 146736983 6D TTGATATGAT GTATCG/------ GTATCGCATT 3070 het 3070 ref 37 16 17 6 GTATCG 2 1 123098 CASAVA_Build 6 146745107 1D TTGTCACTTT G/- GGGGAAACTA 2870 het 2870 ref 25 8 8 10 G 5 4 123099 CASAVA_Build 6 146752249 1I ATAAAAAAGC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 5 6 123100 CASAVA_Build 6 146837459 2D AATGAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 1078 het 1078 ref 44 30 3 11 AG 8 7 123101 CASAVA_Build 6 146845918 1D TTCTCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 1621 het 1621 ref 40 27 5 8 T 15 14 123102 CASAVA_Build 6 146868435 1D GATGATGAGA T/- TTTGAATTGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 3 123103 CASAVA_Build 6 146873469 1I CTTGAGTTAA -/T TTTTGTATAA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 T 4 5 123104 CASAVA_Build 6 146903575 1D AAATGGATTT A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 8 7 123105 CASAVA_Build 6 146904576 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 99 het 43 0 34 13 TA 7 6 123106 CASAVA_Build 6 146922028 2I ACACATAAAA --/AC ACACACTGGA 3070 het 203 hom 33 1 28 4 AC 3 4 123107 CASAVA_Build 6 146922437 2D TACATAAAAC AT/-- ATGTATGTAT 3070 hom 75 het 31 0 26 7 AT 2 1 123108 CASAVA_Build 6 146924134 4D AATTTAGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TTTG 4 3 123109 CASAVA_Build 6 146936200 1I TGGTAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 29 1 24 4 A 10 11 123110 CASAVA_Build 6 146936335 2I AGAAAAAAAA --/AG AGAGAAACTC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 AG 2 3 123111 CASAVA_Build 6 146946717 1D AGATTAAAGC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 9 8 123112 CASAVA_Build 6 146951922 1D TCCTATTAAC T/- ATACCTTCAA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 1 0 123113 CASAVA_Build 6 146963549 1I AAAAACTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 26 1 18 7 T 11 12 123114 CASAVA_Build 6 146979098 1D ATTATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 15 1 14 0 T 13 12 123115 CASAVA_Build 6 146990022 3D CCAACCGAAT ATA/--- ATAACTATAT 3070 hom 123 het 46 0 42 6 ATA 2 1 123116 CASAVA_Build 6 146994793 1D TCTCCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 115 het 43 0 38 5 A 15 14 123117 CASAVA_Build 6 147001584 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 56 het 27 0 19 8 A 10 9 123118 CASAVA_Build 6 147012327 1I ATTTTACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 974 hom 25 3 17 5 T 13 14 123119 CASAVA_Build 6 147020150 2D GCAAAACTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 38 1 26 11 A 13 11 123120 CASAVA_Build 6 147062577 1I ATATCAGAGA -/T TTTGTGGGTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 3 4 123121 CASAVA_Build 6 147066697 1D CTATTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 11 10 123122 CASAVA_Build 6 147067118 1I TTTTCTGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 13 14 123123 CASAVA_Build 6 147068924 2D TGGTTAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 35 3 17 17 A 12 10 123124 CASAVA_Build 6 147069675 1D CAGCTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 2177 het 574 hom 29 6 7 16 T 17 16 123125 CASAVA_Build 6 147081768 1D TTATAGAGAT A/- ACACAACAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 2 1 123126 CASAVA_Build 6 147082012 1D AATGTGAAAT A/- ACATATGTAA 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 A 2 1 123127 CASAVA_Build 6 147082267 1I TTTCCCTGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 123128 CASAVA_Build 6 147084389 31I GTTCAGGCTA -------------------------------/GGGAACATGCAATAATAAGATTTTTAGAGGC GGGCGTGGTG 3070 het 3070 ref 24 14 9 5 GGGAACATGCAATAATAAGATTTTTAGAGGC 0 1 123129 CASAVA_Build 6 147093200 1D AAAAACAAAC A/- AAAAATCTTA 3070 het 3070 hom 49 18 28 3 A 6 5 123130 CASAVA_Build 6 147094187 1I ACCATATGAC -/A AAAAAAAAAA 2700 het 2700 ref 40 15 9 16 A 13 14 123131 CASAVA_Build 6 147095408 2I CTATTTTGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 11 11 A 12 14 123132 CASAVA_Build 6 147095935 9I ATAAAAAAAA ---------/TTAATGTAC TTTATGTGTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 TTAATGTAC 0 1 123133 CASAVA_Build 6 147096104 1I AATTGTATAT -/A ATTTAATCAA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 A 1 2 123134 CASAVA_Build 6 147097868 1I ACTTTCTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 10 11 123135 CASAVA_Build 6 147106721 1D29M1I CCAGCCTGGG TGACAAGAGCGAAACTCCATCTCCAAAAAG-/-GACAAGAGCGAAACTCCATCTCCAAAAAGA AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 25 18 11 7 N/A 0 0 123136 CASAVA_Build 6 147115333 3D ATACTTGCTT ATA/--- ATGTTAACTT 3070 het 3070 hom 39 16 20 6 ATA 1 0 123137 CASAVA_Build 6 147115829 1D ATATTTTTAC T/- TTTTTAAATT 3070 het 2916 hom 23 8 12 5 T 6 5 123138 CASAVA_Build 6 147118612 3D ATTGATTACA TCT/--- TCTAGTTGAC 3070 het 3070 ref 40 23 12 9 TCT 2 1 123139 CASAVA_Build 6 147124986 2I ATATTTTTTT --/TG GGGGGGGTCA 3070 het 3070 ref 52 28 20 4 TG 0 1 123140 CASAVA_Build 6 147136111 1D ATACATAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 10 9 123141 CASAVA_Build 6 147142693 1I TTCCAGCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 27 1 23 3 A 11 12 123142 CASAVA_Build 6 147150360 1I CCTTTTTACC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 47 29 14 4 T 7 8 123143 CASAVA_Build 6 147157839 1D AGAAAACATT G/- TATGACCCCT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 1 0 123144 CASAVA_Build 6 147162968 1I AACTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 443 hom 20 1 16 3 T 9 10 123145 CASAVA_Build 6 147163370 1D GCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 97 het 35 0 32 3 A 9 8 123146 CASAVA_Build 6 147171696 1I ACCAGGTCGT -/G GGGGGTGACA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 G 5 6 123147 CASAVA_Build 6 147171884 1I GCAGGCGCAT -/C ATCTACAGCT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 0 1 123148 CASAVA_Build 6 147172915 3D AAAATATATT TAA/--- AAACTCATAT 1252 het 1252 ref 48 43 3 3 TAA 1 0 123149 CASAVA_Build 6 147173115 3D GATGGCTTTT ATC/--- ATAAAGACAA 1076 het 1076 ref 42 36 3 5 ATC 1 0 123150 CASAVA_Build 6 147174271 2I TTTGTGTGTT --/TA TATATATATA 2597 het 2597 ref 29 12 6 11 TA 7 8 123151 CASAVA_Build 6 147174371 2D GATAAAAATC AT/-- TGCAAACAAT 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 AT 1 0 123152 CASAVA_Build 6 147175186 1D GGGGGTGCCC A/- AAAAAAAATA 2122 het 2122 ref 23 12 5 6 A 9 8 123153 CASAVA_Build 6 147176099 2I TTACTTCTTC --/AA AGAGTGTTCT 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 A 1 3 123154 CASAVA_Build 6 147176279 1I TACAGATGCA -/G GAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 G 1 2 123155 CASAVA_Build 6 147176461 2D TCTGTTTCGC AA/-- AAGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 A 4 2 123156 CASAVA_Build 6 147176836 2I TCTCCTTAAA --/AT ATCTCTCTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AT 1 2 123157 CASAVA_Build 6 147179893 1I ACCTGGTTTT -/A AAAATGGGCA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 4 5 123158 CASAVA_Build 6 147180834 1D GTTACTTAAT A/- AATGCAAATG 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 3 2 123159 CASAVA_Build 6 147182103 6D AAAAAAAAAA AAAAAC/------ AAAAAAACAC 3070 het 43 hom 16 1 12 3 AAAAAC 1 0 123160 CASAVA_Build 6 147182848 1I56M2I AGATTTTGAG -TTTTTTGCCTCTAAGCCTCTGTTTCCTAGATTTCTGTGGACCTTGGTTTTCAAGAC--/TTTTTTTGCCTCTAAGCCTCTGTTTCCTAGATTTCTGTGGACCTTGGTTTTCAAGACAG AGTTCTATCT 3070 het 3070 hom 30 15 15 17 N/A 0 0 123161 CASAVA_Build 6 147183544 5D TGATTGGTTT GTGAG/----- TATGCAAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 GTGAG 1 0 123162 CASAVA_Build 6 147185210 4D AAAAAAAAAA AAAT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1525 hom 25 8 15 3 AAAT 1 0 123163 CASAVA_Build 6 147186018 1D AAAATTGTAC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 A 8 7 123164 CASAVA_Build 6 147191372 1I TAGTTAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 T 10 11 123165 CASAVA_Build 6 147194761 1D GGGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1989 hom 28 7 14 7 A 11 10 123166 CASAVA_Build 6 147202578 3D CCAGGGTTTG GAA/--- GAAGGTGTGT 3070 het 3070 ref 54 28 23 7 GAA 2 1 123167 CASAVA_Build 6 147207656 5I GCTACATGCC -----/CCATG CCATGCAAGT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 CCATG 1 2 123168 CASAVA_Build 6 147212626 2D ATCCCAGAAC TA/-- TATGAACCAG 3070 het 3070 hom 44 21 22 2 TA 2 1 123169 CASAVA_Build 6 147212920 1I TCACAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 39 0 31 8 A 10 11 123170 CASAVA_Build 6 147219031 3I TCAAAAAAGA ---/AAG AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 AAG 0 1 123171 CASAVA_Build 6 147220153 1D CCTATCTGGT C/- CCCTTCTCTG 3070 het 3070 ref 34 18 11 6 C 4 3 123172 CASAVA_Build 6 147226337 1D GTGGTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 11 10 123173 CASAVA_Build 6 147227257 5D AGTTGCTCAG ACTTC/----- ACTTCACAGT 3070 het 3070 ref 36 14 15 9 ACTTC 2 1 123174 CASAVA_Build 6 147234662 1I TTACAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 38 2 25 11 T 10 11 123175 CASAVA_Build 6 147243722 1I TTTGAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 11 12 123176 CASAVA_Build 6 147245041 1D ATGAGAAGGA G/- GAAGATGATA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 G 2 1 123177 CASAVA_Build 6 147250357 1I TTTACCACCA -/C CTGTTTTATG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 C 1 2 123178 CASAVA_Build 6 147254366 4D CCTTGTTGAT TAAG/---- TAAGAACTAC 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 TAAG 2 1 123179 CASAVA_Build 6 147317934 27I AATGGCATGA ---------------------------/TTATATTGAGACATTATCTAAAATGTC TAGAGTTTTC 3070 hom 87 het 28 0 30 4 TTATATTGAGACATTATCTAAAATGTC 0 1 123180 CASAVA_Build 6 147343243 1D AGTTAGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 30 2 21 8 A 14 13 123181 CASAVA_Build 6 147346480 4D AGCAAGAAAA AGAC/---- AGGCAAACAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AGAC 1 0 123182 CASAVA_Build 6 147349731 1I ACCACTGCTC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 7 8 123183 CASAVA_Build 6 147357503 1D ATACAACAAG T/- TGTTTTGATT 3070 hom 138 het 53 0 47 7 T 2 1 123184 CASAVA_Build 6 147358995 2D CTTGATTAAC TG/-- TATTGTGGTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TG 1 0 123185 CASAVA_Build 6 147368283 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 123186 CASAVA_Build 6 147369064 25I TCAAGTAGGC -------------------------/CCCAGTGTCTGTTGTTCCTTTGTAT CCACGTGTAC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 CCCAGTGTCTGTTGTTCCTTTGTAT 0 1 123187 CASAVA_Build 6 147378662 1I CTGCTACACG -/C CAAGGGCTCC 3070 hom 112 het 42 0 37 5 C 1 2 123188 CASAVA_Build 6 147398724 1I TTACCTGATG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 8 9 123189 CASAVA_Build 6 147399091 1I TAATGGACTC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 8 9 123190 CASAVA_Build 6 147446697 1I TGATCTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 13 14 123191 CASAVA_Build 6 147448194 1I ATTACTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 T 11 12 123192 CASAVA_Build 6 147469707 1D CTTCTGATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 11 10 123193 CASAVA_Build 6 147483279 1D TAAACTCTGG C/- CCTGATGAGG 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 C 3 2 123194 CASAVA_Build 6 147498940 1I CTACATAGAG -/A AAAATAATTA 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 A 4 5 123195 CASAVA_Build 6 147505942 1D GCCCTGGAAT A/- AACCAAGCAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 A 3 2 123196 CASAVA_Build 6 147522237 1D TTCTCCCCCC A/- AAAATGTGAT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 A 5 4 123197 CASAVA_Build 6 147526327 4D ACAAAATCTC TAAT/---- TATCTTTCTC 3070 het 107 hom 22 2 9 13 TAAT 1 0 123198 CASAVA_Build 6 147544763 11D CAGCTACTCA GGAGGCTGAGG/----------- CAGGAGAATT 3070 het 1667 hom 17 4 12 2 GGAGGCTGAGG 1 0 123199 CASAVA_Build 6 147545661 4I ACTAAATGAA ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 22 8 11 4 TTAT 4 5 123200 CASAVA_Build 6 147553961 4I37M4I TCAAATTAGT ----GAAACAGGTGGCTCAACGATAAGACTTTAGGTTTAAT----/GAGAGAAACAGGTGGCTCAACGATAAGACTTTAGGTTTAATTAAC TAAAATTAAA 3070 het 3070 hom 28 16 24 3 N/A 0 0 123201 CASAVA_Build 6 147564339 27D TCAGAAGTAG GAAACTGGCTTAAATTGGTGACTCTTT/--------------------------- GAAGTCCCCT 3070 het 3070 ref 32 23 13 8 GAAACTGGCTTAAATTGGTGACTCTTT 1 0 123202 CASAVA_Build 6 147569828 1D TGATAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 13 16 6 A 10 9 123203 CASAVA_Build 6 147577692 1D TCCGGAAATT A/- AGACAGTAGG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 2 1 123204 CASAVA_Build 6 147599427 4I CTCATTTGTG ----/TGTT TGTGCATGTA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 TGTT 0 1 123205 CASAVA_Build 6 147600223 1D CTATATACTG T/- ATAGGTGAAG 3070 het 3070 hom 35 13 13 10 T 1 0 123206 CASAVA_Build 6 147610832 5D AGCTGGGTGC GGTGG/----- GGTGGCTTAA 2725 het 2725 ref 18 11 6 1 GGTGG 2 1 123207 CASAVA_Build 6 147612539 2D AGCTGGCAAA AG/-- AGAGAGATTG 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 AG 4 3 123208 CASAVA_Build 6 147614161 3D CCAACAGGGC CCT/--- CCTGGGTTTC 3070 het 2891 hom 32 10 15 7 CCT 2 1 123209 CASAVA_Build 6 147619188 3I CTTAGCTGAA ---/AGG AGAAGTATGT 3070 hom 159 het 62 0 53 9 AGG 0 1 123210 CASAVA_Build 6 147625634 1D TAATGTAGAG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 8 7 123211 CASAVA_Build 6 147634428 1D ATTTTGAACT G/- AAAAAAACGA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 G 1 0 123212 CASAVA_Build 6 147642897 1I TTCCATGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 T 11 12 123213 CASAVA_Build 6 147655475 1D AGAAAATCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 10 8 A 10 9 123214 CASAVA_Build 6 147656712 3D TGCTGAATGT GAA/--- GAAGAAGATA 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 GAA 3 2 123215 CASAVA_Build 6 147665061 7D AGTTCCGAAC CCTTTAG/------- AGTCAAAACT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 CCTTTAG 1 0 123216 CASAVA_Build 6 147665447 3D AGTTTGAGAC CAG/--- CCTGGCCAAT 3070 het 674 hom 17 3 13 1 CAG 1 0 123217 CASAVA_Build 6 147677889 1I ATTAATGTTT -/G CAAAACACAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 0 1 123218 CASAVA_Build 6 147679598 4I GAAAATTCTG ----/TTTT TTTAAGTCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 3 7 123219 CASAVA_Build 6 147680892 1D AGAATGATTT A/- TTTAATTTGT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 1 0 123220 CASAVA_Build 6 147681498 2D CCCAGTAGAC AG/-- AGAGTCTCAT 3070 het 3070 hom 59 24 31 5 AG 3 2 123221 CASAVA_Build 6 147686903 1I AGCAATTATT -/A AAAAAAGAGT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 A 6 7 123222 CASAVA_Build 6 147698971 1D GGAAATACTG T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 8 7 123223 CASAVA_Build 6 147701717 1I CTATTTATAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 8 9 123224 CASAVA_Build 6 147707630 4I ATTCCGTAAC ----/ACTT ACTGTGTTAG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 ACTT 0 1 123225 CASAVA_Build 6 147716914 2I GGTATGATTG --/AA TGTAAGGATG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 0 2 123226 CASAVA_Build 6 147731088 1D AAAATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 2584 het 2584 ref 20 11 8 2 A 12 11 123227 CASAVA_Build 6 147732762 1D CATTTTTTTT A/- AATTAAAAGA 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 A 3 2 123228 CASAVA_Build 6 147741937 1I CCACAGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 A 12 13 123229 CASAVA_Build 6 147743475 1D CAACCAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 A 10 9 123230 CASAVA_Build 6 147753534 2D GAGACAGGGT GA/-- GAGTTAAGGA 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 GA 2 1 123231 CASAVA_Build 6 147756012 2I TCTGTATCAC --/AT ATGGTTTAGA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 AT 1 2 123232 CASAVA_Build 6 147756419 8I ATATACATGA --------/AAGTATAG AAGTATAGAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 AAGTATAG 1 2 123233 CASAVA_Build 6 147764319 3D TGCTTAGAAA CTT/--- CTTCTGCCAG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 CTT 2 1 123234 CASAVA_Build 6 147775980 4D TTATAGAATT TTTA/---- TTTGTCAATT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 TTTA 1 0 123235 CASAVA_Build 6 147776626 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2464 het 2464 ref 24 7 8 10 A 15 14 123236 CASAVA_Build 6 147830711 1I GATAACATTC -/A AAGATAACTA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 2 3 123237 CASAVA_Build 6 147839610 2D CTATTTTGTC TT/-- TGTTAATATT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 3 1 123238 CASAVA_Build 6 147840499 18I AGAAGGACGT ------------------/GAAGGAGTGGGCGCTGCA GATACCTGGG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 GAAGGAGTGGGCGCTGCA 0 1 123239 CASAVA_Build 6 147841415 9D ATTTTTTAAA ACAGTGTTT/--------- ACAATAGCTA 3070 hom 87 het 32 0 29 6 ACAGTGTTT 1 0 123240 CASAVA_Build 6 147849022 1D TGGTAATTGC A/- AAAAAATTAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 7 6 123241 CASAVA_Build 6 147858418 1D AGAGAGAACT C/- GAACAAGTGC 3070 het 3070 ref 43 27 10 7 C 1 0 123242 CASAVA_Build 6 147878486 1D TAAGCACATG C/- CCATGTGCTA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 C 3 2 123243 CASAVA_Build 6 147880332 15I GGTGTTTGAT ---------------/GATAAATCAGTGGTA GATTTTTAGT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 GATAAATCAGTGGTA 0 1 123244 CASAVA_Build 6 147883965 1D ACTAATTATT A/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 31 17 8 7 A 1 0 123245 CASAVA_Build 6 147903607 1I AGAGAGAGAG -/A GGGGGGGGTC 2570 het 1455 hom 25 4 11 10 A 0 1 123246 CASAVA_Build 6 147910313 1D GTCCACTCTC T/- TGAGCTGGAG 3070 hom 96 het 34 0 31 3 T 2 1 123247 CASAVA_Build 6 147913539 1I GAATGTGTAC -/A AATAGACCTA 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 A 2 3 123248 CASAVA_Build 6 147914642 8D ATATATATGT TATATATA/-------- TATATATATA 1660 het 1660 ref 11 4 7 0 TA 12 8 123249 CASAVA_Build 6 147931902 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2246 het 1353 hom 9 3 5 1 A 8 9 123250 CASAVA_Build 6 147933565 1D GCAAAAAAAA T/- ATATGGTAAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 1 0 123251 CASAVA_Build 6 147934247 1I CCACTGAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 9 10 123252 CASAVA_Build 6 147936320 1I TCCCATGAGG -/T TCCCTCCCTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 1 2 123253 CASAVA_Build 6 147941621 1D TCTGCGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 20 11 A 12 11 123254 CASAVA_Build 6 147944967 1I GTGGGTGGAT -/C CATCTGAGGT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 C 1 2 123255 CASAVA_Build 6 147953980 1D TTTATGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 12 23 12 A 11 10 123256 CASAVA_Build 6 147964313 1I CTTGTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 A 10 11 123257 CASAVA_Build 6 147965611 1D CCAACCAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 10 9 123258 CASAVA_Build 6 147967039 1I ATGTACTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 13 14 123259 CASAVA_Build 6 147969793 1I AGCTTTATCC -/A AAAAAAAAAA 2730 het 2730 ref 37 14 9 14 A 15 16 123260 CASAVA_Build 6 147984303 1I TGCAGCCACT -/G TCAGGAATCC 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 G 0 1 123261 CASAVA_Build 6 147987712 1I ATAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2931 hom 27 10 14 3 A 10 11 123262 CASAVA_Build 6 147997763 9I GAAGCCACTT ---------/GTACACAGA AGTAGTACAC 3070 het 3070 hom 54 21 23 10 GTACACAGA 0 1 123263 CASAVA_Build 6 147998056 3D TCACTGTTGT CAC/--- CACCACCACC 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 CAC 7 6 123264 CASAVA_Build 6 147999745 1I ACTTAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 11 12 123265 CASAVA_Build 6 148013794 3I TTTATTACTT ---/ATC ATGAATTTCT 3070 hom 138 het 51 0 46 5 ATC 0 1 123266 CASAVA_Build 6 148017609 1D TCTTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2550 hom 28 6 17 5 A 13 12 123267 CASAVA_Build 6 148017979 1D TTCAGGCTAG T/- TTGGGCACAC 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 T 3 2 123268 CASAVA_Build 6 148021256 2D ATTTATTTAT TC/-- ATATATATAT 1008 het 1008 ref 25 9 3 13 TC 1 0 123269 CASAVA_Build 6 148023489 6D GTTCTCAGGC GATCTG/------ GATCTGGATG 3070 het 3070 hom 30 13 14 7 GATCTG 2 1 123270 CASAVA_Build 6 148026453 1D TGTGTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 18 0 13 5 A 11 10 123271 CASAVA_Build 6 148041113 3D ATAACAAAAT TTG/--- TTATTGTAAA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 TTG 1 0 123272 CASAVA_Build 6 148042636 1I GGATAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 2747 het 2747 ref 34 15 8 11 T 13 14 123273 CASAVA_Build 6 148042880 3D CAATATTGTT CTC/--- CTTTAAAAGT 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 CTC 1 0 123274 CASAVA_Build 6 148045612 1I GTAGGATATA -/T TTTTCTCATC 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 T 4 5 123275 CASAVA_Build 6 148059166 1D TGATGATGGC T/- TACCCAGCCT 3070 het 3070 ref 48 24 19 6 T 2 1 123276 CASAVA_Build 6 148064482 1I AGTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2573 het 2573 ref 31 14 11 6 A 16 17 123277 CASAVA_Build 6 148073646 1I TGGAATGTAT -/C CCCCCCTGGA 3070 hom 98 het 37 0 32 5 C 6 7 123278 CASAVA_Build 6 148078349 7D TTGTTCAGGG AGCTCCT/------- AGGTCTGGGT 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 AGCTCCT 1 0 123279 CASAVA_Build 6 148081520 1I CTCTTTCTCG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 231 hom 40 1 30 9 T 8 9 123280 CASAVA_Build 6 148090986 2I TGGGCCCAGC --/GG GGCTCACACC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 2 4 123281 CASAVA_Build 6 148091692 3I TCTTTATGCA ---/GTT GTTCTGTGTG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 GTT 1 2 123282 CASAVA_Build 6 148092380 1I AACAAAGAAC -/A AACAAAATAT 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 2 3 123283 CASAVA_Build 6 148098485 1D TATTTTACTA T/- TTTTTTTTTT 2287 het 2287 ref 43 31 5 8 T 12 11 123284 CASAVA_Build 6 148104944 1D ATATCCTTTT A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 45 26 15 6 A 7 6 123285 CASAVA_Build 6 148125346 1D ATTACTGTAC T/- CTTTTATGTT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 1 0 123286 CASAVA_Build 6 148127802 7D ATTTACAGTT TATAATC/------- TATAGATCTC 3070 het 3070 hom 37 18 20 7 TATAATC 1 0 123287 CASAVA_Build 6 148141687 1I TGATTTCTCT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 A 8 9 123288 CASAVA_Build 6 148141819 1I GGAAAATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 842 hom 30 3 23 4 T 13 14 123289 CASAVA_Build 6 148142327 2D GAAGTCATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 941 hom 31 7 13 11 T 16 14 123290 CASAVA_Build 6 148146209 1D TGAAAATACA T/- TTTTTTTTTT 1878 het 1878 ref 25 7 7 11 T 12 11 123291 CASAVA_Build 6 148147030 1D ATTAAGGGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 10 9 123292 CASAVA_Build 6 148157892 2I TCCCATCCTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 959 hom 14 2 10 2 T 9 11 123293 CASAVA_Build 6 148168265 1D TAATGGAAAT C/- CAACTTCCTT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 C 2 1 123294 CASAVA_Build 6 148169146 4D CGCGCGCGCG CGCA/---- CACACACACA 3070 het 194 hom 46 3 26 22 CGCA 1 0 123295 CASAVA_Build 6 148179774 1D AGACATGTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 10 9 123296 CASAVA_Build 6 148185811 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 T 7 6 123297 CASAVA_Build 6 148186266 1D CCAGTGGCAT A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 A 7 6 123298 CASAVA_Build 6 148187422 1I TGGCTGGGGT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 A 7 8 123299 CASAVA_Build 6 148197107 2I TTTATTTCTC --/TT TGTTTTGCTG 3070 het 3070 hom 48 20 20 8 T 1 3 123300 CASAVA_Build 6 148204579 4I GGTCCAAGGA ----/GACT GACTGTTCAG 3070 het 3070 ref 58 29 22 7 GACT 1 2 123301 CASAVA_Build 6 148211773 1D CTCAGGGACT G/- GCAAACTTTT 3070 het 3070 ref 49 21 22 6 G 2 1 123302 CASAVA_Build 6 148220790 4D15M1D GTCCCCAGTC TGATTGTTGCCTCATCCCCT/----TGTTGCCTCATCCCC- GTCAGAATAT 3070 het 3070 ref 48 23 24 6 N/A 0 0 123303 CASAVA_Build 6 148239912 1D GTTTTTATTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 9 8 123304 CASAVA_Build 6 148247482 3D AACTTTCAAC CTT/--- CTTATGTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 CTT 2 1 123305 CASAVA_Build 6 148251413 1D CTCTGGCTGC T/- TTTTAAGATT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 5 4 123306 CASAVA_Build 6 148256926 1D ATGCCACTGG T/- TTTTTTTTTG 2736 het 2269 hom 23 10 7 6 T 10 9 123307 CASAVA_Build 6 148258095 1D TAAAACATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 T 9 8 123308 CASAVA_Build 6 148264270 5I TAAGAACTAA -----/TCTTG TCTTCTCCTT 3070 het 3070 ref 60 31 24 5 TCTTG 0 1 123309 CASAVA_Build 6 148264457 1I TTCTGGAACT -/A AAAGTATGAG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 3 4 123310 CASAVA_Build 6 148270278 3D TTTGCCATTA CTT/--- ATTTTAATGG 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 CTT 1 0 123311 CASAVA_Build 6 148271773 1D ACAGTGACTC A/- ACGACTATAA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 2 1 123312 CASAVA_Build 6 148275297 5I GCTGCTTAAC -----/TTTAA TTTAAATAGC 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 TTTAA 1 2 123313 CASAVA_Build 6 148289302 2I TGTTGGACAC --/AT GTGTGTCTTC 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 AT 0 1 123314 CASAVA_Build 6 148301122 2I GATCAAAGAA --/CT CTCATTACTG 3070 het 3070 hom 47 15 27 5 CT 1 2 123315 CASAVA_Build 6 148311108 1I GCAAGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 1369 het 1369 ref 39 18 5 16 A 13 14 123316 CASAVA_Build 6 148324900 2I TCTCAGATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 128 het 51 0 43 8 A 10 12 123317 CASAVA_Build 6 148349352 5D CTTTGTTTTG TTTTA/----- TTTTGCTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TTTTA 1 0 123318 CASAVA_Build 6 148350486 5D GAGTTTTCTT CTTTA/----- CTTCTGTTCA 3070 hom 114 het 39 0 39 1 CTTTA 1 0 123319 CASAVA_Build 6 148353788 1D AACCAGAAAT A/- ACCATTTGAC 3070 het 402 hom 11 2 7 2 A 2 1 123320 CASAVA_Build 6 148360596 2D GGGATATTGA AT/-- ATGTTTTGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AT 2 1 123321 CASAVA_Build 6 148368241 1D TTTTTTTTTT A/- AAATAATCTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 A 4 3 123322 CASAVA_Build 6 148395584 1D TTCTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 11 10 123323 CASAVA_Build 6 148411474 2D TATATCAAAC TA/-- TGTAAAATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TA 1 0 123324 CASAVA_Build 6 148418743 1I AAACTTTGTA -/T TTTGTGTATG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 3 4 123325 CASAVA_Build 6 148424418 5I GATTCTTCTC -----/TCTTT TCTTCTTTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TCTTT 0 1 123326 CASAVA_Build 6 148431494 1I ATTGAATGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 8 9 123327 CASAVA_Build 6 148466492 10D TTCTAAGGGA TTTCATTCAC/---------- TTTCATTCAC 3070 hom 84 het 30 0 27 4 TTTCATTCAC 2 1 123328 CASAVA_Build 6 148466931 1D GTTTAGCATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 394 hom 42 1 36 5 A 10 9 123329 CASAVA_Build 6 148481345 2I ATTGATGTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 45 0 31 14 A 12 14 123330 CASAVA_Build 6 148485654 3D AATCCTTGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 29 2 13 16 A 17 14 123331 CASAVA_Build 6 148485884 3D TCTCGATGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 33 1 14 19 T 19 16 123332 CASAVA_Build 6 148488225 1D CACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2980 het 23 hom 12 1 8 3 A 17 16 123333 CASAVA_Build 6 148503563 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 2714 het 1302 hom 12 5 7 0 T 8 9 123334 CASAVA_Build 6 148506750 2I TCACTGAGTG --/TC TGCTGATAAG 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 TC 0 1 123335 CASAVA_Build 6 148531864 1I GACAGCCTTT -/C CCCCCCCAAG 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 C 7 8 123336 CASAVA_Build 6 148537651 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2351 het 905 hom 20 5 7 8 A 17 16 123337 CASAVA_Build 6 148539009 1D ACTGTCTGTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 9 8 123338 CASAVA_Build 6 148540618 2I TTAGGGAACA --/TC TGTTTGCAGG 3070 het 3070 ref 53 22 21 10 TC 0 1 123339 CASAVA_Build 6 148542601 1I GAGGGCAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 9 7 8 T 8 9 123340 CASAVA_Build 6 148549883 1D TTAACTTCGC T/- TTCTTCGAGG 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 3 2 123341 CASAVA_Build 6 148554190 1D TGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 2659 het 2174 hom 23 8 9 6 T 13 12 123342 CASAVA_Build 6 148559739 3D AGATGAAGGA GAT/--- GATGGTGTCG 3070 hom 117 het 41 0 39 3 GAT 2 1 123343 CASAVA_Build 6 148565798 1D AAACAAAAAC A/- AAAAACAGAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 6 5 123344 CASAVA_Build 6 148579218 4D GGGTTTTTAA TATT/---- TATTTATTTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TATT 3 2 123345 CASAVA_Build 6 148585991 2D GAGCCTAGAC AG/-- AGAGAGAGCC 2938 het 2938 ref 31 12 10 12 AG 5 4 123346 CASAVA_Build 6 148591963 11D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2556 het 2556 ref 30 10 10 12 A 24 13 123347 CASAVA_Build 6 148602534 1D ATAGATCGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 45 0 31 14 T 13 12 123348 CASAVA_Build 6 148603924 1I CATCAAGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 8 9 123349 CASAVA_Build 6 148626544 1I ACCTGAAAAG -/A AAACTGTCAC 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 A 3 4 123350 CASAVA_Build 6 148629616 1I AATTTTTTTT -/G TTTTTGGTAG 3070 het 1729 hom 25 6 14 5 G 0 1 123351 CASAVA_Build 6 148633212 1D TATTTTAAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 12 24 2 T 9 8 123352 CASAVA_Build 6 148644751 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1928 het 1150 hom 17 4 7 6 A 12 11 123353 CASAVA_Build 6 148645212 1I GCCCAGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 56 hom 19 1 12 6 T 10 11 123354 CASAVA_Build 6 148645597 3I TTAGGAGGAG ---/AGA AGAAGGAGAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 AGA 1 2 123355 CASAVA_Build 6 148646758 1I ATCTATGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 11 12 123356 CASAVA_Build 6 148650530 2D GTGTGGGGGG GT/-- GGGGGGTGGT 3070 het 3070 hom 50 23 22 7 GT 1 0 123357 CASAVA_Build 6 148650992 2D CCCAGCTGTC AG/-- AGAGTTTCCC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AG 3 2 123358 CASAVA_Build 6 148665425 4D ATGCACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 1668 hom 24 5 13 7 AC 9 7 123359 CASAVA_Build 6 148665592 2I58M8D ATTTATATAC --TGTGTGTGTGTATATATATATGTGTGTGTGTATATATTCGAACTCCTGACCTCAGGAGTATATATA/TGTGTGTGTGTGTATATATATATGTGTGTGTGTATATATTCGAACTCCTGACCTCAGGAG-------- TATATATATA 3070 het 3070 hom 28 16 13 8 N/A 0 0 123360 CASAVA_Build 6 148680858 2D AGCCCAGGAC TT/-- AGACTGAGAA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 2 0 123361 CASAVA_Build 6 148722889 1D CCCAGCTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 22 hom 27 1 22 4 T 10 9 123362 CASAVA_Build 6 148723473 1D CCACCCCCCC G/- CCAGGCTTTA 2294 het 1181 hom 26 7 6 13 G 1 0 123363 CASAVA_Build 6 148724430 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1134 hom 14 5 8 2 A 11 10 123364 CASAVA_Build 6 148727952 1I ACTCTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2750 hom 22 7 13 2 A 12 13 123365 CASAVA_Build 6 148730237 1I CTTAGCTTGG -/T TTTTTAGTTG 3070 het 3070 ref 44 30 11 3 T 5 6 123366 CASAVA_Build 6 148732486 1D TTTCCATGAC A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 A 7 6 123367 CASAVA_Build 6 148737537 1I TTTTTTTGGG -/T GGGGGGGGAG 3070 het 832 hom 26 6 16 4 T 0 1 123368 CASAVA_Build 6 148749947 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1463 het 221 hom 16 1 7 8 T 17 16 123369 CASAVA_Build 6 148764083 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1561 het 1561 ref 34 19 6 9 A 17 16 123370 CASAVA_Build 6 148766276 1I CATTCATTGT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 7 8 123371 CASAVA_Build 6 148780549 1D TCCTCATTGG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 T 8 7 123372 CASAVA_Build 6 148781665 3I AAAGTTCTGT ---/GAA GAATACACCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GAA 1 2 123373 CASAVA_Build 6 148785606 2I TTTGTCCGCC --/TG TGTTTCCATT 3070 hom 87 het 30 0 28 2 TG 1 2 123374 CASAVA_Build 6 148797874 1D CTCTATTGGA G/- GGGGTGAGGA 3070 hom 65 het 27 0 22 6 G 5 4 123375 CASAVA_Build 6 148801590 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAACC 2650 het 2297 hom 34 14 10 10 C 0 1 123376 CASAVA_Build 6 148810503 3D CTCTTGTTCT TCC/--- TCCTCTTCTT 3070 het 1768 hom 32 9 14 9 TCC 2 1 123377 CASAVA_Build 6 148811911 9I TCATTTCTTT ---------/TTCTTTTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 22 0 14 9 TTCTTTTTC 0 1 123378 CASAVA_Build 6 148815532 1D GCTGTTCCCT C/- CCCTCACCCC 3070 hom 149 het 55 0 48 8 C 4 3 123379 CASAVA_Build 6 148829576 1I TTTTTAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 20 21 11 T 10 11 123380 CASAVA_Build 6 148835275 1D CTTGGATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 30 2 16 12 A 14 13 123381 CASAVA_Build 6 148836190 3D CAAAGCAATT CTC/--- CTGCTTCAGT 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 CTC 1 0 123382 CASAVA_Build 6 148840374 4I TGGCTTTGTG ----/GGAT GGATGGAGTC 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 GGAT 1 2 123383 CASAVA_Build 6 148840611 1I AGTGCAACCT -/C CCACCTCCCA 3070 het 2238 hom 16 5 9 2 C 2 3 123384 CASAVA_Build 6 148846879 4D GAATGTTTGA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 TTGT 3 2 123385 CASAVA_Build 6 148847476 1D TAGGATAATT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 81 het 30 0 26 8 A 8 7 123386 CASAVA_Build 6 148856842 1I TTTATTTTCT -/A AGTTAAGAAG 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 1 2 123387 CASAVA_Build 6 148861064 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 19 2 14 4 A 13 12 123388 CASAVA_Build 6 148866143 1D TCATCTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 33 1 28 4 A 11 10 123389 CASAVA_Build 6 148867535 14I CACCAGTATT --------------/TATGGGGAGTCTAC TATGGGTGGG 3070 het 3070 hom 42 16 15 11 TATGGGGAGTCTAC 0 1 123390 CASAVA_Build 6 148877376 6I TCAGCAGAAA ------/AGGGAT AGGGATACGA 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 AGGGAT 1 2 123391 CASAVA_Build 6 148879133 2D GAGGCCCCAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 GT 6 5 123392 CASAVA_Build 6 148892410 1D ACTCTTAAGC T/- TTACGTTCAC 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 3 2 123393 CASAVA_Build 6 148898887 11D GCTGCCTTTA GGGATAGATTT/----------- GGGATAGATT 3070 het 3070 ref 56 23 21 17 GGGATAGATTT 2 1 123394 CASAVA_Build 6 148911895 1D CTGCACCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 9 12 A 17 16 123395 CASAVA_Build 6 148919821 1I CATGCATCCT -/C CAAGCACCAG 3070 hom 154 het 59 0 52 7 C 1 2 123396 CASAVA_Build 6 148922352 11D GTATCCAAGG CTTAACTTTGA/----------- CTTAACTTTG 3070 hom 122 het 44 0 41 6 CTTAACTTTGA 2 1 123397 CASAVA_Build 6 148927816 1I CTTGCAGATA -/T TTTTTCCCCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 5 6 123398 CASAVA_Build 6 148929940 4D CTTTCTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 TTTC 4 3 123399 CASAVA_Build 6 148931774 1I GGAGGAGGCG -/C CTGCGCTGGT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 C 1 2 123400 CASAVA_Build 6 148953666 1I TCATTTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 10 11 A 11 12 123401 CASAVA_Build 6 148959224 4I ACTGGGAATT ----/AAAG AAACTATTCC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 AAAG 0 1 123402 CASAVA_Build 6 148967610 5D TGGGAAATAA TCTCT/----- TCTCTTCAAT 3070 het 3070 hom 38 16 21 2 TCTCT 2 1 123403 CASAVA_Build 6 148969234 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 1899 het 1899 ref 16 9 5 2 TA 11 9 123404 CASAVA_Build 6 148969921 5I ATTTAGAAAC -----/ATTGT ATTATTATAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 ATTGT 0 1 123405 CASAVA_Build 6 148983790 7D GCTTACTCCT ACCAATA/------- GCTAACATTT 3070 het 3070 ref 42 24 17 3 ACCAATA 1 0 123406 CASAVA_Build 6 148987743 1I CCAAATCTCT -/C TTTTTTTTTT 2794 het 2794 ref 26 12 9 5 C 0 1 123407 CASAVA_Build 6 148991719 4I TTTTTTCTTT ----/TAAG TAAGAGCTTT 3070 het 3070 hom 24 8 10 6 TAAG 1 2 123408 CASAVA_Build 6 148999814 4D AATTTTCCTT ATGA/---- ATAAGATAAA 3070 het 3070 ref 42 28 10 5 ATGA 1 0 123409 CASAVA_Build 6 149000909 1I AAAAGCTCCT -/G GGGTTCCAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 3 4 123410 CASAVA_Build 6 149018918 1D TTGAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 1971 hom 18 6 8 4 A 9 8 123411 CASAVA_Build 6 149022675 1I GCCATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3011 het 3011 ref 34 15 12 7 A 13 14 123412 CASAVA_Build 6 149023661 1D TGTTGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 A 11 10 123413 CASAVA_Build 6 149026093 1I TTCTATTTTT -/A AATTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 2 3 123414 CASAVA_Build 6 149030378 2D TGTCTGGAAA TG/-- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 TG 1 0 123415 CASAVA_Build 6 149037714 3I CTGAGCAAGG ---/CTA CACAATGGGA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CTA 0 1 123416 CASAVA_Build 6 149038408 1D AGTATACCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 14 22 11 A 10 9 123417 CASAVA_Build 6 149038499 2D CAGCATCTGC TA/-- TGTGTCCTTA 3070 het 3070 hom 42 19 20 4 TA 1 0 123418 CASAVA_Build 6 149043727 9D ACCAAAAAAA AAAATAAAT/--------- AAATAAAAAA 221 het 221 ref 26 17 4 9 AAAATAAAT 1 0 123419 CASAVA_Build 6 149045288 2D ACACACGTGG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 88 het 47 0 34 14 AC 7 6 123420 CASAVA_Build 6 149045364 18D ACACACCACG CACACACACACTCGCACA/------------------ CACACACATT 3070 het 3070 ref 45 24 14 11 CACACACACACTCGCACA 1 0 123421 CASAVA_Build 6 149048453 1I GGATACTTTA -/T TTTTTTTTCT 2613 het 2613 ref 26 14 8 4 T 8 9 123422 CASAVA_Build 6 149049485 1D GGCCACTTAA T/- TTTTTTTTAT 2771 het 2771 ref 23 10 9 4 T 9 8 123423 CASAVA_Build 6 149052449 5D GTGTTTGTGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 775 hom 46 8 14 27 T 16 11 123424 CASAVA_Build 6 149054635 1I CTCTCAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1864 hom 24 5 11 8 T 14 15 123425 CASAVA_Build 6 149062356 1D GCTAGAGTGC G/- GGTGGTGCGA 3070 hom 89 het 37 0 30 7 G 3 2 123426 CASAVA_Build 6 149063150 1D GTGCTGTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 12 11 123427 CASAVA_Build 6 149066389 1D TACTTCTAGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 T 9 8 123428 CASAVA_Build 6 149067738 1D AATTTAAAAA T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 2 1 123429 CASAVA_Build 6 149070626 4D CTTTACTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 29 11 14 5 AAAC 4 3 123430 CASAVA_Build 6 149077759 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 18 15 3 T 9 8 123431 CASAVA_Build 6 149106130 4I GGAAAAAAAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AG 5 7 123432 CASAVA_Build 6 149108400 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 15 0 9 6 T 15 13 123433 CASAVA_Build 6 149144446 1D ACAGATTTTC A/- ATGTAGACAT 3070 hom 132 het 46 0 44 3 A 2 1 123434 CASAVA_Build 6 149167644 12D TTTTTATATG TAAATATATATA/------------ TAAATATATA 3070 het 242 hom 21 2 19 3 TAAATATATATA 2 1 123435 CASAVA_Build 6 149183143 2I CTCAAGACAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 GT 5 6 123436 CASAVA_Build 6 149189262 1I ATTCATCATG -/T TTTTTTTTTT 2347 het 2347 ref 22 14 5 3 T 11 12 123437 CASAVA_Build 6 149190453 1D TCAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1420 het 1420 ref 37 29 4 4 A 11 10 123438 CASAVA_Build 6 149221326 1I TGCATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 769 hom 32 4 16 12 T 13 14 123439 CASAVA_Build 6 149224779 1I AGTGTGATGT -/G GTGCTGAGAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 1 2 123440 CASAVA_Build 6 149228971 40D TATAATCAAT ATTTAGTGATAACTAAATATATTTAGTGATAACTAAATAA/---------------------------------------- ATTTAGTGAT 3070 het 3070 ref 34 21 8 9 ATTTAGTGATAACTAAATATATTTAGTGATAACTAAATAA 1 0 123441 CASAVA_Build 6 149229724 1D CCACAAGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 39 0 29 11 T 10 9 123442 CASAVA_Build 6 149231285 2I GATTCAAAAG --/AC TGAGTGACTC 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 AC 0 1 123443 CASAVA_Build 6 149242764 9D CTGACTTTTC TTTTTTCTT/--------- TTTTTTTTCT 2166 het 2166 ref 33 17 12 4 TTTTTTCTT 1 0 123444 CASAVA_Build 6 149247258 1D GGTATTCAGA G/- TGGGCATCTA 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 G 1 0 123445 CASAVA_Build 6 149260327 1D TTATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 19 0 12 7 T 11 10 123446 CASAVA_Build 6 149266511 1I ACTGGTGACC -/T GGAAGAGGAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 0 1 123447 CASAVA_Build 6 149269524 2I TCTTACTAAC --/TG TGTGATTTGG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 TG 2 3 123448 CASAVA_Build 6 149285197 1I ATATGTGGCC -/T TTTATGTCTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 3 4 123449 CASAVA_Build 6 149285467 1I ACCTAGGTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 24 het 9 0 8 1 T 9 10 123450 CASAVA_Build 6 149288268 1D AACTTTCTAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 47 15 26 6 A 9 8 123451 CASAVA_Build 6 149289779 1I TGAAAAAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 9 10 123452 CASAVA_Build 6 149305847 4D TATAAGATTG TACA/---- TACAGTAGGG 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 TACA 2 1 123453 CASAVA_Build 6 149306611 1D ATTTCATAAC T/- TCATTATTCC 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 2 1 123454 CASAVA_Build 6 149312239 27D ATAATAATAA TAATAATAATAATAATAATAATAATAT/--------------------------- TACTTATTCA 1572 het 877 hom 6 3 7 0 TAATAATAATAATAATAATAATAATAT 1 0 123455 CASAVA_Build 6 149319213 1I GCGGCAAGAG -/A AAATGAGGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 3 4 123456 CASAVA_Build 6 149334055 1D CAGTCATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 59 29 23 7 T 11 10 123457 CASAVA_Build 6 149337149 1I TTATAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 17 10 A 11 12 123458 CASAVA_Build 6 149343491 7I GAAAAAGCTC -------/ATCCTCA ATCCTCATCT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 ATCCTCA 1 2 123459 CASAVA_Build 6 149352051 1I CCCCCCCACC -/T CCCCGCAAAT 3070 het 866 hom 23 5 9 9 T 0 1 123460 CASAVA_Build 6 149356208 1D ACTCTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 A 11 10 123461 CASAVA_Build 6 149366274 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 15 21 13 A 12 10 123462 CASAVA_Build 6 149373909 1D TCCCAATGAG T/- TAAGGATATT 3070 het 3070 hom 37 11 15 12 T 2 1 123463 CASAVA_Build 6 149374689 1D TTCCCAATAA T/- TTTAAAGCCA 3070 het 3070 ref 39 25 9 5 T 4 3 123464 CASAVA_Build 6 149381115 1I ACCGACTCAT -/A AATTTCATCA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 2 3 123465 CASAVA_Build 6 149449013 3D TTGTATGTAC TTG/--- TTGGTTTCGG 2849 het 2849 ref 27 17 7 6 TTG 2 1 123466 CASAVA_Build 6 149499267 2D GGTTTGAGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1118 het 1118 ref 48 35 4 10 TG 9 8 123467 CASAVA_Build 6 149501471 1I AAACTACGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 10 11 123468 CASAVA_Build 6 149547086 1D TTTTTTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 13 12 123469 CASAVA_Build 6 149566176 1D ACAGGGGAAG A/- AAAAAAAAAA 2236 het 2236 ref 28 18 5 6 A 12 11 123470 CASAVA_Build 6 149570212 1D TCTCCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 27 1 17 9 T 13 12 123471 CASAVA_Build 6 149574618 1I ACAGTTTTCT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 8 9 123472 CASAVA_Build 6 149597711 1I AAAAAAAAAA -/C CACACTCTTT 2541 het 2541 ref 29 14 7 8 C 1 2 123473 CASAVA_Build 6 149611865 2I GATTCCTTCC --/TA TATATTTTAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 TA 2 3 123474 CASAVA_Build 6 149627308 1I TTTTTTTTAC -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 7 8 123475 CASAVA_Build 6 149640790 2D TTTCAAAAAC AT/-- ATTAATGATA 3070 het 3070 hom 30 13 16 2 AT 2 1 123476 CASAVA_Build 6 149644993 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 12 13 123477 CASAVA_Build 6 149648948 4D TCTTTTTATC AAGT/---- AAGTAGTTCC 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 AAGT 2 1 123478 CASAVA_Build 6 149650320 3I TGTTTTTTTT ---/AAA TTTAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 0 3 123479 CASAVA_Build 6 149651684 5D TAATTTTTAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1306 het 714 hom 18 5 5 8 T 21 16 123480 CASAVA_Build 6 149652224 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 15 11 A 12 11 123481 CASAVA_Build 6 149655891 2D AAACAACCAT GA/-- GAGAACTCCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GA 3 2 123482 CASAVA_Build 6 149661122 1I AAAGAGAAAG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 6 7 123483 CASAVA_Build 6 149661551 6I GTATTTACTC ------/TTTAAG TTTATTCTAA 3070 hom 84 het 29 0 28 1 TTTAAG 0 1 123484 CASAVA_Build 6 149662671 1D AGTTCTACAA T/- TTTTTTTTTT 2866 het 517 hom 25 3 11 11 T 15 14 123485 CASAVA_Build 6 149670496 2I GTGAAAACCT --/GA GAGTCCGAAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 GA 1 2 123486 CASAVA_Build 6 149671849 1D GATAGATAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 9 8 123487 CASAVA_Build 6 149672122 12D CTTTACATAT ACTTTTGCAAAC/------------ CCTTTACATA 2256 het 2256 ref 40 15 9 18 ACTTTTGCAAAC 1 0 123488 CASAVA_Build 6 149672542 1I ATTCCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 15 0 12 3 A 10 11 123489 CASAVA_Build 6 149672926 1D TTTAGGAGGC G/- GGAGATGGGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 3 2 123490 CASAVA_Build 6 149673395 1D9M2I AATAATATAT ATATTTTTTT--/-TATTTTTTTAA TAAAATTGCA 3070 hom 87 het 30 0 30 1 N/A 0 0 123491 CASAVA_Build 6 149679458 1I TTAAACACGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 10 123492 CASAVA_Build 6 149686748 1I ACTCTTGTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 360 hom 39 1 32 6 T 8 9 123493 CASAVA_Build 6 149692174 1D AGAAGGAAAT A/- ATTGAATGTG 3070 hom 120 het 47 0 41 7 A 2 1 123494 CASAVA_Build 6 149692925 1I AGATGGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 34 1 28 5 T 10 11 123495 CASAVA_Build 6 149699752 1D GCATTTAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 A 12 11 123496 CASAVA_Build 6 149700053 2D31M5I34M4I ACTTGATAAC TGTTTCGGTATAATTGGTTTTCTTAGTAATGTA-----TATTTTATGCATTTAAAACCATATTTTCAAAAAC----/--TTTCGGTATAATTGGTTTTCTTAGTAATGTATATTTTATTTTATGCATTTAAAACCATATTTTCAAAAACAATT AACTATATTT 3070 hom 114 het 21 0 38 5 N/A 0 0 123497 CASAVA_Build 6 149702215 1D TGAAAAAAAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 8 7 123498 CASAVA_Build 6 149702422 1D TTTTTTATTT A/- TTTATTTATT 1410 hom 18 het 11 0 7 4 A 1 0 123499 CASAVA_Build 6 149708381 2D TAATGCATGA AT/-- ATGTGTTATT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AT 2 1 123500 CASAVA_Build 6 149711444 1I GGCTTATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 31 1 23 7 A 10 11 123501 CASAVA_Build 6 149713960 1D TCCTCCTCAG C/- CCAGAGAGAT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 C 3 2 123502 CASAVA_Build 6 149725493 1D CACAAAAATT A/- ACCTTTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 3 A 2 1 123503 CASAVA_Build 6 149729785 1I TGTGTATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 35 1 28 6 T 11 12 123504 CASAVA_Build 6 149732985 1D TTTTTAAACA T/- TGGAAGAAAA 3070 hom 123 het 46 0 42 6 T 2 1 123505 CASAVA_Build 6 149750633 1D ATTATGTCTC T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 8 7 123506 CASAVA_Build 6 149752509 1D TAAACCTTTC T/- AAGCCATAAT 2688 het 56 hom 20 1 15 5 T 1 0 123507 CASAVA_Build 6 149764828 1D ATACTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 30 1 26 3 A 13 12 123508 CASAVA_Build 6 149770985 1D GTAAAAAGTC A/- AAAGTTTTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 A 4 3 123509 CASAVA_Build 6 149782149 3I CGCCTGGCCT ---/CTA CTGTTTATTA 3070 hom 56 het 22 0 18 4 CTA 0 1 123510 CASAVA_Build 6 149793771 1I AATGCTCATG -/A TTATTATAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 0 1 123511 CASAVA_Build 6 149797805 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 174 hom 16 1 12 4 A 11 10 123512 CASAVA_Build 6 149805122 1D GTTTGGCAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 9 123513 CASAVA_Build 6 149807003 6D GTCAGCCAGT GTGTCA/------ GTCAGCCAGT 1725 het 12 hom 31 1 9 22 GTGTCA 1 0 123514 CASAVA_Build 6 149816429 1D TGCACTCCAT C/- CTGGATGACA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 2 1 123515 CASAVA_Build 6 149822754 2I GCGCAGATAT --/AC AGTCATGCAC 3070 hom 120 het 48 0 39 9 AC 0 1 123516 CASAVA_Build 6 149828754 2I ACATCAAGAC --/TG TGTGAACAAG 3070 hom 81 het 32 0 25 7 TG 2 3 123517 CASAVA_Build 6 149843923 1I CACTGAGCCC -/A AAAGGCTTCC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 3 4 123518 CASAVA_Build 6 149861137 1D TTCATAAGTC A/- AAAAAAAAAA 1828 het 1828 ref 40 14 7 19 A 19 18 123519 CASAVA_Build 6 149869544 3D CCACCTCAGT CTC/--- CTAAGTAGCT 3070 het 3070 hom 30 10 13 9 CTC 1 0 123520 CASAVA_Build 6 149958491 1D CATTTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 17 11 A 12 11 123521 CASAVA_Build 6 149985685 1I CTAATAATAC -/A AAAATTAGCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 4 5 123522 CASAVA_Build 6 149997771 1D AAAAGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 14 13 123523 CASAVA_Build 6 150049925 1D AAGATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1592 het 1592 ref 30 18 4 8 T 13 12 123524 CASAVA_Build 6 150082150 1D AAGCACAGAG T/- TTGTAGAAGG 1880 het 1880 ref 17 9 4 4 T 3 2 123525 CASAVA_Build 6 150106662 1I GCAAAGAGCC -/T ATGAGTGCTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 123526 CASAVA_Build 6 150147305 1I TAACTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 728 het 728 ref 25 11 3 11 T 13 14 123527 CASAVA_Build 6 150201891 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1638 het 1638 ref 29 18 4 7 T 14 13 123528 CASAVA_Build 6 150218527 1I GGAAGATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 15 14 T 15 16 123529 CASAVA_Build 6 150233559 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2873 het 987 hom 19 5 8 7 A 15 14 123530 CASAVA_Build 6 150237475 1I CTTAGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 34 0 30 4 T 10 11 123531 CASAVA_Build 6 150245646 1D ACCCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 2261 het 2261 ref 21 10 7 4 A 11 10 123532 CASAVA_Build 6 150248091 1D CCAAACCGCT G/- TGGATGCATT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 G 1 0 123533 CASAVA_Build 6 150263668 1I TTTTGCTGTT -/G TTTTCTCAGC 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 G 0 1 123534 CASAVA_Build 6 150270179 4I CAAAGAAAAT ----/AATA AATAAAAGGA 3070 hom 77 het 32 0 26 6 AATA 1 2 123535 CASAVA_Build 6 150274045 1D ATTCTGCAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 9 8 123536 CASAVA_Build 6 150297893 12D CATATCTCTA TGTGTGTGTCTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 57 28 27 11 TGTGTGTGTCTG 1 0 123537 CASAVA_Build 6 150299506 1I AAACAACAAC -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 A 6 7 123538 CASAVA_Build 6 150312232 1D AAATACATAG A/- AAAATATTTC 3070 het 3070 ref 37 24 9 4 A 5 4 123539 CASAVA_Build 6 150313738 4D TATGTATGTG TGTT/---- TGTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 70 27 32 12 TGTT 2 1 123540 CASAVA_Build 6 150322235 2I TATTCAAAAC --/AT AGAAAACTTG 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 AT 0 1 123541 CASAVA_Build 6 150324127 2D GACTCTGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2197 het 954 hom 20 7 9 4 A 16 14 123542 CASAVA_Build 6 150326290 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2244 het 1909 hom 22 9 8 5 T 13 12 123543 CASAVA_Build 6 150327075 4D CGATCTCCCT GAAC/---- GAACATCGCG 1867 het 1867 ref 28 13 10 5 GAAC 2 1 123544 CASAVA_Build 6 150333167 1D ATTCTAACTG T/- CAGAGGCCAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 1 0 123545 CASAVA_Build 6 150338567 1I AGAAAGAAAA -/G AAAACATGGA 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 G 0 1 123546 CASAVA_Build 6 150342889 1I ACATGGCTGA -/G AAAAATCAGA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 G 0 1 123547 CASAVA_Build 6 150344220 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTGA 1765 het 1765 ref 14 7 5 2 T 9 8 123548 CASAVA_Build 6 150365863 5I GCATTAACTT -----/GCTCC CCTGTTACTC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 GCTCC 0 1 123549 CASAVA_Build 6 150375136 1D ATAATTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 24 2 12 11 T 17 16 123550 CASAVA_Build 6 150379050 1D GTTCTGGAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 8 123551 CASAVA_Build 6 150396412 1D TGTGTGTGTG T/- GGGGGGGGTG 3070 hom 84 het 45 0 34 11 T 1 0 123552 CASAVA_Build 6 150399798 2I GCATCACAAC --/AA ATGTAACCAG 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 1 3 123553 CASAVA_Build 6 150420045 1D CAGCTTGAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 10 9 123554 CASAVA_Build 6 150434158 1D AGGTTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 34 0 21 13 T 15 14 123555 CASAVA_Build 6 150434716 1I TTTTCTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 17 1 11 5 T 13 14 123556 CASAVA_Build 6 150434877 1I GCCCGGCTAG -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 6 7 123557 CASAVA_Build 6 150445075 1I TGATGAAAGT -/G TAGGCAAATG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 0 1 123558 CASAVA_Build 6 150445453 3D CCGTCTATAT AAA/--- AAAAAAAAAA 2942 hom 18 het 8 0 7 1 A 15 12 123559 CASAVA_Build 6 150445626 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 16 2 12 2 A 15 16 123560 CASAVA_Build 6 150447348 1D AAGAATTAAG C/- CCTAAGAGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 3 2 123561 CASAVA_Build 6 150451411 2D AAAAAAAAAC AA/-- AAAAACTCAA 310 het 310 ref 14 9 3 3 A 7 5 123562 CASAVA_Build 6 150453081 2D CTTGACTGGC TG/-- TGTCCCTTCT 3070 hom 102 het 37 0 33 4 TG 2 1 123563 CASAVA_Build 6 150466274 2D AAAAAGACTC TT/-- TTGATAACAA 3070 het 3070 hom 47 17 27 3 T 4 2 123564 CASAVA_Build 6 150467189 8D TAAAAAAATA AGTCAGTG/-------- AGCTTATGGT 3070 het 3070 ref 34 18 13 8 AGTCAGTG 1 0 123565 CASAVA_Build 6 150480531 2D GGTGTGGGAA GG/-- GCACTCTGAT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 G 3 1 123566 CASAVA_Build 6 150485750 1D GTTATCTTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 T 9 8 123567 CASAVA_Build 6 150500366 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1362 hom 29 6 16 7 A 14 15 123568 CASAVA_Build 6 150513098 1I TCATTGACTT -/A ACTTGCTCCA 3070 het 3070 hom 59 18 32 9 A 1 2 123569 CASAVA_Build 6 150514949 25D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------- AAAGAAGTGC 1168 het 1168 ref 7 5 3 1 A 28 3 123570 CASAVA_Build 6 150519181 1D AATACAATGT A/- AAAAACTATT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 A 6 5 123571 CASAVA_Build 6 150519951 4I AAATGAGGAA ----/TTAC TTTACTTAGT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TTAC 0 1 123572 CASAVA_Build 6 150524106 1I AAGACTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 35 2 27 6 A 10 11 123573 CASAVA_Build 6 150525361 1I GATAGCTCCA -/T TCTTTTTATG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 1 2 123574 CASAVA_Build 6 150536845 2I ACCTCTCCCT --/CC CCCCCCCACC 2918 het 2918 ref 25 10 7 8 C 7 9 123575 CASAVA_Build 6 150536992 1I TCACATACTT -/A ACCATTTTCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 1 2 123576 CASAVA_Build 6 150544303 1I CATTAAAAAA -/G AGTTCTCGAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 0 1 123577 CASAVA_Build 6 150544967 1I TGCATTTATA -/G ATTTTCATGT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 G 0 1 123578 CASAVA_Build 6 150556780 2I CGTGTTGTGG --/GA GAGGGACCCT 1960 het 1960 ref 24 14 5 5 GA 1 2 123579 CASAVA_Build 6 150559283 1D TTCTAAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2363 hom 32 10 14 9 T 13 12 123580 CASAVA_Build 6 150566514 5D AGGGGAACCG TCTTC/----- TCTCCAAGAA 3070 het 3070 ref 63 31 26 9 TCTTC 1 0 123581 CASAVA_Build 6 150572505 4D ATGGAGTGTA TGTT/---- TGTGTATGTA 3070 het 3070 ref 81 40 35 10 TGTT 1 0 123582 CASAVA_Build 6 150579389 1I CTATGGTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 10 10 A 12 13 123583 CASAVA_Build 6 150580940 1D GTCTTTTAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 2608 hom 20 7 10 3 A 9 8 123584 CASAVA_Build 6 150587444 4I CTAGCATTTC ----/TCTT TCTTAGAATT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TCTT 1 2 123585 CASAVA_Build 6 150588922 1I TTCATATTCA -/T TTCCCCCCCC 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 2 3 123586 CASAVA_Build 6 150600721 1I GCCCATTAGG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 T 8 9 123587 CASAVA_Build 6 150605170 35I ACAGACAAGT -----------------------------------/ATTTTACATGAACATCGATGTGAAAATTCTGTCAA ATTGAATTCA 3070 hom 84 het 29 0 29 3 ATTTTACATGAACATCGATGTGAAAATTCTGTCAA 0 1 123588 CASAVA_Build 6 150612531 1D CCACCGAGTA C/- TGTGTTTATT 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 C 1 0 123589 CASAVA_Build 6 150623990 1I GGTCCTCCAG -/A ACCTTATGGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 1 2 123590 CASAVA_Build 6 150624749 1D TTACCATGCA T/- TTTTTTTTTT 1551 het 1551 ref 48 14 8 26 T 19 18 123591 CASAVA_Build 6 150626761 1I GCGCAACTGG -/C CTACACCCAC 3070 het 3070 hom 57 26 25 6 C 1 2 123592 CASAVA_Build 6 150627892 2D TGTAAAAAAC AT/-- ACCCTTGGCA 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 AT 1 0 123593 CASAVA_Build 6 150631941 1I GGTAAGATAT -/C ATATGGCCTG 3070 het 129 hom 24 1 10 13 C 0 1 123594 CASAVA_Build 6 150638717 15D CTGCAAGCTC CGCCTCCTGGGTTCA/--------------- CGCCATTCTC 1439 het 25 hom 5 1 4 0 CGCCTCCTGGGTTCA 1 0 123595 CASAVA_Build 6 150646780 1D GTATTTTTAG T/- TAGAGATGGG 1596 het 110 hom 6 1 5 0 T 2 1 123596 CASAVA_Build 6 150661867 1I GCTAAAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 A 9 10 123597 CASAVA_Build 6 150669800 1D ATTTACAAAT A/- AAAATATTAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 4 A 5 4 123598 CASAVA_Build 6 150672803 1D CACCTGAGCT C/- CGCCTTCTGT 2636 het 2634 ref 19 9 8 2 C 2 1 123599 CASAVA_Build 6 150693122 1D TGTCTTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 59 24 22 13 T 11 10 123600 CASAVA_Build 6 150715562 2D GTTAATTTAA CT/-- CTTTCTTTAC 3070 hom 132 het 52 0 43 9 CT 2 1 123601 CASAVA_Build 6 150718565 1D AACAATTTGG A/- AGCCTGCTTG 3070 het 3070 ref 42 20 19 4 A 2 1 123602 CASAVA_Build 6 150721626 1D CATTTTAAAA T/- TAAGATTATA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 2 1 123603 CASAVA_Build 6 150722053 1I AAATGCCAAG -/C CAACAAGTGC 3070 het 3070 ref 42 16 17 9 C 1 2 123604 CASAVA_Build 6 150722651 1D TCTTTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2282 hom 31 7 15 9 T 13 12 123605 CASAVA_Build 6 150722900 1D CCAACACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 12 11 123606 CASAVA_Build 6 150733257 4D CGCATGAGTG TGTT/---- TGTGAGAGAG 3070 het 3070 hom 65 25 32 10 TGTT 1 0 123607 CASAVA_Build 6 150748322 1D TTAATGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 11 10 123608 CASAVA_Build 6 150765741 15I AATTTACAAA ---------------/CTGGGGGTGATTCAC CTTACAAAGA 3070 hom 141 het 50 0 48 3 CTGGGGGTGATTCAC 0 1 123609 CASAVA_Build 6 150766780 1D TCTAATAATT A/- AAAATAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 5 4 123610 CASAVA_Build 6 150770756 2D ATAAGGAGCA TG/-- TGTGCAGAAG 3070 hom 123 het 46 0 41 6 TG 3 2 123611 CASAVA_Build 6 150774773 1I CTCTGAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 5 het 36 1 27 8 A 9 10 123612 CASAVA_Build 6 150792541 5I ATGGCAGAGG -----/AAGTA AAGAAACGAG 3070 het 3070 ref 73 34 27 12 AAGTA 0 1 123613 CASAVA_Build 6 150794886 1D CCACACCTGC A/- ACTGGGGAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 2 1 123614 CASAVA_Build 6 150797837 1D ACACTAATTC A/- AAAACACTTA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 5 4 123615 CASAVA_Build 6 150798157 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 9 10 123616 CASAVA_Build 6 150798464 3I TTCTTTTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3042 hom 35 het 17 0 13 4 TTC 0 1 123617 CASAVA_Build 6 150799151 2D GCCCCCCTTC CG/-- CACCATAGGA 3070 hom 56 het 21 0 19 2 CG 1 0 123618 CASAVA_Build 6 150799824 3D CAAAAATATC AAA/--- AAAAAAAAGA 3070 hom 99 het 34 0 34 1 A 11 8 123619 CASAVA_Build 6 150800945 1D CCAAGAAACC A/- AAAGCAAATG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 4 3 123620 CASAVA_Build 6 150802008 1I CAATTATAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 728 hom 19 2 16 1 A 9 10 123621 CASAVA_Build 6 150802755 3D GGATCATTGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 36 0 30 7 A 13 10 123622 CASAVA_Build 6 150804875 2D TGCTCATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 37 1 29 8 T 14 12 123623 CASAVA_Build 6 150806118 2I ATCCACCCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 43 1 36 6 A 10 12 123624 CASAVA_Build 6 150806787 2D TTATGAAGCG CA/-- CACACACATC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 CA 5 4 123625 CASAVA_Build 6 150809001 9D ACTCCATTTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 28 1 25 5 A 22 13 123626 CASAVA_Build 6 150821139 4I ACATATTAAT ----/TCTA TCTAGCCTAA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 TCTA 1 2 123627 CASAVA_Build 6 150823606 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1669 het 921 hom 15 4 7 4 T 13 14 123628 CASAVA_Build 6 150825315 2D CATTAAAAAG TC/-- TCAGGAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 TC 2 1 123629 CASAVA_Build 6 150829536 1I TTTTAAAACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 9 10 123630 CASAVA_Build 6 150852341 1I AAAAATATTT -/A TAAAAAAAAT 1920 het 1208 hom 11 5 5 1 A 0 1 123631 CASAVA_Build 6 150853165 1I ATTCTGGGAG -/A AGGCAGGCTT 3070 het 3070 hom 51 28 20 3 A 1 2 123632 CASAVA_Build 6 150859288 18D GGATGAAAGG TGACTTGTTATTATAATT/------------------ TGACTCCCCC 3070 het 3070 ref 44 24 19 6 TGACTTGTTATTATAATT 1 0 123633 CASAVA_Build 6 150866004 1D ATAACGTTAA T/- ACTAATAGTG 2851 het 2377 hom 13 6 6 1 T 1 0 123634 CASAVA_Build 6 150880871 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 13 14 123635 CASAVA_Build 6 150897161 2I ATCTTGCCTG --/TC TCCTTAGTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TC 1 2 123636 CASAVA_Build 6 150899520 4D CTACAGCTAA AAGG/---- AAGGACATAT 3070 het 3070 ref 29 15 13 6 AAGG 2 1 123637 CASAVA_Build 6 150901409 1I TTCCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 15 10 T 10 11 123638 CASAVA_Build 6 150906900 1D CCTATATATT G/- TATAATGAGC 3070 het 3070 ref 54 25 24 7 G 1 0 123639 CASAVA_Build 6 150911108 1D CATTGACAGT G/- GAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 13 26 4 G 2 1 123640 CASAVA_Build 6 150916595 1I ATTTTAAGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 9 10 123641 CASAVA_Build 6 150925955 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2771 het 2381 hom 35 9 11 15 A 18 17 123642 CASAVA_Build 6 150937805 1I CTACTATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 9 10 123643 CASAVA_Build 6 150939191 1D CCAGGAGAAT A/- GGGGCAATCT 3070 het 3070 ref 42 21 16 8 A 1 0 123644 CASAVA_Build 6 150950258 2D TGCTGACATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 47 0 41 9 A 12 10 123645 CASAVA_Build 6 150950919 1D TTAACAATCC T/- TGAGAGACTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 2 1 123646 CASAVA_Build 6 150951040 2I ATATAACTAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AT 5 6 123647 CASAVA_Build 6 150952269 1I TAGACCGTAG -/T ACCCCTAGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 0 1 123648 CASAVA_Build 6 150952556 1I GTCCAGCTAA -/T GTTTTGTATT 1369 het 449 hom 5 1 3 1 T 0 1 123649 CASAVA_Build 6 150956127 1I ACAAACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 288 hom 37 2 30 5 A 13 14 123650 CASAVA_Build 6 150966583 3I TCTAAACATC ---/CTT CTTTGGTAAA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 CTT 1 2 123651 CASAVA_Build 6 150979731 6I TTCTCAATCT ------/ATTATG ATAAAAATCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 ATTATG 0 1 123652 CASAVA_Build 6 150999320 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 6 7 123653 CASAVA_Build 6 151061329 6I TACTATATAT ------/ACACAC ACACACACAC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AC 5 8 123654 CASAVA_Build 6 151061426 2D GGGAGCTGCT AA/-- AGAGTATTTG 3070 hom 117 het 45 0 39 8 A 3 1 123655 CASAVA_Build 6 151065299 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 23 2 16 5 A 11 12 123656 CASAVA_Build 6 151066016 1I ACTTCTCTCC -/T TTCCTAACTC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 2 3 123657 CASAVA_Build 6 151078305 1I TTCATCACTA -/T TTTTTTTTCT 2439 hom 56 het 26 0 19 7 T 8 9 123658 CASAVA_Build 6 151078937 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2837 hom 28 het 11 0 8 3 A 15 14 123659 CASAVA_Build 6 151079682 1D TGGGAAGGGA T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 7 6 123660 CASAVA_Build 6 151082125 1D GGCAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 37 1 33 3 A 11 10 123661 CASAVA_Build 6 151084229 1I TGGAAGATGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 144 het 57 0 49 8 T 7 8 123662 CASAVA_Build 6 151084841 2I GCTATTGAAG --/AA AAGAGATATT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 2 4 123663 CASAVA_Build 6 151086068 1D TCAGTACAAA C/- CCCGGGGGGT 3070 hom 101 het 39 0 33 6 C 4 3 123664 CASAVA_Build 6 151114104 1D GAATGAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 12 11 123665 CASAVA_Build 6 151147863 2I CTCTAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 29 0 20 9 A 14 16 123666 CASAVA_Build 6 151158570 2D AACAAAAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 56 het 23 0 19 4 AT 8 7 123667 CASAVA_Build 6 151165309 3I AAGCATATGA ---/GAC AACAAGTCAA 3070 het 3070 ref 48 32 15 1 GAC 0 1 123668 CASAVA_Build 6 151167417 1D AAAAAAAAAA C/- CCTCGTTCTT 3070 het 2921 hom 31 10 13 8 C 3 2 123669 CASAVA_Build 6 151187553 1I GAGACGGGGG -/T TTCACCAAGT 3070 het 1386 hom 19 4 10 5 T 2 3 123670 CASAVA_Build 6 151191447 1D TTTGTATGGC A/- AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 25 19 3 3 A 12 11 123671 CASAVA_Build 6 151195873 1D TACTACTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 808 hom 22 3 12 7 T 17 16 123672 CASAVA_Build 6 151206396 1I CTTTGTGGGG -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 6 7 123673 CASAVA_Build 6 151208672 3I AAAGAAAAAT ---/ATA ATATTCTAAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 ATA 1 2 123674 CASAVA_Build 6 151216503 5I CAGGAGTCTC -----/AAGAT AAGCCAGACC 3070 hom 78 het 35 0 26 9 AAGAT 0 1 123675 CASAVA_Build 6 151226920 8I GAATTATAAG --------/AGTATAAA GGTATAAGGT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 AGTATAAA 0 1 123676 CASAVA_Build 6 151248029 1D TTTTTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 25 0 16 9 T 15 14 123677 CASAVA_Build 6 151252006 4I ACTCCGTCTC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 14 123678 CASAVA_Build 6 151253117 4I TGCAAAAAGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTTG 3 4 123679 CASAVA_Build 6 151254216 2D GCAACACAAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AT 7 6 123680 CASAVA_Build 6 151259773 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2905 het 1712 hom 17 5 7 5 A 11 10 123681 CASAVA_Build 6 151263843 1D GACTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 12 11 123682 CASAVA_Build 6 151270536 1D ATGTCCCTTT C/- CCACCATCAT 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 C 3 2 123683 CASAVA_Build 6 151275131 1I AGTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 T 11 12 123684 CASAVA_Build 6 151275794 2I GAGTTGCCAG --/TC TCTTAATTGC 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 TC 1 2 123685 CASAVA_Build 6 151292694 4I GGCCTGTCTC ----/TTTT TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 6 10 123686 CASAVA_Build 6 151292999 3I TCTGGAGACT ---/GAG GTGGGTGGAT 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 GAG 0 1 123687 CASAVA_Build 6 151296907 4I TTTAAATGGC ----/TAAT TATAGTTATG 3070 het 3070 ref 58 33 20 5 TAAT 0 1 123688 CASAVA_Build 6 151310437 1D AAAGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 T 11 10 123689 CASAVA_Build 6 151324578 1I AACGTATGTC -/A GCAGCCTATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 0 1 123690 CASAVA_Build 6 151326187 2I AAAATTGCTA --/AG AGAGTGGTTA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 AG 2 3 123691 CASAVA_Build 6 151326339 4D ATTTGAAGTT AAGG/---- AAGAAAATAG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AAGG 1 0 123692 CASAVA_Build 6 151328514 4I AGAAAGTCAA ----/TGTC TGTCTAACAT 3070 hom 24 het 20 0 9 11 TGTC 1 2 123693 CASAVA_Build 6 151329947 1D TCCTGCCCCC A/- CCTGCATCCT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 A 1 0 123694 CASAVA_Build 6 151330252 3D TTGCCCCGTT CTC/--- CTCCAGAATT 3070 hom 85 het 33 0 24 9 CTC 2 1 123695 CASAVA_Build 6 151371337 2D AAGATTCCAC AT/-- GTCTTAGAGG 3070 hom 120 het 43 0 40 5 AT 1 0 123696 CASAVA_Build 6 151372364 1D CACCATCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 13 10 1 A 10 9 123697 CASAVA_Build 6 151373595 5D AATCATTTTG AAATA/----- AAATAAAATT 3070 het 3070 hom 25 10 14 4 AAATA 2 1 123698 CASAVA_Build 6 151382277 1I GATATTTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 56 26 22 8 T 9 10 123699 CASAVA_Build 6 151390460 1D TGAGCTTGGC T/- TTTTTTTTTT 1758 het 1758 ref 44 30 6 8 T 15 14 123700 CASAVA_Build 6 151397809 4D TTACAGGCCT CTTA/---- CTTACTACCT 3070 het 3070 hom 50 19 29 3 CTTA 2 1 123701 CASAVA_Build 6 151397892 3D ATGTTTGCTG TTC/--- TTCTTATGCA 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 TTC 2 1 123702 CASAVA_Build 6 151399088 2D TCTATTTTTA TT/-- TTTTTTTTAA 2976 het 2976 ref 33 20 7 6 T 10 8 123703 CASAVA_Build 6 151403343 2I AGTTTGAGAC --/CA GCCTGGGCAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 CA 0 1 123704 CASAVA_Build 6 151404589 3D AAAGCCCCTC TTG/--- TTGTGTCCTC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 TTG 2 1 123705 CASAVA_Build 6 151408907 1D GTCCAATCCA T/- TTGTGTAGAG 1149 het 1149 ref 43 31 3 9 T 3 2 123706 CASAVA_Build 6 151408947 2D TGATATGCAC TT/-- ATTTTTAGCA 2465 het 2465 ref 33 25 6 5 T 2 0 123707 CASAVA_Build 6 151410346 2I GACTAACCCC --/TG TAAGAATTTG 1813 het 1813 ref 41 33 4 4 TG 0 1 123708 CASAVA_Build 6 151425658 2D CAAGACAGCC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1795 hom 26 4 12 10 AT 8 7 123709 CASAVA_Build 6 151434053 4D TGATGGAGAT AGAA/---- AGAGGGAGAA 3070 het 3070 ref 40 22 14 6 AGAA 1 0 123710 CASAVA_Build 6 151435009 1D TTTTTATACC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 8 123711 CASAVA_Build 6 151435821 1D ACCAGGCAGC A/- AAAAACAGTG 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 6 5 123712 CASAVA_Build 6 151436518 2D CTGAAATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 A 12 10 123713 CASAVA_Build 6 151439061 8I GTTGTGGTGG --------/CCTGTAGT CCTAGCTGCT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 CCTGTAGT 0 1 123714 CASAVA_Build 6 151442103 1I ATGAAGGAGC -/T TAAGTCCCCA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 1 2 123715 CASAVA_Build 6 151446025 1D TGAAATGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 T 13 12 123716 CASAVA_Build 6 151448600 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 28 1 22 5 A 11 10 123717 CASAVA_Build 6 151451229 1I AGAAAAGTTG -/A AAACAAGAGG 3070 hom 123 het 43 0 40 3 A 3 4 123718 CASAVA_Build 6 151456238 27I CTCTCAGCCA ---------------------------/AGCGTGGTGGCTCACACCTGTAATCCC AGCACTTTGG 1888 het 1888 ref 10 6 5 0 AGCGTGGTGGCTCACACCTGTAATCCC 0 1 123719 CASAVA_Build 6 151462005 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1353 hom 31 7 12 12 A 17 16 123720 CASAVA_Build 6 151471375 1D CGCATCCCAA C/- CCCCCCCCCC 2257 het 18 hom 14 1 6 7 C 11 10 123721 CASAVA_Build 6 151473962 14D68M3D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATATGCTAATTGGCAAATGGTTTGAGGTTCCCCTATTTAAAAAAAAATAGGGGTTCAAAGC/--------------AAAAAAAAGAATATGCTAATTGGCAAATGGTTTGAGGTTCCCCTATTTAAAAAAAAATAGGGGTTCAA--- AGCTATTTAG 2359 het 2359 ref 17 19 6 10 N/A 0 0 123722 CASAVA_Build 6 151474637 1I GAGCACGTGT -/C CCCCCGTATG 3070 het 3070 ref 38 23 10 5 C 5 6 123723 CASAVA_Build 6 151481557 1I TTTGAGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2854 hom 35 10 14 11 T 12 13 123724 CASAVA_Build 6 151501223 6D TATCACAGAT AGATAG/------ AGATAGAGAG 3070 het 3070 hom 31 12 17 6 AGATAG 2 1 123725 CASAVA_Build 6 151501573 1I TTTTAAATTA -/G CGCACCTGTA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 G 0 1 123726 CASAVA_Build 6 151503141 1I CCCAGGGCAA -/G GGAGGCCCCC 3070 hom 117 het 41 0 38 3 G 2 3 123727 CASAVA_Build 6 151505350 1I GAGGCGGAGC -/T TGCAGTGAGC 347 het 347 ref 14 8 2 4 T 1 2 123728 CASAVA_Build 6 151511884 1D GTGAGCCAAC A/- ACACCCAGCT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 2 1 123729 CASAVA_Build 6 151513509 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 A 9 10 123730 CASAVA_Build 6 151518014 6I TTAAATTTTC ------/ATAGAG ATAGAGTCTT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 ATAGAG 1 2 123731 CASAVA_Build 6 151526787 1D ATTGAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 25 0 12 13 T 17 16 123732 CASAVA_Build 6 151533870 1D CTTGTGATCC A/- AAAAATAGCT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 6 5 123733 CASAVA_Build 6 151534411 2D TCTTTCTCTC TT/-- TTTCTTTCAC 3070 hom 76 het 29 0 26 3 T 5 3 123734 CASAVA_Build 6 151576117 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1359 het 1359 ref 12 7 3 2 A 13 12 123735 CASAVA_Build 6 151583366 1D CCAGAACTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 9 8 123736 CASAVA_Build 6 151583687 1D ATTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1817 het 1817 ref 22 12 5 8 A 13 12 123737 CASAVA_Build 6 151584048 1I TGAGCTGAGC -/A AAAAATTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 A 5 6 123738 CASAVA_Build 6 151593204 1I CCGGAATCCC -/A ACTATGGCTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 1 2 123739 CASAVA_Build 6 151593735 1I AGGCTGAGGC -/A AGGAGGATCA 3070 het 1707 hom 19 5 12 2 A 1 2 123740 CASAVA_Build 6 151605167 2D TTCCTTCCAT TC/-- TCTTTTTCCG 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 TC 2 1 123741 CASAVA_Build 6 151608146 1I TTATCTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 12 13 123742 CASAVA_Build 6 151616550 1D CACAAATGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 10 9 123743 CASAVA_Build 6 151617058 1D AAATTTAAAC A/- AAAAATAGTT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 6 5 123744 CASAVA_Build 6 151617188 1I TAGATTAGTC -/T TTTTTTGTTT 2293 het 2293 ref 29 15 11 3 T 6 7 123745 CASAVA_Build 6 151618001 1I AATGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2581 het 1374 hom 27 7 10 11 T 10 11 123746 CASAVA_Build 6 151618802 1D ATTTGTGGAC T/- TAAACATGCT 3070 het 3070 ref 42 22 13 8 T 2 1 123747 CASAVA_Build 6 151622732 1I TAACTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 1542 het 1542 ref 24 9 8 7 T 11 12 123748 CASAVA_Build 6 151643560 1I ACCCCAAAGT -/C CTGGGCTCAA 3070 hom 28 het 16 0 10 6 C 1 2 123749 CASAVA_Build 6 151648642 1I TATTTGGTTC -/A AAAAGTGCAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 4 5 123750 CASAVA_Build 6 151660401 2D AGTTCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2294 het 974 hom 26 10 10 7 A 18 16 123751 CASAVA_Build 6 151667998 1D GTCAGGGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1580 hom 28 8 11 9 T 17 16 123752 CASAVA_Build 6 151679973 1I CAGAGAAATG -/T TTAGTAGAAG 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 2 3 123753 CASAVA_Build 6 151689647 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 6 7 123754 CASAVA_Build 6 151691952 1I TAAAAATGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 85 het 36 0 28 8 T 9 10 123755 CASAVA_Build 6 151694068 1D TCCATAGGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 10 9 123756 CASAVA_Build 6 151698306 4I ATTTTTACTG ----/TTTT TTGTTTGTTT 3070 hom 62 het 22 0 21 1 T 2 6 123757 CASAVA_Build 6 151701284 1D AGGTTACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 10 14 T 14 13 123758 CASAVA_Build 6 151702580 1I ATCCCTTCCT -/C CCCCCAACCC 3070 het 3070 ref 53 25 16 12 C 5 6 123759 CASAVA_Build 6 151703429 36D GTGATGGCTT TGTGATGGGAACTTGACTGATAGCCTCATGGGCGAA/------------------------------------ TGTGATGGGA 3070 het 3070 ref 41 23 10 15 TGTGATGGGAACTTGACTGATAGCCTCATGGGCGAA 2 1 123760 CASAVA_Build 6 151703611 3I GATTTTCGTC ---/CTT CTGTGACACT 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 CTT 0 1 123761 CASAVA_Build 6 151703886 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 27 1 13 13 T 14 13 123762 CASAVA_Build 6 151706611 8D AGACTGGTTC AAAAAAAG/-------- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 AAAAAAAG 2 1 123763 CASAVA_Build 6 151707217 1D ATGAATATCC A/- AAAAATCTAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 6 5 123764 CASAVA_Build 6 151708297 4I TTAATTGACC ----/TTTT TGTTTAGTAC 3070 het 2648 hom 21 7 12 2 T 1 5 123765 CASAVA_Build 6 151715810 3I TGTAGCAATT ---/GAG GAGGATTTAG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 GAG 1 2 123766 CASAVA_Build 6 151717416 1I TTAGCCAGGA -/T GGTCTCGATC 2353 hom 12 het 6 0 5 1 T 0 1 123767 CASAVA_Build 6 151722607 1D TTCTTTTTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 25 1 20 4 C 1 0 123768 CASAVA_Build 6 151747869 1I ATATGAACTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 8 9 123769 CASAVA_Build 6 151749710 3I TTCAATTAAA ---/AAC AACAATAAGG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 AAC 1 2 123770 CASAVA_Build 6 151750177 22D ATCTTCTCAG TGTCAACACTGAGAAGACATTT/---------------------- TGTCAACACA 3070 het 3070 hom 45 21 21 10 TGTCAACACTGAGAAGACATTT 1 0 123771 CASAVA_Build 6 151750894 1I AATGTTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 12 13 123772 CASAVA_Build 6 151756975 1I TCTAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2809 het 2809 ref 33 12 12 9 A 15 16 123773 CASAVA_Build 6 151764907 1I TTATGTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 10 11 123774 CASAVA_Build 6 151765287 4D ACAGCAACCT GAGA/---- GATAGTTTAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 GA 3 1 123775 CASAVA_Build 6 151766106 3I GGGAGAAAAC ---/ATA ATAATGGCTT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 ATA 1 2 123776 CASAVA_Build 6 151766242 3D CCAAACTATT GAG/--- GATAGGTGAG 3070 het 3070 ref 34 23 11 2 GAG 1 0 123777 CASAVA_Build 6 151767525 2I CCTAGATGCT --/AA AGTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 1 3 123778 CASAVA_Build 6 151775146 1D TGCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1131 het 1131 ref 26 14 7 5 T 15 14 123779 CASAVA_Build 6 151777878 1D AAAGTTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 11 10 123780 CASAVA_Build 6 151778817 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3038 hom 27 10 12 5 T 8 9 123781 CASAVA_Build 6 151780321 1D TTATGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 637 hom 26 4 16 7 T 12 11 123782 CASAVA_Build 6 151780645 1I TTCAATTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 0 1 123783 CASAVA_Build 6 151781246 2I CATCTCAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 10 12 123784 CASAVA_Build 6 151782807 1I TTAGATTTAG -/T TTTTTTAATC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 6 7 123785 CASAVA_Build 6 151787588 1D GACAGGGGAC A/- GGGGAAGAGC 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 A 1 0 123786 CASAVA_Build 6 151787715 8I CCTGATGGAG --------/GGCTGAGA GGCGGCATCT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 GGCTGAGA 0 1 123787 CASAVA_Build 6 151788254 2D GTACAGTAAC GT/-- GTGTGTGTGT 2538 het 2435 hom 48 8 8 32 GT 8 7 123788 CASAVA_Build 6 151792364 1I TATATGGATG -/T ATTTAACAAA 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 0 1 123789 CASAVA_Build 6 151795360 4I TGGGTAACTC ----/ACTT AATCCCTATG 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 ACTT 0 1 123790 CASAVA_Build 6 151796698 2D GGTCTTGCTC TG/-- TCTCCCAGGC 3070 hom 56 het 20 0 19 1 TG 1 0 123791 CASAVA_Build 6 151799723 3I ACTGGATGGA ---/ATG ATGTTTAAGT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 ATG 1 2 123792 CASAVA_Build 6 151805114 3I CTTACACACC ---/AAT AATTGCCACA 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 AAT 1 2 123793 CASAVA_Build 6 151807479 26I AGATCCTCTT --------------------------/GCCTCTTTTCAATCCTTTCCAATTTA ATAAACATTT 2979 het 2979 ref 26 15 8 4 GCCTCTTTTCAATCCTTTCCAATTTA 0 1 123794 CASAVA_Build 6 151810593 4D TATTTTAGAA GTTT/---- GTCTACAGTC 2097 het 2097 ref 16 8 5 4 GTTT 1 0 123795 CASAVA_Build 6 151810639 2D GAGTAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1110 het 82 hom 10 1 5 4 T 20 18 123796 CASAVA_Build 6 151811232 1D AGTTTACACT C/- CATGGTCTAC 3070 het 3070 hom 60 20 33 7 C 2 1 123797 CASAVA_Build 6 151820576 4D TCTTATTAGG CTTA/---- CATTTTCTTT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 CTTA 1 0 123798 CASAVA_Build 6 151829122 1D CCTTGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 12 16 16 A 11 10 123799 CASAVA_Build 6 151837554 2D TCATTAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 1576 het 1150 hom 38 11 10 17 T 20 18 123800 CASAVA_Build 6 151837986 5D TAGGAGGTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 2011 hom 23 6 9 10 TTTTG 5 4 123801 CASAVA_Build 6 151841754 3I CAGTGAGTAA ---/TAC GATTTTGGAG 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 TAC 0 1 123802 CASAVA_Build 6 151843290 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2111 hom 16 6 8 2 A 10 9 123803 CASAVA_Build 6 151845568 1I TTTGGAGGAA -/T TTTTACCGTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 4 5 123804 CASAVA_Build 6 151849066 1D GGTGCTCTTA T/- CATTTTGCCC 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 T 1 0 123805 CASAVA_Build 6 151851828 1I TAAGATGGAT -/C CACATTTATT 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 C 1 2 123806 CASAVA_Build 6 151854048 1D ACCTCGGGGT C/- CCCCCAGCTC 3070 het 3070 ref 38 25 10 3 C 6 5 123807 CASAVA_Build 6 151855665 1I TACTAAAGGC -/T TTTTTTCTTT 576 hom 21 het 14 0 6 8 T 6 7 123808 CASAVA_Build 6 151856708 1I CCGACTCCCC -/T CCAGGTCGCC 2664 het 2307 hom 25 11 9 5 T 0 1 123809 CASAVA_Build 6 151859177 1I CGGATAGAAA -/T TTTTTAGCAT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 5 6 123810 CASAVA_Build 6 151863039 2D TTCTGGTTTG CT/-- CTGTTTTTTT 3070 het 713 hom 33 10 14 9 CT 2 1 123811 CASAVA_Build 6 151863402 2D GGTTGAAAGT AA/-- AAGTGTATAA 3070 het 3070 ref 32 14 16 3 A 4 2 123812 CASAVA_Build 6 151863992 4D AAAATAATGA CTAT/---- CTAATTATGA 3070 het 3070 ref 38 19 19 0 CTAT 1 0 123813 CASAVA_Build 6 151871844 2D ACTCCTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2422 het 46 hom 12 1 6 6 A 18 16 123814 CASAVA_Build 6 151873575 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2566 hom 17 6 10 1 T 10 11 123815 CASAVA_Build 6 151884259 1I TAATTGTGGA -/C CTTTGTCTCA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 C 1 2 123816 CASAVA_Build 6 151894994 1D CTATTGAAAA C/- AATCCCAAAC 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 C 1 0 123817 CASAVA_Build 6 151896897 1D CATTCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 335 hom 34 2 24 8 T 14 13 123818 CASAVA_Build 6 151911419 1I CTGATTACGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 8 9 123819 CASAVA_Build 6 151915143 1D TAAGGGTACA T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 44 27 13 6 T 7 6 123820 CASAVA_Build 6 151919666 1I TCTTCTATCT -/A ACTGTATGCT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 1 2 123821 CASAVA_Build 6 151920860 1I CTTGGGAGGT -/G GAGGTTGCAC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 1 2 123822 CASAVA_Build 6 151922752 1I TCCTTTTATA -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 7 8 123823 CASAVA_Build 6 151930819 1I CGCACCTGTA -/G CCCCAGCTAC 2221 het 1242 hom 10 4 5 5 G 0 1 123824 CASAVA_Build 6 151934150 1I TTTTTAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 T 12 13 123825 CASAVA_Build 6 151940460 1D GCTGTGGGGA C/- CCCCCCCGAT 3070 het 2526 hom 32 9 17 6 C 8 7 123826 CASAVA_Build 6 151951133 4D TGATAAGCTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 8 AAAC 3 2 123827 CASAVA_Build 6 151952098 2D AAACAAACAA AC/-- AAACAAACAC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 AC 1 0 123828 CASAVA_Build 6 151954291 1I CGCTGTTTTA -/G GGGGGGAGGT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 G 6 7 123829 CASAVA_Build 6 151970459 1I TTGATAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 39 1 29 9 T 10 11 123830 CASAVA_Build 6 151974104 1D ACCCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 18 0 13 5 A 11 10 123831 CASAVA_Build 6 151975779 9D CTGTACTGGT CTTTGTTTG/--------- CTTTGTTTGC 3070 hom 99 het 37 0 34 5 CTTTGTTTG 2 1 123832 CASAVA_Build 6 151987867 2D AGAGAGAGAG AA/-- AGAGAAAGAG 3070 het 9 hom 25 1 20 5 A 3 1 123833 CASAVA_Build 6 151992267 1I CTTATTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 36 1 28 7 T 10 11 123834 CASAVA_Build 6 151997537 6D CAATTACTGA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 AT 12 9 123835 CASAVA_Build 6 151998629 3D TATCAAACAT CAA/--- CAACAGTTAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CAA 2 1 123836 CASAVA_Build 6 152001585 1I ATGCTTTTTT -/G GGGGGGGGAG 3070 hom 46 het 25 0 15 10 G 8 9 123837 CASAVA_Build 6 152005340 11I GGTTAAAGTG -----------/GGGGGCGTGGT ATAATTTTGA 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 GGGGGCGTGGT 0 1 123838 CASAVA_Build 6 152035170 1D TGTATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 18 1 10 7 T 13 12 123839 CASAVA_Build 6 152052064 1D TTAGAAAAAA T/- ATTTCGCTTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 1 0 123840 CASAVA_Build 6 152054541 2I GAGAGTAAAC --/TT AGGAAGACCA 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 T 0 2 123841 CASAVA_Build 6 152056271 4I CTCCATCATT ----/CTTC CTTCCATCAT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 CTTC 1 2 123842 CASAVA_Build 6 152078301 1I TCAGGTACAT -/C CATCAAATAT 2686 het 2686 ref 20 14 6 0 C 1 2 123843 CASAVA_Build 6 152099096 5I TTACATGTAA -----/TAAAC TAAACAATGA 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 TAAAC 1 2 123844 CASAVA_Build 6 152120066 1D ACGTTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 A 11 10 123845 CASAVA_Build 6 152141125 3D GATGATGAAG AAT/--- TTCTGGAGAT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 AAT 1 0 123846 CASAVA_Build 6 152141771 1D AGAAAGCCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 10 9 123847 CASAVA_Build 6 152144630 2D AAGTATTGTG CA/-- CAAAAAAAAA 1910 het 1910 ref 33 19 9 5 CA 2 1 123848 CASAVA_Build 6 152161717 1D TAATGAATGG A/- AGGTAGATTA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 A 2 1 123849 CASAVA_Build 6 152165821 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 24 7 A 15 14 123850 CASAVA_Build 6 152166924 2I CTGGGAGCCC --/AA GAGTGAAGTT 3070 hom 111 het 39 0 34 5 A 0 2 123851 CASAVA_Build 6 152180258 1D GGTTTTGCTG T/- TGTTCTAACC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 2 1 123852 CASAVA_Build 6 152186197 5D TAAACCTACA ATGAC/----- ATTGCTGTCA 3070 het 3070 hom 45 19 20 9 ATGAC 1 0 123853 CASAVA_Build 6 152193618 1I GGTGAAGACA -/G TTTTTCTTAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 G 0 1 123854 CASAVA_Build 6 152193975 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 13 11 T 14 13 123855 CASAVA_Build 6 152219431 1I GTTTGGAAGA -/T TTCAGTTCCT 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 2 3 123856 CASAVA_Build 6 152222276 1I GGTAAAAGAG -/A AGGAATGGAT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 1 2 123857 CASAVA_Build 6 152231399 2D TATTTGGTTT TC/-- TGTTTCTATG 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 TC 1 0 123858 CASAVA_Build 6 152231928 1I CTGTTCAGGG -/T TTCTGAGTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 2 3 123859 CASAVA_Build 6 152244315 1D TGAATCCCAG T/- TCTGGGAATA 3070 het 3070 hom 42 21 20 1 T 2 1 123860 CASAVA_Build 6 152257962 1D TTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2948 het 2948 ref 26 12 9 5 T 15 14 123861 CASAVA_Build 6 152277085 1D CTTTTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 A 11 10 123862 CASAVA_Build 6 152287953 12I AGCATCTGGT ------------/TTTTTTTGTTTG TTTTTTTGTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 TTTTTTTGTTTG 1 2 123863 CASAVA_Build 6 152290713 1D ACTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 17 0 15 2 T 11 10 123864 CASAVA_Build 6 152292511 12I GTGGAGGCAG ------------/CCACCTGTAGTC CCAGCTACTC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 CCACCTGTAGTC 0 1 123865 CASAVA_Build 6 152292983 1D GGCTAATTTT G/- TATTTTTAGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 1 0 123866 CASAVA_Build 6 152306976 1I AATAAACTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 10 123867 CASAVA_Build 6 152310697 1D ACAAAAGATG T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 T 8 7 123868 CASAVA_Build 6 152311040 1I TACATCTGAG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 7 8 123869 CASAVA_Build 6 152313687 1D GAGCCCTAGG A/- AATTAATACA 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 A 3 2 123870 CASAVA_Build 6 152316743 2I AGCTCTAACC --/TG TGTAGATTTG 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 TG 1 2 123871 CASAVA_Build 6 152320494 1D CTTAAAGTAG T/- TATACATGCA 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 T 2 1 123872 CASAVA_Build 6 152321144 1I TCTTTTGGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 A 8 9 123873 CASAVA_Build 6 152322522 1I GTCTCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 T 10 11 123874 CASAVA_Build 6 152328681 1I TTCTGTGGTT -/A ATAAAATTTG 3070 hom 128 het 46 0 43 3 A 1 2 123875 CASAVA_Build 6 152328834 1D AACTCAGCAG T/- TGCTTTGCTG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 2 1 123876 CASAVA_Build 6 152332743 1D ACACAACAAA T/- TTTTTTTTTT 666 het 666 ref 32 23 3 7 T 11 10 123877 CASAVA_Build 6 152334320 1D TGGTCTCCAA T/- TCCATCCAGA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 2 1 123878 CASAVA_Build 6 152336170 2I GTCTGCATTC --/AA AAGAGTGTGC 3070 het 3070 ref 49 31 13 5 A 2 4 123879 CASAVA_Build 6 152337182 1I ATTATCTTCA -/T TTTTTTGCTG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 6 7 123880 CASAVA_Build 6 152340808 1D AAAAAAAAAA C/- AAGGAAAGAG 2868 het 682 hom 24 8 13 3 C 1 0 123881 CASAVA_Build 6 152366632 1D ATACATTTTT A/- AAAAGAATAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 A 5 4 123882 CASAVA_Build 6 152381140 1D AAAAATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 A 11 10 123883 CASAVA_Build 6 152381667 1I GTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 10 11 123884 CASAVA_Build 6 152385644 2I TACTAAAAAT --/AC AAAAATTAAA 3070 het 609 hom 12 2 8 2 AC 0 1 123885 CASAVA_Build 6 152387884 1D TTTCCTTATT C/- TTGAATATTC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 C 1 0 123886 CASAVA_Build 6 152389799 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 834 hom 32 4 21 7 T 13 12 123887 CASAVA_Build 6 152390171 1I CTTTAGCCCC -/T AACCCCATTT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 0 1 123888 CASAVA_Build 6 152390418 1D AAGTATTTTT A/- AGTGATTGCT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 2 1 123889 CASAVA_Build 6 152407409 2D CGGCCTTCAG TC/-- TCTGGCTGAC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TC 2 1 123890 CASAVA_Build 6 152463601 1I CTGGGAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 334 hom 20 2 12 6 A 15 16 123891 CASAVA_Build 6 152468255 1D CCTCTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1031 hom 20 5 9 6 T 17 16 123892 CASAVA_Build 6 152471054 8D TGGCCCTGCA CACTCATC/-------- CACCAAATCA 3070 het 3070 ref 39 19 18 5 CACTCATC 1 0 123893 CASAVA_Build 6 152475907 1I AAGGCCGGGG -/C CGCTGCCTGT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 C 1 2 123894 CASAVA_Build 6 152482216 1D ATCATTTCCC A/- AAAAATCCTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 6 5 123895 CASAVA_Build 6 152484495 1D TTGTTTAGGG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 8 7 123896 CASAVA_Build 6 152484597 1D CATAAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 T 11 10 123897 CASAVA_Build 6 152487145 2D TCAAAAACAG AT/-- ATTGGTTCTG 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 AT 2 1 123898 CASAVA_Build 6 152487523 1D AAGCTGAGGG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 132 het 50 0 45 6 A 9 8 123899 CASAVA_Build 6 152492387 1D TTTAGGCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 303 hom 37 2 27 8 A 11 10 123900 CASAVA_Build 6 152494158 2D TGAATGTAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 16 14 123901 CASAVA_Build 6 152495702 1D TGTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 9 T 15 14 123902 CASAVA_Build 6 152502742 4D GGTGGCTCTC TGTT/---- TGTCCGCCGT 3070 hom 86 het 34 0 27 8 TGTT 1 0 123903 CASAVA_Build 6 152503866 4D CCGCCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 AAAC 3 2 123904 CASAVA_Build 6 152524005 1I GTAATGTAAC -/A AAAAATATAA 2005 het 864 hom 10 3 5 2 A 5 6 123905 CASAVA_Build 6 152527901 1I GATATTCGCG -/C CCCCCTCCCC 3070 het 3070 hom 30 12 18 0 C 5 6 123906 CASAVA_Build 6 152545817 4I AGGGCAGTGA ----/ACTC ACTTGGGGTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 ACTC 0 1 123907 CASAVA_Build 6 152546772 8D TTCATCCATC ACTGACTA/-------- ACTGCATGAT 3070 het 3070 ref 45 26 17 7 ACTGACTA 1 0 123908 CASAVA_Build 6 152558339 1D AATCTGCATC A/- TGGGGCACCC 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 1 0 123909 CASAVA_Build 6 152558672 25I AAGGCCCTAG -------------------------/GAGTCTGCAAATAGCAGGTGAAGGA GCCATACAGG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 GAGTCTGCAAATAGCAGGTGAAGGA 0 1 123910 CASAVA_Build 6 152567977 1D TTTAAGCATT A/- AAAAAAAAAA 1222 het 1222 ref 39 30 3 6 A 11 10 123911 CASAVA_Build 6 152576732 4D AAATTATTTT AAAA/---- AAGAAGAAAG 3070 het 3070 ref 21 10 9 4 A 6 2 123912 CASAVA_Build 6 152581266 1D TATTTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 13 12 123913 CASAVA_Build 6 152588109 8D ATATGCGCAA ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 55 het 37 0 20 21 AC 11 7 123914 CASAVA_Build 6 152589148 7D TTCTACTACT CACCTAC/------- CCAAAGCTGA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 CACCTAC 1 0 123915 CASAVA_Build 6 152591745 1I GATGTGAGGC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 579 hom 40 2 32 6 T 8 9 123916 CASAVA_Build 6 152592865 1I ATTTAGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 10 11 123917 CASAVA_Build 6 152597135 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTAGATGG 3070 hom 69 het 28 0 24 6 T 5 4 123918 CASAVA_Build 6 152599805 1I TCTGTGAGCT -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 58 27 26 5 A 7 8 123919 CASAVA_Build 6 152611291 1I ATTTATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 980 hom 26 3 17 6 T 10 11 123920 CASAVA_Build 6 152614720 1D TTTTTTTCTT A/- ATAGTCACTG 3070 hom 56 het 21 0 18 4 A 2 1 123921 CASAVA_Build 6 152614826 1D GTCCGGGCAC A/- GTGGTTCATG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 1 0 123922 CASAVA_Build 6 152632250 1I CACATTTTTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 371 hom 50 1 43 6 A 8 9 123923 CASAVA_Build 6 152638572 1I TAGCTAGGCA -/T GGTGGTGCGC 3070 het 2076 hom 20 5 13 2 T 0 1 123924 CASAVA_Build 6 152639426 1D GAAGTTTCCG T/- TAACAATATT 3070 het 3070 ref 58 30 24 4 T 2 1 123925 CASAVA_Build 6 152648044 3D CTCTCCTTCA CTC/--- ACCAGATCCA 3070 het 3070 ref 44 20 16 9 CTC 1 0 123926 CASAVA_Build 6 152650955 2D TATGTCTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 13 11 123927 CASAVA_Build 6 152674779 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTGTATT 1876 het 1876 ref 12 6 5 1 T 6 5 123928 CASAVA_Build 6 152677827 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 701 het 701 ref 9 5 2 3 A 9 10 123929 CASAVA_Build 6 152682548 1D GAGAAAACAC A/- CCATTAAAAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 1 0 123930 CASAVA_Build 6 152688687 1D TATCACATTG A/- AAAAAGTCCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 6 5 123931 CASAVA_Build 6 152690791 3D TCAGAATTTT AAG/--- AAGTTTATTA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 AAG 2 1 123932 CASAVA_Build 6 152695818 1I AAAGACGAGT -/A AAATGTTAAG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 3 4 123933 CASAVA_Build 6 152699014 2D GCTTAGTCAC AG/-- AGTTTTCTGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AG 2 1 123934 CASAVA_Build 6 152700120 1D ACTCTAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 19 1 9 9 T 15 14 123935 CASAVA_Build 6 152705985 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 23 1 14 8 T 14 13 123936 CASAVA_Build 6 152707158 1D AATGGATTTT C/- CCCCCAAGAT 3070 hom 123 het 47 0 41 7 C 6 5 123937 CASAVA_Build 6 152708406 1D TGAAGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 35 7 T 11 10 123938 CASAVA_Build 6 152711587 1D TTTTTTTTTT C/- CTGTTATATG 3070 het 170 hom 17 1 12 4 C 2 1 123939 CASAVA_Build 6 152713613 1I AATTACAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 9 10 123940 CASAVA_Build 6 152715237 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1161 hom 39 4 25 10 T 12 13 123941 CASAVA_Build 6 152718460 1D GCATATGCTA T/- TTTTTATAGG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 6 5 123942 CASAVA_Build 6 152736506 5D AGTTGCAAAC TACTT/----- TATTTACCAA 3070 hom 84 het 35 0 29 7 TACTT 1 0 123943 CASAVA_Build 6 152773222 1D AGCTGTAGGC T/- TTTTTTTTTT 1278 het 1278 ref 41 25 4 12 T 14 13 123944 CASAVA_Build 6 152839696 1D GACCCTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 14 13 123945 CASAVA_Build 6 152839710 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAGAAAAG 3070 het 166 hom 23 5 15 4 G 1 0 123946 CASAVA_Build 6 152920728 1I AAAGGTAACA -/G TATAGTCAAA 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 G 0 1 123947 CASAVA_Build 6 152929177 1I TTTCGTTTTG -/C CAGTGTCAAG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 C 1 2 123948 CASAVA_Build 6 152937032 2D AAATATATAC AT/-- ATATATATAT 1625 het 754 hom 17 2 6 10 AT 9 8 123949 CASAVA_Build 6 152940609 2D TTCTGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 11 9 123950 CASAVA_Build 6 152970991 1D AATAAATAAA T/- AAAAATAAAT 3070 het 2973 hom 14 6 7 1 T 1 0 123951 CASAVA_Build 6 152971782 1I AATAAAAAAA -/T AATCAGAGTT 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 T 0 1 123952 CASAVA_Build 6 152978257 2I CTTGAAACTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 9 11 123953 CASAVA_Build 6 152982314 1I GACAATCCAG -/T CACCTGTAGT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 0 1 123954 CASAVA_Build 6 152983120 1I GTGTTGAGTG -/C CCCATTTCAC 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 C 3 4 123955 CASAVA_Build 6 152991413 1I GGTACAACAT -/A AAAAAAAAAA 2716 het 2716 ref 23 11 7 5 A 10 11 123956 CASAVA_Build 6 153002803 1D CAAGACTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2725 hom 29 13 10 6 A 12 11 123957 CASAVA_Build 6 153009373 1D TAATGAATCT A/- AAAATCTATT 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 A 5 4 123958 CASAVA_Build 6 153012833 1I CCCTAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 10 11 123959 CASAVA_Build 6 153021527 1D GACTCTATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1520 hom 33 9 15 9 A 13 12 123960 CASAVA_Build 6 153022763 2I ACGCACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 16 19 15 AC 8 9 123961 CASAVA_Build 6 153028861 2D38M1I TTGTGTTGTT TCTCTCTTTCTCTCTTGCTTTTTTCCTTTATTATTTGATA-/--TCTCTTTCTCTCTTGCTTTTTTCCTTTATTATTTGATAT TTTTTGGGTG 3070 het 3070 ref 44 28 24 6 N/A 0 0 123962 CASAVA_Build 6 153031765 1D ATTCTTTCTG T/- TTTTTAGTAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 6 5 123963 CASAVA_Build 6 153032486 1I CAAGAAAAAT -/A AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 6 7 123964 CASAVA_Build 6 153036170 1D TGTGTGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 13 12 123965 CASAVA_Build 6 153043831 4I GGAGGGAGGG ----/AGGA AGGAAGGAAG 3070 hom 33 het 13 0 11 2 AGGA 3 4 123966 CASAVA_Build 6 153046653 2D TATGAAGGAG AC/-- ACACAGCATG 3070 het 3070 hom 31 14 13 5 AC 3 2 123967 CASAVA_Build 6 153047621 2I CTTCAGCTCT --/TC TTTTTCTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TC 0 1 123968 CASAVA_Build 6 153049243 1I TGTGTTGGGG -/C GGGGGGGTTA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 0 1 123969 CASAVA_Build 6 153050420 13D TGAATATTTC CCCAATTTGATAA/------------- TTTTTTGTTC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 CCCAATTTGATAA 1 0 123970 CASAVA_Build 6 153053285 1D CTTAATTACA T/- CTGCAAAGTC 3070 hom 147 het 55 0 49 7 T 1 0 123971 CASAVA_Build 6 153054256 4D TTACTTATTT TTTG/---- TTTGTTTTTT 3070 hom 64 het 27 0 22 6 TTTG 2 1 123972 CASAVA_Build 6 153055100 3I TGATTAATCA ---/TGT TGTTGAGCAC 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 TGT 1 2 123973 CASAVA_Build 6 153056335 1D AACCTACCAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 67 het 29 0 23 6 A 8 7 123974 CASAVA_Build 6 153057540 2I ATTTGATATT --/AA GTTATAAGTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 0 2 123975 CASAVA_Build 6 153057992 1D CTGAAAGTGA C/- CCTTCACTCC 3070 hom 127 het 50 0 40 11 C 3 2 123976 CASAVA_Build 6 153060793 4D TACTACAAAG AGAT/---- AGAATCAAAC 3070 het 3070 hom 43 14 25 6 AGAT 1 0 123977 CASAVA_Build 6 153068884 1D AAAAATTCCT A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 98 het 36 0 30 6 A 7 6 123978 CASAVA_Build 6 153070442 1D CCTCTAGTAG T/- TTTTTGGGTT 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 T 6 5 123979 CASAVA_Build 6 153075722 4D CATAGTTCTT TATA/---- TATATTCTGC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 TA 4 2 123980 CASAVA_Build 6 153077086 1D TTTTTATTAG A/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 46 21 18 7 A 1 0 123981 CASAVA_Build 6 153078269 1D TACCATTCAC A/- AAAAGGCATC 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 A 5 4 123982 CASAVA_Build 6 153078400 2I ACATTTTCTT --/AA AGAGTATAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 1 3 123983 CASAVA_Build 6 153080003 1D TAATTAAATG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 A 9 8 123984 CASAVA_Build 6 153080666 4D AGCAAAAATT AAAC/---- AAATCCATAT 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 AAAC 1 0 123985 CASAVA_Build 6 153087924 1D AAATTACAAA G/- GAAAATATTA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 G 2 1 123986 CASAVA_Build 6 153088000 1I TCCAAAATCT -/A AAAACAAGCA 3070 het 3070 hom 21 7 10 4 A 4 5 123987 CASAVA_Build 6 153088937 2I GTTCAAAGAA --/TG AGTGATGGCC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TG 0 1 123988 CASAVA_Build 6 153090055 1I AAAAAAAAAA -/T TATGGAAAGA 1946 het 257 hom 16 5 10 1 T 1 2 123989 CASAVA_Build 6 153091375 1D TTCTAAGTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 14 15 11 A 10 9 123990 CASAVA_Build 6 153094050 1I ACCTAGCGTG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 8 9 123991 CASAVA_Build 6 153095286 2I GAAAAGTCTC --/TT TGATTCAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 1 3 123992 CASAVA_Build 6 153097495 1D TGCTTTGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 11 10 123993 CASAVA_Build 6 153098264 1I TATTATTAAC -/T TTAAGTAGTC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 2 3 123994 CASAVA_Build 6 153137318 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1927 het 1498 hom 24 10 8 6 A 18 17 123995 CASAVA_Build 6 153144124 2I CATTCATGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 10 12 123996 CASAVA_Build 6 153147688 2D CCATTGGTCT CA/-- GTTCCCTTAC 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 CA 1 0 123997 CASAVA_Build 6 153150649 1D CACATCCTTA G/- CTCACTTTTT 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 G 1 0 123998 CASAVA_Build 6 153150943 2D TCCAATGTTA TC/-- TGTTAGAATC 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 TC 1 0 123999 CASAVA_Build 6 153159115 1I GAAATGTGAT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 0 1 124000 CASAVA_Build 6 153164146 6D GGCCTTTCCA TGCATT/------ TAATTTTTAC 3070 het 3070 hom 35 15 19 3 TGCATT 1 0 124001 CASAVA_Build 6 153165576 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 8 T 11 10 124002 CASAVA_Build 6 153168022 1D CATGCGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 A 11 10 124003 CASAVA_Build 6 153169433 1D TGGAATCTAA G/- ATGATTTTCA 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 G 1 0 124004 CASAVA_Build 6 153169891 1I AAATACCAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 9 10 124005 CASAVA_Build 6 153172230 1D TATGCATTGG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 8 7 124006 CASAVA_Build 6 153173502 1I AACATTTAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 8 9 124007 CASAVA_Build 6 153174013 8I ATTGGTCTTT --------/TTACTGTC TTACTGTCTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 TTACTGTC 1 2 124008 CASAVA_Build 6 153174123 1I TTCATAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 7 T 10 11 124009 CASAVA_Build 6 153182531 2I TCTAAAACCA --/AG AGAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 AG 4 5 124010 CASAVA_Build 6 153195655 1I ATGTTTAAAA -/C AATACCATGA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 C 0 1 124011 CASAVA_Build 6 153207662 125D GATCCCTGAG GAATCGCCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAAAAAAAATAAAGCCTTTTATTAACACTCCTCTGTGAAGCCTGCTATGCACCTATTCCTGCTAT/----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- GAATCATTCT 2057 het 2057 ref 4 15 5 4 GAATCGCCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAAAAAAAATAAAGCCTTTTATTAACACTCCTCTGTGAAGCCTGCTATGCACCTATTCCTGCTAT 1 0 124012 CASAVA_Build 6 153232380 2D GTTTGAGGCT GA/-- GAGTTCACGA 3070 het 3070 ref 36 20 9 8 GA 2 1 124013 CASAVA_Build 6 153233386 4D ATAAATGGAG ACAC/---- ACAAAGCCAG 3070 hom 90 het 35 0 31 7 AC 3 1 124014 CASAVA_Build 6 153234686 4D AAACAAAAAT AAAC/---- AGACATCATG 3070 het 3070 ref 65 36 23 7 AAAC 1 0 124015 CASAVA_Build 6 153238903 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 19 het 18 0 10 9 A 10 9 124016 CASAVA_Build 6 153239614 1D TCATGTAACC A/- AACACCACCT 3070 het 3070 hom 20 8 12 0 A 3 2 124017 CASAVA_Build 6 153241138 1D CTGGTATTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 29 hom 40 1 15 24 A 10 9 124018 CASAVA_Build 6 153244622 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 27 11 13 5 A 8 7 124019 CASAVA_Build 6 153247814 1D AAAGCAGGGG T/- TGCAGTCCTA 2377 het 2377 ref 16 10 5 1 T 2 1 124020 CASAVA_Build 6 153253005 1D AGCACTTCGG A/- AAAAAAACTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 8 7 124021 CASAVA_Build 6 153254466 2D AGTGCAGTGG CA/-- CAGTCTCAGC 2482 het 1142 hom 18 3 7 9 CA 2 1 124022 CASAVA_Build 6 153257479 1D AAAATATGTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 9 8 124023 CASAVA_Build 6 153257997 1D ACAAACAAAC A/- AACAACAACA 2990 het 459 hom 29 3 9 18 A 3 2 124024 CASAVA_Build 6 153273701 6D ATAGTCTCTG ATTTTT/------ ATTTTTATTT 3070 het 3070 hom 22 11 11 2 ATTTTT 2 1 124025 CASAVA_Build 6 153310199 1D TTTATGAAGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 T 8 7 124026 CASAVA_Build 6 153310399 4D ACCTTACAGT CTCA/---- CTCCTAACAG 3070 het 3070 hom 39 18 20 3 CTCA 1 0 124027 CASAVA_Build 6 153326796 1I TATTAATTTC -/A AAAAAACAAA 2782 het 2782 ref 33 21 10 2 A 6 7 124028 CASAVA_Build 6 153332170 4D TTTTGCTTAG TTCT/---- TTCTTGTCTT 3070 het 3070 hom 33 16 14 4 TTCT 2 1 124029 CASAVA_Build 6 153333287 4I TCACACAAAC ----/AAAT GCAGTCTACT 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 AAAT 0 1 124030 CASAVA_Build 6 153333920 1I CACAATACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 T 8 9 124031 CASAVA_Build 6 153334251 1I ACCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 10 11 124032 CASAVA_Build 6 153336328 3D TCTAGGCACA CTG/--- CTATTAGAAA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 CTG 1 0 124033 CASAVA_Build 6 153336801 2D TCAAAAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 A 13 11 124034 CASAVA_Build 6 153350061 3I CAAAGGAGGC ---/CTT CTACAACATA 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 CTT 0 1 124035 CASAVA_Build 6 153352630 1D GTGTTAACTC A/- ACGTTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 2 1 124036 CASAVA_Build 6 153353027 1I AACATGAATC -/A AAATGCGAGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 3 4 124037 CASAVA_Build 6 153353925 5I GTTAAAACAA -----/ATATG ATATATAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 ATATG 0 1 124038 CASAVA_Build 6 153356173 1I TAGCAGCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 9 10 124039 CASAVA_Build 6 153369244 4I TCCATTTATC ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 ATCT 2 3 124040 CASAVA_Build 6 153371158 1D TTAAGATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 22 22 9 A 12 11 124041 CASAVA_Build 6 153373237 4D GATGGATGAA AACT/---- AATAGTTTGG 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 AACT 1 0 124042 CASAVA_Build 6 153374776 4I TGCACTAAAT ----/AAAC AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 AAAC 0 1 124043 CASAVA_Build 6 153387975 1I CTGTCTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 10 11 124044 CASAVA_Build 6 153388782 1I AAGCACTTAC -/A AATTATATGA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 A 2 3 124045 CASAVA_Build 6 153395376 1D CTGAAAAAAA G/- TTTCTGCGGG 3070 hom 63 het 36 0 20 18 G 1 0 124046 CASAVA_Build 6 153395626 5D GATTTGGGAA TACTT/----- TAGTCTTAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 TACTT 1 0 124047 CASAVA_Build 6 153402906 26I GTCCATTTTA --------------------------/TGCCCTGGATTTGGGCATCCATTCCT TGTGTATTTA 3070 hom 150 het 51 0 48 9 TGCCCTGGATTTGGGCATCCATTCCT 0 1 124048 CASAVA_Build 6 153409050 1I TATGGATACA -/T TTTTTTAAGG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 6 7 124049 CASAVA_Build 6 153412580 4D CTCCTTCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AAAT 7 6 124050 CASAVA_Build 6 153415094 1D GGGACCTCTG C/- CCCCAGTGGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 5 4 124051 CASAVA_Build 6 153415458 4D ATTTAGATGA TAGT/---- TAGATAAGAC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TAGT 1 0 124052 CASAVA_Build 6 153415859 1I GATCTCAGAC -/T TTCAACTTTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 3 124053 CASAVA_Build 6 153417568 1I CAACCGGCTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 8 9 124054 CASAVA_Build 6 153421727 1D CGTTAGCGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 47 0 40 8 T 12 11 124055 CASAVA_Build 6 153422959 1I AGGGGAAGTC -/T TGTTTCCCAG 3070 hom 134 het 51 0 44 7 T 1 2 124056 CASAVA_Build 6 153424535 1I GTGGAAATAT -/C CCCCAGAAGG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 C 4 5 124057 CASAVA_Build 6 153426786 1I GTGCTGAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 421 hom 32 1 26 5 A 9 10 124058 CASAVA_Build 6 153429875 8I CTCAAAAACA --------/AAAGAAAC AAACAAACAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 AAAGAAAC 0 1 124059 CASAVA_Build 6 153431120 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAACTAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 6 8 124060 CASAVA_Build 6 153435680 1I TTCAGCACTT -/A AATACCTGTT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 2 3 124061 CASAVA_Build 6 153435772 2D AAGTTAAAAA AT/-- ATATGTCTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 5 AT 3 2 124062 CASAVA_Build 6 153437140 4D CAGCCAGCAG TGCT/---- TGCTCTGTTG 3070 hom 111 het 40 0 36 6 TGCT 2 1 124063 CASAVA_Build 6 153440171 1I GATCCTGCAT -/G GGGAAAAAAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 3 4 124064 CASAVA_Build 6 153456911 1I TATACTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 17 7 T 13 14 124065 CASAVA_Build 6 153457743 3I TTTTTATAAT ---/TAC TACATTCACA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TAC 1 2 124066 CASAVA_Build 6 153459038 3D ATGGAAGATA CAT/--- CATCATCTGC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 CAT 3 2 124067 CASAVA_Build 6 153463374 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 60 het 34 0 29 6 A 8 7 124068 CASAVA_Build 6 153470379 1I TAAAAAAAAA -/T ATTCAAGTAC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 0 1 124069 CASAVA_Build 6 153471938 5I61M1D AATAAACGAT -----AATACAGGAAGTAAATGTAGTTTCTTACTCCATGGTTTGAAAAATCTGCAGCTAAACGCCAT/AAAACAATACAGGAAGTAAATGTAGTTTCTTACTCCATGGTTTGAAAAATCTGCAGCTAAACGCCA- TTTTTTTTCA 3070 hom 163 het 39 0 55 6 N/A 0 0 124070 CASAVA_Build 6 153472488 1I TAGAAAAAAA -/C CAATTTGTAA 3070 hom 124 het 47 0 42 5 C 1 2 124071 CASAVA_Build 6 153481574 2I CCAAGTGCTT --/TC TTAACAATCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TC 0 1 124072 CASAVA_Build 6 153483676 4D CTGGAGACAC CTTT/---- CTTTGTCTGT 3070 hom 108 het 37 0 36 4 CTTT 2 1 124073 CASAVA_Build 6 153489272 17I TTCTGGTTTA -----------------/GCCACAGTGATCTTTTT GCCACAGTGA 3070 hom 90 het 38 0 31 9 GCCACAGTGATCTTTTT 0 1 124074 CASAVA_Build 6 153540805 1D GGCCGATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 492 hom 31 2 21 8 A 12 11 124075 CASAVA_Build 6 153549290 1D CTGTAGGTTG T/- TTCTTTGCTC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 3 2 124076 CASAVA_Build 6 153582311 1I CACCACGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 10 124077 CASAVA_Build 6 153597416 2I AAGGGAGGGA --/GG GAGAGAGAGA 1246 het 518 hom 11 4 3 4 G 1 3 124078 CASAVA_Build 6 153597489 4D AAGAAAGAAA GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 het 10 hom 13 1 8 4 GAAG 4 3 124079 CASAVA_Build 6 153606483 1D TGTCTTACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 37 het 29 1 25 3 T 10 9 124080 CASAVA_Build 6 153607309 1D AGAAATCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 34 0 26 9 T 10 9 124081 CASAVA_Build 6 153610548 4D GCTGTTTCTA ATTT/---- ATTTATCATT 3070 hom 60 het 26 0 21 7 ATTT 2 1 124082 CASAVA_Build 6 153614707 1D GAAGGAACGA T/- TTTTTTTTTG 974 het 974 ref 18 12 4 2 T 10 9 124083 CASAVA_Build 6 153615402 1I AAAGTTTATA -/G GAATAATTGC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 1 2 124084 CASAVA_Build 6 153616152 1I GGTATTTAAG -/A AAGAAGTCTG 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 2 3 124085 CASAVA_Build 6 153616645 1D TCAGAGGCAG T/- AACTGGGTAA 3070 het 3070 hom 50 18 26 6 T 1 0 124086 CASAVA_Build 6 153616897 1D CACATAAACC A/- AATATTGGAT 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 A 3 2 124087 CASAVA_Build 6 153621167 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2355 het 2355 ref 26 13 9 4 T 11 10 124088 CASAVA_Build 6 153621350 1D CACAGTTCTT G/- GACATTCTGG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 G 2 1 124089 CASAVA_Build 6 153622318 1D CCCTGGAAGG T/- TTTTTGCTGG 3070 het 2931 hom 26 9 11 6 T 6 5 124090 CASAVA_Build 6 153622791 1I ATATGTACAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 11 12 11 T 9 10 124091 CASAVA_Build 6 153625290 1D CTCTTCCCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 10 9 124092 CASAVA_Build 6 153629830 1I AATAAATAAT -/A AAAAGAAACA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 4 5 124093 CASAVA_Build 6 153635237 1I CTGGAAACTC -/T TAAGTATGCC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 1 2 124094 CASAVA_Build 6 153645591 3D AAAAAAACTA TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 803 hom 19 5 12 2 TCT 4 3 124095 CASAVA_Build 6 153653871 4D TTTTTGTTTC TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 TTTG 3 2 124096 CASAVA_Build 6 153658519 5D GGATTAAGTA AAAAG/----- AAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 36 22 13 4 AAAAG 2 1 124097 CASAVA_Build 6 153662249 2I CTTTTTCACA --/AG AGTCATAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AG 1 2 124098 CASAVA_Build 6 153665321 1I CCCGCCTTTC -/T CTACCCAGCA 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 T 0 1 124099 CASAVA_Build 6 153668347 4I CTCTTCACTT ----/GACA CCCTGTCTCC 3070 hom 29 het 15 0 12 3 GACA 0 1 124100 CASAVA_Build 6 153687092 2I CATTATGCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 10 12 124101 CASAVA_Build 6 153697101 1D ATGGTGATGG A/- AAAAATATGG 3070 het 3070 ref 44 17 16 11 A 6 5 124102 CASAVA_Build 6 153702612 2D ATACACACAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 63 het 27 0 21 7 AT 5 4 124103 CASAVA_Build 6 153703964 1D AGAAAGAAAT A/- AAAAGGCAAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 5 4 124104 CASAVA_Build 6 153706888 1I AAATATGCAT -/A AAACCCATAA 3070 het 3070 hom 69 26 32 11 A 3 4 124105 CASAVA_Build 6 153717486 3I ACCAAACTTC ---/TTT GTCAATCGTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 0 3 124106 CASAVA_Build 6 153720578 1D TGTTACCCCC T/- GTTCTTCCTT 3070 het 3070 ref 60 33 22 5 T 1 0 124107 CASAVA_Build 6 153721974 1D GACTCACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 40 3 17 20 T 13 12 124108 CASAVA_Build 6 153722256 1I AGAAATGTTA -/C TTTTTAATTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 0 1 124109 CASAVA_Build 6 153723468 1D GAAAACAATA T/- TGTTTATTTG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 2 1 124110 CASAVA_Build 6 153724303 1D ACAAAAAAAA C/- CCATCACTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 C 3 2 124111 CASAVA_Build 6 153724404 3I TCCCACATCC ---/AGA AGATGTGCCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AGA 1 2 124112 CASAVA_Build 6 153725233 30I TTGTGAAAGT ------------------------------/ACTAACTTTCACTAGTTATGAAGTTGTGAA ACGTAAATGA 3070 het 3070 ref 51 27 20 5 ACTAACTTTCACTAGTTATGAAGTTGTGAA 0 1 124113 CASAVA_Build 6 153727498 1I ATTTTACTTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 8 9 124114 CASAVA_Build 6 153748214 1D CAAATAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2605 hom 23 8 12 3 T 13 12 124115 CASAVA_Build 6 153748793 1I GTGATAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 9 10 124116 CASAVA_Build 6 153757140 4I TTCCCTAAAT ----/AATA AATATCATGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AATA 1 2 124117 CASAVA_Build 6 153785027 5I AAGAGAGTGC -----/AGTTG AGTTGTACTC 3070 het 3070 ref 37 27 9 1 AGTTG 1 2 124118 CASAVA_Build 6 153785968 2D GGTAGGAGAG AA/-- GGAATAAAAG 2346 het 2346 ref 40 29 6 6 A 2 0 124119 CASAVA_Build 6 153787368 4D TTTTTATCTT AAGC/---- AAGTCAAGTA 2597 het 2597 ref 43 29 7 7 AAGC 1 0 124120 CASAVA_Build 6 153787641 4I TTTTATTTAC ----/CTTT CTTTCTGAGC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CTTT 1 2 124121 CASAVA_Build 6 153790620 2I6M2I36M4D CTGAAAAGAG --TGTTGG--TAGGGTAGCTGGAGATGGGCTAACTAGAATCCTATGTGAT/GTTGTTGGCCCAGGGTAGCTGGAGATGGGCTAAGTAGAATCCTATG---- TGGCTTGGGT 1491 het 1491 ref 37 44 4 7 N/A 0 0 124122 CASAVA_Build 6 153794736 1I ATGGTAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 9 10 124123 CASAVA_Build 6 153810570 1D ATACACGTAC A/- CACTTTGGAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 A 1 0 124124 CASAVA_Build 6 153812538 2D AAGATCAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2457 het 2457 ref 28 17 7 4 T 13 11 124125 CASAVA_Build 6 153814582 2D ACGAGGTCAG GA/-- GATCGAGACC 1847 het 588 hom 10 3 6 1 GA 2 1 124126 CASAVA_Build 6 153815138 3D TTAATATTCA ATT/--- ATTAAATGTA 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 ATT 2 1 124127 CASAVA_Build 6 153816648 2I AAAGTGGCAG --/GA GAGAGAGAGA 2733 het 2733 ref 26 12 7 7 GA 5 6 124128 CASAVA_Build 6 153818898 2D TTCAGAAGTT TA/-- GATATTGGTC 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 TA 1 0 124129 CASAVA_Build 6 153828012 2I CGCTAATTAA --/CT CTTCAATTTA 3070 het 3020 hom 21 8 12 1 CT 1 2 124130 CASAVA_Build 6 153829926 1D TTAAGACTAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 9 8 124131 CASAVA_Build 6 153838276 1D TCTAGCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 15 14 124132 CASAVA_Build 6 153842107 38D TTGCTTCCTT GTTTGTTAATTAAATAAAATAATCACAAATTATTGCAC/-------------------------------------- ATTTGTGTAT 3070 het 3070 ref 40 25 24 6 GTTTGTTAATTAAATAAAATAATCACAAATTATTGCAC 1 0 124133 CASAVA_Build 6 153845304 2D TCCATTGATA AG/-- AGTCTCTAAT 3070 het 3070 hom 52 21 24 9 AG 2 1 124134 CASAVA_Build 6 153865186 1D GATGTGAGGT A/- AAAAAAAAAA 2343 het 2343 ref 35 11 7 18 A 17 16 124135 CASAVA_Build 6 153866142 1D TTTTAAAGGA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 8 7 124136 CASAVA_Build 6 153866194 1I TAAGGGTTTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 2822 hom 28 9 13 6 A 7 8 124137 CASAVA_Build 6 153871819 8D GCTTGTGATA TAAAATTC/-------- CCTGGAAATG 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 TAAAATTC 1 0 124138 CASAVA_Build 6 153874772 2D TTTAAGAAAG CA/-- AAGATTTTTA 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 CA 1 0 124139 CASAVA_Build 6 153886529 1I TTGAAAAAAG -/A AAAAAGCTTG 3070 hom 126 het 50 0 42 8 A 5 6 124140 CASAVA_Build 6 153888305 1D AACAGTTTGA T/- TATTTTTTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 2 1 124141 CASAVA_Build 6 153888748 1D TTTTTTTTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 784 hom 42 5 25 12 G 2 1 124142 CASAVA_Build 6 153892614 5D AAACATAAAC ATATA/----- ATATAATATG 3070 het 3070 ref 31 15 11 7 ATATA 2 1 124143 CASAVA_Build 6 153893159 1D CACTTCCTAA T/- TTTTTTTTTA 2686 het 2686 ref 30 17 8 5 T 10 9 124144 CASAVA_Build 6 153904904 1I GCCATAGGGT -/C CCCCCCCAAG 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 C 7 8 124145 CASAVA_Build 6 153912689 1D CTGTTATTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 10 9 124146 CASAVA_Build 6 153913204 4I GTTTTATGTA ----/TTGT TTGTTTATTG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TTGT 1 2 124147 CASAVA_Build 6 153931306 3I CTCTTTAATA ---/AAT AATAATAATC 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 AAT 3 4 124148 CASAVA_Build 6 153944246 1D AAATATTTGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 A 8 7 124149 CASAVA_Build 6 154063786 1D TTACTGATTA C/- TTACTATTTA 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 C 1 0 124150 CASAVA_Build 6 154067396 2D TATTAACCTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 27 0 20 8 TA 7 6 124151 CASAVA_Build 6 154071799 1D GATACTTCAT C/- CTTTTCTCAT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 C 2 1 124152 CASAVA_Build 6 154076373 2D TCAGAAGCTG AT/-- ATTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 AT 2 1 124153 CASAVA_Build 6 154079012 3I TTCCAATATT ---/CTC CTATTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CTC 0 1 124154 CASAVA_Build 6 154082267 1I TGTGGTACAT -/A ATAGTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 1 2 124155 CASAVA_Build 6 154089342 1D ACTATTTTAT A/- AATTATAAGA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 3 2 124156 CASAVA_Build 6 154103691 4I TTCAATATCT ----/TAAA TGTTACTACA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TAAA 0 1 124157 CASAVA_Build 6 154106565 1I AAATCATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 10 11 124158 CASAVA_Build 6 154107647 1I TAGACTTTTG -/T TACATAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 1 2 124159 CASAVA_Build 6 154108696 1I TACTGAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 16 12 A 11 12 124160 CASAVA_Build 6 154108963 1I TTTTATTTTT -/A TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 0 1 124161 CASAVA_Build 6 154112020 1D CCAGATTTCC T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 T 8 7 124162 CASAVA_Build 6 154114339 1D TTACCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 11 10 124163 CASAVA_Build 6 154126514 4D CAAATGGGAC TTAA/---- TTAAACTAAA 3070 het 3070 ref 34 18 15 6 TTAA 2 1 124164 CASAVA_Build 6 154138006 5D TTCAAACTGT TTTTC/----- TTTTAACTGT 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 TTTTC 1 0 124165 CASAVA_Build 6 154140021 5I TACAGCCATC -----/TGCTT TGCTTTGCTT 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 TGCTT 2 3 124166 CASAVA_Build 6 154142105 3I TGAAAATAAT ---/GAA GTAGTACTAC 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 GAA 0 1 124167 CASAVA_Build 6 154142616 2D CAAATGGAGT GG/-- GGCTCAGAAC 3070 het 3070 ref 41 25 14 3 G 4 2 124168 CASAVA_Build 6 154143068 5D AAAGTTCTTT TGTTC/----- TCTTCTCTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 TGTTC 1 0 124169 CASAVA_Build 6 154150380 1I CTGCCCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 T 11 12 124170 CASAVA_Build 6 154150927 3I TATTTTAAAC ---/AAT AATAAAAGCA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 AAT 1 2 124171 CASAVA_Build 6 154163049 5D ATTTTGTAGC ACAAA/----- ACAAATTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 8 9 ACAAA 2 1 124172 CASAVA_Build 6 154164580 2I ATTGCCAGTC --/TA GTTTATTACT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 TA 0 1 124173 CASAVA_Build 6 154165582 1I TATCTACTAT -/A GGAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 0 1 124174 CASAVA_Build 6 154168035 1D CTCAGCTGTT G/- GGAGTCTGGC 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 G 3 2 124175 CASAVA_Build 6 154170605 2D TATTTAACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 12 10 124176 CASAVA_Build 6 154171060 4I CTAATTAGTA ----/TTGC TTGCCTCCTT 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 TTGC 1 2 124177 CASAVA_Build 6 154174090 4D AATTTTTTTC ATAT/---- ATATATATAC 1719 het 1719 ref 11 5 4 2 AT 6 4 124178 CASAVA_Build 6 154174481 3D ATACCTGCAC TTG/--- ATAATCTATT 3070 het 3070 ref 49 22 22 6 TTG 1 0 124179 CASAVA_Build 6 154179621 3D AGGGAAACTT AAC/--- AAATATATTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 AAC 1 0 124180 CASAVA_Build 6 154189596 1I CCTCTTATAA -/T TTTATGTTTC 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 3 4 124181 CASAVA_Build 6 154190060 3D TAGTTATCCT TTC/--- TTCTTATTTT 3070 het 3070 ref 38 17 13 9 TTC 2 1 124182 CASAVA_Build 6 154217166 1I CTGTGGGTTG -/C TATCGTTGTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 C 0 1 124183 CASAVA_Build 6 154220636 3D TAATTAAAAT ATA/--- ATCATATACT 3070 het 3070 hom 33 12 19 3 ATA 1 0 124184 CASAVA_Build 6 154250859 1D CTAAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 1134 het 1134 ref 45 36 4 6 T 12 11 124185 CASAVA_Build 6 154289801 1I CTTAAGAAGG -/T TCTTTGTAAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 1 2 124186 CASAVA_Build 6 154302558 1I TTTATTCTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 9 124187 CASAVA_Build 6 154309992 20I TACAGACCAC --------------------/ACTTTGAGAGGTAAGGATAA AGCAAGTAGC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 ACTTTGAGAGGTAAGGATAA 0 1 124188 CASAVA_Build 6 154312309 1D AAATCATTAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 9 8 124189 CASAVA_Build 6 154314433 1I GAAAATAGTG -/A AAGGCACCAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 2 3 124190 CASAVA_Build 6 154314773 6I CTGACACTGT ------/TATATC TATATGACAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TATATC 0 1 124191 CASAVA_Build 6 154315990 9I GTGAGGCAGG ---------/ATCAAGGCA AGAATCGCTT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 ATCAAGGCA 0 1 124192 CASAVA_Build 6 154319543 1D CTGATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 43 1 31 11 A 12 11 124193 CASAVA_Build 6 154319962 1I AAGAAGAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 669 hom 45 2 40 3 T 10 11 124194 CASAVA_Build 6 154322678 26D ACTGTACAAG CAGAAGCTTGGCTTCTGTAGAGGCCT/-------------------------- CAGGGAGCTT 3070 hom 69 het 23 0 23 6 CAGAAGCTTGGCTTCTGTAGAGGCCT 1 0 124195 CASAVA_Build 6 154325487 1I AAAACTTTTG -/A AAATATAAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 4 124196 CASAVA_Build 6 154326409 1D TACCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 550 hom 30 3 21 6 T 15 14 124197 CASAVA_Build 6 154327411 1I TTGCCTTTTT -/A AGATTGTTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 2 124198 CASAVA_Build 6 154328070 3I ATAAAAAGAG ---/TTA TTATTATAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTA 2 3 124199 CASAVA_Build 6 154329424 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 9 8 124200 CASAVA_Build 6 154339860 8I GCACCTGAAA --------/CATCCACT CATCCACTCT 3070 hom 126 het 52 0 41 11 CATCCACT 1 2 124201 CASAVA_Build 6 154340779 3D CTAATGAAAT AAG/--- AAGCCGTTCT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AAG 2 1 124202 CASAVA_Build 6 154343516 1I CACTTGTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 147 hom 31 1 21 9 T 9 10 124203 CASAVA_Build 6 154343831 5I TTCTGGAATC -----/TCTAT TCTGTTCTGT 3070 hom 87 het 31 0 27 4 TCTAT 0 1 124204 CASAVA_Build 6 154350442 1D GTTGTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 824 hom 41 3 28 10 T 12 11 124205 CASAVA_Build 6 154351326 1I ACTAGCCTCA -/T TTTTCAAAAG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 4 5 124206 CASAVA_Build 6 154356001 1D TCACAGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 617 hom 40 2 24 14 T 14 13 124207 CASAVA_Build 6 154450916 1I TGAATGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 36 0 28 8 A 11 12 124208 CASAVA_Build 6 154470989 1D ATAAAGGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 210 hom 20 1 16 3 T 11 10 124209 CASAVA_Build 6 154486128 1I CACGGAGCAG -/A AAAAAAGGAG 3070 hom 117 het 46 0 38 8 A 6 7 124210 CASAVA_Build 6 154489022 1D AGGAGAAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 9 hom 40 1 33 6 A 10 9 124211 CASAVA_Build 6 154489934 1D AGATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 36 1 23 13 A 14 13 124212 CASAVA_Build 6 154503164 1I ATTTTATTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 0 1 124213 CASAVA_Build 6 154504687 1D AGTTCCCGGC T/- TGAATTTTCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 2 1 124214 CASAVA_Build 6 154531780 1I ACATAGTCCA -/C CCTCCGGCCT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 C 2 3 124215 CASAVA_Build 6 154560653 2D ATCCTGGGGG GT/-- GTGTGTGTGT 1127 het 1127 ref 26 21 3 2 GT 7 6 124216 CASAVA_Build 6 154687711 1I CGTTTGAGGG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 8 124217 CASAVA_Build 6 154695115 1D GTGTGAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 556 hom 25 4 13 8 T 17 16 124218 CASAVA_Build 6 154708681 1D TTTTATCTCA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 7 124219 CASAVA_Build 6 154729054 2D10M10D AAATGCTAAA TTTTTTTTTTACTTTTATTTTA/--TTTTTTTTAC---------- TTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 25 13 14 3 N/A 0 0 124220 CASAVA_Build 6 154730982 1I13M3D CAGAAGACCA -CCCCCATGTCAGGGGT/CCCCCCATGTCAGG--- GCGCAATATC 3070 het 3070 ref 50 32 20 8 N/A 0 0 124221 CASAVA_Build 6 154735161 1D TAGCTGCGAC T/- TTTTTTTTTT 1100 het 916 hom 22 5 6 12 T 15 14 124222 CASAVA_Build 6 154748974 4D ATTTCTATTT CTCC/---- CTCCTGTGTC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 CTCC 2 1 124223 CASAVA_Build 6 154751769 1I AAAAATTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2769 hom 29 9 12 8 T 13 14 124224 CASAVA_Build 6 154752506 4I AACATGTTAG ----/AACT AATAAAGGAA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 AACT 0 1 124225 CASAVA_Build 6 154772311 1D GACTTGGAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 9 8 124226 CASAVA_Build 6 154788668 3D CCATACTAGG CTT/--- CTTCCATTAA 3070 het 3070 ref 64 31 27 6 CTT 2 1 124227 CASAVA_Build 6 154791515 1D CAGCTAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2309 hom 21 7 13 1 T 12 11 124228 CASAVA_Build 6 154812768 1I AAATAACTTA -/T TTTTTCCCCT 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 T 5 6 124229 CASAVA_Build 6 154813966 1I GGGTTCGCTT -/A ACGGGAATTT 3070 het 2592 hom 24 6 16 2 A 1 2 124230 CASAVA_Build 6 154814314 20D CACACACACG CACACACGCATACATGCACA/-------------------- CACACGCGCA 3070 het 3070 ref 30 23 9 8 CACACACGCATACATGCACA 1 0 124231 CASAVA_Build 6 154814365 8D ACACGCACAC GCACAGAT/-------- GCACACACAC 1309 het 1309 ref 29 18 5 7 GCACAGAT 1 0 124232 CASAVA_Build 6 154815311 11D CCCAGAATCA CTTAGCCAGTT/----------- CTAAGCCTGA 3070 het 3070 ref 41 25 14 5 CTTAGCCAGTT 1 0 124233 CASAVA_Build 6 154817940 1D TTCGAGACGA G/- GCCTGGCCAA 1743 het 1743 ref 13 7 5 1 G 2 1 124234 CASAVA_Build 6 154818706 1D TCTCAGTATC A/- GTCTTTGACA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 1 0 124235 CASAVA_Build 6 154835629 1D CTTTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2049 hom 27 9 11 7 A 14 13 124236 CASAVA_Build 6 154844230 1I TTATTTGTGC -/T TTGTTTGATA 3070 het 3070 hom 51 23 22 6 T 2 3 124237 CASAVA_Build 6 154846379 1D AACTGTCTTT A/- AAAAAAAAAC 1341 het 1341 ref 44 32 3 9 A 10 9 124238 CASAVA_Build 6 154853563 1I AGTGGCTGAC -/A AATGTCAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 A 2 3 124239 CASAVA_Build 6 154855170 2I GGTCATCCAG --/TC TCTCAAAGAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 TC 2 3 124240 CASAVA_Build 6 154857713 1D ATCTCTCCAA G/- CACTGGCCAA 3070 het 3070 ref 56 33 19 6 G 1 0 124241 CASAVA_Build 6 154860637 2I ACTGAAGCTG --/GT GTGTTTCTTG 3070 hom 129 het 49 0 44 5 GT 2 3 124242 CASAVA_Build 6 154861180 1D GGTCTACGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 A 12 11 124243 CASAVA_Build 6 154862697 1I AAATTGGCCT -/A GGGGTGCTTA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 0 1 124244 CASAVA_Build 6 154864480 1I TGAAAGGCTT -/C TCTGATGACG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 0 1 124245 CASAVA_Build 6 154875187 1D AGTTGTCCTT A/- AAAAAAAAAA 993 het 993 ref 51 41 3 8 A 13 12 124246 CASAVA_Build 6 154968390 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 273 hom 26 2 10 14 T 19 18 124247 CASAVA_Build 6 154979453 1I AAAAGAATAC -/T TTTGCCTCTC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 3 4 124248 CASAVA_Build 6 154995390 4I TATCCTATTT ----/TGGA TGGACCACGA 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 TGGA 1 2 124249 CASAVA_Build 6 155001088 1I CTCTTTCACC -/A ACATGATTTC 3070 het 1661 hom 19 6 11 2 A 1 2 124250 CASAVA_Build 6 155002677 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 1882 het 1882 ref 24 7 5 12 T 13 14 124251 CASAVA_Build 6 155008092 1I TACTTGACTG -/A AAAAAAAAAA 2197 het 2197 ref 17 10 5 2 A 11 12 124252 CASAVA_Build 6 155029709 6D TTGGGAGGCT GAAGTG/------ GAAGGATCAC 2746 het 2746 ref 19 10 9 3 GAAGTG 1 0 124253 CASAVA_Build 6 155035265 1D AGACTTGATA G/- GAATAGGAAT 3070 hom 144 het 55 0 46 11 G 2 1 124254 CASAVA_Build 6 155041145 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 A 11 10 124255 CASAVA_Build 6 155065554 1D TTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1305 het 1006 hom 34 10 6 18 T 19 18 124256 CASAVA_Build 6 155184174 1D TCTGTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1113 het 1113 ref 43 31 4 8 T 12 11 124257 CASAVA_Build 6 155198798 3I3M10I ATTAGCGAAC ---ACC----------/AGAACCACTAATTCTT TAATTTTTAT 3070 hom 117 het 38 0 40 5 N/A 0 0 124258 CASAVA_Build 6 155199506 1D CTAAACATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 18 17 124259 CASAVA_Build 6 155200457 1D AGATTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 T 15 14 124260 CASAVA_Build 6 155201003 1D TAGGGAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 12 11 124261 CASAVA_Build 6 155203144 1D GATTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 T 11 10 124262 CASAVA_Build 6 155209961 1I TAGATCCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 11 11 A 10 11 124263 CASAVA_Build 6 155234821 1I AATATTAAGG -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 6 7 124264 CASAVA_Build 6 155244784 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2580 hom 23 7 11 5 A 11 12 124265 CASAVA_Build 6 155252100 1D AGTTCCTGCC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 9 8 124266 CASAVA_Build 6 155256041 3D TAGTTTCCTG ATA/--- TACATTGGCC 3070 het 3070 ref 40 27 11 2 ATA 1 0 124267 CASAVA_Build 6 155267744 1D CGTAGCACAT A/- ACAGCGGGTG 3070 het 3070 ref 49 25 19 6 A 2 1 124268 CASAVA_Build 6 155268131 3I ACAGTGTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 TTG 5 6 124269 CASAVA_Build 6 155279371 16I GTAAGTAGGC ----------------/TGGACTTCAGTGATCA TGAGCTAGGA 3070 hom 66 het 23 0 23 3 TGGACTTCAGTGATCA 0 1 124270 CASAVA_Build 6 155298898 1D GAGAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 23 1 18 4 A 13 12 124271 CASAVA_Build 6 155316613 4D GGCTGCTTGA GCTC/---- AGGAGTTCAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 GCTC 1 0 124272 CASAVA_Build 6 155317796 2I CCTTCCTGCC --/CT GAGGCGTGCA 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 CT 0 1 124273 CASAVA_Build 6 155323793 1D CCAACTCGGA T/- TATTTTAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 2 1 124274 CASAVA_Build 6 155324369 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2101 het 2101 ref 32 7 11 14 T 15 14 124275 CASAVA_Build 6 155325615 1I AATCCCATCT -/G GTTTTCTAGC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 G 1 2 124276 CASAVA_Build 6 155328412 8D AAAAATTTTA TTTTATTT/-------- TTTTATTTTT 3070 het 954 hom 16 2 9 5 TTTTATTT 2 1 124277 CASAVA_Build 6 155332954 1D TCCTGACTGC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 T 8 7 124278 CASAVA_Build 6 155340208 1D GAATTGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 959 hom 36 7 15 14 T 17 16 124279 CASAVA_Build 6 155345681 6D TTAAAAAAAA AAAAAG/------ AAAAGAAAAG 2785 het 657 hom 10 2 7 1 AAAAAG 1 0 124280 CASAVA_Build 6 155356340 3I CTGAGGCAGG ---/AGA ATCACTTGAA 3070 hom 45 het 17 0 14 3 AGA 0 1 124281 CASAVA_Build 6 155371422 1D CTGGAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 T 13 12 124282 CASAVA_Build 6 155373871 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2974 hom 31 9 17 5 A 14 15 124283 CASAVA_Build 6 155374248 1I GGCTTCTCAA -/T TTTTCATATC 3070 hom 102 het 38 0 32 6 T 4 5 124284 CASAVA_Build 6 155374395 3I TTTCTCCTCA ---/GAG GAGTGTCTGA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 GAG 1 2 124285 CASAVA_Build 6 155376040 1D GTCTACAGCT G/- GCTTAGTCTG 3070 het 3070 hom 41 14 24 4 G 2 1 124286 CASAVA_Build 6 155379613 1I GTAATCCCAG -/C CTACTCGGGA 3070 het 1370 hom 15 4 10 1 C 1 2 124287 CASAVA_Build 6 155381063 1I GACTGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 2276 het 2054 hom 18 6 5 7 A 11 12 124288 CASAVA_Build 6 155385878 10D GTTTTTTTTT TTTTTTTTTC/---------- CCTTGGCAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 5 TTTTTTTTTC 1 0 124289 CASAVA_Build 6 155396872 1D GTTGCTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 574 hom 24 2 16 6 T 13 12 124290 CASAVA_Build 6 155398018 2I TGTTTTGCTG --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 8 10 124291 CASAVA_Build 6 155399656 14D GTTGGTTAGG CTGGTCTCGAACTC/-------------- CTGACCTCAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CTGGTCTCGAACTC 1 0 124292 CASAVA_Build 6 155408282 1I CTTATTAGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 8 9 124293 CASAVA_Build 6 155411392 1D AATGGGGGTC A/- GGGGTGTCCT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 1 0 124294 CASAVA_Build 6 155411479 2D GTGAAGGAGA CT/-- CGGGAGGCCG 2441 het 2441 ref 25 12 6 7 CT 1 0 124295 CASAVA_Build 6 155419335 1I AATTCAGAAA -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 7 8 124296 CASAVA_Build 6 155427708 13I TTCCCTTCCT -------------/TTCTCCCCCTCTA TTCTCCCCTC 3070 hom 92 het 37 0 30 7 TTCTCCCCCTCTA 0 1 124297 CASAVA_Build 6 155427806 2I TTGTTGAGAT --/AG AGTCTTGCTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AG 1 2 124298 CASAVA_Build 6 155428993 48D5M22D TTCCTGTTCC CAAAGGGCCTTTGGCCTCCCAAAGGGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCCAGACATTTCTTTTT/------------------------------------------------CCGTG---------------------- GAAGCCTCCA 3070 hom 61 het 16 0 18 10 N/A 0 0 124299 CASAVA_Build 6 155432282 1I AGAACGACCA -/G GGGTTTCATT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 3 4 124300 CASAVA_Build 6 155434015 1I AAGAAAAAAA -/C GACACATATT 3070 hom 157 het 61 0 52 9 C 0 1 124301 CASAVA_Build 6 155438176 1I CTTGGGAATG -/A AAAAAAAAAA 1414 het 1414 ref 42 25 5 12 A 13 14 124302 CASAVA_Build 6 155444232 1D GAGTCTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 812 hom 33 2 19 12 A 13 12 124303 CASAVA_Build 6 155455673 2D AAGAATGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 102 het 35 0 35 1 CT 2 1 124304 CASAVA_Build 6 155461945 1D CCCGGGAGTC A/- GAGGTTGCGG 3070 hom 33 het 14 0 12 3 A 1 0 124305 CASAVA_Build 6 155462874 3D TATGCAGTCT GTC/--- GTCGGCTATT 3070 hom 144 het 59 0 48 12 GTC 2 1 124306 CASAVA_Build 6 155472773 10D ATGCACAGAC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 21 11 124307 CASAVA_Build 6 155496976 2I TCGTATGATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TG 6 7 124308 CASAVA_Build 6 155497224 1D CATCCCCCCA C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 4 het 31 0 15 16 C 9 8 124309 CASAVA_Build 6 155501258 1D TGCAGCCGTC T/- TTTTTTTTTT 1192 het 1192 ref 34 23 3 8 T 13 12 124310 CASAVA_Build 6 155513592 1D GCATCTTCTT A/- ACTGTATTCT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 2 1 124311 CASAVA_Build 6 155514655 2I CTATAGAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 19 7 T 10 12 124312 CASAVA_Build 6 155522610 3I TTCATATTGA ---/TTC TTATTTAACC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTC 0 1 124313 CASAVA_Build 6 155524050 1D TCACTCTGAT A/- ACCCCAGCTG 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 2 1 124314 CASAVA_Build 6 155524563 1D CTGGCTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 13 12 124315 CASAVA_Build 6 155556230 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 9 8 124316 CASAVA_Build 6 155561896 1I AACTTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 T 12 13 124317 CASAVA_Build 6 155564862 1D TCATAACAAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 111 het 44 0 38 7 A 9 8 124318 CASAVA_Build 6 155575513 9D GGGCCCACTA GGCCCACTC/--------- GGCCCACTCG 3070 het 3070 ref 34 15 11 12 GGCCCACTC 2 1 124319 CASAVA_Build 6 155582704 1I GAAAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 1241 het 1241 ref 35 23 3 9 A 11 12 124320 CASAVA_Build 6 155583953 1D TTTTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 1192 het 62 hom 23 1 10 12 A 13 12 124321 CASAVA_Build 6 155585421 2D17M5D13M1D AGCAAGACTC TGTTTCAAAAACAAAAAACAAACAAAAAAAAAAAACAC/--TTTCAAAAACAAAAAAC-----AAAAAAAAAAACA- AAAAAAAACC 3070 hom 69 het 19 0 22 4 N/A 0 0 124322 CASAVA_Build 6 155593370 10I AAGGAGTGAT ----------/TATGCCAGTC TTGTTCATCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TATGCCAGTC 0 1 124323 CASAVA_Build 6 155593612 1I TATTTATATA -/T AGTAAATATA 3070 hom 33 het 14 0 11 3 T 0 1 124324 CASAVA_Build 6 155596789 1D32M1I ACCCTGTCTC AAAAAAACAAAACAAAAACAATTTGAGAGAAAA-/-AAAAACCAAAACAAAAACAATTTGAGAGAAAAT TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 17 12 8 5 N/A 0 0 124325 CASAVA_Build 6 155620211 2I ATCCTTAAAA --/TT TTACATTCTA 3070 het 3070 hom 33 9 24 1 T 2 4 124326 CASAVA_Build 6 155620406 4D CATTTTTGTA AGAT/---- AGATTGTAAT 3070 hom 126 het 43 0 43 5 AGAT 2 1 124327 CASAVA_Build 6 155621374 2I AAGTTTGAAA --/AT ATAGCTGATA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 1 2 124328 CASAVA_Build 6 155621727 3D AAAGAGGGCC TGA/--- TGATGGCAGT 3070 hom 87 het 36 0 29 9 TGA 2 1 124329 CASAVA_Build 6 155639491 6I TAGCTTTTTC ------/TTTTTT AAGATAATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 6 124330 CASAVA_Build 6 155644648 1D CATAATTCAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 9 8 124331 CASAVA_Build 6 155649308 14D TATATATATG TGTGTGTATATATA/-------------- TGTGTGTATA 3070 hom 24 het 13 0 9 5 TGTGTGTATATATA 3 2 124332 CASAVA_Build 6 155651891 1I AGGACAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 10 11 124333 CASAVA_Build 6 155652079 2D ATGGTGGGAG AA/-- AAAGAGGCTG 3070 het 3070 hom 39 16 17 8 A 5 3 124334 CASAVA_Build 6 155676974 3I GGGACCGGAG ---/TTC TTCTGATACA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 TTC 1 2 124335 CASAVA_Build 6 155682187 6D TTTTTTTTTT TCCTGA/------ GCAGTAGGTC 3070 het 954 hom 29 3 13 15 TCCTGA 1 0 124336 CASAVA_Build 6 155683138 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 10 9 124337 CASAVA_Build 6 155685725 1D CTCTTCATTC T/- TTTGCTTCAT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 T 4 3 124338 CASAVA_Build 6 155690762 1D ATTATTTAAA G/- GAATATAGGG 3024 het 3024 ref 28 17 7 4 G 2 1 124339 CASAVA_Build 6 155706224 3D GCTGGCTGTC CTT/--- CTATTGATGC 3070 het 3070 ref 32 22 9 3 CTT 1 0 124340 CASAVA_Build 6 155706742 1I ATTCACAGGG -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 A 6 7 124341 CASAVA_Build 6 155707293 1D AAAAAAAAAA C/- CTGTTATTTT 3070 het 2014 hom 30 8 15 7 C 2 1 124342 CASAVA_Build 6 155714780 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2498 het 1445 hom 17 4 8 5 T 11 12 124343 CASAVA_Build 6 155727922 3I TAGTTTAATT ---/TCC TCAAGTCTTA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 TCC 0 1 124344 CASAVA_Build 6 155730242 1I GGGAAAAGTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 A 8 9 124345 CASAVA_Build 6 155730330 1D AAGTAATAAA T/- GTGGTCCTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 1 0 124346 CASAVA_Build 6 155731769 4D TATTCTTCTA AGAT/---- AGACTTGTAA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 AGAT 1 0 124347 CASAVA_Build 6 155737499 1I TACTGGATTC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 T 7 8 124348 CASAVA_Build 6 155741429 2I AGAACAAGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 T 11 13 124349 CASAVA_Build 6 155762557 1D GCAGCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1164 het 1164 ref 36 22 3 11 T 12 11 124350 CASAVA_Build 6 155763468 1D GCTGGCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 21 12 19 T 15 14 124351 CASAVA_Build 6 155796467 3D ATGTACTTGT AGC/--- AGCTAGCAGC 3070 het 3070 hom 52 17 30 5 AGC 2 1 124352 CASAVA_Build 6 155796560 2D TCATGGCCAC AG/-- AGTTAGGGGC 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 AG 2 1 124353 CASAVA_Build 6 155798351 1D TATTTGAGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 T 10 9 124354 CASAVA_Build 6 155804128 4I GACTTCTTCA ----/TTGT TTATTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 TTGT 0 1 124355 CASAVA_Build 6 155808714 2D ATATATATGC TA/-- TATATATATA 899 hom 10 het 5 0 4 1 TA 6 5 124356 CASAVA_Build 6 155815465 1I TTTACTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 18 19 12 T 10 11 124357 CASAVA_Build 6 155823020 1D TTTGCCTTTT C/- CTAAAGCATT 3070 het 3070 ref 37 17 17 5 C 2 1 124358 CASAVA_Build 6 155828264 1I GTGGTCTCAA -/C CCTTCCAGCC 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 C 2 3 124359 CASAVA_Build 6 155831193 1D CAAACCTTGG C/- AGCTTCCACC 2648 het 1950 hom 25 10 9 6 C 1 0 124360 CASAVA_Build 6 155853486 1D AAGGAATGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 A 10 9 124361 CASAVA_Build 6 155854060 1I GTTAGTGCTA -/C CTTCCACTTG 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 C 1 2 124362 CASAVA_Build 6 155856987 1D ATTCACATTA T/- ATTTCTTACC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 1 0 124363 CASAVA_Build 6 155864495 4D ATAAAGTTGT GTAA/---- GTGTCACCAC 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 GTAA 1 0 124364 CASAVA_Build 6 155864777 1D CTATTTGTTT A/- ATTCATTTAC 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 A 2 1 124365 CASAVA_Build 6 155874877 3I TGTAAACAAA ---/ATG ATATCACACT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 ATG 0 1 124366 CASAVA_Build 6 155876809 1D TTACTTAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 17 19 6 T 9 8 124367 CASAVA_Build 6 155891165 1I ATCTCTCTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 8 9 124368 CASAVA_Build 6 155892476 1I TGGGGTCATG -/C AAATGTTTAA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 C 0 1 124369 CASAVA_Build 6 155893178 1I TCTTTTTCTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 15 9 10 A 8 9 124370 CASAVA_Build 6 155896401 1D AAAAAAAAAA C/- ACCCTACAAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 C 1 0 124371 CASAVA_Build 6 155903162 2D GGAGTGAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 22 8 T 12 10 124372 CASAVA_Build 6 155935786 6I TTTGGCAATT ------/TTAAAC TTAAACTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTAAAC 1 2 124373 CASAVA_Build 6 155941638 1D TGATAGTTTT C/- CTGGTAATAT 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 C 2 1 124374 CASAVA_Build 6 155953058 3D AGCTCATATT TAC/--- TACACCAAAC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TAC 2 1 124375 CASAVA_Build 6 155954179 1D TGAGATCCAA T/- TTTTTTAGCT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 7 6 124376 CASAVA_Build 6 155959249 3D ATTTTTCTCT TAA/--- TAATAATATT 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 TAA 3 2 124377 CASAVA_Build 6 155959525 1I GCTAAATTTT -/C TTCAAAATTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 C 0 1 124378 CASAVA_Build 6 155961893 1D AGTTTCCCCC T/- ATCTAGATAT 3070 het 3070 hom 43 19 23 2 T 1 0 124379 CASAVA_Build 6 155962829 1D ACTAATATGG A/- AAAAGGTTAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 A 5 4 124380 CASAVA_Build 6 155965034 5I TATTACTGAC -----/CAATT AAATTATTTT 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 CAATT 0 1 124381 CASAVA_Build 6 155966586 4D ATATATATAT ATAC/---- ACGCACACAT 1760 het 1760 ref 20 8 7 6 ATAC 1 0 124382 CASAVA_Build 6 155970110 6D CAACAACAAT AACAAC/------ AACAACAACA 3070 het 3070 ref 58 29 18 18 AAC 7 5 124383 CASAVA_Build 6 155987461 1I CACAGGGCTC -/T TTTTTTTTTC 3061 het 2794 hom 26 8 11 7 T 9 10 124384 CASAVA_Build 6 155992783 4D TATGCATGTG TGTC/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 69 36 24 11 TGTC 1 0 124385 CASAVA_Build 6 155993969 1D TATTTGTCTA C/- TCTCATGCTG 3070 het 3070 ref 28 17 11 0 C 1 0 124386 CASAVA_Build 6 156005713 1D TCACTTCCTG C/- TTGCACAGCC 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 C 1 0 124387 CASAVA_Build 6 156006325 1I GAGTCAGGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 9 10 124388 CASAVA_Build 6 156040712 10I AAGCAAAAAA ----------/TTCCAAAACC TTCTGTAACA 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 TTCCAAAACC 0 1 124389 CASAVA_Build 6 156042891 1I CGAAATATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 A 9 10 124390 CASAVA_Build 6 156044408 5D GTACAGAAAT TAAAG/----- TAATTAGGAG 3070 het 3070 ref 37 22 14 2 TAAAG 1 0 124391 CASAVA_Build 6 156076328 1I TTGAAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 13 14 124392 CASAVA_Build 6 156077201 7D ACTCCATCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2552 het 7 hom 15 1 9 6 A 21 14 124393 CASAVA_Build 6 156100818 1D TACTAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 7 6 124394 CASAVA_Build 6 156100983 4D CAAAAAAAAA AAAT/---- AAATAAAATA 85 het 85 ref 21 4 3 15 AAAT 2 1 124395 CASAVA_Build 6 156101108 2I ATGATCATAA --/CT CTCTGTCATT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 CT 2 3 124396 CASAVA_Build 6 156110575 1D CTGTGGTGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 10 9 124397 CASAVA_Build 6 156117618 6I TGTAGAAATG ------/AAACTA AAACTATAGG 3070 hom 144 het 51 0 49 2 AAACTA 1 2 124398 CASAVA_Build 6 156120614 1D AGGAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 49 0 35 15 T 11 10 124399 CASAVA_Build 6 156125727 3I GCACCAATCT ---/TAA TAAATGAACA 3070 hom 104 het 41 0 34 7 TAA 1 2 124400 CASAVA_Build 6 156150126 8I TGAGGCACTT --------/GGATGTGC TTTAGTCAAG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 GGATGTGC 0 1 124401 CASAVA_Build 6 156155601 6D CCAAGCACTT GCCAGA/------ GCCAGAGTCT 3070 het 3070 ref 41 20 15 9 GCCAGA 2 1 124402 CASAVA_Build 6 156185092 2I CAACATTTTC --/AG AGACTACATC 3070 hom 175 het 65 0 56 9 AG 1 2 124403 CASAVA_Build 6 156185840 2I TGTGTATCTA --/TC TATCTATATC 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 TC 0 1 124404 CASAVA_Build 6 156186007 4I TGTATGTATG ----/TATC TATCTATCTA 3070 hom 132 het 54 0 45 9 TATC 3 4 124405 CASAVA_Build 6 156203956 1I AATATTCCAG -/C CGGGCATGGT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 C 1 2 124406 CASAVA_Build 6 156208999 3I GACATTTCTC ---/AAA AGAAGACACA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 4 124407 CASAVA_Build 6 156210384 1I CTGAGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 11 12 124408 CASAVA_Build 6 156210908 1I TCGAAACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 9 10 124409 CASAVA_Build 6 156212381 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 20 8 8 4 A 9 10 124410 CASAVA_Build 6 156213903 1D TTTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 A 12 11 124411 CASAVA_Build 6 156226554 1I TACCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 A 10 11 124412 CASAVA_Build 6 156227907 1D TCTCTATTAG T/- TATGTATTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 1 124413 CASAVA_Build 6 156239287 4I GAAAATTCAA ----/AGAT AGATATAATG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AGAT 1 2 124414 CASAVA_Build 6 156245413 3D GTAGGAACTC GTG/--- GTGGTTAATA 3070 hom 90 het 34 0 28 8 GTG 2 1 124415 CASAVA_Build 6 156250292 4I CTACAGGGAT ----/CTAA CTGAGAAGGT 3070 hom 151 het 54 0 48 6 CTAA 0 1 124416 CASAVA_Build 6 156260268 5I CTTATAATAC -----/TTGTT TTGTTTTAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TTGTT 1 2 124417 CASAVA_Build 6 156260774 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1250 hom 19 5 11 3 A 14 13 124418 CASAVA_Build 6 156273328 1I GTTGGCATAC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 8 9 124419 CASAVA_Build 6 156276369 1I TTGGGGCAAT -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 6 7 124420 CASAVA_Build 6 156276996 1D TGAATTGTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 112 het 43 0 38 5 T 9 8 124421 CASAVA_Build 6 156277302 2I GAGCATCTGA --/AC ACACACACAC 2794 het 2794 ref 41 16 14 11 AC 8 9 124422 CASAVA_Build 6 156277907 1I GCAATGGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 10 11 124423 CASAVA_Build 6 156278068 1D CTAAAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 11 10 124424 CASAVA_Build 6 156278776 1I CATACCTGAC -/A AATAATAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 A 2 3 124425 CASAVA_Build 6 156281192 2I GTTCTCTTAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 AT 7 8 124426 CASAVA_Build 6 156292991 1I TATCTGAGTC -/T GATTCTGGTG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 0 1 124427 CASAVA_Build 6 156316423 1D TCTAGAGAAC T/- TTTAATGATG 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 T 4 3 124428 CASAVA_Build 6 156332375 6I GATATGAGTT ------/AAAAAA AAAAAGTTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 5 11 124429 CASAVA_Build 6 156335193 1I ACTGTGGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 A 11 12 124430 CASAVA_Build 6 156335432 1I TTTTTCTATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 9 10 124431 CASAVA_Build 6 156335941 2D TATAGGTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 21 11 A 14 12 124432 CASAVA_Build 6 156337449 3D CCACCCCAGC ATG/--- TCAGATGCAA 3070 het 3070 hom 29 11 11 9 ATG 1 0 124433 CASAVA_Build 6 156343844 4D TTTGTTTTGT TTTG/---- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 TTTG 1 0 124434 CASAVA_Build 6 156346024 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 1 0 124435 CASAVA_Build 6 156352890 1D TGTTTTGTTA C/- CCCCCCTCCT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 C 7 6 124436 CASAVA_Build 6 156361946 1D TTTAAATCTG T/- TTTAACAGGC 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 4 3 124437 CASAVA_Build 6 156384201 2D AATTTGTAAG AC/-- ACTCAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 AC 2 1 124438 CASAVA_Build 6 156386720 3D CTAATAATTT TAA/--- TAATAAAGTA 2877 het 2877 ref 17 8 8 1 TAA 3 2 124439 CASAVA_Build 6 156387617 1I TTAAAATTAT -/A AATAAATACA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 2 3 124440 CASAVA_Build 6 156388087 1D TAATTATCTG T/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 1 0 124441 CASAVA_Build 6 156392035 2D TTTGAATACT CC/-- CCTTCCCCAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 4 2 124442 CASAVA_Build 6 156402834 1D GTGGTGGGGT G/- GGGGGAAGGG 2015 hom 12 het 5 0 5 0 G 6 5 124443 CASAVA_Build 6 156402982 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2957 hom 16 7 8 1 A 12 11 124444 CASAVA_Build 6 156406470 1I AAAAAGTCAG -/T GTGGCGATTC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 0 1 124445 CASAVA_Build 6 156408100 11I CCACCGTGCC -----------/CAGCCTAGACT TACTATTCAT 3070 hom 77 het 31 0 24 8 CAGCCTAGACT 0 1 124446 CASAVA_Build 6 156408708 1D AACATGGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 34 0 24 10 A 12 11 124447 CASAVA_Build 6 156415327 1I AACATTTTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 A 9 10 124448 CASAVA_Build 6 156416070 10D GGGAGACTGA GGTGTGAATT/---------- GGCTTACAGG 3070 het 3070 ref 44 23 19 8 GGTGTGAATT 1 0 124449 CASAVA_Build 6 156425941 2I ACCCATGCCC --/AT ATAAACACCA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 AT 1 2 124450 CASAVA_Build 6 156442317 6D CGAGTTGCTT ACCCAC/------ AGGAGGGCTC 3070 het 3070 ref 48 26 20 4 ACCCAC 1 0 124451 CASAVA_Build 6 156444181 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1232 hom 21 3 17 1 A 10 9 124452 CASAVA_Build 6 156444919 1D GTTGATGTCC T/- TATGTCTATT 3070 het 3070 hom 48 16 28 5 T 2 1 124453 CASAVA_Build 6 156448442 3D TTTGTCTGAC AAT/--- AAAACAGTAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 4 AAT 1 0 124454 CASAVA_Build 6 156468890 5D ACGGCACAGT AAAGG/----- AAACACTGGA 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 AAAGG 1 0 124455 CASAVA_Build 6 156470486 1D AAAATTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 11 10 124456 CASAVA_Build 6 156485088 3I GTGTCCCACC ---/AGG AGGAGTCCTC 3070 hom 108 het 42 0 35 7 AGG 1 2 124457 CASAVA_Build 6 156531929 2D GGAATGAGCA TT/-- TCTCAACTCT 3070 het 3070 hom 29 11 18 0 T 3 1 124458 CASAVA_Build 6 156532326 4D ACTAAATGGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 547 hom 30 7 12 11 A 20 16 124459 CASAVA_Build 6 156542019 1I TTGGCTACTG -/T GAATAATTCT 3070 hom 95 het 34 0 33 1 T 0 1 124460 CASAVA_Build 6 156547827 1I CAAGGGACTA -/T TCTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 T 1 2 124461 CASAVA_Build 6 156550973 1I TTTCTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 52 1 41 10 A 11 12 124462 CASAVA_Build 6 156552528 1I TCTTAATATG -/A AATCACCTCT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 2 3 124463 CASAVA_Build 6 156552877 1D CAGGCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 30 7 9 15 T 15 14 124464 CASAVA_Build 6 156556567 1D TTTTAATGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 11 13 8 T 9 8 124465 CASAVA_Build 6 156556724 5D TTCTATTTCT TTTTA/----- TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 14 5 TTTTA 2 1 124466 CASAVA_Build 6 156568394 1D AGGAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1360 hom 27 5 15 7 A 17 16 124467 CASAVA_Build 6 156569843 1D ATATGGAACC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 9 8 124468 CASAVA_Build 6 156574748 6D AGCAATTTTG TTTGGT/------ TTTGTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 18 14 4 TTTGGT 1 0 124469 CASAVA_Build 6 156576850 1D GGATGCCATC T/- TGGTGGGGTT 3070 hom 72 het 26 0 23 4 T 2 1 124470 CASAVA_Build 6 156586750 1I TGAATGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 A 11 12 124471 CASAVA_Build 6 156598092 1D AAATATTTGT A/- AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 43 27 14 3 A 7 6 124472 CASAVA_Build 6 156604703 1D TTAAGGAAGC A/- TTGTAAATGA 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 1 0 124473 CASAVA_Build 6 156617972 1I TCTCTTTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 9 10 124474 CASAVA_Build 6 156625589 1I TTTCTAATCT -/C CAGAAAGCCT 3070 hom 135 het 53 0 45 8 C 1 2 124475 CASAVA_Build 6 156627588 1I ATGACCATGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 8 9 124476 CASAVA_Build 6 156627722 1D TCTGGGTACC A/- AAAAAAAAAA 2922 hom 33 het 25 0 15 12 A 15 14 124477 CASAVA_Build 6 156630127 1D ACCCTCCCCC A/- CCTCCCCACA 3070 het 3070 ref 42 25 9 8 A 1 0 124478 CASAVA_Build 6 156677051 6D AATTAAAGCA GGGTCT/------ GGCAAGACAC 3070 het 3070 hom 44 16 19 10 GGGTCT 1 0 124479 CASAVA_Build 6 156683208 3D CCTCGATTTT CTC/--- CTATGTTACT 3070 het 3070 hom 51 20 26 9 CTC 1 0 124480 CASAVA_Build 6 156685264 4D ATGAGCATGC AATA/---- CCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 12 2 AATA 1 0 124481 CASAVA_Build 6 156685971 3I CTTTTTAATG ---/TGT TGTTAAATTC 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 TGT 1 2 124482 CASAVA_Build 6 156686124 1I GGAAGTGTTT -/C TTCCTCTTCA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 C 0 1 124483 CASAVA_Build 6 156708011 3D AGAAATTATT ATA/--- ATAATATAAA 1267 hom 15 het 7 0 6 2 ATA 3 2 124484 CASAVA_Build 6 156716963 11I CATGGCAGAG -----------/ATATTTGACAA ATATTTGTTA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 ATATTTGACAA 0 1 124485 CASAVA_Build 6 156719215 3D GGACCTCCTC AGG/--- AGGGGCTGCC 3070 het 3070 ref 38 19 13 9 AGG 2 1 124486 CASAVA_Build 6 156722139 6I CCCCTGCTCC ------/TGCTTA TAATTCTCAA 2559 het 2559 ref 32 18 8 6 TGCTTA 0 1 124487 CASAVA_Build 6 156750055 1I GCTTGTTTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 T 9 10 124488 CASAVA_Build 6 156756536 2D AGAACAATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 339 hom 28 6 11 11 A 16 14 124489 CASAVA_Build 6 156762323 2D TTTAATTTTC AA/-- AAAAAAATCA 3070 hom 53 het 32 1 29 2 A 9 7 124490 CASAVA_Build 6 156770054 12D CAAAAAAAAA TTAGAGAGGGAC/------------ TTTTTCTGGA 3070 het 3070 ref 36 22 16 3 TTAGAGAGGGAC 1 0 124491 CASAVA_Build 6 156781731 1D TTTCATTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 A 9 8 124492 CASAVA_Build 6 156791653 13I TGCTCCTGGG -------------/CTGCAAACCTGTA CAGCATGTTA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 CTGCAAACCTGTA 0 1 124493 CASAVA_Build 6 156800087 2I GTGAGCTGCC --/AA AGAGGAGAAA 3070 hom 113 het 42 0 34 8 A 1 3 124494 CASAVA_Build 6 156801666 1D TTGCAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1991 hom 26 6 12 8 T 15 14 124495 CASAVA_Build 6 156811164 1D AAAATGAAAA T/- TTTAAAATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 4 3 124496 CASAVA_Build 6 156828143 1D AAATGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 643 hom 35 3 15 18 A 15 14 124497 CASAVA_Build 6 156829822 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 10 11 124498 CASAVA_Build 6 156840837 1I TAAAAAAAAA -/T ATATGTATAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 1 124499 CASAVA_Build 6 156841763 1I CTTAAAAAAA -/T AGACACATTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 0 1 124500 CASAVA_Build 6 156849777 1D AACATTTCTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 7 124501 CASAVA_Build 6 156857533 4D TAAAATAAAT AAAC/---- AAAACAAAAC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AAAC 1 0 124502 CASAVA_Build 6 156866115 3D CGACCATAAT CAC/--- TGGCCCCTGG 3070 hom 93 het 34 0 32 4 CAC 1 0 124503 CASAVA_Build 6 156870576 1D AATCTGGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 23 5 T 13 12 124504 CASAVA_Build 6 156878898 1D CTCTCCACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 35 3 19 14 A 13 12 124505 CASAVA_Build 6 156879068 1D TGTTAATATA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 97 het 41 0 33 8 T 9 8 124506 CASAVA_Build 6 156884300 1D GGTAATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 26 0 20 6 T 12 11 124507 CASAVA_Build 6 156906320 2I CTGGCCCTCC --/CT GTCCCTCCTC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 CT 0 1 124508 CASAVA_Build 6 156910293 1I AGACTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2998 hom 29 10 11 8 A 10 11 124509 CASAVA_Build 6 156918954 1D TGCATATTGG C/- CCCTCCAGGT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 C 4 3 124510 CASAVA_Build 6 156930958 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 12 11 124511 CASAVA_Build 6 156931218 1I AAATTTGGGG -/C GGGGGGTCAT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 C 0 1 124512 CASAVA_Build 6 156940340 6D TCACTGTAGT CTCTAC/------ CTCTACCTCC 3070 hom 38 het 22 0 14 9 CTCTAC 2 1 124513 CASAVA_Build 6 156942381 1I TACCTAATAG -/A AAAATTTTAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 4 5 124514 CASAVA_Build 6 156943083 1I TTAGAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 35 2 22 11 A 11 12 124515 CASAVA_Build 6 156944595 1I AAAAGAATAC -/T TGGTTGTCAA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 1 2 124516 CASAVA_Build 6 156944995 3D ACCCAGCTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 24 0 19 5 T 15 12 124517 CASAVA_Build 6 156947568 2D TCATGAAGAT AG/-- AGAGTAGAAA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 AG 3 2 124518 CASAVA_Build 6 156952364 1D CAGAAAGGGC A/- AATGCATGAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 3 2 124519 CASAVA_Build 6 156955084 1D ATTCATTAGT G/- GTGGGAATGC 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 G 2 1 124520 CASAVA_Build 6 156962893 4D TCTCACTCTT TCTC/---- TGTTTCTCTG 3070 het 3070 ref 53 34 16 6 TC 2 0 124521 CASAVA_Build 6 156966393 3D AAAATTCATC AAG/--- AAGAAGTATA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 AAG 3 2 124522 CASAVA_Build 6 156978225 1I GGATAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 12 13 124523 CASAVA_Build 6 156986715 1I ATCAATATCC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 8 9 124524 CASAVA_Build 6 156987234 3I TTTTTTTCTT ---/TCC TCCTATTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TCC 1 2 124525 CASAVA_Build 6 156988785 1D CCAGGCTTGA G/- TGCAGTGGCA 1796 het 1796 ref 26 8 6 12 G 1 0 124526 CASAVA_Build 6 156989139 1D TCTCTCTGGT G/- CCTTTTAATT 3070 het 3070 ref 39 19 19 2 G 1 0 124527 CASAVA_Build 6 156992240 1I ATTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 10 11 124528 CASAVA_Build 6 156993305 1I TCCCTCTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 36 1 25 10 A 11 12 124529 CASAVA_Build 6 157009644 10D GGACAAATTG GTGCAGGAGA/---------- GAAGGGAGAA 3070 het 3070 ref 52 23 22 11 GTGCAGGAGA 1 0 124530 CASAVA_Build 6 157011491 1D CCTCCATAAG A/- AAAAAAAAAA 3052 het 2960 hom 33 12 10 11 A 15 14 124531 CASAVA_Build 6 157023678 1I CTTCAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 11 12 124532 CASAVA_Build 6 157050762 19D TGTGGGTAAT GGGACTGGACCTGCGCCTG/------------------- GGGTCCGCCC 2522 het 2420 hom 21 11 8 5 GGGACTGGACCTGCGCCTG 1 0 124533 CASAVA_Build 6 157116429 1D TTAAAAAGCA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 16 hom 24 1 15 8 C 9 8 124534 CASAVA_Build 6 157144108 1D CCCCATAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 10 9 124535 CASAVA_Build 6 157150458 4D TAAATTCACT CTAA/---- CTAATGAATT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 CTAA 2 1 124536 CASAVA_Build 6 157157580 1I ATTTTTGTTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 7 8 124537 CASAVA_Build 6 157157942 18I TGGCCGTGAA ------------------/CTAGTCAGCAGCCGTGAC CTAGTCAGCA 3070 hom 100 het 43 0 31 12 CTAGTCAGCAGCCGTGAC 0 1 124538 CASAVA_Build 6 157158704 1I ACAGCTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 9 10 124539 CASAVA_Build 6 157182774 3D TGGCAGAGAT GGG/--- GGGTCCCACA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 G 6 3 124540 CASAVA_Build 6 157186517 1I CTTTGTTGTT -/G TTTTTTTTTT 2547 het 1241 hom 33 10 13 10 G 0 1 124541 CASAVA_Build 6 157189455 1D TGGCAGTTCT C/- GGGGTCTGTG 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 C 1 0 124542 CASAVA_Build 6 157198758 3I TTGTAGAGAC ---/GAG GTCTCACCAT 3070 het 3070 hom 37 10 26 2 GAG 0 1 124543 CASAVA_Build 6 157203603 3I TGTCTTGCTG ---/ATT TCTTGCTGTG 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 ATT 0 1 124544 CASAVA_Build 6 157207915 15I4M5I TAATTTAGGA ---------------GACA-----/TTCGGAACTCAAATTCACAGCCTC TCTTCAGCCG 3070 het 3070 hom 42 17 19 8 N/A 0 0 124545 CASAVA_Build 6 157215287 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2768 hom 33 11 11 11 A 15 16 124546 CASAVA_Build 6 157219629 25I AAAAACCCAT -------------------------/TGCCTTTGCTTAATGGTAAAATGCA TCAGTCATAT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TGCCTTTGCTTAATGGTAAAATGCA 0 1 124547 CASAVA_Build 6 157233555 1D TGGTAGTGTT A/- AAAAAAAAAA 936 het 936 ref 38 30 3 5 A 13 12 124548 CASAVA_Build 6 157283688 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2248 hom 21 7 9 5 T 12 13 124549 CASAVA_Build 6 157292741 1D TCTTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 11 10 124550 CASAVA_Build 6 157297139 4I GAGCATACAC ----/AGTT AGGTAGCTAG 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 AGTT 0 1 124551 CASAVA_Build 6 157323637 1D CTTTACTGTA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 8 7 124552 CASAVA_Build 6 157325774 1D CGGCCAGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 591 hom 13 2 10 1 T 10 9 124553 CASAVA_Build 6 157332918 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTGAGA 3070 het 2424 hom 19 5 11 3 T 6 7 124554 CASAVA_Build 6 157338783 1I TTGGGAGCAG -/T TTTTTTTGTG 2381 het 2381 ref 25 11 9 5 T 7 8 124555 CASAVA_Build 6 157340111 1D CTGTCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 2247 het 2233 hom 20 7 6 7 T 15 14 124556 CASAVA_Build 6 157341366 2D TTGAATAAAC AT/-- ATGGAAGTCC 3070 het 3070 hom 30 10 16 6 AT 2 1 124557 CASAVA_Build 6 157348889 1D CTTGGAAGGC T/- TTTTGTCTTT 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 5 4 124558 CASAVA_Build 6 157363057 1D AGAGTCTCCC T/- CCTTGAATGA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 1 0 124559 CASAVA_Build 6 157377711 2D TGCCAGGAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 13 11 124560 CASAVA_Build 6 157381718 1D TTCCAACCAT G/- GGGGGTCAGG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 G 6 5 124561 CASAVA_Build 6 157385587 3I AACTTATAAC ---/TTG TTATGTGTGT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 TTG 0 1 124562 CASAVA_Build 6 157385780 4I AACATTCTTC ----/TGTT TGTTTTTATG 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 TGTT 1 2 124563 CASAVA_Build 6 157405281 2I TGTTCTTTGG --/GA GAAGAAAACT 3070 het 3070 ref 25 17 7 1 GA 1 2 124564 CASAVA_Build 6 157427346 1I ACTTGATTTG -/T TTTAATTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 T 3 4 124565 CASAVA_Build 6 157437987 4I CAAAAATGAA ----/AAAC AACTCATTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAAC 0 1 124566 CASAVA_Build 6 157446995 2D TTCTCATCAC AA/-- AGTTTGGTCA 3070 het 2613 hom 26 9 9 8 A 3 1 124567 CASAVA_Build 6 157458679 1I GAAAAAAGGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 A 8 9 124568 CASAVA_Build 6 157459522 1D CCTGAGCTGC G/- GGGTCCCTGA 3070 het 3070 ref 33 13 15 5 G 4 3 124569 CASAVA_Build 6 157462315 3D TCACAGAGTT ATG/--- AGGAGGACCC 3070 het 3070 hom 43 16 22 8 ATG 1 0 124570 CASAVA_Build 6 157466075 1D TTAGCCATAC T/- TTTTTTTTTC 994 het 994 ref 35 26 3 6 T 10 9 124571 CASAVA_Build 6 157475002 1D ATTTTAATAA T/- TGTGTGAATA 3070 het 3070 hom 41 18 21 4 T 2 1 124572 CASAVA_Build 6 157475193 1I ACTAAAATCC -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 6 7 124573 CASAVA_Build 6 157506264 1I TCGAGTAGTT -/G GGGGGGGGCA 2653 het 2653 ref 31 13 8 10 G 8 9 124574 CASAVA_Build 6 157506313 1D TTTAAAAGAT G/- GGGGGGGTGA 3070 het 3070 ref 42 20 11 11 G 8 7 124575 CASAVA_Build 6 157507488 4I AGGACTGGGA ----/CTCT CTCTGGGTAA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 CT 2 4 124576 CASAVA_Build 6 157524353 3D TGAGTCTCTC CTT/--- CTCAGTACTG 3070 het 3070 hom 17 8 9 1 CTT 1 0 124577 CASAVA_Build 6 157528381 1D CAGTATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 11 10 124578 CASAVA_Build 6 157531928 6I GTTGGGATGC ------/GGGAGT GTCTACCTGA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 GGGAGT 0 1 124579 CASAVA_Build 6 157632783 3D AAAAGGTTTC ATG/--- ATAACAGAAA 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 ATG 1 0 124580 CASAVA_Build 6 157633244 3D TACCCCTGAT ATC/--- ATCATTATTT 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 ATC 2 1 124581 CASAVA_Build 6 157640146 30I GGGTCAGCTT ------------------------------/TATCTTTATAAGGTTGGTGATACCCTCCTC TCCCAGGACA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 TATCTTTATAAGGTTGGTGATACCCTCCTC 0 1 124582 CASAVA_Build 6 157646788 1D CTCCATTGTG C/- CCAAATGTTG 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 C 3 2 124583 CASAVA_Build 6 157670285 5D6M8I5M1I AGTATTTACT GAGCACCTCTA--------TGGTC-/-----TCTTTAGGCATAGGTGGTCA TTAAGCGCTG 3070 het 3070 ref 38 25 15 3 N/A 0 0 124584 CASAVA_Build 6 157705355 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAACAA 2821 het 147 hom 20 3 11 6 AC 0 1 124585 CASAVA_Build 6 157711626 1D CCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1287 het 500 hom 23 5 7 11 A 19 18 124586 CASAVA_Build 6 157719384 1I21M1I TTGTATCAGC -TATTTAGAAATCATATCAGCA-/TTATTTAGAAATCATATCAGCAT TATCTTATTT 3070 hom 126 het 38 0 42 5 N/A 0 0 124587 CASAVA_Build 6 157740227 1D TTCACTCTTC T/- TTTGTTAGTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 4 3 124588 CASAVA_Build 6 157744107 1D ATTGTACAAT A/- AAAAAATTAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 6 124589 CASAVA_Build 6 157752773 1D TGTTCATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 26 2 13 11 A 19 18 124590 CASAVA_Build 6 157758429 1D ATCGTGGACA T/- TTTTTTCATA 3070 hom 151 het 61 0 51 10 T 7 6 124591 CASAVA_Build 6 157759347 1I ACATTAAAAG -/T TTTGCAGAAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 3 4 124592 CASAVA_Build 6 157775614 1D75M1I TTAGGCCACA GTAAGAGCTGCAATAGGGCTTTCTTTTAATATCCTGTGAGTACTTTCAAAATGGATCTTTTGCCCCAGTTTTATTC-/-TAAGAGCTGCAATAGGGCTTTCTTTTAATATCCTGTGAGTACTTTCAAAATGGATCTTTTGCCCCAGTTTTATTCA GTTTATCAAA 3070 het 3070 ref 40 31 19 12 N/A 0 0 124593 CASAVA_Build 6 157779161 1I CTAAATCTTC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 8 9 124594 CASAVA_Build 6 157793267 2I GTACCTAGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 22 9 T 13 15 124595 CASAVA_Build 6 157819223 8I TCTTCAGTAC --------/TCTCTACT TCTCTACTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TCTCTACT 1 2 124596 CASAVA_Build 6 157825502 4I ATTTATATAT ----/ACAC ACACACACAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AC 4 6 124597 CASAVA_Build 6 157830456 1D CTTTCAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 11 10 124598 CASAVA_Build 6 157839291 1I ACCACATCTC -/A AAAAAAAAAA 1622 het 1622 ref 32 12 10 10 A 15 16 124599 CASAVA_Build 6 157845213 1D CATATATATA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 10 9 124600 CASAVA_Build 6 157846755 1D ATCAGAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 10 9 124601 CASAVA_Build 6 157847926 1D AGTAGAGTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 10 9 124602 CASAVA_Build 6 157848307 1D TCCTGACTCA T/- TTTTTTTTTT 2945 het 2358 hom 25 12 10 3 T 15 14 124603 CASAVA_Build 6 157860401 1D CATTGCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 12 11 124604 CASAVA_Build 6 157863042 1I ACAAGTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 10 11 124605 CASAVA_Build 6 157864983 1I TATGAAAATA -/T TTTCTTAGGA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 3 4 124606 CASAVA_Build 6 157872312 1D AACGCCCCTG C/- CCCCCCCGGA 3070 hom 62 het 34 0 23 11 C 8 7 124607 CASAVA_Build 6 157878317 1D ATTTGAACTG A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 7 6 124608 CASAVA_Build 6 157882810 1I CCCAGGCTGG -/C CTCGTGTAGA 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 C 1 2 124609 CASAVA_Build 6 157884369 1D ACTTTTACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 12 11 124610 CASAVA_Build 6 157886263 1I GGAGCTTGTT -/G GGGATTATGA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 G 3 4 124611 CASAVA_Build 6 157889460 1D GTTGTTGTTG T/- TTGTTTGTTT 947 het 660 hom 18 4 4 10 T 3 2 124612 CASAVA_Build 6 157897655 2D TAATTGACAG CA/-- CAGTCAGGAG 3070 het 3070 ref 34 17 15 4 CA 2 1 124613 CASAVA_Build 6 157897734 1I AGAGCCGAGG -/C CCCCGGGGCT 3070 het 1939 hom 28 7 11 10 C 4 5 124614 CASAVA_Build 6 157899804 1D CTTTGGTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2428 hom 29 10 14 5 A 12 11 124615 CASAVA_Build 6 157900225 1I GCAAAGGTGA -/T TTCACGAGGA 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 T 2 3 124616 CASAVA_Build 6 157902254 5D GGAAGAAGCA TGCCT/----- TGCTGGGGTC 3070 het 3070 ref 35 16 13 8 TGCCT 1 0 124617 CASAVA_Build 6 157902419 1I ACCTGCTTGC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 283 hom 31 1 23 7 T 7 8 124618 CASAVA_Build 6 157902989 1D GGTTAGATAC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 7 6 124619 CASAVA_Build 6 157907264 1I CTTTCTCTCT -/A AAAAAAACCC 3070 het 384 hom 42 1 35 6 A 7 8 124620 CASAVA_Build 6 157909483 1I TTAATATACT -/A TGAACCTTTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 0 1 124621 CASAVA_Build 6 157914171 1D CACTCGCCAT C/- CCCCTTTCTT 2838 het 2838 ref 32 15 11 6 C 5 4 124622 CASAVA_Build 6 157922222 1I CAGGAACAGG -/T TGTTTAATTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 124623 CASAVA_Build 6 157922319 1I AGTTGGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 12 13 124624 CASAVA_Build 6 157922751 1D TGAAATTAGG A/- ATAGCAACCC 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 2 1 124625 CASAVA_Build 6 157948071 1I AGCATATTCG -/T AAGTATGTAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 0 1 124626 CASAVA_Build 6 157953864 1D TCTCTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 27 3 16 8 A 13 12 124627 CASAVA_Build 6 157958703 1D TTCTGAAATC T/- TTTATTTTGA 3070 het 3070 ref 41 18 20 4 T 4 3 124628 CASAVA_Build 6 157960735 1D TTAGGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 13 10 T 12 11 124629 CASAVA_Build 6 157963894 1I CTGCCTTTAC -/T TTAATCCATA 3070 het 3070 hom 53 21 25 7 T 2 3 124630 CASAVA_Build 6 157967798 2D ATTCCAGTAT CA/-- CACAGAGTAT 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 CA 3 2 124631 CASAVA_Build 6 157971675 2D CACACCCACA CT/-- CATACTAGCC 3070 het 3070 ref 71 29 20 24 CT 1 0 124632 CASAVA_Build 6 157971850 2D72M2I CCCACACTCA CTCTAGCCACTCATATATACTCACCAATAAGCTCACACACACATAGCCTTACACACACATCCTTACCCACATTT--/--CTAGCCACTCATATATACTCACCAATAAGCTCACACACACATAGCCTTACACACACATCCTTACCCACATTTAC ACACACTCAT 3070 het 3070 ref 67 61 23 35 N/A 0 0 124633 CASAVA_Build 6 157972069 2I CCCTTACCCC --/CA CACACACCCT 3070 het 3070 ref 60 29 22 9 CA 3 4 124634 CASAVA_Build 6 157972288 1I GTTTTACTCA -/C CCTGGCTCCA 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 C 2 3 124635 CASAVA_Build 6 157974434 3D TTGGATTAAT GAG/--- GAGGATTCCC 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 GAG 2 1 124636 CASAVA_Build 6 157992595 1D CAAGACCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 136 hom 26 1 13 12 T 12 11 124637 CASAVA_Build 6 158003179 1I TGAGACATAC -/A ATTTTCTAAC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 1 2 124638 CASAVA_Build 6 158005903 1D TCCACTAGGA C/- TTCTGGTCCT 3070 het 3070 ref 52 25 19 9 C 1 0 124639 CASAVA_Build 6 158008638 1I GCAAAGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3058 hom 27 11 9 7 A 13 14 124640 CASAVA_Build 6 158018365 1I CTGAAGCGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2621 hom 23 6 11 6 T 11 12 124641 CASAVA_Build 6 158018871 1D GCCTGCAATT A/- AAAAAAAAAA 1788 het 1788 ref 34 20 5 10 A 17 16 124642 CASAVA_Build 6 158018972 1I AAAAAAAAAA -/G GCATTTTAAA 3070 het 3070 ref 35 14 16 5 G 1 2 124643 CASAVA_Build 6 158020645 1D TGAAAACAAC A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 A 8 7 124644 CASAVA_Build 6 158023256 1I14M2I TCAAAAAAAA -AATAATAATAATAA--/TAATAATAATAATAAAT ATATATATAT 1611 het 1611 ref 7 6 4 0 N/A 0 0 124645 CASAVA_Build 6 158076062 1D GAGGCCCAGG T/- GGGTGGATCA 3070 hom 24 het 10 0 8 3 T 1 0 124646 CASAVA_Build 6 158077026 3I TCAATGATTC ---/CAG ACTGAAGATG 3070 hom 37 het 20 0 12 8 CAG 0 1 124647 CASAVA_Build 6 158078304 1D CTGGTCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 14 0 9 5 T 11 10 124648 CASAVA_Build 6 158079485 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 10 9 124649 CASAVA_Build 6 158082386 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 13 12 124650 CASAVA_Build 6 158084750 1D TAATCATAAA T/- AAGGCCAGGC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 1 0 124651 CASAVA_Build 6 158085019 4D CCTGGGTGAT AGAG/---- AGAGACTCTG 3070 hom 21 het 22 1 20 5 AG 4 2 124652 CASAVA_Build 6 158094253 2D TTTTAGTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 41 2 27 12 A 18 16 124653 CASAVA_Build 6 158133081 1D TATTTTACTT A/- ATTAATTTAT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 2 1 124654 CASAVA_Build 6 158142758 1I AAAAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 2529 het 1582 hom 23 8 8 7 A 13 14 124655 CASAVA_Build 6 158154120 2I TGTTAGTGAT --/CA CAGTGATCTG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 CA 1 2 124656 CASAVA_Build 6 158295060 1D CTGATAGCTT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 8 7 124657 CASAVA_Build 6 158301824 6I ACAGGCGTGA ------/GCCAGC GCCCAGCCTG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 GCCAGC 0 1 124658 CASAVA_Build 6 158311061 1D TTTTCGTTAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 9 8 124659 CASAVA_Build 6 158311286 2D CTTCCATAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 T 12 10 124660 CASAVA_Build 6 158313257 5D GGTTTTTAAT ATCTA/----- ATATAATATT 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 ATCTA 1 0 124661 CASAVA_Build 6 158313432 16D TTTCTGGTTT TTTGTTTGTTTGTTTG/---------------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 TTTG 10 6 124662 CASAVA_Build 6 158320025 1D GTGTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1660 het 259 hom 19 2 6 11 T 15 14 124663 CASAVA_Build 6 158338783 1D AAGCATTGGC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 A 8 7 124664 CASAVA_Build 6 158347921 1D TCGAACTCCT A/- AACCTCAGGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 A 3 2 124665 CASAVA_Build 6 158402704 2I CTCACCTGTG --/CC CCCTCCAGAG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 3 5 124666 CASAVA_Build 6 158407723 1I CGCTTGACCC -/T TTTAGTGGCC 3070 het 3070 ref 57 30 16 11 T 3 4 124667 CASAVA_Build 6 158414362 1I GGATTACAGG -/C CGTGCACCAC 3070 het 3070 hom 16 8 7 1 C 1 2 124668 CASAVA_Build 6 158434473 2I AAAAAAACAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 het 2091 hom 33 12 15 6 AC 0 1 124669 CASAVA_Build 6 158439109 2D ATTAACAGCC AG/-- AGTCATAAAT 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 AG 2 1 124670 CASAVA_Build 6 158440730 1D GCAGGGAATA C/- TGCCATAACA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 C 1 0 124671 CASAVA_Build 6 158446809 2D TGCCTTAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 42 0 31 12 T 12 10 124672 CASAVA_Build 6 158448703 3I ATATTTAGAT ---/GAC AGTATGCTAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 GAC 0 1 124673 CASAVA_Build 6 158458430 2D TTGTGGACAC AA/-- GAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 22 4 A 2 0 124674 CASAVA_Build 6 158462632 1I GATGGGAAGC -/T TAGCATTTAA 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 1 2 124675 CASAVA_Build 6 158467397 1D33M3D TGCTGGGGCT CCCATTAGTCAAAGCTGGAACAATTTGGCACCAAATT/-CCATTAGTCAAAGCTGGAACAATTTGGCACCAA--- ATTAAGTACA 3070 het 3070 ref 30 29 16 3 N/A 0 0 124676 CASAVA_Build 6 158468071 1D AGATTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 27 1 17 10 A 15 14 124677 CASAVA_Build 6 158470722 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 641 hom 25 3 13 9 T 13 12 124678 CASAVA_Build 6 158472493 5D AAAATACATA AATAT/----- AATATAAATA 2051 het 2051 ref 11 6 5 0 AATAT 2 1 124679 CASAVA_Build 6 158478389 4D TTCGTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 27 8 18 1 TTTG 4 3 124680 CASAVA_Build 6 158479533 1I AAAGGTAAGG -/T TTACAGAACA 3070 het 2561 hom 26 6 15 5 T 2 3 124681 CASAVA_Build 6 158490013 1I CAAGAATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2062 hom 29 7 15 7 T 10 11 124682 CASAVA_Build 6 158492449 1I CTCAAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 1495 het 1495 ref 23 7 5 11 T 11 12 124683 CASAVA_Build 6 158499526 1D CTTTCCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 9 6 A 10 9 124684 CASAVA_Build 6 158502404 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 436 het 436 ref 26 11 2 13 A 15 14 124685 CASAVA_Build 6 158504750 12I TGTAGGTTTT ------------/TTGTTGTTGTTG TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 TTG 2 6 124686 CASAVA_Build 6 158513082 2I TTTTTCCCTC --/TT GTTTCTTCCA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 0 2 124687 CASAVA_Build 6 158534225 19I AGGCTGAGGT -------------------/AGGAGGATGGCTTAAGCCC AGGAGGTCAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 3 AGGAGGATGGCTTAAGCCC 0 1 124688 CASAVA_Build 6 158541031 2I GCTTGAGCAC --/GA GAGGTCAAGG 3070 hom 32 het 15 0 10 5 GA 1 2 124689 CASAVA_Build 6 158542539 6I TCACTCCTCC ------/TCCTCT GGCTCCCTCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TCCTCT 0 1 124690 CASAVA_Build 6 158620099 2I AGCTGGGACT --/AC AGGCGCCTGC 960 het 779 hom 6 2 3 1 AC 0 1 124691 CASAVA_Build 6 158642417 1D AATCAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 13 12 124692 CASAVA_Build 6 158642903 4I AAGTAGGTCT ----/TAAA TAATTAATGT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TAAA 0 1 124693 CASAVA_Build 6 158645694 1I TTTTACCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 11 12 124694 CASAVA_Build 6 158655442 6I CTGGCAGAAA ------/AGATGC AGATGCTAAG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 AGATGC 1 2 124695 CASAVA_Build 6 158657283 8I TGTGTGCGTG --------/TCTTTGTA TGGACCTGTG 3070 hom 126 het 45 0 42 3 TCTTTGTA 0 1 124696 CASAVA_Build 6 158658207 1I ACTTTTTTGG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 8 9 124697 CASAVA_Build 6 158658522 1I GAACTCATCC -/T TTTTTTATGG 2582 hom 15 het 7 0 6 1 T 6 7 124698 CASAVA_Build 6 158660438 8I ATCTCTGCCC --------/TTACTTAG TTACCTTATC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTACTTAG 0 1 124699 CASAVA_Build 6 158664555 4I ATGCTAGGTG ----/ACCA ACCACATCTA 3070 hom 135 het 48 0 45 3 ACCA 1 2 124700 CASAVA_Build 6 158668154 1I AAGGATTCAG -/T TGGTTACTAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 1 2 124701 CASAVA_Build 6 158668694 1I TTTTAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 27 0 22 5 T 10 11 124702 CASAVA_Build 6 158669793 1I ATTCTAGACT -/G CATCTTGTGC 3070 hom 114 het 49 0 37 12 G 0 1 124703 CASAVA_Build 6 158670848 4I AAAAACCTAA ----/CTAT CTATTTTCAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CTAT 1 2 124704 CASAVA_Build 6 158671053 3D CATTAAAAGT AAA/--- AAGAAACAGG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 5 2 124705 CASAVA_Build 6 158671159 1D ACCGATACTC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 8 7 124706 CASAVA_Build 6 158671404 3I ATTTCAAACT ---/TAC ATAAAAATTG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TAC 0 1 124707 CASAVA_Build 6 158674652 3I TATTCTCAGA ---/TTG TTTTCAATAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTG 0 1 124708 CASAVA_Build 6 158675622 4I CCCTAACCCC ----/CGCA CGCATTGTTC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 CGCA 1 2 124709 CASAVA_Build 6 158676295 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2962 het 499 hom 21 3 10 8 A 19 18 124710 CASAVA_Build 6 158676479 1I TTCATTCTTA -/T TGATTTTATG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 1 2 124711 CASAVA_Build 6 158687837 3I CCTCATGACT ---/TGA TGATGATGAT 3070 hom 111 het 46 0 37 9 TGA 3 4 124712 CASAVA_Build 6 158695247 1I TTTAATAATT -/G TTGGTTGACG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 G 0 1 124713 CASAVA_Build 6 158701118 1D TTATGCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2626 hom 42 12 18 12 A 11 10 124714 CASAVA_Build 6 158703371 1D CATTGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 12 11 124715 CASAVA_Build 6 158708077 1D TTTTGGATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 11 10 124716 CASAVA_Build 6 158713395 1D TGGAAATGGA T/- TTTTTTTTTA 1309 het 1309 ref 40 30 3 8 T 10 9 124717 CASAVA_Build 6 158722178 1I TGCTTTATGG -/T TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 2 3 124718 CASAVA_Build 6 158727805 6I CTGTTTTCTC ------/TATCTA TATTTGTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 TATCTA 0 1 124719 CASAVA_Build 6 158732864 1D TCTAGTGGCT A/- AGCATGCTTT 3070 het 3070 ref 52 24 19 11 A 2 1 124720 CASAVA_Build 6 158740705 4D GCTTATTGAA TCTT/---- TCTGTGTGCC 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 TCTT 1 0 124721 CASAVA_Build 6 158742627 24D CCCGTGCAGA GTCAAGCTGTGGGCCCAGGGTGTG/------------------------ GTCAAGCCGT 3070 het 3070 ref 40 23 14 12 GTCAAGCTGTGGGCCCAGGGTGTG 1 0 124722 CASAVA_Build 6 158753553 12D AAATCGTAAA CAACTTAGATTT/------------ TTCAAGTATG 3070 het 3070 ref 33 17 16 1 CAACTTAGATTT 1 0 124723 CASAVA_Build 6 158761675 1I CTAATTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 786 hom 26 6 14 6 T 9 10 124724 CASAVA_Build 6 158764654 3D TTTTTGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 TTG 7 6 124725 CASAVA_Build 6 158767509 4D CCTTTCCCCG TTGT/---- TTGTTTTTGT 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 TTGT 2 1 124726 CASAVA_Build 6 158771347 3I ATTATAAGCA ---/ATT ATTTTATAGT 3070 het 2941 hom 28 8 19 1 ATT 1 2 124727 CASAVA_Build 6 158780191 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2968 hom 21 7 11 3 A 10 12 124728 CASAVA_Build 6 158791416 1D TCTTCTCTTT C/- CTGTCACAGT 3070 het 3070 hom 64 29 32 3 C 2 1 124729 CASAVA_Build 6 158791773 1D TTTATTATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3013 hom 26 9 12 5 A 12 11 124730 CASAVA_Build 6 158795535 1I TATTCTTTAC -/A GGGGGAATTT 3070 het 3043 hom 24 8 13 3 A 0 1 124731 CASAVA_Build 6 158797513 8I CCAAGGAAGC --------/CAAAAGAT CAAAAGATTG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 CAAAAGAT 1 2 124732 CASAVA_Build 6 158798946 1I TTCTTAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 18 17 13 A 9 10 124733 CASAVA_Build 6 158800451 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 866 hom 18 4 11 3 A 13 14 124734 CASAVA_Build 6 158802444 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGGAAAAA 2648 het 2400 hom 20 11 8 1 AAG 0 1 124735 CASAVA_Build 6 158807468 1I ATTTGCATTT -/C CCTAAGGATT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 2 3 124736 CASAVA_Build 6 158807887 1D TGCTCTTTGT G/- GGTATTTTTC 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 G 3 2 124737 CASAVA_Build 6 158812238 2D TCAATAAGCT AA/-- AAAGGCAGGA 3070 het 3070 hom 42 19 19 6 A 5 3 124738 CASAVA_Build 6 158813474 1I TCAACCATTG -/A AAAAAATCGC 1288 het 1288 ref 37 31 3 3 A 6 7 124739 CASAVA_Build 6 158821714 1I TGTTGGGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 9 10 124740 CASAVA_Build 6 158826761 1D GGATATCAAA C/- CAAAGAAGAC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 C 2 1 124741 CASAVA_Build 6 158845680 1D CCAGCCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2906 hom 26 10 16 1 T 13 12 124742 CASAVA_Build 6 158846005 9I GCTAGTCAAT ---------/AGGACCCAC AGCTGAGCCA 3070 het 3070 ref 56 29 22 5 AGGACCCAC 0 1 124743 CASAVA_Build 6 158846354 1I TCTAAGCCCA -/G GGGTTGGCAT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 G 3 4 124744 CASAVA_Build 6 158850282 1I CACTTAAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 9 10 124745 CASAVA_Build 6 158850893 8D AACTATGCTT TCATTCAG/-------- TCAGTCTCTG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 TCATTCAG 1 0 124746 CASAVA_Build 6 158854195 1D GGATTTGTTT C/- CCTACACTTC 3070 het 3070 ref 37 24 8 6 C 3 2 124747 CASAVA_Build 6 158854345 1D GTCATAGGAA T/- TTTTTTTTTT 2448 het 730 hom 30 10 9 11 T 19 18 124748 CASAVA_Build 6 158860248 1D CTTTTGTGCT G/- TTTACAATGT 3070 het 3070 hom 53 23 28 2 G 1 0 124749 CASAVA_Build 6 158860686 4D CAGATTTTTT TTGG/---- TGGTTCTTTC 3070 het 3070 ref 36 20 13 6 TTGG 1 0 124750 CASAVA_Build 6 158869023 4I TACAAGAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AAAC 1 2 124751 CASAVA_Build 6 158872397 16I GGAGAATGGC ----------------/GTGAACCCAGGAAGCA GTGAACCCAG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 GTGAACCCAGGAAGCA 1 2 124752 CASAVA_Build 6 158882446 7D TCAAAAAACA AAAAAAC/------- AAAAAACAAA 2095 het 2095 ref 23 11 5 8 AAAAAAC 3 2 124753 CASAVA_Build 6 158901836 1D GACTTTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1613 hom 32 8 14 10 T 12 11 124754 CASAVA_Build 6 158913330 3D CAGGCTGAGC ATA/--- CTATGTCCAT 3070 het 3070 ref 48 20 16 13 ATA 1 0 124755 CASAVA_Build 6 158915110 3I GCAACCAGGA ---/GCC GCCTGACTTG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 GCC 1 2 124756 CASAVA_Build 6 158916378 1I CAGATTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 15 12 T 10 11 124757 CASAVA_Build 6 158931397 1I GGATACCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 10 11 124758 CASAVA_Build 6 158933497 1D AGACCCCATC T/- TTTTTTTTTT 1222 het 1222 ref 29 10 4 15 T 12 11 124759 CASAVA_Build 6 158946152 8D AAAAAAAAAA GTGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 1977 het 711 hom 19 2 8 10 GT 14 10 124760 CASAVA_Build 6 158946890 1D CCCAAGGGAG C/- CCCCCCAGAG 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 C 7 6 124761 CASAVA_Build 6 158954557 2I CTGGCCTGTC --/AG AAAGTGACAT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 AG 0 1 124762 CASAVA_Build 6 158968826 4I TGCACATGTT ----/AATG AAGCCTTCTG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 AATG 0 1 124763 CASAVA_Build 6 158971735 1D TGTTACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 A 13 12 124764 CASAVA_Build 6 158983593 1I TTTCTTTTTA -/G GGGGGTTCAG 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 G 5 6 124765 CASAVA_Build 6 158994530 1I CGTCTCAGAG -/A AAAAAAAAAA 2486 het 2486 ref 28 10 10 8 A 11 12 124766 CASAVA_Build 6 158998446 10D ACTCTGGCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 24 2 15 11 A 21 11 124767 CASAVA_Build 6 158998863 2I GAAACAAAAT --/AC AGTCTTCCTT 3070 hom 69 het 37 0 23 14 AC 0 1 124768 CASAVA_Build 6 158999791 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 64 het 23 0 22 1 A 9 8 124769 CASAVA_Build 6 159010351 2D TTGTTTCCTT CA/-- AACTGTGATC 3070 het 3070 ref 59 33 22 6 CA 1 0 124770 CASAVA_Build 6 159032673 1D AATATTAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2228 hom 23 8 12 3 T 10 9 124771 CASAVA_Build 6 159033971 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGA 1331 het 1331 ref 12 3 4 5 A 8 9 124772 CASAVA_Build 6 159038719 1D CCTATATTCA T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 T 8 7 124773 CASAVA_Build 6 159039852 4I AAGGCCTGTT ----/GAGG AAGGGGCACA 3070 het 3070 ref 48 27 18 3 GAGG 0 1 124774 CASAVA_Build 6 159045170 1D TTAAATGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 11 10 124775 CASAVA_Build 6 159048419 1D AATGTGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 14 13 124776 CASAVA_Build 6 159051535 1D GTCAGTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 A 13 12 124777 CASAVA_Build 6 159058329 1D ATTTTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 T 13 12 124778 CASAVA_Build 6 159063168 8D ACTTTCTTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 TTTG 6 4 124779 CASAVA_Build 6 159066679 8D TCCAATGCTC TTTTTTTG/-------- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 49 27 16 9 TTTTTTTG 2 1 124780 CASAVA_Build 6 159067871 1D TTGAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 1679 het 1233 hom 27 6 7 14 T 17 16 124781 CASAVA_Build 6 159069359 1D ACCACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 6 A 11 10 124782 CASAVA_Build 6 159084501 2I AGCTTCTCCG --/TT TTCATCTACC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 2 4 124783 CASAVA_Build 6 159086771 1I GACAATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 769 hom 36 3 27 6 A 11 12 124784 CASAVA_Build 6 159089866 1I ACTCCGCCTG -/A AAAAAAAAAA 1184 het 1184 ref 20 8 4 8 A 13 14 124785 CASAVA_Build 6 159090249 6I CCTCTCATTA ------/AATAAT AATAATAAAT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 AAT 2 4 124786 CASAVA_Build 6 159106936 4D AGAGAGACTG CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 50 20 18 12 CAAA 3 2 124787 CASAVA_Build 6 159107334 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 879 hom 33 7 18 8 A 11 10 124788 CASAVA_Build 6 159107668 4I TTTCCGTAAT ----/TCAA TCAATCAGTC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TCAA 1 2 124789 CASAVA_Build 6 159107866 2D AGCACTAAAG AC/-- ACAAGCGTGG 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 AC 2 1 124790 CASAVA_Build 6 159109411 1D TTTATAGCCG T/- TGTGAGAACA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 2 1 124791 CASAVA_Build 6 159112203 2I GACAGGCACT --/GG GGCTGCCAGT 3070 hom 80 het 31 0 24 7 G 2 4 124792 CASAVA_Build 6 159118934 1D AATCCCCATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 A 9 8 124793 CASAVA_Build 6 159120948 1I TTACACCTGT -/A ATCCCAGCAC 3061 hom 18 het 7 0 7 0 A 1 2 124794 CASAVA_Build 6 159122768 10I TGGTTCCAAG ----------/TTCCTGTATC TACCCACTTT 3070 hom 73 het 31 0 21 11 TTCCTGTATC 0 1 124795 CASAVA_Build 6 159124266 1D TCAGAGGCAG C/- GGGGAGGAGA 2912 het 2525 hom 26 10 10 6 C 1 0 124796 CASAVA_Build 6 159129768 1D TACTTGATTT A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 7 6 124797 CASAVA_Build 6 159130651 4D GTTTTTCTCT TTTC/---- TTTGAGACAG 3070 het 3070 hom 44 15 25 5 TTTC 1 0 124798 CASAVA_Build 6 159131708 3I CAAACAAACA ---/AAC AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 AAC 0 1 124799 CASAVA_Build 6 159132175 1D ATCCAATATG C/- CCTTAAAGGC 3070 hom 102 het 41 0 33 10 C 3 2 124800 CASAVA_Build 6 159133305 2I ATCATCTCAG --/CT CACTGCAACC 3070 het 3070 ref 35 13 14 9 CT 0 1 124801 CASAVA_Build 6 159137671 1I GATATGCTGT -/G GGGGGCAGTG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 G 5 6 124802 CASAVA_Build 6 159139229 2D43M1I GGCTGTCACT TCTGTCTACCCATTCAGGTGATGGACATTTAACTTGCTCCTTGTT-/--TGTCTACCCATTCAGGTGATGGACATTTAACTTGCTCCTTGTTG GCTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 37 26 29 8 N/A 0 0 124803 CASAVA_Build 6 159143435 2I TATGATTTTT --/TA TGATGCGTTG 3070 het 3070 ref 40 22 10 8 TA 0 1 124804 CASAVA_Build 6 159143757 1D TCACCATGTT A/- AGTTAGATGG 2345 het 988 hom 9 2 6 2 A 2 1 124805 CASAVA_Build 6 159144217 2I TCCTAGTAAC --/TT TGACTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 1 3 124806 CASAVA_Build 6 159145776 1D TTTTCCTTTC T/- TTTTTTCTTA 2121 hom 16 het 9 0 6 4 T 7 6 124807 CASAVA_Build 6 159147501 1D CCACTTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 17 16 T 14 13 124808 CASAVA_Build 6 159150246 4I GGGGCACGGC ----/ACAG ACAGAGATGG 3070 het 3070 ref 57 31 23 3 ACAG 1 2 124809 CASAVA_Build 6 159152951 7I TGGAAGGAAT -------/AAAAGAG AAAAGAGGAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AAAAGAG 1 2 124810 CASAVA_Build 6 159153076 2I CCAAATGAAG --/CT CTGTTACTGG 3070 het 3070 ref 30 17 10 5 CT 1 2 124811 CASAVA_Build 6 159157745 2I TGGCATATTA --/AT ATTCTTTATC 3070 hom 101 het 39 0 33 6 AT 1 2 124812 CASAVA_Build 6 159161273 1D TACGATGCCT G/- GAACAGTACC 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 G 2 1 124813 CASAVA_Build 6 159163211 4I TTTGGAAAAT ----/AAAA AATAAAAATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 6 124814 CASAVA_Build 6 159163540 1D TAAGTATGAC A/- ACATAGCATT 3070 hom 144 het 54 0 48 6 A 2 1 124815 CASAVA_Build 6 159165470 6D2M1I GATGACAGAG CAAGACTC-/------TCT TGTCTCAATT 3070 het 2417 hom 25 8 14 6 N/A 0 0 124816 CASAVA_Build 6 159168166 1D GTTAGTTCCA G/- AACCGGGGTA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 1 0 124817 CASAVA_Build 6 159171673 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 2904 het 1943 hom 23 5 11 7 AG 2 1 124818 CASAVA_Build 6 159180787 26D CTTGAACCCG GGAGGCAGGGGAATTGCTTGAACCCA/-------------------------- GGAGGCAGAG 2266 het 526 hom 6 2 5 0 GGAGGCAGGGGAATTGCTTGAACCCA 1 0 124819 CASAVA_Build 6 159181133 1D AGCAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2770 het 2276 hom 26 11 7 9 T 14 13 124820 CASAVA_Build 6 159181246 1I CTGCTGCCTC -/A AGCCTCCTGA 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 1 2 124821 CASAVA_Build 6 159182137 1D CTGGTAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 30 1 18 11 T 11 10 124822 CASAVA_Build 6 159186619 12D AGCACTAAGG ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 1023 hom 12 het 6 0 4 3 AT 15 9 124823 CASAVA_Build 6 159203716 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1775 het 164 hom 20 3 5 12 A 19 18 124824 CASAVA_Build 6 159213944 1D CTCACCTCGG C/- CTCCCAAAGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 2 1 124825 CASAVA_Build 6 159214370 4D TTTTGTTTTT CAGA/---- CAGAGTCTCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CAGA 2 1 124826 CASAVA_Build 6 159216910 7D TCTCCCTGGA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2101 het 2101 ref 21 11 7 3 T 18 11 124827 CASAVA_Build 6 159233616 1D TTTTCTTAGG T/- TTTTTTTTTT 2884 het 2884 ref 26 15 8 3 T 12 11 124828 CASAVA_Build 6 159239038 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTAAG 2597 hom 15 het 6 0 6 0 T 8 7 124829 CASAVA_Build 6 159247780 1D ATTTTGCCCA T/- TAAATATTAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 1 124830 CASAVA_Build 6 159248004 8I ATCTGATGAT --------/AATGTGAA AATAAATATA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AATGTGAA 0 1 124831 CASAVA_Build 6 159257001 1I TGGATCACGA -/G GTCAGGAGTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 1 2 124832 CASAVA_Build 6 159267940 2I CATTTTTATC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 2937 hom 21 9 8 4 T 9 11 124833 CASAVA_Build 6 159276177 1D TTTTTAAAAG T/- TTTTGTAGAG 3070 het 2662 hom 23 7 12 5 T 5 4 124834 CASAVA_Build 6 159276904 1D AAACTCTTTC T/- TTTGTCAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 4 3 124835 CASAVA_Build 6 159282888 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1816 het 1111 hom 11 3 5 3 T 11 10 124836 CASAVA_Build 6 159288130 1D AACTGAGCAC T/- TAGTGCAGCA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 2 1 124837 CASAVA_Build 6 159302701 2I CAATGGGAAA --/CT CTGCACTTGC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 CT 1 2 124838 CASAVA_Build 6 159304379 2D CCTTTCTTTC TT/-- TCAGATAGGG 1741 het 1507 hom 8 4 4 0 T 3 1 124839 CASAVA_Build 6 159320286 2I GAAATGGAGA --/GT GTGATAGAAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 GT 1 2 124840 CASAVA_Build 6 159363266 1D ACAATACATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 13 22 4 A 9 8 124841 CASAVA_Build 6 159368837 1D CCAATGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2416 hom 40 12 19 9 T 12 11 124842 CASAVA_Build 6 159370129 6D CCCTCTAACT TATTAA/------ TATGATATAT 3070 het 3070 hom 37 14 20 5 TATTAA 1 0 124843 CASAVA_Build 6 159370628 2D18M3I16M1D TATATAATAT AATATATATTAATATAATGT---ATATTATGTATTATAAT/--TATATATTAATATAATGTATAATATTATGTATTATAA- ATATAGTACT 1316 het 1316 ref 9 6 3 5 N/A 0 0 124844 CASAVA_Build 6 159371823 3I CAATGGTCTC ---/ATT ATATTAAGTA 3070 het 3070 hom 42 21 18 3 ATT 0 1 124845 CASAVA_Build 6 159374876 1D AGGCAGAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 10 9 124846 CASAVA_Build 6 159391395 1I CTCCGTTTCC -/A AAAAAAAAAT 1597 het 1597 ref 12 6 5 1 A 9 10 124847 CASAVA_Build 6 159411403 1I AAAATAATAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 8 9 124848 CASAVA_Build 6 159436463 1I TGCATAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 11 12 124849 CASAVA_Build 6 159438310 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 10 11 6 A 12 13 124850 CASAVA_Build 6 159442762 1D2M6I GGCGGTGCCT CTG------/-TGAGCTAA GGCTCAAGAG 3070 het 3070 hom 45 18 18 10 N/A 0 0 124851 CASAVA_Build 6 159449954 2D GCCAGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 13 11 124852 CASAVA_Build 6 159452827 7I AGTGACTGGG -------/AAGGCCT AAGGCCTAGG 3070 het 3070 ref 62 26 21 15 AAGGCCT 1 2 124853 CASAVA_Build 6 159453260 20D CTACTATACG CTACTGTAGACTACTGCACA/-------------------- CTACTGTAGA 3070 het 3070 ref 68 34 33 11 CTACTGTAGACTACTGCACA 2 1 124854 CASAVA_Build 6 159454203 1D CTCCCAGGTT G/- CTCTGTGTGC 3070 hom 129 het 47 0 42 6 G 1 0 124855 CASAVA_Build 6 159456589 3D GTAATAATAG TTC/--- TTATTACCCA 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 TTC 1 0 124856 CASAVA_Build 6 159480092 1I TGTTAACTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 T 9 10 124857 CASAVA_Build 6 159495711 1D AGATGTATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 T 10 9 124858 CASAVA_Build 6 159495994 1I ATACTTAATG -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 6 7 124859 CASAVA_Build 6 159566360 1D CTAAGCTCTG T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 48 22 19 8 T 7 6 124860 CASAVA_Build 6 159569566 1I GGTTGAAACG -/T TTTTTTTTTT 2586 het 2586 ref 26 11 6 9 T 10 11 124861 CASAVA_Build 6 159571975 2D ATCCCAGGAG TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 10 8 124862 CASAVA_Build 6 159576340 1D AATGAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 32 1 25 6 T 12 11 124863 CASAVA_Build 6 159580770 18D CCCACCACTG CCACCACCCGCCGCACGA/------------------ CCACCACCCG 3002 hom 38 het 21 0 11 12 CCACCACCCGCCGCACGA 2 1 124864 CASAVA_Build 6 159581201 1D TATTTATATG A/- AAAAAATTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 7 6 124865 CASAVA_Build 6 159584194 1D GCCAGTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 115 het 43 0 39 5 T 11 10 124866 CASAVA_Build 6 159602971 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 T 8 9 124867 CASAVA_Build 6 159614669 6I ATTGGACTTA ------/CAGCTC CATGTGGGGA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 CAGCTC 0 1 124868 CASAVA_Build 6 159623969 2I AAGATATTTT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 GA 5 6 124869 CASAVA_Build 6 159624151 2D TATGTACACC AT/-- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 56 28 22 7 AT 5 4 124870 CASAVA_Build 6 159624275 2I TATATACACC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 40 20 9 11 TA 5 6 124871 CASAVA_Build 6 159625214 1I CCACGCTCAG -/C CCCCCCTTCC 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 C 6 7 124872 CASAVA_Build 6 159636717 1I TTGTAACTTC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 T 7 8 124873 CASAVA_Build 6 159648143 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACTC 3070 het 2949 hom 27 7 16 4 AG 2 1 124874 CASAVA_Build 6 159651271 1D CATAGTTACT G/- GGGGAGCTCC 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 G 5 4 124875 CASAVA_Build 6 159673250 1D GAAAAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 40 0 32 8 A 11 10 124876 CASAVA_Build 6 159674515 1D66M1I CATGAACACC AAAAAAAAAAAATCATACACAACCTCAGAACTGCACCCTATGCACAAGACATTATTAGAAGAATTTG-/-AAAAAAAAAAATCATACACAACCTCAGAACTGCACCCTATGCACAAGACATTATTAGAAGAATTTGA ACCTGGTAGT 3070 hom 14 het 51 1 68 16 N/A 0 0 124877 CASAVA_Build 6 159679004 2D CACAATAGAC TA/-- TATGCACTGT 3070 hom 78 het 37 0 27 11 TA 2 1 124878 CASAVA_Build 6 159679065 1D ACGTGGGCTT C/- CACCAGGGCT 3070 hom 119 het 47 0 36 12 C 2 1 124879 CASAVA_Build 6 159680506 4D4M1D TGAGACACCA CAGGTGACA/----TGAC- AAATATTCAA 3070 hom 78 het 27 0 27 2 N/A 0 0 124880 CASAVA_Build 6 159682152 1D TATGTTAGAA C/- AAAAAACAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 6 C 1 0 124881 CASAVA_Build 6 159682346 1D TTCTTGCAAC A/- AAATTAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 4 3 124882 CASAVA_Build 6 159682664 2D AGGAGTTCAG GA/-- GACCAGCCTG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 GA 2 1 124883 CASAVA_Build 6 159685016 1D CTCATCAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 33 1 26 7 A 11 10 124884 CASAVA_Build 6 159685211 1I GACAAAAAAA -/T AATAGATTCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 124885 CASAVA_Build 6 159685371 5I TTTTCCAAAG -----/GAAAA GAAATCAGTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 GAAAA 0 1 124886 CASAVA_Build 6 159723321 2I AAAAAATAAA --/AG AGGTAAATTT 3070 het 2825 hom 37 10 21 6 AG 1 2 124887 CASAVA_Build 6 159740679 1I TTAATGAAAA -/T TTTTATATTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 4 5 124888 CASAVA_Build 6 159768133 1D ATTTGCTTCC T/- TTTCTGCCAT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 4 3 124889 CASAVA_Build 6 159768869 1I GTTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2436 het 2436 ref 22 10 6 6 A 10 11 124890 CASAVA_Build 6 159772526 9I CACCTGCTTC ---------/AGGTGTGTG AGGTGGTGAG 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 AGGTGTGTG 0 1 124891 CASAVA_Build 6 159777059 1I TTTCTGCCAG -/A AAAAATCTGT 3070 hom 112 het 40 0 37 3 A 5 6 124892 CASAVA_Build 6 159778563 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 9 8 124893 CASAVA_Build 6 159790701 1D AACCAATAGC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 9 8 124894 CASAVA_Build 6 159792562 4I17M4I TCTCTCACAT ----AGACACACGCACACACA----/AAACAGACACACGCACACACACTCT CTCTCTCATA 3070 hom 87 het 32 0 30 5 N/A 0 0 124895 CASAVA_Build 6 159802635 1I AGCAGATTTA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 8 124896 CASAVA_Build 6 159803298 2D TCCTGAAGCC TG/-- TGTCTCTTCA 3070 hom 90 het 34 0 28 9 TG 2 1 124897 CASAVA_Build 6 159803971 1D TGGTTTTGGT G/- CCCGTCTTTG 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 G 1 0 124898 CASAVA_Build 6 159804652 1D AATGGAGGGA T/- TACTGCCCCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 1 124899 CASAVA_Build 6 159806475 1D GTAGCTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 26 1 21 4 T 11 10 124900 CASAVA_Build 6 159806611 1D TTTTCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 19 8 T 13 12 124901 CASAVA_Build 6 159807856 4D GAAAGGAAGG AAGA/---- AAGAAAGAAA 193 hom 6 het 5 0 2 4 AAGA 4 3 124902 CASAVA_Build 6 159807901 4D AGAAAGAAAG AAAC/---- AAACAAACAA 2708 hom 64 het 26 0 21 6 AAAC 3 2 124903 CASAVA_Build 6 159811412 1I TTCATGATCA -/C TCCTTCCCAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 0 1 124904 CASAVA_Build 6 159811686 1I CCTGTAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 8 9 124905 CASAVA_Build 6 159819608 1I AAATTAAGAG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 6 7 124906 CASAVA_Build 6 159819972 2I CCTAAAAGGG --/AA AGAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 1 3 124907 CASAVA_Build 6 159820279 1D TAAAAAAAAA T/- CTCAAAATTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 1 0 124908 CASAVA_Build 6 159825698 1I AAGATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 10 11 124909 CASAVA_Build 6 159827142 1D TAAATTATGC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 A 8 7 124910 CASAVA_Build 6 159830424 1D TGTAGGGGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 15 16 7 T 10 9 124911 CASAVA_Build 6 159841475 1I AGTAAATACC -/A CTTAGAAAGA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 0 1 124912 CASAVA_Build 6 159841803 13D GAGCTAAAGC CTGCAACATTGAG/------------- CTTACTACAC 3070 het 3070 ref 42 25 14 6 CTGCAACATTGAG 1 0 124913 CASAVA_Build 6 159842657 1D TTCTGCAGAT G/- GTCTAAGTTC 3070 hom 126 het 52 0 43 10 G 2 1 124914 CASAVA_Build 6 159865391 1I GGTTCATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 377 hom 37 1 33 3 T 9 10 124915 CASAVA_Build 6 159936927 1I AGGTGACCTA -/C CTGCCTCAGC 3070 het 2711 hom 24 6 12 6 C 1 2 124916 CASAVA_Build 6 159951773 1I GTGACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2902 het 2902 ref 37 21 8 8 A 10 11 124917 CASAVA_Build 6 159951851 4D AGACGAAGGC TAGT/---- TAGCAAAGCT 3070 het 3070 ref 43 25 12 9 TAGT 1 0 124918 CASAVA_Build 6 159959515 1I AGATACCAGC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 7 8 124919 CASAVA_Build 6 159961543 1D TTCATTTGGC T/- TTTTTTTTTT 2224 het 2224 ref 44 33 5 6 T 11 10 124920 CASAVA_Build 6 159970500 1I TCTGATTAGC -/T TTTCCAGGCC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 3 4 124921 CASAVA_Build 6 159975959 1I TACAAAAGAT -/A AAAAAAAAAT 2729 het 2122 hom 13 5 6 2 A 9 10 124922 CASAVA_Build 6 159978996 4I TGCTTTTAAG ----/CAAA CAGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 CAAA 0 1 124923 CASAVA_Build 6 159992911 2I CTGATATATG --/TA TATATATGTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TA 3 4 124924 CASAVA_Build 6 159998002 1I CAGGTTATCT -/A AAAGTTAAGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 3 4 124925 CASAVA_Build 6 160004218 2I AGAAACTGTA --/AT ATATATATAT 2057 het 2057 ref 21 10 6 5 AT 7 8 124926 CASAVA_Build 6 160004354 2I AGAAACTGTG --/AT ATATATATAT 797 het 797 ref 14 8 2 4 AT 6 7 124927 CASAVA_Build 6 160006502 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 266 hom 13 1 11 1 A 13 12 124928 CASAVA_Build 6 160007958 6D GTGAAAGGAA GTCTTG/------ CAAAAGTCAT 3070 hom 45 het 16 0 13 3 GTCTTG 1 0 124929 CASAVA_Build 6 160008942 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 20 1 13 6 A 15 14 124930 CASAVA_Build 6 160012152 4D GCTCAAGGAG GCCT/---- GCCTGCCTGC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 GCCT 4 3 124931 CASAVA_Build 6 160020892 1D CAAGTGTTCT G/- CCTGCCTTGG 3070 het 3070 hom 27 10 12 6 G 1 0 124932 CASAVA_Build 6 160031644 1I TTACAAACAG -/T TTTTTTATAG 3070 hom 53 het 24 0 18 6 T 6 7 124933 CASAVA_Build 6 160032749 1D AGCTCTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 12 14 13 A 13 12 124934 CASAVA_Build 6 160038373 3I AATTGGTTGT ---/ACC AACCTGTCCT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 ACC 0 1 124935 CASAVA_Build 6 160040857 4I CTACTCGGAG ----/CAGC CAGCCAAAAT 3070 het 3070 ref 47 26 16 6 CAGC 1 2 124936 CASAVA_Build 6 160044428 1D GCTTTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 33 1 26 6 T 13 12 124937 CASAVA_Build 6 160051875 1I ATAACCACCT -/C CATAACCACC 362 het 362 ref 70 53 3 14 C 1 2 124938 CASAVA_Build 6 160060045 1I AGACTTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 T 10 11 124939 CASAVA_Build 6 160064774 4D GAACTAGGAC TTTT/---- TTTTGCAGTT 3070 het 3070 ref 42 18 18 7 T 8 4 124940 CASAVA_Build 6 160069450 2I AACAAAACAA --/AC AACAAAAAAA 3070 het 154 hom 34 3 18 13 AC 0 1 124941 CASAVA_Build 6 160070603 2I TTGAAAAATC --/TG TATAGCATTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TG 0 1 124942 CASAVA_Build 6 160072982 4I AGAATATGGA ----/TACC TACCTGTCTT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 TACC 1 2 124943 CASAVA_Build 6 160074489 1D AAAAAATTAC A/- AAAAATTAAC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 6 5 124944 CASAVA_Build 6 160079854 1D AGTTTACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 12 11 124945 CASAVA_Build 6 160085554 1I CAGTCCTGTT -/C CTGTTTCTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 1 2 124946 CASAVA_Build 6 160088911 4I TGAGTAACCT ----/TAAA TAAATAGTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TAAA 1 2 124947 CASAVA_Build 6 160091108 2D TTTGTGTGAC TT/-- TTCAGCAAGA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 4 2 124948 CASAVA_Build 6 160091869 2I AGGCAATCCC --/CT GTCTGGAATA 3070 hom 56 het 21 0 18 3 CT 0 1 124949 CASAVA_Build 6 160093682 1D TTAAGTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 A 10 9 124950 CASAVA_Build 6 160099278 1D GGCTGCTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 476 hom 34 3 21 12 A 14 13 124951 CASAVA_Build 6 160100257 1I TAATTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 4 5 124952 CASAVA_Build 6 160100682 1I ACAGAGCGAG -/A CTCCGTCTCA 3070 hom 31 het 23 0 9 14 A 0 1 124953 CASAVA_Build 6 160106702 3D AATGCGCCCC CCT/--- CCCCCGGCCT 2179 het 21 hom 17 1 6 10 CCT 1 0 124954 CASAVA_Build 6 160121435 1I AAATCGGTAT -/A AACTTTACAA 3070 het 3070 ref 57 26 21 10 A 2 3 124955 CASAVA_Build 6 160125330 1D ACATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1396 het 1396 ref 21 9 5 7 T 15 14 124956 CASAVA_Build 6 160126120 4D AGCATTACTC CTCT/---- CTATTGATAT 3070 het 3070 ref 42 26 12 5 CT 3 1 124957 CASAVA_Build 6 160127327 1D CATCATCTTT C/- CTCTTAAAGT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 2 1 124958 CASAVA_Build 6 160128615 5D AATGTGTAAC TTCTT/----- TTGTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 17 22 4 TTCTT 1 0 124959 CASAVA_Build 6 160131636 3D GGTTTTGGGG GTT/--- GTTCTCGGTT 2166 het 2166 ref 27 14 8 5 GTT 2 1 124960 CASAVA_Build 6 160134398 1I TTTTTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 10 11 124961 CASAVA_Build 6 160136475 13D GGTGATGACT CTTAACGAGCATG/------------- CTGCCTTCAA 1930 hom 10 het 4 0 4 0 CTTAACGAGCATG 1 0 124962 CASAVA_Build 6 160141270 11D GACGGAAGCG CGTGGGCAGCA/----------- CGTGGGCAGC 3070 hom 63 het 29 0 16 15 CGTGGGCAGCA 2 1 124963 CASAVA_Build 6 160152912 6D GTTTTTTTTG TTTTGT/------ TTTGTTTTGT 3070 het 917 hom 26 6 12 10 TTTTGT 1 0 124964 CASAVA_Build 6 160153479 1D ACAGAGCACT G/- GGGGGGAGGG 3070 hom 86 het 36 0 28 9 G 7 6 124965 CASAVA_Build 6 160154058 3D GGGGAAAAAA AAC/--- AACAACTGAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 AAC 3 2 124966 CASAVA_Build 6 160162460 1D TGGGTATTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 G 1 0 124967 CASAVA_Build 6 160166200 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1583 hom 17 4 9 4 A 15 14 124968 CASAVA_Build 6 160168312 2D TTCAATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 19 3 11 5 T 16 14 124969 CASAVA_Build 6 160170513 1D CTTTTTACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 26 9 T 11 10 124970 CASAVA_Build 6 160179335 2I GTAGTAAGGA --/AG AGTTGGTCAA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 AG 1 2 124971 CASAVA_Build 6 160182624 1I TGCTCAAAAA -/C AAAAAAAAAG 3070 hom 94 het 36 0 31 5 C 0 1 124972 CASAVA_Build 6 160187819 1I ATGGTATTTT -/G TTAAACTTAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 0 1 124973 CASAVA_Build 6 160195015 1I TTTGTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 10 11 124974 CASAVA_Build 6 160195963 1I AATATAGTAA -/G TGTTCAAAAA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 G 0 1 124975 CASAVA_Build 6 160200409 1D GACCCCCCCC T/- CTACAAAAAG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 T 1 0 124976 CASAVA_Build 6 160204241 1I TTAGTGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1137 hom 37 3 26 8 T 14 15 124977 CASAVA_Build 6 160205904 3D TTAAAGTATT ATA/--- ATAATAATAA 3018 hom 21 het 9 0 8 1 ATA 6 5 124978 CASAVA_Build 6 160207091 3D ACAATGCGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 35 1 17 17 T 18 15 124979 CASAVA_Build 6 160211115 1I TATAAAAGGT -/C CTTTTTCTCT 3070 hom 135 het 54 0 45 9 C 1 2 124980 CASAVA_Build 6 160214325 3D AATCAATTAT GAG/--- GGGGGTGGGG 1455 het 50 hom 22 1 6 15 GAG 1 0 124981 CASAVA_Build 6 160218037 1I TTTTCTGGAC -/A TTTTTTTATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 124982 CASAVA_Build 6 160218343 1D CTGGTGGTCA G/- GGAGACCACT 3070 hom 72 het 35 0 23 12 G 3 2 124983 CASAVA_Build 6 160237182 2D AATACAAAAA CT/-- CAGCTGGCAT 3070 hom 78 het 32 0 26 7 CT 1 0 124984 CASAVA_Build 6 160250000 1D CTCCTGAGGC T/- TTTTTTTTTT 991 het 991 ref 41 21 4 16 T 15 14 124985 CASAVA_Build 6 160253632 1I ATATGGGAAA -/C AAAAATCCTT 3070 hom 100 het 39 0 34 5 C 0 1 124986 CASAVA_Build 6 160311189 2D CGAGGGCTGT TC/-- ACCTCGCGCA 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 TC 1 0 124987 CASAVA_Build 6 160315277 5D GAAAGGAACA TCTTT/----- TCTTGTATTT 3070 het 3070 ref 47 28 17 4 TCTTT 1 0 124988 CASAVA_Build 6 160327255 1D GCTGCAGAAC T/- TTTTTTTTTT 1147 het 1147 ref 21 7 3 11 T 17 16 124989 CASAVA_Build 6 160347968 1I TCTAATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2135 hom 28 9 13 6 A 12 13 124990 CASAVA_Build 6 160351008 4I TATTGAGACC ----/TTAA CAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 38 23 15 0 TTAA 0 1 124991 CASAVA_Build 6 160365259 4D CATGAGATGA TAGC/---- TAGGGGAATG 3070 het 3070 ref 68 35 26 10 TAGC 1 0 124992 CASAVA_Build 6 160385477 4D GTCACTTCTT TGTC/---- TGCGTGATGA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 TGTC 1 0 124993 CASAVA_Build 6 160416165 4D TGCACACACA CATT/---- CATCACATAC 3070 het 3070 ref 42 21 17 7 CATT 1 0 124994 CASAVA_Build 6 160417837 2D AGCTGCAGAA AT/-- ATTAATATGT 3070 het 3070 hom 47 18 27 2 AT 2 1 124995 CASAVA_Build 6 160452260 1I TTACATGCGG -/T TTTTTTTTTT 2469 het 2469 ref 27 14 7 6 T 10 11 124996 CASAVA_Build 6 160504035 1I ACCCCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 12 13 124997 CASAVA_Build 6 160504765 1D AGGGTGACCC G/- GCTGGAAGGC 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 G 2 1 124998 CASAVA_Build 6 160505021 2I ACCAAGAAAC --/AG GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 AG 0 1 124999 CASAVA_Build 6 160505507 1D GCATTCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1529 hom 19 6 10 3 T 14 13 125000 CASAVA_Build 6 160516277 1D TTTGTATGAG A/- AAAAACATGT 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 A 6 5 125001 CASAVA_Build 6 160516544 1D ATGATCAGTT A/- AAAGAAAACC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 4 3 125002 CASAVA_Build 6 160523057 1D TTTCTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 12 13 T 13 12 125003 CASAVA_Build 6 160535097 1I CCTGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 24 14 10 A 13 14 125004 CASAVA_Build 6 160535930 1I AAAAATCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 9 10 125005 CASAVA_Build 6 160542476 5I TCAAGATCTA -----/AAGAT AATAGGCATT 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 AAGAT 0 1 125006 CASAVA_Build 6 160547397 2I TGTTAAAAAG --/AT ATACCTGAGT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AT 1 2 125007 CASAVA_Build 6 160551391 1I TGTTCTTCCA -/T TTGTTTGTGT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 2 3 125008 CASAVA_Build 6 160553813 1D GATTATTTTG C/- CTGTTAATTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 2 1 125009 CASAVA_Build 6 160556851 9I GTGACCCACT ---------/GGTAGAGCC GTATAGGAAG 3070 hom 108 het 38 0 35 3 GGTAGAGCC 0 1 125010 CASAVA_Build 6 160565912 1I TGTTTAAAAC -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 8 9 125011 CASAVA_Build 6 160571846 1I GCTTCCTCCT -/A AGCCATGTCC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 1 2 125012 CASAVA_Build 6 160573596 1I ATGCCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 560 hom 22 2 13 7 A 10 11 125013 CASAVA_Build 6 160574038 1D CCTTTCCATC G/- TGGAAATCTA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 G 1 0 125014 CASAVA_Build 6 160577674 1D AGAAATCAAA C/- TTAACTGGTA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 1 0 125015 CASAVA_Build 6 160577862 1I TTAGAGGGTA -/C CAAACCCATG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 C 1 2 125016 CASAVA_Build 6 160582081 1I GTAAAAGGGC -/T TTGTGTTTTA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 2 3 125017 CASAVA_Build 6 160582826 1D CTATTGAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 10 9 125018 CASAVA_Build 6 160582900 4D62M1D CACAATATTT TATATATATATATATATACATAATTCCATTCATATTCTGTCATTCTTGTTTTGTATAAACCTTAAAT/----TATATATATATATACATAATTCCATTCATATTCTGTCATTCTTGTTTTGTATAAACTTTAAA- TTTTTTTTAA 3070 het 51 hom 19 1 16 20 N/A 0 0 125019 CASAVA_Build 6 160583643 1I AAAAAAGATA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 8 9 125020 CASAVA_Build 6 160586651 1I TAATTTCTTA -/C CCGTCCTGAG 3070 hom 57 het 21 0 17 4 C 2 3 125021 CASAVA_Build 6 160596307 1D CCACTTTTAT C/- CCTCTTCCCT 3070 hom 108 het 38 0 35 3 C 3 2 125022 CASAVA_Build 6 160601049 4D GTCTTCATTC TGAA/---- TGAAGGCTCC 3070 hom 114 het 41 0 38 5 TGAA 2 1 125023 CASAVA_Build 6 160607906 4I TATATATAAT ----/AGAG AGAGACAGAG 3070 hom 89 het 37 0 29 9 AG 2 4 125024 CASAVA_Build 6 160619596 1I AGCAATTCCA -/T TCTTCCAGTT 3070 het 3070 ref 41 24 10 7 T 1 2 125025 CASAVA_Build 6 160621732 1D CTTTCTCCAC T/- GAAATGCCTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 T 1 0 125026 CASAVA_Build 6 160622685 5I61M1D TAATTAAGTC -----GTCTGAAAATAAAGAAAAATTAGTTTTCCCTTTCCAGTCTAGATATTTTTTCTTTTTCTCGC/AAGTTGTCTGCAAATAAAGACAAATTAGTTTTCCCTTTCCAGTCTAGATATTTTTTCTTTTTCTCG- CTGAGTGAGC 3070 het 3070 ref 25 30 20 1 N/A 0 0 125027 CASAVA_Build 6 160623346 1D AGAATTCATC A/- AATGAAGACA 3070 het 3070 hom 49 22 25 2 A 3 2 125028 CASAVA_Build 6 160624821 4I TTTAATGTAA ----/TTAT TTATATAGTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TTAT 1 2 125029 CASAVA_Build 6 160625082 1I TTTTTCTTCT -/C TCAGGTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 C 0 1 125030 CASAVA_Build 6 160625411 1D AGGAAGGTTA C/- CCCTGGCATT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 C 4 3 125031 CASAVA_Build 6 160626256 1D CAGTTTATAG T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 T 7 6 125032 CASAVA_Build 6 160637236 10D TACCTCTAAA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 59 27 16 20 TG 13 8 125033 CASAVA_Build 6 160637310 5D CTATTCTACA TTACT/----- AGGGAGGGGT 3070 het 3070 ref 43 20 18 7 TTACT 1 0 125034 CASAVA_Build 6 160637390 1D CCCATATTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 22 12 7 T 10 9 125035 CASAVA_Build 6 160638169 4D TTCACATATT TATC/---- TGTTGATGGA 3070 het 3070 ref 58 28 27 4 TATC 1 0 125036 CASAVA_Build 6 160640209 10D GCGCACACAT GGGCACACAC/---------- ATACACACAT 161 het 161 ref 24 9 3 16 GGGCACACAC 1 0 125037 CASAVA_Build 6 160640401 12I24M6I ATACGCACAT ------------ATACACACATACATACCCCCCCAC------/ATACACACATACATACACACATACATACCCCCCCACACACAG ACACATATAT 3070 het 639 hom 52 8 15 42 N/A 0 0 125038 CASAVA_Build 6 160640735 3I GACTGGCGTC ---/CTT CTGAGGAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 CTT 0 1 125039 CASAVA_Build 6 160642224 1I TTTTTGTATG -/T TTTCTCTTCC 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 3 4 125040 CASAVA_Build 6 160645154 1D GTTGGCTTGA T/- TTTTTTTTTT 2987 het 1009 hom 25 5 11 9 T 17 16 125041 CASAVA_Build 6 160646412 4D AAACGAATGA AAGG/---- AAGGAAGGAA 2979 het 2978 ref 35 12 12 11 AAGG 5 4 125042 CASAVA_Build 6 160648266 4D CAAACATCAA TTGT/---- TTGTTTGTGA 3070 het 3070 hom 38 13 24 6 TTGT 3 2 125043 CASAVA_Build 6 160649470 1D ATACAAAAAA C/- AAAATTAGCC 1259 het 1259 ref 16 7 5 6 C 1 0 125044 CASAVA_Build 6 160651459 4D CATTTATGAT TTTG/---- TTTGAGTATT 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 TTTG 2 1 125045 CASAVA_Build 6 160651732 3I TATTTTTCAC ---/TTT TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 5 8 125046 CASAVA_Build 6 160652206 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTCT 772 het 772 ref 36 12 3 22 T 10 8 125047 CASAVA_Build 6 160653889 1I ATTTTTTCAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 T 9 10 125048 CASAVA_Build 6 160654310 1I TTATATCTTT -/C CCTTGATTTG 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 C 2 3 125049 CASAVA_Build 6 160658019 1I TGGAGTGGGG -/A CAAGCGGGTC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 0 1 125050 CASAVA_Build 6 160658804 1I TCCATTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 8 8 A 11 12 125051 CASAVA_Build 6 160659541 1D TTTTTGCCAG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 8 7 125052 CASAVA_Build 6 160659983 1D ACATATTTAT G/- GGGTAAAATT 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 G 4 3 125053 CASAVA_Build 6 160664550 5I CAATTAAATC -----/TCTTT TCTTTATAAA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 TCTTT 1 2 125054 CASAVA_Build 6 160668511 3I ATTATTATTG ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 TTA 4 5 125055 CASAVA_Build 6 160673346 2I TTTCCTCTCC --/CT CTCTCTCGCT 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 CT 3 4 125056 CASAVA_Build 6 160673462 1I TGTCAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 A 10 11 125057 CASAVA_Build 6 160677280 3D AAAAGTCTGC CAA/--- CAACACAAAC 3070 het 3070 ref 41 19 19 4 CAA 2 1 125058 CASAVA_Build 6 160686672 1D GACTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 11 10 125059 CASAVA_Build 6 160727015 1D TCTTATTTTG T/- TATTGTGCAT 3070 het 3070 hom 44 13 21 10 T 2 1 125060 CASAVA_Build 6 160738755 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1346 hom 24 9 8 7 A 17 16 125061 CASAVA_Build 6 160744802 4D AATGTCATCC ATCA/---- ATCACATCGA 3070 het 3070 hom 52 21 29 8 ATCA 2 1 125062 CASAVA_Build 6 160763797 1D AGCCAGAACC A/- AGAATATTTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 A 2 1 125063 CASAVA_Build 6 160764528 3D GTTTCCTGAC TTA/--- TTTTTAATGA 3070 het 739 hom 16 3 8 5 TTA 1 0 125064 CASAVA_Build 6 160791841 4I TGCAACACCC ----/CTGT CTAAGGTCTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 CTGT 0 1 125065 CASAVA_Build 6 160797812 9D TGGTGATGGT GGTGATGGC/--------- GGTGGTAGTG 1371 het 233 hom 31 4 9 31 GGTGATGGC 1 0 125066 CASAVA_Build 6 160808069 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 5 6 125067 CASAVA_Build 6 160815617 1I CCTTTAAATT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 8 9 125068 CASAVA_Build 6 160828661 1I ATTTTAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 T 10 11 125069 CASAVA_Build 6 160836225 1D CTTCTATGGA T/- TTTTTTTTTC 2668 het 2668 ref 40 29 6 6 T 10 9 125070 CASAVA_Build 6 160840168 1D AATCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 14 12 T 11 10 125071 CASAVA_Build 6 160853065 1D AAATGATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 14 11 T 12 11 125072 CASAVA_Build 6 160876280 3D21M3I18M3I42M6D AGTGATAATG GCAGTGGTGATGATGGTGGTGATG---GTGATAGTGATGATGGTG---GTGGTAATGTTAATGGTGATGGCAGTAGAATTGTGGTGATGGTGATGT/---GTGATGATGGTGGTGGTGATGATAGTGATGGTGATGATGGTGGTAGTGGTAATGATATTGGTGATGGTGGTGGAATTGTGATGGTGG------ TGGTAGTAGC 416 het 416 ref 37 112 2 9 N/A 0 0 125073 CASAVA_Build 6 160880863 1I GTGAGGAAAC -/T GAATCCTTCT 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 T 0 1 125074 CASAVA_Build 6 160886399 1I GTTTTTTTTG -/T CTTTTTTTTT 3070 het 2868 hom 34 13 18 3 T 0 1 125075 CASAVA_Build 6 160898945 1I GCATTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 1418 het 1416 ref 17 5 5 7 T 15 16 125076 CASAVA_Build 6 160932843 1D GAATGTCATT G/- GTTTGGACTA 3070 het 3070 hom 54 26 27 3 G 2 1 125077 CASAVA_Build 6 160933260 4D TGTGTATTTG TGTC/---- TGTCTGTCTG 3070 het 3070 ref 41 20 14 9 TGTC 4 3 125078 CASAVA_Build 6 160948716 2D GATGAAACAC TG/-- TCTCTCTAGA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 TG 1 0 125079 CASAVA_Build 6 160967473 2D GTTTTCAGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 TG 13 12 125080 CASAVA_Build 6 160984224 1D CATACAGTAA T/- TTTTTTCAAT 2584 het 2584 ref 27 20 6 1 T 7 6 125081 CASAVA_Build 6 160994523 7D TAGAACTCAA TAATGAG/------- TAATGAGTTC 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 TAATGAG 2 1 125082 CASAVA_Build 6 161010030 43D ATGATGGTGG TGCTGAGTAGTAATGATGGTGATGGTGGTGGTGGCTGTGGTGA/------------------------------------------- TGATGGTGGT 1504 het 1504 ref 58 52 5 8 TGCTGAGTAGTAATGATGGTGATGGTGGTGGTGGCTGTGGTGA 1 0 125083 CASAVA_Build 6 161027247 1D GATCAAAATC G/- GAATGTTTCA 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 G 2 1 125084 CASAVA_Build 6 161031947 1D ACAGGGACTA C/- CTTTCCTCGA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 C 2 1 125085 CASAVA_Build 6 161036118 1I ATGTTCCAAT -/A AAACTTGATT 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 3 4 125086 CASAVA_Build 6 161041935 1D TAGTAGAGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 18 9 8 2 T 9 8 125087 CASAVA_Build 6 161043962 4I ACAAATACTC ----/ACTT AGTTGCTTGG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 ACTT 0 1 125088 CASAVA_Build 6 161044116 1I CAAAGAAATC -/T AGACTTAGGA 2582 het 2582 ref 31 23 6 2 T 0 1 125089 CASAVA_Build 6 161055497 1I TGCACCCTTG -/A GCTCCCCACT 3070 het 3070 hom 49 18 22 9 A 0 1 125090 CASAVA_Build 6 161055658 12D TCCTGAGTCC TTATTGCCAATT/------------ TTATTGCCAA 3070 het 3070 ref 58 33 22 10 TTATTGCCAATT 1 0 125091 CASAVA_Build 6 161058485 1D TTAATTTCTC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 9 8 125092 CASAVA_Build 6 161067611 1I CTTTAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 10 11 125093 CASAVA_Build 6 161069358 2I CTTATATATT --/AA AAGAGTCAAT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 2 4 125094 CASAVA_Build 6 161070168 1I TAAGCACCTG -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 A 6 7 125095 CASAVA_Build 6 161074869 6D TCCACCTCAG AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2202 het 593 hom 18 4 5 11 A 22 16 125096 CASAVA_Build 6 161078989 1I ATTCCTCTTC -/A TTTAAATTTG 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 A 0 1 125097 CASAVA_Build 6 161086405 8I TTGAATTGAA --------/CCCTTTAC CCCTTTACCA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 CCCTTTAC 1 2 125098 CASAVA_Build 6 161088644 4I TGAAGAAAGG ----/TTTT TTTGTTTTTG 3070 hom 112 het 42 0 38 4 T 3 7 125099 CASAVA_Build 6 161094368 1D ACCCCACCAA T/- TTTTAAATGG 3070 het 3070 ref 27 14 8 6 T 5 4 125100 CASAVA_Build 6 161100353 4I TTTACCAAAT ----/AAAC AAAAGCTGAG 3070 het 3070 hom 52 24 26 2 AAAC 0 1 125101 CASAVA_Build 6 161103732 2I TATATTATAT --/AC ATATATATAC 3070 het 2544 hom 26 12 12 2 AC 0 1 125102 CASAVA_Build 6 161105035 1I GTATATAGAC -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 7 8 125103 CASAVA_Build 6 161107562 3D TCAGTGAAAA CAT/--- CATCTCATGT 3070 het 3070 ref 55 30 20 5 CAT 2 1 125104 CASAVA_Build 6 161107840 3I TTCTGCTGTT ---/AGA CTGTTTTTCG 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 AGA 0 1 125105 CASAVA_Build 6 161111091 1D30M3D TGTCAATAAA TTTTTTTTATCTTGATCTCATAGAATTAGAGAGT/-TTTTTTTATCTTGATCTCATAGAATTAGAG--- AGAATGGTGG 3070 het 3070 ref 38 34 14 5 N/A 0 0 125106 CASAVA_Build 6 161112094 3I TGTGCAATGG ---/TGA TGATTACTGA 3070 hom 135 het 53 0 45 8 TGA 1 2 125107 CASAVA_Build 6 161115635 4I GCAAATACTC ----/ACTT AGTGCTTGGG 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 ACTT 0 1 125108 CASAVA_Build 6 161120324 1D GACTCTAAAT A/- TGCCTTCCAT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 1 0 125109 CASAVA_Build 6 161121199 1I CAGGAAAAGT -/A AAACGGACTA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 3 4 125110 CASAVA_Build 6 161124009 1I CCAAATAGAT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 7 8 125111 CASAVA_Build 6 161124653 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAG AAAAAAAAAA 3070 het 504 hom 34 9 14 11 AAAAG 0 1 125112 CASAVA_Build 6 161124802 2I GTTTGGAGTT --/GA GAGAGAGCTC 3070 het 3070 ref 44 20 13 11 GA 3 4 125113 CASAVA_Build 6 161126719 1D TCCCAAACTC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 21 het 12 0 8 4 A 9 8 125114 CASAVA_Build 6 161128115 2D GTCATTTTCC TT/-- TTTTTCTGTC 3070 hom 80 het 32 0 25 8 T 7 5 125115 CASAVA_Build 6 161132856 1D CACAGCTGAG A/- AAAAAAAAAA 2908 het 2908 ref 33 18 8 8 A 12 11 125116 CASAVA_Build 6 161137206 1D TTTCTGGTGA C/- CACTAAAGGG 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 C 2 1 125117 CASAVA_Build 6 161149123 17D GGTAGCCAAA CCACCTTGGGCACAAGT/----------------- TGTCCAGACC 3070 het 3070 ref 27 16 10 4 CCACCTTGGGCACAAGT 1 0 125118 CASAVA_Build 6 161157089 3D ACCAGATACA CGG/--- ATACTTATGT 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 CGG 1 0 125119 CASAVA_Build 6 161157569 1I AGACTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 2293 het 1810 hom 20 5 9 6 A 15 16 125120 CASAVA_Build 6 161158423 1I TCAATGCACC -/A GTACTCCTGG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 0 1 125121 CASAVA_Build 6 161169965 1D AAAATTAACT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 A 9 8 125122 CASAVA_Build 6 161176855 5I AAATAAACCT -----/AAAAC AAACTATTCA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 AAAAC 0 1 125123 CASAVA_Build 6 161179760 2I ACTGCGTCTC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 A 9 11 125124 CASAVA_Build 6 161181219 7I AAGATTTTGT -------/GGGCCAC CATGCTGTGA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 GGGCCAC 0 1 125125 CASAVA_Build 6 161182222 2D TGTCATCTTG TC/-- TCTGAGTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 16 8 TC 2 1 125126 CASAVA_Build 6 161184737 1I CTCTGGGTTC -/A ACTGTCGTCT 3070 het 3070 hom 49 15 25 9 A 1 2 125127 CASAVA_Build 6 161185301 1I TACACTGATG -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 6 7 125128 CASAVA_Build 6 161189050 6D CAGTAAATGC AAACAT/------ AAATCGACAG 3070 het 3070 ref 40 25 14 4 AAACAT 1 0 125129 CASAVA_Build 6 161189373 3I CCAGATAAAA ---/GAC GATGGTGCAC 2658 het 2658 ref 29 18 7 4 GAC 0 1 125130 CASAVA_Build 6 161191803 1I CAGTGTACCC -/A GAAAATATAC 3070 het 3070 hom 28 15 11 2 A 0 1 125131 CASAVA_Build 6 161196619 2D GTCTTTTCTC TG/-- TATTCACTGT 3070 het 3070 ref 46 20 21 5 TG 1 0 125132 CASAVA_Build 6 161197871 1D TTCACCATCG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 41 21 14 9 T 8 7 125133 CASAVA_Build 6 161199235 23D GTTTTCACTG GGTTCACCATTGTGTTTTTTCTA/----------------------- GGTTCACCAT 3070 het 3070 ref 31 21 11 7 GGTTCACCATTGTGTTTTTTCTA 1 0 125134 CASAVA_Build 6 161202056 4I CACATCTGAG ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 TA 6 8 125135 CASAVA_Build 6 161202888 17I GGTTTTCAGC -----------------/CTCACTGGGAAGTCACA CTGTTGAGTC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 CTCACTGGGAAGTCACA 0 1 125136 CASAVA_Build 6 161202963 2I CAAGAAACTT --/TC TGATTATATC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 TC 0 1 125137 CASAVA_Build 6 161203868 1I ACAGTCAAAG -/A TATTGGTAGG 3070 het 3070 ref 57 27 26 4 A 0 1 125138 CASAVA_Build 6 161208341 1D ACTTTTTAAT G/- ATCGCCATTC 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 G 1 0 125139 CASAVA_Build 6 161212788 1D ATATGGAAAA T/- TTCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 3 2 125140 CASAVA_Build 6 161226756 3D GTCCAGGAAC GAA/--- GAAGGACAGC 3070 het 3070 ref 28 13 12 5 GAA 2 1 125141 CASAVA_Build 6 161227042 1I ATATTCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 10 11 125142 CASAVA_Build 6 161227462 1I ACTGAGATAA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 34 18 16 0 T 7 8 125143 CASAVA_Build 6 161237032 1D44M4I GCCAAAATTT AAAAAAAAAACACTAATTCATATATTTGTATATGCATTAAACAAC----/-AAAAAAAAACACTAATTCATATATTTGTATATGCATTAAACAACTCTA TCAAGTTAAT 3070 het 3070 ref 30 29 9 7 N/A 0 0 125144 CASAVA_Build 6 161239331 2D ACAGAAAGAA AG/-- AGAAAATTAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 AG 2 1 125145 CASAVA_Build 6 161239557 3I6M7I TTGATTTCCT ---GATTTC-------/GAAGAAATCAGGAGAA TCCTGTAGGT 3070 het 3070 ref 40 25 15 2 N/A 0 0 125146 CASAVA_Build 6 161249171 1I CTATGTCCAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 9 125147 CASAVA_Build 6 161249894 1I TTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 22 0 14 8 A 10 11 125148 CASAVA_Build 6 161249925 1D AAAGAAAGCT A/- TTTAGGTAGA 3070 het 2216 hom 22 5 9 8 A 1 0 125149 CASAVA_Build 6 161256491 1I AAAGTACTTT -/G GGGAAAAAAA 2360 het 2360 ref 29 18 7 4 G 3 4 125150 CASAVA_Build 6 161257117 2D65M1I GAAAAGAGAT ACATATATAGAGATATCTCTGTGTACTACGATCAGGTTGCACATATTCTGAGATTTATGTATTCTTA-/--ATATATAGAGAGATCTCTGTGTACTACGATCAGGTTGCACATATTCTGAGATTTATGTATTCTTAT TTAGTTCAAT 3070 hom 90 het 24 0 31 21 N/A 0 0 125151 CASAVA_Build 6 161268446 4D GGAGAAAATG CCCC/---- CCCCCCCACA 3070 het 98 hom 28 2 14 13 C 11 7 125152 CASAVA_Build 6 161269097 1D AACATTTTGA T/- AAGAAAATAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 T 1 0 125153 CASAVA_Build 6 161269879 1D TCAAGCTTTC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 9 8 125154 CASAVA_Build 6 161276541 1I CTTTGAGTTA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 T 6 7 125155 CASAVA_Build 6 161279123 1D TCATAGAATA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 7 6 125156 CASAVA_Build 6 161284744 1D TGATCCTCCC A/- CCTCAGCCTC 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 A 1 0 125157 CASAVA_Build 6 161288227 1D AATTGAGGGC A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 8 7 125158 CASAVA_Build 6 161290833 1I TACTGTTTCA -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 7 8 125159 CASAVA_Build 6 161293914 1I CAAGAAGGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 9 10 125160 CASAVA_Build 6 161299124 22D ATACACACAC TATATATATATATATATATATA/---------------------- TATATATATA 3070 het 124 hom 13 2 10 1 TA 18 7 125161 CASAVA_Build 6 161318687 1D GAGGCCACCT G/- GGGGAAATAT 3070 hom 73 het 28 0 24 4 G 5 4 125162 CASAVA_Build 6 161328880 1D CTGGATAAGG A/- AAATGAGGTA 3070 het 3070 ref 68 38 23 7 A 4 3 125163 CASAVA_Build 6 161330579 4D CAGCTCTACC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 1981 hom 33 10 16 8 A 16 12 125164 CASAVA_Build 6 161332151 1D AATTTCAACA G/- GATTTCTGTA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 G 2 1 125165 CASAVA_Build 6 161334758 1D CTTCAGTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 12 14 A 15 14 125166 CASAVA_Build 6 161334879 3I AAGAAGATCT ---/GAC CAATATTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GAC 0 1 125167 CASAVA_Build 6 161337140 1D4M3D AGTCTTGACC TTGTATGT/-TGAA--- CAACTGTTCT 3070 het 3070 ref 52 24 25 5 N/A 0 0 125168 CASAVA_Build 6 161344056 5D ATTTGATAAC ATGAT/----- ATAACATATG 3070 het 3070 hom 25 11 14 1 ATGAT 1 0 125169 CASAVA_Build 6 161344300 3I AAAGCATATT ---/CTC CTAAATTGTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTC 0 1 125170 CASAVA_Build 6 161344964 2D TCTTGAAAAT AA/-- GAGTTAATCT 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 A 2 0 125171 CASAVA_Build 6 161345136 1D ATATGTCCTG A/- ACATCTATCT 3070 het 3070 hom 45 19 21 6 A 2 1 125172 CASAVA_Build 6 161350011 1I CATCTGAACC -/T TTTTTTTTTT 1675 het 1675 ref 22 7 8 7 T 15 16 125173 CASAVA_Build 6 161351521 1D CTTTCAAATG T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 6 125174 CASAVA_Build 6 161367320 1I GCGCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1869 hom 12 het 8 0 5 3 T 11 12 125175 CASAVA_Build 6 161374573 4I TCCCCTGCAC ----/CTTG CTTGAGTTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 CTTG 1 2 125176 CASAVA_Build 6 161375595 1I TAAAGTTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 10 125177 CASAVA_Build 6 161378682 2I TCAGGTGATC --/CA CACCTGCCTC 3070 het 2356 hom 23 7 11 5 CA 1 2 125178 CASAVA_Build 6 161387556 1I AAAATAATAA -/T TAATAGTAGT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 1 2 125179 CASAVA_Build 6 161388302 1I GTCTCTACCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 16 0 13 3 A 11 12 125180 CASAVA_Build 6 161399780 2D GTCCTTGTAG AT/-- ATATATATAT 2387 het 2387 ref 27 13 5 9 AT 9 8 125181 CASAVA_Build 6 161400165 2I GATTGATTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 35 0 25 10 T 11 13 125182 CASAVA_Build 6 161403940 1I GTTTCTTAAC -/T TTACAGTTTC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 2 3 125183 CASAVA_Build 6 161423461 1D TGTTTCTATC T/- TTTGCTTGTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 4 3 125184 CASAVA_Build 6 161438804 1I CAGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 10 11 125185 CASAVA_Build 6 161446861 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 35 3 23 9 T 15 14 125186 CASAVA_Build 6 161452846 1D CAACTACTTC T/- TTTCTTTTTA 3070 hom 154 het 54 0 49 6 T 4 3 125187 CASAVA_Build 6 161453226 2D AGAACAACTC TT/-- TTGTTGTTTG 3070 het 3070 ref 58 27 24 8 T 4 2 125188 CASAVA_Build 6 161459720 1D GCAATTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 12 11 125189 CASAVA_Build 6 161460985 2D TATATACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 76 het 35 0 25 10 TG 9 8 125190 CASAVA_Build 6 161466422 1D CCTGAATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 11 10 125191 CASAVA_Build 6 161476024 4D CATTTGTATC AACA/---- AACAAACAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 5 AACA 3 2 125192 CASAVA_Build 6 161568907 1I9M1I GGGGGTGGTG -AAAGGAAGT-/AAAAGGAAGTA AACAACTTCC 3070 hom 78 het 27 0 27 3 N/A 0 0 125193 CASAVA_Build 6 161593667 13I CAACATGGTG -------------/AAACCCTGTCTCT ACAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 AAACCCTGTCTCT 0 1 125194 CASAVA_Build 6 161628377 1D GCAAGGAATT G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 100 het 48 1 44 3 G 6 5 125195 CASAVA_Build 6 161630217 3D GCAAGACTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 22 10 A 13 10 125196 CASAVA_Build 6 161630746 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 8 7 125197 CASAVA_Build 6 161635902 1I AAGGGCTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3016 hom 23 9 11 3 T 9 10 125198 CASAVA_Build 6 161637289 1I TAACAGTGTT -/A AACACGTATT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 2 3 125199 CASAVA_Build 6 161638793 1I AATTTAAAAA -/C TTTTGTGAGC 3070 het 2998 hom 24 8 11 5 C 0 1 125200 CASAVA_Build 6 161646701 2D TCCATCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 A 14 12 125201 CASAVA_Build 6 161646874 1D GAATAAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 9 8 125202 CASAVA_Build 6 161653996 1D TTTAAAACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 9 8 125203 CASAVA_Build 6 161656972 14D TGTATATATA TATATATGCGTGTG/-------------- TATATATATA 3070 het 3070 ref 23 13 10 2 TATATATGCGTGTG 1 0 125204 CASAVA_Build 6 161657476 2D28M4D TTTTAAGAGT AAAAAAAAAAAATTAAAAATAGAAAAAAGCTGAT/--AAAAAAAAAATTAAAAATAGAAAAAAGC---- TGATAGAATA 3070 het 3070 hom 27 12 17 4 N/A 0 0 125205 CASAVA_Build 6 161662136 3I TCTCTGTAAG ---/AAA AAAAAAATAT 643 het 643 ref 23 10 6 7 A 7 10 125206 CASAVA_Build 6 161668454 1I GTATAAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 10 11 125207 CASAVA_Build 6 161670497 1D AAGAAAGAAA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 1860 hom 24 7 11 7 G 1 0 125208 CASAVA_Build 6 161671008 1D AGTTCTGAAG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 T 9 8 125209 CASAVA_Build 6 161671515 1I CTGCAGCTGG -/A AAAAAAAAAA 2936 het 2936 ref 27 9 11 7 A 10 11 125210 CASAVA_Build 6 161680485 1D CTGTCTCTAG A/- AAAAAAAAAA 1329 het 1329 ref 25 14 5 7 A 15 14 125211 CASAVA_Build 6 161699385 3D TAATCCCAGC TTG/--- GCTTTGGGAG 3070 het 2643 hom 20 6 11 3 TTG 1 0 125212 CASAVA_Build 6 161705953 2D ACTTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1927 hom 21 7 9 5 A 16 14 125213 CASAVA_Build 6 161706185 6D GAAAGGCAAG AAGTAA/------ AAGTAAAACT 3070 het 3070 ref 35 21 13 5 AAGTAA 2 1 125214 CASAVA_Build 6 161712505 1I TATTTTTTTT -/A AAGAGAAATC 2587 het 2587 ref 18 8 8 2 A 2 3 125215 CASAVA_Build 6 161714637 1I TGAGTTAAAT -/G GGCCATGCCT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 G 2 3 125216 CASAVA_Build 6 161733794 1I GGTATAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 11 12 125217 CASAVA_Build 6 161742647 1D ACTCCCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 A 12 11 125218 CASAVA_Build 6 161760418 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1784 hom 20 4 13 3 T 11 10 125219 CASAVA_Build 6 161766126 2I TTAGGCATGA --/CT CTCTCTTTCT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 CT 3 4 125220 CASAVA_Build 6 161775038 1I AAACTCCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 177 hom 23 1 20 2 A 9 10 125221 CASAVA_Build 6 161775340 2D GTGTCTGCTT AA/-- AGTTTTCTGT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 3 1 125222 CASAVA_Build 6 161780726 1I GGAAGCTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 T 9 10 125223 CASAVA_Build 6 161793122 2I GGATTACAGG --/CA CGCACCACCA 3040 het 3040 ref 19 10 7 2 CA 0 1 125224 CASAVA_Build 6 161797642 6I CCTGACTAAT ------/ACATCC AATCTCCCAC 3022 het 3022 ref 33 23 7 3 ACATCC 0 1 125225 CASAVA_Build 6 161799936 1D CATTTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 11 10 125226 CASAVA_Build 6 161806503 1I CTTTTGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 11 11 T 13 14 125227 CASAVA_Build 6 161807085 2D TAGTTATCTT TG/-- TGTGTGTGTG 1100 het 1100 ref 44 34 3 7 TG 10 9 125228 CASAVA_Build 6 161817212 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 13 14 125229 CASAVA_Build 6 161819539 3I TAACTCTCAA ---/AAT AATAGCTGTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AAT 1 2 125230 CASAVA_Build 6 161827271 1I CAGTTATGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 9 125231 CASAVA_Build 6 161830255 2I TTCATACTGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1082 hom 23 4 12 7 A 11 13 125232 CASAVA_Build 6 161830671 1D TACTTGGAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 10 9 125233 CASAVA_Build 6 161831331 12D ACTTTTCTTT CTTGCTTGCTTG/------------ CTTGCTTGCT 2681 het 23 hom 33 1 14 18 CTTG 7 4 125234 CASAVA_Build 6 161832659 2D CTTAACTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 17 13 T 12 10 125235 CASAVA_Build 6 161833164 3D TGAAAGCACT TTG/--- TTAAGACCTA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 TTG 1 0 125236 CASAVA_Build 6 161840138 2I CAGGGTCTGG --/AC ACACACACAC 2944 het 76 hom 38 2 21 15 AC 8 9 125237 CASAVA_Build 6 161841887 1D TTTAGTTTAG T/- TTTTTTTTTT 1490 het 396 hom 25 2 15 8 T 11 10 125238 CASAVA_Build 6 161842594 1D TGTTGAATGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 T 9 8 125239 CASAVA_Build 6 161845550 5I TGAAACTTTC -----/TTTTT TTTTTTATTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 6 11 125240 CASAVA_Build 6 161850223 2D AAGACTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 24 1 20 4 T 14 12 125241 CASAVA_Build 6 161850659 2D CTCAACACTT GG/-- TGAGAGGCCG 3070 hom 33 het 17 0 10 7 G 2 0 125242 CASAVA_Build 6 161853315 1D AAGGAAATGA C/- CCCCCCCTGA 3070 hom 30 het 24 0 11 13 C 8 7 125243 CASAVA_Build 6 161854496 4D TCTCCTGACC TCGT/---- TCGTGATCTG 3021 hom 27 het 13 0 8 6 TCGT 2 1 125244 CASAVA_Build 6 161860454 1I GTCTAGCAAT -/G TTGATTAGTA 3070 hom 138 het 57 0 44 13 G 0 1 125245 CASAVA_Build 6 161862244 1D TAAGAGAGTG A/- CAAACAGTGA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 1 0 125246 CASAVA_Build 6 161876384 1I TGTTAGAAAT -/A AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 6 7 125247 CASAVA_Build 6 161880582 1D TCTACCTAAT A/- ATAATTATTG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 2 1 125248 CASAVA_Build 6 161890141 6D AAATAATGCA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 2407 het 1781 hom 23 8 9 8 TG 11 8 125249 CASAVA_Build 6 161891714 1I AGGCGGGTAG -/C GGGTGGGGAC 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 C 0 1 125250 CASAVA_Build 6 161893416 5I3M4I6M2D GTTCACCTCC -----ACC----TATGACTG/CGCATACCCGCATATGAC-- TGAATGATCT 1185 het 1185 ref 40 28 3 14 N/A 0 0 125251 CASAVA_Build 6 161896446 2D TGCTGTTGCT CA/-- GTTTTACATG 3070 het 3070 hom 33 10 23 1 CA 1 0 125252 CASAVA_Build 6 161909609 3D AGCAAGACTC CTT/--- CTCAAAAAAT 3070 het 1076 hom 19 3 16 3 CTT 1 0 125253 CASAVA_Build 6 161909995 2D AAAACCTGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 47 2 30 17 A 16 14 125254 CASAVA_Build 6 161914276 11D TAGTGTCAGT AAAATGACAGC/----------- CTCTGGCGTA 3070 hom 75 het 25 0 26 0 AAAATGACAGC 1 0 125255 CASAVA_Build 6 161929409 1D TCCCCTCGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 38 1 31 6 A 12 11 125256 CASAVA_Build 6 161935756 1I ACTGAATAAC -/T TGAACAACTA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 1 2 125257 CASAVA_Build 6 161960348 1D GCTAAGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 26 1 17 8 T 15 14 125258 CASAVA_Build 6 161978735 3D TTTTATCCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 A 17 14 125259 CASAVA_Build 6 161988618 1D CTTGTCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 11 10 125260 CASAVA_Build 6 161988873 5D ATAATTTATT AAAAC/----- AAAATAAGAG 3070 het 3070 hom 43 17 23 7 AAAAC 1 0 125261 CASAVA_Build 6 161993383 6D GAACACCATT AATTTA/------ AATTTAAAGC 3070 het 3070 ref 27 12 14 2 AATTTA 2 1 125262 CASAVA_Build 6 161995027 1D ATAAAATGCA T/- TTTTTTTTTA 2991 het 2991 ref 22 12 7 3 T 10 9 125263 CASAVA_Build 6 161999228 1D TTAAATTGTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 T 9 8 125264 CASAVA_Build 6 162028665 5I TTTTAATAGA -----/GACGG GACGGGGTGT 1286 het 1286 ref 9 5 3 1 GACGG 1 2 125265 CASAVA_Build 6 162030973 2D CTCAAGGGAT AC/-- ACGCCCGCCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AC 2 1 125266 CASAVA_Build 6 162035821 4D AATGCAAACT AAGG/---- AAGAATTCTC 3070 het 3070 hom 44 19 21 6 AAGG 1 0 125267 CASAVA_Build 6 162047619 1I TCCAGGTGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 656 hom 49 3 36 10 T 9 10 125268 CASAVA_Build 6 162048309 2D AGAGAAAGAC AG/-- AGATTAATTC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 AG 2 1 125269 CASAVA_Build 6 162048747 5I TTTTGTACTC -----/TCTTT TAAGATCAGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TCTTT 0 1 125270 CASAVA_Build 6 162049484 3D TTGATTTCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 31 2 19 12 A 17 14 125271 CASAVA_Build 6 162051140 1D AATTCCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 39 0 33 6 A 11 10 125272 CASAVA_Build 6 162051864 27D CCTTCCCCCT TTCCTTCTTCCCTTCCCTTCCCTTTCC/--------------------------- TTCCTTCCTT 3070 hom 32 het 11 0 9 5 TTCCTTCTTCCCTTCCCTTCCCTTTCC 1 0 125273 CASAVA_Build 6 162063267 1D TAATGCCCCC A/- GCATACAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 A 1 0 125274 CASAVA_Build 6 162093405 1D ACAAAAAAAC A/- AAACAAAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 4 3 125275 CASAVA_Build 6 162098985 2I ATACAGTTAA --/AT ATATATATAT 2029 het 357 hom 8 1 6 1 AT 8 9 125276 CASAVA_Build 6 162100523 9D TTGTGTCTTC AGTATTTCT/--------- AGTATTTCTA 3070 hom 111 het 39 0 38 7 AGTATTTCT 2 1 125277 CASAVA_Build 6 162101097 2D GCTCGTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 809 hom 39 7 17 16 A 14 12 125278 CASAVA_Build 6 162109100 1D TCTAATTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 T 12 11 125279 CASAVA_Build 6 162118929 2I TACATATATA --/CT TGTGTATATA 1725 het 1252 hom 7 3 4 0 CT 0 1 125280 CASAVA_Build 6 162124299 1D ATTTGTACTT A/- AAAAAAAAAA 1588 het 1588 ref 44 33 5 6 A 12 11 125281 CASAVA_Build 6 162127934 1I TACTCTGTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 10 125282 CASAVA_Build 6 162150331 1I AATTACCACT -/G TGGGGCTGGG 3070 hom 123 het 44 0 41 3 G 0 1 125283 CASAVA_Build 6 162157750 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1555 hom 22 7 11 4 A 15 14 125284 CASAVA_Build 6 162159353 1D CTTGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 35 4 18 13 T 14 13 125285 CASAVA_Build 6 162161226 1D CACCATTGAA T/- AAAAATTCAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 1 0 125286 CASAVA_Build 6 162162464 4D ATAAAAGGGA TTTT/---- TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 10 6 125287 CASAVA_Build 6 162163143 4D TCTCTAATAT TCAC/---- TCACTCAGTC 3070 het 3070 hom 33 14 17 5 TCAC 2 1 125288 CASAVA_Build 6 162188616 1I AGTCTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 T 11 12 125289 CASAVA_Build 6 162196629 3D TACTGACAAC AAT/--- GTTATGCTAT 3070 het 3070 ref 40 22 10 10 AAT 1 0 125290 CASAVA_Build 6 162199988 8D GGTTCAAGCG ATTCTCCT/-------- ATTCTCCTGC 1721 het 1721 ref 14 7 5 5 ATTCTCCT 2 1 125291 CASAVA_Build 6 162204348 2I TGGATTTATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 11 13 125292 CASAVA_Build 6 162205826 3I TTACAGTCGC ---/CCA CCACCACACC 3070 hom 69 het 24 0 23 1 CCA 2 3 125293 CASAVA_Build 6 162228659 1I TTAATACAAA -/T TATCTTTACT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 1 2 125294 CASAVA_Build 6 162233002 1D ATGGTTTACG A/- AATTCCCAAT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 3 2 125295 CASAVA_Build 6 162247687 12D CATACATATA TATATATATATG/------------ TATATATGAG 3070 hom 3 het 28 1 16 12 TATATATATATG 1 0 125296 CASAVA_Build 6 162249612 1D TGATTACAAG A/- AAAAAAAACG 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 9 8 125297 CASAVA_Build 6 162249689 1D CTTTTCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 11 10 125298 CASAVA_Build 6 162276124 11I AAAGTCTCTG -----------/GAGATTTCACA GTGCCCTTTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 GAGATTTCACA 0 1 125299 CASAVA_Build 6 162277811 1D TTGTTTCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2070 hom 31 7 13 11 T 15 14 125300 CASAVA_Build 6 162281304 1D AAAATATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 37 1 25 11 A 11 10 125301 CASAVA_Build 6 162286135 1I TAACTTTTTT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 132 het 47 0 44 3 A 8 9 125302 CASAVA_Build 6 162297597 4I AATTTTCAAG ----/ATAA ATAAAAGGAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATAA 1 2 125303 CASAVA_Build 6 162308305 1I TTTGGTAGGC -/A GCATCATTGC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 0 1 125304 CASAVA_Build 6 162327514 1D TGCAGTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 846 hom 33 3 12 18 T 17 16 125305 CASAVA_Build 6 162327815 1I AACAGCCAGA -/G CCTGAGAAAT 3070 het 3070 hom 50 21 17 12 G 0 1 125306 CASAVA_Build 6 162330300 2D ATATATATAT AC/-- ACCATCCAGG 3070 het 3070 ref 41 15 16 14 AC 2 1 125307 CASAVA_Build 6 162330785 1D TCCAGGGCCC T/- GACGATGGGC 2051 het 2000 hom 28 10 9 9 T 1 0 125308 CASAVA_Build 6 162331406 1D ACATCTGTAG A/- AAAAAGTAGT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 A 6 5 125309 CASAVA_Build 6 162335265 1I TGGTGTGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 15 23 11 A 12 13 125310 CASAVA_Build 6 162341875 1D AGATTTTTTT G/- TTTTTGCATG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 G 1 0 125311 CASAVA_Build 6 162342554 8I TTACTAACTA --------/GTTCCAGT GTTTGGGGGA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 GTTCCAGT 0 1 125312 CASAVA_Build 6 162343604 2D CAAATAACCA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 17 9 5 T 11 9 125313 CASAVA_Build 6 162346573 1D AAATTGGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 A 11 10 125314 CASAVA_Build 6 162347966 1I AAGAGCGCCA -/G GCACATTGTA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 G 1 2 125315 CASAVA_Build 6 162350402 1D AGAACACTGT A/- CAGAAATTAT 3070 het 3070 hom 51 19 24 8 A 1 0 125316 CASAVA_Build 6 162352929 5I GTGAGAACTT -----/TACTC TGGAGAAATA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TACTC 0 1 125317 CASAVA_Build 6 162355831 1I ACCTTTCGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 17 17 12 T 10 11 125318 CASAVA_Build 6 162357176 1I AAATAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 9 10 125319 CASAVA_Build 6 162361047 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 A 12 11 125320 CASAVA_Build 6 162362318 4I AACCACACTT ----/AAAC AAATGACTAA 1389 het 210 hom 5 1 3 1 AAAC 0 1 125321 CASAVA_Build 6 162375558 11D TTTCACTTAT AAAAATTACAC/----------- AAAACTTGAA 3070 het 3070 ref 35 22 15 1 AAAAATTACAC 1 0 125322 CASAVA_Build 6 162376187 2D CCAGAGAGAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 1619 hom 26 6 15 5 AT 7 6 125323 CASAVA_Build 6 162383473 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 12 13 125324 CASAVA_Build 6 162387927 1I CTTAACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 11 12 125325 CASAVA_Build 6 162389745 2I CTGATGAACT --/AA AAAAAAAAAA 3008 het 396 hom 29 2 19 8 A 16 18 125326 CASAVA_Build 6 162391497 1I ACCCCCTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 34 7 T 9 10 125327 CASAVA_Build 6 162397012 16D CACACACACT CAGGCATGCACGCACA/---------------- CAGGCATGCA 3070 hom 107 het 44 0 31 22 CAGGCATGCACGCACA 2 1 125328 CASAVA_Build 6 162400354 2I AGTAAAATAG --/AT ATGTTAGTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 1 2 125329 CASAVA_Build 6 162404635 24D GGTGCGATCT CCGCTCACTGCAAACTCTGCCTCC/------------------------ CAGGTTCAAG 3070 hom 66 het 21 0 21 5 CCGCTCACTGCAAACTCTGCCTCC 1 0 125330 CASAVA_Build 6 162404953 2D AAATGAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 101 het 42 0 34 8 AC 7 6 125331 CASAVA_Build 6 162405410 1D ATTTTGTAGA G/- TGTAAATTGT 3070 hom 105 het 39 0 36 5 G 1 0 125332 CASAVA_Build 6 162409289 1I TATCGACAGG -/T TTTTTCCAGG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 5 6 125333 CASAVA_Build 6 162412522 1D TCTCCAAAAG T/- TCCAATAGGA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 2 1 125334 CASAVA_Build 6 162415646 2D AAACTTAAAG TA/-- TATATATAAA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 TA 5 4 125335 CASAVA_Build 6 162417404 1I TAATTTGTTT -/C TAACATGGTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 0 1 125336 CASAVA_Build 6 162419895 10D ATAATTAATA CTTAATAATT/---------- AATAAATACT 1276 het 775 hom 12 3 5 5 CTTAATAATT 1 0 125337 CASAVA_Build 6 162424737 1D TCCACTTATC A/- ATTACACAGT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 2 1 125338 CASAVA_Build 6 162432135 2D CTTGCTATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 37 0 24 13 T 13 11 125339 CASAVA_Build 6 162437798 1I ATTTAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 10 11 125340 CASAVA_Build 6 162441622 1D CACCACCACA C/- CTAGATAACT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 2 1 125341 CASAVA_Build 6 162447422 1I AGTGAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 30 2 22 6 T 14 15 125342 CASAVA_Build 6 162489402 1I TAAGAGCTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 9 10 125343 CASAVA_Build 6 162494938 1D AAAGGGCAGC A/- TTCAATTGGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 0 125344 CASAVA_Build 6 162496824 1D TTCAGTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 20 6 A 14 13 125345 CASAVA_Build 6 162497105 1D TGGTTAGACT A/- AAATATTTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 4 3 125346 CASAVA_Build 6 162498026 1D ATCAATCTTT C/- CATTTCTAGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 2 1 125347 CASAVA_Build 6 162508634 1D ATAACAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 44 3 27 14 T 15 14 125348 CASAVA_Build 6 162514557 2D TTGATGCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 45 1 24 20 T 16 14 125349 CASAVA_Build 6 162515569 2I ATGATATGAA --/AC ACACAGTATT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 AC 2 3 125350 CASAVA_Build 6 162517629 1I GTAGTAAACT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 7 8 125351 CASAVA_Build 6 162517952 2I ATGAAATTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 33 1 27 5 T 14 16 125352 CASAVA_Build 6 162521487 2I GAAAGTCATC --/AG AGGTCTCGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AG 1 2 125353 CASAVA_Build 6 162527465 18D GGAGTGAGTG GAGATAATGTTTGAAGGT/------------------ GAGATAATGT 3070 het 3070 ref 44 16 16 17 GAGATAATGTTTGAAGGT 2 1 125354 CASAVA_Build 6 162530863 15D GCATGGTTCT CATTTGTTTGTAGCA/--------------- CATTATGGGA 3070 het 3070 hom 36 20 20 5 CATTTGTTTGTAGCA 1 0 125355 CASAVA_Build 6 162546785 1I CACACACACG -/T TACATAGCAT 3070 het 3070 hom 53 22 22 9 T 1 2 125356 CASAVA_Build 6 162645107 1I GTGAAGGGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 385 hom 42 1 38 3 A 9 10 125357 CASAVA_Build 6 162651783 1I ATATATATAT -/A AAAAAAAAGC 1453 het 1453 ref 8 3 3 2 A 8 9 125358 CASAVA_Build 6 162661483 1I ATACTTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2026 hom 23 5 10 8 A 11 12 125359 CASAVA_Build 6 162663124 1I ATAGAATCTA -/C AAAAATGTCA 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 C 0 1 125360 CASAVA_Build 6 162663231 1I ACAATAGATC -/A AACATATAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 2 3 125361 CASAVA_Build 6 162664328 1I CCACTTATAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 7 8 125362 CASAVA_Build 6 162664443 1D29M1D CTGTCAAAAT AAAAAAAATTAAAGACTTCAAATTTAAAGAT/-AAAAAAATTAAAGACTTCAAATTTAAAGA- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 17 2 N/A 0 0 125363 CASAVA_Build 6 162666162 20I CTTTATTAGT --------------------/GCCAGCCAAATAATGGGTTA GCTAGAGCCC 3070 het 3070 ref 40 18 17 6 GCCAGCCAAATAATGGGTTA 0 1 125364 CASAVA_Build 6 162685355 5D TTTACCTTCC TTTTA/----- TAAGTCAATT 3070 hom 135 het 48 0 46 3 TTTTA 1 0 125365 CASAVA_Build 6 162685651 1I ATGATGCCCC -/T CTGCCCACCG 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 0 1 125366 CASAVA_Build 6 162688359 1D GTATATAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 18 0 16 3 T 10 9 125367 CASAVA_Build 6 162700614 1D TTTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 39 1 30 8 A 13 12 125368 CASAVA_Build 6 162704397 1D TTTCTGTAGG A/- AAAAAATGTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 6 125369 CASAVA_Build 6 162704646 1I CATCATTGTT -/C ACTATTATGC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 0 1 125370 CASAVA_Build 6 162709543 10D TTCTTTCTGT GGCCCTCCTA/---------- GGCTTGTCAC 3070 hom 149 het 51 0 48 6 GGCCCTCCTA 1 0 125371 CASAVA_Build 6 162714167 1D GAATATTTGG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 7 6 125372 CASAVA_Build 6 162715413 3D TCTGCTATAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 33 0 25 9 T 15 12 125373 CASAVA_Build 6 162720241 1I ATTGCCAGGG -/C AAGCTGGGAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 125374 CASAVA_Build 6 162726095 1D ATTCTATTTC T/- TTAACAAAGA 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 T 3 2 125375 CASAVA_Build 6 162733059 1D CATTTCATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 8 125376 CASAVA_Build 6 162736709 4D GAAATTCTCC TTTG/---- TTTGCAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 25 6 TTTG 2 1 125377 CASAVA_Build 6 162737777 2D TATGCACATG CA/-- CACACACACA 957 het 957 ref 49 41 3 5 CA 7 6 125378 CASAVA_Build 6 162743271 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 32 0 22 10 A 17 15 125379 CASAVA_Build 6 162743683 1D TTTTATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3009 het 586 hom 17 2 7 8 T 13 12 125380 CASAVA_Build 6 162751227 1D GAATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 6 T 11 10 125381 CASAVA_Build 6 162753045 1D CTGAGAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 11 10 125382 CASAVA_Build 6 162756836 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 24 7 14 6 A 7 8 125383 CASAVA_Build 6 162760567 1D GTGCAGGGTC A/- ACAAGCTGGA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 2 1 125384 CASAVA_Build 6 162760801 6D CAGAGCCAGA GACAGG/------ GACAGGGACA 3070 hom 69 het 29 0 22 8 GACAGG 4 3 125385 CASAVA_Build 6 162761281 2I CATTTCACAA --/TG TGGCGGGGAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TG 1 2 125386 CASAVA_Build 6 162762302 6I CCTAACATTA ------/TTTTAT TTACCCTCAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TTTTAT 0 1 125387 CASAVA_Build 6 162766086 1D GATTGACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 18 23 13 A 12 11 125388 CASAVA_Build 6 162771181 3I TGATGACGAT ---/GAC GACGACGACG 3070 hom 19 het 45 1 26 18 GAC 5 6 125389 CASAVA_Build 6 162772202 1I TTTAGTTGCT -/A AAAAAAAAAA 2974 het 259 hom 17 5 10 2 A 11 12 125390 CASAVA_Build 6 162774593 3I CCTCAAAATG ---/AGA AGAATTGACT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AGA 1 2 125391 CASAVA_Build 6 162774731 2I TGTTTATTTC --/CT CTGTTTTCTG 3070 hom 117 het 46 0 40 18 CT 1 2 125392 CASAVA_Build 6 162778316 4I AATAGCAAGC ----/TTGT TTATTTTCTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TTGT 0 1 125393 CASAVA_Build 6 162779535 1I AAAAAAAAAA -/T GTATTGATTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 0 1 125394 CASAVA_Build 6 162780716 6D TTCCTCTTCC TCTTTA/------ GCCTACTCAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 5 TCTTTA 1 0 125395 CASAVA_Build 6 162780832 1I TTTTCTCTAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 44 20 16 8 T 7 8 125396 CASAVA_Build 6 162781160 1I TTTCCTTTAA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 T 6 7 125397 CASAVA_Build 6 162784928 1D ATAGCAATGG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 46 16 21 10 A 7 6 125398 CASAVA_Build 6 162785513 2I ATGCTCCCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 11 13 125399 CASAVA_Build 6 162788405 1D AGGTTTAATT A/- CATATGAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 A 1 0 125400 CASAVA_Build 6 162789821 2D GACCTTTCTT TC/-- TCTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 TC 2 1 125401 CASAVA_Build 6 162793043 1D ATACAGGGTT A/- AAATGATGTA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 4 3 125402 CASAVA_Build 6 162793916 3I AATGAATAAA ---/AAG AAATACGCCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AAG 0 1 125403 CASAVA_Build 6 162797534 2D ATTCTTATAC AT/-- GTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 AT 1 0 125404 CASAVA_Build 6 162798769 1I TGATGAAGTA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 T 7 8 125405 CASAVA_Build 6 162802847 1D GACTTCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2142 hom 25 9 9 7 A 13 12 125406 CASAVA_Build 6 162805916 1D GTTTTAAGAG C/- CCCCCCTCCT 3070 het 2504 hom 29 8 17 4 C 7 6 125407 CASAVA_Build 6 162813232 2D AAACTCAAAC TT/-- TTTTTTTATA 3070 het 3050 hom 30 7 19 4 T 9 7 125408 CASAVA_Build 6 162816613 4I ATGAGTGTGT ----/GTGA GTGTGTTTGC 3070 het 3070 hom 59 22 32 5 GTGA 0 1 125409 CASAVA_Build 6 162821087 3D ATTTTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2890 hom 25 10 12 6 A 14 11 125410 CASAVA_Build 6 162823964 4D ATTGTTGGAC AGCT/---- AGCTCTATTT 3070 het 3070 ref 54 32 19 3 AGCT 2 1 125411 CASAVA_Build 6 162824587 4D GGGAAGGAGG GAGA/---- GAGGGAGAGA 302 het 302 ref 33 18 4 14 GA 3 1 125412 CASAVA_Build 6 162839855 13I TGAGAATTGG -------------/ATTATTGTTGAGA ACAGTAGCCG 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 ATTATTGTTGAGA 0 1 125413 CASAVA_Build 6 162841446 1D CACCCGCCTC A/- GACTCCTAAA 3070 het 1789 hom 21 8 9 4 A 1 0 125414 CASAVA_Build 6 162842375 2I CCTTTTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 13 12 T 13 15 125415 CASAVA_Build 6 162845092 4D GAGAGGACAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 48 20 15 13 AG 8 6 125416 CASAVA_Build 6 162846291 1D TTGTAATTGC A/- AAAAATTTGG 3070 het 3070 ref 44 28 15 1 A 6 5 125417 CASAVA_Build 6 162846816 1I TGGAAAACTG -/T TGAGTATTTG 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 T 1 2 125418 CASAVA_Build 6 162852465 1I TACAGAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 9 10 125419 CASAVA_Build 6 162853125 1I TAGGATTCTT -/A AGACGAATCT 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 A 1 2 125420 CASAVA_Build 6 162856451 3D CAAATTATAT TAG/--- TAAGTATTTT 3070 het 3070 ref 35 23 9 4 TAG 1 0 125421 CASAVA_Build 6 162857786 1D CTCTACCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 925 hom 24 3 15 6 A 14 13 125422 CASAVA_Build 6 162863822 1D AACTGATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 39 3 27 9 A 14 13 125423 CASAVA_Build 6 162869346 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2884 het 2884 ref 23 12 9 2 A 13 14 125424 CASAVA_Build 6 162869545 3D ATTTTAACTT CTC/--- CTTGAAGGTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 4 CTC 1 0 125425 CASAVA_Build 6 162869732 2D GATTGATTCT AC/-- GAGTCCTGAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AC 1 0 125426 CASAVA_Build 6 162870291 3I GTATAAAAAT ---/ACC ACTTCATTCA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 ACC 0 1 125427 CASAVA_Build 6 162872663 2D GGGTCTGCAA AT/-- ATCTCAAGCA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 AT 2 1 125428 CASAVA_Build 6 162874993 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2734 het 482 hom 34 4 8 22 A 18 17 125429 CASAVA_Build 6 162877625 1D CCTCTCATTG C/- CATCGATGCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 2 1 125430 CASAVA_Build 6 162888588 2I CTCCCAATGT --/CA CACAGTTAGT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 CA 2 3 125431 CASAVA_Build 6 162889062 1D12M12D TGGCCCCTAC TTCCTCTCTGAGTTTTTTGTTTTTG/-TCCTCTCTGAGT------------ TTTTTGTTTT 3070 het 1610 hom 28 4 10 15 N/A 0 0 125432 CASAVA_Build 6 162890059 1D TTATATGTTG A/- AATCCTGCCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 3 2 125433 CASAVA_Build 6 162894565 1D GTTTACTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 294 hom 39 1 26 12 A 15 14 125434 CASAVA_Build 6 162899350 1D TAATTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 869 het 869 ref 20 10 3 7 T 17 16 125435 CASAVA_Build 6 162915790 1D TACTAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 922 hom 45 3 33 9 T 12 11 125436 CASAVA_Build 6 162940522 3D CAGAAAAAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 94 het 47 0 30 18 AAC 7 6 125437 CASAVA_Build 6 162956470 1D ATGAGATGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 T 10 9 125438 CASAVA_Build 6 162958606 4D TTCCTTCTGT CTAG/---- CTAGCTAGAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 CTAG 3 2 125439 CASAVA_Build 6 162958781 1I TGAAAAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 9 10 125440 CASAVA_Build 6 162960167 3D GTATTTTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 171 hom 23 3 9 13 T 17 14 125441 CASAVA_Build 6 162960339 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2293 het 833 hom 11 3 6 2 T 11 12 125442 CASAVA_Build 6 162961078 5I CATATTATTT -----/CTTGA CTTAACTGCT 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 CTTGA 0 1 125443 CASAVA_Build 6 162961750 8I ATTCTTTTTA --------/ATTTTTGT ATTTTTAATA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 ATTTTTGT 0 1 125444 CASAVA_Build 6 162962127 2D2M4I CTCCACATAT CCAG----/--AGTTCA CTTTGATCCA 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 N/A 0 0 125445 CASAVA_Build 6 162964332 1I TCTTAATTTC -/A AGAGAATTGA 3070 het 3070 hom 36 18 18 0 A 1 2 125446 CASAVA_Build 6 162965121 1D ATATACAAAA T/- TAACTGGGCA 3070 het 3070 hom 17 8 8 1 T 2 1 125447 CASAVA_Build 6 162976618 3D TTATTTTATT ATA/--- ATAATATTAT 3070 het 3070 ref 21 10 8 6 ATA 3 2 125448 CASAVA_Build 6 162977183 1I ATTTGCCCAC -/A AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 6 7 125449 CASAVA_Build 6 162977277 1D AAGTCAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 12 11 125450 CASAVA_Build 6 162980707 1I AGTAGTTGCT -/G CCATTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 G 0 1 125451 CASAVA_Build 6 162994349 4I TTTGTGTGTG ----/TGTC TGTGTGTTTG 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 TGTC 0 1 125452 CASAVA_Build 6 162995868 1D AGAGTGAAGT G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 G 8 7 125453 CASAVA_Build 6 163000347 2I GATTTGTGAC --/AT AGATAACATT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AT 0 1 125454 CASAVA_Build 6 163016173 1D GGTTCAAGCG A/- ATTCTCCTGC 2768 het 1724 hom 11 5 6 0 A 2 1 125455 CASAVA_Build 6 163022094 1D TTCACACGTG T/- TTTTGAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 5 4 125456 CASAVA_Build 6 163033178 1D21M1D AAAGTATAAT AAAAAAAAAAGATTAGAAAATTA/-AAAAAAAAAGATTAGAAAATT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 15 1 N/A 0 0 125457 CASAVA_Build 6 163039333 1D AACTTCTTTC A/- CAGCCAGGAC 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 A 1 0 125458 CASAVA_Build 6 163060566 1I GTTTCAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 10 11 125459 CASAVA_Build 6 163068023 1D GTTCTTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 12 11 125460 CASAVA_Build 6 163071080 4I TCAACAACTG ----/TCTC TCTCTCTTTT 2649 het 2649 ref 24 8 8 8 TC 3 5 125461 CASAVA_Build 6 163075472 5D CTTAAATTAA ATTAT/----- ATCAAACATC 3070 het 3070 hom 34 9 23 4 ATTAT 1 0 125462 CASAVA_Build 6 163075537 2I ATATCAGTGC --/TA TGTTTTTATT 3044 het 3044 ref 25 8 7 10 TA 0 1 125463 CASAVA_Build 6 163077673 1I ATTTTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 11 12 125464 CASAVA_Build 6 163092176 1I TTAGAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 15 15 T 11 12 125465 CASAVA_Build 6 163105425 3D TTTTAATATT TTC/--- TTATAACTGA 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 TTC 1 0 125466 CASAVA_Build 6 163108551 1D TCCTTAGGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 9 8 125467 CASAVA_Build 6 163128847 1D TGTCCTCTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 1571 hom 17 5 11 1 T 9 8 125468 CASAVA_Build 6 163128928 1I ATAGACTTTA -/T TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 33 14 19 0 T 6 7 125469 CASAVA_Build 6 163129417 4D TATACCACAG TTTA/---- TTTATCCATT 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 TTTA 2 1 125470 CASAVA_Build 6 163153641 1D TATCATTTCC A/- AAAAATGTGA 3070 het 3070 hom 36 12 22 3 A 6 5 125471 CASAVA_Build 6 163173836 1D AAAAGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 T 13 12 125472 CASAVA_Build 6 163213250 7D CTCTATGAGA GCTCAGT/------- GCTCAGTGTC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 GCTCAGT 2 1 125473 CASAVA_Build 6 163224932 5I GCTCTCTACA -----/TATAT TATATGCATT 3070 het 3070 ref 37 22 8 7 TATAT 1 2 125474 CASAVA_Build 6 163291530 4D ACTCCATCTC AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AATA 4 3 125475 CASAVA_Build 6 163298695 1D CACTGTTTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 58 het 29 0 20 10 T 10 9 125476 CASAVA_Build 6 163305053 2I AAATACTTAT --/TA TTAATGAATT 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 TA 0 1 125477 CASAVA_Build 6 163308273 1I ACTAAAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 10 11 125478 CASAVA_Build 6 163311867 1D GCATTGCCCC T/- GTCACCTGAG 3070 hom 119 het 46 0 38 11 T 1 0 125479 CASAVA_Build 6 163316792 4I TCCTTCTTCT ----/CTCC CTCCCTCCCT 3070 hom 50 het 23 0 16 7 CTCC 2 3 125480 CASAVA_Build 6 163318429 1I ATTTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 37 0 27 10 A 11 12 125481 CASAVA_Build 6 163319166 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 A 14 13 125482 CASAVA_Build 6 163319506 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AC 7 8 125483 CASAVA_Build 6 163324593 2I TTTAGGAATC --/TT AGTTTTGCTG 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 0 2 125484 CASAVA_Build 6 163325881 1D ATGCGATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 14 8 T 12 11 125485 CASAVA_Build 6 163326990 2D AGCTGCAAAA AT/-- AAAATAAAAT 227 het 227 ref 32 18 2 13 AT 1 0 125486 CASAVA_Build 6 163330045 1I ATTCAATATA -/C CTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 C 1 2 125487 CASAVA_Build 6 163347232 2D TATATATCCC AT/-- ATATATATAT 1460 het 705 hom 6 2 3 1 AT 7 6 125488 CASAVA_Build 6 163359815 2D TCAGCACTAT TC/-- TGTTCCGTTG 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 TC 1 0 125489 CASAVA_Build 6 163383922 6I ACAGTCATTG ------/CATAAA CATAAACATG 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 CATAAA 1 2 125490 CASAVA_Build 6 163405861 1I AGACTAGAAG -/T TTTTTTTTTT 2426 het 2426 ref 32 12 10 10 T 13 14 125491 CASAVA_Build 6 163410667 2D AAATAATGAA GC/-- GCACACTTAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GC 2 1 125492 CASAVA_Build 6 163412290 1I ATGTGGATCA -/T TCTCAAGGAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 2 125493 CASAVA_Build 6 163413064 1D AACTATTCCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 141 hom 28 1 21 7 A 10 9 125494 CASAVA_Build 6 163415669 1I TGCATGCCTG -/T TAACAAAATA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 T 1 2 125495 CASAVA_Build 6 163430700 1I TAATTAAATT -/G TGAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 G 0 1 125496 CASAVA_Build 6 163431106 1I TAAGTCAACA -/T TGAAGTTATT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 T 1 2 125497 CASAVA_Build 6 163433341 5I TGTGAGGAGC -----/CCAGG CCAGGCTTCC 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 CCAGG 1 2 125498 CASAVA_Build 6 163437384 2I CAGGCCACTC --/TG TGCCTAAAGG 3070 het 2639 hom 28 9 14 5 TG 1 2 125499 CASAVA_Build 6 163437555 2I TGGGTTCAAA --/CT CTGTTTGCCG 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 CT 1 2 125500 CASAVA_Build 6 163437845 2D CAAGAAAATT AA/-- GTGAAATCTT 3070 het 3070 hom 47 16 25 7 A 2 0 125501 CASAVA_Build 6 163443844 1D TGTTCTAATC T/- TAATAGTCCT 3070 het 3070 ref 49 26 22 3 T 2 1 125502 CASAVA_Build 6 163447571 1I TAGTATGACA -/T TTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 5 6 125503 CASAVA_Build 6 163449582 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2729 hom 22 8 10 4 T 10 11 125504 CASAVA_Build 6 163455883 1I TCTCAGCATC -/A AAAAAAAAAA 2725 het 2725 ref 42 20 8 14 A 14 15 125505 CASAVA_Build 6 163456637 1I TGAAAACTGA -/T TTGACGGACT 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 T 2 3 125506 CASAVA_Build 6 163470091 4I CTCAGGCTCT ----/AACA AACAGTTTCT 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 AACA 1 2 125507 CASAVA_Build 6 163472294 4D40M13D CACGCCACTG CACTCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAACAAAAAAAAAAAAA/----CACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAC------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 14 0 18 2 N/A 0 0 125508 CASAVA_Build 6 163480404 20I AGACCCTTAT --------------------/CCTAATAAGGTACATTTGTA CCTAATAAGG 3070 het 3070 hom 35 9 13 14 CCTAATAAGGTACATTTGTA 0 1 125509 CASAVA_Build 6 163491625 1D GGCTCAAGTT C/- CCCCGCCTCT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 C 5 4 125510 CASAVA_Build 6 163509581 9I ATTCTAATAA ---------/AACAACAAC AACAACAACA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AAC 3 6 125511 CASAVA_Build 6 163533676 1D TTTTAAATAC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 49 26 19 5 T 8 7 125512 CASAVA_Build 6 163542169 1I AAACATAGGG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 6 7 125513 CASAVA_Build 6 163547796 29I GGGGAGAACA -----------------------------/GAGAAAAGAGAAAACGTTCTCTTTTTGTT GTCTCTTAAG 3070 het 3070 ref 35 22 11 4 GAGAAAAGAGAAAACGTTCTCTTTTTGTT 0 1 125514 CASAVA_Build 6 163549435 1D TACATTTTAC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 7 6 125515 CASAVA_Build 6 163596656 1I CTTCTTGTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2385 hom 26 6 14 6 T 9 10 125516 CASAVA_Build 6 163601995 14I CTAAATAATG --------------/CGTTGAAATGGATC CATTGTCATC 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 CGTTGAAATGGATC 0 1 125517 CASAVA_Build 6 163603549 1D ACATGATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 11 10 125518 CASAVA_Build 6 163608174 1D CACTGGGAGA G/- GGGGTCTGCC 3070 het 3070 ref 43 23 16 6 G 5 4 125519 CASAVA_Build 6 163611560 1D GCCTGACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 11 10 125520 CASAVA_Build 6 163612311 2I CCTCTCCCAG --/CC GACCGACTCA 2854 het 2854 ref 28 20 7 1 C 0 2 125521 CASAVA_Build 6 163614936 4D CTTTTAAATT CTTA/---- CTTGTTAATT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 CTTA 1 0 125522 CASAVA_Build 6 163626946 7I GGACTGAATG -------/ACTCAGC ACTCCATCCC 3070 het 3070 ref 55 26 21 8 ACTCAGC 0 1 125523 CASAVA_Build 6 163629768 1I TTTGAATGGC -/T TTTCCCAATT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 3 4 125524 CASAVA_Build 6 163641466 3D TTTTCGCCTC AGT/--- AGAGAAGCGG 3070 het 3070 hom 43 14 16 16 AGT 1 0 125525 CASAVA_Build 6 163650052 1D TCTGTCAGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 10 9 125526 CASAVA_Build 6 163652798 1I38M1I GTGGAAAAAC -AAAAAAAGCTACATAGTTTACTTACTCCTATGGTCAAA-/AAAAAAAAGCTACATAGTTTACTTACTCCTATGGTCAAAT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 13 22 N/A 0 0 125527 CASAVA_Build 6 163656704 1D AAATATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 A 12 11 125528 CASAVA_Build 6 163657543 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1666 hom 25 9 12 5 A 16 15 125529 CASAVA_Build 6 163660586 1D AGAGAGAGTT A/- AAAAACTCTG 1055 het 1055 ref 12 4 4 4 A 6 5 125530 CASAVA_Build 6 163662995 1D CTCTAGTCCA G/- GTCCCTGGCT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 G 2 1 125531 CASAVA_Build 6 163663128 1I CCTCCCAGCT -/G GGGGCACATT 3070 het 2793 hom 36 9 16 11 G 4 5 125532 CASAVA_Build 6 163664702 1D GGGGCAGCAA C/- CTCAGCGTCA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 C 2 1 125533 CASAVA_Build 6 163665194 1I AAGTGTTATC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 7 8 125534 CASAVA_Build 6 163707687 1I TTTTGAATGC -/T TTTCTTTACT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 3 4 125535 CASAVA_Build 6 163709086 1I AAAACACTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 7 8 125536 CASAVA_Build 6 163709873 1D TCCTAAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 263 hom 41 1 31 9 T 12 11 125537 CASAVA_Build 6 163713436 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2524 het 2524 ref 25 9 7 11 T 11 10 125538 CASAVA_Build 6 163721642 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 1803 het 1803 ref 10 5 4 1 A 9 10 125539 CASAVA_Build 6 163757938 2D CTGGAATGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 25 0 14 13 A 16 14 125540 CASAVA_Build 6 163760327 1D CTTACCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 11 10 125541 CASAVA_Build 6 163762586 4D ACGACTGTAT TTGA/---- TTGAGTGATT 2264 het 2264 ref 28 18 8 4 TTGA 2 1 125542 CASAVA_Build 6 163762685 1D CAGGTGTGTC T/- TTTAATTTTA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 4 3 125543 CASAVA_Build 6 163769770 1I TATATTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1380 hom 41 5 32 4 T 13 14 125544 CASAVA_Build 6 163772516 12D CCTGGTTTAC ATCTACATTTTT/------------ TAAATTTGGG 3070 het 3070 ref 27 18 12 3 ATCTACATTTTT 1 0 125545 CASAVA_Build 6 163776776 4D TGTATATATG AGGA/---- ACTGCAATCT 3070 het 3070 ref 41 26 10 10 AGGA 1 0 125546 CASAVA_Build 6 163781894 1D GGTAAGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 T 12 11 125547 CASAVA_Build 6 163783203 1D ATTTAAAAGA T/- TGCAAAAGTA 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 T 2 1 125548 CASAVA_Build 6 163785565 4D6M4I GCAGTATATT AAAGAAAATC----/----AAAATCTAAT TAAAACGTAT 3070 het 219 hom 21 1 14 6 N/A 0 0 125549 CASAVA_Build 6 163789358 1D ATAGCTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 41 4 25 12 T 16 15 125550 CASAVA_Build 6 163799156 1D GTCAAAAGTA G/- GAACTCAGAT 3070 het 3070 ref 51 29 19 4 G 2 1 125551 CASAVA_Build 6 163807474 4I AACAGTCTTG ----/AGAA AGAACAAAGC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AGAA 1 2 125552 CASAVA_Build 6 163812867 1I ATTTAGATGA -/T TTTTTACAGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 5 6 125553 CASAVA_Build 6 163814945 1D GACATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 11 10 125554 CASAVA_Build 6 163820146 1D TGTCTTTACT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 8 7 125555 CASAVA_Build 6 163828203 1D ATGGATATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 30 1 24 5 T 12 11 125556 CASAVA_Build 6 163832560 6D ATTGACTAGA TTATTT/------ TTAAGTTTGA 3070 het 3070 ref 26 14 12 2 TTATTT 1 0 125557 CASAVA_Build 6 163834868 12I TTTAAAGGGA ------------/CAAAAATATAGT CAAAAATATA 3070 hom 68 het 31 0 23 8 CAAAAATATAGT 0 1 125558 CASAVA_Build 6 163835118 3I AGGCCCCACA ---/TCC TCCTCCAATT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 TCC 2 3 125559 CASAVA_Build 6 163837418 3D TGAAGCATTA AGG/--- AGGAGGTAAA 3070 hom 114 het 41 0 36 5 AGG 3 2 125560 CASAVA_Build 6 163842972 4D GATAAAAAAC TGTT/---- TGTTATGTGT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TGTT 2 1 125561 CASAVA_Build 6 163843329 4D TGGGTTAAAC AGTG/---- AGACCCTGTC 3070 hom 59 het 22 0 20 2 AGTG 1 0 125562 CASAVA_Build 6 163849417 1I AAGCAGCAAG -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 6 7 125563 CASAVA_Build 6 163849546 9D TTCTTTCTTT CTTTCTTTC/--------- TTTTTTTTTT 999 hom 24 het 9 0 9 0 CTTTCTTTC 1 0 125564 CASAVA_Build 6 163849981 6D GCCAACATGG AGAAAC/------ CCCAACTCTA 1674 het 1663 hom 10 6 4 1 AGAAAC 1 0 125565 CASAVA_Build 6 163850501 1D ATTTAATAAA G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 80 het 28 0 23 6 G 10 9 125566 CASAVA_Build 6 163851884 4D TTAATGTAAC TCTT/---- TCAGCAACTA 3070 het 1910 hom 41 8 19 16 TCTT 1 0 125567 CASAVA_Build 6 163851900 1I AGCAACTAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 965 hom 40 4 19 17 A 9 10 125568 CASAVA_Build 6 163853001 1I AATTAACGAT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 8 125569 CASAVA_Build 6 163864233 1I GAAGGCAGGT -/A AAAATACTCT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 4 5 125570 CASAVA_Build 6 163865371 3D TTATCTTAAG CTA/--- CTCTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 19 10 2 CTA 1 0 125571 CASAVA_Build 6 163865665 1I TAATTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 hom 44 het 16 0 14 2 T 4 5 125572 CASAVA_Build 6 163866290 1D TCTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 36 4 19 13 T 14 13 125573 CASAVA_Build 6 163877724 1D ATTGAAAAAT A/- AATGATTGAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 3 2 125574 CASAVA_Build 6 163879059 4D ATGTACACAT CTTC/---- CTCATCCTGC 2513 het 2513 ref 22 10 6 10 CTTC 1 0 125575 CASAVA_Build 6 163883993 4I TTAGGATAAT ----/AGAA AGGCATCTGT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AGAA 0 1 125576 CASAVA_Build 6 163889193 4D TAGAACTGAA TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 49 23 18 9 TGTT 4 3 125577 CASAVA_Build 6 163889356 3D AACAAAGCAC TTG/--- TTGTTTGCTT 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 TTG 2 1 125578 CASAVA_Build 6 163896653 2I AGGTCTACTC --/AG GGGGATTGTG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 AG 0 1 125579 CASAVA_Build 6 163900465 3I CAAATAAGTT ---/GAA GAAGTTTTAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 GAA 1 2 125580 CASAVA_Build 6 163911691 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTG 2939 het 2939 ref 20 9 10 1 T 9 10 125581 CASAVA_Build 6 163912742 1I CAAGTGTTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 301 hom 32 1 28 3 A 9 10 125582 CASAVA_Build 6 163916831 2I TACGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 TA 5 6 125583 CASAVA_Build 6 163925942 4D TCGACTGACA ATTT/---- ATTTAGTCCT 3070 hom 127 het 46 0 43 4 ATTT 2 1 125584 CASAVA_Build 6 163926807 1D AGCCACCACA C/- CCCGGCAATG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 4 3 125585 CASAVA_Build 6 163926993 3I AACTAAGACG ---/GCT GCTGCCAAGT 3070 hom 63 het 25 0 20 5 GCT 1 2 125586 CASAVA_Build 6 163931725 1D GGTTTTCCCT G/- TTGTTGGCCT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 G 1 0 125587 CASAVA_Build 6 163934324 2D TATTAAAAAA AC/-- ACATATAAAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 4 AC 2 1 125588 CASAVA_Build 6 163939560 2I GAGAGAGAGA --/GC GAGAGAGCAC 3070 hom 34 het 41 1 33 7 GC 0 1 125589 CASAVA_Build 6 163941157 1I CTCAAAGCAG -/C CAGTGCAGTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 C 1 2 125590 CASAVA_Build 6 163941350 1D CAGGATCAAA G/- CTTACTTAAG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 G 1 0 125591 CASAVA_Build 6 163946347 1D TTGGAAGGGT G/- ATGATTGTGT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 1 0 125592 CASAVA_Build 6 163951787 1D CACCAACGCG T/- GCCTCTGCAA 2114 het 2114 ref 20 12 5 4 T 1 0 125593 CASAVA_Build 6 163954121 3I TGATAATACA ---/CAT CATCATAACC 3070 het 3070 ref 51 31 18 2 CAT 2 3 125594 CASAVA_Build 6 163955956 1D CCTCATGAAT A/- AGAATAATGC 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 2 1 125595 CASAVA_Build 6 163956836 2I TACCGACTTT --/CA GTTTTACCGT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 CA 0 1 125596 CASAVA_Build 6 163977160 1I GCGATGCATC -/T GGGGACATTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 0 1 125597 CASAVA_Build 6 164001986 1I TTGATCTCTC -/T GTGTATTTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 0 1 125598 CASAVA_Build 6 164003280 1I GCTGCCTGAT -/A GGAATTTGTA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 0 1 125599 CASAVA_Build 6 164010589 4I GGATTTTTTT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AAAC 3 4 125600 CASAVA_Build 6 164013526 8D ACTGTCTCAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 54 het 25 0 19 10 AAAC 7 5 125601 CASAVA_Build 6 164018025 5I TTTTATTTCC -----/TTTCT TTTATCATGT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 TTTCT 0 1 125602 CASAVA_Build 6 164021574 13D TTCCTTCCTT CCTTCCTTCCTTC/------------- CTATTTATTT 1244 hom 9 het 22 0 6 18 CCTTCCTTCCTTC 1 0 125603 CASAVA_Build 6 164039994 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 8 125604 CASAVA_Build 6 164042031 4I GGAATGAGAC ----/CATG CATGGTTGTG 3070 hom 126 het 45 0 40 5 CATG 1 2 125605 CASAVA_Build 6 164056175 1D ACAATTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 479 hom 40 2 34 5 A 11 10 125606 CASAVA_Build 6 164070087 1D AAGAGGCAGG A/- AAAGATCTGT 3070 hom 86 het 36 0 29 7 A 4 3 125607 CASAVA_Build 6 164091334 3I GATGCTAATT ---/CTC CTCGCAACTC 3070 hom 134 het 52 0 43 9 CTC 1 2 125608 CASAVA_Build 6 164098355 1I TCTTTTGTTC -/T TATTTTGTTG 3070 hom 119 het 50 0 40 10 T 1 2 125609 CASAVA_Build 6 164101359 4D TTATCAGCTC AAAT/---- AAACACAACT 3070 hom 92 het 36 0 31 7 AAAT 1 0 125610 CASAVA_Build 6 164109713 1D TGTTTAAGGT A/- AAAAAAAAAA 820 het 820 ref 23 9 4 10 A 14 13 125611 CASAVA_Build 6 164122052 1I CATAGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 12 13 125612 CASAVA_Build 6 164124052 3D AAAAATACAG TAT/--- TATTATGAAG 3070 het 3070 ref 25 11 11 6 TAT 3 2 125613 CASAVA_Build 6 164131192 1I AGCAGAAACA -/C ATTTTATCCA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 C 0 1 125614 CASAVA_Build 6 164133675 7I CACTTAAATA -------/GTTTTAT GTTATATGAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 GTTTTAT 0 1 125615 CASAVA_Build 6 164135751 4I ACAAACAAAC ----/AAAA AGAATGTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 1 5 125616 CASAVA_Build 6 164138941 1I AAAATATGTT -/A AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 A 6 7 125617 CASAVA_Build 6 164140347 1I73M2D CTGGCTGAGA -TAACAATGGTTTAGATACTGCAGAAGTACATTTTAATGTGCTTGAAGACATAACAACAACTATAGAAAATAAAAC/CGAACAATGGTTTAGATACTGCAGAAGTACATTTTAATGTGCTTGAAGACATAATAATAACTATAGAAAATAAA-- ACAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 32 32 15 10 N/A 0 0 125618 CASAVA_Build 6 164141733 1D GTACTAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 A 10 9 125619 CASAVA_Build 6 164147817 3I TATAATTACA ---/TAT TATAATTATA 3070 hom 88 het 34 0 29 5 TAT 1 2 125620 CASAVA_Build 6 164148272 1D TGGCTGTCCC A/- GGAGCAGCTC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 1 0 125621 CASAVA_Build 6 164152733 2I AGTCCTTGGC --/AA AAAAAAAAAA 2498 het 2498 ref 30 10 10 10 A 13 15 125622 CASAVA_Build 6 164154694 2I AGGAACTCTT --/AA ATTTGGAATA 3070 het 3070 ref 52 25 23 4 A 1 3 125623 CASAVA_Build 6 164157653 1D GGGGCGGGGA G/- GGGGGGCGGT 2287 het 2287 ref 26 12 8 6 G 7 6 125624 CASAVA_Build 6 164160172 1I GATTTTAAGA -/T TAAAAAAGCT 3070 het 2705 hom 28 7 18 3 T 1 2 125625 CASAVA_Build 6 164162160 1D GTCTGTCAGT G/- TTTCTCCCAG 3070 het 3070 ref 44 21 14 10 G 1 0 125626 CASAVA_Build 6 164165837 1I TTTCTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2650 het 2650 ref 34 11 11 12 T 13 14 125627 CASAVA_Build 6 164169017 1I TATTTCTTTA -/T TTGTATTACA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 3 125628 CASAVA_Build 6 164170798 108D TGTTGGGTGC TGGTAACAGTTCATCCCGGTAATAAGAAATTGGACTCTGGTTTTGCAAAAGAACAACCAGGAAACTGGTTGAGTGTCCAGCAGGGTCAGTGTCTTAAATATGGCATTA/------------------------------------------------------------------------------------------------------------ TCTGAAATTG 3070 het 3070 ref 31 42 11 11 TGGTAACAGTTCATCCCGGTAATAAGAAATTGGACTCTGGTTTTGCAAAAGAACAACCAGGAAACTGGTTGAGTGTCCAGCAGGGTCAGTGTCTTAAATATGGCATTA 1 0 125629 CASAVA_Build 6 164176372 4D CAAGATGTAG AAAC/---- AAACAAAGTG 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 AAAC 2 1 125630 CASAVA_Build 6 164180825 3D ACAATAAAGC TCT/--- TCAACGCAGA 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 TCT 1 0 125631 CASAVA_Build 6 164183402 1I CCTACATCCA -/C CCCCCCGCAT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 C 6 7 125632 CASAVA_Build 6 164184786 2D GCATAAATCA TC/-- TCTCTCAGAG 3070 hom 78 het 29 0 27 4 TC 4 3 125633 CASAVA_Build 6 164184989 1I CTTCTCTACT -/A AAAAAAACAA 3070 het 2951 hom 25 9 11 5 A 7 8 125634 CASAVA_Build 6 164195849 1I CTCCCAAAAA -/G AAAAAGTAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 125635 CASAVA_Build 6 164198556 1I TAATACTGAT -/G ATGGTGAAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 0 1 125636 CASAVA_Build 6 164206770 32D TTTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------------------- TTTTTTTTTA 2476 het 1169 hom 18 6 6 15 T 41 9 125637 CASAVA_Build 6 164207042 1I TGATCCACTC -/A CCTCTGCCTC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 0 1 125638 CASAVA_Build 6 164229278 1I AAACAAAAAG -/A AAAAAACAAA 3029 het 3029 ref 33 18 12 3 A 6 7 125639 CASAVA_Build 6 164230080 1D AATTTCCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 A 13 12 125640 CASAVA_Build 6 164231197 2I CTGTGCCTAT --/AC AGTTTTTAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AC 0 1 125641 CASAVA_Build 6 164233380 1D TCTCCAAAAC T/- CAGAGCAGGG 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 T 1 0 125642 CASAVA_Build 6 164237060 4D AAAACAATTA CAGT/---- ATTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 13 8 CAGT 1 0 125643 CASAVA_Build 6 164242577 1I GGGCATCTTA -/C ACGCGAGTCT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 C 0 1 125644 CASAVA_Build 6 164244326 1D GAAGTTAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 8 7 125645 CASAVA_Build 6 164264064 1I TTTATTTAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 T 8 9 125646 CASAVA_Build 6 164266779 1D GGAACATGAC G/- GGGTGTTTCC 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 G 4 3 125647 CASAVA_Build 6 164307065 1D GTGCTCGTGA T/- TTTTTTTTTT 1364 het 1364 ref 39 26 6 7 T 13 12 125648 CASAVA_Build 6 164341875 1I ATGTGGAGAT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 7 8 125649 CASAVA_Build 6 164353153 1D ATACAAGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 28 2 15 11 A 17 16 125650 CASAVA_Build 6 164356876 3I TCAGTTAGTC ---/CTT CTTTTTCTTA 3070 hom 160 het 56 0 54 2 CTT 1 2 125651 CASAVA_Build 6 164362667 4D14M2D ATGCACACAC ACAAACACATGCACACAAAC/----ACACATGCACACAA-- ACACAAACGC 3070 het 3070 ref 45 25 25 6 N/A 0 0 125652 CASAVA_Build 6 164362839 4D CTCCCCCCAC ACAA/---- ACACACATGC 3070 het 3070 ref 55 24 22 13 ACAA 1 0 125653 CASAVA_Build 6 164364180 6D ACAAAACCAT TACATG/------ TTAAGATTTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 8 TACATG 1 0 125654 CASAVA_Build 6 164364365 1I AGCCAGTGCT -/C CCCCATGCCC 3070 het 2506 hom 28 9 15 4 C 4 5 125655 CASAVA_Build 6 164369158 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2537 het 261 hom 19 1 10 8 T 14 13 125656 CASAVA_Build 6 164369750 1I GAGAAGATAT -/A ACCTTACCCT 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 A 1 2 125657 CASAVA_Build 6 164371189 4I12M1D GGCACTCAGT ----GATAGTTTTACTA/GATAGATAGTTTTACT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 7 N/A 0 0 125658 CASAVA_Build 6 164378805 4D TAGAAAAGAC TGAG/---- AGCCTTTTAG 3070 hom 96 het 34 0 32 4 TGAG 1 0 125659 CASAVA_Build 6 164379411 4I AGAAGAGCTC ----/AACT AATACTAAGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AACT 0 1 125660 CASAVA_Build 6 164380272 1D ATCTGAATTT A/- AGTGTAAATT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 2 1 125661 CASAVA_Build 6 164381199 1I GCAACACCGA -/G GCAGCACCAA 3070 hom 76 het 28 0 22 6 G 1 2 125662 CASAVA_Build 6 164381435 5I GCCACTGCAT -----/TGCAC TGATTGCACA 3070 hom 66 het 32 0 23 9 TGCAC 0 1 125663 CASAVA_Build 6 164381668 2I GAATTACACC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 179 hom 30 1 27 2 T 9 11 125664 CASAVA_Build 6 164385180 1D TTGCCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 24 0 16 8 T 12 11 125665 CASAVA_Build 6 164385192 1D TTTTTTTTTT G/- CTTTCCTAGA 3070 het 228 hom 21 4 14 4 G 1 0 125666 CASAVA_Build 6 164385540 1I ACCCTTGTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 878 hom 35 2 26 7 A 9 10 125667 CASAVA_Build 6 164388186 2I TGATTTATTC --/AA TCCATGAATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 0 2 125668 CASAVA_Build 6 164392294 1I CTAGATGCTG -/A AGGGAGCACA 3070 het 3070 ref 52 26 25 1 A 1 2 125669 CASAVA_Build 6 164393028 1I AAAATTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 39 1 25 14 T 12 13 125670 CASAVA_Build 6 164401452 1D TATTTCTGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 25 hom 41 1 33 8 T 10 9 125671 CASAVA_Build 6 164419036 1I CACACAGGAA -/C CCCTCACTCC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 C 3 4 125672 CASAVA_Build 6 164428023 1I GACTTTGTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 55 het 37 0 21 16 A 9 10 125673 CASAVA_Build 6 164429327 2I TGAGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 31 10 10 11 TG 8 9 125674 CASAVA_Build 6 164435298 1I GTAGAATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 14 15 125675 CASAVA_Build 6 164435508 1I CTATTATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 T 12 13 125676 CASAVA_Build 6 164436789 1I CCAGGAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 11 13 A 12 13 125677 CASAVA_Build 6 164439431 1I GAGATACCAT -/A ATGCTCATTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 125678 CASAVA_Build 6 164451014 1I ACCGACTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 67 het 29 0 23 6 T 8 9 125679 CASAVA_Build 6 164452281 2I GATGTAGGTT --/TA TGAGACCCAC 3070 hom 125 het 49 0 38 11 TA 0 1 125680 CASAVA_Build 6 164471137 1D6M36D GTGTCATCTT CCCTGTCAGGCCCACACTCTTCTTCCCCAGGCTCCTCTCTCCT/-CCTGAC------------------------------------ TCTTGGAAAG 2886 het 2886 ref 35 34 11 7 N/A 0 0 125681 CASAVA_Build 6 164485699 2I TAGGTAATGC --/TT CTAACTGCCA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 0 2 125682 CASAVA_Build 6 164496956 2I TGACTCAGAA --/AG AGGAAGTAGA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 AG 1 2 125683 CASAVA_Build 6 164500452 1I CTAGGCAGTG -/C CCCAGTGGGG 3070 hom 74 het 33 0 27 6 C 3 4 125684 CASAVA_Build 6 164511503 1I TTTTGAGATT -/C CCCCCCTTTT 2250 het 261 hom 26 2 11 13 C 6 7 125685 CASAVA_Build 6 164539030 1I TTACAGATAG -/A AAAAAAGGCA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 6 7 125686 CASAVA_Build 6 164553030 2D AATATTTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 34 2 18 15 T 16 14 125687 CASAVA_Build 6 164582458 3I ATTCACTACC ---/AGG AGAACAGTAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 AGG 0 1 125688 CASAVA_Build 6 164583925 1D AAAGAAGCTG C/- CCCCAAGTAA 3070 het 3070 ref 41 24 12 7 C 5 4 125689 CASAVA_Build 6 164596181 1D ATTGGGAAAT G/- GGTTTTGAAC 3070 hom 113 het 44 0 40 4 G 3 2 125690 CASAVA_Build 6 164602867 1D GTCCTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 2879 het 2879 ref 41 18 10 13 T 11 10 125691 CASAVA_Build 6 164607533 1D TCTAAAGGTC T/- TTTTTCCCTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 6 5 125692 CASAVA_Build 6 164613144 1D AAATTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 52 1 44 7 A 11 10 125693 CASAVA_Build 6 164617171 2D AAATAATGAC TT/-- TTCCCTCACA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 T 4 2 125694 CASAVA_Build 6 164637446 1D TTATATCAAA T/- TTTTTCATAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 6 5 125695 CASAVA_Build 6 164641305 2D GCATACTCTG TC/-- TCTCTGGGCT 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 TC 3 2 125696 CASAVA_Build 6 164646399 3D CTCTGTCTCA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 AAC 5 4 125697 CASAVA_Build 6 164650784 1D TAACAGAAAT G/- AAACAATAAT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 G 1 0 125698 CASAVA_Build 6 164658007 1I TATATATATA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 7 8 125699 CASAVA_Build 6 164660713 1D TGTCTATGTA C/- CACATTTTCT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 2 1 125700 CASAVA_Build 6 164661891 2D AGAATTTGAA AG/-- AGTTTGTTAA 3070 hom 96 het 38 0 33 7 AG 2 1 125701 CASAVA_Build 6 164665791 1I CAGTGACTCC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 125702 CASAVA_Build 6 164666328 4I ATTTCTATAC ----/TATA TATTATATAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TA 1 3 125703 CASAVA_Build 6 164667133 1I TTAGTTTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 466 hom 45 2 25 18 A 12 13 125704 CASAVA_Build 6 164705778 1D TGGTCATGAG A/- AAAAAAAAAA 1878 het 1878 ref 34 25 4 5 A 12 11 125705 CASAVA_Build 6 164718948 9I ACCACGGTGA ---------/TGCCCTCTG TGTCTGGAGA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 TGCCCTCTG 0 1 125706 CASAVA_Build 6 164767871 1D CTGCCTTTAG A/- AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 7 6 125707 CASAVA_Build 6 164789113 1D AACTTAGGAC T/- TTTTTTTTTT 1755 het 1755 ref 26 11 6 9 T 17 16 125708 CASAVA_Build 6 164806910 1I CAATTTACTT -/A AAAAAAAAAA 2981 het 2749 hom 36 13 10 13 A 15 16 125709 CASAVA_Build 6 164808735 1D TCACTTCACG T/- TATCTCTTTT 3070 hom 123 het 48 0 42 7 T 2 1 125710 CASAVA_Build 6 164825655 1D AGATGACATC A/- AAAATCATAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 5 4 125711 CASAVA_Build 6 164831178 1I GTGTGCATCC -/T TTTTGTTGAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 4 5 125712 CASAVA_Build 6 164854669 2I GTGTGAGATG --/GT ATCTCATTGT 2983 hom 15 het 6 0 6 0 GT 0 1 125713 CASAVA_Build 6 164864887 1D TAAACTGATT C/- ATTCTCTTGC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 1 0 125714 CASAVA_Build 6 164865320 1I GTGAATGGGA -/T AAATTTTAGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 125715 CASAVA_Build 6 164868711 2D AAAAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 6 A 15 13 125716 CASAVA_Build 6 164870073 2D CTGAGAAATG AT/-- ATGGCCACTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AT 2 1 125717 CASAVA_Build 6 164876136 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 8 7 125718 CASAVA_Build 6 164880226 1D AACCTAATAG T/- TTTTACATAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 5 4 125719 CASAVA_Build 6 164882897 15D TTTTTCTTTC TTCTTTCTTTCCTCT/--------------- TTCTTTCTTT 3070 hom 38 het 19 0 14 7 TTCTTTCTTTCCTCT 2 1 125720 CASAVA_Build 6 164899067 1I ATTGATCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1318 hom 36 4 30 2 T 11 12 125721 CASAVA_Build 6 164900315 1I TAAGAAACTA -/T TTTTCTAGTC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 4 5 125722 CASAVA_Build 6 164901778 1I AGAATTGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 7 hom 54 1 43 10 T 9 10 125723 CASAVA_Build 6 164902592 2I CCCCTGCCCT --/AG AGAGACCTGT 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 AG 2 3 125724 CASAVA_Build 6 164907279 8D TCAATTTTCA CCAGGAGC/-------- CCAAAGGCAC 3070 het 3070 ref 42 25 15 4 CCAGGAGC 1 0 125725 CASAVA_Build 6 164911872 1D TTCCAAATGA G/- GAAAAAGTCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 2 1 125726 CASAVA_Build 6 164915015 5I AATATTACAT -----/ATATA ATATAGGATC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 ATATA 1 2 125727 CASAVA_Build 6 164915864 4D TTAGTTGCTG TTAC/---- TTACTTATTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 TTAC 2 1 125728 CASAVA_Build 6 164920985 6I AATAGGGGTA ------/CCTCCT CCTCACTTTT 3070 hom 90 het 33 0 29 4 CCT 1 3 125729 CASAVA_Build 6 164923787 1D CAAAAAAAAA C/- CAAAATTTCT 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 C 2 1 125730 CASAVA_Build 6 164928507 1D TGAGCTACTG A/- AAAATCTTAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 5 4 125731 CASAVA_Build 6 164932138 1D ATGGCTGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 12 11 125732 CASAVA_Build 6 164932480 11D AAAATAAAAA GTTTAATAAAG/----------- GTATAGATTA 3070 het 3070 ref 34 19 12 7 GTTTAATAAAG 1 0 125733 CASAVA_Build 6 164940469 5I AGGCCCTGAT -----/CAATC CAAAATAACT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 CAATC 0 1 125734 CASAVA_Build 6 164943048 1I TTAACTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2515 het 2482 hom 23 9 7 7 T 10 11 125735 CASAVA_Build 6 164945796 1I AAGCTTGTTA -/T TAAACTATTT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 1 2 125736 CASAVA_Build 6 164946646 1D ATTTAGAAAG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 A 7 6 125737 CASAVA_Build 6 164948753 21D GGTGAGTAAT TGGTAGAGCCAGGATTTGAAA/--------------------- TCTGGCATTC 3070 hom 81 het 30 0 26 6 TGGTAGAGCCAGGATTTGAAA 1 0 125738 CASAVA_Build 6 164952417 1D AGTTTTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3034 het 3034 ref 40 18 11 11 A 17 16 125739 CASAVA_Build 6 164958738 1I AACTGCTGCA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 6 7 125740 CASAVA_Build 6 164959271 1I GAACCTGCCA -/T AACAGCTGTA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 0 1 125741 CASAVA_Build 6 164968175 5I TAATTAGTAA -----/TGTAG TGTAGTATTG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TGTAG 1 2 125742 CASAVA_Build 6 164975639 1I TTTTCCTCTC -/T TTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 5 6 125743 CASAVA_Build 6 164977434 1I ACAAGAGCCC -/A AAGGGCATCA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 2 3 125744 CASAVA_Build 6 164977963 1D ATTTATATAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 107 hom 27 2 21 5 A 8 7 125745 CASAVA_Build 6 164977979 1D AATTTAAAAA G/- AAGCCTTGAC 3070 het 274 hom 27 3 23 1 G 1 0 125746 CASAVA_Build 6 164979734 1D AATCCAATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 10 9 125747 CASAVA_Build 6 164981344 1D AGATTAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 11 10 125748 CASAVA_Build 6 164983690 2D TCACCACAGA AG/-- AGTCTTTCCT 3070 het 3070 hom 47 19 26 3 AG 2 1 125749 CASAVA_Build 6 164987831 2D TTGTAATAAT TA/-- TATATATATA 1936 het 1926 hom 10 5 4 1 TA 7 6 125750 CASAVA_Build 6 165025244 1I CTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 9 10 125751 CASAVA_Build 6 165058156 1I GAAAAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 7 9 7 A 10 11 125752 CASAVA_Build 6 165066696 1I ATTCTTAAAG -/A GAAGAATTTT 1929 het 1929 ref 10 6 4 0 A 0 1 125753 CASAVA_Build 6 165071289 3D GGGAACCTAT TTC/--- TTCTTCTCAG 3070 het 3070 hom 32 15 16 2 TTC 3 2 125754 CASAVA_Build 6 165073640 1D AATTTCTTCT C/- CTGTAAAATG 3070 het 3070 hom 52 22 25 6 C 2 1 125755 CASAVA_Build 6 165075573 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1971 hom 20 5 9 6 T 14 12 125756 CASAVA_Build 6 165081578 2D AGGCTGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 856 hom 37 5 15 17 A 14 12 125757 CASAVA_Build 6 165086522 1D GCGCCATTCT C/- CTGCCTCAGC 1508 het 349 hom 6 2 4 0 C 2 1 125758 CASAVA_Build 6 165087593 3D TATTGGAACT ATA/--- ATGACAAAAT 3070 het 1181 hom 50 9 25 16 ATA 1 0 125759 CASAVA_Build 6 165088145 1D TCCAAAAGAT C/- TTTAACAAAC 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 C 1 0 125760 CASAVA_Build 6 165089315 21I TAGAATGACC ---------------------/AAGACCAAGATAATTATAGAT TATCCAAGAC 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 AAGACCAAGATAATTATAGAT 0 1 125761 CASAVA_Build 6 165090004 3D CCATGAAATA CAT/--- CATTAGCAAC 3070 het 3070 ref 36 18 16 5 CAT 2 1 125762 CASAVA_Build 6 165096801 1D TACTCTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 T 12 11 125763 CASAVA_Build 6 165101253 3I TGAGTCACTT ---/CTC CTCAATAGAC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 CTC 1 2 125764 CASAVA_Build 6 165102910 2I ACAAAATTTC --/AT ATGTTAGAGC 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 AT 1 2 125765 CASAVA_Build 6 165106402 1I TTTCAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 10 11 125766 CASAVA_Build 6 165108950 1D GTTATTTCAC G/- GGCCCAACGT 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 G 3 2 125767 CASAVA_Build 6 165121299 2D AGGCAATGCC TT/-- GCCCTGCTTC 1197 hom 7 het 3 0 3 0 T 2 0 125768 CASAVA_Build 6 165122623 1D CAGATTTTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 49 19 24 7 T 9 8 125769 CASAVA_Build 6 165133692 1I ATTGGAAAAT -/G GAAGCGAATT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 G 1 2 125770 CASAVA_Build 6 165136960 1I AGGAAATATT -/G GGAGAATATG 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 G 2 3 125771 CASAVA_Build 6 165140406 1D TACAGGCACT G/- GGTAAATATT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 G 3 2 125772 CASAVA_Build 6 165148806 3D CTATCATGAG AAC/--- AATATGGACA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 AAC 1 0 125773 CASAVA_Build 6 165179387 1I CTTCCAATAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 7 8 125774 CASAVA_Build 6 165186241 1D AAGACTTAAA T/- TTGAATAAGT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 3 2 125775 CASAVA_Build 6 165188357 1D AAGATCCAAT A/- AAAAAAAAAT 2633 het 2633 ref 29 13 6 10 A 10 9 125776 CASAVA_Build 6 165192866 3D TGTGTCACAG AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 15 11 6 A 12 9 125777 CASAVA_Build 6 165196341 8I AAAGGTAGAG --------/AAAAAGAT AATTTGAGGA 3070 het 3070 hom 34 17 12 5 AAAAAGAT 0 1 125778 CASAVA_Build 6 165197680 4D ACTCCTTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 938 hom 14 5 9 0 A 21 17 125779 CASAVA_Build 6 165199097 4D ATTAAAGGGA GTCC/---- GTCCTACAAG 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 GTCC 2 1 125780 CASAVA_Build 6 165199234 1I ACAACTTTGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 8 9 125781 CASAVA_Build 6 165202127 1D TGTCCTATCT A/- AAAAATTATT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 6 5 125782 CASAVA_Build 6 165214058 1I AAAACTGCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 8 9 125783 CASAVA_Build 6 165220650 1I GACCTCCCCC -/T GGGTCCCTCC 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 0 1 125784 CASAVA_Build 6 165223309 1I CTTTTTATTT -/A TTTTTTGTTC 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 0 1 125785 CASAVA_Build 6 165224166 2I TTTTTCAGAC --/TT TAAAGTGAAT 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 T 1 3 125786 CASAVA_Build 6 165238014 1I TATAATTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 9 10 125787 CASAVA_Build 6 165244924 2D AAACCCCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2428 het 585 hom 33 8 9 17 T 18 16 125788 CASAVA_Build 6 165248466 4I TGTAAGCCTT ----/AGAA AGAGCAGGCA 3070 het 3070 hom 61 22 27 12 AGAA 0 1 125789 CASAVA_Build 6 165251426 1I ATCCTTTGTA -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 7 8 125790 CASAVA_Build 6 165264918 2D ATATGTATAC AT/-- ATATATGCAT 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 AT 4 3 125791 CASAVA_Build 6 165270912 1D ACTGAAACAA G/- GTAATTACGA 3070 het 3070 ref 48 27 18 4 G 2 1 125792 CASAVA_Build 6 165279549 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 2821 het 201 hom 15 2 10 3 G 0 1 125793 CASAVA_Build 6 165323086 4D TATCCTCTTT TTGG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTGG 1 0 125794 CASAVA_Build 6 165323953 1D TCTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 495 hom 6 het 36 0 8 29 T 11 10 125795 CASAVA_Build 6 165339378 1D GTACTCTTTT A/- CCTCTCTCCT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 1 0 125796 CASAVA_Build 6 165346488 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 737 hom 50 7 35 9 A 17 16 125797 CASAVA_Build 6 165347016 2D CAATTTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 hom 181 het 71 0 60 11 CA 7 6 125798 CASAVA_Build 6 165349405 1D AGTATGTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 10 9 125799 CASAVA_Build 6 165353541 1I AACATTCCCA -/T TTTTGACGTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 4 5 125800 CASAVA_Build 6 165358522 1D TGATGGTAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 10 9 125801 CASAVA_Build 6 165358889 1D ATAACTCCAG A/- AACAGTTACA 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 A 3 2 125802 CASAVA_Build 6 165360100 1I ATTTAGACAT -/G CTCTAACAAA 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 G 0 1 125803 CASAVA_Build 6 165373027 1D AATTGACATG A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 A 1 0 125804 CASAVA_Build 6 165375155 5I TGACATAGCT -----/TTAAG TTAATTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 TTAAG 0 1 125805 CASAVA_Build 6 165381860 2I TAGAAATCTT --/CA CAGAGACCTC 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 CA 1 2 125806 CASAVA_Build 6 165409310 18I AAAAACTACT ------------------/TTTGTTTCTATAATGCCC TTTGTGGTGT 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 TTTGTTTCTATAATGCCC 0 1 125807 CASAVA_Build 6 165410428 1D TCTTTCCCAC A/- AAAAAACCTT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 7 6 125808 CASAVA_Build 6 165411912 1I TAGAGAATTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 1922 hom 17 5 9 3 T 8 9 125809 CASAVA_Build 6 165414211 1I GATTAAAGGT -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 57 19 27 11 A 7 8 125810 CASAVA_Build 6 165414365 1I ACTAAAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 10 11 125811 CASAVA_Build 6 165462135 1I CAAGAGATAT -/G GTTTCAAATG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 G 1 2 125812 CASAVA_Build 6 165463347 1I GTTCTCCACT -/C CCCCCCAGCA 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 C 6 7 125813 CASAVA_Build 6 165475313 1I TTGAGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 995 het 995 ref 39 32 3 4 A 10 11 125814 CASAVA_Build 6 165477986 3D TCCTGTTACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 T 13 10 125815 CASAVA_Build 6 165485872 5I TAGAAAGTGA -----/TAAAT TAATCTGATA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 TAAAT 0 1 125816 CASAVA_Build 6 165486060 1I CTACATTGAG -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 6 7 125817 CASAVA_Build 6 165491453 4I ATGATGTGCG ----/TGTT TGTGTGTGTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TGTT 0 1 125818 CASAVA_Build 6 165522248 1I TCACCATAAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 8 9 125819 CASAVA_Build 6 165539365 6D CATGCATGCG CACACA/------ CACACACACA 2516 het 2516 ref 33 16 7 13 CA 12 9 125820 CASAVA_Build 6 165571623 1D TGAGAAATCT A/- TTTTTTATAA 2076 het 2076 ref 25 17 5 3 A 1 0 125821 CASAVA_Build 6 165575568 4D CTTATAAGCC ATTG/---- ATTGAGTCAG 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 ATTG 2 1 125822 CASAVA_Build 6 165584767 2D TGGTGAGCAC TT/-- TCTTTGTGAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 7 T 3 1 125823 CASAVA_Build 6 165587346 2D CTACAGTTCT CA/-- GCAGTGATGT 3070 hom 114 het 40 0 39 3 CA 1 0 125824 CASAVA_Build 6 165606899 3D TTCTTGTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 15 12 125825 CASAVA_Build 6 165612212 1D TAGTTGAAGC A/- AATCAATTCA 3070 hom 138 het 52 0 45 7 A 3 2 125826 CASAVA_Build 6 165623624 1D TATTATTAAC A/- ATATTATGTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 1 125827 CASAVA_Build 6 165684647 1I CAATGACTTT -/C ATACACAATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 0 1 125828 CASAVA_Build 6 165722683 1D TCAGTGATCT G/- GGGAACTATT 3070 het 3070 hom 45 15 19 12 G 4 3 125829 CASAVA_Build 6 165731958 2D TAGAGCAAGA CT/-- CTCTCTCTCT 1607 het 1607 ref 31 9 9 13 CT 10 9 125830 CASAVA_Build 6 165743646 1D GCTGTAATAC A/- AAGCGGCAAT 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 A 3 2 125831 CASAVA_Build 6 165743975 2I GATGGCTAGA --/GG GCATTCTGTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 G 1 3 125832 CASAVA_Build 6 165745579 1I GTGATAATAC -/A TAATACCACC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 0 1 125833 CASAVA_Build 6 165746889 1D AAATATAAAT G/- AAAAAAAAAA 3070 het 2429 hom 23 9 13 1 G 1 0 125834 CASAVA_Build 6 165751114 1D CAGCAACAAC A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 A 8 7 125835 CASAVA_Build 6 165757972 1I GATCTACCCC -/T AATAAGACTC 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 0 1 125836 CASAVA_Build 6 165762328 1D CTGCTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 11 10 125837 CASAVA_Build 6 165764083 11I2M4I AATGGACTTA -----------TA----/ACATAACATCTTAACAT AAGATGTTAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 3 N/A 0 0 125838 CASAVA_Build 6 165765100 2D CATACATAAC AT/-- ATATATATAT 1933 het 207 hom 6 1 4 1 AT 7 6 125839 CASAVA_Build 6 165783686 1I ATCTTTGCCC -/A ATTTTTTCTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 125840 CASAVA_Build 6 165794576 1I AGCTCCAACA -/T TTTCCCCTTG 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 T 3 4 125841 CASAVA_Build 6 165807106 1D AAGTGGAGAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 37 11 14 13 A 8 7 125842 CASAVA_Build 6 165810796 4D CCCAGTGAGC CAAG/---- CTTGCCTGGT 2724 het 2724 ref 33 20 7 7 CAAG 1 0 125843 CASAVA_Build 6 165815220 6I GCTAAGACTC ------/TTAAAG TTAACTAGGC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 TTAAAG 0 1 125844 CASAVA_Build 6 165825494 1I AATAAGAAAC -/A AAACGGGAGC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 3 4 125845 CASAVA_Build 6 165829022 2I AAAAACACTC --/GA GAGTATTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 GA 1 2 125846 CASAVA_Build 6 165833726 1I ATTGAAAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 23 8 5 A 9 10 125847 CASAVA_Build 6 165834046 13I ACACAATACA -------------/CTGCGGAAGGCGG CAGGGACCTC 3070 het 3070 ref 30 11 12 7 CTGCGGAAGGCGG 0 1 125848 CASAVA_Build 6 165844914 2D GTGGCCTAAC AT/-- GTGGTATATC 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 AT 1 0 125849 CASAVA_Build 6 165858148 2I GCCCTGAGTC --/AG AGTCTTATCT 2569 het 2569 ref 31 19 7 5 AG 1 2 125850 CASAVA_Build 6 165863748 12D TCTTTATATA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 TG 14 8 125851 CASAVA_Build 6 165864088 3D TGCACATGTA CCC/--- CCCCCACGAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 C 8 5 125852 CASAVA_Build 6 165865241 4D CTCACCATAC TTTA/---- TTTAAGCTAT 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 TTTA 2 1 125853 CASAVA_Build 6 165867324 3D GCAACAAAGC TAT/--- TATATTTATT 3070 het 3070 hom 27 9 15 5 TAT 2 1 125854 CASAVA_Build 6 165870081 1D GATCAATAGT A/- AAAAAAAAAA 1862 het 1862 ref 43 34 4 5 A 13 12 125855 CASAVA_Build 6 165871299 1I AATGTAATTT -/C AACATTTGAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 125856 CASAVA_Build 6 165873237 1I TGTCTCTAAT -/A AAAAAAAAAA 1363 het 1363 ref 15 6 5 4 A 11 12 125857 CASAVA_Build 6 165877324 1D TTAAAATGGT A/- AAAAAACACC 3070 het 3070 hom 59 24 25 12 A 7 6 125858 CASAVA_Build 6 165878053 1D TGGTTAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2609 hom 32 11 14 7 A 15 14 125859 CASAVA_Build 6 165891112 2D CATATTTTTT CC/-- TTCTTTGCTA 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 C 2 0 125860 CASAVA_Build 6 165892430 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATAT 3070 het 2134 hom 16 5 9 2 A 7 8 125861 CASAVA_Build 6 165893957 2D AGCAAATCAA AT/-- AGTTACACAG 3070 het 3070 ref 53 26 25 2 AT 1 0 125862 CASAVA_Build 6 165897460 1I TCAGTCAGTC -/G ACCCCCTCCA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 G 0 1 125863 CASAVA_Build 6 165906755 2D GATGTCTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 789 hom 41 5 22 14 T 16 14 125864 CASAVA_Build 6 165907737 1I TACATTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 13 14 125865 CASAVA_Build 6 165909571 1D AAATATGTAA C/- CCACCCTATG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 3 2 125866 CASAVA_Build 6 165911739 1D TTTGTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 34 1 29 4 T 12 11 125867 CASAVA_Build 6 165912133 1I AATGCATTTA -/C CCCTTTTTGG 3070 hom 47 het 34 0 23 11 C 3 4 125868 CASAVA_Build 6 165912162 1D TCTTTTTCTG T/- TTTTTTCTTA 1325 het 1325 ref 30 5 4 21 T 7 6 125869 CASAVA_Build 6 165921142 1D CAGATATGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 34 0 28 7 T 9 8 125870 CASAVA_Build 6 165945856 1D TAAACACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 12 11 125871 CASAVA_Build 6 165948700 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 2136 het 681 hom 15 4 7 5 AAG 1 0 125872 CASAVA_Build 6 165954063 1I GTAAATGGAT -/G GGGTGCACTG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 G 3 4 125873 CASAVA_Build 6 165954724 1D TTATAGAACT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 27 9 8 10 A 9 8 125874 CASAVA_Build 6 165954777 3D TTAAGCTTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 9 5 A 13 10 125875 CASAVA_Build 6 165957226 1I TGGGCATTCA -/C CCCCTGACCA 266 het 266 ref 34 16 3 15 C 4 5 125876 CASAVA_Build 6 165958602 4D GCCAGCCTTC TTCA/---- TTCAGGGCAA 3070 het 3070 ref 52 27 15 12 TTCA 2 1 125877 CASAVA_Build 6 165963366 1I GTTTTTTTTT -/A AATTAAAGAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 2 3 125878 CASAVA_Build 6 165966558 1D TCACCGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 31 2 25 5 A 12 11 125879 CASAVA_Build 6 165967273 1I GCCGGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 957 hom 22 3 12 7 T 13 14 125880 CASAVA_Build 6 165975496 2D AATCATGAAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 95 het 45 0 29 19 GT 7 6 125881 CASAVA_Build 6 165983970 4I TAACATAAAA ----/ATGT ATGTATCTGA 3070 hom 134 het 52 0 45 7 ATGT 1 2 125882 CASAVA_Build 6 165984240 1D GTTACATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 578 hom 33 3 11 19 T 13 12 125883 CASAVA_Build 6 165987313 1D GGACTCAGTG C/- GTAAGGAAGA 3070 het 3070 ref 45 25 11 11 C 1 0 125884 CASAVA_Build 6 165988685 1I TACTGTCCTT -/G GGGGCATCCA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 4 5 125885 CASAVA_Build 6 165989000 2D CTGCAGGTCT TA/-- TACACGCCAC 3070 het 3070 ref 45 24 12 10 TA 2 1 125886 CASAVA_Build 6 166006570 3D CAGACCTGTC ATA/--- TCTAGGTGAA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 ATA 1 0 125887 CASAVA_Build 6 166007461 1I TAATTTAAAA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 31 het 27 1 24 2 T 6 7 125888 CASAVA_Build 6 166010219 1D ACGATCTGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 10 9 125889 CASAVA_Build 6 166011652 8D TATGTATGTG TGTGTCCA/-------- TGTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 40 25 11 7 TGTGTCCA 1 0 125890 CASAVA_Build 6 166011911 1D TGTATTCTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 10 9 125891 CASAVA_Build 6 166028317 1I AAACAGAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 6 7 125892 CASAVA_Build 6 166028822 2D TAGGAATGGT GA/-- GAGTCTGTGC 3070 het 3070 ref 42 28 10 4 GA 2 1 125893 CASAVA_Build 6 166035152 2I CATGTATGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1907 hom 38 9 14 15 TG 5 6 125894 CASAVA_Build 6 166048427 1I GTGGGTTGTT -/C CCCTTGCTCT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 C 3 4 125895 CASAVA_Build 6 166051062 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3023 hom 34 10 16 8 A 12 14 125896 CASAVA_Build 6 166053116 2I TGTGCAACAG --/GT GTGTAACCCA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 GT 2 3 125897 CASAVA_Build 6 166057328 1I GATAAAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 11 12 125898 CASAVA_Build 6 166057815 3D TTTTGAGACT AAG/--- AAGAGGATCA 3070 hom 114 het 42 0 38 5 AAG 2 1 125899 CASAVA_Build 6 166059112 4I TGTACTGAAC ----/CTGA CTGTCTCCTG 3070 het 3070 hom 55 21 27 7 CTGA 0 1 125900 CASAVA_Build 6 166067352 1D GTCTAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 11 10 125901 CASAVA_Build 6 166092769 1D ACATCCTAAC A/- GAGAGATGAG 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 1 0 125902 CASAVA_Build 6 166098020 10I GTTCCTTCTG ----------/ATGCTCGGAT GTGTTCGGAG 3070 hom 87 het 32 0 27 5 ATGCTCGGAT 0 1 125903 CASAVA_Build 6 166110977 3D CTTTGCAGTC AGT/--- AGTGGCCCAT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 AGT 2 1 125904 CASAVA_Build 6 166111181 3D TATTTACATT TAA/--- TTGTTAATTA 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 TAA 1 0 125905 CASAVA_Build 6 166112781 3D AAAACAAGTC ATT/--- GTTTAGTTTA 3070 het 3070 ref 47 23 20 7 ATT 1 0 125906 CASAVA_Build 6 166114764 1D CCCACCTATT A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 1 0 125907 CASAVA_Build 6 166114996 1I ATGCCCCAAC -/A AAAAATGTTC 3070 het 3070 hom 55 23 21 11 A 5 6 125908 CASAVA_Build 6 166117072 4I GAAACGAGTC ----/ACAA ACATAGAATG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 ACAA 0 1 125909 CASAVA_Build 6 166123290 1D TCTCAGGCAC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 9 8 125910 CASAVA_Build 6 166140128 1I CTGCTGAGCG -/C CCCCCCCCCA 2446 het 1411 hom 21 6 9 6 C 9 10 125911 CASAVA_Build 6 166146930 3D TAGTGACTTT ATG/--- ACCAAATCAG 3070 het 3070 hom 45 15 26 5 ATG 1 0 125912 CASAVA_Build 6 166147934 1D CCTAAAGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 9 125913 CASAVA_Build 6 166155380 1D AGGTGCCGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 85 het 35 0 29 6 T 9 8 125914 CASAVA_Build 6 166156741 1D CTATTTTTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 8 7 125915 CASAVA_Build 6 166158648 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 2185 het 5 hom 20 1 14 5 A 9 8 125916 CASAVA_Build 6 166159778 4I CCCCATGTCC ----/CTTT GTCTTCATGT 3070 het 3070 hom 65 25 28 12 CTTT 0 1 125917 CASAVA_Build 6 166165900 1I ATCCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 11 12 125918 CASAVA_Build 6 166168212 1D AAGAGTGGCT G/- CCATCCAGAG 3070 hom 104 het 40 0 32 8 G 1 0 125919 CASAVA_Build 6 166181569 1D ATGCTAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 23 0 8 15 T 11 10 125920 CASAVA_Build 6 166182709 1D ACATTTTATT A/- AAAAGATAAC 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 5 4 125921 CASAVA_Build 6 166183301 1I GTGTTTTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 70 het 30 0 24 6 A 9 10 125922 CASAVA_Build 6 166189069 2D TCCTCATGAA AG/-- AGGAACAGAA 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 AG 2 1 125923 CASAVA_Build 6 166191083 8D TGGCTTATGC AGAAGCTG/-------- AGAAGCTGAG 3070 het 3070 ref 47 25 18 11 AGAAGCTG 2 1 125924 CASAVA_Build 6 166200155 1D AAAAAAACAA C/- AAAAAAGAGT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 C 1 0 125925 CASAVA_Build 6 166206137 2D GTGTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 hom 83 het 32 0 26 6 TG 1 0 125926 CASAVA_Build 6 166206982 5D AAGGCAACTG TTTAC/----- TTTAATTCAA 3070 het 3070 ref 40 25 12 4 TTTAC 1 0 125927 CASAVA_Build 6 166207862 1I GAAAAAAAAA -/T ATTTAGCCAG 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 0 1 125928 CASAVA_Build 6 166213402 1D ATGAATTCTC G/- GGGGGGGACA 3070 het 2350 hom 22 9 8 6 G 8 7 125929 CASAVA_Build 6 166217027 1I6M1I CAAAAAAAAA -AAAAAT-/TAAAAATA AAATAAAAAT 2242 het 1008 hom 16 7 6 5 N/A 0 0 125930 CASAVA_Build 6 166235359 1I AGCCCAGCCC -/T GTCACATAAA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 0 1 125931 CASAVA_Build 6 166235565 6I TTGAATAAAA ------/ACAAAG ACAAATTTTG 3070 het 3070 hom 67 29 33 5 ACAAAG 0 1 125932 CASAVA_Build 6 166237223 1I GTGTAGATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 9 10 125933 CASAVA_Build 6 166248480 3I CAGAAACACT ---/GTC GTCCCATGCA 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 GTC 1 2 125934 CASAVA_Build 6 166250796 1D CCAAGAGCAT G/- GCCATGGCTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 2 1 125935 CASAVA_Build 6 166253319 1I ATACAAAGCT -/C CAGTGGAAGT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 C 1 2 125936 CASAVA_Build 6 166257253 1D ATTAACTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 T 11 10 125937 CASAVA_Build 6 166262183 7I CGTCTGGAGC -------/ACTTCTG ACTCCCTCAC 3070 het 3070 hom 55 19 30 6 ACTTCTG 0 1 125938 CASAVA_Build 6 166275782 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAT 3070 het 154 hom 29 1 20 8 AC 4 5 125939 CASAVA_Build 6 166279548 1D GGTCATAACC A/- AAAAAAAATC 3070 het 146 hom 30 1 24 5 A 9 8 125940 CASAVA_Build 6 166279977 3D ATCTCAAAAT AAA/--- AAAAAAAAAA 2103 hom 11 het 11 0 8 3 A 15 12 125941 CASAVA_Build 6 166281556 10D TACATATATG TACATATATA/---------- TACACATACA 3070 het 3070 ref 32 16 15 3 TACATATATA 1 0 125942 CASAVA_Build 6 166284235 1D CTAAAGCACT A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 89 het 38 0 30 8 A 8 7 125943 CASAVA_Build 6 166286337 1D TTTATAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2401 hom 25 11 12 2 A 12 11 125944 CASAVA_Build 6 166296045 1I CAAGTTCATG -/T TTTTTCCCAG 3070 hom 179 het 70 0 59 11 T 5 6 125945 CASAVA_Build 6 166304618 1I AGAGGGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 11 12 125946 CASAVA_Build 6 166307051 1D CTTTTTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 26 0 21 5 A 13 12 125947 CASAVA_Build 6 166313875 4D TTATGAAAGC TTTA/---- TTTATTTATA 3070 het 3070 hom 50 23 24 4 TTTA 3 2 125948 CASAVA_Build 6 166316248 2D GGTTTTCATC AA/-- AGAGTCCTCC 3070 het 3070 hom 37 16 21 1 A 3 1 125949 CASAVA_Build 6 166318182 1D CCAAATGCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 10 9 125950 CASAVA_Build 6 166319216 1D CTCCATCCCC A/- GTACGGTGTG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 1 0 125951 CASAVA_Build 6 166320447 1I AGAAGAGACT -/G GGGGAGGTGG 3070 hom 51 het 21 0 12 9 G 4 5 125952 CASAVA_Build 6 166335389 1D GAGCAACCTG A/- GAGACTGAGA 3070 hom 175 het 64 0 58 8 A 1 0 125953 CASAVA_Build 6 166335739 10I GGGAGACTGT ----------/GAGGACTCTG GAGAGGCAAA 3070 het 2688 hom 31 7 19 6 GAGGACTCTG 0 1 125954 CASAVA_Build 6 166336337 1D ATCTGCGGAG C/- CCCCCCCAGC 3070 hom 66 het 25 0 22 5 C 8 7 125955 CASAVA_Build 6 166340101 1D ATTGTATCAG A/- GGGGGTTGTG 3070 het 3070 hom 50 23 23 6 A 1 0 125956 CASAVA_Build 6 166343148 1I AATTTTGAGG -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 A 6 7 125957 CASAVA_Build 6 166345113 1D ACACTATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 23 0 22 3 A 10 9 125958 CASAVA_Build 6 166366007 2I ATTTAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 29 0 24 5 A 11 13 125959 CASAVA_Build 6 166369186 1D ATTGAGGAAT A/- AGGATTCAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 A 2 1 125960 CASAVA_Build 6 166371019 1D GGATCGTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 101 het 45 0 32 13 T 10 9 125961 CASAVA_Build 6 166372069 1D TATTGGTACT A/- AATTCTTCTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 3 2 125962 CASAVA_Build 6 166381430 1D TTTTTTAAAT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 A 7 6 125963 CASAVA_Build 6 166383549 15I GGGTTCAAGT ---------------/GATTCTCATCTCAGC GATTCTCATC 2781 het 2781 ref 21 10 6 5 GATTCTCATCTCAGC 1 2 125964 CASAVA_Build 6 166385890 1I CACTATTGGC -/T TGTTAGCTAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 1 2 125965 CASAVA_Build 6 166386329 1I GTTTCTCTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 9 10 125966 CASAVA_Build 6 166391729 1D TCTAATTCCG C/- CCCCCCCCCG 3070 het 6 hom 26 1 9 16 C 10 9 125967 CASAVA_Build 6 166396096 1D TCTCTATACC A/- ATTTCTGTCT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 2 1 125968 CASAVA_Build 6 166411288 2I TTGGCAATGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 32 0 22 10 A 13 15 125969 CASAVA_Build 6 166412761 2I CAGGGTCATG --/CT CTCTCTGAAG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 CT 3 4 125970 CASAVA_Build 6 166417449 1I TGTGGAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 734 hom 42 2 28 12 A 11 12 125971 CASAVA_Build 6 166430014 11I TTGGCAGTCT -----------/ATTTATTACCA ATCAGTTTCA 3070 het 3070 ref 32 13 8 11 ATTTATTACCA 0 1 125972 CASAVA_Build 6 166430279 2D TTATTAATTT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 15 10 6 A 10 8 125973 CASAVA_Build 6 166436841 1I TCAGGATCAC -/A AAGGCTTCTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 2 3 125974 CASAVA_Build 6 166437067 1D TCAGGTTAGC A/- GTAGTAAAAT 3070 het 3070 hom 43 12 20 12 A 1 0 125975 CASAVA_Build 6 166438490 2I CCACTGCCGC --/CA CAGTGTCTCT 3070 het 3070 hom 36 16 13 7 CA 1 2 125976 CASAVA_Build 6 166442233 3D TCCGTGTTTT TGA/--- TGATGTCTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 TGA 2 1 125977 CASAVA_Build 6 166455052 1D ACAAAATATT G/- TTCTTTGGAT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 G 1 0 125978 CASAVA_Build 6 166481089 2D ATGCGCCTTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 2767 hom 23 7 11 5 T 11 9 125979 CASAVA_Build 6 166482027 1D GTCCTCACGA T/- TTTTAGGAGA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 5 4 125980 CASAVA_Build 6 166484303 4D GTTTGTTTGT TTTG/---- TTTGTTTTTT 2060 het 2060 ref 12 6 6 0 TTTG 2 1 125981 CASAVA_Build 6 166484989 5I CCACTTGATG -----/TATGA TATAATACAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 TATGA 0 1 125982 CASAVA_Build 6 166487989 1D ACGATTCAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 T 9 8 125983 CASAVA_Build 6 166488130 2I AAAAAAATAC --/AA AAGTCAGCTG 3070 het 2947 hom 23 7 12 5 A 2 4 125984 CASAVA_Build 6 166493438 1D GCGGGCAATT G/- AATTCTTATT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 G 1 0 125985 CASAVA_Build 6 166495401 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGC 2076 het 2076 ref 17 8 7 2 A 8 9 125986 CASAVA_Build 6 166503577 1D TTGAAGAGTA C/- GACCCAGGAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 C 1 0 125987 CASAVA_Build 6 166507827 2I TTAGAATTAG --/CA CACATTCTAC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 CA 2 3 125988 CASAVA_Build 6 166513980 1D TGAGGCGTAT A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 7 6 125989 CASAVA_Build 6 166544915 1I GCAGTTCTTT -/A AAAAAATCTG 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 6 7 125990 CASAVA_Build 6 166551409 3I TTCAAAGTAA ---/AAC AACAAGATGC 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 AAC 1 2 125991 CASAVA_Build 6 166568201 1I AGCCCACCAG -/T TTTGAGACAT 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 T 3 4 125992 CASAVA_Build 6 166577725 5D CAGTCCACGA AAGCC/----- AAGCCGGCTT 3070 het 3070 ref 51 27 16 9 AAGCC 2 1 125993 CASAVA_Build 6 166578930 1I45M11D ATTGTCCTAG -CCCCTGCCTTGTTGCTTTGACACGAGGTAAGAACTACTTTCCTCCTTATTACACTG/CCCCCTACCTTGTTGCTTTGACACGAGGTAAGAACTACTTTCCTCC----------- TTTTATGTAG 3070 het 3070 ref 40 37 22 5 N/A 0 0 125994 CASAVA_Build 6 166580865 7D CACCACATTC TTATTTT/------- TTATTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 TTATTTT 3 2 125995 CASAVA_Build 6 166581684 4D AAAGCTTTAA TAGT/---- TAAACAATAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 2 TAGT 1 0 125996 CASAVA_Build 6 166583569 4I GGCCAGAACT ----/TAAG TAAGAGCAGT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 TAAG 1 2 125997 CASAVA_Build 6 166590186 1I TTAAAACAAA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 6 7 125998 CASAVA_Build 6 166592647 2D CTTTCGAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3064 hom 32 12 15 5 T 15 13 125999 CASAVA_Build 6 166593104 44D AAGCTTGTTC ATGTGTCTTTCGCACCCAGCACGTTTTAGACAGTATGCTTGTTG/-------------------------------------------- ATGTGTCTCT 1795 het 1795 ref 26 27 8 4 ATGTGTCTTTCGCACCCAGCACGTTTTAGACAGTATGCTTGTTG 1 0 126000 CASAVA_Build 6 166593522 1D TATAATTTGA T/- ATTCTGTCCT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 1 0 126001 CASAVA_Build 6 166619410 1D AGTTTGTGTC G/- TCTGAGCACC 2867 het 2867 ref 38 24 10 5 G 1 0 126002 CASAVA_Build 6 166620844 4D GTCACCTCTC ACTT/---- AGTCATTATT 3070 het 3070 ref 36 19 15 4 ACTT 1 0 126003 CASAVA_Build 6 166635828 12D GGTGACAGGA TGGCATCAGGAG/------------ TGGCATCAGG 3070 het 2935 hom 37 13 13 15 TGGCATCAGGAG 2 1 126004 CASAVA_Build 6 166637975 14I ACCACGGTTG --------------/GCTGAAATTACCAT GCTGAAAAGC 3070 hom 141 het 50 0 47 4 GCTGAAATTACCAT 0 1 126005 CASAVA_Build 6 166638379 1I TAGGCAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 8 9 126006 CASAVA_Build 6 166638590 1I TGACTATCTT -/A AAAAATCCTG 3070 hom 82 het 35 0 28 7 A 5 6 126007 CASAVA_Build 6 166642265 2D CTGCGGCCCC GG/-- ACACATCCTG 2672 het 2672 ref 25 11 10 5 G 2 0 126008 CASAVA_Build 6 166645316 1D AAATATGGTG T/- TTTTTTTTTT 2395 het 2319 hom 19 7 8 4 T 11 10 126009 CASAVA_Build 6 166646667 1D TTTGGGAATT A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 A 7 6 126010 CASAVA_Build 6 166654034 1I AACTTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 T 9 10 126011 CASAVA_Build 6 166667377 8D CTTCCTGCTG CCACCAAA/-------- CCACCAAACC 3070 het 3070 hom 55 24 25 11 CCACCAAA 3 2 126012 CASAVA_Build 6 166674193 4I ACACATTATA ----/TACT TACTTGTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 TACT 1 2 126013 CASAVA_Build 6 166675309 1I TTTTATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 787 hom 25 3 16 6 A 13 14 126014 CASAVA_Build 6 166677284 2I TAGAATAAAA --/CT CTATGTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 CT 1 2 126015 CASAVA_Build 6 166678781 1D GCCTCAGTTT C/- CCCCCAACAC 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 C 6 5 126016 CASAVA_Build 6 166697654 5I49M1I ACCCTGTCTC -----AAAAGTGACAGAATATGGACCCTTGAGGGAGACTGCGCCTCACAGACTT-/AAAAAAAAAGTGACAGAATATGGACCCTTGAGGGAGACTGCGCCTCACAGACTTC CCCCTCTGCT 3070 het 3070 ref 20 19 9 4 N/A 0 0 126017 CASAVA_Build 6 166706223 1I TACCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 10 11 126018 CASAVA_Build 6 166707355 1D GCAGAGCTTC T/- TTTCATATGC 3070 het 3070 ref 51 30 16 5 T 4 3 126019 CASAVA_Build 6 166710268 3D TTTTCTTGAT TAA/--- TGTTAACATG 3070 het 3070 ref 51 29 14 12 TAA 1 0 126020 CASAVA_Build 6 166714312 3I AGCTACTTGG ---/GAA GAAGCTAAGG 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 GAA 1 2 126021 CASAVA_Build 6 166718465 1D TGACACTGAC T/- TTTCATTGTA 3070 het 3070 ref 57 28 22 7 T 4 3 126022 CASAVA_Build 6 166720580 1D AACATAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 24 1 21 2 A 11 10 126023 CASAVA_Build 6 166720592 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 8 hom 24 1 17 6 A 10 9 126024 CASAVA_Build 6 166726213 7I GTGGGTTCAT -------/GTCCGTG GGTCTCGCTG 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 GTCCGTG 0 1 126025 CASAVA_Build 6 166733536 2I AAAAAAAAAA --/AT AAAAAAAAAT 3070 het 196 hom 19 4 9 6 AT 0 1 126026 CASAVA_Build 6 166744582 1D GTTCTCTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 10 9 126027 CASAVA_Build 6 166781406 6D CTCTTGCTGT CTTTTG/------ GAGAGGATGT 3070 het 3070 hom 27 9 16 5 CTTTTG 1 0 126028 CASAVA_Build 6 166782864 2I CTCCAAAGGC --/CA CAGGGAAGGA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 CA 1 2 126029 CASAVA_Build 6 166783879 12D CACAGGAGAT CACCACAGGGAC/------------ CACCACAGGG 1747 het 1510 hom 29 8 8 19 CACCACAGGGAC 2 1 126030 CASAVA_Build 6 166805297 2I TGTCTTTCCC --/CT GAGGACTCCC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 CT 0 1 126031 CASAVA_Build 6 166812775 1D CCATTATCCA C/- TCACACTTGC 3070 het 3070 ref 28 10 11 7 C 1 0 126032 CASAVA_Build 6 166841953 1D GTGAGCGCTG C/- CCCTCTCTCA 2826 het 2826 ref 27 13 8 6 C 4 3 126033 CASAVA_Build 6 166879961 1I CTGGGAAAAC -/T TTTTTTTTTT 1586 het 1586 ref 39 17 7 15 T 15 16 126034 CASAVA_Build 6 166926177 1I CAGCGCTTCA -/C CTTCCAGGAG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 1 2 126035 CASAVA_Build 6 166956757 1I TAATTAGTTT -/A AAATGTACAT 3070 het 3070 ref 53 22 21 10 A 3 4 126036 CASAVA_Build 6 166963432 3D CTTATGGAAG AGA/--- AGGTGAGTGA 3070 het 3070 ref 59 29 25 5 AGA 1 0 126037 CASAVA_Build 6 166966090 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2093 hom 29 13 10 6 A 16 14 126038 CASAVA_Build 6 166973699 1I CTTAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 7 17 5 A 10 11 126039 CASAVA_Build 6 166976235 1I CAGGATAAGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 A 8 9 126040 CASAVA_Build 6 166980641 1I TGTTCTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 10 11 126041 CASAVA_Build 6 166989728 11D GGGTCTGGCG TTAGCGGTCTC/----------- TGAGAGGAGA 3070 het 2289 hom 23 6 15 5 TTAGCGGTCTC 1 0 126042 CASAVA_Build 6 166990819 1D AAAACAGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 A 11 10 126043 CASAVA_Build 6 166992544 1D CCCCACAACA C/- CCCCCCTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 19 10 C 7 6 126044 CASAVA_Build 6 166992644 3D3M3D CATGAAGAAA ATGAGCATG/---AGC--- AAGTCAGACA 3070 het 3070 ref 36 18 18 3 N/A 0 0 126045 CASAVA_Build 6 166993418 1I TTTTTTTTTT -/C TTAGACACAA 3070 het 1959 hom 29 10 14 5 C 0 1 126046 CASAVA_Build 6 166996602 8I GAGCCTGAGC --------/AGACTAAT AGACTAATAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 AGACTAAT 1 2 126047 CASAVA_Build 6 166997744 3D ATCAAAAGGG CAT/--- CATCATCCCT 3070 het 3070 ref 66 38 20 10 CAT 3 2 126048 CASAVA_Build 6 167004078 2D CCTAAAACAT AA/-- GTGTGATCTT 3070 het 3070 ref 47 23 20 6 A 2 0 126049 CASAVA_Build 6 167015170 11D CCCTGCCCGC CCCCCCCCCCG/----------- CCCCCGCCCA 1671 het 14 hom 11 1 6 6 CCCCCCCCCCG 1 0 126050 CASAVA_Build 6 167030697 1D AGGTAAAGTT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 A 8 7 126051 CASAVA_Build 6 167033970 1D TAAAATTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 A 10 9 126052 CASAVA_Build 6 167034808 2I TTTCCAGTAA --/CT CTGCCAGCAG 3070 het 3070 ref 55 31 20 4 CT 1 2 126053 CASAVA_Build 6 167035903 11D TTTGTCTAGT GCTTGTCTAGC/----------- GCTTGTCTAG 3070 hom 100 het 36 0 32 12 GCTTGTCTAGC 2 1 126054 CASAVA_Build 6 167045263 2D GAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 AG 9 8 126055 CASAVA_Build 6 167050379 1D AATAAACTGC A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 7 126056 CASAVA_Build 6 167051851 1I TGTGAGGCTG -/T TTTGAGTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 3 4 126057 CASAVA_Build 6 167076676 1I CAAACTGTCA -/C CCAAAACACG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 C 2 3 126058 CASAVA_Build 6 167092545 2D29M2I TGTTGCATTC GTGTGTGTGTGTGTGTGCACATGTGTGTGCC--/--GTGTGTGTGTGTGTGCACATGTGTGTGCCTG TGTGTGTGCA 3070 het 3070 ref 46 28 18 13 N/A 0 0 126059 CASAVA_Build 6 167130031 30D GGTGCCACTG CACTCCAGTCTGGCAACAGAGACTCTGTCT/------------------------------ TAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 21 17 7 5 CACTCCAGTCTGGCAACAGAGACTCTGTCT 1 0 126060 CASAVA_Build 6 167132183 1D GCTCTTTCCC A/- AAAGTGATCT 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 A 4 3 126061 CASAVA_Build 6 167133071 2D28M1I CATTTTCATG TTTTTTTTTTTTTTAAAAGGATGAGAGTGG-/--TTTTTTTTTTTTAAAAGGATGAGAGTGGT TGTGAAATCA 3070 hom 16 het 25 1 22 7 N/A 0 0 126062 CASAVA_Build 6 167133238 1I TAGCTGAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 9 10 126063 CASAVA_Build 6 167133531 1D ACACCAGGTA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 8 7 126064 CASAVA_Build 6 167134807 5D GAAAGGGAGG TTTAT/----- TTTATTTTAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 TTTAT 5 4 126065 CASAVA_Build 6 167136411 4D TGTATGTATA TGTG/---- TGTGTGTGTA 2190 het 2190 ref 19 7 8 4 TG 6 4 126066 CASAVA_Build 6 167137649 1I GTAAATTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 10 11 126067 CASAVA_Build 6 167140285 1I TAAAAAAAAA -/T ATTAGTTTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 1 126068 CASAVA_Build 6 167150681 1D CCCTGCTGCT C/- CCCCCTTAGC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 C 6 5 126069 CASAVA_Build 6 167151195 2D ATCTTTTTTC TT/-- TTTTTCTTTT 363 het 363 ref 31 9 7 15 T 7 5 126070 CASAVA_Build 6 167153948 10D AAGCCTTGTG TGAAGGTAGT/---------- TGTCTTGGGA 3070 het 3070 ref 28 14 12 5 TGAAGGTAGT 1 0 126071 CASAVA_Build 6 167158264 28D CGTGTGTGTC TGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTATGTGTG/---------------------------- TCTGTGTGTG 3070 het 1626 hom 53 10 36 19 TGTGTGTGTGTCTGTGTGTCTATGTGTG 1 0 126072 CASAVA_Build 6 167165389 4D ATGATGGATG GATA/---- GATAGACAGA 3070 het 3070 ref 47 25 19 5 GATA 2 1 126073 CASAVA_Build 6 167167892 4D AATGATGAGA AGAC/---- ATGGACACAA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 AGAC 1 0 126074 CASAVA_Build 6 167169927 2D39M1I GTAAATATAC ATGTTAATTATTTTCTATTTTTCTACCTCCAAGTTTTCTGA-/--GTTAATTATTTTCTATTTTTCTACCTCCAAGTTTTCTGAT TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 39 27 22 2 N/A 0 0 126075 CASAVA_Build 6 167178336 3D TAACAATAAC ACA/--- ACAACAACAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 ACA 4 3 126076 CASAVA_Build 6 167179708 1I AATTGCCAAC -/A AAAAAAAAAG 1972 het 1972 ref 28 20 5 3 A 9 10 126077 CASAVA_Build 6 167179882 1I AAGGACATAA -/C AAAAAAAGAA 1390 het 1390 ref 28 21 4 3 C 0 1 126078 CASAVA_Build 6 167181377 15D ACAAAAACAA AGATAAATAGATGGG/--------------- ACTTAATTAA 3070 het 3070 ref 23 16 12 1 AGATAAATAGATGGG 1 0 126079 CASAVA_Build 6 167183683 1D GGTACAAGGA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 8 7 126080 CASAVA_Build 6 167183809 1D CCACTCAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 10 9 126081 CASAVA_Build 6 167187968 1D CACCTTTTTA T/- TCTTTTCCAT 3070 hom 117 het 44 0 40 6 T 2 1 126082 CASAVA_Build 6 167188823 3I21M3I CGAAGAAGAC ---GAAGAAGACAAAGATGAAGAT---/GAAGAAGAAGACAAAGATGAAGATGAA GAAGAAGAAG 3070 hom 62 het 26 0 21 5 N/A 0 0 126083 CASAVA_Build 6 167193619 2I TGGAAATTTC --/CT CTCAGAAACT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CT 1 2 126084 CASAVA_Build 6 167194838 3D CAGGTATATC TAA/--- TAATTTAGTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TAA 2 1 126085 CASAVA_Build 6 167205508 3D GGAATAAAGT AAG/--- AAGTATTTCT 3070 hom 42 het 15 0 14 3 AAG 2 1 126086 CASAVA_Build 6 167223557 1D AAAGGGCTAA T/- TATCCAGAAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 2 1 126087 CASAVA_Build 6 167224461 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAGA 2435 hom 15 het 7 0 5 2 A 8 9 126088 CASAVA_Build 6 167224794 2D TGATCAGGCT AA/-- AAAGGCTTGC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 5 3 126089 CASAVA_Build 6 167251029 1D TGGAAAAGCA T/- TTTTTAAAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 6 5 126090 CASAVA_Build 6 167255401 3D AGTGAAGTAA TCC/--- TCCTCTTGTA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 TCC 2 1 126091 CASAVA_Build 6 167263945 2D ACATGCATGT AC/-- ACACACACAC 1349 het 1349 ref 103 68 5 34 AC 8 7 126092 CASAVA_Build 6 167268694 1D CTTTGCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 862 hom 42 2 35 6 A 12 11 126093 CASAVA_Build 6 167280155 3I ATTAAAAGTC ---/AAT AATACCTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AAT 1 2 126094 CASAVA_Build 6 167281826 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1402 het 1402 ref 24 15 3 7 A 15 14 126095 CASAVA_Build 6 167288525 3I GTAAGAAATC ---/CTT CTATTAACCC 3070 hom 39 het 21 0 14 7 CTT 0 1 126096 CASAVA_Build 6 167288773 4D3M7D CACACGCACA GACGCGCACACACG/----CGC------- ACACACACGC 1485 hom 15 het 9 0 6 3 N/A 0 0 126097 CASAVA_Build 6 167291337 1D TGGAACAGAT G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 G 8 7 126098 CASAVA_Build 6 167292191 10D AGGTACTGAG TATAAAACAA/---------- TATAAAACAA 2770 hom 18 het 7 0 7 0 TATAAAACAA 2 1 126099 CASAVA_Build 6 167294842 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 21 0 20 1 A 11 10 126100 CASAVA_Build 6 167296224 1I GAAATGGTAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 8 9 126101 CASAVA_Build 6 167297838 1D CTTCATTTCT G/- GGTTCTCTAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 3 2 126102 CASAVA_Build 6 167297913 1D TACTGTAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 10 9 126103 CASAVA_Build 6 167299229 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 24 het 10 0 9 2 T 7 6 126104 CASAVA_Build 6 167299628 1I TCATTTATCA -/G TTCCAGGAGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 126105 CASAVA_Build 6 167302149 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1656 het 62 hom 16 1 7 8 T 15 14 126106 CASAVA_Build 6 167306010 1D CTCAGGGCGT C/- CCCCTATGGG 3070 hom 50 het 23 0 18 5 C 5 4 126107 CASAVA_Build 6 167325404 1D TATTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 21 0 14 7 T 11 10 126108 CASAVA_Build 6 167338092 69D GTTCTGGTTT TTGATCCTCAAGAGTGTTGGGTCATGAGCTAAACTGTCTGGAACAAATCCCAACTCCTCGTTGCCTCAC/--------------------------------------------------------------------- TTGATCCTCC 3070 hom 36 het 15 0 13 8 TTGATCCTCAAGAGTGTTGGGTCATGAGCTAAACTGTCTGGAACAAATCCCAACTCCTCGTTGCCTCAC 1 0 126109 CASAVA_Build 6 167342594 20D TTAATGTTGG GCGCGGTGGCTCATGCCTGT/-------------------- AATCCCAGCG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 GCGCGGTGGCTCATGCCTGT 1 0 126110 CASAVA_Build 6 167347290 1I CGCCTCTACT -/G AAAATACAAA 1702 het 1702 ref 16 10 4 2 G 0 1 126111 CASAVA_Build 6 167364346 5D ACCCCATCCC TTTGT/----- ACAAAGCTTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TTTGT 1 0 126112 CASAVA_Build 6 167373510 1I ACCGGTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 33 1 26 6 T 12 13 126113 CASAVA_Build 6 167444145 1I TTTTCATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 37 0 28 9 T 10 11 126114 CASAVA_Build 6 167471787 1D AATGGAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 35 2 23 11 T 15 14 126115 CASAVA_Build 6 167497396 1I TATGACTGCA -/C CCCCCCAGGC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 C 6 7 126116 CASAVA_Build 6 167501144 1I GTCTCGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 11 23 13 A 10 11 126117 CASAVA_Build 6 167502181 2D TGATGAAAAC AT/-- GTGGGTGGAC 2290 het 2290 ref 46 35 6 7 AT 1 0 126118 CASAVA_Build 6 167511261 1I GAGAAGACTG -/C CCCCCCAACT 1637 het 1637 ref 49 38 5 6 C 6 7 126119 CASAVA_Build 6 167514624 1I TATATTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1653 hom 24 4 11 9 A 12 13 126120 CASAVA_Build 6 167517770 1I ACAATGGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 19 1 13 5 T 10 11 126121 CASAVA_Build 6 167535588 1I AAGCTGTGAG -/A AAGTGAATGA 2082 het 2082 ref 33 25 5 3 A 2 3 126122 CASAVA_Build 6 167542558 2D TTCCCCAGCA GG/-- GGGGCAGTCA 2092 het 33 hom 21 0 6 15 G 6 4 126123 CASAVA_Build 6 167544798 6I AGAGAGGTGC ------/TTTTTT TTTTTTTTTT 1791 het 39 hom 18 1 9 8 T 11 17 126124 CASAVA_Build 6 167546934 1D GGGACAGGCG T/- TTTTTATGGA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 6 5 126125 CASAVA_Build 6 167547998 1I16M6D ATGGCTGGAG -CCCAGTGGGACAGTGACCCGGG/CCCCAGTGGGACAGTGA------ CCCGGGCTTC 3070 hom 75 het 26 0 25 2 N/A 0 0 126126 CASAVA_Build 6 167549120 1D TTCCCCAACA T/- TTTTTTTTTG 2273 het 309 hom 9 1 6 6 T 10 9 126127 CASAVA_Build 6 167552215 1D ACATTTACAT C/- TGAAATCTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 1 0 126128 CASAVA_Build 6 167555235 1I CACGTCACCC -/A CCGTGGCTGG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 0 1 126129 CASAVA_Build 6 167556346 4D TGCACTGGGC CAGA/---- CAGTCTCTAG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 CAGA 1 0 126130 CASAVA_Build 6 167556424 10D TAAAAAAAAA ATAAATACGT/---------- AGAAGAAAGA 3070 hom 30 het 11 0 9 2 ATAAATACGT 1 0 126131 CASAVA_Build 6 167558626 1I CTGAAGCCTC -/A ATTTTTGTCT 3070 hom 132 het 46 0 43 3 A 1 2 126132 CASAVA_Build 6 167562538 1D AGTTGTTTTT C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 9 8 126133 CASAVA_Build 6 167565882 1I AAACAAAATT -/C CTAGTCAATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 1 2 126134 CASAVA_Build 6 167579762 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 14 13 126135 CASAVA_Build 6 167584746 1D GTTATAACCA G/- AATGAACAAA 3070 het 3070 hom 49 17 27 5 G 1 0 126136 CASAVA_Build 6 167585443 1I CAGATTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 10 11 126137 CASAVA_Build 6 167591231 2I TTTATTCAAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 TA 6 7 126138 CASAVA_Build 6 167602520 2D CCTGGTGGCC CA/-- CTGGGACCAG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 CA 1 0 126139 CASAVA_Build 6 167606500 2D GCCATAGAAT TG/-- TATTTTTGGT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 TG 1 0 126140 CASAVA_Build 6 167606773 1D TCAGGCCCCC A/- ACTCCTAACT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 2 1 126141 CASAVA_Build 6 167610242 1I AAGTCTAAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 8 9 126142 CASAVA_Build 6 167611334 6I TCTCTGTCCC ------/TCTCTG TCTCTGTCTC 3070 het 2355 hom 27 8 9 10 TCTCTG 1 2 126143 CASAVA_Build 6 167617673 1I TTTACCAGAA -/C CCCCATGGGT 3070 het 3070 ref 52 38 8 6 C 4 5 126144 CASAVA_Build 6 167618696 1I CACAGGCTGG -/C CCCTGAGCCA 3070 het 3070 ref 43 13 13 17 C 3 4 126145 CASAVA_Build 6 167620456 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2481 het 199 hom 9 1 7 3 A 27 16 126146 CASAVA_Build 6 167630879 1D CCACCACATC T/- TTCTCCTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 3 2 126147 CASAVA_Build 6 167632610 4D67M6D AAAAAAAAAT ACACACACACACACACACACATATTTATATATGCATGTACATATACATATACACGTATATATTTCTATATGTATATA/----ACACACACACACACACATATTTATATATGCATGTACATATACATATACACGTATATATTTCTATATG------ TATATATATA 3070 het 3070 ref 14 13 9 2 N/A 0 0 126148 CASAVA_Build 6 167638035 2D ATCTCTCTAG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 732 hom 33 4 20 9 T 11 9 126149 CASAVA_Build 6 167638581 11I CTTCTCTGCT -----------/CCGTCCCCACC CCAGATCCCT 3070 hom 68 het 27 0 22 5 CCGTCCCCACC 0 1 126150 CASAVA_Build 6 167645379 2I CACGGCACAT --/TC TCGTACAGCT 888 het 888 ref 50 36 3 13 TC 1 2 126151 CASAVA_Build 6 167645461 1D CTTCCCACGA G/- GGTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 G 3 2 126152 CASAVA_Build 6 167647707 2D TTCCACACTC CT/-- GTGTGTCTTG 3070 het 3070 ref 41 19 15 9 CT 1 0 126153 CASAVA_Build 6 167650915 1I GGACACTTCA -/C CCTCCAGCGC 3070 hom 87 het 33 0 27 6 C 2 3 126154 CASAVA_Build 6 167655415 1I GGCCCACGGA -/G GGGGGCCCAG 1461 hom 34 het 19 0 8 11 G 5 6 126155 CASAVA_Build 6 167655800 3I TAGTTCCTCT ---/AAG AAGAGGAACT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 AAG 1 2 126156 CASAVA_Build 6 167664046 1I TCACAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3011 hom 25 8 14 3 A 9 10 126157 CASAVA_Build 6 167669465 1D AAAGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 13 2 11 0 A 13 12 126158 CASAVA_Build 6 167672627 2D AAATTTTCAA AC/-- ACTACAGAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AC 2 1 126159 CASAVA_Build 6 167684340 11I GAGCCGCCTA -----------/GAAGGCAACGG GAAGCAGAAG 3070 het 1951 hom 27 10 11 6 GAAGGCAACGG 0 1 126160 CASAVA_Build 6 167693016 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 T 12 13 126161 CASAVA_Build 6 167699458 4D AGGCATATAT TAAC/---- TAACTAAAAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 TAAC 2 1 126162 CASAVA_Build 6 167707406 1D TTTTATTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 11 10 126163 CASAVA_Build 6 167712375 1D CAAAAAAAAA G/- TTTGGAAATT 3070 het 2513 hom 25 7 15 3 G 1 0 126164 CASAVA_Build 6 167725599 33D TTGTCATCTT GGGAGACGTCAGGATCTGACTGCTCGTCTTCAC/--------------------------------- GGGAGACGTC 3070 het 3070 ref 36 25 15 10 GGGAGACGTCAGGATCTGACTGCTCGTCTTCAC 1 0 126165 CASAVA_Build 6 167727791 11D10M1I AGAGAGAGAA AGAAGAGAGAGAGAAAGAAGG-/-----------AGAAAGAAGGA AAAAAAAGAA 2337 het 2337 ref 17 11 5 3 N/A 0 0 126166 CASAVA_Build 6 167735457 2D GAGGGAGACT CA/-- CAGAACCCGT 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 CA 2 1 126167 CASAVA_Build 6 167747708 1D CAGGCTTACA G/- CCCGGGAGCA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 G 1 0 126168 CASAVA_Build 6 167751642 1I AAAAAACAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 52 23 15 14 T 9 10 126169 CASAVA_Build 6 167754243 1I ATAAATAAAT -/A AAAAATACTG 3070 het 2266 hom 16 6 8 2 A 5 6 126170 CASAVA_Build 6 167765506 1I CCAATGATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1305 hom 45 4 36 5 T 13 14 126171 CASAVA_Build 6 167788990 1D GGGCTGACAG T/- TTTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 7 6 126172 CASAVA_Build 6 167794987 4D GTATGTGGTG TGTT/---- TGTGAATGTG 394 het 394 ref 73 61 4 13 TGTT 1 0 126173 CASAVA_Build 6 167795066 2I CGTGTGTGAA --/TG TGTGTGGTGC 3070 het 3070 ref 104 61 18 25 TG 3 4 126174 CASAVA_Build 6 167795119 14D TATGTCTGTA TGTATGTGTGTGAG/-------------- TGTATGTGTG 3070 hom 221 het 104 0 71 48 TGTATGTGTGTGAG 2 1 126175 CASAVA_Build 6 167798450 12D GATGGATGGG TGGATGGATGGA/------------ TGGATGGATG 3070 het 3070 hom 35 17 12 11 TGGA 6 3 126176 CASAVA_Build 6 167798824 4D TGGATGGATG GGAT/---- GGATGGATAG 3070 het 3070 hom 72 34 29 11 GGAT 3 2 126177 CASAVA_Build 6 167801369 4D TCTCTCTCCG CCTT/---- CCTGAGGAAA 3070 hom 111 het 38 0 37 4 CCTT 1 0 126178 CASAVA_Build 6 167803139 2I44M4I14M2I ACACACACAC --ACACATACATATGCACACACACACACACATATTCATTTATACAT----ACACATATACATAT--/ATACACATACATATGCACACACACACACACATATTCATTTATACATACACACACATATACATATAC ACACACATAT 3070 het 3070 ref 53 54 14 21 N/A 0 0 126179 CASAVA_Build 6 167803591 2D ACAGATATAC AT/-- ACACACACAT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 AT 1 0 126180 CASAVA_Build 6 167814472 4I GGAGAGCGTT ----/AGAC AGAGATCTTA 3070 hom 135 het 48 0 45 3 AGAC 0 1 126181 CASAVA_Build 6 167829224 1I GGTGAACCCA -/T GCACATGCCC 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 0 1 126182 CASAVA_Build 6 167829784 2I TGTTTATATT --/TG TGTGTATTTG 3070 het 3070 ref 89 37 31 21 TG 2 3 126183 CASAVA_Build 6 167838696 2D TCAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 35 1 19 16 A 13 11 126184 CASAVA_Build 6 167839862 1D TACCTCAACT C/- CCCCGCCCCT 3070 hom 57 het 22 0 16 6 C 5 4 126185 CASAVA_Build 6 167840659 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 8 9 126186 CASAVA_Build 6 167850592 1I ACACCCCCAG -/C CCCCACCACA 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 C 4 5 126187 CASAVA_Build 6 167855602 1D TGAGCAGGGG C/- GCTGAGCAGA 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 C 1 0 126188 CASAVA_Build 6 167868142 1D AGAAAGTAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 A 9 8 126189 CASAVA_Build 6 167871020 3I GAACTCGATG ---/TAA TAATACCTTT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 TAA 1 2 126190 CASAVA_Build 6 167877954 2I TCTCCTGCCT --/CC CCGCTTTGCG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 C 2 4 126191 CASAVA_Build 6 167887984 8D GGCTGCCGTT GGTGATTG/-------- GGTGATTGGT 3070 het 3070 hom 35 11 14 15 GGTGATTG 2 1 126192 CASAVA_Build 6 167892903 1I TTTTATGCAA -/C AGGGAACATT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 0 1 126193 CASAVA_Build 6 167899537 8I ACCTTAAGGC --------/CAGGGAGA CAGAAAGGTG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CAGGGAGA 0 1 126194 CASAVA_Build 6 167917675 4D AGAGTGAAAC TCTG/---- TCTCAAAAAC 3070 het 2429 hom 24 8 16 1 TCTG 1 0 126195 CASAVA_Build 6 167918123 4D AGCTTTTTCT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 39 1 31 9 A 19 15 126196 CASAVA_Build 6 167918301 1I TCCAGAGTGA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 8 126197 CASAVA_Build 6 167925344 1D AGGAGGTAGT A/- AAAAAAACCA 3070 hom 105 het 39 0 35 5 A 8 7 126198 CASAVA_Build 6 167926561 1D GCTCTATGAC A/- GGAGAATGTT 3070 het 3070 ref 53 30 22 2 A 1 0 126199 CASAVA_Build 6 167926702 1D CATTTTTAAC A/- TTTCATCTTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 A 1 0 126200 CASAVA_Build 6 167927680 1D GGAAGGCCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 9 8 126201 CASAVA_Build 6 167932466 1D ACATGTGACT A/- AAGCAAATTA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 3 2 126202 CASAVA_Build 6 167935837 1I GACAGGCTGC -/T GGGCATGGCT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 0 1 126203 CASAVA_Build 6 167941403 1D CTGACAATCA C/- CCCCCTCCCC 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 C 6 5 126204 CASAVA_Build 6 167944782 1I AGAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 9 10 126205 CASAVA_Build 6 167945277 3D GACTACCCTC CTT/--- CTTGAAACTG 3070 hom 76 het 38 0 34 6 CTT 2 1 126206 CASAVA_Build 6 167950667 1I CTGGCCAACA -/T AGTGAAACCC 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 0 1 126207 CASAVA_Build 6 167953677 1D CTAATTAAGT G/- GGGGGGATAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 7 6 126208 CASAVA_Build 6 167956686 1I TGTCCACCCC -/T GGTCTAGAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 126209 CASAVA_Build 6 167957983 3I TAAATGAAAG ---/AAA AAAGAAGGAA 1561 het 152 hom 19 1 5 13 A 3 6 126210 CASAVA_Build 6 167958680 4I CAGAGAAATT ----/TGTC TGTGCAGTCC 3070 hom 30 het 16 0 11 5 TGTC 0 1 126211 CASAVA_Build 6 167958794 4I AGGATTTAAC ----/AGTG AGCACTACAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AGTG 0 1 126212 CASAVA_Build 6 167964496 2D TCACCTGAGT AA/-- AGTCTAGTCT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 3 1 126213 CASAVA_Build 6 167966666 2D TATATTTGTA TC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 TC 1 0 126214 CASAVA_Build 6 167981856 8I CCATCTCGCC --------/ATCTCGCT ATCTCGCTTA 3070 hom 120 het 47 0 36 11 ATCTCGCT 1 2 126215 CASAVA_Build 6 167986085 2D TGGGTCACAG TA/-- TATACTCTGC 3070 hom 144 het 50 0 49 1 TA 3 2 126216 CASAVA_Build 6 167989659 1I AAACCATATC -/A ACTTGAGTTA 3070 het 3070 ref 48 27 18 3 A 1 2 126217 CASAVA_Build 6 167990505 4D ATAAAAAAAT AGTG/---- AGGTATGTCT 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 AGTG 1 0 126218 CASAVA_Build 6 167992679 5D TGTTGTGAAA ATTGG/----- AGTAGATAAC 3070 het 3070 hom 42 16 18 10 ATTGG 1 0 126219 CASAVA_Build 6 167992993 1D TTATATGAGA T/- TTTTTTGAAC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 T 7 6 126220 CASAVA_Build 6 168000764 7D TGGGGGTGGG GATAGTT/------- GATATTAGAG 3070 het 3070 ref 57 26 23 10 GATAGTT 1 0 126221 CASAVA_Build 6 168003305 3D GGTTTTGTTA TTG/--- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TTG 2 1 126222 CASAVA_Build 6 168008635 5I AGAGATTATA -----/ATATT ATAATTGTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ATATT 0 1 126223 CASAVA_Build 6 168009704 2I GTGTGAAGTC --/TT TGAATAATAT 3070 hom 106 het 44 0 34 10 T 1 3 126224 CASAVA_Build 6 168020300 1D AACATTTACA T/- TTTTTTTTTT 2539 het 2539 ref 43 23 6 14 T 12 11 126225 CASAVA_Build 6 168027421 1D TCACAAAACA T/- TTCTCTGTAG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 3 2 126226 CASAVA_Build 6 168033109 1I ATTACAGGCT -/C CCGCCCCCAT 3070 hom 56 het 22 0 18 4 C 2 3 126227 CASAVA_Build 6 168040607 1I AATTACCGAC -/T TTGTATTTAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 2 3 126228 CASAVA_Build 6 168051310 1D GGAGGATGAA T/- TTTTTTTTTT 1291 het 1291 ref 52 32 3 17 T 13 12 126229 CASAVA_Build 6 168058057 1D AGATTCCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 10 9 126230 CASAVA_Build 6 168072772 1I CTCCAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 13 14 126231 CASAVA_Build 6 168074547 3D CAGTGGAGAT GAC/--- GAGATGGTTT 3070 het 3070 hom 34 12 20 4 GAC 1 0 126232 CASAVA_Build 6 168081124 3I ACAAACAGAT ---/ATA TTTATAAATT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 ATA 0 1 126233 CASAVA_Build 6 168088693 1I TGATTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2326 hom 27 7 13 7 T 10 11 126234 CASAVA_Build 6 168090109 1I TGTTTTATGA -/T TTCTGTAGGA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 2 3 126235 CASAVA_Build 6 168090705 2D ATGTTTTACA TT/-- TTTTTTTTTT 2960 het 1531 hom 24 9 8 7 T 17 15 126236 CASAVA_Build 6 168091354 1D AATATTACAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 10 9 126237 CASAVA_Build 6 168093383 3I TTTCTACCTC ---/ACA ACATGGATAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 ACA 1 2 126238 CASAVA_Build 6 168098513 2D ATAACATGGA TT/-- TTAATTCAGT 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 T 4 2 126239 CASAVA_Build 6 168098828 1I CCTTTTCCTT -/C CCCCCCTCAG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 C 6 7 126240 CASAVA_Build 6 168103931 3I AATTATGAAA ---/ATG ATAATTGTTC 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 ATG 0 1 126241 CASAVA_Build 6 168105132 3D TATCTTTCTG TGT/--- TGTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 19 4 TGT 2 1 126242 CASAVA_Build 6 168117271 1I GGGGAAGGAA -/T TGGAAGCCCG 3070 het 1138 hom 24 4 10 10 T 1 2 126243 CASAVA_Build 6 168125596 2D GCTCCTTCTG TC/-- TCTCTCTGTC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 TC 4 3 126244 CASAVA_Build 6 168128694 3I GTTTTCAATT ---/TCC AATTCCAGAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TCC 0 1 126245 CASAVA_Build 6 168134381 1I GGGGATGCCT -/C CCCCGACGGC 1388 het 1231 hom 17 6 7 4 C 4 5 126246 CASAVA_Build 6 168137068 3D GGCCGAAGAA CTT/--- CTGCTTTACA 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 CTT 1 0 126247 CASAVA_Build 6 168144339 3I ACTCCTGACT ---/CTG TTGCTTTGCT 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 CTG 0 1 126248 CASAVA_Build 6 168150300 9I GATTACCATA ---------/TGTCTCGTT TGCGGTTCTA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 TGTCTCGTT 0 1 126249 CASAVA_Build 6 168151304 1D AAGAGTGTGG T/- TTTTCTTGTA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 5 4 126250 CASAVA_Build 6 168152780 1D CTATACCTAA T/- TTATTAAGAG 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 T 3 2 126251 CASAVA_Build 6 168157272 2I CCTTCTGCCT --/CC GGGCAGATCT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 C 0 2 126252 CASAVA_Build 6 168160734 4I ACACACACAC ----/ACAG AGACACACAC 3070 het 3070 hom 50 16 25 9 ACAG 0 1 126253 CASAVA_Build 6 168167847 1I TGACACACAG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 T 8 9 126254 CASAVA_Build 6 168194539 1D GGGATGGGGT G/- GGGGGGGCCA 2852 hom 41 het 20 0 13 7 G 8 7 126255 CASAVA_Build 6 168196694 10I TTCCCCACTG ----------/CGTGTTCACC CGTGTTCACC 3070 hom 65 het 27 0 20 7 CGTGTTCACC 1 2 126256 CASAVA_Build 6 168197176 3I ACGGACGGCT ---/GAG TTTTCTGCAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 GAG 0 1 126257 CASAVA_Build 6 168200167 3I CACAGTGATG ---/ATA ACTGTGAACT 3070 hom 91 het 39 0 27 12 ATA 0 1 126258 CASAVA_Build 6 168218419 2D GGTGCGTAAC TG/-- TGTGCATGTG 3070 hom 190 het 71 0 63 8 TG 3 2 126259 CASAVA_Build 6 168220811 1I ACACTCCGAT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 378 hom 34 2 17 15 G 9 10 126260 CASAVA_Build 6 168223983 1D GGCAAAAAAA C/- CACAAAAAAA 3070 het 136 hom 19 1 15 3 C 2 1 126261 CASAVA_Build 6 168235426 2I TCCGGATCAG --/GT GTGTCACTAG 3070 hom 69 het 27 0 21 6 GT 2 3 126262 CASAVA_Build 6 168239940 2D GCCACTGGGC AG/-- ACAGACAAGG 3070 hom 64 het 26 0 19 8 AG 1 0 126263 CASAVA_Build 6 168271309 1I CCCAATGGCA -/G GGGAGCTTGG 3070 het 3070 ref 40 13 17 10 G 3 4 126264 CASAVA_Build 6 168273658 4D ACGTCAGGCT TTGA/---- TTGATGACTT 3070 hom 84 het 29 0 27 4 TTGA 2 1 126265 CASAVA_Build 6 168278774 1I GTCAAGCCCG -/A CCCAGCCTGG 3070 het 2396 hom 36 13 16 7 A 0 1 126266 CASAVA_Build 6 168281958 1I AACTCCTGAG -/C TCAAGTGATC 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 C 0 1 126267 CASAVA_Build 6 168282647 1I TCCTTTTTTT -/C ATGCCATGCA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 C 0 1 126268 CASAVA_Build 6 168283388 1I GGAATAATTC -/T TCAAGTCTCA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 1 2 126269 CASAVA_Build 6 168284792 1D TTCATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 T 12 11 126270 CASAVA_Build 6 168285523 4I TTGGGTGGAG ----/TTGT TTCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 TTGT 0 1 126271 CASAVA_Build 6 168286953 1D TTGATTTCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 9 8 126272 CASAVA_Build 6 168290193 2D GGGCACTTGT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 TG 1 0 126273 CASAVA_Build 6 168326865 16I GGGCCTGAAA ----------------/AGCTTTAGGCCGCATC AGCCTAAGAG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AGCTTTAGGCCGCATC 0 1 126274 CASAVA_Build 6 168327157 1I TTGCTGATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 10 11 126275 CASAVA_Build 6 168331368 1D ATTTCTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1455 hom 24 7 10 7 T 11 10 126276 CASAVA_Build 6 168337842 1D CAGAGGCCGC G/- GTTCTCTGCA 2433 het 2433 ref 32 13 10 11 G 2 1 126277 CASAVA_Build 6 168339420 1I CGCGAGCCCA -/G GATCACATCT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 G 1 2 126278 CASAVA_Build 6 168348185 1D CATGCACCAT C/- CCCCCCCCTA 3070 het 2966 hom 30 12 12 6 C 9 8 126279 CASAVA_Build 6 168351802 3D GGTAGTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 11 14 T 16 13 126280 CASAVA_Build 6 168359471 2I TGCCGAATGA --/CT CTCCGACAAT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 CT 1 2 126281 CASAVA_Build 6 168365423 1I AGGGCCCTGC -/A AGTGCACACA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 1 2 126282 CASAVA_Build 6 168375409 2D CTACACAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 2639 het 2639 ref 25 12 6 7 A 13 11 126283 CASAVA_Build 6 168376890 13I CAAGATGTTA -------------/AATTCACGCAGAG ATATCTGTTG 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 AATTCACGCAGAG 0 1 126284 CASAVA_Build 6 168385595 1D CACGTCAACA C/- CCCCACTCTC 3070 het 2430 hom 25 8 9 8 C 5 4 126285 CASAVA_Build 6 168398149 1I AAAGTTTTAG -/T TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 5 6 126286 CASAVA_Build 6 168403178 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 12 11 126287 CASAVA_Build 6 168413693 3D26M10D13M11D16M13D ATACACCACA CCCCACATACCATATACTCACACCACACACACACACACGCATCACACACACCATATAAATATGCCACACTGCACACACCAGGCACACCATAT/---CACACAACATATACACACACCACAAA----------CATAATACACAAC-----------CCACACGTCACACTCC------------- ATACACACAT 3070 het 3070 ref 59 53 11 12 N/A 0 0 126288 CASAVA_Build 6 168426368 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 23 3 17 3 A 13 12 126289 CASAVA_Build 6 168435259 1I ATTCAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 A 10 11 126290 CASAVA_Build 6 168445877 5D AACCATGGTC CTCTT/----- CTCTTAGCCA 3070 het 3070 ref 48 24 19 6 CTCTT 2 1 126291 CASAVA_Build 6 168447313 2D TAATGATACG CT/-- CTGTTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 CT 2 1 126292 CASAVA_Build 6 168449139 1I TCAGCCCGGT -/C AGCTACAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 C 0 1 126293 CASAVA_Build 6 168466949 1D TGCTGTCTTC T/- AGAAACCTTA 2722 het 2722 ref 23 11 6 6 T 1 0 126294 CASAVA_Build 6 168470775 1D CTTCAACATG A/- AAGGAGCTTT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 3 2 126295 CASAVA_Build 6 168471062 1D TATTTTACAA T/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 6 5 126296 CASAVA_Build 6 168474215 1D CATTTTACAA C/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 54 27 23 5 C 1 0 126297 CASAVA_Build 6 168478551 1I TGGAAAAAAA -/T AATATAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 0 1 126298 CASAVA_Build 6 168487533 1D GTGGGGAGAT G/- GCGATTTAGC 3070 het 3070 ref 58 28 21 9 G 2 1 126299 CASAVA_Build 6 168492771 1I CTCCATCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2002 hom 26 7 9 10 A 10 11 126300 CASAVA_Build 6 168495571 1D AAAACGGCAG C/- CCATGGATTG 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 C 3 2 126301 CASAVA_Build 6 168498610 4I TTTTATATGT ----/AATG AATGACGTTC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 AATG 1 2 126302 CASAVA_Build 6 168512747 1I CCACCTGTGC -/A AAATCCCAGC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 3 4 126303 CASAVA_Build 6 168515247 1D TGCGGGTAGA G/- TTGATTCTAG 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 G 1 0 126304 CASAVA_Build 6 168518421 5D CCTGCTCTTC TCATT/----- TCATTTGTTG 2909 het 2909 ref 25 9 10 7 TCATT 2 1 126305 CASAVA_Build 6 168526872 2I GTGTGCGTGA --/GT GTGTGCATGC 3070 het 3070 ref 82 39 32 11 GT 2 3 126306 CASAVA_Build 6 168541416 2D CTTGGGGGGG GA/-- GCAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 7 GA 1 0 126307 CASAVA_Build 6 168568698 1D TTTTGTTATG T/- TTTTTTAGAT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 7 6 126308 CASAVA_Build 6 168571540 1I CCAGATAGCA -/C TGTCCGTATG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 0 1 126309 CASAVA_Build 6 168573071 2D CTATGTGTGT AG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 205 het 76 0 68 8 AG 1 0 126310 CASAVA_Build 6 168625927 2D AATTTATAAC TT/-- TTATAACATG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 4 2 126311 CASAVA_Build 6 168626359 1D TGAAGAAAGC T/- TTTGAGAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 17 8 T 4 3 126312 CASAVA_Build 6 168648444 3I CTTAAAGACT ---/GGG GGGAGCAAGA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 G 3 6 126313 CASAVA_Build 6 168648505 3I TACATATAAA ---/GTG GTGGTGCAGC 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 GTG 2 3 126314 CASAVA_Build 6 168656548 11D ATATCTTTCT ATAAAATGTCC/----------- ATAAAAGTAA 3070 hom 102 het 34 0 35 2 ATAAAATGTCC 1 0 126315 CASAVA_Build 6 168656872 1I TCCTTATAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 9 10 126316 CASAVA_Build 6 168658236 1D CTGTAGAAGT G/- GGGAGGTCAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 4 3 126317 CASAVA_Build 6 168658990 1D CGCTTTCCGC T/- CCACGAGTTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 1 0 126318 CASAVA_Build 6 168659288 2D CAGGAGCAAA AC/-- ACACTGAGCC 3070 hom 65 het 26 0 22 5 AC 3 2 126319 CASAVA_Build 6 168662123 2D TGTGTGTGAA TG/-- TGTGTTCATG 3070 hom 256 het 91 0 85 6 TG 3 2 126320 CASAVA_Build 6 168662904 2D CTTCCAGCAG AC/-- ACAGTTATCA 3070 het 3070 hom 58 22 28 9 AC 2 1 126321 CASAVA_Build 6 168676572 1I TCTGTGTGAT -/A ACCTGTGACA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 1 2 126322 CASAVA_Build 6 168698948 1I GCAGCTCCCA -/C CCATCAAGCT 3070 hom 83 het 32 0 27 5 C 2 3 126323 CASAVA_Build 6 168700125 1I CCTTGGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 13 2 8 3 T 10 11 126324 CASAVA_Build 6 168702334 2D GCGTGTGCGC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 53 30 17 7 AT 1 0 126325 CASAVA_Build 6 168706817 2D GTAAGTTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 TG 6 5 126326 CASAVA_Build 6 168722785 1I CTCATCTTAA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 6 7 126327 CASAVA_Build 6 168723598 4D TTCCGAGATG GTCT/---- GTCTTTGTCA 3070 het 3070 ref 46 29 13 9 GTCT 2 1 126328 CASAVA_Build 6 168728177 1D CCGAACAGGC A/- AAAAATATGT 3070 het 3070 hom 46 18 21 9 A 6 5 126329 CASAVA_Build 6 168732496 3I GTAGTCTCAG ---/CTA CTCTGAAGGC 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 CTA 0 1 126330 CASAVA_Build 6 168734120 1I GCGTGTGAGC -/T TTGCCAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 2 3 126331 CASAVA_Build 6 168735368 1D AAGTGACATA T/- TTTCATCTAA 3070 het 3070 ref 21 14 7 1 T 4 3 126332 CASAVA_Build 6 168741722 4D GTCACACACA CACT/---- CACACTCACA 3070 het 3070 ref 39 15 16 10 CACT 1 0 126333 CASAVA_Build 6 168742268 4D TACCCACACT CACA/---- CACTCCCCTA 2538 het 2538 ref 36 20 10 9 CA 3 1 126334 CASAVA_Build 6 168745723 5I CTGACATTTC -----/CCCTG CCCTGCTTGC 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 CCCTG 1 2 126335 CASAVA_Build 6 168761957 4D AGGCATCTGC CAGA/---- CAAATTAATA 3070 het 3070 hom 38 12 24 4 CAGA 1 0 126336 CASAVA_Build 6 168764316 8D AAAACCATCA GATCTCAC/-------- GATCTCACGC 3070 het 3070 ref 22 14 8 4 GATCTCAC 2 1 126337 CASAVA_Build 6 168767478 2D ATTCACAGAA AC/-- ACACACACAA 3070 hom 175 het 73 0 59 18 AC 5 4 126338 CASAVA_Build 6 168780841 3I TAATGTTGTT ---/ATC ATTGTTATTA 3070 het 2597 hom 27 7 15 5 ATC 0 1 126339 CASAVA_Build 6 168782345 2D GCAGGTACCT GG/-- GATGTCAGCA 3070 hom 83 het 31 0 28 5 G 3 1 126340 CASAVA_Build 6 168801679 3I GTGTGAGTGG ---/GGT TGTGTATGTA 3070 hom 86 het 38 0 29 9 GGT 0 1 126341 CASAVA_Build 6 168803722 1D CCTTACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 11 10 126342 CASAVA_Build 6 168805734 1D CTGAGGCCAA C/- CTGAGCCCAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 2 1 126343 CASAVA_Build 6 168861399 4D4M26D CTTGGTTTAC ACATATGGGTCCACCAGGGGAGGGTTCCCGCCAT/----ATGG-------------------------- CTGGTGATGT 2884 het 2884 ref 31 16 7 20 N/A 0 0 126344 CASAVA_Build 6 168870621 1I ATCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 27 1 14 12 A 11 12 126345 CASAVA_Build 6 168892031 1I ATTTTTTATA -/T TTTTTTATCA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 6 7 126346 CASAVA_Build 6 168892883 1I TTTAGAATTG -/T TTTTTCTAGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 5 6 126347 CASAVA_Build 6 168900587 1D TTTTGGCCAA G/- GGGGGCCTAG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 G 6 5 126348 CASAVA_Build 6 168909837 1I GTGGATTTTT -/C CATCCATATC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 C 1 2 126349 CASAVA_Build 6 168910484 1D TGTTTTTTTG T/- TTTGTTGTGT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 4 3 126350 CASAVA_Build 6 168912098 1I AGGCCCCCCC -/T GGGAATGCTT 3070 het 32 hom 23 1 17 5 T 0 1 126351 CASAVA_Build 6 168916481 1D GTTATTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 35 2 27 6 T 13 12 126352 CASAVA_Build 6 168919839 1D ACTGTCGGGG A/- AAAACAGAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 4 126353 CASAVA_Build 6 168983886 4D GATGGGATGG AGAC/---- AGACAGGAGG 2133 het 2133 ref 51 25 16 11 AGAC 2 1 126354 CASAVA_Build 6 168999298 4I AGGTGAACTC ----/AGAT GAGGCATGAC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AGAT 0 1 126355 CASAVA_Build 6 169003394 1D ACCTTGGTTC T/- TGTCCCGCCG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 2 1 126356 CASAVA_Build 6 169003480 1I TGTTGCCTAG -/A AAAAGATTGT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 4 5 126357 CASAVA_Build 6 169007052 4D41M6D GAAAGAGACG GAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAGAGACAGAGAA/----GAGAGAGAGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAAAAAGAAAGAGAC------ AGACAGGGAG 3070 hom 11 het 25 0 19 21 N/A 0 0 126358 CASAVA_Build 6 169007980 4D AGGATATATT AGTC/---- AGGGTTCTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 AGTC 1 0 126359 CASAVA_Build 6 169011717 1I GAAGAAATTT -/A TTTAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 0 1 126360 CASAVA_Build 6 169014620 2I AGACATTCAG --/AA CAACATTTAG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 0 2 126361 CASAVA_Build 6 169015557 4I CCTACGTGAA ----/TGTT TGGGTTTGAC 3070 hom 42 het 16 0 12 4 TGTT 0 1 126362 CASAVA_Build 6 169028917 2I TTTTCCTCTT --/AA AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 8 10 126363 CASAVA_Build 6 169035527 1D TTTTTCATGA T/- TTTTAGTGCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 5 4 126364 CASAVA_Build 6 169036572 2D CTGTGTTTGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AT 9 8 126365 CASAVA_Build 6 169037493 1D64M2D CATTGTGTGT GTGTGCATGTATGTGTGCATCCATACGTGTGTATGTATGTATGCATCTGTGTATGTGTGCATGCATG/-TGTGCATGTATGTGTGCATCCATACGTGTGTATGTATGTATGCATCTGTGTATGTGTGCATGCA-- TGTGTGCGTC 3070 het 97 hom 73 2 69 34 N/A 0 0 126366 CASAVA_Build 6 169044282 3D AATCAACCTC CTT/--- CTCAGCGATC 3070 het 3070 ref 53 30 16 7 CTT 1 0 126367 CASAVA_Build 6 169047218 1I22M1D17M5I TCATCATGCA -CTTTTTCTGAGGTCATACTTTTCTGGTGTCTAATGGAGAA-----/TTTTTTTCTGAGGTCATACTTTT-TGGTGTCTAATGGAGAAGAATT GATAAAGATA 3070 het 2943 hom 30 6 13 19 N/A 0 0 126368 CASAVA_Build 6 169052266 4D CAGCGTCGGT AGTC/---- AGCGTCGTGG 2147 het 1856 hom 29 9 10 12 AGTC 1 0 126369 CASAVA_Build 6 169053883 1I TATTTCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 40 3 30 7 T 11 12 126370 CASAVA_Build 6 169055174 5I TGCAACTTTC -----/AGTAA TTCCATTTCT 3070 hom 121 het 45 0 40 5 AGTAA 0 1 126371 CASAVA_Build 6 169055745 1I ACTTTCATCC -/G GCCTTCCACA 3070 hom 99 het 39 0 32 7 G 1 2 126372 CASAVA_Build 6 169057028 1I GATCATTGGT -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 86 het 32 0 29 3 C 8 9 126373 CASAVA_Build 6 169075736 4D TGAACATTTT GTTA/---- GTTACTTTCT 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 GTTA 2 1 126374 CASAVA_Build 6 169077298 7D AAAAGCAGCA AGCAGCG/------- AGCAGCAGTG 3070 hom 138 het 48 0 43 7 AGCAGCG 1 0 126375 CASAVA_Build 6 169083608 18D ATGCCACTGC GGGGCTGCCCGGTGCACA/------------------ GGGTCTGCGG 3070 het 3070 ref 41 26 14 4 GGGGCTGCCCGGTGCACA 1 0 126376 CASAVA_Build 6 169086513 2I TTTTAGAAAT --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 A 8 10 126377 CASAVA_Build 6 169086815 2D CAGCAAAAAC AA/-- AGAGAAGATC 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 A 3 1 126378 CASAVA_Build 6 169087806 1D ACTTTGTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2774 hom 25 7 12 6 T 10 9 126379 CASAVA_Build 6 169089532 1D TACCAAACCA T/- TTTCACCTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 4 3 126380 CASAVA_Build 6 169096052 9D TCTTTTCTTC TTGTTGTTG/--------- TTGTTGTTGA 3070 het 3070 ref 42 20 19 5 TTG 6 3 126381 CASAVA_Build 6 169104867 23D TCTGAAGCTT GGTCCTCGGGCAGGGAGGAGGCA/----------------------- GGTCCTCGGG 3070 het 3070 ref 34 22 10 5 GGTCCTCGGGCAGGGAGGAGGCA 1 0 126382 CASAVA_Build 6 169109229 1I ATGAGCCCCA -/T TGTCACTTTG 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 1 2 126383 CASAVA_Build 6 169109480 1I CCTTCCACTT -/C CCCCACTGTG 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 C 4 5 126384 CASAVA_Build 6 169111611 4I TGTTTTTAAA ----/TGTT TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TGTT 1 2 126385 CASAVA_Build 6 169123220 1I AATTATTGGT -/G AAAACTTCCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 126386 CASAVA_Build 6 169127134 1D GCTGACCAAG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 8 7 126387 CASAVA_Build 6 169131806 1D GTTTTCTGCT G/- TAAGTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 10 17 6 G 1 0 126388 CASAVA_Build 6 169138847 1I GTTTCTTAAA -/T TTGATTATAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 2 3 126389 CASAVA_Build 6 169143598 3D TACTCATGGC CTG/--- CTGTTGACCC 3070 het 3070 ref 50 27 17 8 CTG 2 1 126390 CASAVA_Build 6 169146799 1I ATGAAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 34 2 28 4 A 13 14 126391 CASAVA_Build 6 169148894 1D ATTTGAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 11 10 126392 CASAVA_Build 6 169165976 1D CAGAGCTCCG T/- TGGCTGGGTC 3070 hom 41 het 16 0 13 3 T 2 1 126393 CASAVA_Build 6 169171418 1I TTGGTGGACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 9 10 126394 CASAVA_Build 6 169180167 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 8 7 126395 CASAVA_Build 6 169182788 1D ATGTGTGGCG T/- TGGGAGACCC 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 T 2 1 126396 CASAVA_Build 6 169184000 1I TTGGAGAATT -/A TTCTGTGGCT 3070 het 2866 hom 27 7 17 3 A 0 1 126397 CASAVA_Build 6 169196308 9I TTTTACCAAT ---------/TATCTTAGC TAGATCTTCT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 TATCTTAGC 0 1 126398 CASAVA_Build 6 169196793 8D TTAGAGGCCA TTATAGGG/-------- TTATTAACTG 3070 het 3070 ref 45 26 19 1 TTATAGGG 1 0 126399 CASAVA_Build 6 169201741 5I TTGTAATTTT -----/TAGTA TAGAAGTGTT 1246 het 1246 ref 29 19 3 7 TAGTA 0 1 126400 CASAVA_Build 6 169207883 4D AGAAAGAAAA AGAG/---- AGCCCAAGGT 2130 het 2103 hom 19 7 11 5 AG 3 1 126401 CASAVA_Build 6 169208283 1I TTATGCAGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 18 8 9 T 8 9 126402 CASAVA_Build 6 169230218 1D AAGAAATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 12 11 126403 CASAVA_Build 6 169240291 1D GAAGGTTTTT A/- TGGAAAGCTA 3070 het 3070 ref 37 21 13 5 A 1 0 126404 CASAVA_Build 6 169244591 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 32 1 28 4 A 13 12 126405 CASAVA_Build 6 169248144 2D ATCTTATCTC TA/-- TATTATACAA 3070 hom 114 het 42 0 39 5 TA 2 1 126406 CASAVA_Build 6 169279812 2I CTCTATAGGG --/AA AAAAAAAAAA 1636 het 680 hom 44 3 8 33 A 10 12 126407 CASAVA_Build 6 169289930 1D TCTGACAAAA G/- GCTAATATCC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 2 1 126408 CASAVA_Build 6 169291777 1D AGAATCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 41 0 29 12 T 11 10 126409 CASAVA_Build 6 169309509 6D3M2I GGATCATGTC AGCGTGCAT--/------GATTA GCCACGCTGC 3070 hom 54 het 20 0 19 3 N/A 0 0 126410 CASAVA_Build 6 169310971 1D CAGAGACAGC A/- AAAAATGTGC 3070 hom 77 het 28 0 24 4 A 6 5 126411 CASAVA_Build 6 169317422 3I ACGCCTGTTC ---/TGA TGAAGTTATT 3070 hom 52 het 32 0 18 14 TGA 1 2 126412 CASAVA_Build 6 169321157 4D GGGCAACAAC AAAT/---- AAACACACAC 3070 hom 119 het 42 0 38 7 AAAT 1 0 126413 CASAVA_Build 6 169324165 5D AAAAAAATTA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 27 het 10 0 10 1 AAAAT 4 3 126414 CASAVA_Build 6 169328637 32I CCTACGCCTT --------------------------------/GCCATGAGCTCAATAAACCCCACTACGCCCTC GCCATGAGCT 3070 hom 59 het 31 0 19 12 GCCATGAGCTCAATAAACCCCACTACGCCCTC 0 1 126415 CASAVA_Build 6 169376946 1D AAAGCCAACC A/- GGGGGAGCTC 3070 het 2618 hom 33 11 16 7 A 1 0 126416 CASAVA_Build 6 169386621 2D CACACGCACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 CA 9 8 126417 CASAVA_Build 6 169389548 1I GTTTATGTGT -/G GGGGGATGTG 3070 het 3070 ref 79 40 29 10 G 5 6 126418 CASAVA_Build 6 169390070 2D TGTGCGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 90 37 38 16 TG 6 5 126419 CASAVA_Build 6 169392052 1D TCCGTCCCAG A/- AAAAAAAAAA 1470 het 1470 ref 17 8 5 4 A 14 13 126420 CASAVA_Build 6 169396661 8D GCACAGAGCA AGGACTCG/-------- AGAGAACGAG 3070 het 3070 ref 33 14 13 8 AGGACTCG 1 0 126421 CASAVA_Build 6 169562348 1D ATGTGCATAA C/- ATTTCACTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 5 C 1 0 126422 CASAVA_Build 6 169563166 3D TGTTCTCCTG ACC/--- ACCAGGTGGC 3070 hom 55 het 24 0 17 8 ACC 2 1 126423 CASAVA_Build 6 169563289 4I ATCCAGGACA ----/TGCT TGACCCGTGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TGCT 0 1 126424 CASAVA_Build 6 169564776 2I ACAGGAAAAC --/AG AAAGTGGATG 3070 hom 72 het 33 0 25 8 AG 0 1 126425 CASAVA_Build 6 169569461 1I GGACCGTGGG -/C CCCCCCATCT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 6 7 126426 CASAVA_Build 6 169579311 1I ATTGGTGTCA -/G GGGGTGCACT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 4 5 126427 CASAVA_Build 6 169580257 1D TTACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1020 het 118 hom 20 2 8 10 T 19 18 126428 CASAVA_Build 6 169582998 1I TGTTGCTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 9 10 126429 CASAVA_Build 6 169603678 1D AAAAAAAAAA C/- AAAACAAGAA 977 het 977 ref 39 22 5 12 C 1 0 126430 CASAVA_Build 6 169637544 1I TTGAAAAGAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 9 10 126431 CASAVA_Build 6 169639577 2D CTAAAACTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 A 13 11 126432 CASAVA_Build 6 169642399 22D CTGTCTCACA AATGCTTAGCTGCTGCTGAACT/---------------------- AATGCTTAGT 3070 het 3070 ref 48 28 24 8 AATGCTTAGCTGCTGCTGAACT 1 0 126433 CASAVA_Build 6 169643741 1I TTTTCTTTAA -/T TACCGAGGAT 3070 hom 98 het 44 0 30 14 T 1 2 126434 CASAVA_Build 6 169647478 59D12M25D AGGTACATTT GTTATTCCTTCTCTATACTTAGGGAAACAGGGACTCATAATTTGAGAAATTTGTCCTAGGTTATCTAACTTACTGGTAGAATGGAGAACCAAGCCC/-----------------------------------------------------------GTTATGTACCTT------------------------- AAGCAGACTG 3070 hom 48 het 17 0 17 5 N/A 0 0 126435 CASAVA_Build 6 169653555 3I TCTGTATTAT ---/AAG AAGAAAATTA 3070 hom 114 het 48 0 39 9 AAG 1 2 126436 CASAVA_Build 6 169656569 1I TGGGGGAAAA -/T ATATATATAT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 0 1 126437 CASAVA_Build 6 169669755 1D GGCTGGAGCA T/- GATGAAAAGG 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 1 0 126438 CASAVA_Build 6 169675290 1D CAGCCCACAT G/- GGTTGGAGTA 3070 hom 45 het 30 0 18 12 G 3 2 126439 CASAVA_Build 6 169676994 1I ATAATTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 483 hom 31 2 27 2 A 11 12 126440 CASAVA_Build 6 169682453 1D GAATAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 14 9 T 13 12 126441 CASAVA_Build 6 169684810 2D TATAATATAT AC/-- ACAATCTAAT 3070 hom 53 het 25 0 21 4 AC 2 1 126442 CASAVA_Build 6 169706727 2I TGGCTCCCAC --/GA GAGACTCTCA 3070 hom 113 het 46 0 34 12 GA 2 3 126443 CASAVA_Build 6 169706879 4I AACCAAACGC ----/GTGA GTGAGTGAGT 3070 hom 101 het 39 0 30 9 GTGA 3 4 126444 CASAVA_Build 6 169707648 2D ATCTGTTCCT AA/-- AGAGTCAATG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 3 1 126445 CASAVA_Build 6 169710178 13D TGACAGCAAT CACTCAGGAACCA/------------- CACTCAGGAA 3070 hom 121 het 44 0 37 9 CACTCAGGAACCA 2 1 126446 CASAVA_Build 6 169715044 1I ACAGAGCCGT -/C CCCCACGCCA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 4 5 126447 CASAVA_Build 6 169717261 4I CTCCCTCTCT ----/ATCC ATCCATCCAT 2243 hom 42 het 29 0 12 17 ATCC 4 5 126448 CASAVA_Build 6 169718083 1I GCTTTTGGAG -/T TAACGGGCCT 3070 hom 92 het 34 0 30 4 T 1 2 126449 CASAVA_Build 6 169718788 1D CCTTTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 27 1 18 9 A 12 11 126450 CASAVA_Build 6 169722974 2D ATATATATAT AC/-- ATATATATAT 2134 hom 15 het 7 0 6 1 AC 1 0 126451 CASAVA_Build 6 169723836 1I AGAGAAGAGC -/G GGGTCACAAG 3070 hom 85 het 32 0 29 3 G 3 4 126452 CASAVA_Build 6 169725440 4D61M22D GCAATTCAAA TACTTAGATTTTTTATAGCTGTTGATAAATAAGTTCCTCTTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATACATATATATATATATATG/----TAGATTTTTTATAGCTGTTGATAAATAAGTTCCTCTTTAATTGTGTGTGTGTGTGTGTATA---------------------- TATATATACA 3070 het 16 hom 31 1 31 6 N/A 0 0 126453 CASAVA_Build 6 169725766 1D AGACAATTCC T/- TTTTCCCGCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 5 4 126454 CASAVA_Build 6 169726078 11I TGACCCACAT -----------/CTCCCCATTTC CTCCCCCTCC 3070 hom 126 het 47 0 40 7 CTCCCCATTTC 0 1 126455 CASAVA_Build 6 169728464 1I CATGTGTAAT -/G GACCCTCTGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 1 2 126456 CASAVA_Build 6 169730196 3D CTCCTGAGCT CAC/--- CACAACAGCA 3070 het 3070 hom 37 13 21 5 CAC 2 1 126457 CASAVA_Build 6 169731982 28I GAACCAAATC ----------------------------/AACAAGTCCTGAGAGAAGAAGCAAGAAA AAGGGAAGCA 3070 hom 126 het 40 0 42 2 AACAAGTCCTGAGAGAAGAAGCAAGAAA 0 1 126458 CASAVA_Build 6 169739982 1D CATAGGTCTC T/- TTTTTTTTTT 1257 het 1257 ref 28 19 3 7 T 11 10 126459 CASAVA_Build 6 169747617 1I TTTTTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1062 hom 46 5 37 4 A 11 12 126460 CASAVA_Build 6 169757977 1I AAAACCTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 22 1 19 2 A 12 13 126461 CASAVA_Build 6 169882832 1I ATGGCCCCAA -/T TTTTTTTTTT 1907 het 1907 ref 25 7 6 12 T 15 16 126462 CASAVA_Build 6 170173338 1I AACTGTTGGG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 7 8 126463 CASAVA_Build 6 170175755 1D ACCCGGAACA G/- GGGGGAGGCG 3070 hom 65 het 25 0 21 5 G 6 5 126464 CASAVA_Build 6 170182045 4D TTGGGGTAAA TGTC/---- TGAGCCTCAT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 TGTC 1 0 126465 CASAVA_Build 6 170182860 1D CATCTGCCTA C/- GACCTCCTAA 3070 hom 80 het 32 0 24 8 C 1 0 126466 CASAVA_Build 6 170183019 6D GGGAGGGAGC ATGTTG/------ ATGTTGATGG 3070 hom 74 het 29 0 20 12 ATGTTG 2 1 126467 CASAVA_Build 6 170185104 2I AGACAGAGAC --/AG AGAGAGACAG 3070 hom 88 het 38 0 30 8 AG 3 4 126468 CASAVA_Build 6 170191164 4D ACAGACACAC TCTT/---- TCCAAATCTA 3070 hom 95 het 36 0 30 7 TCTT 1 0 126469 CASAVA_Build 6 170199718 1I ACTCAAATTC -/T CATGTTTAAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 0 1 126470 CASAVA_Build 6 170217702 1D TACTGCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 30 9 A 11 10 126471 CASAVA_Build 6 170220501 8D GTCTGCAGGG CAGGGAAC/-------- CAGGCCTCGG 3070 hom 107 het 39 0 33 8 CAGGGAAC 1 0 126472 CASAVA_Build 6 170223265 4D ATCCCTCCAT CCAC/---- CCCAACCCTC 747 het 46 hom 13 1 3 9 CCAC 1 0 126473 CASAVA_Build 6 170227863 6D GGAAAAGAGG AAGTCA/------ AATTGTCCCT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 AAGTCA 1 0 126474 CASAVA_Build 6 170246655 1I CTCCACCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 10 11 126475 CASAVA_Build 6 170250221 20D CAGCGCCGCA CAGCTCCCAACGGCACCGCG/-------------------- CAGCTCCCAA 3070 hom 98 het 41 0 28 15 CAGCTCCCAACGGCACCGCG 1 0 126476 CASAVA_Build 6 170261037 1I TTGAGCTATT -/C TCCTGCCTCA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 0 1 126477 CASAVA_Build 6 170268656 1I AGACTGGAAC -/T CGGGTCATAA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 T 0 1 126478 CASAVA_Build 6 170270318 1I GTTGCATCAG -/A AAAAACTGTA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 5 6 126479 CASAVA_Build 6 170299696 1D GATAGTGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 98 het 40 0 33 7 A 10 9 126480 CASAVA_Build 6 170304157 1I5M1D ACAGGAGGGT -ACCGAG/GAATGA- CTCGGAGCAA 3070 hom 86 het 37 0 24 13 N/A 0 0 126481 CASAVA_Build 6 170308351 1I ATATTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 538 hom 22 2 16 4 A 12 13 126482 CASAVA_Build 6 170309042 1I TGTTCCTTCA -/C ATGCCTGGAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 126483 CASAVA_Build 6 170310520 1D CTGTGGGGGA G/- GGGGAAGGAG 3070 hom 46 het 17 0 12 5 G 5 4 126484 CASAVA_Build 6 170351419 1D ACAGAGACTT A/- GGGGTCTTCT 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 1 0 126485 CASAVA_Build 6 170356396 1D AAAAAAGTAC A/- AAAAAATTAG 1424 het 1424 ref 12 6 4 2 A 7 6 126486 CASAVA_Build 6 170358223 5D ATACATTATT TGAAA/----- TGAAATGAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 6 TGAAA 3 2 126487 CASAVA_Build 6 170363335 2D GCATGGGTGT GA/-- GTGTGGGTGA 3070 het 3070 hom 67 31 29 10 GA 1 0 126488 CASAVA_Build 6 170363922 2I TCTACACACA --/CG CACACACACA 1516 het 1516 ref 45 19 13 13 CG 0 1 126489 CASAVA_Build 6 170367769 1D AGCAGGAGAT G/- GTGGGAAAGG 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 G 2 1 126490 CASAVA_Build 6 170386981 1D CTATTGATTA G/- GGGGAGGGGG 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 G 5 4 126491 CASAVA_Build 6 170404061 1I GCCGTGGGTT -/G GGGGGGCAAC 2933 het 2933 ref 25 11 9 5 G 6 7 126492 CASAVA_Build 6 170414600 2I GCGGTGGGAG --/GT GACCTGGGCT 3070 hom 132 het 51 0 42 9 GT 0 1 126493 CASAVA_Build 6 170416124 4D AGTGAGTGGA GAGT/---- GAGTGGGAAG 3070 het 3070 ref 82 57 16 9 GAGT 2 1 126494 CASAVA_Build 6 170421714 4D GCTATTTTTA TTTT/---- ATTTTATTAT 1949 het 1764 hom 11 5 4 2 T 4 0 126495 CASAVA_Build 6 170440294 3D CGCTCGGCCT CTC/--- CTCCTCGCCC 2444 hom 30 het 12 0 7 5 CTC 3 2 126496 CASAVA_Build 6 170463745 1D TCTAACATTT G/- TTCAAACAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 0 126497 CASAVA_Build 6 170548996 1D CCCTCTTTGG C/- TTGGGGTTGC 3070 hom 92 het 40 0 29 11 C 1 0 126498 CASAVA_Build 6 170552959 1D GGATGCATGA G/- TGGCCACAGG 3070 hom 79 het 31 0 23 9 G 1 0 126499 CASAVA_Build 6 170557027 1D ACTTTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 A 11 10 126500 CASAVA_Build 6 170561940 7D AAAGAAAAAT AAATGGC/------- AGAAAGTATT 3070 hom 144 het 51 0 48 8 AAATGGC 1 0 126501 CASAVA_Build 6 170563475 3I GTTTTTTTTT ---/TTC CTGTGGGTTT 3070 hom 48 het 22 0 18 4 TTC 0 1 126502 CASAVA_Build 6 170565621 2D AGATTCCGCT CC/-- CCCCCCCCAC 1014 hom 17 het 9 0 5 4 C 10 8 126503 CASAVA_Build 6 170567077 4D AGAAAAGAAT AAAG/---- AAAGGAAGAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAAG 2 1 126504 CASAVA_Build 6 170571741 1I TATGTTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 852 hom 26 2 23 1 A 10 11 126505 CASAVA_Build 6 170574601 1I ACACTGAGGT -/G GGGGGGATCA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 6 7 126506 CASAVA_Build 6 170580321 1D TTAAACACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 25 0 18 8 A 10 9 126507 CASAVA_Build 6 170593339 1D TCCCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 34 1 29 4 A 12 11 126508 CASAVA_Build 6 170595285 2D CCGCTGTGAA AC/-- ACACCCTCAG 1231 het 1231 ref 25 8 8 9 AC 3 2 126509 CASAVA_Build 6 170600535 1I ATGATGAGAA -/T TTTTTTCATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 126510 CASAVA_Build 6 170603884 4I GAGTGTGTGA ----/GAGT GTGTGTGTAA 3070 het 18 hom 90 3 45 42 GAGT 0 1 126511 CASAVA_Build 6 170604716 2I ATCCGCCGGC --/CT CTTCCCCCGG 3070 hom 45 het 19 0 12 7 CT 1 2 126512 CASAVA_Build 6 170605756 1I GTCCCAGACA -/G GAAGTGGTAA 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 G 1 2 126513 CASAVA_Build 6 170626811 1D GAGCATATGT G/- TGCTATACAA 1908 het 1908 ref 28 19 4 5 G 1 0 126514 CASAVA_Build 6 170627389 1D CAACAACAAC A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 A 7 6 126515 CASAVA_Build 6 170632283 1D ATTATTATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 10 9 126516 CASAVA_Build 6 170633507 4I GTGGTATATC ----/CAGA CAATGAAATA 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 CAGA 0 1 126517 CASAVA_Build 6 170635305 1I CTGATGGACA -/T TCCCTTAATG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 1 2 126518 CASAVA_Build 6 170642400 4I AGACTAAGAC ----/AGAT AGATACTCCA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 AGAT 1 2 126519 CASAVA_Build 6 170643489 1I ATGTTGGCCA -/G GCTGGTCTAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 G 1 2 126520 CASAVA_Build 6 170648704 2I AAGCTAAAAG --/AT CTGTAATCTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 AT 0 1 126521 CASAVA_Build 6 170657385 2D AAAAATGGGC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 351 hom 25 3 9 13 A 11 9 126522 CASAVA_Build 6 170663699 2D TGCAGGAGGG AC/-- ACACACACAC 1038 het 1038 ref 58 43 3 13 AC 7 6 126523 CASAVA_Build 6 170672019 1I CATATGGAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 9 10 126524 CASAVA_Build 6 170672973 1D TTTGGCCCAG C/- AATCCCACTA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 C 1 0 126525 CASAVA_Build 6 170680417 4D ACTGAAACCC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 30 13 16 4 AG 7 5 126526 CASAVA_Build 6 170681378 3D TCTGTCTGGC GGA/--- GGAGGCACAA 3070 het 3070 hom 53 23 24 7 GGA 2 1 126527 CASAVA_Build 6 170685693 1D TAAAGGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 24 1 21 2 T 13 12 126528 CASAVA_Build 6 170695237 1I TCCTTTACAG -/A AAAAATTACG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 5 6 126529 CASAVA_Build 6 170703532 1D GCTAAACGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 11 10 126530 CASAVA_Build 6 170707389 2D TTTTTTTTTT TA/-- ACAGTTTCAT 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 TA 1 0 126531 CASAVA_Build 6 170716046 16D GGCATGCGCC TGTAATCCCGGCTACT/---------------- TGGGAGGCTG 1604 het 957 hom 8 2 6 1 TGTAATCCCGGCTACT 1 0 126532 CASAVA_Build 6 170717567 3I AAAATGTATC ---/ATT AGAGAAGCTA 3070 het 3070 hom 36 17 19 0 ATT 0 1 126533 CASAVA_Build 6 170719467 3D ACATTCTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 TTG 5 4 126534 CASAVA_Build 6 170721097 2I TGACCCTAAC --/CT CTTGTATCAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 CT 1 2 126535 CASAVA_Build 6 170725823 3I GCTCATAGGG ---/TTT TTATTTTACC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 5 126536 CASAVA_Build 6 170729184 1I AGAATAGCCA -/C CCTGATATGG 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 C 2 3 126537 CASAVA_Build 6 170730146 1I AGTGTGCCAC -/T TAATGCCTTC 3070 het 3070 hom 60 23 29 8 T 1 2 126538 CASAVA_Build 6 170730288 1D ACTAAGAATG A/- GCCTCTGCTC 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 1 0 126539 CASAVA_Build 6 170734409 1I GCATGAAAAA -/T TTTTAAAGTA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 T 4 5 126540 CASAVA_Build 6 170734845 4I AACTGAAAAT ----/ACTC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 ACTC 0 1 126541 CASAVA_Build 6 170741199 2I GATATTAAAG --/AC ACACACACAC 2086 het 2086 ref 35 18 6 11 AC 6 7 126542 CASAVA_Build 6 170752365 1D GAAAAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 18 14 3 T 12 11 126543 CASAVA_Build 6 170758073 5D TTTAGTTATC CTTCT/----- CTTCTTGTTG 3070 het 3070 ref 38 28 8 3 CTTCT 2 1 126544 CASAVA_Build 6 170758185 2D TTCGTTAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 9 13 T 13 11 126545 CASAVA_Build 6 170758489 1I TTGGTGAGGT -/G TCTGTTCAGA 3070 het 3070 ref 52 36 11 5 G 0 1 126546 CASAVA_Build 6 170777885 2I CAACACAGAG --/TC CCCACTAGGG 2100 het 2100 ref 19 6 7 6 TC 0 1 126547 CASAVA_Build 6 170851676 6I TACACACACA ------/CGCGTG CACACACACA 1056 het 1056 ref 19 8 3 8 CGCGTG 0 1 126548 CASAVA_Build 6 170852359 1I TGAAATAAGA -/C CCATGAAATC 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 C 2 3 126549 CASAVA_Build 6 170877196 3D ATCTGGGTGT GTA/--- GGAGTGTGAA 3070 het 3070 ref 70 59 10 3 GTA 1 0 126550 CASAVA_Build 6 170884772 1D CAGGTCAAAG A/- ACTTACCAAA 2147 het 2147 ref 22 15 5 2 A 2 1 126551 CASAVA_Build 6 170887622 3D CTTCACATCT GTG/--- GTGGGTCAAG 3070 hom 44 het 16 0 15 1 GTG 2 1 126552 CASAVA_Build 10 51373 1D GTGTTGCTTC A/- TCCAGTTTGC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 1 0 126553 CASAVA_Build 10 58259 1D AGTATGAAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 8 7 126554 CASAVA_Build 10 65823 4I ACAGGCAAGT ----/AGAG AGCCAAATCA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 AG 1 3 126555 CASAVA_Build 10 68540 3D ACCTTCCAAG AGA/--- ATAGAACATA 3070 het 3070 ref 72 48 11 13 AGA 1 0 126556 CASAVA_Build 10 68555 1I AGAACATAAT -/G GTCAGATTTT 3070 het 3070 ref 71 48 10 13 G 1 2 126557 CASAVA_Build 10 68636 4I AACTAAAAAA ----/TTAT TTGTCTTTCA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 TTAT 0 1 126558 CASAVA_Build 10 69050 1I ATGTATTACA -/G AAGTTTATGA 3070 het 3070 ref 80 55 11 15 G 0 1 126559 CASAVA_Build 10 69122 2D CAAATAAAAC TG/-- TAACAAATCA 1531 het 1531 ref 28 18 5 9 TG 1 0 126560 CASAVA_Build 10 69180 1I ATATAGGTAT -/G AAACACTCAA 313 het 313 ref 68 21 1 47 G 0 1 126561 CASAVA_Build 10 85430 1I AAAGCTGCTC -/A GCTGGAGAAC 3070 hom 104 het 57 0 32 25 A 0 1 126562 CASAVA_Build 10 86718 3D CAGCTTTTTG AGC/--- TGCTGAGGTC 2794 het 2794 ref 43 33 7 3 AGC 1 0 126563 CASAVA_Build 10 87669 3D CATAAATATT CTC/--- CTATTATCCA 3070 het 1037 hom 29 5 19 5 CTC 1 0 126564 CASAVA_Build 10 88298 1D GATGTTGCTA G/- AAAAGAGGGT 3070 het 3070 ref 97 79 14 6 G 1 0 126565 CASAVA_Build 10 88603 1D TATTATCTTT A/- ACAAAAAATG 1361 het 1361 ref 40 32 3 7 A 2 1 126566 CASAVA_Build 10 89450 3I GCCTAAAGTA ---/GGG GAAGACTGAG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 G 1 4 126567 CASAVA_Build 10 92533 2I35M1D GGGAAGTGCT --ACGCACTTGTAGATAACCAGGTCTCATGAAAACTTA/ACACACACTTGTAGATAACCAGCTCTGATAAAAACTT- ACTATTGTGA 3070 het 3070 ref 41 41 12 3 N/A 0 0 126568 CASAVA_Build 10 93754 1I CAACACTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 75 22 17 36 T 9 10 126569 CASAVA_Build 10 94203 2I3M3I32M3D AGCCATTCAA --AAT---TAAGAAAATCTCAACTTTCCCTCATTTTTCTGTCT/CCAGTCTCTAAGAAAATCTCAACTTTCCCTCATTTTTCTG--- TCTTCTGAGT 3070 het 3070 ref 45 38 15 14 N/A 0 0 126570 CASAVA_Build 10 97493 3I ACCCATGTGC ---/TGA AGAGAAGAAT 3070 het 3070 ref 48 33 11 4 TGA 0 1 126571 CASAVA_Build 10 97742 3I TATATTTCCA ---/ATT ATTATATCCT 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 ATT 1 2 126572 CASAVA_Build 10 97939 1D AGGTAAAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 60 29 17 14 T 10 9 126573 CASAVA_Build 10 98319 1I AAGCAACTAA -/T TAAAAACTCT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 1 2 126574 CASAVA_Build 10 103094 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 726 hom 30 4 19 7 T 13 12 126575 CASAVA_Build 10 106217 4D TTTGTTTTTG TTTT/---- TTTATTTTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 7 3 126576 CASAVA_Build 10 113644 1I ATACTCTTTG -/T TTAGGAGCAG 1379 het 1379 ref 35 28 3 4 T 2 3 126577 CASAVA_Build 10 123202 1D AAGGGCAAAG C/- CCCCCATGCT 3070 het 3070 hom 37 10 10 17 C 6 5 126578 CASAVA_Build 10 123784 1D ACCAGGACCT G/- GGGGAAGCAC 2604 het 843 hom 18 5 7 6 G 5 4 126579 CASAVA_Build 10 129630 1D AGTTCAGTCA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 9 8 126580 CASAVA_Build 10 145324 5D TAATAACTGC TTAGA/----- TTATTCTTTG 3070 het 3070 ref 35 17 14 7 TTAGA 1 0 126581 CASAVA_Build 10 154354 4D CACTACTGTC TTAA/---- TTGTACTGTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TTAA 1 0 126582 CASAVA_Build 10 163276 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 3 A 8 7 126583 CASAVA_Build 10 181167 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATGTG 2661 het 1632 hom 13 5 6 2 TA 4 3 126584 CASAVA_Build 10 195071 1D TTTTTTTTTC T/- TAATAGCTGA 1146 het 1146 ref 29 17 5 7 T 2 1 126585 CASAVA_Build 10 205893 4D CAGAAAACAC CAAG/---- CAGGCTAAAT 3070 hom 114 het 40 0 38 3 CAAG 1 0 126586 CASAVA_Build 10 224532 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2751 het 8 hom 17 1 7 9 A 19 18 126587 CASAVA_Build 10 235771 1D ATTTAGTTCC T/- TTTTTTAACT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 7 6 126588 CASAVA_Build 10 245688 6D TCGTGTTCGT TCTTTA/------ TCTTGTTCTT 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 TCTTTA 1 0 126589 CASAVA_Build 10 253066 2I TTTAGAACAC --/TT TATTCAAACA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 1 3 126590 CASAVA_Build 10 258973 1D TCCTTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 13 12 126591 CASAVA_Build 10 261303 4I TTTTTATGTG ----/TGTT TGTTTTTAGG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TGTT 1 2 126592 CASAVA_Build 10 263446 14D AGGTTATGTT TGAGCCATTTGTAC/-------------- TGTAACTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 15 6 TGAGCCATTTGTAC 1 0 126593 CASAVA_Build 10 269163 1I CCTTTGAGGT -/A AAAATTCACA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 4 5 126594 CASAVA_Build 10 278947 1D TAAGTGGTAA T/- TTTTAACATA 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 5 4 126595 CASAVA_Build 10 292930 3D TCTAGTAGCC ATT/--- ATTTGAAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 22 6 ATT 2 1 126596 CASAVA_Build 10 294038 4D GGGGGAAGTT AGAA/---- AGAGGCTTGC 3070 het 3070 ref 28 14 13 5 AGAA 1 0 126597 CASAVA_Build 10 297382 3D ATAGAGCTTT AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 2912 hom 25 11 10 4 A 12 9 126598 CASAVA_Build 10 306288 1I TTCTGACTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 42 0 36 6 A 9 10 126599 CASAVA_Build 10 306958 5D TCAGGGTGAA CCTCT/----- CCTAAGCTGT 3070 het 3070 ref 51 24 21 7 CCTCT 1 0 126600 CASAVA_Build 10 313007 1I GAAAAGAAAG -/T TTTTGAAATG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 5 126601 CASAVA_Build 10 319192 1D TGGGGGGGGG C/- CGCCAGCCTG 3070 hom 112 het 44 0 32 12 C 2 1 126602 CASAVA_Build 10 325212 1D CCCAGTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 34 0 20 14 T 13 12 126603 CASAVA_Build 10 340496 2D CACACGAATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 167 het 68 0 53 15 CA 9 8 126604 CASAVA_Build 10 340640 2D56M4I CACACACTAG CACAAACTCATCTGCATGCACACACGTACACATGTAACATACTTACACACACATAAAA----/--CAAACTCATCTGCATGCACACACGTACACATGTAACATACTTACACACACATAAAACACT CAGTACACTA 3070 hom 334 het 71 0 112 13 N/A 0 0 126605 CASAVA_Build 10 340967 2D CTCATGACAC AT/-- ATATGCACGT 3070 hom 217 het 82 0 73 10 AT 3 2 126606 CASAVA_Build 10 341365 1I TTCTGCTGCT -/A AAGTCTCAAG 3070 hom 176 het 65 0 58 7 A 2 3 126607 CASAVA_Build 10 349427 5I AAAACTGCAC -----/CTGTA CTGAACAGGC 3070 hom 148 het 53 0 50 3 CTGTA 0 1 126608 CASAVA_Build 10 354851 1I CACATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 25 1 20 4 T 12 13 126609 CASAVA_Build 10 359415 2D GTTGTTAGAA CG/-- CAGTCAGTCT 3070 hom 33 het 12 0 12 3 CG 1 0 126610 CASAVA_Build 10 364539 5I TTCCTATATA -----/AATAC AAAACTTAAA 3070 hom 160 het 58 0 54 4 AATAC 0 1 126611 CASAVA_Build 10 365571 16D TGTCAGGGCG GGAGCTCAGCAAGGCT/---------------- GGAGCTCAGC 3070 hom 78 het 27 0 24 12 GGAGCTCAGCAAGGCT 2 1 126612 CASAVA_Build 10 366302 3I TACATATTTT ---/ATC ATCAATTGAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 ATC 1 2 126613 CASAVA_Build 10 372282 3D TGCTGAAGCA CAC/--- CACGTTACTT 3070 hom 129 het 47 0 42 10 CAC 2 1 126614 CASAVA_Build 10 374365 1D CCCTACACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 560 hom 31 3 17 11 T 15 14 126615 CASAVA_Build 10 381304 1I AGCGTTGTGA -/C CATGTGCAGA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 C 1 2 126616 CASAVA_Build 10 389122 2D ACACAGGGAA AC/-- ACAAAGAGTC 3070 hom 83 het 31 0 28 6 AC 2 1 126617 CASAVA_Build 10 411814 1D AGGTCTTTCA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 138 het 54 0 45 10 T 8 7 126618 CASAVA_Build 10 428833 4D CACACGTGCC CACA/---- CACAGGCGCG 3070 hom 63 het 27 0 19 9 CA 4 2 126619 CASAVA_Build 10 432750 31D ACGTGGAGTG CTGGCTGCAAATCCGGTGGGGGGGGGGGAAA/------------------------------- CTGGCTGCAA 3070 hom 39 het 23 0 13 15 CTGGCTGCAAATCCGGTGGGGGGGGGGGAAA 1 0 126620 CASAVA_Build 10 434744 1D AATAATAATT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 71 het 29 0 24 5 A 9 8 126621 CASAVA_Build 10 440151 1I TCATTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 928 hom 29 3 12 14 T 16 17 126622 CASAVA_Build 10 463531 4I AAAAAATCTG ----/GACA GACATTTTAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GACA 1 2 126623 CASAVA_Build 10 477880 28D CAAGACAGGT GACAGACGGGGTAGAGAATTAAAGCAGA/---------------------------- GACAGACGCT 3070 hom 96 het 28 0 30 6 GACAGACGGGGTAGAGAATTAAAGCAGA 1 0 126624 CASAVA_Build 10 495319 2I CAGAGGACAC --/AG GGGACCGGGA 3070 hom 139 het 48 0 42 6 AG 0 1 126625 CASAVA_Build 10 500502 2I CCATTGTGGA --/AG AGAGTGTGGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AG 2 3 126626 CASAVA_Build 10 510510 4I GCTGTGGCTG ----/CTCA CTGTGTTGGT 3070 hom 80 het 32 0 25 7 CTCA 0 1 126627 CASAVA_Build 10 512964 1I ATTTAAATCC -/A AAACGTCAGT 3070 hom 81 het 33 0 24 9 A 3 4 126628 CASAVA_Build 10 513620 3D GTGAATAGAT AGG/--- AGGAAAGCGG 2870 het 1361 hom 10 3 6 1 AGG 2 1 126629 CASAVA_Build 10 522093 3I CTCTAAACCA ---/AAT AATATGTTGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AAT 1 2 126630 CASAVA_Build 10 537268 4D AAGAATATAC TTTA/---- TTTAGAAGGC 3070 hom 114 het 42 0 39 7 TTTA 2 1 126631 CASAVA_Build 10 544070 2D TCCCTCACGC CA/-- CAGAGGAGCT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 CA 2 1 126632 CASAVA_Build 10 547583 3D CAGCCTCCCC CCA/--- CAAGTCAGTC 3070 hom 69 het 30 0 21 9 CCA 1 0 126633 CASAVA_Build 10 549565 6I ACACCTTACC ------/TGAAAG TGAAAGTCAC 3070 hom 99 het 37 0 31 6 TGAAAG 1 2 126634 CASAVA_Build 10 551658 2D AGTGAGACTG TC/-- TCTCAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TC 3 2 126635 CASAVA_Build 10 560047 1D CCCCTTCAGG A/- AGGAGTCCCT 3070 hom 80 het 29 0 25 4 A 2 1 126636 CASAVA_Build 10 565419 2D GACACAAAAG TT/-- AGTTCTCAAA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 T 2 0 126637 CASAVA_Build 10 569942 2D GACATGCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2490 hom 34 10 15 9 A 13 11 126638 CASAVA_Build 10 582731 1D TCATTATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 6 A 11 10 126639 CASAVA_Build 10 633389 1D TATCCCAGTG C/- CCCCCTACAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 C 6 5 126640 CASAVA_Build 10 637305 1I TTAGATGTCC -/A AAATGCATAT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 3 4 126641 CASAVA_Build 10 647142 2D TTCCCCTTCA CT/-- CTCTCTTTCC 3070 hom 117 het 46 0 38 10 CT 4 3 126642 CASAVA_Build 10 647923 4D TTTTTAAGGG ATCT/---- ATTATAGTTA 3070 hom 51 het 20 0 18 4 ATCT 1 0 126643 CASAVA_Build 10 653124 3D GCCCCTACTG TGT/--- TGGTATCTCA 3070 hom 50 het 22 0 14 8 TGT 1 0 126644 CASAVA_Build 10 654541 4D TCATGACTAC TAAA/---- TAATGATTTT 3070 hom 126 het 47 0 42 7 TAAA 1 0 126645 CASAVA_Build 10 721894 2I GAGTGAGACC --/CT GTCTCAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 CT 0 1 126646 CASAVA_Build 10 736760 1I CACACGGAAG -/A AAAATATGAC 3070 het 3070 ref 59 31 23 5 A 4 5 126647 CASAVA_Build 10 739711 4D TCTGGGGGCT TCTA/---- TCTGTGTGTT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 TCTA 1 0 126648 CASAVA_Build 10 756323 1I CTCAGGAAGC -/A AAAAAACAAC 3070 hom 134 het 51 0 44 7 A 6 7 126649 CASAVA_Build 10 770552 3D TTAAAATGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 37 1 25 11 A 16 13 126650 CASAVA_Build 10 771234 6D AACCAAGTTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 16 0 12 6 A 18 12 126651 CASAVA_Build 10 779302 1D TACAAAAGAT G/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 G 1 0 126652 CASAVA_Build 10 786065 7D ATAAATAAAT AAAAGAA/------- AAAAGAAAAA 3070 hom 30 het 10 0 11 0 AAAAGAA 3 2 126653 CASAVA_Build 10 797256 1D ATACTGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 11 23 7 A 10 9 126654 CASAVA_Build 10 801106 1I TAAAAAAAAA -/T AAATGGTCAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 0 1 126655 CASAVA_Build 10 821687 1D GCAAGTGAGA G/- GGGGGACTGA 901 het 901 ref 23 14 4 5 G 6 5 126656 CASAVA_Build 10 821735 1I ATGGGGGTGA -/G GGGGTCTCAC 865 het 865 ref 24 15 3 6 G 4 5 126657 CASAVA_Build 10 821843 1D AGCGAACCAC A/- AATGTTAAGC 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 3 2 126658 CASAVA_Build 10 896068 1D GTGTGGGGGT G/- GGGGGGAGGG 3070 hom 18 het 30 1 19 11 G 7 6 126659 CASAVA_Build 10 899167 1I ATAGGTTTCA -/T TTTTTTTTTT 1811 het 503 hom 15 2 7 6 T 15 16 126660 CASAVA_Build 10 912680 1D ATGCCCTGGT G/- GGGGCTTCTC 3070 hom 86 het 35 0 27 8 G 5 4 126661 CASAVA_Build 10 913325 14I TGTCTCTAAA --------------/AAAACAAATGAAAC AAAACAAACA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 AAAACAAATGAAAC 0 1 126662 CASAVA_Build 10 929012 1D CACCATACCC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 61 het 23 0 21 2 T 8 7 126663 CASAVA_Build 10 937069 4I CCATGTTGGC ----/CAGG CTGGTTTCGA 3070 hom 38 het 15 0 13 2 CAGG 0 1 126664 CASAVA_Build 10 965538 1D ACTCCAACTC G/- GGGGGGGAAG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 G 8 7 126665 CASAVA_Build 10 977712 5D TTTTTGTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 8 15 6 TTTGT 4 3 126666 CASAVA_Build 10 981471 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 1212 het 11 hom 7 0 4 3 A 8 7 126667 CASAVA_Build 10 992043 3D AAATGGGCAC CTT/--- CTTTGCACAG 1951 het 1951 ref 22 8 6 9 CTT 2 1 126668 CASAVA_Build 10 1000363 1D GTTATATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 21 1 13 7 T 11 10 126669 CASAVA_Build 10 1004283 4I GTTTGTGTGA ----/TAAT TAATTAAAAT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 TAAT 1 2 126670 CASAVA_Build 10 1007955 4D ATTCCCATTC CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 CT 7 5 126671 CASAVA_Build 10 1022018 1D TAATCCCCAT G/- TAAAGGCTCC 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 G 1 0 126672 CASAVA_Build 10 1022880 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 19 1 13 5 A 16 14 126673 CASAVA_Build 10 1023068 1D TAGCTTTGCT A/- ATCTCGGAAA 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 A 2 1 126674 CASAVA_Build 10 1031446 2D TTGGGAGCAA AG/-- AGAGGGAATT 3070 hom 82 het 29 0 27 3 AG 3 2 126675 CASAVA_Build 10 1032024 3I GTGGAAAAAA ---/AAC TAATATTTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AAC 0 1 126676 CASAVA_Build 10 1037623 3D TCATGGGTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 2234 het 130 hom 29 3 11 16 T 17 14 126677 CASAVA_Build 10 1039094 1D ATGACAGAGA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 8 7 126678 CASAVA_Build 10 1046786 2I TGTCCCGACA --/CT CTGGTGGAGA 3070 hom 69 het 27 0 14 13 CT 1 2 126679 CASAVA_Build 10 1049419 10D GCGTGGTGGC GGGCGCCTGT/---------- AGTCCCAGCT 1731 het 1236 hom 8 4 4 0 GGGCGCCTGT 1 0 126680 CASAVA_Build 10 1058200 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1311 hom 17 5 10 2 A 15 16 126681 CASAVA_Build 10 1065489 1I CCCTGGTTAA -/T TTTTTTTTTT 2324 het 2324 ref 15 7 7 1 T 10 11 126682 CASAVA_Build 10 1074004 2I CCTCCCTCCC --/CT GTCACCCCTG 3070 hom 186 het 67 0 61 6 CT 0 1 126683 CASAVA_Build 10 1076798 2I CCTACTAAAA --/AC ACAGAGTTTC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 AC 1 2 126684 CASAVA_Build 10 1085602 1D ACGTTCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 21 1 12 8 T 12 11 126685 CASAVA_Build 10 1091656 1D ACTTCACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2396 hom 20 6 9 5 T 12 11 126686 CASAVA_Build 10 1101968 2I AGCAATTAAC --/AT GTGGAAACCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 126687 CASAVA_Build 10 1108631 1D TCTCCAAAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 10 9 126688 CASAVA_Build 10 1111214 7D TAGCAATTCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1484 het 1070 hom 12 5 5 3 T 18 11 126689 CASAVA_Build 10 1115032 1D AACTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2588 hom 22 7 8 7 T 11 10 126690 CASAVA_Build 10 1126558 1D ACAGCAGACT C/- CCCGCTCTGG 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 C 4 3 126691 CASAVA_Build 10 1136227 7I GTCCTGGGAG -------/CACTGCA CACTGCACAC 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 CACTGCA 1 2 126692 CASAVA_Build 10 1143259 1D GGCAGAGGGG C/- CCGCATGACT 3070 hom 53 het 25 0 14 11 C 3 2 126693 CASAVA_Build 10 1147847 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 1496 het 1496 ref 21 7 8 6 C 0 1 126694 CASAVA_Build 10 1149025 2D AAGGACAGAC TG/-- ATGCTCTTGT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TG 1 0 126695 CASAVA_Build 10 1167634 2I GTGTGTGTGT --/GC GTGTGTGTGT 3070 het 728 hom 48 7 16 25 GC 0 1 126696 CASAVA_Build 10 1171740 1I TTTTTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 2905 het 2905 ref 41 17 11 13 T 11 12 126697 CASAVA_Build 10 1178497 1D AACTGAAAGA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 42 21 17 6 T 8 7 126698 CASAVA_Build 10 1186386 4D2M2D CACGAGCACA CACGTGCA/----TG-- CATGCACCAC 3070 het 413 hom 61 3 21 39 N/A 0 0 126699 CASAVA_Build 10 1191173 2I ATTAGCTCTC --/TT TTTTTCTCTC 3070 het 3070 hom 51 17 25 9 T 5 7 126700 CASAVA_Build 10 1203135 10I ACTTTGGGGA ----------/TTATCTCCAC TATACTTGTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TTATCTCCAC 0 1 126701 CASAVA_Build 10 1204572 1D AGCTGCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 T 13 12 126702 CASAVA_Build 10 1211896 1D ACACACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 11 6 A 13 12 126703 CASAVA_Build 10 1213348 2I GCAAATTAAC --/AT ATGTAAATTC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 AT 1 2 126704 CASAVA_Build 10 1214091 1I GATCCCTCGT -/C GGGGGGATGG 2781 hom 37 het 19 0 11 8 C 0 1 126705 CASAVA_Build 10 1215078 5I TTCATCAAAA -----/TACTC TAACTATTCT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TACTC 0 1 126706 CASAVA_Build 10 1216607 7I ACGTGGGGTC -------/CCCTCTG CCCTCTGCAG 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 CCCTCTG 1 2 126707 CASAVA_Build 10 1224557 1I CCTTCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 37 1 21 15 T 12 13 126708 CASAVA_Build 10 1230467 4I TATCTATCTA ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 hom 108 het 44 0 34 10 ATCT 3 4 126709 CASAVA_Build 10 1237304 2D TACAATTTAA AC/-- AGTCATTGAT 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 AC 1 0 126710 CASAVA_Build 10 1238053 1I GTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 761 hom 54 2 45 7 T 9 10 126711 CASAVA_Build 10 1249137 4D ATAAAAAGAC AAAG/---- AGAGACAGAG 3070 het 3070 ref 49 23 19 8 AAAG 1 0 126712 CASAVA_Build 10 1265786 6D ATGTGCTTAC GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 60 20 26 16 GT 11 8 126713 CASAVA_Build 10 1284712 1I TGCAAGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 T 12 13 126714 CASAVA_Build 10 1322414 1I TCTGACAAGT -/A GGATTCTGTC 3070 hom 102 het 36 0 32 4 A 0 1 126715 CASAVA_Build 10 1325619 1D TTTTAGCCCC G/- TCCTCCTCTG 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 G 1 0 126716 CASAVA_Build 10 1332557 5I CCCAGCCTCT -----/CACAC CACACCACAC 3070 het 2585 hom 33 12 17 4 CACAC 3 4 126717 CASAVA_Build 10 1333523 2D GTGGCCAAGC AA/-- AAGTCATCAA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 A 4 2 126718 CASAVA_Build 10 1333758 4I CTCTCTTCTC ----/TCTG TCTCTCTCTC 3070 hom 56 het 27 0 19 8 TCTG 0 1 126719 CASAVA_Build 10 1340281 4D ATAATAAAAA AAAT/---- AAATTAAAAA 2119 het 457 hom 9 1 8 0 AAAT 2 1 126720 CASAVA_Build 10 1350813 1I GTGTACAAGT -/G GGGGCAACAA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 4 5 126721 CASAVA_Build 10 1360163 13D CACCAGTACT CAGCGCCTCCTCA/------------- CAGCGCCTCC 3070 het 3070 ref 69 33 16 21 CAGCGCCTCCTCA 1 0 126722 CASAVA_Build 10 1360701 1D CCGCGTCCTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 T 9 8 126723 CASAVA_Build 10 1364680 3I AGTTTTGTTT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 het 2592 hom 35 12 15 8 TTG 0 1 126724 CASAVA_Build 10 1378244 1D GAAAATGCCC T/- GTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 T 1 0 126725 CASAVA_Build 10 1387406 2I ACAAACACTC --/TT TTGTCACTCT 3070 hom 101 het 35 0 33 2 T 2 4 126726 CASAVA_Build 10 1389677 1I GGATGCATGG -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 7 8 126727 CASAVA_Build 10 1390828 1D AAATGGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 36 4 14 19 T 11 10 126728 CASAVA_Build 10 1390843 6I TTTTTTCAGC ------/AAAACA AAAACAAAGA 3070 het 962 hom 32 4 11 17 AAAACA 1 2 126729 CASAVA_Build 10 1401907 1I GCCCACCAAT -/G GGCAGCTCTG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 G 2 3 126730 CASAVA_Build 10 1402472 1D AACTGTCAAC A/- AACTAGGCAT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 3 2 126731 CASAVA_Build 10 1404516 1I4M1I AGGGGGAGGG -AGGA-/TAGGAG ATGGGTAAGA 3070 het 3070 ref 50 29 21 0 N/A 0 0 126732 CASAVA_Build 10 1404671 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 78 het 29 0 26 4 A 8 7 126733 CASAVA_Build 10 1405492 2D GTCTCTACCC CT/-- GTTTCTGTCT 2795 het 2795 ref 44 20 10 14 CT 1 0 126734 CASAVA_Build 10 1408159 2I CATGCACACA --/CG CACACATGTG 3070 hom 201 het 78 0 60 18 CG 0 1 126735 CASAVA_Build 10 1413369 2D TTGTGCATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AC 11 10 126736 CASAVA_Build 10 1414902 1I GATGCCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 35 3 18 14 T 15 16 126737 CASAVA_Build 10 1415631 2D GAGTATGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 12 10 126738 CASAVA_Build 10 1436442 3I GCTTGGCCAT ---/GAG GAGAGCAGGA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 GAG 1 2 126739 CASAVA_Build 10 1447690 13I CATGAGTTGG -------------/CGGTCAATGACAA CCAGATAAAC 3070 het 3070 ref 50 29 18 3 CGGTCAATGACAA 0 1 126740 CASAVA_Build 10 1455718 1I ACTCTTCCTA -/G GGCCTAGTTG 3070 hom 114 het 40 0 36 4 G 2 3 126741 CASAVA_Build 10 1463334 14D AATACACATA TTTTTCAATTTCTT/-------------- CTGAAACACT 3070 hom 178 het 62 0 60 10 TTTTTCAATTTCTT 1 0 126742 CASAVA_Build 10 1472618 3D TACAAACGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 14 11 126743 CASAVA_Build 10 1477023 1D CAGCCATCCA C/- CCACCCACCC 3070 het 3070 ref 52 22 18 13 C 3 2 126744 CASAVA_Build 10 1478262 1D ATGGAAGGGA G/- GGGGTGAAGG 3070 het 3070 hom 54 22 23 9 G 5 4 126745 CASAVA_Build 10 1478513 1D CCAAATGGTA C/- CCCCAATACA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 5 4 126746 CASAVA_Build 10 1484941 1I CACGTGTATA -/C CTGTGTAACA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 126747 CASAVA_Build 10 1490059 18I GACTGGAACA ------------------/AAAATCATCCCTCTGCCC AAAATCATCC 3070 het 3070 hom 47 18 17 13 AAAATCATCCCTCTGCCC 0 1 126748 CASAVA_Build 10 1490196 3I12M4I ACCCTCCCTC ---CTTTCTCTCCTG----/CTTCTTTCTCTCCTGCTCT CTCTTTCCCC 2405 het 2405 ref 46 29 8 12 N/A 0 0 126749 CASAVA_Build 10 1490570 1I GGGTCTCACA -/G GCTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 1 2 126750 CASAVA_Build 10 1491048 15D ACAAACACTC GACGGAACAAACACT/--------------- CAAAGAACAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 GACGGAACAAACACT 1 0 126751 CASAVA_Build 10 1491726 1D GGGAGGCCAA G/- GGGGGGTGGA 2896 hom 12 het 18 0 8 10 G 7 6 126752 CASAVA_Build 10 1493711 1I GCATATATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 0 1 126753 CASAVA_Build 10 1493867 2D CTTTTTTTTT TC/-- CTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 TC 1 0 126754 CASAVA_Build 10 1506336 1I AGGCTTGATT -/C CCTGCATGGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 2 3 126755 CASAVA_Build 10 1512854 5D GATTGTGCCC CTGCA/----- CTCCAACCTG 2142 het 2142 ref 15 7 6 3 CTGCA 1 0 126756 CASAVA_Build 10 1520102 4D AGAAAAAAGG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 AAAC 5 4 126757 CASAVA_Build 10 1520421 1D TTTGGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 32 6 13 14 A 11 10 126758 CASAVA_Build 10 1522002 27D GAGGGATCCT AATAATTAGCATATTAGGATCAAACAC/--------------------------- TCTTGGGTGT 3070 het 3070 ref 30 24 13 4 AATAATTAGCATATTAGGATCAAACAC 1 0 126759 CASAVA_Build 10 1527792 107D AGGTGGTAAG CTTTAGAGGAGCCTTAGAAATATTCCATTCCATTAGTTAGAATATGATGAAAAGTACAAACTTTTCTAGTCATCATGGTTGTCATTATTAACATGATTGTCACCATA/----------------------------------------------------------------------------------------------------------- CTTATTAATA 3070 het 3070 ref 24 38 11 8 CTTTAGAGGAGCCTTAGAAATATTCCATTCCATTAGTTAGAATATGATGAAAAGTACAAACTTTTCTAGTCATCATGGTTGTCATTATTAACATGATTGTCACCATA 1 0 126760 CASAVA_Build 10 1531199 4I CTCACTCAAT ----/ACTC ACTCATTACT 3070 het 3070 hom 66 26 28 12 ACTC 1 2 126761 CASAVA_Build 10 1531465 1D TCACTGCTCA C/- TCACACTCAC 3070 het 3070 ref 72 35 28 10 C 1 0 126762 CASAVA_Build 10 1537306 4D GCACACACAG ACAC/---- ACACAACATA 3070 het 3070 hom 99 45 46 14 AC 4 2 126763 CASAVA_Build 10 1542223 4D TTCTTTTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 13 9 TCTT 3 2 126764 CASAVA_Build 10 1559622 3D GCAAACTGCC TGA/--- TGATATTTAA 3070 het 3070 hom 44 18 22 7 TGA 2 1 126765 CASAVA_Build 10 1567068 1I CACACCCTGG -/C CCCCACGCCT 2107 het 2107 ref 19 10 7 2 C 4 5 126766 CASAVA_Build 10 1573513 5D GACCCTGGAT CACAG/----- CCGTCCAGAC 1483 het 1365 hom 15 5 4 9 CACAG 1 0 126767 CASAVA_Build 10 1576214 2D AAAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 1593 het 249 hom 31 2 12 18 A 11 9 126768 CASAVA_Build 10 1578206 1D TTAGTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 9 A 11 10 126769 CASAVA_Build 10 1581406 1I GCGTGGAGCT -/G GGGGGGGTCC 1711 hom 21 het 9 0 7 2 G 7 8 126770 CASAVA_Build 10 1585120 4I TAATTAATTC ----/ATTT GTTTAGTCAC 3070 hom 62 het 27 0 19 8 ATTT 0 1 126771 CASAVA_Build 10 1589437 2I CCACCACCTC --/TT GTCTGACTCC 3070 hom 62 het 28 0 18 10 T 0 2 126772 CASAVA_Build 10 1592800 3I TTGGAGAGTT ---/CTC CTCCAGCAAA 3070 hom 59 het 23 0 18 5 CTC 1 2 126773 CASAVA_Build 10 1594648 3D TCTGAACCTG CTC/--- CTCAAGTGTC 3070 het 3070 hom 44 15 23 7 CTC 2 1 126774 CASAVA_Build 10 1598259 11D TCAGTCTAGC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 2367 hom 32 14 14 5 A 47 36 126775 CASAVA_Build 10 1601326 2I ACAGAGACAA --/AG AGAGAGAGAC 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 AG 4 5 126776 CASAVA_Build 10 1602642 4D AAGCAGGACG GGCA/---- GGCACCATGC 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 GGCA 2 1 126777 CASAVA_Build 10 1610872 2I ACACACACAC --/AG AGAGAGAAGT 3070 hom 162 het 63 0 53 10 AG 3 4 126778 CASAVA_Build 10 1610947 2I GCACACAGGT --/AC ACCTATGTTT 3070 hom 153 het 54 0 50 4 AC 1 2 126779 CASAVA_Build 10 1612699 2I GTCTTAAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 39 1 29 9 T 12 14 126780 CASAVA_Build 10 1614400 6I AGGAAACCAT ------/TTGGAG TTGGAGTTGG 3070 hom 92 het 43 0 30 13 TTGGAG 2 3 126781 CASAVA_Build 10 1615392 1I ATATGCAGTG -/T TTCAAAATTT 3070 hom 113 het 40 0 37 3 T 2 3 126782 CASAVA_Build 10 1634194 1I CCTCAGAGAT -/G GGACTCTTGG 3070 hom 99 het 38 0 32 6 G 2 3 126783 CASAVA_Build 10 1635154 2D TACACACATG CA/-- CACACAGACA 3070 het 3070 ref 81 35 28 19 CA 4 3 126784 CASAVA_Build 10 1642244 1I GATTGCTGCA -/T TTTTTTTTTT 3006 het 3006 ref 24 8 9 7 T 11 12 126785 CASAVA_Build 10 1643890 1I CATTTTTGCC -/T TTGTTGTAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 3 126786 CASAVA_Build 10 1647106 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 9 10 126787 CASAVA_Build 10 1648761 2D CAGACACACT CC/-- GCACCACCCT 3070 het 2682 hom 53 13 21 19 C 2 0 126788 CASAVA_Build 10 1650707 1I43M1I CAACAAGTCA -TTTTTTTTGTTCAAGTACAGTGTCACTAGGTTTAAAAATCAGA-/TTTTTTTTTGTTCAAGTACAGTGTCACTAGGTTTAAAAATCAGAT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 16 16 N/A 0 0 126789 CASAVA_Build 10 1651485 5D CATTGAAAGT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 33 1 28 4 A 19 14 126790 CASAVA_Build 10 1654109 1D ATCTAATAGT A/- AAAAACAATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 6 5 126791 CASAVA_Build 10 1655963 1I GAGGGCTGAG -/C TTTGCAGTCA 3070 hom 110 het 41 0 37 4 C 0 1 126792 CASAVA_Build 10 1669436 2I GTGATGATGT --/AA AAATCCTGTT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 3 5 126793 CASAVA_Build 10 1674207 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 86 het 32 0 28 4 A 10 9 126794 CASAVA_Build 10 1679608 2D ATGTGTGTGC AT/-- ATATGTGTAT 3070 het 3070 hom 59 25 25 10 AT 3 2 126795 CASAVA_Build 10 1682700 1I CCACAGCGCA -/G GGGAAACGCA 3070 het 3070 ref 48 20 16 12 G 3 4 126796 CASAVA_Build 10 1684039 1D GCTCTTCTCA C/- CCCCACACGA 3070 hom 84 het 31 0 26 5 C 5 4 126797 CASAVA_Build 10 1687507 1I CAACACCCCA -/G GGTCTAAGGG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 G 2 3 126798 CASAVA_Build 10 1690250 1I TCTGTCTCTA -/G CTGTCTCTCT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 G 0 1 126799 CASAVA_Build 10 1691343 1D TCAGGTGTAA C/- ACAGGGGACT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 C 1 0 126800 CASAVA_Build 10 1708980 1I TTCATTTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 77 het 29 0 27 2 T 8 9 126801 CASAVA_Build 10 1709071 4D GGTGAGGCCC AGTG/---- AGTGTCAGAA 3070 het 3070 ref 29 18 10 4 AGTG 2 1 126802 CASAVA_Build 10 1713680 1I AAAAAATATT -/A AAAAAAAAAA 2165 het 2165 ref 23 12 8 3 A 11 12 126803 CASAVA_Build 10 1719081 4D AAAGTTTCAG CTAA/---- CTAATTGTGA 3070 het 3070 hom 45 20 24 2 CTAA 2 1 126804 CASAVA_Build 10 1728345 4I GTATATTGTG ----/TGTA TGTATGTGTT 3070 hom 239 het 102 0 77 25 TGTA 1 2 126805 CASAVA_Build 10 1729166 1D TATTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 12 11 126806 CASAVA_Build 10 1762862 1I GTTACTCTTC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 7 8 126807 CASAVA_Build 10 1764523 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AATTTCCTTT 3070 het 43 hom 41 2 24 15 AAC 0 1 126808 CASAVA_Build 10 1765607 1D CTTCTTTTAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 A 9 8 126809 CASAVA_Build 10 1766153 1D TGAACGTTGC T/- TTGCCGCGAT 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 T 3 2 126810 CASAVA_Build 10 1770486 1D TTTTAAGCAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 9 8 126811 CASAVA_Build 10 1785615 4D GGTGGCTTGA ATCT/---- ATCTGTCTCC 3070 het 3070 hom 49 13 24 14 ATCT 2 1 126812 CASAVA_Build 10 1786473 1I GTGACTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2721 hom 35 10 18 7 T 10 11 126813 CASAVA_Build 10 1803106 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 11 0 10 2 A 10 9 126814 CASAVA_Build 10 1804475 1I TGTTGTTTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 10 11 126815 CASAVA_Build 10 1808211 4D ACCAATAGAT AATG/---- AAGAAGGAGA 3070 het 3070 ref 44 23 20 2 AATG 1 0 126816 CASAVA_Build 10 1813993 1I TTTCTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 2101 het 2101 ref 25 12 7 6 T 10 11 126817 CASAVA_Build 10 1821480 1D CCCTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2614 hom 46 16 14 16 T 15 14 126818 CASAVA_Build 10 1855551 1D TGGCAATTAG T/- TAATATCTAT 3070 hom 110 het 43 0 36 9 T 2 1 126819 CASAVA_Build 10 1857824 1D GCCCTAACTT A/- AATGACACCT 3070 hom 120 het 46 0 40 7 A 3 2 126820 CASAVA_Build 10 1858037 1I TACACAAAAA -/G CAATAAACAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 126821 CASAVA_Build 10 1877116 2I TAGATCTAAT --/AA AAAAAAATAC 3070 hom 84 het 38 0 28 10 A 7 9 126822 CASAVA_Build 10 1880732 1I GTGTTTATGT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 8 9 126823 CASAVA_Build 10 1882849 1D GTGATTATGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 34 0 32 4 A 9 8 126824 CASAVA_Build 10 1883813 9I CGTCTCTACT ---------/AAAAATACA AAAAATTAGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AAAAATACA 0 1 126825 CASAVA_Build 10 1896322 3I CAAGTCCTCC ---/AGA AGATCTAGCT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AGA 1 2 126826 CASAVA_Build 10 1897161 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2939 het 11 hom 20 1 11 9 A 11 12 126827 CASAVA_Build 10 1899273 2I GCACATAAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 41 hom 23 1 13 9 AT 8 9 126828 CASAVA_Build 10 1900856 1I CCCCAATCCT -/A TGGGAGAACA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 0 1 126829 CASAVA_Build 10 1903004 1I CCTGGGCCCT -/G GGGGGGATCA 3070 hom 96 het 36 0 30 6 G 6 7 126830 CASAVA_Build 10 1903979 4D GAAGAGGAAA AGGG/---- AGAAAGAGAA 1138 het 17 hom 35 1 9 25 AGGG 1 0 126831 CASAVA_Build 10 1904178 4D AGAGGAAGAG AGAA/---- AGAGAAAGAG 3070 hom 65 het 27 0 19 8 AGAA 1 0 126832 CASAVA_Build 10 1906396 1D CTGTTGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 39 0 29 10 T 11 10 126833 CASAVA_Build 10 1912069 5I TATATATATG -----/ATATA TATTTTTTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 ATATA 0 1 126834 CASAVA_Build 10 1915847 1I AGGAAAATGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 8 9 126835 CASAVA_Build 10 1921558 1I GAATCTATCA -/G GGCGGTACCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 2 3 126836 CASAVA_Build 10 1922041 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 2642 hom 18 het 7 0 7 0 T 6 7 126837 CASAVA_Build 10 1924590 1I TTGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 1973 hom 10 het 4 0 4 7 G 3 4 126838 CASAVA_Build 10 1926629 1I TATACTTAAT -/A AAAAATTAAT 2981 hom 15 het 6 0 6 0 A 5 6 126839 CASAVA_Build 10 1927259 2D TACACTGTAG TA/-- TATACACCAC 3070 hom 182 het 67 0 61 6 TA 3 2 126840 CASAVA_Build 10 1931306 1D AGATCTAATT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 8 7 126841 CASAVA_Build 10 1934726 1D TTACAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 112 het 47 0 37 10 T 11 10 126842 CASAVA_Build 10 1936289 10D CATACACACA CACACACAGG/---------- CACACACACA 2416 het 423 hom 57 2 21 42 CACACACAGG 1 0 126843 CASAVA_Build 10 1936674 1I CAGAGCTCAA -/C CCCCCCCCGA 1948 het 1948 ref 28 13 10 5 C 8 9 126844 CASAVA_Build 10 1939014 2I GACAAATATC --/TA TTATAACATT 3070 het 3070 ref 33 13 15 5 TA 0 1 126845 CASAVA_Build 10 1940499 2I TATCTCTGGT --/AG GTCTGTCCAG 3070 het 2622 hom 19 8 8 3 AG 0 1 126846 CASAVA_Build 10 1941865 1I TCATCAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 11 12 126847 CASAVA_Build 10 1948869 2I CTTGAAAAAC --/TA ATTTGCTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TA 0 1 126848 CASAVA_Build 10 1951349 1I TTATTATTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 8 9 126849 CASAVA_Build 10 1953294 3I TATCCAGCTG ---/TTC TTCTAGCTCA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 TTC 1 2 126850 CASAVA_Build 10 1956839 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2719 het 2675 hom 18 7 7 4 A 11 12 126851 CASAVA_Build 10 1957729 9D GAATAAAGAG ATGTGCACT/--------- TTTAGATGGT 3070 het 3070 ref 34 18 17 2 ATGTGCACT 1 0 126852 CASAVA_Build 10 1960333 4I GAAAATTAAC ----/AAAT AAATCGGAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAAT 1 2 126853 CASAVA_Build 10 1965173 1I ACTCGGGGCT -/G GGGGGGGTTC 3070 het 2974 hom 30 11 11 8 G 7 8 126854 CASAVA_Build 10 1968732 7D TGTAGAGAGA GAGAGAT/------- GATAATTATC 2082 het 615 hom 15 3 5 10 GAGAGAT 1 0 126855 CASAVA_Build 10 1970353 2I GAGTTTTTGA --/AG AATAAAAATG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 AG 0 1 126856 CASAVA_Build 10 1971255 1D GCCCAGTTAA T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 7 6 126857 CASAVA_Build 10 1986899 2I TAGAAATAAT --/CA GTGTTGAGAC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 CA 0 1 126858 CASAVA_Build 10 1988103 1I AGGTATGGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 9 10 126859 CASAVA_Build 10 2006625 1D CCACAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 833 hom 39 2 27 11 T 15 14 126860 CASAVA_Build 10 2074233 1I TTTGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 25 1 18 6 T 15 16 126861 CASAVA_Build 10 2088748 2D CACAGATATA TG/-- TCAAAGCATA 3070 hom 143 het 52 0 48 5 TG 1 0 126862 CASAVA_Build 10 2098147 7I TAAAAGAAAA -------/TAGCTGC TAAGTAGGTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TAGCTGC 0 1 126863 CASAVA_Build 10 2101348 1D TACAGAACAA T/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 T 7 6 126864 CASAVA_Build 10 2106876 1D GTTTGTTTTG T/- TTTGCAGAGA 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 T 4 3 126865 CASAVA_Build 10 2108635 1D GAATCATTGG A/- AAAATTGTGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 5 4 126866 CASAVA_Build 10 2117934 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 145 hom 29 3 20 7 AC 7 6 126867 CASAVA_Build 10 2118683 1I CTTCATTAAC -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 A 7 8 126868 CASAVA_Build 10 2123579 4D ACCCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2818 het 550 hom 19 6 8 7 A 20 16 126869 CASAVA_Build 10 2124896 1I CTCCCTTCCC -/A CAGTGTAACC 3070 het 3070 ref 50 20 20 10 A 0 1 126870 CASAVA_Build 10 2133600 1D CTGTCAGTTC A/- CCATCACCAG 3070 het 3070 ref 58 28 21 10 A 1 0 126871 CASAVA_Build 10 2137144 1D CGGGAGGGGA G/- GAACAGCCTT 3070 het 2629 hom 28 10 14 4 G 2 1 126872 CASAVA_Build 10 2143285 1D GGTATTAGTG T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 7 126873 CASAVA_Build 10 2152014 1I ACCTCTACAT -/A AGCGTGAGAG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 1 2 126874 CASAVA_Build 10 2152153 1I GGAGCTGCCA -/T TGTTGAACAT 3070 hom 59 het 22 0 17 5 T 1 2 126875 CASAVA_Build 10 2153242 1I TGAAAAGACA -/T TTGAGAAGCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 2 3 126876 CASAVA_Build 10 2157250 5D TTTAATTGAT ATATC/----- ATAGTTTAAG 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 ATATC 1 0 126877 CASAVA_Build 10 2160966 1D GGAATATGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 10 9 126878 CASAVA_Build 10 2168287 1D GTCAGATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 38 1 25 12 T 13 12 126879 CASAVA_Build 10 2176909 1D CGTAGAGGTT G/- GTGGCTCTCT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 G 2 1 126880 CASAVA_Build 10 2182565 11D TGAGTCAACA GACTATTTCCT/----------- GATTTGTATT 3070 hom 123 het 45 0 41 8 GACTATTTCCT 1 0 126881 CASAVA_Build 10 2185865 1D AGAAAAAAAA T/- GTTTAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 13 10 T 1 0 126882 CASAVA_Build 10 2197005 1I TCCCAAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 A 8 9 126883 CASAVA_Build 10 2199242 4D GATCAGAAAA TACT/---- TACAGGAGGA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TACT 1 0 126884 CASAVA_Build 10 2249717 4I AAAGCATGGA ----/TCTT TAGTCTGTGA 3070 hom 141 het 49 0 48 1 TCTT 0 1 126885 CASAVA_Build 10 2258614 2I TAAAATTAGC --/AA AGTCACTGAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 3 126886 CASAVA_Build 10 2260606 1I GACAGTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 32 1 26 5 T 10 11 126887 CASAVA_Build 10 2266563 1I GAAAGTATAG -/A TACATAATTA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 0 1 126888 CASAVA_Build 10 2266825 2D CTGGGGGAGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 66 het 31 0 22 11 TC 6 5 126889 CASAVA_Build 10 2269469 2D TCAAACTAGA AT/-- ATGTGTGTAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 AT 2 1 126890 CASAVA_Build 10 2287276 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2990 het 2469 hom 16 6 8 2 A 13 14 126891 CASAVA_Build 10 2289811 1I AACAGAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 47 2 42 3 A 10 11 126892 CASAVA_Build 10 2290199 1D GTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 41 0 34 9 T 10 9 126893 CASAVA_Build 10 2291704 1D TGTGACTCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 42 0 34 9 T 10 9 126894 CASAVA_Build 10 2294064 1D AGATTTTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 305 hom 34 1 29 4 T 10 9 126895 CASAVA_Build 10 2297366 7D CTATATTCAC ATATTCT/------- ATATTCTATA 3070 hom 33 het 15 0 12 4 ATATTCT 2 1 126896 CASAVA_Build 10 2302029 2D AAATATATTC AA/-- AGACTTAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 3 1 126897 CASAVA_Build 10 2322967 1I GTGGCCCAGG -/A TGGGCCCCAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 0 1 126898 CASAVA_Build 10 2323310 1D TGATGGGAGC G/- CCCTGGAGAC 3070 hom 33 het 17 0 12 6 G 1 0 126899 CASAVA_Build 10 2324421 1I TTATTTAAAA -/C TGCTAATACT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 126900 CASAVA_Build 10 2325157 22D AAAGACCCAT CTCTGCCCCTGTATGTTTATGA/---------------------- CTCTGCCCCT 3070 hom 75 het 28 0 26 8 CTCTGCCCCTGTATGTTTATGA 2 1 126901 CASAVA_Build 10 2329353 1D GCCCGGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 13 0 10 3 T 11 10 126902 CASAVA_Build 10 2331314 6I GTCAGACCCT ------/TTACTG TTACTAAGTT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TTACTG 0 1 126903 CASAVA_Build 10 2336814 1I ATCTGATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1420 hom 48 5 28 15 T 13 14 126904 CASAVA_Build 10 2337068 1D ATTTAAGAAA T/- ACAATTATCT 3070 hom 98 het 40 0 32 8 T 1 0 126905 CASAVA_Build 10 2345239 1D TAGAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 36 0 28 8 A 11 10 126906 CASAVA_Build 10 2346513 9D ATTCTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 14 0 12 6 A 23 14 126907 CASAVA_Build 10 2346970 1D GGATAGAGAG A/- AGAGGGGGCA 3070 hom 108 het 41 0 35 7 A 2 1 126908 CASAVA_Build 10 2347985 1D TAAAAAGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 10 9 126909 CASAVA_Build 10 2349428 1D CACCGCCCCC T/- GGCCAAATAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 1 0 126910 CASAVA_Build 10 2349714 40D GTTCGAGTTC ACTCAGTAGGAGCAAGCTCGGAGTGGGCGGGTTCGAGTTA/---------------------------------------- ACTCAGTAGG 3070 hom 61 het 20 0 19 8 ACTCAGTAGGAGCAAGCTCGGAGTGGGCGGGTTCGAGTTA 1 0 126911 CASAVA_Build 10 2354079 1I TCTTGTCTCA -/G TGTTGATGGC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 G 0 1 126912 CASAVA_Build 10 2354455 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 809 hom 7 het 4 0 3 1 A 12 11 126913 CASAVA_Build 10 2356784 14I ATTTTCTTAC --------------/CATTTGTGTGTTCA CTGGAAAAGC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CATTTGTGTGTTCA 0 1 126914 CASAVA_Build 10 2358108 1D TAAGTTACTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 9 8 126915 CASAVA_Build 10 2359140 1D TACAAAGGTA C/- TAAAGGGCAA 3070 het 3070 ref 43 25 18 1 C 1 0 126916 CASAVA_Build 10 2371033 1D GGTTTTCAAC T/- TTTTTTTTTT 2421 hom 21 het 12 0 8 4 T 17 16 126917 CASAVA_Build 10 2371846 1D TATTCTTAAT G/- GGTACTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 3 2 126918 CASAVA_Build 10 2399390 1D CCACTAAAGA T/- TTTTATGAGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 5 4 126919 CASAVA_Build 10 2402489 2I AAAGCAAATA --/GT TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 GT 0 1 126920 CASAVA_Build 10 2410713 2D AGACTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 27 1 22 4 A 14 12 126921 CASAVA_Build 10 2414960 12I CGGAAAGGAC ------------/AATCACGACTAA AATGTTGTCA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 AATCACGACTAA 0 1 126922 CASAVA_Build 10 2418204 2D ACTGTTATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 30 0 11 20 A 13 11 126923 CASAVA_Build 10 2418425 1D GGACGGAGAT G/- GCAAAGTCTC 3070 hom 123 het 48 0 40 9 G 2 1 126924 CASAVA_Build 10 2419820 2I ATCTACTCAC --/AT GTTTGATACT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AT 0 1 126925 CASAVA_Build 10 2419968 1D CACATAATTC T/- TTAAATACTC 3070 hom 111 het 40 0 38 3 T 3 2 126926 CASAVA_Build 10 2433497 2D CCTAAATTAC AT/-- ATATATGTTT 2526 het 852 hom 16 8 7 2 AT 4 3 126927 CASAVA_Build 10 2433916 1I ATGTTTGCCT -/A AATGGTGGTG 3070 het 3070 hom 47 16 27 4 A 2 3 126928 CASAVA_Build 10 2442499 1D TGAGCATATA C/- ATGTGCACCT 3070 het 3070 ref 68 33 27 12 C 1 0 126929 CASAVA_Build 10 2453815 1D ATCTTACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 A 13 12 126930 CASAVA_Build 10 2457803 1D GTGACAAACA C/- TGCATTCATG 3070 het 3070 ref 54 30 20 6 C 1 0 126931 CASAVA_Build 10 2485297 1I TATAACATTA -/T TTTTTCTGGA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 5 6 126932 CASAVA_Build 10 2491558 1D TCTTACATTC T/- TTGAACAATG 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 3 2 126933 CASAVA_Build 10 2492823 1D TTTTGTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2766 hom 35 10 16 9 T 12 11 126934 CASAVA_Build 10 2492882 1D TTATTTCCTT C/- TTTCTGCTTG 3070 het 3070 ref 35 14 15 7 C 1 0 126935 CASAVA_Build 10 2492967 12I TCTTTTCCCT ------------/GGGTCTTTCCTA GGAACGTACA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 GGGTCTTTCCTA 0 1 126936 CASAVA_Build 10 2496191 2I TCACAGAGGA --/AG AGTCTATCAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AG 1 2 126937 CASAVA_Build 10 2497476 1D TGGGAAATCA T/- TACTTCTAGA 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 T 2 1 126938 CASAVA_Build 10 2498878 1D TTTTACATAC A/- AATCTATCAC 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 3 2 126939 CASAVA_Build 10 2500504 1I TCAATCTCAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 T 8 9 126940 CASAVA_Build 10 2501631 1D CAGCACATAT A/- GACACAGATG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 1 0 126941 CASAVA_Build 10 2502535 4I GCCTCCCTCC ----/ATCT GTCTTGCCCT 3070 hom 119 het 46 0 38 8 ATCT 0 1 126942 CASAVA_Build 10 2505053 4I TCCACTGAGA ----/CAAT CAAGCATTGT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 CAAT 0 1 126943 CASAVA_Build 10 2511396 1I TTGAGTTCTT -/A AGAGTTCTTC 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 A 1 2 126944 CASAVA_Build 10 2514148 22D ATAAACACAT CTATTAGTATTACAATACTGAG/---------------------- CTATTAGTAT 3070 het 3070 hom 23 8 10 6 CTATTAGTATTACAATACTGAG 1 0 126945 CASAVA_Build 10 2514607 1I ATTTCTTATA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 T 7 8 126946 CASAVA_Build 10 2517281 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTGAG 3070 het 2633 hom 25 10 13 2 T 8 7 126947 CASAVA_Build 10 2517831 1I ACTTTACCCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 8 9 126948 CASAVA_Build 10 2520971 1D TACAGCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 T 12 11 126949 CASAVA_Build 10 2521268 2D AACAGACACA CT/-- CTCATTTCTA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 CT 2 1 126950 CASAVA_Build 10 2522718 1D ACAGATGTAG A/- AAAAGGACAT 3070 het 3070 ref 44 23 19 3 A 5 4 126951 CASAVA_Build 10 2523068 1I CGTGACAAAT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 0 1 126952 CASAVA_Build 10 2525206 3I TGTAAAACCA ---/TAG TGTCTTATGC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 TAG 0 1 126953 CASAVA_Build 10 2532487 2I ACATTCCGTG --/AT ATATTGCCTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AT 2 3 126954 CASAVA_Build 10 2532866 6I ACACAGGCTT ------/ACACAC ACACACACAA 3070 hom 205 het 74 0 66 13 AC 4 7 126955 CASAVA_Build 10 2532922 2D82M12D ACACGCTCAA ACACACACACTCAAACACACACATGCTCAAACACACACAATAAACACACAGGCTCAGACACACACCTGCACAAACACACACACAAACACACACCTG/--ACACACACTCAAACACACACATGCTCAAACACACACAATAAACACACAGGCTCAGACACACACCTGCACAAACACACACACA------------ CTCAAACACA 3070 het 3070 hom 49 26 29 57 N/A 0 0 126956 CASAVA_Build 10 2539609 1I CCTTGGGCCT -/A GCTGTAGTGT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 0 1 126957 CASAVA_Build 10 2542555 4D ACTTAAAAAG TGTT/---- TGAAGGTCCA 3070 hom 114 het 41 0 38 4 TGTT 1 0 126958 CASAVA_Build 10 2562695 1D AGACCACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 34 1 20 13 T 13 12 126959 CASAVA_Build 10 2566589 1D TTAAATATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 118 hom 29 2 15 12 A 18 17 126960 CASAVA_Build 10 2566972 9D AGCTGAGTGT GAGGTGCAA/--------- GAGGCATGTC 3070 hom 120 het 43 0 39 7 GAGGTGCAA 1 0 126961 CASAVA_Build 10 2577855 1D CGGCCTCCAC T/- TTTCATCTTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 4 3 126962 CASAVA_Build 10 2582251 2D GGAGAGAGAA AG/-- AGAGAAATGA 3070 het 3070 hom 31 13 12 8 AG 3 2 126963 CASAVA_Build 10 2585399 1I TGCCAATGCA -/G TCCCTGTCTG 3070 hom 144 het 52 0 48 4 G 0 1 126964 CASAVA_Build 10 2586473 2I AAGAAATTTA --/AG AGTTATAATC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AG 1 2 126965 CASAVA_Build 10 2588227 3I TTCAACTTTG ---/TTC TTCTCTTTCA 3070 hom 86 het 34 0 29 5 TTC 1 2 126966 CASAVA_Build 10 2589372 2D AATATTAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 17 8 A 14 12 126967 CASAVA_Build 10 2590651 1D GATGCCTGCC T/- TATCTTTCTT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 1 126968 CASAVA_Build 10 2592583 2D ATATAATCAC AT/-- AGAAAAATCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AT 1 0 126969 CASAVA_Build 10 2601934 6D TTATGCAAAT TGTGTA/------ CTCTAGAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TGTGTA 1 0 126970 CASAVA_Build 10 2603017 1D AATAACTTAA C/- CCTGCTTTAT 3070 hom 123 het 45 0 41 5 C 3 2 126971 CASAVA_Build 10 2610397 4D TACTGAAAAT ACAA/---- ACAATTAGCC 2509 hom 27 het 10 0 7 3 ACAA 2 1 126972 CASAVA_Build 10 2615074 1D GTCAGTCATG T/- TCTCCTACTA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 T 2 1 126973 CASAVA_Build 10 2634575 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTCCTTCTTT 1503 het 621 hom 20 5 6 10 TTC 2 1 126974 CASAVA_Build 10 2636707 4D ACATACCACT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 30 14 9 9 ATAG 4 3 126975 CASAVA_Build 10 2645473 1D AAATACAGAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 126976 CASAVA_Build 10 2653088 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 975 het 534 hom 27 6 4 17 A 15 14 126977 CASAVA_Build 10 2661628 2I ATCAGCGCAC --/TA TGAGAAGTGG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 TA 0 1 126978 CASAVA_Build 10 2665658 1I TCCCCTATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 A 9 10 126979 CASAVA_Build 10 2672461 13D GATCTGGTGG TTTTATCGGGGCT/------------- TTTCCCCTTT 3070 het 3070 ref 38 20 19 3 TTTTATCGGGGCT 1 0 126980 CASAVA_Build 10 2679523 4I CATCTGTCCA ----/TCTG TCTGTCAGTG 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 TCTG 1 2 126981 CASAVA_Build 10 2689732 25D GGGAAAAAAA AGTATATATATATATATATATATAT/------------------------- ATATATATAT 3070 het 1452 hom 21 5 14 4 AGTATATATATATATATATATATAT 1 0 126982 CASAVA_Build 10 2698087 1D CAAAACAGAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 9 8 126983 CASAVA_Build 10 2701083 4D ACACACATAA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 133 hom 40 2 16 22 GT 9 7 126984 CASAVA_Build 10 2716633 1D AATAATGTAT A/- AAATGTTCCC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 4 3 126985 CASAVA_Build 10 2725203 1I AGCAAGATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 10 126986 CASAVA_Build 10 2726603 1I ATGTGCCAGG -/A TAAGTTTACC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 0 1 126987 CASAVA_Build 10 2742291 10I AATATGGCTG ----------/CTTTGAAAGT CTTTATTTCT 3070 hom 91 het 37 0 29 8 CTTTGAAAGT 0 1 126988 CASAVA_Build 10 2770039 7D AAAGATAAGT TGGTGGG/------- TGGGTGGATA 3070 het 3070 ref 47 23 20 7 TGGTGGG 1 0 126989 CASAVA_Build 10 2773736 1I TTTAGTTCTA -/T TGTCCTGTGT 3070 het 3070 ref 57 27 24 6 T 1 2 126990 CASAVA_Build 10 2774461 2D CTTCTCTGCA CT/-- CTCTCCGACA 1576 het 1576 ref 36 19 7 11 CT 3 2 126991 CASAVA_Build 10 2775153 2D CATTTGATCT GA/-- GAGAGTGAAG 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 GA 3 2 126992 CASAVA_Build 10 2777508 1I CCCGGATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 10 11 126993 CASAVA_Build 10 2782935 34I TCAGTCTGCT ----------------------------------/ACTGCTGCTGTGAAGCTGTTAATCTTCACTTAAC CTATTTGTGA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 ACTGCTGCTGTGAAGCTGTTAATCTTCACTTAAC 0 1 126994 CASAVA_Build 10 2787176 8D CACACACGCA CACACACG/-------- CACACACGCA 3070 het 88 hom 45 3 28 18 CACACACG 3 2 126995 CASAVA_Build 10 2794386 2I CTTTCTACTT --/TC TGTTTCTACG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TC 0 1 126996 CASAVA_Build 10 2811018 1D AATTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 31 1 20 11 T 11 10 126997 CASAVA_Build 10 2811624 1D ATTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2629 hom 28 10 14 5 A 15 14 126998 CASAVA_Build 10 2812376 2D TTTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 37 0 29 8 TG 9 8 126999 CASAVA_Build 10 2816387 1D TCCCCACCCC A/- CCCCCCAAAA 1531 het 412 hom 17 2 8 8 A 1 0 127000 CASAVA_Build 10 2837715 1I ATAAACAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 38 2 22 14 A 14 15 127001 CASAVA_Build 10 2844657 1D CACTGTATTC A/- GTCTTAGTTT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 1 0 127002 CASAVA_Build 10 2849411 2I TAATAATTAT --/TA TATATATATA 3070 het 468 hom 15 1 10 4 TA 6 7 127003 CASAVA_Build 10 2857476 2I ATATATTATT --/AA TATATATATA 2815 hom 21 het 8 0 8 0 A 0 2 127004 CASAVA_Build 10 2861509 1D TAAATTATTA T/- TTAAAACTAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 3 T 3 2 127005 CASAVA_Build 10 2881050 2D TTCTTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 32 2 15 15 T 18 16 127006 CASAVA_Build 10 2906617 1I TGCCAGTAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 8 9 127007 CASAVA_Build 10 2908742 1I TTTCAATTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 127008 CASAVA_Build 10 2924939 1I TGTTTTTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 9 10 127009 CASAVA_Build 10 2934659 2D ACATGGTCAC AT/-- GTTTAGCTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 1 0 127010 CASAVA_Build 10 2939108 2D CGCACACAAT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 90 65 12 19 CA 7 6 127011 CASAVA_Build 10 2952148 6D GGAGAAAAAT TCTTTG/------ GCTTAAAATT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TCTTTG 1 0 127012 CASAVA_Build 10 2956003 1I CCCAGGGCTG -/C AGAAGGAAGG 3070 het 3070 hom 39 10 20 9 C 0 1 127013 CASAVA_Build 10 2962441 1D AAATTATATT A/- GCTTGCCCCC 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 A 1 0 127014 CASAVA_Build 10 2962853 2I CAAAAAAAAA --/AT AAAAATTAAA 1022 het 1022 ref 29 11 8 10 AT 0 1 127015 CASAVA_Build 10 2972983 1I TTTTTAGGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 9 127016 CASAVA_Build 10 2979933 1D CTTTTATCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 9 8 127017 CASAVA_Build 10 2998450 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 20 0 15 5 A 11 12 127018 CASAVA_Build 10 3006328 1I AATTACTTTG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 8 9 127019 CASAVA_Build 10 3014397 1D CAACTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 23 0 15 8 A 12 11 127020 CASAVA_Build 10 3021625 3I TTCTACAGAG ---/GCA GCAGCAGGAG 3070 hom 96 het 37 0 31 6 GCA 2 3 127021 CASAVA_Build 10 3025162 1I AAATTTCGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 18 0 13 5 A 10 11 127022 CASAVA_Build 10 3025824 2I AGGCAGCTTT --/TG GGGGGGTCTC 3070 hom 98 het 34 0 30 4 TG 0 1 127023 CASAVA_Build 10 3040037 1I TTCTCTGGCC -/T TTGGATGCTG 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 2 3 127024 CASAVA_Build 10 3053771 1I TCAATAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 29 6 T 10 11 127025 CASAVA_Build 10 3058192 1D TCCAGAAAAA T/- GTCCCAAATA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 0 127026 CASAVA_Build 10 3058633 1I GCTACTCTGG -/A TACCTCATAT 3070 hom 66 het 27 0 21 6 A 0 1 127027 CASAVA_Build 10 3058742 1I AGTTTCCTTC -/T TTTTTTTTCT 2922 hom 35 het 15 0 11 4 T 8 9 127028 CASAVA_Build 10 3059887 2I AAAAAAAAAA --/AC CAGGAAAAGA 3070 hom 87 het 37 0 28 9 AC 0 1 127029 CASAVA_Build 10 3060353 4D CAGACAAACA CACT/---- CAGTCATAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 CACT 1 0 127030 CASAVA_Build 10 3060803 1I AGCTGGATCG -/T TAAGTTCCCC 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 T 1 2 127031 CASAVA_Build 10 3062823 1D TTATTTTTTT A/- AATGTCAACA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 3 2 127032 CASAVA_Build 10 3067254 1D AGCGTCTTTT C/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 1 0 127033 CASAVA_Build 10 3071214 1D TCTAAAAACC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 7 6 127034 CASAVA_Build 10 3077666 2I GAGGGACGGG --/GA GAGAAAGAGC 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 GA 2 3 127035 CASAVA_Build 10 3079203 11D GGCTGCTCCC ACCACAGAGCT/----------- GGCCAGCATC 3070 het 3070 ref 26 14 11 6 ACCACAGAGCT 1 0 127036 CASAVA_Build 10 3079760 1D GTGTATTTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 A 9 8 127037 CASAVA_Build 10 3084686 1I AAAATGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 18 9 T 10 11 127038 CASAVA_Build 10 3085451 1I GCCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 9 10 127039 CASAVA_Build 10 3095014 28D GAGTCATTCA TTCACTCACTCACTCATTCACTCCTTCG/---------------------------- GTCACTCACT 3070 hom 142 het 45 0 47 6 TTCACTCACTCACTCATTCACTCCTTCG 1 0 127040 CASAVA_Build 10 3095258 4D CTCATTTACC CACT/---- CACTCACTTA 3070 hom 135 het 56 0 45 14 CACT 3 2 127041 CASAVA_Build 10 3111434 1I CATGTCCAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 20 0 14 7 T 9 10 127042 CASAVA_Build 10 3115832 5D TTGCTTTAAC TTATT/----- TTATTTTATT 3070 hom 114 het 42 0 39 5 TTATT 3 2 127043 CASAVA_Build 10 3124880 1D GAAAAAATAT G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 82 het 34 0 27 7 G 5 4 127044 CASAVA_Build 10 3139942 4I GCACATTCTT ----/ACTC ACAAAGCCAC 3070 hom 56 het 28 0 18 10 ACTC 0 1 127045 CASAVA_Build 10 3141272 2I TGTGTTTCTA --/GT GTGAGTTTCT 3070 hom 84 het 34 0 27 7 GT 1 2 127046 CASAVA_Build 10 3145847 21I TGTGACTGAA ---------------------/TGACTACTTATTTAAGGCAAG GCATTGCTTC 3070 hom 60 het 24 0 18 6 TGACTACTTATTTAAGGCAAG 0 1 127047 CASAVA_Build 10 3146234 12I CCGAGGCATA ------------/GGGATGCCAACT GGGCTGGGTG 3070 hom 108 het 40 0 36 5 GGGATGCCAACT 0 1 127048 CASAVA_Build 10 3147648 2D CCGGGGTGAA GG/-- TGTGTGTCCC 3070 het 336 hom 20 4 12 5 G 2 0 127049 CASAVA_Build 10 3148294 1I TTTATGTGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 8 9 127050 CASAVA_Build 10 3151294 1D27M3D GACTCCTTAA CCCGGGCCTCATCTATTCAGTGAGCTCTTAA/-CCGGGCCTCATCTATTCAGTGAGCTCT--- TGTATTTCAG 3070 het 3070 ref 39 25 19 8 N/A 0 0 127051 CASAVA_Build 10 3153255 1I ACTGGTAAAT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 A 7 8 127052 CASAVA_Build 10 3157592 1I CAGGGTAAAA -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 32 12 15 5 T 7 8 127053 CASAVA_Build 10 3160698 2I AAATAATACT --/CA CTCTCCCACA 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 CA 0 1 127054 CASAVA_Build 10 3165105 2I TGGGTGGGAC --/AG AGCAAGAGAG 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 AG 1 2 127055 CASAVA_Build 10 3166612 9D18M9I AAATTGTCAT TTCTATTTAACAGCAAAGTGTTACTGT---------/---------ACAGTAACACTTTGCTGTTAAATAGAA ATAACTGGTA 3070 het 3070 ref 40 29 15 3 N/A 0 0 127056 CASAVA_Build 10 3167604 2D31M3I TTTTGCCTCT CAGTGTGTGTATGTGTGAGCATAAATTAGTGTC---/--GTGTGTGTATGTGTGAGCATAAATTAGTGTCCTG CTGTAATTTA 3070 het 3070 hom 41 23 24 3 N/A 0 0 127057 CASAVA_Build 10 3168965 4D ATATGAGCAG AATT/---- AATTAAACAT 3070 het 3070 ref 58 32 21 9 AATT 2 1 127058 CASAVA_Build 10 3169619 2D CAAAAACAAA CT/-- CTGTTTGGGA 3070 het 3070 hom 30 10 12 10 CT 2 1 127059 CASAVA_Build 10 3176702 5I ACGCTTAAAA -----/AAAAT AAAATAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 AAAAT 1 2 127060 CASAVA_Build 10 3186646 1D CAGGATTGAT G/- GCATTTGGTG 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 G 2 1 127061 CASAVA_Build 10 3188885 4D GTTCATACAC ACAA/---- ACATACATAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 ACAA 1 0 127062 CASAVA_Build 10 3194044 2D AAGACTGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 2920 het 2920 ref 21 10 10 1 A 14 12 127063 CASAVA_Build 10 3195378 2D AATCTTGCAA AT/-- ATGTTTTTAC 2967 het 2967 ref 29 20 7 2 AT 2 1 127064 CASAVA_Build 10 3209520 1I TTTTCTTGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 T 8 9 127065 CASAVA_Build 10 3216881 1I CCGCACCCGG -/C CCCAGATGCA 2309 het 2309 ref 23 11 6 6 C 3 4 127066 CASAVA_Build 10 3235270 1I GTGTTTAGCT -/C CCACTTATAC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 C 2 3 127067 CASAVA_Build 10 3236437 1I AACGCTGTTT -/C GCAGGGCAGC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 0 1 127068 CASAVA_Build 10 3236765 1I GGGAGAAATA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 7 8 127069 CASAVA_Build 10 3242046 1D CTCTCTGTCT C/- CTCTCTCTGT 2521 hom 30 het 28 0 10 18 C 2 1 127070 CASAVA_Build 10 3255159 25I CCATCTTCAC -------------------------/CATGAAGATAGTCACTTTGACCAAA CACTCAGCAT 3070 hom 93 het 32 0 31 3 CATGAAGATAGTCACTTTGACCAAA 0 1 127071 CASAVA_Build 10 3267670 1D CGACAGAGTG A/- AAAAAAAAAA 2952 het 40 hom 13 1 11 1 A 13 12 127072 CASAVA_Build 10 3280070 1D AAGGAACTGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 A 9 8 127073 CASAVA_Build 10 3289826 3D CGGAGAGACT ATC/--- TGCAGCAAGG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 ATC 1 0 127074 CASAVA_Build 10 3293386 1D CTTAGGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 11 10 127075 CASAVA_Build 10 3293686 1D CATTAGCCTG A/- TTTTTGCCTG 3070 hom 150 het 53 0 49 5 A 1 0 127076 CASAVA_Build 10 3294602 1I AAAGAGATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 8 9 127077 CASAVA_Build 10 3304496 2I ACAGGCAGAA --/AC ACACGCACAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 AC 2 3 127078 CASAVA_Build 10 3305238 1D CTTGATAGTA C/- CAGGACCAGC 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 C 2 1 127079 CASAVA_Build 10 3306516 3D TTTTCGGCCG TTT/--- TCAGCACTCC 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 T 4 1 127080 CASAVA_Build 10 3315824 1D TATTTTTAAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 34 het 14 0 12 2 T 9 8 127081 CASAVA_Build 10 3318104 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 9 8 127082 CASAVA_Build 10 3320292 3D TCTGTTTTTT AAA/--- ATTCAACTTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 A 4 1 127083 CASAVA_Build 10 3328493 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2325 het 305 hom 16 4 11 1 T 19 18 127084 CASAVA_Build 10 3331857 1D TTTGCTGTAG C/- CCTCCTTGTC 3070 het 3070 hom 69 31 34 4 C 3 2 127085 CASAVA_Build 10 3338502 1I TTTCACAGCA -/T TTTTTTTTTT 2886 het 2886 ref 25 13 7 5 T 13 14 127086 CASAVA_Build 10 3339644 1I TGTTTCCTAT -/G CAACAGGAAA 3070 hom 144 het 50 0 48 2 G 0 1 127087 CASAVA_Build 10 3340675 1I52M3I GAGAAGTCCA -GCCAACCACTCGTGAAAAGGAGGGACTGAGCAGTAGGGATGCAGTGGCGAGA---/GGCCAACCACTCGTGAAAAGGAGGGACTGAGCAGTAGGGATGCAGTGGCGAGAAGG AGGTGGATTG 3070 hom 146 het 52 0 47 39 N/A 0 0 127088 CASAVA_Build 10 3349728 1I CTAATAAAAC -/A AAATAAAATA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 3 4 127089 CASAVA_Build 10 3352545 9I CCGAGAGCGA ---------/GCGAGGGCT GCGAGGGCTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 GCGAGGGCT 1 2 127090 CASAVA_Build 10 3363930 1D TGGTACTTGC A/- AAAAAAAAAA 2650 het 481 hom 18 2 10 6 A 17 16 127091 CASAVA_Build 10 3370208 1D TTTCTGTAAC T/- TTTTTTTTTG 819 hom 10 het 11 0 4 7 T 10 9 127092 CASAVA_Build 10 3373188 1D GATGTGAGCG T/- TAGACACCCA 3070 het 3070 hom 46 16 24 7 T 2 1 127093 CASAVA_Build 10 3375582 3I GCTTGAAGTC ---/AGG AGTTCAAGAG 3070 het 2618 hom 16 7 8 1 AGG 0 1 127094 CASAVA_Build 10 3378700 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2003 het 882 hom 24 4 7 13 A 17 16 127095 CASAVA_Build 10 3378950 2I AATTCTCGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 10 12 127096 CASAVA_Build 10 3380545 3D GTTCTGACTT TAC/--- TTAAAGTTGC 3070 het 3070 hom 43 20 18 6 TAC 1 0 127097 CASAVA_Build 10 3384547 4I CTCATTTCTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 TTTG 2 3 127098 CASAVA_Build 10 3394961 2D ACCTTTCTCT CC/-- AGTAGATGAT 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 C 2 0 127099 CASAVA_Build 10 3406291 4I AAAGTAATAC ----/AATT AATTCTCTTT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 AATT 1 2 127100 CASAVA_Build 10 3429845 1I CCAATGCTTC -/T ATTTTACAGT 3070 hom 91 het 39 0 33 6 T 0 1 127101 CASAVA_Build 10 3431048 2D CTCGAGTAGA CC/-- TCAGATGATC 3048 het 3048 ref 25 12 10 4 C 2 0 127102 CASAVA_Build 10 3431131 1D TGCTCGGTGT G/- GGGGGGGTTT 3070 hom 59 het 23 0 20 3 G 8 7 127103 CASAVA_Build 10 3431476 1D GTTTGTCTTC A/- ACGAAGCTTC 3070 het 3005 hom 35 12 16 7 A 2 1 127104 CASAVA_Build 10 3439049 39D TTCCAAAGAT GGACAGAAATAATAAATGTTCATTCTGCGAGGTGCTGAC/--------------------------------------- GGCGTGGCTT 3070 het 3070 ref 39 37 9 9 GGACAGAAATAATAAATGTTCATTCTGCGAGGTGCTGAC 1 0 127105 CASAVA_Build 10 3441722 1I CAAATGAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 A 10 11 127106 CASAVA_Build 10 3443945 2D AGGCAAAGAC AT/-- GTTTGGACTC 3070 het 3070 hom 43 16 18 10 AT 1 0 127107 CASAVA_Build 10 3444811 1D AGGTGGGGAC A/- AGGACAGTGG 3070 het 3070 hom 24 11 11 3 A 2 1 127108 CASAVA_Build 10 3447903 4I TCCTATTCTT ----/AGAA GGACTCCAGG 3070 hom 96 het 34 0 31 3 AGAA 0 1 127109 CASAVA_Build 10 3448912 1I12M1I TTGTAATCAA -CCCCCTCCTAAA-/CCCCCCTCCTAAAG GACAGGTCTG 3070 hom 123 het 43 0 41 4 N/A 0 0 127110 CASAVA_Build 10 3449665 4I TCCTGCAACA ----/TAAT TACAGATTTC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TAAT 0 1 127111 CASAVA_Build 10 3449917 3D28M3D TTATCAGTTA ATTATTATATATTACTATTAAGCAATGAATATTT/---ATTATATATTACTATTAAGCAATGAATA--- ATTATTTATA 429 hom 5 het 4 0 2 4 N/A 0 0 127112 CASAVA_Build 10 3450011 3D AAATTATTGT TTA/--- TTATTAAATT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 TTA 3 2 127113 CASAVA_Build 10 3454336 1D ATGAGTCAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 T 10 9 127114 CASAVA_Build 10 3460598 1I ATTTTATTTT -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 0 1 127115 CASAVA_Build 10 3469558 2I AAAGAATGTT --/AA AAAGTTTCAA 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 A 3 5 127116 CASAVA_Build 10 3474474 1D GAAGTCTCAT G/- GCCCTAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 G 2 1 127117 CASAVA_Build 10 3493876 1D ACCTCCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 46 1 33 13 T 11 10 127118 CASAVA_Build 10 3503810 4I CTCTATTCTC ----/TCTG TCTGTTATTC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TCTG 1 2 127119 CASAVA_Build 10 3504258 1I ATCTCTGTTT -/G GGGGCATTTC 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 G 4 5 127120 CASAVA_Build 10 3518199 4I CCAATTTTAC ----/TTAG TTAAATGGGA 3070 hom 108 het 44 0 36 8 TTAG 0 1 127121 CASAVA_Build 10 3533035 2D GTGCACACAC TG/-- TGTCTTGTTT 3070 hom 143 het 54 0 43 11 TG 2 1 127122 CASAVA_Build 10 3533986 1D TTCTGTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 34 2 23 10 T 11 10 127123 CASAVA_Build 10 3541704 1I TTCACTCATA -/C CCGAGGGCTC 3070 het 3070 ref 36 13 11 12 C 2 3 127124 CASAVA_Build 10 3574930 1D TCTCAAATTG T/- TAACTCCCAC 3070 hom 110 het 42 0 33 10 T 2 1 127125 CASAVA_Build 10 3585965 1D GATGGCAGAT A/- AAAGTTGAGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 4 3 127126 CASAVA_Build 10 3589632 1D TAAGAAATAC T/- TTTTTTTTTT 2694 het 605 hom 21 4 8 9 T 15 14 127127 CASAVA_Build 10 3592607 1D TACTGTCCCT C/- CCCAGGGGAA 3070 het 3070 ref 54 25 24 6 C 4 3 127128 CASAVA_Build 10 3611674 4I TAGATTAGAT ----/AGAG AGATGATAGG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 AG 1 3 127129 CASAVA_Build 10 3622504 1I AACTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 1888 het 26 hom 11 1 6 4 A 17 18 127130 CASAVA_Build 10 3622858 1D CCAAGTTGTT A/- AAAAACCAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 6 5 127131 CASAVA_Build 10 3632255 4D GGGGGTTAAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 3 TTTG 5 4 127132 CASAVA_Build 10 3636850 2D AAAAAAAGAA AG/-- AAAGAAAGAA 801 het 547 hom 14 4 7 3 AG 1 0 127133 CASAVA_Build 10 3639273 1I AAAAGCTGGG -/T TTTTTTTTTT 752 het 752 ref 25 15 3 7 T 11 12 127134 CASAVA_Build 10 3646240 1D TAATTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 11 10 127135 CASAVA_Build 10 3650821 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 11 10 127136 CASAVA_Build 10 3657288 2I ATTAAAAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 29 0 22 7 A 10 12 127137 CASAVA_Build 10 3676419 1I TTTTATTTTG -/A AAAAAAAAGA 2960 het 2960 ref 23 10 8 5 A 8 9 127138 CASAVA_Build 10 3679911 1D ATTTAGTGGT C/- AGTATGATTC 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 C 1 0 127139 CASAVA_Build 10 3683010 1D TTTTTACCCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 9 8 127140 CASAVA_Build 10 3688042 1D GGTGAGGGGG C/- CCCTTTAGGT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 C 4 3 127141 CASAVA_Build 10 3697922 1D TGTGTCTGTG C/- CCTAATCTCT 3070 het 3070 ref 35 18 11 8 C 3 2 127142 CASAVA_Build 10 3700506 1D ATGTTTTCAC T/- TTTTTTTTTC 2405 het 2405 ref 21 10 6 6 T 10 9 127143 CASAVA_Build 10 3706388 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1730 het 1730 ref 24 6 9 9 A 15 16 127144 CASAVA_Build 10 3721594 4D ATTATGACAA TATC/---- TATTGTTATC 3070 het 3070 ref 33 17 12 6 TATC 1 0 127145 CASAVA_Build 10 3734023 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1990 het 1990 ref 27 15 7 5 T 10 11 127146 CASAVA_Build 10 3734682 1D TCTGTTTTTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 32 0 25 8 A 9 8 127147 CASAVA_Build 10 3738140 1I AAAATATGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 9 10 127148 CASAVA_Build 10 3738617 2D ATATATATAT AC/-- ACACACATAT 1945 het 1945 ref 21 11 6 4 AC 4 3 127149 CASAVA_Build 10 3740018 1D AGCTCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 12 11 127150 CASAVA_Build 10 3756853 1I TTTTTGGTAG -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 T 6 7 127151 CASAVA_Build 10 3760971 1I CTGCGTGGCA -/T TTTTTTAGCC 2401 het 2401 ref 39 22 8 9 T 6 7 127152 CASAVA_Build 10 3763883 11I GGCAGGCACT -----------/TGTAATTCCAG TGTAATTCCA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 TGTAATTCCAG 1 2 127153 CASAVA_Build 10 3769423 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 9 0 9 1 TA 9 8 127154 CASAVA_Build 10 3770009 1D CCATGAATAC A/- TAAACTATAT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 1 0 127155 CASAVA_Build 10 3784858 19I TTTTAGTACA -------------------/GACAGGTTTCACCATGTTG GACAGGCTGG 2046 het 2046 ref 23 14 7 2 GACAGGTTTCACCATGTTG 0 1 127156 CASAVA_Build 10 3786401 1I ATATAAATTT -/A TAGAGCTATA 2625 het 2220 hom 14 5 6 3 A 0 1 127157 CASAVA_Build 10 3786704 3D AAGAGGACTA AAT/--- AATACAAAAC 3070 het 3070 hom 57 24 28 6 AAT 2 1 127158 CASAVA_Build 10 3788659 3I43M3D ACAAATGCAT ---TCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCTCCTCCTGCTACTCCTCCTCCTT/TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTTCTCCTCCTGCTACTCCTCCTC--- CTTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 48 17 29 8 N/A 0 0 127159 CASAVA_Build 10 3793691 2D TTTTTTTTTT TC/-- CAAGAGCTCT 3028 het 235 hom 29 4 12 16 TC 1 0 127160 CASAVA_Build 10 3810114 2I AACATTGGGG --/TT GTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 T 0 2 127161 CASAVA_Build 10 3813143 5D TCCTACTGAT AAGAG/----- AAGAGCCTGC 3070 het 3070 hom 47 20 24 5 AAGAG 2 1 127162 CASAVA_Build 10 3818506 1I AAATGTCGAG -/A ACTCGAACCA 2510 het 2510 ref 28 18 6 4 A 1 2 127163 CASAVA_Build 10 3820864 2I AAAATGTTCC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 T 9 11 127164 CASAVA_Build 10 3827253 1D TGAGCAGCAT C/- CCCCCTCGCT 3070 het 3070 ref 54 29 13 12 C 6 5 127165 CASAVA_Build 10 3833094 1I CACATTGCAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 7 8 127166 CASAVA_Build 10 3834732 4D ACACACCCTG ACAC/---- ACACAGAGGC 3070 het 3070 ref 63 38 23 4 AC 4 2 127167 CASAVA_Build 10 3836163 1D CTGGAGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 47 0 30 17 T 14 13 127168 CASAVA_Build 10 3848201 1I AACATTGGTC -/A GGGGGACATC 3070 het 3070 ref 54 28 19 8 A 0 1 127169 CASAVA_Build 10 3855165 6D TTAAATCAAT AAGATG/------ AAGATATTTT 3070 het 3070 ref 25 14 11 1 AAGATG 1 0 127170 CASAVA_Build 10 3855885 1D AAACAGAAAG T/- TTGGTGTGAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 3 2 127171 CASAVA_Build 10 3865907 1I TCAGAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 A 10 11 127172 CASAVA_Build 10 3870268 4I CACTTGACAT ----/ACAA ACAAAGCAGG 3070 het 3070 hom 41 17 13 11 ACAA 1 2 127173 CASAVA_Build 10 3879692 2I TTCTTCTTCT --/TC TTTTTTTTTT 1583 het 1098 hom 24 3 12 9 TC 0 1 127174 CASAVA_Build 10 3880090 1D AAATTGTTTT A/- AGACACCAGC 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 A 2 1 127175 CASAVA_Build 10 3891147 1D AATTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3025 het 2071 hom 19 6 9 4 A 12 11 127176 CASAVA_Build 10 3902206 1I AGTTGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2975 het 1863 hom 24 4 10 10 A 11 12 127177 CASAVA_Build 10 3902678 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2173 hom 26 8 15 3 A 10 9 127178 CASAVA_Build 10 3906879 1D CGCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2592 het 2592 ref 27 13 7 7 T 12 11 127179 CASAVA_Build 10 3913940 2I AGCAACTCAT --/AA GTTTAGCGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 2 127180 CASAVA_Build 10 3916961 1D AAGAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 20 21 10 A 13 12 127181 CASAVA_Build 10 3917646 1I TGACGTTGAC -/T TTTTGTAGTT 3070 het 3070 hom 57 22 28 7 T 4 5 127182 CASAVA_Build 10 3921313 1I CCTCCCAAAG -/T TGCTGGGATT 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 T 1 2 127183 CASAVA_Build 10 3922060 1D TTTATAAAAA C/- AAGTGGTGTT 3070 het 3070 hom 48 19 22 9 C 1 0 127184 CASAVA_Build 10 3924460 1I AGAAAGAAAT -/A AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 A 5 6 127185 CASAVA_Build 10 3925576 1I TCAAATATTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 127186 CASAVA_Build 10 3926718 1I CGAGCAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 35 1 26 8 A 10 11 127187 CASAVA_Build 10 3928901 17I CCTGTGGTCC -----------------/AGGCGGGTGGAGGTCCT CAGCTACTAG 3070 het 3070 ref 34 15 17 2 AGGCGGGTGGAGGTCCT 0 1 127188 CASAVA_Build 10 3933049 1I CCCTGACTCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 9 10 127189 CASAVA_Build 10 3933198 1I AAGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 2708 het 2708 ref 28 12 9 7 A 9 10 127190 CASAVA_Build 10 3935808 6D TATATATATA TATATT/------ GATATATTCT 3070 hom 36 het 12 0 13 1 TATATT 1 0 127191 CASAVA_Build 10 3939263 2D ACTGAGTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 23 2 16 6 T 12 10 127192 CASAVA_Build 10 3943840 1D ATCTGAGTAA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 50 16 22 14 T 7 6 127193 CASAVA_Build 10 3944545 1D CTTCCTCTGG A/- AAAATATTAG 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 5 4 127194 CASAVA_Build 10 3954962 1D CTGGCTAATA T/- TTTTTTGGGG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 7 6 127195 CASAVA_Build 10 3957039 9D AAAATATTAT GAATATACA/--------- GAATATACAG 3070 hom 33 het 17 0 11 8 GAATATACA 2 1 127196 CASAVA_Build 10 3957996 3D AATCCTAATT ATA/--- ATAATATTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 ATA 3 2 127197 CASAVA_Build 10 3958098 1I TTTATATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 11 12 127198 CASAVA_Build 10 3960362 6I GTGCACACTT ------/AAACCC ACACACACGC 3070 hom 103 het 41 0 35 6 AAACCC 0 1 127199 CASAVA_Build 10 3961513 1D GACTCCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 30 0 25 5 A 12 11 127200 CASAVA_Build 10 3981800 1D AAATAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 22 24 2 T 11 10 127201 CASAVA_Build 10 3983300 1I GAGGTGAGGG -/A GTGCAGCAGT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 0 1 127202 CASAVA_Build 10 4005113 2I AGTTTCCCAT --/TC TGGTGCACAC 3070 hom 101 het 40 0 32 8 TC 0 1 127203 CASAVA_Build 10 4007150 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 8 7 127204 CASAVA_Build 10 4007289 1I AGCCTTTGAA -/T TCCCTCATAG 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 T 1 2 127205 CASAVA_Build 10 4008323 1D GTTATCATCT A/- AAGACCAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 3 2 127206 CASAVA_Build 10 4008831 1I ATAAAACTGC -/T TTCATCAACA 3070 hom 86 het 31 0 28 3 T 2 3 127207 CASAVA_Build 10 4017665 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2349 het 1628 hom 14 4 6 4 A 9 10 127208 CASAVA_Build 10 4028981 2D TCCCTCTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2274 hom 47 14 16 19 T 13 11 127209 CASAVA_Build 10 4029436 2D AAATGGTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1194 hom 32 8 13 11 T 16 14 127210 CASAVA_Build 10 4032229 4D TTGGCAAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 3 AAAT 3 2 127211 CASAVA_Build 10 4042174 5I AGGATTGAAA -----/GCCAT GCCATGCATT 3070 het 3070 ref 50 22 22 6 GCCAT 1 2 127212 CASAVA_Build 10 4042680 9D CCTGGGTTCA AGAGATCCT/--------- CCCACCACCC 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 AGAGATCCT 1 0 127213 CASAVA_Build 10 4042753 13I CCAGTCTCTT -------------/TTTCATTTTTATG TTTCATTTTT 3021 het 1754 hom 16 5 8 3 TTTCATTTTTATG 1 2 127214 CASAVA_Build 10 4051093 2D CATGATGTGC AT/-- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 38 20 13 7 AT 5 4 127215 CASAVA_Build 10 4084762 1D CCAAAATTAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 A 9 8 127216 CASAVA_Build 10 4093139 4D ATTTTATAAA TAAT/---- TAATAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 TAAT 2 1 127217 CASAVA_Build 10 4114268 1I ACTTACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 500 hom 30 2 15 13 A 15 16 127218 CASAVA_Build 10 4124740 1I GTTTTTGAAG -/A AAAAATTACT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 5 6 127219 CASAVA_Build 10 4129548 1I TAAAAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 0 1 127220 CASAVA_Build 10 4130166 1D TATTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 35 3 24 8 T 13 12 127221 CASAVA_Build 10 4138310 1D AGTACACAGG A/- AATGTTCATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 2 127222 CASAVA_Build 10 4139873 1I AAAATTAACA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 8 9 127223 CASAVA_Build 10 4140059 1I GGAAACGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 291 hom 44 1 40 3 T 9 10 127224 CASAVA_Build 10 4142309 1I TCAGAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 30 0 23 7 T 14 15 127225 CASAVA_Build 10 4142665 1D GATAAAAGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 8 127226 CASAVA_Build 10 4143023 3I ATAGCAGCAG ---/ACA ACAACATCTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 ACA 2 3 127227 CASAVA_Build 10 4143742 4I TTAATTAAAA ----/AAAT AAAAAGATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAAT 0 1 127228 CASAVA_Build 10 4148571 4D CTTGGGAAAT GGAG/---- GGAAAAAGCT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 GGAG 1 0 127229 CASAVA_Build 10 4149883 4D GGAGACAATG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 hom 69 het 30 0 21 10 AGAA 4 3 127230 CASAVA_Build 10 4158360 3D GAGAATACAG CTT/--- CTTCTTGCAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CTT 3 2 127231 CASAVA_Build 10 4162145 1D CTTCACAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 10 9 127232 CASAVA_Build 10 4164805 1D GCACACAAAC T/- TCACCAACAC 3070 hom 138 het 53 0 46 9 T 2 1 127233 CASAVA_Build 10 4202521 3I TAGCTATAAT ---/GAG GAGATGATGA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 GAG 1 2 127234 CASAVA_Build 10 4203959 1I GATGCAATAC -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 7 8 127235 CASAVA_Build 10 4209363 4D TATGTGTGGA TGTG/---- TGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 85 47 32 9 TG 4 2 127236 CASAVA_Build 10 4223939 1D ATTTTACGTA C/- CCAAAGCAGG 3070 hom 117 het 43 0 39 5 C 3 2 127237 CASAVA_Build 10 4230001 1D GCTGCCTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 15 23 12 A 10 9 127238 CASAVA_Build 10 4230717 3I ATTCTCTACC ---/ATT ATTTATTTAA 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 ATT 1 2 127239 CASAVA_Build 10 4238092 45I TTTCTCCCTC ---------------------------------------------/CCAGCCTTCTCTTCACATGGTGTCAGATTCCTGTCAACCCCAATG CCAGCAACAC 3070 hom 75 het 29 0 23 7 CCAGCCTTCTCTTCACATGGTGTCAGATTCCTGTCAACCCCAATG 0 1 127240 CASAVA_Build 10 4241831 1I TGCATTTTTG -/T TTTTTTGCAT 2656 het 1654 hom 19 6 7 6 T 6 7 127241 CASAVA_Build 10 4257368 1D AAAGACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 11 10 127242 CASAVA_Build 10 4278456 1D GTATGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 7 T 11 10 127243 CASAVA_Build 10 4282140 16I CCTCAAGTAA ----------------/TCCACCAGCCTCGGCC TCCCAAAGTG 3070 hom 75 het 26 0 25 3 TCCACCAGCCTCGGCC 0 1 127244 CASAVA_Build 10 4286939 1I CTTGTGGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 9 10 127245 CASAVA_Build 10 4289904 1I ACTAATTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 9 10 127246 CASAVA_Build 10 4291876 1I AAAGAACCCC -/T TCAGAGCAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 2 127247 CASAVA_Build 10 4294189 2D TTTCTTTCTT TC/-- TTTTTTTTTT 362 het 99 hom 9 3 3 3 TC 1 0 127248 CASAVA_Build 10 4314551 3I GATGGTGAAA ---/CCT CCTCCCTATG 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 CCT 1 2 127249 CASAVA_Build 10 4331165 1D GCCTGTGGAA C/- CATGAGCCGA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 C 2 1 127250 CASAVA_Build 10 4334624 2D CCTGTTACAT AA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 82 het 32 0 28 5 A 10 8 127251 CASAVA_Build 10 4345212 1I ATAATGGTTA -/T TTTTAAAATA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 4 5 127252 CASAVA_Build 10 4347210 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 12 11 127253 CASAVA_Build 10 4352764 1I TGCTAAATCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 8 9 127254 CASAVA_Build 10 4363689 4D TTACCTAGGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 32 2 16 14 T 14 10 127255 CASAVA_Build 10 4372597 1I CCTCCAGAAC -/T ATTTGTCCTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 127256 CASAVA_Build 10 4381493 2I ATCATATAAC --/AT GTGGTCTTTT 3070 hom 105 het 42 0 34 8 AT 0 1 127257 CASAVA_Build 10 4391929 1D AGAATGCAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 8 127258 CASAVA_Build 10 4393451 1D CGTGTACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 242 hom 57 1 50 6 T 11 10 127259 CASAVA_Build 10 4394164 43D CATGCAATAG AATATATACTCTGGTGCTGATTATTGATATTAATGTTATTATT/------------------------------------------- AATATATACT 3070 hom 69 het 26 0 24 9 AATATATACTCTGGTGCTGATTATTGATATTAATGTTATTATT 1 0 127260 CASAVA_Build 10 4399749 1I TGTGCTTTTT -/C TAAAAAATAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 0 1 127261 CASAVA_Build 10 4400828 1D GATACAAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 61 het 37 0 29 8 A 10 9 127262 CASAVA_Build 10 4410099 1I TTCCCCCGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 9 10 127263 CASAVA_Build 10 4410872 1I AGAAAGGCTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 7 8 127264 CASAVA_Build 10 4412814 44D ACCCATCAAA ACATTTGTTTTGAAAATAATACTTATGTCCAAAACTTTCTGAGT/-------------------------------------------- CTTTATAATG 3070 het 3070 ref 21 16 11 2 ACATTTGTTTTGAAAATAATACTTATGTCCAAAACTTTCTGAGT 1 0 127265 CASAVA_Build 10 4413341 1D AAAAAATTGA T/- TTTTAAGTGT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 5 4 127266 CASAVA_Build 10 4414497 1I CTTAGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 T 10 11 127267 CASAVA_Build 10 4424411 1D TAAATTAGTT A/- CTATTTCTAA 3070 het 3070 ref 46 24 20 3 A 1 0 127268 CASAVA_Build 10 4438668 6D3M1D GGATTGAAAA ATTGACACAC/------ACA- CTGAAAGCTA 3070 het 3070 ref 41 21 18 4 N/A 0 0 127269 CASAVA_Build 10 4458224 1D AGTTATTCTC T/- TGCATTCTCC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 2 1 127270 CASAVA_Build 10 4477983 1D TTTTATCTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 9 8 127271 CASAVA_Build 10 4478229 1D CAAACACATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 22 10 11 2 A 10 9 127272 CASAVA_Build 10 4479253 1D TTTTACATTT A/- AAATTTTTTT 2713 het 2713 ref 21 11 7 3 A 4 3 127273 CASAVA_Build 10 4520808 1D GCCCTAGAAC A/- AAAGATAACT 3070 hom 97 het 39 0 30 10 A 4 3 127274 CASAVA_Build 10 4522141 3I CTTAGGAAAA ---/AGC AGCAGCTAGA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AGC 2 3 127275 CASAVA_Build 10 4523742 1I TACCTTTCAC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 7 8 127276 CASAVA_Build 10 4524388 2D AAATAAGTTG AT/-- ACAACTTGTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AT 1 0 127277 CASAVA_Build 10 4525151 5D AAATTTTAAA AAATT/----- AAATTAAAGT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 AAATT 2 1 127278 CASAVA_Build 10 4527234 1D TTTAATTACT G/- GGGTATGTAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 4 3 127279 CASAVA_Build 10 4529644 1I CCCCACTGGG -/A AAGAGCTCTT 3070 hom 138 het 50 0 43 7 A 2 3 127280 CASAVA_Build 10 4529801 1I AACTGACAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 8 9 127281 CASAVA_Build 10 4531123 1I TCCTTGTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 9 10 127282 CASAVA_Build 10 4531770 1D TTACCACATA T/- TTTTCTCTCC 3070 hom 54 het 22 0 19 4 T 5 4 127283 CASAVA_Build 10 4538507 2D ACTCACAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 41 0 23 18 T 14 12 127284 CASAVA_Build 10 4553041 1D TTTATGTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 T 9 8 127285 CASAVA_Build 10 4561921 1I ATTCAGCCAA -/T TTTTATTGAG 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 4 5 127286 CASAVA_Build 10 4562922 1D TCTCCCCTCA T/- TTGACAGATT 3070 hom 38 het 14 0 13 1 T 3 2 127287 CASAVA_Build 10 4577017 1D GCATTAGGAC A/- AATACCTAAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 3 2 127288 CASAVA_Build 10 4579005 1I CATAATGACT -/A AAGTATTGAA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 A 2 3 127289 CASAVA_Build 10 4582451 1I GAAGATACAA -/T TGCTTTCATA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 1 2 127290 CASAVA_Build 10 4584130 6D TTTTAAACTC TTATAA/------ TTATATCTAT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 TTATAA 1 0 127291 CASAVA_Build 10 4584911 2D GTTTTAAAGG AA/-- AAGACAAGCA 3070 het 3070 ref 36 17 17 3 A 4 2 127292 CASAVA_Build 10 4585225 1I CACTGTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 10 11 127293 CASAVA_Build 10 4586247 1D GGCTCAAGCC A/- TCCTCCTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 1 0 127294 CASAVA_Build 10 4588815 1D TCAAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 809 hom 37 5 13 19 T 15 14 127295 CASAVA_Build 10 4589003 1I TTCTAACAGG -/A AAAATAGTCA 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 4 5 127296 CASAVA_Build 10 4593073 1I TGTCACTGTG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 T 7 8 127297 CASAVA_Build 10 4600614 2I TGATGCACAG --/CA CCAGTGCATT 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 CA 0 1 127298 CASAVA_Build 10 4607074 1D TCATTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 10 9 127299 CASAVA_Build 10 4609940 1I TTGTTGTGGG -/A GCTGCCCAGT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 0 1 127300 CASAVA_Build 10 4614933 1D TGTTAATGCC T/- TTTTTCATTT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 T 6 5 127301 CASAVA_Build 10 4616094 1I CAAGAGCCGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 8 9 127302 CASAVA_Build 10 4619550 1D TTCTGGGGGG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 52 24 24 4 A 7 6 127303 CASAVA_Build 10 4624690 1I GTATTTTTGT -/A AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 4 5 127304 CASAVA_Build 10 4628176 1D AGCTTTTATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 A 10 9 127305 CASAVA_Build 10 4630990 1D TTAAAAAAAA T/- ATATTGGTGA 2345 het 952 hom 11 3 7 2 T 1 0 127306 CASAVA_Build 10 4632308 4I TGCTCAAGTG ----/ACTA ACTATCAAAG 3070 hom 132 het 52 0 45 7 ACTA 1 2 127307 CASAVA_Build 10 4633424 2D TGACATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 AT 7 6 127308 CASAVA_Build 10 4634348 1D GTGAAGGAAG C/- CATCACCACC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 2 1 127309 CASAVA_Build 10 4637258 1I TAATTTAATT -/A TAGTATTTAA 3070 het 3070 ref 38 27 8 3 A 0 1 127310 CASAVA_Build 10 4639039 3D GAAAGCATAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 14 11 127311 CASAVA_Build 10 4639560 1D7M4D TTCCTTCCTT CTTTTCTTTTTC/-TTTTCTT---- TTTCTTTCTT 3070 het 864 hom 22 4 16 2 N/A 0 0 127312 CASAVA_Build 10 4639724 4I CTCTTTCCTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 2388 hom 25 10 11 4 TTTC 3 4 127313 CASAVA_Build 10 4644157 4D CACCTAATTT TTAG/---- TTATTTTTAC 3070 het 3070 ref 34 18 12 7 TTAG 1 0 127314 CASAVA_Build 10 4645324 1I ACAAGCGTGA -/G CCACTGCACT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 0 1 127315 CASAVA_Build 10 4646223 2D CCTAAAAATC CT/-- CTGTGTTCCA 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 CT 2 1 127316 CASAVA_Build 10 4665718 1I TACTGTTTAG -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 7 8 127317 CASAVA_Build 10 4671209 1D AGTTTCTGGG T/- TTTTTGTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 6 5 127318 CASAVA_Build 10 4675177 1D AAGGTCCTCC T/- TTCCTCCTGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 3 2 127319 CASAVA_Build 10 4678075 1D ATTAGCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 13 12 127320 CASAVA_Build 10 4679074 1I GCATCATAGG -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 6 7 127321 CASAVA_Build 10 4697568 1I CATTCTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1270 hom 32 3 19 10 A 15 16 127322 CASAVA_Build 10 4698215 1D TTTATATCTC T/- TTTTTTGTAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 7 6 127323 CASAVA_Build 10 4706662 2D AAGACAATGC AA/-- AAAAGCATTT 3070 hom 95 het 37 0 31 6 A 6 4 127324 CASAVA_Build 10 4708070 1I ACAATTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 557 hom 32 2 25 5 A 11 12 127325 CASAVA_Build 10 4725438 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTGTATT 2917 het 1243 hom 13 5 6 2 T 5 6 127326 CASAVA_Build 10 4746445 2D AATATATATG TA/-- TATATATATG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TA 5 4 127327 CASAVA_Build 10 4749587 1D AAACCAAATA T/- TTTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 T 6 5 127328 CASAVA_Build 10 4762696 1D TTGTATTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 15 14 127329 CASAVA_Build 10 4769433 1D GTGAAAACAT G/- CCTTTGGTTG 3070 het 3070 hom 44 15 21 9 G 1 0 127330 CASAVA_Build 10 4778009 1I GGCTGCTTGC -/T TCGGCCAGGG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 1 2 127331 CASAVA_Build 10 4785107 1I TAAAATGAGA -/T AACACTTCAC 3070 het 3070 ref 32 22 8 2 T 0 1 127332 CASAVA_Build 10 4789069 2D TCTCTGTTCC TA/-- TGTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 43 17 25 1 TA 1 0 127333 CASAVA_Build 10 4791685 3D GTAAGTTTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 2950 het 2950 ref 36 14 13 11 A 19 16 127334 CASAVA_Build 10 4797376 1I GTCATTAATG -/T TTTTTTTTTT 1374 het 1374 ref 36 23 6 7 T 11 12 127335 CASAVA_Build 10 4806851 1I ACCTATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 11 12 127336 CASAVA_Build 10 4816696 2I AATTAATGAC --/AA GAGAGAAAAC 3070 het 2480 hom 20 6 13 1 A 0 2 127337 CASAVA_Build 10 4822564 1I TATAGATGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 A 9 10 127338 CASAVA_Build 10 4825004 2I CTTTTTTTTT --/TA TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 18 7 10 1 TA 0 1 127339 CASAVA_Build 10 4831700 6D ACACACACAT GCACAC/------ GCACACAGAC 2772 het 2772 ref 63 31 13 25 GCACAC 2 1 127340 CASAVA_Build 10 4834573 2I AGAAAATGTT --/AC AGTCTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 AC 0 1 127341 CASAVA_Build 10 4834922 1I TTCATAGGTA -/G ATTTCTGCAC 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 G 0 1 127342 CASAVA_Build 10 4838685 1D TAATATTTAA G/- TCTATAATCT 2324 het 2324 ref 35 26 5 5 G 1 0 127343 CASAVA_Build 10 4846625 2D CTGTCTCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 22 2 12 8 A 18 16 127344 CASAVA_Build 10 4848428 2D TATAAATAAT CA/-- ATAAGAAGAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 CA 1 0 127345 CASAVA_Build 10 4851078 1I TTTCCAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 28 0 21 7 A 11 12 127346 CASAVA_Build 10 4853600 1D TGAGGTGTGC A/- AAAATTCAAG 3070 hom 129 het 53 0 44 9 A 5 4 127347 CASAVA_Build 10 4853782 1D GTCCAGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1309 hom 47 4 32 11 A 12 11 127348 CASAVA_Build 10 4856328 2D TTCTGTCTAG TC/-- TCTGATTTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 2 TC 2 1 127349 CASAVA_Build 10 4859268 2D ACCTTGCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 1241 het 1241 ref 29 10 6 13 A 18 16 127350 CASAVA_Build 10 4864313 1I AAGCAGAATG -/T TAAGACCATG 3070 hom 153 het 59 0 50 9 T 1 2 127351 CASAVA_Build 10 4871646 4D TAACAATCTT TATC/---- TGAGTGCTCA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 TATC 1 0 127352 CASAVA_Build 10 4873668 1I CCTGAGAGTC -/A GGGGGAGTCA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 0 1 127353 CASAVA_Build 10 4875134 1D AGGGCACTGC T/- TTGAGTTGTG 3070 hom 100 het 42 0 30 13 T 3 2 127354 CASAVA_Build 10 4885635 1D ACTTGTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 44 3 30 12 A 16 15 127355 CASAVA_Build 10 4885908 1D CACCTTGAAT A/- GGGGCTGAGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 1 0 127356 CASAVA_Build 10 4887621 2D AGTTATAAAC TT/-- TGCTGCAGGT 3070 hom 141 het 53 0 48 6 T 3 1 127357 CASAVA_Build 10 4887753 1I CCCAGGTTCA -/G GGTCCAATTC 3070 hom 81 het 28 0 27 1 G 2 3 127358 CASAVA_Build 10 4889108 3I TTCACATTGT ---/GAA TGTGCAACCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 GAA 0 1 127359 CASAVA_Build 10 4889591 1I GTGTGTAGTA -/C CCCCCCACAC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 C 6 7 127360 CASAVA_Build 10 4896780 2I CCTATTCAAC --/AT AGTGTTGGAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AT 0 1 127361 CASAVA_Build 10 4902221 14I GGTAGAATGT --------------/TGTTAGGTAGAAAA TCTATAAATC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TGTTAGGTAGAAAA 0 1 127362 CASAVA_Build 10 4902850 1D ATTTGAATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 10 9 127363 CASAVA_Build 10 4904156 5I AAAGTCTTAG -----/TCAAT TCATTGTTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TCAAT 0 1 127364 CASAVA_Build 10 4925215 1D GAAGTTTGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 110 het 43 0 37 6 T 9 8 127365 CASAVA_Build 10 4925847 1I AGTTATCTTT -/A AAAGAGATTG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 3 4 127366 CASAVA_Build 10 4943642 1I CAGGACCCCC -/T CTCACTTTTT 3070 hom 71 het 29 0 22 7 T 0 1 127367 CASAVA_Build 10 4958459 1I GACATCCAAA -/C AAAAGCAAAT 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 C 0 1 127368 CASAVA_Build 10 4960437 2D ATAAACACTG GA/-- ATACACTTCA 3070 het 3070 ref 29 17 11 3 GA 1 0 127369 CASAVA_Build 10 4963343 1D TTGTCTCTGA T/- TTCCTTTGAG 3070 het 3070 ref 42 25 16 2 T 3 2 127370 CASAVA_Build 10 4973003 1D ATGTAGGCAC A/- AAAGGGCATT 1805 het 1805 ref 49 41 4 4 A 4 3 127371 CASAVA_Build 10 4974230 1I TGCTTATTCC -/A AAATGAAATC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 3 4 127372 CASAVA_Build 10 4983782 2D ACTGCTAAAC AT/-- GTGTAATACT 3070 het 3070 hom 45 19 22 6 AT 1 0 127373 CASAVA_Build 10 4987640 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 16 hom 31 1 13 17 T 9 8 127374 CASAVA_Build 10 4987766 1D GAATTTTTTG C/- CCCAATAAGT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 4 3 127375 CASAVA_Build 10 4990891 1D GAAATAACTT G/- GTTTTTGATT 2846 het 2846 ref 41 27 6 8 G 2 1 127376 CASAVA_Build 10 5001703 1D ACCTGTTTAT G/- GGAGATATCT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 G 3 2 127377 CASAVA_Build 10 5001778 1D20M3D CCTATGACTG CCCCCGCTCCTAGTTGGCTGCTCT/-CCCCGCTCCTAGTCGGCTGC--- TCTTTGGAGT 1481 het 1481 ref 47 45 4 10 N/A 0 0 127378 CASAVA_Build 10 5004546 1I CCGGTTTGAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 8 9 127379 CASAVA_Build 10 5005359 1D TAACTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2125 hom 31 8 15 9 T 11 10 127380 CASAVA_Build 10 5006108 4I TATATGAAAT ----/ATAC ATCATATATG 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 ATAC 0 1 127381 CASAVA_Build 10 5012151 1D AAAACATGTA T/- TTTTGAAATT 1930 het 1930 ref 20 12 4 4 T 5 4 127382 CASAVA_Build 10 5018861 3I AATGTACCTA ---/ATC ATCTGATAGC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 ATC 1 2 127383 CASAVA_Build 10 5020199 1I TCTGAGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2945 hom 20 8 10 2 T 11 12 127384 CASAVA_Build 10 5020619 1D GCTAGAAATA T/- TTTTTGGTGG 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 T 6 5 127385 CASAVA_Build 10 5026462 4I ATAATATATC ----/AATT TATATATATT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 AATT 0 1 127386 CASAVA_Build 10 5037718 1I ACTAAAATCC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 25 0 21 5 A 9 10 127387 CASAVA_Build 10 5038787 1D AACTCCATCT G/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 G 1 0 127388 CASAVA_Build 10 5039483 1I GTGAAATTTG -/T CTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 0 1 127389 CASAVA_Build 10 5041809 1D CCAGCAAAGG C/- CCCCACCTTT 2610 het 2610 ref 21 8 9 4 C 5 4 127390 CASAVA_Build 10 5043993 1I CCTTAATGAA -/T CAAGAACTTG 3070 het 3070 ref 67 52 10 5 T 0 1 127391 CASAVA_Build 10 5046387 2I TTCAAAAACA --/TC TGTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 TC 0 1 127392 CASAVA_Build 10 5054175 1I TTAGACAGGG -/A GTTTCAAGGG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 0 1 127393 CASAVA_Build 10 5097114 1I CAAAATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 44 1 32 11 A 12 13 127394 CASAVA_Build 10 5107668 1I CATAAATAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 97 het 35 0 31 4 T 8 9 127395 CASAVA_Build 10 5112379 3I TAAGAACATC ---/TGG TTAAGATGTG 3070 hom 111 het 40 0 36 4 TGG 0 1 127396 CASAVA_Build 10 5113900 11D AGCATTACTC CCCATTTTCTT/----------- CCCTCTCCTG 3070 hom 93 het 31 0 30 6 CCCATTTTCTT 1 0 127397 CASAVA_Build 10 5115284 2D TTATTATTAT AC/-- ACTTTAAGTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AC 2 1 127398 CASAVA_Build 10 5124676 1D CTCTTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 48 2 28 19 T 15 14 127399 CASAVA_Build 10 5127940 1D GTAAATTCTT A/- ACAGATTTCA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 2 1 127400 CASAVA_Build 10 5136585 1I17M4D TGATTTTTTA -CTCTACCATAAATGAAACATT/CCTCTACCATAAACGAAA---- CATTCACAAA 3070 hom 114 het 36 0 39 0 N/A 0 0 127401 CASAVA_Build 10 5137426 2I TATATAATCT --/TC TGTTATTTAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TC 0 1 127402 CASAVA_Build 10 5137474 24D TCTAGGTACA TGACCCTATCATGTGGGCACAATG/------------------------ TGACCCTATC 3070 hom 42 het 22 0 15 13 TGACCCTATCATGTGGGCACAATG 2 1 127403 CASAVA_Build 10 5139107 3I AAGGAAAATA ---/AAT AATAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAT 1 2 127404 CASAVA_Build 10 5139946 16D TGGCTCAGAA GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 69 het 36 0 24 12 GT 15 7 127405 CASAVA_Build 10 5140020 4I20M4I TGATTTGCCT ----GTAAGTTAGGAGTGGGGGAA----/GTAAGTAAGTTAGGAGTGGGGGAATAAT TAATAATCAT 3070 hom 60 het 24 0 20 11 N/A 0 0 127406 CASAVA_Build 10 5140591 13D20M8D14M6D TATGTACACA TGTGCACATGTGTATATATGTACATATGCACACGTGTATATGTGTGTACTTGTGTGTGTGC/-------------ATGTATGTGCATATGTACAC--------GTGTGCACATGTGT------ ATGTATATAC 3070 hom 30 het 23 0 11 19 N/A 0 0 127407 CASAVA_Build 10 5149323 2D GGCAGTGAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 14 12 127408 CASAVA_Build 10 5151132 1D AAATTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 11 10 127409 CASAVA_Build 10 5152569 1I TAGTGCCACT -/G GGTTAGGGTC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 2 3 127410 CASAVA_Build 10 5154266 4I GAAAGAATCT ----/GCAA GCATCACTTA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 GCAA 0 1 127411 CASAVA_Build 10 5155444 1I GCAGGAGTCC -/T TAATGCCCAC 3070 hom 165 het 67 0 54 13 T 1 2 127412 CASAVA_Build 10 5164371 1I ACTCAGTGTT -/G GGGGGAGGTT 3070 hom 120 het 49 0 41 8 G 5 6 127413 CASAVA_Build 10 5167957 4I CACATGATGC ----/TATT TAAAGGAATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TATT 0 1 127414 CASAVA_Build 10 5168651 1I GAGGCAGGAG -/A ATAAGTTCAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 127415 CASAVA_Build 10 5189411 5I ACAGAGTCAT -----/GCCAG GCCAGGGGCT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 GCCAG 1 2 127416 CASAVA_Build 10 5190740 3I TCGCTTTAAT ---/AGG AGTTTTTCAG 3070 hom 117 het 48 0 39 9 AGG 0 1 127417 CASAVA_Build 10 5191997 1D AGAAGACATC A/- AAGCAGAAAC 3070 hom 102 het 41 0 35 7 A 3 2 127418 CASAVA_Build 10 5206273 1D TAATTAACCT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 35 het 17 0 13 4 A 10 9 127419 CASAVA_Build 10 5226983 1I GCATATTCTT -/A AGTCTCGACA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 A 1 2 127420 CASAVA_Build 10 5228340 1D GGTCACCACT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 9 8 127421 CASAVA_Build 10 5238105 1I TCTGTTGTAA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 45 29 13 3 T 6 7 127422 CASAVA_Build 10 5238829 3D TGAATGCTTT TTC/--- TTGTCATCTC 3070 het 3070 hom 35 12 19 6 TTC 1 0 127423 CASAVA_Build 10 5240037 1D GTGAAAAAAA G/- GAAAGTTAAC 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 G 2 1 127424 CASAVA_Build 10 5240872 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 9 10 A 10 11 127425 CASAVA_Build 10 5241807 8D TGGGTGGGGA CACATAGC/-------- CAAACCATAT 3070 het 3070 hom 26 12 11 4 CACATAGC 1 0 127426 CASAVA_Build 10 5246337 1D GACTTAGTCT C/- TTATATAATA 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 C 1 0 127427 CASAVA_Build 10 5250506 2D TCTTATTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 29 0 22 10 A 14 12 127428 CASAVA_Build 10 5250612 4D TCATATAAAT TCAC/---- TTTGCTACCA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TCAC 1 0 127429 CASAVA_Build 10 5251144 3D CTCTTCCAGA AAG/--- AAGAAAACAC 3070 het 3070 ref 55 25 23 8 AAG 2 1 127430 CASAVA_Build 10 5261274 1D ATTGGTCTGA G/- GGGGGAGGTG 2076 het 2076 ref 19 7 5 7 G 6 5 127431 CASAVA_Build 10 5262372 1D AATCAAAATT A/- ACTCCACAAT 665 het 665 ref 27 17 3 8 A 2 1 127432 CASAVA_Build 10 5267684 6D AAAGGAATAG CATCAA/------ CATCAACAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 CATCAA 2 1 127433 CASAVA_Build 10 5268137 1D AAAGGATATC A/- GATTGAAGAT 2115 het 2115 ref 23 15 5 4 A 1 0 127434 CASAVA_Build 10 5268323 3I GATATTATCC ---/AGA AGAAGAGTCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AGA 2 3 127435 CASAVA_Build 10 5269763 4D ATGACCACAG AAGA/---- AAGCAGGAAA 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 AAGA 1 0 127436 CASAVA_Build 10 5272838 3D CCAGAACTTA AAG/--- AATAAAAAAA 3070 het 2886 hom 19 7 10 2 AAG 1 0 127437 CASAVA_Build 10 5275397 1D ATGAATGAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 A 10 9 127438 CASAVA_Build 10 5285274 4D AAAACTGAGG AGTA/---- AGATGGAGAG 3070 het 3070 hom 28 15 13 2 AGTA 1 0 127439 CASAVA_Build 10 5290249 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 1383 hom 17 3 10 4 A 8 9 127440 CASAVA_Build 10 5294197 1D CCCAAAGTGC T/- GGGATTACAG 1408 het 1273 hom 14 7 6 1 T 1 0 127441 CASAVA_Build 10 5298924 1D AACTTAAAAT A/- AAAGTTGGAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 4 3 127442 CASAVA_Build 10 5299254 1D TGTATCTGAC A/- AAAATGACCT 3070 het 3070 ref 34 19 15 1 A 5 4 127443 CASAVA_Build 10 5302334 2D TTCTCTTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 867 het 867 ref 45 33 2 10 TG 7 6 127444 CASAVA_Build 10 5305733 1D TGAAAATGTC T/- TTTCTTGGAA 3070 het 3070 ref 49 22 22 5 T 4 3 127445 CASAVA_Build 10 5309144 1D AGGACCACCA C/- CCCCCCGCTG 3070 hom 72 het 34 0 22 12 C 7 6 127446 CASAVA_Build 10 5315919 2I GACGTGTGTA --/TG TGTGTGTGCA 3070 hom 143 het 53 0 45 8 TG 4 5 127447 CASAVA_Build 10 5336346 1D TCCCCACCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 T 11 10 127448 CASAVA_Build 10 5337208 2D TTCTCCTATA AT/-- AATTGGAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 4 AT 1 0 127449 CASAVA_Build 10 5338627 8D TGTAACTGTG GACATGCT/-------- GAGCTCGAAG 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 GACATGCT 1 0 127450 CASAVA_Build 10 5338858 4D TGAATCAATC AATT/---- AGAGTTCACC 3070 het 3070 ref 42 22 15 10 AATT 1 0 127451 CASAVA_Build 10 5342269 1I GGTTTGTGTG -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 T 7 8 127452 CASAVA_Build 10 5350816 3D CATGAGGGTT AAG/--- AAGCATTGGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 AAG 2 1 127453 CASAVA_Build 10 5354623 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 A 12 11 127454 CASAVA_Build 10 5363620 1D GGTATGAAAT G/- GAGATGTGGA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 G 2 1 127455 CASAVA_Build 10 5364839 2I CTTATTACTC --/AT ATTAAATGAT 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 AT 1 2 127456 CASAVA_Build 10 5366338 1D TTGACTCCCC G/- AAGAAACCGC 3070 het 3070 ref 52 27 16 10 G 1 0 127457 CASAVA_Build 10 5368847 3I ATATGTTGTG ---/TGT TGTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 76 36 29 11 TGT 1 2 127458 CASAVA_Build 10 5368907 1I CATGTGTGTT -/G TGTGTTATGT 3070 het 3070 hom 63 26 23 14 G 0 1 127459 CASAVA_Build 10 5419689 2I CTAAAAATAC --/AA AATTAGCCAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 4 127460 CASAVA_Build 10 5420535 2D CAAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2597 hom 33 het 15 0 11 4 A 16 14 127461 CASAVA_Build 10 5424046 2I CTGTGCTGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 43 0 30 13 A 12 14 127462 CASAVA_Build 10 5430716 1I TATGAGATCG -/T TTTTGCAATA 3070 het 3070 hom 33 8 20 5 T 4 5 127463 CASAVA_Build 10 5435707 1D AGCCTCTCCC T/- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 7 6 127464 CASAVA_Build 10 5438214 1I TATAACTGAA -/T TTTTTTTTCT 2676 het 2676 ref 23 13 8 2 T 8 9 127465 CASAVA_Build 10 5440977 4D TAATATATAC ATAT/---- ATATATATAT 2676 het 73 hom 16 1 6 10 AT 11 9 127466 CASAVA_Build 10 5443960 1D TGTTTAACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 10 9 127467 CASAVA_Build 10 5445469 2D AGCGAAGCTC AG/-- GGGATAGCTA 3070 het 3070 hom 49 20 27 2 AG 1 0 127468 CASAVA_Build 10 5451655 1D TCTCTGTTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 87 hom 36 2 22 12 T 8 7 127469 CASAVA_Build 10 5451844 2D TTAAGAAGTC AG/-- AATCTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 27 18 6 AG 1 0 127470 CASAVA_Build 10 5457232 3D AAAAAACAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 100 het 44 0 33 13 AAC 5 4 127471 CASAVA_Build 10 5460002 10D TTGCCGTTCC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1775 het 628 hom 29 8 8 14 T 29 19 127472 CASAVA_Build 10 5460409 1I GAGAAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 31 1 22 12 T 10 11 127473 CASAVA_Build 10 5464573 1D TAAATTTATC T/- TATAATTGTG 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 T 2 1 127474 CASAVA_Build 10 5464678 1D AGATGAAATC T/- TTTTTTTTTT 2251 het 2251 ref 25 12 9 7 T 12 11 127475 CASAVA_Build 10 5464890 1I CTGATACCTT -/A ATGTAATACC 3070 het 3070 hom 52 24 23 5 A 1 2 127476 CASAVA_Build 10 5469632 1D TTCCCTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 31 2 13 17 T 11 10 127477 CASAVA_Build 10 5474399 1I TCACTTGAAA -/G GGGGAGAACA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 G 4 5 127478 CASAVA_Build 10 5482028 4D ACACGCGTGT GTCA/---- GTCAGTCAGC 3070 het 3070 hom 44 14 22 10 GTCA 3 2 127479 CASAVA_Build 10 5491102 1I GAGGTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 2534 het 2534 ref 34 12 9 13 A 12 13 127480 CASAVA_Build 10 5491392 4D GCTGAAGAGA GTCT/---- AATTTCCCTG 3070 het 3070 ref 41 19 18 7 GTCT 1 0 127481 CASAVA_Build 10 5493336 2I AAGGAATGGT --/AG AGTGTCGCCA 3070 hom 104 het 36 0 31 5 AG 1 2 127482 CASAVA_Build 10 5496289 1I TAATCCCAAT -/A ACTTTGGGAG 3070 het 2511 hom 29 7 14 8 A 1 2 127483 CASAVA_Build 10 5513728 11D CCCGTTCCTC TTCCGTGCTTT/----------- TTCCCTCAGG 3070 het 3070 hom 31 13 11 8 TTCCGTGCTTT 1 0 127484 CASAVA_Build 10 5524261 2D ATAGAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 256 hom 49 5 16 28 A 13 11 127485 CASAVA_Build 10 5527475 1I TTCCATCTCG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 21 11 10 0 A 9 10 127486 CASAVA_Build 10 5529519 4D58M4D ACACATGGAC ACAGACATTCACGCAGACCCACAGATAGACACAGACAGACACACAGATACACAGACACAGACACAG/----ACATTCACGCAGACCCACAGATAGACACAGACAGACACACAGATACACAGACACAGAC---- ACAGACACAC 3070 het 19 hom 70 4 98 13 N/A 0 0 127487 CASAVA_Build 10 5543893 1D TCTTTTCCTG C/- CCCCCACCCC 3070 hom 87 het 35 0 26 9 C 6 5 127488 CASAVA_Build 10 5548146 1I ATCAAACAGG -/C CACCTGGGCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 2 127489 CASAVA_Build 10 5554515 4D GGTACATGAT TATC/---- TAGGCGTTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 5 TATC 1 0 127490 CASAVA_Build 10 5558237 1I TTTCATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 11 12 127491 CASAVA_Build 10 5575525 1D CCTGGTGCCC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 9 8 127492 CASAVA_Build 10 5599336 4D AGACCCGTCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 CAAA 5 4 127493 CASAVA_Build 10 5607207 3I CTTGGGATTA ---/GAG GAGTGTGTGT 3070 hom 63 het 25 0 18 7 GAG 1 2 127494 CASAVA_Build 10 5610027 13I AAGTTCTTCG -------------/TTTTTTTTTTTGT TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 18 0 12 6 TTTTTTTTTTTGT 0 1 127495 CASAVA_Build 10 5616543 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1065 het 1065 ref 20 11 3 6 A 13 14 127496 CASAVA_Build 10 5679694 1I GAATGCCTCA -/G GGTTTCCTCT 3070 hom 113 het 41 0 38 3 G 2 3 127497 CASAVA_Build 10 5680143 2I AAAGGAGAAC --/AA GAGAGAGGAG 3070 hom 78 het 35 0 24 11 A 0 2 127498 CASAVA_Build 10 5682951 3D AGATAGCTGG AAA/--- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 33 0 28 6 A 11 8 127499 CASAVA_Build 10 5687599 4I GGTTTGTGTG ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 104 het 47 0 33 14 TGTT 3 4 127500 CASAVA_Build 10 5690562 1I GAAGGAGATA -/C TCCAGGAAGA 3070 hom 138 het 51 0 44 7 C 0 1 127501 CASAVA_Build 10 5692618 8D AGAAAGAAAG AAAGAAAA/-------- AGAAAGAAAG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AAAGAAAA 1 0 127502 CASAVA_Build 10 5708725 4I AGAAAGATAG ----/GAAC GAACTGTTAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 GAAC 1 2 127503 CASAVA_Build 10 5711301 1I CAAACACATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 9 hom 39 1 31 7 A 9 10 127504 CASAVA_Build 10 5721694 65I TGATAGATGG -----------------------------------------------------------------/TCCATGAGTATCCGCAAAACTAAATAATAAGTGGGCGATGGTGCCCCCTGGGTGCGGGCAGCCTC TCTTACTAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 TCCATGAGTATCCGCAAAACTAAATAATAAGTGGGCGATGGTGCCCCCTGGGTGCGGGCAGCCTC 0 1 127505 CASAVA_Build 10 5724541 1I AAGTAAAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 127506 CASAVA_Build 10 5731701 2I TTCACCATGT --/TG GCCAGGCTGG 2482 het 2482 ref 16 8 6 2 TG 0 1 127507 CASAVA_Build 10 5739387 1I CCACAAACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 10 11 127508 CASAVA_Build 10 5746483 2I CAATATTCAC --/AT AGTCACAATA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 AT 0 1 127509 CASAVA_Build 10 5751197 1I18M2I AGGGAGAGAC -GGGGAGGCAGCCCTATAA--/AGGGGAGGCAGCCCTATAATT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 22 12 11 2 N/A 0 0 127510 CASAVA_Build 10 5751535 2D AAAAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 29 3 17 9 A 13 11 127511 CASAVA_Build 10 5753145 2I GGGAAATAAC --/AA GACTACTCAG 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 A 0 2 127512 CASAVA_Build 10 5758645 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2647 het 2647 ref 21 12 7 2 A 12 11 127513 CASAVA_Build 10 5760577 1D TGCAGACCTG A/- CACTTGTGCA 3070 het 3070 ref 56 34 13 11 A 1 0 127514 CASAVA_Build 10 5762638 1D AAAAAGTAGG A/- ACAGAAGGGA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 2 1 127515 CASAVA_Build 10 5762751 1D AAGACAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 T 11 10 127516 CASAVA_Build 10 5773066 2D AGGCTGAGGT GG/-- GGGAATCGCT 3070 het 2571 hom 21 9 12 0 G 5 3 127517 CASAVA_Build 10 5779262 3I AAAAGGAAAC ---/CTT CTTAACTTTA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 CTT 1 2 127518 CASAVA_Build 10 5782941 1I GTGCAGAAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 9 10 127519 CASAVA_Build 10 5783894 1D TGACTTCTTC T/- TTTCTGATTT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 4 3 127520 CASAVA_Build 10 5786193 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 24 2 15 7 A 15 14 127521 CASAVA_Build 10 5788973 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 28 2 20 6 A 12 13 127522 CASAVA_Build 10 5796608 1D10M1D TATTATCTAA TTGTCAAGAACA/-TGTCAAGAAC- ATGAATTAGC 3070 hom 117 het 39 0 40 1 N/A 0 0 127523 CASAVA_Build 10 5797611 1D AGGCAGTTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 26 5 G 2 1 127524 CASAVA_Build 10 5806159 4I TATTCATGTA ----/GTAT GTATTTGTAT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 GTAT 1 2 127525 CASAVA_Build 10 5806604 2D ATATATATAT AG/-- ATAGATAGAT 2136 hom 15 het 6 0 6 0 AG 1 0 127526 CASAVA_Build 10 5807587 1D ATTAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 11 10 127527 CASAVA_Build 10 5811308 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGAGTTAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 CT 1 2 127528 CASAVA_Build 10 5811861 8I TCAGTCAAAG --------/CATGGGCC CAGGAGAGGA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 CATGGGCC 0 1 127529 CASAVA_Build 10 5818389 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2796 het 334 hom 14 2 8 4 A 12 11 127530 CASAVA_Build 10 5820742 1I AATCATTGCC -/T TAGCAGAGTT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 T 1 2 127531 CASAVA_Build 10 5825875 2I AAAGGCACAC --/AT GTGTGCTATC 3070 hom 147 het 59 0 48 11 AT 0 1 127532 CASAVA_Build 10 5827251 3I CATGTACAAT ---/AGG AGGTATTCAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AGG 1 2 127533 CASAVA_Build 10 5844189 2D CTGCACTGTA AC/-- CTGGGTGGCA 3070 hom 38 het 19 0 12 8 AC 1 0 127534 CASAVA_Build 10 5845380 2D GCACATTATG CT/-- CTGTTTTAAA 3070 hom 105 het 42 0 36 7 CT 2 1 127535 CASAVA_Build 10 5847738 1I ACTTCACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1429 hom 38 5 24 9 A 11 12 127536 CASAVA_Build 10 5849288 1I TTGTGATTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 T 9 10 127537 CASAVA_Build 10 5856077 6D TCAAAAACAC AAACAT/------ AATCAGTTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 5 AAACAT 1 0 127538 CASAVA_Build 10 5865294 6D CCCCTTTACC TTAAAT/------ TTGAGTCCTT 3070 hom 78 het 27 0 27 2 TTAAAT 1 0 127539 CASAVA_Build 10 5866162 2D CTCTGAAATT TC/-- TTTCTTCTAC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 TC 1 0 127540 CASAVA_Build 10 5880847 1I AGAAGGCTGA -/G GCATGAAAAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 1 2 127541 CASAVA_Build 10 5884567 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 23 8 A 13 12 127542 CASAVA_Build 10 5886066 1I TCATTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 28 1 21 6 T 11 12 127543 CASAVA_Build 10 5893930 1D TGTTACCTGT A/- AAAAAAAAAA 1444 het 1444 ref 27 14 5 8 A 17 16 127544 CASAVA_Build 10 5898155 11I AGGAAGGTCA -----------/AGGCTACAGTC AGCCATGATG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 AGGCTACAGTC 0 1 127545 CASAVA_Build 10 5908984 2D GCTCCATCTC AA/-- AAAAAAAATA 874 het 446 hom 27 2 5 20 A 10 8 127546 CASAVA_Build 10 5909781 1D ATTAAAGGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 10 9 127547 CASAVA_Build 10 5919880 2D TGACATGGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 12 10 127548 CASAVA_Build 10 5920049 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 11 12 127549 CASAVA_Build 10 5937343 2D16M1I CCTGGGTGAC AGAGGGAGACTATGTCTC-/--AGGGAGACTATGTCTCA AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 32 13 5 N/A 0 0 127550 CASAVA_Build 10 5954141 1D GAGCATTAGG A/- TTTGCTTGTA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 1 0 127551 CASAVA_Build 10 5961689 3I8M13I TTATGATGCA ---TATATTGT-------------/GTTTATGTTATGGTTTAAATAACA TATGGTTTAA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 N/A 0 0 127552 CASAVA_Build 10 5968560 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 2213 hom 23 6 15 2 A 9 8 127553 CASAVA_Build 10 5974045 1I TGATTTTCTG -/A GGCAAAAGCT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 0 1 127554 CASAVA_Build 10 5977471 1D AAGGAAATTA T/- TTGGTATCCA 3070 het 3070 hom 36 14 18 7 T 3 2 127555 CASAVA_Build 10 5985472 1I GCTAATTTTG -/T TTTTTTAGTA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 6 7 127556 CASAVA_Build 10 5989587 10D GGATTACAGA CATGTGCCAC/---------- CATGCCTGGC 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 CATGTGCCAC 1 0 127557 CASAVA_Build 10 5995332 1D GTTTTATCCA C/- AGGTGTAGTA 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 C 1 0 127558 CASAVA_Build 10 5998674 2I ATGGGGGAAC --/AG GGGAAGTGTT 3070 het 3070 hom 55 25 21 9 AG 0 1 127559 CASAVA_Build 10 6000040 2I GAGAAGACAC --/TT TGCCTCATTT 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 T 1 3 127560 CASAVA_Build 10 6004580 4I GATCACACAC ----/CTGG CTGGTTGTGG 3070 het 3070 hom 59 24 33 2 CTGG 1 2 127561 CASAVA_Build 10 6016334 1D CAAAGACAGG T/- TTTTTTTTTT 868 hom 17 het 26 0 10 17 T 11 10 127562 CASAVA_Build 10 6020200 2I CTTGATGTTT --/AG AGAAGGTAGA 3070 het 3070 hom 65 23 36 6 AG 1 2 127563 CASAVA_Build 10 6021030 4D TTGGAGCAAA CTGT/---- CTGTACAGGG 3070 het 3070 hom 30 13 12 8 CTGT 2 1 127564 CASAVA_Build 10 6032065 3I ACTCTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 9 12 127565 CASAVA_Build 10 6043394 5I AGGTGGGGGG -----/AAGAA AAGAAAAGAA 3018 het 3018 ref 34 19 9 6 AAGAA 2 3 127566 CASAVA_Build 10 6047197 1I GCAGACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 26 1 14 11 A 10 11 127567 CASAVA_Build 10 6056989 1I ACATTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1631 hom 24 6 10 8 A 13 14 127568 CASAVA_Build 10 6057562 1I TGTTAAAGGG -/A AAAAAAAACA 2429 het 2429 ref 25 11 10 4 A 8 9 127569 CASAVA_Build 10 6066772 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 A 10 9 127570 CASAVA_Build 10 6071266 1I CAACTATTAG -/T AAGTGTTTCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 127571 CASAVA_Build 10 6075823 2I AAAAAAAAAA --/AC CATGCCAACA 3070 hom 93 het 43 1 41 1 AC 0 1 127572 CASAVA_Build 10 6076434 1I AAGGTAGAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 8 9 127573 CASAVA_Build 10 6080440 2D TTTCATACAA AT/-- ATATATATAT 2428 hom 30 het 15 0 10 6 AT 8 7 127574 CASAVA_Build 10 6098497 1I CTTGGGCTCA -/C CCCCAGACAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 4 5 127575 CASAVA_Build 10 6104775 73D AGGCAGAGCC AGCCTTCGAGAAAGGACAACAAGCATTGGCCTCTTTGAAGCCTTCCAATAACTGTGCAGGGTGATATGGGGGA/------------------------------------------------------------------------- AGTAGAACAA 3070 het 3070 ref 38 39 14 7 AGCCTTCGAGAAAGGACAACAAGCATTGGCCTCTTTGAAGCCTTCCAATAACTGTGCAGGGTGATATGGGGGA 1 0 127576 CASAVA_Build 10 6114125 1D AATGTATGAG A/- AAAAAACTCA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 7 6 127577 CASAVA_Build 10 6114662 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 14 13 127578 CASAVA_Build 10 6115292 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 10 11 127579 CASAVA_Build 10 6134611 1D AGAAAACGCG C/- CCCCCCTCAC 3025 het 3025 ref 32 17 9 6 C 7 6 127580 CASAVA_Build 10 6134859 1D TCTAAAGATG C/- CCCCAAGCTG 3008 het 3008 ref 26 12 7 7 C 5 4 127581 CASAVA_Build 10 6145143 2D GGGTTCCAAA AC/-- ACATCACGTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 AC 2 1 127582 CASAVA_Build 10 6160058 1D TCTTCCTACT G/- GGGGGGGTCA 3070 het 851 hom 22 2 14 7 G 8 7 127583 CASAVA_Build 10 6165456 1D CAGAGATACG C/- CTCGTGGGAG 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 C 2 1 127584 CASAVA_Build 10 6174625 2D GTGAATGGAT GA/-- GAGTGTGATG 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 GA 2 1 127585 CASAVA_Build 10 6180024 5I TCCTTGAAAT -----/AACTC AACATGTAAA 3070 hom 148 het 51 0 50 1 AACTC 0 1 127586 CASAVA_Build 10 6181561 6D CTTGCAATAC CTAACA/------ CAATGTAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 9 CTAACA 1 0 127587 CASAVA_Build 10 6182639 1D ATCCTGGTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 51 0 42 9 A 10 9 127588 CASAVA_Build 10 6190835 7D13M4D GCCTGCCTGG CTCTGTCACCTGAGGCCGCACCTG/-------ATCTGAGAATGCA---- GATCTCAGAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 10 N/A 0 0 127589 CASAVA_Build 10 6191105 1I CTTGATTAGA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 6 7 127590 CASAVA_Build 10 6192918 5D CATGAAGCTG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 52 18 18 21 GTTTT 5 4 127591 CASAVA_Build 10 6201049 1D ACTGGCCTGG T/- TTTTTTTTTT 1913 hom 22 het 11 0 8 3 T 13 12 127592 CASAVA_Build 10 6207787 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 8 9 127593 CASAVA_Build 10 6214010 1I TCACTAAAAT -/A AAAAAAATTA 1519 het 1519 ref 16 10 4 2 A 7 8 127594 CASAVA_Build 10 6235146 8D GTCTCAGAAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 3070 hom 72 het 32 0 25 11 AAAG 6 4 127595 CASAVA_Build 10 6242036 1I CCTACGATAC -/T TTTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 15 9 T 5 6 127596 CASAVA_Build 10 6244102 3D GTGGAATCTT ACA/--- ACATTTGTCT 3070 het 3070 hom 45 17 21 11 ACA 2 1 127597 CASAVA_Build 10 6249924 1D CTAGGTCGTT C/- CTGCTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 C 2 1 127598 CASAVA_Build 10 6250986 12I AGTGCACTGG ------------/CACGATCTCAGC TCACTGCAAC 3070 hom 61 het 25 0 18 7 CACGATCTCAGC 0 1 127599 CASAVA_Build 10 6252655 19D GGTGAGGACA GTATGGAGGTGGGGACAGG/------------------- GTATGGAGGT 3070 hom 80 het 28 0 23 8 GTATGGAGGTGGGGACAGG 1 0 127600 CASAVA_Build 10 6263304 3D ATGTTTATAT CAG/--- CATTATTCAC 3070 het 3070 hom 28 10 15 5 CAG 1 0 127601 CASAVA_Build 10 6273989 1D TAGATGAGTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 38 22 14 5 T 8 7 127602 CASAVA_Build 10 6276202 2D CCTATTGGAT AA/-- AAGCTTTGGA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 4 2 127603 CASAVA_Build 10 6276847 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1978 hom 25 6 9 10 T 13 14 127604 CASAVA_Build 10 6287178 2I GTAAAAAGAT --/AC CCGCAGCCTG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 AC 0 1 127605 CASAVA_Build 10 6287358 8D TCTTTCTTCC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1838 het 1475 hom 26 9 7 14 T 22 14 127606 CASAVA_Build 10 6293178 3D GCTGTCTTTA TTG/--- TTGTTATTGT 3070 hom 115 het 44 0 37 9 TTG 2 1 127607 CASAVA_Build 10 6298847 1D CCTCCTGCTG C/- CCATGTTCCT 3070 hom 102 het 37 0 32 6 C 3 2 127608 CASAVA_Build 10 6299531 3I ATCACTTGCT ---/GTG ACAGCTCCAG 3070 hom 105 het 37 0 34 3 GTG 0 1 127609 CASAVA_Build 10 6303009 4D TGTGCATCTC TGTA/---- TGGCTCTGTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TGTA 1 0 127610 CASAVA_Build 10 6306676 1I GGCTGGTCTT -/G GAACTCCTGG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 G 1 2 127611 CASAVA_Build 10 6307724 2I ATCCTGCCTC --/AG GGGTCAGCGG 3070 hom 63 het 26 0 20 6 AG 0 1 127612 CASAVA_Build 10 6310664 1D GAATAGTGGG A/- GTGTGGTGGG 3070 hom 77 het 28 0 24 5 A 1 0 127613 CASAVA_Build 10 6319410 1I GGAAGGCTTT -/A ATAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 1 2 127614 CASAVA_Build 10 6322222 5I TTTGAAATAA -----/TTTAT TTTATTTTAT 3070 hom 78 het 27 0 26 1 TTTAT 2 3 127615 CASAVA_Build 10 6322880 1D TAGAATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 T 12 11 127616 CASAVA_Build 10 6324562 1D TCTGTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2391 hom 26 8 14 4 T 13 12 127617 CASAVA_Build 10 6326709 3I GCACGTTGGA ---/TGG CTGGAAATGC 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 TGG 0 1 127618 CASAVA_Build 10 6344349 1D CGTGAACCCT G/- GGGGGCGGAG 1243 hom 19 het 8 0 7 2 G 6 5 127619 CASAVA_Build 10 6345696 1I TGCTCTGTCA -/C CCAGGTTGGA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 C 2 3 127620 CASAVA_Build 10 6356805 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 A 10 11 127621 CASAVA_Build 10 6356879 2I CTGGTGACCG --/AC ACACAGAGGC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AC 2 3 127622 CASAVA_Build 10 6358624 1D TAATTCAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 8 127623 CASAVA_Build 10 6360818 1I TGGTGGGTGG -/T TAAAATCATA 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 T 1 2 127624 CASAVA_Build 10 6361516 1D AGAAAGGCTC T/- TTTCCTGCTT 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 T 4 3 127625 CASAVA_Build 10 6361917 2D TTGGAAGACT CA/-- GAGCTTTGCA 3070 het 3070 ref 41 22 17 5 CA 1 0 127626 CASAVA_Build 10 6363566 2D GTTTTTCCCC CA/-- CCCTCCAATT 3070 het 3070 hom 28 11 17 0 CA 1 0 127627 CASAVA_Build 10 6380342 1D TTCAGGGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 35 3 18 14 T 15 14 127628 CASAVA_Build 10 6384030 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1984 hom 33 6 19 8 T 12 13 127629 CASAVA_Build 10 6392441 1D AAGATATTCG A/- AAAAAAAAGT 1928 het 1928 ref 16 10 4 2 A 9 8 127630 CASAVA_Build 10 6394284 1I AAAATATACA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 8 127631 CASAVA_Build 10 6394895 6I GTGACTGGAA ------/AAGACC AAGAAACAGA 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 AAGACC 0 1 127632 CASAVA_Build 10 6398210 1I GAAAACCTCT -/A AGGAGCTCCT 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 A 1 2 127633 CASAVA_Build 10 6403357 5I AATTTCATTC -----/TCTTT TAATTCAGTA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 TCTTT 0 1 127634 CASAVA_Build 10 6409614 1I GAACATCAAG -/A AAAATTACGT 3070 hom 138 het 54 0 45 9 A 4 5 127635 CASAVA_Build 10 6420423 4I TTTAAATGAC ----/TGAT TGACGTACAC 3070 het 3070 hom 47 19 26 2 TGAT 0 1 127636 CASAVA_Build 10 6428168 1I AAAAGCCCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 441 hom 26 1 21 4 A 9 10 127637 CASAVA_Build 10 6433713 4D GAGAGGGAGA CAGG/---- CAGGCAGGCA 3070 hom 102 het 51 0 32 20 CAGG 4 3 127638 CASAVA_Build 10 6435278 6D GTGTGTGTGT GTGTGC/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 78 het 32 0 26 7 GTGTGC 1 0 127639 CASAVA_Build 10 6446667 1D ACCATCATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 11 10 127640 CASAVA_Build 10 6457747 1D TTAGTGGCTT A/- AAAACAACTC 3070 het 3070 hom 58 24 26 8 A 5 4 127641 CASAVA_Build 10 6469123 6I CACACATATA ------/CACATG CACATACACA 3070 hom 177 het 73 0 59 14 CACATG 0 1 127642 CASAVA_Build 10 6474493 9I AGACTGGGTG ---------/GCAGCGAAT GCAACGGATT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 GCAGCGAAT 0 1 127643 CASAVA_Build 10 6479385 1D TTAAATTGAA T/- TTTTGTCATC 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 5 4 127644 CASAVA_Build 10 6479893 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 1032 het 1032 ref 25 20 3 2 A 10 11 127645 CASAVA_Build 10 6480705 6D TAGAGCTGAA TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 TTTTTC 2 1 127646 CASAVA_Build 10 6485803 1I TAAATGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 A 10 11 127647 CASAVA_Build 10 6486355 5D TCTTTCGTTC TTTCT/----- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 TTTCT 2 1 127648 CASAVA_Build 10 6486535 4D CCTTTCTTCC TTCT/---- TTCTCTTTCT 3070 het 343 hom 28 5 16 7 TTCT 2 1 127649 CASAVA_Build 10 6496761 1I AGTGATAAAG -/A AAAAAAAAAA 2636 het 2636 ref 29 15 11 3 A 12 13 127650 CASAVA_Build 10 6498202 1I ATTTCAATAG -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 7 8 127651 CASAVA_Build 10 6498318 1D TGTGCAGACC T/- TTGTCCCTCA 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 3 2 127652 CASAVA_Build 10 6499471 1I GTCAAACCCC -/A AAATTCGAAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 3 4 127653 CASAVA_Build 10 6500484 2I AAGGAATACC --/TG TGCCCACCAC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TG 1 2 127654 CASAVA_Build 10 6501202 4D TCATCAAATC TATT/---- TATGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 19 15 7 TATT 1 0 127655 CASAVA_Build 10 6501310 1D AGTTGTTTCT C/- CTTACCGTAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 C 2 1 127656 CASAVA_Build 10 6518777 1D CTGGAAGGAA C/- CCTTTCTTCC 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 C 3 2 127657 CASAVA_Build 10 6521663 2I TAGAATTTTC --/TT TTCTGTAGCT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 2 4 127658 CASAVA_Build 10 6523439 1D TTTTTTTTTT C/- CCCTTTATTG 3070 het 2651 hom 29 11 16 2 C 4 3 127659 CASAVA_Build 10 6539916 1I TGATATCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 45 3 32 10 T 11 12 127660 CASAVA_Build 10 6543069 8D TCCATCATTT ATCCATCC/-------- ATCCATCCAT 3070 het 3070 hom 71 22 24 32 ATCC 7 5 127661 CASAVA_Build 10 6552895 1D AGACTGTCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 21 2 13 6 A 15 14 127662 CASAVA_Build 10 6572861 1I TTCTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 T 11 12 127663 CASAVA_Build 10 6575265 1D GATATCTGAA T/- TTTTCAAATG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 5 4 127664 CASAVA_Build 10 6576445 1I GTCACCCTTC -/A TGCAGGTCAA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 0 1 127665 CASAVA_Build 10 6586867 1I AGATTTATTC -/T TTTTTTTTTT 1681 het 1507 hom 23 9 5 9 T 13 14 127666 CASAVA_Build 10 6587372 4D ACTTTTTCTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 44 hom 45 1 20 26 CTTT 4 3 127667 CASAVA_Build 10 6587394 1D CTTTCCTTCC T/- TCCTTTCTTC 3070 het 1965 hom 40 9 15 16 T 2 1 127668 CASAVA_Build 10 6587499 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 T 5 2 127669 CASAVA_Build 10 6599310 1D AAGTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 17 0 12 5 T 11 10 127670 CASAVA_Build 10 6613026 1I GAGCCCACAT -/G GTTCTCAGAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 2 127671 CASAVA_Build 10 6616066 1I TTAATTATTT -/A AATATCATTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 2 3 127672 CASAVA_Build 10 6626953 1D TTCCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 993 hom 38 4 24 11 T 14 13 127673 CASAVA_Build 10 6634863 1I AAATTAAAAT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 0 1 127674 CASAVA_Build 10 6636360 2D AAGTGAGACA AT/-- ATGAGAACAG 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 AT 2 1 127675 CASAVA_Build 10 6638638 3I GTAAATTTTA ---/TGT TGTTTATTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TGT 1 2 127676 CASAVA_Build 10 6641792 4D CTTTGAGTTT TGTG/---- TGTGTGTGTT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 TG 6 4 127677 CASAVA_Build 10 6648267 4D CTGACCTACA CTGG/---- CTGTTCTGCA 3070 hom 141 het 53 0 48 9 CTGG 1 0 127678 CASAVA_Build 10 6656936 4I CTACTGAAAC ----/ACTA ACACAATCAT 3070 hom 135 het 48 0 44 4 ACTA 0 1 127679 CASAVA_Build 10 6669869 2I CTCAAAATAT --/AA AGATACCTGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 1 3 127680 CASAVA_Build 10 6671071 1D GAGCATATGC A/- AAACCAGTGA 3070 hom 135 het 50 0 46 5 A 4 3 127681 CASAVA_Build 10 6676851 4D TTTGAAAAAG TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 TTAT 5 4 127682 CASAVA_Build 10 6690082 1D TTCAGCTGTC T/- TATCATTTCT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 2 1 127683 CASAVA_Build 10 6694304 1D CTCACTAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 82 hom 35 1 30 4 A 10 9 127684 CASAVA_Build 10 6694481 1D ATGGCTGTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 114 het 47 0 36 12 T 8 7 127685 CASAVA_Build 10 6704816 5I GGTATAAAGA -----/AAGTG AAGTGACATT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 AAGTG 1 2 127686 CASAVA_Build 10 6705686 1I TCCAGGGGGG -/C GTTTAAGGGA 3070 hom 96 het 39 0 31 8 C 0 1 127687 CASAVA_Build 10 6723385 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 16 6 A 14 15 127688 CASAVA_Build 10 6729633 1D CCTTGGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 26 1 18 7 T 14 13 127689 CASAVA_Build 10 6733981 1D49M1I TTCCTTTTTT AAAAAAAAATTTCCACTTCAACGTAATTAAGAAAACATCAAAATATAAAG-/-AAAAAAAATTTCCACTTCAACGTAATTAAGAAAACATCAAAATATAAAGA AAAAAAATCA 3070 hom 141 het 36 0 48 5 N/A 0 0 127690 CASAVA_Build 10 6741342 2D ATTTTAAATA AT/-- AATATGTGGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AT 1 0 127691 CASAVA_Build 10 6760953 1I TTTTCTTGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 301 hom 27 1 26 0 T 9 10 127692 CASAVA_Build 10 6761954 4I TGTGTGTGTG ----/TGTA TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 40 0 32 8 TGTA 0 1 127693 CASAVA_Build 10 6763170 1D GGGTTTCTCT G/- GTTGTGTGAG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 2 1 127694 CASAVA_Build 10 6763780 2D ATTTAGTAAG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 11 9 127695 CASAVA_Build 10 6764042 1I AGCATAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1371 hom 38 4 29 5 T 11 12 127696 CASAVA_Build 10 6764197 1I AAGTGTATTT -/A TTGGGATTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 0 1 127697 CASAVA_Build 10 6765078 5D AAAACTTTTT CTTCA/----- CTTATTTTCA 3070 hom 126 het 43 0 43 5 CTTCA 1 0 127698 CASAVA_Build 10 6768641 3I TGGCTTTAAA ---/TCT TGTTCCTTCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCT 0 1 127699 CASAVA_Build 10 6768853 2I CACTGTGCAC --/AA ACTATTCCAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 3 127700 CASAVA_Build 10 6768934 3D GAGCCCCCAC ACA/--- ACAAGTTAAG 3070 hom 61 het 24 0 23 2 ACA 2 1 127701 CASAVA_Build 10 6769064 2D CTCACATTGC TT/-- ACTGCAGCCG 3070 hom 111 het 41 0 36 5 T 2 0 127702 CASAVA_Build 10 6774036 1D21M1I ATAGCCACAA CTCCATCATTCCTCTGAAAAGG-/-TCCATCATTCCTCTGAAAAGGA ATTAACAGCA 3070 hom 96 het 30 0 32 2 N/A 0 0 127703 CASAVA_Build 10 6774956 2D CAGAGAAGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 135 het 49 0 43 6 TG 9 8 127704 CASAVA_Build 10 6775023 2D GTGTGTGCAC AT/-- ATGTGTATGT 3070 hom 131 het 53 0 43 12 AT 2 1 127705 CASAVA_Build 10 6787915 1I AGGGCTGGAG -/A AACTTTTCTA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 2 3 127706 CASAVA_Build 10 6790361 2D GTGTGTAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 74 het 33 0 25 8 AG 8 7 127707 CASAVA_Build 10 6792504 3D GCAAAAATGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 25 2 11 12 T 17 14 127708 CASAVA_Build 10 6797608 1D ACTACATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 306 hom 26 1 20 5 A 10 9 127709 CASAVA_Build 10 6802667 4D ATTCCTTGAG AGAA/---- AGAAGCTTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 6 AGAA 2 1 127710 CASAVA_Build 10 6806135 3D AAACTATCGA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 123 het 47 0 42 6 AAT 5 4 127711 CASAVA_Build 10 6809863 1D GTGAATGCAT A/- AATCAACATG 3070 hom 80 het 38 0 30 8 A 3 2 127712 CASAVA_Build 10 6825283 1D CTTCAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 T 13 12 127713 CASAVA_Build 10 6825730 1I CCCCACTCAT -/G GCCTATCTAC 3070 hom 110 het 41 0 33 8 G 1 2 127714 CASAVA_Build 10 6831246 1D ATAAAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 584 hom 37 5 25 8 T 16 15 127715 CASAVA_Build 10 6837035 1D GGTCCCTAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 39 0 29 10 T 10 9 127716 CASAVA_Build 10 6839716 1D TGATGGAGGT G/- GGCTCTCAGT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 G 3 2 127717 CASAVA_Build 10 6845199 1D CTGCTATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 11 10 127718 CASAVA_Build 10 6851965 2I TTCATGAGCG --/AA AAAAGGGAAT 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 A 4 6 127719 CASAVA_Build 10 6853029 1D CAGCTATGCC A/- AGGCTCTCCT 3070 het 3070 ref 41 24 12 6 A 2 1 127720 CASAVA_Build 10 6855958 1D AAGTGGCACA T/- TTTAAAAAAG 3070 het 3070 hom 50 17 28 7 T 4 3 127721 CASAVA_Build 10 6874080 1D AGAAGAAGAA G/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 1 0 127722 CASAVA_Build 10 6876036 2D CTAAAAAAAA AT/-- AATACCACAT 3070 hom 48 het 20 0 17 7 AT 1 0 127723 CASAVA_Build 10 6879875 1I AGGAGATTCA -/G CATAGTCCTG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 0 1 127724 CASAVA_Build 10 6881933 1I TACAAGAGGA -/G GACGCAAAGG 1220 hom 7 het 3 0 3 0 G 1 2 127725 CASAVA_Build 10 6894175 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 18 4 T 10 11 127726 CASAVA_Build 10 6895031 7D CACTCATTTC AGATTCT/------- AAGAAACTTC 3070 hom 117 het 40 0 39 5 AGATTCT 1 0 127727 CASAVA_Build 10 6896469 5D TGCAAATATC AAATT/----- AAAGAGGCAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AAATT 1 0 127728 CASAVA_Build 10 6897908 1I AAATTTTATG -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 6 7 127729 CASAVA_Build 10 6903401 5I TGCGGGGGGG -----/AAAGA AAAAACCTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAAGA 0 1 127730 CASAVA_Build 10 6904351 4D TATGTCATTA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 72 het 35 0 25 12 AAAT 3 2 127731 CASAVA_Build 10 6908364 1I AGAATTGACC -/T CAAGGTGCCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 0 1 127732 CASAVA_Build 10 6911769 1I TCTTCATTTT -/A TTCCTAGTCC 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 A 0 1 127733 CASAVA_Build 10 6914328 3D TTCTTTTCCA GTC/--- TTCTTTTAGA 1772 het 1772 ref 32 26 5 2 GTC 1 0 127734 CASAVA_Build 10 6915757 7I GGCTGGAGAA -------/GGTTGAT GGTTGATAGT 3070 hom 91 het 33 0 28 5 GGTTGAT 1 2 127735 CASAVA_Build 10 6917997 10D11M1I GGTAGATTTA CATAACATGTTATATAGTTAT-/----------TATATACATATA ATTTATATAT 2814 het 380 hom 9 2 6 3 N/A 0 0 127736 CASAVA_Build 10 6918547 6D62M4D TGCATATATA TACATGTATGTATATGTACATATATAATATAGGTATATGCATGTATATATGTCTACATATATGTATGTATAC/------CATGTATATGTACATATATAATATAGGTATATGCATGTATATATGTCTACATATATGTATGT---- ATACATATAT 1870 het 1870 ref 25 14 5 24 N/A 0 0 127737 CASAVA_Build 10 6921928 1I GAGAAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 922 hom 33 4 18 11 T 15 16 127738 CASAVA_Build 10 6922349 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 6 7 127739 CASAVA_Build 10 6927361 2I GGTTAACATG --/TT TTTTTTTGAA 3070 hom 61 het 29 0 21 8 T 7 9 127740 CASAVA_Build 10 6930137 1I TATTTTTTGT -/G CGGGGGGGTG 3070 hom 55 het 22 0 17 5 G 0 1 127741 CASAVA_Build 10 6936106 1I TCCGTCTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 996 hom 27 3 19 5 A 13 14 127742 CASAVA_Build 10 6938182 1I TATGTCCCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 673 hom 32 3 26 3 T 10 11 127743 CASAVA_Build 10 6948574 16D CACCCTTCCA TCTCTTCCTTCCTCCT/---------------- TCTCTTCCTT 3070 hom 97 het 39 0 28 15 TCTCTTCCTTCCTCCT 1 0 127744 CASAVA_Build 10 6949029 4D TTCCTTCCTT CCTC/---- CCTCCCTCCT 2629 hom 33 het 15 0 12 4 CCTC 3 2 127745 CASAVA_Build 10 6949253 11D GCACCTTCAT ATTAGATTATC/----------- TCTAGATTAG 3070 hom 60 het 22 0 21 3 ATTAGATTATC 1 0 127746 CASAVA_Build 10 6949714 1I ACTACATGCA -/T TTTTGTGGAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 4 5 127747 CASAVA_Build 10 6951876 1D CATCATTTAT G/- GGGTATAGCG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 4 3 127748 CASAVA_Build 10 6953479 4D CATGGATTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 TTTG 3 2 127749 CASAVA_Build 10 6959584 1I ATGGGTTGGG -/T TGTGTGAGTT 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 1 2 127750 CASAVA_Build 10 6963975 1I TGCCTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 11 12 127751 CASAVA_Build 10 6967617 1D AGTTAGTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 9 8 127752 CASAVA_Build 10 6969195 9I AAAAATCAAA ---------/GCCCAGGAT GGTGAGAAGT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 GCCCAGGAT 0 1 127753 CASAVA_Build 10 6974462 1D CTTCAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 2660 het 2660 ref 44 31 6 8 A 11 10 127754 CASAVA_Build 10 6977099 4I TATAACAGAC ----/AAAT AGTTTATAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AAAT 0 1 127755 CASAVA_Build 10 6978501 1D AAAAAAAAAA C/- ACAGAATAAA 1894 het 517 hom 14 2 7 6 C 1 0 127756 CASAVA_Build 10 6978855 1I CCACACGGCT -/G GGGAGGCTTC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 G 3 4 127757 CASAVA_Build 10 6986906 1I GGCAGAGGGC -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 7 8 127758 CASAVA_Build 10 6989831 1D ATATAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 11 10 127759 CASAVA_Build 10 6994997 1I AACCCATCCA -/T TTTATGAAAC 3070 het 3070 hom 63 29 31 3 T 3 4 127760 CASAVA_Build 10 6999203 5D TCTGGATCCG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 51 6 20 28 A 16 11 127761 CASAVA_Build 10 7003354 8D AAAAAATAAT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 TTTG 5 3 127762 CASAVA_Build 10 7004497 3D TTTATTATTT TCA/--- TCAAGAATTT 1977 het 1977 ref 15 8 6 3 TCA 2 1 127763 CASAVA_Build 10 7006503 1D TGAAGCTCTG T/- TTTAGGAATG 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 T 4 3 127764 CASAVA_Build 10 7009613 2D GAGTCAGTAG CT/-- CTATTTTTAT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 CT 2 1 127765 CASAVA_Build 10 7026462 2I GTAGAATTCT --/GA GAGAGTTGCC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 GA 2 3 127766 CASAVA_Build 10 7032548 1I TTATGGGAGC -/T TACAATTCAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 1 2 127767 CASAVA_Build 10 7032758 3D CCCACCTGTA CCC/--- CCCCAAAAAC 3070 hom 78 het 30 0 24 6 C 7 4 127768 CASAVA_Build 10 7034337 3D ACACCCTATA ATG/--- ATAAGGGTGT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 ATG 1 0 127769 CASAVA_Build 10 7038274 1D CCAGGATCCT A/- ACTCAAGGTA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 2 1 127770 CASAVA_Build 10 7039615 1D CCATCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 30 9 A 12 11 127771 CASAVA_Build 10 7049764 1I GGGAGGGGAC -/A AAAAAAAAAA 2357 hom 24 het 10 0 8 2 A 10 11 127772 CASAVA_Build 10 7051020 2I CTCATTATAC --/AA AAAAGATACT 3070 hom 18 het 10 0 7 4 A 4 6 127773 CASAVA_Build 10 7051133 40D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATATACACAC/---------------------------------------- ACACACACAC 2292 hom 12 het 4 0 5 1 ATATATATATATATATATATATATATATATATATACACAC 1 0 127774 CASAVA_Build 10 7051526 4I AACTATTGAG ----/ATAA ATAAATAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 7 ATAA 3 4 127775 CASAVA_Build 10 7053888 1D TCTGTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 132 het 53 0 45 8 A 11 10 127776 CASAVA_Build 10 7056640 2D31M1I GGATTCCCTT TCTCTCTCTCTACCCTTTTCCACTATAGAGGAA-/--TCTCTCTCTACCCTTTTCCACTATAGAGGAAC CCCATTGATC 3070 hom 163 het 52 0 51 13 N/A 0 0 127777 CASAVA_Build 10 7061769 1D TAAAATGGGG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 55 28 23 4 A 8 7 127778 CASAVA_Build 10 7063821 4D TCTGCTTTTG TTTA/---- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 8 TTTA 1 0 127779 CASAVA_Build 10 7064450 4D AGTACCTACC ACAA/---- ACAAACAAAA 3070 het 3070 ref 49 29 19 3 ACAA 3 2 127780 CASAVA_Build 10 7065813 4I TTCTTTCTTG ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 hom 66 het 30 0 21 9 CCTT 4 5 127781 CASAVA_Build 10 7070410 2I AAACAGAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AG 8 9 127782 CASAVA_Build 10 7071774 1I CAAGACTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 37 2 25 10 A 11 12 127783 CASAVA_Build 10 7084994 7I TCCTCATCAT -------/CTCCCAA CTCCAACTGG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CTCCCAA 0 1 127784 CASAVA_Build 10 7091931 2I AATCCCAAAG --/CA CAGATTTTTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CA 1 2 127785 CASAVA_Build 10 7095201 1D TTTCATAATG C/- CTGTGGGTGC 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 C 2 1 127786 CASAVA_Build 10 7125502 2D TGTGGGTGAC TT/-- TGTGTGGGCA 3070 hom 176 het 63 0 57 7 T 3 1 127787 CASAVA_Build 10 7148511 11D GCTGAGGCCG GAGAATGGCGT/----------- GAACCCGGGA 504 hom 5 het 7 0 3 4 GAGAATGGCGT 1 0 127788 CASAVA_Build 10 7149294 4D TGGGAGGAAA TATT/---- TGTTTCTAAA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TATT 1 0 127789 CASAVA_Build 10 7178307 1D ATTCTGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 24 8 A 13 12 127790 CASAVA_Build 10 7178649 2D AGAGCCTCCT CA/-- CATCCCACAT 3070 hom 74 het 31 0 21 11 CA 2 1 127791 CASAVA_Build 10 7180271 4D77M4D CACATAGACA CACTCACTCACACTCACAATCACACTCACATACACACCAGACTCACAGTCTCACACTCACATATACACACGACTCACACTCACAG/----TACTCACACTCACAATCACACTCACATACACACCAGACTCACAGTCTCACACTCACATATACACACGACTCACACTC---- ACATACAAAC 3070 het 1639 hom 65 12 63 47 N/A 0 0 127792 CASAVA_Build 10 7180427 4D ACATAGTCAT ACTC/---- ACAAACACAC 3070 het 3070 ref 68 38 22 14 ACTC 1 0 127793 CASAVA_Build 10 7180551 4I CTCACATACA ----/CATT CAATCACATG 3070 hom 181 het 72 0 61 15 CATT 0 1 127794 CASAVA_Build 10 7182363 2D AACAAAATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 235 hom 29 2 22 5 T 16 14 127795 CASAVA_Build 10 7183908 3D AAGTAATGGC TTG/--- TTGTGTTTGT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 TTG 2 1 127796 CASAVA_Build 10 7187072 4I GTTGTTTCTC ----/TCTT GTAAATTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TCTT 0 1 127797 CASAVA_Build 10 7187203 1D GTGCTCTTTG T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 7 127798 CASAVA_Build 10 7194274 1I ATAGGTATGG -/T TTCCCCCATG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 2 3 127799 CASAVA_Build 10 7199486 4D CAAGCCAGAG ATTT/---- ATTTTGAATA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 ATTT 2 1 127800 CASAVA_Build 10 7217467 1D AAAAAATATC T/- TTATTTCTTA 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 T 3 2 127801 CASAVA_Build 10 7225700 1D CGTGTGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 40 0 28 12 T 12 11 127802 CASAVA_Build 10 7234464 3D GCAGAAGAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 2562 het 699 hom 33 9 9 16 A 19 16 127803 CASAVA_Build 10 7236622 1D AACATAACAG A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 29 14 12 4 A 7 6 127804 CASAVA_Build 10 7262092 1I TTAGGTTTGC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 41 het 20 0 13 7 T 8 9 127805 CASAVA_Build 10 7267796 1I GGTGGAGGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 929 hom 42 4 30 8 T 9 10 127806 CASAVA_Build 10 7286488 4D AAACGCAATG ATTT/---- ATTAGGTTAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATTT 1 0 127807 CASAVA_Build 10 7287284 18D GGTCTCAAAA TCCTGGGCTCAAGCATTC/------------------ TCCTGCCTTG 3070 het 3070 hom 34 15 19 3 TCCTGGGCTCAAGCATTC 1 0 127808 CASAVA_Build 10 7290655 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2360 hom 28 het 16 0 10 7 A 14 13 127809 CASAVA_Build 10 7295215 1D AAAGTAAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 8 7 127810 CASAVA_Build 10 7301676 1D AAATCCTAGG A/- AAAAAAACCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 7 127811 CASAVA_Build 10 7302792 4I GCACCCTTCC ----/TTCT TTCTTTTTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TTCT 1 2 127812 CASAVA_Build 10 7313684 4D CCCTAGAACA ATGT/---- TGCTCATTTC 3070 hom 117 het 48 0 40 9 ATGT 1 0 127813 CASAVA_Build 10 7317702 3D AAATTTACAG AAC/--- AACAGATAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AAC 2 1 127814 CASAVA_Build 10 7318663 2I TAAAACTGCA --/AG AGTTTTAAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AG 1 2 127815 CASAVA_Build 10 7328761 7I GTCTGTTGAG -------/TTTAATT TTTAATTGAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TTTAATT 1 2 127816 CASAVA_Build 10 7332393 1I ACTTGCATTC -/T TTTTTATGGC 3070 hom 162 het 62 0 52 10 T 5 6 127817 CASAVA_Build 10 7333139 1I ATTAAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 12 13 127818 CASAVA_Build 10 7347105 16D TGCTGAGATC TCCCTCCCTCCCTCCT/---------------- TCCCTCCCTC 3070 hom 33 het 22 0 12 16 TCCCTCCCTCCCTCCT 2 1 127819 CASAVA_Build 10 7348300 1I TCAGGTGATC -/A CACCCACCTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 0 1 127820 CASAVA_Build 10 7351018 1D CGTCTTCAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 9 8 127821 CASAVA_Build 10 7351796 1D AAGATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 25 1 20 4 T 13 12 127822 CASAVA_Build 10 7358469 1I AGAAGGTGCC -/T TTTTCAAGTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 5 127823 CASAVA_Build 10 7364847 1D AATGAAGATT C/- ACCAATTTCT 3070 hom 123 het 42 0 42 0 C 1 0 127824 CASAVA_Build 10 7370822 1D TATGGTGAAA C/- CCCCCCCCCC 1271 hom 12 het 6 0 4 2 C 11 10 127825 CASAVA_Build 10 7384980 2D TTACAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 13 11 127826 CASAVA_Build 10 7389556 1D ACAGACTCTC T/- GATAAATAGT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 1 0 127827 CASAVA_Build 10 7391635 1I CCCTGAACCT -/G GCCCTTGTTA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 G 1 2 127828 CASAVA_Build 10 7393014 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2254 hom 16 het 10 0 8 2 A 18 16 127829 CASAVA_Build 10 7393102 2I AGTTTCCCCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 12 127830 CASAVA_Build 10 7398852 2D CCACACATAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 98 het 50 0 37 14 AC 8 7 127831 CASAVA_Build 10 7402630 1D TAGGAAGCAC T/- TTTCATTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 8 T 4 3 127832 CASAVA_Build 10 7462623 1I AATGCAACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 473 hom 25 2 18 5 T 10 11 127833 CASAVA_Build 10 7466454 3D AGTGAAATCC TTT/--- TTTAACAGTT 3070 hom 105 het 38 0 35 4 T 6 3 127834 CASAVA_Build 10 7470198 1D GCCAATGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 35 1 25 10 T 14 13 127835 CASAVA_Build 10 7471514 3D TTTTGTACAA AGT/--- TAACTCTACT 3070 hom 120 het 46 0 41 7 AGT 1 0 127836 CASAVA_Build 10 7475467 1I ACAGCAGTGA -/T TTTTTTGCAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 127837 CASAVA_Build 10 7475970 1I AGTATTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 302 hom 41 1 32 8 T 10 11 127838 CASAVA_Build 10 7477670 1D CTAAAAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 31 2 22 9 T 15 14 127839 CASAVA_Build 10 7479344 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 27 0 17 10 T 11 12 127840 CASAVA_Build 10 7484081 1D ATTTAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 957 hom 35 5 20 10 A 15 14 127841 CASAVA_Build 10 7490073 2I TGGAGCAAAT --/TG TGCGCTTGTC 3070 hom 56 het 24 0 17 7 TG 1 2 127842 CASAVA_Build 10 7512700 1D CTAAAAACAC A/- AAAAAATTAG 1331 hom 10 het 4 0 4 1 A 7 6 127843 CASAVA_Build 10 7515307 11I ACGTATCTTG -----------/GCTGTTGCCTC TATGTAGGTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 GCTGTTGCCTC 0 1 127844 CASAVA_Build 10 7525566 1I TGGTCTCCGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 10 127845 CASAVA_Build 10 7525744 3D AATGTTTCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 1298 het 419 hom 20 8 4 8 T 19 16 127846 CASAVA_Build 10 7528305 1D ACGCTCGGCA T/- TTTTTTTTTT 2947 het 921 hom 29 5 16 8 T 15 14 127847 CASAVA_Build 10 7539239 1I TTTAGTAGAG -/A GGGGGTTTCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 0 1 127848 CASAVA_Build 10 7541040 1D AGACAAACCC A/- AAGAGAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 3 2 127849 CASAVA_Build 10 7547161 1I AATGTGGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 9 10 127850 CASAVA_Build 10 7547473 1I GGGACCTGTC -/A GGGGGTGGGG 3070 hom 111 het 39 0 37 2 A 0 1 127851 CASAVA_Build 10 7560322 8D TCCTTTTTGG TTAGATAT/-------- TAAGATGTTT 3070 hom 108 het 35 0 37 1 TTAGATAT 1 0 127852 CASAVA_Build 10 7568411 3I CTACACCTTT ---/TTA ATTTTATTTT 3070 hom 103 het 41 0 34 7 TTA 0 1 127853 CASAVA_Build 10 7570177 2D GGTTGACTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 17 0 14 3 A 15 13 127854 CASAVA_Build 10 7587657 2D TTGCTAGGGG GA/-- GGGGAAAGGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GA 1 0 127855 CASAVA_Build 10 7627325 1D CCCCTAATCC A/- AGATGACTGA 3070 hom 27 het 10 0 9 1 A 2 1 127856 CASAVA_Build 10 7642933 1D AAATACTATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 47 het 21 0 16 5 T 10 9 127857 CASAVA_Build 10 7643012 1D ACCCCATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 14 1 A 14 13 127858 CASAVA_Build 10 7645084 1D GGCCAAGTGT C/- CATCCCTGTG 3070 hom 120 het 47 0 37 11 C 2 1 127859 CASAVA_Build 10 7646885 2D ACTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 106 het 44 0 34 13 TA 8 7 127860 CASAVA_Build 10 7647749 2I ATGCATACAT --/AC ACAGACTATA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AC 1 2 127861 CASAVA_Build 10 7663234 1I GTCTCAACAG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3048 hom 16 8 7 1 A 6 7 127862 CASAVA_Build 10 7664426 1D ATTTCCTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 T 10 9 127863 CASAVA_Build 10 7677316 2I AAAGAATATA --/CT TTTCTTACTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CT 0 1 127864 CASAVA_Build 10 7686799 1I GATTGTTTCA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 7 127865 CASAVA_Build 10 7687739 13I GATAAGCACT -------------/TCCACGTTTGTTA TCTCATTTAA 3070 hom 123 het 40 0 42 0 TCCACGTTTGTTA 0 1 127866 CASAVA_Build 10 7695411 11D CTTGAGCCCT AAGGGACTCCA/----------- AAGTTTGGAT 3070 hom 81 het 27 0 28 2 AAGGGACTCCA 1 0 127867 CASAVA_Build 10 7709091 1D AAAAACATCA G/- AATAATTTCA 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 G 1 0 127868 CASAVA_Build 10 7709300 8D AAGATAAAGT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 1145 hom 20 9 10 3 A 20 12 127869 CASAVA_Build 10 7713011 1D GCAGCCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2428 hom 24 10 12 2 A 12 11 127870 CASAVA_Build 10 7713138 1D TCTTCTTAAT A/- AAAAATACTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 6 5 127871 CASAVA_Build 10 7729560 1I CGTGAACACC -/T TGTCTAGTCT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 1 2 127872 CASAVA_Build 10 7736926 1D AAAACCAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 10 9 127873 CASAVA_Build 10 7751118 1I ATCTGATCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 9 10 127874 CASAVA_Build 10 7752417 1I CAACCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 11 12 127875 CASAVA_Build 10 7754181 4D AAGGAAAGAA AGAC/---- AGAAAGAGGG 1978 hom 21 het 9 0 7 2 AGAC 1 0 127876 CASAVA_Build 10 7755965 12D TCTTCTGCTT TCTTCCTCTTCC/------------ TCTTCCTCTT 2278 het 2278 ref 22 11 8 3 TCTTCC 4 2 127877 CASAVA_Build 10 7756154 1I ATTTTTTGCA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 840 hom 12 2 9 1 T 5 6 127878 CASAVA_Build 10 7757140 1D TTAAATAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 20 0 11 10 A 12 11 127879 CASAVA_Build 10 7759451 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3025 hom 28 9 9 10 A 12 11 127880 CASAVA_Build 10 7762381 1D TCTCTACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 19 1 9 9 A 15 14 127881 CASAVA_Build 10 7765597 12D TCATATGGAA CCAAAAAAGAGT/------------ CTAAATAGCC 539 het 539 ref 36 27 3 11 CCAAAAAAGAGT 1 0 127882 CASAVA_Build 10 7765696 1I TACAGTAACC -/A AAACAGCACA 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 3 4 127883 CASAVA_Build 10 7765823 1D AGCAATGAGG A/- AAAAAACTCC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 7 6 127884 CASAVA_Build 10 7772479 1I AGTACAATTA -/C ACCTTGATTT 3070 hom 160 het 60 0 54 6 C 0 1 127885 CASAVA_Build 10 7823716 1I CCCATTCTTG -/A GTGTTTCAGG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 0 1 127886 CASAVA_Build 10 7824158 1I TGCACATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 7 12 9 T 10 11 127887 CASAVA_Build 10 7828881 5D ATCTAGGGTC ATGCA/----- ATGCCAAGAT 3070 hom 138 het 51 0 46 8 ATGCA 1 0 127888 CASAVA_Build 10 7833795 1I AGTTTAGCTT -/C TTAGTATTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 0 1 127889 CASAVA_Build 10 7837910 4I TTAGCTGAAC ----/AACT AACTATACAG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AACT 1 2 127890 CASAVA_Build 10 7838742 1I TAAGCATTAC -/A GATACTCAAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 0 1 127891 CASAVA_Build 10 7840645 2D TGGTCCATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 337 hom 34 4 11 19 A 16 14 127892 CASAVA_Build 10 7847409 1I ATTTAAAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 A 8 9 127893 CASAVA_Build 10 7853115 1I AAATCCACGT -/A AAGATAAGCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 3 127894 CASAVA_Build 10 7859216 1I AAGCAAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2456 hom 24 7 8 9 T 13 14 127895 CASAVA_Build 10 7869051 1D CATAGTGTAG C/- CATATAAGGC 3070 het 3039 hom 26 7 14 5 C 2 1 127896 CASAVA_Build 10 7871412 2I GGAAGTCAGA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 9 11 127897 CASAVA_Build 10 7876470 2D TTGTGTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 537 hom 30 7 14 9 T 14 12 127898 CASAVA_Build 10 7883151 1D ATACCATCTA T/- TTTCTAATAC 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 T 4 3 127899 CASAVA_Build 10 7890298 2D7M2D CAGAGTAAGA CTCTGTTCCAA/--CTGTTCC-- AAAAAAAAAA 3070 het 1218 hom 26 7 16 6 N/A 0 0 127900 CASAVA_Build 10 7890969 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 9 7 T 10 11 127901 CASAVA_Build 10 7892015 1I TTCAAACTGC -/T TTTTTTTTTT 1587 het 1587 ref 29 15 6 8 T 10 11 127902 CASAVA_Build 10 7894671 1D CTAAAAAGAC A/- AAAATTAGCC 3070 het 110 hom 15 1 13 1 A 5 4 127903 CASAVA_Build 10 7899379 10D GTGAATATCA TGTTCAAAGT/---------- TCTGGAATAG 3070 het 3070 hom 53 25 26 4 TGTTCAAAGT 1 0 127904 CASAVA_Build 10 7903192 1I ATTTGGTGAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 112 het 43 0 38 5 T 8 9 127905 CASAVA_Build 10 7906270 1D TTTGATTTGC T/- TTTCACTTTG 3070 het 3070 hom 42 19 18 7 T 4 3 127906 CASAVA_Build 10 7909293 1I AATCAAGTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 9 10 127907 CASAVA_Build 10 7910870 4I GGGTGTGGTG ----/GTGC GTGCCTGTAG 2594 het 769 hom 9 2 7 0 GTGC 1 2 127908 CASAVA_Build 10 7917299 1I GCTGTGGGTT -/G GACAAGCTTG 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 G 1 2 127909 CASAVA_Build 10 7923620 2I CCCAAGGGAC --/AG ATGATAGGAA 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 AG 0 1 127910 CASAVA_Build 10 7927210 1D GGGAACTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 12 11 127911 CASAVA_Build 10 7928589 4I GCTAACAAAA ----/AAAC AAGGAGAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 AAAC 0 1 127912 CASAVA_Build 10 7929954 1D GTCCAGGCTG A/- TCGCAAACTC 3070 het 3070 hom 18 8 7 3 A 1 0 127913 CASAVA_Build 10 7930512 13D ACCCCTTCCA GGTCCCTCGACCT/------------- GGTCCCTCGA 3070 het 3070 ref 30 12 12 10 GGTCCCTCGACCT 1 0 127914 CASAVA_Build 10 7932024 1D GAGTGAGAAG T/- TTACAGGCTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 3 2 127915 CASAVA_Build 10 7939749 6I TGATGTTTTT ------/GTTAAG GTTAAGAAAG 3070 het 2823 hom 32 8 18 6 GTTAAG 1 2 127916 CASAVA_Build 10 7946792 1D ATAGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 11 10 127917 CASAVA_Build 10 7958998 1I TGCTCACTAC -/T TTTTTTTTTT 2337 het 2337 ref 24 12 9 3 T 13 14 127918 CASAVA_Build 10 7966964 1D TTTTGTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 12 11 127919 CASAVA_Build 10 7970479 3D AGATCTTCTA AAG/--- AAGATGTGGA 3070 het 3070 ref 48 28 17 3 AAG 2 1 127920 CASAVA_Build 10 7970975 1I GTTGAGGCAC -/T TTTTTTTTTC 910 het 910 ref 42 34 3 5 T 9 10 127921 CASAVA_Build 10 7982981 41I GTGCTTGTGG -----------------------------------------/TGAATCTTTCCAGGTGTTCACTTTTTTTTTTAAACCTAGAC TGATCATCCA 3070 hom 60 het 17 0 21 0 TGAATCTTTCCAGGTGTTCACTTTTTTTTTTAAACCTAGAC 0 1 127922 CASAVA_Build 10 7986465 1I CCTGATACAC -/A GCATTTATCT 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 A 0 1 127923 CASAVA_Build 10 8009943 2D GCTCCCCCAC TT/-- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 10 8 127924 CASAVA_Build 10 8011229 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1865 hom 24 7 11 6 T 10 11 127925 CASAVA_Build 10 8015068 1D TAAAGCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 11 10 127926 CASAVA_Build 10 8028687 1D GTAAGACCCT G/- GTCTCAAACG 232 het 232 ref 26 15 1 11 G 2 1 127927 CASAVA_Build 10 8031729 1I CTATAAAACA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 7 8 127928 CASAVA_Build 10 8039948 1D AAATTTTGCA G/- TTTTATAATA 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 G 1 0 127929 CASAVA_Build 10 8049206 1D CATTTATCCC T/- TGTGTACCTA 3070 het 3070 hom 56 23 25 8 T 2 1 127930 CASAVA_Build 10 8053422 1D ATATATGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 276 hom 31 2 20 10 T 15 14 127931 CASAVA_Build 10 8057040 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAG 3070 het 1123 hom 18 5 10 4 A 22 9 127932 CASAVA_Build 10 8059494 1D ACGTAAAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 10 9 127933 CASAVA_Build 10 8061332 1D AAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 324 hom 27 2 21 5 A 14 13 127934 CASAVA_Build 10 8072006 2D TAAAATTAAC TG/-- TATCTATTTT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 TG 1 0 127935 CASAVA_Build 10 8078742 1D TCCACCTCCT G/- GGCTCAAGCT 3070 het 3070 hom 23 7 15 1 G 3 2 127936 CASAVA_Build 10 8101256 4D AGAAAGTGAA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 TATT 5 4 127937 CASAVA_Build 10 8123277 1I TCCTGAAAGG -/A GAGTTTAACA 3070 het 2304 hom 17 5 8 4 A 0 1 127938 CASAVA_Build 10 8142505 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 10 11 127939 CASAVA_Build 10 8144303 1D AATGTGGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 86 hom 25 1 12 12 A 11 10 127940 CASAVA_Build 10 8146265 7D9M2D TTTCTTTCTT TCTTTTCTTCTTCTTCTT/-------TTCTTCTTC-- TTTTTTTTTT 1909 het 1909 ref 34 11 11 14 N/A 0 0 127941 CASAVA_Build 10 8146908 3D TATAAGGAAG ACA/--- ACTTATAGGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ACA 1 0 127942 CASAVA_Build 10 8148047 1I GTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 8 9 127943 CASAVA_Build 10 8148415 5D TTCTTTCTTT CTTTC/----- TTTTTTTTTT 569 het 569 ref 33 7 6 20 CTTTC 1 0 127944 CASAVA_Build 10 8149006 1D TAGCTCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 23 17 7 A 12 11 127945 CASAVA_Build 10 8150144 1I AAAGTGAAAG -/A AAAAATCTCT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 5 6 127946 CASAVA_Build 10 8151857 1D GTTTATAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 A 12 11 127947 CASAVA_Build 10 8156248 1I TAGTGCTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 34 1 27 6 A 10 11 127948 CASAVA_Build 10 8158997 1D ACCTTTTTTT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 A 7 6 127949 CASAVA_Build 10 8164222 1I CAGTGCATGG -/C CCTTTCCTGC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 2 3 127950 CASAVA_Build 10 8175719 1I GAATTGGGCC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2680 hom 37 9 22 6 T 8 9 127951 CASAVA_Build 10 8185367 6D GGCTGGAGGC GGGGGG/------ GGGGGGGTTG 1546 hom 26 het 10 0 6 4 G 13 7 127952 CASAVA_Build 10 8190220 1I AACACGTTTT -/A TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 0 1 127953 CASAVA_Build 10 8194626 2D CCCTATAAAC TG/-- TGCGTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 TG 2 1 127954 CASAVA_Build 10 8201776 1I ATTATTGCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 A 9 10 127955 CASAVA_Build 10 8212333 1I CCACAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 16 8 T 11 12 127956 CASAVA_Build 10 8219283 1D TGGTTCACAT C/- TATATCCCTG 3070 het 3070 hom 48 24 22 2 C 1 0 127957 CASAVA_Build 10 8220762 2I TTTTCATCTA --/TT TTTTTTTTTT 1877 het 1756 hom 46 7 15 24 T 15 17 127958 CASAVA_Build 10 8221084 1D CCAAAGCAAC T/- GTCCTGGAGA 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 1 0 127959 CASAVA_Build 10 8223442 4D CCAGAGTGAT AGAA/---- AGAGTCCTAG 3070 het 3070 hom 26 9 10 8 AGAA 1 0 127960 CASAVA_Build 10 8235163 1I CTTTTAAAGG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 7 8 127961 CASAVA_Build 10 8263892 1D TCTAAGCTCC T/- TTTAGCCCTG 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 T 4 3 127962 CASAVA_Build 10 8265430 1D TTGTGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 11 10 127963 CASAVA_Build 10 8269177 1I TCTGCTTTTC -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 T 7 8 127964 CASAVA_Build 10 8279588 1I GCAAGAGTGC -/A AAATTGATGC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 3 4 127965 CASAVA_Build 10 8283376 3D GATTTTAGCA AAG/--- GAGGAATGAA 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 AAG 1 0 127966 CASAVA_Build 10 8283498 1I TGATAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 11 12 127967 CASAVA_Build 10 8288223 1D TTACCCTCTT A/- GAAATTACTA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 1 0 127968 CASAVA_Build 10 8304210 1I TTATTACAAC -/T TTTTTTTTTT 2062 het 2062 ref 23 8 5 10 T 15 16 127969 CASAVA_Build 10 8310444 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3066 hom 31 10 10 11 T 12 11 127970 CASAVA_Build 10 8314146 1I GTGAAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 10 11 127971 CASAVA_Build 10 8352587 1I GGACAAAAAC -/A TGCAACTTCA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 0 1 127972 CASAVA_Build 10 8368719 1I GCAAATGCTA -/T TTTTTTGACA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 6 7 127973 CASAVA_Build 10 8368833 3D GTTTTTGTTG TGA/--- TTGTTGTGAT 3070 hom 72 het 32 0 24 9 TGA 1 0 127974 CASAVA_Build 10 8392779 1I TAGAGAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 A 9 10 127975 CASAVA_Build 10 8399912 1I AAGTATTTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 39 0 37 2 T 9 10 127976 CASAVA_Build 10 8401922 14D CTATTGCCCA GGCTGGAGTGCAGT/-------------- GGCACCATAT 367 het 367 ref 29 15 2 15 GGCTGGAGTGCAGT 1 0 127977 CASAVA_Build 10 8420016 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2464 het 1449 hom 16 5 6 6 A 14 12 127978 CASAVA_Build 10 8428843 1D TCCTGTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 32 1 26 6 A 12 11 127979 CASAVA_Build 10 8433798 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2458 hom 24 het 10 0 9 2 A 15 11 127980 CASAVA_Build 10 8435403 1I AACTTTCCAA -/G TAGATCCAGT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 0 1 127981 CASAVA_Build 10 8435516 2D CCACCATGCT AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 A 10 8 127982 CASAVA_Build 10 8443840 1D AGTTATTCTT G/- GACAGAAAAA 3070 hom 162 het 57 0 54 5 G 2 1 127983 CASAVA_Build 10 8447399 1I TCCTTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 25 1 19 5 T 10 11 127984 CASAVA_Build 10 8454703 1D GTGGCAGAGT G/- TGAGAATTTG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 G 1 0 127985 CASAVA_Build 10 8464909 1I TCACCCTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 35 1 28 6 A 10 11 127986 CASAVA_Build 10 8466898 4I ACTCTGTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AAAC 3 4 127987 CASAVA_Build 10 8469460 1I GCTTTTTTTT -/C TTTCCTTTTT 3070 hom 6 het 18 1 16 1 C 0 1 127988 CASAVA_Build 10 8474074 1I GGGTAGTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 9 10 127989 CASAVA_Build 10 8477753 1I TAACTAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 9 10 127990 CASAVA_Build 10 8486496 1I TTGCTTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 28 0 20 8 T 13 14 127991 CASAVA_Build 10 8495508 2D ACTTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 16 14 127992 CASAVA_Build 10 8497765 1D ATGATGTGGC A/- AGTAAAGATG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 2 1 127993 CASAVA_Build 10 8507407 1D GGGTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 9 T 11 10 127994 CASAVA_Build 10 8510094 1D TAACATGGTG A/- AACCTTGCCT 2439 het 2341 hom 12 6 5 1 A 3 2 127995 CASAVA_Build 10 8511117 1D AAGTTTTGAG T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 T 7 6 127996 CASAVA_Build 10 8517699 1I GCCAATGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1370 hom 37 3 27 7 T 9 10 127997 CASAVA_Build 10 8520483 1D TGAAAGCATT A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 7 6 127998 CASAVA_Build 10 8523713 1I CAGGATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 18 19 10 T 10 11 127999 CASAVA_Build 10 8525441 1I CCCTATCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 991 hom 39 4 19 16 A 15 16 128000 CASAVA_Build 10 8526917 2I TCTCTCTCTC --/TT GATCTGAGGT 3070 het 1872 hom 33 7 21 5 T 0 2 128001 CASAVA_Build 10 8528783 1I TTTTTTTTTT -/C TCTTTTTTAA 3070 het 2121 hom 23 8 10 5 C 0 1 128002 CASAVA_Build 10 8533783 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 26 2 13 11 T 17 16 128003 CASAVA_Build 10 8534581 4I TTCCTCCCTC ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 hom 69 het 31 0 20 11 CCTT 4 5 128004 CASAVA_Build 10 8542587 2D CTCGGCCTCG CA/-- AAGTGCTGGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CA 1 0 128005 CASAVA_Build 10 8542945 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAACA 1150 het 48 hom 36 2 12 22 A 9 8 128006 CASAVA_Build 10 8545633 1D TCCGCAGAAA C/- CCCATGGAAA 3070 hom 108 het 40 0 35 6 C 4 3 128007 CASAVA_Build 10 8551414 2D CCAAAATACA GT/-- GTTAAAGAGT 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 GT 2 1 128008 CASAVA_Build 10 8552230 1I AAAAATCGAA -/G AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 G 0 1 128009 CASAVA_Build 10 8552954 1I GAAAAAGCGA -/C AAAAAAAGCA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 0 1 128010 CASAVA_Build 10 8553340 2I53M2D AAAACAATTT --AGTGATTCCTATATTCTTGTGACAGGTCAGAGCCCATATATTTGGGTTTTTTGTT/ACAGTGATTCCTATATTCTTGTGACAGGTCAGAGCCCATATATTTGGGTTTTTTG-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 18 20 13 N/A 0 0 128011 CASAVA_Build 10 8557301 1I AATTAATATA -/T TGTTTGAAAC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 1 2 128012 CASAVA_Build 10 8558606 1I GACTTTTGAT -/A AAAAGAATGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 5 128013 CASAVA_Build 10 8567629 2D GATTCTCATG AC/-- TACTCCCACA 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 AC 1 0 128014 CASAVA_Build 10 8567725 1D CTCTCGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 13 12 128015 CASAVA_Build 10 8570608 1D ACAATTGGGC T/- GAAATGGTGA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 1 0 128016 CASAVA_Build 10 8575228 6D TTTCTTTTTC TTTTGT/------ TTTTTTTTTT 2153 hom 18 het 10 0 7 5 TTTTGT 1 0 128017 CASAVA_Build 10 8577745 9I TTCTTTTCTC ---------/TTTTTCTTT TTTTTCTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TTTTTCTTT 1 2 128018 CASAVA_Build 10 8580295 3D AACATAGGAG GTT/--- GTTGTTGTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 8 GTT 4 3 128019 CASAVA_Build 10 8582223 2D CCTCTCTCTC TT/-- TCTTTCTTTC 195 het 131 hom 17 2 2 14 T 3 1 128020 CASAVA_Build 10 8582526 6D TCCCTATTGA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 41 1 33 8 T 22 16 128021 CASAVA_Build 10 8583958 1D TACACAAAAC A/- TTGAAACAAC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 0 128022 CASAVA_Build 10 8584156 1D TATCAGGAAA C/- CAAAATGTTA 3070 het 3070 hom 46 22 22 3 C 2 1 128023 CASAVA_Build 10 8584306 1D TGAAAAGTCA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 21 hom 39 3 33 4 T 4 3 128024 CASAVA_Build 10 8585242 1D TTTTTCACCC A/- AAGAAAATAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 3 2 128025 CASAVA_Build 10 8585749 3D AAACTTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 35 4 18 13 T 17 14 128026 CASAVA_Build 10 8589975 1I GCTATAGACA -/T TTTTTATTGA 3070 het 3062 hom 22 7 13 2 T 5 6 128027 CASAVA_Build 10 8592558 4I ACCAACTTGC ----/TTTA TTTACATTTG 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 TTTA 1 2 128028 CASAVA_Build 10 8597896 1I CCATCTCAAC -/A AAAAAAAAAA 3019 het 698 hom 21 3 14 4 A 15 16 128029 CASAVA_Build 10 8600156 1D GTATTTATTC A/- AATATTAGAT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 3 2 128030 CASAVA_Build 10 8600664 1I TTACTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 A 10 11 128031 CASAVA_Build 10 8606079 1I AATTTTTTGA -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 6 7 128032 CASAVA_Build 10 8606764 1I TATTTATTTA -/T TTTTATTTAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 4 5 128033 CASAVA_Build 10 8614057 1I GACTTCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 32 0 16 16 A 12 13 128034 CASAVA_Build 10 8618259 1D GATCAGAATG T/- TGTCAGAATC 3070 het 3070 ref 30 10 11 9 T 2 1 128035 CASAVA_Build 10 8623187 1D AATTTACAAA G/- AAAAGAGGTT 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 G 1 0 128036 CASAVA_Build 10 8632757 1D ATGTGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 12 17 T 15 14 128037 CASAVA_Build 10 8634717 1I ATTTTGGGGA -/G GGGGGTCACA 3070 hom 115 het 42 0 39 3 G 5 6 128038 CASAVA_Build 10 8652194 1I TTCTCAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 23 1 17 5 A 14 15 128039 CASAVA_Build 10 8653650 1I TAATTTTTTT -/C GGTGTAACTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 128040 CASAVA_Build 10 8655899 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2911 het 605 hom 19 3 13 3 T 13 14 128041 CASAVA_Build 10 8658618 4D ATCAGATTCA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 TTTG 4 3 128042 CASAVA_Build 10 8664217 10I TAACTACACA ----------/CACACACACC CACACACACA 3070 het 3070 ref 47 16 15 16 CACACACACC 0 1 128043 CASAVA_Build 10 8665526 1D TTATGTCCAC A/- AAAAAACCAC 3070 hom 129 het 49 0 44 6 A 7 6 128044 CASAVA_Build 10 8679550 3I GCATATGCGG ---/TTA TTGTTACCAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TTA 0 1 128045 CASAVA_Build 10 8680634 2D TCTACTAAAA AT/-- ACAAAAAAAT 2749 hom 28 het 11 0 10 1 AT 1 0 128046 CASAVA_Build 10 8683857 1D ATTAAAAAAA T/- AATAATAACC 3070 hom 26 het 12 0 11 1 T 1 0 128047 CASAVA_Build 10 8684377 1I GAAGGGGGAA -/G GTCAGGCTGA 3070 hom 135 het 53 0 46 7 G 1 2 128048 CASAVA_Build 10 8686463 1I ATGTTACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 10 11 128049 CASAVA_Build 10 8690608 1D TCAATGAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 A 10 9 128050 CASAVA_Build 10 8815127 8D3M3D ATACCACCAC TTTGGGAGGCCAAG/--------GCC--- GCAGGTGGAT 3070 het 3070 ref 28 13 17 5 N/A 0 0 128051 CASAVA_Build 10 8819638 3D TGGAGCCTTT ACA/--- ACATTTCAGA 3070 het 3070 hom 45 19 22 5 ACA 2 1 128052 CASAVA_Build 10 8820632 8D AAAAATGCTG GGCTCAGT/-------- GGCTCACACC 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 GGCTCAGT 1 0 128053 CASAVA_Build 10 8822551 7D TTTCTGGCAT ATGGCAA/------- ATGGCAAACA 3070 het 3070 hom 45 21 22 4 ATGGCAA 2 1 128054 CASAVA_Build 10 8827573 2I TATGCACTTC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 TA 6 7 128055 CASAVA_Build 10 8831235 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 475 hom 42 2 34 6 A 10 11 128056 CASAVA_Build 10 8839582 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 T 7 6 128057 CASAVA_Build 10 8839972 1D TTGCAATATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 50 25 19 8 T 9 8 128058 CASAVA_Build 10 8840857 1D TAAACTTAAA T/- TTTAGTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 22 8 T 4 3 128059 CASAVA_Build 10 8842267 2I AGAATATTTG --/AC AACATATTAT 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 AC 0 1 128060 CASAVA_Build 10 8845843 5I CTATCCCTCT -----/CAAAA CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 CAAAA 2 3 128061 CASAVA_Build 10 8848316 1I AATATCATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 A 9 10 128062 CASAVA_Build 10 8854025 1I GATATGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 A 10 11 128063 CASAVA_Build 10 8855894 2D GAGGCTCCTC AG/-- AGACATCTGA 3070 het 3070 ref 38 24 13 2 AG 2 1 128064 CASAVA_Build 10 8858031 1D AATAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 51 0 39 12 A 11 10 128065 CASAVA_Build 10 8861273 1D TTAAATGATC A/- ATGTTGGAGA 3070 het 3070 ref 56 28 23 5 A 2 1 128066 CASAVA_Build 10 8862373 1I TATTTCTTTA -/C CCATTTTCCA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 C 2 3 128067 CASAVA_Build 10 8865837 3I TCGCACCTAC ---/ACT ACAATTGAGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ACT 0 1 128068 CASAVA_Build 10 8868928 2D GTCATCAGGT AC/-- AGTTAATTCA 3070 het 3070 ref 49 25 18 8 AC 1 0 128069 CASAVA_Build 10 8871851 1I AGCCTGAGGA -/C CCCCCCAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 C 6 7 128070 CASAVA_Build 10 8874560 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 260 hom 37 1 31 5 T 8 9 128071 CASAVA_Build 10 8875756 1D ATATCTCTCT C/- TTTTTTTTTA 569 het 569 ref 34 23 2 9 C 1 0 128072 CASAVA_Build 10 8882996 2D GATAATTCAC TG/-- TGTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 TG 2 1 128073 CASAVA_Build 10 8887185 1D CCTTTAGTTT C/- CTCCCAGGCC 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 C 2 1 128074 CASAVA_Build 10 8890245 1D TGCTCCTTAC T/- ACTGTACACG 3070 het 3070 hom 51 20 25 7 T 1 0 128075 CASAVA_Build 10 8890376 1I CTTGCTTGTC -/T TATGTCTGCA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 1 2 128076 CASAVA_Build 10 8892987 1I AAGCTCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 6 A 10 11 128077 CASAVA_Build 10 8897620 1I ATCCTCGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 37 0 27 10 T 9 10 128078 CASAVA_Build 10 8899830 1D TTTAAAATCC T/- TTGAAAGTAA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 T 3 2 128079 CASAVA_Build 10 8902134 4D CAACATCTGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 90 het 38 0 31 8 AT 8 6 128080 CASAVA_Build 10 8905379 10D TCTCTCTCTT TCTCTCTCTC/---------- TCTCTCTCTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TC 15 10 128081 CASAVA_Build 10 8909127 1D GCTGCACAGA T/- TTTAAGAGGA 3070 hom 111 het 43 0 37 8 T 4 3 128082 CASAVA_Build 10 8909340 3D AAAAATAATT ATC/--- ATTTATAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATC 1 0 128083 CASAVA_Build 10 8913103 1D AGAATCTCAA G/- GAAAAGAATT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 2 1 128084 CASAVA_Build 10 8919579 1D GACATGCCCA G/- AAATAATGTT 3070 het 3070 hom 48 19 20 10 G 1 0 128085 CASAVA_Build 10 8925782 1D ACTGTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 12 11 128086 CASAVA_Build 10 8943678 2D GCATCTCCTC CA/-- GTTTTATTTT 3070 hom 80 het 31 0 26 5 CA 1 0 128087 CASAVA_Build 10 8945494 1D TTTTCAGCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 46 0 36 10 T 10 9 128088 CASAVA_Build 10 8948179 5D AAATGGCTTT GTTAA/----- GCAAAATCTC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 GTTAA 1 0 128089 CASAVA_Build 10 8953107 6D TCTGTTGACC TTAATA/------ TTAATATTAA 3070 hom 39 het 20 0 14 7 TTAATA 2 1 128090 CASAVA_Build 10 8953976 1I AAAATATCTA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 6 7 128091 CASAVA_Build 10 8964143 2D TTTTTTTTTT TC/-- CTTTGGTGAG 3070 het 87 hom 26 1 20 6 TC 1 0 128092 CASAVA_Build 10 8984822 3I ATAACAATAC ---/TGT TGTTGTTATA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 TGT 2 3 128093 CASAVA_Build 10 8996096 1I TCTTTTTAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 10 128094 CASAVA_Build 10 8998719 2D ACTCAGAAAC AG/-- AAAGTCAAAC 3070 hom 163 het 57 0 55 6 AG 1 0 128095 CASAVA_Build 10 9000756 3D TAAATAATGT GAA/--- GAAGAAGTCC 3070 hom 150 het 54 0 45 9 GAA 3 2 128096 CASAVA_Build 10 9001951 2I TGTACATGTT --/TA TATATATATA 3070 het 1682 hom 26 5 20 1 TA 7 8 128097 CASAVA_Build 10 9003200 1D GCAAAAAAAA C/- AAAGAAAAAA 1887 het 66 hom 29 1 12 16 C 1 0 128098 CASAVA_Build 10 9023635 3I CCCAGCTAAT ---/TTG TTGTTGTTAA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 TTG 2 3 128099 CASAVA_Build 10 9027340 5I AGTGAGCATC -----/CTTGT CTTGTTCTAG 3070 hom 135 het 50 0 46 4 CTTGT 1 2 128100 CASAVA_Build 10 9040266 1D CTTAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 195 hom 21 1 15 5 A 15 14 128101 CASAVA_Build 10 9047807 1D GAAAAGCGAC T/- GGATTTAGCA 3070 hom 135 het 54 0 45 9 T 1 0 128102 CASAVA_Build 10 9053304 1D AAACAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 40 0 37 5 A 12 11 128103 CASAVA_Build 10 9069401 1I ACAAAGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 37 2 31 4 A 12 13 128104 CASAVA_Build 10 9070314 1D CAAGATTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 12 11 128105 CASAVA_Build 10 9073053 5D TTTAGCTTTC CTAAA/----- CTAAATAGTT 3070 hom 39 het 14 0 14 3 CTAAA 2 1 128106 CASAVA_Build 10 9081066 1D AGGCATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 41 1 29 11 T 12 11 128107 CASAVA_Build 10 9081835 1I CACTGCTCCA -/G GCCAGTCAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 1 2 128108 CASAVA_Build 10 9083203 1D GAAAATGAAC G/- GGCCGGGCGC 3070 hom 42 het 16 0 13 3 G 3 2 128109 CASAVA_Build 10 9085270 1I AAAGTGAGGA -/G GGAGAGAGGC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 2 3 128110 CASAVA_Build 10 9093843 1D GAGAAATAAA T/- TTGTCTTTAA 3070 het 3070 ref 43 27 11 5 T 3 2 128111 CASAVA_Build 10 9098360 1I TTCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 10 11 128112 CASAVA_Build 10 9107551 1D ATTATGTGTG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 8 7 128113 CASAVA_Build 10 9116020 1I AAGAAGCCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 9 10 128114 CASAVA_Build 10 9124005 1I TGCAATATAT -/G TCTTTACTAA 3070 hom 157 het 57 0 53 4 G 0 1 128115 CASAVA_Build 10 9124969 2D GTTTATATTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 39 hom 32 2 16 15 A 11 9 128116 CASAVA_Build 10 9125720 2D CTGTAATGAA TT/-- TTTTATGTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 6 4 128117 CASAVA_Build 10 9126407 1D ACAAATAAGA T/- TGCTAAGATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 1 128118 CASAVA_Build 10 9133101 4D ATATATAAAT TATA/---- TATATATATA 2396 hom 18 het 8 0 7 1 TA 8 6 128119 CASAVA_Build 10 9137161 5I TTAAAACCTC -----/ATATT ATATCTTAAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATATT 0 1 128120 CASAVA_Build 10 9137756 50D AAGGCTGAAT CATATTTTACTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------------------- TATATTTCAC 3070 hom 69 het 24 0 24 1 CATATTTTACTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 128121 CASAVA_Build 10 9145517 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 25 1 17 8 A 15 14 128122 CASAVA_Build 10 9146247 1I AACTCTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1674 hom 46 4 31 11 T 11 12 128123 CASAVA_Build 10 9157178 1I GACTTTGTTT -/A AAAAAATCTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 6 7 128124 CASAVA_Build 10 9172415 2I TTACTTGCCC --/AA AGTCATAAGC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 1 3 128125 CASAVA_Build 10 9174574 1D TTTCTTTATT G/- CCTTTTTCAT 3070 hom 86 het 37 0 29 8 G 1 0 128126 CASAVA_Build 10 9175880 1D ATGCAGTCAT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 151 het 55 0 50 5 A 7 6 128127 CASAVA_Build 10 9178026 2D GTGTTGAAAC AT/-- GTGTCAAAGA 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 AT 1 0 128128 CASAVA_Build 10 9190733 2D ATCCCGGCTA AC/-- ACAGTGAAAC 2438 hom 17 het 9 0 6 4 AC 2 1 128129 CASAVA_Build 10 9192381 2I TATATGTATT --/TA TATATATATA 3070 hom 46 het 17 0 16 1 TA 5 6 128130 CASAVA_Build 10 9195865 4I CTCTGATCTC ----/CTTA CTAATATTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CTTA 0 1 128131 CASAVA_Build 10 9201321 1I CTTGAGCAGC -/A ATGTTTTAAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 1 2 128132 CASAVA_Build 10 9216877 1D CTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 11 10 128133 CASAVA_Build 10 9232133 4D AAGATAAAAC ACTT/---- ACTAGTCAGT 3070 het 3070 ref 43 24 19 0 ACTT 1 0 128134 CASAVA_Build 10 9233666 1I TGAAAAAACT -/G GATGTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 G 1 2 128135 CASAVA_Build 10 9240960 1D GACATATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 18 8 A 11 10 128136 CASAVA_Build 10 9242395 9D CACAGGCCCA GAGGCCTAG/--------- GAGGCAAGAA 3070 het 3070 ref 37 21 13 6 GAGGCCTAG 1 0 128137 CASAVA_Build 10 9243165 1D AAATAACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 10 13 T 12 11 128138 CASAVA_Build 10 9245962 1I CCCTCCAAAG -/T GATGAGTAGA 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 T 0 1 128139 CASAVA_Build 10 9250444 1D CTTGATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2332 hom 38 12 20 6 A 16 15 128140 CASAVA_Build 10 9259134 1I TTTTTCTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1063 hom 25 5 15 5 G 0 1 128141 CASAVA_Build 10 9261211 3D TGCCTTTTTC AAT/--- AATAATGCCT 3070 het 3070 hom 34 11 21 3 AAT 3 2 128142 CASAVA_Build 10 9288881 1I AAATTTAAAA -/T TTAAAAGTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 128143 CASAVA_Build 10 9352031 2D CAGAAATTAG AA/-- AAGTGATTCC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 4 2 128144 CASAVA_Build 10 9356406 12I TGGGGAGAAT ------------/GTGGAGTTATTA GTCAAGGGGC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 GTGGAGTTATTA 0 1 128145 CASAVA_Build 10 9357328 3D CATGACCCAT CAA/--- CCACCACCAC 3070 het 3070 hom 40 18 16 7 CAA 1 0 128146 CASAVA_Build 10 9361621 3D TAATAATAAC AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 26 12 14 0 AAT 6 5 128147 CASAVA_Build 10 9370697 2D CACACAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3001 het 1503 hom 31 11 10 11 A 17 15 128148 CASAVA_Build 10 9384389 2I ACAAGTAAAC --/TT TATCATATAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 1 3 128149 CASAVA_Build 10 9395142 1D ATAACAAATG A/- AAAAAAACTA 3070 het 2883 hom 26 7 16 4 A 8 7 128150 CASAVA_Build 10 9399335 4I AAAATAAAAT ----/TGAG TTTCTGATCA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 TGAG 0 1 128151 CASAVA_Build 10 9399436 1D TGGAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2537 hom 24 7 15 2 A 11 10 128152 CASAVA_Build 10 9400553 1I TAATATATAT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 6 7 128153 CASAVA_Build 10 9401003 2I GAAGCAATGA --/AT ATATATACAT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 AT 3 4 128154 CASAVA_Build 10 9410332 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 A 11 10 128155 CASAVA_Build 10 9412327 2I ATGAGCAAGT --/TC TCTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 TC 3 4 128156 CASAVA_Build 10 9414107 2I AATCCTTGTC --/TT TGTGTCCAGG 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 1 3 128157 CASAVA_Build 10 9422592 1I GAGAAAAAAA -/T GTCTCTATAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 0 1 128158 CASAVA_Build 10 9423337 1I AATTAAACTT -/A AAAAATGAAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 5 6 128159 CASAVA_Build 10 9425800 1I GGTTCTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1680 hom 24 4 13 7 T 15 16 128160 CASAVA_Build 10 9428495 1D TTATCTGCAA C/- CATCTTCCTT 3070 het 3070 ref 67 29 30 8 C 2 1 128161 CASAVA_Build 10 9433347 2I TTGCTTTATT --/TA CTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 TA 0 1 128162 CASAVA_Build 10 9434811 1D AGCACCCGAC T/- TCCCTACTTA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 2 1 128163 CASAVA_Build 10 9438488 15I AGGTTGCAGT ---------------/GAGCTGAGATTGCAC CCTTGCACTC 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 GAGCTGAGATTGCAC 0 1 128164 CASAVA_Build 10 9438529 1D20M5D ACGCCAGCTC AAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAG/-AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA----- AGAGAGAGAG 2818 het 1688 hom 20 10 8 10 N/A 0 0 128165 CASAVA_Build 10 9439598 1I GCTGGAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 A 10 11 128166 CASAVA_Build 10 9442508 1I CTGTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 2066 het 2066 ref 25 9 6 10 T 14 15 128167 CASAVA_Build 10 9442562 1D57M3D ACTGTTTAGA TTTTTTTTTATAAACTCGCTAAAGCATTTTATTTGCAAACTAAAATGATATAGAAAAATTG/-TTTTTTTTATAAACTCGCTAAAGCATTTTATTTGCAAACTAAAATGATATAGAAAAA--- TTGTCAATAA 3070 het 3070 ref 33 27 21 4 N/A 0 0 128168 CASAVA_Build 10 9443460 5I GTTCTAAGAC -----/AGACG AGACAATACA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 AGACG 0 1 128169 CASAVA_Build 10 9450716 1D GAAATCTCCA T/- GAATAACTTA 3070 het 3070 hom 52 25 25 2 T 1 0 128170 CASAVA_Build 10 9451195 1D TTATAAGTAA T/- TTTTTCCCAA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 T 6 5 128171 CASAVA_Build 10 9451431 1I TGGATAAGGT -/A AAAATATGAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 4 5 128172 CASAVA_Build 10 9458532 5D GGAGGGTTTT CTTTC/----- CTTTCACTGC 3070 het 3070 ref 50 21 18 12 CTTTC 2 1 128173 CASAVA_Build 10 9460540 1I TATTCATTGC -/A AAGGGGTAAG 3070 hom 75 het 26 0 23 3 A 2 3 128174 CASAVA_Build 10 9473723 1D AGACTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2856 het 2856 ref 19 9 6 4 A 13 12 128175 CASAVA_Build 10 9476196 62D CCACAGACTG GGTGACTTACTAAACAACATGAATTTATCTCTCACTCTTCTGGATGCTGGAAGTCCCAAGAT/-------------------------------------------------------------- CAGGGTGCCA 2122 het 2122 ref 35 44 10 2 GGTGACTTACTAAACAACATGAATTTATCTCTCACTCTTCTGGATGCTGGAAGTCCCAAGAT 1 0 128176 CASAVA_Build 10 9476739 1I CTGACATTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 9 12 12 A 9 10 128177 CASAVA_Build 10 9479673 1I TTGATAAATA -/G ATTATTTTAT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 G 0 1 128178 CASAVA_Build 10 9492445 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 11 10 128179 CASAVA_Build 10 9497435 12I TTTCTGACCT ------------/TTGTTATTCAGA CAGCTTTCCA 3070 hom 116 het 45 0 37 8 TTGTTATTCAGA 0 1 128180 CASAVA_Build 10 9529328 1I AAGCTGTCTG -/T TTTTTTTTTT 2291 het 2291 ref 24 12 8 4 T 11 12 128181 CASAVA_Build 10 9535672 5I TTATGTCTGT -----/CTTTA CTTTAATCTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CTTTA 1 2 128182 CASAVA_Build 10 9540941 3D CTGTGGTCAA AAC/--- AAGATAAGAA 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 AAC 1 0 128183 CASAVA_Build 10 9548262 1I TAAATGTTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 9 10 128184 CASAVA_Build 10 9548345 1D ATGGAAAAAA C/- ATCCCATATT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 C 1 0 128185 CASAVA_Build 10 9549785 1I GGGTTGGGGT -/G GGGGGTGGGA 3070 hom 60 het 27 0 14 13 G 5 6 128186 CASAVA_Build 10 9551357 4D TGGAAAAATT TAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 TAAA 1 0 128187 CASAVA_Build 10 9556635 4I TATAATTGTG ----/TATA TATATATGTA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TA 3 5 128188 CASAVA_Build 10 9557629 1D GAGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 14 13 128189 CASAVA_Build 10 9557763 2D TTTCTCAATT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 87 het 32 0 29 4 TC 10 9 128190 CASAVA_Build 10 9558396 1D GTAAAGCATC A/- AAAACAACTT 3070 hom 129 het 45 0 44 2 A 5 4 128191 CASAVA_Build 10 9559526 1D ATGCAAGTTT A/- AAAGCTACAT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 4 3 128192 CASAVA_Build 10 9559584 2D ATATTAAAAC AG/-- ATTATTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 AG 1 0 128193 CASAVA_Build 10 9570487 1D CAGAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 11 10 128194 CASAVA_Build 10 9571022 1D TGACAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 A 11 10 128195 CASAVA_Build 10 9587506 2I ACACTGGCGT --/GC GCGCGCGCAC 3070 het 2956 hom 51 15 17 19 GC 4 5 128196 CASAVA_Build 10 9618015 1I ATGTTCACGT -/A AATTGGGAGG 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 A 2 3 128197 CASAVA_Build 10 9621961 1D TTATCTTATT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 32 19 13 0 A 9 8 128198 CASAVA_Build 10 9637020 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 12 1 9 2 T 11 10 128199 CASAVA_Build 10 9650021 7D TGGGAACACA CAACCTC/------- CTGAGATTGA 3070 het 3070 ref 33 23 10 2 CAACCTC 1 0 128200 CASAVA_Build 10 9652831 1I TTTGAGCCTA -/T TTTTTTTTTT 1113 het 1113 ref 50 35 3 12 T 10 11 128201 CASAVA_Build 10 9656831 1D TAGGTAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 16 16 11 A 10 9 128202 CASAVA_Build 10 9660423 3I ATGGAAAATT ---/GGA GTAGTAATAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 GGA 0 1 128203 CASAVA_Build 10 9683182 1D GAGGGGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2881 hom 33 9 10 14 A 15 14 128204 CASAVA_Build 10 9683438 1D AAGAGAGTTT G/- GGGGGGTGAT 3070 hom 96 het 37 0 32 7 G 7 6 128205 CASAVA_Build 10 9691379 1I CACTTGGTTA -/G CTGTGAATTA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 G 0 1 128206 CASAVA_Build 10 9692712 1I GAAGAATATC -/T CTATGAACTG 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 0 1 128207 CASAVA_Build 10 9711322 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 36 1 30 5 T 10 11 128208 CASAVA_Build 10 9723827 1D GTGACATGGG A/- AAATAATCAC 3070 het 3070 hom 19 7 11 1 A 4 3 128209 CASAVA_Build 10 9738194 1I ATTCAGCTCA -/T TTTTTTTTTT 1739 het 1739 ref 35 17 5 13 T 13 14 128210 CASAVA_Build 10 9745105 3I TTCTCTTTTT ---/AGG TGGAGATTAC 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 AGG 0 1 128211 CASAVA_Build 10 9767540 1D TGTAATATGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 10 9 128212 CASAVA_Build 10 9768952 1I TAAAATGGAT -/G TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 G 0 1 128213 CASAVA_Build 10 9773406 41I AGGAAAATGT -----------------------------------------/ATACATTACATTAGTATACATACTGTATACATAATGTATAC ATACATTAGT 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 ATACATTACATTAGTATACATACTGTATACATAATGTATAC 0 1 128214 CASAVA_Build 10 9779314 4D ATTATTTTGG CAAA/---- CAAGCCGTCT 3070 het 3070 ref 50 26 20 9 CAAA 1 0 128215 CASAVA_Build 10 9781054 1D AATACATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 7 A 15 14 128216 CASAVA_Build 10 9782952 1D CAGAGTACTG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 1638 hom 19 4 13 3 T 9 8 128217 CASAVA_Build 10 9800768 1D ATACTCTATG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 A 7 6 128218 CASAVA_Build 10 9804863 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2355 het 2355 ref 31 15 8 8 T 11 12 128219 CASAVA_Build 10 9820621 4I GAAAAAAAAC ----/ACTT ACATGTGGAG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 ACTT 0 1 128220 CASAVA_Build 10 9821699 1I ATTCAAATAC -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 6 7 128221 CASAVA_Build 10 9836996 2I ATGTTCAGGC --/AG AGAGTGTGGA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 AG 2 3 128222 CASAVA_Build 10 9853763 1D AAAAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 11 10 128223 CASAVA_Build 10 9855110 1I ATATCCCTCC -/A AAAAATAATC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 5 6 128224 CASAVA_Build 10 9875688 4D15M2I AACCCTGATT AGCAATACATGCACACACA--/----ATTCATGTATATATATT CACACACATA 3070 het 3070 ref 32 17 18 2 N/A 0 0 128225 CASAVA_Build 10 9882228 4I CTTTTGGGTT ----/GTAA GTGAGTGTCA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 GTAA 0 1 128226 CASAVA_Build 10 9889946 1I CAGGCATGGG -/A ACCCTCCAGT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 1 2 128227 CASAVA_Build 10 9900697 1D AAATAACCAA T/- TTTTGGTTTC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 5 4 128228 CASAVA_Build 10 9920688 1I AATAAAAAAA -/T AATAGATGTT 3070 het 1629 hom 16 5 10 1 T 0 1 128229 CASAVA_Build 10 9942360 2I TGTTAACTTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 992 hom 68 3 52 13 TG 7 8 128230 CASAVA_Build 10 9948287 1D AGATGACTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 11 10 128231 CASAVA_Build 10 9951486 1I AAGTTGTGGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 8 9 128232 CASAVA_Build 10 9952470 1D GCTTTTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 721 hom 33 6 12 17 A 19 18 128233 CASAVA_Build 10 9960857 8D TTCAAATTTT TATTTATG/-------- TATTTATGTA 3070 het 3070 ref 31 12 9 11 TATTTATG 3 2 128234 CASAVA_Build 10 9962485 4D TTTCTATTTA TCTG/---- TCTGTCTGTC 3070 het 3070 ref 57 25 24 12 TCTG 4 3 128235 CASAVA_Build 10 9969761 2I TAGGTGTCTA --/CC AGAAATTTTC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 C 0 2 128236 CASAVA_Build 10 9974151 1D GAGGCCTTCT G/- GGAAATATAC 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 G 3 2 128237 CASAVA_Build 10 9975783 1I TCCCTGACGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1538 hom 31 4 23 4 T 12 13 128238 CASAVA_Build 10 9979907 2I CCAAATTAAC --/TG TGCAGAATTT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 TG 1 2 128239 CASAVA_Build 10 9980950 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 692 hom 37 5 24 8 A 12 11 128240 CASAVA_Build 10 9983799 7D GTATATTCCT TATAAAC/------- TATAGAGTCA 3070 het 3070 hom 45 22 22 3 TATAAAC 1 0 128241 CASAVA_Build 10 9984571 1I AAATGCATTT -/A TTGTGTATAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 0 1 128242 CASAVA_Build 10 9991790 1D TTGGCCCGTG T/- AAAAAATTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 1 0 128243 CASAVA_Build 10 9995033 5D TATTAAAAAT ATAAA/----- AAAAAAAAAA 1952 hom 24 het 11 0 9 2 ATAAA 1 0 128244 CASAVA_Build 10 9998731 1I ACTCCACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 10 11 128245 CASAVA_Build 10 10045690 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 ATA 5 4 128246 CASAVA_Build 10 10054803 1I TACTATAAAT -/A AAAACACTTA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 4 5 128247 CASAVA_Build 10 10061853 2I TAATCAAGAC --/AT AATAAAATCA 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 AT 0 1 128248 CASAVA_Build 10 10064051 1D TAAAAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 467 hom 37 1 13 23 T 12 11 128249 CASAVA_Build 10 10072386 1D GGTTGTGATC G/- TTGTATTGTG 3070 het 3070 ref 53 26 21 7 G 1 0 128250 CASAVA_Build 10 10072882 7D GTTCATCTTT CACCCCA/------- CACCCCACAC 3070 het 3070 ref 50 22 18 12 CACCCCA 3 2 128251 CASAVA_Build 10 10080088 1I GAAAAATAAG -/T GCCTCTTACT 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 T 0 1 128252 CASAVA_Build 10 10086612 4D TTAGAAACAT ACTC/---- AGGAAGTGGC 3070 het 3070 ref 48 27 18 4 ACTC 1 0 128253 CASAVA_Build 10 10089498 1D ATTTCTGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 17 11 11 A 10 9 128254 CASAVA_Build 10 10090976 5D GTTAAGAAAA TATAT/----- TAAAGTGTTC 3070 het 3070 hom 50 23 25 5 TATAT 1 0 128255 CASAVA_Build 10 10096850 3D CAATTGTGTT ATA/--- ATTGCCTGCA 3070 het 3070 ref 61 30 28 3 ATA 1 0 128256 CASAVA_Build 10 10100611 1D TTTTTACCAC A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 7 6 128257 CASAVA_Build 10 10104408 4I CCAGGAACTG ----/CTGC CTGCCTGCCT 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 CTGC 3 4 128258 CASAVA_Build 10 10107448 1I AAAAAAAAAA -/T GTATTCTTCC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 0 1 128259 CASAVA_Build 10 10112790 1I ACACACTGTC -/T TAGTAAGGAA 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 T 1 2 128260 CASAVA_Build 10 10127907 1D TTGCTGTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 9 8 128261 CASAVA_Build 10 10131951 10I ACTACCTGGG ----------/CATGGTGGCA CATGGTGGCA 2527 het 1171 hom 18 6 7 5 CATGGTGGCA 1 2 128262 CASAVA_Build 10 10143323 1D TTTGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 2891 het 2891 ref 51 34 8 9 T 13 12 128263 CASAVA_Build 10 10166705 1I GATTTTTTGT -/A CTTTAATTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 0 1 128264 CASAVA_Build 10 10219958 2D AAAATAAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 16 6 A 12 10 128265 CASAVA_Build 10 10256768 1D GCCAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 42 1 34 7 A 11 10 128266 CASAVA_Build 10 10262604 1I TTAAAACAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 8 128267 CASAVA_Build 10 10291128 1D TGCTGGCAAT G/- CCTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 G 1 0 128268 CASAVA_Build 10 10297672 1I AGAAAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 10 11 128269 CASAVA_Build 10 10298746 2D CGTTAATTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 30 het 30 1 23 6 TG 10 9 128270 CASAVA_Build 10 10312339 1D CTATCTTGGC A/- AATGACTCTG 3070 hom 126 het 46 0 42 6 A 3 2 128271 CASAVA_Build 10 10313999 6D GCTTGCAAAG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 26 10 T 17 11 128272 CASAVA_Build 10 10314799 2D TTGTGATGAG AA/-- AAAATATATA 3070 het 103 hom 29 1 25 3 A 6 4 128273 CASAVA_Build 10 10316614 1D TTAATTTTAC T/- TTTTTTGTTA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 7 6 128274 CASAVA_Build 10 10318011 1I TTACTCACCG -/C CCCCCCCCAA 3070 het 350 hom 44 1 35 8 C 8 9 128275 CASAVA_Build 10 10327832 1D35M4D TATATTTGGA TTTTTTTATTTTTAAAATAAAGTTATTAAACATATTTTAC/-TTTTTTATTTTTAAAATAAAGTTATTAAACATATT---- TTATTTATAT 3070 hom 33 het 9 0 12 0 N/A 0 0 128276 CASAVA_Build 10 10331929 1D CAGACTGGAT A/- TTTTTTTATA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 1 0 128277 CASAVA_Build 10 10334407 1I CTCAGCTAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 8 9 128278 CASAVA_Build 10 10336983 9D CAGGTTGTCA GATGAAGAT/--------- GATGAAGATA 3070 hom 111 het 39 0 37 6 GATGAAGAT 2 1 128279 CASAVA_Build 10 10340225 3D TGGTCTCGAT CTC/--- CTGACCTCAC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CTC 1 0 128280 CASAVA_Build 10 10342416 1I CATTTGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 33 1 23 9 A 10 11 128281 CASAVA_Build 10 10343429 1D TTCTATTTTT C/- CCCTTAATTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 4 3 128282 CASAVA_Build 10 10344191 2D TGTGAATTCA TC/-- TGTTTCTCCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TC 1 0 128283 CASAVA_Build 10 10344790 8D ATGAATATTA GAAACTTT/-------- GAAAACTTTA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 GAAACTTT 1 0 128284 CASAVA_Build 10 10345240 1I TATTTTTTTT -/A AATTTTATTA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 2 3 128285 CASAVA_Build 10 10349660 1D ATTGACGTTG T/- TTTGTGAATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 4 3 128286 CASAVA_Build 10 10350490 1I ACTGAATAAT -/A GATGCTAAAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 128287 CASAVA_Build 10 10369536 1D AATGATAGGA G/- GAGGAAGGCT 3070 het 3070 hom 44 16 25 4 G 2 1 128288 CASAVA_Build 10 10374023 1D ATAAAAAAAA T/- AAAGCCCCAC 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 1 0 128289 CASAVA_Build 10 10376301 2D GGGTGGGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 85 27 28 30 GT 9 8 128290 CASAVA_Build 10 10378187 1D TCACCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2213 hom 31 11 11 9 A 15 14 128291 CASAVA_Build 10 10379871 1I AAATAAAACT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 6 7 128292 CASAVA_Build 10 10417336 1D TGAAAAAAAA T/- GAAAAGAATA 3070 het 3070 ref 33 13 15 5 T 1 0 128293 CASAVA_Build 10 10417664 1D GGGTCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 1293 het 1293 ref 20 14 4 3 A 12 11 128294 CASAVA_Build 10 10418930 1D TCAGGAAAAT A/- AGAAACATTT 3070 het 3053 hom 20 8 11 1 A 2 1 128295 CASAVA_Build 10 10428051 4D TTATGGAAAA AGAG/---- AGAGAAGCAG 3070 het 3070 hom 39 21 16 4 AG 4 2 128296 CASAVA_Build 10 10431351 1D ATATATAATG A/- AATTCATTAC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 3 2 128297 CASAVA_Build 10 10453983 1I GTTACATTTC -/T GGAATTGCCT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 0 1 128298 CASAVA_Build 10 10472710 1D GTCCTTGATA T/- CTTGTTTCTG 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 T 1 0 128299 CASAVA_Build 10 10484809 1D ATTTGACCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 10 9 128300 CASAVA_Build 10 10506574 3D AAAGTTGACC TTA/--- TTATCGTAGG 3070 het 3070 hom 41 19 21 3 TTA 2 1 128301 CASAVA_Build 10 10522438 5D TTGATTCCAT GACTC/----- GACTCAAAGA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GACTC 2 1 128302 CASAVA_Build 10 10523612 2I GTTTTATATC --/TG TAGATATTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TG 0 1 128303 CASAVA_Build 10 10529594 3D GCTTTCTATC ATT/--- ATATTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 19 18 1 ATT 1 0 128304 CASAVA_Build 10 10536951 3D TTTCCCTCTC CTT/--- CTACTCATCA 3070 het 3070 hom 48 20 24 5 CTT 1 0 128305 CASAVA_Build 10 10542370 1D TTCAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2089 het 2089 ref 32 18 6 9 T 17 16 128306 CASAVA_Build 10 10545928 1I ACCTTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 15 16 128307 CASAVA_Build 10 10558189 2I TCATTTTATA --/TC TCTACTTTCT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 TC 1 2 128308 CASAVA_Build 10 10560468 1I TGTTTTGGAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 8 9 128309 CASAVA_Build 10 10565723 1D AAAATGCAGC A/- AATTGAACAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 A 3 2 128310 CASAVA_Build 10 10571748 1I GAAAATCAGC -/A AAAATGGTAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 4 5 128311 CASAVA_Build 10 10572538 1D CTATCTGGTT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 G 9 8 128312 CASAVA_Build 10 10574875 1D GGGAAATCCC T/- TTCACTTGGT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 3 2 128313 CASAVA_Build 10 10575500 1D TTTTTTTTTT G/- TTTGTTTCTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 G 1 0 128314 CASAVA_Build 10 10581918 2D CTAGGACAAT AG/-- AGAGACATAC 3070 hom 152 het 53 0 51 4 AG 3 2 128315 CASAVA_Build 10 10588050 1D TATTCTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 11 10 128316 CASAVA_Build 10 10589276 3I AATACTCACA ---/GTG CCTAAATTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 GTG 0 1 128317 CASAVA_Build 10 10590138 2D AGACAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 37 10 A 14 12 128318 CASAVA_Build 10 10597301 6I TCATGTTCAT ------/ACAATG ACATCTTCCC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 ACAATG 0 1 128319 CASAVA_Build 10 10600693 2I ATGATTTTTT --/AA TTTAAAAAAA 2655 het 2655 ref 31 14 10 7 A 0 2 128320 CASAVA_Build 10 10609426 1I AAAAAAAAAA -/T AAAAAAGTAA 2647 het 126 hom 14 3 8 3 T 0 1 128321 CASAVA_Build 10 10620229 1I CCTTCCTGCC -/T TCCCTCTGGT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 1 2 128322 CASAVA_Build 10 10644895 2D GTCTAAGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 12 10 128323 CASAVA_Build 10 10652313 2D AGTGAGAGAC AG/-- AGAAAACAGA 3070 het 3070 ref 54 30 19 5 AG 2 1 128324 CASAVA_Build 10 10654306 1I TGGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 10 11 128325 CASAVA_Build 10 10656842 13D CCATGCCTGG TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 2303 het 1565 hom 15 8 8 1 T 25 12 128326 CASAVA_Build 10 10667402 4D AAACTACATG ATGT/---- ATGTATATGG 3070 het 3070 ref 64 37 23 5 ATGT 2 1 128327 CASAVA_Build 10 10676358 8I TGGACAGACA --------/CTGTGCAT CTGTGCATTT 3070 het 3070 hom 48 20 26 2 CTGTGCAT 1 2 128328 CASAVA_Build 10 10677285 1I CCACAGTCAC -/T GGGTAATAGA 3070 het 3070 hom 55 25 23 7 T 0 1 128329 CASAVA_Build 10 10684462 1I TGTTCTAGAT -/A AGCTAATGAC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 1 2 128330 CASAVA_Build 10 10685066 1I AAATCACACT -/G CAACCATAAA 3070 het 3070 ref 44 29 14 1 G 0 1 128331 CASAVA_Build 10 10699679 1D GCTTTGTAAA G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 G 8 7 128332 CASAVA_Build 10 10709041 1D CAGAGAAATC A/- AAGTTCCTGG 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 3 2 128333 CASAVA_Build 10 10715677 4I TGAGTATGTC ----/TGTT TGTTATAGTA 3070 het 3070 ref 24 14 7 3 TGTT 1 2 128334 CASAVA_Build 10 10732510 1D ATTGAAACAG C/- CTAAGCATTT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 C 2 1 128335 CASAVA_Build 10 10739362 2I TATTTAAAAG --/TA TATATACATA 2847 het 2847 ref 30 17 9 4 TA 3 4 128336 CASAVA_Build 10 10744666 1D CTAAATTGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 57 23 23 12 A 10 9 128337 CASAVA_Build 10 10752803 2I TAGTTGAAAT --/CA CACAGTCTGT 3070 het 3070 ref 52 30 20 3 CA 2 3 128338 CASAVA_Build 10 10752893 2D ACCTCAACAC TT/-- TCAGAGGCTG 3070 het 3070 ref 41 22 13 8 T 3 1 128339 CASAVA_Build 10 10753700 1D TCTGTATGTC T/- TTTTTTTTTT 2081 het 2081 ref 35 23 5 7 T 13 12 128340 CASAVA_Build 10 10757555 1I CCCTTCTTAT -/A TTCTTTTTAC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 0 1 128341 CASAVA_Build 10 10770807 1D TGTGTATACC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 9 8 128342 CASAVA_Build 10 10771455 5D GCAGTATATC AAATT/----- AAAAAGCACA 3070 het 3070 ref 49 32 17 1 AAATT 1 0 128343 CASAVA_Build 10 10779088 1D AGAAGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 13 9 A 12 11 128344 CASAVA_Build 10 10786275 1I CCTTCCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 15 12 2 T 9 10 128345 CASAVA_Build 10 10786862 2D TTATATAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2095 hom 32 11 10 13 T 16 14 128346 CASAVA_Build 10 10794117 17D GGATAGAGAC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 21 7 A 26 9 128347 CASAVA_Build 10 10796847 1D AGCCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 1365 het 1365 ref 36 23 3 10 A 13 12 128348 CASAVA_Build 10 10804477 1I GCCTGAATTG -/A AAAAATTGAA 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 A 5 6 128349 CASAVA_Build 10 10809745 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2779 het 1950 hom 15 6 6 3 A 13 12 128350 CASAVA_Build 10 10815582 1I AGCATGGCTT -/G GGGGGGGCCT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 G 7 8 128351 CASAVA_Build 10 10816062 1D TACATGTTCA T/- TTTTTTTTTA 1244 het 1244 ref 63 53 3 8 T 10 9 128352 CASAVA_Build 10 10824197 2D TTTGTTAACC AT/-- GTTTCACATA 3070 het 3070 ref 29 19 7 5 AT 1 0 128353 CASAVA_Build 10 10825881 3D CACTGTAGTC CAG/--- CAGCAGCCAT 3070 het 3070 ref 44 21 20 4 CAG 3 2 128354 CASAVA_Build 10 10827101 2D AAAAAACAAA AC/-- AAAAAAAAAC 495 het 495 ref 27 13 7 7 AC 1 0 128355 CASAVA_Build 10 10828318 2I AAAATTTGTT --/AC AGTCACCCCG 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 AC 0 1 128356 CASAVA_Build 10 10839264 1I CCTTCTCTAC -/A AAAAAAATAA 2814 het 2814 ref 18 9 8 1 A 7 8 128357 CASAVA_Build 10 10840546 2D CCCAGTGTCT AC/-- ACAGAGTGGG 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 AC 2 1 128358 CASAVA_Build 10 10854817 1I GAAAACTCAC -/T TATTTGAACA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 1 2 128359 CASAVA_Build 10 10868448 1D GATCCATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 10 A 15 14 128360 CASAVA_Build 10 10876557 1D AACAAACCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 T 10 9 128361 CASAVA_Build 10 10877727 4I AAATTAAGAA ----/AAAG AAAGGCAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AAAG 1 2 128362 CASAVA_Build 10 10882046 1I TATTCATGAC -/T TCTGTCTTCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 2 128363 CASAVA_Build 10 10884525 1D GACTTGAGAG A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 128364 CASAVA_Build 10 10892343 1I GCCTTTAAGA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 7 8 128365 CASAVA_Build 10 10905553 1D TCTTATGCAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 9 8 128366 CASAVA_Build 10 10910676 1D ATTTGGTCAC T/- CATTTATAAA 3070 hom 151 het 54 0 51 3 T 1 0 128367 CASAVA_Build 10 10912667 1D ATTTCTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 10 9 128368 CASAVA_Build 10 10917353 1D AGCAGATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 20 0 11 9 T 15 14 128369 CASAVA_Build 10 10927432 2D AGCAAAACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 37 0 31 7 AC 7 6 128370 CASAVA_Build 10 10946210 1D CATCAGGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 11 10 128371 CASAVA_Build 10 10948341 6I AGCACTTTGG ------/GAGGCT GAGGCAGGCA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 GAGGCT 0 1 128372 CASAVA_Build 10 10956410 1D GAAAATGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2229 hom 38 10 17 11 A 15 14 128373 CASAVA_Build 10 10957674 1D AGAATCTGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 T 9 8 128374 CASAVA_Build 10 10963719 1D CTAGAATCCC T/- TTTTTTCAGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 7 6 128375 CASAVA_Build 10 10986198 1I CCATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 11 12 128376 CASAVA_Build 10 10996101 1D ACCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 12 11 128377 CASAVA_Build 10 11001239 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 30 6 A 11 10 128378 CASAVA_Build 10 11015100 1D CAAGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 26 1 22 3 A 13 12 128379 CASAVA_Build 10 11023961 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2328 hom 28 het 15 0 9 6 A 20 18 128380 CASAVA_Build 10 11035788 1I CAAGCAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2378 hom 29 7 19 3 A 13 14 128381 CASAVA_Build 10 11050701 1D TGGTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 A 11 10 128382 CASAVA_Build 10 11064876 1D CTGGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 12 11 128383 CASAVA_Build 10 11069225 1D TCTAGAGATC T/- TTTTTTTTTT 2432 het 2432 ref 34 19 6 9 T 13 12 128384 CASAVA_Build 10 11072938 2D GTTCTTTTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1560 het 1560 ref 49 33 4 12 GT 10 9 128385 CASAVA_Build 10 11108046 2I GAAAAACAGA --/CT CTTCACAGAG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 CT 1 2 128386 CASAVA_Build 10 11110392 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 24 1 11 12 T 15 13 128387 CASAVA_Build 10 11114647 9I GTCCAAACTC ---------/TTGGAAAAT TTGGAAAATT 3070 het 3070 hom 38 15 22 1 TTGGAAAAT 1 2 128388 CASAVA_Build 10 11115227 5D GTTCAGGGCA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 38 14 13 16 T 20 15 128389 CASAVA_Build 10 11116330 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 2976 hom 25 8 11 6 T 9 8 128390 CASAVA_Build 10 11119045 4D CACTGCTAAT AAAG/---- AAAGATGTAC 3070 het 3070 ref 31 17 11 5 AAAG 2 1 128391 CASAVA_Build 10 11119943 1D AAGTTTATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 51 22 18 12 A 10 9 128392 CASAVA_Build 10 11122707 3D ATTTTGTGAG TTC/--- TTCTCTTCCA 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 TTC 2 1 128393 CASAVA_Build 10 11140040 1I TCTGAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1838 hom 39 10 12 17 A 15 16 128394 CASAVA_Build 10 11141380 7I GGAGCAAATT -------/TAAGACC TAAGACCGTT 3070 het 3070 ref 57 29 23 5 TAAGACC 1 2 128395 CASAVA_Build 10 11144909 1D TTCAGCAGCA C/- CCCCCCCGCC 2632 het 2632 ref 32 15 7 11 C 8 7 128396 CASAVA_Build 10 11150536 1D CATTATTTCT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 634 hom 19 4 10 5 G 1 0 128397 CASAVA_Build 10 11152099 5I AAAAAGTAAA -----/AAAAT AAAATAAAAG 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 AAAAT 1 2 128398 CASAVA_Build 10 11154787 1I CTGATTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2741 hom 23 9 8 6 T 10 11 128399 CASAVA_Build 10 11160154 1D GTCTATTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 40 1 29 10 A 12 11 128400 CASAVA_Build 10 11162303 1I TAATTTCTTA -/G TAAGCACCTA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 G 0 1 128401 CASAVA_Build 10 11163037 3D GAAAAAATTA TTC/--- TTTAAATGGT 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 TTC 1 0 128402 CASAVA_Build 10 11170534 23I TAGCAGAGCC -----------------------/GGTGTGCATACCCCTGCTCACCT GGATTTCTCA 3070 het 3070 ref 42 21 16 7 GGTGTGCATACCCCTGCTCACCT 0 1 128403 CASAVA_Build 10 11174029 1I ATTTAATCTG -/T TAACTTCTAA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 T 1 2 128404 CASAVA_Build 10 11175222 7D TTGGGCCACA GTTTGGT/------- GTTTGGGAAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 GTTTGGT 1 0 128405 CASAVA_Build 10 11192243 1D ACCATGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1235 het 1235 ref 40 29 3 9 A 11 10 128406 CASAVA_Build 10 11226884 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAG 2137 het 123 hom 19 3 11 5 G 0 1 128407 CASAVA_Build 10 11234383 1D GTTGTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 1126 het 1126 ref 42 32 3 8 A 12 11 128408 CASAVA_Build 10 11251538 1I ATGAAGTAGA -/G GAAGGGAAGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 2 128409 CASAVA_Build 10 11278004 1I GGCAGGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1335 hom 30 3 23 4 A 13 14 128410 CASAVA_Build 10 11281518 1I GCCCTCTGCC -/A ACCACCCCTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 1 2 128411 CASAVA_Build 10 11291757 2I TGGACTCTGG --/AA AAAAAAAAAA 534 het 125 hom 30 1 5 24 A 10 12 128412 CASAVA_Build 10 11297561 1D CAGATTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 41 1 24 16 T 14 13 128413 CASAVA_Build 10 11313616 1I AACTCTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 34 2 20 12 A 11 12 128414 CASAVA_Build 10 11316573 1I ATGGCGTGAA -/C CCCGGGGGGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 3 4 128415 CASAVA_Build 10 11326628 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 972 hom 27 4 19 4 A 13 14 128416 CASAVA_Build 10 11336856 20D CCCCTTTCCA TCCCATCTCTCCCCTTCCTG/-------------------- TCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 51 32 21 5 TCCCATCTCTCCCCTTCCTG 1 0 128417 CASAVA_Build 10 11348797 2D ATTCTCTCCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 96 het 44 0 31 13 TC 8 7 128418 CASAVA_Build 10 11350668 1D TCTTGTTTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 T 10 9 128419 CASAVA_Build 10 11353687 2D AGGGTGTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 36 14 12 12 TG 9 8 128420 CASAVA_Build 10 11356820 4D CAGCAGTGTT AGTG/---- AGTTTCCCCA 3070 hom 132 het 49 0 44 6 AGTG 1 0 128421 CASAVA_Build 10 11357252 1I TGCTCTGAAG -/T TGTCTCTGTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 1 2 128422 CASAVA_Build 10 11366956 4I GTGGATGAGA ----/GATG GATGGATGTG 3070 hom 153 het 59 0 45 14 GATG 2 3 128423 CASAVA_Build 10 11376967 2D GTTTACACTC TT/-- ATTGCTGCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 7 T 2 0 128424 CASAVA_Build 10 11381785 1I ATCATCAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 34 1 26 7 T 10 11 128425 CASAVA_Build 10 11387030 1I CAACTCGGTG -/C CCCCTCCTCC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 C 4 5 128426 CASAVA_Build 10 11396100 4I CTGTTTTCCT ----/TTTG TTTTTCAGTG 3070 hom 96 het 38 0 29 9 TTTG 0 1 128427 CASAVA_Build 10 11402796 1D GCTACTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 978 hom 39 6 18 17 T 17 16 128428 CASAVA_Build 10 11404608 1D ATACTCATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 16 15 128429 CASAVA_Build 10 11412323 1D TCCCTAATGA C/- CTAAGATTTG 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 C 2 1 128430 CASAVA_Build 10 11413425 2I CAAAATGTGA --/TC TGTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TC 0 1 128431 CASAVA_Build 10 11414581 36D CAACACAAGC TCCAGTCTTCCTCTTCGGCATGCCCTGGAAGCTTCT/------------------------------------ TCCAGTCTTC 3070 hom 53 het 29 0 17 17 TCCAGTCTTCCTCTTCGGCATGCCCTGGAAGCTTCT 2 1 128432 CASAVA_Build 10 11415228 1I GGGAAAGTCC -/T TTTTTGCCCT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 5 6 128433 CASAVA_Build 10 11432323 1D ATGCCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 2819 het 1652 hom 37 12 10 15 T 17 16 128434 CASAVA_Build 10 11433589 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3060 het 3060 ref 33 13 9 11 A 9 10 128435 CASAVA_Build 10 11435582 1D ATGTGTATGA T/- TTGCGTTTCC 3070 het 3070 hom 50 18 25 7 T 3 2 128436 CASAVA_Build 10 11436391 1I CTTTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 26 4 11 11 T 11 12 128437 CASAVA_Build 10 11449214 1I CCCTCGCCAA -/C CCTGGGAGGC 3070 hom 83 het 37 0 22 15 C 2 3 128438 CASAVA_Build 10 11452710 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 9 10 128439 CASAVA_Build 10 11458526 1D ACCTCCTGGG T/- TTAAGCAATC 2381 het 2323 hom 13 6 6 1 T 3 2 128440 CASAVA_Build 10 11464131 1I TGCACCACTA -/T TGCCCAGATA 3070 het 3070 ref 45 21 16 9 T 1 2 128441 CASAVA_Build 10 11488585 1I CTTCTGATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 9 10 128442 CASAVA_Build 10 11488787 1D GGGGATGGGA C/- CCAAATGTCA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 C 3 2 128443 CASAVA_Build 10 11493283 1D CAACAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 43 1 39 3 A 11 10 128444 CASAVA_Build 10 11497598 1D GCTTCTGGCA G/- TAGGAGGGGG 3070 het 3070 hom 23 11 9 4 G 1 0 128445 CASAVA_Build 10 11497730 1I TCTTTTATTG -/T TTTTTTGGAG 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 T 6 7 128446 CASAVA_Build 10 11501282 1I AATATTAAAA -/T TATGTTAGGC 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 1 2 128447 CASAVA_Build 10 11507763 1D CTTTATTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 35 1 22 13 A 14 13 128448 CASAVA_Build 10 11532746 1I TGAAGAGGCC -/A AAAAAGAACC 3070 hom 75 het 28 0 24 4 A 5 6 128449 CASAVA_Build 10 11534487 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2467 het 2459 hom 28 11 9 8 A 14 15 128450 CASAVA_Build 10 11535274 1I CCACTACAAT -/A AAAAACTTTT 2279 het 2279 ref 19 7 6 6 A 5 6 128451 CASAVA_Build 10 11537932 1I CACTGAATAT -/C CCATAGGAAT 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 C 2 3 128452 CASAVA_Build 10 11541875 1D AAGATGTTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 7 128453 CASAVA_Build 10 11543277 4I TGTTTCAATG ----/AAAA AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 A 7 11 128454 CASAVA_Build 10 11563317 1I AATGCTATTT -/G GTGGTTCTGT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 1 2 128455 CASAVA_Build 10 11566402 1D AATTCTCCAG T/- TTTTTTTTTT 2275 het 2275 ref 37 13 10 14 T 15 14 128456 CASAVA_Build 10 11568164 2D GGGAAACCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 176 hom 23 3 11 11 A 16 14 128457 CASAVA_Build 10 11590170 1D AGTTAGATTT C/- CTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 C 2 1 128458 CASAVA_Build 10 11592033 4D TTTAATTCTC TTCT/---- TTCTTATTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 6 TTCT 2 1 128459 CASAVA_Build 10 11592644 2I GGGCCCATGA --/GT GTAGTAAGTA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 GT 1 2 128460 CASAVA_Build 10 11603739 1D TATACAGTCA T/- TTTATACAGT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 4 3 128461 CASAVA_Build 10 11608105 16I3M8I TCATGCTCCA ----------------TCA--------/CATGCTCTCATGCTCCTCATGCTCCTC ACTCTTCTAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 N/A 0 0 128462 CASAVA_Build 10 11610310 1D TTCTCTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 11 10 128463 CASAVA_Build 10 11619125 1D GGGGGATTTT G/- TTTGTTTTGA 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 G 1 0 128464 CASAVA_Build 10 11619390 2I GTGCTACGAT --/TA TATAGGCATG 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 TA 2 3 128465 CASAVA_Build 10 11620914 3D TTCACTCTGC TCT/--- TCATCTCTCC 3070 het 3070 hom 47 20 25 5 TCT 1 0 128466 CASAVA_Build 10 11623030 1I CTCCAAGCAC -/A AGTACCACAG 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 A 1 2 128467 CASAVA_Build 10 11635108 1D CCTTCACCCC T/- CTACCTGTAA 3070 het 3070 ref 34 18 10 7 T 1 0 128468 CASAVA_Build 10 11642720 4D ATATATATAT TATA/---- TATATATATA 1595 het 918 hom 8 2 5 1 TA 10 8 128469 CASAVA_Build 10 11647937 1D GAAGATTCTT A/- CTCTTCAACC 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 A 1 0 128470 CASAVA_Build 10 11655040 2D CTATGAATAT AA/-- GACTGTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 6 A 2 0 128471 CASAVA_Build 10 11658421 1I TAACCCCCAA -/G GGTGATGGTA 3070 het 3070 ref 58 29 19 10 G 2 3 128472 CASAVA_Build 10 11663073 4D AAGAATTACA AACT/---- AATAGGTCTC 3070 het 3070 ref 30 16 10 9 AACT 1 0 128473 CASAVA_Build 10 11665315 1D GCCTCAGTCT C/- CCGAGTAGCT 1450 het 1294 hom 10 5 4 1 C 3 2 128474 CASAVA_Build 10 11668797 5D GAGTACTTGC CTAAA/----- CTAAACTTAA 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 CTAAA 2 1 128475 CASAVA_Build 10 11669447 3D CATACTATAA GAT/--- GATAAGTATC 3070 het 3070 hom 36 17 15 5 GAT 2 1 128476 CASAVA_Build 10 11673291 1I ATTTGGAGCA -/C CACTGGTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 C 1 2 128477 CASAVA_Build 10 11691056 5D ATGGACTATG CTTTT/----- CTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 50 17 23 12 CTTTT 5 4 128478 CASAVA_Build 10 11691467 1I AAGAATGGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 A 8 9 128479 CASAVA_Build 10 11692626 1I GCGTCCTCAC -/T TTTTTTTTTT 1662 het 1662 ref 45 21 5 19 T 15 16 128480 CASAVA_Build 10 11711460 1I CCCAATTTTG -/A AAAAAAAAAA 1618 het 1618 ref 21 9 5 7 A 13 14 128481 CASAVA_Build 10 11729917 1D TACACAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 50 0 37 13 A 10 9 128482 CASAVA_Build 10 11750701 2D CTGCAATGAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 11 9 128483 CASAVA_Build 10 11755424 4D ATCCACTAAA TATT/---- CATTCATTAG 3070 het 3070 ref 47 27 12 12 TATT 1 0 128484 CASAVA_Build 10 11760530 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 2586 hom 10 het 15 0 10 5 T 13 14 128485 CASAVA_Build 10 11761558 4D TCTATCTATG TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 66 het 34 0 23 11 TATT 6 5 128486 CASAVA_Build 10 11768177 1D TTGGCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 11 10 128487 CASAVA_Build 10 11774028 2I AGGGTCTCAC --/TG TGTCACCCAG 2825 het 2818 hom 19 8 7 4 TG 1 2 128488 CASAVA_Build 10 11778408 2D CAATGGTCAA CT/-- CTCAGTCTTC 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 CT 2 1 128489 CASAVA_Build 10 11782117 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1428 het 484 hom 9 1 6 2 A 13 14 128490 CASAVA_Build 10 11783159 1D AGCATAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 30 1 21 8 T 15 14 128491 CASAVA_Build 10 11785489 1I TTGTAGAGAT -/G GGGTCTCGCT 3070 hom 66 het 23 0 22 1 G 3 4 128492 CASAVA_Build 10 11790972 1D TCAACAAATA T/- TTCCTGTTGA 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 T 3 2 128493 CASAVA_Build 10 11792504 1D GACATCAGTC A/- TACAATTTAG 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 A 1 0 128494 CASAVA_Build 10 11792708 2D TTATTCCTTT TG/-- AGTCTCAATT 3070 het 3070 hom 39 15 17 8 TG 1 0 128495 CASAVA_Build 10 11792987 1D AAAGTTTCAG T/- TTTGCAACTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 4 3 128496 CASAVA_Build 10 11796321 1D TCGGCCATCC A/- AAACTCACAG 3070 hom 104 het 38 0 32 6 A 4 3 128497 CASAVA_Build 10 11797669 6I TGTTTGTTGT ------/TGTTGC TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 TGTTGC 0 1 128498 CASAVA_Build 10 11802983 1D AAAAAAAAAA T/- GGACAGAACC 3028 het 519 hom 26 6 8 13 T 1 0 128499 CASAVA_Build 10 11805424 5D TATTCCATGT TTATA/----- TTATATGTTA 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 TTATA 2 1 128500 CASAVA_Build 10 11809447 4I GCAGGGGATG ----/CCAC CTCAGAGACA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 CCAC 0 1 128501 CASAVA_Build 10 11820077 4D TCATCTACTC TGTT/---- TATTTTCTGC 3070 hom 99 het 36 0 31 6 TGTT 1 0 128502 CASAVA_Build 10 11820706 1I GCCCAGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 13 14 128503 CASAVA_Build 10 11821517 1I CGACTTCTTG -/C CCCCCTAGAT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 5 6 128504 CASAVA_Build 10 11823283 5I TGTTATTATT -----/AAATC AAATGTAGAA 3070 hom 61 het 26 0 21 5 AAATC 0 1 128505 CASAVA_Build 10 11830234 2D TAACGTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 33 1 23 9 T 13 11 128506 CASAVA_Build 10 11830523 1D TGCAGAGACA G/- GGGTCTCACT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 4 3 128507 CASAVA_Build 10 11831748 8D ATCCTTTATC CCAGCAAT/-------- CCAGCAATTA 2124 hom 12 het 10 0 5 5 CCAGCAAT 2 1 128508 CASAVA_Build 10 11835232 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAGTTAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 6 5 128509 CASAVA_Build 10 11836304 16I TGCCTTGGGG ----------------/AAAGTAACCCAAATTT TATTCCCATC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 AAAGTAACCCAAATTT 0 1 128510 CASAVA_Build 10 11839603 1I ATCACTCAAC -/T TGGAGACTCG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 2 128511 CASAVA_Build 10 11841375 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 20 1 15 4 AC 1 0 128512 CASAVA_Build 10 11843093 1D CAGTGCATGT G/- GGCTCCATCT 3070 hom 58 het 27 0 19 8 G 3 2 128513 CASAVA_Build 10 11844074 1D CCCATCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 15 10 A 15 14 128514 CASAVA_Build 10 11845845 1I GCGACCCCCC -/T GACATAGCAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 0 1 128515 CASAVA_Build 10 11848006 1D ACAAATTTTC T/- GATAACCACA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 1 0 128516 CASAVA_Build 10 11850892 3D AGTCCAGACA AGG/--- AGGAGTTTCC 3070 hom 112 het 41 0 37 4 AGG 2 1 128517 CASAVA_Build 10 11852294 1D TTACTGGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 12 11 128518 CASAVA_Build 10 11854491 1I GTTACATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 10 11 128519 CASAVA_Build 10 11863691 1I AGTGGAGGGG -/A CAGAGTCTCC 3070 hom 45 het 18 0 15 5 A 0 1 128520 CASAVA_Build 10 11879176 1I GCTTTCTACA -/T TTTTTTAATG 2890 het 2890 ref 25 11 7 7 T 6 7 128521 CASAVA_Build 10 11895542 1I TCCCCACCCT -/G GTATAATCAT 3070 hom 125 het 47 0 41 6 G 1 2 128522 CASAVA_Build 10 11898815 1D AGACTTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 26 1 12 13 A 17 16 128523 CASAVA_Build 10 11907260 1D CCTCTAGAAC T/- TAGAAGTTCA 2573 het 2573 ref 24 10 7 7 T 2 1 128524 CASAVA_Build 10 11914823 1D TAGGGTGCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 31 0 25 6 T 10 9 128525 CASAVA_Build 10 11927589 1I GGGAAAGCAA -/C CAGAGGATGG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 1 2 128526 CASAVA_Build 10 11934547 2I CAGTTGACTC --/TT TTTTTTTTGA 3070 hom 47 het 21 0 14 7 T 8 10 128527 CASAVA_Build 10 11934898 5D ACTCCTGTGC AAGTA/----- AAGATGCTTT 3070 het 3070 ref 22 9 9 9 AAGTA 1 0 128528 CASAVA_Build 10 11945830 4D GTGCACAGAT GATA/---- GATAAATGCT 3070 het 3070 ref 55 32 16 9 GATA 2 1 128529 CASAVA_Build 10 11948112 1D AAAAAAAAAA T/- CCCTTCGTTT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 1 0 128530 CASAVA_Build 10 11954733 1D CTTAAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2864 hom 32 12 17 3 A 12 11 128531 CASAVA_Build 10 11955991 1D TTTGGTGGAG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 8 7 128532 CASAVA_Build 10 11959455 1D AAAGGGAGGT G/- GGGGGGTGAG 2011 hom 32 het 17 0 8 9 G 7 6 128533 CASAVA_Build 10 11970719 3I ATAATATAAT ---/AAC AAATAGATTG 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 AAC 0 1 128534 CASAVA_Build 10 11972913 1D GAGCTAAACT G/- GGATAGCTGG 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 G 3 2 128535 CASAVA_Build 10 11977951 1D TGCATCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1542 hom 38 10 13 15 T 15 14 128536 CASAVA_Build 10 11978852 9I GTTGGCCTCA ---------/TGTGTGTCT TCTTTTGAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TGTGTGTCT 0 1 128537 CASAVA_Build 10 11978931 1D GAGCAGATAA G/- GGTGCAGAAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 G 3 2 128538 CASAVA_Build 10 11979089 1D16M1D TTTTTTTTTT AAATAAAATATTCTTAGT/-AATAAAATATTCTTAG- CCCCCCTTCA 3070 het 3070 ref 28 18 9 4 N/A 0 0 128539 CASAVA_Build 10 11980353 1D TCAGCCTTCA C/- CTCTGTGCGT 3070 het 3070 hom 57 24 25 8 C 2 1 128540 CASAVA_Build 10 11984319 8D CTGTATGTGT GCGCGCGC/-------- GTGCGCGCGC 1384 het 497 hom 33 6 9 18 GC 4 0 128541 CASAVA_Build 10 11986297 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2117 hom 22 9 11 2 T 13 12 128542 CASAVA_Build 10 11996689 3I TCAATGTGAA ---/GAC GACGAGGATG 3070 het 1103 hom 31 4 25 2 GAC 1 2 128543 CASAVA_Build 10 11999466 3I TCAACGTGAA ---/GAC GACGAGGATG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 GAC 1 2 128544 CASAVA_Build 10 12002350 1D GGGGGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 11 10 128545 CASAVA_Build 10 12003822 6D TCTTCTACAA CTTATT/------ CTTAAGGTGC 3070 het 3070 ref 52 24 19 10 CTTATT 1 0 128546 CASAVA_Build 10 12006583 1I ATGTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 26 0 18 8 A 11 12 128547 CASAVA_Build 10 12008719 2I AATAATGAAC --/CT CTCTTTTCTA 3070 hom 110 het 46 0 35 11 CT 2 3 128548 CASAVA_Build 10 12015712 4D TTAAGTAGGC ATTG/---- ATTAATTTAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 4 ATTG 1 0 128549 CASAVA_Build 10 12026016 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2409 hom 31 16 10 5 A 12 11 128550 CASAVA_Build 10 12048439 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 8 7 128551 CASAVA_Build 10 12063692 1D TAAGGTACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 26 0 23 3 T 10 9 128552 CASAVA_Build 10 12078359 1D TCATTCAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 31 1 22 8 T 12 11 128553 CASAVA_Build 10 12079399 1I GCAAAAATGC -/A AAACAATTGC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 3 4 128554 CASAVA_Build 10 12087860 1D ACAGGCGTGA G/- CCACCACGCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 1 0 128555 CASAVA_Build 10 12093658 2I TAAAAATACA --/TT TTTAAAGTCA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 3 5 128556 CASAVA_Build 10 12094274 1D CACCATGTTG C/- GCCAAGCTGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 1 0 128557 CASAVA_Build 10 12121628 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1721 het 1189 hom 18 4 8 6 T 17 16 128558 CASAVA_Build 10 12132166 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 633 het 633 ref 21 15 3 3 A 15 14 128559 CASAVA_Build 10 12134162 1D ATGTGTAGGA T/- TTTTTTTTTT 1176 het 1176 ref 21 12 3 6 T 13 12 128560 CASAVA_Build 10 12137849 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 31 2 19 10 A 18 16 128561 CASAVA_Build 10 12141722 1I TTGAACACTC -/T TATTAATGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 1 2 128562 CASAVA_Build 10 12142402 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 6 7 128563 CASAVA_Build 10 12156671 1D TGCTATGTTG C/- CCCAGGCTGG 2902 het 62 hom 12 1 9 2 C 4 3 128564 CASAVA_Build 10 12157578 2D CAGGGTCTCA CT/-- CTGTTGCCCA 3070 hom 75 het 29 0 25 6 CT 2 1 128565 CASAVA_Build 10 12157949 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 782 hom 28 3 18 7 A 12 13 128566 CASAVA_Build 10 12159827 2D AGGAACGTTC AG/-- AGAGGTTTGT 3070 hom 110 het 43 0 37 8 AG 3 2 128567 CASAVA_Build 10 12164622 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 624 hom 38 2 30 6 T 12 13 128568 CASAVA_Build 10 12166311 1D TGCCACATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 28 1 16 11 T 13 12 128569 CASAVA_Build 10 12171978 1D ACCTAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 684 hom 34 2 27 5 T 12 11 128570 CASAVA_Build 10 12192431 1D ACAATTCTTC T/- TCTTCCGGTG 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 2 1 128571 CASAVA_Build 10 12200391 1I CATAATTCTC -/T TTTTTTTTTT 2171 hom 28 het 21 0 10 11 T 15 16 128572 CASAVA_Build 10 12206328 1I CTGAGGCAGG -/A AAATCACTTG 3070 hom 68 het 24 0 22 2 A 3 4 128573 CASAVA_Build 10 12206965 1D TACCCCGCCC A/- AAAAAAAAAA 1600 het 1600 ref 25 11 6 8 A 17 16 128574 CASAVA_Build 10 12209465 4I TTCCCAGGCT ----/CTTA CTTGAACCAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CTTA 0 1 128575 CASAVA_Build 10 12214662 1I GATTCCATGA -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 60 het 35 0 22 13 T 7 8 128576 CASAVA_Build 10 12224968 1I CACTTTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 11 12 128577 CASAVA_Build 10 12235064 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 25 1 19 7 A 15 14 128578 CASAVA_Build 10 12241843 1I CTTAATATGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 10 128579 CASAVA_Build 10 12242715 2D AAAATGACTC AA/-- TATTTTCACA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 A 2 0 128580 CASAVA_Build 10 12249943 1D GGTGATAACG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 126 het 52 0 43 10 T 8 7 128581 CASAVA_Build 10 12260153 1I AAAATCGGAA -/C TAAAACGAAA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 0 1 128582 CASAVA_Build 10 12261671 1D TAGGCAAGTG C/- CCCTACTTTG 3070 hom 101 het 41 0 34 8 C 4 3 128583 CASAVA_Build 10 12273431 3I CAAAGGAAAA ---/ACC ACCACCACCA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 ACC 3 4 128584 CASAVA_Build 10 12274950 1I CACTTATGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 36 0 27 10 T 9 10 128585 CASAVA_Build 10 12275018 1D ACTGAAATTA T/- GCTACTTGGT 3070 het 3070 hom 28 10 11 8 T 1 0 128586 CASAVA_Build 10 12276908 1D GGCTCACGCC T/- TGTAAACCCA 2855 hom 24 het 13 0 7 6 T 2 1 128587 CASAVA_Build 10 12279387 1D AAGAACTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 26 0 20 6 T 12 11 128588 CASAVA_Build 10 12293256 2I TTGAGTTGAC --/AG GGGAAAGTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AG 0 1 128589 CASAVA_Build 10 12303290 7I GGTCGCCAGG -------/AACCCAT GCTCTTTCAG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 AACCCAT 0 1 128590 CASAVA_Build 10 12323168 4D TATTTTTCTT AGTA/---- AGTGAGGATG 3070 hom 66 het 27 0 23 6 AGTA 1 0 128591 CASAVA_Build 10 12327264 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 415 hom 34 1 21 13 T 10 9 128592 CASAVA_Build 10 12337546 1D AGTTCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 17 9 A 13 12 128593 CASAVA_Build 10 12346515 16D CTAGGCCTTC CTCTCGTATTCTCTTT/---------------- CTCTCGTATT 3070 het 3070 hom 37 13 14 15 CTCTCGTATTCTCTTT 1 0 128594 CASAVA_Build 10 12364950 1I TTGGTTCCAC -/T TTTTTTTTTT 1941 het 125 hom 17 1 8 8 T 15 16 128595 CASAVA_Build 10 12368780 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 21 0 12 9 A 12 13 128596 CASAVA_Build 10 12370949 15D CCCAGCTACT CGGGAGGCTGAGGCA/--------------- CGGGAGGCTG 3070 hom 60 het 26 0 20 6 CGGGAGGCTGAGGCA 2 1 128597 CASAVA_Build 10 12372672 20D TCATATTTTC TTTTTTTTTTTCTTTTTCTT/-------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 15 0 12 8 TTTTTTTTTTTCTTTTTCTT 1 0 128598 CASAVA_Build 10 12374247 1D AAATTAGCTT G/- GGCAACACAG 3070 hom 34 het 19 0 12 7 G 3 2 128599 CASAVA_Build 10 12374329 2D TCTTTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 14 0 8 6 T 13 11 128600 CASAVA_Build 10 12376532 1I CTAAAAAAAA -/G AAGAAAAGTA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 0 1 128601 CASAVA_Build 10 12383446 2I TGTCTCTAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 36 0 24 12 A 11 13 128602 CASAVA_Build 10 12384572 1D GCCTGGCTAA T/- TTTGTTTTTG 3070 het 1092 hom 19 4 10 6 T 4 3 128603 CASAVA_Build 10 12388267 1D TTTAAAGATG T/- TTTTCTTTGC 3070 het 3070 ref 17 9 7 1 T 5 4 128604 CASAVA_Build 10 12389571 1I CCTGGTGACA -/G GGCGAGTCTC 1257 het 10 hom 7 0 4 3 G 2 3 128605 CASAVA_Build 10 12390490 1D TGAGGCAGGA G/- GACTGTTTGA 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 G 2 1 128606 CASAVA_Build 10 12395833 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1207 het 1207 ref 18 11 3 4 A 14 13 128607 CASAVA_Build 10 12414195 1I CATGTCACCC -/A AGGCTGGTCT 3014 het 2564 hom 15 7 8 0 A 1 2 128608 CASAVA_Build 10 12418009 1D TATCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 10 9 128609 CASAVA_Build 10 12418477 3D CTCTGTCTCA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 25 16 7 4 AAC 4 3 128610 CASAVA_Build 10 12418840 1D TTGACTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1660 het 567 hom 20 5 6 9 T 19 18 128611 CASAVA_Build 10 12422437 1I AAAGGAAGGA -/C CCCCCGAGGC 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 C 5 6 128612 CASAVA_Build 10 12423505 1D TTTTTATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 21 1 15 5 A 12 11 128613 CASAVA_Build 10 12425845 1I ACTTGGCTAA -/T TTTAAAAATT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 3 4 128614 CASAVA_Build 10 12429262 1I CTTCTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 1911 het 1846 hom 25 7 11 7 T 13 14 128615 CASAVA_Build 10 12430338 1D AGGGAGCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 10 9 128616 CASAVA_Build 10 12432577 2D GCGGGCGGTG CT/-- CTCTCCGGGC 3070 het 3070 ref 41 18 13 11 CT 3 2 128617 CASAVA_Build 10 12436581 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 6 128618 CASAVA_Build 10 12446201 8I GCTAAGAGGC --------/ATGTAGAA ATGTAGAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 ATGTAGAA 1 2 128619 CASAVA_Build 10 12446623 1D GACTGATGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 A 10 9 128620 CASAVA_Build 10 12471200 1I GCGTGGGGGT -/G GTGTGTGGTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 2 128621 CASAVA_Build 10 12474935 4D TTGAAAGTAT ACAC/---- ACACACAACA 3070 hom 71 het 29 0 24 6 AC 5 3 128622 CASAVA_Build 10 12485989 1D TTGCTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2984 hom 32 11 12 9 A 12 11 128623 CASAVA_Build 10 12493822 6I GCAGGCTGGT ------/CTCAAA CTCCTGACCT 1907 het 1907 ref 13 7 5 1 CTCAAA 0 1 128624 CASAVA_Build 10 12512889 1I TTAAGTAGCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 54 het 23 0 17 8 G 2 3 128625 CASAVA_Build 10 12519119 1I AGCAGCCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 10 128626 CASAVA_Build 10 12530383 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 10 9 128627 CASAVA_Build 10 12539396 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3013 het 336 hom 23 2 9 13 A 13 11 128628 CASAVA_Build 10 12539602 1I CCTGGCCAAC -/A ATGGTGAAAC 3070 het 1843 hom 18 5 11 2 A 1 2 128629 CASAVA_Build 10 12540465 1I ACTGTCACCC -/A AGGCTGGAGT 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 A 1 2 128630 CASAVA_Build 10 12544002 2D TCTTACGTCT TA/-- TATACCAAGA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TA 3 2 128631 CASAVA_Build 10 12546820 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 2294 het 727 hom 11 3 7 1 A 17 16 128632 CASAVA_Build 10 12549261 6I GGGTTCAAGC ------/GATTGT GATTGTCCTG 3070 het 2414 hom 22 6 12 4 GATTGT 1 2 128633 CASAVA_Build 10 12550130 1D GTGCCATCAT G/- GCGCACTGCA 3070 het 2873 hom 27 9 17 1 G 2 1 128634 CASAVA_Build 10 12553431 11D CCAGGGTAGG GCTGGCTGTGT/----------- GCTGGCTGTG 3070 hom 78 het 39 0 24 16 GCTGGCTGTGT 2 1 128635 CASAVA_Build 10 12554502 1I TGTCTCACTC -/T TTCAGTTCGG 3070 hom 84 het 39 0 28 11 T 2 3 128636 CASAVA_Build 10 12556873 1D CGTTCCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 19 10 T 11 10 128637 CASAVA_Build 10 12568169 1D TGCCAGTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 27 4 15 8 T 13 12 128638 CASAVA_Build 10 12576626 1D CTGGAGTGCA G/- TGGTGTGATC 3070 het 1481 hom 17 4 11 2 G 1 0 128639 CASAVA_Build 10 12583656 1D CTGAGAGTGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 110 het 43 0 36 7 T 8 7 128640 CASAVA_Build 10 12583865 1D TGTGGTCCCC A/- AAAGCCATTT 3070 hom 120 het 43 0 39 4 A 4 3 128641 CASAVA_Build 10 12585030 2D TGTATATATG CA/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 55 20 26 11 CA 1 0 128642 CASAVA_Build 10 12587017 2D CTGCCACTGA CT/-- CTCGCTTCTA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 CT 2 1 128643 CASAVA_Build 10 12592420 3I GACTCCGTCT ---/AAA AAAAAAAAAT 1631 het 1286 hom 12 3 6 3 A 9 12 128644 CASAVA_Build 10 12597409 15D TTCCTTTTCT TTTTTTTTTTTTTTC/--------------- TTTTTTTTTT 2562 het 663 hom 13 3 6 4 TTTTTTTTTTTTTTC 1 0 128645 CASAVA_Build 10 12599743 1D TTGTGGTGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 9 8 128646 CASAVA_Build 10 12604004 2I ATATTTGAAC --/TG TAGCTTTTGG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TG 0 1 128647 CASAVA_Build 10 12628377 2D TGACAGAGAC AG/-- AGAGCAGTAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 AG 3 2 128648 CASAVA_Build 10 12636106 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 32 0 24 16 T 8 9 128649 CASAVA_Build 10 12640560 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 12 9 128650 CASAVA_Build 10 12642926 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 31 het 17 0 12 5 T 11 9 128651 CASAVA_Build 10 12645360 1D CTCTGTCTCT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 94 het 35 0 32 4 A 9 8 128652 CASAVA_Build 10 12653911 1I CTAAAACAAT -/A AAAAATGCTT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 A 5 6 128653 CASAVA_Build 10 12654045 1I AAAAACTAAA -/C CCCCCCCCCA 3070 het 450 hom 32 2 19 11 C 9 10 128654 CASAVA_Build 10 12683190 5D TTTTTTTTTT GTTTG/----- TTTGTTTTTT 2535 het 1146 hom 21 8 8 5 GTTTG 1 0 128655 CASAVA_Build 10 12686109 1I GCTCCTGTCA -/C CCCCCCATCA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 C 6 7 128656 CASAVA_Build 10 12697600 1I AGGTGTGTAT -/G TGTGTTTGCA 3070 hom 166 het 60 0 56 4 G 0 1 128657 CASAVA_Build 10 12697874 2I TATGCATGTA --/TG TGTGTATAAG 3070 hom 254 het 92 0 81 11 TG 2 3 128658 CASAVA_Build 10 12698515 3D TGTTTGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 66 het 32 0 21 11 TTG 7 6 128659 CASAVA_Build 10 12700083 1I TTTGGATCTA -/G GTATTGAGAG 3070 hom 108 het 46 0 34 12 G 1 2 128660 CASAVA_Build 10 12703245 2D GTTGTTTTTC AG/-- AGTTGTTTAG 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 AG 2 1 128661 CASAVA_Build 10 12703807 2I TAGTTCTAGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 56 het 39 0 33 6 TG 6 7 128662 CASAVA_Build 10 12720507 2D TCACCCCTCA CT/-- CTCTTTCCTT 2008 het 2008 ref 31 14 8 9 CT 3 2 128663 CASAVA_Build 10 12727006 2D AATTTGTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 57 hom 37 2 19 16 T 12 10 128664 CASAVA_Build 10 12727201 1D CTTGACAGGA G/- CAATCATTTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 G 1 0 128665 CASAVA_Build 10 12728989 1D TGGGATTATA G/- GGCATGTGCC 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 G 3 2 128666 CASAVA_Build 10 12741647 1I GAGGAAATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 23 18 10 T 9 10 128667 CASAVA_Build 10 12751248 2I AAACAAACAA --/AC AAAAACCCCA 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 AC 0 1 128668 CASAVA_Build 10 12755239 1D GTTGAATCTG T/- TTACCAATTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 T 3 2 128669 CASAVA_Build 10 12766791 1I GTTTGGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 11 12 128670 CASAVA_Build 10 12810558 5I TACTGTGTGT -----/CGGAA GAGGTGATCC 3070 hom 165 het 58 0 55 3 CGGAA 0 1 128671 CASAVA_Build 10 12811935 5I CAGGAGGCCT -----/CGTCC CGTCCCATAG 3070 hom 123 het 45 0 39 6 CGTCC 1 2 128672 CASAVA_Build 10 12817789 1I AGTCAGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 34 1 24 9 T 13 14 128673 CASAVA_Build 10 12818727 1D TCTTTTGATG A/- ATAGCACCAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 1 128674 CASAVA_Build 10 12823643 1D CAGGAGCCTC T/- TGTCTTAGGT 3070 hom 73 het 27 0 23 4 T 2 1 128675 CASAVA_Build 10 12833918 1I TTTGCAAGGC -/T TGAGCAATAG 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 T 1 2 128676 CASAVA_Build 10 12839145 1D ATTCACTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 28 15 11 2 T 9 8 128677 CASAVA_Build 10 12840374 1D GTCATAAAAA T/- ATATGACAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 0 128678 CASAVA_Build 10 12852441 1I ATTAGAATAC -/T TTGTGATTGT 3070 het 3070 hom 62 26 36 0 T 2 3 128679 CASAVA_Build 10 12854042 1D CTATCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 2228 het 316 hom 13 1 6 7 A 13 12 128680 CASAVA_Build 10 12856293 2D AATTTTAACT AC/-- AGTGTGCAGG 3070 het 3070 ref 24 10 10 5 AC 1 0 128681 CASAVA_Build 10 12870230 1D GGCCTCACTC T/- TGTTGCCCAG 3070 hom 65 het 23 0 22 1 T 2 1 128682 CASAVA_Build 10 12871814 3I CAACAAGTAC ---/CTT TTTGTCAGCT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 CTT 0 1 128683 CASAVA_Build 10 12908142 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2166 het 2166 ref 21 9 6 6 A 12 11 128684 CASAVA_Build 10 12909184 2D CCCTCTCTCT TC/-- TCTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 15 12 8 TC 3 2 128685 CASAVA_Build 10 12914182 1D CCTGTCTGGG C/- CTCCCTGGCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 2 1 128686 CASAVA_Build 10 12923207 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2695 het 2275 hom 24 8 7 10 A 14 13 128687 CASAVA_Build 10 12947265 2D ATCTTGTGTG TA/-- TGATTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 TA 1 0 128688 CASAVA_Build 10 12957745 2I TTTTATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 AC 5 6 128689 CASAVA_Build 10 12958724 1D GGGAGGAGAT A/- ACACACGATC 3070 hom 103 het 39 0 26 14 A 2 1 128690 CASAVA_Build 10 12963448 2I GTCTCTACCC --/CA AAAAAAAAAA 2715 het 2177 hom 22 8 10 4 CA 0 1 128691 CASAVA_Build 10 12977347 3D AATGCTTTGC TGT/--- TGTTGCTGCC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 TGT 2 1 128692 CASAVA_Build 10 12978128 5D TCTTGTTATG TGAGT/----- TGAGTTTGGA 3070 hom 75 het 33 0 23 12 TGAGT 2 1 128693 CASAVA_Build 10 12979100 1D TGCAGTGTCT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 59 het 24 0 15 10 G 8 7 128694 CASAVA_Build 10 12984836 1I GCAAGACTTA -/C GAGCCCAGAC 3070 het 3070 hom 61 28 28 5 C 0 1 128695 CASAVA_Build 10 12985858 1D CTGATTGTAG A/- AAAAACATTT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 6 5 128696 CASAVA_Build 10 12993210 1I TGTTGCATCA -/C CCTGCTTCTC 3070 het 3070 ref 50 24 23 4 C 2 3 128697 CASAVA_Build 10 13009591 1D TACAAATGGC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 9 8 128698 CASAVA_Build 10 13015963 1I TCTAATTTTT -/A ATTATTACTT 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 A 1 2 128699 CASAVA_Build 10 13019115 1D CCCTGTGGAC T/- TTTTTTTTTT 1683 het 428 hom 21 5 5 12 T 12 11 128700 CASAVA_Build 10 13021627 37D AGATGGTAGG AGCGGATCAATTCTGTCCAGATGAGATACCCTGGGAA/------------------------------------- AGCGGATCAA 2163 het 2163 ref 31 19 5 14 AGCGGATCAATTCTGTCCAGATGAGATACCCTGGGAA 2 1 128701 CASAVA_Build 10 13022337 1D ATGGTGGCTG A/- CATTTCAAGT 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 A 1 0 128702 CASAVA_Build 10 13026612 1D CTCAAGACTT C/- CTGGGGCCAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 C 2 1 128703 CASAVA_Build 10 13030905 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 6 7 128704 CASAVA_Build 10 13035097 1D TTTATACAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 8 128705 CASAVA_Build 10 13045586 3D GTTTTCCGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 1980 het 67 hom 25 1 7 18 T 21 18 128706 CASAVA_Build 10 13046383 1I CATCTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 11 12 128707 CASAVA_Build 10 13077093 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 23 1 18 4 A 14 13 128708 CASAVA_Build 10 13079249 1D TCGTTAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 33 2 21 12 A 15 14 128709 CASAVA_Build 10 13096992 2D GCCAACAAAC AG/-- GGAGTGATTT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AG 1 0 128710 CASAVA_Build 10 13100100 1D GAATGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 11 10 128711 CASAVA_Build 10 13105094 1D TTTTGCACAC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 8 128712 CASAVA_Build 10 13114190 1D AGGCTGGTTG A/- AACATATGCA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 3 2 128713 CASAVA_Build 10 13121429 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1973 hom 26 8 12 6 A 13 14 128714 CASAVA_Build 10 13124913 5D AGACTGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1080 het 145 hom 12 2 5 7 A 21 16 128715 CASAVA_Build 10 13125099 1D TTTTAGGCTT A/- GGGGGTACAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 1 0 128716 CASAVA_Build 10 13126028 1D GCATCTGTTG T/- TTTTTTGACT 3070 hom 51 het 20 0 17 4 T 7 6 128717 CASAVA_Build 10 13128555 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2712 hom 21 het 8 0 8 0 A 9 8 128718 CASAVA_Build 10 13137505 2I CTGGTTAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 10 12 128719 CASAVA_Build 10 13139475 1I TTGTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2909 het 2909 ref 21 8 8 5 A 11 12 128720 CASAVA_Build 10 13142157 5D GTTTCATCAG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 41 14 25 6 AAACA 4 3 128721 CASAVA_Build 10 13144205 1D GCAAGATAAG A/- AAAAAATCAG 3070 hom 106 het 47 0 37 10 A 7 6 128722 CASAVA_Build 10 13149398 1I AAGTGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 10 11 128723 CASAVA_Build 10 13152114 1I TGAGGTAATC -/T TTTTGACTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 4 5 128724 CASAVA_Build 10 13153303 1D GTCCACGCAA C/- CCCCCCTCAA 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 C 7 6 128725 CASAVA_Build 10 13154680 5D TTGCTGAGTT TTTTC/----- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 TTTTC 1 0 128726 CASAVA_Build 10 13155377 7I GAGCTGGAAG -------/AAAACAC ATGCACAGAC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 AAAACAC 0 1 128727 CASAVA_Build 10 13155555 21I TCACCCAGGC ---------------------/TGGAGTGCAGTGGTACGATCA TGGCTCACTG 3070 het 3070 hom 31 9 14 8 TGGAGTGCAGTGGTACGATCA 0 1 128728 CASAVA_Build 10 13161283 3I GGCACGCGTT ---/GTG GTGGCCTTAG 3070 hom 61 het 29 0 20 9 GTG 1 2 128729 CASAVA_Build 10 13161457 1D CCAGTAAAGC A/- ATTCCTTAGT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 2 1 128730 CASAVA_Build 10 13164799 8D CTTCAGCTCC TATCTCTG/-------- TATGGCCTGG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TATCTCTG 1 0 128731 CASAVA_Build 10 13177151 1D CTGTTTTCAG T/- TTCTTTGGAG 3070 het 3070 hom 54 24 23 8 T 3 2 128732 CASAVA_Build 10 13181051 1D GAATTTTTTT A/- AATTCTCTAT 2219 het 2219 ref 20 9 6 5 A 3 2 128733 CASAVA_Build 10 13184954 1I GTCTTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3026 het 3026 ref 24 12 9 3 A 11 12 128734 CASAVA_Build 10 13190551 1D TATTGTACCC T/- TTTTTTTTTT 845 het 845 ref 23 8 4 11 T 15 14 128735 CASAVA_Build 10 13191943 2I GTATCTCAAG --/CC ATGGCTTTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 0 2 128736 CASAVA_Build 10 13193542 1D CATCTCTACT A/- AAAATACAAA 1865 het 1560 hom 17 7 5 5 A 5 4 128737 CASAVA_Build 10 13211579 1I TGGTGGTCTC -/G GAACAGTTGA 3070 hom 82 het 32 0 28 4 G 1 2 128738 CASAVA_Build 10 13222359 2I ATACTCTCTC --/TT TGTTGATATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 3 128739 CASAVA_Build 10 13230877 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1736 het 1576 hom 11 5 5 2 A 13 12 128740 CASAVA_Build 10 13233723 1I TTTTTAAATG -/A AAAAAACTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 128741 CASAVA_Build 10 13234115 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 T 12 11 128742 CASAVA_Build 10 13245599 4I3M4I CCTAAGTAGA ----ATC----/GTGTATCCACG ATACAGTAAG 3070 het 3070 ref 49 29 17 4 N/A 0 0 128743 CASAVA_Build 10 13245694 2I CCCAATAATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 55 21 25 9 TG 8 9 128744 CASAVA_Build 10 13249592 1D GGGGAGGACC G/- GGGGGGGCAT 3070 het 3070 hom 42 15 21 8 G 8 7 128745 CASAVA_Build 10 13250545 2D AGTAGGTCAG AT/-- ATCCTTAATA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 AT 2 1 128746 CASAVA_Build 10 13254885 4I GTCCCCATTG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 AGAA 2 3 128747 CASAVA_Build 10 13262747 3D AATCACCACA CAT/--- CATTGAGTTG 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 CAT 2 1 128748 CASAVA_Build 10 13272124 3I TCGTCACTAC ---/ATT ATTATATAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 ATT 1 2 128749 CASAVA_Build 10 13272534 1D TACAAAATGC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 7 128750 CASAVA_Build 10 13278507 4D ATTTACTATG TTTA/---- TTTATTTATT 2936 het 1856 hom 18 6 7 6 TTTA 4 3 128751 CASAVA_Build 10 13278929 1I TTTCCTTCTC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 37 24 9 4 T 7 8 128752 CASAVA_Build 10 13286997 46D CTCATGTATG TATGTATGTATGTATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------------------- TATATATATA 3070 hom 42 het 15 0 15 5 TATGTATGTATGTATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 128753 CASAVA_Build 10 13289997 4D CTTCTCTCTT TCTC/---- TCTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 TC 4 2 128754 CASAVA_Build 10 13290573 4D CCATCTCTCC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2386 het 2386 ref 23 14 7 3 A 16 12 128755 CASAVA_Build 10 13291994 1I AGAAAGAAGG -/C TGTCTGCTCT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 0 1 128756 CASAVA_Build 10 13297128 2D GACAGGCTGA CT/-- CTTCTGTTAG 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 CT 2 1 128757 CASAVA_Build 10 13298757 3I TCAAACACAT ---/CTC CTTCAAACAC 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 CTC 0 1 128758 CASAVA_Build 10 13301395 2D TCAATGTAAC TG/-- ATAAAAACCA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 TG 1 0 128759 CASAVA_Build 10 13301480 4D AAATCTAAAT AAAC/---- AAAGGCACAC 3070 het 3070 ref 31 17 14 2 AAAC 1 0 128760 CASAVA_Build 10 13302319 1I ACACTGAGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 8 9 128761 CASAVA_Build 10 13305882 1I TTACAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2611 hom 36 10 12 14 A 11 12 128762 CASAVA_Build 10 13313093 3I ATCTCAAATC ---/CTT CTTGGAAGTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTT 1 2 128763 CASAVA_Build 10 13314152 1I GGCCGAGGCA -/G GGGGGGTCAC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 G 6 7 128764 CASAVA_Build 10 13330256 1D GAGACTGGGT A/- ATTTATAAAG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 2 1 128765 CASAVA_Build 10 13334209 1I GAATCGAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 24 0 17 7 T 9 10 128766 CASAVA_Build 10 13338823 3D TTATATAATA TAT/--- TATTATTTAA 2529 het 988 hom 8 2 6 0 TAT 3 2 128767 CASAVA_Build 10 13340691 8I GAAGAAGTCG --------/AAGAGAGA AAGAGAGAGA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AAGAGAGA 1 2 128768 CASAVA_Build 10 13344080 1I CGCCCGGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 11 13 2 T 9 10 128769 CASAVA_Build 10 13344753 4I TTTTTCTGTT ----/ACTC ACCACCAAAA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 ACTC 0 1 128770 CASAVA_Build 10 13347194 1I TTTACTTTGC -/A AAAGCACTCC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 3 4 128771 CASAVA_Build 10 13352565 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 15 3 A 13 12 128772 CASAVA_Build 10 13353915 26D CACCATCTGT TTTCTGTTTCTCACGGTCAAGGGCAG/-------------------------- TTTCTGTTTC 3070 hom 52 het 25 0 17 13 TTTCTGTTTCTCACGGTCAAGGGCAG 2 1 128773 CASAVA_Build 10 13357990 1I TCCTCCCCCC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 63 het 25 0 16 9 A 8 9 128774 CASAVA_Build 10 13360118 1D ACTTTTACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 422 hom 46 1 34 11 T 10 9 128775 CASAVA_Build 10 13372538 1D AGAAAGGATA G/- GGGGACTCTC 3070 hom 108 het 41 0 37 6 G 5 4 128776 CASAVA_Build 10 13374940 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 159 hom 18 1 14 3 A 18 16 128777 CASAVA_Build 10 13378277 19I TACGCTTTAT -------------------/GTTCAAAATGTTAACTATG GTCACCAAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 3 GTTCAAAATGTTAACTATG 0 1 128778 CASAVA_Build 10 13379443 1I TATAACCAAA -/T TACAAGCTAA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 1 2 128779 CASAVA_Build 10 13379841 1I ATGGCTCAGG -/C CTGCAATCCC 3070 hom 12 het 14 0 12 2 C 1 2 128780 CASAVA_Build 10 13386145 7I AAAAAAAAAA -------/AATAAAT AAAAAAAAAT 3070 hom 35 het 17 0 14 3 AATAAAT 0 1 128781 CASAVA_Build 10 13404150 1D TTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 27 0 17 10 T 16 15 128782 CASAVA_Build 10 13408557 1D GATCTATAAC T/- TTTTTTTTTT 1969 het 1969 ref 33 19 5 9 T 15 14 128783 CASAVA_Build 10 13410041 5D ATAGCTCCAG TATCT/----- TAAACTTTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TATCT 1 0 128784 CASAVA_Build 10 13412838 8D ATGTTCTTTT TTTTTAAA/-------- TTTTTTAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TTTTTAAA 1 0 128785 CASAVA_Build 10 13418800 6I ACAGATTCTA ------/AAAATG AAAATGGCTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAAATG 1 2 128786 CASAVA_Build 10 13425684 1I AGCCGGGCAT -/G GTGGCAGGGG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 1 2 128787 CASAVA_Build 10 13428653 1D TTGGAAGGCG T/- TTTCAACAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 4 3 128788 CASAVA_Build 10 13429194 1D CATGGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1104 het 75 hom 18 1 7 10 T 11 10 128789 CASAVA_Build 10 13430846 1I GTTTACGGTT -/C CCCCGCTGGT 3070 hom 98 het 36 0 29 7 C 4 5 128790 CASAVA_Build 10 13450835 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 2440 het 39 hom 23 1 11 11 A 15 14 128791 CASAVA_Build 10 13453260 1D ATCATTATTT A/- AAAAAAAAAA 1248 het 1248 ref 19 9 6 4 A 17 16 128792 CASAVA_Build 10 13461638 1D ATAAAAAAAC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 7 6 128793 CASAVA_Build 10 13463062 1D CCATCTATAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 61 het 25 0 19 6 A 7 6 128794 CASAVA_Build 10 13509483 4D AAGCAATAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AAAG 3 2 128795 CASAVA_Build 10 13511614 4I AAGAAAACAA ----/ACAG ACAATCACAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ACAG 0 1 128796 CASAVA_Build 10 13518855 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 7 6 128797 CASAVA_Build 10 13534403 2D ATAAGACTTT AA/-- GAGAGCAAAT 3070 het 3070 hom 42 14 22 7 A 2 0 128798 CASAVA_Build 10 13543739 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2832 hom 17 8 8 1 A 13 14 128799 CASAVA_Build 10 13545201 1D AGCAGAATAT A/- AAATAACTCC 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 A 4 3 128800 CASAVA_Build 10 13547891 2D TCTCTCTCTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2570 hom 39 10 10 20 GT 9 8 128801 CASAVA_Build 10 13548565 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 13 12 128802 CASAVA_Build 10 13551372 1D CGCCTCTCTC A/- TGCTAAGGGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 1 0 128803 CASAVA_Build 10 13557714 1I TAAAGAATCC -/A AAATGCTAGA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 3 4 128804 CASAVA_Build 10 13560598 3D GTAAGAATGT ATA/--- ATACCATAAT 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 ATA 2 1 128805 CASAVA_Build 10 13561815 7I GAAGGCTTAT -------/GTCCTTC GTCCTTCTGG 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 GTCCTTC 1 2 128806 CASAVA_Build 10 13562602 4I GAGGAAGCTC ----/TTAG TTAGAAATTA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 TTAG 1 2 128807 CASAVA_Build 10 13581731 5I ATTTAGAAAT -----/AAAAC AGAACAGTAC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 AAAAC 0 1 128808 CASAVA_Build 10 13583852 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2628 hom 25 10 10 6 A 14 13 128809 CASAVA_Build 10 13584070 2I TAAGGATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 TA 6 7 128810 CASAVA_Build 10 13596097 6I AGGTCTCAGT ------/TTCAAG TTCATTTTCT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TTCAAG 0 1 128811 CASAVA_Build 10 13596594 1D AACCAGGGAA G/- TTGGGTCGGA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 G 1 0 128812 CASAVA_Build 10 13604139 2I GCAATGAATT --/TC TGTTGAATGA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TC 0 1 128813 CASAVA_Build 10 13609233 1I ACGGATGTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 9 10 128814 CASAVA_Build 10 13630665 1I TAATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 778 hom 40 2 28 10 A 13 14 128815 CASAVA_Build 10 13631016 1D CTCCCTTAGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 9 8 128816 CASAVA_Build 10 13642441 10I CTCCAACCTG ----------/AGTTTTTATA AGCCTGCTTG 3070 hom 75 het 30 0 24 6 AGTTTTTATA 0 1 128817 CASAVA_Build 10 13650411 1D TAAACAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2108 hom 31 7 13 11 T 11 10 128818 CASAVA_Build 10 13653618 1I CCCAGGCTGG -/A AGTACAGTGG 3070 het 3070 hom 30 13 12 6 A 1 2 128819 CASAVA_Build 10 13656442 4D TCCCTCCCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 2388 het 1792 hom 28 7 11 11 CCTT 4 3 128820 CASAVA_Build 10 13661948 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 545 hom 45 2 37 6 T 11 10 128821 CASAVA_Build 10 13665775 4D CTTTGCTGTT TAAG/---- TTACATTCCA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TAAG 1 0 128822 CASAVA_Build 10 13666015 1I AAAATTTAAC -/T TTTTTAAGGT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 5 6 128823 CASAVA_Build 10 13668360 1D GGTTGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 12 11 128824 CASAVA_Build 10 13672128 1I AATGATCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 11 128825 CASAVA_Build 10 13677413 3I TCTTTCTACA ---/CAT CAGCCCTTTC 3070 hom 107 het 43 0 33 10 CAT 0 1 128826 CASAVA_Build 10 13684517 1I TTTCATTATG -/T TTTTTTTTTT 1836 het 1836 ref 32 18 4 10 T 11 12 128827 CASAVA_Build 10 13699553 1I CTTTTAGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 38 1 28 9 A 12 13 128828 CASAVA_Build 10 13719097 1I CTGATGATGG -/A ACATGTGAGT 3070 het 3070 ref 51 32 18 1 A 1 2 128829 CASAVA_Build 10 13720897 1D GCTGCCTTCC T/- GTGGGCCTCA 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 T 1 0 128830 CASAVA_Build 10 13721192 3D CAGATGGAAC TGA/--- TGTTAAAAGC 3070 het 3070 ref 42 21 16 8 TGA 1 0 128831 CASAVA_Build 10 13721526 1I AACGTGGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 10 11 128832 CASAVA_Build 10 13722298 1I TTCACTATCT -/G GTTGACAGTT 3070 het 2820 hom 34 7 22 5 G 1 2 128833 CASAVA_Build 10 13722617 8D AGTCTCCTCA AGACCTAT/-------- GTCCAATCAG 3070 het 3070 ref 63 33 24 8 AGACCTAT 1 0 128834 CASAVA_Build 10 13723522 1I AGATGGGAAC -/T TTTAAGGAAT 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 T 3 4 128835 CASAVA_Build 10 13724049 2I GTTCTTCAGC --/TA TTTGCTGGAG 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 TA 0 1 128836 CASAVA_Build 10 13724557 4I ATGAAAGGGC ----/AGAT AGATAAACAG 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 AGAT 1 2 128837 CASAVA_Build 10 13727370 1I TCCACCCCCA -/C CCCCATCCCC 3070 hom 49 het 19 0 16 3 C 4 5 128838 CASAVA_Build 10 13730026 1I GGTACCAAAC -/A ACAGCTTCAC 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 A 1 2 128839 CASAVA_Build 10 13739795 1I GATTTCTGGG -/T TTTTTTTTTT 2336 het 2336 ref 35 17 8 10 T 15 16 128840 CASAVA_Build 10 13741874 1I CTTCCCCCCC -/A AAAAAAAACC 3070 het 188 hom 24 1 22 1 A 8 9 128841 CASAVA_Build 10 13745053 1I TACAAAAATT -/A GCCAGGTGTG 3070 hom 22 het 32 1 25 7 A 0 1 128842 CASAVA_Build 10 13745196 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2550 het 698 hom 22 7 8 8 A 16 15 128843 CASAVA_Build 10 13745314 2D GAGGTGAATA CT/-- GGGAAATGAG 3070 hom 99 het 35 0 33 4 CT 1 0 128844 CASAVA_Build 10 13746711 1D CATGTTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 10 8 11 T 13 12 128845 CASAVA_Build 10 13763491 3I TTGTCCAAAC ---/ATA ATGAGTTGGT 3070 het 3070 ref 57 28 22 7 ATA 0 1 128846 CASAVA_Build 10 13764070 1I TACAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2907 hom 27 10 13 4 A 11 12 128847 CASAVA_Build 10 13771205 12D AACTCTTTGC GGGGGGGGGGGG/------------ GGGGGGGGGG 3070 het 173 hom 23 3 15 5 G 22 10 128848 CASAVA_Build 10 13774673 2I CTCCTGGCTA --/TG TGATTGGATC 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 TG 1 2 128849 CASAVA_Build 10 13776850 2D CCTGTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 23 2 11 10 A 12 10 128850 CASAVA_Build 10 13778749 2I TAGAGTGAGA --/CT CTGTCTAAAA 2928 het 2928 ref 24 10 7 7 CT 1 2 128851 CASAVA_Build 10 13781001 1D CTAATGCTAT G/- GGGCATTTGG 3070 het 3070 ref 46 20 22 4 G 4 3 128852 CASAVA_Build 10 13781061 1I TACAATAATC -/T TTTTTTTTTT 2583 het 1213 hom 25 10 10 6 T 17 18 128853 CASAVA_Build 10 13782282 2I CTTATCACCT --/CC CCCCCTTGAC 3070 hom 45 het 19 0 13 6 C 5 7 128854 CASAVA_Build 10 13784920 2D AAAGTGAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 1091 het 279 hom 19 4 5 10 A 18 16 128855 CASAVA_Build 10 13797059 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2097 het 2097 ref 19 12 7 0 A 11 10 128856 CASAVA_Build 10 13810450 10D AGTTGCCACT GAAACTCACC/---------- GAGTCTGACT 3070 hom 66 het 25 0 21 5 GAAACTCACC 1 0 128857 CASAVA_Build 10 13811199 3I GATAACATAC ---/GAG GAGAAGGCCC 3070 hom 54 het 21 0 17 5 GAG 1 2 128858 CASAVA_Build 10 13813034 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2198 hom 19 8 8 3 A 13 12 128859 CASAVA_Build 10 13814339 1I GCTTTTTTGT -/G GGGGATGAGG 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 G 4 5 128860 CASAVA_Build 10 13816663 1D CTTCTCCTTA C/- ACCCAGTTGA 2560 het 2560 ref 21 12 6 4 C 1 0 128861 CASAVA_Build 10 13820636 1I TGTTTATTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 T 9 10 128862 CASAVA_Build 10 13836296 1I ATCATCCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 11 11 A 10 11 128863 CASAVA_Build 10 13856966 1I GAAAAAAAAA -/C AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 29 15 13 1 C 0 1 128864 CASAVA_Build 10 13857908 1D GTAACTAAAT A/- AGTGAAAGCA 3070 het 3070 ref 52 25 20 8 A 2 1 128865 CASAVA_Build 10 13859351 12I TATATATAAA ------------/AAATTTAAAAAT AAATTTAAAT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 AAATTTAAAAAT 0 1 128866 CASAVA_Build 10 13861326 1D CATCTCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 12 10 A 14 13 128867 CASAVA_Build 10 13864155 1D AATTTTTTTT A/- AAAAAGAAAC 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 A 6 5 128868 CASAVA_Build 10 13865550 4I ACCACCACGC ----/CTGA CTAATTTTTT 2902 het 2902 ref 25 12 8 5 CTGA 0 1 128869 CASAVA_Build 10 13869884 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2876 het 203 hom 21 2 10 10 A 13 12 128870 CASAVA_Build 10 13870843 1I CGTCCCCTTC -/T TTTGACAAGT 3070 hom 41 het 20 0 14 6 T 3 4 128871 CASAVA_Build 10 13871140 1D TGCAGCCAAG C/- CTCTGATGCT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 C 2 1 128872 CASAVA_Build 10 13872704 1D TCCAGTGACC A/- GGGGGTACGA 3070 hom 51 het 18 0 16 5 A 1 0 128873 CASAVA_Build 10 13882022 2I CATCTCTACT --/AA AAAAAAAAAT 2592 hom 15 het 6 0 6 0 A 9 11 128874 CASAVA_Build 10 13885663 1I CTTTTCTAGC -/A GCTTCTACAC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 0 1 128875 CASAVA_Build 10 13889572 1D TTGCTAACAA T/- ATTAAACATT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 1 0 128876 CASAVA_Build 10 13889807 1I TTAGAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1659 hom 35 4 17 14 T 15 16 128877 CASAVA_Build 10 13891526 1I AAAAGCTTTT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 8 128878 CASAVA_Build 10 13893578 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 26 3 11 12 A 15 14 128879 CASAVA_Build 10 13900259 1I CAGCCTCCAA -/C TCCTGGGATC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 0 1 128880 CASAVA_Build 10 13901156 2D ACAAAACAAA AC/-- AAAATCCCCA 3070 hom 108 het 40 0 37 5 AC 1 0 128881 CASAVA_Build 10 13904055 2D AATGGAAACG AT/-- ATATATATAT 2117 het 2117 ref 44 34 6 4 AT 7 6 128882 CASAVA_Build 10 13913942 1I AGCTCAGGGC -/T TTTTTTAGCC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 6 7 128883 CASAVA_Build 10 13922586 1D CTTGAGGTCA G/- GAGTTCAAAA 3070 het 1732 hom 20 8 11 1 G 2 1 128884 CASAVA_Build 10 13939500 14D TATGAGCCTT TTTCCTATTTTCTG/-------------- TTTCCTATAT 3070 het 3070 ref 39 23 19 7 TTTCCTATTTTCTG 1 0 128885 CASAVA_Build 10 13939826 3D ATTGGCATTG AAC/--- AACAGATCTG 3070 het 3070 hom 45 20 22 4 AAC 2 1 128886 CASAVA_Build 10 13944945 1D TTCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1266 hom 25 5 15 5 T 11 10 128887 CASAVA_Build 10 13944956 1D TTTTTTTTTT G/- TTTCTTTTTT 3070 het 1332 hom 22 5 16 1 G 1 0 128888 CASAVA_Build 10 13945434 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2081 het 1262 hom 14 4 7 3 A 13 12 128889 CASAVA_Build 10 13945760 1I AATATGTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 150 hom 27 1 23 3 T 9 10 128890 CASAVA_Build 10 13952688 5D CACGCTCCGT CCTCC/----- CCTCCCCTCC 3070 hom 92 het 41 0 29 14 CCTCC 4 3 128891 CASAVA_Build 10 13955190 2D CTCAAAAAAA AT/-- AAAATAAAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AT 1 0 128892 CASAVA_Build 10 13968237 1I GCCGTTTTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 8 9 128893 CASAVA_Build 10 13986262 1D CCAAGGAGAA C/- GCTCCTACAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 1 0 128894 CASAVA_Build 10 13989868 1I AAAGTCACTT -/A AAAAAAAAAA 2921 hom 30 het 18 0 10 8 A 13 14 128895 CASAVA_Build 10 14004308 1D GTGAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 12 11 128896 CASAVA_Build 10 14006417 1I TTCTCGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2124 hom 34 6 14 14 T 11 12 128897 CASAVA_Build 10 14009259 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 10 128898 CASAVA_Build 10 14015165 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 12 11 128899 CASAVA_Build 10 14015295 1I ACTTTGTAAC -/T TTACTTCATC 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 2 3 128900 CASAVA_Build 10 14026298 1D GGAGCACGAA C/- CCTGTTCGTG 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 3 2 128901 CASAVA_Build 10 14034153 1D TTTTATACTC T/- TTTTTCTGAT 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 T 6 5 128902 CASAVA_Build 10 14050846 1D GACTAACAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 458 hom 23 1 15 9 T 10 9 128903 CASAVA_Build 10 14084782 1I GGATGGGGTG -/C CTGGAAGAGC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 C 1 2 128904 CASAVA_Build 10 14085677 3D GCCCAAACTA CAG/--- CAGCAGAGAA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 CAG 3 2 128905 CASAVA_Build 10 14091820 2I TGAGAGAGAC --/AG GGGGAGACGG 3070 hom 105 het 42 0 34 8 AG 0 1 128906 CASAVA_Build 10 14111816 2D AGTTTACATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 26 1 15 12 A 16 14 128907 CASAVA_Build 10 14119665 1D ATGTGTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 28 5 A 10 9 128908 CASAVA_Build 10 14134730 2I TAACTGGCTA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 24 het 16 0 9 7 T 9 11 128909 CASAVA_Build 10 14139577 6D GAATTTATAA TCTTTT/------ TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 21 0 19 3 TCTTTT 1 0 128910 CASAVA_Build 10 14140946 1I TGATCAAGGG -/A AAAAATGCCC 3070 hom 153 het 55 0 51 4 A 5 6 128911 CASAVA_Build 10 14143028 1I ACCAATAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 9 10 128912 CASAVA_Build 10 14145184 1I ATAAATCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 32 1 28 3 T 10 11 128913 CASAVA_Build 10 14145567 1I TTTTCTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 48 1 38 9 A 11 12 128914 CASAVA_Build 10 14157761 2I TTATATTTAT --/AC ACACACACAT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 AC 4 5 128915 CASAVA_Build 10 14170454 1D TTCCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 975 het 975 ref 23 6 7 10 A 15 14 128916 CASAVA_Build 10 14181349 1D GACAGAAGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 9 8 128917 CASAVA_Build 10 14188874 9I TATATACCCA ---------/AAATAAAAG AAATCATTCT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 AAATAAAAG 0 1 128918 CASAVA_Build 10 14250967 1D ATGCCTTGAA G/- GGGGGTTGTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 6 5 128919 CASAVA_Build 10 14251117 1I10M6I GGCTTTATGG -AAAAATTAAA------/TAAAAATTTAATAGCAT CATAAAAATA 3070 hom 111 het 40 0 37 5 N/A 0 0 128920 CASAVA_Build 10 14252831 1I TCTTCTCCCC -/T GTCCTCTCCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 0 1 128921 CASAVA_Build 10 14253044 1I TATTTGTTTG -/T TTTTTTGCGA 3070 hom 38 het 22 0 11 11 T 6 7 128922 CASAVA_Build 10 14266497 1I CTATTATGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 8 9 128923 CASAVA_Build 10 14267623 2D CAGAAAGGGG AT/-- ATATACTTCA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 AT 3 2 128924 CASAVA_Build 10 14282034 1D ATTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 477 hom 34 2 20 12 T 13 12 128925 CASAVA_Build 10 14284146 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 21 0 20 2 A 13 12 128926 CASAVA_Build 10 14303731 1D CGCCGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 21 1 15 5 T 12 11 128927 CASAVA_Build 10 14309885 1I CTGGCCAGAA -/T TTTTTTTTTT 2267 het 2267 ref 29 16 7 6 T 10 11 128928 CASAVA_Build 10 14315423 1D AAAAATATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 6 128929 CASAVA_Build 10 14316230 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 32 0 26 6 A 11 10 128930 CASAVA_Build 10 14316713 1D GCTCGATGCT A/- AAAACCAATT 3070 het 3070 ref 55 27 20 8 A 5 4 128931 CASAVA_Build 10 14325070 8D TCCATCCATT CATCCATC/-------- CATCCATACA 3070 het 3070 ref 56 29 17 14 CATC 3 1 128932 CASAVA_Build 10 14325287 1I ATTGGATCAT -/G GGGGGCGGTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 G 5 6 128933 CASAVA_Build 10 14330209 4I TAGAAAACTA ----/ATGC ATCTGCCCAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATGC 0 1 128934 CASAVA_Build 10 14330486 1I ATTCAATTCA -/T TTTTTTACAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 6 7 128935 CASAVA_Build 10 14331357 1I AATCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2160 het 2160 ref 22 9 8 5 A 13 14 128936 CASAVA_Build 10 14340328 1I GGTTTTAACT -/G AAAAAAAAAA 3070 het 2473 hom 20 6 12 2 G 0 1 128937 CASAVA_Build 10 14342029 1D TAGAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2776 hom 38 11 10 18 A 17 16 128938 CASAVA_Build 10 14350148 1D ACTAAAAAAA T/- GAGAAATAAT 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 T 1 0 128939 CASAVA_Build 10 14364638 1D GTGTGGGGGA C/- CCTTCCAGGA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 C 3 2 128940 CASAVA_Build 10 14392180 1D TTTTGCTCAG C/- CCTTCCCTTG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 3 2 128941 CASAVA_Build 10 14395196 1D CATTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 25 0 21 4 A 12 11 128942 CASAVA_Build 10 14395638 5D TTGGACAGGA ATCTG/----- ATTGGTGTCA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 ATCTG 1 0 128943 CASAVA_Build 10 14396955 1I TTATATATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 10 11 128944 CASAVA_Build 10 14400324 1D CAAGCTATAT C/- CCCCCCCACC 1025 het 1025 ref 40 9 7 24 C 8 7 128945 CASAVA_Build 10 14405593 1D ATCCTTTTTG C/- CCTTCCTAGC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 C 3 2 128946 CASAVA_Build 10 14414720 1I TAAGAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1326 hom 27 3 22 2 A 11 12 128947 CASAVA_Build 10 14420619 1I GAAGTCAGAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 128948 CASAVA_Build 10 14423667 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 10 11 128949 CASAVA_Build 10 14425186 1I CTATTATCCC -/T AATAGCTTTC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 0 1 128950 CASAVA_Build 10 14432813 2D AAACAAACAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 177 hom 47 1 45 1 AC 1 0 128951 CASAVA_Build 10 14443036 3D TCTAGCTGAA AAG/--- AAAACAGCTG 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 AAG 1 0 128952 CASAVA_Build 10 14458685 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAC 1115 het 240 hom 9 3 3 3 A 10 9 128953 CASAVA_Build 10 14463387 6D CACCACCTTC ACTGCT/------ ACATCCTCAA 3070 het 3070 ref 59 25 28 9 ACTGCT 1 0 128954 CASAVA_Build 10 14466249 9I CAAAACCACA ---------/GTGAGATGG GACTTCACAT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 GTGAGATGG 0 1 128955 CASAVA_Build 10 14473141 1I AGAAGTTGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 8 9 128956 CASAVA_Build 10 14480399 1D TTAATTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 13 12 128957 CASAVA_Build 10 14486025 3I GTTACCCTAC ---/ATT ATGTCAACAG 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 ATT 0 1 128958 CASAVA_Build 10 14487842 4D TGGGTCGAGT TGGC/---- TGGCACGGGT 3070 hom 111 het 42 0 36 9 TGGC 2 1 128959 CASAVA_Build 10 14493605 1I CCTCTGTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 9 10 128960 CASAVA_Build 10 14503467 2D GTCTGCTCTA TC/-- TCTTTCAAAG 3070 het 3070 ref 49 28 15 6 TC 2 1 128961 CASAVA_Build 10 14503996 1I GCCGACAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 11 12 128962 CASAVA_Build 10 14509618 1D CAGCCTGGGC A/- CTGCTCTGCC 3070 het 3070 ref 35 16 13 9 A 1 0 128963 CASAVA_Build 10 14516005 2D TGGTGCCTCC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 9 hom 37 1 27 10 CT 7 6 128964 CASAVA_Build 10 14517497 2D GGGTTAGGAA AG/-- AGTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 AG 2 1 128965 CASAVA_Build 10 14520324 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 20 0 8 12 A 12 13 128966 CASAVA_Build 10 14522982 4I AATGTAAATG ----/ACGA GTTAATGGGT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 ACGA 0 1 128967 CASAVA_Build 10 14525670 5D ATATTATGAT ATATA/----- ATATATATTT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 ATATA 2 1 128968 CASAVA_Build 10 14526454 1I ACAGGCTATG -/A AAAAAATATT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 6 7 128969 CASAVA_Build 10 14531552 2D ACACACATAA AC/-- ACACACATAG 3070 het 3070 ref 97 45 41 13 AC 4 3 128970 CASAVA_Build 10 14533563 1D AGAGGGACCC A/- AGGGGGAGGT 3070 hom 72 het 27 0 23 4 A 2 1 128971 CASAVA_Build 10 14542902 1D AAAATATCAC T/- TATTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 2 1 128972 CASAVA_Build 10 14547650 6I CTGCACTCCA ------/GTCTGG GTGACAGAGT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 GTCTGG 0 1 128973 CASAVA_Build 10 14550558 1I CCACTCAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 10 19 11 A 10 11 128974 CASAVA_Build 10 14552918 2I CTACAAAGGT --/CA CACAAACAAC 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 CA 2 3 128975 CASAVA_Build 10 14562201 1I AATTCGATTT -/G GGGGAACCGT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 4 5 128976 CASAVA_Build 10 14567768 3D CCTATTTATC CTT/--- CTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 CTT 2 1 128977 CASAVA_Build 10 14574789 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 72 het 25 0 24 2 AAAG 5 4 128978 CASAVA_Build 10 14576485 1D AGGTTCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 25 2 19 4 A 13 12 128979 CASAVA_Build 10 14584950 3D9M2D8M9D TTTTACTTTT AAGTAAAATATTAAGTAAATACAGATATTTA/---TTAAGTGTT--GTGTGTAC--------- CTTAAATATC 3070 hom 126 het 42 0 43 7 N/A 0 0 128980 CASAVA_Build 10 14593355 1I TGTTCATATA -/T TATATATATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 2 128981 CASAVA_Build 10 14598606 4D TCAGGTATAC TCAA/---- TCTATAGCCG 3070 hom 69 het 29 0 24 10 TCAA 1 0 128982 CASAVA_Build 10 14601164 1D CTTAAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 1703 het 1703 ref 31 26 4 1 T 12 11 128983 CASAVA_Build 10 14617603 4D GTCTAAAAAG GTCT/---- GTCTATCACA 3070 hom 88 het 31 0 30 2 GTCT 2 1 128984 CASAVA_Build 10 14634477 1I CCCAACAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 886 hom 47 2 35 10 A 11 12 128985 CASAVA_Build 10 14637213 1D AAGCACCCAT A/- AAGCCTAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 3 2 128986 CASAVA_Build 10 14640199 4D TGTGTGCACA CACT/---- CACGTGCACG 3070 hom 159 het 55 0 50 6 CACT 1 0 128987 CASAVA_Build 10 14640596 1D CTGATCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 37 1 33 3 T 11 10 128988 CASAVA_Build 10 14641744 2D GCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1288 hom 28 het 13 0 9 4 T 16 14 128989 CASAVA_Build 10 14645576 1I GATAGACAAA -/T TTTTAATGTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 4 5 128990 CASAVA_Build 10 14645970 1I CATCTCATAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 4 hom 47 1 40 6 T 8 9 128991 CASAVA_Build 10 14650524 3D34M3D GGAGGCTGGC TGATGATCTCAGGGTTAGACCAGGAGGTGAAGATACTCAG/---TGATCTCTGGGTTAGACCAGGAGGTGAAGATACT--- GTAAGAGGAG 1520 het 1520 ref 83 89 5 27 N/A 0 0 128992 CASAVA_Build 10 14652807 1I62M1D ACTCCATCTC -AAAAAAAAAAGAAGTAAATTAAACTCAGCACATATCAGTGTTTTGTTGTGGTCATGTGTTCAT/AAAAAAAAAAAGAAGTAAATTAAACTCAGCACATATCAGTGTTTTGTTGTGGTCATGTGTTCA- TTTTTTTTTT 3070 het 2603 hom 18 13 18 17 N/A 0 0 128993 CASAVA_Build 10 14655965 9I TATCTGCTCT ---------/TTCTGCTCC TTCTCTCATA 3070 hom 102 het 39 0 33 6 TTCTGCTCC 0 1 128994 CASAVA_Build 10 14662025 1D ACTTCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 24 1 19 4 A 15 14 128995 CASAVA_Build 10 14708261 3D TTGCTCCCTT CTC/--- CTCTGTCTTC 3070 hom 108 het 37 0 37 3 CTC 2 1 128996 CASAVA_Build 10 14725416 1D GTCAGTCTAA T/- TTTTTTTTTT 1962 het 1962 ref 51 23 6 22 T 17 16 128997 CASAVA_Build 10 14732216 1I TCGCATACAG -/T TTTTTTTTTT 1558 het 1558 ref 52 34 4 14 T 11 12 128998 CASAVA_Build 10 14734161 1D TTCAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 29 1 23 5 A 11 10 128999 CASAVA_Build 10 14749874 5D28M2D ATAAATGCCA AGTAGAGTAGAGTAACTACAGGGGCGTTGGGTGAC/-----AGTAGAGTAACTACAGGGGCGTTGGGTG-- ACAACTCCAG 3070 het 3070 ref 35 21 15 5 N/A 0 0 129000 CASAVA_Build 10 14753072 10D CTCTTTAAAG CCATCTCATC/---------- CCATCTCATC 3070 het 3070 hom 40 15 23 8 CCATCTCATC 2 1 129001 CASAVA_Build 10 14754110 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 2963 hom 24 het 16 0 9 7 T 11 12 129002 CASAVA_Build 10 14765230 7D TTTTGGGAAA TCTAATC/------- TACAGTGGAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 6 TCTAATC 1 0 129003 CASAVA_Build 10 14766833 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 T 11 10 129004 CASAVA_Build 10 14767143 5D AATAACATCC TTTTA/----- TTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 26 7 18 1 TTTTA 1 0 129005 CASAVA_Build 10 14772938 8D TGGGCATTTG TTGATTGA/-------- TTGATTGATT 3070 het 3070 ref 46 22 19 8 TTGA 5 3 129006 CASAVA_Build 10 14775481 1I ACACCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2918 het 2918 ref 31 12 11 8 A 14 15 129007 CASAVA_Build 10 14775560 1D GAAGCAAATT A/- ACACATCCAT 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 A 2 1 129008 CASAVA_Build 10 14785053 1D CATTCATTCT C/- CCAGGTAATC 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 C 3 2 129009 CASAVA_Build 10 14789376 2D40M1D ATTCTCAAAG ACACACAAAGAGGGACTGCATCATCACTCCAGCAGCTCAGAGA/--ACACAAAGAGGGACTGCATCATCACTCCAGCAGCTCAGAG- AGTTTGCGTT 3070 hom 135 het 39 0 46 10 N/A 0 0 129010 CASAVA_Build 10 14794632 6I ACAAAAAAAA ------/AAGAAG AAGAAGAAGA 3070 het 2225 hom 27 8 9 10 AAG 4 6 129011 CASAVA_Build 10 14799763 2I CCCCTCCCAG --/AC ACACCCAAGA 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 AC 2 3 129012 CASAVA_Build 10 14811509 1I TGTCAGGGGG -/A CATAAGTATG 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 A 0 1 129013 CASAVA_Build 10 14817297 1I TTTTTTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2764 hom 28 8 13 7 T 11 12 129014 CASAVA_Build 10 14845517 1D GGTGAAAATA C/- CTCAGGCCTA 3070 het 3070 ref 50 20 18 13 C 2 1 129015 CASAVA_Build 10 14855657 1I AGTGGCACCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 129016 CASAVA_Build 10 14862268 1D AGACTCCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 A 11 10 129017 CASAVA_Build 10 14863131 1D GCTATCTATC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 20 19 3 A 10 9 129018 CASAVA_Build 10 14878423 1I CCACTTTCTT -/A AAGTATTAGA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 2 3 129019 CASAVA_Build 10 14885383 1D8M1D TGTCATTGGA GGGCAATAAT/-GGCAATAA- TGTGAATGCA 3070 hom 163 het 53 0 55 3 N/A 0 0 129020 CASAVA_Build 10 14907159 1I20M1D GACAGGGTTT -ACCATATTGGCCAGGCTGGTA/CACCATATTGGCCAGGCTGGT- CTTGAACTCC 3070 hom 36 het 12 0 11 6 N/A 0 0 129021 CASAVA_Build 10 14930674 2D TGAGTATGGT TC/-- TGTTATTGCT 3070 het 3070 hom 36 12 18 7 TC 1 0 129022 CASAVA_Build 10 14989863 11D TTTTTTTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 2329 hom 27 8 11 8 T 21 10 129023 CASAVA_Build 10 15010792 1D GTGTATGGTG T/- TTTTTTTTTT 1231 het 1231 ref 36 13 5 18 T 17 16 129024 CASAVA_Build 10 15028673 1I GCTAAAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2733 hom 39 9 15 15 T 11 12 129025 CASAVA_Build 10 15042147 1I TCTTTAAGTT -/C AGGAAACAGG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 0 1 129026 CASAVA_Build 10 15049191 1I GGTAGACCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 23 14 9 A 9 10 129027 CASAVA_Build 10 15049838 1I ATGACAAACC -/T TTTTCTTAAT 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 T 4 5 129028 CASAVA_Build 10 15053548 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 A 11 10 129029 CASAVA_Build 10 15114626 7D ACTCAGTTTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2945 het 1198 hom 20 6 8 9 A 19 12 129030 CASAVA_Build 10 15125483 1D TCTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1002 het 1002 ref 40 20 5 15 T 17 16 129031 CASAVA_Build 10 15174835 1D AGGAAAAGGC G/- GGGGGGGGGG 934 het 53 hom 10 1 4 5 G 12 11 129032 CASAVA_Build 10 15184200 1D GCTCAGATCA T/- TTTTTTTTTT 2123 het 1541 hom 45 13 9 23 T 19 18 129033 CASAVA_Build 10 15249187 2D TCCTCTCTTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 11 9 129034 CASAVA_Build 10 15254171 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 11 1 8 2 A 18 17 129035 CASAVA_Build 10 15264439 1I GAGCTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 104 hom 33 2 29 2 A 13 14 129036 CASAVA_Build 10 15264452 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 2212 het 707 hom 36 9 13 14 G 1 0 129037 CASAVA_Build 10 15273378 2D TTTTGTGGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 550 hom 32 5 11 16 T 14 12 129038 CASAVA_Build 10 15283327 1I TGAGGTGGGA -/G GGTTGCTTGA 3070 hom 87 het 31 0 28 3 G 2 3 129039 CASAVA_Build 10 15285294 14D CCATTCCCCA CACCCCTATGATTG/-------------- CACCCCCAAC 3070 het 3070 hom 34 13 21 7 CACCCCTATGATTG 1 0 129040 CASAVA_Build 10 15293540 3I GGCCTCCCAA ---/AGT AGTGCTGGGA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AGT 1 2 129041 CASAVA_Build 10 15298838 1D TATTGCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 496 hom 35 2 19 14 A 16 15 129042 CASAVA_Build 10 15312649 1I AAGCAACTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 T 9 10 129043 CASAVA_Build 10 15316663 1I TGTACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1800 het 647 hom 18 2 7 9 T 13 14 129044 CASAVA_Build 10 15316834 1D ATTTTTATTT A/- TTTTTTGTAT 2415 het 993 hom 11 4 7 0 A 1 0 129045 CASAVA_Build 10 15318868 1D AGGCTGAGGC A/- GGAGGATCAC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 1 0 129046 CASAVA_Build 10 15319791 1I ACCCCCTTTT -/C CCCCTACCGG 3070 hom 17 het 33 1 22 10 C 4 5 129047 CASAVA_Build 10 15325806 1I2M7D2M3D CAGTCAATGT -ATACATTGACTGAG/GAT-------CT--- CAGCTCACCG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 N/A 0 0 129048 CASAVA_Build 10 15340340 1D CTCTGCTTTC A/- AAAATCTGTT 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 5 4 129049 CASAVA_Build 10 15349891 7I CAAACACCTC -------/ACTAAGA ACAGTGCTGC 3070 hom 162 het 59 0 52 7 ACTAAGA 0 1 129050 CASAVA_Build 10 15361525 1D ACCAAGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 34 1 25 8 T 12 11 129051 CASAVA_Build 10 15363871 1I CTCCAAAAAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 7 8 129052 CASAVA_Build 10 15374912 1D ACTTATTCAA T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 8 7 129053 CASAVA_Build 10 15375563 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 0 129054 CASAVA_Build 10 15378859 1I GCTGGAACTT -/A AGAGTACCAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 129055 CASAVA_Build 10 15404855 1D AAAGTACACC T/- TTTTTTTGGC 1751 het 1751 ref 42 31 4 7 T 8 7 129056 CASAVA_Build 10 15411633 2D CATCTCACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 33 1 15 17 A 18 16 129057 CASAVA_Build 10 15414921 1I TTAAAGGGTG -/T TTCAAGCAAA 3070 hom 150 het 61 0 50 11 T 2 3 129058 CASAVA_Build 10 15418321 1I AAGACCCAGA -/T TTTTTTTTTT 2232 het 2232 ref 24 7 8 9 T 13 14 129059 CASAVA_Build 10 15418801 3D CCAAGGATAC AAT/--- GATTGCAGTG 3070 het 3070 hom 38 17 17 7 AAT 1 0 129060 CASAVA_Build 10 15452107 1I AAAACGCTGA -/T TTTTAAAAAC 3070 hom 37 het 17 0 11 6 T 4 5 129061 CASAVA_Build 10 15454547 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAATTAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 7 6 129062 CASAVA_Build 10 15459818 2D AAACGACAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 12 10 129063 CASAVA_Build 10 15471778 4I AACAAAAACT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 60 het 29 0 20 9 AAAC 2 3 129064 CASAVA_Build 10 15473274 12I TGTAATCCCA ------------/GCTACTCGGGAG GCTGAGGCAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 GCTACTCGGGAG 0 1 129065 CASAVA_Build 10 15479992 4D CAAAAGTGAG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 55 het 24 0 15 10 TC 11 9 129066 CASAVA_Build 10 15482930 1I AATAATCTGT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 8 9 129067 CASAVA_Build 10 15485548 4I AACATACGCA ----/AATC AATCAATGTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AATC 1 2 129068 CASAVA_Build 10 15485791 1D AAGATAAGGA T/- GCCCACATTC 3070 hom 120 het 46 0 39 8 T 1 0 129069 CASAVA_Build 10 15495558 1D TCCAAACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 12 11 129070 CASAVA_Build 10 15523652 2D AAAAACAAAC TT/-- ATTTCAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 2 0 129071 CASAVA_Build 10 15544857 1D ATTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 43 1 31 11 T 15 14 129072 CASAVA_Build 10 15548087 1D CCATGTCTTA C/- TTGATTATTT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 C 1 0 129073 CASAVA_Build 10 15551552 1I TTATTTTTTT -/G TGGGGGGGGA 3070 het 2882 hom 26 11 13 2 G 0 1 129074 CASAVA_Build 10 15556532 2I AATATTTTCT --/AA AAACATCCAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 3 5 129075 CASAVA_Build 10 15562988 9D CTTTTACCTA AATGCATTC/--------- CACAGTCACT 3070 het 3070 ref 49 26 21 3 AATGCATTC 1 0 129076 CASAVA_Build 10 15564541 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTGGGG 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 T 6 7 129077 CASAVA_Build 10 15568361 3I TGTGATTTAT ---/ATA TATTATTTCA 3070 hom 98 het 36 0 34 2 ATA 0 1 129078 CASAVA_Build 10 15570422 1D GCTTTTTTTT C/- TTTGAGACAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 0 129079 CASAVA_Build 10 15570492 9D TGCAACCTCT GCCTCCCGG/--------- GTTCAAACGA 2400 hom 15 het 6 0 6 0 GCCTCCCGG 1 0 129080 CASAVA_Build 10 15572154 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTCT 1397 hom 15 het 8 0 6 2 T 9 8 129081 CASAVA_Build 10 15572781 21I GCACCCGGCC ---------------------/TATTGGCCTATTTTTCTATTT CTACATGAGT 2470 hom 15 het 6 0 6 0 TATTGGCCTATTTTTCTATTT 0 1 129082 CASAVA_Build 10 15573758 3D CCTCTGAGGA GGG/--- GGAAATGGTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 G 5 2 129083 CASAVA_Build 10 15579512 24I16M1I AGTGTCCTGC ------------------------AGGAATGAAATGAATG-/AGGGACTTTGATTCATAGAGCAATAGGAATGAAACGAATGA AAATGTGAAA 3070 het 3070 hom 45 21 34 3 N/A 0 0 129084 CASAVA_Build 10 15585806 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTAATAGA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 T 4 5 129085 CASAVA_Build 10 15585993 1D CATTTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2744 hom 27 8 12 7 T 11 10 129086 CASAVA_Build 10 15586755 1D TTAAAGGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 14 10 T 15 14 129087 CASAVA_Build 10 15603190 1I CACCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 2730 het 2730 ref 35 16 10 9 T 11 12 129088 CASAVA_Build 10 15612284 1D TGGGCGCAGT G/- GCTTATGCCT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 G 2 1 129089 CASAVA_Build 10 15614734 1D GCTCTTGAGA C/- CCAAGTGTTA 3070 het 3070 hom 33 12 19 3 C 3 2 129090 CASAVA_Build 10 15616087 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3011 hom 24 8 15 1 T 8 9 129091 CASAVA_Build 10 15618244 1I GATCAATCTG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 6 7 129092 CASAVA_Build 10 15621224 1D ACCTCAAACG A/- GGCAACAGAA 3070 het 3070 hom 59 29 25 5 A 1 0 129093 CASAVA_Build 10 15627690 1D AGTTTGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 45 0 33 13 T 11 10 129094 CASAVA_Build 10 15637707 1D CCACCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 19 1 11 7 T 12 11 129095 CASAVA_Build 10 15645458 1I ATCATGTAAA -/T TTTTTTATAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 6 7 129096 CASAVA_Build 10 15645924 5D GGCTGTCTCC AAAAA/----- AAAAAAAAAC 203 het 22 hom 37 0 3 37 A 14 9 129097 CASAVA_Build 10 15649160 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2967 het 2967 ref 28 10 8 10 A 11 12 129098 CASAVA_Build 10 15681091 1I CTATAGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 339 hom 41 1 36 4 T 11 12 129099 CASAVA_Build 10 15681728 1D CAGTTTGAGA G/- CAGTCTGGCC 3070 hom 81 het 33 0 25 8 G 1 0 129100 CASAVA_Build 10 15686464 1D TGGCAAGTGC A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 A 7 6 129101 CASAVA_Build 10 15692509 1D TGATTGGAAC A/- AAAAAACCCA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 7 6 129102 CASAVA_Build 10 15698748 1D CACTATAACC A/- ACTTAATAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 2 1 129103 CASAVA_Build 10 15699803 1I AATTTAGATG -/T TAAGAAAACT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 1 2 129104 CASAVA_Build 10 15700238 1D AAATAAATTT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 7 6 129105 CASAVA_Build 10 15704365 1I GGACATCTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 8 9 129106 CASAVA_Build 10 15707470 2D AATTGCTGAA AG/-- CCCTGGAGGA 3070 het 3070 ref 55 26 19 11 AG 1 0 129107 CASAVA_Build 10 15719812 1D ACTTTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 30 1 19 10 T 13 12 129108 CASAVA_Build 10 15721965 1I TCTGTGTTGT -/A GCAAACCCTT 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 0 1 129109 CASAVA_Build 10 15735354 1I AATAGACTTT -/A TTTTTTAGAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 0 1 129110 CASAVA_Build 10 15737101 2I GGCTGAAGAC --/TT TATAAAATTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 3 129111 CASAVA_Build 10 15740525 2D CTCTTCACAC AT/-- GTCTGGCTGG 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 AT 1 0 129112 CASAVA_Build 10 15741218 1D GATCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 11 10 129113 CASAVA_Build 10 15743510 10D AAAAACAGAA GTCATACTTT/---------- GTCATACTTT 3070 het 3070 ref 42 24 12 11 GTCATACTTT 3 2 129114 CASAVA_Build 10 15745137 1I GTGCTCACTG -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 6 7 129115 CASAVA_Build 10 15746270 1D AGAGTCCAGG A/- CTCTTAAGCG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 1 0 129116 CASAVA_Build 10 15746509 1D TCATTTACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1506 hom 32 8 12 12 T 10 9 129117 CASAVA_Build 10 15746526 3I TTTCCACATT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 322 hom 18 1 9 9 TTA 4 5 129118 CASAVA_Build 10 15760195 12D ACAAAAAAGT AATGATAAAAAG/------------ AATGATAAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 AATGATAAAAAG 1 0 129119 CASAVA_Build 10 15764952 1I CACTAATCGA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 82 het 33 0 27 6 T 6 7 129120 CASAVA_Build 10 15766693 1D AGAAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 44 0 36 8 T 12 11 129121 CASAVA_Build 10 15808590 2D GTCTAGTGAG GT/-- GTGCTAGGTG 3070 hom 120 het 45 0 41 5 GT 2 1 129122 CASAVA_Build 10 15811099 3I ATTACAGTAG ---/GTT GTTAAAATTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 GTT 1 2 129123 CASAVA_Build 10 15819324 21D ATAAAATTGT TATTTTAGGGTTGATAAATAC/--------------------- TATCCCATTT 3070 het 3070 ref 35 29 9 4 TATTTTAGGGTTGATAAATAC 1 0 129124 CASAVA_Build 10 15821142 1D AGACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 30 0 23 8 A 12 11 129125 CASAVA_Build 10 15823439 1I TCTTGCTTGC -/T TTTTTGTCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 5 6 129126 CASAVA_Build 10 15823544 1D TCTCCTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 9 129127 CASAVA_Build 10 15837626 1D CTATTTCATG T/- TTTTTTTTTT 1120 het 1120 ref 40 27 3 10 T 11 10 129128 CASAVA_Build 10 15877010 2I CATTCACTCC --/CA GTTTCAACTG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 CA 0 1 129129 CASAVA_Build 10 15975176 1I GACGATGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 9 10 129130 CASAVA_Build 10 15991675 1D CCAGGCCTAA T/- TTTTTTTTTT 2002 het 2002 ref 36 14 7 15 T 19 18 129131 CASAVA_Build 10 15997728 5D CTGAATTCTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1625 het 1625 ref 39 16 8 15 T 21 16 129132 CASAVA_Build 10 16024709 5I AGAGTTGCGT -----/ATACA ATACAACAAA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 ATACA 1 2 129133 CASAVA_Build 10 16026182 5D AGCTGGCTTG GCACA/----- GCACAGCAGC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 GCACA 2 1 129134 CASAVA_Build 10 16030793 2I TGTGTATATG --/TA TATATATATA 2345 het 2345 ref 24 12 9 3 TA 6 7 129135 CASAVA_Build 10 16044483 1D CAAAACTAAC A/- AAAACTCAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 5 4 129136 CASAVA_Build 10 16045423 1D GCAGAAGGTG A/- AAGGCACGTC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 3 2 129137 CASAVA_Build 10 16052293 1D CATTAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 32 1 20 11 T 17 16 129138 CASAVA_Build 10 16055753 1I TGTACTGCCA -/G GAGTCCCCAC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 1 2 129139 CASAVA_Build 10 16055990 3I TACCCAAGGA ---/CAT CACCACCACC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CAT 0 1 129140 CASAVA_Build 10 16057259 1D ATATAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 34 1 27 6 A 12 11 129141 CASAVA_Build 10 16058650 2D TAATCCACAC AT/-- GTCATAGGAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AT 1 0 129142 CASAVA_Build 10 16063713 7I AATAGTTTGC -------/TGAGAAT AATAGTTTCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TGAGAAT 0 1 129143 CASAVA_Build 10 16069667 1D AAGAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 1 0 129144 CASAVA_Build 10 16084643 1I GACTAATGTC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 9 129145 CASAVA_Build 10 16091119 5D CGGTCTTGAT GGTCA/----- GTGTTGTGAA 3070 hom 90 het 36 0 29 11 GGTCA 1 0 129146 CASAVA_Build 10 16102663 1I ATATCATAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 73 het 33 0 24 9 A 9 10 129147 CASAVA_Build 10 16109298 2I CTCAAAACAA --/AC ACACAAACAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 AC 2 3 129148 CASAVA_Build 10 16117034 1D TAATTGAAAT A/- AAAAACACAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 7 A 6 5 129149 CASAVA_Build 10 16142549 5I GGAAAAAGAT -----/ATATG AGTAAGAAGT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 ATATG 0 1 129150 CASAVA_Build 10 16144871 2I ATATGTATAC --/AT GTGCCATGTT 3070 het 1119 hom 21 3 13 6 AT 0 1 129151 CASAVA_Build 10 16147075 1I TTACCCCCCC -/T TTTTTTTTTT 2579 het 636 hom 18 3 8 7 T 11 12 129152 CASAVA_Build 10 16157115 7D GTTTGGTTGG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 549 hom 15 2 10 3 T 18 11 129153 CASAVA_Build 10 16159565 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1071 het 1071 ref 36 22 5 9 A 15 14 129154 CASAVA_Build 10 16169879 1I TTCCATTTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 A 9 10 129155 CASAVA_Build 10 16183761 1D GGATCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 13 12 129156 CASAVA_Build 10 16190571 1I TTGAGATCAG -/C CTGGCCAGTA 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 C 1 2 129157 CASAVA_Build 10 16193057 1D AAAAAATTGC A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 26 13 9 6 A 8 7 129158 CASAVA_Build 10 16193727 1D TTGGTGTTTT A/- AAATAGGATT 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 A 4 3 129159 CASAVA_Build 10 16195108 4D GATCAGAATT AAAC/---- AGGCAAGAAA 3070 het 3070 ref 51 29 19 7 AAAC 1 0 129160 CASAVA_Build 10 16195786 1I AAGGCTTTTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 25 12 13 0 A 7 8 129161 CASAVA_Build 10 16235168 1I AATTCAATGG -/T TTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 52 29 19 4 T 5 6 129162 CASAVA_Build 10 16243064 1D TAGTTCCTTA T/- ATATGTGGTT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 T 1 0 129163 CASAVA_Build 10 16245085 2D TTTTTTTTTT TA/-- TTTTATCTCT 3070 het 438 hom 33 2 18 13 TA 1 0 129164 CASAVA_Build 10 16260217 5I TTGTATCCTT -----/CAATC CAATCAAGTT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 CAATC 1 2 129165 CASAVA_Build 10 16276459 1D GATATTAATA G/- CTGGTGATGA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 G 1 0 129166 CASAVA_Build 10 16279960 1D TGTTGCAGTC A/- AAAAAGTTTA 3070 hom 108 het 38 0 36 3 A 6 5 129167 CASAVA_Build 10 16283514 2D ACATATATAT AC/-- ACACAAATAC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AC 3 2 129168 CASAVA_Build 10 16284166 1D CATGAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 2441 het 2441 ref 35 20 6 9 T 15 14 129169 CASAVA_Build 10 16303622 1D ATTTTTTTTT A/- TTATTTATTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 0 129170 CASAVA_Build 10 16305347 2D ACAATCACAC AT/-- GTTTTACAAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 AT 1 0 129171 CASAVA_Build 10 16306778 1I CTTCATCAGC -/T TTCAGAACTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 2 3 129172 CASAVA_Build 10 16330598 5I ACAAATCAGC -----/AAGAA AAAAACAAAT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AAGAA 0 1 129173 CASAVA_Build 10 16332428 2D GGTCTGTGCT GA/-- GGAAGATTAG 2706 het 14 hom 14 0 7 8 GA 1 0 129174 CASAVA_Build 10 16335937 1D AACCCCATTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 33 het 18 0 12 6 A 9 8 129175 CASAVA_Build 10 16341401 4D AATCCGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 TTTG 4 3 129176 CASAVA_Build 10 16347261 1D GAGTCCGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 23 1 9 13 A 17 16 129177 CASAVA_Build 10 16360059 1I TGTGGCCCCT -/C CCCATGCTTT 3070 het 1449 hom 26 6 12 8 C 3 4 129178 CASAVA_Build 10 16367465 1D CTCTCCTCCG T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 T 7 6 129179 CASAVA_Build 10 16369632 1D GTTTCAAAAA C/- AAAAAAAGGG 3070 het 72 hom 27 1 22 4 C 1 0 129180 CASAVA_Build 10 16370260 1D CTTTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 44 2 20 22 T 17 16 129181 CASAVA_Build 10 16377168 3D GGCTGAAGCG GGA/--- GGAGGATCGC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 GGA 3 2 129182 CASAVA_Build 10 16377677 1I CATTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 562 hom 30 2 15 13 T 15 16 129183 CASAVA_Build 10 16379474 1I AGAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 9 10 129184 CASAVA_Build 10 16383736 2D TAAATACTGC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 TA 7 6 129185 CASAVA_Build 10 16394726 1D TCAGGTGCAA C/- CCAATATCTG 3070 hom 129 het 45 0 43 2 C 3 2 129186 CASAVA_Build 10 16405424 2I11M1I3M6I5M15I5M2I TGGAGAAAGG --AGAATTCTGAA-TCT------AGATG---------------ACCAA--/TCACTATCCTGAACTCTCCTCAAAAATGTTGGTTAGAATCACAGCCAAGG ACAGAATGCT 1342 het 1342 ref 25 19 3 4 N/A 0 0 129187 CASAVA_Build 10 16409352 1I ACCTTCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 11 12 129188 CASAVA_Build 10 16409423 1I CATATGAATC -/T AACTCAGAGC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 0 1 129189 CASAVA_Build 10 16417246 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 27 1 22 6 A 13 12 129190 CASAVA_Build 10 16423994 1I GAGAAGACAA -/C TTACACTTTT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 C 0 1 129191 CASAVA_Build 10 16434317 10I CTCAAATACT ----------/TGTACACAAA TGTTCACAGT 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 TGTACACAAA 0 1 129192 CASAVA_Build 10 16437982 3D CTAATTTTTG TAT/--- TATTTTTTTA 1706 het 1307 hom 9 3 5 2 TAT 2 1 129193 CASAVA_Build 10 16438198 1D GATTAAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 16 9 T 10 9 129194 CASAVA_Build 10 16438957 1D CATTAATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 T 12 11 129195 CASAVA_Build 10 16439242 2D TTTGTATTTA CT/-- CTCTCTCTCT 840 het 840 ref 47 40 2 7 CT 8 7 129196 CASAVA_Build 10 16442356 1I CCCACAATAG -/A AAATTCCGTC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 3 4 129197 CASAVA_Build 10 16445673 1I ACAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1748 het 1748 ref 22 10 7 5 A 10 11 129198 CASAVA_Build 10 16462332 6D TTCCTTTTTC TTTTTT/------ TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 26 8 T 10 4 129199 CASAVA_Build 10 16469455 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2689 het 2689 ref 28 11 9 8 T 10 11 129200 CASAVA_Build 10 16470662 1D39M2I ACAAACAAAC AAAAAAAAAACCACACACACACAATAGCATTTGCAAGGGT--/-AAAAAAAAACCACAGACACACAATAGCATTTGCAAGGGTTC TGGGGGAGTC 3070 het 3070 ref 25 19 10 8 N/A 0 0 129201 CASAVA_Build 10 16477951 1D CAGGTGATCT G/- CCCACATCAG 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 G 1 0 129202 CASAVA_Build 10 16481178 1D AACAAACAAA C/- AAAAACCTCA 3070 het 3070 ref 30 13 14 4 C 1 0 129203 CASAVA_Build 10 16484412 3D AAGCTGATGC AGG/--- AGAAGTGAGC 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 AGG 1 0 129204 CASAVA_Build 10 16486074 2I CTGGAGCAGA --/CT CTATGCATGT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 CT 1 2 129205 CASAVA_Build 10 16523894 1D ATAATCAGCC T/- TTTTTTTTTT 687 het 687 ref 56 45 4 7 T 11 10 129206 CASAVA_Build 10 16534683 6D CTGATGATGA TTCTCC/------ TTCTCCTTCT 2931 het 2931 ref 36 16 10 13 TTCTCC 4 3 129207 CASAVA_Build 10 16549807 4I ATTATGTCTC ----/AAAA AATAATAATA 3070 het 1968 hom 18 5 12 1 A 2 6 129208 CASAVA_Build 10 16561093 1D AGTCAATTTG A/- AAAAAAAAAA 1383 het 1383 ref 34 25 3 7 A 11 10 129209 CASAVA_Build 10 16573946 2D TGTATGGGTG CA/-- CACACACACA 1252 het 1252 ref 59 38 3 20 CA 8 7 129210 CASAVA_Build 10 16579927 1D TTGGACACCA T/- TTTTTTTTTT 1203 het 1203 ref 45 27 5 13 T 11 10 129211 CASAVA_Build 10 16595494 1D TGCATGTTTA G/- CAGATATTTG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 G 1 0 129212 CASAVA_Build 10 16610463 1I AAATAAAACA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 7 8 129213 CASAVA_Build 10 16611416 1D CCACCCTGAG C/- CCCCAAGCTG 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 C 5 4 129214 CASAVA_Build 10 16614918 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1362 hom 19 5 10 4 A 13 14 129215 CASAVA_Build 10 16622774 1D AAACATAGGA T/- TTTTCCCTTT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 5 4 129216 CASAVA_Build 10 16623417 1D CTATTCCCCA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 616 hom 26 2 16 8 C 11 10 129217 CASAVA_Build 10 16652941 1D TCCCCAAGGA C/- ACACAGCTAA 3070 het 3070 ref 49 27 16 6 C 1 0 129218 CASAVA_Build 10 16664510 1I TTCAGAGAAA -/C CATTGCCATA 3070 het 3070 hom 22 8 8 6 C 1 2 129219 CASAVA_Build 10 16665678 1D TGCTCTGAGC T/- TCGTTCTGGG 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 T 2 1 129220 CASAVA_Build 10 16668057 6I TTTCCTTTTC ------/CCTTTT CTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 CCTTTT 0 1 129221 CASAVA_Build 10 16690420 7D AAATACCCAG CTACCTA/------- CTACCTACAT 2522 het 2522 ref 44 28 10 8 CTACCTA 2 1 129222 CASAVA_Build 10 16706224 2D TGTGTGTGTG TC/-- TGTAAGTGTG 3070 het 3070 hom 53 19 26 8 TC 1 0 129223 CASAVA_Build 10 16710498 2D AACTTTCTGT GA/-- AAGTGAGGTG 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 GA 1 0 129224 CASAVA_Build 10 16739535 1D ATCATACTAG A/- AAAAAAAAAA 1154 het 1154 ref 34 27 3 4 A 12 11 129225 CASAVA_Build 10 16759956 3I TGAAACACAC ---/ACG ACGTCATCTT 3070 het 3070 ref 46 20 21 5 ACG 1 2 129226 CASAVA_Build 10 16768862 1D GCAGCTGTAG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 7 6 129227 CASAVA_Build 10 16771018 1D GTCCCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 2079 het 2079 ref 34 22 7 5 A 13 12 129228 CASAVA_Build 10 16778850 3D TTGATCTTTG TTT/--- TTATCTTTAC 3070 het 3070 ref 33 16 17 0 T 5 2 129229 CASAVA_Build 10 16783621 2D AGTACAACTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 18 13 11 AC 9 8 129230 CASAVA_Build 10 16785996 1I TTGGGTGAAG -/C CCCTAGTGTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 C 3 4 129231 CASAVA_Build 10 16790955 2I ATCCCATAAC --/TT TACTGAATTC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 1 3 129232 CASAVA_Build 10 16793342 1D TTATCTTTTC A/- AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 7 6 129233 CASAVA_Build 10 16814128 3I AATGAAAAGC ---/AGG AGTTCTGATG 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 AGG 0 1 129234 CASAVA_Build 10 16819763 1D TAACTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 11 10 129235 CASAVA_Build 10 16839075 11D GTACACGGTA TGTGTGTGTGC/----------- TGTGGGTGTG 3070 het 3070 hom 25 9 11 8 TGTGTGTGTGC 1 0 129236 CASAVA_Build 10 16840176 1I GGGCAGAAAG -/A AAGTCCTTAA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 2 3 129237 CASAVA_Build 10 16841883 14I CAAATTCTGA --------------/TGGAGGGTGCCTTT TGGATCACAC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 TGGAGGGTGCCTTT 0 1 129238 CASAVA_Build 10 16845001 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1773 hom 26 10 11 6 A 13 12 129239 CASAVA_Build 10 16856105 2D GTATTCCGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 A 14 12 129240 CASAVA_Build 10 16857232 2D TTAAATCAAT TC/-- TGTTTGATAG 3070 het 3070 ref 27 16 9 3 TC 1 0 129241 CASAVA_Build 10 16864889 2I GCATATACAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 34 15 10 10 GT 6 7 129242 CASAVA_Build 10 16865664 1D CGGCCGCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1774 hom 24 6 12 6 T 11 10 129243 CASAVA_Build 10 16867395 4D AACTCATTCA CTCT/---- CTCTCTATCT 2075 het 1250 hom 13 5 7 2 CT 5 3 129244 CASAVA_Build 10 16873641 2D TCAAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 1821 het 189 hom 18 3 9 6 A 16 14 129245 CASAVA_Build 10 16875111 1I CACCAACACA -/C CCAGAATCAT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 C 2 3 129246 CASAVA_Build 10 16878742 1D CAGGAAACGT G/- GAGGCAGCAT 3070 het 3070 ref 43 22 20 3 G 2 1 129247 CASAVA_Build 10 16879862 1D GGATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 543 het 543 ref 25 10 6 9 T 23 22 129248 CASAVA_Build 10 16881635 1I AAAAAATTAG -/A AAAAAAAAAT 2837 het 2837 ref 28 12 9 7 A 9 10 129249 CASAVA_Build 10 16883732 1I GAAATCAAAC -/A GAAAGATAGC 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 0 1 129250 CASAVA_Build 10 16884198 1D GAGGCTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2826 hom 35 9 12 15 A 13 12 129251 CASAVA_Build 10 16884729 1D GGTATGCAAA G/- GTGGTTCAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 G 2 1 129252 CASAVA_Build 10 16891838 1I AGTGTTATAG -/T TTCTTATGGT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 2 3 129253 CASAVA_Build 10 16893009 1I CCTGGGCAAC -/A AGAGTGAGAC 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 1 2 129254 CASAVA_Build 10 16896842 4I AAGCAAGTGG ----/CTAT CTTTTCTTCC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CTAT 0 1 129255 CASAVA_Build 10 16902703 1I CTAACCCACT -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 6 7 129256 CASAVA_Build 10 16907913 1I TGAGTGTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 9 10 129257 CASAVA_Build 10 16910172 1I CAGAGGGAGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 8 9 129258 CASAVA_Build 10 16913850 4I TGTGTGTGTT ----/TGTG TGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 TG 2 4 129259 CASAVA_Build 10 16929898 1D TATAATCTCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 9 8 129260 CASAVA_Build 10 16931370 1I TGACTCTCTG -/A AAATCTATGC 3070 het 3070 hom 55 24 24 7 A 3 4 129261 CASAVA_Build 10 16943680 1D ACAAACTGAG T/- TTGAATCTGG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 T 3 2 129262 CASAVA_Build 10 16967656 1I CTCACCTGAT -/C AACTGAGCTC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 C 0 1 129263 CASAVA_Build 10 16968561 6I GTGTGAAAGC ------/CTCCAT CTCCATTAAA 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 CTCCAT 1 2 129264 CASAVA_Build 10 16973720 1I AACTTGGGGG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 A 7 8 129265 CASAVA_Build 10 16979325 1I TTTACCACGT -/G GCCTTGCACA 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 G 1 2 129266 CASAVA_Build 10 16980072 2D TTATTATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 21 het 11 0 8 4 TA 10 9 129267 CASAVA_Build 10 16985912 1D AAATCTTTAT G/- GAAAAAAATC 2385 het 2385 ref 18 10 5 3 G 2 1 129268 CASAVA_Build 10 17004151 1I ATTTTGTTTG -/T TTTACTGCCA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 3 4 129269 CASAVA_Build 10 17011007 1D TAGGTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 33 1 29 3 A 12 11 129270 CASAVA_Build 10 17013269 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1709 hom 26 9 11 6 A 13 12 129271 CASAVA_Build 10 17025442 1I ATCTTCAATC -/A TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 0 1 129272 CASAVA_Build 10 17034008 3D AGGTGTGTTG TGT/--- TGTTGTGCGT 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 TGT 3 2 129273 CASAVA_Build 10 17036130 1I GAATTTGGAT -/A AAAACTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 4 5 129274 CASAVA_Build 10 17047825 1I29M1I TGATAGGTAC -TTAAATACATTTGTTTACATTTGATTCTT-/TTTAAATACATTTGTTTACATTTGATTCTTA ACAGTTCCAC 3070 het 3070 ref 46 38 27 1 N/A 0 0 129275 CASAVA_Build 10 17048459 1I CTTTACTACA -/T TTTTTTTTTT 3040 het 3040 ref 39 13 12 14 T 11 12 129276 CASAVA_Build 10 17050329 1D GCACAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 10 9 T 12 11 129277 CASAVA_Build 10 17051257 8D ATTTATTCAG CTATGCAT/-------- CTATTAACAA 3070 het 3070 ref 40 23 16 5 CTATGCAT 1 0 129278 CASAVA_Build 10 17051367 1I TACTGCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 714 hom 27 4 17 6 T 13 14 129279 CASAVA_Build 10 17055622 1I CGTGATGGGT -/A GGTTTTCAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 1 129280 CASAVA_Build 10 17056544 1I TGCCTGGCTG -/A CTTTTTATAT 1814 het 1371 hom 10 4 5 1 A 0 1 129281 CASAVA_Build 10 17062901 1D AAACAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 10 9 129282 CASAVA_Build 10 17063449 1I AACTTGGGTA -/C CCAAGAGGTC 3070 hom 95 het 39 0 29 10 C 2 3 129283 CASAVA_Build 10 17065013 1D GTTTCCTTCC A/- AGAATTGTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 1 129284 CASAVA_Build 10 17073071 1D AATTTACATT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 48 22 24 4 A 8 7 129285 CASAVA_Build 10 17078627 3I TATCTGTGTG ---/TTT TTTTTAATAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 5 8 129286 CASAVA_Build 10 17079051 1I TTTTAATAGC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 7 8 129287 CASAVA_Build 10 17103799 1I GAAAGCCCTT -/A GCTTTTCATC 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 0 1 129288 CASAVA_Build 10 17105277 1I TTTGCCTTTG -/A GGGGGAGAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 0 1 129289 CASAVA_Build 10 17141122 1D GACCAACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 12 11 129290 CASAVA_Build 10 17142102 1D AATCCTATTC T/- CTTTAACAAT 3070 hom 92 het 34 0 30 5 T 1 0 129291 CASAVA_Build 10 17147135 1D CTCTCTCTCT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 23 het 30 1 24 5 C 12 11 129292 CASAVA_Build 10 17149909 1D TAATGCCTAC A/- AGGCCACAAC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 2 1 129293 CASAVA_Build 10 17151453 12D CATCTCCACC AGGAGTGTATAA/------------ AGGTTCCAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 4 AGGAGTGTATAA 1 0 129294 CASAVA_Build 10 17163058 1I TCCTTGTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 9 10 129295 CASAVA_Build 10 17163971 1I AATAATACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 9 10 129296 CASAVA_Build 10 17167075 1I CCACTTCCCT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 7 8 129297 CASAVA_Build 10 17167971 3D TCTGTCTGAA TTT/--- TTTTTTTTTT 1410 het 733 hom 19 6 3 10 T 19 16 129298 CASAVA_Build 10 17169142 2D ATTGCATTGA CT/-- CTATTCCTCT 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 CT 2 1 129299 CASAVA_Build 10 17173408 1D AATACTTTTT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 8 7 129300 CASAVA_Build 10 17183506 1D TCCTCAAAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 9 8 129301 CASAVA_Build 10 17184607 1I ACTCTTTTTT -/A TTTTTTTTTT 1408 het 645 hom 21 9 7 5 A 0 1 129302 CASAVA_Build 10 17195431 1D GGCATCCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 11 10 129303 CASAVA_Build 10 17204767 1I CAAAAATATA -/C CTGATATTTA 3070 het 47 hom 34 1 26 7 C 1 2 129304 CASAVA_Build 10 17214011 4D AAAACTACAC TGAT/---- TGATAGACAA 3070 hom 117 het 41 0 39 4 TGAT 2 1 129305 CASAVA_Build 10 17219844 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 960 het 960 ref 17 7 3 7 A 13 12 129306 CASAVA_Build 10 17222745 4I AACAACAAAA ----/AAGT AAGATCACAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AAGT 0 1 129307 CASAVA_Build 10 17223520 1D ATTATTTAAA T/- GCTCTTTCAG 3070 hom 57 het 21 0 19 3 T 1 0 129308 CASAVA_Build 10 17224058 1I AGCTTTTCTA -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 6 7 129309 CASAVA_Build 10 17242388 1D CTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 A 12 11 129310 CASAVA_Build 10 17243605 5D CTAAGAAGAA AAAGT/----- AAAGAAAATC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AAAGT 1 0 129311 CASAVA_Build 10 17263693 8I CAAATTTTTT --------/ACCTTGGA AACACCTACA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 ACCTTGGA 0 1 129312 CASAVA_Build 10 17265003 1D GAAAATGTGC T/- GTCCTTCATG 3070 het 3070 hom 56 24 26 7 T 1 0 129313 CASAVA_Build 10 17270466 6D GCATGACTGA CGCTGG/------ CGCTGGCTCT 3070 hom 94 het 34 0 31 5 CGCTGG 2 1 129314 CASAVA_Build 10 17284874 4I GGAAAGGGAA ----/CCTT AGGGAGTCTC 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 CCTT 0 1 129315 CASAVA_Build 10 17286774 2I TGGAGGTGGT --/AC ACAATAGGGA 3070 hom 104 het 41 0 34 7 AC 1 2 129316 CASAVA_Build 10 17287049 1D GCGTTTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 36 0 31 6 A 10 9 129317 CASAVA_Build 10 17288200 3I ACTCCATCTC ---/AAA AAAAAAATAT 1409 het 457 hom 18 2 9 8 A 7 10 129318 CASAVA_Build 10 17290207 7D AAAAATTAGG ATCATGA/------- ATCATGAATA 3070 het 3070 ref 32 19 11 5 ATCATGA 2 1 129319 CASAVA_Build 10 17293255 5D CTTTTTCACC TAATA/----- TGTTATCATT 3070 het 3070 ref 49 31 17 2 TAATA 1 0 129320 CASAVA_Build 10 17294338 1D AAGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 10 9 129321 CASAVA_Build 10 17297312 1D TGTTCAGATG C/- CAAGGCTTGT 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 C 2 1 129322 CASAVA_Build 10 17301295 2I TTATTCTGCT --/AC AGTTAACTCT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 AC 0 1 129323 CASAVA_Build 10 17313344 1D TGCACAACTA T/- TTTGTGATCT 3070 het 3070 ref 50 27 20 3 T 4 3 129324 CASAVA_Build 10 17333230 1D ATTAGGAAAC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 T 7 6 129325 CASAVA_Build 10 17352341 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1995 het 1995 ref 37 14 6 17 T 15 14 129326 CASAVA_Build 10 17362122 5I TGTTTTAGCA -----/ATTCC AGTTCTAGGG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATTCC 0 1 129327 CASAVA_Build 10 17367237 28I GTGTAGTAGT ----------------------------/CTGTTCTCGCCCTGCTATAAAGAAATAC CTGAGACAGG 3070 het 3070 hom 30 12 14 6 CTGTTCTCGCCCTGCTATAAAGAAATAC 0 1 129328 CASAVA_Build 10 17371772 5D TCTCCTGACC TCGTT/----- TCGTGATCTG 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 TCGTT 1 0 129329 CASAVA_Build 10 17378728 1I GTCTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2339 het 2339 ref 29 13 9 7 A 13 14 129330 CASAVA_Build 10 17390003 3I ATAAAAAAAA ---/AAT TTTTTTTGAG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AAT 0 1 129331 CASAVA_Build 10 17390324 1D CTGGGATTAC A/- AGCAGGAGCC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 2 1 129332 CASAVA_Build 10 17391478 1D TGTTGATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 11 10 129333 CASAVA_Build 10 17426997 1D AATGTAACAG A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 55 18 19 18 A 7 6 129334 CASAVA_Build 10 17427031 6D CCCATGGAGA ACTCTT/------ AGCTAGTGGG 3070 het 2547 hom 45 6 26 17 ACTCTT 1 0 129335 CASAVA_Build 10 17430851 1I TAAGAATGAT -/C CCTTCCTACC 3070 het 970 hom 18 3 9 6 C 2 3 129336 CASAVA_Build 10 17431941 4D AATTAAATAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 AC 9 7 129337 CASAVA_Build 10 17432389 1D CAATGAATGC T/- TGCTTCACAC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 2 1 129338 CASAVA_Build 10 17434063 1D AAAAAAAAAA T/- GTTAAGCATA 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 T 1 0 129339 CASAVA_Build 10 17442431 3I AGAACATGAT ---/GAA GAGTACTGGG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 GAA 0 1 129340 CASAVA_Build 10 17446083 8I CAAATGCTCC --------/TGAGTATA TGATACTTTT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 TGAGTATA 0 1 129341 CASAVA_Build 10 17450339 6D TTGAACCTGG GAGGCA/------ GAGGTCACAG 3070 het 266 hom 13 1 11 1 GAGGCA 1 0 129342 CASAVA_Build 10 17451697 4I TGTTTCTCTC ----/TTTA TTTGCTTCAT 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 TTTA 0 1 129343 CASAVA_Build 10 17456215 2I TGAGGGAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 10 12 129344 CASAVA_Build 10 17456465 9D ATGCCTATGA TTATAGGCC/--------- TCCCAGCACT 3070 het 2588 hom 18 7 10 1 TTATAGGCC 1 0 129345 CASAVA_Build 10 17462747 20D59M2I CCAAGATGTG TGTGTGTATGTGTTCATGTTTGTGTGTATGTGTTCATGTTTGTGTGTATGTGTACATGTTTGTGTGAATGTATGTGTAC--/--------------------TGTGTGTATGTGTTCATGTTTGTGTGTATGTGTACGTGTTTGTGTGAATGTATGTGTACAT GTTTGTGTGT 3070 het 33 hom 30 0 10 44 N/A 0 0 129346 CASAVA_Build 10 17462920 4D62M1D ATGTGTGTTT GTGCGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTACGTGTTTGTATTTGAAAGGCCTTCATGTTTTGAG/----GTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTATGTGTACACGTTTGTATTTGAAAGGCCTTCATGTTTTGA- GGGTTTTTTT 3070 hom 82 het 35 0 28 24 N/A 0 0 129347 CASAVA_Build 10 17463038 1D TGAGCAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 35 0 25 11 T 11 10 129348 CASAVA_Build 10 17463484 1D AATTGGCTTT A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 8 7 129349 CASAVA_Build 10 17464260 1I TCAGTGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 10 11 129350 CASAVA_Build 10 17466265 5I TTGGAACCTC -----/AAGAG GAGAGGAAAT 3070 hom 73 het 29 0 25 4 AAGAG 0 1 129351 CASAVA_Build 10 17468177 2I CGGAGTGAGA --/CT CTGTCACACA 629 hom 20 het 14 0 7 7 CT 1 2 129352 CASAVA_Build 10 17472867 1D TTTGAAGACC T/- TTTTTTTTTT 2156 het 1015 hom 20 5 6 9 T 14 13 129353 CASAVA_Build 10 17493178 4D TTGAACTCTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 59 12 22 25 TG 11 9 129354 CASAVA_Build 10 17493928 1D TTAAGGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 T 11 10 129355 CASAVA_Build 10 17496166 1D CATGGATGTA C/- CCAACTCTTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 C 3 2 129356 CASAVA_Build 10 17507703 24D AAGGAAAGGT AGGAAGGAGGAAGGAAGGGAAGGA/------------------------ AGGAAGGAGG 3070 het 3070 ref 41 19 13 15 AGGAAGGAGGAAGGAAGGGAAGGA 2 1 129357 CASAVA_Build 10 17509109 1I ACTGTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 2199 het 1798 hom 33 8 7 18 A 15 16 129358 CASAVA_Build 10 17512377 1D TGCATGTGTA T/- TTTTCATATA 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 T 5 4 129359 CASAVA_Build 10 17522213 1D CTCAAATGTA T/- TTTTTTTTTT 1433 het 1433 ref 24 9 4 11 T 17 16 129360 CASAVA_Build 10 17550236 1D TTACTAACTT G/- GAACTTCTCT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 2 1 129361 CASAVA_Build 10 17551824 1I CAGGTCATAG -/A AACCAGAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 3 129362 CASAVA_Build 10 17571872 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 1343 het 1149 hom 20 8 7 5 G 0 1 129363 CASAVA_Build 10 17586005 5D GCTCGTTGAC TTGAA/----- TTGAGGACAG 3070 het 3070 ref 47 25 16 7 TTGAA 1 0 129364 CASAVA_Build 10 17593848 1D GTCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2099 het 2099 ref 23 9 7 7 T 13 12 129365 CASAVA_Build 10 17598066 5D CTCTCATGAC CTAAT/----- CATCTCCCCC 3070 het 3070 ref 31 18 10 7 CTAAT 1 0 129366 CASAVA_Build 10 17611235 2D CAAATATCAT GA/-- ATGAATAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 GA 1 0 129367 CASAVA_Build 10 17631767 1D TTCTGAATGG A/- AAAAAAAAAA 2985 het 2985 ref 39 26 7 7 A 12 11 129368 CASAVA_Build 10 17631828 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 988 hom 29 6 11 12 T 8 9 129369 CASAVA_Build 10 17640055 9D TCACGCCTGT AATCCAGCA/--------- AATCCCAGCA 3070 het 3070 hom 28 12 13 6 AATCCAGCA 1 0 129370 CASAVA_Build 10 17646322 1I TCAATGGCAT -/A AAAATACAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 4 5 129371 CASAVA_Build 10 17648803 1I CCCACCTCTT -/C CATACCATCA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 C 1 2 129372 CASAVA_Build 10 17665103 2D GCTAAAAATA TC/-- TGTCAGACTA 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 TC 1 0 129373 CASAVA_Build 10 17666286 4D ATCACTTGAG GTCA/---- GTCAGGAGTT 3070 het 2706 hom 31 7 12 12 GTCA 2 1 129374 CASAVA_Build 10 17670205 1I TTTTAAAATC -/A AACTACTGTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 2 3 129375 CASAVA_Build 10 17671912 1I TGCTGCCTTA -/T TTCCTGAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 2 3 129376 CASAVA_Build 10 17673248 1D AGCTGCCCCC T/- GGCTATCCTG 2989 het 2989 ref 23 12 8 3 T 1 0 129377 CASAVA_Build 10 17686648 1D TGTATGATCA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 12 21 8 T 7 6 129378 CASAVA_Build 10 17698247 3I GCACTCCAGC ---/CTG CAAGACCGAG 2832 het 2832 ref 15 7 8 0 CTG 0 1 129379 CASAVA_Build 10 17700571 1D GAAATTCCTT G/- CACCTACTGA 3070 hom 60 het 27 0 21 7 G 1 0 129380 CASAVA_Build 10 17783279 3D TTTATGAAAA AAT/--- AAAAAGTATG 3070 hom 135 het 47 0 45 2 AAT 1 0 129381 CASAVA_Build 10 17810387 1D AAAAAACAAG A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 7 6 129382 CASAVA_Build 10 17888084 1D CAAACCCCTA G/- GGGGGAGCAT 2101 het 2101 ref 21 9 7 7 G 6 5 129383 CASAVA_Build 10 17892071 4D CTTGATTGTT AGAA/---- AGTTCATCCT 1439 het 1439 ref 12 8 3 2 AGAA 1 0 129384 CASAVA_Build 10 17897519 4I GTTCACAGTC ----/CAGG CAGGACACAG 1810 het 1810 ref 24 15 4 5 CAGG 1 2 129385 CASAVA_Build 10 17935460 2I TATAATGGTG --/TA TATATATATA 2437 het 1546 hom 12 5 5 2 TA 5 6 129386 CASAVA_Build 10 18172158 1I TTAGAGCTAG -/A AAATGTATTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 3 4 129387 CASAVA_Build 10 18243924 2D CATGTGTGGC AT/-- ATATATATGT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 AT 5 4 129388 CASAVA_Build 10 18261414 1D GATCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 990 het 990 ref 14 9 3 2 A 13 12 129389 CASAVA_Build 10 18278530 3D CTTTCCTTGA CAG/--- TTAAGCCCAA 2983 het 2983 ref 25 15 8 2 CAG 1 0 129390 CASAVA_Build 10 18279123 4D GACCTTCGCG GTGA/---- GTGTTATAGC 2361 het 2361 ref 14 7 5 3 GTGA 1 0 129391 CASAVA_Build 10 18280994 2D TTGCATCATC CT/-- CTGTCACTTT 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 CT 2 1 129392 CASAVA_Build 10 18289961 1D TCAGATAGTT C/- TGTACTAGGG 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 C 1 0 129393 CASAVA_Build 10 18309507 1D CTGAGATGGA C/- AAATGTCTTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 C 1 0 129394 CASAVA_Build 10 18311663 1I TCCCTGGGCA -/C GTTTACATTC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 C 0 1 129395 CASAVA_Build 10 18314386 1D AAGAGGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 T 11 10 129396 CASAVA_Build 10 18318543 1D TTGTAGACAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 52 het 27 0 17 10 T 10 9 129397 CASAVA_Build 10 18323368 1I AGAATGTACA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 382 hom 41 1 37 3 T 7 8 129398 CASAVA_Build 10 18323899 2I CGCCAAGACG --/GA GAAAATATAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 GA 1 2 129399 CASAVA_Build 10 18325194 1D TTTTCTATGA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 7 6 129400 CASAVA_Build 10 18327237 2I TAGCAGAGTG --/TA TAATATTGGC 3070 het 3070 hom 37 9 23 5 TA 1 2 129401 CASAVA_Build 10 18344162 6D ATTAAATCTA TATATC/------ TATATATCTG 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 TATATC 1 0 129402 CASAVA_Build 10 18344579 1D TTTTATTTTT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 A 7 6 129403 CASAVA_Build 10 18354172 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 9 8 129404 CASAVA_Build 10 18369705 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 899 het 899 ref 27 8 4 16 A 17 16 129405 CASAVA_Build 10 18375331 1I CAATGAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 10 11 129406 CASAVA_Build 10 18381998 1D GCAGAAGGGG A/- AAATGGGTAC 3070 het 3070 ref 39 20 13 8 A 4 3 129407 CASAVA_Build 10 18383570 4I AAAATATTAG ----/CGAA CAAACAATTA 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 CGAA 0 1 129408 CASAVA_Build 10 18394220 1I TGCTCATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 27 14 8 T 10 11 129409 CASAVA_Build 10 18396652 1D TGTGAACTGT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 C 1 0 129410 CASAVA_Build 10 18401411 1I CCTTTATAGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 8 9 129411 CASAVA_Build 10 18402665 1D TTTTTTTTTT C/- CAGACAGGGT 2087 het 779 hom 25 5 10 11 C 2 1 129412 CASAVA_Build 10 18441177 2D GGCAGTGTTC GG/-- GGGGTAACCT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 6 4 129413 CASAVA_Build 10 18447458 1D AGATCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2706 het 1773 hom 22 7 9 6 A 15 14 129414 CASAVA_Build 10 18450544 4I GTGTGTTGTT ----/TGTG TGTGAAGCAG 3070 het 3070 hom 95 31 48 16 TG 2 4 129415 CASAVA_Build 10 18457740 1I AATACAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 A 9 10 129416 CASAVA_Build 10 18465713 1I GGAGAAACAT -/A AAAAAAACAG 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 7 8 129417 CASAVA_Build 10 18468177 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2990 het 1365 hom 20 4 9 7 A 19 18 129418 CASAVA_Build 10 18474349 1D TTGAATGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 122 het 47 0 41 8 T 11 10 129419 CASAVA_Build 10 18475412 1D GGCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 19 1 8 11 T 12 11 129420 CASAVA_Build 10 18477025 1I CACTCTACAG -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 19 het 27 1 21 5 T 6 7 129421 CASAVA_Build 10 18482152 6D ATCCCAAAGG GTAAAT/------ ATACAGGTCT 3070 het 3070 hom 47 21 24 3 GTAAAT 1 0 129422 CASAVA_Build 10 18484799 2D GAGAGAGAAT GA/-- GAGAGAGAGG 671 het 330 hom 23 3 7 13 GA 5 4 129423 CASAVA_Build 10 18484825 2I8M8D GAGAGAGAGA --GAACATATTATATATA/ACGAACATAT-------- TATATATATA 3070 het 1101 hom 22 5 17 3 N/A 0 0 129424 CASAVA_Build 10 18489110 1I ACATAATTTT -/G GGGGAGAACA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 4 5 129425 CASAVA_Build 10 18490566 1I GCAAATCTCT -/C TTTTTTTTTT 70 het 39 hom 16 1 3 12 C 0 1 129426 CASAVA_Build 10 18492283 1D CAAATTGGTA T/- TACTCTTGGG 3070 hom 147 het 55 0 49 7 T 2 1 129427 CASAVA_Build 10 18497011 1I GCTGGGTTTT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 7 8 129428 CASAVA_Build 10 18498129 1I GGCATATATA -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 5 6 129429 CASAVA_Build 10 18500348 1D GACTGTGTCT C/- CCCCGCATGG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 C 5 4 129430 CASAVA_Build 10 18509387 1I TAAGGCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 11 12 T 13 14 129431 CASAVA_Build 10 18510725 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 13 12 129432 CASAVA_Build 10 18511455 2D GAAGAAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1546 hom 19 7 9 3 A 13 11 129433 CASAVA_Build 10 18512272 1I TTTTTTATTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 8 9 129434 CASAVA_Build 10 18515355 1I ACTCCGTCTG -/A AAAAAAAAAA 2441 het 2441 ref 17 7 7 3 A 11 12 129435 CASAVA_Build 10 18534022 1D GAGGGTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 9 8 129436 CASAVA_Build 10 18540800 1D ACGTGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 28 0 23 6 T 11 10 129437 CASAVA_Build 10 18541299 1D ATATATTGTG T/- TTTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 63 34 25 4 T 7 6 129438 CASAVA_Build 10 18544042 2I ACTGAGACTT --/TC TTTCCCTTCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TC 0 1 129439 CASAVA_Build 10 18545532 1D AAAACACTTG T/- TTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 T 5 4 129440 CASAVA_Build 10 18552927 1D AAGGGGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 30 3 13 14 T 12 11 129441 CASAVA_Build 10 18557677 1D TCTTAATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 10 9 129442 CASAVA_Build 10 18571046 2I ATATGTATAC --/AT ATGTGTGTGT 3070 het 670 hom 29 3 23 3 AT 1 2 129443 CASAVA_Build 10 18571764 2D CTAAAAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 13 0 12 1 A 13 11 129444 CASAVA_Build 10 18594669 2D GTAAAATTTC AA/-- AAGTTTATTG 3070 het 3070 hom 52 26 25 2 A 4 2 129445 CASAVA_Build 10 18596131 1D TGGAACTGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 T 10 9 129446 CASAVA_Build 10 18603163 1D GTCAGTCCAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 A 9 8 129447 CASAVA_Build 10 18618397 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 1808 hom 12 4 7 1 T 6 7 129448 CASAVA_Build 10 18630366 1I CCCGCTCTAC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 7 8 129449 CASAVA_Build 10 18638216 1D CAATAGAGTC A/- AAAATGTCTC 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 5 4 129450 CASAVA_Build 10 18651812 1D ATATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1234 het 1234 ref 25 16 3 6 T 13 12 129451 CASAVA_Build 10 18654458 4I TCTTTCTTTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 TCTT 3 4 129452 CASAVA_Build 10 18660393 1I CATCTCATTT -/A AAAAAAAAAA 1353 het 1353 ref 34 16 5 13 A 15 16 129453 CASAVA_Build 10 18664876 1I CCTCAGTTGC -/T TTTGGTTACC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 3 4 129454 CASAVA_Build 10 18665564 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 7 A 11 10 129455 CASAVA_Build 10 18676493 1D ATCTCTAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 13 8 7 T 10 9 129456 CASAVA_Build 10 18678662 1I GAGATGATTT -/A AAAAAAAAAA 2956 het 2956 ref 29 10 9 10 A 13 14 129457 CASAVA_Build 10 18680086 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 31 1 25 5 T 13 12 129458 CASAVA_Build 10 18682360 1D AAAAAAAAAA T/- TATGATTCTA 2055 het 2055 ref 29 18 7 4 T 2 1 129459 CASAVA_Build 10 18683870 1I TTGAGTACTT -/A ACGTAGGCTA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 1 2 129460 CASAVA_Build 10 18684143 1I ATGTACACTC -/T TAAGTGTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 1 2 129461 CASAVA_Build 10 18691843 1D AACTCTGTTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 53 het 35 1 32 4 A 9 8 129462 CASAVA_Build 10 18696145 1D ACAAATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 37 1 30 6 T 12 11 129463 CASAVA_Build 10 18712651 1D AGTGCCATTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 T 9 8 129464 CASAVA_Build 10 18713690 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3045 hom 34 10 13 11 A 8 9 129465 CASAVA_Build 10 18714707 1I AAAATACATC -/T TTGGAGATTA 1645 het 1645 ref 19 12 4 3 T 2 3 129466 CASAVA_Build 10 18717746 1D AGTACTTTTC T/- TTTAATTATT 3070 het 3070 ref 39 24 14 2 T 4 3 129467 CASAVA_Build 10 18719114 1D GCTGCTCAAG A/- AAAGGCCTGG 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 A 4 3 129468 CASAVA_Build 10 18719585 1I ATTGGCTTGA -/T TTTTTGAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 5 6 129469 CASAVA_Build 10 18726229 2I TGGCAAAACC --/GT GTCTCTACTG 3070 het 1916 hom 16 5 8 3 GT 1 2 129470 CASAVA_Build 10 18743419 12D TACTACTACC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 6 T 22 10 129471 CASAVA_Build 10 18744403 1D CTTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 29 7 A 13 12 129472 CASAVA_Build 10 18745969 1D AAAGTGCATT A/- AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 30 25 3 2 A 11 10 129473 CASAVA_Build 10 18746136 1D CTTCGTGCAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 15 het 32 2 28 3 T 9 8 129474 CASAVA_Build 10 18748292 1I GTATGTTAGG -/C TAAGACATAG 3070 hom 148 het 57 0 50 7 C 0 1 129475 CASAVA_Build 10 18749266 2D ACACACACAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 42 het 30 0 15 15 AG 10 9 129476 CASAVA_Build 10 18750164 1D GAAATACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 30 0 21 9 T 12 11 129477 CASAVA_Build 10 18754463 1D TTAGCTGGCC A/- ATGGTGACAG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 A 2 1 129478 CASAVA_Build 10 18757619 11D AGACACTGTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 25 0 15 14 A 23 12 129479 CASAVA_Build 10 18759067 1D AGAAGATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 13 12 129480 CASAVA_Build 10 18760708 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 10 9 129481 CASAVA_Build 10 18762612 1I ATATTTTTTT -/C CTTAAGCTAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 C 1 2 129482 CASAVA_Build 10 18766291 1I TGGGCATGGA -/C CCCCCTACAA 3070 het 3070 hom 61 21 27 13 C 5 6 129483 CASAVA_Build 10 18769599 1D AAAAGCTTCT G/- TGAAGGTGAC 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 G 1 0 129484 CASAVA_Build 10 18772652 1I CCTACATACC -/T TTTTTTTTTT 1997 het 72 hom 24 2 9 13 T 17 18 129485 CASAVA_Build 10 18776654 1D AGTGACTTTG A/- AAAAAAAAAA 1219 het 1219 ref 37 28 3 6 A 11 10 129486 CASAVA_Build 10 18783975 1I CCAATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1850 hom 47 10 18 19 A 16 17 129487 CASAVA_Build 10 18786034 1I ACTTTGGGTG -/T TGGGTGTATG 3070 hom 96 het 35 0 31 4 T 1 2 129488 CASAVA_Build 10 18789823 3D AGATCTTTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 20 0 12 9 A 17 14 129489 CASAVA_Build 10 18813333 1D23M1I TGTCTCAAAG AAAAAAAAAAAAATAGATACAGTA-/-AAAAAAAAAAAATAGATACAGTAT TAGAGAAAAC 3070 hom 29 het 11 0 10 1 N/A 0 0 129490 CASAVA_Build 10 18816774 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 22 2 13 7 A 15 14 129491 CASAVA_Build 10 18833373 1D TGCTCTTGCA T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 111 het 47 0 38 10 T 7 6 129492 CASAVA_Build 10 18843042 1I TTTAATTTTC -/T TTGCGTACTG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 2 3 129493 CASAVA_Build 10 18857640 1D CAAAACTTCA G/- TAACAGGTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 G 1 0 129494 CASAVA_Build 10 18860784 3I TAGAAAGGTG ---/TTC TTCATTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 TTC 1 2 129495 CASAVA_Build 10 18861621 17D CAAAAAAAAA AAAAAAAAAAACAAAAC/----------------- AAAAAAACAA 3070 hom 49 het 19 0 16 6 AAAAAAAAAAACAAAAC 1 0 129496 CASAVA_Build 10 18867917 1I CTGCTGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 128 hom 24 1 22 1 T 12 13 129497 CASAVA_Build 10 18869988 4I TAGTAAGAAA ----/TGTT TGTTTACACA 3070 hom 147 het 54 0 49 5 TGTT 1 2 129498 CASAVA_Build 10 18876736 1I ACTGGGAAGG -/A AGAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 129499 CASAVA_Build 10 18881115 1D GTTATAGTTG A/- AAAGTTATTC 3070 hom 96 het 41 0 32 9 A 4 3 129500 CASAVA_Build 10 18882651 12D AAATGTAACA AATGGAGAATGG/------------ AATGGAGAAT 3070 hom 151 het 53 0 51 5 AATGGAGAATGG 2 1 129501 CASAVA_Build 10 18885248 17I GAATGCAATG -----------------/GAGAATGGAATGGAATA GAGAATGGAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 GAGAATGGAATGGAATA 0 1 129502 CASAVA_Build 10 18885261 34D AATGGAATGG GGAATGTAATGGAATGGGGAGTAGTATGGAATGC/---------------------------------- AATAGAGAAT 840 het 840 ref 48 39 6 29 GGAATGTAATGGAATGGGGAGTAGTATGGAATGC 1 0 129503 CASAVA_Build 10 18888744 7D GAATAGAATG GAAAAGA/------- GAATGGAATG 3070 hom 141 het 52 0 45 10 GAAAAGA 1 0 129504 CASAVA_Build 10 18897784 5I TTCCATTCTA -----/CATTC CATTCAATTC 3070 hom 117 het 48 0 39 9 CATTC 1 2 129505 CASAVA_Build 10 18898989 4D17M1D CATTCCATTC TATTTGCATTCCATTCCATTCT/----TTCATTCCATTCTATTC- CCATTCCATT 1691 het 1691 ref 81 81 4 9 N/A 0 0 129506 CASAVA_Build 10 18913933 1D GAGACCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 29 1 20 9 A 13 12 129507 CASAVA_Build 10 18914735 5I TCAAATTACC -----/ACAAG ACAAGGATAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 ACAAG 1 2 129508 CASAVA_Build 10 18930457 18I TAATTTTCCT ------------------/CTCTAGTGAGGAAAACCA AGTGGCTGGA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 CTCTAGTGAGGAAAACCA 0 1 129509 CASAVA_Build 10 18931502 1I ATGGTGTTTC -/A ACCATGTTGG 1549 het 353 hom 5 1 4 0 A 1 2 129510 CASAVA_Build 10 18934306 1I CTGTTAATAA -/G GTAAGTAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 G 1 2 129511 CASAVA_Build 10 18935274 1I51M5I GAGTGACATT -AACAAAATACCTTAGTCTCAAAACTGTCAAGGTCTTACAAACAAGGCAAGA-----/CAACAAAATACCTTAGTCTCAAAACTGTCAAGGTCTTACAAACAAGGCAAGACTGAG TAGTTATCGC 3070 het 3070 hom 47 10 28 29 N/A 0 0 129512 CASAVA_Build 10 18937259 2D ATACTAGATT TC/-- TCTTTTTATA 3070 het 3070 hom 40 16 23 3 TC 2 1 129513 CASAVA_Build 10 18943288 1I GATTTATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 39 1 32 6 A 11 12 129514 CASAVA_Build 10 18949039 3D TTTTTTTTTT TTG/--- AGACGGAGTC 3070 het 154 hom 17 2 13 2 TTG 1 0 129515 CASAVA_Build 10 18963704 1D ACAAACAAAC A/- AAACAAAACA 316 het 151 hom 26 1 3 23 A 4 3 129516 CASAVA_Build 10 18970611 1I ATCCAGCCTG -/A AAACCTATTT 3070 hom 114 het 45 0 35 10 A 3 4 129517 CASAVA_Build 10 18974201 4I GTCCACATGG ----/CTAT CTGAGATAGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CTAT 0 1 129518 CASAVA_Build 10 18975480 1D CATTTGTTGT G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 31 5 G 2 1 129519 CASAVA_Build 10 18977586 3I ACAATCTAAA ---/AAG AAGAAGTTCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAG 2 3 129520 CASAVA_Build 10 18980192 1I CGGTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 661 hom 38 3 28 7 T 11 12 129521 CASAVA_Build 10 18984706 2D CCATGACTGC CA/-- CACTGAGCAG 3070 hom 89 het 35 0 26 10 CA 2 1 129522 CASAVA_Build 10 18986918 1D CGAAAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 484 hom 35 4 23 8 A 15 14 129523 CASAVA_Build 10 18988305 1D TTGGGGCTGT G/- GAGAGGCTGT 2708 hom 22 het 10 0 6 4 G 2 1 129524 CASAVA_Build 10 18995965 5I AGCCAGACTT -----/GTCAA GTCAAAAGAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 GTCAA 1 2 129525 CASAVA_Build 10 18997759 1D GGCTAGAGTG C/- AGTGGAGTGA 3070 hom 60 het 28 0 17 11 C 1 0 129526 CASAVA_Build 10 18998608 1D TAACCAATTA T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 T 7 6 129527 CASAVA_Build 10 19000005 1I ACAGTTGTTT -/C CCCATATTCT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 C 3 4 129528 CASAVA_Build 10 19017692 1I AAACAATCAC -/A AAAAGATAGT 3070 hom 53 het 23 0 18 5 A 4 5 129529 CASAVA_Build 10 19023336 1I TGCATGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1600 het 1600 ref 40 29 5 6 T 11 12 129530 CASAVA_Build 10 19025268 1I TGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 9 10 129531 CASAVA_Build 10 19027410 2I TGGTCCAGTT --/AC ACAGTCTAGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AC 1 2 129532 CASAVA_Build 10 19034424 1D AAAATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3015 het 3015 ref 31 19 8 4 T 11 10 129533 CASAVA_Build 10 19034831 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2642 het 1660 hom 12 5 7 0 T 11 12 129534 CASAVA_Build 10 19036955 3D ACTTGTCTTC TTA/--- TTTTGTTGAT 3070 het 3070 ref 28 12 12 7 TTA 1 0 129535 CASAVA_Build 10 19040540 1D GTCCAAACCC A/- AAAAAATGGA 3070 hom 95 het 39 0 32 7 A 7 6 129536 CASAVA_Build 10 19046555 1D GAAAGGTCAG A/- AAATCTTTCC 3070 het 3070 ref 37 23 13 2 A 4 3 129537 CASAVA_Build 10 19046896 1D AAGAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 25 0 12 13 T 17 16 129538 CASAVA_Build 10 19049865 2I ATGTATTTAA --/AT ATATATATAT 2006 het 1277 hom 8 3 5 0 AT 5 6 129539 CASAVA_Build 10 19052204 1I ACAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2734 het 2553 hom 18 7 10 2 A 11 12 129540 CASAVA_Build 10 19053129 1D AAACCTAGGG A/- AAAAGAAATT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 5 4 129541 CASAVA_Build 10 19058995 4D ACGGAGGAAC TGTT/---- TGTGTCTGTC 3070 het 3070 ref 40 18 14 11 TGTT 1 0 129542 CASAVA_Build 10 19076186 1I TCCATATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1872 hom 25 6 10 9 T 13 14 129543 CASAVA_Build 10 19080361 1I ATGCACCACC -/A ACACCTGGCT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 1 2 129544 CASAVA_Build 10 19084083 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 627 hom 21 4 8 9 T 12 11 129545 CASAVA_Build 10 19088368 2D TGCTATAAAC AT/-- GTGTGCAAGT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 AT 1 0 129546 CASAVA_Build 10 19088670 27D TTCTTCTCTT GCTTTCCTCACCCTAGGGCCACCAATG/--------------------------- GCTTATAGTT 3070 het 3070 ref 52 34 22 7 GCTTTCCTCACCCTAGGGCCACCAATG 1 0 129547 CASAVA_Build 10 19091364 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 11 10 129548 CASAVA_Build 10 19092759 1I GGTCAGAGAA -/G ATCTTTCCAA 3070 hom 147 het 51 0 43 8 G 0 1 129549 CASAVA_Build 10 19097429 9D CTATCATGAA AAATGCAAC/--------- AAATGCAACT 3070 hom 138 het 52 0 45 9 AAATGCAAC 2 1 129550 CASAVA_Build 10 19103367 1I CAAAAAATAC -/A AAAAATTTCA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 5 6 129551 CASAVA_Build 10 19103668 2D CTGTACTGTT AA/-- AACTGCTAAA 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 A 4 2 129552 CASAVA_Build 10 19107621 3D ATAGAATTCT TGC/--- TGATGTTGTC 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 TGC 1 0 129553 CASAVA_Build 10 19113200 1I ATTGTAGAGA -/T TTTTTTACCC 3070 het 3070 hom 47 24 19 4 T 6 7 129554 CASAVA_Build 10 19115349 3I AATAGTAGAT ---/AAC AACTCTAGTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AAC 1 2 129555 CASAVA_Build 10 19120282 1D AATTAAGTCT G/- GGGTTGGGGT 3070 het 3070 hom 37 18 15 5 G 4 3 129556 CASAVA_Build 10 19120876 2I GCATAATAAT --/GA GAGATGTTTG 3070 het 3070 hom 47 15 27 5 GA 2 3 129557 CASAVA_Build 10 19127059 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3000 hom 20 8 11 1 A 10 9 129558 CASAVA_Build 10 19130176 1D ATAGAAGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 80 het 32 0 27 5 A 10 9 129559 CASAVA_Build 10 19140248 1I CATAATGAAA -/C CAATTCATCA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 C 1 2 129560 CASAVA_Build 10 19156178 1I ACTAATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 T 12 13 129561 CASAVA_Build 10 19159139 1D TAAAAAAAAA T/- CTATGTGTAT 3070 het 2472 hom 24 7 14 3 T 1 0 129562 CASAVA_Build 10 19171834 25D GCCTCACAAG GGGATTACAGGTGTAATCCCTTGCT/------------------------- GGGATTACAG 3070 het 3070 hom 44 17 18 11 GGGATTACAGGTGTAATCCCTTGCT 1 0 129563 CASAVA_Build 10 19176785 1I ATCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 10 11 129564 CASAVA_Build 10 19181570 1I TCATAACAGG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 8 9 129565 CASAVA_Build 10 19182056 1I TCATAGCAGC -/T TTTTTTTTTT 2459 het 2459 ref 37 19 7 11 T 10 11 129566 CASAVA_Build 10 19182327 1D GTGGTTGCCT G/- GGGGGTGTGG 3070 het 3070 ref 26 11 12 5 G 6 5 129567 CASAVA_Build 10 19193704 1D TCTTTGGTAG T/- TTTAGTGCCT 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 T 4 3 129568 CASAVA_Build 10 19199551 16I TTAATTTGAA ----------------/TAAATTTAAATAAATC ACTTTATTAA 2949 het 2949 ref 14 6 6 2 TAAATTTAAATAAATC 0 1 129569 CASAVA_Build 10 19202922 1D TAAGAAATTT G/- GGTGGGCGTG 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 G 3 2 129570 CASAVA_Build 10 19203208 2D TCTCAAAAAC AA/-- AAAAAACAAA 3070 het 2115 hom 28 9 14 6 A 8 6 129571 CASAVA_Build 10 19206438 5D ATTTTTTGGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2399 het 2399 ref 40 17 10 13 T 21 16 129572 CASAVA_Build 10 19209894 1I AAAAGGCGGG -/T GTTTTTTTAC 3070 het 2863 hom 22 7 13 2 T 0 1 129573 CASAVA_Build 10 19211522 3D ATATGATAAC ATT/--- AATTTTAATT 1837 het 1837 ref 10 5 4 1 ATT 1 0 129574 CASAVA_Build 10 19224685 1I TTTTAATGAT -/A AAAAATGGAA 3070 het 2463 hom 25 8 15 2 A 5 6 129575 CASAVA_Build 10 19225953 1D CTATTTAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 11 10 129576 CASAVA_Build 10 19227153 1D CAATACCCTG T/- TTACGCCTAC 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 T 3 2 129577 CASAVA_Build 10 19243258 1D CTTAGTTGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 T 9 8 129578 CASAVA_Build 10 19280478 2I CTTATTGCCT --/GG GGGGCCAGCA 1045 hom 24 het 9 0 7 2 G 4 6 129579 CASAVA_Build 10 19293619 1D CGTTTAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 47 1 41 5 T 12 11 129580 CASAVA_Build 10 19298667 4D AAGAATCTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 29 1 14 14 T 20 16 129581 CASAVA_Build 10 19311893 1I CTCCCAGAGA -/T TGAGAGATAC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 1 2 129582 CASAVA_Build 10 19403555 1I TTAACTGATA -/C GATATCAACA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 0 1 129583 CASAVA_Build 10 19411593 1D TTCTCACTTT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 9 8 129584 CASAVA_Build 10 19416482 1D GTCTCGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 564 hom 33 4 22 9 T 14 13 129585 CASAVA_Build 10 19416741 1I TTCTTTCTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 T 9 10 129586 CASAVA_Build 10 19430918 5D TTATATATGT TATAA/----- TATAATTATA 1479 hom 10 het 4 0 4 0 TATAA 2 1 129587 CASAVA_Build 10 19431009 3I ATTATAACAT ---/AAC ATATATGGTA 1522 hom 10 het 4 0 4 0 AAC 0 1 129588 CASAVA_Build 10 19431610 1I CATCAGTGAT -/A ACTCATTAAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 1 2 129589 CASAVA_Build 10 19431787 3I GTTCAGTCAT ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTC 2 3 129590 CASAVA_Build 10 19440084 2I ATGGGCCATC --/AT ATATATATTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AT 4 5 129591 CASAVA_Build 10 19463477 4D AATGTGTAAG TTTA/---- TTTATGCTGG 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 TTTA 2 1 129592 CASAVA_Build 10 19467098 8I TTAATACTTC --------/AGACTCCT AGCTTTAAAC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 AGACTCCT 0 1 129593 CASAVA_Build 10 19470546 2I TATAGGAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 AT 7 8 129594 CASAVA_Build 10 19473765 1D ATGTAGAGTG T/- TAAGAATTAA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 2 1 129595 CASAVA_Build 10 19474589 1D ACTCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 35 2 18 15 A 17 16 129596 CASAVA_Build 10 19475299 1I TTTCCTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 23 13 10 A 9 10 129597 CASAVA_Build 10 19482627 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1335 hom 33 3 21 9 A 12 13 129598 CASAVA_Build 10 19482819 1I GTTTGAAATT -/G TGTATATTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 129599 CASAVA_Build 10 19494913 5D TTCAGATAAC AAAAT/----- AACACCATAG 3070 het 3070 hom 53 23 29 3 AAAAT 1 0 129600 CASAVA_Build 10 19500607 6D15M12D19M2I GTGTGTATAT AAATACACACATATATGTGTGTATGTGTGTGTATATATACGTATATACACGT--/------ATACGTATATGCACG------------TATATACGTATATATACGTGC ATATACGTAT 1120 het 1120 ref 18 11 3 11 N/A 0 0 129601 CASAVA_Build 10 19501226 1I CCATGAGATG -/C GTCATTATTT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 C 0 1 129602 CASAVA_Build 10 19504095 1I TTGTAAGACA -/T TTACTTTTGT 3070 het 3070 ref 60 28 22 10 T 2 3 129603 CASAVA_Build 10 19505758 4I48M2D TGTGTGTCTG ----TGTGTGTGTGCATGCCTGTGTGTCTGTGTGTGTGCGTGCATGTGTGCATG/CGTATGTGTGTGTGCATGCCTGTGTGTCTGTGTGTGTGCGTGCATGTGTGCA-- TGTGTGTGTG 3070 het 517 hom 49 5 27 38 N/A 0 0 129604 CASAVA_Build 10 19508556 1I CTGTCTGCCA -/C CCCCCCCATA 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 C 7 8 129605 CASAVA_Build 10 19509986 1I AGCTATAATT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 8 9 129606 CASAVA_Build 10 19510668 1I CTCTTGCCAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 A 7 8 129607 CASAVA_Build 10 19511931 1I TAAAAGATAA -/T TTTTTTAGAC 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 6 7 129608 CASAVA_Build 10 19512051 5D ATTTTGAGGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 6 T 16 11 129609 CASAVA_Build 10 19517479 2D GAGTTTACAC TG/-- TGATCTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 7 TG 2 1 129610 CASAVA_Build 10 19517790 1D AGGGTGAGAG C/- AGTAGAGATG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 1 0 129611 CASAVA_Build 10 19518442 1I AAGAGACTGC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 108 het 47 0 37 10 A 8 9 129612 CASAVA_Build 10 19519472 12D ACCCTGATTT CAAAACTTATTA/------------ CAAAACTACA 3070 het 3070 ref 46 31 18 4 CAAAACTTATTA 1 0 129613 CASAVA_Build 10 19519594 4D GAACAAGTGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 38 0 28 11 T 17 13 129614 CASAVA_Build 10 19521675 4D AGGTTTGTGG TTGT/---- TTGTTACATA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 TTGT 2 1 129615 CASAVA_Build 10 19521864 1D TGATTTATGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 T 9 8 129616 CASAVA_Build 10 19522770 1I AGTCTGGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 23 0 15 8 A 8 9 129617 CASAVA_Build 10 19523987 1D CCCAGGATGT G/- GAATCATCCT 3070 het 3070 ref 42 29 9 5 G 2 1 129618 CASAVA_Build 10 19525472 2D CCACTCTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 207 hom 35 6 19 10 T 16 14 129619 CASAVA_Build 10 19539643 2I GAAATCTTCT --/AA AAGTCATAGA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 2 4 129620 CASAVA_Build 10 19541627 1I GTTTACACTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 7 8 129621 CASAVA_Build 10 19541864 4D TTAAATGGGG TTGT/---- TTGTTTTTCA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTGT 2 1 129622 CASAVA_Build 10 19552358 1D TTCTAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 11 10 129623 CASAVA_Build 10 19562501 1I TTGTAAATGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2959 hom 22 8 8 6 T 8 9 129624 CASAVA_Build 10 19562784 1D AATTGGTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 T 9 8 129625 CASAVA_Build 10 19563568 1I GCTTATCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 59 24 27 8 A 9 10 129626 CASAVA_Build 10 19564315 1D ATTCTAAGCA T/- TTTTTTTTCG 3070 het 3070 hom 31 17 12 4 T 9 8 129627 CASAVA_Build 10 19564403 1D AATCGGGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 10 9 129628 CASAVA_Build 10 19567999 1D TGTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 222 hom 26 1 13 12 T 13 12 129629 CASAVA_Build 10 19589218 4D ACAGACAGAC AGAT/---- AGATAGACAG 3070 het 3070 ref 50 24 19 10 AGAT 2 1 129630 CASAVA_Build 10 19591283 2D ACCCCTCCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 TG 7 6 129631 CASAVA_Build 10 19595084 1I TTGGATATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 10 11 129632 CASAVA_Build 10 19597183 1D CCAGAGACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2234 hom 25 5 16 4 A 10 9 129633 CASAVA_Build 10 19598629 1D AGAAGAAACG C/- TTTTCTCATT 3070 het 3070 ref 55 30 20 6 C 1 0 129634 CASAVA_Build 10 19603798 1D ATGGATATAG T/- TTCTGGTTTT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 3 2 129635 CASAVA_Build 10 19605232 2D GCATTTTAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 1829 hom 16 4 9 4 TA 7 6 129636 CASAVA_Build 10 19605311 3I CGATCAAATT ---/AGA AGATTATTTT 3070 het 1668 hom 23 4 18 1 AGA 1 2 129637 CASAVA_Build 10 19642241 5I AAATATTATT -----/AAATA AATATTAAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AAATA 0 1 129638 CASAVA_Build 10 19648830 1D ATAATGAGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 9 8 129639 CASAVA_Build 10 19653535 1I AGAGATCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 11 129640 CASAVA_Build 10 19654349 1D AAGTCCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 931 hom 31 3 17 11 T 14 13 129641 CASAVA_Build 10 19654975 1D AATTTTAGAA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 7 129642 CASAVA_Build 10 19666996 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 4 A 15 14 129643 CASAVA_Build 10 19667155 1D CACTCTTGGT G/- CTGTATGTTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 1 0 129644 CASAVA_Build 10 19669282 1I ATGTGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 859 hom 45 2 35 8 T 12 13 129645 CASAVA_Build 10 19670524 2I ATAAAACACT --/CA CACACACACA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 CA 6 7 129646 CASAVA_Build 10 19673656 1I CATGTCAATT -/G GGGGGGGGGG 2728 hom 3 het 17 0 10 7 G 10 11 129647 CASAVA_Build 10 19674170 4I CATTATAAAG ----/ATCT ATTTAGCAGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ATCT 0 1 129648 CASAVA_Build 10 19674698 1I TGAAGTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1225 hom 47 5 32 10 T 11 12 129649 CASAVA_Build 10 19681246 2D CATTCTAATC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 44 0 35 9 TG 7 6 129650 CASAVA_Build 10 19681427 2D TTTTCTCCAA GT/-- GTTTTGGTCT 3070 hom 60 het 26 0 21 7 GT 2 1 129651 CASAVA_Build 10 19684474 1D ATTTCTCTGA T/- TTAGGAGCAT 3070 hom 123 het 45 0 41 5 T 3 2 129652 CASAVA_Build 10 19688704 3D TGAAAAAAAA AAT/--- AATTAAAGAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AAT 2 1 129653 CASAVA_Build 10 19689846 1I ACCAGTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 10 11 129654 CASAVA_Build 10 19694595 15D TATAAATTCT AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 26 0 22 6 A 29 14 129655 CASAVA_Build 10 19698087 13D TAATATTATA TATAAACTAATAT/------------- TTATATATAA 161 hom 3 het 5 0 1 4 TATAAACTAATAT 1 0 129656 CASAVA_Build 10 19698338 2I TATATAAATG --/CA CACACACACA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 CA 5 6 129657 CASAVA_Build 10 19698578 1D AGATATATTT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 7 129658 CASAVA_Build 10 19702089 1I GTTGCTCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 95 hom 21 1 15 5 T 9 10 129659 CASAVA_Build 10 19702206 5I ACTTTGGGAG -----/GCCGA GGCGGACGGA 2900 hom 18 het 8 0 7 1 GCCGA 0 1 129660 CASAVA_Build 10 19706575 1I GTCATAATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 10 129661 CASAVA_Build 10 19709849 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 11 10 129662 CASAVA_Build 10 19711299 2I GTATGTGTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 6 het 34 1 26 7 GT 5 6 129663 CASAVA_Build 10 19715352 1I AGAAGACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 10 11 129664 CASAVA_Build 10 19716234 1D AAAGTGATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 35 1 26 8 T 15 14 129665 CASAVA_Build 10 19730769 5D GAGAGTTATT TAATC/----- AAAACAATCT 3070 hom 114 het 40 0 39 2 TAATC 1 0 129666 CASAVA_Build 10 19731941 1D ATAATGTTAG A/- AAAAAATAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 6 129667 CASAVA_Build 10 19734793 1D TTAGGATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 814 hom 51 2 43 7 T 11 10 129668 CASAVA_Build 10 19742499 1I TTTAATCATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 10 129669 CASAVA_Build 10 19742907 1I AACCAAAAAA -/C AAAAAAACAA 3070 het 2038 hom 34 7 19 8 C 0 1 129670 CASAVA_Build 10 19743754 1I ATGGAGTTTC -/T TTGCAAAATT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 2 3 129671 CASAVA_Build 10 19757626 1I CAAAAATTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 9 10 129672 CASAVA_Build 10 19760276 5D TCTAATTCAT TAGTA/----- TAGTTTGAGA 3070 het 3070 hom 39 16 20 5 TAGTA 1 0 129673 CASAVA_Build 10 19766027 1I ACGAGTGTGA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 8 129674 CASAVA_Build 10 19767757 3D ACAGACAAGC CTT/--- CTTCTTTGTA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 CTT 3 2 129675 CASAVA_Build 10 19768054 1D TTTGTAATTG T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 6 5 129676 CASAVA_Build 10 19768473 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 8 129677 CASAVA_Build 10 19770754 1D ATGTGGGCTC T/- TTTTTGGTTC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 6 5 129678 CASAVA_Build 10 19775104 11D GTCCTGATTT TCCATGTACCG/----------- TCTGTCATGG 1246 het 1246 ref 16 14 3 1 TCCATGTACCG 1 0 129679 CASAVA_Build 10 19776677 1D AGATAGACCA C/- CCTTTCCTTT 3070 hom 114 het 46 0 39 8 C 3 2 129680 CASAVA_Build 10 19789387 1D CACACACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 28 1 20 7 T 13 12 129681 CASAVA_Build 10 19790616 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATTTT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 6 7 129682 CASAVA_Build 10 19792316 9D TATGATACAA TGCATCCTC/--------- TGCATCCTCT 3070 hom 90 het 38 0 29 16 TGCATCCTC 3 2 129683 CASAVA_Build 10 19796171 3D GCGCCTGTAG TCT/--- CAGCTACTCA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TCT 1 0 129684 CASAVA_Build 10 19796631 2I CTTTTTTGGC --/TT TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 10 129685 CASAVA_Build 10 19796737 1D ATTAAAATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 10 9 129686 CASAVA_Build 10 19797044 1D ACTTTAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 10 9 129687 CASAVA_Build 10 19799718 1I TTAATTATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 58 het 24 0 21 3 T 8 9 129688 CASAVA_Build 10 19800599 1I CTCTGCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 30 0 10 20 T 11 12 129689 CASAVA_Build 10 19803055 2I ATTGGACATT --/TG TGTGTATGTT 3070 hom 133 het 53 0 44 9 TG 2 3 129690 CASAVA_Build 10 19805866 1I TTGTCAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 9 129691 CASAVA_Build 10 19811724 5D GTAATTATAA ATAAC/----- ATAACACAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 6 ATAAC 2 1 129692 CASAVA_Build 10 19812142 1D AGAATCCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 29 2 25 5 A 12 11 129693 CASAVA_Build 10 19815027 3D ACATTGTGTA AAG/--- AAGGAGAGAT 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 AAG 2 1 129694 CASAVA_Build 10 19816299 1I TTTTTATTTG -/T TTTATTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 3 4 129695 CASAVA_Build 10 19816453 2D CTATTTTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 30 0 12 18 T 18 16 129696 CASAVA_Build 10 19817030 1D TGAAGTTGAT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 8 7 129697 CASAVA_Build 10 19819660 1D TTAGTTTTAG A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 A 7 6 129698 CASAVA_Build 10 19831865 3I TAAAGATTAT ---/TAA TAAGAGTATT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TAA 1 2 129699 CASAVA_Build 10 19832835 2I TGCTGGGAAC --/TG AGAATATGAA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 TG 0 1 129700 CASAVA_Build 10 19842684 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 10 11 129701 CASAVA_Build 10 19853664 1D GGAAAATGAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 9 8 129702 CASAVA_Build 10 19855292 1I ATGATTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 10 11 129703 CASAVA_Build 10 19858482 1I AAAAACAGGA -/G GGGGGGGGGA 3070 het 465 hom 28 1 12 15 G 9 10 129704 CASAVA_Build 10 19861682 6I TCCTGACTCT ------/ATGAGA GTGTCTGTTT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 ATGAGA 0 1 129705 CASAVA_Build 10 19863807 3D TATAAAGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TTG 7 6 129706 CASAVA_Build 10 19869287 1D TGGGATGTGG T/- TGCAAAGACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 2 1 129707 CASAVA_Build 10 19874594 1D TTCCTGGAAA T/- TTAATGAGCC 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 3 2 129708 CASAVA_Build 10 19907082 1I TAAGAAAAGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 T 8 9 129709 CASAVA_Build 10 19918225 2D AAAGTATGTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 123 het 49 0 42 8 TA 7 6 129710 CASAVA_Build 10 19921941 1D TAAAATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 29 3 20 6 A 15 14 129711 CASAVA_Build 10 19944877 2D CATTGTTTAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 31 0 30 2 T 11 9 129712 CASAVA_Build 10 19948942 13D TTCCTGTCTC AATAATAATAATA/------------- AATAATAATA 3070 hom 29 het 15 0 10 8 AATAATAATAATA 2 1 129713 CASAVA_Build 10 19951143 1I GAAGTTATCA -/T TGATGGTATA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 1 2 129714 CASAVA_Build 10 19966622 1D GCACCTGGGG C/- TAAGTCAGGG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 C 1 0 129715 CASAVA_Build 10 19969432 1D TATGTTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 T 10 9 129716 CASAVA_Build 10 19972452 4D AAGTTAATTG ATTA/---- ATTGACTAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 ATTA 1 0 129717 CASAVA_Build 10 19973413 44I GTCATCAGAC --------------------------------------------/ATGAACAAAAGGAAGCAGTTACTTCATTTAGATCATGCATAGTG ATGGGGGCCA 3070 hom 99 het 33 0 33 7 ATGAACAAAAGGAAGCAGTTACTTCATTTAGATCATGCATAGTG 0 1 129718 CASAVA_Build 10 19975543 1D GTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 7 A 12 11 129719 CASAVA_Build 10 19977339 4I ATGCACCAGG ----/GAGA GAAAGTTTGG 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 GA 1 3 129720 CASAVA_Build 10 19982141 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTTG 2752 het 1217 hom 15 5 7 3 T 9 10 129721 CASAVA_Build 10 19983170 2D TTTGATGGAT AA/-- AAGACTAAGC 3070 het 3070 ref 48 30 16 4 A 4 2 129722 CASAVA_Build 10 19986481 1I TTTCTTAACA -/T TTTTTTTTTA 2157 het 2157 ref 22 13 6 3 T 9 10 129723 CASAVA_Build 10 19994820 1D TTTCTAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2758 hom 40 13 10 17 T 15 14 129724 CASAVA_Build 10 20009284 1I ATATTTAGAA -/T AGTTAGCTCT 2521 het 2521 ref 20 11 6 3 T 0 1 129725 CASAVA_Build 10 20012069 1I ATCTCTACCG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 0 1 129726 CASAVA_Build 10 20015129 1I TAAAGTACAC -/T TGGAAGAGGG 3070 hom 129 het 53 0 44 9 T 1 2 129727 CASAVA_Build 10 20033064 1I AAAATCAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 T 9 10 129728 CASAVA_Build 10 20039227 1D CACTCTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 T 11 10 129729 CASAVA_Build 10 20041980 1D CAGAAATGAA G/- GGGGGGGTTC 3008 het 2493 hom 27 9 7 11 G 8 7 129730 CASAVA_Build 10 20042106 1D AAGCCACACA T/- TAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 2 1 129731 CASAVA_Build 10 20076612 2I3M3I5M5I TTTGAAATAA --TTC---CTAGG-----/GTTTCAAATAAGGTTCAA TTCTATAGGA 2286 het 2286 ref 31 21 8 5 N/A 0 0 129732 CASAVA_Build 10 20083046 1I AAAAATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 11 12 129733 CASAVA_Build 10 20103586 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 35 9 15 11 T 16 14 129734 CASAVA_Build 10 20109794 1D TGCAAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 T 13 12 129735 CASAVA_Build 10 20113090 1D GAAAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 11 10 129736 CASAVA_Build 10 20116290 1D CCTTTTAGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 257 hom 27 1 24 2 A 10 9 129737 CASAVA_Build 10 20125922 2D31M6D TATATATATA TGTGTGTGTGTGTGTGTATATATACATACATACATATAT/--TGTGTGTGTGTGTGTATATATACATACATAC------ ATATATATAT 2759 het 401 hom 9 3 10 1 N/A 0 0 129738 CASAVA_Build 10 20131753 1D GAGAAAGTCC T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 96 het 34 0 32 3 T 7 6 129739 CASAVA_Build 10 20134082 1I TTTCAATCCA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 8 9 129740 CASAVA_Build 10 20140032 1I CATAATAGGC -/A AAAAAGTGGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 5 6 129741 CASAVA_Build 10 20148417 1I AATTCAGTAT -/G GGGGGGAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 G 6 7 129742 CASAVA_Build 10 20156500 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 20 1 15 4 T 14 13 129743 CASAVA_Build 10 20159156 1D ATTTAAGAGA T/- TTTTCAGATA 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 T 5 4 129744 CASAVA_Build 10 20159930 1D GTTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2498 het 2498 ref 29 13 10 6 T 11 10 129745 CASAVA_Build 10 20172204 1I GGAATACTTA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 7 8 129746 CASAVA_Build 10 20178263 2I TCTCACACAT --/AC ACACACACAA 3070 het 329 hom 33 2 27 4 AC 4 5 129747 CASAVA_Build 10 20192760 1I TATTCAAAAA -/T TTTTTTAATA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 6 7 129748 CASAVA_Build 10 20207119 1I GCATCACATA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 9 10 129749 CASAVA_Build 10 20220344 1I ATTTTCTCCC -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 55 27 19 9 T 6 7 129750 CASAVA_Build 10 20226163 1I TTCCCTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2940 hom 30 10 13 7 T 11 12 129751 CASAVA_Build 10 20258976 1I CATTTATTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 T 9 10 129752 CASAVA_Build 10 20272179 1D37M1I TTGATAGAAC TTTTTTTTTTTCTTATAAGTGTTCTGTAACATTAGGAT-/-TTTTTTTTTTCTTATAAGTGTTCTGTAACATTAGGATA TTTTTCAGTA 3070 het 3070 hom 40 23 26 10 N/A 0 0 129753 CASAVA_Build 10 20277326 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1666 hom 56 11 25 21 T 16 14 129754 CASAVA_Build 10 20295744 1D CGCGTTACCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 39 0 28 11 T 10 9 129755 CASAVA_Build 10 20319447 2I GCTGGATTCT --/AA AAGTGTTAGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 2 4 129756 CASAVA_Build 10 20322248 2I ATAGTATATC --/AT ATAATTACAC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 AT 1 2 129757 CASAVA_Build 10 20327747 1D ACAGTGGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 13 19 7 A 10 9 129758 CASAVA_Build 10 20328326 1D TAGGTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1096 hom 35 7 25 3 T 12 11 129759 CASAVA_Build 10 20330470 1I ATCTGTTTTT -/A AAAAACTCTG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 A 5 6 129760 CASAVA_Build 10 20343826 1I AAAGAGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 17 14 T 10 11 129761 CASAVA_Build 10 20347256 2I TGAAATCAGT --/AA AAGATATATG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 2 4 129762 CASAVA_Build 10 20348112 3I AAAACCAAAT ---/AGC TGACTGTTTT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 AGC 0 1 129763 CASAVA_Build 10 20348951 1I CTTTTCTTGC -/T TTTTTTTTTT 1663 het 1663 ref 27 15 9 3 T 10 11 129764 CASAVA_Build 10 20349487 2D CTCTGTTCAT GA/-- GAGATATATA 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 GA 3 2 129765 CASAVA_Build 10 20350132 4D TCCTGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TTTG 4 3 129766 CASAVA_Build 10 20352713 1I ATGTTTTATT -/A AAAAAAACCC 2877 het 2877 ref 18 9 6 3 A 7 8 129767 CASAVA_Build 10 20371525 4D TTTGATCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 11 25 10 TTTG 5 4 129768 CASAVA_Build 10 20386858 1D AATCTGCATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 10 11 7 A 10 9 129769 CASAVA_Build 10 20388275 1I TCAGCGTTTG -/C CAAGTACAGG 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 C 1 2 129770 CASAVA_Build 10 20392546 1I AGCAGAGATT -/G TAATAATTAG 3070 hom 148 het 54 0 50 4 G 0 1 129771 CASAVA_Build 10 20393053 1I TTCTTGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 10 11 129772 CASAVA_Build 10 20393846 1D GTTTGTTTGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 115 het 44 0 36 8 T 9 8 129773 CASAVA_Build 10 20396623 1D ACTCCGACTC A/- AAAAAAAAAA 2667 het 2667 ref 35 18 8 9 A 17 16 129774 CASAVA_Build 10 20403800 3I AGTTGTTTTG ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 TAT 5 6 129775 CASAVA_Build 10 20406279 1I TATTTTTCTA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 6 7 129776 CASAVA_Build 10 20407660 6D TCTTGTAATA ATAATT/------ ATAAGGAGTG 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 ATAATT 1 0 129777 CASAVA_Build 10 20409309 2D ATCAGCAAAC TG/-- AGGATCAAGG 3070 het 3070 ref 44 20 17 8 TG 1 0 129778 CASAVA_Build 10 20410344 1I AAATGCAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 451 hom 24 2 21 1 A 8 9 129779 CASAVA_Build 10 20411425 2D CATAATATCA CT/-- CCTAATAAGT 3070 het 3070 hom 37 15 19 5 CT 1 0 129780 CASAVA_Build 10 20414103 1I CTGTGTGCTT -/A AAAAAAAGGT 2940 hom 30 het 18 0 10 8 A 7 8 129781 CASAVA_Build 10 20415298 1I TATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1703 het 1703 ref 14 6 4 4 T 10 11 129782 CASAVA_Build 10 20416331 1D CTGAGTAATT A/- AAAAAATTTG 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 A 7 6 129783 CASAVA_Build 10 20419404 1D AGTTTTTTTA C/- CCCCATGCCC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 5 4 129784 CASAVA_Build 10 20420984 8I ATTTACTAAG --------/CGAAACTT CGAAACTTCA 3070 het 3070 hom 32 8 10 14 CGAAACTT 1 2 129785 CASAVA_Build 10 20423491 1I TTTTTCATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 9 10 129786 CASAVA_Build 10 20441274 1I TAGGAAAATG -/A AAAAAAAAAA 2403 het 2403 ref 31 14 9 8 A 14 15 129787 CASAVA_Build 10 20445987 1D CTTAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 A 11 10 129788 CASAVA_Build 10 20454869 2D AGAAATGAAC AT/-- ATATATATAT 1980 het 1454 hom 17 4 6 7 AT 9 8 129789 CASAVA_Build 10 20459706 19D AATCTTCATT CTATTAATGTAGTATATCA/------------------- CATTTATTGA 3070 het 3070 hom 33 18 19 4 CTATTAATGTAGTATATCA 1 0 129790 CASAVA_Build 10 20461200 2I TTGACCTAAC --/AT GTGGATCTAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 AT 0 1 129791 CASAVA_Build 10 20461706 1D TTTGATCTTT A/- AAAAAAAAAA 2945 het 2945 ref 25 14 7 4 A 12 11 129792 CASAVA_Build 10 20470211 4I GGGAAAGTAC ----/ATAT ATATATCTTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 AT 3 5 129793 CASAVA_Build 10 20475246 1I TTTTGCTCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 T 8 9 129794 CASAVA_Build 10 20490266 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2829 het 2829 ref 28 15 8 5 A 11 10 129795 CASAVA_Build 10 20503089 1D GACTCAAGAA C/- CCCCCCTCCT 3070 het 3070 ref 37 24 7 6 C 7 6 129796 CASAVA_Build 10 20506687 1D AAAAAATAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 9 8 129797 CASAVA_Build 10 20512978 1I ACAGAATAAG -/C CCCCTCCTTA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 C 4 5 129798 CASAVA_Build 10 20517944 1D TTATAATCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 8 13 8 T 10 9 129799 CASAVA_Build 10 20536801 2I CTGAGAGAAT --/GA GAGAGATTGT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 GA 3 4 129800 CASAVA_Build 10 20544191 5D AGTAGGACAC CATGG/----- AAGATGTTGG 3070 het 3070 ref 56 28 25 4 CATGG 1 0 129801 CASAVA_Build 10 20547260 5I CTTGAATAAA -----/AAATT AAATTAAATA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AAATT 1 2 129802 CASAVA_Build 10 20547640 1I TTGATCTTGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 T 6 7 129803 CASAVA_Build 10 20550082 1D ACGGCCAACA C/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 C 1 0 129804 CASAVA_Build 10 20550239 1D TAAAGCAGTG C/- CTTATGATGC 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 C 2 1 129805 CASAVA_Build 10 20552252 1I ATTGAATTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 723 hom 39 6 19 14 C 0 1 129806 CASAVA_Build 10 20554749 1I TGAGCACCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 9 10 129807 CASAVA_Build 10 20560941 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 A 13 14 129808 CASAVA_Build 10 20562305 4I TACAAAAATT ----/AAAA TAAAAAAAGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 0 4 129809 CASAVA_Build 10 20570072 1D TAAAGGAACA T/- TTTTTAAAAG 3070 hom 82 het 30 0 28 2 T 6 5 129810 CASAVA_Build 10 20572642 1I TTTAATAGAC -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 A 7 8 129811 CASAVA_Build 10 20576414 1I CTGGTCTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 A 11 12 129812 CASAVA_Build 10 20581910 1I ATTATCCTTA -/T TTTTATCATA 2892 het 2892 ref 22 11 6 5 T 4 5 129813 CASAVA_Build 10 20585395 6I2M12I ACACTGAGAC ------TG------------/CATGTGTGTTTTAACACTAA CACCAAATGT 1437 het 1437 ref 16 10 3 3 N/A 0 0 129814 CASAVA_Build 10 20590791 3D CTCCATCTCA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AAT 6 5 129815 CASAVA_Build 10 20592564 4D TACAAGAGAA AAAC/---- AAACAACCTC 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 AAAC 2 1 129816 CASAVA_Build 10 20593059 1D CCATGGAATA T/- TATGCAGCCA 3070 hom 72 het 28 0 25 5 T 2 1 129817 CASAVA_Build 10 20598953 5D GCTCCATCAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 20 het 17 0 12 6 AAAAT 7 6 129818 CASAVA_Build 10 20599878 2D TGGGTATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 22 3 12 7 A 12 10 129819 CASAVA_Build 10 20602483 2D ACATACATAG AC/-- ACACATATAT 3070 het 3070 ref 64 33 28 5 AC 3 2 129820 CASAVA_Build 10 20604134 1I AGGTTCAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 9 10 129821 CASAVA_Build 10 20604897 1I GAAGGGTAGG -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 7 8 129822 CASAVA_Build 10 20619284 1D ATTTTATATC T/- TTTTTTTTTT 1746 het 879 hom 12 4 5 3 T 17 16 129823 CASAVA_Build 10 20620467 3D4M3I TAGCATTAGG AGATATA---/---TATATCT CCTAATGCTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 N/A 0 0 129824 CASAVA_Build 10 20637654 1D GAGGTTGAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 10 9 129825 CASAVA_Build 10 20639051 1D AAACAATCAC A/- AAAGACTGCA 3070 het 3070 hom 46 19 24 4 A 4 3 129826 CASAVA_Build 10 20644077 3D GAGGTATGGG AGA/--- AGGAGTGCAG 3070 het 3070 ref 47 29 17 1 AGA 1 0 129827 CASAVA_Build 10 20646089 1D GAGATTACCC A/- AGTCTAGAGA 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 A 2 1 129828 CASAVA_Build 10 20655216 1D CAACAATTTT A/- AAGCTAGTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 3 2 129829 CASAVA_Build 10 20670642 1D CCAAGCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3058 hom 37 15 11 11 T 15 14 129830 CASAVA_Build 10 20671728 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 A 10 9 129831 CASAVA_Build 10 20688808 1D GGATTGGTAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 A 9 8 129832 CASAVA_Build 10 20699150 1D CTGTGGGGGA G/- GGGGGGGTGA 3070 hom 46 het 27 0 14 13 G 8 7 129833 CASAVA_Build 10 20701377 2I TTTCAAATGC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 2516 hom 21 7 9 5 T 9 11 129834 CASAVA_Build 10 20702131 1D ACCGTAACCT C/- CACCTCCAGG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 C 2 1 129835 CASAVA_Build 10 20709772 4D GAATTCTATC ATAA/---- ATAAATAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 6 ATAA 3 2 129836 CASAVA_Build 10 20710752 1D TCTAATTTAT G/- TTTTTATATT 3070 het 3070 hom 36 18 18 0 G 1 0 129837 CASAVA_Build 10 20716962 1D AAATTGTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 17 24 11 A 11 10 129838 CASAVA_Build 10 20720349 1D TTTTTAGAGG A/- AAAAAAAAAA 2231 het 2231 ref 24 11 7 6 A 13 12 129839 CASAVA_Build 10 20727387 4D AATTTTTATA AATT/---- AAAACATAAC 3070 het 3070 hom 37 15 20 4 AATT 1 0 129840 CASAVA_Build 10 20728744 1D TCAGGGTGGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 16 18 5 A 9 8 129841 CASAVA_Build 10 20738891 1D AAAAAAAAAA T/- TCTGTAGCGA 2417 het 1675 hom 33 11 9 13 T 2 1 129842 CASAVA_Build 10 20740553 2D ATGCATTGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 14 12 129843 CASAVA_Build 10 20741955 3D CAACAAACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1953 het 1592 hom 36 14 8 14 T 21 18 129844 CASAVA_Build 10 20746191 1D TGTGAAGAAG A/- AATTTCTGTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 3 2 129845 CASAVA_Build 10 20747183 2I CAGGGCACTC --/TT TGAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 T 1 3 129846 CASAVA_Build 10 20750327 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 A 11 10 129847 CASAVA_Build 10 20752299 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTAA 435 het 435 ref 21 11 4 6 T 9 8 129848 CASAVA_Build 10 20753099 1I ATTTTTGCAT -/C TACGTTCACC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 C 0 1 129849 CASAVA_Build 10 20754382 1D TAATTAAGCC T/- TTGAGTTGAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 3 2 129850 CASAVA_Build 10 20755334 1I TCCTCCAAGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 8 9 129851 CASAVA_Build 10 20764427 1D GTTTTCATAG T/- TTCCAGAAGC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 3 2 129852 CASAVA_Build 10 20764662 1D AAGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2106 hom 30 8 17 5 A 15 14 129853 CASAVA_Build 10 20769766 3D TCATGTACAC TTT/--- CATGTACACG 1681 het 1681 ref 17 8 4 6 T 3 0 129854 CASAVA_Build 10 20769841 1D CTTTTTATTC T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 7 6 129855 CASAVA_Build 10 20772335 1I GAGTCTAGGG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 8 9 129856 CASAVA_Build 10 20788597 4D TTACTGTAAC TTTA/---- TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 TTTA 2 1 129857 CASAVA_Build 10 20796142 4D GTTTGACTAC CTAT/---- CTATTTCTCA 3070 het 3070 ref 32 14 13 7 CTAT 2 1 129858 CASAVA_Build 10 20803196 1D AATAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 A 13 12 129859 CASAVA_Build 10 20803509 1D TGAGTTATGT A/- AGGTGCCAAG 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 A 2 1 129860 CASAVA_Build 10 20809245 8I CTCCTCCTTT --------/CCTCCTTC CCTAGCTCTA 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 CCTCCTTC 0 1 129861 CASAVA_Build 10 20812112 1D AGCTGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 48 2 33 13 A 15 14 129862 CASAVA_Build 10 20815897 1I GCCAGGAGCT -/A GGGGAGGGAG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 0 1 129863 CASAVA_Build 10 20816052 1D CTTGGAGGGG A/- CCTTAGGTTC 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 1 0 129864 CASAVA_Build 10 20820157 3I TTTTTAATTT ---/TCA TCATCATACC 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 TCA 2 3 129865 CASAVA_Build 10 20822367 1D ACAGTACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 28 8 A 11 10 129866 CASAVA_Build 10 20822882 1D CCCAGAGAGG T/- GAGGATGACC 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 T 1 0 129867 CASAVA_Build 10 20835660 1I ATTTCACGTC -/A AAAAAAAATG 3070 het 65 hom 36 1 31 4 A 8 9 129868 CASAVA_Build 10 20835697 2I AGTGAATATG --/AT ATATATATAT 2231 het 2231 ref 30 8 5 17 AT 7 8 129869 CASAVA_Build 10 20837413 4D ATTTTGTTAC AGGA/---- AGGAAGGGTG 3070 hom 108 het 38 0 37 2 AGGA 2 1 129870 CASAVA_Build 10 20865251 1I TGAGGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 40 0 24 16 A 14 15 129871 CASAVA_Build 10 20903193 1I AAAAACCTTC -/T TTGGTAATCT 3070 het 3070 hom 52 23 27 2 T 2 3 129872 CASAVA_Build 10 20940965 2D GTTTTTGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 12 10 T 12 10 129873 CASAVA_Build 10 20957205 1D TCTGAGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 11 10 129874 CASAVA_Build 10 20960939 2D TCATAATTTA AC/-- AGTTTCAACC 3070 hom 163 het 60 0 54 6 AC 1 0 129875 CASAVA_Build 10 20962012 3D CTTAATTTTT CTA/--- CTGTTATAAC 3070 hom 96 het 33 0 33 0 CTA 1 0 129876 CASAVA_Build 10 20970922 4I ATGAAGATAA ----/TTTT TTTTAATGCT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 T 4 8 129877 CASAVA_Build 10 20973366 1D ATGTATGAGC T/- TTTTCCATGA 3070 hom 96 het 37 0 32 8 T 5 4 129878 CASAVA_Build 10 20995413 3D AACATGGTGA AAC/--- AACCCCATCT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 AAC 2 1 129879 CASAVA_Build 10 21005784 2D TTTTGAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 12 10 129880 CASAVA_Build 10 21027155 1D TCTGTAAACT C/- GAAACAATAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 0 129881 CASAVA_Build 10 21039058 1D CTATGGCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 30 4 17 9 A 13 12 129882 CASAVA_Build 10 21043629 2I GCAGAGTGAC --/AA GACATTAGTC 3070 hom 135 het 49 0 44 5 A 0 2 129883 CASAVA_Build 10 21044395 1I AAATAAAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 434 hom 25 1 22 2 T 9 10 129884 CASAVA_Build 10 21045502 3I TTCATTACAC ---/TTA TTATATTGCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTA 1 2 129885 CASAVA_Build 10 21072883 1D AATCCTACTG T/- TATGTTTCAG 3070 hom 99 het 39 0 33 7 T 2 1 129886 CASAVA_Build 10 21080587 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTTTTTTTTT 798 hom 5 het 3 0 2 1 TTA 1 0 129887 CASAVA_Build 10 21091800 16D GAAAGAGAAG GAGAAAAAGAAAACAT/---------------- GAGATTTTGT 3070 hom 96 het 32 0 31 7 GAGAAAAAGAAAACAT 1 0 129888 CASAVA_Build 10 21094486 1I CTCAGCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 11 12 129889 CASAVA_Build 10 21099427 10D CCAGCTCAAG CGGATGCCCA/---------- CTCATTGCCA 3070 hom 114 het 40 0 36 6 CGGATGCCCA 1 0 129890 CASAVA_Build 10 21113294 1D AGGGCTAGCA T/- AAAGCCTGCA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 1 0 129891 CASAVA_Build 10 21121059 1D TTCCAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 14 13 129892 CASAVA_Build 10 21123268 2D TCATATTATC TT/-- TGTTTTAATT 3070 het 3070 ref 49 22 20 8 T 3 1 129893 CASAVA_Build 10 21137285 1D TTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 807 het 807 ref 42 27 2 13 A 13 12 129894 CASAVA_Build 10 21180924 1I AACTGACATC -/T TTTGCAACTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 3 4 129895 CASAVA_Build 10 21184459 1I ACAAAACAAA -/C ACAAAAAAAA 2252 het 277 hom 39 2 14 23 C 0 1 129896 CASAVA_Build 10 21217163 1D AAAAAACAGG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 7 6 129897 CASAVA_Build 10 21231342 2D ACACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 13 11 129898 CASAVA_Build 10 21232980 3D ATAGCAAGAG AAC/--- AACTAGTAAT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 AAC 2 1 129899 CASAVA_Build 10 21238086 1I AGTTACAAAC -/A ATCCAACTAC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 2 129900 CASAVA_Build 10 21239764 1D TTCGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 37 1 33 3 T 13 12 129901 CASAVA_Build 10 21248905 1D AAAAATTGAG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 7 129902 CASAVA_Build 10 21250730 2I ACACACACAC --/AT ATATGTATAC 3070 hom 115 het 46 0 39 7 AT 2 3 129903 CASAVA_Build 10 21253459 1D TATCTTGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 15 14 129904 CASAVA_Build 10 21254649 1I AACAACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1194 hom 44 4 32 8 A 11 12 129905 CASAVA_Build 10 21255341 1D GAAATTTTGC T/- TCTTTTATGA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 2 1 129906 CASAVA_Build 10 21260052 1D TTCCCATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 9 129907 CASAVA_Build 10 21280411 1D TTGCATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 11 10 129908 CASAVA_Build 10 21281376 1D TGTCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 24 2 14 8 A 19 18 129909 CASAVA_Build 10 21299421 1I TCCCCCCACC -/A AAAAAAAAAA 1187 het 1187 ref 18 11 3 4 A 11 12 129910 CASAVA_Build 10 21313061 1I AATGTACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1208 hom 35 4 24 7 A 11 12 129911 CASAVA_Build 10 21353755 1D CCTCTCCAGC A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 89 het 34 0 30 5 A 7 6 129912 CASAVA_Build 10 21355269 1I CACTGTACAG -/C CCCCTCCCTG 3070 hom 101 het 39 0 34 5 C 4 5 129913 CASAVA_Build 10 21356237 1D TATTATCTTT A/- AAAAAAAAAC 2082 het 2082 ref 31 10 10 11 A 10 9 129914 CASAVA_Build 10 21358915 7D TAATGATAGA CGTCCCC/------- CGTCCCCCTC 3070 hom 84 het 30 0 27 4 CGTCCCC 2 1 129915 CASAVA_Build 10 21361569 12D TTCAGAAAGC AGACTTATGAGA/------------ GCTGCTGATA 3070 hom 81 het 25 0 28 0 AGACTTATGAGA 1 0 129916 CASAVA_Build 10 21362689 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAAAGAA 2986 het 41 hom 16 1 10 5 AG 0 1 129917 CASAVA_Build 10 21364262 1D TGCTCTCCTT C/- CCCCCGCCCC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 6 5 129918 CASAVA_Build 10 21364673 1I TATTACCTTC -/A AAAATCATAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 4 5 129919 CASAVA_Build 10 21366378 1D AATTGCAAAG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 47 het 18 0 16 2 A 8 7 129920 CASAVA_Build 10 21366760 4I GAGTAGAAAG ----/ATAA ATAGACAAAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 ATAA 0 1 129921 CASAVA_Build 10 21367432 2D TTGCTAAGAC TG/-- ATGGCTTACA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TG 1 0 129922 CASAVA_Build 10 21369273 1D GACTCCATTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 9 129923 CASAVA_Build 10 21382968 7D ACTCCATCTC AAAACAA/------- AAAACAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 AAAACAA 3 2 129924 CASAVA_Build 10 21393153 1I AGTTAACGTC -/A AAAAAAATTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 129925 CASAVA_Build 10 21395758 4I ACATTGTTCT ----/CTTA GCGGTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CTTA 0 1 129926 CASAVA_Build 10 21396915 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 9 8 129927 CASAVA_Build 10 21400744 1D AGTGTTGGGC T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 5 4 129928 CASAVA_Build 10 21424270 5I AAAAGCAGAT -----/AAGAG AAAAGATAAG 3070 het 3070 ref 42 18 21 3 AAGAG 0 1 129929 CASAVA_Build 10 21427150 4D CACACACATT CTCA/---- CTCACACGTG 3070 het 3070 ref 65 31 33 4 CTCA 2 1 129930 CASAVA_Build 10 21471435 1D GAAACAAACT A/- AACAAGACAA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 3 2 129931 CASAVA_Build 10 21572852 6D GAAGGAAGGC GAAAGG/------ GAAAGGGAAA 2343 het 1379 hom 23 6 6 12 GAAAGG 4 3 129932 CASAVA_Build 10 21573927 1D TGCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1745 het 1745 ref 35 17 8 11 A 17 16 129933 CASAVA_Build 10 21612154 1I42M4D GACCTCTGGT -TGTCCTCACTGCTACATTCCCATTAGCGCCATGACGGTTTACAAAT/CATTCCTCACTACTACACTCCCACCAGCGCCATGACAGTTTAC---- AAATGCCATG 2273 het 2273 ref 32 34 5 3 N/A 0 0 129934 CASAVA_Build 10 21675092 1D CATGGTGAAA C/- CCTCGTCTCT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 C 3 2 129935 CASAVA_Build 10 21754353 2D AATGAAGTAG AC/-- ACAGTTACTT 3070 het 3070 ref 44 28 15 1 AC 2 1 129936 CASAVA_Build 10 21782933 1D ATCAGTAAAT A/- AATAAATGGT 2636 het 2636 ref 22 11 7 4 A 3 2 129937 CASAVA_Build 10 21940298 1I AGATAATTAG -/T TTTTTTTTTT 3051 het 3051 ref 44 34 7 3 T 13 14 129938 CASAVA_Build 10 21943161 1D TTTTTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 1933 het 248 hom 28 4 10 14 A 19 18 129939 CASAVA_Build 10 21944393 17D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- GAAAAAAAAA 2414 het 2060 hom 12 7 5 2 A 17 0 129940 CASAVA_Build 10 21991401 1D CCTCAAGCTT A/- AGAGATTTTT 3070 het 3070 hom 53 18 23 13 A 2 1 129941 CASAVA_Build 10 22038166 2D TTTTATCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 25 0 19 7 T 16 14 129942 CASAVA_Build 10 22043283 1D TTAAAGTTTT A/- AAAAAAACCG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 7 129943 CASAVA_Build 10 22070210 1D AGTATTTTTT C/- CCCCCCAGTG 3070 het 3070 hom 52 19 26 7 C 7 6 129944 CASAVA_Build 10 22075462 1D CTCTTCTCTT A/- AAAAAAAAAG 1802 het 830 hom 25 6 6 13 A 10 9 129945 CASAVA_Build 10 22076924 1D GCTGCTTTCT C/- CAACTCCCTG 3070 hom 66 het 24 0 21 4 C 2 1 129946 CASAVA_Build 10 22094779 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 9 129947 CASAVA_Build 10 22119447 1I ATAAATTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1783 hom 31 6 14 11 A 12 13 129948 CASAVA_Build 10 22120395 1D ATCAGCTCAT G/- GAACATTCTC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 2 1 129949 CASAVA_Build 10 22142327 1D GCAAACAGTC T/- TTTTTTTTTT 2270 het 4 hom 16 1 10 5 T 15 14 129950 CASAVA_Build 10 22172328 1D GAGGTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 675 het 524 hom 25 5 4 16 T 19 18 129951 CASAVA_Build 10 22193558 4D CTCTGTCTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 36 het 16 0 13 7 AAAC 5 4 129952 CASAVA_Build 10 22199889 8I CCAGTACTAG --------/AAGGAACA AAGGAACAGA 3070 hom 108 het 41 0 36 6 AAGGAACA 1 2 129953 CASAVA_Build 10 22206235 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AT 7 6 129954 CASAVA_Build 10 22219114 1I TGGGAGGCTG -/A GGGGGGGGTG 3070 hom 31 het 16 0 11 5 A 0 1 129955 CASAVA_Build 10 22255196 1D CAGCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1654 het 1654 ref 26 12 7 8 T 17 16 129956 CASAVA_Build 10 22274870 1D GTTTCTTCAT A/- AATTCCAACT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 3 2 129957 CASAVA_Build 10 22280457 1D61M3I GTTTTCCCTT AAAAAAAAAAAGTTTAACAATGTAAAATTAACTTGATATATAAACCATTCCTTCATAGTGCA---/-AAAAAAAAAAGTTTAACAATGTAAAATTAACTTGATATATAAACCATTCCTTCATAGTGCACTT AGTGCTTCAC 3070 het 3070 hom 40 17 41 11 N/A 0 0 129958 CASAVA_Build 10 22295370 1I CTAGTGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 180 hom 43 2 31 10 T 11 12 129959 CASAVA_Build 10 22302680 1I CTTAAAAAAA -/G AAAAAGAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 0 1 129960 CASAVA_Build 10 22322051 2I TATATTTACC --/AT ATATATATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 5 6 129961 CASAVA_Build 10 22352742 1I TATGACTCTC -/A GGGGGAACAA 3070 hom 149 het 58 0 49 9 A 0 1 129962 CASAVA_Build 10 22357087 1D TTGACAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 36 2 27 9 T 13 12 129963 CASAVA_Build 10 22375615 1I TTTCAACAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 9 10 129964 CASAVA_Build 10 22395827 1D ATTTTGTTCT A/- AAAAAAAAAA 507 het 507 ref 23 12 4 7 A 15 14 129965 CASAVA_Build 10 22396810 1I TTGATGAAAA -/G TGTGTTGAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 129966 CASAVA_Build 10 22397442 1I TTTTTAAAAT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 129967 CASAVA_Build 10 22518722 3D ATTTAGTAAC AGG/--- AGAAGAAGGC 3070 het 3070 ref 36 23 11 4 AGG 1 0 129968 CASAVA_Build 10 22637235 1I CTATGTAAAG -/T TTTTTTTTTT 2096 het 2096 ref 33 19 5 9 T 13 14 129969 CASAVA_Build 10 22757436 1D TAAGAGTGCC T/- TTTTTTTTTC 647 het 647 ref 36 24 3 9 T 10 9 129970 CASAVA_Build 10 22828143 3I TAGAAAGTCT ---/TTC TTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 TTC 1 2 129971 CASAVA_Build 10 22836208 1D CATCATGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 10 9 129972 CASAVA_Build 10 22849251 1I ATTTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 10 11 129973 CASAVA_Build 10 22855785 1I TAAGGGTTCA -/T TTTCTGAAAT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 3 4 129974 CASAVA_Build 10 22857203 1D CTTGTAGTAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 9 8 129975 CASAVA_Build 10 22862921 4I GAAACGTGTA ----/ACTC ACTCCAGATA 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 ACTC 1 2 129976 CASAVA_Build 10 22864826 1D CATTTGGAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 9 8 129977 CASAVA_Build 10 22865294 1D GAACAATGAA G/- GCTCCAGGCA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 G 2 1 129978 CASAVA_Build 10 22865901 3D CACCCCCCCC CAA/--- CACACACACA 3070 het 3070 ref 28 13 8 9 CAA 1 0 129979 CASAVA_Build 10 22867740 1I GCTCGGGGGC -/G GGTGAGGTCC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 G 2 3 129980 CASAVA_Build 10 22877819 1D TAGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2931 hom 30 9 14 7 A 13 12 129981 CASAVA_Build 10 22884833 2D TGATGAGCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2129 het 479 hom 27 1 8 19 A 16 14 129982 CASAVA_Build 10 22891168 4D AAAGTTAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 AAAC 3 2 129983 CASAVA_Build 10 22894015 7D GACCCAGTGT CTCCTGG/------- CTCCTGTAAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 7 CTCCTGG 1 0 129984 CASAVA_Build 10 22894774 1I TTATAAACAG -/C CCCCCCCAGG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 C 7 8 129985 CASAVA_Build 10 22897344 1D CTCCCGTCTT A/- AGAGTTACTG 3070 het 3070 ref 51 24 17 10 A 2 1 129986 CASAVA_Build 10 22903035 3D GGAGAGTTGC AAA/--- AAAAACACAA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 8 5 129987 CASAVA_Build 10 22903133 2I TTCATAAAAC --/AG GGGTCCCTCT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AG 0 1 129988 CASAVA_Build 10 22903377 1I TTTTCATTTT -/G CTGTTTTTTT 3070 het 1097 hom 41 11 14 16 G 0 1 129989 CASAVA_Build 10 22910085 4D GAGTAGGGCT TTTC/---- TTTCCCCTGA 3070 hom 132 het 48 0 37 13 TTTC 2 1 129990 CASAVA_Build 10 22913257 1D TGTTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 12 11 129991 CASAVA_Build 10 22928031 1D ACCTTTTGGG A/- AAAAAACGTC 2824 het 2824 ref 38 23 8 7 A 7 6 129992 CASAVA_Build 10 22934779 1D TAATTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1959 hom 24 7 9 8 A 15 14 129993 CASAVA_Build 10 22948016 1I GTACTGGGGG -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 A 6 7 129994 CASAVA_Build 10 22948375 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2972 het 1405 hom 26 8 10 8 T 15 14 129995 CASAVA_Build 10 22956024 1I TATCAACTAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 8 9 129996 CASAVA_Build 10 22957071 2D ACAATGCCAA TG/-- ATTAAGTTTC 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 TG 1 0 129997 CASAVA_Build 10 22967848 3D CTTGTTAAAG TCT/--- TCTTCAGACA 3070 het 3070 ref 55 29 22 4 TCT 2 1 129998 CASAVA_Build 10 22974485 1D CTATTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3064 hom 39 11 15 13 A 16 15 129999 CASAVA_Build 10 22979769 1D GAAATCTACT G/- GGTTTTTTTT 3070 het 356 hom 38 1 31 6 G 3 2 130000 CASAVA_Build 10 22981058 1I TGCACACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 11 1 T 13 14 130001 CASAVA_Build 10 22989753 1D ACTTTAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 49 38 4 7 A 12 11 130002 CASAVA_Build 10 22993936 1D AGGAAAAAAA C/- ATAACATTAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 1 0 130003 CASAVA_Build 10 22996307 1I TATTACATAA -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 6 7 130004 CASAVA_Build 10 23003913 1D CTTTAAAAAA C/- AAAAAAAAGT 3070 het 1036 hom 23 5 14 4 C 1 0 130005 CASAVA_Build 10 23005043 1I TTTTCATCTC -/T TCTGAGCCTC 3070 hom 105 het 40 0 32 8 T 1 2 130006 CASAVA_Build 10 23010737 1I ACTTTCCCTG -/T CAAGGGTTAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 0 1 130007 CASAVA_Build 10 23014467 1I CATTTTCTAT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 107 het 39 0 35 4 A 6 7 130008 CASAVA_Build 10 23016080 1D AAGTCAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 600 hom 42 2 23 17 A 15 14 130009 CASAVA_Build 10 23019101 11D TAACTCATTT AAACCTCAAAA/----------- AAACCCTATT 3070 hom 120 het 42 0 41 2 AAACCTCAAAA 1 0 130010 CASAVA_Build 10 23020399 1I TTTATACCAG -/A GGAGACTTGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 0 1 130011 CASAVA_Build 10 23038999 1D CCCATGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 751 hom 34 5 14 15 A 19 18 130012 CASAVA_Build 10 23046743 1D CATTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 33 3 19 12 A 17 16 130013 CASAVA_Build 10 23057420 1I TAGTAGAGAT -/G GGGATTTCAC 3070 hom 32 het 12 0 11 1 G 3 4 130014 CASAVA_Build 10 23061991 1D CTGAAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 36 0 29 7 A 12 11 130015 CASAVA_Build 10 23118146 3D CTGCAACCTC CTT/--- CTCCTGCCTC 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 CTT 1 0 130016 CASAVA_Build 10 23120294 1D AAAATATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 12 11 130017 CASAVA_Build 10 23120685 1D CACTGAAATC A/- ATACGCAGAA 3070 het 3070 ref 49 24 15 11 A 2 1 130018 CASAVA_Build 10 23122708 1D TGAAGCCCCT C/- CAAGCTGGCT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 C 2 1 130019 CASAVA_Build 10 23130021 2I TTTCTCTCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 TC 7 8 130020 CASAVA_Build 10 23139399 2D AATATACCAC AT/-- GTTACAAAGA 3070 het 3070 ref 39 20 14 7 AT 1 0 130021 CASAVA_Build 10 23146563 1D CAGTCACACT G/- GGGGGGTAGG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 G 7 6 130022 CASAVA_Build 10 23147432 1I AAGTTTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 10 11 130023 CASAVA_Build 10 23159724 1D AACCCTGTCT A/- CTACTAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 1 0 130024 CASAVA_Build 10 23173536 1I GGGCGCTGTG -/C CTTCCCTAAG 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 C 1 2 130025 CASAVA_Build 10 23174590 7D CCAACATCTA TATAGAG/------- TATAGAGTTA 3070 het 3070 ref 49 25 20 8 TATAGAG 2 1 130026 CASAVA_Build 10 23185720 3D TTTTTTGAAG GAA/--- AAAAAAAAAA 1899 het 1899 ref 31 12 7 13 GAA 1 0 130027 CASAVA_Build 10 23192230 2I GTTTTGTTGT --/TG TTTTTTTTTT 2334 het 2334 ref 20 10 9 1 TG 0 1 130028 CASAVA_Build 10 23199019 1D TATTTTAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 17 9 7 A 10 9 130029 CASAVA_Build 10 23207112 5D CAAATTCAGG ATATT/----- AGTCCATTGT 3070 het 3070 ref 39 26 12 4 ATATT 1 0 130030 CASAVA_Build 10 23220757 1I AGTTTTTTGC -/T CTCAAGAGGG 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 0 1 130031 CASAVA_Build 10 23225076 2D ATTTTTTGAG AT/-- GGAGTCTCAC 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 AT 1 0 130032 CASAVA_Build 10 23232715 1D CAGCTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2611 hom 34 11 15 8 T 13 12 130033 CASAVA_Build 10 23233428 1D TCACGGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 12 11 130034 CASAVA_Build 10 23234065 1I AGACCAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 36 2 26 8 A 14 15 130035 CASAVA_Build 10 23234782 1D AACTCTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 A 12 11 130036 CASAVA_Build 10 23249779 1I TTTGAATCTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 21 8 13 0 T 7 8 130037 CASAVA_Build 10 23258251 15D AAAAGAAAAA GAAAGGAAAGGAAAG/--------------- GAAAGGAAAG 2854 het 2854 ref 31 16 8 9 GAAAG 5 2 130038 CASAVA_Build 10 23259871 1D GAAAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1604 hom 19 4 10 5 T 12 11 130039 CASAVA_Build 10 23282544 13D5M2D CTTTTCCCCT AAGATCAGGAGCAAGAGAAG/-------------AGAGA-- GATGTCTGCT 3070 het 3070 ref 37 28 11 7 N/A 0 0 130040 CASAVA_Build 10 23303864 1I4M1I7M1I GGCATGAGCC -CCAC-CCTGGCC-/ACCACACCTGGCCA AAGACTCTCT 3070 hom 96 het 32 0 33 2 N/A 0 0 130041 CASAVA_Build 10 23319101 1D TGTGTGATTT C/- CCCCCCCCAC 3070 het 291 hom 40 1 34 7 C 9 8 130042 CASAVA_Build 10 23321936 2I TCACGGAGAC --/AT ATGAAAAGTC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AT 1 2 130043 CASAVA_Build 10 23332777 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 33 1 26 6 A 11 10 130044 CASAVA_Build 10 23339480 3I CCCTTCCCTG ---/TTC TTCTCTTCTT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 TTC 1 2 130045 CASAVA_Build 10 23346013 1I CAATTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 34 1 23 10 T 11 12 130046 CASAVA_Build 10 23357301 5D ATTTTTATAC TTCAT/----- TTCAAGAGTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTCAT 1 0 130047 CASAVA_Build 10 23381144 2D TTAGCATGCT AA/-- AAGACACTCC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 4 2 130048 CASAVA_Build 10 23389203 1D CAGGGGAGAC G/- GGGGGGGGTA 3070 het 1580 hom 31 9 14 8 G 9 8 130049 CASAVA_Build 10 23397259 16I GGCCTAGAGA ----------------/CCTGCCCGCCTCGTTG CTTAAAGGTG 3070 het 2481 hom 26 7 14 5 CCTGCCCGCCTCGTTG 0 1 130050 CASAVA_Build 10 23397837 1D CCATTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 8 A 11 10 130051 CASAVA_Build 10 23400274 1I AGTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2657 hom 35 11 17 7 T 11 12 130052 CASAVA_Build 10 23419196 1D CACCATACTT G/- GGGGGTATTG 3070 hom 98 het 43 0 32 12 G 6 5 130053 CASAVA_Build 10 23423377 1I AGAGACTGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 8 9 130054 CASAVA_Build 10 23426155 2I AATGATAAAC --/AG GGAGTATTTC 3070 het 3070 ref 52 31 18 3 AG 0 1 130055 CASAVA_Build 10 23436894 4D TTTTCATTGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2604 hom 31 9 14 9 T 16 12 130056 CASAVA_Build 10 23442411 1I GGATCAAGTA -/T TTTTATTTAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 4 5 130057 CASAVA_Build 10 23445154 4D TTAAAACAAT CATA/---- CAATCTATAA 3070 het 3070 ref 30 16 13 3 CATA 1 0 130058 CASAVA_Build 10 23451860 3D ATACTAATAT ATA/--- ATAATATATG 3070 het 2816 hom 18 7 11 1 ATA 3 2 130059 CASAVA_Build 10 23452533 1D GACATTTTTC A/- AAAAAATTAA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 7 6 130060 CASAVA_Build 10 23455449 4D GTAATGAAAT TATA/---- TGATAATACA 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 TA 2 0 130061 CASAVA_Build 10 23455965 6D ATACACACAC CACACA/------ CACACACACA 3070 het 76 hom 22 2 11 9 CA 14 11 130062 CASAVA_Build 10 23468715 1I CAATGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 2805 het 2805 ref 34 17 10 7 A 12 13 130063 CASAVA_Build 10 23471403 1I CGCAGCACTA -/T TCACAATAGC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 1 2 130064 CASAVA_Build 10 23473956 6D CTTTTCTCTA TAGAGT/------ TTTGCTCTGT 3070 het 3070 hom 34 10 21 7 TAGAGT 1 0 130065 CASAVA_Build 10 23477363 2D GTGTGTGTTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 57 26 19 13 GT 6 5 130066 CASAVA_Build 10 23522998 3D TGATGAAATA GAT/--- GATTTCTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 GAT 2 1 130067 CASAVA_Build 10 23536397 1D CATGCTAATG A/- ACTAATGAAT 3070 het 3070 hom 56 24 29 3 A 2 1 130068 CASAVA_Build 10 23583435 1D ATGAGCCACC A/- CTACTGGCTG 2515 het 1894 hom 14 5 7 2 A 1 0 130069 CASAVA_Build 10 23584636 1D TTTATAACCG A/- AAAAAAAAAG 1234 het 1234 ref 38 29 3 6 A 10 9 130070 CASAVA_Build 10 23586734 1D TCAGACTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 T 13 12 130071 CASAVA_Build 10 23595084 1D CCCCCACTCA G/- GGGGTGAGAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 8 G 5 4 130072 CASAVA_Build 10 23621200 1D GCCATGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 13 12 130073 CASAVA_Build 10 23640659 4I AGAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAATTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AAAG 1 2 130074 CASAVA_Build 10 23654411 1D TTGGGCTGCT A/- AAAAAAAAAA 2515 het 1151 hom 17 4 7 6 A 15 14 130075 CASAVA_Build 10 23661611 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1909 hom 31 6 14 11 A 15 16 130076 CASAVA_Build 10 23673991 6I ATCAGTATGT ------/CATTGC CATTGTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 CATTGC 0 1 130077 CASAVA_Build 10 23679563 1I TTGTGAGAGT -/A AAAAATTTGG 3070 het 3070 ref 33 12 15 6 A 5 6 130078 CASAVA_Build 10 23681600 1D TGCAATAATA T/- TATCATCCCT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 T 2 1 130079 CASAVA_Build 10 23691799 1I AGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 12 13 130080 CASAVA_Build 10 23728179 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2175 het 2175 ref 37 21 7 9 T 13 12 130081 CASAVA_Build 10 23799023 4I TTTCTCTCTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 1079 het 1079 ref 16 9 4 3 TCTT 3 4 130082 CASAVA_Build 10 23800037 1I GCAAAGGGGC -/T TTTATCTCAC 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 T 3 4 130083 CASAVA_Build 10 23807795 1I TTAAATTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3027 hom 26 7 13 6 T 11 12 130084 CASAVA_Build 10 23828275 2D CAAATGGGGG AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 993 hom 22 5 11 7 A 10 8 130085 CASAVA_Build 10 23835342 5D ATATGTTCTT AAAAC/----- AAAACAAGAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 4 AAAAC 2 1 130086 CASAVA_Build 10 23856950 1I TAGTCAGGCG -/C ATGTATGTAT 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 C 0 1 130087 CASAVA_Build 10 23864788 1I CTGTGGGAGA -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 6 7 130088 CASAVA_Build 10 23873007 1D ATGTTGCGGG A/- GGGTCACAGG 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 A 1 0 130089 CASAVA_Build 10 23876481 1I GACTTCATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 T 9 10 130090 CASAVA_Build 10 23882887 1D TAAACCTTAA T/- TGTCCCATTC 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 2 1 130091 CASAVA_Build 10 23887260 7D GTCCTTGCCC TATGTGT/------- TATTTTCAGA 3070 het 3070 hom 51 22 26 6 TATGTGT 1 0 130092 CASAVA_Build 10 23899409 6D CAGGAGATCG AGACCA/------ AGACCACCCT 3070 hom 34 het 13 0 11 2 AGACCA 2 1 130093 CASAVA_Build 10 23906071 1D CTTGGGCCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 10 9 130094 CASAVA_Build 10 23909117 1D ATTCTTGAAA G/- CACAGGACCG 3070 het 3070 hom 27 13 12 4 G 1 0 130095 CASAVA_Build 10 23912664 1I CCGCTTCCCG -/A AAGGTAAGCA 3070 het 3070 hom 50 18 26 6 A 2 3 130096 CASAVA_Build 10 23918009 1I TTAGCATGAA -/G GGCTGTTGGA 2421 het 2421 ref 14 8 5 1 G 2 3 130097 CASAVA_Build 10 23920232 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTCCAA 3070 het 3024 hom 20 10 8 2 T 7 6 130098 CASAVA_Build 10 23926110 1D TCTTCCTAGC G/- TTGATGGTCT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 G 1 0 130099 CASAVA_Build 10 23929450 3I GAGGCAATTA ---/ATT ATAAAGGTTT 3070 het 3070 hom 47 19 27 1 ATT 0 1 130100 CASAVA_Build 10 23929802 1D CTTTTTATAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 8 9 8 T 9 8 130101 CASAVA_Build 10 23932785 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 A 13 12 130102 CASAVA_Build 10 23934637 8D TTGTCCTCAC CCCCATCT/-------- CCACCAGCAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 6 CCCCATCT 1 0 130103 CASAVA_Build 10 23936248 1I CCTTAAGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 13 14 130104 CASAVA_Build 10 23940464 4D ATCTAGCAAA AAAG/---- CAAACAAAAA 283 het 283 ref 35 20 3 12 AAAG 1 0 130105 CASAVA_Build 10 23945110 4D ATAGGACGGG GCTA/---- GCTAGCTTAG 3070 het 3070 ref 40 24 11 6 GCTA 2 1 130106 CASAVA_Build 10 23949087 1D TTATATTTGC A/- ATTATTTTTG 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 A 2 1 130107 CASAVA_Build 10 23949213 1I ACTCTGTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 A 10 11 130108 CASAVA_Build 10 23950154 1D ACAAGGGCCT A/- ATTGCTTTCT 3070 hom 128 het 48 0 42 7 A 2 1 130109 CASAVA_Build 10 23972209 1D CTTTATGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 T 13 12 130110 CASAVA_Build 10 23972584 1I AAAGCTTGAG -/T TAGGGCATGG 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 1 2 130111 CASAVA_Build 10 23975406 4I AAAGTACGTA ----/TTTC TTTTTAATCA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TTTC 0 1 130112 CASAVA_Build 10 23990101 1I ACTTCTGCCT -/C CCAGGTTTGA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 C 2 3 130113 CASAVA_Build 10 23990566 1D GGTGGGCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 A 11 10 130114 CASAVA_Build 10 23995357 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2984 het 2984 ref 27 10 10 8 T 11 10 130115 CASAVA_Build 10 24029854 1D AAGGAAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2069 hom 35 6 24 5 T 10 9 130116 CASAVA_Build 10 24053211 1D TTCTTATGTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 50 22 21 8 T 8 7 130117 CASAVA_Build 10 24054954 1I TTCCTCACTC -/A AAAAAGGGAC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 5 6 130118 CASAVA_Build 10 24057443 1I TTTTTGATGG -/T TTTTTTTTTT 1240 het 1240 ref 13 7 4 2 T 11 12 130119 CASAVA_Build 10 24059590 1D TTGTAGTGTC T/- TTATTTTATT 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 T 3 2 130120 CASAVA_Build 10 24059722 1D TCTCAAATTC T/- TTCTTGTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 3 2 130121 CASAVA_Build 10 24060673 1D CTGTAGGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 10 9 130122 CASAVA_Build 10 24061957 1I TATGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 10 11 130123 CASAVA_Build 10 24062557 1D TTGTTGTTAT G/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 1 0 130124 CASAVA_Build 10 24063777 1I GGGCATATAT -/G CAGGCTCGTT 3070 het 3070 hom 29 11 18 0 G 0 1 130125 CASAVA_Build 10 24065067 4D AGTCAAATGT ATCA/---- ATCATTTATT 3070 het 3070 hom 45 21 23 3 ATCA 2 1 130126 CASAVA_Build 10 24066856 1D CTTACTGTGT G/- GCAAATTTAT 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 G 2 1 130127 CASAVA_Build 10 24067671 1I ATGGATAGAT -/A ATTGATTAAT 3070 het 3070 ref 58 34 21 3 A 1 2 130128 CASAVA_Build 10 24068228 1D ATGCATGTTA T/- TTTGGGTGAT 3070 het 3070 ref 65 36 29 3 T 4 3 130129 CASAVA_Build 10 24068965 1I39M7I TGGTGAAGAT -GGGGGGGTTCCATTTTATACATCTTAAATTTGAGATGCC-------/GGGGGGGGTTCCATTTTATACATCTTAAATTTGAGATGCCTCTTGAG TATGTAAGTG 3070 het 3070 ref 37 30 24 4 N/A 0 0 130130 CASAVA_Build 10 24072834 1D TAATTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 A 11 10 130131 CASAVA_Build 10 24083775 1D TTCCTGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2206 hom 26 7 11 9 T 12 11 130132 CASAVA_Build 10 24088258 1I ATAATTAGGG -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 T 6 7 130133 CASAVA_Build 10 24095204 1D GCAAAAATTG A/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 14 9 A 1 0 130134 CASAVA_Build 10 24097186 1D GGTCAGAGGA G/- GGATAGGAAT 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 G 3 2 130135 CASAVA_Build 10 24107891 4D ACTATACAAC TATT/---- TATTTATTCA 3070 het 3070 hom 47 14 25 9 TATT 3 2 130136 CASAVA_Build 10 24112140 1I AAAAAATTGC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 7 8 130137 CASAVA_Build 10 24114682 1I AGTAAGGTCA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 6 7 130138 CASAVA_Build 10 24121970 24D ATCACCTCTC ATGTGGGAGAAGGGATGACAAGGG/------------------------ ATGTGGGAGA 3070 het 3070 hom 48 22 28 10 ATGTGGGAGAAGGGATGACAAGGG 1 0 130139 CASAVA_Build 10 24141424 1D TTATTGTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 T 9 8 130140 CASAVA_Build 10 24141923 2I TCTATGGTAA --/CT CTATGTTTAA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 CT 1 2 130141 CASAVA_Build 10 24143755 1I GTAGATAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 11 12 130142 CASAVA_Build 10 24145378 1I CAGGCACCTG -/C CCACCATACC 2269 het 793 hom 11 3 5 3 C 2 3 130143 CASAVA_Build 10 24186892 1D CAATCTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 8 A 12 11 130144 CASAVA_Build 10 24201229 1D GACCAATAGA T/- TTTAAAAGAC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 4 3 130145 CASAVA_Build 10 24204131 3D GAAGATCACA TTT/--- TAACATGAGA 3070 het 3070 ref 40 28 10 3 T 4 1 130146 CASAVA_Build 10 24209749 2D ATGGGGAAAC AT/-- AGAATTGATG 3070 het 3070 ref 31 13 14 6 AT 1 0 130147 CASAVA_Build 10 24210969 2D AAATAGAGTG TC/-- TCTTTCTTGT 3070 het 3070 ref 48 26 16 8 TC 2 1 130148 CASAVA_Build 10 24218628 15I AAGTTTATTG ---------------/AAGTCTATTTTATCA AGTTTTCTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAGTCTATTTTATCA 0 1 130149 CASAVA_Build 10 24227240 4D CTATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AC 11 9 130150 CASAVA_Build 10 24230849 2D ACTCTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 14 12 A 17 15 130151 CASAVA_Build 10 24234120 1D AAGGGGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 36 0 23 14 T 12 11 130152 CASAVA_Build 10 24238468 1D TTGAAATTAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 59 het 22 0 20 3 A 8 7 130153 CASAVA_Build 10 24241283 1D TTTTTAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 21 5 T 11 10 130154 CASAVA_Build 10 24242351 1D TTTCTGTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 31 0 23 9 A 12 11 130155 CASAVA_Build 10 24253133 13D GTTCTAGGAT ACATGTGCAAGCC/------------- ACTGTGTTTG 3070 hom 87 het 30 0 25 6 ACATGTGCAAGCC 1 0 130156 CASAVA_Build 10 24253891 1I GAGAAAACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 130157 CASAVA_Build 10 24254153 1D GAAGGAAAAA G/- ATAAGGAAAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 1 0 130158 CASAVA_Build 10 24261446 4I GGCCTAATAC ----/ACAA ACAACTTTGA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 ACAA 1 2 130159 CASAVA_Build 10 24263442 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2440 hom 12 het 5 0 5 0 T 12 11 130160 CASAVA_Build 10 24267605 1D GATTTAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 11 10 130161 CASAVA_Build 10 24267737 2D AAGAGATGAC TG/-- TGTATATGCA 3070 hom 144 het 51 0 48 4 TG 2 1 130162 CASAVA_Build 10 24271623 1D TGTCAAACAC A/- AAATTCTGAA 3070 hom 90 het 38 0 31 8 A 4 3 130163 CASAVA_Build 10 24273308 1I TGCAGTGAGC -/T GAGATGGCAC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 0 1 130164 CASAVA_Build 10 24279427 1D GGATACGGGA G/- GGGAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 4 3 130165 CASAVA_Build 10 24295966 4D AATCAGTATT AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 69 het 27 0 22 6 AATA 3 2 130166 CASAVA_Build 10 24302113 1D GAATTTAAAG T/- TTTTTTCCGC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 7 6 130167 CASAVA_Build 10 24303819 1I GATTATCCTT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 C 9 10 130168 CASAVA_Build 10 24310671 2I CTGACAAGAC --/TT TTATTGGCCT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 2 4 130169 CASAVA_Build 10 24315489 1I AGTTGTATTA -/T TTTTTATGAC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 5 6 130170 CASAVA_Build 10 24316354 1D TTGTTTTTTT A/- AAAAAAAACC 1882 het 1726 hom 15 5 5 5 A 9 8 130171 CASAVA_Build 10 24316989 1I ATTTTTTTTT -/A AAAAAGCAGC 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 A 5 6 130172 CASAVA_Build 10 24317050 7I GGCTGTCCAG -------/CAGTACC CACTCCCTTG 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 CAGTACC 0 1 130173 CASAVA_Build 10 24327892 27D AGCACAACAG ATGGTATATTTGGATATATATTCAAAT/--------------------------- ATGCAGACTA 3070 het 3070 ref 40 31 22 1 ATGGTATATTTGGATATATATTCAAAT 1 0 130174 CASAVA_Build 10 24348332 1I TAAGGAATGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 8 9 130175 CASAVA_Build 10 24350822 1D ATCAATATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 10 9 130176 CASAVA_Build 10 24361015 1I TAACCTCTTC -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 6 7 130177 CASAVA_Build 10 24387906 2D ATCTTAGAAG AA/-- AAGTTTTCAA 3070 het 3070 ref 49 27 19 4 A 4 2 130178 CASAVA_Build 10 24403639 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2396 het 1135 hom 28 6 8 14 T 18 17 130179 CASAVA_Build 10 24414240 1I ATTTGAGGGG -/A TTTAAGGGAG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 0 1 130180 CASAVA_Build 10 24414606 1D AATTTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 11 6 A 12 11 130181 CASAVA_Build 10 24414908 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 11 12 130182 CASAVA_Build 10 24421351 1D CCACTCCCAA C/- AAAAATAACC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 C 1 0 130183 CASAVA_Build 10 24447642 1I CTGGATTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1336 hom 30 4 16 10 T 12 13 130184 CASAVA_Build 10 24458208 1I AAAAACTTAT -/A AGTCATTACC 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 1 2 130185 CASAVA_Build 10 24461546 2D TCTACTGAGG CT/-- CCCAGTTCTA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 CT 1 0 130186 CASAVA_Build 10 24467582 1D TTCATTAACC A/- AAAAAAAAAA 1183 het 1183 ref 28 17 4 7 A 13 12 130187 CASAVA_Build 10 24516076 1D GTTCATTAAC T/- AATTGCAGAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 1 0 130188 CASAVA_Build 10 24519830 1D TGTCATGCTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 1732 hom 22 7 11 4 A 9 8 130189 CASAVA_Build 10 24522885 1I CACTTTGGAA -/G GTCTAGGTGG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 1 2 130190 CASAVA_Build 10 24528803 1D TTATATTTGG A/- AGTAAGGAAA 3070 het 2219 hom 14 6 8 0 A 2 1 130191 CASAVA_Build 10 24530864 1D TGATCACCCC T/- GATCCTCCTA 2259 het 2259 ref 26 10 7 9 T 1 0 130192 CASAVA_Build 10 24537546 1I TTGTTTGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 9 10 130193 CASAVA_Build 10 24542510 4I TGTGGTTGGC ----/CTCT CTATTTCAAA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 CT 1 3 130194 CASAVA_Build 10 24542923 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2756 hom 28 8 12 8 A 9 10 130195 CASAVA_Build 10 24572595 2I ATATATATAT --/AC ACACATCTAT 2835 het 2835 ref 28 12 10 6 AC 2 3 130196 CASAVA_Build 10 24576060 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2557 het 2557 ref 32 15 9 8 T 14 15 130197 CASAVA_Build 10 24579375 1I CATTTGGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 38 2 25 11 T 11 12 130198 CASAVA_Build 10 24584283 4D TCCTGAGCGG CTGA/---- CTGTCAGGGG 3070 het 3070 hom 30 9 15 9 CTGA 1 0 130199 CASAVA_Build 10 24587119 4I CTGTCCCCTC ----/AAAA AACCTAACTC 3070 hom 141 het 50 0 46 4 A 2 6 130200 CASAVA_Build 10 24608173 1D CTAGTGTCTG T/- TTTTTTTTTT 799 het 321 hom 23 4 8 11 T 11 10 130201 CASAVA_Build 10 24611142 1I CTCTACAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 61 het 25 0 20 5 T 9 10 130202 CASAVA_Build 10 24612845 1D TTTTCCTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1294 hom 22 6 13 3 T 10 9 130203 CASAVA_Build 10 24622498 1D TTGGGCTTGG C/- AGCCGTCAGG 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 C 1 0 130204 CASAVA_Build 10 24644700 1I ACAAAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 10 11 130205 CASAVA_Build 10 24644865 1I TTTATCTAAT -/G GGGGGGGGGG 894 het 894 ref 24 9 5 10 G 10 11 130206 CASAVA_Build 10 24652054 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 29 1 20 9 A 12 11 130207 CASAVA_Build 10 24657436 1D AGTTTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 11 10 130208 CASAVA_Build 10 24689834 1D TGCTAAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 T 12 11 130209 CASAVA_Build 10 24694336 1D CTTTTTTTTT G/- TCCCCCTTTT 3070 het 3070 hom 24 12 10 2 G 1 0 130210 CASAVA_Build 10 24707571 1I CTATTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 11 12 130211 CASAVA_Build 10 24708063 1I TACCTTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 A 9 10 130212 CASAVA_Build 10 24713219 1D TTATCATGAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 8 7 130213 CASAVA_Build 10 24713610 1I TAGCTGGGAC -/T GCAGGTGCCT 2037 het 2037 ref 19 9 7 3 T 0 1 130214 CASAVA_Build 10 24718848 2I CAGGCATCCA --/TC TCTCTAGTAC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 TC 2 3 130215 CASAVA_Build 10 24719491 4I TTCAAAAGAA ----/AGAG AGGGAGAAAG 2233 het 2233 ref 25 13 7 5 AG 1 3 130216 CASAVA_Build 10 24721179 1D AGCTCATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 A 11 10 130217 CASAVA_Build 10 24730772 2I GCACCAAAAC --/AA AACTCTCCTA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 2 4 130218 CASAVA_Build 10 24746795 1I AATAGCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 13 14 130219 CASAVA_Build 10 24751794 1I AGGTGGTTAT -/G GGGGGGCAAG 2388 het 2388 ref 20 11 7 2 G 6 7 130220 CASAVA_Build 10 24761558 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2964 het 2964 ref 30 14 10 6 T 11 10 130221 CASAVA_Build 10 24762479 1I ATTTTTGAAT -/G GCTACATCTG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 G 1 2 130222 CASAVA_Build 10 24762714 9I ACACATAACA ---------/AGTTAGAAT AGTTAGAATA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AGTTAGAAT 1 2 130223 CASAVA_Build 10 24794113 3D GGTGAGAAAT AAC/--- AAACCCTTGC 3070 het 3070 ref 47 22 17 10 AAC 1 0 130224 CASAVA_Build 10 24800407 1D TCCTGAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 11 10 130225 CASAVA_Build 10 24811330 3I CCAACTAGAA ---/CTT CTTCAAAGAG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 CTT 1 2 130226 CASAVA_Build 10 24816582 1D TTTTTGCCTG T/- TTTTTTTACA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 8 7 130227 CASAVA_Build 10 24821739 18I TGCAGATGCA ------------------/CCATCTCTCAAAAAGAGC CCAGCTTAAT 3070 het 3070 ref 40 18 14 11 CCATCTCTCAAAAAGAGC 0 1 130228 CASAVA_Build 10 24830032 2I TAAAAAAAAA --/AC ATAAACAAAA 2836 het 2836 ref 23 12 8 3 AC 0 1 130229 CASAVA_Build 10 24852607 1D CATTTTATGC A/- AAAGCACCTG 3070 het 3070 hom 55 25 26 5 A 4 3 130230 CASAVA_Build 10 24858922 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 het 1177 hom 15 4 10 1 G 3 4 130231 CASAVA_Build 10 24859268 2D TAAAATGCTC TT/-- GTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 23 11 3 T 2 0 130232 CASAVA_Build 10 24859966 1D CCCCGCCTGT A/- AAAAAAAAAA 2425 het 1824 hom 21 9 9 5 A 11 10 130233 CASAVA_Build 10 24864788 1I TTTGGGAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 9 10 130234 CASAVA_Build 10 24877828 2D TGGAGAAACC AG/-- AGTCAGGTGT 3070 het 3070 ref 38 19 15 6 AG 2 1 130235 CASAVA_Build 10 24878670 1D GCCTCCTCAC T/- TGTGCCTTAG 3070 het 3070 ref 41 22 13 7 T 2 1 130236 CASAVA_Build 10 24892025 2D TCTCCATCCC CT/-- CTTTCCCAAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 CT 2 1 130237 CASAVA_Build 10 24899826 1I TAGAGAAGAG -/A AGGGCCCACT 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 A 1 2 130238 CASAVA_Build 10 24908505 2D TCAAAAAAAC AA/-- AAAAGTAACA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 6 4 130239 CASAVA_Build 10 24911295 1D GGCGGATCGC T/- TTGAGCCTCG 3070 het 2210 hom 23 7 9 7 T 3 2 130240 CASAVA_Build 10 24916402 13D TTAAAGTAAA AATTTAGGCTGTT/------------- CTATCAAAGA 3070 het 3070 hom 38 15 21 5 AATTTAGGCTGTT 1 0 130241 CASAVA_Build 10 24923553 6I GTTTTCCCTG ------/TATTCT TATTCTATTT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 TATTCT 1 2 130242 CASAVA_Build 10 24924786 1D CCAAAGGGGG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 47 22 20 6 A 8 7 130243 CASAVA_Build 10 24925178 4D CAAAGAGACT GAAA/---- GAAAGAGAGG 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 GAAA 2 1 130244 CASAVA_Build 10 24926011 4D11M1I GTGCTATAAT TTTCTTTAAAACAGC-/----TTTAAAACAGCA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 15 5 N/A 0 0 130245 CASAVA_Build 10 24934747 3D AAAAATAGCC AGG/--- AGAATTCTGA 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 AGG 1 0 130246 CASAVA_Build 10 24937714 1D AACTTTCTTT A/- AAAGCAGCTC 3070 het 3070 ref 48 23 23 2 A 4 3 130247 CASAVA_Build 10 24944707 5D TGTTATTTTA TTATT/----- TTATTTTATT 3070 het 3070 ref 28 13 12 6 TTATT 3 2 130248 CASAVA_Build 10 24946982 1D ACCCTGTCTC T/- TATCACTTAC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 2 1 130249 CASAVA_Build 10 24948197 1I GAAGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 10 11 130250 CASAVA_Build 10 24954466 1D TTCTGCATTA T/- TTCAAATATT 3070 het 2819 hom 24 7 11 6 T 3 2 130251 CASAVA_Build 10 24956400 5I ATGTGAATTA -----/AGGAT AGGTTAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 34 4 AGGAT 0 1 130252 CASAVA_Build 10 24957358 1D GCTTTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 T 11 10 130253 CASAVA_Build 10 24960354 5I GGCAGTGCTA -----/CTATT CTATCTCCAC 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 CTATT 0 1 130254 CASAVA_Build 10 24968855 1I TTAAGTATAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 21 10 10 A 9 10 130255 CASAVA_Build 10 24987492 1I GAAACCATCA -/T TCTGAGCAAA 1101 het 1101 ref 32 27 3 2 T 1 2 130256 CASAVA_Build 10 24987745 7I ACATGTACCC -------/TAGAACT TAAAGTATTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TAGAACT 0 1 130257 CASAVA_Build 10 24989245 1D CTTGAGCTCA T/- GAATTTGAGG 3070 het 3070 ref 46 24 21 1 T 1 0 130258 CASAVA_Build 10 24993659 4I CCATAAACCC ----/TTTT TTGAGTGAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 6 130259 CASAVA_Build 10 24994243 1D TTGATAGTGC A/- AAAAAAAAAA 1675 het 1675 ref 49 33 4 12 A 12 11 130260 CASAVA_Build 10 25000659 1D CTTAACAAAA T/- TTTTTTTTTT 1753 het 1753 ref 35 22 6 7 T 17 16 130261 CASAVA_Build 10 25016063 5I AGGTGGGAGG -----/ATCGC GTGAGCCCAT 3070 hom 96 het 33 0 32 1 ATCGC 0 1 130262 CASAVA_Build 10 25033401 1I TATTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 14 7 T 11 12 130263 CASAVA_Build 10 25039533 1I TTTATGCTGC -/T GCACCCTCAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 0 1 130264 CASAVA_Build 10 25046794 1D CTCCAAACAG T/- TGGGACTACA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 T 2 1 130265 CASAVA_Build 10 25049930 1I AAACACGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 12 13 130266 CASAVA_Build 10 25066687 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2414 hom 4 het 8 0 7 2 A 11 10 130267 CASAVA_Build 10 25067627 1I GCCTGGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 990 hom 19 4 11 4 T 17 18 130268 CASAVA_Build 10 25070790 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 33 0 24 10 T 10 9 130269 CASAVA_Build 10 25071006 3I TGGTCTCGAA ---/CTC CTGAGCTCAA 3070 hom 60 het 24 0 18 6 CTC 0 1 130270 CASAVA_Build 10 25071124 1I TGCTGTGTTG -/C CCAGGCTGGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 2 3 130271 CASAVA_Build 10 25072482 2I ACAAGGTAAC --/TG TTATTTTTAT 3070 hom 62 het 24 0 21 3 TG 0 1 130272 CASAVA_Build 10 25073625 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACTATA 1573 het 568 hom 17 4 9 4 AC 5 3 130273 CASAVA_Build 10 25081550 13D GGCAAGGAAG AGACAGTCAAGTC/------------- AGTGGTAACA 3070 hom 69 het 22 0 24 1 AGACAGTCAAGTC 1 0 130274 CASAVA_Build 10 25082382 1I TAGTCCTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 477 hom 21 1 12 8 A 9 10 130275 CASAVA_Build 10 25087440 10D TCCTTTCTTT CTTTCCCTTC/---------- CTTTCCCTTC 3070 hom 24 het 19 0 8 19 CTTTCCCTTC 3 2 130276 CASAVA_Build 10 25087880 1D CTAGCCATGC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 38 0 29 9 T 9 8 130277 CASAVA_Build 10 25096558 9D TTCCTTCCTT CCCTCCCTC/--------- CCTTCCCTCC 94 het 94 ref 32 18 3 19 CCCTCCCTC 1 0 130278 CASAVA_Build 10 25096718 5I TTTCTCTTCG -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 TTTCT 3 4 130279 CASAVA_Build 10 25109584 1D AATTAATTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 9 8 130280 CASAVA_Build 10 25124997 1D TCTACAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 31 1 21 9 A 13 12 130281 CASAVA_Build 10 25130192 1D AAAATTTAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 T 10 9 130282 CASAVA_Build 10 25130915 1D CAAAAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 11 10 130283 CASAVA_Build 10 25134643 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAATAGA 3070 het 2956 hom 17 7 8 5 A 7 6 130284 CASAVA_Build 10 25136938 1I AGACTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 A 13 14 130285 CASAVA_Build 10 25141283 1D GTTTTCTTTT C/- CCCTCCTGCA 3070 het 3070 hom 31 13 18 1 C 4 3 130286 CASAVA_Build 10 25161174 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 A 8 9 130287 CASAVA_Build 10 25168723 1I TCAAACACTG -/T TTTTACTCTG 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 T 4 5 130288 CASAVA_Build 10 25195728 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 AG 9 8 130289 CASAVA_Build 10 25197731 1D TCCTTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 812 hom 28 2 22 4 T 13 12 130290 CASAVA_Build 10 25210171 6D CCAGCTGATT TTTTTA/------ TTTTTATTTT 3070 hom 39 het 21 0 15 8 TTTTTA 3 2 130291 CASAVA_Build 10 25212408 1D AAGGCCACCA C/- GAAAAAGGAA 3070 het 2065 hom 27 10 12 5 C 1 0 130292 CASAVA_Build 10 25216400 1D ATAAGGGCTT C/- CCCCCTCTCC 3070 het 3070 ref 40 22 8 10 C 6 5 130293 CASAVA_Build 10 25220561 1I CCAGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 12 14 10 A 12 13 130294 CASAVA_Build 10 25222393 1I CCAGTTAGTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 1666 hom 27 7 17 3 T 7 8 130295 CASAVA_Build 10 25236148 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 10 11 130296 CASAVA_Build 10 25240812 4D AAAAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 22 15 7 1 AAAC 4 3 130297 CASAVA_Build 10 25249511 2D TAGCTAACAC AT/-- GTGGGGCTTA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 AT 1 0 130298 CASAVA_Build 10 25250029 1D ACAAGTGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 10 9 130299 CASAVA_Build 10 25250650 1D GTTCTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 29 1 17 12 A 17 16 130300 CASAVA_Build 10 25254620 2I GTTGTGATTA --/GT ATACTAATAA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 GT 0 1 130301 CASAVA_Build 10 25259012 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 1887 het 1887 ref 64 42 5 18 AC 9 8 130302 CASAVA_Build 10 25265225 1I AAACAACAGC -/T TTTTTTTTTT 852 het 852 ref 52 33 3 16 T 11 12 130303 CASAVA_Build 10 25270201 1D ACATTGCCCA G/- GCTGGTCTCA 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 G 2 1 130304 CASAVA_Build 10 25272129 3D TGGAAAAGAT TTC/--- TTATTAAAAG 3070 het 3070 hom 22 11 10 3 TTC 1 0 130305 CASAVA_Build 10 25277081 1D GTATTTTCAT G/- GGGGGTGACA 3070 het 3070 ref 55 30 14 11 G 6 5 130306 CASAVA_Build 10 25368962 4D CTTCTCTGTG TGTC/---- TGTCCTCTCT 3070 het 3070 ref 40 23 13 6 TGTC 2 1 130307 CASAVA_Build 10 25457514 3D CTTCCCCGAG TCC/--- TCCTTCTTCG 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 TCC 2 1 130308 CASAVA_Build 10 25464118 1D ATAAGTAGAT A/- TATACTGTTG 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 A 1 0 130309 CASAVA_Build 10 25470479 1D TGCATATTTA T/- TTTTTTTCTA 2032 het 2032 ref 24 16 5 4 T 8 7 130310 CASAVA_Build 10 25478442 1I CATTTCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 11 12 130311 CASAVA_Build 10 25481912 1D GTTGTCTACC T/- TTTTTTTTTT 2458 het 2458 ref 33 18 6 9 T 14 13 130312 CASAVA_Build 10 25482922 1D TTTAAGGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 T 11 10 130313 CASAVA_Build 10 25490456 1I AGTATTTATC -/A TTTTTTTTGT 3070 het 2423 hom 22 7 13 2 A 0 1 130314 CASAVA_Build 10 25499173 1I TTAATAATAC -/T TTTTTACTGG 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 5 6 130315 CASAVA_Build 10 25504316 1D AAAAGTGATT C/- CCCCCCCTCC 3070 het 1182 hom 28 9 11 8 C 8 7 130316 CASAVA_Build 10 25528616 2D AGTTTCTCCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 CT 6 5 130317 CASAVA_Build 10 25538381 5D TAAATTGTAT CTTTA/----- CTTCTGTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 20 9 CTTTA 1 0 130318 CASAVA_Build 10 25538571 1I TAGTTAACTG -/T TTGATATTAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 2 3 130319 CASAVA_Build 10 25540076 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2453 het 1564 hom 17 6 7 4 A 13 12 130320 CASAVA_Build 10 25540634 2I ACCCTGTCAC --/AA AAATATTCTC 3070 het 3070 ref 57 32 19 6 A 3 5 130321 CASAVA_Build 10 25547794 1D ATGGAACTTA T/- TTTTTTTTTT 2809 het 2007 hom 18 6 7 5 T 11 10 130322 CASAVA_Build 10 25555043 2D TTTTCTCCAG AA/-- AGTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 47 15 20 13 A 3 1 130323 CASAVA_Build 10 25572243 1D GTCATCAATA G/- AAGCAAGCTG 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 G 1 0 130324 CASAVA_Build 10 25573779 1I TATCCTAGAC -/T TTTTTTTTTT 1693 het 1693 ref 36 21 5 10 T 13 14 130325 CASAVA_Build 10 25623560 1I AGGAATGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 A 10 11 130326 CASAVA_Build 10 25623709 5I3M3I GCATGGAAGC -----TCT---/AAAATTCTCCA TAGGCATTGA 3070 het 3070 ref 49 24 22 7 N/A 0 0 130327 CASAVA_Build 10 25625401 4D TGGTCTATCA TCTG/---- TCTGTCTTTC 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 TCTG 2 1 130328 CASAVA_Build 10 25629520 1I ATTCTTAAGT -/A ACTCTTTTTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 1 2 130329 CASAVA_Build 10 25630637 1D TTGACACAGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 T 9 8 130330 CASAVA_Build 10 25648758 1I GAACACCCCA -/C CCCCCCCCAA 2165 het 1080 hom 15 5 9 1 C 8 9 130331 CASAVA_Build 10 25655305 1I GCTTTACCCA -/T TTTTTAATTG 3070 het 3070 ref 41 25 10 6 T 5 6 130332 CASAVA_Build 10 25656498 2I GAGATAAAGA --/CT CTCTTCATCT 3070 het 3070 hom 49 19 28 2 CT 2 3 130333 CASAVA_Build 10 25656778 1D TATCAAACTT G/- TTTGGTAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 G 1 0 130334 CASAVA_Build 10 25658950 1I GAGATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 20 0 12 8 T 12 13 130335 CASAVA_Build 10 25680967 3I CCCAGAACCA ---/CTC CTCAAATACA 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 CTC 1 2 130336 CASAVA_Build 10 25694008 1I TTATTTAAAA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 6 7 130337 CASAVA_Build 10 25694178 27D TTGTGAGTGA TAAACAATATTTAATTTTCTCCCCATT/--------------------------- TAAACAATAT 3070 hom 54 het 30 0 19 12 TAAACAATATTTAATTTTCTCCCCATT 1 0 130338 CASAVA_Build 10 25695068 5D GTAGACAAAC TTTTG/----- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 TTTTG 1 0 130339 CASAVA_Build 10 25695314 4I CACTAAAACT ----/TTGA TTGTCAGTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 TTGA 0 1 130340 CASAVA_Build 10 25695780 2D GAAACCTTTC TA/-- TATGTTTATT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 TA 2 1 130341 CASAVA_Build 10 25696603 2I TGTTTGTCTC --/TT TGACCTCTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 3 130342 CASAVA_Build 10 25696783 2D GTTGCACAAA CT/-- CTCTTCTGTA 3070 het 3070 hom 43 17 18 10 CT 3 2 130343 CASAVA_Build 10 25697220 3I TAAGACAGTA ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 9 12 130344 CASAVA_Build 10 25697714 3I GGCCATTTTC ---/ATG ATATTGATTC 1250 hom 9 het 5 0 3 2 ATG 0 1 130345 CASAVA_Build 10 25704403 2I GTTTTTCTCT --/TA TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TA 0 1 130346 CASAVA_Build 10 25707341 1D GATAGGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 11 10 130347 CASAVA_Build 10 25707550 2D CCAGTTAGGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 AT 6 5 130348 CASAVA_Build 10 25708828 1D76M1I ATTTACCTCC TTTTTTTTTTTACCTTGGATCTTGGTCCCTCCATTTTGGCTTCACATAAGCTTTCTTATGCCTCTCCATAGGGTTTT-/-TTTTTTTTTTACCTTGGATCTTGGACCCTCCATTTTGGCTTCACATAAGCTTTCTTATGCCTCTCCATAGGGTTTTA TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 29 14 27 14 N/A 0 0 130349 CASAVA_Build 10 25710273 4D GATGAGGGAG GTAA/---- GTAAATGGAG 3070 het 3070 ref 48 28 17 4 GTAA 2 1 130350 CASAVA_Build 10 25711360 1D AATAGAAAAG T/- TTCTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 3 2 130351 CASAVA_Build 10 25713640 6I ATTTCTGTTA ------/AATGCC AAACAAGTCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AATGCC 0 1 130352 CASAVA_Build 10 25714308 1D ATTTGTTGAT G/- GGTATTTGGG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 G 3 2 130353 CASAVA_Build 10 25715532 4D TGTCACTGTC ACTT/---- ATTTATGTCT 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 ACTT 1 0 130354 CASAVA_Build 10 25720157 1I GGAAAATGTG -/T GGTGGGAACC 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 T 0 1 130355 CASAVA_Build 10 25720434 1I AGATCATTTT -/G GAGCTTTAAG 3070 het 3070 ref 56 39 12 5 G 1 2 130356 CASAVA_Build 10 25736902 1D AATATATGAG C/- AGTTAACATA 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 C 1 0 130357 CASAVA_Build 10 25742093 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 A 9 10 130358 CASAVA_Build 10 25745555 5D AAAAAGTAAC AAAAT/----- AAAAAGTTGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AAAAT 1 0 130359 CASAVA_Build 10 25745775 3I TGAAATAAAA ---/AAG ACACTTCTAG 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 AAG 0 1 130360 CASAVA_Build 10 25749262 1D TTTTGAAACA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 74 het 31 0 24 7 T 7 6 130361 CASAVA_Build 10 25751564 1I TTGTATTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 509 hom 45 3 26 16 A 13 14 130362 CASAVA_Build 10 25751786 1I TATTCCCTTA -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 48 het 18 0 14 4 C 8 9 130363 CASAVA_Build 10 25752327 1D CTTTTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 34 0 23 11 T 12 11 130364 CASAVA_Build 10 25755741 2D GAAGAACGTC AG/-- TGAGAGATTT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 AG 1 0 130365 CASAVA_Build 10 25755914 4D11M1D TAATTCAAAT TAGATAGTTTTAATAT/----TATTTTTGATA- TTTTTTGCTA 3070 hom 105 het 35 0 36 6 N/A 0 0 130366 CASAVA_Build 10 25760949 6D ATAATAAAAT AAAAAA/------ AAATGCAAAG 3070 hom 57 het 20 0 20 4 A 9 3 130367 CASAVA_Build 10 25761222 3D CGTCCATAAA AAT/--- AATAATTCTC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 AAT 3 2 130368 CASAVA_Build 10 25762276 1D ATTGAAACTT A/- ACGTGCCAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 1 130369 CASAVA_Build 10 25763879 1D TATATATGCA T/- TAGATGTTAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 1 130370 CASAVA_Build 10 25766336 1I CATTTTTGTA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 110 het 39 0 38 1 T 6 7 130371 CASAVA_Build 10 25768569 1I ATTCCTATAA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 T 6 7 130372 CASAVA_Build 10 25771144 1D AGTTTTAAGG T/- TTTTTTATTT 3070 het 2909 hom 30 11 15 5 T 7 6 130373 CASAVA_Build 10 25772026 1I CACCCCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 29 0 21 8 T 10 11 130374 CASAVA_Build 10 25772678 1I AATGCCCTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 8 9 130375 CASAVA_Build 10 25776794 4I TCAGTTTAAT ----/AAAA AAATGCACAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 7 130376 CASAVA_Build 10 25779913 1D TATATATGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 194 hom 24 1 20 4 T 10 9 130377 CASAVA_Build 10 25786378 1I TTCTGTATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 9 10 130378 CASAVA_Build 10 25799892 1I TGATGTCTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 8 9 130379 CASAVA_Build 10 25805465 1D GAAGAATTGC A/- AAAGTATTAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 3 130380 CASAVA_Build 10 25807959 1I TATGTGCCAC -/A TTTTCTTAAT 1219 hom 7 het 3 0 3 0 A 0 1 130381 CASAVA_Build 10 25809484 1D TATGATATTG C/- CTTTTCCAGG 3070 het 3070 hom 45 20 21 5 C 2 1 130382 CASAVA_Build 10 25810149 1I GGGCACAGAG -/T TGTCACCCAA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 T 1 2 130383 CASAVA_Build 10 25815317 2I CTAGCTGTGT --/GA CGTTGGGTTA 3070 hom 183 het 67 0 60 7 GA 0 1 130384 CASAVA_Build 10 25815748 2I ATGATAGACC --/TT ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 21 7 T 0 2 130385 CASAVA_Build 10 25819626 3D CCAGTCTATC ATT/--- GTTGGACATT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 ATT 1 0 130386 CASAVA_Build 10 25828145 1I TATAATTCAC -/A AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 6 7 130387 CASAVA_Build 10 25831548 1D ACTAACTTGC A/- AAAAGTACAA 3070 het 3070 hom 49 22 23 5 A 5 4 130388 CASAVA_Build 10 25832292 1I TATCTGGGAC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 7 8 130389 CASAVA_Build 10 25890960 1D TGCAGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 1945 het 1945 ref 23 9 5 10 T 18 17 130390 CASAVA_Build 10 26009798 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 13 12 130391 CASAVA_Build 10 26031646 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 8 7 130392 CASAVA_Build 10 26033167 6D GATTTCTCCC TCCAGA/------ TCAACAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 7 TCCAGA 1 0 130393 CASAVA_Build 10 26043318 1I ATCTTCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 168 hom 29 1 23 5 A 10 11 130394 CASAVA_Build 10 26046624 1D TCCATTCCTC T/- GTCTCCCTTA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 0 130395 CASAVA_Build 10 26053031 15D CCCTGGGGCT ACTAATAGGACCCAG/--------------- ACTATCTCTG 2407 het 2407 ref 25 17 6 5 ACTAATAGGACCCAG 1 0 130396 CASAVA_Build 10 26053167 1D CGAAACCCCC T/- ATCTACTAAG 3070 hom 66 het 25 0 20 5 T 1 0 130397 CASAVA_Build 10 26055348 4D CTTCTTTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 TCTT 4 3 130398 CASAVA_Build 10 26061726 2D GTTGTTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 42 0 30 13 T 16 14 130399 CASAVA_Build 10 26066448 17I AGCCTGGATG -----------------/ACAGCACATCTCTTTAT GGCATGGTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 ACAGCACATCTCTTTAT 0 1 130400 CASAVA_Build 10 26068206 1I TGGGCTTGGT -/G GCACACACCT 3070 hom 39 het 14 0 13 1 G 1 2 130401 CASAVA_Build 10 26068659 4D ATACAGAATA TTGT/---- CCCTGGCAAA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 TTGT 1 0 130402 CASAVA_Build 10 26069862 1D CTACAAAATA T/- GTATTTAACA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 1 0 130403 CASAVA_Build 10 26070706 1D TTCTCTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 321 hom 41 2 29 10 A 15 14 130404 CASAVA_Build 10 26071230 4D CATTTAAATG AAAT/---- AAAATTATAC 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 AAAT 1 0 130405 CASAVA_Build 10 26075572 3D GACTCTGATA TTC/--- TTCTACTACT 3070 het 3070 hom 46 17 28 2 TTC 2 1 130406 CASAVA_Build 10 26084030 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2258 het 1140 hom 16 3 9 4 A 17 18 130407 CASAVA_Build 10 26084559 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2603 het 2603 ref 27 13 8 6 A 11 12 130408 CASAVA_Build 10 26090378 6D GAACAGCAAA AGGGAT/------ AGTGAGAAAG 3070 het 3070 hom 49 24 22 4 AGGGAT 1 0 130409 CASAVA_Build 10 26096829 1I TTAAATACAA -/T TTTTTGTTAA 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 T 5 6 130410 CASAVA_Build 10 26120364 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 6 7 130411 CASAVA_Build 10 26124780 1I ACGCAGACAT -/A AAAAAGAATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 5 6 130412 CASAVA_Build 10 26127073 1D TTTTTTTTTT C/- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 C 1 0 130413 CASAVA_Build 10 26141034 1I CCTATTAAAT -/G CAAACTGAGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 0 1 130414 CASAVA_Build 10 26143113 2D GAGACCAAAC AT/-- ATAAAGCAGC 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 AT 2 1 130415 CASAVA_Build 10 26147577 1I TATCACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 A 10 11 130416 CASAVA_Build 10 26155269 1D AATGAAAATT C/- CACTGTCTGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 2 1 130417 CASAVA_Build 10 26155907 1D TTTTACCCTG T/- TGGCCAGGCT 2444 het 2444 ref 26 16 8 2 T 2 1 130418 CASAVA_Build 10 26161968 1I ATTTTATTAC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 55 18 26 11 A 7 8 130419 CASAVA_Build 10 26168604 1D ACAATTTTTG T/- TAACAGTATG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 2 1 130420 CASAVA_Build 10 26176187 1D AATGCCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2311 hom 35 9 18 8 A 12 11 130421 CASAVA_Build 10 26178601 2D AACCTCACCA TC/-- TCTCTCTCAG 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 TC 5 4 130422 CASAVA_Build 10 26183509 1I TTTCTAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 11 12 130423 CASAVA_Build 10 26184573 1D GTATTGAAGG A/- ATGTTTGCTA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 2 1 130424 CASAVA_Build 10 26189813 29D TTGCAATGAC TTTTTTTTAAAGTTGGGTTTGCAATGACT/----------------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 19 12 1 TTTTTTTTAAAGTTGGGTTTGCAATGACT 1 0 130425 CASAVA_Build 10 26190426 1D ATTTTTAAAA T/- TTTTTTACTT 2675 het 2675 ref 17 9 8 0 T 7 6 130426 CASAVA_Build 10 26191495 1I AACATAAAGG -/A AAAAGACCAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 4 5 130427 CASAVA_Build 10 26194734 2D CAAAGCAAAA CT/-- CTGATTGGTC 3070 het 3070 hom 41 15 21 7 CT 2 1 130428 CASAVA_Build 10 26206764 1I AAGTGCAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 9 10 130429 CASAVA_Build 10 26212855 4I TCACAGAATG ----/TCTA TCTACCATCG 3070 het 3070 ref 49 20 21 8 TCTA 1 2 130430 CASAVA_Build 10 26219220 1I AAGAAGAAGA -/G CAAATGAGAA 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 G 0 1 130431 CASAVA_Build 10 26223508 1I AAAGGTTAGA -/G AGAATGAGGA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 G 0 1 130432 CASAVA_Build 10 26237168 1D AAAAAAAAAA G/- GCTTGAGTAA 3070 het 659 hom 32 5 21 6 G 2 1 130433 CASAVA_Build 10 26244160 14D ACCCATGATC AACAATAAGTGCTA/-------------- AACCCAGAGT 3070 hom 75 het 29 0 25 5 AACAATAAGTGCTA 1 0 130434 CASAVA_Build 10 26250583 2D TGCAAAAATG AA/-- AAGAGTTCTG 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 4 2 130435 CASAVA_Build 10 26268814 1D TCTTTCAGCC T/- TTATTTGACA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 2 130436 CASAVA_Build 10 26271726 2D TTTAATTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 29 0 23 7 T 13 11 130437 CASAVA_Build 10 26281773 2D GCTCTGCTAG TC/-- TCTGCTTACA 3070 hom 56 het 22 0 19 3 TC 2 1 130438 CASAVA_Build 10 26329613 1D TGAGATGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 31 0 23 8 T 12 11 130439 CASAVA_Build 10 26346738 5D AGTAAAAATA TAAAG/----- TATAGTCATA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 TAAAG 1 0 130440 CASAVA_Build 10 26356290 1D TACTTTTTTG T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 8 7 130441 CASAVA_Build 10 26358226 1I AGTATGAGAA -/T TTCATGATGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 3 130442 CASAVA_Build 10 26365185 1D35M1I CCTAAGACTA TTTTTTTAATTAAATTAAGGATACAGAGTGTGGAAA-/-TTTTTTAATTAAATTAAGGATACAGAGTGTGGAAAC AACTAAGTTT 3070 hom 66 het 23 0 20 10 N/A 0 0 130443 CASAVA_Build 10 26385618 1D ATGTGTTCAA G/- TTCCAAATGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 1 0 130444 CASAVA_Build 10 26385896 1D GGACAGGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 10 9 130445 CASAVA_Build 10 26386892 1I TGGTACTTTT -/G TTACAATTAG 3070 hom 141 het 58 0 44 14 G 0 1 130446 CASAVA_Build 10 26387876 1I77M1D TTTCATTGGG -GGGTGCAAATGTAAGTGGTATTGTGTTTTTAATTTCCATTTTCACTTATTCATTTCTGGTATATAGGAAAGCAGTGAC/AGGGTGCTAATGTAAGTGGTATTGTGTTTTTAATTTCCATTTTCACTTATTCATTTCTGGTATATAGGAAAGCAGTGA- TTTTTTATAT 3070 hom 81 het 28 0 28 27 N/A 0 0 130447 CASAVA_Build 10 26388142 1I GCATTAGCTA -/T TGACTTCCAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 1 2 130448 CASAVA_Build 10 26389497 10I1M2D CCATAAATTT ----------CCA/GTTATTTTAAC-- TATCAAAATA 3070 hom 69 het 25 0 22 4 N/A 0 0 130449 CASAVA_Build 10 26389873 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTGA 2057 hom 12 het 8 0 5 4 T 9 8 130450 CASAVA_Build 10 26390407 1D AGGAAAATAA T/- TCCAGGTAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 T 2 1 130451 CASAVA_Build 10 26390792 4I GTCCATAAAA ----/ACAG ACAGAAAATT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ACAG 1 2 130452 CASAVA_Build 10 26390980 1D CCAGACGTTG T/- GGGGGGATAT 3070 hom 111 het 41 0 38 5 T 1 0 130453 CASAVA_Build 10 26391161 1D15M1D AAGTGTATAA TTTTTTTAAGTGGCATA/-TTTTTTAAGTGGTAT- AAAAATTATG 3070 hom 111 het 35 0 38 4 N/A 0 0 130454 CASAVA_Build 10 26391532 1I CATTAGATAC -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 130455 CASAVA_Build 10 26393489 1I GATCTGACAT -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 153 het 57 0 51 6 A 0 1 130456 CASAVA_Build 10 26396618 1I ATTTCAAACA -/T TTTTTGTGAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 5 6 130457 CASAVA_Build 10 26396790 1I TTTACACTGC -/T TGATACATGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 130458 CASAVA_Build 10 26398165 1D CTGAACTGAG T/- ATGGGAGCGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 1 0 130459 CASAVA_Build 10 26399207 1I AATGTCACTT -/A AATTTTGAGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 3 130460 CASAVA_Build 10 26399784 5I ATCTAAATAT -----/TATAA TATATGTGCA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TATAA 0 1 130461 CASAVA_Build 10 26399959 1I CCAAACAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 10 11 130462 CASAVA_Build 10 26400975 9D GCAAGCAAGG ACCCTCTTC/--------- ACATGGCAGC 3070 hom 72 het 24 0 24 2 ACCCTCTTC 1 0 130463 CASAVA_Build 10 26402582 10D10M1D TAATAATAAT AATGATAATAAATAAATAAAT/----------AATAAATAAA- AAATAATTAT 3070 hom 33 het 11 0 12 0 N/A 0 0 130464 CASAVA_Build 10 26403500 1D ATATACTTCA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 T 7 6 130465 CASAVA_Build 10 26410841 2D TTGGGACACT CA/-- CAGTATTTGG 3070 hom 75 het 28 0 24 4 CA 2 1 130466 CASAVA_Build 10 26414122 1I GTCAATCTTA -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 59 het 25 0 23 2 T 6 7 130467 CASAVA_Build 10 26415920 2I TGGGGATAGG --/TA TATATATATA 3070 hom 54 het 28 0 19 9 TA 5 6 130468 CASAVA_Build 10 26421401 3I ACTCTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 2694 hom 24 het 11 0 9 2 A 10 13 130469 CASAVA_Build 10 26433050 2D TCTGATTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 14 12 130470 CASAVA_Build 10 26435865 1I AATGTATCTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 8 130471 CASAVA_Build 10 26443522 1D TTAGATTTAT A/- AAAAAATTCT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 7 6 130472 CASAVA_Build 10 26452860 7D GACTCCATCT AAAACAA/------- AAAACAAAAA 2714 hom 21 het 9 0 8 2 AAAACAA 3 2 130473 CASAVA_Build 10 26456692 1D GACCAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 14 13 130474 CASAVA_Build 10 26460286 1D CAGTAAAACA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 7 6 130475 CASAVA_Build 10 26461603 2I TGAACTAAAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 11 13 130476 CASAVA_Build 10 26463410 1D GTATTATCAC T/- GTTTTTTAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 1 0 130477 CASAVA_Build 10 26465965 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 10 11 130478 CASAVA_Build 10 26468288 1I TGATTTTCTT -/G TCTCAGCCTC 3070 hom 90 het 32 0 31 3 G 0 1 130479 CASAVA_Build 10 26476167 21D AGTGAGACAC AGATGATAAGGAGCTACCTTA/--------------------- AGATGATAAG 3070 hom 66 het 39 0 22 19 AGATGATAAGGAGCTACCTTA 2 1 130480 CASAVA_Build 10 26478547 1D TAGATTACCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 40 0 34 6 T 9 8 130481 CASAVA_Build 10 26493072 7D AGTGATGGGA AGTGAAG/------- AGTGAAGAGT 3070 hom 74 het 30 0 24 11 AGTGAAG 2 1 130482 CASAVA_Build 10 26493314 3D GGATGAAAAT CTC/--- CTCTGAAGGA 3070 hom 101 het 38 0 32 8 CTC 2 1 130483 CASAVA_Build 10 26494618 1I TGTTAACACT -/A CAATGTGAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 0 1 130484 CASAVA_Build 10 26503816 1I AATTAGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 10 11 130485 CASAVA_Build 10 26511897 2D GACCAGGCAG GT/-- GTGTGTGTAA 3070 hom 141 het 52 0 48 6 GT 5 4 130486 CASAVA_Build 10 26517984 1D CTTGATGGGG A/- TGGCATTGAA 3070 het 1772 hom 14 5 9 0 A 1 0 130487 CASAVA_Build 10 26521591 1I CTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 18 0 11 7 T 12 13 130488 CASAVA_Build 10 26536687 1D GCTTTGACTA C/- CAAAGGGTCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 2 1 130489 CASAVA_Build 10 26536988 1I GTTTTCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 T 10 11 130490 CASAVA_Build 10 26574289 2I CTGCACATCC --/TG CGCATGTACC 1439 het 1439 ref 9 5 3 1 TG 0 1 130491 CASAVA_Build 10 26584582 6D GAAAAGGGGA GGGGAG/------ GGGGAAGGGG 2609 het 1655 hom 26 6 7 16 GGGGAG 1 0 130492 CASAVA_Build 10 26586570 1D TACTTTTATA C/- CTACTACTAG 3070 het 3070 ref 48 25 21 3 C 2 1 130493 CASAVA_Build 10 26601490 2I TTGGAAAATC --/AG ATAATTTTTC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 AG 0 1 130494 CASAVA_Build 10 26605393 1I CTTGCCTCAC -/T TGCAACCTCT 1389 het 1389 ref 12 5 3 4 T 1 2 130495 CASAVA_Build 10 26623977 1D CATTATCACT G/- GGCTGAGGGA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 G 3 2 130496 CASAVA_Build 10 26625856 1D CATATTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 12 11 130497 CASAVA_Build 10 26632380 4D TAAGGGAGGA AGGG/---- AGGGAGGGAG 254 het 53 hom 13 2 5 6 AGGG 6 5 130498 CASAVA_Build 10 26632916 6D CTGTTCCTGT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 TC 8 5 130499 CASAVA_Build 10 26633909 1I GGAATCTTTT -/G TTTTTGTTTT 3070 het 2685 hom 18 6 10 2 G 0 1 130500 CASAVA_Build 10 26634395 1I CTCTTAAAAA -/T AAAAAAGTCC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 0 1 130501 CASAVA_Build 10 26637689 1I CCTGACTGCA -/T TTTACCTATC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 3 4 130502 CASAVA_Build 10 26643505 4D AGAAAGAGTC GTGG/---- GTGGGTTTGA 3070 het 3070 hom 34 17 16 3 GTGG 2 1 130503 CASAVA_Build 10 26643881 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTTATCAC 1485 het 207 hom 23 2 8 13 C 1 0 130504 CASAVA_Build 10 26664939 1D TCAAAATAGA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 7 6 130505 CASAVA_Build 10 26669189 1I TTTTCGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 657 hom 31 2 21 8 T 13 14 130506 CASAVA_Build 10 26670971 5D AAGGAAGGAA GAAAG/----- GAAAGGAAAG 3070 hom 69 het 35 0 22 13 GAAAG 4 3 130507 CASAVA_Build 10 26677606 2D ATTGTAAAAC AT/-- GTGTGTTTGA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 AT 1 0 130508 CASAVA_Build 10 26680708 4D TAATTATTGT ATTG/---- ATTGTTATTC 3070 hom 42 het 17 0 15 5 ATTG 2 1 130509 CASAVA_Build 10 26680941 1I GCGCTCTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2809 hom 27 11 12 4 A 11 12 130510 CASAVA_Build 10 26687449 1I CAAGACCTTT -/A AAAATAATAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 4 5 130511 CASAVA_Build 10 26688608 2I ACATATGGAC --/AA AAAAAAAAAT 2381 het 2381 ref 33 12 8 13 A 9 11 130512 CASAVA_Build 10 26692212 1D TAAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 1567 het 1446 hom 9 4 5 0 A 13 12 130513 CASAVA_Build 10 26700470 3I TAAAATGAAA ---/AAT AATATTTTCC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 AAT 1 2 130514 CASAVA_Build 10 26702908 18D CCTTTGTATA TATTACTGATGTGATCTC/------------------ TATTACTGAT 3070 het 3070 ref 35 15 14 10 TATTACTGATGTGATCTC 2 1 130515 CASAVA_Build 10 26703817 2I ACCAGATACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 10 12 130516 CASAVA_Build 10 26707782 1I TTTGTATAGG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 T 7 8 130517 CASAVA_Build 10 26712437 1D GTTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1288 het 992 hom 27 9 5 13 T 17 16 130518 CASAVA_Build 10 26714836 6D AGGCTGGAGT GCAATG/------ GCATGATCTC 3008 het 1705 hom 19 7 7 6 GCAATG 1 0 130519 CASAVA_Build 10 26715080 3D AGGTAATTTG CAA/--- CAACAATTTT 3070 het 3070 ref 41 23 9 10 CAA 3 2 130520 CASAVA_Build 10 26716243 1I TCTCAACCAG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 7 8 130521 CASAVA_Build 10 26717276 1I CTGGTTGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 15 10 T 13 14 130522 CASAVA_Build 10 26719922 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAATAG 3070 het 2402 hom 22 6 13 3 A 8 7 130523 CASAVA_Build 10 26720086 1D CAAAAAAACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 9 8 130524 CASAVA_Build 10 26723360 1D AGCATGGGGG A/- AACTGCCCCC 3070 hom 111 het 42 0 35 8 A 3 2 130525 CASAVA_Build 10 26734908 1D TACAATTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 10 130526 CASAVA_Build 10 26761856 3I GTCAATTAAA ---/CTT CTTTTCTTTA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CTT 1 2 130527 CASAVA_Build 10 26766159 1D ACTGATAATA T/- TAAACAGTCA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 2 1 130528 CASAVA_Build 10 26768595 2I GTTTCCTAGA --/GC CACTCAGGGC 3070 hom 93 het 33 0 30 3 GC 0 1 130529 CASAVA_Build 10 26769607 4I TTAAACACAA ----/TACT TACTAGGTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TACT 1 2 130530 CASAVA_Build 10 26772639 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 22 0 18 5 A 10 9 130531 CASAVA_Build 10 26774424 1I GGGCTCAAGT -/G ATCCTCCCGC 3070 hom 27 het 12 0 8 7 G 0 1 130532 CASAVA_Build 10 26775023 1I TTAGTTATGT -/G GGGGCAGAAG 3070 hom 96 het 41 0 32 9 G 4 5 130533 CASAVA_Build 10 26776155 1I AAAAAAGTAC -/A AAAAAATTAG 1956 hom 12 het 8 0 5 3 A 6 7 130534 CASAVA_Build 10 26777088 4I56M1I AAATAATATA ----TTAATTTTGATATAATTGAAATTATGTTACATTTAAGTAATAGTAAGATTATTTCA-/TTACTTAATTTTGATATAATTGAAATTATGTTACATTTAAGTAATAGTAAGATTATTTCAT TTTTTTTAAT 3070 hom 60 het 16 0 21 4 N/A 0 0 130535 CASAVA_Build 10 26781087 2I ATTCTTAGAC --/AA AAAAAAAAGT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 8 10 130536 CASAVA_Build 10 26781851 2D TATTTGAATT TC/-- TGTTTCTGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TC 1 0 130537 CASAVA_Build 10 26783497 1I GATGGTTACC -/A GAGGCTGGGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 0 1 130538 CASAVA_Build 10 26784088 1D GGATGCCAGG A/- AAAACAGTAT 3070 hom 108 het 41 0 36 6 A 5 4 130539 CASAVA_Build 10 26798030 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 23 0 19 4 T 12 11 130540 CASAVA_Build 10 26816133 1D GGGCTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2467 hom 39 13 13 14 T 13 12 130541 CASAVA_Build 10 26838231 1D TTCAAGGGGG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 A 8 7 130542 CASAVA_Build 10 26842640 1D GTACAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 2919 het 2657 hom 29 7 11 11 T 14 13 130543 CASAVA_Build 10 26855446 1I ACGAAGTCAG -/T GAGATCAAGA 3070 het 2336 hom 17 6 9 2 T 0 1 130544 CASAVA_Build 10 26859624 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2057 het 2057 ref 16 6 6 4 A 14 13 130545 CASAVA_Build 10 26866103 1I CCTTTCCGTC -/T TTTTGTTCAC 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 T 4 5 130546 CASAVA_Build 10 26871702 1I TGTCCTAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 T 10 11 130547 CASAVA_Build 10 26872427 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 A 8 7 130548 CASAVA_Build 10 26893072 3I TAGAAAAAAA ---/AAC TTCCAAATTT 873 het 873 ref 34 30 2 3 AAC 0 1 130549 CASAVA_Build 10 26899408 1D TTTAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1395 het 1395 ref 15 10 3 2 T 13 12 130550 CASAVA_Build 10 26900303 4D16M2I ATAGAGTGGG TCTAACTCTGAATTTATTTT--/----ACTGTGGATTTCTTTTTA ATTAAGTTGT 2314 het 2314 ref 47 44 7 11 N/A 0 0 130551 CASAVA_Build 10 26901596 1I TTGTCTATTC -/T TTTGCCAATA 3070 het 3070 ref 40 33 7 0 T 3 4 130552 CASAVA_Build 10 26903428 4I9M4D CTACTTAAAA ----TTTAAAAACCAAG/TTTTTTTTAAAAC---- TCAAGCAATC 1797 het 1797 ref 34 33 4 6 N/A 0 0 130553 CASAVA_Build 10 26903598 2I TTTCAAAGTC --/TA TATAAGGAAA 3070 het 3070 ref 60 34 21 5 TA 2 3 130554 CASAVA_Build 10 26912442 4I TGCGGTTTGG ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 AT 6 8 130555 CASAVA_Build 10 26921065 1I ATAGCATATC -/A ACCCAGCTAG 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 A 1 2 130556 CASAVA_Build 10 26921988 1I CCCAGGAGTT -/G GGAGACCAGC 1818 het 1818 ref 24 17 5 2 G 2 3 130557 CASAVA_Build 10 26922845 4I AATTTAAAAT ----/AATG AATGCTGCTG 2946 het 2758 hom 22 8 7 7 AATG 1 2 130558 CASAVA_Build 10 26930869 1D TTGATTTGGA T/- TTTTTTTTTT 1095 het 1095 ref 35 23 3 9 T 11 10 130559 CASAVA_Build 10 26939982 1I CCCCTCCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 19 7 A 10 11 130560 CASAVA_Build 10 26952084 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 23 1 20 2 A 13 14 130561 CASAVA_Build 10 26954893 1I TTCACAAGAG -/C TTTTAATTTG 3070 het 3070 ref 58 31 18 13 C 0 1 130562 CASAVA_Build 10 26955061 1D ATTTTAAGTT A/- AAATTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 30 8 5 A 4 3 130563 CASAVA_Build 10 26955899 1I AAGGCAAGGT -/A GGGGAGAGTG 3070 het 3070 ref 51 34 12 6 A 0 1 130564 CASAVA_Build 10 26957681 8I ATGAAACTGC --------/AAAAAAAG AAAAAAAGAA 3070 hom 66 het 34 0 23 11 AAAAAAAG 1 2 130565 CASAVA_Build 10 26998741 1D CATACAGGCC A/- GGGGCAGTGG 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 1 0 130566 CASAVA_Build 10 27002332 4I TGGACCAGCA ----/CAGC CAGCTGGTTG 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 CAGC 1 2 130567 CASAVA_Build 10 27005286 1I35M1I GTGTTTAGTT -TTTTAGGCAATACCAAACCTTCTTTTTTATTAACC-/ATTTTAGGCAATACCAAACCTTCTTTTTTATTAACCA AAAAAACATC 3070 het 3070 hom 41 21 23 7 N/A 0 0 130568 CASAVA_Build 10 27005611 2D GCCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 2803 hom 27 8 18 2 A 11 9 130569 CASAVA_Build 10 27009482 1I TTAATTTGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 9 10 130570 CASAVA_Build 10 27009898 1I CCATAAAGCC -/A AATTGACCTT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 2 3 130571 CASAVA_Build 10 27017747 1I ATGAGCCACC -/G TGCCCAGCCT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 G 0 1 130572 CASAVA_Build 10 27018925 5D GGGCACCTGT AGGGG/----- GATTGGGGGG 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 AGGGG 1 0 130573 CASAVA_Build 10 27019233 1I CCTGTCTCTA -/C TAAAATTAGC 2680 het 2680 ref 21 9 11 1 C 0 1 130574 CASAVA_Build 10 27019400 4D ATAAATACAT TAAA/---- TAAATAAATA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 TAAA 5 4 130575 CASAVA_Build 10 27020653 1I AAAATAATTT -/C TTCAGTAGGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 0 1 130576 CASAVA_Build 10 27020902 1D TCACTTTTTT G/- GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 6 G 4 3 130577 CASAVA_Build 10 27021148 1I ATATTATTAA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 7 8 130578 CASAVA_Build 10 27021746 1I CTGATAAAAT -/A AAACATCCTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 3 4 130579 CASAVA_Build 10 27022738 2D AAAATCGTCA TC/-- TGTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 TC 1 0 130580 CASAVA_Build 10 27027112 4I ATGGACAAGG ----/TTAA TTAAGCCTGG 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 TTAA 1 2 130581 CASAVA_Build 10 27031074 1D TGGATGTAAC G/- TAACTTGTTT 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 G 1 0 130582 CASAVA_Build 10 27032278 2D AGTTAGTTAT TA/-- TAACTAATCA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TA 2 1 130583 CASAVA_Build 10 27035945 2D CTGAGAGAAA GT/-- GTGTGGTTTG 3070 het 3070 ref 51 30 15 7 GT 3 2 130584 CASAVA_Build 10 27046990 1I TTGGTTTTTT -/G TGTGTTTTTT 3037 het 3037 ref 20 11 7 2 G 0 1 130585 CASAVA_Build 10 27071399 4D GAAATAAATA GATT/---- TTCTCAGATT 3070 het 3070 ref 32 16 13 6 GATT 1 0 130586 CASAVA_Build 10 27076917 5I CTCTTTTTGC -----/TTCTT TTGTTTCACA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 TTCTT 0 1 130587 CASAVA_Build 10 27077752 2D TAAGACAAAG AC/-- AATTAAATAT 3070 het 3070 hom 36 13 20 5 AC 1 0 130588 CASAVA_Build 10 27080026 1D TCAACTTGTA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 8 7 130589 CASAVA_Build 10 27083886 1I CTCCCCCCCC -/A ACAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 1 2 130590 CASAVA_Build 10 27086354 1I AAAAAAGTCA -/C CAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 C 1 2 130591 CASAVA_Build 10 27107434 1D TAGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1086 hom 25 7 10 8 A 15 14 130592 CASAVA_Build 10 27139752 1D CTGTTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 2360 het 2360 ref 22 10 6 6 A 13 12 130593 CASAVA_Build 10 27142321 4D ATCACCAAGT AGTC/---- AGTCAGTAAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 AGTC 2 1 130594 CASAVA_Build 10 27142653 1D AGTGATCGTC T/- TACCAAACAT 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 T 2 1 130595 CASAVA_Build 10 27143652 2I ATTTGGTAAC --/TA TTAATCTAAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TA 0 1 130596 CASAVA_Build 10 27150024 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAGTTCA 3070 het 3070 hom 25 11 10 5 A 6 5 130597 CASAVA_Build 10 27150735 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1941 het 1941 ref 29 12 7 10 A 15 14 130598 CASAVA_Build 10 27152903 1D TCTAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 1797 het 1797 ref 36 29 5 2 A 11 10 130599 CASAVA_Build 10 27160668 1D GGTATCTTGT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 8 7 130600 CASAVA_Build 10 27164516 1D TCTCCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1496 het 1496 ref 19 7 4 8 A 12 11 130601 CASAVA_Build 10 27170582 1I TATTTGACTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 9 10 130602 CASAVA_Build 10 27170884 1I GTATATGCCC -/A GATAAGGAAT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 0 1 130603 CASAVA_Build 10 27172675 1I TAGGAGAGGT -/A AGGATGGGTG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 1 2 130604 CASAVA_Build 10 27174082 1I TAAATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 13 14 130605 CASAVA_Build 10 27174746 4I GAAAAATAAT ----/AAAG AGTCACAGTC 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 AAAG 0 1 130606 CASAVA_Build 10 27175965 1D GGCCAACTAT A/- AAATCACTTG 3070 het 3070 ref 45 29 14 2 A 4 3 130607 CASAVA_Build 10 27177341 1I TTAATTTTAA -/C AACCGCCTAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 0 1 130608 CASAVA_Build 10 27180014 1I AAAAAAGCAC -/G ATGAGAACTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 0 1 130609 CASAVA_Build 10 27182236 1D AACAATGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 12 11 130610 CASAVA_Build 10 27183294 2D TATGCAGTAT TC/-- TCACCTTGAG 3070 het 3070 ref 39 21 10 10 TC 2 1 130611 CASAVA_Build 10 27183956 1I AACATGACAC -/T AAAAATAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 0 1 130612 CASAVA_Build 10 27185013 1I CCTGAGGCCA -/G GAGTTCGAGA 3070 het 3070 hom 28 9 9 10 G 1 2 130613 CASAVA_Build 10 27197774 1D GTTAAATTTC T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 7 6 130614 CASAVA_Build 10 27203659 1I GAGTATTTAA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 7 8 130615 CASAVA_Build 10 27209925 2D50M3I TCAGTCTAAC TGTTTATTGTAACAATATTTGCAATACTAAAAGTTTTATAACTTATAGATTC---/--TTTATTGTAACAATATTTGCAATACTAAAAGTTTTATAACTTATAGATTCATA ATAATGCAAA 3070 het 3070 ref 34 31 8 8 N/A 0 0 130616 CASAVA_Build 10 27212377 2I TGATTGCTTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 13 15 130617 CASAVA_Build 10 27212661 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1325 hom 28 3 18 7 A 13 12 130618 CASAVA_Build 10 27214503 1D AATCGCTTGA C/- CCCAGGAGGG 3070 het 4 hom 14 1 10 3 C 4 3 130619 CASAVA_Build 10 27220432 5D TAAACATCTC TATTT/----- TATTTATTTA 3070 het 3070 ref 55 27 25 8 TATTT 2 1 130620 CASAVA_Build 10 27221002 4I AGCCTCACTG ----/TTTC TCCAGATCAG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TTTC 0 1 130621 CASAVA_Build 10 27245952 44D AGGATAATGT AAATGCTAAATTATGACATATACAATAAAGGCTGTGGGAATCAC/-------------------------------------------- AAATGCTAAA 2916 het 2916 ref 32 17 6 17 AAATGCTAAATTATGACATATACAATAAAGGCTGTGGGAATCAC 2 1 130622 CASAVA_Build 10 27255257 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 765 het 765 ref 38 16 3 19 A 15 14 130623 CASAVA_Build 10 27255281 5I ACTTAAAGAA -----/GAAAT GAATTATCAA 2146 het 2146 ref 37 13 7 17 GAAAT 0 1 130624 CASAVA_Build 10 27256469 4D AACCCACAGT TATA/---- CCCACTGTAT 1389 het 1389 ref 30 25 3 5 TA 2 0 130625 CASAVA_Build 10 27263579 1I TACTTCTTAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 1185 hom 22 4 14 4 A 6 7 130626 CASAVA_Build 10 27265425 3D AGGGGAAGAA GAG/--- GAGGAAACAG 3070 het 3070 hom 44 21 21 4 GAG 2 1 130627 CASAVA_Build 10 27266850 8I ATATATATGT --------/ATATACAC ACATATATAT 3070 het 3070 ref 67 51 12 4 ATATACAC 0 1 130628 CASAVA_Build 10 27267458 1I AACACATTCA -/C TGATCACATC 3070 het 3070 ref 95 74 15 6 C 0 1 130629 CASAVA_Build 10 27267526 1D AAGGTGGTGC A/- AACTTAATGA 1370 het 1370 ref 66 58 4 5 A 3 2 130630 CASAVA_Build 10 27267569 1I18M4D TGGAGGGATC -AAACATGTGAATTCCCTTTCTC/AAAACATGTGTATTCCCAT---- TATCCTCTTA 3070 het 3070 ref 81 78 17 12 N/A 0 0 130631 CASAVA_Build 10 27272028 1I GTTGCCTTGC -/T TGTGGTTCCC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 1 2 130632 CASAVA_Build 10 27272310 1D AGCAGCTCCC A/- AGGCCAGGTG 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 A 2 1 130633 CASAVA_Build 10 27273629 1I23M1I ATTCAAAGAC -CCACCTTGCCCCATCGCCTCTGA-/ATCCCCTTGCCTCATCGCCTCTGAC TTTTTTTGGA 2739 het 2739 ref 44 42 6 5 N/A 0 0 130634 CASAVA_Build 10 27278370 4I ATCACATTAT ----/TCAG TCAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 TCAG 1 2 130635 CASAVA_Build 10 27289085 1I CCTTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1189 het 1189 ref 39 17 5 17 A 11 12 130636 CASAVA_Build 10 27296060 5D GACAAGTGAT ATAAC/----- ATAGACATTC 3070 het 3070 hom 33 7 23 8 ATAAC 1 0 130637 CASAVA_Build 10 27296468 2I GACACTCAAT --/CA TATCTCTCTA 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 CA 0 1 130638 CASAVA_Build 10 27298948 12I TTTGTATTTT ------------/TAGTAGAGACAG AGTTTTGTCA 3070 hom 27 het 13 0 9 4 TAGTAGAGACAG 0 1 130639 CASAVA_Build 10 27303277 1D TACTTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3037 hom 34 het 19 0 9 10 T 17 16 130640 CASAVA_Build 10 27305158 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 10 9 130641 CASAVA_Build 10 27308866 1D CAGTCTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 36 0 30 7 T 10 9 130642 CASAVA_Build 10 27309832 1I TTCTTTAAGA -/G GAGATAAAGC 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 G 1 2 130643 CASAVA_Build 10 27331873 1I AATCTTTCCT -/A AATATATGTA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 2 3 130644 CASAVA_Build 10 27333710 1I AGACTGAAAG -/A ATCTAACAGA 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 A 1 2 130645 CASAVA_Build 10 27345515 1I CCCAGCTTTG -/T TTTTTTTTTT 2143 het 2143 ref 23 9 7 7 T 13 14 130646 CASAVA_Build 10 27345811 1I TAAATATGTG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 8 9 130647 CASAVA_Build 10 27349913 1I CTTTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 2036 het 2036 ref 26 15 7 4 A 11 12 130648 CASAVA_Build 10 27370149 6I CAAAGTAGAC ------/AGAGAT AGAGATCACA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 AGAGAT 1 2 130649 CASAVA_Build 10 27372626 2D AACTGATTTT TG/-- TTAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TG 1 0 130650 CASAVA_Build 10 27373128 1D TAGTAGGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 12 11 130651 CASAVA_Build 10 27384782 5D TGCTTTTTTG TTACA/----- TTACATGTAG 3070 het 3070 ref 48 33 11 7 TTACA 2 1 130652 CASAVA_Build 10 27395278 4D CACATACTTT ATTA/---- ATTATGAACT 3070 het 3070 ref 29 17 12 1 ATTA 2 1 130653 CASAVA_Build 10 27403048 1I TGGTAATATG -/A AAAAAACAGC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 6 7 130654 CASAVA_Build 10 27415204 3I AACACCTTTT ---/TTC TTATTTATAC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 TTC 0 1 130655 CASAVA_Build 10 27417289 1I TGTGTGTGTC -/T ATCTTTATAC 3070 het 3070 ref 53 28 21 4 T 0 1 130656 CASAVA_Build 10 27419354 2D AAAATAAAAT AA/-- GAGGTAATTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 2 0 130657 CASAVA_Build 10 27428802 1I TGCTCTCTAA -/G GGGATTTCGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 3 4 130658 CASAVA_Build 10 27430759 4I TTCGAGACCA ----/GCCT GGCCAACGTG 3028 het 3028 ref 21 9 8 5 GCCT 0 1 130659 CASAVA_Build 10 27430888 15I12M1I14M2D AGGCAGAGGT ---------------TCACACCACTGC-CTCTGGAGTGGAGACT/GACAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCTGGAGTGGAGA-- CTTGGATGGA 3070 het 3070 ref 24 19 8 3 N/A 0 0 130660 CASAVA_Build 10 27431473 1D GATAAAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3029 het 424 hom 27 6 13 8 T 17 16 130661 CASAVA_Build 10 27435329 6D ACTTGACCAG AGCTCT/------ CATCTGTCCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AGCTCT 1 0 130662 CASAVA_Build 10 27435399 3D CCAGACCAAT CTC/--- AACACAGTAG 1765 het 1765 ref 21 14 5 3 CTC 1 0 130663 CASAVA_Build 10 27438612 4I AAAAATCAAG ----/ATCC ATCTGATAAA 2061 het 148 hom 25 2 9 14 ATCC 0 1 130664 CASAVA_Build 10 27448757 1D AAAAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 A 12 11 130665 CASAVA_Build 10 27449934 5D CTACAGTTAA TTTAT/----- TTTAAAAACC 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 TTTAT 1 0 130666 CASAVA_Build 10 27450684 6D CAAGCCACTA TTTTTT/------ TTTTTTTTTG 2765 het 1772 hom 20 10 8 2 T 15 9 130667 CASAVA_Build 10 27455459 1D TGCAGTTACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 A 10 9 130668 CASAVA_Build 10 27458654 2D35M5I AAGATAAAAT AAAAAAAAAAAATCAGTAGAAAAACCACTCATTTTGA-----/--AAAAAAAAAATCAGTAGGAAAACCACTCATTTTGACTTGT CTTAATATAA 3070 het 1334 hom 37 4 27 15 N/A 0 0 130669 CASAVA_Build 10 27460294 4I CTAGCACTTA ----/ATAG ATACTATTAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 ATAG 0 1 130670 CASAVA_Build 10 27461042 1D TCTGGATTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 9 8 130671 CASAVA_Build 10 27464732 4I ATTGATGGGT ----/GGCA GGCAGTCTGG 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 GGCA 1 2 130672 CASAVA_Build 10 27470997 2D TTTTTTTCTC AT/-- ATATATATAT 2846 het 2389 hom 19 6 9 4 AT 7 6 130673 CASAVA_Build 10 27474224 12D TGAAAAATTG CAAAAAAAAAAA/------------ CAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 13 3 CAAAAAAAAAAA 1 0 130674 CASAVA_Build 10 27474793 1D TGAGAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 13 12 130675 CASAVA_Build 10 27477094 1I AAAACAGGTG -/T TTTTTTTTTA 1435 het 1435 ref 16 9 3 4 T 9 10 130676 CASAVA_Build 10 27480837 1I AAAATTAAAA -/T TAAAAAAAAG 245 het 245 ref 11 4 4 3 T 1 2 130677 CASAVA_Build 10 27485466 4D AGACAGTCTT TCTC/---- TGTCGCCCAG 3070 het 3070 hom 20 7 10 3 TC 2 0 130678 CASAVA_Build 10 27490484 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAATGA 2850 het 2850 ref 22 11 6 5 A 8 7 130679 CASAVA_Build 10 27495648 3D AGTGAGAGTA ATC/--- ATACCACTGC 3070 het 3070 hom 34 12 15 11 ATC 1 0 130680 CASAVA_Build 10 27495880 4D TCTTGTGGAC TAGA/---- TAGTGTTTAC 3070 het 3070 hom 34 14 12 9 TAGA 1 0 130681 CASAVA_Build 10 27495909 24D AATAGTTCTG ATATGTAATTCTTAATACATATTA/------------------------ ATATGTAATT 3070 het 2014 hom 35 6 22 16 ATATGTAATTCTTAATACATATTA 1 0 130682 CASAVA_Build 10 27500508 1D CTGGGATTAT A/- AGGGGCCCAC 3070 het 1722 hom 15 4 8 3 A 2 1 130683 CASAVA_Build 10 27505785 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 34 1 22 11 T 16 15 130684 CASAVA_Build 10 27510334 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 2963 hom 22 8 12 2 A 8 9 130685 CASAVA_Build 10 27516942 1D TTTCCGGGGG A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 A 8 7 130686 CASAVA_Build 10 27517143 3D GTAATAACTA CTT/--- AGATTTAATG 3070 het 3070 ref 38 25 11 3 CTT 1 0 130687 CASAVA_Build 10 27518545 1D CATCACACAC T/- GGGGCCTGTT 346 het 3 hom 2 0 1 2 T 1 0 130688 CASAVA_Build 10 27518705 2D TATAATAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AT 9 8 130689 CASAVA_Build 10 27519262 3I CCCCATTAAA ---/TGT TGTTAAACAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 TGT 1 2 130690 CASAVA_Build 10 27519583 2D TATAGTACAA AT/-- ATATTTACTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AT 3 2 130691 CASAVA_Build 10 27521183 1D TCCTTGACAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 9 8 130692 CASAVA_Build 10 27522208 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAATTAC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 6 130693 CASAVA_Build 10 27525485 2D AGTGATTTTC GT/-- GTGTTTCCTT 3070 het 3070 hom 47 20 18 11 GT 3 2 130694 CASAVA_Build 10 27529932 1D TATAGTGAGA C/- CCCCATCTCA 3070 hom 92 het 33 0 30 3 C 5 4 130695 CASAVA_Build 10 27540029 4I ACAAATTAGA ----/AATG AATGACACTT 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 AATG 1 2 130696 CASAVA_Build 10 27547524 1D AGTTACACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 24 0 17 7 T 15 14 130697 CASAVA_Build 10 27550075 1D CTTACAACCC T/- TGGATCCAGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 1 130698 CASAVA_Build 10 27555585 2D TTTTTTTTAA TT/-- TTTTTTGTTA 3070 hom 66 het 27 0 21 7 T 8 6 130699 CASAVA_Build 10 27556066 1D TGGCCACCCC T/- GGTCTAAAGT 3070 hom 57 het 27 0 20 9 T 1 0 130700 CASAVA_Build 10 27563869 4D TCCATCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AAAC 3 2 130701 CASAVA_Build 10 27566153 1I GAATGATATT -/A AAAAATACAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 5 6 130702 CASAVA_Build 10 27568548 4I TTATTAAAAT ----/AAAG AGAAATTACT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AAAG 0 1 130703 CASAVA_Build 10 27570612 1I AGACGAGCCT -/G GGCAACATGG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 2 3 130704 CASAVA_Build 10 27571671 3I AATAAATAAA ---/CCT CCTCTTTAGG 3070 hom 99 het 35 0 31 4 CCT 1 2 130705 CASAVA_Build 10 27573683 1I GTCAAGTCTG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 9 het 40 1 32 7 T 7 8 130706 CASAVA_Build 10 27582224 17D AACCCGGGAG GCGGAGGTTGCAGTTGA/----------------- GCCACTGTAC 1428 het 1428 ref 10 6 3 2 GCGGAGGTTGCAGTTGA 1 0 130707 CASAVA_Build 10 27589105 2D ACCCTGAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 1152 het 140 hom 20 3 5 14 T 18 16 130708 CASAVA_Build 10 27590795 1I TAATGATCGG -/A AAAAAACCTA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 6 7 130709 CASAVA_Build 10 27593069 2D39M1D GTGTGTGTAC ATATATATATATATGTATTTTTTTTTCTTTTTGCCAGCCTCA/--ATATATATATATGTATTTTTTTTTCTTTTTGCCAGCCTC- AGTTTATTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 17 N/A 0 0 130710 CASAVA_Build 10 27593403 1D ATTATTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 14 1 12 1 T 11 10 130711 CASAVA_Build 10 27598144 15I GCTCATGGCT ---------------/CCTTGGCTCACGGCC CCACATCACT 3070 hom 70 het 28 0 20 8 CCTTGGCTCACGGCC 0 1 130712 CASAVA_Build 10 27598319 1D TTTTGCATAG A/- ACATACAACA 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 A 2 1 130713 CASAVA_Build 10 27609753 10I GCAAGTGAGT ----------/TTTAAAATAC TGCTTTTTCC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTTAAAATAC 0 1 130714 CASAVA_Build 10 27613181 1I AATAAAATTT -/A AAAAATTGCC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 5 6 130715 CASAVA_Build 10 27615437 1D AAAAACTCAC T/- TTAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 T 3 2 130716 CASAVA_Build 10 27617837 5I TGATTCCAAG -----/TTTAC TTTATGTTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TTTAC 0 1 130717 CASAVA_Build 10 27618075 1I TTTTTAAAGC -/T GGACTTTGGT 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 0 1 130718 CASAVA_Build 10 27624290 1D GTCTTTACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 10 9 130719 CASAVA_Build 10 27627079 2I GAGCATACTG --/AT ATGATACACA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AT 1 2 130720 CASAVA_Build 10 27634257 4I ATACATATGT ----/AACA AACCTGAACA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AACA 0 1 130721 CASAVA_Build 10 27635978 2D AGTTTTTAAC AG/-- AGGTATAATG 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 AG 2 1 130722 CASAVA_Build 10 27638727 6D AGCACCTCAG GAGGCC/------ GAGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 27 11 11 6 GAGGCC 1 0 130723 CASAVA_Build 10 27639576 1D ATAGCCAATG T/- AAAATTATTA 3070 het 3070 hom 23 7 13 3 T 1 0 130724 CASAVA_Build 10 27640903 1D GTCTAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 2241 het 2241 ref 20 7 6 7 T 12 11 130725 CASAVA_Build 10 27642006 1I AAAGACAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 406 hom 37 1 32 4 A 9 10 130726 CASAVA_Build 10 27643169 6I AATTTTTAAA ------/AAATTC AAGAATCTAA 3070 het 3070 hom 21 9 9 4 AAATTC 0 1 130727 CASAVA_Build 10 27643995 1D GTTGGTTAGA T/- TTAACAGAGC 3070 het 3070 ref 33 19 8 7 T 3 2 130728 CASAVA_Build 10 27646164 1I GTGTATTATT -/G GTACATACAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 2 130729 CASAVA_Build 10 27652166 1D ATTGCATCTA T/- TTTTAGGATA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 5 4 130730 CASAVA_Build 10 27657613 1I TAGGTGTGTG -/T TTTTTTTTTA 2974 het 2974 ref 33 18 9 6 T 9 10 130731 CASAVA_Build 10 27659468 1D TTATTCCATT A/- CCCCCACCCC 3070 het 3070 ref 50 33 15 2 A 1 0 130732 CASAVA_Build 10 27661957 1I TAAGGGTTTT -/C ACTGTAGGAA 3070 het 3070 ref 55 38 10 7 C 0 1 130733 CASAVA_Build 10 27662073 3D GGCAATGAGA ATG/--- AAGAACTTTA 1709 het 1709 ref 42 29 7 8 ATG 1 0 130734 CASAVA_Build 10 27662142 2D CCTCCTTAAA AC/-- AGTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 61 34 22 7 AC 1 0 130735 CASAVA_Build 10 27662245 2I CAGTAAGGCT --/TC CCAGGTCAAC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 TC 0 1 130736 CASAVA_Build 10 27662503 28D CATACATACA TACATACATACATACATACATACATAAT/---------------------------- TATTTCTTCA 2358 het 2358 ref 25 20 6 5 TACATACATACATACATACATACATAAT 1 0 130737 CASAVA_Build 10 27662871 1I13M3I TTAAGAAAAT -TTTTTTCGGATAA---/ATTTTTTCAGATAATAT TTTCTGAGAT 2190 het 2190 ref 30 27 6 1 N/A 0 0 130738 CASAVA_Build 10 27662961 2I AAATCAAAGC --/TA TATATATATA 1365 het 1365 ref 40 33 3 4 TA 5 6 130739 CASAVA_Build 10 27677089 4D19M3D CTTTTCTTTC CTTTCTTTCTTTCCTTTCTTTCTTTC/----CTTTCTTTCCTTTCTTTCT--- TTTCTTTCTT 2147 hom 27 het 10 0 10 0 N/A 0 0 130740 CASAVA_Build 10 27679457 5I TCTCTATCTC -----/TATGG CGTAAGTATC 3070 hom 69 het 27 0 24 5 TATGG 0 1 130741 CASAVA_Build 10 27684965 4D CACACACATG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 105 het 46 0 32 14 CA 9 7 130742 CASAVA_Build 10 27685087 4D ATCTCACATA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 99 het 40 0 34 11 AC 7 5 130743 CASAVA_Build 10 27694392 3D GAATTGCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 31 3 14 14 T 19 16 130744 CASAVA_Build 10 27696070 7D TCACTTTGGG GGGAAGA/------- GACATTTAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 4 GGGAAGA 1 0 130745 CASAVA_Build 10 27697990 1I CTATCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 2920 het 2920 ref 36 15 10 11 T 15 16 130746 CASAVA_Build 10 27702971 3I TGTCTCAAAA ---/AAG AAGAAGTCAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 AAG 2 3 130747 CASAVA_Build 10 27705350 4D CAAGGGTGGG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 38 2 16 21 T 22 18 130748 CASAVA_Build 10 27712366 1D ATTATAAAAT C/- CCCCCCTGGA 2052 het 2052 ref 27 17 5 5 C 7 6 130749 CASAVA_Build 10 27712909 1D ACTAGAATGT A/- ATTTCCTTTG 3070 het 3070 hom 49 18 25 7 A 2 1 130750 CASAVA_Build 10 27732453 1I AGAACAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 A 12 13 130751 CASAVA_Build 10 27736351 1D TGATGAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 A 12 11 130752 CASAVA_Build 10 27740288 3I ATATAATCTT ---/GAA GAAGAACAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GAA 2 3 130753 CASAVA_Build 10 27742049 1I TCTTCCTCAT -/A CCCTCTCACC 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 A 0 1 130754 CASAVA_Build 10 27743732 1D AAAAGTGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 42 0 37 6 A 9 8 130755 CASAVA_Build 10 27753317 1I CTTTAGTAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 10 130756 CASAVA_Build 10 27758057 2D AAAATTGGTG GC/-- AGGGACATCT 3070 het 3070 hom 41 19 17 6 GC 1 0 130757 CASAVA_Build 10 27761755 1I AGATTTCAGT -/A AAAAAAAAAA 1652 het 1652 ref 32 14 5 13 A 14 15 130758 CASAVA_Build 10 27762587 1D CTAAAAGGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 9 130759 CASAVA_Build 10 27765200 1D CTCTCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2619 hom 33 9 17 8 A 11 10 130760 CASAVA_Build 10 27771496 1D TTTTTCCGTG A/- AAAAAAAAAA 1223 het 1223 ref 39 31 3 5 A 11 10 130761 CASAVA_Build 10 27774040 1I TAAAATTAAC -/A AAAAAAAAAA 1895 het 1895 ref 20 8 7 5 A 13 14 130762 CASAVA_Build 10 27775749 4D TTTCTCTCTT TCTC/---- TCTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 TC 4 2 130763 CASAVA_Build 10 27776130 1D CCGGCTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 22 1 15 6 A 17 16 130764 CASAVA_Build 10 27780093 4D GAACTTTTTG AGAC/---- AGACAGGGTT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AGAC 2 1 130765 CASAVA_Build 10 27780632 1D TCCATTTTGA T/- TTTTTAAACA 3070 het 3070 ref 34 16 17 1 T 6 5 130766 CASAVA_Build 10 27783782 7D CTATCTATGC CTTGATT/------- CATTTCTACT 3070 het 3070 ref 20 12 8 4 CTTGATT 1 0 130767 CASAVA_Build 10 27796266 1D TAATTATGAC A/- AGCTTAAAGA 3035 het 3035 ref 20 8 9 3 A 2 1 130768 CASAVA_Build 10 27800557 1I GAGCAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 32 1 20 11 T 10 11 130769 CASAVA_Build 10 27803443 7D GTTTGCTGCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 24 1 15 8 T 21 14 130770 CASAVA_Build 10 27808638 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 565 hom 21 2 14 5 A 15 16 130771 CASAVA_Build 10 27814592 4I TTGCAATGAG ----/TGAC TGGTTTTATT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 TGAC 0 1 130772 CASAVA_Build 10 27815297 1I TAGGGCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 62 34 21 7 T 10 11 130773 CASAVA_Build 10 27816318 5I TCAAAAAAAA -----/AAAAG AAAAAAAAAG 3070 het 886 hom 24 5 11 8 AAAAG 0 1 130774 CASAVA_Build 10 27817956 1D TACTTTTTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 9 8 130775 CASAVA_Build 10 27819409 23D GTCAGAAAAT ATAATTGAACAGTATATAAAGGA/----------------------- ATAACTTACC 3070 het 3070 ref 39 23 22 3 ATAATTGAACAGTATATAAAGGA 1 0 130776 CASAVA_Build 10 27820949 22D AAAATTGTTG AAAATTGAAGAAGGTAGTTTGA/---------------------- AATTTGTTTC 3070 het 3070 hom 34 16 19 6 AAAATTGAAGAAGGTAGTTTGA 1 0 130777 CASAVA_Build 10 27823477 2D TATTATTAAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 120 hom 40 3 14 24 AC 10 9 130778 CASAVA_Build 10 27826587 2I ACACACACAC --/AA AAACATTAGC 2043 het 1216 hom 12 5 6 2 A 3 5 130779 CASAVA_Build 10 27827709 1D AGTTTTAAGG T/- TTTTTTGTAC 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 T 7 6 130780 CASAVA_Build 10 27836193 1I CTTTCTAGTG -/T ATTTCATAGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 0 1 130781 CASAVA_Build 10 27837375 5I ACAAGGTAAT -----/CTTAA CTTATGTTTT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 CTTAA 0 1 130782 CASAVA_Build 10 27854363 2I TGTGCTTTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 12 14 130783 CASAVA_Build 10 27861266 5D TTTATAAATA ATTTT/----- ATTTTGTGAC 3070 het 3070 ref 30 19 11 1 ATTTT 2 1 130784 CASAVA_Build 10 27862626 2D CGCCATTGCT TC/-- TTTCTTTAAT 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 TC 1 0 130785 CASAVA_Build 10 27864965 1I TTGCAGTGAG -/C CGAGATCACG 1710 hom 16 het 13 0 4 9 C 1 2 130786 CASAVA_Build 10 27870571 1D TATTTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2111 hom 23 5 10 8 T 13 12 130787 CASAVA_Build 10 27882840 2D TAAAATTTCA TC/-- TTTTTTTTAA 2390 het 2390 ref 16 8 6 2 TC 1 0 130788 CASAVA_Build 10 27893353 1D TTGCTCCTCT A/- GAGATAAAGT 3070 het 3070 ref 49 26 19 5 A 1 0 130789 CASAVA_Build 10 27902381 4I TTTTTCTTGC ----/CTAA AAATAGCTCT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 CTAA 0 1 130790 CASAVA_Build 10 27902910 1D AAATGCTGAT G/- TTTTTCCTGT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 G 1 0 130791 CASAVA_Build 10 27908875 1D GAAGTGGTGG T/- TATGGTTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 2 1 130792 CASAVA_Build 10 27910772 1D CCTTTTTTTA T/- TTTAATTATT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 4 3 130793 CASAVA_Build 10 27917144 1D TTCCAGCAGA C/- CTGCAGCAGA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 C 2 1 130794 CASAVA_Build 10 27918799 1D AGTTGGAGAC T/- TTTAACACCC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 4 3 130795 CASAVA_Build 10 27920596 4I ACAGACAAAC ----/AGAG AGCCAAATCA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AG 1 3 130796 CASAVA_Build 10 27931458 5D AAACTTTTGG ACTTA/----- ACTTAAGAAT 3070 het 3070 ref 34 20 11 6 ACTTA 2 1 130797 CASAVA_Build 10 27933427 1D GAACAAGTGC T/- AATGTTATTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 0 130798 CASAVA_Build 10 27936050 1I AGAAATAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 15 20 18 T 13 14 130799 CASAVA_Build 10 27940042 2I CTGGCTGATT --/AA AAAAAAAAAA 1673 het 1673 ref 23 14 5 4 A 10 12 130800 CASAVA_Build 10 27941995 2I TCTGCATAAG --/CT CTCTCTCTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 7 CT 4 5 130801 CASAVA_Build 10 27942407 1D ACTGGAACAT G/- GGCAGGATTC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 G 3 2 130802 CASAVA_Build 10 27942577 1I TTTAATATTC -/T TTTTTGCCAG 1804 het 1804 ref 16 10 5 1 T 5 6 130803 CASAVA_Build 10 27951307 1I AAAATATTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 60 hom 30 1 26 3 A 9 10 130804 CASAVA_Build 10 27953123 1D TGGGAAAGAT G/- GGGGGGGCAT 3070 hom 109 het 43 0 35 8 G 8 7 130805 CASAVA_Build 10 27958459 1I ATAAAACAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 9 10 130806 CASAVA_Build 10 27971781 1I TTCTTACAGA -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 130807 CASAVA_Build 10 27973953 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 31 1 26 4 T 12 11 130808 CASAVA_Build 10 27981197 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 10 11 130809 CASAVA_Build 10 27985185 51D TCCAGCCTGG GAGACACAGTGAGACTTCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/--------------------------------------------------- GAGAGAAAGA 2429 het 2429 ref 14 12 5 2 GAGACACAGTGAGACTTCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 130810 CASAVA_Build 10 27999151 1D CACCTGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 24 1 18 9 T 13 12 130811 CASAVA_Build 10 28000320 1D TCTCAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 26 1 18 7 A 12 11 130812 CASAVA_Build 10 28014174 3I CATTGTATAT ---/ATA GAAAGCCTAT 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 ATA 0 1 130813 CASAVA_Build 10 28015946 1I ACCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 C 0 1 130814 CASAVA_Build 10 28019231 1I ATTTGAGCCC -/G GGAGGCGGAG 3070 het 2657 hom 18 7 10 1 G 2 3 130815 CASAVA_Build 10 28030304 6D AAGATGATTT TATATA/------ TATATATATA 1951 het 1804 hom 13 5 4 4 TA 9 6 130816 CASAVA_Build 10 28030763 8D TGTGTGTGTG TATATATA/-------- TATATATATA 2974 het 528 hom 10 3 7 1 TA 10 6 130817 CASAVA_Build 10 28032342 5D AAAGTCTAAA ACCAT/----- AATATGAGCA 3070 het 3070 hom 46 16 28 4 ACCAT 1 0 130818 CASAVA_Build 10 28032455 1I ACATCTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 A 10 11 130819 CASAVA_Build 10 28034186 1I ACACAGCTGT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 8 9 130820 CASAVA_Build 10 28044138 4I GCAGGCAGAC ----/AGAT GCTTGCTTTG 3070 het 3070 hom 58 27 22 9 AGAT 0 1 130821 CASAVA_Build 10 28044867 2I AGAGGAAGAC --/TT ATAAAAGCAG 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 0 2 130822 CASAVA_Build 10 28050196 1D GAATATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 A 11 10 130823 CASAVA_Build 10 28060591 1D TTGCATAACT A/- AAAAAAAAAA 2863 het 2863 ref 25 12 9 4 A 12 11 130824 CASAVA_Build 10 28060927 2D GTATTTGTCA TT/-- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 17 8 7 2 T 9 7 130825 CASAVA_Build 10 28065319 1D ACTTCCATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 49 28 16 6 T 10 9 130826 CASAVA_Build 10 28080287 1I TTCATTTAAC -/T TTTTTTTTTT 1297 het 1297 ref 21 10 4 7 T 13 14 130827 CASAVA_Build 10 28116075 1D TTTTAGAGAT A/- AGTTCTCACT 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 A 2 1 130828 CASAVA_Build 10 28117045 2D CTGGGGATGA AG/-- AGTCAGGAGC 3070 het 3070 ref 47 24 21 3 AG 2 1 130829 CASAVA_Build 10 28117619 1I TGCAAAAGGC -/T TTTTTTTTTT 2316 het 2316 ref 29 16 8 5 T 13 14 130830 CASAVA_Build 10 28118990 4D TTATCATGAT GGTG/---- GGTGGTTGAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 7 GGTG 2 1 130831 CASAVA_Build 10 28134798 1I ACATATGTGA -/T TTTTTTTTTT 1400 het 1400 ref 47 31 4 12 T 11 12 130832 CASAVA_Build 10 28135349 2D GCCTTGGTGG GA/-- AAAAAAAAAA 1561 het 1262 hom 29 10 11 8 GA 1 0 130833 CASAVA_Build 10 28136679 1D ATTGTATCAG T/- TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 T 7 6 130834 CASAVA_Build 10 28141120 2D GGCCATATCC TT/-- TTTATTAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 T 5 3 130835 CASAVA_Build 10 28158867 1D GGCAGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 9 11 A 13 12 130836 CASAVA_Build 10 28162313 1D GTACAAACTG A/- AAAAAAAAAT 2890 het 2890 ref 26 14 8 5 A 10 9 130837 CASAVA_Build 10 28164861 1D AAATCCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2739 hom 26 12 9 5 A 13 12 130838 CASAVA_Build 10 28188163 2I ATATGTTTTT --/TA TATAGTTTAC 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 TA 2 3 130839 CASAVA_Build 10 28220887 5D AAGAACAAAG AATTT/----- AATATATGGA 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 AATTT 1 0 130840 CASAVA_Build 10 28222493 4I AACAAAGACG ----/TTAT TTATTTCAAA 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 TTAT 1 2 130841 CASAVA_Build 10 28232484 1I ATTTAGAAAA -/C CCCATCGTCT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 C 3 4 130842 CASAVA_Build 10 28235699 1D AATACAGGAA C/- AAAAAACCAA 2475 het 1494 hom 14 5 6 4 C 1 0 130843 CASAVA_Build 10 28236432 1I AACTGACCAG -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 7 8 130844 CASAVA_Build 10 28237699 1I ACCAGGGGGG -/A AAAAATGTAT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 5 6 130845 CASAVA_Build 10 28245450 1D GGGACCACTT A/- ACATGTGGGT 3070 het 3070 ref 49 23 21 6 A 2 1 130846 CASAVA_Build 10 28247844 1D CATTACTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 11 10 130847 CASAVA_Build 10 28250457 1I TCCAGTAATT -/A AAAAAAAAAA 2810 het 2810 ref 29 14 7 8 A 11 12 130848 CASAVA_Build 10 28250671 2D TCCCCAGTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 13 11 130849 CASAVA_Build 10 28251265 1D TTCTCCTAGA G/- GGATGAGCTC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 G 3 2 130850 CASAVA_Build 10 28251914 3D ATGATTAAAT AAG/--- AAGGAGGATG 3070 het 3070 ref 32 15 16 1 AAG 2 1 130851 CASAVA_Build 10 28264638 2I CTACTTGGAT --/AA AAAAAAAAAA 2585 het 2585 ref 26 10 11 5 A 12 14 130852 CASAVA_Build 10 28280365 1I CAAAGAGAAA -/G ATCCAGAAAC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 G 0 1 130853 CASAVA_Build 10 28314205 1I TCTAGTACAA -/G CAAACATTAA 782 het 782 ref 30 14 4 12 G 0 1 130854 CASAVA_Build 10 28356248 1D TTATCATATG A/- AAAAAGTTCC 3070 het 3070 hom 44 21 21 4 A 6 5 130855 CASAVA_Build 10 28373303 2D TATAATATTA AT/-- ATATAAATAT 2945 het 2825 hom 13 7 6 0 AT 3 2 130856 CASAVA_Build 10 28374544 2D GACTGTAGGT GA/-- GAGAGAGAGT 3070 het 3070 hom 39 16 16 8 GA 5 4 130857 CASAVA_Build 10 28376464 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 8 7 130858 CASAVA_Build 10 28379477 2D CAGAGAGGTT CA/-- GTGTTTTTCC 3070 het 3070 ref 51 26 18 9 CA 1 0 130859 CASAVA_Build 10 28386636 2I CAGTGCCCAA --/GT GTCAGGAGGC 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 GT 1 2 130860 CASAVA_Build 10 28388986 1D GAAAAAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 11 10 T 14 13 130861 CASAVA_Build 10 28390779 3I TGTCACAGAT ---/TTC TTATTATAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTC 0 1 130862 CASAVA_Build 10 28392552 3D ACCACCTGAG CTC/--- CTCCTCCTGT 3070 het 3070 ref 45 22 13 10 CTC 3 2 130863 CASAVA_Build 10 28405805 1I CCTGGGTGAC -/A AGAGTAAGAC 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 1 2 130864 CASAVA_Build 10 28429057 2D TAAGAAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2386 hom 28 11 8 10 A 14 12 130865 CASAVA_Build 10 28431023 9D TGTAAATTTC TGCAATTCA/--------- TGCAATTCAT 3070 het 3070 ref 36 21 15 2 TGCAATTCA 2 1 130866 CASAVA_Build 10 28432074 4D GTTGGGGGGT CAGA/---- CCGTGCACAT 3070 het 3070 ref 43 21 13 15 CAGA 1 0 130867 CASAVA_Build 10 28432683 2I TCAAAAATAT --/TG TGTTATAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 TG 1 2 130868 CASAVA_Build 10 28434165 19D GTTATCCATC TGCCAATAAGAATACATTT/------------------- TGCACAACAT 3070 het 3070 ref 30 18 12 4 TGCCAATAAGAATACATTT 1 0 130869 CASAVA_Build 10 28450748 1I CCATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2726 het 2726 ref 26 12 7 7 A 13 14 130870 CASAVA_Build 10 28464697 1I GATCTCACCT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 A 8 9 130871 CASAVA_Build 10 28474722 4D ATAAAATGAA AAAT/---- AACCAAATTA 3070 het 3070 ref 36 17 15 6 AAAT 1 0 130872 CASAVA_Build 10 28478652 1I TCTCTCTCCA -/T GAGTTTAAAG 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 T 0 1 130873 CASAVA_Build 10 28481885 1I GCAGATTCAA -/T GACATAATAA 3070 het 3070 hom 33 16 16 2 T 0 1 130874 CASAVA_Build 10 28489049 1D TGATCATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 708 hom 43 4 23 16 A 15 14 130875 CASAVA_Build 10 28496612 4I AGTTTGCTGG ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 36 17 8 11 TA 5 7 130876 CASAVA_Build 10 28504384 1D GAATTTTTTT A/- AAATGCCATG 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 A 4 3 130877 CASAVA_Build 10 28504545 4D ACTTATAAAG GAAA/---- GAAAGTTATA 3070 het 3070 hom 35 18 16 2 GAAA 2 1 130878 CASAVA_Build 10 28510445 4D22M1D4M6D ATAATACTTC AATAAATGAATCCAATGAGATGTGAGCATCTATTATC/----AATGAATCCAATGAGATGTGAG-ATGT------ GTGCCCCACG 3070 het 3070 ref 38 30 21 2 N/A 0 0 130879 CASAVA_Build 10 28511120 1I10M4I TAACCAAAGC -AAAAAAAATA----/AAAAAAAAATAGCAG GCAAAGGATA 3070 het 3070 ref 40 19 20 4 N/A 0 0 130880 CASAVA_Build 10 28513142 2I TATATATCTT --/TA TATATGTTAA 2209 het 1549 hom 10 4 5 1 TA 2 3 130881 CASAVA_Build 10 28513808 1D ATTTTTATGA T/- TTTTTATAAT 2226 het 1405 hom 10 3 6 1 T 6 5 130882 CASAVA_Build 10 28515283 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2901 het 476 hom 16 2 11 3 A 12 13 130883 CASAVA_Build 10 28517691 1D AGGATAAGAA T/- TACTTCAGGC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 2 1 130884 CASAVA_Build 10 28518586 1I GCACACATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 10 11 130885 CASAVA_Build 10 28528553 3D GCCCCCAAAC TTT/--- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 26 13 8 6 T 9 6 130886 CASAVA_Build 10 28531926 1I ACGGTAGCGT -/A ACTACATAAA 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 A 1 2 130887 CASAVA_Build 10 28532432 4D AACAGTCTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2790 hom 36 14 12 11 A 20 16 130888 CASAVA_Build 10 28540043 1I CTGTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 27 16 8 T 10 11 130889 CASAVA_Build 10 28540380 4D ATTTTTTGCC ATAT/---- ATATATATAT 2872 het 2872 ref 31 12 12 8 AT 9 7 130890 CASAVA_Build 10 28544275 1I AGAAGGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 10 11 130891 CASAVA_Build 10 28559280 3D CCCCAAAAAG CTT/--- CAATTACAAG 3070 het 3070 ref 44 25 16 4 CTT 1 0 130892 CASAVA_Build 10 28564268 2D TGCTAATAAC AG/-- GGGAAACTAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 3 AG 1 0 130893 CASAVA_Build 10 28574597 1I TTTTATCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 T 10 11 130894 CASAVA_Build 10 28574827 1I GATCAAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 10 11 130895 CASAVA_Build 10 28578171 1D ATCACAACCT A/- AAAATATTTA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 5 4 130896 CASAVA_Build 10 28581618 1I CCAGATGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 T 9 10 130897 CASAVA_Build 10 28585553 1I AAATTGGACT -/A CGTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 0 1 130898 CASAVA_Build 10 28586681 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1970 het 1114 hom 13 5 6 2 A 15 14 130899 CASAVA_Build 10 28590609 4I GTACAAGAAA ----/CTGT CTGATCATAC 3070 het 3070 hom 58 28 28 2 CTGT 0 1 130900 CASAVA_Build 10 28592291 1I TTGCATAGTT -/C CTGCAAATAA 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 C 1 2 130901 CASAVA_Build 10 28598461 1D TGTTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 832 hom 26 5 10 11 T 17 16 130902 CASAVA_Build 10 28606299 1D GCTGACGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1025 hom 22 7 9 6 A 13 12 130903 CASAVA_Build 10 28621387 2D ATCATTACGG AA/-- AAAAAAAAAA 1203 het 1203 ref 47 20 3 24 A 14 12 130904 CASAVA_Build 10 28624489 1D TCCCAATGCC A/- AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 7 6 130905 CASAVA_Build 10 28629188 7D TGTCATAATT AATTTAA/------- AGAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 26 13 9 9 AATTTAA 1 0 130906 CASAVA_Build 10 28629885 1D TCCACCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1819 het 1503 hom 24 8 8 8 A 15 14 130907 CASAVA_Build 10 28632123 1I ACTTGAAGAC -/A GCCTCTCCAG 2440 het 2440 ref 19 9 7 3 A 0 1 130908 CASAVA_Build 10 28633888 3I TGTTTTTATC ---/AGT AGAAGATGGA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 AGT 0 1 130909 CASAVA_Build 10 28637108 1D CAGCTGTCTC T/- TAACAAACAG 3070 hom 143 het 52 0 45 9 T 2 1 130910 CASAVA_Build 10 28637853 1I CCAAGGACAC -/A GGACTAAGAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 0 1 130911 CASAVA_Build 10 28638772 8D5M4D TCCCCTCCCT GGGGATTGGCTCCAGGG/--------GCACC---- TTGGCTCCAG 3070 hom 41 het 13 0 12 4 N/A 0 0 130912 CASAVA_Build 10 28639945 4I TGTCAGGGGC ----/TTTG TTTGACTTAT 3070 hom 86 het 35 0 29 6 TTTG 1 2 130913 CASAVA_Build 10 28640503 2I GTGTCCGGTA --/AT ATATATATGT 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 AT 4 5 130914 CASAVA_Build 10 28642447 5D TCTCAGAAAG ATAAA/----- ATAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 ATAAA 2 1 130915 CASAVA_Build 10 28649341 1I TTACTGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1083 hom 31 3 24 4 T 10 11 130916 CASAVA_Build 10 28649768 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 T 10 11 130917 CASAVA_Build 10 28652390 1D TCTATCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3043 het 2349 hom 25 13 7 5 A 13 12 130918 CASAVA_Build 10 28652643 8D ATAAATAAAT AAATAGAG/-------- AGAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 30 11 19 5 AAATAGAG 1 0 130919 CASAVA_Build 10 28656318 1D TTGCAGCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 10 9 130920 CASAVA_Build 10 28656794 1D CATGGACCAG A/- AAGAGCTCGG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 3 2 130921 CASAVA_Build 10 28659034 1I CACACCTGCC -/A ATACTCACTA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 1 2 130922 CASAVA_Build 10 28659417 1D ATTTTTAGAC T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 42 24 13 6 T 6 5 130923 CASAVA_Build 10 28666611 1D AAACAGTGAC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 A 8 7 130924 CASAVA_Build 10 28666721 2D AATGGAATAA AG/-- AGTCATGTCA 3070 hom 111 het 41 0 37 5 AG 2 1 130925 CASAVA_Build 10 28673333 4I AACATGGCAG ----/AGAA AGAACTGAAA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 AGAA 1 2 130926 CASAVA_Build 10 28676078 1I AGAAAGAGAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 8 130927 CASAVA_Build 10 28678256 1D CATAATTCAA G/- GTGAAAAATA 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 G 2 1 130928 CASAVA_Build 10 28680290 1I ATGTGTTTTT -/G TCCTTCACTC 3070 hom 101 het 40 0 32 8 G 0 1 130929 CASAVA_Build 10 28680890 1I TCTCTCCCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 27 2 17 8 T 10 11 130930 CASAVA_Build 10 28685567 1D AATAAAAAAA T/- AATAATAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 1 0 130931 CASAVA_Build 10 28701209 1I CACTACGGGC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 8 9 130932 CASAVA_Build 10 28703562 5D6M1D6M2D5M3D TCAATATATT TCCAAATGGTTAGCATTTCACCATTCAG/-----ATGATT-GCATAT--ATATT--- GTGCACTTAC 1924 het 1924 ref 13 14 4 0 N/A 0 0 130933 CASAVA_Build 10 28707330 1I ATCTTTTTTT -/C TTTTTTTTTC 3070 het 631 hom 23 6 13 4 C 0 1 130934 CASAVA_Build 10 28711964 4I AAAATATCTT ----/GTTA TTTATATTGA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 GTTA 0 1 130935 CASAVA_Build 10 28712350 1I TATTTAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 8 9 130936 CASAVA_Build 10 28716738 1D TGCATTCCCA G/- CACTTTGGGA 3070 het 3070 ref 42 19 15 9 G 1 0 130937 CASAVA_Build 10 28721632 1D CCACCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 10 9 130938 CASAVA_Build 10 28722217 1D CATTCCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 11 10 130939 CASAVA_Build 10 28723789 6I CTAACAAAAT ------/AATAAG AATAATAATA 2732 het 2732 ref 23 9 7 7 AATAAG 0 1 130940 CASAVA_Build 10 28724464 9D TTCCTTCTTT TCCTTCTTC/--------- TCCTCCACTA 3070 het 3070 hom 54 26 23 7 TCCTTCTTC 1 0 130941 CASAVA_Build 10 28724853 1D ATAACCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 T 12 11 130942 CASAVA_Build 10 28736242 1D AAAAGATAAT C/- CACCCATTGT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 C 2 1 130943 CASAVA_Build 10 28736421 6D TTTCTTTCTT TCTTTC/------ TTTTTTTTTT 2798 het 2798 ref 27 9 13 6 TCTTTC 1 0 130944 CASAVA_Build 10 28741562 1I AGTTATTTTT -/G TGAAGGGTGT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 G 0 1 130945 CASAVA_Build 10 28743097 1D41M1D2M1D AGGAAAAAAG AAAAAGAAAGGAAACAGCGAGCTCAGCACTTGACATTGTCAGCTGA/-AAAAGAAAGGAAACAGCGAGCTCAGCACTTGACATTGTCAG-TG- CTTCCCGGAC 3070 het 3070 ref 42 32 17 6 N/A 0 0 130946 CASAVA_Build 10 28757357 32D AACCAATAAG ATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 21 het 8 0 8 3 AT 22 6 130947 CASAVA_Build 10 28769267 1D AGACTGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 11 10 130948 CASAVA_Build 10 28769755 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 37 22 15 0 T 6 5 130949 CASAVA_Build 10 28775438 1I TAAAAATATC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 8 9 130950 CASAVA_Build 10 28777578 4D TTAGTAATTC TCTA/---- TCTTTCTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TCTA 1 0 130951 CASAVA_Build 10 28795727 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2585 het 364 hom 24 2 11 11 A 15 14 130952 CASAVA_Build 10 28801245 1D TAAATAAAAG T/- CACTCCTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 0 130953 CASAVA_Build 10 28804118 2D TTTCTTTCTT CC/-- TTTTTTTTTT 1424 het 39 hom 14 1 9 4 C 2 0 130954 CASAVA_Build 10 28825715 1D AGATGGAATT G/- GGGAGATAGA 3070 hom 120 het 49 0 41 8 G 4 3 130955 CASAVA_Build 10 28829974 1D TTAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 10 9 130956 CASAVA_Build 10 28832539 3D TCCATCACAG TTT/--- TAAACATAAG 3070 hom 138 het 51 0 47 6 T 4 1 130957 CASAVA_Build 10 28839527 2D CTGTAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 16 14 130958 CASAVA_Build 10 28839878 1D CCAGAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 43 2 25 16 T 15 14 130959 CASAVA_Build 10 28853576 2D AAAACACTCT CA/-- GTCTTTACCA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 CA 1 0 130960 CASAVA_Build 10 28854378 3D AATGCATGTC GTT/--- GTTTTCAAAG 3070 hom 81 het 28 0 27 3 GTT 2 1 130961 CASAVA_Build 10 28860028 2I GCCAGTTTTC --/AA AAAGTTTCTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 3 5 130962 CASAVA_Build 10 28860777 20D ACCGCTGGGT ATGGAAAACGTTAGAAAGGG/-------------------- ATGGAAAACG 3070 hom 41 het 28 0 14 17 ATGGAAAACGTTAGAAAGGG 2 1 130963 CASAVA_Build 10 28864823 1I AATCCTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 10 11 130964 CASAVA_Build 10 28868508 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 626 hom 27 2 15 10 T 11 10 130965 CASAVA_Build 10 28872258 1D TTTTAGTATA T/- TTTATTTGAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 4 3 130966 CASAVA_Build 10 28878094 2D TCAGCCTCCC AA/-- AGTGCTGGGA 3070 hom 120 het 43 0 41 4 A 3 1 130967 CASAVA_Build 10 28882199 4I TGTTTACAAA ----/TAAT TTTTGTTTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TAAT 0 1 130968 CASAVA_Build 10 28884373 1D GTAAGGAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 42 0 30 13 T 10 9 130969 CASAVA_Build 10 28888072 12D AGAAACCTGA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 134 het 51 0 42 12 TG 14 8 130970 CASAVA_Build 10 28890433 1I CTTTTAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 10 11 130971 CASAVA_Build 10 28894042 1D TGAAATGTGC T/- TTTTTTCACT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 7 6 130972 CASAVA_Build 10 28902054 1I TACATGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 27 0 22 5 T 9 10 130973 CASAVA_Build 10 28903922 1D TTACATTAAT G/- GTACCTAGAG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 G 2 1 130974 CASAVA_Build 10 28908110 1I GGTAGATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 T 15 16 130975 CASAVA_Build 10 28916104 3D AAACTGGGAA ATT/--- ATTCATTTCA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 ATT 2 1 130976 CASAVA_Build 10 28923104 4D TGCTGCCCTT TTTG/---- TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TTTG 1 0 130977 CASAVA_Build 10 28924356 2D CATATGTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 12 10 130978 CASAVA_Build 10 28928023 1D ATTTGACATA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 8 7 130979 CASAVA_Build 10 28941628 1D TTTAAGTCTT C/- CCGTTTGTTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 3 2 130980 CASAVA_Build 10 28943407 14I AACTTGACTG --------------/TCTTCTTTAAAACA CCACATTTTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TCTTCTTTAAAACA 0 1 130981 CASAVA_Build 10 28949306 1D TTGCACCCTG T/- TAAGAATGGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 2 1 130982 CASAVA_Build 10 28958481 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2922 hom 29 het 14 0 7 7 T 15 14 130983 CASAVA_Build 10 28962833 1D TGTCAGACTG T/- TTCACGCGCT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 3 2 130984 CASAVA_Build 10 28964415 1I10M3I TAAATACATA -ATACATACAT---/CATACATACATAAG AAGAGGAGAC 3070 hom 111 het 37 0 37 3 N/A 0 0 130985 CASAVA_Build 10 28965466 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 67 het 24 0 21 6 A 22 9 130986 CASAVA_Build 10 28966346 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 4 het 30 1 28 1 A 9 10 130987 CASAVA_Build 10 28967600 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 9 130988 CASAVA_Build 10 28968489 1D ATTTTTAAGT G/- TATAGCACAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 0 130989 CASAVA_Build 10 28972067 1D CCCTTTACTT C/- CTGGCTGTGG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 2 1 130990 CASAVA_Build 10 28983344 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 690 hom 30 3 19 8 A 16 17 130991 CASAVA_Build 10 28996845 1D TCTATTAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 130992 CASAVA_Build 10 29011532 1D TGTTATTTGC T/- TTTAAAATTA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 4 3 130993 CASAVA_Build 10 29025909 2I TTCTTCTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 19 9 T 13 15 130994 CASAVA_Build 10 29028526 1D TGAGAGAGAG A/- AGAGAGAGAA 1745 hom 20 het 17 0 6 11 A 2 1 130995 CASAVA_Build 10 29030786 4D TCAGTAACTT CTAA/---- CTTCTAACAT 3070 het 3070 ref 38 23 15 1 CTAA 1 0 130996 CASAVA_Build 10 29041350 1D GTCCCCCTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 9 8 130997 CASAVA_Build 10 29042135 1I ATTTTTTGGT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 8 9 130998 CASAVA_Build 10 29056659 1I CGGACTAATA -/C ATGGAGCATG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 C 0 1 130999 CASAVA_Build 10 29058338 4I AAAAACAAAA ----/AAAC AAACAAAACA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AAAC 1 2 131000 CASAVA_Build 10 29064803 1I AGTAGCAGAT -/G GGGCCACAGT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 G 3 4 131001 CASAVA_Build 10 29066918 3D CATGCCTGGC GAA/--- GAAGTTGAAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 GAA 2 1 131002 CASAVA_Build 10 29068809 6D TCTCTCTCTC TCTCTG/------ TGTCTCACAC 230 het 230 ref 57 41 4 13 TCTCTG 1 0 131003 CASAVA_Build 10 29081757 1I CTACAGGTGC -/A TGCCACCATG 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 A 0 1 131004 CASAVA_Build 10 29086696 1D CACTAGCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2928 hom 31 13 12 6 T 13 12 131005 CASAVA_Build 10 29088261 1I TGCCTGTAAT -/C CCAGTACTTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 2 3 131006 CASAVA_Build 10 29089625 3I TATGGAATAA ---/TAT TATTATTTTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 TAT 2 3 131007 CASAVA_Build 10 29091234 1I ATAGGATATA -/T TTTTTCTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 5 6 131008 CASAVA_Build 10 29093316 1D CCAGATTGAT A/- ATGTCACTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 2 1 131009 CASAVA_Build 10 29101602 1D AATACTATAT A/- AAAAAAATAA 2489 het 962 hom 8 2 6 0 A 8 7 131010 CASAVA_Build 10 29102205 1I CCTTGTTTCT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 7 8 131011 CASAVA_Build 10 29105829 1D AACTCTGTTG A/- AAAAAAAAAA 2941 het 2941 ref 35 17 11 7 A 13 12 131012 CASAVA_Build 10 29106888 1D GAGACTGCTC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 129 het 48 0 41 7 A 9 8 131013 CASAVA_Build 10 29110227 1D CCTTCCTTTT G/- TAAGGACCCT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 G 1 0 131014 CASAVA_Build 10 29115704 1I GCTTCACAGG -/T TCTTTGAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 2 131015 CASAVA_Build 10 29116584 4I GTCCCACTTA ----/TAAG TAAGAACATG 3070 hom 123 het 45 0 39 6 TAAG 1 2 131016 CASAVA_Build 10 29122362 2D TCTAAATACG TA/-- TATATGTTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TA 3 2 131017 CASAVA_Build 10 29123087 1D14M13D CCATCTCTAC AAAAAAAAAAATATGTATATATATATTC/-AAAAAAAAAATATG------------- AATATATATA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 N/A 0 0 131018 CASAVA_Build 10 29125475 3D TTTTATTGTC GTT/--- GTTGTTGCTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 GTT 3 2 131019 CASAVA_Build 10 29127206 2I TAAAGTGTTT --/CC CCCCCCGACC 3070 hom 112 het 40 0 36 4 C 6 8 131020 CASAVA_Build 10 29128855 2D TGCCAAAGAC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 30 0 28 4 T 11 9 131021 CASAVA_Build 10 29132226 2D CCATCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 12 10 131022 CASAVA_Build 10 29132371 1D GGTCCAACCA G/- TCTTTCTTGC 3070 hom 107 het 39 0 35 4 G 1 0 131023 CASAVA_Build 10 29132773 3I TCATTTACTT ---/GTA GTGGTTTAGG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 GTA 0 1 131024 CASAVA_Build 10 29134559 1D GTCTTACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 34 0 20 14 T 13 12 131025 CASAVA_Build 10 29134955 2D GGCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 14 4 T 16 14 131026 CASAVA_Build 10 29139432 1I GCCTGGATTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 8 9 131027 CASAVA_Build 10 29140610 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGGGTTCA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 7 6 131028 CASAVA_Build 10 29141695 1I TGAAAGAAAG -/A AAAGAAAGAA 3070 hom 40 het 21 0 16 5 A 3 4 131029 CASAVA_Build 10 29142868 4I TTCATTTATG ----/TAGA TAGTGCCCTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAGA 0 1 131030 CASAVA_Build 10 29143896 4I TCACTTAAAT ----/AAAC CAATCTACAT 3070 hom 91 het 34 0 31 3 AAAC 0 1 131031 CASAVA_Build 10 29144311 1D11M1I AGCAAGATTT AACTGCAAAGAG-/-ACTGCAAAGAGC AAAAGAACAA 2648 hom 24 het 9 0 7 2 N/A 0 0 131032 CASAVA_Build 10 29147477 1D ACATTTCCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 101 het 40 0 33 7 A 10 9 131033 CASAVA_Build 10 29149854 2I TTTTAGAGTC --/AG GGGGTGTACG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 AG 0 1 131034 CASAVA_Build 10 29150601 2D CAAAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 29 0 25 4 A 14 12 131035 CASAVA_Build 10 29152548 1I CAAATATAAC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 68 het 42 1 36 5 T 6 7 131036 CASAVA_Build 10 29157431 1I GACCCTGGGG -/A TAGAGCAGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 0 1 131037 CASAVA_Build 10 29160733 1I GTGATAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 24 8 T 11 12 131038 CASAVA_Build 10 29166616 5I AGGACAGGAA -----/AGGAG AGGAGAGGAG 3070 hom 63 het 28 0 20 8 AGGAG 3 4 131039 CASAVA_Build 10 29171227 1I CTCTGTCAAT -/A AAAGCAAATT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 3 4 131040 CASAVA_Build 10 29172680 1I ATTGGAGCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 10 11 131041 CASAVA_Build 10 29173955 3D TTTTGGAAAG ATT/--- ATTATCTATG 3070 het 3070 ref 31 16 12 7 ATT 2 1 131042 CASAVA_Build 10 29175189 1I TGGAAGTTAG -/A TTTGGGATGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 0 1 131043 CASAVA_Build 10 29181509 1D TAATAAACGG T/- TTACCTTTGC 3070 hom 138 het 49 0 47 3 T 3 2 131044 CASAVA_Build 10 29188788 3I CGTGGCTGGC ---/CCT CCTCATATCT 3070 hom 71 het 28 0 24 4 CCT 1 2 131045 CASAVA_Build 10 29190527 1I TTTGAGATGA -/T AGAAAATTCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 131046 CASAVA_Build 10 29193196 32D CTAAACTGTG ATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AT 21 5 131047 CASAVA_Build 10 29193932 2D CAGGGTCTCA CT/-- CTGTTGCCCA 3070 hom 83 het 34 0 25 10 CT 2 1 131048 CASAVA_Build 10 29195277 1I AATGTTAGAA -/T TTTTTTGGAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 6 7 131049 CASAVA_Build 10 29201985 1D TCATACTGCT C/- CCTGTAGATC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 C 3 2 131050 CASAVA_Build 10 29202331 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACGT 3070 hom 63 het 29 0 22 8 AC 5 4 131051 CASAVA_Build 10 29205529 1D GTAAAGCAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 32 0 21 11 A 9 8 131052 CASAVA_Build 10 29206175 1I GTTCTGCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 28 2 14 12 T 13 14 131053 CASAVA_Build 10 29217322 34D CACACACACA CACACACACACACACACACACACACACACACACG/---------------------------------- GTGAGACCCT 3070 hom 49 het 14 0 14 12 CACACACACACACACACACACACACACACACACG 1 0 131054 CASAVA_Build 10 29221463 4I44M5I AAATTAAACG ----TTTAACTAATATTAAACCACATGTCTGATTGTGCAAAGCATTTC-----/TTTCTTTAACTAATATTAAACCACATGTCTGATTGTGCAAAGCATTTCATTTT GAGGCTAATC 3070 het 3070 ref 43 36 28 8 N/A 0 0 131055 CASAVA_Build 10 29226342 4I AAACAAACAA ----/ACAG AAAACAGAAA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 ACAG 0 1 131056 CASAVA_Build 10 29227634 2D ATGTTTATAA AT/-- ATATGATAGA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 AT 3 2 131057 CASAVA_Build 10 29229319 1D ACTTCTTTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 10 9 131058 CASAVA_Build 10 29230159 1I AAAAAGTGAC -/A ACAGTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 A 1 2 131059 CASAVA_Build 10 29244467 4D ATAAGGTCTT TGTC/---- TGTCACCCAC 3070 het 3070 ref 24 15 8 2 TGTC 2 1 131060 CASAVA_Build 10 29256096 1D TGAGCCTGTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 T 8 7 131061 CASAVA_Build 10 29264039 1I TAAAGAGTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 9 10 131062 CASAVA_Build 10 29269086 1D CTTGGCGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2304 hom 37 14 13 10 T 12 11 131063 CASAVA_Build 10 29270673 12D ATTATAGATT CAAAGGAAGTTG/------------ CAAAGGAAGT 3070 hom 72 het 27 0 25 5 CAAAGGAAGTTG 2 1 131064 CASAVA_Build 10 29276849 1I CTTTAGCCCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 8 9 131065 CASAVA_Build 10 29278231 1D GCTTGCATCA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 8 7 131066 CASAVA_Build 10 29279763 1D AGAGTAGCAC T/- GGCTTTTATA 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 T 1 0 131067 CASAVA_Build 10 29281361 1I CAAAGAGATG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 7 8 131068 CASAVA_Build 10 29281750 1I CTAAAGGTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 A 9 10 131069 CASAVA_Build 10 29282857 1D AAACTCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 134 hom 31 1 22 8 A 15 14 131070 CASAVA_Build 10 29284263 1D CTTAAAGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 10 9 131071 CASAVA_Build 10 29284774 1D CTTAAAAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 764 hom 36 2 21 13 A 10 9 131072 CASAVA_Build 10 29291306 2D ATTCTTTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 13 11 131073 CASAVA_Build 10 29292669 1I AGAAGGCTTC -/T TACAGTGTTT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 1 2 131074 CASAVA_Build 10 29293188 1D ACTTGGGCAA G/- TAACCAGCGC 3070 het 3070 hom 73 28 31 15 G 1 0 131075 CASAVA_Build 10 29301827 1D CAACAGACTG A/- AAGGCATGTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 7 A 3 2 131076 CASAVA_Build 10 29302371 1D AATTTTAACA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 T 9 8 131077 CASAVA_Build 10 29305848 1I GCTTGAAGTA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 T 7 8 131078 CASAVA_Build 10 29310577 3D TGCAAACTGA TGG/--- TGGCTTTATG 3070 hom 87 het 37 0 28 10 TGG 2 1 131079 CASAVA_Build 10 29323022 2D TGTTATTGTG AT/-- ATGTTATGAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 AT 2 1 131080 CASAVA_Build 10 29327273 1I GGCTCTTGAC -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 A 6 7 131081 CASAVA_Build 10 29329325 1I TGTAGGTTTC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 T 7 8 131082 CASAVA_Build 10 29341315 2D TCCTTTAAAC AA/-- AAGTTCAATG 2149 het 2149 ref 13 6 5 2 A 4 2 131083 CASAVA_Build 10 29347289 1I AAATAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 154 hom 35 2 28 5 A 10 11 131084 CASAVA_Build 10 29347739 1I ATGAGTGGAT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 7 8 131085 CASAVA_Build 10 29356982 2D CTAATTTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 2617 het 77 hom 12 1 6 5 T 12 10 131086 CASAVA_Build 10 29361274 1D AAAAAAGAAA G/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 36 22 14 0 G 1 0 131087 CASAVA_Build 10 29362326 1I ATGAACAGTG -/A AAAAAACTCC 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 A 6 7 131088 CASAVA_Build 10 29379441 2D ACAAACAGGA TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 8 131089 CASAVA_Build 10 29380287 1I AAAAGAAATC -/T GGTGAAACCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 0 1 131090 CASAVA_Build 10 29383061 1I GTGTGTGCAA -/G GGGACTTCAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 3 4 131091 CASAVA_Build 10 29401775 1I TTAAAGCAGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 8 9 131092 CASAVA_Build 10 29403308 2I CCTGGGTGAC --/GA GAGAGAGATT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 GA 4 5 131093 CASAVA_Build 10 29403428 1I AATTTACAGA -/G GTTGCTAAGA 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 G 1 2 131094 CASAVA_Build 10 29403521 1D AATCCCCCCC T/- ATCACATAAC 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 T 1 0 131095 CASAVA_Build 10 29408536 9D CTTCATTTAT GAGAATGAA/--------- GGTAAGATGT 3070 het 3070 hom 53 24 25 7 GAGAATGAA 1 0 131096 CASAVA_Build 10 29414410 14D GAGGAAGATC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 2101 het 1521 hom 21 8 8 5 T 28 14 131097 CASAVA_Build 10 29417977 5D AAAAAAAAGA AAAAG/----- AAAAGTTAAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 AAAAG 2 1 131098 CASAVA_Build 10 29419619 13I CTCTAGCTCT -------------/ATCTCTCTCTCCC ATCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 45 17 17 11 ATCTCTCTCTCCC 1 2 131099 CASAVA_Build 10 29419941 1D AAATTAGGAA G/- TAACTAAACT 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 G 1 0 131100 CASAVA_Build 10 29420730 1I GCCTGTCCCA -/G GTTCCACTCC 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 G 1 2 131101 CASAVA_Build 10 29427170 17D GCCTCCCAAA GTGCTGGGATTACAGGC/----------------- GTGCTGGGAT 3070 hom 36 het 14 0 13 2 GTGCTGGGATTACAGGC 2 1 131102 CASAVA_Build 10 29427877 4D TACAGCATCT GTTG/---- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 GTTG 1 0 131103 CASAVA_Build 10 29457000 1D CTCCTTGCTT C/- GAGTTGCCCC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 C 1 0 131104 CASAVA_Build 10 29457746 4I AAGTCAGAAA ----/GTCT GTCTGCCTAT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 GTCT 1 2 131105 CASAVA_Build 10 29458832 1I AATTTTTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 9 10 131106 CASAVA_Build 10 29461828 1D16M5D9M7D3M4D AGCAAGGGGA GGGTGTGGCTCCCAAACGTCCTCTTCCTCTTCCCATCAGCTCACA/-CGTTTGGGAGCCACAC-----CCTCCCCTT-------GCT---- CTGACTGGCA 3070 het 788 hom 26 7 30 0 N/A 0 0 131107 CASAVA_Build 10 29462568 8D AAGCACTTTC TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 3070 het 164 hom 23 5 12 8 TGTT 10 8 131108 CASAVA_Build 10 29465419 5D AACAGCATGC TTCTT/----- TTCTTCTCTT 3070 het 3070 ref 28 14 13 4 TTCTT 2 1 131109 CASAVA_Build 10 29478754 1D AAAAGAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 5 A 10 9 131110 CASAVA_Build 10 29484081 1D AGTTAAGGAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 9 8 131111 CASAVA_Build 10 29490354 18D AATATATATA TGTGTGTGTGTGTGTGTG/------------------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 17 11 14 1 TG 16 7 131112 CASAVA_Build 10 29502138 2I TTGTGAGACT --/TA TATTCACTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TA 1 2 131113 CASAVA_Build 10 29510953 6D TCTTCTCTAA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AT 10 7 131114 CASAVA_Build 10 29511524 1D TTTTCAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 18 0 A 13 12 131115 CASAVA_Build 10 29514904 1D TAGAGGCAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 9 8 131116 CASAVA_Build 10 29523969 1D GAAGACACTC T/- TTTTTTTTTT 2680 het 2680 ref 41 24 7 11 T 13 12 131117 CASAVA_Build 10 29541944 1I TAGAACTGCA -/C CATCAGCTCT 3070 het 3070 ref 56 28 22 6 C 1 2 131118 CASAVA_Build 10 29561977 1I GGTTTTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 10 11 131119 CASAVA_Build 10 29569788 3I AAAGAAATTG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 12 15 131120 CASAVA_Build 10 29570791 3D37M6I GGAAAAAGAA AAGAAAGGGGGGCAGAAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGAGAG------/---AAAGGGGGGCAGAAGGAAGGAAGGGAAGGGAAGAGAGAAAGAA AGAGAAAGAA 2664 het 2664 ref 35 28 8 6 N/A 0 0 131121 CASAVA_Build 10 29573653 1I GGAAAAAAAA -/G GAGTCAGGCT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 G 1 2 131122 CASAVA_Build 10 29581576 2D CAGAGAAAGA CT/-- CTCTCTCTCT 894 het 894 ref 48 35 3 10 CT 9 8 131123 CASAVA_Build 10 29583212 20D ACAGGAGGAG GAGGAAGAGGAGGAGAGGGA/-------------------- GAAGAGGAGG 3070 het 2493 hom 26 10 15 5 GAGGAAGAGGAGGAGAGGGA 1 0 131124 CASAVA_Build 10 29587392 2D CAGATGGACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 12 10 131125 CASAVA_Build 10 29587611 1I3M1D AGAGAGAGAG -GAGA/AGAG- GAGAGAGAGA 1073 het 1073 ref 22 11 8 4 N/A 0 0 131126 CASAVA_Build 10 29603231 2D GTAAAATAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1876 hom 23 7 9 7 AT 8 7 131127 CASAVA_Build 10 29611127 1D GCCCAACCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 A 10 9 131128 CASAVA_Build 10 29616675 1D TGTAAATGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 19 16 6 T 9 8 131129 CASAVA_Build 10 29617750 4I GTTTGCAGAC ----/TGTT GCCTCAGAGA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 TGTT 0 1 131130 CASAVA_Build 10 29618187 16I ATTACTCTTA ----------------/TGAAGCCAACTGTCTC TGAGAACCAG 2148 het 2148 ref 27 18 6 3 TGAAGCCAACTGTCTC 0 1 131131 CASAVA_Build 10 29620482 2I TAGAAATCCT --/AA AAAAATGCCC 2913 het 900 hom 12 5 6 1 A 5 7 131132 CASAVA_Build 10 29651126 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 901 hom 30 7 9 14 T 15 14 131133 CASAVA_Build 10 29662381 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 419 hom 34 1 28 5 T 9 10 131134 CASAVA_Build 10 29674426 1I TGTCAGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 10 11 131135 CASAVA_Build 10 29680967 1I ATCAATGTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 9 10 131136 CASAVA_Build 10 29691488 1I ATGGTGTACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 9 10 131137 CASAVA_Build 10 29694744 1I GCACCTCATC -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 99 het 35 0 32 3 T 6 7 131138 CASAVA_Build 10 29696548 2I TAACACTCAC --/TG TGTGAGGGTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TG 2 3 131139 CASAVA_Build 10 29698265 2I TAGAGGGAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 A 12 14 131140 CASAVA_Build 10 29700212 2D TGTTTTGTAG AT/-- AAAGTATTTG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AT 1 0 131141 CASAVA_Build 10 29701312 2D TTATAACATG CC/-- CTGCCTTATT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 C 3 1 131142 CASAVA_Build 10 29702573 2D TGTCTCTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 11 0 10 2 AT 9 8 131143 CASAVA_Build 10 29705958 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2768 het 2768 ref 24 14 9 3 A 12 11 131144 CASAVA_Build 10 29715400 1D CCATCAGAGC G/- GGGAAAGATG 3070 hom 117 het 44 0 38 6 G 4 3 131145 CASAVA_Build 10 29721363 1I TTTTTTTATC -/T TTGAGCAAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 3 131146 CASAVA_Build 10 29812557 1I57M3I ATCACATAGA -TTTTATGCTTTAGCTTGTTCTTTTTTCCTTTGCTATACCAAATAAAATCTTCTGAGC---/TTTTTATGCTTTAGCTTGTTTTTTTTTCCTCTGCTATACCAAATAAAATCTTTTGAGCTGT TGTAGTTCCA 2634 het 2634 ref 39 49 6 5 N/A 0 0 131147 CASAVA_Build 10 29823848 2I CCAGTAGGTA --/TG CCTTTGTTAT 1631 het 1631 ref 34 25 4 5 TG 0 1 131148 CASAVA_Build 10 29823991 5D TTCTGATCAG AAACT/----- GCTTGGCGTG 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 AAACT 1 0 131149 CASAVA_Build 10 29841104 1D TTTCGCATAT G/- AAATGCTTGC 3070 het 3070 ref 53 42 8 4 G 1 0 131150 CASAVA_Build 10 29864195 2D GAGATGAGCC AG/-- TGTTGGAGGT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 AG 1 0 131151 CASAVA_Build 10 29922664 2D CACCATACAC AT/-- GTTAAGAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 AT 1 0 131152 CASAVA_Build 10 29923495 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1165 hom 23 6 8 9 T 15 14 131153 CASAVA_Build 10 29932024 1I GAAACTCGAG -/C ACTCCTTCCC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 C 0 1 131154 CASAVA_Build 10 29932464 5I TCCCAAGAAT -----/TATGA TATAATTTAT 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 TATGA 0 1 131155 CASAVA_Build 10 29933850 1D TGTACAGTAT G/- GGGAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 G 4 3 131156 CASAVA_Build 10 29948570 2I TAAAGGCCAG --/CA CACACACATA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 CA 4 5 131157 CASAVA_Build 10 29956163 10D ACCTTGAACT ACTACCTTCC/---------- AGATACAAGG 3070 het 3070 ref 30 17 13 5 ACTACCTTCC 1 0 131158 CASAVA_Build 10 29960359 3I TGGGCAGATC ---/ATG ATGAGGTCAG 3070 het 3070 hom 25 9 9 7 ATG 1 2 131159 CASAVA_Build 10 29961776 4D ATTATCTTTA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 16 23 9 AC 11 9 131160 CASAVA_Build 10 29962599 1D AGAAATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 12 11 131161 CASAVA_Build 10 29967402 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1675 het 1675 ref 22 16 5 1 A 13 12 131162 CASAVA_Build 10 29977751 1I GACAGCTGGG -/A AAAAAAAAAA 2686 het 2686 ref 38 10 8 20 A 13 14 131163 CASAVA_Build 10 29978605 2D GCATGGGCGT AC/-- ACACACACAC 2011 het 2011 ref 47 27 5 15 AC 8 7 131164 CASAVA_Build 10 29993627 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 2629 hom 34 9 15 10 AC 8 9 131165 CASAVA_Build 10 29999592 4I GTTCAGGAAA ----/CTCT CTCTGAGTTT 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 CT 2 4 131166 CASAVA_Build 10 30001697 1D ATTTTAGCAC T/- GCTATTCCAT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 1 0 131167 CASAVA_Build 10 30016833 1I CAGTCACTAA -/T TTTGGTTATC 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 T 3 4 131168 CASAVA_Build 10 30023401 1I CAAAATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 10 11 131169 CASAVA_Build 10 30031252 1I35M3I ATATTCAAAG -AAAAAAAATCCACATTCAACAGTGCAACCAGAGTC---/AAAAAAAAATCCACATTCAACAGTGCAACCAGAGTCTTT TTACAGCATT 3070 het 3070 ref 36 27 14 6 N/A 0 0 131170 CASAVA_Build 10 30031639 1D AGCTCACAGA C/- CTTTGACCTT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 2 1 131171 CASAVA_Build 10 30034417 1D ACTTCAAATC T/- TTTTTTTTTT 1974 het 1974 ref 49 35 5 10 T 12 11 131172 CASAVA_Build 10 30045136 4D AATATTTTAC ACAG/---- ACAGCACAAG 3070 het 3070 ref 29 18 9 4 ACAG 2 1 131173 CASAVA_Build 10 30046236 2D TCACAGATAT CA/-- CACACTATAT 2871 het 2871 ref 18 8 8 2 CA 3 2 131174 CASAVA_Build 10 30060112 1I CCTCATACTT -/G GAAGTATTTG 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 G 1 2 131175 CASAVA_Build 10 30061137 3D TCCCTCTCTG TCC/--- TCCTGTCCAT 3070 het 3070 ref 61 32 27 3 TCC 2 1 131176 CASAVA_Build 10 30070791 1D ATGCTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 2774 het 1995 hom 21 5 8 9 A 12 11 131177 CASAVA_Build 10 30081896 4I ATACATTGTT ----/TAAC TATAAGGTAA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 TAAC 0 1 131178 CASAVA_Build 10 30085750 1D CAGATGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 11 10 131179 CASAVA_Build 10 30128045 2D GGAAAGGGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2610 hom 33 12 13 8 T 16 14 131180 CASAVA_Build 10 30132650 1D AGAGGAAGGG A/- AAGGGGCAGG 3070 het 3070 ref 45 24 16 8 A 3 2 131181 CASAVA_Build 10 30134131 2D GCAGAGTTTA GT/-- GTGTAGCATG 3070 het 3070 ref 46 21 15 10 GT 3 2 131182 CASAVA_Build 10 30135842 1D TAGAACTTTA C/- ACATGACTTA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 C 1 0 131183 CASAVA_Build 10 30139082 1D GTTTATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 12 11 131184 CASAVA_Build 10 30141630 4D CTTTTTTTGT TTTG/---- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 TTTG 2 1 131185 CASAVA_Build 10 30141796 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTATTT 3070 het 2038 hom 20 5 13 3 T 7 6 131186 CASAVA_Build 10 30143396 10D GTCAATAAGG CTTTTTTTTT/---------- CTTTTTTTTT 3070 het 2661 hom 33 8 18 7 CTTTTTTTTT 2 1 131187 CASAVA_Build 10 30149405 1D AGCCTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 2512 het 1934 hom 23 8 8 7 T 15 14 131188 CASAVA_Build 10 30169278 4D CCAGGGCTAG AGGA/---- AGGAAGGCTA 3070 het 3070 ref 34 13 12 10 AGGA 2 1 131189 CASAVA_Build 10 30186348 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 719 het 151 hom 13 3 5 5 A 19 18 131190 CASAVA_Build 10 30198778 4I AACCTCAAAC ----/TGGT TGGTCTCTTA 3070 het 3070 hom 46 13 26 7 TGGT 1 2 131191 CASAVA_Build 10 30203140 1D ATCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 C 1 0 131192 CASAVA_Build 10 30217635 1I GTTGAGGGAG -/C CCCCTTTGTA 3070 het 3070 hom 50 18 27 5 C 4 5 131193 CASAVA_Build 10 30241044 1D ACATGTTTGT C/- CTATGGCTTG 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 C 2 1 131194 CASAVA_Build 10 30266212 1D TCCCTCTCCC A/- ATCCACTCAC 3070 hom 90 het 34 0 30 6 A 2 1 131195 CASAVA_Build 10 30267476 6I GATATAGAGC ------/TACTTT TAAAAGTAGC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TACTTT 0 1 131196 CASAVA_Build 10 30277235 2D TTGTAGAGAC AG/-- AGTCTCTCTA 3070 het 3070 ref 22 14 8 1 AG 2 1 131197 CASAVA_Build 10 30278915 1D TGGTTTCCTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 9 8 131198 CASAVA_Build 10 30280135 1I ATAAAAAAAA -/T TCACTACTTC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 1 2 131199 CASAVA_Build 10 30282048 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAGA 2080 het 2080 ref 21 14 5 3 A 9 8 131200 CASAVA_Build 10 30297040 3I AAGGGAATCC ---/ATA ATAATGAACA 3070 het 3070 hom 53 18 29 6 ATA 1 2 131201 CASAVA_Build 10 30315155 1D AGATGATCCA C/- CCCCCTCAGC 2789 het 1204 hom 13 5 6 2 C 6 5 131202 CASAVA_Build 10 30326434 1I TCATGTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 17 16 14 T 11 12 131203 CASAVA_Build 10 30335978 1I GCACGGGCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 10 131204 CASAVA_Build 10 30350079 1I ACAGTCCCCT -/G GGCTCTTTCT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 2 3 131205 CASAVA_Build 10 30351350 3D ATGAGGATTC TTA/--- TGTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 TTA 1 0 131206 CASAVA_Build 10 30365386 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 13 12 131207 CASAVA_Build 10 30366581 1D TTTTGTTATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 A 9 8 131208 CASAVA_Build 10 30431771 1D ATCGTGGCAG A/- AGGCAAATGA 1912 het 1912 ref 27 16 6 5 A 2 1 131209 CASAVA_Build 10 30446259 1I AATAAGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 11 12 131210 CASAVA_Build 10 30449410 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2682 hom 19 7 9 3 A 8 9 131211 CASAVA_Build 10 30458381 1D CGTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1635 het 476 hom 32 5 7 20 T 19 18 131212 CASAVA_Build 10 30463913 2I TGCATGTGTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 54 25 20 9 CA 8 9 131213 CASAVA_Build 10 30464068 1I TATTATTATG -/T GTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 1 131214 CASAVA_Build 10 30466583 5I ACTGGAACAT -----/TAAAC TAAATGTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAAAC 0 1 131215 CASAVA_Build 10 30468434 1D GTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 13 12 131216 CASAVA_Build 10 30470033 1I TTCCTTTTCC -/A GTGACTTTAG 3070 hom 92 het 35 0 30 5 A 0 1 131217 CASAVA_Build 10 30475275 1I ACTTAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 9 10 131218 CASAVA_Build 10 30478896 3D GGAGTATTAA AGT/--- CCCCCACTAT 3070 het 3070 hom 27 13 11 4 AGT 1 0 131219 CASAVA_Build 10 30480427 1I TTAAATAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 22 0 13 9 T 12 13 131220 CASAVA_Build 10 30482214 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 214 hom 55 1 45 9 T 9 10 131221 CASAVA_Build 10 30483409 1D CAGTGGGACT G/- GGATTGGGGG 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 G 3 2 131222 CASAVA_Build 10 30499843 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 33 2 23 8 A 13 14 131223 CASAVA_Build 10 30503757 1I CACTTTGTTG -/C CCCAGGCTGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 3 4 131224 CASAVA_Build 10 30508486 1I ATTCCTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 11 12 131225 CASAVA_Build 10 30509804 2I AACATGCACT --/CA CACACACACA 3070 hom 78 het 37 0 26 11 CA 8 9 131226 CASAVA_Build 10 30510003 1I AAAAACACCC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 8 9 131227 CASAVA_Build 10 30511419 2D TGTAAGACTC AG/-- GACACGGGAA 3070 hom 68 het 25 0 22 4 AG 1 0 131228 CASAVA_Build 10 30511644 2I CTGGCGTCTC --/CT CTCGCATGTC 3070 hom 62 het 26 0 20 6 CT 1 2 131229 CASAVA_Build 10 30531233 2D GTCTGTTGTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 21 0 15 8 TA 6 5 131230 CASAVA_Build 10 30532416 3D TTAATTCTAA TAG/--- TAGGCTTACT 3070 hom 92 het 35 0 31 5 TAG 2 1 131231 CASAVA_Build 10 30532731 1I ACTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 40 2 32 6 A 10 11 131232 CASAVA_Build 10 30535161 1D AACTAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 10 9 131233 CASAVA_Build 10 30538442 1I AAAACTAAAG -/T TTTTAGGAAG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 4 5 131234 CASAVA_Build 10 30541912 2D TGGAACAGCA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 142 het 54 0 51 5 AG 7 6 131235 CASAVA_Build 10 30546636 2D GGTTACAGGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 AT 7 6 131236 CASAVA_Build 10 30560989 1D CTCCTGCCTC A/- AGCCTCCTGA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 2 1 131237 CASAVA_Build 10 30561205 1D AAGTTTGCCC T/- GCTAACTTCA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 1 0 131238 CASAVA_Build 10 30565444 8D ATTGAAAAGT AGCCACAG/-------- AGCCACAGAA 3070 hom 39 het 15 0 12 3 AGCCACAG 2 1 131239 CASAVA_Build 10 30573489 1D TTACAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 540 hom 31 4 18 9 A 14 13 131240 CASAVA_Build 10 30578922 1I TGTGGGCGGT -/G GGGGGGGAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 G 7 8 131241 CASAVA_Build 10 30582671 1I GAATGTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 451 hom 35 3 23 9 T 13 14 131242 CASAVA_Build 10 30585752 1D TTTATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 11 10 131243 CASAVA_Build 10 30590531 1I AACAAAAACT -/A ATGAAATGGA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 1 2 131244 CASAVA_Build 10 30593747 2I TTGAAGAGGA --/TG CACACAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TG 0 1 131245 CASAVA_Build 10 30596512 1D AAACTCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 226 hom 43 2 21 20 A 16 15 131246 CASAVA_Build 10 30599570 2D GAAACACTCC AA/-- GAGTATAAGA 3070 hom 96 het 33 0 33 2 A 2 0 131247 CASAVA_Build 10 30600205 1I TAATCCGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 721 hom 26 5 16 5 A 15 16 131248 CASAVA_Build 10 30603859 4D CAGAAATCAT AACA/---- AACAGCCTCT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 AACA 2 1 131249 CASAVA_Build 10 30620483 2D ACACACACAC AT/-- GCATGTGCAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 AT 1 0 131250 CASAVA_Build 10 30620990 1I AAAAAAACAC -/T TTTTTTTTTT 2092 het 2092 ref 22 8 7 7 T 11 12 131251 CASAVA_Build 10 30626797 1I ATTTCAGCGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 11 131252 CASAVA_Build 10 30633541 4I AGAAAGAGAA ----/AGAG AGAGAGAAAG 3070 hom 50 het 24 0 17 7 AG 3 5 131253 CASAVA_Build 10 30634651 4D CCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 60 het 22 0 19 5 AAAC 5 4 131254 CASAVA_Build 10 30644158 1I TTATTTTAAC -/A AAAGAGTCCA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 3 4 131255 CASAVA_Build 10 30653926 2D ACTATGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 11 12 A 13 11 131256 CASAVA_Build 10 30658906 1I TTTTTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 A 10 11 131257 CASAVA_Build 10 30669441 5D TCTAACATAC TATTT/----- TAGCTCATAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 TATTT 1 0 131258 CASAVA_Build 10 30669854 1I ACTCCATGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 9 10 131259 CASAVA_Build 10 30676833 2D CCCGAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 12 10 131260 CASAVA_Build 10 30680072 1I CAGTAGGTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 197 hom 28 1 23 4 T 9 10 131261 CASAVA_Build 10 30680385 1D AAAGTAGCTA T/- TTTTATAGAA 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 T 5 4 131262 CASAVA_Build 10 30684536 1I AAGGGACTCA -/C TTGTTGCCCA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 C 0 1 131263 CASAVA_Build 10 30690383 1I TTTCTCTACT -/C CCCCTCCCCC 3070 het 3064 hom 28 9 11 8 C 4 5 131264 CASAVA_Build 10 30690670 4I TTGCAATCTT ----/TAAA TAGGTATTTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 TAAA 0 1 131265 CASAVA_Build 10 30692021 3I GCATAAACTT ---/CTC CTTGATTTTC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 CTC 0 1 131266 CASAVA_Build 10 30696143 2D GTTTTGCGAC AG/-- AGTGTCACTC 3070 het 3070 ref 24 15 7 4 AG 2 1 131267 CASAVA_Build 10 30701952 6I GAAGAAGCAG ------/ACATAA ACAGGCTGAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 ACATAA 0 1 131268 CASAVA_Build 10 30703678 2I GTGTATACTT --/TA TATATATATA 2805 het 2273 hom 20 8 7 5 TA 6 7 131269 CASAVA_Build 10 30712761 1I TCTTGCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 A 10 11 131270 CASAVA_Build 10 30723270 2D AAGTGGAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 27 1 12 14 T 16 14 131271 CASAVA_Build 10 30726195 5I ATAGTAAAAA -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 het 2299 hom 24 6 12 6 AAAAT 3 4 131272 CASAVA_Build 10 30728223 1I CTAGTAAGAC -/A ACCAGGCAGG 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 A 1 2 131273 CASAVA_Build 10 30743827 1D30M2D GTGTTACATC TGATATATATTTTATGTAACAATATATAAACAT/-GATATATATTTTATGTAACAATATATAAAC-- GTGTAATATG 3070 hom 60 het 20 0 21 4 N/A 0 0 131274 CASAVA_Build 10 30753960 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 18 2 11 5 A 17 16 131275 CASAVA_Build 10 30757857 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 T 13 12 131276 CASAVA_Build 10 30758584 1D CTGTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 841 hom 18 2 12 5 A 13 12 131277 CASAVA_Build 10 30759009 1I CATATCAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 27 1 22 4 A 10 11 131278 CASAVA_Build 10 30765743 1I TACTGAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 32 1 24 7 T 11 12 131279 CASAVA_Build 10 30775006 1I AAGTTTTAAA -/C AAAATAGAAA 3070 hom 77 het 33 0 25 9 C 0 1 131280 CASAVA_Build 10 30783321 4D TACAAAAAGT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 123 het 45 0 41 5 AAAC 4 3 131281 CASAVA_Build 10 30788596 1I CAGAAGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 T 11 12 131282 CASAVA_Build 10 30795190 1D TGCCTAGGTA T/- TTTTTTTTTT 1255 het 1255 ref 33 24 4 5 T 13 12 131283 CASAVA_Build 10 30797328 1D CTATATTTTT G/- TTTGTTTTGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 1 0 131284 CASAVA_Build 10 30804070 1D AAAATTAAGA T/- TTATTTTTCT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 3 2 131285 CASAVA_Build 10 30809856 21I CCAGGAAATG ---------------------/TGTGTGTTATGACCACACATT TGTGTGTTAT 3070 hom 57 het 20 0 20 4 TGTGTGTTATGACCACACATT 0 1 131286 CASAVA_Build 10 30809996 1I AAACAAAACC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 131287 CASAVA_Build 10 30814048 1D GAATGCCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 10 10 6 T 10 9 131288 CASAVA_Build 10 30819118 3I TTTTTTTCTT ---/CTC CTTTTTAGAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CTC 0 1 131289 CASAVA_Build 10 30820011 1D CTCCGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 19 8 A 11 10 131290 CASAVA_Build 10 30832245 1I ATCAACCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1112 hom 35 5 24 6 T 13 14 131291 CASAVA_Build 10 30832603 1D CCCCCTCCTA C/- CCACTCTTAT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 C 3 2 131292 CASAVA_Build 10 30846196 1D GAGCCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 33 3 18 12 T 17 16 131293 CASAVA_Build 10 30858028 1I CCCTGTCTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 118 hom 22 1 21 0 A 8 9 131294 CASAVA_Build 10 30878390 36D TTCTTTTTTA TTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT/------------------------------------ TATTTATTTA 2272 het 116 hom 12 3 5 4 TTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATT 1 0 131295 CASAVA_Build 10 30878922 1D GTAATGTGAT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 A 8 7 131296 CASAVA_Build 10 30880395 13I GTAGAGATGA -------------/GGTCTTACTGTGC GGTCTTACTG 3070 het 3070 hom 31 9 12 10 GGTCTTACTGTGC 1 2 131297 CASAVA_Build 10 30880813 1I TTACATTGTA -/T TAATAATGTA 1755 het 1755 ref 29 20 5 4 T 1 2 131298 CASAVA_Build 10 30890181 1I GGTCTTTCCA -/T TGCACACTGC 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 1 2 131299 CASAVA_Build 10 30892032 1I AACAGCTGAA -/C AGGTGTGAAC 3070 hom 104 het 41 0 34 7 C 0 1 131300 CASAVA_Build 10 30896188 3I TTCTTGGTGG ---/TGT TCTTGAAAGC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TGT 0 1 131301 CASAVA_Build 10 30900114 2D TGTAATTATT TA/-- TACTTATACT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TA 2 1 131302 CASAVA_Build 10 30901043 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 25 0 18 7 A 10 11 131303 CASAVA_Build 10 30902616 1D TAATTAACCT A/- AAAAAAATGC 2294 het 2294 ref 20 11 7 3 A 8 7 131304 CASAVA_Build 10 30904959 1D ATCATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 1218 het 1218 ref 29 10 8 11 A 17 16 131305 CASAVA_Build 10 30907821 1D GTGCTTTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 T 10 9 131306 CASAVA_Build 10 30919046 4D CAAGGGACTT AAAC/---- AAATTTGTAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 7 AAAC 1 0 131307 CASAVA_Build 10 30919137 1D AAAACAAGTG A/- AAAAAACCTC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 7 6 131308 CASAVA_Build 10 30919899 1I TTAAAAGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2299 hom 24 8 9 7 A 10 11 131309 CASAVA_Build 10 30922989 1I CAACCCTCCC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 44 26 10 8 T 7 8 131310 CASAVA_Build 10 30926062 1I ATCACCTTTT -/A AAATGAAAGA 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 A 3 4 131311 CASAVA_Build 10 30926977 1D GATCCCCCCC G/- GGGACTTAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 G 4 3 131312 CASAVA_Build 10 30929601 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTCTAG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 6 7 131313 CASAVA_Build 10 30930985 1I ATCCTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 1343 het 1343 ref 11 5 4 2 T 11 12 131314 CASAVA_Build 10 30932838 1D AGGTGGGTGA C/- CCCGATGCTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 C 4 3 131315 CASAVA_Build 10 30934672 22D CCCCTCCTCT GCTATTATCCCTCCCCTTCTCC/---------------------- GCTATTTTCT 1873 het 1873 ref 24 20 5 1 GCTATTATCCCTCCCCTTCTCC 1 0 131316 CASAVA_Build 10 30936654 1I ACCCAGGATT -/C CCTCCCAGAT 3070 het 3070 hom 54 18 26 10 C 2 3 131317 CASAVA_Build 10 30939058 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 12 11 131318 CASAVA_Build 10 30940638 4D AAAGAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 999 het 281 hom 20 3 5 12 AAAG 5 4 131319 CASAVA_Build 10 30941729 1D CCCATGACAG C/- CCAAGTCTTC 3070 het 3070 ref 39 21 12 7 C 3 2 131320 CASAVA_Build 10 30942970 1D TATTGCTTCA G/- ACATAACAAA 2377 het 2377 ref 24 16 6 2 G 1 0 131321 CASAVA_Build 10 30944823 1I ACTGGTTTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 317 hom 23 1 19 3 A 9 10 131322 CASAVA_Build 10 30945800 37D TGATAATGAA AATATACTTTTAATTTTTCTAGTAATTATTTACTTTT/------------------------------------- AATATACTTT 3070 hom 84 het 44 0 29 16 AATATACTTTTAATTTTTCTAGTAATTATTTACTTTT 1 0 131323 CASAVA_Build 10 30959874 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 1201 het 1201 ref 33 22 4 7 C 1 0 131324 CASAVA_Build 10 30962423 1D TTAACAATTC T/- TTTTTTTTTT 1380 het 1380 ref 23 11 4 8 T 17 16 131325 CASAVA_Build 10 30971934 4I GATGCGTCTC ----/TGTT TGCCACCAGC 3070 hom 72 het 31 0 24 7 TGTT 0 1 131326 CASAVA_Build 10 30974692 3I GTCCTTGTCG ---/TCT TCATTTCACT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 TCT 0 1 131327 CASAVA_Build 10 30976350 1D ACCTGCACTG T/- GAGCACGGGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 0 131328 CASAVA_Build 10 30988055 2D GAACACATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 15 8 T 14 12 131329 CASAVA_Build 10 30988473 2I GGGGAGACAA --/AG AGAGTTGGAT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AG 2 3 131330 CASAVA_Build 10 30989305 3D AGATTCCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 32 1 22 9 A 14 11 131331 CASAVA_Build 10 30994275 1D ATTCTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 21 0 13 8 A 13 12 131332 CASAVA_Build 10 31000168 1D CTAGAAGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 10 9 131333 CASAVA_Build 10 31001140 5D TACAGTAATG TATGT/----- TATAAGTTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TATGT 1 0 131334 CASAVA_Build 10 31009297 1D TACCTGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 32 2 24 6 T 14 13 131335 CASAVA_Build 10 31013697 3I GCCAGAAAAC ---/CTT CTCCTGCCCC 3070 hom 78 het 27 0 26 1 CTT 0 1 131336 CASAVA_Build 10 31018295 5I CACGCCAAGC -----/AGTTT CTGATCAGAA 3070 het 2567 hom 38 10 23 5 AGTTT 0 1 131337 CASAVA_Build 10 31021019 6I CTGTTTTCCT ------/TTGGGC TGGCCTCACT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 TTGGGC 0 1 131338 CASAVA_Build 10 31023090 2D TAGATCCTGA AC/-- ACACAATCAT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 AC 3 2 131339 CASAVA_Build 10 31028701 1I AATAGGGGAG -/A AGAGGCAGGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 2 131340 CASAVA_Build 10 31030207 1I GTATAGCAGA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 2 131341 CASAVA_Build 10 31036039 10I TCTGTTATTC ----------/CTAAATAGCG CTACTGGTAC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 CTAAATAGCG 0 1 131342 CASAVA_Build 10 31040316 1I TTGACAATCA -/T CCACGAGGTG 3070 hom 75 het 26 0 25 1 T 0 1 131343 CASAVA_Build 10 31043601 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGGGGTCT 3070 hom 69 het 27 0 22 6 G 7 8 131344 CASAVA_Build 10 31046505 1D TAGACAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 20 0 14 6 T 12 11 131345 CASAVA_Build 10 31047148 8D TCTGGAAATC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 17 9 131346 CASAVA_Build 10 31047734 2I CTCAGTGCCT --/TA AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TA 0 1 131347 CASAVA_Build 10 31049241 1D TTTTGTTCTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 278 hom 27 1 25 2 T 9 8 131348 CASAVA_Build 10 31052347 7I ACTAATAGAG -------/TTCTTCT AAGAAAGATT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TTCTTCT 0 1 131349 CASAVA_Build 10 31057137 1D CTGCTTGCTT G/- TTGGCCAGCC 3070 hom 123 het 46 0 40 6 G 1 0 131350 CASAVA_Build 10 31062948 1I GGGAGGCTGA -/G GGGGGGGCTG 3070 het 213 hom 17 1 15 1 G 7 8 131351 CASAVA_Build 10 31078853 2D ATAGCATTTT CA/-- GTGTTTTCAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CA 1 0 131352 CASAVA_Build 10 31094690 3I ACGGCCCTCT ---/GGA GGAGGAGCAT 3070 hom 99 het 36 0 31 5 GGA 2 3 131353 CASAVA_Build 10 31102228 2I ACACATATAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 57 20 22 15 AC 5 6 131354 CASAVA_Build 10 31104189 14D GGAGAGGAAG CTTCTGGCTTAAGC/-------------- CAATCCATGC 3070 het 3070 ref 30 19 14 4 CTTCTGGCTTAAGC 1 0 131355 CASAVA_Build 10 31106963 16I GGTATTGAGG ----------------/GGTGGGGCCTTTAAGA GGTAATGGAA 3070 hom 95 het 36 0 30 6 GGTGGGGCCTTTAAGA 0 1 131356 CASAVA_Build 10 31121290 2D TTTACTTGTG TA/-- TTATATATTG 3070 het 3070 hom 37 12 20 6 TA 1 0 131357 CASAVA_Build 10 31127615 1I TCAGGCAAGC -/A GAGGGAGATG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 0 1 131358 CASAVA_Build 10 31136331 1D TTTTTTGTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2030 hom 28 5 19 5 T 10 9 131359 CASAVA_Build 10 31140519 2D TTAATTTTGT AC/-- AGAGTGAGCC 3070 het 3070 hom 47 20 20 8 AC 1 0 131360 CASAVA_Build 10 31153985 1D AAAGGAGCTC T/- GATTTTGTCT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 T 1 0 131361 CASAVA_Build 10 31157190 3D CTTGCATCCC CAA/--- CAACTGAAGT 3070 het 3070 ref 35 16 18 3 CAA 2 1 131362 CASAVA_Build 10 31158913 2I AAACAGCCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 14 10 A 11 13 131363 CASAVA_Build 10 31170248 2I CCACTGGACC --/CT CTAGGGCTCT 3070 het 3070 hom 49 17 19 13 CT 1 2 131364 CASAVA_Build 10 31190623 3I CTTTTATTAG ---/TTC TTATTTCTGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTC 0 1 131365 CASAVA_Build 10 31194390 1D AAAAATGAAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 8 7 131366 CASAVA_Build 10 31196257 1D CTTCTCATTA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 8 7 131367 CASAVA_Build 10 31197008 1I TTTTTAAAGA -/C ATTTTTTTTT 2570 het 2570 ref 20 9 9 2 C 0 1 131368 CASAVA_Build 10 31197483 1D TTACTCTATT A/- AAAAGCATTA 3070 het 3070 hom 25 11 13 3 A 5 4 131369 CASAVA_Build 10 31198428 7I TATTTTATTT -------/CAACTTC CAACTTCCAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 CAACTTC 1 2 131370 CASAVA_Build 10 31203050 32D TGTGTGTGTG TATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------- TATATATATA 636 het 4 hom 12 0 5 8 TA 24 8 131371 CASAVA_Build 10 31209831 2D TTATTTAAAC AG/-- ACACAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 16 3 AG 1 0 131372 CASAVA_Build 10 31220363 3D TAATTCTGCC ATT/--- AATAAACTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 ATT 1 0 131373 CASAVA_Build 10 31221164 2D TACGAAACCC TA/-- TATATACTGT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TA 4 3 131374 CASAVA_Build 10 31221283 1D AACAACATAT A/- ATGTGTGAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 1 131375 CASAVA_Build 10 31231317 2I TGAGCTAGAC --/AT AGAGTGCTGA 3070 hom 41 het 19 0 14 5 AT 0 1 131376 CASAVA_Build 10 31255590 1D GACAGGGTGG A/- AAAAAAAAAA 2259 het 1374 hom 16 5 8 4 A 13 12 131377 CASAVA_Build 10 31256811 1I TCACTGAGCC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 8 9 131378 CASAVA_Build 10 31262533 2D ATCTTGGGTG AC/-- AGAGTGAGAC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AC 1 0 131379 CASAVA_Build 10 31264864 1D GTGGAAATTA C/- GAGTATTACA 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 C 1 0 131380 CASAVA_Build 10 31265608 1I ACATCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 9 10 131381 CASAVA_Build 10 31268581 9D CCTACAGGTA AAAGTCTCT/--------- CCTGTAACTA 3070 het 3070 ref 47 25 16 9 AAAGTCTCT 1 0 131382 CASAVA_Build 10 31269857 4I CTTAAAAAAC ----/TATA TATATATATA 2190 het 1993 hom 13 4 5 4 TA 6 8 131383 CASAVA_Build 10 31270580 1D ATGGCATTCA T/- TTTTATCTGA 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 T 5 4 131384 CASAVA_Build 10 31274324 1D ATTCTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 24 1 20 3 T 13 12 131385 CASAVA_Build 10 31282589 2D AAAAAAACAT AC/-- ACACACACAC 2286 het 662 hom 18 2 10 6 AC 8 7 131386 CASAVA_Build 10 31289735 6D GACAAGATAG ATATAA/------ ATATAAAAAT 3070 hom 42 het 18 0 15 5 ATATAA 2 1 131387 CASAVA_Build 10 31294929 1I GCAATACTGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 46 26 11 9 A 8 9 131388 CASAVA_Build 10 31298765 1I GTTTTTATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 9 10 131389 CASAVA_Build 10 31305676 1D TTTATTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 30 1 22 8 A 14 13 131390 CASAVA_Build 10 31316304 1D ATGCTGAATT A/- AAAAAAAAAA 923 het 923 ref 39 27 3 9 A 12 11 131391 CASAVA_Build 10 31318814 1I TTATGAAATA -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 5 6 131392 CASAVA_Build 10 31323979 1I CAGAGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 932 hom 27 2 21 4 A 11 12 131393 CASAVA_Build 10 31327323 3D AGAAAAATAC AAA/--- AAATTAGCCG 1429 het 841 hom 6 3 3 0 A 6 3 131394 CASAVA_Build 10 31345179 1D TAATTATAAC A/- GGGGTGATGT 3070 het 3070 ref 25 12 11 4 A 1 0 131395 CASAVA_Build 10 31349654 4I TATCTTTTAG ----/TAGT TAAACAACAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TAGT 0 1 131396 CASAVA_Build 10 31350331 4D AGTACAGTAG TTCT/---- TTATTTCATA 3070 het 3070 hom 20 8 12 3 TTCT 1 0 131397 CASAVA_Build 10 31350511 4D CATTTCTCAC TTTG/---- TTTTTTTTCT 2112 het 2112 ref 24 14 6 5 TTTG 1 0 131398 CASAVA_Build 10 31351196 1I GCTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3045 het 312 hom 15 1 10 4 T 10 11 131399 CASAVA_Build 10 31353260 2D AACTGGTAAC TT/-- TAAAAGATTC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 3 1 131400 CASAVA_Build 10 31358262 4I GCTTACATAA ----/TACT TACTATTTTT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 TACT 1 2 131401 CASAVA_Build 10 31364916 2D GCAGCATAAC AT/-- AGTAAAGCAC 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 AT 1 0 131402 CASAVA_Build 10 31370641 2I AGGCAACCTC --/AG ATATCTGCAT 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 AG 0 1 131403 CASAVA_Build 10 31383595 1I GCTGTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2270 hom 24 6 12 6 A 10 11 131404 CASAVA_Build 10 31388843 1I GGAAAGAGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1591 hom 30 6 16 8 T 8 9 131405 CASAVA_Build 10 31390649 1D TTTTGTTTTG T/- TTTGTTTGTT 1145 het 854 hom 42 8 7 27 T 4 3 131406 CASAVA_Build 10 31411735 2D ACTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1743 hom 32 8 14 10 T 14 12 131407 CASAVA_Build 10 31417718 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2499 hom 4 het 9 0 6 3 A 17 16 131408 CASAVA_Build 10 31462678 2D TCGTGGGCCA GC/-- GCAGCTTGCT 2919 het 1942 hom 16 6 9 2 GC 2 1 131409 CASAVA_Build 10 31499057 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2269 het 2269 ref 20 10 6 5 A 15 14 131410 CASAVA_Build 10 31501890 1D GAGGTGCTTT G/- GGGGGGATGC 3070 het 3070 hom 46 14 31 1 G 7 6 131411 CASAVA_Build 10 31511764 1I AGATTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 2635 het 2635 ref 31 10 14 7 T 13 14 131412 CASAVA_Build 10 31519070 2D TGGCAGTGGT AA/-- AGAGTGGTGA 3070 het 3070 ref 52 26 21 6 A 3 1 131413 CASAVA_Build 10 31523390 1D AAAGCCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 31 0 12 19 T 15 14 131414 CASAVA_Build 10 31523802 1I GTCTCAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 953 hom 45 3 39 3 T 11 12 131415 CASAVA_Build 10 31524729 2D GATTATACAA AT/-- ATATATATAC 3070 hom 81 het 37 0 30 7 AT 5 4 131416 CASAVA_Build 10 31530129 1I GAACATGGTT -/G GAAAACAACA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 1 2 131417 CASAVA_Build 10 31539464 1D CCCCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 40 0 30 10 A 11 10 131418 CASAVA_Build 10 31542277 19D CCTGTTTTGC TCACCAGGCTATCATCTGT/------------------- TCACCAGGCT 3070 hom 111 het 44 0 36 13 TCACCAGGCTATCATCTGT 2 1 131419 CASAVA_Build 10 31548835 1D GACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 A 13 12 131420 CASAVA_Build 10 31564926 1D CAGTACCAAG A/- GGGAAGTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 0 131421 CASAVA_Build 10 31573243 6I CAACAACAAC ------/AACAAT AACAACAACA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AACAAT 0 1 131422 CASAVA_Build 10 31580809 1D CCTAACAGAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 10 9 131423 CASAVA_Build 10 31610673 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGTTTCAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 5 4 131424 CASAVA_Build 10 31617908 1D TACCAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 2390 het 2390 ref 34 18 8 8 A 15 14 131425 CASAVA_Build 10 31659767 6I AAGATAGTTT ------/TTTAAG TTTAACTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTTAAG 0 1 131426 CASAVA_Build 10 31756020 1D AAATATGTTT A/- AAAAAAAAAC 638 het 638 ref 24 17 2 6 A 10 9 131427 CASAVA_Build 10 31828048 1I TGTTGAAAAC -/A AAAATTTAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 5 131428 CASAVA_Build 10 31833247 2I TCCACTGGTC --/TG TGTGTGTCTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TG 3 4 131429 CASAVA_Build 10 31834797 1I AATGTTTCTA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 82 hom 25 1 21 3 T 6 7 131430 CASAVA_Build 10 31884556 1I CATGGCTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 11 12 131431 CASAVA_Build 10 31914595 2D AGTTTGTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2701 het 162 hom 18 3 8 7 T 18 16 131432 CASAVA_Build 10 31914758 1I GGCCCAGCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 533 hom 14 2 9 4 T 7 8 131433 CASAVA_Build 10 31915100 4I CCCTTGATCG ----/TCAC TCATACTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 TCAC 0 1 131434 CASAVA_Build 10 31922513 1D GGCAATACAG T/- GAGAAATAAT 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 T 1 0 131435 CASAVA_Build 10 31935062 1D GACATGTTAC T/- TTTCTTTACT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 4 3 131436 CASAVA_Build 10 31938234 1I TCTGTTACTA -/T TTTTTTTTTT 800 het 800 ref 41 30 2 10 T 10 11 131437 CASAVA_Build 10 31949501 1D GAAGGCGGTA C/- CCCCCCCAAC 2434 het 1788 hom 21 8 9 5 C 8 7 131438 CASAVA_Build 10 31952752 1D TAGAGAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 T 12 11 131439 CASAVA_Build 10 31956949 1I ATTCTGAAAG -/A ATAAAATTCA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 1 2 131440 CASAVA_Build 10 31957206 6D CTGCACAGCC AGATGG/------ AGATGGAGGA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AGATGG 2 1 131441 CASAVA_Build 10 31963722 1I TCCAGCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 10 11 131442 CASAVA_Build 10 31976851 3I TTCCTGGAGC ---/ACA ACAAGTATAG 3070 hom 111 het 46 0 38 8 ACA 1 2 131443 CASAVA_Build 10 31996234 1I TTGTCTTCTG -/C CATGAGTGGA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 C 1 2 131444 CASAVA_Build 10 32000259 2I GTTTGCAAAC --/TG GAGACCCAAG 3070 hom 144 het 54 0 48 6 TG 0 1 131445 CASAVA_Build 10 32009449 1I CCACACTTTT -/G CTTTCCTTGG 3070 hom 114 het 41 0 35 6 G 0 1 131446 CASAVA_Build 10 32035559 8D ACACACACAC ATACATAT/-------- ACACCATACT 2002 hom 82 het 44 0 23 25 ATACATAT 1 0 131447 CASAVA_Build 10 32047718 1D TTCAGCTCTG T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 7 6 131448 CASAVA_Build 10 32049017 1I AACAGGGAAG -/C TTAACATAAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 0 1 131449 CASAVA_Build 10 32055032 1D CTTTAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 11 10 131450 CASAVA_Build 10 32055320 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 5 A 10 9 131451 CASAVA_Build 10 32062689 1I AGATAGCAAC -/A AAGATAAAAA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 2 3 131452 CASAVA_Build 10 32070218 2D AAGAAGTGGC AA/-- GTATTTTAGA 3070 het 3070 ref 55 29 23 3 A 2 0 131453 CASAVA_Build 10 32070379 1D TTCCTACCAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 10 9 131454 CASAVA_Build 10 32072915 2D AGAGTCTCAC TG/-- TGTCACCCAG 3070 het 1845 hom 29 6 21 3 TG 2 1 131455 CASAVA_Build 10 32073462 2D CAGGGAAGAC TT/-- TATGCAGAGT 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 T 3 1 131456 CASAVA_Build 10 32077328 1I AAATTGCTCT -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 0 1 131457 CASAVA_Build 10 32079954 1I AAAAACACAC -/A AAAAAAAACA 2353 het 2353 ref 25 15 7 4 A 8 9 131458 CASAVA_Build 10 32106845 1D TGCCCTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 16 0 12 4 T 13 12 131459 CASAVA_Build 10 32112724 1I TGAAAACTAG -/C TTTTTTAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 0 1 131460 CASAVA_Build 10 32113220 1I TGAGAAGCTG -/T TCAGCTCATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 2 131461 CASAVA_Build 10 32118581 1D TTGTTTTTTT G/- TAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 1 0 131462 CASAVA_Build 10 32130696 20D GGTTGCCTGT TTATTATCAATAGGATAATG/-------------------- TTATTATCAA 3070 hom 66 het 28 0 23 10 TTATTATCAATAGGATAATG 2 1 131463 CASAVA_Build 10 32142580 2I TCAGTTAAAC --/AT GTGGATTTGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AT 0 1 131464 CASAVA_Build 10 32157154 2I ACCTTATTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 10 12 131465 CASAVA_Build 10 32165523 1I GTGACATTAA -/G GAACTGAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 1 2 131466 CASAVA_Build 10 32169290 1I CAATAACGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 642 hom 30 2 23 5 T 10 11 131467 CASAVA_Build 10 32244321 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1082 het 1082 ref 24 10 3 11 A 17 16 131468 CASAVA_Build 10 32250063 1I CTACAAAAAC -/T TAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 1 2 131469 CASAVA_Build 10 32253637 5D ACTCTAACCT CATAA/----- CATATTCTGA 3070 het 3070 hom 41 13 21 10 CATAA 1 0 131470 CASAVA_Build 10 32305226 2D AAAAAAAAAA GG/-- GAGAGAAAAA 1223 het 94 hom 28 1 13 14 G 3 1 131471 CASAVA_Build 10 32305648 2D CGTGGCAGTG CA/-- CACTGGTAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CA 2 1 131472 CASAVA_Build 10 32305921 17D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAG/----------------- AGAAATAAAT 3070 hom 63 het 20 0 22 5 AAAAAAAAAAAAAAAAG 1 0 131473 CASAVA_Build 10 32307582 1D TTATTTTTTT A/- TTTTTTTATT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 1 0 131474 CASAVA_Build 10 32319739 15I AGGGGCAAGT ---------------/GTCTGTACAGATACA GGCTCATATC 3070 hom 105 het 36 0 36 1 GTCTGTACAGATACA 0 1 131475 CASAVA_Build 10 32323579 22D AAAGCAAGGT GATGTGATAGTGATTGGCAGGG/---------------------- GATGTTTGGG 3070 hom 120 het 41 0 38 8 GATGTGATAGTGATTGGCAGGG 1 0 131476 CASAVA_Build 10 32327112 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 11 12 131477 CASAVA_Build 10 32334374 15D GTTGACATCA GCCAGTCTGTCATCC/--------------- GCCAGTCTGT 3070 hom 140 het 51 0 45 12 GCCAGTCTGTCATCC 2 1 131478 CASAVA_Build 10 32336240 2D AAAAAAATGC TG/-- TGTCTGTATC 3070 hom 120 het 41 0 41 1 TG 2 1 131479 CASAVA_Build 10 32347541 1I TTTATTCTGT -/A ATATTGTACT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 1 2 131480 CASAVA_Build 10 32347958 1I TATGCCTTCT -/A AAACAACAGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 4 131481 CASAVA_Build 10 32352523 4D AACACTAAGG ACAA/---- ACAAAGTCAC 3070 hom 147 het 53 0 49 4 ACAA 2 1 131482 CASAVA_Build 10 32356420 2D TCTCTACTAT TA/-- TATGTTTGAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 TA 2 1 131483 CASAVA_Build 10 32363046 1D CCTTTAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2420 het 2130 hom 41 13 11 17 T 17 16 131484 CASAVA_Build 10 32367044 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 1235 het 1235 ref 15 8 5 2 A 15 16 131485 CASAVA_Build 10 32375858 4I AACACCATGG ----/CTTA CTTAGCCTAG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 CTTA 1 2 131486 CASAVA_Build 10 32403607 1I TTGAAAAGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 9 10 131487 CASAVA_Build 10 32407396 1I CAAGAGATCG -/A GACCATCTTG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 0 1 131488 CASAVA_Build 10 32411516 5D ACTCCATCAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 A 19 14 131489 CASAVA_Build 10 32420672 1D ACTCTGCGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 23 1 11 11 T 16 15 131490 CASAVA_Build 10 32421073 1I TTTGGGAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 55 het 24 0 17 7 T 9 10 131491 CASAVA_Build 10 32424672 10D GTCAGTACAA ATGCATTAAG/---------- ATGCATTAAG 3070 hom 57 het 22 0 19 6 ATGCATTAAG 2 1 131492 CASAVA_Build 10 32432755 1I AAAAACAAGC -/A AACAATGTGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 2 3 131493 CASAVA_Build 10 32462983 1I GCAAGTCACA -/G GGGGATATAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 4 5 131494 CASAVA_Build 10 32473590 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 22 1 18 3 A 11 10 131495 CASAVA_Build 10 32477897 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1798 het 4 hom 15 1 11 3 A 14 16 131496 CASAVA_Build 10 32481382 4I TAATACAGTG ----/AAAC AAACCCCATC 3070 hom 33 het 14 0 12 3 AAAC 1 2 131497 CASAVA_Build 10 32491475 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 1888 hom 24 6 12 6 A 6 7 131498 CASAVA_Build 10 32499921 2I GTGTGTGTGT --/GC GTGCGCAAGT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 GC 0 1 131499 CASAVA_Build 10 32500273 1I ATTAAGTCTG -/T TGCAGTCCAG 3070 het 3070 hom 51 14 22 15 T 1 2 131500 CASAVA_Build 10 32501755 1D ACTAAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2734 het 476 hom 23 4 8 11 A 15 14 131501 CASAVA_Build 10 32501944 5I TCTTAATTTT -----/TTTAA TTTAATTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 14 4 TTTAA 1 2 131502 CASAVA_Build 10 32514089 1I TAGAGACTAT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 6 7 131503 CASAVA_Build 10 32514424 1I AATGAATTTA -/G GGGGGAAATT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 G 5 6 131504 CASAVA_Build 10 32515117 1D CGATACTTTA C/- TTGTGCGTAA 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 C 1 0 131505 CASAVA_Build 10 32519333 6D GACTGTGTCT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 2697 hom 33 12 16 7 A 27 21 131506 CASAVA_Build 10 32529969 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 1798 hom 20 8 10 2 A 0 1 131507 CASAVA_Build 10 32533437 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 2350 hom 15 5 9 1 A 7 6 131508 CASAVA_Build 10 32554757 1I GAGGTCGAGG -/C GGGTGGATCA 2934 het 1270 hom 14 3 8 3 C 0 1 131509 CASAVA_Build 10 32558431 2D CATGGGCAGC AG/-- AGTTAGACCC 2233 het 2233 ref 29 16 6 7 AG 2 1 131510 CASAVA_Build 10 32560886 1I GTCTTTTTTT -/C CTCATACAGG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 C 1 2 131511 CASAVA_Build 10 32564957 1I CAAAGAACTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 8 9 131512 CASAVA_Build 10 32574331 1D AACTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1125 het 1125 ref 26 14 3 9 T 17 16 131513 CASAVA_Build 10 32610609 1I ACATTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 23 0 17 6 T 12 13 131514 CASAVA_Build 10 32618401 1I CATTCTAACT -/G GTGTGGCAGG 3070 hom 66 het 23 0 22 1 G 1 2 131515 CASAVA_Build 10 32628965 1I TCCTGCCTCA -/G CCTCCTGAGT 3070 hom 21 het 9 0 7 2 G 0 1 131516 CASAVA_Build 10 32629205 1I ATACTTTAAG -/T TTCTAGGGTA 1735 het 1735 ref 9 5 4 0 T 2 3 131517 CASAVA_Build 10 32634436 1D TATATCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 15 14 131518 CASAVA_Build 10 32640247 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 14 13 131519 CASAVA_Build 10 32649846 7D TGTGAGTTCT TTAAATG/------- TTTGGTGGGA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 TTAAATG 1 0 131520 CASAVA_Build 10 32652048 3I GTAAATATGT ---/ACA ACTATTATGT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 ACA 0 1 131521 CASAVA_Build 10 32654721 1I TTTTTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 24 1 21 2 T 10 11 131522 CASAVA_Build 10 32656994 2D GGGAGGCTTG CA/-- CAGTTGGAAG 3070 hom 60 het 24 0 18 7 CA 2 1 131523 CASAVA_Build 10 32660467 1I ACTTCAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 79 het 29 0 27 2 A 9 10 131524 CASAVA_Build 10 32662703 3I AAGGCTTTAC ---/GAG GAGAAGGGTG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 GAG 1 2 131525 CASAVA_Build 10 32664425 4D AAGCAGAAGC TGTT/---- TATTTTCCCA 3070 hom 122 het 45 0 41 7 TGTT 1 0 131526 CASAVA_Build 10 32665006 1I CTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 33 1 26 6 C 0 1 131527 CASAVA_Build 10 32665245 1I CTCGTGATCC -/A ACCTGCCTCG 3070 hom 69 het 26 0 22 4 A 1 2 131528 CASAVA_Build 10 32669866 1D AAAGTTATTG T/- TATCAATGCA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 2 1 131529 CASAVA_Build 10 32672073 1D AAGTCTATTA T/- TTCGCTGTGA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 3 2 131530 CASAVA_Build 10 32678509 4D TATAAAATTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 84 het 32 0 27 7 AAAC 4 3 131531 CASAVA_Build 10 32691996 1D ATCTGTAACA G/- GAAGAGGGAG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 G 2 1 131532 CASAVA_Build 10 32692390 1D AGTATCCTGA G/- CCAGGTTCTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 1 0 131533 CASAVA_Build 10 32692607 2I CACACACATG --/AT TATATATACG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AT 0 1 131534 CASAVA_Build 10 32693136 4D3M2D7M14D TTAGTAGAGA CTTTTAGTAGATTTTGTATTTTAGTAGAGA/----TGG--GGTTTTG-------------- CCATGTTGGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 N/A 0 0 131535 CASAVA_Build 10 32693842 3D TTTTTCATGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 32 1 18 13 T 19 16 131536 CASAVA_Build 10 32695547 1D CTGCCATCAA T/- TTTTTTTGGC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 8 7 131537 CASAVA_Build 10 32695634 1D ATGACAGAAC A/- AAAAGCAGCA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 5 4 131538 CASAVA_Build 10 32700849 1D AAAATAAAAC A/- AAAAGATTCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 5 4 131539 CASAVA_Build 10 32707241 1I TTTAACAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 36 1 31 4 A 10 11 131540 CASAVA_Build 10 32709087 2D ACATACATAT AC/-- ACACACACAC 1083 het 1083 ref 52 44 3 5 AC 6 5 131541 CASAVA_Build 10 32710895 1D ACAGTCTAGG A/- AGAGGCTACA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 2 1 131542 CASAVA_Build 10 32711144 1D GGTAGAGGGG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 72 het 25 0 24 3 A 8 7 131543 CASAVA_Build 10 32713767 1D TAATTTTTTT C/- TTGTATTTTT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 C 1 0 131544 CASAVA_Build 10 32715911 1I TTTGCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 12 13 131545 CASAVA_Build 10 32717157 1D AGCTTTCAGC T/- TTTTCATATG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 5 4 131546 CASAVA_Build 10 32722829 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 1244 het 1244 ref 32 20 4 8 A 13 14 131547 CASAVA_Build 10 32723818 1D TTATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 T 12 11 131548 CASAVA_Build 10 32725692 1D GTTAACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 A 11 10 131549 CASAVA_Build 10 32743691 1I ACAAACAAAC -/A AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 3 4 131550 CASAVA_Build 10 32747910 4I AACTTTTTCA ----/CTTT CTTTTAATTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CTTT 1 2 131551 CASAVA_Build 10 32753482 1D GTACCCGGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 10 9 131552 CASAVA_Build 10 32773068 1D ATACTGAATA G/- ACATAGTGAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 G 1 0 131553 CASAVA_Build 10 32783512 1I AACAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 10 11 131554 CASAVA_Build 10 32787394 6D TGTGTTTGCA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 1926 hom 21 het 23 0 8 15 TG 11 8 131555 CASAVA_Build 10 32789562 1I GTGGACATTA -/T TTTCTAAACA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 3 4 131556 CASAVA_Build 10 32796203 2D GCCCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1963 het 55 hom 11 1 5 5 T 16 14 131557 CASAVA_Build 10 32796366 4D TTTAATGGTG TTGT/---- TTGTTTGTGT 2842 het 2842 ref 25 13 6 9 TTGT 3 2 131558 CASAVA_Build 10 32797685 2I TGTGAGTCTC --/TT TGAGTTAGGA 3070 het 3070 ref 67 32 27 8 T 1 3 131559 CASAVA_Build 10 32805292 2I TTCCTCTGTG --/TC TTTCAATAGT 2871 hom 24 het 26 0 9 17 TC 0 1 131560 CASAVA_Build 10 32805521 3D AGGAGCATGA CTG/--- CTAAGTCATA 3070 het 3070 hom 45 18 23 6 CTG 1 0 131561 CASAVA_Build 10 32805998 1I AAACTTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 36 1 27 8 T 10 11 131562 CASAVA_Build 10 32808773 1D TGGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 19 0 13 6 T 13 12 131563 CASAVA_Build 10 32811130 4D TTTCAGAATT AAAA/---- AATTTAAATT 3070 het 3070 hom 34 15 17 4 A 6 2 131564 CASAVA_Build 10 32811324 4D TTTCAAATAA CTTT/---- CTTTAAGTTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 3 CTTT 2 1 131565 CASAVA_Build 10 32819272 1D GTGTTCTTCC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 T 7 6 131566 CASAVA_Build 10 32821499 9D GACATTCTGC TAAGTATAA/--------- TAAGCCAGCC 3070 het 3070 ref 49 22 19 9 TAAGTATAA 1 0 131567 CASAVA_Build 10 32823691 1I AGTATTCCAT -/G GGTGTATATG 3070 het 3070 ref 17 9 7 1 G 2 3 131568 CASAVA_Build 10 32847643 2I ATGAAAAAAC --/AG ATAAAATTTA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AG 0 1 131569 CASAVA_Build 10 32848513 1D TAAAACATTT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 7 6 131570 CASAVA_Build 10 32853006 1I TCCTTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1575 hom 24 5 13 6 T 14 15 131571 CASAVA_Build 10 32859304 4D GCAGTATGGT CATA/---- CATACCTCAA 3070 het 3070 hom 44 21 22 3 CATA 2 1 131572 CASAVA_Build 10 32869085 4D GGTCTAAGTC TCTT/---- TGTAGGTCCC 3070 het 3070 hom 28 13 14 3 TCTT 1 0 131573 CASAVA_Build 10 32882038 1D TCTTGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 2821 het 2330 hom 20 9 7 4 T 15 14 131574 CASAVA_Build 10 32886175 2D CTTTTGTATA AT/-- ATGTCATTTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 AT 2 1 131575 CASAVA_Build 10 32889984 1I ACTTTAAACC -/A ACAAAGATCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 1 2 131576 CASAVA_Build 10 32917324 1D GTCACATGCA T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 8 7 131577 CASAVA_Build 10 32921490 1I AAGATATATA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 6 7 131578 CASAVA_Build 10 32941297 1I TGTCATCTGC -/A AACAGAGAGA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 2 3 131579 CASAVA_Build 10 32942062 1I AGGGATTCTG -/T TTTTTTCCTG 1600 het 1600 ref 22 13 5 4 T 6 7 131580 CASAVA_Build 10 32945917 4D ATTATTGGTC TGTT/---- TGAGAGTTTT 3070 het 3070 ref 51 31 18 2 TGTT 1 0 131581 CASAVA_Build 10 32955969 1D GCTATTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 787 hom 40 2 34 4 T 13 12 131582 CASAVA_Build 10 32960607 1D CAATTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 34 1 24 9 A 13 12 131583 CASAVA_Build 10 32961074 3D TCTTTTTTTT GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 hom 63 het 25 0 21 5 G 13 10 131584 CASAVA_Build 10 32972956 4D ATGGTGTCAC TCTT/---- TATTGTAGTC 3070 het 3070 ref 35 21 13 3 TCTT 1 0 131585 CASAVA_Build 10 32977192 11D AAGTTGGCTA CTGTGATGCTT/----------- CTGGCTTTTT 3070 het 3070 ref 37 22 16 1 CTGTGATGCTT 1 0 131586 CASAVA_Build 10 32984999 3I TGATACAATC ---/TTA TTATTCTATT 3070 het 3070 ref 27 18 7 2 TTA 1 2 131587 CASAVA_Build 10 32987383 1D TATAAAACCA T/- TCATATCTCG 3070 het 3070 ref 43 19 17 8 T 2 1 131588 CASAVA_Build 10 32987946 1D ATTTCTAGAG T/- TTTTCTAGTC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 5 4 131589 CASAVA_Build 10 32992898 2D AAAATGAGAC AG/-- AATATGGCTG 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 AG 1 0 131590 CASAVA_Build 10 33004227 12D3M17D AGGTTTGATT ACCATAAAGTTAAAATTACAGTTACGATTACC/------------AAA----------------- ATAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 28 18 15 2 N/A 0 0 131591 CASAVA_Build 10 33009362 1D ATGTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 11 10 131592 CASAVA_Build 10 33013892 2D TTTAATTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 26 0 13 13 T 14 12 131593 CASAVA_Build 10 33018673 2D CTGCTGGGCT TG/-- TGTTTTTTTT 2606 het 2606 ref 33 20 10 3 TG 2 1 131594 CASAVA_Build 10 33024930 1D CAATGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 44 1 34 9 T 13 12 131595 CASAVA_Build 10 33038800 22D AAAAATCTTA TCATTGACTGCTCTCACTCTCG/---------------------- TCATTGACTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 9 TCATTGACTGCTCTCACTCTCG 1 0 131596 CASAVA_Build 10 33064004 1I GCTCTTGGTG -/C CTATATGATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 2 131597 CASAVA_Build 10 33069871 1D CAAAACTGAA G/- ATAATATTAA 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 G 1 0 131598 CASAVA_Build 10 33073074 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAAAG 2552 het 1385 hom 16 4 7 5 A 9 10 131599 CASAVA_Build 10 33093405 1I AGCAGAGATT -/C ATGGTTTAAT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 C 0 1 131600 CASAVA_Build 10 33098318 1I TTTACTTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 9 10 131601 CASAVA_Build 10 33105304 1D AGAATAATGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 10 9 131602 CASAVA_Build 10 33105804 1D AATGTTAGGG T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 7 6 131603 CASAVA_Build 10 33106446 1D GTGTACATGT C/- CCCTTTTCTC 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 C 4 3 131604 CASAVA_Build 10 33111164 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 3 het 25 1 23 1 T 8 7 131605 CASAVA_Build 10 33116220 2D GTCAAAATGC AA/-- AGACAGCCCT 3070 het 3070 hom 48 21 20 12 A 3 1 131606 CASAVA_Build 10 33126116 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 1841 hom 28 11 14 3 TA 5 6 131607 CASAVA_Build 10 33126681 6I GTGAGTGGTG ------/CCACTT CCACTTCCAC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 CCACTT 1 2 131608 CASAVA_Build 10 33137749 1I ACTGACACTG -/T TTATAGCTGA 3070 hom 102 het 44 0 34 10 T 2 3 131609 CASAVA_Build 10 33138876 1D TGTTTATTGC G/- GCACTATTCA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 G 2 1 131610 CASAVA_Build 10 33139012 2I TCAAATGTTA --/CT CTATGGCAGA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 CT 1 2 131611 CASAVA_Build 10 33150935 1D AAAAGTGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 11 10 131612 CASAVA_Build 10 33172194 4D ACAGTATTAT ATAA/---- ATAATTAATC 3070 het 3070 ref 32 16 15 5 ATAA 2 1 131613 CASAVA_Build 10 33186988 13D CTCAAAAAAT ATAAGCTACCAAG/------------- ATTGAATCAG 526 het 526 ref 29 20 2 14 ATAAGCTACCAAG 1 0 131614 CASAVA_Build 10 33190666 1I AAGAAAAAAA -/C AATCCCATCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 0 1 131615 CASAVA_Build 10 33215328 4I AAATATGCTC ----/AAAG AAAGACCTAA 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 AAAG 1 2 131616 CASAVA_Build 10 33215725 1D AATAAACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 469 hom 14 1 10 3 A 10 9 131617 CASAVA_Build 10 33218530 3I TTTCAAATTA ---/AAG AAGGACAGTG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 AAG 1 2 131618 CASAVA_Build 10 33219051 2D TACTCTGAGG TT/-- TTCTTACTAC 3070 het 3070 hom 52 19 24 10 T 4 2 131619 CASAVA_Build 10 33222135 1I TTCTTTCCTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 103 het 44 0 34 10 T 8 9 131620 CASAVA_Build 10 33223398 4D TCTGTAGGGA AAAG/---- AAAGAGAGAT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 AAAG 2 1 131621 CASAVA_Build 10 33232394 1D ATGAAGTCTG A/- AACTTCATCC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 3 2 131622 CASAVA_Build 10 33232938 1D AGGGAAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 6 A 12 11 131623 CASAVA_Build 10 33233624 4D ATGCTCATTC ATTT/---- ATTTCAATTG 3070 het 3070 hom 26 11 12 5 ATTT 2 1 131624 CASAVA_Build 10 33233978 1D AATATGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 14 13 131625 CASAVA_Build 10 33237137 4D ATTTAGGATG CTTT/---- CTGTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 CTTT 1 0 131626 CASAVA_Build 10 33258139 4I CAGAAGAGTT ----/AAAA AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 8 12 131627 CASAVA_Build 10 33259884 1D GTGAAAATGT G/- GGGGAAACAG 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 G 5 4 131628 CASAVA_Build 10 33262104 1I ATTTGGGACC -/T GTGATTTTGG 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 0 1 131629 CASAVA_Build 10 33271618 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 26 2 16 8 T 14 13 131630 CASAVA_Build 10 33276232 1I TTCATTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 10 11 131631 CASAVA_Build 10 33281394 4I CTCCTCCAAT ----/AATC AAACATGACC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AATC 0 1 131632 CASAVA_Build 10 33287984 1D30M1D AAAGTTTCTT CCTAAGGAGTACAGTTTCTGTTTCACCTCTTA/-CTAAGGAGTACAGTTTCTGTTTCACCTCTT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 18 14 13 N/A 0 0 131633 CASAVA_Build 10 33288955 5D GAGGAAAAAG AAATT/----- AAAGAAACAT 3070 het 3070 ref 39 19 17 6 AAATT 1 0 131634 CASAVA_Build 10 33291737 1I TTAAGCACTT -/A ACACGATTAG 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 1 2 131635 CASAVA_Build 10 33292743 4D TAAATAAAAA TTAG/---- TTAGACAAGT 3070 het 3070 ref 27 10 10 8 TTAG 2 1 131636 CASAVA_Build 10 33312215 3I AAATTTAAAT ---/GTG TTAAGTCAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GTG 0 1 131637 CASAVA_Build 10 33331000 1D TTTGCTGACT G/- TGGAAAGCCC 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 G 1 0 131638 CASAVA_Build 10 33331640 3I CTACAAAAAA ---/AAT AAAAATAATA 1969 het 1969 ref 19 10 5 4 AAT 0 1 131639 CASAVA_Build 10 33332934 1D TAGATACTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 T 10 9 131640 CASAVA_Build 10 33362130 4D TTAAAGTCCA AATG/---- AATATCTCAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 AATG 1 0 131641 CASAVA_Build 10 33370603 1D TTCAGGACTG T/- TTTTTTTTTT 2417 het 1124 hom 29 6 7 16 T 12 11 131642 CASAVA_Build 10 33377718 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 14 11 9 TA 7 8 131643 CASAVA_Build 10 33391448 15D ATGTTTACTG TAGGACTATTCACAA/--------------- TAGCCAAGAT 3070 het 3070 ref 44 26 16 6 TAGGACTATTCACAA 1 0 131644 CASAVA_Build 10 33412002 1I AGACTTTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 857 hom 31 2 22 7 T 9 10 131645 CASAVA_Build 10 33415001 1I CCCACCCCCC -/A AGGAAATTAA 3070 hom 83 het 30 0 28 2 A 1 2 131646 CASAVA_Build 10 33416641 3D TCCTGATTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 14 11 131647 CASAVA_Build 10 33436411 1I TCATTTCTTA -/G GGAAAAACAT 3070 het 3070 ref 57 35 18 4 G 2 3 131648 CASAVA_Build 10 33436494 4I CATAAGCAAT ----/TGAA TGAAAGAGTT 3070 hom 157 het 55 0 53 2 TGAA 1 2 131649 CASAVA_Build 10 33441723 8D5M13D CATAGAATAT TTTTTTTCTATGATATTCATTCATTT/--------AAGGA------------- TTGAATGAAT 3070 hom 66 het 22 0 23 2 N/A 0 0 131650 CASAVA_Build 10 33443231 1D TTTGTGATCA T/- TATTTTTAGT 3070 het 3070 hom 36 14 21 3 T 2 1 131651 CASAVA_Build 10 33450673 2D CAGCCACATT AA/-- AAAAAAACCC 3070 hom 108 het 39 0 37 4 A 9 7 131652 CASAVA_Build 10 33460899 1D AAAGGGTCAC A/- ATGGGGCACA 3070 het 3070 ref 50 23 19 9 A 2 1 131653 CASAVA_Build 10 33461224 1D ACATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2034 het 2034 ref 29 14 7 8 T 13 12 131654 CASAVA_Build 10 33461925 5D TTTAAAAAAA TACTT/----- TAAGTTCTGG 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 TACTT 1 0 131655 CASAVA_Build 10 33466851 18I AGGGAAGGAG ------------------/AGAAGAGTGGGGAGCACC AGAAGAGTGA 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 AGAAGAGTGGGGAGCACC 0 1 131656 CASAVA_Build 10 33467955 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1996 hom 22 9 10 5 A 12 11 131657 CASAVA_Build 10 33473224 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1856 het 331 hom 13 2 5 6 A 11 12 131658 CASAVA_Build 10 33477686 6D TCAAATTCAT AGAGAC/------ AGAAAGTAGA 3070 het 3070 hom 41 13 24 6 AGAGAC 1 0 131659 CASAVA_Build 10 33478381 1I AAAATCAGAA -/G TTGAATGAGG 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 G 0 1 131660 CASAVA_Build 10 33519955 1D GGCTGATTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 15 12 4 A 10 9 131661 CASAVA_Build 10 33527081 1I TTTTTAAATT -/A TTTTTTTTTT 1109 het 895 hom 8 3 4 1 A 0 1 131662 CASAVA_Build 10 33527697 1I AAGATGCTAT -/G GGTTCCTCCT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 2 3 131663 CASAVA_Build 10 33531513 9D GGGGGGGGTC TGAAAATAA/--------- TGAAAATAAG 3070 het 3070 ref 41 25 15 6 TGAAAATAA 2 1 131664 CASAVA_Build 10 33535502 2D TTGGTAGCTC AA/-- GACACAAATA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 2 0 131665 CASAVA_Build 10 33539126 1I TTAAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 1039 het 1039 ref 46 28 4 14 T 13 14 131666 CASAVA_Build 10 33546312 1D CTGCCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 A 13 12 131667 CASAVA_Build 10 33548748 1D GTTTACCTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 8 7 131668 CASAVA_Build 10 33552395 1D TCTCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 892 het 892 ref 22 8 3 11 A 15 14 131669 CASAVA_Build 10 33553483 1I CATTTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 T 14 15 131670 CASAVA_Build 10 33556380 1I GGAAGAGGGT -/A AAAGATTTCT 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 A 3 4 131671 CASAVA_Build 10 33557076 1I ACACAAGCTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 8 9 131672 CASAVA_Build 10 33559026 4D TCTCCAGCAC TTAG/---- TGTGCAACCC 3070 het 3070 ref 49 23 23 5 TTAG 1 0 131673 CASAVA_Build 10 33572561 4D AGAATAATGC CATA/---- CATAAGTGCA 3070 het 3070 hom 40 18 19 5 CATA 2 1 131674 CASAVA_Build 10 33575065 1I AATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3043 het 3043 ref 39 18 9 12 T 13 14 131675 CASAVA_Build 10 33599090 1D CTGAAATACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 10 9 131676 CASAVA_Build 10 33604679 3D TTCTCTACAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2604 het 71 hom 16 1 8 7 T 14 11 131677 CASAVA_Build 10 33610314 1D GTGAACTGAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 115 het 45 0 37 8 T 9 8 131678 CASAVA_Build 10 33611063 1I CCATAGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1887 hom 39 8 20 11 T 12 13 131679 CASAVA_Build 10 33621920 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2101 het 460 hom 22 2 10 10 A 13 14 131680 CASAVA_Build 10 33626852 1D CTATTCTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 10 9 131681 CASAVA_Build 10 33635550 4I ATTATGGTTG ----/GTTT ATTTCCTTTG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 GTTT 0 1 131682 CASAVA_Build 10 33642956 4I CCTTCCTTCT ----/TTCC CTCTCTCTCT 2103 het 432 hom 10 2 5 3 TTCC 0 1 131683 CASAVA_Build 10 33644651 4D CAGAGGACGG AGAA/---- AGAAAGACCG 3070 hom 125 het 47 0 41 9 AGAA 2 1 131684 CASAVA_Build 10 33652176 1I TATGTTTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 577 hom 41 2 31 8 A 9 10 131685 CASAVA_Build 10 33662167 1D ATGTTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 11 10 131686 CASAVA_Build 10 33666156 19I CCGACCTTGT -------------------/CTCCACCGCTCCCTCCTGC CTTTCCCGAA 3070 hom 56 het 24 0 13 11 CTCCACCGCTCCCTCCTGC 0 1 131687 CASAVA_Build 10 33676106 1D GGCCTTGATA T/- TTTTTGTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 6 5 131688 CASAVA_Build 10 33678282 1D TCATTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 12 11 131689 CASAVA_Build 10 33691461 1I AGAAGAAAAG -/A AAACTGGCAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 3 4 131690 CASAVA_Build 10 33696698 1D AGTTTGCTTT G/- GCTAAGTAGC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 G 2 1 131691 CASAVA_Build 10 33698458 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 896 hom 23 7 9 7 A 16 14 131692 CASAVA_Build 10 33714564 2I TAATTAGCTT --/TG TGTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 TG 1 2 131693 CASAVA_Build 10 33716329 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1453 het 393 hom 10 2 3 5 T 15 14 131694 CASAVA_Build 10 33721337 1D AATGTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 20 12 A 13 12 131695 CASAVA_Build 10 33724533 1D AGAGAAATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 12 17 10 T 10 9 131696 CASAVA_Build 10 33728605 2I TGTATATATA --/AT ATATATATAT 1629 het 1366 hom 13 4 6 3 AT 5 6 131697 CASAVA_Build 10 33748212 1D TCAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 11 10 131698 CASAVA_Build 10 33757098 1D TGCTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 T 13 12 131699 CASAVA_Build 10 33759962 4I AGGCCATGCC ----/TAGA TAGATGCCTG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 TAGA 1 2 131700 CASAVA_Build 10 33774833 1D GCTATGAATT A/- AGAGTCCCAC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 1 131701 CASAVA_Build 10 33819598 1I ACCTCTTGTA -/C CTTTTTCTGC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 C 1 2 131702 CASAVA_Build 10 33837486 1I CTGGGCATGG -/T AGTGCATGCC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 0 1 131703 CASAVA_Build 10 33857581 4I CTACATAAAT ----/AAAA AAATTGGAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 3 7 131704 CASAVA_Build 10 33883900 1D CATGTTTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 52 21 22 9 T 10 9 131705 CASAVA_Build 10 33885930 1D CACACTCTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 10 8 8 T 10 9 131706 CASAVA_Build 10 33891865 4D ACACCCCTGA TCTT/---- TCTTTCCCTT 3070 het 3070 hom 49 23 21 7 TCTT 2 1 131707 CASAVA_Build 10 33898678 1I7M1I CTCAAAAAAC -AACAAAC-/AAACAAACA AACAAAAAAA 3070 hom 105 het 35 0 36 7 N/A 0 0 131708 CASAVA_Build 10 33903519 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 10 12 A 11 12 131709 CASAVA_Build 10 33907360 7D GAAACAGATC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2203 het 1814 hom 30 8 11 11 T 21 14 131710 CASAVA_Build 10 33929476 1I ATACCACTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 A 10 11 131711 CASAVA_Build 10 33931075 1D AGAATATACT C/- CAAAATAGAA 3070 het 3070 ref 46 24 16 7 C 2 1 131712 CASAVA_Build 10 33934600 2D ACCATGTGTG TT/-- TTTTTGTTTG 3070 hom 132 het 49 0 45 6 T 7 5 131713 CASAVA_Build 10 33934768 1D ATTCAATTAA T/- TTTTTTATAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 6 131714 CASAVA_Build 10 33936426 1I GACTATTCTG -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 7 8 131715 CASAVA_Build 10 33937101 1D TCAGTTACAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 9 8 131716 CASAVA_Build 10 33938243 1I ACACAATATC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 9 10 131717 CASAVA_Build 10 33939870 1D GTTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 40 3 23 14 T 12 11 131718 CASAVA_Build 10 33957910 1D CAAATTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 17 0 A 11 10 131719 CASAVA_Build 10 34006230 1D TACAATATAC A/- AAAAAAAAAA 1899 het 1899 ref 33 20 5 9 A 13 12 131720 CASAVA_Build 10 34023221 2D TGTGCCATAT AA/-- GTGGGACATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 0 131721 CASAVA_Build 10 34028854 1I CCTCCTACCC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 32 het 16 0 11 5 T 7 8 131722 CASAVA_Build 10 34044851 1I TGTTCATTCC -/T TTTTTTTTTT 2317 het 2317 ref 46 18 10 18 T 16 17 131723 CASAVA_Build 10 34101739 3D GTTGGGGTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TTA 7 6 131724 CASAVA_Build 10 34112916 1D TATCTTCTGG T/- GGCTATGCAG 3070 hom 126 het 50 0 42 8 T 1 0 131725 CASAVA_Build 10 34114530 1D AGCTGCTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 10 9 131726 CASAVA_Build 10 34118344 2I TATATAAAAA --/AT AGATAAATAC 3070 hom 99 het 34 0 33 1 AT 0 1 131727 CASAVA_Build 10 34119009 1I GAAATGGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 33 2 30 1 T 12 13 131728 CASAVA_Build 10 34120061 1D AAGATAACCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 131729 CASAVA_Build 10 34122078 2I TTTGGGAGAC --/TG AGGCAGGAGA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TG 0 1 131730 CASAVA_Build 10 34148223 4D GAACTTTCTT TCTC/---- TCACTCAGGC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TC 3 1 131731 CASAVA_Build 10 34169011 10D TTATTTTTAC TTTTATTTTA/---------- TTTTATTTTA 2786 hom 21 het 12 0 8 4 TTTTA 4 2 131732 CASAVA_Build 10 34171288 4D TGGGTGTGTA CCAT/---- CCATCATTAG 3070 hom 75 het 27 0 26 4 CCAT 2 1 131733 CASAVA_Build 10 34181279 1D CTGCAGAGTG T/- TTTCCAACTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 4 3 131734 CASAVA_Build 10 34183504 2D AAAGGATGAT AA/-- GAGTCTACTA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 2 0 131735 CASAVA_Build 10 34184120 1D AAAGAATTCA C/- CCCTCACCAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 C 4 3 131736 CASAVA_Build 10 34184452 1D AATGGGGAAG A/- ATTTTGTCCT 3070 hom 120 het 42 0 41 2 A 2 1 131737 CASAVA_Build 10 34188683 1D GATTCTCTCA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 8 7 131738 CASAVA_Build 10 34191346 1I TAACACTGAT -/G GGAGCTATCG 3070 hom 105 het 37 0 36 2 G 2 3 131739 CASAVA_Build 10 34198320 1D GGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 36 3 24 9 T 11 10 131740 CASAVA_Build 10 34199474 2D GAGGACAAGC CT/-- GGAGGTGAGG 3070 hom 90 het 39 0 30 10 CT 1 0 131741 CASAVA_Build 10 34206063 1D AAAATACAAA G/- ACACAACCCC 3070 hom 78 het 31 0 26 7 G 1 0 131742 CASAVA_Build 10 34215100 1D TCCATCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 24 1 16 7 A 12 11 131743 CASAVA_Build 10 34222975 2I AGAAAAGAAA --/AC ACTCTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 AC 1 2 131744 CASAVA_Build 10 34224811 1D CAGGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 2868 het 2439 hom 19 10 7 2 T 12 11 131745 CASAVA_Build 10 34226145 1D ATTTTTTTTT G/- TTTCGTTAGT 3070 het 332 hom 24 1 22 1 G 1 0 131746 CASAVA_Build 10 34293117 1I CCTCCAAGGA -/C CCCCTTTCCC 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 C 4 5 131747 CASAVA_Build 10 34294133 4D CTAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 AAAG 4 3 131748 CASAVA_Build 10 34310239 6D TTTCTCCAGT TCTCAC/------ TCTCACACAA 3070 hom 105 het 41 0 39 2 TCTCAC 2 1 131749 CASAVA_Build 10 34333691 1D CCACACCAAG C/- CACACTAAGT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 2 1 131750 CASAVA_Build 10 34336277 4I ATTTCTAGCT ----/CTAA CTAACTGATG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 CTAA 1 2 131751 CASAVA_Build 10 34339294 3D GGAGAGAGAG AAA/--- AAGAAAGGAA 1983 het 5 hom 15 0 4 12 A 5 2 131752 CASAVA_Build 10 34342251 4I TGCCTTTTTG ----/TCTC TCTGTCTCTG 3070 hom 85 het 31 0 28 3 TC 1 3 131753 CASAVA_Build 10 34347153 1I AATAAATAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 34 het 18 0 12 6 T 8 9 131754 CASAVA_Build 10 34366779 2D TAAATAAATT TA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 TA 1 0 131755 CASAVA_Build 10 34367835 1I TGTTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 1713 het 643 hom 23 4 8 11 A 15 16 131756 CASAVA_Build 10 34368132 2D AGACCCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 A 13 11 131757 CASAVA_Build 10 34403015 4D AGAGACAGAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 AGAA 4 3 131758 CASAVA_Build 10 34419660 1I TTTAGTATGT -/C CCCCCAGACA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 C 5 6 131759 CASAVA_Build 10 34431896 1I AATGGTATGT -/A AAAAAAAAAA 1743 het 1743 ref 29 17 5 7 A 13 14 131760 CASAVA_Build 10 34444639 1D CAATTTATAA T/- TTTTTTCTTT 1215 het 1215 ref 17 12 4 2 T 7 6 131761 CASAVA_Build 10 34452229 1I AAAATATGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 T 9 10 131762 CASAVA_Build 10 34456776 4I ATAGTTAAGA ----/ATGT ATTTATCACA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 ATGT 0 1 131763 CASAVA_Build 10 34460749 1D TTAGATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 T 11 10 131764 CASAVA_Build 10 34472235 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 2421 hom 21 6 14 2 CT 2 1 131765 CASAVA_Build 10 34476030 1D TATTTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 12 11 131766 CASAVA_Build 10 34476367 1I CTAGTTTGAC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 7 8 131767 CASAVA_Build 10 34477703 2D AGGTGTTAAT TC/-- TCTGTCTTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TC 2 1 131768 CASAVA_Build 10 34480107 2D GTAAGCTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 35 0 28 7 T 14 12 131769 CASAVA_Build 10 34481711 1D CCATGCAGAC A/- ACTGGCCGTA 3070 hom 138 het 54 0 46 9 A 2 1 131770 CASAVA_Build 10 34485766 6I ATATGAAAGG ------/AAAGAA AAAACAGCTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AAAGAA 0 1 131771 CASAVA_Build 10 34496519 11D AAATGGCAAA AGGTAATATTT/----------- AGGTATATGT 3070 hom 105 het 41 0 36 11 AGGTAATATTT 1 0 131772 CASAVA_Build 10 34496986 1D CTTAATATGG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 85 het 47 1 42 4 T 7 6 131773 CASAVA_Build 10 34505882 4D AGAAGCAGGT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 95 het 51 0 30 24 TG 11 9 131774 CASAVA_Build 10 34510433 1D TAGAAGAAAT G/- AGTGAGAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 0 131775 CASAVA_Build 10 34517683 2I TTAAAATCGC --/TA TTTTTTTTTT 1475 het 570 hom 36 2 13 21 TA 0 1 131776 CASAVA_Build 10 34518784 1D AGGAAAACCA C/- TGACAGTATT 3070 hom 120 het 46 0 41 6 C 1 0 131777 CASAVA_Build 10 34523547 2D ATGCCAAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 39 hom 30 1 13 17 T 20 18 131778 CASAVA_Build 10 34534230 1I TCTGACTGTA -/T TTTAGCCTGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 3 4 131779 CASAVA_Build 10 34540956 1D AGTGCTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 625 hom 35 3 21 11 T 17 16 131780 CASAVA_Build 10 34543062 1I CTTGAACTCC -/T TAGCTTCGAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 1 2 131781 CASAVA_Build 10 34574400 1I ACCCTGACTA -/G GAATTTAGAA 3070 het 3070 hom 49 17 24 8 G 1 2 131782 CASAVA_Build 10 34577524 1D AACATCCAAG T/- TAAGTGGCAG 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 2 1 131783 CASAVA_Build 10 34579603 1D AGCTGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 9 A 13 12 131784 CASAVA_Build 10 34579706 3D TAATTATCAT ATA/--- ATGATACAAG 3070 het 3070 hom 41 16 22 5 ATA 1 0 131785 CASAVA_Build 10 34581329 1I TATCTCCTCG -/T TCCTTCCTCT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 1 2 131786 CASAVA_Build 10 34581693 2I TATGTATGTC --/TA TATATATATA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 TA 7 8 131787 CASAVA_Build 10 34582618 12D TTTCAAAGAA TCAGACGACCAC/------------ TCAGAGAAGA 3070 het 3070 ref 48 25 21 4 TCAGACGACCAC 1 0 131788 CASAVA_Build 10 34583331 1D AAACAAAAAC A/- AAAACAAAAA 3070 het 334 hom 22 2 15 6 A 5 4 131789 CASAVA_Build 10 34588253 1D AATGGGTTTC A/- ACTGGGTGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 A 2 1 131790 CASAVA_Build 10 34591056 13D TAAAAATGTG GGTTTGTAGTCAA/------------- CTACATCTAC 3070 het 3070 ref 41 24 16 4 GGTTTGTAGTCAA 1 0 131791 CASAVA_Build 10 34593682 2D AAAACTGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2077 het 25 hom 28 1 7 20 T 18 16 131792 CASAVA_Build 10 34595164 1I GTCTTTCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 34 0 24 10 A 12 13 131793 CASAVA_Build 10 34596056 1D TGTCAACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2727 hom 37 10 16 11 T 13 12 131794 CASAVA_Build 10 34597083 1D AAGATCGTTT A/- AAAATTGTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 5 4 131795 CASAVA_Build 10 34605182 1D TCCTTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 11 10 131796 CASAVA_Build 10 34607150 1I CCTGCTAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 8 9 131797 CASAVA_Build 10 34621995 1D AAAATCAAAC A/- AATAAACAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 A 3 2 131798 CASAVA_Build 10 34623018 3I ACCTTTCTCT ---/AGG AGGACAAACA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 AGG 1 2 131799 CASAVA_Build 10 34629566 1D GATCTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 199 hom 26 2 17 7 A 15 14 131800 CASAVA_Build 10 34632002 3D AAACCAAGTT TTA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TTA 1 0 131801 CASAVA_Build 10 34632406 2I CCTCCATTCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 32 1 25 6 A 10 12 131802 CASAVA_Build 10 34633273 1I CTACAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2594 hom 30 10 12 8 A 14 15 131803 CASAVA_Build 10 34635153 3I AGGCAGAGGT ---/TGC TGCAGTGGGC 2706 het 2706 ref 23 9 7 7 TGC 1 2 131804 CASAVA_Build 10 34635988 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 1711 het 1068 hom 9 4 5 0 T 10 9 131805 CASAVA_Build 10 34660688 1I AATTAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 11 12 131806 CASAVA_Build 10 34677935 1D TGTTTTAATG A/- AAGAACATTT 3070 het 3070 hom 41 18 22 2 A 3 2 131807 CASAVA_Build 10 34692262 1I GGGATAGTTT -/C ATTTATTATA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 C 0 1 131808 CASAVA_Build 10 34697962 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCCCTCAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 C 6 7 131809 CASAVA_Build 10 34705716 10D ATAGAAACCA TATATGAAAC/---------- TATAAGAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 22 5 TATATGAAAC 1 0 131810 CASAVA_Build 10 34716738 1D AACCTATGTG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 T 8 7 131811 CASAVA_Build 10 34736780 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 A 10 9 131812 CASAVA_Build 10 34740416 6D TAGAACAAAA AGGCTG/------ AGGAAGAGGA 3070 het 3070 ref 36 20 13 5 AGGCTG 1 0 131813 CASAVA_Build 10 34747862 6D ATGTCACCAT AACAGG/------ CTAATTTTTG 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 AACAGG 1 0 131814 CASAVA_Build 10 34766016 4I TTTAAAAATT ----/AAAA AAAGAATGTT 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 A 3 7 131815 CASAVA_Build 10 34768678 2D AAAAATAATA AC/-- ATGTCAAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 AC 1 0 131816 CASAVA_Build 10 34772957 2I CAGTTTGCCT --/CA GTTTGTATAA 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 CA 0 1 131817 CASAVA_Build 10 34774722 1D TGCAGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 13 12 131818 CASAVA_Build 10 34776739 10I ACTCTGTCTC ----------/AAAAAAAAAA AAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 4 14 131819 CASAVA_Build 10 34778533 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAG 1905 het 1905 ref 25 10 9 6 A 9 10 131820 CASAVA_Build 10 34778584 1D TCTGAGTCTT C/- CATATGAAAG 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 C 2 1 131821 CASAVA_Build 10 34783552 1D AAGATTATAC A/- AAAAAAAATG 2735 het 2735 ref 23 14 7 2 A 9 8 131822 CASAVA_Build 10 34809729 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1486 het 568 hom 17 3 6 8 T 19 18 131823 CASAVA_Build 10 34811929 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 14 1 12 1 A 12 13 131824 CASAVA_Build 10 34825826 11D TAACGTTTAA AAATAGTATAC/----------- TATTTTTAAA 3070 het 3070 hom 37 16 21 5 AAATAGTATAC 1 0 131825 CASAVA_Build 10 34840469 4I GAGAATGAAT ----/GCAG GCAGCATCCT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 GCAG 1 2 131826 CASAVA_Build 10 34840591 1D TACATATATA C/- AAAGTGATTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 C 1 0 131827 CASAVA_Build 10 34860940 3D GGAGGGGGCT ATG/--- ATATTACTAT 3070 het 3070 hom 50 18 29 3 ATG 1 0 131828 CASAVA_Build 10 34875451 1D19M3D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAGTGGAATTTTG/-AAAAAAAAAAAGTGGAATT--- TTGTTGTTTT 2326 het 2099 hom 17 6 6 9 N/A 0 0 131829 CASAVA_Build 10 34877497 1D AAGATAACAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 A 9 8 131830 CASAVA_Build 10 34885320 1D TTCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2547 het 1507 hom 32 10 8 14 T 15 14 131831 CASAVA_Build 10 34888386 1D AAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 A 13 12 131832 CASAVA_Build 10 34889397 1I TTGATGAAAA -/C GAGGACACAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 C 0 1 131833 CASAVA_Build 10 34896942 1D CAGGTTAAGG A/- ACAAAACCAA 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 A 2 1 131834 CASAVA_Build 10 34904888 4D TCTGTAGGTT CTAA/---- CTGAGATGCA 3070 het 3070 ref 42 26 11 6 CTAA 1 0 131835 CASAVA_Build 10 34927232 1I CAATTACCAC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 7 8 131836 CASAVA_Build 10 34995173 4I AGCCAATTCT ----/CAAA CAAAGAAAAA 3070 hom 147 het 54 0 49 5 CAAA 1 2 131837 CASAVA_Build 10 35000804 1I ATATAACTCT -/A AGATTTACAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 1 2 131838 CASAVA_Build 10 35020735 4D ACCTACAACC ATCT/---- ATCTGATCTT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 ATCT 2 1 131839 CASAVA_Build 10 35031131 1D TTTTAATATT A/- AAAAAAAAAA 1408 het 707 hom 8 3 3 2 A 12 11 131840 CASAVA_Build 10 35034425 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1308 hom 34 4 15 15 A 13 14 131841 CASAVA_Build 10 35039391 3I TTCCCAATAA ---/AAT AATGACTGTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAT 1 2 131842 CASAVA_Build 10 35056505 1D GCTATGTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 44 het 34 1 30 3 T 10 9 131843 CASAVA_Build 10 35057094 1I TTATTCTCTA -/T TTTTCTATCT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 4 5 131844 CASAVA_Build 10 35060054 1I CTATGAGCAA -/T TTTTTTTACG 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 7 8 131845 CASAVA_Build 10 35067452 2I AGCACATCAC --/TT TACCTCATTA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 1 3 131846 CASAVA_Build 10 35079626 1D GACATAACAA T/- TTTTTTTTTT 2931 het 328 hom 19 4 9 6 T 15 14 131847 CASAVA_Build 10 35080151 1D TAAATGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 27 18 10 A 11 10 131848 CASAVA_Build 10 35081887 4I GTGGAAATTC ----/TCTA TCTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 TCTA 0 1 131849 CASAVA_Build 10 35084704 1D TATAACATGC T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 59 19 34 6 T 8 7 131850 CASAVA_Build 10 35089126 5D GTGTGGGGGA CAGCG/----- CAGCGGTGTA 3070 het 3070 ref 30 16 11 5 CAGCG 2 1 131851 CASAVA_Build 10 35095640 1I AGGGGTATAG -/A AAACAAAGGC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 3 4 131852 CASAVA_Build 10 35096535 4D TTTCTTTGTC TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 49 22 22 6 TGTT 3 2 131853 CASAVA_Build 10 35103654 1I CAATAAAACA -/T TCCTTCTCAC 3070 het 3070 hom 55 23 30 2 T 1 2 131854 CASAVA_Build 10 35118469 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1120 het 1120 ref 31 19 3 9 A 11 12 131855 CASAVA_Build 10 35118681 4D TTATATATAC ACAA/---- ACAAACAGAA 3070 het 3070 hom 28 10 16 6 ACAA 2 1 131856 CASAVA_Build 10 35120778 1D TGCCTCGTTT A/- AAAAAAAAAA 947 het 947 ref 33 16 4 13 A 17 16 131857 CASAVA_Build 10 35127097 1D CTACAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 A 10 9 131858 CASAVA_Build 10 35127607 1D CCATTGCACT C/- CAGACTGGGG 1582 het 1582 ref 32 17 7 8 C 2 1 131859 CASAVA_Build 10 35136623 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATATAAA 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 TGTA 1 0 131860 CASAVA_Build 10 35137117 5I GTGTGGCGGC -----/ACACA ACACAACTGT 2665 het 1997 hom 28 10 9 9 ACACA 1 2 131861 CASAVA_Build 10 35137295 1D ACTAAAAGAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 9 8 131862 CASAVA_Build 10 35138954 2I TGACTGTCAT --/TA TGTTACTAAT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 TA 0 1 131863 CASAVA_Build 10 35139618 4I AGCAATAGTG ----/GGAC GGACACCTGG 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 GGAC 1 2 131864 CASAVA_Build 10 35142224 14D ACGTACTGCA GAGTGCATATTACT/-------------- TTATTTCTCT 3070 het 3070 ref 49 25 24 8 GAGTGCATATTACT 1 0 131865 CASAVA_Build 10 35150792 2I AAGGAAGAAG --/GA GAGAGAGAAA 2309 het 749 hom 10 2 5 3 GA 4 5 131866 CASAVA_Build 10 35150907 2I AGGAAAATAA --/AG AGAGAAAGAA 3070 het 1140 hom 18 4 11 3 AG 2 3 131867 CASAVA_Build 10 35151723 1D CATGCATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1327 hom 34 8 14 12 T 13 12 131868 CASAVA_Build 10 35158057 5D AAATAAAATG TTATA/----- TTATGAAGAA 3070 het 3070 hom 33 13 19 3 TTATA 1 0 131869 CASAVA_Build 10 35179182 4I AGAAAGAACA ----/AAAG AAAGAAAGGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAAG 2 3 131870 CASAVA_Build 10 35179955 1D TTTTGAGGAA T/- TTTTTTTTTT 1330 het 5 hom 17 0 6 12 T 15 14 131871 CASAVA_Build 10 35182583 13D TTTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 1826 het 52 hom 12 1 6 9 T 25 12 131872 CASAVA_Build 10 35185443 1D AACCCCTGTC T/- TCTGGCAGGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 131873 CASAVA_Build 10 35185729 1D TCTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1966 het 1750 hom 28 10 10 8 A 17 16 131874 CASAVA_Build 10 35188046 1D GCAAGCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 237 hom 49 1 43 5 T 11 10 131875 CASAVA_Build 10 35191283 1D TTTAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 956 hom 37 3 19 15 T 17 16 131876 CASAVA_Build 10 35192277 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2187 het 2109 hom 22 8 7 7 T 13 12 131877 CASAVA_Build 10 35196321 1I TCTTTTATTA -/C CTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 26 2 21 3 C 1 2 131878 CASAVA_Build 10 35201906 3D AAATATTTAA AAC/--- AATAATGACT 3070 het 3070 ref 38 23 14 2 AAC 1 0 131879 CASAVA_Build 10 35205160 1D TTCTACAAAA G/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 G 1 0 131880 CASAVA_Build 10 35209057 2D ATCTCTATAT TA/-- TTTTTTTTAA 3070 het 1118 hom 11 3 8 1 TA 1 0 131881 CASAVA_Build 10 35210897 4D TTCCGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 451 hom 18 4 7 7 AAAC 3 2 131882 CASAVA_Build 10 35216726 1D TTTCCCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2436 hom 29 7 15 7 A 13 12 131883 CASAVA_Build 10 35218922 1I AAAAAAAAAA -/T AAATAATAAA 3070 het 2256 hom 18 7 10 1 T 0 1 131884 CASAVA_Build 10 35221014 1D GAAGGTGACC T/- TTTTTTTTTT 1724 het 1724 ref 48 24 7 17 T 15 14 131885 CASAVA_Build 10 35243510 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1531 het 285 hom 17 3 7 7 T 14 15 131886 CASAVA_Build 10 35253921 1D TAGGCAAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 10 9 131887 CASAVA_Build 10 35260600 4I ACGAACACTG ----/TTTA TTTGTCTCAA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 TTTA 0 1 131888 CASAVA_Build 10 35266679 1D GGCAATGTGG A/- AAAAAAAAAC 1360 het 1360 ref 41 34 3 5 A 10 9 131889 CASAVA_Build 10 35267615 1D CCTGCCCCAC T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 7 6 131890 CASAVA_Build 10 35269235 1I CAAAGTGTCT -/C CACCCATCTG 3070 het 1547 hom 17 5 10 2 C 1 2 131891 CASAVA_Build 10 35275207 1I GAACTGAGGG -/T TCCTCCCCTT 3070 hom 54 het 19 0 18 1 T 1 2 131892 CASAVA_Build 10 35278790 1I GATTCCAAAG -/T TTTTTTACCT 1520 het 1520 ref 16 9 5 2 T 6 7 131893 CASAVA_Build 10 35283535 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2203 het 444 hom 28 3 11 14 T 17 16 131894 CASAVA_Build 10 35287104 1I GCCCAGCTAA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 3 4 131895 CASAVA_Build 10 35288627 3D GCAGGTTGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 1814 het 573 hom 8 2 5 1 A 15 12 131896 CASAVA_Build 10 35289362 4I CCACGCTCGG ----/CTAA CTTTTTGTAT 2245 hom 21 het 8 0 8 0 CTAA 0 1 131897 CASAVA_Build 10 35290233 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTCTTTTT 3070 het 2381 hom 29 10 16 3 T 5 4 131898 CASAVA_Build 10 35308008 1D TCTTGTGGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2812 hom 29 10 11 8 A 10 9 131899 CASAVA_Build 10 35326475 7D ACTGTCTCAA AAAAAAG/------- AAAAAAGAAA 2620 het 2620 ref 27 19 7 8 AAAAAAG 2 1 131900 CASAVA_Build 10 35330108 12D GGTTTTCCTG GGTCTCTAGCTA/------------ GCAGACAGCA 2612 het 2612 ref 30 23 9 3 GGTCTCTAGCTA 1 0 131901 CASAVA_Build 10 35342279 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1401 het 1196 hom 14 7 5 2 A 17 16 131902 CASAVA_Build 10 35350405 5D43M2D9M1D28M4D ACACACACAC AAATATGTAGTGATAAAACTATATAGATGATATTTCCATAATTAATACATGTTTATATTAATGTCAATTTTAATGTATGAATATGTATTAAA/-----CGTAGTGATAAAACTATGTAAATGATATTTCCATAATTAATAC--GTTTATATT-ATGTTACTTTTAATGGATGAATATGTAT---- TAAAAACCCA 3070 het 3070 ref 36 48 9 69 N/A 0 0 131903 CASAVA_Build 10 35351011 2D AACTATGTAC GT/-- ATGTCTGTCT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 GT 1 0 131904 CASAVA_Build 10 35352693 1I TTTCTTAGGG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 0 1 131905 CASAVA_Build 10 35359756 5I GAGCCCAGGA -----/GGATC GTTAGAGTCC 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 GGATC 0 1 131906 CASAVA_Build 10 35368362 1D GTGATCTCTG T/- TATGAATAAC 3070 het 3070 hom 23 8 12 4 T 2 1 131907 CASAVA_Build 10 35370480 5D TTTCTTTTTC TTTCT/----- TTTGTCAGAC 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 TTTCT 1 0 131908 CASAVA_Build 10 35374337 5I CCTGGGCAAT -----/AGAGC AGAGCGAGAC 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 AGAGC 1 2 131909 CASAVA_Build 10 35377152 4I ATGCAAAACT ----/CTAC CTAAGAGAGC 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 CTAC 0 1 131910 CASAVA_Build 10 35383204 2I TTTTTCGTTC --/CT CTGAGGATTC 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 CT 1 2 131911 CASAVA_Build 10 35388393 1I ATCAACAGCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 T 8 9 131912 CASAVA_Build 10 35395409 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTAGTAAA 1289 het 1289 ref 17 5 4 8 T 5 4 131913 CASAVA_Build 10 35416819 1I ATCTAAGAAC -/A AAAGCCAACA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 3 4 131914 CASAVA_Build 10 35417364 1I3M6I ATTGCTTGAA -CTG------/CCTGGGAGGC GGAGGTTGCA 3070 het 3070 hom 27 14 13 0 N/A 0 0 131915 CASAVA_Build 10 35420558 1D TGTCTGGTCC T/- TTTTTTTTTT 1867 het 1867 ref 31 19 5 7 T 11 10 131916 CASAVA_Build 10 35421723 1D AAACTACCCC T/- GCTCTTGCTT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 1 0 131917 CASAVA_Build 10 35421825 2I GTAGGCATAT --/AC TTCTATTAAT 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 AC 0 1 131918 CASAVA_Build 10 35426893 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 19 8 8 4 A 7 6 131919 CASAVA_Build 10 35443017 1D AATTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1149 het 360 hom 10 2 4 5 T 12 11 131920 CASAVA_Build 10 35443761 1I GGTCTGAAAT -/A AAAAAATACA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 6 7 131921 CASAVA_Build 10 35445891 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1936 hom 26 8 8 10 A 15 16 131922 CASAVA_Build 10 35447617 7D TTTCCCTCTG TGCTCAT/------- TGCTCATACT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 TGCTCAT 2 1 131923 CASAVA_Build 10 35462243 1D CAAAAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 1256 het 1256 ref 30 12 3 15 T 17 16 131924 CASAVA_Build 10 35465143 5I CAAATAAAAC -----/AAAAT ATTTCCAAGT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 AAAAT 0 1 131925 CASAVA_Build 10 35474079 4I TGGGTGACAG ----/AGCA AGCAAGACAC 2210 het 1085 hom 28 6 7 17 AGCA 1 2 131926 CASAVA_Build 10 35477246 1I TCAACCTGTA -/T TTTCCAAATA 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 T 3 4 131927 CASAVA_Build 10 35481718 5D ATATTGTATG TACAA/----- TACAAGTAGT 3070 het 3070 ref 37 20 15 6 TACAA 2 1 131928 CASAVA_Build 10 35482002 3D TCTCTTTAAT AAA/--- AAATAAATTA 3070 het 2552 hom 22 7 14 2 A 6 3 131929 CASAVA_Build 10 35486211 4I ACACACCCAC ----/AACT AACTAACATC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 AACT 1 2 131930 CASAVA_Build 10 35486810 1I TTAGATCTAA -/T TACATGAATT 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 T 1 2 131931 CASAVA_Build 10 35490598 1D CTGTCTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 10 7 4 A 11 10 131932 CASAVA_Build 10 35495201 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 8 9 131933 CASAVA_Build 10 35501064 10D ATTTTTTTCC TTTGTTTTCT/---------- TTTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 16 12 2 TTTGTTTTCT 1 0 131934 CASAVA_Build 10 35501507 1D CCACTTGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 44 1 33 12 T 13 12 131935 CASAVA_Build 10 35501644 1I GCAGAAAGCA -/C CCCCCCCGCT 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 C 7 8 131936 CASAVA_Build 10 35511317 1I GAGCTGTAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 8 9 131937 CASAVA_Build 10 35513732 4D AGTAAAGCAA AAAG/---- AAAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 13 8 AAAG 2 1 131938 CASAVA_Build 10 35520873 10I CACTACTATC ----------/CCACCTGGTG CTTGATGCCA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 CCACCTGGTG 0 1 131939 CASAVA_Build 10 35523257 1D TTTGACATTT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 26 11 9 8 A 8 7 131940 CASAVA_Build 10 35523676 2D AGTCAATGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2764 hom 32 8 16 8 T 14 12 131941 CASAVA_Build 10 35541238 1D TTGCTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 11 10 131942 CASAVA_Build 10 35543579 4I GCACTGGGAC ----/TGAG TGAGCACTTA 3070 het 3070 ref 42 25 12 5 TGAG 1 2 131943 CASAVA_Build 10 35544014 2I GTGTGGGATC --/CA GAGTTCTCAC 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 CA 0 1 131944 CASAVA_Build 10 35550878 1D CAAAACAAAA C/- AAATATATAA 3070 het 3070 ref 30 21 9 2 C 1 0 131945 CASAVA_Build 10 35551824 13D TTCAAACAGT CCTCCCACCTCGG/------------- CCTCCCAAAG 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 CCTCCCACCTCGG 1 0 131946 CASAVA_Build 10 35554009 2D GAAAGAAAAC AT/-- ATTTCACTTG 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 AT 2 1 131947 CASAVA_Build 10 35569207 9I TTTTCTTTTT ---------/TTTTCTTTC TTTTTTTTTT 2699 het 448 hom 21 7 13 1 TTTTCTTTC 0 1 131948 CASAVA_Build 10 35570965 1I ATCAAGTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 11 15 15 T 13 14 131949 CASAVA_Build 10 35585238 1D GTTTACTTGA T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 T 7 6 131950 CASAVA_Build 10 35585686 3I ATTAAAAAAA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 het 2726 hom 33 12 16 7 AAC 0 1 131951 CASAVA_Build 10 35586122 12D TAATTCTCTC TTTCTTTTCTTT/------------ TTTCTTTTCT 1548 het 1548 ref 27 17 7 4 TTTCTTTTCTTT 2 1 131952 CASAVA_Build 10 35588604 10D GCCTGGCTAA TTGTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1710 het 663 hom 11 4 5 2 TTGTTTTTTT 1 0 131953 CASAVA_Build 10 35590999 1I GAGTTCGAGA -/C CAGCCTGGGC 3070 het 2929 hom 18 7 9 2 C 1 2 131954 CASAVA_Build 10 35591860 1I TTCTAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2518 het 2518 ref 23 10 9 4 A 10 11 131955 CASAVA_Build 10 35595874 2I AAACATTAGC --/TG TGTGTGGTGG 3070 het 1990 hom 20 5 13 2 TG 3 4 131956 CASAVA_Build 10 35612718 1D CGGTTTTTCT A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 7 6 131957 CASAVA_Build 10 35635905 4I TCAGGGAATC ----/AGTG AGTAAGTTCT 3070 het 3070 ref 56 28 18 10 AGTG 0 1 131958 CASAVA_Build 10 35650049 1D GGCTTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1492 hom 39 10 12 17 A 18 17 131959 CASAVA_Build 10 35652459 3D AAGAAACCTT ACA/--- CACAAGAGTC 3070 het 3070 ref 47 26 20 1 ACA 1 0 131960 CASAVA_Build 10 35652952 1D ACTTTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 15 14 131961 CASAVA_Build 10 35657657 1I AGAGCTGTCA -/G GGCCAGGTTT 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 G 2 3 131962 CASAVA_Build 10 35666667 1D CATTCTACCG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 8 7 131963 CASAVA_Build 10 35673348 1D GCCTTGGGCT G/- GGCGCCGTGG 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 G 3 2 131964 CASAVA_Build 10 35683801 3D ATAGTAAATT CTC/--- CTATCTTTCT 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 CTC 1 0 131965 CASAVA_Build 10 35686037 10D TTTTGGGCAT CCCGCATCAC/---------- CCCGCATCAC 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 CCCGCATCAC 2 1 131966 CASAVA_Build 10 35688426 3D AACTCTTTAT TTA/--- TTATTATTAT 2972 het 1347 hom 19 4 7 8 TTA 7 6 131967 CASAVA_Build 10 35720914 5D CCTTCTATAA CATTT/----- ATTCCTATAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 8 CATTT 1 0 131968 CASAVA_Build 10 35728250 21I GCTTGACTGC ---------------------/CCAGGGGGTCCTTCTCCATGG CCAGGATGCT 3070 hom 96 het 35 0 30 8 CCAGGGGGTCCTTCTCCATGG 0 1 131969 CASAVA_Build 10 35738124 1D TACAGTGTGG C/- CAGCTGCCTT 2939 het 2939 ref 45 24 13 8 C 2 1 131970 CASAVA_Build 10 35748468 1D AGACCGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1127 hom 36 6 14 16 T 15 14 131971 CASAVA_Build 10 35767259 1I ATTAAAAAAA -/G AAATTTTTTT 2962 het 2633 hom 22 9 10 3 G 0 1 131972 CASAVA_Build 10 35786520 1D CATAGATGTA T/- TTTTTTTTTT 1888 het 1888 ref 29 18 5 6 T 13 12 131973 CASAVA_Build 10 35814659 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 865 het 61 hom 12 2 4 6 A 15 14 131974 CASAVA_Build 10 35820788 1D ACCTCGTGAT C/- CCACCCGCCT 1427 het 1247 hom 11 3 6 2 C 3 2 131975 CASAVA_Build 10 35856018 1I ATCCAGAAGC -/A AGACACCTAG 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 1 2 131976 CASAVA_Build 10 35872636 1D CTTCTACTTA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 T 4 3 131977 CASAVA_Build 10 35880523 5D TGTAGTAGTA ATTTC/----- ATAGTTCAGA 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 ATTTC 1 0 131978 CASAVA_Build 10 35891813 1D AGCTCTTTTT A/- ACATCATTTT 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 A 2 1 131979 CASAVA_Build 10 35893123 1I CTAAATTCTT -/A AAAACTATGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 4 5 131980 CASAVA_Build 10 35900898 1D ACTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 13 12 131981 CASAVA_Build 10 35902028 2I TTATTTTTAA --/AT ATATATATAT 1674 het 1585 hom 11 4 5 2 AT 6 7 131982 CASAVA_Build 10 35917110 1I TGTTACCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 19 17 13 T 9 10 131983 CASAVA_Build 10 35926407 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1462 het 289 hom 18 5 5 8 A 17 16 131984 CASAVA_Build 10 35936218 6I AACTACCTGA ------/TGCTCT TGCTGTGAGT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TGCTCT 0 1 131985 CASAVA_Build 10 35938473 1D AGAAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 17 9 T 13 12 131986 CASAVA_Build 10 35940792 11D CAGGTGGTGA CTCAGGGACCC/----------- CTCCATCCTG 3070 hom 120 het 41 0 38 6 CTCAGGGACCC 1 0 131987 CASAVA_Build 10 35943646 3D GGTTTATGAA ATG/--- ATGTGTTATT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 ATG 2 1 131988 CASAVA_Build 10 35943994 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 29 5 17 9 A 15 14 131989 CASAVA_Build 10 35948739 1I GTTTCTGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 62 het 26 0 19 7 T 9 10 131990 CASAVA_Build 10 35959170 2D ACACCTGGCC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 30 het 15 0 10 5 TG 9 8 131991 CASAVA_Build 10 35962828 1D TATGAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 920 hom 34 3 15 17 T 17 16 131992 CASAVA_Build 10 35967352 1D GCAAAAACTC A/- ATTTTGATTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 2 1 131993 CASAVA_Build 10 35967674 1I TATTTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 449 hom 23 1 18 4 T 10 11 131994 CASAVA_Build 10 35979735 4D CTCTTTGTGT CTAA/---- CTAACTTCTG 3070 hom 108 het 41 0 36 7 CTAA 2 1 131995 CASAVA_Build 10 35984384 1D CCTTTGTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 10 9 131996 CASAVA_Build 10 35985244 1I TATTTTAATG -/A CTAAGGTTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 131997 CASAVA_Build 10 35992213 1I CTATTACTTA -/T TGGCAGAAGC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 1 2 131998 CASAVA_Build 10 36010196 1I TAAAAGTCCC -/T GTGCATGTGG 3070 hom 153 het 55 0 51 4 T 0 1 131999 CASAVA_Build 10 36012976 2I CTCAAAATCA --/TT TTTTTTTTTT 2336 hom 41 het 34 0 14 20 T 10 12 132000 CASAVA_Build 10 36015302 13D TATAGGTATG AGCCACTGCACCC/------------- AGCCAAGAAG 3070 hom 63 het 21 0 22 1 AGCCACTGCACCC 1 0 132001 CASAVA_Build 10 36016634 4D AAGTCTTTCC TTCT/---- TTTCTTTCCT 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 TTCT 1 0 132002 CASAVA_Build 10 36025770 4D TAGTTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 77 het 35 0 24 12 TG 10 8 132003 CASAVA_Build 10 36030679 1D TGGTATTTTG C/- CACCCATCCG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 2 1 132004 CASAVA_Build 10 36032531 1I TCCTGAACGC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 412 hom 36 1 29 6 T 8 9 132005 CASAVA_Build 10 36041491 1I ATATGTACAC -/G TAACAGAAAC 3070 hom 87 het 33 0 27 6 G 0 1 132006 CASAVA_Build 10 36044759 2D ACAGAGACAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 80 het 30 0 24 6 AG 9 8 132007 CASAVA_Build 10 36052288 1I GTAGACGCAG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 396 hom 40 1 36 3 A 7 8 132008 CASAVA_Build 10 36057994 4I ACACACACAC ----/AACT AATTATATAT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 AACT 0 1 132009 CASAVA_Build 10 36063860 1D CTTTGATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 37 0 31 7 T 11 10 132010 CASAVA_Build 10 36064040 1D TTAAAAACAA T/- TTTTTCTGTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 6 5 132011 CASAVA_Build 10 36064422 3D GTTCAGTTAA CTT/--- CTTTTTATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 CTT 2 1 132012 CASAVA_Build 10 36064981 1D TGTATTGCTA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 8 7 132013 CASAVA_Build 10 36069255 1D TTTGAAACTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 9 8 132014 CASAVA_Build 10 36081158 1D CATAAGTAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 39 0 35 4 T 10 9 132015 CASAVA_Build 10 36081292 1D TGGGACTACA G/- GCGCCCGCCA 3070 hom 45 het 24 0 13 11 G 2 1 132016 CASAVA_Build 10 36084020 1D TTCAAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 31 1 25 5 T 11 10 132017 CASAVA_Build 10 36090864 1D TTTTTGAGAT G/- GGAGTCTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 3 2 132018 CASAVA_Build 10 36164609 1I AGATGTGAAA -/G GATGTATGGT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 G 1 2 132019 CASAVA_Build 10 36168786 1D GGTGAGAGAT A/- GGGGTTTAGT 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 A 1 0 132020 CASAVA_Build 10 36170786 2D TTAGGAATTA TT/-- TTCTTTGTTT 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 T 4 2 132021 CASAVA_Build 10 36174338 4D AAACATAAAT TGCA/---- TGCACTCCAT 3070 het 3070 ref 48 29 18 2 TGCA 2 1 132022 CASAVA_Build 10 36179076 1I CTTTCCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2821 hom 26 7 15 4 T 10 11 132023 CASAVA_Build 10 36223490 2D TGCAGCCATG AA/-- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 50 30 17 3 A 10 8 132024 CASAVA_Build 10 36224173 1I TTTAAAAAAT -/A AAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 5 6 132025 CASAVA_Build 10 36234820 1D TGGGCATTTA G/- GTTGATTCCA 3070 het 3070 ref 58 24 22 13 G 2 1 132026 CASAVA_Build 10 36236297 1D ACAAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 2210 het 2210 ref 16 8 5 3 A 11 10 132027 CASAVA_Build 10 36241073 3I TTATTATATA ---/ATT ATATAATGCT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 ATT 0 1 132028 CASAVA_Build 10 36241733 1D GATTTCATAG C/- GTAGGAGAGT 3070 hom 120 het 45 0 39 6 C 1 0 132029 CASAVA_Build 10 36243541 1D GTGGGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 41 1 28 12 T 12 11 132030 CASAVA_Build 10 36245918 3I GGCTAGATGA ---/AAG AGGGAGGCTC 3070 hom 84 het 35 0 28 7 AAG 0 1 132031 CASAVA_Build 10 36278455 1D ATGATTGTTA T/- TAAGCAGTAA 3070 hom 129 het 45 0 40 5 T 2 1 132032 CASAVA_Build 10 36281626 1I CAAGAATAGT -/G GTGCTGTTTC 1336 het 1336 ref 48 42 3 3 G 1 2 132033 CASAVA_Build 10 36288865 2D CTAGCCACTC TT/-- TGTTTCCCCC 3070 het 2187 hom 33 7 16 13 T 3 1 132034 CASAVA_Build 10 36297134 1I TCATCACTCC -/T TTTTCAATAG 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 4 5 132035 CASAVA_Build 10 36304970 1D ATTTTCATTT A/- AACTTTAGAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 3 2 132036 CASAVA_Build 10 36307183 1I CATTGTGAGT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 7 8 132037 CASAVA_Build 10 36333439 2D GGGATGCATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 TG 10 9 132038 CASAVA_Build 10 36334736 1D18M2I ATGGAAAAAT AAAAAAAAAATAAATGATG--/-AAAAAAAAATAAATGATGAA AAAAAAAAAA 3046 het 1027 hom 21 4 11 10 N/A 0 0 132039 CASAVA_Build 10 36345607 4D GCACCCGGCC TCTT/---- TTTTTTTGTT 363 het 363 ref 16 6 4 8 TCTT 1 0 132040 CASAVA_Build 10 36347519 1I TTAGAAATGG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 7 8 132041 CASAVA_Build 10 36349844 17I TAGGAAGAGC -----------------/GCTTGGGAGAGTGTCTG GCACGCGGTA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 GCTTGGGAGAGTGTCTG 0 1 132042 CASAVA_Build 10 36353569 1I CCCTAAGTTG -/T TTTACCTGCA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 T 3 4 132043 CASAVA_Build 10 36354902 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2867 hom 21 7 12 2 A 12 13 132044 CASAVA_Build 10 36358539 1D TTTTGATGTT C/- CCCACCCTGG 2289 het 2289 ref 22 8 7 7 C 4 3 132045 CASAVA_Build 10 36363745 1I AGCTTCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 10 11 132046 CASAVA_Build 10 36366264 2D TTTTGGAGTC TA/-- TAACCAATTT 3070 het 3070 ref 49 30 17 3 TA 2 1 132047 CASAVA_Build 10 36366959 7D AAAAAAAAAA AAAAAAC/------- GCCACACTTT 3070 het 1772 hom 30 10 13 10 AAAAAAC 1 0 132048 CASAVA_Build 10 36381070 1D GTATCATAAT A/- AAAAGCCAGA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 5 4 132049 CASAVA_Build 10 36386775 1I CGTTAAGCTT -/A AAAAAAAAAA 2467 het 2467 ref 32 10 10 12 A 13 14 132050 CASAVA_Build 10 36412794 1D CGTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 10 9 132051 CASAVA_Build 10 36421335 1D TTCAAGCATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 10 9 132052 CASAVA_Build 10 36427058 1I TCATTGGCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 9 10 132053 CASAVA_Build 10 36436576 4D AGTATATATA TAAG/---- TGTGTGTATA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 TAAG 1 0 132054 CASAVA_Build 10 36456851 1I AAAACGCGTG -/A CACCAAGGAT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 0 1 132055 CASAVA_Build 10 36462641 1I GGGTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 T 10 11 132056 CASAVA_Build 10 36477884 2D TTTTCCTTGT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 11 9 132057 CASAVA_Build 10 36481851 1D TTAAAAAAAA C/- ATGTTATTTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 1 0 132058 CASAVA_Build 10 36488224 12D TCTTCAAATC TTTTGTCCATTT/------------ TTAAATTGGG 3070 het 3070 ref 32 22 9 3 TTTTGTCCATTT 1 0 132059 CASAVA_Build 10 36492804 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2800 hom 20 9 10 1 A 11 10 132060 CASAVA_Build 10 36499993 1D CAAATGGCAA T/- TTTTTTTGAC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 8 7 132061 CASAVA_Build 10 36501962 1D TTGGACCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 37 0 28 9 T 11 10 132062 CASAVA_Build 10 36503646 1D TGGTACTGAG A/- AAACTGGATA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 A 4 3 132063 CASAVA_Build 10 36503936 1D AATTGGACTT A/- ACAGTTCCAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 1 132064 CASAVA_Build 10 36509609 14D TCTCTCTTTC TCTCTCTCTCCCTT/-------------- TCTCTCTCTC 3070 hom 93 het 40 0 31 11 TCTCTCTCTCCCTT 2 1 132065 CASAVA_Build 10 36514749 1D TTTTTCTGCT C/- ATTAGCTACT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 1 0 132066 CASAVA_Build 10 36531351 1I GTTCCAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 41 2 35 4 T 10 11 132067 CASAVA_Build 10 36555288 13D AGGAGATCCG CCCACCTCAGCCT/------------- CCCAGATGCT 3070 hom 66 het 25 0 23 5 CCCACCTCAGCCT 1 0 132068 CASAVA_Build 10 36558409 1D TATTAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 20 5 T 12 11 132069 CASAVA_Build 10 36561279 1I CAGCCTGGGC -/G ACAGAGCGAG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 G 0 1 132070 CASAVA_Build 10 36564610 3I TCCTAAAGAC ---/ATG ATAAGAGACT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 ATG 0 1 132071 CASAVA_Build 10 36594499 1I CTTCAATGGA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 8 9 132072 CASAVA_Build 10 36605420 2D TAGCAAAAAC AT/-- AGAACCAACC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AT 1 0 132073 CASAVA_Build 10 36613636 8D TGTTGGAGGG AGTGGTAT/-------- AGTGGTATAG 3070 hom 66 het 33 0 23 10 AGTGGTAT 2 1 132074 CASAVA_Build 10 36617142 1D TTTCTAACTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 50 het 34 1 29 6 T 9 8 132075 CASAVA_Build 10 36623019 1D CTGTGTTATC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 9 8 132076 CASAVA_Build 10 36636443 2D GGAATACCTC TG/-- TGGGAACTCT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 TG 2 1 132077 CASAVA_Build 10 36639946 1I AGAATCTAGC -/T TATTTTTAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 2 132078 CASAVA_Build 10 36648604 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2064 hom 36 8 12 17 T 16 15 132079 CASAVA_Build 10 36680517 5D TTGCTTGCTA CTTGT/----- CTTATTTTAC 3070 het 3070 hom 46 19 23 9 CTTGT 1 0 132080 CASAVA_Build 10 36687359 4D GGAGTTCCAA TACC/---- TACCTCCATT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TACC 2 1 132081 CASAVA_Build 10 36689859 1I TGAATGCCGC -/A TGAGGCCCAG 3070 het 3070 ref 49 24 14 11 A 0 1 132082 CASAVA_Build 10 36763114 1D TAATATTGAG A/- ATTCTATAAT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 2 1 132083 CASAVA_Build 10 36766261 1D CTCAGATAAA T/- GCCTGGTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 0 132084 CASAVA_Build 10 36771811 1D CTCCGTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 12 11 132085 CASAVA_Build 10 36779731 1D GAAATAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 29 0 19 11 A 12 11 132086 CASAVA_Build 10 36781759 1D GTTTATCAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 A 10 9 132087 CASAVA_Build 10 36795482 1D TTATGTTTCT G/- ATCTTTGTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 G 1 0 132088 CASAVA_Build 10 36829599 1I ATTTAGTTGA -/T TTTTTTTTTT 1884 het 1884 ref 50 23 5 22 T 15 16 132089 CASAVA_Build 10 36846158 1D ACCAGAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 25 0 19 6 A 11 10 132090 CASAVA_Build 10 36847287 1D ATAATTCTGG A/- AAAAAGAGTG 3070 hom 154 het 54 0 52 2 A 6 5 132091 CASAVA_Build 10 36874510 4D ACAAAAACAG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 132 het 54 0 44 10 AAAC 5 4 132092 CASAVA_Build 10 36887998 5D AAAGTTGAGT CAAAG/----- CAAAGCAGTA 3070 hom 111 het 42 0 38 6 CAAAG 2 1 132093 CASAVA_Build 10 36894821 2D TACACACACG CA/-- CACACACACA 2835 het 2835 ref 57 44 6 7 CA 7 6 132094 CASAVA_Build 10 36896246 2I GTTAATTAAA --/AC ACAGATGTGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AC 1 2 132095 CASAVA_Build 10 36897297 4D AAAGTGTTCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2514 hom 24 het 9 0 7 2 T 15 11 132096 CASAVA_Build 10 36910221 1I ATGAGCCTGG -/A ATATCTTAAG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 1 2 132097 CASAVA_Build 10 36913013 1D TTTCTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 T 11 10 132098 CASAVA_Build 10 36923476 1I AGCAATGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 305 hom 20 1 14 5 T 13 14 132099 CASAVA_Build 10 36929586 2D CATTGTTTAG CT/-- GCCCCTTATT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 CT 1 0 132100 CASAVA_Build 10 36934582 1D ATTTAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 11 10 132101 CASAVA_Build 10 36938662 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAGA 1906 het 1540 hom 10 4 4 2 A 9 8 132102 CASAVA_Build 10 36947194 3D GAAAATACTT GAA/--- GAAGTTAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 21 3 GAA 2 1 132103 CASAVA_Build 10 36951235 2D TCCTAATCTC TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 61 het 37 1 31 7 T 10 8 132104 CASAVA_Build 10 36952286 1D TAGAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 1806 het 1806 ref 41 22 6 13 T 12 11 132105 CASAVA_Build 10 36960993 7D AAAAAAACAA AGGAGCC/------- AGGAGCCCAA 3070 hom 66 het 34 0 23 14 AGGAGCC 2 1 132106 CASAVA_Build 10 36962359 2D CACTAAAAAG TA/-- TATATATACT 2950 het 2022 hom 14 5 6 4 TA 5 4 132107 CASAVA_Build 10 36968498 1D CTATAGTATC T/- TTTTTTTTTT 2337 hom 17 het 16 0 9 7 T 15 14 132108 CASAVA_Build 10 36971234 7I CTAGGAAAAA -------/CATACAC CTAGCTTTAC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CATACAC 0 1 132109 CASAVA_Build 10 36976012 1I CCACAAACAA -/T TATTTAACCT 3070 hom 157 het 55 0 53 2 T 1 2 132110 CASAVA_Build 10 36977588 2D ATTATAAATT AA/-- AAAAGAGAAT 3070 het 3070 hom 33 11 19 5 A 6 4 132111 CASAVA_Build 10 36984923 1I AGCAGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 A 13 14 132112 CASAVA_Build 10 37004220 2D AAACACAGTC TA/-- TTTGTCTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 TA 1 0 132113 CASAVA_Build 10 37014287 1D CTTGTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 11 10 132114 CASAVA_Build 10 37027896 1I ATCCAATGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 A 8 9 132115 CASAVA_Build 10 37039634 1D CTGGTAAACA C/- TTAAGCTGTC 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 C 1 0 132116 CASAVA_Build 10 37043505 5I TATAAATTCA -----/TATAT TATATACTAT 1308 het 1308 ref 12 6 4 2 TATAT 1 2 132117 CASAVA_Build 10 37050446 1I TGATGTACTC -/A TAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 A 0 1 132118 CASAVA_Build 10 37069728 1I GTCTAGAAGG -/T TAAAATTGCA 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 T 1 2 132119 CASAVA_Build 10 37070761 2D GCCAGAGGTG AA/-- AAAAAGATCT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 7 5 132120 CASAVA_Build 10 37071675 1I GGAAATGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 11 12 A 10 11 132121 CASAVA_Build 10 37074720 1I GGATGACTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 12 13 132122 CASAVA_Build 10 37083630 8D GAGGCCAGAA TGATCATG/-------- TGATAAAGGA 3070 het 3070 ref 51 25 26 4 TGATCATG 1 0 132123 CASAVA_Build 10 37099678 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 31 1 22 8 A 14 15 132124 CASAVA_Build 10 37117839 4I GCTGGGATTA ----/CAGG CATAAGCCAC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 CAGG 0 1 132125 CASAVA_Build 10 37118539 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2334 het 392 hom 20 2 6 12 A 13 12 132126 CASAVA_Build 10 37124865 1I GTTAATTGAT -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 A 6 7 132127 CASAVA_Build 10 37136531 1D AAGCAGTAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 8 7 132128 CASAVA_Build 10 37144456 1I AACAGACTTG -/A GGATTACACA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 0 1 132129 CASAVA_Build 10 37147610 1D CAGCTAATGG T/- TTTTTTTTTT 1112 het 161 hom 21 1 10 11 T 13 12 132130 CASAVA_Build 10 37150102 2I TTCTGGACAC --/AA GAGGATCATA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 0 2 132131 CASAVA_Build 10 37150323 1D AAGGATGTAT A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 A 7 6 132132 CASAVA_Build 10 37151694 2I ACAGGTTTCC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 9 11 132133 CASAVA_Build 10 37153031 1D CCTATGATTT A/- TAAATAGTTC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 A 1 0 132134 CASAVA_Build 10 37156092 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3022 hom 20 10 10 1 A 10 9 132135 CASAVA_Build 10 37161975 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1582 het 1271 hom 17 7 5 5 A 17 16 132136 CASAVA_Build 10 37162686 5I CACTTGAGGT -----/CGGGA ATTTGAGAGT 1985 het 1985 ref 18 5 6 7 CGGGA 0 1 132137 CASAVA_Build 10 37181017 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 9 8 132138 CASAVA_Build 10 37188597 1I AGGCCAAGGC -/A GGAGGATCCA 3070 het 2519 hom 22 7 12 3 A 0 1 132139 CASAVA_Build 10 37191152 29D CCTCAGTATC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------------------- TTTTTTTTTT 2715 het 2715 ref 28 14 11 7 T 43 14 132140 CASAVA_Build 10 37194214 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 11 10 132141 CASAVA_Build 10 37203677 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1030 hom 10 het 5 0 4 1 T 13 14 132142 CASAVA_Build 10 37212839 1D13M1D AAAACAAAAC AAAAAACAAAAAACA/-AAAAACAAAAAAC- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 36 18 19 6 N/A 0 0 132143 CASAVA_Build 10 37221601 1I TGAATTTATA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 7 8 132144 CASAVA_Build 10 37229415 4D GGATTTTTAA AAAT/---- AAATATTTAT 3070 het 2681 hom 27 7 18 2 AAAT 2 1 132145 CASAVA_Build 10 37233189 4I AAGATTCTCT ----/TAAA TAGTGACAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TAAA 0 1 132146 CASAVA_Build 10 37233406 1D CTGATTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 T 13 12 132147 CASAVA_Build 10 37247050 1D AGGTTCTAGG T/- GGGGACTGAG 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 T 1 0 132148 CASAVA_Build 10 37247328 1D TCATGCCTGT A/- AATCCCGGCA 1904 het 1904 ref 17 7 5 5 A 3 2 132149 CASAVA_Build 10 37248435 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 11 12 132150 CASAVA_Build 10 37254699 16D ACACACAAAC ACACACACACACACAA/---------------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 21 13 9 ACACACACACACACAA 1 0 132151 CASAVA_Build 10 37256561 1I AGTGATCAGC -/A AATGATTTGC 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 2 3 132152 CASAVA_Build 10 37257389 1I TTCTTAGGGT -/A AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 53 27 24 2 A 5 6 132153 CASAVA_Build 10 37261489 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1832 het 512 hom 9 1 5 3 T 6 7 132154 CASAVA_Build 10 37266990 3D TTTCTATGTT AGG/--- AGTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 AGG 1 0 132155 CASAVA_Build 10 37275319 2I ATATTAACAA --/AG AGCTTATTTC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AG 1 2 132156 CASAVA_Build 10 37294419 1I TTACTTTATC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 8 9 132157 CASAVA_Build 10 37295266 3I TTGTAATGCC ---/GTA GAAGTGTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 GTA 0 1 132158 CASAVA_Build 10 37299692 1I CAAGTTTAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 9 10 132159 CASAVA_Build 10 37304553 3D AGATATTTTT AAG/--- AAGAAGATAT 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 AAG 3 2 132160 CASAVA_Build 10 37318789 1I AATAGCACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 10 11 132161 CASAVA_Build 10 37327586 1D TTATTTAGTG T/- ATACTATGTG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 1 0 132162 CASAVA_Build 10 37342785 1I CACCACCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 10 9 A 10 11 132163 CASAVA_Build 10 37352604 1D CTAGCATTTT A/- GAAGTAGTCA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 A 1 0 132164 CASAVA_Build 10 37383669 4I AGAAAGAGAT ----/AAAG AAAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AAAG 1 2 132165 CASAVA_Build 10 37385137 1D ATGTATAGAA T/- TTATTAAGTA 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 T 3 2 132166 CASAVA_Build 10 37394626 1D TGCAAATTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 9 8 132167 CASAVA_Build 10 37399336 1D TCAAGACCAT G/- CTTGGCCAAC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 1 0 132168 CASAVA_Build 10 37399708 2D ACTTTGAAAC TA/-- TGAGGTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 TA 1 0 132169 CASAVA_Build 10 37401344 2D GTTTCCGGGA AT/-- ATATATCCAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 AT 4 3 132170 CASAVA_Build 10 37406384 2D AGGAGGCCAC GG/-- GGGGGGCAAA 2469 het 1066 hom 22 7 7 9 G 8 6 132171 CASAVA_Build 10 37408080 2I CAATAAAAAC --/TG TGACCAGACA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 TG 1 2 132172 CASAVA_Build 10 37416107 3I TTTACCCCTC ---/CTT CTTAACCACA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 CTT 1 2 132173 CASAVA_Build 10 37431745 4D AAGAAGGATC AAGT/---- AAGTGGGTGT 3070 hom 30 het 11 0 11 1 AAGT 2 1 132174 CASAVA_Build 10 37433686 3I ACAAAAACAG ---/CAA CAACCACAAT 1398 het 1398 ref 25 22 3 0 CAA 1 2 132175 CASAVA_Build 10 37451867 1I TCCAAGGACC -/T TCAAGTACCC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 1 2 132176 CASAVA_Build 10 37452146 1I ACTGCAACCT -/C CGCTTTCCAG 3070 hom 50 het 20 0 15 5 C 1 2 132177 CASAVA_Build 10 37458697 3D TACTTTCTTC AGG/--- AGAATATTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AGG 1 0 132178 CASAVA_Build 10 37460109 3I TTATATCCTT ---/CTC CTCAGAATTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CTC 1 2 132179 CASAVA_Build 10 37475236 2I TTTTAAGCCC --/CT ATTTACCTAA 2834 het 2834 ref 41 30 6 5 CT 0 1 132180 CASAVA_Build 10 37583489 1D TATTTTTATG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 8 7 132181 CASAVA_Build 10 37589070 1I TAAAAAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 10 11 132182 CASAVA_Build 10 37589933 2I CATTCCACAA --/TG TATCTTTTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TG 0 1 132183 CASAVA_Build 10 37595904 1I ATAATTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 9 10 132184 CASAVA_Build 10 37597118 1I TGTGATAATG -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 6 7 132185 CASAVA_Build 10 37600023 6I TCAGACAGAA ------/TATATT TATGAAAATA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 TATATT 0 1 132186 CASAVA_Build 10 37608257 1D CTTTTTGCAC T/- GCATGCAATA 2939 het 2939 ref 29 13 8 9 T 1 0 132187 CASAVA_Build 10 37615185 11D TCTGTTCTGT TTTTTGAATGG/----------- TTTTCTGTGT 1419 het 1419 ref 14 13 3 2 TTTTTGAATGG 1 0 132188 CASAVA_Build 10 37639309 1D GTCGCTTGAA C/- CCAGGAGACG 3070 hom 87 het 33 0 29 6 C 3 2 132189 CASAVA_Build 10 37679168 3D CGCTGTTCTC TCT/--- TCTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 TCT 3 2 132190 CASAVA_Build 10 37685388 1I TTTAGTTATT -/C TTGTACTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 C 0 1 132191 CASAVA_Build 10 37699716 1I CTAGTTTGTT -/G GGGGGGGGGG 2147 het 835 hom 33 6 16 11 G 11 12 132192 CASAVA_Build 10 37704019 3I AAACTAAGGT ---/GTG GTGGAGATGT 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 GTG 1 2 132193 CASAVA_Build 10 37723709 15I TGAATAGGAG ---------------/GAACCGATAAATCTT GAGAAACTGG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 GAACCGATAAATCTT 0 1 132194 CASAVA_Build 10 37741176 1D AAATTGAAAA C/- ACAAAATCAT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 C 1 0 132195 CASAVA_Build 10 37846206 2I AAAGACAGGT --/AG AGAAGCTTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AG 1 2 132196 CASAVA_Build 10 37848444 1I TATTCCTTTA -/T TTTTTTTTTT 1331 het 1331 ref 27 20 3 4 T 11 12 132197 CASAVA_Build 10 37870531 8I TTTATAAGGC --------/CAGTATCA TCCTGATACC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 CAGTATCA 0 1 132198 CASAVA_Build 10 37891670 7D CTTGGAAAGC TATATTG/------- AGATCTGGAG 3070 het 3070 ref 30 15 12 5 TATATTG 1 0 132199 CASAVA_Build 10 37892141 1I AAAATGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 T 11 12 132200 CASAVA_Build 10 37897623 1D ATCTTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2635 hom 28 7 11 10 T 13 12 132201 CASAVA_Build 10 37898661 1D ATGGAAAATA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 T 6 5 132202 CASAVA_Build 10 37898731 4D GTATAATAAC TATT/---- TATATAACTT 3070 het 3070 ref 24 16 8 1 TATT 1 0 132203 CASAVA_Build 10 37902287 1D GGAGATTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 9 8 132204 CASAVA_Build 10 37905420 1I TAAAACACAG -/T TTTCACCTGT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 T 3 4 132205 CASAVA_Build 10 37906620 1I GAAGACTGGG -/A AATGGTAATG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 132206 CASAVA_Build 10 37912769 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 888 hom 13 2 11 0 A 7 6 132207 CASAVA_Build 10 37914458 1D ACGGTGTTCC T/- TTTTTGTAGT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 6 5 132208 CASAVA_Build 10 37916040 1I TAAGCTGTGA -/T TTTTCTACAA 2797 het 2797 ref 26 15 8 3 T 4 5 132209 CASAVA_Build 10 37922643 2I GCTGGAGGTC --/TG TGCACGTGCA 3070 het 3070 hom 49 16 24 9 TG 1 2 132210 CASAVA_Build 10 37924028 1D TTCATACTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 9 8 132211 CASAVA_Build 10 37932377 4I GATCTAAAAA ----/CTAT CTGTCGGGTA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CTAT 0 1 132212 CASAVA_Build 10 37933031 4D GGTAGGTAGG TAGA/---- TAGATAGAAC 3070 het 3070 hom 54 22 25 12 TAGA 3 2 132213 CASAVA_Build 10 37934565 1D CAGGGCATTC A/- GCAATATTCT 3070 het 3070 ref 35 19 15 3 A 1 0 132214 CASAVA_Build 10 37937456 1D ATAATAAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 9 8 132215 CASAVA_Build 10 37943010 2D AATTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2323 hom 31 9 15 7 T 14 12 132216 CASAVA_Build 10 37943531 1I ACATCATTTT -/A TAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 0 1 132217 CASAVA_Build 10 37951949 5D ATAAGGCAGC TATTT/----- GATATGTTGC 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 TATTT 1 0 132218 CASAVA_Build 10 37952888 1D ATCTCTGCTA T/- TTTTTTTTTT 2475 het 2255 hom 27 9 11 7 T 15 14 132219 CASAVA_Build 10 37973621 1I GACTACTAAT -/G AGGTAAACAA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 G 0 1 132220 CASAVA_Build 10 37981484 3D TTTCTTCTTC TTA/--- TTCTTTAGAC 3070 het 3070 ref 25 15 9 3 TTA 1 0 132221 CASAVA_Build 10 37982174 1I GAAAAAAAAA -/T GTCTTTATAT 3070 het 3070 ref 29 14 15 0 T 0 1 132222 CASAVA_Build 10 37986973 1D GGTTCAAAAG A/- TAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 1 0 132223 CASAVA_Build 10 37995873 1I CACAAACAAG -/A TAAACCCAAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 0 1 132224 CASAVA_Build 10 37996026 5I GGATGATAAA -----/TATCT TATAAAACAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 TATCT 0 1 132225 CASAVA_Build 10 37998324 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1809 hom 26 7 15 4 A 13 12 132226 CASAVA_Build 10 38116442 4D CGGTTTTTGG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 26 13 8 7 TTTA 5 4 132227 CASAVA_Build 10 38116581 1D TCCCCATGCC A/- AAAAAAAAAA 2517 het 2517 ref 25 10 6 9 A 12 11 132228 CASAVA_Build 10 38118226 1I ATTATATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 11 12 132229 CASAVA_Build 10 38133036 5D TTTCTTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 46 het 46 ref 33 11 1 24 T 19 14 132230 CASAVA_Build 10 38159275 1D ATTCATGCAT A/- TATGCCAGGA 3070 het 3070 hom 50 21 24 6 A 1 0 132231 CASAVA_Build 10 38174315 1I GAATGGATTT -/A AAAAAAAAAA 1340 het 1340 ref 28 18 4 6 A 15 16 132232 CASAVA_Build 10 38191488 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2257 hom 24 het 14 0 7 7 T 19 16 132233 CASAVA_Build 10 38196159 1D TCCACTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 562 hom 39 3 29 7 A 12 11 132234 CASAVA_Build 10 38196384 1I ACTTGCTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 68 het 31 0 24 7 T 9 10 132235 CASAVA_Build 10 38197064 1I18M1I AAGACTGATA -TTAAAGCTGAAAAAATAT-/CTAAAAGCTGAAAAAATATA TTTTTTTTGC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 N/A 0 0 132236 CASAVA_Build 10 38198828 1D GGGTTTATTG T/- TAAGAGTACT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 1 132237 CASAVA_Build 10 38206041 4D AATTTTTGTA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TATT 5 4 132238 CASAVA_Build 10 38211851 2D ACTCCATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 20 1 12 7 A 18 16 132239 CASAVA_Build 10 38216237 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 69 het 26 0 24 5 A 6 7 132240 CASAVA_Build 10 38228320 1I CATTAATAAT -/G GGAGACTTTA 2881 het 1597 hom 11 4 7 0 G 2 3 132241 CASAVA_Build 10 38231911 1I AAAACTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 10 11 132242 CASAVA_Build 10 38239455 1I TTTACAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 510 hom 27 2 20 5 T 10 11 132243 CASAVA_Build 10 38243385 1I AATAATAGAT -/C CTTTAACTTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 2 132244 CASAVA_Build 10 38261682 2D GAAACATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 TG 9 8 132245 CASAVA_Build 10 38267656 1D TGTCTCTAAT A/- AAAAAGGTGG 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 6 5 132246 CASAVA_Build 10 38274426 1I ACAGAGAAAG -/T TTTTTTTTTT 2711 het 967 hom 29 4 15 10 T 15 16 132247 CASAVA_Build 10 38278315 1I CATATCTACC -/A AAAAAAAAAA 2206 het 12 hom 13 1 8 4 A 13 14 132248 CASAVA_Build 10 38300250 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 28 2 15 11 A 17 16 132249 CASAVA_Build 10 38304322 1I ATTATGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 43 1 30 12 A 11 12 132250 CASAVA_Build 10 38315093 1D ACTTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 689 hom 32 3 24 5 A 15 14 132251 CASAVA_Build 10 38321992 2D GAATGATGGG GC/-- GGGGGGAGTA 3070 hom 75 het 31 0 23 9 GC 1 0 132252 CASAVA_Build 10 38331781 4D GCACACACAC ACTT/---- AGTTTCTCTG 3070 het 3070 ref 35 23 9 5 ACTT 1 0 132253 CASAVA_Build 10 38353096 2D CAAAAACAAA AC/-- AAAAAAAAAA 256 het 256 ref 23 9 3 11 AC 1 0 132254 CASAVA_Build 10 38355208 2I TTTTATCAAA --/GT GTATTTCTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 15 GT 1 2 132255 CASAVA_Build 10 38356460 1D CCCAGCTATC T/- TTTTTTTTTT 952 het 952 ref 37 27 3 7 T 13 12 132256 CASAVA_Build 10 38368122 1I TGGACCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 26 1 21 4 T 10 11 132257 CASAVA_Build 10 38372444 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 10 11 132258 CASAVA_Build 10 38373319 2I AATTTTTCTG --/TA TTTTTAGTAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TA 0 1 132259 CASAVA_Build 10 38506712 1D9M4D CTATACATTC AATTTCAATGGATA/-ATTTCAATG---- AATAAGAATA 1247 het 1247 ref 30 29 3 3 N/A 0 0 132260 CASAVA_Build 10 38510928 3I CACAGATTTT ---/CAA CTGACCTTGC 1282 het 1282 ref 49 43 3 3 CAA 0 1 132261 CASAVA_Build 10 38514859 2I GGTTAGATGA --/TT TTTATAGAAC 1774 het 1774 ref 47 30 4 13 T 3 5 132262 CASAVA_Build 10 38523674 5I TTAGCACAGC -----/TTATT TTATTTTAGG 3070 het 3070 ref 61 43 13 5 TTATT 1 2 132263 CASAVA_Build 10 38529976 1D GATTGCTCAA G/- TGTAGGAGTT 3004 het 3004 ref 27 14 7 6 G 1 0 132264 CASAVA_Build 10 38568919 1D CATACCACTA C/- AGGAAACCAT 1846 het 1846 ref 49 38 4 7 C 1 0 132265 CASAVA_Build 10 38601008 1D TAGCCTGGAT G/- ACAGAGTGAG 3070 het 3070 ref 47 32 11 4 G 1 0 132266 CASAVA_Build 10 38602303 2I44M2I GCCTCTCTCT --CTCGCTCTACCCCCCACCCCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCCC--/CCCTCTCTCTACTCCCCACCCCTCTCTCTCTCTCCCTCTCGCTCCCTA TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 27 18 18 N/A 0 0 132267 CASAVA_Build 10 38603328 4I CACTTTACAA ----/ACTT ACTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 66 35 22 9 ACTT 1 2 132268 CASAVA_Build 10 38604341 2I TGGAAACTAC --/AA AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 51 17 29 5 A 7 9 132269 CASAVA_Build 10 38604890 3I TTATAAAGAA ---/AAG AAGTTTAATT 3070 het 3070 ref 58 27 24 7 AAG 1 2 132270 CASAVA_Build 10 38606010 1D TGATGTACAG A/- AAAAAATGGG 3070 het 3070 ref 51 22 16 13 A 7 6 132271 CASAVA_Build 10 38606292 1D TCCCAGCTAC T/- TGGGAGGCTG 3070 het 2696 hom 17 6 10 1 T 2 1 132272 CASAVA_Build 10 38607182 1I AGAAGCAGAG -/C GGGCTCATGA 3070 het 3070 ref 51 27 15 9 C 0 1 132273 CASAVA_Build 10 38607838 1D GAGGTTGCAT C/- CTTTTTAGTC 3070 het 3070 ref 72 44 22 6 C 2 1 132274 CASAVA_Build 10 38607898 1D AGGGGGTAGA G/- GAATAGTCAC 3070 het 3070 ref 75 40 20 15 G 2 1 132275 CASAVA_Build 10 38609264 3I CAGAGCTCTC ---/CTT CTCTCTCCCA 3070 het 3070 ref 63 39 21 3 CTT 0 1 132276 CASAVA_Build 10 38609981 1I CATGGCCAGG -/T TTTTTTTTTT 1068 het 1068 ref 40 27 5 8 T 13 14 132277 CASAVA_Build 10 38614010 1I TAAAGGAAGA -/T TTTTTGTTGG 1798 het 1798 ref 55 46 4 5 T 5 6 132278 CASAVA_Build 10 38615826 1I AGAGAATAAC -/A AAAAAATGAA 2376 het 2376 ref 39 30 5 4 A 6 7 132279 CASAVA_Build 10 38617848 1I TTCTAAGAAT -/A AAAAAAACTC 2507 het 2507 ref 36 26 8 2 A 7 8 132280 CASAVA_Build 10 38643672 1I AAGACTACCC -/A AACCTTTCAA 1941 het 1941 ref 44 32 5 7 A 2 3 132281 CASAVA_Build 10 38701234 1D TCACCATGAA T/- TTTTTTTTAA 1350 het 1350 ref 53 38 3 12 T 9 8 132282 CASAVA_Build 10 38708095 1I TTATGAGCAA -/T TTTTTTTAGC 1766 het 1766 ref 38 26 4 8 T 7 8 132283 CASAVA_Build 10 38712688 1D AGCACCCAGG A/- AAAAAATGAT 1536 het 1536 ref 38 32 4 2 A 7 6 132284 CASAVA_Build 10 38712810 3I GGGATTTGAA ---/AAG AAGAGATATG 1605 het 1605 ref 38 31 4 3 AAG 1 2 132285 CASAVA_Build 10 38720314 1I32M4D TACAAAGAAC -AAAAAAGGGAGTACAGGCTAACTATAACAAACAGAA/AAAAAAAGGGAGTACAGGCTAACTATAACAAAC---- AGAACAATCA 3070 het 3070 ref 41 47 9 6 N/A 0 0 132286 CASAVA_Build 10 38808851 2D TGTGCCAGCT AG/-- AGAGAGAGAG 1510 het 1510 ref 41 28 4 9 AG 6 5 132287 CASAVA_Build 10 38913873 4D AATGGAATGG ATGC/---- AATGGACTTG 1234 het 1234 ref 83 59 7 24 ATGC 1 0 132288 CASAVA_Build 10 38914631 5D GACTGTTATA GAATG/----- GAATGGAATG 2862 het 2862 ref 67 41 13 14 GAATG 3 2 132289 CASAVA_Build 10 38916871 3D ATTGAAAGGA ATC/--- ATCATCTAAT 1919 het 1919 ref 82 63 5 16 ATC 3 2 132290 CASAVA_Build 10 38918853 1D GGCATCAAAT A/- GAATCATCAT 3070 het 3070 ref 102 68 20 21 A 1 0 132291 CASAVA_Build 10 38925259 10I TCGAATGGAA ----------/TCAAATGGAC TCATATTCGA 2691 het 2691 ref 74 49 16 9 TCAAATGGAC 0 1 132292 CASAVA_Build 10 38929801 1I AAGGAATCAG -/A AACAAATATT 3070 het 3070 ref 67 38 20 9 A 2 3 132293 CASAVA_Build 10 38929964 2I ACATTGACTC --/TG AGAAACAGAT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 TG 0 1 132294 CASAVA_Build 10 38930037 3D TTCATATTCT AGA/--- AGGATAAATT 2325 het 2325 ref 58 47 5 7 AGA 1 0 132295 CASAVA_Build 10 38932179 2I AAAAACTTGG --/AT ATGTCAGAGA 3070 het 3070 hom 66 29 34 3 AT 1 2 132296 CASAVA_Build 10 38933243 1D ATTAGTTAAT A/- CCCTCAAGAT 1365 het 1365 ref 22 19 3 0 A 1 0 132297 CASAVA_Build 10 38940494 4D GATAGATCAA TGAT/---- TGATTATAGA 1821 het 1821 ref 27 21 4 2 TGAT 2 1 132298 CASAVA_Build 10 38942145 4I AAATAAAAAT ----/AAAA AAAAAGAATA 3070 het 3070 ref 40 29 8 3 A 5 9 132299 CASAVA_Build 10 38945104 1D AGGCCAACCA G/- CACAAATATA 3070 het 3070 ref 46 24 15 8 G 1 0 132300 CASAVA_Build 10 38945394 2D TCCGTGTGAC AA/-- AAGAGTCTGA 3070 het 3070 ref 61 34 21 7 A 4 2 132301 CASAVA_Build 10 38947957 11I ACAAAAAAGC -----------/CGAGGACTAGA CAGATTCACA 2835 het 2835 ref 39 30 6 3 CGAGGACTAGA 0 1 132302 CASAVA_Build 10 38950958 5D TTGTGTTTTC ACAGA/----- GATAGACTCG 3070 het 3070 ref 38 26 8 5 ACAGA 1 0 132303 CASAVA_Build 10 38951115 4I TGTGTCTGTT ----/TGTG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 53 24 18 11 TG 4 6 132304 CASAVA_Build 10 38953719 1I TCACCTCTAC -/A AAAAAAATAC 2893 het 2893 ref 31 23 7 1 A 7 8 132305 CASAVA_Build 10 38957639 3D17M1D TACCAAGAAA GACGATCTATAAGAAAAAAAC/---GATCTATAAGAAAAAAA- TATAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 31 8 1 N/A 0 0 132306 CASAVA_Build 10 38961750 2I AGAGTCCACC --/AA AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 55 32 19 4 A 8 10 132307 CASAVA_Build 10 38962128 1I AGAAAAAAGT -/C CCCAAATTCA 3070 het 3070 ref 74 38 28 8 C 3 4 132308 CASAVA_Build 10 38964428 9I AGCTCAGTAC ---------/TAGCACAAT TGGTGAATAA 3070 het 3070 ref 51 35 10 6 TAGCACAAT 0 1 132309 CASAVA_Build 10 38968635 1I AAAAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 12 8 21 A 10 11 132310 CASAVA_Build 10 38969421 1D AGGAAAAAGG A/- AAAATAACTC 3070 het 3070 ref 61 40 18 3 A 5 4 132311 CASAVA_Build 10 38971310 1I TGGAAAAAAA -/T TTGTAAAGTA 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 T 2 3 132312 CASAVA_Build 10 38972928 2D GTATTTTCTA AG/-- AGTTATTTCC 3070 het 3070 ref 85 65 14 8 AG 2 1 132313 CASAVA_Build 10 38973582 3D TCTATTACTT AAC/--- ATATTATTTA 3070 het 3070 ref 28 18 7 5 AAC 1 0 132314 CASAVA_Build 10 38973854 1I GAGGGATTAC -/T TTAAACTTTC 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 T 2 3 132315 CASAVA_Build 10 38974059 1D CTTCTGTCAT G/- TGAAATAATT 3070 het 3070 ref 89 47 34 9 G 1 0 132316 CASAVA_Build 10 38974830 1D TTGAATTCTA T/- TTTTGCTGCA 3070 het 3070 ref 91 68 13 11 T 5 4 132317 CASAVA_Build 10 38974935 1D CTTACTGGAC G/- GTTGTGAAAA 3070 het 3070 ref 95 68 18 9 G 2 1 132318 CASAVA_Build 10 38975054 1I23M2I AATGAGTTCC -TTGAAGTTTTTGTTTTAGAATGA--/TTTGAAGTTTTTGTTTTAGAATGACT CTACTGGGTC 1342 het 1342 ref 61 42 6 23 N/A 0 0 132319 CASAVA_Build 10 38978580 4I CAGCAGATGA ----/AAAC AAACATAAAT 1746 het 1746 ref 46 38 5 3 AAAC 1 2 132320 CASAVA_Build 10 38979155 1I CAATAGTTTT -/A AATGAAAGTA 3070 het 3070 ref 50 33 14 3 A 2 3 132321 CASAVA_Build 10 38979271 2I TTGGTTTAAA --/AG AAAAAAGAGC 3070 het 3070 hom 83 34 30 19 AG 0 1 132322 CASAVA_Build 10 38979338 3D ATGTGTTTCT GAA/--- GAAGGTCCTT 3070 het 3070 ref 60 44 7 10 GAA 2 1 132323 CASAVA_Build 10 38979454 3D TCTTACCAAC AAT/--- ATTTGATTCA 3070 het 3070 ref 56 43 9 8 AAT 1 0 132324 CASAVA_Build 10 38979626 1D GTTAAAGTCT C/- CCTCACCTTT 3070 het 3070 ref 59 30 16 14 C 3 2 132325 CASAVA_Build 10 38979638 1I CTCACCTTTT -/C TTTTTCACTT 3070 het 3070 ref 61 30 12 19 C 0 1 132326 CASAVA_Build 10 38979993 4I AATATTAAAC ----/TTAA TTAATAAAAA 3070 het 3070 hom 40 10 16 14 TTAA 1 2 132327 CASAVA_Build 10 38982682 1I3M2I TTTACATTTT -TTC--/ATTCTA TATGTTTTAT 1627 het 1627 ref 32 23 5 4 N/A 0 0 132328 CASAVA_Build 10 38985079 1I AAGAAAAAAA -/G AAGACCAAGT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 G 0 1 132329 CASAVA_Build 10 38985339 1D AAAAAAAATA C/- AAAAGATTCC 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 C 1 0 132330 CASAVA_Build 10 38985423 2D AGCAAAAAAT AA/-- AAAAAAACAG 1488 het 1488 ref 24 16 4 4 A 9 7 132331 CASAVA_Build 10 38986116 1D TGGAACGGAA T/- AGTTTTATGA 2877 het 2877 ref 69 54 7 9 T 1 0 132332 CASAVA_Build 10 38987169 1D GTCTGCAAAA T/- ATCTCAAGCA 1900 het 1900 ref 48 43 5 1 T 1 0 132333 CASAVA_Build 10 38988687 2D16M1I18M3D AAGATATATA TTGTGTGACATTGATAAC-AAGTGAGAAGGAGGTGTAAAG/--GTGTGACATTGATAACAAAGTGAGAAGGAGGTGTA--- AAGTAGAGTT 3070 het 3070 ref 65 58 12 21 N/A 0 0 132334 CASAVA_Build 10 38988888 1I CGTCCCTACC -/A AAAAAAAGAA 1067 het 1067 ref 57 38 5 14 A 7 8 132335 CASAVA_Build 10 38989072 1I TGAATGGATT -/A AAAAAATCTA 1364 het 1364 ref 48 36 3 9 A 6 7 132336 CASAVA_Build 10 39001849 1I AAGATGAGGG -/C CAGAAGGCTC 1191 het 1191 ref 41 33 3 5 C 1 2 132337 CASAVA_Build 10 39002214 2D GTGTGGAGTG AA/-- AGACTGTCAG 3070 het 3070 ref 92 48 41 4 A 3 1 132338 CASAVA_Build 10 39002428 1D AAGGAAGAGG A/- ATTTTTTTTT 2799 het 2799 ref 47 32 9 6 A 2 1 132339 CASAVA_Build 10 39002440 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTCAGA 2985 het 2985 ref 43 17 14 12 T 7 6 132340 CASAVA_Build 10 39004349 3I ATTGCAGATT ---/TTA TTTTTAACTT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 TTA 0 1 132341 CASAVA_Build 10 39004906 1D TGGAATGAGC T/- TTCTATGGAG 3070 het 3070 ref 73 61 7 6 T 3 2 132342 CASAVA_Build 10 39005122 1I AGCCATTAGT -/A AGGTTGGAAT 3070 het 3070 ref 79 42 30 7 A 1 2 132343 CASAVA_Build 10 39005265 1I TCAAGTAGTG -/T TTTATAAGTA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 3 4 132344 CASAVA_Build 10 39005612 1D CAAAATGTGT G/- TAAATAAGAT 2695 het 2695 ref 58 48 6 4 G 1 0 132345 CASAVA_Build 10 39006435 1D TTGTCTTATG A/- CTTCTGTGGG 1747 het 1747 ref 67 53 4 11 A 1 0 132346 CASAVA_Build 10 39007190 1D GACATATAAA T/- AGACAAAATA 3070 het 3070 ref 64 54 7 3 T 1 0 132347 CASAVA_Build 10 39007785 12I TTAAAGTAGT ------------/ACTTCAAAAGCA ACTTCAAAAG 3070 het 3070 ref 63 31 26 6 ACTTCAAAAGCA 0 1 132348 CASAVA_Build 10 39007935 1D TCTTAGAGTG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 43 31 10 3 A 8 7 132349 CASAVA_Build 10 39009296 13I GATTAAATGA -------------/CAGACATAGATTT CAGAATCTGG 3070 het 3070 hom 84 34 39 11 CAGACATAGATTT 0 1 132350 CASAVA_Build 10 39011981 1I GACCAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1594 hom 32 4 15 14 A 12 13 132351 CASAVA_Build 10 39013973 1I GCAATTGCAA -/T CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 55 23 29 3 T 0 1 132352 CASAVA_Build 10 39015031 1D ATAGATGACA C/- CAAACAAATA 3070 het 3070 ref 45 32 8 6 C 2 1 132353 CASAVA_Build 10 39015803 1I AATCAGCAAG -/A AAAAAATCAA 1827 het 1827 ref 58 46 4 9 A 6 7 132354 CASAVA_Build 10 39016176 1D119M6I9M2D TCATTATATG AAAAAAACACTTGCACATACGTTTATTGCAGCACAATTTGCAATTGTGAAGGATATGGAACTAGCTCAAATGCCCATCAATCAAAGAATGCATAGAGAAAATGTGGTGTATATATATATA------TGTGTATATGC/-AAAAAACACTTGCACACACGTTTACTGCAGCACAATTTGCAATTGTGAAAGATATGGAACTAGCTCAAATGCCCATCAATCAATGAACGCATAGAGAAAATGTGGTGTATATATATATATGTGTGTGTGTATAT-- ACACATATAT 3070 het 3070 ref 47 81 9 28 N/A 0 0 132355 CASAVA_Build 10 39017699 5I AACATACAGA -----/TATGT TATAATACAG 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 TATGT 0 1 132356 CASAVA_Build 10 39018183 1I TCATAAGAAG -/C TTTCACTAAA 3070 het 3070 hom 78 25 45 8 C 0 1 132357 CASAVA_Build 10 39018503 1D TGCATAATTC A/- TTTTAAAAGA 3070 het 3070 ref 63 47 12 4 A 1 0 132358 CASAVA_Build 10 39027562 3I ATTTGAAAAC ---/ATA ATGTCTGAAA 3070 het 3070 ref 51 33 16 2 ATA 0 1 132359 CASAVA_Build 10 39027967 4D CTTTTAAGAT AAAA/---- GGATATGACA 3070 het 3070 ref 34 25 8 2 A 4 0 132360 CASAVA_Build 10 39029768 3D AACACTGAGC CTG/--- CATAGTTTAC 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 CTG 1 0 132361 CASAVA_Build 10 39032360 1I ATATTAAAAA -/C AAATCCCATC 3070 het 3070 hom 69 29 26 14 C 0 1 132362 CASAVA_Build 10 39033402 1D26M1I GCCTGTAAAA TTAAAAAAAAAAACAAGTTATTTACTT-/-TAAAAAAAAAAACAAGTTATTTACTTC CAAGATACAA 3070 het 3070 ref 51 43 13 11 N/A 0 0 132363 CASAVA_Build 10 39036024 1D AAATATAGGA G/- AAAATATTTA 3070 het 3070 ref 40 20 12 9 G 1 0 132364 CASAVA_Build 10 39043739 3I TCTGTCTAAA ---/AAT AAAAAAAAAA 22 het 22 ref 19 6 1 12 AAT 0 1 132365 CASAVA_Build 10 39043832 1I AATAAACTAT -/A AAACAAAGAA 2170 het 2170 ref 30 20 5 5 A 3 4 132366 CASAVA_Build 10 39047047 1I CCAAGTGACT -/G GGTATAAAGG 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 G 2 3 132367 CASAVA_Build 10 39048315 3D TTTTCTTGTA CTT/--- CTTCGTCTCA 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 CTT 2 1 132368 CASAVA_Build 10 39055079 1D ATCAAGAGAG A/- AAAGGGGGCT 3070 het 3070 ref 66 28 29 10 A 4 3 132369 CASAVA_Build 10 39068841 4I ATGGCCACAG ----/AGAC AGACAGCAGC 1421 het 1421 ref 43 34 4 5 AGAC 1 2 132370 CASAVA_Build 10 39068902 1D TCGTGCCTGG C/- CTGCTGGGTG 1550 het 1550 ref 30 16 7 7 C 2 1 132371 CASAVA_Build 10 39079136 3I ATGAGATTAA ---/ATG ATGAGTTGAA 1309 het 1309 ref 57 46 5 6 ATG 1 2 132372 CASAVA_Build 10 39079471 4D GCAATGAAAT AATG/---- AAAATGAAAT 1702 het 1702 ref 42 33 4 6 AATG 1 0 132373 CASAVA_Build 10 39083284 3D TATCAAGTGC ATA/--- ATAAGTTCAT 3070 het 3070 ref 46 31 13 4 ATA 2 1 132374 CASAVA_Build 10 39089271 1I GGGGCACTAT -/G ACTATGCATA 3070 het 3070 hom 87 33 50 4 G 0 1 132375 CASAVA_Build 10 39090343 2D TTGAATGCTG GT/-- AAGTAATATT 1326 het 1326 ref 53 40 3 10 GT 1 0 132376 CASAVA_Build 10 39091483 3D TGGATTTATT GTC/--- ATTTAATTGG 2883 het 2883 ref 36 28 6 3 GTC 1 0 132377 CASAVA_Build 10 39096170 2D34M2D CAGAGCAAGA CTCTGTCTCAAAAATGAACAAAGAAAGAAAAGAAAGAA/--CTGTCTCAAAAATGAACAAAGAAAGAAAAGAAAG-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 56 43 9 27 N/A 0 0 132378 CASAVA_Build 10 39098198 4D ACTTCAGAAA CAAG/---- CAATGGAGGG 3070 het 3070 hom 88 39 38 13 CAAG 1 0 132379 CASAVA_Build 10 39098233 1D CCTGGGCCCT G/- GGGGCAAAGG 2688 het 2688 ref 100 56 7 38 G 5 4 132380 CASAVA_Build 10 39098551 1I28M1I GTTGACAAGG -AAAAAACTAAAATAAGAAAATAAGAGAG-/AAAAAAAATAAAATAAGACAATAAGAGAGA AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 73 46 16 20 N/A 0 0 132381 CASAVA_Build 10 39099247 1D AAAAAAAAAA T/- TATTCTTACT 1358 het 1358 ref 27 14 4 12 T 2 1 132382 CASAVA_Build 10 39099651 1D GGTCTCTAAC A/- AAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 87 59 15 14 A 5 4 132383 CASAVA_Build 10 39099822 4D ACAGTATCAA ACAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 70 44 22 11 AC 2 0 132384 CASAVA_Build 10 39100353 1D ACACTTAAAA T/- TTTATTTACC 3070 het 3070 ref 23 16 7 1 T 4 3 132385 CASAVA_Build 10 39101676 2D27M1I ACAATAAAAC TATTTTTTTTAAACTACGGGACAAAAAAC-/--TTTTTTTTAAACTAAGGGGCAAAAAACA AAAAAACCAA 1109 het 1109 ref 54 53 3 3 N/A 0 0 132386 CASAVA_Build 10 39102371 1D CCAAAATAGG C/- CCCTGAAAAA 1993 het 1993 ref 70 38 11 22 C 4 3 132387 CASAVA_Build 10 39103150 13I TTACCATTAA -------------/GGGCATTGAAATG GGGAAATTAC 3070 het 3070 hom 68 15 46 7 GGGCATTGAAATG 0 1 132388 CASAVA_Build 10 39103326 1I AGCCAGTGAC -/T CTTAGAAGCT 3070 het 3070 hom 85 23 50 12 T 0 1 132389 CASAVA_Build 10 39105937 2D CACAGTGCTC AT/-- AGTGGCCATC 2232 het 2232 ref 33 25 5 4 AT 1 0 132390 CASAVA_Build 10 39109087 1D ACATTTTTTT C/- CTTTCCTTTC 3070 het 3070 ref 51 32 12 8 C 2 1 132391 CASAVA_Build 10 39109224 1D GCTCAGTCAG T/- TTTTGTGAGA 3070 het 3070 ref 68 38 22 9 T 5 4 132392 CASAVA_Build 10 39109291 1I TTGCATAAAA -/G TCCTATTAAT 3070 het 3070 hom 72 19 48 5 G 0 1 132393 CASAVA_Build 10 39109420 2D CTTTTTAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 10 10 A 14 12 132394 CASAVA_Build 10 39110898 1D AAGCGTTTCC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 77 44 30 3 T 8 7 132395 CASAVA_Build 10 39111635 3D TGTCTCAGAT AAA/--- AATAATTGAT 3070 het 3070 ref 46 34 9 4 A 5 2 132396 CASAVA_Build 10 39112235 2D CTCACAAAAT TA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 33 10 12 TA 1 0 132397 CASAVA_Build 10 39112367 1D ACTGTAGTAA C/- CCAAAACATC 3070 het 3070 ref 29 21 7 1 C 3 2 132398 CASAVA_Build 10 39113437 1D AATCAACCTA G/- GTTTCCAACA 1349 het 1349 ref 45 38 3 4 G 2 1 132399 CASAVA_Build 10 39124167 15I TTTCAGTCCA ---------------/TTCCAATTGATTCCC TTCTATTCCA 3070 het 3070 ref 76 55 11 11 TTCCAATTGATTCCC 0 1 132400 CASAVA_Build 10 39124262 5D TTGCATTCCG TTTGA/----- TTACATTCCG 2232 het 2232 ref 83 66 8 14 TTTGA 1 0 132401 CASAVA_Build 10 39134518 1I TTCGCTTTCA -/T AGGCATTCGA 3070 het 3070 ref 97 72 9 16 T 0 1 132402 CASAVA_Build 10 39134551 1I4M1D CTTTCCATTA -TATTG/CTATT- GAGTCCTTTC 660 het 660 ref 100 64 6 97 N/A 0 0 132403 CASAVA_Build 10 39149892 10D ATTCACTTCC ATTCCATTCG/---------- ATTCCATTCG 3070 het 185 hom 64 4 32 32 ATTCCATTCG 2 1 132404 CASAVA_Build 10 39151832 10D ATTCCATTCC ATTTGATTAT/---------- ATTCCATTCA 3070 het 3070 ref 74 60 10 11 ATTTGATTAT 1 0 132405 CASAVA_Build 10 39155919 1D GGAATGGACT G/- GAATATAATG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 G 2 1 132406 CASAVA_Build 10 39161230 5D7M20D AATGGAATGG ACTCAAATTGAATGGATTCTCAAGAAATATAG/-----AATTGAA-------------------- TCAAATGGAA 1006 het 1006 ref 68 64 7 13 N/A 0 0 132407 CASAVA_Build 10 39165257 4D4M1D18M5D42M9D ATGGAATGGA GTACAACGAAATGGAAAGGAATTGAATGCAAAGGAATGGTATAGAATGGAATACAATGGAATGGAACAGAGTGGAATTGAGTC/----AACG-AATGGAACGGAATGGAAT-----GGATTGGAATAGAAAGTAATAGAATGGAATGGAATCGTTTGG--------- AATGGAATCG 2116 het 2116 ref 67 100 5 12 N/A 0 0 132408 CASAVA_Build 10 39165400 15D29M5D AATCGAATGG ATTGGCCTGGAAAAAAATGGAATCAAACAGATTGGAATCAAACGAAACA/---------------AATGGAATCGAATGGATTGATATCAACTG----- CAATGGAATG 3070 het 3070 ref 56 131 22 158 N/A 0 0 132409 CASAVA_Build 10 39165733 5D GTAATCAAAT CAAAA/----- GGAGTGGAAT 1411 het 1411 ref 79 52 9 24 CAAAA 1 0 132410 CASAVA_Build 10 39168724 15D TCAAATGCAA AGCAATAGTATGCAT/--------------- TGGAAATCAA 3070 het 3070 ref 79 65 15 13 AGCAATAGTATGCAT 1 0 132411 CASAVA_Build 10 39173058 5D TATGGAATCG AATTA/----- AATGGAATGA 3070 het 3070 ref 75 54 16 12 AATTA 1 0 132412 CASAVA_Build 10 41687649 15D ATTCCGTTCG ATTCCATTCCAATCC/--------------- ATTCCATTCC 1750 het 1750 ref 22 14 4 6 ATTCCATTCCAATCC 1 0 132413 CASAVA_Build 10 41692574 15D ATTCCGTTCG ATTCCATTCCAATCC/--------------- ATTCCATTCC 3070 het 3070 ref 38 29 16 1 ATTCCATTCCAATCC 1 0 132414 CASAVA_Build 10 41728421 1I TTCTTTTTGT -/G TGAGTGTATT 3070 het 3070 ref 62 42 9 11 G 0 1 132415 CASAVA_Build 10 41751793 11D TTTATTGAGG AGTTTGGAAAC/----------- AGTTTGGAAA 3070 het 3070 hom 36 18 17 5 AGTTTGGAAAC 2 1 132416 CASAVA_Build 10 41785920 1D AAATGTGTCC T/- TTTTTACCCT 3070 het 3070 ref 54 24 21 9 T 6 5 132417 CASAVA_Build 10 41847899 1I GCCTCAAACT -/G CTTGAAATCT 3070 het 3070 hom 84 36 36 13 G 0 1 132418 CASAVA_Build 10 41851734 1D CAACACAAAG A/- AGTTACTGGG 235 het 235 ref 54 46 3 6 A 2 1 132419 CASAVA_Build 10 41856156 2I AAGTAGTAAC --/TG AGAATTCTTC 3070 het 3070 hom 48 14 28 6 TG 0 1 132420 CASAVA_Build 10 41922131 1D ATAGAAAAAC A/- AACAAACCAA 1692 het 1692 ref 76 54 9 13 A 3 2 132421 CASAVA_Build 10 41923712 1I AGTTTCTAAC -/A GTGAAAGAAA 3070 hom 44 het 23 0 13 10 A 0 1 132422 CASAVA_Build 10 41924259 1D CTTCCAAGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 80 31 27 22 T 9 8 132423 CASAVA_Build 10 41925472 2I GAAATAGTAT --/CA GAGATGAGAG 3070 het 3070 ref 52 24 24 4 CA 0 1 132424 CASAVA_Build 10 41925757 1D CTTTCAAGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 21 0 16 6 A 10 9 132425 CASAVA_Build 10 41926141 7I7M2I TCCTCCTTCC -------ATCACTT--/TTCTTTTCTCACTTTC TTTCTTTCTT 1964 het 1964 ref 29 19 6 6 N/A 0 0 132426 CASAVA_Build 10 41928987 1I CTTGATGTTA -/G TCTATCAGCT 3070 het 3070 ref 80 55 20 6 G 0 1 132427 CASAVA_Build 10 41929144 1D TCTATTAATT A/- AAAAATGTGT 1110 het 1110 ref 73 54 4 17 A 6 5 132428 CASAVA_Build 10 41929474 1D ATATGTCAAT A/- AAATGTCTTA 2468 het 2468 ref 101 58 8 36 A 4 3 132429 CASAVA_Build 10 41929675 4D GGCAGAAACA TAGT/---- TAGATAAAAA 3070 het 3070 ref 89 59 21 12 TAGT 1 0 132430 CASAVA_Build 10 41930080 3I GTTCTTTGCA ---/ATT TTTTTTTTTA 853 het 853 ref 37 28 2 8 ATT 0 1 132431 CASAVA_Build 10 41930435 1D GGGATTATAG T/- TTTGAGGCAC 1485 het 1485 ref 53 41 5 8 T 4 3 132432 CASAVA_Build 10 41930569 1D TATATAAAAA T/- TTTTTTTCAA 1665 het 1665 ref 24 12 4 8 T 8 7 132433 CASAVA_Build 10 41930810 19D TAGTGAGCAG AGACTAGCATCATTAGAAC/------------------- AGACTGTGAC 1188 het 1188 ref 71 60 5 10 AGACTAGCATCATTAGAAC 1 0 132434 CASAVA_Build 10 41932066 4D57M1D ACAAAGAAAT AGAAAGAGCTTCAAGAACACTCTAATCTTTAAAAAATAAAATGTCTATAATCGGCCATACGA/----AGAGCTTCAAGAACACTCTAATCTTTAAAAAATAAAATGTCTATAATTGGCCATACG- AAAAAATTGG 2889 het 2889 ref 44 54 7 13 N/A 0 0 132435 CASAVA_Build 10 41932829 2D ACATCTCCAT AC/-- AATTGACAGG 1498 het 1498 ref 43 34 4 5 AC 1 0 132436 CASAVA_Build 10 41934297 2D CTATTTTTCT GC/-- ATGTTTATCC 3070 het 3070 ref 77 54 16 18 GC 1 0 132437 CASAVA_Build 10 41937067 5D TTTCCTCTTC CTTTT/----- CTTTTCTTTT 1150 het 1150 ref 58 46 3 9 CTTTT 3 2 132438 CASAVA_Build 10 41937628 1D ATATTATTTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 72 14 42 16 A 8 7 132439 CASAVA_Build 10 41939626 1D ATCAAAGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 A 10 9 132440 CASAVA_Build 10 41942977 1D GAACTTATTT A/- AAAATTTTAA 1208 het 1208 ref 28 22 3 3 A 5 4 132441 CASAVA_Build 10 41943632 2D GGACATACAC AT/-- GTTTGCATAT 2236 het 2236 ref 46 32 5 12 AT 1 0 132442 CASAVA_Build 10 41944250 1D TGAGGTCCCC A/- AAAGGTCTGA 3070 het 3070 ref 54 21 26 7 A 4 3 132443 CASAVA_Build 10 41944507 3I TATGCCTTTT ---/CTA CTATTTATCT 3070 het 3070 hom 42 10 27 5 CTA 1 2 132444 CASAVA_Build 10 41946479 4D57M2D ATCACAATAA TATTTATTGTACATATGGAGGTAAAGATACTCAAAATATTACCCTAAAATACATTTTTTTTTG/----TATTGTACATATGGAGGTAAAGATACTCAAAATATTACCCTAAAATACATTTTTTTT-- AGATGGAGTT 1655 het 1655 ref 22 17 4 9 N/A 0 0 132445 CASAVA_Build 10 41951131 1D CCTTCACTAA C/- CTTTTCTATC 1951 het 1951 ref 77 59 5 13 C 2 1 132446 CASAVA_Build 10 41951212 1D AAGAGTGCCC T/- TTTGGTGAGC 835 het 835 ref 63 52 3 12 T 4 3 132447 CASAVA_Build 10 41952271 3D CAGGGAAGTG TTC/--- TTCTTCCAAC 2996 het 2996 ref 101 78 8 21 TTC 3 2 132448 CASAVA_Build 10 41954875 3D AAAAAAATTG TTC/--- TTCTAACTGC 3070 het 3070 ref 89 48 8 33 TTC 2 1 132449 CASAVA_Build 10 41955142 1I GTTACCCCAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 87 45 31 14 T 7 8 132450 CASAVA_Build 10 41955410 1D35M1I TCTACAATTT CTTTTAGTTGGTTAATCTGTATTACTGTATATTTTG-/-TTTTAGTTGGTTAATCTGTATTAGTGTATATTTTGT TATTTTATTC 3070 het 3070 hom 83 39 47 10 N/A 0 0 132451 CASAVA_Build 10 41960383 1I TTTTAAACTT -/C TTTGCTATTG 3003 het 3003 ref 53 33 10 10 C 0 1 132452 CASAVA_Build 10 41960981 4I CTTCAAAGCT ----/GTCA GACAGGGACA 3070 het 3070 hom 94 28 52 14 GTCA 0 1 132453 CASAVA_Build 10 41962828 1D ATTACACTTT C/- CCCCCTTTTT 1481 het 1481 ref 77 62 4 12 C 6 5 132454 CASAVA_Build 10 41963764 1I GCTCAGTGCA -/G GGCTCAAGTG 3070 het 3070 ref 63 40 9 14 G 2 3 132455 CASAVA_Build 10 41966422 10I GGCGGCGGGG ----------/GGAGAAAGAC GCAAAATAGT 372 het 372 ref 39 20 2 17 GGAGAAAGAC 0 1 132456 CASAVA_Build 10 41966915 3D GGAAAGGGGC AGG/--- AGAAGTATCT 3070 het 3070 ref 89 77 10 4 AGG 1 0 132457 CASAVA_Build 10 41968130 2I TTATATAAAA --/TT TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 68 23 18 27 T 7 9 132458 CASAVA_Build 10 41969570 1D GTTAATAATG T/- TCTTATGTGG 3070 het 3070 ref 99 84 8 7 T 2 1 132459 CASAVA_Build 10 41970779 1D CTTAAATTAA G/- GGTGTGTACA 2857 het 2857 ref 80 67 7 6 G 3 2 132460 CASAVA_Build 10 41971405 1D AGAAAAATTT C/- TATTTTTGAA 3070 het 3070 ref 92 74 11 7 C 1 0 132461 CASAVA_Build 10 41971620 8I ACAGATATTG --------/ACCTATAA ATTTTCTGTC 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 ACCTATAA 0 1 132462 CASAVA_Build 10 41971834 2D CTATTTTTCT GC/-- ATGTTTATCA 1046 het 1046 ref 82 53 4 30 GC 1 0 132463 CASAVA_Build 10 41972621 1D TTACCACAAT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 50 24 11 15 A 7 6 132464 CASAVA_Build 10 41973309 1I GAAATCTAGT -/A ATAATTTCCC 2359 het 2359 ref 95 52 7 41 A 1 2 132465 CASAVA_Build 10 41974113 5D TTTGACAGTC ATATT/----- ATAAGGCATG 3070 het 3070 ref 96 56 20 34 ATATT 1 0 132466 CASAVA_Build 10 41976258 1D CAGGTGAGCT C/- CCCAGGTTGG 2843 het 2843 ref 57 43 7 9 C 4 3 132467 CASAVA_Build 10 41976332 2D CAATGGAAAC TT/-- AACATTCAAA 3070 het 3070 ref 55 42 7 8 T 2 0 132468 CASAVA_Build 10 41976394 1I TGATTGGTCC -/T AATTTCTACC 3070 het 3070 ref 72 30 31 11 T 0 1 132469 CASAVA_Build 10 41977270 1I TACCATGTCT -/A GGTTATATGG 3070 het 3070 ref 100 43 51 6 A 0 1 132470 CASAVA_Build 10 41977540 2D TGTATCAAAC AT/-- ATTATAAAAC 3070 het 3070 ref 64 40 10 14 AT 2 1 132471 CASAVA_Build 10 41977985 1I ATCTTGTGCA -/C ATAATTATTT 3070 het 3070 hom 90 27 54 9 C 0 1 132472 CASAVA_Build 10 41979025 3I AATAGAAAAT ---/GAA GAAGAAAACA 3070 het 3070 hom 100 35 53 12 GAA 2 3 132473 CASAVA_Build 10 41979974 1D AAATGGCAAA T/- AAAAATGACT 3070 het 3070 ref 101 66 26 10 T 1 0 132474 CASAVA_Build 10 41980366 1D17M2I ATTTGCTTTC AAAAATTTTTTTAAAAAA--/-AAAATTTTTTTAAAAAATT GAATATATTG 3070 het 3070 ref 84 35 20 58 N/A 0 0 132475 CASAVA_Build 10 41987922 1I AAAAATGACA -/T TAAGAAGACC 1166 het 1166 ref 71 64 3 4 T 1 2 132476 CASAVA_Build 10 41988584 1I38M2I AAGGAATCAG -AACAAATATTAAAAAGTAGGAATATCAACAGAGATAAC--/AAAAAAATATTAAAAAGTAGGAATATCAACAGAGATAACAG AAATTCTGGA 3070 het 3070 ref 60 50 18 8 N/A 0 0 132477 CASAVA_Build 10 41989156 8D TAATTTGGTC CTGTAATT/-------- CTTCATTGCT 1829 het 1829 ref 25 21 4 1 CTGTAATT 1 0 132478 CASAVA_Build 10 41990665 5I TCACCTGAAA -----/TGAAG TGTTTACTGA 3070 het 3070 ref 48 30 9 9 TGAAG 0 1 132479 CASAVA_Build 10 41990908 2D TCTAAGTATC AG/-- AGAGATAATT 3070 het 3070 ref 43 27 9 7 AG 3 2 132480 CASAVA_Build 10 41993469 1I CCTCAGAAGC -/G ATGAGTGGAA 1182 het 1182 ref 28 22 4 2 G 0 1 132481 CASAVA_Build 10 41993611 1D TAAACCCACA T/- TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 78 57 9 13 T 6 5 132482 CASAVA_Build 10 41993794 1I AAGGTAATTT -/G TCTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 90 36 18 37 G 0 1 132483 CASAVA_Build 10 41994602 4D CTTCAGAATG ATAA/---- ATAGTCTTTC 3070 het 3070 ref 87 46 35 9 ATAA 1 0 132484 CASAVA_Build 10 41996228 1I CAAGTGTCCT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 89 58 12 19 A 8 9 132485 CASAVA_Build 10 41997662 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 63 13 16 40 A 8 7 132486 CASAVA_Build 10 41997820 2I CTCAAGACAC --/TT TCTACATAAG 3070 het 3070 ref 63 30 31 2 T 1 3 132487 CASAVA_Build 10 41998684 1I CTAAGAAAGA -/T TTGGCAAAGG 1512 het 1512 ref 66 51 4 11 T 2 3 132488 CASAVA_Build 10 42001222 1D CTTATTACTG T/- CAACAGAGTG 1287 het 1287 ref 86 67 3 17 T 1 0 132489 CASAVA_Build 10 42002137 1D TGAAAAACTT A/- TATTAAGTCA 3070 het 3070 hom 96 38 49 11 A 1 0 132490 CASAVA_Build 10 42002408 1I AAGCAGGCAG -/A AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 46 29 14 3 A 6 7 132491 CASAVA_Build 10 42002592 10I88M1I TCCTGTAAGT ----------TAATATGTAATAAACCCATATATATATATTGAACTTATTAGTTTTGTCCCTCTAGAGAACCCTCACTAATACAGATTTCGGTACCAGG-/TAATATGTAATAATATGTAATAAACCCATATATATATATAGAACTTATTAGTTCTGTCCCTCTAGAGAACCCTCACTAATACAGATTTTGGTACCAGGA ATGGTTCTGC 3070 het 3070 ref 44 42 27 17 N/A 0 0 132492 CASAVA_Build 10 42005933 1D GGGTGTTGCC A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 51 25 17 11 A 8 7 132493 CASAVA_Build 10 42006586 3I AGCATGGGAG ---/AAA AAAGATGTAG 3070 het 3070 ref 74 62 8 4 A 3 6 132494 CASAVA_Build 10 42007732 1I ACAAAAAAAC -/A CCTACTGCCT 3070 het 3070 ref 63 36 20 7 A 0 1 132495 CASAVA_Build 10 42007844 4I TTCTTTTTTC ----/TCTG TCTGGTGTTC 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 TCTG 1 2 132496 CASAVA_Build 10 42008146 1I AGCAAGAATT -/A AAAATATGTC 2029 het 2029 ref 53 46 5 2 A 4 5 132497 CASAVA_Build 10 42010264 1I CCAAGATTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 22 9 6 T 9 10 132498 CASAVA_Build 10 42010867 1I CAATAAACAT -/G GGGGATGCAG 3070 het 3070 ref 58 42 10 6 G 4 5 132499 CASAVA_Build 10 42011320 1I GAAATGTCTG -/T TCAGAGCATT 3070 hom 235 het 82 0 79 3 T 1 2 132500 CASAVA_Build 10 42011375 1D TGTTGATATG T/- TTGAATTCCT 2334 het 2334 ref 68 21 5 44 T 3 2 132501 CASAVA_Build 10 42011419 3D CTGCCGGATG AGT/--- AGTTTATATT 3070 het 3070 ref 81 39 33 14 AGT 2 1 132502 CASAVA_Build 10 42011791 1D TGGCATCTTT G/- TAAAAAATCC 2866 het 2866 ref 70 60 7 4 G 1 0 132503 CASAVA_Build 10 42011889 1D ATGATGTTTT G/- GGTTACTACA 3070 het 3070 hom 84 23 51 12 G 3 2 132504 CASAVA_Build 10 42012013 1I TCTCTTTGGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 80 22 8 50 T 7 8 132505 CASAVA_Build 10 42012691 1I CTGCGGCCTT -/G CAGACACTGC 3070 het 3070 ref 52 32 12 8 G 0 1 132506 CASAVA_Build 10 42012863 1D CCCTCCTTCC T/- CCCAGTGTTG 2098 het 2098 ref 50 41 5 5 T 1 0 132507 CASAVA_Build 10 42013447 1D TTATTAGAGG A/- AAAAATATTG 2499 het 2499 ref 62 46 6 10 A 6 5 132508 CASAVA_Build 10 42013988 3D TTCCAGAGGC TGT/--- TATTTCAATT 1714 het 1714 ref 38 27 4 9 TGT 1 0 132509 CASAVA_Build 10 42016071 4D ACTCAATAAT AAAC/---- AAACAAAAAA 1181 het 1181 ref 24 19 3 2 AAAC 2 1 132510 CASAVA_Build 10 42016541 1D TCTAAAAAAA T/- AATAGTTAAA 2850 het 2850 ref 74 63 7 6 T 1 0 132511 CASAVA_Build 10 42018343 2I TAGCTGTTAT --/TA TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 64 23 25 16 TA 0 1 132512 CASAVA_Build 10 42018529 1D CGTCCACACC A/- AACAATTCCA 2994 het 2994 ref 90 72 7 15 A 3 2 132513 CASAVA_Build 10 42021127 1I24M3D ACAGGAAAAA -GTTTGTCTTTGTCACTTTAATCTTATC/TATTTGTCTTTGTCACTTTAATCTT--- ATTACTAGAG 2343 het 2343 ref 41 41 5 5 N/A 0 0 132514 CASAVA_Build 10 42021428 2D AAAAAAATAA TT/-- TTTGTTAGAG 3070 het 3070 ref 88 61 20 12 T 5 3 132515 CASAVA_Build 10 42022525 2I TCTCTTATTT --/TC TTATTTTAGT 3070 het 3070 ref 44 11 9 24 TC 0 1 132516 CASAVA_Build 10 42023052 11I GTTATAGTCA -----------/GGAGATTTTTG GGAATTGTGG 3070 het 2320 hom 70 12 55 3 GGAGATTTTTG 0 1 132517 CASAVA_Build 10 42023731 1I CTACCCTCCC -/A AACCAAAACA 3070 het 3070 hom 50 16 29 5 A 2 3 132518 CASAVA_Build 10 42024728 1D GGAGGGTAAA C/- CTCTGAAGAC 1806 het 1806 ref 34 26 4 4 C 2 1 132519 CASAVA_Build 10 42025169 1D CAGCCTTAAG T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 52 17 31 4 T 7 6 132520 CASAVA_Build 10 42025267 1D TCTGCAAAGC T/- TTGAATTCTG 3070 het 2667 hom 30 7 10 13 T 3 2 132521 CASAVA_Build 10 42026152 8I GCATTTATAT --------/ATATACAC ATATATACAA 3070 het 3070 hom 21 10 8 3 ATATACAC 0 1 132522 CASAVA_Build 10 42027767 1I GTCAAAATTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 94 79 9 6 A 7 8 132523 CASAVA_Build 10 42029307 2I GAATCAGAAT --/AA AAAAAAAGAA 2564 het 2564 ref 53 27 7 19 A 7 9 132524 CASAVA_Build 10 42029357 2I CAATCAATAA --/TT TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 71 13 15 43 T 7 9 132525 CASAVA_Build 10 42032363 6I TCAGCACTAA ------/TCCCTC AGGAGTAAAA 3070 het 3070 ref 73 49 9 15 TCCCTC 0 1 132526 CASAVA_Build 10 42032521 4D TTCCTTGTCA TGTT/---- TGTTTTGTCT 927 het 927 ref 74 51 4 25 TGTT 2 1 132527 CASAVA_Build 10 42033822 1D TCATGACCTT A/- AAAACTCCAC 3070 het 3070 hom 67 13 47 7 A 5 4 132528 CASAVA_Build 10 42040840 2D GAGGTAATGG TT/-- TTGATTGGTC 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 T 4 2 132529 CASAVA_Build 10 42041641 8D CTCATTTCAT TTCATCTC/-------- ATCATTTTTC 2191 het 2191 ref 34 25 6 5 TTCATCTC 1 0 132530 CASAVA_Build 10 42041957 5D CTTCATTTCA TCATT/----- TCATTTCAAC 3070 het 3070 ref 54 40 7 8 TCATT 2 1 132531 CASAVA_Build 10 42042473 3D TCATTTTATC TCA/--- TCATTTCATC 1441 het 1441 ref 52 34 6 14 TCA 2 1 132532 CASAVA_Build 10 42042490 3D TTCATCTCAT CTC/--- ATCTCAATTC 1289 het 1289 ref 59 37 5 19 CTC 1 0 132533 CASAVA_Build 10 42043387 5D ATTTCATTTC ATTAT/----- GTCATTTCAT 3070 het 3062 hom 52 15 22 18 ATTAT 1 0 132534 CASAVA_Build 10 42044097 3D23M1D6M7D TCATTTCATC TCATCATTTCTTCTCATCATTTCATCTCATCATTTTATCC/---TCGTTTCATCTCATCATTTCATC-CATCAT------- ATCATCTCAT 3070 het 3070 ref 38 40 9 6 N/A 0 0 132535 CASAVA_Build 10 42053027 1D AATCAACAGA T/- TAAAAAAAGG 3070 het 1935 hom 11 4 7 0 T 2 1 132536 CASAVA_Build 10 42060634 3D GGGTATTGTT GTA/--- TATGAGCTGG 1326 het 1326 ref 48 45 3 6 GTA 1 0 132537 CASAVA_Build 10 42060826 1I GTTACTTTAC -/A ACGTCAATGG 3070 het 3070 hom 92 30 56 6 A 1 2 132538 CASAVA_Build 10 42063583 1D CTGTTCATAT C/- CTTTGTCCAT 3070 het 3070 ref 96 78 9 9 C 2 1 132539 CASAVA_Build 10 42063697 1D TTTGTGATGA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 31 13 8 10 T 8 7 132540 CASAVA_Build 10 42064388 1D AATACCAGTT G/- TATGATGTAA 1262 het 1262 ref 73 67 3 4 G 1 0 132541 CASAVA_Build 10 42064459 1D TATTTTGTCT A/- TTTATATGTC 2310 het 2310 ref 56 47 5 4 A 1 0 132542 CASAVA_Build 10 42065626 1I GGCAGGAGCA -/T CCAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 77 52 16 9 T 0 1 132543 CASAVA_Build 10 42068321 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 7 8 132544 CASAVA_Build 10 42069234 3D GAAAAAAAAA AAT/--- TCCTCTTCCT 1929 het 1929 ref 28 21 5 2 AAT 1 0 132545 CASAVA_Build 10 42074000 1I CATTTTTCCA -/T GTGTCTGTTG 1405 het 1405 ref 23 19 3 1 T 0 1 132546 CASAVA_Build 10 42079253 1D CTGCACCCAC T/- CTCCAACCAG 3070 het 3070 ref 43 28 11 4 T 1 0 132547 CASAVA_Build 10 42079917 1D ATTTGTATTT C/- TTTTTGGAAA 3070 het 3070 hom 74 23 44 10 C 1 0 132548 CASAVA_Build 10 42080719 7D TTCTCTAGCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1106 het 1106 ref 25 12 3 13 T 22 15 132549 CASAVA_Build 10 42082817 2D TGCCTCCCTT TA/-- TGTTTCACTG 3070 het 3070 ref 66 47 13 6 TA 1 0 132550 CASAVA_Build 10 42083000 3D AAAAACTCTA CTT/--- CTTTACACCT 3070 het 3070 ref 39 25 8 8 CTT 2 1 132551 CASAVA_Build 10 42083688 1I TACAGTTCTT -/G GTTGACAGTT 3070 het 3070 ref 52 33 14 5 G 1 2 132552 CASAVA_Build 10 42084534 1I TGTAAAACCT -/A AAAATCAGTG 3068 het 3068 ref 45 27 9 9 A 4 5 132553 CASAVA_Build 10 42085235 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 52 24 25 3 T 7 6 132554 CASAVA_Build 10 42086295 2D ACTCATTCTG GT/-- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 GT 1 0 132555 CASAVA_Build 10 42086390 1I ATCTTTTGTA -/T TTTTTTTTCC 1383 het 1383 ref 34 27 3 4 T 8 9 132556 CASAVA_Build 10 42086990 3I CATCTTGTGC ---/TTG TTAAGTCTTT 3070 het 3070 ref 57 30 24 4 TTG 0 1 132557 CASAVA_Build 10 42088944 1I TGAAAATATG -/T TTTTTTATTT 1343 het 1343 ref 35 27 3 5 T 6 7 132558 CASAVA_Build 10 42089174 2D CTGTCTCTAC AA/-- AAAAAATACA 2584 het 2584 ref 35 24 6 8 A 8 6 132559 CASAVA_Build 10 42089808 1I ATGCAAAAAA -/C CCTCTATTAT 3070 het 3070 hom 81 33 36 12 C 2 3 132560 CASAVA_Build 10 42090007 1D ACGTAAAGTG C/- CTTAGCACTC 3070 het 3070 ref 47 35 7 5 C 2 1 132561 CASAVA_Build 10 42090837 3D39M1I ACCATTATCG TCATCATCTCTTAAAAGTCAGTGGGTTTGGCTTTTGTTTTTG-/---TCATCTCTTAAAAGTCAATGGGTTTGGTTTCTGTTTTTGT TTTTTTCTGT 1835 het 1835 ref 35 42 4 4 N/A 0 0 132562 CASAVA_Build 10 42092026 2I ATTAACTCAG --/TT TAATATTTTT 2438 het 2438 ref 49 31 8 10 T 1 3 132563 CASAVA_Build 10 42094249 3D AAATTTTAAG TTT/--- TTTATTTATA 1454 het 1239 hom 10 3 3 4 T 6 3 132564 CASAVA_Build 10 42094724 1D TCTTATAAAC T/- TTTTTTGTAT 2375 het 2375 ref 25 9 5 11 T 7 6 132565 CASAVA_Build 10 42096562 2D TTAATCCAAC AA/-- AGACTTTGCT 3070 het 3070 ref 49 37 9 5 A 3 1 132566 CASAVA_Build 10 42097761 1D25M1I AATAGAAACC TTTTTTTTTTTAAGTTTTTTCATGGG-/-TTTTTTTTTTAAGTTTTTTCATGGGT TTTTTTTCAG 2224 het 1564 hom 14 8 7 4 N/A 0 0 132567 CASAVA_Build 10 42099512 1D GTCTATATCG T/- TAATGGTATA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 2 1 132568 CASAVA_Build 10 42099615 2D ATTAGTAGAC TT/-- TGTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 53 43 8 3 T 3 1 132569 CASAVA_Build 10 42101971 9I TTTATTCACC ---------/AATTGTGCT AGTACTGAGC 3070 het 3070 ref 72 46 20 7 AATTGTGCT 0 1 132570 CASAVA_Build 10 42102292 4I CCAACTGAAA ----/ATTT TTTTTTAATT 3070 het 2823 hom 33 9 17 7 ATTT 0 1 132571 CASAVA_Build 10 42104002 2I CCATTTATTG --/AA AAGATTGTCC 1878 het 1878 ref 36 25 4 7 A 2 4 132572 CASAVA_Build 10 42106153 2D TCCTTAGTAT GG/-- GGGGGGAACA 1402 het 1402 ref 23 20 3 0 G 8 6 132573 CASAVA_Build 10 42107801 1D AGTTTTCTTT C/- CTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 18 9 2 C 2 1 132574 CASAVA_Build 10 42108257 1I CTCAATAGTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 T 8 9 132575 CASAVA_Build 10 42110286 1D CAGAAAATTA C/- CCATTTTCTC 3070 het 3070 ref 27 19 7 2 C 3 2 132576 CASAVA_Build 10 42115919 5D TCCATTTGTA TCCAT/----- TCCATTCCAT 3070 het 3070 ref 57 33 21 5 TCCAT 3 2 132577 CASAVA_Build 10 42117418 4D52M5D12M4D2M1D TCCATTCGAG TCCAATCCTTACCATTAAACTCCATTCCATTCCACTTGAGTCAGTTTCATTCGAGTGAATTCCATTTCATTCCATTTGAG/----AATCGAATCAATTACATTGCAATCCATTACTATTGAGTCCGTTTTATTCCAG-----TCCACTGCATTC----TG- TCCATTCCAT 2184 het 2184 ref 51 70 5 25 N/A 0 0 132578 CASAVA_Build 10 42127207 10I TCGTGTCCAG ----------/TCCATTCCAT TCCATTCCAT 3070 het 3070 ref 64 30 20 14 TCCAT 2 4 132579 CASAVA_Build 10 42129129 10D TGTTCCATTC CATTCCATTA/---------- CATTCCATTG 3070 het 3070 ref 81 43 23 23 CATTCCATTA 1 0 132580 CASAVA_Build 10 42134054 10D TTTCATTCCA TTCCTTTCCT/---------- TTCGAGTCCA 1903 het 1903 ref 75 51 5 59 TTCCT 2 0 132581 CASAVA_Build 10 42142764 2D GTTCTTTCCA TT/-- TGTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 19 8 9 5 T 3 1 132582 CASAVA_Build 10 42149008 1D AAAAAATATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 A 10 9 132583 CASAVA_Build 10 42153139 3D GCTTTGCCAC ATT/--- CTTCACATTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 ATT 1 0 132584 CASAVA_Build 10 42158398 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 7 8 132585 CASAVA_Build 10 42159246 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAATTGG 2206 het 2206 ref 13 7 6 0 A 7 6 132586 CASAVA_Build 10 42161133 3D TAGCATGAGG TAA/--- TAAAGATTGT 1797 het 1797 ref 18 12 4 2 TAA 2 1 132587 CASAVA_Build 10 42174774 5I CTGTTTGAGA -----/ATAGC TCTTCAGGTG 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 ATAGC 0 1 132588 CASAVA_Build 10 42175361 5I TTAGGTAATA -----/GAAAG CTCAAGAATA 3070 het 2325 hom 24 6 17 1 GAAAG 0 1 132589 CASAVA_Build 10 42175761 5D CAAGGAGAGT TAAAA/----- AAAAAAAAAA 2788 het 2788 ref 54 36 6 13 TAAAA 1 0 132590 CASAVA_Build 10 42200882 1I GGCCCTTTAA -/T TGGGAGGGCC 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 T 1 2 132591 CASAVA_Build 10 42208750 37D GGGTTATCTT GGGGCTGGCATCTTCCCAGCCAGAGGGGGCTTACCTC/------------------------------------- GGGGCTGGCA 1819 het 1819 ref 41 35 6 8 GGGGCTGGCATCTTCCCAGCCAGAGGGGGCTTACCTC 1 0 132592 CASAVA_Build 10 42211109 1D AATAAAAACC A/- AAAAAAACTA 2254 het 2254 ref 20 9 6 7 A 8 7 132593 CASAVA_Build 10 42211345 7I GGAATTTATT -------/AAGCAAA AAGGATAAAG 1122 het 1122 ref 46 32 5 9 AAGCAAA 0 1 132594 CASAVA_Build 10 42215073 3D CATATGAAAC TGT/--- ACAGTCCTTT 3070 het 3070 ref 36 16 16 6 TGT 1 0 132595 CASAVA_Build 10 42228200 1D ATAGGCAGTG T/- TTTTTTGTTA 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 T 7 6 132596 CASAVA_Build 10 42235163 4I TGTAAAAAAA ----/AAAC AAAAAAAAAA 3070 het 2369 hom 34 14 16 4 AAAC 0 1 132597 CASAVA_Build 10 42244568 34D AAAAAAGCTC ACCTTTGCTTGATATGATAATATAGTGCCAAGGT/---------------------------------- CACACTGTGG 3070 het 3070 ref 23 17 7 3 ACCTTTGCTTGATATGATAATATAGTGCCAAGGT 1 0 132598 CASAVA_Build 10 42248524 4I50M7D TGCTTATTTG ----CTGATTTTTCCTTCCACCATGATGTCTAAGATTAAAAGAGAAACTGATACTTAATAT/CTAACTGATTTTTCCTTCCACCCTGACGTCTAAGATTAAAAGAGAAATTGATAC------- TTAAAATCTG 2068 het 2068 ref 44 57 5 8 N/A 0 0 132599 CASAVA_Build 10 42249083 1D AAAAAAGTTT A/- AAATAATATT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 4 3 132600 CASAVA_Build 10 42249428 9I CTGAAAACAG ---------/GTGACAAAA ATGACAACTT 3056 het 3056 ref 43 32 7 4 GTGACAAAA 0 1 132601 CASAVA_Build 10 42259961 4I GCTTCCAAAT ----/AAAA AAAGCCAGGG 3070 het 3070 ref 46 26 10 10 A 3 7 132602 CASAVA_Build 10 42260917 1D GCTTCAGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 12 10 A 13 12 132603 CASAVA_Build 10 42261692 1I CACTTCTGAT -/A AAAAATACCA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 5 6 132604 CASAVA_Build 10 42262405 1D ATAGCTTTTG T/- TTTTACCTCT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 5 4 132605 CASAVA_Build 10 42266365 1D12M1I20M1I AAGTCTACTC AAAACTACAAAAA-AAAAGTTATAAACTCCCATA-/-AAACTACAAAAAGAAAGGTTACACACTCCCATAT TTTACTGCAC 3070 het 3070 ref 49 51 11 10 N/A 0 0 132606 CASAVA_Build 10 42272762 1D AATAAAGCTA C/- TACATGAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 C 1 0 132607 CASAVA_Build 10 42292562 2I GTAAGTTGGG --/TT TTCAGCATCT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 2 4 132608 CASAVA_Build 10 42293141 1D TTGTGTTATG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 T 9 8 132609 CASAVA_Build 10 42294008 1D ACTGGATAAT G/- GTCATGCATG 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 G 2 1 132610 CASAVA_Build 10 42298521 1D CAGACACAGA C/- CCCCCCAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 C 7 6 132611 CASAVA_Build 10 42329393 2I CATTCTTCTA --/CT CTCTATCTCT 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 CT 2 3 132612 CASAVA_Build 10 42341256 5I AAGAGTTAAT -----/AAAAG AATAGTTTGT 3070 het 3070 hom 25 7 16 2 AAAAG 0 1 132613 CASAVA_Build 10 42365699 4I ACCAACAGGC ----/AATA AATACATAAA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 AATA 1 2 132614 CASAVA_Build 10 42372393 23D TTCCCATTCT GTTGCTGCCAGCACACTGGAATG/----------------------- GACAGAGGGA 3070 het 3070 ref 26 16 13 6 GTTGCTGCCAGCACACTGGAATG 1 0 132615 CASAVA_Build 10 42375476 9I GATAAGCCTT ---------/TGATAACTG GGTGTCTATC 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 TGATAACTG 0 1 132616 CASAVA_Build 10 42385832 1D GGCCTACACT G/- TCCTGCACAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 G 1 0 132617 CASAVA_Build 10 42393544 2D GAGGAAACAG AC/-- ACTGATCCTG 2762 het 2762 ref 27 13 8 7 AC 2 1 132618 CASAVA_Build 10 42414900 21D TTCATACATG TGTATATTACATATATACATA/--------------------- TGTATATTAC 3070 hom 66 het 30 0 23 13 TGTATATTACATATATACATA 2 1 132619 CASAVA_Build 10 42422795 4D GTGTACACAT AAAC/---- AAACATAGAG 3070 het 3070 hom 24 11 12 5 AAAC 2 1 132620 CASAVA_Build 10 42433292 3I GTGATAATTG ---/GCT GCTAATAGAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 GCT 1 2 132621 CASAVA_Build 10 42435350 22D AGAAGGGAAT AATATATAATATAAAATAATAA/---------------------- AAATATAAAA 3070 het 3070 hom 17 8 8 6 AATATATAATATAAAATAATAA 1 0 132622 CASAVA_Build 10 42438849 1D AAACAGGAAC T/- TTGAGCAGAT 2871 het 2871 ref 41 31 6 4 T 3 2 132623 CASAVA_Build 10 42440830 4D TTTGTATATG TTCA/---- TTGTTAGTGG 3070 het 3070 ref 38 21 12 6 TTCA 1 0 132624 CASAVA_Build 10 42442606 3D TACAGGCGTG CAC/--- CACCACACCA 1363 het 1363 ref 16 10 4 2 CAC 3 2 132625 CASAVA_Build 10 42443911 1I AACTACAATT -/A AAAATGTGCT 1203 het 1203 ref 52 43 3 6 A 4 5 132626 CASAVA_Build 10 42454247 12I TCCCGGGGCG ------------/CTCTCCCAGTGC ACCCAAAGGG 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 CTCTCCCAGTGC 0 1 132627 CASAVA_Build 10 42460720 1I GAGTTCCTGC -/T GCACCTCCCT 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 T 0 1 132628 CASAVA_Build 10 42474238 1D CACCAGGCAT A/- AAAAAAAAAA 1740 het 1740 ref 41 29 4 10 A 12 11 132629 CASAVA_Build 10 42475357 1I GAGGTAAGGG -/T AAATACCCAT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 0 1 132630 CASAVA_Build 10 42477682 3D TAAATAGTTG TTC/--- TTCTTTATTA 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TTC 2 1 132631 CASAVA_Build 10 42480170 3D TGTACATTTA GTT/--- ATTATAAATC 3070 het 3070 ref 29 15 10 6 GTT 1 0 132632 CASAVA_Build 10 42486735 1I CCTAAAACTT -/A AAAGTATAAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 3 4 132633 CASAVA_Build 10 42495324 2D GGCAGTACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2664 hom 28 8 15 5 T 13 11 132634 CASAVA_Build 10 42513294 1I TTCTTTACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 9 10 132635 CASAVA_Build 10 42582011 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 A 8 7 132636 CASAVA_Build 10 42600064 2D CCATTGATTC TT/-- TTTTTAAATA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 7 5 132637 CASAVA_Build 10 42603504 2D GTTTGGTGAC AA/-- AGAGCTACAG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 3 1 132638 CASAVA_Build 10 42605047 1D AATCTTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 11 10 132639 CASAVA_Build 10 42620185 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2571 het 1078 hom 24 7 9 9 T 13 12 132640 CASAVA_Build 10 42624869 1I CTTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 13 6 T 10 11 132641 CASAVA_Build 10 42625653 3D GAAATGTGTG TGT/--- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 26 14 12 1 TGT 1 0 132642 CASAVA_Build 10 42626504 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 10 9 132643 CASAVA_Build 10 42629780 1D TTCTGTTGAT A/- CAGGTTTCAG 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 A 1 0 132644 CASAVA_Build 10 42630399 1I CTCTGGGCCT -/G GGTCAACTTC 2497 het 2497 ref 39 30 7 2 G 2 3 132645 CASAVA_Build 10 42647879 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 12 11 132646 CASAVA_Build 10 42648864 1I AAATGTATCA -/T TTAGGCAATT 2137 het 2137 ref 56 48 5 3 T 2 3 132647 CASAVA_Build 10 42648944 1I ACCTGGGCTC -/T TATGGTATGG 3070 het 3070 hom 57 23 31 3 T 1 2 132648 CASAVA_Build 10 42649851 1D CGCTGATGGG A/- AAAAGAGCAT 2676 het 2676 ref 29 19 7 3 A 5 4 132649 CASAVA_Build 10 42655013 7I TAAGTTTCTT -------/ATCTGTA AGATGGGGAT 2920 het 2470 hom 14 5 7 2 ATCTGTA 0 1 132650 CASAVA_Build 10 42657160 1D GAGGTGGGGG A/- TTGCTTGAGC 3070 het 3070 hom 26 12 14 1 A 1 0 132651 CASAVA_Build 10 42658910 6I TTTCACCATG ------/TTGGCC TTGGCCAAGT 1935 hom 10 het 4 0 4 0 TTGGCC 1 2 132652 CASAVA_Build 10 42660085 2I ACTTTAAACA --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 474 hom 25 2 18 5 CT 7 8 132653 CASAVA_Build 10 42680638 1I AAGGAGATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 9 10 132654 CASAVA_Build 10 42701742 1D TTCAGGTTAC T/- GTCTGTTTTG 3070 het 3070 ref 21 10 10 2 T 1 0 132655 CASAVA_Build 10 42704550 3D CATTGGGATG GAT/--- GATGATGCCC 3070 hom 59 het 25 0 20 5 GAT 3 2 132656 CASAVA_Build 10 42708189 1D TTTAAAGGGG A/- AAAAAAGATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 7 6 132657 CASAVA_Build 10 42711726 1I ACTCTGAGGG -/A AAAAAAAAAC 3048 het 2377 hom 19 7 8 4 A 9 10 132658 CASAVA_Build 10 42713015 3D3M1D GGCTTGTGGG GGAGTGA/---GTG- CAAAGCAGTG 3070 het 3070 ref 36 16 17 7 N/A 0 0 132659 CASAVA_Build 10 42730638 1D CCCATTAAAG T/- AACAACTCAA 2608 het 2608 ref 24 17 6 3 T 1 0 132660 CASAVA_Build 10 42732220 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2151 het 2151 ref 22 12 6 4 A 12 11 132661 CASAVA_Build 10 42734711 1I ATTTATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 25 1 14 10 A 11 12 132662 CASAVA_Build 10 42753851 1D CCCTCCCTGG C/- CCCTCCTTCA 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 C 4 3 132663 CASAVA_Build 10 42768379 1D TGCGGTGAGG C/- CTCTCCTTCT 3070 het 3070 ref 40 22 10 8 C 2 1 132664 CASAVA_Build 10 42773345 4D ACACTAAAAT AACA/---- AACAAAGAGT 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 AACA 2 1 132665 CASAVA_Build 10 42781236 1D TTCTCCAACG A/- AGCCATCTGG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 2 1 132666 CASAVA_Build 10 42815964 1D CAGCAGATGC T/- GCAATTCAGC 3070 het 3070 ref 49 28 14 7 T 1 0 132667 CASAVA_Build 10 42830170 1D TCAAAGTGCT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 7 132668 CASAVA_Build 10 42830673 34D GAAAATAACC ATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------- ATATATATAT 3070 het 22 hom 11 1 11 4 AT 23 6 132669 CASAVA_Build 10 42836393 1D AGTGACAAAA G/- GAAAAATAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 2 1 132670 CASAVA_Build 10 42866172 1I TTCTGAAACA -/T TAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 1 2 132671 CASAVA_Build 10 42898059 2D CTGGCCCTTG CT/-- CCTCTGTGCT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 CT 1 0 132672 CASAVA_Build 10 42921332 1I GCAGAGCCAT -/C CCAGGTGCCC 3029 het 3029 ref 30 14 11 5 C 2 3 132673 CASAVA_Build 10 42925253 3D AATATTCATT AAA/--- GAAGATGAGG 3070 het 3070 ref 47 19 20 8 A 3 0 132674 CASAVA_Build 10 42927766 1D CCTGGGGTGG C/- TCTCCCTGCT 3070 het 2529 hom 30 13 14 3 C 1 0 132675 CASAVA_Build 10 42950721 1D GGCTAGAGTG C/- CCGTGGTGCA 3070 hom 113 het 42 0 34 8 C 3 2 132676 CASAVA_Build 10 42960020 1D ACTGGAGGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 T 9 8 132677 CASAVA_Build 10 42962798 3D GTTGTGTTTG TTA/--- TTATTTCATT 3028 het 3028 ref 18 10 7 1 TTA 2 1 132678 CASAVA_Build 10 42967879 4I TTATGCAACT ----/AACA TTTACATTCT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 AACA 0 1 132679 CASAVA_Build 10 42973646 2D ATATATACAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 AT 7 6 132680 CASAVA_Build 10 42983441 5D AATTTAATCA TAAAG/----- TAGACAGATT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 TAAAG 1 0 132681 CASAVA_Build 10 42991385 1D TTGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2155 het 2155 ref 22 7 7 8 T 13 12 132682 CASAVA_Build 10 42998341 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1729 het 1229 hom 19 7 7 5 A 11 10 132683 CASAVA_Build 10 43000454 1I AGTTTAGTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 25 7 15 3 T 7 8 132684 CASAVA_Build 10 43010536 2I CTGGGAATGC --/AG AGAGGGACAA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 AG 2 3 132685 CASAVA_Build 10 43014370 1I CAGCTGTGAC -/A GGGGCTCAGG 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 A 0 1 132686 CASAVA_Build 10 43025144 1D AAGCCCCCCC A/- CCAGGGCTAG 2630 het 1577 hom 26 7 9 10 A 1 0 132687 CASAVA_Build 10 43025770 1D ACTAACATTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 A 9 8 132688 CASAVA_Build 10 43038458 1D ACTTTATTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 T 10 9 132689 CASAVA_Build 10 43042847 1I CAGGCCTGGA -/C CCCCCAATGC 3070 het 2296 hom 26 7 14 5 C 5 6 132690 CASAVA_Build 10 43051318 1D GCAGGACGGG T/- TGAGGGCCAA 3070 hom 79 het 33 0 22 13 T 2 1 132691 CASAVA_Build 10 43053613 19D TCACAGAGTA ACACCTGCCCCTCAGGAGG/------------------- GTTAGCCATG 3070 het 3070 hom 20 11 11 0 ACACCTGCCCCTCAGGAGG 1 0 132692 CASAVA_Build 10 43055378 5D AGAAAGCTTA AAAGG/----- AAAGTTTCAG 3070 het 3070 ref 53 30 16 9 AAAGG 1 0 132693 CASAVA_Build 10 43058243 8D CACCTCGGTC TCCCGAGG/-------- TGCTGGGATT 1976 het 1976 ref 28 18 6 4 TCCCGAGG 1 0 132694 CASAVA_Build 10 43059859 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 A 11 10 132695 CASAVA_Build 10 43062803 1I GAAAATGATC -/T GGTATAGTTC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 1 132696 CASAVA_Build 10 43063095 1I GAAATCTGAC -/A AAAAAAGGCC 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 A 6 7 132697 CASAVA_Build 10 43064346 6I GGGAGACACA ------/AATACT AATACTAAAC 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 AATACT 1 2 132698 CASAVA_Build 10 43066097 1I CGAAGGGGAA -/G GGGGGGGGTC 2374 het 1259 hom 30 6 11 13 G 8 9 132699 CASAVA_Build 10 43075753 7I CCCACACCTG -------/CTGCTCC CTGCTCCTTC 3070 het 3070 ref 41 15 10 16 CTGCTCC 1 2 132700 CASAVA_Build 10 43085282 2D CACTGCTTTA CT/-- CTCTCTCTCA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 CT 5 4 132701 CASAVA_Build 10 43087100 1I CCCATCACCA -/C CATGGCACTG 3070 hom 141 het 49 0 45 4 C 1 2 132702 CASAVA_Build 10 43087855 1D TGTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 931 het 931 ref 34 20 4 10 T 11 10 132703 CASAVA_Build 10 43089432 1I GAAGAGTCTC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 7 8 132704 CASAVA_Build 10 43093173 4D TATGCATTGT ATAG/---- ATATATACAC 3070 hom 96 het 38 0 32 7 ATAG 1 0 132705 CASAVA_Build 10 43094139 1I CCAACACTTT -/G GGAGGCTGAG 3070 hom 36 het 14 0 12 2 G 2 3 132706 CASAVA_Build 10 43095594 4I ACTAACTAAA ----/AGAC AGAGACTGTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AGAC 0 1 132707 CASAVA_Build 10 43097450 1I TGTTCTTGGC -/T TATTTCAATG 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 T 1 2 132708 CASAVA_Build 10 43106297 1I CAAATGTCAG -/T TTTTCCCCTA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 4 5 132709 CASAVA_Build 10 43129686 6I GACCAGCCCC ------/AGACCA AGACCACGCT 3070 hom 93 het 35 0 27 8 AGACCA 1 2 132710 CASAVA_Build 10 43132130 1I TTCTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 23 2 17 4 T 14 15 132711 CASAVA_Build 10 43135122 3I GTCAGCCAAG ---/ACA GGACTGCTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 ACA 0 1 132712 CASAVA_Build 10 43145928 2D AGGGACACAA AC/-- ACGGCCGAAG 1889 hom 12 het 5 0 5 1 AC 2 1 132713 CASAVA_Build 10 43150280 12I GATAGAGCCA ------------/CTGCACTCCAGC CTGGGCAACA 3070 hom 54 het 20 0 17 3 CTGCACTCCAGC 0 1 132714 CASAVA_Build 10 43150356 1I TGGCACATCC -/T ATGCTATGGA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 0 1 132715 CASAVA_Build 10 43150735 1D GATTATTTCA C/- CGGGTATATA 3070 hom 42 het 23 0 15 8 C 2 1 132716 CASAVA_Build 10 43157368 1I ATTTTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 2532 het 1720 hom 22 7 12 3 T 15 16 132717 CASAVA_Build 10 43167103 1I GCCCACCCTA -/G GTTCCAGGCC 899 hom 12 het 6 0 4 2 G 1 2 132718 CASAVA_Build 10 43168624 15I TGTGTCCGGT ---------------/CCTCTGAGGGACACA CCTGGGGCAT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 CCTCTGAGGGACACA 0 1 132719 CASAVA_Build 10 43169774 1I GATTACTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 29 2 22 5 A 11 12 132720 CASAVA_Build 10 43170096 1I TAAGCTCCTG -/C CTAGGATCAG 3070 hom 25 het 15 0 12 3 C 1 2 132721 CASAVA_Build 10 43173783 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 18 0 14 4 A 13 14 132722 CASAVA_Build 10 43184023 1I CTTAAATTTT -/A AAAAGTTAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 4 5 132723 CASAVA_Build 10 43187499 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 10 0 9 1 A 14 13 132724 CASAVA_Build 10 43194000 1I GGTAGGGGGG -/A ACCAGAGAAA 3070 het 3070 ref 44 18 14 12 A 1 2 132725 CASAVA_Build 10 43207126 2I CAGAGTCCAG --/GA GAGTTTGTAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 GA 1 2 132726 CASAVA_Build 10 43210586 1I TTTAAATATC -/G GGGGGCAGGG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 G 5 6 132727 CASAVA_Build 10 43216536 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2941 het 2380 hom 18 8 9 1 A 12 11 132728 CASAVA_Build 10 43217837 1D ATTCACTTCT A/- ATCCTTTATC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 2 1 132729 CASAVA_Build 10 43218349 1D TTATGATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 11 10 132730 CASAVA_Build 10 43233932 1I AGAAGCAGGC -/A AATCACTTGA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 2 3 132731 CASAVA_Build 10 43235264 1D CCCTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1496 het 1496 ref 25 17 4 4 T 13 12 132732 CASAVA_Build 10 43236570 1I GTTGCGTAAC -/G TCAGATCCCT 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 G 0 1 132733 CASAVA_Build 10 43239232 1D TGGGAGTTCA T/- AGACCAGCCT 3070 het 1895 hom 17 5 9 3 T 1 0 132734 CASAVA_Build 10 43245443 1D TTTTTTTTTT C/- CTTTTGAGAC 3070 het 2757 hom 22 7 11 5 C 2 1 132735 CASAVA_Build 10 43249506 6I TATCCTTCAT ------/ATATAA ATATAAGTGT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 ATATAA 1 2 132736 CASAVA_Build 10 43262705 16I GAGAACAACA ----------------/TTTTTTTTTTCTTTTC TTTTTTTTTT 2518 het 2518 ref 21 12 7 3 TTTTTTTTTTCTTTTC 0 1 132737 CASAVA_Build 10 43265133 1D TATTGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 2985 het 2985 ref 40 18 9 13 T 16 15 132738 CASAVA_Build 10 43267981 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2435 hom 28 7 15 7 T 10 9 132739 CASAVA_Build 10 43269233 2D TGCGAAAACT CA/-- CAGTTAATAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 CA 2 1 132740 CASAVA_Build 10 43279155 4I CACAACTGTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 82 het 44 0 25 19 TTTC 3 4 132741 CASAVA_Build 10 43279168 3I CTTTCTTTCT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 40 2 26 12 TTC 0 1 132742 CASAVA_Build 10 43324769 1I CCTCATGGTG -/T GATTACTGGA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 T 0 1 132743 CASAVA_Build 10 43335644 1D TCTTGACTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 51 1 42 8 T 10 9 132744 CASAVA_Build 10 43337377 2I ATATACAAAA --/AT AGAGTTGTGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 0 1 132745 CASAVA_Build 10 43347816 1D ATTTGTCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 10 9 132746 CASAVA_Build 10 43353002 5D AATCTGTCTG TAAAA/----- TAAAATAAAA 3070 hom 33 het 17 0 12 7 TAAAA 5 4 132747 CASAVA_Build 10 43354425 4D CCTTCTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTC 3070 hom 96 het 33 0 33 1 TTTC 3 2 132748 CASAVA_Build 10 43354814 4D CTTTCCTTTT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 TTCC 5 4 132749 CASAVA_Build 10 43355515 2D GCTTCAGTGC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 93 het 40 0 32 9 AG 7 6 132750 CASAVA_Build 10 43358108 4I82M1D AGAAAATCAG ----CCTTCCCACAAATTGCAGTGGACTTCAAGATGTTTGGAAAGCCCAGAACATTCTTCAGCCCTGAAATCTCCTTTTATTTTTAT/CCTTCCTTCCCACAAATTGCAGTGGACTTCAAGATGTTTGGAAAGCCCAGAACATTCTTAAGCCCTGAAATCTCCTTTTATTTTTA- TTTTTTTTTT 3070 het 505 hom 28 2 34 11 N/A 0 0 132751 CASAVA_Build 10 43360836 2D ACCTTTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 36 0 31 5 A 12 10 132752 CASAVA_Build 10 43362863 1D CATGTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2220 het 2138 hom 12 6 5 1 A 11 10 132753 CASAVA_Build 10 43365540 1I TAGGTTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1602 hom 41 4 28 9 T 11 12 132754 CASAVA_Build 10 43368207 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 10 9 132755 CASAVA_Build 10 43368367 3D CTCCATCTCA AAG/--- AAGAAGAAGA 2647 het 2647 ref 26 18 6 3 AAG 4 3 132756 CASAVA_Build 10 43369268 2I TTAAAAAAAT --/TA TGTGGTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 TA 0 1 132757 CASAVA_Build 10 43369898 21I AAATCTTTAT ---------------------/ATCTAATGTAAGTATTTAATA CTCTGATTTC 3070 het 3070 hom 39 20 20 2 ATCTAATGTAAGTATTTAATA 0 1 132758 CASAVA_Build 10 43375968 7I GGCTCAGCCC -------/TAGCCCT TAGCCCTTAG 3070 het 3070 ref 32 14 8 10 TAGCCCT 1 2 132759 CASAVA_Build 10 43396520 2I TGATATTCTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 TA 8 9 132760 CASAVA_Build 10 43398046 1D ACTCTATTGA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 T 8 7 132761 CASAVA_Build 10 43430779 4D ATCATTTCGC TCTG/---- TCTGTCTTAG 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 TCTG 2 1 132762 CASAVA_Build 10 43433379 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2580 het 1792 hom 23 6 9 8 T 15 16 132763 CASAVA_Build 10 43436574 1D ATGTACAGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2410 hom 32 7 16 9 A 10 9 132764 CASAVA_Build 10 43447312 1D CAGTGCTCCC T/- TGGCTGGTTT 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 T 2 1 132765 CASAVA_Build 10 43454215 1D GTAGGAATAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 9 8 132766 CASAVA_Build 10 43457212 1I TGGTGACATA -/G CCCCCCATCT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 G 0 1 132767 CASAVA_Build 10 43465325 1I CAAAGGTGTC -/G TGTAAGTAAT 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 G 0 1 132768 CASAVA_Build 10 43479051 1D GTGCTACTAT A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 7 6 132769 CASAVA_Build 10 43481597 1D CTGGTGAGCA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 9 8 132770 CASAVA_Build 10 43506272 1D GATTAAAATA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 9 8 132771 CASAVA_Build 10 43517290 5D CCATCCCCCA CCCCC/----- CCCCCCCCAA 3070 hom 50 het 20 0 13 8 C 13 8 132772 CASAVA_Build 10 43518012 2I ATGCCTGTGT --/GG AATGTGCTGG 3070 hom 60 het 21 0 19 2 G 0 2 132773 CASAVA_Build 10 43538293 3I ATAAAAAAAT ---/AAA AAAAGAATGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 4 7 132774 CASAVA_Build 10 43540778 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAGAA 3070 hom 70 het 26 0 23 3 A 7 9 132775 CASAVA_Build 10 43544333 1I CACTTTTCGT -/G TTGTCATCTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 G 0 1 132776 CASAVA_Build 10 43551871 1I TTTGGCAAAT -/A AAAAACATAG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 5 6 132777 CASAVA_Build 10 43562354 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 15 16 132778 CASAVA_Build 10 43562659 4D TCTTGATGCT AAGA/---- AAGAAGGTGG 3070 hom 163 het 60 0 54 7 AAGA 2 1 132779 CASAVA_Build 10 43569446 4D AGGCTCCCCA GGTG/---- GGTGGGTGGT 3070 hom 62 het 24 0 19 5 GGTG 3 2 132780 CASAVA_Build 10 43573708 2I CCACACCTTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 10 12 132781 CASAVA_Build 10 43576987 1I ATTTATTCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 433 hom 27 1 23 3 T 9 10 132782 CASAVA_Build 10 43580185 1I ATTAAAATAC -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 7 132783 CASAVA_Build 10 43584217 1I CGTCTCCCCA -/T TTCCTTCCCC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 2 3 132784 CASAVA_Build 10 43592928 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 848 het 848 ref 34 16 3 16 C 1 0 132785 CASAVA_Build 10 43595293 2I CTTTTAGAAA --/AC ACATATTCCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AC 1 2 132786 CASAVA_Build 10 43610244 2D TGCATCTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1588 het 19 hom 22 1 7 14 T 18 16 132787 CASAVA_Build 10 43610640 3I CCCAAATTAA ---/AAT ACATAGTAAG 3070 hom 129 het 46 0 43 3 AAT 0 1 132788 CASAVA_Build 10 43619748 8D ACAGGCCAAA ATATATAT/-------- ATATATATAT 2713 hom 15 het 7 0 6 5 AT 13 9 132789 CASAVA_Build 10 43622246 1I CTAATTAAAC -/T TTTTTTTTTT 2496 het 385 hom 25 2 10 13 T 15 16 132790 CASAVA_Build 10 43636710 1D TGGGGAAACC T/- CTCTGCCCAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 T 1 0 132791 CASAVA_Build 10 43660278 1D TATTAGCCCA T/- TTTTTTTTCT 2665 het 2665 ref 29 17 7 5 T 9 8 132792 CASAVA_Build 10 43670068 5I ATTTTATGTG -----/TTGAC TTGACCAGGT 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 TTGAC 1 2 132793 CASAVA_Build 10 43713294 4D TCTCCCTAAA CTCT/---- CTCTGTGTTG 3070 hom 96 het 35 0 30 6 CT 4 2 132794 CASAVA_Build 10 43726750 1I AATAAATGTG -/A AAAAATAGTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 5 6 132795 CASAVA_Build 10 43754686 1D TTACAGCTCA T/- TTTTTTGCTG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 7 6 132796 CASAVA_Build 10 43787965 1D TACAGGATAT G/- GAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 2 1 132797 CASAVA_Build 10 43788275 12D TTTCTTTTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTG 3070 het 1393 hom 23 8 9 6 T 21 9 132798 CASAVA_Build 10 43797105 1D TAATATTGTG C/- CCCCATCACC 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 C 5 4 132799 CASAVA_Build 10 43806431 2D GTCTTGACTC TT/-- TATCCGATTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 3 1 132800 CASAVA_Build 10 43810005 3D ATCATTGTCA TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 3070 hom 65 23 28 16 TCC 6 5 132801 CASAVA_Build 10 43817591 1D GTTGGCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 10 7 A 12 11 132802 CASAVA_Build 10 43825260 4D GTTTTATTGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 19 2 10 9 A 16 12 132803 CASAVA_Build 10 43826096 2I TAACATGATG --/TA TATATTTTGG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TA 2 3 132804 CASAVA_Build 10 43831118 1I AGCTTCTGAT -/G ATCAGTGGAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 G 0 1 132805 CASAVA_Build 10 43848659 1D TTTGCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1711 hom 31 11 14 7 T 14 13 132806 CASAVA_Build 10 43849219 1I ATAGCCTAAG -/T TTTTTTGTTG 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 6 7 132807 CASAVA_Build 10 43856803 4D GAAACGTTCA ATAG/---- ATAGACTTAA 3070 het 3070 ref 26 11 12 4 ATAG 2 1 132808 CASAVA_Build 10 43871844 1D TTGATTGCAG C/- GGGTTCTGAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 C 1 0 132809 CASAVA_Build 10 43899256 1D TCTTCAGAGC A/- AATCAGATGG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 3 2 132810 CASAVA_Build 10 43902460 1I TTATGATGTA -/T TTTTTTTTTT 1484 het 1484 ref 40 28 4 8 T 11 12 132811 CASAVA_Build 10 43926866 1I TCCTATATTT -/C TTGGAGGCTT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 C 0 1 132812 CASAVA_Build 10 43947387 6D CTGTCTCTCC ATATAT/------ ATATATATAT 858 het 858 ref 10 3 3 5 AT 12 9 132813 CASAVA_Build 10 43958290 2D GAAAGTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 586 hom 17 2 13 3 AT 9 8 132814 CASAVA_Build 10 43972742 1D CTGCCTGCTT A/- AAAAAAAAAA 1267 het 1267 ref 45 36 3 7 A 12 11 132815 CASAVA_Build 10 43981584 2I GAAATTCTGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 12 14 132816 CASAVA_Build 10 43982884 2D TCTCTCTGTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 TC 6 5 132817 CASAVA_Build 10 44020178 1D AGAGAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 11 10 132818 CASAVA_Build 10 44037588 1D GTAAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 22 1 14 7 T 15 14 132819 CASAVA_Build 10 44121211 1I AAATAAATAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 8 9 132820 CASAVA_Build 10 44124688 2D AGGTACAAAT AA/-- GAGTTGTGTT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 2 0 132821 CASAVA_Build 10 44143173 1D TCCACTGCTG T/- TGGGTGCTGA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 2 1 132822 CASAVA_Build 10 44173215 1I TTTTACTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 27 0 22 5 T 10 11 132823 CASAVA_Build 10 44173435 1I TTCAGTGTTC -/T GTATTAAACT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 132824 CASAVA_Build 10 44190939 5I GGCCACCTCT -----/GCTGG GCTAGCAGGT 1434 het 1434 ref 26 11 7 8 GCTGG 0 1 132825 CASAVA_Build 10 44213114 1D GGGTCCCTGC A/- ACTTAGCTTC 1938 het 1938 ref 25 11 8 6 A 2 1 132826 CASAVA_Build 10 44214645 3D CAATCCTCTC CCT/--- CTCCTGACCT 3070 het 3070 hom 43 20 22 2 CCT 1 0 132827 CASAVA_Build 10 44216967 1I GTTATTTTTC -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 5 6 132828 CASAVA_Build 10 44228890 1I TATCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 A 10 11 132829 CASAVA_Build 10 44234799 4D GTGGGCTTCT GTGA/---- GTATTAAGTG 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 GTGA 1 0 132830 CASAVA_Build 10 44254912 1D GTGCCCAGGA T/- TGTAGGGACA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 T 2 1 132831 CASAVA_Build 10 44269373 2I AGAAATCTAG --/AA AGTCTGGCTG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 1 3 132832 CASAVA_Build 10 44293830 1D TCCATTTTTT C/- CCCCTGGATA 3070 het 3070 hom 51 16 29 7 C 5 4 132833 CASAVA_Build 10 44306982 3I CAAAAGAATA ---/CAT CTATGCCACC 2816 het 2816 ref 18 7 7 4 CAT 0 1 132834 CASAVA_Build 10 44319011 4I AGCAACAATG ----/GATA GATAGAGCTG 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 GATA 1 2 132835 CASAVA_Build 10 44320456 1D AGCCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 2851 het 2851 ref 25 16 7 2 A 11 10 132836 CASAVA_Build 10 44342341 4I CTAATTAGTT ----/CATC CATTCATCTG 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 CATC 0 1 132837 CASAVA_Build 10 44344596 1I ATAGCAGTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 9 10 132838 CASAVA_Build 10 44346194 1I ATTTATATTT -/A AAGTAATTAC 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 A 2 3 132839 CASAVA_Build 10 44356002 3D TTTTAATAAT GGC/--- CATTCTGACT 1912 het 1912 ref 22 13 4 8 GGC 1 0 132840 CASAVA_Build 10 44357264 1D TTTTGACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 T 14 13 132841 CASAVA_Build 10 44358244 7D TTTTTAATGA TCGTCAT/------- TCTAACTGGT 2665 hom 15 het 6 0 6 0 TCGTCAT 1 0 132842 CASAVA_Build 10 44362708 1D GGCAACATAA T/- AAGACCAGAT 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 T 1 0 132843 CASAVA_Build 10 44362905 1D TGTTGCTAAG T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 8 7 132844 CASAVA_Build 10 44364824 1D TGCTTTCTGC A/- ACCAATCAGA 2729 het 2729 ref 28 16 8 4 A 2 1 132845 CASAVA_Build 10 44365137 7D TCATGTCTGC TGTTCAG/------- TGCATTCATT 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 TGTTCAG 1 0 132846 CASAVA_Build 10 44371117 1D GGAGTTCCCT G/- GGGGTGCCTA 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 G 5 4 132847 CASAVA_Build 10 44381921 1I AGGACAGCAC -/T GGGGGGAATT 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 T 0 1 132848 CASAVA_Build 10 44387238 1D ACTGAGGAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 9 8 132849 CASAVA_Build 10 44399504 1I7M6D CGGGGCCTGT -TGTGGGGTGGGGA/GTGTGTGG------ GAGGGGGGAG 3070 het 1695 hom 16 6 10 4 N/A 0 0 132850 CASAVA_Build 10 44404209 16D CAGGTTGTAA GCGTCTATAACCAAAT/---------------- GCATTAGTTG 3070 het 3070 ref 33 18 16 4 GCGTCTATAACCAAAT 1 0 132851 CASAVA_Build 10 44406450 4I AGCCTATCTC ----/CTTT CTAAGTCTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 CTTT 0 1 132852 CASAVA_Build 10 44417822 4I TATTAAGTAG ----/ACTA ACTATCTTTA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 ACTA 1 2 132853 CASAVA_Build 10 44418694 1D CGTATACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 12 12 T 14 13 132854 CASAVA_Build 10 44427102 1D ACTTGTCAAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 9 8 132855 CASAVA_Build 10 44431546 1I TCAGCACACC -/A AAAAAAAAAA 2724 het 140 hom 17 1 9 7 A 13 14 132856 CASAVA_Build 10 44435752 8I ATGTCTGCTG --------/AATCAACA AATCAACAAA 3070 het 3070 hom 61 23 23 15 AATCAACA 2 3 132857 CASAVA_Build 10 44444083 1D TCTTGGATCT C/- ATTGATGGAT 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 C 1 0 132858 CASAVA_Build 10 44446665 1D ATTAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2383 hom 26 7 14 5 A 11 10 132859 CASAVA_Build 10 44485907 2D CAAAGAGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 GA 9 8 132860 CASAVA_Build 10 44486566 1D ACTTCAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 A 9 8 132861 CASAVA_Build 10 44487321 1I ACTTCAACAT -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 A 7 8 132862 CASAVA_Build 10 44487604 2D TTTGCATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 15 10 A 12 10 132863 CASAVA_Build 10 44490235 1D TCCTACTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 A 13 12 132864 CASAVA_Build 10 44493104 1I CAATAGATGC -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 7 8 132865 CASAVA_Build 10 44496890 5I TGGCCAGTCA -----/TGGCC TGGCCTGTGG 2900 het 2742 hom 33 11 10 12 TGGCC 1 2 132866 CASAVA_Build 10 44533199 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1399 hom 30 5 13 13 T 17 16 132867 CASAVA_Build 10 44549298 2D CATAAACATG CA/-- CACACACACA 1104 het 1104 ref 34 27 3 6 CA 9 8 132868 CASAVA_Build 10 44561130 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 2323 het 2284 hom 13 6 5 3 A 12 11 132869 CASAVA_Build 10 44568157 1I AGTCATGGAG -/A GGACAAGAAA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 A 0 1 132870 CASAVA_Build 10 44653994 1I TTCCCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 1630 het 1630 ref 38 18 6 14 T 13 14 132871 CASAVA_Build 10 44656846 1D CTATAACCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 39 1 32 6 A 13 12 132872 CASAVA_Build 10 44683948 1D CCCAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 29 2 18 10 A 16 15 132873 CASAVA_Build 10 44694004 2D CTTAATTTAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 26 0 16 10 T 11 9 132874 CASAVA_Build 10 44694265 1I GTTGGAGGAG -/C CAGAGAGGAA 3070 hom 90 het 34 0 28 6 C 1 2 132875 CASAVA_Build 10 44700886 2I CAGGTTACTC --/TA TTTTATAAGG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TA 0 1 132876 CASAVA_Build 10 44711754 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 21 0 13 9 T 14 13 132877 CASAVA_Build 10 44736852 1D GTTCAGTGTT C/- CCTTGCCCCT 3070 het 3070 hom 47 22 19 6 C 3 2 132878 CASAVA_Build 10 44739980 1D CCAGGAGCCG C/- CCCCCAAGGA 1453 het 1453 ref 27 9 9 9 C 6 5 132879 CASAVA_Build 10 44749682 1I TCCACTTCAC -/T GGGTGCATAC 3070 hom 132 het 48 0 44 4 T 0 1 132880 CASAVA_Build 10 44754739 1D TGTCATTGTC T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 7 6 132881 CASAVA_Build 10 44762803 1D ATACAAGAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 9 132882 CASAVA_Build 10 44765858 2D GCTGGCAAAC AG/-- AGTCCAGCCA 3070 het 3070 ref 31 10 10 11 AG 2 1 132883 CASAVA_Build 10 44770641 8D22M4D GGAGAAAGAA AGAAAAAGAAAGAAAGAGAAAAAGAAAGAAAAAG/--------AAAGAAAGAGAAAAAGAAAGAA---- AAAGAAAGAA 3070 hom 33 het 15 0 12 8 N/A 0 0 132884 CASAVA_Build 10 44771600 1D TGGCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 16 26 12 A 12 11 132885 CASAVA_Build 10 44773076 4I TTCTTTCCTA ----/TCTC TCTTTCTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TC 1 3 132886 CASAVA_Build 10 44776350 1I CCAGAAACCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 T 9 10 132887 CASAVA_Build 10 44780322 1I TGTCAAAACG -/A ATTAAATTCA 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 A 1 2 132888 CASAVA_Build 10 44784455 2D TGTTTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1210 het 1210 ref 79 58 4 17 TG 8 7 132889 CASAVA_Build 10 44784559 2I TATGCGTGTG --/TT TTTTTGTGTG 3070 het 3070 ref 70 34 22 14 T 5 7 132890 CASAVA_Build 10 44789463 4D CAGCCCAGGG TACC/---- GGTACCGGCC 3070 het 3070 hom 35 18 17 0 TACC 1 0 132891 CASAVA_Build 10 44819893 1D10M6I TTAGGACTTT CTGTGGAAGAA------/-TGTGGAAGAAAAAATT AAAAGGGAGA 3070 hom 102 het 32 0 35 1 N/A 0 0 132892 CASAVA_Build 10 44821824 1I CCCATCCTGC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 108 het 44 0 35 9 T 7 8 132893 CASAVA_Build 10 44824616 1I AAAAGTTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 9 10 132894 CASAVA_Build 10 44844013 1D TCAATTTTTG T/- TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 6 5 132895 CASAVA_Build 10 44846321 1I TTTTCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 583 hom 25 3 19 3 T 13 14 132896 CASAVA_Build 10 44852672 5D TGTTATTAAA AAGCC/----- AAAAAATAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAGCC 1 0 132897 CASAVA_Build 10 44855816 18D GTTCTCACTC ATAAGTGGGAGTTAATCT/------------------ ATAAGGACAC 1322 het 1129 hom 37 5 7 31 ATAAGTGGGAGTTAATCT 1 0 132898 CASAVA_Build 10 44864384 1I TTTTCTTTAA -/G ATTTAACATG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 0 1 132899 CASAVA_Build 10 44866629 1I TTTTTTTTTT -/A TTAATTTTTA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 0 1 132900 CASAVA_Build 10 44882836 1I GGCTATTTGA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 7 8 132901 CASAVA_Build 10 44893640 1D AATTTTAACT G/- GGAGATCCAC 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 G 3 2 132902 CASAVA_Build 10 44896915 4D TAAAATTCTG TTAA/---- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 TTAA 1 0 132903 CASAVA_Build 10 44898247 4D GTGTGAGTGT GTGA/---- GTATGAGCAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 GTGA 1 0 132904 CASAVA_Build 10 44899142 3D AAGAAAAATC ATT/--- ATGGCAGGAT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 ATT 1 0 132905 CASAVA_Build 10 44902313 2D TTATAAATCC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 7 6 132906 CASAVA_Build 10 44905515 1D TTAAAAAATA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 T 8 7 132907 CASAVA_Build 10 44920394 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 10 11 132908 CASAVA_Build 10 44968021 1I TTTTGTCGTG -/T TTAATTTGAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 2 3 132909 CASAVA_Build 10 44968857 11D TGATGAAAGA AGTAAGCAATC/----------- TGTTATTATC 3070 hom 93 het 31 0 32 3 AGTAAGCAATC 1 0 132910 CASAVA_Build 10 44969071 5I TTAATGATAT -----/TTAAG TTAATACACT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTAAG 0 1 132911 CASAVA_Build 10 44969859 2I GTGGTGCATT --/TG TCTTTACCTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TG 0 1 132912 CASAVA_Build 10 44969982 3I AAAGAGAAAA ---/ATG ATGCTAGGAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 ATG 1 2 132913 CASAVA_Build 10 44977645 5I CAGAAAATAT -----/AGAGA AAAGAAACCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AGAGA 0 1 132914 CASAVA_Build 10 44983353 7I GTAATTTAAC -------/ATTTTAA ATTTTAATTA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 ATTTTAA 1 2 132915 CASAVA_Build 10 44984833 1I AAGCCTTAAC -/T TTAGTCTTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 2 3 132916 CASAVA_Build 10 44998603 1I CATAGCTGTT -/A AAAAGAAATG 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 A 4 5 132917 CASAVA_Build 10 45001412 3I CTGCCTCCTC ---/CTT ATCAGACTAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 CTT 0 1 132918 CASAVA_Build 10 45005801 1I ACTAACAAAC -/G ATAACTATCT 1310 het 1310 ref 56 48 3 5 G 0 1 132919 CASAVA_Build 10 45006623 4D ATGAGACAGA ATCT/---- ATCTCACTCT 2878 het 2312 hom 12 5 7 0 ATCT 2 1 132920 CASAVA_Build 10 45007271 3I GTTTTTTAAT ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 9 12 132921 CASAVA_Build 10 45008600 3I GTTTAAAAAA ---/TCT TCTAAATTCT 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 TCT 1 2 132922 CASAVA_Build 10 45010082 17D GAGAATCTAT GCAAAGTATTTTGGAGA/----------------- GTTCTTAGCA 3070 het 3070 ref 27 18 11 1 GCAAAGTATTTTGGAGA 1 0 132923 CASAVA_Build 10 45011083 5D CTAAAATGAT TAATC/----- TATAATTATT 2694 het 2694 ref 31 24 6 3 TAATC 1 0 132924 CASAVA_Build 10 45012807 1D CATCTTGTGC A/- AATTGATAGC 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 A 3 2 132925 CASAVA_Build 10 45016839 2D AGAAAATGAT AA/-- AGAGATCCTG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 3 1 132926 CASAVA_Build 10 45022694 1I ATCTGATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 11 12 132927 CASAVA_Build 10 45026729 1D AGCAGAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 11 10 132928 CASAVA_Build 10 45028976 1I CTCAACTTAA -/T TAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 1 2 132929 CASAVA_Build 10 45038025 1D TGTTTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1318 hom 29 3 18 8 A 12 11 132930 CASAVA_Build 10 45038358 6I AGTACCCAAT ------/GTTATA ACTGAAATTT 3070 het 3070 ref 46 34 8 5 GTTATA 0 1 132931 CASAVA_Build 10 45049401 4D AAAAAAAAAA AACC/---- TGTCAATATA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AACC 1 0 132932 CASAVA_Build 10 45056267 1D AGGCAGTGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 A 9 8 132933 CASAVA_Build 10 45060283 10I GTAAGTGGCA ----------/CTCTGTGCCC CGCTGAGTGG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CTCTGTGCCC 0 1 132934 CASAVA_Build 10 45081890 14D AAGAGAGCAG TGGTTCTCTCAGCA/-------------- TGGCGTTTGA 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 TGGTTCTCTCAGCA 1 0 132935 CASAVA_Build 10 45092967 2D CACAATCTCC AA/-- AGTTATCAGA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 3 1 132936 CASAVA_Build 10 45101964 1I ATTCCACTGG -/A AGGCTATATG 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 1 2 132937 CASAVA_Build 10 45119072 1I GCGGTGTAAT -/A ACATGCACAC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 1 2 132938 CASAVA_Build 10 45126087 1I GGATTTTTGG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 7 8 132939 CASAVA_Build 10 45128027 1I AGATATGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 A 10 11 132940 CASAVA_Build 10 45128780 1D ATGTCACCAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 9 8 132941 CASAVA_Build 10 45221194 1D TTCATCTACC T/- TTTTTTTTTT 1578 het 1578 ref 26 11 8 7 T 15 14 132942 CASAVA_Build 10 45235192 13I GACCCTGTTT -------------/CAAAAGACAAAAA CAAAAGGCAC 3070 hom 51 het 23 0 17 6 CAAAAGACAAAAA 0 1 132943 CASAVA_Build 10 45253584 1D TGACTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 559 hom 37 2 27 10 T 13 12 132944 CASAVA_Build 10 45319279 4I ATACTACAAT ----/ATGA ATGAACCCTG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 ATGA 1 2 132945 CASAVA_Build 10 45364450 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2095 het 1449 hom 13 6 5 2 A 15 14 132946 CASAVA_Build 10 45389552 1I CTTAAACCGT -/A AGTATAGTAT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 1 2 132947 CASAVA_Build 10 45392241 1I AAAAAAAAAA -/G AAAACTAGCC 1926 het 689 hom 26 9 11 6 G 0 1 132948 CASAVA_Build 10 45392724 1D TAATGGGCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 10 9 132949 CASAVA_Build 10 45394821 1D CTAGGTAAGC T/- TTTTTTTTTT 918 het 918 ref 19 15 2 2 T 11 10 132950 CASAVA_Build 10 45403619 1D TGTCAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1949 het 1949 ref 47 32 5 10 A 13 12 132951 CASAVA_Build 10 45452091 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 920 het 920 ref 37 21 3 13 A 13 14 132952 CASAVA_Build 10 45499817 3I TATGTTATTG ---/AAA AAAATTTTTT 2956 het 1147 hom 14 4 6 4 A 4 7 132953 CASAVA_Build 10 45574078 1D TTTTTTTTTT G/- TGAGACAGGG 1492 het 770 hom 13 4 6 3 G 1 0 132954 CASAVA_Build 10 45574748 1I CTTCCCCACC -/A CCCCCCCCAC 953 het 236 hom 7 1 5 1 A 0 1 132955 CASAVA_Build 10 45594799 1I TAGAATTTCA -/C CCCCCCTCTT 3070 het 3070 ref 41 24 9 8 C 6 7 132956 CASAVA_Build 10 45948378 3D TGTGTGTGGT GTG/--- GTGTATGTGA 3070 het 3070 ref 66 30 20 22 GTG 2 1 132957 CASAVA_Build 10 45988806 2D GTGATAGGAC AT/-- GTTATTCAAA 1950 hom 10 het 5 0 4 2 AT 1 0 132958 CASAVA_Build 10 46001523 1D TTAATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 11 10 132959 CASAVA_Build 10 46018373 1I TATAAAAGCA -/C CCCCCCCAAA 1490 het 29 hom 10 0 5 5 C 7 8 132960 CASAVA_Build 10 46074567 3D AAACTACCTT AAG/--- ACGCACTATG 3070 het 1638 hom 24 6 16 2 AAG 1 0 132961 CASAVA_Build 10 46109291 2I CTCTCTCTCC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 46 17 18 11 CT 8 9 132962 CASAVA_Build 10 46110979 1I TGAAAAAGTA -/G GGCTATTTCA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 G 2 3 132963 CASAVA_Build 10 46226862 3D GAGCCACAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 15 12 132964 CASAVA_Build 10 46285621 1I TCTCAAAAAA -/C CCCAAAAAAA 1334 hom 7 het 3 0 3 0 C 3 4 132965 CASAVA_Build 10 46329145 1D TGGCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 28 13 7 A 11 10 132966 CASAVA_Build 10 46335142 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 A 9 8 132967 CASAVA_Build 10 46350726 1D CAGAAGTGAG T/- TTAGCTGTGC 2687 het 2687 ref 51 38 6 7 T 3 2 132968 CASAVA_Build 10 46352215 3I TTGCGCAAAC ---/CAG CAGCACACCA 3070 het 3070 ref 51 32 9 10 CAG 1 2 132969 CASAVA_Build 10 46368628 1D GCCTGTTGAA G/- GTCATTTGAG 2204 het 2204 ref 89 80 5 4 G 2 1 132970 CASAVA_Build 10 46375011 3D AGGCAGCAGA GTC/--- GTCTTCAGCT 3070 het 3070 ref 85 47 27 14 GTC 2 1 132971 CASAVA_Build 10 46377178 1I AGGAAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 12 13 11 A 9 10 132972 CASAVA_Build 10 46377474 1I ACCAATGGTA -/G GGGGGGGAAA 1921 het 1921 ref 77 61 7 9 G 7 8 132973 CASAVA_Build 10 46378959 1D ATTGAGGATG A/- GACAAGAATA 3070 het 3070 ref 64 43 16 5 A 1 0 132974 CASAVA_Build 10 46380924 2D AAATTAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 18 1 9 11 A 14 12 132975 CASAVA_Build 10 46384481 3I CAGGTGGCTG ---/ACC ACCACCACCT 3070 hom 176 het 67 0 51 16 ACC 3 4 132976 CASAVA_Build 10 46384703 1D GGTGGAGGCA G/- GCAGGACAGT 3070 het 3070 ref 90 59 9 22 G 2 1 132977 CASAVA_Build 10 46385894 1I CTGGACACCT -/G GGGGGGGACA 3070 het 3070 ref 95 55 16 24 G 7 8 132978 CASAVA_Build 10 46391607 3D GTGTGTGTGT GGG/--- GGGGGGGAGG 2518 hom 31 het 12 0 9 3 G 10 7 132979 CASAVA_Build 10 46393831 3D TCATCCCCTC CTT/--- GTCCTCATGG 3070 het 3070 ref 92 53 25 16 CTT 1 0 132980 CASAVA_Build 10 46396100 1D CTGACCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 93 47 32 15 T 11 10 132981 CASAVA_Build 10 46399399 3I GTTTTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 1526 hom 44 6 16 22 TTG 5 6 132982 CASAVA_Build 10 46406858 2D TATATTTACA CT/-- CTACTTTAAA 3070 het 3070 ref 80 41 29 10 CT 2 1 132983 CASAVA_Build 10 46409846 1D GCAAGCAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 1163 hom 74 8 33 34 A 9 8 132984 CASAVA_Build 10 46412451 1D GCCCTATAGG A/- AACGGGGTCT 1989 het 1989 ref 30 14 6 10 A 3 2 132985 CASAVA_Build 10 46414382 1D ACTTGGGCCA G/- GCGCTGTGGC 3070 het 3070 ref 49 29 17 3 G 2 1 132986 CASAVA_Build 10 46415546 2D GGGATTTATT TC/-- TGTTTTGCAG 3070 het 3070 ref 101 53 33 16 TC 1 0 132987 CASAVA_Build 10 46421300 1D GTGAGGCTGT G/- GGGGCTCGCT 3070 het 3070 ref 81 43 24 14 G 5 4 132988 CASAVA_Build 10 46421374 1I ACAGAAACAT -/G GGGCTTTGGC 3070 hom 180 het 68 0 57 11 G 3 4 132989 CASAVA_Build 10 46438734 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAACAAC 2024 het 2024 ref 74 34 10 31 A 7 6 132990 CASAVA_Build 10 46439235 2D TACAGTGGGC CT/-- CTCTGTATCA 3070 het 3070 hom 91 17 66 10 CT 3 2 132991 CASAVA_Build 10 46440517 2D AAAAATTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 82 12 38 32 A 13 11 132992 CASAVA_Build 10 46441743 3I CTATGATGCG ---/GCT GAGACAGGAA 3070 het 3070 hom 83 34 38 11 GCT 0 1 132993 CASAVA_Build 10 46443109 6D17M3I30M6D3M1D TGTGTGTGTG GTATTCTGTGGTGTGTGTGGTGT---GTGTAGTGTGTGGTGTGTGTAGTGTGTGTGTGTGGTGCAG/------TGTGGTGTGTGTGGGGTGTGGTGTTGTGTGTGGTTTGTGTGATGTGTATG------GCA- TGTGTGTGGT 3070 het 3070 ref 57 71 16 58 N/A 0 0 132994 CASAVA_Build 10 46446418 1I CATTTAAAGG -/T TTTTTGTTTC 3070 het 3070 hom 73 33 34 6 T 5 6 132995 CASAVA_Build 10 46458886 1D AGCAATTCAC A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 87 72 11 4 A 7 6 132996 CASAVA_Build 10 46460365 2I ACACCCACTG --/TA TATATATATG 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 TA 4 5 132997 CASAVA_Build 10 46467094 1I ATTGGTTGTT -/A AAAACTCAGC 3070 het 3070 hom 88 31 46 11 A 4 5 132998 CASAVA_Build 10 46474556 1D ATAAATGCTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 92 60 15 18 T 8 7 132999 CASAVA_Build 10 46482523 11D AAGATTAGAG ATGAATGTCTA/----------- ATGAATGTCT 3070 het 3070 hom 95 30 38 38 ATGAATGTCTA 2 1 133000 CASAVA_Build 10 46482888 1I TTTCCCCCCC -/T GGGCCCTTCA 3070 het 3070 ref 102 62 26 14 T 0 1 133001 CASAVA_Build 10 46483321 5D GCATATTATA ACTTT/----- ACTTTAGAAA 3070 het 3070 ref 95 76 12 10 ACTTT 2 1 133002 CASAVA_Build 10 46483678 6I TCCCAGGAAT ------/GCAGTG GCAGTGGCAT 1437 het 1437 ref 47 36 4 7 GCAGTG 1 2 133003 CASAVA_Build 10 46484180 1I AAAAATATTA -/T TTTTTTTTTG 2689 het 2689 ref 70 51 7 12 T 9 10 133004 CASAVA_Build 10 46485661 1I AGAAAACTAG -/T TACCTTGAGA 2663 het 2663 ref 78 59 7 12 T 1 2 133005 CASAVA_Build 10 46487958 4D CTTAGCTTTC CAAA/---- CAATCTGTCT 3070 het 3070 ref 80 57 12 14 CAAA 1 0 133006 CASAVA_Build 10 46488827 1D TTTTATTATT A/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 34 23 10 1 A 1 0 133007 CASAVA_Build 10 46501900 1I GGAGTGGGGA -/G ACAAAGGTGC 3070 het 3070 hom 100 17 66 17 G 0 1 133008 CASAVA_Build 10 46510538 1D GGGCCTCAGG C/- CCCCCCTGGA 3070 hom 82 het 81 2 60 19 C 7 6 133009 CASAVA_Build 10 46511789 1I TGATGTGGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 62 31 19 12 T 9 10 133010 CASAVA_Build 10 46512089 4D TTTATTCATT AAAC/---- AAATATGTCA 3070 het 3070 hom 86 10 69 10 AAAC 1 0 133011 CASAVA_Build 10 46514079 1D AAATTAAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 76 20 45 11 T 10 9 133012 CASAVA_Build 10 46525953 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAGAAAAG 3070 het 1732 hom 59 11 33 15 AG 0 1 133013 CASAVA_Build 10 46526852 3I CACTATGTTT ---/GTC ATCAGTGAAG 3070 het 3070 hom 75 29 42 4 GTC 0 1 133014 CASAVA_Build 10 46526944 1I ACTCAGAAGG -/A AAAGGCATGT 3070 het 3070 hom 90 36 45 9 A 3 4 133015 CASAVA_Build 10 46529108 1D CTCCTGGGCA C/- CTCACTCACC 3070 het 3070 hom 89 33 43 14 C 2 1 133016 CASAVA_Build 10 46529462 1I AGAGCATCCT -/C CCCCCCCCAT 2304 het 2304 ref 78 54 11 13 C 8 9 133017 CASAVA_Build 10 46533057 1I TGTGGGACAT -/G GGGGGGACTC 3070 het 3070 hom 73 15 50 8 G 6 7 133018 CASAVA_Build 10 46533806 4I AAAATATTTG ----/AAGA AATAATGGTA 3070 het 3070 hom 101 16 77 8 AAGA 0 1 133019 CASAVA_Build 10 46539803 1D CCATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 21 28 6 A 11 10 133020 CASAVA_Build 10 46540378 2D CCATTAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 90 40 14 40 T 13 11 133021 CASAVA_Build 10 46543473 1D CCAGCTATGT G/- GGAGGCTGAG 3070 het 3070 ref 66 42 16 9 G 3 2 133022 CASAVA_Build 10 46543580 1I GTTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 83 28 37 18 A 11 12 133023 CASAVA_Build 10 46553073 1I GCATGGGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 538 hom 56 2 43 11 A 10 11 133024 CASAVA_Build 10 46555044 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 101 58 30 13 T 6 7 133025 CASAVA_Build 10 46561638 1D AACCTCTGTC T/- TTACACACAC 3070 het 3070 ref 96 37 19 40 T 3 2 133026 CASAVA_Build 10 46565539 2D AATAAATAAA AC/-- AGGGAATAGA 3070 het 3070 hom 68 32 32 4 AC 1 0 133027 CASAVA_Build 10 46569892 2I GCATGAATAA --/TT TGTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 52 30 20 2 T 1 3 133028 CASAVA_Build 10 46570245 2I ACTCAACAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 75 29 26 20 A 11 13 133029 CASAVA_Build 10 46571117 3D ACTGATGAAG TTT/--- TTTTTTTCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 10 7 133030 CASAVA_Build 10 46580237 1I CACTAAAAAG -/A AAACGTTTGG 2157 hom 12 het 6 0 5 1 A 3 4 133031 CASAVA_Build 10 46715942 1D GTTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1475 hom 18 7 7 4 A 13 12 133032 CASAVA_Build 10 46758339 1D GCATCATAGC A/- AATTTATTTC 3070 het 3070 ref 59 32 22 5 A 3 2 133033 CASAVA_Build 10 46787020 1D GAGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 25 2 16 9 A 14 13 133034 CASAVA_Build 10 46817202 5D TCAAAAAAAC AAAAA/----- AAAACAAAAA 226 het 226 ref 53 31 4 22 A 9 4 133035 CASAVA_Build 10 47022733 2D TTTGAAAAAG AA/-- AGAATAAAAA 1384 het 1384 ref 29 25 3 1 A 3 1 133036 CASAVA_Build 10 47038125 4D TATATATAAC TATA/---- TATATATATA 1881 hom 10 het 4 0 4 2 TA 8 6 133037 CASAVA_Build 10 47041994 2D AAAACACAAA CT/-- CTGAGAATCA 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 CT 2 1 133038 CASAVA_Build 10 47078437 1I GAGGTGGCTC -/T GTCAGGGGGG 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 0 1 133039 CASAVA_Build 10 47081826 1D19M1I GACTTTGCCC TTTTTGGGCAGCAGAGCCAC-/-TTTTCGGCAGCAGAGCCACT GCATACTTGC 3070 het 2037 hom 56 9 27 35 N/A 0 0 133040 CASAVA_Build 10 47087828 1I CTTATCACAC -/T CCCCAGGTCA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 0 1 133041 CASAVA_Build 10 47091355 1D GTCATTTCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 9 8 133042 CASAVA_Build 10 47095347 1D CCCTAAAGCA C/- AGAAAACACA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 C 1 0 133043 CASAVA_Build 10 47100402 1I TTGCAGGAGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 9 133044 CASAVA_Build 10 47103026 1I CTACAACCTT -/G TGCAAAGACC 3070 het 3070 hom 50 19 28 3 G 0 1 133045 CASAVA_Build 10 47106568 1I GCAAACATTG -/T TTTTTTTTTT 2808 het 1078 hom 23 4 10 9 T 12 13 133046 CASAVA_Build 10 47109302 2D ACACAACAAA CT/-- CACACACTAG 3070 het 3070 ref 49 25 18 7 CT 1 0 133047 CASAVA_Build 10 47110780 19D ATTGGGAGAA AAGCTGAGTGTTGGGAGAG/------------------- AAGCTGAGGC 3070 het 3070 hom 28 11 14 5 AAGCTGAGTGTTGGGAGAG 1 0 133048 CASAVA_Build 10 47113369 7I CTTCCTCTCT -------/CTTTACC CTTTACCCTG 2943 het 2943 ref 26 14 8 4 CTTTACC 1 2 133049 CASAVA_Build 10 47116333 1D CTCTTCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 24 0 16 8 A 11 10 133050 CASAVA_Build 10 47116548 1D ATTTTATTTT A/- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 1 0 133051 CASAVA_Build 10 47116903 1I TTTTCTTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 T 7 8 133052 CASAVA_Build 10 47118790 1I AATTTTTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 7 8 133053 CASAVA_Build 10 47125517 7I AAAGGATAAA -------/AGAGGAC AGAGAAATAG 3070 hom 67 het 29 0 26 3 AGAGGAC 0 1 133054 CASAVA_Build 10 47132635 1I CTTTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 45 1 35 9 T 11 12 133055 CASAVA_Build 10 47134750 2I TGTGTGCACC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 17 hom 61 1 22 38 TG 7 8 133056 CASAVA_Build 10 47134763 2D GTGTGTGTGT GC/-- CTCTGTGTGT 2568 het 607 hom 52 7 8 37 GC 1 0 133057 CASAVA_Build 10 47134841 1I AAGTGTCTTT -/G GGGGTGTTGG 3070 het 3070 ref 48 24 11 13 G 4 5 133058 CASAVA_Build 10 47136079 1I GGGCTGGGCA -/G GGCAGGGCTC 3070 het 504 hom 27 3 11 13 G 2 3 133059 CASAVA_Build 10 47136095 20D GCTCTCAGAG CTCCGGCCATGGCAGGGACT/-------------------- CTCTGCCCAC 3070 het 1233 hom 27 4 12 15 CTCCGGCCATGGCAGGGACT 1 0 133060 CASAVA_Build 10 47142260 2D ATCCACCTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 A 12 10 133061 CASAVA_Build 10 47166388 1I TTTTGGGGAG -/C AGTTTACTAG 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 C 0 1 133062 CASAVA_Build 10 47166981 1D CACCAATCAA T/- TTTTTCTGGA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 6 5 133063 CASAVA_Build 10 47172668 1D GTAGGGCTTT G/- GGGGGCTTTC 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 G 6 5 133064 CASAVA_Build 10 47187328 1D TTAGTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 2339 het 483 hom 10 1 7 2 T 11 10 133065 CASAVA_Build 10 47216598 1I TTGCCCCCGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 21 het 12 0 8 4 A 8 9 133066 CASAVA_Build 10 47460777 4D AAGCTTGTGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 AT 8 6 133067 CASAVA_Build 10 47506362 2I CAACAGTAAA --/AT ATATATATAT 2364 het 2267 hom 13 6 5 2 AT 6 7 133068 CASAVA_Build 10 47506739 1I TCTCAATCAG -/T TTTTTTTTAA 2833 het 2833 ref 32 18 9 5 T 8 9 133069 CASAVA_Build 10 47532546 2I TTCAAACACA --/CG ATCAGTAACT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 CG 0 1 133070 CASAVA_Build 10 47737447 1I AGAATGATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 56 het 24 0 19 5 T 9 10 133071 CASAVA_Build 10 47812791 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAACTA 1358 hom 10 het 4 0 4 0 A 8 7 133072 CASAVA_Build 10 47965665 1I AGTTTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 532 hom 28 2 20 6 T 11 12 133073 CASAVA_Build 10 47978747 4I TGTGCAGTCA ----/GGGC CCAGAGGATG 3070 het 3070 ref 64 48 9 7 GGGC 0 1 133074 CASAVA_Build 10 48074307 1I CCCTTCCCTT -/C CCTTCCTTCC 743 hom 9 het 5 0 3 2 C 2 3 133075 CASAVA_Build 10 48086431 1D AACTGCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 20 1 13 6 A 15 14 133076 CASAVA_Build 10 48100855 1D ATCCTAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 264 hom 23 2 12 9 A 17 16 133077 CASAVA_Build 10 48104628 2D AATCTTGGGA AG/-- AGAATCCATG 3070 hom 100 het 36 0 32 4 AG 2 1 133078 CASAVA_Build 10 48107665 3I AATTCTGTTT ---/AAA AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 6 9 133079 CASAVA_Build 10 48137869 1I CCAATCTGCA -/G CCCTCTGCCA 3070 hom 111 het 39 0 36 3 G 0 1 133080 CASAVA_Build 10 48141866 4I CGATGTATGA ----/TTCT TTATACATTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 TTCT 0 1 133081 CASAVA_Build 10 48147521 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 13 1 9 3 A 13 14 133082 CASAVA_Build 10 48162162 1I GTCTCCCTAG -/C CCCCCGCAGC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 C 5 6 133083 CASAVA_Build 10 48176147 2I TTGTGTGAAC --/TA TATGTCCTCT 3070 het 3070 ref 56 34 16 6 TA 1 2 133084 CASAVA_Build 10 48184889 4I GTGCCTGTGA ----/GTGT GTATGTCTGT 3070 hom 171 het 65 0 57 8 GT 1 3 133085 CASAVA_Build 10 48196694 1I CAAAATGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 A 13 14 133086 CASAVA_Build 10 48196812 1I TGTTTGTCAA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 8 9 133087 CASAVA_Build 10 48197859 5D TGAAGTTGTG TTAAA/----- TTAAAGAAGT 3070 het 3070 hom 49 19 27 7 TTAAA 2 1 133088 CASAVA_Build 10 48203696 1D ACATATGATT G/- TTTCCATAAA 3070 het 3070 ref 55 28 20 7 G 1 0 133089 CASAVA_Build 10 48212144 1I TCCTTTTTTT -/C TTTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 C 0 1 133090 CASAVA_Build 10 48214276 3D ACTAAAAGAT CAC/--- CACTTCTATT 3070 hom 83 het 35 0 24 11 CAC 2 1 133091 CASAVA_Build 10 48222585 4I AAGAAGGAAG ----/GGAA GGAAGGAAGG 3070 het 3070 hom 44 16 13 15 GGAA 3 4 133092 CASAVA_Build 10 48227266 15D GTAGCATATC AACTTGTATGTATAT/--------------- AACTTGTATG 3070 het 3070 ref 39 17 14 14 AACTTGTATGTATAT 2 1 133093 CASAVA_Build 10 48235592 1D TTTACAATAC G/- GATTGGCTGA 3070 het 3070 hom 59 26 26 8 G 2 1 133094 CASAVA_Build 10 48240021 1I AGGTATACTT -/C CAAAATAATC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 C 1 2 133095 CASAVA_Build 10 48262232 4I GTGATTCCTC ----/ACTA ACTATGTAAT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 ACTA 1 2 133096 CASAVA_Build 10 48263263 1I GTGTGGGAGT -/G GGGGCGGGTA 3070 het 2148 hom 32 8 12 12 G 4 5 133097 CASAVA_Build 10 48266013 1I AACACATTTT -/A AAAAAAATTT 2326 het 2326 ref 17 6 6 5 A 7 8 133098 CASAVA_Build 10 48267406 1D ATGCGTGCAT G/- GGGCTCAGGA 3070 het 3070 hom 49 17 22 10 G 4 3 133099 CASAVA_Build 10 48283004 1D CAAGGCCTCC T/- TCATCCCCAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 2 1 133100 CASAVA_Build 10 48370018 2D CTTTCATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 1435 het 1435 ref 14 9 3 2 A 12 10 133101 CASAVA_Build 10 48375699 2D GTGATAGGAC AT/-- GTTATTCAAA 2920 hom 21 het 8 0 7 1 AT 1 0 133102 CASAVA_Build 10 48497892 1I TGAAAAAGTA -/G GGCTATTTCA 1359 het 1359 ref 42 35 3 4 G 2 3 133103 CASAVA_Build 10 48497977 1I AATTCCCCTC -/A AAAAAAAAAG 2932 het 2932 ref 27 13 11 3 A 9 10 133104 CASAVA_Build 10 48504486 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 693 hom 32 2 11 19 T 11 12 133105 CASAVA_Build 10 48505280 12I GTTTTATTTA ------------/GTTGGTTTACTT GTTGGTTTTC 2433 het 963 hom 9 2 5 2 GTTGGTTTACTT 0 1 133106 CASAVA_Build 10 48514871 1D GACAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 2976 het 1780 hom 21 8 7 6 T 15 14 133107 CASAVA_Build 10 48551041 1I CTTCTCTGTT -/A AAAATAATCC 3070 het 3065 hom 20 7 11 2 A 4 5 133108 CASAVA_Build 10 48561010 1I GCATCCTGTA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 1206 hom 15 3 12 0 T 7 8 133109 CASAVA_Build 10 48576732 2I GATTAATTAT --/AA AAAAAAAAAC 1365 het 1365 ref 8 5 3 0 A 9 11 133110 CASAVA_Build 10 48578567 1D AACTTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 16 15 18 T 13 12 133111 CASAVA_Build 10 48599719 1I ACAAAAAAAA -/C AAAACAAAAA 3070 het 214 hom 16 3 8 5 C 0 1 133112 CASAVA_Build 10 48612228 1I GTGCAGCCTG -/C CAAAGCACAA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 C 1 2 133113 CASAVA_Build 10 48667296 1D GCATCATAGC A/- AATTTATTTC 1872 het 1872 ref 10 5 4 1 A 3 2 133114 CASAVA_Build 10 48873366 2D CAATGTACAC AT/-- GTCATGGCTT 3070 het 3070 ref 48 31 8 10 AT 1 0 133115 CASAVA_Build 10 48874034 1I CCCTCTCCAA -/G ATTAGGCCAA 3070 het 3070 hom 45 12 31 2 G 0 1 133116 CASAVA_Build 10 48879608 1D GGCTGTGTGT C/- CCCCCACTCG 2762 het 2762 ref 46 31 7 8 C 6 5 133117 CASAVA_Build 10 48909261 1D GCAGAGCCAG C/- TTTTGTTCCT 1332 het 1332 ref 17 8 3 6 C 1 0 133118 CASAVA_Build 10 48949515 1D AAGCACCACT G/- GATCTGCTAG 3070 het 3070 hom 34 10 22 3 G 2 1 133119 CASAVA_Build 10 48954522 4D GTAGTAGCAG AAAC/---- AAACATAGAG 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 AAAC 2 1 133120 CASAVA_Build 10 49032036 3I AAACTACCTT ---/AAG ACGCACTATG 3070 het 477 hom 10 1 9 0 AAG 0 1 133121 CASAVA_Build 10 49052382 1D AATAAAGGGG A/- CATAAAGGAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 1 0 133122 CASAVA_Build 10 49079983 1D TTCTACAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 11 10 133123 CASAVA_Build 10 49138946 1D TGGAAAAGGT G/- GGGCAAGATG 3070 hom 69 het 27 0 24 5 G 4 3 133124 CASAVA_Build 10 49154335 1I CATTTTGGTA -/T TTTTCCCCCT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 4 5 133125 CASAVA_Build 10 49165319 2I CCAAACAGTC --/TG TGTTTCTTCC 3070 het 3070 hom 58 23 25 10 TG 1 2 133126 CASAVA_Build 10 49171013 1D TTAGTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 24 16 13 A 12 11 133127 CASAVA_Build 10 49180764 2I AATGCTGACC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 13 19 15 T 10 12 133128 CASAVA_Build 10 49189058 4I GTGCTCCAAT ----/CTAA CTAACTGTGG 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 CTAA 1 2 133129 CASAVA_Build 10 49191471 1D GGCAGAGGTG T/- AGACTCTGTC 3070 hom 55 het 22 0 19 3 T 1 0 133130 CASAVA_Build 10 49195448 2I TCCTGGCCTC --/AT GTGATCTTAC 3070 het 1967 hom 30 8 19 3 AT 0 1 133131 CASAVA_Build 10 49202734 1D TTATATTTAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 9 8 133132 CASAVA_Build 10 49207558 1I TGAGGCCTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 9 10 133133 CASAVA_Build 10 49215445 1I AGAAATACAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 8 9 133134 CASAVA_Build 10 49234127 1I ATGAAGAAAG -/T TGACTCTCAG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 1 2 133135 CASAVA_Build 10 49250725 1I GATTAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 7 6 A 11 12 133136 CASAVA_Build 10 49253556 1I GTCTCAGCCC -/A AAATCTTAAG 3070 hom 27 het 15 0 10 5 A 3 4 133137 CASAVA_Build 10 49255410 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 10 11 133138 CASAVA_Build 10 49256471 1D ATACATAACA G/- TTAAGAATTT 3070 het 3070 hom 51 17 30 5 G 1 0 133139 CASAVA_Build 10 49279018 1D TCCCAATATG C/- CTAACTACTT 3070 het 3070 ref 51 24 21 7 C 2 1 133140 CASAVA_Build 10 49283942 1D TTATCAAGGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 9 8 133141 CASAVA_Build 10 49303881 14I2M3I AATATGAATA --------------TG---/CAAGAATACATTCTTGTAA ACTAATGTAT 3070 het 3070 ref 40 20 19 2 N/A 0 0 133142 CASAVA_Build 10 49307043 1I GCTAATTTTG -/T TTTTTTTTTT 2508 het 2508 ref 21 10 7 4 T 12 13 133143 CASAVA_Build 10 49318172 1D ATTTAGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 256 hom 34 4 9 21 T 11 10 133144 CASAVA_Build 10 49319471 5D CTGAGGGATC AGAAG/----- AGTTCAAAGG 3070 het 3070 ref 23 11 10 3 AGAAG 1 0 133145 CASAVA_Build 10 49323860 1D GCTACGGGGC G/- GGGGGGAGTA 3070 hom 42 het 22 0 12 12 G 7 6 133146 CASAVA_Build 10 49337236 8D CCCCATGATG GGTAGGAT/-------- GGACATGGCC 3070 hom 48 het 16 0 14 4 GGTAGGAT 1 0 133147 CASAVA_Build 10 49337411 1I GGCCTGGGGT -/C CCGGATGCAG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 C 2 3 133148 CASAVA_Build 10 49338793 4I TCAATGAATG ----/AATA GAGTACCAAG 3070 hom 84 het 37 0 28 9 AATA 0 1 133149 CASAVA_Build 10 49344319 1D AGTCCCTGCG C/- CCCCCCCCAG 1732 het 1732 ref 15 4 6 5 C 9 8 133150 CASAVA_Build 10 49352451 1D TTAATGTCTT C/- CTTTTAAATC 3070 hom 75 het 28 0 26 4 C 2 1 133151 CASAVA_Build 10 49361917 1D GTGCAGAAGA T/- TTTTTAGTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 6 5 133152 CASAVA_Build 10 49373688 1D CCGGTGAACC T/- TCCTCCTGGT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 2 1 133153 CASAVA_Build 10 49383094 2I CTCCAGAAAC --/TG TACATTTTAT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 TG 0 1 133154 CASAVA_Build 10 49394063 1I ACCTTAACTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 9 10 133155 CASAVA_Build 10 49397928 1D TGGGGCCAAG C/- GTGGGGTTTG 3070 hom 72 het 26 0 23 4 C 1 0 133156 CASAVA_Build 10 49401577 1D CTCGCAGGTT G/- CCGCCGCGAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 1 0 133157 CASAVA_Build 10 49408930 6D CTTAAAGAAC TAAAAG/------ TAAAACTACC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TAAAAG 1 0 133158 CASAVA_Build 10 49409702 24D CTTGCAAGAG GAGGGCACCGAAGTACAGAGAAGT/------------------------ GAGGGCACCG 3070 hom 157 het 49 0 53 1 GAGGGCACCGAAGTACAGAGAAGT 2 1 133159 CASAVA_Build 10 49440345 2I CTCCTACATA --/TT TACCCAAGAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 3 133160 CASAVA_Build 10 49454806 4D TGAGGTTTCT TTTC/---- TATCTTTCTC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 TTTC 1 0 133161 CASAVA_Build 10 49456576 10D ATGCAGTGTA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 48 13 21 14 TG 14 9 133162 CASAVA_Build 10 49456739 1I TTTGAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 11 12 133163 CASAVA_Build 10 49458920 1D TACAATTTAA C/- CCCTAGCTCA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 4 3 133164 CASAVA_Build 10 49491724 1D AGAAGAATGT A/- AAAAAAAAAA 2286 het 2286 ref 27 14 6 7 A 12 11 133165 CASAVA_Build 10 49498319 1I15M1I CTTGTACATG -TTTTTTTTTTTAAAG-/TTTTTTTTTTTTAAAGT TTGGACAGTT 3070 het 297 hom 43 1 17 26 N/A 0 0 133166 CASAVA_Build 10 49508147 2D AAGAAGTGAC TT/-- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 T 8 6 133167 CASAVA_Build 10 49509277 2D ATTAAGGACT TG/-- TTTACATCTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TG 1 0 133168 CASAVA_Build 10 49525637 2D GACCCTTATG TA/-- TGAGGTGGGA 3070 het 3070 ref 38 19 17 4 TA 1 0 133169 CASAVA_Build 10 49532734 2D GGTGTGTGTG TT/-- TAAGTGTGTG 3070 hom 142 het 56 0 46 12 T 3 1 133170 CASAVA_Build 10 49535490 47D GCCTCGGACA CTTCTTAGCCGGGTCTCTAGGGGGCTCAGAGAGCCTGAGCCCCCTTC/----------------------------------------------- CTCATGTATA 3070 hom 93 het 32 0 31 5 CTTCTTAGCCGGGTCTCTAGGGGGCTCAGAGAGCCTGAGCCCCCTTC 1 0 133171 CASAVA_Build 10 49541374 3D ATTAAAAAAC ATT/--- ATTTGATAAA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 ATT 2 1 133172 CASAVA_Build 10 49545813 1I AGATCGCGCC -/A CTGCACTCCA 3070 hom 22 het 18 0 13 5 A 0 1 133173 CASAVA_Build 10 49546733 6D AAGAATATAA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 159 hom 27 4 14 10 AT 8 5 133174 CASAVA_Build 10 49547128 4D GTCAACGGGT GTGA/---- GTGACTTTGT 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 GTGA 2 1 133175 CASAVA_Build 10 49583010 1D GAGGGGCCCT G/- GTGAGAGAAC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 2 1 133176 CASAVA_Build 10 49595794 1I GCTCCATTTG -/T TTTTTCAGTA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 5 6 133177 CASAVA_Build 10 49603222 2D TGGTCCATGA AG/-- CCCAGCTTCT 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 AG 1 0 133178 CASAVA_Build 10 49767551 1I ACCTCTTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 100 het 41 0 33 8 T 8 9 133179 CASAVA_Build 10 49787091 1D GAGATGGGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 10 9 133180 CASAVA_Build 10 49793469 1I TGCTTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 685 hom 39 2 27 10 T 11 12 133181 CASAVA_Build 10 49796800 1D GTTGTCAGCA G/- GGGGTAGGAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 5 4 133182 CASAVA_Build 10 49797919 1D GATCTCTTTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 8 133183 CASAVA_Build 10 49798175 1D GACTAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 10 9 133184 CASAVA_Build 10 49799658 1D AGCTCTGTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 126 het 50 0 41 10 A 10 9 133185 CASAVA_Build 10 49810697 1D GAGAGCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2923 hom 39 12 12 15 A 12 11 133186 CASAVA_Build 10 49814657 2D CGGAGGCCGA AG/-- AGGGTGGATC 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 AG 2 1 133187 CASAVA_Build 10 49820431 2I GCGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 620 hom 36 3 18 15 GT 7 8 133188 CASAVA_Build 10 49847798 1D TCCCCTCCCC T/- AATCCCATCA 3070 hom 65 het 29 0 20 9 T 1 0 133189 CASAVA_Build 10 49858345 2I CATGTTGTTC --/TT TTACATTGCT 3070 het 3070 hom 57 21 32 4 T 2 4 133190 CASAVA_Build 10 49860930 1I TATTGCACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 598 hom 41 2 29 10 A 11 12 133191 CASAVA_Build 10 49878479 1D GTTTATGTCT C/- CCCTGCCTGT 3070 hom 105 het 45 0 34 12 C 4 3 133192 CASAVA_Build 10 49881278 1D GGGTTTTCAC A/- AAGCTCGTAG 3070 het 3070 ref 47 28 16 3 A 3 2 133193 CASAVA_Build 10 49882878 2I AAAAAGAAAA --/AG AAAAATCCCT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 AG 0 1 133194 CASAVA_Build 10 49885011 13D AATTCTGGGA TGGATGGCAGAGG/------------- TGGTTGAACA 3070 het 3070 ref 38 24 15 1 TGGATGGCAGAGG 1 0 133195 CASAVA_Build 10 49886992 4D ATATGACATT AATG/---- AGCCGAGGGT 3070 hom 84 het 32 0 25 9 AATG 1 0 133196 CASAVA_Build 10 49889546 1D CTGCACTGCT A/- CCTGGGGGTG 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 1 0 133197 CASAVA_Build 10 49891742 1I GAGGATTGGG -/T AGCCCCAATC 3070 hom 116 het 45 0 37 8 T 0 1 133198 CASAVA_Build 10 49892661 2D CTGGGGAATG TT/-- TTTTTTTTCC 3070 hom 120 het 42 0 40 2 T 10 8 133199 CASAVA_Build 10 49898582 1D AGATAAGAGA C/- ATAAACAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 C 1 0 133200 CASAVA_Build 10 49902996 1D TGCAGATGGG T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 7 6 133201 CASAVA_Build 10 49910990 1D ACTCTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 13 13 T 14 13 133202 CASAVA_Build 10 49912242 9D CCATTATCAC CACCATCAT/--------- CACCATCATC 3070 het 3070 ref 75 33 27 17 CACCATCAT 2 1 133203 CASAVA_Build 10 49927807 1D TACTGACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 36 6 22 8 T 13 12 133204 CASAVA_Build 10 49928114 1I TCCATCAGCA -/G GGGACTAGTT 3070 hom 157 het 54 0 53 1 G 3 4 133205 CASAVA_Build 10 49930007 2I TTTTTCATAT --/TG TTATATTCTC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 TG 0 1 133206 CASAVA_Build 10 49930603 1D ATATTTATTG A/- AAAATATTTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 5 4 133207 CASAVA_Build 10 49978848 2I AATAGCTAAG --/AC AATTTAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 AC 0 1 133208 CASAVA_Build 10 49982856 4D ACAGAGAGAT AGAG/---- AGATACAGAG 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 AG 3 1 133209 CASAVA_Build 10 49983381 5I AGAGAGAGAC -----/AGAGA GGGGGGGGGA 3070 het 2173 hom 32 9 14 9 AGAGA 0 1 133210 CASAVA_Build 10 49987526 2I14M1I TCAAGACAGA --TGATTTCAGGATCA-/TGTGATTTCAGGATCAT TTTTTCCTTA 3070 het 3070 ref 27 16 14 2 N/A 0 0 133211 CASAVA_Build 10 49997471 2I GGAAAGAGAG --/AC AGAGACACAG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 AC 0 1 133212 CASAVA_Build 10 50001634 1D ATTTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 T 13 12 133213 CASAVA_Build 10 50019918 1I AAGAACTTTG -/C AAGCCAGTTG 2505 het 2505 ref 21 11 6 4 C 0 1 133214 CASAVA_Build 10 50031324 1D ACATCCAATG A/- CTCCCGAACC 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 1 0 133215 CASAVA_Build 10 50033552 2D TAAGATGGCA GT/-- GTGTAGGAAG 3070 het 3070 ref 57 26 22 9 GT 3 2 133216 CASAVA_Build 10 50037784 16D CAGAGAGAGT GAGAGAGAGACAGAGA/---------------- GAGAAACAGG 3070 het 3070 hom 36 14 21 4 GAGAGAGAGACAGAGA 1 0 133217 CASAVA_Build 10 50049382 1D CCAGAATACA G/- GCCCTTGCTG 3070 hom 156 het 59 0 49 10 G 2 1 133218 CASAVA_Build 10 50054537 1D CAGAGAGAGC A/- GGGGAGGCTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 1 0 133219 CASAVA_Build 10 50055887 12D TGTCTGCCAG TGGGGCTAAGCA/------------ TGGGCTGGCC 3070 het 3070 ref 37 22 14 4 TGGGGCTAAGCA 1 0 133220 CASAVA_Build 10 50059881 1D CGAAAAAAAA G/- ATTAATAAGT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 G 1 0 133221 CASAVA_Build 10 50061994 2D CAGCTATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 216 hom 49 3 22 24 A 12 10 133222 CASAVA_Build 10 50071991 2I TAGGAAGGTC --/AG AGACTCTGAG 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 AG 1 2 133223 CASAVA_Build 10 50076275 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2435 het 357 hom 18 2 8 8 A 15 16 133224 CASAVA_Build 10 50076738 1D GAAGAAATAC T/- TTTACCAGAA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 T 4 3 133225 CASAVA_Build 10 50076987 1I ATGATATTAA -/C ATGGAGGTGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 0 1 133226 CASAVA_Build 10 50079711 1I AAACTATACC -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 7 8 133227 CASAVA_Build 10 50081483 9D TGCTCATTCC TTTGCTTGT/--------- TTTTCTCTAC 3070 het 3070 ref 39 21 15 7 TTTGCTTGT 1 0 133228 CASAVA_Build 10 50081954 1I CCTTTGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1810 hom 25 5 14 6 T 10 11 133229 CASAVA_Build 10 50088761 1D TGGGTTGGGG A/- AAAAATCTTT 3070 hom 129 het 47 0 43 6 A 6 5 133230 CASAVA_Build 10 50095687 1I CAACACAGGT -/A AAAAAAAAAA 1975 hom 45 het 32 0 14 18 A 11 12 133231 CASAVA_Build 10 50109339 1D ACGTCAGTGC A/- CTCTCAGGAG 3070 hom 132 het 45 0 45 0 A 1 0 133232 CASAVA_Build 10 50111297 8D CTCAGAATGG GGGAGGGT/-------- GGGAGGGAGA 3070 het 2321 hom 21 9 12 3 GGGAGGGT 1 0 133233 CASAVA_Build 10 50115212 1I TGAACATTTT -/A CTTGTGCTGC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 0 1 133234 CASAVA_Build 10 50121711 2D TTATAAAAGA AG/-- AAATAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 AG 1 0 133235 CASAVA_Build 10 50122302 1I ACAAAGTGGT -/G GGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 G 8 9 133236 CASAVA_Build 10 50139312 1D ATTGCTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 497 hom 41 4 18 19 A 13 12 133237 CASAVA_Build 10 50141287 1D AATGTTAGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 41 0 34 9 A 10 9 133238 CASAVA_Build 10 50141497 1I GTCAACCTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 133239 CASAVA_Build 10 50141683 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1396 hom 29 3 19 7 A 11 12 133240 CASAVA_Build 10 50143976 4D GACACATGAC AATT/---- AAACTTCTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AATT 1 0 133241 CASAVA_Build 10 50145496 1D GTGAAAAAAA T/- TGAATCCTCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 1 133242 CASAVA_Build 10 50145697 1D AGGAAACTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 10 9 133243 CASAVA_Build 10 50145919 1D GGAAAGAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 9 8 133244 CASAVA_Build 10 50146955 1D CAAAAGACCC T/- GTTGGGAGGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 1 0 133245 CASAVA_Build 10 50147140 2D AAATAAACAC AA/-- AAAAAAAGAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 9 7 133246 CASAVA_Build 10 50152359 1D GAAGAGGCCA G/- GAAGGATGTG 3070 hom 100 het 35 0 34 2 G 2 1 133247 CASAVA_Build 10 50155362 4D AAGCAGGGAC TCTG/---- TCTGTCTTGT 3070 hom 104 het 38 0 35 3 TCTG 2 1 133248 CASAVA_Build 10 50163721 1I AGGCCGAGGT -/G GGTGGATCAT 3070 hom 45 het 17 0 14 3 G 2 3 133249 CASAVA_Build 10 50165849 14D GTTAGCTTTG TTGTGATCCAGCGA/-------------- TTGTCTCCAA 3070 hom 86 het 29 0 26 7 TTGTGATCCAGCGA 1 0 133250 CASAVA_Build 10 50168386 6I TGTTTCCTGT ------/CATCTG GTTCCTGCTC 3070 hom 129 het 47 0 43 4 CATCTG 0 1 133251 CASAVA_Build 10 50200455 1D TTTTGCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 A 11 10 133252 CASAVA_Build 10 50223427 1I AAGAGGATAC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 7 8 133253 CASAVA_Build 10 50224095 1I AAATTAAAAA -/G CTTCTGCACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 0 1 133254 CASAVA_Build 10 50235378 2D AAAAATTTTT TC/-- TGTTTCATAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 TC 1 0 133255 CASAVA_Build 10 50236623 1D TGAAAAAAAA C/- ATCTGTCCTC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 C 1 0 133256 CASAVA_Build 10 50250166 1D TGGCGACTGT G/- GGGTCACAAG 3070 hom 109 het 44 0 36 10 G 4 3 133257 CASAVA_Build 10 50265715 1D ACTCCATCAC A/- AAAAAAAAAA 1540 het 1540 ref 29 12 4 13 A 15 14 133258 CASAVA_Build 10 50267893 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 838 het 838 ref 28 15 2 12 T 15 14 133259 CASAVA_Build 10 50268869 1D AGGGATCCGG T/- TTTTCATCTC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 T 5 4 133260 CASAVA_Build 10 50271143 1I GCCAAAATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 52 33 12 7 A 9 10 133261 CASAVA_Build 10 50292095 4D GCCCCGCCTC ATTG/---- ATTGGCATTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 9 ATTG 2 1 133262 CASAVA_Build 10 50296418 1D GCTCCTGAAA C/- CCCCATAGAG 3070 het 2325 hom 33 7 16 10 C 5 4 133263 CASAVA_Build 10 50303772 10D CACGCTGGGA GCTGTAGACT/---------- GCTGTAGACT 3070 het 3070 ref 40 25 14 3 GCTGTAGACT 2 1 133264 CASAVA_Build 10 50305063 2D GTTTTATAAC CT/-- GACATTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 CT 1 0 133265 CASAVA_Build 10 50310851 1D ATAAAGCCTA T/- TTTTAAAAAA 2024 het 2015 hom 21 9 9 3 T 5 4 133266 CASAVA_Build 10 50319649 3I CTGATTTCTT ---/AAC AACAAAGCGT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AAC 1 2 133267 CASAVA_Build 10 50325754 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2903 hom 29 het 11 0 8 4 A 13 12 133268 CASAVA_Build 10 50328401 1D ACCATTTTTT A/- AAAAAATACA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 7 6 133269 CASAVA_Build 10 50328869 1D AGAAATACGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 25 1 11 13 T 13 12 133270 CASAVA_Build 10 50331823 1D TGGTTGACAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 5 hom 33 1 26 7 T 9 8 133271 CASAVA_Build 10 50332189 1I TCATTTTTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 8 9 133272 CASAVA_Build 10 50336635 1D TTAGATTGCC A/- AAAAAAAAAA 1292 het 1292 ref 37 29 3 5 A 13 12 133273 CASAVA_Build 10 50347036 1D ACAGTCATGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 9 8 133274 CASAVA_Build 10 50377976 1D TTTATTACAT A/- AAGTTCATAG 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 3 2 133275 CASAVA_Build 10 50381006 1D AAAGCTCTCC A/- AAAAAACTGA 3070 hom 91 het 39 0 30 11 A 7 6 133276 CASAVA_Build 10 50384465 5I CAAAAAATAG -----/ATTTT ATTTATAATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 ATTTT 0 1 133277 CASAVA_Build 10 50385973 40D AAACTGAACA GATATATATACACTTTCCTGATACACATATCTGAATTCTT/---------------------------------------- GATATATATA 3070 hom 36 het 27 0 13 25 GATATATATACACTTTCCTGATACACATATCTGAATTCTT 2 1 133278 CASAVA_Build 10 50416942 1D GGGGCCGCGG C/- CCGCCCGAGA 1499 hom 32 het 13 0 7 6 C 3 2 133279 CASAVA_Build 10 50446618 1D TTGGCTTTTT A/- CTCTCTGCCA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 1 0 133280 CASAVA_Build 10 50447417 1I TCACAAAAGA -/G GTTAAATTCG 3070 hom 120 het 47 0 38 9 G 1 2 133281 CASAVA_Build 10 50456601 1I AGCAAGAGAG -/A GGGGGGGTGG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 0 1 133282 CASAVA_Build 10 50472438 1I ACTCCATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 33 1 27 5 A 11 12 133283 CASAVA_Build 10 50493054 4I GGCACAAAAC ----/ACAG ACAAACAGAC 3070 hom 68 het 28 0 22 6 ACAG 0 1 133284 CASAVA_Build 10 50517528 1D TTCTGATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 9 133285 CASAVA_Build 10 50527999 1I CCCTGCTTTA -/G GGGGGAGTAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 G 5 6 133286 CASAVA_Build 10 50531480 1D TGCCCTCCAA C/- CTGCTTTCAG 3070 hom 103 het 40 0 33 7 C 2 1 133287 CASAVA_Build 10 50532877 1D AGGTTGGGAA T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 8 7 133288 CASAVA_Build 10 50538496 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 31 1 20 10 A 13 12 133289 CASAVA_Build 10 50551015 3D TAAAACTAGA CAT/--- CAACAAGAAG 3070 hom 90 het 32 0 30 4 CAT 1 0 133290 CASAVA_Build 10 50552423 1I AGACTCTATC -/A AAAAAACCTC 3070 hom 92 het 37 0 30 7 A 6 7 133291 CASAVA_Build 10 50554082 2I AGACAAGTAT --/CA CATGTTTTCA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 CA 1 2 133292 CASAVA_Build 10 50562645 4I CATATATTCC ----/TAAG TGTTTTGTTC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TAAG 0 1 133293 CASAVA_Build 10 50585123 1I AAAAATTAAT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 6 7 133294 CASAVA_Build 10 50589707 2I AATGGAAGTA --/TG TGTGTGTCAT 3070 hom 131 het 49 0 42 7 TG 3 4 133295 CASAVA_Build 10 50602443 1D TTTATATAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 104 het 38 0 34 4 T 10 9 133296 CASAVA_Build 10 50609400 4D CTGCGCAATA GAGT/---- GAGAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 13 2 GAGT 1 0 133297 CASAVA_Build 10 50620027 7I CATACACTAC -------/ACACACT ACACACACAA 3070 hom 125 het 50 0 42 9 ACACACT 0 1 133298 CASAVA_Build 10 50620138 7I CCCCACACAT -------/ACCACAC ACCACACAAA 3070 hom 86 het 48 0 25 23 ACCACAC 1 2 133299 CASAVA_Build 10 50621443 6I CCCAGGACAT ------/TCGGTC TCGGTCTCGG 3070 hom 79 het 40 0 25 15 TCGGTC 1 2 133300 CASAVA_Build 10 50629493 1I GTGCTCCCCC -/A AGCCCCTGCA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 A 1 2 133301 CASAVA_Build 10 50637581 1D GTTCTAAGAG C/- CCTCTGCCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 C 3 2 133302 CASAVA_Build 10 50645706 1D ATTCACCCGT G/- ATATAATATA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 G 1 0 133303 CASAVA_Build 10 50649787 1D AGCATAATTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 74 het 30 0 26 5 T 10 9 133304 CASAVA_Build 10 50659286 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 11 10 133305 CASAVA_Build 10 50660153 1D TGGGTCTTCA C/- AATAAATCTT 3070 hom 77 het 30 0 26 5 C 1 0 133306 CASAVA_Build 10 50662536 1D CAACTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1102 hom 35 3 22 10 T 13 12 133307 CASAVA_Build 10 50666044 4D AAATTACCAA TTTT/---- TCTCCTCTTA 3070 hom 75 het 26 0 24 2 T 5 1 133308 CASAVA_Build 10 50681792 1D ATAGTTGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 409 hom 29 1 25 4 T 10 9 133309 CASAVA_Build 10 50691932 5I ACCTCAGAGA -----/TTAAG TTAAGAAGGA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 TTAAG 1 2 133310 CASAVA_Build 10 50771192 1D23M1D ATATGTTCAG TTTTTCTAAAAAACAGCCAGACCCT/-TTTTCTAAAAAACAGCCAGACCC- TTTCCAACAT 3070 hom 87 het 24 0 30 2 N/A 0 0 133311 CASAVA_Build 10 50795891 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 10 11 133312 CASAVA_Build 10 50800808 2I AAGCAAATGC --/TA TATAAAATAG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TA 2 3 133313 CASAVA_Build 10 50912549 1I ATTAAACCTC -/T TTTTTGTTAT 1419 het 1419 ref 8 4 3 1 T 5 6 133314 CASAVA_Build 10 51031496 1D AAAATACTGG A/- AAAAAAAAAA 1949 hom 10 het 6 0 4 2 A 11 10 133315 CASAVA_Build 10 51032173 1D TGAGTCATGG T/- TCACAGTATC 2854 het 2854 ref 47 37 6 6 T 2 1 133316 CASAVA_Build 10 51045872 5D CAATATACAT AAATC/----- AAATATATTT 2464 het 408 hom 6 1 5 0 AAATC 1 0 133317 CASAVA_Build 10 51047857 1I ATATCCATAC -/A AATGGAATAT 3070 het 2471 hom 20 5 13 2 A 2 3 133318 CASAVA_Build 10 51125849 2D GTACAACTCC TT/-- TTTTTTTTGG 3070 het 448 hom 42 4 13 25 T 10 8 133319 CASAVA_Build 10 51126634 3D TTAATTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 2270 het 2270 ref 16 7 7 6 TTG 4 3 133320 CASAVA_Build 10 51126817 1D AAAAAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 17 1 12 4 A 11 10 133321 CASAVA_Build 10 51138214 2I GCCAAGTGAC --/AG AGTGAAACTC 3070 hom 27 het 14 0 10 4 AG 1 2 133322 CASAVA_Build 10 51155582 1D ATTGTGCTTG C/- CCTCTGGATT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 C 3 2 133323 CASAVA_Build 10 51158635 1I TCTCTAGGAG -/A AAAAATAAAT 3070 het 3070 ref 45 27 10 8 A 5 6 133324 CASAVA_Build 10 51158706 8I43M2D AAAAGACAGT --------GAGAGAGGGAAAAGAGACAAGACAGAGAAATAGCCAATAAAGCAG/GAGGGGGAGAGAGAGGGAAAAGAGACAAGACAGAGAAATAGCCAATAAAGC-- ACACACACAA 3070 het 3070 ref 56 30 33 22 N/A 0 0 133325 CASAVA_Build 10 51161287 3D GCCTCTGGCT AGA/--- AGAAGCCTGT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 AGA 2 1 133326 CASAVA_Build 10 51165690 2D GAAAGAAAAC CT/-- AATATGCTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 CT 1 0 133327 CASAVA_Build 10 51167162 1D TGCCTCCCCC T/- GGTGTTGTCA 3070 het 3070 ref 46 19 17 11 T 1 0 133328 CASAVA_Build 10 51171283 1D GGGAAGGGTC A/- TCTAATCTGC 2837 het 2837 ref 21 11 8 2 A 1 0 133329 CASAVA_Build 10 51171970 3D TGTGTGGGAA GTT/--- GTGCTGTGGG 3070 het 3070 hom 56 24 27 6 GTT 1 0 133330 CASAVA_Build 10 51174969 2D TGCTCCTTTA TC/-- TCTCTCTCTC 1735 het 1735 ref 33 20 7 6 TC 9 8 133331 CASAVA_Build 10 51177852 1D GGAAATTAAG A/- AAATTATATT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 4 3 133332 CASAVA_Build 10 51180307 1I ATTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 1260 het 1260 ref 18 9 4 5 A 13 14 133333 CASAVA_Build 10 51182400 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 21 1 9 11 T 11 12 133334 CASAVA_Build 10 51183530 2I CATTCAAGAC --/AT AGGCATAGGC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AT 0 1 133335 CASAVA_Build 10 51184194 1I AACCCAAATG -/C CCATCAATGA 3070 hom 36 het 14 0 10 4 C 2 3 133336 CASAVA_Build 10 51188090 1D TCCTGACACT A/- AGCACTCCAC 3070 het 3070 hom 42 13 22 8 A 2 1 133337 CASAVA_Build 10 51192955 2D TCCATCTTGC AA/-- AAGTGAAACT 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 A 4 2 133338 CASAVA_Build 10 51206744 1I ATAGTGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 10 11 133339 CASAVA_Build 10 51209013 10D ACCTGGCTAA TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1979 het 1979 ref 17 7 5 5 T 22 12 133340 CASAVA_Build 10 51209752 1D GAACTTGCTA C/- CCCCAATAGA 3070 het 3070 ref 33 23 8 2 C 5 4 133341 CASAVA_Build 10 51214687 4D AACTGGACTC AAAT/---- AAGCCAAGCA 3070 het 3070 hom 48 21 20 10 AAAT 1 0 133342 CASAVA_Build 10 51217009 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 8 9 133343 CASAVA_Build 10 51218802 1I GTTGTGGTGG -/C CAGAGCAAAC 3070 hom 134 het 50 0 42 8 C 1 2 133344 CASAVA_Build 10 51219228 2I ATCGCTGAGG --/CT CTGTTTCTTT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CT 1 2 133345 CASAVA_Build 10 51249528 20D TTCAGCTTAC TTAGATTACTAACTACTTAG/-------------------- ATTTTTGATT 3070 het 3070 hom 44 21 25 9 TTAGATTACTAACTACTTAG 1 0 133346 CASAVA_Build 10 51253025 3D ACTATGTGTC ATT/--- GTTAACTTTT 2819 het 2819 ref 27 16 7 6 ATT 1 0 133347 CASAVA_Build 10 51277575 1D GAAAGGCCAA G/- GGAGAATCTG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 G 3 2 133348 CASAVA_Build 10 51282473 2D TTTCGGAAAC AT/-- AAAGTCAAGA 3070 het 3070 hom 37 10 25 5 AT 1 0 133349 CASAVA_Build 10 51286364 1D CAAAGAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 A 12 11 133350 CASAVA_Build 10 51286506 10I TCCAGTCTGG ----------/AAGACAGAGT GAGACTTTGT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 AAGACAGAGT 0 1 133351 CASAVA_Build 10 51288431 2I GCATATATTG --/TA TAAGGTCTTT 3070 het 3070 ref 57 31 25 1 TA 1 2 133352 CASAVA_Build 10 51291229 1D TAGCAACTAC A/- GTGATTTGTC 3070 het 3070 ref 22 11 8 4 A 1 0 133353 CASAVA_Build 10 51291671 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 57 32 11 15 A 10 9 133354 CASAVA_Build 10 51293059 1I GACGCGCAAC -/T TTAGTGTAGA 3070 het 3070 ref 48 22 15 11 T 2 3 133355 CASAVA_Build 10 51396709 1I GAGCCCTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 9 10 133356 CASAVA_Build 10 51407387 4I AGGAAAAAAA ----/AAAG AAAAACATCA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AAAG 0 1 133357 CASAVA_Build 10 51408460 2D TTTAAAAGAA AG/-- AGAAATTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 AG 2 1 133358 CASAVA_Build 10 51447684 4I CAAAGCCAGA ----/TTCT TTCTCCCTGC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TTCT 1 2 133359 CASAVA_Build 10 51454097 1D CCACTCCTGT C/- CCCTCTCCCA 3070 hom 20 het 14 0 11 3 C 4 3 133360 CASAVA_Build 10 51463866 2D ATGCAAAGAC TT/-- TTGCTGGGAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 4 2 133361 CASAVA_Build 10 51466032 4D ATCTCAAAAA AAGT/---- AAGAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 12 10 5 AAGT 1 0 133362 CASAVA_Build 10 51475770 3I TGCCCACCTC ---/CTT TGCCTCCCAG 2453 hom 24 het 9 0 8 1 CTT 0 1 133363 CASAVA_Build 10 51476498 1I CTTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 500 hom 29 4 15 10 T 13 14 133364 CASAVA_Build 10 51479496 2I TAGAAATATC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 10 12 133365 CASAVA_Build 10 51481781 1I CTTCTGACAG -/T TTTTTTTTTT 1717 het 1717 ref 25 11 7 7 T 15 16 133366 CASAVA_Build 10 51483089 1D GTGTATTTCA T/- CAGGGAGGCC 3070 het 3070 hom 24 13 10 1 T 1 0 133367 CASAVA_Build 10 51484326 1D AACTCTATTG A/- GAAAAACCTG 3070 hom 53 het 20 0 18 3 A 1 0 133368 CASAVA_Build 10 51485594 2D GCTGGACGTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 11 9 133369 CASAVA_Build 10 51487072 1I CTCCTGCTTT -/A AAAAAAATCA 1142 het 289 hom 5 1 3 2 A 7 8 133370 CASAVA_Build 10 51537379 1I AGCAGATTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 9 10 133371 CASAVA_Build 10 51596282 1I ATTTTGAAAT -/C CCCCCCTTTC 1947 het 1947 ref 11 6 4 1 C 6 7 133372 CASAVA_Build 10 51677090 3D CAAACAGCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 2735 het 167 hom 22 2 6 15 T 14 11 133373 CASAVA_Build 10 51694472 1I AATGGAAAAC -/A AAAAAAAGGC 2550 hom 18 het 10 0 7 3 A 7 8 133374 CASAVA_Build 10 51701166 2D ATCTATGGAG TA/-- CCAGACACTG 3070 het 3070 ref 57 30 24 5 TA 1 0 133375 CASAVA_Build 10 51702140 1D GCTTTCTCGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 40 1 35 4 A 11 10 133376 CASAVA_Build 10 51707502 1D ATTGTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 35 0 23 13 A 13 12 133377 CASAVA_Build 10 51714511 1D ATTTAAGCCC T/- TTTGCACTCA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 4 3 133378 CASAVA_Build 10 51731635 3I ACAAATGTAT ---/GAA GAAGATGTGG 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 GAA 1 2 133379 CASAVA_Build 10 51734315 1I TTTTTTAGGG -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 6 7 133380 CASAVA_Build 10 51742104 2D GTGAGAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2137 het 2137 ref 33 10 7 18 A 18 16 133381 CASAVA_Build 10 51750814 1I TCTAGAAACG -/T TTGCTCAGGA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 2 3 133382 CASAVA_Build 10 51756767 14I TCCAACACAC --------------/AAACTAGAACACAT ATTTCCCCAG 3070 het 2242 hom 33 6 21 6 AAACTAGAACACAT 0 1 133383 CASAVA_Build 10 51761580 2I AATAGACAAT --/AG AGAGGTGGGC 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 AG 2 3 133384 CASAVA_Build 10 51768314 1D TTCACAGAGA C/- CCCCAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 21 10 3 C 5 4 133385 CASAVA_Build 10 51771455 16I ACCTGAGGCC ----------------/AGATCCCAGGCTGCCT TCATTCCAGC 3070 het 3070 ref 34 15 12 9 AGATCCCAGGCTGCCT 0 1 133386 CASAVA_Build 10 51779318 1I TTGGCTGTGT -/C CCCACCCAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 3 4 133387 CASAVA_Build 10 51782242 5D AGAACTGGTA ATAAT/----- ATAAGAGTAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 ATAAT 1 0 133388 CASAVA_Build 10 51791107 1I TCTCCTCATA -/C CCCCCAGGAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 C 5 6 133389 CASAVA_Build 10 51792882 2I TTCACTGGAC --/AT ATATACATTC 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 AT 2 3 133390 CASAVA_Build 10 51802714 1I GCTATAATAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 8 9 7 A 8 9 133391 CASAVA_Build 10 51803210 2D CCATTTGATG AA/-- AAGTCAGTTT 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 A 4 2 133392 CASAVA_Build 10 51809205 4D CATATACATT TATA/---- TATATATATA 1800 het 1800 ref 15 6 4 6 TA 9 7 133393 CASAVA_Build 10 51810550 1I CTCTTTTTTT -/A AACTAAGTCT 3070 het 3070 hom 37 20 16 1 A 2 3 133394 CASAVA_Build 10 51814156 2I TCTTTTTCTC --/TT TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 1 3 133395 CASAVA_Build 10 51814221 4D TCTCTTTCTC TCCT/---- TCCTTCCTTC 3070 het 2612 hom 26 8 11 8 TCCT 4 3 133396 CASAVA_Build 10 51821957 1I AGTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 13 14 133397 CASAVA_Build 10 51828916 2I TATATAGAAA --/AT ATATACCGCA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 AT 2 3 133398 CASAVA_Build 10 51836471 1I GCTATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 13 14 133399 CASAVA_Build 10 51849265 1I GGTAGCAAAT -/A AGGCTTAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 2 133400 CASAVA_Build 10 51853070 2I CCACTTAATT --/CC TAGCTCTGCA 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 C 0 2 133401 CASAVA_Build 10 51853405 1D GTGGCATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 25 11 7 A 11 10 133402 CASAVA_Build 10 51854185 1I TTTGCCTGTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 7 8 133403 CASAVA_Build 10 51856454 1I ACAGAAAACA -/C CCAGAATTCA 3070 hom 126 het 53 0 43 10 C 2 3 133404 CASAVA_Build 10 51866573 2D TGGCCATGAG AC/-- ACAGTTGTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 AC 2 1 133405 CASAVA_Build 10 51874493 1D CCCATTTATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 10 9 133406 CASAVA_Build 10 51879624 1D TTGGTTGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 10 9 133407 CASAVA_Build 10 51880776 1D AAGTAATTTT A/- AAGTCTGAAA 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 A 3 2 133408 CASAVA_Build 10 51882885 1I AAATAAGAGA -/C CCATCAGTGA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 C 2 3 133409 CASAVA_Build 10 51907706 4D7M5I CCAGTAGTTC TTTACAGCAGT-----/----CAGTAGTCTCCA GTGAGGGCAG 3070 het 3070 ref 42 22 17 7 N/A 0 0 133410 CASAVA_Build 10 51925533 1I CAAGAATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 11 12 133411 CASAVA_Build 10 51958611 3D TTCCAAAAAG AGA/--- AGAAGAAGCC 3070 het 3070 hom 54 20 23 15 AGA 3 2 133412 CASAVA_Build 10 51961142 1D TGTTTACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 19 25 11 T 11 10 133413 CASAVA_Build 10 51972414 2I CACACACATG --/CA CACACACACA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 CA 6 7 133414 CASAVA_Build 10 51983281 3I ACAAAAAAAT ---/CTA CTTTCACCCC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 CTA 0 1 133415 CASAVA_Build 10 51989827 5D TAAAATATAA ATAAT/----- ATAATATATA 1481 het 1171 hom 8 3 4 1 ATAAT 2 1 133416 CASAVA_Build 10 52006492 1I TGCAACCCTT -/C ATTTCCGGAG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 C 0 1 133417 CASAVA_Build 10 52029238 1I GCTGGGAGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 9 10 133418 CASAVA_Build 10 52034621 6D ATCATACAAG AAATAT/------ AAATATAACA 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 AAATAT 2 1 133419 CASAVA_Build 10 52034912 1I ACAAAACCCC -/T GGACCACTGC 3070 het 3070 hom 43 14 18 11 T 0 1 133420 CASAVA_Build 10 52047515 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 T 6 7 133421 CASAVA_Build 10 52066853 1D TCCTAAAATC T/- TTTTTTTTTT 2344 het 2344 ref 23 10 6 7 T 13 12 133422 CASAVA_Build 10 52081584 1I CTAGCTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 22 16 15 T 11 12 133423 CASAVA_Build 10 52085967 3D TTTGTACAAC AAT/--- GTTATTAAGC 3070 het 3070 ref 37 26 10 1 AAT 1 0 133424 CASAVA_Build 10 52104444 1D CAGGTCCAGG T/- GAGCAAGGGA 2272 hom 32 het 12 0 9 4 T 1 0 133425 CASAVA_Build 10 52114489 4I2M2D AAAGCCCAGC ----TGCC/TTTATG-- TCAGGCTTCC 2718 hom 36 het 15 0 11 5 N/A 0 0 133426 CASAVA_Build 10 52117314 1I TAGGAATGTT -/A AGTGAGCCAT 3070 hom 72 het 25 0 21 4 A 1 2 133427 CASAVA_Build 10 52126851 8D CCAAGCCTTC CCATCGCG/-------- GCTCCTCCAG 3070 hom 42 het 15 0 13 2 CCATCGCG 1 0 133428 CASAVA_Build 10 52127423 7D TGCCCCTCTT CCCCTTG/------- CCTGTTTACT 2692 hom 24 het 12 0 8 4 CCCCTTG 1 0 133429 CASAVA_Build 10 52133759 1I ATCTTTTATA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 8 9 133430 CASAVA_Build 10 52137766 2D AACTGAGGAG GA/-- GGGAAGCACA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 GA 1 0 133431 CASAVA_Build 10 52145966 10D TTTCTGATGC ACCACTGCAG/---------- GCCACATATA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 ACCACTGCAG 1 0 133432 CASAVA_Build 10 52149358 1I TCTCACCATG -/A AAAAAAGTAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 6 7 133433 CASAVA_Build 10 52150589 1D CAGCATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 34 0 25 9 A 15 14 133434 CASAVA_Build 10 52159835 1D TATTTCACAC A/- AAGACACTGC 2793 het 2793 ref 63 54 6 4 A 3 2 133435 CASAVA_Build 10 52162379 5D TATTCATGTA TTTAC/----- TTTTTATGGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTTAC 1 0 133436 CASAVA_Build 10 52163022 1D CTGCTTTCAC A/- AAAAAACACG 3070 hom 60 het 24 0 19 5 A 7 6 133437 CASAVA_Build 10 52163402 2I TTAAAAAAGG --/CT CTAGTTAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 CT 1 2 133438 CASAVA_Build 10 52165308 1D TAAAAGTTGG A/- AAAAAAGCAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 6 133439 CASAVA_Build 10 52172329 5D GGACTCTTTA TTTTG/----- TTTTATTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 5 TTTTG 1 0 133440 CASAVA_Build 10 52173725 4I GCCTGTATTA ----/TTAG TTACTGATTG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TTAG 0 1 133441 CASAVA_Build 10 52183923 2I ATATATGTAT --/AC ACACACACAC 2501 het 980 hom 13 2 9 2 AC 5 6 133442 CASAVA_Build 10 52188955 16I TTCCCCCTTG ----------------/AGACTCTTCCCCTATA ACATCAATGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AGACTCTTCCCCTATA 0 1 133443 CASAVA_Build 10 52190376 1D TAGATGCAAT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 7 6 133444 CASAVA_Build 10 52197537 1I CTCAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 11 12 133445 CASAVA_Build 10 52197622 2D GAAAGTAATA AC/-- AGTGTTTTCT 3070 het 979 hom 12 2 9 2 AC 1 0 133446 CASAVA_Build 10 52200305 1D TGGATTGTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 9 8 133447 CASAVA_Build 10 52204103 1I CCCCATCTCC -/A AATGATGAGT 1704 het 1704 ref 26 18 5 3 A 2 3 133448 CASAVA_Build 10 52212376 1I CCTCCCCCAT -/A CCCCCACCCC 2464 hom 12 het 5 0 5 0 A 0 1 133449 CASAVA_Build 10 52219033 1I TAAAAACTGT -/G GGTTATAGGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 2 3 133450 CASAVA_Build 10 52224489 1D TTTTATCATA T/- TTTATTATTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 4 3 133451 CASAVA_Build 10 52232445 6D TTAGGAAATC TTAGTG/------ TTAGAGTTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 5 TTAGTG 1 0 133452 CASAVA_Build 10 52262634 1D AGGTACTATG T/- TTTTTTTTTT 1213 het 1213 ref 27 19 3 5 T 11 10 133453 CASAVA_Build 10 52270043 1I TAAAATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 12 10 16 T 13 14 133454 CASAVA_Build 10 52283517 1D GAGTCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 768 hom 26 3 19 4 T 15 14 133455 CASAVA_Build 10 52294309 1I AGACACTGTG -/T TTTTTATTAG 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 T 5 6 133456 CASAVA_Build 10 52320187 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 30 2 24 4 A 13 14 133457 CASAVA_Build 10 52330773 1I AGCAAGAAAG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 8 133458 CASAVA_Build 10 52343340 1D AAATTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 55 1 39 15 T 13 12 133459 CASAVA_Build 10 52347417 1I TTGACTTCTA -/G GGCTGATGAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 2 3 133460 CASAVA_Build 10 52365045 4I TGCCAGCATC ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 90 het 44 0 31 13 TGTT 3 4 133461 CASAVA_Build 10 52386112 1I CAGATACAAC -/T TTTTTAGTCT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 5 6 133462 CASAVA_Build 10 52403049 4I TAAATAGATG ----/AATA AATTAATTAA 3070 hom 42 het 21 0 15 6 AATA 0 1 133463 CASAVA_Build 10 52405829 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2964 het 1489 hom 23 6 9 8 A 12 13 133464 CASAVA_Build 10 52413634 1I TATGCCTAGC -/T TTTTTTTTTT 2813 het 2813 ref 31 12 8 11 T 13 14 133465 CASAVA_Build 10 52416481 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 11 10 133466 CASAVA_Build 10 52418513 1I TATTAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 32 2 25 5 A 10 11 133467 CASAVA_Build 10 52418690 1I GTCCTTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 13 14 133468 CASAVA_Build 10 52418809 1I TCAGAATCAT -/A AGAGTTTCTA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 1 2 133469 CASAVA_Build 10 52419051 5D CTTCTACCAG CATGT/----- CTTTTCTCAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 CATGT 1 0 133470 CASAVA_Build 10 52419907 4I GCTCTCTGTG ----/ATAC ATAGATATAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 ATAC 0 1 133471 CASAVA_Build 10 52428525 5D CTCAAAAAAC AAAAT/----- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 25 9 16 1 AAAAT 1 0 133472 CASAVA_Build 10 52430510 1D AGTTCATAGA T/- TTTTTTTTTT 1690 het 1690 ref 51 42 4 6 T 11 10 133473 CASAVA_Build 10 52431726 1D TGGTCTTACA T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 93 het 33 0 30 3 T 7 6 133474 CASAVA_Build 10 52442941 1I TTTACACTTA -/T TTTTTCATCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 6 133475 CASAVA_Build 10 52455230 2D TCTGCTTTGG AC/-- ACTTGTTGAG 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 AC 2 1 133476 CASAVA_Build 10 52458348 1I AGAAGCCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 A 9 10 133477 CASAVA_Build 10 52463611 2I TCCATTGCAT --/TA TATATCCTGC 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 TA 2 3 133478 CASAVA_Build 10 52467549 1D ACTCGATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1648 hom 22 6 15 1 A 13 12 133479 CASAVA_Build 10 52472211 1D AATTCTGGGC T/- TTGGCCAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 T 3 2 133480 CASAVA_Build 10 52483020 1I AATAAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 21 0 12 9 A 11 12 133481 CASAVA_Build 10 52486149 1D AGCTTGATCT C/- CCTTTACTGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 C 3 2 133482 CASAVA_Build 10 52500178 1D GGACTTGTTA C/- TTTTAGCAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 C 1 0 133483 CASAVA_Build 10 52501984 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 10 9 133484 CASAVA_Build 10 52515375 1I AAGAGTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 10 11 133485 CASAVA_Build 10 52527716 1I AGTTAACTGG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 7 8 133486 CASAVA_Build 10 52532911 1I AAAAAAAAAA -/T TAGTTAGAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 1 2 133487 CASAVA_Build 10 52547924 1D AGTTAAGAGC A/- GAGCAGCAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 0 133488 CASAVA_Build 10 52557975 1I31M2D TGTGATACTT -AAAAAAAATCCGGATAGACTTAGGAATATAAAT/AAAAAAAAAACCGGTTAGACTTAGGAATATAA-- ATATCAATTC 3070 hom 93 het 33 0 32 11 N/A 0 0 133489 CASAVA_Build 10 52574795 3I CAAGCATCTT ---/AAC AACAGAATTA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AAC 1 2 133490 CASAVA_Build 10 52577206 2D AAGTAAAAGG AA/-- AAAAAAAACG 3070 hom 114 het 45 0 39 7 A 10 8 133491 CASAVA_Build 10 52581336 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 513 hom 36 2 28 6 T 12 11 133492 CASAVA_Build 10 52589725 1D GCAGCCTGAT G/- GTGATGGCAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 2 1 133493 CASAVA_Build 10 52601783 1D TTCAATTACC T/- TTTAAGTCAA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 4 3 133494 CASAVA_Build 10 52604957 1I GTGTTCCTTA -/G GCCAGAGTCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 2 133495 CASAVA_Build 10 52613320 3I TGTTGTATTG ---/TTT TTGCATTTTA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 2 5 133496 CASAVA_Build 10 52651897 2D CGCCCCCCCC CG/-- ACCCCAGCCT 800 het 74 hom 12 2 5 5 CG 1 0 133497 CASAVA_Build 10 52671074 1I GCTCCAATCC -/A AAAAAAAAAA 2428 het 2428 ref 46 26 9 11 A 12 13 133498 CASAVA_Build 10 52691517 2I CCAGGGCTTG --/GC AGGGGAAGTA 3070 hom 110 het 43 0 36 7 GC 0 1 133499 CASAVA_Build 10 52712549 1D CAAATTATAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 9 8 133500 CASAVA_Build 10 52722971 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 6 7 133501 CASAVA_Build 10 52724250 2I CCTTTCCCCA --/GT GTGTGTGTTC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 GT 4 5 133502 CASAVA_Build 10 52732323 2I AAAACATCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 39 0 24 15 T 14 16 133503 CASAVA_Build 10 52734011 11D CTTGAAAATT AGTTAGAAAAG/----------- ATGCGTAGAG 3070 hom 57 het 21 0 20 4 AGTTAGAAAAG 1 0 133504 CASAVA_Build 10 52747003 2I CATGGTTTAC --/AT GTGTTTAGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 0 1 133505 CASAVA_Build 10 52750835 1I TAGAGGAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 10 133506 CASAVA_Build 10 52759697 1I TAGGGAAATC -/T TTTTTTTTTT 2508 het 1256 hom 20 4 10 6 T 15 16 133507 CASAVA_Build 10 52760482 2I TTCTGGTCAC --/TT ATTGATTTCT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 0 2 133508 CASAVA_Build 10 52776891 1D AAAAAACTGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 119 het 47 0 41 6 T 9 8 133509 CASAVA_Build 10 52777672 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 43 het 16 0 15 1 A 8 7 133510 CASAVA_Build 10 52783652 13I GCCAAGATTT -------------/GGGAGCAACCTAA GTGTTCATCA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 GGGAGCAACCTAA 0 1 133511 CASAVA_Build 10 52783966 1D TAATGGGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 11 10 133512 CASAVA_Build 10 52806852 1D GTTAGCAGTT A/- AAAAAAAAAA 1622 het 1622 ref 38 30 4 4 A 11 10 133513 CASAVA_Build 10 52807445 1D GTTTTTCTTT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 3 A 7 6 133514 CASAVA_Build 10 52820629 20D GAGGCCATGG ATGGTGCTAAACATCCAACA/-------------------- ATGCACAGGA 3070 het 3070 ref 38 27 15 2 ATGGTGCTAAACATCCAACA 1 0 133515 CASAVA_Build 10 52825285 4D GAGAGCTGTC TCTT/---- TAGTAGGAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TCTT 1 0 133516 CASAVA_Build 10 52827463 1D TTCTGGCAGT G/- GAAATATAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 2 1 133517 CASAVA_Build 10 52833642 2D AAAATAAATC TA/-- TTTTAGTTGA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 TA 1 0 133518 CASAVA_Build 10 52837079 2I ATGTCATAAT --/TA TACACTTATC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TA 1 2 133519 CASAVA_Build 10 52842229 1D GCCAACATGG T/- GAAAACCCAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 0 133520 CASAVA_Build 10 52867966 1I TAGACTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 10 11 133521 CASAVA_Build 10 52868779 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1420 hom 30 6 17 7 A 9 10 133522 CASAVA_Build 10 52869968 1I TGCAGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 10 11 133523 CASAVA_Build 10 52888199 1D TTAATAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 12 11 133524 CASAVA_Build 10 52900931 1I TTCATGGCTT -/A AATAGCCTCA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 2 3 133525 CASAVA_Build 10 52903522 3I GAAACACTGA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 13 16 133526 CASAVA_Build 10 52906368 3D AGTGGATTAT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 TTG 7 6 133527 CASAVA_Build 10 52908511 1I TGAGATACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 11 12 133528 CASAVA_Build 10 52911506 1D AAAAGGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 9 9 T 13 12 133529 CASAVA_Build 10 52912266 1D CTGCCATTGG C/- CTGGCTCACT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 2 1 133530 CASAVA_Build 10 52912776 4D CTTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 689 hom 24 5 8 11 T 20 16 133531 CASAVA_Build 10 52917428 3D GGGCCAAACA ATT/--- ATTAAGAATA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 ATT 2 1 133532 CASAVA_Build 10 52923534 1D CTTATTTGTG C/- CCTGTTTTAC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 C 3 2 133533 CASAVA_Build 10 52937065 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 9 10 133534 CASAVA_Build 10 52950032 4D CATATAGAGT TATA/---- TATATGCATA 3070 hom 27 het 10 0 10 1 TA 4 2 133535 CASAVA_Build 10 52958270 1D GGAAAATCAC T/- TAGCTTAAGT 3070 hom 75 het 26 0 24 2 T 2 1 133536 CASAVA_Build 10 52958338 1D TCAGTACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 28 1 25 2 A 12 11 133537 CASAVA_Build 10 52959471 3I CTCAGTCCTC ---/TTG TTATTTTTCT 3070 hom 155 het 57 0 49 8 TTG 0 1 133538 CASAVA_Build 10 52964331 1I CTACTCGGGA -/G GCTGAGACAG 2453 het 2453 ref 19 8 7 4 G 1 2 133539 CASAVA_Build 10 52972441 1I TTCGCATGAT -/A AGTCTGCAAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 1 2 133540 CASAVA_Build 10 52976815 1D TGTAGGTGTT G/- GCCTCTACCA 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 G 2 1 133541 CASAVA_Build 10 52977146 2D ATGCAAAATT CA/-- ACAAGTTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 7 CA 1 0 133542 CASAVA_Build 10 52978023 2I AAGGGCTTAC --/AA GTCTCCAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 A 0 2 133543 CASAVA_Build 10 52984462 1I TTTTAAGGGG -/A AAAAAAGTAC 3070 het 3070 hom 51 24 25 2 A 6 7 133544 CASAVA_Build 10 52986187 1I GGTATGATAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 8 9 133545 CASAVA_Build 10 52986729 2D GGAATTTAAA TC/-- TGTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 40 15 24 2 TC 1 0 133546 CASAVA_Build 10 52993387 3I TTGTCGACTG ---/TTA TTACTCCGTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 TTA 1 2 133547 CASAVA_Build 10 52993979 5D AATAAACAGG CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 12 10 CAAAA 5 4 133548 CASAVA_Build 10 52997953 5I AATCTTCACC -----/CTTTT CTTATGTATT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 CTTTT 0 1 133549 CASAVA_Build 10 52998518 2D CATCATTACA CC/-- CCCTGGCTTT 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 C 5 3 133550 CASAVA_Build 10 52999816 2D CCCAAACTAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TA 9 8 133551 CASAVA_Build 10 53000463 1D AGAATTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 A 10 9 133552 CASAVA_Build 10 53006549 1I AATTATTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 8 9 133553 CASAVA_Build 10 53010482 1D AATTATATTC T/- TTTTTTTTGT 2355 het 2355 ref 24 12 6 6 T 9 8 133554 CASAVA_Build 10 53018133 1I ATTTAAATAT -/A AAAAAGGCCT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 5 6 133555 CASAVA_Build 10 53037947 4I AGACTGCATA ----/TACT TACTATAACC 3070 het 3070 hom 65 31 29 5 TACT 1 2 133556 CASAVA_Build 10 53040821 1I ACTTACAGTT -/A AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 26 17 3 6 A 13 14 133557 CASAVA_Build 10 53041245 1D TTATTTGCCC T/- TTTTTAAAAA 3070 het 189 hom 18 2 8 9 T 6 5 133558 CASAVA_Build 10 53044287 1I ATTTAATCTA -/T TTTATATTCA 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 T 3 4 133559 CASAVA_Build 10 53050333 3I ATTGTTAAAC ---/ATT ATTATACATC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 ATT 1 2 133560 CASAVA_Build 10 53051100 3I TTTATACTTT ---/AAA AAGTTTTTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 5 133561 CASAVA_Build 10 53055490 1D GTTAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 13 12 133562 CASAVA_Build 10 53061860 1I CATTATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 41 0 32 9 T 11 12 133563 CASAVA_Build 10 53065052 2D TTATTTTAGC AA/-- AAAAAAAAAA 2242 het 2118 hom 30 10 10 10 A 17 15 133564 CASAVA_Build 10 53070826 1I ATAATAAGAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 8 9 133565 CASAVA_Build 10 53076917 1D AGATCAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2430 hom 43 15 17 11 A 17 16 133566 CASAVA_Build 10 53082088 1I GACACAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 32 1 23 8 A 10 11 133567 CASAVA_Build 10 53090797 3D AGAGATTTTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 122 het 48 0 40 9 TTG 4 3 133568 CASAVA_Build 10 53097346 1D AAAGCTCACA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 44 19 18 9 T 8 7 133569 CASAVA_Build 10 53105978 1D CAAATTAATT A/- AAATTATATT 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 A 4 3 133570 CASAVA_Build 10 53109491 2I TTTTTTAATG --/TT TTTTTTTTTT 1172 het 346 hom 12 2 5 6 T 11 13 133571 CASAVA_Build 10 53121075 1D TCTTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 1522 het 1522 ref 33 18 7 8 T 17 16 133572 CASAVA_Build 10 53123201 1I CAGAGTCTCA -/C TCTGTTGCCC 3070 hom 27 het 13 0 9 4 C 0 1 133573 CASAVA_Build 10 53150079 1D ATTCATACCT A/- AAAGTTCCAA 3070 het 3070 hom 38 10 18 10 A 4 3 133574 CASAVA_Build 10 53150926 1D CTGCAGTGAG C/- CCATGATTAT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 C 3 2 133575 CASAVA_Build 10 53151521 3I TATATTTTCA ---/TGT TGTTCCTGTG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 TGT 1 2 133576 CASAVA_Build 10 53153384 1I AAAGCATGAC -/A AAAAAAAAAG 301 het 301 ref 45 19 5 21 A 9 10 133577 CASAVA_Build 10 53155202 1I CTTAGGCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 8 13 T 13 14 133578 CASAVA_Build 10 53158346 1D CTTATCTCAG A/- AGGGTTGTTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 1 133579 CASAVA_Build 10 53164644 2D CCATGGAAAC AT/-- ATAGGCTCAT 3070 het 3070 ref 40 22 18 1 AT 2 1 133580 CASAVA_Build 10 53165336 1I CAGTATTTGT -/G GGGGGGATTA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 G 6 7 133581 CASAVA_Build 10 53184778 1I ACTCAATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 14 16 17 A 15 16 133582 CASAVA_Build 10 53190245 1I TTCGTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 G 0 1 133583 CASAVA_Build 10 53195558 1D GTTTTGCCCC T/- AAGTATGCTG 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 1 0 133584 CASAVA_Build 10 53224539 1D TTTAAAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 9 8 133585 CASAVA_Build 10 53239055 1D CAGATCATAG A/- AAAAAAAAAA 962 het 962 ref 50 41 3 6 A 11 10 133586 CASAVA_Build 10 53268925 2D TATTTTTTTA AC/-- AGTTGGTTGA 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 AC 1 0 133587 CASAVA_Build 10 53271419 1D TGAATTTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 22 10 11 1 A 10 9 133588 CASAVA_Build 10 53277830 1I TGATAACCGG -/T GGACCAAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 133589 CASAVA_Build 10 53292896 13I ATCAGTAGGA -------------/ATCAAGCATGTAC CCCCAGAGTA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 ATCAAGCATGTAC 0 1 133590 CASAVA_Build 10 53303684 1D TTTATTTGCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 8 7 133591 CASAVA_Build 10 53305701 13D TCCTTTATTC CTTTCTTTTCTTT/------------- CTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 16 7 CTTTCTTTTCTTT 1 0 133592 CASAVA_Build 10 53314376 1D ACTCAGTGTG C/- CAATGTTCTA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 C 2 1 133593 CASAVA_Build 10 53316749 3I ATGTATGCCA ---/ATT ATTATTATGA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 ATT 2 3 133594 CASAVA_Build 10 53317081 2D TTATTTCATC TA/-- TAAGTGACAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 9 TA 2 1 133595 CASAVA_Build 10 53317239 1I CTATTTTAAA -/T TTTTTTGAGG 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 6 7 133596 CASAVA_Build 10 53320864 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 10 9 133597 CASAVA_Build 10 53326311 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 47 24 20 4 A 7 6 133598 CASAVA_Build 10 53337143 1I GGCTAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2532 hom 37 8 16 13 T 13 14 133599 CASAVA_Build 10 53340008 1I TCACATAGGT -/G AAATCCAGTG 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 G 0 1 133600 CASAVA_Build 10 53344059 1I AAATAAAAAC -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 7 8 133601 CASAVA_Build 10 53348614 1D TTTTCAACTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 9 8 133602 CASAVA_Build 10 53352033 1D39M1I TATATTAGTA TTTTTGTATCTTCTCTCTCTTTTTTTCTTGGTTAGCCTTG-/-TTTTGTATCTTCTCTCTCTTTTTTTCTTGGTTAGCCTTGC TAGGGATTTA 3070 hom 97 het 33 0 42 5 N/A 0 0 133603 CASAVA_Build 10 53354982 4I TTTGTCTGTT ----/TGTC TGGCAAGAAG 3070 hom 115 het 45 0 37 8 TGTC 0 1 133604 CASAVA_Build 10 53369359 1D ATAAACTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 8 T 13 12 133605 CASAVA_Build 10 53381453 1I GACAGAAAGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 8 9 133606 CASAVA_Build 10 53384815 4D TTTCAGGTTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 15 19 10 TG 8 6 133607 CASAVA_Build 10 53386479 4I TATAAAACTC ----/CTCT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 CT 5 7 133608 CASAVA_Build 10 53391161 1D TGAAAAAAAA G/- AATCTGCATT 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 G 1 0 133609 CASAVA_Build 10 53400849 1D CTAAACAAAA G/- AAGAACAGAG 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 G 1 0 133610 CASAVA_Build 10 53404348 1D ATATTCCCTC T/- CTTTCATATG 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 T 1 0 133611 CASAVA_Build 10 53408185 1D CTTAGGATTG C/- CTTGGCCATT 3070 het 3070 ref 38 16 12 11 C 2 1 133612 CASAVA_Build 10 53419360 1I CAATGATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 11 12 133613 CASAVA_Build 10 53424843 1D GAGGTTAAAT A/- ACTTGCTTAT 3070 het 3070 hom 64 28 31 5 A 2 1 133614 CASAVA_Build 10 53426855 1D AATAGAGAGC A/- AGAATGTTGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 1 133615 CASAVA_Build 10 53428776 1I CTTTCTAACA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 T 6 7 133616 CASAVA_Build 10 53435864 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAACA 1318 het 1318 ref 43 20 5 18 AAC 1 0 133617 CASAVA_Build 10 53437154 2D GACCCACCTC AT/-- ATACAATAAC 3070 het 3070 hom 43 13 25 6 AT 2 1 133618 CASAVA_Build 10 53437347 1I ACCTAACTAT -/C CTAAATATAT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 C 1 2 133619 CASAVA_Build 10 53448740 1I ATTTATGAAG -/A AAAAGGGTTC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 4 5 133620 CASAVA_Build 10 53449858 2I AGTTTCTGAG --/TT TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 T 7 9 133621 CASAVA_Build 10 53460828 1D CTCAAACTTT A/- AAAAAAAAAA 779 het 779 ref 44 34 3 8 A 11 10 133622 CASAVA_Build 10 53479825 2D GAGTGTGTTC AT/-- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 hom 64 27 34 6 AT 1 0 133623 CASAVA_Build 10 53481743 3D GAAAGATGTT CTC/--- CTCTCCCGCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 7 CTC 2 1 133624 CASAVA_Build 10 53482996 1I ATAAGAAATA -/C CTTTTTTATT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 2 133625 CASAVA_Build 10 53489203 1D TCATTCAATG A/- AAATATTAGT 3070 hom 114 het 46 0 39 9 A 4 3 133626 CASAVA_Build 10 53511646 1D CCTGACAATA G/- GGGTCTCATT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 G 4 3 133627 CASAVA_Build 10 53516105 1D AAAAGTAGCA C/- ACTATACACT 2486 het 2486 ref 26 18 6 2 C 1 0 133628 CASAVA_Build 10 53516174 3D ATAGGTATGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 915 hom 32 6 10 17 T 17 14 133629 CASAVA_Build 10 53528968 1I TGTAATCTCA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 7 8 133630 CASAVA_Build 10 53531128 1I ACATTATATA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 6 7 133631 CASAVA_Build 10 53534882 5D TTAAAATCTT AAAAG/----- GAAGAACTTA 3070 het 3070 hom 31 12 18 2 AAAAG 1 0 133632 CASAVA_Build 10 53534957 1D GAGACAACTG T/- TTTTTTTTTT 706 het 706 ref 38 32 3 3 T 11 10 133633 CASAVA_Build 10 53535725 1D AGTCTTTTAT C/- CCCCCACTCC 3070 het 3070 ref 33 13 14 7 C 6 5 133634 CASAVA_Build 10 53538677 1D ACTGCAACCT A/- CTGCCTCCCA 3070 hom 79 het 31 0 26 5 A 1 0 133635 CASAVA_Build 10 53554414 6D CAATAATAAA TTAACT/------ TTAGCTTATT 3070 het 3070 ref 37 21 13 4 TTAACT 1 0 133636 CASAVA_Build 10 53570578 1I ACATGCACCC -/A AATGGTGATT 3070 het 3070 hom 53 20 24 9 A 2 3 133637 CASAVA_Build 10 53572816 2D GTGTTATGAT AA/-- AAAAAAATAG 3070 hom 120 het 44 0 40 6 A 9 7 133638 CASAVA_Build 10 53574505 1D ATTGCTTGAA C/- CCAGGAGGTG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 3 2 133639 CASAVA_Build 10 53580783 1D TTTGATAGGA T/- TTTTTTGCCA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 7 6 133640 CASAVA_Build 10 53583835 3D TATTCAAAAT GGA/--- ACAAGTGATG 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 GGA 1 0 133641 CASAVA_Build 10 53584950 1D CTGAAATCCC A/- GTACTACTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 1 0 133642 CASAVA_Build 10 53596002 1I TTAATAAACA -/T TTAGAAATTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 2 3 133643 CASAVA_Build 10 53600645 3D GGTTGCTCTT CGG/--- CGGCTTTCAG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CGG 2 1 133644 CASAVA_Build 10 53600892 2D TATTGGTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 2405 het 100 hom 23 1 9 13 T 14 12 133645 CASAVA_Build 10 53601487 1D TTGCTTTTTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 9 8 133646 CASAVA_Build 10 53603874 1I AGGTTTTTTT -/A AATTTATTTT 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 A 2 3 133647 CASAVA_Build 10 53625000 1D CCTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 11 10 133648 CASAVA_Build 10 53628861 1D TTGCTCTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 9 8 133649 CASAVA_Build 10 53635877 1D TTTTTAATTC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 6 133650 CASAVA_Build 10 53644999 1I CATCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 het 311 hom 16 2 8 6 A 4 5 133651 CASAVA_Build 10 53647107 4I CACATTTATA ----/TATC TATCTATCTA 3070 hom 7 het 26 1 15 10 TATC 3 4 133652 CASAVA_Build 10 53648979 1I CATGTGCAAC -/A TATTTACAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 0 1 133653 CASAVA_Build 10 53649750 1D ATTTGCCTCT G/- TAAATAAATA 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 G 1 0 133654 CASAVA_Build 10 53650716 1I GATATTTCTG -/T TTTTTAGGTG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 5 6 133655 CASAVA_Build 10 53650832 1I GCATCTGTTA -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 7 8 133656 CASAVA_Build 10 53656551 1I GGAACAGGTC -/A AAAATCCATG 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 4 5 133657 CASAVA_Build 10 53662951 1D AAAGGGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1072 hom 31 4 15 12 A 13 12 133658 CASAVA_Build 10 53674299 2I CAAAAAGTTG --/CA CAATGAGGCA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 CA 1 2 133659 CASAVA_Build 10 53676742 5D AATCAGACAT ATTTG/----- ATTTGAGAAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 ATTTG 2 1 133660 CASAVA_Build 10 53679604 1I TAAAAAAAAC -/A AAAAAGCAAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 4 A 5 6 133661 CASAVA_Build 10 53683287 5I CATATAAAAG -----/TTAGC TTAGTTTAAA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TTAGC 0 1 133662 CASAVA_Build 10 53683696 1I ACACACTGTA -/G GACAATCAGA 3070 hom 138 het 49 0 43 6 G 1 2 133663 CASAVA_Build 10 53688888 1I TAGACTTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 13 14 133664 CASAVA_Build 10 53690494 5I GTGAAAAAAA -----/TAACT TAAAGTGTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TAACT 0 1 133665 CASAVA_Build 10 53693875 1I79M2I ACTGCTGCAG -AACAGGATGTCTACATTGCTTTCTGAACGTAGAATCTAAGGCCAGTGTCCTACAGGGCTGTGAAGAGCTTTCTGGCAAC--/AAAAAGGATGTCTACATTGCTTTCTGAACGTAGAATCTAAGGCCAGTGTCCTACAGGGCTGTGAAGAGCTTTCTGGCAACAG GGGAATATTG 3070 het 3070 hom 36 12 20 34 N/A 0 0 133666 CASAVA_Build 10 53694169 1D CCCCTCCAGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 T 9 8 133667 CASAVA_Build 10 53699794 1I GTTTGAGAAG -/A AAAAACAAAC 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 A 5 6 133668 CASAVA_Build 10 53700662 1D AAAAAAAGAT A/- AAAAAAATTA 2262 het 2262 ref 19 12 6 1 A 8 7 133669 CASAVA_Build 10 53700991 2D AAGGATTTAC TG/-- TGTTTTGACT 3070 het 3070 ref 48 25 21 4 TG 2 1 133670 CASAVA_Build 10 53702531 4I TGTTAGAATT ----/AGAC AGCTCTGTAG 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 AGAC 0 1 133671 CASAVA_Build 10 53711218 1D TGGATCTGTT A/- ACAGCTTGAT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 2 1 133672 CASAVA_Build 10 53733886 4D CCCACCTTGG CCTC/---- CAATATTATA 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 CCTC 1 0 133673 CASAVA_Build 10 53754485 2D TCTCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 339 het 339 ref 17 5 2 10 T 20 18 133674 CASAVA_Build 10 53775013 1D GTATATATAT C/- CTGGAAACTA 3070 hom 42 het 18 0 15 4 C 2 1 133675 CASAVA_Build 10 53813612 4D GGTAGGAAAG AATA/---- AAGTCTGGCA 3070 hom 52 het 21 0 18 3 AATA 1 0 133676 CASAVA_Build 10 53816915 4D TATATATACA ATAT/---- ATATATTCAG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AT 5 3 133677 CASAVA_Build 10 53819344 1I TAGTATAATG -/T TATCTCCAGT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 1 2 133678 CASAVA_Build 10 53821428 3D GAGTCCTCAA AAG/--- AAGGAGACCC 3070 hom 114 het 43 0 39 5 AAG 2 1 133679 CASAVA_Build 10 53828791 1D CTGGAAAGAA C/- TGAGATCCTA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 C 1 0 133680 CASAVA_Build 10 53828945 1I GCTGTCCTTG -/C CCGGGGAAGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 2 3 133681 CASAVA_Build 10 53833835 1I TGGTATCTCA -/T TCTGGTTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 1 2 133682 CASAVA_Build 10 53843284 8D AAAAACAGGC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3011 het 1728 hom 20 7 7 7 T 20 12 133683 CASAVA_Build 10 53850003 1D TTTAAACCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 15 14 133684 CASAVA_Build 10 53853500 1D TTCTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 10 14 A 15 14 133685 CASAVA_Build 10 53861338 1I GCTTTGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 11 12 T 11 12 133686 CASAVA_Build 10 53861474 1I TGTTTGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 11 12 133687 CASAVA_Build 10 53867317 1D CCATGCATTG T/- TAAGGTCCTA 3070 het 3070 hom 54 23 22 9 T 2 1 133688 CASAVA_Build 10 53873639 1D GCCAACTATT G/- GCTAAAGAAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 2 1 133689 CASAVA_Build 10 53891895 4D CACAAAAGAA TGGC/---- TTGAAACAAT 3070 het 3070 hom 42 16 22 6 TGGC 1 0 133690 CASAVA_Build 10 53895583 1I GAAGGTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 11 12 133691 CASAVA_Build 10 53912693 4D TCCCTAAATG GGTT/---- TTAGATCATC 3070 hom 90 het 32 0 28 5 GGTT 1 0 133692 CASAVA_Build 10 53914532 1D AATAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 18 7 A 11 10 133693 CASAVA_Build 10 53920104 1D TGTACTTCAA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 7 133694 CASAVA_Build 10 53921212 1I AATGAGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 11 12 133695 CASAVA_Build 10 53921706 1I TTCATGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 263 hom 37 1 33 3 A 10 11 133696 CASAVA_Build 10 53926900 2D TTTCCCACTT TA/-- TGTTTTTGTT 3070 hom 45 het 17 0 16 2 TA 1 0 133697 CASAVA_Build 10 53940409 1D TTTAAAGCCA G/- GCTTGTTTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 2 1 133698 CASAVA_Build 10 53944321 2I ACTTAGGGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 11 13 133699 CASAVA_Build 10 53947659 15D TCTGGTATAT TGGTCTAGATCCCAA/--------------- ATTACCAAAA 3070 hom 57 het 19 0 20 1 TGGTCTAGATCCCAA 1 0 133700 CASAVA_Build 10 53951494 12I TGGTTTTTCA ------------/CAGTTTGCTTTT CATTTAAGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CAGTTTGCTTTT 0 1 133701 CASAVA_Build 10 53951801 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 13 11 A 12 11 133702 CASAVA_Build 10 53960416 5I TAAATAAATT -----/AAGTA AAGTGTCAGG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 AAGTA 0 1 133703 CASAVA_Build 10 53964759 4D CATCATAAGT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 85 het 39 0 25 15 CA 11 9 133704 CASAVA_Build 10 53966874 1D GTAATTTTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 56 het 26 0 19 7 T 8 7 133705 CASAVA_Build 10 53971211 1I CAAGGGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 23 17 13 T 10 11 133706 CASAVA_Build 10 53977299 2I GCTCTATGTG --/AA AAAGCCATTG 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 A 3 5 133707 CASAVA_Build 10 53981826 2D TGGCTATGTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 70 het 40 0 29 11 AT 9 8 133708 CASAVA_Build 10 53990226 2D TTTGTATATA AT/-- ATATATATAT 1420 het 1257 hom 8 3 4 1 AT 8 7 133709 CASAVA_Build 10 54004828 1I AATGATTAGG -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 7 8 133710 CASAVA_Build 10 54007857 4I GTAGCTAAAC ----/TTTA TTTAGTATTC 3070 het 3070 hom 48 16 27 5 TTTA 1 2 133711 CASAVA_Build 10 54014262 1I CTCCACCAGC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 9 133712 CASAVA_Build 10 54017307 1I ACTTTTCATG -/T TTGTTGATCT 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 T 2 3 133713 CASAVA_Build 10 54017373 1D TTATTATTTC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 8 7 133714 CASAVA_Build 10 54031376 3I AATTTCTTGC ---/TCT TCTTTGCATT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 TCT 1 2 133715 CASAVA_Build 10 54033595 4I ATAGTTATGA ----/AAGT AAGCATCATA 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 AAGT 0 1 133716 CASAVA_Build 10 54048568 1D CTAATAAATG T/- TTTTTTTTTT 1911 het 1911 ref 39 25 6 8 T 15 14 133717 CASAVA_Build 10 54068272 2D AAAAACAAAC AA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 83 het 31 0 29 2 A 10 8 133718 CASAVA_Build 10 54070264 2D ATAAAATCTA CC/-- CCCCCCCGAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 9 7 133719 CASAVA_Build 10 54074034 1D AAAACACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 37 2 28 7 T 13 12 133720 CASAVA_Build 10 54076542 1I TTGCTCGTGT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 133721 CASAVA_Build 10 54077052 1D AGATCTTCAA T/- TAAAATAGCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 2 1 133722 CASAVA_Build 10 54079816 4D ATAATTACTT TCTC/---- TCTTTCTATT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 TC 3 1 133723 CASAVA_Build 10 54081363 5D GGCAGAGGAC AAATT/----- GTGGATCATA 3070 het 3070 hom 50 20 28 4 AAATT 1 0 133724 CASAVA_Build 10 54081868 1D TTGTTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 13 12 133725 CASAVA_Build 10 54082760 1D GGAAATCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 712 hom 34 3 15 17 A 18 17 133726 CASAVA_Build 10 54088229 2I AATATTCCAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 47 12 22 13 TG 7 8 133727 CASAVA_Build 10 54097526 1D GAATTTTGAA T/- TGATAGAACT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 133728 CASAVA_Build 10 54098148 1I ACAGATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 37 1 29 7 A 11 12 133729 CASAVA_Build 10 54115689 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 958 hom 16 2 11 3 A 9 10 133730 CASAVA_Build 10 54116686 4I TGTCTCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAAC 2 3 133731 CASAVA_Build 10 54145383 1D ACGCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 23 2 16 5 A 17 16 133732 CASAVA_Build 10 54148629 5D TGGGATTATT TAAAC/----- TAAAGAGATT 3070 hom 81 het 29 0 28 4 TAAAC 1 0 133733 CASAVA_Build 10 54154774 1D CAAATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 613 hom 24 2 18 5 A 14 13 133734 CASAVA_Build 10 54156035 3I ATCAACAAGA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAC 3 4 133735 CASAVA_Build 10 54167547 1D TACAAAGCTG A/- AAAAAATGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 6 133736 CASAVA_Build 10 54169238 1I TCAGGCTTGT -/G GGGGGGGTTG 3070 hom 70 het 27 0 23 4 G 7 8 133737 CASAVA_Build 10 54174823 1I ATGGTGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 9 10 133738 CASAVA_Build 10 54175101 4D TATATTTGAG TCCT/---- TGTGGACAAA 3070 het 3070 ref 29 20 8 5 TCCT 1 0 133739 CASAVA_Build 10 54175580 1I GAAAGTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3018 het 3018 ref 23 8 8 7 T 10 11 133740 CASAVA_Build 10 54199682 2D GACATGAGTC TA/-- TTACCCCACT 3070 het 3070 ref 58 32 22 4 TA 1 0 133741 CASAVA_Build 10 54201793 6D TAGGAGCTTC CTCTTT/------ CTCTCCATGT 3070 het 3070 ref 48 28 21 2 CTCTTT 1 0 133742 CASAVA_Build 10 54206716 1D TTCCCTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 11 12 A 12 11 133743 CASAVA_Build 10 54222261 1D AACATATAAC A/- AGTAAAGTGA 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 A 2 1 133744 CASAVA_Build 10 54226516 1D ATGTGGGCTC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 8 7 133745 CASAVA_Build 10 54227033 1D TATAAGGGGT A/- TTTTCCCCCT 3070 hom 132 het 48 0 42 7 A 1 0 133746 CASAVA_Build 10 54229406 1D TAAGTGGAGC A/- TTTACATTCA 2694 hom 15 het 11 0 6 5 A 1 0 133747 CASAVA_Build 10 54229465 1D39M1D ATGCTATTTG TTTTTCTGAACACCTTGTTTATTTATTTATTTGTTTGTTTG/-TTTCCTGAACACCTTGTTTATTTATTTATTTATTTGTTT- TTTTGTTGTT 3070 hom 21 het 13 0 8 10 N/A 0 0 133748 CASAVA_Build 10 54282591 1I TTTAAAATCC -/T TTTGCAACAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 3 4 133749 CASAVA_Build 10 54290121 2I GTGTACAGAC --/AA AGAGTAGTAG 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 1 3 133750 CASAVA_Build 10 54293126 2I TGGGGCTAAT --/AA CATCAGTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 0 2 133751 CASAVA_Build 10 54302329 1D GTTCAGAGCC G/- TCACATAGAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 1 0 133752 CASAVA_Build 10 54303034 1I CCTCAAACTT -/A ACTGCCTCAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 1 2 133753 CASAVA_Build 10 54308779 2D TTTAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTGA 3070 hom 123 het 42 0 41 2 AT 1 0 133754 CASAVA_Build 10 54310359 1I CATGTAAATA -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 2 133755 CASAVA_Build 10 54313079 4D GTATTTATAA AAAG/---- AAAGAGACAG 3070 hom 99 het 36 0 34 4 AAAG 2 1 133756 CASAVA_Build 10 54315342 1D13M1I AAAACAAAAC AAAAAAAAAACAAC-/-AAAAAAAAACAACA AAAAAAAAGA 3070 hom 120 het 42 0 41 4 N/A 0 0 133757 CASAVA_Build 10 54327010 1D CTATTCTCTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 9 8 133758 CASAVA_Build 10 54327310 2D GTCACCCAGG CT/-- CTTGAGTGTG 3070 hom 111 het 40 0 36 5 CT 2 1 133759 CASAVA_Build 10 54332680 3I AAAAAAAAAA ---/GAG AGAGAGAGAG 2976 het 194 hom 17 1 12 4 GAG 0 1 133760 CASAVA_Build 10 54335941 1D TTTACTCATT A/- AATAGAATTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 3 2 133761 CASAVA_Build 10 54340725 1I TTCTAGTCCC -/A AGTTTCCATT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 1 2 133762 CASAVA_Build 10 54351168 2D TTGGTAGTGA TC/-- TTTTATGACT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 TC 1 0 133763 CASAVA_Build 10 54353909 1I TCATGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 34 0 31 3 A 10 11 133764 CASAVA_Build 10 54354586 1D CAATCGCTTT G/- TGCGCCAGCC 3070 hom 80 het 35 0 22 14 G 1 0 133765 CASAVA_Build 10 54356334 1I ATACCCAGTA -/G TTGGATTGCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 0 1 133766 CASAVA_Build 10 54360691 1D GTTTTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 1848 het 1848 ref 43 28 5 10 T 13 12 133767 CASAVA_Build 10 54363332 1D AGTATGCTTC T/- TTTTTTTTTT 1692 het 1692 ref 46 19 6 21 T 17 16 133768 CASAVA_Build 10 54369599 1I GGCACTTCTG -/C CTTCGCCCCA 3070 hom 100 het 37 0 33 4 C 1 2 133769 CASAVA_Build 10 54380429 1D ACTTCGTAGC A/- AATTCTCTAT 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 A 3 2 133770 CASAVA_Build 10 54391073 5D TGCTGTTATA TAACT/----- GTTCTCTGGG 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TAACT 1 0 133771 CASAVA_Build 10 54394662 3D CTCTTCTCTC CTT/--- CTCATTGCCC 3070 hom 140 het 52 0 44 10 CTT 1 0 133772 CASAVA_Build 10 54399528 1D AAAAATCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 335 hom 20 2 12 6 T 13 12 133773 CASAVA_Build 10 54408418 1I CCTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 634 hom 36 2 30 4 T 10 11 133774 CASAVA_Build 10 54410552 1I CTTTGGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 174 hom 29 1 21 7 T 10 11 133775 CASAVA_Build 10 54412596 4I CTCCTCACTC ----/CAAT CAATCATGGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 CAAT 1 2 133776 CASAVA_Build 10 54413089 1D ATGCCAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 25 1 16 8 T 13 12 133777 CASAVA_Build 10 54414541 1I GGGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 340 hom 47 1 37 9 A 9 10 133778 CASAVA_Build 10 54420208 1D GGTCTATAGC A/- AACACTAGTA 3070 hom 114 het 40 0 38 3 A 3 2 133779 CASAVA_Build 10 54421819 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 4 CT 2 1 133780 CASAVA_Build 10 54423654 1D AAGAAGCCTC A/- AGGGGGAATA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 1 133781 CASAVA_Build 10 54430366 1I ACATTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 941 hom 36 5 19 12 T 13 14 133782 CASAVA_Build 10 54445107 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 4 5 133783 CASAVA_Build 10 54466805 1D AGAGAAGCAG C/- TATTTAAATA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 1 0 133784 CASAVA_Build 10 54474703 1D19M1D AGGCATACAA GGAAAGATCAAGGTTAAAATA/-GAAAGATCAAGGTTAAAAT- AAAACAGAAT 3070 hom 63 het 29 0 22 9 N/A 0 0 133785 CASAVA_Build 10 54474768 1D ACTGACAAAA G/- CTAAAAAGAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 G 1 0 133786 CASAVA_Build 10 54474882 1D TAAGATTTCT G/- GGAAAATTAA 3070 hom 36 het 22 0 13 10 G 3 2 133787 CASAVA_Build 10 54477476 1D GAAGATACTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 9 8 133788 CASAVA_Build 10 54477571 1D GGCTAAATAG C/- ATTATTGATT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 1 0 133789 CASAVA_Build 10 54479394 1D TATCTTCAAC T/- TTTATCCACC 3070 het 3070 ref 42 22 19 2 T 4 3 133790 CASAVA_Build 10 54485806 1D9M1D ATAAGGCAAA GTAAAAATTTG/-TAAAAATTT- TTATTTTACC 2656 hom 24 het 18 0 9 17 N/A 0 0 133791 CASAVA_Build 10 54486327 1D TATTATTGTA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 8 7 133792 CASAVA_Build 10 54489361 1D CAGGTTGCTG C/- AAAAGTCATT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 C 1 0 133793 CASAVA_Build 10 54489664 3I TTAAAACCAC ---/TTG TTGTGAATGG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTG 1 2 133794 CASAVA_Build 10 54489824 1D TTTGATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 11 10 133795 CASAVA_Build 10 54491146 1D AAAACACCTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 9 8 133796 CASAVA_Build 10 54491672 1D GAGCTGTGAG C/- ACAAAAGCAT 3070 hom 126 het 45 0 43 3 C 1 0 133797 CASAVA_Build 10 54493552 1D AAATGTATTC T/- TTGGTCATAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 3 2 133798 CASAVA_Build 10 54494648 1D CTAGGCTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 43 0 32 12 T 10 9 133799 CASAVA_Build 10 54497133 1D ATAACACAAT A/- AAAAATCTGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 6 5 133800 CASAVA_Build 10 54499551 1I TACCACATAG -/A AAAAAACCCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 6 7 133801 CASAVA_Build 10 54504224 1D ACAAAAGCAG T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 T 7 6 133802 CASAVA_Build 10 54509124 1D AGAAAAAAAG C/- ACCACATATT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 C 1 0 133803 CASAVA_Build 10 54512270 1I GTGACTCTTA -/T TTTTGTGAGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 4 5 133804 CASAVA_Build 10 54512710 1I TTCAAAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 661 hom 21 2 13 6 T 10 11 133805 CASAVA_Build 10 54530347 1D TTTTTTTGAG T/- ACGGAGTCTC 1758 hom 29 het 20 0 11 9 T 1 0 133806 CASAVA_Build 10 54537724 1D GGTTAACAAA C/- CCTTGCAAGC 3070 hom 88 het 37 0 29 8 C 3 2 133807 CASAVA_Build 10 54538399 1D AATTATAGAG A/- AAAGACCTGG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 4 3 133808 CASAVA_Build 10 54548270 1D8M1D AGCCCTTCCC GAAAACTAAC/-AAAACTAA- ACCACCTTTG 3070 hom 57 het 23 0 18 7 N/A 0 0 133809 CASAVA_Build 10 54548337 1D6M1D AGGGCCCTAA GATTTCAG/-ATTTCA- CTAAGATGCA 345 hom 13 het 22 0 4 23 N/A 0 0 133810 CASAVA_Build 10 54553346 4D AGCTGCTCTT TGTC/---- AGTCAGTGGA 3070 hom 132 het 47 0 45 4 TGTC 1 0 133811 CASAVA_Build 10 54553648 1D ACCTCCACTT G/- GTTCAGCTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 2 1 133812 CASAVA_Build 10 54553742 2I TTTGTGTTAA --/GG GGTACATGAG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 2 4 133813 CASAVA_Build 10 54554151 1I7M1D AGTACTGTCC -CCCCAATG/TCCTCAAT- GAGGCAGCCA 3070 hom 98 het 35 0 31 6 N/A 0 0 133814 CASAVA_Build 10 54554217 8D TCCAGCCAAG GAAGATAA/-------- AAGGAAGAAT 3070 hom 57 het 25 0 20 6 GAAGATAA 1 0 133815 CASAVA_Build 10 54554537 1I CTCTGCTGAA -/G GAAAACTCTT 1783 hom 15 het 32 0 6 26 G 1 2 133816 CASAVA_Build 10 54554693 3D AAGAAGGAAG TAA/--- TAATAATAAT 3070 hom 72 het 36 0 25 13 TAA 5 4 133817 CASAVA_Build 10 54554820 19I ATATTATATT -------------------/CTCTTCTATTATTAGATAA ATCCTACTGG 3070 hom 90 het 31 0 31 3 CTCTTCTATTATTAGATAA 0 1 133818 CASAVA_Build 10 54562165 1D CAATAACTTA C/- ATTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 C 1 0 133819 CASAVA_Build 10 54565667 1D TTTTCCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 11 10 133820 CASAVA_Build 10 54566925 1D GCAAAAGTCT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 2 1 133821 CASAVA_Build 10 54569453 1D AAGCCCAGCT G/- GGCACCTCCT 3070 hom 66 het 23 0 23 1 G 3 2 133822 CASAVA_Build 10 54570235 2D AACCTTAGTT NN/-- TATAGTTTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 N 2 0 133823 CASAVA_Build 10 54574627 1D TATAATAAAA T/- TAGTCTTGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 1 133824 CASAVA_Build 10 54575461 1D TCATCCATGT G/- CCCTGGCAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 1 0 133825 CASAVA_Build 10 54576323 1D TTGAGTTAAT C/- TTTTGTGTAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 1 0 133826 CASAVA_Build 10 54576667 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTACTA 3070 het 3070 ref 24 13 7 5 T 7 6 133827 CASAVA_Build 10 54582365 1D ATTCTACCAA T/- TTTTAAAACA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 5 4 133828 CASAVA_Build 10 54582528 5D TTAAGATATT AAATA/----- AAATATTAGA 3070 het 3070 hom 33 13 19 4 AAATA 2 1 133829 CASAVA_Build 10 54583368 1I CATTACAAAC -/T TTTAAGTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 3 4 133830 CASAVA_Build 10 54583749 2D GAGTTGAGAG AA/-- ATTCCTCTTG 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 A 3 1 133831 CASAVA_Build 10 54584006 1D AAAAAAAAAT A/- AACTATAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 3 2 133832 CASAVA_Build 10 54584210 17I TCTGAAACAT -----------------/AAAAAATTTTAAAAATA TAAAAATTCT 3070 hom 51 het 18 0 18 1 AAAAAATTTTAAAAATA 0 1 133833 CASAVA_Build 10 54584692 2D AGCAATGGGC TA/-- TATATATAGT 3070 hom 196 het 75 0 66 9 TA 5 4 133834 CASAVA_Build 10 54585237 1I AAGAGAAAGA -/G GTACAAAGAG 3070 het 2759 hom 21 7 11 3 G 1 2 133835 CASAVA_Build 10 54585886 4I CACATGTTTT ----/ACAA ACAGTTTGTG 1506 het 1506 ref 12 7 5 0 ACAA 0 1 133836 CASAVA_Build 10 54590218 2I GACAGTTGGG --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 8 10 133837 CASAVA_Build 10 54590946 1D ACTGGTGCAC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 9 het 43 1 39 4 A 8 7 133838 CASAVA_Build 10 54595521 5I TTATTTCTAG -----/AAAAT AAAAGCAACA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 AAAAT 0 1 133839 CASAVA_Build 10 54596399 1D AAAACTAATT A/- AAAAGCAAGC 3070 het 3070 hom 35 13 20 3 A 5 4 133840 CASAVA_Build 10 54600087 18D AGAGCTAACC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 2994 het 1682 hom 26 8 10 11 T 30 12 133841 CASAVA_Build 10 54600373 2I AATCTAAAAC --/AT GTGCTCTATG 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 AT 0 1 133842 CASAVA_Build 10 54602315 1D TTTTAAAAGC A/- GTAAGTATAT 3070 het 3070 ref 31 13 12 9 A 1 0 133843 CASAVA_Build 10 54602502 2D AAATACATTG TT/-- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 16 6 T 8 6 133844 CASAVA_Build 10 54603385 1D TACCTAATAG A/- AAAAAATGGG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 7 6 133845 CASAVA_Build 10 54603806 1I CTTTGTAGTC -/A GTCTCCAGTT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 A 0 1 133846 CASAVA_Build 10 54605451 1D AAGTTTATAT G/- GGGAGATAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 4 3 133847 CASAVA_Build 10 54607006 1D85M1D CTACTACATT CTTGCTGTGAACTTAGAACTGCTCTAAAAAAAAAGTCTATTAAAAACATTTTAAAAAAAGATAGCAATTTGTGTTTCAGTTAGCTTC/-TTGCTGTGAACTTAGAACTGCTCTAAAAAAAAAGTCTATTAAAAACATTTTAAAAAAAGATAGCAATTTGTGTTTCAGTTAGCTT- TTGCTGTGTA 3070 hom 108 het 39 0 35 27 N/A 0 0 133848 CASAVA_Build 10 54607241 1D CCAAAAAGTG A/- AATCTAATTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 3 2 133849 CASAVA_Build 10 54610023 1D TCAAATTGCA T/- TTTTTTCTCA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 7 6 133850 CASAVA_Build 10 54613101 2D AACTATTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 89 hom 40 1 34 6 A 12 10 133851 CASAVA_Build 10 54618969 2I CATGTAAAAC --/TG TGAGTCAATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TG 1 2 133852 CASAVA_Build 10 54620439 1D TTAAACTGTA T/- TCATTACTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 1 133853 CASAVA_Build 10 54625089 11I10M1I ATTTTCTGGT -----------ATTTATCTAG-/AAATACCAGAAAATTATCTAGT TTTTTTTTTC 3070 het 97 hom 39 1 36 3 N/A 0 0 133854 CASAVA_Build 10 54627370 1D GGGTAATTTT C/- TTCTTTTGCT 3070 hom 72 het 27 0 25 5 C 1 0 133855 CASAVA_Build 10 54627664 5D ACTTGGATTC TACAT/----- TACATAAGTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 TACAT 2 1 133856 CASAVA_Build 10 54628089 2I TAACTTTGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 29 1 17 11 T 10 12 133857 CASAVA_Build 10 54631676 4D ATTGTGTATG TGCT/---- TTGGTATTTA 3070 hom 120 het 43 0 40 4 TGCT 1 0 133858 CASAVA_Build 10 54633008 1I TAGAAAATCC -/A AAAGAGTCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 3 4 133859 CASAVA_Build 10 54633646 1D ATCTTTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 30 1 24 5 A 13 12 133860 CASAVA_Build 10 54642397 1D CTACAGTGAG T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 6 133861 CASAVA_Build 10 54645473 1D GCTTTAAAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 533 hom 40 2 33 5 T 10 9 133862 CASAVA_Build 10 54653506 1D AGATAAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 10 9 133863 CASAVA_Build 10 54657358 1D CCTAAAAGAA G/- ATGGATAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 1 0 133864 CASAVA_Build 10 54657529 2D AAAAAAAAAA AG/-- GGGGAAATAA 3070 hom 35 het 39 1 30 10 AG 1 0 133865 CASAVA_Build 10 54665880 1D TGCATCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 11 10 133866 CASAVA_Build 10 54682397 7I TTGCTTCTCC -------/TTGATCT TTGATCTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 TTGATCT 1 2 133867 CASAVA_Build 10 54693458 2D AAAAAAAAAA AG/-- AGCATACCTT 3070 hom 75 het 31 0 24 8 AG 2 1 133868 CASAVA_Build 10 54699327 1D CTCCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 41 2 31 9 A 12 11 133869 CASAVA_Build 10 54700045 1D TATTCTAAGA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 10 9 133870 CASAVA_Build 10 54706078 2D ATAGCAGTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 25 9 A 12 10 133871 CASAVA_Build 10 54706323 1I AAACAAACCT -/A AAAATTCATC 3070 hom 55 het 26 0 19 7 A 4 5 133872 CASAVA_Build 10 54708094 5D AAGGGATTCA TTATT/----- TTATTTTTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TTATT 2 1 133873 CASAVA_Build 10 54708946 1D ACATAGCTTT A/- ACCCCATAAG 3070 hom 123 het 45 0 42 7 A 2 1 133874 CASAVA_Build 10 54712523 1I TAACAAGGAA -/T ATTTTTTTTT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 0 1 133875 CASAVA_Build 10 54713519 2D TTTTATAAAC AG/-- AGAAAAATGC 3070 hom 58 het 24 0 21 3 AG 2 1 133876 CASAVA_Build 10 54715590 1D TATGTATATG T/- TTTTTTCAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 7 6 133877 CASAVA_Build 10 54719526 4I ATCATTGATC ----/TGGA TGGAGCTAAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TGGA 1 2 133878 CASAVA_Build 10 54719701 4D TTTTGATATG ATAA/---- ATATTTTACT 3070 hom 57 het 23 0 20 5 ATAA 1 0 133879 CASAVA_Build 10 54721364 1D GAATTAACTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 26 het 32 1 29 2 A 10 9 133880 CASAVA_Build 10 54721493 1I TATTGAGTCA -/T TCTACTTGAC 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 1 2 133881 CASAVA_Build 10 54725734 1I GTTAAAAAGA -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 0 1 133882 CASAVA_Build 10 54726196 1I GTCCCCGACC -/T TTTTTGGCAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 5 6 133883 CASAVA_Build 10 54726590 6D AGGATATTCC ATCTTG/------ ACCTTGACTT 3070 hom 77 het 27 0 25 3 ATCTTG 1 0 133884 CASAVA_Build 10 54727624 1I GACCCAGCAA -/C CTGGATTGTG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 C 1 2 133885 CASAVA_Build 10 54729008 2D CGTCCAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 24 0 17 9 T 13 11 133886 CASAVA_Build 10 54730814 2I TATAAGAAAA --/AT ATAAGAATAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AT 1 2 133887 CASAVA_Build 10 54731075 4I AAGCTAATAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AC 5 7 133888 CASAVA_Build 10 54731171 1I TCTTTCAGGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 200 hom 33 1 25 7 A 8 9 133889 CASAVA_Build 10 54735540 6I CATAGTTCTA ------/CTATTC TTCTTTTCCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CTATTC 0 1 133890 CASAVA_Build 10 54737343 1D CAGAACCTCC A/- AAAAATAGAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 5 133891 CASAVA_Build 10 54740509 1I AAAATGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1214 hom 42 4 28 10 A 12 13 133892 CASAVA_Build 10 54742494 2I ACATAATATC --/TG TAGGTTCTGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 0 1 133893 CASAVA_Build 10 54745787 1D CCTTTGAGAA G/- TTATTTAACC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 1 0 133894 CASAVA_Build 10 54750724 3I TAAATAATAT ---/ATA ATATAATAAT 2821 hom 21 het 10 0 8 2 ATA 1 2 133895 CASAVA_Build 10 54751786 3I TCTTTGTTTT ---/TAA CTCAAAATGT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TAA 0 1 133896 CASAVA_Build 10 54753668 3D TAAAAATAAT GAC/--- AACAAATTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 10 GAC 1 0 133897 CASAVA_Build 10 54757892 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 32 1 28 3 TC 0 1 133898 CASAVA_Build 10 54765676 6I TCTCATGCTA ------/TGGTTT GTGGCTTAAG 3070 hom 38 het 18 0 11 7 TGGTTT 0 1 133899 CASAVA_Build 10 54787174 1I TTTAAAATGG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 A 7 8 133900 CASAVA_Build 10 54789412 1I TTCTATTTAT -/G TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 0 1 133901 CASAVA_Build 10 54799626 1D ATAAACTGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 10 9 133902 CASAVA_Build 10 54802329 2I ACTATCCTAA --/AT ATATATATAC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AT 4 5 133903 CASAVA_Build 10 54812106 1I ATACAATGTC -/A CAGTGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 A 0 1 133904 CASAVA_Build 10 54819960 1I AATATAGGTA -/G GCACATTATT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 G 1 2 133905 CASAVA_Build 10 54821652 1D AGCAAGAAGT G/- GGAACCTGCT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 G 3 2 133906 CASAVA_Build 10 54851297 1D TTCTGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2042 hom 27 9 10 8 T 16 15 133907 CASAVA_Build 10 54854389 2D TTTTTGTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 1490 het 43 hom 23 0 6 18 TG 9 8 133908 CASAVA_Build 10 54854405 1D TGTGTGTGTG T/- GGGGGGGGTT 3070 het 730 hom 24 2 10 12 T 1 0 133909 CASAVA_Build 10 54855724 1D GGCAAAAAAA G/- GGAGATTGTC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 G 3 2 133910 CASAVA_Build 10 54862712 1I TGAGCTGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 13 14 133911 CASAVA_Build 10 54864976 1I AACATTATGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 8 9 133912 CASAVA_Build 10 54901198 1D CAAGTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 12 11 133913 CASAVA_Build 10 54907101 2D TTTGGCAGAC AA/-- AAGACATGAG 3070 het 3070 hom 55 21 28 7 A 4 2 133914 CASAVA_Build 10 54913473 1D TAAAAAAAAA T/- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 31 11 13 8 T 1 0 133915 CASAVA_Build 10 54920055 1I TGTTAATATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 24 16 13 T 10 11 133916 CASAVA_Build 10 54920792 2D AGTGAAAGTC CT/-- CTGTGTTAAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 CT 2 1 133917 CASAVA_Build 10 54945949 1I ATGCTATGTT -/A TATTTGAGTA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 A 0 1 133918 CASAVA_Build 10 54949370 1D TTGGTAAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 9 19 9 A 9 8 133919 CASAVA_Build 10 54952671 2D GGAATCATAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 11 14 11 TA 7 6 133920 CASAVA_Build 10 54953269 1I GGAGGGGGGG -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 A 6 7 133921 CASAVA_Build 10 54955590 4I CAAATCTGCT ----/AATA AATAAATAAG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AATA 2 3 133922 CASAVA_Build 10 54959085 1I AGCAGAATTG -/T TTTTTGTGTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 5 6 133923 CASAVA_Build 10 54969886 4D31M3I GAATATGAAG ATAAATAGACATTAATTAAAATAATCTTTCAGTGG---/----ATAGACATTAATTAAAATAATCTTTCAGTGGGTT GTTGTAAGTG 3070 het 3070 ref 36 24 20 9 N/A 0 0 133924 CASAVA_Build 10 54972965 1D ATCTCCTTCC T/- TTTTAAGACT 3070 het 3070 hom 31 8 20 4 T 5 4 133925 CASAVA_Build 10 54974646 1I AGAGCAGGAG -/T TCAAAGTTTG 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 T 1 2 133926 CASAVA_Build 10 54988833 1D AGAGAAAAAA G/- AAAACTAGAG 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 G 1 0 133927 CASAVA_Build 10 54989135 1D TTATGATCAG T/- TTTGTTCAAT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 4 3 133928 CASAVA_Build 10 54989426 4D AAGAAACAGC AATT/---- AAACTGACAA 3070 het 3070 ref 42 20 14 14 AATT 1 0 133929 CASAVA_Build 10 54990760 1I AATACAGAAG -/A GCATCTTAAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 0 1 133930 CASAVA_Build 10 54994240 1I ATCCACTGAC -/A GCTTGCCCTG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 0 1 133931 CASAVA_Build 10 54994517 1D GCTGTATTTA C/- CCAATGCCTG 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 C 3 2 133932 CASAVA_Build 10 54995473 1I AGGACATAAC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 6 7 133933 CASAVA_Build 10 54995569 1I TATCAAAAGG -/A TAATCCAGCG 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 A 0 1 133934 CASAVA_Build 10 54995664 2I AAATAGAATT --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 16 18 12 A 8 10 133935 CASAVA_Build 10 54996328 1I AGAATCTATA -/T TGTGAAAATG 3070 het 3070 ref 48 22 20 7 T 1 2 133936 CASAVA_Build 10 54996562 1I CATAGTACTG -/A GCATATAAAT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 0 1 133937 CASAVA_Build 10 54996921 3D AAGATATAGA GAG/--- GAGATCTAAT 932 het 932 ref 13 10 2 3 GAG 2 1 133938 CASAVA_Build 10 54997079 2D AATCAGCAAG AA/-- AAAAACAGAC 1264 het 1264 ref 24 18 4 2 A 7 5 133939 CASAVA_Build 10 54997412 1I TTTGATCCAG -/T AATCCCATTA 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 T 0 1 133940 CASAVA_Build 10 54997479 2D ATGCACACAC AT/-- GTTTATAGCA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 AT 1 0 133941 CASAVA_Build 10 54998027 4D AAATAAATAG AAGT/---- AATAAATGAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 5 AAGT 1 0 133942 CASAVA_Build 10 54998494 2I TAAGTCAAAC --/AG AGAGAGAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 AG 3 4 133943 CASAVA_Build 10 54999064 1D GCTCTTATAA C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 C 8 7 133944 CASAVA_Build 10 55001268 1D AAGTAACCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3016 hom 20 8 9 3 T 11 10 133945 CASAVA_Build 10 55009067 1I TTCAAATATT -/A CAGTTATTTG 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 0 1 133946 CASAVA_Build 10 55010623 2D ATATTTCTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 AT 6 5 133947 CASAVA_Build 10 55013218 1D TCATAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 1241 het 1241 ref 42 33 3 6 A 10 9 133948 CASAVA_Build 10 55013900 1I GATACACAAG -/A ATTGATTAAT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 1 2 133949 CASAVA_Build 10 55015377 3D CCATATACTC GTT/--- GTGAATTCTG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 GTT 1 0 133950 CASAVA_Build 10 55020810 11D GGGTTTTTTG TTTTTTTTGTT/----------- TTTTTTTTGG 3070 het 2809 hom 22 8 12 3 TTTTTTTTGTT 1 0 133951 CASAVA_Build 10 55021618 1D ACCTTTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 12 11 133952 CASAVA_Build 10 55022960 1D AGATTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 T 12 11 133953 CASAVA_Build 10 55026281 2I AATATTTGCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 10 12 133954 CASAVA_Build 10 55026594 1D TTACTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2880 hom 34 12 17 5 A 13 12 133955 CASAVA_Build 10 55049984 2D ATTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAGAG 3070 hom 118 het 45 0 40 6 A 9 7 133956 CASAVA_Build 10 55059518 1D TTAGAAGCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 558 hom 44 2 21 21 A 17 16 133957 CASAVA_Build 10 55062031 28D TATGGTAAAA GTATATATATACATGTGTATATATATAT/---------------------------- GTATATATAT 1948 het 1948 ref 21 6 4 13 GTATATATATACATGTGTATATATATAT 2 1 133958 CASAVA_Build 10 55062619 1I TTATCATTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 9 26 5 T 8 9 133959 CASAVA_Build 10 55066732 3I ATTTTTAATC ---/ATT ATATTGAAAT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 ATT 0 1 133960 CASAVA_Build 10 55080192 1I AGCAACAAAA -/G CTAAATTCCT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 0 1 133961 CASAVA_Build 10 55083093 1D AGTTTGTATC A/- AATGACCCTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 3 2 133962 CASAVA_Build 10 55119741 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 A 13 12 133963 CASAVA_Build 10 55120246 1D ATGTGTTTTA T/- TATCAGGAAA 3070 het 3070 ref 42 20 19 5 T 2 1 133964 CASAVA_Build 10 55143164 1I CCCTCTGAAA -/C CCCTAATATA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 C 3 4 133965 CASAVA_Build 10 55153755 1D AATAAAAAAC A/- ATTGAACAAG 3070 het 3070 ref 46 20 19 8 A 2 1 133966 CASAVA_Build 10 55154775 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 2423 het 1841 hom 16 5 6 5 T 12 11 133967 CASAVA_Build 10 55161627 1I TCTTTCAATG -/C CTGCTGTCTG 3070 het 2048 hom 19 5 12 2 C 1 2 133968 CASAVA_Build 10 55165805 4I ATTAATATAT ----/TAAA TAAAAAACAT 2022 het 1543 hom 14 5 6 3 TAAA 1 2 133969 CASAVA_Build 10 55174236 1I TGCTGGTGGA -/C CTACCATTCT 3070 hom 66 het 26 0 20 6 C 1 2 133970 CASAVA_Build 10 55175360 1D GTACTGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 12 11 133971 CASAVA_Build 10 55180424 1D CAGAGATGGC A/- AAAATACATA 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 A 5 4 133972 CASAVA_Build 10 55184415 1I TCTTCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2413 hom 29 8 15 6 T 13 14 133973 CASAVA_Build 10 55190421 1D AATAGTTATC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 19 8 A 10 9 133974 CASAVA_Build 10 55199521 1D TTTGAAAACT G/- TTCTTGACAA 3070 het 3070 hom 41 16 25 1 G 1 0 133975 CASAVA_Build 10 55211761 1D TTTACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2640 het 2640 ref 32 18 7 8 A 11 10 133976 CASAVA_Build 10 55212307 1I TTGAAAGTAC -/A TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 45 22 21 2 A 0 1 133977 CASAVA_Build 10 55216055 1D CCAAGGAAGA C/- CCCCCCTCCT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 C 7 6 133978 CASAVA_Build 10 55220956 1D AGCGTCTTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 9 8 133979 CASAVA_Build 10 55246931 4D GTTGTTGGTG AGTT/---- AGTTATTTTA 3070 het 3070 ref 43 25 14 5 AGTT 2 1 133980 CASAVA_Build 10 55253547 1D GATTCTTAGC T/- GTATCTGATT 3070 het 3070 hom 52 18 31 3 T 1 0 133981 CASAVA_Build 10 55253911 1D GATTGATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 6 A 11 10 133982 CASAVA_Build 10 55260949 4D GGTACGAGAT AGAC/---- AGACAGATAA 3070 het 3070 hom 61 25 30 6 AGAC 2 1 133983 CASAVA_Build 10 55261467 3D ATAAGCAATA AAG/--- AAGAGGAGTA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 AAG 2 1 133984 CASAVA_Build 10 55264185 4I CCATATTTAT ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 9 22 8 TTTG 1 2 133985 CASAVA_Build 10 55265296 1I CAATGTGAGC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 A 8 9 133986 CASAVA_Build 10 55266281 1D CCTACAGCAC G/- CAGGCCTCTA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 G 1 0 133987 CASAVA_Build 10 55268222 1D CCCAAGTGGC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 7 133988 CASAVA_Build 10 55268690 1I GAATTGATGA -/G GCCAGGCACG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 1 2 133989 CASAVA_Build 10 55269441 1D CTGTTAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 13 12 133990 CASAVA_Build 10 55276298 1D ATTTAACTGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 T 8 7 133991 CASAVA_Build 10 55295516 3I AAGAAAAATA ---/TTT AAGCATTGAT 3070 het 3070 ref 39 25 11 3 T 0 3 133992 CASAVA_Build 10 55300943 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 765 het 765 ref 11 5 4 2 A 15 14 133993 CASAVA_Build 10 55304508 1I CCGTTGAGAT -/A AAAAAAATCA 1687 het 1687 ref 22 13 5 4 A 7 8 133994 CASAVA_Build 10 55305101 4I TAGTAATGGC ----/ATAA ATAAATAATT 2410 het 2410 ref 27 14 7 6 ATAA 2 3 133995 CASAVA_Build 10 55305381 1D TGAACAAAAT A/- AAAAAAAAAG 1270 het 1270 ref 28 19 3 7 A 10 9 133996 CASAVA_Build 10 55305965 1I15M2I TGTTTTTTTG -TTTTTTTTTTGACAC--/TTTTTTTTTTTGACACAG AGTCTTGCTC 3070 het 3070 ref 32 12 14 7 N/A 0 0 133997 CASAVA_Build 10 55306391 1D AAACTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 9 8 A 12 11 133998 CASAVA_Build 10 55307245 6I TTAAACAGCT ------/TAAGTA TATCTTTTAC 3070 het 3070 hom 46 18 28 0 TAAGTA 0 1 133999 CASAVA_Build 10 55308867 1D CTATTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 T 11 10 134000 CASAVA_Build 10 55310371 1D AAAAATTTTT A/- AAAAAACCTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 7 6 134001 CASAVA_Build 10 55311895 19D GAGTGTTGGG AGAAAAGCTGAGTGTTGGC/------------------- AGAGAAGCTG 3070 het 3070 ref 29 18 11 4 AGAAAAGCTGAGTGTTGGC 1 0 134002 CASAVA_Build 10 55312052 1D CCACATCACC T/- TTTTTGTTTG 3005 het 3005 ref 27 14 7 6 T 6 5 134003 CASAVA_Build 10 55312941 2I ATGCATACAC --/AT ATACATATGT 3070 het 3070 hom 39 16 22 1 AT 1 2 134004 CASAVA_Build 10 55320857 1I60M1I ATTTTCCTCA -TTTTTTCCCCTTATATTCGTGTTATAGATCTCCTGTGTCAGGTCAGTACAGCACAAAGTT-/TTTTTTTCCCCTTATATTCGTGTTATAGATCTCCTGTGTCAGGTCAGTACAGCACAAAGTTA AATGGAGGTT 3070 het 3070 hom 35 26 27 4 N/A 0 0 134005 CASAVA_Build 10 55326965 1I TGCAGATTCT -/G ATATGGCCTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 0 1 134006 CASAVA_Build 10 55327364 2D TAAGTGTATT CA/-- CATTGTTCTG 3070 het 3070 ref 35 23 11 2 CA 2 1 134007 CASAVA_Build 10 55329757 2D CTACTTAGAC TG/-- TGTCTTCCTC 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 TG 2 1 134008 CASAVA_Build 10 55330930 1I AGTCTTCGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 T 8 9 134009 CASAVA_Build 10 55346287 4I GACTTTTAGC ----/TCAG TCAGTTTCTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TCAG 1 2 134010 CASAVA_Build 10 55346705 1D TACCAGAAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 9 8 134011 CASAVA_Build 10 55351157 1I CTAATATGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 T 9 10 134012 CASAVA_Build 10 55372029 4D26M1D ACTAGTTTAT TTACTTACTTATTTTACTGTCCTGCATTTTC/----TTACTTATTTTACTGTCCTGCATTTT- TTTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 50 26 22 9 N/A 0 0 134013 CASAVA_Build 10 55375230 15D AATATTGTAC ATTGTTGTCAACTAT/--------------- GGTCACCATG 3070 het 3070 hom 37 18 20 3 ATTGTTGTCAACTAT 1 0 134014 CASAVA_Build 10 55379497 1D CTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 1560 het 1560 ref 39 30 4 5 A 10 9 134015 CASAVA_Build 10 55389019 2I ACACTACATT --/TA TATATATATA 895 het 895 ref 20 11 4 5 TA 7 8 134016 CASAVA_Build 10 55391851 1I ATCAATGAAG -/T TATCTCTACT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 134017 CASAVA_Build 10 55393408 3I TCAAAACCAG ---/AAT AATGATTTCA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 AAT 1 2 134018 CASAVA_Build 10 55395637 1I AAGCCAAAAT -/A TTTTTTTTGC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 0 1 134019 CASAVA_Build 10 55401736 2I AAAAAGAGCC --/CA CACAGCCAAG 1897 hom 10 het 6 0 4 2 CA 2 3 134020 CASAVA_Build 10 55402086 1I TGTTAGACCT -/A AAAACCATAA 1470 hom 7 het 4 0 3 1 A 4 5 134021 CASAVA_Build 10 55403772 4D TTTATATTTG TTTA/---- TTTGTTTATT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TTTA 1 0 134022 CASAVA_Build 10 55406461 1I TTCGAGTAGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 8 9 134023 CASAVA_Build 10 55407090 1I TGAAAGCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 19 15 1 A 8 9 134024 CASAVA_Build 10 55412603 1I AAAAAAATAT -/A AAAAAAAGAA 1198 het 1134 hom 9 3 3 3 A 7 8 134025 CASAVA_Build 10 55425977 2I AGCATAATAC --/TA TGACTAGAAC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 TA 0 1 134026 CASAVA_Build 10 55430415 1D GAGGCAAGAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 A 8 7 134027 CASAVA_Build 10 55430823 1D GCTGAAGGAC A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 A 8 7 134028 CASAVA_Build 10 55433865 8I CTTTCATGAT --------/AAAAACCC AAAAACCCTC 3070 het 3070 hom 39 20 17 2 AAAAACCC 1 2 134029 CASAVA_Build 10 55434630 1D AAACAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 11 10 134030 CASAVA_Build 10 55434718 2D GTACTGGCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 A 12 10 134031 CASAVA_Build 10 55438486 1D ATAGCAAGTC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 37 14 15 9 T 8 7 134032 CASAVA_Build 10 55440880 2I GCAGCCACCC --/CA CACTCCCTGG 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 CA 1 2 134033 CASAVA_Build 10 55444109 3I CACATGTATA ---/AAG AAGAGCTGGT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AAG 1 2 134034 CASAVA_Build 10 55444966 1I CAACTAACCA -/G GGTGGTGAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 G 2 3 134035 CASAVA_Build 10 55445155 5I ATTATTCACA -----/AAACC AGAAAAATGT 3070 hom 78 het 33 0 27 7 AAACC 0 1 134036 CASAVA_Build 10 55445656 1D ACAGCAAAAA T/- TGACAAGTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 2 1 134037 CASAVA_Build 10 55446029 1D AGTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 42 0 32 11 A 11 10 134038 CASAVA_Build 10 55446267 4D AATGGTAGAC TAAA/---- TAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 45 20 18 10 TAAA 2 1 134039 CASAVA_Build 10 55448180 1I TTGTCAGTAA -/T TTATCATAGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 3 134040 CASAVA_Build 10 55452110 1D AATGTGAAAA C/- AATACAGAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 0 134041 CASAVA_Build 10 55453457 3D TATTTATGTG ATA/--- ATGTTTATTA 3070 het 3070 hom 23 9 14 1 ATA 1 0 134042 CASAVA_Build 10 55453672 1I ACTTAACAAA -/T TGCTTGTGGA 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 T 1 2 134043 CASAVA_Build 10 55455839 1I TAGGATGGGA -/T TTTTTTTTTT 2647 het 268 hom 21 2 10 9 T 15 16 134044 CASAVA_Build 10 55458720 3D TAAAAAAAAG ACT/--- ACAATATCCC 3070 het 1721 hom 23 4 15 10 ACT 1 0 134045 CASAVA_Build 10 55461006 1D CTGATATAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 113 het 48 0 37 11 T 10 9 134046 CASAVA_Build 10 55461320 1I GTAGAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 660 hom 37 2 28 7 A 10 11 134047 CASAVA_Build 10 55464393 12I GACTGCATTC ------------/ATTTGTAGAGAA AAAGAGCTAA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 ATTTGTAGAGAA 0 1 134048 CASAVA_Build 10 55466257 1I AACAATGCCT -/C AATAAAAGCA 3070 hom 148 het 51 0 50 1 C 0 1 134049 CASAVA_Build 10 55467322 1D ACACAATGCT A/- ATTGCAGTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 2 1 134050 CASAVA_Build 10 55472769 1D GATTTTGGAA T/- TTGCTAATTT 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 T 3 2 134051 CASAVA_Build 10 55474969 2D TGGGAATGGC CT/-- CTCTCATCAT 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 CT 3 2 134052 CASAVA_Build 10 55476384 2I AATGTGCAAC --/AA AAAAAAACCC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 7 9 134053 CASAVA_Build 10 55476657 1D AAACCAAGTT G/- GTTGCCAAGC 3070 het 3070 hom 34 10 20 5 G 2 1 134054 CASAVA_Build 10 55478696 1D TTTGATAGGA G/- TAGCATTGCA 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 G 1 0 134055 CASAVA_Build 10 55484587 1I TTGTGTGGGC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 6 7 134056 CASAVA_Build 10 55491586 1D AAATTGTTGA T/- TGGTAGGTTA 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 T 2 1 134057 CASAVA_Build 10 55491994 11D ATTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2310 het 520 hom 12 3 7 2 A 25 14 134058 CASAVA_Build 10 55492540 1D GAAAAGCGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 A 10 9 134059 CASAVA_Build 10 55497510 1D TATGCTATGG T/- ATTAAATATT 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 T 1 0 134060 CASAVA_Build 10 55497723 1I20M1I AGTCAAGTGA -TTTTTTTTATTTTTTATTTT-/TTTTTTTTTATTTTTTATTTTA TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 4 N/A 0 0 134061 CASAVA_Build 10 55505159 1D TAAAAAAAAA G/- ATCTATATAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 1 0 134062 CASAVA_Build 10 55508521 1I TGTCTAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1372 hom 42 3 29 10 T 12 13 134063 CASAVA_Build 10 55511078 4I AGTATTTGGA ----/ATAT ATATATATGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AT 4 6 134064 CASAVA_Build 10 55513850 1D TAATGTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 12 11 134065 CASAVA_Build 10 55516980 1D AATTCAATGG T/- TTTTAGCATA 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 T 5 4 134066 CASAVA_Build 10 55518698 4I GCTTAAAGTT ----/TTTC TTTAACATTT 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 TTTC 0 1 134067 CASAVA_Build 10 55521115 1D GTCAGCAGGA T/- TCTGAGAGAG 3070 het 3070 hom 47 17 20 10 T 2 1 134068 CASAVA_Build 10 55522853 4D ACTGTATTTA TATT/---- TATTATTTTT 3070 het 3070 hom 30 15 14 5 TATT 2 1 134069 CASAVA_Build 10 55530603 1D TGGGGGGGGA T/- TTTTTTTTTT 1032 het 1032 ref 42 34 3 5 T 11 10 134070 CASAVA_Build 10 55546004 1D CTGAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 33 0 20 13 A 17 16 134071 CASAVA_Build 10 55547040 1D GGTGCCAGTA T/- AGGAGGAAGG 3070 hom 86 het 39 0 23 16 T 1 0 134072 CASAVA_Build 10 55552641 1D AAACACTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 33 1 20 12 A 14 13 134073 CASAVA_Build 10 55571467 2D AAAAATTGTG AC/-- ACTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 AC 2 1 134074 CASAVA_Build 10 55573851 1D GTTGGAAGTT G/- GGGGGCTGAA 3070 het 3070 hom 42 16 18 10 G 6 5 134075 CASAVA_Build 10 55580200 1D TGAGACTTCC T/- TTTTTTTTTG 1209 het 1209 ref 39 32 3 4 T 10 9 134076 CASAVA_Build 10 55582451 2D TTTAGCTTGC TG/-- TGTGTGTGTG 872 het 872 ref 34 20 3 11 TG 10 9 134077 CASAVA_Build 10 55588484 4I AATGACACAG ----/AATT AAAGCCACAG 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 AATT 0 1 134078 CASAVA_Build 10 55588875 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1183 het 1183 ref 30 11 4 15 A 15 14 134079 CASAVA_Build 10 55591971 5D CCTTCTTATG CACCT/----- CACAAAGTTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 7 CACCT 1 0 134080 CASAVA_Build 10 55593173 2I ATGGCAGCAG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 47 19 15 13 GA 7 8 134081 CASAVA_Build 10 55595726 2D TTACAGAAAC AT/-- AAAAATACTT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 AT 1 0 134082 CASAVA_Build 10 55601299 8I ATTCACCGTT --------/CTCAACTA CTCAACTACT 2729 het 1242 hom 13 3 7 3 CTCAACTA 1 2 134083 CASAVA_Build 10 55603328 5D ACCTGAAATA TAAGT/----- TATTTCCCAT 3070 het 3070 ref 29 18 10 3 TAAGT 1 0 134084 CASAVA_Build 10 55606723 1I ATGTCCATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 329 hom 42 1 36 5 A 11 12 134085 CASAVA_Build 10 55607353 1I AAAACTGCTC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 8 9 134086 CASAVA_Build 10 55608496 4I TACAAGAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAAC 1 2 134087 CASAVA_Build 10 55614153 1I AGAAGTTACA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 6 7 134088 CASAVA_Build 10 55619271 1D GAGTATACAA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 7 6 134089 CASAVA_Build 10 55621965 4I AGAAAGGAAA ----/GAAG GAAGGAAGGA 2304 het 1466 hom 25 7 10 8 GAAG 3 4 134090 CASAVA_Build 10 55623975 1I TTAGAAAGAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 8 9 134091 CASAVA_Build 10 55626975 6D TTTTCTCCCA TTAAGT/------ TTAAGAAGTT 3070 het 3070 ref 21 11 10 2 TTAAGT 1 0 134092 CASAVA_Build 10 55631516 2D TGTTTTTCCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 37 het 31 1 24 6 GT 6 5 134093 CASAVA_Build 10 55632590 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAAAAAGT 2595 het 283 hom 27 5 11 11 AG 0 1 134094 CASAVA_Build 10 55634132 1D AAAAAAAAAA G/- AGAAAAGTAA 3070 het 1113 hom 40 3 35 3 G 1 0 134095 CASAVA_Build 10 55634371 1I AAATGTTACT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 7 8 134096 CASAVA_Build 10 55636479 3D GTCAATATTT CTC/--- CTCCACCTAC 3070 hom 93 het 35 0 31 6 CTC 2 1 134097 CASAVA_Build 10 55641005 1D AACTGGGACA T/- TTAAAAGAGC 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 3 2 134098 CASAVA_Build 10 55641754 1I CTATTAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 10 11 134099 CASAVA_Build 10 55644019 4D AAATGGAAAA TGTT/---- TGGATGATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TGTT 1 0 134100 CASAVA_Build 10 55644956 4D ATTAAATGAC TTAT/---- TTAAGTTAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 5 TTAT 1 0 134101 CASAVA_Build 10 55645112 1D AATGAGGGGG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 86 het 34 0 30 4 A 8 7 134102 CASAVA_Build 10 55684681 1I TTCAACGTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 134103 CASAVA_Build 10 55690162 2I ATGCTAGTTT --/AA AAAAAAATTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 7 9 134104 CASAVA_Build 10 55690275 1I CATTTTAATG -/A ATTTATATAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 1 2 134105 CASAVA_Build 10 55691425 4I TTCTATTCTT ----/AATG AACACACATA 3070 hom 42 het 23 0 15 8 AATG 0 1 134106 CASAVA_Build 10 55692484 1I GGGTTCTCAT -/G GGGGCATGGG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 G 4 5 134107 CASAVA_Build 10 55693525 4D TGGTTAATAT TGAG/---- TGTCAACTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 TGAG 1 0 134108 CASAVA_Build 10 55695818 1D TCAAGAAATT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 8 7 134109 CASAVA_Build 10 55696967 1I CAACAGATAC -/A GTTAAAGTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 134110 CASAVA_Build 10 55702285 1I GGAAGAGGGG -/A TACTTTTTGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 134111 CASAVA_Build 10 55703152 1D AAAAAAAAAA G/- GTGATGCTTT 3070 hom 61 het 28 0 21 7 G 2 1 134112 CASAVA_Build 10 55704959 2D ACCAATTAGG AA/-- AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 51 23 25 5 A 7 5 134113 CASAVA_Build 10 55706437 5D TTTAAAATTC AATTA/----- AAGATTAGAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 AATTA 1 0 134114 CASAVA_Build 10 55707658 5I ATGGTTTGAA -----/AAATG AAATGGAAAG 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 AAATG 1 2 134115 CASAVA_Build 10 55710048 1D AAATTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2417 hom 27 8 8 11 T 15 14 134116 CASAVA_Build 10 55724461 2D AGACACACAC AT/-- GAGTCAATCT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 AT 1 0 134117 CASAVA_Build 10 55735901 1D AGACTCCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 18 17 10 A 10 9 134118 CASAVA_Build 10 55745745 2D TTGGGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 T 11 9 134119 CASAVA_Build 10 55749482 1D CAGACCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1009 hom 19 4 10 5 T 13 12 134120 CASAVA_Build 10 55749553 1I CCTTCCAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 9 10 134121 CASAVA_Build 10 55750350 1D ATATTTTAAA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 12 8 2 T 4 3 134122 CASAVA_Build 10 55750843 1I16M2I TTACATTTGA -CATTTTTCTCAATAAC--/CCTTTTTTCTCAATAACAT AAATAAGTTA 2073 het 2073 ref 11 5 5 2 N/A 0 0 134123 CASAVA_Build 10 55751515 1I ATAATAGGAG -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 6 7 134124 CASAVA_Build 10 55752418 1I CTTACCAACC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 7 8 134125 CASAVA_Build 10 55753571 4I CCTACATATG ----/TATT TACTCCCTGT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 TATT 0 1 134126 CASAVA_Build 10 55754780 19I CCATTTGATC -------------------/TTTCATATCTCTAATTTTT TTTCTAGATC 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 TTTCATATCTCTAATTTTT 0 1 134127 CASAVA_Build 10 55756959 1I ATTGCATGAT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 7 8 134128 CASAVA_Build 10 55758571 1I GAGGGAAGTA -/T TAAGGATGGA 3070 het 3070 ref 44 25 10 9 T 1 2 134129 CASAVA_Build 10 55759936 3D CATTAAATAC AAA/--- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 11 8 134130 CASAVA_Build 10 55760931 1D AAACTCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 A 11 10 134131 CASAVA_Build 10 55763404 1I TAAAGCCATG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 7 8 134132 CASAVA_Build 10 55768663 1I GACATGATAA -/T TTATTGTCTA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 2 3 134133 CASAVA_Build 10 55769133 1I ATTAAACAAA -/C AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 C 0 1 134134 CASAVA_Build 10 55772342 13I AGTGGAATTG -------------/GAGTCCCCACACA GAGTCCCCAC 2919 het 2919 ref 30 17 7 6 GAGTCCCCACACA 0 1 134135 CASAVA_Build 10 55773639 1I AAAGGCTCAA -/T TTTAATTATT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 3 4 134136 CASAVA_Build 10 55789175 1I TATGGGACAT -/A ATGAGAACTG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 1 2 134137 CASAVA_Build 10 55803048 1D CAGGAGTGAA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 7 134138 CASAVA_Build 10 55805730 1D GTGTGATCTT G/- GTTCACTGCA 3070 hom 30 het 14 0 9 5 G 2 1 134139 CASAVA_Build 10 55808076 1D CTTTTTCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 10 9 134140 CASAVA_Build 10 55814093 2D ATCCCCCCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 23 0 19 4 T 12 10 134141 CASAVA_Build 10 55816847 3D CATATCAAAT ATC/--- ATGTTTTACA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 ATC 1 0 134142 CASAVA_Build 10 55821149 1D TTTTGAGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 T 10 9 134143 CASAVA_Build 10 55822056 1I CATGGCGAAA -/C CCCATCTGTA 3070 hom 42 het 18 0 13 5 C 3 4 134144 CASAVA_Build 10 55823988 2I ACATTCTTAT --/TA TATATAGCAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TA 3 4 134145 CASAVA_Build 10 55838260 2I CTATTAACAT --/GA GTTTTACAAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 GA 0 1 134146 CASAVA_Build 10 55840666 1D TGTTGAATAA G/- GGGCCCTGAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 4 3 134147 CASAVA_Build 10 55840992 1D TATATATAGG C/- CCACTGCACC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 3 2 134148 CASAVA_Build 10 55845399 1D GAACATAATC A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 36 18 16 6 A 7 6 134149 CASAVA_Build 10 55845546 9D TTATTGACAT AAACAAAAA/--------- TGACAAAATG 3070 het 3070 ref 34 18 16 4 AAACAAAAA 1 0 134150 CASAVA_Build 10 55849149 2I CCAGCAATTT --/TA TGTGTAGCTC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 TA 0 1 134151 CASAVA_Build 10 55862054 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 8 9 134152 CASAVA_Build 10 55864013 1I ATTACTGAAG -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 6 7 134153 CASAVA_Build 10 55864822 4I TTAAACTTAT ----/CTAA CTTACTTCCT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 CTAA 0 1 134154 CASAVA_Build 10 55866575 2I AATATGTAAC --/TT ATCACAAAAT 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 T 0 2 134155 CASAVA_Build 10 55868905 3I TAGTTTAGAA ---/GAG GAGTTAATAT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 GAG 1 2 134156 CASAVA_Build 10 55877724 1D TATTACTCAA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 7 134157 CASAVA_Build 10 55887456 1I CTAAACAATA -/T TTTTTTAAAA 2220 het 2220 ref 20 9 7 4 T 6 7 134158 CASAVA_Build 10 55892080 2D ATATATATAT AA/-- AATGAAATCC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 4 2 134159 CASAVA_Build 10 55954100 1I CATCTGTCCA -/T TTTCTGTACA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 3 4 134160 CASAVA_Build 10 55966149 1D ATGACTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 11 10 134161 CASAVA_Build 10 55969699 1I CAGAAATTTT -/A AAAAAATTCT 1285 het 1285 ref 27 20 5 2 A 6 7 134162 CASAVA_Build 10 55978723 1D TCTAGAAATG T/- GTCTATTTTG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 1 0 134163 CASAVA_Build 10 55978987 2I TCTTTTCTTT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 AC 8 9 134164 CASAVA_Build 10 55993055 2I ACCATAAAGC --/CA CAGATTAGCA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 CA 1 2 134165 CASAVA_Build 10 55999806 2D ACAATTAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2492 hom 40 14 22 4 GT 9 8 134166 CASAVA_Build 10 56003469 4D TATCTTTATC GATA/---- GTTTTCCCCA 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 GATA 1 0 134167 CASAVA_Build 10 56005440 1D AAATTCCTAA T/- TTTTCAATAT 3070 het 3070 hom 42 17 18 10 T 5 4 134168 CASAVA_Build 10 56005903 4D GTATGTATCC ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 48 24 21 4 ATCT 4 3 134169 CASAVA_Build 10 56006715 1D CACCAAGTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 40 21 14 7 T 9 8 134170 CASAVA_Build 10 56012798 1D ACAATCTGAG C/- TTTTTGATCA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 C 1 0 134171 CASAVA_Build 10 56014948 2D CTAAAGGTTT AG/-- ATTAAATAAA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 AG 1 0 134172 CASAVA_Build 10 56015385 1I TATGTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 G 0 1 134173 CASAVA_Build 10 56018438 2I CTACTTCCCA --/GG CTCAAGCGAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 G 0 2 134174 CASAVA_Build 10 56033845 7D ATTTGTGAAT CATATGG/------- TTTCTTGTTT 3070 het 3070 ref 45 27 17 2 CATATGG 1 0 134175 CASAVA_Build 10 56045479 2I AAATAACAAC --/AT GTGTGAAGCA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 AT 0 1 134176 CASAVA_Build 10 56048914 1D AATCTAACTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 8 7 134177 CASAVA_Build 10 56071493 4D GACTATATTG CTAA/---- CTGTTTATTT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 CTAA 1 0 134178 CASAVA_Build 10 56089534 1I AAAAAAAAAA -/T ATACATATCA 3070 het 851 hom 29 4 19 6 T 0 1 134179 CASAVA_Build 10 56095934 11D6M6D TAATATGAGT ACCCCCTAAAGCTTAATATAAAA/-----------CTTTCT------ GACTCAGCAT 3070 hom 90 het 29 0 31 3 N/A 0 0 134180 CASAVA_Build 10 56102501 4I TAATGAGATT ----/TTAA TTATTTTATA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 TTAA 0 1 134181 CASAVA_Build 10 56111259 1D CCAAATGAAG A/- AAGGATTTCA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 A 3 2 134182 CASAVA_Build 10 56111954 1D ACTATTTTTA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 8 7 134183 CASAVA_Build 10 56114577 5I GTTATTTCCT -----/ATAGA ATAGTAGTGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATAGA 0 1 134184 CASAVA_Build 10 56127752 4I CTAAATCAAT ----/ACTC ACTCATCCTG 3070 hom 156 het 59 0 50 9 ACTC 1 2 134185 CASAVA_Build 10 56139447 2D ATGGGAGTAA TG/-- TGTGTGTGTG 1659 het 1659 ref 8 4 4 0 TG 7 6 134186 CASAVA_Build 10 56141532 1D AAAGTTATTA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 T 7 6 134187 CASAVA_Build 10 56148912 1I TCAGAATATT -/A AAAAAAGGGT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 6 7 134188 CASAVA_Build 10 56150285 1I AGTCTCTTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 9 10 134189 CASAVA_Build 10 56152346 1D AATTGGGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 16 11 5 A 15 14 134190 CASAVA_Build 10 56154014 8D AACTTGGATG GAACTAGA/-------- GGTCATTATC 3070 het 3070 ref 38 25 11 4 GAACTAGA 1 0 134191 CASAVA_Build 10 56154670 6D GTACATATAT ATATAG/------ ATATAGATAT 3070 hom 69 het 32 0 23 10 ATATAG 4 3 134192 CASAVA_Build 10 56155319 2D TATATATAAT TA/-- TATATATATA 1949 het 1949 ref 11 5 4 2 TA 7 6 134193 CASAVA_Build 10 56175096 3D41M1I AAACTATTCA AAGAAAAGATTAAATGAGAACCAAATCCTTTTATATACACACAG-/---AAAAGATTAAATGAGAACCAAATCCTTTTATATACACACAGA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 12 19 16 N/A 0 0 134194 CASAVA_Build 10 56176134 2D GTACAAACAT AC/-- AGTTAGATGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AC 1 0 134195 CASAVA_Build 10 56178912 2D TAGCCTTATA AT/-- TCCCAGGCCA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 AT 1 0 134196 CASAVA_Build 10 56182481 1I AATGAAAGTA -/C TATAAAGCCA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 C 0 1 134197 CASAVA_Build 10 56182567 1I TTCCACCTTT -/C CCCCCCTTGT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 C 6 7 134198 CASAVA_Build 10 56186487 6D TGTATGTGAA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 3070 het 2104 hom 41 12 20 10 AG 11 8 134199 CASAVA_Build 10 56186777 4I AGCAAGCTCC ----/CATT CAATTGGATT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 CATT 0 1 134200 CASAVA_Build 10 56190141 1D CAACATATAT A/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 A 1 0 134201 CASAVA_Build 10 56191969 3D TAGCTTATTT TTC/--- TTGTCTTATA 3070 hom 84 het 30 0 29 4 TTC 1 0 134202 CASAVA_Build 10 56194257 1I TGCCCCAAAC -/T TAAGTAAATG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 1 2 134203 CASAVA_Build 10 56195809 1D GTGCAGTGTC T/- TTGTGTGAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 3 2 134204 CASAVA_Build 10 56202363 1I ATGGCTCTTA -/C TTAACGTTCA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 C 0 1 134205 CASAVA_Build 10 56213815 3I GGGAGAAGAA ---/CTC CTTATTACAC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 CTC 0 1 134206 CASAVA_Build 10 56214104 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 20 5 A 12 11 134207 CASAVA_Build 10 56217038 1I GATAAAAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 9 10 134208 CASAVA_Build 10 56240319 1D AATATGTCAC A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 7 6 134209 CASAVA_Build 10 56240902 2I ATATTATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TA 6 7 134210 CASAVA_Build 10 56249781 1D AAGTTTCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 219 hom 45 1 38 6 A 10 9 134211 CASAVA_Build 10 56251182 1I CCTTTTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 A 10 11 134212 CASAVA_Build 10 56258248 6D ACAAGATATA TGTATG/------ TGTATGTGTA 3070 het 3070 hom 46 14 16 23 TGTATG 4 3 134213 CASAVA_Build 10 56271950 2D GTATGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 73 het 36 0 25 12 GT 10 9 134214 CASAVA_Build 10 56282028 3I ATTCTTGCTG ---/AGT AGTTCTTAGA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 AGT 1 2 134215 CASAVA_Build 10 56289499 1D AACTAATTTG T/- TTCAGGTTCA 3070 hom 74 het 27 0 24 3 T 3 2 134216 CASAVA_Build 10 56296544 4I ATGCAAAGAT ----/AGAA AGACAGTAGG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AGAA 0 1 134217 CASAVA_Build 10 56301195 1I GTCTGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 121 hom 36 1 25 10 A 12 13 134218 CASAVA_Build 10 56303329 2I CATATACGTA --/TG TGTGTGTGTG 2697 het 234 hom 13 2 9 2 TG 6 7 134219 CASAVA_Build 10 56312868 1I GAGAAAGTGG -/T TTTTTCTCTG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 5 6 134220 CASAVA_Build 10 56314092 1I GAGACACATT -/A AAATCAAATA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 3 4 134221 CASAVA_Build 10 56314485 4D AATAGCCAAA TTGT/---- TTGAAATGTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTGT 1 0 134222 CASAVA_Build 10 56317529 16I GCTGACCTTT ----------------/TCTCTTTTAGGTTTCA CAGTCTTAGT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TCTCTTTTAGGTTTCA 0 1 134223 CASAVA_Build 10 56318500 3D GCACATTTTC CTG/--- TTGTTGTTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 CTG 1 0 134224 CASAVA_Build 10 56326280 1D TTCCCAGCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 31 2 28 2 A 12 11 134225 CASAVA_Build 10 56326363 1I ATGTTTTTTT -/A AAAAAATGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 7 134226 CASAVA_Build 10 56329626 1D74M1I CATATTTTTC AAATATGTATTTCAGTAGAAAATAATTTTTAGAGTTGCTTAAAATTTGCTGTGCATTCCAATAATAAAGTGCTTT-/-AATATGTATTTCAGTAGAAAATAATTTTTAGAGTTGCTTAAAATTTGCTGTGCATTCCAATAATAAAGTGCTTTA AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 22 N/A 0 0 134227 CASAVA_Build 10 56330878 3I TCAGAAGTTA ---/AAG AACAGCCTGG 3070 hom 102 het 36 0 33 3 AAG 0 1 134228 CASAVA_Build 10 56331762 4D TGATACATTC CATT/---- CAAATGATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 CATT 1 0 134229 CASAVA_Build 10 56347765 25D ACGATAGTGA TTTTCTCCCTGATTTTATTCAAAGC/------------------------- TTTTCTCCCT 3070 hom 135 het 41 0 46 1 TTTTCTCCCTGATTTTATTCAAAGC 1 0 134230 CASAVA_Build 10 56355194 2D CTATTCAGGC GT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 GT 1 0 134231 CASAVA_Build 10 56398208 1I TAGATTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 10 11 134232 CASAVA_Build 10 56425396 1I AATTAACCCT -/C CCCCCCCACG 2467 het 2467 ref 17 9 7 1 C 7 8 134233 CASAVA_Build 10 56429073 1D ATAAAGAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 10 9 134234 CASAVA_Build 10 56433823 1I ACTTGCTATA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 6 7 134235 CASAVA_Build 10 56438019 1I TAAATCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 10 11 134236 CASAVA_Build 10 56440566 2D AACAACTTAT AA/-- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 25 10 12 5 A 10 8 134237 CASAVA_Build 10 56440874 2I TTTTCTTGTT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 AC 6 7 134238 CASAVA_Build 10 56444280 1I CAATAAAATA -/T TTTTTGTACT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 5 6 134239 CASAVA_Build 10 56446176 1I AGAACCCATC -/A ACCTTCCCCA 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 A 1 2 134240 CASAVA_Build 10 56448979 5D TCCACTGAAC TTACA/----- TTACATCAAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 TTACA 2 1 134241 CASAVA_Build 10 56449709 2I AAAGAAACTC --/TT TACTACTCTT 2013 het 2013 ref 19 8 6 5 T 1 3 134242 CASAVA_Build 10 56451699 1D TGCCAAGCAC A/- AAAAGACATA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 5 4 134243 CASAVA_Build 10 56452478 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1556 het 1280 hom 11 3 4 4 T 17 16 134244 CASAVA_Build 10 56453522 6D ATCCTATATT TGTGTC/------ TGTGTATAAC 3070 het 3070 ref 36 22 9 8 TGTGTC 1 0 134245 CASAVA_Build 10 56453653 8D ACATGTATAT ACACATAC/-------- ATGTATGTGA 1689 het 1689 ref 23 12 5 7 ACACATAC 1 0 134246 CASAVA_Build 10 56454221 2D ATATATATAT AC/-- ACACACATAT 1317 het 1317 ref 24 13 8 3 AC 4 3 134247 CASAVA_Build 10 56456919 3I GAAAAATAAG ---/ATA ATAATGCAAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 ATA 1 2 134248 CASAVA_Build 10 56457761 1I ATGCAACCAC -/A AAAAAACTCA 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 6 7 134249 CASAVA_Build 10 56458746 1D TGCATTCAAA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 8 7 134250 CASAVA_Build 10 56460770 1I GAAATGCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 T 9 10 134251 CASAVA_Build 10 56477179 1D5M1D AGACTTCAAT CTCATTC/-TCATT- TGAATTAACC 3070 hom 129 het 44 0 44 1 N/A 0 0 134252 CASAVA_Build 10 56486296 2D TAAGTTTCCA TT/-- TTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 T 4 2 134253 CASAVA_Build 10 56489754 1D ACAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 11 10 134254 CASAVA_Build 10 56501056 6D TCCAATTAAA AGACAC/------ AGACTGGCAA 2489 het 2489 ref 21 10 6 6 AGACAC 1 0 134255 CASAVA_Build 10 56512349 1D AATTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 2967 het 2967 ref 30 20 8 2 A 13 12 134256 CASAVA_Build 10 56523344 1I AATGGTTTTG -/C CTAGGTTTTC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 1 2 134257 CASAVA_Build 10 56551125 1I GCTCAGAGCT -/G GGGGGGGGGC 3070 het 930 hom 27 3 20 4 G 9 10 134258 CASAVA_Build 10 56556673 2D CTGGATTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 36 0 27 10 A 12 10 134259 CASAVA_Build 10 56561479 9I CAGGAGTGGG ---------/TAGCTCCTC TAGCTCCTCT 2723 het 2723 ref 40 21 6 13 TAGCTCCTC 1 2 134260 CASAVA_Build 10 56567303 2D CAGATTCGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2986 het 145 hom 26 2 9 15 T 12 10 134261 CASAVA_Build 10 56567380 3I TTTATTCAAT ---/TAA TAAGATATAT 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 TAA 1 2 134262 CASAVA_Build 10 56569152 1D AATTTTCTCT A/- TGTATTTTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 1 0 134263 CASAVA_Build 10 56571627 1I AAGGTTTATT -/G ATTTTTTTTT 3070 het 75 hom 24 1 17 6 G 0 1 134264 CASAVA_Build 10 56573589 3D ACCTAGTGGG TAC/--- TACTACAGGA 3070 hom 114 het 40 0 39 4 TAC 3 2 134265 CASAVA_Build 10 56573783 1I GTGTAAGGGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 325 hom 35 1 30 4 A 8 9 134266 CASAVA_Build 10 56574034 2D TATTACGGCT GA/-- GAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 46 1 26 19 GA 2 1 134267 CASAVA_Build 10 56574595 1D TTTTAAATGA T/- TTTTTATTTA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 6 5 134268 CASAVA_Build 10 56575806 1D CGAACTCAGC T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 111 het 39 0 38 2 T 7 6 134269 CASAVA_Build 10 56576626 3I TTTTACTGAC ---/TTA TTATGATTAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTA 1 2 134270 CASAVA_Build 10 56577428 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTTATTA 3070 hom 60 het 22 0 21 8 A 3 2 134271 CASAVA_Build 10 56577887 1I GATGATGGGC -/T TTTCTACTTC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 3 4 134272 CASAVA_Build 10 56579021 4D AATAAATGTT AATA/---- AATATTCAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 2 AATA 2 1 134273 CASAVA_Build 10 56579464 1D ATATCTTTTT C/- TCTTCCTTTC 3070 hom 135 het 50 0 46 5 C 1 0 134274 CASAVA_Build 10 56582139 3I GCTTAGGATT ---/TGC TTTTCTAGTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TGC 0 1 134275 CASAVA_Build 10 56584862 1D GGTATAATAG T/- ATAGATACCA 3070 het 3070 hom 55 21 28 7 T 1 0 134276 CASAVA_Build 10 56586892 4D ATTCTATCTA TATC/---- TATCTATCTA 3070 het 3070 ref 28 15 10 5 TATC 4 3 134277 CASAVA_Build 10 56587746 4D ATTAACATAA ATAC/---- ATAAATATTG 862 het 862 ref 12 4 3 7 ATAC 1 0 134278 CASAVA_Build 10 56588369 1D TTCAGAGGGT C/- TGGGGTCAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 0 134279 CASAVA_Build 10 56588460 1D TGTTCTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 12 11 134280 CASAVA_Build 10 56588651 2D63M1D GGGAGGGAGA AGAGAGAGAGAGAGAAAAAACAAGAGCTCAAGATATAGACAGAGAAGTGCTAAAGTGTTTTGCTGT/--AGAGAGAGAGAGAAAAAACAAGAGCTCAAGATATAGACAGAGAAGTGCTAAAGTGTTTTGCTG- TTGATGAAGC 3070 hom 51 het 25 0 17 21 N/A 0 0 134281 CASAVA_Build 10 56589112 32D TTACCATATC TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATATATA/-------------------------------- TATATATATA 3070 hom 57 het 14 0 20 2 TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATATATA 1 0 134282 CASAVA_Build 10 56594704 5I ATTAGAGTGT -----/TTGTA TTGTATTGGA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 TTGTA 1 2 134283 CASAVA_Build 10 56601679 1D ACCAGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 20 0 A 10 9 134284 CASAVA_Build 10 56602237 2D AATAAATGAC TT/-- TTGAGAAAGC 3070 het 3070 hom 52 24 26 2 T 4 2 134285 CASAVA_Build 10 56604278 1D AATGAGATGG C/- CAAAGTGTCC 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 C 2 1 134286 CASAVA_Build 10 56605430 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1563 het 492 hom 15 4 5 6 A 15 13 134287 CASAVA_Build 10 56607636 1I TACAGACGGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 T 8 9 134288 CASAVA_Build 10 56609339 1I CCCATAGAAA -/C CCTGGACTCA 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 C 2 3 134289 CASAVA_Build 10 56613444 1I TTAAAACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 34 1 25 8 T 10 11 134290 CASAVA_Build 10 56616510 2I TACTCTCCTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 17 14 14 TG 8 9 134291 CASAVA_Build 10 56620031 1I TGAAGTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 A 10 11 134292 CASAVA_Build 10 56641739 1D GCCTGAAAAA T/- TTGAGCTGCA 3070 hom 93 het 35 0 31 6 T 3 2 134293 CASAVA_Build 10 56644093 4D ATTTTCATAG ACTA/---- ACTACTGAGA 3070 het 3070 ref 41 23 15 5 ACTA 2 1 134294 CASAVA_Build 10 56657214 31D AAAGAAACAT AGGATCTTAAGGTAAGAATTGATTGATTCCC/------------------------------- AGGATAACTG 3070 het 3070 ref 36 27 15 2 AGGATCTTAAGGTAAGAATTGATTGATTCCC 1 0 134295 CASAVA_Build 10 56661972 2D ATAAGGACTC AT/-- ATGTTATATT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 AT 2 1 134296 CASAVA_Build 10 56662839 2I ATATTGTCTC --/TT ATAATTTTCT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 0 2 134297 CASAVA_Build 10 56664854 1I GAAAGAAGTG -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 6 7 134298 CASAVA_Build 10 56683373 1I CCATAATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 T 10 11 134299 CASAVA_Build 10 56684720 1D AAGTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 11 10 134300 CASAVA_Build 10 56692108 1I CATGGATCTA -/G GTGACGACAG 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 G 1 2 134301 CASAVA_Build 10 56697735 3D AGTTTAATCC TTT/--- TTATTGTGTC 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 T 5 2 134302 CASAVA_Build 10 56703695 2D TAACACCTCC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 41 13 22 8 CA 7 6 134303 CASAVA_Build 10 56714336 1I CTGCATATTA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 T 6 7 134304 CASAVA_Build 10 56732853 2D GATATTTGAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 13 14 7 AT 9 8 134305 CASAVA_Build 10 56758987 1I GAATTCAAAT -/C TATTTTATAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 0 1 134306 CASAVA_Build 10 56767618 4D TGAAAGGAAA TAAT/---- TAACGAAATA 3070 het 3070 ref 37 21 13 4 TAAT 1 0 134307 CASAVA_Build 10 56773391 1I GCCCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 11 12 134308 CASAVA_Build 10 56775037 1D CATGACATAA T/- TTAAAATATA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 T 3 2 134309 CASAVA_Build 10 56775449 1I GTGTGATACT -/C TTTTACTCTT 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 C 0 1 134310 CASAVA_Build 10 56775547 1D CACTCTACTG A/- ATAAATTTCC 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 A 2 1 134311 CASAVA_Build 10 56795426 1I CACGAGATAT -/G ATGGTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 G 0 1 134312 CASAVA_Build 10 56802682 3D TAAAGGATAT CAA/--- CAAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 18 0 CAA 2 1 134313 CASAVA_Build 10 56823990 1I TATAACACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 9 10 134314 CASAVA_Build 10 56825832 1D TTCGTTAGAT A/- AAAAATAGAA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 A 6 5 134315 CASAVA_Build 10 56827937 1I CTGTTTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 13 14 134316 CASAVA_Build 10 56831118 1I ATGAGATTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 8 9 134317 CASAVA_Build 10 56835835 1I GTTCCCATCT -/A AAAAAAAAAA 1747 het 1747 ref 30 18 6 6 A 11 12 134318 CASAVA_Build 10 56837958 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 29 1 20 8 T 13 12 134319 CASAVA_Build 10 56840111 1I TCTTCATTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 8 9 134320 CASAVA_Build 10 56854887 5D ATGACTTAAA TTTTG/----- TTTTAAGACA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 TTTTG 1 0 134321 CASAVA_Build 10 56857574 3D ATTATTAAAT ATC/--- ATATTTAAAT 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 ATC 1 0 134322 CASAVA_Build 10 56860071 1I ATAAATAAAT -/A AGTTGAAAGT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 1 2 134323 CASAVA_Build 10 56863450 2D CATTCATTTT TA/-- TGATTTATAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 TA 1 0 134324 CASAVA_Build 10 56866985 13I GATCTCAATT -------------/TTCAATATACCTG TAATTGGAGA 3070 het 3070 hom 50 17 30 3 TTCAATATACCTG 0 1 134325 CASAVA_Build 10 56871235 5I GAAGGAAACC -----/AATTA AATTAGTCAC 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 AATTA 1 2 134326 CASAVA_Build 10 56871723 2D ATGCGGCCAC AT/-- GTCAAGGAAT 3070 het 3070 ref 48 28 17 4 AT 1 0 134327 CASAVA_Build 10 56881264 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAATA 2010 het 2010 ref 12 6 5 1 A 9 8 134328 CASAVA_Build 10 56882010 2I AACCAAAGAC --/TG GAGTGTAAAT 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 TG 0 1 134329 CASAVA_Build 10 56885375 1D TTATTAATTG A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 A 8 7 134330 CASAVA_Build 10 56887573 6D TTCCCATAAA TCATTT/------ TCAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 TCATTT 1 0 134331 CASAVA_Build 10 56891306 1I GACACAGAAT -/G TTGATCTTAT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 G 0 1 134332 CASAVA_Build 10 56908704 1D TCACAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 15 14 134333 CASAVA_Build 10 56909794 1D TTCTTCCAGT C/- TGTGAAGAAT 3070 het 3070 hom 38 10 23 6 C 1 0 134334 CASAVA_Build 10 56913048 1D AAATTTTTAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 A 9 8 134335 CASAVA_Build 10 56916233 1I ATGTTGTACA -/T TTTTATATTA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 4 5 134336 CASAVA_Build 10 56916557 1I ACAAGTGTGA -/T TTCACTGCAC 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 T 2 3 134337 CASAVA_Build 10 56923308 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1032 het 1032 ref 41 33 3 6 A 11 10 134338 CASAVA_Build 10 56937485 3I AATGATTCGT ---/ATA ATAATTTGAC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 ATA 1 2 134339 CASAVA_Build 10 56941032 1D TGATCTATCC T/- TTTTGGTAAC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 5 4 134340 CASAVA_Build 10 56949067 2I AAAAAAAAAA --/AC CCCAATAGAT 3070 het 1303 hom 27 7 15 5 AC 0 1 134341 CASAVA_Build 10 56949503 1I TATGTGTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 9 10 134342 CASAVA_Build 10 56951138 4D AGAAATGCAT TTAA/---- TACTGGCAGC 3070 het 3070 hom 36 12 23 5 TTAA 1 0 134343 CASAVA_Build 10 56962834 1I TTCAAAAAGT -/A AAAACGTCCC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 4 5 134344 CASAVA_Build 10 56967315 1D AATTCTCCTG C/- CTCAGCCTCC 3070 het 889 hom 13 3 9 1 C 2 1 134345 CASAVA_Build 10 56973146 2I ATAATGCCTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 TA 6 7 134346 CASAVA_Build 10 56979693 1I TGTGAGTGTT -/G GGGGGTGTGT 3070 het 3070 hom 49 15 22 12 G 5 6 134347 CASAVA_Build 10 56994064 1D ATTATTGAGC T/- TTTGCTAATA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 4 3 134348 CASAVA_Build 10 57006498 2I ACAGATATCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 A 10 12 134349 CASAVA_Build 10 57011256 1I ATTTGCTCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 T 8 9 134350 CASAVA_Build 10 57017194 1D ACTGGTACGG A/- AAAATATATA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 5 4 134351 CASAVA_Build 10 57043880 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 190 hom 23 1 16 6 A 13 12 134352 CASAVA_Build 10 57044998 1D TAGATTTGAC A/- AAACATTTAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 4 3 134353 CASAVA_Build 10 57046295 1I CAAAAAAAAA -/C AAAAAGAGTA 3070 het 1739 hom 22 5 13 4 C 0 1 134354 CASAVA_Build 10 57057928 1I TTTTCGGGGT -/A AAAAAAAAAA 2160 het 2160 ref 22 14 5 3 A 10 11 134355 CASAVA_Build 10 57060478 2I3M2I AGGCTAGTGG --GGT--/GTGGTTA ATTGTGATCA 3070 hom 54 het 19 0 18 2 N/A 0 0 134356 CASAVA_Build 10 57067514 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 2557 het 2557 ref 25 10 8 7 A 13 14 134357 CASAVA_Build 10 57069256 1D GGTGAAACAA G/- GGAGTTGGCC 3070 hom 102 het 35 0 34 1 G 3 2 134358 CASAVA_Build 10 57071207 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2713 het 1471 hom 29 8 10 11 T 13 12 134359 CASAVA_Build 10 57082715 1D AGACCCCTGA T/- TTTCCCACTC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 4 3 134360 CASAVA_Build 10 57083258 1D ATCTTGTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 10 9 134361 CASAVA_Build 10 57086956 1I CCATGAGCAC -/T TTCTGGGAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 2 3 134362 CASAVA_Build 10 57090867 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2479 hom 20 8 8 4 T 9 10 134363 CASAVA_Build 10 57096894 4D AATTGTTCTC TTTG/---- TTTGTTTGGC 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 TTTG 3 2 134364 CASAVA_Build 10 57104228 3D CACAGACAGC TCT/--- TATCATTTTG 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TCT 1 0 134365 CASAVA_Build 10 57106108 1D CCTCCCTTAG T/- CCCCCCACCC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 1 0 134366 CASAVA_Build 10 57110023 2D CAGATAGCAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 AT 8 7 134367 CASAVA_Build 10 57122123 1I TGCATCCCTG -/A TTTTTAATTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 0 1 134368 CASAVA_Build 10 57124403 2I AATAACAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 12 134369 CASAVA_Build 10 57124904 6I TAATAATTTT ------/CTTTTC CTTTTCCTGG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 CTTTTC 1 2 134370 CASAVA_Build 10 57125004 1D TTCTAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 28 1 19 9 T 11 10 134371 CASAVA_Build 10 57129551 1D AACGAAAGTG A/- AAAAAAATGC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 8 7 134372 CASAVA_Build 10 57130087 4D CATTGAATAA CTAC/---- ATTTTTTGTA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 CTAC 1 0 134373 CASAVA_Build 10 57132509 1I GCTATTGCTT -/G AATTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 0 1 134374 CASAVA_Build 10 57133464 1D AATTACAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 24 0 20 6 A 9 8 134375 CASAVA_Build 10 57136117 1I AACAGAGTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 822 hom 22 2 17 3 G 0 1 134376 CASAVA_Build 10 57138155 1D ACCTAAAATA T/- TAGGACATTT 3070 hom 154 het 56 0 52 5 T 2 1 134377 CASAVA_Build 10 57139454 1D GTATTTTTAT A/- TTTTATCTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 1 0 134378 CASAVA_Build 10 57141065 1I TTTCAGTTAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 8 9 134379 CASAVA_Build 10 57145929 1I TCCTTTGAAC -/T TTTTTTGCAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 7 134380 CASAVA_Build 10 57147555 9D TCTAATATAA TTATATATG/--------- TATATACATA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TTATATATG 1 0 134381 CASAVA_Build 10 57149448 1I TATTTTCTAT -/A AAAAACTATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 5 6 134382 CASAVA_Build 10 57157041 10D CAGTCAGAAA TATATTTCTC/---------- TATATATTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TATATTTCTC 1 0 134383 CASAVA_Build 10 57165563 1D TCCACATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 315 hom 40 1 33 6 T 10 9 134384 CASAVA_Build 10 57168201 4D29M1I CAAGAAAAAC AAAAAAAAAAAAAGGAAGAATTTATGTTCTTTT-/----AAAAAAAAAGGAAGAATTTATGTTCTTTTA AAAAAAACAT 3070 hom 51 het 21 0 18 10 N/A 0 0 134385 CASAVA_Build 10 57168491 1D TAGATGAAGC A/- GAGGGGAGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 1 0 134386 CASAVA_Build 10 57169285 1D AAAGAATTGC T/- GGATCAAAGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 0 134387 CASAVA_Build 10 57169557 1D AAACTACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 296 hom 33 2 30 3 A 11 10 134388 CASAVA_Build 10 57169693 3D AAAAACAAGT GAA/--- GAACAATTTC 3070 het 3070 hom 54 21 29 8 GAA 2 1 134389 CASAVA_Build 10 57173363 1I TAAAACATAT -/A AACAGAAATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 3 134390 CASAVA_Build 10 57174093 1I ATCAGGAAGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 426 hom 31 1 26 4 A 8 9 134391 CASAVA_Build 10 57174667 1I TTTCTAAGGG -/A AAAAAAAAAA 1945 het 1945 ref 31 22 7 2 A 10 11 134392 CASAVA_Build 10 57179482 1I CATCTTATGA -/C AGAGATTTGG 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 C 0 1 134393 CASAVA_Build 10 57180651 1D GAGCTAATAT A/- AATTATGCTT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 A 3 2 134394 CASAVA_Build 10 57181968 3I CACATTTTCC ---/ATA ATGTCATAAT 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 ATA 0 1 134395 CASAVA_Build 10 57182313 1I AATATGTTAT -/A TTTTATATTA 1431 het 1431 ref 15 11 3 1 A 0 1 134396 CASAVA_Build 10 57183072 1I ATTGTTGTAC -/A AAAAACACTG 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 A 5 6 134397 CASAVA_Build 10 57190411 4I CCATATTGAT ----/ACTC ACTAGATGAT 2415 het 2415 ref 15 7 6 2 ACTC 0 1 134398 CASAVA_Build 10 57193097 1D ATGAGTTGAC A/- AAAATAATAG 3070 het 3070 ref 30 11 11 10 A 5 4 134399 CASAVA_Build 10 57197663 3I AACTAAAGTA ---/GTT GTGAAAGTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 GTT 0 1 134400 CASAVA_Build 10 57197863 6D ATATACGTGT CCCTAG/------ CATTAGGACA 3070 het 3070 ref 26 17 9 3 CCCTAG 1 0 134401 CASAVA_Build 10 57199055 1I TATAGCATAG -/T TATTCGGATT 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 T 1 2 134402 CASAVA_Build 10 57201431 12D TATGTGTGTG TGTATATATATA/------------ TATATATATA 3070 hom 34 het 22 0 11 13 TGTATATATATA 1 0 134403 CASAVA_Build 10 57208849 1I AGTCACTTTG -/C CCCCCTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 C 5 6 134404 CASAVA_Build 10 57217389 1D TGGATTTACA T/- CAGAGCTGAG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 1 0 134405 CASAVA_Build 10 57221610 1I TGACCTAGAG -/T ATTTTATTCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 0 1 134406 CASAVA_Build 10 57223359 1D TTTTAGAGGC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 A 9 8 134407 CASAVA_Build 10 57225237 3D CTCCGTTTAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 2655 hom 19 8 8 4 AAT 7 6 134408 CASAVA_Build 10 57227540 1D GAAGAAAGAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 8 7 134409 CASAVA_Build 10 57227947 4D GCTGGGAAAT AATC/---- AACTTTTCAA 2045 het 2045 ref 24 16 5 6 AATC 1 0 134410 CASAVA_Build 10 57238720 5D TGCACCTGGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 21 0 18 4 T 23 18 134411 CASAVA_Build 10 57239872 5I GTTTAATTGA -----/TTTGT TTTGGTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TTTGT 0 1 134412 CASAVA_Build 10 57240255 1D TACAAATGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 346 hom 35 1 33 1 A 10 9 134413 CASAVA_Build 10 57240677 1D TATATATATA T/- TTTTTTAAGC 3070 hom 66 het 32 0 23 9 T 7 6 134414 CASAVA_Build 10 57246680 1D GCATTATAGC T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 T 7 6 134415 CASAVA_Build 10 57253250 3D AGCACCTTGT AAC/--- AACCCCTGCC 3070 hom 57 het 20 0 20 1 AAC 2 1 134416 CASAVA_Build 10 57256778 2D TAAAAAGTGA AC/-- ACACACACAC 2622 het 702 hom 34 8 8 19 AC 10 9 134417 CASAVA_Build 10 57257153 1I GTTTTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 2971 het 2971 ref 35 16 8 11 A 11 12 134418 CASAVA_Build 10 57270828 2I AATTTGAAAA --/AC AGTGACAATT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AC 0 1 134419 CASAVA_Build 10 57271287 1D ACATGGCCCC A/- AACCCTCTAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 3 2 134420 CASAVA_Build 10 57273560 5D GTTGTCACTA AGCAC/----- AGCCCATATT 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 AGCAC 1 0 134421 CASAVA_Build 10 57279182 4I CAAAAATCTT ----/GTGA GTAAGTGATT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 GTGA 0 1 134422 CASAVA_Build 10 57279446 1I AAAGTTAAAA -/T AGTTATTAGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 0 1 134423 CASAVA_Build 10 57287216 1D TGCAGTTAGC T/- GTGGCTTCTG 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 T 1 0 134424 CASAVA_Build 10 57287972 1D ACAATCTTCT C/- CATACACTTC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 C 2 1 134425 CASAVA_Build 10 57293476 1D AAAATATATT A/- AAAAATCAAT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 6 5 134426 CASAVA_Build 10 57296003 1I ATTTAAGCTG -/T TTTTTGGGTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 5 6 134427 CASAVA_Build 10 57298847 1D CAGGCATGAG C/- CCCCCACGCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 6 5 134428 CASAVA_Build 10 57301418 1D AAGAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2760 hom 34 11 14 9 T 12 11 134429 CASAVA_Build 10 57302983 4D ACACAAACAC ACAG/---- ACAGACAGAC 3070 hom 62 het 27 0 21 7 ACAG 3 2 134430 CASAVA_Build 10 57307439 1D TCTCTCTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 T 8 7 134431 CASAVA_Build 10 57309404 1I AGTGTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 10 134432 CASAVA_Build 10 57314039 1I CTCCGCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 938 hom 31 5 21 5 T 15 16 134433 CASAVA_Build 10 57323791 3I GCTTAGTATA ---/TTG TTTAAGATGT 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 TTG 0 1 134434 CASAVA_Build 10 57346545 2I GTAGGGAAGC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 2815 hom 35 9 16 10 AG 5 6 134435 CASAVA_Build 10 57354082 1D GAAAAATATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 A 9 8 134436 CASAVA_Build 10 57357766 1D TTTATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1468 het 1468 ref 12 5 3 4 T 11 10 134437 CASAVA_Build 10 57359564 1I TGGCAAGTTA -/T TGGAGCCAGA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 1 2 134438 CASAVA_Build 10 57362140 6I TAAAAAATTG ------/TTTTAC TTTGACTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TTTTAC 0 1 134439 CASAVA_Build 10 57368298 1D CATATCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 T 11 10 134440 CASAVA_Build 10 57369621 4I ATTATCTTAT ----/AAGA AAGATAGCCC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AAGA 1 2 134441 CASAVA_Build 10 57376063 4D ATTTTCTGTT TAAC/---- TAAGGTAATC 3070 het 3070 ref 32 18 9 7 TAAC 1 0 134442 CASAVA_Build 10 57377110 4D GGTTTTTAAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 9 TTTG 3 2 134443 CASAVA_Build 10 57386499 1D ATTTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 13 12 134444 CASAVA_Build 10 57390664 11D TGAATCTGAA ATTAGCTGGAT/----------- ATTTGGCTAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 7 ATTAGCTGGAT 1 0 134445 CASAVA_Build 10 57406878 1I TGCTACTCTT -/C TCTTGCCTAC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 C 0 1 134446 CASAVA_Build 10 57425593 2D TATAGGAGAA AG/-- AGAGAAAGAG 3070 het 2759 hom 29 13 14 4 AG 3 2 134447 CASAVA_Build 10 57426153 1D CTTTTATTAG A/- GACTTATTTT 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 A 1 0 134448 CASAVA_Build 10 57436894 1D CATTCTTATG C/- CCATTGCATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 3 2 134449 CASAVA_Build 10 57439036 7I GATATTTTAA -------/CTTCACC ATATTAGTTA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 CTTCACC 0 1 134450 CASAVA_Build 10 57442752 2D GCCTGAGCTG TT/-- CTATTGTGCC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 2 0 134451 CASAVA_Build 10 57450479 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 13 9 3 A 10 9 134452 CASAVA_Build 10 57475036 1D TTATTCACTG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 44 23 20 2 T 8 7 134453 CASAVA_Build 10 57478557 1D CCACATTTTT A/- AAAAACAATA 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 A 6 5 134454 CASAVA_Build 10 57483675 2I TGAATGTAAG --/TA CACACAAATA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TA 0 1 134455 CASAVA_Build 10 57485350 1I CCCCTTAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 8 9 134456 CASAVA_Build 10 57485603 1I ACTGAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 T 0 1 134457 CASAVA_Build 10 57486137 1I TCTTTAAAGT -/A AAAAAAGGTA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 6 7 134458 CASAVA_Build 10 57487035 1D AATGCACAGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 34 12 17 7 T 9 8 134459 CASAVA_Build 10 57487396 1I TCTATTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 10 11 134460 CASAVA_Build 10 57487576 1I TGACCTTATG -/C AGTTGAGGAC 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 C 0 1 134461 CASAVA_Build 10 57490126 1D GGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 458 hom 20 3 14 3 T 11 10 134462 CASAVA_Build 10 57491277 1D TTTTACTGTG A/- AGAGTCAGAG 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 2 1 134463 CASAVA_Build 10 57493271 1I TTAGAATCAC -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 48 26 21 1 T 6 7 134464 CASAVA_Build 10 57493576 1I AAATTACTTT -/A AAATGGCAAA 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 3 4 134465 CASAVA_Build 10 57495584 4I TTAGGATTTC ----/TTTG TTAGTTTTCT 3070 het 3070 hom 67 27 34 6 TTTG 0 1 134466 CASAVA_Build 10 57499076 2I TGCAAGAGTG --/TT GCACACTAGC 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 T 0 2 134467 CASAVA_Build 10 57499566 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 T 10 9 134468 CASAVA_Build 10 57499841 3I TCACAATAAA ---/TAT TATTATTCAG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 TAT 2 3 134469 CASAVA_Build 10 57500177 6I ATCTCATTGT ------/CAGAGG AATTTTGTAA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 CAGAGG 0 1 134470 CASAVA_Build 10 57501806 1I TTTCGATTAC -/T TATATCCCCA 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 T 1 2 134471 CASAVA_Build 10 57503763 9D9M4D AAGCAATACT GCTTCTGGAATTTCACAAGGGT/---------ATAAAACAA---- AATACTATAA 602 het 602 ref 34 23 2 12 N/A 0 0 134472 CASAVA_Build 10 57505582 3I CACTTGAAAA ---/GGG GCAATCAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 G 1 4 134473 CASAVA_Build 10 57507516 1D GCTCTTACAT A/- ATAAGCCTCA 3070 het 3070 hom 52 25 24 3 A 2 1 134474 CASAVA_Build 10 57508080 1D AAGAAATCAG A/- AAAAAAAAGT 1747 het 1747 ref 18 9 5 4 A 9 8 134475 CASAVA_Build 10 57508653 1I ATTTAAAAAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 7 8 134476 CASAVA_Build 10 57512059 4D CTAGTTTTGC TTTG/---- TTTGGTTTCC 3070 het 3070 ref 33 18 11 9 TTTG 2 1 134477 CASAVA_Build 10 57518411 9D ATATCATGAA AATGGCCAT/--------- AATGGCCATA 1026 het 1026 ref 19 15 3 5 AATGGCCAT 2 1 134478 CASAVA_Build 10 57520080 1D10M1I AAATAAAAAA GACAAGTTAAT-/-ACAAGTTAATA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 21 12 1 N/A 0 0 134479 CASAVA_Build 10 57537202 2D TGAAATATCA TG/-- TGTTTTATAA 3070 het 3070 ref 46 25 16 7 TG 2 1 134480 CASAVA_Build 10 57549123 4D ATTATTTGAC TTCT/---- TTAAATATTA 3070 hom 117 het 45 0 40 7 TTCT 1 0 134481 CASAVA_Build 10 57549435 1D TTCTCTCTCC T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 8 7 134482 CASAVA_Build 10 57550004 1D TGCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 10 9 134483 CASAVA_Build 10 57554942 1D TACACATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 19 0 10 10 T 12 11 134484 CASAVA_Build 10 57556232 4D AAATAAATAA ATAT/---- ATATATAAAA 2201 hom 24 het 9 0 8 1 AT 5 3 134485 CASAVA_Build 10 57561987 1D GTTAATTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 782 hom 22 3 15 5 T 13 12 134486 CASAVA_Build 10 57572163 1D TTTGACATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 43 0 28 16 T 12 11 134487 CASAVA_Build 10 57572581 1I ATTTGGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 42 1 31 10 T 11 12 134488 CASAVA_Build 10 57587889 2I ATATTTAGAT --/GA GTTTTAAATA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 GA 0 1 134489 CASAVA_Build 10 57591907 1D CAAATTTGCC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 8 7 134490 CASAVA_Build 10 57595257 1D GGGAGGGGCT A/- GGGGCATAAG 3070 het 3070 hom 41 16 21 6 A 1 0 134491 CASAVA_Build 10 57597049 1D TACATTGCAA T/- TTTAATTGAC 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 T 4 3 134492 CASAVA_Build 10 57599645 1I GTCTCAACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 30 0 24 6 T 9 10 134493 CASAVA_Build 10 57600211 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 792 hom 27 2 18 7 T 13 12 134494 CASAVA_Build 10 57625249 1I GTTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 27 1 25 1 G 0 1 134495 CASAVA_Build 10 57636452 11D GAGTCTTAGT GTATTTAACTA/----------- GTTTGATCAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 5 GTATTTAACTA 1 0 134496 CASAVA_Build 10 57640291 1D ATAATTGAAT C/- ATGGGGGCAG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 1 0 134497 CASAVA_Build 10 57641427 2D GGTATAATTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 11 9 134498 CASAVA_Build 10 57642945 2I CAATGTGACA --/AT GTGTCCACAA 3070 hom 164 het 62 0 51 11 AT 0 1 134499 CASAVA_Build 10 57648922 1I TGCATAATGA -/G TAAATATTTA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 G 0 1 134500 CASAVA_Build 10 57650703 8D TATCCAGGTC TATTTACT/-------- TATTTACTTA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 TATTTACT 2 1 134501 CASAVA_Build 10 57654016 1I TCACCAGTAT -/A AATAAAGCTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 3 134502 CASAVA_Build 10 57655109 1I ATGTAAAATT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 8 134503 CASAVA_Build 10 57655249 2D TTTTTCTTTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 22 0 16 10 TA 6 5 134504 CASAVA_Build 10 57655668 3I AAAATAAAAC ---/AAG AAAAAGAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAG 0 1 134505 CASAVA_Build 10 57657064 1I ATTAACAATT -/A AAAAAATGTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 6 7 134506 CASAVA_Build 10 57657660 1I ATCATGTTGC -/T TGGCTAAACT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 1 2 134507 CASAVA_Build 10 57658613 5D ATTATCTGGC TCTTG/----- TCTTAGTTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TCTTG 1 0 134508 CASAVA_Build 10 57660666 2D ATATTCAGCG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 33 0 26 7 A 14 12 134509 CASAVA_Build 10 57662084 2D TGTATATATG TA/-- TATGTTATTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TA 2 1 134510 CASAVA_Build 10 57662791 1I TTTCTGAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 41 0 31 10 A 9 10 134511 CASAVA_Build 10 57663520 1D TGCAACTGTT A/- AACCAAATGG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 3 2 134512 CASAVA_Build 10 57667805 1I ACTTGACTAA -/T TATATTTCAT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 1 2 134513 CASAVA_Build 10 57668007 1D TGACACTGTA G/- GAAGTCCTCA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 G 2 1 134514 CASAVA_Build 10 57670428 1D CAGCAAACAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 9 8 134515 CASAVA_Build 10 57688153 2D GTATTCCTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1041 hom 39 14 16 10 T 18 16 134516 CASAVA_Build 10 57690703 1I CTGTTTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 T 10 11 134517 CASAVA_Build 10 57699179 1I GAAATGTATC -/A AAAAGTGAGT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 4 5 134518 CASAVA_Build 10 57702990 6D CAATACTGAT GAGCAA/------ GAACAAGGAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 7 GAGCAA 1 0 134519 CASAVA_Build 10 57704124 1D ATCACGCTCC A/- TGATTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 17 2 A 1 0 134520 CASAVA_Build 10 57713611 2D TCTTCTCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 13 8 A 13 11 134521 CASAVA_Build 10 57713993 4D TGGTTATCTT TCTA/---- TCTTAGTAAT 3070 het 3070 ref 53 28 22 4 TCTA 1 0 134522 CASAVA_Build 10 57729638 2I GTGGGGGGGG --/GC GGTAAAATAG 3070 het 325 hom 30 7 21 2 GC 0 1 134523 CASAVA_Build 10 57738156 1I ATGATTTCAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 8 9 134524 CASAVA_Build 10 57742361 4D ATTCTTATAC ATAA/---- ATAAATATTG 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 ATAA 2 1 134525 CASAVA_Build 10 57744801 1I TCTCTTGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 11 12 134526 CASAVA_Build 10 57748991 4D CCTGGGTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 458 het 458 ref 46 21 3 23 TTTG 1 0 134527 CASAVA_Build 10 57750582 1D ACTATGTCAA G/- CAACAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 G 1 0 134528 CASAVA_Build 10 57750708 6I ATAAACATAT ------/ATGTGC ATGTGTCTTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 ATGTGC 0 1 134529 CASAVA_Build 10 57758034 2D TACCTTTACC TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 10 8 134530 CASAVA_Build 10 57758877 1I TTTCACAAAA -/C GAGACTGATA 3070 het 3070 ref 45 19 21 5 C 0 1 134531 CASAVA_Build 10 57760586 1I ACTAGGACAT -/A AAACACAATT 3070 het 3070 ref 39 25 13 1 A 3 4 134532 CASAVA_Build 10 57776689 1I ATACTACAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 10 134533 CASAVA_Build 10 57783792 3D CCTCACTGAT CAC/--- CACTGCTGCA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 CAC 2 1 134534 CASAVA_Build 10 57785724 4D AGAATGAATG AATA/---- AATAAGTAAA 3070 het 3070 hom 49 22 23 9 AATA 2 1 134535 CASAVA_Build 10 57786503 1I GTGACAAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 T 14 15 134536 CASAVA_Build 10 57794390 1I TCTTTAAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 8 9 134537 CASAVA_Build 10 57794550 2D GTGTTCTAGA CT/-- CTCTGAAGCA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 CT 3 2 134538 CASAVA_Build 10 57795554 2D TATGTATATC TA/-- TATATATATA 494 het 494 ref 9 3 3 3 TA 6 5 134539 CASAVA_Build 10 57802333 12D TACTCAAATA ACAGTTTGACAC/------------ AATAACCTCA 3070 het 3070 ref 36 26 10 4 ACAGTTTGACAC 1 0 134540 CASAVA_Build 10 57820750 3I ATTATACAAT ---/AAG AAGAACAGTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AAG 1 2 134541 CASAVA_Build 10 57828568 2I TCTCAGTCTC --/TT CTACTTTATG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 0 2 134542 CASAVA_Build 10 57839734 1D CTGGCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 11 12 A 15 14 134543 CASAVA_Build 10 57846294 1I TTTTATTTCA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 6 7 134544 CASAVA_Build 10 57858857 5I TGTGAAAGAT -----/AGGTA AGGTAAGTTG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 AGGTA 1 2 134545 CASAVA_Build 10 57879163 1D GCCAAATCTG C/- CCCCCCCCCT 3070 het 11 hom 20 1 15 4 C 10 9 134546 CASAVA_Build 10 57883307 1I AAAATAGTAT -/A AATCTTCATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 3 134547 CASAVA_Build 10 57890509 1D CTAGAAATCA T/- TGTGACTTGA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 2 1 134548 CASAVA_Build 10 57910602 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3069 het 2878 hom 29 10 11 8 T 15 16 134549 CASAVA_Build 10 57912067 8I TGATTGCCCA --------/CAACTAGG GGAGTTGGGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CAACTAGG 0 1 134550 CASAVA_Build 10 57918141 1I AAATATATAA -/T TTTTTCATGC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 5 6 134551 CASAVA_Build 10 57919127 1D CCTTTTGATA T/- GAAGATGCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 0 134552 CASAVA_Build 10 57920974 2I AAGAAAAAAA --/AC AATAATTAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AC 0 1 134553 CASAVA_Build 10 57925974 1I AACTTCTTCT -/A AGGCTTGTAA 3070 hom 144 het 50 0 49 1 A 1 2 134554 CASAVA_Build 10 57927614 1D CTTTTTTTTT A/- ATTGTTCATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 2 1 134555 CASAVA_Build 10 57928744 1D GAAACTGGGA G/- GGGCTTTAGT 3070 hom 106 het 41 0 35 6 G 4 3 134556 CASAVA_Build 10 57934043 1I CTAGATCTAT -/G GTTAAGCAGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 1 2 134557 CASAVA_Build 10 57942681 1D ACAATTTATA T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 T 8 7 134558 CASAVA_Build 10 57949667 1I AGGGGGTTCC -/A AACTCTCCCA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 2 3 134559 CASAVA_Build 10 57954347 1D TTTCATTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 A 11 10 134560 CASAVA_Build 10 57955599 1D CCTTTACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 40 0 29 11 T 11 10 134561 CASAVA_Build 10 57959087 1I TATTCAATTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2600 hom 18 7 9 2 T 9 10 134562 CASAVA_Build 10 57961702 1D AAAGTATAGT A/- AAAAAATTTT 2187 hom 15 het 9 0 6 4 A 7 6 134563 CASAVA_Build 10 57962792 1I TGTCACAAGT -/A AAGTATTGGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 3 134564 CASAVA_Build 10 57964357 1D ATGAGGAAAA C/- ATTAGAGATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 1 0 134565 CASAVA_Build 10 57973438 1D TACTTGGAAA C/- CATTGAGAAG 2677 het 2096 hom 12 5 6 2 C 2 1 134566 CASAVA_Build 10 57979927 1I ACTGGCCATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 9 10 134567 CASAVA_Build 10 57994653 4I GAAATGTGTT ----/AATG ATTGCCTTGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AATG 0 1 134568 CASAVA_Build 10 58006342 1I TAGTTTATAG -/T TTTTTTAACA 3070 het 1938 hom 19 6 11 2 T 6 7 134569 CASAVA_Build 10 58009715 6I TGACAATGTA ------/ATAAAC ATAAAGTATT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 ATAAAC 0 1 134570 CASAVA_Build 10 58013032 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 TA 7 6 134571 CASAVA_Build 10 58018626 1I AAAGTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 T 10 11 134572 CASAVA_Build 10 58022510 1I TATTTATTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 T 8 9 134573 CASAVA_Build 10 58024651 1I GAGTAAGAAC -/A AAAACTTAGT 3070 het 3070 ref 56 29 20 7 A 4 5 134574 CASAVA_Build 10 58025289 1I TTTCCATGTT -/G TTCTGCCTGC 3070 hom 126 het 46 0 39 7 G 0 1 134575 CASAVA_Build 10 58027275 3D AAAGAGGAGA TAT/--- TATTATTGTT 3070 het 3070 ref 50 25 20 6 TAT 3 2 134576 CASAVA_Build 10 58030295 1I GCTAAAATAT -/G GGATTCTAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 G 2 3 134577 CASAVA_Build 10 58030830 2D TTTTGAAATT TG/-- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 TG 2 1 134578 CASAVA_Build 10 58045040 3D AAAATTGTAG AAC/--- AATATCATCA 3070 het 3070 hom 37 15 20 4 AAC 1 0 134579 CASAVA_Build 10 58053741 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 A 8 9 134580 CASAVA_Build 10 58057140 2I TATCAAAACA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 T 9 11 134581 CASAVA_Build 10 58058036 1D ACAATTTGAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 A 8 7 134582 CASAVA_Build 10 58060370 1D TACACATTTA T/- TTTTTACCCA 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 T 6 5 134583 CASAVA_Build 10 58060456 1I GATTTTGGGG -/A AAAAAGTCTC 3070 het 3070 ref 45 20 22 3 A 5 6 134584 CASAVA_Build 10 58062595 1D ATCCCCTTCC T/- TTTTTGTGTG 3070 het 3070 ref 60 30 23 8 T 6 5 134585 CASAVA_Build 10 58063058 4D TATAGCAGGC TAAT/---- TAATAAATGG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 TAAT 2 1 134586 CASAVA_Build 10 58063654 2D TGTCATTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 T 16 14 134587 CASAVA_Build 10 58075385 1I TATTATCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 337 hom 25 2 13 10 T 13 14 134588 CASAVA_Build 10 58078383 6I CTTTATTCAT ------/ATTTTA ATTTTAACAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATTTTA 1 2 134589 CASAVA_Build 10 58084380 3D TGAAGATAAA ATG/--- ATAAGAAGTT 3070 het 3070 hom 47 22 23 2 ATG 1 0 134590 CASAVA_Build 10 58084808 1D CCTGTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 38 1 12 25 A 15 14 134591 CASAVA_Build 10 58085626 4D CATTTTAGAA AGAT/---- CTTTATACTA 3070 het 3070 ref 30 16 12 4 AGAT 1 0 134592 CASAVA_Build 10 58086303 2D TTTTCTTTCT TC/-- TTTTTTTAAA 3070 hom 11 het 26 1 19 6 TC 1 0 134593 CASAVA_Build 10 58087159 1D TTTTTGATGG A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 A 1 0 134594 CASAVA_Build 10 58087288 1D TAGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1770 het 1472 hom 26 9 10 7 T 15 14 134595 CASAVA_Build 10 58094205 1I AAAAGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 9 10 134596 CASAVA_Build 10 58097834 5I ATAAAAAAGA -----/TTAAT TTATGAGCCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTAAT 0 1 134597 CASAVA_Build 10 58103664 1D GTTTAATATT C/- CCACAAACAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 C 3 2 134598 CASAVA_Build 10 58104309 1D AATATGGAAT A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 33 15 15 4 A 7 6 134599 CASAVA_Build 10 58106137 1I CTTGTAACAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2598 hom 21 7 11 3 T 9 10 134600 CASAVA_Build 10 58121723 1D TTCTACAGGA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 105 het 41 0 36 7 T 9 8 134601 CASAVA_Build 10 58123208 9I TGAAAAATGC ---------/TCAATATCA TCAATATCAC 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 TCAATATCA 1 2 134602 CASAVA_Build 10 58123926 1D AGTTAAAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 9 8 134603 CASAVA_Build 10 58124744 1I GTTGCCAAAA -/G TCACATGCAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 0 1 134604 CASAVA_Build 10 58126882 2D ATTAAAAATT AA/-- AAAGAGTATA 2909 het 1607 hom 17 5 7 6 A 5 3 134605 CASAVA_Build 10 58127390 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2042 hom 30 8 16 6 A 14 15 134606 CASAVA_Build 10 58128685 1D CTGCTTTTTG T/- TTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 6 5 134607 CASAVA_Build 10 58129226 1D CAGCTGTATG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 8 7 134608 CASAVA_Build 10 58130322 5I CAATAAATCT -----/TAAAA TAAAATGTAA 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 TAAAA 1 2 134609 CASAVA_Build 10 58136446 1I TATACAAAAT -/G GACTATGTGT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 1 2 134610 CASAVA_Build 10 58136602 2D TAAATGTGAC TG/-- TGAACATTTT 3070 het 3070 ref 41 22 19 1 TG 2 1 134611 CASAVA_Build 10 58137221 1D AAACTAAGTA T/- TTACATGACA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 3 2 134612 CASAVA_Build 10 58137541 2D TATATAATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 17 8 7 2 TA 8 7 134613 CASAVA_Build 10 58144231 1D ACTAAATCGT G/- GAGCTCTATA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 G 2 1 134614 CASAVA_Build 10 58144498 1D AAAGATGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 195 hom 28 2 12 14 T 11 10 134615 CASAVA_Build 10 58145537 1D AGTACTTGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 18 7 8 3 T 9 8 134616 CASAVA_Build 10 58145678 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCTCCCC 1394 hom 7 het 3 0 3 0 C 5 6 134617 CASAVA_Build 10 58146521 1D AGAAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 13 12 134618 CASAVA_Build 10 58147310 1I TTACAAATTT -/A TACATCATGA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 134619 CASAVA_Build 10 58153858 48I GACGGGGTTT ------------------------------------------------/CACCGTGTTAGCGAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCC CACCTCGGCC 2177 hom 18 het 7 0 6 1 CACCGTGTTAGCGAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCC 0 1 134620 CASAVA_Build 10 58157094 2D ATGAACACAC AT/-- GTGTGTATAT 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 AT 1 0 134621 CASAVA_Build 10 58161847 1I AATTTTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 16 19 16 T 14 15 134622 CASAVA_Build 10 58165694 1I TACATTTTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 9 10 134623 CASAVA_Build 10 58166250 1I TTGATCATCT -/C CCAAATAAAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 2 3 134624 CASAVA_Build 10 58167318 1D ACTTATTCAG C/- AATTAAATCA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 1 0 134625 CASAVA_Build 10 58168344 1I ATCCTGACCA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 8 9 134626 CASAVA_Build 10 58168792 1I GGAAGAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 10 12 T 11 12 134627 CASAVA_Build 10 58171821 1I GGTGACAAGA -/G AAAGAGAGTA 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 G 0 1 134628 CASAVA_Build 10 58171967 13D TTCAACATAT GAATTTGGCAGTG/------------- GAGGGCACAA 3070 het 3070 ref 31 24 9 3 GAATTTGGCAGTG 1 0 134629 CASAVA_Build 10 58174434 1D AGTGAAGCTG C/- AGACCTTCGA 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 C 1 0 134630 CASAVA_Build 10 58175039 2D CAATCCAAAA TG/-- TGGCCCACTA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 TG 2 1 134631 CASAVA_Build 10 58175934 23I TCTTAGAAAC -----------------------/TAAAGACTTAGAAACTTAGACTT AGCTAAAGTC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TAAAGACTTAGAAACTTAGACTT 0 1 134632 CASAVA_Build 10 58177126 3I TTTGATTAAC ---/AAA ATATAAGTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 1 4 134633 CASAVA_Build 10 58179165 4D ATTTTAAAAT TAGA/---- TAGAAATTTC 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 TAGA 2 1 134634 CASAVA_Build 10 58180632 1D TATTTTTTTT G/- TTGTTAAAGC 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 1 0 134635 CASAVA_Build 10 58182996 1I62M4I GCCTAAAAAA -TTTTTAAATAGAAAAAGACATATAAAATAAAGATATGAAATATTTTGCACAGCTGTACAATG----/TTTTTTAAATAGAAAAAGACATATAAAATAAAGATATGAAATATTTTGCACAGCTGTACAATGTGTT TGTATTTTAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 19 N/A 0 0 134636 CASAVA_Build 10 58184685 1D ACTAGATATA T/- TTTTTTTTTC 1505 het 1505 ref 33 14 5 14 T 10 9 134637 CASAVA_Build 10 58190722 1I CTCAAAAAAG -/A AAGAAATTTC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 2 3 134638 CASAVA_Build 10 58198109 6D CATCAATGTT TATATA/------ TATATATATA 2183 hom 12 het 9 0 5 5 TA 11 8 134639 CASAVA_Build 10 58198336 3D TAAGTCCAAT ACC/--- ACTTTACATT 3070 het 3070 hom 34 14 19 4 ACC 1 0 134640 CASAVA_Build 10 58202641 2D ATTGGCAGAC TG/-- TATATAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 TG 1 0 134641 CASAVA_Build 10 58205899 1D AATTCGGGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 A 10 9 134642 CASAVA_Build 10 58214203 4D TCTCTTTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 66 het 28 0 20 8 TCTT 3 2 134643 CASAVA_Build 10 58215360 1I ACAATACATA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 8 9 134644 CASAVA_Build 10 58217458 4D ATACTTTCCT TTGA/---- TTGACTGATT 3070 hom 140 het 50 0 47 6 TTGA 2 1 134645 CASAVA_Build 10 58217798 3I TTCAAAGTTA ---/TTC TTCTCTTCAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TTC 1 2 134646 CASAVA_Build 10 58218479 2I CTTCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 33 1 23 9 T 10 12 134647 CASAVA_Build 10 58219844 1D TATATGGTCA C/- CCTCCAAATT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 3 2 134648 CASAVA_Build 10 58220470 4D ATGTATGCAG CAGA/---- CAAAGACCTT 3070 hom 105 het 37 0 36 3 CAGA 1 0 134649 CASAVA_Build 10 58221620 1D TAAAGTTTCT A/- ACAAGATTGA 3070 hom 135 het 53 0 46 8 A 2 1 134650 CASAVA_Build 10 58224398 1I GAGGGAAAAG -/A AAAAGCTGTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 4 5 134651 CASAVA_Build 10 58226484 3I GTTTCATTCC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 29 0 23 6 T 14 17 134652 CASAVA_Build 10 58226841 1I66M1D ATTACTATGG -TTTGTCTGCTCATAACTGTTATACCCGTGTGTCTCTCACTTGCATACCTGATTGTTTTATGTTTGCA/TTTTGTCTGCTCATAACTGTTATACCCGTGTGTCTCTCACTTGCATACCTGATTGTTTTATGTTTGC- AAAAATATGT 3070 hom 163 het 38 0 55 2 N/A 0 0 134653 CASAVA_Build 10 58232763 1D AATAAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 11 10 134654 CASAVA_Build 10 58234325 1D TTTACAGATG A/- AAAAAAGGCA 3070 hom 124 het 50 0 42 8 A 7 6 134655 CASAVA_Build 10 58234470 2D GAAAAATGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 36 1 26 9 A 17 15 134656 CASAVA_Build 10 58234529 1I TTTCAAATTT -/C CCATTTAGTA 3070 hom 73 het 36 0 27 9 C 2 3 134657 CASAVA_Build 10 58236025 1D GTACAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 34 1 23 10 A 12 11 134658 CASAVA_Build 10 58240693 1D TTTATAGTGA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 34 0 27 8 T 9 8 134659 CASAVA_Build 10 58243918 1I TGACTGCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 27 1 17 9 A 10 11 134660 CASAVA_Build 10 58244761 2D TCTTTGAAGA AC/-- CTTCTTTCTG 3070 hom 99 het 39 0 33 7 AC 1 0 134661 CASAVA_Build 10 58246625 3I TAACAGCACA ---/AAC AACAGCCAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAC 1 2 134662 CASAVA_Build 10 58255825 1D ACAACAGTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 10 9 134663 CASAVA_Build 10 58258730 1D AAGACATGAA C/- AGCTATTTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 1 0 134664 CASAVA_Build 10 58259325 4D AAAACAACGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 63 het 31 0 23 11 AAAC 5 4 134665 CASAVA_Build 10 58265284 3D AATGAGATGA TAT/--- TATGGCAGTC 3070 het 3070 hom 42 20 21 2 TAT 2 1 134666 CASAVA_Build 10 58265928 1D AGAAAAAAAA T/- ATATAAAATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 0 134667 CASAVA_Build 10 58281640 4D AGTGTGTGTC TGTT/---- TGTTTTAGTG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TGTT 2 1 134668 CASAVA_Build 10 58287701 1I AGTGTAGAGA -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 134669 CASAVA_Build 10 58297430 1D GACCTGTTGG A/- AAAAAACACT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 6 134670 CASAVA_Build 10 58302209 1I CCCAGTTAAG -/A AACAAGACAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 2 3 134671 CASAVA_Build 10 58302410 1I ACACATACTT -/A ACCAAGCACC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 1 2 134672 CASAVA_Build 10 58303178 2D AAAAGAAGAG AA/-- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 10 8 134673 CASAVA_Build 10 58309727 1I CAGAATAATT -/G GCCATTAAGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 2 134674 CASAVA_Build 10 58310852 4D CTCAGTCAAA TTCT/---- TTCTTCTGAG 3070 het 3070 hom 43 20 19 5 TTCT 2 1 134675 CASAVA_Build 10 58314860 2D AAAAAAAAAA AG/-- CAGCTCCAAG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 AG 1 0 134676 CASAVA_Build 10 58316559 1I GTTTTCAGAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 8 9 134677 CASAVA_Build 10 58326159 4I GTGTGGTTTC ----/TTAA TTATTACCCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTAA 0 1 134678 CASAVA_Build 10 58333044 2D TTTCAAATTT TC/-- TTTTTGTCAC 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 TC 1 0 134679 CASAVA_Build 10 58339143 1D TACAGAACCA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 1540 hom 30 12 10 8 T 1 0 134680 CASAVA_Build 10 58343505 1I CCTGTATCAA -/T GGGACTGCCA 3070 hom 87 het 39 0 28 11 T 0 1 134681 CASAVA_Build 10 58344105 2I AAATATTCCC --/TG TTCACTGCAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TG 0 1 134682 CASAVA_Build 10 58344547 3D AGTGATCATA CTT/--- CTAAGGATGA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 CTT 1 0 134683 CASAVA_Build 10 58346388 2D AAAAGAAACC TT/-- TTTGACAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 3 134684 CASAVA_Build 10 58348212 2I AGTGTGTAAC --/AT GTGGTCACAG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 AT 0 1 134685 CASAVA_Build 10 58349168 1D AAAATGCTCT C/- CTTTTTTTTT 3070 het 296 hom 30 5 17 8 C 2 1 134686 CASAVA_Build 10 58355678 1I TGTCAGATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 30 0 22 8 A 10 11 134687 CASAVA_Build 10 58368475 2D TTAATAAGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AT 6 5 134688 CASAVA_Build 10 58378982 1I TCACCAGCAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 8 9 134689 CASAVA_Build 10 58381081 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAACA 2364 het 2364 ref 27 14 8 5 A 9 8 134690 CASAVA_Build 10 58381420 5D ATTGTTTTGA TATCT/----- TCTCTAAGAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 7 TATCT 1 0 134691 CASAVA_Build 10 58387774 2D CTGATTGTGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 72 het 30 0 24 7 GT 6 5 134692 CASAVA_Build 10 58389233 1I TTCAAAAAGA -/G ATCAGGCTGG 3070 hom 120 het 41 0 41 0 G 0 1 134693 CASAVA_Build 10 58390964 2I CTTAAAGTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 10 12 134694 CASAVA_Build 10 58392269 1D TCAGCTAAAT G/- AAAATAACAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 0 134695 CASAVA_Build 10 58395927 1D CATCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 22 1 13 8 A 13 12 134696 CASAVA_Build 10 58401251 11D AACCAAAATG TAACCAGCTGT/----------- TCTCCATCTC 3070 hom 48 het 16 0 16 3 TAACCAGCTGT 1 0 134697 CASAVA_Build 10 58401912 1I GAGTAAAAGT -/G GGGGGGGGTC 3070 het 71 hom 31 1 24 6 G 8 9 134698 CASAVA_Build 10 58408023 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 TG 6 7 134699 CASAVA_Build 10 58417746 1I GCAATACAGG -/A AAAGATGCTA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 3 4 134700 CASAVA_Build 10 58418443 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 29 1 15 13 A 13 12 134701 CASAVA_Build 10 58444574 1D AATCTCAGGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 T 9 8 134702 CASAVA_Build 10 58446396 1I ACACAGTTAG -/T TAACTGCATA 3070 hom 126 het 53 0 43 10 T 1 2 134703 CASAVA_Build 10 58452338 1I GGGTTATGGA -/T TTTTTTGAAG 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 6 7 134704 CASAVA_Build 10 58460882 2I ATAAGAACAA --/AT ATATATATAT 3070 het 453 hom 21 1 17 3 AT 5 6 134705 CASAVA_Build 10 58462000 1I ACTGAAAGGG -/A GACAATGTAG 3070 hom 39 het 21 0 15 6 A 0 1 134706 CASAVA_Build 10 58462370 1I GGAAAAGCCA -/C AGACACTCAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 0 1 134707 CASAVA_Build 10 58479221 2D GTCTGCTCTT GG/-- TCACCCTCTG 3070 hom 108 het 38 0 36 4 G 2 0 134708 CASAVA_Build 10 58495140 1D TAATCATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 T 11 10 134709 CASAVA_Build 10 58495394 1I CCTCATAGAA -/T GAGTTAGTAA 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 T 0 1 134710 CASAVA_Build 10 58513903 1I AGCTCCCTTT -/C TTTCTCTCTC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 C 0 1 134711 CASAVA_Build 10 58515328 2D AGGATTACCC AA/-- ATACCTATTT 3070 het 3070 ref 31 18 13 3 A 3 1 134712 CASAVA_Build 10 58516064 3D TCAAATTCAT AGA/--- AGTAGAGAAT 3070 het 3070 ref 65 40 21 4 AGA 1 0 134713 CASAVA_Build 10 58518345 1I CATTTTGGTC -/A CAACCATTTA 3070 het 3070 hom 55 22 28 5 A 0 1 134714 CASAVA_Build 10 58522232 1D AAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 1047 het 1047 ref 8 4 3 1 T 10 9 134715 CASAVA_Build 10 58526922 1D AGTGAAGGAG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 9 8 134716 CASAVA_Build 10 58528832 4I CGATAAAAAT ----/ACAC AGATAGCTTA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 AC 0 2 134717 CASAVA_Build 10 58531128 8I GTTTTTGCAA --------/TTTCTCAC TGTAAACAAT 2747 het 1565 hom 12 4 7 1 TTTCTCAC 0 1 134718 CASAVA_Build 10 58532820 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 A 9 10 134719 CASAVA_Build 10 58533003 1I TGCTCTCCCC -/G TTCGCAGAAG 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 G 0 1 134720 CASAVA_Build 10 58534147 1D GCATTTTCTT A/- ATGACAAACT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 2 1 134721 CASAVA_Build 10 58534629 5I TAAGCCATAC -----/CTATG CTCTTCTGGT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 CTATG 0 1 134722 CASAVA_Build 10 58536802 1I CCTCAGGGAG -/C TTTTACTCGT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 C 0 1 134723 CASAVA_Build 10 58541141 10I ATAAAATAGA ----------/AATTCTAGGG AAATTATAGG 2505 het 2505 ref 21 11 6 4 AATTCTAGGG 0 1 134724 CASAVA_Build 10 58541361 1I AGACCTTGGA -/T TTTTGGAGCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 4 5 134725 CASAVA_Build 10 58542061 1D TCATTTATTA T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 7 6 134726 CASAVA_Build 10 58542991 1D ATTTATTATA T/- TTTTCCTTCT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 5 4 134727 CASAVA_Build 10 58543156 6I GTGAACATTT ------/CATATG CACCTGAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 CATATG 0 1 134728 CASAVA_Build 10 58544213 1D ATTTTCATTG T/- TTTTTAACAT 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 T 6 5 134729 CASAVA_Build 10 58550802 1D AGTACTGTGT A/- ATATATACTC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 2 1 134730 CASAVA_Build 10 58557656 8D CTGGCTATAT TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 1696 het 1696 ref 14 10 5 0 TTTA 4 2 134731 CASAVA_Build 10 58557830 1I TGTCTCATCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 T 8 9 134732 CASAVA_Build 10 58561056 2I AAAATATAAC --/AA GTTTGAGTGT 3070 het 3070 hom 38 10 20 8 A 0 2 134733 CASAVA_Build 10 58567361 5D TAGAAGAATA GGTGG/----- GTAAATCAAA 3019 het 3019 ref 27 18 7 3 GGTGG 1 0 134734 CASAVA_Build 10 58580193 1D TCGAATGGGG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 A 7 6 134735 CASAVA_Build 10 58585397 1D GATAAAGAAC T/- TTTTTTCACT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 7 6 134736 CASAVA_Build 10 58586967 1I AACATAACCA -/T TTTTACATGA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 4 5 134737 CASAVA_Build 10 58588346 1D TACGAAAACG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 10 9 134738 CASAVA_Build 10 58589977 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 10 11 134739 CASAVA_Build 10 58592092 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 2796 het 2796 ref 27 10 11 6 A 13 14 134740 CASAVA_Build 10 58597850 3D TAGCTACAAC AAT/--- GTTATGAGGG 3070 het 3070 ref 38 23 14 2 AAT 1 0 134741 CASAVA_Build 10 58598177 1I CATTACCACA -/G GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 G 5 6 134742 CASAVA_Build 10 58600849 2I AAATGTGGTG --/TA TATATATATG 2447 het 2447 ref 30 15 7 8 TA 4 5 134743 CASAVA_Build 10 58601574 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 9 10 134744 CASAVA_Build 10 58605952 1D TACATCTGAA G/- TTAGAGCTTC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 G 1 0 134745 CASAVA_Build 10 58607288 1D TAAGGAGATC A/- AGAAGAAATA 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 A 2 1 134746 CASAVA_Build 10 58608916 5D ATTAGAAGTA TTCTC/----- TTCTATTATT 3070 het 3070 hom 44 23 19 2 TTCTC 1 0 134747 CASAVA_Build 10 58609358 2D TAGTTTGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1970 het 852 hom 35 7 10 20 T 16 14 134748 CASAVA_Build 10 58609961 1I TTATTGTCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 T 8 9 134749 CASAVA_Build 10 58610286 1D CGAAGTACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 12 11 134750 CASAVA_Build 10 58610471 1D GTCTTTGTTC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 T 8 7 134751 CASAVA_Build 10 58611856 1I TGTTTATCCG -/T TCACCTATTG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 1 2 134752 CASAVA_Build 10 58612935 2D TTCAATTGCC AA/-- AAAAAAAACC 3070 het 687 hom 49 5 22 22 A 10 8 134753 CASAVA_Build 10 58615470 3D ACTGCCAGTA TGG/--- TAACTCTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 TGG 1 0 134754 CASAVA_Build 10 58623441 1I CTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 A 10 11 134755 CASAVA_Build 10 58625455 5I AAAATGTTTT -----/AATAA AATAAAGAAT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 AATAA 1 2 134756 CASAVA_Build 10 58627487 2D AGATACAAGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 41 11 20 10 AG 10 9 134757 CASAVA_Build 10 58628007 1D TTGAAAAGAA C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 C 8 7 134758 CASAVA_Build 10 58635450 1D TTTTGGCCAC T/- TTTTTTGAAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 7 6 134759 CASAVA_Build 10 58635760 1D AACAAAAAAA T/- GTGTTCTCTT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 T 1 0 134760 CASAVA_Build 10 58635979 2I42M4I GTATTAACAC --ATATGCACACATTTCAGTTTTGAACTGGAATTAACATTTGAA----/ATATATGCACACATTTCAGTTTTGAACTGGAATTAACATTTGAATATT TATTATTTTC 3070 het 3070 hom 36 21 24 3 N/A 0 0 134761 CASAVA_Build 10 58637181 4I TGAGACTCCG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 AAAC 4 5 134762 CASAVA_Build 10 58641735 4D CTGTCCTAAC AGAG/---- GGAGGATTCA 3070 het 3070 ref 38 23 13 6 AG 2 0 134763 CASAVA_Build 10 58643651 9D TGTTGTTGTC GTTGTTGTT/--------- GTTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 28 19 10 2 GTT 7 4 134764 CASAVA_Build 10 58649599 4D TTTTATGGAC ACTG/---- ACTGGATCCT 3070 het 3070 ref 33 22 10 2 ACTG 2 1 134765 CASAVA_Build 10 58655285 4I ATAAATTAAA ----/TAAG TAAGCTAAAA 2666 het 2666 ref 27 16 7 4 TAAG 1 2 134766 CASAVA_Build 10 58657825 1D CCAATTTTCT A/- AAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 A 5 4 134767 CASAVA_Build 10 58660519 2I GCATCTAGTG --/AC ACAGTGGCCT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 AC 1 2 134768 CASAVA_Build 10 58663796 2I AGTAATAACC --/AA AAAACATTCA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 4 6 134769 CASAVA_Build 10 58664439 4D GGCTTGCAGC AAGG/---- ATTCCTATCT 3070 het 3070 ref 45 23 19 5 AAGG 1 0 134770 CASAVA_Build 10 58665243 1D AATAATCCTG T/- TTTTTGTTGT 2272 het 2272 ref 20 9 5 6 T 6 5 134771 CASAVA_Build 10 58666511 3I ATGTGAGAGA ---/AAG AATAAGAAGG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 AAG 0 1 134772 CASAVA_Build 10 58666930 2D GGTAGAGAGC AG/-- AGAGAGCAAG 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 AG 4 3 134773 CASAVA_Build 10 58669213 1I CTCCATGTTG -/T TTTTTGTGAT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 5 6 134774 CASAVA_Build 10 58673056 9D TTATAACATT AAATCATTA/--------- ATTTTGAGCA 3070 het 3070 ref 29 16 13 2 AAATCATTA 1 0 134775 CASAVA_Build 10 58673222 1D GAGTGCAATG C/- CCACTATCAT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 C 3 2 134776 CASAVA_Build 10 58673685 2D ATTTATTAAC AT/-- ATGTGGATTT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 AT 2 1 134777 CASAVA_Build 10 58673921 1I CAGGTTATAT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 6 7 134778 CASAVA_Build 10 58677368 11I AGCAAGTTAT -----------/CCTTCACGAGG CCTGCAAAGG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 CCTTCACGAGG 0 1 134779 CASAVA_Build 10 58678944 1I GTTTGAACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 9 10 134780 CASAVA_Build 10 58679404 2I AGAATGTGAG --/AC AGAGATTTTC 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 AC 0 1 134781 CASAVA_Build 10 58680929 1D GCATGAACTT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 39 19 19 4 A 9 8 134782 CASAVA_Build 10 58681642 1I TGATTCTGGG -/T TTTTCTCACT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 4 5 134783 CASAVA_Build 10 58683052 2I ATAGGCAGAC --/AA GGGTAATTTC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 0 2 134784 CASAVA_Build 10 58726512 4D ATATATTCTT ACAC/---- AATTACTATA 951 het 951 ref 8 4 2 3 AC 2 0 134785 CASAVA_Build 10 58764436 1D ATGCCAGCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 10 9 134786 CASAVA_Build 10 58793821 1I TGACTAATAG -/A AGGAGGTTCT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 1 2 134787 CASAVA_Build 10 58799646 1D ATTAATGAAC A/- AAAAATGAAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 6 5 134788 CASAVA_Build 10 58825897 10D TAATTTTGTG GAGCTTGACT/---------- GAAACGCATA 3070 het 3070 ref 50 31 19 8 GAGCTTGACT 1 0 134789 CASAVA_Build 10 58831296 1I ACATGCAATG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 7 8 134790 CASAVA_Build 10 58833304 1I TTCTATGAAC -/T TTATGTTTGA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 2 3 134791 CASAVA_Build 10 58839822 2D AAGTTAGATA AC/-- ACATATTCAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AC 2 1 134792 CASAVA_Build 10 58840201 1I TTCCATTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 9 10 134793 CASAVA_Build 10 58841651 2I TTAAAGAGAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 10 12 134794 CASAVA_Build 10 58845934 5D AATGATAATG TGGAT/----- TGGTTTCTGA 3070 hom 57 het 23 0 19 5 TGGAT 1 0 134795 CASAVA_Build 10 58846122 1D CTAATTTTTT G/- TATTTTTAGT 3070 hom 39 het 16 0 14 3 G 1 0 134796 CASAVA_Build 10 58848390 2D ACACAGCGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AC 11 10 134797 CASAVA_Build 10 58848996 2D CTATATCAAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AT 6 5 134798 CASAVA_Build 10 58849657 1I TGAAAAAATG -/T TCTGGGTAAG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 1 2 134799 CASAVA_Build 10 58851055 2D GGATTCCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1181 het 141 hom 28 1 12 15 T 14 12 134800 CASAVA_Build 10 58851077 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 476 het 260 hom 25 4 3 18 T 9 10 134801 CASAVA_Build 10 58871094 3I ATTATCCACT ---/CCA CCTAGAATAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CCA 0 1 134802 CASAVA_Build 10 58876366 1D CCTTTGGGCA T/- TTTTGTGCTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 5 4 134803 CASAVA_Build 10 58885559 2I CAAAATGGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 A 10 12 134804 CASAVA_Build 10 58895429 1D ATATATAAAC A/- AATTGTGGCA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 A 3 2 134805 CASAVA_Build 10 58898442 1I ATGTGGACTT -/A ACAATCACAT 3070 hom 120 het 42 0 40 2 A 1 2 134806 CASAVA_Build 10 58903407 1D TTTGGGAGGC T/- GAGGTGGGCA 3070 hom 84 het 37 0 34 3 T 1 0 134807 CASAVA_Build 10 58913194 4D ACTTCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2871 het 4 hom 14 1 11 2 A 20 16 134808 CASAVA_Build 10 58914726 6D GATGATTTTG TTTAAT/------ TTTAACTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 4 TTTAAT 1 0 134809 CASAVA_Build 10 58914893 2I CCCAAATTCA --/TT TTGTATTGCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 4 134810 CASAVA_Build 10 58918982 1D TACCATTGAC T/- TTTTTCACAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 6 5 134811 CASAVA_Build 10 58920455 1D CACGTGTATA T/- CTATGTAACG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 0 134812 CASAVA_Build 10 58921154 1D AGGACTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 38 0 29 9 T 11 10 134813 CASAVA_Build 10 58923156 7I TGGATAAATA -------/AATAAAG AATAAAGAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AATAAAG 1 2 134814 CASAVA_Build 10 58923424 1I GGAATAAAGG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 314 hom 43 1 36 6 A 0 1 134815 CASAVA_Build 10 58923805 1I ATAAAAATTT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 7 8 134816 CASAVA_Build 10 58924925 1I ATTTTTTGAG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 7 8 134817 CASAVA_Build 10 58925003 1D TTTACTTCTG C/- CTGTGTTCTT 3070 hom 37 het 25 0 21 5 C 2 1 134818 CASAVA_Build 10 58928087 1D AAAAATTTTC T/- TATGGTCAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 2 1 134819 CASAVA_Build 10 58928648 1I TCACACCATG -/T TTTCCTTGGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 4 134820 CASAVA_Build 10 58931612 4I TAATCTTCTG ----/AAGT AAGTTCAATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AAGT 1 2 134821 CASAVA_Build 10 58938034 2D AAGTAAAACA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 AT 6 5 134822 CASAVA_Build 10 58940148 1I TTTAGAATAG -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 6 7 134823 CASAVA_Build 10 58944192 4I TCTTCTTATA ----/GATT GAGAAAATTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 GATT 0 1 134824 CASAVA_Build 10 58949011 1I TATTAATACA -/T TTGTCCTAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 3 134825 CASAVA_Build 10 58949861 4I TGTGCATGTA ----/TCTC TCTCTATTTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TC 2 4 134826 CASAVA_Build 10 58952950 1D TCACGTATAT G/- GGAGAAATCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 3 2 134827 CASAVA_Build 10 58953673 1I TGCTGAAATC -/T TTCACTTAGT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 2 3 134828 CASAVA_Build 10 58958079 1I GAGGAAGGAT -/A AGTATATCAC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 1 2 134829 CASAVA_Build 10 58958304 1I TGCATTCCAA -/G GCTGTTCACT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 1 2 134830 CASAVA_Build 10 58959628 1I ATACAGTACG -/C ATTTGAGTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 134831 CASAVA_Build 10 58960035 6D AGATGGTGTC ATTATT/------ ATTATTATTA 3070 hom 72 het 37 0 24 14 ATT 8 6 134832 CASAVA_Build 10 58964265 5I CTTTATTGAT -----/TTGAG TTGTGTATTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTGAG 0 1 134833 CASAVA_Build 10 58968119 1D ATAGACAGAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 36 0 28 9 A 8 7 134834 CASAVA_Build 10 58972994 3I AGAGAGAAAG ---/AAA GGAAAGGAAA 3070 hom 74 het 28 0 24 4 A 0 3 134835 CASAVA_Build 10 58983349 1D CCAATATGAG T/- TTTTTTTTTT 2793 het 211 hom 19 2 10 7 T 16 15 134836 CASAVA_Build 10 58986545 4D AATTCAATTC TCAG/---- TCAGCACATA 3070 hom 108 het 43 0 37 7 TCAG 2 1 134837 CASAVA_Build 10 59044403 4I ATCAAAAGGA ----/AAGG AAGGAAACAA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 AAGG 1 2 134838 CASAVA_Build 10 59048197 1D GCCAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 742 hom 31 2 23 7 A 13 12 134839 CASAVA_Build 10 59054722 1D GAATAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 6 hom 33 1 29 3 A 10 9 134840 CASAVA_Build 10 59073370 1I GAGAGGAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 9 10 134841 CASAVA_Build 10 59076711 32D GATGTCTATG TCTATATCTCTATAGATATCTCTATAGATATC/-------------------------------- TCTATATCTC 3070 hom 36 het 19 0 13 9 TCTATATCTCTATAGATATCTCTATAGATATC 1 0 134842 CASAVA_Build 10 59085700 1I TTTCATGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 85 het 35 0 28 7 T 9 10 134843 CASAVA_Build 10 59086908 3I ATAAGCACTT ---/AAC AACCATAAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAC 1 2 134844 CASAVA_Build 10 59092812 1D AATAGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 34 1 27 6 A 12 11 134845 CASAVA_Build 10 59092998 1I TCTTGTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 857 hom 34 3 25 6 A 11 12 134846 CASAVA_Build 10 59093160 1I TTATAAGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 10 134847 CASAVA_Build 10 59096250 1D ACCACTTATG A/- AAAATTGTAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 5 4 134848 CASAVA_Build 10 59096618 1D TCCTTCATCT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 G 10 9 134849 CASAVA_Build 10 59148165 1I AATGGAAGGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 637 hom 22 2 18 2 A 9 10 134850 CASAVA_Build 10 59160939 2D ATATGGAAAG GA/-- GAGTCTTCAT 3070 hom 138 het 49 0 47 4 GA 2 1 134851 CASAVA_Build 10 59175974 1D TATAAGCCAA T/- TTTTTTTTTT 2314 het 374 hom 22 1 10 11 T 15 14 134852 CASAVA_Build 10 59183777 2D CCTTGTGAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 26 0 16 12 A 16 14 134853 CASAVA_Build 10 59184649 1I ATTCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2105 hom 39 7 25 7 A 12 13 134854 CASAVA_Build 10 59188441 2D TATACATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 22 hom 27 2 17 9 TG 9 8 134855 CASAVA_Build 10 59190905 1D GATAAATGGA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 8 7 134856 CASAVA_Build 10 59191017 1I TAACATTGAA -/T GGACATTAGT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 0 1 134857 CASAVA_Build 10 59191231 5I CCTTCTATAT -----/CTTAA CTTAAGTGTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 CTTAA 1 2 134858 CASAVA_Build 10 59191748 1I GAAAAAAAAA -/T CATCATGAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 134859 CASAVA_Build 10 59194923 13D CAAAAAAAAC AAAAACAAAAACA/------------- AAAAAAAACA 3070 het 25 hom 16 0 9 11 AAAAACAAAAACA 1 0 134860 CASAVA_Build 10 59197042 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 8 7 134861 CASAVA_Build 10 59200063 9I ACTACATAAT ---------/TATAAAGGG TATAAAGGGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TATAAAGGG 1 2 134862 CASAVA_Build 10 59200576 1D AGGCAGAAAT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 99 het 40 0 33 8 A 8 7 134863 CASAVA_Build 10 59204015 4I GAAAACATTA ----/TTTC TTTGGTCTAT 3070 hom 113 het 42 0 38 4 TTTC 0 1 134864 CASAVA_Build 10 59205299 1I CAAAACTTTA -/T GAGGATATGT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 0 1 134865 CASAVA_Build 10 59205442 4I TTGACTGACA ----/GTTT CACAGGGCTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GTTT 0 1 134866 CASAVA_Build 10 59208575 1I CATCTCATGG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 7 134867 CASAVA_Build 10 59209335 8I CTGGGAAAGA --------/CCTCCCAG CCTCCCAGTA 3070 hom 72 het 31 0 23 8 CCTCCCAG 1 2 134868 CASAVA_Build 10 59212214 1D CAATCAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 27 1 23 3 A 11 10 134869 CASAVA_Build 10 59214785 7D AGAGTATAAA GGGTCGT/------- TCATTATCAC 3070 hom 114 het 38 0 39 1 GGGTCGT 1 0 134870 CASAVA_Build 10 59221714 1I GTCAAATGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 630 hom 42 2 34 6 T 9 10 134871 CASAVA_Build 10 59224755 1D TAAGCTTTTT G/- CCTACATTTT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 G 1 0 134872 CASAVA_Build 10 59226717 1D TTTCTCCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 10 9 134873 CASAVA_Build 10 59228679 1D CTATGGAGTG A/- TTTTATAGTG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 1 0 134874 CASAVA_Build 10 59234244 2D CACAACTCTA CT/-- CTCTGTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 CT 3 2 134875 CASAVA_Build 10 59254578 9I GGTGTTCTGC ---------/TTCCTATAT TTCCTATATT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTCCTATAT 1 2 134876 CASAVA_Build 10 59256386 1I AAAAAAAAAA -/C AATTAAACAT 3070 het 403 hom 38 1 32 5 C 0 1 134877 CASAVA_Build 10 59272243 1I AAGGTTTAGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 9 134878 CASAVA_Build 10 59287393 1D GATCCTAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 10 9 134879 CASAVA_Build 10 59293629 1D CTAACCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 11 10 134880 CASAVA_Build 10 59300493 5D TTCTTTTCTT TTTTC/----- TTTTCTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 8 TTTTC 2 1 134881 CASAVA_Build 10 59331437 1D TGCAGACAAC A/- AAAAAAAAAA 2942 het 705 hom 23 6 12 5 A 11 10 134882 CASAVA_Build 10 59342617 4D AGCAAAAATA AATT/---- AATATCTACA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AATT 1 0 134883 CASAVA_Build 10 59375131 1I TAGGATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 25 1 18 6 T 12 13 134884 CASAVA_Build 10 59378443 4D AAATATTGGA ATAT/---- ATATACTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 AT 4 2 134885 CASAVA_Build 10 59379503 2D GGAAGAAAAA AG/-- AGATTAATGC 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 AG 2 1 134886 CASAVA_Build 10 59382059 1I AGCTACCAGA -/T TTCTTCTTTC 3070 het 3070 hom 46 14 22 10 T 2 3 134887 CASAVA_Build 10 59385234 3D GCATTACGGT GAA/--- GAAGAATTAA 3070 het 3070 hom 45 19 20 7 GAA 3 2 134888 CASAVA_Build 10 59387059 3D AAGGTGTTAC AAG/--- AAGATGTACA 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 AAG 2 1 134889 CASAVA_Build 10 59390917 2D AAAGAAACAC AT/-- GTGTATTATA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 AT 1 0 134890 CASAVA_Build 10 59399011 1I TTTAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 10 11 134891 CASAVA_Build 10 59399309 3I CAAAATGTAT ---/TGA TGATATCAAC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 TGA 1 2 134892 CASAVA_Build 10 59399561 1D CCTGAAAAGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 9 8 134893 CASAVA_Build 10 59401627 2I AAGGAAGAAG --/GA TTTTCTTAAT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 GA 0 1 134894 CASAVA_Build 10 59404679 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 1642 het 805 hom 10 3 5 2 A 15 12 134895 CASAVA_Build 10 59412675 5I TGTTCTAAAC -----/AAGTT AAGGATCACA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 AAGTT 0 1 134896 CASAVA_Build 10 59412992 1I TTATGCTAAC -/A AAATGACTAA 3070 het 3070 ref 64 31 25 8 A 3 4 134897 CASAVA_Build 10 59413807 1I CTTCCCTGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3034 hom 38 13 18 7 T 9 10 134898 CASAVA_Build 10 59416781 1I CAGGGTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 8 9 134899 CASAVA_Build 10 59421412 1D CATGGTGAAA C/- CCCCATCTTT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 C 5 4 134900 CASAVA_Build 10 59431347 6I TACTGTGTGC ------/ATATAT TTAAAATATT 3070 het 3070 hom 31 11 19 2 AT 0 3 134901 CASAVA_Build 10 59439825 3D TTTCTCCTAA AAG/--- AAGACAAAAA 3070 het 3070 ref 41 24 15 3 AAG 2 1 134902 CASAVA_Build 10 59459752 3I CATTCATAAA ---/ATT CTGGGCAACA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 ATT 0 1 134903 CASAVA_Build 10 59490132 1I AATGTATTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 9 10 134904 CASAVA_Build 10 59490429 1D ACAGGTGACT G/- GGCATCCCAA 3070 hom 129 het 50 0 43 7 G 3 2 134905 CASAVA_Build 10 59504764 1I TTTATGCCAG -/T TGCCAGGCTA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 1 2 134906 CASAVA_Build 10 59508237 1D CGTCTGCACG A/- GGGGATATGC 3070 hom 71 het 29 0 22 8 A 1 0 134907 CASAVA_Build 10 59514355 1I TCCCCAAAGA -/C CCTCACTTGT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 C 2 3 134908 CASAVA_Build 10 59514468 1D TTTAAACAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 10 9 134909 CASAVA_Build 10 59514702 11I AATCTTACTG -----------/ACAGTTACAGA ACAACCAACA 3070 hom 123 het 45 0 39 6 ACAGTTACAGA 0 1 134910 CASAVA_Build 10 59515694 1D TGTAGCACCT C/- CCCCTGTGCT 3070 hom 96 het 34 0 32 3 C 5 4 134911 CASAVA_Build 10 59517659 2I AATATACAAA --/AC ATGTGTTAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AC 0 1 134912 CASAVA_Build 10 59518044 1D ATAATGCCAT A/- AAAATATAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 5 4 134913 CASAVA_Build 10 59521413 1D AAATTTAAAA C/- TTTTGCTCTG 3070 hom 21 het 18 0 8 10 C 1 0 134914 CASAVA_Build 10 59521963 4D AAACTATATT AGTC/---- AGGGCTCTCC 3070 hom 123 het 42 0 41 4 AGTC 1 0 134915 CASAVA_Build 10 59524243 1D CTCAGAGACC T/- TGACATTCCT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 2 1 134916 CASAVA_Build 10 59525269 3D GGGTACTCTC CTT/--- CTTTTACTCA 3070 hom 114 het 43 0 35 8 CTT 2 1 134917 CASAVA_Build 10 59525576 1D GGGCCAAGCA T/- CTCAACGTAG 3070 hom 101 het 37 0 33 5 T 1 0 134918 CASAVA_Build 10 59540519 2I GTGATATCTA --/TC TGTTTATACA 2519 het 2364 hom 14 6 7 1 TC 0 1 134919 CASAVA_Build 10 59550280 1D30M1D13M1D AATGCTTTTA GCACTGTTGGTGGGAGTTTAAATTAATTCAAGCTATTGTGGGAAAG/-CACTGTTGGTGGGAGTTTAAATTAATTCAA-CTATTGTGGGAAA- CAGTGTGGTG 3070 hom 78 het 20 0 27 0 N/A 0 0 134920 CASAVA_Build 10 59566549 2I GTATATATAT --/AG ATATACGTAT 899 het 523 hom 10 2 5 3 AG 0 1 134921 CASAVA_Build 10 59573023 1I ATTGTGGAGA -/G GCTATTGAAT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 G 1 2 134922 CASAVA_Build 10 59592553 1D AAGGTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 11 10 134923 CASAVA_Build 10 59593327 1D TGTGGAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 10 9 134924 CASAVA_Build 10 59615007 1D TACAACTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 305 hom 37 2 24 11 T 15 14 134925 CASAVA_Build 10 59633310 2D CTCAAACTCC TG/-- AGCTCAAGCG 2831 het 2831 ref 21 9 7 5 TG 1 0 134926 CASAVA_Build 10 59641578 1I20M2I TACTCGGAAG -AGGCTGAGGCAGGAGGATCC--/AAGGCTGAGGCAGGAGGATCCCG GGAACCCAGG 2911 hom 30 het 18 0 11 7 N/A 0 0 134927 CASAVA_Build 10 59690875 1I GCTGAGCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 682 hom 37 3 26 8 A 13 14 134928 CASAVA_Build 10 59691329 1I AACCAAAAAC -/A AAAAACCTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 5 6 134929 CASAVA_Build 10 59698845 1I TTCCTTATGG -/C CCAGGACAGC 3070 hom 54 het 19 0 17 2 C 2 3 134930 CASAVA_Build 10 59701023 1D GCCGGGATGG C/- TCTCGATCTC 2309 hom 15 het 7 0 6 1 C 1 0 134931 CASAVA_Build 10 59706514 1D GTTTCGGGGC T/- TTTTTTTTTT 2164 het 699 hom 21 5 7 9 T 13 12 134932 CASAVA_Build 10 59707373 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 13 12 134933 CASAVA_Build 10 59717275 1D TCTGCCGAGC A/- TAATACTGAT 3070 het 3070 hom 53 22 27 5 A 1 0 134934 CASAVA_Build 10 59722783 2I TTCCTAATAA --/TC TCTCTCTCCA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 TC 4 5 134935 CASAVA_Build 10 59723295 1D GTGGGGGAAA G/- GGGGGGGCAG 3070 het 721 hom 16 3 12 2 G 8 7 134936 CASAVA_Build 10 59800430 1D CACTTTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2895 hom 31 10 18 3 A 12 11 134937 CASAVA_Build 10 59814080 1D ACAGAAAGGT A/- AATAGACTGT 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 A 3 2 134938 CASAVA_Build 10 59815849 2D TTTTAATAAG TC/-- TCTAGCATTC 3070 het 3070 hom 41 11 22 8 TC 2 1 134939 CASAVA_Build 10 59825993 4D CTGATATTTA CTGT/---- CTGTCTGTTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 9 CTGT 3 2 134940 CASAVA_Build 10 59829221 1D GCAGTTTTGA T/- TAGACCCATC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 2 1 134941 CASAVA_Build 10 59832695 1I TTCCAGAGTA -/G GGCATCCTCA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 G 2 3 134942 CASAVA_Build 10 59839977 1I GGTGTGCTTG -/C TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 16 12 C 0 1 134943 CASAVA_Build 10 59850002 1I TCTAAAATTC -/T CCTTTTTGGT 1422 het 1422 ref 11 8 3 0 T 0 1 134944 CASAVA_Build 10 59860791 1D ACTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 12 9 T 12 11 134945 CASAVA_Build 10 59862338 1D TTGCAGTGAG C/- CCGAGATCGT 2441 het 2441 ref 20 9 7 4 C 3 2 134946 CASAVA_Build 10 59863949 1I TACGTAAATT -/A AAAGCATACA 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 A 3 4 134947 CASAVA_Build 10 59870427 2D CCGATCTTTT TG/-- TCACTATAGA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 TG 1 0 134948 CASAVA_Build 10 59871144 2D AGATATAGGC TT/-- TGCAAAGGTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 3 1 134949 CASAVA_Build 10 59872146 1I ATGCTAGGGA -/T CACTAATGAC 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 T 0 1 134950 CASAVA_Build 10 59873077 2I TAATAATTTA --/TC TCTGAATTAT 3070 het 3070 hom 17 8 9 2 TC 1 2 134951 CASAVA_Build 10 59873812 4I CAGCCTGGGT ----/GACA GACACAGTGA 1921 het 1921 ref 27 12 5 10 GACA 1 2 134952 CASAVA_Build 10 59874304 1D CCCTTATTGC A/- ACATCACTAT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 2 1 134953 CASAVA_Build 10 59874651 1D GGATTACTTA G/- GGACTGCTAT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 G 3 2 134954 CASAVA_Build 10 59875160 1I TCCCATTCCA -/T TTTTTGTATT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 5 6 134955 CASAVA_Build 10 59875417 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 TA 5 6 134956 CASAVA_Build 10 59876757 3D GTATCTCATT GTG/--- GTGGTTTGAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 7 GTG 2 1 134957 CASAVA_Build 10 59880619 5I TAAAAATGTT -----/TTATA TTATCTTCCA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 TTATA 0 1 134958 CASAVA_Build 10 59898040 1D CTCCCTCCCT C/- CCTTCCCTCC 892 het 11 hom 12 1 6 6 C 3 2 134959 CASAVA_Build 10 59911718 1I CTCCCTTCCT -/C CCTCCCCTTG 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 2 3 134960 CASAVA_Build 10 59930603 1I GCAACAAAAC -/A AAACAGATAA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 3 4 134961 CASAVA_Build 10 59935805 1D AGTATAATAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 A 9 8 134962 CASAVA_Build 10 59937683 2I AGACAAACAG --/AT ATATATATAT 3070 het 2869 hom 27 12 13 2 AT 5 6 134963 CASAVA_Build 10 59941930 2D TCCATTCAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 A 11 9 134964 CASAVA_Build 10 59943196 4D CTCCAGCCTA CGGC/---- CGGCCGGTTT 901 het 723 hom 17 5 7 6 CGGC 2 1 134965 CASAVA_Build 10 59944443 2D CTCCCCTTCC CT/-- CTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 6 CT 3 2 134966 CASAVA_Build 10 59946262 1I TTTTTCATGG -/T TTTTTTACTG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 6 7 134967 CASAVA_Build 10 59947757 3D GCTATCTAAA TAT/--- TATTATTGGC 3070 het 3070 ref 47 25 17 6 TAT 3 2 134968 CASAVA_Build 10 59950643 2D ATGCCCACAC AT/-- AATTTATTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 AT 1 0 134969 CASAVA_Build 10 59955469 6I CCTAAAACTT ------/AAAATA TAATAATAAA 3070 het 2822 hom 15 6 9 0 AAAATA 0 1 134970 CASAVA_Build 10 59955758 1I ATTACATGGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 8 9 134971 CASAVA_Build 10 59962068 1D ATGTATTATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 13 6 A 10 9 134972 CASAVA_Build 10 59964603 1D AACACAAATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 9 8 134973 CASAVA_Build 10 59965163 6I TCTCAGCAGA ------/AACCTT ACAAACCAGA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 AACCTT 0 1 134974 CASAVA_Build 10 59967125 1I AAAAAAAAAA -/T TCATGATGAA 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 1 2 134975 CASAVA_Build 10 59968068 9D CAAAATAGAG AACCAAGAA/--------- ATAAAGCCGA 3070 het 3070 ref 32 17 14 7 AACCAAGAA 1 0 134976 CASAVA_Build 10 59969303 1I CTACTGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 9 10 134977 CASAVA_Build 10 59970071 1D GAAAAAGAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 10 9 134978 CASAVA_Build 10 59971617 4D AGTGGAATAA AGAC/---- AGACAGACAT 3070 hom 84 het 36 0 29 9 AGAC 3 2 134979 CASAVA_Build 10 59972614 1I GGCCATTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 A 9 10 134980 CASAVA_Build 10 59974853 2D TTCCAGAAAT TG/-- TGAGACAATA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 TG 2 1 134981 CASAVA_Build 10 59977457 4D TCAGTATGGA TATT/---- TATTTATTTT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 TATT 3 2 134982 CASAVA_Build 10 59978914 1D CCTCAGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 T 11 10 134983 CASAVA_Build 10 59979383 1D TCTGTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 12 11 134984 CASAVA_Build 10 59984561 1D TTACATTTGA T/- TTTTTTTTTT 2737 het 2737 ref 17 7 6 4 T 13 12 134985 CASAVA_Build 10 59984632 1D CTGTTATATA T/- ACCTCCTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 1 0 134986 CASAVA_Build 10 59988873 1D TTAATAACCA C/- CCCCCCAGGA 3070 het 3070 ref 32 14 9 10 C 7 6 134987 CASAVA_Build 10 59992519 1I GTAAGGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 45 1 33 11 T 10 11 134988 CASAVA_Build 10 59993670 1I TTGAGTACTC -/A AAACACATAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 3 4 134989 CASAVA_Build 10 59994855 2I CCTGGGTATC --/AT GTGAATATTC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 AT 0 1 134990 CASAVA_Build 10 59995915 4I AATTCAATGA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 49 21 16 12 TG 7 9 134991 CASAVA_Build 10 59996056 2D AGATACAAAC AT/-- GTACACACAC 3070 het 92 hom 29 2 10 19 AT 1 0 134992 CASAVA_Build 10 60003600 1D CTAAGCTTAA G/- GGTACTAATC 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 G 3 2 134993 CASAVA_Build 10 60004279 1I ATACAAGCTT -/A AATTTTATAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 2 3 134994 CASAVA_Build 10 60005080 1I AAAGATCCCC -/A GGGTCCCTGG 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 0 1 134995 CASAVA_Build 10 60005344 1D GTTTTTTTTT G/- GTTGTTGTTG 3070 het 32 hom 38 1 32 5 G 2 1 134996 CASAVA_Build 10 60009656 2I CATAATAGAA --/TG TATATACTCT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 TG 0 1 134997 CASAVA_Build 10 60009738 2D TTGCCCTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 19 8 T 12 10 134998 CASAVA_Build 10 60009794 1D CTCTTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 159 hom 32 2 11 19 T 15 14 134999 CASAVA_Build 10 60022323 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGA 2180 hom 15 het 6 0 6 0 A 5 6 135000 CASAVA_Build 10 60023093 1I CAGCAGAATT -/A AATGTCCCTG 2849 het 2849 ref 30 14 9 7 A 2 3 135001 CASAVA_Build 10 60036209 1I GGATAGCATT -/G GGGAGATATA 1119 het 573 hom 5 2 3 0 G 3 4 135002 CASAVA_Build 10 60048787 1I TCTCTCCTTG -/T TGCTTCCATT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 1 2 135003 CASAVA_Build 10 60049245 1D GTTTTGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 17 3 11 3 T 17 16 135004 CASAVA_Build 10 60051282 2D AGGGTAAGAC AA/-- GAGAAGACGA 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 A 2 0 135005 CASAVA_Build 10 60059085 1D CGTAGATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 41 0 35 7 T 11 10 135006 CASAVA_Build 10 60061761 5D GTTCCAGAGC CTAAG/----- CTTTTCTTGG 3070 het 3070 ref 47 22 22 5 CTAAG 1 0 135007 CASAVA_Build 10 60068608 8D13M9D AAATTCTTTT TTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCTCTTC/--------TTTTCTTTTCTTT--------- TCTTTTTTCT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 N/A 0 0 135008 CASAVA_Build 10 60076559 1I CTGTTCCTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 73 het 29 0 25 4 T 8 9 135009 CASAVA_Build 10 60079628 1D ATTTGGATTC A/- GGGGGTCTGG 3070 hom 102 het 36 0 35 3 A 1 0 135010 CASAVA_Build 10 60083446 1D TTGTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 9 T 11 10 135011 CASAVA_Build 10 60087575 1D ATCACTCATA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 9 8 135012 CASAVA_Build 10 60087792 3I CCACTAGTGG ---/TGT TAACTGTGAT 3070 hom 163 het 61 0 55 6 TGT 0 1 135013 CASAVA_Build 10 60088757 2I TGTGTATGAA --/TG TGTGTGTATG 3070 hom 132 het 52 0 45 7 TG 3 4 135014 CASAVA_Build 10 60090200 2D CTTTTCTTGC TG/-- TGACTCTTGT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 TG 2 1 135015 CASAVA_Build 10 60094236 2D TTCCTCAGTC TG/-- TGGCTTTGTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TG 2 1 135016 CASAVA_Build 10 60097072 2I CTTTACCAAA --/CT CTATGAGAAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 CT 1 2 135017 CASAVA_Build 10 60097211 1D5M2D13M2D9M2D7M5D19M1D4M1D3M1D TCTTATAATT CTTAGGGAAGGTAGTTTTAACCTTAATTCTCAGGGTTCAAGGAATTCTTATATTTCCCTTTCAAAGGTCTGGATG/-TTAGG--AAGTAGTTTTAAC--TTATTCTCA--GTTCAAG-----ATTTTATTTTCCTTTCAAA-GTCT-GAT- GTGTTACCAA 3070 hom 84 het 20 0 29 2 N/A 0 0 135018 CASAVA_Build 10 60103732 7D TAAACACTCA AGCTAAT/------- AGCTTGCTGG 3070 hom 54 het 20 0 19 3 AGCTAAT 1 0 135019 CASAVA_Build 10 60104031 1D AACTCAGATC A/- AGTGTCAGTT 3070 hom 99 het 40 0 33 8 A 2 1 135020 CASAVA_Build 10 60133073 3I GGACTATAGG ---/CGC ACACCACCAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 CGC 0 1 135021 CASAVA_Build 10 60133717 1I TCCTCTCCCC -/T ATGCCATTAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 1 135022 CASAVA_Build 10 60136664 1I TACAGTGAGT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 8 135023 CASAVA_Build 10 60138489 1D TGTTGCCTGC T/- TACTTACTGT 3070 hom 99 het 37 0 31 6 T 2 1 135024 CASAVA_Build 10 60144638 1D CTCATTAGCT A/- AAAAAAAAAA 921 het 921 ref 30 11 7 12 A 17 16 135025 CASAVA_Build 10 60147135 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAGCTT 3070 het 1129 hom 35 4 26 5 C 0 1 135026 CASAVA_Build 10 60149279 1D GGCACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 24 7 T 12 11 135027 CASAVA_Build 10 60162790 1I AAATTTGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 763 hom 29 3 23 3 A 9 10 135028 CASAVA_Build 10 60166155 3I AAAAAACAAC ---/ATA ATATGTAGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 ATA 1 2 135029 CASAVA_Build 10 60169309 1I TTTAGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 11 135030 CASAVA_Build 10 60171926 2I GTTTGAAAAC --/TT TTGTTTTTTT 3070 hom 131 het 51 0 44 7 T 2 4 135031 CASAVA_Build 10 60174453 5D CATCTTTATC CTTAT/----- CTTGAGATTT 3070 hom 114 het 41 0 39 4 CTTAT 1 0 135032 CASAVA_Build 10 60178348 1D AAACCTGTTC T/- GGTATAGTAG 3070 hom 151 het 53 0 51 2 T 1 0 135033 CASAVA_Build 10 60184890 2I TTTTTCTTTG --/TT TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 6 8 135034 CASAVA_Build 10 60186393 20D ACTACTAGCC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 32 1 17 18 T 32 12 135035 CASAVA_Build 10 60192824 1I GAAATATAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 8 9 135036 CASAVA_Build 10 60195082 1D TCAGCCTCCC A/- AAAGTGCTGG 3070 hom 47 het 24 0 20 4 A 4 3 135037 CASAVA_Build 10 60198459 1D TCATAACATC A/- AAAAAAATGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 7 135038 CASAVA_Build 10 60209425 14D GAGTGATTCA GTGACTTTTCCAAG/-------------- GTGACAGAGT 3070 het 3070 ref 50 28 22 4 GTGACTTTTCCAAG 1 0 135039 CASAVA_Build 10 60209667 1D CTTTCTGAGA T/- TTTTTTCACA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 7 6 135040 CASAVA_Build 10 60213374 9D GGTGGTAAAT TGTGAAAGG/--------- TGTGAAAGGT 3070 hom 78 het 37 0 26 15 TGTGAAAGG 3 2 135041 CASAVA_Build 10 60214456 1D TCCAATTTAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 135042 CASAVA_Build 10 60220046 1D TGTATTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 A 13 12 135043 CASAVA_Build 10 60231361 1D ATCCTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 331 hom 46 1 36 9 T 11 10 135044 CASAVA_Build 10 60238484 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 1432 hom 38 het 32 0 13 19 T 15 16 135045 CASAVA_Build 10 60241971 3I3M1I ACTTGGGGTA ---TTA-/TGTTTAG AGATGACACT 3070 hom 102 het 38 0 34 5 N/A 0 0 135046 CASAVA_Build 10 60244877 1D TTTTTCAGGG T/- TTTTGACAAA 3070 hom 181 het 65 0 61 4 T 5 4 135047 CASAVA_Build 10 60266566 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 12 11 135048 CASAVA_Build 10 60274940 1I AAATCGTTTA -/G GGGGGGGGAT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 G 8 9 135049 CASAVA_Build 10 60283421 1D CTTCTAACTA T/- TTTTTTTTTT 2150 het 1243 hom 26 5 7 16 T 17 16 135050 CASAVA_Build 10 60285262 1I TTTTTGTTGT -/A TGTTGTTGAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 0 1 135051 CASAVA_Build 10 60323901 1D TTTAGATGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 8 135052 CASAVA_Build 10 60334036 1D GAGACCTCTA T/- TACATACTCC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 1 135053 CASAVA_Build 10 60340395 3I AGAAAATCTC ---/ATT ATAACAATGA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 ATT 0 1 135054 CASAVA_Build 10 60351323 1I TCTTTCTAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 9 10 135055 CASAVA_Build 10 60355655 1I GAAGGGTTGA -/C TACATAGGGG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 0 1 135056 CASAVA_Build 10 60359205 5D2M1D TCAAAGTATT TCAAAGTA/-----GT- GGCATTTGAG 3070 het 3070 hom 45 19 26 3 N/A 0 0 135057 CASAVA_Build 10 60360764 1D CGTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 A 11 10 135058 CASAVA_Build 10 60360818 2D ATGAAACCAG CT/-- CAAGGGGGAA 3070 het 3070 ref 37 18 11 9 CT 1 0 135059 CASAVA_Build 10 60371260 1D AACCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1326 het 1326 ref 19 14 3 2 A 12 11 135060 CASAVA_Build 10 60406306 4I CCAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 1280 hom 31 8 14 9 AAAG 3 4 135061 CASAVA_Build 10 60406814 1D ATTTAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 40 2 15 24 A 11 10 135062 CASAVA_Build 10 60413966 1I GTCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1134 het 1134 ref 23 7 5 11 T 17 18 135063 CASAVA_Build 10 60418700 2D TATACAGGGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 62 22 18 23 TG 10 9 135064 CASAVA_Build 10 60423458 1I TTTCGTTTAC -/T GCTTTCATAC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 0 1 135065 CASAVA_Build 10 60435932 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 10 11 135066 CASAVA_Build 10 60437693 1I AAAGAAACCA -/T TTGAACATCT 3070 het 3070 ref 49 28 14 7 T 2 3 135067 CASAVA_Build 10 60454448 1D ATTATACAGT C/- CTTCTTCACC 3070 het 3070 ref 48 25 16 8 C 2 1 135068 CASAVA_Build 10 60462514 3D GTGTGTGTGT GGG/--- GGGGGGGGTG 3070 het 2183 hom 27 8 11 10 G 11 8 135069 CASAVA_Build 10 60482286 1D TTCTTTGTCA T/- TTTTTTTTTT 1346 het 1346 ref 46 34 3 9 T 13 12 135070 CASAVA_Build 10 60644080 1D ATTAAAGCAC A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 99 het 41 0 34 8 A 8 7 135071 CASAVA_Build 10 60645602 1D GCCTTCATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 817 hom 33 2 24 7 A 12 11 135072 CASAVA_Build 10 60652500 1I GTTTCAAAAG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 7 8 135073 CASAVA_Build 10 60660874 1D AAAAAAACAA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 80 het 32 0 25 7 T 8 7 135074 CASAVA_Build 10 60669641 1I CTCTAAAGCA -/T TCTTAAGTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 135075 CASAVA_Build 10 60670268 1I TCTATTTTAT -/A AAAAAAAAAA 2881 het 2881 ref 27 17 8 2 A 11 12 135076 CASAVA_Build 10 60676809 1I ATAGAGAAAG -/A AAAAAAATAG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 8 135077 CASAVA_Build 10 60679086 7I AGGAGAATGG -------/CGTGAAC CGTGAACCCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 CGTGAAC 1 2 135078 CASAVA_Build 10 60721437 1I AACCTGGAAA -/G GGGGAATCCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 4 5 135079 CASAVA_Build 10 60723007 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 953 hom 7 het 4 0 3 1 T 9 10 135080 CASAVA_Build 10 60727667 1I CTCTGGGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 13 13 A 10 11 135081 CASAVA_Build 10 60729278 2D CCAATATGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 13 11 135082 CASAVA_Build 10 60731792 1D6M1D AACAATTTGC GGTAAAGC/-GTAAAG- CCCATCATTT 3070 hom 144 het 54 0 48 10 N/A 0 0 135083 CASAVA_Build 10 60735395 1D AAGAATACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 T 10 9 135084 CASAVA_Build 10 60745807 2D GAGATTCTCA TG/-- TCTCAGCCTC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 TG 1 0 135085 CASAVA_Build 10 60748452 3D TGTGGGCAGT GAA/--- GGAGAGCCCT 3070 het 3070 ref 46 23 20 6 GAA 1 0 135086 CASAVA_Build 10 60751971 1D TTGAGATGGA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 47 18 21 9 T 7 6 135087 CASAVA_Build 10 60753697 4I CAAGCACACA ----/GTTG GCATTTCTGA 3070 het 3070 ref 55 22 19 14 GTTG 0 1 135088 CASAVA_Build 10 60757342 1I CCCCCCCACC -/A AAAAAAGGTG 1844 het 1844 ref 32 19 9 4 A 6 7 135089 CASAVA_Build 10 60769176 1I CAGCTGTTAG -/A AAGTAGAAAT 3070 hom 105 het 43 0 35 8 A 2 3 135090 CASAVA_Build 10 60769983 1D TTTTCTGATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 A 9 8 135091 CASAVA_Build 10 60772127 1D AGTTTGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 112 het 41 0 38 4 A 13 12 135092 CASAVA_Build 10 60773188 1D AAGACCAATT A/- ACTTCATCTT 3070 het 3070 ref 43 22 20 2 A 2 1 135093 CASAVA_Build 10 60773716 1I AAACTATTTC -/T TTTTTTTTTT 1166 het 565 hom 14 4 7 3 T 11 12 135094 CASAVA_Build 10 60775974 5I AGGGGAGGGT -----/AGAAA AGAAATGGCC 3070 hom 111 het 39 0 37 2 AGAAA 1 2 135095 CASAVA_Build 10 60792275 2I CTCCGGGAGT --/TA GAGCACATAC 3070 hom 65 het 23 0 21 2 TA 0 1 135096 CASAVA_Build 10 60795166 1I CTGTTTTTAA -/C CAGTGTTCCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 135097 CASAVA_Build 10 60797005 3D TTTGAGCTAT TAA/--- TGTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 TAA 1 0 135098 CASAVA_Build 10 60832679 1I CAATTTATGC -/A AAAAAAGCCA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 6 7 135099 CASAVA_Build 10 60835219 1I AAGTAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 1199 het 1199 ref 38 28 3 7 A 10 11 135100 CASAVA_Build 10 60846334 1I CTGAATGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 12 15 A 13 14 135101 CASAVA_Build 10 60874314 4D TAACAGATGG ATAA/---- ATAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 ATAA 2 1 135102 CASAVA_Build 10 60886206 1D TTCAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 28 10 A 12 11 135103 CASAVA_Build 10 60897044 1D GAAAAAAAAA C/- CCCCAGAATA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 C 5 4 135104 CASAVA_Build 10 60903814 1D AAAAAGAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 85 het 32 0 28 4 A 10 9 135105 CASAVA_Build 10 60910955 1I CAGGAAAAGT -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 A 6 7 135106 CASAVA_Build 10 60911237 16D AGGGAATTAG AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2609 hom 29 10 11 10 A 27 11 135107 CASAVA_Build 10 60918221 1I CTCACGAAAG -/A AAAAAAAAAA 2349 het 2349 ref 27 8 9 10 A 10 11 135108 CASAVA_Build 10 60921134 1D TGGCATATAG T/- TTGTTGTTGC 3070 het 3070 hom 48 22 25 3 T 3 2 135109 CASAVA_Build 10 60925722 4D AAATTTTTTC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ATTT 6 5 135110 CASAVA_Build 10 60933163 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 43 het 27 0 19 8 A 10 9 135111 CASAVA_Build 10 60933355 1I ATGTGATTTC -/A AAATAAATAC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 A 3 4 135112 CASAVA_Build 10 60934431 2D CCAACTTATC AT/-- GTGTGTATAT 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 AT 1 0 135113 CASAVA_Build 10 60950369 1D GGTAATTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 10 12 A 13 12 135114 CASAVA_Build 10 60951914 8D TCTCTCTCTT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 1284 het 1284 ref 24 8 4 15 TC 16 12 135115 CASAVA_Build 10 60964398 2D GAGCCCACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 56 14 26 18 AC 8 7 135116 CASAVA_Build 10 60965152 5D TTTTGGAAAA TAGTC/----- TAGCAATTTT 3070 het 3070 ref 45 28 16 3 TAGTC 1 0 135117 CASAVA_Build 10 60967617 1D GAATGAGGTG T/- TTTTTTTTTT 1319 het 1319 ref 45 28 5 12 T 12 11 135118 CASAVA_Build 10 60973553 1D AAATTCCCTG T/- TTACACAAGG 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 T 3 2 135119 CASAVA_Build 10 60976305 19D ATCTCAATAA AACTTCTGGCATAAATGCC/------------------- AATATTGAAA 2342 het 2342 ref 12 10 5 3 AACTTCTGGCATAAATGCC 1 0 135120 CASAVA_Build 10 60979342 6I CACTGATCTG ------/CTATTA CTTTCGATTC 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 CTATTA 0 1 135121 CASAVA_Build 10 60980821 6D TTTTCTTGCA ACTACT/------ ACTACTACTT 3070 hom 63 het 24 0 21 4 ACT 5 3 135122 CASAVA_Build 10 60981423 1D TATTTAACAT A/- AAGATTCCAA 3070 hom 129 het 45 0 43 3 A 3 2 135123 CASAVA_Build 10 60993208 3D GTTGCAAAAC TGG/--- CTGAAGGATA 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 TGG 1 0 135124 CASAVA_Build 10 60995713 3D TGCATAAATG TCT/--- TCTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 27 9 18 0 TCT 2 1 135125 CASAVA_Build 10 61002892 1D AAACTATAGG C/- CCCAGATGTC 3070 hom 114 het 41 0 39 4 C 4 3 135126 CASAVA_Build 10 61003498 1I TAAAGGGTAC -/A AAATTTCATC 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 A 3 4 135127 CASAVA_Build 10 61007431 1I ACTTTTGCGC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 39 9 24 6 A 7 8 135128 CASAVA_Build 10 61010529 2D GCTTTTTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 12 10 135129 CASAVA_Build 10 61011104 4D ATAGACTATC AATG/---- AAGAGGATGT 3070 het 3070 ref 47 25 19 7 AATG 1 0 135130 CASAVA_Build 10 61013028 1D GCCCTTGGGG C/- AAGTGTTTGG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 1 0 135131 CASAVA_Build 10 61014559 1I TGTTATAAAG -/A ACAAATAAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 135132 CASAVA_Build 10 61020718 7D GCAAGCCACG GACAGTC/------- CCTTGACTCT 3070 het 3070 ref 48 25 15 9 GACAGTC 1 0 135133 CASAVA_Build 10 61024702 1D TTTGTATCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 10 9 135134 CASAVA_Build 10 61025748 1D AGGCACTTCT A/- AACCTTTCAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 3 2 135135 CASAVA_Build 10 61026290 1D13M1I14M1D GTGAGGCAGG CTGAAGCACTTGCC-TGGGTGCAGAATTGC/-TGAAGCACTTGCCTTGGGTGCAGAATTG- AAGCGGCTGC 3070 hom 120 het 37 0 38 8 N/A 0 0 135136 CASAVA_Build 10 61029045 1I ATCTTGGAAA -/T TTTTACTTAT 3070 het 3070 hom 29 8 17 4 T 4 5 135137 CASAVA_Build 10 61033164 1I AAAATACAGG -/T TGCTCTGAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 1 2 135138 CASAVA_Build 10 61035222 5I GAAAAGAAAG -----/CTAAA CTAAATTTCA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 CTAAA 1 2 135139 CASAVA_Build 10 61036574 1D TGATAGATAG C/- CTGTCATTCT 3070 hom 181 het 69 0 61 9 C 2 1 135140 CASAVA_Build 10 61039469 1D AAGGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 30 0 13 17 T 15 14 135141 CASAVA_Build 10 61040207 1D81M2I AAAGTTATGA GGCTTTAGAAATGTCAGACTTTGTCTTTGTCTTGCAACTAATGTAGCTGAGTTCACATTCTAATACATAACTGACTGATACA--/-GCTTTAGAAATGTCAGACTTTGTCTTTGTCTTGCAACTAATGTAGCTGAGTTCACATTCTAATACATAACTGACTGATACAAT TTTTTTGTCT 3070 het 321 hom 56 3 52 30 N/A 0 0 135142 CASAVA_Build 10 61041761 1D16M1D TTATATTGTT CTTGTTGCTTGTTTGAGC/-TTGTTGCTTGTTTGAG- ACAGGGTCTC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 N/A 0 0 135143 CASAVA_Build 10 61044736 1D CATGGTGAAA C/- CCCCACCTCT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 5 4 135144 CASAVA_Build 10 61048302 1D AAAAAACAAA G/- GTCTTTTGAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 2 1 135145 CASAVA_Build 10 61049566 1D TGCAAGTTTT C/- CCCCTGCATC 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 C 5 4 135146 CASAVA_Build 10 61053127 1I AAATCATCTC -/T GACCATGCAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 0 1 135147 CASAVA_Build 10 61055234 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1609 het 1609 ref 33 11 10 12 A 13 14 135148 CASAVA_Build 10 61057509 1D TCCAGTCCTG T/- TAAGCACTTA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 2 1 135149 CASAVA_Build 10 61060301 1D AAAAAATTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 10 9 135150 CASAVA_Build 10 61074480 1D CAAGAATCTA G/- CTCTTGCCAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 0 135151 CASAVA_Build 10 61077892 2D CCTTTAGAAC TT/-- AAACAGGACG 3070 het 3070 ref 49 24 19 8 T 2 0 135152 CASAVA_Build 10 61079622 1I GATCCACCCA -/C CTCAGTCTCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 1 2 135153 CASAVA_Build 10 61085311 1D AAAAGTAGAA T/- TTTTTTAGGG 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 T 7 6 135154 CASAVA_Build 10 61088121 1D CTCTGTCACA G/- GCCATTTGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 2 1 135155 CASAVA_Build 10 61106756 4D AAGAAATGTT TAAA/---- TAAGCTAATA 3070 het 3070 ref 22 10 8 5 TAAA 1 0 135156 CASAVA_Build 10 61108937 18D CTGTTTCAGC ACTTGGGTAGTGTGAGAA/------------------ ACAGAACCAC 3070 het 3070 hom 44 23 25 6 ACTTGGGTAGTGTGAGAA 1 0 135157 CASAVA_Build 10 61112584 2I TTTTGAGAAA --/CT CTATGAAACA 3070 hom 116 het 41 0 39 2 CT 1 2 135158 CASAVA_Build 10 61131379 3D TATAAAACCA TGT/--- TGTGTTCATA 3070 het 3070 hom 36 12 20 7 TGT 2 1 135159 CASAVA_Build 10 61137350 2D TCACCACACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 36 3 11 22 A 16 14 135160 CASAVA_Build 10 61150778 1I TCTGCTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 12 135161 CASAVA_Build 10 61152803 2I9M1D AGCCTGGCCA --TTGGTGAAAN/ATATGGTGAAA- CCCCGTCTCT 3070 hom 97 het 34 0 31 8 N/A 0 0 135162 CASAVA_Build 10 61170061 2I AAAAAATGAC --/TG TGTTAATAGT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TG 1 2 135163 CASAVA_Build 10 61198119 20I TTATGTTAAT --------------------/AACTAGATGCTTAGCAATAG AACGAGGAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 AACTAGATGCTTAGCAATAG 0 1 135164 CASAVA_Build 10 61199722 3D ACTGTTTTTT TTC/--- TTAACTGCTT 3070 hom 45 het 21 0 15 7 TTC 1 0 135165 CASAVA_Build 10 61201614 1I CATCAGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 135166 CASAVA_Build 10 61201942 6D TAGCAGAATG ATCCTT/------ AGCAGGATCC 3070 hom 132 het 45 0 43 4 ATCCTT 1 0 135167 CASAVA_Build 10 61214681 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 11 10 135168 CASAVA_Build 10 61218508 1D AAAAAAGATA G/- GGTTTAAGGC 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 G 3 2 135169 CASAVA_Build 10 61218858 1D AGAAGGCTCA G/- GGGTCAACCT 3070 hom 66 het 25 0 22 6 G 4 3 135170 CASAVA_Build 10 61219664 1D TCTGGTTGAA T/- TCTGTTAGAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 2 1 135171 CASAVA_Build 10 61249815 1D TTCAATGAAT A/- AACTTAATAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 3 2 135172 CASAVA_Build 10 61300351 8I CCTACAATCT --------/GGTGGGAC AGAGGACCAC 3070 het 3070 hom 58 27 27 4 GGTGGGAC 0 1 135173 CASAVA_Build 10 61302551 1D GATGGGGGGG T/- GGGGGAAGGT 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 T 1 0 135174 CASAVA_Build 10 61304497 3D AATGGAGGCA GAG/--- AAGAGATCAG 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 GAG 1 0 135175 CASAVA_Build 10 61309357 1I ACATATCCCA -/T TCTCGGCAAA 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 T 1 2 135176 CASAVA_Build 10 61314414 1I TGTAAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 A 10 11 135177 CASAVA_Build 10 61315684 3D ACCCCGCCCC CCG/--- CCCCCCCAAC 3070 het 1522 hom 25 5 13 8 CCG 1 0 135178 CASAVA_Build 10 61318269 1I GGCAGCAGGT -/A AAAAGGTCTC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 4 5 135179 CASAVA_Build 10 61321544 1D AACTTGTTTA T/- TTACAATGCA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 3 2 135180 CASAVA_Build 10 61323066 22D GACTTCATTT TTAAATTCACTGAGCAGCCGGG/---------------------- TATGGTGGCT 3070 het 3070 ref 37 18 15 8 TTAAATTCACTGAGCAGCCGGG 1 0 135181 CASAVA_Build 10 61323505 1D CTCCACCGAA G/- GCTTTACAAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 G 2 1 135182 CASAVA_Build 10 61324320 4D TGGCATACAG CAGA/---- CACTCATGTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 CAGA 1 0 135183 CASAVA_Build 10 61326354 1I GTCTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 11 12 135184 CASAVA_Build 10 61331710 1I CCCCTACTCC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 52 23 18 11 A 8 9 135185 CASAVA_Build 10 61333955 1I GATGTCAGTG -/T TAGTTAAGGG 3070 hom 175 het 62 0 59 3 T 1 2 135186 CASAVA_Build 10 61345468 1D ATAGTCAAGT C/- CCCTTTGACA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 C 4 3 135187 CASAVA_Build 10 61349695 1D CGTGTATTTT A/- AGGTGTTCAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 2 1 135188 CASAVA_Build 10 61355191 1D GAGAAAATAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 9 8 135189 CASAVA_Build 10 61355347 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 2793 het 1109 hom 10 4 6 0 T 10 9 135190 CASAVA_Build 10 61356309 4I AGCAAGAAAC ----/AAAT AACAAACCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAAT 0 1 135191 CASAVA_Build 10 61357763 21I CCTCCCAAAT ---------------------/TGATCTACATATTCAATCCAG TGGCTAACAA 3070 hom 93 het 36 0 31 6 TGATCTACATATTCAATCCAG 0 1 135192 CASAVA_Build 10 61362153 1I TCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2088 het 1435 hom 16 6 7 3 T 10 11 135193 CASAVA_Build 10 61362987 1D ATTTAGTAGT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 A 8 7 135194 CASAVA_Build 10 61363257 6I AACACAAGTT ------/ATACTC ATACCTTGTG 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 ATACTC 0 1 135195 CASAVA_Build 10 61364801 2D ACTATAAGTC AT/-- ATGTAATGTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 5 AT 2 1 135196 CASAVA_Build 10 61365885 2D TAATGTTTGG AA/-- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 A 9 7 135197 CASAVA_Build 10 61383132 1D GACATATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 10 9 135198 CASAVA_Build 10 61384208 1D AATCTGAGCT A/- AAACCCTGTG 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 A 4 3 135199 CASAVA_Build 10 61386640 1I ATGTTTAGAA -/T TTCCAGTGCA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 2 3 135200 CASAVA_Build 10 61387183 4D CCACGCCCGG CTAA/---- CTTTTTTTTA 1780 het 416 hom 10 1 5 4 CTAA 1 0 135201 CASAVA_Build 10 61389239 1I GATTTTGCTA -/T TTAACCATTT 3070 hom 90 het 36 0 28 8 T 2 3 135202 CASAVA_Build 10 61438141 2D AGACTTAAAA AG/-- AAAAAAGAAA 287 het 287 ref 30 9 3 18 AG 1 0 135203 CASAVA_Build 10 61460863 4D TGAATGCTTT GTAA/---- GTAAGTCTCT 3070 het 3070 hom 45 20 21 8 GTAA 2 1 135204 CASAVA_Build 10 61463603 1I TCTCAAACTT -/G GGTTGCACAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 G 2 3 135205 CASAVA_Build 10 61471726 1D GTGAACTAAA G/- GAAGTGATTT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 G 2 1 135206 CASAVA_Build 10 61472584 1I ATAAAGCAGT -/C CCATTCTGAT 3070 het 136 hom 46 1 43 2 C 2 3 135207 CASAVA_Build 10 61473642 1D GAAGACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 52 1 44 8 A 11 10 135208 CASAVA_Build 10 61480676 1I CTATTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 1925 het 1925 ref 40 23 7 10 T 15 16 135209 CASAVA_Build 10 61482601 1I GTATTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 294 hom 28 1 23 4 A 11 12 135210 CASAVA_Build 10 61484804 1D GGTTTTAAAG T/- GATTAGAAAT 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 T 1 0 135211 CASAVA_Build 10 61496312 4I TATACCTGAG ----/AGCA AGCAGAGACT 3070 hom 62 het 28 0 22 6 AGCA 1 2 135212 CASAVA_Build 10 61506422 1I GAAGTTAAAA -/T AAAAACAACT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 0 1 135213 CASAVA_Build 10 61511580 1D GGTCCTACTC T/- TTTCCCCCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 4 3 135214 CASAVA_Build 10 61513688 1I TTTTGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 2040 het 2040 ref 40 17 5 18 T 15 16 135215 CASAVA_Build 10 61521221 1I GGGGATAAAG -/A GGGGTAGATA 3070 hom 122 het 45 0 40 5 A 0 1 135216 CASAVA_Build 10 61524490 14D CATAGATAGT AGGTAAGTGTGAAA/-------------- AGGCAAAAGG 3070 hom 107 het 38 0 35 5 AGGTAAGTGTGAAA 1 0 135217 CASAVA_Build 10 61533252 1D CAGATTTGGG A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 1 0 135218 CASAVA_Build 10 61542063 30D AAAACTCTTC AACATCTTTGCTCCCTGAATGTATCCCAGA/------------------------------ TGTTATATAG 3070 hom 66 het 24 0 21 4 AACATCTTTGCTCCCTGAATGTATCCCAGA 1 0 135219 CASAVA_Build 10 61543793 2D AATTTTTCTC AA/-- AAAAAAAACT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 8 135220 CASAVA_Build 10 61546358 1I ACTACTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 27 1 21 5 A 10 11 135221 CASAVA_Build 10 61546543 1I TCCTAGAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 135222 CASAVA_Build 10 61550385 1D CTCTCTAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 10 9 135223 CASAVA_Build 10 61562588 1I ACCACGTTGG -/C CAGGCTGGTC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 1 2 135224 CASAVA_Build 10 61563888 1I GTACAACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 10 135225 CASAVA_Build 10 61566264 1I TTAACATTGG -/T GGTGTATGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 135226 CASAVA_Build 10 61572976 7I TTGTGTTAGG -------/TAATCAC AAAATTTGTT 3070 hom 178 het 66 0 60 6 TAATCAC 0 1 135227 CASAVA_Build 10 61581350 1D AATGCAGAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 42 0 36 6 A 10 9 135228 CASAVA_Build 10 61581780 4D GGTAAATACC TTGT/---- TTCTGATGGT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TTGT 1 0 135229 CASAVA_Build 10 61688575 5D TTCCACTCCC TACTG/----- TATTTTGTCA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 TACTG 1 0 135230 CASAVA_Build 10 61694412 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 34 3 23 8 A 11 10 135231 CASAVA_Build 10 61710850 1I GAAAATTCTA -/C CCCCTCAGAA 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 C 4 5 135232 CASAVA_Build 10 61713080 2I GGAGTTACTC --/TT AACACAGTCT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 0 2 135233 CASAVA_Build 10 61720166 1I GCTTTTATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 24 hom 26 1 19 6 T 9 10 135234 CASAVA_Build 10 61741239 5D TATGGAAGCC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 40 3 14 23 A 21 16 135235 CASAVA_Build 10 61751121 1I40M3D ACCCTATCTC -AAAAAAAACAAAAGGAAAAGAAAGAAAAAAGAAAAGAGAAGAG/AAAAAAAAACAAAAGGAAAAGAAAGAAAAAAGAAAAGAAAA--- AAGAAAAGAA 3070 het 2157 hom 33 10 15 18 N/A 0 0 135236 CASAVA_Build 10 61756651 1I CGGGTGCGGT -/G GCGGGCGCCT 2380 hom 27 het 11 0 9 2 G 1 2 135237 CASAVA_Build 10 61761030 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 20 0 20 1 A 9 8 135238 CASAVA_Build 10 61766791 1I AAAAGGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 40 0 28 12 A 11 12 135239 CASAVA_Build 10 61768785 1I ATTAGCATAT -/A ACTCCAAGAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 2 135240 CASAVA_Build 10 61774417 2I TTCAAAACTC --/TT TTAAAAAATG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 2 4 135241 CASAVA_Build 10 61774860 1D TATTGTGAAA C/- AAAGCCCAAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 C 1 0 135242 CASAVA_Build 10 61776066 1D AAAAAAGGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 8 135243 CASAVA_Build 10 61776208 1D27M2I ATAGGCATAC AAAAAAGTACTCAAACTTATAACTCTTT--/-AAAAAGTACTCAAACTTATAACTCTTTAA ATAAATTCAG 3070 hom 114 het 36 0 39 6 N/A 0 0 135244 CASAVA_Build 10 61776398 1D GGGATGGGGG C/- AATTCAGCAA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 C 1 0 135245 CASAVA_Build 10 61776725 2D64M2D TTCATACATA AGAGTCTTTTAAACAACTTGAGACCATCTATTAGTAGCTTTTTTAGTTTCTATCTAGTATGTATGTAC/--AGTCTTTTAAACAACTTGAGACCATCTATTAGTATCTTTTTTAGTTTCTATCTAGTATGTATGT-- AGTACTGCAT 3070 hom 87 het 32 0 30 11 N/A 0 0 135246 CASAVA_Build 10 61778846 2D TGAGAAACAC AG/-- AGAGGGAAGA 3070 hom 126 het 46 0 42 5 AG 3 2 135247 CASAVA_Build 10 61779272 1I TAGAACCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 10 135248 CASAVA_Build 10 61780799 1I TATTTCCTCA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 7 8 135249 CASAVA_Build 10 61787321 12I TCGAGTTGCA ------------/CCTAGATCTGGC CAGTTGAATA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 CCTAGATCTGGC 0 1 135250 CASAVA_Build 10 61794506 1D AGCCATAGAG C/- CTACTAGTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 2 1 135251 CASAVA_Build 10 61817217 9I TTACAAGTAG ---------/TATATGAAA TATATGAAAT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 TATATGAAA 1 2 135252 CASAVA_Build 10 61833977 1I AACACCACAA -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 1 2 135253 CASAVA_Build 10 61853186 1I ATTCTCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 11 12 135254 CASAVA_Build 10 61860250 3I GGTGAAAAAT ---/GAG GAGGTTAAAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 GAG 1 2 135255 CASAVA_Build 10 61862921 1D AACAACACTG A/- AAAAGAGAAC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 5 4 135256 CASAVA_Build 10 61871861 1D TCCCATATAC T/- TTTTTTTTTT 1420 het 1420 ref 31 18 5 8 T 17 16 135257 CASAVA_Build 10 61894272 6D AACACTCTCT AACTAA/------ AACATCTTAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 AACTAA 1 0 135258 CASAVA_Build 10 61900230 1D ATTTTATACT C/- TTTTTTTGAA 3070 hom 53 het 39 1 32 6 C 1 0 135259 CASAVA_Build 10 61904037 1I ACAGGAATAC -/A TACTTACAGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 0 1 135260 CASAVA_Build 10 61915083 1I GAAGGCTACA -/G GTCTCGGCAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 G 1 2 135261 CASAVA_Build 10 61916574 1I ATATATTCAA -/G TTAACACTAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 G 0 1 135262 CASAVA_Build 10 61917354 1D AATGCATATC T/- CTGGGTCCCA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 1 0 135263 CASAVA_Build 10 61931788 20D TTTAACATCT CCCCAAATGACTACAGGATA/-------------------- CCCCAAATGA 3070 het 3070 ref 49 31 21 2 CCCCAAATGACTACAGGATA 2 1 135264 CASAVA_Build 10 61932651 2D AGGGAAAGAA AG/-- AGAGAAAGAG 3070 het 3027 hom 24 8 11 5 AG 3 2 135265 CASAVA_Build 10 61941554 1D GGGAAAGGCA T/- TTTTTTTTTT 2913 het 1124 hom 30 5 8 17 T 16 15 135266 CASAVA_Build 10 61942684 1I AACAAGGAAG -/A GCATTATTTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 0 1 135267 CASAVA_Build 10 61947911 3I AGCCTGGGGC ---/AAG AAGGACATCA 3070 het 3070 hom 73 28 38 7 AAG 1 2 135268 CASAVA_Build 10 61950704 1D TTTGTCTTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 10 9 135269 CASAVA_Build 10 62014221 2I TGTCTCCACC --/AA AAAAATTTAA 3070 hom 63 het 24 0 20 4 A 5 7 135270 CASAVA_Build 10 62088652 2D GAAAAGAGAA AG/-- AGAGAGAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 10 7 AG 4 3 135271 CASAVA_Build 10 62135589 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 22 1 13 8 T 19 18 135272 CASAVA_Build 10 62145636 1I25M2I6M2I17M2I CATGCTGACC -AATCAGCTTGACTGTACTCCTTAAC--AAGACT--CTTCTTCAAGAAATATT--/AAATCAGCTTGACTGTACTCCTTAACAAAAGACTCCCTTCTTCAAGAAATATTAA AAATGTGTAT 3070 hom 196 het 54 0 66 7 N/A 0 0 135273 CASAVA_Build 10 62170176 2D CTCTACAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 A 13 11 135274 CASAVA_Build 10 62184097 1I TTGATACATT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 8 9 135275 CASAVA_Build 10 62188540 2I TCTTAAAAGG --/AA AAAAAAAAGG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 8 10 135276 CASAVA_Build 10 62194945 1D CTAAAAGACA T/- TTTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 39 18 19 2 T 7 6 135277 CASAVA_Build 10 62195144 3D GAAGAGAGAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 32 15 17 1 AAG 6 5 135278 CASAVA_Build 10 62197402 1D CCATTTGAAA T/- ATGGTAACAC 3070 het 3070 ref 47 28 15 5 T 1 0 135279 CASAVA_Build 10 62198416 1D TTTACCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 T 11 10 135280 CASAVA_Build 10 62208911 2D AGGCACTTAA CT/-- CTCATGAGCA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 CT 2 1 135281 CASAVA_Build 10 62217453 4D TAAAAATGAA AGAT/---- AGAAAAGGCC 3070 het 3070 ref 37 17 18 4 AGAT 1 0 135282 CASAVA_Build 10 62222311 1D TTAATACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 11 10 135283 CASAVA_Build 10 62226123 2D ACTTGAAAAC AG/-- AGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 AG 2 1 135284 CASAVA_Build 10 62227543 1D CTTTTATAAC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 7 6 135285 CASAVA_Build 10 62230247 3I CCATCTTAAA ---/TCT TCTTGCTAGA 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 TCT 1 2 135286 CASAVA_Build 10 62235550 2I CTTGTGTAAC --/CT GTGTATTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 CT 0 1 135287 CASAVA_Build 10 62238195 1I TGCCCTTTCC -/T GTCAGGATCC 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 T 0 1 135288 CASAVA_Build 10 62245531 1D CTTGCAGGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 9 8 135289 CASAVA_Build 10 62246608 1D GGAATAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2458 hom 33 7 10 16 T 15 14 135290 CASAVA_Build 10 62251357 2D TTCCAATTGC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 14 17 9 TG 9 8 135291 CASAVA_Build 10 62259864 2I ATGTATATAT --/AA TATATATATG 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 A 0 2 135292 CASAVA_Build 10 62261001 4D GTAAATTATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2872 hom 37 12 20 8 A 16 12 135293 CASAVA_Build 10 62270363 3D TCCTAGGTGA CTT/--- CTTCTCTCCA 3070 het 3070 ref 41 18 17 8 CTT 2 1 135294 CASAVA_Build 10 62280035 1D GAGGGAGGGG A/- AAGATAGCTG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 3 2 135295 CASAVA_Build 10 62310780 3D CCCATAATTC CCA/--- CGTGTTGTGG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 CCA 1 0 135296 CASAVA_Build 10 62311968 2D CTTTTTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2993 het 2843 hom 23 8 10 5 A 13 11 135297 CASAVA_Build 10 62322870 1D TGTCACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 8 A 12 11 135298 CASAVA_Build 10 62325164 1D AAATAAGATT A/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 31 14 16 3 A 1 0 135299 CASAVA_Build 10 62672157 1D GGTAAAGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 10 9 135300 CASAVA_Build 10 62721533 1D TGGTTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 42 1 35 6 T 12 11 135301 CASAVA_Build 10 62723200 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1752 het 1752 ref 22 10 5 9 A 16 15 135302 CASAVA_Build 10 62727354 10D TTTTGATGGA TATTAACTGG/---------- TATTTTTAGA 3070 het 3070 hom 34 18 18 0 TATTAACTGG 1 0 135303 CASAVA_Build 10 62730829 1D AGGCCATGAG C/- TTTGAAGACA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 C 1 0 135304 CASAVA_Build 10 62732906 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 948 hom 27 6 17 6 T 14 13 135305 CASAVA_Build 10 62740847 1I GTTCTAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 T 11 12 135306 CASAVA_Build 10 62745283 2D ATAGTAATTT CA/-- CAGTGGAGAA 3070 hom 132 het 49 0 45 6 CA 2 1 135307 CASAVA_Build 10 62746934 1D ACAATGATTA C/- CCCTTAGAAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 4 3 135308 CASAVA_Build 10 62749365 1D AGGAATGAAA G/- GAGAAGCCAT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 G 2 1 135309 CASAVA_Build 10 62750141 1D AAAAATATCT A/- AAGACTTGAA 3070 hom 115 het 43 0 38 5 A 3 2 135310 CASAVA_Build 10 62755336 1I CCAAATGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 12 13 135311 CASAVA_Build 10 62767537 1I CTGCCAGTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 66 het 28 0 21 7 T 8 9 135312 CASAVA_Build 10 62770123 1D GAAAGTGGGC A/- AAAGACACAA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 A 4 3 135313 CASAVA_Build 10 62779759 1D AATAATGAAC A/- AAAAAAGACC 3070 hom 117 het 43 0 40 5 A 7 6 135314 CASAVA_Build 10 62788101 1D TTATTTTCTA T/- AACTGTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 1 0 135315 CASAVA_Build 10 62798944 3I AAAAGTATTT ---/TTC TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 TTC 0 1 135316 CASAVA_Build 10 62801085 1I TTACCGTAAC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 6 7 135317 CASAVA_Build 10 62808946 1I ATAATCTCCT -/G GTGTGCCATT 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 G 1 2 135318 CASAVA_Build 10 62814346 1D TAGTGTTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 10 14 9 T 10 9 135319 CASAVA_Build 10 62820548 6I AATGACAATG ------/ATAATA ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 ATA 3 5 135320 CASAVA_Build 10 62828873 1I ACAAGTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 T 10 11 135321 CASAVA_Build 10 62862414 1D AGAGGACTTA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 7 6 135322 CASAVA_Build 10 62876648 8D AAAGATGCTG ACACAGAA/-------- ACACAGAAAC 2419 het 2419 ref 20 14 5 3 ACACAGAA 2 1 135323 CASAVA_Build 10 62892010 1I AAAAACATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 91 het 38 0 31 7 A 9 10 135324 CASAVA_Build 10 62908253 1D ATGAAACACT A/- ACTGGAATGT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 2 1 135325 CASAVA_Build 10 62910811 1D AACAGGTTTG A/- GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 1 0 135326 CASAVA_Build 10 62912660 7D ACTCTCTCCC TTCTCTT/------- TTGAATACCC 3070 het 3070 ref 47 20 18 11 TTCTCTT 1 0 135327 CASAVA_Build 10 62925873 1D TGAATAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1007 het 1007 ref 35 26 3 6 T 11 10 135328 CASAVA_Build 10 62937637 1D AGGACACAAT A/- AAAAATTATT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 6 5 135329 CASAVA_Build 10 62938244 1D CCTGGCCAAC A/- ATGATGAAAC 3070 hom 48 het 18 0 14 4 A 2 1 135330 CASAVA_Build 10 62941953 1I TTTGAAGCAA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 1 2 135331 CASAVA_Build 10 62956469 3D GTTGGATGAT GAG/--- AAATTACTCA 3070 het 3070 ref 42 22 15 7 GAG 1 0 135332 CASAVA_Build 10 62958839 17I ATATACCAAC -----------------/CTTAGCTATTGAATTTT CTTCTCTTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 CTTAGCTATTGAATTTT 0 1 135333 CASAVA_Build 10 62967652 3D TTAAATTATT TTA/--- TTATTCACAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 TTA 2 1 135334 CASAVA_Build 10 62976650 1D GACCTATGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 10 9 135335 CASAVA_Build 10 62979747 1I CTCATTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 25 1 20 4 T 10 11 135336 CASAVA_Build 10 62985322 1I ATTTTCCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 25 10 3 T 10 11 135337 CASAVA_Build 10 62986983 2D CAGTCATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 47 2 17 30 A 13 11 135338 CASAVA_Build 10 62990686 1I CATATTGGAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 79 het 35 0 27 8 A 8 9 135339 CASAVA_Build 10 62990971 8I CTTTTAAAAA --------/TGTATTGT TGTCTAACAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TGTATTGT 0 1 135340 CASAVA_Build 10 63000978 1D TCCTTCTGGC A/- AAAAAAGATT 3070 het 3070 hom 43 13 25 6 A 7 6 135341 CASAVA_Build 10 63003504 7D AGTACTCATG TGGAGCA/------- TTCCTACCTA 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 TGGAGCA 1 0 135342 CASAVA_Build 10 63008374 1I TCTCATTTCG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 7 8 135343 CASAVA_Build 10 63015187 1D GATGGTACTT A/- AAAAAAAAAA 1249 het 1249 ref 42 36 3 3 A 11 10 135344 CASAVA_Build 10 63018056 1I ATTTTAAAAA -/G CTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 G 0 1 135345 CASAVA_Build 10 63020134 1D CTTTAATGCT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 A 8 7 135346 CASAVA_Build 10 63021174 1I TAAAAATAAA -/G TATGGACTCT 3070 hom 141 het 50 0 47 3 G 0 1 135347 CASAVA_Build 10 63032135 1I TATCATGGGG -/A AAAAAACGCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 6 7 135348 CASAVA_Build 10 63034407 1D TCTTGTAGTT A/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 1 0 135349 CASAVA_Build 10 63038315 2I ATCTCCCATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 133 het 53 0 42 11 A 10 12 135350 CASAVA_Build 10 63038982 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2259 hom 25 5 12 8 A 13 12 135351 CASAVA_Build 10 63044409 5I TCGGCTCACT -----/GCAAC CTCCGCCTCC 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 GCAAC 0 1 135352 CASAVA_Build 10 63046460 2D GCTCACAGAA GT/-- CTTACCTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 GT 1 0 135353 CASAVA_Build 10 63047365 29D TTTTATTCCC ATTTTTATTCCCATTTTATTCCCATTTTT/----------------------------- ATTACTCATT 3070 het 3070 ref 31 24 11 1 ATTTTTATTCCCATTTTATTCCCATTTTT 1 0 135354 CASAVA_Build 10 63050364 6D GGTCTTGTCT CAAAAA/------ CAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 30 17 8 6 CAAAAA 2 1 135355 CASAVA_Build 10 63054557 3I TATTATTAAC ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 TAT 4 5 135356 CASAVA_Build 10 63055422 1I TGTTCAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 28 2 21 5 A 11 12 135357 CASAVA_Build 10 63055433 1I AAAAAAAAAA -/G TTCCTTATCC 3070 het 438 hom 26 1 22 3 G 0 1 135358 CASAVA_Build 10 63061659 1I GGCACTGGAC -/A AAAGAAAAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 3 4 135359 CASAVA_Build 10 63062422 1I ACAACCTACC -/T TTTTTTTTTT 2953 het 2953 ref 28 16 7 5 T 11 12 135360 CASAVA_Build 10 63066462 1D AATACTTTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 7 6 135361 CASAVA_Build 10 63073072 1I ACTGAATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 11 12 135362 CASAVA_Build 10 63074041 1D TTTGAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 10 15 20 T 17 16 135363 CASAVA_Build 10 63081616 1D TCATTGGGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 10 9 135364 CASAVA_Build 10 63088646 1I GCACAGCAAC -/G TAAGCAGTGG 3070 het 3070 ref 57 27 25 5 G 0 1 135365 CASAVA_Build 10 63091349 3D TTCACCAATT GAA/--- GAAATTTTAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 6 GAA 2 1 135366 CASAVA_Build 10 63093377 3D GGCTGGAAAA TCT/--- TCTCTGGTTA 3070 het 3070 hom 29 13 13 5 TCT 2 1 135367 CASAVA_Build 10 63093589 1D CAGATATTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 10 9 135368 CASAVA_Build 10 63095320 1D GTATCAATAA T/- TTTTTTCATA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 T 7 6 135369 CASAVA_Build 10 63098586 4D GTGCCAAAAA ACTC/---- AGTAATCAAG 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 ACTC 1 0 135370 CASAVA_Build 10 63110814 14I AGATTATGGG --------------/CATTATAGAATTTT CATTAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 CATTATAGAATTTT 0 1 135371 CASAVA_Build 10 63139408 2D AAATTTTTTT AA/-- AGTCATTTAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 3 1 135372 CASAVA_Build 10 63139458 1D CCTCAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1754 hom 23 5 13 6 A 13 12 135373 CASAVA_Build 10 63141879 25D TAAAAGCATT CCTATTTCTCCACATCCTCCACAGC/------------------------- CCTATTTCTC 3070 hom 21 het 7 0 8 2 CCTATTTCTCCACATCCTCCACAGC 2 1 135374 CASAVA_Build 10 63146664 1D TGTGACTTTC T/- TCTGTATACT 3070 het 3070 hom 38 14 19 7 T 2 1 135375 CASAVA_Build 10 63147191 34D TATAATATTA ACATCTTTAACTGCCAGGAAAAGAAAAGCCTAAT/---------------------------------- AATGACTTAG 3070 het 3070 ref 26 27 9 3 ACATCTTTAACTGCCAGGAAAAGAAAAGCCTAAT 1 0 135376 CASAVA_Build 10 63150057 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 9 8 135377 CASAVA_Build 10 63150454 1I ATCATGTGGT -/G GGGGGGGCAG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 G 7 8 135378 CASAVA_Build 10 63161566 1D GAAGGGGGGG A/- AAGTTTCTTT 1364 het 898 hom 15 6 5 4 A 3 2 135379 CASAVA_Build 10 63162244 3D GACTGTAAAG ACA/--- ACAACTACCA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 ACA 2 1 135380 CASAVA_Build 10 63164282 1D AGGAAGGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 A 10 9 135381 CASAVA_Build 10 63169333 2D GATTAGGGAC AG/-- AGAGATTAAT 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 AG 3 2 135382 CASAVA_Build 10 63171339 3D TGATGTTACC AAT/--- AATAAGTTGT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 AAT 2 1 135383 CASAVA_Build 10 63177926 1I GATACGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 10 11 135384 CASAVA_Build 10 63182555 1I ATTTAGCACC -/A AAAGCTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 3 4 135385 CASAVA_Build 10 63207614 2I CAGAATACTT --/AA AAAGTGGCAG 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 3 5 135386 CASAVA_Build 10 63214987 1D TTGATGGAGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 8 7 135387 CASAVA_Build 10 63219238 1D ATAATAAATC A/- AAAGCTCAAT 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 A 4 3 135388 CASAVA_Build 10 63223409 1I TATAATCCAC -/A AAAAAAAAAA 1213 het 1213 ref 32 25 3 4 A 10 11 135389 CASAVA_Build 10 63229962 8D TATATGCTGC TTTTAAAG/-------- AAGTAAAGCA 3070 het 3070 hom 35 14 20 4 TTTTAAAG 1 0 135390 CASAVA_Build 10 63233292 1D GAGGGTTAAC A/- TGTGATGCAA 3070 het 3070 ref 43 24 19 1 A 1 0 135391 CASAVA_Build 10 63250480 1D CTATGTGTTC A/- CCATTGGCCA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 1 0 135392 CASAVA_Build 10 63255348 1I GCAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 9 10 135393 CASAVA_Build 10 63265275 1D AACATGGGGG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 40 20 15 6 A 8 7 135394 CASAVA_Build 10 63265549 1D TAAAATCCGA G/- GGCATTATCA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 3 2 135395 CASAVA_Build 10 63267073 6D CATACACACC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2969 het 2382 hom 28 10 10 8 A 20 14 135396 CASAVA_Build 10 63267876 1I ATTTGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 A 10 11 135397 CASAVA_Build 10 63270853 1I TAAACAGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 128 hom 38 1 27 10 T 9 10 135398 CASAVA_Build 10 63301448 4D AAGAAAAGAC AGTT/---- AGGATTTAGC 3070 het 3070 ref 43 25 16 3 AGTT 1 0 135399 CASAVA_Build 10 63322731 1I TGAGTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 478 hom 26 2 20 4 T 10 11 135400 CASAVA_Build 10 63335211 1I TTGCAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 2285 het 2285 ref 29 9 8 12 T 13 14 135401 CASAVA_Build 10 63336999 1D ATCAGCAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 50 19 19 12 T 10 9 135402 CASAVA_Build 10 63337175 1D TGACCACACT G/- GCCTTAGACA 3070 het 3070 hom 38 16 16 7 G 2 1 135403 CASAVA_Build 10 63337809 1D AGAAATTGTA C/- TTCAATATTA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 C 1 0 135404 CASAVA_Build 10 63342527 1I ATATACATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 9 10 135405 CASAVA_Build 10 63346929 1D TGTTTCTAGT A/- AAAAAAAAAA 1331 het 1009 hom 18 4 5 9 A 17 16 135406 CASAVA_Build 10 63348593 1D GAGGTTAGGA G/- TTTGTGACCA 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 G 1 0 135407 CASAVA_Build 10 63350851 2D TACTTGAAAC AT/-- ATTTAGCACC 3070 het 3070 hom 43 21 20 3 AT 2 1 135408 CASAVA_Build 10 63373236 1I TTATTTGAGG -/C CCCCCCCCCT 2825 het 2592 hom 34 7 8 19 C 9 10 135409 CASAVA_Build 10 63377027 14D ACTTACTTTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 12 8 T 25 11 135410 CASAVA_Build 10 63377324 1D TGTGAGCCAC T/- GTGTCCAACC 3070 het 3070 ref 27 13 10 6 T 1 0 135411 CASAVA_Build 10 63424560 18I CGTGTAATTA ------------------/TGATATAAGCACAGAATT AGAGTCATTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TGATATAAGCACAGAATT 0 1 135412 CASAVA_Build 10 63466164 6I AGCCCAGCCT ------/AACAAA AGCAAGCAGG 3070 hom 108 het 41 0 35 6 AACAAA 0 1 135413 CASAVA_Build 10 63470105 2D ATTATAACAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 33 0 27 8 TA 7 6 135414 CASAVA_Build 10 63476568 3I TTAGTGGGAG ---/TTT TCTTGCCACC 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 1 4 135415 CASAVA_Build 10 63485661 1I GAAAGAAAAA -/G GGTTCGAAAT 3070 hom 114 het 46 0 38 8 G 2 3 135416 CASAVA_Build 10 63488927 1D TTTCTCGTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 11 21 9 A 10 9 135417 CASAVA_Build 10 63494512 1D AGACAATTTA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 8 7 135418 CASAVA_Build 10 63501376 2I ACCCATAGTA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 37 10 11 16 GT 7 8 135419 CASAVA_Build 10 63505970 1D AACCCATCAC A/- AGATCTGAGT 3070 het 3070 ref 56 26 25 5 A 2 1 135420 CASAVA_Build 10 63507296 1D GACCCCCCCC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 A 9 8 135421 CASAVA_Build 10 63509046 1D GGTCGAACTC A/- AAATTTTGAC 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 A 4 3 135422 CASAVA_Build 10 63516655 1I TCCAGGAAAG -/A GGGACCTTGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 0 1 135423 CASAVA_Build 10 63528172 1I CCTCTGCCCC -/T GGCTTCCCTT 3070 het 3070 ref 53 34 14 5 T 0 1 135424 CASAVA_Build 10 63531720 1D TTTGTTTGGC T/- TTTTTTTTTA 966 het 966 ref 44 34 3 8 T 10 9 135425 CASAVA_Build 10 63534525 1D CCAAAGACAT A/- AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 A 7 6 135426 CASAVA_Build 10 63541478 1D CTTGTGAGTT G/- CAGAGCTGGG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 G 1 0 135427 CASAVA_Build 10 63547987 4D AAAAACAAAC AAAT/---- AAATAAATAA 2692 het 2692 ref 25 8 8 10 AAAT 6 5 135428 CASAVA_Build 10 63552754 1I TTGGCCACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 864 hom 25 4 18 3 T 9 10 135429 CASAVA_Build 10 63565942 1D GCTACAAACA T/- TTTTTTTTTT 769 het 769 ref 31 22 3 6 T 13 12 135430 CASAVA_Build 10 63566596 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1197 het 550 hom 15 4 4 7 T 17 16 135431 CASAVA_Build 10 63570090 1D TTTTTAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 28 2 18 8 T 13 12 135432 CASAVA_Build 10 63577218 1D CAACCTCTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 T 10 9 135433 CASAVA_Build 10 63579525 1D TACTTATACT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 38 15 15 9 A 9 8 135434 CASAVA_Build 10 63611446 17D ACTTCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 2456 het 2456 ref 16 9 6 3 A 27 10 135435 CASAVA_Build 10 63613993 1D AGGAGACGCG T/- TGTCTTTTCC 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 2 1 135436 CASAVA_Build 10 63615971 8I CTTAACGTAT --------/ATGCTTTC ATGCTTTCAT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 ATGCTTTC 1 2 135437 CASAVA_Build 10 63616514 1I CAGAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 T 10 11 135438 CASAVA_Build 10 63619581 1I GCAACAGAGA -/T TTTTTTTTTT 993 het 993 ref 33 22 3 8 T 12 13 135439 CASAVA_Build 10 63621813 1D TATTATAAGG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 15 8 9 T 9 8 135440 CASAVA_Build 10 63639152 6D ATTGTCTATG GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 GT 9 6 135441 CASAVA_Build 10 63641540 4D ATTATCCTGC CTTA/---- CTTAGCCTCC 3070 hom 48 het 21 0 17 5 CTTA 2 1 135442 CASAVA_Build 10 63641870 1D ATCTCTACTT A/- AAAAAAAAAT 467 hom 4 het 10 0 1 9 A 10 9 135443 CASAVA_Build 10 63648084 1D AAGGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 11 10 135444 CASAVA_Build 10 63648381 2D CAGAGAATAT AA/-- GTGATCTCAT 3070 hom 60 het 23 0 20 4 A 2 0 135445 CASAVA_Build 10 63648589 10D TGTCTCTACT AAAAATACAA/---------- AAATTAGCTG 3070 hom 41 het 16 0 11 5 AAAAATACAA 1 0 135446 CASAVA_Build 10 63649016 1D GGGCCTGAGA G/- GGTGATGACA 3070 hom 108 het 42 0 35 9 G 3 2 135447 CASAVA_Build 10 63651358 4I CAATTTAAAC ----/ACTT ACATGCATCA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 ACTT 0 1 135448 CASAVA_Build 10 63653738 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATACACA 3070 hom 135 het 50 0 45 6 TA 4 3 135449 CASAVA_Build 10 63654104 1I TACAAAAAAG -/A AAAAAATTTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 135450 CASAVA_Build 10 63654823 1I CATGATCCTC -/T TGAGTCCTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 1 2 135451 CASAVA_Build 10 63670020 1I AAACCACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 32 2 21 9 A 11 12 135452 CASAVA_Build 10 63670478 1D ATATTGAAGG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 7 135453 CASAVA_Build 10 63672388 1D ATCTATTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 29 7 T 11 10 135454 CASAVA_Build 10 63674313 1D CAACTTAACA T/- ATGTCATTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 1 0 135455 CASAVA_Build 10 63675589 1I CTTAAACTCT -/A AAAGTTCTAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 3 4 135456 CASAVA_Build 10 63689044 5I TTTTTCTTAA -----/TAAAT TACTCAGTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAAAT 0 1 135457 CASAVA_Build 10 63690300 2D AACAAATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 128 het 56 0 43 15 TG 10 9 135458 CASAVA_Build 10 63694602 1D GGCTTGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 153 hom 36 1 19 16 T 15 14 135459 CASAVA_Build 10 63694868 1D AGTCAGGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 10 9 135460 CASAVA_Build 10 63696312 4I GGAATGGAAC ----/TGGA TGGAGACCGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TGGA 1 2 135461 CASAVA_Build 10 63700889 5I GAGGCTAAAG -----/GAAAA GAAAACACTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 GAAAA 1 2 135462 CASAVA_Build 10 63703095 1D ACAACTTACC T/- TGCTGTCTAG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 2 1 135463 CASAVA_Build 10 63716151 1I AATAAAATTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 9 10 135464 CASAVA_Build 10 63724895 2D TTTCCATTTA AT/-- ATATATATAT 2767 hom 21 het 10 0 8 2 AT 9 8 135465 CASAVA_Build 10 63727138 1D GTGGTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 T 12 11 135466 CASAVA_Build 10 63738033 30I AGCATTGTTT ------------------------------/GGATAATGGAAATAGGGCACGCACATTTGA AAAGCTGCTT 3070 het 3070 ref 41 23 16 3 GGATAATGGAAATAGGGCACGCACATTTGA 0 1 135467 CASAVA_Build 10 63738365 1D CCGAAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 1301 het 1301 ref 47 35 4 8 T 11 10 135468 CASAVA_Build 10 63742459 1I TTTTAAAAAT -/A AAAATAAGAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 4 5 135469 CASAVA_Build 10 63746684 1D TTGCCTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 47 1 40 7 A 11 10 135470 CASAVA_Build 10 63747398 1I TGTCAGTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 12 13 135471 CASAVA_Build 10 63758363 1I GAAGTATGAA -/T TTCAAATATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 3 135472 CASAVA_Build 10 63759509 11D GTGTCTTTTA CTTATTTGGGT/----------- CTTCTTCTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 8 CTTATTTGGGT 1 0 135473 CASAVA_Build 10 63767094 1D TTTATCACAG T/- TCTGGAGGCT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 T 2 1 135474 CASAVA_Build 10 63770764 3I CTTGAAACAA ---/TTT TTTTTTTCTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 7 10 135475 CASAVA_Build 10 63785124 1I AATTAAGGGA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 7 8 135476 CASAVA_Build 10 63787547 1D CAATGGGCAG A/- AACTTCACCT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 3 2 135477 CASAVA_Build 10 63793359 1I ACATTCAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 24 1 17 6 T 12 13 135478 CASAVA_Build 10 63799548 2D20M4D ATATTTAACT TCTCTATATATATATATGTCCCATAT/--TCTATATATATATATGTCCC---- ATATATATCT 2870 hom 24 het 12 0 8 4 N/A 0 0 135479 CASAVA_Build 10 63813873 1D ATATTTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1271 hom 26 3 17 6 T 15 14 135480 CASAVA_Build 10 63819205 2I AATAGTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 11 13 135481 CASAVA_Build 10 63827039 1D CTGAGCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 33 0 25 8 T 12 11 135482 CASAVA_Build 10 63830590 1D GCCCTGTTAA G/- GGCTTCAGGT 3070 hom 128 het 47 0 42 5 G 3 2 135483 CASAVA_Build 10 63831252 1D TTCAGTTTAT G/- GGGGGGGTAG 3070 hom 84 het 37 0 29 8 G 8 7 135484 CASAVA_Build 10 63832450 1D TCATTAAAAG C/- CCCATTTGGC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 C 4 3 135485 CASAVA_Build 10 63833893 2I TCCAGGATGG --/AA AAGAGTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 4 135486 CASAVA_Build 10 63844133 1D TGACTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 29 0 27 2 T 12 11 135487 CASAVA_Build 10 63844851 1D ATTTTCCTTA T/- TTTTTTGAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 7 6 135488 CASAVA_Build 10 63845980 1I AAGTGTCTTA -/G ACTTCTACCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 0 1 135489 CASAVA_Build 10 63847431 2D ATCTCCTGTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 11 9 135490 CASAVA_Build 10 63848374 1D TTTTCGTAAT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 7 135491 CASAVA_Build 10 63848664 8I GCCAATGTGG --------/TATAATTT TGTGATGACT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TATAATTT 0 1 135492 CASAVA_Build 10 63848794 4D ATACCCTGGA AATT/---- TATTGCCAAT 3070 hom 141 het 51 0 48 5 AATT 1 0 135493 CASAVA_Build 10 63850550 1D GTTTTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 48 1 36 12 T 11 10 135494 CASAVA_Build 10 63852981 2I ATAGAAACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 10 12 135495 CASAVA_Build 10 63858308 1D CCTGAGGCCT C/- CCCAGCCCTG 3070 hom 51 het 18 0 16 2 C 4 3 135496 CASAVA_Build 10 63866170 1D TATTTAGGAG A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 8 7 135497 CASAVA_Build 10 63869152 1D CAACTCTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 34 1 23 11 A 15 14 135498 CASAVA_Build 10 63870087 2D GGGATGGGGG GT/-- TTTTTCTACA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 GT 1 0 135499 CASAVA_Build 10 63876368 1D CTTCCAGGGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 T 8 7 135500 CASAVA_Build 10 63893653 1I TACTACCAAC -/T TAACAGGTCA 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 T 1 2 135501 CASAVA_Build 10 63928691 3D TATTTTTGGT GAA/--- GAAGAAGCAA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 GAA 3 2 135502 CASAVA_Build 10 63934936 5D GTGACTGGCA CCCAG/----- TGTCCTGGGT 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 CCCAG 1 0 135503 CASAVA_Build 10 63942611 7I ATGTGTCCTG -------/ATTAGTC ATTAAACAGC 3070 hom 131 het 47 0 44 3 ATTAGTC 0 1 135504 CASAVA_Build 10 63953421 7D AAGAACCAGC TTTTTCT/------- TTTTTCTTTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 TTTTTCT 3 2 135505 CASAVA_Build 10 63954021 1D TCATTCAGTT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 8 7 135506 CASAVA_Build 10 63955569 1D GCTCTTAAGA T/- TTATTTCCTT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 T 3 2 135507 CASAVA_Build 10 63955651 1D TTCCCAGGTG T/- TTTTTTGAGC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 6 135508 CASAVA_Build 10 63955744 1D TTCCAAACTT G/- TTAGATTTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 G 1 0 135509 CASAVA_Build 10 63958404 1D TTTGAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 21 15 13 A 15 14 135510 CASAVA_Build 10 63959772 1D TTCCCGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1178 hom 29 5 13 12 T 13 12 135511 CASAVA_Build 10 63960450 1I ATATCTCAGC -/A AAAAAAAATA 2892 het 2892 ref 19 9 6 4 A 8 9 135512 CASAVA_Build 10 63961090 1D GCCGGGCGCA C/- GTGGCTCACG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 1 0 135513 CASAVA_Build 10 63962917 5I TATTATGATC -----/AAAGA AAAGTCATAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AAAGA 0 1 135514 CASAVA_Build 10 63963582 5D GACAAAAAGG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 AAAGA 4 3 135515 CASAVA_Build 10 63964339 1D AGGAGGTCAA G/- GGCTGCAGTA 3070 hom 54 het 39 1 32 6 G 3 2 135516 CASAVA_Build 10 63966438 1D TCTGCACAGC A/- AAAAAAAGCT 2900 het 2900 ref 22 15 6 1 A 8 7 135517 CASAVA_Build 10 63966748 5I AAGTCAAAAA -----/ATAAC AGATGCTGGT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 ATAAC 0 1 135518 CASAVA_Build 10 63968709 8I ATATGGAAGC --------/AAACTGTG AAACTGTGTC 3070 het 3070 hom 47 22 20 6 AAACTGTG 1 2 135519 CASAVA_Build 10 63977377 1D AAGAAAAAGA T/- AGGTAGCTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 0 135520 CASAVA_Build 10 63981678 15I AAAAAAGTTT ---------------/TAACTTGGAATGTAA TAATGTAGAT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 TAACTTGGAATGTAA 0 1 135521 CASAVA_Build 10 63983977 1I CCAGTTATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 T 9 10 135522 CASAVA_Build 10 63991043 1D AAAGGATATT A/- ATCATTTATG 3070 hom 99 het 40 0 33 8 A 2 1 135523 CASAVA_Build 10 63991913 1D ACTCCGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2809 hom 31 9 15 7 A 15 14 135524 CASAVA_Build 10 64010154 1I4M1I4M1D TATTTGTCTT -CTAG-GGACN/CCTAGTGGAC- AATAGGAAAG 3070 hom 48 het 27 0 13 16 N/A 0 0 135525 CASAVA_Build 10 64012219 1D CTGCAATTGC T/- TTTTTTTTTT 1018 het 1018 ref 49 33 3 13 T 11 10 135526 CASAVA_Build 10 64021314 1D ACAGAGAAAA G/- CAAATCTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 G 1 0 135527 CASAVA_Build 10 64022635 10D ACACTAATGA GCATTCATCT/---------- GTGCACAGTG 3070 het 3070 ref 40 20 20 3 GCATTCATCT 1 0 135528 CASAVA_Build 10 64031327 2D TTTTCTTTCA CT/-- CTCTGGTTGT 3070 het 3070 ref 37 25 10 3 CT 3 2 135529 CASAVA_Build 10 64032496 1I TTAAACGTGA -/T TTTTTTTTTA 2246 hom 20 het 15 0 7 8 T 9 10 135530 CASAVA_Build 10 64039384 1D AAATATTCAG C/- TAGACACCCA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 1 0 135531 CASAVA_Build 10 64041218 1D GACTTGGTTC T/- TCCCACACAA 3070 hom 126 het 44 0 42 3 T 2 1 135532 CASAVA_Build 10 64061174 1I GTTGACTCTC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 7 8 135533 CASAVA_Build 10 64061453 1D TCCTTATTTT C/- CCTGAACATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 3 2 135534 CASAVA_Build 10 64070059 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2515 hom 25 10 11 4 A 11 12 135535 CASAVA_Build 10 64073431 1I GTTTCCTCCA -/C CCCCCCAGTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 C 6 7 135536 CASAVA_Build 10 64101980 1D AGTTTTTCAC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 8 7 135537 CASAVA_Build 10 64115338 1D GCCCTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 29 1 23 5 A 14 13 135538 CASAVA_Build 10 64128743 1D CTAAATTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 11 12 A 16 15 135539 CASAVA_Build 10 64141953 1I GTGATTCCTC -/A AAAAATTAAA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 5 6 135540 CASAVA_Build 10 64163271 5D AAAGCGTTTG CAGCT/----- CAGCCCCACA 3070 het 3070 hom 36 10 21 6 CAGCT 1 0 135541 CASAVA_Build 10 64166048 3I ATTGTGTAAT ---/AGG AGGAGGGTTT 3070 het 3070 ref 54 25 22 7 AGG 2 3 135542 CASAVA_Build 10 64168955 1I ATTCCAATCA -/T CCAGCTCATC 3070 het 3070 ref 58 32 20 6 T 0 1 135543 CASAVA_Build 10 64173767 1I CGTGGAGCAC -/A AAGGGGAATG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 2 3 135544 CASAVA_Build 10 64180691 1I AATTATCCTT -/C CCCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 C 3 4 135545 CASAVA_Build 10 64181815 1D CTCCGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 22 0 19 3 A 13 12 135546 CASAVA_Build 10 64187947 1D TAGGCGTTTG C/- GGTTGATTCC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 1 0 135547 CASAVA_Build 10 64189579 12D TTCTGGTGGA ACTTCTCATAAC/------------ ACCTTCCTTT 3070 het 3070 hom 44 16 23 11 ACTTCTCATAAC 1 0 135548 CASAVA_Build 10 64222147 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 12 11 135549 CASAVA_Build 10 64226245 2D ATCAATACTC AG/-- AGTCTTCGGA 3070 het 3070 hom 46 22 24 1 AG 2 1 135550 CASAVA_Build 10 64232294 1D CTCACTTTAG A/- AAAAAGACTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 5 135551 CASAVA_Build 10 64242044 1D CAGGGAGTGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 T 8 7 135552 CASAVA_Build 10 64250082 1D GATTTTCAGG T/- TTTTTTTTTT 929 het 929 ref 37 29 3 5 T 11 10 135553 CASAVA_Build 10 64257303 1I TGGAGGAGAT -/A AGATTCATCC 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 A 1 2 135554 CASAVA_Build 10 64260557 1D CAAGCCATGG A/- GGAACAGCCA 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 1 0 135555 CASAVA_Build 10 64266369 1D ACACCCCCCC A/- CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 1 0 135556 CASAVA_Build 10 64266811 3D ATTATGTAGC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 TAT 6 5 135557 CASAVA_Build 10 64276031 1D AAGTCAGCTC A/- AAAATGGCTC 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 5 4 135558 CASAVA_Build 10 64296758 7I AACCTACTCT -------/TAAAGTA TAATTTCTTG 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 TAAAGTA 0 1 135559 CASAVA_Build 10 64311174 2D GCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 20 9 T 12 10 135560 CASAVA_Build 10 64322078 1D TACCTGGCTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 A 8 7 135561 CASAVA_Build 10 64323420 1I TGCCTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 40 0 31 9 A 10 11 135562 CASAVA_Build 10 64324049 1I ACCACAGAAC -/A ATCATTCCAT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 1 2 135563 CASAVA_Build 10 64339637 1I ATGGCCCATT -/A AAAAAAACCT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 A 7 8 135564 CASAVA_Build 10 64342499 1D GTTTGGAGGA C/- CCCCCCAGGA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 C 7 6 135565 CASAVA_Build 10 64342818 1I GCTCTTGCCT -/C CCCTAGGCAT 3070 hom 117 het 41 0 38 3 C 3 4 135566 CASAVA_Build 10 64355195 1D ACTAATGGAT A/- AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 7 6 135567 CASAVA_Build 10 64357501 2I CAATATCAAC --/AA AGTGTTCAAA 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 A 1 3 135568 CASAVA_Build 10 64363839 1D TTACCACTGA T/- TTTATTACTG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 4 3 135569 CASAVA_Build 10 64371034 1D TTTTTTTACA T/- TTTTTTTTTA 2223 het 709 hom 14 3 8 4 T 10 9 135570 CASAVA_Build 10 64372168 1D GTAAATGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 38 1 34 3 A 11 10 135571 CASAVA_Build 10 64375394 1D CTTACAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 174 hom 31 1 21 10 T 15 14 135572 CASAVA_Build 10 64394067 1D CTGGTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 8 A 13 12 135573 CASAVA_Build 10 64410807 1D GGGGGGGGGG T/- CACTTTTGCC 1586 het 1586 ref 35 16 4 15 T 1 0 135574 CASAVA_Build 10 64410909 1D TAAACTAATG A/- GTTTAAATTG 3070 het 3070 hom 49 18 28 3 A 1 0 135575 CASAVA_Build 10 64418851 1D CAGTGTTGAC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 T 8 7 135576 CASAVA_Build 10 64421280 1I TATATATAAT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 30 het 17 0 11 6 A 7 8 135577 CASAVA_Build 10 64426665 1D AGGATATTGG A/- AAAAAATCAG 3070 hom 156 het 56 0 52 5 A 7 6 135578 CASAVA_Build 10 64428902 2D GTGTGTGTGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 GA 8 7 135579 CASAVA_Build 10 64429060 1D AGACACTTTC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 8 7 135580 CASAVA_Build 10 64444730 2I AATCTGCTAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 GT 5 6 135581 CASAVA_Build 10 64452588 3D TCCTAATAAA CTG/--- CTTTCACTTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 CTG 1 0 135582 CASAVA_Build 10 64472689 1D CCATATACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 11 10 135583 CASAVA_Build 10 64478211 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1605 het 1088 hom 19 5 4 10 A 17 16 135584 CASAVA_Build 10 64491933 1I TTAAAAGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1024 hom 35 4 27 4 A 11 12 135585 CASAVA_Build 10 64492464 1I TGGAGTGCAG -/T GGTGTGATCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 135586 CASAVA_Build 10 64507163 4D TCATCTTAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 25 10 14 3 AAAT 5 4 135587 CASAVA_Build 10 64513204 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 1 0 135588 CASAVA_Build 10 64517329 37D CACGTAGACC TTGCCTCCACCCCAGTTACCCTGCCTTGGGTCATATT/------------------------------------- ATTTCCTCCG 2901 het 2901 ref 31 28 8 5 TTGCCTCCACCCCAGTTACCCTGCCTTGGGTCATATT 1 0 135589 CASAVA_Build 10 64519192 1D AGGTACTCCA G/- GCTCTGAAGT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 G 2 1 135590 CASAVA_Build 10 64520348 1I ACAACACAAA -/T ATCAATAGCT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 0 1 135591 CASAVA_Build 10 64522007 1I CTCCTAGCAA -/T TTTTTTTTTT 2442 het 498 hom 28 3 11 14 T 16 17 135592 CASAVA_Build 10 64527695 1I TCTCAAACGC -/T TGGCCTCAAG 3070 het 2681 hom 27 7 11 9 T 1 2 135593 CASAVA_Build 10 64529920 1D AGAACACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 36 1 28 9 A 13 12 135594 CASAVA_Build 10 64535241 3I ACTTACTGTT ---/TTG TTTTTTGTTT 3070 hom 53 het 23 0 16 7 TTG 0 1 135595 CASAVA_Build 10 64538623 1I ATTTTCCACA -/C CCCTGTGATT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 C 3 4 135596 CASAVA_Build 10 64539860 1D CTTCATTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 15 7 A 12 11 135597 CASAVA_Build 10 64541866 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 9 8 135598 CASAVA_Build 10 64546927 1I ACAAAACAAA -/C AAAAAAAAGC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 0 1 135599 CASAVA_Build 10 64558273 1D GCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2402 het 383 hom 25 3 15 7 A 17 16 135600 CASAVA_Build 10 64568501 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 30 het 21 0 14 9 CT 2 1 135601 CASAVA_Build 10 64577588 8D GGAGTTATCT GCTGTAGG/-------- GCCAAGCATA 3070 het 3070 ref 23 12 11 1 GCTGTAGG 1 0 135602 CASAVA_Build 10 64579709 1D TCTCCACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 32 1 14 17 T 17 16 135603 CASAVA_Build 10 64584023 1I AGGAAATAAT -/A ACAGTAATCG 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 A 1 2 135604 CASAVA_Build 10 64584525 3D TGCACTACTC ATA/--- ATGATAACCT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 ATA 1 0 135605 CASAVA_Build 10 64586035 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 2841 het 1159 hom 18 8 8 3 T 1 0 135606 CASAVA_Build 10 64595337 3D AGTGAAACCC CAT/--- CATCTCTATG 3070 hom 54 het 21 0 16 5 CAT 2 1 135607 CASAVA_Build 10 64595706 5D GGGAAAGAAC TAAAG/----- TAAAGTATTC 3070 hom 50 het 33 1 30 2 TAAAG 2 1 135608 CASAVA_Build 10 64596722 4I TTCAGTTGAG ----/AAGA AAGAAAGGCT 3070 het 3070 ref 50 26 22 2 AAGA 1 2 135609 CASAVA_Build 10 64601054 1D CTGTGGAGGG A/- TGTACAGGAG 3070 hom 108 het 38 0 37 3 A 1 0 135610 CASAVA_Build 10 64603599 1I AGAAATTGGC -/A AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 46 13 24 9 A 6 7 135611 CASAVA_Build 10 64609550 1D TTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1398 hom 22 6 12 5 A 15 14 135612 CASAVA_Build 10 64612647 4D TTTTTTTTGA GATG/---- GAGTTTTGCT 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 GATG 1 0 135613 CASAVA_Build 10 64613821 1I AGCCTCCTGA -/G TAGCTGGGAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 0 1 135614 CASAVA_Build 10 64621676 1I GCTGGAACCT -/G GAAGTCAGAG 3070 hom 57 het 20 0 19 1 G 1 2 135615 CASAVA_Build 10 64625120 1I ACACCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2271 het 1139 hom 16 4 6 6 A 17 18 135616 CASAVA_Build 10 64641764 3D AGCCTTAAAT AAG/--- AAGAAGATCA 3070 het 3070 hom 39 14 19 9 AAG 3 2 135617 CASAVA_Build 10 64647522 3D CTTTACCATA AAC/--- AACTATAAAT 3070 het 3070 ref 30 18 11 2 AAC 2 1 135618 CASAVA_Build 10 64650874 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3027 het 346 hom 25 1 15 9 A 15 16 135619 CASAVA_Build 10 64655752 1D TTCTCCCCCA C/- CCCCCCCTTC 3070 hom 22 het 33 0 18 15 C 8 7 135620 CASAVA_Build 10 64667115 3I AACACTCACT ---/AAA AAAAATTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 5 8 135621 CASAVA_Build 10 64677606 10D TCAAATGCAT AAAACAAAAC/---------- AAAACAAAAC 3070 hom 71 het 32 0 23 12 AAAAC 5 3 135622 CASAVA_Build 10 64684473 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTGTTTT 2467 het 1701 hom 17 6 7 4 T 6 5 135623 CASAVA_Build 10 64687697 1I CCAGCTGGAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 A 7 8 135624 CASAVA_Build 10 64688593 1D CTTACAAGAC T/- TTTATCAACT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 T 4 3 135625 CASAVA_Build 10 64689179 1I AATTTAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 10 11 135626 CASAVA_Build 10 64692589 1D AGTTAGGGTA C/- CCCCCCCACT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 C 8 7 135627 CASAVA_Build 10 64697999 1D TTAGTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2918 het 188 hom 26 3 12 11 A 17 16 135628 CASAVA_Build 10 64707831 1I TTATTAGGTT -/A AATAAGATTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 2 3 135629 CASAVA_Build 10 64715801 1D AGATTTACTG A/- AATCAGAAAT 3070 hom 123 het 49 0 42 8 A 3 2 135630 CASAVA_Build 10 64719085 2D TAAGAGAAAC AT/-- AAACATTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AT 1 0 135631 CASAVA_Build 10 64723556 1I ATTTCTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 126 het 54 0 42 12 T 10 11 135632 CASAVA_Build 10 64724793 1I CATCAAATTT -/A AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 6 7 135633 CASAVA_Build 10 64735279 4D AGGTCTGACC CTCT/---- CTCTCTCTCT 2681 het 1661 hom 24 6 7 13 CT 9 7 135634 CASAVA_Build 10 64744315 2I CCTGTCACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 AC 6 7 135635 CASAVA_Build 10 64749128 1I TGTTTGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 10 11 135636 CASAVA_Build 10 64753206 1D GAATCACTTG A/- ACCCAGGAGG 3070 hom 91 het 32 0 30 2 A 2 1 135637 CASAVA_Build 10 64759245 1D CCATCAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 32 1 14 17 A 15 14 135638 CASAVA_Build 10 64769390 2I TCTCTAATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 11 13 135639 CASAVA_Build 10 64769826 4I ACTTCATTTC ----/AATA AATAAATAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AATA 3 4 135640 CASAVA_Build 10 64772617 1I AACTTTGTTT -/A AATGCACACC 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 2 3 135641 CASAVA_Build 10 64774501 1I GCATGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2727 het 2727 ref 27 16 7 4 A 10 11 135642 CASAVA_Build 10 64777972 2D ACTTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 33 0 19 15 A 17 15 135643 CASAVA_Build 10 64784441 4I TTCTACTGCT ----/TTTG TTTTTCTGTT 3070 hom 54 het 19 0 19 2 TTTG 0 1 135644 CASAVA_Build 10 64786771 1I GTATGCCTTC -/A AAAAATGAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 5 6 135645 CASAVA_Build 10 64792240 6D TATATTTATT TATATA/------ TATATTTATT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TA 5 2 135646 CASAVA_Build 10 64801447 3D TTCTTATAAC ATA/--- ATACTTTCCA 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 ATA 2 1 135647 CASAVA_Build 10 64817330 1D CAAATAGAAG A/- AAAAAATCTC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 7 6 135648 CASAVA_Build 10 64820340 3D CAAGAATGCT ACA/--- ACAACAACAA 3070 hom 57 het 28 0 19 11 ACA 6 5 135649 CASAVA_Build 10 64826020 1I TAAAGGGTAG -/T AAGAATGAGA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 0 1 135650 CASAVA_Build 10 64826819 2D TTCAGTAACA CT/-- CTATTTTGAC 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 CT 2 1 135651 CASAVA_Build 10 64828779 3D TGTTTCTAAA AAG/--- AAGAATAAAT 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 AAG 2 1 135652 CASAVA_Build 10 64836376 2I GGTAGGCTAG --/TA TATAACTAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TA 2 3 135653 CASAVA_Build 10 64842806 3D AGTATATCAA AAC/--- AATACCACAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 5 AAC 1 0 135654 CASAVA_Build 10 64845042 3I TCATTATTCA ---/TTT TTTAAAAGCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 3 6 135655 CASAVA_Build 10 64852724 1D TTACCAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 11 10 135656 CASAVA_Build 10 64853995 1D CATACCCAGC T/- TTTTTTTTTT 2286 het 336 hom 22 1 8 13 T 17 16 135657 CASAVA_Build 10 64854363 1I GCCTCGACCT -/C CCTGGGCTCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 2 3 135658 CASAVA_Build 10 64862207 2D ACCCACCCAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 138 het 57 0 43 15 TG 6 5 135659 CASAVA_Build 10 64880688 1D ACACACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 984 hom 34 3 20 11 A 15 14 135660 CASAVA_Build 10 64888485 5I ATAGCTTTTT -----/TTTTA TTTTATTTAT 3070 hom 33 het 22 0 12 10 TTTTA 1 2 135661 CASAVA_Build 10 64894207 1I ACACAAAGGG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 7 8 135662 CASAVA_Build 10 64896776 1D ACCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 A 11 10 135663 CASAVA_Build 10 64907164 2D AAAAAGATAG AT/-- ATACATAGAT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AT 2 1 135664 CASAVA_Build 10 64907320 1D TCCATATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 29 1 20 8 A 17 16 135665 CASAVA_Build 10 64909038 1D ATTTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2015 het 2015 ref 34 19 8 7 T 15 14 135666 CASAVA_Build 10 64910090 1D TATAGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 40 2 31 7 T 15 14 135667 CASAVA_Build 10 64910397 1D GTACTATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 32 5 14 13 A 16 15 135668 CASAVA_Build 10 64918308 1D AATGAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 888 hom 38 2 28 8 A 12 11 135669 CASAVA_Build 10 64920184 1D TATTTATTTA T/- TTTATTTTTT 612 het 612 ref 19 5 3 11 T 4 3 135670 CASAVA_Build 10 64930794 2D ATTCCCAATT CC/-- TATGGATGAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 2 0 135671 CASAVA_Build 10 64935712 1D TCCCCCTGCC A/- AAATTTAGTC 3070 het 3070 hom 49 20 24 6 A 4 3 135672 CASAVA_Build 10 64939774 1D ATTTTAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 24 0 17 7 T 13 12 135673 CASAVA_Build 10 64945768 28D AGAAAGGTCC TCCTGCTATCAAGAATATAATACCTTTA/---------------------------- TCTATTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 14 3 TCCTGCTATCAAGAATATAATACCTTTA 1 0 135674 CASAVA_Build 10 64945907 1D TCGTTTACTG A/- ATAATTCCAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 2 1 135675 CASAVA_Build 10 64950886 1D TCGCCGCGAG T/- GTGGGCGTCC 2231 hom 35 het 15 0 8 7 T 1 0 135676 CASAVA_Build 10 64954778 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 177 hom 30 2 22 7 A 14 13 135677 CASAVA_Build 10 64957720 2D CTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 345 hom 39 1 29 9 T 14 12 135678 CASAVA_Build 10 64959945 1I TAATGAAAAA -/C ATCCTCATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 0 1 135679 CASAVA_Build 10 64960261 1D TAAAAATATA T/- GTAGGAAATG 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 1 0 135680 CASAVA_Build 10 64976693 1I TCTTCGTGAC -/T TTTTTTTTTT 382 het 382 ref 25 11 3 11 T 13 14 135681 CASAVA_Build 10 64988509 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 8 9 135682 CASAVA_Build 10 64992471 4I TCTGCAGCAA ----/TCAG TCAATCAATT 3070 het 3070 ref 53 23 18 12 TCAG 0 1 135683 CASAVA_Build 10 64994389 1I CCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 11 12 135684 CASAVA_Build 10 64996998 3D ATAACATAAA ATT/--- ATCCATTTCA 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 ATT 1 0 135685 CASAVA_Build 10 64998589 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 18 0 15 3 T 11 10 135686 CASAVA_Build 10 64999245 1I CCAAATCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1203 hom 34 4 20 10 T 12 13 135687 CASAVA_Build 10 65002072 1I TTAAACCGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 T 11 12 135688 CASAVA_Build 10 65008813 1I TTTTTGGGGG -/A GGGGGAGATG 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 0 1 135689 CASAVA_Build 10 65019079 1D AGTGCTGGAA C/- CTTCTATTTT 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 C 2 1 135690 CASAVA_Build 10 65020286 1D ATCAAGGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 11 11 T 12 11 135691 CASAVA_Build 10 65021183 1D ACAAAAAAAA T/- CATAGGTTCA 3070 het 3070 hom 36 10 22 5 T 1 0 135692 CASAVA_Build 10 65035986 3I TTTATTGACT ---/AAG AAGACCGCTG 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 AAG 1 2 135693 CASAVA_Build 10 65065084 2I CTCACTCAGG --/TC TCTCTGCTCA 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 TC 2 3 135694 CASAVA_Build 10 65067037 1I AAGTTAGAAA -/C CTAGGAGTTG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 1 2 135695 CASAVA_Build 10 65068854 1D CTTAAGCATG A/- AAAAAGGTAT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 6 5 135696 CASAVA_Build 10 65069830 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACTTTTA 3070 hom 15 het 18 1 15 2 C 0 1 135697 CASAVA_Build 10 65070169 2I CAAATTGCAC --/AT AGTTATTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AT 0 1 135698 CASAVA_Build 10 65070278 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 24 10 11 4 A 1 0 135699 CASAVA_Build 10 65072110 1I GGGTTCAAGC -/A ATTCTCCTGC 1253 hom 7 het 4 0 3 1 A 1 2 135700 CASAVA_Build 10 65072173 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1059 het 772 hom 6 2 3 1 T 11 12 135701 CASAVA_Build 10 65080709 10D ATTTTTTTTA TTTTTTTTAT/---------- TTTTTTTATT 1193 het 1027 hom 10 4 5 4 TTTTTTTTAT 1 0 135702 CASAVA_Build 10 65081486 1D TTTTTGTATT C/- TTTAGTAGAG 2642 hom 15 het 6 0 6 0 C 1 0 135703 CASAVA_Build 10 65087245 1D ATAACTTTAC G/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 G 1 0 135704 CASAVA_Build 10 65087706 1D TTGGCCATGG C/- GCCACTGATA 3070 hom 98 het 40 0 32 8 C 1 0 135705 CASAVA_Build 10 65093689 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 15 14 135706 CASAVA_Build 10 65098290 1D CATTCTCCTG C/- CTCAGCCTCC 3070 het 2070 hom 19 5 12 2 C 2 1 135707 CASAVA_Build 10 65114419 4D TAAAATAAAT AAAG/---- AGGATTGGTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 7 AAAG 1 0 135708 CASAVA_Build 10 65115791 1I ATTAGCCATT -/C ATATGTCGTA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 C 0 1 135709 CASAVA_Build 10 65116702 1I AATAAGCTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 9 10 135710 CASAVA_Build 10 65139200 3D CCTGTCTCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 AAC 7 6 135711 CASAVA_Build 10 65155113 1D ACAATAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 12 11 135712 CASAVA_Build 10 65156010 1D AAAAATAAAG T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 T 7 6 135713 CASAVA_Build 10 65157594 1D CCTACCAGCC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 A 9 8 135714 CASAVA_Build 10 65163527 14D ATATATCTAT AGATCTATATCTAC/-------------- AGATCTATAG 2023 het 2023 ref 28 13 7 10 AGATCTATATCTAC 1 0 135715 CASAVA_Build 10 65164579 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 T 13 12 135716 CASAVA_Build 10 65168423 1D ACACCAGTGG C/- CCCCCAGAGT 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 C 6 5 135717 CASAVA_Build 10 65173181 1I TTTTAAATAC -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 135718 CASAVA_Build 10 65174819 12I TTGTTAACAT ------------/GGGCCATAATTG GGCCATACTA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 GGGCCATAATTG 0 1 135719 CASAVA_Build 10 65181430 2D ACTCCAACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 774 hom 19 7 9 3 A 18 16 135720 CASAVA_Build 10 65182479 1I CTGTTCTTTA -/G TTGCTTTGTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 0 1 135721 CASAVA_Build 10 65184803 1D CCCCCTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 46 0 43 3 A 11 10 135722 CASAVA_Build 10 65187368 4D AGCTCTTCAC CTTA/---- CTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 CTTA 1 0 135723 CASAVA_Build 10 65197164 1D CCCCAACCAA C/- CCCTTGTTGC 3070 hom 114 het 42 0 38 5 C 4 3 135724 CASAVA_Build 10 65207900 1D TGCATGTGCC A/- ATGTTGGTGT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 2 1 135725 CASAVA_Build 10 65209073 2I ACATTCAATC --/AT ATTTGAGACA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 AT 1 2 135726 CASAVA_Build 10 65215621 1D GGTTGTTCTC T/- TATTTCCCCC 1552 het 1552 ref 24 15 5 4 T 2 1 135727 CASAVA_Build 10 65217477 1D CTAAGATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2175 hom 26 5 14 7 T 11 10 135728 CASAVA_Build 10 65234037 4D AAACAAACAG ACAA/---- ACAAACAACA 3070 het 3070 hom 34 16 15 5 ACAA 3 2 135729 CASAVA_Build 10 65242373 3D TTAGCCTGGC TGT/--- TGTTGGTGTG 3070 hom 27 het 10 0 10 1 TGT 2 1 135730 CASAVA_Build 10 65242484 1I GACTATGGCA -/T TTTTTTGGTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 6 7 135731 CASAVA_Build 10 65243505 2D AATTTGTTTG AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 A 10 8 135732 CASAVA_Build 10 65244800 1D TGCTTCTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 64 het 29 0 22 8 A 10 9 135733 CASAVA_Build 10 65247063 1D TTTATATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 46 3 32 11 T 12 11 135734 CASAVA_Build 10 65248178 1I CTCTGATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1358 hom 31 3 20 8 T 10 11 135735 CASAVA_Build 10 65248256 1D ATTAAAACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 T 10 9 135736 CASAVA_Build 10 65248385 1I AATGTGCTCT -/C CCCAGCCTAG 3070 hom 123 het 43 0 42 1 C 3 4 135737 CASAVA_Build 10 65249110 2D GAAAGAGGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 33 7 12 14 T 13 11 135738 CASAVA_Build 10 65254727 4D TAATGAGATC CTTT/---- CTTACGAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 CTTT 1 0 135739 CASAVA_Build 10 65255776 1I CAAAGAACAA -/T AACAGGCTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 0 1 135740 CASAVA_Build 10 65256359 1D AATTAATTAA C/- TAGTAAATTA 3070 het 3070 hom 27 13 12 3 C 1 0 135741 CASAVA_Build 10 65259042 1D AATCTCACCT G/- CTGTGCTAAG 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 1 0 135742 CASAVA_Build 10 65272454 2D AGCAAGAGAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 70 het 39 0 24 15 TC 10 9 135743 CASAVA_Build 10 65275229 1D GTCTTGCTGG C/- CTAGCATAGT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 C 2 1 135744 CASAVA_Build 10 65305551 1I CCATTCTGTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 7 8 135745 CASAVA_Build 10 65308041 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 18 0 13 5 A 15 16 135746 CASAVA_Build 10 65322466 9I TACCTGGAAG ---------/ACACTCAGT ACCTCTGGTT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 ACACTCAGT 0 1 135747 CASAVA_Build 10 65327917 1D ATTTTACTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 9 8 135748 CASAVA_Build 10 65334027 5I GTCTGGAATT -----/AAAAG AAAGTAATCT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AAAAG 0 1 135749 CASAVA_Build 10 65341134 3I ACAATTATTC ---/TGT TGTTGTTTTT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 TGT 2 3 135750 CASAVA_Build 10 65341973 1D GAATCCAGTT G/- GGGATTTTAG 3070 hom 125 het 45 0 42 3 G 4 3 135751 CASAVA_Build 10 65344416 1I AATTAACATA -/T CCAAATTTCA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 T 0 1 135752 CASAVA_Build 10 65345007 1I TTTAAAAGGG -/A AAAAATATCC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 5 6 135753 CASAVA_Build 10 65347682 1D AGGGTAATGG A/- AAAATAAGAC 3070 hom 120 het 44 0 41 4 A 5 4 135754 CASAVA_Build 10 65349958 1I TTTCCCTTAA -/G GGATTTTCCA 3070 hom 138 het 56 0 47 9 G 2 3 135755 CASAVA_Build 10 65352254 3D AAGAGAGGAA GAG/--- GGAAAAGGAG 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 GAG 1 0 135756 CASAVA_Build 10 65369700 2D GGGACATGAC AG/-- AGAGTAACTG 3070 hom 138 het 53 0 47 8 AG 3 2 135757 CASAVA_Build 10 65373452 1D AAAAAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 51 1 44 6 A 12 11 135758 CASAVA_Build 10 65381042 4D AGTCACAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AAAG 3 2 135759 CASAVA_Build 10 65387197 1D ATTTCATTCG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 116 het 52 0 38 14 T 9 8 135760 CASAVA_Build 10 65395984 1I CAGTAAAAGG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 T 8 9 135761 CASAVA_Build 10 65410298 2D CTACAGTAGA CT/-- CTGCGCTAGG 3070 het 3070 ref 49 30 14 6 CT 2 1 135762 CASAVA_Build 10 65417067 4I CCCAGAAGAC ----/AAGG AACCCCAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AAGG 0 1 135763 CASAVA_Build 10 65417154 1I TATATTTGAA -/G GGGGGGGCCG 2446 het 2446 ref 21 10 9 2 G 7 8 135764 CASAVA_Build 10 65434087 1D TAGAATTTGT A/- AAAAATGTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 6 5 135765 CASAVA_Build 10 65434828 2I AGTGATAAAA --/CT CTGTGGAACA 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 CT 1 2 135766 CASAVA_Build 10 65441602 1D GCATTCTTTC A/- TCAATTGACA 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 A 1 0 135767 CASAVA_Build 10 65451141 4D CCCTGCTTCG GCTC/---- ACGCCCGGTG 3070 het 2933 hom 23 8 12 4 GCTC 1 0 135768 CASAVA_Build 10 65461797 1D AGGAAGAGGA G/- GGGCACGAAC 3070 hom 87 het 32 0 28 4 G 4 3 135769 CASAVA_Build 10 65482568 4I CAAGAGTGAC ----/ATTT ATTTACTCCA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 ATTT 1 2 135770 CASAVA_Build 10 65484763 2D CACTCCCCCA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 48 het 25 0 16 9 C 11 9 135771 CASAVA_Build 10 65498685 1D TTGCTCTTAA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 117 het 43 0 38 5 T 9 8 135772 CASAVA_Build 10 65500443 1D GACTCAGGGC T/- TTTGCATGCT 3070 hom 135 het 50 0 45 7 T 4 3 135773 CASAVA_Build 10 65518892 11I TTCATTCAGT -----------/AAACTTGTTTG AAACTCTTAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAACTTGTTTG 0 1 135774 CASAVA_Build 10 65520958 3D CTCTCTCTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 643 hom 32 2 25 6 CTC 1 0 135775 CASAVA_Build 10 65523332 1D CTTTAAGTTA G/- GGGCTTCTAT 3070 hom 138 het 49 0 47 3 G 4 3 135776 CASAVA_Build 10 65532272 1I CTGCTAGTCA -/T AAACCTCATA 3070 hom 125 het 53 0 41 12 T 0 1 135777 CASAVA_Build 10 65562370 4I AAAATTATCA ----/GAAG GAAGCAATTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 GAAG 1 2 135778 CASAVA_Build 10 65564196 1I ATTCAATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 36 2 24 10 A 14 15 135779 CASAVA_Build 10 65573867 1I TGAATAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 29 0 21 8 T 10 11 135780 CASAVA_Build 10 65587886 2I GAAAAACACC --/CT GTTTGAAGCA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CT 0 1 135781 CASAVA_Build 10 65611963 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1105 hom 28 3 20 5 A 11 12 135782 CASAVA_Build 10 65627422 1I TGACCTAAGA -/G GCAGCAGTTG 3070 hom 138 het 51 0 45 6 G 1 2 135783 CASAVA_Build 10 65630356 6D AGACACTGTT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 17 14 8 AC 12 9 135784 CASAVA_Build 10 65638639 4D CAGAATCTTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 40 14 13 13 AAAC 6 5 135785 CASAVA_Build 10 65642770 1I TACTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 892 hom 38 3 32 3 A 0 1 135786 CASAVA_Build 10 65648900 19I AACTCCCAAG -------------------/CTCTTTATAAAAACATGTT CGATTGGACA 3070 hom 87 het 27 0 29 2 CTCTTTATAAAAACATGTT 0 1 135787 CASAVA_Build 10 65652255 2I AATTTCCTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 28 3 T 10 12 135788 CASAVA_Build 10 65653504 1D AATTGGTTCA C/- CCCCACCTGC 3070 hom 65 het 26 0 20 7 C 5 4 135789 CASAVA_Build 10 65700892 6I AAGAAATATA ------/TTTTAC TTTTATGCTA 3070 hom 125 het 43 0 42 1 TTTTAC 0 1 135790 CASAVA_Build 10 65705052 1I TACAGAAAGT -/A AAAAAATAAT 3070 hom 83 het 33 0 28 5 A 6 7 135791 CASAVA_Build 10 65712325 1D CAGACTTTTG A/- AAAAATTTCT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 6 5 135792 CASAVA_Build 10 65734743 1D AGATTTTTAT A/- CCATAATTCC 3070 hom 129 het 46 0 43 4 A 1 0 135793 CASAVA_Build 10 65758037 1D AGCTAAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3012 hom 43 14 17 12 A 17 16 135794 CASAVA_Build 10 65819353 1I AATACAAATT -/A AAACCACAAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 3 4 135795 CASAVA_Build 10 65877563 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1294 het 1294 ref 24 10 5 9 A 19 18 135796 CASAVA_Build 10 65886461 2I13M1I GCTATATAGG --TCTTATCTTCAGG-/TCTCTAATCTTCAGGA CAGAGTTCAT 1471 hom 7 het 6 0 3 3 N/A 0 0 135797 CASAVA_Build 10 65891766 1I ATTTCTTATT -/A AAAACTTGGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 4 5 135798 CASAVA_Build 10 65900001 1D AAATACAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 9 8 135799 CASAVA_Build 10 65948724 1D CATTTTCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 10 9 135800 CASAVA_Build 10 65953857 4D TACATGTGGT AATA/---- AATGTGAAGA 3070 het 3070 hom 52 21 27 5 AATA 1 0 135801 CASAVA_Build 10 65982765 1D GTGGGGGAAA C/- CTTCGCTTGT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 C 2 1 135802 CASAVA_Build 10 65990904 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2950 hom 46 12 18 16 T 15 14 135803 CASAVA_Build 10 65991722 6D GAAGTGTCTG TTCATA/------ TCCTTTGCCC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TTCATA 1 0 135804 CASAVA_Build 10 65993068 1D GTTCTTGTTA T/- TTTGAGATAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 4 3 135805 CASAVA_Build 10 65997297 3D ACAACAACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 125 het 50 0 40 11 AAC 5 4 135806 CASAVA_Build 10 66001839 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2804 het 235 hom 19 1 9 9 T 14 15 135807 CASAVA_Build 10 66007198 3D TGCAGGTGAA GAG/--- GAGAGAAGAG 3070 het 3070 hom 32 14 10 8 GAG 2 1 135808 CASAVA_Build 10 66020247 10I ATGTAATAAT ----------/ATGTAAAATA ATGTTTCTGC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 ATGTAAAATA 0 1 135809 CASAVA_Build 10 66038983 3D ATATTAAAAC AGG/--- AGTTGTCTGC 3070 het 3070 hom 45 20 20 6 AGG 1 0 135810 CASAVA_Build 10 66039496 4D ATAAGAATTT TCCC/---- TCCCTCCCTC 1067 het 267 hom 12 1 6 5 TCCC 5 4 135811 CASAVA_Build 10 66042182 2D ATACATACAC AT/-- GTCTGTACAT 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 AT 1 0 135812 CASAVA_Build 10 66059318 1I GTACAGTACA -/C AATACTTGAC 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 C 0 1 135813 CASAVA_Build 10 66062524 3I TGAATATAAA ---/GAG GAGTTATGAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 GAG 1 2 135814 CASAVA_Build 10 66071260 1I ATATTAAGGG -/T TTTTTTTTTT 1076 het 1004 hom 22 5 5 12 T 17 18 135815 CASAVA_Build 10 66075544 4D TAGTGAAAAC AAAT/---- AAATAATTGC 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 AAAT 2 1 135816 CASAVA_Build 10 66093873 1I TTTTGCAAGG -/A ATTGCATTGA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 1 2 135817 CASAVA_Build 10 66101999 1D GGTTGAAGTG A/- AGTGGCGAGA 3070 hom 84 het 34 0 25 9 A 2 1 135818 CASAVA_Build 10 66107857 1D CCCTTCTTAT G/- ATCTTTTGGA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 G 1 0 135819 CASAVA_Build 10 66110600 1D GATGCTTTTG C/- CCTCACATAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 3 2 135820 CASAVA_Build 10 66114671 4I GCATTTGGAA ----/TCTT TCTTGGGTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TCTT 1 2 135821 CASAVA_Build 10 66119882 2D GTGATTTAAA AC/-- ACATGGATGT 3070 hom 126 het 46 0 43 4 AC 2 1 135822 CASAVA_Build 10 66125228 22D ATGTTAAGGT AGTATTGAATTACTATTAAAGC/---------------------- AGTATTGAAT 3070 hom 63 het 34 0 22 12 AGTATTGAATTACTATTAAAGC 2 1 135823 CASAVA_Build 10 66130753 5D17M1I TGTTTTTTCT TTTAATTTAGAAAGCATTTCAA-/-----TTTAGAAAGCATTTCAAT TTTTTTTTGT 3070 hom 54 het 19 0 19 6 N/A 0 0 135824 CASAVA_Build 10 66130888 1I ATTTTGACAT -/A AAAAATTAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 8 A 5 6 135825 CASAVA_Build 10 66132507 1I ATAGTTACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 408 hom 40 1 32 7 T 9 10 135826 CASAVA_Build 10 66140872 1D AATTTTATTT G/- TACAGAATCT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 G 1 0 135827 CASAVA_Build 10 66144966 2I TGGTTTTTTT --/TG TTGTTGTTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 0 1 135828 CASAVA_Build 10 66148447 4I AGTACTTCTG ----/AAAA AAAAAACTCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 6 10 135829 CASAVA_Build 10 66149946 1I TCTTTATAAC -/T TTTTTGGGGG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 5 6 135830 CASAVA_Build 10 66156130 1D CTGTCACCCA G/- GGCTGTAGTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 3 2 135831 CASAVA_Build 10 66160119 1D CAGAAAAATC T/- TTCTTTCTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 3 2 135832 CASAVA_Build 10 66161093 1I CTAGAAGAGC -/A ATCATAACTG 3070 hom 97 het 37 0 32 5 A 1 2 135833 CASAVA_Build 10 66161520 1D TCTCCGACTC A/- AAAAAAAAAA 2486 het 1539 hom 19 4 7 9 A 13 12 135834 CASAVA_Build 10 66169446 1I TTAGCTACTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 21 18 16 A 0 1 135835 CASAVA_Build 10 66169846 1I AAGACATAGT -/A AGATTTGAGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 2 135836 CASAVA_Build 10 66174693 2D TCAGCTGCAT TA/-- TGTTAATTTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 5 TA 1 0 135837 CASAVA_Build 10 66176466 3I GCTCACTGCA ---/ACC ACCTCTTCCT 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 ACC 1 2 135838 CASAVA_Build 10 66176807 1I CCAGGAATGA -/C CCAAGGAGAG 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 C 2 3 135839 CASAVA_Build 10 66187323 1I AAGAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2275 hom 26 6 17 3 A 12 13 135840 CASAVA_Build 10 66196393 1D AACAAGATTG T/- TTTTTACTGT 3070 het 3070 ref 43 29 12 2 T 6 5 135841 CASAVA_Build 10 66231097 2I ACATCCTCAC --/AG ACACACCCTG 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 AG 0 1 135842 CASAVA_Build 10 66241927 2D CCCCACTGCA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 53 14 26 13 AT 7 6 135843 CASAVA_Build 10 66244943 1I CAATGTCTTT -/G TTTTCATCAT 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 G 0 1 135844 CASAVA_Build 10 66246529 1I CTTATAATTC -/T TCTTTTTGTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 135845 CASAVA_Build 10 66249346 1I TCATTGACCT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 7 8 135846 CASAVA_Build 10 66251144 7D ACAAAATACT GTATGTA/------- GTATGTAGAA 3070 het 3070 ref 37 19 17 4 GTATGTA 2 1 135847 CASAVA_Build 10 66256169 1I ATGAAGGGCC -/A GGGGGCTCGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 0 1 135848 CASAVA_Build 10 66257240 4D AATATATGTC TGTT/---- TGTTTACTCT 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 TGTT 2 1 135849 CASAVA_Build 10 66258816 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 39 1 33 5 T 10 11 135850 CASAVA_Build 10 66260823 1I AGCTGATTTG -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 A 7 8 135851 CASAVA_Build 10 66261281 5D TAAATGATAA ATCCC/----- TTTGTTTTAA 3070 het 3070 hom 23 9 11 5 ATCCC 1 0 135852 CASAVA_Build 10 66270660 1D ACTGCAAGGG T/- GTTTTGAGAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 1 0 135853 CASAVA_Build 10 66271578 1D CTCTGCTCAC A/- AAAAAAAAAA 2844 het 2844 ref 27 7 10 10 A 12 11 135854 CASAVA_Build 10 66274472 1D CAATAAAGCT G/- GGAAACAATT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 G 3 2 135855 CASAVA_Build 10 66276233 1I ACTTCTCCAC -/T TTTAGAAACA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 3 4 135856 CASAVA_Build 10 66279837 11D ATAGGAAATC TATCAAATCTA/----------- TCAAAATCTC 3070 het 3070 hom 35 10 21 5 TATCAAATCTA 1 0 135857 CASAVA_Build 10 66280524 1D TTTTCTTATA T/- TTTTACCTGA 3003 het 3003 ref 32 19 9 4 T 5 4 135858 CASAVA_Build 10 66284654 1I TGATTCATTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 8 9 135859 CASAVA_Build 10 66287164 4I ATATTTACTC ----/ACTT ACATGTGAAC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 ACTT 0 1 135860 CASAVA_Build 10 66292050 1D TTAAATATAA T/- TTTACGGTAA 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 T 4 3 135861 CASAVA_Build 10 66296702 1I CCCTACTTCA -/T TTTAGTGAGT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 3 4 135862 CASAVA_Build 10 66306238 2D ATGTGTTCTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 396 hom 33 3 12 18 GT 9 8 135863 CASAVA_Build 10 66329138 4D CACAAAGACT ATTA/---- ATTACTGACA 3070 het 3070 ref 32 14 16 3 ATTA 2 1 135864 CASAVA_Build 10 66330762 1D TAGATATTCA G/- GAATCTAAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 3 G 2 1 135865 CASAVA_Build 10 66332614 2I TCTTTACATT --/GA GTCTTAGTTT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 GA 0 1 135866 CASAVA_Build 10 66343750 3D TATACAATAC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 ATT 4 3 135867 CASAVA_Build 10 66346844 1I GTTAGAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 17 22 11 A 13 14 135868 CASAVA_Build 10 66349742 1D AGAGAGCCAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 9 8 135869 CASAVA_Build 10 66351906 5D TTAATTGTAA TAAAG/----- TAATTTTATA 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 TAAAG 1 0 135870 CASAVA_Build 10 66361688 1D ATCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 185 hom 16 2 8 6 T 8 7 135871 CASAVA_Build 10 66361741 1D TCAGGCTGGT G/- CTCGACCTCC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 1 0 135872 CASAVA_Build 10 66364508 2D AAACAATCTC TT/-- TTCAATATGA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 T 4 2 135873 CASAVA_Build 10 66370054 2I GTTCATGTAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 AT 6 7 135874 CASAVA_Build 10 66376178 1I ACTTTATCAA -/T TTAAATAACA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 3 135875 CASAVA_Build 10 66376738 1D TTAAAAAAAA G/- CAGTGCTATT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 G 1 0 135876 CASAVA_Build 10 66380063 1D CATAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 30 1 28 1 T 11 10 135877 CASAVA_Build 10 66387386 1I ATAAAATAGG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 9 135878 CASAVA_Build 10 66392202 1D TTGAAAAAAA T/- ATCTGAAAAA 1993 het 1993 ref 15 9 5 1 T 1 0 135879 CASAVA_Build 10 66396495 2I CCATCAAAAG --/AA AAAACTCAAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 4 6 135880 CASAVA_Build 10 66399995 1I GGAAGTGTTA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 6 7 135881 CASAVA_Build 10 66400437 2D TTTTATAAAC AT/-- ATAATATTTC 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 AT 2 1 135882 CASAVA_Build 10 66412146 1D AAATGAGTAT A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 A 7 6 135883 CASAVA_Build 10 66413309 1I TTTGATTTTT -/G TTTTGGATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 135884 CASAVA_Build 10 66415496 4I GATGACAAAA ----/ATAT ATATATTTAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AT 3 5 135885 CASAVA_Build 10 66417387 1I ATTATTTGTT -/A AAAGTTTCTA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 3 4 135886 CASAVA_Build 10 66420080 1D TTCAAAATAT G/- ACATATTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 1 0 135887 CASAVA_Build 10 66438816 1D TTAAAAGAAG C/- CCCAGATAGT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 4 3 135888 CASAVA_Build 10 66439141 2D TGCAGGTGAC AT/-- ATTGTTGAAC 3070 het 3070 hom 45 18 24 5 AT 2 1 135889 CASAVA_Build 10 66443720 1D TACATTTTTT G/- TTTGTTTGTA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 G 1 0 135890 CASAVA_Build 10 66443901 1I CCCCTACTCC -/T GCTATATTTT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 T 0 1 135891 CASAVA_Build 10 66446786 1I TTTAGGCTTT -/A AAAAAACTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 6 7 135892 CASAVA_Build 10 66447825 5I CTGAAGAAAA -----/TATTT TATTAGTGCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TATTT 0 1 135893 CASAVA_Build 10 66454168 1D GTAGCTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 39 6 18 15 T 15 14 135894 CASAVA_Build 10 66471498 1I TAATTTTAAA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 6 7 135895 CASAVA_Build 10 66473924 2D TCTGGATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 T 13 11 135896 CASAVA_Build 10 66475072 1I GAGATAAGAA -/T GCAATACATT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 0 1 135897 CASAVA_Build 10 66475408 3D GTATATAAAA TGT/--- TGATTTTATT 3070 het 3070 ref 23 10 7 7 TGT 1 0 135898 CASAVA_Build 10 66483071 1D AAGTCAGCGT A/- AAAATGATAC 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 5 4 135899 CASAVA_Build 10 66485010 1I GTCTTGTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1273 hom 41 4 23 14 A 12 13 135900 CASAVA_Build 10 66486017 2D AAGAAGAAAC TG/-- GTCAAAGAAT 3070 het 3070 ref 47 26 20 3 TG 1 0 135901 CASAVA_Build 10 66486225 1D AATAAAGAGG T/- CAGAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 T 1 0 135902 CASAVA_Build 10 66495693 1D TTCTCCTTAA T/- TTTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 7 6 135903 CASAVA_Build 10 66495780 1D TGATCCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 32 1 21 10 T 13 12 135904 CASAVA_Build 10 66499007 1I CTTTTGTGTG -/T TTTTTTATGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 6 7 135905 CASAVA_Build 10 66499688 1D GTACTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2820 hom 25 8 12 5 T 11 10 135906 CASAVA_Build 10 66499779 8I GTCTTAATTT --------/TGGTAGAC ATTTCGTTAA 3070 hom 84 het 29 0 28 1 TGGTAGAC 0 1 135907 CASAVA_Build 10 66504042 1I ATCTAACGCA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 7 8 135908 CASAVA_Build 10 66504246 2D CTCCCTTCTC TT/-- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 26 11 10 6 T 9 7 135909 CASAVA_Build 10 66518174 1D TCATCAAGAC A/- TAAGCAAAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 1 0 135910 CASAVA_Build 10 66518368 1I TCAATATGAA -/T TAGAAATAAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 T 1 2 135911 CASAVA_Build 10 66521198 1I TAATATGTAC -/A AAAAAAAAAA 1921 het 1921 ref 28 18 5 6 A 11 12 135912 CASAVA_Build 10 66523672 1D AAAAAGCATC A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 117 het 41 0 40 2 A 8 7 135913 CASAVA_Build 10 66527329 1D CTTCTGTCAG C/- TGCTCAGAAA 3070 het 3070 ref 51 24 21 7 C 1 0 135914 CASAVA_Build 10 66528218 1I TATATGTCCA -/C CAAAAAGCAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 2 135915 CASAVA_Build 10 66550261 1I AGTGAGAGGT -/A GGGGTACAGT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 0 1 135916 CASAVA_Build 10 66553850 1D TCCGTTTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 10 9 135917 CASAVA_Build 10 66558831 1I AGAACTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 34 1 23 10 T 11 12 135918 CASAVA_Build 10 66559071 1I ATCTTTGTCA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 73 het 30 0 25 5 T 7 8 135919 CASAVA_Build 10 66564126 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 T 9 10 135920 CASAVA_Build 10 66565482 1I TTGGACCATT -/C ATAAATGCTG 3070 hom 120 het 49 0 41 8 C 0 1 135921 CASAVA_Build 10 66568616 3D CCAGTTCTTT ATA/--- ATATTAAGGA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 ATA 2 1 135922 CASAVA_Build 10 66568711 1D AAGATCATGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 8 135923 CASAVA_Build 10 66569287 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 24 het 12 0 9 6 T 7 6 135924 CASAVA_Build 10 66569757 2D25M1D CTGTTTGCTT TGTGTTTCATTTGCTCTTTTCTTTCTAT/--TGTTTCATTTGCTCTTTTCTTTCTA- TTTTTTGTAG 3070 het 1485 hom 24 5 10 19 N/A 0 0 135925 CASAVA_Build 10 66575477 1I GTTACACAGA -/C CCCCTTTAAT 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 C 4 5 135926 CASAVA_Build 10 66578584 1D GGGTAGAACT A/- AAAAGCCCAT 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 A 5 4 135927 CASAVA_Build 10 66584852 1D CAAAATATAT A/- GTAGAAACAT 3070 het 1787 hom 19 5 13 1 A 1 0 135928 CASAVA_Build 10 66595252 4D TAAAAGAAAA AATC/---- AAAGAAAACC 3070 het 3070 ref 27 16 10 3 AATC 1 0 135929 CASAVA_Build 10 66601788 2I TTATATATAC --/AT ATATATATGT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 AT 4 5 135930 CASAVA_Build 10 66614312 1D TCGATCCCTA C/- CTCCCATTCC 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 C 2 1 135931 CASAVA_Build 10 66614663 1D AAACAAAAGG T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 7 6 135932 CASAVA_Build 10 66615640 1I TGTTTATTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 9 10 135933 CASAVA_Build 10 66622796 1I ATTATTAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 9 10 135934 CASAVA_Build 10 66626877 2D CTGAAAAGTT TC/-- TCTCTCTCAC 3070 het 3070 ref 38 21 14 5 TC 5 4 135935 CASAVA_Build 10 66633552 4D GAGTATGTAC ATAT/---- ATATATATAT 1445 het 986 hom 9 2 6 2 AT 9 7 135936 CASAVA_Build 10 66657252 1I TGGGAAGCCT -/G GCTTAAAATC 3070 het 3070 hom 43 11 27 5 G 1 2 135937 CASAVA_Build 10 66663387 1I ATTTTTTTTT -/G TGTGTTATCA 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 G 0 1 135938 CASAVA_Build 10 66668096 1D ATATTTTTTT C/- ATCCTGATTT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 C 1 0 135939 CASAVA_Build 10 66673406 1D AAGCAGCCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 31 hom 31 1 28 3 T 10 9 135940 CASAVA_Build 10 66677405 1I CTTGAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 45 2 39 4 T 11 12 135941 CASAVA_Build 10 66686407 1I AGAATGACTA -/C CAAGCACTGA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 1 2 135942 CASAVA_Build 10 66690799 1D TTGCATAATG A/- AAAAAATACA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 7 6 135943 CASAVA_Build 10 66695592 14I ATGGAACAAC --------------/ACGGATTGATCCTA ACTGTATTTT 3070 het 3070 ref 52 24 21 8 ACGGATTGATCCTA 0 1 135944 CASAVA_Build 10 66695802 4I TGATACAAGA ----/CTTT ATATATTATC 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 CTTT 0 1 135945 CASAVA_Build 10 66696867 1D GATGCACTAA T/- ATTTAGCAAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 1 0 135946 CASAVA_Build 10 66697109 1D CAGTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 12 11 135947 CASAVA_Build 10 66697493 1I ATTTAAAATA -/T TTTTTAAATC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 5 6 135948 CASAVA_Build 10 66697994 1D AATTAAATGA T/- TATTTTCTCC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 2 1 135949 CASAVA_Build 10 66709796 1D GGGAAGGGCA G/- GGGCAGAATA 3070 het 3070 ref 50 23 17 10 G 4 3 135950 CASAVA_Build 10 66717418 1I CATCATCATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 9 10 135951 CASAVA_Build 10 66718136 4D34M2D AGATGATCTT AGACAGTAGTAATTTTCTAATTGGATATGAATTTTATATC/----AGTAGTAATTTTCTAATTGGATATGAATTTTATA-- TCGTGGAGTG 3070 het 3070 ref 35 20 20 5 N/A 0 0 135952 CASAVA_Build 10 66731298 2D18M2D TGTGTGTGTG TATATATATATATATACACCCA/--TATATATATATATACACC-- CACACACACA 3070 het 127 hom 24 2 13 14 N/A 0 0 135953 CASAVA_Build 10 66732639 3D CTGTCTTCAC AAA/--- AAAAAAAAAA 2944 het 1104 hom 26 8 9 9 A 19 16 135954 CASAVA_Build 10 66752223 2D AAATTAAAAC TT/-- ATTTTCAGTA 3070 het 3070 ref 46 24 18 6 T 2 0 135955 CASAVA_Build 10 66758374 4I TTTTATGTGC ----/CATA CATACTTTCT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 CATA 1 2 135956 CASAVA_Build 10 66758542 1I AAAAAGAAAA -/G CTTTGTAGAG 674 het 674 ref 33 16 6 11 G 0 1 135957 CASAVA_Build 10 66763683 1D TTTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1365 het 1365 ref 39 33 3 3 T 12 11 135958 CASAVA_Build 10 66769056 5D CTAAATCTTC TAATA/----- TAATTAATTT 2851 het 2851 ref 26 16 9 3 TAATA 1 0 135959 CASAVA_Build 10 66778967 1D CAAATAAATG T/- TTTTTTTTTC 2191 het 2191 ref 31 15 6 11 T 10 9 135960 CASAVA_Build 10 66779532 4D ATCATATATA TATG/---- TATATGTATA 84 het 84 ref 27 17 2 9 TATG 1 0 135961 CASAVA_Build 10 66782887 1I GACCAGGACC -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 107 het 40 0 35 5 T 7 8 135962 CASAVA_Build 10 66783073 1D CGAGTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 16 15 135963 CASAVA_Build 10 66790259 1D AATTTTACAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 9 8 135964 CASAVA_Build 10 66798473 1D AAAAGTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 10 9 135965 CASAVA_Build 10 66801767 1D TATGATTCGG A/- AGCTGTTCAT 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 A 2 1 135966 CASAVA_Build 10 66805244 1I AAAATGTAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 9 10 135967 CASAVA_Build 10 66805424 1D GCCTAAGAGG T/- TTTCCTGTGT 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 T 4 3 135968 CASAVA_Build 10 66812997 18D GGGAAAACAT TATATATATATATATATA/------------------ TATATATATA 3070 het 1177 hom 29 4 19 8 TA 15 6 135969 CASAVA_Build 10 66814589 2D TCTCATTTTG CT/-- CTCTCTCTCT 1697 het 903 hom 9 2 6 1 CT 7 6 135970 CASAVA_Build 10 66815145 1D TGGGTCAAAT G/- GTATTTCTAG 2189 hom 12 het 5 0 5 0 G 2 1 135971 CASAVA_Build 10 66817371 2D TTGTATGAGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 AT 7 6 135972 CASAVA_Build 10 66818167 4D CACAATTAAA TAAC/---- TGATTATTGG 3070 het 3070 hom 30 13 16 2 TAAC 1 0 135973 CASAVA_Build 10 66818747 1D TTTTAAAAAA C/- AACAGTCTTT 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 C 1 0 135974 CASAVA_Build 10 66819261 1D ACTACACAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 116 het 43 0 37 6 A 9 8 135975 CASAVA_Build 10 66823220 1D CCAGGATCTC T/- TTTTATAAGG 3070 hom 111 het 40 0 36 4 T 5 4 135976 CASAVA_Build 10 66823733 12D ATGAAGAAAA TAAGTCTGTGGG/------------ TAAGTTTAAA 3070 hom 96 het 34 0 32 3 TAAGTCTGTGGG 1 0 135977 CASAVA_Build 10 66825280 3I CTATCTTTTA ---/AAT AATATTCTAT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 AAT 1 2 135978 CASAVA_Build 10 66826635 3D AAATATTCTA CCT/--- CATTAATACA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 CCT 1 0 135979 CASAVA_Build 10 66830328 9D CACAATGAAA AACCCTGAT/--------- AACGTTTAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 6 AACCCTGAT 1 0 135980 CASAVA_Build 10 66830753 1D GTATTTACTG A/- AAAAAAATAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 7 135981 CASAVA_Build 10 66830978 9D TTTGTGACCA TTTATTCAT/--------- TTTATTCATT 3070 hom 72 het 26 0 25 8 TTTATTCAT 2 1 135982 CASAVA_Build 10 66832780 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2166 hom 15 het 12 0 6 6 A 11 12 135983 CASAVA_Build 10 66832944 17I CACTTAAATA -----------------/GCCACATACAGAGATAT GCACACAAAT 3070 hom 72 het 25 0 25 3 GCCACATACAGAGATAT 0 1 135984 CASAVA_Build 10 66833997 1I TTTCCAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 9 10 135985 CASAVA_Build 10 66837316 1D TGTCCGACAC T/- GCAGATTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 1 0 135986 CASAVA_Build 10 66841766 1I ACCAGCACAG -/T TCAAACTCAT 3070 hom 150 het 55 0 49 6 T 1 2 135987 CASAVA_Build 10 66847080 1D AAGCTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1256 hom 23 6 12 5 A 15 14 135988 CASAVA_Build 10 66851440 7D TGAGGGGTAG AAGAAGA/------- AAGTGACTAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 AAGAAGA 1 0 135989 CASAVA_Build 10 66855816 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2392 hom 24 7 12 5 A 13 12 135990 CASAVA_Build 10 66863505 4I TTAATGGAAA ----/TTAT TAATTTATGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTAT 0 1 135991 CASAVA_Build 10 66865830 1D AACTCTGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 31 1 27 4 A 12 11 135992 CASAVA_Build 10 66870253 1I GTCTATTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 44 1 38 5 A 10 11 135993 CASAVA_Build 10 66874748 4I AGCGTGGTCT ----/TGGA TGGACTCTCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TGGA 1 2 135994 CASAVA_Build 10 66882825 1D AGTCTATTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 T 10 9 135995 CASAVA_Build 10 66888083 1D TTTTTTTTTT A/- AATTATACTT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 A 3 2 135996 CASAVA_Build 10 66898756 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 12 11 135997 CASAVA_Build 10 66926394 4D GCCAGAATAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 17 8 T 18 14 135998 CASAVA_Build 10 66928735 3I TGCAAAAAAA ---/AAC AAACAGAAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAC 0 1 135999 CASAVA_Build 10 66932328 1I TGCAGCAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 10 136000 CASAVA_Build 10 66933131 1D ACGTATATGC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 120 het 47 0 41 7 A 9 8 136001 CASAVA_Build 10 66938746 1D GGCAAAAAAA G/- GTTCATCAGA 3070 hom 85 het 34 0 29 5 G 2 1 136002 CASAVA_Build 10 66942095 1I GACAATTATC -/T AGGCTCTGCT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 0 1 136003 CASAVA_Build 10 66944375 1I TCTATTTCTG -/T GAAGAATATC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 0 1 136004 CASAVA_Build 10 66945780 5I TTTAAAAAAA -----/AAAAG AAACCAACTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAAAG 0 1 136005 CASAVA_Build 10 66949420 21D CAGCTCTGAG TCTCATTCAATGCCCACGGCA/--------------------- AGTACTGCCT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TCTCATTCAATGCCCACGGCA 1 0 136006 CASAVA_Build 10 66949673 5I AAGTCCTCTT -----/TTCTC TTCCCTCTCC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TTCTC 0 1 136007 CASAVA_Build 10 66950980 1I CCAGAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 30 1 25 4 A 10 11 136008 CASAVA_Build 10 66951985 1I TGTCATGTGG -/A ATATCATGCC 3070 hom 160 het 59 0 54 5 A 1 2 136009 CASAVA_Build 10 66952219 1D CATGCTTACT A/- AATGCAATGT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 A 3 2 136010 CASAVA_Build 10 66963341 4D ATACTCATTC CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 79 het 32 0 27 5 CT 7 5 136011 CASAVA_Build 10 66963633 1D GTTAGTGAGA T/- TTTTTAGTTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 6 5 136012 CASAVA_Build 10 66963901 1I TAAAAAGAAG -/A AAAATTCTAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 4 5 136013 CASAVA_Build 10 66965641 1I AATTATTATG -/C AAAAATCAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 0 1 136014 CASAVA_Build 10 66966574 2I GACGCATATC --/AA AACAATTTCC 3070 hom 123 het 51 0 42 9 A 2 4 136015 CASAVA_Build 10 66972083 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 762 hom 27 5 11 11 A 16 17 136016 CASAVA_Build 10 66996528 4I CTATATTCTT ----/AAAA AACGTACGTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 2 6 136017 CASAVA_Build 10 67000973 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 9 8 136018 CASAVA_Build 10 67002929 3I TTATTATAGC ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 AAT 5 6 136019 CASAVA_Build 10 67007200 2D TCTGAATACT AA/-- GTTCTTCATT 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 A 2 0 136020 CASAVA_Build 10 67007654 6D TATATATATT ATTATC/------ AGTTATTCTG 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 ATTATC 1 0 136021 CASAVA_Build 10 67009115 2D TATATGTCAC AT/-- ATACTGAAGG 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 AT 2 1 136022 CASAVA_Build 10 67014402 2D CAAAAATAAA AC/-- AAATTTATTG 3070 het 2213 hom 28 6 19 4 AC 1 0 136023 CASAVA_Build 10 67014934 1I AGTAAGACAC -/T TAAGGGGCAA 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 T 1 2 136024 CASAVA_Build 10 67019330 1I TCTAAAATTC -/T CCTTTTTTGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 0 1 136025 CASAVA_Build 10 67032840 1I ATTCTACATA -/T TTGGAAGAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 2 3 136026 CASAVA_Build 10 67033608 1I TAAATTTTGA -/T TTTTTAAAGC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 5 6 136027 CASAVA_Build 10 67034593 1D TTTCCAGGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 10 9 136028 CASAVA_Build 10 67042015 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 23 1 10 12 A 15 14 136029 CASAVA_Build 10 67050068 1D AATACCTGCA T/- TAGTTAAAGT 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 T 2 1 136030 CASAVA_Build 10 67053727 2D TCTCTCACCA CT/-- CTAGCTAATA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 CT 2 1 136031 CASAVA_Build 10 67058897 1I57M1D ATTATATTTA -TTTTTTGGCCAAAAAATTTAATTATAAACTTTTGCCAAATTGTCTTTGTCAATTAATA/TTTTTTTGGCCAAAAAATTTAATTATAAACTTTTGCCAAATTGTCTTTGTCAATTAAT- AAGTTTAAAA 2618 het 2618 ref 20 15 7 9 N/A 0 0 136032 CASAVA_Build 10 67064297 1D CCTCCCCTCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 9 8 136033 CASAVA_Build 10 67065015 1I AAAGCATAAT -/A AAAAAAAAGA 2996 het 2400 hom 18 7 7 4 A 8 9 136034 CASAVA_Build 10 67066086 1D CAGCAGAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 10 9 136035 CASAVA_Build 10 67066387 1I AATCAGTAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 53 het 19 0 18 1 A 9 10 136036 CASAVA_Build 10 67068501 4D TTTGAACTTT TTTA/---- TTTGATTGTG 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 TTTA 1 0 136037 CASAVA_Build 10 67075384 4I ATTTTTTCAA ----/TTAC TTCTTTGTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTAC 0 1 136038 CASAVA_Build 10 67078667 1D TTTATAAGTT C/- AATCAAATAT 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 C 1 0 136039 CASAVA_Build 10 67079179 1I ATCAAACAAC -/A AATAATAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 2 3 136040 CASAVA_Build 10 67081643 1I TCAAAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 10 11 136041 CASAVA_Build 10 67085181 1I GCTATCTAGA -/T TAATTAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 136042 CASAVA_Build 10 67088426 34D AGAACACACA ATTTGCCTATATAACAAATCTGCACTTGTTATGT/---------------------------------- ATTTGCCTAT 3070 het 3070 ref 35 16 8 19 ATTTGCCTATATAACAAATCTGCACTTGTTATGT 1 0 136043 CASAVA_Build 10 67095284 1D ACACTGCAGG T/- TTTTCTTTGC 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 T 5 4 136044 CASAVA_Build 10 67097057 2I TCAATATGCA --/TG TGTCAAGATC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TG 1 2 136045 CASAVA_Build 10 67102040 1I CTTTTCTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 9 10 136046 CASAVA_Build 10 67103989 1D ATATAAAATC A/- AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 A 7 6 136047 CASAVA_Build 10 67109248 2I TATTTTTCTT --/TA TATATATATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TA 6 7 136048 CASAVA_Build 10 67111046 1D TACTTTTGTC A/- TAGTACATAA 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 A 1 0 136049 CASAVA_Build 10 67112719 3D CTTATATAAA TCT/--- TCTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 25 7 11 7 TCT 2 1 136050 CASAVA_Build 10 67118830 1I TTTAAAAAAA -/T TGGATGGTCA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 1 2 136051 CASAVA_Build 10 67122354 1D TTACCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 555 hom 39 3 21 16 A 15 14 136052 CASAVA_Build 10 67124828 1I TAAATCTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 9 10 136053 CASAVA_Build 10 67127039 3D AAAAAGACAT ACC/--- TAACTAAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 ACC 1 0 136054 CASAVA_Build 10 67130149 2I ATCTGTGGAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 GT 8 9 136055 CASAVA_Build 10 67133767 1I TTAGTGTCTC -/T TATTATCCTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 2 136056 CASAVA_Build 10 67135574 3D AGAGTCTGAT CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 het 214 hom 21 3 13 5 C 15 12 136057 CASAVA_Build 10 67135779 1I GGGAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 21 0 16 5 A 10 11 136058 CASAVA_Build 10 67147708 5D TGAATGTAAG AATAA/----- AATAATATAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AATAA 2 1 136059 CASAVA_Build 10 67152382 4I TTAAATTGAA ----/AGAG AGGCCAGGTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 AG 1 3 136060 CASAVA_Build 10 67155104 1I CTTTTAAAGT -/G GTTTGACTTT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 1 2 136061 CASAVA_Build 10 67155979 1I GTGCTAATAC -/A CAATATTTGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 0 1 136062 CASAVA_Build 10 67159990 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 86 het 37 0 28 10 AC 8 7 136063 CASAVA_Build 10 67166918 2I TTAATTTGGA --/AT ATATATATAT 3070 het 1293 hom 22 3 18 1 AT 8 9 136064 CASAVA_Build 10 67176707 1D ACTCTTCATA G/- GGCTACATAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 3 2 136065 CASAVA_Build 10 67188488 3D TGTTAGATTT GAA/--- GAAATTAGTC 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 GAA 2 1 136066 CASAVA_Build 10 67201816 1D CCCTTTAAAC A/- AAAATGGAGT 3070 het 3070 hom 50 17 27 6 A 5 4 136067 CASAVA_Build 10 67202494 1I TTAATAATAC -/A AAAAAAAAAA 1306 het 1306 ref 26 13 5 8 A 15 16 136068 CASAVA_Build 10 67204132 2D TGATTGTGTC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 CA 13 12 136069 CASAVA_Build 10 67262412 1I TTTAAGAGAT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 8 136070 CASAVA_Build 10 67262733 1D TTCTATTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 10 9 136071 CASAVA_Build 10 67291577 1D AAACAATGAA T/- TTTTGAATCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 4 136072 CASAVA_Build 10 67293269 4D ATAGAAGATT AGAC/---- ATAGACCTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 8 AGAC 1 0 136073 CASAVA_Build 10 67293694 1D TGCTTGGCTA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 8 7 136074 CASAVA_Build 10 67305846 1I CTTAGAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 9 10 136075 CASAVA_Build 10 67309890 4I ATTCCTGGTG ----/TCAA TCAGAGTCCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TCAA 0 1 136076 CASAVA_Build 10 67319709 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 538 hom 28 2 21 5 A 11 12 136077 CASAVA_Build 10 67328870 1I CTAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 59 het 24 0 20 4 A 9 10 136078 CASAVA_Build 10 67332907 2D CATACACACA AC/-- ACACACACAT 3070 hom 159 het 57 0 53 4 AC 5 4 136079 CASAVA_Build 10 67347226 3I TATTATTTCG ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 9 12 136080 CASAVA_Build 10 67347572 3I TTAGTTTTTA ---/ACT ACATAATGGG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 ACT 0 1 136081 CASAVA_Build 10 67348539 1D AATAATGACC T/- ATTAAATAGA 3070 hom 132 het 47 0 44 3 T 1 0 136082 CASAVA_Build 10 67404541 1I ACTCTGGGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 8 9 136083 CASAVA_Build 10 67408260 1D TTTTTTTTTT A/- ACTTTCATTC 3070 hom 86 het 53 0 38 15 A 2 1 136084 CASAVA_Build 10 67412319 2I TTGCACACAC --/AT GTTTATAGCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 0 1 136085 CASAVA_Build 10 67416091 1D AGGCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 26 0 19 8 A 12 11 136086 CASAVA_Build 10 67419377 1I TTTTATGGGG -/T TACATGTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 136087 CASAVA_Build 10 67422273 2D TCATTTCCCC TA/-- TGTCTTCCAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TA 1 0 136088 CASAVA_Build 10 67439912 1D GAAAACATTG T/- TCATTCTAAA 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 T 2 1 136089 CASAVA_Build 10 67451256 2I TAAAAATAAC --/TT GAGGTATTTG 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 0 2 136090 CASAVA_Build 10 67463827 1D AAGAAAAGAA T/- TTAGAACAGG 3070 het 3070 hom 31 9 20 4 T 3 2 136091 CASAVA_Build 10 67464679 2I TTACTAAATA --/AT AGTTACTAAT 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 AT 0 1 136092 CASAVA_Build 10 67467437 1D ATTCCAGTAC G/- GTCAAGAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 G 2 1 136093 CASAVA_Build 10 67471208 1D CACTGTACTA T/- GGTTATGTAA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 1 0 136094 CASAVA_Build 10 67474741 1D GACAATCTCA G/- GATTCAATAG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 2 1 136095 CASAVA_Build 10 67478737 1D TCTACACAGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 9 8 136096 CASAVA_Build 10 67480189 1D TCCTCATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 12 11 136097 CASAVA_Build 10 67480623 1D CATTTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2049 hom 24 6 12 6 T 11 10 136098 CASAVA_Build 10 67482210 1I TAAAGCATTC -/A GAGGTCAAAG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 0 1 136099 CASAVA_Build 10 67488845 1I AACAAAGAGG -/T TTTTCAGCTG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 4 5 136100 CASAVA_Build 10 67495003 2D GGTTTTTTTT TG/-- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 TG 1 0 136101 CASAVA_Build 10 67501151 47I AACACAAGAA -----------------------------------------------/AAACAACTAACACATATATGACAGACACTCTTCTTGAAACCATGAAC ACATTTAAAC 3070 het 3070 hom 31 17 16 3 AAACAACTAACACATATATGACAGACACTCTTCTTGAAACCATGAAC 0 1 136102 CASAVA_Build 10 67512799 1I TCTAAAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 9 10 136103 CASAVA_Build 10 67515627 19I TAGTACCATA -------------------/AGAATTATTTTACATGAAT ATTTATGTTA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 AGAATTATTTTACATGAAT 0 1 136104 CASAVA_Build 10 67549511 1I ATTCAATCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 8 9 136105 CASAVA_Build 10 67563359 1D AATATCCTGG A/- AAAAAAAAAA 1211 het 1211 ref 38 29 4 5 A 11 10 136106 CASAVA_Build 10 67563664 2I AAAATCTAAC --/AG TTAATAGAAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 AG 0 1 136107 CASAVA_Build 10 67564622 3I AGAGAAAAAC ---/AAT AAAGATTTAA 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 AAT 0 1 136108 CASAVA_Build 10 67566477 13I TTTAGAAGAG -------------/AGTAACACAACAC AGCATTGTGT 3070 het 3070 hom 37 16 18 6 AGTAACACAACAC 0 1 136109 CASAVA_Build 10 67574785 1I AAAGTAGCTT -/C CTATATTATG 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 C 1 2 136110 CASAVA_Build 10 67579370 5D ACTTTTAAAA TAAAG/----- TATTCTTGAT 3070 het 3070 hom 27 10 16 5 TAAAG 1 0 136111 CASAVA_Build 10 67595532 3I TTTATTTATT ---/TTA TTATTATTAT 2324 het 1203 hom 10 3 6 1 TTA 5 6 136112 CASAVA_Build 10 67596515 1D TTATAACAGC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 40 24 10 9 A 8 7 136113 CASAVA_Build 10 67598122 1D CCATTTATTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 9 8 136114 CASAVA_Build 10 67608259 2I ACACACACAT --/AC ACACACACCC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AC 4 5 136115 CASAVA_Build 10 67621381 1D GTATGACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 15 14 136116 CASAVA_Build 10 67625498 1D TTAATGGAGC A/- TTATCAATAT 3070 het 3070 hom 49 23 25 1 A 1 0 136117 CASAVA_Build 10 67629228 1D TTTAACAAGC A/- AAAAAAAAAG 1087 het 1087 ref 51 41 3 7 A 10 9 136118 CASAVA_Build 10 67636952 4D ATATCTAATG ATCT/---- ATCTAATGAT 2951 het 2951 ref 22 13 8 3 ATCT 2 1 136119 CASAVA_Build 10 67638175 3D TAGAAACAAC ATG/--- GTAAAACTTA 3070 het 3070 ref 54 31 18 8 ATG 1 0 136120 CASAVA_Build 10 67644823 1I CTAATACTTG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 8 9 136121 CASAVA_Build 10 67647699 4I CCTAACTGAT ----/TCTC TCTGAATAAT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 TC 1 3 136122 CASAVA_Build 10 67649386 1D CAATTAAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 T 10 9 136123 CASAVA_Build 10 67653627 1D CACAATGTGG T/- TGGGCATCAT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 2 1 136124 CASAVA_Build 10 67659492 1D TTATTTGTAA T/- TTTTTTAGCT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 7 6 136125 CASAVA_Build 10 67665550 1D TCTGACAATT A/- ATAGGGCCAG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 2 1 136126 CASAVA_Build 10 67667260 1I GCAATTTGAA -/G GCATGATTGG 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 G 1 2 136127 CASAVA_Build 10 67668446 2D AAATGTCCAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 21 7 12 2 AT 8 7 136128 CASAVA_Build 10 67670921 1D TAAAAGGGTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 9 8 136129 CASAVA_Build 10 67674356 2I AGAAAAACAA --/TC TCTGCCTGGT 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 TC 1 2 136130 CASAVA_Build 10 67678113 1I AGAAAATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 15 7 A 10 11 136131 CASAVA_Build 10 67680424 13I TGTTTTATCA -------------/TTATCAGTGGCAC TTATCAGTGG 3070 het 3070 ref 54 27 24 4 TTATCAGTGGCAC 0 1 136132 CASAVA_Build 10 67681076 1D CTTTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 507 hom 31 3 14 14 A 11 10 136133 CASAVA_Build 10 67702412 6I ATTGGGCACT ------/TAAAAG TAAAAGGCAG 3070 het 3070 ref 54 28 16 10 TAAAAG 1 2 136134 CASAVA_Build 10 67704000 1I TTCAATATGA -/T TTTATGGACA 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 3 4 136135 CASAVA_Build 10 67706595 1I CTATTGTTTA -/T TTAAGCATTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 2 3 136136 CASAVA_Build 10 67710593 1I ATTAAAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 10 11 136137 CASAVA_Build 10 67715649 1I CTGCATATAC -/T TTTTTGTATC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 5 6 136138 CASAVA_Build 10 67716263 2D CAGAAAAACA GT/-- TACAACAGGG 3070 het 3070 ref 44 27 17 0 GT 1 0 136139 CASAVA_Build 10 67723200 1I TAAAACAGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 8 9 136140 CASAVA_Build 10 67724954 3I ATTTATTGAC ---/ATT ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 ATT 3 4 136141 CASAVA_Build 10 67726337 2I GTATATATAT --/AC ACACACACAC 1510 het 1510 ref 31 10 7 14 AC 6 7 136142 CASAVA_Build 10 67726379 2D CTATATCTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 27 16 8 6 AC 7 6 136143 CASAVA_Build 10 67740349 2D TTATTCTGTG TT/-- TTCATCATGC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 4 2 136144 CASAVA_Build 10 67751352 1D GTTGCATACA T/- TTTTGAAAAC 3070 het 3070 hom 27 12 15 1 T 5 4 136145 CASAVA_Build 10 67783657 1D GGGAAAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 A 13 12 136146 CASAVA_Build 10 67784079 2I TATGAACACT --/AA AAAAAAAAAA 2761 het 2761 ref 31 13 8 10 A 11 13 136147 CASAVA_Build 10 67785495 5D4M1D CAAGGAAATC AAATTATAAT/-----ATAA- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 33 15 17 3 N/A 0 0 136148 CASAVA_Build 10 67785670 1D TTCAATGTCT A/- AATTGTTCCA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 3 2 136149 CASAVA_Build 10 67789962 1D AACACTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 4 T 12 11 136150 CASAVA_Build 10 67790694 2I TTCCTTTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 TC 7 8 136151 CASAVA_Build 10 67794078 1D AGGCTGAGGT G/- GGAGGATCAC 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 G 3 2 136152 CASAVA_Build 10 67810766 1D AATGAGACAG A/- AGGTTAACAA 3070 het 1401 hom 12 3 8 2 A 2 1 136153 CASAVA_Build 10 67820817 5D TTATTCCGCC CAATA/----- CAATAGTCAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 CAATA 2 1 136154 CASAVA_Build 10 67821042 2I TCTGCAGCAC --/TT TTATTCACAC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 2 4 136155 CASAVA_Build 10 67821837 1D ATTTTTTTAC A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 7 6 136156 CASAVA_Build 10 67832161 2D AGTACCAAAA AG/-- AGTGTCAGGA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 AG 2 1 136157 CASAVA_Build 10 67834547 2I TTCCTGTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 T 10 12 136158 CASAVA_Build 10 67849011 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAGCAAAA 743 het 743 ref 35 23 6 6 A 5 4 136159 CASAVA_Build 10 67918673 1D AAAAGTAGAC T/- TTTTTTTTTG 1686 het 1686 ref 47 32 6 10 T 10 9 136160 CASAVA_Build 10 67922215 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2763 het 680 hom 22 3 9 10 T 17 16 136161 CASAVA_Build 10 67936203 2D CTTGAATTTT CA/-- CAGTTTTTCC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 CA 2 1 136162 CASAVA_Build 10 67940324 4I TTGTGTTGAG ----/GTAT GTATATTCCC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GTAT 1 2 136163 CASAVA_Build 10 67941237 1D ATTTGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 24 1 19 4 T 11 10 136164 CASAVA_Build 10 67953951 42I CTGTGAAGCC ------------------------------------------/TGTCCCATTCCCTATACCCAGCAAATTGAATTTTCTCCTTTG TGTTTAAAAA 3070 hom 81 het 27 0 28 3 TGTCCCATTCCCTATACCCAGCAAATTGAATTTTCTCCTTTG 0 1 136165 CASAVA_Build 10 67954279 1I TGGCTGGTGA -/T TGGTTATGAG 3070 hom 136 het 50 0 43 7 T 1 2 136166 CASAVA_Build 10 67954976 1I CAGATAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 79 het 36 0 26 10 A 9 10 136167 CASAVA_Build 10 67961152 4D TGGTTTGTTC GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 hom 83 het 39 0 28 12 GTTT 4 3 136168 CASAVA_Build 10 67964234 20D TATAAAAATC ATATATATATATATATATAT/-------------------- ATATATATAT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 AT 16 6 136169 CASAVA_Build 10 67973664 6D CTTCTTGAGA TGTGTG/------ TGTGTGTATA 616 hom 12 het 7 0 4 3 TG 6 3 136170 CASAVA_Build 10 67973777 4I AATGGATGAC ----/CTAT CTATCTGCCA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 CTAT 1 2 136171 CASAVA_Build 10 67980805 2I AGAAAAATAA --/CT CTGTTTTCTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CT 1 2 136172 CASAVA_Build 10 68002146 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 376 hom 31 1 23 8 A 15 14 136173 CASAVA_Build 10 68011178 1I CTTTTGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 31 1 21 9 T 11 12 136174 CASAVA_Build 10 68050112 2I AATTAATTAC --/AA AAAATACAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 6 136175 CASAVA_Build 10 68053226 1D GCTGGCCACC G/- AGGCTTATTA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 G 1 0 136176 CASAVA_Build 10 68053480 1I ACTAGGTAAT -/A AGAGTATATT 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 A 1 2 136177 CASAVA_Build 10 68056143 1I TCATATAGTT -/A AATTGTAATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 2 3 136178 CASAVA_Build 10 68057242 1I AAAGTCTTTA -/T TTTCTTTTTA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 3 4 136179 CASAVA_Build 10 68061524 1D CTAAATGAAT A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 8 7 136180 CASAVA_Build 10 68061726 3D ACAAAATTTG TTA/--- TTATAGCAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 TTA 2 1 136181 CASAVA_Build 10 68068557 1D TCTCTTTTCT C/- CCCCGCCCAT 3070 hom 131 het 50 0 42 8 C 5 4 136182 CASAVA_Build 10 68068968 1D TTGAACCATA G/- AAAAAGAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 1 0 136183 CASAVA_Build 10 68074480 4D CTCACTGATC TTAT/---- TTTTCTCCAG 3070 hom 99 het 34 0 34 1 TTAT 1 0 136184 CASAVA_Build 10 68076781 1D AGCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 23 6 A 11 10 136185 CASAVA_Build 10 68078456 1D CCAGACTTTT G/- TTTGGGAAAC 3070 hom 90 het 32 0 31 2 G 1 0 136186 CASAVA_Build 10 68081224 1I ACACCAAGTG -/C CCGCACTCCT 3070 hom 39 het 16 0 12 4 C 2 3 136187 CASAVA_Build 10 68081565 25I ACCCGCATTG -------------------------/GCCCTTGATCGCGGCACACAGCAGC GCCGGTTCCC 2788 hom 30 het 11 0 10 1 GCCCTTGATCGCGGCACACAGCAGC 0 1 136188 CASAVA_Build 10 68081862 9D TCAAGGAACT AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 25 0 12 15 A 22 13 136189 CASAVA_Build 10 68083167 3I AAATTTAAAC ---/AAG GAGGTAAAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAG 0 1 136190 CASAVA_Build 10 68090917 1I CACTATTTTC -/A ATTCTGCCAA 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 1 2 136191 CASAVA_Build 10 68094482 1D TTGCTAGGAA G/- AAAAATCCCA 3070 hom 126 het 47 0 42 6 G 1 0 136192 CASAVA_Build 10 68094979 10D AATGAAGCTT ACTTCAGCTC/---------- ATTTCAGCTC 3070 hom 99 het 37 0 34 6 ACTTCAGCTC 1 0 136193 CASAVA_Build 10 68096580 1I AAAAACTTAC -/T TTTTTTAATG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 6 7 136194 CASAVA_Build 10 68096955 2I AGAGTAGTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 128 hom 34 1 30 3 T 10 12 136195 CASAVA_Build 10 68097083 3D ATTCATTATT TTC/--- TGAAGCTCTG 3070 hom 72 het 26 0 25 5 TTC 1 0 136196 CASAVA_Build 10 68105873 8D AACCTTTAAA ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 17 22 6 AC 10 6 136197 CASAVA_Build 10 68118866 8D GTGTGTATCC ATGAATCA/-------- ATGAATCAAT 3070 hom 79 het 38 0 24 16 ATGAATCA 3 2 136198 CASAVA_Build 10 68125681 1I AGAGACGTAA -/G GGGGGGGGGG 1730 het 1153 hom 23 5 7 11 G 10 11 136199 CASAVA_Build 10 68126535 1D TGTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 11 10 136200 CASAVA_Build 10 68139283 5D CATTCTGTCT CAAAA/----- CAGAAATTAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 CAAAA 1 0 136201 CASAVA_Build 10 68147904 1I TGTATTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 10 11 136202 CASAVA_Build 10 68162870 1D AAGTCATACC T/- TTTTAAAATA 2773 het 2773 ref 20 8 7 5 T 5 4 136203 CASAVA_Build 10 68163916 1D ATCATTCCTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 9 8 136204 CASAVA_Build 10 68176625 6D AATGGATGCA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 110 het 49 0 35 15 GT 12 9 136205 CASAVA_Build 10 68193241 1I CTCTCAGTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 10 136206 CASAVA_Build 10 68198549 2D GACTGACAGC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 95 het 38 0 33 7 A 11 9 136207 CASAVA_Build 10 68200614 4D AATTTTAATA AATT/---- AACAGTATTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 AATT 1 0 136208 CASAVA_Build 10 68201804 1D GGCATCAAGC T/- GTACAAGTCA 3070 hom 141 het 54 0 47 7 T 1 0 136209 CASAVA_Build 10 68204334 4I TGGAGATCTC ----/TATT TATTCCATTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TATT 1 2 136210 CASAVA_Build 10 68205089 1I ATATTTACTC -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 100 het 37 0 33 4 T 7 8 136211 CASAVA_Build 10 68209288 1D GCCTGGCTTA T/- TTTTTTTTTT 2668 het 1974 hom 17 6 6 5 T 11 10 136212 CASAVA_Build 10 68210169 2D GGACTCTATA AT/-- AGAGTAACCT 3070 het 3070 ref 59 32 21 6 AT 1 0 136213 CASAVA_Build 10 68213412 1D GCTCATATGG C/- AACGACTTTG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 1 0 136214 CASAVA_Build 10 68218926 1I TTACTAAACC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 T 8 9 136215 CASAVA_Build 10 68221721 5D CTGAAAAGAT ATAAC/----- ATCATATGAG 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 ATAAC 1 0 136216 CASAVA_Build 10 68223940 1I TGTAAATAAG -/A CCCCACAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 A 0 1 136217 CASAVA_Build 10 68224653 1I CACAAAACAA -/C TTCCTTTGTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 0 1 136218 CASAVA_Build 10 68233334 7I GCTACAGATC -------/CTACAAT CTATAAAGCA 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 CTACAAT 0 1 136219 CASAVA_Build 10 68240418 1I TACTTAAAAT -/C CTTCAATGTT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 1 2 136220 CASAVA_Build 10 68251883 2I TAAATATTAC --/AT GTTTATATTT 3070 het 3070 ref 15 8 7 0 AT 0 1 136221 CASAVA_Build 10 68260727 1I TAAAAAAGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 8 9 136222 CASAVA_Build 10 68268798 1D TCATACTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 20 10 A 11 10 136223 CASAVA_Build 10 68274703 1D AGAACATGTT G/- GGTGGTATAG 3070 het 3070 ref 44 22 17 7 G 3 2 136224 CASAVA_Build 10 68279673 1I AAAGCTTAAA -/T TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 6 7 136225 CASAVA_Build 10 68282834 1I CTAGAAATGG -/T TTTCACATTT 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 3 4 136226 CASAVA_Build 10 68284075 3I ATCAAATTGT ---/TTA TGCTTTCTTC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 TTA 0 1 136227 CASAVA_Build 10 68287152 1D TATTTGGACT A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 20 20 10 A 2 1 136228 CASAVA_Build 10 68293372 2D CTGGAGGAAT AG/-- AGTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 40 23 12 6 AG 2 1 136229 CASAVA_Build 10 68303143 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 10 11 136230 CASAVA_Build 10 68303881 1D CAAGTCACAG T/- CATTCAATGA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 1 0 136231 CASAVA_Build 10 68305408 1D GCTTTAAAAT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 A 8 7 136232 CASAVA_Build 10 68306460 3I TGTTTAACCT ---/TTC TAGCAGGATC 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 TTC 0 1 136233 CASAVA_Build 10 68318312 1D TAGTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 12 11 136234 CASAVA_Build 10 68322297 10I GGGGCTTCCT ----------/ATTTGAAATA ATTTGAAATA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 ATTTGAAATA 1 2 136235 CASAVA_Build 10 68323307 1I ACAGAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 A 13 14 136236 CASAVA_Build 10 68328131 1D CTACAAAGTA T/- CTGTAAAGCT 3070 het 3070 hom 46 17 24 8 T 1 0 136237 CASAVA_Build 10 68332675 1D AAAAAGTCCA G/- GACCAGACAG 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 G 2 1 136238 CASAVA_Build 10 68351506 1D TATATTTTTC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 8 7 136239 CASAVA_Build 10 68356058 1I CCCACCCCCC -/A AAAAAACTGT 2718 het 2718 ref 32 17 9 6 A 6 7 136240 CASAVA_Build 10 68359821 1D TTTTTACTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2892 hom 26 7 14 5 T 9 8 136241 CASAVA_Build 10 68362463 7D AAAATGAATT AAAGAAA/------- TAATAATAAT 3070 hom 28 het 21 0 11 13 AAAGAAA 1 0 136242 CASAVA_Build 10 68373284 1D TCCCCCACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 31 1 21 10 T 13 12 136243 CASAVA_Build 10 68388225 1D AATAAAAAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 10 9 136244 CASAVA_Build 10 68393610 1D TAGACATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 21 2 14 5 T 16 15 136245 CASAVA_Build 10 68395001 4D TTGGGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 29 10 11 8 TTTG 3 2 136246 CASAVA_Build 10 68395314 1I GAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1132 het 533 hom 18 4 9 5 A 12 13 136247 CASAVA_Build 10 68396250 1D ATGTAATATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 10 9 136248 CASAVA_Build 10 68397098 2I GGATATAGAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 AT 6 7 136249 CASAVA_Build 10 68401191 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 442 hom 34 1 27 7 A 11 10 136250 CASAVA_Build 10 68413917 1D ATCCGCTACC A/- AAAAAAACAC 3070 het 16 hom 30 1 14 16 A 8 7 136251 CASAVA_Build 10 68416260 5I GACTCCATCT -----/CAAAA TGCTAAACTA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 CAAAA 0 1 136252 CASAVA_Build 10 68430400 3D AGATCTGCTG CCT/--- CCTATTACAG 3070 hom 104 het 38 0 35 4 CCT 2 1 136253 CASAVA_Build 10 68434266 1D TTCTTCCCTC A/- AAAAATGCTG 3070 hom 90 het 37 0 30 8 A 6 5 136254 CASAVA_Build 10 68434782 6D AGGTAGTTTC ATAGAG/------ ATAATCACAA 3070 het 3070 ref 41 22 16 6 ATAGAG 1 0 136255 CASAVA_Build 10 68436309 2D TTCTATTCTC TT/-- ATAACTTCAA 3070 hom 99 het 38 0 33 7 T 2 0 136256 CASAVA_Build 10 68436562 1I CAGTCTTAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 9 10 136257 CASAVA_Build 10 68441194 1I ATTGCTAGTG -/A AAAAAACAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 6 7 136258 CASAVA_Build 10 68449780 1D TACCAATATC A/- ACTGCTTTCC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 2 1 136259 CASAVA_Build 10 68455667 1I TGTGGCACAT -/A ATACACCATG 1007 hom 7 het 3 0 3 0 A 1 2 136260 CASAVA_Build 10 68465562 1D CATTTGCTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 47 0 40 8 A 9 8 136261 CASAVA_Build 10 68467153 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2880 hom 30 12 10 8 A 10 9 136262 CASAVA_Build 10 68475877 1I CTAATCCCAG -/A AAAAGGCAGT 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 A 4 5 136263 CASAVA_Build 10 68478795 3D TGATAACTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 237 hom 33 2 18 13 T 14 11 136264 CASAVA_Build 10 68483959 1D CCTGGTTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 A 10 9 136265 CASAVA_Build 10 68485196 1I ACAGTTCCTG -/C TCCAAAGGGA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 C 0 1 136266 CASAVA_Build 10 68491723 1D GTAAAAAAAA T/- CAATCTTAGG 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 T 1 0 136267 CASAVA_Build 10 68491963 2D TAAAACCCAC AG/-- AGAGTAAATT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 AG 3 2 136268 CASAVA_Build 10 68495703 1D GCTGCCATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 13 24 9 A 12 11 136269 CASAVA_Build 10 68496409 1I ACTAAATAAT -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 6 7 136270 CASAVA_Build 10 68497065 5I CAGTAACCAC -----/TTTAA TTTAATACTG 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 TTTAA 1 2 136271 CASAVA_Build 10 68498821 1D GGAAAAAAAA T/- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 1 0 136272 CASAVA_Build 10 68501095 3I GTATTTTGGG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 T 13 16 136273 CASAVA_Build 10 68501275 2D AAGTTTTTTT TG/-- TTTGTTTGTT 3020 het 3020 ref 28 18 8 3 TG 1 0 136274 CASAVA_Build 10 68502652 7I TGGAAGCTCT -------/TAGCCTA GCCTTTGGCT 1528 het 1528 ref 35 16 5 14 TAGCCTA 0 1 136275 CASAVA_Build 10 68504850 11D TGGTACCTGA ACAATTCAGAT/----------- ACATTTGTAG 3070 het 3070 ref 39 21 16 7 ACAATTCAGAT 1 0 136276 CASAVA_Build 10 68512935 1I CTAATTTGAG -/A AAAAAAAAAA 1866 het 1866 ref 52 40 5 7 A 11 12 136277 CASAVA_Build 10 68521852 1I CGATAGTGAC -/A AAGGACTACA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 2 3 136278 CASAVA_Build 10 68522937 1I ACACTTTAAA -/T TAGAGCCTTC 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 T 1 2 136279 CASAVA_Build 10 68524769 2D AATTGGCTTT AA/-- GTTTATACAT 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 A 2 0 136280 CASAVA_Build 10 68531221 1I TCTCCATTTT -/C CTTATAAGAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 C 1 2 136281 CASAVA_Build 10 68531723 3D GAGCATGCGA AAG/--- AAGAAGTTAT 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 AAG 3 2 136282 CASAVA_Build 10 68532112 2I AACCAAGCAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 AC 5 6 136283 CASAVA_Build 10 68542388 1I TTTTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 11 12 136284 CASAVA_Build 10 68543842 1I GGGAGAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 A 11 12 136285 CASAVA_Build 10 68554208 1I ATCTATATGG -/A AAAATATTAC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 4 5 136286 CASAVA_Build 10 68567076 1I TTTCTGTATT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 A 7 8 136287 CASAVA_Build 10 68571068 1I CACTCTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 10 11 136288 CASAVA_Build 10 68581101 1I TACAGTGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 50 24 16 10 A 9 10 136289 CASAVA_Build 10 68582558 1I AGTAAACCTT -/C TATATAGCTT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 C 0 1 136290 CASAVA_Build 10 68584786 1D AAATTGTTTC T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 53 29 17 7 T 8 7 136291 CASAVA_Build 10 68584942 1D ATCCTCAGCA C/- CTTTTACAAT 3070 het 3070 hom 31 10 19 3 C 2 1 136292 CASAVA_Build 10 68585294 6D TATTAATATA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 15 21 7 TG 10 7 136293 CASAVA_Build 10 68586665 5I TATCCTACTG -----/TTATA TTATATTGCT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 TTATA 1 2 136294 CASAVA_Build 10 68666887 40D AACTATGGTG TATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------------- TATATATATA 987 hom 10 het 5 0 4 2 TATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 136295 CASAVA_Build 10 68669130 2D TACACGTGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3024 hom 34 14 15 6 A 15 13 136296 CASAVA_Build 10 68678220 1I15M1D CGCTTAGTCA -CTAGGCTGGAGTGCAG/CCTAGGCTGGAGTGCA- GTGGCACAAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 N/A 0 0 136297 CASAVA_Build 10 68746936 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 7 6 136298 CASAVA_Build 10 68747678 2D CACAGTTGAA TC/-- TCTTTAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TC 2 1 136299 CASAVA_Build 10 68747778 1D ATGAAAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 28 1 23 6 T 13 12 136300 CASAVA_Build 10 68751880 1I CTTATACTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 9 10 136301 CASAVA_Build 10 68754967 1I TTCATTGATC -/T TTTAAATGCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 3 4 136302 CASAVA_Build 10 68760468 1I GTCATTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 591 hom 48 2 38 8 A 10 11 136303 CASAVA_Build 10 68762436 4D TGTTAGCCTA TATC/---- TATCTCTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TATC 2 1 136304 CASAVA_Build 10 68769410 1I ATACAACATG -/T TTCTGATATA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 3 136305 CASAVA_Build 10 68771784 1I CATCTATTCT -/A ACATAGCTAT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 1 2 136306 CASAVA_Build 10 68780890 4I CTCAAAAGGC ----/TAGA TATAGTATGA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TAGA 0 1 136307 CASAVA_Build 10 68781148 1I ACTTTCAAAT -/A AAAAAATCTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 6 7 136308 CASAVA_Build 10 68783250 6D GCACGTTACA TAGTCT/------ TAAAGATTGC 3070 hom 132 het 49 0 45 5 TAGTCT 1 0 136309 CASAVA_Build 10 68792561 1D ATTCAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 32 1 23 8 A 13 12 136310 CASAVA_Build 10 68794978 1I TATCTTATAC -/A AAAAAATAAC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 6 7 136311 CASAVA_Build 10 68804191 1I AAAATTGGAT -/A AACGAATGAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 2 3 136312 CASAVA_Build 10 68807397 1D AGCTTATTTT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 7 136313 CASAVA_Build 10 68813429 1I GAGCTATGCT -/A AGGCATATCT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 1 2 136314 CASAVA_Build 10 68826570 1I GGGGCAGTTA -/C CCCCATGCTG 3070 hom 51 het 24 0 17 7 C 4 5 136315 CASAVA_Build 10 68846126 1D AATCCCAGCA C/- CTTTGGGAGG 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 2 1 136316 CASAVA_Build 10 68848279 1I ATTTCACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 673 hom 33 2 24 7 A 13 14 136317 CASAVA_Build 10 68849625 1I TTAAACAGGA -/T TTTTTTTTTT 1052 het 1052 ref 22 15 3 4 T 13 14 136318 CASAVA_Build 10 68874468 1I ATCAGAGATT -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 6 7 136319 CASAVA_Build 10 68922128 1I AAGGCAGAAA -/C TAGATTACTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 0 1 136320 CASAVA_Build 10 68938644 1D TAAATAGACA T/- TTTTTTTTTT 1948 het 1948 ref 32 24 5 3 T 13 12 136321 CASAVA_Build 10 69031957 1I AAATACCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 13 14 136322 CASAVA_Build 10 69166031 1D CCAGAAACTA G/- GGGCAGGAAG 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 G 4 3 136323 CASAVA_Build 10 69181312 1I TAATGATCGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 10 12 7 A 10 11 136324 CASAVA_Build 10 69187443 2D GGCTCTCAGG CC/-- TTTGGCCACA 3070 het 3070 hom 24 13 11 1 C 2 0 136325 CASAVA_Build 10 69188538 1D GATTTGGTTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 9 8 136326 CASAVA_Build 10 69190410 1D GGTGAGAGAG T/- AAAGCTTCAT 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 T 1 0 136327 CASAVA_Build 10 69193038 1D GCCAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 15 14 136328 CASAVA_Build 10 69194365 1I GGTGCTCTTA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 32 het 14 0 9 5 T 6 7 136329 CASAVA_Build 10 69200139 3D AATATTTGCT TAA/--- TGTCTCTGTG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TAA 1 0 136330 CASAVA_Build 10 69202202 1D TCACTATAAT A/- AAAAAAGTTC 3070 hom 126 het 43 0 43 0 A 7 6 136331 CASAVA_Build 10 69202936 1D TCTCTTCCCC T/- TTTCACCAGA 3070 hom 99 het 40 0 32 9 T 4 3 136332 CASAVA_Build 10 69206018 2D ATTCTTTGGG TT/-- TTTTTTTCTC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 T 9 7 136333 CASAVA_Build 10 69207047 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1856 het 338 hom 28 3 9 16 A 18 17 136334 CASAVA_Build 10 69208673 1I TACACTTTTT -/A AAACAACTAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 3 4 136335 CASAVA_Build 10 69214758 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 10 136336 CASAVA_Build 10 69217550 2D TCTTGAAGGG GA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 GA 1 0 136337 CASAVA_Build 10 69218317 1D ACTGTTCAAG T/- TGAAGTCTGG 3070 hom 72 het 27 0 23 5 T 2 1 136338 CASAVA_Build 10 69219942 2D GTGGTTTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2963 hom 12 het 22 0 8 14 A 16 14 136339 CASAVA_Build 10 69226054 1I TATACATATA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 7 8 136340 CASAVA_Build 10 69243801 1I CAGAATTGCC -/A AAAAAAAAAA 2984 het 2984 ref 32 13 11 8 A 14 15 136341 CASAVA_Build 10 69247485 1D CACTAAAAAT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 8 7 136342 CASAVA_Build 10 69247894 1D GCTTGAGCCT G/- GGAGGTTGAG 3070 het 2002 hom 22 7 11 5 G 3 2 136343 CASAVA_Build 10 69253465 1D ATCTTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1930 hom 24 5 12 7 A 11 10 136344 CASAVA_Build 10 69255906 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 11 10 136345 CASAVA_Build 10 69257451 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 31 2 19 10 A 15 14 136346 CASAVA_Build 10 69275748 4I ATACTTTATT ----/TAAG TGTCTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 4 TAAG 0 1 136347 CASAVA_Build 10 69276939 1D ATCCCAGCAC T/- TTTAGGAGGC 3070 hom 41 het 15 0 13 2 T 4 3 136348 CASAVA_Build 10 69277193 10D CTCCGTCTAG AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAG 2745 het 978 hom 12 4 7 3 A 19 9 136349 CASAVA_Build 10 69282608 15D CCATGGCGCC CGGCCCCCGTCTTAT/--------------- CTCTTTAATT 3070 het 3070 ref 21 12 11 5 CGGCCCCCGTCTTAT 1 0 136350 CASAVA_Build 10 69285160 1D TTCAGAGTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 9 8 136351 CASAVA_Build 10 69290105 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2732 het 2732 ref 27 9 8 10 A 15 14 136352 CASAVA_Build 10 69291180 1I ATAAAAAAAA -/T AATACCTTCT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 0 1 136353 CASAVA_Build 10 69292323 1I TGACACAGCA -/C CCCCCCCCAA 2387 het 2387 ref 18 10 6 2 C 8 9 136354 CASAVA_Build 10 69300556 1I AACATCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 12 13 136355 CASAVA_Build 10 69306364 2D CTCTACAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 28 2 20 6 T 14 12 136356 CASAVA_Build 10 69310129 1I GGAGTGCAGT -/G GCGTGATCTT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 G 1 2 136357 CASAVA_Build 10 69311117 1I AGGTGATCTG -/C CCCCCCCTCA 2034 het 1695 hom 14 6 5 3 C 7 8 136358 CASAVA_Build 10 69315365 1D TTTTGCAAAC T/- TGACACCTGT 2671 het 2671 ref 26 15 7 5 T 2 1 136359 CASAVA_Build 10 69334207 1I GTACTACTAC -/T TTTAGTTTGA 3070 hom 27 het 14 0 9 5 T 3 4 136360 CASAVA_Build 10 69335634 1D ACATATTCCA C/- TATTATGGAT 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 C 1 0 136361 CASAVA_Build 10 69345502 5D GAAGCTACTT AACAC/----- AAATTGGGTA 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 AACAC 1 0 136362 CASAVA_Build 10 69371122 3D ACTTTACAAC TGT/--- TTTCTCCCAG 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 TGT 1 0 136363 CASAVA_Build 10 69374972 5D AAGCAGCAAG AGAAA/----- AGAAACAACA 3070 het 3070 ref 38 21 11 10 AGAAA 2 1 136364 CASAVA_Build 10 69375385 1I ATGAACCAAT -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 6 7 136365 CASAVA_Build 10 69391987 1D TTAAATAAGC A/- AAAAAAAAAA 1942 het 1942 ref 18 8 7 3 A 12 11 136366 CASAVA_Build 10 69393760 4I TACCTAGGTC ----/AGAG AGAGATGAAG 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 AG 2 4 136367 CASAVA_Build 10 69395602 1D CACAAATGGC T/- AGCAAATAAG 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 T 1 0 136368 CASAVA_Build 10 69397678 1I GCAGGGATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 303 hom 40 1 27 12 A 9 10 136369 CASAVA_Build 10 69399939 4I AACTCCTGAC ----/TAAA TAAACTCAAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TAAA 1 2 136370 CASAVA_Build 10 69412255 1I TGATTAATGA -/C TTAAATCTAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 C 0 1 136371 CASAVA_Build 10 69420795 1D AACAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 11 10 136372 CASAVA_Build 10 69423288 1I ACCCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 1705 het 1328 hom 17 6 5 6 A 14 15 136373 CASAVA_Build 10 69425119 4I TAGTTTCTCC ----/CTAT CTATTATATA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTAT 1 2 136374 CASAVA_Build 10 69426076 2D CTTGAAATAG AC/-- ACCCCCCCTG 3070 hom 29 het 25 0 10 15 AC 2 1 136375 CASAVA_Build 10 69430340 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1896 het 1547 hom 23 5 6 12 A 15 16 136376 CASAVA_Build 10 69431947 1D ATAAAAAAAA C/- ATCAAGTTTA 3070 het 3070 hom 53 23 26 5 C 1 0 136377 CASAVA_Build 10 69433784 2D TGTTATTGCC CT/-- CTTTCAGATA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 CT 2 1 136378 CASAVA_Build 10 69435437 1D TTTAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 T 11 10 136379 CASAVA_Build 10 69448033 1D AGATTAAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 48 16 25 8 A 9 8 136380 CASAVA_Build 10 69450815 1I GCCAAAAACT -/C CCCAAATATG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 C 3 4 136381 CASAVA_Build 10 69455442 1I CCACCTTCCT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 7 8 136382 CASAVA_Build 10 69468116 1D AGCTAGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 13 12 136383 CASAVA_Build 10 69470914 6I CCACTAATGT ------/TAACAA TTAGTAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TAACAA 0 1 136384 CASAVA_Build 10 69476964 1D CTTCTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1490 hom 21 6 12 3 A 13 12 136385 CASAVA_Build 10 69481105 11D GTTAACACTA TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2549 het 966 hom 14 4 7 3 T 21 10 136386 CASAVA_Build 10 69487472 1D CACCTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 11 10 136387 CASAVA_Build 10 69508366 1D GAGTAAAGTA T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 T 8 7 136388 CASAVA_Build 10 69509179 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 1323 het 1323 ref 32 27 3 3 A 10 9 136389 CASAVA_Build 10 69512234 2D TGTCTCAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1246 hom 25 6 15 4 A 14 12 136390 CASAVA_Build 10 69514382 1D GATAAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 T 11 10 136391 CASAVA_Build 10 69524172 1D GGACTACAGG C/- TGCCTGCCAC 3070 hom 42 het 17 0 13 4 C 1 0 136392 CASAVA_Build 10 69524413 1I AGCATTTAAT -/A ACAAATAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 1 2 136393 CASAVA_Build 10 69525538 2I GGAATAGGGG --/GA GTTATTGTTT 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 GA 0 1 136394 CASAVA_Build 10 69527541 1D TAGCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 13 12 136395 CASAVA_Build 10 69547054 1I ACATAAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 11 12 136396 CASAVA_Build 10 69571292 1D ATTACTTTTT A/- TTATGTTGAT 3070 het 59 hom 29 1 23 6 A 1 0 136397 CASAVA_Build 10 69587623 5I ACAAACAAAC -----/AAACA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 AAACA 0 1 136398 CASAVA_Build 10 69589455 1D TAGAGCAATC A/- TATGATAGAA 1292 het 1292 ref 19 14 3 2 A 1 0 136399 CASAVA_Build 10 69597347 1D TCAAAATGAT A/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 47 23 18 7 A 7 6 136400 CASAVA_Build 10 69604895 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 80 het 33 0 27 8 A 10 9 136401 CASAVA_Build 10 69614201 1I GTTGGAGGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 900 hom 36 4 24 8 T 9 10 136402 CASAVA_Build 10 69617817 1I TTTGTTGTGA -/G GGGGGGCAGA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 G 6 7 136403 CASAVA_Build 10 69619794 1I CTCACCAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 9 10 136404 CASAVA_Build 10 69619893 1I ATGTTGAACA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 27 16 7 4 T 6 7 136405 CASAVA_Build 10 69619955 2D AGGTCTTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 TG 7 6 136406 CASAVA_Build 10 69620223 1I CCAAAGTACT -/G GGATTACAGG 3070 hom 72 het 25 0 22 3 G 2 3 136407 CASAVA_Build 10 69622476 2I CTGGTCTGCT --/TA AGTTTTCTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TA 0 1 136408 CASAVA_Build 10 69623764 2I AGGTAATGAG --/AA AATATCCACT 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 A 2 4 136409 CASAVA_Build 10 69625553 1D GTCTCTGGGG C/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 C 1 0 136410 CASAVA_Build 10 69629352 6D AGGTTTGCTG CTGGGA/------ CCCCTAAACA 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 CTGGGA 1 0 136411 CASAVA_Build 10 69631359 1D ACGAAACCCC T/- ATCTCTCCTA 2627 hom 21 het 8 0 8 2 T 1 0 136412 CASAVA_Build 10 69632205 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 11 21 0 A 10 9 136413 CASAVA_Build 10 69637378 1D AATGTGTGTT G/- CTCCAATCCC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 1 0 136414 CASAVA_Build 10 69641145 1D GAGGAAGGAA G/- AGATACAAAC 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 G 1 0 136415 CASAVA_Build 10 69641817 2D ATGCTGTGCT AG/-- AGATACTGCG 3070 hom 129 het 46 0 43 4 AG 2 1 136416 CASAVA_Build 10 69643423 1D TTCTTCCTTT C/- CCCTGCAGTG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 C 4 3 136417 CASAVA_Build 10 69644606 1D CACTGCACCC G/- GCCTCTACAG 2695 het 2695 ref 24 10 9 6 G 2 1 136418 CASAVA_Build 10 69648252 1I CAAGACCCTC -/T TGACAGCAAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 1 2 136419 CASAVA_Build 10 69648326 3I AAAGTTTTTT ---/TTG TTGGTTTGTT 3070 het 142 hom 44 1 41 2 TTG 1 2 136420 CASAVA_Build 10 69649308 1D CCGAACTGTT C/- CTGCCAATCA 3070 het 3070 hom 41 17 14 10 C 2 1 136421 CASAVA_Build 10 69650631 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 56 het 21 0 19 2 T 8 9 136422 CASAVA_Build 10 69651711 1D GTTTAGACAA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 53 het 23 0 18 5 C 10 9 136423 CASAVA_Build 10 69652199 1I TTTGTCTTCC -/A AAGATGGCAT 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 A 2 3 136424 CASAVA_Build 10 69653673 3D AAAGGCTCTA AGG/--- AGAAGTCCCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 AGG 1 0 136425 CASAVA_Build 10 69654170 2D GCCCAGAAAG TT/-- TTTTTAAATG 3070 het 2502 hom 22 8 13 3 T 7 5 136426 CASAVA_Build 10 69654880 4D TTGATAATGA AAAT/---- AAACAACTAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AAAT 1 0 136427 CASAVA_Build 10 69658308 1D GTCTTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 868 hom 25 2 18 5 A 11 10 136428 CASAVA_Build 10 69669033 1I AGAGACCATC -/T TGCACAGTGT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 1 2 136429 CASAVA_Build 10 69692633 2D TCTCTCTCTC TT/-- CCTCCTGCTC 3070 hom 60 het 23 0 21 4 T 2 0 136430 CASAVA_Build 10 69712170 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 588 hom 24 3 16 5 A 12 11 136431 CASAVA_Build 10 69715667 3D TGGTCTCGAA CTC/--- CTGATCTCAA 3070 het 125 hom 17 1 12 5 CTC 1 0 136432 CASAVA_Build 10 69719845 2I GCTTGGGGCA --/CT GAGGGGGATT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 CT 0 1 136433 CASAVA_Build 10 69723647 1D CTGAGGCAGG A/- AAATCACTTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 4 3 136434 CASAVA_Build 10 69730406 2I TAAGCCATGG --/AT TTGTGTTCAA 3070 hom 83 het 32 0 26 6 AT 0 1 136435 CASAVA_Build 10 69733390 4I CTTGTCTTGA ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AAAC 1 2 136436 CASAVA_Build 10 69742530 1D CCGCCACCAT G/- GCCTGGCTAA 2046 hom 12 het 5 0 5 0 G 2 1 136437 CASAVA_Build 10 69754724 1D AACACTACAT C/- TGGGCTAGGT 3070 hom 16 het 10 0 7 3 C 1 0 136438 CASAVA_Build 10 69763219 1D TTTTGTGCAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 102 het 39 0 35 7 T 9 8 136439 CASAVA_Build 10 69765198 4D TATTTAAAAA AAAT/---- AAATAAAACG 3070 het 3070 ref 27 15 8 6 AAAT 2 1 136440 CASAVA_Build 10 69770587 2I TTTTTTTGAC --/AG AGTCTCCCAC 3070 hom 83 het 31 0 25 6 AG 1 2 136441 CASAVA_Build 10 69778754 1D ATAGGATACT A/- CAGGATTCTT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 A 1 0 136442 CASAVA_Build 10 69784613 1D GGTCAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 38 2 21 15 T 15 14 136443 CASAVA_Build 10 69895017 1I TCCTGACTTC -/G TGATCCGCCC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 0 1 136444 CASAVA_Build 10 69931889 7D ACCTGGGAGG CAGAGGT/------- TGCAGTGAGC 3070 hom 68 het 24 0 21 4 CAGAGGT 1 0 136445 CASAVA_Build 10 69945129 1D CCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 24 2 18 5 A 15 14 136446 CASAVA_Build 10 69966107 1I ATACAGGGGT -/G GGGGGTGGGG 3070 hom 64 het 26 0 20 6 G 5 6 136447 CASAVA_Build 10 69972203 1I TTGCTTATGG -/C CCAGGATGTA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 C 2 3 136448 CASAVA_Build 10 69972973 2I GCACTCTAGA --/CT CTCTGGGGTT 3070 hom 117 het 50 0 39 11 CT 2 3 136449 CASAVA_Build 10 69974242 2D3M1I AGCTGGAACA TCTGA-/--TGAC TTCTGCTAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 N/A 0 0 136450 CASAVA_Build 10 69981045 1D TCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 35 1 29 7 A 13 12 136451 CASAVA_Build 10 69982881 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 10 9 136452 CASAVA_Build 10 69985012 2I GCAGTGAGCT --/GA GATCACGCCA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 GA 1 2 136453 CASAVA_Build 10 69986583 1D AAACATAATG A/- AAATATTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 4 3 136454 CASAVA_Build 10 69987497 1D AAGTGATCCT C/- CCCCCCTCTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 7 6 136455 CASAVA_Build 10 69996588 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 C 0 1 136456 CASAVA_Build 10 70007260 4D AAAAAACAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 AAAC 4 3 136457 CASAVA_Build 10 70011600 1I ACCGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 13 14 136458 CASAVA_Build 10 70013970 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 871 het 871 ref 6 2 3 1 T 9 10 136459 CASAVA_Build 10 70014592 1I ACATATCTCT -/C TTTTTTTTTT 2449 het 2449 ref 27 13 8 6 C 0 1 136460 CASAVA_Build 10 70017299 4I TGAGTTGGTA ----/AAAC AAACAGACTA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 AAAC 1 2 136461 CASAVA_Build 10 70019266 5D GGGGTTTCAC TGTGT/----- TGCCCAGGCT 2924 het 2463 hom 14 6 7 2 TGTGT 1 0 136462 CASAVA_Build 10 70028443 1D ATTCATTAGG T/- TTTTTTTTTC 2253 het 2253 ref 34 16 11 7 T 10 9 136463 CASAVA_Build 10 70036375 1I AAAACAAAAA -/C AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 C 0 1 136464 CASAVA_Build 10 70053815 5I TTCATGAAGC -----/AATAT AATATAATAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AATAT 1 2 136465 CASAVA_Build 10 70053863 3I TCTTTCTTTC ---/TTT TTTTCTTTTT 1187 het 648 hom 25 3 4 18 T 4 7 136466 CASAVA_Build 10 70055890 1D AAAAGAAAAG A/- AAATACTTAA 1244 het 3 hom 12 0 5 7 A 4 3 136467 CASAVA_Build 10 70063132 1I TTATACTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 10 11 136468 CASAVA_Build 10 70068838 1D TATAACTAAT A/- AAAAAGTTCA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 6 5 136469 CASAVA_Build 10 70071429 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 19 0 17 3 T 10 9 136470 CASAVA_Build 10 70077374 4D CTTAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 1181 hom 19 3 11 5 AAAG 3 2 136471 CASAVA_Build 10 70081317 1D TTAATACAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 10 9 136472 CASAVA_Build 10 70082139 2D TAAATTACGA AG/-- AGTGTCTAAT 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 AG 2 1 136473 CASAVA_Build 10 70087548 1D CTTAAACTTT A/- GGTAGAGGTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 A 1 0 136474 CASAVA_Build 10 70089067 2D TCAATAGAGC AG/-- ATGTGGCAAT 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 AG 1 0 136475 CASAVA_Build 10 70089577 4I TACAAAGTGA ----/ACAT ACATACCTAT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 ACAT 1 2 136476 CASAVA_Build 10 70091202 1I TCCTGTGCTT -/A AGAGATTATA 2819 het 2819 ref 17 10 6 1 A 1 2 136477 CASAVA_Build 10 70091909 3I AATTGCTGGG ---/ATT ACAGGCTTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 ATT 0 1 136478 CASAVA_Build 10 70092254 4D25M1I TTAATTTTTA TTTCTTCCATGAATTCACTCTTCATAGCC-/----TTCCATGAATTCACTCTTCATAGCCT TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 20 14 8 6 N/A 0 0 136479 CASAVA_Build 10 70094177 1I TATTTTTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2681 hom 23 6 9 8 T 8 9 136480 CASAVA_Build 10 70095045 4D GTTTACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 90 hom 33 2 19 15 AC 9 7 136481 CASAVA_Build 10 70096013 1I AATTTTTCTA -/T TTTTGCATTC 3070 het 3070 ref 26 18 8 0 T 4 5 136482 CASAVA_Build 10 70099016 1D CACCCCCCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 107 het 39 0 37 2 A 10 9 136483 CASAVA_Build 10 70109818 1D ATCCTATGGA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 8 7 136484 CASAVA_Build 10 70111731 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 11 1 10 0 A 11 12 136485 CASAVA_Build 10 70112875 1D AAATAAAGTG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 A 8 7 136486 CASAVA_Build 10 70126497 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1054 hom 23 4 14 8 T 11 10 136487 CASAVA_Build 10 70129263 2I TCTGGGTCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 AC 7 8 136488 CASAVA_Build 10 70133445 1I AAATCTCGCC -/A ACTTGCACTC 2175 het 2175 ref 18 8 5 5 A 1 2 136489 CASAVA_Build 10 70136561 1D ACCCTGTCTC T/- ACTAAAAATA 3070 het 1235 hom 11 3 8 0 T 1 0 136490 CASAVA_Build 10 70146925 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 2285 hom 23 9 12 2 T 9 8 136491 CASAVA_Build 10 70148998 1I GAAAGGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2037 hom 23 6 15 2 A 9 10 136492 CASAVA_Build 10 70153924 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2972 het 815 hom 12 3 8 1 A 12 11 136493 CASAVA_Build 10 70155161 1I ACTCCAGCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 2949 hom 30 8 14 8 A 8 9 136494 CASAVA_Build 10 70155261 1I TTAGGAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 11 12 136495 CASAVA_Build 10 70159686 1D GATGACTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 11 10 136496 CASAVA_Build 10 70163259 1D TTTTCTTTTC A/- CTGTAGATTC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 1 0 136497 CASAVA_Build 10 70166099 3I TCACCTACTT ---/ATC ATCTTTTGTG 3069 het 3069 ref 32 21 8 3 ATC 1 2 136498 CASAVA_Build 10 70182858 24I CTTCTGCTTT ------------------------/TAGTTGTCTTTAAAAAAGACAATG TAGTTGTCTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 6 TAGTTGTCTTTAAAAAAGACAATG 0 1 136499 CASAVA_Build 10 70187597 3D TTTGAGAACT AAG/--- AAGGTAGGAT 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 AAG 2 1 136500 CASAVA_Build 10 70190643 3D AACAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 2479 het 57 hom 13 1 6 7 A 14 11 136501 CASAVA_Build 10 70192091 1D27M1D GACTCTGTCT AAAAAAAAAAACAAAACAAAAAACAAACA/-AAAAAAAAAACAAAACAAAAAACAAAC- AAAAAAAAAC 3070 het 1924 hom 18 7 15 3 N/A 0 0 136502 CASAVA_Build 10 70192876 1D TTGTGATTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 9 8 136503 CASAVA_Build 10 70208296 1I ATCCTCTCCT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 0 1 136504 CASAVA_Build 10 70211608 1I GGCAACACTC -/T TGTCTCAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 T 1 2 136505 CASAVA_Build 10 70237770 1D TAGGTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 52 hom 30 1 19 10 T 11 10 136506 CASAVA_Build 10 70239478 3I TTTTTTAATG ---/TCT TCTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 TCT 2 3 136507 CASAVA_Build 10 70267403 1I CCCCCATGGG -/C CTACGGGAGT 3070 hom 94 het 38 0 27 11 C 1 2 136508 CASAVA_Build 10 70277935 1D AGGGACACTA G/- GTCCTGTTGC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 G 2 1 136509 CASAVA_Build 10 70281062 1I GAGACTTTCT -/A AAAAAAAAAA 1979 het 1085 hom 24 7 11 6 A 17 18 136510 CASAVA_Build 10 70286155 3D TCTCCTTCTC CTT/--- CTCCCCGTTT 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 CTT 1 0 136511 CASAVA_Build 10 70302680 1D GTAATTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 11 10 136512 CASAVA_Build 10 70306274 1D AAGAATCAGT A/- AATTAACAAC 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 3 2 136513 CASAVA_Build 10 70313108 1D TGAATTCAGA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 T 8 7 136514 CASAVA_Build 10 70354430 1D TAAAGCTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 A 10 9 136515 CASAVA_Build 10 70360325 7D AGTTATGGTG TAGCCTC/------- TAGCCTCTAC 3070 het 3070 ref 51 22 15 17 TAGCCTC 2 1 136516 CASAVA_Build 10 70362819 4D CATTGCAACA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 39 14 13 12 TTGT 4 3 136517 CASAVA_Build 10 70363401 3D TGTGTGTATT AAA/--- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 A 11 8 136518 CASAVA_Build 10 70364955 8I TACTTCTTAG --------/TCCAGCAT TGTAAATGGG 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 TCCAGCAT 0 1 136519 CASAVA_Build 10 70367161 1D ATTTGTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 14 13 9 A 10 9 136520 CASAVA_Build 10 70375072 1D AATAACAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 T 12 11 136521 CASAVA_Build 10 70380027 2D TGCCTAGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 T 13 11 136522 CASAVA_Build 10 70387540 1I GAGATTATTC -/T TTAATCTATG 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 2 3 136523 CASAVA_Build 10 70388208 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2794 hom 17 8 8 1 T 11 10 136524 CASAVA_Build 10 70395664 2I GCCAAATGTT --/AC AGTCTCTACT 3070 het 3021 hom 32 8 18 6 AC 0 1 136525 CASAVA_Build 10 70412770 3D TTTATTGTTA CTT/--- CTTCATCAGT 3070 het 3070 hom 42 14 23 8 CTT 2 1 136526 CASAVA_Build 10 70426631 1D TAAAATAAAA T/- AAAAAATATT 2002 het 2002 ref 14 9 5 0 T 1 0 136527 CASAVA_Build 10 70429175 1I CTTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 2487 het 2487 ref 18 10 6 2 A 0 1 136528 CASAVA_Build 10 70457855 4D TCTGCTCCAC TGAT/---- TGATTGTGCA 3070 hom 141 het 50 0 48 5 TGAT 2 1 136529 CASAVA_Build 10 70463115 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2957 het 2957 ref 30 17 8 5 A 11 12 136530 CASAVA_Build 10 70483354 1D TAGCTAATTT A/- AAAAATTTTT 3070 hom 61 het 26 0 21 5 A 6 5 136531 CASAVA_Build 10 70498601 1I TTTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 881 hom 46 6 25 15 T 12 13 136532 CASAVA_Build 10 70524262 1I TTTCCTTCCA -/T TTTTTCCCCC 2923 het 2923 ref 22 9 9 4 T 5 6 136533 CASAVA_Build 10 70534290 1D TTATAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 11 10 136534 CASAVA_Build 10 70548557 1D GCCAGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 A 12 11 136535 CASAVA_Build 10 70555086 1D TTCTTAGAGC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 7 6 136536 CASAVA_Build 10 70556006 1D GCGGATCACC T/- TGAAGTCGGG 3070 hom 45 het 17 0 13 4 T 2 1 136537 CASAVA_Build 10 70556328 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 A 23 18 136538 CASAVA_Build 10 70556632 4D TTTTTTCCTC AGTT/---- ATTTTTTTCT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 AGTT 1 0 136539 CASAVA_Build 10 70561708 1D AGCAATTGAT C/- TTTGTCCCTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 C 1 0 136540 CASAVA_Build 10 70562104 1D TTGTTTAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 10 9 136541 CASAVA_Build 10 70572120 1D CTGGCTAATT A/- AAAAAATTTT 3070 het 44 hom 21 1 17 3 A 7 6 136542 CASAVA_Build 10 70574931 1I25M4D CTGAGTAGCT -GGATTACAGGCACCCACGACCACACCTGA/GGGATTACAGGCACCCACGACCACAC---- CTAATTTTTA 3070 hom 81 het 23 0 27 1 N/A 0 0 136543 CASAVA_Build 10 70575485 4D ACTTTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 346 het 346 ref 38 19 2 20 TTTC 1 0 136544 CASAVA_Build 10 70584908 2D TCCTTTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 12 10 136545 CASAVA_Build 10 70588649 5D TCATTTTATC AATTA/----- AATTATATAT 3070 het 3070 hom 32 11 19 7 AATTA 2 1 136546 CASAVA_Build 10 70595600 8D CTCAGCTACT TGGGAGGC/-------- TGAGGCAGAA 3070 hom 63 het 22 0 21 1 TGGGAGGC 1 0 136547 CASAVA_Build 10 70597189 6D CTGCCTCAAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 2528 hom 21 het 11 0 8 3 AAAAAG 3 2 136548 CASAVA_Build 10 70603980 4I CACGGCTCCG ----/TTCT TTAAGTCAGC 3070 hom 63 het 30 0 20 10 TTCT 0 1 136549 CASAVA_Build 10 70613645 1I CCCCAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1224 hom 38 8 19 11 T 14 15 136550 CASAVA_Build 10 70615267 1I CATTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 30 0 17 13 T 15 16 136551 CASAVA_Build 10 70618266 8I CTTGATTTTT --------/TTTGTTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 100 het 41 0 33 8 TTTG 2 4 136552 CASAVA_Build 10 70620192 1D TTGCATTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 51 1 46 4 T 11 10 136553 CASAVA_Build 10 70620763 1D AGGTCTTTAC A/- TTCTTAAATT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 1 0 136554 CASAVA_Build 10 70623021 4D TTAAACAAAT AGGA/---- AGGTACTTTA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 AGGA 1 0 136555 CASAVA_Build 10 70624120 2D AAAAAAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 764 het 764 ref 26 15 3 8 T 12 10 136556 CASAVA_Build 10 70630403 1D AAACTGCATT A/- AAAAAAGCCC 3070 hom 110 het 42 0 36 6 A 7 6 136557 CASAVA_Build 10 70638949 4I TGTGTGTGTG ----/TTTT TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 3 7 136558 CASAVA_Build 10 70641967 1I TTCTAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 600 hom 46 2 33 11 T 10 11 136559 CASAVA_Build 10 70645078 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 9 10 136560 CASAVA_Build 10 70648783 1D GGGAGGATCA C/- CTGAGCCCAG 3070 het 3070 hom 37 19 17 3 C 2 1 136561 CASAVA_Build 10 70652143 2I TGATTAGATT --/CA CAGAGCCCTC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 CA 1 2 136562 CASAVA_Build 10 70665883 1D AGCATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1736 het 1645 hom 28 8 9 11 T 17 16 136563 CASAVA_Build 10 70667586 1D TGCATTCGGC T/- TGGGCTCTAT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 2 1 136564 CASAVA_Build 10 70672047 1D ACCACAGATT G/- GGGGGGCCAC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 G 7 6 136565 CASAVA_Build 10 70674427 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 27 0 20 7 A 12 11 136566 CASAVA_Build 10 70677980 1D GAATAAGCAC T/- TCCCCGAGCC 3070 het 2996 hom 23 11 11 1 T 2 1 136567 CASAVA_Build 10 70681976 1I ATTCTAGGGT -/A AAAAACACCC 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 A 5 6 136568 CASAVA_Build 10 70685679 2D AATCTGTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 27 4 12 12 A 14 12 136569 CASAVA_Build 10 70697045 1D ATTAAGAGAA C/- AAAGACTTTG 3070 het 3070 ref 47 26 17 5 C 1 0 136570 CASAVA_Build 10 70702417 1D TTTCTGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 31 2 24 5 T 13 12 136571 CASAVA_Build 10 70704987 1I ACCAAAAAAC -/A AAAAAACCTT 3070 het 302 hom 16 1 13 2 A 6 7 136572 CASAVA_Build 10 70705161 1D AAAAAAAAAA C/- AACTTAAATT 3070 het 1577 hom 14 4 10 0 C 1 0 136573 CASAVA_Build 10 70717738 1D CTGTGTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2254 het 2254 ref 28 13 8 7 A 16 15 136574 CASAVA_Build 10 70724464 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 8 7 136575 CASAVA_Build 10 70728396 1D TCTTAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 A 10 9 136576 CASAVA_Build 10 70729016 1D CTCACTGCAG C/- CTCCACCCCG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 C 2 1 136577 CASAVA_Build 10 70732142 1D GGTATAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 15 1 8 6 T 13 12 136578 CASAVA_Build 10 70740819 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1795 het 579 hom 12 2 6 4 A 14 15 136579 CASAVA_Build 10 70790802 3I CAGGAGCCTT ---/CTC CTCTTGACTC 3070 het 3070 ref 40 15 16 9 CTC 1 2 136580 CASAVA_Build 10 70800798 2I TGCTAGAGGG --/AA ACAGGAATTT 3070 het 3070 hom 54 16 27 11 A 1 3 136581 CASAVA_Build 10 70804818 1I AAAATGTGGA -/T TTGCCACTTG 3070 het 3070 ref 55 26 19 10 T 2 3 136582 CASAVA_Build 10 70815871 2I ATGTGCCTCA --/TT TGCTCCATCT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 1 3 136583 CASAVA_Build 10 70817306 1I GCCTTGGCCT -/C CCAAAGTGTT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 C 2 3 136584 CASAVA_Build 10 70817637 1I CTGTTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 28 0 23 5 T 10 11 136585 CASAVA_Build 10 70818200 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCTTA 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 CT 2 1 136586 CASAVA_Build 10 70820139 11D CCAGCTACAT TTCATAGCTAC/----------- TTCATAGCTA 3070 hom 57 het 29 0 19 11 TTCATAGCTAC 2 1 136587 CASAVA_Build 10 70827040 1D AGCAGCCCGT G/- AAAGTTCTAG 3070 het 3070 hom 40 15 16 10 G 1 0 136588 CASAVA_Build 10 70830218 1I GTGGGGCGCT -/G GGGGGTCTCA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 G 5 6 136589 CASAVA_Build 10 70831761 1D GGCGGAGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 11 10 136590 CASAVA_Build 10 70840117 1I TATCTCTATT -/A AAAAAAAATT 2192 het 2192 ref 22 12 6 4 A 8 9 136591 CASAVA_Build 10 70847484 1I AGCGGGAGTC -/G GGGGGGGCAT 2874 het 2874 ref 42 17 10 15 G 7 8 136592 CASAVA_Build 10 70854961 3D AAAGCCAGGA ATG/--- ATGATGACAG 2637 hom 36 het 30 0 12 18 ATG 3 2 136593 CASAVA_Build 10 70863245 2I ATCTATATCT --/AC ACACACACAC 3070 hom 48 het 20 0 16 4 AC 5 6 136594 CASAVA_Build 10 70867731 4D TGTCAGTAGT TTGA/---- TTGAATTAGA 3070 het 3070 hom 47 21 19 10 TTGA 2 1 136595 CASAVA_Build 10 70874782 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 21 0 17 4 A 14 12 136596 CASAVA_Build 10 70884278 1D GACTCGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 A 11 10 136597 CASAVA_Build 10 70888019 3I GACAGTTTCC ---/AGG AGGAGATTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AGG 1 2 136598 CASAVA_Build 10 70888971 2D CAGGAGCATT CA/-- GTCTTAACCA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 CA 1 0 136599 CASAVA_Build 10 70889311 4D CATCCCAGGC AGAG/---- AGAGCCATGA 3070 hom 96 het 35 0 31 5 AG 4 2 136600 CASAVA_Build 10 70889568 3D CTCCGAGATG CCT/--- CCTCTGTGGG 3070 hom 69 het 25 0 23 3 CCT 2 1 136601 CASAVA_Build 10 70891524 1D TGCAGTAGGG T/- TGGGGTGCTG 2698 hom 31 het 13 0 9 5 T 2 1 136602 CASAVA_Build 10 70894080 4D CCAACTGAGC AGGG/---- AGGGCCCTGA 3070 hom 57 het 20 0 20 2 AGGG 2 1 136603 CASAVA_Build 10 70894979 11D GCTCTGGGCT TCCCCTGGGGG/----------- TGGCAGTGGC 3070 het 3070 ref 37 16 12 14 TCCCCTGGGGG 1 0 136604 CASAVA_Build 10 70895622 1D CTCTGATCCT C/- CCCGAAGCTC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 C 4 3 136605 CASAVA_Build 10 70897650 1D TCTTTTTCAT A/- AAAAATGTCC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 6 5 136606 CASAVA_Build 10 70910100 1I AGAAGAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 10 11 136607 CASAVA_Build 10 70912455 2D32M1D TCAGATGAGA ACACAGACTCACATGGTCAAATGCCTGTCCAAGGC/--ACAGACTCACGTGGTCAAATGCCTGTCCAAGG- CCAGGGTTAG 3070 hom 72 het 30 0 25 12 N/A 0 0 136608 CASAVA_Build 10 70915539 1D GGGAGGCTGT G/- GGGGGTCATC 3070 hom 125 het 47 0 39 8 G 6 5 136609 CASAVA_Build 10 70921293 12I CCTGGATAAT ------------/TGTGTGTGTTTG TGTGTGTGTT 3070 hom 52 het 22 0 18 4 TGTGTGTGTTTG 1 2 136610 CASAVA_Build 10 70932339 1D CCCTGGTCTT G/- GGGCCTGTGA 3070 het 2402 hom 30 8 15 8 G 4 3 136611 CASAVA_Build 10 70933952 1D45M1I TGCTAGTGGA GGGGTGGTTCTCCCAGGTAAAAGTCATGGAACCTGCATTCCTACAG-/-GGGTGGTTCTCCCAGGTAAAAGTCATGGAACCTGCATTCCTACAGT TTTTTTCACG 3070 het 3070 ref 26 19 10 9 N/A 0 0 136612 CASAVA_Build 10 70935287 13D30M1D CCTAGTAGTA CTTCTGGAAAATTCTTTGTATATTAAAACCAATGCAGAAATGCT/-------------CTTTGTATATTAAAACCAATGCAGAAATGC- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 24 14 12 N/A 0 0 136613 CASAVA_Build 10 70939196 1D GGTTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1849 hom 22 9 12 1 T 12 11 136614 CASAVA_Build 10 70943369 3I ATGCGTGATG ---/CTT CTTCTGGTGT 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 CTT 1 2 136615 CASAVA_Build 10 70948188 1I AAACTCTTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 8 9 136616 CASAVA_Build 10 70949506 1I ATTGTAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2477 hom 28 7 18 3 T 10 11 136617 CASAVA_Build 10 70950756 8D GTTATTTTCC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTGG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 T 16 8 136618 CASAVA_Build 10 70952206 1I ACCAGATTGC -/T TTTTTTTTTT 3037 het 3037 ref 24 10 8 6 T 11 12 136619 CASAVA_Build 10 70954403 1D TGCAAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 13 12 136620 CASAVA_Build 10 70954546 2D TATATGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 33 0 22 11 T 14 12 136621 CASAVA_Build 10 70957358 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 19 1 14 5 A 13 14 136622 CASAVA_Build 10 70959197 4I ATTATATCTC ----/AATT AATTAAACTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AATT 1 2 136623 CASAVA_Build 10 70961677 4D CATAGCTGCA AAAC/---- AAACAAACAA 796 het 796 ref 40 19 5 16 AAAC 4 3 136624 CASAVA_Build 10 70963431 1I ATGGAAAAAG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 6 7 136625 CASAVA_Build 10 70966748 1D CTACATCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1722 hom 25 5 10 10 A 16 15 136626 CASAVA_Build 10 70975763 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 A 7 8 136627 CASAVA_Build 10 70980392 3I AAATGGAAGT ---/ATC ATGTTGTAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATC 0 1 136628 CASAVA_Build 10 70990661 1I ACTCCACCTC -/T TACTGGGTAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 T 1 2 136629 CASAVA_Build 10 71011219 1D ATGCTCTGTC A/- CCCTTTGGAG 2609 het 2609 ref 34 24 8 2 A 1 0 136630 CASAVA_Build 10 71038159 1D GCCTAACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1273 hom 19 5 10 4 T 15 14 136631 CASAVA_Build 10 71038766 2D GTTCTCTGTC AA/-- AGACTCTGCT 3070 het 3070 ref 37 18 12 10 A 3 1 136632 CASAVA_Build 10 71040491 1D AAGGACTAAC A/- TTACCTGACT 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 A 1 0 136633 CASAVA_Build 10 71045090 1D TACTAAATAC A/- ATTTAAGATA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 2 1 136634 CASAVA_Build 10 71061726 11I TGCAGAGAGC -----------/TGGGTAAGACT TGGGGAAGAT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 TGGGTAAGACT 0 1 136635 CASAVA_Build 10 71064704 2D TAGCCGGCCT AA/-- GAGGCAGGGC 3070 het 3010 hom 26 10 13 3 A 2 0 136636 CASAVA_Build 10 71067426 1I TCACTTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 12 13 T 11 12 136637 CASAVA_Build 10 71068775 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 T 6 5 136638 CASAVA_Build 10 71072265 3I6M2I TGATTGGGTG ---CCTACC--/TACCCCACCCA ATGTACCAGG 3070 hom 108 het 38 0 36 6 N/A 0 0 136639 CASAVA_Build 10 71072380 1D TGAACTCACT C/- AGCTGTTAAG 3070 hom 121 het 44 0 35 9 C 1 0 136640 CASAVA_Build 10 71073212 1I CCACCAGGTG -/A AGAAGCTCCA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 1 2 136641 CASAVA_Build 10 71089801 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 20 0 9 11 T 12 11 136642 CASAVA_Build 10 71099970 3D AGGTATCAAA GAG/--- GCCCTCCAGA 3070 het 3070 hom 64 22 36 7 GAG 1 0 136643 CASAVA_Build 10 71108871 1D CTAAAAGTAC A/- AAAAAAAAAA 2496 hom 19 het 8 0 7 2 A 11 10 136644 CASAVA_Build 10 71117627 18I CCAGAGAGGA ------------------/GGAGGGCGTCAAGCTGGT GGCTGGCTGG 3070 hom 90 het 37 0 29 8 GGAGGGCGTCAAGCTGGT 0 1 136645 CASAVA_Build 10 71131918 1I TGCCTTTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 8 9 136646 CASAVA_Build 10 71134365 1D TAAGAACCCC T/- TTCCCCTCTC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 3 2 136647 CASAVA_Build 10 71135182 1I CGAAGTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 11 12 136648 CASAVA_Build 10 71137047 1D TCTTTGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2135 hom 34 9 12 13 T 17 16 136649 CASAVA_Build 10 71138963 3D CAGAGAAAAC AGA/--- AGATCATTCC 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 AGA 2 1 136650 CASAVA_Build 10 71149366 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1226 hom 12 3 7 2 A 13 12 136651 CASAVA_Build 10 71157101 2D TCTTGCAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 1759 het 934 hom 31 7 7 17 T 18 16 136652 CASAVA_Build 10 71164283 4D CATGCACACA CACT/---- CACACACAGA 3070 het 3070 ref 75 34 31 12 CACT 1 0 136653 CASAVA_Build 10 71166386 1I TCTTAAACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 A 12 13 136654 CASAVA_Build 10 71168525 1I GTTGTGCTAT -/A GGAAATTAAA 3070 hom 123 het 48 0 40 8 A 0 1 136655 CASAVA_Build 10 71170250 1D TTCCCTCTGT G/- GGCCTCAGTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 G 3 2 136656 CASAVA_Build 10 71170513 7D GAGATATTTG TTGGTGA/------- TTGGTGATCT 3070 het 3070 ref 44 23 18 8 TTGGTGA 2 1 136657 CASAVA_Build 10 71177455 19D ACAAGGCACT CAGGGGTGCAAGGGGTGGC/------------------- CAGGGGTGCA 3070 het 3070 hom 33 14 11 12 CAGGGGTGCAAGGGGTGGC 2 1 136658 CASAVA_Build 10 71178515 1I CCTCTCCTTA -/C CCCCATTCCA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 C 4 5 136659 CASAVA_Build 10 71180933 1I AAATGACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 9 10 136660 CASAVA_Build 10 71183545 1I ACAGTCACAC -/A ACTGGAGTGG 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 1 2 136661 CASAVA_Build 10 71184368 1I ACTTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 1406 het 1406 ref 42 32 4 6 A 10 11 136662 CASAVA_Build 10 71201365 1D TGCACAGGGA G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 120 het 49 0 39 10 G 9 8 136663 CASAVA_Build 10 71217680 1D CGCTCCCCCC T/- GGGGTAGCCT 3070 hom 120 het 45 0 40 8 T 1 0 136664 CASAVA_Build 10 71220739 25I TTTGTTCTCT -------------------------/CTGTCTGTACCCCCAACACCCTGCC CTTTCTAGGT 3070 hom 153 het 51 0 51 3 CTGTCTGTACCCCCAACACCCTGCC 0 1 136665 CASAVA_Build 10 71221739 21D ATCACCACCA CCACCACCGTCACCACCATCT/--------------------- CCACCACCAT 2947 het 2947 ref 60 28 10 36 CCACCACCGTCACCACCATCT 1 0 136666 CASAVA_Build 10 71227380 1I ACAAGCAAAC -/A AAAAAACAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 3 A 6 7 136667 CASAVA_Build 10 71245650 1I AAAAATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 10 11 136668 CASAVA_Build 10 71249870 1D CTCCTGGTAT A/- AAAAAACCAC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 A 7 6 136669 CASAVA_Build 10 71260356 6D TAAAGAAATG ATGGAA/------ ATGGTAAACA 3070 het 3070 ref 39 24 12 5 ATGGAA 1 0 136670 CASAVA_Build 10 71266803 18D AGACCTGCCT GTTTGTGGTCATGGAGGG/------------------ GTCTCCATGC 1839 het 1839 ref 25 19 8 7 GTTTGTGGTCATGGAGGG 1 0 136671 CASAVA_Build 10 71267575 1D CGCAGAGAAG A/- AGACAGATTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 2 1 136672 CASAVA_Build 10 71269515 3I GAAGAAGAGA ---/AAG AAGGTCAGAG 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 AAG 1 2 136673 CASAVA_Build 10 71272984 1D ACATGATAGC T/- GGTGTGATGA 3070 het 3070 ref 45 23 12 10 T 1 0 136674 CASAVA_Build 10 71280518 1I GCAACAGACC -/T GGGCAAAGGA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 0 1 136675 CASAVA_Build 10 71290443 1I CTGGGCAGAA -/C CCTGCAGCCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 2 3 136676 CASAVA_Build 10 71294080 4I AGTAAATGTC ----/GATT GATTGAATGA 3070 hom 141 het 56 0 47 9 GATT 1 2 136677 CASAVA_Build 10 71299099 1D CTTTGCCCAG T/- GCTGGCTGAA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 1 0 136678 CASAVA_Build 10 71299948 1D TATATATATA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 8 7 136679 CASAVA_Build 10 71300038 1I AAACCTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1867 hom 17 5 12 1 T 9 10 136680 CASAVA_Build 10 71317203 1D GTGTCTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1953 hom 33 11 16 8 T 12 11 136681 CASAVA_Build 10 71319473 8D GTCGGTGTCC AGCTTACT/-------- GCTCTCAAAC 3070 het 3070 ref 51 27 21 7 AGCTTACT 1 0 136682 CASAVA_Build 10 71356912 1D GGCACTGGAC G/- GGGGGGCTGG 3070 het 2302 hom 23 8 9 6 G 7 6 136683 CASAVA_Build 10 71378104 1I GTGAATTCCA -/T TCTCTTCAAC 3070 het 3070 hom 55 24 24 7 T 1 2 136684 CASAVA_Build 10 71411879 2D TTCTAAACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 12 10 136685 CASAVA_Build 10 71415736 1I GGTTTCATTC -/A CTGTGTCCAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 136686 CASAVA_Build 10 71417431 1I AAATTTAATA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 6 7 136687 CASAVA_Build 10 71421844 1I AATTTATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 9 10 136688 CASAVA_Build 10 71435540 1D ACCAGTTTAG C/- AAAACAGTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 C 1 0 136689 CASAVA_Build 10 71437383 1D CTTTTTGTTG T/- TTTTTTAGAT 3070 het 3070 ref 54 27 20 7 T 7 6 136690 CASAVA_Build 10 71440918 1D TAGATATGAG C/- CCAACTATAT 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 C 3 2 136691 CASAVA_Build 10 71441890 4I ATTTATTTAT ----/TTAC TTACTTATTT 2121 het 2121 ref 22 13 6 3 TTAC 1 2 136692 CASAVA_Build 10 71444648 1D ATCCAAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 A 11 10 136693 CASAVA_Build 10 71448196 1I AGGAGTTAGA -/G GGGAGGGAGG 2479 het 2479 ref 39 27 7 5 G 3 4 136694 CASAVA_Build 10 71451401 1D GATAAAGAGT G/- ACATTATATA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 G 1 0 136695 CASAVA_Build 10 71459611 3D AGACTACAAC AAT/--- GTGTTGAACT 3070 het 3070 ref 39 21 18 1 AAT 1 0 136696 CASAVA_Build 10 71465627 1I TTCTATCAAA -/G GGGTGGGAGA 3070 het 2703 hom 31 8 15 8 G 3 4 136697 CASAVA_Build 10 71469761 1I CACTTTGGGA -/G GCAGAGGCAG 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 G 1 2 136698 CASAVA_Build 10 71475747 8I CAGTCATTAA --------/AAAGAAGG AAAGAAGGAA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 AAAGAAGG 1 2 136699 CASAVA_Build 10 71478870 1D CTGCGTGTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 441 hom 36 1 26 10 T 10 9 136700 CASAVA_Build 10 71485311 5I GAAAGAAATG -----/AAATA AAATATAAGG 3070 het 3070 hom 48 16 21 11 AAATA 1 2 136701 CASAVA_Build 10 71500841 2I ATGTGCATGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 47 15 10 22 GT 8 9 136702 CASAVA_Build 10 71506758 4D GCATCATGAG CCTT/---- CCTTCCTCTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 CCTT 2 1 136703 CASAVA_Build 10 71509434 7D TAGGTAGAGA TCAGTTG/------- TCAAGGAGCA 3070 het 3070 ref 30 17 12 5 TCAGTTG 1 0 136704 CASAVA_Build 10 71512179 1D AAACTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2918 hom 22 9 8 5 A 14 13 136705 CASAVA_Build 10 71515764 2D TTGCTTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 2395 het 2395 ref 21 12 6 3 T 13 11 136706 CASAVA_Build 10 71556685 1I CCCAAGACAA -/G CCCCCCGGCA 2851 het 2851 ref 43 21 9 13 G 0 1 136707 CASAVA_Build 10 71578781 1I TCAAACAAAA -/C CAACTCATTT 3070 hom 119 het 46 0 38 8 C 1 2 136708 CASAVA_Build 10 71584234 1I TCCTGTCCTC -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 35 9 14 12 A 7 8 136709 CASAVA_Build 10 71584575 1D ATAAGTGTCA C/- AATGAATGGG 3070 het 3070 hom 51 20 26 7 C 1 0 136710 CASAVA_Build 10 71592320 4D GAAACTAATA TTCT/---- TTCTTGACAC 2725 het 2398 hom 12 5 6 2 TTCT 2 1 136711 CASAVA_Build 10 71600880 1I TTACAGAGAC -/A AGGTTTCACC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 2 136712 CASAVA_Build 10 71602507 1D TGGCGAATCA C/- AAGGTCAGGA 3070 het 2314 hom 21 7 11 3 C 1 0 136713 CASAVA_Build 10 71602726 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1040 het 1040 ref 20 6 6 8 A 18 16 136714 CASAVA_Build 10 71605788 9D CATGGCTGGT CACGGTGGC/--------- CACCATGCCC 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 CACGGTGGC 1 0 136715 CASAVA_Build 10 71614168 1I AACCTTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 13 14 136716 CASAVA_Build 10 71637698 1I CTCACGCCTG -/T TAATCCCACC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 1 2 136717 CASAVA_Build 10 71640534 2I CTCCAATTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 21 0 12 9 T 12 14 136718 CASAVA_Build 10 71654976 4D CCCACCACTC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 TTAT 5 4 136719 CASAVA_Build 10 71660228 1D ACAGTACACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 10 9 136720 CASAVA_Build 10 71665394 1D CAAATCTAGT G/- GCACTTTTCA 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 G 2 1 136721 CASAVA_Build 10 71681383 1D CCTCTGGCCC T/- TTTCCCCCAT 2687 het 2687 ref 40 19 10 12 T 4 3 136722 CASAVA_Build 10 71687789 1D TGAAATAATG A/- AAATAATAAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 4 3 136723 CASAVA_Build 10 71698501 1I GAAGCTACAA -/G CTTCTTAAGT 3070 hom 120 het 46 0 39 7 G 0 1 136724 CASAVA_Build 10 71707694 1I TCTAGATGTT -/G GGGGAAGACT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 G 4 5 136725 CASAVA_Build 10 71713262 4D GCACCCCAGG TCTC/---- TCTCCCTCAC 2629 het 2284 hom 20 8 7 6 TC 4 2 136726 CASAVA_Build 10 71722333 4I GGAACTCCAG ----/CTCT CTGTCTTAGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 CT 1 3 136727 CASAVA_Build 10 71748520 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 21 0 10 11 A 12 11 136728 CASAVA_Build 10 71751637 1D ATGACCATTC T/- TGGTAAGAAG 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 2 1 136729 CASAVA_Build 10 71751888 1I TCCCTTATCT -/G GGCAAAAGCC 3070 hom 84 het 30 0 25 5 G 2 3 136730 CASAVA_Build 10 71753895 2D GCCAGGAAGG CA/-- CAGAGGAAGC 1662 het 1662 ref 16 9 5 2 CA 2 1 136731 CASAVA_Build 10 71757127 1D ACTTGAGATC A/- AGAGTTCGAG 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 2 1 136732 CASAVA_Build 10 71758046 7D AAGGGTAATC TTTGTTT/------- TTTGTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 22 15 TTTGTTT 2 1 136733 CASAVA_Build 10 71768089 3D AATGCCCACA CCT/--- CCTCTAGGAA 3070 het 3070 ref 53 22 21 11 CCT 2 1 136734 CASAVA_Build 10 71778900 3I GCACAGACAG ---/TGC TATATAGTTC 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 TGC 0 1 136735 CASAVA_Build 10 71780949 1D TCTCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 14 12 A 12 11 136736 CASAVA_Build 10 71781888 1D GACATGCTTT G/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 39 23 15 3 G 1 0 136737 CASAVA_Build 10 71783115 1I27M8D TGATCTCAGC -TTGTCATGCATTAACTCAGTTAACCCCCACAACAT/ATTGTCATGCATTAACTCAGTTAACCCC-------- CACAACATCC 3070 het 3070 ref 28 19 11 4 N/A 0 0 136738 CASAVA_Build 10 71785660 3I CTCTGACAAA ---/CGC CGCACACACG 3070 hom 84 het 31 0 27 4 CGC 1 2 136739 CASAVA_Build 10 71792499 1D AGGGGGGCAG T/- TTTGCCCCCA 3070 het 2223 hom 28 8 16 4 T 4 3 136740 CASAVA_Build 10 71792884 1D AAAAAAAAAA T/- TTTAAATTAG 3070 hom 54 het 19 0 18 1 T 4 3 136741 CASAVA_Build 10 71793602 1I CTCCAAGTCA -/C ACCCCCAACA 3070 hom 99 het 38 0 30 8 C 0 1 136742 CASAVA_Build 10 71799639 1D GTCAGGAGTT C/- GAGACCAGCC 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 C 1 0 136743 CASAVA_Build 10 71800594 5D ACAGCCTAGG CAACA/----- CAGTGAGACC 3070 het 3070 hom 35 11 18 9 CAACA 1 0 136744 CASAVA_Build 10 71803011 1I TCAATTACCA -/C CTCCTCCAGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 1 2 136745 CASAVA_Build 10 71805242 2I CCTGGACCAC --/CT CTCTCTGCCT 3070 hom 110 het 43 0 35 8 CT 3 4 136746 CASAVA_Build 10 71805540 3I CACACACAGG ---/CAC ACACACAGGT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 CAC 0 1 136747 CASAVA_Build 10 71807811 4D TGAGGATTGA GAGC/---- ACAAAATGTA 3070 hom 151 het 53 0 51 5 GAGC 1 0 136748 CASAVA_Build 10 71813154 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 10 11 136749 CASAVA_Build 10 71815197 1D ACCAGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2609 hom 27 9 11 7 A 13 12 136750 CASAVA_Build 10 71815871 1I CATCCACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 30 0 23 7 A 11 12 136751 CASAVA_Build 10 71820395 1I AATATCTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 28 1 21 6 A 10 11 136752 CASAVA_Build 10 71822145 3D AAAAAAATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1848 het 634 hom 18 4 7 7 T 17 14 136753 CASAVA_Build 10 71823434 1D TTGTATTTTT A/- GTAGAGATGG 3070 het 1151 hom 18 4 13 1 A 1 0 136754 CASAVA_Build 10 71823975 1D GCCAAGCCCT G/- GGGGTGGCTC 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 G 5 4 136755 CASAVA_Build 10 71824964 1I AGGAGTCTTG -/C TCTGTCACCC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 0 1 136756 CASAVA_Build 10 71864646 3D GAAGCTTGAG AGA/--- ATAAGCAACC 3070 het 3070 ref 57 28 21 10 AGA 1 0 136757 CASAVA_Build 10 71877426 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 23 1 16 6 A 11 12 136758 CASAVA_Build 10 71879545 3D AGACATAATC TAT/--- TATTCTATAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 TAT 2 1 136759 CASAVA_Build 10 71903654 2D AGGTGATCCA CC/-- CCCCCCCCCT 2096 het 118 hom 15 1 6 8 C 11 9 136760 CASAVA_Build 10 71905322 2D GATGTCAGGG AA/-- GAGTGGGGAG 3070 hom 161 het 60 0 49 11 A 2 0 136761 CASAVA_Build 10 71906668 3D TGTATGTGTG TAT/--- TATGTGCATA 3070 hom 154 het 55 0 52 3 TAT 2 1 136762 CASAVA_Build 10 71906798 6D TGTGTGCATA CACATG/------ CACATGTATG 3070 hom 144 het 49 0 49 4 CACATG 2 1 136763 CASAVA_Build 10 71907680 1I CGAGGAAGCA -/C CAGCGAAGAG 3070 hom 36 het 17 0 13 4 C 1 2 136764 CASAVA_Build 10 71914935 2I TAAAGTTAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 35 0 23 12 T 12 14 136765 CASAVA_Build 10 71917063 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTGT 2099 hom 21 het 9 0 8 1 T 6 7 136766 CASAVA_Build 10 71917891 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 11 10 136767 CASAVA_Build 10 71921181 2I CCCCACCTGC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 9 11 136768 CASAVA_Build 10 71926087 1I TTGATGAATT -/G GCTACGGTTG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 G 1 2 136769 CASAVA_Build 10 71926781 1D TATTTCCAAG T/- CTCGTTTCAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 1 0 136770 CASAVA_Build 10 71928349 1D TCCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 12 8 T 13 12 136771 CASAVA_Build 10 71928692 1D CTTTATCTCA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 17 1 G 1 0 136772 CASAVA_Build 10 71931474 4I AAAATAAAGA ----/TATC TATCCAGGAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TATC 1 2 136773 CASAVA_Build 10 71941021 4D TTTCTTCGTC CTGT/---- CTAAGCCCAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 CTGT 1 0 136774 CASAVA_Build 10 71944218 1I CCCAGCCCCC -/A AGACAGCTTT 2864 het 2864 ref 18 10 7 1 A 1 2 136775 CASAVA_Build 10 71947105 1D TAAGTGTTCA T/- TTTTTTTTTT 2293 het 1168 hom 20 4 7 9 T 17 16 136776 CASAVA_Build 10 71951461 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 9 8 136777 CASAVA_Build 10 71957907 1I ATTCCATGGT -/G GTATATGAAG 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 G 1 2 136778 CASAVA_Build 10 71965430 10D TCTCCTCCTC CTTCTCCTTT/---------- CTTCTCCTTT 2888 het 2888 ref 28 15 8 6 CTTCTCCTTT 2 1 136779 CASAVA_Build 10 71966091 1D AACCCAAACC A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 8 7 136780 CASAVA_Build 10 71968381 3D CTGGTACCTT CTC/--- CTCAGTCTCA 3070 het 3070 ref 35 19 10 8 CTC 2 1 136781 CASAVA_Build 10 71981072 1I AACCAGAAGT -/C CCCAGGTGGC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 C 3 4 136782 CASAVA_Build 10 71981670 2I AGAGTCTCCC --/AG AGTCTCCCAG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 AG 1 2 136783 CASAVA_Build 10 71985785 4D AACAAAAACC CTGG/---- CTGCCAAAGT 3070 het 3070 hom 29 8 18 6 CTGG 1 0 136784 CASAVA_Build 10 72011006 1D TAAAGCTATT C/- TCCTGCCTCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 1 0 136785 CASAVA_Build 10 72013806 1I AGACGTAATT -/A GGGGAGAAAG 3070 hom 93 het 43 0 32 11 A 0 1 136786 CASAVA_Build 10 72015392 4I GAGCTGGCAC ----/TGTA TGCCACCTGT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 TGTA 0 1 136787 CASAVA_Build 10 72018307 1I CATTAAAAGT -/A AAGTAATTGT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 2 3 136788 CASAVA_Build 10 72025632 2D TCAAACAAAC AA/-- GGGGGCCTCG 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 A 2 0 136789 CASAVA_Build 10 72032359 1D TCAGCCTCTT C/- CCCTCCACCC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 C 4 3 136790 CASAVA_Build 10 72035368 10D ATTCAAGTCC TTTGCCCCTA/---------- TTTTGAACTG 3070 het 3070 ref 38 22 13 7 TTTGCCCCTA 1 0 136791 CASAVA_Build 10 72044853 1I GCCACTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 293 hom 36 2 25 9 T 11 12 136792 CASAVA_Build 10 72045431 2D TATGTGTAAA CT/-- CTGTTTCATT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 CT 2 1 136793 CASAVA_Build 10 72049412 2I TTAAAGAAAA --/AG AAGTTGATTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AG 0 1 136794 CASAVA_Build 10 72055714 1D CCTCCCTTTT A/- AGAGTTTAGG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 2 1 136795 CASAVA_Build 10 72059923 1I GGGCTATCAT -/A AAAAAAAAAA 2449 het 2449 ref 28 14 6 8 A 10 11 136796 CASAVA_Build 10 72061898 1D GCTCATACCT G/- TAATCTCAGC 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 G 1 0 136797 CASAVA_Build 10 72072074 1D CTGTGGGATT G/- GGTGGTGATA 1351 hom 7 het 4 0 3 1 G 3 2 136798 CASAVA_Build 10 72083610 2I ACTTACTAGC --/TG TGTGTGGCTT 3070 het 3070 hom 46 22 23 1 TG 3 4 136799 CASAVA_Build 10 72095999 6I2M4I ACAAAAATTA ------CA----/GCCAGGCATGGT GGCCCATGCC 2367 het 748 hom 8 2 5 3 N/A 0 0 136800 CASAVA_Build 10 72105893 1D CACGATGAGG T/- TTTTTTTTTT 1550 het 1550 ref 33 14 9 10 T 15 14 136801 CASAVA_Build 10 72110074 5D AGGCAGGAGA ATCGC/----- ATCGCTTGAA 2421 het 2421 ref 15 8 6 2 ATCGC 2 1 136802 CASAVA_Build 10 72127536 4I GGCTTACACC ----/TGAA CTGAGGGGCT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 TGAA 0 1 136803 CASAVA_Build 10 72161026 1D CATGCATGCA C/- AGGCACTCAC 3070 het 3070 hom 70 28 34 9 C 1 0 136804 CASAVA_Build 10 72166035 1D GTGCTGGGGT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 G 8 7 136805 CASAVA_Build 10 72167855 1I TGTAAAATCT -/C CCCCAGGTGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 4 5 136806 CASAVA_Build 10 72178486 4D GACTGGCACA TAGT/---- TAGTGTTCTC 3070 het 3070 ref 40 22 17 2 TAGT 2 1 136807 CASAVA_Build 10 72182218 8I CCTGCCAGCC --------/CCCAGCCA CCCAGCCATG 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 CCCAGCCA 1 2 136808 CASAVA_Build 10 72189866 3D TCCAGGTGAC GCT/--- GCTGCTGCTG 3070 hom 66 het 28 0 23 6 GCT 4 3 136809 CASAVA_Build 10 72194133 1I GTAGGGGTCT -/G GGGGGGAGGA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 G 6 7 136810 CASAVA_Build 10 72203228 1I AAAATACAGG -/C CCCCCCCGGC 3070 het 2998 hom 26 8 13 5 C 7 8 136811 CASAVA_Build 10 72210039 3I TGCACTTGAG ---/GAC GACCCTTCTG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 GAC 1 2 136812 CASAVA_Build 10 72214787 1D TAAGCCACCA G/- GGGGTCATAA 3070 hom 111 het 43 0 36 7 G 5 4 136813 CASAVA_Build 10 72227492 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAGAATCA 3070 hom 63 het 25 0 20 5 AG 0 1 136814 CASAVA_Build 10 72233405 1I CTCTATGTGA -/C CTTAAACCAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 1 2 136815 CASAVA_Build 10 72236214 1I AGGCTGTTGT -/A AACAAAGTGC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 2 3 136816 CASAVA_Build 10 72245266 1D TTTTTGGGGT G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 57 het 28 0 21 7 G 9 8 136817 CASAVA_Build 10 72265679 1D CTTACACTCA G/- GGGCCCTAGG 3070 hom 93 het 33 0 32 3 G 4 3 136818 CASAVA_Build 10 72269110 2I GGGCAAATAA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 11 136819 CASAVA_Build 10 72276152 1D ACTTTTCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 10 9 136820 CASAVA_Build 10 72285728 1I TAGGAGCCAA -/T CCAGGAGCCA 3070 hom 109 het 41 0 37 6 T 0 1 136821 CASAVA_Build 10 72293835 1D TAGGTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 T 12 11 136822 CASAVA_Build 10 72300271 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 719 hom 25 3 18 4 A 14 13 136823 CASAVA_Build 10 72305150 2D CCTTCATTTA TT/-- TTTTTGTTTT 3070 hom 111 het 43 0 37 8 T 7 5 136824 CASAVA_Build 10 72312974 1D CACCATTAAT C/- ACTTGCGTTC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 1 0 136825 CASAVA_Build 10 72319082 2D TCGAAAGTAC GT/-- ATGTTTTAAT 3070 het 3070 hom 51 22 25 7 GT 1 0 136826 CASAVA_Build 10 72319965 1I ACATTTCACA -/T TTTTTCTATT 3070 hom 59 het 25 0 19 6 T 5 6 136827 CASAVA_Build 10 72321748 1I TAGTGCTCTC -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 8 136828 CASAVA_Build 10 72323412 1I GTCACTCCCA -/G GGCACGCACA 3070 hom 87 het 35 0 28 7 G 2 3 136829 CASAVA_Build 10 72331630 1D TGAATTTTTT C/- CCCCAGGGGA 3070 het 3070 ref 35 17 11 8 C 5 4 136830 CASAVA_Build 10 72332992 1D AAGATTGGGC G/- GGGGGGATGA 1820 het 1820 ref 25 10 6 10 G 7 6 136831 CASAVA_Build 10 72333792 1D TTTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 32 het 14 0 11 3 A 10 9 136832 CASAVA_Build 10 72336063 1D TTTCCCTGCA G/- GCAGGTGTAA 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 G 2 1 136833 CASAVA_Build 10 72340255 1I TAAACAACCA -/G GGCTCAGGTG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 G 2 3 136834 CASAVA_Build 10 72371860 1I CACCTCTTCA -/T TGCCATGATT 3070 het 2240 hom 33 9 17 7 T 1 2 136835 CASAVA_Build 10 72384706 1D AAGGCCCAGA G/- GGGGTTACTG 3070 het 3070 hom 50 18 24 9 G 5 4 136836 CASAVA_Build 10 72389944 15I TTTGTCCCAT ---------------/GTTTCCAGGGTCAAG GTTATGATAT 3070 het 3070 ref 55 31 17 8 GTTTCCAGGGTCAAG 0 1 136837 CASAVA_Build 10 72390166 4D47M2D31M8D AGTGCATGTG GGTCTGAGTGTGAGTGTGCGAGTATGTGTGTGTAAGAGTATGTATATGTGTGAGTGTGAGAATGTGTGTGAGAATTGTGTGTGAGAGCATGT/----TGAGTGTGAGTGTGCGAGTATGTGTGTGTAAGAGTATGTATATGTGT--GTGTGAGAATGTGTGTGAGAATTGTGTGTGA-------- GTGAGAATTG 3070 het 3070 ref 47 35 16 52 N/A 0 0 136838 CASAVA_Build 10 72390542 2D GCATGTGAGC GT/-- GTGTGTGTGA 3070 hom 198 het 81 0 65 18 GT 5 4 136839 CASAVA_Build 10 72390706 2D5M2D22M4D GAGAGTGTGT GAGAGTAGTGTGTGTGAGTGTGTGAGATAATGTAA/--GAGTA--GTGTGTGAGTGTGTGAGATAAT---- GTGTGTGAGA 1608 het 1608 ref 56 32 9 34 N/A 0 0 136840 CASAVA_Build 10 72390883 4D30M2I GTGTGAGAGA ATGTGTGAGTGTGTGAGAGAATGTGTGAGTGTGT--/----GTGAGTGTGTGAGAGAATGTGTGAGTGTGTGA GAGTGTGTAT 3070 hom 114 het 47 0 33 28 N/A 0 0 136841 CASAVA_Build 10 72400307 1I CTTCCCCTCC -/A AACATGCCCA 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 A 2 3 136842 CASAVA_Build 10 72408313 1I ACCTAAGTGT -/C CCCCCTCAGG 3070 hom 72 het 25 0 23 2 C 5 6 136843 CASAVA_Build 10 72408394 1D CTGGCCTCCA G/- TGCCAATTTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 G 1 0 136844 CASAVA_Build 10 72410058 1I AAAATTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 10 11 136845 CASAVA_Build 10 72410506 2I TGATATTGTT --/TC ATGATATTAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 TC 0 1 136846 CASAVA_Build 10 72412583 1I CAGAGTCCTT -/C CCAGGTCTTG 3070 hom 96 het 38 0 31 7 C 2 3 136847 CASAVA_Build 10 72415983 1I TCCTCCCGGG -/A GAGCCTCCCC 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 A 0 1 136848 CASAVA_Build 10 72416707 5D GAAGTGAAAA GAAAC/----- AAACAGGTGA 2215 het 2215 ref 26 18 6 4 GAAAC 1 0 136849 CASAVA_Build 10 72418375 13I AGTGACGTCA -------------/GTAGGCCTCCTCC TGGCCGCTCC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 GTAGGCCTCCTCC 0 1 136850 CASAVA_Build 10 72425087 1I TGGAGAAGGA -/C TGTGCCACTT 3070 het 3070 hom 49 24 20 5 C 0 1 136851 CASAVA_Build 10 72430762 1D TGTCCATTAC A/- AAAAAGAGAA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 A 6 5 136852 CASAVA_Build 10 72451657 1I TATTAGAACC -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 7 8 136853 CASAVA_Build 10 72467301 2I TTACCTTTTC --/TA TGTTTAGGTA 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 TA 0 1 136854 CASAVA_Build 10 72487649 1D ACAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1839 hom 22 9 12 2 A 17 16 136855 CASAVA_Build 10 72524300 24D CCAGCAAGCT CCCAGCTGACGTGGATGCTTCTGA/------------------------ TCCAGATGAC 3070 het 3070 ref 44 23 20 8 CCCAGCTGACGTGGATGCTTCTGA 1 0 136856 CASAVA_Build 10 72528136 17D5M13D AAATTCAAAT TGCCTTTTTTTTTTGTGGAAATGGACAAGCTGATC/-----------------GAAAT------------- CTAAAATTCA 3070 het 3070 ref 28 27 8 3 N/A 0 0 136857 CASAVA_Build 10 72531574 1I TGCCATGTGG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 6 7 136858 CASAVA_Build 10 72533327 1I CAAAATTACC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 8 9 136859 CASAVA_Build 10 72538468 2D TGGTGAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 36 3 19 14 T 14 12 136860 CASAVA_Build 10 72551975 1I TTTTTAATGG -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 6 7 136861 CASAVA_Build 10 72553555 2D ACTCCATGTC AA/-- AAAAAAAAAA 2391 het 2391 ref 19 7 6 8 A 13 11 136862 CASAVA_Build 10 72565692 1D AAAAGCCCCA C/- CCCCCCAGAC 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 C 7 6 136863 CASAVA_Build 10 72566141 2D CATTCGAGGA CT/-- CTGACTTTCC 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 CT 2 1 136864 CASAVA_Build 10 72567458 3I CTCAGGAGCT ---/GGG GGGTGCCCAG 3056 het 3056 ref 27 13 9 5 G 3 6 136865 CASAVA_Build 10 72569827 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 C 0 1 136866 CASAVA_Build 10 72575951 1I GCCTCCTACC -/T TATTCTCCCC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 1 2 136867 CASAVA_Build 10 72576660 2I ACCGCCCTGC --/CT CCTGCTTTGT 3070 het 3070 hom 48 22 20 6 CT 0 1 136868 CASAVA_Build 10 72585383 1I ACCTGCTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 9 10 136869 CASAVA_Build 10 72587537 2I ACATGGTTAT --/TA AAAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TA 0 1 136870 CASAVA_Build 10 72600843 9D AATGCCAGTA ATATTAAGT/--------- ATATTAACAG 3070 het 3070 ref 47 27 18 6 ATATTAAGT 1 0 136871 CASAVA_Build 10 72605269 1D TCCAGGTATT A/- AAGAGCAAGA 3070 het 3070 hom 48 25 23 0 A 3 2 136872 CASAVA_Build 10 72634778 2I GGGAATTTTG --/TC TCTCTTCCAA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 TC 2 3 136873 CASAVA_Build 10 72652082 5I GAGGTCTCTT -----/AGTAC AGTGGAAAGA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 AGTAC 0 1 136874 CASAVA_Build 10 72655027 1I GTTCTCCAAA -/C CCCACGGGGG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 C 3 4 136875 CASAVA_Build 10 72667311 1D GTAAGAGCAG T/- GAGACGTCAA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 1 0 136876 CASAVA_Build 10 72681812 2D TAAGTGTCAC AT/-- ATATATATTA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 AT 5 4 136877 CASAVA_Build 10 72682952 1I CTCCAACCTC -/A GGGGGAACCC 3070 het 3070 ref 47 19 12 16 A 0 1 136878 CASAVA_Build 10 72703998 1D GTGGCGGGTG C/- CTGTAATCCC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 2 1 136879 CASAVA_Build 10 72705944 1D GGGATAGCTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 8 7 136880 CASAVA_Build 10 72706650 2I GGGTATAGGG --/AC ACAGCAAGAG 3070 hom 53 het 21 0 16 5 AC 1 2 136881 CASAVA_Build 10 72719522 12D GCTGAACCAG GAGCCCAGCCCT/------------ GAGGGGTCCT 3070 hom 42 het 15 0 14 2 GAGCCCAGCCCT 1 0 136882 CASAVA_Build 10 72729414 1I AGTTCCGTTC -/T TCGTTTTCTT 1903 het 1903 ref 18 9 6 3 T 1 2 136883 CASAVA_Build 10 72729688 1I CCTTTTTAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 9 10 136884 CASAVA_Build 10 72736600 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAGT 3020 het 3020 ref 24 12 9 3 A 8 9 136885 CASAVA_Build 10 72739030 12D ATGACAAGCC CTTCCTTATAGA/------------ CTTCCTGTAA 3070 het 3070 hom 43 15 24 8 CTTCCTTATAGA 1 0 136886 CASAVA_Build 10 72775119 2D TTCATATCCC CT/-- CTCTCTCTCT 1454 het 1454 ref 47 29 7 16 CT 7 6 136887 CASAVA_Build 10 72775442 4D TCCTGCCTTC GAAG/---- CTAGGGCCAT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 GAAG 1 0 136888 CASAVA_Build 10 72779289 2I GCAGGCAACA --/CT CTGACTGCCC 3070 hom 102 het 41 0 33 8 CT 1 2 136889 CASAVA_Build 10 72796417 9D CCACTCAGTG CTCCAGGGA/--------- GAAGACTTCG 3070 het 3070 ref 41 21 17 5 CTCCAGGGA 1 0 136890 CASAVA_Build 10 72796971 2I GTGGTGATGG --/TA TAGAGCCTGG 2578 het 2578 ref 20 12 7 1 TA 1 2 136891 CASAVA_Build 10 72806160 2I CCTGTAGAGC --/TG TGTGTCAGAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TG 2 3 136892 CASAVA_Build 10 72807614 17I TCTGATTTTG -----------------/TAGGGAAAGTATGGTTA CTGTCCCAAG 3070 hom 132 het 43 0 44 1 TAGGGAAAGTATGGTTA 0 1 136893 CASAVA_Build 10 72816961 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1246 het 8 hom 7 0 5 2 T 11 10 136894 CASAVA_Build 10 72817936 1D ATCTTAAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 A 10 9 136895 CASAVA_Build 10 72819137 2D CCTACCAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 542 hom 45 5 22 19 T 12 10 136896 CASAVA_Build 10 72819436 1I CAGTTTGGAT -/A AACTGTAGTG 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 2 3 136897 CASAVA_Build 10 72844413 1D GTTCATGTGA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 T 7 6 136898 CASAVA_Build 10 72846791 1I TTTGGTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 9 11 7 T 9 10 136899 CASAVA_Build 10 72847528 1I GCTCACCATG -/A ATGCCTGGCT 3070 het 3070 hom 46 11 29 6 A 1 2 136900 CASAVA_Build 10 72849414 1I GTACATTTTG -/T TTACATTTCC 3070 het 3070 hom 47 14 28 5 T 2 3 136901 CASAVA_Build 10 72858217 2D ACTTGTTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TG 8 7 136902 CASAVA_Build 10 72862178 2I GTGTGTGTGT --/GA GAGTGTGTGG 3070 hom 108 het 55 0 40 16 GA 1 2 136903 CASAVA_Build 10 72867999 1D CCAGCTACTC G/- GGGGGGCTGA 3070 hom 8 het 20 1 18 1 G 7 6 136904 CASAVA_Build 10 72870230 1I ACAGGAGAAA -/C CCCAGCCAGA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 C 3 4 136905 CASAVA_Build 10 72871500 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2960 hom 31 11 16 4 A 11 10 136906 CASAVA_Build 10 72896943 1D AGGACCACCC A/- GGACCTGGGC 3070 het 3070 ref 39 21 12 7 A 1 0 136907 CASAVA_Build 10 72897495 2D GTGCAGAAAC TT/-- AGTGCGTGTA 3070 het 3070 hom 50 17 27 7 T 2 0 136908 CASAVA_Build 10 72901310 7I CAGTGATACC -------/CAGATTG CAGTCTCCAG 3070 hom 101 het 39 0 30 9 CAGATTG 0 1 136909 CASAVA_Build 10 72909819 7D GCCTCTAGAA TCCACCG/------- TGGCACAGGG 3070 het 3070 ref 47 24 18 9 TCCACCG 1 0 136910 CASAVA_Build 10 72915764 1I TCAATATATT -/A TGGAGTAGAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 1 136911 CASAVA_Build 10 72926099 2D AAGCAAAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 14 12 136912 CASAVA_Build 10 72927268 1D TTCAGGGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 89 het 33 0 29 5 A 10 9 136913 CASAVA_Build 10 72947322 1I GCGAGAAGCT -/G GGGGGGGAGA 3070 hom 82 het 32 0 25 7 G 7 8 136914 CASAVA_Build 10 72947835 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1339 het 1339 ref 38 26 3 9 TG 9 8 136915 CASAVA_Build 10 72951892 1I CTTACACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 11 12 136916 CASAVA_Build 10 72984128 1D ACTGGACTAA T/- TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 33 15 7 11 T 15 14 136917 CASAVA_Build 10 72992676 1D ATAACAAGAT C/- TTTCTTTCAG 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 C 1 0 136918 CASAVA_Build 10 73008482 1D GCTCTGCCCA C/- CCCCCCATAC 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 C 7 6 136919 CASAVA_Build 10 73071859 6D CTTCCATCTA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 3070 hom 20 9 11 3 AAT 7 5 136920 CASAVA_Build 10 73075980 1I TCCCATCAGG -/A AGCCTCTGCA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 1 2 136921 CASAVA_Build 10 73087684 2I AGGGACACAT --/AC ACACACACAC 2678 het 1804 hom 30 12 8 10 AC 7 8 136922 CASAVA_Build 10 73094676 1I CTTTATCTCT -/C CCCCCAGCCC 3016 het 1261 hom 18 3 8 7 C 5 6 136923 CASAVA_Build 10 73099764 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 26 het 16 0 11 5 A 10 9 136924 CASAVA_Build 10 73101407 3D GTCGCTGCCC CTG/--- CTGCCTGGAT 3070 hom 85 het 33 0 21 12 CTG 2 1 136925 CASAVA_Build 10 73113874 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 25 0 23 2 A 9 10 136926 CASAVA_Build 10 73121178 7D ACCTCATGAG GTTGCTA/------- GTCAGCTCAG 3070 het 3070 ref 40 28 11 4 GTTGCTA 1 0 136927 CASAVA_Build 10 73121304 1I ATACAAATTC -/A AAATTCATAT 3070 het 3070 hom 40 19 15 6 A 3 4 136928 CASAVA_Build 10 73182926 1D GCTGTCCAGC A/- AGCGATCTGC 3070 hom 106 het 38 0 32 6 A 2 1 136929 CASAVA_Build 10 73198993 11I TCTAAAACAT -----------/CTTTCTCTCAC TTGCTAATCT 3070 hom 132 het 45 0 45 0 CTTTCTCTCAC 0 1 136930 CASAVA_Build 10 73200208 15D TGTACGGAAG CCCTGGCATGCATGT/--------------- CCCTGGCTTT 3070 het 3070 ref 37 17 16 8 CCCTGGCATGCATGT 1 0 136931 CASAVA_Build 10 73204004 4D TGTGCACCCG CCCT/---- CCCTCCCTGG 3070 het 1365 hom 26 6 14 6 CCCT 3 2 136932 CASAVA_Build 10 73207197 1D GATGTCTGCT G/- GGGGTCGCAG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 G 5 4 136933 CASAVA_Build 10 73236239 1D TTGAGCGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 21 23 9 A 11 10 136934 CASAVA_Build 10 73241588 2I CCACCGGAGC --/CT CACAAGCCTG 1798 het 740 hom 13 5 6 2 CT 0 1 136935 CASAVA_Build 10 73248711 6D CCCACGGCCA AGTCTC/------ AGAGCAACCC 1725 het 1725 ref 16 7 6 5 AGTCTC 1 0 136936 CASAVA_Build 10 73253955 1D TCAAAACACT G/- TGTAGCAAGA 3070 het 2861 hom 27 6 19 2 G 1 0 136937 CASAVA_Build 10 73256507 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1271 hom 24 5 12 7 A 13 14 136938 CASAVA_Build 10 73268199 2I AGAGACACGC --/AT GGTCATCTCC 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 AT 0 1 136939 CASAVA_Build 10 73268942 9D AGCACTCGGG GCAAATTGA/--------- GCACTTCACT 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 GCAAATTGA 1 0 136940 CASAVA_Build 10 73279821 1I TAAGACAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 9 10 136941 CASAVA_Build 10 73292608 1D ACAGAGCTGT C/- CCCCTGGGGT 3070 hom 147 het 55 0 49 6 C 5 4 136942 CASAVA_Build 10 73295305 1D CTATATCTGC T/- CCACAAGCCC 3070 hom 36 het 13 0 9 4 T 1 0 136943 CASAVA_Build 10 73308894 4I ACTGTTTGTT ----/AACA AAGTGTACAG 3070 hom 21 het 12 0 8 4 AACA 0 1 136944 CASAVA_Build 10 73313047 1D GACTTACTAG A/- AAACGAAAGA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 4 3 136945 CASAVA_Build 10 73314064 2I7M1I3M4D TTAGCCAGGC --TGTGGTG-GCATATG/ATGGTGGTGCGCA---- CCTGTAATCC 2359 hom 21 het 6 0 8 2 N/A 0 0 136946 CASAVA_Build 10 73314205 6D CCTTGTCTCA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 11 AAAAAC 4 3 136947 CASAVA_Build 10 73317029 1D TAAATCTTAG T/- TTTTGTTTTT 3070 het 2495 hom 23 8 13 2 T 5 4 136948 CASAVA_Build 10 73318220 5I AGGAGAGAAA -----/GAAAG GAAAGAAGGA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 GAAAG 1 2 136949 CASAVA_Build 10 73319651 1D CCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAG 527 het 527 ref 15 7 2 7 A 10 9 136950 CASAVA_Build 10 73334258 9D GAGAGTGCCT GCTCCCCAG/--------- GCTCCCCAGC 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 GCTCCCCAG 2 1 136951 CASAVA_Build 10 73337504 1D AACCCCTGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 9 8 136952 CASAVA_Build 10 73338736 8D AAGAAAAGAC AGAAAGGA/-------- AGAAAGGAAG 1781 het 1781 ref 20 7 5 8 AGAAAGGA 2 1 136953 CASAVA_Build 10 73359672 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2188 het 2188 ref 11 6 5 0 A 12 11 136954 CASAVA_Build 10 73363450 3I CATATCAGCA ---/AGG AGACTGTTGT 3070 hom 90 het 35 0 28 7 AGG 0 1 136955 CASAVA_Build 10 73370502 3D GACAGGCAGC AGT/--- AGTAGTACTA 3070 hom 73 het 28 0 22 9 AGT 3 2 136956 CASAVA_Build 10 73377211 2D TTTCTTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3050 het 10 hom 24 1 12 11 T 15 13 136957 CASAVA_Build 10 73383947 1D AGGTGAAATC A/- AATAGGTTTG 3070 hom 116 het 43 0 38 5 A 3 2 136958 CASAVA_Build 10 73384230 1I CCACCTCCCC -/T GGTTAAAGCA 1785 hom 10 het 6 0 4 2 T 0 1 136959 CASAVA_Build 10 73385015 1I TCCGGGGTCC -/A GGGTCTAAAA 3070 hom 74 het 28 0 18 10 A 0 1 136960 CASAVA_Build 10 73387227 1I ATTTCAAACA -/G ATGACAAGAC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 G 0 1 136961 CASAVA_Build 10 73391938 16D GGGGCTGTTG CGGGGGTGGTGGGAGA/---------------- CGGGGGTGGT 3070 hom 83 het 32 0 23 13 CGGGGGTGGTGGGAGA 2 1 136962 CASAVA_Build 10 73407429 4D TGGAGCTTGA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 77 het 28 0 24 5 TTGT 5 4 136963 CASAVA_Build 10 73413161 1D CCAGCAGTGG C/- CCTGGTGCCT 3070 hom 53 het 24 0 18 6 C 3 2 136964 CASAVA_Build 10 73416480 1D GAGATCGCCT G/- GGGCTGGTTC 3070 hom 87 het 34 0 27 7 G 4 3 136965 CASAVA_Build 10 73421700 1I ACTCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 24 1 16 7 A 11 12 136966 CASAVA_Build 10 73422592 1I GCTTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 21 het 8 0 7 1 T 6 7 136967 CASAVA_Build 10 73426156 6I CAAGACTCTC ------/TCTCTT TCTCTTTCTC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 TCTCTT 1 2 136968 CASAVA_Build 10 73430289 5I AGGAGCCAGC -----/CAGAG CAGAGCAGAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 CAGAG 1 2 136969 CASAVA_Build 10 73443382 1D TGGGTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 31 0 17 14 T 15 14 136970 CASAVA_Build 10 73447708 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 14 0 13 2 A 10 9 136971 CASAVA_Build 10 73450531 6D CACAGCCAGC TAATTT/------ TAATTTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TAATTT 2 1 136972 CASAVA_Build 10 73452018 1D ACTGGCAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 10 9 136973 CASAVA_Build 10 73458146 2D AACCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 4 A 17 15 136974 CASAVA_Build 10 73458710 2I TTTTTTTTCT --/TA CGTACTCTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TA 0 1 136975 CASAVA_Build 10 73460950 2D AGATCAGCCC CT/-- CTCCCAGCTT 3070 hom 87 het 31 0 25 6 CT 2 1 136976 CASAVA_Build 10 73467774 36D AAGCTACATA CCTCCCTCACAATTTGCCTACAAGGAAATTCCTTGT/------------------------------------ CCTCCCTCAC 3070 hom 50 het 33 0 16 26 CCTCCCTCACAATTTGCCTACAAGGAAATTCCTTGT 2 1 136977 CASAVA_Build 10 73481269 1I GTTGGCTTGG -/A AAAAAATTTA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 6 7 136978 CASAVA_Build 10 73512696 12I GGCTATAATG ------------/AGAAAAGCGTAA GCCAGGAAGA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AGAAAAGCGTAA 0 1 136979 CASAVA_Build 10 73518112 1D GGTTCGACCT G/- GGGGGGTCTT 3070 hom 44 het 18 0 14 4 G 7 6 136980 CASAVA_Build 10 73519945 1I TTTTTTTTTT -/G TTTGTTTCTG 3070 hom 66 het 32 0 21 11 G 0 1 136981 CASAVA_Build 10 73525471 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1455 hom 18 het 7 0 7 0 A 14 15 136982 CASAVA_Build 10 73537067 1D AAATAAGTTA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 45 het 19 0 16 4 C 10 9 136983 CASAVA_Build 10 73572711 1I TGGATCACGA -/G GTCAGGAGAT 3070 hom 71 het 30 0 24 6 G 1 2 136984 CASAVA_Build 10 73596266 1I TTTTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 10 11 136985 CASAVA_Build 10 73626044 1D GTCTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 1859 het 562 hom 24 7 6 12 T 17 16 136986 CASAVA_Build 10 73652184 8D CCGTAAATAA ATACATAC/-------- ATACATACCA 1217 hom 7 het 5 0 3 2 ATAC 4 2 136987 CASAVA_Build 10 73701948 3D TTAATTCAGA TCT/--- TCTCTCTGGC 3070 het 3070 ref 38 19 17 6 TCT 2 1 136988 CASAVA_Build 10 73703227 1D CCACGGGCAT C/- CCCCCCGTGT 1896 het 1180 hom 23 7 6 10 C 7 6 136989 CASAVA_Build 10 73711109 1D AGGAAAAACA T/- TTTTTTTTTT 2091 het 2091 ref 39 10 9 20 T 17 16 136990 CASAVA_Build 10 73717140 1D TCCGCATACA T/- TTTCCCCCAC 3070 het 3070 ref 53 27 14 13 T 4 3 136991 CASAVA_Build 10 73748856 1D AGAAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 1944 het 610 hom 42 7 10 25 T 19 18 136992 CASAVA_Build 10 73760167 1I ATGGACAGAT -/A AAAGTGGTTA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 3 4 136993 CASAVA_Build 10 73761694 1I GCCACCTGAC -/A AGTGGGTGGG 3070 hom 77 het 29 0 22 7 A 1 2 136994 CASAVA_Build 10 73763879 2D AAAAGTAGAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TA 7 6 136995 CASAVA_Build 10 73793596 1I TCCTTGAAAA -/C CCTTGCTTAG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 2 3 136996 CASAVA_Build 10 73799465 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 695 het 695 ref 14 7 3 5 TG 1 0 136997 CASAVA_Build 10 73799731 1I3M1I18M1I3M1I TGCAAGTACC -CCT-CCAGGTTCATGCCATTCT-CTG-/ACCTCCCAGGTTCATGCCATTCTCCTGC CTCAGCCTCC 2547 hom 18 het 7 0 6 2 N/A 0 0 136998 CASAVA_Build 10 73806891 1D CGTATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2208 hom 27 7 10 10 T 11 10 136999 CASAVA_Build 10 73817521 4I GAGAACAAAG ----/AGTA AGCCTTATCT 3070 hom 51 het 37 0 17 20 AGTA 0 1 137000 CASAVA_Build 10 73817536 1I TATCTGGTGC -/T TTTTTTTTTT 2337 het 238 hom 33 1 9 23 T 12 13 137001 CASAVA_Build 10 73820909 3D AAAAATATTT AAG/--- AAAATGTCGG 3070 hom 75 het 30 0 23 7 AAG 1 0 137002 CASAVA_Build 10 73831915 1D GATTTCTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 41 0 26 15 A 13 12 137003 CASAVA_Build 10 73833765 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTGGAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 6 7 137004 CASAVA_Build 10 73852480 1D TTTAGGTATT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 34 3 20 11 C 1 0 137005 CASAVA_Build 10 73853884 1D TTTCCCCCCC A/- CCTTTTTTTT 3070 hom 36 het 34 1 21 12 A 1 0 137006 CASAVA_Build 10 73864798 1I TACTTTGGGC -/T TTAGTAATCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 3 137007 CASAVA_Build 10 73897583 1D AACGTAACAA T/- TTTTTTTTTT 1822 het 1822 ref 35 18 6 11 T 17 16 137008 CASAVA_Build 10 73898059 2D TAGTTTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 29 0 16 13 T 16 14 137009 CASAVA_Build 10 73901349 1I GTTTTTATTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 8 9 137010 CASAVA_Build 10 73912601 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 2969 hom 21 het 9 0 8 1 AT 8 7 137011 CASAVA_Build 10 73914695 2D TAAACTATGG TT/-- GGTAACCTGC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 2 0 137012 CASAVA_Build 10 73915646 2I AAAGGTCAGT --/CA CACACACACA 3070 het 2297 hom 44 12 14 18 CA 8 9 137013 CASAVA_Build 10 73924234 2D ATATTGAACT CA/-- GTCTTGCTAG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 CA 1 0 137014 CASAVA_Build 10 73924957 2I CCCAAATTAC --/AT ATGTCTGCAT 3070 hom 45 het 28 0 16 12 AT 1 2 137015 CASAVA_Build 10 73924998 1D TCAGAGATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 21 0 10 11 A 17 16 137016 CASAVA_Build 10 73940416 1I TCCTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 10 11 137017 CASAVA_Build 10 73947190 19D TGCATACGAT GGAATACTACTCAGCCATA/------------------- AAAAGGAACG 3070 hom 72 het 25 0 24 5 GGAATACTACTCAGCCATA 1 0 137018 CASAVA_Build 10 73947546 1D GAAATAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 7 T 15 14 137019 CASAVA_Build 10 73947781 1I TATTTTATTG -/T TGTTGTTTTC 3070 hom 41 het 17 0 12 5 T 1 2 137020 CASAVA_Build 10 73951637 1I ACAGGTGCAC -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 0 1 137021 CASAVA_Build 10 73954948 3I TCCTGAAGGC ---/CAA TGGCATTTGG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CAA 0 1 137022 CASAVA_Build 10 73956697 12D TAATGGCTTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAGA 3070 hom 34 het 25 0 21 7 A 20 8 137023 CASAVA_Build 10 73967495 3D AAATACTATA AAT/--- ATGTGTGTAA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AAT 1 0 137024 CASAVA_Build 10 73995404 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 13 12 137025 CASAVA_Build 10 74003152 1I CATATAAAAA -/G AGGAGAAAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 137026 CASAVA_Build 10 74018091 1I CAGTCTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 35 0 23 12 T 11 12 137027 CASAVA_Build 10 74019396 1I ATAAGACATT -/A AAAACATATA 3070 hom 94 het 38 0 31 7 A 4 5 137028 CASAVA_Build 10 74025001 2D AGATCACTTA AG/-- GTTAGGAGTC 3070 hom 36 het 13 0 12 1 AG 1 0 137029 CASAVA_Build 10 74025238 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3066 hom 12 het 25 1 15 10 A 12 11 137030 CASAVA_Build 10 74025742 1I AATAAAAAAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 7 8 137031 CASAVA_Build 10 74031567 15D TTTCTTTTTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- GAGGCAGAGT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 15 0 137032 CASAVA_Build 10 74032773 1I CCAGCTACTC -/G GGAGGCTGAG 2745 hom 18 het 7 0 7 0 G 2 3 137033 CASAVA_Build 10 74034126 1I CAACCTCCCC -/G CTCCTGGGTT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 G 0 1 137034 CASAVA_Build 10 74035895 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2823 het 631 hom 15 2 6 8 A 15 14 137035 CASAVA_Build 10 74042048 1I TTTCTTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 482 hom 37 2 26 9 A 12 13 137036 CASAVA_Build 10 74046350 1I AAACTCCATC -/T TAAAAAAAAA 1112 het 351 hom 13 4 6 3 T 1 2 137037 CASAVA_Build 10 74053140 1I GAGAAGAAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 7 8 137038 CASAVA_Build 10 74058682 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 9 10 137039 CASAVA_Build 10 74070760 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 17 1 12 5 A 26 25 137040 CASAVA_Build 10 74076986 1D TGATGGGGTT G/- TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 G 1 0 137041 CASAVA_Build 10 74087465 1D GATTCAGTGA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 8 7 137042 CASAVA_Build 10 74132754 1I AAAAAAGAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 764 hom 34 2 29 3 G 0 1 137043 CASAVA_Build 10 74146892 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 44 2 19 23 T 15 14 137044 CASAVA_Build 10 74154853 1I TCAGCCTCTT -/C CAAGTAGCTG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 1 2 137045 CASAVA_Build 10 74155212 1D ATTTAAAAAT G/- TTTTTTATGG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 G 1 0 137046 CASAVA_Build 10 74155456 1I TCGAGACCAG -/C CTGACCAACA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 C 1 2 137047 CASAVA_Build 10 74161346 1D TCACTGCAGG A/- AAAAAAAAAC 1033 het 1033 ref 58 44 3 11 A 10 9 137048 CASAVA_Build 10 74164881 1I TGTATCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 40 1 27 12 T 12 13 137049 CASAVA_Build 10 74170863 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1873 het 617 hom 21 3 7 11 T 17 16 137050 CASAVA_Build 10 74187360 1I TTCATAATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 10 137051 CASAVA_Build 10 74197878 1I AGAGGAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 9 137052 CASAVA_Build 10 74221605 1D TCTAAATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 13 12 137053 CASAVA_Build 10 74226462 1I TTTTTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 489 hom 27 2 13 12 G 0 1 137054 CASAVA_Build 10 74239787 4D TGTGTGTGTT TGTA/---- TGTGTGTGCG 3070 hom 103 het 40 0 34 7 TGTA 1 0 137055 CASAVA_Build 10 74241849 1D TTTATAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 11 10 137056 CASAVA_Build 10 74242529 3D AGCTTTCTTC AAA/--- CCATTACTGC 3070 hom 141 het 53 0 48 6 A 3 0 137057 CASAVA_Build 10 74243571 1D ATTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 32 1 23 8 T 11 10 137058 CASAVA_Build 10 74254137 7D ATTTTTTGTA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 T 18 11 137059 CASAVA_Build 10 74255400 2D GGGAAAACAA AG/-- AGGTTGATTT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 AG 2 1 137060 CASAVA_Build 10 74255871 1D AACTTTAATG T/- TGCATGTGAA 3070 hom 135 het 49 0 44 5 T 2 1 137061 CASAVA_Build 10 74259378 1D AGTAAAGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 18 0 16 2 A 13 12 137062 CASAVA_Build 10 74273594 1D TTTCCCCTTG T/- TTAAACTCAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 3 2 137063 CASAVA_Build 10 74278495 2I TGTTTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 419 hom 44 1 29 14 TG 7 8 137064 CASAVA_Build 10 74319519 1I AGTGGCTGCC -/A GGGGTGAGGG 3070 hom 147 het 57 0 47 10 A 0 1 137065 CASAVA_Build 10 74401574 1I ATTTTGATGA -/G GATATTTGCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 1 2 137066 CASAVA_Build 10 74406225 1I AAAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 27 0 24 3 A 10 11 137067 CASAVA_Build 10 74407782 1D TCTGGTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 9 137068 CASAVA_Build 10 74408206 3D AGTGTTCCTC TTG/--- TTATTGATGT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 TTG 1 0 137069 CASAVA_Build 10 74412759 1D ACTTGGATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 22 9 T 11 10 137070 CASAVA_Build 10 74413575 1D CCATCAGTTG T/- TTTTTTTTTC 1343 het 1343 ref 8 4 3 1 T 10 9 137071 CASAVA_Build 10 74415109 4I GCAAAAAGTA ----/GTTT GTTAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 GTTT 0 1 137072 CASAVA_Build 10 74415228 2I CTAGCCAGAC --/AA AGTGTTGTAC 3070 het 3070 hom 44 12 28 4 A 1 3 137073 CASAVA_Build 10 74427713 1I AAATTTTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 9 10 137074 CASAVA_Build 10 74430471 3D GACAGGACAA AGG/--- AGGATGACCC 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 AGG 2 1 137075 CASAVA_Build 10 74431198 3D CCCTACCCCC TTT/--- TTTTTTTTTT 1648 het 1648 ref 20 9 5 6 T 15 12 137076 CASAVA_Build 10 74434261 1I AACCATTTTA -/T TTTTTTTTTG 2133 het 2133 ref 21 10 7 4 T 9 10 137077 CASAVA_Build 10 74434966 2D GGATTTTTCC CT/-- CTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 CT 2 1 137078 CASAVA_Build 10 74437502 3I TGAAAGGGCA ---/AAC ATCACATGGA 2233 het 2233 ref 36 26 5 5 AAC 0 1 137079 CASAVA_Build 10 74437784 4I TTTAAGGTTT ----/TACA TATGCAATAT 3070 het 3070 ref 49 25 23 1 TACA 0 1 137080 CASAVA_Build 10 74438591 1I TAATTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 21 6 T 10 11 137081 CASAVA_Build 10 74439051 4I TAAAAATGTG ----/GCCA GTCCTGCACT 3070 het 3070 hom 52 14 26 12 GCCA 0 1 137082 CASAVA_Build 10 74439378 6D TAAAAATAGT TAAAAA/------ TAAAATCTGT 3070 het 3070 ref 32 18 12 5 TAAAAA 1 0 137083 CASAVA_Build 10 74442390 2I GAAAGAAAAC --/AG AAACAGGGAA 2788 het 2788 ref 23 11 8 4 AG 0 1 137084 CASAVA_Build 10 74444589 14D TATTATTTTC TTTTTTCTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTGA 3070 het 2140 hom 21 6 11 6 TTTTTTCTTTTTTT 1 0 137085 CASAVA_Build 10 74445642 1I AGGTGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2840 het 2840 ref 26 8 9 9 T 12 13 137086 CASAVA_Build 10 74447355 3I AAGCCCCAAA ---/TGC TGCTGAACTC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TGC 1 2 137087 CASAVA_Build 10 74447752 1I GTCTTGCTCT -/G GGGGCCAGTA 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 G 4 5 137088 CASAVA_Build 10 74450913 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 7 8 137089 CASAVA_Build 10 74457997 1I TTGAGATAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 9 10 137090 CASAVA_Build 10 74459406 2I CCTATGCTTA --/TT GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 T 0 2 137091 CASAVA_Build 10 74460829 1I TTGTACAGAA -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 6 7 137092 CASAVA_Build 10 74461393 6D GTGGTTGCCA GGGGAT/------ GGGGATGGGG 3070 het 1528 hom 24 6 14 5 GGGGAT 2 1 137093 CASAVA_Build 10 74462666 11I GTGGATTCTT -----------/AGATGAATCTA AGATTTATCC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 AGATGAATCTA 0 1 137094 CASAVA_Build 10 74464085 5I ACCATTTTAA -----/TTATT TTAAGTGTAC 2996 het 2996 ref 31 18 7 6 TTATT 0 1 137095 CASAVA_Build 10 74466766 1I TGAGTTGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 T 9 10 137096 CASAVA_Build 10 74471777 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3024 hom 20 7 10 3 T 8 9 137097 CASAVA_Build 10 74476490 1I AAACCCAGTT -/G AAGGGTACAT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 G 0 1 137098 CASAVA_Build 10 74478399 1D TAGCAGACTC T/- TTGTTTTATA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 3 2 137099 CASAVA_Build 10 74492750 3I TTTTTTCTGG ---/CCC CCCCATTAGT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 C 4 7 137100 CASAVA_Build 10 74493747 1I GTATGGGCAG -/A AAAAAGACTG 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 A 5 6 137101 CASAVA_Build 10 74494246 14I CTGTCTCAAA --------------/AAAATAAAATAAAG AAAATAAAGA 3050 het 3050 ref 33 16 9 8 AAAATAAAATAAAG 0 1 137102 CASAVA_Build 10 74506516 1I GAATAAGTTA -/C CATTACAGTA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 C 1 2 137103 CASAVA_Build 10 74514907 1I CATCTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 9 15 13 A 11 12 137104 CASAVA_Build 10 74517033 2D AATGCCTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 2939 het 1023 hom 28 5 9 14 T 18 16 137105 CASAVA_Build 10 74520825 14D AGTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1730 hom 13 6 9 2 A 24 10 137106 CASAVA_Build 10 74522444 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 891 het 891 ref 8 5 3 0 A 13 12 137107 CASAVA_Build 10 74532386 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1286 hom 21 4 15 2 A 11 10 137108 CASAVA_Build 10 74533321 1D TAATGCAACC A/- AATCTGCCAC 3070 hom 45 het 17 0 16 2 A 3 2 137109 CASAVA_Build 10 74542185 1D GTCTGTGTCC T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 8 7 137110 CASAVA_Build 10 74542661 1I GTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 8 9 137111 CASAVA_Build 10 74545219 1I ATTACAGGCG -/C TAAGTCACCA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 C 0 1 137112 CASAVA_Build 10 74545766 1D TAAGAAATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2381 hom 24 8 14 2 T 9 8 137113 CASAVA_Build 10 74547322 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1747 het 980 hom 16 4 5 7 A 17 18 137114 CASAVA_Build 10 74553851 1D CAGGCACACG C/- CCCCCACACC 3070 het 3070 ref 36 15 12 10 C 6 5 137115 CASAVA_Build 10 74556399 1D ACCCTTCTAG C/- CTACAGGGCT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 C 2 1 137116 CASAVA_Build 10 74566919 1I GATTTAGCTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 2513 hom 19 7 11 1 A 8 9 137117 CASAVA_Build 10 74568721 5I ATGAATTCCT -----/TTGAG TTTTCAGTAT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 TTGAG 0 1 137118 CASAVA_Build 10 74573130 1I ACAGGGTTTC -/A CCATATTGGC 2295 hom 12 het 7 0 5 2 A 0 1 137119 CASAVA_Build 10 74573550 1D ATTCGTTCTA T/- TTTTTTTTTT 2569 het 245 hom 22 1 8 13 T 15 14 137120 CASAVA_Build 10 74576887 2I GGCACATGCC --/TA TAGTCTCAGC 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 TA 1 2 137121 CASAVA_Build 10 74577012 3D ATACAACAAC AAT/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 AAT 1 0 137122 CASAVA_Build 10 74579104 1I TTGACTTAAC -/A ATTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 A 1 2 137123 CASAVA_Build 10 74581294 1D GCATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 11 10 137124 CASAVA_Build 10 74590048 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1216 hom 24 5 14 6 A 15 14 137125 CASAVA_Build 10 74590929 1D CCTATACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 12 11 137126 CASAVA_Build 10 74595566 1I TATTTTTATT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 7 8 137127 CASAVA_Build 10 74598324 1D CTCCAGCTGA G/- GGCGTGTCGC 3070 het 2125 hom 25 7 12 6 G 3 2 137128 CASAVA_Build 10 74600289 1I TAAATAAATA -/T AAAATAAGAA 2380 het 1907 hom 15 5 7 3 T 0 1 137129 CASAVA_Build 10 74601857 3I ATATTTTTTG ---/TTA TTATCTAATT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 TTA 1 2 137130 CASAVA_Build 10 74603196 4I AAATCAAGAT ----/AGAG AGCTGTTTCA 3070 het 3070 ref 37 21 9 7 AG 1 3 137131 CASAVA_Build 10 74604808 4D TAGAATGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 AAAC 4 3 137132 CASAVA_Build 10 74607339 4I TTCTGTCTCC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 10 14 137133 CASAVA_Build 10 74609187 4I GCTCTTTCTT ----/TCTG TCTGTCTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 TCTG 1 2 137134 CASAVA_Build 10 74623061 3D TCCATCTCCA TTC/--- TATGGAAGAG 3070 het 3070 ref 45 24 14 8 TTC 1 0 137135 CASAVA_Build 10 74626957 1I CAGCAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 het 1736 hom 19 5 12 2 G 3 4 137136 CASAVA_Build 10 74627211 1I CTCAGCACTG -/T AAGACGGTGA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 0 1 137137 CASAVA_Build 10 74632059 3I TTCTTTTAAT ---/AGC AGTTATAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 AGC 0 1 137138 CASAVA_Build 10 74632221 1D GTTTGATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2425 hom 26 7 9 10 T 12 11 137139 CASAVA_Build 10 74635099 2D GGCACCTCTC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 44 15 18 12 CA 7 6 137140 CASAVA_Build 10 74639645 1D TCTGGATGCA T/- TTTTTTTTTC 1260 het 1260 ref 33 14 7 13 T 10 9 137141 CASAVA_Build 10 74642542 2I GTCGTTTTTC --/AT ATGTTTGTTG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 AT 1 2 137142 CASAVA_Build 10 74644567 1D GAGTTATACT G/- GCCTCATAGA 3070 het 3070 ref 43 31 9 3 G 2 1 137143 CASAVA_Build 10 74645880 3I GATTGTTACA ---/TCT TCTTGTTGAA 3070 het 3070 ref 55 29 21 5 TCT 1 2 137144 CASAVA_Build 10 74646253 1D TCTGTCTTTT G/- TCTTTGTGGT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 G 1 0 137145 CASAVA_Build 10 74651131 2I GATTAACTGT --/AG TTCTTTTGTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 AG 0 1 137146 CASAVA_Build 10 74653002 1I CCCCACAAGA -/G TAACCCCATC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 137147 CASAVA_Build 10 74653499 1D GTGTGTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 33 4 11 19 T 13 12 137148 CASAVA_Build 10 74656574 1D TTGTCATGGA C/- CAGTTGGTTC 3070 het 2714 hom 19 6 9 4 C 2 1 137149 CASAVA_Build 10 74658374 1I TATTTTTTCA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 2227 hom 27 6 14 7 T 8 9 137150 CASAVA_Build 10 74661051 4D AAAGTTACTC TAAA/---- TATTCTTGTA 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 TAAA 1 0 137151 CASAVA_Build 10 74661405 4I ATTTTGGGAG ----/ATAA TGAAATTTAA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 ATAA 0 1 137152 CASAVA_Build 10 74661984 1I GCTTTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 9 22 3 A 9 10 137153 CASAVA_Build 10 74665977 1D AGAAATGACC A/- AACAACTGGG 3070 het 3070 hom 55 23 27 5 A 3 2 137154 CASAVA_Build 10 74672178 2D TTTCAAAGTT AA/-- AGAATCAGAA 3045 het 3045 ref 26 13 11 2 A 3 1 137155 CASAVA_Build 10 74672323 1D GATTTCACTC T/- TTGTTTTGAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 3 2 137156 CASAVA_Build 10 74674891 1D CGTTCCCCTC A/- AGCTCACCAG 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 A 2 1 137157 CASAVA_Build 10 74676122 1D CCAATCTTCA T/- TAACTGCTAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 3 T 2 1 137158 CASAVA_Build 10 74681307 1D GCCCAACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2025 hom 18 6 11 1 T 12 11 137159 CASAVA_Build 10 74683030 2D TGAAGTATGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 10 11 T 14 12 137160 CASAVA_Build 10 74683890 2D TTGAAGACCC CT/-- CTTTTGTGGG 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 CT 2 1 137161 CASAVA_Build 10 74690261 1I GTGTCTTTAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 53 28 23 2 A 7 8 137162 CASAVA_Build 10 74690890 1D ATTGTCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1587 hom 31 8 12 11 T 16 15 137163 CASAVA_Build 10 74693007 1I GGGACTACAA -/G GTGCCATCAT 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 G 1 2 137164 CASAVA_Build 10 74695638 3I GTCATAGCTA ---/TTT TTTTTTTTTT 3058 het 3058 ref 32 10 11 11 T 13 16 137165 CASAVA_Build 10 74696663 1D CTCCTTATCA T/- TTTCTCAATT 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 T 4 3 137166 CASAVA_Build 10 74696725 1I TTTATTTAAA -/T AATTAATTCA 3070 het 2970 hom 17 6 8 3 T 0 1 137167 CASAVA_Build 10 74702862 1D GGATCTCTGA T/- AATTGCTCTC 3070 het 3070 ref 51 27 20 5 T 1 0 137168 CASAVA_Build 10 74706759 1D AACATATGCC T/- TTAGAGTCTG 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 3 2 137169 CASAVA_Build 10 74713275 3D TAAAAAGCTG TGT/--- TGTTTAGTGC 3070 het 3070 ref 58 36 19 4 TGT 2 1 137170 CASAVA_Build 10 74714437 1I ATTGTGGTTT -/G TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 G 0 1 137171 CASAVA_Build 10 74723209 1D AGTAGAGAGG T/- TTCATAAGCA 3070 het 3070 ref 50 27 22 2 T 3 2 137172 CASAVA_Build 10 74733356 1D AATGCCTTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 10 9 137173 CASAVA_Build 10 74736746 1I TTCTCTCCTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 8 9 137174 CASAVA_Build 10 74737661 1D GTAATCCTAG C/- ACTTTGGGAG 3070 het 2597 hom 20 7 10 3 C 1 0 137175 CASAVA_Build 10 74741027 2I GCAAATTCTC --/TG TGTTATTCTC 3070 het 3070 ref 47 27 19 1 TG 1 2 137176 CASAVA_Build 10 74744998 4D AAAAAAAAAA AAAC/---- AGCTTTATTG 1577 het 1577 ref 32 16 6 14 AAAC 1 0 137177 CASAVA_Build 10 74750435 1D ATAATTATCC T/- TTTTTTTTTT 2477 het 2477 ref 26 13 6 7 T 13 12 137178 CASAVA_Build 10 74752408 5I TGCATTTTAG -----/ATTCA TCTGTGCTGT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 ATTCA 0 1 137179 CASAVA_Build 10 74763383 1I AGTTGTGAAA -/G GAAAAACCCG 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 G 1 2 137180 CASAVA_Build 10 74765714 1I AGACCAGGCT -/G GGCAACAAAG 3070 het 3070 ref 36 14 16 6 G 2 3 137181 CASAVA_Build 10 74765904 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 14 11 A 13 12 137182 CASAVA_Build 10 74769586 2I CCCCAGGTGT --/CA CAGACCTGGC 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 CA 1 2 137183 CASAVA_Build 10 74780081 20I CAGGGTTTGA --------------------/TAACATACTTACCTATGTGG TATGTTATCA 3070 het 3070 ref 51 25 23 6 TAACATACTTACCTATGTGG 0 1 137184 CASAVA_Build 10 74783784 4D TTTTTTTTTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 1422 hom 22 5 13 4 TGTT 4 3 137185 CASAVA_Build 10 74801277 1I TTAAAGTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 14 16 10 A 10 11 137186 CASAVA_Build 10 74805418 1I AGATGTAAAG -/A GTTGAATTTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 0 1 137187 CASAVA_Build 10 74811622 14I TTTCCATATC --------------/CACTCACTGTTACA CACTATCCTT 3070 het 3070 ref 36 22 10 5 CACTCACTGTTACA 0 1 137188 CASAVA_Build 10 74812084 6I ACCTTCATCA ------/TCTCAT TCTAAGTGTG 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 TCTCAT 0 1 137189 CASAVA_Build 10 74817551 3I TCTGTCCCTG ---/GAA GAAGAACCAC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 GAA 2 3 137190 CASAVA_Build 10 74820786 2I ATACAAAAAT --/TA GCTGGGCGTG 3070 het 1350 hom 16 3 9 5 TA 0 1 137191 CASAVA_Build 10 74826694 1I GAAGGCTTCC -/T TTTTGGCTTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 4 5 137192 CASAVA_Build 10 74827198 4D CTCCAGTAAA AAAT/---- AAGTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 AAAT 1 0 137193 CASAVA_Build 10 74829912 4D TCTCAAAAAC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 38 21 7 13 ACAA 5 4 137194 CASAVA_Build 10 74831027 1D9M1D ACACATACAC AACACACACAC/-ACACACACA- ACACACACAC 1278 het 1278 ref 30 16 6 14 N/A 0 0 137195 CASAVA_Build 10 74831562 8I CACCTCACCC --------/GGCCAAGG GGCCAAGGCT 3070 het 2953 hom 23 8 10 5 GGCCAAGG 1 2 137196 CASAVA_Build 10 74835725 1D TTTTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2590 hom 26 9 12 5 T 12 11 137197 CASAVA_Build 10 74849288 1D AATTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 15 14 137198 CASAVA_Build 10 74884144 1D ATTTCACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 8 A 11 10 137199 CASAVA_Build 10 74894333 3I GTACATACAT ---/ACA TTATACATGA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 ACA 0 1 137200 CASAVA_Build 10 74899959 7D TAATTAAAAA AAAGCTC/------- AAATACAAAT 3070 het 3070 ref 37 21 15 5 AAAGCTC 1 0 137201 CASAVA_Build 10 74903989 2I GTATTTTTAG --/TA GAGATGGGGT 2605 het 1572 hom 10 4 6 0 TA 0 1 137202 CASAVA_Build 10 74962583 1D AATTGCAAGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 A 8 7 137203 CASAVA_Build 10 74992065 2D AATAAACACC CA/-- CACACCCATG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 CA 3 2 137204 CASAVA_Build 10 74994666 12D CATCTCTACC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 1993 het 1993 ref 25 12 6 10 A 23 11 137205 CASAVA_Build 10 74994899 3I AATCAGTAGT ---/ATC ATCCCTACTT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 ATC 1 2 137206 CASAVA_Build 10 75000172 2D GTGGGGAAGT AA/-- AAAAAAAAAC 3029 het 3029 ref 22 11 7 6 A 11 9 137207 CASAVA_Build 10 75000468 1D TGCCACCTCA C/- CCGTTGTACT 2413 het 2413 ref 26 14 6 6 C 3 2 137208 CASAVA_Build 10 75006271 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1178 het 1178 ref 21 10 4 8 A 14 13 137209 CASAVA_Build 10 75011869 2I TTCTCTCAGC --/CT CTGTTTCGGA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 CT 1 2 137210 CASAVA_Build 10 75014151 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2107 hom 17 6 9 2 A 10 11 137211 CASAVA_Build 10 75017980 6D TTGTTGTTGT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 2285 het 2285 ref 21 8 6 8 TTTTTG 3 2 137212 CASAVA_Build 10 75020765 1I AAATCTATGA -/T ATTTTTTTTT 2868 het 2868 ref 22 10 9 3 T 0 1 137213 CASAVA_Build 10 75022887 1D TTTTGGGAGG C/- CATTGCGGGA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 C 2 1 137214 CASAVA_Build 10 75024181 7I ATTTGGGAAC -------/TTTTTAT TTTTTAAGAG 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 TTTTTAT 0 1 137215 CASAVA_Build 10 75029498 6D TAATAATCTA TATATT/------ TATTTTTTGT 3070 het 3070 ref 23 13 10 2 TATATT 1 0 137216 CASAVA_Build 10 75031268 1D CAAAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 20 8 T 12 11 137217 CASAVA_Build 10 75038030 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 8 9 137218 CASAVA_Build 10 75038176 1I TACATTTACG -/A AGTAATTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 A 1 2 137219 CASAVA_Build 10 75040425 1D CAGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2714 hom 23 7 10 6 A 10 9 137220 CASAVA_Build 10 75045222 4D TGTACATTTT TAAA/---- TAACTACAAG 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 TAAA 1 0 137221 CASAVA_Build 10 75049169 1D AATTTTTCAC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 8 7 137222 CASAVA_Build 10 75050086 4I CAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 2232 het 1492 hom 14 6 6 2 AAAG 3 4 137223 CASAVA_Build 10 75050629 3I ACTCTGTCTC ---/AAA AAACAAACAG 2123 het 2123 ref 14 7 5 2 A 3 6 137224 CASAVA_Build 10 75057510 3I CAAGGATTTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TTG 2 3 137225 CASAVA_Build 10 75060457 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 A 15 14 137226 CASAVA_Build 10 75066226 1D CAAATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 12 11 137227 CASAVA_Build 10 75086697 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 169 hom 27 3 14 10 A 16 15 137228 CASAVA_Build 10 75097656 2I GAACAGGGCA --/TG GGGGGCAACC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TG 0 1 137229 CASAVA_Build 10 75098898 1I AACTTTAAAA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 7 8 137230 CASAVA_Build 10 75123280 1D TGGCCAACAT G/- GGTGAAACCC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 3 2 137231 CASAVA_Build 10 75144615 2D GTCATGTATA TT/-- TTTCATTTGT 3070 het 3070 ref 29 19 8 3 T 5 3 137232 CASAVA_Build 10 75154989 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2007 het 920 hom 16 3 5 8 T 12 13 137233 CASAVA_Build 10 75156929 1I CTAACTTAGT -/A AAAGTATAAG 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 A 3 4 137234 CASAVA_Build 10 75159736 1I37M1I ACAGACACAC -ACACGAGCGGAAACAGAAAGTCTTTATATATCACCAT-/AACACGAGCGGAAACAGAAAGTCTTTATATATCACCATA ATGTCAAGGA 1200 het 1200 ref 26 39 3 5 N/A 0 0 137235 CASAVA_Build 10 75174756 4D AGTGTCAGTG ACCT/---- ACCTCTGTAA 3070 het 3070 hom 22 9 11 4 ACCT 2 1 137236 CASAVA_Build 10 75187464 19I GAAGCCGGGG -------------------/CGAGAGGATTGATTGAGCC TAGGAGTTCA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 CGAGAGGATTGATTGAGCC 0 1 137237 CASAVA_Build 10 75229669 4I AGAGCGAGAC ----/TCTA TCTATCTCAA 3070 het 3070 hom 53 13 29 11 TCTA 1 2 137238 CASAVA_Build 10 75238318 2D CCCTTAGCAT AG/-- GGTAGGGGAG 3070 het 3070 ref 34 17 14 6 AG 1 0 137239 CASAVA_Build 10 75262892 1D ACTCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1197 het 1197 ref 23 11 3 9 T 17 16 137240 CASAVA_Build 10 75263365 1I TCTATCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 13 14 137241 CASAVA_Build 10 75277703 1D CCCGAGGAGC A/- AGGACATCTG 3070 hom 80 het 32 0 23 9 A 2 1 137242 CASAVA_Build 10 75300253 1I CTCGATTGGA -/C CCCCCCCAGA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 C 7 8 137243 CASAVA_Build 10 75308633 1D GAGTGCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 22 0 10 12 T 11 10 137244 CASAVA_Build 10 75312772 1D GGCAAAAAAA T/- GTATATATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 0 137245 CASAVA_Build 10 75315627 19I TTTTACAGAT -------------------/GAGAAAACTGAGGCACAGA GAGATTGCGC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GAGAAAACTGAGGCACAGA 0 1 137246 CASAVA_Build 10 75319198 4I TTTTCTTTCC ----/TTCT TTCTTTCTTT 3070 hom 24 het 14 0 9 5 TTCT 3 4 137247 CASAVA_Build 10 75319935 1D GCACCTGGCC A/- TCCTCCAGCT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 1 0 137248 CASAVA_Build 10 75320257 4I CACCTCTACC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 31 0 24 7 A 13 17 137249 CASAVA_Build 10 75330342 2D GCATACATCT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 126 het 58 0 43 17 AC 11 10 137250 CASAVA_Build 10 75332008 1I TTTCTGTTTA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 93 het 43 0 38 5 T 6 7 137251 CASAVA_Build 10 75332703 2D CTCCAAGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 1330 het 1330 ref 24 12 4 8 T 18 16 137252 CASAVA_Build 10 75339654 2D CCAGAGATGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 86 het 44 0 29 16 GT 9 8 137253 CASAVA_Build 10 75342384 1I AGAGGTCAAG -/T GTGAGTGGAT 3070 hom 89 het 33 0 25 8 T 0 1 137254 CASAVA_Build 10 75342614 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 511 hom 26 2 19 5 A 12 13 137255 CASAVA_Build 10 75347173 1D GACCACTCCT G/- TACACTGAAT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 G 1 0 137256 CASAVA_Build 10 75349548 1I TGTCTCCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 15 0 13 2 A 13 14 137257 CASAVA_Build 10 75350273 9I CTGTTTTTGC ---------/TTTTGTTTT TTTTGTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TTTTGTTTT 1 2 137258 CASAVA_Build 10 75364087 2I TATTGGAATG --/CT CTGTTTTGCC 3070 hom 99 het 36 0 31 5 CT 1 2 137259 CASAVA_Build 10 75384443 1D CATGCATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 29 0 13 16 T 18 17 137260 CASAVA_Build 10 75392610 1D CTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 18 0 14 4 T 13 12 137261 CASAVA_Build 10 75395468 1I CCAATAAAGG -/T TTTTTTAAGG 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 6 7 137262 CASAVA_Build 10 75398260 1I CAGGGACATG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 100 het 40 0 33 7 A 7 8 137263 CASAVA_Build 10 75443668 1D GTGTTGATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 393 hom 41 1 37 3 A 10 9 137264 CASAVA_Build 10 75446811 5D ATTTCCTTCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2167 hom 18 het 12 0 7 5 T 19 14 137265 CASAVA_Build 10 75447497 10D TTTTTGTGTG TATGTGTATA/---------- TATTATACAC 3070 hom 36 het 11 0 13 4 TATGTGTATA 1 0 137266 CASAVA_Build 10 75453481 2D ACATTTCTAT AA/-- AAGTCTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 25 7 A 4 2 137267 CASAVA_Build 10 75462475 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1199 hom 7 het 6 0 3 3 T 1 0 137268 CASAVA_Build 10 75467764 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 945 het 60 hom 13 1 6 6 T 16 15 137269 CASAVA_Build 10 75470931 1I TCTTACTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 9 10 137270 CASAVA_Build 10 75471502 1I CTAAAAATCC -/A AAAAAAAAAA 2199 het 484 hom 16 3 9 4 A 14 15 137271 CASAVA_Build 10 75488655 2I CACAGAAAGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 822 hom 39 2 28 9 GT 8 9 137272 CASAVA_Build 10 75525914 3I TTAAAATGGA ---/CTT CTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 CTT 1 2 137273 CASAVA_Build 10 75531088 1I CGACTCTACC -/A AAAAAAAAAA 2900 het 2400 hom 27 9 11 7 A 13 14 137274 CASAVA_Build 10 75531805 1D AATTTTTCTA T/- TTTTTAGTAG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 6 5 137275 CASAVA_Build 10 75546461 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 het 65 hom 16 2 11 3 T 0 1 137276 CASAVA_Build 10 75548922 2I ACATGTCTCC --/TA TATCCTGGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TA 1 2 137277 CASAVA_Build 10 75553141 2I ATTTCCTCTC --/TT GGGACAGATA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 0 2 137278 CASAVA_Build 10 75559767 1D CTGAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 182 hom 44 1 37 6 A 10 9 137279 CASAVA_Build 10 75562477 1I CCCTGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 39 1 26 12 A 12 13 137280 CASAVA_Build 10 75569216 2D CATCTCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 20 0 12 8 A 13 11 137281 CASAVA_Build 10 75577048 3D GACTCCATCT CAA/--- CAACAACAAA 3070 hom 59 het 24 0 20 7 CAA 4 3 137282 CASAVA_Build 10 75590547 1I GTTCGTATAT -/G GGGGGGAAAT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 G 6 7 137283 CASAVA_Build 10 75601902 1D ATGGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 33 3 9 21 T 19 18 137284 CASAVA_Build 10 75605748 1D TCTTAGATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 10 9 137285 CASAVA_Build 10 75615286 1D AACAATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 693 hom 24 2 11 11 T 15 14 137286 CASAVA_Build 10 75642596 1D17M1D AATGGTTGGG AAGAGAGTGCAGTAATACT/-AGAGAGTGCAGTAATAC- TTTCGTGTTA 3070 hom 94 het 42 0 32 13 N/A 0 0 137287 CASAVA_Build 10 75643299 2D AAAAAAAAAG AA/-- AGAGTAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 3 A 3 1 137288 CASAVA_Build 10 75645594 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 8 7 137289 CASAVA_Build 10 75686969 1D TACAAATATG T/- TAAGTCCCAC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 2 1 137290 CASAVA_Build 10 75692426 14I ATTCATGTAT --------------/TCATTTATTCATTA TCATTTATTC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TCATTTATTCATTA 0 1 137291 CASAVA_Build 10 75695389 1I CAATCACTTT -/A ATCAAAGTCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 137292 CASAVA_Build 10 75701297 1I15M1D TTTAGCATTA -GTATATCTCCTAATGA/GGTATATCTCCTAATG- CTATCCCTCC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 137293 CASAVA_Build 10 75704273 1D19M1D TTGCAGTGAG CCTGAAATTGCGCCATTGCAG/-CTGAAATTGCGCCATTGCA- CTCCAGCCTG 3070 hom 32 het 14 0 13 3 N/A 0 0 137294 CASAVA_Build 10 75706689 1D TTCAAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 11 10 137295 CASAVA_Build 10 75715288 14D ATATTTATAC ATCTATATCTATAT/-------------- ATCTATATCT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 ATCTATATCTATAT 2 1 137296 CASAVA_Build 10 75719598 1I TTAGTGGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 539 hom 19 2 11 6 A 13 14 137297 CASAVA_Build 10 75725523 1D ATGTTCCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 10 9 137298 CASAVA_Build 10 75725831 2D ATTTAGCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 16 14 137299 CASAVA_Build 10 75729389 2I TACATTATAC --/AT ATATATATGG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 AT 4 5 137300 CASAVA_Build 10 75732619 1I GTTTTTGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 73 het 28 0 25 3 A 9 10 137301 CASAVA_Build 10 75732861 1D GTTTACAGCT G/- GGGACATCTT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 G 4 3 137302 CASAVA_Build 10 75733735 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 24 0 19 5 A 13 12 137303 CASAVA_Build 10 75742055 4I ACTTGTAGAT ----/AGAG AGAGTGTGTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 2 4 137304 CASAVA_Build 10 75743792 4D TTCATATAAT TAGA/---- TAGGTCTGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TAGA 1 0 137305 CASAVA_Build 10 75745375 1D GTCAGTTCTG C/- CTACACTAGA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 C 2 1 137306 CASAVA_Build 10 75746657 1D TCTTTTGCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 10 9 137307 CASAVA_Build 10 75748776 1I ATTACGTTTT -/A ACCACACATA 3070 hom 166 het 61 0 56 5 A 1 2 137308 CASAVA_Build 10 75758160 1D TCCACCATAG A/- AAACTTGCAT 3070 hom 93 het 33 0 30 3 A 4 3 137309 CASAVA_Build 10 75759770 1D TACAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 13 12 137310 CASAVA_Build 10 75775071 1D ATCACGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 12 11 137311 CASAVA_Build 10 75784080 1D37M2I CGGAAGTATT CCAGTAACTCTTTGAATTTTTTCCTAGAAAAATTGGCA--/-CAGTAACTCTTTGAATTTTTTCCTAGAAAAATTGGCATC TCTGTTACCC 3070 hom 126 het 36 0 43 6 N/A 0 0 137312 CASAVA_Build 10 75792134 1D GCTTCATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 25 1 21 4 T 12 11 137313 CASAVA_Build 10 75794958 6D CACAATGCTG CACAAC/------ CACAACCATA 3070 hom 123 het 42 0 42 2 CACAAC 2 1 137314 CASAVA_Build 10 75813535 1D AGACCTGTTT G/- TTTAGATTCA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 1 0 137315 CASAVA_Build 10 75818592 2D AGGGTTACTC TG/-- TAGATTTCAA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 TG 1 0 137316 CASAVA_Build 10 75822515 7D TTGAAAATAA TATATAT/------- TATTAAGTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 7 TATATAT 1 0 137317 CASAVA_Build 10 75826515 1I GCCAGGAGTT -/A TGAGACCAGC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 0 1 137318 CASAVA_Build 10 75846335 1I TTTGTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 34 0 25 9 T 10 11 137319 CASAVA_Build 10 75863590 1D GAAATACTTT G/- AGTACACAGG 3070 hom 99 het 41 0 34 8 G 1 0 137320 CASAVA_Build 10 75868170 1I TTTTTTTTTT -/A ATCTTTAGTA 2466 het 705 hom 16 2 11 4 A 1 2 137321 CASAVA_Build 10 75869101 1I TTTTTCCTTC -/T CCTGTCTTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 137322 CASAVA_Build 10 75877949 2I AAAAATAAAT --/AA AAGAGTTAGG 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 2 4 137323 CASAVA_Build 10 75885284 1I AATTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 21 het 13 0 8 5 T 9 10 137324 CASAVA_Build 10 75894604 12I TATTTAAGAA ------------/AAAAAGAGAGAG AAAAAGAGAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AAAAAGAGAGAG 1 2 137325 CASAVA_Build 10 75900840 2D ATACTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 17 15 137326 CASAVA_Build 10 75902958 6D ATACACACAG ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 57 het 23 0 20 10 AC 12 9 137327 CASAVA_Build 10 75904917 5D CAAACAAAAA AAAAC/----- AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 8 AAAAC 2 1 137328 CASAVA_Build 10 75905312 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 31 0 26 6 A 11 10 137329 CASAVA_Build 10 75909160 1D TTTTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 1529 het 1529 ref 42 20 6 16 T 15 14 137330 CASAVA_Build 10 75918395 11I GATAGCAGGA -----------/TTTTTCTCCTC TTAAAGAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TTTTTCTCCTC 0 1 137331 CASAVA_Build 10 75919791 1I GAGCCCATCA -/T TTTGAAAGCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 4 137332 CASAVA_Build 10 75942504 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 7 137333 CASAVA_Build 10 75950358 1D AAACACTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 11 10 137334 CASAVA_Build 10 75966246 1I TAATTCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 10 11 137335 CASAVA_Build 10 76028094 1D TTGCCATTTT A/- TGAGGTTTAA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 A 1 0 137336 CASAVA_Build 10 76092999 1I ATGCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 186 het 123 hom 12 1 1 10 A 12 13 137337 CASAVA_Build 10 76100606 2I AATAGAAGAC --/TT TTGGCTTGAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 2 4 137338 CASAVA_Build 10 76111415 2I TTCGAGACCA --/GC CCGGCCAACA 3070 hom 68 het 25 0 19 6 GC 0 1 137339 CASAVA_Build 10 76121476 1I GACAAAGCAC -/T GCAACAGATC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 0 1 137340 CASAVA_Build 10 76123363 2I GTGAGGGAAG --/TA TATTAGTCCT 3070 hom 135 het 54 0 45 9 TA 1 2 137341 CASAVA_Build 10 76128636 3I TTTTGTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TTG 5 6 137342 CASAVA_Build 10 76135051 8D GTGTTAACTG CAGCAGCT/-------- CAGCAGCTCA 3070 hom 83 het 38 0 26 14 CAGCAGCT 2 1 137343 CASAVA_Build 10 76135224 2D AACTTTGGAC AT/-- ATGTGTACAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 2 1 137344 CASAVA_Build 10 76140516 1D AATGAATGTT A/- AGACCTCATT 3070 hom 144 het 53 0 49 4 A 2 1 137345 CASAVA_Build 10 76141658 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1889 het 1889 ref 28 17 5 6 A 13 14 137346 CASAVA_Build 10 76141820 1D AGCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 24 1 12 12 A 17 16 137347 CASAVA_Build 10 76141937 3I ATCAAGAAAT ---/AAG AAACACAAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAG 0 1 137348 CASAVA_Build 10 76142819 1D TACTGAGTAG T/- TTTGAGTTCC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 4 3 137349 CASAVA_Build 10 76154771 1I TTTTTAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 110 hom 24 1 20 3 A 12 13 137350 CASAVA_Build 10 76155843 5D AAAAAAGAAT AGAAA/----- AGAAAAGAAC 3070 hom 48 het 20 0 17 5 AGAAA 2 1 137351 CASAVA_Build 10 76157941 1D AACCCTGTAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 24 0 19 6 A 10 9 137352 CASAVA_Build 10 76162999 1I CATTTTAACG -/C CCCCCCCCCT 2656 hom 31 het 19 0 13 7 C 9 10 137353 CASAVA_Build 10 76178073 4I CCCCTGTGAG ----/TTGT TTATCAGTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTGT 0 1 137354 CASAVA_Build 10 76181767 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 268 hom 34 1 24 10 T 12 11 137355 CASAVA_Build 10 76183572 13D GAAATATTTT TGGCCTGAATGAA/------------- TGGCCTGAAG 3070 hom 93 het 38 0 32 10 TGGCCTGAATGAA 1 0 137356 CASAVA_Build 10 76185708 1D CCATCGCTAC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 8 7 137357 CASAVA_Build 10 76194108 1D GGCGACACCA G/- TTGAAACAGG 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 G 1 0 137358 CASAVA_Build 10 76225207 1D TCACCAGCCC T/- TTTTTTTTTT 875 het 875 ref 21 11 4 6 T 13 12 137359 CASAVA_Build 10 76258222 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 24 2 20 2 T 13 12 137360 CASAVA_Build 10 76287937 1D3M1D GAACGGGGGC GTGCA/-TGC- CTCTTGCCTC 3070 hom 93 het 33 0 29 5 N/A 0 0 137361 CASAVA_Build 10 76327850 1D TTCTTTAGTT A/- AAAAAAAAAC 1679 het 1679 ref 38 29 4 5 A 10 9 137362 CASAVA_Build 10 76365045 2D ATACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 AT 6 5 137363 CASAVA_Build 10 76382055 1I TGGAGATCGA -/G GCTGGAGTGA 3070 hom 65 het 26 0 22 4 G 1 2 137364 CASAVA_Build 10 76427883 2D TCAAAAAGTA AT/-- ACATAAAACA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AT 1 0 137365 CASAVA_Build 10 76447025 1D TCTCTATGAT G/- TACTCAATAA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 G 1 0 137366 CASAVA_Build 10 76699223 3I ACCAGTTTTC ---/TGA ATCTGAATCC 3070 hom 102 het 38 0 32 6 TGA 0 1 137367 CASAVA_Build 10 76701595 1I ATATGAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 30 1 26 3 T 12 13 137368 CASAVA_Build 10 76706645 3I TTCCTCCACA ---/TCC TCCTCGCCAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TCC 1 2 137369 CASAVA_Build 10 76706977 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 9 10 137370 CASAVA_Build 10 76712043 1I CTGCTGGGGA -/G GGGTTCCTCT 3070 hom 129 het 47 0 42 5 G 3 4 137371 CASAVA_Build 10 76723371 2I CTGGGATTAC --/CA CAGAGTGCCC 3070 hom 122 het 44 0 40 4 CA 1 2 137372 CASAVA_Build 10 76726263 1I GGCTCAGACA -/C CCCCCCCTTC 3070 het 2979 hom 32 10 16 6 C 7 8 137373 CASAVA_Build 10 76746115 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 697 het 697 ref 38 18 3 17 T 13 14 137374 CASAVA_Build 10 76753834 4I TTTTATATGC ----/AAGT GTTTGTCAGA 3070 hom 67 het 27 0 23 4 AAGT 0 1 137375 CASAVA_Build 10 76754093 1I TGTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 2892 het 2360 hom 24 8 11 5 T 10 11 137376 CASAVA_Build 10 76755537 3D ATTTATTTAG TTC/--- TTCTTTGATT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 TTC 2 1 137377 CASAVA_Build 10 76755627 2D ATGGTATTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 760 hom 26 5 15 6 T 14 12 137378 CASAVA_Build 10 76757715 3D AATAATAATA ATT/--- ATTATTATTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 6 ATT 4 3 137379 CASAVA_Build 10 76762233 1I TAAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 21 1 15 5 T 13 14 137380 CASAVA_Build 10 76776572 1D TTAAAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 21 0 12 9 T 15 14 137381 CASAVA_Build 10 76777156 2I CAGGGCTGAC --/AA GAGAGGAGAA 3070 hom 81 het 33 0 25 8 A 0 2 137382 CASAVA_Build 10 76784319 1I TCTACAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3029 het 3029 ref 30 18 9 3 A 11 12 137383 CASAVA_Build 10 76784601 10D TGTGCTTCAT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 1788 het 1788 ref 24 15 6 3 TTTTG 4 2 137384 CASAVA_Build 10 76784771 1D CCCAGCTAAC T/- TTTTTTTTTG 2564 het 2365 hom 21 7 8 6 T 10 9 137385 CASAVA_Build 10 76787128 1I CAAAAAAAAA -/G AAAAATTAGC 3070 het 1865 hom 30 6 19 5 G 0 1 137386 CASAVA_Build 10 76790054 1D CTGGCTAATG T/- TTTTTTGTAT 2637 het 945 hom 16 3 7 6 T 7 6 137387 CASAVA_Build 10 76875338 1I CTTTAGCCGG -/T GTTGGTTCCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 0 1 137388 CASAVA_Build 10 76879294 1I AGTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 32 1 23 8 T 13 14 137389 CASAVA_Build 10 76881640 1I TTGCTCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2663 hom 40 8 24 8 A 15 16 137390 CASAVA_Build 10 76887894 3D AATGGGAGAT AGA/--- AGGAGTTGTG 3070 het 3070 ref 46 21 16 10 AGA 1 0 137391 CASAVA_Build 10 76888233 4I AAAAGGGAAG ----/CCCT AGGGAGGAAG 3070 hom 111 het 45 0 36 9 CCCT 0 1 137392 CASAVA_Build 10 76936251 1I TCTGTTGTTT -/G TTTTTTGGTG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 G 0 1 137393 CASAVA_Build 10 76938024 1D TATGGTGGTG T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 105 het 41 0 32 10 T 7 6 137394 CASAVA_Build 10 76943929 1D CCTTTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 31 3 13 15 T 16 15 137395 CASAVA_Build 10 76964211 5I ACTCTTAGAA -----/CTTTT CTTTGCTTTC 3070 hom 112 het 43 0 37 6 CTTTT 0 1 137396 CASAVA_Build 10 76986481 6I TGAAGCATAA ------/AGGCTG GGGGTGGGGT 3070 hom 51 het 21 0 15 6 AGGCTG 0 1 137397 CASAVA_Build 10 77011480 1I TTCTCAATTG -/T TAAGTGGGAG 3070 hom 32 het 14 0 10 4 T 1 2 137398 CASAVA_Build 10 77016586 1I GGTTATTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 214 hom 20 1 14 5 T 11 12 137399 CASAVA_Build 10 77020196 1I TGGTTTCCTT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 137400 CASAVA_Build 10 77025636 1I GGTTACCACA -/T TTTTCAGAGA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 4 5 137401 CASAVA_Build 10 77048009 2D AAAATAACAC TG/-- TAAAAGTGAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TG 1 0 137402 CASAVA_Build 10 77048276 2D CCATATATAT TA/-- TATATATATA 1355 hom 10 het 5 0 4 1 TA 9 8 137403 CASAVA_Build 10 77052083 2I GAAAAAATAT --/AA GATACCCCAA 3070 het 3070 hom 49 23 20 6 A 0 2 137404 CASAVA_Build 10 77059380 1D TTAAGTCCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 10 9 137405 CASAVA_Build 10 77069602 1D TGTCCTGCGC G/- GCTGCGCTCG 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 G 2 1 137406 CASAVA_Build 10 77069966 1D CATAGCAGCA T/- TTTTAAAGTA 3070 hom 156 het 57 0 51 6 T 5 4 137407 CASAVA_Build 10 77072064 1I CCATGGTGAG -/T TATCCAGACT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 1 2 137408 CASAVA_Build 10 77076840 7D GATGGAGCTT GCCCAAC/------- GCTGCTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 GCCCAAC 1 0 137409 CASAVA_Build 10 77077768 10I GATACCAAAT ----------/GCTACCAAAG GCTACTTCTC 3070 het 3070 hom 49 20 19 10 GCTACCAAAG 0 1 137410 CASAVA_Build 10 77079767 4I CATTAGGACT ----/TCTG TCTATTTTGA 3070 het 3070 ref 46 22 21 4 TCTG 0 1 137411 CASAVA_Build 10 77080251 1I AATTATTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 10 11 137412 CASAVA_Build 10 77083846 1I ATGTGTTGTC -/T TTCTTTGGCG 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 T 2 3 137413 CASAVA_Build 10 77088552 1I TAGAATTTTC -/T ACTGGGGGAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 0 1 137414 CASAVA_Build 10 77095355 2D AAAACAAAAC TT/-- TAAAATGAAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 5 T 3 1 137415 CASAVA_Build 10 77096985 1D GATTTTATAA C/- CCCCCCCCCC 2274 het 2274 ref 21 11 6 5 C 11 10 137416 CASAVA_Build 10 77100151 1I AACCAGAGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 11 12 11 T 8 9 137417 CASAVA_Build 10 77105472 1D ATTGTTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 37 0 26 12 T 12 11 137418 CASAVA_Build 10 77107151 1D GCTGCAGATA T/- CCCAGTCAAA 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 T 1 0 137419 CASAVA_Build 10 77112199 2I GTGTGTGGGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 2584 hom 46 15 16 15 GT 7 8 137420 CASAVA_Build 10 77121027 2I TGTATATGTG --/TA TATATATATA 2909 het 2515 hom 23 9 8 6 TA 8 9 137421 CASAVA_Build 10 77132948 1D TATACTGCAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 8 137422 CASAVA_Build 10 77135628 5D CATTTAGCTT CTTTA/----- CTTTTGCATT 3070 het 3070 hom 41 19 20 5 CTTTA 1 0 137423 CASAVA_Build 10 77136008 1I TTCTCACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 T 10 11 137424 CASAVA_Build 10 77140350 2D CAGAGGAGAC TT/-- TTTGCTGCTG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 5 3 137425 CASAVA_Build 10 77166826 2D CGCACGCACG CA/-- CACACACACA 1061 het 1061 ref 50 30 3 20 CA 8 7 137426 CASAVA_Build 10 77171201 1D CCACTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 2536 het 2536 ref 49 28 7 14 A 12 11 137427 CASAVA_Build 10 77183604 1I TTGTGGTGGT -/C CATGGGATAG 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 C 1 2 137428 CASAVA_Build 10 77192187 5I ATGTATGGCC -----/CAAGA CAATTCTTCC 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 CAAGA 0 1 137429 CASAVA_Build 10 77194979 1D GTTAGGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1605 hom 28 7 16 7 T 12 11 137430 CASAVA_Build 10 77195352 1I GTGTGCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 9 7 T 10 11 137431 CASAVA_Build 10 77215120 1I GGTGTGGAGG -/C AGCAAAGCTC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 C 0 1 137432 CASAVA_Build 10 77224710 1D CTATTTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 38 0 24 15 T 12 11 137433 CASAVA_Build 10 77225936 1I ATTTTATGTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 7 8 137434 CASAVA_Build 10 77227884 1D TCTTTTTTTC A/- AAAAACATTC 3070 het 3070 hom 31 16 14 1 A 6 5 137435 CASAVA_Build 10 77230203 1I AATCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2764 het 2521 hom 29 7 7 15 T 12 13 137436 CASAVA_Build 10 77244356 1D ACCTGAAACA T/- TCATGTTCTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 2 1 137437 CASAVA_Build 10 77249170 1I TAATGTGAAA -/T TTTGGGGAGT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 3 4 137438 CASAVA_Build 10 77254992 24D CTCTTCCCAC TTTCTTCTCCCAAAATAAATACAT/------------------------ TTTCTAAGAC 3070 het 3070 ref 38 20 19 4 TTTCTTCTCCCAAAATAAATACAT 1 0 137439 CASAVA_Build 10 77267525 1D ACATTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 11 10 137440 CASAVA_Build 10 77270030 1I GACTACCACC -/A AAAGGATTGA 3070 hom 114 het 48 0 38 10 A 3 4 137441 CASAVA_Build 10 77274975 1D GAGCCACAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 10 9 137442 CASAVA_Build 10 77277186 3I AAGGAAACAT ---/AGG AGGAAAGCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AGG 1 2 137443 CASAVA_Build 10 77279145 1I TAGACTGGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 9 10 137444 CASAVA_Build 10 77282306 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 1 0 137445 CASAVA_Build 10 77282659 4I GAGGATTAAT ----/TAAC TCACAGTTCT 3070 hom 157 het 59 0 53 6 TAAC 0 1 137446 CASAVA_Build 10 77300146 2I ATTTAGAAAC --/AT ATGTGTTATG 3070 hom 114 het 50 0 39 11 AT 1 2 137447 CASAVA_Build 10 77303517 1D TTTATGATCA T/- TTTGGTTAGT 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 T 4 3 137448 CASAVA_Build 10 77320871 1D TCAGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 22 5 11 6 A 12 11 137449 CASAVA_Build 10 77332270 14I GCTTTGGGGT --------------/ATCTGAATGTTTAC ATCTAGAGCT 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 ATCTGAATGTTTAC 0 1 137450 CASAVA_Build 10 77335695 1D TAGCCAAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 15 14 15 T 10 9 137451 CASAVA_Build 10 77336635 8D GTGGACTTGG GGGTGCAA/-------- GGTTGAACAG 3070 het 3070 hom 41 18 19 6 GGGTGCAA 1 0 137452 CASAVA_Build 10 77358052 1I TAGTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 32 2 23 7 T 11 12 137453 CASAVA_Build 10 77390159 2D TGCAGGAAAG AA/-- AAGAGCTTAG 3070 hom 93 het 37 0 31 7 A 4 2 137454 CASAVA_Build 10 77398755 1I TTAAACAATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 447 hom 25 1 19 5 A 8 9 137455 CASAVA_Build 10 77446764 1D AAATTCATAC T/- TTGAAACCCT 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 T 3 2 137456 CASAVA_Build 10 77448488 4I TGCGCCACCA ----/TGTG TGTGCAGCTG 3070 hom 45 het 21 0 16 5 TG 2 4 137457 CASAVA_Build 10 77474204 3D TTTTTCTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 107 hom 33 2 15 16 T 17 14 137458 CASAVA_Build 10 77475904 1I CTTGGTTAAC -/T CCTCTCTCAT 3070 hom 163 het 60 0 55 5 T 0 1 137459 CASAVA_Build 10 77480603 1D AACAATGGAC T/- TGAAGGTTAA 3070 hom 114 het 44 0 37 7 T 2 1 137460 CASAVA_Build 10 77483293 2D AACTTGTATT AC/-- ACTCAGGATT 3070 hom 95 het 35 0 32 3 AC 2 1 137461 CASAVA_Build 10 77487200 1D TTTTCAAGAT G/- TGGTGAGAGT 3070 het 3070 ref 56 29 25 4 G 1 0 137462 CASAVA_Build 10 77500474 3I25M3D TGAAATACTT ---CTGCTCTTCTGAGACATCTACTTCCTAG/CTCCTGCTCTTCTGAGACATCTACTTCC--- TAAGAGTAAA 3070 hom 126 het 41 0 42 6 N/A 0 0 137463 CASAVA_Build 10 77508611 1I8M1D AAACAAAAAC -AAACAAACA/AAAACAAAC- AAAAAAATGG 3070 hom 75 het 25 0 26 2 N/A 0 0 137464 CASAVA_Build 10 77513598 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1829 hom 25 het 24 0 10 14 A 17 18 137465 CASAVA_Build 10 77516186 1D TTATTTCTTC A/- AACAAGCCCT 3070 hom 160 het 58 0 54 5 A 3 2 137466 CASAVA_Build 10 77521630 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 80 het 31 0 25 6 T 7 8 137467 CASAVA_Build 10 77530316 2I CTTTTGCTTT --/AA ATGGGTGGGT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 1 3 137468 CASAVA_Build 10 77531501 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 955 hom 36 3 26 7 A 10 11 137469 CASAVA_Build 10 77542462 1D AGGTCCGGCT C/- CCGGAGCCCC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 C 3 2 137470 CASAVA_Build 10 77542580 1I GAGTTTTTCT -/C CTCTGGTTGC 3070 hom 96 het 36 0 31 5 C 1 2 137471 CASAVA_Build 10 77549954 1D TATGTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 2797 het 2797 ref 37 18 7 13 T 17 16 137472 CASAVA_Build 10 77557336 1D GAGTGCAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 29 2 17 10 T 13 12 137473 CASAVA_Build 10 77566387 3I TTAAAAAAAA ---/AGC AGCAAAAATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AGC 1 2 137474 CASAVA_Build 10 77572284 1I TCACGCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 9 10 137475 CASAVA_Build 10 77587745 1D GTATCTAAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 48 15 29 6 A 9 8 137476 CASAVA_Build 10 77618414 1D TTAGCACTCA C/- GTTCTGGGCC 3070 hom 117 het 45 0 39 7 C 1 0 137477 CASAVA_Build 10 77668562 1D AAGTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 T 11 10 137478 CASAVA_Build 10 77676322 1D AGGGAAAGCC G/- TACGAATCCA 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 G 1 0 137479 CASAVA_Build 10 77684597 1I TTTTATTTTA -/G GAAGTTACGA 3070 hom 103 het 39 0 35 4 G 1 2 137480 CASAVA_Build 10 77691249 1I CACTGGTTCT -/A AAAAAAAAAA 3018 het 3018 ref 27 12 7 8 A 10 11 137481 CASAVA_Build 10 77696005 1I AATAATCATC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 46 14 27 5 T 7 8 137482 CASAVA_Build 10 77702925 1D TATATGATAT C/- CCTGTTCCCA 3070 het 3070 ref 42 23 15 5 C 3 2 137483 CASAVA_Build 10 77706071 1D GTCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 T 11 10 137484 CASAVA_Build 10 77710579 1I AATGTGCCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 9 10 137485 CASAVA_Build 10 77715198 2D GCTAAATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 32 4 13 15 A 13 11 137486 CASAVA_Build 10 77716962 3D CTGGTTGTGG CTT/--- CTTCTTTATT 3070 het 3070 ref 35 17 17 3 CTT 3 2 137487 CASAVA_Build 10 77733479 1I ATTGCCACTC -/T TTTTTTTTTT 2934 het 968 hom 27 3 12 12 T 15 16 137488 CASAVA_Build 10 77735023 12D GTAGCATGTG TGGGCCCTTTCT/------------ TGGGCCCTTT 3070 hom 99 het 43 0 32 11 TGGGCCCTTTCT 2 1 137489 CASAVA_Build 10 77740249 1I AAAAGAGGTA -/T TTTTTTCCCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 6 7 137490 CASAVA_Build 10 77741108 1I GTGCTTTTAA -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 6 7 137491 CASAVA_Build 10 77745374 3D GAGCGCAGGA AGC/--- AGCAGCCCAG 2872 hom 32 het 13 0 10 4 AGC 3 2 137492 CASAVA_Build 10 77749525 1I AGAGGCTGAC -/A TATTTCCCAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 0 1 137493 CASAVA_Build 10 77769731 1D CCATAACTGA C/- CCTAAGCAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 3 2 137494 CASAVA_Build 10 77794276 1I AAGTTTATGT -/A AAAATTTCCA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 4 5 137495 CASAVA_Build 10 77799891 1I TTATGCCAGC -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 7 8 137496 CASAVA_Build 10 77805085 1D GTTTCAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 11 10 137497 CASAVA_Build 10 77805448 11I TTAAATCCTG -----------/ATGTTACTAGT ATGTTACTAG 3070 het 3070 ref 43 23 10 10 ATGTTACTAGT 1 2 137498 CASAVA_Build 10 77805488 1I CCATGCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1220 hom 45 4 18 23 T 16 17 137499 CASAVA_Build 10 77830512 1I GCTTTTTTGA -/T TCTCTGAAGC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 1 2 137500 CASAVA_Build 10 77870315 1D TTAGTCTGAT C/- TTCCCTCGTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 1 0 137501 CASAVA_Build 10 77882258 1I GAACTGAATG -/A AAAAAAAAAA 1164 het 1164 ref 55 41 3 11 A 11 12 137502 CASAVA_Build 10 77887276 1I TGTGTTTGTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 53 18 27 8 T 8 9 137503 CASAVA_Build 10 77897902 1I AGACTGTAGC -/T TATGCCCAGT 3070 het 3070 ref 44 17 19 8 T 1 2 137504 CASAVA_Build 10 77903383 1D GGATTCTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 11 10 137505 CASAVA_Build 10 77918242 3I GATTCAACCA ---/TGT TGTGTGTATC 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TGT 1 2 137506 CASAVA_Build 10 77924091 1D GCTACATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 9 10 T 15 14 137507 CASAVA_Build 10 77925011 1I TGTCCAGCTG -/C CCCATCATAA 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 C 3 4 137508 CASAVA_Build 10 77928775 3D AATAAGCATG ATC/--- ATCATCATCA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 ATC 5 4 137509 CASAVA_Build 10 77933237 1I TGATTGGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 11 12 137510 CASAVA_Build 10 77936970 1D ATGTTGAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 10 9 137511 CASAVA_Build 10 77937045 1D TTTGCCCATT A/- AAAAAAAATC 1407 het 1407 ref 31 19 3 9 A 9 8 137512 CASAVA_Build 10 77940178 1I TGTGGCATGC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 8 9 137513 CASAVA_Build 10 77946113 3D TAAAATTATT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 1074 hom 16 3 9 4 TTA 4 3 137514 CASAVA_Build 10 77955381 1I GGCGGACTAC -/T ATTTCTTATG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 0 1 137515 CASAVA_Build 10 77955849 1D ACAAAAGTAG C/- ACATTGGCTA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 C 1 0 137516 CASAVA_Build 10 77971357 1D TTTTGTTTCC A/- GGGGTAAGAA 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 A 1 0 137517 CASAVA_Build 10 77984566 1D GAAAGGGAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 94 het 36 0 29 7 A 9 8 137518 CASAVA_Build 10 77990077 3D CTGGCTGTCT TTC/--- TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 TTC 2 1 137519 CASAVA_Build 10 77997993 1D CCACATCTTC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 54 28 18 8 T 7 6 137520 CASAVA_Build 10 78002849 4D CTCAAGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 18 18 10 TG 9 7 137521 CASAVA_Build 10 78003025 3D ATTCTAAGGC AAA/--- AAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 40 16 18 9 A 8 5 137522 CASAVA_Build 10 78006537 3I CATGTGACTT ---/AAG AATTAATAGA 3070 het 3070 hom 49 16 26 7 AAG 0 1 137523 CASAVA_Build 10 78006775 2D71M4D GTGTTCAGCC TTTTTATGTAAAGAATTGTTAAAGAGAAATGTTACCAAATCAGGAAAAATTACTTGCATCGATAAACAGTATTAAAG/--TTTATGTAAAGAATTGTTAAAGAGAAATGTTACCAAATCAGGAAAAATTACTTGCATCGATAAACAGTATT---- AAAAACAACT 3070 het 3070 ref 33 29 27 2 N/A 0 0 137524 CASAVA_Build 10 78007574 4D GAAGGGATTC TAAT/---- TAATTGCCCC 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 TAAT 2 1 137525 CASAVA_Build 10 78023807 4D TGGTAGAATT TGTC/---- TGTGAATCCA 3070 het 3070 ref 37 23 11 6 TGTC 1 0 137526 CASAVA_Build 10 78024078 4I CTTATTTGAA ----/TCTT TCTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TCTT 1 2 137527 CASAVA_Build 10 78024229 1D TATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 10 9 137528 CASAVA_Build 10 78024738 3D TCTCTCTCTC TCT/--- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 TCT 1 0 137529 CASAVA_Build 10 78025963 4D TTTTCCTTTA TAAG/---- TAAGTAAGTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 9 TAAG 3 2 137530 CASAVA_Build 10 78026070 1I TCTTTTTTGC -/A ATGAATCTCC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 1 2 137531 CASAVA_Build 10 78026731 2D GTAACATATT AA/-- GTTATATTAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 2 0 137532 CASAVA_Build 10 78026972 4I TTTTTCCCCT ----/TAAG TAAGTCATTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 TAAG 1 2 137533 CASAVA_Build 10 78027618 4I AATGTATCTC ----/TGTT TGTTTATGCA 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 TGTT 1 2 137534 CASAVA_Build 10 78028474 4D39M1I TGGCCCTGAT TCAATCAATCAGTTGAAAGATCTTAAAAGCAGAAAACCTGAGG-/----TCAATCAGTTGAAAGATCTTAAAAGCAGAAAACCTGAGGT TTTTCTTTTA 3070 het 3070 ref 44 31 20 12 N/A 0 0 137535 CASAVA_Build 10 78028965 2I TAATCCCAAC --/AA AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 7 9 137536 CASAVA_Build 10 78029059 4I TACGTTTTAG ----/AGAT AGATAGAATC 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 AGAT 1 2 137537 CASAVA_Build 10 78029184 3D GTAATTATAA TAT/--- TATTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TAT 2 1 137538 CASAVA_Build 10 78029760 4I ATTAGTATCA ----/TTGT TTGTTAGACT 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 TTGT 1 2 137539 CASAVA_Build 10 78029962 1D TCATGATAGG C/- CCCCCCATGA 2368 het 2368 ref 24 13 6 5 C 7 6 137540 CASAVA_Build 10 78031332 2I AGCAAAAAAC --/TT TTTGAAGAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 3 5 137541 CASAVA_Build 10 78035951 4I TTTCCCTTCC ----/ACTT ACTTACTGAA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 ACTT 1 2 137542 CASAVA_Build 10 78036709 3I ATAGAAAAAC ---/ATT AGTATTAATA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 ATT 0 1 137543 CASAVA_Build 10 78041801 1I GCTTACCAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 1302 hom 11 4 7 0 A 8 9 137544 CASAVA_Build 10 78044427 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 12 0 A 11 10 137545 CASAVA_Build 10 78048339 1I TTGGAAGGGT -/G GGAGTGTGGG 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 G 2 3 137546 CASAVA_Build 10 78051114 1I ATATCAGCAA -/G CTTCTTGCAG 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 G 0 1 137547 CASAVA_Build 10 78061686 1D CTAATGGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 12 11 137548 CASAVA_Build 10 78076534 1D ATACCAGGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 10 9 137549 CASAVA_Build 10 78082242 1D TTCCACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 13 12 137550 CASAVA_Build 10 78089680 7I AAAAATAAAA -------/AATAAAT AAAAATTAAA 2487 het 2487 ref 14 7 6 1 AATAAAT 0 1 137551 CASAVA_Build 10 78104272 1D AAGGACGCCT C/- CAAAGTTATT 3070 het 3070 hom 50 20 18 13 C 2 1 137552 CASAVA_Build 10 78112143 1D ATTTTTATCA G/- GAACAAGGTT 3070 het 3070 ref 43 23 11 10 G 2 1 137553 CASAVA_Build 10 78112844 4D27M4I TCTCCTCTCA TCTGTCTATCTATCTATCTATATCTGTCTAT----/----TCTATCTATCTATCTATATCTGTCTATTATC TATCTATCTT 3070 het 3070 hom 44 19 22 10 N/A 0 0 137554 CASAVA_Build 10 78122999 5I CAGCATTGCT -----/TAAAG TATTTTCCAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 TAAAG 0 1 137555 CASAVA_Build 10 78131899 1D AGTGTTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2635 hom 42 17 16 9 T 15 14 137556 CASAVA_Build 10 78133456 1I TTTGTTTGAC -/A GCTTAGGTAC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 0 1 137557 CASAVA_Build 10 78140089 1I ACACAAATGG -/A AAGATATTCC 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 2 3 137558 CASAVA_Build 10 78142009 1D ACTACAGTTA G/- GCTCTCATGA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 G 2 1 137559 CASAVA_Build 10 78143163 5I CACAGGACTT -----/ATAAC ATAAGAATAC 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 ATAAC 0 1 137560 CASAVA_Build 10 78144356 1I TAGCAAAATT -/A AACCAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 2 3 137561 CASAVA_Build 10 78154535 24D TGGTAAGAGC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------ AAAAAAAAAA 3070 het 2761 hom 28 11 10 8 A 36 12 137562 CASAVA_Build 10 78182438 1I TTTAAAATAC -/T TTAAGTAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 3 137563 CASAVA_Build 10 78192209 1D ACTTCAGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1032 hom 41 5 23 13 A 15 14 137564 CASAVA_Build 10 78248412 1I CTCTTCACAC -/G GACGCGCATG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 2 137565 CASAVA_Build 10 78268246 1D TGCAACCCCG T/- TCTCTACTAA 2508 hom 20 het 10 0 7 4 T 2 1 137566 CASAVA_Build 10 78290678 1I ATGGTCTCCA -/T TTTTTCCCAG 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 5 6 137567 CASAVA_Build 10 78297316 1D ATGCTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 45 1 36 8 A 11 10 137568 CASAVA_Build 10 78318826 4I CCATCTCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AAAC 3 4 137569 CASAVA_Build 10 78326625 1D TGAATATGCT A/- AAAAAAAAAC 1733 het 1733 ref 28 16 4 9 A 10 9 137570 CASAVA_Build 10 78330021 1I AAGTTATCAG -/A AAAATGATAT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 4 5 137571 CASAVA_Build 10 78367870 4I TCTGAGATGG ----/TCCT TATACTTCTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TCCT 0 1 137572 CASAVA_Build 10 78375571 1D TCATTTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 11 10 137573 CASAVA_Build 10 78376945 2I CTGAAAATAC --/AA AAAAAAAGTA 3070 hom 48 het 17 0 17 2 A 7 9 137574 CASAVA_Build 10 78384962 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 518 hom 32 7 12 14 T 15 14 137575 CASAVA_Build 10 78403600 1I ACCAAGCCTC -/T TTTATGGTCC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 3 4 137576 CASAVA_Build 10 78409228 4I ACCAATGTTA ----/CTTT CTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 CTTT 2 3 137577 CASAVA_Build 10 78414488 4D AATCCAGTAT TGTG/---- TGTGTAGTTA 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 TG 4 2 137578 CASAVA_Build 10 78417572 1I AAACTGCAAA -/G GGCTTTGAAT 3070 hom 111 het 40 0 36 4 G 2 3 137579 CASAVA_Build 10 78418888 1I AATAACCCCC -/A AAATCACTGG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 3 4 137580 CASAVA_Build 10 78437776 12D CAGGCTACTC TGTAGACTGCAT/------------ TGGGGGATGA 3070 het 3070 ref 37 24 15 5 TGTAGACTGCAT 1 0 137581 CASAVA_Build 10 78447640 1I ATGGGGTTGC -/T GTGAGAGTTT 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 T 0 1 137582 CASAVA_Build 10 78462493 1D CAAAGCCCAA C/- CCCCCTTTTT 1330 het 1330 ref 49 28 6 15 C 6 5 137583 CASAVA_Build 10 78514586 1I CTTTGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 12 13 137584 CASAVA_Build 10 78529479 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2832 het 673 hom 20 5 9 7 A 15 14 137585 CASAVA_Build 10 78538172 3D AACAAGAGCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 12 12 A 15 12 137586 CASAVA_Build 10 78538823 1I TTTTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 12 11 12 A 13 14 137587 CASAVA_Build 10 78539170 1D CATAAATGGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 21 13 4 A 9 8 137588 CASAVA_Build 10 78557331 4D TAGAGAAAAT AGGA/---- AGGAAGGAAG 3070 het 3070 ref 48 21 12 16 AGGA 6 5 137589 CASAVA_Build 10 78557422 2I AGGAGGGGAA --/AG AGGGAGAGAA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 AG 1 2 137590 CASAVA_Build 10 78562899 1I TAGCCTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 10 11 137591 CASAVA_Build 10 78563383 1D AATGTGTAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 A 9 8 137592 CASAVA_Build 10 78566357 2D GGAAATGCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 12 5 A 14 12 137593 CASAVA_Build 10 78566900 1D TCATTCACTG C/- TTCAGGGTTC 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 C 1 0 137594 CASAVA_Build 10 78572134 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 1773 het 1194 hom 13 6 5 2 A 13 12 137595 CASAVA_Build 10 78576548 1D GGGGCTGTGA C/- AATAAATTGA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 C 1 0 137596 CASAVA_Build 10 78578297 1I TACTTGTTTT -/G GGGGGGGATT 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 G 7 8 137597 CASAVA_Build 10 78580971 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 1092 het 1092 ref 16 6 6 6 TCTT 3 2 137598 CASAVA_Build 10 78581113 1D12M1D5M1I GCCTCAGCCT CCCCAAGTAGCTAGGGACT-/-CCCAAGTAGCTA-GGACTA CAGGTGAGAG 2846 hom 15 het 8 0 6 3 N/A 0 0 137599 CASAVA_Build 10 78581234 1D TTGTGATCTG C/- CCCCCCTTGC 2773 het 2773 ref 21 11 7 3 C 7 6 137600 CASAVA_Build 10 78587242 3D GTTGGACACA TTC/--- TTCTTGGCAT 3070 hom 39 het 16 0 14 3 TTC 2 1 137601 CASAVA_Build 10 78602467 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 29 0 21 8 A 12 11 137602 CASAVA_Build 10 78616143 2I AACAAAAAAC --/AA AAAAAAAAAC 2912 het 2912 ref 38 22 12 4 A 9 11 137603 CASAVA_Build 10 78630407 1I AATCTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 13 11 A 11 12 137604 CASAVA_Build 10 78635386 2I TGATGAAGGT --/GG TTCTTATAGT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 G 0 2 137605 CASAVA_Build 10 78636507 4I GACTAAGTAC ----/TGTG TCAATAAACT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 TG 0 2 137606 CASAVA_Build 10 78638310 4I GAAAGCCCAT ----/GATA GAACAGCAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 GATA 0 1 137607 CASAVA_Build 10 78650528 1I CAGTTTCTGC -/T TAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 1 2 137608 CASAVA_Build 10 78651771 3I AATGGTGATC ---/ATA ATAACTCCTT 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 ATA 1 2 137609 CASAVA_Build 10 78657555 1D GAGTACTTCT G/- CCACTTCCCA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 G 1 0 137610 CASAVA_Build 10 78658928 4I GATGGAAAAG ----/CAAA CAAAGGTGGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CAAA 1 2 137611 CASAVA_Build 10 78671253 1I TCTACAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 25 hom 18 1 15 2 T 8 9 137612 CASAVA_Build 10 78672959 7I TGCCACCACT -------/CCACACA CCACACACCA 3070 het 3070 hom 60 23 20 17 CCACACA 1 2 137613 CASAVA_Build 10 78674576 1I AGGGAGACAA -/G GACTTCCCAT 3070 hom 147 het 55 0 47 8 G 1 2 137614 CASAVA_Build 10 78685365 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 2456 hom 15 6 7 2 A 7 8 137615 CASAVA_Build 10 78688727 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 16 7 7 2 A 7 8 137616 CASAVA_Build 10 78835362 4I CTAAAACCTT ----/ATTC ATTATTTATC 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 ATTC 0 1 137617 CASAVA_Build 10 78847111 1D TTGGCATACA G/- CAATGTGCTT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 G 1 0 137618 CASAVA_Build 10 78850439 10D TGCAACAAAC AATCAATATT/---------- TATTAATATA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 AATCAATATT 1 0 137619 CASAVA_Build 10 78900909 2I CACACACATA --/AC ACAACTCACA 3070 het 3070 ref 90 41 28 21 AC 1 2 137620 CASAVA_Build 10 78911606 1D AAATCTCATA C/- GTTAATCTTG 3070 het 3070 ref 29 18 7 5 C 1 0 137621 CASAVA_Build 10 78926457 3I TTTACCTACT ---/TGA TGATTTCTCA 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 TGA 1 2 137622 CASAVA_Build 10 78937054 4I AAGAAGGTAC ----/TGTT TGTTTGTTCC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 TGTT 2 3 137623 CASAVA_Build 10 78945527 2D TTCCTGAAGA CT/-- CTGTTCAAGC 3070 het 3070 hom 32 13 13 7 CT 2 1 137624 CASAVA_Build 10 78949260 1D AGATAATTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 T 10 9 137625 CASAVA_Build 10 78959004 1I CCCTCTTTTT -/C CCCCCTGCAC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 C 5 6 137626 CASAVA_Build 10 78962547 1I GTAACCCTGA -/T TAGTCAATAG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 T 1 2 137627 CASAVA_Build 10 78970769 1I ACTTCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2539 hom 28 8 10 10 A 11 12 137628 CASAVA_Build 10 78972771 26D ACAATCAAGA CTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCATT/-------------------------- CTCTCTCTCT 3070 het 2293 hom 35 12 8 22 CTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCATT 2 1 137629 CASAVA_Build 10 78976146 1D CTCTGATCCA C/- CCCCACAGGG 3070 hom 57 het 22 0 19 5 C 5 4 137630 CASAVA_Build 10 78983613 1D TAGTAAATGA G/- TAAACAGACA 3070 het 3070 ref 40 17 11 13 G 1 0 137631 CASAVA_Build 10 78984222 2I TTAGCTGAGC --/GT GTGCTAGTGT 3070 het 2184 hom 20 6 11 3 GT 1 2 137632 CASAVA_Build 10 78985623 14I AAATCTTGTT --------------/TGTATTTGGGGGCC TCTGGTTCTG 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 TGTATTTGGGGGCC 0 1 137633 CASAVA_Build 10 78990823 1I ATGGAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1226 hom 22 3 15 4 T 10 11 137634 CASAVA_Build 10 78990893 1I AAAATACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 35 0 19 16 T 11 12 137635 CASAVA_Build 10 78995134 12I GCACATTTTC ------------/CCAAATTGCTAT CCAAATTGCT 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 CCAAATTGCTAT 1 2 137636 CASAVA_Build 10 78997550 1D ACTGTAAATT A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 1 0 137637 CASAVA_Build 10 79000508 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 1871 het 456 hom 5 1 4 0 A 8 9 137638 CASAVA_Build 10 79006301 1D GTCCCCTCCA C/- TGGAGACGTG 3070 het 3070 ref 52 31 12 9 C 1 0 137639 CASAVA_Build 10 79020548 17D TCTAAATTTA TTTAAATTTCTAAAGGT/----------------- TTTCTCCCTC 3070 hom 75 het 25 0 25 3 TTTAAATTTCTAAAGGT 1 0 137640 CASAVA_Build 10 79021923 1D TAAATAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 9 8 137641 CASAVA_Build 10 79034305 1I CTCATTTCTA -/C CCCCCAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 C 5 6 137642 CASAVA_Build 10 79038692 4D AAGCAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 AG 8 6 137643 CASAVA_Build 10 79039517 1D TGTTCATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 20 8 A 11 10 137644 CASAVA_Build 10 79055788 1D TGATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 862 hom 44 2 32 10 T 13 12 137645 CASAVA_Build 10 79062024 1I TTGGGGAAAC -/A CTGGCCTAGG 3070 hom 110 het 43 0 33 10 A 0 1 137646 CASAVA_Build 10 79064315 12I ACAGAATTTC ------------/AGATGCTACAAA AGACCTGCTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AGATGCTACAAA 0 1 137647 CASAVA_Build 10 79069788 4I TTGAGGTTCC ----/TTTA TTTATTAGCC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TTTA 1 2 137648 CASAVA_Build 10 79074831 2I TGCAACCAGG --/AA AAAAAAAATC 3070 hom 120 het 49 0 41 8 A 8 10 137649 CASAVA_Build 10 79076023 1D AGGAGACTGC T/- GTTCCCTGGC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 1 0 137650 CASAVA_Build 10 79082868 1D CCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 24 11 A 14 13 137651 CASAVA_Build 10 79090147 2D GATATTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 19 10 T 13 11 137652 CASAVA_Build 10 79093777 2I TTTTCTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 31 0 25 6 T 10 12 137653 CASAVA_Build 10 79099672 1I CTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 20 4 A 10 11 137654 CASAVA_Build 10 79182725 4D TCAACAGCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 AAAC 3 2 137655 CASAVA_Build 10 79182953 1I ACTGAACGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 10 11 137656 CASAVA_Build 10 79183924 1D AAGTACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 767 hom 33 3 21 9 A 15 14 137657 CASAVA_Build 10 79206088 1D GCATTATAAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 8 7 137658 CASAVA_Build 10 79208283 1D ACTGACCATT A/- AAAAAAAAAA 3063 het 2924 hom 25 8 9 8 A 14 13 137659 CASAVA_Build 10 79209325 2I GACTGATATC --/TA TATATATATA 3070 het 2656 hom 23 7 10 6 TA 5 6 137660 CASAVA_Build 10 79217824 2D ACAGCTAATC TG/-- TGCTTGATGC 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 TG 2 1 137661 CASAVA_Build 10 79248548 1D ACTTCGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 12 11 137662 CASAVA_Build 10 79263120 1I TTAAAACTCT -/A AATCACAATC 3070 het 3070 hom 52 24 24 4 A 2 3 137663 CASAVA_Build 10 79305275 3D GGGAAGAAAG AGA/--- AGGAGCTGTG 3070 het 3070 ref 42 19 20 5 AGA 1 0 137664 CASAVA_Build 10 79334534 1I TCTTCCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 A 11 12 137665 CASAVA_Build 10 79347288 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2806 het 1674 hom 30 10 9 11 A 13 12 137666 CASAVA_Build 10 79354602 4D AGCAATTTAG TCTC/---- TCTGTCAGTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 TC 3 1 137667 CASAVA_Build 10 79361178 1I CACCTAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 11 12 137668 CASAVA_Build 10 79375684 1I AAACAAACAC -/A AAAAAAACCC 2801 het 2801 ref 25 11 10 4 A 7 8 137669 CASAVA_Build 10 79380526 1I TATCTCCGCC -/T CCCACCCCAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 0 1 137670 CASAVA_Build 10 79438614 1D TTTGTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 2685 het 1952 hom 25 12 7 6 A 17 16 137671 CASAVA_Build 10 79453804 4I CCTTAGTGCC ----/ATCT AGATAAACAC 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 ATCT 0 1 137672 CASAVA_Build 10 79472562 2I CTTTTCCTAG --/CA CACCACAACC 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 CA 1 2 137673 CASAVA_Build 10 79472771 2D GCACACACAT AC/-- ACACATATTT 3070 het 2140 hom 24 8 12 5 AC 3 2 137674 CASAVA_Build 10 79485131 1I AAGTTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2358 hom 22 7 9 6 T 11 12 137675 CASAVA_Build 10 79491514 1D CTCCACAGGA G/- GGGCTGTGAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 9 G 4 3 137676 CASAVA_Build 10 79494336 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2621 hom 20 8 11 2 T 12 11 137677 CASAVA_Build 10 79509581 1I CAGGTTCCCA -/G GGGACACTGG 2846 het 2846 ref 37 23 8 6 G 3 4 137678 CASAVA_Build 10 79515131 1I CACTGTATTG -/C CTAGGCTGGT 3070 hom 83 het 31 0 27 4 C 1 2 137679 CASAVA_Build 10 79524228 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 2727 het 1464 hom 16 6 7 3 A 11 12 137680 CASAVA_Build 10 79535229 1D GTGTGCAGCC T/- AGGGATTTGG 1498 het 1498 ref 18 5 5 8 T 1 0 137681 CASAVA_Build 10 79553700 2I TTTTTTTTTT --/TA AAATTCAGGA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 TA 0 1 137682 CASAVA_Build 10 79555687 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2485 het 1908 hom 20 8 9 3 T 15 14 137683 CASAVA_Build 10 79556529 1D AAACAGATCT C/- GCAGCATGGA 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 C 1 0 137684 CASAVA_Build 10 79560302 1I CTAGCTTTAC -/A AAAAAAAAAA 2847 het 2847 ref 26 12 8 6 A 12 13 137685 CASAVA_Build 10 79565444 1D GAGTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2092 het 1510 hom 40 11 10 19 T 19 18 137686 CASAVA_Build 10 79568971 24D TGTGTGCACA TGTGCATGTGGCTGCATATGTATG/------------------------ TGTGCATGGG 3070 het 3070 ref 54 29 20 14 TGTGCATGTGGCTGCATATGTATG 1 0 137687 CASAVA_Build 10 79570202 1D CCCAAATGCT A/- GCGTCTGCAC 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 A 1 0 137688 CASAVA_Build 10 79589320 1I CTAGGTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 10 11 137689 CASAVA_Build 10 79594497 1D CACTCACACA G/- ATACTTCAGC 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 G 1 0 137690 CASAVA_Build 10 79616158 4I ACATCCTGGG ----/GATA GATAGATGAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 GATA 1 2 137691 CASAVA_Build 10 79617674 1D GCGATCCCCC T/- GCCTCAGCCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 1 0 137692 CASAVA_Build 10 79627974 1I TGGAGTTTTT -/G TAACTGCTAC 3070 hom 146 het 57 0 43 14 G 0 1 137693 CASAVA_Build 10 79632216 13D TTGGGGAAAC TGAGGTTCAGCAG/------------- GGAGGCTACT 3070 het 3070 hom 45 20 24 2 TGAGGTTCAGCAG 1 0 137694 CASAVA_Build 10 79642972 19D TCATCCTCCA GGGCCTCTCCACGTGGCTT/------------------- GGGCCTCTCC 3070 het 3070 ref 30 16 13 7 GGGCCTCTCCACGTGGCTT 1 0 137695 CASAVA_Build 10 79646637 4I ATTTTGTCAC ----/CTAA CTATTAGTCT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CTAA 0 1 137696 CASAVA_Build 10 79665754 1I AAGATCAGAC -/A GTCCAAAAAG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 0 1 137697 CASAVA_Build 10 79670175 2I ATGTTTATGG --/TT TTTTTTTTTT 2172 het 2172 ref 23 7 7 9 T 12 14 137698 CASAVA_Build 10 79672258 1D GCTGGAACAG T/- TTTGGAGGGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 4 3 137699 CASAVA_Build 10 79676894 1I CGTCTGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 10 137700 CASAVA_Build 10 79709140 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 T 10 9 137701 CASAVA_Build 10 79710240 2D TACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 CA 7 6 137702 CASAVA_Build 10 79719629 4D CAGGTGGGGT ACAG/---- ACAGAGACAG 3070 het 3070 hom 53 25 20 9 ACAG 2 1 137703 CASAVA_Build 10 79722895 1D GGTTGATAGA C/- CCAGCTGCTG 3070 het 2166 hom 20 6 9 5 C 3 2 137704 CASAVA_Build 10 79732405 1I GCTGTAAAAA -/G TCTGCCACAC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 G 0 1 137705 CASAVA_Build 10 79734121 1D GTATGATGTT G/- GGGGGGGGGG 1857 het 459 hom 25 3 7 16 G 11 10 137706 CASAVA_Build 10 79738074 7D TAATTTTAAC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1789 het 1314 hom 19 6 7 6 T 21 14 137707 CASAVA_Build 10 79766670 2D GCTAGCCTTG AC/-- AGACGGTAGC 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 AC 1 0 137708 CASAVA_Build 10 79770701 1D CAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 1 0 137709 CASAVA_Build 10 79777332 4I GTTTTCTGAA ----/TGAT TGGTGGAAGG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TGAT 0 1 137710 CASAVA_Build 10 79790805 3D CTGCTCATGG CTT/--- CTTGCCCCAC 2122 het 2122 ref 29 14 8 9 CTT 2 1 137711 CASAVA_Build 10 79820810 9D ATTGGAAGAG AGGCTTAGT/--------- AGGCTTAGTA 3070 hom 74 het 29 0 23 7 AGGCTTAGT 2 1 137712 CASAVA_Build 10 79879305 3I AAGCACTCCC ---/CTT CTTCTCCCCA 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 CTT 1 2 137713 CASAVA_Build 10 79890332 1I GAAATTCAAC -/T TTGGTTCTAG 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 2 3 137714 CASAVA_Build 10 79891860 1D GATACCATGG C/- CCCCAAGGTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 C 5 4 137715 CASAVA_Build 10 79956851 4I ACCCCGTCTC ----/TAAA TAAATAAATA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TAAA 3 4 137716 CASAVA_Build 10 79960637 1I GACCTGCACC -/T TAAGTGGCCT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 1 2 137717 CASAVA_Build 10 79975637 1D TTCTCTTGGC T/- TTTTTTTTTT 2379 het 791 hom 25 7 11 8 T 17 16 137718 CASAVA_Build 10 79977316 4I TCCCTAATCA ----/GGGG GCCTTATGTC 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 G 1 5 137719 CASAVA_Build 10 79978385 4D GAGAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGGAAG 3070 het 3070 ref 38 16 10 15 AG 5 3 137720 CASAVA_Build 10 79993891 1D CTCCCATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 114 hom 36 2 26 10 A 11 10 137721 CASAVA_Build 10 80017614 1D TCACAGGGGG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 9 8 137722 CASAVA_Build 10 80017833 1I TTGCACTGGA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 115 het 45 0 39 6 T 7 8 137723 CASAVA_Build 10 80025629 10D AGTGCTATAG TGATACCAAT/---------- TGATGATCAC 3070 het 608 hom 35 5 13 19 TGATACCAAT 1 0 137724 CASAVA_Build 10 80026638 3D GTGCTGGTGT CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 hom 48 het 27 0 21 6 C 15 12 137725 CASAVA_Build 10 80038551 1I TGTTCTATAG -/T TTTTCTTTAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 5 137726 CASAVA_Build 10 80084222 2D GGCACCAGGC AA/-- AGACTTCACT 3070 het 3070 ref 39 17 18 5 A 3 1 137727 CASAVA_Build 10 80089904 1D CACCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 21 3 T 11 10 137728 CASAVA_Build 10 80115956 1D TAGACCCCCC A/- CACACACACC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 1 0 137729 CASAVA_Build 10 80119717 1I AGCAGGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 639 hom 21 2 13 6 T 15 16 137730 CASAVA_Build 10 80134359 1D CCTCAAAATT A/- AAAACTTAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 5 4 137731 CASAVA_Build 10 80142023 2D TTTTGTTTTT TG/-- TTTTTGTTTT 649 het 649 ref 40 7 7 27 TG 1 0 137732 CASAVA_Build 10 80144349 1D ACTTATAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 39 2 34 4 A 12 11 137733 CASAVA_Build 10 80154439 1I AATTGTAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 144 hom 36 1 29 6 T 9 10 137734 CASAVA_Build 10 80178274 1D AGAAAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 1561 het 1561 ref 39 21 5 14 A 12 11 137735 CASAVA_Build 10 80180593 1D GTGTTCATTC T/- TTTGACAGTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 4 3 137736 CASAVA_Build 10 80182026 1D CTTCTTGTTT A/- AAAAAATGTG 3070 hom 79 het 31 0 27 4 A 7 6 137737 CASAVA_Build 10 80259347 1I GTTTTCTGTA -/T TTTTTTTTTT 1963 het 1963 ref 23 8 6 9 T 10 11 137738 CASAVA_Build 10 80278280 1D AGACACAAGG A/- AAAACGGAGC 3029 het 3029 ref 37 17 7 14 A 5 4 137739 CASAVA_Build 10 80307733 1D GGATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2519 het 1678 hom 20 8 10 2 T 13 12 137740 CASAVA_Build 10 80308739 1I GCCTAATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 A 10 11 137741 CASAVA_Build 10 80314953 1I ACTCCGCCTC -/A AAAAAATAAA 2983 het 2983 ref 27 13 10 4 A 6 7 137742 CASAVA_Build 10 80328331 2D ACCCAAGAGT CA/-- CCAGTAAGAG 3070 het 3070 hom 43 15 24 6 CA 1 0 137743 CASAVA_Build 10 80338924 2D CCAGGGCCTG AC/-- ACACGTAGTA 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 AC 3 2 137744 CASAVA_Build 10 80367379 6I GTGAGAAGCA ------/GGTGGT GGAGGCAGTG 2932 het 2932 ref 40 25 8 7 GGT 0 2 137745 CASAVA_Build 10 80368677 1I TCATGAAAAC -/A AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 6 7 137746 CASAVA_Build 10 80459627 4I GGGAGGCAGA ----/AGAG AGAGAGCCCT 3070 hom 96 het 44 0 31 14 AG 3 5 137747 CASAVA_Build 10 80463047 1I AAAATGAGAC -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 7 8 137748 CASAVA_Build 10 80467996 5I ATCTACAGGT -----/AAACA AAACAGGTTA 3070 hom 101 het 42 0 33 9 AAACA 1 2 137749 CASAVA_Build 10 80471181 7D ACTTTAAAGC AAGTATG/------- AAGTATGATT 3070 hom 90 het 35 0 31 6 AAGTATG 2 1 137750 CASAVA_Build 10 80477473 2I GCTCTTGGGG --/AC ACTTCTCTGT 3070 het 3070 hom 32 8 19 5 AC 1 2 137751 CASAVA_Build 10 80485880 1D CATAGGTGCT G/- GCACCCCTGC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 G 2 1 137752 CASAVA_Build 10 80503602 2I GGGTTGGGTC --/AG GGGCCCGGCA 3065 het 2369 hom 23 8 9 6 AG 0 1 137753 CASAVA_Build 10 80510953 1I ATGTGGTGAA -/T TTGGTCCTCA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 2 3 137754 CASAVA_Build 10 80511950 1D TCTGGCTGTG C/- CCACCAGAAA 3070 het 3070 hom 35 15 11 9 C 3 2 137755 CASAVA_Build 10 80513339 1D TCAGATGTGT C/- CCTCTAAGAT 3070 hom 129 het 54 0 41 13 C 3 2 137756 CASAVA_Build 10 80515052 1D GTTCTGGGGG C/- TCAGCACCAG 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 C 1 0 137757 CASAVA_Build 10 80517138 1D TTTTGACTCC T/- TCCCCAGGGC 3070 hom 153 het 54 0 50 5 T 2 1 137758 CASAVA_Build 10 80558379 1I CCTGGAACTC -/A AATAAATTAG 3070 hom 117 het 43 0 38 5 A 2 3 137759 CASAVA_Build 10 80575108 14I ATTCCGGAGT --------------/GCCCGCGCGACAGA GCCTGCGAGG 3070 hom 71 het 29 0 20 9 GCCCGCGCGACAGA 0 1 137760 CASAVA_Build 10 80578416 1D CGGGGTTTTT A/- ATAAAGCTGC 3070 hom 69 het 26 0 21 5 A 2 1 137761 CASAVA_Build 10 80615575 1D AGAAAAGAAT C/- CCCCTGGAAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 5 4 137762 CASAVA_Build 10 80644810 1I TCTGAGATTT -/A TAAGGAGATG 3070 hom 56 het 21 0 18 3 A 0 1 137763 CASAVA_Build 10 80648283 1D AAACCTAGTG A/- TTAACTATAC 3070 hom 57 het 24 0 20 5 A 1 0 137764 CASAVA_Build 10 80669936 1I CGGGGGCTGC -/A AGCTCGCCCT 1830 het 1830 ref 25 10 6 9 A 1 2 137765 CASAVA_Build 10 80710517 5I TCCCACATTT -----/GAGGG GAGTCTCACC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 GAGGG 0 1 137766 CASAVA_Build 10 80721809 1D GAGGCCCCGT C/- CCCTCTAGGT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 C 4 3 137767 CASAVA_Build 10 80723101 1I CATTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 1152 het 1152 ref 17 8 3 6 T 10 11 137768 CASAVA_Build 10 80732325 3D TCCTGGAGGA GGT/--- GATGACCTGG 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 GGT 1 0 137769 CASAVA_Build 10 80733300 2I GTGTGGACTC --/AG GGGCCCTGTG 2687 het 2687 ref 31 13 7 11 AG 0 1 137770 CASAVA_Build 10 80733696 1D AGCTGCACGA G/- GAAGTGGGGA 3070 het 3070 ref 38 19 9 11 G 2 1 137771 CASAVA_Build 10 80747356 4D GACAGGCTGA CTCT/---- CTCTGAACAG 2845 het 2845 ref 28 12 11 5 CT 4 2 137772 CASAVA_Build 10 80772359 1I AGACCCTCCC -/T TGCAGAGTTA 3070 hom 124 het 51 0 37 14 T 1 2 137773 CASAVA_Build 10 80787182 1I ACTGAAAAAA -/G GGCACTCTGA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 G 2 3 137774 CASAVA_Build 10 80789591 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 2569 het 1278 hom 10 3 6 3 A 10 9 137775 CASAVA_Build 10 80795030 3D TTTCAGAAAG AAA/--- AAGGATTAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 5 2 137776 CASAVA_Build 10 80795664 1D TTTCATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 A 11 10 137777 CASAVA_Build 10 80797182 1D CACCACTGCA C/- CTCAGCTTGG 3070 hom 103 het 38 0 32 6 C 2 1 137778 CASAVA_Build 10 80806954 13D TGTGAGTGCC TGTGTGAGATGTG/------------- TGTGTGAGAT 3070 het 3070 ref 102 44 34 32 TGTGTGAGATGTG 2 1 137779 CASAVA_Build 10 80807656 11D40M2D ATGAGTGCGC GTGTGAGATGTGTGTGAGTGCGCGTGTGACATTTGAGGGTGCGAATGTGAGAT/-----------GTGTGAGTGCGCGTGTGACATTTGAGGGTGCGAATGTGAG-- GTGTGAGGGT 3070 het 3070 ref 64 55 20 25 N/A 0 0 137780 CASAVA_Build 10 80808262 2I AGATGTGTGT --/GA GAGAGATGTG 3070 het 3070 ref 82 41 30 11 GA 3 4 137781 CASAVA_Build 10 80817400 3I GAGAGGGGGC ---/AGG AGAACCTGGA 3070 hom 74 het 26 0 20 6 AGG 0 1 137782 CASAVA_Build 10 80818524 13D CCTAAGTCAG GCCACCTAATGTC/------------- GCCACCTAAT 3070 hom 104 het 43 0 32 12 GCCACCTAATGTC 2 1 137783 CASAVA_Build 10 80824977 1I CTGGCTACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 9 10 137784 CASAVA_Build 10 80828807 1D AGAGACCCCC T/- AGCAGGAATT 3070 hom 60 het 24 0 19 6 T 1 0 137785 CASAVA_Build 10 80850924 1I CATCTATGCC -/A AAGCCACCAC 3070 hom 90 het 36 0 27 9 A 2 3 137786 CASAVA_Build 10 80865683 1D AGAGCTCTAT C/- CCCCTCCTGC 2824 het 2824 ref 33 16 8 11 C 5 4 137787 CASAVA_Build 10 80880504 10D CCCTCTCTAC AAAAAGTACA/---------- AAAAAGTACA 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 AAAAAGTACA 2 1 137788 CASAVA_Build 10 80945633 1I GTGTAGAATG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 23 9 2 T 8 9 137789 CASAVA_Build 10 80955292 3I GAACATGAAC ---/TTG TTGTCAGACA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 TTG 1 2 137790 CASAVA_Build 10 81058031 1D ACCGCTGGAT G/- GGGGTCTGAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 G 5 4 137791 CASAVA_Build 10 81064191 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1694 het 1694 ref 13 6 4 3 T 13 12 137792 CASAVA_Build 10 81080053 1D TCTTATTATT G/- AGTATGATGT 2425 het 489 hom 8 1 5 2 G 1 0 137793 CASAVA_Build 10 81085443 1D CACCAGATAG A/- AAAAGAAAAC 3070 het 2561 hom 20 9 8 3 A 5 4 137794 CASAVA_Build 10 81086873 1I ATGTGCTGAA -/C ATAGTTGGTC 3070 het 3070 ref 52 26 16 10 C 0 1 137795 CASAVA_Build 10 81089483 3I CATAGACCCA ---/TCT TCTTCTTCAC 3070 hom 41 het 20 0 13 7 TCT 2 3 137796 CASAVA_Build 10 81094290 4I GGAATGGGGA ----/TGGT TGGTATTCAA 3070 het 3070 ref 39 26 12 1 TGGT 1 2 137797 CASAVA_Build 10 81096099 2D TAGACAAGAC AT/-- ATATATATCT 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 AT 5 4 137798 CASAVA_Build 10 81098623 2D TGTAAATTAT TG/-- TGTTTTTTCT 3070 het 1658 hom 23 7 11 5 TG 2 1 137799 CASAVA_Build 10 81099220 1D AGACTTTATC T/- TTTTTTTTTC 1372 het 887 hom 16 6 5 5 T 10 9 137800 CASAVA_Build 10 81102379 1D TGCAGAGCTG T/- TAGAGCTGCA 288 het 288 ref 25 14 2 9 T 2 1 137801 CASAVA_Build 10 81131490 2D CTCAGACAGC AG/-- GGGCCGGAGG 1391 het 1391 ref 11 7 3 1 AG 1 0 137802 CASAVA_Build 10 81197490 1D TGCACATGTA T/- TTTTTTTTGT 1875 het 1875 ref 14 9 4 1 T 9 8 137803 CASAVA_Build 10 81220465 4I AATCATACCA ----/GTCT GTCAAGATAT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 GTCT 0 1 137804 CASAVA_Build 10 81255976 1D AGGGGCCAGA G/- GGCCACCCAG 3070 hom 32 het 12 0 11 1 G 3 2 137805 CASAVA_Build 10 81275912 1I ATTTTTTTTT -/A AATTTTTACA 3070 het 424 hom 13 2 11 0 A 2 3 137806 CASAVA_Build 10 81365855 6I TGTATCTCGA ------/CTTATG ATGGGGTGAC 2833 hom 15 het 6 0 6 0 CTTATG 0 1 137807 CASAVA_Build 10 81420629 1D CTTTGTGATA T/- TGTGCATCTT 2478 hom 12 het 5 0 5 0 T 2 1 137808 CASAVA_Build 10 81458042 1I TTAACCCTCA -/C CCCCAGGTCA 2704 hom 16 het 7 0 6 1 C 4 5 137809 CASAVA_Build 10 81502160 2D AGAAAACCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2802 het 6 hom 7 0 6 1 T 16 14 137810 CASAVA_Build 10 81518992 2D CAGATACAAT CA/-- CACTGAGGAT 3070 het 385 hom 11 1 9 2 CA 2 1 137811 CASAVA_Build 10 81535841 1D ACAAATGAAC A/- AAAAAAAAAA 2763 het 547 hom 14 2 8 4 A 13 12 137812 CASAVA_Build 10 81554719 2I TCAACTGAAA --/TT TTGTTTCCTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 2 4 137813 CASAVA_Build 10 81560565 1D ATAATTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 10 9 137814 CASAVA_Build 10 81564739 1I AAAATATGCC -/T TTTTGGAGCT 3070 hom 53 het 22 0 18 4 T 4 5 137815 CASAVA_Build 10 81566347 3I ATTTGCAATT ---/AGG AGTAATAACG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AGG 0 1 137816 CASAVA_Build 10 81568600 6I CATTCTATTC ------/TCTATT TCTATGAGTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TCTATT 0 1 137817 CASAVA_Build 10 81570244 2D AATTATTGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 6 A 12 10 137818 CASAVA_Build 10 81571548 4I TGTTACATTG ----/AAGT AAGGAGAGAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AAGT 0 1 137819 CASAVA_Build 10 81572179 1D TTAAAAAAAT A/- AATAAATTCA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 3 2 137820 CASAVA_Build 10 81572538 1D ATTTCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 870 hom 25 2 20 3 T 11 10 137821 CASAVA_Build 10 81574394 4D CCTGTTAAAC TGTT/---- TGTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 6 TGTT 2 1 137822 CASAVA_Build 10 81580425 4D ATTTTAAAAT AATC/---- AAATTAGCAA 2310 het 2310 ref 15 8 5 4 AATC 1 0 137823 CASAVA_Build 10 81581755 4D GGCAGAGACT GAGA/---- GAGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 42 25 12 7 GA 5 3 137824 CASAVA_Build 10 81581969 4I TTAAATATTT ----/TCAA TCAATTATTT 3070 het 3070 ref 34 23 7 4 TCAA 1 2 137825 CASAVA_Build 10 81584973 4D CTGTCATGAC TGAT/---- TGATTGGTGA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TGAT 2 1 137826 CASAVA_Build 10 81607607 1D TGAAGGTGTT A/- ACTACCAATT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 2 1 137827 CASAVA_Build 10 81615355 3D TTTTTTTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 2184 het 58 hom 18 1 7 10 T 21 18 137828 CASAVA_Build 10 81616391 4D CAATTCAGAC TAAG/---- TGTCAGGCCA 2261 het 2261 ref 39 33 5 3 TAAG 1 0 137829 CASAVA_Build 10 81627249 1I GCTGAAGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 A 11 12 137830 CASAVA_Build 10 81635592 2D CAGCATATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 25 1 16 8 A 14 12 137831 CASAVA_Build 10 81640053 2D TTAGAAAATG TT/-- TAGCCTTCTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 3 1 137832 CASAVA_Build 10 81641390 1D ACTCTGCTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 9 8 137833 CASAVA_Build 10 81644043 2D ACTCCCTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 A 12 10 137834 CASAVA_Build 10 81645026 1D TATTTCACAC A/- AAGACACTGC 3070 het 2104 hom 18 5 11 3 A 3 2 137835 CASAVA_Build 10 81649436 25I CTCAGGCTGG -------------------------/AGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCA CTGCAACCTC 3070 hom 54 het 21 0 18 4 AGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCA 0 1 137836 CASAVA_Build 10 81650590 3I CTTAGCTTTG ---/GAA GAAGAATTTA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 GAA 2 3 137837 CASAVA_Build 10 81655943 1D TTAAAAATTC G/- TTTTTTTCAG 3070 hom 68 het 24 0 23 1 G 1 0 137838 CASAVA_Build 10 81658127 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 913 hom 43 4 25 14 T 15 16 137839 CASAVA_Build 10 81659873 1I TCTTGTTCAA -/T TCAACACTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 1 2 137840 CASAVA_Build 10 81662043 3D ATGGAAATGG AAT/--- ATCTCAATTT 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 AAT 1 0 137841 CASAVA_Build 10 81666710 4I GCTAATAGGT ----/TGAA TGATAAAATA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TGAA 0 1 137842 CASAVA_Build 10 81674393 1I CACATATGAA -/G CCATAGTGTA 3070 hom 154 het 58 0 51 7 G 0 1 137843 CASAVA_Build 10 81674877 2I TTTCCTCCTA --/TC TCTCTCAATG 3070 hom 111 het 46 0 37 9 TC 3 4 137844 CASAVA_Build 10 81674968 1D ATAAGCCTCC T/- TTCCCTGCCC 3070 hom 141 het 51 0 48 4 T 3 2 137845 CASAVA_Build 10 81676489 4I GTGGGCTAAA ----/TATT TATCAGCTAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TATT 0 1 137846 CASAVA_Build 10 81678028 1I ACTGGCGGGG -/C GCTCAGCCCC 3070 hom 64 het 23 0 19 4 C 0 1 137847 CASAVA_Build 10 81681183 1D ATATGTTGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 T 10 9 137848 CASAVA_Build 10 81682482 1I TCATTCTTTC -/A ATAAGAGCTT 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 A 1 2 137849 CASAVA_Build 10 81685359 1I CCACAAATTT -/G GGGTTTTTTT 3070 het 75 hom 36 1 26 9 G 3 4 137850 CASAVA_Build 10 81685588 1D AGGTTGTTTG C/- CCCCCCCCTT 1277 het 133 hom 18 2 5 11 C 9 8 137851 CASAVA_Build 10 81687144 3D ACTGCACTCC GAT/--- ATTGGTGACA 3070 hom 29 het 26 0 18 8 GAT 1 0 137852 CASAVA_Build 10 81687980 4D AGAAGAAGAA AGTC/---- AGGTTGGGGT 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 AGTC 1 0 137853 CASAVA_Build 10 81689704 2I TAGGGCAAAG --/TC TCTGCTTTAA 3070 hom 82 het 30 0 25 5 TC 1 2 137854 CASAVA_Build 10 81699593 3D TCTGTATGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1089 hom 29 9 13 7 T 14 11 137855 CASAVA_Build 10 81702472 2I CTTGGGAAGA --/AT ACAGACCCAC 3070 hom 82 het 31 0 22 9 AT 0 1 137856 CASAVA_Build 10 81703159 2D GACAGGTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 13 15 T 14 12 137857 CASAVA_Build 10 81703741 1D TTTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 19 7 5 T 11 10 137858 CASAVA_Build 10 81703900 7D GATTGTGGTT TGGTTTG/------- GTTCATTTCT 3070 het 3070 ref 34 23 9 4 TGGTTTG 1 0 137859 CASAVA_Build 10 81704163 1I GTCCGCACAT -/G GGAGGACCTG 3070 het 3070 hom 50 15 22 13 G 2 3 137860 CASAVA_Build 10 81705864 1D TTGTGAAAAT G/- TTAACATTGT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 G 1 0 137861 CASAVA_Build 10 81712039 1D AATAATAATT A/- AAAAAAATCA 3070 het 1605 hom 19 4 15 0 A 8 7 137862 CASAVA_Build 10 81713085 2D CGTGTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1654 hom 40 13 13 14 A 16 14 137863 CASAVA_Build 10 81717969 1I CCTGTGCAGG -/T TTGTTACATG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 2 3 137864 CASAVA_Build 10 81727564 4D TTTCTTCCTC TCTT/---- TCTTTCATTA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TCTT 2 1 137865 CASAVA_Build 10 81739444 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2842 het 357 hom 14 1 7 6 A 11 12 137866 CASAVA_Build 10 81739692 1I AAATTGAAAT -/A AAAAAATGAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 6 7 137867 CASAVA_Build 10 81739973 1D CAACCTTGAA G/- AAATTCAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 G 1 0 137868 CASAVA_Build 10 81740218 1I CTCTATACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 11 12 137869 CASAVA_Build 10 81747793 1D CCTCTCTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 A 10 9 137870 CASAVA_Build 10 81751313 1D CACAAAACAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 17 25 1 A 10 9 137871 CASAVA_Build 10 81757825 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 31 1 20 11 A 15 14 137872 CASAVA_Build 10 81763987 1I CTCTACAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 16 1 12 3 A 13 14 137873 CASAVA_Build 10 81765178 2D AATATTTTAC AG/-- AGTTTAACTC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 AG 2 1 137874 CASAVA_Build 10 81770076 1I AGCAGATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2164 hom 52 7 25 20 T 12 13 137875 CASAVA_Build 10 81774315 3D TAAAGATAAC AAT/--- CTTTGGAGAG 3070 het 3070 ref 18 9 8 2 AAT 1 0 137876 CASAVA_Build 10 81774425 2I CTTTGTGGGG --/AA AAAAAAAATG 2147 het 2147 ref 20 10 7 3 A 8 10 137877 CASAVA_Build 10 81776618 3D CTGTTCTTCA GAG/--- AAGAAACACG 3070 het 3070 ref 32 19 8 6 GAG 1 0 137878 CASAVA_Build 10 81778156 1D AGCTGTGCAT A/- TCTGGACTCC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 1 0 137879 CASAVA_Build 10 81778905 10I AAAAGAGGTC ----------/CTGGCTTAAA TAGGGAAAGG 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 CTGGCTTAAA 0 1 137880 CASAVA_Build 10 81780950 3D AGGAAGGGGG GGA/--- GGAAAGGGTT 1770 het 1770 ref 30 18 7 6 GGA 2 1 137881 CASAVA_Build 10 81781544 3D CAATAAAGAT AAC/--- AACCTTTGGA 1382 het 1382 ref 30 27 3 1 AAC 2 1 137882 CASAVA_Build 10 81782593 12D57M2D GGAGTTCTAC ATATATATATATATATATATATATAAAATATATATACATAATATAAATATATATTTTATAAATATAAACAT/------------ATATATATATATAAAATATATATACATAATATAAATATATATTTTATAAATATAAAC-- ATATTTATAT 1452 het 1452 ref 6 4 3 1 N/A 0 0 137883 CASAVA_Build 10 81783438 3D GGCTGGAGTG AGA/--- AGATCACTTG 2074 het 2074 ref 24 14 7 4 AGA 2 1 137884 CASAVA_Build 10 81795370 5I ATGTAGTTTA -----/TTTAT TTTATTTTTA 1130 hom 7 het 5 0 3 3 TTTAT 1 2 137885 CASAVA_Build 10 81803388 1D GAGTGGGGGG A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 8 7 137886 CASAVA_Build 10 81804975 23I AGGATGTGAA -----------------------/GAAATTGGAGCCCCTGAACACTG GAAATGTAAA 3070 hom 69 het 25 0 22 5 GAAATTGGAGCCCCTGAACACTG 0 1 137887 CASAVA_Build 10 81805296 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2271 het 315 hom 15 2 8 6 A 15 14 137888 CASAVA_Build 10 81806872 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 26 0 14 12 A 12 11 137889 CASAVA_Build 10 81810892 18D TCCCCACTTT TTGGATACAATGAATTCA/------------------ TTGGATACAA 3070 hom 63 het 25 0 22 5 TTGGATACAATGAATTCA 2 1 137890 CASAVA_Build 10 81811661 6D ATATACATAT TATATA/------ TATATATATA 1861 hom 12 het 8 0 5 4 TA 11 8 137891 CASAVA_Build 10 81813411 1D ACGCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 311 hom 22 3 16 3 A 17 16 137892 CASAVA_Build 10 81820875 1I TGCTAAAAAT -/A AAAAAAAATA 1641 het 1641 ref 14 6 6 2 A 8 9 137893 CASAVA_Build 10 81825087 2D CGTCTCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 25 3 14 8 A 14 12 137894 CASAVA_Build 10 81828206 2I GAAAAGTGAC --/AG AGGAGTGTCT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AG 1 2 137895 CASAVA_Build 10 81831026 2D AAAAAAAGAC TT/-- TAAGAGTCAT 3070 hom 77 het 27 0 25 2 T 3 1 137896 CASAVA_Build 10 81836205 1D AAACAAAATA T/- TTTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 5 4 137897 CASAVA_Build 10 81837671 5D GAAGTTTATC AATGT/----- AGTCAGTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 AATGT 1 0 137898 CASAVA_Build 10 81838170 2I TTCCATTATG --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 T 8 10 137899 CASAVA_Build 10 81838728 5D GCTCCCTTTG TTTCA/----- TTTCATTTTC 3070 het 3070 hom 44 13 22 10 TTTCA 2 1 137900 CASAVA_Build 10 81843384 9I GAGACTATCC ---------/TGACTAACA TGGCTAACAT 2402 hom 15 het 7 0 5 2 TGACTAACA 0 1 137901 CASAVA_Build 10 81845394 1I AAATTCACTT -/A AAAAAAAAAA 2564 het 2564 ref 24 10 8 6 A 11 12 137902 CASAVA_Build 10 81851369 2D AAGACATCCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 847 hom 30 3 14 13 A 14 12 137903 CASAVA_Build 10 81858603 1I TAGTTCATTC -/G CTTGATACAC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 0 1 137904 CASAVA_Build 10 81860225 1D CTACCTACCC A/- AGGTCACAGA 3070 het 3070 hom 48 22 22 5 A 2 1 137905 CASAVA_Build 10 81863784 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2770 hom 25 8 12 5 A 12 13 137906 CASAVA_Build 10 81868440 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTGAGAT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 G 0 1 137907 CASAVA_Build 10 81870909 2I TGACTTGAAG --/GT ACTCTCACAG 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 GT 0 1 137908 CASAVA_Build 10 81876106 1D ACTTGGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 6 A 14 13 137909 CASAVA_Build 10 81876972 1D GTGCCCTGGG C/- CCACCTCCTA 3070 hom 89 het 36 0 33 4 C 3 2 137910 CASAVA_Build 10 81880312 1I ATGTAAAAGG -/C CCTTTGACGC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 2 3 137911 CASAVA_Build 10 81880579 5D GATTATTTTC TTTTA/----- TTTTAAGATG 2763 het 2763 ref 34 20 9 6 TTTTA 2 1 137912 CASAVA_Build 10 81889956 1I CCAATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 11 12 137913 CASAVA_Build 10 81897962 1D CTGCCCTGGA G/- GGGGGGGTCC 3070 hom 45 het 22 0 16 7 G 8 7 137914 CASAVA_Build 10 81899197 4I TTTGTTGTTG ----/TTGT TTGTTTTCTT 3070 hom 70 het 49 0 24 25 TTGT 1 2 137915 CASAVA_Build 10 81905036 1I TTTCTGGCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 T 9 10 137916 CASAVA_Build 10 81915963 1D AACAACCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 11 10 137917 CASAVA_Build 10 81925323 1D GAGACAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3041 hom 26 8 11 8 A 9 8 137918 CASAVA_Build 10 81926367 1D GCCCCCAAAG T/- CCTGGCTGGT 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 T 1 0 137919 CASAVA_Build 10 81930247 3D AGAAGCCACA CAG/--- CAGTGACACC 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 CAG 2 1 137920 CASAVA_Build 10 81936444 1D CTTCTCTCCT C/- CTGCCTGCCT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 C 2 1 137921 CASAVA_Build 10 81937396 4D GACACAGGTC TCTG/---- TCTTTGTTTA 2596 het 2596 ref 38 13 9 19 TCTG 1 0 137922 CASAVA_Build 10 81938142 7I CCACTCTGAG -------/CCTTTCT CCTTTCTCCT 3070 het 3070 ref 47 29 12 6 CCTTTCT 1 2 137923 CASAVA_Build 10 81938217 18D GTATTCTCAC ATATATATATATATATAT/------------------ ATATATATAT 3070 het 281 hom 24 2 17 10 AT 15 6 137924 CASAVA_Build 10 81938442 8I TGGATTACTA --------/CGAGGACT TGAGGACTAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 CGAGGACT 0 1 137925 CASAVA_Build 10 81944261 1D AGGAAGAGTC G/- GGGGGGGAAG 3070 hom 77 het 29 0 23 6 G 8 7 137926 CASAVA_Build 10 81964855 1I AGTATCTGTG -/C CCTGCAGGTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 2 3 137927 CASAVA_Build 10 81994477 1I ATGGAAAAAA -/G GATGCTCCAC 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 G 1 2 137928 CASAVA_Build 10 82009277 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 935 hom 28 3 17 9 A 17 16 137929 CASAVA_Build 10 82012838 1D ATAATCTTGT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 G 2 1 137930 CASAVA_Build 10 82021918 10I GCTGCCTCTC ----------/CCAGCCTGAA CCAGCACCAT 3070 hom 53 het 22 0 16 6 CCAGCCTGAA 0 1 137931 CASAVA_Build 10 82022522 1D TTCTAAAGCT G/- CTGGTCAGTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 0 137932 CASAVA_Build 10 82035044 4D TTGCTAAAAA TAAT/---- TATCTATTTG 3070 hom 126 het 50 0 41 13 TAAT 1 0 137933 CASAVA_Build 10 82040022 6D CAGAGAACAA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 36 0 33 3 TG 14 11 137934 CASAVA_Build 10 82041661 1D TGCATCTCGC T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 5 137935 CASAVA_Build 10 82066257 4D CATCAGAAGG AACA/---- AACTCTGGAC 3070 het 105 hom 33 1 29 3 AACA 1 0 137936 CASAVA_Build 10 82071632 1D CAAAAATAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 10 9 137937 CASAVA_Build 10 82076594 2D CTGGCTCAGT GA/-- GAGAGCCATG 3070 hom 69 het 28 0 23 6 GA 3 2 137938 CASAVA_Build 10 82085437 1D CCACCACCAC G/- CCCGGCTAAT 3070 hom 57 het 20 0 17 3 G 1 0 137939 CASAVA_Build 10 82089225 1D GAACAAGAGA T/- TTTTAAGGAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 5 4 137940 CASAVA_Build 10 82094799 2I ATGAGAAAAT --/AG AGTGTTTAAA 3070 hom 99 het 38 0 33 6 AG 1 2 137941 CASAVA_Build 10 82104833 1I ACATTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1621 hom 52 4 38 10 A 11 12 137942 CASAVA_Build 10 82114447 2D ATGTCTAGAC TA/-- TGTGCAAGTT 3070 hom 138 het 52 0 46 7 TA 1 0 137943 CASAVA_Build 10 82115891 1D GCCTCAGCCT C/- CCAAGTAGCT 1946 hom 12 het 6 0 5 1 C 3 2 137944 CASAVA_Build 10 82117682 2D AAAACTGAAA CT/-- CTACACCCAT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 CT 2 1 137945 CASAVA_Build 10 82118376 1I49M2D TTTGTATATC -TTTTTTGGAAAAATGTCTATTCAAGTCCTTTGCCCATTTTTTAATTGCATT/TTTTTTTGGAAAAATGTCTATTCAAGTCCTTTGCCCATTTTTTAATTGCA-- TTTTTTTTTT 3070 hom 135 het 32 0 46 5 N/A 0 0 137946 CASAVA_Build 10 82119800 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 9 8 137947 CASAVA_Build 10 82120417 1I CCTTCAGTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 8 9 137948 CASAVA_Build 10 82122566 1I GAAAACACTT -/G AAGGTTCAGA 3070 hom 108 het 44 0 34 10 G 0 1 137949 CASAVA_Build 10 82128717 1D GCTGAAGGCT G/- GGGTGGCTAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 4 3 137950 CASAVA_Build 10 82133006 1D AAATAGGTAG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 86 het 33 0 28 5 T 8 7 137951 CASAVA_Build 10 82134978 1D CTTTGTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1878 hom 33 het 22 0 8 14 T 17 16 137952 CASAVA_Build 10 82135022 2I GGAGTGCAGT --/GG AGTACGATCA 3070 hom 34 het 18 0 12 6 G 0 2 137953 CASAVA_Build 10 82154627 1I GTAAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 290 het 290 ref 43 21 5 17 A 7 8 137954 CASAVA_Build 10 82167495 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 620 hom 39 7 20 12 T 13 12 137955 CASAVA_Build 10 82172386 1I TAGGTATTTC -/T TTTGATTTGT 3070 hom 31 het 36 0 16 20 T 3 4 137956 CASAVA_Build 10 82174087 14D AGAAGATCAC TTGAGCCCAGGAAT/-------------- TTGAGACCAC 3070 het 3070 hom 20 9 11 3 TTGAGCCCAGGAAT 1 0 137957 CASAVA_Build 10 82178883 6I4M2I TGGGATTACA ------AGCT--/GGCATGAGCTAC CACGCCTGGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 N/A 0 0 137958 CASAVA_Build 10 82192082 4D CTCAAAAAAC AAAA/---- GAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 A 4 0 137959 CASAVA_Build 10 82193821 1I AATGAGACAA -/G GGGGCTTTGT 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 G 4 5 137960 CASAVA_Build 10 82194533 8D GACAGACTGA CACACACG/-------- CACACACACA 3070 het 3070 hom 36 17 16 4 CACACACG 1 0 137961 CASAVA_Build 10 82194691 2D TCCCCAAAGC TG/-- TGTGACAGGG 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 TG 3 2 137962 CASAVA_Build 10 82196401 1D19M4I ACACCCACTT AACCTTCAGCAGGTGCCCAT----/-ACCTTCAGCAGGTGCCCATTCTG TCTACTTCCA 3070 het 3070 hom 48 21 30 9 N/A 0 0 137963 CASAVA_Build 10 82197696 3I TCCCTCCCTC ---/CCT CATCCTTTCC 1729 het 1729 ref 23 12 5 6 CCT 0 1 137964 CASAVA_Build 10 82207975 10D AGTGGTAGCG AGGTGACTGA/---------- AGGTGGACTC 3070 het 3070 ref 46 23 17 11 AGGTGACTGA 1 0 137965 CASAVA_Build 10 82246455 1D TTTACTGATC T/- TTTCTTCCAT 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 T 4 3 137966 CASAVA_Build 10 82249653 3D GAGGGAGACA AAG/--- AAGGTCACTT 3070 het 3070 ref 31 11 11 10 AAG 2 1 137967 CASAVA_Build 10 82252857 1D TAAGATGGGT G/- GGGATGGAGC 1780 het 1780 ref 24 9 7 8 G 4 3 137968 CASAVA_Build 10 82269251 4I TTGATGATGA ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 36 0 25 11 T 13 17 137969 CASAVA_Build 10 82279627 1I AAACTCAGTG -/T TATTTCTCTC 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 T 1 2 137970 CASAVA_Build 10 82410863 22D GTATGCACTC TAATATGGAGATTAGAGTTCTA/---------------------- ATCTAATATG 3070 het 3070 ref 43 21 18 8 TAATATGGAGATTAGAGTTCTA 1 0 137971 CASAVA_Build 10 82413075 1D ACTTAAAAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 T 10 9 137972 CASAVA_Build 10 82432052 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1665 het 56 hom 17 1 6 10 T 18 16 137973 CASAVA_Build 10 82434734 1I ACTTGAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 10 11 137974 CASAVA_Build 10 82436398 1D GCACGGCCTG T/- TGCCCAATCC 3070 hom 141 het 53 0 38 16 T 2 1 137975 CASAVA_Build 10 82448563 2D ATATTAAAAC AT/-- ATGAAACATG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 AT 2 1 137976 CASAVA_Build 10 82456190 3D GTTAGAAAAT AGG/--- AGAGTGAGAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 AGG 1 0 137977 CASAVA_Build 10 82458313 4D AAGAATTTTC TTAA/---- TTTTTAAGAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 6 TTAA 1 0 137978 CASAVA_Build 10 82459929 1D GTTCGGGGCC T/- TTCGCAGCCT 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 3 2 137979 CASAVA_Build 10 82469059 1D GAGACTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1920 het 1920 ref 30 9 7 15 A 15 14 137980 CASAVA_Build 10 82488284 1D TGCCTAACAC A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 29 11 13 7 A 8 7 137981 CASAVA_Build 10 82554124 2D TCTCAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2084 het 237 hom 29 3 8 18 A 20 18 137982 CASAVA_Build 10 82559424 1I TTCAGGCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2559 hom 26 9 12 5 T 13 14 137983 CASAVA_Build 10 82563359 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 12 11 137984 CASAVA_Build 10 82566027 1D GGTAACAAAA C/- AGAAGTTGTT 3070 het 3070 hom 46 15 25 6 C 1 0 137985 CASAVA_Build 10 82566152 1D AAAACCCAAA G/- GTTGGCCAGG 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 G 2 1 137986 CASAVA_Build 10 82578202 1D CAGATCCCAA G/- GGGGGCCAAG 1078 het 1078 ref 29 17 5 8 G 6 5 137987 CASAVA_Build 10 82583340 1I AAAACAAAAC -/A AAAACAAATA 3070 het 1633 hom 16 6 8 2 A 4 5 137988 CASAVA_Build 10 82583628 1I GCATGGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 10 11 137989 CASAVA_Build 10 82585654 1I TGCTATCCCT -/C CCCCTTACCC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 C 4 5 137990 CASAVA_Build 10 82599011 1I27M1I GTCTGGCCAA -TTTTTTTTTAAGACCTCAAAGGCACAG-/TTTTTTTTTTAAGACCTCAAAGGCACAGA ACAACAAAAA 3070 het 3070 ref 32 26 17 6 N/A 0 0 137991 CASAVA_Build 10 82599756 5I CTGGAGGACA -----/TTATG TTAAGTGAAA 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 TTATG 0 1 137992 CASAVA_Build 10 82605079 1D GAGAGGATTC A/- GGCCATGAAC 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 A 1 0 137993 CASAVA_Build 10 82613024 1D TATGACTTTG C/- GTTTCTAAAG 3070 het 3070 hom 40 12 26 3 C 1 0 137994 CASAVA_Build 10 82614763 4I ATTCATTAGC ----/ATTA ATTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 ATTA 0 1 137995 CASAVA_Build 10 82617856 1I AGTTTTGGCA -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 T 6 7 137996 CASAVA_Build 10 82618458 4D ATTACACGTC AAGT/---- AAGCACAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 24 6 AAGT 1 0 137997 CASAVA_Build 10 82621784 1I GTCTTGCTAC -/T TTTATTCCAC 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 T 3 4 137998 CASAVA_Build 10 82624832 1D GTGGTTTGAT G/- CATCCATCAA 3070 het 3070 ref 19 11 8 2 G 1 0 137999 CASAVA_Build 10 82626960 1I TGCCCATTCA -/G TATGATGTCG 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 G 0 1 138000 CASAVA_Build 10 82642882 1D TGACCATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 A 12 11 138001 CASAVA_Build 10 82650738 1D GCAATGCATC T/- GCATCTTCTC 3070 het 3070 ref 48 23 21 5 T 1 0 138002 CASAVA_Build 10 82658253 1D AAGTCATCAG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 9 8 138003 CASAVA_Build 10 82658985 4D ACAATAAATA AATT/---- ACCTGTCTTA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 AATT 1 0 138004 CASAVA_Build 10 82674191 1I TGCCCTCCTA -/C CCCATGGTCT 3070 het 3070 ref 53 25 19 9 C 3 4 138005 CASAVA_Build 10 82697999 3D CCACCACCGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 31 0 23 8 A 15 12 138006 CASAVA_Build 10 82702448 1D GGGCCCCCCC T/- CAACACCTGG 2181 het 2181 ref 24 12 5 7 T 1 0 138007 CASAVA_Build 10 82704501 1D GAATCTCAGA T/- AAGACCTTTT 3070 het 3070 hom 15 7 7 1 T 1 0 138008 CASAVA_Build 10 82706825 3I GTGTTTTTCT ---/TGG TGACTTTTTA 3070 hom 123 het 46 0 40 6 TGG 0 1 138009 CASAVA_Build 10 82708072 7D TTTGATTTAT TTTCAAG/------- TTTCATCACT 3070 het 3070 ref 39 28 10 4 TTTCAAG 1 0 138010 CASAVA_Build 10 82709671 4D TTTTACAGTG CCAC/---- CCACTTATTG 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 CCAC 2 1 138011 CASAVA_Build 10 82711506 3I GACAGTTCAC ---/AGA AGAAGGACTA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 AGA 1 2 138012 CASAVA_Build 10 82713918 1I TAACTGGAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 8 9 138013 CASAVA_Build 10 82715925 4I ACAAATAAAT ----/TATC TATAAAATGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TATC 0 1 138014 CASAVA_Build 10 82716377 1D ATGGGAGGGA C/- AAAAATTAAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 C 1 0 138015 CASAVA_Build 10 82719247 1D ATAAAATAAT A/- AAAATAATTG 3070 het 3070 ref 35 22 10 4 A 5 4 138016 CASAVA_Build 10 82724442 4D GAACTTCTTG TACA/---- ACCAAAAGAC 3070 het 3070 ref 43 20 19 6 TACA 1 0 138017 CASAVA_Build 10 82725981 1I TTCCTTATTT -/A TTTTTGATAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 0 1 138018 CASAVA_Build 10 82731337 5I ATATCATATA -----/TTAAC TTATCTTTGG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TTAAC 0 1 138019 CASAVA_Build 10 82731926 1I TTTCAAAGAA -/C CAACTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 C 1 2 138020 CASAVA_Build 10 82736562 1D GCTTCCTGCT C/- CCCTCAAGCC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 C 4 3 138021 CASAVA_Build 10 82736923 1I TTTTTGCTGT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 0 1 138022 CASAVA_Build 10 82738479 1D CTAGGAGGTG A/- AGGAAGAGAG 3070 het 3070 hom 47 21 23 4 A 2 1 138023 CASAVA_Build 10 82740189 1D TTTGAGTTTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 T 8 7 138024 CASAVA_Build 10 82743664 3D ATTTTGTCAC TAT/--- TATTATTCAG 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 TAT 3 2 138025 CASAVA_Build 10 82744696 2D ACCTTAAGTT TA/-- TATGAGTCCT 3070 het 3070 hom 23 9 10 5 TA 2 1 138026 CASAVA_Build 10 82751618 1D TTTTAGCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 13 12 138027 CASAVA_Build 10 82752474 11I TATACGTTGA -----------/AAGTTTGAGCC AAGAAGATTA 3070 het 3070 ref 42 15 13 14 AAGTTTGAGCC 0 1 138028 CASAVA_Build 10 82764800 1D ATGTGTGTGA G/- GGGGGCAGAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 G 6 5 138029 CASAVA_Build 10 82770115 1I TTTCCCCCCC -/T ACAAGGATAC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 0 1 138030 CASAVA_Build 10 82787721 1D6M1D4M1D AAGATATATA GGAACAAGTTCAG/-GAACAA-TTCA- ATGCCGCCAA 3070 hom 102 het 37 0 35 5 N/A 0 0 138031 CASAVA_Build 10 82848662 1I TTTTGGGGAG -/A GGGGGGATAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 0 1 138032 CASAVA_Build 10 82865215 1D CTTAGACCAC T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 8 7 138033 CASAVA_Build 10 82869285 4I AGTGTGTGTG ----/TGTC TGTCTGTGCC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 TGTC 1 2 138034 CASAVA_Build 10 82870036 1I AAAACTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 10 11 138035 CASAVA_Build 10 82871096 1D TTTTTTTTTT C/- CTCCATGAAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 C 2 1 138036 CASAVA_Build 10 82875555 1D CTTCCTGGTA T/- TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 7 6 138037 CASAVA_Build 10 82881283 1I TTATTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 2471 het 470 hom 26 4 10 12 T 14 15 138038 CASAVA_Build 10 82894916 1I GTTGCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 1013 het 1013 ref 24 19 3 2 A 11 12 138039 CASAVA_Build 10 82902280 4D AAAGGAAATT AGAA/---- AGTACACTCA 3070 het 3070 ref 43 20 17 8 AGAA 1 0 138040 CASAVA_Build 10 82925842 1I ATAAAATAAA -/C TTTTTAAACA 3070 het 2907 hom 23 7 13 3 C 0 1 138041 CASAVA_Build 10 82937844 4D TTACATTTAT GGAA/---- GGAATATTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GGAA 2 1 138042 CASAVA_Build 10 82946184 4I GGCTTTTGTA ----/TTAC TTAAAGAAGT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 TTAC 0 1 138043 CASAVA_Build 10 83009546 1D CTTGGATTGC T/- TTTTTTTTTC 1567 het 1567 ref 50 39 4 7 T 10 9 138044 CASAVA_Build 10 83011642 1I CTGTTTAAAA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 6 7 138045 CASAVA_Build 10 83011884 1I GCTAGTGTGC -/T TTTCTTACCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 3 4 138046 CASAVA_Build 10 83019705 1D CACCTCGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 11 10 138047 CASAVA_Build 10 83021548 4D ATACAAAAAT TAAC/---- TAAACATTGG 3070 het 3070 hom 36 17 17 4 TAAC 1 0 138048 CASAVA_Build 10 83041582 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2535 hom 28 8 18 2 A 10 11 138049 CASAVA_Build 10 83048325 4I TATCTTTAAC ----/TAAG TGAGTTTAAT 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 TAAG 0 1 138050 CASAVA_Build 10 83058143 1D TACAGCTCGT A/- AAAGCAGCGT 3070 het 2590 hom 19 7 8 4 A 4 3 138051 CASAVA_Build 10 83060905 4D AGAATAAAGG ACAA/---- ACAATCACAT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 ACAA 2 1 138052 CASAVA_Build 10 83064885 1D AGCAATGCAT G/- GGGGAATTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 5 4 138053 CASAVA_Build 10 83065842 1D AGGTGATCCG C/- CCCCCCTTGG 3070 het 46 hom 30 2 19 10 C 7 6 138054 CASAVA_Build 10 83067204 1D TCTCTGGTTA C/- TTGGATAAGT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 C 1 0 138055 CASAVA_Build 10 83070772 1D ATGTAGTCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 9 8 138056 CASAVA_Build 10 83072043 2I TTTCTGAGAC --/AG AGTCTCGCTC 2962 het 2906 hom 21 9 8 4 AG 1 2 138057 CASAVA_Build 10 83093458 1D TTTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 12 11 138058 CASAVA_Build 10 83103547 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGG 2936 het 2445 hom 21 6 8 7 A 9 8 138059 CASAVA_Build 10 83104235 5I TTTGAGTCTT -----/TTCTC TTTTTTTCTT 3070 het 2897 hom 42 9 23 10 TTCTC 0 1 138060 CASAVA_Build 10 83104312 1D CATTCCCCCA C/- CCCCCCCCTT 3070 het 2456 hom 26 7 10 9 C 9 8 138061 CASAVA_Build 10 83106506 3D AATAATTTAC TCT/--- TTTTTATTGT 3070 het 3070 hom 36 17 16 5 TCT 1 0 138062 CASAVA_Build 10 83107517 2D TATGGGCAGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 11 9 138063 CASAVA_Build 10 83116478 4I GCTCTGATCT ----/TTAA TTAAAATACT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TTAA 1 2 138064 CASAVA_Build 10 83119574 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 13 14 138065 CASAVA_Build 10 83123457 3D TCACTGCTTG TTA/--- TTATTGGTCG 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 TTA 2 1 138066 CASAVA_Build 10 83127649 2D TAGGACTTCT AG/-- TATTATGTTG 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 AG 1 0 138067 CASAVA_Build 10 83137015 1I GCTGGCACTC -/A AACAATACTT 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 A 2 3 138068 CASAVA_Build 10 83138720 1D ATGAACTTGG A/- ACTAGTCTCA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 2 1 138069 CASAVA_Build 10 83142355 1D TTGATAGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3066 hom 44 17 15 12 T 13 12 138070 CASAVA_Build 10 83148079 1I GAAAATGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 14 15 10 A 10 11 138071 CASAVA_Build 10 83150552 1I GTTACCCCCC -/T GGTACATCAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 0 1 138072 CASAVA_Build 10 83154059 1D CTATTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 28 12 8 A 11 10 138073 CASAVA_Build 10 83158396 1D GATTAGTTTG T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 7 6 138074 CASAVA_Build 10 83158640 4I CTGCTATGAA ----/TGTT TGTGGGAAGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TGTT 0 1 138075 CASAVA_Build 10 83163723 1D AAAATTGTTC T/- CTTTTCTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 T 1 0 138076 CASAVA_Build 10 83180029 1D AACGCAATCA T/- CACAGGGTCC 3070 het 2106 hom 17 5 11 1 T 1 0 138077 CASAVA_Build 10 83189146 1I ACTGTATTGG -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 T 6 7 138078 CASAVA_Build 10 83196047 4D CTTTCTTTCC TTCT/---- TTCTTTCTTT 2846 het 2846 ref 33 12 11 10 TTCT 4 3 138079 CASAVA_Build 10 83215385 2D GATTCGATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1991 hom 30 7 11 12 T 15 13 138080 CASAVA_Build 10 83226143 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 2902 hom 38 13 15 10 AC 10 9 138081 CASAVA_Build 10 83233838 1D TTTTCTTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 8 A 10 9 138082 CASAVA_Build 10 83250306 1D TAAGGTGTGA T/- TTTTTTCTAG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 7 6 138083 CASAVA_Build 10 83260954 1I TCAACTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 685 hom 27 4 19 4 T 12 13 138084 CASAVA_Build 10 83263940 1I ATCAAGATAA -/T TCTCTTTGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 138085 CASAVA_Build 10 83270675 4D AATTTTTCTT ACTC/---- ACCCATGCAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 ACTC 1 0 138086 CASAVA_Build 10 83288123 2D TGTTAAGTAC AT/-- ATAGTTGTAA 3070 het 3070 ref 51 26 23 2 AT 2 1 138087 CASAVA_Build 10 83290991 2D40M2D TGTGTGTGTG TATATATATATATATACACACATATAATATATACATAGATAGAT/--TGTATATATATATACACACATATAATATATACATAGATAG-- ATATATATAT 2218 het 2218 ref 22 15 10 3 N/A 0 0 138088 CASAVA_Build 10 83292962 18D ACTGTTAAAC TATATATATATATATATA/------------------ TATATATATA 3070 het 1083 hom 16 5 8 4 TA 16 7 138089 CASAVA_Build 10 83293612 1I AAATATTTTG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 7 8 138090 CASAVA_Build 10 83293862 1D ACATGCGAAA G/- AATAAATTTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 G 1 0 138091 CASAVA_Build 10 83299708 2I TCAGTATTCT --/TA AAGAAAACAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TA 0 1 138092 CASAVA_Build 10 83303677 1I TGCAGCTATA -/G AAAGGAATGA 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 G 0 1 138093 CASAVA_Build 10 83312265 5I TTTTAGATAG -----/GGCCC CCCAGGCAAT 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 GGCCC 0 1 138094 CASAVA_Build 10 83312382 3D TGAAGAAAAT AGA/--- AGATTAGATA 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 AGA 2 1 138095 CASAVA_Build 10 83323579 4D ACACACACAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 2449 hom 21 6 14 3 AT 7 5 138096 CASAVA_Build 10 83327426 1I CTGGAGACTT -/G GGAGGGCTCA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 G 2 3 138097 CASAVA_Build 10 83327883 1I CTTTTTATCA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 7 8 138098 CASAVA_Build 10 83330032 1D GAAGACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 44 0 16 29 A 11 10 138099 CASAVA_Build 10 83332315 5I TTTCATGTAG -----/ATTTT ATTTTGTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 ATTTT 1 2 138100 CASAVA_Build 10 83333740 1I AGAATGTGTA -/T TAGTTTAGCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 2 138101 CASAVA_Build 10 83335311 14D TATAGCCTAG TAGGCTATGCCGTC/-------------- TAGTTTGTGT 3070 het 3070 ref 56 31 20 7 TAGGCTATGCCGTC 1 0 138102 CASAVA_Build 10 83337391 8D TGTGTGTGTT TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 758 hom 37 8 19 10 TG 13 9 138103 CASAVA_Build 10 83343922 2I CAACAATGTG --/TA TATATATATC 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 TA 4 5 138104 CASAVA_Build 10 83350192 10I TTTGAAATAA ----------/CTTTTAATGT CTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 34 24 9 1 CTTTTAATGT 0 1 138105 CASAVA_Build 10 83353280 1I TTGGGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 16 12 T 11 12 138106 CASAVA_Build 10 83355607 1D GAACTCCAAT A/- ATTTTTATTC 3070 het 2698 hom 16 7 7 3 A 2 1 138107 CASAVA_Build 10 83360744 3I TAAGTCTAGC ---/TAG TCTGAAAAGG 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 TAG 0 1 138108 CASAVA_Build 10 83361913 3I AGTAAATACT ---/GTA TGTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 GTA 0 1 138109 CASAVA_Build 10 83363508 3D TAAAATGGAG GAA/--- GAAGAAGAAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 GAA 4 3 138110 CASAVA_Build 10 83366077 1D ACAATATGAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 8 138111 CASAVA_Build 10 83366410 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 19 0 11 8 A 10 11 138112 CASAVA_Build 10 83372098 4D21M4D TTTTTTTACC TAATTATTTTGGTATGATGTATCACATTG/----TATTTTGGTATGATGTATCAC---- ATTGATTGGC 3070 het 3070 ref 33 19 17 4 N/A 0 0 138113 CASAVA_Build 10 83372756 1I TTAACTTTTC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 8 9 138114 CASAVA_Build 10 83375280 3D TGAATTGCTC TCT/--- TCTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 TCT 2 1 138115 CASAVA_Build 10 83382633 1I TGCTTTTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 T 9 10 138116 CASAVA_Build 10 83398137 1I ACACTGGCTG -/T CCCTACAGTT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 T 0 1 138117 CASAVA_Build 10 83399931 1I TGTTCTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3020 het 3020 ref 26 8 9 9 T 9 10 138118 CASAVA_Build 10 83411080 1D TGGGAGTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 T 10 9 138119 CASAVA_Build 10 83422338 1D AACCCAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 81 hom 27 2 13 13 T 15 14 138120 CASAVA_Build 10 83450017 1D TAGAAAATCT A/- AAAAAAAAAA 1285 het 1285 ref 26 19 3 4 A 12 11 138121 CASAVA_Build 10 83477056 1D CCTAAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 2507 het 2507 ref 45 26 8 11 A 13 12 138122 CASAVA_Build 10 83479324 1D AAGGAAGGAA G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 G 8 7 138123 CASAVA_Build 10 83480149 3D TGCCAGAGTG ATA/--- ATAACAAGGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 ATA 2 1 138124 CASAVA_Build 10 83495365 1I CAAGTAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 11 10 14 T 11 12 138125 CASAVA_Build 10 83498088 1D TCAAGCAGAG A/- AAAAAACTAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 7 6 138126 CASAVA_Build 10 83500770 3D AATATTTATT TTG/--- TTGTTGTCGT 3070 het 3070 ref 41 21 16 7 TTG 3 2 138127 CASAVA_Build 10 83523475 4I ACTTTATTAT ----/GATA GATAGAGGCT 3070 het 3070 hom 47 11 28 8 GATA 1 2 138128 CASAVA_Build 10 83550276 1I TTTTTAACCA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 18 10 G 1 2 138129 CASAVA_Build 10 83550390 1D GTTTCTATAT A/- AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 7 6 138130 CASAVA_Build 10 83553044 2D ACCTATAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 30 0 24 6 T 13 11 138131 CASAVA_Build 10 83553416 3D AATCACTCTC ATT/--- ATTAATAGAA 3070 hom 110 het 45 0 35 13 ATT 2 1 138132 CASAVA_Build 10 83554626 1I CAGGCTCTAC -/A AAAAGCTTCC 3070 hom 95 het 39 0 32 7 A 4 5 138133 CASAVA_Build 10 83557501 1I TGCTAGAGAT -/A AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 6 7 138134 CASAVA_Build 10 83558213 1D GGAAGAATTA G/- GTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 G 2 1 138135 CASAVA_Build 10 83560218 4I TCATATTAAT ----/TAAC TAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 TAAC 0 1 138136 CASAVA_Build 10 83561737 1I CAAAAAGTAA -/C CCATAATGGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 C 2 3 138137 CASAVA_Build 10 83563724 1I TATAAAAATG -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 27 7 17 3 A 6 7 138138 CASAVA_Build 10 83565107 1I GTTTAATGAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 49 28 14 7 T 8 9 138139 CASAVA_Build 10 83570718 1D TCCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 15 8 T 13 12 138140 CASAVA_Build 10 83596034 1I TCTCTCATAC -/A AATAATTATC 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 2 3 138141 CASAVA_Build 10 83596377 1I AAATATAAAG -/T TTTTTCTGAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 5 6 138142 CASAVA_Build 10 83598357 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1747 hom 27 12 11 4 C 0 1 138143 CASAVA_Build 10 83610138 1D TAAATGATAC T/- TTGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 3 2 138144 CASAVA_Build 10 83610595 1D TATTTGGTTC T/- TTTTTTTATC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 138145 CASAVA_Build 10 83613556 1I ATTATGACAT -/A AAAGATCCAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 3 4 138146 CASAVA_Build 10 83620220 1D CAAAACAAAA C/- AAAAAAAACA 2780 het 2780 ref 25 12 10 4 C 1 0 138147 CASAVA_Build 10 83622361 1I AACGTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 T 10 11 138148 CASAVA_Build 10 83622967 1D AGGATTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2791 hom 31 10 13 8 T 13 12 138149 CASAVA_Build 10 83646397 1I AATCTAGGGC -/T TTTTTTTTTT 2655 het 2655 ref 35 17 7 11 T 13 14 138150 CASAVA_Build 10 83662821 1I ACCATTGGGG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 7 8 138151 CASAVA_Build 10 83662914 8D TCATTGATGG AGTAACCA/-------- AGGGCTTGGT 3070 het 3070 ref 34 20 9 7 AGTAACCA 1 0 138152 CASAVA_Build 10 83673474 1I TTCCCCCTTG -/T TTTTATCTTC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 4 5 138153 CASAVA_Build 10 83675484 1D CTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 10 9 138154 CASAVA_Build 10 83688130 1I GTGTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 G 0 1 138155 CASAVA_Build 10 83689440 2D TGATCTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 A 12 10 138156 CASAVA_Build 10 83763469 1D TTATCTCTAA T/- TTTCTCACTC 3070 hom 69 het 25 0 24 2 T 4 3 138157 CASAVA_Build 10 83773459 1D GGCAAGTCAA T/- TTTTTTAACG 3070 hom 141 het 52 0 47 6 T 7 6 138158 CASAVA_Build 10 83784435 13I CTGTTTCTTA -------------/CTTTCTATATTAC CTCCTTGTCA 3070 hom 153 het 55 0 50 6 CTTTCTATATTAC 0 1 138159 CASAVA_Build 10 83790145 7D TATACAATAT ATATGTA/------- ATATGTAATC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 ATATGTA 2 1 138160 CASAVA_Build 10 83791563 4I TCTCTCTCTC ----/TGTG TCTGTCTATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TG 0 2 138161 CASAVA_Build 10 83793899 1D TGTACCACAT A/- AGTTTATTGT 3070 hom 132 het 47 0 45 3 A 2 1 138162 CASAVA_Build 10 83801768 1I CCGCATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 562 hom 45 3 27 15 T 15 16 138163 CASAVA_Build 10 83804579 1I CCAGATCTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1423 hom 23 6 13 4 A 9 10 138164 CASAVA_Build 10 83807055 1I ACTCCTACTC -/T CAATTTCTGT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 0 1 138165 CASAVA_Build 10 83807710 1D CTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 195 hom 34 1 26 7 T 14 13 138166 CASAVA_Build 10 83809240 4I AAAACGTGAT ----/AGAA AGAAGGAGGA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 AGAA 1 2 138167 CASAVA_Build 10 83811579 2D AGTGTCCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 1281 het 1281 ref 48 26 4 19 TC 10 9 138168 CASAVA_Build 10 83813056 1D CGCAAATGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 A 10 9 138169 CASAVA_Build 10 83816758 1D TATACAAAAG T/- TAAGAGGCTT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 2 1 138170 CASAVA_Build 10 83822430 1I TATAGATGAC -/T TTTTTTTTTG 2418 het 2418 ref 17 7 5 5 T 9 10 138171 CASAVA_Build 10 83825691 1I AAACATAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 A 11 12 138172 CASAVA_Build 10 83833970 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 6 7 138173 CASAVA_Build 10 83836947 17D TGACAATTGT ATTAAGACTTTATGGAC/----------------- ATAAGACCTA 3070 het 3070 hom 41 17 26 4 ATTAAGACTTTATGGAC 1 0 138174 CASAVA_Build 10 83840492 2I ATTTGAACTC --/TG TATATCTGAA 3070 het 3070 ref 61 32 26 3 TG 0 1 138175 CASAVA_Build 10 83845037 1D TGCTTAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 8 A 12 11 138176 CASAVA_Build 10 83850601 1D TATTAGGAAG A/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 A 1 0 138177 CASAVA_Build 10 83851525 1D ACTTGAAAAT G/- TCTATTACTG 3070 het 3070 hom 30 11 13 9 G 1 0 138178 CASAVA_Build 10 83878489 1I ATTTCTGGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 8 9 138179 CASAVA_Build 10 83881271 1D TTTGTGGTTT C/- CCTATCAAAT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 3 2 138180 CASAVA_Build 10 83889651 4I CACCAGATTT ----/GTGA GTTAGTCTCT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 GTGA 0 1 138181 CASAVA_Build 10 83901449 4D CCCTTATTGT CTTA/---- CTTCCCCAAA 3070 hom 138 het 47 0 47 4 CTTA 1 0 138182 CASAVA_Build 10 83902452 2D4M3D ATATGGAAAA TGCCATATA/--GCAT--- TTTGAAATCT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 N/A 0 0 138183 CASAVA_Build 10 83907482 5I TGGTGTTATT -----/GGAGA GTAAGTTAAA 3070 hom 187 het 70 0 63 7 GGAGA 0 1 138184 CASAVA_Build 10 83919732 1D TTCATGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1318 hom 45 3 34 8 T 13 12 138185 CASAVA_Build 10 83921117 1D TTTAAAGCAC T/- GCTTCTACTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 0 138186 CASAVA_Build 10 83923007 1D ATACATTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 57 20 20 17 T 12 11 138187 CASAVA_Build 10 83931930 2I TTTTAATCTA --/CT CTCTGCCACT 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 CT 2 3 138188 CASAVA_Build 10 83937695 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 39 0 36 3 A 11 10 138189 CASAVA_Build 10 83959082 2I ACATATTACA --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CT 5 6 138190 CASAVA_Build 10 83971006 1D GAGAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 2414 het 2414 ref 33 13 9 12 A 12 11 138191 CASAVA_Build 10 84001678 1I TGTGGGGTGA -/G GGGCATTGCC 3070 het 38 hom 28 1 24 3 G 3 4 138192 CASAVA_Build 10 84059203 1I TTTGCATTAC -/A AAAAAAAAAA 1430 het 1430 ref 35 19 4 12 A 13 14 138193 CASAVA_Build 10 84093802 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1638 hom 25 4 17 4 T 10 9 138194 CASAVA_Build 10 84102621 1D TGCTATGTGG T/- TTTTTTTTTT 1178 het 1178 ref 39 24 3 12 T 15 14 138195 CASAVA_Build 10 84125273 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1376 het 470 hom 11 1 6 4 A 15 16 138196 CASAVA_Build 10 84130004 2I GCAGATCAGA --/TT TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 T 8 10 138197 CASAVA_Build 10 84133164 1I TTCCTTTTTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 A 8 9 138198 CASAVA_Build 10 84137011 1D TAAAACACTC A/- AAATATATAT 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 A 4 3 138199 CASAVA_Build 10 84137922 1D GAGATTCATT A/- AAAAACATTA 3070 het 3070 hom 40 11 24 6 A 6 5 138200 CASAVA_Build 10 84142629 1I TATATATATA -/T TATATATTTT 527 het 527 ref 22 10 3 9 T 1 2 138201 CASAVA_Build 10 84142764 1I CACCTTTCTG -/A CAGGAATGGG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 0 1 138202 CASAVA_Build 10 84151134 2I TTATATATAG --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 49 29 18 2 AC 4 5 138203 CASAVA_Build 10 84156827 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2153 hom 23 6 13 4 T 8 9 138204 CASAVA_Build 10 84159226 1I ATGAGTCTGA -/G GCTGGGTAGA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 G 1 2 138205 CASAVA_Build 10 84160187 2D CCATATATAC AT/-- ATATATATAT 1967 het 1001 hom 14 3 6 5 AT 7 6 138206 CASAVA_Build 10 84171562 1D AAAGGACCCC T/- TTCTCTCTTT 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 T 3 2 138207 CASAVA_Build 10 84172380 1D TTTTGTTTTG T/- TTTGTTTTGA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 T 4 3 138208 CASAVA_Build 10 84175142 1D TAAATGGAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 10 9 138209 CASAVA_Build 10 84178106 8D TTTCATAATT GTTGGTAC/-------- GTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 GTTGGTAC 1 0 138210 CASAVA_Build 10 84189110 1D TTTATACTTT A/- AAACAAATTA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 4 3 138211 CASAVA_Build 10 84192950 1D GGATGCACTT G/- GTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 G 2 1 138212 CASAVA_Build 10 84193095 1I TCTAGATGGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 8 9 138213 CASAVA_Build 10 84211451 11I GGCACAGTGC -----------/TTGATGTGTAG TTGATACTTG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 TTGATGTGTAG 0 1 138214 CASAVA_Build 10 84250373 3D CTTTGGCAAT AAG/--- GAGGAAGCAG 3070 het 3070 ref 53 27 21 6 AAG 1 0 138215 CASAVA_Build 10 84277059 2D AAAAAAAAAA AT/-- ATTAGTAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AT 2 1 138216 CASAVA_Build 10 84283254 1I GAATTATCCA -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 6 7 138217 CASAVA_Build 10 84286404 1I CAAGAAATTG -/T GATGGAATGA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 0 1 138218 CASAVA_Build 10 84297236 2I TACATATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 TA 5 6 138219 CASAVA_Build 10 84299591 1D ATTAGATGAA T/- TTCTCAGTGT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 T 3 2 138220 CASAVA_Build 10 84301343 1I TAAAATACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 11 12 138221 CASAVA_Build 10 84307291 2D TAATTTTCAC AT/-- GTTTTCTCCC 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 AT 1 0 138222 CASAVA_Build 10 84317014 1D CACTAAGGAT A/- TTTCTCATGA 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 A 1 0 138223 CASAVA_Build 10 84322333 2D TGGTTTTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 TG 7 6 138224 CASAVA_Build 10 84343298 1I TCTCGGCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 9 10 138225 CASAVA_Build 10 84345520 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1825 hom 27 4 20 3 A 13 12 138226 CASAVA_Build 10 84357076 73D GTAATGCTCC TCTTTATCACTGATAATTCTCTTTGCTCTGAAGTTGCCTTGATTGGAAATTAATATAGCTGCTCCAGGTTGCT/------------------------------------------------------------------------- TTTGATTAGA 1802 het 1802 ref 19 31 4 2 TCTTTATCACTGATAATTCTCTTTGCTCTGAAGTTGCCTTGATTGGAAATTAATATAGCTGCTCCAGGTTGCT 1 0 138227 CASAVA_Build 10 84368667 1D ATAGGAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 11 10 138228 CASAVA_Build 10 84374441 2I ATATGCATAC --/AT ATATATATAT 2199 het 2199 ref 17 7 5 5 AT 6 7 138229 CASAVA_Build 10 84376740 1D TATTTAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1526 het 1526 ref 45 33 4 8 T 11 10 138230 CASAVA_Build 10 84385960 2D TATCTACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 31 15 13 4 TG 8 7 138231 CASAVA_Build 10 84387666 1D TATAAAAAAA T/- GTCCTCATTT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 1 0 138232 CASAVA_Build 10 84392004 1I GTAGATGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 32 0 25 7 T 11 12 138233 CASAVA_Build 10 84393635 6D CACACACACA CACACC/------ CACACACACA 1059 het 899 hom 29 11 7 13 CACACC 1 0 138234 CASAVA_Build 10 84407641 1I ACATACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2100 hom 39 7 27 5 A 13 14 138235 CASAVA_Build 10 84408298 1D AAAAAGCCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 A 10 9 138236 CASAVA_Build 10 84411988 1D GGTGTGGGTT G/- GGGGCAAGAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 G 5 4 138237 CASAVA_Build 10 84433771 2D CAGAGCGCCC CT/-- GTGTTCACTG 3070 het 3070 hom 42 21 19 3 CT 1 0 138238 CASAVA_Build 10 84435914 1D CTATGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1588 hom 23 5 13 5 T 12 11 138239 CASAVA_Build 10 84440013 2D AATTGGCCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 10 10 T 14 12 138240 CASAVA_Build 10 84442597 1I AACTGAGGGG -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 5 6 138241 CASAVA_Build 10 84447922 3D ATTTTTTTGT TTC/--- TTTTCTTTGG 3070 het 3070 ref 53 26 22 7 TTC 1 0 138242 CASAVA_Build 10 84448539 1I ATGTATTTGC -/T GTCAGTACTG 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 T 0 1 138243 CASAVA_Build 10 84455494 1D AAATCTATCC A/- AGTGATCCAC 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 A 2 1 138244 CASAVA_Build 10 84457305 1D GTTTGTTTTT G/- TTTTTGTAGA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 G 1 0 138245 CASAVA_Build 10 84461941 5I AGGGATTTTA -----/TATAT TATATTCTAT 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 TATAT 1 2 138246 CASAVA_Build 10 84484743 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2721 het 2721 ref 32 11 11 10 A 11 12 138247 CASAVA_Build 10 84485670 5D AAAAAGAAAG ATAAT/----- AGAATATTAA 3070 het 3070 ref 15 8 7 1 ATAAT 1 0 138248 CASAVA_Build 10 84486765 1I CAAGAATTTA -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 7 8 138249 CASAVA_Build 10 84487815 1I CTAAGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 A 12 13 138250 CASAVA_Build 10 84487978 1I GACCAGTGTG -/T TTGCATAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 2 3 138251 CASAVA_Build 10 84489737 4D TCTTTTTCTT TCTC/---- TCTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 18 8 TC 4 2 138252 CASAVA_Build 10 84557935 1I CACACGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 701 hom 31 2 22 7 A 12 13 138253 CASAVA_Build 10 84559678 1I TCTACACAGG -/T TTTTTTTTTT 1718 het 1718 ref 36 26 4 6 T 11 12 138254 CASAVA_Build 10 84635600 1I GCCTGGCCTA -/T TTTTTTTTTT 2707 het 1165 hom 17 5 8 4 T 11 12 138255 CASAVA_Build 10 84703694 1I ATTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 874 hom 35 2 25 8 A 13 14 138256 CASAVA_Build 10 84729948 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2862 hom 26 8 13 5 A 11 10 138257 CASAVA_Build 10 84745011 2D TTAAATGTTC AA/-- GACAGGTTAG 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 A 2 0 138258 CASAVA_Build 10 84759596 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 hom 66 het 23 0 22 1 G 3 4 138259 CASAVA_Build 10 84793576 1I CTGTTAACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 14 20 11 T 9 10 138260 CASAVA_Build 10 84896792 5I TAAAAACGTA -----/TAATG TAAAGTCATA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TAATG 0 1 138261 CASAVA_Build 10 84928061 10I AATGTATATT ----------/AATGTCTATC ACAAAGCATG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AATGTCTATC 0 1 138262 CASAVA_Build 10 85057178 1I CCAAAGTATG -/A AAAAATCCAC 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 A 5 6 138263 CASAVA_Build 10 85068865 1D AAGAGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 A 11 10 138264 CASAVA_Build 10 85073728 3I AGCCAGGTGC ---/AGA AGAACAGACA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AGA 1 2 138265 CASAVA_Build 10 85093461 1I ACTGTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 15 17 13 T 13 14 138266 CASAVA_Build 10 85096575 1D TTAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 15 8 A 11 10 138267 CASAVA_Build 10 85101851 15D AAGAACAGAA TAAAAGATAAAAGAC/--------------- TAGATACCTA 3070 het 3070 hom 37 14 23 5 TAAAAGATAAAAGAC 1 0 138268 CASAVA_Build 10 85104303 1D GTAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 15 8 A 11 10 138269 CASAVA_Build 10 85109597 1I TGGTATCTCA -/T TGTGGTTTTG 3070 het 2484 hom 21 6 13 2 T 1 2 138270 CASAVA_Build 10 85112848 3I ATTATTTATA ---/TGT TATTTTGCTT 3070 het 3070 ref 28 13 7 8 TGT 0 1 138271 CASAVA_Build 10 85130798 1D TATCTGATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 T 11 10 138272 CASAVA_Build 10 85137259 5I TCCTTTTTTT -----/CTTTC CTTCCTGTCT 3070 het 3070 ref 48 29 13 6 CTTTC 0 1 138273 CASAVA_Build 10 85141161 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 948 het 90 hom 11 1 3 7 T 12 13 138274 CASAVA_Build 10 85145788 1D GAGAGCTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 10 9 138275 CASAVA_Build 10 85148425 2D GGAAATAATA AT/-- AGTGTCTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 AT 1 0 138276 CASAVA_Build 10 85151375 1I GCCCTCAGTC -/A AAAATCTTCC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 4 5 138277 CASAVA_Build 10 85160508 2I ACTATAAAAC --/TA TCGGATGACA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 TA 0 1 138278 CASAVA_Build 10 85181252 1D CTATGTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 18 13 T 13 12 138279 CASAVA_Build 10 85186137 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 10 9 138280 CASAVA_Build 10 85188374 4I TAGAGGTTAA ----/AGTT AGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 AGTT 1 2 138281 CASAVA_Build 10 85192195 1I TTTACAGCAA -/T TTGGTAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 2 3 138282 CASAVA_Build 10 85198433 1D AACAAACAAA C/- AAAAAACCAC 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 C 1 0 138283 CASAVA_Build 10 85199241 4I TAAATGAGTT ----/AAAC AAGCCAATAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 AAAC 0 1 138284 CASAVA_Build 10 85199874 1D TGCAGAAAAA T/- TTTTGAGAAG 3070 het 3070 ref 54 29 19 7 T 5 4 138285 CASAVA_Build 10 85202119 1D TCAGACAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 A 11 10 138286 CASAVA_Build 10 85209976 1D AAAATAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 A 11 10 138287 CASAVA_Build 10 85213609 1D GTCTCTGGTG C/- TTTTCTAGTT 2889 het 2428 hom 13 5 8 0 C 1 0 138288 CASAVA_Build 10 85214316 4I GCAGGGGGAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 33 19 7 7 AAAC 3 4 138289 CASAVA_Build 10 85214474 1D AAAAGTAAAG T/- TTGCTAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 3 2 138290 CASAVA_Build 10 85215447 1D AAACATAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 A 10 9 138291 CASAVA_Build 10 85216227 1I CCAATATCAC -/T GATGAATATT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 0 1 138292 CASAVA_Build 10 85218933 5D TATCTACATT AAAAA/----- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 13 8 138293 CASAVA_Build 10 85220839 1D AAACAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 11 10 138294 CASAVA_Build 10 85222062 2I AAAAACAAAC --/AT ATATCAATGG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 AT 2 3 138295 CASAVA_Build 10 85231008 4D TCACAGTTTG TTTA/---- TTCATTCACC 3070 het 3070 ref 45 24 20 1 TTTA 1 0 138296 CASAVA_Build 10 85231627 1D TAGTTTTAGA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 8 7 138297 CASAVA_Build 10 85232303 18D68M2I ACTTGTTTTC TGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGATTTTGTTTTGTTTTATTGGTTTTACTAGTTTTTTGCTTTTAAGTTTTT--/------------------TGTGTGTGTGTGTGTGTTGATTTTGTTTTGTTTTATTGGTTTTACTAGTTTTTTGCTTTTAAGTTTTTTA TTATTGTTGT 3070 het 3070 ref 44 36 15 23 N/A 0 0 138298 CASAVA_Build 10 85233701 29D TTTACCTTTA TGTGTAACAAATATATTTGTTATATTTTT/----------------------------- TGTGTAGCTT 3070 het 3070 ref 35 23 14 5 TGTGTAACAAATATATTTGTTATATTTTT 1 0 138299 CASAVA_Build 10 85235250 1D ATCACTCAAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 T 9 8 138300 CASAVA_Build 10 85239087 3I TAGTCTCCTC ---/CTT CTGCTCCCTG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 CTT 0 1 138301 CASAVA_Build 10 85239839 2I CAACAACAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 A 10 12 138302 CASAVA_Build 10 85240506 4I ACTTAAGTGA ----/TGCC ACCATATAGG 3070 het 3070 ref 50 29 21 0 TGCC 0 1 138303 CASAVA_Build 10 85251713 1I CAATAAGGAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 T 8 9 138304 CASAVA_Build 10 85253221 1D TGACCAAAAC T/- AGTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 1 0 138305 CASAVA_Build 10 85254128 1I GGATCGAATA -/G GTTTGCAAAT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 G 1 2 138306 CASAVA_Build 10 85256046 3D AGTAATTGAT AGA/--- AGTAGTCCGA 3070 het 3070 hom 41 13 23 6 AGA 1 0 138307 CASAVA_Build 10 85256931 4D AGTTTAATAA TAAG/---- TAATTTATAT 3070 het 3070 ref 32 15 15 4 TAAG 1 0 138308 CASAVA_Build 10 85272616 1I AATTTCTTGT -/C CTCCTATGCA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 C 1 2 138309 CASAVA_Build 10 85276097 16D GCTCCAGAGA GGGAGCTCATGCTAGG/---------------- GGGAGCTCAT 3070 het 3070 hom 63 26 24 16 GGGAGCTCATGCTAGG 2 1 138310 CASAVA_Build 10 85279439 1I TTTTTAAAAG -/A TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 A 0 1 138311 CASAVA_Build 10 85282255 1D AAGATATATA C/- AAAAATATTC 2049 het 2049 ref 19 13 5 1 C 1 0 138312 CASAVA_Build 10 85284384 2I GTGTTTACCA --/TG TGTCAGGCAC 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 TG 1 2 138313 CASAVA_Build 10 85285774 1D AGAAAAAATT A/- AAAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 A 6 5 138314 CASAVA_Build 10 85291809 4I CTTAAACACT ----/GTAA GTTTCACTCA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 GTAA 0 1 138315 CASAVA_Build 10 85292663 2D GCATTCTCGC TG/-- TGTTTGCTTT 3070 het 3070 hom 48 19 24 6 TG 2 1 138316 CASAVA_Build 10 85316699 1I CCAAGTAGAT -/A TAAAATAAAC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 0 1 138317 CASAVA_Build 10 85335235 1D CTAGTTTGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 11 7 T 10 9 138318 CASAVA_Build 10 85345652 10D GATGCCTTTA ACCATGCCTC/---------- ACCTTCAGAA 3070 het 3070 ref 41 24 15 6 ACCATGCCTC 1 0 138319 CASAVA_Build 10 85370685 1D CAAGGCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 16 10 A 13 12 138320 CASAVA_Build 10 85385658 4I GGGTGTAAAT ----/TATA TATAATTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 TA 2 4 138321 CASAVA_Build 10 85397361 1I CTCTGTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 T 13 14 138322 CASAVA_Build 10 85402443 1D CACCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 11 10 138323 CASAVA_Build 10 85408850 4D AGCATTTCTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 TTTA 3 2 138324 CASAVA_Build 10 85413219 1I ACATATAAAT -/G GGGGGCACCA 3070 het 3070 ref 51 32 16 3 G 5 6 138325 CASAVA_Build 10 85415061 3I GGAGTTCAAG ---/GTC GTCAGCCTGG 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 GTC 1 2 138326 CASAVA_Build 10 85420023 1D GTATGTAGCC T/- TTTCATACTG 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 4 3 138327 CASAVA_Build 10 85420819 1D ACCCGAGAGG C/- GGAGCTTGCA 3070 het 448 hom 14 2 8 5 C 1 0 138328 CASAVA_Build 10 85423028 1D ATAGATGAAG A/- AAAGAGTTTG 3070 hom 141 het 53 0 47 6 A 4 3 138329 CASAVA_Build 10 85427010 6I GACACTAGAC ------/TTAAAG TTAATGAGAT 3070 hom 105 het 39 0 34 5 TTAAAG 0 1 138330 CASAVA_Build 10 85428849 10I TTCCTTAAAC ----------/AGAAAAGCCG AGGCATAGAA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 AGAAAAGCCG 0 1 138331 CASAVA_Build 10 85430366 1I TTTTCCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 34 1 29 4 T 11 12 138332 CASAVA_Build 10 85431245 2D GCTATACATT AA/-- GTCTCCAGAA 3070 het 3070 ref 42 23 13 8 A 2 0 138333 CASAVA_Build 10 85438626 2D CACACACACA CC/-- CCCAGAGGGA 2027 het 2027 ref 23 11 9 3 C 5 3 138334 CASAVA_Build 10 85445991 1I GAAGAAAGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 9 10 138335 CASAVA_Build 10 85495163 1I TGGTGGTGAC -/A AAAATCTCTC 1955 het 881 hom 6 2 4 0 A 4 5 138336 CASAVA_Build 10 85503700 1D GGGGAAACCA C/- CCCCCATGAT 3070 hom 128 het 48 0 42 7 C 6 5 138337 CASAVA_Build 10 85507324 2I TTTATGACAA --/AC ACACAGCTAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AC 2 3 138338 CASAVA_Build 10 85507641 1D CTATTTCTCT A/- AACTGAGAAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 3 2 138339 CASAVA_Build 10 85508607 3D TTAAAGAAAT ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 ATA 4 3 138340 CASAVA_Build 10 85509127 4D CAACCCAGCA CTTT/---- CTTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 CTTT 1 0 138341 CASAVA_Build 10 85516084 1I ACAGAGAAAA -/C ATTTTTAAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 0 1 138342 CASAVA_Build 10 85518837 1I GAATGAAAGA -/G ATGTTTAGGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 0 1 138343 CASAVA_Build 10 85527199 2D AATATTAGAC TT/-- AAAATAGACT 3070 het 3070 ref 46 26 14 7 T 2 0 138344 CASAVA_Build 10 85543118 1D TCTGTTTATC T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 114 het 40 0 37 3 T 8 7 138345 CASAVA_Build 10 85559754 1D TGCAGGCAAT A/- AGGGTTTCCT 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 A 2 1 138346 CASAVA_Build 10 85566720 1D CTGCCTCCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2796 hom 31 10 17 4 T 10 9 138347 CASAVA_Build 10 85574239 2D GAAAAATAGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 A 11 9 138348 CASAVA_Build 10 85575234 1D GAAGCAAAGT G/- GGGCTGGCAC 3070 hom 105 het 44 0 35 9 G 4 3 138349 CASAVA_Build 10 85577010 5D GCATCAACTT GATTG/----- GATTGAAGGA 3070 het 3070 hom 48 18 29 1 GATTG 2 1 138350 CASAVA_Build 10 85577794 1I AGAAAAAAAA -/T AAATACTATT 3070 het 3058 hom 22 9 12 1 T 0 1 138351 CASAVA_Build 10 85585667 1D GAATTTCTCC T/- TCATCATAGC 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 2 1 138352 CASAVA_Build 10 85588897 1I AAATTTATAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 8 9 138353 CASAVA_Build 10 85614714 1I ACCTTCATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 A 11 12 138354 CASAVA_Build 10 85632992 1D TTATTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 12 11 138355 CASAVA_Build 10 85668464 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2526 het 492 hom 18 2 10 6 A 14 15 138356 CASAVA_Build 10 85676276 3I GGCTTTATTT ---/CCC CCATTAACTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 2 5 138357 CASAVA_Build 10 85677668 1I GTAAAAATGA -/T TGCAGCCATT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 1 2 138358 CASAVA_Build 10 85683542 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 1748 hom 10 het 4 0 4 0 A 9 10 138359 CASAVA_Build 10 85683665 13D AGCCGAGAGT GAGCTTGCAGTGA/------------- GCGCCACTGC 2609 hom 15 het 6 0 6 1 GAGCTTGCAGTGA 1 0 138360 CASAVA_Build 10 85752938 3D GTATCCAAAA TGT/--- TATTATCTGG 3070 het 3070 ref 45 23 17 9 TGT 1 0 138361 CASAVA_Build 10 85755728 1D GAGATTTTGA T/- TTAATCAGGA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 3 2 138362 CASAVA_Build 10 85779590 2I TTACAGAAAC --/TT TGTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 T 1 3 138363 CASAVA_Build 10 85790113 1D CAGGCTGGAG C/- TGCAGTGGCA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 C 1 0 138364 CASAVA_Build 10 85803678 2I CAGTTGCCTT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 60 17 28 15 CA 7 8 138365 CASAVA_Build 10 85804926 2D AATGAGAATG TA/-- TATATATATA 1041 het 1041 ref 45 35 3 8 TA 7 6 138366 CASAVA_Build 10 85814748 1I CCATCCCCCT -/A AAAAAAAAAG 1693 het 1693 ref 25 12 7 6 A 9 10 138367 CASAVA_Build 10 85815107 1D ATTTAATCTA C/- CCCCAAAGAC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 C 5 4 138368 CASAVA_Build 10 85819046 1D GAGGCAGTGG A/- GGCCCCTGGG 2796 het 2796 ref 29 16 6 7 A 1 0 138369 CASAVA_Build 10 85838923 4I ATAAATACTA ----/TACT TACTTACTGC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 TACT 2 3 138370 CASAVA_Build 10 85840762 2D TGCACGCACG CA/-- CACACACACA 3070 het 2239 hom 34 9 17 9 CA 9 8 138371 CASAVA_Build 10 85841241 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 51 het 26 0 18 9 A 8 7 138372 CASAVA_Build 10 85854080 3I TCTTGTTCAA ---/AAG AAGAACCTAA 2705 het 2705 ref 29 21 6 2 AAG 1 2 138373 CASAVA_Build 10 85855177 1D ATATTTGAGA T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 6 5 138374 CASAVA_Build 10 85857370 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 A 9 10 138375 CASAVA_Build 10 85899282 12I AATTTTTTAC ------------/TGTAATTTTTAT GAAATTGTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TGTAATTTTTAT 0 1 138376 CASAVA_Build 10 85906032 3D AGTAAAAGTT GAA/--- GAAGTAGAAT 3070 hom 135 het 49 0 46 4 GAA 2 1 138377 CASAVA_Build 10 85906439 5D TTTCCACCTT TAAAG/----- TAAGATTCTT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TAAAG 1 0 138378 CASAVA_Build 10 85949907 3D GCTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1984 hom 24 9 12 5 A 17 14 138379 CASAVA_Build 10 85956067 1D GGAGGAAACG T/- TGGACTCCCA 3070 het 3070 hom 38 13 13 12 T 2 1 138380 CASAVA_Build 10 85983240 1I CAAAGGTGAT -/C CAGCTAGATT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 C 1 2 138381 CASAVA_Build 10 85985331 16D GTTCTCTGCT GTATTCCCAGCACCTA/---------------- GAATTGGAAG 3070 het 3070 ref 45 27 19 4 GTATTCCCAGCACCTA 1 0 138382 CASAVA_Build 10 85991236 9I CGTCCCACCG ---------/GCCCAGCAA GCCCAGCAAG 3070 hom 54 het 27 0 18 9 GCCCAGCAA 1 2 138383 CASAVA_Build 10 85999114 1D AGTGGTGTGA C/- CTCGGCTCAC 1673 het 1673 ref 17 7 4 7 C 2 1 138384 CASAVA_Build 10 86005380 1D CGTAACAAGC A/- ACAAAGATTA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 2 1 138385 CASAVA_Build 10 86006755 1D AGTTAAGAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 9 8 138386 CASAVA_Build 10 86009070 2I TACTGTAAAC --/AG AGCTGTGATA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 AG 1 2 138387 CASAVA_Build 10 86009844 1D CTTGAGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2393 hom 25 10 10 5 T 13 12 138388 CASAVA_Build 10 86011286 1I TTTTAGGATC -/T TTGTCCCCTG 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 2 3 138389 CASAVA_Build 10 86024137 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 8 9 138390 CASAVA_Build 10 86035734 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 1774 hom 15 5 10 0 A 9 8 138391 CASAVA_Build 10 86046833 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 535 hom 23 2 14 7 T 15 14 138392 CASAVA_Build 10 86051017 1D ATATTTGGTG C/- TATATATTTC 3070 hom 75 het 31 0 26 6 C 1 0 138393 CASAVA_Build 10 86051261 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 397 hom 27 3 17 7 TA 5 6 138394 CASAVA_Build 10 86054579 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 22 1 12 9 T 11 10 138395 CASAVA_Build 10 86057404 1D CTGTTGCCCA G/- GCTGGTCTTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 2 1 138396 CASAVA_Build 10 86067541 1D ATTGGTGTAC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 41 25 11 5 T 9 8 138397 CASAVA_Build 10 86088041 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAAAAAAAAC 3070 het 89 hom 23 1 16 7 AC 1 0 138398 CASAVA_Build 10 86090206 2I CAGAATATAC --/AA ATAAGCAATT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 1 3 138399 CASAVA_Build 10 86098479 1I AAGTTTTGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 T 7 8 138400 CASAVA_Build 10 86100116 1I TATTTAATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2628 hom 22 8 8 6 T 9 10 138401 CASAVA_Build 10 86100854 2D AAATTGTACC TA/-- GATAGTTCAT 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 TA 1 0 138402 CASAVA_Build 10 86102054 10I AAACAAAAAC ----------/AAACAAAAAA AAAATAGGTG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 AAACAAAAAA 0 1 138403 CASAVA_Build 10 86108514 2D ATCTCCACTC TT/-- TTCAGGTACA 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 T 4 2 138404 CASAVA_Build 10 86113821 1D TATAAAAGAG A/- AAAAAATGGT 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 A 7 6 138405 CASAVA_Build 10 86125272 2D TGTTGGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2759 het 671 hom 27 6 7 15 T 16 14 138406 CASAVA_Build 10 86128004 1I GATAATGAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 T 8 9 138407 CASAVA_Build 10 86129347 1I TAGCAGTTAG -/T TTCTTTTTAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 2 3 138408 CASAVA_Build 10 86129983 1I GATTTTGTCA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 7 8 138409 CASAVA_Build 10 86130258 1I TGCTCATATA -/T TGGCGTGTGT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 1 2 138410 CASAVA_Build 10 86133037 1I TGCTTTGATC -/T TTTTTATTTA 2532 het 2532 ref 15 7 6 2 T 5 6 138411 CASAVA_Build 10 86144468 4I TTTTTAAAAT ----/AAGA AAGATATAAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAGA 1 2 138412 CASAVA_Build 10 86144960 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1389 het 382 hom 21 4 6 11 A 19 18 138413 CASAVA_Build 10 86149662 4D TTTCTTTCTT TAAG/---- TAACCATCTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TAAG 1 0 138414 CASAVA_Build 10 86152922 1I10M1I TTGAAAAAGG -TTAGAGGCAG-/TTTAGAGGCAGT TTTAACAAAT 3070 hom 114 het 34 0 39 5 N/A 0 0 138415 CASAVA_Build 10 86157226 9D CTTCTTGCTT ACTTCTCAG/--------- TTAACTTTCG 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 ACTTCTCAG 1 0 138416 CASAVA_Build 10 86157897 1D ACAGAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 5 A 11 10 138417 CASAVA_Build 10 86159046 1I ATTTAAAAAA -/T ATTTTTTTTT 1987 het 1702 hom 12 5 5 2 T 0 1 138418 CASAVA_Build 10 86159313 1I GATTGCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 11 12 138419 CASAVA_Build 10 86168753 1D AACTAGCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 22 19 11 T 10 9 138420 CASAVA_Build 10 86169101 15I CAAAAAAAAA ---------------/AAATAAAATAAAAAT AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 AAATAAAATAAAAAT 0 1 138421 CASAVA_Build 10 86178422 1D GTTTCTGATA T/- GGGGGGAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 1 0 138422 CASAVA_Build 10 86179609 1D AAAAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 12 11 138423 CASAVA_Build 10 86181182 1I CATCTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 11 12 138424 CASAVA_Build 10 86185692 2D AGAGACTGAC AA/-- AGACTACTCA 3070 het 3070 hom 27 9 11 8 A 3 1 138425 CASAVA_Build 10 86187250 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 11 10 138426 CASAVA_Build 10 86188201 5D TCTTTCTGAA ATTGT/----- ATTGTATATC 3070 het 3070 hom 32 13 17 4 ATTGT 2 1 138427 CASAVA_Build 10 86191939 2I TAAGAAAAGT --/AG TGAGATCTCT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 AG 0 1 138428 CASAVA_Build 10 86194871 1D AAAAAGATAG T/- TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 32 10 21 3 T 7 6 138429 CASAVA_Build 10 86206597 4D TTCATATGAC TGTT/---- TGCCATTTAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 TGTT 1 0 138430 CASAVA_Build 10 86207834 1I ATAGATCATG -/T TTTTGGTCTA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 4 5 138431 CASAVA_Build 10 86214172 1I AGTGAAAGTG -/T TTTTTTTATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 138432 CASAVA_Build 10 86214912 1D CCCAGTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2117 hom 27 5 15 7 A 11 10 138433 CASAVA_Build 10 86232845 1D TTGTCAACCA C/- CCTTTTTGTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 3 2 138434 CASAVA_Build 10 86234234 6I CACGTGTGTG ------/TGTGTA TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 22 12 8 2 TGTGTA 0 1 138435 CASAVA_Build 10 86242017 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1184 het 1184 ref 22 10 4 8 A 15 14 138436 CASAVA_Build 10 86244735 4D TTTCTTTCTT CTTA/---- CTTTGGGTTT 3070 het 1542 hom 32 4 20 11 CTTA 1 0 138437 CASAVA_Build 10 86245716 6D CTTTTTTCTT TATTTC/------ TGTTTTTTCT 3070 het 2945 hom 17 9 8 1 TATTTC 1 0 138438 CASAVA_Build 10 86255605 4I AGCTTGTGGG ----/ATTT ATTTTTTTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATTT 1 2 138439 CASAVA_Build 10 86262761 1I GGTGTACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 10 11 138440 CASAVA_Build 10 86274101 1I TGCCAAACCA -/T TTTTTTTTCA 2846 het 2846 ref 23 11 8 4 T 8 9 138441 CASAVA_Build 10 86275628 1I AGCTCGAATG -/C CTGGGTTTAT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 C 1 2 138442 CASAVA_Build 10 86278147 1I TTCCCATCTG -/A AAAAAAAAAG 1748 het 1748 ref 26 16 5 5 A 9 10 138443 CASAVA_Build 10 86283763 1I GGGTCCAGGG -/C CCTTATGCTG 2638 het 2638 ref 22 16 6 0 C 2 3 138444 CASAVA_Build 10 86285438 1D GTTCCCCACC T/- TGTACTTGCC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 2 1 138445 CASAVA_Build 10 86303610 3I GACAGTGCTT ---/GGG TACATCCATT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 0 3 138446 CASAVA_Build 10 86306323 6D ACGTATCATG TACATA/------ AAGCTATTGC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TACATA 1 0 138447 CASAVA_Build 10 86306466 12D CATACACATA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 2524 het 2524 ref 21 8 6 9 TG 13 7 138448 CASAVA_Build 10 86307198 1D TCCATTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 8 18 10 A 13 12 138449 CASAVA_Build 10 86309716 2D TATTTCCATT AC/-- AGTTAAGGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AC 1 0 138450 CASAVA_Build 10 86311042 1I TGCTATTTGT -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 G 3 4 138451 CASAVA_Build 10 86311130 4D ACATGTTGTT TAAG/---- TATTCTCATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TAAG 1 0 138452 CASAVA_Build 10 86313563 1D CTAATCTTTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 7 6 138453 CASAVA_Build 10 86314108 1I TATACTTCTT -/C TTTTTTTTTT 1124 hom 43 het 28 0 13 15 C 0 1 138454 CASAVA_Build 10 86335819 1D CAATCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 11 10 138455 CASAVA_Build 10 86337095 3D AAGCAGAGGC CAA/--- CAACAGTCAG 3070 hom 114 het 41 0 37 4 CAA 2 1 138456 CASAVA_Build 10 86347315 1D ATGGGAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 T 11 10 138457 CASAVA_Build 10 86365548 2D GCATGCTAAT AA/-- AAGTCTAGAT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 A 4 2 138458 CASAVA_Build 10 86367601 1D CAGTCCCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2028 hom 35 7 14 14 T 14 13 138459 CASAVA_Build 10 86373476 1D TCTGTGGTGG T/- TGGTGGCTGA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 T 2 1 138460 CASAVA_Build 10 86375189 1I GAGGTGGACC -/A GGGGGGCAGG 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 A 0 1 138461 CASAVA_Build 10 86377954 1I ATTTTTTCTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 T 8 9 138462 CASAVA_Build 10 86382212 1I TGTACAGCAC -/G GTTTTAAGCT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 G 1 2 138463 CASAVA_Build 10 86386525 1D TTGATCTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 13 22 6 A 10 9 138464 CASAVA_Build 10 86389681 1I GAGCAAACAC -/A TTCAAAACTA 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 A 0 1 138465 CASAVA_Build 10 86392751 1I GCTTAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 19 4 A 11 12 138466 CASAVA_Build 10 86393319 1I GCCAGATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2910 hom 21 7 12 2 T 9 10 138467 CASAVA_Build 10 86393990 1I TTCAATCTCA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 7 8 138468 CASAVA_Build 10 86404344 1I AAAAGAGTAG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 6 7 138469 CASAVA_Build 10 86405043 5D CTTATAGCAA TGCCT/----- TGTAATAGTG 3070 het 3070 hom 43 19 23 2 TGCCT 1 0 138470 CASAVA_Build 10 86407144 5D7M24D TAACCCATTG TATAACCCATTGTACACGTTTCCTGTATAACCCATT/-----CCCTCTG------------------------ GTCACGAGCT 3070 het 3070 ref 38 27 17 7 N/A 0 0 138471 CASAVA_Build 10 86467343 2I CATGTCCTAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 27 10 T 13 15 138472 CASAVA_Build 10 86472739 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 35 0 23 12 A 11 12 138473 CASAVA_Build 10 86472800 1I TTGAGACAGC -/T TCCAGAACAG 3070 het 3070 hom 31 10 10 11 T 1 2 138474 CASAVA_Build 10 86473680 2I AGTCAAGAAA --/CT CTCTCCTCTG 3070 hom 113 het 45 0 41 4 CT 2 3 138475 CASAVA_Build 10 86489433 3D AGTCTCTATT TTA/--- TTATTATTGT 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 TTA 3 2 138476 CASAVA_Build 10 86491048 4D CTGCTATTGT TGGA/---- TGAAGTGTTC 3070 het 3070 ref 43 19 21 4 TGGA 1 0 138477 CASAVA_Build 10 86494025 1I CAGTTTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 8 9 138478 CASAVA_Build 10 86505739 5D CTCAGTAAGT AGCTC/----- AAGATCACAG 3070 het 3070 hom 48 21 22 6 AGCTC 1 0 138479 CASAVA_Build 10 86519796 2I AACTTAAAAC --/TG TGAATACAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TG 1 2 138480 CASAVA_Build 10 86520880 5D CTTAAGCTGA CTTTT/----- CTTTTAACAG 3070 het 3070 ref 61 31 26 6 CTTTT 2 1 138481 CASAVA_Build 10 86531981 1I TTATGTGTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 27 10 6 T 9 10 138482 CASAVA_Build 10 86533069 3D ATTGTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1367 hom 40 8 16 17 T 14 11 138483 CASAVA_Build 10 86539604 3D CTTGGAGGAG GGA/--- GCCATTCCCT 3070 het 3070 hom 50 18 30 5 GGA 1 0 138484 CASAVA_Build 10 86540800 3D45M1D AAGATGGTAA CTTCTTTTTTGTGGAAGTACAGACTTGGATCTCTTTTTAGTCTTCCTTA/---CTTTTTTGTGGAAGTACAGACTTGGATCTCTTTTTAGTCTTCCTT- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 43 16 21 22 N/A 0 0 138485 CASAVA_Build 10 86550437 5D TCTTTCTTTC TTTCT/----- TTTTTTTTTT 1712 hom 7 het 14 0 10 4 TTTCT 1 0 138486 CASAVA_Build 10 86555288 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 1411 het 661 hom 31 7 11 13 TC 0 1 138487 CASAVA_Build 10 86560010 1I CATCCCCCAT -/G GGGGGGGGTC 3070 het 265 hom 27 1 18 8 G 8 9 138488 CASAVA_Build 10 86564021 1I TCTCTAATGA -/T TTAGTGAGTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 2 3 138489 CASAVA_Build 10 86571240 1I CTGTAGTCCC -/A GCTACTCAGG 3010 het 2038 hom 15 6 7 2 A 0 1 138490 CASAVA_Build 10 86606390 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1363 het 1363 ref 26 18 3 5 A 13 12 138491 CASAVA_Build 10 86616680 1D CAGCTGTGCT G/- GGGGGAGGGT 3070 hom 27 het 37 1 22 15 G 6 5 138492 CASAVA_Build 10 86678816 1D TGTGAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1153 het 1153 ref 40 33 3 4 A 11 10 138493 CASAVA_Build 10 86803951 1D GCCCAATGAG A/- AAAAAACCAC 3070 hom 126 het 46 0 42 5 A 7 6 138494 CASAVA_Build 10 86808678 3D GCAGAGAAAG AGA/--- AGGAGAGAAT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 AGA 1 0 138495 CASAVA_Build 10 86809413 1I GCCCTCCAAC -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 7 8 138496 CASAVA_Build 10 86810024 2D TATATATGAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TA 7 6 138497 CASAVA_Build 10 86823109 1D TAGTGTTAAA C/- AAGGATAGAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 1 0 138498 CASAVA_Build 10 86827325 2I ATAAGGTGCT --/AA AAAAAAATAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 9 138499 CASAVA_Build 10 86827493 3D CAAAGAAAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 27 1 26 1 A 14 11 138500 CASAVA_Build 10 86829492 1I TAAGCCATGC -/A AAAACATGGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 4 5 138501 CASAVA_Build 10 86836334 3D AAAAATCAAT AAC/--- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 AAC 1 0 138502 CASAVA_Build 10 86837112 1D TCAGGGATTT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 8 7 138503 CASAVA_Build 10 86838623 1I56M1I CAACCAAAAA -TTTATACCCAGCAAAACTAATCTTCAATAATGAAAAATTAAAACATTCACAGATTT-/TTTTATACCCAGCAAAACTAATCTTCAATAATGAAAAATTAAAACATTCACAGATTTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 23 10 7 N/A 0 0 138504 CASAVA_Build 10 86840896 1D TTCAATTCCA T/- TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 T 7 6 138505 CASAVA_Build 10 86843524 1D TTTGAGGAAT A/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 1 0 138506 CASAVA_Build 10 86845329 5D AACTCAATAC AATAA/----- AGGCCATATA 3070 het 3070 hom 39 16 19 7 AATAA 1 0 138507 CASAVA_Build 10 86848456 1D TTAATAAAAT A/- AAAATGTATT 2458 het 2458 ref 21 9 6 6 A 5 4 138508 CASAVA_Build 10 86861646 1D TTTATAATTT A/- GGGGGGGACC 3070 het 3070 ref 40 23 14 4 A 1 0 138509 CASAVA_Build 10 86868159 1D TTTCTATGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 8 23 2 T 9 8 138510 CASAVA_Build 10 86883773 1I ACTCTCCTAA -/G TCCTTTAAAA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 G 0 1 138511 CASAVA_Build 10 86885461 10D GTGTCAAAGC TCCTGTCGTT/---------- CTGGATGCAT 3070 het 3070 hom 42 19 23 1 TCCTGTCGTT 1 0 138512 CASAVA_Build 10 86901213 2D ATTAAATGAG AT/-- AACACAACTG 3070 het 3070 ref 57 33 19 8 AT 1 0 138513 CASAVA_Build 10 86909709 1D GAAAAAAAAA G/- GTTGTATCAA 1197 het 1197 ref 35 15 13 7 G 2 1 138514 CASAVA_Build 10 86921741 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAG 1655 het 1655 ref 43 36 4 3 A 10 9 138515 CASAVA_Build 10 86936837 9D AACTGTTTTT TTAATAGTC/--------- TTAATTACAT 3070 het 3070 ref 31 18 13 1 TTAATAGTC 1 0 138516 CASAVA_Build 10 86937305 1D ATTAAAACTC T/- TTTGTATATA 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 T 4 3 138517 CASAVA_Build 10 86938115 1D AACTGAGAAG A/- AAAAAACCTT 1438 het 1438 ref 21 7 3 11 A 7 6 138518 CASAVA_Build 10 86940998 2D ATATATTGAC AG/-- AGAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 AG 4 3 138519 CASAVA_Build 10 86942797 2D GAATAAATCA TG/-- TGTCATATAC 3070 het 3070 ref 48 23 21 7 TG 2 1 138520 CASAVA_Build 10 86943370 2I TAACAATAAC --/TG AGCTTTTGCG 3070 het 3070 hom 53 22 29 2 TG 0 1 138521 CASAVA_Build 10 86946577 1D ATCACTCAGT G/- GACCCAGCAG 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 G 2 1 138522 CASAVA_Build 10 86952233 1I ATAAAATTAG -/A GGACAAACAT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 0 1 138523 CASAVA_Build 10 86954754 1D CCAACCCCCG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 A 10 9 138524 CASAVA_Build 10 86955603 1D CTATCCTTAT A/- AAAAAAAAAA 2664 het 2664 ref 26 13 11 4 A 12 11 138525 CASAVA_Build 10 86955804 1D TCTGTCTCCT C/- CTCTCGTCTA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 C 2 1 138526 CASAVA_Build 10 86957312 1I GAATATTTAC -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 6 7 138527 CASAVA_Build 10 86957614 1I TGGCGTCAAA -/G CTTTTCCATC 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 G 0 1 138528 CASAVA_Build 10 86958053 1D CATCTGAAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 9 8 138529 CASAVA_Build 10 86959178 1I TCTCCAGTGA -/C TTACCAATTG 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 C 0 1 138530 CASAVA_Build 10 86973271 1I GCCAGGCACC -/T TTGCAAAACT 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 T 2 3 138531 CASAVA_Build 10 86982679 3D AGCTCTCAGA CCT/--- CCTCTTCTCA 3070 het 3070 ref 56 26 23 10 CCT 2 1 138532 CASAVA_Build 10 86986451 1I AAGTACTGTG -/A AAAAAAAAAA 2953 het 2953 ref 32 12 8 12 A 10 11 138533 CASAVA_Build 10 86993718 6D TCAACTCTTA CCTTAG/------ CCTTCCCCAG 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 CCTTAG 1 0 138534 CASAVA_Build 10 87002844 3D TCTAAAAGAC AGA/--- AGGACAGGCT 3070 het 3070 hom 35 11 21 5 AGA 1 0 138535 CASAVA_Build 10 87003601 2D CCTTCATAGA TT/-- TATTTATGAG 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 T 3 1 138536 CASAVA_Build 10 87006460 8I GGGATTATTC --------/CCTTCCAG CCACTGAATC 3070 het 3070 ref 39 25 11 3 CCTTCCAG 0 1 138537 CASAVA_Build 10 87010491 7D6M4D TTGAATCTAA AATTCCTGTATTTAAAA/-------GGAGGT---- TGGGCATAAG 3070 het 3070 ref 45 25 19 8 N/A 0 0 138538 CASAVA_Build 10 87012549 1D CCTGGGTGAC A/- AGAGTGAGAC 972 het 972 ref 15 4 3 8 A 2 1 138539 CASAVA_Build 10 87013047 1D GACATGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 21 7 A 13 12 138540 CASAVA_Build 10 87014139 1D TTCTCTCTAC T/- TTTGCATGTG 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 T 4 3 138541 CASAVA_Build 10 87014406 3D ATCTGCATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TTG 4 3 138542 CASAVA_Build 10 87038704 4I TCAACAAATA ----/ACAC TGGACTTAAA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 AC 0 2 138543 CASAVA_Build 10 87045242 1D TTTTCCCGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 8 18 7 T 9 8 138544 CASAVA_Build 10 87050650 1I AAAGAGTGAC -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 6 7 138545 CASAVA_Build 10 87065584 1I GCCTCTTTGA -/C CCCGCAGGTC 3070 het 3070 hom 63 25 29 9 C 3 4 138546 CASAVA_Build 10 87066706 1D TAATTCGTGC A/- AAAAAAAAAA 2456 het 2456 ref 32 12 9 11 A 13 12 138547 CASAVA_Build 10 87069155 1D ACGCGCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2870 hom 38 12 13 13 T 13 12 138548 CASAVA_Build 10 87069635 1I GAGGTGCAAA -/G AACTCCTTTC 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 G 0 1 138549 CASAVA_Build 10 87072731 3I AACAAAAAAT ---/ATG CCAGCCCAGA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 ATG 0 1 138550 CASAVA_Build 10 87076237 2D CATTAAGGTA TG/-- TGTCCCTTGT 3070 het 3070 ref 42 25 15 3 TG 2 1 138551 CASAVA_Build 10 87076707 1I AGTCCTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 22 7 4 T 11 12 138552 CASAVA_Build 10 87080095 2I TTGCAAACTC --/TT TGTCAGATTT 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 T 1 3 138553 CASAVA_Build 10 87080289 1I AGTAGGTATA -/G GGTTATTTAG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 G 2 3 138554 CASAVA_Build 10 87083585 1D GAGGGCTCGT C/- ACAGTGGCCC 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 C 1 0 138555 CASAVA_Build 10 87084833 1I CATTTTTAAC -/A AAGGTGTCAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 2 3 138556 CASAVA_Build 10 87098844 1I TCCTAGAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 9 10 138557 CASAVA_Build 10 87099803 1I CTCTTCATAT -/C AAAAAAAAAA 496 het 496 ref 34 17 7 10 C 0 1 138558 CASAVA_Build 10 87104578 1D TTGAAGGCCA T/- GGGGTTAGCA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 T 1 0 138559 CASAVA_Build 10 87115252 4D ACTATCATGG TATA/---- TATAATTTTT 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 TA 4 2 138560 CASAVA_Build 10 87116505 1I GACGTTTTGC -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 T 6 7 138561 CASAVA_Build 10 87119596 6D ATTCACAGTG TTAAAC/------ TTAATACTCA 3070 het 3070 hom 27 10 12 7 TTAAAC 1 0 138562 CASAVA_Build 10 87119994 1I TTCAGATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2062 hom 28 8 14 6 T 10 11 138563 CASAVA_Build 10 87134520 1D TATATATATA T/- AAAAAAAAAA 2793 het 1630 hom 17 4 9 5 T 1 0 138564 CASAVA_Build 10 87158209 2I AGCCGCTAGG --/CC CCCCAATACA 3070 het 3070 ref 55 27 19 9 C 4 6 138565 CASAVA_Build 10 87158251 2D TGTCTTGATC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 50 16 12 26 TG 7 6 138566 CASAVA_Build 10 87171067 1I TAGGTTTTAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 65 het 25 0 21 4 A 8 9 138567 CASAVA_Build 10 87177632 1D TTCTGTTGAG A/- AACACTGCCC 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 3 2 138568 CASAVA_Build 10 87180381 1D TTAAAATTAA T/- TGCTGGACTC 3070 het 3070 hom 20 7 13 0 T 2 1 138569 CASAVA_Build 10 87181530 1I AATCAGGTTC -/T TTTTTTTTTT 2302 het 2302 ref 33 14 8 11 T 15 16 138570 CASAVA_Build 10 87187750 1D AGAACAGGTG T/- ACATTTATTT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 1 0 138571 CASAVA_Build 10 87198295 1I ACATTTGTAA -/T CCAGGTCTGT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 0 1 138572 CASAVA_Build 10 87199759 1I TCTGAAACAA -/C TTTTCAAGAA 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 C 0 1 138573 CASAVA_Build 10 87213170 3I ATTCCGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 13 16 138574 CASAVA_Build 10 87214598 1I AAACTATAGT -/G TTACTGGGCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 0 1 138575 CASAVA_Build 10 87219849 1D AAAAAAAAAA C/- ATTGGGTATT 3070 hom 9 het 31 1 29 1 C 1 0 138576 CASAVA_Build 10 87220161 1I CCATACTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 29 1 22 6 A 11 12 138577 CASAVA_Build 10 87220937 1D TCAATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 24 1 17 7 A 12 11 138578 CASAVA_Build 10 87227706 2I AAGCTGAATG --/CA CAGATATAAA 3070 hom 81 het 38 0 26 12 CA 1 2 138579 CASAVA_Build 10 87230592 1D ATATTAAAGG A/- GACTGAAGAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 1 0 138580 CASAVA_Build 10 87234177 1I TTATTACAAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 8 138581 CASAVA_Build 10 87240117 4D AATGGATAAG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 AAAC 3 2 138582 CASAVA_Build 10 87247587 1D TTGCCTGCTT G/- TTTTATCAGT 3070 hom 114 het 41 0 39 4 G 1 0 138583 CASAVA_Build 10 87250300 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 23 1 19 3 T 10 11 138584 CASAVA_Build 10 87271556 4D AAAAATTTAA TCTT/---- TCCTTATAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TCTT 1 0 138585 CASAVA_Build 10 87272068 1D ACTTGTACAG C/- CCTGGGTCCT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 C 3 2 138586 CASAVA_Build 10 87276192 1D GTGGGGACAA G/- GGGGGAAGAC 3070 hom 126 het 49 0 43 8 G 6 5 138587 CASAVA_Build 10 87279857 1D TCTTGGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 43 1 34 8 A 12 11 138588 CASAVA_Build 10 87291728 1I TTGATTTATA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 6 7 138589 CASAVA_Build 10 87292206 1D GTGATTTATT G/- GCCTCCTGCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 2 1 138590 CASAVA_Build 10 87304994 2D AGATGTTAAC TG/-- TGTGCAGGGT 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 TG 3 2 138591 CASAVA_Build 10 87305330 37D CTTCTTCTTC TAAGAAAGAAGTTAATTACTTCTTTCAGTTAATTAAT/------------------------------------- TCTTCTTCAG 3070 het 3070 ref 38 30 14 6 TAAGAAAGAAGTTAATTACTTCTTTCAGTTAATTAAT 1 0 138592 CASAVA_Build 10 87310160 1I TCTTCATATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 9 10 138593 CASAVA_Build 10 87317668 1I ATATCTACTC -/T CTTAGTTTGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 1 138594 CASAVA_Build 10 87329555 1D AAGTCAACAC A/- AAAAAATTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 6 138595 CASAVA_Build 10 87332881 1D TTTATGGGTA C/- CAGGATGGAG 3070 hom 81 het 32 0 25 7 C 2 1 138596 CASAVA_Build 10 87341572 1D GTGTTGAATT A/- AAAAAAAAAA 1068 het 1068 ref 36 26 3 7 A 12 11 138597 CASAVA_Build 10 87362050 1I AGTCTGAGAA -/G GAGCCCGCCG 3070 hom 132 het 52 0 42 10 G 1 2 138598 CASAVA_Build 10 87387862 1D AAAGTAAAAT A/- AGAAGAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 1 138599 CASAVA_Build 10 87388979 1I CCACACACAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 7 8 138600 CASAVA_Build 10 87439184 1D AAAGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 41 2 33 6 A 11 10 138601 CASAVA_Build 10 87447041 3I GCTCCATTTT ---/TAA GTGCATAAAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TAA 0 1 138602 CASAVA_Build 10 87451119 1D GGACGCCAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 42 1 37 4 A 10 9 138603 CASAVA_Build 10 87467665 1I15M3I GTCAGATTTT -AAGCTCCAAAATGAT---/AAAGCTCCAAAATGATCTC CTTTGACTCC 3070 hom 90 het 29 0 30 3 N/A 0 0 138604 CASAVA_Build 10 87481202 1I TGATACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 22 0 17 5 A 13 14 138605 CASAVA_Build 10 87518151 1I TCCAAGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 565 hom 37 2 29 6 A 10 11 138606 CASAVA_Build 10 87532030 1D TCATGCAAGG A/- AAATGTTTGG 3070 hom 115 het 41 0 39 3 A 4 3 138607 CASAVA_Build 10 87549898 1D ATAGAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 14 10 A 11 10 138608 CASAVA_Build 10 87579042 1D AACATACCTC A/- AAAAAAAAAG 1020 het 1020 ref 40 33 3 4 A 10 9 138609 CASAVA_Build 10 87580283 9D AGAAAAATTT TGCAAACTA/--------- TGCAAACTAT 3070 hom 66 het 28 0 23 6 TGCAAACTA 2 1 138610 CASAVA_Build 10 87581789 1D GGTAAGAAAA C/- AATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 C 1 0 138611 CASAVA_Build 10 87663447 1D AATTGCTTGA G/- GCCCGGGAGG 3070 hom 36 het 17 0 13 4 G 2 1 138612 CASAVA_Build 10 87669677 1I ACTCCCAACA -/G CCAGCCAACA 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 G 0 1 138613 CASAVA_Build 10 87672875 1D CAGCCCCTCC T/- TGATGGTCAT 3070 het 3070 ref 27 15 12 2 T 2 1 138614 CASAVA_Build 10 87677907 1D ATCTTAACAG T/- TTGGGAGAGA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 T 3 2 138615 CASAVA_Build 10 87718011 1D CATGGTGAAA C/- CCCCGTCTCT 2148 hom 15 het 6 0 5 1 C 5 4 138616 CASAVA_Build 10 87734613 4D TCTTAACACT CTGA/---- CTCTTAATTC 3070 hom 114 het 40 0 38 3 CTGA 1 0 138617 CASAVA_Build 10 87736871 1D GCTCAGAGTT G/- CCCCAGCTTG 3070 hom 104 het 37 0 32 6 G 1 0 138618 CASAVA_Build 10 87748949 1D ACTCTATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 34 1 21 12 A 16 15 138619 CASAVA_Build 10 87749057 2I AATGTAACAC --/AT AGTTAAAAGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AT 0 1 138620 CASAVA_Build 10 87750680 1I CTAGAAACAA -/C CCACTTGTTC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 2 3 138621 CASAVA_Build 10 87751071 1D ATAAGCAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 44 0 35 10 A 9 8 138622 CASAVA_Build 10 87752261 1D TCAGCAAAAT G/- CCTTGTTTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 1 0 138623 CASAVA_Build 10 87755088 1I AAATAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 910 hom 30 2 25 3 A 10 11 138624 CASAVA_Build 10 87759789 2D AGCCAGGCAA CT/-- CTCAAACACC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 CT 2 1 138625 CASAVA_Build 10 87762102 2I CAGGAGTAAA --/GT GTACCTAGCA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 GT 1 2 138626 CASAVA_Build 10 87770784 8D TTCAACCTGA CCTGCCTG/-------- CCTGCCTGCC 3070 hom 63 het 32 0 20 15 CCTG 7 5 138627 CASAVA_Build 10 87803104 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 10 138628 CASAVA_Build 10 87809186 3D CATTCAATGT AAC/--- AACAATTACC 3070 het 3070 hom 34 14 15 7 AAC 2 1 138629 CASAVA_Build 10 87839863 1I GAATCAGTGA -/C CTAAAAGATA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 2 138630 CASAVA_Build 10 87877916 1I TTCCTCTGTG -/A AGAGGAGAAT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 1 2 138631 CASAVA_Build 10 87879938 15I AGTTTTAGGA ---------------/CGGTTTGTTACACTG CACACAGCTA 3070 het 3070 ref 64 35 23 6 CGGTTTGTTACACTG 0 1 138632 CASAVA_Build 10 87928943 1I AGCCCAGCTA -/C CCTTCCTCTT 3070 het 2494 hom 32 12 15 5 C 2 3 138633 CASAVA_Build 10 87936295 1D AGCTTCATAG C/- CACCAGTGTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 C 2 1 138634 CASAVA_Build 10 87940419 1I CCTTGAGCTG -/C CCGAGGCCCT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 C 2 3 138635 CASAVA_Build 10 87941945 2D ACACACACAC AT/-- GGAGGCTCCA 3070 het 3070 hom 68 31 27 11 AT 1 0 138636 CASAVA_Build 10 87942272 1D GCTGAAGGGA G/- GGGGGAGATG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 6 5 138637 CASAVA_Build 10 87943265 4I GGGCACACCA ----/CAAG GAGCTAAGAA 2801 het 2801 ref 41 17 9 16 CAAG 0 1 138638 CASAVA_Build 10 87977310 1I ATGAGCTCAG -/C CCAGCCCAGT 2583 het 2583 ref 35 21 8 6 C 2 3 138639 CASAVA_Build 10 87978471 2D AAGAGACACC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 CA 6 5 138640 CASAVA_Build 10 87981739 1I CGCATGGACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 9 10 138641 CASAVA_Build 10 87998298 17D GGCATGACAA TTCTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 2599 het 1389 hom 22 5 11 11 TTCTTTTTTTTTTTTTT 1 0 138642 CASAVA_Build 10 88000943 4D CAATCACTGC GGAA/---- GGAAGGCGGC 1817 het 1817 ref 17 12 4 2 GGAA 2 1 138643 CASAVA_Build 10 88009241 6I ATACGAGGTT ------/GTATAA GTATATTAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 GTATAA 0 1 138644 CASAVA_Build 10 88015617 1D GAGGATCTGC A/- AAGTCGCTGA 3070 het 3070 ref 55 30 20 7 A 3 2 138645 CASAVA_Build 10 88017129 1I GCCCCGCCCT -/C GGGGCTGCTG 709 het 709 ref 47 28 3 16 C 0 1 138646 CASAVA_Build 10 88028171 1D ATATCAAAGC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 8 7 138647 CASAVA_Build 10 88033285 6D CACACACCTG CCCTTA/------ CACACACATG 1506 het 1506 ref 56 19 11 33 CCCTTA 1 0 138648 CASAVA_Build 10 88034732 3I GCTGGAAGGT ---/ACA ACGAGACCAT 3070 hom 148 het 54 0 48 6 ACA 0 1 138649 CASAVA_Build 10 88049069 2I TCTCTATTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 T 12 14 138650 CASAVA_Build 10 88061339 1D GCCAGAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 11 10 138651 CASAVA_Build 10 88064745 6D CTGACCTTCT GCCCCC/------ GCCCACTGCT 3070 het 3070 hom 42 16 20 7 GCCCCC 1 0 138652 CASAVA_Build 10 88074342 1D CTTTAAGGAA C/- AAAAACCTGG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 C 1 0 138653 CASAVA_Build 10 88077746 1D TATCTATTAA G/- GGGGGGTATC 3070 het 3070 ref 44 23 17 6 G 7 6 138654 CASAVA_Build 10 88092705 12D GGCACTCAGG AAATGAATGAAC/------------ AAATGAATGG 3070 het 3070 hom 38 18 20 5 AAATGAATGAAC 1 0 138655 CASAVA_Build 10 88114291 1I TGATGGGTCC -/T TTCTCCATGC 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 T 2 3 138656 CASAVA_Build 10 88125362 1I CTTCCCATCC -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 6 7 138657 CASAVA_Build 10 88131816 4I CAGAACAGAA ----/AGAC AGCCCAAAAT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 AGAC 0 1 138658 CASAVA_Build 10 88150834 1D GCGCGCGTGT C/- CCCCCGACCC 2453 hom 24 het 9 0 8 1 C 6 5 138659 CASAVA_Build 10 88159341 1I CTTTATTCAT -/A ATAGCCCCAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 1 2 138660 CASAVA_Build 10 88169703 1I TTGGGAGACC -/G GGGTGGGTGG 3070 het 2469 hom 21 7 13 1 G 3 4 138661 CASAVA_Build 10 88181142 1I CTGGGATTAC -/A AGGCGTGAGC 3070 het 2968 hom 22 8 12 2 A 1 2 138662 CASAVA_Build 10 88186154 3I CAGTGGTGTG ---/AAC AATAATACAA 3070 hom 77 het 33 0 25 8 AAC 0 1 138663 CASAVA_Build 10 88195265 1D CTCTAGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 T 12 11 138664 CASAVA_Build 10 88202029 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 29 1 22 6 A 12 11 138665 CASAVA_Build 10 88208464 3D GGTTAGCCAC TAT/--- TATTATCCCC 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 TAT 3 2 138666 CASAVA_Build 10 88211610 2D ACTGATTGTC TT/-- TTCTTATTAT 3070 het 3070 ref 48 24 19 6 T 4 2 138667 CASAVA_Build 10 88216429 3I ATTCCTAATA ---/GCC TACATGTAGT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 GCC 0 1 138668 CASAVA_Build 10 88217414 1D CTCTAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 836 het 836 ref 18 11 4 3 T 18 17 138669 CASAVA_Build 10 88221691 1D TTTAGCGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 39 1 25 13 T 15 14 138670 CASAVA_Build 10 88230376 3D ATATCTTGAG ACA/--- ACACCACCTG 3070 hom 102 het 36 0 35 2 ACA 2 1 138671 CASAVA_Build 10 88235482 1I AGGAAGCAAT -/A ATGCTTCTGG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 1 2 138672 CASAVA_Build 10 88246624 1I GGTGTGCAGT -/G GGGGGAGGAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 G 5 6 138673 CASAVA_Build 10 88253490 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 12 11 138674 CASAVA_Build 10 88254929 1I TTTTTTTATG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 74 het 29 0 25 4 T 8 9 138675 CASAVA_Build 10 88259503 1D AGCTCTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1802 het 57 hom 21 1 5 15 T 17 16 138676 CASAVA_Build 10 88260731 1D ATCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2841 het 1956 hom 32 10 13 10 T 15 14 138677 CASAVA_Build 10 88262589 1I GTACATGAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 T 9 10 138678 CASAVA_Build 10 88263182 2I AGCAGTTCCC --/CT GCCTCAGTGT 3070 hom 63 het 22 0 21 2 CT 0 1 138679 CASAVA_Build 10 88268871 1I TTCACAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 12 138680 CASAVA_Build 10 88278589 1D AAAAAATGAA T/- TTTTTTTTTG 2490 het 2443 hom 14 7 7 0 T 10 9 138681 CASAVA_Build 10 88281013 1D TCCCTCTCCT A/- AAAAAAAAAA 2027 het 2027 ref 28 19 6 4 A 17 16 138682 CASAVA_Build 10 88283584 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 46 0 41 6 A 10 9 138683 CASAVA_Build 10 88293398 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 A 10 9 138684 CASAVA_Build 10 88297368 3D GCTGACATGG GCA/--- GATCGCTTGA 3070 het 3070 hom 42 20 21 2 GCA 1 0 138685 CASAVA_Build 10 88297711 2D TACACACACC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2423 hom 30 11 11 8 AT 8 7 138686 CASAVA_Build 10 88300118 1D TTTCAAGTCT A/- AAAAAAAAAA 1072 het 1072 ref 33 19 4 10 A 12 11 138687 CASAVA_Build 10 88315831 1D GGAGATTGAA G/- GGTAGTGAGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 G 3 2 138688 CASAVA_Build 10 88320856 21D CCACTTTTGA TTCCAGTTGTCCCACCTTTAC/--------------------- TTCCAGTTGT 3070 het 3070 hom 49 13 16 23 TTCCAGTTGTCCCACCTTTAC 2 1 138689 CASAVA_Build 10 88321168 4I ATAGTATGAG ----/TTTC TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 TTTC 0 1 138690 CASAVA_Build 10 88327174 1I GGTTTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 9 10 T 10 11 138691 CASAVA_Build 10 88328367 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2675 hom 34 9 9 16 T 13 14 138692 CASAVA_Build 10 88341105 4I AAAGCAAAAT ----/CACA CACACAATCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CA 3 5 138693 CASAVA_Build 10 88365495 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 21 4 T 13 12 138694 CASAVA_Build 10 88376478 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 9 8 138695 CASAVA_Build 10 88419016 16D GGCTGGGCTG GACTGAGTACTGGGCA/---------------- CCTGCTCCAT 3070 hom 98 het 34 0 27 9 GACTGAGTACTGGGCA 1 0 138696 CASAVA_Build 10 88419768 1I GGAGTAATCT -/C TTTTTTTGTT 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 0 1 138697 CASAVA_Build 10 88424923 1I GAGCAAGCAT -/C CCCCCCGGCC 3070 hom 66 het 27 0 18 9 C 6 7 138698 CASAVA_Build 10 88438788 1D CAGTGAGTAA C/- CCTCTTGGCC 3070 hom 92 het 35 0 29 7 C 3 2 138699 CASAVA_Build 10 88444879 10D TTCTCCTTCC TGGTGCTGTG/---------- TGGTGCTGTG 3070 hom 129 het 50 0 43 7 TGGTGCTGTG 2 1 138700 CASAVA_Build 10 88448466 2D TGCAAAATCT TC/-- TCTCTGGGGA 3070 het 3070 hom 36 15 14 8 TC 3 2 138701 CASAVA_Build 10 88462803 2D CGTCTCAAAA AT/-- ATATATATAT 1160 het 1160 ref 12 5 4 3 AT 9 8 138702 CASAVA_Build 10 88469130 1D CCTGTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1268 het 1268 ref 39 30 3 6 A 15 14 138703 CASAVA_Build 10 88470181 1I ACTCCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 A 10 11 138704 CASAVA_Build 10 88476083 1D CTTGCCACGC T/- AGCTTTCTGA 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 T 1 0 138705 CASAVA_Build 10 88476755 1D GATTTGAGAA T/- TTTTTTTTTT 2334 het 1241 hom 31 9 7 15 T 19 18 138706 CASAVA_Build 10 88477088 1D ACCTCTACTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 10 8 6 T 10 9 138707 CASAVA_Build 10 88479843 1D CCCAGAACCC A/- ATTGGAAGCC 3070 het 3070 ref 52 29 19 5 A 2 1 138708 CASAVA_Build 10 88480167 8D GACCTACTGG CATATTGC/-------- CAACCCAGGG 3070 het 3070 ref 37 25 10 4 CATATTGC 1 0 138709 CASAVA_Build 10 88481577 1D GATTGAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 T 13 12 138710 CASAVA_Build 10 88482234 8D GGGGCAAGGC TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 2100 het 2100 ref 28 12 11 8 TGTT 5 3 138711 CASAVA_Build 10 88484988 1I CAAAACTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 A 10 11 138712 CASAVA_Build 10 88488761 1I AAAAAAAAAA -/T TGCTATGAGA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 1 2 138713 CASAVA_Build 10 88489908 1I CATCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 het 471 hom 12 1 11 0 A 4 5 138714 CASAVA_Build 10 88493148 9D AACCTTTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1398 het 871 hom 13 6 5 3 T 19 10 138715 CASAVA_Build 10 88497014 4D21M1I ACCTGCTCAG CTCAGCCTTAAGAACAAAGTCTTGA-/----GCCTTAAGAACAAAGTCTTGAG GCCTAGCACG 1036 het 737 hom 22 5 3 14 N/A 0 0 138716 CASAVA_Build 10 88498400 9I28M9I GTCAGGGTTT ---------AACTGGCAAGGTTTTTCTTCCTTAGTTG---------/TTAAGAAAAAACTGGCAAGGTTTTTCTTCCTTAGTTGTACATAAAA TACATAAAAT 3070 het 3070 ref 53 27 23 17 N/A 0 0 138717 CASAVA_Build 10 88501422 2I ATATATGCAC --/AT GTGTGCACAT 1191 het 1191 ref 41 21 4 16 AT 0 1 138718 CASAVA_Build 10 88501525 14D CATACGCATA TGCGCACATATGTG/-------------- TGCACACATA 2312 het 2312 ref 30 21 6 7 TGCGCACATATGTG 1 0 138719 CASAVA_Build 10 88537620 1I GGGAAATCTG -/C CCCCCCCCCA 1184 het 1184 ref 30 12 6 12 C 9 10 138720 CASAVA_Build 10 88540413 4D AATGCAGGTT GAAA/---- GAAGTCAGTC 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 GAAA 1 0 138721 CASAVA_Build 10 88545154 1D AAGTGATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1131 hom 45 7 16 22 T 12 11 138722 CASAVA_Build 10 88560639 2D GCACAACATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 58 het 28 0 17 11 TG 9 8 138723 CASAVA_Build 10 88568893 3I GGCTACTTAT ---/TTA TTATTATTAT 2432 het 1610 hom 20 5 7 8 TTA 5 6 138724 CASAVA_Build 10 88570110 1D AGATGACATC T/- TTTTTTTTTT 1167 het 1167 ref 25 14 3 8 T 15 14 138725 CASAVA_Build 10 88588332 1D TTGAGATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 34 1 23 10 T 12 11 138726 CASAVA_Build 10 88616051 10D GCCAGCGCCT TAACATGCAG/---------- TAACAAGTGG 2496 het 2496 ref 24 14 7 5 TAACATGCAG 1 0 138727 CASAVA_Build 10 88625091 1D GCCTGGGCGA C/- CGAGCAAAAC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 2 1 138728 CASAVA_Build 10 88628711 1I ACAAATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2013 hom 29 5 13 11 A 9 10 138729 CASAVA_Build 10 88632400 1D TACTTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 779 het 779 ref 21 15 3 3 A 15 14 138730 CASAVA_Build 10 88646022 2D ATCTTCTATC AT/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 19 18 4 AT 1 0 138731 CASAVA_Build 10 88657308 1I GTGGAATCAA -/C CCGTGTCCAT 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 C 2 3 138732 CASAVA_Build 10 88674252 1I TCAACCACCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 47 34 8 5 T 8 9 138733 CASAVA_Build 10 88684788 1I ATTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 300 hom 20 2 14 4 G 0 1 138734 CASAVA_Build 10 88687190 1I ACTGCAGCCC -/T TTTTTTTTTT 2496 het 2496 ref 44 17 14 13 T 12 13 138735 CASAVA_Build 10 88691536 7D GACCCATCTT AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 434 het 184 hom 26 3 4 19 A 17 10 138736 CASAVA_Build 10 88699267 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 936 het 936 ref 32 20 3 9 A 13 12 138737 CASAVA_Build 10 88699998 1I GAATCGCTTG -/A ACCCGGGAGG 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 1 2 138738 CASAVA_Build 10 88701441 1D AATGAAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 A 10 9 138739 CASAVA_Build 10 88727876 1I GGTATGCTGT -/C CTTTCTGTAA 3070 het 3070 hom 21 7 12 2 C 1 2 138740 CASAVA_Build 10 88734089 3D GATCTAACTC ATT/--- AACTGTATTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 ATT 1 0 138741 CASAVA_Build 10 88744793 3I ATTGATGATG ---/ATA ATAATAATAG 3070 het 3070 hom 17 8 8 1 ATA 3 4 138742 CASAVA_Build 10 88746908 2D TGTATGTGTG TA/-- CATGTGTGGA 3070 het 3070 ref 46 28 13 5 TA 1 0 138743 CASAVA_Build 10 88761108 1D TTGAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2698 het 1784 hom 13 4 7 2 A 11 10 138744 CASAVA_Build 10 88767401 4I CAAAGCCAGA ----/TTCT TTCTCCCTGC 891 het 891 ref 36 27 3 6 TTCT 1 2 138745 CASAVA_Build 10 88768404 1D TGCCCTGGGC A/- AAAACATCCT 2485 het 2485 ref 25 11 6 8 A 5 4 138746 CASAVA_Build 10 88773504 4I AACAACAGAA ----/ATTT ATTTCTCACA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 ATTT 1 2 138747 CASAVA_Build 10 88773897 1D TTCTATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 794 hom 15 2 7 7 A 13 12 138748 CASAVA_Build 10 88777566 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 10 9 138749 CASAVA_Build 10 88781553 1D GAAGTAAATG A/- AAAAAAAAAA 1299 het 1299 ref 26 17 4 5 A 12 11 138750 CASAVA_Build 10 88794218 1D ATTTTATGCA T/- TTTTTTTTTT 2734 het 324 hom 18 1 8 9 T 13 12 138751 CASAVA_Build 10 88796777 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 150 hom 27 1 23 3 A 9 10 138752 CASAVA_Build 10 88804909 12D GTAGAGGCAC GGGATTTAATCA/------------ GGGATTTAAT 3070 hom 114 het 43 0 36 13 GGGATTTAATCA 2 1 138753 CASAVA_Build 10 88809214 1D TCTATTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 12 11 138754 CASAVA_Build 10 88819315 4I ATAATTAAAG ----/TTCT TTCTAAGGGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TTCT 1 2 138755 CASAVA_Build 10 88832001 2I CTTCCACACA --/AC AGTGTAAACA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AC 0 1 138756 CASAVA_Build 10 88834300 2I TCAAAAGCAA --/AC ACACAAAAGC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AC 2 3 138757 CASAVA_Build 10 88840981 1D CAAGACAACT G/- GGGGGGGGCA 3070 het 146 hom 31 1 26 5 G 9 8 138758 CASAVA_Build 10 88845905 1I GCCTCAGCCT -/C CGGGGTAGCT 2827 hom 21 het 8 0 7 1 C 1 2 138759 CASAVA_Build 10 88848251 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 841 het 841 ref 14 9 2 3 A 17 16 138760 CASAVA_Build 10 88856158 1I ATTTACAAAA -/G GGGGGGGAAC 3070 hom 83 het 31 0 28 3 G 7 8 138761 CASAVA_Build 10 88863742 1I GACTGTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 621 hom 37 3 27 7 A 11 12 138762 CASAVA_Build 10 88865261 1I AAGCACGTCC -/A TTTTAACATC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 0 1 138763 CASAVA_Build 10 88866340 3I ATCCACTGAG ---/ATT ATAGTGGGGA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 ATT 0 1 138764 CASAVA_Build 10 88916087 5I ATCACATTTC -----/TAGAG TAGAGTGACT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 TAGAG 1 2 138765 CASAVA_Build 10 88925601 2D TTTTGGTGAC TT/-- TTGTTTTTAC 3070 het 2623 hom 17 7 7 5 T 4 2 138766 CASAVA_Build 10 88936366 4D TTCTTCATTC TTTT/---- TATCAGCTAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 5 1 138767 CASAVA_Build 10 88938644 1D CCTCTCTCCG T/- TTTTTTCCCC 2358 het 2358 ref 46 37 6 3 T 7 6 138768 CASAVA_Build 10 88940908 2D CAAGACAAGC GT/-- GTCTTTCTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GT 2 1 138769 CASAVA_Build 10 88953180 9D AATCAGGTCG TTGGTTATT/--------- TTGGTTATTT 1216 het 1216 ref 26 21 5 1 TTGGTTATT 2 1 138770 CASAVA_Build 10 88964657 6D TTTCTTTTTC TTTTCT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 1771 hom 31 9 9 13 TTTTCT 1 0 138771 CASAVA_Build 10 88971978 1I ACATGTGTAG -/C CTACAATTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 2 138772 CASAVA_Build 10 88973577 1I CATTCCTCTA -/C TGGGTGGAAG 3070 hom 56 het 21 0 19 2 C 0 1 138773 CASAVA_Build 10 88995595 1I AGACCAGCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1169 hom 30 4 13 13 A 15 16 138774 CASAVA_Build 10 88997300 2D TATTGCCCAG AT/-- ATGTCAGAGC 3070 het 3070 hom 42 15 25 4 AT 2 1 138775 CASAVA_Build 10 89001140 1D TGTTAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 11 10 T 12 11 138776 CASAVA_Build 10 89004589 2D TTCTCTCTCC CA/-- CACAAGTCCA 3070 het 951 hom 22 2 11 9 CA 3 2 138777 CASAVA_Build 10 89004908 1I AGCCCGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 23 16 11 T 10 11 138778 CASAVA_Build 10 89006814 3I ACATAATACT ---/TAA TAATGATAAT 3070 het 3070 ref 25 16 7 2 TAA 1 2 138779 CASAVA_Build 10 89007681 3D TTTATTTTTT TGG/--- GGGGGGGTGA 2782 het 243 hom 15 4 6 6 TGG 1 0 138780 CASAVA_Build 10 89009438 1D CCTTTAATCG T/- TTTTGCTGGA 3070 het 3070 hom 59 23 31 8 T 5 4 138781 CASAVA_Build 10 89013213 5D ATCCTATAAT GTTAA/----- GTTGTTACAT 1561 het 1561 ref 21 17 4 1 GTTAA 1 0 138782 CASAVA_Build 10 89022781 1I CAAGAAAATC -/A TTCAAAATCA 3070 het 3070 hom 57 20 31 6 A 0 1 138783 CASAVA_Build 10 89041218 3I GGAGATGAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 56 33 10 13 AAG 4 5 138784 CASAVA_Build 10 89049495 1I GGAGTGAGCA -/G GGGGGGAGTA 2259 het 2259 ref 54 43 5 6 G 6 7 138785 CASAVA_Build 10 89060653 2D CATGCTCTGC AT/-- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 AT 5 4 138786 CASAVA_Build 10 89072149 2I GAATAGATTT --/TG TGTGACTCCA 3070 het 3070 ref 47 34 10 3 TG 2 3 138787 CASAVA_Build 10 89073300 2D CAAGTATTTT TC/-- TGTTATGTAA 2463 het 2463 ref 35 22 6 8 TC 1 0 138788 CASAVA_Build 10 89078460 2D AGATTCTCAT TA/-- TATATATATA 3070 het 648 hom 28 4 8 16 TA 8 7 138789 CASAVA_Build 10 89078895 3I AAATATTGAC ---/ATT AATGTGATAA 1156 het 1156 ref 66 60 3 3 ATT 0 1 138790 CASAVA_Build 10 89080128 5D ATGATTATTC TATAT/----- TATATGTATA 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 TATAT 2 1 138791 CASAVA_Build 10 89081136 1D AAAGGAAAGG A/- AAAGGTCACA 2782 het 2782 ref 56 41 6 9 A 4 3 138792 CASAVA_Build 10 89089895 1D AATTTATCTC T/- TCTCCACTTT 3070 het 3070 ref 40 28 8 5 T 2 1 138793 CASAVA_Build 10 89094359 3D AGTAGAAGGA AAT/--- GATTCTGTGA 2524 het 2524 ref 40 30 6 4 AAT 1 0 138794 CASAVA_Build 10 89102084 2I CAGAAGTCAT --/AA GAGGATTCTT 3070 het 3070 ref 78 60 13 5 A 0 2 138795 CASAVA_Build 10 89144825 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 A 13 14 138796 CASAVA_Build 10 89154755 2D ATTTAAAATG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 11 9 138797 CASAVA_Build 10 89162968 1D AAATGTTTAG A/- GGTCAAGAAA 3070 het 3070 ref 32 20 10 3 A 1 0 138798 CASAVA_Build 10 89181418 1D GAGGGTGAGT G/- GTGAAGGGGA 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 G 2 1 138799 CASAVA_Build 10 89219072 3D AGAAAGCTAA TAT/--- TATCCCATTT 2458 het 2458 ref 26 17 6 4 TAT 2 1 138800 CASAVA_Build 10 89219209 4D AAAAAAACAA AAAC/---- AAAAACAAAA 2849 het 2849 ref 29 18 7 8 AAAC 1 0 138801 CASAVA_Build 10 89229058 5D GGGTAAAAAT TAAAA/----- TAAAATTTTA 3070 het 3070 hom 48 22 26 4 TAAAA 2 1 138802 CASAVA_Build 10 89235410 37D AACTTTGTTC TTTAAAATTATATGCTATTAGAAAAGAAACGTTGTCG/------------------------------------- TTTGAAATTA 1915 het 1915 ref 32 37 6 4 TTTAAAATTATATGCTATTAGAAAAGAAACGTTGTCG 1 0 138803 CASAVA_Build 10 89239744 1D GCCTAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2984 het 1117 hom 22 6 9 7 A 13 12 138804 CASAVA_Build 10 89240728 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 1068 het 1068 ref 9 3 3 3 A 9 10 138805 CASAVA_Build 10 89257234 1I TACATACTGA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 8 9 138806 CASAVA_Build 10 89268869 3D CCAAAAGACT ACA/--- ACAAGGGATA 3070 het 3070 ref 37 20 16 2 ACA 2 1 138807 CASAVA_Build 10 89273255 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2324 hom 26 het 11 0 8 3 T 15 14 138808 CASAVA_Build 10 89282720 1D AACATTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 T 12 11 138809 CASAVA_Build 10 89292055 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 7 8 T 11 10 138810 CASAVA_Build 10 89307944 1D GCCCTGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 11 10 138811 CASAVA_Build 10 89330136 1D CACCACTGAT G/- GGCACCTAGG 3070 het 3070 ref 56 25 26 5 G 3 2 138812 CASAVA_Build 10 89332614 1I CAGCTTAAAC -/A AAAAAAACAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 7 8 138813 CASAVA_Build 10 89333662 1D GAGCAAAAGG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 8 7 138814 CASAVA_Build 10 89336809 1D TCATTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 2969 het 386 hom 23 1 10 12 T 15 14 138815 CASAVA_Build 10 89337765 1D GAATGTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 25 7 T 12 11 138816 CASAVA_Build 10 89339093 10D TAGCACGTGC TTCATAGAAG/---------- TTCATAGAAG 3070 hom 90 het 42 0 30 14 TTCATAGAAG 2 1 138817 CASAVA_Build 10 89339753 1I TCTGCCACTA -/G GATAAATATC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 2 138818 CASAVA_Build 10 89341493 1D GCAATGAAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 111 het 43 0 37 7 A 9 8 138819 CASAVA_Build 10 89342936 1I TGGTAGAGAT -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 4 5 138820 CASAVA_Build 10 89359381 6I ACCCCCAGGC ------/CATGGA CCAGTATCAG 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 CATGGA 0 1 138821 CASAVA_Build 10 89369848 1I GGGAAAATAT -/A AACAGGTTTC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 2 3 138822 CASAVA_Build 10 89397377 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1879 hom 18 6 9 4 A 10 9 138823 CASAVA_Build 10 89401865 1D AGGCAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 2663 het 1173 hom 23 5 8 10 T 15 14 138824 CASAVA_Build 10 89403392 1I ATAAACCTCT -/A AGTGACATAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 A 1 2 138825 CASAVA_Build 10 89404731 2I CAGAATTATT --/TG TGTGTACATC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TG 2 3 138826 CASAVA_Build 10 89407588 1D GCTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 29 2 18 10 T 13 12 138827 CASAVA_Build 10 89410879 1D GGAGAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 11 10 138828 CASAVA_Build 10 89425258 1D ATTCATGTAT A/- GGGGGGCCAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 A 1 0 138829 CASAVA_Build 10 89426284 5I GGATCAAATT -----/AACTC AACTAATTAG 3070 het 3070 ref 58 29 24 5 AACTC 0 1 138830 CASAVA_Build 10 89428328 1I CCAGCAGCGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 15 12 A 10 11 138831 CASAVA_Build 10 89432832 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2990 het 2613 hom 27 9 8 10 T 14 12 138832 CASAVA_Build 10 89433430 1D AGATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 14 9 T 15 14 138833 CASAVA_Build 10 89441226 1D TGAGACACTT A/- AAAAAAAAAA 1343 het 1343 ref 42 25 5 12 A 13 12 138834 CASAVA_Build 10 89444884 2I TATAAAAAAC --/AG AAAGTTATTT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 AG 0 1 138835 CASAVA_Build 10 89447576 1D ACTGCACAGA C/- CTCTGGATTG 3070 hom 132 het 48 0 43 5 C 2 1 138836 CASAVA_Build 10 89450982 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTCTTT 1690 hom 18 het 11 0 7 4 T 6 7 138837 CASAVA_Build 10 89454332 3I CAATATAATT ---/CCA CCATCTAAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 CCA 1 2 138838 CASAVA_Build 10 89459064 4D TGTCATGTTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 6 AT 9 7 138839 CASAVA_Build 10 89465621 1D GTTGTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 11 10 138840 CASAVA_Build 10 89470481 1D TCCAAAAGCC A/- AAAAAAAACC 3070 het 2097 hom 22 5 14 3 A 9 8 138841 CASAVA_Build 10 89473175 1I GTGAGGAAAC -/T TGAGTTTAGA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 1 2 138842 CASAVA_Build 10 89473416 4D CCGGCAGTTG CTGT/---- CTATTTCCGG 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 CTGT 1 0 138843 CASAVA_Build 10 89474404 4I TTTTAATAAA ----/TTAT TTATTTATTA 1808 het 54 hom 6 1 4 1 TTAT 2 3 138844 CASAVA_Build 10 89478478 1I TGTCTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 2557 het 2557 ref 31 13 7 11 A 10 11 138845 CASAVA_Build 10 89487110 1I TGGTTCCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 A 11 12 138846 CASAVA_Build 10 89489918 1D ATGATAAATC T/- TAAGGTTTCA 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 T 2 1 138847 CASAVA_Build 10 89496143 2I TACAATTGAC --/CA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 CA 0 1 138848 CASAVA_Build 10 89499044 1D GCTTCATGCA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 7 T 8 7 138849 CASAVA_Build 10 89499272 2D TCTGAAAGGC AT/-- ATGTTATCAT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 AT 2 1 138850 CASAVA_Build 10 89501928 1I AAACTCTACA -/T AAAAAGGCCT 3070 het 3070 ref 58 29 23 6 T 0 1 138851 CASAVA_Build 10 89502286 4I ACAGACACAC ----/AGTT AGTTAATGGG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 AGTT 1 2 138852 CASAVA_Build 10 89510458 3I ATGATGAGGC ---/TGG TGGTCAGCTA 3070 het 3070 hom 39 9 26 4 TGG 1 2 138853 CASAVA_Build 10 89520525 2I GGATAGAAAT --/AA AGAGAGTGGA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 1 3 138854 CASAVA_Build 10 89528132 1I TCCCTTATCC -/A AAGATGCTGA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 2 3 138855 CASAVA_Build 10 89531385 1I AGATGAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 10 11 138856 CASAVA_Build 10 89531691 1D CTGAGAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 11 10 138857 CASAVA_Build 10 89540942 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 21 2 10 10 A 18 16 138858 CASAVA_Build 10 89541193 1I GCCAGATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 12 12 A 10 11 138859 CASAVA_Build 10 89547062 1I AAGAGGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 A 9 10 138860 CASAVA_Build 10 89549531 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAAAGTGTGT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 TA 1 0 138861 CASAVA_Build 10 89559269 1D AACTTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 A 13 12 138862 CASAVA_Build 10 89627813 1D GAAAGGTAAA T/- TTTTTTTTTT 2286 het 1340 hom 18 8 5 5 T 15 14 138863 CASAVA_Build 10 89629037 1D AGCAGTTGTA G/- ATAGATGATT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 G 1 0 138864 CASAVA_Build 10 89645223 1I CAAAAACTAC -/A AAAAAATCCC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 6 7 138865 CASAVA_Build 10 89666291 32D AAGTATTAGG TAGGTCATAGTTTGACAACAAGACTTGGAAGA/-------------------------------- TAGGTGGAAG 3070 hom 99 het 35 0 34 7 TAGGTCATAGTTTGACAACAAGACTTGGAAGA 1 0 138866 CASAVA_Build 10 89697642 4D AAAAGAAAAG AAAA/---- AGAAAAGAAA 3070 hom 74 het 27 0 25 2 A 5 1 138867 CASAVA_Build 10 89698345 1D GTTAGAGAAT A/- AAAACTGGCC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 5 4 138868 CASAVA_Build 10 89736712 4D GCCAGTGTTA GTTT/---- GTTGAGTGTA 3070 hom 90 het 34 0 29 7 GTTT 1 0 138869 CASAVA_Build 10 89756520 3I CCATCTACTC ---/AAG AAGAAGAGTA 3070 hom 145 het 53 0 46 7 AAG 2 3 138870 CASAVA_Build 10 89765305 1I CTTTTATAAT -/A TTTTAAGCTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 0 1 138871 CASAVA_Build 10 89767609 13D TCAATTGAGG TTGTTGTGTGCTC/------------- TTCTAGTCTT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 TTGTTGTGTGCTC 1 0 138872 CASAVA_Build 10 89768287 1I AAAGGATATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 692 hom 45 2 35 8 T 9 10 138873 CASAVA_Build 10 89770336 1I GAGAAGTCCT -/A ACACATTAAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 138874 CASAVA_Build 10 89784585 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1703 hom 45 4 22 19 A 13 14 138875 CASAVA_Build 10 89792347 3I TGGAAATGGA ---/GCT GCGCCCTGCG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GCT 0 1 138876 CASAVA_Build 10 89793061 2I TCTTTCTGGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 GT 5 6 138877 CASAVA_Build 10 89799675 8I GGTGGATCAC --------/AAGGTCAG AAGGTCAGGA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAGGTCAG 1 2 138878 CASAVA_Build 10 89800969 1I CTCCTTGGTT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 93 het 33 0 30 3 A 7 8 138879 CASAVA_Build 10 89804889 1I GAGGTTAAGC -/A AATTTGTTCA 3070 hom 53 het 21 0 18 3 A 2 3 138880 CASAVA_Build 10 89805591 1I TATTTTTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 138881 CASAVA_Build 10 89826841 2D TGGGCTGATT TC/-- TTTTTTTTTT 2666 hom 34 het 27 0 17 10 TC 1 0 138882 CASAVA_Build 10 89855438 1I GTGCATCTAC -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 T 6 7 138883 CASAVA_Build 10 89856784 1D TAGTTATAGC T/- TAACCTATTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 2 1 138884 CASAVA_Build 10 89862183 1I TAATTCTTGT -/C CCCACGATCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 C 3 4 138885 CASAVA_Build 10 89862540 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 11 12 138886 CASAVA_Build 10 89883761 12D CATTTTATTT ACATATTCATTC/------------ ACATATTCAT 3070 hom 63 het 31 0 22 15 ACATATTCATTC 3 2 138887 CASAVA_Build 10 89884287 1I TCACCATCAT -/C AATATGACCA 3070 het 3070 ref 102 59 38 5 C 0 1 138888 CASAVA_Build 10 89890370 1D AGAATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 9 A 13 12 138889 CASAVA_Build 10 89892464 7I TATTTTAACA -------/TTTCACC TTTCACCATT 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 TTTCACC 1 2 138890 CASAVA_Build 10 89895575 1I GGGTGGGGGG -/A ACACAGAAAG 2723 het 2723 ref 34 14 10 10 A 1 2 138891 CASAVA_Build 10 89901066 1D AATCTCAAAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 7 6 138892 CASAVA_Build 10 89905536 1I GTTTATTATC -/A ATATAAACAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 2 138893 CASAVA_Build 10 89910225 1I CCCCAACTCA -/C CCCCCCCAAC 3070 hom 48 het 19 0 15 4 C 7 8 138894 CASAVA_Build 10 89916164 1I GGAGGCTGAC -/A ATGAGTGGCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 2 138895 CASAVA_Build 10 89925911 1D TTAGCCTATC T/- TTTTTTTTTT 2758 het 1308 hom 27 11 7 9 T 13 12 138896 CASAVA_Build 10 89950729 2D AAATGAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 33 3 17 14 T 14 12 138897 CASAVA_Build 10 89972441 1D GTAAGTGTCT A/- ACCTTTGGAA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 2 1 138898 CASAVA_Build 10 89979392 4D TTTGTCCATT AACA/---- ATCACTCCTT 3070 het 3070 ref 41 20 13 9 AACA 1 0 138899 CASAVA_Build 10 89990151 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2806 hom 28 11 12 5 A 13 12 138900 CASAVA_Build 10 89996288 1I AGTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 T 10 11 138901 CASAVA_Build 10 90002417 1D TGTGAACATC A/- ATCAGCCAGC 3070 het 3070 ref 55 24 24 7 A 2 1 138902 CASAVA_Build 10 90006781 1D GTGTTGTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 507 hom 29 4 21 5 A 13 12 138903 CASAVA_Build 10 90016597 3D AAGGTAGCTG GCT/--- GCTGGTGTCA 3070 hom 96 het 37 0 31 7 GCT 2 1 138904 CASAVA_Build 10 90023593 1D TTGATAGGTT A/- AAAAATTACG 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 6 5 138905 CASAVA_Build 10 90024963 1D CCATTTTACA T/- TCTTTATCCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 2 1 138906 CASAVA_Build 10 90029336 18I TGAATCTGCA ------------------/ACACTAAGGAAATGAATC TACTTAGCCA 3070 hom 99 het 34 0 34 3 ACACTAAGGAAATGAATC 0 1 138907 CASAVA_Build 10 90036531 1I TCCCTTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 11 12 138908 CASAVA_Build 10 90039819 5D AATTAAAGAT GAAAG/----- GAAAGAGGTA 3070 het 3070 ref 43 21 21 3 GAAAG 2 1 138909 CASAVA_Build 10 90058187 1I ATAAAAAAAA -/C AACCCCATTA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 C 0 1 138910 CASAVA_Build 10 90065476 2I ACATTTCAGG --/TT TTTTTTTTTT 2622 het 1566 hom 34 5 14 15 T 15 17 138911 CASAVA_Build 10 90078017 1D TGCATTATGA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 8 7 138912 CASAVA_Build 10 90091770 2D CAAAAGTAAC TG/-- TGGTTTTACC 3070 het 3070 ref 52 25 16 11 TG 2 1 138913 CASAVA_Build 10 90109051 1D AAACTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 12 11 138914 CASAVA_Build 10 90115120 2I GCAAAACAAT --/AG ATTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 AG 0 1 138915 CASAVA_Build 10 90118278 2D TTTTCCTTTA GT/-- GTGTTATGTT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 GT 3 2 138916 CASAVA_Build 10 90126787 4I GGGAAAATTC ----/TCTT TCTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 TCTT 1 2 138917 CASAVA_Build 10 90129169 1D TTTCAAATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 22 0 21 2 T 10 9 138918 CASAVA_Build 10 90131644 1I AAATAACAAT -/A TTTTTGGTAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 0 1 138919 CASAVA_Build 10 90139283 35D AATATTTCGG TTTTAGGGATTTCTTAACTGAGTTGTTAAGGATCC/----------------------------------- TTTTAGGGAT 3070 het 3070 ref 36 28 8 12 TTTTAGGGATTTCTTAACTGAGTTGTTAAGGATCC 2 1 138920 CASAVA_Build 10 90146443 1D ATAATGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 13 12 138921 CASAVA_Build 10 90150764 5D TTCAGAAAAC AATAA/----- TTCAAATTGT 3070 het 3070 ref 32 17 15 4 AATAA 1 0 138922 CASAVA_Build 10 90153435 1D TTCTTGTAGC T/- TTTTTTTTTC 1771 het 1771 ref 33 23 4 7 T 10 9 138923 CASAVA_Build 10 90168333 4D AAATATCCTG AAGA/---- AATAGCTAAA 3070 het 3070 hom 49 18 28 5 AAGA 1 0 138924 CASAVA_Build 10 90178145 2D CTGGTCTAAA TT/-- TGATTCTGTT 3070 het 3070 ref 44 20 18 7 T 3 1 138925 CASAVA_Build 10 90197110 4I CCAATAACAG ----/ACAA ACAGAGAGCC 2415 het 2415 ref 20 11 6 3 ACAA 0 1 138926 CASAVA_Build 10 90200734 3I GACAGGAAAA ---/AAG AAGTTGTCCA 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 AAG 1 2 138927 CASAVA_Build 10 90205002 1I AAGTAAAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 A 9 10 138928 CASAVA_Build 10 90207354 1D GGATTTAGGG T/- TTATGAGGTT 3070 het 3070 hom 43 21 18 4 T 3 2 138929 CASAVA_Build 10 90208841 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2922 het 2384 hom 26 11 10 5 T 14 13 138930 CASAVA_Build 10 90229531 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 13 9 T 15 14 138931 CASAVA_Build 10 90236687 4I AGTAAAACAT ----/GGAA TTAACCTAAA 3070 hom 77 het 31 0 22 9 GGAA 0 1 138932 CASAVA_Build 10 90237140 1I GCAACTGGTT -/A AAAAAAATGC 3070 het 136 hom 28 1 24 3 A 7 8 138933 CASAVA_Build 10 90247681 2D TATTGAAGAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 11 9 138934 CASAVA_Build 10 90255135 4D AGAGACACTC TGTT/---- TGTGAGTGTG 3070 hom 111 het 39 0 36 3 TGTT 1 0 138935 CASAVA_Build 10 90259189 1I GAGAGAGAGA -/G AAAAAAAGGA 3070 hom 33 het 17 0 12 5 G 0 1 138936 CASAVA_Build 10 90291957 4D CTCTGAGGGC CTGA/---- CTGTGAGGCT 3070 het 3070 ref 45 23 21 2 CTGA 1 0 138937 CASAVA_Build 10 90296642 1D CCATGAAACC A/- AAAAAAAAAA 2319 het 2319 ref 33 15 7 11 A 15 14 138938 CASAVA_Build 10 90299018 9I AAAATATTTT ---------/ATGCTGGGC ATGGTGGCTC 3070 hom 87 het 37 0 28 10 ATGCTGGGC 0 1 138939 CASAVA_Build 10 90311821 1I TTGTCAAACG -/T TAAGAGTGAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 1 2 138940 CASAVA_Build 10 90319058 1D AAGATGTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 321 hom 37 1 26 10 T 12 11 138941 CASAVA_Build 10 90325543 1I CATCGCACTT -/A AGAGTATAAA 3070 het 3070 ref 50 22 18 10 A 1 2 138942 CASAVA_Build 10 90368451 1I AGTTGCCAGC -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 7 8 138943 CASAVA_Build 10 90375155 9I TAAAATAGAT ---------/GAGTATATA GAGGATTCCT 3070 het 3070 hom 34 16 15 4 GAGTATATA 0 1 138944 CASAVA_Build 10 90447366 2I AATTTCTACA --/TC TCATCTCACC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 TC 1 2 138945 CASAVA_Build 10 90451329 3I GTCTTTTAAA ---/CTT CTCAATGATT 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 CTT 0 1 138946 CASAVA_Build 10 90463135 4I ATTTTTTGTT ----/GTAA GTATTACCAT 3070 het 3070 hom 40 13 25 2 GTAA 0 1 138947 CASAVA_Build 10 90466217 1D GCCTCAGCCT C/- CCGAGTAGCT 1816 het 1528 hom 12 5 5 3 C 3 2 138948 CASAVA_Build 10 90466608 1D TGGATTTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 9 8 138949 CASAVA_Build 10 90470856 3D9M8D CTTAGTCTAA TATCCTTATATGCATTAGCA/---GGATATATG-------- TATAAGGATA 3070 het 3070 hom 30 11 19 3 N/A 0 0 138950 CASAVA_Build 10 90474403 1D ATTTATTCAG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 39 22 16 3 A 7 6 138951 CASAVA_Build 10 90475821 1I ACTGCTTCCT -/C CCCCTCTTCT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 C 4 5 138952 CASAVA_Build 10 90492502 1I TTTTAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 11 12 138953 CASAVA_Build 10 90506729 1D TTAACTCAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 A 9 8 138954 CASAVA_Build 10 90508102 2I TAATTTTATT --/AA AAAAAAAAAA 1586 het 1195 hom 15 6 5 4 A 14 16 138955 CASAVA_Build 10 90519251 1D TATTAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 10 T 14 13 138956 CASAVA_Build 10 90520193 1D AGCACTGACT G/- GGCAGAATAC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 G 3 2 138957 CASAVA_Build 10 90522593 1D AAATAATCTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 A 9 8 138958 CASAVA_Build 10 90532350 4D ATAGTGTGAT ACTC/---- AATAGCTTCA 3070 het 3070 ref 38 21 15 5 ACTC 1 0 138959 CASAVA_Build 10 90555640 1D TACAGACTTC A/- AAACAGCCAG 3070 het 3070 hom 48 22 22 5 A 4 3 138960 CASAVA_Build 10 90579409 2D ATTTTTAAAC AT/-- ATGATTGTAA 3070 hom 117 het 42 0 40 4 AT 2 1 138961 CASAVA_Build 10 90594822 2I AGAAACTCAC --/TT TTCTCCTCAC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 2 4 138962 CASAVA_Build 10 90609458 4I CACTCAGTAA ----/TCTC TCTATGTATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TC 1 3 138963 CASAVA_Build 10 90613093 2D AACTTCTTCG AA/-- AAAAAAAAAA 2587 het 2587 ref 29 14 7 9 A 13 11 138964 CASAVA_Build 10 90617459 4I AAAAAGTAAC ----/ACTT ACTTATTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 ACTT 1 2 138965 CASAVA_Build 10 90617543 1D TCTATGTGCA T/- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 7 6 138966 CASAVA_Build 10 90625401 1I TGGGACTACA -/G GTGTGCACCA 2843 het 2843 ref 20 8 7 5 G 1 2 138967 CASAVA_Build 10 90662311 1I CAATAGAACT -/C CCTGTGATGA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 C 2 3 138968 CASAVA_Build 10 90692481 1D TTTCCAACCA T/- TTTTTTTTTT 935 het 935 ref 48 34 3 11 T 13 12 138969 CASAVA_Build 10 90713157 15I ACTCGTCAGG ---------------/AGTAAGGGATTAAAC AGTAAGTCTG 3070 hom 99 het 33 0 34 1 AGTAAGGGATTAAAC 0 1 138970 CASAVA_Build 10 90715398 3D TCAAGCCATT ATA/--- ATGCAAAGCA 3070 hom 72 het 28 0 24 5 ATA 1 0 138971 CASAVA_Build 10 90718136 13D TAAAACTCAT AATGGAGCAATTA/------------- AAACCATGTT 3070 hom 117 het 40 0 39 4 AATGGAGCAATTA 1 0 138972 CASAVA_Build 10 90738168 7D TTTTTTTTTT TGTTTTG/------- TTTTTTATCT 3070 hom 69 het 24 0 22 4 TGTTTTG 1 0 138973 CASAVA_Build 10 90743043 2I GTGGGTTGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 12 14 138974 CASAVA_Build 10 90743530 2I TAACGAACAT --/AA ATTGGGCTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 3 138975 CASAVA_Build 10 90744830 2I GCTATGTATG --/TA TATATATATA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TA 5 6 138976 CASAVA_Build 10 90745581 1I ACAAAGAAAC -/A AAAAAATCAT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 6 7 138977 CASAVA_Build 10 90745937 1I78M1I AAGACTCTTG -TTTTTTTGCTGAGGATTTAGCTTTGGTTTTTAGCCATTCTCACAGAGATCATTGGTCCTAATTAACTGGTTGTTGTTG-/TTTTTTTTGCTGAGGATTTAGCTTTGGTTTTTAGCCATTCTCACAGAGATCATTGGTCCTAATTAACTGGTTGTTGTTGT TTTTTTTTCA 3070 het 206 hom 37 1 35 21 N/A 0 0 138978 CASAVA_Build 10 90771265 1I TCCCAAAAAG -/A AAAAAGAGAA 3070 hom 53 het 24 0 18 6 A 5 6 138979 CASAVA_Build 10 90783172 4D TATTAACCTG TATA/---- TATAATTCAT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 TA 4 2 138980 CASAVA_Build 10 90787314 1I GATTATTAGA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 6 7 138981 CASAVA_Build 10 90794558 2I TTTGTTGTTG --/TA TATATTTTTT 1254 het 1254 ref 20 10 5 5 TA 2 3 138982 CASAVA_Build 10 90803647 1I ACTCAGTCAG -/A ACAAACAGAC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 1 2 138983 CASAVA_Build 10 90806944 2D AGAGTAGAAC TT/-- ATATCCCTAA 3070 het 3070 hom 51 19 21 12 T 2 0 138984 CASAVA_Build 10 90815274 4I ATAAAAATTA ----/AATT AATTGAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 AATT 1 2 138985 CASAVA_Build 10 90815639 2D ATAAAGGTCA AT/-- ATGGGACAGT 2609 het 2609 ref 13 6 6 4 AT 2 1 138986 CASAVA_Build 10 90821067 5D ATGAGCGTAA TAAAT/----- TAAATTAAAG 3070 het 3070 ref 30 13 11 10 TAAAT 2 1 138987 CASAVA_Build 10 90822404 1I ATATACCACA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 T 8 9 138988 CASAVA_Build 10 90832447 3I AATTTTGAAG ---/ATA ATTTTAATTA 2007 het 2007 ref 17 6 5 6 ATA 0 1 138989 CASAVA_Build 10 90841197 2I ATGCATATCC --/AG AGATACCTTT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 AG 1 2 138990 CASAVA_Build 10 90841990 1D CATGGTCATC T/- TTTTTTGAGG 3070 het 3070 ref 54 24 22 9 T 7 6 138991 CASAVA_Build 10 90847467 1D TAAAAAAAAA T/- CTTAGATCTA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 T 1 0 138992 CASAVA_Build 10 90864180 4I TAGTTGGGTA ----/ACAG AACAAATACA 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 ACAG 0 1 138993 CASAVA_Build 10 90864434 3I AGTTCAAAGA ---/AGG AGGAGAGATC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AGG 1 2 138994 CASAVA_Build 10 90864579 4I ATCATTCTGG ----/TAAC TAACTACCAG 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 TAAC 1 2 138995 CASAVA_Build 10 90868972 1I AGGAGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 10 11 138996 CASAVA_Build 10 90869731 18D TCCAGGAAAG TTTCCTGGAATACAGAGT/------------------ TTTCCTGGAA 3070 het 3070 ref 51 28 16 13 TTTCCTGGAATACAGAGT 2 1 138997 CASAVA_Build 10 90870287 3D GTGTTACCTA TGT/--- TGTTGTGTGT 3070 het 3070 hom 39 18 19 4 TGT 3 2 138998 CASAVA_Build 10 90873033 1I CTGCTTTCGT -/C CCCCCTGTGT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 C 5 6 138999 CASAVA_Build 10 90873819 20I TAACAGATAC --------------------/ATATTACAAACTAATATGTA ATATTACATA 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 ATATTACAAACTAATATGTA 0 1 139000 CASAVA_Build 10 90878540 2I GGCTTGATGC --/AA AGAGTTGAGT 3070 het 3070 ref 51 22 20 9 A 1 3 139001 CASAVA_Build 10 90880337 3D AAGTATGGTG ATA/--- ATATTTCAGA 3070 het 3070 hom 33 15 14 6 ATA 2 1 139002 CASAVA_Build 10 90884259 1D CAGGTTTTTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 T 7 6 139003 CASAVA_Build 10 90884644 1D TCTAGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3051 hom 23 8 11 4 T 12 11 139004 CASAVA_Build 10 90885185 3I AAATATAAAA ---/CTT CTTCTTCATG 2046 het 2046 ref 18 7 7 4 CTT 2 3 139005 CASAVA_Build 10 90889213 1I CTTCAGTGTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 7 8 139006 CASAVA_Build 10 90890811 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 18 7 A 14 12 139007 CASAVA_Build 10 90892070 1D TCATTCCTAC A/- AAAAAAAAAA 2441 het 2080 hom 20 7 7 6 A 15 14 139008 CASAVA_Build 10 90973038 5I ACTCAACAGG -----/AAGTT CTTCAGCCCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAGTT 0 1 139009 CASAVA_Build 10 90993330 1D CACAGAGGTT A/- AAAAAAAAAA 1296 het 1296 ref 36 29 4 3 A 12 11 139010 CASAVA_Build 10 91021637 1I CCAACTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 A 11 12 139011 CASAVA_Build 10 91058056 1D CTATTAGGAA T/- TTTTTTTTTT 1521 het 1521 ref 33 23 4 6 T 12 11 139012 CASAVA_Build 10 91065325 1D AAATGAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 10 9 139013 CASAVA_Build 10 91080493 1I TCACTCAAGA -/T TGCCTGATAA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 1 2 139014 CASAVA_Build 10 91084340 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCGGC 2493 hom 24 het 9 0 7 2 CTC 0 1 139015 CASAVA_Build 10 91085423 2I ATTAATTACT --/AG AGTGTTCAGC 3070 hom 133 het 51 0 42 9 AG 1 2 139016 CASAVA_Build 10 91130173 1D CAAACTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 39 4 15 20 T 17 16 139017 CASAVA_Build 10 91137851 1I AAAAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 10 11 139018 CASAVA_Build 10 91142302 3I CACCCACAGC ---/TTA TTACACCATT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 TTA 1 2 139019 CASAVA_Build 10 91145558 1D CAAAATTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 11 10 139020 CASAVA_Build 10 91147419 2I ATCCAGAGCA --/TT TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 8 10 139021 CASAVA_Build 10 91148779 1I TATATCCTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 9 10 139022 CASAVA_Build 10 91149346 1I CTTTCCCACA -/C CATTTGTTGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 1 2 139023 CASAVA_Build 10 91151528 1D AAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 583 hom 28 3 21 5 A 12 11 139024 CASAVA_Build 10 91154897 24D TCTTCATGAA GATGTTTTAATTTTAATTCAATGT/------------------------ GAAAGGGTTC 3070 hom 93 het 29 0 32 3 GATGTTTTAATTTTAATTCAATGT 1 0 139025 CASAVA_Build 10 91162537 1D CCAGAAGGAA G/- AAACTCCAGA 3070 hom 59 het 30 0 26 5 G 1 0 139026 CASAVA_Build 10 91169099 1I16M4D AATTGTTCTC -TTTTTTTTTTTAACTAAAAC/TTTTTTTTTTTTAACTA---- AAATCTGCAA 3070 het 109 hom 25 1 22 3 N/A 0 0 139027 CASAVA_Build 10 91169763 1I TGTAAATTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 10 139028 CASAVA_Build 10 91174753 3D TATTTTAAAA CAT/--- CATGTTGTAC 3070 hom 39 het 14 0 13 1 CAT 2 1 139029 CASAVA_Build 10 91175238 1D AGGGAGGGAT A/- TTGGGAGAGG 3070 hom 75 het 31 0 24 7 A 1 0 139030 CASAVA_Build 10 91178590 1I GTCAGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 13 10 14 A 13 14 139031 CASAVA_Build 10 91180741 1D TACCTTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 17 0 14 3 T 12 11 139032 CASAVA_Build 10 91209054 1I CAGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 11 12 139033 CASAVA_Build 10 91210220 1I CCAGCACTTT -/G GGAGGCTGAG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 G 2 3 139034 CASAVA_Build 10 91213140 1I CAAATAAGGT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 8 9 139035 CASAVA_Build 10 91220657 6D ACTACCACAA GGACAC/------ GGACACGTGA 3070 hom 98 het 39 0 31 9 GGACAC 2 1 139036 CASAVA_Build 10 91222027 9D TTTACATTAA TAATAATGT/--------- AATAATAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TAATAATGT 1 0 139037 CASAVA_Build 10 91229044 1D ACTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1434 het 1434 ref 50 36 4 10 T 11 10 139038 CASAVA_Build 10 91236462 1I AAAAAAAGAG -/A AAAAACGAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 5 6 139039 CASAVA_Build 10 91247478 1I CAGAAAGAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 392 hom 27 1 22 4 A 9 10 139040 CASAVA_Build 10 91266575 1D GGAATCCACT A/- AATCCATAGT 2642 het 2642 ref 30 19 9 2 A 3 2 139041 CASAVA_Build 10 91267218 1D AGGTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 11 10 139042 CASAVA_Build 10 91269026 4I CTGCTGGGTG ----/AAGA AATCATTTGT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 AAGA 0 1 139043 CASAVA_Build 10 91322287 6D TGAGCCACCA CACCTG/------ GCCAAAGAAT 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 CACCTG 1 0 139044 CASAVA_Build 10 91337310 1D TCCACTTTAA G/- GAAACAAACT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 G 2 1 139045 CASAVA_Build 10 91343272 1D ATGGGGGGGG A/- AAATTAATGC 3070 het 3070 hom 53 18 25 11 A 4 3 139046 CASAVA_Build 10 91352249 1D GCTACTTGGA T/- TTTTCAAACA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 5 4 139047 CASAVA_Build 10 91356359 1I CTCCTGGGCT -/C CAAGCGATCC 3070 hom 51 het 20 0 18 3 C 1 2 139048 CASAVA_Build 10 91357575 4I CAGAGCCTTG ----/CAGA GTGCACAGCC 3070 hom 63 het 25 0 21 4 CAGA 0 1 139049 CASAVA_Build 10 91360202 2D GACATAGAAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 123 het 44 0 42 4 A 11 9 139050 CASAVA_Build 10 91360724 1D AGGGAATGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 10 9 139051 CASAVA_Build 10 91369809 2D TTTCCTATGC GT/-- CTTTAATCTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 GT 1 0 139052 CASAVA_Build 10 91375481 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 44 1 38 6 A 11 10 139053 CASAVA_Build 10 91378176 3D46M4I AAGATCACGT ATGATATGATTTCACTCATTTGAAATGTCCAGAATAAGCAAAACTCTAG----/---ATATGATTTCACTCATTTGAAATGTCCAGAATAAGCAAAACTCTAGATCT AGACAGAAAA 3070 hom 129 het 35 0 44 3 N/A 0 0 139054 CASAVA_Build 10 91383270 1D AGCCCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 32 4 12 16 T 11 10 139055 CASAVA_Build 10 91387668 1D AATTTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 T 11 10 139056 CASAVA_Build 10 91389927 2D AGAACAATGG AC/-- ACAGAGATGT 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 AC 2 1 139057 CASAVA_Build 10 91397609 1D TTTTTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2659 hom 30 7 13 10 T 12 11 139058 CASAVA_Build 10 91403414 1D TTGTTGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 12 15 T 11 10 139059 CASAVA_Build 10 91406193 1I GGGCAGTGCA -/G AGGGGAGATG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 G 0 1 139060 CASAVA_Build 10 91407379 1D GAGAAAATCA G/- GGTTTTTTTC 3070 het 58 hom 34 3 22 11 G 3 2 139061 CASAVA_Build 10 91411331 1D AAAGGAACAA T/- AAAACATCTG 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 T 1 0 139062 CASAVA_Build 10 91415484 4D TGGCTGGGAG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 35 17 16 7 GA 7 5 139063 CASAVA_Build 10 91425010 4I TTGAATTGAA ----/TTTT TTTTTTTTTT 2057 het 1747 hom 22 10 9 3 T 10 14 139064 CASAVA_Build 10 91431873 4D ATGAAGAGTC TATT/---- TATTAAATGG 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 TATT 2 1 139065 CASAVA_Build 10 91441166 1I CAAACATTAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 7 8 139066 CASAVA_Build 10 91446455 2D TTTAAAAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 2027 het 2027 ref 21 11 8 2 T 15 13 139067 CASAVA_Build 10 91447680 3D CTTACAGAAT ATA/--- ATTCTAGCTC 3070 het 3070 hom 49 16 28 5 ATA 1 0 139068 CASAVA_Build 10 91447788 3D TTCACAGTCA TGC/--- TGAAGTAGGT 3070 het 3070 ref 52 27 21 5 TGC 1 0 139069 CASAVA_Build 10 91449075 1D GGCCAGGGCA G/- AAAAATCAGC 3070 het 3070 hom 42 19 22 3 G 1 0 139070 CASAVA_Build 10 91449398 3D TAGTTTCTCC AGG/--- AGATTAACCT 3070 het 3070 hom 50 20 25 6 AGG 1 0 139071 CASAVA_Build 10 91450065 1I TATTCCTTTT -/C CCCCCCTCCT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 6 7 139072 CASAVA_Build 10 91454302 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 12 11 139073 CASAVA_Build 10 91456369 2D CTTCCATACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 T 13 11 139074 CASAVA_Build 10 91457245 1D TTTCTTTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2667 hom 29 10 11 9 T 10 9 139075 CASAVA_Build 10 91458303 1D AGGGCCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 3 T 11 10 139076 CASAVA_Build 10 91460351 1D ATGATTAAAA T/- CCAGAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 1 0 139077 CASAVA_Build 10 91463176 1D TTAAAATGTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 A 9 8 139078 CASAVA_Build 10 91464680 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 8 9 139079 CASAVA_Build 10 91465192 3D TCACGTTATT CTC/--- CTGCTTTGTA 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 CTC 1 0 139080 CASAVA_Build 10 91472501 4I TGTTTTACTC ----/AGTT AGAAAGTATG 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 AGTT 0 1 139081 CASAVA_Build 10 91472811 2D ACAACAACAC TG/-- TGATCAGCAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TG 2 1 139082 CASAVA_Build 10 91476989 1D TTTCTGTCTT C/- CCCCCCCCTT 3057 het 1705 hom 27 11 11 5 C 9 8 139083 CASAVA_Build 10 91482241 1D CAGTTTCAAA G/- CTGTCTGTAG 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 G 1 0 139084 CASAVA_Build 10 91483059 1D TATAATAGTT A/- AAACTCATTA 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 A 4 3 139085 CASAVA_Build 10 91486096 2D TCATGGAATC TA/-- TGAGGAAAGT 2264 het 2264 ref 25 15 6 5 TA 1 0 139086 CASAVA_Build 10 91487001 2D GCTTATTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 12 10 139087 CASAVA_Build 10 91487883 6I AACAATAGAC ------/TAAAAG TAAAGGAGAA 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 TAAAAG 0 1 139088 CASAVA_Build 10 91489971 1D TTGTGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 36 4 23 9 T 17 16 139089 CASAVA_Build 10 91494533 5I GATTTTAATT -----/CTTAA CTTAAGGTAA 3070 het 3070 ref 55 25 21 9 CTTAA 1 2 139090 CASAVA_Build 10 91496580 1I AAGATGCAGC -/T TTATCAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 2 3 139091 CASAVA_Build 10 91501404 3I ATATGCAGTA ---/AAG AAGGAGTAAG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 AAG 1 2 139092 CASAVA_Build 10 91516921 1I CCACATACTC -/T TTTTTTTTTT 2267 het 2267 ref 30 21 6 3 T 14 15 139093 CASAVA_Build 10 91519422 2D ATATATACAC AT/-- GTGTGCACAT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 AT 1 0 139094 CASAVA_Build 10 91525151 1I GTTGATCACC -/T TTTTCACATG 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 4 5 139095 CASAVA_Build 10 91535408 1D TTGTGAAGCC T/- TTTGTAAAGG 3070 hom 96 het 36 0 32 5 T 4 3 139096 CASAVA_Build 10 91542559 1I TCTGTGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1811 hom 40 5 26 9 T 13 14 139097 CASAVA_Build 10 91551804 1I TGACTCTTCC -/T TTCATGAAAG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 2 3 139098 CASAVA_Build 10 91568749 1I TTCTGAAATC -/T AGGCGGAAGT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 0 1 139099 CASAVA_Build 10 91574985 1I ACTGGGAGAT -/A AAACACCTGG 3070 hom 150 het 53 0 50 3 A 3 4 139100 CASAVA_Build 10 91585109 4I TTGAGTGTCT ----/TATC TATCTATCAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TATC 2 3 139101 CASAVA_Build 10 91601127 1D GTATAATTAC A/- AAAAAAAAAA 2809 het 333 hom 24 2 12 10 A 18 17 139102 CASAVA_Build 10 91604912 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1068 het 1068 ref 34 21 3 10 T 13 14 139103 CASAVA_Build 10 91616911 1D TTTCTTTTTT C/- TTTTTTTTAA 2823 het 2823 ref 33 17 12 4 C 1 0 139104 CASAVA_Build 10 91617316 1D TAGAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 11 10 139105 CASAVA_Build 10 91620135 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 34 2 14 18 T 13 12 139106 CASAVA_Build 10 91625598 1D TTATATAATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 44 27 15 4 T 9 8 139107 CASAVA_Build 10 91630354 1I GTTCTAATAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 9 10 139108 CASAVA_Build 10 91630658 1I GTTTTGAGAG -/T TTTTTATCTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 5 6 139109 CASAVA_Build 10 91635064 4D TTTACCTCTT AAAC/---- AAAATGTAAT 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 AAAC 1 0 139110 CASAVA_Build 10 91637068 1D GTTTTGGAGA T/- TTTTTTTATA 2380 het 2380 ref 22 14 5 4 T 8 7 139111 CASAVA_Build 10 91650106 1D ATTTGTTAAT G/- TTTATTAGTA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 G 1 0 139112 CASAVA_Build 10 91661779 1D ATACGAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 758 hom 39 2 30 7 T 11 10 139113 CASAVA_Build 10 91663807 1I AATCTTGCTC -/T GCATATTAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 0 1 139114 CASAVA_Build 10 91669648 4D CACCCCCCCC CCCT/---- ACCAAATTAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 CCCT 1 0 139115 CASAVA_Build 10 91675202 2I AGATAGAAAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 57 het 51 1 39 11 AG 7 8 139116 CASAVA_Build 10 91697017 1D TTGTATTTGG A/- AAAACCTAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 5 4 139117 CASAVA_Build 10 91726901 1D GAAACGTTAC A/- TTTTTTTTTA 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 1 0 139118 CASAVA_Build 10 91727615 1D TTCAGACATA T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 114 het 45 0 38 9 T 6 5 139119 CASAVA_Build 10 91730781 1I TTGAACCTGC -/A GAGGTGGAGG 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 0 1 139120 CASAVA_Build 10 91740084 1I TAACATTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 286 hom 17 1 12 4 A 11 12 139121 CASAVA_Build 10 91744237 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 9 10 139122 CASAVA_Build 10 91744354 1I TGACCCTATC -/T TTTATTTCTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 3 4 139123 CASAVA_Build 10 91747698 4I TTAACATCTA ----/TATC TATATCTATC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TATC 0 1 139124 CASAVA_Build 10 91753261 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 65 het 25 0 22 6 T 10 9 139125 CASAVA_Build 10 91767603 3D CTCTATTCCT ATG/--- ATATGTTATT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 ATG 1 0 139126 CASAVA_Build 10 91772886 4D TATTATGTGA CTGT/---- CTATCACAGT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 CTGT 1 0 139127 CASAVA_Build 10 91775601 4I AAAGAAAAAC ----/AATG AAGATAACTA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 AATG 0 1 139128 CASAVA_Build 10 91787236 1D TGGCTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 1418 het 1418 ref 34 22 5 7 A 13 12 139129 CASAVA_Build 10 91792554 1I ACCTGAAGAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 36 het 18 0 14 4 T 7 8 139130 CASAVA_Build 10 91818943 1I TGACAGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 24 7 T 10 11 139131 CASAVA_Build 10 91833323 1I TGTATGGGTT -/G GGCACCACGG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 2 3 139132 CASAVA_Build 10 91837152 56I CATATAAGTT --------------------------------------------------------/CTGATCATCTGGCATTTTGAGTCCTCTCAGAGGTCATGGACGTATGGAGAGAGAAA CTGAGACATG 3070 hom 48 het 15 0 17 1 CTGATCATCTGGCATTTTGAGTCCTCTCAGAGGTCATGGACGTATGGAGAGAGAAA 0 1 139133 CASAVA_Build 10 91838186 1I GCCAACATAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 435 hom 30 1 23 6 T 8 9 139134 CASAVA_Build 10 91843538 1D ACTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 902 hom 29 2 22 5 T 13 12 139135 CASAVA_Build 10 91843830 2D AATACCTGTC TT/-- TTTAAGAATG 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 5 3 139136 CASAVA_Build 10 91847337 1D ATATTCTATG A/- AAAATTCTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 5 4 139137 CASAVA_Build 10 91861558 1I TGTGTGACTC -/T ACCCCTTTAC 3070 hom 184 het 64 0 62 2 T 0 1 139138 CASAVA_Build 10 91886175 19I AGACACATTG -------------------/CTGGTTGTCTGTGGTACAT TGCAGCTTCA 3070 hom 87 het 34 0 30 6 CTGGTTGTCTGTGGTACAT 0 1 139139 CASAVA_Build 10 91900802 1D TTTTACTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 24 0 18 6 A 12 11 139140 CASAVA_Build 10 91901240 1I TCGGAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 27 1 22 4 T 11 12 139141 CASAVA_Build 10 91915543 1D GATTATTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 10 9 139142 CASAVA_Build 10 91917020 1D TGTGTAAAGC T/- TTAAAGCTAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 3 2 139143 CASAVA_Build 10 91921803 1I AAATACCCCC -/T CCTCTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 0 1 139144 CASAVA_Build 10 91928490 2D TATATGTATA TG/-- TGTGTGTATA 530 hom 10 het 6 0 4 4 TG 4 3 139145 CASAVA_Build 10 91951015 1I AAAAAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 T 10 11 139146 CASAVA_Build 10 91953990 4D CTGAGAATTT AATC/---- AAGCAATTAT 3070 het 3070 hom 35 12 20 5 AATC 1 0 139147 CASAVA_Build 10 91956482 2I TCTTTTTTTC --/TA TATATATGTT 3070 hom 36 het 23 0 13 10 TA 3 4 139148 CASAVA_Build 10 91958831 2I ATTCAGAAAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 131 het 57 0 40 17 AC 7 8 139149 CASAVA_Build 10 91959770 1D GGAATTTTTT G/- GGGATGATGG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 4 3 139150 CASAVA_Build 10 91963071 1D AAAGGAGACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 139151 CASAVA_Build 10 91979833 1I GTAAGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 2268 het 2268 ref 20 8 7 5 A 10 11 139152 CASAVA_Build 10 91986482 2D ATCTCAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2858 hom 32 14 12 7 T 13 11 139153 CASAVA_Build 10 91987720 1I TAATGGTTCT -/C CCTTTGTTGT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 C 2 3 139154 CASAVA_Build 10 92041855 4D AAAGAATAAG AAGC/---- AAGAGAATCT 3070 het 3070 ref 45 21 22 5 AAGC 1 0 139155 CASAVA_Build 10 92043354 2D CAGTGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 390 het 390 ref 14 6 3 6 CT 2 1 139156 CASAVA_Build 10 92044672 5D TACTTATTGA ATAAT/----- ATAAAGTTCT 3070 het 2499 hom 34 7 25 5 ATAAT 1 0 139157 CASAVA_Build 10 92051824 1I GGTTTTACAC -/A AGAGACATTC 2329 het 2329 ref 19 8 5 6 A 1 2 139158 CASAVA_Build 10 92054706 4D TCTCTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 2856 het 2856 ref 35 16 15 5 TC 7 5 139159 CASAVA_Build 10 92055660 3D32M2D AGAAAATCAT TAATAATAAAATATCAAAACCGTCTTAACTCATATTA/---TAATAAAATATCAAAAACATCTTAACTCATAT-- TGTTTATTAT 3070 het 3070 ref 36 19 17 6 N/A 0 0 139160 CASAVA_Build 10 92057848 2I CATATCTACT --/AA AAAAAAAAAA 1163 het 1163 ref 13 7 4 3 A 12 14 139161 CASAVA_Build 10 92058539 2I TTTTTCACTC --/TT TTGCAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 2 4 139162 CASAVA_Build 10 92058677 1D GAATATTTGC A/- AAATTTTGCC 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 A 4 3 139163 CASAVA_Build 10 92061213 1I CCCGCTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 A 10 11 139164 CASAVA_Build 10 92063168 1D TGCTATTTTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 49 29 16 4 A 8 7 139165 CASAVA_Build 10 92063385 6I GAGTCCATAA ------/ATTACC ATTACCATAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 ATTACC 1 2 139166 CASAVA_Build 10 92065172 1I CAATGGATAA -/G GTCACCCCAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 G 1 2 139167 CASAVA_Build 10 92065545 4I AATTTTCACC ----/TAGA TAAATTCTTG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 TAGA 0 1 139168 CASAVA_Build 10 92066043 1D TTTGGACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 12 11 139169 CASAVA_Build 10 92075064 4I AAGATGGGGG ----/TCTC TCTATGTTGC 3070 hom 62 het 22 0 21 1 TC 1 3 139170 CASAVA_Build 10 92080193 6D ACTCGGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2869 het 41 hom 19 1 11 8 A 22 16 139171 CASAVA_Build 10 92101207 1D TGTTTGCATC T/- GTGCTAAAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 8 T 1 0 139172 CASAVA_Build 10 92107406 1I TGCTTCTGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 932 hom 23 2 17 4 A 9 10 139173 CASAVA_Build 10 92131963 1I AAAAGATCTG -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 8 139174 CASAVA_Build 10 92134499 1I TACCTTGTGA -/C CCCCCACACC 2996 hom 18 het 9 0 7 2 C 5 6 139175 CASAVA_Build 10 92135728 5D AAGATTTCTC AAAAT/----- AAAAACCCTT 3070 hom 90 het 31 0 31 5 AAAAT 1 0 139176 CASAVA_Build 10 92140502 6D ATAAGAAAAA TAAACT/------ TTAACTATAA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TAAACT 1 0 139177 CASAVA_Build 10 92145738 1D CTTCAATTTC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 8 139178 CASAVA_Build 10 92147807 7I CAGCCATAAG -------/AAAGAGA AGGACTATGA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 AAAGAGA 0 1 139179 CASAVA_Build 10 92155673 3I CATGTAATGA ---/TTT TTTTATTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 4 7 139180 CASAVA_Build 10 92158853 2I AAGGGAAAAG --/AT ATATATATAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AT 7 8 139181 CASAVA_Build 10 92163926 1D AATATAGTTG T/- TTGCATCAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 3 2 139182 CASAVA_Build 10 92175562 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 27 het 10 0 9 1 T 8 7 139183 CASAVA_Build 10 92208115 1I CTTCAACTCT -/A AAAAATCTAT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 5 6 139184 CASAVA_Build 10 92210085 1D AAGAAAGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 196 hom 45 2 39 4 A 10 9 139185 CASAVA_Build 10 92211577 1D TGAAACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 32 1 22 9 A 13 12 139186 CASAVA_Build 10 92217930 5D CTATCATTTA CTTAT/----- CTTAGTATGG 3070 hom 87 het 31 0 30 4 CTTAT 1 0 139187 CASAVA_Build 10 92229474 1I CATTAGATAG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 6 7 139188 CASAVA_Build 10 92246605 1I GTTTTGTCTC -/A GGGGGAGTTT 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 0 1 139189 CASAVA_Build 10 92247077 1D CTAGGACTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 46 het 32 1 28 4 T 9 8 139190 CASAVA_Build 10 92251930 1D CCTCTAGGAA G/- CTTCCTTGAT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 G 1 0 139191 CASAVA_Build 10 92282080 4I CTCACTGTCA ----/TAAT TAATTTCCTC 3070 hom 89 het 33 0 29 4 TAAT 1 2 139192 CASAVA_Build 10 92293483 1I TTAAATGCAA -/G GCACTGTGGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 G 1 2 139193 CASAVA_Build 10 92294050 1I TAGAGGTTGG -/A CTTTTTAATG 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 0 1 139194 CASAVA_Build 10 92317916 1I ATGTATCATA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 378 hom 47 1 41 5 T 7 8 139195 CASAVA_Build 10 92325017 1D TTGGGGGGGG A/- GATCTGAATA 3070 hom 93 het 32 0 29 3 A 1 0 139196 CASAVA_Build 10 92330098 1D TGCCAGAATT A/- AAAAAAAAAA 1557 het 1557 ref 46 35 5 6 A 13 12 139197 CASAVA_Build 10 92343485 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 29 0 14 16 A 16 14 139198 CASAVA_Build 10 92344080 5I TATCATAAGA -----/ACAGC ACAGCACAGG 3070 hom 99 het 43 0 33 12 ACAGC 1 2 139199 CASAVA_Build 10 92346543 1D CCAGGTAACT C/- CAGGGCTCAT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 2 1 139200 CASAVA_Build 10 92353645 1D CAAATTTCTT C/- CTTATTCCTG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 2 1 139201 CASAVA_Build 10 92355289 1D ATGAACCAAT C/- CCCAACCCAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 4 3 139202 CASAVA_Build 10 92364781 2D TTACTGATTT AC/-- ACAGTCCTGC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AC 2 1 139203 CASAVA_Build 10 92374622 6I GTTGACAAAT ------/TTACAA TTACAATTTG 3070 hom 97 het 43 0 33 10 TTACAA 1 2 139204 CASAVA_Build 10 92375081 1I TAAAAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 26 1 20 5 A 10 11 139205 CASAVA_Build 10 92381428 1I GCTCAACAAT -/A AAAAACAACC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 5 6 139206 CASAVA_Build 10 92381854 1D ATTAATCCAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 47 het 43 1 35 9 A 9 8 139207 CASAVA_Build 10 92389556 1D ACTACCAAAA G/- ACATCAATCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 1 0 139208 CASAVA_Build 10 92390545 1D ACAGGAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 32 1 19 12 A 14 13 139209 CASAVA_Build 10 92394711 5D GAATCAGCAC CAAGT/----- CACTGAGGGT 3070 hom 111 het 42 0 36 8 CAAGT 1 0 139210 CASAVA_Build 10 92400380 2D GTTTAAAAAG AA/-- AAAAAAATAA 3070 hom 57 het 21 0 20 3 A 9 7 139211 CASAVA_Build 10 92404166 1I AAAAAAAAAA -/C CAGAAATGAT 3070 het 16 hom 40 1 37 2 C 1 2 139212 CASAVA_Build 10 92407887 1I TTTTATGGAG -/T AGAACAGGCC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 0 1 139213 CASAVA_Build 10 92416589 1D TTCCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 35 1 26 8 A 12 11 139214 CASAVA_Build 10 92422009 1D ATCTATTTTT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 108 het 40 0 37 6 A 8 7 139215 CASAVA_Build 10 92427072 3D ACAACCTCCA CCT/--- CCTCCTGGGT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 CCT 3 2 139216 CASAVA_Build 10 92444987 1D TTCTTCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 40 0 35 5 T 13 12 139217 CASAVA_Build 10 92449117 2D TAGCTTGTTG AC/-- ACACAGAGGC 3070 hom 102 het 36 0 34 3 AC 3 2 139218 CASAVA_Build 10 92458990 2D AGCTCTTGAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 30 0 27 5 TA 7 6 139219 CASAVA_Build 10 92462750 4D ATTTGGCGGT GGGG/---- GGGGGGGGTT 3070 hom 92 het 35 0 30 8 G 12 8 139220 CASAVA_Build 10 92571642 1I ATTCCCTTTA -/C TTTCTGCCAT 3070 hom 82 het 33 0 24 9 C 0 1 139221 CASAVA_Build 10 92579119 1D TGTCAAATCA T/- TTTTTTTTTA 1303 het 1303 ref 28 20 3 5 T 10 9 139222 CASAVA_Build 10 92592455 1D TTATTTAGTG A/- AAAAAAAAAA 1976 het 1976 ref 47 31 6 11 A 12 11 139223 CASAVA_Build 10 92603208 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 924 het 924 ref 36 20 3 13 T 12 13 139224 CASAVA_Build 10 92628688 3I CAGAAATGTC ---/AGT AGTATATTAG 3070 hom 123 het 51 0 42 9 AGT 1 2 139225 CASAVA_Build 10 92640557 1I TTAATAAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 116 het 45 0 40 5 A 9 10 139226 CASAVA_Build 10 92647520 1I ATGTAAAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 9 10 139227 CASAVA_Build 10 92667828 11D AGGCTCAAAA CTATCTAAATG/----------- CTGACATCTC 3070 hom 123 het 44 0 42 4 CTATCTAAATG 1 0 139228 CASAVA_Build 10 92668721 18D TAAAGCCAAA ATAAATAAATATATATAT/------------------ ATATATATAT 3070 hom 79 het 22 0 27 2 ATAAATAAATATATATAT 1 0 139229 CASAVA_Build 10 92671461 3D GTCACTGGCC ATA/--- ATTAGCACAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 ATA 1 0 139230 CASAVA_Build 10 92683689 1D TCTACAAAAA G/- TAAGATAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 7 G 1 0 139231 CASAVA_Build 10 92685888 7I CTACAATTTC -------/TTATTCT TTAGAGTACA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TTATTCT 0 1 139232 CASAVA_Build 10 92692615 2I TTAAACACCG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 10 12 139233 CASAVA_Build 10 92692678 1D CTTCCCCCCA C/- CCCCTTTTTT 2738 het 343 hom 23 4 8 11 C 5 4 139234 CASAVA_Build 10 92696205 1I GTCATGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 41 1 36 4 T 10 11 139235 CASAVA_Build 10 92705087 1I CTGGGGTGTG -/A AAAAAAACTC 3070 hom 99 het 37 0 33 5 A 7 8 139236 CASAVA_Build 10 92707899 2D GACAATAATA AC/-- ACACATATTT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 AC 3 2 139237 CASAVA_Build 10 92708317 1I AGTTTGTAAT -/A AATGCGTAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 3 139238 CASAVA_Build 10 92711912 1D GAGCGGTGTC T/- TGAGTTGATA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 2 1 139239 CASAVA_Build 10 92719669 1D ATTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 30 1 20 9 T 12 11 139240 CASAVA_Build 10 92723713 1D GACATATTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 416 hom 38 1 26 12 A 10 9 139241 CASAVA_Build 10 92730048 1D ATTTTTAATA T/- TTTTTCCCAC 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 6 5 139242 CASAVA_Build 10 92733609 2D ACCCTGTGGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 120 het 56 0 39 17 TG 8 7 139243 CASAVA_Build 10 92745367 1D TTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 9 139244 CASAVA_Build 10 92746182 1I TTTGGTGACC -/A AAAAAAAACC 3070 het 87 hom 47 1 41 5 A 8 9 139245 CASAVA_Build 10 92766356 2D ATACTCTTCC AT/-- ATATATATAT 2471 het 2471 ref 22 12 6 4 AT 6 5 139246 CASAVA_Build 10 92784266 1D TCAGAAGAGA G/- GGTTGAATAG 3070 het 3070 hom 53 22 25 7 G 3 2 139247 CASAVA_Build 10 92788308 1I GATGATAAAA -/G ATATTTGTTC 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 G 0 1 139248 CASAVA_Build 10 92805003 27D CCCAAGGGCA GAGCAAGGAATGTCTGCTCTTTCTTGT/--------------------------- GATGATATAA 3070 het 3070 ref 23 19 10 4 GAGCAAGGAATGTCTGCTCTTTCTTGT 1 0 139249 CASAVA_Build 10 92809268 1I GCCCACCCTG -/C CCCCCCACCA 1770 het 606 hom 12 4 4 4 C 6 7 139250 CASAVA_Build 10 92816834 1D CTCAATAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 6 A 13 12 139251 CASAVA_Build 10 92823923 4D TACAAGAAAA AAAC/---- AAACAACCCC 3070 het 2737 hom 15 7 8 0 AAAC 2 1 139252 CASAVA_Build 10 92828138 1D CCTCTCCCAA C/- AAATGCTGCT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 C 1 0 139253 CASAVA_Build 10 92829179 2D TTTTTAAAGA CT/-- CTCAATTAAG 3070 het 3070 hom 41 15 24 3 CT 2 1 139254 CASAVA_Build 10 92832898 1I CAAAGACATT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 7 8 139255 CASAVA_Build 10 92841950 1D TGTTCATCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 13 8 T 10 9 139256 CASAVA_Build 10 92843516 1D GGAAATGGAC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 8 7 139257 CASAVA_Build 10 92844774 1I AGGAAAAAAT -/A AGTAGTCAAT 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 A 1 2 139258 CASAVA_Build 10 92844915 8D ATTACCTGTT AGAAATAC/-------- AGAATAGGGG 3070 het 3070 hom 35 15 18 6 AGAAATAC 1 0 139259 CASAVA_Build 10 92857939 1D GCCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 10 9 139260 CASAVA_Build 10 92886089 2D TGTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 29 0 29 1 T 12 10 139261 CASAVA_Build 10 92887849 1I TTTTGAAGTG -/T TTTTTTTATG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 7 8 139262 CASAVA_Build 10 92888668 1D AACTAATTAG A/- AAAAAAAAAA 951 het 951 ref 35 30 3 2 A 11 10 139263 CASAVA_Build 10 92928505 1I TAAAAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 A 11 12 139264 CASAVA_Build 10 92947442 1D TCAACCGGTA C/- TGGACATCAT 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 C 1 0 139265 CASAVA_Build 10 92950126 2D AATCTAGTTA AG/-- AGAGAGTGAG 3070 het 3070 hom 39 16 20 5 AG 4 3 139266 CASAVA_Build 10 92954072 1I GTTTTCATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 9 10 139267 CASAVA_Build 10 93020118 1I AGATCAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 A 12 13 139268 CASAVA_Build 10 93050808 5I CCTGAGAACT -----/TGGAG TGGGGTGGGG 3070 het 3070 ref 25 10 12 3 TGGAG 0 1 139269 CASAVA_Build 10 93060953 2I TTCATTGAGA --/TT TTTTTAACTT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 5 7 139270 CASAVA_Build 10 93267187 1D ACTTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 1644 het 1644 ref 25 14 4 7 T 13 12 139271 CASAVA_Build 10 93333613 1I TCTTCTGGGA -/G AAGAAAAGCA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 G 0 1 139272 CASAVA_Build 10 93334318 2I ACTGCAGCCT --/CC CCTTCCCAGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 2 4 139273 CASAVA_Build 10 93357149 2D AAAATAAAAA AG/-- AGATAAGCAC 3070 hom 45 het 17 0 16 2 AG 2 1 139274 CASAVA_Build 10 93362633 1D TCAGTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 34 1 19 15 T 15 14 139275 CASAVA_Build 10 93381265 1D AATTCACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 9 A 12 11 139276 CASAVA_Build 10 93386090 96D CTTGAAGATC ACTTACGGAGTTTCAGTGAAAGAGTCAGGGAAGTTGCGAACTGGTTTTTTTTTTTTTTAATTATTATTAAAAGGAGCAGGTTTTGCATTTTGGAGA/------------------------------------------------------------------------------------------------ ACAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 17 16 7 8 ACTTACGGAGTTTCAGTGAAAGAGTCAGGGAAGTTGCGAACTGGTTTTTTTTTTTTTTAATTATTATTAAAAGGAGCAGGTTTTGCATTTTGGAGA 1 0 139277 CASAVA_Build 10 93387668 1D AGGAGAGAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 16 7 4 T 9 8 139278 CASAVA_Build 10 93389990 10D TCACACACAC ACACACACAA/---------- ACATATCACA 3070 het 3070 hom 33 12 15 8 ACACACACAA 1 0 139279 CASAVA_Build 10 93390067 7D CACAAGATGT TCAGAAC/------- TCTTTGTTCC 3070 het 3070 ref 48 26 20 5 TCAGAAC 1 0 139280 CASAVA_Build 10 93390991 1I AATCTAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 27 2 20 5 T 11 12 139281 CASAVA_Build 10 93392317 1I CACCTGCCCA -/G GATGGCTTTC 3070 hom 117 het 43 0 38 5 G 1 2 139282 CASAVA_Build 10 93395750 2I ATTCAATATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 15 0 12 3 A 12 14 139283 CASAVA_Build 10 93411011 1D TGTCAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 11 10 139284 CASAVA_Build 10 93416012 1I TCTGCAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 37 1 30 6 A 11 12 139285 CASAVA_Build 10 93419797 4I TATATCCTTA ----/TAAC TAACCTGCAC 3070 hom 113 het 42 0 38 4 TAAC 1 2 139286 CASAVA_Build 10 93431229 1D ACGTGGGTAA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 35 14 14 9 T 8 7 139287 CASAVA_Build 10 93432582 12D ACATTAAAAC AATAACAACAAT/------------ AATAACAACT 3070 het 3070 hom 46 18 26 7 AATAACAACAAT 1 0 139288 CASAVA_Build 10 93434174 1D TGGAGGGGGG T/- GCGGCTACCT 3070 hom 78 het 27 0 26 1 T 1 0 139289 CASAVA_Build 10 93434623 1D AATACTTTAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 8 7 139290 CASAVA_Build 10 93460001 1I TCTAAAAAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 30 het 19 0 11 8 T 7 8 139291 CASAVA_Build 10 93475447 1D GTAGGTGGTC A/- AAAAAATAGT 3070 hom 169 het 63 0 57 6 A 7 6 139292 CASAVA_Build 10 93475742 7I GTTTGAGATG -------/GAGTCTC TCTCTGTCAT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 GAGTCTC 0 1 139293 CASAVA_Build 10 93476690 7D TCTGCAACAG CAGCAGC/------- CATCTTGCAA 1150 hom 10 het 37 0 7 30 CAGCAGC 1 0 139294 CASAVA_Build 10 93490395 2D AAGGTCCACT AC/-- ACACACACAC 783 het 783 ref 53 37 3 13 AC 6 5 139295 CASAVA_Build 10 93493636 1D TGTTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 12 11 139296 CASAVA_Build 10 93514235 2I TATCAAAAAG --/AC ACACCTGCAC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 AC 2 3 139297 CASAVA_Build 10 93515551 3D CTCTCTCTTG GTT/--- GTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 26 8 GTT 2 1 139298 CASAVA_Build 10 93551218 1I GGAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2072 het 2072 ref 25 11 10 4 T 11 12 139299 CASAVA_Build 10 93557762 4I GTCTAGAAAA ----/TAAG TAAGGCAGTA 3053 het 24 hom 13 1 8 4 TAAG 1 2 139300 CASAVA_Build 10 93560136 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 18 hom 17 1 9 7 A 8 9 139301 CASAVA_Build 10 93561796 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 17 1 10 6 A 17 16 139302 CASAVA_Build 10 93564832 4I CTTTTGTGAG ----/ACAA ACAGATTCAA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 ACAA 0 1 139303 CASAVA_Build 10 93565224 6I AGAGTTTTCC ------/AAATAT AGTTATAATC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 AAATAT 0 1 139304 CASAVA_Build 10 93568137 1I TATTAGTGTC -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 A 6 7 139305 CASAVA_Build 10 93569098 1D TAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2858 het 2858 ref 34 21 8 5 T 15 14 139306 CASAVA_Build 10 93578228 1D AGAACTAGCA T/- TTTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 7 6 139307 CASAVA_Build 10 93579021 1D TTCTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 12 11 139308 CASAVA_Build 10 93582210 1I ACCCAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 41 1 32 8 T 13 14 139309 CASAVA_Build 10 93584934 1I TAGCAGATGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 8 9 139310 CASAVA_Build 10 93585622 5D TGGGATTACA GGCAT/----- GAGCCACCAC 3070 het 2744 hom 22 8 12 3 GGCAT 1 0 139311 CASAVA_Build 10 93589073 1I ACCATCAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 9 10 139312 CASAVA_Build 10 93590278 5D GTATCATGTA TGTTG/----- TGTTTTGTCC 3070 het 3070 hom 40 20 18 5 TGTTG 1 0 139313 CASAVA_Build 10 93591702 1I TTAATGCATT -/A AAAAAATCCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 6 7 139314 CASAVA_Build 10 93597317 14I GTTGGCCAGG --------------/CTGGCCTCAAACTC CTGACCTCAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CTGGCCTCAAACTC 0 1 139315 CASAVA_Build 10 93599620 1D AGTTCTCTCT C/- AAGCCTGACA 3070 het 3070 hom 40 15 23 4 C 1 0 139316 CASAVA_Build 10 93601157 4I AATTTAAAAA ----/TATG TATGAGAGAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TATG 1 2 139317 CASAVA_Build 10 93603870 2D GGTGGTAAAC TG/-- TGGATTTCTC 3070 het 3070 hom 35 16 18 3 TG 2 1 139318 CASAVA_Build 10 93604656 1I AAAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 2382 het 6 hom 18 1 11 6 A 11 12 139319 CASAVA_Build 10 93606665 3D CACCTTAAAA TCT/--- TCTGCGGACA 3070 het 3070 ref 53 27 22 5 TCT 2 1 139320 CASAVA_Build 10 93611230 1I AATTACAGAA -/G GAAACAGGAA 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 G 1 2 139321 CASAVA_Build 10 93617022 2D AAACTCAAAC AG/-- ATTACAGACT 3070 het 3070 ref 37 19 17 3 AG 1 0 139322 CASAVA_Build 10 93618187 4D TGAAGAAGAA AAAT/---- AAAGCAGGAG 3070 het 3070 ref 36 17 16 5 AAAT 1 0 139323 CASAVA_Build 10 93620483 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 154 hom 22 1 20 1 A 9 10 139324 CASAVA_Build 10 93621674 1D TCTTCTGAAA T/- CCAAGGGAGT 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 T 1 0 139325 CASAVA_Build 10 93622832 1D AAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 56 het 23 0 19 6 A 10 9 139326 CASAVA_Build 10 93624636 1I CTTCTGCCTC -/T TATTGCAAGC 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 1 2 139327 CASAVA_Build 10 93640906 1I TTTGTAAATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 8 9 139328 CASAVA_Build 10 93643475 11D AGGTTCGTTA TATAGGTAAAC/----------- TTGTGTCATA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 TATAGGTAAAC 1 0 139329 CASAVA_Build 10 93647057 1I ATTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 370 hom 25 het 24 0 8 16 A 13 14 139330 CASAVA_Build 10 93647090 3D AAAAAGAAGA AGG/--- AGGAGGAGGA 2020 het 248 hom 26 4 10 14 AGG 6 5 139331 CASAVA_Build 10 93649919 5I ATGTCTATAT -----/GAGAC TTCTGTCAAT 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 GAGAC 0 1 139332 CASAVA_Build 10 93652710 6I TTTTTTTTTC ------/CTTTTT CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 CTTTTT 1 2 139333 CASAVA_Build 10 93659096 5D TTTCAGATGA TTCCT/----- TGGAAACATG 3070 het 3070 hom 38 15 20 6 TTCCT 1 0 139334 CASAVA_Build 10 93662622 1D CACTTGGAAG C/- CCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 C 3 2 139335 CASAVA_Build 10 93665879 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1623 het 1170 hom 16 7 5 4 T 13 12 139336 CASAVA_Build 10 93669943 5D TAATACTTAG TCTTT/----- TCTTTTCATT 3070 het 3070 ref 24 13 10 3 TCTTT 2 1 139337 CASAVA_Build 10 93671662 2D TAGCTACCTC TT/-- GTCATTTAGG 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 T 2 0 139338 CASAVA_Build 10 93677854 1I ATTAGAATAA -/T TTTTTGAAGT 3070 het 2110 hom 28 7 17 4 T 5 6 139339 CASAVA_Build 10 93678498 4D AAGAATCCAT CCCC/---- CCCCCCCCCG 3070 hom 38 het 27 0 12 16 C 13 9 139340 CASAVA_Build 10 93679563 1I AATGCTGGGA -/T TTACAAGCAT 2786 het 2562 hom 19 8 8 3 T 2 3 139341 CASAVA_Build 10 93685661 1I AGACTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 2353 het 2353 ref 37 22 6 9 T 13 14 139342 CASAVA_Build 10 93692023 1I CTCACTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3029 het 3029 ref 34 11 9 14 A 10 11 139343 CASAVA_Build 10 93699349 15D TCAAATCTCA ATTTTAGCTTTTTAG/--------------- ATTTTAGCTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 8 ATTTTAGCTTTTTAG 2 1 139344 CASAVA_Build 10 93712044 4D GTCACACACA TAGT/---- TAGGCGTGGT 3070 het 3070 ref 56 28 18 10 TAGT 1 0 139345 CASAVA_Build 10 93719823 1I TGTCCAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 35 2 24 9 T 12 13 139346 CASAVA_Build 10 93721576 1D AATTTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 11 10 139347 CASAVA_Build 10 93722967 4D TCCCTTAAAT AGAC/---- AGGATCTGAG 3070 het 3070 hom 44 17 23 7 AGAC 1 0 139348 CASAVA_Build 10 93728247 3D GTGAGAAAAT AAG/--- AACTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 14 6 AAG 1 0 139349 CASAVA_Build 10 93736287 1D AAAATTGCTG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 8 7 139350 CASAVA_Build 10 93739928 1D TGTGATTGTT A/- ACAAGATTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 2 1 139351 CASAVA_Build 10 93747865 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 25 1 13 11 A 16 15 139352 CASAVA_Build 10 93748060 1D TATGATTCCT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 8 7 139353 CASAVA_Build 10 93768501 1D TCATATATAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 9 8 139354 CASAVA_Build 10 93769848 1I ATCTTTTTAC -/T TTCTTGATAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 2 3 139355 CASAVA_Build 10 93774469 8I CGCTTATGTA --------/GTTTTTTT GTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 34 0 22 12 GTTTTTTT 1 2 139356 CASAVA_Build 10 93780387 4I TAGAGCTAGA ----/AGTC AGTCAGATAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AGTC 1 2 139357 CASAVA_Build 10 93781450 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAATAC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 8 7 139358 CASAVA_Build 10 93784029 3D CTAATAAAAC ATT/--- GTTGAATCTC 3070 het 3070 hom 37 16 21 2 ATT 1 0 139359 CASAVA_Build 10 93784677 1I ACATACATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 10 11 139360 CASAVA_Build 10 93787673 3I TTTATCAGTA ---/GTT GTTGTTAAGC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 GTT 2 3 139361 CASAVA_Build 10 93789422 1D AGCTATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 A 13 12 139362 CASAVA_Build 10 93790139 6D CAGTCAGAAA ATAGAT/------ ATAGAGACAT 3070 het 3070 hom 28 9 10 11 ATAGAT 1 0 139363 CASAVA_Build 10 93795127 1D ACCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 T 11 10 139364 CASAVA_Build 10 93797002 1I ATTATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2857 hom 34 12 17 5 A 11 12 139365 CASAVA_Build 10 93805483 1D TAATATGGTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 9 8 139366 CASAVA_Build 10 93823832 1I TTTTTAACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 9 10 139367 CASAVA_Build 10 93830337 1D TGCAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1442 het 1442 ref 38 20 5 13 T 13 12 139368 CASAVA_Build 10 93846914 1D ATTGTCAGAC T/- TTTTCCATTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 5 4 139369 CASAVA_Build 10 93849981 3D TGTTTCCCCC CAG/--- CAGCAAGGAG 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 CAG 2 1 139370 CASAVA_Build 10 93854117 3D GAAATGCAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 1711 het 1393 hom 33 12 7 14 T 21 18 139371 CASAVA_Build 10 93856703 1I GCAAAGTTGG -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 44 18 21 5 A 6 7 139372 CASAVA_Build 10 93858162 2I AGGTAGGGAC --/AT ATATGCATAA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AT 2 3 139373 CASAVA_Build 10 93863553 2D AGGCCCATCT CA/-- CAGCCATAAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 6 CA 2 1 139374 CASAVA_Build 10 93867482 1D ATTTTTCATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 10 9 139375 CASAVA_Build 10 93873127 7D AAGTCACAGG CAAGGAC/------- CAAGGACGCT 3070 het 3070 hom 50 17 28 8 CAAGGAC 2 1 139376 CASAVA_Build 10 93904117 1I ATTTATTTTC -/A AATCTTATTC 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 A 2 3 139377 CASAVA_Build 10 93929940 1D AGTTAGTAAG T/- TTTTGCTGCT 3070 het 3070 hom 32 10 16 7 T 5 4 139378 CASAVA_Build 10 93939573 1D CCTCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 7 T 12 11 139379 CASAVA_Build 10 93978938 1I TTTTAAAAAA -/T TTTTTAATTT 2065 het 1310 hom 13 5 6 2 T 5 6 139380 CASAVA_Build 10 93982495 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1605 hom 23 8 12 3 A 16 15 139381 CASAVA_Build 10 94001127 2D TCTCTCCTCT TC/-- TCTCTCTCTC 1196 het 1196 ref 52 37 4 11 TC 10 9 139382 CASAVA_Build 10 94020479 1I TCTGGGGTGC -/T TTTTTTTTTG 2311 het 2311 ref 18 9 6 3 T 9 10 139383 CASAVA_Build 10 94037399 1D TTTTAAAAGC T/- TTATTGAGAT 3070 het 3070 ref 31 18 10 4 T 3 2 139384 CASAVA_Build 10 94047904 2I CACTGCACGA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 1739 hom 31 7 17 7 TC 5 6 139385 CASAVA_Build 10 94049081 1I TTCAACGGGG -/T TAACGTGCTT 3070 het 3070 ref 57 31 19 7 T 1 2 139386 CASAVA_Build 10 94063952 1I AATCTTAAAT -/A AAAAGAGAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 5 139387 CASAVA_Build 10 94066467 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 7 T 10 11 139388 CASAVA_Build 10 94069958 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3046 het 3046 ref 26 15 8 3 T 10 9 139389 CASAVA_Build 10 94070482 3D AGTTAAAGTT AAA/--- AGTGTATAGA 3070 het 3070 hom 23 10 13 2 A 4 1 139390 CASAVA_Build 10 94094220 1D CTTGAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 741 het 741 ref 44 27 3 15 T 12 11 139391 CASAVA_Build 10 94096913 1D AGACCCTGTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 67 het 26 0 22 4 T 9 8 139392 CASAVA_Build 10 94103484 5I GACTACTAGA -----/ATTCT ATTCTTTTCA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 ATTCT 1 2 139393 CASAVA_Build 10 94104335 1I TCTAGGACAG -/T TTTGATACAT 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 T 3 4 139394 CASAVA_Build 10 94107402 1I ATAAATTCAC -/T TAACTTAATG 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 1 2 139395 CASAVA_Build 10 94120460 1I ATTATTTAGG -/A AAAAAAAAAA 1459 het 576 hom 15 5 6 4 A 14 15 139396 CASAVA_Build 10 94120792 1I AAGAATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 13 5 A 12 13 139397 CASAVA_Build 10 94136605 1D CCCCATAAAA G/- GCACTCCCTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 G 2 1 139398 CASAVA_Build 10 94141234 2D ATCATGAATG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 A 11 9 139399 CASAVA_Build 10 94141629 3D TCCATCTCGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 935 hom 27 8 10 9 A 15 12 139400 CASAVA_Build 10 94142924 2I CACAACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 61 32 11 18 AC 7 8 139401 CASAVA_Build 10 94145073 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 5 6 139402 CASAVA_Build 10 94151950 1D ATTATGGTTT A/- GGGGTCATGC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 1 0 139403 CASAVA_Build 10 94152315 2D CGCAGTTCCC CT/-- GTCTTGATAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 CT 1 0 139404 CASAVA_Build 10 94157236 1D TTTTGTTTTT G/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 G 1 0 139405 CASAVA_Build 10 94165215 1I AAGACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 33 15 3 15 T 13 14 139406 CASAVA_Build 10 94165453 1D AGGTGATCCA C/- CCCCCCCCTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 9 8 139407 CASAVA_Build 10 94204995 4I GGTGGATCAC ----/TTGA TTGAGGTCAG 2520 het 2419 hom 23 7 9 8 TTGA 1 2 139408 CASAVA_Build 10 94207219 3I TCTCTCCATT ---/CCA CCACCATGCT 3070 het 3070 hom 51 17 29 5 CCA 2 3 139409 CASAVA_Build 10 94226895 1I GCTTAGCACA -/T TTTTTTTTTT 2657 het 2657 ref 44 19 8 17 T 11 12 139410 CASAVA_Build 10 94228910 1I CATAAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 10 11 139411 CASAVA_Build 10 94229348 2D GTGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 46 13 13 21 GT 9 8 139412 CASAVA_Build 10 94240978 1D TTGTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1219 het 1219 ref 30 20 3 8 A 13 12 139413 CASAVA_Build 10 94253763 1D CCCAAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 13 12 139414 CASAVA_Build 10 94256846 1D TGTTTTACGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 10 9 139415 CASAVA_Build 10 94258212 1D GCACTTTAGG A/- GGCCAAGATG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 1 0 139416 CASAVA_Build 10 94261432 1I TTTGCCTCAA -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 T 7 8 139417 CASAVA_Build 10 94273881 3D TATTAAAAAT ATC/--- ATTCAATTCA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 ATC 1 0 139418 CASAVA_Build 10 94283761 1D ACTCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 34 1 22 11 A 15 14 139419 CASAVA_Build 10 94288515 1I GCTTAATAGA -/C CAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 31 0 17 14 C 1 2 139420 CASAVA_Build 10 94296987 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 10 6 T 15 14 139421 CASAVA_Build 10 94315740 1D TATCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 11 8 A 12 11 139422 CASAVA_Build 10 94315930 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1480 het 808 hom 22 7 5 10 A 15 14 139423 CASAVA_Build 10 94318992 1I GTTGGGCTAA -/G GCCAGCCAAC 3070 hom 154 het 61 0 52 9 G 1 2 139424 CASAVA_Build 10 94326330 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2472 het 1119 hom 25 3 11 11 T 13 14 139425 CASAVA_Build 10 94346294 2I TTTTTCAAGT --/AG AGCCATCCAT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 AG 1 2 139426 CASAVA_Build 10 94351358 4D TCTTTTATTT GTTA/---- GTTTGTTTGA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 GTTA 1 0 139427 CASAVA_Build 10 94361880 1I TTTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 11 12 139428 CASAVA_Build 10 94365580 1D GATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2151 hom 24 het 12 0 6 6 T 15 14 139429 CASAVA_Build 10 94368016 2D TTCCTTGATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 14 12 139430 CASAVA_Build 10 94382494 5I TCAAAACTGA -----/TAATT TAATTTTGTG 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 TAATT 1 2 139431 CASAVA_Build 10 94412208 1D TCCTTTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 T 13 12 139432 CASAVA_Build 10 94428315 1I TCAATAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1121 hom 25 6 13 6 T 14 15 139433 CASAVA_Build 10 94434909 7I CCATCACCAT -------/AACATAA AAGTGCAAAG 3070 hom 120 het 47 0 40 7 AACATAA 0 1 139434 CASAVA_Build 10 94437521 4I TGATTCTTCT ----/TGAA TGAATTATTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TGAA 1 2 139435 CASAVA_Build 10 94443456 1D TTGAGACTAT A/- AGGCTTGCAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 2 1 139436 CASAVA_Build 10 94450174 1I CCAGGGATAG -/T TTTTTTTTTT 2205 het 2205 ref 21 8 7 6 T 14 15 139437 CASAVA_Build 10 94451639 1I TCAAAGCGTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 44 12 21 11 A 8 9 139438 CASAVA_Build 10 94452560 1I CAGTTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 10 11 139439 CASAVA_Build 10 94453943 1D ATTCCTTTAG T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 T 8 7 139440 CASAVA_Build 10 94454882 3D GACCAGGTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2383 het 1945 hom 23 9 6 8 T 15 12 139441 CASAVA_Build 10 94466579 9D GAGTGGTAAC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 2295 hom 35 11 15 15 T 23 14 139442 CASAVA_Build 10 94471053 1I TCATCTCTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 9 10 139443 CASAVA_Build 10 94471916 2I TTTAAAACGT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 11 139444 CASAVA_Build 10 94473853 1D CTCATCTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 10 9 139445 CASAVA_Build 10 94474418 1D21M1D AACACATTTT ACAAAGATGACTCATGAAAGTAG/-CAAAGATGACTCATGAAAGTA- GGCTAAAAAA 3070 hom 120 het 35 0 40 10 N/A 0 0 139446 CASAVA_Build 10 94479184 1D CAAACAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 11 10 139447 CASAVA_Build 10 94488842 4D CTTGCAAGGC AGAG/---- AGAGGACAGT 3070 hom 63 het 25 0 21 5 AG 4 2 139448 CASAVA_Build 10 94498483 4D GGGCTTTTCC TTAT/---- AACAAAGTAC 3070 het 3070 hom 48 17 28 8 TTAT 1 0 139449 CASAVA_Build 10 94500187 1D TCTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 34 1 19 14 T 13 12 139450 CASAVA_Build 10 94502419 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1739 het 1588 hom 12 6 5 1 A 11 10 139451 CASAVA_Build 10 94504788 3I TAAAGCCACA ---/CTT CTTCACGCCT 3070 het 3070 ref 53 30 18 5 CTT 1 2 139452 CASAVA_Build 10 94504979 1D TCCTTCATTC A/- TTGGTCGTTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 A 1 0 139453 CASAVA_Build 10 94505526 1D TTTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 12 5 A 11 10 139454 CASAVA_Build 10 94508483 1I TATTTCAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1439 hom 42 7 17 18 T 15 16 139455 CASAVA_Build 10 94509320 1I GCATCTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 27 1 20 6 T 14 15 139456 CASAVA_Build 10 94511094 1I AAATGTTACT -/C CCCCTCTACT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 C 4 5 139457 CASAVA_Build 10 94511295 1D TAAAATTTTT C/- CTTTCCAATT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 C 2 1 139458 CASAVA_Build 10 94512850 1I CCTTGATTCC -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 18 2 T 5 6 139459 CASAVA_Build 10 94512938 1I TTCTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2668 het 1601 hom 25 7 11 7 T 13 14 139460 CASAVA_Build 10 94516673 1D TACAAAAAGT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 A 9 8 139461 CASAVA_Build 10 94519952 1D AATTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2538 hom 27 9 10 8 T 11 10 139462 CASAVA_Build 10 94523157 1I GAATTATGTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 T 8 9 139463 CASAVA_Build 10 94528686 10D TAGAAGACAG CCGGGTAACT/---------- CCCTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 14 12 5 CCGGGTAACT 1 0 139464 CASAVA_Build 10 94534231 1D TTTTTGTGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 9 8 139465 CASAVA_Build 10 94537957 2I CTGCCCTTGA --/CT CTTCCTTTGG 3070 hom 84 het 37 0 26 11 CT 1 2 139466 CASAVA_Build 10 94539128 4I CTTCTTCTTC ----/TTTT TGTTTTTTTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 5 139467 CASAVA_Build 10 94539231 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 9 10 139468 CASAVA_Build 10 94540501 1I AGTGGGAGGG -/C AGTGGGGAGG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 0 1 139469 CASAVA_Build 10 94543374 1D ATAGAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2340 hom 29 5 12 12 T 11 10 139470 CASAVA_Build 10 94558744 2D CAAATCTGTT AA/-- GTGTCAAGTG 3070 het 3070 ref 49 27 15 8 A 2 0 139471 CASAVA_Build 10 94572257 4I GGGGGCGTGT ----/GGTA GGTAGCATGG 3070 hom 68 het 26 0 23 3 GGTA 1 2 139472 CASAVA_Build 10 94584397 1I GAAAACGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 11 12 139473 CASAVA_Build 10 94589863 1I AGAAAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 10 6 A 11 12 139474 CASAVA_Build 10 94593889 1I TGTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2022 hom 34 8 13 13 A 13 14 139475 CASAVA_Build 10 94602200 2D CAGATTTTAC AA/-- AAAATTTTAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 6 4 139476 CASAVA_Build 10 94606904 1I TCTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 11 12 139477 CASAVA_Build 10 94607519 2I TGGTGTTCTT --/TG TGTGTGTGTC 3070 het 32 hom 54 1 43 10 TG 4 5 139478 CASAVA_Build 10 94612070 1I GTTTCATGCC -/A CCCCCCCCAT 3070 het 1893 hom 31 11 14 6 A 0 1 139479 CASAVA_Build 10 94614393 2D CTGAGGCCTC AA/-- ATGGAATAAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 6 A 3 1 139480 CASAVA_Build 10 94622503 3D TAAATGCACA AAT/--- AATAAGTGTA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 AAT 2 1 139481 CASAVA_Build 10 94624163 1D ATTGTGACAC A/- AACAGAAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 3 2 139482 CASAVA_Build 10 94626699 2D GCTTTTAGGG CT/-- CTCTCTTACT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 CT 4 3 139483 CASAVA_Build 10 94629310 1I AATAAATCAT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 6 7 139484 CASAVA_Build 10 94640143 4D TAATTCATGC ATTT/---- ATTAATGAAT 3070 het 3070 ref 42 27 13 4 ATTT 1 0 139485 CASAVA_Build 10 94645039 1I CCCATAACCC -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 56 17 28 11 T 6 7 139486 CASAVA_Build 10 94646323 3D AAAATTGTAG TAT/--- TATTATTATT 2865 het 1350 hom 18 3 7 8 TAT 6 5 139487 CASAVA_Build 10 94648007 1I AATTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 24 1 18 5 A 13 14 139488 CASAVA_Build 10 94667164 1I CTTTTAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 11 12 139489 CASAVA_Build 10 94667271 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 13 12 139490 CASAVA_Build 10 94669055 5D ATAGTAAAAA TAATT/----- TAAGTTCACT 3070 het 3070 hom 33 14 19 2 TAATT 1 0 139491 CASAVA_Build 10 94693448 1I CACGTACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 12 13 139492 CASAVA_Build 10 94693962 1D GATACCGATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 17 10 2 T 10 9 139493 CASAVA_Build 10 94698552 1I CTGTGGAAGA -/T TTTAAAAGAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 3 4 139494 CASAVA_Build 10 94713270 1I TAAAGAGCAA -/T TTTTTTTTTT 2028 het 978 hom 26 8 10 8 T 17 18 139495 CASAVA_Build 10 94716930 1D ATATTAGCCC T/- TTGTCAGATG 3070 het 1125 hom 15 4 9 2 T 3 2 139496 CASAVA_Build 10 94719423 4D ATTTTCTTTC TTTT/---- ATTTTTATTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 4 0 139497 CASAVA_Build 10 94721087 1D AGCCTAGTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 38 het 14 0 13 1 T 9 8 139498 CASAVA_Build 10 94726360 2I TGACCCTGCC --/AA ATCCCCCTCT 2884 het 1582 hom 16 5 8 3 A 1 3 139499 CASAVA_Build 10 94727008 1I TGGAATGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 9 10 139500 CASAVA_Build 10 94730196 4I GTTTTAAAAC ----/TCTT TATAGTATTA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 TCTT 0 1 139501 CASAVA_Build 10 94732160 39D CCATGGTAGG CTACCATGATTAGACCATTTTTTTAAAAATGGTCTAGAA/--------------------------------------- AATGATTAGA 3070 hom 114 het 32 0 38 6 CTACCATGATTAGACCATTTTTTTAAAAATGGTCTAGAA 1 0 139502 CASAVA_Build 10 94733228 1D TATTTCTTTC T/- TTCTTCTTCT 2303 het 32 hom 21 1 12 8 T 3 2 139503 CASAVA_Build 10 94742755 4D AAATGATGAT AGTG/---- AGTTTGTATA 3070 het 3070 hom 38 16 17 7 AGTG 1 0 139504 CASAVA_Build 10 94744147 1D GTTTGTCTAA G/- GGTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 G 3 2 139505 CASAVA_Build 10 94745144 5D GCTTATGAAA TTAAT/----- TTAATAGTAA 3070 het 3070 hom 42 18 21 7 TTAAT 2 1 139506 CASAVA_Build 10 94746344 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 26 1 20 5 A 14 15 139507 CASAVA_Build 10 94772854 3D CATGCTTCTG TTT/--- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 9 6 139508 CASAVA_Build 10 94773655 1D TGAGGTGTCA C/- ATATAACTGA 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 C 1 0 139509 CASAVA_Build 10 94794768 1D CGCCACCACG C/- CCGGCTAATT 3070 het 564 hom 17 3 8 6 C 3 2 139510 CASAVA_Build 10 94800895 1D TGTATTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2093 hom 38 8 18 12 T 12 11 139511 CASAVA_Build 10 94804701 4D TTACAAAAAT AAAG/---- AAAATAACAG 3070 het 3070 hom 28 12 15 3 AAAG 1 0 139512 CASAVA_Build 10 94805447 8I ATCCTAGTGT --------/TTCAACTG TTCAACTGTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TTCAACTG 1 2 139513 CASAVA_Build 10 94806394 7D CAAGGGTTAA TATATAT/------- TATATTAACA 3070 hom 51 het 18 0 18 2 TATATAT 1 0 139514 CASAVA_Build 10 94806798 1I GTATATTCTG -/A AAACTTTTTT 3070 hom 83 het 32 0 28 4 A 3 4 139515 CASAVA_Build 10 94809810 14D TGTAGATTGA CAAGAGTCGTCGGG/-------------- CAAACTCGGG 3070 het 3070 hom 50 24 23 9 CAAGAGTCGTCGGG 1 0 139516 CASAVA_Build 10 94811374 5D ACCTAGATAC TCCGT/----- TCCCTCGAAG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TCCGT 1 0 139517 CASAVA_Build 10 94822258 9I CCGGCAGGTG ---------/GAGAGCAGA GAGAGCAGAG 3070 hom 66 het 31 0 21 10 GAGAGCAGA 1 2 139518 CASAVA_Build 10 94832671 1D GCTCTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 568 hom 38 2 25 12 A 15 14 139519 CASAVA_Build 10 94835972 2D GGTGATCATT CA/-- CACTTTCTGA 3070 hom 120 het 47 0 41 7 CA 2 1 139520 CASAVA_Build 10 94846612 1I ATATAAATGG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 7 8 139521 CASAVA_Build 10 94852908 1D CTGTGTGTGT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 290 hom 21 1 17 3 G 1 0 139522 CASAVA_Build 10 94854324 3I TGATATGTTG ---/TTA TTATTTTTTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTA 1 2 139523 CASAVA_Build 10 94864101 1I CTAGTAGGGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 88 het 35 0 30 5 A 8 9 139524 CASAVA_Build 10 94864954 1D AGTTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 1167 het 1167 ref 39 35 3 1 A 11 10 139525 CASAVA_Build 10 94874161 1D GGTAGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 24 2 18 4 T 13 12 139526 CASAVA_Build 10 94878997 1D AGATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 37 2 25 10 T 13 12 139527 CASAVA_Build 10 94888720 4D GTTCTCACTA GGTT/---- GGTTGCCCAG 3070 hom 57 het 25 0 19 6 GGTT 2 1 139528 CASAVA_Build 10 94899423 1I CTCTGTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 39 1 25 13 A 17 18 139529 CASAVA_Build 10 94900479 5D ATTTAACATG CACCT/----- GTGCAAGGCA 3070 hom 150 het 53 0 49 6 CACCT 1 0 139530 CASAVA_Build 10 94901748 1I TCATTCTTTA -/C CCCCAAATAG 3070 hom 126 het 51 0 41 10 C 4 5 139531 CASAVA_Build 10 94902697 1I ACACCCTGTG -/T TTATGGATTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 2 3 139532 CASAVA_Build 10 94903352 1I GAAAACTTAA -/C CCCCAATGCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 4 5 139533 CASAVA_Build 10 94914176 1D CATGCATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 40 0 30 11 T 13 12 139534 CASAVA_Build 10 94914556 2D CTTTTTAATG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 11 9 139535 CASAVA_Build 10 94925634 1D AGAGGGGGTC G/- GGTGGGAAGT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 3 2 139536 CASAVA_Build 10 94929751 3D AAATACAAAA ATT/--- AGCCGGGCAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 ATT 1 0 139537 CASAVA_Build 10 94932971 1I TAATAGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 36 0 27 9 A 12 13 139538 CASAVA_Build 10 94934546 1D GCTTTTTAAT G/- GGTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 3 2 139539 CASAVA_Build 10 94939160 1I GGTGCCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 30 0 24 6 T 13 14 139540 CASAVA_Build 10 94940554 1I GTTCCAGGAG -/T TAACTCAAAG 3070 hom 87 het 36 0 28 8 T 1 2 139541 CASAVA_Build 10 94949740 2D CTGAAAGGTT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 10 8 139542 CASAVA_Build 10 94951444 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 484 hom 22 2 16 4 A 12 13 139543 CASAVA_Build 10 94957796 2D TTTTAGCTCT TC/-- TGTTTCCTCT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TC 1 0 139544 CASAVA_Build 10 94962562 3I ATATTGAAAT ---/ATC ATGCTGTACC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 ATC 0 1 139545 CASAVA_Build 10 94975779 1I CCAGAGGGAG -/T TGTTACAGTG 3070 hom 90 het 33 0 29 4 T 1 2 139546 CASAVA_Build 10 94976793 1I CATATTTGGG -/A AAAAAAAGAT 1583 hom 10 het 7 0 4 3 A 7 8 139547 CASAVA_Build 10 94983962 1D CAGTGCAGAG T/- TTTGTCTTCT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 4 3 139548 CASAVA_Build 10 94988693 1D TTTTTTGAGA C/- GGAGTCTCGC 3070 hom 58 het 23 0 18 5 C 1 0 139549 CASAVA_Build 10 94991728 2D CGGGAAAGAC TG/-- TGTGTGCCAA 3070 hom 107 het 39 0 35 5 TG 4 3 139550 CASAVA_Build 10 95012972 2I GTCTAAGGGG --/AC CTCTGGTCAT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 AC 0 1 139551 CASAVA_Build 10 95014512 1D CTCATCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 21 0 17 4 T 13 12 139552 CASAVA_Build 10 95020428 2D GGCACTTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 28 1 19 8 A 16 14 139553 CASAVA_Build 10 95022902 2I TACATGGAAA --/CT CTTTCACACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 CT 1 2 139554 CASAVA_Build 10 95025668 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 40 1 30 9 T 13 12 139555 CASAVA_Build 10 95029571 2I CCCTGTCTCT --/AC AAAAAAATAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AC 0 1 139556 CASAVA_Build 10 95033706 4D TTGTGTAAAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 14 10 139557 CASAVA_Build 10 95033852 1D TGTTCCTTTT C/- CAGTAAGAAT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 C 2 1 139558 CASAVA_Build 10 95037327 5D CATGTCTGCC TGGCA/----- TGGCACTCTT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 TGGCA 2 1 139559 CASAVA_Build 10 95039388 2D CCAACAAGAC AG/-- TGACCACCTT 3070 hom 160 het 58 0 54 5 AG 1 0 139560 CASAVA_Build 10 95039870 1D AAGTTTTGTA T/- TTTTTAGTGG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 6 5 139561 CASAVA_Build 10 95045351 1I TTATGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3044 het 3044 ref 22 11 9 2 T 10 11 139562 CASAVA_Build 10 95047445 2I TATAAACAAC --/AG ACATTTATTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AG 0 1 139563 CASAVA_Build 10 95051358 1D TTTTGTGTGT G/- TTTTTTTTAA 3070 hom 56 het 32 0 24 8 G 1 0 139564 CASAVA_Build 10 95062096 3D CTTTTTTTTC TTT/--- TTTATTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 6 3 139565 CASAVA_Build 10 95065714 1D CTAAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 2588 hom 27 het 14 0 10 4 A 14 13 139566 CASAVA_Build 10 95066915 7I GATCAGCCCA -------/CAGTATC CAGTATCACC 3070 het 1644 hom 17 4 10 3 CAGTATC 1 2 139567 CASAVA_Build 10 95071749 1D CCCTGATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 31 1 26 4 A 13 12 139568 CASAVA_Build 10 95073195 4D GATGAAACTA TTTC/---- TTTCTTTGGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTTC 2 1 139569 CASAVA_Build 10 95077418 2I GCAAGTTCAC --/AT GTTAGAAGCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AT 0 1 139570 CASAVA_Build 10 95079294 4I AAATCCATAC ----/CTAA CTGAGTGATA 3070 het 3070 hom 44 21 18 5 CTAA 0 1 139571 CASAVA_Build 10 95090483 1I25M1D TGTCAAGTTT -CCATTGGCCAAATCCTTTCATGTGAT/CCCATTGGCCAAATCCTTTCATGTGA- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 26 20 6 N/A 0 0 139572 CASAVA_Build 10 95092098 1D TTCATTTGAC T/- TTGTACAGAT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 3 2 139573 CASAVA_Build 10 95092800 1D TGGAAGTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 49 21 18 11 T 10 9 139574 CASAVA_Build 10 95093067 2D CAGTGAAAAT AA/-- AAAAACCTGG 3070 het 3070 ref 48 20 23 6 A 7 5 139575 CASAVA_Build 10 95094597 1D CAACAGCGTA T/- GCAGAGGGAG 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 T 1 0 139576 CASAVA_Build 10 95109096 5D TTACTGTTCT ATTTA/----- ATTTATTATT 3070 het 3070 hom 42 18 21 6 ATTTA 2 1 139577 CASAVA_Build 10 95126834 3D CGTGCTTCTG GGA/--- GTGGGGCCTC 1904 het 1904 ref 31 22 6 4 GGA 1 0 139578 CASAVA_Build 10 95131991 4D TTTTCTCTAT TTTC/---- TTTTTTTTTG 2903 het 2903 ref 30 17 9 4 TTTC 1 0 139579 CASAVA_Build 10 95133234 1D CTAGCTTAGT C/- CACTGTCACC 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 C 2 1 139580 CASAVA_Build 10 95134394 2D TCTGTCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2792 het 728 hom 19 6 8 6 A 16 14 139581 CASAVA_Build 10 95145370 9D CAATGTGTTG GCTATCAAT/--------- GCTTGTCAGA 3070 het 3070 hom 39 17 21 7 GCTATCAAT 1 0 139582 CASAVA_Build 10 95148777 1D ACAGGGCACT G/- GGGGGGGGTC 3070 het 73 hom 19 1 10 8 G 9 8 139583 CASAVA_Build 10 95149631 1I ACAAACAAAC -/A AAAATTAGCC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 4 5 139584 CASAVA_Build 10 95150776 1I ATTTCTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2420 hom 16 7 9 0 T 10 11 139585 CASAVA_Build 10 95152516 1D ATTCTTTGAT C/- CCCCCCAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 7 6 139586 CASAVA_Build 10 95154866 4I ATTTGCTTTA ----/TCTT TCTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 27 19 1 TCTT 0 1 139587 CASAVA_Build 10 95156318 1I CCTCCCCACC -/G CATCCAGTCT 3070 het 1855 hom 25 7 12 6 G 0 1 139588 CASAVA_Build 10 95156594 1I AAGAAGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 10 11 139589 CASAVA_Build 10 95162035 1D CTTTTTCAGG C/- TACTGGGAAA 3070 het 3070 hom 54 18 30 6 C 1 0 139590 CASAVA_Build 10 95163943 2D TCTCTGCCTC TG/-- TGTGGTCACA 3070 hom 53 het 20 0 17 5 TG 3 2 139591 CASAVA_Build 10 95166980 8D ACCTGTCTCC TTTCTGAA/-------- TATCAGTAAC 3070 het 3070 ref 55 27 25 7 TTTCTGAA 1 0 139592 CASAVA_Build 10 95171780 1I CAAACATTCA -/T TTTATAGAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 4 139593 CASAVA_Build 10 95176640 1I TCTTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 2052 het 646 hom 13 2 6 5 C 0 1 139594 CASAVA_Build 10 95177598 2D ATTTTAGGGC AG/-- AGTTTGCTGT 3070 het 3070 hom 49 20 21 9 AG 2 1 139595 CASAVA_Build 10 95177944 2D TTTATGTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 157 hom 30 1 11 18 T 18 16 139596 CASAVA_Build 10 95178121 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3005 het 263 hom 17 1 12 4 T 12 11 139597 CASAVA_Build 10 95180773 4I TTTCTTTTCT ----/TTTC TTTTTTTTTT 192 het 192 ref 18 3 1 14 TTTC 0 1 139598 CASAVA_Build 10 95187007 1D GCTTAAACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1453 hom 23 4 10 9 T 10 9 139599 CASAVA_Build 10 95190169 1I AAAAAAAAAA -/T CCCCCAAAAC 3070 hom 63 het 26 0 20 6 T 0 1 139600 CASAVA_Build 10 95192744 1I CGTCTCTGGT -/A AAAAAAAATA 1828 het 1828 ref 13 5 5 3 A 8 9 139601 CASAVA_Build 10 95197318 1D CAGCTAAACT C/- CCCCCTTCCC 3070 het 3070 ref 27 11 8 8 C 6 5 139602 CASAVA_Build 10 95202921 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 10 11 139603 CASAVA_Build 10 95210329 1D TGGACAACAT G/- GGTGAAACCC 3070 hom 57 het 23 0 21 2 G 3 2 139604 CASAVA_Build 10 95210841 5D AACTCCATCT AAGAA/----- AAGAAAAGAA 3070 het 3070 hom 36 18 18 1 AAGAA 4 3 139605 CASAVA_Build 10 95213766 3D CATAAGTCCA GAT/--- GTTGCTGTCG 3070 het 3070 ref 36 22 12 3 GAT 1 0 139606 CASAVA_Build 10 95219153 1I ATCTCTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 12 13 139607 CASAVA_Build 10 95230836 1D TGAGATTTAG A/- AACCCCACTT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 3 2 139608 CASAVA_Build 10 95246817 1I AACTTGTGCC -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 7 8 139609 CASAVA_Build 10 95255610 1I TTTTTTTTTT -/G AGATAGAATC 3070 het 426 hom 13 1 12 0 G 0 1 139610 CASAVA_Build 10 95258845 10D ATTATCTTAA GCTTACATGT/---------- GCTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 43 23 19 7 GCTTACATGT 1 0 139611 CASAVA_Build 10 95261319 1I TTTCTCATAC -/T TTAAGTGATG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 2 3 139612 CASAVA_Build 10 95266203 2D GTAATACAGT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 45 14 18 13 TC 10 9 139613 CASAVA_Build 10 95267902 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 29 0 24 5 T 11 10 139614 CASAVA_Build 10 95277465 1I CTATTTCTAC -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 16 7 9 0 A 6 7 139615 CASAVA_Build 10 95277634 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 A 11 12 139616 CASAVA_Build 10 95278249 1D GTTTTGGGGG T/- TTTGAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 15 28 7 T 4 3 139617 CASAVA_Build 10 95278892 4D TTGTTTAAAA AAAC/---- AAATGTGTTG 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 AAAC 1 0 139618 CASAVA_Build 10 95279852 1D TCAAAAAAAT A/- ACTTTGGAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 1 139619 CASAVA_Build 10 95280041 1D AATTGAAGAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 40 22 10 9 T 8 7 139620 CASAVA_Build 10 95281262 1I CTCAGCAATG -/T TTTACAGCTT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 3 4 139621 CASAVA_Build 10 95291108 9D GTAACAAAAC TGCAGGTTT/--------- TGCAGGTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 TGCAGGTTT 2 1 139622 CASAVA_Build 10 95291388 1D ACTTCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 11 10 139623 CASAVA_Build 10 95297031 6I AATTGACCCA ------/GGAAAG GGAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 34 13 15 6 GGAAAG 1 2 139624 CASAVA_Build 10 95298976 1D AGGAGAATCA C/- CCGACCGGGA 3070 het 2971 hom 18 7 8 3 C 3 2 139625 CASAVA_Build 10 95300894 1D AAAGTTAGCC A/- GGCCTTAGAG 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 A 1 0 139626 CASAVA_Build 10 95306941 1D AGGATTTTTT G/- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 G 1 0 139627 CASAVA_Build 10 95339987 2D CTCTCGTGAG AC/-- AGAGGCATCT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 AC 1 0 139628 CASAVA_Build 10 95354516 2I GTGGGTTCAG --/TA TATAATAATG 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TA 2 3 139629 CASAVA_Build 10 95372036 4I AGCAAGTCTG ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 10 14 139630 CASAVA_Build 10 95372396 2D GTTTTTTTTT TG/-- TTTTTTTTTT 2386 het 121 hom 33 3 11 20 TG 1 0 139631 CASAVA_Build 10 95387993 1D CTCACCTTCT C/- CCTTTCCATC 3070 het 3070 hom 49 21 24 5 C 3 2 139632 CASAVA_Build 10 95392282 1I TTCTGACACA -/T TGAACTACCC 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 1 2 139633 CASAVA_Build 10 95393447 1D CAACTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1923 hom 21 8 11 2 T 14 13 139634 CASAVA_Build 10 95395656 2D TGTATGAACC TA/-- TGTGTAATTT 3070 het 3070 hom 58 21 32 5 TA 1 0 139635 CASAVA_Build 10 95407490 2D TATGTCCCTG TA/-- TATATATATG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TA 5 4 139636 CASAVA_Build 10 95413435 3I CCAAATGTCT ---/CCA CATTGGGAGA 3070 hom 132 het 50 0 43 7 CCA 0 1 139637 CASAVA_Build 10 95428601 1I CCTGTCTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 904 hom 35 3 20 12 A 12 13 139638 CASAVA_Build 10 95432699 1I CCATGTGATT -/G AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 G 0 1 139639 CASAVA_Build 10 95433104 1D TGATTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2049 hom 32 7 14 11 T 13 12 139640 CASAVA_Build 10 95434245 1D TTGTGGTCTC T/- TTTTTTTTTT 2766 het 490 hom 31 3 10 19 T 17 16 139641 CASAVA_Build 10 95435290 1D TACTGTTACC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 8 7 139642 CASAVA_Build 10 95436404 3I TATGAGCCAC ---/AAT GATAGCATAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AAT 0 1 139643 CASAVA_Build 10 95437674 4D CCTTGGTACT CACA/---- GAGGTTTAAA 3070 het 3070 ref 44 25 15 5 CA 2 0 139644 CASAVA_Build 10 95438807 3D TTGTTGTGGG GTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 31 2 17 15 GTT 1 0 139645 CASAVA_Build 10 95444759 1D GATTGGTGGT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 A 8 7 139646 CASAVA_Build 10 95445493 3D AAAAAAAAAA GAG/--- AGAGACAGAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 GAG 1 0 139647 CASAVA_Build 10 95448323 1D CTTAACATTA T/- TTTAATACCT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 4 3 139648 CASAVA_Build 10 95454775 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1664 hom 22 6 10 6 T 14 13 139649 CASAVA_Build 10 95456396 4I AAATATATAC ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AT 5 7 139650 CASAVA_Build 10 95457655 1D GGGGGTGACT A/- AAAAATGACA 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 6 5 139651 CASAVA_Build 10 95458700 1D TGTCTCTACT A/- AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 6 5 139652 CASAVA_Build 10 95458867 1D GGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1957 het 1957 ref 17 10 5 2 A 12 11 139653 CASAVA_Build 10 95461487 4I ACAGCACTCA ----/AAGT AATACTTGTA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AAGT 0 1 139654 CASAVA_Build 10 95461617 22D TCAGGAGAAG TTAGAAATTTGGATTTTTAGAT/---------------------- TTAGAAATTT 3070 het 3070 ref 28 15 7 10 TTAGAAATTTGGATTTTTAGAT 2 1 139655 CASAVA_Build 10 95464880 1D AAAGCCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 12 11 139656 CASAVA_Build 10 95465138 1I AAATGTCTTT -/C TTTTTCTTGC 3070 het 3070 hom 51 20 29 2 C 0 1 139657 CASAVA_Build 10 95466041 1D TTAAAAAAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 69 hom 26 2 10 14 T 10 9 139658 CASAVA_Build 10 95466280 1D ATTTATAAAG A/- AAAAAAGTTT 2008 het 2008 ref 23 11 8 4 A 7 6 139659 CASAVA_Build 10 95468113 1I AAATAATTTA -/T TTTTTTTTTG 2620 het 2620 ref 21 10 6 5 T 9 10 139660 CASAVA_Build 10 95468616 1D CCTCCACTAG A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 7 6 139661 CASAVA_Build 10 95471787 1D TTAGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 134 hom 26 2 15 9 T 10 9 139662 CASAVA_Build 10 95474630 3I4M2D5M11D GATTTTTCTC ---CTTTCCTTTTCCTGAAATGCAA/TGAATTT--GTTTC----------- TCTGAAACAA 2308 het 2308 ref 25 17 5 7 N/A 0 0 139663 CASAVA_Build 10 95474713 2D ACATGCGTAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TC 10 9 139664 CASAVA_Build 10 95475228 1D AGAATTTAAC A/- ATCTGTGTTT 3070 het 3070 ref 26 13 8 6 A 2 1 139665 CASAVA_Build 10 95492068 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTATAG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 7 6 139666 CASAVA_Build 10 95507073 2D AGGGTGGGAG AA/-- GAGAGGGAGG 3070 het 3070 ref 40 20 17 6 A 2 0 139667 CASAVA_Build 10 95512498 1D TAATTACTTC T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 19 5 T 6 5 139668 CASAVA_Build 10 95513029 16D ACACACAGAC ACACACACACACACAG/---------------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 54 26 17 16 ACACACACACACACAG 1 0 139669 CASAVA_Build 10 95532914 1I CACAAGGTCA -/G GAGATCGAGA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 1 2 139670 CASAVA_Build 10 95538667 1D TTTATTGTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 31 0 24 7 A 10 9 139671 CASAVA_Build 10 95538930 1D CTGTGATCAC A/- GGAAAAGAAC 3070 hom 87 het 31 0 28 4 A 1 0 139672 CASAVA_Build 10 95565551 1D CTCTCTGATT C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 99 het 39 0 32 7 C 9 8 139673 CASAVA_Build 10 95566031 2D AGGTAGACTC AG/-- AGCTCCCTAG 3070 hom 94 het 35 0 25 12 AG 2 1 139674 CASAVA_Build 10 95571237 1D AATAAAAAAA C/- AACAGAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 C 1 0 139675 CASAVA_Build 10 95581513 1I TTTAGGTGGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 8 9 139676 CASAVA_Build 10 95588824 1I TCAAAAAAAA -/T AAATAGATAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 0 1 139677 CASAVA_Build 10 95592251 3D GGCTTCTTAC TGG/--- TAAGTGCATC 3070 het 3070 ref 40 23 12 6 TGG 1 0 139678 CASAVA_Build 10 95592619 1D TAGAGCTGTT C/- CCTGGTACTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 C 3 2 139679 CASAVA_Build 10 95598283 2D CTAACTACTC AG/-- GGGACTAAGG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 AG 1 0 139680 CASAVA_Build 10 95643003 4I AAAGAATATA ----/TATC TTTTACCAGG 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 TATC 0 1 139681 CASAVA_Build 10 95651456 3D TTGGTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 TTG 5 4 139682 CASAVA_Build 10 95653700 4I AAGTTTAAAC ----/TGTT TGTCTGACCC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TGTT 0 1 139683 CASAVA_Build 10 95657543 15D TAACTTAGTC AAAATAAAATAAAAT/--------------- AAAATAAAAT 3070 het 2416 hom 30 7 13 18 AAAAT 7 4 139684 CASAVA_Build 10 95659215 1D TTAGTGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 11 10 139685 CASAVA_Build 10 95671347 1I CGTTTCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 12 16 13 T 9 10 139686 CASAVA_Build 10 95683604 1I ACTAATACTA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 T 3 4 139687 CASAVA_Build 10 95688464 1I ACCTGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 15 5 T 10 11 139688 CASAVA_Build 10 95690149 2D GACTTGAGAC TT/-- TCACCCAATC 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 T 3 1 139689 CASAVA_Build 10 95721578 1D CTTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 9 12 A 12 11 139690 CASAVA_Build 10 95732182 3D TCTCCTTCCT TTA/--- TTATCCACAG 3070 het 3070 hom 46 21 21 6 TTA 2 1 139691 CASAVA_Build 10 95736596 2D GTTTCTTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2351 hom 33 12 10 11 T 18 16 139692 CASAVA_Build 10 95745862 2D CTTGCTGCAC GT/-- GTGTGTGTGT 2847 het 2847 ref 35 13 9 13 GT 9 8 139693 CASAVA_Build 10 95753353 1I ATTAAAATTA -/G TTTGCTGCTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 139694 CASAVA_Build 10 95795713 1D CAGGCGTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 13 12 139695 CASAVA_Build 10 95797407 1D ATTTTTATTT G/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 G 1 0 139696 CASAVA_Build 10 95809921 1D CTTGGTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 12 11 139697 CASAVA_Build 10 95861419 1I TTCTGGAAGA -/G AGGAAAGAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 0 1 139698 CASAVA_Build 10 95863019 1D AGCTGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 38 1 29 8 A 15 14 139699 CASAVA_Build 10 95864508 1D TGCACAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 27 1 20 6 T 12 11 139700 CASAVA_Build 10 95868193 1D CCAAATCTCA C/- CTTATAGCTC 3070 hom 85 het 31 0 26 5 C 2 1 139701 CASAVA_Build 10 95887231 2D AAGTGATGAC AA/-- GAGGATTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 18 8 A 2 0 139702 CASAVA_Build 10 95890125 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2893 het 2439 hom 27 8 9 10 A 15 14 139703 CASAVA_Build 10 95891374 2I33M1D13M7D11M2D AGGAAGGCAG --AAGGAGGAAAGAAAGAAGGAAGGAAAGAAGAAAGGGAGGGAGGGAGGAAAGAAAGAAGGAAGGGAGG/GAAGGGAGGAAAGAAAGAAGGAAGGAAAGAAGATA-GGAGGGAGGGAGG-------GAAGGAAGGAA-- GAGAGAAGGA 1832 het 697 hom 9 4 4 8 N/A 0 0 139704 CASAVA_Build 10 95904711 1D TAATTGGGGG A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 8 7 139705 CASAVA_Build 10 95917257 1I GTAGGCACTC -/T TTTTTTTTTA 1593 het 1593 ref 21 8 6 7 T 9 10 139706 CASAVA_Build 10 95925120 4D CATTACTCCC TCAT/---- TCATTCATTC 3070 hom 69 het 32 0 24 9 TCAT 5 4 139707 CASAVA_Build 10 95929847 3D GTTGAACCCA GTT/--- GTTCTGGCTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 GTT 2 1 139708 CASAVA_Build 10 95934594 1D GACTTGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 11 10 139709 CASAVA_Build 10 95953663 1D AACCCTCAGG T/- TTTAGTCTGA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 4 3 139710 CASAVA_Build 10 95973851 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 563 het 563 ref 39 23 3 13 GT 9 8 139711 CASAVA_Build 10 95979789 1I ATAATAGAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 T 8 9 139712 CASAVA_Build 10 95980359 1I GGCATGAGGT -/A AAAAAACAAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 6 7 139713 CASAVA_Build 10 95998339 4D TGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AAAC 4 3 139714 CASAVA_Build 10 95999173 1I CCCTAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 11 12 139715 CASAVA_Build 10 96016175 1D TATGGTAACC A/- AAAAAAATGC 3070 hom 120 het 46 0 41 7 A 8 7 139716 CASAVA_Build 10 96024311 1D GCCACTTTCA G/- GGGCTAAGCA 3070 hom 147 het 55 0 48 8 G 4 3 139717 CASAVA_Build 10 96036960 4I GTGTATTTTC ----/ATTT TCTTTAGAAA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 ATTT 0 1 139718 CASAVA_Build 10 96050405 13I8M1I TTGTTACTCT -------------GAGTTGAG-/GAGTCTCAACTCAGAGTTGAGT GCAGATTATC 3070 het 3070 ref 40 24 18 3 N/A 0 0 139719 CASAVA_Build 10 96051654 2I AATGACAGAC --/TT TTCCAATCCT 3070 hom 105 het 42 0 34 8 T 2 4 139720 CASAVA_Build 10 96074363 1I CTGATACCCA -/T TAATTACACT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 2 139721 CASAVA_Build 10 96079910 4I GATTCTGATG ----/CTTT CTAAGCGCTG 3070 hom 111 het 44 0 37 7 CTTT 0 1 139722 CASAVA_Build 10 96081617 2D CAAGTTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 29 0 12 17 T 20 18 139723 CASAVA_Build 10 96087105 7D AGGGCCATTC AAAAAAA/------- AAAAAAAGAC 3070 hom 45 het 18 0 16 4 A 14 7 139724 CASAVA_Build 10 96087298 1I TAAAAAAATG -/T TTTTTCAAGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 5 6 139725 CASAVA_Build 10 96089102 4I TTACATAAAG ----/AGTT AGAGTAGTGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AGTT 0 1 139726 CASAVA_Build 10 96156802 1D GAGAAACCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 132 het 51 0 43 8 A 10 9 139727 CASAVA_Build 10 96196311 1D TGAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 9 8 139728 CASAVA_Build 10 96224086 1D TCAGGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 11 10 139729 CASAVA_Build 10 96233691 1D TGTATTTTGA T/- TTGATTTTTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 3 2 139730 CASAVA_Build 10 96233996 1D GTTTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1152 hom 21 4 12 5 T 15 14 139731 CASAVA_Build 10 96259085 4I CTCAGGTGAT ----/CCAC CCATCTTGGC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 CCAC 0 1 139732 CASAVA_Build 10 96277248 1D TTCTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 34 2 28 4 T 11 10 139733 CASAVA_Build 10 96278608 1I AATTTGAGGA -/G GGGGGAAGAG 3070 hom 53 het 20 0 16 4 G 5 6 139734 CASAVA_Build 10 96278757 1I TGGTTCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 29 1 20 8 T 11 12 139735 CASAVA_Build 10 96310823 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 78 hom 23 1 16 6 A 10 9 139736 CASAVA_Build 10 96335879 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 7 8 139737 CASAVA_Build 10 96343413 1D CCATTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 29 1 18 10 T 15 14 139738 CASAVA_Build 10 96377000 1I AGTTATGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 208 hom 42 1 33 8 T 10 11 139739 CASAVA_Build 10 96456875 3I TTAAACAATT ---/ATA ATATGTGAGC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 ATA 1 2 139740 CASAVA_Build 10 96474531 1D TATTCTCAGG T/- TGTTTACATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 1 139741 CASAVA_Build 10 96516052 4I GAGGGGTGAT ----/TGTA TGAGGTATCC 3070 hom 75 het 26 0 24 2 TGTA 0 1 139742 CASAVA_Build 10 96533983 1I TACTTCATTC -/T TTTTTGTGGA 3070 hom 111 het 49 0 38 11 T 5 6 139743 CASAVA_Build 10 96565840 1D TGCTTATATA T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 72 het 31 0 24 9 T 8 7 139744 CASAVA_Build 10 96603850 3D ACTGCAATCT CCA/--- CCTCCTGGAT 3070 hom 77 het 28 0 24 4 CCA 1 0 139745 CASAVA_Build 10 96609509 2I AAAACTAATG --/CC CCCCCCCCAA 3070 hom 45 het 20 0 13 7 C 8 10 139746 CASAVA_Build 10 96610611 1I ATGTAACCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 9 10 139747 CASAVA_Build 10 96633262 2I ATAAACAACA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 25 0 17 8 AC 0 1 139748 CASAVA_Build 10 96635484 1I ACAATTCAAT -/C CAGCAATCCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 139749 CASAVA_Build 10 96643104 1D CACCATCATC A/- AAGACCAAAG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 3 2 139750 CASAVA_Build 10 96651658 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 18 2 9 8 A 15 14 139751 CASAVA_Build 10 96652060 3I GGGCAATGAT ---/AAG AAATCTCTGC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AAG 0 1 139752 CASAVA_Build 10 96675179 1D ATTTTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 13 12 139753 CASAVA_Build 10 96679089 1D TGACAAAATT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 25 2 19 5 G 2 1 139754 CASAVA_Build 10 96683264 5D AAAAATAAAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AAAAC 3 2 139755 CASAVA_Build 10 96702533 4I TTTGGCTCTT ----/ATAG ATAGATAATC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ATAG 1 2 139756 CASAVA_Build 10 96718371 1D TTTTGTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 739 hom 39 3 28 8 T 11 10 139757 CASAVA_Build 10 96745894 1I CAGTCTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 27 1 21 5 T 10 11 139758 CASAVA_Build 10 96792151 1D ACAAAGAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 8 139759 CASAVA_Build 10 96796179 1D GAGAGCAATT G/- GGGGGGGCAC 3070 hom 99 het 41 0 33 8 G 8 7 139760 CASAVA_Build 10 96798405 1I CCAGCAGATG -/T TTGTAATAGG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 2 3 139761 CASAVA_Build 10 96802787 1D TTTAAAAAAA C/- ATAAAGACTC 3070 hom 45 het 17 0 16 3 C 1 0 139762 CASAVA_Build 10 96805285 1I ATAAAACATC -/G GGTTAAATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 2 3 139763 CASAVA_Build 10 96808745 1I GGCTGCATAG -/T ATTCCATGGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 139764 CASAVA_Build 10 96809187 2I CATAAATGTC --/TT CTTTTGAGAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 0 2 139765 CASAVA_Build 10 96818810 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 24 1 20 3 A 14 13 139766 CASAVA_Build 10 96821748 1D TAGAGCGGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 T 9 8 139767 CASAVA_Build 10 96823789 4D GTGGGTACAT AGTC/---- AGTGTACTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 5 AGTC 1 0 139768 CASAVA_Build 10 96825505 1D GAAGAATGAC A/- TTTTTTTTGG 3070 hom 75 het 27 0 26 3 A 1 0 139769 CASAVA_Build 10 96835654 2D ATTAAAAGAC TT/-- TGATGCATTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 3 1 139770 CASAVA_Build 10 96838946 1I ATGTAGACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 10 11 139771 CASAVA_Build 10 96842366 1I ATGCTCAAAG -/T TTTAAAGGGG 3070 hom 90 het 39 0 27 12 T 3 4 139772 CASAVA_Build 10 97000101 1D TCTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 905 het 905 ref 36 27 3 7 A 15 14 139773 CASAVA_Build 10 97003404 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 34 0 23 11 A 14 15 139774 CASAVA_Build 10 97011756 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 560 hom 21 2 13 6 A 15 14 139775 CASAVA_Build 10 97013231 1D AGATTCCCTC A/- AACACTCCCC 3070 hom 92 het 35 0 31 4 A 3 2 139776 CASAVA_Build 10 97014706 1I TCTGATAGCC -/T CAATCAGCAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 0 1 139777 CASAVA_Build 10 97015497 1D CCCCATCCGT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 115 het 43 0 36 7 A 8 7 139778 CASAVA_Build 10 97020084 1D GCCACAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1909 het 1909 ref 36 22 5 9 A 12 11 139779 CASAVA_Build 10 97054538 1D TTCCTTGATT C/- CCCCTCTTTC 3070 hom 104 het 41 0 35 6 C 5 4 139780 CASAVA_Build 10 97056648 1D TGTTATAGTC T/- TTTGGTAAGC 3070 het 3070 hom 62 22 29 12 T 4 3 139781 CASAVA_Build 10 97061029 2D GATGCCAGGG GA/-- GACTGCATGC 3070 het 3070 hom 37 14 21 3 GA 2 1 139782 CASAVA_Build 10 97062715 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 2314 het 2314 ref 36 19 7 10 A 13 14 139783 CASAVA_Build 10 97069594 1I AAATAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 921 hom 44 2 33 9 T 10 11 139784 CASAVA_Build 10 97073806 2D CCACTTGTTT CA/-- CAGAGAGACA 3070 het 3070 ref 38 18 16 6 CA 2 1 139785 CASAVA_Build 10 97075302 4D GCACTACTTC TTTT/---- TTTTTCTTTT 508 het 508 ref 24 10 8 6 T 9 5 139786 CASAVA_Build 10 97113450 1I TAGTTGTATT -/A GGATATTGGG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 0 1 139787 CASAVA_Build 10 97115778 1D TAGGTAGGAT A/- TGTCCCAGAG 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 A 1 0 139788 CASAVA_Build 10 97119901 4I CTGTCTTGGT ----/TCTG TCTGCTTAAG 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 TCTG 1 2 139789 CASAVA_Build 10 97123494 4D TGTGGCAGAG TGGT/---- TGCAGTAGGA 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 TGGT 1 0 139790 CASAVA_Build 10 97136002 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 12 12 T 12 11 139791 CASAVA_Build 10 97140556 1I CACTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 10 11 139792 CASAVA_Build 10 97152530 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 112 hom 28 1 20 7 T 10 11 139793 CASAVA_Build 10 97155193 1I ATGCTGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 81 hom 24 1 19 4 A 11 12 139794 CASAVA_Build 10 97155975 3I3M6D AACTCGTTAG ---GATCTCAAC/GGAGAT------ CCTGAGTCCT 3070 het 3070 hom 42 19 24 2 N/A 0 0 139795 CASAVA_Build 10 97164861 3I ATGAGAGAGA ---/AAG AAGAACAGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAG 1 2 139796 CASAVA_Build 10 97169171 8D GATAATGGCA GTAGGGAG/-------- GTAAGCAAAA 3070 het 3070 hom 50 15 15 23 GTAGGGAG 1 0 139797 CASAVA_Build 10 97172519 1I CTAATCACCC -/A TTCCTGAGTG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 0 1 139798 CASAVA_Build 10 97183910 1D ATGGCCCGGT G/- AGCATCAGAG 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 G 1 0 139799 CASAVA_Build 10 97192270 4D GCACCCCCCC CCCG/---- CACCCTTACT 3069 het 1495 hom 15 6 7 2 CCCG 1 0 139800 CASAVA_Build 10 97194813 3D CTGAGAGGGT AGA/--- AGGAGAATGG 3070 het 3070 ref 38 17 14 9 AGA 1 0 139801 CASAVA_Build 10 97225680 1D GATTTGAAAC T/- TAAGTCTATG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 2 1 139802 CASAVA_Build 10 97232988 4I ATATTTTTGT ----/CTGA CTATTAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 CTGA 0 1 139803 CASAVA_Build 10 97240079 1D GTAGGAAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 10 21 8 A 10 9 139804 CASAVA_Build 10 97251091 1I GTGACCCACC -/T TGTTGAGACA 3070 hom 150 het 55 0 48 7 T 1 2 139805 CASAVA_Build 10 97259368 1D TTTCTTCCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 67 hom 32 2 18 12 A 9 8 139806 CASAVA_Build 10 97260546 4I TCTGTCAAAA ----/ATTT ATTTTTAAAG 3070 hom 84 het 48 0 29 19 ATTT 1 2 139807 CASAVA_Build 10 97261939 1D CCAAAGCAGG C/- AGATTACTTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 0 139808 CASAVA_Build 10 97262543 1I GAAGATACAT -/G GGGAAAAAAA 3070 het 1038 hom 39 4 28 7 G 3 4 139809 CASAVA_Build 10 97263076 1D AAGAGCCAAT C/- CTGGCTCCAA 3070 hom 75 het 31 0 23 8 C 2 1 139810 CASAVA_Build 10 97265242 1D CAAAAATTGC T/- GCTAGCCTGC 3070 het 1704 hom 20 5 12 4 T 1 0 139811 CASAVA_Build 10 97271176 1D TCTCTTAGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 10 9 139812 CASAVA_Build 10 97276874 2D CTCATATGAA AG/-- AATTTTAACA 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 AG 1 0 139813 CASAVA_Build 10 97283335 1D AAGGGGAGTG A/- TGAGCTGTCA 3070 hom 126 het 52 0 42 11 A 1 0 139814 CASAVA_Build 10 97285166 4D AGGGAAAGGC AACT/---- AACTATCAGT 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 AACT 2 1 139815 CASAVA_Build 10 97293711 2D AAACAGGAGA GT/-- GTCACCTAGG 3070 het 3070 ref 53 29 18 7 GT 2 1 139816 CASAVA_Build 10 97297573 2D AACATCAGAG CT/-- CTCTTTCTCC 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 CT 3 2 139817 CASAVA_Build 10 97300400 1D ATCATTTAAC A/- AACACTTCTT 3070 het 3070 ref 38 24 13 1 A 3 2 139818 CASAVA_Build 10 97301184 1D CTACCGGCGC T/- GATATCTAGG 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 1 0 139819 CASAVA_Build 10 97331493 1D TCAGACTGTC A/- AAAAAAAAAA 2270 hom 29 het 12 0 7 5 A 12 11 139820 CASAVA_Build 10 97337206 1I AATGAGGCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 9 139821 CASAVA_Build 10 97361517 1D TCAGGAGTTC A/- AAAACCAACC 3070 het 3070 ref 27 15 8 5 A 5 4 139822 CASAVA_Build 10 97363184 1I2M4I GAACACCTTG -CA----/ACACGTG TATATAAGGT 3070 het 3070 ref 50 27 17 8 N/A 0 0 139823 CASAVA_Build 10 97370682 1I AACTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 2032 het 125 hom 9 1 6 2 A 15 16 139824 CASAVA_Build 10 97373159 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 TC 0 1 139825 CASAVA_Build 10 97374051 1D AACAACAAGC T/- GTGGAACCTT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 1 0 139826 CASAVA_Build 10 97379682 1I AAACCTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 11 12 139827 CASAVA_Build 10 97379868 1I CTTTCCCCCC -/T CCTCTCCCAA 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 T 0 1 139828 CASAVA_Build 10 97388638 1D TTTTTTTTTT G/- AAACACAGTC 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 G 1 0 139829 CASAVA_Build 10 97389978 2D TCCATTTTCA AT/-- ATGAGTAGCT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 AT 2 1 139830 CASAVA_Build 10 97390098 1I CCCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2370 hom 25 8 11 7 T 11 12 139831 CASAVA_Build 10 97390858 2I CAGGGGCACC --/AG TCACACTGTG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 AG 0 1 139832 CASAVA_Build 10 97391247 1I GTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 896 het 896 ref 18 7 4 7 T 11 12 139833 CASAVA_Build 10 97401171 2D CTTATAAAAC TG/-- TGTTAGGCCA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 TG 2 1 139834 CASAVA_Build 10 97405302 1D70M1D TCACTGAAAT AAGAGATTGAAGACTGACGTAGAAACCAAGCCTCCTGACCTCTCCCCTGTACCACCATCTCTGACTGACCAG/-AGAGATTGAAGACTGACGTAGAAACCAAGCCTCCTGACCTCTCCCCTGTACCACCATCTCTGACTGACCA- GCAGAGTGTA 3070 het 62 hom 43 1 42 37 N/A 0 0 139835 CASAVA_Build 10 97414216 1D AGACACAAGG A/- AATGAATATC 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 A 3 2 139836 CASAVA_Build 10 97416203 17D GAATAAATAA TAAACTTTCTTTTGACT/----------------- TAAACTTACA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 TAAACTTTCTTTTGACT 1 0 139837 CASAVA_Build 10 97420096 6D ACCTACTTTA TTTTAT/------ TTTTATTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TTTTAT 3 2 139838 CASAVA_Build 10 97422720 4D GATTACAGGT GTGA/---- GTGAGCCACT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 GTGA 2 1 139839 CASAVA_Build 10 97430484 1D TTAGTGGAAG A/- ACACAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 10 12 10 A 2 1 139840 CASAVA_Build 10 97433711 1I AAATGTAATT -/A AAAAAATATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 6 7 139841 CASAVA_Build 10 97435492 2D CTTGACCACC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 CT 6 5 139842 CASAVA_Build 10 97442328 1D TTCAAAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 26 1 17 8 A 13 12 139843 CASAVA_Build 10 97444416 3D GAATGGAAAT AGA/--- AGATTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AGA 2 1 139844 CASAVA_Build 10 97449360 4D GTCCAAAAAA AAAG/---- AAAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 25 9 13 4 AAAG 2 1 139845 CASAVA_Build 10 97454608 2D GGTAAAATAT TA/-- TATATATATA 2480 het 1390 hom 20 5 7 8 TA 6 5 139846 CASAVA_Build 10 97471983 1I CCCATTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 11 1 7 3 T 10 11 139847 CASAVA_Build 10 97474877 1D TCAATCTATT A/- TACTTTTGGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 0 139848 CASAVA_Build 10 97480303 1I AATAATGGGG -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 6 7 139849 CASAVA_Build 10 97513466 1D AACCACTGAG T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 54 22 22 10 T 7 6 139850 CASAVA_Build 10 97609595 1D TTTAATAGAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 T 9 8 139851 CASAVA_Build 10 97639561 5D TACAGTTGGT TTTCA/----- TTTCCTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 TTTCA 1 0 139852 CASAVA_Build 10 97652622 9D TAAAGGCATG ATGGCATCA/--------- ATGTGCATCA 3070 het 3070 ref 59 31 25 5 ATGGCATCA 1 0 139853 CASAVA_Build 10 97665046 1I TCATTTCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 22 13 0 T 9 10 139854 CASAVA_Build 10 97666683 1D AGGTCTGATA T/- TTTTTGGTTG 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 T 6 5 139855 CASAVA_Build 10 97677980 1D TTGCACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 10 7 A 12 11 139856 CASAVA_Build 10 97708307 4D AACAATAAAG AGAT/---- AGAAAATTGA 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 AGAT 1 0 139857 CASAVA_Build 10 97710269 1D ACATATTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 T 9 8 139858 CASAVA_Build 10 97726857 1I19M1I GGTGGCTCAC -CGTGTAATCCCAGCACTTT-/GCCTGTAATCCCAGCACTTTG GGAGGCCAAG 3070 hom 59 het 20 0 18 3 N/A 0 0 139859 CASAVA_Build 10 97736076 10D GAAAAGAACC TACGTGAAAT/---------- AACGTTGAAT 1437 het 1437 ref 11 7 3 1 TACGTGAAAT 1 0 139860 CASAVA_Build 10 97753183 4I TATTTATTTA ----/TTTT GAGATGGAGT 3070 het 1999 hom 23 5 18 1 T 0 4 139861 CASAVA_Build 10 97755798 1D TGTTTGCCTA T/- TCTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 T 2 1 139862 CASAVA_Build 10 97763241 4I AGTAATAAAT ----/TAAA TAAATAATTA 3070 het 870 hom 11 2 8 1 TAAA 1 2 139863 CASAVA_Build 10 97765217 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2407 hom 31 8 16 7 T 10 11 139864 CASAVA_Build 10 97809335 2D TGCTCCTTTC TG/-- TGGGAGAAGA 3070 het 3070 hom 32 10 14 9 TG 2 1 139865 CASAVA_Build 10 97815471 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1808 het 729 hom 17 3 7 7 A 15 16 139866 CASAVA_Build 10 97819860 1I TTGTACTGTA -/G GGGGGGACAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 G 6 7 139867 CASAVA_Build 10 97820362 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2857 hom 29 12 10 7 A 15 14 139868 CASAVA_Build 10 97823995 3I TTCCAAAAAT ---/ATA ATACACAATT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 ATA 1 2 139869 CASAVA_Build 10 97841773 1I CAAAAATGGA -/G GGGGTTGAAC 3070 het 3070 ref 40 27 10 3 G 4 5 139870 CASAVA_Build 10 97844326 1D CATAAATTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 9 8 139871 CASAVA_Build 10 97862065 1I ATGGCTGAGA -/T TTTTCCCAAA 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 T 4 5 139872 CASAVA_Build 10 97867188 1I GGGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 1581 het 1581 ref 40 18 9 13 A 15 16 139873 CASAVA_Build 10 97869217 4D TATTCTGAGG ATCT/---- ATCTGTCTCA 3070 het 3070 hom 26 11 13 4 ATCT 2 1 139874 CASAVA_Build 10 97871336 12D TCTCTTTCTC TTTCTTTCTTCT/------------ TTTCTTTCTT 1488 het 1488 ref 21 6 6 11 TTTCTTTCTTCT 1 0 139875 CASAVA_Build 10 97877261 1D TTCATATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 38 3 17 18 T 17 16 139876 CASAVA_Build 10 97884659 1D GTTGAAGGTT G/- TGGCTGGTAA 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 G 1 0 139877 CASAVA_Build 10 97886994 1D GCATTTCTTT C/- CTATCCTTTA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 C 2 1 139878 CASAVA_Build 10 97892332 1D GAGTTTTTAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 T 9 8 139879 CASAVA_Build 10 97910090 1I TGTGAAATGT -/C CTAGGAGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 2 139880 CASAVA_Build 10 97913063 1I GTATCCTTTA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 6 7 139881 CASAVA_Build 10 97913207 1I TAGTTTGTCC -/A ATCTCCACTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 1 2 139882 CASAVA_Build 10 97914215 1D TAGTGGAAAC T/- TTTTCCTGTA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 5 4 139883 CASAVA_Build 10 97921936 4I TACATGAAAG ----/TAAT TAAGTAAGTA 3070 het 3070 hom 42 21 18 3 TAAT 0 1 139884 CASAVA_Build 10 97923070 1D TCTGTGGAGA T/- CACAGTTCTA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 T 1 0 139885 CASAVA_Build 10 97926539 1D CTACTCAGGA G/- GGCTGACGCA 2086 hom 15 het 6 0 5 1 G 3 2 139886 CASAVA_Build 10 97929589 3I CCTCCTCATC ---/CTT CTTCTTCTTT 897 het 897 ref 20 8 4 8 CTT 3 4 139887 CASAVA_Build 10 97947660 2I AGACAACATC --/AA AAAAAAAAAA 1496 het 1330 hom 12 4 6 2 A 11 13 139888 CASAVA_Build 10 97953280 4D TGGGCAGTTA CGTT/---- CTGTGAGCCT 3070 het 3070 ref 34 21 10 5 CGTT 1 0 139889 CASAVA_Build 10 97953529 1D TTGTTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 35 1 26 8 A 13 12 139890 CASAVA_Build 10 97954719 3D CACCCTCTAC TTG/--- CCATGTGGCC 3070 het 3070 ref 46 26 16 6 TTG 1 0 139891 CASAVA_Build 10 97962112 1I AACAAAGCAC -/T TAGCATTTTA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 1 2 139892 CASAVA_Build 10 97970490 1D CAGGTATTAG A/- AATCCTTCTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 3 2 139893 CASAVA_Build 10 97985312 1I CATGAGACTG -/A GGAAAACTCA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 0 1 139894 CASAVA_Build 10 97987100 1D TGGATTTTTA T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 T 7 6 139895 CASAVA_Build 10 97990171 1D TTTCTTAATA T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 7 6 139896 CASAVA_Build 10 97995936 1D TGAGATGCTA G/- GCTTTCCCTC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 G 2 1 139897 CASAVA_Build 10 98000525 1D TTTGGTGCTT G/- CTTGGCATTT 3070 hom 132 het 53 0 45 9 G 1 0 139898 CASAVA_Build 10 98019169 1I GTCTGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1584 het 1584 ref 40 22 7 11 A 13 14 139899 CASAVA_Build 10 98024373 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2316 hom 23 6 15 2 T 12 13 139900 CASAVA_Build 10 98038351 1I ACTCCCAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 8 9 139901 CASAVA_Build 10 98064982 1D CCAATGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 35 0 24 11 T 15 14 139902 CASAVA_Build 10 98070686 12D CTCTCCTCTG TCTCTCTCTCTC/------------ TCTCTCTCTC 3060 het 70 hom 34 2 14 21 TC 15 9 139903 CASAVA_Build 10 98078787 1I ATCTTGTTTA -/T TTATACTTAC 3070 hom 169 het 60 0 57 3 T 2 3 139904 CASAVA_Build 10 98080064 2D CTTTGTGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 36 1 27 8 T 17 15 139905 CASAVA_Build 10 98092084 3I GTAAAGGAAA ---/AAG AAGAAGAGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAG 2 3 139906 CASAVA_Build 10 98094215 1I AAAAAAAAAA -/T GGCTGGGGAT 3070 het 287 hom 26 1 17 8 T 0 1 139907 CASAVA_Build 10 98100681 1I GAAGAATAAT -/A AAAGTATATG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 4 139908 CASAVA_Build 10 98108920 3I ATTTTCTGTC ---/CTT CTTACTTTTC 3070 hom 91 het 34 0 24 10 CTT 1 2 139909 CASAVA_Build 10 98128164 1D CCCCACAGTG T/- AATGGAGAAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 1 0 139910 CASAVA_Build 10 98132186 2D CCCTGGTGAC AA/-- GAGCCCTAAT 3070 hom 84 het 32 0 27 7 A 2 0 139911 CASAVA_Build 10 98179111 1I AAATATTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 334 hom 26 2 20 4 A 13 14 139912 CASAVA_Build 10 98179884 1I GAAACATAAT -/C CCCAGTGTTG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 3 4 139913 CASAVA_Build 10 98181016 1I CTTAGTCATC -/T TTTTTTACCA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 6 7 139914 CASAVA_Build 10 98188807 1I CATTTGCTAA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 7 8 139915 CASAVA_Build 10 98196251 1D CCCCCCACCT C/- CATAAGAAAG 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 C 2 1 139916 CASAVA_Build 10 98198199 1D GGTGTTAGTA T/- TTTTTCATCT 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 T 6 5 139917 CASAVA_Build 10 98200101 9D GATTTGAATC ACCTGGGAA/--------- GCCTTTAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 ACCTGGGAA 1 0 139918 CASAVA_Build 10 98209758 1D GTAAGAATAA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 T 8 7 139919 CASAVA_Build 10 98214960 1I TGACCTTAAC -/T TTTAAGAGAC 3070 het 3070 ref 61 27 23 11 T 3 4 139920 CASAVA_Build 10 98220915 1D ACTTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 9 8 139921 CASAVA_Build 10 98222796 1I GTTCCATCAG -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 C 8 9 139922 CASAVA_Build 10 98226385 1I TTCTAAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 9 10 139923 CASAVA_Build 10 98227100 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 22 2 10 10 T 15 14 139924 CASAVA_Build 10 98230895 1D GGGGGATGGA T/- TTTTTTTTTT 1783 het 642 hom 25 5 6 14 T 13 12 139925 CASAVA_Build 10 98230908 1I TTTTTTTTTT -/A AAGAGAGACA 3070 het 122 hom 25 2 15 8 A 2 3 139926 CASAVA_Build 10 98235726 1I GAGAGAAGCA -/G GGGGGTGGGA 3070 hom 89 het 34 0 29 5 G 5 6 139927 CASAVA_Build 10 98246738 1D TGTAAGGATA C/- TAAAAATGGC 3070 het 2814 hom 26 8 11 7 C 1 0 139928 CASAVA_Build 10 98252453 1D CTGCGACCTG A/- AAAAGAGTTA 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 A 5 4 139929 CASAVA_Build 10 98257045 1D TGAGCTGCCT C/- CCCCCAGCTC 3070 hom 73 het 29 0 23 6 C 6 5 139930 CASAVA_Build 10 98260793 8D CCCTCTGCAT TCTGAGTC/-------- CACAGTAGGA 3070 het 3070 hom 46 19 26 3 TCTGAGTC 1 0 139931 CASAVA_Build 10 98264064 1I CCTGTGTACG -/C GATTCATGTC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 0 1 139932 CASAVA_Build 10 98265191 3I CCTGAAAGCC ---/AGA AGGAGTCAAA 3070 hom 135 het 53 0 45 8 AGA 0 1 139933 CASAVA_Build 10 98268595 5I ACCTTGATTG -----/ATAAA ATAGTTTCAT 3070 hom 42 het 20 0 14 6 ATAAA 0 1 139934 CASAVA_Build 10 98270356 3D ATTAAACTAG AAA/--- CTCAGTGGTT 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 A 3 0 139935 CASAVA_Build 10 98271474 1D TTGGATTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 11 10 139936 CASAVA_Build 10 98279395 1I CTCTATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 13 14 139937 CASAVA_Build 10 98281143 1D TACATATATA T/- AAAAAACCTC 984 het 984 ref 33 13 4 17 T 1 0 139938 CASAVA_Build 10 98282514 1I TTGGCCTGCA -/G GATTAGTAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 G 1 2 139939 CASAVA_Build 10 98284256 1D TTCTTAATAA C/- TACAAGACTC 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 C 1 0 139940 CASAVA_Build 10 98289048 34I TGAAACTGTT ----------------------------------/TGGATTGCTTGAACCCCAGGGGCAGAGGTTGCAG TGAGCCGAGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 TGGATTGCTTGAACCCCAGGGGCAGAGGTTGCAG 0 1 139941 CASAVA_Build 10 98290962 1D CCCACGAAAG A/- AAAGACTTTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 4 3 139942 CASAVA_Build 10 98293092 9I AGTGAGATTC ---------/TTTTTTTTT TTTTTTTTGA 3070 hom 30 het 17 0 11 6 T 8 17 139943 CASAVA_Build 10 98297365 1I GTCAGGAGTT -/C CACAGCAGCC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 C 1 2 139944 CASAVA_Build 10 98301671 1D TCTATATGCA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 52 26 17 9 T 7 6 139945 CASAVA_Build 10 98305994 1I TTGTCATAAA -/T TTTAGAATGC 3070 hom 102 het 36 0 34 2 T 3 4 139946 CASAVA_Build 10 98308054 1I GAGGTAGGGG -/A AAAAATTTTA 3070 het 2944 hom 33 8 19 6 A 5 6 139947 CASAVA_Build 10 98309177 3I TATATTCTTC ---/TTT GTTTATCTCT 3070 hom 175 het 65 0 59 6 T 0 3 139948 CASAVA_Build 10 98311001 1D AATGAATAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 24 11 10 4 A 9 8 139949 CASAVA_Build 10 98312800 1I TGGGATTGTA -/G GGGGATAATG 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 G 4 5 139950 CASAVA_Build 10 98316866 3D AGTTTCACTC TTG/--- TTGTCCAAGC 702 het 702 ref 15 5 2 8 TTG 2 1 139951 CASAVA_Build 10 98320492 1I CAACGGTGGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 7 8 139952 CASAVA_Build 10 98329471 1I AAAATAATGC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 6 7 139953 CASAVA_Build 10 98331031 6I AGAAGATAAT ------/ATGCTG ATGCTGACGT 3070 het 3070 ref 38 19 8 11 ATGCTG 1 2 139954 CASAVA_Build 10 98333739 1D GGACATTGTG C/- CACTGTACTC 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 C 2 1 139955 CASAVA_Build 10 98341470 1I TGTGTCTCCT -/C CCCGCGCGCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 3 4 139956 CASAVA_Build 10 98347772 1D TTATAGTGGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 332 hom 21 2 12 7 T 8 7 139957 CASAVA_Build 10 98350827 1I TCTCCTGTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 10 139958 CASAVA_Build 10 98365047 1D GGGACAGGAG C/- CCCTGGAAGG 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 C 4 3 139959 CASAVA_Build 10 98365669 1D TAATAGGGCT C/- CATTCAAGAT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 C 2 1 139960 CASAVA_Build 10 98381623 24I AGAGCAAGAC ------------------------/AGAGACAGGGTTTCACTGTGTTGT TCTGTCTCAA 3070 het 2933 hom 24 6 16 2 AGAGACAGGGTTTCACTGTGTTGT 0 1 139961 CASAVA_Build 10 98382300 2D TGTGGAGCAC AT/-- GTGTGTGGAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 7 AT 1 0 139962 CASAVA_Build 10 98386594 1I GCTTGAACAG -/A TGAGAGAACA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 0 1 139963 CASAVA_Build 10 98388701 3D AAATATTTTT GAA/--- TGAATGAATG 3070 het 866 hom 52 4 16 32 GAA 1 0 139964 CASAVA_Build 10 98390115 1D CCCAGAACTG C/- CCCCCCAAGG 3070 hom 69 het 30 0 23 8 C 7 6 139965 CASAVA_Build 10 98403983 4I CTGCCAAATG ----/GACT GACTGACTCT 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 GACT 2 3 139966 CASAVA_Build 10 98417547 1D AATCAAAAAG A/- AAAGACTTCA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 A 4 3 139967 CASAVA_Build 10 98440184 1I TAATTTTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 8 9 139968 CASAVA_Build 10 98441230 1I TTGGGTTTTA -/T TTTTATGTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 4 5 139969 CASAVA_Build 10 98450684 10I GGGACTACTG ----------/TGTCATGACC TGCCCATAAC 3070 hom 74 het 30 0 23 7 TGTCATGACC 0 1 139970 CASAVA_Build 10 98476673 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2809 het 417 hom 17 1 11 5 A 13 14 139971 CASAVA_Build 10 98493592 9I TACTGCCAAG ---------/CACTTTGCA CACTTTGCAT 3070 het 3070 hom 47 20 19 8 CACTTTGCA 1 2 139972 CASAVA_Build 10 98494512 1D GTAACCTCTG C/- CCCCCAGACT 3070 hom 47 het 20 0 15 6 C 6 5 139973 CASAVA_Build 10 98495123 1I TACTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1072 het 34 hom 4 1 3 0 A 15 16 139974 CASAVA_Build 10 98495305 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 11 139975 CASAVA_Build 10 98500671 1D GTTAATTCCT A/- AAAAAAAAAA 1861 het 1596 hom 28 11 6 11 A 26 25 139976 CASAVA_Build 10 98504916 1I ACAGATGTCC -/A AAAAAAAAAA 2459 het 1128 hom 38 8 11 19 A 17 18 139977 CASAVA_Build 10 98506523 1D AAACACTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 27 0 17 11 A 15 14 139978 CASAVA_Build 10 98507714 1D CTGGGCGACC A/- AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 30 16 7 7 A 14 13 139979 CASAVA_Build 10 98511830 4D AACTAAAATC TCTT/---- TCTATCAATT 3070 het 2925 hom 20 7 12 4 TCTT 1 0 139980 CASAVA_Build 10 98516059 1I AGCCCAGACA -/G CAACTGTTTT 2535 het 2535 ref 32 16 6 10 G 0 1 139981 CASAVA_Build 10 98527767 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 12 1 10 1 A 11 10 139982 CASAVA_Build 10 98529538 3D GGCCGATCAC GAA/--- GTCAGGAGTT 2597 hom 28 het 12 0 7 5 GAA 1 0 139983 CASAVA_Build 10 98530674 1I ACAGAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 T 10 11 139984 CASAVA_Build 10 98531094 1D AAAAACCCAC A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 6 5 139985 CASAVA_Build 10 98595996 1I TGGCTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 1164 het 1164 ref 30 19 3 8 T 11 12 139986 CASAVA_Build 10 98603940 2D GACTAAATGA AT/-- ATCTTACTGG 3070 het 3070 hom 44 16 20 9 AT 2 1 139987 CASAVA_Build 10 98615298 1D GTTGTATACA C/- CCCTATGGCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 4 3 139988 CASAVA_Build 10 98658471 1I GTATACACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 18 1 14 3 T 10 11 139989 CASAVA_Build 10 98719224 2D TAAAGTTAAC TA/-- TGTGCATTTC 3070 het 3070 ref 48 28 13 8 TA 1 0 139990 CASAVA_Build 10 98737834 1D GCAATCACTG A/- AGCTCTGCCA 3070 het 3070 hom 53 25 21 7 A 2 1 139991 CASAVA_Build 10 98782498 1D AGCCCCCGTG T/- TCCCCAGCAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 2 1 139992 CASAVA_Build 10 98784875 3I GATCTCTCTT ---/CTC CTCTTCTCAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 CTC 1 2 139993 CASAVA_Build 10 98794956 1D CATTGCTTAT A/- AAAAAAAAAA 1166 het 1166 ref 32 23 3 6 A 13 12 139994 CASAVA_Build 10 98801009 1D ATCAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 33 3 13 17 A 12 11 139995 CASAVA_Build 10 98801278 4I AAATGAAAAT ----/GTTG GTCGGGCGCG 1732 het 1732 ref 16 11 4 1 GTTG 0 1 139996 CASAVA_Build 10 98806509 1D AGGCATTTTT G/- GGGGGGGCTC 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 G 8 7 139997 CASAVA_Build 10 98814885 14D GCACCCCCCT ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 hom 84 het 36 0 25 14 AC 16 9 139998 CASAVA_Build 10 98828405 2D TAGCTTCGTC CT/-- CTTCAACTCT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 CT 2 1 139999 CASAVA_Build 10 98833759 3I CTGGCCCCAG ---/TCT TCTTCATCTA 3070 het 2763 hom 26 10 12 4 TCT 1 2 140000 CASAVA_Build 10 98840345 1D ATAGGGTGTT G/- GGGGGGGCAG 3070 hom 65 het 27 0 22 5 G 8 7 140001 CASAVA_Build 10 98848899 1I TGTCCAGTTT -/G GGGGGGATGC 2667 het 2667 ref 36 14 8 14 G 6 7 140002 CASAVA_Build 10 98867033 1I CAGGTAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 8 9 140003 CASAVA_Build 10 98867853 1I TTCTGAGGTG -/T TCTGGCCCCA 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 T 1 2 140004 CASAVA_Build 10 98875031 9I CAATGTTTAT ---------/AAGAGCAAA AAGACTGAAA 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 AAGAGCAAA 0 1 140005 CASAVA_Build 10 98878674 1I AAACTAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 9 10 140006 CASAVA_Build 10 98879131 2D ACTGTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 25 9 A 16 14 140007 CASAVA_Build 10 98888404 1I CTGTTTTTTT -/C TTTTTTCTAG 3070 het 564 hom 36 6 21 9 C 0 1 140008 CASAVA_Build 10 98891933 1I CTCTCTTCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 9 10 140009 CASAVA_Build 10 98893945 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 922 hom 17 2 11 5 A 13 12 140010 CASAVA_Build 10 98898224 10I TTTTGTAGAG ----------/ACGGGGTCTT CCTATGCTGC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 ACGGGGTCTT 0 1 140011 CASAVA_Build 10 98902206 1D ATTTCCTGGG C/- ACCTCCCGTG 3070 hom 120 het 46 0 39 7 C 1 0 140012 CASAVA_Build 10 98903308 1I AATAGGTCCC -/A ACTCCAGCTC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 1 2 140013 CASAVA_Build 10 98906594 1I GCTGACCCAT -/A AGCTCCTTCA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 A 1 2 140014 CASAVA_Build 10 98908079 1I GAGGTTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 10 11 140015 CASAVA_Build 10 98909150 1D TCAATACAAT C/- CTTAAAGCAA 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 C 2 1 140016 CASAVA_Build 10 98928538 6D GAGAGAGAAA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 GT 12 9 140017 CASAVA_Build 10 98939019 1D GATTGTGGCA G/- GGGGTTCAGG 3070 het 2819 hom 37 9 12 16 G 5 4 140018 CASAVA_Build 10 98942612 6I TGGTCTTCCC ------/ATCATA ACGGCTGGTG 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 ATCATA 0 1 140019 CASAVA_Build 10 98947302 1I TCTTGATTGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 8 9 140020 CASAVA_Build 10 98951820 10D AATTAGCTGG GCATGGTGGT/---------- GCCTATAATC 3070 het 3070 ref 25 15 11 3 GCATGGTGGT 1 0 140021 CASAVA_Build 10 98954896 7I AAGTGACTTG -------/CCTTTCA CCTTTCACCA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 CCTTTCA 1 2 140022 CASAVA_Build 10 98965214 1I TAATGATACA -/T TTTTATTAAC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 4 5 140023 CASAVA_Build 10 98969102 1D TATATGTGGA T/- TTTTCGACTG 3070 hom 105 het 38 0 36 4 T 5 4 140024 CASAVA_Build 10 98997479 1D ATGGAGAGAA G/- GAAGAAACAC 3070 het 3070 hom 34 17 14 4 G 2 1 140025 CASAVA_Build 10 99000138 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2375 het 235 hom 18 1 8 9 T 13 12 140026 CASAVA_Build 10 99000495 5I CAAACAAGAA -----/TATAT TATATCTATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TATAT 1 2 140027 CASAVA_Build 10 99007559 1D ACAATCTCTC T/- CCTTTACCTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 1 0 140028 CASAVA_Build 10 99011083 1D AACAAAAATT A/- TTTCCAGTTA 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 A 1 0 140029 CASAVA_Build 10 99041860 2D AACTGAAGTC GA/-- GAGAGGTTTA 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 GA 3 2 140030 CASAVA_Build 10 99048983 1I GTCAGGAGAT -/C CGAGACCATC 1879 het 487 hom 7 1 5 1 C 1 2 140031 CASAVA_Build 10 99052664 1I ACCTCAAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 8 9 140032 CASAVA_Build 10 99055872 4D AAATATGTGA ATTT/---- ATTTGTTTAT 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 ATTT 2 1 140033 CASAVA_Build 10 99070237 1D AATGAAGGAC T/- TTGGCCCTAT 3070 hom 123 het 45 0 40 5 T 3 2 140034 CASAVA_Build 10 99077526 2D CGGTAGGCCT CA/-- GTTAACTGTA 3070 het 3070 ref 42 23 15 5 CA 1 0 140035 CASAVA_Build 10 99079406 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 23 1 17 5 A 11 10 140036 CASAVA_Build 10 99099140 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1868 hom 33 11 11 11 A 15 14 140037 CASAVA_Build 10 99100698 2I AAGTCTACAC --/AT GAGGGACAGG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 AT 0 1 140038 CASAVA_Build 10 99102800 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2529 hom 31 10 13 8 AT 6 7 140039 CASAVA_Build 10 99104174 2D ACTCCTAAGA CT/-- CTCTTTCGCC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 CT 3 2 140040 CASAVA_Build 10 99104212 1I ACTGACTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 717 hom 26 4 13 9 T 13 14 140041 CASAVA_Build 10 99105856 1D TGGGAAGAAT G/- TATCAGTCAG 3070 het 3070 ref 55 35 16 4 G 1 0 140042 CASAVA_Build 10 99128622 4D AATAATAATA AAAT/---- AAATAAATAA 1900 het 1180 hom 9 3 6 2 AAAT 5 4 140043 CASAVA_Build 10 99131934 1D TTCTGCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 T 12 11 140044 CASAVA_Build 10 99135278 1I GCCTTCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 11 12 140045 CASAVA_Build 10 99136737 2D ACTCCATCAC AA/-- AAAAAAAAAG 2743 het 1926 hom 19 8 9 2 A 11 9 140046 CASAVA_Build 10 99149707 3D TAAATAAATT TAG/--- TTCTTGCTAG 3070 het 3070 ref 30 18 12 1 TAG 1 0 140047 CASAVA_Build 10 99152361 3D TACAAGCATG CAC/--- CACCGCGCCC 1996 het 1996 ref 16 7 6 4 CAC 2 1 140048 CASAVA_Build 10 99157270 1I CTGAATACAG -/C CCCTGGCTAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 C 3 4 140049 CASAVA_Build 10 99164502 1D GCATGATGGC G/- GGTGCCTATA 2153 het 2092 hom 14 6 6 2 G 3 2 140050 CASAVA_Build 10 99181637 1D CTTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2821 het 2482 hom 27 8 9 10 A 14 13 140051 CASAVA_Build 10 99200606 1I ATGAATCAAC -/A ATGGAGGTCC 3070 het 3070 hom 27 9 10 8 A 1 2 140052 CASAVA_Build 10 99247270 1I TTTTTAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 11 12 10 T 12 13 140053 CASAVA_Build 10 99252566 2I ATTGTCACTC --/AT ATATGTGTGT 3070 hom 44 het 17 0 15 2 AT 2 3 140054 CASAVA_Build 10 99254070 1I TGCTCAAGCC -/T TCCTGTGACA 3070 het 3070 hom 48 18 27 3 T 1 2 140055 CASAVA_Build 10 99274033 1D TGTAGGGATG C/- GGGGGGGTCT 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 C 1 0 140056 CASAVA_Build 10 99282929 11D AGAGGATGCC TTTTCCACCAG/----------- CTGGGAGCTG 3070 hom 120 het 40 0 37 6 TTTTCCACCAG 1 0 140057 CASAVA_Build 10 99289687 2I TGTGCAGCCC --/CT GAGGCCCTTC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CT 0 1 140058 CASAVA_Build 10 99297649 1I CAACTTTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1139 hom 29 5 17 7 A 13 14 140059 CASAVA_Build 10 99305416 2I GGTACGTGAC --/AG GGGCTGCATG 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 AG 0 1 140060 CASAVA_Build 10 99311151 1D TGGGAGCATC T/- GCAAGCTACT 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 1 0 140061 CASAVA_Build 10 99316017 1D CATATTGAGA T/- TTTTTTTTTT 1520 hom 15 het 19 0 5 14 T 17 16 140062 CASAVA_Build 10 99358551 1I GGACTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 12 13 140063 CASAVA_Build 10 99363194 1I TCAACACGGC -/A AAACCCCATG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 3 4 140064 CASAVA_Build 10 99375088 1D TAAGTATCTC T/- AAATCTCAGT 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 T 1 0 140065 CASAVA_Build 10 99403664 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2122 hom 32 8 16 8 A 12 13 140066 CASAVA_Build 10 99404561 5I AATTTGACTT -----/AAATC AAGTATAATA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 AAATC 0 1 140067 CASAVA_Build 10 99419213 1I CAGGATGGTA -/G GGGAGGTTGG 3070 het 3070 hom 57 24 25 8 G 3 4 140068 CASAVA_Build 10 99436616 12I AGGCGCAGCT ------------/CTGGGCTTCCTG CTGCGAAGGT 3070 hom 80 het 32 0 25 7 CTGGGCTTCCTG 0 1 140069 CASAVA_Build 10 99467346 1D TCCATCCTTC T/- CAAGATCTCC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 1 0 140070 CASAVA_Build 10 99475943 1D TCCGCCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 19 9 9 2 A 11 10 140071 CASAVA_Build 10 99488849 1D TTTTCACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 13 12 140072 CASAVA_Build 10 99494898 4D TCGATCTAGC TGTT/---- TGTTTTCACA 2766 het 2766 ref 35 18 6 11 TGTT 2 1 140073 CASAVA_Build 10 99512010 2I GGGAACCAGA --/CT CTGCTGCAGC 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 CT 1 2 140074 CASAVA_Build 10 99532649 2D ACAATGCTAC GA/-- GAGACGGGTG 3070 het 3070 ref 50 21 18 11 GA 3 2 140075 CASAVA_Build 10 99538146 1I AAATCACATT -/A AAAAAAATCA 3070 het 2241 hom 25 7 13 5 A 7 8 140076 CASAVA_Build 10 99544412 5I TTTTATTTTG -----/AATAA AATAAAATAA 1780 het 1780 ref 21 11 6 4 AATAA 3 4 140077 CASAVA_Build 10 99553771 1D GACTCCTTCT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 A 8 7 140078 CASAVA_Build 10 99559450 1I AAGTTTTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 38 hom 35 1 26 8 A 9 10 140079 CASAVA_Build 10 99560042 1I ACCTCAGCCT -/C CCAAAGTGCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 2 3 140080 CASAVA_Build 10 99564731 3I CTTGTGCTCA ---/CAT CATGCAGCAG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 CAT 1 2 140081 CASAVA_Build 10 99570219 1I GTAATGTTTT -/C AAGTTTCATC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 140082 CASAVA_Build 10 99628198 1D TGGCAGGGGC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 679 hom 33 3 27 3 T 9 8 140083 CASAVA_Build 10 99631409 2D GCAGAGAAGA CT/-- CTGGAATTTC 3070 hom 117 het 47 0 39 8 CT 2 1 140084 CASAVA_Build 10 99634471 3I CCATGTTGGA ---/TAG TAGTGCAGCT 3070 hom 139 het 52 0 41 11 TAG 1 2 140085 CASAVA_Build 10 99636397 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 20 1 16 3 T 13 14 140086 CASAVA_Build 10 99640043 1D TTTGTAGAAA G/- GGGGGTCTCG 3070 het 2650 hom 29 10 12 8 G 6 5 140087 CASAVA_Build 10 99643017 3I TTCTGCACAT ---/ACG ATGTGTGTAT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 ACG 0 1 140088 CASAVA_Build 10 99657301 4D TTTTCTGTGT GTAG/---- GGTGGTCTTA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 GTAG 1 0 140089 CASAVA_Build 10 99662318 2D TCCATCTCTC AG/-- ACTGCATCTG 3070 het 3070 ref 43 22 15 7 AG 1 0 140090 CASAVA_Build 10 99668543 1D GTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2648 het 2648 ref 32 7 7 19 T 12 11 140091 CASAVA_Build 10 99677956 5D AAGGTCTCAG AGTCC/----- AGTCCAGTAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AGTCC 2 1 140092 CASAVA_Build 10 99680670 2D GAGCAAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 45 0 35 10 A 12 10 140093 CASAVA_Build 10 99680896 1I ACTTAGATAT -/C AATTTTTCCC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 0 1 140094 CASAVA_Build 10 99694543 11D ATATACAAAA TTTGGCTACCT/----------- TAAGACCACC 3070 hom 102 het 41 0 34 7 TTTGGCTACCT 1 0 140095 CASAVA_Build 10 99712066 2I AAACAGGACA --/CT CTGCGTCAGT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 CT 1 2 140096 CASAVA_Build 10 99716741 2D TGTAAAGTCA CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 81 het 30 0 27 4 C 13 11 140097 CASAVA_Build 10 99748734 1D CAATAGGGGT A/- AAAAAAAAAT 1136 het 1136 ref 30 26 3 2 A 10 9 140098 CASAVA_Build 10 99751297 1D ATTAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 851 het 851 ref 44 38 2 4 A 12 11 140099 CASAVA_Build 10 99762304 1I GGCAGCCAAG -/A GCAAGGCTGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 140100 CASAVA_Build 10 99768567 2I CACGGGAACA --/CT CTGCCCCACA 3070 hom 95 het 38 0 28 10 CT 1 2 140101 CASAVA_Build 10 99770111 1D ACATAAGTAA C/- CCACTTAATA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 C 3 2 140102 CASAVA_Build 10 99784199 2D GACAAATGAC TT/-- TGTTAATTCT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 3 1 140103 CASAVA_Build 10 99792763 1I AGAGTCTGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 8 140104 CASAVA_Build 10 99795752 1D GGTGTGCTGC A/- AAAATCACAA 3070 hom 84 het 34 0 25 10 A 5 4 140105 CASAVA_Build 10 99803117 1I TATACTGTGG -/C AAGCAGTGAG 3070 hom 69 het 25 0 22 3 C 0 1 140106 CASAVA_Build 10 99811558 6I TCCTTGGCTG ------/GTGTGT GTGTGTGTGT 3070 hom 78 het 35 0 23 12 GT 5 8 140107 CASAVA_Build 10 99837148 1I GGGAAAGCAA -/G GTCTGGCTAT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 G 1 2 140108 CASAVA_Build 10 99837953 1I GTTTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 25 1 20 4 G 0 1 140109 CASAVA_Build 10 99839223 1I TGAAAAACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 362 hom 29 2 22 5 A 9 10 140110 CASAVA_Build 10 99839776 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 18 0 11 7 T 16 14 140111 CASAVA_Build 10 99853370 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 8 9 140112 CASAVA_Build 10 99856193 1I CTATGGAAGG -/A ATTAAGTTCA 3070 hom 126 het 44 0 42 2 A 1 2 140113 CASAVA_Build 10 99863642 4D AGAGAGATAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 2442 het 2442 ref 26 13 8 8 AGAA 5 4 140114 CASAVA_Build 10 99867911 2D CGTGCAGGTT TG/-- TTACATATGT 1990 hom 12 het 5 0 5 0 TG 1 0 140115 CASAVA_Build 10 99869425 1D TTCCTAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2109 hom 37 9 20 8 T 15 14 140116 CASAVA_Build 10 99872109 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 23 1 17 5 T 13 12 140117 CASAVA_Build 10 99892712 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAAAAA 1550 het 1550 ref 35 11 9 17 AAAC 1 0 140118 CASAVA_Build 10 99895924 2I TGATAGCATC --/TT TTTTTTGGTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 8 140119 CASAVA_Build 10 99937157 6D TAAGAAACAG TCATAA/------ TCATAGGTCT 3070 hom 114 het 40 0 39 3 TCATAA 1 0 140120 CASAVA_Build 10 99944529 3I ATCTCACACC ---/TGT TAAGATGGCC 3070 hom 123 het 49 0 41 8 TGT 0 1 140121 CASAVA_Build 10 99948248 1I TGATTTGAAA -/T TTAGGGCCTT 3070 hom 78 het 36 0 26 10 T 2 3 140122 CASAVA_Build 10 99956001 1I CCTTGTGAAC -/G AAATAAAAGC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 0 1 140123 CASAVA_Build 10 99956346 3D ATTTCTACCC ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 ATT 5 4 140124 CASAVA_Build 10 99977324 1D GCAGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 17 16 140125 CASAVA_Build 10 100004838 1D TCCCAAAGTC T/- TTTTGGGTAA 3070 hom 144 het 52 0 47 6 T 5 4 140126 CASAVA_Build 10 100005832 8D TCAAGCGGCC CAGATCGT/-------- CAGTTGTGCT 3070 hom 54 het 25 0 19 7 CAGATCGT 1 0 140127 CASAVA_Build 10 100032871 1I TGTTGGAACG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 8 9 140128 CASAVA_Build 10 100033336 2I ATAGGCATAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 44 0 34 10 T 11 13 140129 CASAVA_Build 10 100035705 2I ACCTGGTTAT --/TA TAGCTGGAAT 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 TA 1 2 140130 CASAVA_Build 10 100047798 1D GACCGTTAGC T/- TTTTATTCTG 3070 hom 80 het 39 0 29 10 T 5 4 140131 CASAVA_Build 10 100080160 9D CCAAGACTCC TGCAGAAGA/--------- TGCAGAAGCA 3070 het 3070 ref 49 27 18 7 TGCAGAAGA 1 0 140132 CASAVA_Build 10 100082933 1D TTTTATTTGG T/- TTGGTGTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 T 3 2 140133 CASAVA_Build 10 100091390 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1663 het 182 hom 21 3 9 9 T 14 15 140134 CASAVA_Build 10 100094291 1D AACACTGCCT C/- CTCCTCCTCC 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 C 2 1 140135 CASAVA_Build 10 100101214 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2653 hom 33 8 20 5 A 11 10 140136 CASAVA_Build 10 100105832 1I AATATAAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 18 21 2 T 8 9 140137 CASAVA_Build 10 100111371 1D TATGTCGCCT G/- GGAGAGAGTC 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 G 3 2 140138 CASAVA_Build 10 100120402 4I AATTGCCTGG ----/CTCT CTAAGTTTTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CT 1 3 140139 CASAVA_Build 10 100182639 1I4M4D TTTTCAAAGT -GTGGTTCC/AGCAG---- TGGACAAGCA 3070 het 3070 ref 21 15 8 2 N/A 0 0 140140 CASAVA_Build 10 100188860 2D TATGGAAATG GC/-- AGGATGTCCA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 GC 1 0 140141 CASAVA_Build 10 100209674 1D ATCCCAACAA C/- CCCCCCACTC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 C 7 6 140142 CASAVA_Build 10 100210124 1D CTATAATCTC A/- GCATTTTGGG 3070 het 3070 ref 36 21 8 7 A 1 0 140143 CASAVA_Build 10 100211146 1I TGGAAGGCAT -/G GGGGTGGGAG 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 G 4 5 140144 CASAVA_Build 10 100218151 1D GCAATTACTT C/- AAGTGTGTCC 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 C 1 0 140145 CASAVA_Build 10 100220583 2D ACAGCTACGC AG/-- AGAGTTTCCA 3070 het 3070 hom 48 22 24 4 AG 3 2 140146 CASAVA_Build 10 100222570 4I AAGATAATAC ----/TCTT TCTAATAGTT 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 TCTT 0 1 140147 CASAVA_Build 10 100225218 3D TTAGATCACT GAA/--- GAAGAAGAAG 3070 het 3053 hom 23 8 13 4 GAA 4 3 140148 CASAVA_Build 10 100240956 1D TCTGATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 696 hom 46 2 35 9 T 12 11 140149 CASAVA_Build 10 100244806 2D CATTTTTTGC AG/-- AGCAAGTCTA 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 AG 2 1 140150 CASAVA_Build 10 100245458 1D AGCTCCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 T 11 10 140151 CASAVA_Build 10 100260885 1I CTGTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 418 hom 33 1 28 4 G 0 1 140152 CASAVA_Build 10 100271884 1I GGATAATTAT -/A AAAAAAAAAA 3014 het 3014 ref 20 9 8 3 A 11 12 140153 CASAVA_Build 10 100272857 4D TTTGTTTTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 12 19 5 TTTG 5 4 140154 CASAVA_Build 10 100274192 13D CACCCCAGAA CTTTTTTTGAATG/------------- CAGGAAGAAG 3070 het 3070 ref 24 16 9 2 CTTTTTTTGAATG 1 0 140155 CASAVA_Build 10 100281026 3D AACTTGTTCC AGG/--- AGGAGAATGG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AGG 2 1 140156 CASAVA_Build 10 100284158 1I GAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3062 het 2262 hom 24 8 10 6 T 11 12 140157 CASAVA_Build 10 100284716 1I TTAGCATGTT -/A ACCTCCTAAG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 1 2 140158 CASAVA_Build 10 100299135 3D GAAGATAAAT GTC/--- GTATTCATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 GTC 1 0 140159 CASAVA_Build 10 100300037 1D ATGCTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 33 0 23 10 T 13 12 140160 CASAVA_Build 10 100301896 1D CATGTTTATA G/- GGGAACAATG 3070 het 3070 hom 44 16 22 7 G 4 3 140161 CASAVA_Build 10 100310613 8D ACTGCACAGC CAGTTGTA/-------- CAGTTGTATA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 CAGTTGTA 2 1 140162 CASAVA_Build 10 100311597 4D TCAGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 60 het 28 0 21 8 AAAC 5 4 140163 CASAVA_Build 10 100311832 1I TTATACCATA -/T TTTTCCCGTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 4 5 140164 CASAVA_Build 10 100314905 2I ACTTGAAGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 35 1 25 10 T 12 14 140165 CASAVA_Build 10 100317496 2D CAAATGGATG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 289 hom 56 1 46 9 GT 12 11 140166 CASAVA_Build 10 100318661 2I GTTTGGGGTT --/TC TTTTTGGTGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TC 0 1 140167 CASAVA_Build 10 100320574 1I AAGTTTGGGG -/T TTGAAATGAT 3070 hom 126 het 52 0 43 9 T 2 3 140168 CASAVA_Build 10 100321384 4I TACTTACTCC ----/AGAT AGATACTGGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AGAT 1 2 140169 CASAVA_Build 10 100323217 1D AGCCCACTCT G/- GGGAGTGTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 G 4 3 140170 CASAVA_Build 10 100326562 4I TTCTCTATAG ----/TCTT TCTATTGGAT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 TCTT 0 1 140171 CASAVA_Build 10 100330105 9I TTCTCTCCTC ---------/TGTTCTCTT TGTTCTCTCC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 TGTTCTCTT 0 1 140172 CASAVA_Build 10 100340874 1D AATAGGGATC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 511 hom 32 2 10 20 A 9 8 140173 CASAVA_Build 10 100346084 5I ATTTTTAGTA -----/GTTTT GTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 GTTTT 1 2 140174 CASAVA_Build 10 100346220 1I ATTAGCATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 664 hom 38 2 17 19 T 11 12 140175 CASAVA_Build 10 100348091 1I AGGCCTGGTG -/T TAAGTCCTCA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 1 2 140176 CASAVA_Build 10 100349016 1I CAGGAGCTGG -/C CTGGTGCTAG 3070 hom 99 het 39 0 30 9 C 1 2 140177 CASAVA_Build 10 100350506 1D ACAAAAAAAA T/- ATACACACAT 389 het 389 ref 19 5 5 9 T 1 0 140178 CASAVA_Build 10 100350876 3D GGCAGAATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 TTG 4 3 140179 CASAVA_Build 10 100354054 1D AGAAAGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 6 A 12 11 140180 CASAVA_Build 10 100355350 1D ACTCTAGGCA C/- CAAGTTCAGT 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 C 2 1 140181 CASAVA_Build 10 100396070 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 37 1 28 8 T 13 12 140182 CASAVA_Build 10 100405549 2D CCATGGTTAT GA/-- GAGTAAGGAA 3070 hom 159 het 58 0 53 6 GA 2 1 140183 CASAVA_Build 10 100406960 4I GAAGCTGTGC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 30 9 A 11 15 140184 CASAVA_Build 10 100409516 1I TAAAGAGTCT -/C CTTTGAACAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 1 2 140185 CASAVA_Build 10 100416787 1I TTAACAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 42 0 32 10 A 9 10 140186 CASAVA_Build 10 100418889 1I AAATACTCAA -/C ATCACTAATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 0 1 140187 CASAVA_Build 10 100421277 4I ACTTATCAAC ----/TGAT TAAGAACAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TGAT 0 1 140188 CASAVA_Build 10 100427978 1D AAGGCCAATT C/- CCCAGGACAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 4 3 140189 CASAVA_Build 10 100430823 1I GAATTGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 10 11 140190 CASAVA_Build 10 100434683 1I GTCATATATA -/T TTTCAAAGCA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 3 4 140191 CASAVA_Build 10 100446359 1I CAACCATGGA -/G ATGCGTAGAT 3070 hom 80 het 32 0 24 8 G 0 1 140192 CASAVA_Build 10 100446799 1D AGAAGCAGTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 8 140193 CASAVA_Build 10 100452201 12D CTCTGGATCA AGTGGCCCTAAT/------------ AGACATCTAC 3070 hom 48 het 15 0 17 0 AGTGGCCCTAAT 1 0 140194 CASAVA_Build 10 100453224 1D13M1D GAGACACAAC AAAAAAAAGAAAACT/-AAAAAAAGAAAAC- TCAGGCCAAT 3070 hom 80 het 22 0 26 3 N/A 0 0 140195 CASAVA_Build 10 100454174 2D CATATGGAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 12 10 140196 CASAVA_Build 10 100455856 1I CAGTGGAGGA -/G GTTGTGAGAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 1 2 140197 CASAVA_Build 10 100456847 1I TGTAGGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1340 hom 35 4 20 11 A 10 11 140198 CASAVA_Build 10 100462028 1I AAATTAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 A 10 11 140199 CASAVA_Build 10 100473130 1D TTATTGAGGA T/- TTTTGCATCA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 5 4 140200 CASAVA_Build 10 100484300 1D GGCCATCCTA G/- TAAGTGTGAA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 G 1 0 140201 CASAVA_Build 10 100489928 1D TTCTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 25 1 15 9 T 13 12 140202 CASAVA_Build 10 100493441 1D GCAAATGGTG T/- GTATTCACTA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 1 0 140203 CASAVA_Build 10 100504750 1D ACAAGATGAC A/- GGATCAAATC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 1 0 140204 CASAVA_Build 10 100507960 1D ATGTAAATGT A/- AAATGTAGAA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 4 3 140205 CASAVA_Build 10 100508062 2I AAGCAATTAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 24 0 15 9 A 13 15 140206 CASAVA_Build 10 100508937 1D ACTTGAGGGT A/- GAGTGTGGGA 3070 hom 129 het 54 0 44 10 A 1 0 140207 CASAVA_Build 10 100512463 1D CCATACTTTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 212 hom 48 1 42 5 A 9 8 140208 CASAVA_Build 10 100513273 5D TTCTCATGTG TTCTC/----- TTCTCTGGAA 3070 hom 90 het 34 0 30 8 TTCTC 2 1 140209 CASAVA_Build 10 100518839 5D TGTCCCAACA TTATT/----- TTAAGTTTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TTATT 1 0 140210 CASAVA_Build 10 100526026 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2154 het 267 hom 7 1 6 0 A 18 16 140211 CASAVA_Build 10 100552048 1I TCTCTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 24 1 23 0 T 10 11 140212 CASAVA_Build 10 100568974 1D GTGCAACCCC T/- GTCATGATCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 0 140213 CASAVA_Build 10 100576908 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 24 het 15 0 11 5 T 9 8 140214 CASAVA_Build 10 100578725 1D TGAATGAATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 96 het 42 0 33 9 A 9 8 140215 CASAVA_Build 10 100592927 3D CTGATACTCT TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 hom 75 het 34 0 26 10 TCC 5 4 140216 CASAVA_Build 10 100598164 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 13 14 140217 CASAVA_Build 10 100598764 1D TGGGAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 2250 het 2250 ref 23 14 6 3 A 13 12 140218 CASAVA_Build 10 100601139 1D GGTTTTCATG A/- AGTGAAAAGA 3070 hom 111 het 41 0 35 6 A 2 1 140219 CASAVA_Build 10 100601753 2I ATGTCAGACT --/AA GTTTGCAGAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 2 140220 CASAVA_Build 10 100620693 1I TTAAATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 33 0 24 9 A 13 14 140221 CASAVA_Build 10 100638947 4D TTTTTTAAAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 60 het 27 0 21 7 TTTA 4 3 140222 CASAVA_Build 10 100643652 1D GGTAAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 32 2 24 6 A 12 11 140223 CASAVA_Build 10 100675112 2I TTTAATTGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 18 15 16 T 12 14 140224 CASAVA_Build 10 100682972 2D TTATTTACCC CA/-- GAGTCATTCA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 CA 1 0 140225 CASAVA_Build 10 100697482 3D TATCTATGAA GCT/--- GCTAACCCCA 3070 het 3070 hom 46 17 23 9 GCT 2 1 140226 CASAVA_Build 10 100699176 1D GGTGGCAAAG T/- TGTGTCAGAG 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 2 1 140227 CASAVA_Build 10 100706548 4I TGTGCCTAAC ----/AAAG AAAGAAAGGA 3070 hom 149 het 55 0 46 9 AAAG 2 3 140228 CASAVA_Build 10 100717626 2D CAAGCAAAAG GA/-- GAGGGAATAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 7 GA 2 1 140229 CASAVA_Build 10 100721140 2D CTTGCAAAGC CT/-- CTCTCTTTCA 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 CT 4 3 140230 CASAVA_Build 10 100727698 2I TTATATACCC --/AT ATGATTATAT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 AT 1 2 140231 CASAVA_Build 10 100754044 5D TATTGTTTTC TTGTT/----- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 18 12 13 TTGTT 5 4 140232 CASAVA_Build 10 100755015 3I TCTTTCTCTT ---/CTC CTTGAAATCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CTC 0 1 140233 CASAVA_Build 10 100760763 1D CCCACCCTTC A/- ACCCCTCTGT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 2 1 140234 CASAVA_Build 10 100760884 1I CTGTGTTAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 38 0 28 10 T 9 10 140235 CASAVA_Build 10 100775632 1D AAGAAAAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 9 8 140236 CASAVA_Build 10 100790834 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 863 hom 17 4 10 3 A 15 14 140237 CASAVA_Build 10 100794439 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 8 9 140238 CASAVA_Build 10 100801697 2I GCTTGAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 A 12 14 140239 CASAVA_Build 10 100802787 1I TAATTTCTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 A 9 10 140240 CASAVA_Build 10 100805868 3I TAAAAGCAGA ---/CAT CATCACTACA 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 CAT 1 2 140241 CASAVA_Build 10 100807665 1D CTTATGGGTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 9 8 140242 CASAVA_Build 10 100814352 2D ATTTACTTAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 58 het 25 0 20 5 AT 10 9 140243 CASAVA_Build 10 100821773 2D ACTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 33 4 17 12 T 13 11 140244 CASAVA_Build 10 100822096 5D AAACTATCAT CAGAG/----- CAAACAGGCA 2771 het 2771 ref 18 11 7 1 CAGAG 1 0 140245 CASAVA_Build 10 100827468 2D TGTATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 52 hom 42 3 31 8 TG 8 7 140246 CASAVA_Build 10 100846444 1D AATTGTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 T 11 10 140247 CASAVA_Build 10 100855997 4D TCATAGGCTG TCTC/---- TCTATTTTAA 3070 het 3070 ref 30 19 11 1 TC 3 1 140248 CASAVA_Build 10 100862710 2D ACACACACAC AT/-- ATACACATGC 3070 het 3070 hom 51 19 23 10 AT 2 1 140249 CASAVA_Build 10 100863839 1I AAAAATTTCC -/A ACTCCAATCT 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 A 1 2 140250 CASAVA_Build 10 100871292 3I AAATAAAAAT ---/AAC AAAGAATGTA 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 AAC 0 1 140251 CASAVA_Build 10 100872361 4D TAATAAGAAT AGAA/---- AGAAAATTCT 3070 het 3070 hom 20 8 11 3 AGAA 2 1 140252 CASAVA_Build 10 100876140 3I CAGAAAAGAC ---/AGA AGCTCATCCA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 AGA 0 1 140253 CASAVA_Build 10 100879557 1I AATTGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 13 14 140254 CASAVA_Build 10 100884952 10I AAGAACACTC ----------/AGATTCATAA AGCAAGTTCT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 AGATTCATAA 0 1 140255 CASAVA_Build 10 100895350 2I TAATCTAGGT --/GG GGCAACTCTA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 G 2 4 140256 CASAVA_Build 10 100900574 1D AGGAAAAAAT A/- AAGTGAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 26 5 A 3 2 140257 CASAVA_Build 10 100915754 2D GTTTTGTTTA TC/-- TGTTTCTATA 3070 het 3070 hom 56 26 25 5 TC 1 0 140258 CASAVA_Build 10 100915893 2I TAGTTAATTC --/CT TTTTATTGCT 3070 hom 112 het 50 0 37 13 CT 0 1 140259 CASAVA_Build 10 100922797 1D TTCCACTTGC T/- GTCATACTCA 3070 het 3070 ref 47 26 16 7 T 1 0 140260 CASAVA_Build 10 100928268 3D AAAATCTAGG AAA/--- ACCGGATAAA 2321 het 2321 ref 14 8 5 1 A 4 1 140261 CASAVA_Build 10 100942351 1I ATCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 10 11 140262 CASAVA_Build 10 100945594 2I TCACCAAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 10 12 140263 CASAVA_Build 10 100950422 3I CAATAATAAA ---/ATG ATGATGACAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 ATG 2 3 140264 CASAVA_Build 10 100950902 1I TACATTTTCC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 34 9 16 9 A 7 8 140265 CASAVA_Build 10 100966235 1I AGCCACTGCA -/C CCGGCCTAAC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 2 3 140266 CASAVA_Build 10 100982964 1D ACCACCACCA C/- CACACACACA 3070 hom 66 het 26 0 22 5 C 2 1 140267 CASAVA_Build 10 100996493 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1207 hom 19 6 9 6 A 13 11 140268 CASAVA_Build 10 101008138 2D AAATGGAGTA AT/-- ATATATATAT 1149 het 1149 ref 26 17 3 6 AT 9 8 140269 CASAVA_Build 10 101009989 1D GAGCTCCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 13 13 A 13 12 140270 CASAVA_Build 10 101014563 1D GTATCACCCC T/- CACCCCAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 T 1 0 140271 CASAVA_Build 10 101028850 1D TTATCATCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 10 9 140272 CASAVA_Build 10 101030892 4D ATTGTGTATG TTAT/---- TTATTATTGT 3070 hom 62 het 26 0 22 4 TTAT 2 1 140273 CASAVA_Build 10 101031091 2D13M1I ATTTAATAAA GTGTTATATCGAGAG-/--GTTATATCGAGAGA ATTCACAAAA 3070 hom 18 het 14 0 7 9 N/A 0 0 140274 CASAVA_Build 10 101033254 1I ACAAAAAATC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 8 9 140275 CASAVA_Build 10 101033753 1I AAACTTAAAG -/A GGAAGAAACA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 0 1 140276 CASAVA_Build 10 101037908 1D AGGGCTTCAG T/- TTCCCCATTC 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 T 3 2 140277 CASAVA_Build 10 101039103 1D ACATCATCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 10 9 140278 CASAVA_Build 10 101039294 1I TTTTACTCAG -/T TGCCAAGAGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 1 2 140279 CASAVA_Build 10 101040361 1D TCTGATCACT G/- CTCCATTTAT 3070 hom 141 het 52 0 47 5 G 1 0 140280 CASAVA_Build 10 101045101 1I TCAGGAGAAT -/G GAATTATGGT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 G 1 2 140281 CASAVA_Build 10 101054965 1I TCTCTAGTCC -/T CAATAAATCT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 1 140282 CASAVA_Build 10 101056248 1D GTTACCCCCC A/- AAAAAACCTC 3070 hom 122 het 46 0 41 5 A 7 6 140283 CASAVA_Build 10 101058526 2D ATCCTAGAAA AC/-- ACAGCATTCC 3070 hom 57 het 28 0 20 12 AC 2 1 140284 CASAVA_Build 10 101066562 1I GACAGAGTAT -/C CCCTCTACCC 2688 het 2688 ref 20 12 7 1 C 3 4 140285 CASAVA_Build 10 101068712 1D TTCTCTCCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 14 20 12 T 10 9 140286 CASAVA_Build 10 101070974 10I AAGAATCTCA ----------/TGGGAGTGTG CACACTGCAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 TGGGAGTGTG 0 1 140287 CASAVA_Build 10 101075463 1I TTATGAATGA -/T TTTTTATTAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 5 6 140288 CASAVA_Build 10 101076428 1I AAAAAAAAAA -/G AAGAAAGAAA 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 G 0 1 140289 CASAVA_Build 10 101096942 1D AAGTTAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2947 hom 19 9 8 2 A 10 9 140290 CASAVA_Build 10 101106234 8D AAAGAAAGAA AGAGAGAG/-------- AGAGAGAGAG 2350 hom 22 het 13 0 8 5 AG 12 8 140291 CASAVA_Build 10 101108928 2I AATCTAAGGA --/AT GAAGGGGGCG 3070 het 3070 ref 32 16 7 9 AT 0 1 140292 CASAVA_Build 10 101109671 1D TTCCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2592 het 512 hom 21 4 10 7 A 13 12 140293 CASAVA_Build 10 101109775 1D AAAGCAAATG T/- TTTCAACCAA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 4 3 140294 CASAVA_Build 10 101117628 1I CTGGACTGTT -/A ATACACACTG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 1 2 140295 CASAVA_Build 10 101123498 1D ATTATTTCCC T/- ATGTCCACTT 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 1 0 140296 CASAVA_Build 10 101142563 1I CATGGTGAAA -/C CCCCATCTCT 2627 het 2627 ref 16 8 6 2 C 4 5 140297 CASAVA_Build 10 101145356 1I TATTTCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 13 14 140298 CASAVA_Build 10 101159095 1D GGTCAGGCTG C/- TCTCCAACTC 3070 het 2801 hom 15 7 8 0 C 1 0 140299 CASAVA_Build 10 101167799 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 9 2 7 0 A 11 10 140300 CASAVA_Build 10 101190552 14I GTTTTTGTTT --------------/TTTGTTTGTTTTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 TTTGTTTGTTTTTG 1 2 140301 CASAVA_Build 10 101196286 1D TATCTGAGAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 8 7 140302 CASAVA_Build 10 101204772 2I AGAATAAGAC --/AG AAAAGAAAAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AG 0 1 140303 CASAVA_Build 10 101204840 1D GCAGAGTAGA G/- AAAACAAGAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 G 1 0 140304 CASAVA_Build 10 101206976 2D TTAATTCAAA AG/-- CAGTTATTTA 3070 het 3070 ref 39 20 16 5 AG 1 0 140305 CASAVA_Build 10 101208612 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 984 hom 25 6 13 6 A 13 14 140306 CASAVA_Build 10 101212902 1D TGGCCAACAT G/- GTGAAATCCT 3070 het 2719 hom 23 6 14 4 G 2 1 140307 CASAVA_Build 10 101218535 1D CATATTTCTG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 T 8 7 140308 CASAVA_Build 10 101223590 1D TATTTAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1270 hom 17 5 10 2 T 11 10 140309 CASAVA_Build 10 101225609 1I CCTCCCCCCA -/T TTCCCCCCCC 3070 het 2923 hom 31 12 11 8 T 2 3 140310 CASAVA_Build 10 101226537 8D AACTAGTCAA ATACATTT/-------- AAAAGAATTC 3070 het 3070 ref 35 22 10 4 ATACATTT 1 0 140311 CASAVA_Build 10 101227388 2I GGAAAAAAAA --/AT AAAAATTACT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AT 0 1 140312 CASAVA_Build 10 101228047 1I TCCATTTCTG -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 0 1 140313 CASAVA_Build 10 101234981 1I GCTCTCTTCC -/A AGTCCATTCC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 1 2 140314 CASAVA_Build 10 101236292 1I GCCCAGCTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 390 hom 43 1 37 5 T 9 10 140315 CASAVA_Build 10 101237347 1I ACCCCACACC -/T CCAGTGACAG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 0 1 140316 CASAVA_Build 10 101239838 7D AGACCTTGTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 293 het 293 ref 29 7 4 18 A 23 16 140317 CASAVA_Build 10 101240940 1D ACCCCTCCCC T/- GACACAGAAA 3070 hom 77 het 32 0 26 6 T 1 0 140318 CASAVA_Build 10 101252298 1D22M1D GAAGGAAACT GGGGGGCTGGGTATGTGGGAAAAT/-AGGGGCTGGGTATGTGGGAAAA- TAGGATACTT 3070 het 3070 ref 34 22 18 2 N/A 0 0 140319 CASAVA_Build 10 101261986 1D CCATATACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 21 0 17 4 A 11 10 140320 CASAVA_Build 10 101264242 1D TATATCTGCC T/- TTGCCACTGA 3070 hom 144 het 54 0 48 6 T 3 2 140321 CASAVA_Build 10 101267630 1D CTTTTTATTT A/- AAAGAGAGAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 4 3 140322 CASAVA_Build 10 101272595 1I TTTGCTTTCC -/A AGTGGGAAGT 3070 hom 55 het 24 0 15 9 A 1 2 140323 CASAVA_Build 10 101278102 1D TAGCAACAAC A/- AAAAAAGTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 6 140324 CASAVA_Build 10 101285644 1I CTCAGGGGCG -/A AGGAGGATGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 1 2 140325 CASAVA_Build 10 101323236 1I GGTTTTAGCC -/T ACAATATTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 0 1 140326 CASAVA_Build 10 101324479 1I GTGGTGCATG -/C CTGTAATCCC 3070 hom 72 het 28 0 24 5 C 1 2 140327 CASAVA_Build 10 101324853 1D ACTGCTAAGA G/- GTCTGTCCCT 3070 hom 78 het 28 0 24 4 G 2 1 140328 CASAVA_Build 10 101325673 1D TAAAAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 19 1 15 3 A 13 12 140329 CASAVA_Build 10 101326608 16D ATCAGTGTTA ACGGTTAGTTACTATT/---------------- ATTCAATACC 3070 het 3070 ref 31 18 17 0 ACGGTTAGTTACTATT 1 0 140330 CASAVA_Build 10 101327511 1I GATTAAACGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 34 1 23 10 T 10 11 140331 CASAVA_Build 10 101331418 1D ATTGCTTGAG C/- CCAGGAGGCT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 C 3 2 140332 CASAVA_Build 10 101336876 2D AGGTGAACTT TG/-- TGTGTGTGTG 2984 het 2984 ref 31 14 9 9 TG 10 9 140333 CASAVA_Build 10 101336969 2D GTGTAAAAAG AA/-- AAAAGAGTCC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 6 4 140334 CASAVA_Build 10 101341191 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 11 10 140335 CASAVA_Build 10 101347855 1I TCAGGCATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 14 13 T 10 11 140336 CASAVA_Build 10 101349760 3I AATTCATACC ---/CCT CCTTCCTCTG 3070 het 3070 ref 40 14 13 13 CCT 1 2 140337 CASAVA_Build 10 101352443 5D GAATATAAAT AAATA/----- AAAGAGAAGG 3070 het 3070 ref 32 19 13 4 AAATA 1 0 140338 CASAVA_Build 10 101356125 3D CTTTGTTTAA ATG/--- ATGACAGTAG 3070 het 3070 ref 38 17 16 6 ATG 2 1 140339 CASAVA_Build 10 101357689 1I GTTTACTCTG -/A CCTACACTTA 3070 het 3070 hom 55 25 27 3 A 0 1 140340 CASAVA_Build 10 101367259 1D TCCTCCCCAC T/- CATCCACTTA 3070 hom 111 het 39 0 36 3 T 1 0 140341 CASAVA_Build 10 101373985 2D16M4D CTTTCTTTTT TCTCTCTTTCTTTTTCTTTCTC/--TCTCTTTCTTTTTCTT---- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 28 17 13 3 N/A 0 0 140342 CASAVA_Build 10 101376530 1D TGGAGCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 38 0 30 8 T 13 12 140343 CASAVA_Build 10 101377629 1I CCCGCAAGTT -/C CCCGCCACCC 3070 hom 63 het 22 0 21 1 C 3 4 140344 CASAVA_Build 10 101384180 4I ATTCGAGGAA ----/ATAG ATAGCATAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATAG 1 2 140345 CASAVA_Build 10 101385265 1I TGTCTCTACT -/A AAATACAAAA 3051 hom 21 het 8 0 8 0 A 3 4 140346 CASAVA_Build 10 101386986 1D AATCCAGCCT C/- CCTTTATGAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 3 2 140347 CASAVA_Build 10 101397913 1I GCCCAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 27 1 17 9 T 12 13 140348 CASAVA_Build 10 101412414 12D GGGACGGAGA AACCAAAGGAGG/------------ AGGCAGGCAA 3070 hom 108 het 38 0 37 3 AACCAAAGGAGG 1 0 140349 CASAVA_Build 10 101413213 1I ATTTTATTTG -/T TTTTTTTTTT 2958 het 2351 hom 30 9 13 8 T 15 16 140350 CASAVA_Build 10 101423760 2D AAATATAAAC AG/-- GGAATATTGA 3070 het 3070 ref 52 23 22 9 AG 1 0 140351 CASAVA_Build 10 101442618 3D CTGAATTTTG TGA/--- TGATGTCAGT 3070 het 3070 hom 29 8 18 3 TGA 2 1 140352 CASAVA_Build 10 101445356 1I TATTAAAGGA -/T TGTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 1 2 140353 CASAVA_Build 10 101448095 2D TATTCCTCTC TT/-- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 T 8 6 140354 CASAVA_Build 10 101451038 1D ACAAAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3066 het 80 hom 24 1 15 8 T 15 14 140355 CASAVA_Build 10 101452996 1I TTTTAGGTAC -/T CTGTACCCTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 0 1 140356 CASAVA_Build 10 101456084 1I ACTCTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 11 12 140357 CASAVA_Build 10 101456261 1D TTTTTATTTT A/- TTTTTTTAGA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 1 0 140358 CASAVA_Build 10 101465269 1D AAGGTCTTTG T/- TGCATTGGAC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 2 1 140359 CASAVA_Build 10 101467991 1I AAATATAGTT -/C CCTGCTCTAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 2 3 140360 CASAVA_Build 10 101470540 1I55M2I GTTCAATATT -TTTGTTCAATTGACAGTAAAGTAGAATTTTTGGAAGAGAGAAAGGAACAGGAAAC--/GGTTGTTCAATTGACAGTAAAGTAGAATTTTTGGAAGAGAGAAAGGAACAGGAAACAG AGGGTGAAGA 3070 het 3070 hom 46 20 19 25 N/A 0 0 140361 CASAVA_Build 10 101480333 1I TCCATCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 28 1 19 8 A 10 11 140362 CASAVA_Build 10 101490182 1D GGTTGACAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 325 hom 42 1 40 1 T 10 9 140363 CASAVA_Build 10 101501008 1D TTTAATACTC A/- ACTTTCTCCA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 2 1 140364 CASAVA_Build 10 101501311 1I AAAAGTTACA -/T TTATTAAGTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 2 3 140365 CASAVA_Build 10 101504742 2I TGGAAGAGTC --/AT AGTCATTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AT 0 1 140366 CASAVA_Build 10 101512046 1I TTTAAAAAGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 8 9 140367 CASAVA_Build 10 101514308 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 17 11 A 14 13 140368 CASAVA_Build 10 101516591 2I CTATTTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 2475 hom 28 het 18 0 9 9 T 14 16 140369 CASAVA_Build 10 101518330 1I ACACTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 A 11 12 140370 CASAVA_Build 10 101519981 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 772 hom 23 4 14 5 T 13 14 140371 CASAVA_Build 10 101524224 1D CAGAAGAGTA T/- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 7 6 140372 CASAVA_Build 10 101542809 2I AGGAGCACAG --/CA CTAGGTCTAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CA 0 1 140373 CASAVA_Build 10 101543900 3I TAGTGATGAG ---/AGT AGTAAAATAC 3070 hom 103 het 42 0 35 7 AGT 1 2 140374 CASAVA_Build 10 101552247 1D TTAGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 866 hom 33 3 21 9 T 13 12 140375 CASAVA_Build 10 101603159 1I AGTGTTGGCT -/G GGGGGGGCGC 3070 hom 79 het 33 0 27 6 G 7 8 140376 CASAVA_Build 10 101611723 3D TTGTTGTTGT TGG/--- TGGTATTTGT 3070 hom 76 het 29 0 25 7 TGG 2 1 140377 CASAVA_Build 10 101615085 4I TAATTCTGTG ----/AAGA AAGTCAATTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AAGA 0 1 140378 CASAVA_Build 10 101618333 1D GTTCTGTTCT C/- CCCGTCACTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 4 3 140379 CASAVA_Build 10 101621088 2D ATTTATCTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 42 1 29 13 T 15 13 140380 CASAVA_Build 10 101623934 1I CTTCCCTCTC -/T TTCCCCCCAT 3070 het 16 hom 54 1 48 5 T 2 3 140381 CASAVA_Build 10 101625508 1I TGCACTTGGA -/G GGAACAGGGG 3070 hom 126 het 45 0 42 3 G 2 3 140382 CASAVA_Build 10 101626142 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 2800 het 110 hom 21 2 10 9 A 10 9 140383 CASAVA_Build 10 101628210 4D TCTATAATAA CTGT/---- CTGCTTGGTA 3070 het 3070 ref 47 24 18 8 CTGT 1 0 140384 CASAVA_Build 10 101632903 20I GGCAAAAGTG --------------------/TTCTGAAAAAAATCCTTGTT TTTTTAGAGC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TTCTGAAAAAAATCCTTGTT 0 1 140385 CASAVA_Build 10 101649385 2D38M4I ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAACCCTGTATTTAGTCTTCTCACCTATGCTC----/--AAAAAAAAACCCTGTATTTAGTCTTCTCACCTATGCTCTTGT TTATTTGGAC 3070 hom 66 het 25 0 22 11 N/A 0 0 140386 CASAVA_Build 10 101650040 1I TATGTATTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 9 10 140387 CASAVA_Build 10 101662878 1I ACCCGTCTCT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 A 7 8 140388 CASAVA_Build 10 101666403 1I TTTTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 22 1 19 2 A 11 12 140389 CASAVA_Build 10 101667733 6D AAAAAAAAAA AAAAAG/------ AAAAGAAAGG 3070 hom 72 het 28 0 23 9 AAAAAG 1 0 140390 CASAVA_Build 10 101671389 1D TCACTTGAGG C/- CAGGAGATTG 3070 het 51 hom 23 1 11 12 C 2 1 140391 CASAVA_Build 10 101671440 1D GTCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 29 4 13 12 A 14 13 140392 CASAVA_Build 10 101673140 3I CTCCAAAAAA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAT 3 4 140393 CASAVA_Build 10 101673659 1I CCAGCACTTC -/G GGGGGCCGAG 3070 hom 50 het 20 0 15 5 G 5 6 140394 CASAVA_Build 10 101683263 1D TATGGGTTCA G/- GGGGATCTGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 5 4 140395 CASAVA_Build 10 101694469 1D ATGTTTCATT C/- CCCAACACAC 3070 hom 126 het 48 0 41 7 C 4 3 140396 CASAVA_Build 10 101704798 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 8 9 140397 CASAVA_Build 10 101710631 1I AGGCTGAGGT -/G GGAAGACTGC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 2 3 140398 CASAVA_Build 10 101718436 1D CTACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 670 hom 29 2 18 11 A 17 16 140399 CASAVA_Build 10 101730194 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1142 hom 23 3 12 8 A 17 16 140400 CASAVA_Build 10 101730515 1I TTGTGCCACT -/G CATTCCAGCC 3070 hom 90 het 31 0 29 2 G 0 1 140401 CASAVA_Build 10 101737826 1D TTTGCTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 32 0 23 9 A 11 10 140402 CASAVA_Build 10 101741754 1I GGAGGCCAAG -/A GGGGCAGATG 3070 hom 33 het 18 0 13 5 A 0 1 140403 CASAVA_Build 10 101744820 1I TTTTTTTTTT -/G GAGACAGTCT 2967 het 870 hom 24 3 16 5 G 1 2 140404 CASAVA_Build 10 101745501 2I TGTGACAAAC --/TT AATCTGGAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 2 140405 CASAVA_Build 10 101752078 4D AAAGAAAGAA AAAG/---- AAAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 16 21 3 AAAG 2 1 140406 CASAVA_Build 10 101753825 1I AAAAAATTAC -/A AAAAAAAAAA 2306 hom 20 het 10 0 7 3 A 12 13 140407 CASAVA_Build 10 101775675 1I GACACAGGAT -/A GGGGGTGGGG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 A 0 1 140408 CASAVA_Build 10 101781849 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 958 het 958 ref 33 13 6 14 AAG 1 0 140409 CASAVA_Build 10 101783383 1I CTTTTTCATG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 7 8 140410 CASAVA_Build 10 101792596 1I ATCCCAGCAC -/T TTGGGAGGCT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 2 3 140411 CASAVA_Build 10 101809149 6I ACATAACAAT ------/AACAAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 AAC 4 6 140412 CASAVA_Build 10 101818614 1I TAATTGTTGG -/T TAAGCACACA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 2 140413 CASAVA_Build 10 101819228 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 26 1 16 10 A 15 14 140414 CASAVA_Build 10 101835104 1D CATTATTGAC T/- TTCCCCCTTG 3070 hom 101 het 42 0 34 11 T 3 2 140415 CASAVA_Build 10 101844901 2D18M1D ATAGGGTGTA TGTGTGTGTGTGTGTGTGACA/--TGTGTGTGTGTGTGTGAC- GGGGCAGGAA 3070 hom 73 het 38 0 33 15 N/A 0 0 140416 CASAVA_Build 10 101846667 6I GACTATAGTT ------/AATAAC AATGTTTTGT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 AATAAC 0 1 140417 CASAVA_Build 10 101855287 1I GCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 924 hom 31 5 15 11 A 15 16 140418 CASAVA_Build 10 101856453 9I GGAACGTAAG ---------/GCAGAGTAA GAGACCGAGG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 GCAGAGTAA 0 1 140419 CASAVA_Build 10 101856808 1D TTCTTAGTGC G/- CATGCTTGAG 3070 hom 102 het 39 0 32 8 G 1 0 140420 CASAVA_Build 10 101862081 1D85M1D AGAATATGGG TTTTTTTTTTAACATCCTACCAACAAATTATGACAAATAAAAACATGTTCTTTTACAACTTTTATTTTAACATATTTTATTTTGTTA/-TTTTTTTTTAACATCCTACCAACAAATTATGACAAATAAAAACATGTTCTTTTACAACTTTTATTTTAACATATTTTATTTTGTT- GTATATTTTT 3070 hom 56 het 44 1 57 12 N/A 0 0 140421 CASAVA_Build 10 101873051 1I CCTATTTCTC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 6 7 140422 CASAVA_Build 10 101875261 4D ATAGTGGTAG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 102 het 42 0 35 8 GA 9 7 140423 CASAVA_Build 10 101877952 6I GACAGACAGG ------/AGAGAA AGAGAAATGG 3070 hom 107 het 40 0 33 7 AGAGAA 1 2 140424 CASAVA_Build 10 101879630 1D TGTTGAGGTG T/- TTTTTTTTTT 2098 het 348 hom 36 4 8 24 T 17 16 140425 CASAVA_Build 10 101894140 4I TGCAGTGGCA ----/CGTG CGATCTTGGC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 CGTG 0 1 140426 CASAVA_Build 10 101900004 1D CCTCACACAT G/- GGAGTTTAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 3 2 140427 CASAVA_Build 10 101962748 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 16 1 10 6 A 15 14 140428 CASAVA_Build 10 101981873 1I AGATGAATGC -/T TTAAGAGAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 2 3 140429 CASAVA_Build 10 101983552 2D TGTGAGGTAC AG/-- AGATAACACA 3070 hom 135 het 50 0 46 6 AG 2 1 140430 CASAVA_Build 10 101994773 1D GAATATCAAC T/- TTTTTTTTTT 2005 hom 18 het 11 0 6 5 T 15 14 140431 CASAVA_Build 10 102015273 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1714 hom 17 het 9 0 6 3 T 15 14 140432 CASAVA_Build 10 102031442 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1437 hom 7 het 3 0 3 0 T 1 0 140433 CASAVA_Build 10 102034830 1I ACAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 35 2 27 6 A 11 12 140434 CASAVA_Build 10 102040962 1I AGAGTTTTCA -/G GGTGGGTTTG 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 G 2 3 140435 CASAVA_Build 10 102048772 9D TCGGCTCACC GCAACCTCT/--------- GCAACCTCTG 3070 het 1453 hom 16 3 8 6 GCAACCTCT 2 1 140436 CASAVA_Build 10 102050143 1I AAGTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 A 10 11 140437 CASAVA_Build 10 102050602 1D CAAATGGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 10 9 140438 CASAVA_Build 10 102052436 1D GAGACTCTGT C/- CCCCAAAAAA 2755 het 864 hom 17 3 9 6 C 5 4 140439 CASAVA_Build 10 102059127 2D ATAGTAAAAC AA/-- TATAAAAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 0 140440 CASAVA_Build 10 102081461 3D TGTAGTCCCA GCT/--- GCTACTCAGG 3070 hom 49 het 22 0 16 8 GCT 2 1 140441 CASAVA_Build 10 102093102 1I CAGTCTTTAG -/T TTTTTTTTTT 2021 het 2021 ref 21 8 7 6 T 15 16 140442 CASAVA_Build 10 102098336 3I TTTGAAGTGT ---/AGA GCTGTGCTGG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AGA 0 1 140443 CASAVA_Build 10 102101095 1D GAGAGCGTTG C/- CCGGTGAGAG 3070 het 3070 hom 40 13 18 10 C 3 2 140444 CASAVA_Build 10 102102731 1I CCCCAACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 10 11 140445 CASAVA_Build 10 102103330 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2132 het 898 hom 19 7 7 5 A 18 17 140446 CASAVA_Build 10 102106199 5D AGACAGCCCA TCCCC/----- TCCCAATTAG 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 TCCCC 1 0 140447 CASAVA_Build 10 102117643 1D TTCCAGCTCC T/- TTTTTTTTTT 1125 het 1125 ref 30 23 3 4 T 12 11 140448 CASAVA_Build 10 102119731 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1178 het 1178 ref 15 10 4 1 T 15 14 140449 CASAVA_Build 10 102123323 1D CCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1287 het 53 hom 19 1 8 10 T 13 12 140450 CASAVA_Build 10 102169230 16D GAAGGAAGGA AGGGAGGGAGGGAGGG/---------------- AGGGAGGGAG 2735 hom 23 het 12 0 8 4 AGGG 9 5 140451 CASAVA_Build 10 102202897 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 18 8 A 12 11 140452 CASAVA_Build 10 102226341 4I GGTACACCAG ----/ATTT CATGGAACAA 3070 het 3070 hom 27 10 17 0 ATTT 0 1 140453 CASAVA_Build 10 102275009 1D CATTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1060 het 1060 ref 33 21 4 8 T 12 11 140454 CASAVA_Build 10 102277406 5D CAATAAAAAG AAAAA/----- AAGTCACACA 3070 het 3070 ref 40 19 20 5 A 7 2 140455 CASAVA_Build 10 102314988 4D TTGTGAAGAA TTTG/---- TTTGGGAGTC 3070 het 3070 hom 49 20 25 7 TTTG 2 1 140456 CASAVA_Build 10 102341437 1D AGATTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 1373 het 1373 ref 33 22 3 9 A 12 11 140457 CASAVA_Build 10 102366557 26D ATTTCCTCCC TGTCTCTTGCCCTTCCATAGCCTAAT/-------------------------- TGTCTCTTGC 3070 hom 54 het 34 0 17 18 TGTCTCTTGCCCTTCCATAGCCTAAT 1 0 140458 CASAVA_Build 10 102376187 2D CTGCGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 39 14 14 12 GT 9 8 140459 CASAVA_Build 10 102378231 1I CACACCTGGG -/C CAGGTCAGTG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 C 1 2 140460 CASAVA_Build 10 102381861 1D AAGGGAAGTC A/- AAAGAGTCCC 3070 het 3040 hom 36 10 12 14 A 4 3 140461 CASAVA_Build 10 102382988 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 909 het 909 ref 19 14 2 3 A 12 11 140462 CASAVA_Build 10 102386044 1I ATCTACCATG -/T TAGGGCTGTG 3070 het 3070 hom 67 22 33 12 T 1 2 140463 CASAVA_Build 10 102404183 3I CTCCTTCCTC ---/CTT CTCTCCCTCT 3070 hom 39 het 17 0 10 7 CTT 0 1 140464 CASAVA_Build 10 102441987 3D CTGCATTCCC CAT/--- CATCTTTCCC 3070 hom 111 het 43 0 35 9 CAT 2 1 140465 CASAVA_Build 10 102443029 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 28 1 23 4 A 10 11 140466 CASAVA_Build 10 102446239 4I AAAGAAAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 45 het 18 0 14 4 AG 6 8 140467 CASAVA_Build 10 102465890 1I AATACGCGCC -/G GGGGCTGGTC 2035 het 2035 ref 25 10 9 6 G 4 5 140468 CASAVA_Build 10 102471772 5I TTATACTACA -----/TAAAT TAATTTAATT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 TAAAT 0 1 140469 CASAVA_Build 10 102473506 1I AGCTGGAGAC -/A AAAGATAGGG 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 A 3 4 140470 CASAVA_Build 10 102482662 6D TTCTCACCAG CCAGCC/------ CCAGCCTGAC 3070 het 3070 ref 30 20 10 2 CCAGCC 2 1 140471 CASAVA_Build 10 102483671 1I AGGCTAATCA -/C ATGTGTGATC 3070 het 3070 ref 65 37 20 8 C 0 1 140472 CASAVA_Build 10 102490526 7I GCCCCTTTAG -------/CTGTGCA GAGGTCCATG 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 CTGTGCA 0 1 140473 CASAVA_Build 10 102544609 1D GTGTAATTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 10 9 140474 CASAVA_Build 10 102592047 12I TGAAGTTTTC ------------/AATAATAAAAAA AATGTTTAAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 AATAATAAAAAA 0 1 140475 CASAVA_Build 10 102594136 1D TATACATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 11 10 140476 CASAVA_Build 10 102598257 1D TACAGGTGAT G/- TTTTTTTCGC 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 G 1 0 140477 CASAVA_Build 10 102605756 1D GCCTTCTACC A/- TGAGTAAGAG 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 1 0 140478 CASAVA_Build 10 102640096 1D TTCCTTTCCA C/- CCCGTCACAG 3070 hom 104 het 39 0 35 4 C 4 3 140479 CASAVA_Build 10 102644300 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1409 hom 23 6 10 7 A 12 13 140480 CASAVA_Build 10 102649306 1I CTCTCCAGGC -/T TTTTTTTTTT 2550 het 1015 hom 28 6 10 12 T 16 17 140481 CASAVA_Build 10 102650202 1D ATCATATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 32 1 14 17 T 12 11 140482 CASAVA_Build 10 102664059 1D GTGTGTGTGT G/- TTTTTTTTTA 1848 het 1848 ref 27 11 6 11 G 1 0 140483 CASAVA_Build 10 102676829 1D ATTTTTTGTG T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 T 7 6 140484 CASAVA_Build 10 102677059 2D TGAAATTGAC TG/-- TGTTTTAGTT 3070 het 3070 hom 50 22 22 9 TG 2 1 140485 CASAVA_Build 10 102682005 1D ACATCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 A 13 12 140486 CASAVA_Build 10 102682621 1D TTGCGGTTAA G/- GTAAGATCCA 3070 het 3070 hom 51 23 25 4 G 2 1 140487 CASAVA_Build 10 102686613 2D TGAAAGTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 13 11 140488 CASAVA_Build 10 102714837 2D GTCCTATGAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 26 8 9 9 TG 8 7 140489 CASAVA_Build 10 102723698 1I AAGTGTTTTA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 T 6 7 140490 CASAVA_Build 10 102734685 4D ACATGTGGTA ACAC/---- ACACCTGTAT 3070 het 3070 hom 58 27 27 5 AC 4 2 140491 CASAVA_Build 10 102739924 6D GGGCATGGTG ATGGCA/------ TATGCCTGTG 3070 hom 81 het 28 0 27 1 ATGGCA 1 0 140492 CASAVA_Build 10 102762339 2I ATGCGGAAAC --/TG AGGCTCAGAG 3070 hom 93 het 38 0 30 8 TG 0 1 140493 CASAVA_Build 10 102763763 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1161 hom 14 het 8 0 5 3 T 15 14 140494 CASAVA_Build 10 102765340 1D GCTGGGTGAC T/- GAAGGACCGT 2867 het 2867 ref 27 12 9 6 T 1 0 140495 CASAVA_Build 10 102770345 1D CTCCAACCTT G/- GGAGATCTGA 1944 het 1944 ref 24 6 8 11 G 3 2 140496 CASAVA_Build 10 102778350 1D TTTCCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2842 het 2496 hom 25 9 11 6 A 15 14 140497 CASAVA_Build 10 102779134 1I GTATAGAATT -/G GTGCTCCATG 3070 het 107 hom 42 1 36 5 G 1 2 140498 CASAVA_Build 10 102781342 1I CCTCCTCCTC -/T TGTCAGAAGG 1460 het 1460 ref 32 19 5 8 T 1 2 140499 CASAVA_Build 10 102809783 1D GCATTTTTAC G/- GTATGTAGGG 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 G 2 1 140500 CASAVA_Build 10 102810236 2I CCCGGACTTG --/TT TCTGCTCTGT 3070 hom 96 het 35 0 30 5 T 1 3 140501 CASAVA_Build 10 102825362 2D CTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 53 16 18 20 CA 9 8 140502 CASAVA_Build 10 102838148 1I CCACTGCTCC -/G TCTGACCACT 3070 het 2329 hom 25 7 12 6 G 0 1 140503 CASAVA_Build 10 102838971 2I GTGATGCCCT --/CA CAGTATTCCC 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 CA 1 2 140504 CASAVA_Build 10 102843607 1D ACACAGCCAC G/- GGCCAGACAC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 G 3 2 140505 CASAVA_Build 10 102863850 5D GGAAGAAAGG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 1970 het 1970 ref 18 10 5 3 AAAGA 5 4 140506 CASAVA_Build 10 102898427 1D AACCATTGTC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 9 8 140507 CASAVA_Build 10 102952070 1D AAATGAATAC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 A 8 7 140508 CASAVA_Build 10 102960458 1I GTAAGCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 22 0 16 6 T 13 14 140509 CASAVA_Build 10 102960565 1D GCAATTCTCC T/- GCTTCAGCCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 1 0 140510 CASAVA_Build 10 102985499 1D TGTGTGTGTT G/- GGGGGGGGGG 1939 hom 12 het 16 0 8 8 G 11 10 140511 CASAVA_Build 10 102995210 4D TTGTGTGTTT GTTC/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 GTTC 1 0 140512 CASAVA_Build 10 103001501 1I CATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 25 11 14 T 9 10 140513 CASAVA_Build 10 103007649 1D TTTCTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 1287 het 1287 ref 17 8 4 5 T 10 9 140514 CASAVA_Build 10 103011155 1D CCAGGAAGTG C/- CCCCCCCCAT 2965 het 1018 hom 17 4 8 6 C 9 8 140515 CASAVA_Build 10 103015285 2D TATAGTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 1721 het 579 hom 24 7 9 8 T 18 16 140516 CASAVA_Build 10 103028518 1D TTATTGAAGC T/- TTTTTTTTTT 1602 het 1602 ref 19 13 4 2 T 12 11 140517 CASAVA_Build 10 103035954 2D AACTACCCTC TT/-- TTTCCTATCT 1545 het 1545 ref 11 6 5 2 T 5 3 140518 CASAVA_Build 10 103043882 1D TTTTGAAGTA T/- TGAGTTTGAG 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 T 2 1 140519 CASAVA_Build 10 103051092 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 2795 hom 30 10 13 7 T 7 6 140520 CASAVA_Build 10 103059270 6I AACAAATACT ------/TAAGTA TAAGTATATC 3070 het 2607 hom 22 7 8 7 TAAGTA 1 2 140521 CASAVA_Build 10 103083128 1D GTGTTCCTGG C/- CCCCAACTTC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 C 5 4 140522 CASAVA_Build 10 103101874 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTTTTTTTGT 2672 het 598 hom 37 7 12 18 TTA 1 0 140523 CASAVA_Build 10 103102300 3D TATTTCTTGA GAT/--- GATGTCTGCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GAT 2 1 140524 CASAVA_Build 10 103112147 1I GTGCAAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 13 6 T 13 14 140525 CASAVA_Build 10 103113880 3D GGTAAGATGC TTA/--- TTATGACAAC 3070 hom 117 het 41 0 40 3 TTA 2 1 140526 CASAVA_Build 10 103114251 1I TTTTAACAGC -/T TTTCCATCTC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 3 4 140527 CASAVA_Build 10 103120912 1D ACCACTATTC T/- TTTTTTTTTG 2267 hom 27 het 27 0 11 16 T 10 9 140528 CASAVA_Build 10 103128545 8I GTGCTAGAAT --------/TACAGGCA TGAACCACTG 3070 hom 90 het 31 0 30 1 TACAGGCA 0 1 140529 CASAVA_Build 10 103130878 5I TGGTGATAAT -----/AATAA AATAACAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AATAA 1 2 140530 CASAVA_Build 10 103132269 1I ATATGCTGTG -/T TTTTTTTTTT 1851 het 1851 ref 47 35 5 7 T 10 11 140531 CASAVA_Build 10 103135577 1I ATCTAGCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 352 hom 28 1 21 6 T 10 11 140532 CASAVA_Build 10 103140244 4I GCCACCACGC ----/CCGG CTAATTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 CCGG 0 1 140533 CASAVA_Build 10 103140513 4D TTGTCTTAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 AAAG 5 4 140534 CASAVA_Build 10 103146501 3D TTGTTGATGT TTG/--- TTTTTACATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTG 1 0 140535 CASAVA_Build 10 103150168 2I GCTGAGTATC --/AG GGGATCCTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AG 0 1 140536 CASAVA_Build 10 103155782 2D GCTCTCAAAC TA/-- TGTAGATTTG 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 TA 1 0 140537 CASAVA_Build 10 103160449 1I TTGAGTTGTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 7 8 140538 CASAVA_Build 10 103161462 4I70M1D TCATTGTCAG ----TTTTTTTCTGGGTCTGCTTCCATTGACTGATAGTCCTCCTAGTTATGAATCATATTTTGTGCCTCTTGTCT/TTTTTTTTTTTCTGGGTCTGCTTCCATTGACTGATAGTCCTCCTAGTTATGAATCATATTTTGTGCCTCTTGTC- TGTAATTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 20 N/A 0 0 140539 CASAVA_Build 10 103168249 4D ATGAATACTT AATA/---- CTTATTTTCA 3070 hom 54 het 21 0 18 6 AATA 1 0 140540 CASAVA_Build 10 103176781 2D TCCGAATGAC TG/-- TGAGATTTTT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 TG 2 1 140541 CASAVA_Build 10 103181882 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 44 1 37 6 T 13 12 140542 CASAVA_Build 10 103199745 1I ATAAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1138 hom 30 3 22 5 A 12 13 140543 CASAVA_Build 10 103203875 1D AAAACAAAAC T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 8 7 140544 CASAVA_Build 10 103205916 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 13 1 8 4 A 13 12 140545 CASAVA_Build 10 103209976 1D CTTTACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 10 14 6 A 11 10 140546 CASAVA_Build 10 103211861 3D AACAAAAGAC AGG/--- AGGAAACCCT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AGG 2 1 140547 CASAVA_Build 10 103213696 1D AGGAAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 11 10 140548 CASAVA_Build 10 103228529 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 14 0 12 2 A 15 14 140549 CASAVA_Build 10 103228956 3D CTATCTTTGC CCT/--- CCTCCTTTTC 3070 hom 99 het 34 0 33 1 CCT 3 2 140550 CASAVA_Build 10 103233906 2I TTGTTGTCAC --/TG TGTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 TG 1 2 140551 CASAVA_Build 10 103236191 1D TTTCTCAGGG A/- AAAAAAAAAA 1125 het 26 hom 27 1 5 22 A 12 11 140552 CASAVA_Build 10 103239852 1I CCCACCCCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 10 140553 CASAVA_Build 10 103240806 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 20 1 14 5 A 15 14 140554 CASAVA_Build 10 103245756 1I TCATATAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 28 1 19 8 T 13 14 140555 CASAVA_Build 10 103250935 1I ACTGCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 545 hom 32 2 23 7 A 13 14 140556 CASAVA_Build 10 103260257 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 16 hom 23 1 18 4 A 9 10 140557 CASAVA_Build 10 103264211 1D CCCTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 28 3 17 8 T 14 13 140558 CASAVA_Build 10 103268594 6I ATCTCTAACC ------/ACTTAG ACTTAAATAA 3070 hom 141 het 52 0 47 6 ACTTAG 0 1 140559 CASAVA_Build 10 103270715 1I CTCCAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 2281 het 2281 ref 25 12 7 6 A 9 10 140560 CASAVA_Build 10 103277106 2I CAAATGCCTC --/AG AGATTTTTAT 3070 hom 32 het 14 0 11 3 AG 1 2 140561 CASAVA_Build 10 103278045 1D GATGGATGTG A/- AAATGCCAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 4 3 140562 CASAVA_Build 10 103281466 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 33 0 25 8 A 9 8 140563 CASAVA_Build 10 103335931 5D AGATGACTAC TGTTG/----- TAACTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 16 23 13 TGTTG 1 0 140564 CASAVA_Build 10 103343926 23I CTGAACACAT -----------------------/AGGTTTGGTTTTAGGAAGTGGGG AGAGAGATAA 3070 het 3070 ref 53 26 23 7 AGGTTTGGTTTTAGGAAGTGGGG 0 1 140565 CASAVA_Build 10 103347998 1I CACCTCACTT -/A ATCCAGCCCT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 1 2 140566 CASAVA_Build 10 103357471 2I CCTCTCACTT --/GA GAGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 GA 1 2 140567 CASAVA_Build 10 103392134 1D CCTATCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3031 hom 27 8 9 10 T 11 10 140568 CASAVA_Build 10 103413384 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2429 hom 33 9 14 10 A 14 15 140569 CASAVA_Build 10 103416673 1I AAAAAGAATG -/A AAAAAAAAAC 2669 het 2481 hom 17 9 7 1 A 9 10 140570 CASAVA_Build 10 103419507 1I GGGAGTGGAC -/T TTTTTTTTTT 2693 het 1732 hom 22 5 10 7 T 13 14 140571 CASAVA_Build 10 103438882 1I TTCCAGGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 776 hom 55 3 45 7 A 12 13 140572 CASAVA_Build 10 103452680 5D TATAATGAAC AGTAG/----- AGTAAGTAAG 3070 het 3070 hom 33 15 14 6 AGTAG 1 0 140573 CASAVA_Build 10 103464626 6D CATTGGTCTA TGTGTC/------ TGTGTCTGTT 3070 hom 42 het 15 0 15 3 TGTGTC 2 1 140574 CASAVA_Build 10 103472020 1D CCCTATCTCT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 91 het 39 0 27 12 A 9 8 140575 CASAVA_Build 10 103476297 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTCGAG 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 6 7 140576 CASAVA_Build 10 103478478 35D15M1I CAGCACTTTG GGATATGCATACATAGATTTACATACATATACAAAGGAGGCTGAGGCAGG-/-----------------------------------GGAGACCAAGGCAGGT GGATCACCCG 3070 het 3070 ref 26 23 12 3 N/A 0 0 140577 CASAVA_Build 10 103543998 1D GAAAGTAAGT C/- CCAAGTTTGT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 C 3 2 140578 CASAVA_Build 10 103590298 1D CCCCCCCGCA C/- CCCCCCCCCA 706 hom 8 het 8 0 4 4 C 10 9 140579 CASAVA_Build 10 103601790 1D TCCAAGATGG A/- AATCAGCCCC 3070 hom 122 het 44 0 39 5 A 3 2 140580 CASAVA_Build 10 103619036 5D TTATAGAAAA CAACT/----- CAACAACAAG 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 CAACT 1 0 140581 CASAVA_Build 10 103624980 1D AAAGTGACTG A/- AAAAAAAAAA 778 het 778 ref 39 30 2 7 A 12 11 140582 CASAVA_Build 10 103633164 1I CCTTGTCTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 A 9 10 140583 CASAVA_Build 10 103634541 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 1008 het 1008 ref 36 20 4 12 A 9 10 140584 CASAVA_Build 10 103669650 1D CTTCTGGAGA G/- TCCGCCTGGC 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 G 1 0 140585 CASAVA_Build 10 103693185 1D GTAATGGGAC A/- AATTAGCCTA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 3 2 140586 CASAVA_Build 10 103698059 1D GATCAGTTAA G/- TCCAAGAGTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 G 1 0 140587 CASAVA_Build 10 103729261 3I CAGAAGAGTA ---/ACT ACTACTACTG 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 ACT 3 4 140588 CASAVA_Build 10 103735063 2I ATGTATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 AT 5 6 140589 CASAVA_Build 10 103741142 1D ATTTGAAATC T/- TTTTTTTTTT 927 het 927 ref 30 19 3 8 T 12 11 140590 CASAVA_Build 10 103746451 1I ATACAAAACT -/A AGGCTTATTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 1 2 140591 CASAVA_Build 10 103772935 1D AATCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2311 hom 24 het 17 0 8 9 A 17 16 140592 CASAVA_Build 10 103804136 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1111 het 1111 ref 19 8 4 7 A 17 16 140593 CASAVA_Build 10 103814546 2I CTTCCTTCCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 TC 7 8 140594 CASAVA_Build 10 103823281 1I TAGAGGTGAG -/C CCCCCCCAAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 C 7 8 140595 CASAVA_Build 10 103845592 1D CTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 22 3 14 5 T 15 14 140596 CASAVA_Build 10 103892049 2D GAGGTTTCAC TA/-- TGTTGGCCAG 2379 het 489 hom 7 1 5 1 TA 1 0 140597 CASAVA_Build 10 103971821 8D CCATCGCAAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 1930 het 1930 ref 24 15 7 3 AAAC 4 2 140598 CASAVA_Build 10 104000756 1D AGTGATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 13 12 140599 CASAVA_Build 10 104006310 4D TTGCCCAGGC TGGA/---- TGGAGTACAG 2519 het 2519 ref 29 18 8 3 TGGA 2 1 140600 CASAVA_Build 10 104031841 2D ACCCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1001 hom 10 het 4 0 4 0 T 14 12 140601 CASAVA_Build 10 104035942 1D AGCATAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 38 2 24 13 T 23 22 140602 CASAVA_Build 10 104036619 2D CACCCTTACA GT/-- GGCTGCCTTG 3070 hom 147 het 50 0 47 3 GT 1 0 140603 CASAVA_Build 10 104038075 8D AGACTGAGAT ATATAATG/-------- ATATAATGAT 3070 hom 62 het 24 0 21 10 ATATAATG 2 1 140604 CASAVA_Build 10 104038853 2D TCTGTCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 27 2 12 13 A 16 14 140605 CASAVA_Build 10 104043148 4D ATTACTAGTT TATC/---- TATTTCATAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TATC 1 0 140606 CASAVA_Build 10 104046805 1I AAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 215 hom 34 2 28 4 A 8 9 140607 CASAVA_Build 10 104062043 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1965 hom 39 12 13 14 A 15 14 140608 CASAVA_Build 10 104068223 1I CAGGCATGAG -/C CACCGTGCCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 2 140609 CASAVA_Build 10 104082135 1I GTAATTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 653 hom 34 3 18 13 T 13 14 140610 CASAVA_Build 10 104087043 8I AAGAATGGTG --------/CGAACCCA CGTGGGGGAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 CGAACCCA 0 1 140611 CASAVA_Build 10 104093547 1D TCTGTCTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1197 hom 26 5 13 8 A 17 16 140612 CASAVA_Build 10 104101531 3I CCTCTCTCTT ---/ACC ACCCTTGAGT 3070 het 3070 hom 66 23 33 10 ACC 1 2 140613 CASAVA_Build 10 104138677 4D AAATCTGCTC CTCT/---- CTCAGTGTGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 CT 3 1 140614 CASAVA_Build 10 104146381 1I AGTGCTGTAG -/T TTTGGTTCAG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 3 4 140615 CASAVA_Build 10 104161037 19I TCCGTCAGCA -------------------/AGGACCTATCCCTCTTCTC AGGACCCGTC 3070 hom 95 het 38 0 30 8 AGGACCTATCCCTCTTCTC 0 1 140616 CASAVA_Build 10 104179569 1D AGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 23 1 11 11 T 15 14 140617 CASAVA_Build 10 104180394 1I CTCCCTCCCT -/C CCTCCTGTTT 3070 hom 84 het 33 0 26 7 C 2 3 140618 CASAVA_Build 10 104193812 1I TACTTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 22 1 17 4 T 11 12 140619 CASAVA_Build 10 104196091 10I CAGAGAAGCC ----------/ATCCCTGATT ATCTTATTCT 3070 hom 72 het 28 0 23 5 ATCCCTGATT 0 1 140620 CASAVA_Build 10 104196825 3D ATATATATAT ATA/--- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 ATA 1 0 140621 CASAVA_Build 10 104199396 3I TTATTGTTTT ---/TTG TTTTTTTGTT 3070 hom 40 het 25 0 23 2 TTG 0 1 140622 CASAVA_Build 10 104204379 1I CAGGTAAACA -/C GTGAACAAAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 0 1 140623 CASAVA_Build 10 104205066 4D ATCTGATCTC TCTT/---- TCTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 TCTT 2 1 140624 CASAVA_Build 10 104205364 1I TAAAAATGCT -/G GGGGGGCACT 2973 het 2973 ref 24 13 7 4 G 6 7 140625 CASAVA_Build 10 104217408 1D GTGCTTCTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 40 het 18 0 14 6 T 7 6 140626 CASAVA_Build 10 104217782 1D TTTGGGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 11 6 A 11 10 140627 CASAVA_Build 10 104219048 1I CCACCCAGTC -/A AGAGGCCTGG 3070 hom 97 het 37 0 26 11 A 1 2 140628 CASAVA_Build 10 104219299 2I AGGTTTTTTT --/TG GTTTTTTTTT 2744 hom 24 het 15 0 9 6 TG 0 1 140629 CASAVA_Build 10 104220921 11D AAGTCTGATT TCGGTGCTGGG/----------- TCCCCGGCTG 3070 hom 47 het 20 0 12 8 TCGGTGCTGGG 1 0 140630 CASAVA_Build 10 104236700 1D TACCCGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 20 2 12 6 T 13 12 140631 CASAVA_Build 10 104248072 3I TCTCTCTCTC ---/TCT TTTTTTTTTT 846 het 574 hom 34 4 9 21 TCT 0 1 140632 CASAVA_Build 10 104281406 1D TCAGGGTCCC A/- AATAAGGGAT 3070 hom 119 het 45 0 38 7 A 3 2 140633 CASAVA_Build 10 104307799 1I GGCATGCACC -/A AACATGCCTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 2 3 140634 CASAVA_Build 10 104310155 1D CATCTCTGCT A/- AAAAAAAAAT 918 het 759 hom 5 2 3 0 A 10 9 140635 CASAVA_Build 10 104345345 3I AAGGGCTGTT ---/CTC CTTCCTAGTC 3070 hom 141 het 54 0 46 8 CTC 0 1 140636 CASAVA_Build 10 104355480 1D TTCTTTCTCT G/- GAAAGTTCAG 3070 hom 72 het 32 0 22 10 G 2 1 140637 CASAVA_Build 10 104365725 2D AGTCTCAGGT GC/-- CCCCAGCCAC 3070 hom 62 het 23 0 19 4 GC 1 0 140638 CASAVA_Build 10 104405084 1D AGGACCAGGC T/- GGTGGCACCC 3070 hom 73 het 29 0 25 4 T 1 0 140639 CASAVA_Build 10 104405801 11D TCTCCCCGGG CTCTCCCTGGA/----------- CTGCCTTTTC 2474 hom 37 het 14 0 10 6 CTCTCCCTGGA 1 0 140640 CASAVA_Build 10 104425585 2I CCAGCACTGT --/TA AAAAATTGAT 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 TA 0 1 140641 CASAVA_Build 10 104449070 2D CCATGTTTCT AA/-- CACATGGCAG 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 2 0 140642 CASAVA_Build 10 104457918 1D AAAGGCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 11 10 140643 CASAVA_Build 10 104483641 1D TGTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 37 0 27 10 T 12 11 140644 CASAVA_Build 10 104486001 1D GGTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 23 6 T 12 11 140645 CASAVA_Build 10 104491922 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 32 hom 28 1 21 6 T 10 9 140646 CASAVA_Build 10 104496357 1D GGGTTTTTTT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 78 het 32 0 25 7 G 8 7 140647 CASAVA_Build 10 104501070 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2717 hom 28 het 20 0 9 11 T 13 14 140648 CASAVA_Build 10 104507766 1I CTGAGTAGCT -/G GGACTACAGG 1354 hom 10 het 4 0 4 0 G 2 3 140649 CASAVA_Build 10 104516579 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 13 11 140650 CASAVA_Build 10 104521307 1I CCAGACATGG -/T TGGCTCATGC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 1 2 140651 CASAVA_Build 10 104529449 1I CCGGCCACAC -/T TTTGAGAGAC 3070 hom 50 het 19 0 16 3 T 3 4 140652 CASAVA_Build 10 104534620 8D CTTTTTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTAG 2190 hom 18 het 8 0 7 2 T 16 8 140653 CASAVA_Build 10 104549072 1D GGCTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1383 het 1383 ref 20 13 4 3 A 13 12 140654 CASAVA_Build 10 104550146 1I AAGCCAGGGC -/A AGGGGGGTGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 2 140655 CASAVA_Build 10 104555983 2D ACAATAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 7 A 13 11 140656 CASAVA_Build 10 104557043 12I ATTAGGAAAT ------------/AGAGGTAAGCAA AGAACAAAGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AGAGGTAAGCAA 0 1 140657 CASAVA_Build 10 104558289 1D AGGAAGAAGC G/- GCTGCTAATG 3070 hom 96 het 35 0 30 5 G 2 1 140658 CASAVA_Build 10 104558628 1D GGGCACTAAG A/- AAGTGAAGCA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 3 2 140659 CASAVA_Build 10 104565403 2I TCCTTCCACC --/TT TTTTTTTATT 3070 hom 89 het 32 0 29 3 T 7 9 140660 CASAVA_Build 10 104573017 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1369 hom 36 6 18 12 T 14 15 140661 CASAVA_Build 10 104580827 35D GCCCTGCCCA GGGAACCCTGATCTGAGGATGTAGCCTTATTATGG/----------------------------------- GGGAACCCCC 3070 hom 84 het 29 0 26 6 GGGAACCCTGATCTGAGGATGTAGCCTTATTATGG 1 0 140662 CASAVA_Build 10 104608895 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3039 het 663 hom 22 5 9 8 T 14 13 140663 CASAVA_Build 10 104611465 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 9 8 8 A 10 9 140664 CASAVA_Build 10 104619784 3I GCAGTCACAG ---/CTC CTCTTCTCCC 2959 het 2959 ref 24 13 7 4 CTC 1 2 140665 CASAVA_Build 10 104625749 1D TATCTATATA G/- AAATGATTTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 1 0 140666 CASAVA_Build 10 104626089 1D CTGAGTTAGA G/- GGGTCCAGAT 3070 hom 35 het 26 0 16 10 G 4 3 140667 CASAVA_Build 10 104629642 2D TTTATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 TA 8 7 140668 CASAVA_Build 10 104630050 1D TTGTTTTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 T 9 8 140669 CASAVA_Build 10 104666944 1D TCAAGGAAAA G/- ACCAATTTGG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 G 1 0 140670 CASAVA_Build 10 104670448 1D AAGTATCGCC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 A 8 7 140671 CASAVA_Build 10 104676872 4D ATTAGATGCG TAGT/---- TACTTATAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 TAGT 1 0 140672 CASAVA_Build 10 104678330 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1057 het 442 hom 15 3 3 9 A 17 16 140673 CASAVA_Build 10 104681104 2D TCCTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2138 het 265 hom 29 5 8 16 T 18 16 140674 CASAVA_Build 10 104687119 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 15 21 11 A 13 12 140675 CASAVA_Build 10 104687534 1D TACAGAAACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 10 9 140676 CASAVA_Build 10 104690259 1D TCCGCCTCCC G/- GGTTCACACC 2125 hom 12 het 5 0 5 0 G 3 2 140677 CASAVA_Build 10 104691030 5I TATAAAAAAT -----/TATAA TACGTAGTAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TATAA 0 1 140678 CASAVA_Build 10 104697202 1D AAAAATGAAG A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 8 7 140679 CASAVA_Build 10 104698627 4I TTTCAATGAT ----/ACTG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 ACTG 0 1 140680 CASAVA_Build 10 104710645 1I TGATTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 2081 het 1442 hom 27 6 9 12 T 13 14 140681 CASAVA_Build 10 104711712 2D AAAAACAAAC TT/-- ATGACTTGAA 3070 het 3070 ref 25 17 8 0 T 2 0 140682 CASAVA_Build 10 104717862 2D TATAGTAAGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 AT 6 5 140683 CASAVA_Build 10 104723564 1D TTCATGTATT C/- CCCCCCCCCC 3053 het 107 hom 25 3 10 12 C 11 10 140684 CASAVA_Build 10 104729544 1D ACTTAATTTT A/- ATTTTTATTA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 2 1 140685 CASAVA_Build 10 104733520 1D AAATTGTAAA T/- TTTTTTTTTT 2287 het 1597 hom 16 6 7 3 T 13 12 140686 CASAVA_Build 10 104736365 1I ATGTCTCTAC -/T TTAAAAAAAA 945 het 945 ref 11 8 3 0 T 2 3 140687 CASAVA_Build 10 104752864 1I TGTGTGAATC -/T TTTTTTTTTT 2765 het 433 hom 24 1 15 8 T 15 16 140688 CASAVA_Build 10 104759687 2D AATTTAAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2839 hom 47 9 21 17 T 13 11 140689 CASAVA_Build 10 104761202 5I TCCATCTCAA -----/AAAAT AAAATAAAAG 3070 het 2800 hom 20 7 11 2 AAAAT 1 2 140690 CASAVA_Build 10 104764640 1D CCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 12 7 A 14 13 140691 CASAVA_Build 10 104765222 3I TTTATAACAC ---/TTT TTACAAATTA 3070 het 3070 ref 42 18 21 3 T 2 5 140692 CASAVA_Build 10 104770538 10D GAAGGGGCGA AGGGCGCATG/---------- AGGGTGTAGG 3070 het 3070 ref 40 19 20 3 AGGGCGCATG 1 0 140693 CASAVA_Build 10 104771509 3I TCTTTCCCCC ---/AGA AGAATACAAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AGA 1 2 140694 CASAVA_Build 10 104778732 1I ACCATGCCCA -/G CTAACTTTTG 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 G 0 1 140695 CASAVA_Build 10 104781586 1D TACAAAATGC G/- GGGGGGGCGT 3070 het 2376 hom 30 8 12 11 G 8 7 140696 CASAVA_Build 10 104809498 1D CAGGCATACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 10 9 140697 CASAVA_Build 10 104811614 1I GGAAAGTAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 A 9 10 140698 CASAVA_Build 10 104832527 2I TGGAGGCAGG --/TC TCTCCTACCT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 TC 2 3 140699 CASAVA_Build 10 104836210 4I AAATATGTAG ----/TTGT TTGTCTCAGG 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 TTGT 1 2 140700 CASAVA_Build 10 104842106 4I AAGGCTGTCA ----/TGTC TGTCTATCTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 TGTC 1 2 140701 CASAVA_Build 10 104842650 5I CAACATTCTA -----/AACTT AACTTAACCT 3070 het 3070 hom 48 14 30 4 AACTT 1 2 140702 CASAVA_Build 10 104843995 1I ACGGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 940 hom 27 4 16 7 A 12 13 140703 CASAVA_Build 10 104844760 1I AAATTACAAT -/A ACTTATTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 1 2 140704 CASAVA_Build 10 104869552 1D TTCATTAAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 9 8 140705 CASAVA_Build 10 104873595 1I CTTCGAAATT -/G GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 G 8 9 140706 CASAVA_Build 10 104873959 1D TCATAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 T 13 12 140707 CASAVA_Build 10 104886968 1I AGAGACTATA -/G GATTTTCTTC 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 G 1 2 140708 CASAVA_Build 10 104899737 9I TATCCTTTTG ---------/AATATGAAC AATCAACAAC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 AATATGAAC 0 1 140709 CASAVA_Build 10 104915423 1D CCCAAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 10 5 T 13 12 140710 CASAVA_Build 10 104918762 1D GTTTCTATTT A/- AAATTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 4 3 140711 CASAVA_Build 10 104919366 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAATTA 2244 het 2244 ref 20 12 6 2 A 8 7 140712 CASAVA_Build 10 104924387 2D TCTAGCAACC AA/-- AGACATTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 A 3 1 140713 CASAVA_Build 10 104933020 27D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATCACAC/--------------------------- ACTCCTTCCC 2828 het 1095 hom 15 5 7 7 ATATATATATATATATATATATCACAC 1 0 140714 CASAVA_Build 10 104934758 2I CAAAAAAGAC --/TG TAATTTTGCT 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 TG 0 1 140715 CASAVA_Build 10 104938786 7D AGAGCCTGCT TGTACTA/------- TGTGCTTGGA 3070 het 3070 ref 34 17 9 10 TGTACTA 1 0 140716 CASAVA_Build 10 104941457 1D TCCTTCAGAA C/- CCCCCCCACT 3070 het 1608 hom 20 6 10 4 C 8 7 140717 CASAVA_Build 10 104949588 1D TTACCACAGT A/- AAAAAAAAAA 1514 het 1514 ref 41 28 4 10 A 15 14 140718 CASAVA_Build 10 104951396 4D CTCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 AAAC 4 3 140719 CASAVA_Build 10 104952002 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAATATAA 2073 het 2073 ref 15 10 5 1 A 5 6 140720 CASAVA_Build 10 105019381 4I ATTAATTTAT ----/TTAA TTAATTAATT 1460 het 1188 hom 10 4 4 2 TTAA 2 3 140721 CASAVA_Build 10 105055836 1I14M1I GGCTGCATCC -GCAAGCAATCCACC-/AGCAAGCAATCCACCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 N/A 0 0 140722 CASAVA_Build 10 105074076 1D TTGACTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2312 hom 22 7 13 2 A 13 12 140723 CASAVA_Build 10 105092667 2I ACATAACAAA --/TG TCTCTTGCCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TG 0 1 140724 CASAVA_Build 10 105095256 1D GTGCTACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2419 hom 30 12 9 9 T 13 12 140725 CASAVA_Build 10 105097753 1D TAGTATTTTT C/- CCTCTCTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 C 3 2 140726 CASAVA_Build 10 105101391 1D TTCGAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 27 2 12 14 T 17 16 140727 CASAVA_Build 10 105108119 1I CCAGGATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 14 13 T 14 15 140728 CASAVA_Build 10 105108754 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 12 11 140729 CASAVA_Build 10 105119094 1I AAAAGTTGAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 8 9 140730 CASAVA_Build 10 105120993 1D CCGTCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 2657 het 2657 ref 26 13 9 5 A 15 14 140731 CASAVA_Build 10 105136816 4D GCCCACTCAG AACT/---- AACTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 16 8 5 AACT 2 1 140732 CASAVA_Build 10 105142390 1I GCCTTCCTGA -/T AAGAAAAGCT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 0 1 140733 CASAVA_Build 10 105159074 1I TTTTTTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 10 11 140734 CASAVA_Build 10 105181387 1I TCATTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 A 11 12 140735 CASAVA_Build 10 105185778 1D TGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1388 het 1388 ref 32 12 3 17 T 15 14 140736 CASAVA_Build 10 105203156 3I CTTCTCTTTA ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 het 6 hom 19 1 13 5 TTC 5 6 140737 CASAVA_Build 10 105215642 1I CCAGCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 1846 het 769 hom 17 5 7 5 T 15 16 140738 CASAVA_Build 10 105217517 1D TCCAATCGTA T/- TTCTGCGTGG 3070 het 3070 ref 38 20 12 7 T 3 2 140739 CASAVA_Build 10 105224197 4I CTCTCATCTT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 2626 hom 27 8 9 10 TTTA 4 5 140740 CASAVA_Build 10 105244556 2D TGGGTCGTCC GT/-- GTCTCCAGGG 3070 hom 90 het 36 0 28 8 GT 2 1 140741 CASAVA_Build 10 105269514 1I CCAGCAATAG -/T TTTTTTGTTG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 6 7 140742 CASAVA_Build 10 105271688 2I GAGTCAGTGA --/AG AGAGATAGGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AG 2 3 140743 CASAVA_Build 10 105272201 1I CTAATAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 104 hom 12 1 9 2 A 12 13 140744 CASAVA_Build 10 105275945 1I TGTAGCTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 53 het 36 0 29 7 T 8 9 140745 CASAVA_Build 10 105276676 1I TGGTATCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 283 hom 25 1 19 5 T 13 14 140746 CASAVA_Build 10 105277048 1I TTTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 36 2 24 10 T 12 13 140747 CASAVA_Build 10 105280567 1I GGATTACAGG -/C ATGAGCCACC 3070 hom 30 het 17 0 12 5 C 0 1 140748 CASAVA_Build 10 105290212 1D AATTTTTGTA T/- TTTTAGTACA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 5 4 140749 CASAVA_Build 10 105301819 3I GGGGCAGGAG ---/TGA TGATGTGAAG 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 TGA 1 2 140750 CASAVA_Build 10 105309953 1D ATGGGGAGCT A/- GGGGTGCTGA 3070 het 3070 ref 42 18 17 8 A 1 0 140751 CASAVA_Build 10 105311010 1D TCTGTATTCC T/- TTTTTTTTTT 1581 het 1581 ref 25 12 5 8 T 15 14 140752 CASAVA_Build 10 105322740 1D GTTGAAAACC T/- TTTTTTTTTT 2408 het 2408 ref 43 26 7 10 T 12 11 140753 CASAVA_Build 10 105326061 2D TAGGTCAGAC AG/-- GGGGGTGTCC 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 AG 1 0 140754 CASAVA_Build 10 105363851 1I TTTTTTTTTT -/A AATTAGCTGG 3070 hom 59 het 24 0 18 6 A 2 3 140755 CASAVA_Build 10 105365402 1D TTCAGCCGGG T/- TTTCTCAGTC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 4 3 140756 CASAVA_Build 10 105368789 3D GCCCAAAAGC AGA/--- AGGAGGGTGA 3070 het 3070 hom 34 12 18 6 AGA 1 0 140757 CASAVA_Build 10 105377584 1D CCTCTGAGCA C/- CCCAGGTCTT 3070 hom 81 het 35 0 28 8 C 4 3 140758 CASAVA_Build 10 105382607 1D CTGTAGTCCC A/- AGTAACTCGA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 2 1 140759 CASAVA_Build 10 105390071 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 684 hom 21 6 11 4 A 13 12 140760 CASAVA_Build 10 105400492 13I CAGAGCAGAT -------------/TGTGCCATCCTTC TGAGTCCTAG 3070 hom 160 het 57 0 51 7 TGTGCCATCCTTC 0 1 140761 CASAVA_Build 10 105404724 3I GCCCAAGACT ---/GGG GGGCTAGCAT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 G 3 6 140762 CASAVA_Build 10 105407028 1I GTCCTAAGAA -/G GAAACAATCC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 G 1 2 140763 CASAVA_Build 10 105418444 2D GAGGAGAACC AG/-- AGAGAGAGAA 3070 hom 39 het 20 0 11 9 AG 5 4 140764 CASAVA_Build 10 105430985 1D TAAGAGACTT G/- GGAGTCCTGT 3070 hom 89 het 33 0 29 5 G 3 2 140765 CASAVA_Build 10 105444295 1D AAGGTCCAGG A/- AATCTGCATT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 A 3 2 140766 CASAVA_Build 10 105448412 1I CTAAAAGCAC -/T TTTTTAAGCT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 5 6 140767 CASAVA_Build 10 105451478 3D3M5D TCCATCCATC ATTCATCCAGC/---CAT----- CATCCATCCG 3070 het 3070 ref 82 29 18 45 N/A 0 0 140768 CASAVA_Build 10 105451550 1I TCCATCTATC -/A TTCATCCAGT 3070 het 3070 ref 74 31 23 20 A 0 1 140769 CASAVA_Build 10 105456948 1D TATATTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1972 hom 28 8 11 9 T 15 14 140770 CASAVA_Build 10 105467757 1I TCCATGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 901 hom 33 2 20 11 T 14 15 140771 CASAVA_Build 10 105468247 1I GGGCTGGGGG -/C GCTGGAGGGG 1300 het 1300 ref 23 12 4 7 C 0 1 140772 CASAVA_Build 10 105472349 2D TATGCCTAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 56 hom 45 1 27 17 T 17 15 140773 CASAVA_Build 10 105480028 1D ATTTTTTTTG T/- TTTTTAATTT 3070 hom 59 het 33 0 22 12 T 6 5 140774 CASAVA_Build 10 105483676 1D AATTTTAAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 80 het 33 0 26 7 T 10 9 140775 CASAVA_Build 10 105488729 1I TTTAGTAGAG -/A TGGGGTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 1 140776 CASAVA_Build 10 105492697 1D GAACCTCCCT C/- CCCCCCTCAA 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 C 7 6 140777 CASAVA_Build 10 105498901 14I GGCCTCCCAA --------------/AGTGCTGGGATTAC AGGTGGGAGC 3070 het 2322 hom 26 9 9 8 AGTGCTGGGATTAC 0 1 140778 CASAVA_Build 10 105499760 1I TTAAGCAGTT -/C CTGAATTCCT 3070 het 3070 hom 40 21 17 2 C 1 2 140779 CASAVA_Build 10 105500532 2I GGGCACGGGC --/TT TTTTTTTGTT 2820 het 2736 hom 18 7 8 3 T 7 9 140780 CASAVA_Build 10 105513461 1D GGCTACTGCT A/- GGGGCTTCCA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 1 0 140781 CASAVA_Build 10 105520130 1I GTTTAAAAAC -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 6 7 140782 CASAVA_Build 10 105533205 2D TCTGGGGGGC AG/-- AGTCTGAGAA 2820 het 2820 ref 37 21 9 9 AG 2 1 140783 CASAVA_Build 10 105538926 1D GGGGGAGGAT G/- GGGGGGGTAG 3070 het 2310 hom 39 8 21 11 G 8 7 140784 CASAVA_Build 10 105588318 1D TAATGTGTCA G/- AAGGCAGCAC 3070 hom 129 het 48 0 43 7 G 1 0 140785 CASAVA_Build 10 105591964 1I36M5I CGCCATTCAA -CCCCCATCTCATACACTATGTTTTTGACCTATTTTG-----/CCCCCCATCTCATACACTATGTTTTTGACCTAGTTTGTTATT TTATTGTATT 3070 hom 60 het 20 0 21 8 N/A 0 0 140786 CASAVA_Build 10 105597695 8D TCAAAAAAAA AAAAAACC/-------- AACTAAAACA 3070 hom 63 het 20 0 21 5 AAAAAACC 1 0 140787 CASAVA_Build 10 105602634 1D ACATGCAATG A/- AAAAAACCCA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 7 6 140788 CASAVA_Build 10 105609102 2I GACTCTCCCC --/CT GAGTTGTGTA 3070 hom 98 het 38 0 31 7 CT 0 1 140789 CASAVA_Build 10 105613128 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 17 6 A 14 13 140790 CASAVA_Build 10 105614938 1D CAGGGCAGAA G/- GTTGGAATGG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 G 2 1 140791 CASAVA_Build 10 105616461 4D TCTCCAACTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 84 het 34 0 25 10 TTTG 4 3 140792 CASAVA_Build 10 105631926 7I AAACTGTAAG -------/CAAGTGA CACTCATCCA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CAAGTGA 0 1 140793 CASAVA_Build 10 105633461 1D AGTCACCAAT C/- AATGTTATCT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 C 1 0 140794 CASAVA_Build 10 105636148 1I AGTCTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1258 hom 38 4 26 8 T 13 14 140795 CASAVA_Build 10 105638172 4I TGCTTCCTTC ----/TCTT TCTAACTAGT 3070 hom 153 het 54 0 51 3 TCTT 0 1 140796 CASAVA_Build 10 105639444 16D TTCTTTTTCC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 26 0 21 6 T 24 8 140797 CASAVA_Build 10 105647062 1I TCTGTCTCCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 29 1 19 9 A 10 11 140798 CASAVA_Build 10 105650509 4D TTCTCCACTT TCTC/---- TCTCTCATAC 3070 hom 50 het 30 0 22 11 TC 5 3 140799 CASAVA_Build 10 105657877 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 16 7 A 16 14 140800 CASAVA_Build 10 105658170 2I GCCGCTGGCC --/TT TTGTTTCAGC 3070 hom 87 het 32 0 28 4 T 2 4 140801 CASAVA_Build 10 105658637 1D ATGCAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 35 2 27 6 T 13 12 140802 CASAVA_Build 10 105660125 1D GCCCGTGTCT G/- GGGCTATAAG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 G 4 3 140803 CASAVA_Build 10 105660763 1I CTTCTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 896 hom 25 3 11 11 T 13 14 140804 CASAVA_Build 10 105666541 1I ATTCTAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1485 hom 36 6 20 10 A 13 14 140805 CASAVA_Build 10 105677503 1D TGTTTTCCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 421 hom 28 1 16 12 T 9 8 140806 CASAVA_Build 10 105693514 2I GTTTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 406 hom 44 2 33 9 GT 8 9 140807 CASAVA_Build 10 105696470 2D GGGATGAGCA GT/-- GTTAATGACA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 GT 2 1 140808 CASAVA_Build 10 105700495 1I TTTTTTTTTT -/C GAGATGGAGT 3070 hom 30 het 23 0 17 6 C 0 1 140809 CASAVA_Build 10 105706825 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAATA 1046 hom 5 het 14 0 7 7 A 8 9 140810 CASAVA_Build 10 105709179 1D TATTACTCTG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 93 het 39 0 32 8 A 8 7 140811 CASAVA_Build 10 105712937 1I ACAAAGATGC -/T TTGTATATGC 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 T 2 3 140812 CASAVA_Build 10 105721004 3D TTCTCTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 69 het 25 0 24 5 TTG 4 3 140813 CASAVA_Build 10 105722420 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 15 16 140814 CASAVA_Build 10 105723639 1D GTTTTTAAAG A/- ATTTTTAAGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 2 1 140815 CASAVA_Build 10 105725277 4I ATCATCTCTT ----/ACTC AGACTACTGC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 ACTC 0 1 140816 CASAVA_Build 10 105729987 3D GATTATTTAT TAA/--- TGCTTATTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 7 TAA 1 0 140817 CASAVA_Build 10 105764652 1D TAAGTTCATC T/- TTTTTTTTTT 873 het 873 ref 33 26 3 4 T 11 10 140818 CASAVA_Build 10 105771587 2D GGCAGGAAAC AT/-- AGAGATGAAA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 AT 1 0 140819 CASAVA_Build 10 105785636 4I GAGTACTGGA ----/GTGT GTGTATGGGA 2167 het 109 hom 43 1 13 29 GT 2 4 140820 CASAVA_Build 10 105787684 1D TCCTTCCCCT A/- AATTACAGAT 3070 hom 95 het 37 0 28 9 A 3 2 140821 CASAVA_Build 10 105791643 1D AGTTTCCTCC T/- CTGTAAACCA 3070 hom 108 het 44 0 34 10 T 1 0 140822 CASAVA_Build 10 105806330 1D ACGCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 A 12 11 140823 CASAVA_Build 10 105808682 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 16 1 12 3 A 13 12 140824 CASAVA_Build 10 105829675 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1968 het 8 hom 10 0 7 3 A 15 16 140825 CASAVA_Build 10 105835751 1I TGCTGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 148 hom 27 1 24 2 A 10 11 140826 CASAVA_Build 10 105856490 1D GGTACGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 43 2 19 22 T 17 16 140827 CASAVA_Build 10 105857167 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTAAGA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 7 6 140828 CASAVA_Build 10 105858047 11D AGCTGGGTTA CAGGTGTGTGC/----------- CACCATGCCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CAGGTGTGTGC 1 0 140829 CASAVA_Build 10 105942126 2D ATTGAATGGC CA/-- CAGAGATATG 3070 het 3070 ref 40 18 16 7 CA 2 1 140830 CASAVA_Build 10 105951429 1D TACTTTCACA T/- TTTTTTTTTT 2449 het 2449 ref 26 11 6 9 T 13 12 140831 CASAVA_Build 10 106106424 1I TTTTCTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3016 het 3016 ref 27 10 8 9 T 11 12 140832 CASAVA_Build 10 106158850 1D CCCGTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 174 hom 30 1 25 4 A 11 10 140833 CASAVA_Build 10 106159613 6I AAAAATCTTA ------/TCTTTG TCTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 TCTTTG 1 2 140834 CASAVA_Build 10 106169311 1D ATCTGTGTCC T/- TTTTTTTTTT 1416 het 1416 ref 35 18 5 13 T 13 12 140835 CASAVA_Build 10 106173293 1I TAAACAGGAG -/T TTTTTTTTTT 2748 het 2748 ref 30 11 11 8 T 13 14 140836 CASAVA_Build 10 106190097 1D GTTGAATTTT A/- AAAAAACCAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 A 7 6 140837 CASAVA_Build 10 106200726 1I TTAACATTTT -/G GGTTTCAGGA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 G 2 3 140838 CASAVA_Build 10 106201644 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2300 het 1870 hom 27 7 9 11 T 15 16 140839 CASAVA_Build 10 106219839 1I CTTGTCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2035 hom 21 8 10 3 T 10 11 140840 CASAVA_Build 10 106234095 1D GAACCCAAAT C/- TTGTGTATTC 3070 hom 144 het 52 0 49 4 C 1 0 140841 CASAVA_Build 10 106240985 1I ATGGTATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 54 0 33 21 T 10 11 140842 CASAVA_Build 10 106241974 1I CTTATTATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 68 het 31 0 23 8 T 9 10 140843 CASAVA_Build 10 106243059 1I AAGGAGGTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 9 10 140844 CASAVA_Build 10 106246278 3I GGCTCATGTG ---/AGA AGAAGAGAGA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AGA 2 3 140845 CASAVA_Build 10 106249899 1D ACTCCAGGCT G/- GGTGACAGAG 3070 hom 93 het 32 0 31 1 G 3 2 140846 CASAVA_Build 10 106252499 1D ATTCTGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 11 10 140847 CASAVA_Build 10 106255230 4D TCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 72 het 25 0 25 3 AAAC 4 3 140848 CASAVA_Build 10 106258043 1I TGAGAAGGGT -/C CCATCCTGAA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 C 2 3 140849 CASAVA_Build 10 106266340 21D GTTAGCTTGA AGTGGGGGGAAGCTTGAAGTT/--------------------- AGCCATGGAA 3070 hom 117 het 41 0 36 7 AGTGGGGGGAAGCTTGAAGTT 1 0 140850 CASAVA_Build 10 106268531 1D CTAGGAAGGG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 8 140851 CASAVA_Build 10 106269003 1I TGCTTCCTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 62 het 23 0 18 5 T 8 9 140852 CASAVA_Build 10 106278079 1I TTTTTTTAAG -/T TTTTTTTTCC 1167 het 1167 ref 15 6 6 3 T 8 9 140853 CASAVA_Build 10 106284869 3D AGATGGGGTT TCA/--- TCATGTTGGC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TCA 2 1 140854 CASAVA_Build 10 106297900 1I CATACCTGTT -/G GGTATCCTTT 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 G 2 3 140855 CASAVA_Build 10 106314841 2D AACAAACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 T 13 11 140856 CASAVA_Build 10 106316462 2D TGAGGTGATA TC/-- TCATTGTGGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TC 2 1 140857 CASAVA_Build 10 106318233 1D AGTGGTTCAG T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 T 7 6 140858 CASAVA_Build 10 106318786 3I GTTCATAGTA ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 hom 19 het 31 1 19 11 T 9 12 140859 CASAVA_Build 10 106331650 1D GGCACTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 46 0 36 10 T 11 10 140860 CASAVA_Build 10 106344972 3I ACCCAGGGTA ---/CTG CTGCTCAAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 CTG 1 2 140861 CASAVA_Build 10 106347070 1I AACTCTATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 15 16 140862 CASAVA_Build 10 106348458 1D TACAGGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 33 3 11 19 T 15 14 140863 CASAVA_Build 10 106364049 1D AGCAAGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 32 0 17 17 A 15 14 140864 CASAVA_Build 10 106374332 9D TTCAATTAAA AACAGAATG/--------- AACAGAATGA 3070 hom 100 het 36 0 34 2 AACAGAATG 2 1 140865 CASAVA_Build 10 106374777 2D AGCAACCACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 32 3 12 18 A 14 12 140866 CASAVA_Build 10 106376168 1I AATTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 25 0 22 3 A 10 11 140867 CASAVA_Build 10 106377020 1D AATTTATGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 10 9 140868 CASAVA_Build 10 106382789 1I GCCAAACTTT -/C TTAGAACTTC 3070 hom 120 het 49 0 40 9 C 0 1 140869 CASAVA_Build 10 106384341 1D CTAAGAAATG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 9 8 140870 CASAVA_Build 10 106387560 5I ACGAGACAAG -----/AGTTT TTATGGGTGT 3070 hom 51 het 30 0 15 15 AGTTT 0 1 140871 CASAVA_Build 10 106410050 4I TATCCTGCAT ----/CTAA CTGTGCATCC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 CTAA 0 1 140872 CASAVA_Build 10 106419643 1D ACACTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 11 10 140873 CASAVA_Build 10 106420627 1D TTGACAACTC T/- TTTCTGTCCT 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 T 4 3 140874 CASAVA_Build 10 106421258 1D AACTTAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 11 10 140875 CASAVA_Build 10 106431080 4D GTCATCCTCC CCCG/---- CCCGCCCCTG 3070 hom 63 het 27 0 17 12 CCCG 2 1 140876 CASAVA_Build 10 106438214 1I TGCCAGCCAG -/C CGTGGGCAGA 3070 hom 69 het 33 0 21 12 C 1 2 140877 CASAVA_Build 10 106440569 12D ACCAGGCAAG ACCCTGATAGCA/------------ ATAACTCAAT 3070 het 3070 ref 36 19 18 5 ACCCTGATAGCA 1 0 140878 CASAVA_Build 10 106450168 1D GGGAAACGTG T/- GTTCTGGCAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 1 0 140879 CASAVA_Build 10 106469739 1I TTTTTTTTTT -/A TATACTTTAA 3070 het 2178 hom 23 6 12 5 A 0 1 140880 CASAVA_Build 10 106500781 2I ACAAATTGGA --/AG AGACATACAA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 AG 1 2 140881 CASAVA_Build 10 106502701 1I ACCAAGCCAA -/G CCAACCAACC 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 G 0 1 140882 CASAVA_Build 10 106507976 2D GTGTGTTTGG AA/-- ACTGCTTTGT 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 A 3 1 140883 CASAVA_Build 10 106510656 1I ACAGATTACG -/T TTTTTTTTTT 1618 het 1618 ref 43 24 6 13 T 13 14 140884 CASAVA_Build 10 106513751 1D CAATTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1615 hom 26 5 11 10 T 15 14 140885 CASAVA_Build 10 106529886 1I GAGGAGGCAG -/T TTTTTTTTTT 2471 het 2471 ref 29 11 9 9 T 13 14 140886 CASAVA_Build 10 106535340 2I AAAATAAATT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 1134 hom 20 3 14 3 TA 0 1 140887 CASAVA_Build 10 106540090 4D GGAAACAAAA AGTC/---- AGCCATATTG 3070 het 3070 hom 48 23 23 3 AGTC 1 0 140888 CASAVA_Build 10 106565418 1D AATAGACACA C/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 C 1 0 140889 CASAVA_Build 10 106568782 1D GGAAAAGGTT A/- AATAACTAGG 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 3 2 140890 CASAVA_Build 10 106592487 1I GTAAGCTTCC -/T TTTTTTCCCT 3070 hom 107 het 40 0 33 7 T 6 7 140891 CASAVA_Build 10 106620188 1D TTGTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 40 2 30 8 T 11 10 140892 CASAVA_Build 10 106623986 2I GCATTTTCAG --/AT AGTTTCTAGT 3070 hom 138 het 51 0 46 5 AT 0 1 140893 CASAVA_Build 10 106630375 3I TAGGTTGCTA ---/CTT CTTCTGCCAA 3070 hom 85 het 33 0 26 7 CTT 1 2 140894 CASAVA_Build 10 106637097 1I ATGGCATGAG -/C CAAAATCTTG 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 C 1 2 140895 CASAVA_Build 10 106638301 1I AGTACTCACC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 59 25 25 9 T 8 9 140896 CASAVA_Build 10 106655094 17D TCTTCTTGCC TGTGTTGGAAAACACCA/----------------- TGTGTTGGAA 3070 het 3070 ref 48 33 21 4 TGTGTTGGAAAACACCA 1 0 140897 CASAVA_Build 10 106659540 1I TTTTCTGTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2796 hom 48 17 18 13 G 0 1 140898 CASAVA_Build 10 106672525 1I GGCATATTCA -/G AGTGGTAACT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 G 0 1 140899 CASAVA_Build 10 106677473 1I CTAAAAGTAC -/A AAAATTAGCC 3070 het 2897 hom 22 8 11 3 A 4 5 140900 CASAVA_Build 10 106678278 1I AAATGACTCG -/T ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 T 0 1 140901 CASAVA_Build 10 106679808 1D GAAAATGGCA G/- AGAAATAATT 3070 het 3070 hom 49 15 28 6 G 1 0 140902 CASAVA_Build 10 106688307 1D AAAATGATCC T/- CCCTAACTTT 3070 het 3070 hom 32 8 19 5 T 1 0 140903 CASAVA_Build 10 106689282 1D GAGAACGTCC A/- AATGGGTCTG 3070 het 3070 ref 50 21 19 10 A 3 2 140904 CASAVA_Build 10 106755278 2I GAAGTGTTCA --/GT GTAGTGGGGG 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 GT 1 2 140905 CASAVA_Build 10 106760469 1I GCATAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 27 12 8 T 12 13 140906 CASAVA_Build 10 106768564 2D TTTCTATTAC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 CT 6 5 140907 CASAVA_Build 10 106772046 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2761 het 2761 ref 41 15 10 16 T 16 14 140908 CASAVA_Build 10 106772222 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTGG 2214 het 2214 ref 22 10 7 6 T 9 8 140909 CASAVA_Build 10 106815154 1I TTGCATTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 A 10 11 140910 CASAVA_Build 10 106822903 2D ACACTGAGGA AG/-- AGACAGGAAA 3070 het 3070 hom 58 20 32 6 AG 2 1 140911 CASAVA_Build 10 106828706 1D ATTGTATCTT G/- GGCTCTAATA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 G 3 2 140912 CASAVA_Build 10 106832945 3D TTACATTAGC AAT/--- AATAATATAT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 AAT 3 2 140913 CASAVA_Build 10 106834482 1D CTGCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1133 het 1133 ref 26 11 5 10 T 15 14 140914 CASAVA_Build 10 106836195 2I GTGTGAGCTG --/GC GTGACGAGGG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 GC 0 1 140915 CASAVA_Build 10 106836730 18D TGAAGTCTTT GCCCATGCCTATGTCCTG/------------------ GCCCATGCCT 3070 hom 48 het 24 0 16 8 GCCCATGCCTATGTCCTG 2 1 140916 CASAVA_Build 10 106838198 67D GACCTTTCAA GAAGTAATAATTTTATTTTAACCAATAAAAATCATTTTAGTTTTTCTAAAACATACCACTTGCTGCC/------------------------------------------------------------------- GAAGTAATAA 1441 het 1441 ref 32 12 6 24 GAAGTAATAATTTTATTTTAACCAATAAAAATCATTTTAGTTTTTCTAAAACATACCACTTGCTGCC 1 0 140917 CASAVA_Build 10 106849145 1D AAAGTTTTTT C/- TCTGAGATGA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 C 1 0 140918 CASAVA_Build 10 106857795 6I TTTCTATCTT ------/TTACTA TTATCTATCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTACTA 0 1 140919 CASAVA_Build 10 106861997 1I TATTGCTTTT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 6 7 140920 CASAVA_Build 10 106879912 2I TACTAATATC --/TG TGTTTTCCAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TG 1 2 140921 CASAVA_Build 10 106895647 1D CAAATCAAAT G/- GGTTTACTCC 3070 het 3070 hom 51 16 27 9 G 3 2 140922 CASAVA_Build 10 106902688 2I TCACTATTAA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 9 11 140923 CASAVA_Build 10 106925717 4D AGAATAAAAT AGAG/---- AGAGACAGAG 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 AG 4 2 140924 CASAVA_Build 10 106928349 2D TCTCTCATAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 AC 7 6 140925 CASAVA_Build 10 106931824 2I AGCTTCCTAG --/AA AAAAAAAAAA 2746 het 2746 ref 28 11 7 10 A 10 12 140926 CASAVA_Build 10 106963614 1I TAGCAAGGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 9 14 8 A 8 9 140927 CASAVA_Build 10 106990690 1I ACAAACACTG -/A AAAAAAATAT 2463 hom 12 het 5 0 5 0 A 7 8 140928 CASAVA_Build 10 106996164 1D TCATTTCTTC T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 8 7 140929 CASAVA_Build 10 106997497 3D TTCTGTCAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 102 het 46 0 34 14 AAG 7 6 140930 CASAVA_Build 10 107029199 1D67M5D TCTTTCTTCA TTTTTTTTGCTGTAATAGGCCTGAATATTAGTTAATATTTACACATACATATTTTTATTTTTATGTGTGATGA/-TTTTTTTGCTGTAATAGGCCTGAATATTAGTTAATATTTACACATACATATTTTTATTTTTATGTGT----- GATAAGGACA 3070 hom 42 het 13 0 14 18 N/A 0 0 140931 CASAVA_Build 10 107029583 4D CTTTAGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 11 18 14 TTTG 4 3 140932 CASAVA_Build 10 107029773 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 11 10 140933 CASAVA_Build 10 107030066 6D AATGGGCTAG TAGATC/------ TAGATCTATA 3070 hom 105 het 40 0 36 6 TAGATC 2 1 140934 CASAVA_Build 10 107030297 1I AGCAAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 54 2 40 12 T 10 11 140935 CASAVA_Build 10 107031298 2D CTGCATGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 45 0 38 7 A 12 10 140936 CASAVA_Build 10 107032884 1D36M2I ACAAAATTGA TTTTTTTTTTCTTTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTATT--/-TTTTTTTTTCTTTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTATTTA TTTTTTTTTT 3070 het 125 hom 19 1 14 4 N/A 0 0 140937 CASAVA_Build 10 107038741 12I AAGATGCCAG ------------/TTTATAGATTAA TTAGTAAATT 3070 hom 97 het 38 0 33 5 TTTATAGATTAA 0 1 140938 CASAVA_Build 10 107050728 26I TTCAATGCAA --------------------------/TTCCTATCAAGATACCAATGTCATTT TTCACAGAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 3 TTCCTATCAAGATACCAATGTCATTT 0 1 140939 CASAVA_Build 10 107093284 6D TGAGAACTCT GGCACA/------ GGCACAGGCA 3070 hom 93 het 31 0 31 3 GGCACA 2 1 140940 CASAVA_Build 10 107093786 1D TGCCTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 222 hom 36 2 26 8 T 15 14 140941 CASAVA_Build 10 107103333 1D GAATGAACGA T/- TATCATCAGA 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 T 2 1 140942 CASAVA_Build 10 107104848 5D ATTTAAGTTG CTTTA/----- CTTTGCACTA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 CTTTA 1 0 140943 CASAVA_Build 10 107112734 1D AGTTCATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 27 1 19 7 T 15 14 140944 CASAVA_Build 10 107115104 1D AGAGAGAGAT A/- TTGTTTAATT 3070 het 43 hom 43 1 12 31 A 1 0 140945 CASAVA_Build 10 107115639 1I TGTAATTTTT -/A TTTTTAGAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 0 1 140946 CASAVA_Build 10 107126551 1I AGTGTCCCCA -/C TTTTTTTTCT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 C 0 1 140947 CASAVA_Build 10 107133121 1D CTTGGCTCCT C/- CCCCCCTAGT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 7 6 140948 CASAVA_Build 10 107136713 1D TTTAAGGGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 9 8 140949 CASAVA_Build 10 107166852 1D AGCCTGGCAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 9 8 140950 CASAVA_Build 10 107187058 2D CATGATAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 35 1 26 8 A 15 13 140951 CASAVA_Build 10 107217465 1D AGCAACTTTT G/- CCACTGCAAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 1 0 140952 CASAVA_Build 10 107220095 1D7M1D TAATGTCTGG ACTCAGGGC/-CTCAGGG- TTTGATTCTA 3070 hom 138 het 49 0 47 4 N/A 0 0 140953 CASAVA_Build 10 107241377 1I TTCTTACCTG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 7 8 140954 CASAVA_Build 10 107246949 2D ATAAAATAAC AT/-- GTGTAGAACC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 AT 1 0 140955 CASAVA_Build 10 107249748 1I TGTTGGTCCA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 6 7 140956 CASAVA_Build 10 107250920 8D AAATTAGTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 60 23 31 9 TTTG 5 3 140957 CASAVA_Build 10 107252460 1I TTCTTTTATT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 6 7 140958 CASAVA_Build 10 107252791 3I TTCTGAGACC ---/ATA ATGACTCCTA 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 ATA 0 1 140959 CASAVA_Build 10 107256716 4I TGGGCAGCCC ----/AAAG AAAGAGTCAT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 AAAG 1 2 140960 CASAVA_Build 10 107259423 4D GTGCTACTGT TTGA/---- TTGGGGATGA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 TTGA 1 0 140961 CASAVA_Build 10 107264644 1D GTTAACTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2816 hom 40 11 17 12 A 16 15 140962 CASAVA_Build 10 107279609 1I CCTGGAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 17 14 T 15 16 140963 CASAVA_Build 10 107284994 1I TGCATCTTTT -/G TGGTGTTTTC 3070 het 3070 ref 42 16 17 9 G 0 1 140964 CASAVA_Build 10 107291462 1D TTCCAAAGAC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 42 21 20 3 T 9 8 140965 CASAVA_Build 10 107310860 1D3M1D12M1D ACGCCACTGC GACTGCCACCCTGGCCAT/-ACT-CCACCCTGGCCA- ACAAGAGCGA 3070 hom 27 het 14 0 9 6 N/A 0 0 140966 CASAVA_Build 10 107314976 1D TATTCTCATA C/- CTCTCTCATT 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 C 2 1 140967 CASAVA_Build 10 107319101 5I AGTTAAAAAC -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 54 25 26 3 AAAAT 2 3 140968 CASAVA_Build 10 107321214 1D GAACAGACAC T/- TTTCAAAAGA 3070 het 2241 hom 21 8 11 3 T 4 3 140969 CASAVA_Build 10 107323682 1D GATATGGTTT G/- GCTTTGTCCC 3070 het 3070 hom 52 23 21 8 G 2 1 140970 CASAVA_Build 10 107327451 1D ATGCTGGCAA G/- TCATACTCGC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 1 0 140971 CASAVA_Build 10 107329716 1D CCATTCATGG C/- TGCCTGGGCT 3070 hom 49 het 25 0 18 8 C 1 0 140972 CASAVA_Build 10 107329963 1D TACCTGCAGG C/- TCCAAGGAGC 3070 het 1598 hom 36 11 13 13 C 1 0 140973 CASAVA_Build 10 107331427 1D CATGCATTAG C/- ATGGCCAATT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 C 1 0 140974 CASAVA_Build 10 107331788 1D ATGCTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 10 8 A 13 12 140975 CASAVA_Build 10 107333874 1D2M5D TTCTGTAAAA TCTATTTC/-CT----- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 N/A 0 0 140976 CASAVA_Build 10 107338365 1I AGTTCATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 18 8 T 10 11 140977 CASAVA_Build 10 107341164 1I CTGTCTACCT -/C CACTGTTGAC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 1 2 140978 CASAVA_Build 10 107347016 1I CTCAATGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 10 11 140979 CASAVA_Build 10 107347648 4I TTGGGAAGAT ----/AAAG AACAAAATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAAG 0 1 140980 CASAVA_Build 10 107348423 3D TATTAATATC TTA/--- TTTTTTTCTA 3070 het 2933 hom 19 9 8 2 TTA 1 0 140981 CASAVA_Build 10 107353643 1D ACTAAACTTT A/- AAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 7 6 140982 CASAVA_Build 10 107357337 1D TGCTTTAAAC T/- TCTGTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 2 1 140983 CASAVA_Build 10 107360078 1D AGAAGTCTAG C/- AGGTAGGTGA 3070 hom 141 het 52 0 48 6 C 1 0 140984 CASAVA_Build 10 107367094 1D AGGAAGGGAG C/- GATGAGCGAA 3070 het 3070 hom 52 23 24 6 C 1 0 140985 CASAVA_Build 10 107373278 1D TGCCAGTGCT A/- AGTCTGTAAC 3070 hom 66 het 32 0 23 9 A 2 1 140986 CASAVA_Build 10 107382912 1I GATGATGGGG -/T TTTTTTAGAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 T 6 7 140987 CASAVA_Build 10 107390225 1I7M1I24M1D7M1D AAATATATGT -ACCTACT-AAAAGAATCAACTGTTCTAAGGACTTTAAGTTC/AACCTACTAAAAAGAATCAACTGTTCTAAGGAC-TTAAGTT- CATTAATTGG 3070 hom 33 het 12 0 12 5 N/A 0 0 140988 CASAVA_Build 10 107399797 2D TTGAACAAAC TG/-- TTAAAATGGG 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 TG 1 0 140989 CASAVA_Build 10 107406522 1I AAAAAAAAAA -/C CATAAAACAG 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 C 1 2 140990 CASAVA_Build 10 107415818 2I CAAGGTGTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 45 0 39 7 T 10 12 140991 CASAVA_Build 10 107418267 8I TCTAAAATTA --------/AAAAAATG AAAACTGTGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAAAAATG 0 1 140992 CASAVA_Build 10 107422042 1I AATGTCTTTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 45 het 16 0 15 1 A 7 8 140993 CASAVA_Build 10 107427462 1D ATACGTGCCT G/- GGGGGAGGGT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 6 5 140994 CASAVA_Build 10 107442224 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 A 10 9 140995 CASAVA_Build 10 107449603 1D AGGAGGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 37 3 22 12 T 15 14 140996 CASAVA_Build 10 107449721 1I TCCACAGAAT -/C CCTGTATGCT 3070 hom 78 het 36 0 26 10 C 2 3 140997 CASAVA_Build 10 107455783 1I AGAAAGAGGC -/T GCCAAATGTT 3070 hom 120 het 48 0 39 9 T 0 1 140998 CASAVA_Build 10 107458145 1I AGAAAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 26 1 16 9 T 12 13 140999 CASAVA_Build 10 107468915 1D TTTTTTGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 A 9 8 141000 CASAVA_Build 10 107506931 1D TTCACTTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 28 0 25 4 T 10 9 141001 CASAVA_Build 10 107510652 7D CTGTAATCTC TCCAACT/------- GGGATCATGT 3070 hom 151 het 53 0 51 5 TCCAACT 1 0 141002 CASAVA_Build 10 107512894 1D ACTTGGTCCC T/- TGTCCTAAAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 1 141003 CASAVA_Build 10 107523795 1I GCTTATAGAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 387 hom 40 1 37 2 T 8 9 141004 CASAVA_Build 10 107549658 1I TTAGAGGCTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 53 21 17 15 T 8 9 141005 CASAVA_Build 10 107550055 5D GTATAATAAT AAATA/----- AAAGTGATAG 3070 het 2896 hom 17 8 9 0 AAATA 1 0 141006 CASAVA_Build 10 107553528 1I ACTAGTTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 10 141007 CASAVA_Build 10 107553920 1D CCATTTCATC T/- TTTTTTTTTT 1375 het 1375 ref 34 25 3 6 T 15 14 141008 CASAVA_Build 10 107556526 13D CCTTGCAGTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 12 T 25 12 141009 CASAVA_Build 10 107565689 3I ATGGGAGAAC ---/ATT ATCTTAAACA 3070 hom 117 het 44 0 37 7 ATT 0 1 141010 CASAVA_Build 10 107567162 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 535 hom 20 3 15 2 A 14 15 141011 CASAVA_Build 10 107593424 2I TCGGTCTCTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 35 0 22 13 TG 0 1 141012 CASAVA_Build 10 107608664 1I ACTTTTGAAC -/A GTAAAACCTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 0 1 141013 CASAVA_Build 10 107619295 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACACA 3070 hom 102 het 48 0 42 6 C 0 1 141014 CASAVA_Build 10 107620565 2D AGTCACACTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 24 9 T 13 11 141015 CASAVA_Build 10 107625994 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 10 11 141016 CASAVA_Build 10 107660663 1I CCTCCCCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 9 10 141017 CASAVA_Build 10 107673201 1D CTCAAAAAAA C/- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 C 1 0 141018 CASAVA_Build 10 107676467 2I AAAAAAAAAA --/AG GAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 14 5 AG 0 1 141019 CASAVA_Build 10 107677614 1D GAAAATCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 A 11 10 141020 CASAVA_Build 10 107678724 1D AGATTAAACC A/- AAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 A 6 5 141021 CASAVA_Build 10 107681037 10D AGACATTGTG ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AT 11 6 141022 CASAVA_Build 10 107682349 2D ACAAAAATAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 110 het 52 0 36 17 AC 10 9 141023 CASAVA_Build 10 107682594 2I CTGGCAACAG --/AA AAAGTACACA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 3 5 141024 CASAVA_Build 10 107685914 1D CCCCAATGTT G/- GGAGATGGGG 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 G 3 2 141025 CASAVA_Build 10 107687478 1I CACACAACCT -/G ACTTCCAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 141026 CASAVA_Build 10 107688330 1I CACAAAAATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 8 9 141027 CASAVA_Build 10 107692616 2D TGAGACAGTC TT/-- TTGTCTTCAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 4 2 141028 CASAVA_Build 10 107695519 5I GAGGGGTAAC -----/TTAAT TTAATCATTA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 TTAAT 1 2 141029 CASAVA_Build 10 107696589 4D TCTTCACATC TGGG/---- TGGGTCAGAG 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 TGGG 2 1 141030 CASAVA_Build 10 107712734 1D AAAGCAATGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 T 10 9 141031 CASAVA_Build 10 107714257 3I AACAATGGAT ---/TTA TTTTCAGTAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 TTA 0 1 141032 CASAVA_Build 10 107714387 4D ACACATATAC ACAT/---- ACATACATAC 3070 het 3070 ref 37 12 11 15 ACAT 4 3 141033 CASAVA_Build 10 107714437 1I ATCCTAGTTT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 A 6 7 141034 CASAVA_Build 10 107715177 3D ATGTTTATTA AAT/--- AATAAGTGCT 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 AAT 2 1 141035 CASAVA_Build 10 107718143 3I CTCTTAAATC ---/CTA CTGATGAAGT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 CTA 0 1 141036 CASAVA_Build 10 107719221 1D GCCTTGCAAG A/- AAAAAGAAGT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 6 5 141037 CASAVA_Build 10 107722323 2I TATATAATGA --/CT CTGTAGATAC 2179 het 2179 ref 16 9 6 1 CT 1 2 141038 CASAVA_Build 10 107750998 1D AAAATGATAT A/- AAAAAAGGAT 3070 hom 111 het 44 0 38 7 A 7 6 141039 CASAVA_Build 10 107753906 1I CATATAATCC -/T TTTTTTTTTT 1985 het 676 hom 15 3 6 6 T 17 18 141040 CASAVA_Build 10 107759098 2D CAAAGATAGT AC/-- ACAGTTTCTA 3070 hom 72 het 28 0 25 5 AC 2 1 141041 CASAVA_Build 10 107770037 1I TATAGCCTTT -/A AAAGACCATG 3070 hom 49 het 19 0 17 2 A 3 4 141042 CASAVA_Build 10 107800865 4D TGTTTATATT TATG/---- GTATTTATGG 3070 het 3070 hom 28 9 17 3 TATG 1 0 141043 CASAVA_Build 10 107805117 5I TATATTAGTC -----/TCTTT AGGGTAAATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TCTTT 0 1 141044 CASAVA_Build 10 107808388 3D GAAAGATATT AAG/--- AAGAGCATAA 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 AAG 2 1 141045 CASAVA_Build 10 107808538 1D TATCAATGAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 9 8 141046 CASAVA_Build 10 107825649 2D GTATCATCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 951 hom 25 6 9 10 T 14 12 141047 CASAVA_Build 10 107827351 1D TAAATTGAAG A/- AAAAAGTTAT 3070 het 3070 hom 31 9 19 4 A 6 5 141048 CASAVA_Build 10 107828306 5I TTTTTAACTT -----/GTTTG GTTTGTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 GTTTG 1 2 141049 CASAVA_Build 10 107830391 2D GTGGTGATAT AA/-- AGAACAGGGA 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 A 3 1 141050 CASAVA_Build 10 107831207 1I TAGAAGACCA -/T TTTTTAAAGG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 5 6 141051 CASAVA_Build 10 107833603 1I GTCTGCAATG -/A AAAAACCCAG 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 A 5 6 141052 CASAVA_Build 10 107838031 2I AAGGTACTTC --/AG AGAAGGTATT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 AG 1 2 141053 CASAVA_Build 10 107840447 4I ACCTGGCATT ----/ATAA ATAAATAATC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ATAA 2 3 141054 CASAVA_Build 10 107844908 15I GTTTATACAT ---------------/CAAGTTCACTACCTA CAAGTTCACA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 CAAGTTCACTACCTA 0 1 141055 CASAVA_Build 10 107845484 2D TAAGAGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 2104 het 2104 ref 27 14 5 8 TG 8 7 141056 CASAVA_Build 10 107846170 5D TTAGAATTGA TATAT/----- TATTTTGGTG 3070 het 3070 hom 43 16 22 8 TATAT 1 0 141057 CASAVA_Build 10 107846865 5D AGGCAGCCAC TAAGA/----- TAATAATTAA 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 TAAGA 1 0 141058 CASAVA_Build 10 107850254 1D GCCTGGTGAC A/- ACAGCTAGGA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 A 2 1 141059 CASAVA_Build 10 107854546 4D AGTTTTAAAA TAAC/---- TAATCCTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 21 2 TAAC 1 0 141060 CASAVA_Build 10 107854670 7I3M2I9M2D3M7D CATATTGTTT -------AAG--GGGATTCCCTACTTTACCCCC/GGGGGTAAAGTAGGGAATCCC--CTT------- AAACAGAAAG 3070 het 3070 ref 29 17 12 2 N/A 0 0 141061 CASAVA_Build 10 107855840 1D CAGTGGACTG A/- AAAAAAAATA 1000 het 1000 ref 53 41 3 11 A 9 8 141062 CASAVA_Build 10 107858295 1D AATTTCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 A 13 12 141063 CASAVA_Build 10 107859833 2D TAAAAAAAAG AA/-- AAAAAGAGGA 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 A 7 5 141064 CASAVA_Build 10 107860273 17I ATGATGTACA -----------------/CAAATTACTTCTTCTTT CAAATTACTT 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 CAAATTACTTCTTCTTT 1 2 141065 CASAVA_Build 10 107878173 1I TTTCATATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 A 0 1 141066 CASAVA_Build 10 107883126 1I GATTAGACTT -/G GGGGGTCAAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 5 6 141067 CASAVA_Build 10 107883603 1I CATGGAATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 9 10 141068 CASAVA_Build 10 107884088 4D ATAGCAAAAA TAAG/---- TATTATTATA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 TAAG 1 0 141069 CASAVA_Build 10 107884419 6D TATAAAAACG TAGAGA/------ TAGAGAATTA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 TAGAGA 2 1 141070 CASAVA_Build 10 107885783 1I GGAAAAACTG -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 59 24 26 9 A 6 7 141071 CASAVA_Build 10 107885875 4I ATATTGGAAA ----/AGAT AGATACAAAG 3070 hom 72 het 31 0 25 7 AGAT 1 2 141072 CASAVA_Build 10 107886525 4I AACTCTTGAA ----/AATT AATTAAACAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AATT 1 2 141073 CASAVA_Build 10 107888018 1I AAATTGGAGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 141074 CASAVA_Build 10 107888829 11D AAGGAAGGAC TAGAACAAAGG/----------- TAATAATCAC 3070 hom 117 het 40 0 40 3 TAGAACAAAGG 1 0 141075 CASAVA_Build 10 107889249 4D TAACTTATTT CAAA/---- CAAACAAAGT 3070 hom 50 het 36 0 17 24 CAAA 3 2 141076 CASAVA_Build 10 107889972 1D AACAGAAATG A/- ACCCTTGATG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 2 1 141077 CASAVA_Build 10 107890080 5D AATGTGTGAG TATTA/----- TATTTTATTT 3070 hom 128 het 47 0 44 4 TATTA 1 0 141078 CASAVA_Build 10 107898419 4I AGGGAAAAGG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 AAAC 4 5 141079 CASAVA_Build 10 107900365 2I GACCTTACAC --/AG GGGATAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AG 0 1 141080 CASAVA_Build 10 107904515 5I TGTCAAAATC -----/AAATT AAATTAACAC 3070 hom 151 het 55 0 51 4 AAATT 1 2 141081 CASAVA_Build 10 107910991 2I ATCAGTAATC --/TG TCTTTTAAGA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TG 0 1 141082 CASAVA_Build 10 107916336 2D TAGGGAAAAA AG/-- AGAACTTGCT 3070 het 3070 hom 31 13 14 7 AG 2 1 141083 CASAVA_Build 10 107920392 1D AGTAGTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1007 hom 29 6 11 13 T 15 14 141084 CASAVA_Build 10 107923138 4D TAAAGGACTT AGAA/---- AGCATATTTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AGAA 1 0 141085 CASAVA_Build 10 107926488 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTTTG 2767 hom 18 het 7 0 7 3 T 10 9 141086 CASAVA_Build 10 107929199 1D GAATCCTGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 10 9 141087 CASAVA_Build 10 107935352 1I TCCATAGTTA -/C CTTGATGCAC 3070 het 3070 hom 65 27 31 7 C 1 2 141088 CASAVA_Build 10 107943671 5D TGGAGAAAGG AGAGT/----- AGAGTATTAA 3070 het 2686 hom 24 8 14 3 AGAGT 2 1 141089 CASAVA_Build 10 107948035 3I GGAATAGTTA ---/TAT CATCAACCAG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 TAT 0 1 141090 CASAVA_Build 10 107948854 25D GGCCAGATGG TCTGGATCTCTTGACGTCATGATCC/------------------------- TCTGGATCTC 1573 hom 10 het 6 0 4 2 TCTGGATCTCTTGACGTCATGATCC 2 1 141091 CASAVA_Build 10 107962890 2D AGAAAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 332 hom 48 5 16 27 AG 10 9 141092 CASAVA_Build 10 107964892 1I TTAGGCACCT -/A AAAAAGCTAG 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 A 5 6 141093 CASAVA_Build 10 107970210 1D ACAAAAAAAA C/- ATAAAAATTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 C 1 0 141094 CASAVA_Build 10 107974130 3I AACTTTAAGT ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 1445 hom 13 3 8 2 ATA 5 6 141095 CASAVA_Build 10 107985580 1I GTGAAATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 15 11 A 14 15 141096 CASAVA_Build 10 107988173 1D TAAAAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 11 10 141097 CASAVA_Build 10 107990436 1D TTTTGGAGTG T/- TTAGCTTGCA 3070 hom 111 het 43 0 38 6 T 3 2 141098 CASAVA_Build 10 108001757 1I CTATTATTTT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 7 8 141099 CASAVA_Build 10 108002389 1I TTTCACATTT -/G GGGGTGACAG 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 G 4 5 141100 CASAVA_Build 10 108010752 2I GGAGTAGCTA --/TG TGTTAATTTC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TG 1 2 141101 CASAVA_Build 10 108011447 1D GATTCTACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 13 12 141102 CASAVA_Build 10 108015030 2I TTTCAATCAA --/AC AGTTTCTAGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AC 0 1 141103 CASAVA_Build 10 108024949 1I GCCATAGTAA -/G GTTCATGGCA 3070 hom 153 het 57 0 51 6 G 1 2 141104 CASAVA_Build 10 108030390 4D AAAGGGTGAT AGTG/---- AGTGTCAATC 3070 het 3070 hom 31 14 15 5 AGTG 2 1 141105 CASAVA_Build 10 108038674 2D TTTATTATTT CA/-- GTTTCCAGAT 3070 het 3070 hom 54 23 26 5 CA 1 0 141106 CASAVA_Build 10 108055613 1I TTTATGTACC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 7 8 141107 CASAVA_Build 10 108057322 1I AGAAAAAAAA -/T ATTTAAATTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 0 1 141108 CASAVA_Build 10 108057774 1D GAAACACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 T 11 10 141109 CASAVA_Build 10 108059811 1I AAGGGTATGT -/A AAAAAGACAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 6 141110 CASAVA_Build 10 108060063 1D AGACAGTCTT G/- CCCCTACAGC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 0 141111 CASAVA_Build 10 108060168 1I GGAAAAAAAT -/A AAAAAATTTC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 6 7 141112 CASAVA_Build 10 108066764 1D AAAATGTAGG T/- TGGCAACTTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 141113 CASAVA_Build 10 108068711 1I AGATACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2097 hom 34 7 15 12 A 10 11 141114 CASAVA_Build 10 108070401 5D CTCATTCTTC CTGGA/----- CTGGACACAG 3070 hom 61 het 31 0 23 12 CTGGA 2 1 141115 CASAVA_Build 10 108073416 1I GTGGAGTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 83 het 30 0 27 3 T 8 9 141116 CASAVA_Build 10 108078889 4I TCCCAGCACC ----/ATTT ATTAGTGAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 ATTT 0 1 141117 CASAVA_Build 10 108080563 1I AAAAAAAGAA -/G AAAAGAAAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 0 1 141118 CASAVA_Build 10 108084741 2D TCCTCCTAGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 6 5 141119 CASAVA_Build 10 108094879 1I GTTCAGACTT -/A AAGTATTTAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 2 3 141120 CASAVA_Build 10 108107827 7I GACATTCTAG -------/AAAATAC AAAATTATAG 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 AAAATAC 0 1 141121 CASAVA_Build 10 108111780 1D GAAATACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 13 12 141122 CASAVA_Build 10 108149004 1D AACAGTCCCA T/- TTCATTGTAT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 3 2 141123 CASAVA_Build 10 108149864 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 11 12 141124 CASAVA_Build 10 108152857 1I ATTATTCTGG -/A AAAAAGAATT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 5 6 141125 CASAVA_Build 10 108153104 2D GCTGAGAATT AG/-- AGTTTGTTGA 3070 het 3070 ref 39 19 15 7 AG 2 1 141126 CASAVA_Build 10 108158754 1D AATTAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 24 11 A 13 12 141127 CASAVA_Build 10 108163178 1I GATGCTTTTA -/T TTTTTTAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 6 7 141128 CASAVA_Build 10 108168684 2D ATATATATAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AT 8 7 141129 CASAVA_Build 10 108170005 1I CCCCACTCTC -/T TAATGTTTTC 3070 hom 150 het 58 0 49 9 T 1 2 141130 CASAVA_Build 10 108170301 1D TTTGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 T 11 10 141131 CASAVA_Build 10 108174242 1I TACTGGAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1679 hom 41 4 23 14 A 12 13 141132 CASAVA_Build 10 108175791 2I ATGTGGGAGA --/AT CCACATTCCC 3070 hom 155 het 59 0 51 8 AT 0 1 141133 CASAVA_Build 10 108177134 2I GTATATCTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 341 hom 36 1 30 5 AC 7 8 141134 CASAVA_Build 10 108207210 12D CTTCCATGAT GCATATATTGAA/------------ GCATATATAC 3070 hom 96 het 33 0 32 4 GCATATATTGAA 1 0 141135 CASAVA_Build 10 108209901 1I AATCCCTACC -/A AAAAAAAAAA 2899 het 2899 ref 22 13 9 0 A 12 13 141136 CASAVA_Build 10 108212726 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2407 hom 26 7 12 7 T 11 10 141137 CASAVA_Build 10 108241694 3D TACATATATA ATT/--- ATATTTCCCT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 ATT 1 0 141138 CASAVA_Build 10 108249812 3D CCTTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTGTT 3070 hom 96 het 41 0 34 8 TTG 1 0 141139 CASAVA_Build 10 108252582 2I CCTCTGTGTT --/AC AGAGTCACGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AC 0 1 141140 CASAVA_Build 10 108258392 1D GCAGAGATAT G/- GTATTATAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 2 1 141141 CASAVA_Build 10 108379685 1I CCAGCTACTC -/G GGGGGGGCTG 2460 het 2460 ref 27 15 9 3 G 7 8 141142 CASAVA_Build 10 108441686 1D GACCTCTCAC A/- TTATGGTCTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 0 141143 CASAVA_Build 10 108445468 3I TATTAATGAT ---/ATC AACAAAATTC 3070 hom 151 het 55 0 51 4 ATC 0 1 141144 CASAVA_Build 10 108445890 4I CATGAAGAAG ----/CAAA CAAACAAAGA 3070 hom 126 het 51 0 41 10 CAAA 2 3 141145 CASAVA_Build 10 108447204 1I ACTCCATCTC -/A AAAATAAATA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 4 5 141146 CASAVA_Build 10 108447358 3D CTATGAGAGT AGA/--- AGAACACTGT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 AGA 2 1 141147 CASAVA_Build 10 108450191 26D AAGTAACCAA AACAAACAAACGAAAACAAAGATTGC/-------------------------- ATATAACCAC 3070 hom 160 het 43 0 54 6 AACAAACAAACGAAAACAAAGATTGC 1 0 141148 CASAVA_Build 10 108456938 2D TTTAATTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 21 10 T 16 14 141149 CASAVA_Build 10 108469167 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 21 0 12 9 T 15 14 141150 CASAVA_Build 10 108470309 1I CCGATGCTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 137 hom 48 1 38 9 T 9 10 141151 CASAVA_Build 10 108471191 7D GATTTTTTAA AGTTCAC/------- TGAAGAAGAA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AGTTCAC 1 0 141152 CASAVA_Build 10 108475607 7D TGAACCCAGG GGGCAGA/------- GGTTGCAGTG 3070 hom 60 het 21 0 19 3 GGGCAGA 1 0 141153 CASAVA_Build 10 108477788 1I TAAGCAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 25 1 16 8 T 11 12 141154 CASAVA_Build 10 108478063 2I AAAATATTGA --/TC TCTGTTATGT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TC 1 2 141155 CASAVA_Build 10 108479192 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 288 hom 38 1 31 6 T 13 12 141156 CASAVA_Build 10 108486336 32D AAACATCATC AAGATAACCCTGGTTAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------------------- AAGATAACCC 3070 hom 79 het 21 0 29 5 AAGATAACCCTGGTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 141157 CASAVA_Build 10 108486804 12I TGTGTGTGCA ------------/TGTGAGTGTGCG TGTGAGTGTG 3070 hom 35 het 30 0 20 10 TGTGAGTGTGCG 0 1 141158 CASAVA_Build 10 108487196 1D TTTTTAAAGA G/- GGGGGTGGTG 3070 hom 64 het 26 0 21 7 G 6 5 141159 CASAVA_Build 10 108509670 1D TGCATCCCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 9 8 141160 CASAVA_Build 10 108515122 1I TCCTGAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 889 hom 43 4 33 6 T 11 12 141161 CASAVA_Build 10 108520229 2D AAAAAATCGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 30 1 22 8 A 16 14 141162 CASAVA_Build 10 108530726 3D TCACTTCTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 47 1 31 18 T 14 11 141163 CASAVA_Build 10 108532868 1I CATTAAATCC -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 8 141164 CASAVA_Build 10 108537865 4I GATGATAAAT ----/TAAC TAATCAAACA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 TAAC 0 1 141165 CASAVA_Build 10 108544250 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1574 het 59 hom 16 1 4 11 T 19 18 141166 CASAVA_Build 10 108547269 1I GAGGAGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 57 2 47 8 T 10 11 141167 CASAVA_Build 10 108548601 1I TACCAATGAC -/T TTTTTTCACT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 6 7 141168 CASAVA_Build 10 108571876 4D ACATCAGTGT TAGA/---- TAGACACAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 TAGA 2 1 141169 CASAVA_Build 10 108582830 4D AGAGTGACTT AGTC/---- AGATTTACAT 3070 hom 114 het 42 0 39 5 AGTC 1 0 141170 CASAVA_Build 10 108590251 1I AATATATTCC -/T GGTGAATGTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 0 1 141171 CASAVA_Build 10 108603146 1D ATTTTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 24 0 19 5 T 13 12 141172 CASAVA_Build 10 108619726 3D TCAGCTGATA AAC/--- AACTTCAGCA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAC 2 1 141173 CASAVA_Build 10 108621628 1D TCACATGTAT C/- CCCCCAACCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 6 5 141174 CASAVA_Build 10 108623387 1D TACGTTCCTG C/- TTTTTAGATG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 1 0 141175 CASAVA_Build 10 108627914 1I CAGACAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 657 hom 40 3 22 15 T 15 16 141176 CASAVA_Build 10 108638226 4D GGGTCAGTAT TTAG/---- CTAAGTACCT 3070 hom 87 het 34 0 30 6 TTAG 1 0 141177 CASAVA_Build 10 108640561 1D TATACATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 41 1 33 7 T 13 12 141178 CASAVA_Build 10 108645698 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTATATATA 3070 het 575 hom 34 2 27 5 TA 0 1 141179 CASAVA_Build 10 108662091 1I TGCCCACCCC -/T GACAGTCCAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 0 1 141180 CASAVA_Build 10 108672500 1I ATATATTCTA -/C CAAGTCTGGA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 1 2 141181 CASAVA_Build 10 108717093 1I TGATTTTGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 9 10 141182 CASAVA_Build 10 108735567 3I ACAGGTATCA ---/GCC GCCACCGAGC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 GCC 1 2 141183 CASAVA_Build 10 108740669 1I GAATGATTTT -/A AAATTTGTGA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 3 4 141184 CASAVA_Build 10 108760185 4I CTTTATTTTT ----/TTTG TTTGTTTCCG 3070 hom 105 het 38 0 34 4 TTTG 1 2 141185 CASAVA_Build 10 108764340 1D CAAAGTGCGG C/- CCCTGGACCT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 4 3 141186 CASAVA_Build 10 108765730 5D CTATTGAAAT AAAAC/----- AAATGTTTAA 3070 het 3070 hom 42 15 26 2 AAAAC 1 0 141187 CASAVA_Build 10 108776782 2D ATATATATAT AA/-- AAATATATAT 1552 het 129 hom 10 1 7 2 A 5 3 141188 CASAVA_Build 10 108791153 1D AAAGGGGATT A/- AAAAAAAAAA 2458 het 2458 ref 36 22 6 9 A 15 14 141189 CASAVA_Build 10 108809628 1D AAAGTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 11 10 141190 CASAVA_Build 10 108820950 1I TTTACGGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3020 hom 27 8 16 3 A 9 10 141191 CASAVA_Build 10 108831893 1I TCACACCTGC -/A ACTTTCGGAA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 A 1 2 141192 CASAVA_Build 10 108837031 1D ACAATCCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 T 10 9 141193 CASAVA_Build 10 108837883 30I AGCCAGGATG ------------------------------/GTCTCGGTCTCCTGACCTCATGATCCGCCC GTCTCGGCCT 2439 het 1098 hom 14 4 6 4 GTCTCGGTCTCCTGACCTCATGATCCGCCC 0 1 141194 CASAVA_Build 10 108884387 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 A 9 10 141195 CASAVA_Build 10 108891231 1D AAGGTAGTAG T/- TATGTAACAC 3070 het 3070 hom 44 22 21 3 T 2 1 141196 CASAVA_Build 10 108896063 7D TAAACCATGA CAACCAG/------- CACTCCACCT 3070 het 3070 hom 55 25 26 5 CAACCAG 1 0 141197 CASAVA_Build 10 108926076 4I TCTCTCTCTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 het 2767 hom 30 14 12 4 TCTT 2 3 141198 CASAVA_Build 10 108932593 1D ATTAAGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 A 12 11 141199 CASAVA_Build 10 108950948 1I GATCCAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 8 9 141200 CASAVA_Build 10 108958318 1D GTTAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 582 hom 29 2 22 5 A 12 11 141201 CASAVA_Build 10 108958840 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2176 het 223 hom 26 1 10 16 T 17 16 141202 CASAVA_Build 10 108960916 3D GGGATGAGTC CCT/--- CCTCCTCAAT 3070 het 3070 hom 29 15 13 1 CCT 3 2 141203 CASAVA_Build 10 108965401 2D TTCACAGGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 36 1 13 23 A 14 12 141204 CASAVA_Build 10 108967941 1I ATCCATATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 22 8 6 A 10 11 141205 CASAVA_Build 10 108985419 1D GACTGTTAGG A/- AAAAATGCAG 3070 het 3070 hom 38 12 19 9 A 6 5 141206 CASAVA_Build 10 108991624 1I AGTATGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 36 2 30 4 T 10 11 141207 CASAVA_Build 10 108992305 1I AAACTATAGG -/T TTTTATCTAT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 4 5 141208 CASAVA_Build 10 108995647 1I AATTTGGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 9 10 141209 CASAVA_Build 10 109003225 4D ACAAATAAAG AACA/---- AACAAATTAC 3070 het 3070 hom 37 15 21 2 AACA 2 1 141210 CASAVA_Build 10 109007581 1I ACATCGATAC -/A AAAAAACCTC 3070 het 3070 hom 58 26 25 7 A 6 7 141211 CASAVA_Build 10 109013981 2I CTCCATTATC --/TA ATGTGCTGGT 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 TA 0 1 141212 CASAVA_Build 10 109027493 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 12 10 T 10 11 141213 CASAVA_Build 10 109033506 3I TTGAACGATG ---/AGA AGAACACATG 3070 het 3070 ref 36 19 8 9 AGA 1 2 141214 CASAVA_Build 10 109036866 1D GACTGTTAGA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 7 6 141215 CASAVA_Build 10 109037721 1D CATTATAGCT A/- ATATTTCACT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 A 2 1 141216 CASAVA_Build 10 109042484 1D AAATAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1558 hom 28 7 12 10 T 17 16 141217 CASAVA_Build 10 109046862 2D AAATAGAAAC AG/-- AGAGTAGAAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 8 AG 3 2 141218 CASAVA_Build 10 109048267 1D TTTCTGAAAA G/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 G 1 0 141219 CASAVA_Build 10 109058613 2D ACTAAATATA TC/-- TGTCATAACA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 TC 1 0 141220 CASAVA_Build 10 109069489 1D ATATTCTCAT A/- ACTGTATATT 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 A 2 1 141221 CASAVA_Build 10 109071350 1I GAAAGAGGGA -/G GGGAGCAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 G 3 4 141222 CASAVA_Build 10 109082188 1D GATTTCACTC T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 46 25 16 8 T 7 6 141223 CASAVA_Build 10 109082665 1I GTATGTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 9 10 141224 CASAVA_Build 10 109085798 2D TTCCAAACAG TC/-- TCTCTCTCTC 1246 het 1246 ref 48 34 4 11 TC 9 8 141225 CASAVA_Build 10 109086514 3D TTTCTTAAAC AGA/--- AGGAGTCTTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 AGA 1 0 141226 CASAVA_Build 10 109092296 1D TAGAGTTCAT A/- AAAGTAAAGA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 4 3 141227 CASAVA_Build 10 109097017 2I TCTAGAATAC --/AT AGAGAATTTC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AT 0 1 141228 CASAVA_Build 10 109101038 1D CAGCCAGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 10 9 141229 CASAVA_Build 10 109147916 1I TGTATAATAT -/C TGATATATTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 0 1 141230 CASAVA_Build 10 109157434 1D TTACTTAATA C/- TCTTTGCCTC 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 C 1 0 141231 CASAVA_Build 10 109171187 5D GTGGAATCTC CTATT/----- CTTTTAACCA 3070 het 3070 hom 48 20 27 3 CTATT 1 0 141232 CASAVA_Build 10 109172313 2D AATTCTAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 783 hom 32 6 14 12 T 13 11 141233 CASAVA_Build 10 109176346 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 7 6 141234 CASAVA_Build 10 109179735 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 A 7 6 141235 CASAVA_Build 10 109181075 1D ATACAGCAGG A/- AAAAAATGAG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 7 6 141236 CASAVA_Build 10 109204158 1D CAGGGCCTTG C/- TTTATACAAG 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 C 1 0 141237 CASAVA_Build 10 109206761 1D CCAGCACTTT G/- GGGAGGCTGA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 G 4 3 141238 CASAVA_Build 10 109210532 1I GAACAACAAC -/A AAAAAAACAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 7 8 141239 CASAVA_Build 10 109222041 1D CTTTGGATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 144 het 53 0 47 6 A 11 10 141240 CASAVA_Build 10 109229188 1I CTCCGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1817 hom 32 5 23 4 T 13 14 141241 CASAVA_Build 10 109246053 2D CTTTAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 28 2 16 10 A 14 12 141242 CASAVA_Build 10 109247655 1D ATATATTATA T/- TATGATATAT 2452 het 2336 hom 10 5 5 0 T 2 1 141243 CASAVA_Build 10 109255817 1I AGAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 572 het 572 ref 11 4 6 1 A 12 13 141244 CASAVA_Build 10 109263689 1D AGTTGTTATT A/- AAAAAAAAAA 1881 het 1881 ref 35 24 4 7 A 13 12 141245 CASAVA_Build 10 109264668 1I CTTTGAAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 T 9 10 141246 CASAVA_Build 10 109266128 1D GTCTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2934 hom 22 7 12 3 A 11 10 141247 CASAVA_Build 10 109279396 1D TTCACACACA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 C 1 0 141248 CASAVA_Build 10 109280646 1D GATGTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 20 11 A 12 11 141249 CASAVA_Build 10 109291521 1I TTTCCCAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 17 17 11 A 9 10 141250 CASAVA_Build 10 109303587 1D TATTGATATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 9 141251 CASAVA_Build 10 109305334 3D CTTCAACCAT CTC/--- CTTCAGGAAA 3070 het 3070 ref 34 17 17 3 CTC 1 0 141252 CASAVA_Build 10 109308280 1D AGTAGACCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 44 het 55 1 41 13 T 10 9 141253 CASAVA_Build 10 109313534 1D TCCTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 21 6 A 11 10 141254 CASAVA_Build 10 109316021 2I AATATTCAAC --/TT TTAGAATCAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 2 4 141255 CASAVA_Build 10 109319016 2D GCTTCTGTCC CT/-- CTGTCCCCAG 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 CT 2 1 141256 CASAVA_Build 10 109323499 2D ATCAAGCCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 32 2 19 11 A 14 12 141257 CASAVA_Build 10 109351637 1D TTTGAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 10 9 141258 CASAVA_Build 10 109377310 2D TAATTTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2339 hom 18 5 8 5 AT 9 8 141259 CASAVA_Build 10 109378162 5I ATAAACTAAT -----/AAAAG AAAAGTAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AAAAG 1 2 141260 CASAVA_Build 10 109378289 2I CATCCTGGCT --/AC AACTCAGTGA 2853 het 2853 ref 29 11 9 9 AC 0 1 141261 CASAVA_Build 10 109380248 2I TTTTAAACTT --/AC AAAATCTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AC 0 1 141262 CASAVA_Build 10 109382040 1D AATGTATCAC A/- AAAAATGGAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 6 5 141263 CASAVA_Build 10 109382774 1D ATCTTGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 9 5 T 11 10 141264 CASAVA_Build 10 109387712 2D CCCATAGAAC AG/-- AGACTCTGTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AG 2 1 141265 CASAVA_Build 10 109388614 1D TCTGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1346 hom 25 4 17 4 A 11 10 141266 CASAVA_Build 10 109390881 2D TGAAATTGTG AA/-- AAGAGATTTT 3070 het 1256 hom 28 4 22 3 A 4 2 141267 CASAVA_Build 10 109411954 1D ATCCAAAGGC T/- TAGGGAGATT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 T 2 1 141268 CASAVA_Build 10 109418697 1I GGACTTCATA -/C CTAAGGTATA 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 C 1 2 141269 CASAVA_Build 10 109429466 1D GTTCAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 13 12 141270 CASAVA_Build 10 109437377 1D TAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 A 11 10 141271 CASAVA_Build 10 109440556 1I TGTTTTTTTT -/A ACTTGGCTTT 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 A 1 2 141272 CASAVA_Build 10 109441499 4D AGTTTTATTT ATTC/---- CTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 ATTC 1 0 141273 CASAVA_Build 10 109444466 1D CCCACTGTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 163 hom 37 1 33 5 T 10 9 141274 CASAVA_Build 10 109447248 4I CTTTCCTTCC ----/TTCT TTCTTTTTCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTCT 1 2 141275 CASAVA_Build 10 109454138 4D AGAGCCTGAA AGAG/---- AGAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 AG 3 1 141276 CASAVA_Build 10 109458985 1I GGACTGACTC -/A ATCTACGCCA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 1 2 141277 CASAVA_Build 10 109475895 1I GTTTCCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 35 2 26 7 T 12 13 141278 CASAVA_Build 10 109478396 4D ACTTTTAAAT AGTC/---- AGATTAAAAG 3070 het 3070 hom 31 14 16 3 AGTC 1 0 141279 CASAVA_Build 10 109483379 2D TGTGGGTGGC AT/-- ATGTGATAAA 3070 het 3070 ref 30 17 8 8 AT 2 1 141280 CASAVA_Build 10 109483908 1I GTCCCTTCTT -/C AGCTCACGCA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 C 0 1 141281 CASAVA_Build 10 109489026 19D AACAGTACAG AATTTTCTTCAAAAATTAA/------------------- AATTTTCTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 AATTTTCTTCAAAAATTAA 1 0 141282 CASAVA_Build 10 109489627 2D ATCAAAAAAA AC/-- AAAAAGAAAA 3070 het 10 hom 24 1 15 8 AC 1 0 141283 CASAVA_Build 10 109493451 1I AAATAGCATT -/A AAAATATTTA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 4 5 141284 CASAVA_Build 10 109494090 1I ATGAAAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 8 9 141285 CASAVA_Build 10 109503799 1D ATAAAATATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 T 10 9 141286 CASAVA_Build 10 109509340 1D GATACCTGAG A/- AAAAATCTCA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 6 5 141287 CASAVA_Build 10 109510410 4I CAATAACAGA ----/ACTT ACTTACTAAG 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 ACTT 1 2 141288 CASAVA_Build 10 109521755 3D AATAAACCAA GTG/--- GTGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 GTG 2 1 141289 CASAVA_Build 10 109526778 1D CTGTATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 31 3 15 14 A 13 12 141290 CASAVA_Build 10 109527435 1D AAAGTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 30 2 19 10 T 13 12 141291 CASAVA_Build 10 109531159 1D ATCCTCCACT G/- GTTTTCTAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 8 G 2 1 141292 CASAVA_Build 10 109538193 1I ACATGATAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 42 19 12 11 T 7 8 141293 CASAVA_Build 10 109544728 3I41M1I TGCCTTCAAG ---TTCAATTTATCTTTAATTTTCCTTAAACTGTGATGTGCTTA-/TTCTTCAATTTATCTTTAATTTTCCTTAAACTGTGATGTGCTTAT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 23 12 3 N/A 0 0 141294 CASAVA_Build 10 109545562 2D TAAAGTCTTT GA/-- GACTTCTGAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 GA 2 1 141295 CASAVA_Build 10 109546191 1D CTGTCTCAGT A/- AGTCTGAACT 3070 hom 132 het 45 0 42 3 A 2 1 141296 CASAVA_Build 10 109550238 1D ACGTTACTGG T/- GCTGAAAGCC 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 T 1 0 141297 CASAVA_Build 10 109551294 1I ATAAATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1453 hom 12 3 8 1 A 9 10 141298 CASAVA_Build 10 109554691 1I TCCAGGAAGT -/G GAATCCTTTG 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 G 1 2 141299 CASAVA_Build 10 109566969 5D AACTTCTTGT TGAGA/----- TAAGATTAAT 3070 het 3070 ref 46 23 19 6 TGAGA 1 0 141300 CASAVA_Build 10 109567864 1D TCTATTTGCA T/- TTTTTTAATA 3070 hom 138 het 51 0 44 8 T 7 6 141301 CASAVA_Build 10 109569633 4I GAATAATATG ----/GATA AAGAGTGTTC 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 GATA 0 1 141302 CASAVA_Build 10 109570680 8D AGGGATGATT AAAGCAGG/-------- ACAAGTCACT 3070 het 3070 ref 46 24 17 10 AAAGCAGG 1 0 141303 CASAVA_Build 10 109571585 1D TGAGTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 10 9 141304 CASAVA_Build 10 109571748 1I CCGCACAGCA -/T TAAGTGCTCA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 1 2 141305 CASAVA_Build 10 109574281 1D TACATCTAAG A/- AATACTTTGG 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 A 3 2 141306 CASAVA_Build 10 109574732 1I11M2D CCTTGTCTCG -TTGTAATGTTAGG/TTTGTAATGTTA-- CGCCAGGGGC 3070 het 3070 hom 27 15 14 2 N/A 0 0 141307 CASAVA_Build 10 109576315 3D TATTTTTCCC TAT/--- TATTATTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 TAT 3 2 141308 CASAVA_Build 10 109579292 3D CAGTGATACT TTC/--- TTATTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 TTC 1 0 141309 CASAVA_Build 10 109580245 3D GGTAAACCCA AAG/--- AAGATTTATT 3070 het 3070 hom 25 12 12 3 AAG 2 1 141310 CASAVA_Build 10 109583174 2D AAAAAAAACT GC/-- AAGGAAAGAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 GC 1 0 141311 CASAVA_Build 10 109589584 2I AGAGACAGAA --/AG AGAAAATGAG 3070 hom 115 het 44 0 38 6 AG 1 2 141312 CASAVA_Build 10 109589895 1D TAGTTACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 972 hom 31 3 19 9 T 13 12 141313 CASAVA_Build 10 109590531 1D AGTATACAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 13 12 141314 CASAVA_Build 10 109595390 1I ACAAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 C 0 1 141315 CASAVA_Build 10 109595793 3D TAATCTGCCT TTC/--- TTTAGAAAAC 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 TTC 1 0 141316 CASAVA_Build 10 109599311 3D AGCAACTTAA AAC/--- AACATTTGTT 3070 hom 126 het 46 0 43 6 AAC 2 1 141317 CASAVA_Build 10 109602227 3D ATCAAAATAA AAT/--- AATTTTTTAA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 AAT 2 1 141318 CASAVA_Build 10 109603721 2I TTCACTGTCT --/CC CCTTCCCTCC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 2 4 141319 CASAVA_Build 10 109614660 1D CTTCCACACA C/- CCTCCCATCT 3070 hom 111 het 43 0 37 8 C 3 2 141320 CASAVA_Build 10 109621616 1I ACATCAATGT -/G GGTTTTTTTT 3070 het 102 hom 32 1 21 10 G 2 3 141321 CASAVA_Build 10 109624681 2I TTGGCTTGTT --/AG AGTTTATAAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AG 1 2 141322 CASAVA_Build 10 109626825 4D CAAGAAACTT AAAC/---- AAATTTACAA 3070 hom 54 het 20 0 17 4 AAAC 1 0 141323 CASAVA_Build 10 109628013 5I AATTTAAAGT -----/AACAA AATAGAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AACAA 0 1 141324 CASAVA_Build 10 109628210 2D TTTTAATAAA CT/-- CTCATCAGAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 CT 2 1 141325 CASAVA_Build 10 109631799 1I AGAGAAAAGG -/A AAAAAAACAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 7 8 141326 CASAVA_Build 10 109636430 5D ATCAATAGAA GAATG/----- GAATGGATAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 GAATG 2 1 141327 CASAVA_Build 10 109637764 4I CCCTAAAATA ----/TATT TATTTGGCAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TATT 1 2 141328 CASAVA_Build 10 109639505 4I TTCTGGAATG ----/AAGC AAGTGACTAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAGC 0 1 141329 CASAVA_Build 10 109643307 1D TATCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 11 10 141330 CASAVA_Build 10 109644116 2I TTATCCACTC --/TG TGGTTTTTGA 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 TG 1 2 141331 CASAVA_Build 10 109653834 8D TGAGCCAAAC AAGAAAAA/-------- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 8 5 AAGAAAAA 3 2 141332 CASAVA_Build 10 109656948 2I ATTTTTAGCT --/TC TTTTATAATG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TC 0 1 141333 CASAVA_Build 10 109657541 4D ACATAAGTTG GATA/---- AATACCTGAG 3070 het 3070 hom 48 21 25 3 GATA 1 0 141334 CASAVA_Build 10 109659790 1D TAACACCTTG C/- CCTTTCATGC 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 C 3 2 141335 CASAVA_Build 10 109660141 2I TTTAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 2992 het 2992 ref 27 16 10 1 A 11 13 141336 CASAVA_Build 10 109660553 2D GTTCTACATT AA/-- AAAACTATAA 3070 het 3070 hom 52 25 24 3 A 6 4 141337 CASAVA_Build 10 109662772 1D TATGATTGTT A/- ACGTAGGCAG 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 2 1 141338 CASAVA_Build 10 109667206 1I AAAAATTAGC -/A AAAATGCAGG 3070 het 3070 hom 58 26 26 6 A 4 5 141339 CASAVA_Build 10 109668221 10D ACAACGGCAC AATTGGTCAG/---------- AATTGGTCAT 3070 het 3070 ref 36 18 16 6 AATTGGTCAG 1 0 141340 CASAVA_Build 10 109671783 1I AGACAGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 10 11 141341 CASAVA_Build 10 109674725 1I AGTCTATCTT -/G GGGTTTATCT 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 G 3 4 141342 CASAVA_Build 10 109674982 1I AGATTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2441 hom 21 6 10 5 A 10 11 141343 CASAVA_Build 10 109675642 1D CAAAATAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 T 10 9 141344 CASAVA_Build 10 109679502 12D CGTTTCTCTA AGGAATAGCGAC/------------ AGGCTATGTC 3070 het 3070 hom 44 19 19 11 AGGAATAGCGAC 1 0 141345 CASAVA_Build 10 109688437 1D ACTTAGAATA T/- ATCGTCTTAA 1930 het 1930 ref 15 11 4 0 T 1 0 141346 CASAVA_Build 10 109701503 1D CTGCTCACTC T/- TTGGGTCCAC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 3 2 141347 CASAVA_Build 10 109717660 1D TATACATTTC T/- TTCTTAAGAC 3070 het 3070 hom 52 20 26 6 T 3 2 141348 CASAVA_Build 10 109728130 1I AAAACAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 9 10 141349 CASAVA_Build 10 109732462 14I TCAGGAGGAT --------------/CCAAGGACAGGAGC TCAAACTGTA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 CCAAGGACAGGAGC 0 1 141350 CASAVA_Build 10 109734191 1D GCTTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 11 10 141351 CASAVA_Build 10 109746934 1I TCCTGGATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 T 9 10 141352 CASAVA_Build 10 109748460 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAG 2362 het 2362 ref 16 8 5 3 A 9 10 141353 CASAVA_Build 10 109752212 1D GTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2863 het 1447 hom 15 6 7 2 A 12 11 141354 CASAVA_Build 10 109762982 4D40M16D TTTATTGGAG ATATATATATATATATATCCAATATTTATCTATTTATATATATATCTGTATTTATATATG/----ATATATATATATATCCAATATTTATCTATTTATATATATA---------------- TCTGTATTTA 3070 het 3070 hom 17 11 11 9 N/A 0 0 141355 CASAVA_Build 10 109774167 1I AAATCTACAA -/G AAATGGATAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 G 0 1 141356 CASAVA_Build 10 109779464 1D GTGATTCGAG A/- AAAAAAAAAA 2561 het 2561 ref 41 27 6 8 A 12 11 141357 CASAVA_Build 10 109780093 2D GATTTGGCAA TG/-- TGGTTTATTG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 TG 2 1 141358 CASAVA_Build 10 109795495 2D ATATATGTGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AT 7 6 141359 CASAVA_Build 10 109797589 1I AATGTTCATA -/T TTTTTAATCA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 5 6 141360 CASAVA_Build 10 109803938 1I GGCAGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 A 13 14 141361 CASAVA_Build 10 109808677 2I TGTATGAATG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 48 16 23 9 A 9 11 141362 CASAVA_Build 10 109810690 2D ATACTCACTG CT/-- CTCTGGAGCT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 CT 3 2 141363 CASAVA_Build 10 109828383 1I ACCCATCACC -/T TTTTTTAGTA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 T 6 7 141364 CASAVA_Build 10 109843071 1D TGTAGCCATC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 49 21 19 9 A 9 8 141365 CASAVA_Build 10 109869742 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 548 hom 13 3 8 2 A 14 15 141366 CASAVA_Build 10 109945443 1I AGAATTTAAC -/A ACAACTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 1 2 141367 CASAVA_Build 10 109962923 3D TATGTCCTTC TTT/--- GTCTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 6 T 3 0 141368 CASAVA_Build 10 109975726 1D CCTATTAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 A 10 9 141369 CASAVA_Build 10 109983981 1D AAAAGCAATA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 T 8 7 141370 CASAVA_Build 10 110019437 1I CTTTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 11 12 141371 CASAVA_Build 10 110029616 1D GGTTTTCAGG T/- TTGTACATAT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 3 2 141372 CASAVA_Build 10 110031157 5I AAAAACAGAG -----/AAGTT AAGTAATCTA 3070 het 3070 ref 57 24 22 11 AAGTT 0 1 141373 CASAVA_Build 10 110033142 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 19 16 6 TA 7 6 141374 CASAVA_Build 10 110037214 1I TTCTCTGAGT -/A AACCCTGGAA 3070 hom 83 het 31 0 26 5 A 2 3 141375 CASAVA_Build 10 110043998 1D TTCTATTGCA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 8 7 141376 CASAVA_Build 10 110070172 1I CAATCATGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 10 141377 CASAVA_Build 10 110072349 4D AACCACCTCC TGAG/---- TATCAACAGA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 TGAG 1 0 141378 CASAVA_Build 10 110088277 2D CAGTTAAATC AT/-- ATAATAATGA 3070 het 3070 ref 41 22 14 7 AT 2 1 141379 CASAVA_Build 10 110089094 1D GAAATAGTTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 T 8 7 141380 CASAVA_Build 10 110097809 1I AATTAGGAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 A 8 9 141381 CASAVA_Build 10 110101224 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 A 7 8 141382 CASAVA_Build 10 110102148 1I AGAAATGAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 A 8 9 141383 CASAVA_Build 10 110104113 2D GATTTCAAGA CT/-- CTGATGCACG 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 CT 2 1 141384 CASAVA_Build 10 110104479 20I GCACAACAGG --------------------/ATGGACTATAGTCAATAATA ATGGATTGGA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 ATGGACTATAGTCAATAATA 0 1 141385 CASAVA_Build 10 110112536 1I15M3D AAGGAAAGTT -AAAAAAAACCATAATACA/AAAAAAAAACCATAAT--- AATTGACCCA 3070 het 3070 ref 44 28 17 7 N/A 0 0 141386 CASAVA_Build 10 110113999 1I AGATGAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 10 11 141387 CASAVA_Build 10 110121108 1I TTTTTTTTTT -/A ATTATACTTT 1916 het 1872 hom 19 7 7 5 A 1 2 141388 CASAVA_Build 10 110123179 1I GTTTTTGCCC -/A TTCAGTATGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 141389 CASAVA_Build 10 110129761 1I TTCATTTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 T 8 9 141390 CASAVA_Build 10 110136547 1D TCCCAGGGGC T/- TTTTTGCAGG 3070 hom 117 het 42 0 40 3 T 6 5 141391 CASAVA_Build 10 110136691 5I TTTCTGATGC -----/ATTTA TTTATAAGAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 ATTTA 0 1 141392 CASAVA_Build 10 110137131 1D CTTAGATTCA T/- TTTTCCGTAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 5 4 141393 CASAVA_Build 10 110137975 5D AGCAAAAAAC AAACA/----- AACAAACAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 3 AAACA 1 0 141394 CASAVA_Build 10 110147355 32D TAAAGACCGA ACCATTCTCCCACTGATGTTTCTATGAACGAT/-------------------------------- ACCATTCTCC 3070 het 3070 ref 45 25 13 15 ACCATTCTCCCACTGATGTTTCTATGAACGAT 1 0 141395 CASAVA_Build 10 110147765 2D GAGTGAATGC CA/-- CAGAGTCCTA 3070 hom 114 het 44 0 38 7 CA 2 1 141396 CASAVA_Build 10 110148086 3I CTTCTTCCAG ---/ATA ATATTTTTCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 ATA 1 2 141397 CASAVA_Build 10 110148847 2D AATATTTATA TG/-- TGTGTATTAC 3070 het 3070 hom 40 15 20 8 TG 3 2 141398 CASAVA_Build 10 110156136 1D TAAAATTGAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 8 7 141399 CASAVA_Build 10 110157362 1I GATGCTAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 9 10 141400 CASAVA_Build 10 110159734 1I CGTGTGGCAT -/G GGTTGTTTGC 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 G 2 3 141401 CASAVA_Build 10 110160041 2I ATATATATAT --/AC ACACACCACA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AC 3 4 141402 CASAVA_Build 10 110162552 1I GGGCAAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 141403 CASAVA_Build 10 110164370 1I GGTGGGGGGA -/G GGGGGAGGGA 1836 hom 11 het 6 0 5 1 G 5 6 141404 CASAVA_Build 10 110165489 1I TTGGTGAGAT -/A CTCAAAAGAT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 0 1 141405 CASAVA_Build 10 110169187 1D CATGAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 38 1 29 8 A 12 11 141406 CASAVA_Build 10 110171233 1I CCAAAAGTCT -/A AAAAAAAAAA 2329 het 275 hom 26 2 9 15 A 14 15 141407 CASAVA_Build 10 110171579 2D CGATGGAGAA TC/-- TCTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 TC 3 2 141408 CASAVA_Build 10 110179882 5D CATAATCTTC AAATA/----- AAATAAAGAC 3070 hom 93 het 33 0 31 4 AAATA 2 1 141409 CASAVA_Build 10 110186393 4D TTTGAACTTC TTTA/---- TTTATCCTGT 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 TTTA 2 1 141410 CASAVA_Build 10 110193267 1I CTGGAAAAGG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 A 7 8 141411 CASAVA_Build 10 110197777 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 69 het 27 0 24 5 AC 7 6 141412 CASAVA_Build 10 110198125 2I ACACCAAGAA --/AG AGGTAGATGG 3070 hom 80 het 31 0 26 5 AG 1 2 141413 CASAVA_Build 10 110207881 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1604 hom 13 4 8 1 A 11 10 141414 CASAVA_Build 10 110208784 1I TTCTAATATC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 8 141415 CASAVA_Build 10 110210921 1I ATTAGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2352 hom 20 5 11 4 A 9 10 141416 CASAVA_Build 10 110223055 1D AAATCTGCCT C/- ATGACACTAG 3070 het 3070 ref 50 32 14 5 C 1 0 141417 CASAVA_Build 10 110229480 1D TGCTCATGAG T/- TTTTTTAAGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 7 6 141418 CASAVA_Build 10 110232351 1D ACTTGAGCCA G/- GATTTGGAAG 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 G 2 1 141419 CASAVA_Build 10 110233149 1I TTAATTGAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 88 het 33 0 30 3 T 9 10 141420 CASAVA_Build 10 110238371 1D GATGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 874 hom 19 5 10 4 T 15 14 141421 CASAVA_Build 10 110241024 1D GACCTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 13 22 10 A 11 10 141422 CASAVA_Build 10 110245208 1D TATTCCACCA T/- TTTGGGGGCA 3070 het 3070 hom 54 23 24 8 T 4 3 141423 CASAVA_Build 10 110245594 1I AAGCAGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 18 11 A 11 12 141424 CASAVA_Build 10 110251478 1D TAAACAAAAA C/- AAAAGCAAAC 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 C 1 0 141425 CASAVA_Build 10 110252007 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 2256 hom 26 11 9 6 A 8 9 141426 CASAVA_Build 10 110253648 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTTATT 2788 het 2788 ref 24 12 9 5 T 9 7 141427 CASAVA_Build 10 110256362 1I GACCCATCAG -/T GTGCTGTATT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 0 1 141428 CASAVA_Build 10 110265354 4D GAATCTCCTC TCTT/---- TCTCCTCTCC 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 TCTT 1 0 141429 CASAVA_Build 10 110270654 1I TATCTTAGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 8 9 141430 CASAVA_Build 10 110274226 1D AGTCATTTAA G/- GGGCAGTGTA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 G 4 3 141431 CASAVA_Build 10 110291256 22I CAAAAACTGC ----------------------/AATTATGTTTGCACCATACTTA AATGACAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 AATTATGTTTGCACCATACTTA 0 1 141432 CASAVA_Build 10 110292930 8I AAGTAACAAA --------/AGACTAGT AGACTAGTAG 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 AGACTAGT 1 2 141433 CASAVA_Build 10 110295573 2D CACTTGGATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 16 12 T 15 13 141434 CASAVA_Build 10 110302469 1D AAAAAAATGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 15 15 7 A 9 8 141435 CASAVA_Build 10 110302860 1I TTGAAGTGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 9 10 141436 CASAVA_Build 10 110303783 1I ACTGAAACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 9 10 141437 CASAVA_Build 10 110308956 1I AGCAGGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 22 8 T 10 11 141438 CASAVA_Build 10 110310718 1D ACCACTGGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 56 het 35 1 30 6 T 9 8 141439 CASAVA_Build 10 110318144 12I ATTATTAATT ------------/AATGTCACCAAA TGATATTTGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AATGTCACCAAA 0 1 141440 CASAVA_Build 10 110319861 1I ACATTCTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 27 0 24 3 A 9 10 141441 CASAVA_Build 10 110322327 3D TATATATATA TAT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 13 0 9 6 TAT 1 0 141442 CASAVA_Build 10 110342725 4D CAAACAAATG ACAA/---- ACAAAGAACA 3070 het 3070 hom 42 20 20 4 ACAA 2 1 141443 CASAVA_Build 10 110344310 4D AGGTCATGTG TCCT/---- TCCTTCCTTT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 TCCT 3 2 141444 CASAVA_Build 10 110351341 12I TGCCCGGCTT ------------/CCATCCAGGAGC CCACCAAAAG 3070 het 3070 hom 30 14 13 5 CCATCCAGGAGC 0 1 141445 CASAVA_Build 10 110395965 1D GATTTAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 122 hom 42 3 18 21 A 10 9 141446 CASAVA_Build 10 110396803 1I ATATAATCTA -/T TCATCTATTC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 1 2 141447 CASAVA_Build 10 110398135 1D CTCAGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 10 7 T 11 10 141448 CASAVA_Build 10 110409568 4D ATTTTCAAAA TTGT/---- TTGAGCCATT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 TTGT 1 0 141449 CASAVA_Build 10 110422464 1I GAAGCTAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 17 27 1 A 9 10 141450 CASAVA_Build 10 110430169 3D CTGACTCATA AAC/--- AATATCCTTC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AAC 1 0 141451 CASAVA_Build 10 110432591 3I GAAATGTAAA ---/TCT TCTTAAGTAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TCT 1 2 141452 CASAVA_Build 10 110435576 1D TTGTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 G 1 0 141453 CASAVA_Build 10 110446079 4D TTTTTTTGTC TGTT/---- CATTTTGTTT 3070 het 3070 hom 42 12 26 4 TGTT 1 0 141454 CASAVA_Build 10 110447737 3D TAAAAAGTGA TGC/--- TGAATATGGG 3070 hom 96 het 36 0 33 5 TGC 1 0 141455 CASAVA_Build 10 110447983 1I AAACCTGCAT -/G TTGTGCATAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 0 1 141456 CASAVA_Build 10 110449549 1D CTTGCCTAGC A/- CCCCCACCCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 0 141457 CASAVA_Build 10 110452838 4I CAGATTCTGT ----/TGTC TGGTGAGGAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TGTC 0 1 141458 CASAVA_Build 10 110456582 3I TTTCAGCGCG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 10 13 141459 CASAVA_Build 10 110469288 1D TCCGAAAAAA G/- GGGGAGTACA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 G 5 4 141460 CASAVA_Build 10 110476559 1D AAACTATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 12 11 141461 CASAVA_Build 10 110476852 1D AATTAAAAAC A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 45 24 15 7 A 8 7 141462 CASAVA_Build 10 110477455 1I TAGATGACAC -/A AGCAAATAGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 1 2 141463 CASAVA_Build 10 110493051 1D ATGGCTTGCC T/- GTGCGTATGT 3070 het 3070 ref 63 31 22 10 T 1 0 141464 CASAVA_Build 10 110516165 16I GAAACTTATG ----------------/AGAGATGGAGTGGAAT ATTTGATATT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 AGAGATGGAGTGGAAT 0 1 141465 CASAVA_Build 10 110526064 1I GCTTGTGGGA -/G GAGAGGGTGA 3070 hom 120 het 46 0 38 8 G 1 2 141466 CASAVA_Build 10 110554097 5I TGATTTCATG -----/TGTTC TGTTCTGTGT 3070 het 3070 ref 55 29 23 3 TGTTC 1 2 141467 CASAVA_Build 10 110564186 1D TTTGAGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 12 13 T 11 10 141468 CASAVA_Build 10 110594696 1I TAATAGACTT -/A TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 52 32 19 1 A 0 1 141469 CASAVA_Build 10 110712516 1D ACGTTAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 11 10 141470 CASAVA_Build 10 110734473 1D ATGTAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 1079 het 1079 ref 27 14 3 10 T 15 14 141471 CASAVA_Build 10 110808756 1I AACCCCTTTT -/A AAAGGATTTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 3 4 141472 CASAVA_Build 10 110810388 1I CCTATAAAGA -/C CCCAGACTCA 3070 hom 84 het 31 0 27 4 C 3 4 141473 CASAVA_Build 10 110943643 1I CAAAAGACAA -/C CTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 C 1 2 141474 CASAVA_Build 10 110955224 1D CCCCACCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 28 0 19 9 A 13 12 141475 CASAVA_Build 10 110964843 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAAAGAAA 3070 het 602 hom 27 4 16 8 AAAG 1 0 141476 CASAVA_Build 10 110964938 2I GCATCTCGCT --/CA CAGAGTTTGG 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 CA 1 2 141477 CASAVA_Build 10 110965811 1D AACAGATAAA G/- GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 G 2 1 141478 CASAVA_Build 10 110966399 1I CGATGGCTAC -/T TTATTTGACA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 2 3 141479 CASAVA_Build 10 110973133 1I CACATCAGGG -/A AAAAAGATTA 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 A 5 6 141480 CASAVA_Build 10 110992926 4D TAAAAAAATA AATT/---- AAAAAAAAAA 2580 het 47 hom 9 1 8 1 AATT 1 0 141481 CASAVA_Build 10 110996110 3I TGTGGAACCA ---/ACC ACAATGGTGG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 ACC 0 1 141482 CASAVA_Build 10 110997505 1D GTACAGCTGA C/- CCCCTTGTGA 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 C 5 4 141483 CASAVA_Build 10 110998672 4I ATAACATGTT ----/AAAA ATCATATATT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 A 1 5 141484 CASAVA_Build 10 110999694 1D ACAACTAAAT A/- AAGGCAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 3 2 141485 CASAVA_Build 10 110999799 3D ATTTGTATAC AGG/--- AGTTCAACTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 AGG 1 0 141486 CASAVA_Build 10 111008940 1I GGGTCAAACG -/T TAACACCTTC 3070 het 3070 ref 37 19 18 0 T 1 2 141487 CASAVA_Build 10 111009304 12D TTCAGTGAGC CCTCCCCTTCCT/------------ CCTCCCCTGC 3070 het 3070 ref 50 31 15 7 CCTCCCCTTCCT 1 0 141488 CASAVA_Build 10 111014438 6I TTTCCATGTC ------/TCTGTG TACATAGTGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TCTGTG 0 1 141489 CASAVA_Build 10 111014889 1I CTTTAATGTC -/A AAAAAAAGCG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 7 8 141490 CASAVA_Build 10 111025275 1I GACATGTGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 A 9 10 141491 CASAVA_Build 10 111027224 2D CATGGTAATG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 57 25 20 12 CT 6 5 141492 CASAVA_Build 10 111034171 1I ATCTTGTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 T 8 9 141493 CASAVA_Build 10 111042276 3D AATGAAGAAT AAG/--- AAGAAGATTC 3070 het 3070 hom 29 15 13 3 AAG 3 2 141494 CASAVA_Build 10 111056115 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTAA 2201 het 1360 hom 8 3 5 0 A 1 0 141495 CASAVA_Build 10 111070586 1D TCTTTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 1383 het 1383 ref 37 24 4 9 T 11 10 141496 CASAVA_Build 10 111162519 2D CTAAAAACAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 36 17 12 9 TG 8 7 141497 CASAVA_Build 10 111165397 1D ACAAAGGGCT A/- ATATCCAGAA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 A 2 1 141498 CASAVA_Build 10 111222833 2I CAAACATATA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 32 0 30 2 T 12 14 141499 CASAVA_Build 10 111234302 1D AGCAGCTTGA T/- ACATAATCTG 3070 hom 102 het 36 0 34 3 T 1 0 141500 CASAVA_Build 10 111235561 2D GAAACATTAC TG/-- AGTACTTTCT 3070 hom 43 het 19 0 15 6 TG 1 0 141501 CASAVA_Build 10 111240646 1D CCATCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 718 hom 28 2 17 9 A 14 13 141502 CASAVA_Build 10 111242887 1D AGCTTTTGCC T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 7 6 141503 CASAVA_Build 10 111246766 12I AGGGACCCCT ------------/GTGGTCCAAAGA GTGTAGAGAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 GTGGTCCAAAGA 0 1 141504 CASAVA_Build 10 111249905 30D GCACACGCTG TGTGGGCTGAATTCTGAGCACTACACATCA/------------------------------ TGTGGGTGTG 3070 hom 80 het 27 0 26 6 TGTGGGCTGAATTCTGAGCACTACACATCA 1 0 141505 CASAVA_Build 10 111256506 1D ACCCTCAAAA C/- ATTTAGAATC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 C 1 0 141506 CASAVA_Build 10 111256620 3I TAGGAAGGAA ---/AAC AAAAAAAAAC 3070 hom 98 het 35 0 33 2 AAC 0 1 141507 CASAVA_Build 10 111266673 1D GATGAGCTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 43 het 20 0 15 6 A 9 8 141508 CASAVA_Build 10 111275012 1I CTTTTTAAAG -/A AAAATGCCTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 4 5 141509 CASAVA_Build 10 111311832 1I CCAGTGTTAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 8 9 141510 CASAVA_Build 10 111362177 1I TGGAAGCTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 9 10 141511 CASAVA_Build 10 111371063 2I TACCCAAGAC --/TG GGAAGAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 35 8 TG 0 1 141512 CASAVA_Build 10 111374631 1D TCCACAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 646 hom 40 3 30 7 A 13 12 141513 CASAVA_Build 10 111383908 1I GGTTTGATGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 299 hom 30 2 24 4 A 9 10 141514 CASAVA_Build 10 111384893 3D AGGTTTCCAC CTT/--- TTTTAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 CTT 1 0 141515 CASAVA_Build 10 111388276 2D AAGTTTGTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 31 1 21 11 A 14 12 141516 CASAVA_Build 10 111391449 1D CCACAGGTTG C/- CAATGTTCCA 3070 hom 156 het 57 0 52 7 C 2 1 141517 CASAVA_Build 10 111396382 2D TTCTAAAGGT AA/-- AAAAAAACAG 3070 hom 93 het 38 0 32 8 A 9 7 141518 CASAVA_Build 10 111408253 2I TTTCCACTGG --/AA AAAAAAAATA 2211 hom 24 het 10 0 9 1 A 8 10 141519 CASAVA_Build 10 111413199 7D GCCCAGGAAG TACCCCC/------- TACCCCCTAC 3070 hom 84 het 34 0 27 9 TACCCCC 2 1 141520 CASAVA_Build 10 111416709 1I GAAGAGATAT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 8 9 141521 CASAVA_Build 10 111416883 2I CACGCACGCG --/CA CACACACACA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 CA 7 8 141522 CASAVA_Build 10 111417573 1I AATATTAAGT -/C AATGGGGGGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 0 1 141523 CASAVA_Build 10 111417666 1D TGGAACAAAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 126 het 45 0 43 3 A 9 8 141524 CASAVA_Build 10 111418596 1I GTCTCTGTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 340 hom 56 1 49 6 A 8 9 141525 CASAVA_Build 10 111423828 1D TTTCTACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 33 1 28 4 A 11 10 141526 CASAVA_Build 10 111425818 1D AAAAACCGGC A/- AAAAAAATCA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 A 8 7 141527 CASAVA_Build 10 111437704 1D GATATACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 27 0 16 11 A 15 14 141528 CASAVA_Build 10 111437875 1D TATTCAATCC A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 7 141529 CASAVA_Build 10 111439008 1I TTTGGAGAAA -/T TATTTGTTCA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 1 2 141530 CASAVA_Build 10 111446913 1D GGCTGAGGGC A/- GTGACCCCAA 3070 hom 117 het 43 0 38 6 A 1 0 141531 CASAVA_Build 10 111448477 1I ATTTTAGTAA -/C GTTTTTGTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 0 1 141532 CASAVA_Build 10 111454418 3D GCAGTTGGGG GAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 7 GAA 1 0 141533 CASAVA_Build 10 111460321 4I AATTTTGGTT ----/AGAC AGGATGAACA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AGAC 0 1 141534 CASAVA_Build 10 111464854 1I TTTTGATGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 10 141535 CASAVA_Build 10 111472801 6D ATTTATTTAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 47 het 18 0 16 5 AT 8 5 141536 CASAVA_Build 10 111474875 2D GAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 13 11 141537 CASAVA_Build 10 111475980 4I TGCTTTTTTC ----/CTAA CTATTAATTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 CTAA 0 1 141538 CASAVA_Build 10 111493288 1D ACTTAGCAGC T/- TTTTTTTTTT 1392 het 1392 ref 30 23 3 4 T 11 10 141539 CASAVA_Build 10 111545259 4D TTCTTTTTTC TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 7 TTCT 3 2 141540 CASAVA_Build 10 111545426 1I CCTCCCCCCT -/C CCCCCACCCC 2696 het 302 hom 12 3 6 3 C 5 6 141541 CASAVA_Build 10 111555065 1D TTCTGTGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 582 hom 47 2 34 12 A 12 11 141542 CASAVA_Build 10 111583240 2D AGTCCTGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 47 0 32 15 T 12 10 141543 CASAVA_Build 10 111610774 1I GGAAGAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 767 hom 32 3 18 11 T 13 14 141544 CASAVA_Build 10 111611457 1I TCCTTGAGAG -/A AAAAAAAAAA 1925 het 59 hom 37 2 17 18 A 17 18 141545 CASAVA_Build 10 111613139 1D ATGTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 30 2 19 9 A 14 13 141546 CASAVA_Build 10 111613704 1D18M1D TTTTGAATAC AAAAAAAAAAGGAGTCAGCA/-AAAAAAAAAGGAGTCAGC- AAAAATATAA 3070 hom 105 het 33 0 36 5 N/A 0 0 141547 CASAVA_Build 10 111636898 12I GTGTACTGAA ------------/CAAAAGCTTTAT CAGCAACATT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 CAAAAGCTTTAT 0 1 141548 CASAVA_Build 10 111707728 2D GAAGAAACCT CA/-- CACACACACA 3070 hom 38 het 44 1 35 8 CA 9 8 141549 CASAVA_Build 10 111756499 1D TTAGGGAGGA G/- GGGGGGGATG 3070 hom 89 het 34 0 29 5 G 8 7 141550 CASAVA_Build 10 111760833 1D TACTAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 2200 het 2200 ref 45 32 5 8 T 15 14 141551 CASAVA_Build 10 111775333 4I AAATAGAAAT ----/AAAG AGAGAGGGTG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 AAAG 0 1 141552 CASAVA_Build 10 111792436 1I TCTGGTGCTG -/T TTTTTTTTTT 2682 het 1189 hom 28 5 13 10 T 15 16 141553 CASAVA_Build 10 111796655 1I AATTTTGTCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 257 hom 48 1 40 7 T 8 9 141554 CASAVA_Build 10 111808942 1D CATACAGGCC G/- GGTACAGTGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 3 2 141555 CASAVA_Build 10 112018509 1D TGTGGTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1471 het 1471 ref 37 28 4 6 A 11 10 141556 CASAVA_Build 10 112032040 8D GCTGAGTAGG AGCCTTTT/-------- AAATAGTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 8 AGCCTTTT 1 0 141557 CASAVA_Build 10 112034544 3I ATAATTAATG ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 51 22 21 8 TTC 2 3 141558 CASAVA_Build 10 112034833 5D TCTCCTCTTT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 AAAAC 5 4 141559 CASAVA_Build 10 112035935 1I GTTAACATAG -/T TAAGTTCAGC 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 T 1 2 141560 CASAVA_Build 10 112037183 4I CCTTAAGAGG ----/TAAC TAACTATCTC 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 TAAC 1 2 141561 CASAVA_Build 10 112037417 1I TTGGGAGCAT -/C CCTTTAGCTA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 C 2 3 141562 CASAVA_Build 10 112038400 4I TGGTTCACTT ----/AAAC AAAATTCCAT 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 AAAC 0 1 141563 CASAVA_Build 10 112042033 1I TTTCAAAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 9 10 141564 CASAVA_Build 10 112066605 4D ATCATTTAGA AAAT/---- AAATAACCCA 3070 het 3070 hom 25 10 11 5 AAAT 2 1 141565 CASAVA_Build 10 112083039 1D CTAATTTACC T/- TTTTTTTTTT 2163 het 2002 hom 18 9 5 4 T 11 10 141566 CASAVA_Build 10 112102374 1D AATTGAGCAG T/- TGTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 T 2 1 141567 CASAVA_Build 10 112129688 2I TGTTTTTGTA --/AT ATTAGTTCAC 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AT 1 2 141568 CASAVA_Build 10 112136671 1I GGAAGTGGAA -/T TTGCTGGACC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 2 3 141569 CASAVA_Build 10 112146879 1D TGAGGGGATT A/- GGGGTGCCAA 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 A 1 0 141570 CASAVA_Build 10 112168440 1D TTTTACTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 12 11 141571 CASAVA_Build 10 112189347 1I TCCTGTGTCC -/A AAAAAAAAAA 2991 het 2565 hom 39 10 16 13 A 13 14 141572 CASAVA_Build 10 112194546 4D AAAGGAAAAT AAAG/---- GAAGAAGGAA 2464 het 2464 ref 28 18 8 3 AAAG 1 0 141573 CASAVA_Build 10 112197703 2I TTTAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 9 11 141574 CASAVA_Build 10 112203038 18I GTTATTTGTG ------------------/GGATCTAAAAATCAAAAC GTGATGGCAT 3070 het 3070 hom 15 7 9 1 GGATCTAAAAATCAAAAC 0 1 141575 CASAVA_Build 10 112203195 1D TTAATGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 7 11 7 A 11 10 141576 CASAVA_Build 10 112204133 4I CCGTCCATAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 AAAC 3 4 141577 CASAVA_Build 10 112207172 1I TAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 A 9 10 141578 CASAVA_Build 10 112215039 1I TGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 9 10 141579 CASAVA_Build 10 112221228 2D CCTAGAAACA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 2219 hom 22 9 9 5 T 11 9 141580 CASAVA_Build 10 112222361 1D AAACTCATAA T/- TTTTTTTTTT 1240 het 397 hom 13 2 4 7 T 19 18 141581 CASAVA_Build 10 112224985 1I CTGTAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 11 23 13 A 15 16 141582 CASAVA_Build 10 112227895 5I GAGCTATGAT -----/CACGC CACTGCACTT 3070 het 3070 ref 25 9 8 8 CACGC 0 1 141583 CASAVA_Build 10 112236130 16D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2204 hom 17 7 10 1 A 27 11 141584 CASAVA_Build 10 112239422 4D TTTCCACTAC CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 28 9 16 4 CAAA 4 3 141585 CASAVA_Build 10 112244339 1I ACAAAATTAT -/A TAACAATTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 141586 CASAVA_Build 10 112246995 1D TCACCGCCGA C/- CCCCAACCCC 3070 hom 76 het 30 0 24 6 C 5 4 141587 CASAVA_Build 10 112251916 3D GTCAGCAGTG TTC/--- TTCTTAGCAC 3070 hom 129 het 46 0 43 3 TTC 2 1 141588 CASAVA_Build 10 112261366 4I CTTCATTGGG ----/ATTT ATTTATTTGT 3070 hom 112 het 42 0 37 5 ATTT 2 3 141589 CASAVA_Build 10 112280737 4D GTCTCTATTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 AAAC 4 3 141590 CASAVA_Build 10 112283989 1D ATGTGTTTGG C/- TGGTTGGTCC 3070 hom 72 het 29 0 23 6 C 1 0 141591 CASAVA_Build 10 112286818 1I ATGAAAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 9 10 141592 CASAVA_Build 10 112287934 1D TTATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 11 10 141593 CASAVA_Build 10 112288870 1I TGTCAGTGTC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 7 8 141594 CASAVA_Build 10 112290186 1D TGTATTCACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 10 9 141595 CASAVA_Build 10 112292464 2D TGAATATGAC AT/-- ATATACACAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AT 3 2 141596 CASAVA_Build 10 112295807 1I ATATGTTGTT -/A ACACAGCGAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 1 2 141597 CASAVA_Build 10 112297770 3D GCTTCTATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 39 het 18 0 14 6 TTG 6 5 141598 CASAVA_Build 10 112304823 4D GATTACCAAG GTTT/---- GTTTATTCAG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 GTTT 2 1 141599 CASAVA_Build 10 112320179 1D GAAGGCATAC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 9 8 141600 CASAVA_Build 10 112323324 3I TTTTGTTCAC ---/TGT TGTTTAATTT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TGT 1 2 141601 CASAVA_Build 10 112332104 6D TGAAGGCTTC TTGTAG/------ TTGTAGTATA 3070 hom 66 het 25 0 23 5 TTGTAG 2 1 141602 CASAVA_Build 10 112342012 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 29 1 18 12 A 15 14 141603 CASAVA_Build 10 112343856 7I AAATGTGATC -------/ATTTGGT ATATAGCAGG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ATTTGGT 0 1 141604 CASAVA_Build 10 112345493 2D GATTCATGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 36 1 29 6 T 12 10 141605 CASAVA_Build 10 112358164 16D GGTATTTTTT TCTTTTTTTTTTTTTC/---------------- TCTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 8 TCTTTTTTTTTTTTTC 1 0 141606 CASAVA_Build 10 112358754 3I ACAAAACGTG ---/TCT TCTTAAAAAT 3070 hom 39 het 18 0 11 7 TCT 1 2 141607 CASAVA_Build 10 112359043 2D CTGAGCGAGA CT/-- CTATCTCAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 CT 2 1 141608 CASAVA_Build 10 112379813 1D TTCGTGGTGC T/- GATCAGTTGC 3070 het 3070 ref 50 23 23 4 T 1 0 141609 CASAVA_Build 10 112387690 1D CCAGTGAGTC G/- GTCGGGCAGA 3070 het 3070 hom 44 14 21 10 G 2 1 141610 CASAVA_Build 10 112392418 1D TTACCAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1487 hom 43 4 25 14 T 12 11 141611 CASAVA_Build 10 112395561 1D TACTGAGTCT C/- CACTTGTGAC 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 C 2 1 141612 CASAVA_Build 10 112395652 3I AAATATTTCA ---/TAT TATTATTCTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TAT 2 3 141613 CASAVA_Build 10 112398463 1D GGGAAGAAAA G/- GGGGGGGTGC 3070 het 389 hom 39 6 14 19 G 8 7 141614 CASAVA_Build 10 112403280 1D ATATAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 29 1 23 5 T 13 12 141615 CASAVA_Build 10 112405653 1I TTTTTTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 10 11 141616 CASAVA_Build 10 112416457 2D CTAACTCACA TC/-- TGTCTGGCTC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TC 1 0 141617 CASAVA_Build 10 112418015 1I CAAAAGGGAA -/G TTAGGGACCA 3070 hom 101 het 40 0 32 8 G 0 1 141618 CASAVA_Build 10 112418356 1D GAGGGAGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 10 9 141619 CASAVA_Build 10 112421485 2D ACTGTTTAAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 44 18 21 6 AT 7 6 141620 CASAVA_Build 10 112424837 3I AATTTGTCTG ---/GAA GAAGAAGAAC 3070 hom 129 het 51 0 40 11 GAA 3 4 141621 CASAVA_Build 10 112426540 1D ACAAATGCTA T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 8 7 141622 CASAVA_Build 10 112427074 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 11 9 141623 CASAVA_Build 10 112431571 1I ACTACAGACA -/T TTTTTCAGAT 3070 hom 89 het 33 0 30 3 T 5 6 141624 CASAVA_Build 10 112448001 1I GCAAAGACTT -/C CCCCTATACT 2636 het 2636 ref 17 8 8 1 C 4 5 141625 CASAVA_Build 10 112452740 1D TTTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 2772 het 2245 hom 27 10 10 7 T 11 10 141626 CASAVA_Build 10 112460935 1D AAAATTAGCT G/- GGCGTGGTGG 3070 het 950 hom 14 3 10 1 G 3 2 141627 CASAVA_Build 10 112466672 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1021 hom 24 6 12 6 A 12 11 141628 CASAVA_Build 10 112481402 5I CATTTCTCCC -----/TCTTG TCTTGTTATC 3070 het 3070 hom 52 19 21 12 TCTTG 1 2 141629 CASAVA_Build 10 112484546 1D CCCCACTCAT G/- CCCCCTGAAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 5 G 1 0 141630 CASAVA_Build 10 112486410 1I TGGCTCTGCC -/A AAACACCCTG 3070 het 3070 ref 41 15 13 13 A 3 4 141631 CASAVA_Build 10 112500751 10I GAAGTGGGGC ----------/AGATGGGATG AGACTAGAGT 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 AGATGGGATG 0 1 141632 CASAVA_Build 10 112511234 1D TTAAGTTCCT G/- TGTACTTGGC 3070 het 3070 hom 52 15 24 13 G 1 0 141633 CASAVA_Build 10 112514022 4D AGCAAGCAAG CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 33 11 12 11 CAAA 4 3 141634 CASAVA_Build 10 112539164 1I TTTGTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 T 10 11 141635 CASAVA_Build 10 112541654 1D ACCTGTCTTA C/- GTGTGGCTCC 3070 het 3070 ref 45 19 17 10 C 1 0 141636 CASAVA_Build 10 112561812 1D CGAGTGGCCA G/- TGCTGTGCTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 G 1 0 141637 CASAVA_Build 10 112563858 1I CTGACCTGGG -/T AGTTGGTGAC 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 0 1 141638 CASAVA_Build 10 112564130 1I TACAGCGGAT -/G GAGCTGCTCT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 G 1 2 141639 CASAVA_Build 10 112568234 1I ACAGTTGGCG -/T TTTCAGTCTC 2615 het 2615 ref 32 15 9 8 T 3 4 141640 CASAVA_Build 10 112574761 8D CAGGTGTACC ATTTTTAT/-------- AGTCAGATCT 3070 het 3070 hom 30 12 12 8 ATTTTTAT 1 0 141641 CASAVA_Build 10 112574794 1I GCAAACTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1202 hom 31 5 14 12 T 10 11 141642 CASAVA_Build 10 112578416 9D ACTTACAGCA CTATTATTC/--------- CTATTTCACA 3070 het 3070 ref 53 26 23 8 CTATTATTC 1 0 141643 CASAVA_Build 10 112578585 1D TTTGTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 G 1 0 141644 CASAVA_Build 10 112580343 1I TTTTATTTAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 8 9 141645 CASAVA_Build 10 112593424 9I TAGTGGGAGC ---------/CCCTCTGGA GGGGACACTG 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 CCCTCTGGA 0 1 141646 CASAVA_Build 10 112597774 4D TTGTACAATT AAGA/---- AAGAAAACGA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAGA 2 1 141647 CASAVA_Build 10 112598133 2D TCTTCATAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 29 0 21 9 T 13 11 141648 CASAVA_Build 10 112601198 4I GAGAGAGAGC ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 GA 5 7 141649 CASAVA_Build 10 112603392 2D ACAATATGTG TA/-- TATCATTTCA 3070 hom 117 het 48 0 39 9 TA 2 1 141650 CASAVA_Build 10 112611867 1I GTATAGTACT -/C CATTTGCTGA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 C 1 2 141651 CASAVA_Build 10 112612350 1I GGTGGTACTT -/A AAAGTATTCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 3 4 141652 CASAVA_Build 10 112656318 1I TTCTTCTTCC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 8 9 141653 CASAVA_Build 10 112658541 1D AGGAATGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 780 hom 46 2 30 14 A 15 14 141654 CASAVA_Build 10 112658952 3D AAAAGTTGGC CTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 CTT 1 0 141655 CASAVA_Build 10 112667578 2D TAAGCGCTAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 108 het 45 0 37 9 TA 6 5 141656 CASAVA_Build 10 112672201 2I TTCTTTAAAC --/TG TTCAGATATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TG 0 1 141657 CASAVA_Build 10 112673434 2D CATTTATGAG AA/-- AGAGTGAACA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 3 1 141658 CASAVA_Build 10 112691880 10I CATTGGTCTT ----------/CTGGAAAATA CTGGCTCTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CTGGAAAATA 0 1 141659 CASAVA_Build 10 112694133 1I TCTTTGAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1972 hom 35 7 16 12 A 16 17 141660 CASAVA_Build 10 112704278 4I TATGGGTCTT ----/AATC AACTACTATA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AATC 0 1 141661 CASAVA_Build 10 112720478 1D TGTGATGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 468 hom 48 4 31 13 T 15 14 141662 CASAVA_Build 10 112725342 4D TCATTTTTCC TTTG/---- TTTAATTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 TTTG 1 0 141663 CASAVA_Build 10 112729633 3I TCAGAGAATT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 117 het 48 0 39 9 TTG 3 4 141664 CASAVA_Build 10 112750809 1I CGCCAGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 24 0 18 6 T 13 14 141665 CASAVA_Build 10 112752528 1D TCATTCTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 668 hom 36 2 24 11 A 13 12 141666 CASAVA_Build 10 112760430 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 9 8 141667 CASAVA_Build 10 112767253 1I AATGTCAGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 73 het 38 0 25 13 T 8 9 141668 CASAVA_Build 10 112773266 2I GCAGAGAGAG --/AA ATTCTACAAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 1 3 141669 CASAVA_Build 10 112786094 2I CCTTGAAAAC --/AT GTGAAAAAGC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 AT 0 1 141670 CASAVA_Build 10 112799227 1D CCCAACAAAG A/- AAAAGCCCAG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 5 4 141671 CASAVA_Build 10 112831734 4I CCCTCTGGGC ----/CATA CATGCAGCAT 3070 hom 101 het 39 0 34 5 CATA 0 1 141672 CASAVA_Build 10 112834310 1D TGGAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 1915 het 1915 ref 38 15 9 14 T 17 16 141673 CASAVA_Build 10 112885813 4D AAAATAAAAA CTGT/---- CTGACTTCAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 CTGT 1 0 141674 CASAVA_Build 10 112902141 2I ACCCTTGTGA --/CT CTATCATCGT 3070 hom 179 het 65 0 57 8 CT 1 2 141675 CASAVA_Build 10 112942391 1I TCTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1590 het 1590 ref 52 34 4 14 A 13 14 141676 CASAVA_Build 10 112988621 1D GCTTGAAAGT A/- AAAAATTACT 3070 hom 105 het 37 0 35 4 A 6 5 141677 CASAVA_Build 10 113005590 1D TGAGGTAAGG C/- ACAGCAAGTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 1 0 141678 CASAVA_Build 10 113010940 2D GAGGGGAAAC AG/-- AGACAGGGAG 3070 hom 120 het 48 0 41 9 AG 2 1 141679 CASAVA_Build 10 113016408 1D AATGTACGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 9 8 141680 CASAVA_Build 10 113017300 1I GGGTTGGGGG -/A AGCCATGGAG 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 1 2 141681 CASAVA_Build 10 113017835 1D CAAATAGAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 8 7 141682 CASAVA_Build 10 113022147 1I GAAGGGAGGG -/A GGGGAGAAGA 3070 hom 75 het 32 0 23 9 A 0 1 141683 CASAVA_Build 10 113025269 1I ACATGTAACT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 8 9 141684 CASAVA_Build 10 113025402 1D GGAGACAATA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 60 het 23 0 20 4 T 9 8 141685 CASAVA_Build 10 113026943 1I TCACACCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 42 0 26 16 A 10 11 141686 CASAVA_Build 10 113044551 1I ATGTTGAGCA -/T TTTTTTCATA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 6 7 141687 CASAVA_Build 10 113050748 2I AGATGTGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 489 hom 39 2 35 2 AC 8 9 141688 CASAVA_Build 10 113071991 6I AAAGTGTATT ------/ATAAAC ATAACAGCTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATAAAC 0 1 141689 CASAVA_Build 10 113072694 1I GTGACAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 31 0 24 7 A 10 11 141690 CASAVA_Build 10 113074383 1I ATATTGAGAC -/A ACAAAAATAC 3070 hom 120 het 41 0 41 0 A 1 2 141691 CASAVA_Build 10 113075448 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 16 1 10 5 A 17 16 141692 CASAVA_Build 10 113080307 1I TGGAGGCATT -/A ATTCCTACTT 3070 hom 153 het 55 0 51 4 A 1 2 141693 CASAVA_Build 10 113080495 1D TATTCATTTA C/- TTTTCCCATC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 C 1 0 141694 CASAVA_Build 10 113083822 2I AGGAGACAAA --/AT ATTCACACCT 3070 hom 72 het 28 0 23 5 AT 1 2 141695 CASAVA_Build 10 113093643 12D ACACATACAC ACACACACACAT/------------ ACACACACAC 3070 hom 78 het 32 0 26 9 ACACACACACAT 1 0 141696 CASAVA_Build 10 113095350 3I CAAAAACGAG ---/AAA AAAAAGCACT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 5 8 141697 CASAVA_Build 10 113100537 1I TACAATGCAC -/A AGATGCCCCC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 141698 CASAVA_Build 10 113100733 1D GAAAGAAATG T/- GATGGAAAGA 3070 hom 132 het 48 0 43 6 T 1 0 141699 CASAVA_Build 10 113101298 1I CTTTAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 18 hom 38 1 35 2 A 9 10 141700 CASAVA_Build 10 113102368 2I AGACCCCCTC --/TA TGTGATGTAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TA 0 1 141701 CASAVA_Build 10 113103804 1I CTGCATCATT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 7 8 141702 CASAVA_Build 10 113104089 1D GGAGGGAAGC A/- AGCCAGCAAG 3070 hom 132 het 50 0 43 7 A 2 1 141703 CASAVA_Build 10 113114179 1I ATTAGGTATT -/A TTTTTTTGCC 3070 hom 105 het 41 0 34 7 A 0 1 141704 CASAVA_Build 10 113116101 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGCATCC 1325 het 1325 ref 31 15 7 9 G 6 5 141705 CASAVA_Build 10 113119009 1I CCCACCCAGA -/G ACAAGGAGGA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 0 1 141706 CASAVA_Build 10 113127116 1D TGGGCAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 24 1 20 3 A 12 11 141707 CASAVA_Build 10 113131830 1D AAACAGGAAG A/- GAGGTTCTCA 3070 het 3070 ref 37 19 18 1 A 1 0 141708 CASAVA_Build 10 113139276 1D GCTGGACAGA G/- ACCATGTCAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 6 G 1 0 141709 CASAVA_Build 10 113150897 10I CTGTGTGGGT ----------/TTATTTTCTG GACTGTCTAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TTATTTTCTG 0 1 141710 CASAVA_Build 10 113151504 4D ATTTCTGTAC ACAG/---- ACAGAAGATA 3070 het 3070 hom 36 16 16 6 ACAG 2 1 141711 CASAVA_Build 10 113154413 1I ACAGGTACAG -/T TGTAGACTAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 1 2 141712 CASAVA_Build 10 113158499 1I ACTTCCTCCT -/C CCCTTGGCAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 3 4 141713 CASAVA_Build 10 113160661 4I TTTTTGAGAC ----/ACAG ACAGTGAGAT 3070 hom 150 het 60 0 49 11 ACAG 1 2 141714 CASAVA_Build 10 113164572 3D GTACATAATC ATT/--- ATAAATATTA 3070 hom 90 het 37 0 31 9 ATT 1 0 141715 CASAVA_Build 10 113166188 1I CATACATACA -/T TTTTTAGGGA 3070 hom 130 het 50 0 43 7 T 5 6 141716 CASAVA_Build 10 113205503 2D GTTGAGAAAG TC/-- TGTTTACACC 3070 hom 93 het 36 0 31 6 TC 1 0 141717 CASAVA_Build 10 113214620 3I CACATTAGAT ---/GTG GTGGTAAGAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 GTG 1 2 141718 CASAVA_Build 10 113215297 1I ACATATATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 9 10 141719 CASAVA_Build 10 113219708 1D AACTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1766 het 1766 ref 47 30 4 13 A 12 11 141720 CASAVA_Build 10 113221995 1D CTCGCACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 101 het 40 0 34 6 A 10 9 141721 CASAVA_Build 10 113222945 2D AATTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2014 het 338 hom 50 3 8 39 T 14 12 141722 CASAVA_Build 10 113224359 1I TTATACTGAT -/A ACAGTTGCAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 141723 CASAVA_Build 10 113233272 1I TGTGTACCTG -/C CCAGTGCCAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 2 3 141724 CASAVA_Build 10 113252660 5I GATGAAAATC -----/TTTAA TTTTTTTCCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TTTAA 0 1 141725 CASAVA_Build 10 113262433 2D CTAGACCAAT GA/-- GAGAGAAATT 3070 hom 113 het 41 0 38 3 GA 4 3 141726 CASAVA_Build 10 113265966 4D GGCAAACTGG TGAC/---- TGACAGTGGT 3070 hom 90 het 33 0 31 5 TGAC 2 1 141727 CASAVA_Build 10 113273230 1D TATTTACAGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 156 het 63 0 52 12 A 9 8 141728 CASAVA_Build 10 113275942 1D TAATCTTTAC A/- TCTTAAATAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 141729 CASAVA_Build 10 113276939 3D ATAGGGAATC ATT/--- ATATTTCTGA 3070 hom 138 het 52 0 47 7 ATT 1 0 141730 CASAVA_Build 10 113279222 4I ATAAGGAAAA ----/AGAT AGATAGAGAA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 AGAT 1 2 141731 CASAVA_Build 10 113280085 1D GATCTAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 11 10 141732 CASAVA_Build 10 113282288 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTGTGTCT 3070 het 860 hom 38 5 22 11 C 1 0 141733 CASAVA_Build 10 113282855 1I ATAAAAAAAA -/T AATAATAAAA 2843 hom 24 het 10 0 8 2 T 0 1 141734 CASAVA_Build 10 113318019 1I3M4D ACTCTCAGAA -ACTGGTG/CTCT---- CAGGGTTCAC 3070 hom 93 het 34 0 30 8 N/A 0 0 141735 CASAVA_Build 10 113327544 2D GAGAAATAGG AA/-- AAGTCCATAG 3070 hom 157 het 59 0 53 6 A 4 2 141736 CASAVA_Build 10 113340186 2D CATTGGTGAA AT/-- ATATGTTTTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 3 2 141737 CASAVA_Build 10 113356629 1I GAATAACCTT -/A ACTCAGCCTT 3070 hom 138 het 49 0 46 3 A 1 2 141738 CASAVA_Build 10 113357105 4I TAATTTTTTT ----/CAGA CAGAGTCTCA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 CAGA 1 2 141739 CASAVA_Build 10 113377403 1D GGCATTATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 34 0 28 9 A 10 9 141740 CASAVA_Build 10 113385601 1I TTCAGTCAGT -/G TTAGACATTT 3070 hom 157 het 57 0 53 4 G 0 1 141741 CASAVA_Build 10 113395330 1D AGGTGACAGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 70 het 28 0 24 4 G 11 10 141742 CASAVA_Build 10 113423643 1I ATTTTAAAAG -/A AAAACTACAG 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 4 5 141743 CASAVA_Build 10 113427608 4D GTTTAGAAAA TCAT/---- TCATTGTGAC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TCAT 2 1 141744 CASAVA_Build 10 113428517 4D ATAACAATAT AAAG/---- ATTTATTAAC 3070 hom 129 het 45 0 44 2 AAAG 1 0 141745 CASAVA_Build 10 113428800 1I TTCTAAGGAG -/A AAAAAAGCAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 6 7 141746 CASAVA_Build 10 113438626 1D CCAATATCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 11 10 141747 CASAVA_Build 10 113442159 1I ATACTGGCAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 8 9 141748 CASAVA_Build 10 113446587 1D AAAAGGTGGG A/- AAAAAAGGCA 3070 hom 120 het 46 0 40 7 A 7 6 141749 CASAVA_Build 10 113447555 1I AAAACATTTT -/C TTTTATGTTC 3070 hom 66 het 37 0 32 5 C 0 1 141750 CASAVA_Build 10 113448783 2D TAGAATAATT TA/-- TATAGATACT 3070 hom 104 het 41 0 35 8 TA 3 2 141751 CASAVA_Build 10 113450329 6D TTATCTTTTG ACAATT/------ ACAACCACTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ACAATT 1 0 141752 CASAVA_Build 10 113452164 1D CTAGTCTGAC T/- TTTTTTTTTC 1109 het 1109 ref 48 36 3 9 T 10 9 141753 CASAVA_Build 10 113454830 1I AAAATAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1122 hom 42 3 30 9 A 10 11 141754 CASAVA_Build 10 113465878 2D GGATAGATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 39 0 26 16 A 16 14 141755 CASAVA_Build 10 113475688 1I TATTTACTAT -/G GGGTTAGTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 3 4 141756 CASAVA_Build 10 113483471 8D AGATATAGAT ATATACAC/-------- ACACACACAC 2410 hom 20 het 6 0 7 2 ATATACAC 1 0 141757 CASAVA_Build 10 113503041 1D TTGTTTTGTG T/- GTGTGTATGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 0 141758 CASAVA_Build 10 113514543 2I CATGCTCAAC --/AA AGAGTCAGTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 3 141759 CASAVA_Build 10 113515750 1D CCTGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 35 1 26 8 A 14 13 141760 CASAVA_Build 10 113529642 1D CAAAGCTCCC T/- TTTTTTTGAC 3070 hom 123 het 46 0 40 6 T 8 7 141761 CASAVA_Build 10 113539406 1I AAAGTCATTA -/C AGTGAATGAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 0 1 141762 CASAVA_Build 10 113556959 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 28 1 24 3 T 11 10 141763 CASAVA_Build 10 113557524 1D CCACTTTGCT G/- GGGGGTGCAT 3070 hom 78 het 33 0 28 5 G 6 5 141764 CASAVA_Build 10 113569431 1D GTTGGGGGGA G/- GGGGGGAGGG 1396 het 26 hom 5 1 3 1 G 7 6 141765 CASAVA_Build 10 113571320 2I CCACTGTGCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 636 hom 32 2 21 9 A 13 15 141766 CASAVA_Build 10 113572603 6D AGAATACATT ATTTCC/------ ACTCACGTGT 3070 het 293 hom 48 4 18 26 ATTTCC 1 0 141767 CASAVA_Build 10 113579809 1D GTCGTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 40 1 36 3 A 11 10 141768 CASAVA_Build 10 113584058 1D ATTCCCCCCG C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 76 het 33 0 29 4 C 9 8 141769 CASAVA_Build 10 113592436 5D ACTTTTTACT TTATA/----- TATTTTTTAA 3070 hom 96 het 33 0 33 2 TTATA 1 0 141770 CASAVA_Build 10 113593623 1I CATCACTATT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 8 9 141771 CASAVA_Build 10 113595829 4I ATAGATAGAT ----/AGAC AGACAGACAG 3070 hom 112 het 46 0 37 9 AGAC 3 4 141772 CASAVA_Build 10 113627188 2D ACAGGTTTAC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 69 het 31 0 24 9 CT 7 6 141773 CASAVA_Build 10 113648893 2I46M4D ACACATATAC --ATATATATATATATACACGCATATTTATATACATATATCTCTTTATACAC/ATATATATATATATATACACGCATATTTATATACATATATCTCTTTAT---- ACACACACAC 3070 het 520 hom 26 2 32 4 N/A 0 0 141774 CASAVA_Build 10 113649663 1D CTCACTGTTT G/- GAAAATTGTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 G 2 1 141775 CASAVA_Build 10 113651386 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1499 het 346 hom 13 2 6 5 A 15 14 141776 CASAVA_Build 10 113654994 1I ATTTCACAGA -/T TTTTTTATAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 6 7 141777 CASAVA_Build 10 113662681 4D CAAAGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 90 het 39 0 31 9 TTTG 5 4 141778 CASAVA_Build 10 113676828 1D CCTCAAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 589 hom 36 2 26 8 A 13 12 141779 CASAVA_Build 10 113677625 1I CAGTGGTTCC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 8 9 141780 CASAVA_Build 10 113685722 1I AGAGATTAGC -/A CTTCAACCAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 141781 CASAVA_Build 10 113687469 1I CATTGACAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 318 hom 55 1 41 13 T 9 10 141782 CASAVA_Build 10 113688737 3D TATGGGAAAT AGA/--- AGTTGTCCTG 3070 hom 123 het 45 0 41 5 AGA 1 0 141783 CASAVA_Build 10 113697230 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 21 0 14 8 A 16 14 141784 CASAVA_Build 10 113708971 2I GCAACAGAAT --/TG TAGTAGTGAT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 TG 0 1 141785 CASAVA_Build 10 113719139 2D TAATATAAAA AG/-- AGATCTTATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AG 2 1 141786 CASAVA_Build 10 113721499 3D TTGTCTATAT TAC/--- TAATTTTCAA 3070 hom 87 het 32 0 30 5 TAC 1 0 141787 CASAVA_Build 10 113724078 1D AACATGATAA G/- GGCAGCCTGT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 G 3 2 141788 CASAVA_Build 10 113751747 4D TCTCAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 20 10 10 1 AAAG 3 2 141789 CASAVA_Build 10 113754903 1D CTGGTCCTGG A/- AAAAAAAAAA 2021 het 2021 ref 30 15 5 11 A 17 16 141790 CASAVA_Build 10 113835618 1I TGTTATTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 13 14 141791 CASAVA_Build 10 113852724 1I TTCTCTGGTG -/C TGCAGGCACT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 0 1 141792 CASAVA_Build 10 113852933 1I CTGACTAGAA -/T TAGAGCTCAA 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 1 2 141793 CASAVA_Build 10 113903618 2D TCTTTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3043 hom 25 11 9 5 T 13 11 141794 CASAVA_Build 10 113913195 3D CAAATCATTT TAA/--- TAATAACTAT 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 TAA 3 2 141795 CASAVA_Build 10 113923850 11I AATTTACTGG -----------/GTGACAACTAT GTGAATTTGA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 GTGACAACTAT 0 1 141796 CASAVA_Build 10 114036169 12D CCATTACTTC CCTGTGGCCTTT/------------ CCTTTCTAGG 3070 het 3070 ref 52 29 22 4 CCTGTGGCCTTT 1 0 141797 CASAVA_Build 10 114095194 10D ATTTCTGCAT GTGGTAACAG/---------- GTGTTATCCC 3070 het 3070 ref 39 23 15 8 GTGGTAACAG 1 0 141798 CASAVA_Build 10 114098550 5I CATACCATAA -----/TGTTC TGCAGCTTGA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 TGTTC 0 1 141799 CASAVA_Build 10 114098767 25I CAAAACAATG -------------------------/TGGTCCATCCTCTCCTCTCCTCATC TGCCTGAAGG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TGGTCCATCCTCTCCTCTCCTCATC 0 1 141800 CASAVA_Build 10 114104820 1I ACAACCAAAC -/A AAATACAAGT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 3 4 141801 CASAVA_Build 10 114105750 1I ACAGAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 24 1 17 6 A 11 12 141802 CASAVA_Build 10 114113656 1D TCAGGGGGAT A/- AAAAAAAAAA 2122 het 134 hom 27 2 10 15 A 14 13 141803 CASAVA_Build 10 114113907 1I CACACTTGGG -/T TAACACTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 1 2 141804 CASAVA_Build 10 114115258 13D5M1D TGACTTGAAA AGGCTTGACGTAGAGGTCA/-------------AGGTC- AAACAGCCTA 3070 het 3070 ref 43 30 17 6 N/A 0 0 141805 CASAVA_Build 10 114118368 1D TCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 19 1 16 2 A 12 11 141806 CASAVA_Build 10 114133561 1I CATTTTATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 10 141807 CASAVA_Build 10 114141117 1I ACTGTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 42 2 31 9 A 14 15 141808 CASAVA_Build 10 114158047 1D GCACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1719 het 1719 ref 29 9 6 14 A 16 15 141809 CASAVA_Build 10 114175847 1I ACAGTTCCAT -/G GGTGTTGAAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 2 3 141810 CASAVA_Build 10 114178519 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 114 hom 25 1 20 5 A 12 11 141811 CASAVA_Build 10 114198354 2D TTTTGTTTAG TT/-- TTGTTAGGGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 T 4 2 141812 CASAVA_Build 10 114201948 1D TGGGCAAGGT C/- CCAGCTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 3 2 141813 CASAVA_Build 10 114202708 1I TCTGTTTGTT -/G CTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 G 0 1 141814 CASAVA_Build 10 114213061 1D CACTTGCAAT C/- ATCGTTACTA 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 C 1 0 141815 CASAVA_Build 10 114216585 1I TCTGGAAACT -/G GAAGTTGGAG 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 G 1 2 141816 CASAVA_Build 10 114216970 1D GTCTTTTTTG T/- TTCTCAAAGA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 3 2 141817 CASAVA_Build 10 114222283 1D ACCCATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2475 hom 44 12 18 14 T 16 15 141818 CASAVA_Build 10 114233527 2D TGGGGATTTC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 AG 9 8 141819 CASAVA_Build 10 114263481 1D TCTGTTGAGG T/- TTTTTTATTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 7 6 141820 CASAVA_Build 10 114268401 2D TATATACGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TA 9 8 141821 CASAVA_Build 10 114314493 1D GGCTCCTGGC T/- TTTTAAAGGA 2257 het 2257 ref 23 11 7 6 T 5 4 141822 CASAVA_Build 10 114317907 1I CTGGACAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 389 hom 44 1 38 5 A 9 10 141823 CASAVA_Build 10 114321813 1I GGATCATTGC -/T ACCTCAAACC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 0 1 141824 CASAVA_Build 10 114325594 1D CAAATTGTTC T/- GTTAAATTAA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 1 0 141825 CASAVA_Build 10 114335881 1I AAAGAGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 17 13 T 11 12 141826 CASAVA_Build 10 114339174 8D CATGATCGTG GAACTGTA/-------- AGTTCCACCC 3070 het 3070 hom 37 13 15 11 GAACTGTA 1 0 141827 CASAVA_Build 10 114346065 1I ATATAATAAT -/A AAAAAAGCCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 6 7 141828 CASAVA_Build 10 114351176 1I AATTATTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 35 1 25 9 T 13 14 141829 CASAVA_Build 10 114359925 1D TTTTCCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3061 het 3061 ref 25 14 9 3 T 13 12 141830 CASAVA_Build 10 114376166 2I GAGATATATA --/TT ATCAACATTC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 0 2 141831 CASAVA_Build 10 114379057 1I TATGACCAGG -/C CCCTGAAGGG 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 C 3 4 141832 CASAVA_Build 10 114393735 1D AATAGGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 12 13 A 13 12 141833 CASAVA_Build 10 114400211 1I ACTCTTCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 140 hom 30 1 26 3 T 9 10 141834 CASAVA_Build 10 114406137 2D TTCCCAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 2480 het 17 hom 23 1 8 14 T 20 18 141835 CASAVA_Build 10 114415054 1D ACAGTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 34 1 22 11 A 13 12 141836 CASAVA_Build 10 114421920 1D ACCTGTTTGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 9 8 141837 CASAVA_Build 10 114428729 1I TTCATTTTTG -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 7 8 141838 CASAVA_Build 10 114435411 1D GATGTTGTTG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 T 7 6 141839 CASAVA_Build 10 114528446 1I GTCCTCCAGG -/A AAAAAATTTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 6 7 141840 CASAVA_Build 10 114529507 14D AGAATAATCG GAAAATAGGCATCT/-------------- GAAGGATTAC 3070 het 3070 ref 43 24 21 7 GAAAATAGGCATCT 1 0 141841 CASAVA_Build 10 114531456 14D GGGGTGTGAT GGTGCACACTCATA/-------------- GGTGCACACT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 GGTGCACACTCATA 2 1 141842 CASAVA_Build 10 114538986 1I ACTAAAAAAA -/C ATTCTCTTAT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 C 0 1 141843 CASAVA_Build 10 114539702 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 42 0 31 11 T 13 12 141844 CASAVA_Build 10 114547305 1D GAGATTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 A 11 10 141845 CASAVA_Build 10 114547453 1D AGGATTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 G 1 0 141846 CASAVA_Build 10 114547808 2D AAACACCAGG CT/-- CCAAAGCTTC 3070 hom 122 het 45 0 40 7 CT 1 0 141847 CASAVA_Build 10 114560704 1I GTTCTTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 A 10 11 141848 CASAVA_Build 10 114568558 1D GTGGTACCCC A/- AGCAGCCTCT 3070 het 3070 ref 36 20 16 2 A 2 1 141849 CASAVA_Build 10 114610714 1I AAAGAGCCAC -/A GGAAGGCTTA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 A 0 1 141850 CASAVA_Build 10 114621609 2I AGCCAGTTCC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 AT 5 6 141851 CASAVA_Build 10 114693841 1D AAGTCATTAG A/- AATTCAGTGT 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 A 3 2 141852 CASAVA_Build 10 114703941 1D ATAGGGTGTG T/- TTTTAATGGC 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 T 5 4 141853 CASAVA_Build 10 114708920 1I CAAGCTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 17 9 T 11 12 141854 CASAVA_Build 10 114709732 1D AAATGATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 T 11 10 141855 CASAVA_Build 10 114712125 1D CCTACTCTGC T/- TTGAAGGAGA 3070 het 3070 ref 48 23 22 5 T 3 2 141856 CASAVA_Build 10 114731058 1D ACCCGTCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 9 10 A 13 12 141857 CASAVA_Build 10 114762244 1I AAAGGCACTC -/A AAAGGAAGAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 3 4 141858 CASAVA_Build 10 114765813 1D GCTTGGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 41 2 22 18 T 15 14 141859 CASAVA_Build 10 114767129 8D ACAAATGACC AGTGGTGG/-------- AGCGGGAGCT 3070 hom 105 het 40 0 32 8 AGTGGTGG 1 0 141860 CASAVA_Build 10 114769548 2D ACAGCTGACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 13 11 141861 CASAVA_Build 10 114772572 2I CTGTGCTGAG --/CT AGAGGTGAGT 3070 hom 160 het 54 0 54 0 CT 0 1 141862 CASAVA_Build 10 114781230 1D CTGTGCAACC T/- TTTTTTTTTT 1511 het 331 hom 31 4 7 20 T 19 18 141863 CASAVA_Build 10 114827439 1I AATTTCTTTC -/T TTTTCTTTTC 1130 het 1130 ref 16 8 5 3 T 4 5 141864 CASAVA_Build 10 114827881 1I CTTCAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 A 11 12 141865 CASAVA_Build 10 114832093 3I CTTGAAAAAA ---/ATT ATTATCTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 ATT 1 2 141866 CASAVA_Build 10 114836523 1I AAAAAAAAAA -/G AAACTATAGT 3070 het 2315 hom 27 9 12 6 G 0 1 141867 CASAVA_Build 10 114857802 1I TCTTGGTCTT -/C CCTTTGAGAG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 C 2 3 141868 CASAVA_Build 10 114869420 1D CCTTAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 1287 het 1287 ref 40 32 3 6 T 11 10 141869 CASAVA_Build 10 114873951 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 8 7 141870 CASAVA_Build 10 114874993 1D AAGATTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2883 hom 24 8 12 4 A 12 11 141871 CASAVA_Build 10 114875545 2D CAAACAAAAA AG/-- AGAAAGGGAA 3070 het 3070 ref 31 12 13 9 AG 2 1 141872 CASAVA_Build 10 114875861 1D GGTAGGTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 G 1 0 141873 CASAVA_Build 10 114879828 1D TATGCTTTTT C/- CCCCCCCTTA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 C 8 7 141874 CASAVA_Build 10 114896371 1I AAAGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2053 het 2053 ref 26 11 9 6 T 13 14 141875 CASAVA_Build 10 114945416 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1401 het 1401 ref 36 25 4 7 T 12 11 141876 CASAVA_Build 10 115056896 1D GTTTTGTGAT A/- AAAAAAAAAA 1076 het 1076 ref 40 30 3 8 A 11 10 141877 CASAVA_Build 10 115057448 1D CCCTGCCTCT A/- AAAAAAAAAA 586 het 586 ref 41 26 3 13 A 13 12 141878 CASAVA_Build 10 115068930 8D TGTGTGGGGG GGGGGGGT/-------- GGGTGGCAAT 400 het 36 hom 28 0 5 27 GGGGGGGT 1 0 141879 CASAVA_Build 10 115077306 11D AGTTTATTTT TTATTTTTTTA/----------- TTATTTTTTT 3070 het 2969 hom 24 7 14 4 TTATTTTTTTA 2 1 141880 CASAVA_Build 10 115080790 1I CAGAAAGCAA -/C AGAGTGAGAG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 C 0 1 141881 CASAVA_Build 10 115087051 1D AAAACCCACA T/- TTTTAAAAAT 3070 hom 98 het 42 0 27 15 T 5 4 141882 CASAVA_Build 10 115095329 1I TGAGGGGAAA -/C TTGTAGTACC 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 C 0 1 141883 CASAVA_Build 10 115106141 5I GAGACACGGA -----/GAGTT GAGTTAAGGT 3070 het 3070 ref 51 20 19 12 GAGTT 1 2 141884 CASAVA_Build 10 115117445 2I GAAGTCCTGC --/AA AAAAAAAACC 3070 hom 114 het 44 0 37 7 A 8 10 141885 CASAVA_Build 10 115121305 2D GATTTCACAC AT/-- GTTGTTTATT 3070 het 3070 ref 54 23 19 18 AT 1 0 141886 CASAVA_Build 10 115122299 2D GAAGGGCCTC CT/-- CTCTCTCTCT 1273 het 1273 ref 52 45 3 4 CT 6 5 141887 CASAVA_Build 10 115134709 1I AAGAATAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 11 12 141888 CASAVA_Build 10 115141786 1D ATTTGGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 15 14 141889 CASAVA_Build 10 115141904 3I TAATATGGTT ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 32 14 8 10 ATA 5 6 141890 CASAVA_Build 10 115142374 1I GGTTTGAAAG -/A AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 A 6 7 141891 CASAVA_Build 10 115142768 2D GCTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2146 het 1065 hom 15 5 6 4 A 16 14 141892 CASAVA_Build 10 115145739 1D GTAGGGCTGG A/- AAGGCCCACA 3070 hom 168 het 64 0 55 9 A 3 2 141893 CASAVA_Build 10 115161579 1D GTGTAATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2905 hom 30 11 13 6 A 12 11 141894 CASAVA_Build 10 115183940 1I CATAAAGCCC -/T GATTTGCTCT 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 T 0 1 141895 CASAVA_Build 10 115184187 2D CAAAGAATGT TC/-- TCTGTCTGGT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 TC 2 1 141896 CASAVA_Build 10 115192759 1D CTTACCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1558 het 69 hom 39 2 6 31 T 17 16 141897 CASAVA_Build 10 115203264 1D TAGTACCCCC T/- GGCACTGTGG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 1 0 141898 CASAVA_Build 10 115203963 3I TTTCACACCA ---/AAT AATGATGGGA 2797 hom 6 het 17 0 9 8 AAT 1 2 141899 CASAVA_Build 10 115219679 1D TCAGTGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 28 1 23 5 A 12 11 141900 CASAVA_Build 10 115225826 1D TTGGAACTTT A/- AAAAAAAAAA 2758 het 386 hom 16 1 8 8 A 15 14 141901 CASAVA_Build 10 115231644 1I CTTTGTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 547 hom 35 2 28 5 T 11 12 141902 CASAVA_Build 10 115232577 1D GACTTCACAC A/- CCATAATGGC 3070 het 3070 ref 46 19 18 10 A 1 0 141903 CASAVA_Build 10 115259857 2D TTGTACCAAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 19 0 15 6 AT 7 6 141904 CASAVA_Build 10 115264492 4D AAAAAACAAC AACA/---- AACAACAACA 1555 het 1489 hom 29 10 9 10 AACA 2 1 141905 CASAVA_Build 10 115265747 4I GCAGCTGGGG ----/AAGA AAGAAAGCTG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 AAGA 1 2 141906 CASAVA_Build 10 115275550 1I GATCACACAG -/C CCCAAGTCGC 3070 hom 100 het 39 0 31 8 C 3 4 141907 CASAVA_Build 10 115284858 1I GAGCCTGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 33 2 23 8 T 11 12 141908 CASAVA_Build 10 115287268 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 977 het 977 ref 16 7 4 6 A 15 14 141909 CASAVA_Build 10 115324787 5I GACAGAAAAG -----/AAAAT AAGAAGCTGG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AAAAT 0 1 141910 CASAVA_Build 10 115337088 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 9 10 141911 CASAVA_Build 10 115337252 4D TAAAATGGAA ATCT/---- ATCTATAAGA 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 ATCT 2 1 141912 CASAVA_Build 10 115338717 1D ATCAGGGTGG A/- CATGGCTCAC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 1 0 141913 CASAVA_Build 10 115339388 1D TTGCAAGCCA G/- GGGTGGCTTT 3070 hom 97 het 41 0 31 11 G 4 3 141914 CASAVA_Build 10 115345162 1I TTTAGCTCAG -/C CCCATTACCA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 C 3 4 141915 CASAVA_Build 10 115348233 1D CTTTGAACTC T/- TGGGTTCAAC 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 T 2 1 141916 CASAVA_Build 10 115350088 1I AACTGCCTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 9 10 141917 CASAVA_Build 10 115351596 1D AGTCTAAGAT G/- GTGGATCAAA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 G 2 1 141918 CASAVA_Build 10 115360002 1D AGGAGGCTGA G/- GCAGGAGAAT 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 G 2 1 141919 CASAVA_Build 10 115379033 1D ACCAAGGGCC T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 8 7 141920 CASAVA_Build 10 115388908 5I TGAAATGAGT -----/AAGTC AAGTCAATCC 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 AAGTC 1 2 141921 CASAVA_Build 10 115390683 1D GGCCACAGTA G/- GTTTTCAATG 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 G 2 1 141922 CASAVA_Build 10 115391022 1D AGAAGACAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 9 8 141923 CASAVA_Build 10 115395165 4D ACCTTTTTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 53 27 18 13 TTGT 4 3 141924 CASAVA_Build 10 115401918 5D GCAGGACTAA TGTTT/----- TCCTCACTTT 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 TGTTT 1 0 141925 CASAVA_Build 10 115427736 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 630 hom 14 3 9 3 T 7 6 141926 CASAVA_Build 10 115433481 4D ACATATTCTT TATC/---- TATTCATTCA 3070 het 3070 ref 40 25 13 4 TATC 1 0 141927 CASAVA_Build 10 115440014 1I GTTCTGATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 9 10 141928 CASAVA_Build 10 115448416 2I AAACAAGTTG --/TT TTTTTTTTTT 2153 het 2153 ref 23 9 8 6 T 11 13 141929 CASAVA_Build 10 115449631 1D CAAAATAATT A/- TTAAATAGAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 1 0 141930 CASAVA_Build 10 115450479 3D AAGCCCAGCC ATG/--- CCATGTTTAC 3070 het 3070 ref 54 28 22 4 ATG 1 0 141931 CASAVA_Build 10 115454975 1D TGTCTTGGCC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 9 8 141932 CASAVA_Build 10 115458763 2D AGCTATTCCC CT/-- GTCGTTCCCA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 CT 1 0 141933 CASAVA_Build 10 115463378 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 86 hom 49 3 21 25 T 10 9 141934 CASAVA_Build 10 115467786 1I CTGCTTTTGA -/G GTCTCACTCA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 1 2 141935 CASAVA_Build 10 115472952 1D CCCCACCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 13 12 141936 CASAVA_Build 10 115477068 4D GCCTACTCAC TATT/---- TACCAAGCAC 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 TATT 1 0 141937 CASAVA_Build 10 115481233 2D AACATAAAAG TA/-- TCTTCTTTCA 3070 het 3070 ref 42 24 18 0 TA 1 0 141938 CASAVA_Build 10 115483053 4D TATATATATA TATT/---- TTTTTTTGGT 3070 het 144 hom 28 3 19 7 TATT 1 0 141939 CASAVA_Build 10 115490569 1D CGTGGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 A 11 10 141940 CASAVA_Build 10 115501194 1D CTGGCAGGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 9 8 141941 CASAVA_Build 10 115503637 3I TCGGCTCACT ---/ACA ACCTCTGCCT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 ACA 0 1 141942 CASAVA_Build 10 115532989 3I GTCTCAAAAA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 17 5 AAC 0 1 141943 CASAVA_Build 10 115536309 1I CCTCATATGA -/C AGCCACTAGT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 0 1 141944 CASAVA_Build 10 115550227 5D ATATAGATAT ATATG/----- ATGTTTATGT 3070 het 3070 hom 21 8 11 3 ATATG 1 0 141945 CASAVA_Build 10 115553641 2D TACGTTTTCT AG/-- AGAAGCAGAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 4 AG 2 1 141946 CASAVA_Build 10 115557883 1D GATTCTCGAA T/- TTTTTGTTGG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 6 5 141947 CASAVA_Build 10 115572396 1I GTTTCACCAT -/G TTGACCAGGC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 G 0 1 141948 CASAVA_Build 10 115575923 1I TTTTCCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 A 13 14 141949 CASAVA_Build 10 115583074 1I GTATTTTTTT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 7 8 141950 CASAVA_Build 10 115597318 7D TGCACCAAAA AAAATTT/------- TTTTAAATTC 3070 het 3070 hom 24 10 14 2 AAAATTT 1 0 141951 CASAVA_Build 10 115606236 4I TTATCCCATC ----/AAAT AAACTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 AAAT 0 1 141952 CASAVA_Build 10 115612245 1D AAAAAAAAAA C/- AGTAATGTAG 3070 het 3013 hom 31 8 19 5 C 1 0 141953 CASAVA_Build 10 115625662 1D AGCCAAACAC T/- TTTTTTTTTT 2068 het 2068 ref 39 25 6 8 T 15 14 141954 CASAVA_Build 10 115649789 1I GATAAGAGTA -/G TAGGAGTTAG 3070 het 3070 ref 42 21 20 1 G 0 1 141955 CASAVA_Build 10 115674001 1I ACAGCTGCCA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 21 3 9 9 T 1 2 141956 CASAVA_Build 10 115684583 1I CGTTTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 910 hom 35 3 26 6 A 13 14 141957 CASAVA_Build 10 115698761 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 11 12 141958 CASAVA_Build 10 115700184 4D AGATGCTAGG TAGA/---- TAGATAGACT 3070 hom 126 het 48 0 43 7 TAGA 3 2 141959 CASAVA_Build 10 115700701 1D AAATAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 35 0 25 10 T 12 11 141960 CASAVA_Build 10 115701246 1D TGCTGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 29 1 18 10 T 15 14 141961 CASAVA_Build 10 115706915 1D GCCTTTATGC T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 141962 CASAVA_Build 10 115715729 2D TTGACTACTT TA/-- GATACCTCAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TA 1 0 141963 CASAVA_Build 10 115717674 13I TCAAATGATT -------------/CTCCTGCTTCGGC CTCCTGAGTA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 CTCCTGCTTCGGC 0 1 141964 CASAVA_Build 10 115725429 1I GCCTCCCAAA -/G TGTTGGGATT 3070 hom 35 het 13 0 12 1 G 0 1 141965 CASAVA_Build 10 115726449 4D CTCTCTCCTT TCCC/---- CCCCCCCCAC 3070 hom 46 het 28 0 21 9 TCCC 1 0 141966 CASAVA_Build 10 115734872 3D AAACCTAAGA CAG/--- CATCAATTAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 CAG 1 0 141967 CASAVA_Build 10 115747823 1I TGATTACTTG -/T TTAATTGGCC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 2 3 141968 CASAVA_Build 10 115752877 2D ATTAACCCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 34 0 26 8 T 14 12 141969 CASAVA_Build 10 115754139 4D GTAATCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 210 hom 26 3 10 14 T 16 12 141970 CASAVA_Build 10 115755754 2D ATTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 20 4 T 16 14 141971 CASAVA_Build 10 115763258 1I TGCAAGCTAT -/A AGTCTCTTCT 3070 het 3070 hom 69 29 30 10 A 1 2 141972 CASAVA_Build 10 115768162 1D ATAAATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 12 11 141973 CASAVA_Build 10 115775343 1I GTTTCTGGCC -/T TTTTTGAGCA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 5 6 141974 CASAVA_Build 10 115779264 1D AAATGTTGAA G/- GGCCATTTAT 3070 het 3070 hom 46 19 21 8 G 3 2 141975 CASAVA_Build 10 115784476 1D CCTGTGTTCT G/- GAATCATTGT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 G 2 1 141976 CASAVA_Build 10 115796223 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 A 8 9 141977 CASAVA_Build 10 115802112 1D GAGATAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 11 10 141978 CASAVA_Build 10 115805998 1D CTCTACAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 11 10 141979 CASAVA_Build 10 115821977 1I CTTCCCTGTC -/A GGGGATCTCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 0 1 141980 CASAVA_Build 10 115830217 1I TATTTTCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 9 10 141981 CASAVA_Build 10 115839222 1I TTGTCTCTCC -/A AAAAAACACA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 A 6 7 141982 CASAVA_Build 10 115839768 1D GCTACTCAGG A/- GGCTGAGGCA 3070 hom 75 het 30 0 26 14 A 1 0 141983 CASAVA_Build 10 115840041 1I CAGTTTTGTG -/T TTTTTTGTCA 3070 hom 65 het 30 0 22 8 T 6 7 141984 CASAVA_Build 10 115841272 1D CATTGGTCCC T/- TTTTTTATCT 3070 hom 120 het 42 0 41 2 T 7 6 141985 CASAVA_Build 10 115852052 3D TATAAACAAT GGG/--- GGGGGGGGGT 1849 hom 17 het 11 0 5 6 G 12 9 141986 CASAVA_Build 10 115852496 1D9M1D16M1D8M1D CTGTCCCCCA GGGCTGGAGTGGCAGTGGCACGATCTCGGGCTCACTG/-GGCTGGAGT-GCAGTGGCACGATCTC-GGCTCACT- GCAAGCTCCA 1742 hom 6 het 5 0 4 3 N/A 0 0 141987 CASAVA_Build 10 115874063 5I GTTCTTCATA -----/AATAT TTATCTTTAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AATAT 0 1 141988 CASAVA_Build 10 115888982 1D TCCTCCACAT G/- GGAATGCCTT 3070 het 36 hom 32 2 22 8 G 3 2 141989 CASAVA_Build 10 115895086 1I GTGCCAACAC -/T TTATTTTTTC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 2 3 141990 CASAVA_Build 10 115927584 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1806 het 1806 ref 29 10 7 14 T 17 16 141991 CASAVA_Build 10 115931595 1D ACAACATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 528 hom 28 2 14 13 A 17 16 141992 CASAVA_Build 10 115941804 1I TATTTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 841 hom 40 2 27 11 T 12 13 141993 CASAVA_Build 10 115944614 2I CTCAAGCAAT --/CC CCCATTTGCT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 C 3 5 141994 CASAVA_Build 10 115948380 1I CTTTGGCTAG -/A CAGAGCAGGT 3070 hom 99 het 35 0 33 3 A 0 1 141995 CASAVA_Build 10 115969337 1D CTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2636 het 720 hom 23 3 11 9 T 17 16 141996 CASAVA_Build 10 115992434 1I GACTCTAAGC -/T TGGGTTTTTC 3070 hom 144 het 56 0 48 8 T 1 2 141997 CASAVA_Build 10 115994383 1I TTCACCCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 107 het 41 0 36 5 A 9 10 141998 CASAVA_Build 10 116003358 1D CCTCCTCCCC T/- CTCAGCATTT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 T 1 0 141999 CASAVA_Build 10 116004979 1D CATCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1528 het 1528 ref 39 25 4 10 T 13 12 142000 CASAVA_Build 10 116005521 1D AAAAGGGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 44 0 36 8 T 11 10 142001 CASAVA_Build 10 116044606 4D TTTAAAAAAC CTAA/---- CTAACTCACC 3070 hom 48 het 23 0 15 10 CTAA 2 1 142002 CASAVA_Build 10 116050185 1I CTGCAGGGGA -/G GGCCTGTACC 3070 hom 68 het 26 0 22 4 G 2 3 142003 CASAVA_Build 10 116059374 1I GCCTAAAGCT -/C CCCCGAAAGC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 C 4 5 142004 CASAVA_Build 10 116064511 17I ATGTCTGGTT -----------------/CCTTGCTGGGTCTGGTC CCTTGCTGGG 3070 hom 51 het 24 0 17 8 CCTTGCTGGGTCTGGTC 1 2 142005 CASAVA_Build 10 116065262 2I CCTGCCCCTT --/CC CCCCAAGGAG 3070 hom 81 het 36 0 27 9 C 4 6 142006 CASAVA_Build 10 116075775 3I AGATCTGGCC ---/CCG CAAGGTCAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CCG 0 1 142007 CASAVA_Build 10 116085748 1I ATACCTATAC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 7 142008 CASAVA_Build 10 116089931 2D AAAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 15 0 10 5 A 14 12 142009 CASAVA_Build 10 116109651 18D CTGGTGTCCT TCACCAAGGACATATATG/------------------ TCACCAAGGA 3070 hom 103 het 38 0 34 14 TCACCAAGGACATATATG 2 1 142010 CASAVA_Build 10 116113715 1D CCAGGATCCT A/- AAAGCCCATT 3070 hom 172 het 60 0 58 2 A 4 3 142011 CASAVA_Build 10 116115483 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTCTTCT 3070 het 130 hom 24 1 22 1 C 0 1 142012 CASAVA_Build 10 116121603 1I AAAAGGAAGA -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 7 8 142013 CASAVA_Build 10 116124423 1D CTAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2857 hom 31 10 17 4 A 10 9 142014 CASAVA_Build 10 116128806 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 7 8 142015 CASAVA_Build 10 116128962 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 14 11 142016 CASAVA_Build 10 116131620 2I AAGAGAGTGT --/AC ACACACACAC 3070 het 279 hom 41 1 25 15 AC 8 9 142017 CASAVA_Build 10 116132028 1I2M15I CCCAGTGATT -TA---------------/ATATGAACTGGTGCTCGC CATATAAAGG 3070 hom 120 het 40 0 41 2 N/A 0 0 142018 CASAVA_Build 10 116144200 1D CAGGAGAGAG T/- TGGGAGGGTC 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 T 2 1 142019 CASAVA_Build 10 116146872 1D TTACACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 8 A 11 10 142020 CASAVA_Build 10 116173068 1D ATGAAACGAC A/- AGGTTCATTA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 2 1 142021 CASAVA_Build 10 116173855 1D TTGACAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 12 11 142022 CASAVA_Build 10 116174750 1I ATCTTGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 962 hom 38 4 26 8 T 12 13 142023 CASAVA_Build 10 116181734 1D AACAGTGATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 9 8 142024 CASAVA_Build 10 116192426 1I AGTTATTGGC -/A GTATCACGCT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 0 1 142025 CASAVA_Build 10 116192596 1D ATTAAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2227 hom 31 7 13 11 T 12 11 142026 CASAVA_Build 10 116193068 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3006 het 1330 hom 21 6 9 6 T 11 10 142027 CASAVA_Build 10 116199961 4D AATAAACCAT AAAA/---- AAAAAAAAAC 75 het 75 ref 26 14 2 11 A 13 9 142028 CASAVA_Build 10 116200378 1D AATAGAGGAG A/- CAGGGTTTCG 3070 het 2723 hom 23 8 14 1 A 1 0 142029 CASAVA_Build 10 116211143 1D AACTGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 1837 het 1837 ref 20 10 7 3 T 15 14 142030 CASAVA_Build 10 116218170 1I ACTACAGGCG -/T CCGCCACCAC 3070 hom 53 het 21 0 18 3 T 0 1 142031 CASAVA_Build 10 116256941 4I GTGGCTGGAC ----/TTCA TTCATCTCCT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 TTCA 1 2 142032 CASAVA_Build 10 116262338 1I CTTTAGGAGG -/C CCGAGGAGGA 3070 het 2042 hom 23 6 11 6 C 2 3 142033 CASAVA_Build 10 116265591 17D CATAAGCAAG GAAGCTGGAAGAGGCCA/----------------- GAAGCTGGAA 3070 het 3070 hom 46 21 20 8 GAAGCTGGAAGAGGCCA 2 1 142034 CASAVA_Build 10 116268570 1I CACACTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 44 2 35 7 A 11 12 142035 CASAVA_Build 10 116292407 1I TCCAAGTTGC -/T CCCAACTCAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 0 1 142036 CASAVA_Build 10 116296905 1D CCAGGCTACA T/- TTAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 3 2 142037 CASAVA_Build 10 116300136 1D AGTTTTTTTT A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 8 7 142038 CASAVA_Build 10 116307587 1D TATGACTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 33 3 14 16 A 17 16 142039 CASAVA_Build 10 116336013 1D GACAATTTCC A/- TTCACATGTG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 1 0 142040 CASAVA_Build 10 116336446 2I CAGAAATATT --/TA TGATAGAATA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TA 0 1 142041 CASAVA_Build 10 116341530 1I AAACTTTGGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 T 8 9 142042 CASAVA_Build 10 116342778 24I ATGAGGTCAC ------------------------/TAGAAAGTAGACAGGGAGAAGAGG TCTGAGTATG 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TAGAAAGTAGACAGGGAGAAGAGG 0 1 142043 CASAVA_Build 10 116343549 1D GTAAGCAGTG T/- TATTTTGGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 2 1 142044 CASAVA_Build 10 116344888 1D AGTTTCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 494 hom 32 2 15 15 A 15 14 142045 CASAVA_Build 10 116344903 1D AAAAAAAAAA T/- AGATCTTGGT 3070 het 790 hom 33 8 15 10 T 1 0 142046 CASAVA_Build 10 116398698 1D AACTGAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 A 11 10 142047 CASAVA_Build 10 116399612 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 32 3 16 13 T 11 10 142048 CASAVA_Build 10 116403126 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 30 2 26 2 A 10 11 142049 CASAVA_Build 10 116423006 1D GACTCCAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 10 6 A 14 13 142050 CASAVA_Build 10 116426250 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 73 het 39 0 27 12 A 9 10 142051 CASAVA_Build 10 116427902 1D TTTCTAATCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 10 9 142052 CASAVA_Build 10 116429089 2D CAAGTTAGAA AT/-- ATCTTAAACC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AT 2 1 142053 CASAVA_Build 10 116429905 1I GATGGAACTC -/T TAATTGCCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 2 142054 CASAVA_Build 10 116443121 6D AATGAAGGCC TGTGAG/------ TGTAAGTGAC 3070 hom 90 het 35 0 27 9 TGTGAG 1 0 142055 CASAVA_Build 10 116447768 1D AATCCCCCAC A/- TAGAAATCTC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 1 0 142056 CASAVA_Build 10 116475929 3I GTTTAGAAAT ---/TTC TTGTTGTTGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTC 0 1 142057 CASAVA_Build 10 116476336 1I CCCAGACCAG -/C CCTGACCAAC 3070 hom 50 het 28 0 14 14 C 2 3 142058 CASAVA_Build 10 116498330 1D TGCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 968 hom 47 4 32 11 A 14 13 142059 CASAVA_Build 10 116498409 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 967 het 967 ref 28 13 3 13 T 14 13 142060 CASAVA_Build 10 116511016 1I AGAAATCGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 35 1 27 7 A 13 14 142061 CASAVA_Build 10 116513158 1I TTGATAGTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 9 10 142062 CASAVA_Build 10 116515122 1D AAAAAAAAAA T/- ATTCTATTAT 3070 het 298 hom 28 2 22 4 T 1 0 142063 CASAVA_Build 10 116516885 2I TATCCAACAC --/AT GTTATCAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AT 0 1 142064 CASAVA_Build 10 116517364 1D GGGAATTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 24 1 17 7 T 13 12 142065 CASAVA_Build 10 116520880 6I GCACCCGGCC ------/TATTTT TATTCTTTTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TATTTT 0 1 142066 CASAVA_Build 10 116531302 4D TATCTATATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TG 8 6 142067 CASAVA_Build 10 116531409 2D ATATATATAT GC/-- GTGTATATAT 326 het 157 hom 11 1 4 6 GC 1 0 142068 CASAVA_Build 10 116539541 1D TGTATATTTG T/- TTTTTTTTTT 2275 het 1917 hom 19 8 6 5 T 15 14 142069 CASAVA_Build 10 116555643 2D GCTGTCAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 32 0 16 16 T 18 16 142070 CASAVA_Build 10 116565109 2I CTTCTAGAAA --/AT ATGTCATTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AT 1 2 142071 CASAVA_Build 10 116570426 2D GTTCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 887 het 373 hom 15 2 6 7 T 22 20 142072 CASAVA_Build 10 116573411 1D ACACGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 622 hom 12 het 10 0 3 7 T 17 16 142073 CASAVA_Build 10 116577755 2D TGATTCACAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 8 T 12 10 142074 CASAVA_Build 10 116584872 3I ATGATGGAAA ---/GTT GTTGATGACA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 GTT 1 2 142075 CASAVA_Build 10 116596164 1I TTTGAAATAC -/T GGTTTTAATG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 0 1 142076 CASAVA_Build 10 116600293 1I AAAATTTTTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 56 het 21 0 18 3 A 7 8 142077 CASAVA_Build 10 116613001 1I GTTTGCTGTA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 7 8 142078 CASAVA_Build 10 116614742 2D TCAAAAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 886 hom 14 het 15 0 4 11 T 13 11 142079 CASAVA_Build 10 116620769 2D TAGCCTCCAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 53 het 25 0 18 8 AT 7 6 142080 CASAVA_Build 10 116623701 1D CAGGAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 37 2 29 6 A 11 10 142081 CASAVA_Build 10 116624015 1I AGATCTTTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 9 142082 CASAVA_Build 10 116626743 3I TTCCCAGTAT ---/TGA TGAGCAATTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TGA 1 2 142083 CASAVA_Build 10 116627628 1D GTGTGAATTA T/- TTTTATCAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 4 142084 CASAVA_Build 10 116629162 5D TCATCTAAAA AATGC/----- AATTATACCA 3070 hom 126 het 44 0 41 4 AATGC 1 0 142085 CASAVA_Build 10 116632624 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 18 1 15 2 A 15 14 142086 CASAVA_Build 10 116634661 1I AGACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3014 het 307 hom 19 3 12 4 A 15 16 142087 CASAVA_Build 10 116643435 2D TGTGGTATTC TG/-- TGTGTGTGTG 879 het 879 ref 56 45 3 8 TG 7 6 142088 CASAVA_Build 10 116644544 1D AAAATACAAC A/- AAAAAACTGG 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 7 6 142089 CASAVA_Build 10 116650385 1I AAATGTCCTC -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 8 142090 CASAVA_Build 10 116653480 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAACCA 3070 hom 82 het 30 0 27 4 C 1 0 142091 CASAVA_Build 10 116656029 16D AATTGTTGCA TAGCCCACTCTGAAGT/---------------- AGTAGAAGAT 1311 het 1311 ref 36 10 5 23 TAGCCCACTCTGAAGT 1 0 142092 CASAVA_Build 10 116679054 1I CTAATATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 10 11 142093 CASAVA_Build 10 116689236 1D TTAAACCAGT A/- ACAGGGACTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 2 1 142094 CASAVA_Build 10 116696475 1I ACTTTCAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 9 10 142095 CASAVA_Build 10 116697095 1D GTTTTAAGAC A/- GATTGGTAAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 1 0 142096 CASAVA_Build 10 116704658 1I AGTTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 493 hom 31 2 23 6 T 12 13 142097 CASAVA_Build 10 116721310 5I TGGATCATTG -----/TTAAA TTAAATTTAT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TTAAA 1 2 142098 CASAVA_Build 10 116725225 1D ACAATATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 27 11 T 12 11 142099 CASAVA_Build 10 116725985 2I TGTAGGGTGT --/TA TCCCTGTGAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TA 0 1 142100 CASAVA_Build 10 116731255 1D TTTTGTTTAA T/- TTAAAGCCTA 3070 het 3070 ref 49 23 18 9 T 3 2 142101 CASAVA_Build 10 116733654 2D GTGGAAGGTC TT/-- TTCTTATTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 4 2 142102 CASAVA_Build 10 116736905 2I44M1D TTTTCTTTTT --TTTTTTTTTTTAATCAGTTTTGGTCTGTCTCCTCAAGTGGGCTGA/TCTTTTTTTTTTTAATCAGTTTTGGTCTGTCTCCTCAAGTGGGCTG- AAAAAAAAGA 3070 hom 53 het 30 1 33 5 N/A 0 0 142103 CASAVA_Build 10 116738035 4D CCTGAATTGT GGAA/---- GGGTTTTTCC 3070 hom 120 het 47 0 40 7 GGAA 1 0 142104 CASAVA_Build 10 116741945 1I GTCCCTCCAA -/C AATCCTGCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 142105 CASAVA_Build 10 116746391 12D TAGTCTTATT GTTTTTTTTTTG/------------ GTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 25 7 GTTTTTTTTTTG 1 0 142106 CASAVA_Build 10 116750242 4D AGAAAGAGAC AAAG/---- AAAGAAAGAG 3070 hom 44 het 20 0 16 4 AAAG 3 2 142107 CASAVA_Build 10 116750745 1D CGAACGGTTA C/- CCTATGGGGT 3070 hom 135 het 53 0 45 8 C 3 2 142108 CASAVA_Build 10 116754067 1D GGTGAGACAC A/- AGGGCCTTTC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 2 1 142109 CASAVA_Build 10 116759002 3D ATGACTAATG ATC/--- ATGATTTTCT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 ATC 1 0 142110 CASAVA_Build 10 116760007 1D GGGAGGCCAA G/- GGGGGGTGTA 3070 het 1738 hom 19 7 9 3 G 7 6 142111 CASAVA_Build 10 116760593 1D AAAAAAAAAA G/- AAGGCATTTC 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 G 1 0 142112 CASAVA_Build 10 116782723 2I GTATAGAATC --/AT ATCATTAGCA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 AT 1 2 142113 CASAVA_Build 10 116785806 2D CTGACTCAGC CT/-- CTCAAGTAGC 1854 het 1854 ref 22 16 4 4 CT 2 1 142114 CASAVA_Build 10 116790541 2I CAGAAAGAAA --/AG AGAGAGGAGA 3070 hom 77 het 30 0 24 6 AG 3 4 142115 CASAVA_Build 10 116791297 1D GCAAAAAAGA G/- ACGAAATCTG 3070 hom 47 het 19 0 16 3 G 1 0 142116 CASAVA_Build 10 116794270 1I GCAATTGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 28 1 22 5 A 10 11 142117 CASAVA_Build 10 116802585 1I AGGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 375 hom 39 2 21 16 A 12 13 142118 CASAVA_Build 10 116808641 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 2332 het 2332 ref 22 9 5 8 A 9 10 142119 CASAVA_Build 10 116817013 11D CTGGAGTACA GTAGCACGATC/----------- TTGGCTCACT 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 GTAGCACGATC 1 0 142120 CASAVA_Build 10 116817279 1D AATAACTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 48 2 30 17 A 13 12 142121 CASAVA_Build 10 116824441 1D TTTTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 1953 het 210 hom 20 2 11 7 T 17 16 142122 CASAVA_Build 10 116832950 1I CGCTGTGTAG -/T TCAGAGATGC 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 T 1 2 142123 CASAVA_Build 10 116837322 2D GTTAAATGTC TT/-- TATCCTCATA 3070 het 3070 ref 46 25 18 5 T 3 1 142124 CASAVA_Build 10 116842246 2D AGCAGAAAAG GA/-- GAGACGTGCG 1978 het 1978 ref 21 13 6 2 GA 3 2 142125 CASAVA_Build 10 116861821 1D AAAAAAACCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 A 10 9 142126 CASAVA_Build 10 116864525 1D AAAAGGGAAG T/- TTTTGTACAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 5 4 142127 CASAVA_Build 10 116892199 1I GAAGTTACAC -/A AACAAGGGAG 3070 het 3070 ref 55 26 16 13 A 2 3 142128 CASAVA_Build 10 116893166 1I TTTCTTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 12 13 142129 CASAVA_Build 10 116907077 4D CTTTTTGTCG TTGT/---- TTGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 TTGT 2 1 142130 CASAVA_Build 10 116907309 1I CCCTGCATTC -/T TTGCCTCCTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 142131 CASAVA_Build 10 116907807 3I TTTAGAAAAG ---/TTA TTATACAAGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTA 1 2 142132 CASAVA_Build 10 116911898 1D TGGCAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 27 8 A 11 10 142133 CASAVA_Build 10 116911909 1D AAAAAAAAAA C/- ACTATTACCA 3070 het 3 hom 29 2 21 6 C 1 0 142134 CASAVA_Build 10 116921092 2I TGTTTTTCTC --/TT TAATAAAATC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 3 142135 CASAVA_Build 10 116922131 1D GTTTTATTTC T/- TGAGGAATTT 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 T 2 1 142136 CASAVA_Build 10 116923594 1I54M1I GAATCACTTT -AAAAAAATGTATTTCTTGCATACGAGAGAGTTGAATTTTGCTTTGTGATTCCTG-/AAAAAAAATGTATTTCTTGCATACGAGAGAGTTGAATTTTGCTTTGTGATTCCTGT TTTTTTTTTT 3070 het 658 hom 39 5 51 9 N/A 0 0 142137 CASAVA_Build 10 116936915 1I TTCTGGGAAT -/A ATTTTTTTTT 3070 het 1292 hom 53 6 28 19 A 1 2 142138 CASAVA_Build 10 116937786 6D CTGGGAGAGA GGGAGG/------ GGGAGGGGGA 2719 het 304 hom 12 1 9 2 GGGAGG 3 2 142139 CASAVA_Build 10 116938478 2D TTAATATCAC AT/-- GTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 AT 1 0 142140 CASAVA_Build 10 116939672 1I CCATTTTTTA -/T TTTTTTACAC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 6 7 142141 CASAVA_Build 10 116960790 1D TCCTGACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 15 14 142142 CASAVA_Build 10 116971702 1I GGCACAAACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 9 10 142143 CASAVA_Build 10 116982204 4D TCATATGTAG TTGT/---- TTGTGTACCC 3070 het 3070 ref 41 23 18 1 TTGT 2 1 142144 CASAVA_Build 10 116990684 2D TATATCTCAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 AT 7 6 142145 CASAVA_Build 10 117009466 7D TTTTAGTATA ATTGAAG/------- ATTGAAGATG 3070 het 3070 hom 36 18 17 5 ATTGAAG 2 1 142146 CASAVA_Build 10 117013552 1D CATCATTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 11 9 T 11 10 142147 CASAVA_Build 10 117014539 1I TTAATGAGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 930 hom 30 2 25 3 T 9 10 142148 CASAVA_Build 10 117028131 2I GAATACACTC --/AT AAATTATGTT 3070 het 3070 ref 56 25 22 9 AT 0 1 142149 CASAVA_Build 10 117032294 1D TTATCCCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2968 hom 31 9 16 6 T 12 11 142150 CASAVA_Build 10 117038408 1D GAAATTTTTT A/- GTTCCTTATA 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 A 1 0 142151 CASAVA_Build 10 117041478 9D AGCAGTGAAG CCATCTGGT/--------- CCTGGACTTT 3070 het 3070 ref 22 14 8 3 CCATCTGGT 1 0 142152 CASAVA_Build 10 117046635 5I AGTCTTTTCT -----/CTTAA CTTGTCTTGA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 CTTAA 0 1 142153 CASAVA_Build 10 117061044 4D11M1D TATGGTCTAT CTTGGAAAATATTCCA/----GACAGCAGGTC- TGTGCTGATG 3070 het 3070 ref 37 21 21 2 N/A 0 0 142154 CASAVA_Build 10 117062681 1D TAGTGTGATC T/- TTTTGGCAGT 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 T 5 4 142155 CASAVA_Build 10 117079205 1D TTAATCCTAC T/- TACTTTTCCA 3070 het 3070 hom 47 22 22 4 T 2 1 142156 CASAVA_Build 10 117082325 1I TTAATATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 T 10 11 142157 CASAVA_Build 10 117096233 1I ATAATTGGGC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 T 7 8 142158 CASAVA_Build 10 117109825 4D TTCTATTTAA TTTG/---- TTTGTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 15 14 6 TTTG 2 1 142159 CASAVA_Build 10 117120837 1I CACCAACAGC -/T TGGCACCCTG 3070 het 3070 ref 44 18 14 12 T 1 2 142160 CASAVA_Build 10 117128533 1I TTCTAAAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2502 hom 27 7 16 4 T 9 10 142161 CASAVA_Build 10 117132814 1I TGATGTCTCC -/T CTTTCATTCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 0 1 142162 CASAVA_Build 10 117141122 1D ATTCAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 11 10 142163 CASAVA_Build 10 117144613 2D AAGCAAAAAC AT/-- GTGGCATTTG 3070 het 3070 hom 48 23 22 3 AT 1 0 142164 CASAVA_Build 10 117153089 1I CTGAGTAGCT -/G GGACTACAGG 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 G 2 3 142165 CASAVA_Build 10 117161087 1D AATTAAGCCA T/- TACAGAAGAC 3070 het 3070 ref 38 17 16 6 T 2 1 142166 CASAVA_Build 10 117174836 4D TATGTAATAA TTAC/---- TTAAACCATA 3070 het 3070 hom 17 8 9 2 TTAC 1 0 142167 CASAVA_Build 10 117190139 7I ATTATAGTTA -------/GCTAATG TCAGTCCTTA 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 GCTAATG 0 1 142168 CASAVA_Build 10 117196018 1D TTAAATAGCT A/- AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 A 7 6 142169 CASAVA_Build 10 117202838 1D TTTTTTAGAG A/- AATGTCTATT 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 A 3 2 142170 CASAVA_Build 10 117212751 1I CCCCATCACC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 8 9 142171 CASAVA_Build 10 117214343 1I CATTAATAGT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 7 8 142172 CASAVA_Build 10 117215115 3D AATAGAAAAT AAG/--- AAGGAAGTTA 3070 het 3070 ref 33 15 17 2 AAG 2 1 142173 CASAVA_Build 10 117218082 2I TTCAGCACTC --/AA TATGTGTTTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 0 2 142174 CASAVA_Build 10 117219733 3D GAAAAAATTT TTC/--- TTCTTATTTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 7 TTC 2 1 142175 CASAVA_Build 10 117222553 1D TCATGAAACA G/- TGTTAATAAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 7 G 1 0 142176 CASAVA_Build 10 117230059 3D GTTAAAGATG TAT/--- TAACTATACT 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 TAT 1 0 142177 CASAVA_Build 10 117232050 3D ATAAACAAAT ATA/--- ATAATTTTTA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 ATA 2 1 142178 CASAVA_Build 10 117245202 1D ATGATTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 608 hom 40 4 16 20 T 12 11 142179 CASAVA_Build 10 117247167 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2600 hom 32 6 17 9 T 10 11 142180 CASAVA_Build 10 117254780 3D3M4D ATCTTAGACT AGCATGGCAT/---ATG---- CCATGCTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 N/A 0 0 142181 CASAVA_Build 10 117263978 1I GGGCAGATGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 8 9 142182 CASAVA_Build 10 117266213 12D ATACTCCAGA TCTTATGACTTT/------------ TCATAAACAT 3070 het 3070 ref 43 23 19 10 TCTTATGACTTT 1 0 142183 CASAVA_Build 10 117268378 2I AAAACATTTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 36 12 13 11 TA 5 6 142184 CASAVA_Build 10 117277000 1D TAAAACCTGT A/- AAAAATGATT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 A 6 5 142185 CASAVA_Build 10 117277723 4I ATTTTTTAAA ----/TGTT TGGGTAGAAT 3070 hom 86 het 32 0 27 5 TGTT 0 1 142186 CASAVA_Build 10 117278988 20D62M1D CTTCTGATTT TTATTAATTGAATGAGCTTCTTATTAATTGAATGAGCTTCTAATGTTCTTTTATTTTCCTTTTAGCAGTTTAAGAATTATAGT/--------------------TTATTAATTGAATGAGCTTCTAATGTTCTTTTATTTTCCTTTTAGCAGTTTAAGAATTATAG- TTTTTTTATT 1401 het 1401 ref 28 21 3 20 N/A 0 0 142187 CASAVA_Build 10 117279619 4I TTTATTTCTC ----/TATT TATTAGTTGA 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 TATT 1 2 142188 CASAVA_Build 10 117286474 1D GTCTCTGTTT A/- AAAAAATAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 6 142189 CASAVA_Build 10 117287975 1I TCATGTGCTT -/A ATTAGTTATA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 1 2 142190 CASAVA_Build 10 117288767 1D TTGTTATAAA G/- GAAAAACCTT 3070 hom 120 het 48 0 41 8 G 2 1 142191 CASAVA_Build 10 117289624 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 1413 hom 18 het 13 0 7 6 ATA 4 3 142192 CASAVA_Build 10 117319277 4D CTTTAAATAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 29 4 9 18 T 15 11 142193 CASAVA_Build 10 117323855 2D TATATAAATG TA/-- TATATATATA 3070 het 1603 hom 20 4 13 4 TA 6 5 142194 CASAVA_Build 10 117328549 3D TTTCATACCA TTG/--- TTGTCAGAAA 3070 het 3070 hom 33 13 20 0 TTG 2 1 142195 CASAVA_Build 10 117330191 1I TCCCTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 8 9 142196 CASAVA_Build 10 117331247 1I GACACTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 14 7 T 10 11 142197 CASAVA_Build 10 117337352 4I CTATTAAAAT ----/AACA AACAAAGTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AACA 1 2 142198 CASAVA_Build 10 117337413 5D TAATGGAGAA AGGAG/----- AGGAGAGGAG 3070 het 3070 ref 30 15 8 8 AGGAG 3 2 142199 CASAVA_Build 10 117344007 4D ATACTTGTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 14 5 TTTG 1 0 142200 CASAVA_Build 10 117345292 1D TCTCAATTTG A/- AAAGGTTAGA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 4 3 142201 CASAVA_Build 10 117346491 1I AAAAAAGGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 8 9 142202 CASAVA_Build 10 117348423 1I GTTGTGAATA -/C TTTTCTGTTA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 C 0 1 142203 CASAVA_Build 10 117349030 1D TAAACCCGGA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 54 23 26 6 T 8 7 142204 CASAVA_Build 10 117350430 7D TTTTATTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1288 hom 35 9 13 14 T 18 11 142205 CASAVA_Build 10 117358913 1D TCCTGAGTTG A/- AGTAATATAG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 2 1 142206 CASAVA_Build 10 117359155 1I CTCCTATTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 T 9 10 142207 CASAVA_Build 10 117366871 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 9 10 142208 CASAVA_Build 10 117368013 1D CTTTTTACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 10 9 142209 CASAVA_Build 10 117378021 6I TCCCGTTCTA ------/TAGATT TAGATTGTCT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 TAGATT 1 2 142210 CASAVA_Build 10 117385800 1D CAATAGCAAT A/- GGGGGATCCC 3070 het 3070 ref 47 19 14 15 A 1 0 142211 CASAVA_Build 10 117396038 3D ATAACCACAT CTG/--- CTGCATTTCA 3070 het 3070 ref 37 19 16 4 CTG 2 1 142212 CASAVA_Build 10 117399877 1I ATTGTTTATC -/A TGATTTATAT 3070 het 3070 hom 40 16 23 1 A 0 1 142213 CASAVA_Build 10 117401735 1D GTTGTTGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 18 2 T 10 9 142214 CASAVA_Build 10 117413064 3D AGTGAGTGAT ATC/--- ATCCAAATTG 3070 het 3070 ref 51 32 19 0 ATC 2 1 142215 CASAVA_Build 10 117431718 1I ATCCTGTGCC -/T TTTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 17 17 4 T 3 4 142216 CASAVA_Build 10 117445624 14D GGTCTCGATC TCCTGAGCTCGTGA/-------------- TCCGCCTGCC 1008 het 813 hom 8 3 4 2 TCCTGAGCTCGTGA 1 0 142217 CASAVA_Build 10 117459633 1I ATCCTATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 10 11 142218 CASAVA_Build 10 117462368 1D ACAATGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2241 hom 32 9 15 9 A 12 11 142219 CASAVA_Build 10 117463119 4D TTATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 61 het 34 0 19 16 AC 8 6 142220 CASAVA_Build 10 117463831 1I GGGTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 A 11 12 142221 CASAVA_Build 10 117471762 1D AAAAGCCTAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 A 9 8 142222 CASAVA_Build 10 117473559 1D AATAATTGGC A/- ATAGCAGATT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 2 1 142223 CASAVA_Build 10 117475238 1I CATTTACTAT -/C CCTTAGCATT 3070 het 3070 ref 43 20 21 2 C 2 3 142224 CASAVA_Build 10 117475900 1D TATTTAATAA T/- AATTTTATTA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 1 0 142225 CASAVA_Build 10 117476356 2D ATTTTTACTG TT/-- TTTTTTTTTT 2327 het 2327 ref 29 15 5 9 T 12 10 142226 CASAVA_Build 10 117483690 1D TTACTTTATG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 8 7 142227 CASAVA_Build 10 117484734 1D AACTCTCTTA C/- GTCTTTCTAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 1 0 142228 CASAVA_Build 10 117485594 2I GGTTATTTCT --/AA AAGTTATTGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 4 142229 CASAVA_Build 10 117486771 1D TACAAAACAT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 60 het 26 0 19 7 C 11 10 142230 CASAVA_Build 10 117487763 3D2M2I CCTCAGCCCC AGTCT--/---CTGA GTAGCTGGGG 3070 hom 39 het 14 0 14 1 N/A 0 0 142231 CASAVA_Build 10 117489617 4I TACTTTAGAT ----/AAAC AAACATTTTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAAC 1 2 142232 CASAVA_Build 10 117489870 2D CATTAATGAC AT/-- ATAAAAGTGG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AT 2 1 142233 CASAVA_Build 10 117492932 2I CTAAAGTGGT --/AG AGTTTAACTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AG 1 2 142234 CASAVA_Build 10 117493284 17D ATGTGTATTT TATTAAAATTGTATGTG/----------------- TATTAAAATA 3070 hom 60 het 20 0 21 3 TATTAAAATTGTATGTG 1 0 142235 CASAVA_Build 10 117493506 1I CATGAATAAA -/T TGTGAGTAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 142236 CASAVA_Build 10 117499493 1I TCAACATTTG -/T TATCTAAACA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 1 2 142237 CASAVA_Build 10 117502843 1D CATTCCCCAA C/- AGGCCCCAGT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 1 0 142238 CASAVA_Build 10 117507859 2D TGTTTGATAG TT/-- TTTTCCTTCT 3070 hom 33 het 15 0 11 5 T 6 4 142239 CASAVA_Build 10 117509082 4I AAAGTTTTAA ----/TTAG TTAGGTTTTG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TTAG 1 2 142240 CASAVA_Build 10 117509675 1I TCCCCTTTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 A 9 10 142241 CASAVA_Build 10 117510615 1D GCTCTTTTTT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 7 6 142242 CASAVA_Build 10 117510970 1D TAAATAACTT C/- CCCCCCAGTT 3070 hom 125 het 48 0 42 7 C 7 6 142243 CASAVA_Build 10 117511798 3D TGCACTGATG ACT/--- TCTTCAGAAA 3070 het 3070 ref 34 21 13 1 ACT 1 0 142244 CASAVA_Build 10 117515484 3D TTTCCCCCCC CCG/--- GCTCACTAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 7 CCG 1 0 142245 CASAVA_Build 10 117525294 1D CGACTCTACT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 8 7 142246 CASAVA_Build 10 117525456 1D TGAAACTCCA T/- TCTCAAAAAA 1344 het 34 hom 14 1 7 6 T 2 1 142247 CASAVA_Build 10 117543028 1D32M1D TAACTTTGAA CGAAGCTGAAAGCTTCATTTAGTTTAATAATAAC/-GAAGCTGAAAGCTTCATTTAGTTTAATAATAA- GATGCTTGAG 3070 hom 165 het 39 0 55 4 N/A 0 0 142248 CASAVA_Build 10 117558821 1D CTCTGCATTT C/- CCGTATAAAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 C 3 2 142249 CASAVA_Build 10 117581269 4I GTCAAGTGAG ----/TCTT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 TCTT 0 1 142250 CASAVA_Build 10 117628571 1D TATTACAGCA C/- CCCCCCAGGG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 C 7 6 142251 CASAVA_Build 10 117653315 3D GGGCTGGAGG AGA/--- AGGAGAAGGC 3070 hom 107 het 38 0 35 3 AGA 1 0 142252 CASAVA_Build 10 117670830 1D TTAAGCAGTG T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 102 het 46 0 35 11 T 7 6 142253 CASAVA_Build 10 117671027 1I TAAGGTTCTT -/A AAATTCTTTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 3 4 142254 CASAVA_Build 10 117675823 1D ACCTCAAATC G/- GACACCCTAA 3070 hom 81 het 28 0 27 1 G 2 1 142255 CASAVA_Build 10 117693787 2D TTTTGTTCCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 26 0 16 10 A 18 16 142256 CASAVA_Build 10 117698386 2I AGTGTTCAAA --/AC AGATTGTGTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AC 0 1 142257 CASAVA_Build 10 117703135 10D GCTCAAAAAC TCTAAACAAT/---------- TCAGTGAAGA 3070 het 3070 hom 41 20 20 5 TCTAAACAAT 1 0 142258 CASAVA_Build 10 117703982 4I GGCCTGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TTTG 3 4 142259 CASAVA_Build 10 117708610 2D GCTCCAAATA AG/-- AGACAATTTG 3070 het 3070 ref 48 21 23 6 AG 2 1 142260 CASAVA_Build 10 117712152 10I ATTCCCATTG ----------/GAGCTGATCT GAACAGATGA 3070 het 3070 hom 48 15 26 7 GAGCTGATCT 0 1 142261 CASAVA_Build 10 117723867 5I ACCAATAGCC -----/TCCAA TCCAAGCATG 3070 het 3070 ref 52 28 16 8 TCCAA 1 2 142262 CASAVA_Build 10 117733780 5I ATCTATTAAA -----/TAAAT TAAAGTTATT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 TAAAT 0 1 142263 CASAVA_Build 10 117734855 1I CTTAGCAGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 9 10 142264 CASAVA_Build 10 117740708 2D TTTTTGTACA CT/-- CAGTTTTAGG 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 CT 1 0 142265 CASAVA_Build 10 117749636 1D TTTACCTTCT A/- AAATATTGTT 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 A 4 3 142266 CASAVA_Build 10 117755977 1D ACATGTATCT A/- AGTGCCTGCC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 2 1 142267 CASAVA_Build 10 117760689 2D GATTGTTAGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 11 9 142268 CASAVA_Build 10 117767846 5D TGTGCCCAGC ACTGT/----- GCTGTGGGGT 3070 het 3070 ref 41 23 16 4 ACTGT 1 0 142269 CASAVA_Build 10 117778865 16I CTCTGATGCA ----------------/CCCCATGCCCCGACTC CTGGCCCTCT 3070 het 3070 hom 47 14 26 7 CCCCATGCCCCGACTC 0 1 142270 CASAVA_Build 10 117780091 5I TGCAGATTAC -----/AATTA CAATTAGCAG 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 AATTA 0 1 142271 CASAVA_Build 10 117788596 5D CCAGATCATA AGAAT/----- TTAGGCTGCA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 AGAAT 1 0 142272 CASAVA_Build 10 117792147 2D ATTTTTTAAA CT/-- CTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 37 22 15 0 CT 2 1 142273 CASAVA_Build 10 117795334 1I GATGATATTT -/A AAGTGCTTTG 3070 hom 135 het 49 0 44 5 A 2 3 142274 CASAVA_Build 10 117807236 2I TCTGAAACTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 12 14 142275 CASAVA_Build 10 117810316 4I TCGTGCATGT ----/CTAA CTAACTAACT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 CTAA 2 3 142276 CASAVA_Build 10 117813539 21D AACTGTTAAA ATCATCATCATGATCATGATG/--------------------- ATCATCATCA 3070 het 3070 hom 43 12 13 20 ATCATCATCATGATCATGATG 2 1 142277 CASAVA_Build 10 117831981 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 80 het 32 0 26 6 T 10 9 142278 CASAVA_Build 10 117834433 4D CCATTTCATA TAAG/---- TAAGTCGAAG 3070 het 3070 ref 32 16 12 7 TAAG 2 1 142279 CASAVA_Build 10 117836781 1D GGGGGGCGGA G/- GGACAGGGGG 3070 hom 69 het 26 0 22 4 G 3 2 142280 CASAVA_Build 10 117837803 1D GATGGGGGCT G/- GGGGGCCTCG 3070 hom 129 het 45 0 43 2 G 6 5 142281 CASAVA_Build 10 117838532 1I AAAAATCAAT -/A AAAAAAGCAG 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 6 7 142282 CASAVA_Build 10 117845995 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 41 hom 34 1 27 6 T 9 10 142283 CASAVA_Build 10 117855114 4D TATAAAAATT AGTG/---- AGAGAATTGG 3070 het 3070 ref 43 19 19 6 AGTG 1 0 142284 CASAVA_Build 10 117867545 1D TTTCTCTAGA G/- GAACAAATCT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 G 2 1 142285 CASAVA_Build 10 117876603 1D GAAGAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 23 10 A 13 12 142286 CASAVA_Build 10 117885498 1D TTATGGATAC T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 107 het 45 0 36 9 T 7 6 142287 CASAVA_Build 10 117891631 2D CAAGCAGTGC AG/-- GATTATTCAT 3070 hom 129 het 49 0 42 7 AG 1 0 142288 CASAVA_Build 10 117894945 3D AGGGAACTTA ATT/--- ATTAAGGAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 ATT 2 1 142289 CASAVA_Build 10 117897059 2D AGTGTGACTC TG/-- TCACCACAAG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TG 1 0 142290 CASAVA_Build 10 117898014 1I ACAAACCTCA -/G GGGGTTGTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 4 5 142291 CASAVA_Build 10 117898550 1D CACAAGCCTG T/- TGGCAATGAG 3070 hom 91 het 40 0 28 12 T 2 1 142292 CASAVA_Build 10 117904747 1D TGATGACTGG C/- CGGAGCACAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 2 1 142293 CASAVA_Build 10 117913825 1I GCATTTTCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 258 hom 31 3 19 9 A 13 14 142294 CASAVA_Build 10 117915366 1I CTTGTGTCAT -/G GGGGTTTGCT 3070 hom 79 het 30 0 27 3 G 4 5 142295 CASAVA_Build 10 117923375 4D GGTCGGGAGT TCGA/---- TCGAGACCAG 3070 hom 41 het 15 0 14 1 TCGA 2 1 142296 CASAVA_Build 10 117927802 1I ACAAGGGGCC -/G GGGGGGGCGT 2845 het 402 hom 27 2 15 10 G 7 8 142297 CASAVA_Build 10 117931128 1I AAATATGAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 29 het 17 0 10 7 T 9 10 142298 CASAVA_Build 10 117941347 1D TGGCCAACAT G/- GTGAAACCCC 3070 hom 45 het 19 0 14 5 G 2 1 142299 CASAVA_Build 10 117956611 3D4M30D3M10D GGGTCAGGTA TTTTCTCATCTGTAAAATGTAAAACTGTAAAACAGTTTCCTCATCTGTAA/---TCTC------------------------------TCC---------- AATTCTCTCA 3070 hom 48 het 10 0 17 3 N/A 0 0 142300 CASAVA_Build 10 117956853 1I CTAAAAGCTT -/A AACATTGTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 142301 CASAVA_Build 10 117957117 2I ATATATGATT --/GA GATATATATA 3070 hom 116 het 44 0 38 6 GA 1 2 142302 CASAVA_Build 10 117963626 1I GCGCTTGCTT -/C CTGGAACCCA 3070 hom 149 het 56 0 47 9 C 1 2 142303 CASAVA_Build 10 117982005 3D TTCCTCATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 30 1 23 9 A 14 11 142304 CASAVA_Build 10 117990649 2I TTTCTAAAAC --/AT GTGTGTTTTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AT 0 1 142305 CASAVA_Build 10 117991655 3I CTTCATCTCT ---/CCA CTATTCTTGT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 CCA 0 1 142306 CASAVA_Build 10 117993672 19D AATCTTTCAG ATTGATCTATTACGGATCT/------------------- ATTGATCTAT 3070 hom 36 het 14 0 13 3 ATTGATCTATTACGGATCT 1 0 142307 CASAVA_Build 10 118012003 1D CCATTTTTGT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 129 het 46 0 44 3 A 9 8 142308 CASAVA_Build 10 118013917 1D CAGGATCAAG A/- AAAGATGCTT 3070 hom 100 het 41 0 33 8 A 4 3 142309 CASAVA_Build 10 118022806 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 40 het 21 0 14 7 A 9 10 142310 CASAVA_Build 10 118026002 1D ATCCATTAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 10 9 142311 CASAVA_Build 10 118036229 1D CACTTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 22 2 16 4 A 13 12 142312 CASAVA_Build 10 118037426 3D AAGGTGAAAT AAG/--- AGAATAATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AAG 1 0 142313 CASAVA_Build 10 118093018 1D TGATCATTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 23 2 13 9 T 17 16 142314 CASAVA_Build 10 118159177 1D TATGTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 1285 het 1285 ref 23 13 3 7 T 13 12 142315 CASAVA_Build 10 118165397 1D ATGCCCAAAA C/- CTTGGATAGT 3070 hom 111 het 42 0 37 7 C 2 1 142316 CASAVA_Build 10 118184948 1D TAAATGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 31 1 21 10 A 13 12 142317 CASAVA_Build 10 118185778 1D ACAAATGGTA T/- TGGGAATATT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 1 142318 CASAVA_Build 10 118197461 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 2236 het 393 hom 14 1 9 4 A 15 14 142319 CASAVA_Build 10 118198012 1I GGAAAAGAGG -/A ACCAAAGAAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 1 2 142320 CASAVA_Build 10 118198804 4D GAGTGATTGA ATAG/---- ATAGTTTTGA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 ATAG 2 1 142321 CASAVA_Build 10 118200417 1I TCCAGTGGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 9 142322 CASAVA_Build 10 118201345 1I GAACTAACAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 9 142323 CASAVA_Build 10 118204854 2I GGTGGATAAC --/AG TGTAGGAATG 3070 hom 108 het 45 0 37 8 AG 0 1 142324 CASAVA_Build 10 118205141 1I ATGTTGATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 37 0 27 10 T 10 11 142325 CASAVA_Build 10 118207953 1D AAAGACTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 740 hom 41 3 24 15 T 16 15 142326 CASAVA_Build 10 118212722 2I CAAGAAAAAT --/TA TGTTATTGCC 3070 hom 135 het 53 0 46 7 TA 0 1 142327 CASAVA_Build 10 118219674 1I CTAGTTTCTC -/A CATGTTACGT 3070 hom 135 het 52 0 44 8 A 0 1 142328 CASAVA_Build 10 118228372 1I AGGAAGCACC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 129 het 52 0 43 9 A 8 9 142329 CASAVA_Build 10 118229611 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 10 4 A 13 12 142330 CASAVA_Build 10 118241955 9D TCATTATTAA CCTTTTATG/--------- CCCATTATTG 3070 hom 66 het 23 0 23 3 CCTTTTATG 1 0 142331 CASAVA_Build 10 118250058 1D GTTCTTGGGC A/- GGGGGAGAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 7 A 1 0 142332 CASAVA_Build 10 118252524 1D TTTTTTAATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 A 9 8 142333 CASAVA_Build 10 118252990 1I TCTGGCATGG -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 7 8 142334 CASAVA_Build 10 118254715 1I TGGCCCTCAG -/C CTCGTGAGGT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 C 1 2 142335 CASAVA_Build 10 118257440 1I TTTTCCTTCC -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 8 142336 CASAVA_Build 10 118258055 1I GGAGTGTAGT -/G GGGAGGAAAT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 G 3 4 142337 CASAVA_Build 10 118262297 2I CAGTTACGCA --/AG AGAGAGAGTA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 AG 4 5 142338 CASAVA_Build 10 118263109 1I CTGATCAGAC -/A GGAGGCAGAG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 0 1 142339 CASAVA_Build 10 118264406 1I AATGAAGAAT -/A GAAGAAGGAG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 0 1 142340 CASAVA_Build 10 118264680 1I AGGGTAAAGA -/G GAGGCCAGGT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 G 1 2 142341 CASAVA_Build 10 118267890 1I ACTGGGAGGC -/A AAAAAAATAC 3070 hom 32 het 36 1 29 6 A 7 8 142342 CASAVA_Build 10 118269874 1D AACTTGAGTG T/- TTATGTTATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 3 2 142343 CASAVA_Build 10 118271070 1I TTTTCATCTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 8 9 142344 CASAVA_Build 10 118294049 1I GGCTTCTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 94 het 39 0 32 7 T 9 10 142345 CASAVA_Build 10 118300793 1D TTATCTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 33 4 12 17 A 16 15 142346 CASAVA_Build 10 118352444 2I TGTAGATGTA --/TT TGTGTGTGTG 3070 hom 124 het 66 0 42 24 T 1 3 142347 CASAVA_Build 10 118364646 1D GGGAAGGGCA G/- GGGGGAATGA 3070 het 3070 hom 53 22 23 10 G 6 5 142348 CASAVA_Build 10 118369615 1I CATTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 11 12 142349 CASAVA_Build 10 118370620 1D CTGTCTAACT C/- CCTGTGCACT 3070 het 2899 hom 31 9 9 13 C 3 2 142350 CASAVA_Build 10 118373454 1I TAGGAAAAGA -/G GTCTGCTACG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 2 142351 CASAVA_Build 10 118373806 2I CTTACACATT --/CA CACACACACT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 CA 4 5 142352 CASAVA_Build 10 118374232 1I GAGCCAGGTG -/T CTGTCAATAG 3070 het 3070 hom 45 22 19 4 T 0 1 142353 CASAVA_Build 10 118378666 1D CCAAGGCACT G/- GGTGAAGGAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 G 3 2 142354 CASAVA_Build 10 118383674 4D GCATCTCTCC TCTG/---- TCTATCTATC 2531 het 2531 ref 23 16 7 4 TCTG 1 0 142355 CASAVA_Build 10 118397985 1D GACTCGGTCT A/- AAAAAAAAAA 2097 het 2097 ref 31 11 10 10 A 13 12 142356 CASAVA_Build 10 118399549 1I TCTTCTAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 T 10 11 142357 CASAVA_Build 10 118402485 4D TGGGTTCAAG GGAT/---- GGATTCTCCT 1398 het 1398 ref 9 5 4 0 GGAT 2 1 142358 CASAVA_Build 10 118411341 2D TGTATGAGGG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 15 18 9 AC 6 5 142359 CASAVA_Build 10 118415957 3D AATAAAACCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 21 12 T 14 11 142360 CASAVA_Build 10 118419878 6D AATACAGGAG CTTCCT/------ GGGCCTGGCA 1188 het 745 hom 11 4 5 3 CTTCCT 1 0 142361 CASAVA_Build 10 118427486 1D AAATTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 711 hom 44 2 34 8 T 13 12 142362 CASAVA_Build 10 118438746 1I CCCACCACTG -/C CCCAGAAACC 3070 hom 96 het 38 0 25 13 C 3 4 142363 CASAVA_Build 10 118439301 1D AAGGCAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 49 4 26 19 A 17 16 142364 CASAVA_Build 10 118447523 43D ATCCTACTGA TGAATAACATTCATTGTAAGATAGATCACATTTTGTTTCTGGC/------------------------------------------- TGAATAACAT 2173 het 2173 ref 53 28 6 33 TGAATAACATTCATTGTAAGATAGATCACATTTTGTTTCTGGC 1 0 142365 CASAVA_Build 10 118448642 1I CCCTGATGGA -/T GGCCTAATCG 3070 het 3070 ref 54 27 17 10 T 0 1 142366 CASAVA_Build 10 118448998 1I TGCCAGGGGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 1345 hom 28 4 17 7 A 7 8 142367 CASAVA_Build 10 118453037 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 13 12 142368 CASAVA_Build 10 118458568 1D GAAAACAGGG A/- CTCAAGGAGA 3070 het 3070 ref 44 22 15 8 A 1 0 142369 CASAVA_Build 10 118460519 11I GAAATAAAAT -----------/ACAAAGGGTCA ACAGAATATT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 ACAAAGGGTCA 0 1 142370 CASAVA_Build 10 118477821 1I CATTTTCTAC -/T TAATGATATT 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 T 1 2 142371 CASAVA_Build 10 118506525 1D CAGGTAATAG T/- ATTATATTCA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 1 0 142372 CASAVA_Build 10 118510517 1D CATAGAGGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 76 het 34 0 29 5 A 9 8 142373 CASAVA_Build 10 118511072 1D TAAAAAAAGT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 8 7 142374 CASAVA_Build 10 118520394 1I ACAAGCCTCT -/C CTTGGGGGAG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 C 1 2 142375 CASAVA_Build 10 118521305 2I ACAATGGTGA --/GG GAGTGCACCC 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 G 1 3 142376 CASAVA_Build 10 118524499 3I AACTGTGCTG ---/CTA CTTTGGGGGA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 CTA 0 1 142377 CASAVA_Build 10 118538166 1I TGTAGCCTGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 64 het 39 1 35 3 T 7 8 142378 CASAVA_Build 10 118543082 4D CACTGAAAAC AACA/---- AACAAACAAA 3070 hom 103 het 48 0 34 14 AACA 3 2 142379 CASAVA_Build 10 118547558 5I TCTGGAGAGA -----/GGCAG GGCAGGGGCT 3070 hom 37 het 22 0 11 11 GGCAG 1 2 142380 CASAVA_Build 10 118552562 1D GAGATGAGGA T/- TGTTCGTTAC 3070 hom 138 het 52 0 42 10 T 2 1 142381 CASAVA_Build 10 118556080 1I TGTTTGCCAC -/T AGGCCATGAT 3070 hom 138 het 55 0 45 10 T 0 1 142382 CASAVA_Build 10 118563219 1I CCCTCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 2306 het 2306 ref 17 9 5 3 A 9 10 142383 CASAVA_Build 10 118564601 1D TCCCTACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 11 10 142384 CASAVA_Build 10 118589412 1I GGTTAGTGCC -/T TTTTTTTTTT 1267 het 1267 ref 43 26 3 14 T 11 12 142385 CASAVA_Build 10 118616309 1I CTGTCCCATT -/A AAAAAAAAAA 1327 het 1327 ref 26 12 4 10 A 15 16 142386 CASAVA_Build 10 118619409 3I AATGGAGATC ---/ATA ATAATATCTT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 ATA 2 3 142387 CASAVA_Build 10 118628209 5D TTTTAGTGGT AATAA/----- AATAATAGTG 3070 hom 10 het 17 0 9 10 AATAA 2 1 142388 CASAVA_Build 10 118631946 1I GCCTGAATTG -/C CTCTTTTGTA 3070 hom 5 het 19 1 14 4 C 1 2 142389 CASAVA_Build 10 118639667 4D24M1I TTCTGTTCAA TTTTTTTTTCTACTTTAATGCAACCTCT-/----TTTTTCTACTTTAATGCAACCTCTA AAGGACTAAG 3070 hom 144 het 38 0 47 5 N/A 0 0 142390 CASAVA_Build 10 118669370 1D CCAATTCTTA C/- GAGAGAAAAT 3070 hom 132 het 53 0 44 10 C 1 0 142391 CASAVA_Build 10 118673908 3D GAGTACTTAT ATA/--- TATATTTACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATA 1 0 142392 CASAVA_Build 10 118691717 1D ATTACAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 26 1 15 10 T 15 14 142393 CASAVA_Build 10 118698306 3D ACAATATAGG AGA/--- AGATTTTATT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 AGA 2 1 142394 CASAVA_Build 10 118708179 1D TCTCTTGCCC A/- AAAACACCTA 3070 hom 117 het 42 0 38 4 A 5 4 142395 CASAVA_Build 10 118744368 4D AGTGACATAT TAAA/---- TAAACCCATT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 TAAA 2 1 142396 CASAVA_Build 10 118759693 1D ATTAACGAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 7 142397 CASAVA_Build 10 118767898 1I ATAGATTTAG -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 142398 CASAVA_Build 10 118768634 2D GACTAGAAAC TG/-- AAATTTTAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 TG 1 0 142399 CASAVA_Build 10 118773580 1D23M4I AATGAGGGCT GGTTATTGCTGTGGTCAGGCACTC----/-GTTATTGCTGTGGTCAGGCACTCTGAA TGAATTTTTT 3070 hom 96 het 29 0 30 5 N/A 0 0 142400 CASAVA_Build 10 118775925 2D GATAGACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 38 0 19 20 T 16 14 142401 CASAVA_Build 10 118776695 1I CAACATTGGA -/G GGGGGGGCCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 7 8 142402 CASAVA_Build 10 118781555 1I TAAAGGGATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 107 het 41 0 36 5 A 8 9 142403 CASAVA_Build 10 118783223 1I AAGGCACATC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 9 142404 CASAVA_Build 10 118785326 1D ACATGCCTGT A/- AATCCCAGCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 3 2 142405 CASAVA_Build 10 118787429 1I ATTGTTTGAA -/C CTGGGAGGCA 1644 hom 10 het 4 0 4 5 C 1 2 142406 CASAVA_Build 10 118787806 1D TACCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 2681 hom 27 het 14 0 9 5 T 15 14 142407 CASAVA_Build 10 118788010 1D GGACTGCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 10 9 142408 CASAVA_Build 10 118789352 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 23 1 11 11 A 15 14 142409 CASAVA_Build 10 118793789 3D TGTTTTACTT AAC/--- AATATATCTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AAC 1 0 142410 CASAVA_Build 10 118805088 1D ATGGTTAAGA C/- CTGGGTGCAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 2 1 142411 CASAVA_Build 10 118810637 1D AGCTTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 34 1 23 10 T 15 14 142412 CASAVA_Build 10 118820834 4D GCAGGAAATA CTCT/---- CTGTTTTCTG 3070 hom 120 het 44 0 40 6 CT 3 1 142413 CASAVA_Build 10 118828525 1I GATTTGTGAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 36 het 13 0 13 1 T 8 9 142414 CASAVA_Build 10 118836694 2I TTCTGTAAAC --/AG ATAATGGTGA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 AG 0 1 142415 CASAVA_Build 10 118850619 3D TGGATAGAAG AGA/--- AGGAGTTGAA 3070 hom 120 het 44 0 41 7 AGA 1 0 142416 CASAVA_Build 10 118856962 3D GAAGCAAATC ACA/--- ACACATATCT 3070 hom 105 het 39 0 35 7 ACA 2 1 142417 CASAVA_Build 10 118863069 8D TTTCTACTTT ACTAGGTA/-------- ACCATATGCG 3070 hom 132 het 45 0 45 4 ACTAGGTA 1 0 142418 CASAVA_Build 10 118867865 10D AATCCATTTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 23 0 16 9 A 25 15 142419 CASAVA_Build 10 118873409 1D CCTGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 1547 het 1547 ref 30 14 6 10 A 17 16 142420 CASAVA_Build 10 118877556 4D AGAGACTCTC AGAT/---- AGTCAGCTAT 3070 hom 132 het 47 0 44 3 AGAT 1 0 142421 CASAVA_Build 10 118888354 1I GTGGGGGGAG -/A AAAAAAAAAA 2856 het 77 hom 13 2 8 3 A 10 11 142422 CASAVA_Build 10 118916044 1D CGTGATCCGC G/- GGGGGCGCAG 3070 hom 60 het 29 0 16 13 G 6 5 142423 CASAVA_Build 10 118928017 8I CTGCCTCCCA --------/TTCTATTC TTCTATTCAA 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 TTCTATTC 1 2 142424 CASAVA_Build 10 118937342 1D ATGTAGCATA T/- TTTTTTTTGC 2448 het 2448 ref 29 18 8 4 T 9 8 142425 CASAVA_Build 10 118937674 5D ACTTTGTCAC TTCAT/----- TTGAGTTATG 3070 het 3070 ref 55 27 25 6 TTCAT 1 0 142426 CASAVA_Build 10 118939719 1D GTTTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 11 10 142427 CASAVA_Build 10 118949937 20D GTGTAACAGC TTGCTTTTCCTAAAAGCCTT/-------------------- TTGCTTTTAG 3070 hom 33 het 15 0 12 4 TTGCTTTTCCTAAAAGCCTT 1 0 142428 CASAVA_Build 10 118968000 1D ATCCTCCCCA G/- GACGGAGGTC 3070 hom 57 het 27 0 17 10 G 2 1 142429 CASAVA_Build 10 118977945 3D CTCCCTTTTC CCT/--- CCATCCTTCC 3070 hom 74 het 28 0 20 9 CCT 1 0 142430 CASAVA_Build 10 118978430 6I GCCAGGCTAA ------/TTTATT TTTATTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTTATT 1 2 142431 CASAVA_Build 10 118981311 1I GCGGAGGTAG -/A AGTGAGGGAT 3070 hom 93 het 36 0 29 7 A 1 2 142432 CASAVA_Build 10 118985436 6D ACACAGAGAA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 3070 hom 72 het 41 0 24 18 AG 12 9 142433 CASAVA_Build 10 118986766 1I CTGTTAGTGC -/A ATCTCCAGTA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 A 1 2 142434 CASAVA_Build 10 118988511 3D AAAGAGAGAG ATA/--- ATAATTTTAT 3070 hom 87 het 30 0 30 1 ATA 2 1 142435 CASAVA_Build 10 118999341 1D CTTACTCAAA T/- TGGATTAACT 3070 hom 129 het 52 0 44 8 T 2 1 142436 CASAVA_Build 10 119008075 2D TTAAATTTTA TT/-- TTTTTTTATC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 7 142437 CASAVA_Build 10 119011742 1D ATTGTGTCAT A/- AAACAAAACC 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 4 3 142438 CASAVA_Build 10 119018085 1I AACTGTACGG -/C CCCCTGGCCT 3070 hom 102 het 38 0 32 6 C 4 5 142439 CASAVA_Build 10 119018491 8D ACACATTCAT ACACACAA/-------- ACACACATAC 3070 hom 119 het 43 0 34 14 ACACACAA 1 0 142440 CASAVA_Build 10 119018676 4D ACACATACAT ATAC/---- ACACATACAC 3070 het 2061 hom 59 13 27 26 ATAC 1 0 142441 CASAVA_Build 10 119037873 1D GGAAAGGCAT A/- TATTTATGTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 1 0 142442 CASAVA_Build 10 119040366 12D TGGTGTATCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 2055 hom 25 8 13 6 T 23 11 142443 CASAVA_Build 10 119041032 1I TCCACCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 20 1 15 4 A 11 12 142444 CASAVA_Build 10 119041359 1I CAACTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 883 hom 41 4 28 9 A 12 13 142445 CASAVA_Build 10 119042080 1D TTGGAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 31 1 14 17 T 12 11 142446 CASAVA_Build 10 119043829 1D22M4D CCAAAAAGAC AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAC/-AAAAAAAAACAAAAAAACAAAA---- AAATATTGAC 3070 het 147 hom 41 2 25 19 N/A 0 0 142447 CASAVA_Build 10 119045002 4D TTCCTTCCCA ACAC/---- ACAAAAAACT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 AC 3 1 142448 CASAVA_Build 10 119045691 1D TATTACAATT A/- AAATTATAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 4 3 142449 CASAVA_Build 10 119049564 1D ATATGAGAAA C/- CCCCCCCATG 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 C 8 7 142450 CASAVA_Build 10 119056159 1D ATAGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 22 1 18 3 T 11 10 142451 CASAVA_Build 10 119056747 1D AGGTTTCTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 8 7 142452 CASAVA_Build 10 119058906 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACATAGT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 0 1 142453 CASAVA_Build 10 119060754 2D AAAATTAATA TT/-- GAGTAGTATA 3070 hom 93 het 32 0 32 3 T 2 0 142454 CASAVA_Build 10 119063267 1D TTTCCTTTAC A/- CTAAGTCTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 1 0 142455 CASAVA_Build 10 119066922 1I TGTAGACACT -/G TTGCTGACAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 0 1 142456 CASAVA_Build 10 119077922 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 14 het 19 1 14 4 T 8 7 142457 CASAVA_Build 10 119082002 5D TCTGTAAGGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1275 het 604 hom 25 5 5 16 T 23 18 142458 CASAVA_Build 10 119086668 1D GATCTCTTTT C/- CATGTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 C 2 1 142459 CASAVA_Build 10 119088630 10D GGACTTAACC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 199 hom 33 2 19 12 A 24 14 142460 CASAVA_Build 10 119092577 1I ATCCATCATC -/A CATACCTGAC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 0 1 142461 CASAVA_Build 10 119095172 1D GTATGACCCA T/- ACAGCAAAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 T 1 0 142462 CASAVA_Build 10 119099756 2D CTGTTTTTTT TG/-- TTTGTTTGTT 1366 het 1366 ref 31 12 9 10 TG 1 0 142463 CASAVA_Build 10 119114625 1I AATATATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 22 16 11 A 10 11 142464 CASAVA_Build 10 119121910 1D AGTCTACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 A 10 9 142465 CASAVA_Build 10 119127780 4I CTGTGTTTGA ----/TACT TAAGTTAGGA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TACT 0 1 142466 CASAVA_Build 10 119131037 3I TTAGTACCTC ---/ATT GTTTTTTATA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATT 0 1 142467 CASAVA_Build 10 119144396 1I GGATACCATT -/A AAAAAATGGG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 6 7 142468 CASAVA_Build 10 119145753 1D CTCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 11 10 142469 CASAVA_Build 10 119147094 1D3M1D3M1D4M1D2M1D3M1D4M1D4M4D7M2D5M1D2M1D8M4D3M1D11M4D5M2D10M1D AATTACAAAT CATATCTTCAAGATGTCAATCATGACATTGGGTTATGGATAGTTGATACGTGATGGTTCTACTACAGCCTAACCACATGGTGACATTTTATTATGTGATTC/-ATA-CTT-AAGA-GT-AAT-ATGA-ATTG----TTTGATA--TTATA-GT-ATGTCTCT----CAG-CTACCCATGTG----CATTT--TTTTGTGATT- GTGTAATTCA 3070 hom 117 het 32 0 40 5 N/A 0 0 142470 CASAVA_Build 10 119151507 1D AGTACCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 33 1 20 12 T 16 15 142471 CASAVA_Build 10 119168422 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 A 8 7 142472 CASAVA_Build 10 119174958 3D TTGCACACAG GTT/--- GTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 GTT 3 2 142473 CASAVA_Build 10 119176231 1I GCTCCAGAGG -/A AAGGTCTTCA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 2 3 142474 CASAVA_Build 10 119177682 1I TTCAAGTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 11 12 142475 CASAVA_Build 10 119188079 5D TTCATATTAA TTAAC/----- TTATCTATTA 3070 het 3070 ref 28 12 12 5 TTAAC 1 0 142476 CASAVA_Build 10 119190171 3D GGAAGGAAGG TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 TTC 5 4 142477 CASAVA_Build 10 119193250 2D CCCGAATCTC AT/-- ATTGAATTGT 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 AT 2 1 142478 CASAVA_Build 10 119194186 1D AATGCTCCCA T/- TTTCACAGGT 3070 het 3070 hom 46 16 15 15 T 4 3 142479 CASAVA_Build 10 119204385 1I TAGCATATCT -/G GAGGTGAGAC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 G 1 2 142480 CASAVA_Build 10 119229790 4D CTGTTGCAGT CCAG/---- CCAGCTGCAT 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 CCAG 2 1 142481 CASAVA_Build 10 119248981 4D AGCCTCACCT TGCC/---- GCACCCAGCT 3070 het 3070 ref 59 31 24 5 TGCC 1 0 142482 CASAVA_Build 10 119268903 1I ACAAAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 13 14 142483 CASAVA_Build 10 119270423 1I TTTCTACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 9 10 142484 CASAVA_Build 10 119280184 1D CTATACACCA T/- TGAGTATAGG 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 T 2 1 142485 CASAVA_Build 10 119291104 3D AACAGATGGC ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 ATA 5 4 142486 CASAVA_Build 10 119295628 1D AGTGTGAAGA C/- CCCTGCTGGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 4 3 142487 CASAVA_Build 10 119300572 1D GTCTGTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2005 hom 25 8 13 5 A 13 12 142488 CASAVA_Build 10 119312380 2I88M2I TGTGGGTGCT --TGTGTGTGTGTATGGATGTATGTTTGAGCATGTGTATGAGTGTGCATAGGTGTGTATGTGTGTATATGGGTGTGTGTGGGTGTGTACA--/TATGTGTGTGTGTATGGATGTATGTTTGAGCATGCGTATGAGTGTGCATAGGTGTGTATGTGTGTATATGGGTGTGTGTGGGTGTGTACATG TGTGTATGCA 3070 het 3015 hom 54 14 52 51 N/A 0 0 142489 CASAVA_Build 10 119312655 2D GTGTCTGTGG GT/-- GTGTGTGGGT 3070 hom 208 het 93 0 61 34 GT 4 3 142490 CASAVA_Build 10 119312949 1D TCGTGGGTGT G/- GGGGGGTCTG 3070 hom 135 het 63 0 50 14 G 7 6 142491 CASAVA_Build 10 119314149 12D GCCCCTGGGA GCACGCGCCGGG/------------ GAGGAGGGAG 3070 hom 93 het 32 0 29 8 GCACGCGCCGGG 1 0 142492 CASAVA_Build 10 119319913 1D AAGTTGGCAA G/- GGGGAGTAGG 3070 hom 108 het 39 0 36 4 G 5 4 142493 CASAVA_Build 10 119323647 1D TCTCTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 24 7 A 12 11 142494 CASAVA_Build 10 119329886 3I TCCACTTTAT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TTC 3 4 142495 CASAVA_Build 10 119332082 2D TCCCCCATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 33 3 20 10 T 25 23 142496 CASAVA_Build 10 119337060 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1100 hom 18 4 10 4 A 12 11 142497 CASAVA_Build 10 119339091 4D TCCTGGCTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TTTG 3 2 142498 CASAVA_Build 10 119340812 3I TTCATCTTTC ---/CTT CTTCTTTCCC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 CTT 2 3 142499 CASAVA_Build 10 119347218 1I TTTGTTGTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 132 het 51 0 44 7 T 7 8 142500 CASAVA_Build 10 119359613 1D GCCCTGGATA T/- TGTAATCTCC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 2 1 142501 CASAVA_Build 10 119363403 1D ATTCAACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 30 1 18 11 T 15 14 142502 CASAVA_Build 10 119381686 2I TTCTGGGTTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 60 het 26 0 19 7 TC 6 7 142503 CASAVA_Build 10 119382731 4I GAACACAGTC ----/AGAT AGGTCCTGAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AGAT 0 1 142504 CASAVA_Build 10 119386955 1D TTAAGCTTTT G/- GGGGGGAATA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 G 7 6 142505 CASAVA_Build 10 119389077 5D TCAGCACTTA GTACT/----- GTCAATTTAT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 GTACT 1 0 142506 CASAVA_Build 10 119390875 1I TTTTTGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 11 142507 CASAVA_Build 10 119401204 1I TTTGTAATTT -/A TAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 0 1 142508 CASAVA_Build 10 119410491 1I ACCTGGCCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 76 het 27 0 26 1 T 8 9 142509 CASAVA_Build 10 119421689 1D TTACTAAAAT G/- GACCAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 G 2 1 142510 CASAVA_Build 10 119439455 1I GATTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 16 9 T 13 14 142511 CASAVA_Build 10 119445411 1D TCCCCTACGC A/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 A 1 0 142512 CASAVA_Build 10 119471884 2I CAGCACGTTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 41 0 28 13 A 10 12 142513 CASAVA_Build 10 119473716 1I CTGTTGGGGG -/A TGTGGGGTCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 0 1 142514 CASAVA_Build 10 119477159 8I ACATGAGACC --------/TTATAGGA TTTCCACTGT 3070 hom 123 het 48 0 38 10 TTATAGGA 0 1 142515 CASAVA_Build 10 119482966 1D CACATACATT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 A 9 8 142516 CASAVA_Build 10 119488199 1D CTTCTTATTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 T 9 8 142517 CASAVA_Build 10 119490171 2I CATGTATTTT --/AG AGTCTTCTTG 3070 hom 126 het 52 0 43 9 AG 1 2 142518 CASAVA_Build 10 119500631 1I ATTCAGGGTC -/G ACTTCCTTTA 3070 hom 120 het 48 0 30 18 G 0 1 142519 CASAVA_Build 10 119501546 6I7M3I GGAACATGTG ------GGAACAT---/CCTTACTGTAGATAGG GTGGTCAGGG 3070 hom 93 het 31 0 31 3 N/A 0 0 142520 CASAVA_Build 10 119504330 1I AGATATACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 32 0 23 9 A 9 10 142521 CASAVA_Build 10 119517976 2D AAATGGACGG AT/-- ATATATATAC 3070 hom 42 het 20 0 15 5 AT 5 4 142522 CASAVA_Build 10 119535760 1D TTCAATTTTT C/- CCATCCTCAT 3070 hom 117 het 40 0 40 0 C 3 2 142523 CASAVA_Build 10 119536630 1D CCATACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 30 1 22 7 A 11 10 142524 CASAVA_Build 10 119538382 1D AAAACACTAA C/- CGTGATTTTG 3070 hom 146 het 52 0 47 5 C 2 1 142525 CASAVA_Build 10 119545226 4D AGGCAGTGAT ATCA/---- GGTCACAACC 3070 hom 153 het 55 0 49 6 ATCA 1 0 142526 CASAVA_Build 10 119546115 1I ATGACCTGTT -/C CGGTTAATCA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 C 1 2 142527 CASAVA_Build 10 119553180 1D TGGTTAGGTA T/- TTTCCTCCCC 3070 hom 90 het 35 0 27 8 T 4 3 142528 CASAVA_Build 10 119554224 1D AGCGAAGCTC T/- GAGTCGTCAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 1 0 142529 CASAVA_Build 10 119560531 5I ACAAATTTAC -----/AAGAA AAAAACAAAC 3070 hom 39 het 14 0 14 1 AAGAA 0 1 142530 CASAVA_Build 10 119570168 1D GCTTTGTATG A/- AAAAAGTATG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 5 142531 CASAVA_Build 10 119594707 1D TCTTTAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 10 9 142532 CASAVA_Build 10 119624058 1D ATTTTGATTA G/- ACCCGGCTCA 3070 het 3070 hom 33 10 18 6 G 1 0 142533 CASAVA_Build 10 119627009 1I TAATTTTGTA -/T TTTTTTGTAG 1350 het 1265 hom 12 5 3 4 T 6 7 142534 CASAVA_Build 10 119628975 4D TACCTGGAGG TCCC/---- TTTCTCCCCT 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 TCCC 1 0 142535 CASAVA_Build 10 119632457 1I CTGTGGTCCC -/A AGCTACTTGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 1 2 142536 CASAVA_Build 10 119632579 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 23 5 A 10 9 142537 CASAVA_Build 10 119637575 1D ATTCCATATC T/- TTGGTGTCCC 3070 hom 153 het 55 0 51 4 T 3 2 142538 CASAVA_Build 10 119639555 1I TTTCTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 34 0 19 15 A 14 15 142539 CASAVA_Build 10 119646531 1I GTGTCTTAAA -/G GTTTGGGAGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 2 142540 CASAVA_Build 10 119659034 1D CATAAAGGAA G/- AACCTCCAAC 3070 hom 164 het 57 0 55 3 G 1 0 142541 CASAVA_Build 10 119664599 1I TTTATATAAT -/A AAAGATCTAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 3 4 142542 CASAVA_Build 10 119671747 1D TTAAAAGTGA T/- TTTTGAAATA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 5 4 142543 CASAVA_Build 10 119674518 2I TACACGTACT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 68 25 24 19 CA 6 7 142544 CASAVA_Build 10 119674593 4I TCAGGCACTT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 68 31 22 15 AC 6 8 142545 CASAVA_Build 10 119674706 1D ATTTGAGCCA C/- CCAATCCCCT 3070 het 3070 ref 63 34 17 12 C 3 2 142546 CASAVA_Build 10 119676101 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2491 het 2491 ref 35 17 8 10 A 13 12 142547 CASAVA_Build 10 119680585 3I CTACAAGGGC ---/AGG AGAAGACCAA 3070 het 3070 ref 37 25 8 4 AGG 0 1 142548 CASAVA_Build 10 119687023 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 321 het 321 ref 7 3 2 2 T 9 10 142549 CASAVA_Build 10 119692973 1D TTGTCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 184 hom 32 2 23 7 A 15 14 142550 CASAVA_Build 10 119701363 6D2M7D2M4D CTTCACCTCT GAAAACTTGGACTACCAAGTG/------TT-------CA---- GATTAGGGCT 2460 het 2460 ref 26 21 8 0 N/A 0 0 142551 CASAVA_Build 10 119703571 1I AAAGTTAGAG -/T TGTGCAGGTG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 1 2 142552 CASAVA_Build 10 119704021 4D TCCTTTCTGA TTCT/---- TTCTTTCTTT 2154 hom 15 het 7 0 6 1 TTCT 4 3 142553 CASAVA_Build 10 119716169 1I TGGCAGTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2741 hom 30 10 10 10 T 12 13 142554 CASAVA_Build 10 119721537 1I CATTTCTGCC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 8 9 142555 CASAVA_Build 10 119722337 1I ATGCCAGCCT -/G GAAGTTCTTG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 1 2 142556 CASAVA_Build 10 119726280 1I AAAAAGTACT -/A AAAAAAAAAA 2870 het 1028 hom 25 4 12 9 A 15 16 142557 CASAVA_Build 10 119736456 1D TGAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 11 10 142558 CASAVA_Build 10 119738397 1D TCTGCATGGC G/- TCCCTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 0 142559 CASAVA_Build 10 119752390 1D CTCACGTAAT C/- CCCAGCACTT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 C 4 3 142560 CASAVA_Build 10 119774266 1D GCCCACAACA C/- CCTGGCCAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 C 3 2 142561 CASAVA_Build 10 119780287 2I ATTTGCATTA --/GT GAGTTAGCAC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 GT 0 1 142562 CASAVA_Build 10 119781840 100D26M2D TAAATATTTA ATAGACTTTTCTGCCTGGTCTTCAATGCTCACTATAATTTAGGGTGTGTGTGTGTGCATTAGGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTTTAACCTATTCAGCCATATCTTTTACTCCTTTCCACCATATC/----------------------------------------------------------------------------------------------------CATATCTTTTACTCCTTTCCACCATA-- TCTGTTTTAG 1760 het 1760 ref 22 41 5 15 N/A 0 0 142563 CASAVA_Build 10 119789067 1I ATTAACCTTC -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 A 6 7 142564 CASAVA_Build 10 119797874 4I AACAATAGAA ----/AATT AATTATAATA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AATT 1 2 142565 CASAVA_Build 10 119806473 10D TGTGGTATAC ATTGTGTACT/---------- ATTATAAATA 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 ATTGTGTACT 1 0 142566 CASAVA_Build 10 119809182 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1298 het 358 hom 28 5 6 17 A 17 18 142567 CASAVA_Build 10 119811061 1D GTTTTTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 9 142568 CASAVA_Build 10 119815597 1D GTATGAGCTG C/- CCATGGAGAG 3070 het 3070 hom 49 20 26 5 C 3 2 142569 CASAVA_Build 10 119818184 1D GAGGTACTAC T/- TTTTTTTTTA 2810 het 2810 ref 20 12 7 1 T 10 9 142570 CASAVA_Build 10 119826197 1I CTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 9 10 142571 CASAVA_Build 10 119827035 1D CCAGACATCT C/- CCTCAGTTAG 3070 hom 84 het 33 0 27 6 C 3 2 142572 CASAVA_Build 10 119834463 2I CCAGTGGGGA --/CT CTGTGTGGAG 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 CT 1 2 142573 CASAVA_Build 10 119841701 1D AAGGCTGAGT C/- CCCATTTAGC 3070 het 15 hom 30 0 16 14 C 4 3 142574 CASAVA_Build 10 119844465 5I CCTACTACTT -----/AGAGA AGTGTATCTT 3070 hom 115 het 44 0 39 5 AGAGA 0 1 142575 CASAVA_Build 10 119846005 2D TAGTTTTATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 111 het 49 0 38 12 CA 8 7 142576 CASAVA_Build 10 119849620 1D ATTAAATGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 27 14 7 6 T 8 7 142577 CASAVA_Build 10 119851666 1D ACTGGAGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 18 9 4 T 10 9 142578 CASAVA_Build 10 119854540 2D AGTGAATAAC TG/-- TGGCTGAATA 3070 het 3070 ref 44 28 12 6 TG 2 1 142579 CASAVA_Build 10 119861122 1I CCTGCTAAAG -/A AAAAAAAAAT 2659 het 2659 ref 24 17 7 0 A 9 10 142580 CASAVA_Build 10 119861411 1D AAAACTCAAG T/- TGAATATTCT 3070 het 3070 hom 28 14 14 1 T 2 1 142581 CASAVA_Build 10 119867535 1I ACAGAATCTT -/A ACAGCTGAGA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 A 1 2 142582 CASAVA_Build 10 119867624 1D AAACTCCTTG C/- CCAAGGTCAC 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 C 3 2 142583 CASAVA_Build 10 119869160 2D GATTTAATGA CT/-- CTGTTTACTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 CT 2 1 142584 CASAVA_Build 10 119872874 2I CCCCCCCCCC --/AA AAAAAGATAT 2052 het 2052 ref 28 10 9 9 A 5 7 142585 CASAVA_Build 10 119874141 2I TATTATATAT --/CC TTAGGGGGTA 3070 het 3070 hom 48 20 26 2 C 0 2 142586 CASAVA_Build 10 119912735 1D TGCTTTCACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3023 hom 39 11 17 11 A 12 11 142587 CASAVA_Build 10 119919825 1I GTTTTTCTGG -/A AAATCTATAC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 3 4 142588 CASAVA_Build 10 119926986 1D GAATAGGGCA G/- GGCCAGCAGA 3070 hom 72 het 27 0 24 4 G 3 2 142589 CASAVA_Build 10 119928347 1D34M1I19M1I TGATTAAATT GGGACTTCATCAAAATTAAAAACTCTTGCTGTTAG-AAAATACTATTAAGAGAAT-/-GGACTTCATCAAAATTAAAAACTCTTGCTGTTAGAAAAATACTATTAAGAGAATA AAAACCCAAA 3070 hom 123 het 36 0 42 12 N/A 0 0 142590 CASAVA_Build 10 119929055 14D11M1D AAATAGAAAT GGGGGACTACTGGAGGGGAGAGGGAT/--------------GGGGAGAGGGA- GGATAGAGGC 3070 het 3070 ref 25 18 11 4 N/A 0 0 142591 CASAVA_Build 10 119932528 3D GTTCTAACTC CTT/--- CTAGTTGAGA 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 CTT 1 0 142592 CASAVA_Build 10 119933307 1I ACCTCTCAGA -/T TTGTGATTAT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 T 2 3 142593 CASAVA_Build 10 119944516 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 21 1 15 6 A 10 11 142594 CASAVA_Build 10 119946835 2I TTATATATAT --/CA ATTGATATAT 2417 het 869 hom 8 2 6 0 CA 0 1 142595 CASAVA_Build 10 119956113 1D ACTGCTGAAG A/- AAAAAAATAT 2452 het 2452 ref 23 12 6 5 A 8 7 142596 CASAVA_Build 10 119979629 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 9 8 142597 CASAVA_Build 10 119980966 1I ACTTAGGTTG -/T TTGTCAAGGT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 2 3 142598 CASAVA_Build 10 119981124 4D GCTTGCAAAA ATAT/---- ATATGTTATT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 AT 4 2 142599 CASAVA_Build 10 119987553 2D ATGGGAAGAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 74 28 25 21 TG 8 7 142600 CASAVA_Build 10 119987898 2D CTAAAGGTGA CC/-- CTCGCCCTCA 3070 het 3070 ref 57 24 19 14 C 3 1 142601 CASAVA_Build 10 119988723 20D AAAGAGACAG GAGAGAGAGAGAGAGAGAGA/-------------------- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 33 20 14 7 GA 18 8 142602 CASAVA_Build 10 119991660 2I GGGGTTTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 TG 6 7 142603 CASAVA_Build 10 119995015 3D ACAACCCTTT TTC/--- TTCTTCTTCA 3070 het 3070 ref 50 22 21 10 TTC 4 3 142604 CASAVA_Build 10 120009219 4I TAGGGCTGAC ----/AGAG AGATCCATGT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 AG 1 3 142605 CASAVA_Build 10 120013497 1I CATTGAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 11 12 142606 CASAVA_Build 10 120020755 2I TTTTTTTCCT --/TC TCTCTCTCTC 1559 hom 33 het 15 0 12 3 TC 5 6 142607 CASAVA_Build 10 120022278 1I CAAATTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 13 14 142608 CASAVA_Build 10 120032525 1D ACCACATACA C/- CACACACCAC 1192 het 995 hom 37 7 4 28 C 2 1 142609 CASAVA_Build 10 120032802 1I AGACTATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 9 10 142610 CASAVA_Build 10 120042402 1D TTTTGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 27 0 19 9 T 13 12 142611 CASAVA_Build 10 120053313 8D ACTCCGTCTC AAAAAGAA/-------- AAAAAGAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AAAAAGAA 2 1 142612 CASAVA_Build 10 120060834 1I TACAAAGGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 359 hom 46 1 37 8 A 9 10 142613 CASAVA_Build 10 120089306 1I AATTATCCTC -/A AAGACATTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 2 3 142614 CASAVA_Build 10 120094274 2D TCCATCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 13 11 142615 CASAVA_Build 10 120100464 1D ACTCTCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1001 hom 29 3 22 4 A 13 12 142616 CASAVA_Build 10 120101925 2D TATTTTATAT TA/-- TATATATATA 2574 hom 18 het 7 0 7 0 TA 10 9 142617 CASAVA_Build 10 120126137 1D TATTTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 510 hom 45 3 34 8 T 13 12 142618 CASAVA_Build 10 120128940 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 T 7 6 142619 CASAVA_Build 10 120130666 3D CCAGCCTGTC ACA/--- ACCAGTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 34 5 ACA 1 0 142620 CASAVA_Build 10 120135875 1I TCCTCCCCCC -/T GTATCCCTAC 3070 hom 114 het 44 0 37 7 T 0 1 142621 CASAVA_Build 10 120141200 1D GCCTCTCCCA T/- TGTGAGGACA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 2 1 142622 CASAVA_Build 10 120146350 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 2992 het 961 hom 16 5 9 2 G 0 1 142623 CASAVA_Build 10 120148790 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 1770 het 1279 hom 10 3 6 1 T 10 9 142624 CASAVA_Build 10 120150597 4D ATATTTTCCA AAAC/---- AAACAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 AAAC 2 1 142625 CASAVA_Build 10 120152698 1I CATTAATAGA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 25 13 12 0 T 6 7 142626 CASAVA_Build 10 120153069 4I TAGTTCCCTA ----/TATT TATTCAGATT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 TATT 1 2 142627 CASAVA_Build 10 120155212 1D TGCTTGTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 A 14 13 142628 CASAVA_Build 10 120160060 3D TCAGTTGGAA TTC/--- TTCTCTCCAG 3070 het 3070 ref 44 24 16 7 TTC 2 1 142629 CASAVA_Build 10 120162464 9D CTCACCGTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTG 3070 het 1652 hom 23 6 14 4 T 18 9 142630 CASAVA_Build 10 120168533 6I TGGAAATGAC ------/CAATGA CAATTCTGGG 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 CAATGA 0 1 142631 CASAVA_Build 10 120169052 1I TGGGCTTTTG -/A AAATGATTTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 3 4 142632 CASAVA_Build 10 120186565 3D CAAACTGCTG CTT/--- CTTCTGAATT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 CTT 2 1 142633 CASAVA_Build 10 120191090 1D TACTTGTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 39 3 16 21 A 11 10 142634 CASAVA_Build 10 120192755 1I TCTCAAATTT -/A AAAAAAAAAA 1729 het 861 hom 25 8 12 5 A 16 17 142635 CASAVA_Build 10 120201568 1I AGAACTCAGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 7 8 142636 CASAVA_Build 10 120203303 1D24M1I ACCCTGTCTC AAAAAAAACAAAACAAACAAACAAA-/-AAAAAAACAAAACAAACAAACAAAC AAAAAACCCA 2485 het 1036 hom 12 6 9 5 N/A 0 0 142637 CASAVA_Build 10 120204130 1I TTCTGCAATG -/A GACCTCTGCT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 0 1 142638 CASAVA_Build 10 120209987 6D CTCAGTTTGA AAACCC/------ AAACTTAGAA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 AAACCC 1 0 142639 CASAVA_Build 10 120211238 2D CACTGGCAGT AG/-- AGACTGGTAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AG 2 1 142640 CASAVA_Build 10 120225495 1I ATCATCATCA -/T TTTTTTTTTT 2554 het 2554 ref 41 18 8 15 T 13 14 142641 CASAVA_Build 10 120225776 11I ACAAAAATTA -----------/ATAACGTGTCT ATAACCACTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATAACGTGTCT 0 1 142642 CASAVA_Build 10 120225918 2D GATTGTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 AT 7 6 142643 CASAVA_Build 10 120229675 1I TCCTCCTTTT -/C CCTTTCTTCT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 C 2 3 142644 CASAVA_Build 10 120243288 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTAGGT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 7 6 142645 CASAVA_Build 10 120253902 14I AGAAAAGAAA --------------/AGAAAGAAAGAAAG AGAAAGAAAG 3070 hom 24 het 14 0 8 6 AGAAAGAAAGAAAG 0 1 142646 CASAVA_Build 10 120255277 1D ATATAATATT A/- AATATATATT 1426 het 1242 hom 6 3 3 0 A 3 2 142647 CASAVA_Build 10 120255759 1I GATTATATAT -/A AAAAAAATCT 1263 het 495 hom 5 1 3 1 A 7 8 142648 CASAVA_Build 10 120256778 1I GGGGGTGGGG -/C GGGGGGTTCC 3070 het 675 hom 30 3 14 13 C 0 1 142649 CASAVA_Build 10 120270154 1I CTATGCCGTT -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 31 10 20 1 A 6 7 142650 CASAVA_Build 10 120286002 1I CTTTTGCTGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 8 9 142651 CASAVA_Build 10 120289102 1I ATTGTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 15 1 12 2 T 11 12 142652 CASAVA_Build 10 120293606 1D CCAGGATTGA C/- CCCCTGCCCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 5 4 142653 CASAVA_Build 10 120327306 1D CTCCATCATG C/- CCCCCCCATT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 8 7 142654 CASAVA_Build 10 120340609 1D GTTGTTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 8 7 142655 CASAVA_Build 10 120347971 1I ATAAATAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 60 22 28 10 A 9 10 142656 CASAVA_Build 10 120371339 1D AGTGTCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 15 12 A 12 11 142657 CASAVA_Build 10 120380457 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 125 hom 5 het 7 0 2 5 TA 8 6 142658 CASAVA_Build 10 120381689 5I TGAGTTCTCA -----/CTCAT TTATCTCCAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CTCAT 0 1 142659 CASAVA_Build 10 120388734 1I GAAACCTACA -/T GGGGTCTCTA 3070 het 3070 ref 45 20 13 12 T 0 1 142660 CASAVA_Build 10 120412576 1I CACTGTTGGT -/G GGGTTTTGGG 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 G 3 4 142661 CASAVA_Build 10 120417048 9D AAGACCAACC TGACCAACA/--------- TGGAGAAACC 1656 hom 21 het 9 0 7 2 TGACCAACA 1 0 142662 CASAVA_Build 10 120417239 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 16 1 12 3 A 10 11 142663 CASAVA_Build 10 120420475 1I CCGGGATGCC -/A AGTCAGTGTA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 1 2 142664 CASAVA_Build 10 120448422 1I GTAGTTATTT -/G TTTTGCTGCA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 G 0 1 142665 CASAVA_Build 10 120449152 1I CATGAGACAA -/T TTTTTTTTTT 2219 het 1382 hom 17 6 8 3 T 12 13 142666 CASAVA_Build 10 120450219 9D ACTCCGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 2726 hom 23 11 12 6 A 19 10 142667 CASAVA_Build 10 120470961 5D CATCACTCTA ATTTT/----- ATTAAAATGG 3070 het 3070 ref 38 17 18 4 ATTTT 1 0 142668 CASAVA_Build 10 120477820 1I GTGACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1688 het 1688 ref 28 12 6 10 T 15 16 142669 CASAVA_Build 10 120483359 1D ACAAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 39 1 30 8 A 11 10 142670 CASAVA_Build 10 120485892 1I TTATTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1469 hom 24 4 13 7 T 12 13 142671 CASAVA_Build 10 120500307 1I GTCAACCTAA -/C AGGTGGAAAA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 C 0 1 142672 CASAVA_Build 10 120506174 4D TTTTCACTCC CTCT/---- CTAATTGCAG 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 CT 3 1 142673 CASAVA_Build 10 120534527 4D TTTTTTTATT AATA/---- AATAATATTG 3070 het 3070 hom 35 17 16 3 AATA 2 1 142674 CASAVA_Build 10 120537592 1D CCAGCAGAAG A/- AAAAAAAATA 2817 het 2817 ref 21 8 8 5 A 9 8 142675 CASAVA_Build 10 120554345 1I AGCAAAAGAG -/A AACTTGTGCA 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 A 2 3 142676 CASAVA_Build 10 120561266 1D TCACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 11 10 142677 CASAVA_Build 10 120678013 1D ACTTTTTAGC A/- AAAAAAAAAA 1777 het 1777 ref 37 25 5 7 A 15 14 142678 CASAVA_Build 10 120703410 1D CCCTCCTAGG T/- TAACTCCATT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 T 2 1 142679 CASAVA_Build 10 120712264 2I CTTGAGGCTG --/CT CTGTCTATGG 3070 het 1371 hom 27 8 10 9 CT 1 2 142680 CASAVA_Build 10 120716693 2D ACAGAAACAT CC/-- TCGGCTTCGA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 C 2 0 142681 CASAVA_Build 10 120718328 2I CTCAACTCGT --/GA GAGTCTCACA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GA 1 2 142682 CASAVA_Build 10 120718759 1D GGCAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 28 1 23 6 A 13 12 142683 CASAVA_Build 10 120721096 1D TTAAAATTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 113 het 46 0 35 11 A 10 9 142684 CASAVA_Build 10 120722539 2D AAGACAGACC AA/-- AAAAAAAAAA 2797 het 1556 hom 19 7 7 6 A 15 13 142685 CASAVA_Build 10 120724116 1I ATGGTGGCTT -/A TGCCTGTAAT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 0 1 142686 CASAVA_Build 10 120724393 1I AAAAAAAAAA -/C ACACACACAA 2581 het 2581 ref 26 10 6 10 C 0 1 142687 CASAVA_Build 10 120738419 1I ATCCAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 11 12 142688 CASAVA_Build 10 120739420 1I GGTTTATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2264 hom 27 6 17 4 T 12 13 142689 CASAVA_Build 10 120740212 1I TTTTAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2729 hom 36 8 19 9 A 11 12 142690 CASAVA_Build 10 120745892 1D TGTTGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 12 11 142691 CASAVA_Build 10 120756755 4D AGATATACTA AATT/---- AAAAAGTGTG 3070 het 3070 hom 46 14 18 17 AATT 1 0 142692 CASAVA_Build 10 120759646 1I TATTTTTACT -/G GAATTTCTGA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 G 1 2 142693 CASAVA_Build 10 120775218 8D TGCCAGGCAG GCCCCACT/-------- GCCCCACTCC 3070 hom 75 het 29 0 22 8 GCCCCACT 2 1 142694 CASAVA_Build 10 120776964 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 27 3 17 7 A 13 14 142695 CASAVA_Build 10 120778269 2I GCGAGGGGGT --/AC ACACACACAC 3070 het 831 hom 37 3 15 19 AC 8 9 142696 CASAVA_Build 10 120782288 3I TCTGACATTG ---/CTA CTATTTTACC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 CTA 1 2 142697 CASAVA_Build 10 120783375 1D GTCTTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 43 1 26 16 A 15 14 142698 CASAVA_Build 10 120783390 1D AAAAAAAAAA C/- ACAGGCAGTT 3070 het 639 hom 41 6 24 11 C 1 0 142699 CASAVA_Build 10 120785201 1D TTTCAAAATC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 9 8 142700 CASAVA_Build 10 120786563 1D TAACCCAAAT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 23 het 20 0 9 11 C 12 11 142701 CASAVA_Build 10 120794445 10D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 20 4 T 20 10 142702 CASAVA_Build 10 120818715 1I TGAGACGTCT -/G TAATAGTCAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 0 1 142703 CASAVA_Build 10 120820065 1D TCTATACTTA T/- TTCATCACAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 2 142704 CASAVA_Build 10 120821746 1D CAAGTTCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 566 hom 20 2 12 6 A 14 13 142705 CASAVA_Build 10 120823654 2I TAAAACTGAA --/TT TCACTGTATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 3 142706 CASAVA_Build 10 120823978 1I TCAAAAAAAA -/T AAAATAAAAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 0 1 142707 CASAVA_Build 10 120825825 1D ACAAGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1187 hom 29 7 13 9 A 17 16 142708 CASAVA_Build 10 120836178 1D ATGCCTGTAA T/- TCCCAGCTAC 3070 hom 48 het 18 0 16 3 T 2 1 142709 CASAVA_Build 10 120836301 1D CCATCTCAAC A/- AAAATAAAAT 3070 het 2682 hom 21 7 13 1 A 5 4 142710 CASAVA_Build 10 120841664 4D ACTACCTGTT TTAA/---- TTCTCTCCCA 3070 het 3070 hom 35 15 17 6 TTAA 1 0 142711 CASAVA_Build 10 120843200 1I AGTGTTCTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 9 142712 CASAVA_Build 10 120846204 1I GAGTAACTTT -/A ACAACAGAGA 3070 het 3070 ref 44 23 20 1 A 1 2 142713 CASAVA_Build 10 120849801 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAACTG 934 het 934 ref 48 19 3 26 A 9 7 142714 CASAVA_Build 10 120850740 1I TCAAAGCTGC -/A AGTGAGCCGT 2876 het 2876 ref 21 12 7 2 A 1 2 142715 CASAVA_Build 10 120857685 1D GCGTGAAGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 12 14 8 A 10 9 142716 CASAVA_Build 10 120857984 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 632 hom 7 het 6 0 3 3 A 17 16 142717 CASAVA_Build 10 120858453 1I GTGTTGGCTC -/A ACGCCAGTAA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 A 1 2 142718 CASAVA_Build 10 120863003 1I CTAGCCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 11 12 142719 CASAVA_Build 10 120863193 1I CAAAAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 810 hom 39 2 24 13 A 13 14 142720 CASAVA_Build 10 120864277 1I TATTTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2942 hom 28 10 10 8 T 13 14 142721 CASAVA_Build 10 120866168 15D TCTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTGAGA 3070 het 641 hom 28 3 20 8 T 21 6 142722 CASAVA_Build 10 120866338 2D ACCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1055 hom 24 3 12 9 T 15 13 142723 CASAVA_Build 10 120869616 1D CAGGTGTGGT G/- GTGTGTGCCT 3070 het 691 hom 13 3 7 4 G 2 1 142724 CASAVA_Build 10 120872366 1D CAGAGTGGGA T/- TTTTCAGAGG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 5 4 142725 CASAVA_Build 10 120875988 2D CTTTTTTGAG AC/-- AGAGTCTCCC 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 AC 1 0 142726 CASAVA_Build 10 120885748 9D GCCCAGGCTG GAGTGCAGT/--------- GGTGCAATCA 1444 het 1444 ref 18 6 5 8 GAGTGCAGT 1 0 142727 CASAVA_Build 10 120894597 3D AAATATAAAT ATC/--- ATTACAATTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 ATC 1 0 142728 CASAVA_Build 10 120901733 1I CTTTCGGGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 705 hom 29 2 17 10 T 11 12 142729 CASAVA_Build 10 120904405 1D ATGCCCCATC T/- TATCAGGGGG 3070 hom 102 het 36 0 35 2 T 2 1 142730 CASAVA_Build 10 120914526 4I AAATTTCAGC ----/TGTT TGTTTTTATC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TGTT 1 2 142731 CASAVA_Build 10 120916457 2I CTGCTATGTC --/CA GTCTTAACAA 3070 het 3070 ref 53 23 20 10 CA 0 1 142732 CASAVA_Build 10 120924447 1D GAATGACAAG A/- AAAAAAGACT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 7 6 142733 CASAVA_Build 10 120925286 1I GTTTCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 2125 hom 22 het 11 0 7 4 T 13 14 142734 CASAVA_Build 10 120930189 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2457 het 2457 ref 20 8 8 4 A 17 16 142735 CASAVA_Build 10 120940566 1I AAAAGATAAC -/A AAAAAAAAAG 1819 het 1819 ref 18 7 7 4 A 9 10 142736 CASAVA_Build 10 120943653 7D GGTCCTCACT CTGTCAC/------- CCAGGCTGAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 CTGTCAC 1 0 142737 CASAVA_Build 10 120955113 1D CGCCCGGCTA T/- TTTTTTTTTG 834 hom 7 het 8 0 3 5 T 10 9 142738 CASAVA_Build 10 120960570 2D TCATGAACAC TT/-- GTGATAATTA 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 T 2 0 142739 CASAVA_Build 10 120963468 2D TTTTTACATG TT/-- TTTTTGTTTG 3070 hom 101 het 39 0 34 5 T 7 5 142740 CASAVA_Build 10 120977950 2D CCCAATCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 21 1 11 9 A 16 14 142741 CASAVA_Build 10 120987426 26D TCAAGAGAGA GAGGGATGGAGGAAGGGGCTGGAGTT/-------------------------- GAGGGATGGA 3070 hom 100 het 45 0 32 18 GAGGGATGGAGGAAGGGGCTGGAGTT 2 1 142742 CASAVA_Build 10 120993065 4I GTTCCCAGTT ----/TTTC TTTCTTTTTT 3070 hom 74 het 30 0 25 5 TTTC 1 2 142743 CASAVA_Build 10 121000606 1D CTCCCCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 11 10 142744 CASAVA_Build 10 121030284 1D CCTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 27 4 11 12 T 16 15 142745 CASAVA_Build 10 121037466 1D TGCTGGCCCT G/- GGTTCATCCT 3070 het 2705 hom 41 8 24 9 G 3 2 142746 CASAVA_Build 10 121042352 1D ACAGATACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 T 13 12 142747 CASAVA_Build 10 121057272 1I GGTCTCCTGG -/T TGGCGAGCCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 142748 CASAVA_Build 10 121058367 1D CCTGTATGGA T/- TTGGGGGAAT 3070 hom 58 het 25 0 16 9 T 3 2 142749 CASAVA_Build 10 121091596 1I CTGGTCAGGC -/A GAGATGGGCA 3070 hom 98 het 36 0 28 8 A 0 1 142750 CASAVA_Build 10 121102115 4D AAGCTCCTGG GTCT/---- GTTTTGGTTT 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 GTCT 1 0 142751 CASAVA_Build 10 121124275 9I GTCATGAGGG ---------/CAGACCCCT CATTGTTGGT 3070 het 3070 hom 55 23 28 4 CAGACCCCT 0 1 142752 CASAVA_Build 10 121128170 10D CTTGTGTGCG GGCTGCGCCT/---------- CCGTGGGCTC 2051 het 2051 ref 19 10 6 4 GGCTGCGCCT 1 0 142753 CASAVA_Build 10 121134207 1D TGATGCTCAG A/- TTGGGCCCAG 3070 het 3070 hom 49 19 22 11 A 1 0 142754 CASAVA_Build 10 121143956 3I GTATCTGCTT ---/GTC AGTGGGCACG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 GTC 0 1 142755 CASAVA_Build 10 121147912 2I GCGTATCCAC --/GA GAGATTGCCC 3070 hom 107 het 41 0 34 7 GA 2 3 142756 CASAVA_Build 10 121155979 1D TGGCTCCCTT C/- CAAGTACCTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 C 2 1 142757 CASAVA_Build 10 121160368 1D TGGAGCCACC T/- GTGTCTAAAG 3070 het 3070 ref 47 23 17 8 T 1 0 142758 CASAVA_Build 10 121165603 1D CTTCATCCCT G/- GGTGCCTCCA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 3 2 142759 CASAVA_Build 10 121174130 1I GTCACTTTTT -/C AGAGAGACCC 3070 hom 74 het 26 0 23 3 C 0 1 142760 CASAVA_Build 10 121178872 1I CCCAGTTCTG -/C CTCGATCCAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 C 1 2 142761 CASAVA_Build 10 121190055 1D AGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2733 het 2733 ref 24 10 9 5 T 15 14 142762 CASAVA_Build 10 121198692 1I TACAGTAGAT -/C CTGGTGGTAG 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 C 1 2 142763 CASAVA_Build 10 121199138 1I ACTAAAATAC -/A AAAATTAACC 3070 het 1994 hom 17 5 11 1 A 4 5 142764 CASAVA_Build 10 121205042 1D GGGGGTTATC A/- AAAAAAAAAA 2055 het 2055 ref 27 13 6 8 A 13 12 142765 CASAVA_Build 10 121208904 1D AAAGACACTT C/- CCCCCCAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 C 7 6 142766 CASAVA_Build 10 121211509 2D ACTCTGTCCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1213 hom 25 5 13 7 A 13 11 142767 CASAVA_Build 10 121216115 1D AAATGCTTGC T/- TTTTCTGAGT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 5 4 142768 CASAVA_Build 10 121219404 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAAAAGAAA 3070 het 2295 hom 29 6 19 4 AG 1 2 142769 CASAVA_Build 10 121221524 1I GGTTGTGGTT -/G GGCAGTACTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 2 3 142770 CASAVA_Build 10 121225311 7I7M3I AAAAGAAAAA -------AAAAGAA---/AAAAAAGAAAAGAAAAG AAGAAAAGAA 1658 het 1658 ref 26 19 6 5 N/A 0 0 142771 CASAVA_Build 10 121225379 1I AAGGATTGTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 8 9 142772 CASAVA_Build 10 121229832 1I AGTAGAGACA -/G GGGTTTCACC 2020 hom 15 het 6 0 5 1 G 3 4 142773 CASAVA_Build 10 121231142 9I CCCCTTCTAC ---------/CCCCTGAGG CCCCTGAGGC 1982 het 1982 ref 35 19 5 11 CCCCTGAGG 1 2 142774 CASAVA_Build 10 121233378 1D TAAGGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2242 hom 30 8 13 9 A 12 11 142775 CASAVA_Build 10 121234323 1I ATGGCTCACG -/C CTGTAATCGC 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 C 1 2 142776 CASAVA_Build 10 121235395 1D GTCTTGAACT C/- CTGACCTTAG 3070 het 2136 hom 28 6 7 15 C 2 1 142777 CASAVA_Build 10 121239959 1I CCCGGCCGGG -/A ATCTGCTACC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 1 2 142778 CASAVA_Build 10 121241840 1D AAAACAGGCC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 9 8 142779 CASAVA_Build 10 121243454 1D CATGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1713 het 1713 ref 10 5 4 1 A 13 12 142780 CASAVA_Build 10 121272221 10D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 10 A 17 7 142781 CASAVA_Build 10 121289648 1I CTACACCTAC -/A AATTCCAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 2 3 142782 CASAVA_Build 10 121375196 2D GAGAGAGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 2826 hom 42 het 16 0 14 3 GA 6 5 142783 CASAVA_Build 10 121389768 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 124 hom 30 1 19 10 T 10 9 142784 CASAVA_Build 10 121399072 1I CCCTGCATAC -/T TTTGAATCTC 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 3 4 142785 CASAVA_Build 10 121427022 3D ACCCCGTTGC TTG/--- TTGTTCTGCA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 TTG 2 1 142786 CASAVA_Build 10 121434477 5I GGCGATCGAT -----/ATCTC AGCTACCCTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ATCTC 0 1 142787 CASAVA_Build 10 121440397 1D ACCCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 32 1 19 12 A 15 14 142788 CASAVA_Build 10 121455332 1D ACCTGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 2649 het 450 hom 24 4 13 7 T 19 18 142789 CASAVA_Build 10 121462846 3I CAAAAAACAA ---/AAC AAACAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AAC 0 1 142790 CASAVA_Build 10 121469708 1D AACAACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 28 2 17 12 T 15 14 142791 CASAVA_Build 10 121525854 1I AAAATGTGTA -/T TTTATTTTAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 3 4 142792 CASAVA_Build 10 121597669 1D TTCACAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 36 2 26 10 A 15 14 142793 CASAVA_Build 10 121614233 1D GTGGAAGCTT A/- AATTATTCAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 3 2 142794 CASAVA_Build 10 121647792 2D AAGAAAAAAC TG/-- TTTTTTTCTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TG 1 0 142795 CASAVA_Build 10 121652064 3D GCAATGTGTA ATC/--- ATCACATCAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATC 2 1 142796 CASAVA_Build 10 121662751 2D TATGTTTTGT TG/-- TGTGGAGAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TG 3 2 142797 CASAVA_Build 10 121663061 1D GGCGTGATCT G/- GGGCTCACTG 3070 hom 69 het 26 0 21 5 G 4 3 142798 CASAVA_Build 10 121671478 1D GAATTGAGTC T/- TCTCAGCATT 3070 hom 129 het 44 0 44 0 T 2 1 142799 CASAVA_Build 10 121681438 1D TTTAGTCATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 30 0 28 2 A 10 9 142800 CASAVA_Build 10 121697464 4D TATTTATGAA TGTT/---- CTCCCAAAGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TGTT 1 0 142801 CASAVA_Build 10 121707678 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 17 1 13 4 A 14 13 142802 CASAVA_Build 10 121707947 1D CAAGTGATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 31 0 21 10 T 11 10 142803 CASAVA_Build 10 121708981 4D AGGAATGGCC TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 89 het 42 0 29 14 TTTG 3 2 142804 CASAVA_Build 10 121711142 3I AGGAAGCCAA ---/CTT CTTCTTCTTC 3070 hom 66 het 29 0 22 7 CTT 3 4 142805 CASAVA_Build 10 121714476 18I GTGTTTCATC ------------------/AGAAACATGGGTCCCCCA TGTGGGTCCT 3070 hom 93 het 32 0 31 3 AGAAACATGGGTCCCCCA 0 1 142806 CASAVA_Build 10 121715141 1I TGCAAATTAG -/A TGGAGGAATC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 142807 CASAVA_Build 10 121716666 1D TTTGAGATAT C/- CTTAGGACAT 3070 hom 135 het 51 0 45 7 C 2 1 142808 CASAVA_Build 10 121724171 1I GATCTGGTCC -/T TTCTGCTCCT 3070 hom 41 het 17 0 13 4 T 2 3 142809 CASAVA_Build 10 121743909 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 331 hom 24 1 22 2 T 10 9 142810 CASAVA_Build 10 121747259 1D ACGCTTCCCC T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 39 het 23 0 16 10 T 8 7 142811 CASAVA_Build 10 121769955 4D GCTGAAGGTT AAAG/---- AAAGAAGTAG 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AAAG 2 1 142812 CASAVA_Build 10 121795475 4D TTAACTATTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 48 het 20 0 17 5 TTTC 5 4 142813 CASAVA_Build 10 121796076 1D CATTATAATC T/- TTTTTTTTTT 2102 het 561 hom 20 6 6 8 T 17 16 142814 CASAVA_Build 10 121807043 1D CAAATAAATG A/- AAAAAAAAAA 1388 het 1388 ref 29 19 3 7 A 11 10 142815 CASAVA_Build 10 121808626 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 13 12 142816 CASAVA_Build 10 121814135 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 9 8 142817 CASAVA_Build 10 121826268 1I CAAACTTTTT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 7 8 142818 CASAVA_Build 10 121828614 4D TTGCTGTTGA CATG/---- CATGCCATCT 3070 hom 100 het 41 0 34 11 CATG 2 1 142819 CASAVA_Build 10 121832648 1D AATATTAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 25 1 18 7 A 13 12 142820 CASAVA_Build 10 121840231 2D GTATGTATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 97 het 42 0 32 10 AC 9 8 142821 CASAVA_Build 10 121847396 1I CTAAACAGAA -/C TGTGACCTGT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 C 0 1 142822 CASAVA_Build 10 121847729 2D CATGATACAC AT/-- GTTCCAACCG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 AT 1 0 142823 CASAVA_Build 10 121852426 1I AAAAAAAAAA -/G GAAAAAAAAG 3070 het 185 hom 35 1 28 6 G 1 2 142824 CASAVA_Build 10 121853595 6I TCCCACCCAC ------/AATGCA GGGAGCAATC 3070 hom 117 het 45 0 35 10 AATGCA 0 1 142825 CASAVA_Build 10 121858746 4I TCTCCTTAAT ----/TAAC TGGGCAGGGT 3070 hom 105 het 39 0 34 5 TAAC 0 1 142826 CASAVA_Build 10 121860493 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 T 10 11 142827 CASAVA_Build 10 121869971 1D AAGAAGCCAA G/- GTCTTGTGCC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 2 1 142828 CASAVA_Build 10 121873691 1I AAAGTAATGC -/A AAAAAACTGC 3070 hom 92 het 38 0 31 7 A 6 7 142829 CASAVA_Build 10 121873957 1D TATTGAGTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 40 0 31 11 T 10 9 142830 CASAVA_Build 10 121877848 1D CCTATTATGG T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 56 het 24 0 17 8 T 7 6 142831 CASAVA_Build 10 121878153 1D TGGTGGCGGG C/- GCCTGTAGTC 3070 het 104 hom 11 1 10 0 C 1 0 142832 CASAVA_Build 10 121878281 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2709 hom 30 het 13 0 9 4 A 20 16 142833 CASAVA_Build 10 121878392 4D AATACACCAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 2260 het 22 hom 16 1 8 8 T 22 18 142834 CASAVA_Build 10 121878588 1I CACACAGAAA -/C TCAATATTCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 0 1 142835 CASAVA_Build 10 121885357 2I TCTGTTTGTT --/AA AAAAAAAACC 3070 het 69 hom 40 1 35 4 A 8 10 142836 CASAVA_Build 10 121888202 2D TTGCAGCAGG AA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 102 het 44 0 36 9 A 10 8 142837 CASAVA_Build 10 121899070 1I GGTTGTTTTT -/G GGTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 22 8 G 2 3 142838 CASAVA_Build 10 121907021 1D CCACGCCCAG C/- TAATTTTTTG 3070 hom 36 het 13 0 13 2 C 1 0 142839 CASAVA_Build 10 121909825 1I GAGGTGTCTG -/T TTAGATTATT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 2 3 142840 CASAVA_Build 10 121912969 1I AAAAAAAAAA -/T TACCTTTGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 2 142841 CASAVA_Build 10 121919571 1D GTCAATTTTT G/- CTTTACATAT 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 G 1 0 142842 CASAVA_Build 10 121919783 1D TCTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 19 1 16 2 T 11 10 142843 CASAVA_Build 10 121920197 9D TCTGTTTTAT GTTCCTCAG/--------- TTACTCCTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 4 GTTCCTCAG 1 0 142844 CASAVA_Build 10 121930341 3D CCCAGTCTAC TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 TAT 4 3 142845 CASAVA_Build 10 121949717 1D TCCTTGTATT G/- TTTTCGTTCT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 G 1 0 142846 CASAVA_Build 10 121951834 1I TTCTTTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 638 hom 32 2 24 6 T 11 12 142847 CASAVA_Build 10 121953291 5I GTTTCTCTTT -----/CTTTC CTTATATTAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CTTTC 0 1 142848 CASAVA_Build 10 121954865 4I ACATAATAAT ----/AAAA AAAGTTTGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 3 7 142849 CASAVA_Build 10 121959221 1I AAGTTGGCTT -/A AGGGGGTGGA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 A 1 2 142850 CASAVA_Build 10 121963615 1D AAGTTAGCTT A/- TAGGCCCTAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 1 0 142851 CASAVA_Build 10 121965591 1I GCGAGAGCTG -/C TCTTTCAAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 0 1 142852 CASAVA_Build 10 121969474 18I GATTTTGTGG ------------------/TGTCATAGCTGGAGTGCC TGTCTTTTCG 3070 hom 154 het 57 0 52 8 TGTCATAGCTGGAGTGCC 0 1 142853 CASAVA_Build 10 121970074 1D4M1D40M1D TTCCGTGCGG AGTCCATGAGTACCTCCAAGTCAGCTCTGAGGCTTCAGCTCCTATAG/-GTCC-TGAGTACCTCCAAGTCAGCTCTGAGGCTTCAGCTCCTATA- CCTGGAAGCC 3070 hom 21 het 15 0 8 20 N/A 0 0 142854 CASAVA_Build 10 121973330 3I TCCACACTGC ---/TAT TATATTCAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TAT 1 2 142855 CASAVA_Build 10 121973493 1I TTTTAAACTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 8 9 142856 CASAVA_Build 10 121978982 2I AGCCATGGGT --/AG AGAGTCTACT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 AG 2 3 142857 CASAVA_Build 10 121980384 1D CCAGCATCCA T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 T 8 7 142858 CASAVA_Build 10 121990518 2D TCATCCCGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 45 1 39 5 T 17 15 142859 CASAVA_Build 10 121991775 1I CTCTTCCACG -/T CTCACTTCTC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 0 1 142860 CASAVA_Build 10 121992452 1D TCAACATCAA G/- GGGGGCAAAG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 G 6 5 142861 CASAVA_Build 10 121995587 1D TCCTCACCTC T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 6 T 7 6 142862 CASAVA_Build 10 121996370 3I GAAGTTGCAC ---/AAG AAGAAGTGGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAG 2 3 142863 CASAVA_Build 10 122013717 1D CATCAGACTC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 26 11 11 5 A 8 7 142864 CASAVA_Build 10 122024734 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 32 1 27 4 T 13 12 142865 CASAVA_Build 10 122039220 1I GGCTTTATTT -/A AAATTCCACG 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 A 3 4 142866 CASAVA_Build 10 122054468 1D CTGATTACAA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 8 7 142867 CASAVA_Build 10 122090927 1I AACCCAATGG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 56 17 29 10 A 6 7 142868 CASAVA_Build 10 122099117 1I AGCCTGGAAT -/G GGGGTAATCT 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 G 4 5 142869 CASAVA_Build 10 122109363 1D TCACAGAATA C/- CATAGGCTGG 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 C 2 1 142870 CASAVA_Build 10 122109906 2D TTTCACTCAT AA/-- AAGTGGGAGC 3070 het 3070 ref 25 15 7 4 A 4 2 142871 CASAVA_Build 10 122111877 1I CTTGTCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 26 6 T 11 12 142872 CASAVA_Build 10 122113201 1I TGTTACTTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 9 10 142873 CASAVA_Build 10 122115445 4I GTGAATGTGG ----/TCTC TCTCTCTCTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TC 4 6 142874 CASAVA_Build 10 122120485 1D TTTTATGTGA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 35 het 30 1 26 3 T 8 7 142875 CASAVA_Build 10 122122856 1D GCACTCCAAA C/- CTATACAATG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 C 2 1 142876 CASAVA_Build 10 122123802 1I TCTATGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 472 hom 32 2 20 10 A 12 13 142877 CASAVA_Build 10 122132857 1I CATTTTTTTC -/A CAGGGCTGGA 3070 hom 140 het 56 0 43 13 A 0 1 142878 CASAVA_Build 10 122146471 13I2M5I ACATGTAGGC -------------AA-----/GTTATGCCTAGGTAACTCCT AGGAGTTACC 3070 het 3070 hom 50 21 27 5 N/A 0 0 142879 CASAVA_Build 10 122153064 1D GGGGAGGGTC A/- GGGGTAGATC 3070 hom 94 het 35 0 31 4 A 1 0 142880 CASAVA_Build 10 122154042 4I GTGCCACTCC ----/TCTG TCTGTCACTG 3070 hom 141 het 49 0 48 1 TCTG 1 2 142881 CASAVA_Build 10 122161194 4D AATGGAAAAA AGAC/---- AGATTAACAG 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 AGAC 1 0 142882 CASAVA_Build 10 122163489 1I TTTGCTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 11 142883 CASAVA_Build 10 122167071 1D ATTTTTCATG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 7 6 142884 CASAVA_Build 10 122169531 4D TTGATCCAGT GAGG/---- GGTATTGAAG 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 GAGG 1 0 142885 CASAVA_Build 10 122181600 1I CACCTGTAAC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 T 7 8 142886 CASAVA_Build 10 122187599 1D GATTCTTGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 T 10 9 142887 CASAVA_Build 10 122191806 13D GTGGTTTTCT TGAGGGATGCCAC/------------- TGAGAATTTA 3070 het 3070 hom 32 9 23 0 TGAGGGATGCCAC 1 0 142888 CASAVA_Build 10 122216265 2D AACGGGTACA CT/-- CTCTCACCTC 3070 hom 144 het 54 0 49 6 CT 3 2 142889 CASAVA_Build 10 122220860 1D AGCTGACTAG C/- TCAAGTGTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 1 0 142890 CASAVA_Build 10 122225413 1D GCGGGGGGCA C/- CAGTGTCCAC 3070 hom 92 het 35 0 32 3 C 2 1 142891 CASAVA_Build 10 122228974 1D TTTGTTTTTC T/- TATGGCATTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 T 2 1 142892 CASAVA_Build 10 122241318 16D TCTCTAAGAA CAACAACAACAAAACC/---------------- CAACAACAAC 3070 het 3070 ref 43 19 13 15 CAACAACAACAAAACC 2 1 142893 CASAVA_Build 10 122246363 2D GCATGGGAGT GA/-- GAGAGAGAGA 1290 het 1290 ref 48 34 5 10 GA 9 8 142894 CASAVA_Build 10 122260216 1D AAGTCGTTTT C/- CTAATGTGTT 3070 het 3070 ref 50 24 21 7 C 2 1 142895 CASAVA_Build 10 122263267 1D TACATCATCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 19 20 10 T 10 9 142896 CASAVA_Build 10 122266014 3I TGAATTTCCT ---/ACA ACAACAAAAG 3070 hom 90 het 40 0 30 10 ACA 2 3 142897 CASAVA_Build 10 122276618 4D GTCTGTCTAC CTAT/---- CTATCAATCA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 CTAT 2 1 142898 CASAVA_Build 10 122277420 1I GCTGGTTCTT -/A AGAGTGGTTG 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 1 2 142899 CASAVA_Build 10 122278478 2D GCCCCTCATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 10 9 T 12 10 142900 CASAVA_Build 10 122278688 2D ACAAGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 42 19 15 11 GT 8 7 142901 CASAVA_Build 10 122289141 1I AAGCCTTTTA -/T TTATTTATTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 2 3 142902 CASAVA_Build 10 122289502 1I GTAAACTTGT -/A AAAAAAAAAA 985 het 985 ref 22 11 4 7 A 15 16 142903 CASAVA_Build 10 122303946 2D TCTTCCTGTC TT/-- TGGCTGAGCC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 3 1 142904 CASAVA_Build 10 122304171 1I GGAGCATGAC -/T GGGGAGGTCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 142905 CASAVA_Build 10 122308809 1D TTCATGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 11 10 142906 CASAVA_Build 10 122309122 1D TATATGTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 10 9 142907 CASAVA_Build 10 122309832 1D GGACCATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 540 hom 40 7 16 17 A 15 14 142908 CASAVA_Build 10 122318741 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1556 het 1556 ref 26 7 10 9 A 15 16 142909 CASAVA_Build 10 122332070 1I GCATATCTTT -/C CAAAAGGACA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 C 1 2 142910 CASAVA_Build 10 122335620 4D TTTTTTCTCT TTTC/---- TTTTTCTTTT 950 het 950 ref 30 9 6 16 TTTC 1 0 142911 CASAVA_Build 10 122335638 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 668 hom 23 2 11 10 T 14 13 142912 CASAVA_Build 10 122341119 1D TGCTACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 11 10 142913 CASAVA_Build 10 122343984 6I TGTGTTTGTG ------/TTTGTT TTTATGCCTT 3070 het 3070 hom 58 26 26 6 TTTGTT 0 1 142914 CASAVA_Build 10 122346829 1I CAACAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 28 1 19 8 A 10 11 142915 CASAVA_Build 10 122348647 3I CTATGGGGAA ---/GTG ACCCGCCTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GTG 0 1 142916 CASAVA_Build 10 122348867 2D GCTCTGAGCT GA/-- GAGAGAAGAA 3070 het 3070 hom 41 19 15 9 GA 4 3 142917 CASAVA_Build 10 122350199 4D TTCAGGAAAC AGAG/---- AGGATGGAAG 3070 het 3070 hom 31 10 18 4 AG 3 1 142918 CASAVA_Build 10 122351924 1D GAATTGTGAT C/- CTTGTACATA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 C 2 1 142919 CASAVA_Build 10 122353379 1I CGGCTCCCCC -/T CTCCCCCAAC 3070 hom 83 het 34 0 27 7 T 0 1 142920 CASAVA_Build 10 122370491 1D TTGCCCAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 11 10 142921 CASAVA_Build 10 122370711 1I GCCCCAGGAG -/A ATGGGCAGGT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 1 2 142922 CASAVA_Build 10 122372283 1D CCTGTGGATC A/- AGGAGTTATT 3070 het 3070 ref 34 20 14 0 A 2 1 142923 CASAVA_Build 10 122389805 1I CCTTAAACTG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 29 0 26 3 A 8 9 142924 CASAVA_Build 10 122404136 1I GCCAGAAGCT -/G GGGGGAGAAG 3070 hom 160 het 56 0 54 2 G 5 6 142925 CASAVA_Build 10 122404379 1D TTGTGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 11 10 142926 CASAVA_Build 10 122406376 5D ATTCTAATAG CATGT/----- CATGGTATTT 3070 hom 129 het 48 0 44 7 CATGT 1 0 142927 CASAVA_Build 10 122408552 3D CCAAGGTTCA AAG/--- AAGTAAACAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AAG 2 1 142928 CASAVA_Build 10 122409839 1I ATTATTTTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 355 hom 37 1 35 1 T 8 9 142929 CASAVA_Build 10 122412864 1D62M1D GCTATTAGGC AATATATTGTAAAATGAAGCAAATAAGTCATCCCTTGGTTTTGAGAATTTCATCAGGATTCTCA/-ATATATTGTAAAATGAAGCAAATAAGTCATCCCTTGGTTTTGAGAATTTCATCAGGATTCTC- AGGGTGGAAA 3070 hom 84 het 16 0 29 4 N/A 0 0 142930 CASAVA_Build 10 122415611 1D AACAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 46 1 36 9 A 11 10 142931 CASAVA_Build 10 122415949 1I TCCTCCTGGA -/T TGGCCTTGGC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 1 2 142932 CASAVA_Build 10 122430609 1D TGTCCCATGG T/- TGGCTGCCAG 3070 het 3070 ref 41 15 18 8 T 2 1 142933 CASAVA_Build 10 122431255 2I ATTGAATGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 10 12 142934 CASAVA_Build 10 122438155 1I GTGTAATGGG -/A AAAAATGGTG 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 5 6 142935 CASAVA_Build 10 122440179 8D GCCAGGCTAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2082 hom 12 het 5 0 5 0 T 19 11 142936 CASAVA_Build 10 122450538 1I TAATTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 1055 het 18 hom 13 1 7 5 C 0 1 142937 CASAVA_Build 10 122450679 8D TGCTGCTCCC AGTGCCAA/-------- AGTGCTGAAT 2987 het 2987 ref 28 20 7 3 AGTGCCAA 1 0 142938 CASAVA_Build 10 122455448 1D TGTTCTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 32 1 14 18 T 13 12 142939 CASAVA_Build 10 122471326 1I CAGATCCGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 32 0 22 10 T 12 13 142940 CASAVA_Build 10 122481469 1D AAATGAGAAT A/- AGGAGAGTAC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 2 1 142941 CASAVA_Build 10 122501461 5D AAATAATGAC TTTTG/----- TTTTTTATTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TTTTG 1 0 142942 CASAVA_Build 10 122501986 5D TATTCCTTTG GGTAT/----- GGTATGTCCC 3070 hom 102 het 38 0 35 8 GGTAT 2 1 142943 CASAVA_Build 10 122502897 1I CTTTGTTGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 8 9 142944 CASAVA_Build 10 122503649 1D TTGTTGTTTG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 142945 CASAVA_Build 10 122510906 3D TTGGAAAGTT TGA/--- TGGCTCTTAA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 TGA 1 0 142946 CASAVA_Build 10 122517368 9D CACCCACCAC CACACCCGA/--------- CACACCCGAC 3070 hom 43 het 19 0 15 5 CACACCCGA 2 1 142947 CASAVA_Build 10 122520780 1D ACTATGTGAA T/- GACACCCTTG 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 T 1 0 142948 CASAVA_Build 10 122532780 4I TGTATGTGCC ----/TGTG TGTGTGTGCC 3070 hom 57 het 24 0 18 6 TG 4 6 142949 CASAVA_Build 10 122532842 2I TGAGTGTGCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2477 hom 26 8 11 7 TG 7 8 142950 CASAVA_Build 10 122546368 4D CTAGCAATTT GAAA/---- GAAAGATTAG 3070 hom 114 het 44 0 39 6 GAAA 2 1 142951 CASAVA_Build 10 122547239 1I TAATTGGAGA -/T TTTTAACACC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 4 5 142952 CASAVA_Build 10 122547535 1D CTCACTGCAA C/- CCCCCCTGCC 1873 hom 16 het 13 0 6 7 C 7 6 142953 CASAVA_Build 10 122554249 1I AGAATCATTA -/T GCACACTCAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 0 1 142954 CASAVA_Build 10 122558766 2D17M1D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAACAAAAAC/--AAAAAAACAAACAAACA- AAAAAAAAAC 3070 het 54 hom 29 1 30 5 N/A 0 0 142955 CASAVA_Build 10 122563288 2D CTATGAAATA AC/-- AGAGCTGCAC 3070 het 3070 ref 49 23 19 8 AC 1 0 142956 CASAVA_Build 10 122563811 1I TTGTGACTTG -/T TACTTTTCCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 142957 CASAVA_Build 10 122564317 1D AATCTGATGG T/- TTTTGTAAGT 3070 hom 148 het 52 0 50 2 T 5 4 142958 CASAVA_Build 10 122566373 1I ACTCATCCCA -/G CCTATCTTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 142959 CASAVA_Build 10 122572567 1D CCCCAATCAG A/- AAGTCAATTG 3070 hom 111 het 43 0 35 9 A 3 2 142960 CASAVA_Build 10 122581605 1D AAAGTCAACT G/- GGGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 G 9 8 142961 CASAVA_Build 10 122593905 5D TGAAATTGCT CAGAA/----- CAGCAAAGTG 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 CAGAA 1 0 142962 CASAVA_Build 10 122594220 1D GTTAGGGTGT G/- GGGTAAGGAA 3070 het 3070 ref 39 19 13 8 G 4 3 142963 CASAVA_Build 10 122619027 6D TTTAATTTAA ACTTTT/------ AATTAAACTT 1392 het 469 hom 22 3 6 15 ACTTTT 1 0 142964 CASAVA_Build 10 122620997 1D CCTGGAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 36 0 30 6 A 13 12 142965 CASAVA_Build 10 122622072 5I AAGTAAAAAT -----/ATAAA ATAAGTACCT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 ATAAA 0 1 142966 CASAVA_Build 10 122673911 1I GTCTAGCTCA -/G GGTTTGTGAA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 2 3 142967 CASAVA_Build 10 122675512 16D GTAAAATGGT GATAATAGGGTCTCCC/---------------- GATAATAGGG 3070 het 3070 ref 37 17 13 12 GATAATAGGGTCTCCC 2 1 142968 CASAVA_Build 10 122677186 1I TTCAAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1260 hom 42 4 32 6 T 11 12 142969 CASAVA_Build 10 122680558 18D AAAGGAGGAG TTTCCTAGGACACCAGAC/------------------ TTTCAACTAG 3070 het 3070 hom 32 15 19 7 TTTCCTAGGACACCAGAC 1 0 142970 CASAVA_Build 10 122687471 1I TGGCTTGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 14 13 A 11 12 142971 CASAVA_Build 10 122687572 1I AATAAGCATA -/G GCATTGTGGT 3070 het 2320 hom 25 5 12 8 G 1 2 142972 CASAVA_Build 10 122687591 2D TGCACCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 585 het 561 hom 18 5 2 12 T 16 14 142973 CASAVA_Build 10 122688957 5I CACCCTGTCT -----/CTGCG CTGCGCCTCC 3070 hom 64 het 25 0 20 5 CTGCG 1 2 142974 CASAVA_Build 10 122690350 1D TCCTGGCACT C/- GGGGTAACTT 3070 hom 141 het 53 0 47 6 C 1 0 142975 CASAVA_Build 10 122691789 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 1641 hom 15 het 6 0 6 0 A 7 6 142976 CASAVA_Build 10 122691968 7D ATAAATAAAT AAAAGAA/------- AAAAGAAAAA 1381 hom 21 het 14 0 8 8 AAAAGAA 2 1 142977 CASAVA_Build 10 122692755 2D ACTGCAGCCC AG/-- AGAGGGGAGG 3070 hom 87 het 33 0 29 5 AG 3 2 142978 CASAVA_Build 10 122693705 1D AGTAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 12 0 9 3 A 8 7 142979 CASAVA_Build 10 122694394 1D CCTTAGAGTT A/- TAAGGAGCTG 2280 het 1693 hom 18 5 6 7 A 1 0 142980 CASAVA_Build 10 122702248 1I AATGCTCTAC -/A AATCAGATAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 A 2 3 142981 CASAVA_Build 10 122707521 1I GGTACACTGT -/G GCTGCAAGGG 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 G 1 2 142982 CASAVA_Build 10 122713547 1I CCTGGCTGCC -/G GGGGGGGTCT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 G 7 8 142983 CASAVA_Build 10 122715546 2D GCTGCCACAC AA/-- AGAGTTCAGC 3070 het 3070 ref 38 20 11 9 A 3 1 142984 CASAVA_Build 10 122740821 1I ATTCTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 24 21 9 A 10 11 142985 CASAVA_Build 10 122756139 4I AAAAAAACTT ----/TTTC TTTATTTTTG 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 TTTC 0 1 142986 CASAVA_Build 10 122761768 1D TGTTAAAAGG A/- ATTCTTCAGA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 2 1 142987 CASAVA_Build 10 122770768 1I CTGTGTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 16 15 A 10 11 142988 CASAVA_Build 10 122773133 3I AACTTTGTAC ---/ACA CTGTTTACCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 ACA 0 1 142989 CASAVA_Build 10 122777502 2I TCTACTTGTC --/TT TTATTACAAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 2 4 142990 CASAVA_Build 10 122785301 1D ACAGTGCAGT G/- GGGGGGGGGC 1132 hom 4 het 4 0 3 1 G 10 9 142991 CASAVA_Build 10 122795502 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 2831 het 2158 hom 30 10 9 11 TG 9 8 142992 CASAVA_Build 10 122795730 1I ATACACACAC -/A AAAAAAATAT 2510 het 1372 hom 12 4 6 2 A 7 8 142993 CASAVA_Build 10 122797941 1D AATGCTCAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 T 9 8 142994 CASAVA_Build 10 122803606 1D TTTAACATAG A/- GATTTATTAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 1 0 142995 CASAVA_Build 10 122807331 3I GGCCAACTTT ---/GAA GAAGTCTAAC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 GAA 1 2 142996 CASAVA_Build 10 122811513 1I AGCTGATAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 57 17 29 11 T 9 10 142997 CASAVA_Build 10 122823100 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 348 hom 17 2 10 8 A 10 9 142998 CASAVA_Build 10 122823126 1D ATAAAATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1028 hom 17 3 9 5 A 12 11 142999 CASAVA_Build 10 122833031 1D ATAAACCCTA G/- GGAAGTGGCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 3 2 143000 CASAVA_Build 10 122837264 14D ATGCACACAC ATACACACATACAT/-------------- ATACACACAT 3070 het 3070 hom 80 20 32 35 ATACACACATACAT 2 1 143001 CASAVA_Build 10 122842457 1D TTGGCATGGC T/- AACCAATATT 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 T 1 0 143002 CASAVA_Build 10 122843960 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 9 10 143003 CASAVA_Build 10 122847270 1D ATCAGAGCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 T 9 8 143004 CASAVA_Build 10 122853017 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 8 9 143005 CASAVA_Build 10 122855012 1I AGAAACTGCA -/G GCTATGTGAT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 G 1 2 143006 CASAVA_Build 10 122862755 3I GAGGTTTGAT ---/CTC CAGAGTGGGG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 CTC 0 1 143007 CASAVA_Build 10 122864261 1I ACCAAACCCA -/C CAACCAATAC 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 C 1 2 143008 CASAVA_Build 10 122880585 1I AAAGCTCAGG -/C CCTGGAAGAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 C 2 3 143009 CASAVA_Build 10 122890947 1I TGGTCTGTAA -/C CTCTTTCTCT 3070 het 3070 ref 44 18 10 16 C 1 2 143010 CASAVA_Build 10 122891143 1D TTTGGGATAA T/- TCTCTGAGAA 3070 hom 126 het 47 0 42 6 T 2 1 143011 CASAVA_Build 10 122901143 1I TCAGGTCCTA -/C CTGCTTTCAT 3070 het 3070 hom 43 14 26 3 C 1 2 143012 CASAVA_Build 10 122901977 4D41M2I TTATTAATAA ATTTATATTGAAAAAAATATATAGGCCTAAACTCTTGAAATAAAT--/----ATATTGAAAAAATTATATAGGCCTAAACTCTTGAATTAAATTG TCTTAAATAT 3070 het 3070 ref 23 16 9 5 N/A 0 0 143013 CASAVA_Build 10 122904739 1I AATTGGTGCT -/G GGAAATTAAC 3070 hom 148 het 57 0 50 7 G 2 3 143014 CASAVA_Build 10 122924920 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 30 1 20 9 T 11 10 143015 CASAVA_Build 10 122937133 1D CTCCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3029 het 3029 ref 32 13 9 10 A 11 10 143016 CASAVA_Build 10 122937833 1D AATGAGTATC T/- GGTCAACCAA 3070 het 3070 ref 47 28 12 7 T 1 0 143017 CASAVA_Build 10 122942457 1D CTGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 17 1 14 2 A 12 11 143018 CASAVA_Build 10 122946630 1D ACAAATGAGC A/- CACAAAATGG 3070 hom 163 het 58 0 55 3 A 1 0 143019 CASAVA_Build 10 122947406 1I CAAGTAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 T 10 11 143020 CASAVA_Build 10 122948689 5D2M2I CCTCATCAAG GTTTTGC--/-----GCAG CTTTTACTAC 3070 het 3070 ref 42 23 19 3 N/A 0 0 143021 CASAVA_Build 10 122974681 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 684 hom 22 3 9 11 G 11 10 143022 CASAVA_Build 10 122983383 1D TCTACATCAA T/- TTTCTCCATG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 4 3 143023 CASAVA_Build 10 122983946 8I CTGCAACCCA --------/GGGGCTCG GGGTTGGCTT 3070 hom 75 het 27 0 22 5 GGGGCTCG 0 1 143024 CASAVA_Build 10 122989151 1D TTTCTGGTTA G/- CTTTGAAGAC 3070 hom 137 het 52 0 43 9 G 1 0 143025 CASAVA_Build 10 122993773 1D CATTTACTGA G/- TCCTGATGGT 3070 hom 87 het 31 0 28 3 G 1 0 143026 CASAVA_Build 10 122994862 1D ATACAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 30 1 25 4 A 13 12 143027 CASAVA_Build 10 123001240 1D CCACTCATCT C/- CAGCCTCCCA 3070 het 3070 hom 36 12 18 7 C 2 1 143028 CASAVA_Build 10 123002746 1D CAGAAGGAGG C/- CCCATTTCAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 C 4 3 143029 CASAVA_Build 10 123005807 1D TATGCAGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2741 hom 24 8 12 5 A 12 11 143030 CASAVA_Build 10 123007946 7I TATTTTGATC -------/TGAGTGG TGATTAAACA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TGAGTGG 0 1 143031 CASAVA_Build 10 123021228 1I TTGTACAGCT -/C CCCCGCCACC 3070 hom 48 het 19 0 15 4 C 4 5 143032 CASAVA_Build 10 123052793 1D ATAAAACAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 10 9 143033 CASAVA_Build 10 123055758 1D CATACAGCTA C/- AAACTGGAAG 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 C 1 0 143034 CASAVA_Build 10 123066950 1I TATGCAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 9 10 143035 CASAVA_Build 10 123074393 1D GGGGGACCCC T/- GGTCTAAAGC 3070 hom 135 het 50 0 43 7 T 1 0 143036 CASAVA_Build 10 123074669 1I AAAAAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 10 11 143037 CASAVA_Build 10 123079377 1I TGTGATAGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 8 9 143038 CASAVA_Build 10 123080090 1D TTTTCCCTCT C/- CCCCCTCCCC 3070 het 3070 ref 37 20 7 10 C 6 5 143039 CASAVA_Build 10 123080384 1I AACTTTAGGG -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 6 7 143040 CASAVA_Build 10 123083982 1I ATAAATAATG -/T TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 6 7 143041 CASAVA_Build 10 123096258 1D GGCTGCCTTT A/- AAAAAAACAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 7 143042 CASAVA_Build 10 123120825 4I GAGGAGAAAC ----/AATA AATATCTGGC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 AATA 1 2 143043 CASAVA_Build 10 123121419 1I AATTTTTTTT -/A TTTTTTAATT 3070 het 2861 hom 22 11 10 1 A 0 1 143044 CASAVA_Build 10 123130465 2I ACAACTGGGT --/GG GTGTGCTTCA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 G 1 3 143045 CASAVA_Build 10 123137184 2I TCACAGAATT --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 85 het 34 0 29 5 A 9 11 143046 CASAVA_Build 10 123141491 1I CTCAAAATAT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 A 7 8 143047 CASAVA_Build 10 123141708 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 29 0 13 16 T 13 12 143048 CASAVA_Build 10 123146104 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 48 het 21 0 19 2 A 6 7 143049 CASAVA_Build 10 123148086 4I TTTTTTTTCT ----/TTTC TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 25 1 15 9 TTTC 0 1 143050 CASAVA_Build 10 123148583 13D TTATTACCCT GATACCAAAACCA/------------- GACAAAGACA 3070 het 3070 ref 23 13 12 3 GATACCAAAACCA 1 0 143051 CASAVA_Build 10 123149041 3D TTCAACATAG TAC/--- TACTAGTCAT 3070 hom 108 het 41 0 36 9 TAC 2 1 143052 CASAVA_Build 10 123160812 1I AAGCAATAGG -/A AAAAAACTTT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 6 7 143053 CASAVA_Build 10 123171833 1D CAGATGAAAA G/- AGACAAGAAA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 G 1 0 143054 CASAVA_Build 10 123172936 4I AAGCCCTAAC ----/GTTA GCCCAGTGTG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 GTTA 0 1 143055 CASAVA_Build 10 123178047 4D TTAGTCCAAA TACC/---- TACCTACCTA 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 TACC 4 3 143056 CASAVA_Build 10 123190464 1I CGTCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 4 5 143057 CASAVA_Build 10 123191290 2I TGCACAACAC --/TG TGAATGTACT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TG 1 2 143058 CASAVA_Build 10 123201499 1D CGCTTTTTTC A/- ACTCTCATTA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 2 1 143059 CASAVA_Build 10 123205901 3D ACAGCCTTTA AAT/--- AGGAGAGTTG 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 AAT 1 0 143060 CASAVA_Build 10 123213233 1I AAGAAAGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 9 10 143061 CASAVA_Build 10 123214521 1D GTTCTGCCCC T/- TTTCTGACCC 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 4 3 143062 CASAVA_Build 10 123217137 1I CCTCAAATCT -/C CCAACCCTCC 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 C 2 3 143063 CASAVA_Build 10 123219856 1I CTGGAAGAGA -/C CCAGGTTTAC 3070 het 3070 hom 48 21 19 8 C 2 3 143064 CASAVA_Build 10 123222437 1D CTGCGCATGT C/- TTTTTTTTTT 1506 het 1089 hom 25 5 5 15 C 1 0 143065 CASAVA_Build 10 123236723 22D AATCTGTCCT TTCTAAGGCCAGCTCCTGCACC/---------------------- TTCTACGAAT 2077 het 2077 ref 29 18 6 15 TTCTAAGGCCAGCTCCTGCACC 1 0 143066 CASAVA_Build 10 123237742 1I CAGTTGCGGT -/A ATACTATAAG 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 1 2 143067 CASAVA_Build 10 123254335 1D GTTTCTATGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 111 het 46 0 37 9 A 9 8 143068 CASAVA_Build 10 123267657 2I TAGCGTCCAG --/TA TAGTACATTC 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 TA 1 2 143069 CASAVA_Build 10 123271077 26D47M1D TAGAGAAATG CAAATCAGACGAGATCGGGCGCGTTCCAAATCAAAACCACAAGGAGCTATCACATGACACCTGTCAGGATGGGA/--------------------------CAAATCAAAACCACAAGGAGCTATCACATGACACCTGTCAGGATGGG- AGAAAAAAAA 3070 hom 77 het 32 0 31 18 N/A 0 0 143070 CASAVA_Build 10 123275129 4D ATTATTGAGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 60 het 31 0 21 14 GA 11 9 143071 CASAVA_Build 10 123277095 1D ATTTTACCAC A/- ATTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 19 7 A 2 1 143072 CASAVA_Build 10 123287231 2I ACCAAAAGAA --/AG GGCTCAAGGT 3070 hom 126 het 52 0 39 13 AG 0 1 143073 CASAVA_Build 10 123301528 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 31 1 26 5 A 11 10 143074 CASAVA_Build 10 123323184 1I GAAAGAGGGA -/G GGGGCAGAGA 3070 hom 90 het 40 0 29 11 G 4 5 143075 CASAVA_Build 10 123327746 1D AGAACATCAT G/- GCGCATTGAG 3070 hom 108 het 41 0 36 6 G 2 1 143076 CASAVA_Build 10 123329976 2D CTGGCCAGCA TC/-- TCGAAACCCG 3070 hom 93 het 34 0 30 4 TC 2 1 143077 CASAVA_Build 10 123333264 1I ATTCTCCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 660 hom 32 2 20 10 A 12 13 143078 CASAVA_Build 10 123337915 1D AGCTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 657 hom 36 2 31 4 A 11 10 143079 CASAVA_Build 10 123338200 15I GGCCAAGGCT ---------------/GGAGGATCACTTGAG GCCAGGAGTT 3070 hom 81 het 28 0 27 2 GGAGGATCACTTGAG 0 1 143080 CASAVA_Build 10 123349956 1D GTTTTGAGGA G/- GGGGGGGAAG 3070 het 2830 hom 24 12 10 2 G 8 7 143081 CASAVA_Build 10 123355020 1D CTATAAAAGT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 153 hom 20 3 13 5 G 10 9 143082 CASAVA_Build 10 123370850 1D AGGCGCCTGT A/- AATCGCAGCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 3 2 143083 CASAVA_Build 10 123371909 1I GGTTGGGAGG -/C CCTGAGCAGG 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 C 2 3 143084 CASAVA_Build 10 123374968 1D TGATAAAACT G/- GCAAGGAGGA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 G 2 1 143085 CASAVA_Build 10 123375847 7D ATGTAGATTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1154 hom 31 11 14 6 T 19 12 143086 CASAVA_Build 10 123380438 1I TCATGCAGTA -/T TTTATCCTTT 3070 het 3070 hom 55 16 35 4 T 3 4 143087 CASAVA_Build 10 123382510 1D GTTGGGCGGC A/- GGGAGGGGGG 2027 het 2027 ref 20 10 7 4 A 1 0 143088 CASAVA_Build 10 123384574 1I CCAAAGTGCT -/G GGGATTACAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 3 4 143089 CASAVA_Build 10 123386886 1D GACACCTGAC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 26 17 8 3 T 7 6 143090 CASAVA_Build 10 123400496 5D CTCTGTTTCA AAAAT/----- AAAATAAAAT 2611 het 1655 hom 17 5 6 7 AAAAT 3 2 143091 CASAVA_Build 10 123402885 2D CTATTGAAAT AA/-- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 A 9 7 143092 CASAVA_Build 10 123403786 1D CAAAACGGGG A/- TTTCCTTTTG 3070 het 3070 hom 66 31 28 8 A 1 0 143093 CASAVA_Build 10 123405553 1D CACTTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2626 hom 33 13 11 9 T 15 14 143094 CASAVA_Build 10 123408105 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 A 10 9 143095 CASAVA_Build 10 123415814 1I TATGTTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 11 12 143096 CASAVA_Build 10 123419478 1I CAGTGTGGGA -/T TTTTTTTTTT 1173 het 1173 ref 32 23 3 6 T 13 14 143097 CASAVA_Build 10 123431265 4I GAGGCCAGTG ----/TCTC TCTCTGGTTC 3070 hom 93 het 34 0 29 5 TC 2 4 143098 CASAVA_Build 10 123431888 3D AATTAAAAAC AAA/--- AAAACTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 4 143099 CASAVA_Build 10 123432581 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 13 het 23 1 20 2 A 8 9 143100 CASAVA_Build 10 123438690 1I GGATACATGG -/T TTTTTTTTTT 1420 het 1420 ref 20 8 7 5 T 11 12 143101 CASAVA_Build 10 123439244 1D GACAAGGAGG C/- CCTGGGGCAC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 C 3 2 143102 CASAVA_Build 10 123444496 2I TAACCTTTCC --/AA AAAAAAAAAA 1136 het 1136 ref 35 5 7 23 A 14 16 143103 CASAVA_Build 10 123455853 1D AAAATTGAAC T/- GCTTCCTATC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 T 1 0 143104 CASAVA_Build 10 123461227 8I AGGCAGGAGA --------/ATCGCTTG ATCGCTTGAA 2261 het 1021 hom 10 3 5 2 ATCGCTTG 1 2 143105 CASAVA_Build 10 123461555 1D TCCTGTGCTA T/- TTTTTTTTTT 2714 het 1941 hom 27 8 9 10 T 15 14 143106 CASAVA_Build 10 123462515 1I TTTGTTTTTG -/T TTTGTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 3 4 143107 CASAVA_Build 10 123466177 1I CTTTGTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 10 11 143108 CASAVA_Build 10 123469111 5D GTCTCTACTT TCTGA/----- TCTGACACTG 3070 het 2918 hom 22 6 14 2 TCTGA 2 1 143109 CASAVA_Build 10 123469206 1D CAACTCTTGC G/- ATAAGGCTGA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 G 1 0 143110 CASAVA_Build 10 123477067 2I GCCCATCTAA --/TT TTTTTTGTAT 3070 het 2533 hom 18 7 9 2 T 6 8 143111 CASAVA_Build 10 123477922 1I GCTAAATTGT -/G GGCAGTTACA 3070 het 3070 hom 57 25 25 7 G 2 3 143112 CASAVA_Build 10 123487642 5D AGCATGACAC ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 het 3070 hom 42 10 20 12 ATTTT 4 3 143113 CASAVA_Build 10 123491921 2D AGTGGGGACT AA/-- AAACGGCTTG 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 A 5 3 143114 CASAVA_Build 10 123495241 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 9 143115 CASAVA_Build 10 123510980 1D GTTTTTTTTT C/- CCAACATAAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 3 2 143116 CASAVA_Build 10 123513709 1D TAAAGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 29 0 19 11 A 13 12 143117 CASAVA_Build 10 123514827 8D AAAGCTCTGC CAGACTCT/-------- CAGACTCTCA 2409 het 2409 ref 26 14 7 8 CAGACTCT 2 1 143118 CASAVA_Build 10 123517010 1D ACAACCCTCC A/- AAGAACTACA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 3 2 143119 CASAVA_Build 10 123518517 4I2M1D TCCTATCAAG ----TCT/GAAATC- CTGTAAGAAT 3070 hom 66 het 23 0 21 2 N/A 0 0 143120 CASAVA_Build 10 123524339 1D AATTAAATGA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 8 7 143121 CASAVA_Build 10 123525850 2I ATCCCTCCTA --/TC TCTCTAATCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TC 2 3 143122 CASAVA_Build 10 123529133 7D TCTTTCTTGT AGAAGAA/------- AGAAGAAAGA 3070 hom 160 het 61 0 54 9 AGAAGAA 2 1 143123 CASAVA_Build 10 123530681 1D CAGTCTGTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 104 het 39 0 35 5 T 10 9 143124 CASAVA_Build 10 123532706 1D ATCTGTTCCT A/- AGATCAGCAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 1 143125 CASAVA_Build 10 123533034 1D4M1D TCTAACTGGC AGCACT/-GCAC- TTTTTTTTTT 3070 het 684 hom 30 5 18 10 N/A 0 0 143126 CASAVA_Build 10 123536145 1I GCCTGGCCTC -/A AAAAAAAAAA 1120 het 1120 ref 30 15 5 10 A 14 15 143127 CASAVA_Build 10 123539457 1I GTCAGTAAGT -/G GCACGAGCAC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 1 2 143128 CASAVA_Build 10 123541637 2I TTGAGGACTT --/AA AAGACTGACT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 2 4 143129 CASAVA_Build 10 123544038 7D TTGAGCCCAG GAGGGTA/------- GAGGGTAGAG 3070 het 3010 hom 18 8 8 3 GAGGGTA 2 1 143130 CASAVA_Build 10 123548258 1I TACAAAAATT -/A GTTGGGCGTG 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 A 0 1 143131 CASAVA_Build 10 123548472 1D CAATAAGATG A/- TAAAATAGTA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 1 0 143132 CASAVA_Build 10 123551056 6D CAAAGAAGAT AATATA/------ AAGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 5 AATATA 1 0 143133 CASAVA_Build 10 123556915 6I TCATAGAGTA ------/TAAACC TAAGTTTCAT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 TAAACC 0 1 143134 CASAVA_Build 10 123575758 9D AACTGAGCAC TTAAAAGTG/--------- TTTAAGAGGG 3070 hom 126 het 49 0 43 7 TTAAAAGTG 1 0 143135 CASAVA_Build 10 123598237 8I CCAACTTGGT --------/AGTTGGTA GAAACCCTGT 2531 het 130 hom 8 1 6 1 AGTTGGTA 0 1 143136 CASAVA_Build 10 123612454 1I AAAGGGGGGT -/A ATACATATAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 1 2 143137 CASAVA_Build 10 123619998 2D AGGAAAGACC AA/-- GAGAGAGGTC 3070 het 3070 ref 46 24 19 4 A 2 0 143138 CASAVA_Build 10 123621676 5D GTAATTGATG CATTA/----- ATTAGCATAG 3070 het 3070 hom 31 12 16 5 CATTA 1 0 143139 CASAVA_Build 10 123627157 16D GGCCAATAAA TACGTAAAAAGCTCCC/---------------- TATTTAGTCA 3070 het 3070 ref 36 20 16 4 TACGTAAAAAGCTCCC 1 0 143140 CASAVA_Build 10 123637045 1D GCCCCCCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 9 8 143141 CASAVA_Build 10 123646468 1D CACCTCTGCA T/- TTTGCTAGTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 4 3 143142 CASAVA_Build 10 123654208 1D CAAAGTCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1695 hom 18 5 8 5 A 12 11 143143 CASAVA_Build 10 123655361 1I CAAGAGAGAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 8 9 143144 CASAVA_Build 10 123659999 1D AAATTACATT A/- AAAAATTTAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 6 5 143145 CASAVA_Build 10 123663102 4I CGCTAAACTC ----/AGAA TTCTGATATA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AGAA 0 1 143146 CASAVA_Build 10 123671065 2I CTTCAAGTAT --/TC TGTTTTATCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TC 0 1 143147 CASAVA_Build 10 123674368 1D CACATCGAAG T/- TAATTATATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 1 143148 CASAVA_Build 10 123678208 8I GGATTGAAAG --------/TTAGCCTC TCAGGCCGCC 3070 hom 57 het 25 0 16 9 TTAGCCTC 0 1 143149 CASAVA_Build 10 123682852 1D CTAATTTTGT A/- TATTTAGTAG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 A 1 0 143150 CASAVA_Build 10 123688413 1I TAAGAACATC -/T TACTAAAGTC 3070 hom 119 het 52 0 43 9 T 1 2 143151 CASAVA_Build 10 123688683 1D ACAGCAACAA C/- AAAAAAAAGC 3070 het 178 hom 32 1 27 4 C 1 0 143152 CASAVA_Build 10 123689105 3D AAAGAAAAAA AAG/--- AAATGAACAG 465 het 4 hom 6 0 4 3 AAG 1 0 143153 CASAVA_Build 10 123712125 1I AAAAACAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 17 0 11 6 T 10 11 143154 CASAVA_Build 10 123713103 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 915 hom 25 2 15 8 T 13 14 143155 CASAVA_Build 10 123714692 1D TGGCTCCAGA C/- CCGCACACTT 3070 hom 45 het 19 0 14 6 C 3 2 143156 CASAVA_Build 10 123716226 1D AAGGACTGAA C/- AACTCAGATG 3070 hom 96 het 39 0 33 7 C 1 0 143157 CASAVA_Build 10 123739624 1D CTTCTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 11 10 143158 CASAVA_Build 10 123740047 2I TAATTTTCTG --/CC CCCAAGTACG 3070 hom 73 het 35 0 24 11 C 3 5 143159 CASAVA_Build 10 123763537 1D ATCATGCTGC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 39 0 31 9 A 9 8 143160 CASAVA_Build 10 123764580 1I ACCACTTATG -/T GTACTTACAG 3070 het 3070 ref 37 13 12 12 T 0 1 143161 CASAVA_Build 10 123764612 1D CATCTGCTAT A/- AAAAAAAAAA 2006 het 789 hom 34 7 8 19 A 15 14 143162 CASAVA_Build 10 123765459 1I CCAAAATGTT -/A AAAAAAAAAA 2945 het 2945 ref 24 11 8 5 A 13 14 143163 CASAVA_Build 10 123767461 1I AGTGGAATTC -/T TTTTTTTTTT 2781 het 2189 hom 20 8 10 2 T 13 14 143164 CASAVA_Build 10 123769818 2D AGCATGTGAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 166 hom 47 4 21 22 TG 13 12 143165 CASAVA_Build 10 123772221 1I TATGGCCATT -/A AAAAATGATT 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 A 5 6 143166 CASAVA_Build 10 123772556 1D TTCCCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2356 hom 31 10 17 4 T 12 11 143167 CASAVA_Build 10 123773300 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 725 het 315 hom 13 2 3 8 A 14 13 143168 CASAVA_Build 10 123775951 1D TTTTCTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 T 11 10 143169 CASAVA_Build 10 123783713 3D CTGTTAGGTG GGT/--- GGTGCACTTG 3070 het 3070 ref 24 12 11 6 GGT 2 1 143170 CASAVA_Build 10 123795464 1I22M1I TGGATCACGA -GTCAGGAGATCGAGACCAGCCT-/GGTCAGGAGATCGAGACCAGCCTG GCCAACATGG 3070 hom 38 het 17 0 13 6 N/A 0 0 143171 CASAVA_Build 10 123808400 1D CCTCTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 1973 het 1424 hom 25 8 7 10 T 15 14 143172 CASAVA_Build 10 123809067 1D TTCTCTCCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 18 15 9 T 10 9 143173 CASAVA_Build 10 123809471 1I AGCCCAGGGA -/T TCTGGCACTC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 1 2 143174 CASAVA_Build 10 123812573 1I TGACTCTCAC -/A AGGTGTCTGA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 1 2 143175 CASAVA_Build 10 123818177 1I CTCCGAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 905 hom 28 2 15 11 T 10 11 143176 CASAVA_Build 10 123831592 2D AGGCTGAGGT GG/-- GAAGATTGCT 3070 het 3070 ref 37 17 18 3 G 3 1 143177 CASAVA_Build 10 123842603 1D TGTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 683 hom 47 4 31 12 T 14 13 143178 CASAVA_Build 10 123854752 1D CTCTGTGTCT G/- GGGAGTGTTT 3070 het 3070 ref 48 31 14 4 G 4 3 143179 CASAVA_Build 10 123855494 2D TACATATACA TT/-- TTTTTTTTTT 2102 het 521 hom 19 6 7 6 T 16 14 143180 CASAVA_Build 10 123858639 1I TACAAGTATC -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 6 7 143181 CASAVA_Build 10 123860284 22D GTGATTGCCA TAATAAATTACCACAAAACTAG/---------------------- TAATTTTGGC 3070 het 3070 ref 36 24 14 5 TAATAAATTACCACAAAACTAG 1 0 143182 CASAVA_Build 10 123860709 1I TTCATTCCCC -/T TTGTCATGTA 3070 hom 69 het 27 0 21 6 T 2 3 143183 CASAVA_Build 10 123860987 4I TATGACCCAC ----/AGTT AGGGCACAAG 3070 hom 129 het 46 0 43 6 AGTT 0 1 143184 CASAVA_Build 10 123861162 3I TGCCCAGCTA ---/TTT TTTTTTTTTT 1365 het 798 hom 14 3 5 6 T 11 14 143185 CASAVA_Build 10 123861438 4D ACAAGGAATC TATT/---- TAAGTTTCCA 3070 het 3070 ref 40 25 13 3 TATT 1 0 143186 CASAVA_Build 10 123864805 22D GTGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGA/---------------------- GATACCTGAG 3070 hom 113 het 35 0 37 6 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGA 1 0 143187 CASAVA_Build 10 123871210 1I ATTGGCTTCT -/A GGGCCTGGGC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 1 143188 CASAVA_Build 10 123875607 1D CACACTCCCC A/- CCGCCTGCCT 3070 hom 62 het 22 0 20 2 A 1 0 143189 CASAVA_Build 10 123894913 1D GTGAGAAAGA C/- TGGACTCAAA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 C 1 0 143190 CASAVA_Build 10 123986094 3D TAACCACAGA TTC/--- CTCCTCCTCA 3070 hom 130 het 47 0 42 6 TTC 1 0 143191 CASAVA_Build 10 123991098 1I GCCTTATTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 T 9 10 143192 CASAVA_Build 10 124008097 2D AGGTGGAGAG GA/-- GAAAGCTCAC 3070 het 3070 ref 44 19 14 12 GA 2 1 143193 CASAVA_Build 10 124008307 1D CTTTTTCCCC T/- TGCACTTACT 3070 hom 113 het 44 0 35 10 T 2 1 143194 CASAVA_Build 10 124008714 1D CCTTGGGTGT A/- AGATCTGAGG 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 A 2 1 143195 CASAVA_Build 10 124011005 1I TTTCCCTATG -/T TTTTTTCTAG 2618 het 2591 hom 27 6 7 14 T 6 7 143196 CASAVA_Build 10 124012627 1D TATGAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 38 5 26 8 T 13 12 143197 CASAVA_Build 10 124012932 1D TCTTTTTTTT C/- CCCGTCTGAC 3070 het 3070 hom 48 21 22 7 C 4 3 143198 CASAVA_Build 10 124018463 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 9 8 143199 CASAVA_Build 10 124020267 1D CATCTCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2885 hom 20 6 8 6 A 11 10 143200 CASAVA_Build 10 124022533 3I AAAAATAAAT ---/ATA ACGATGATAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ATA 0 1 143201 CASAVA_Build 10 124024016 2I CGCAACCCCA --/TT TAATCAAATG 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 T 1 3 143202 CASAVA_Build 10 124024353 1I ACCTGCTTAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 8 9 143203 CASAVA_Build 10 124038081 11I CCAGTGTGTG -----------/TGAGCCTGGGA TGAGCCTGGG 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 TGAGCCTGGGA 1 2 143204 CASAVA_Build 10 124044058 2I CATGTGTATG --/CA CACACACACG 3070 het 3070 ref 62 29 18 15 CA 4 5 143205 CASAVA_Build 10 124045468 1I ACCAATTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 8 9 143206 CASAVA_Build 10 124060527 1D GCTAGGAGGG A/- ACGTAGTTGA 3070 het 2716 hom 36 9 15 12 A 2 1 143207 CASAVA_Build 10 124075545 1D ATATTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 13 13 11 A 11 10 143208 CASAVA_Build 10 124094212 1D TCTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3065 het 1903 hom 24 8 11 5 T 13 12 143209 CASAVA_Build 10 124095804 2D AAAAAAAAAA GG/-- AGGAATTGGG 565 het 565 ref 36 18 7 11 G 2 0 143210 CASAVA_Build 10 124100324 1I CGTATTCTGA -/G TCCACCTGGA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 G 0 1 143211 CASAVA_Build 10 124102562 1D CCCTAGCACA G/- GGGCTCCCTG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 4 3 143212 CASAVA_Build 10 124108185 1I AACCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 11 12 143213 CASAVA_Build 10 124111688 1I TAGAGAAGAT -/G GGGGGCATCA 3070 het 3070 hom 46 23 20 3 G 5 6 143214 CASAVA_Build 10 124121655 1I AGCAGAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 11 12 143215 CASAVA_Build 10 124132820 1D TTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 21 1 15 5 T 12 11 143216 CASAVA_Build 10 124135815 1D GTGTTCCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 35 0 27 8 T 12 11 143217 CASAVA_Build 10 124140333 4I GTAGAATGGC ----/TGGA TGGATCATAT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 TGGA 1 2 143218 CASAVA_Build 10 124142927 1I CAGGCTTTAG -/A ATTTGTCTTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 2 143219 CASAVA_Build 10 124145589 1I TTGAATATTG -/T TTTTTCTCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 6 143220 CASAVA_Build 10 124147828 1D TGTTTTCAAC T/- TTTAAATCCC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 4 3 143221 CASAVA_Build 10 124149081 6D ATTTGTGGAC TTTATT/------ TTTATTTTTA 3070 hom 51 het 23 0 17 8 TTTATT 4 3 143222 CASAVA_Build 10 124153108 1D AGTGTCAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 21 9 T 13 12 143223 CASAVA_Build 10 124157759 3D TAAGAGAAAA AGT/--- AGTGAATGGT 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 AGT 2 1 143224 CASAVA_Build 10 124164399 1I TTATGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 34 0 24 10 T 10 11 143225 CASAVA_Build 10 124170659 1I TTTACTCAGG -/T TGGTCAGATG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 1 2 143226 CASAVA_Build 10 124180633 1I TAAGTACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 29 0 21 8 T 11 12 143227 CASAVA_Build 10 124182055 1I GGAAAAATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 9 10 143228 CASAVA_Build 10 124183036 1D CTTAGTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 58 1 49 10 T 11 10 143229 CASAVA_Build 10 124186241 3D GTAAGATAAG TGT/--- TGTGATGGAG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 TGT 2 1 143230 CASAVA_Build 10 124188375 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 35 0 24 12 A 13 12 143231 CASAVA_Build 10 124192524 1I34M1I CTGGGACTAC -GGTGCCTGCCACCACGCTCAGCTAAGTTTTTGTA-/AGGTGCCTGCCACCACGCTCAGCTAAGTTTTTGTAT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 14 8 8 6 N/A 0 0 143232 CASAVA_Build 10 124193133 1D ACTGCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 702 hom 14 3 9 2 A 14 13 143233 CASAVA_Build 10 124198553 6D TTTGTTTTTG ATAAAC/------ ATAAATTCTT 3070 het 3070 hom 40 19 18 5 ATAAAC 1 0 143234 CASAVA_Build 10 124204591 2I TTCTGGAGTG --/GT GTGCCCTGCA 3070 het 3070 ref 59 29 20 10 GT 1 2 143235 CASAVA_Build 10 124206375 2I GTCATGTGTC --/TA TTTAAAAATG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 TA 0 1 143236 CASAVA_Build 10 124207748 1I TTCAAAACTG -/C CCCCCTTTCC 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 C 5 6 143237 CASAVA_Build 10 124207893 4I AGAATCTAAA ----/AGAG AGAAAGAGCA 3070 het 3070 hom 49 21 26 2 AG 1 3 143238 CASAVA_Build 10 124227419 1D TATGCCCAGA C/- CCCACATGGC 3070 hom 103 het 39 0 32 8 C 4 3 143239 CASAVA_Build 10 124228188 1I TTGAGCCACT -/G CGCCCGGCTG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 0 1 143240 CASAVA_Build 10 124229292 6I GTGGGCCCGA ------/GGAGAT GGAGATGGCG 3070 het 2784 hom 35 10 18 7 GGAGAT 1 2 143241 CASAVA_Build 10 124229847 1D ACATCAGGGC G/- GGCGAGGGCA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 G 3 2 143242 CASAVA_Build 10 124230800 1I ACTTCAAAGC -/A CACAAATATA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 A 0 1 143243 CASAVA_Build 10 124232258 9D ACCCCATCTC TACTAAAAA/--------- TACAAAAAAT 3070 het 2347 hom 22 6 15 1 TACTAAAAA 1 0 143244 CASAVA_Build 10 124255603 24I CCTATTCGGT ------------------------/CTTGCTGTCTTGGGTCCTGGAGGC CTTGCTGTCC 3070 het 3070 ref 38 16 14 11 CTTGCTGTCTTGGGTCCTGGAGGC 0 1 143245 CASAVA_Build 10 124269672 1I TGAGGCGCCA -/G GGAATGGTGT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 G 2 3 143246 CASAVA_Build 10 124306891 4D TGTCCCCCTC GTCT/---- GTCTGTCAGG 3070 hom 22 het 23 1 20 5 GTCT 2 1 143247 CASAVA_Build 10 124308294 1I AGCTCACAAA -/C CCTTATTTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 C 2 3 143248 CASAVA_Build 10 124309415 4I ACCTTCTTGG ----/TAGA TAGAGTGTGT 3070 hom 85 het 36 0 28 8 TAGA 1 2 143249 CASAVA_Build 10 124309855 2I AAACCATCCC --/AA AGAGATGCTT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 1 3 143250 CASAVA_Build 10 124311406 6I ATCACCTTTC ------/TCTCTG TCTCTGTCTC 3070 hom 27 het 32 1 23 8 TCTCTG 2 3 143251 CASAVA_Build 10 124314025 4D AAGGAATAAT GAAA/---- GAAAGTATGC 3070 hom 66 het 27 0 23 7 GAAA 2 1 143252 CASAVA_Build 10 124314139 1I ATCACATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 25 7 T 12 13 143253 CASAVA_Build 10 124314542 1I CTCCAATCTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 8 9 143254 CASAVA_Build 10 124315114 7D GTGGCTGTTG TCAATGC/------- CAGCTATACT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 TCAATGC 1 0 143255 CASAVA_Build 10 124318649 1I TTCAGTCTCA -/G CCCCCCAGAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 0 1 143256 CASAVA_Build 10 124322182 3I TCTACATATC ---/CTT CTGAAGTTGG 3070 hom 117 het 46 0 39 7 CTT 0 1 143257 CASAVA_Build 10 124322818 1D CGAAACCACC T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 23 het 48 1 45 3 T 7 6 143258 CASAVA_Build 10 124391443 1D TGTTTGGCCT G/- GTGGGGCTTG 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 G 2 1 143259 CASAVA_Build 10 124391687 3I CTGTGAAAAA ---/AAC AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 AAC 0 1 143260 CASAVA_Build 10 124393931 2I TGAGTCCAGA --/CT CTCTTTCCTC 3070 het 3070 hom 55 21 24 10 CT 2 3 143261 CASAVA_Build 10 124400292 1D CACCACTGCA G/- ATTTCTACAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 G 1 0 143262 CASAVA_Build 10 124410961 3I TTTGTTTTGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 40 15 20 6 TTG 3 4 143263 CASAVA_Build 10 124442570 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2534 het 2534 ref 26 12 7 7 T 13 12 143264 CASAVA_Build 10 124494258 1I TTTTTTTTTT -/C TCTCTTTGTT 3070 het 2205 hom 18 6 10 2 C 0 1 143265 CASAVA_Build 10 124500489 1D GCATTGTAGC T/- TTTCCTCCAT 3070 het 3070 ref 69 34 27 8 T 4 3 143266 CASAVA_Build 10 124508621 1I TTTTTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 T 11 12 143267 CASAVA_Build 10 124516216 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 53 27 13 13 AC 6 7 143268 CASAVA_Build 10 124519079 1D TCTTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 26 1 17 8 T 15 14 143269 CASAVA_Build 10 124519162 1D CTTACTGCAA C/- CTTTCTCTCC 3070 het 2022 hom 19 5 9 6 C 2 1 143270 CASAVA_Build 10 124555441 1I AGTGTGATTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 8 9 143271 CASAVA_Build 10 124555998 2D AGAAGGGTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 25 0 17 10 A 14 12 143272 CASAVA_Build 10 124564874 28D CCTCCCTCCC TCCCTCCCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT/---------------------------- TCCCTCCTTC 2417 hom 20 het 14 0 8 6 TCCCTCCCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCT 1 0 143273 CASAVA_Build 10 124565689 1I CAAGAGAATA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 8 9 143274 CASAVA_Build 10 124639129 1I GTGTAATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 25 0 20 5 A 10 11 143275 CASAVA_Build 10 124701580 6D ATATTGTCAC TTTTAA/------ TAGTTACACT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 TTTTAA 1 0 143276 CASAVA_Build 10 124703276 1D TGGGGACGTT A/- TATGAAATTC 3070 hom 33 het 14 0 11 3 A 1 0 143277 CASAVA_Build 10 124704538 1D CGAGTGGAAA G/- GGGGGGTCTC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 G 7 6 143278 CASAVA_Build 10 124712343 3D TTCTGAAAAT TGC/--- TCACTGCACT 3070 het 3070 ref 48 29 14 6 TGC 1 0 143279 CASAVA_Build 10 124713527 1D TGTTATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2772 hom 26 8 10 8 A 11 10 143280 CASAVA_Build 10 124719132 3D GGACACATAG AGA/--- AGAACAACAC 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 AGA 2 1 143281 CASAVA_Build 10 124728142 1I AAGCCTATTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 8 9 143282 CASAVA_Build 10 124731862 12I CTGGAGCACC ------------/TATTAGGTGCCA GACCCTCTGC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 TATTAGGTGCCA 0 1 143283 CASAVA_Build 10 124744648 1D TTGCTCACAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 9 8 143284 CASAVA_Build 10 124748869 1D AAAGGCTCTT A/- AGACATAGTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 1 143285 CASAVA_Build 10 124750477 3I ATCTTAAGTA ---/TCT TCTCCCACTG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TCT 1 2 143286 CASAVA_Build 10 124753913 1D AGTACAACGT G/- ACAGTGCAGT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 G 1 0 143287 CASAVA_Build 10 124754136 1I TGATAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 964 hom 49 3 34 12 A 13 14 143288 CASAVA_Build 10 124763832 4D CTATTTTTAA AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 2191 hom 24 6 14 5 AATT 3 2 143289 CASAVA_Build 10 124765911 4D ATTTGAACAC AGTT/---- AGAACACTCA 3070 het 3070 hom 41 12 18 12 AGTT 1 0 143290 CASAVA_Build 10 124769831 5I ATTTCCCAGA -----/GGTTG GGTTGCTGCT 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 GGTTG 1 2 143291 CASAVA_Build 10 124771550 1I TCAAGAAGAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 8 9 143292 CASAVA_Build 10 124776233 1D TTGCTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 11 10 143293 CASAVA_Build 10 124777759 4D ATAAACTAGT TTAA/---- TTATTGTAAC 3070 het 3070 ref 37 24 12 5 TTAA 1 0 143294 CASAVA_Build 10 124780274 7I TCAATTCTTT -------/TACTAAC TGGGTTTCAC 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 TACTAAC 0 1 143295 CASAVA_Build 10 124783705 1I TCATGTTAAC -/A AACTAATTTG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 2 3 143296 CASAVA_Build 10 124789863 3D TCAAAAAAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 48 het 19 0 17 5 AAT 4 3 143297 CASAVA_Build 10 124790546 1D ATAGGGTATA T/- TTTTTGGAAA 3070 hom 144 het 52 0 49 4 T 6 5 143298 CASAVA_Build 10 124793600 1D GATAAGAATT G/- GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 G 7 6 143299 CASAVA_Build 10 124794852 1D GCCCAGCCAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 8 7 143300 CASAVA_Build 10 124800237 2D TTTGATCAAA AG/-- AGAGTTGAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AG 3 2 143301 CASAVA_Build 10 124802676 1D GGTAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 12 11 143302 CASAVA_Build 10 124808257 1I TATTAGTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1122 hom 28 3 18 7 T 10 11 143303 CASAVA_Build 10 124818480 1D CTTGTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 843 hom 29 7 11 12 T 13 12 143304 CASAVA_Build 10 124820131 1D TATTATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 11 10 143305 CASAVA_Build 10 124822586 2D CATTACAGAC AA/-- GAGAGCTTTA 3070 het 3070 hom 54 21 28 7 A 2 0 143306 CASAVA_Build 10 124823487 10D ACTGGGGTCT GTGCAAAAGG/---------- ACATTAGACC 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 GTGCAAAAGG 1 0 143307 CASAVA_Build 10 124824470 5D TGGAGGGAAA CAACT/----- CAGTGTCCAG 3070 het 3070 ref 44 24 17 6 CAACT 1 0 143308 CASAVA_Build 10 124835148 1I ATCCTCACTC -/T TTCTTCACTG 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 T 2 3 143309 CASAVA_Build 10 124844877 1I TGAATTACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 80 het 32 0 27 5 A 9 10 143310 CASAVA_Build 10 124860544 4D TTCTTTTGAT AGTC/---- AGTAAGTTCT 3070 hom 62 het 25 0 20 5 AGTC 1 0 143311 CASAVA_Build 10 124864322 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 C 0 1 143312 CASAVA_Build 10 124864486 1D AATCCAGCTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 T 9 8 143313 CASAVA_Build 10 124891000 1D GGAGCTGCTG C/- CACCACTCAC 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 C 2 1 143314 CASAVA_Build 10 124959321 1D ACCTGCTCAA T/- AAATGATTGT 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 T 1 0 143315 CASAVA_Build 10 124965154 1I GTAAGACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 T 11 12 143316 CASAVA_Build 10 124965647 1D TTTTGACGTT A/- AAAATAATGA 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 A 5 4 143317 CASAVA_Build 10 125003091 1D AATGCAATTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 58 23 30 6 T 9 8 143318 CASAVA_Build 10 125006657 13D GAATAATGTC AAGACGCAGGTGA/------------- AAGTGACTTG 3070 hom 106 het 40 0 33 9 AAGACGCAGGTGA 1 0 143319 CASAVA_Build 10 125009323 1D TTGAGAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 46 1 29 18 T 13 12 143320 CASAVA_Build 10 125012579 2D TTTTTTTCCC CA/-- GAGTTTGTGA 3070 hom 90 het 35 0 29 6 CA 1 0 143321 CASAVA_Build 10 125170440 1I TTTCCTGTGT -/C CTCTTGTTTT 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 C 1 2 143322 CASAVA_Build 10 125188450 1I CTTTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 269 hom 24 2 14 8 A 13 14 143323 CASAVA_Build 10 125201757 1D AAGGAAAAAG C/- TTTTACAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 C 1 0 143324 CASAVA_Build 10 125206597 1I AACTTGCCAC -/A AAAACCACAC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 4 5 143325 CASAVA_Build 10 125208066 2I TCTTTCCCCC --/CT CTCTCTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 CT 3 4 143326 CASAVA_Build 10 125218504 1I CTTTGAAACA -/G AAGTATGGAA 3070 het 3070 ref 33 13 16 4 G 0 1 143327 CASAVA_Build 10 125261924 1I CTGGCTGACC -/A ACGGTGAACA 3070 hom 97 het 40 0 27 13 A 1 2 143328 CASAVA_Build 10 125264912 1D TTCCCACGTG C/- CCCCCTCTAT 3070 hom 166 het 61 0 55 8 C 6 5 143329 CASAVA_Build 10 125283190 4I CAAGAAAAAG ----/AAAT AAAGGGCATC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 AAAT 0 1 143330 CASAVA_Build 10 125298314 5D TTCACAATGT CGCTG/----- TTGGATCATA 3070 hom 132 het 48 0 44 7 CGCTG 1 0 143331 CASAVA_Build 10 125302480 1D CCAAAGGCTC A/- GGGGCTTCGA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 1 0 143332 CASAVA_Build 10 125314366 1D TTAAAACAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 C 1 0 143333 CASAVA_Build 10 125316991 2D GGAGAAAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2743 hom 23 11 8 4 AC 1 0 143334 CASAVA_Build 10 125324281 1D GGACAGTCTA C/- CAAAAACCAG 3070 het 3070 hom 43 14 26 3 C 2 1 143335 CASAVA_Build 10 125325879 3D CATGGTGTTT GGG/--- GGGGGGGGGC 3070 het 89 hom 28 2 14 14 G 12 9 143336 CASAVA_Build 10 125330505 2D CTCTCCATTT AG/-- AGAGCATCCA 3070 hom 93 het 37 0 28 9 AG 3 2 143337 CASAVA_Build 10 125333844 1I CCAGATCGAG -/C CCCCCGAGGC 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 C 5 6 143338 CASAVA_Build 10 125336539 1I AAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1321 het 1047 hom 19 6 6 7 A 14 15 143339 CASAVA_Build 10 125344199 4I ATGACCCTGG ----/CATT CATTCCACTC 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 CATT 1 2 143340 CASAVA_Build 10 125344344 1D TTGTGGCATA C/- CCATAGAGTG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 C 3 2 143341 CASAVA_Build 10 125359513 8D TGTCACTTCA TCATTCAC/-------- TCAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 26 27 5 TCATTCAC 1 0 143342 CASAVA_Build 10 125365403 2I GTGTTAAAAC --/AT ATTTGCAGGC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AT 1 2 143343 CASAVA_Build 10 125367353 1I GAATAGATAC -/T TAGGCTGGCT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 1 2 143344 CASAVA_Build 10 125374510 1D TTTTTTTTTT C/- CACAATTTGA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 C 2 1 143345 CASAVA_Build 10 125375956 3D TTGACATGTA TAG/--- TTCAATTATT 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 TAG 1 0 143346 CASAVA_Build 10 125385299 6I ATACTACCAC ------/ATTCTT GATCTTTGTA 3070 hom 90 het 34 0 28 6 ATTCTT 0 1 143347 CASAVA_Build 10 125395553 21D CTTTGGGGTA CACAGACTGTGTAGTCAGAGC/--------------------- CACAAATGAG 3070 het 3070 ref 37 20 16 6 CACAGACTGTGTAGTCAGAGC 1 0 143348 CASAVA_Build 10 125396189 1I GTTACAGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 9 10 143349 CASAVA_Build 10 125399547 2I ACCTTTTTTT --/TG TTTTTTTGTG 3070 het 554 hom 36 7 18 11 TG 0 1 143350 CASAVA_Build 10 125400928 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 20 0 20 1 A 10 9 143351 CASAVA_Build 10 125403049 1D ACTTGCCCCT A/- AAAAAAAAAA 2621 het 2621 ref 26 13 9 5 A 13 12 143352 CASAVA_Build 10 125403850 4D ATATAAAAAG AGAT/---- AGAACACAGT 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 AGAT 1 0 143353 CASAVA_Build 10 125404364 2I GGCACTTTCT --/TA TAAAGTTAAA 3070 het 1333 hom 22 4 11 7 TA 1 2 143354 CASAVA_Build 10 125411565 1I GGATCAATCA -/T TGTGGCTTTT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 1 2 143355 CASAVA_Build 10 125414784 1D TACTAGGGTT A/- GCTGTCTAGG 3070 hom 84 het 32 0 25 7 A 1 0 143356 CASAVA_Build 10 125426689 1I ATTTTCCTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 118 hom 31 1 28 2 A 0 1 143357 CASAVA_Build 10 125429138 1I GTGTTTGAAT -/G AATTGCCCAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 143358 CASAVA_Build 10 125432540 2D ATGTGTTTAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 117 het 50 0 37 13 GT 8 7 143359 CASAVA_Build 10 125432620 61D AAGGTGTAAA TAAAGGGTGCTAATTTGTCACTTTAAACTCAGGATTTGAAAGTACAGGTGCTTGATCACAC/------------------------------------------------------------- TGAGGAATGG 3070 hom 75 het 18 0 24 5 TAAAGGGTGCTAATTTGTCACTTTAAACTCAGGATTTGAAAGTACAGGTGCTTGATCACAC 1 0 143360 CASAVA_Build 10 125436082 3D TCCACCAGCT TCC/--- TCCTCCTCCT 2645 het 2645 ref 33 18 10 8 TCC 4 3 143361 CASAVA_Build 10 125437177 1D ACAGAGATGG T/- CATATCTCCC 3070 hom 144 het 57 0 48 10 T 1 0 143362 CASAVA_Build 10 125447579 4I TCAGCAAAGG ----/TTTC CCTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TTTC 0 1 143363 CASAVA_Build 10 125450565 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 12 11 143364 CASAVA_Build 10 125460644 2D TAGAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTGG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AT 1 0 143365 CASAVA_Build 10 125464074 1I ACTGTATATT -/C TGGAATTCAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 0 1 143366 CASAVA_Build 10 125473666 3D ACAGAAAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 27 1 14 13 A 17 14 143367 CASAVA_Build 10 125474043 3I TCTGGCGGTA ---/AGG AGGAGAAAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AGG 1 2 143368 CASAVA_Build 10 125475703 2I ACTCGGTTTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 13 15 143369 CASAVA_Build 10 125489751 2D ACCTGAAAAC AA/-- TAATCAGCAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 2 0 143370 CASAVA_Build 10 125510451 3I CAAATTCATC ---/ATT GTCTTGACCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATT 0 1 143371 CASAVA_Build 10 125521478 1D AAATTACCCA G/- TCTCATGTAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 6 G 1 0 143372 CASAVA_Build 10 125521762 21D CGCTACCCTG GTTGTGGTTCTCACCTTCACT/--------------------- GTTGTGGTTC 3070 hom 138 het 51 0 42 22 GTTGTGGTTCTCACCTTCACT 1 0 143373 CASAVA_Build 10 125527055 1I AAGAACCTCC -/A CAGACCCCTG 3070 hom 84 het 31 0 27 4 A 0 1 143374 CASAVA_Build 10 125537786 2D ACCCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1936 het 348 hom 26 7 8 12 A 18 16 143375 CASAVA_Build 10 125547113 20I TGAGACAGGG --------------------/TCTCACTCCATTGCCCAGGC TGGAGTGTAG 3070 het 2939 hom 19 8 9 2 TCTCACTCCATTGCCCAGGC 0 1 143376 CASAVA_Build 10 125550291 1D TCTCAAACTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 A 10 9 143377 CASAVA_Build 10 125558511 1D AAGTTTTAAA T/- TGCACCATTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 10 T 2 1 143378 CASAVA_Build 10 125560657 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 T 11 10 143379 CASAVA_Build 10 125566498 2D CTTCTACCTC AG/-- AAAAATTTCT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 AG 1 0 143380 CASAVA_Build 10 125568587 9D CACCTAGATG CTTTGGGCT/--------- CCTCCTACCT 3070 het 3070 ref 25 14 9 4 CTTTGGGCT 1 0 143381 CASAVA_Build 10 125579458 1D GCCATTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1775 hom 35 6 14 17 A 15 14 143382 CASAVA_Build 10 125580280 1D AATAATATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 22 16 8 A 10 9 143383 CASAVA_Build 10 125583423 1D AGCAGACCCC T/- TACAGGGCAC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 2 1 143384 CASAVA_Build 10 125601275 1D ACATCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1796 het 129 hom 20 3 7 10 A 17 16 143385 CASAVA_Build 10 125606243 1D GATTACAGGC G/- TGTGCCACCA 3070 het 1728 hom 16 4 11 3 G 1 0 143386 CASAVA_Build 10 125610294 1I GTGTTCATCC -/T CTCATAAAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 143387 CASAVA_Build 10 125612241 1D TGGAAAGGAC A/- AATGCTTGTT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 A 3 2 143388 CASAVA_Build 10 125615908 1D CATCTCTACT A/- AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 6 5 143389 CASAVA_Build 10 125619708 1D GTTAGGTGTC T/- TGAGTTATAA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 2 1 143390 CASAVA_Build 10 125630456 1I AGACTTGTGA -/C CCCCAGAGCT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 C 4 5 143391 CASAVA_Build 10 125635792 2D CCTAATCCTT AC/-- ACACTCCCAT 3070 het 3070 ref 45 23 19 5 AC 3 2 143392 CASAVA_Build 10 125636771 1I TCCACTTAGG -/T TCCTTAGAGT 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 T 1 2 143393 CASAVA_Build 10 125652992 1D GCATTTCCTC T/- TGAGTGTCCT 3070 het 3070 ref 56 25 22 10 T 2 1 143394 CASAVA_Build 10 125654569 2I GGACTTTCCA --/GC CCTGTTACCA 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 GC 0 1 143395 CASAVA_Build 10 125660490 1D ACATGGCACT C/- CCCTCGTGTG 3070 het 3070 ref 39 17 14 9 C 4 3 143396 CASAVA_Build 10 125666285 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 T 12 11 143397 CASAVA_Build 10 125668611 1I AAAGTAGCAT -/A AGACAAGGCT 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 A 1 2 143398 CASAVA_Build 10 125671777 1D AATTTCATGG T/- ATAGTGATTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 1 0 143399 CASAVA_Build 10 125679710 2I CTGAGTACAC --/AT GTGGGCCCTG 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 AT 0 1 143400 CASAVA_Build 10 125685573 10D2M2D ACCATCATCA CCACTATCTTTACC/----------TA-- ATCACCACCA 3070 het 3070 ref 64 45 9 16 N/A 0 0 143401 CASAVA_Build 10 125704477 1I AAACCTCAAA -/G AAAATGAACA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 G 0 1 143402 CASAVA_Build 10 125705407 1D GTATGATCTT A/- AAGTTTTGAG 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 3 2 143403 CASAVA_Build 10 125707271 1I ACATGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 10 11 143404 CASAVA_Build 10 125711854 1I ACCAGGGAAA -/C CTTGATTCTT 2778 het 2778 ref 27 15 9 3 C 1 2 143405 CASAVA_Build 10 125720667 1I ACATCCCCCC -/A CACACACTGA 3070 het 3070 hom 45 13 24 8 A 0 1 143406 CASAVA_Build 10 125720708 4I AACACACAAT ----/CACA CACAAACACC 3070 het 3070 hom 37 11 13 13 CA 2 4 143407 CASAVA_Build 10 125720959 1D TAAACACCCA C/- CCCCAACACA 3070 het 3070 hom 47 19 19 10 C 5 4 143408 CASAVA_Build 10 125721047 4I30M4D ACACACAATT ----ACAAGAACACACACAAACACTTCCACACTGACAC/ACTCACAAGAACACACACAAACACTTCCACACTG---- ACAAACACAA 3070 het 3070 ref 40 28 13 10 N/A 0 0 143409 CASAVA_Build 10 125725366 1D GAACTTTGAA T/- TTTTTTTATT 2169 het 2169 ref 19 8 6 5 T 8 7 143410 CASAVA_Build 10 125725418 1I CTTTATTTTT -/A TATCTTTATG 2459 het 1653 hom 16 4 7 5 A 0 1 143411 CASAVA_Build 10 125725503 1I CAACATTTTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 1147 hom 14 3 9 2 A 7 8 143412 CASAVA_Build 10 125727101 5I GCAAAAACTA -----/AACTT AAGAATTCAG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AACTT 0 1 143413 CASAVA_Build 10 125728786 1D31M1I AAAAGAAAGT AAAAAAAAAACCCAAGACATGGAAAAGCAACA-/-AAAAAAAAACCCAAGACATGGAAAAGCAACAT TAAAATGGGT 3070 het 3070 ref 30 25 9 10 N/A 0 0 143414 CASAVA_Build 10 125729411 1D TGAATCACTC T/- TGACAACTGT 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 T 2 1 143415 CASAVA_Build 10 125734390 3I ACATACTAAC ---/TTA TTATAATAGG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTA 1 2 143416 CASAVA_Build 10 125738796 4I TGCTAGTGAG ----/TTGT TTGAGTTCTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TTGT 0 1 143417 CASAVA_Build 10 125740638 5I CTTCTCAGCT -----/AAGGC AAGGCAATGG 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 AAGGC 1 2 143418 CASAVA_Build 10 125744612 1I CTTTCTCTGG -/C CCCCCCAGTT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 C 6 7 143419 CASAVA_Build 10 125753079 1I GTCTGAGCTG -/C CATTCTGCTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 1 2 143420 CASAVA_Build 10 125754316 4I GGAAAATGTT ----/CTAA CTATTTCTCC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CTAA 0 1 143421 CASAVA_Build 10 125757490 2D GTGCCCTCTG GA/-- GAGAAAGGCC 3070 hom 80 het 32 0 26 7 GA 3 2 143422 CASAVA_Build 10 125767015 2D AAAGGCACAA TG/-- TGGTAGAAAC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 TG 2 1 143423 CASAVA_Build 10 125770743 1D CGGGGGGTAC G/- GGGGGGGGGG 1387 hom 21 het 11 0 8 3 G 12 11 143424 CASAVA_Build 10 125772992 1I AACCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 26 4 15 7 A 14 15 143425 CASAVA_Build 10 125782429 10I TGGATCAATT ----------/ATAGAAGTAA AGGCTGAATG 3070 het 3070 hom 37 18 19 1 ATAGAAGTAA 0 1 143426 CASAVA_Build 10 125858667 1I CTGGGCGAGT -/G GGGGGGGGGT 1202 het 1100 hom 14 6 4 4 G 9 10 143427 CASAVA_Build 10 125913569 1I GCGAAGGCAG -/T TGAGTGTTGG 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 1 2 143428 CASAVA_Build 10 125918221 2I CTGCGCACTC --/GT GTGTGTGCGT 2912 het 2203 hom 22 8 11 3 GT 3 4 143429 CASAVA_Build 10 125924471 1I CCAATGGCAG -/C CGCCAAGAGC 3070 het 3070 ref 50 20 18 12 C 1 2 143430 CASAVA_Build 10 125930047 2I TCCAAGGTCC --/CT CTCCAAGGCC 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 CT 1 2 143431 CASAVA_Build 10 125950076 1D TTCTTGTGAT A/- GTGAATAAGT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 1 0 143432 CASAVA_Build 10 125951838 1D AAAAAACACA G/- AAGAAAAGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 6 G 1 0 143433 CASAVA_Build 10 125964145 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2415 het 2070 hom 22 8 10 4 A 13 12 143434 CASAVA_Build 10 125972437 2D TCGGTGATCC AG/-- AGTCTGTCTA 3070 het 2771 hom 29 7 13 10 AG 2 1 143435 CASAVA_Build 10 125974173 2D TGAGTCACAG AC/-- ACACACAGAC 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 AC 4 3 143436 CASAVA_Build 10 125983573 2I TCCTCATTAT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 TC 0 1 143437 CASAVA_Build 10 125984510 3I TCACCATTAT ---/CAC CACCACCACC 3070 het 3070 hom 60 21 28 11 CAC 3 4 143438 CASAVA_Build 10 125984694 3D TCTTCAACAC CAT/--- CATCATCATC 3070 het 3070 ref 69 27 26 20 CAT 6 5 143439 CASAVA_Build 10 125985309 1D ATATAAGAAC A/- ATTTAACTCA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 2 1 143440 CASAVA_Build 10 125990387 2D CAACATCTCT AG/-- AGAGAATATT 3070 het 3070 ref 48 24 22 3 AG 3 2 143441 CASAVA_Build 10 125992120 2D CTCTCCTCCT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 108 het 57 0 33 25 AC 9 8 143442 CASAVA_Build 10 125994798 2I CAAGAAAATA --/AT ATAACAACAG 3070 hom 113 het 42 0 36 6 AT 1 2 143443 CASAVA_Build 10 126003355 3I AAAACCTCTC ---/CTT CTTGCTTGGA 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 CTT 1 2 143444 CASAVA_Build 10 126005276 1I CTTTTCTGGT -/G GGAAGACTTC 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 G 2 3 143445 CASAVA_Build 10 126012023 12D ACAGACCCAT GAAATAATGGAA/------------ GAAATAATGG 3070 het 3070 ref 40 23 21 4 GAAATAATGGAA 2 1 143446 CASAVA_Build 10 126013297 1D AAGGGGGAAA C/- CCCTTATAAA 3070 het 3070 hom 29 7 16 8 C 4 3 143447 CASAVA_Build 10 126013879 1I CCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2940 het 2105 hom 22 6 11 5 T 11 12 143448 CASAVA_Build 10 126019207 1D TCCAGGTGAC A/- AAGCCCTTCT 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 A 3 2 143449 CASAVA_Build 10 126019493 1D CCTGCACCAG C/- CGCTGAATTA 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 C 2 1 143450 CASAVA_Build 10 126020441 31D ACAGCCATCA CACCGTGTCACCCTTCACAGTGTCACTGAGT/------------------------------- CACCGTGTCA 3070 het 3070 ref 47 28 17 15 CACCGTGTCACCCTTCACAGTGTCACTGAGT 1 0 143451 CASAVA_Build 10 126026161 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 9 10 143452 CASAVA_Build 10 126036910 1I TTGGGGGTGG -/T TTTTTTTTTT 2194 het 295 hom 21 2 6 14 T 15 16 143453 CASAVA_Build 10 126040369 1D AACCCAGCTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 17 hom 18 1 12 5 T 9 8 143454 CASAVA_Build 10 126041531 1D TTTGTAGAGA G/- GGGGGTCTCA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 6 5 143455 CASAVA_Build 10 126050566 2D TCCAACTGGA CT/-- CTGTTTTCTG 3070 het 3070 ref 34 18 16 0 CT 2 1 143456 CASAVA_Build 10 126062357 1I AGGGTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 29 3 13 13 T 14 15 143457 CASAVA_Build 10 126088119 1I ATAAAAAAAA -/T AAAATAAAAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 0 1 143458 CASAVA_Build 10 126092592 1D CTCTGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2806 hom 28 9 9 10 A 15 14 143459 CASAVA_Build 10 126098673 4D AAGCAAGACC ATCT/---- ATCTTAATCA 3070 hom 111 het 40 0 35 5 ATCT 2 1 143460 CASAVA_Build 10 126104534 1D ATTGTAAATC A/- TTTCATCTTT 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 A 1 0 143461 CASAVA_Build 10 126111163 1D GAAAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 1423 het 1423 ref 24 17 4 4 A 13 12 143462 CASAVA_Build 10 126116121 1I TTGGTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1095 hom 19 3 12 4 T 13 14 143463 CASAVA_Build 10 126118824 4D CTAATAATAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1146 het 433 hom 11 4 4 3 A 16 12 143464 CASAVA_Build 10 126122908 1D TCATATCTAC A/- AAAAAAAAAG 2185 het 2185 ref 19 10 5 5 A 10 9 143465 CASAVA_Build 10 126145677 1I AGTGAGACTC -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 1 2 143466 CASAVA_Build 10 126168484 1D CACCAGGGGG A/- CAGCACTCCA 3070 het 3070 hom 42 15 20 10 A 1 0 143467 CASAVA_Build 10 126170329 1D ACTAAAAATA C/- AAAAATTAGC 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 C 1 0 143468 CASAVA_Build 10 126170833 3I TGAAAAGATT ---/TTC TTTTTAGTGA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 TTC 0 1 143469 CASAVA_Build 10 126171680 1I GTTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2007 hom 28 6 17 5 A 11 12 143470 CASAVA_Build 10 126204583 1I GGACCCCTGT -/A AGGCAGCCTC 3070 het 2577 hom 28 8 13 7 A 1 2 143471 CASAVA_Build 10 126208356 2D TCATGCACAT AC/-- ACACACACAC 2317 het 1350 hom 42 10 10 23 AC 8 7 143472 CASAVA_Build 10 126209478 3D CCAGCCCGTC CTT/--- CTTGTCTCCC 2801 het 2801 ref 35 18 11 6 CTT 2 1 143473 CASAVA_Build 10 126222339 1D AATTAATATA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 9 8 143474 CASAVA_Build 10 126222794 2I GCCCCCATGC --/AG AGTCATGCTG 3053 het 2622 hom 25 9 8 8 AG 1 2 143475 CASAVA_Build 10 126223109 1D TGTCTTTATT C/- ACCACCAGAC 3070 het 3070 hom 38 18 15 5 C 1 0 143476 CASAVA_Build 10 126223440 1D ACATCGAGTG T/- TCTGGCCACT 2341 het 2341 ref 27 16 8 3 T 2 1 143477 CASAVA_Build 10 126226755 1I CTTGGGGCCC -/G GGCCACTCCA 2369 het 1497 hom 25 8 8 9 G 2 3 143478 CASAVA_Build 10 126231772 1D CAGAACACGG C/- TGATTTTCTG 2345 het 2345 ref 18 8 7 3 C 1 0 143479 CASAVA_Build 10 126250245 1I ACTTTTTGTG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 7 8 143480 CASAVA_Build 10 126257523 1D TAGCACGGAC G/- GGGGGGTCCG 3070 hom 69 het 30 0 26 4 G 7 6 143481 CASAVA_Build 10 126258662 5D4M1D TCCTTTGTAG CTTCACTGTG/-----CTGT- GAATGCTTGT 3070 het 3070 ref 36 20 11 7 N/A 0 0 143482 CASAVA_Build 10 126259000 1D GACTTGTGTA T/- ATGGTGTGAG 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 T 1 0 143483 CASAVA_Build 10 126260372 1I AACAGATTCT -/C GCTTTGTCGG 1212 het 1212 ref 17 10 3 4 C 0 1 143484 CASAVA_Build 10 126261119 1I ATCTGTATAT -/A ACCTTTGACT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 1 2 143485 CASAVA_Build 10 126262766 1D CCCATCTCTG A/- AAAAAAAAAA 2383 het 1140 hom 13 3 8 2 A 13 12 143486 CASAVA_Build 10 126264629 2D AGGCGTGAGC CA/-- CACTACACCC 1309 het 1309 ref 12 8 3 2 CA 2 1 143487 CASAVA_Build 10 126265331 1I TTAATTACGC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 7 8 143488 CASAVA_Build 10 126266858 1I TTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1542 hom 22 7 10 5 T 11 12 143489 CASAVA_Build 10 126270398 3I AACATTCTCA ---/TCT TCTCTCTGAT 3070 hom 107 het 43 0 35 8 TCT 1 2 143490 CASAVA_Build 10 126273188 1I TTCAGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1485 hom 34 8 16 10 T 15 16 143491 CASAVA_Build 10 126281168 3D TGAGTGCCTC CTT/--- CTGCGAGGAG 3070 hom 34 het 14 0 11 4 CTT 1 0 143492 CASAVA_Build 10 126281616 1I TACTGGGGCT -/G GGGCCAGGCC 3070 hom 42 het 16 0 13 3 G 3 4 143493 CASAVA_Build 10 126284837 1I CACCATTCTC -/G GGGGGGACAG 3070 hom 42 het 18 0 13 5 G 6 7 143494 CASAVA_Build 10 126289987 4D TGTGAGGCTC GTGA/---- GTGCTGTGCT 3070 hom 72 het 31 0 20 11 GTGA 1 0 143495 CASAVA_Build 10 126306368 4D GCCTGCCCCA GCCG/---- GCCTCCCTAG 3070 hom 54 het 21 0 17 5 GCCG 1 0 143496 CASAVA_Build 10 126306472 4D CCACGGGGAT ACAG/---- ACAAAGGTGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ACAG 1 0 143497 CASAVA_Build 10 126313646 6D ATTATTTTAT TTTTTA/------ TTTTTATTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 TTTTTA 2 1 143498 CASAVA_Build 10 126322614 1D ATGTGACTCA G/- GGTAAATTCA 3070 hom 89 het 38 0 26 13 G 3 2 143499 CASAVA_Build 10 126355178 1D GAAGCTGGCT G/- GGGGGGCTTC 3070 hom 47 het 22 0 11 11 G 7 6 143500 CASAVA_Build 10 126362297 4D GTGGGTGAGC CTGA/---- CTCTGGCCCT 3070 hom 107 het 39 0 31 11 CTGA 1 0 143501 CASAVA_Build 10 126380340 1D CTGAGCCTCA G/- GGCCATCTCC 3070 hom 71 het 28 0 21 7 G 3 2 143502 CASAVA_Build 10 126397607 1I CAAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 49 het 19 0 17 2 A 9 10 143503 CASAVA_Build 10 126398866 1I TCGTCTTGAC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 6 7 143504 CASAVA_Build 10 126405890 2D GAGTGATTGT GG/-- GGGGGGGGGG 2476 hom 24 het 11 0 8 3 G 14 12 143505 CASAVA_Build 10 126437064 1D CTCTATGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 44 2 28 14 A 17 16 143506 CASAVA_Build 10 126450428 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 1710 het 1710 ref 29 19 5 5 A 9 10 143507 CASAVA_Build 10 126455449 1D AGCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 10 9 143508 CASAVA_Build 10 126457282 1I ACTCCGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 31 0 16 15 A 15 16 143509 CASAVA_Build 10 126465717 2D GTGTTAGCCA AG/-- GCATGGTCTC 1749 hom 15 het 6 0 6 0 AG 1 0 143510 CASAVA_Build 10 126468458 1I AATATATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 13 5 T 11 12 143511 CASAVA_Build 10 126479077 3D AGAATCACAA AAG/--- AAGTGAAAAT 3070 het 138 hom 12 1 10 1 AAG 2 1 143512 CASAVA_Build 10 126483234 1D TCTCAGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 661 hom 28 2 21 6 T 12 11 143513 CASAVA_Build 10 126488033 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGTTTCTC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 G 5 4 143514 CASAVA_Build 10 126495053 1I GATTTTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 30 1 25 4 A 10 11 143515 CASAVA_Build 10 126498349 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1076 het 1076 ref 19 10 3 6 A 13 14 143516 CASAVA_Build 10 126511866 1I TCTCTACTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 21 1 14 6 A 12 13 143517 CASAVA_Build 10 126515011 1D ACGCTGCAGA C/- CACTTTATCT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 C 2 1 143518 CASAVA_Build 10 126523271 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2553 hom 25 het 16 0 10 6 T 13 12 143519 CASAVA_Build 10 126530139 2I TGTGAATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 407 hom 37 1 32 4 TA 5 6 143520 CASAVA_Build 10 126532139 2I TCTACAAAAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AC 6 7 143521 CASAVA_Build 10 126536898 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 507 hom 20 2 15 3 A 11 12 143522 CASAVA_Build 10 126542410 1I AATACCACGG -/C CCGGGGCCCA 2927 hom 54 het 21 0 17 4 C 2 3 143523 CASAVA_Build 10 126548599 3I AAGAGAAGAT ---/CTC CTCCCCAGCT 3070 hom 95 het 37 0 30 7 CTC 1 2 143524 CASAVA_Build 10 126553188 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 17 1 12 6 T 16 15 143525 CASAVA_Build 10 126553584 1D TATTTTTTTT G/- ATTTGATTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 1 0 143526 CASAVA_Build 10 126560724 4I TATACATATG ----/TAAC TAACCTGCAT 1467 hom 7 het 3 0 3 0 TAAC 1 2 143527 CASAVA_Build 10 126574141 1D TGCTCCAGAA T/- TTTTTTTTTT 1220 het 1220 ref 21 9 3 9 T 15 14 143528 CASAVA_Build 10 126578305 1I TCAGCTACCT -/G GGATGTTGAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 2 3 143529 CASAVA_Build 10 126580719 1I GCTAATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 38 1 25 12 A 11 12 143530 CASAVA_Build 10 126594347 1D TGGCAGTAGT G/- ATAGGTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 1 0 143531 CASAVA_Build 10 126611698 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 18 0 9 9 T 15 14 143532 CASAVA_Build 10 126611794 5D CTCCCAGGTT CAAGC/----- GATTCTCCTG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 CAAGC 1 0 143533 CASAVA_Build 10 126618532 1D TGGATCAGGG A/- AAAAAATGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 7 6 143534 CASAVA_Build 10 126619758 1D TCAAGCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 25 1 17 7 A 13 12 143535 CASAVA_Build 10 126623969 12D CTTAAAATCA TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 116 het 49 0 36 18 T 25 13 143536 CASAVA_Build 10 126633783 1D CATTAAAAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 8 143537 CASAVA_Build 10 126635732 1D ACAGCACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 38 0 27 11 T 13 12 143538 CASAVA_Build 10 126635745 1D TTTTTTTTTT A/- TTTCATGATT 3070 hom 24 het 32 1 25 7 A 1 0 143539 CASAVA_Build 10 126650924 1I CCTCAGATTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 6 7 143540 CASAVA_Build 10 126657507 3I CCAATAATTC ---/CAG CAGCGCCTTG 3070 hom 63 het 27 0 20 7 CAG 1 2 143541 CASAVA_Build 10 126660635 2I GAAGAGTAAC --/AT GTGTTTTTAT 3070 hom 184 het 71 0 62 9 AT 0 1 143542 CASAVA_Build 10 126664218 1I TTATTGTGTC -/T TTTAAGTTTT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 3 4 143543 CASAVA_Build 10 126664841 30D CACACGCACG CGCGCGCGCGCACACACACACACACACACA/------------------------------ CACACACACA 3070 het 2637 hom 26 11 13 8 CGCGCGCGCGCACACACACACACACACACA 1 0 143544 CASAVA_Build 10 126665452 2I AGCGTTGTCC --/AG AGAGTACACG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 AG 2 3 143545 CASAVA_Build 10 126674750 1D CGTCACAGCG C/- CCCCCCCGGC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 8 7 143546 CASAVA_Build 10 126678814 1D ACCTCCATAA C/- CCTCACCGCT 3070 hom 90 het 36 0 27 9 C 3 2 143547 CASAVA_Build 10 126709581 16D CCCACAGCGA GCGCTTCCCTAGGGAG/---------------- GCTGCAGAAG 3070 hom 54 het 19 0 18 2 GCGCTTCCCTAGGGAG 1 0 143548 CASAVA_Build 10 126712019 1D ATTTCACAGC T/- TTAACACTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 3 2 143549 CASAVA_Build 10 126715067 1D ATTTAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 80 hom 30 1 23 6 A 10 9 143550 CASAVA_Build 10 126731651 3I GAAGAGAGAG ---/AGA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 AGA 0 1 143551 CASAVA_Build 10 126738816 1I GGAAAACAAA -/G GCTCTGGAGC 3070 hom 98 het 39 0 31 8 G 1 2 143552 CASAVA_Build 10 126741017 9I CGTGGGGACA ---------/GTGCCACCC ACTCTGAAGG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 GTGCCACCC 0 1 143553 CASAVA_Build 10 126742615 1I AAAATGCATT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 A 7 8 143554 CASAVA_Build 10 126743898 2I CACATGAATC --/TG TGTGCTTTTC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 TG 2 3 143555 CASAVA_Build 10 126749397 1I GCTAATTTTG -/T TATTTTTAGT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 1 2 143556 CASAVA_Build 10 126760683 1D GGCGTGCCCT C/- CCTGATGGCC 3070 het 2225 hom 29 8 18 3 C 3 2 143557 CASAVA_Build 10 126761149 6D AGCTTTCCTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2125 het 1985 hom 33 10 7 16 T 18 12 143558 CASAVA_Build 10 126803019 3I TGTCAGCAAC ---/AAT AATAAAAGTA 3070 hom 98 het 38 0 34 4 AAT 1 2 143559 CASAVA_Build 10 126808601 1D GATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2288 het 2288 ref 34 15 8 11 T 15 14 143560 CASAVA_Build 10 126813355 11D TCCCATCTTC CCCCAGCCTTT/----------- CCCTCCCAGC 2038 het 2038 ref 17 12 5 1 CCCCAGCCTTT 1 0 143561 CASAVA_Build 10 126833212 1D TGTCGTTGCT A/- AAAAAACTGA 3070 het 3070 ref 45 22 22 2 A 7 6 143562 CASAVA_Build 10 126834244 1I AGATAGGATT -/A AAAAAAAAAA 1707 het 1707 ref 33 23 4 6 A 13 14 143563 CASAVA_Build 10 126835953 1D GGTGGGGGTT A/- AAAAAAAAAA 2371 het 837 hom 25 4 5 16 A 13 12 143564 CASAVA_Build 10 126848351 2D CCCAGGGCTT TG/-- TGAGTTGCAA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 TG 2 1 143565 CASAVA_Build 10 126876460 1D CCCAGCAGAT A/- AAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 7 6 143566 CASAVA_Build 10 126896339 1D GGCTATAGTG C/- AGTGGCATGA 3070 hom 96 het 37 0 28 9 C 1 0 143567 CASAVA_Build 10 126896786 1D GGATAAGATG A/- AGGATCTAAT 3070 hom 113 het 43 0 38 5 A 2 1 143568 CASAVA_Build 10 126899664 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 0 1 143569 CASAVA_Build 10 126902856 1D GTACTTTTGG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 8 7 143570 CASAVA_Build 10 126904358 1D AGTTTATGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 9 143571 CASAVA_Build 10 126907341 2D GTGGGGAGTC AG/-- GGGAGGCATG 2742 het 2742 ref 35 17 8 10 AG 1 0 143572 CASAVA_Build 10 126907918 1D AATGGCTGCA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 138 het 56 0 53 3 T 7 6 143573 CASAVA_Build 10 126909614 1D CACCCTCTCA C/- CGTGCTGTGG 3070 hom 86 het 34 0 26 8 C 2 1 143574 CASAVA_Build 10 126918085 1I CATGACAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 8 9 143575 CASAVA_Build 10 126938175 1I TAGTTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 2202 het 5 hom 13 1 7 5 A 13 14 143576 CASAVA_Build 10 126939449 1I TCTCATAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 91 het 33 0 29 4 A 9 10 143577 CASAVA_Build 10 126960142 1I GAGGTGGTGA -/T GGGGAAGAGG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 0 1 143578 CASAVA_Build 10 127056889 1D AAGCAGAATG A/- AAAAAAAAAA 1459 het 1459 ref 43 30 4 10 A 13 12 143579 CASAVA_Build 10 127083429 1I TTGAAGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 29 1 25 3 T 10 11 143580 CASAVA_Build 10 127093564 1I CAGGATAGGC -/T TTTTTTTTTT 1266 het 1266 ref 41 28 4 9 T 11 12 143581 CASAVA_Build 10 127104599 1I GATGAAACTG -/C AAAAAAAAAA 3070 het 931 hom 44 3 39 2 C 0 1 143582 CASAVA_Build 10 127128139 1D CCATGTGTCA C/- CCAATGGAGG 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 C 3 2 143583 CASAVA_Build 10 127136914 7D AAGAATCTTT AAAACAA/------- AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 15 3 AAAACAA 3 2 143584 CASAVA_Build 10 127142357 1I TTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 8 9 143585 CASAVA_Build 10 127155622 1D TTTTTACGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2677 hom 28 10 13 5 T 12 11 143586 CASAVA_Build 10 127160778 1D ACCCTCCCCT A/- ACTAATAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 7 A 2 1 143587 CASAVA_Build 10 127162831 1I CTTGAACATT -/A AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 6 7 143588 CASAVA_Build 10 127164028 1I CACACAGAAA -/C CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 7 8 143589 CASAVA_Build 10 127170205 1I TTGTGTGGGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 21 18 3 T 8 9 143590 CASAVA_Build 10 127181245 2D TGCCATACAG TT/-- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 54 35 13 7 T 9 7 143591 CASAVA_Build 10 127213916 4D TGCCCGGGGC CAAG/---- CGCTTACGTA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 CAAG 1 0 143592 CASAVA_Build 10 127233439 3D TCTTCCCTCC CTT/--- CTTTCTTCCT 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 CTT 2 1 143593 CASAVA_Build 10 127234729 1D CAGAAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 9 9 A 11 10 143594 CASAVA_Build 10 127244406 1I AAGAAAACTG -/T TTTTTTTTTT 2832 het 2832 ref 27 14 10 3 T 13 14 143595 CASAVA_Build 10 127249767 1D TTTCAAAGTG A/- AAACTTGAAC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 4 3 143596 CASAVA_Build 10 127274757 1D TACAGCAAAA G/- GGACTTTGCC 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 G 3 2 143597 CASAVA_Build 10 127373882 4D TACAGTAAAT AGAC/---- AGCCTGACAG 3070 het 3070 hom 49 17 26 7 AGAC 1 0 143598 CASAVA_Build 10 127376079 8I GAAAAAAAAG --------/AAAGAGAA AGAAAAGAGA 943 het 943 ref 12 6 3 3 AAAGAGAA 0 1 143599 CASAVA_Build 10 127389511 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 13 12 143600 CASAVA_Build 10 127405596 1D TTGTACAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 43 0 36 9 T 10 9 143601 CASAVA_Build 10 127413753 1D TTAATGTAAT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 G 2 1 143602 CASAVA_Build 10 127427150 1I TGTTGATTTT -/C CCCCCCCCGT 3070 hom 55 het 23 0 17 6 C 8 9 143603 CASAVA_Build 10 127441049 1D GGACTCATTT A/- AAAAAAAAAA 1188 het 1188 ref 33 22 3 8 A 15 14 143604 CASAVA_Build 10 127496200 2I GATCTATTGA --/AC ACTTACTGCC 3070 hom 183 het 67 0 61 6 AC 1 2 143605 CASAVA_Build 10 127500879 1D CCCCGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 1946 het 1898 hom 26 9 7 10 T 15 14 143606 CASAVA_Build 10 127508565 1I ACAAAGGGCA -/G GGGGGTTCTC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 G 5 6 143607 CASAVA_Build 10 127519747 2I CCTCTCCTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TG 6 7 143608 CASAVA_Build 10 127569451 39D52M1D GCAACACAGT GAGACCCCGTCTCACTTAAAAAATAGAGGTCACTTAATAGAGACCCCGTCTCTATTAAAAAAACATATTTTTTAATGTATATACAGAAAGTC/---------------------------------------GAGACCCTGTCTCTATTAAAAAAACATATTTTTAAATGTATATACAGAAAGT- CCCCCCGAGC 3070 het 3070 ref 83 50 44 150 N/A 0 0 143609 CASAVA_Build 10 127577887 1D CCAAAGTGCT G/- GGATTACAGG 2753 het 2753 ref 53 31 11 13 G 3 2 143610 CASAVA_Build 10 127579198 11D TTTTTTTTGT TTGTTTGTTTG/----------- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 38 23 12 8 TTGTTTGTTTG 1 0 143611 CASAVA_Build 10 127582558 10D ACAGAATGTG ATCCCACAGC/---------- TGTGACCACA 3070 het 3070 hom 96 34 62 21 ATCCCACAGC 1 0 143612 CASAVA_Build 10 127583397 1D TCTCTTAAAA G/- TTTCTGGCCG 3070 het 2077 hom 83 6 57 20 G 1 0 143613 CASAVA_Build 10 127583534 1I AATACAACAA -/C AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 C 0 1 143614 CASAVA_Build 10 127583698 22D CCAAAAAAAA AAAAAAAAAAAACAAAAAAAAC/---------------------- GTTTCTGTAG 2196 het 2196 ref 32 16 16 39 AAAAAAAAAAAACAAAAAAAAC 1 0 143615 CASAVA_Build 10 127586785 1I GAACTCCTCA -/C CCTCAGGTGA 3070 het 3070 ref 85 46 23 16 C 2 3 143616 CASAVA_Build 10 127591873 39D65M4D TGACACCTAA ACTCAGGTGACACCTAAATGCTGCATGACACCCAAACTCATTCTGCATGACACCTAAACCCTTTAGCAGTCGGCCAAAAGGAGGAAGGAGGGCGTGTTTATGAAACAG/---------------------------------------ATGCTGCATGACACCTAAACCCTTTAGTAGTCGGCCAAAAGGAGGAATGAGGGCGTGTTTATGAA---- ACAGCTGTCG 738 het 738 ref 61 229 5 94 N/A 0 0 143617 CASAVA_Build 10 127592876 1I TGGTCTTTTT -/A ATGTGTCAGT 3070 het 3070 ref 79 23 25 31 A 1 2 143618 CASAVA_Build 10 127594827 8I ATCTCTTGAC --------/CTCGTGAT CCGCCTGCCT 3070 het 3070 hom 53 16 23 15 CTCGTGAT 0 1 143619 CASAVA_Build 10 127599065 3I TTCTGGAATA ---/GTC CTAGAAATAA 3070 het 3070 hom 65 26 31 8 GTC 0 1 143620 CASAVA_Build 10 127599330 4D10M1D22M2I TTGATTAGAA TTTGTTTTTTAAAAGGTTTAATATGAGTTTATATCTC--/----TTTTTTAAAA-GCTTAATATGAGTTTATATCTCTT TAAATATCAG 3070 het 3070 ref 63 58 26 45 N/A 0 0 143621 CASAVA_Build 10 127601710 3D9M2I TCAATTTTGA TTTTTTTTTTCC--/---TTTTTTTCCCT AAAAATTCAT 2950 het 2950 ref 31 18 7 10 N/A 0 0 143622 CASAVA_Build 10 127602885 25D CAATCTCGGC TCACTGCAACCTCCAGCTCCTGGGT/------------------------- TCAAGCAATT 3070 het 3070 hom 26 13 14 0 TCACTGCAACCTCCAGCTCCTGGGT 1 0 143623 CASAVA_Build 10 127606277 1I GCTTGGCTAA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 96 15 74 28 T 8 9 143624 CASAVA_Build 10 127616854 1D ATTTATGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 A 10 9 143625 CASAVA_Build 10 127633139 1D AGTTCATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 443 hom 24 1 19 4 T 10 9 143626 CASAVA_Build 10 127652381 2I TGTTGTTGAG --/GT GTGGTGTATG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GT 1 2 143627 CASAVA_Build 10 127661476 1D ACTTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 16 10 T 12 11 143628 CASAVA_Build 10 127673580 1I GCACTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 39 3 27 9 T 12 13 143629 CASAVA_Build 10 127682238 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 8 9 143630 CASAVA_Build 10 127686248 2I GCGTGTGTGC --/AT ACACACGAGT 3070 hom 105 het 46 0 34 24 AT 0 1 143631 CASAVA_Build 10 127690465 1I CTTAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 927 hom 31 2 26 3 A 10 11 143632 CASAVA_Build 10 127692986 1D CATAAAAATG C/- CCCCCCCCCG 3070 hom 65 het 31 0 19 12 C 10 9 143633 CASAVA_Build 10 127693393 1I ACAGTCTTTT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 143634 CASAVA_Build 10 127700215 4I AGAGCACGGA ----/TTGT TTGTTTATAT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TTGT 1 2 143635 CASAVA_Build 10 127704017 3I GAAGACTATC ---/CTT CTGAAATAAG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 CTT 0 1 143636 CASAVA_Build 10 127705975 1I TGGGAGAGAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 172 hom 25 1 16 8 A 9 10 143637 CASAVA_Build 10 127712259 10D GCAGATCTCT ACTTTCTATC/---------- ACTTCTTGCA 3070 hom 136 het 48 0 43 12 ACTTTCTATC 1 0 143638 CASAVA_Build 10 127714521 1I ACTCTTATTA -/T TTATACTCCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 143639 CASAVA_Build 10 127722838 1I TTATAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 1945 hom 15 het 11 0 6 5 A 13 14 143640 CASAVA_Build 10 127749758 1D AGCTAAACAC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 T 8 7 143641 CASAVA_Build 10 127752104 1D GATCCTCTCC T/- TTCCCAGTGT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 3 2 143642 CASAVA_Build 10 127752959 1D CATTCCTTTC A/- AAGCAACAAA 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 A 3 2 143643 CASAVA_Build 10 127759274 1D AAAATAAAAA G/- AGGATGAAAC 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 G 1 0 143644 CASAVA_Build 10 127759658 1I CTGGATTCAA -/G GGGGGCTGCA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 G 5 6 143645 CASAVA_Build 10 127759940 1D TGATTGGGGG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 7 6 143646 CASAVA_Build 10 127764096 4D TCTGTCCATT TCTA/---- TCTATCCATT 3070 het 3070 ref 63 31 19 15 TCTA 2 1 143647 CASAVA_Build 10 127765588 1I CGAGGCTCAG -/T CTCAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 0 1 143648 CASAVA_Build 10 127767107 1I TAAATATACC -/A AAAAAAAAAA 2774 het 119 hom 14 1 10 3 A 13 14 143649 CASAVA_Build 10 127767284 7I AAACAAAAAC -------/AAAAAAA AAAAAGAGAG 3070 hom 73 het 29 0 25 4 A 5 12 143650 CASAVA_Build 10 127769707 1D AGGAATTCTG A/- AAAAAGCCTT 3070 het 3070 hom 36 12 17 8 A 6 5 143651 CASAVA_Build 10 127770171 1D GTAATGGGGG A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 8 7 143652 CASAVA_Build 10 127796435 18D TATGGTTGTG TCCCACTGTATAATGTCT/------------------ ACCACCTCCA 3070 het 3070 ref 50 31 18 9 TCCCACTGTATAATGTCT 1 0 143653 CASAVA_Build 10 127800054 5D ATGTAACAAT ATATA/----- ATATAATAGA 2932 het 1102 hom 9 3 6 0 ATATA 2 1 143654 CASAVA_Build 10 127805132 1I AGTAAGCCAT -/G GGAGAGCCAA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 G 2 3 143655 CASAVA_Build 10 127808748 1D TCTAGTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 11 10 143656 CASAVA_Build 10 127818496 2D AGCATGATAA TT/-- CTCTGACTAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 2 0 143657 CASAVA_Build 10 127820328 4I GGAATGCTAC ----/CAGA CAAAGTCTGT 3070 het 3070 ref 50 26 19 5 CAGA 0 1 143658 CASAVA_Build 10 127821249 1I CCTAAAATCC -/A ATACATGGGC 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 A 1 2 143659 CASAVA_Build 10 127821950 4D TGTGTGTATA TGTT/---- TGTATATGGT 3070 het 3070 hom 54 22 28 8 TGTT 1 0 143660 CASAVA_Build 10 127822151 2I10M2D21M2I TGTGTGTATA --TGCATGTATCTGTATGTATATGGGGGTGCGTGG--/TGTGCATGTATC--TATGTATATGGGGGTGCGTGGGT GTGTGTGTAT 3070 het 3070 ref 54 43 22 15 N/A 0 0 143661 CASAVA_Build 10 127824022 10D GAACTGGAGG CAGTGTAGCA/---------- CAGCATATAG 3070 het 3070 ref 50 29 21 6 CAGTGTAGCA 1 0 143662 CASAVA_Build 10 127826697 1I CAGTCGAGAG -/A AAAAGATGTG 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 4 5 143663 CASAVA_Build 10 127827428 1D CTTCCCAGCC A/- AAAGCCTCAG 3070 hom 100 het 38 0 30 8 A 4 3 143664 CASAVA_Build 10 127833964 1I TGTGACCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 13 16 T 13 14 143665 CASAVA_Build 10 127836399 1D CCCTGTCACG C/- AGTCATGAGC 3010 het 3010 ref 33 14 11 8 C 1 0 143666 CASAVA_Build 10 127836773 1D ACACAGGACA T/- ATCTGCAGAG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 1 0 143667 CASAVA_Build 10 127881851 1I TTAATATGTC -/A TATGCCTTCC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 0 1 143668 CASAVA_Build 10 127883891 1D AAGTATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 32 1 28 4 A 13 12 143669 CASAVA_Build 10 127899949 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 22 0 12 10 A 18 16 143670 CASAVA_Build 10 127908013 4D CCTTTTAAAA TTGT/---- TTGTAGAATA 3070 het 3070 ref 23 12 10 4 TTGT 2 1 143671 CASAVA_Build 10 127908503 2I GGTGCTCAAC --/TG GAGTTGTGCT 3070 het 3070 hom 45 19 17 9 TG 0 1 143672 CASAVA_Build 10 127930086 12D GGGATGGACA GGATGGATAGAT/------------ GGATGGATAG 3070 het 3070 hom 75 28 38 19 GGATGGATAGAT 1 0 143673 CASAVA_Build 10 127936944 20D CCCACTGCCT CCGTGCCCCACACGCCCCAC/-------------------- CCGTGCCCCA 3070 het 3070 hom 33 9 17 10 CCGTGCCCCACACGCCCCAC 2 1 143674 CASAVA_Build 10 127939126 1I CCTCATTCTG -/A AACATACAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 3 143675 CASAVA_Build 10 127942044 1D TTTTTGTTTG T/- TTTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 T 4 3 143676 CASAVA_Build 10 127970538 1D GGGGTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 192 hom 48 2 37 9 T 11 10 143677 CASAVA_Build 10 127979488 1D TTCAGTTTGA T/- TTGCTTAATG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 3 2 143678 CASAVA_Build 10 127986798 1I CAGTTTTATC -/T TTTGCAAACT 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 T 3 4 143679 CASAVA_Build 10 127992168 4D CCATCCATCC ATCT/---- GTCCATCTGT 3070 het 3070 hom 51 20 22 11 ATCT 1 0 143680 CASAVA_Build 10 127996179 1I TTAAGAAATG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 7 8 143681 CASAVA_Build 10 128004764 1D CCGGGGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 14 13 143682 CASAVA_Build 10 128005662 2D AAGAATGCAC AT/-- GAGGAGAGAA 3070 het 3070 ref 53 21 19 14 AT 1 0 143683 CASAVA_Build 10 128007689 1I ACAAATACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 13 14 143684 CASAVA_Build 10 128028810 1D AGGGCTGGGT G/- GGGAGCAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 G 4 3 143685 CASAVA_Build 10 128033008 10I GCATGCAGTA ----------/GGCACTCAAT GAACGTCTGC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 GGCACTCAAT 0 1 143686 CASAVA_Build 10 128045018 1D AACTACAGCT A/- AAAAAGGGAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 7 A 6 5 143687 CASAVA_Build 10 128054469 1D CATATATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1682 hom 28 6 16 6 T 12 11 143688 CASAVA_Build 10 128060534 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1955 hom 26 7 12 7 A 13 12 143689 CASAVA_Build 10 128076709 1I CACTCTGGGT -/G GGGGGGGTTA 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 G 7 8 143690 CASAVA_Build 10 128086719 1D TTTTTCCAGT G/- AGACGCACAT 3070 het 123 hom 29 1 26 3 G 1 0 143691 CASAVA_Build 10 128090094 2D CACAAGTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 2716 het 2716 ref 29 12 11 6 T 12 10 143692 CASAVA_Build 10 128098828 2D ACATGCTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 805 hom 41 4 15 22 A 16 14 143693 CASAVA_Build 10 128107223 1D ATTATTTTAA T/- TGCTTAGTTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 2 1 143694 CASAVA_Build 10 128115359 2D AATAGCAGGG TT/-- TTTGTTGTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 T 5 3 143695 CASAVA_Build 10 128125396 1D ATTTGTTAAG A/- AAAAAATATA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 6 143696 CASAVA_Build 10 128126410 3D TTGTTGTTGT TGC/--- TGCTTTTGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TGC 2 1 143697 CASAVA_Build 10 128128552 1D ACGCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1146 het 1146 ref 20 13 4 4 A 17 16 143698 CASAVA_Build 10 128132043 2D GACGGCTTTG TA/-- GAAGAAGGGG 3070 het 3070 hom 46 19 19 9 TA 1 0 143699 CASAVA_Build 10 128142497 14I GATTAACTTG --------------/TGTTCCAAGTGAAA TTACTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 21 23 0 TGTTCCAAGTGAAA 0 1 143700 CASAVA_Build 10 128144594 1I TTGTACTCTT -/C GATTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 C 0 1 143701 CASAVA_Build 10 128150502 2I ACACACACAC --/AT GTGCACACAC 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 AT 0 1 143702 CASAVA_Build 10 128169450 1D AAAAGTACGT A/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 7 6 143703 CASAVA_Build 10 128172157 1I CGCAGGTGAT -/C CGCCCACCTC 2364 het 2364 ref 27 16 7 4 C 1 2 143704 CASAVA_Build 10 128190126 1D AGAATCGCTG T/- TTTTTTTTTT 1133 het 1133 ref 34 24 3 7 T 11 10 143705 CASAVA_Build 10 128195432 17I AGCTTGTAGA -----------------/GGCTACCAGCATTCCTT GGCTCACAGC 3070 hom 105 het 38 0 32 7 GGCTACCAGCATTCCTT 0 1 143706 CASAVA_Build 10 128196620 2D CTCTTGTATG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 53 het 25 0 17 10 T 11 9 143707 CASAVA_Build 10 128198891 17D GTCCTCCAAA ACTCAAATGCAAGGGAT/----------------- TCGTTTCTCC 3070 hom 99 het 37 0 33 8 ACTCAAATGCAAGGGAT 1 0 143708 CASAVA_Build 10 128205666 7D GTATGATCAC ACCACAT/------- ACCACATTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 7 ACCACAT 2 1 143709 CASAVA_Build 10 128223409 1D AGTGGTGGGG A/- GGACTTTGAT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 A 1 0 143710 CASAVA_Build 10 128224163 2D TTAAATGGGA CT/-- CTCTCCTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 CT 3 2 143711 CASAVA_Build 10 128225974 2D CAAGACTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 860 hom 12 3 9 0 A 14 12 143712 CASAVA_Build 10 128226058 1I TAACTGAGTG -/A AAAAAAAAAA 2259 het 2259 ref 29 13 7 9 A 15 16 143713 CASAVA_Build 10 128228304 1I TCATAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 39 4 20 15 A 17 18 143714 CASAVA_Build 10 128234080 3D CAAAAAAAAA AAC/--- AAAAAATTAG 1639 het 1639 ref 19 10 4 5 AAC 1 0 143715 CASAVA_Build 10 128234410 12D ATGAATGGTT AATTCACTTCAG/------------ AAGTTACTTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 AATTCACTTCAG 1 0 143716 CASAVA_Build 10 128239647 1I TTCCTGTCAC -/T TGGTTTTTAC 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 T 1 2 143717 CASAVA_Build 10 128258319 1D TAAAGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 A 12 11 143718 CASAVA_Build 10 128259505 2I GTTCTTGGCC --/CT ATTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 66 34 26 6 CT 0 1 143719 CASAVA_Build 10 128260086 1I CAGGTCAGTC -/A ATGTTTCCTC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 1 2 143720 CASAVA_Build 10 128299303 1D TGGGGGCTAG A/- AAAAAAAAAA 2193 het 2193 ref 42 27 6 9 A 13 12 143721 CASAVA_Build 10 128314471 2I AGTTTGAGAG --/AC ACAGACACTT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 AC 1 2 143722 CASAVA_Build 10 128340230 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2216 hom 31 6 10 15 T 13 12 143723 CASAVA_Build 10 128347566 10I AGCTATGAAC ----------/ACTTTTGTAA AATGCATAAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ACTTTTGTAA 0 1 143724 CASAVA_Build 10 128348263 1D ACTCTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 994 hom 40 4 22 14 T 15 14 143725 CASAVA_Build 10 128354809 3D TGCAATCATC CTT/--- CTAAAACAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 3 CTT 1 0 143726 CASAVA_Build 10 128376000 3D AATTCCCACA TGT/--- TGTGGGAGGG 2841 het 2841 ref 20 8 9 4 TGT 2 1 143727 CASAVA_Build 10 128377576 8I AAATGAAAAC --------/AGAAAATT ATGTAATATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AGAAAATT 0 1 143728 CASAVA_Build 10 128393425 2D GGGGAGCTCC TT/-- TTATAGCACA 3070 hom 72 het 32 0 22 11 T 4 2 143729 CASAVA_Build 10 128402572 3I AGGTAATAAC ---/GAT GACCTTACCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 GAT 0 1 143730 CASAVA_Build 10 128404030 8I CTGTTCAATT --------/ATGTCTCA CCCACCTATG 2503 hom 15 het 6 0 6 0 ATGTCTCA 0 1 143731 CASAVA_Build 10 128407305 1D ATTTGGCATA C/- CCTTCAAAAA 3070 het 3070 ref 47 19 20 9 C 3 2 143732 CASAVA_Build 10 128428859 6D ATATATATAT ATATAC/------ ACACACACAT 3070 hom 69 het 24 0 24 3 ATATAC 1 0 143733 CASAVA_Build 10 128430159 4D TATTACTAAG TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 TATT 7 6 143734 CASAVA_Build 10 128431320 4D CTCTTCTTTT CTTG/---- CTTAATCTTG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CTTG 1 0 143735 CASAVA_Build 10 128435080 6I GCTCACTGCA ------/ACCTCC ACCTCCTGGG 3070 hom 44 het 16 0 13 3 ACCTCC 1 2 143736 CASAVA_Build 10 128436324 2D TGCAATTAAT TG/-- TGAACCTGTA 3070 het 3070 ref 31 14 11 7 TG 2 1 143737 CASAVA_Build 10 128436823 1I CTCAAAGCTG -/C CCCCCCCAAT 3070 hom 63 het 27 0 19 8 C 7 8 143738 CASAVA_Build 10 128440259 1I CTATTTCTCC -/A AAATCTTCTC 1812 het 1812 ref 10 5 4 1 A 3 4 143739 CASAVA_Build 10 128456974 1D TCCAGTACTC A/- AAAAAATCTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 7 6 143740 CASAVA_Build 10 128459308 4D TTCTCGTGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 hom 25 8 15 3 AGTG 2 1 143741 CASAVA_Build 10 128460731 1D ATACGTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 819 hom 35 2 30 3 A 11 10 143742 CASAVA_Build 10 128468273 3D AAAAATGAAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 T 14 11 143743 CASAVA_Build 10 128471600 1D CCATTCATGA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 4 3 143744 CASAVA_Build 10 128472189 1I CAAGCCACAT -/G TAGAAGAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 143745 CASAVA_Build 10 128473390 1D ACTATTGAAA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 72 hom 38 1 33 4 T 4 3 143746 CASAVA_Build 10 128479639 4I CACTATGTAT ----/ACAA ACAAAGTCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ACAA 1 2 143747 CASAVA_Build 10 128481740 1D TGAATACCCC A/- AAAAATGCAA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 6 5 143748 CASAVA_Build 10 128486485 4D GTTGAAAGAC AGAA/---- AGAGAAGTGC 3070 het 3070 ref 52 25 26 3 AGAA 1 0 143749 CASAVA_Build 10 128487770 1D CAACTCAATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 9 8 143750 CASAVA_Build 10 128488540 1D AACCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2967 het 2967 ref 26 12 7 8 A 13 12 143751 CASAVA_Build 10 128488683 1I ACTCAGCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 9 10 143752 CASAVA_Build 10 128490679 2I CCATTGAAAG --/AA AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 7 9 143753 CASAVA_Build 10 128490760 1D AAAGAACAAT A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 7 6 143754 CASAVA_Build 10 128490879 1D ATTTGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2791 hom 28 10 10 8 A 12 11 143755 CASAVA_Build 10 128491047 2I AAAATCTAAC --/AT ATAAGAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AT 1 2 143756 CASAVA_Build 10 128494621 1D GTAGCGGGTA G/- GGGGGACAGG 3070 het 1995 hom 31 8 13 10 G 6 5 143757 CASAVA_Build 10 128496468 1D ATCAATAGTC A/- AAAAGAGGTC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 5 4 143758 CASAVA_Build 10 128502471 1D AATGTGGATG A/- ACCTTGAACA 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 A 2 1 143759 CASAVA_Build 10 128513185 1D GTATATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 37 1 32 4 T 11 10 143760 CASAVA_Build 10 128519841 1I CTGGTTCTAT -/A ACCCCCACAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 1 2 143761 CASAVA_Build 10 128521095 2D AGCCAGAAGA GG/-- GGGGATCTCC 3070 hom 72 het 30 0 25 8 G 6 4 143762 CASAVA_Build 10 128521391 1I AAATGTTAAA -/T ATTGGCCTCT 3070 hom 72 het 30 0 23 7 T 0 1 143763 CASAVA_Build 10 128529979 1D TTACGCTCAG A/- AAAGCAGCTC 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 A 4 3 143764 CASAVA_Build 10 128530802 1D TAGAACTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 10 9 143765 CASAVA_Build 10 128543729 8I AGGGAGATTA --------/TCCTGAAT TCCTGAATTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TCCTGAAT 1 2 143766 CASAVA_Build 10 128544902 1D AACTTGGCTA T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 7 6 143767 CASAVA_Build 10 128545046 18D ATTTCTTTTC TTTTCTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTGA 3070 het 1458 hom 22 6 12 4 TTTTCTTTTTTTTTTTTT 1 0 143768 CASAVA_Build 10 128546437 1D GCTTTATAAG A/- AGCCCAACAG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 2 1 143769 CASAVA_Build 10 128550209 1I GGGAGGCCAA -/G GGGGGGCGGA 3070 hom 71 het 30 0 22 8 G 6 7 143770 CASAVA_Build 10 128557816 1I CTTTCAAGCA -/G AGGGGAAGAG 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 G 0 1 143771 CASAVA_Build 10 128567066 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1352 het 552 hom 11 2 3 6 T 15 14 143772 CASAVA_Build 10 128570635 1D CACACACACA C/- CATATACAAC 567 het 567 ref 24 6 2 17 C 2 1 143773 CASAVA_Build 10 128575960 3I AAAAACAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 1970 hom 30 5 20 5 AAC 3 4 143774 CASAVA_Build 10 128581209 3I TCCACCTGGA ---/GTT GTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 GTT 1 2 143775 CASAVA_Build 10 128585699 1D CGAGAGGTTC G/- GGGTGGATAT 3070 hom 83 het 31 0 27 4 G 4 3 143776 CASAVA_Build 10 128591547 1I GGCCTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 2084 het 2084 ref 39 14 9 16 T 15 16 143777 CASAVA_Build 10 128591883 4I ATGAGTAGGG ----/CAGC CAGCCTCATA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 CAGC 1 2 143778 CASAVA_Build 10 128600191 4D GAGGACGGGT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 GA 7 5 143779 CASAVA_Build 10 128692494 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 337 het 337 ref 22 11 2 9 A 11 12 143780 CASAVA_Build 10 128699968 4D TGTAGTCACT TGAG/---- GGACTATTGT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TGAG 1 0 143781 CASAVA_Build 10 128705178 2D CACCACACAC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 73 35 20 19 CA 8 7 143782 CASAVA_Build 10 128705445 4I CACCACACAT ----/ACAC ACACACGCAC 3070 het 3070 ref 63 31 24 8 AC 3 5 143783 CASAVA_Build 10 128715868 1D AAAAAAAACA T/- TAAACCTTCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 1 143784 CASAVA_Build 10 128723119 1D GACCCTGGAG A/- AAGGGGACTG 3070 hom 155 het 60 0 44 16 A 3 2 143785 CASAVA_Build 10 128727002 1I GGCCGGAGGT -/C CCTGGGAGCA 3070 hom 104 het 40 0 35 5 C 2 3 143786 CASAVA_Build 10 128727544 1D AAACTAGGTG A/- AATACATGAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 3 2 143787 CASAVA_Build 10 128735455 1I TTATGAACAA -/G GATTATTATT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 G 1 2 143788 CASAVA_Build 10 128735866 1I ACTACTGCCC -/A AAAACAAGAC 3070 hom 101 het 35 0 34 1 A 4 5 143789 CASAVA_Build 10 128737320 1I TTCACGTTGA -/T TTTTGTATAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 5 143790 CASAVA_Build 10 128738660 7D ATTGCCACTT TACCCTC/------- TAAAAAATTT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 TACCCTC 1 0 143791 CASAVA_Build 10 128754110 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 9 8 143792 CASAVA_Build 10 128756734 2I CGTCTTTATA --/TG TGTGTTCCAG 2102 hom 20 het 24 0 7 17 TG 2 3 143793 CASAVA_Build 10 128806495 13D CAAGCCACAT CCTTGATGTACCC/------------- CCTTCCACCT 3070 hom 149 het 51 0 49 5 CCTTGATGTACCC 1 0 143794 CASAVA_Build 10 128807304 1I GGAATCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 22 0 19 3 T 12 13 143795 CASAVA_Build 10 128809481 1D CCCCTCCTCC T/- TTTTTTTTTT 1592 het 193 hom 20 3 7 10 T 15 14 143796 CASAVA_Build 10 128810884 1I GTTATAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1508 hom 38 7 16 15 T 16 17 143797 CASAVA_Build 10 128811537 1D ATTCAGCTTG T/- TTTCCAGAAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 4 3 143798 CASAVA_Build 10 128814677 1D TTTCAGGGAC T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 6 5 143799 CASAVA_Build 10 128816591 1D TCTCGTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 37 1 20 17 T 14 13 143800 CASAVA_Build 10 128819930 3I TTTTAAAGTC ---/GTT GTTGCTCTGT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 GTT 1 2 143801 CASAVA_Build 10 128829931 1I TCTTTAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2689 het 2689 ref 35 12 12 11 A 15 16 143802 CASAVA_Build 10 128837964 2I AGGGTATGAC --/AA ATTACAATGT 3070 hom 132 het 49 0 43 6 A 1 3 143803 CASAVA_Build 10 128838633 5I AGGGAAGTGA -----/CCTGT CCCTGTGTAT 3070 hom 182 het 67 0 57 10 CCTGT 0 1 143804 CASAVA_Build 10 128840265 2D CAGTGTTCAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 102 het 47 0 35 12 AT 7 6 143805 CASAVA_Build 10 128852054 1D AAAGCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1752 het 1752 ref 40 17 7 16 T 19 18 143806 CASAVA_Build 10 128861497 2D ATTCCATCCC CT/-- GTCTGCAGGA 3070 het 3070 hom 51 15 32 6 CT 1 0 143807 CASAVA_Build 10 128878920 9D ATCCTATCTT CCCCCCCCC/--------- CCCCCCCCCG 1959 het 77 hom 16 1 6 11 C 18 9 143808 CASAVA_Build 10 128883162 3D TAAACCGCTT CAC/--- CGCTGCTTCT 3070 hom 83 het 33 0 25 8 CAC 1 0 143809 CASAVA_Build 10 128891900 4D TCCGTAAACG TTTT/---- TTTTTTTTTT 2821 het 596 hom 41 8 8 26 T 16 12 143810 CASAVA_Build 10 128897444 1I GAAGGTTTCA -/T GTTCTTTACA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 0 1 143811 CASAVA_Build 10 128908722 1D AATTTCAGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 10 9 143812 CASAVA_Build 10 128914753 1I ATCTCAGCAC -/T TTTGGGAGCC 3070 hom 48 het 20 0 15 5 T 3 4 143813 CASAVA_Build 10 128923620 1D TAGAACGACA T/- TAAAAATGGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 143814 CASAVA_Build 10 128924043 1D GTGGTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 11 10 143815 CASAVA_Build 10 128928526 1I TAGTTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 34 2 24 8 T 13 14 143816 CASAVA_Build 10 128950284 2D ATGTGTGTGC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 62 27 20 16 AT 1 0 143817 CASAVA_Build 10 128950850 1D TTATTGCCTT C/- ATGTGGTAAG 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 C 1 0 143818 CASAVA_Build 10 128951509 1D5M8D6M9D13M3I3M10D15M10I5M4I10M12I4M2I20M2D AGAAAAATCA CGTCTCCCTAGCATTGTCATAAAGTAATCCTCTTATGGAAAT---TGCAGATACCATATTCTATGTCTTTATC----------TACCT----GCCATATATG------------TGTA--TATATAGATTGCCTCTTACTAG/-GCCTC--------TGTGGT---------CTCTTATGTATTTGTGTGC----------TTGTTTGTCTTTGTCTCTGTGAACATACCTTTTCTCGATACACGGGGCTTGTAAAATGTAATTAAAGACAATGTCTATTAGT-- ATTGGTGATA 3070 het 3070 ref 48 64 11 9 N/A 0 0 143819 CASAVA_Build 10 128951981 3D GACTTGCTCG GAT/--- TCACGCTTTG 3070 het 3070 hom 56 21 25 10 GAT 1 0 143820 CASAVA_Build 10 128960178 2I CTTTAAGATC --/TA TATTAGCCAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 TA 1 2 143821 CASAVA_Build 10 128965484 1D CTATACAATT A/- TAAACATTAT 1905 het 1905 ref 27 20 4 5 A 1 0 143822 CASAVA_Build 10 128976017 2I TGTTTTTCTG --/TC TCTCTTATAA 3070 hom 133 het 58 0 43 15 TC 2 3 143823 CASAVA_Build 10 128982905 2D AGTTGTCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2456 het 2159 hom 25 12 9 4 T 16 14 143824 CASAVA_Build 10 128997715 1D CGGTTGTCAA T/- TTTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 T 6 5 143825 CASAVA_Build 10 129002143 2I TGCTCGTATT --/TG TGTTTGATCC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 TG 1 2 143826 CASAVA_Build 10 129005333 1D AGGAAAGCTA T/- TTTTGAGACT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 T 5 4 143827 CASAVA_Build 10 129005971 1D GATAATGAAC T/- TGGCCAGCTT 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 T 2 1 143828 CASAVA_Build 10 129008388 22D TCAGTCCCAG TAGCCGTCTAAGAGCAGAAGCT/---------------------- TCTGGGGCCT 3070 het 3070 ref 40 21 17 6 TAGCCGTCTAAGAGCAGAAGCT 1 0 143829 CASAVA_Build 10 129010442 4D ATAATTTCCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1903 hom 24 8 9 8 T 16 12 143830 CASAVA_Build 10 129010793 1I TAACTGATGA -/C CCCAATCCAG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 C 3 4 143831 CASAVA_Build 10 129011305 11D CTGGATGATT GATCAATGCTC/----------- GATCAATGCG 3070 het 3070 ref 48 20 19 12 GATCAATGCTC 1 0 143832 CASAVA_Build 10 129023823 1I TTTTTTTGAG -/A ATGGAGTCTT 2406 het 1933 hom 11 5 6 0 A 1 2 143833 CASAVA_Build 10 129031038 1D2M1D AAACCGCATA TATG/-AT- TAGTCCATAA 3070 het 3070 hom 28 12 16 1 N/A 0 0 143834 CASAVA_Build 10 129036890 1I CAGTTTTGGC -/G GGGGTGGGTG 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 G 4 5 143835 CASAVA_Build 10 129038561 1I TCACGGTGCA -/T CCCCTCACCC 1338 het 1338 ref 13 4 4 5 T 0 1 143836 CASAVA_Build 10 129042254 3I TATTTTTAAT ---/ATA ATCAGCTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 ATA 0 1 143837 CASAVA_Build 10 129047398 1D TGCAAATGTC A/- AAAAAAAAAA 1374 het 1374 ref 37 26 4 8 A 12 11 143838 CASAVA_Build 10 129051091 12D34M8I12M2I ACCCACACAT ACACACACACACACACATGTACATCCCCACACACACACATACACAT--------CCCCACACACAC--/------------ACACATGCACGTCCCCACACACACACATACACATACACATCCCCCCACACACACAT ACACATGTAC 3070 het 3070 ref 34 43 16 27 N/A 0 0 143839 CASAVA_Build 10 129054931 1I TGTCGGTGAT -/G GTGGGCGAAT 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 G 1 2 143840 CASAVA_Build 10 129061739 1I TGCGCTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 9 10 143841 CASAVA_Build 10 129073347 3D TTTTAAAAAA AAT/--- CAATAGCCCT 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 AAT 1 0 143842 CASAVA_Build 10 129073714 1I GTTTCAGAAG -/T TTTTTAAAAC 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 T 5 6 143843 CASAVA_Build 10 129074644 11D CACAGCAGCA GGTGAGCAACG/----------- GGTGAGCAAG 3070 het 3070 ref 37 14 16 10 GGTGAGCAACG 1 0 143844 CASAVA_Build 10 129077130 3I CAGGTGAGTC ---/GGG TAACAATCAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 G 0 3 143845 CASAVA_Build 10 129079871 1D CTTAGGGAAT A/- GCGAGCCTTC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 1 0 143846 CASAVA_Build 10 129080505 1D CAGCTGGTCT G/- GGGTGGGCCT 2812 het 2812 ref 28 12 10 6 G 4 3 143847 CASAVA_Build 10 129082149 1I CCCGAGCTAA -/T TAATGACTCC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 1 2 143848 CASAVA_Build 10 129084040 2D TAGCAGATTC CA/-- CAGTGTCAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 CA 2 1 143849 CASAVA_Build 10 129085009 1D TCTCTGTTAC A/- AAAAAAAAAA 2422 het 407 hom 19 4 9 6 A 19 18 143850 CASAVA_Build 10 129088973 1D TCACCTTTGC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 A 8 7 143851 CASAVA_Build 10 129095963 5I TGTCCAGGAA -----/TGACT TGACTGCAGA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 TGACT 1 2 143852 CASAVA_Build 10 129097144 1D ACGCAAGTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 11 hom 20 1 11 8 A 9 8 143853 CASAVA_Build 10 129105177 1I GCTGGCCACA -/C CCAGTGCATC 3070 hom 108 het 43 0 33 10 C 2 3 143854 CASAVA_Build 10 129124887 1D CTTTTTTTTT C/- AATCTGTATC 3070 het 3070 ref 24 10 12 2 C 1 0 143855 CASAVA_Build 10 129131568 17I CCAAGAGACC -----------------/AATTAGTAAAGTAGGGA AATTAGTAAA 3070 het 3070 ref 40 18 15 8 AATTAGTAAAGTAGGGA 0 1 143856 CASAVA_Build 10 129134519 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2201 het 2201 ref 21 11 9 1 A 11 12 143857 CASAVA_Build 10 129137057 1I TGAGACATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 28 1 18 9 T 11 12 143858 CASAVA_Build 10 129141982 1I TTGTATTTAT -/A AAAAAATAAA 1441 het 1441 ref 10 4 4 2 A 6 7 143859 CASAVA_Build 10 129144242 6D GCATTCTCTC CTCTCT/------ CTCTCTCTCT 2915 het 524 hom 32 6 12 16 CT 12 9 143860 CASAVA_Build 10 129145964 1I AAAGCTGTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2796 hom 35 8 24 3 T 9 10 143861 CASAVA_Build 10 129146411 1D TGACAAAGCC T/- TCAGGCCATG 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 T 2 1 143862 CASAVA_Build 10 129168785 3D GTAATCAACA GGC/--- GGCTGGACAC 3070 het 3070 hom 35 18 15 2 GGC 2 1 143863 CASAVA_Build 10 129168976 1D ATTTCCTATC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 T 8 7 143864 CASAVA_Build 10 129175457 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 10 11 143865 CASAVA_Build 10 129179139 2D TGGAGGTGAC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 T 11 9 143866 CASAVA_Build 10 129179590 1D TCCAACTCTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 8 7 143867 CASAVA_Build 10 129180910 1I CTCATAACTA -/T TTTTATAATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 4 5 143868 CASAVA_Build 10 129183012 2D AAAGTAAAAC AG/-- GGAATTTAAA 3070 het 3070 ref 50 26 19 7 AG 1 0 143869 CASAVA_Build 10 129183106 4I GGATGTTTGT ----/TTAA TTGTTTTCTG 3070 het 3070 hom 49 24 21 4 TTAA 0 1 143870 CASAVA_Build 10 129204154 1I AATAAATGAC -/G GACAGAGCCT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 G 1 2 143871 CASAVA_Build 10 129217922 1I CTTTAAAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 9 10 143872 CASAVA_Build 10 129218565 1I TCTGTCTTAC -/A AAAAAAAAAA 3069 het 862 hom 23 3 9 11 A 12 13 143873 CASAVA_Build 10 129223917 1I AAAGAGCTTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 8 9 143874 CASAVA_Build 10 129224761 1I CAAAAATGGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 8 9 143875 CASAVA_Build 10 129227112 1I CTTACGGCCC -/T TTTTTGGCCT 3070 hom 86 het 32 0 27 5 T 5 6 143876 CASAVA_Build 10 129234605 1I ATGATACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 121 hom 27 1 22 4 T 10 11 143877 CASAVA_Build 10 129234727 1I TTTTCTCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 544 hom 33 2 22 9 T 9 10 143878 CASAVA_Build 10 129234822 1D GAGCTTTTTC A/- TGAGTCCTCA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 1 0 143879 CASAVA_Build 10 129239511 1D9M3I AAAAGGGGGG AAAAAGCCCA---/-AAAAGCCCATTT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 20 15 4 N/A 0 0 143880 CASAVA_Build 10 129241042 1I TAAATTGAGT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 7 8 143881 CASAVA_Build 10 129241830 1I GTGTTCGCTG -/T TAAGCCACAC 3070 het 3070 ref 61 28 26 7 T 1 2 143882 CASAVA_Build 10 129243855 1D AAGCTCATGG T/- TAAGTGTGGT 3070 het 3070 ref 51 25 21 6 T 2 1 143883 CASAVA_Build 10 129246150 1I CCTTAAAAAA -/C AAACAAAGAG 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 C 0 1 143884 CASAVA_Build 10 129256265 1D ACCCCACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2153 hom 19 6 11 2 T 12 11 143885 CASAVA_Build 10 129259365 4I TGTTTTTTGA ----/AAAC AAACTGTAAT 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 AAAC 1 2 143886 CASAVA_Build 10 129260908 1I GTGACTACTT -/C TCCCCTGTGC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 143887 CASAVA_Build 10 129261015 1D TGCAGAGATA C/- TCTACTGAGA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 C 1 0 143888 CASAVA_Build 10 129277343 2D AGCACCTACT AG/-- AGAGTCAGGC 3070 hom 105 het 36 0 36 2 AG 3 2 143889 CASAVA_Build 10 129282966 2I AGAAAATGTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 AT 7 8 143890 CASAVA_Build 10 129292276 1I AAAGTTTAAG -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 A 6 7 143891 CASAVA_Build 10 129309291 3I GGGACTTGCT ---/CCA TTGCCCACCC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 CCA 0 1 143892 CASAVA_Build 10 129311116 1D TATTTTGGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 16 16 1 T 9 8 143893 CASAVA_Build 10 129316571 14D TATGTGTTGA TATTTTGTATGTCC/-------------- TATTTTGGGA 3070 het 3070 ref 46 25 21 4 TATTTTGTATGTCC 1 0 143894 CASAVA_Build 10 129329718 1D TATATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 837 hom 37 2 29 6 A 12 11 143895 CASAVA_Build 10 129338628 2D AATTGAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 2769 het 644 hom 25 5 9 11 T 14 12 143896 CASAVA_Build 10 129351759 2D GTATTCATGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 117 hom 31 3 13 16 GT 9 8 143897 CASAVA_Build 10 129359819 1D GGTAGAAAAG A/- AAAAAAAATC 2924 het 2924 ref 25 12 6 7 A 9 8 143898 CASAVA_Build 10 129360198 1D TTTAAAGAGA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 34 1 29 5 G 2 1 143899 CASAVA_Build 10 129371893 1I TTCTGCTCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 638 hom 28 3 19 6 T 9 10 143900 CASAVA_Build 10 129372158 3I ACAAAAACAA ---/CAG CAACAGCAAC 3070 hom 150 het 53 0 50 3 CAG 0 1 143901 CASAVA_Build 10 129374380 10I3M1D ATGGATGCAG ----------TGAG/TCCATGCAGTTGA- TGGACTTTCA 3070 hom 138 het 51 0 44 7 N/A 0 0 143902 CASAVA_Build 10 129384370 1D CAGTTAGATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 10 9 143903 CASAVA_Build 10 129386253 1D GTAAGTTAAA G/- GAATTAGAGA 3070 het 3070 hom 53 24 26 5 G 2 1 143904 CASAVA_Build 10 129387185 1D CCCTGTCACG A/- GTACACCTGT 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 A 1 0 143905 CASAVA_Build 10 129389544 1D ACTAACCTAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 7 6 143906 CASAVA_Build 10 129391120 4D TCGGGAGGTG CTGT/---- CTGTCAGGGG 3070 hom 48 het 19 0 15 4 CTGT 2 1 143907 CASAVA_Build 10 129393368 1D TGATGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 T 11 10 143908 CASAVA_Build 10 129394512 1I GCAACTAATC -/A AAAAAAAAGA 2621 het 166 hom 22 1 6 15 A 8 9 143909 CASAVA_Build 10 129394528 6D AAGAAAAATG GTATAA/------ GTATATCATT 3070 het 688 hom 24 3 15 7 GTATAA 1 0 143910 CASAVA_Build 10 129394719 13D TTATAGAATT AAAAATTAACATA/------------- TTTAAGGTTA 3070 het 3070 ref 21 13 8 1 AAAAATTAACATA 1 0 143911 CASAVA_Build 10 129401757 1I CCTGCGGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 9 10 143912 CASAVA_Build 10 129404324 3D ATTCATTCTC CTT/--- CTCACCCTCA 3070 het 3070 ref 45 22 18 8 CTT 1 0 143913 CASAVA_Build 10 129406356 6I TTATCGGGAA ------/ATATCT TTACCTGTGG 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 ATATCT 0 1 143914 CASAVA_Build 10 129407232 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 574 hom 20 3 12 5 A 16 15 143915 CASAVA_Build 10 129408896 3I AGGGAAGAGT ---/GAG GAGGACTTTG 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 GAG 1 2 143916 CASAVA_Build 10 129410696 1D AGAAAGAGAT A/- GGGGTAGAAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 1 0 143917 CASAVA_Build 10 129411117 5I TTGCATCAGT -----/GCCAG GCCTGTCCCA 3070 het 3070 hom 31 16 15 1 GCCAG 0 1 143918 CASAVA_Build 10 129411427 1I ACTTCTTTTT -/G CTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 143919 CASAVA_Build 10 129411664 1D AAAATGGCAG A/- AAAAAAGTCC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 A 7 6 143920 CASAVA_Build 10 129412660 3I AACCCAAAAT ---/TAG TAGAAGAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 TAG 1 2 143921 CASAVA_Build 10 129412734 1D ACAAAAGATC A/- AATCAAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 3 2 143922 CASAVA_Build 10 129419780 1D TGGTTGACCT C/- CAGATCTCAT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 C 2 1 143923 CASAVA_Build 10 129422340 3D CTGATGATGG AGA/--- AGGAGAAGAG 3070 hom 86 het 31 0 26 8 AGA 1 0 143924 CASAVA_Build 10 129424306 4D GGCGAGGCCA GCTT/---- CCAGGAGGTC 3070 hom 74 het 28 0 21 8 GCTT 1 0 143925 CASAVA_Build 10 129424468 2I TACCCAGCCC --/GG AGCGTCAGCC 1165 hom 15 het 13 0 5 8 G 0 2 143926 CASAVA_Build 10 129429150 1I ATAAACCTGG -/C CCCTGGTCAT 3070 hom 122 het 43 0 35 8 C 3 4 143927 CASAVA_Build 10 129429678 1D GGGAAGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 32 0 23 9 T 11 10 143928 CASAVA_Build 10 129437807 1I GAGATGGAAC -/A AAATTTGCAG 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 A 3 4 143929 CASAVA_Build 10 129446315 2D AACAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1494 hom 23 9 10 4 A 14 12 143930 CASAVA_Build 10 129450386 1I AACATACTTT -/G TATGATTTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 143931 CASAVA_Build 10 129462869 1I AAATAGCACC -/A GGGGCAAATC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 0 1 143932 CASAVA_Build 10 129463300 1D ACAGAGGGTG T/- TGCACTAAGC 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 2 1 143933 CASAVA_Build 10 129464252 1D GTATTTATGG C/- GGGGGGGTGG 3070 het 1711 hom 34 9 17 8 C 1 0 143934 CASAVA_Build 10 129464740 4I AGTAATCAAA ----/TTGT TTGCCTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TTGT 0 1 143935 CASAVA_Build 10 129466886 1D TTTTATCTAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 2036 hom 17 5 10 2 A 8 7 143936 CASAVA_Build 10 129492815 2D TTACAGTCAG GT/-- GTACTCTAAG 3070 het 3070 hom 21 9 10 3 GT 2 1 143937 CASAVA_Build 10 129497551 2I GCAATAGTGG --/GT GTATATTTTT 3070 hom 105 het 44 0 34 10 GT 1 2 143938 CASAVA_Build 10 129504817 1I AGAAGCCTGG -/T TAGGCCTATA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 1 2 143939 CASAVA_Build 10 129505501 3D ACTAAGATAG TGC/--- TGCTGCTTTG 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 TGC 3 2 143940 CASAVA_Build 10 129505779 1I AAGATGATAT -/A ACCAAGCTTC 3070 het 3070 hom 56 25 23 8 A 1 2 143941 CASAVA_Build 10 129509831 2D GTGTGTATAT AG/-- AGAGTATTAG 3070 het 3070 ref 36 24 10 5 AG 3 2 143942 CASAVA_Build 10 129510152 1I TCTACTTGAC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 9 143943 CASAVA_Build 10 129512550 1I TTAAGCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 12 13 143944 CASAVA_Build 10 129518532 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 36 1 25 11 T 15 14 143945 CASAVA_Build 10 129520842 2I AGTAAATCAC --/TT TGTAACCTCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 1 3 143946 CASAVA_Build 10 129521954 1D TTTTACAGGG A/- AAAAACATAT 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 A 6 5 143947 CASAVA_Build 10 129525320 1D CAAATGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 32 0 25 8 A 11 10 143948 CASAVA_Build 10 129533011 1I CAACTGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 327 hom 35 2 23 10 A 15 16 143949 CASAVA_Build 10 129537363 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 867 het 102 hom 5 1 2 2 A 12 11 143950 CASAVA_Build 10 129541576 1I TTTTAAAGTA -/T TTTTTTATCC 2811 het 2811 ref 25 10 7 8 T 6 7 143951 CASAVA_Build 10 129541855 1I AAAACCCGTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 402 hom 35 3 18 14 A 8 9 143952 CASAVA_Build 10 129541871 2D AACAAAAAAC AA/-- AAAAAAACAA 3070 het 1073 hom 30 8 11 11 A 9 7 143953 CASAVA_Build 10 129545208 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 het 892 hom 19 2 13 4 A 6 7 143954 CASAVA_Build 10 129555567 2I TTGAAGATTT --/AA TAAAAAAAAA 3070 het 2950 hom 25 8 13 4 A 0 2 143955 CASAVA_Build 10 129572550 9D AGGGTAGGTC ACCCTGAAA/--------- ACCTGTGCAC 3070 het 3070 ref 34 19 14 8 ACCCTGAAA 1 0 143956 CASAVA_Build 10 129580254 1D AAGAAATCAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 A 9 8 143957 CASAVA_Build 10 129584511 5D TGTTGCTGTC TTTTA/----- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 28 20 8 0 TTTTA 1 0 143958 CASAVA_Build 10 129590168 2I CAAAAAATAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 12 14 143959 CASAVA_Build 10 129640597 1D CCGCCCCCCC T/- AGCCCTTAGT 1857 het 1857 ref 19 14 4 1 T 1 0 143960 CASAVA_Build 10 129670503 1D GAAAACTGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 19 16 12 T 9 8 143961 CASAVA_Build 10 129689452 2I AGAGATCTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 59 21 23 15 GT 7 8 143962 CASAVA_Build 10 129698304 4D TGATGAGGGC CATT/---- CATTCATTCA 3070 hom 88 het 38 0 27 13 CATT 4 3 143963 CASAVA_Build 10 129721257 1D GGTATAATTT G/- TAATTTATAC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 1 0 143964 CASAVA_Build 10 129748336 4D ACCACACACT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 56 het 81 2 52 31 AC 11 9 143965 CASAVA_Build 10 129750270 1D CCTACATGGC T/- CCCCAAGTTT 3070 hom 123 het 48 0 42 7 T 1 0 143966 CASAVA_Build 10 129755454 2D GTGCACACAC AT/-- ACACCCACAC 3070 het 3070 hom 94 31 40 26 AT 1 0 143967 CASAVA_Build 10 129755648 4I ACATGTGCAC ----/ACAT ACACACATAC 3070 hom 202 het 76 0 66 10 ACAT 0 1 143968 CASAVA_Build 10 129760613 1D TTACTTGCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 10 9 143969 CASAVA_Build 10 129761757 1I GGTCCCTCCA -/G GGGCAGCCTG 3070 hom 119 het 46 0 35 11 G 3 4 143970 CASAVA_Build 10 129768344 2D ATTTCAATGT TA/-- TACTCGTCCA 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 TA 2 1 143971 CASAVA_Build 10 129769404 1D AGATTTTGGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 A 10 9 143972 CASAVA_Build 10 129771549 1D GAAGTCAGTT C/- GAAAATGCAC 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 C 1 0 143973 CASAVA_Build 10 129772558 2D TTTTTGGTAC TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 44 19 25 1 T 10 8 143974 CASAVA_Build 10 129773074 4D TTCTCTGGTC ATTT/---- ATTTGAGAGT 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 ATTT 2 1 143975 CASAVA_Build 10 129779483 4D CATTTACTTA TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 TTTG 2 1 143976 CASAVA_Build 10 129782403 1D TGTCTCTCCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 9 143977 CASAVA_Build 10 129782969 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1060 hom 20 het 19 0 6 13 T 16 15 143978 CASAVA_Build 10 129784509 4D CTTCTTCAGG ACTA/---- ACTGACCTAC 3070 het 3070 ref 34 21 9 5 ACTA 1 0 143979 CASAVA_Build 10 129815642 5D AGGTTTACAA TGTTT/----- TGTTATTAGA 3070 het 3070 ref 43 23 17 5 TGTTT 1 0 143980 CASAVA_Build 10 129816947 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 14 1 9 5 A 12 11 143981 CASAVA_Build 10 129818259 3D ACAAAATTCC AAT/--- AATGATTGAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 AAT 2 1 143982 CASAVA_Build 10 129821017 1D TCCATCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 32 4 11 17 T 15 14 143983 CASAVA_Build 10 129827129 1D CGCCAGGCCT A/- AAAAAAAAAA 2168 het 2168 ref 20 6 7 8 A 13 12 143984 CASAVA_Build 10 129842099 2D ATTTTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2278 het 2278 ref 26 12 7 8 T 14 12 143985 CASAVA_Build 10 129843482 1D CATATCAAGC T/- TTTTTTTTTT 1204 het 1204 ref 37 26 4 7 T 11 10 143986 CASAVA_Build 10 129882608 1I TCCGCCTCCC -/G GGGTTCACGC 1834 het 4 hom 7 0 6 1 G 3 4 143987 CASAVA_Build 10 129883267 3D TGTTTTCTGA TTT/--- TCACATTCCA 3070 het 3070 ref 44 19 20 6 T 4 1 143988 CASAVA_Build 10 129884009 1D TTAAGATAAT G/- GCCTCCAGCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 2 1 143989 CASAVA_Build 10 129885588 3D AAGAAAAAAT AGG/--- AGGATGATAT 3070 het 3070 hom 41 19 21 3 AGG 2 1 143990 CASAVA_Build 10 129885989 2I GAGATAACAC --/AA AGATACCTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 3 143991 CASAVA_Build 10 129887020 40D GTATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAC/---------------------------------------- ATACTGGGAT 2742 hom 15 het 6 0 6 0 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAC 1 0 143992 CASAVA_Build 10 129894291 1I CATAAGAGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 9 10 143993 CASAVA_Build 10 129897543 51D AAAAGGACGT TAGTTAAAAATGAAAAAAAAAAAATGGGAATAAACGAAGGGCTTCAGCTGA/--------------------------------------------------- TAATAGTGTA 2090 het 2087 ref 19 8 10 14 TAGTTAAAAATGAAAAAAAAAAAATGGGAATAAACGAAGGGCTTCAGCTGA 1 0 143994 CASAVA_Build 10 129900061 5I ATGAAAGTCC -----/TGAGG TGAGAAATAA 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 TGAGG 0 1 143995 CASAVA_Build 10 129918227 1D CTTGCCAATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 9 8 143996 CASAVA_Build 10 129941095 1D CGAGATAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 20 29 7 T 11 10 143997 CASAVA_Build 10 129942589 1D TTCCTTTTAG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 9 8 143998 CASAVA_Build 10 129944369 9D GGGTTCATGA GGCTGCTGG/--------- GGCCTAGACC 3070 het 2575 hom 27 9 16 6 GGCTGCTGG 1 0 143999 CASAVA_Build 10 129953361 1I CCTGGTAAGA -/G GGGGCTGGCT 2784 het 2784 ref 28 19 8 1 G 4 5 144000 CASAVA_Build 10 130015418 1D CTTACATACT G/- GGGGCAGCAG 1450 het 1450 ref 28 10 4 15 G 5 4 144001 CASAVA_Build 10 130015549 1D CCTTACTACC A/- AGCTTCCCAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 2 1 144002 CASAVA_Build 10 130016424 2D ATAAAATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 2054 het 476 hom 27 7 8 12 A 13 11 144003 CASAVA_Build 10 130019606 1D TCCTTGACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 A 13 12 144004 CASAVA_Build 10 130031648 1D TCTATACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 18 23 14 T 12 11 144005 CASAVA_Build 10 130038700 1I ATATTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 10 11 144006 CASAVA_Build 10 130038846 3I ATAAAATGCT ---/TAG TATGTAATTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TAG 0 1 144007 CASAVA_Build 10 130039118 1I ATAAATTTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 8 9 144008 CASAVA_Build 10 130047391 1D ACAGCCTGTT C/- CCCAGCCAGC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 C 4 3 144009 CASAVA_Build 10 130052284 51D GGAGGAGACC AAGGTGGAGCAACCAGAGAGGTACTACCAGGAGGGGTCTGCCTTGATGCCA/--------------------------------------------------- AGGGAGAAGG 2184 het 2184 ref 42 40 8 12 AAGGTGGAGCAACCAGAGAGGTACTACCAGGAGGGGTCTGCCTTGATGCCA 1 0 144010 CASAVA_Build 10 130053710 1I CTGCTGCCAT -/C TTCCCCCCAA 3070 het 2761 hom 34 9 18 7 C 0 1 144011 CASAVA_Build 10 130054152 1I TCACAACACG -/T TTTTTTTTTT 1743 het 1743 ref 59 43 4 12 T 10 11 144012 CASAVA_Build 10 130058790 1D AAACAAAAAC A/- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 5 4 144013 CASAVA_Build 10 130059480 5D TCACCTCCCA CCAGG/----- CCCCTTCTGT 3070 hom 123 het 45 0 38 9 CCAGG 1 0 144014 CASAVA_Build 10 130070504 2D CACCTGCTGC CT/-- CTCTCAGGCC 3070 hom 90 het 31 0 28 5 CT 3 2 144015 CASAVA_Build 10 130072107 1D CAGATAAACA T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 8 7 144016 CASAVA_Build 10 130074173 4I TTGGTGAGAA ----/CGCG CGCGGAAGCA 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 CG 2 4 144017 CASAVA_Build 10 130083873 1D TTTGGGATTA C/- AGGCATGAGC 3070 het 2704 hom 23 9 11 4 C 1 0 144018 CASAVA_Build 10 130084192 1I AGTTACATGT -/A AAGGCAGACA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 2 3 144019 CASAVA_Build 10 130088874 1D ATCAGCATTT G/- GCTTTCTAAC 3070 het 3070 ref 47 24 18 6 G 2 1 144020 CASAVA_Build 10 130091592 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1352 het 772 hom 7 2 4 1 T 7 6 144021 CASAVA_Build 10 130092485 1I TTCTCAGCTA -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 6 7 144022 CASAVA_Build 10 130094515 1D TCAGATTCCA T/- TTTTTTAGGG 3070 het 3070 hom 37 10 20 8 T 7 6 144023 CASAVA_Build 10 130096369 1I AGATCCACTA -/T TTTTTGTAGC 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 T 5 6 144024 CASAVA_Build 10 130097742 1D TGTTTTTTTT G/- TGTGTCTTAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 G 1 0 144025 CASAVA_Build 10 130097874 1D TCTCTTACAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 T 9 8 144026 CASAVA_Build 10 130115185 1D CGTCTCTTCC A/- AAAAAATACA 3070 het 2813 hom 23 8 14 1 A 7 6 144027 CASAVA_Build 10 130126600 4D GAGAGAGACT GACA/---- GTTACAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 8 GACA 1 0 144028 CASAVA_Build 10 130139785 2D TGATTTCCAA AT/-- ATATATATAT 2260 het 2023 hom 18 5 8 5 AT 10 9 144029 CASAVA_Build 10 130152001 1D GCAGGAGGGA G/- GCTGGGGGCG 1974 het 1974 ref 23 10 6 7 G 2 1 144030 CASAVA_Build 10 130160156 10D AAAACATACC CAAACACACA/---------- CAAACACATA 3070 het 3070 hom 78 35 35 13 CAAACACACA 1 0 144031 CASAVA_Build 10 130165818 3I TTTTCTCTGA ---/TCT TCTTCAAAAA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 TCT 1 2 144032 CASAVA_Build 10 130170919 1D TTTACTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 31 2 24 5 A 13 12 144033 CASAVA_Build 10 130186782 3I GCTCTCTGCA ---/AAG AAGACCCAGC 3070 hom 75 het 27 0 22 5 AAG 1 2 144034 CASAVA_Build 10 130187895 3D CCACCACCAC CAT/--- GGCAGCTGGA 3070 het 3070 ref 33 13 12 9 CAT 1 0 144035 CASAVA_Build 10 130200656 4D TGAAAAACAC TTCG/---- TTTGTGGGTG 3070 hom 132 het 46 0 43 4 TTCG 1 0 144036 CASAVA_Build 10 130212551 2D GGAGTTAGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 96 het 39 0 33 8 AT 8 7 144037 CASAVA_Build 10 130216024 1I GCGCTTCAAA -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 16 7 C 0 1 144038 CASAVA_Build 10 130217842 3I CCATCTCCTC ---/CTT GCCAGAGGCA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 CTT 0 1 144039 CASAVA_Build 10 130224049 5D GTCCTGTCAC TCTTT/----- TCTTGTTGAC 3070 het 3070 ref 50 27 19 5 TCTTT 1 0 144040 CASAVA_Build 10 130224427 2I CGATGGTCCT --/TA TCACCCCACG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TA 0 1 144041 CASAVA_Build 10 130229405 1D GATTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2021 het 1515 hom 20 7 7 6 T 13 12 144042 CASAVA_Build 10 130231704 8D CAAAGCATCC AAACTGTT/-------- AAAAAGGAAG 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 AAACTGTT 1 0 144043 CASAVA_Build 10 130271889 4I CTGTCTACCT ----/TCTA TCTATCTACC 2606 het 2606 ref 43 35 6 2 TCTA 2 3 144044 CASAVA_Build 10 130274107 2D CCAATCCTGC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 AT 1 0 144045 CASAVA_Build 10 130276790 1D CTTTCTCCTA C/- CCCCATCCCC 3070 het 3070 ref 30 17 13 1 C 5 4 144046 CASAVA_Build 10 130276896 2I ATTCCAGACA --/CT CTTCTCCTCT 2352 het 2352 ref 29 18 9 2 CT 1 2 144047 CASAVA_Build 10 130276951 19I GTCTTATTCA -------------------/TCCACTTAAGAATACTGCC TCCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 6 TCCACTTAAGAATACTGCC 0 1 144048 CASAVA_Build 10 130278120 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2369 hom 25 6 10 9 T 12 11 144049 CASAVA_Build 10 130284821 5D AAGGTACTTC CCAAG/----- CCAAGCCAGT 3070 hom 139 het 50 0 44 7 CCAAG 2 1 144050 CASAVA_Build 10 130286614 3D GAGTCTCTGA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 AAT 4 3 144051 CASAVA_Build 10 130286977 1D CTCTAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 12 16 18 T 13 12 144052 CASAVA_Build 10 130293004 5D TTAAAAAACT TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 TTTTA 5 4 144053 CASAVA_Build 10 130328863 1D TAGTGATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 12 11 144054 CASAVA_Build 10 130343099 1D TAGGACTTTC T/- TTTATTGCAC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 4 3 144055 CASAVA_Build 10 130382620 4D CAAACAGACA GACC/---- GACGCATCAG 3070 het 2864 hom 34 12 18 7 GACC 1 0 144056 CASAVA_Build 10 130402861 1I ATTCTCGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 13 14 144057 CASAVA_Build 10 130434582 1D ATTAGGACAA T/- TTTTTAAAGG 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 T 6 5 144058 CASAVA_Build 10 130448315 2D GGAAAGGACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2591 hom 30 11 12 8 T 17 15 144059 CASAVA_Build 10 130467677 1I AGATACTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 9 10 144060 CASAVA_Build 10 130470102 1D CCTCTTTTGG C/- CAATGAGTGT 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 C 2 1 144061 CASAVA_Build 10 130471906 1I AAGTTTGTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 19 0 T 9 10 144062 CASAVA_Build 10 130486453 2D ACACACTTAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 70 25 28 19 AC 6 5 144063 CASAVA_Build 10 130497068 1D TAACTAATTC T/- TCTGAGGTGT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 2 1 144064 CASAVA_Build 10 130499722 1I AACCAAAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 9 10 144065 CASAVA_Build 10 130510164 2D CCCAGCCAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2035 het 783 hom 17 6 7 4 T 14 12 144066 CASAVA_Build 10 130510937 1I GGCAGTTACC -/T GGGGAACAGT 3070 het 3070 hom 47 17 15 15 T 0 1 144067 CASAVA_Build 10 130511368 2D CACTCAGCAC AT/-- GTTTGCTGAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 AT 1 0 144068 CASAVA_Build 10 130524115 1I CTCAGAAAGG -/T TTTTTTGCTA 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 T 6 7 144069 CASAVA_Build 10 130532456 1D ACAGTAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 35 2 28 6 A 12 11 144070 CASAVA_Build 10 130561023 1I GTACTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 11 144071 CASAVA_Build 10 130576705 3D AAATATGAGA GGG/--- GACTATCCTC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 4 1 144072 CASAVA_Build 10 130594201 1I TGCTTGTACG -/T TTTTCTTCCT 3070 het 3070 hom 52 20 26 6 T 4 5 144073 CASAVA_Build 10 130605608 1D TGAGGGACGA G/- GGGAGCCCAG 3070 hom 122 het 47 0 39 8 G 4 3 144074 CASAVA_Build 10 130607487 1D CTGCTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 11 10 144075 CASAVA_Build 10 130611101 1I CTGGGTGGCA -/G TGGTGTAGGA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 0 1 144076 CASAVA_Build 10 130625319 3D TACAGAGGCT GAG/--- AAGTCCCACA 3070 het 3070 hom 52 23 24 9 GAG 1 0 144077 CASAVA_Build 10 130640504 1D ACTTTTTTTT C/- CCCCTTAACA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 C 5 4 144078 CASAVA_Build 10 130641277 9D TTAACCCTTT AGTCCCTGA/--------- AGCGACCTGT 3070 hom 93 het 32 0 31 2 AGTCCCTGA 1 0 144079 CASAVA_Build 10 130641613 1D ACGTTTGGCA T/- TTTTTAATTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 6 5 144080 CASAVA_Build 10 130643571 2I AAAATATTGG --/GA AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 GA 0 1 144081 CASAVA_Build 10 130645320 1D TGTTACATCA C/- CCCCCCTGAA 3070 hom 94 het 36 0 30 6 C 7 6 144082 CASAVA_Build 10 130646567 1D AACAGGCCGA T/- TTCCTGCTCA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 T 3 2 144083 CASAVA_Build 10 130663371 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2685 hom 20 7 10 3 T 11 10 144084 CASAVA_Build 10 130664250 1D GAAATATTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 11 19 4 T 9 8 144085 CASAVA_Build 10 130681866 1D AGGAAGAGAT G/- CCTGGAAGGT 3070 hom 66 het 26 0 19 7 G 1 0 144086 CASAVA_Build 10 130685224 15D ATCTTCAAAA GCCAAGGAGGGGGTG/--------------- GCCACACCTT 3070 het 3070 ref 39 23 13 6 GCCAAGGAGGGGGTG 1 0 144087 CASAVA_Build 10 130685716 1I GGACTCAGGG -/A AGGCAAAGGG 3070 hom 113 het 42 0 37 5 A 1 2 144088 CASAVA_Build 10 130687117 1D AGTTATTTCT C/- CGATTTTGAT 3070 het 3070 ref 31 14 8 10 C 2 1 144089 CASAVA_Build 10 130698153 1I ATCCAGAAAT -/A AAAAATAGAT 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 A 5 6 144090 CASAVA_Build 10 130700724 3D CACGGGTCAC AGA/--- AGAATCCTCT 3070 het 3070 ref 34 19 11 7 AGA 2 1 144091 CASAVA_Build 10 130723468 1I AGCCAGCGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1981 hom 20 5 11 4 T 9 10 144092 CASAVA_Build 10 130759214 2D AGCTAGATAC AG/-- AGTGTCGACT 3070 hom 45 het 19 0 16 4 AG 2 1 144093 CASAVA_Build 10 130764568 1I ATTGGCCCAC -/G ACTCCAAAGC 3070 hom 87 het 36 0 25 11 G 0 1 144094 CASAVA_Build 10 130794094 2D GCATCCCACC AT/-- AGAGGCCAAG 3070 hom 101 het 37 0 29 10 AT 1 0 144095 CASAVA_Build 10 130799548 1D GACAGGGGCT C/- CGAGACTCTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 C 2 1 144096 CASAVA_Build 10 130805971 5D GTCTGGAAAA TACTT/----- TAGGAAGTGC 3070 hom 148 het 55 0 50 7 TACTT 1 0 144097 CASAVA_Build 10 130808290 2D TTCTTAATCG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 12 10 144098 CASAVA_Build 10 130811916 1D CACATGCAGG A/- AGCAAAACCA 3070 hom 108 het 39 0 35 4 A 2 1 144099 CASAVA_Build 10 130812367 1I TCTTCTATAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 7 8 144100 CASAVA_Build 10 130812558 4D GCCAATAACC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 22 2 14 6 A 20 16 144101 CASAVA_Build 10 130820044 1D AAGGCACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 39 0 31 8 T 11 10 144102 CASAVA_Build 10 130826820 1I AGATAGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 11 12 144103 CASAVA_Build 10 130829354 2D GGACGCTGTG TC/-- TAAGGCCGTG 3070 het 3070 hom 44 22 19 3 TC 1 0 144104 CASAVA_Build 10 130830296 1I TTTCTAAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 8 9 144105 CASAVA_Build 10 130832262 1D CTGTCAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 9 8 144106 CASAVA_Build 10 130837184 2D CCCATAAGAC TA/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TA 1 0 144107 CASAVA_Build 10 130838211 1I TAACTGGGCA -/G AGAAATGGGC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 G 0 1 144108 CASAVA_Build 10 130841950 1D TCCTAGTGTA C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 C 8 7 144109 CASAVA_Build 10 130848524 3I31M3D GTCATGTATA ---TATTATATATAAATTTTATATAATAAATTATATA/TATTATTATATATAAATTTTATATAATAAATTAT--- ATGTCATTTA 3070 hom 21 het 6 0 8 0 N/A 0 0 144110 CASAVA_Build 10 130850794 1D AATTTTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 33 3 14 16 A 17 16 144111 CASAVA_Build 10 130856094 5I TTTTAATGTC -----/TTTAT TTTATGATTT 3070 hom 146 het 59 0 48 11 TTTAT 1 2 144112 CASAVA_Build 10 130873859 1I CAGGGAGATT -/A TCCACCAGAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 0 1 144113 CASAVA_Build 10 130892024 1D TCAATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 27 0 23 4 A 13 12 144114 CASAVA_Build 10 130910615 2D ACACGCAATC AG/-- AGTTTTTATC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AG 2 1 144115 CASAVA_Build 10 130922570 1I CAGAAGACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 9 10 144116 CASAVA_Build 10 130927345 2I ATCCCAGCTA --/CC CTCTGGAGGC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 1 3 144117 CASAVA_Build 10 130931107 1I CGAATGGAGC -/T TTTATAAGAT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 T 3 4 144118 CASAVA_Build 10 130936477 4D ATGGATGGAT AGAC/---- AGGTGGATGG 148 het 148 ref 23 3 3 18 AGAC 1 0 144119 CASAVA_Build 10 130936492 4I GGTGGATGGA ----/TAGG TGGATGAATG 2468 het 319 hom 25 2 13 10 TAGG 0 1 144120 CASAVA_Build 10 130937963 11D GGGTGTGTGC ATGGAGGGGTG/----------- TGTGCATGGA 3070 het 837 hom 27 8 11 10 ATGGAGGGGTG 1 0 144121 CASAVA_Build 10 130940285 1I TGGCCTCAGC -/A AAAAAGGATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 6 144122 CASAVA_Build 10 130942107 1I ATTATATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 13 14 144123 CASAVA_Build 10 130942968 12D AACCCCTTCC TCTCACTCTCTT/------------ TCTCACTCTC 3070 hom 92 het 36 0 30 8 TCTCACTCTCTT 2 1 144124 CASAVA_Build 10 130945349 1I TAATTGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 11 12 144125 CASAVA_Build 10 130946633 3D ACAGAAAAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 9 A 14 11 144126 CASAVA_Build 10 130969966 2D TCCCAGAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 24 1 16 8 T 14 12 144127 CASAVA_Build 10 130973128 10D GGTGGAAGAT AGGATCACCA/---------- AGGGGCACAA 3070 hom 123 het 41 0 42 0 AGGATCACCA 1 0 144128 CASAVA_Build 10 130973906 1D GGTAATACAA G/- CAATGGGGAG 3070 het 3070 ref 48 25 20 4 G 1 0 144129 CASAVA_Build 10 130982974 1D TAGCTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 976 het 976 ref 33 26 3 4 T 11 10 144130 CASAVA_Build 10 130985733 3I GCTAGCACTA ---/CTT CTTGCTGAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTT 1 2 144131 CASAVA_Build 10 131002507 8D GGCAAGCTAT AGCCAGGG/-------- AGCCAAATCC 3070 het 3070 ref 49 22 20 8 AGCCAGGG 1 0 144132 CASAVA_Build 10 131002947 1I CTGGGCATTG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 7 8 144133 CASAVA_Build 10 131006009 1D TCCCACAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2627 hom 28 9 10 10 T 12 11 144134 CASAVA_Build 10 131007932 3I TAAGCAAAAA ---/AAG AATACGTACT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 AAG 0 1 144135 CASAVA_Build 10 131014109 1D CCTTGGGCAG A/- ACATAGCTCA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 2 1 144136 CASAVA_Build 10 131038076 1D CTGTGGAAGT C/- CACAAGACAG 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 C 2 1 144137 CASAVA_Build 10 131041117 1I CACTGCCTTT -/G GAACCTGCTC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 G 1 2 144138 CASAVA_Build 10 131044335 1D ATAATATGCA G/- ATATTACCCA 3070 het 3070 ref 47 32 8 7 G 1 0 144139 CASAVA_Build 10 131050146 1I AGTGAGACAA -/G GGCCAGCCAA 3070 hom 74 het 29 0 23 6 G 2 3 144140 CASAVA_Build 10 131052801 2I TCTTATTAAA --/AC CTCAAGATAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AC 0 1 144141 CASAVA_Build 10 131057405 22D CATGCAGGTG CATGCATACACAGGCATGCATA/---------------------- CATGCATACA 3070 hom 115 het 57 0 36 26 CATGCATACACAGGCATGCATA 2 1 144142 CASAVA_Build 10 131059376 1I TTTCTACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 35 2 28 5 A 11 12 144143 CASAVA_Build 10 131068362 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 55 het 23 0 16 7 T 10 9 144144 CASAVA_Build 10 131073232 2D ATTTACACAC AT/-- ATATATATAT 883 het 883 ref 34 19 14 1 AT 6 5 144145 CASAVA_Build 10 131092212 1I AAGTTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 10 11 144146 CASAVA_Build 10 131095369 3I ACAAGATGGG ---/GCA GTGGGGGGGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GCA 0 1 144147 CASAVA_Build 10 131105755 1D CTTTCAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 25 1 21 4 A 10 9 144148 CASAVA_Build 10 131122459 1D CTGGCCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 207 hom 32 2 23 7 T 15 14 144149 CASAVA_Build 10 131126979 1D CTAGACAAGG A/- AGAGGAGACA 3070 hom 62 het 25 0 20 7 A 2 1 144150 CASAVA_Build 10 131137146 1D TCTCTAAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2172 hom 21 6 12 3 T 10 9 144151 CASAVA_Build 10 131140167 3I GTCACTCCTC ---/CTT TAACCCACTC 3070 het 3070 hom 54 23 26 5 CTT 0 1 144152 CASAVA_Build 10 131147179 1I AATACTCTCA -/G GAATATTGAT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 G 1 2 144153 CASAVA_Build 10 131156323 12I TGGTCCAGAG ------------/AGGGGTCACCAC AGCTGTTCTC 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 AGGGGTCACCAC 0 1 144154 CASAVA_Build 10 131166488 1I GGTTGGTTGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 63 hom 28 2 12 14 T 6 7 144155 CASAVA_Build 10 131167179 1I TGAGAATCTC -/T TAAGAATATG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 1 2 144156 CASAVA_Build 10 131167641 2I GATTGGTTGA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 9 11 144157 CASAVA_Build 10 131175840 2I CAAAAAATTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 13 13 13 TA 5 6 144158 CASAVA_Build 10 131178146 5I AGTTTTGCTT -----/CTTTC CTTCTACTCT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CTTTC 0 1 144159 CASAVA_Build 10 131178759 5I TTATTGTTAT -----/TGTTA TAAGATTATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TGTTA 0 1 144160 CASAVA_Build 10 131190133 1I GTTCCACTCC -/T TTCAAGGGTG 3070 het 3070 ref 54 23 20 11 T 2 3 144161 CASAVA_Build 10 131193504 1D CCCAACCCCA C/- TTTTATTTTC 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 C 1 0 144162 CASAVA_Build 10 131197150 1D ATCAGATTGC T/- TACTTGGTTG 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 2 1 144163 CASAVA_Build 10 131201160 1I TAAGGACATA -/C CCCCCCAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 C 6 7 144164 CASAVA_Build 10 131210311 8D ACTTAATGCA CACAGAAC/-------- CACAGAACCA 3070 hom 90 het 38 0 29 10 CACAGAAC 3 2 144165 CASAVA_Build 10 131211665 1I CCTAGTAAAC -/T TAAAGGAATC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 1 2 144166 CASAVA_Build 10 131211977 1I ATTTTAAAGG -/A ACAGCCACAG 3070 hom 90 het 33 0 26 7 A 1 2 144167 CASAVA_Build 10 131217927 2I TTTTTTAACT --/CA CAGAATTATT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 CA 1 2 144168 CASAVA_Build 10 131218061 2I ACAGTGTAAC --/AT ATTAGCTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 AT 1 2 144169 CASAVA_Build 10 131225397 3D TTTCTGACCA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 AAG 4 3 144170 CASAVA_Build 10 131232308 3D CCCTGCTCTT AAC/--- AATAAGTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 15 7 AAC 1 0 144171 CASAVA_Build 10 131252420 12I CTTTCCTCCC ------------/CCTCCCCTTCCT CCTCCCCCTC 1281 hom 10 het 8 0 4 4 CCTCCCCTTCCT 0 1 144172 CASAVA_Build 10 131267209 1I ACATCAGTCA -/T TTTGTGCATT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 3 4 144173 CASAVA_Build 10 131272694 1I GCTTAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 T 10 11 144174 CASAVA_Build 10 131286701 2D GGCACATCCT GG/-- GGGTGCTGCC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 5 3 144175 CASAVA_Build 10 131306764 14D TTCCATGTAG AATAAGTGGATTAA/-------------- TTAGTATAGA 3070 het 3070 ref 50 23 22 8 AATAAGTGGATTAA 1 0 144176 CASAVA_Build 10 131313991 4D GTGTGTGTGC GTGT/---- GTGTGCATGC 3070 het 79 hom 39 1 15 23 GT 4 2 144177 CASAVA_Build 10 131314664 4D TTGAGACTTC CTTG/---- AGCTTCCGGC 3070 het 3070 hom 26 12 10 5 CTTG 1 0 144178 CASAVA_Build 10 131315675 3D6M2D ACTCAAAAAA AAGAAAGAAAG/---AAAGAA-- AAAAAAGCAG 3070 het 3070 ref 35 18 17 6 N/A 0 0 144179 CASAVA_Build 10 131321074 3D TTCTCATTTA ATG/--- ATATTTGATT 3070 het 3070 hom 40 15 23 3 ATG 1 0 144180 CASAVA_Build 10 131328849 3I GAAAATACAC ---/GAG GAGGAAATAC 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 GAG 1 2 144181 CASAVA_Build 10 131335544 1I GTAATCAGAG -/C CCCTTCTGTG 3070 hom 49 het 21 0 17 4 C 3 4 144182 CASAVA_Build 10 131365425 1I AACACATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 10 11 144183 CASAVA_Build 10 131384576 1D GCATTATATC A/- GGGGGTGGGG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 1 0 144184 CASAVA_Build 10 131409197 1D TGTCAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 25 0 20 6 A 12 11 144185 CASAVA_Build 10 131410068 1D5M12D2M4D AATTCTTTTA TTAGAATTAGCATATTAGAATGCT/-AAGAA------------AA---- AAAATGTAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 3 N/A 0 0 144186 CASAVA_Build 10 131412915 3D ATGCAGCAAA AAT/--- AATAATAAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAT 3 2 144187 CASAVA_Build 10 131413372 2D TTACTCTTCT TC/-- TCTCCAGCCA 3070 hom 105 het 38 0 33 5 TC 3 2 144188 CASAVA_Build 10 131420414 1D CTTTTTTAAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 8 7 144189 CASAVA_Build 10 131431255 1D GGTAAACGAT A/- AAAAAACGGA 3070 hom 87 het 33 0 28 6 A 7 6 144190 CASAVA_Build 10 131438741 1I GATAAAAAAT -/G GTTCAACAAC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 1 2 144191 CASAVA_Build 10 131443181 5D AAGTGGATTA GAGCC/----- GAGCCCCTAG 3070 hom 91 het 35 0 29 7 GAGCC 2 1 144192 CASAVA_Build 10 131447980 4I TACAGCAGCT ----/AACA AACAGACAGA 3070 hom 132 het 50 0 40 10 AACA 1 2 144193 CASAVA_Build 10 131459143 1I GGGATTTAAA -/T TTTTTGGCTT 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 5 6 144194 CASAVA_Build 10 131463829 1D TCAGACAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 37 1 24 15 A 13 12 144195 CASAVA_Build 10 131469237 3I CCTCCAAAAA ---/AAG AGAGAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AAG 0 1 144196 CASAVA_Build 10 131474456 3D CTGTCGGCAA ATC/--- ATTAATCTCT 3070 het 3070 ref 53 32 18 5 ATC 1 0 144197 CASAVA_Build 10 131474658 1I GGGAGGCGTG -/C CTTCCCGCAG 3070 hom 63 het 26 0 20 6 C 1 2 144198 CASAVA_Build 10 131480234 1I ATTAAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 24 1 21 2 A 10 11 144199 CASAVA_Build 10 131498920 1I GAACAGGGAG -/C CTCTGGGCCC 3070 hom 90 het 32 0 25 7 C 1 2 144200 CASAVA_Build 10 131500727 1I TAAATCTTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 112 het 46 0 37 9 T 7 8 144201 CASAVA_Build 10 131512395 1I GCTAATGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1304 hom 28 5 19 4 T 12 13 144202 CASAVA_Build 10 131515326 1I AGAGACTGTC -/A AAAAAAAAAA 2045 het 2045 ref 37 9 8 20 A 16 17 144203 CASAVA_Build 10 131516362 1I GTCAGTTTTG -/A AATCAAAATA 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 A 2 3 144204 CASAVA_Build 10 131523330 1I CAGGACCACG -/T TAAGTGACAA 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 T 1 2 144205 CASAVA_Build 10 131524853 1I TCCTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2285 het 831 hom 36 2 8 26 A 11 12 144206 CASAVA_Build 10 131531179 1D CTGTGACAAG T/- TTTTTCTGCT 3070 hom 92 het 38 0 24 14 T 6 5 144207 CASAVA_Build 10 131531352 1I GTTCTGGCAT -/G GGGGGGGAGG 3070 hom 69 het 29 0 19 10 G 7 8 144208 CASAVA_Build 10 131534013 1I TGTATATTAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 8 144209 CASAVA_Build 10 131535132 1D GAGGGCTTAT G/- GGAAAAAATG 3070 hom 72 het 27 0 23 4 G 3 2 144210 CASAVA_Build 10 131558247 1D AATAATTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 39 1 32 6 A 12 11 144211 CASAVA_Build 10 131574288 12D TTGGTTTTAA TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 188 hom 37 4 18 19 T 28 16 144212 CASAVA_Build 10 131613091 1I TGGCTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 10 11 144213 CASAVA_Build 10 131613340 4D GTGTGCACGC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 36 het 26 0 12 14 GT 9 7 144214 CASAVA_Build 10 131674550 2I GGTTGGTCTT --/GA GAACTCCTGA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 GA 1 2 144215 CASAVA_Build 10 131683858 1I TTTAAAAGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 8 9 144216 CASAVA_Build 10 131719676 4I GTGTCAAGTA ----/TATT TATTTACATT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TATT 1 2 144217 CASAVA_Build 10 131721730 2I TACTAAAAAT --/AC AAAAATTAGC 3070 het 51 hom 9 1 8 0 AC 0 1 144218 CASAVA_Build 10 131736100 1I ACTGGAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 11 12 144219 CASAVA_Build 10 131745896 1I TGTGGGGGAA -/G GGGGGCTTCA 3070 het 3070 hom 42 20 17 5 G 5 6 144220 CASAVA_Build 10 131746835 1D TTAAACAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 975 hom 36 5 12 19 T 15 14 144221 CASAVA_Build 10 131748316 8D CAGGTGGGAA CAGGCAGG/-------- CAGGACTGGC 3070 het 3070 ref 45 25 17 8 CAGG 3 1 144222 CASAVA_Build 10 131757871 1D TTCTGGAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 10 9 144223 CASAVA_Build 10 131758113 1D CCATTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 11 10 144224 CASAVA_Build 10 131760605 1I TATTCTACTC -/A AAACATTCTC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 3 4 144225 CASAVA_Build 10 131774041 1I TTTTAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 9 10 144226 CASAVA_Build 10 131786008 1I TGATCTATGC -/T TTTATCTGGA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 3 4 144227 CASAVA_Build 10 131788126 2I TGGACTCTCA --/CT CTGTCACCCA 2224 het 977 hom 12 3 7 3 CT 1 2 144228 CASAVA_Build 10 131790529 3D CGGTTTGATA TTC/--- GTTTATTATT 2740 het 2740 ref 23 15 7 1 TTC 1 0 144229 CASAVA_Build 10 131792125 1I ATGACACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 10 11 144230 CASAVA_Build 10 131798280 2D TACTTCTTTC AG/-- TGCCCCTAAG 3070 het 3070 ref 56 24 25 10 AG 1 0 144231 CASAVA_Build 10 131801324 1I CACTTTTGAT -/A TCGCTGGCCT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 0 1 144232 CASAVA_Build 10 131801937 6D TGAAAAACTT TAAAAA/------ TAATATGTGA 3070 het 3070 ref 22 13 9 2 TAAAAA 1 0 144233 CASAVA_Build 10 131804171 1D ACCCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 14 10 A 11 10 144234 CASAVA_Build 10 131804331 1I GTGTAATCCA -/G AAATTCCACT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 G 0 1 144235 CASAVA_Build 10 131804724 1D TGTCAGGGCC T/- TGGGAGGAGG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 2 1 144236 CASAVA_Build 10 131812035 1I CATAGTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2830 hom 31 8 17 6 A 12 13 144237 CASAVA_Build 10 131822207 4I TGTGTGTGCG ----/TTGT TTGTTTTTGT 3070 het 1637 hom 29 8 11 10 TTGT 1 2 144238 CASAVA_Build 10 131879516 1D ACCCCTGCTG C/- CTCCCCCCGT 3070 hom 61 het 32 0 26 7 C 2 1 144239 CASAVA_Build 10 131887803 12D CCGTCTCAGG AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2708 het 2708 ref 24 13 8 4 A 23 11 144240 CASAVA_Build 10 131895437 2I14M6I CACATGCACT --CACACACTCATGCA------/CACACACACTCATACACACACT CACACTCACA 3070 hom 117 het 53 0 37 20 N/A 0 0 144241 CASAVA_Build 10 131895508 4I TCTCACTCAT ----/ACTC ACTTTCACAC 3070 hom 113 het 49 0 36 15 ACTC 0 1 144242 CASAVA_Build 10 131895586 2D ACACACACTA AC/-- ACACTGACAC 3070 het 3070 hom 64 16 31 18 AC 3 2 144243 CASAVA_Build 10 131895608 2I CACACACATT --/CA CACACACACC 3070 het 2591 hom 66 10 24 32 CA 4 5 144244 CASAVA_Build 10 131895786 2I ACACTCACAC --/AT GTCACACACA 3070 hom 82 het 41 0 28 13 AT 0 1 144245 CASAVA_Build 10 131895941 4D39M3D ACCACACACA CCCCCCCCCCACACTATCTCACACACTCACACTTAGACACACTCTC/----CCCCCCACACTATCTCACACACTCACACTTAGACACACT--- ACACACACAC 3070 het 1254 hom 45 6 31 23 N/A 0 0 144246 CASAVA_Build 10 131902125 8D TGAGCGCGTT CCATTCCC/-------- CCATTCCCAC 3070 hom 57 het 25 0 17 11 CCATTCCC 2 1 144247 CASAVA_Build 10 131906305 3D CACAGGTTTG CAC/--- CACCATGTCT 3070 hom 3 het 25 1 14 11 CAC 2 1 144248 CASAVA_Build 10 131912052 1I ACCTCTATGC -/T TTTTTTTTTT 1657 het 1657 ref 27 14 5 8 T 13 14 144249 CASAVA_Build 10 131912435 1I TTTTTCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 45 0 35 10 T 11 12 144250 CASAVA_Build 10 131913771 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 34 0 28 6 A 11 10 144251 CASAVA_Build 10 131920733 2D GCACTTCTGG GC/-- GCCTCCCTCC 3070 hom 94 het 35 0 31 5 GC 2 1 144252 CASAVA_Build 10 131930035 1I CTTTTCTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 T 9 10 144253 CASAVA_Build 10 131934375 3D TTCAGTAAAT TGG/--- TGCTTTCCTT 3070 het 3070 ref 45 26 14 6 TGG 1 0 144254 CASAVA_Build 10 131936777 2I TCATCCACAG --/CA CACACACGTG 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 CA 3 4 144255 CASAVA_Build 10 131948715 1D TTTAGAATAA T/- TTTTTTTAAG 1176 het 1176 ref 16 8 4 4 T 8 7 144256 CASAVA_Build 10 131949612 11D GTGGCCCGTT CTCCAGGTGGG/----------- CTCCAGGTGG 3070 het 2674 hom 44 11 21 15 CTCCAGGTGGG 2 1 144257 CASAVA_Build 10 131976357 1I CAAATTACAG -/T TAAGGAAAAA 3070 het 3070 hom 22 12 10 0 T 1 2 144258 CASAVA_Build 10 131999160 2D GACACCAGGG CA/-- CACAGGACCC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 CA 3 2 144259 CASAVA_Build 10 132021776 2I CTGCTGATTT --/CA ATATTAGTCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CA 0 1 144260 CASAVA_Build 10 132026823 4D ATGAGTGTGT GTGA/---- GTGTGTGTGA 2126 het 2126 ref 35 13 9 15 GTGA 1 0 144261 CASAVA_Build 10 132031477 1D AACAGAACTT C/- CCGTGCCCAG 3070 hom 144 het 50 0 49 2 C 3 2 144262 CASAVA_Build 10 132036033 1D ATTTAAAAAT A/- TTTTTTTCTT 3070 het 2167 hom 24 5 18 2 A 1 0 144263 CASAVA_Build 10 132039179 2I TGCCAACCCC --/CG CCCCCCCTTC 2525 het 45 hom 25 2 11 12 CG 0 1 144264 CASAVA_Build 10 132040961 1D GTTTTCCTGT A/- AAAAAAAAAG 2963 het 2963 ref 19 10 7 3 A 10 9 144265 CASAVA_Build 10 132049465 1I TTGGTCCGGG -/T TCAAAAGCAC 3070 hom 68 het 31 0 20 11 T 1 2 144266 CASAVA_Build 10 132051004 15D TCAGGGACAG CAGGTCCTCCGCCTT/--------------- CAGGTCCTCC 3070 hom 65 het 28 0 21 10 CAGGTCCTCCGCCTT 2 1 144267 CASAVA_Build 10 132059153 1D ACCAAAGCAG C/- CCCCCCCTTG 3070 hom 88 het 35 0 27 8 C 8 7 144268 CASAVA_Build 10 132067771 2D GGTTCCGGAG TC/-- TCTGTGGGAT 3070 hom 75 het 31 0 24 10 TC 2 1 144269 CASAVA_Build 10 132071049 1I ATAAGGTTCA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 144270 CASAVA_Build 10 132071243 1I GGCAGAATTC -/T TTCTTTGGTG 3070 hom 108 het 38 0 36 2 T 2 3 144271 CASAVA_Build 10 132072180 12D38M4I AACCAACCAA CCAACCTATCAGCCAACCAACCAACCAATCTACCAGCCAGCTAACCAACC----/------------CCAACCAACTAACCAAACTACCAGCCAACCAACCAACCAACG TACCAGCCAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 N/A 0 0 144272 CASAVA_Build 10 132075863 1I TGCGTGGCTC -/T GCAGAAATCT 3070 hom 120 het 44 0 38 6 T 0 1 144273 CASAVA_Build 10 132077228 1D TCTCCCCAGG C/- CTGCCGGTCT 3070 hom 77 het 33 0 20 13 C 2 1 144274 CASAVA_Build 10 132079670 1D ACCTTGCCAG C/- CCTGGGAGGG 3070 hom 98 het 39 0 26 14 C 3 2 144275 CASAVA_Build 10 132082248 3I GGCATATGAC ---/CTT CTGAGGATAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CTT 0 1 144276 CASAVA_Build 10 132083307 4D AGCCCCCTGA GAGT/---- GAGTGGCAGG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GAGT 2 1 144277 CASAVA_Build 10 132104797 3D TGTGCAGCTC CCT/--- CCTCTGTGTA 3070 het 3070 hom 45 17 16 13 CCT 2 1 144278 CASAVA_Build 10 132108929 6I ATGTATATGT ------/ATACAC ATACACATAG 3070 het 3070 ref 42 18 12 12 ATACAC 1 2 144279 CASAVA_Build 10 132110761 1D ATTCTATAAT G/- GGGGGGGGCT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 G 9 8 144280 CASAVA_Build 10 132122980 8I GCTGGATTTG --------/GCTTTCCA GAAAGTCTGC 3070 het 1655 hom 30 5 22 3 GCTTTCCA 0 1 144281 CASAVA_Build 10 132124988 2I TAGCACCATC --/CT CTCTTGGTGC 3070 het 3070 hom 45 18 17 10 CT 2 3 144282 CASAVA_Build 10 132127022 2D TTTGTACTCT GG/-- GGCAAGGTTT 3070 het 3070 hom 39 16 20 5 G 4 2 144283 CASAVA_Build 10 132132999 1D AAGGACCATC T/- TCCCCACTTA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 T 2 1 144284 CASAVA_Build 10 132136358 1D TGGACCCTTC G/- AGTCTACATT 3070 het 3070 hom 53 23 27 3 G 1 0 144285 CASAVA_Build 10 132144165 2D CCCGCCCGAC TG/-- TGCCTGTCTG 1855 het 1855 ref 35 13 7 16 TG 2 1 144286 CASAVA_Build 10 132144192 2I GCGGCTGCTC --/TG TGTTGACCTC 3070 hom 58 het 35 0 20 15 TG 1 2 144287 CASAVA_Build 10 132174629 1I ACGAACTTTC -/G GGGGTGCCAT 3070 hom 86 het 37 0 28 9 G 4 5 144288 CASAVA_Build 10 132175166 3D AAGTGATTAA CTT/--- CTTCTACTCT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 CTT 2 1 144289 CASAVA_Build 10 132175632 1I TTTGCCATTA -/C CTACCCAACT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 1 2 144290 CASAVA_Build 10 132178885 4I ATTTCCTTGT ----/TTGA TGATCTTGCC 3070 hom 135 het 51 0 45 6 TTGA 0 1 144291 CASAVA_Build 10 132184259 1D GTTTCCAGGA C/- ACGGTTGGGG 3070 hom 68 het 29 0 23 6 C 1 0 144292 CASAVA_Build 10 132200273 1D CAGAGATGTA T/- TTCTCACAGT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 3 2 144293 CASAVA_Build 10 132206345 1I GACACTTCCA -/G GGCAATTGGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 2 3 144294 CASAVA_Build 10 132222462 1I CATTTCCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1266 hom 33 3 23 7 A 13 14 144295 CASAVA_Build 10 132225704 1I AATTTACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 14 0 9 5 A 10 11 144296 CASAVA_Build 10 132226549 1I AAGTACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 23 0 16 7 A 11 12 144297 CASAVA_Build 10 132233316 1I CCCGTGGTGG -/T TGGAGGGAGT 3070 hom 89 het 34 0 28 6 T 1 2 144298 CASAVA_Build 10 132234346 4D TTTGTGAGGC CGCT/---- CGCTGAGCTG 3070 hom 93 het 32 0 32 2 CGCT 2 1 144299 CASAVA_Build 10 132259035 1D CTCCACTTCA C/- CCTCCAGGGG 3070 hom 59 het 23 0 20 4 C 3 2 144300 CASAVA_Build 10 132273058 1I AAAAGCTTTT -/G GGGGGGGAAA 3070 het 60 hom 30 2 22 6 G 7 8 144301 CASAVA_Build 10 132277007 1I AATTCACAGA -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 6 7 144302 CASAVA_Build 10 132287806 1D CCCTTTCCTG T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 8 7 144303 CASAVA_Build 10 132288630 1I TTAAGTTACC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 8 9 144304 CASAVA_Build 10 132291178 1D TATGTTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 T 10 9 144305 CASAVA_Build 10 132310764 1I ATCCCTGGTG -/C TCTTGTGTCT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 C 0 1 144306 CASAVA_Build 10 132325081 2I TCATCTACTC --/TT TACTCAGATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 3 144307 CASAVA_Build 10 132330603 3I CCCCCACTGA ---/TGT TTTTTATCTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 TGT 0 1 144308 CASAVA_Build 10 132334807 1D AATAACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 51 1 37 13 T 11 10 144309 CASAVA_Build 10 132342441 4I TTGGGCAACA ----/GAGT GAGACTCCGT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 GAGT 0 1 144310 CASAVA_Build 10 132348351 1I GAAGGAGGTT -/G GGGGGGGTCT 3070 hom 53 het 23 0 15 8 G 7 8 144311 CASAVA_Build 10 132365104 1D TTCAATAAAG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 8 7 144312 CASAVA_Build 10 132371061 1D TGCAAAGTTA T/- CCCTGGGCTG 3070 hom 143 het 55 0 48 8 T 1 0 144313 CASAVA_Build 10 132379288 1I TAATGTAGGG -/A ATGGCTCACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 2 144314 CASAVA_Build 10 132399651 4I GCTGCGCTCT ----/AAAC AGACAGCCTG 3070 hom 137 het 51 0 45 6 AAAC 0 1 144315 CASAVA_Build 10 132406741 1I TGGAGGGGGC -/A CAGAGGAAGT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 A 0 1 144316 CASAVA_Build 10 132420035 1D ATGGTGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1010 hom 41 3 27 11 T 12 11 144317 CASAVA_Build 10 132423398 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 38 2 28 8 T 13 12 144318 CASAVA_Build 10 132438028 3I GTCCTGACTT ---/CTC CACCTATCCT 3070 hom 87 het 37 0 30 10 CTC 0 1 144319 CASAVA_Build 10 132444872 1D ACAAAGACTA C/- AAAAAAGCAA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 1 0 144320 CASAVA_Build 10 132454280 1I TCTGGGTGGG -/T GGGGGGGGCT 866 hom 8 het 7 0 4 3 T 0 1 144321 CASAVA_Build 10 132457900 1D GAGTGTAGTT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 81 het 35 0 22 13 G 8 7 144322 CASAVA_Build 10 132461482 1I TGTTTTTGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 9 10 144323 CASAVA_Build 10 132468639 3I TCTTTCCTTT ---/GAG GAGGTGAGAA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 GAG 1 2 144324 CASAVA_Build 10 132469097 1D CAGAAATATC T/- GATGGAGAAT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 T 1 0 144325 CASAVA_Build 10 132473209 3D TAAGCCTCAC CTT/--- CTTCCCTCTT 3070 hom 70 het 28 0 21 7 CTT 2 1 144326 CASAVA_Build 10 132481865 1I CTAAATATTG -/T TATTGCATAC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 1 2 144327 CASAVA_Build 10 132491753 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 9 10 144328 CASAVA_Build 10 132496147 10I AGAGGAGAGG ----------/CACCAGGACC ACAAGCTGAG 3070 hom 108 het 40 0 33 7 CACCAGGACC 0 1 144329 CASAVA_Build 10 132497406 1I TCAGAAACGC -/T GGATCGTGTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 144330 CASAVA_Build 10 132497895 1I TGGCACGGGT -/A ATGCATTATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 144331 CASAVA_Build 10 132498932 2D TTTTCACTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 9 A 13 11 144332 CASAVA_Build 10 132502334 1D TTCAGCTGAG C/- CCTGATTAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 3 2 144333 CASAVA_Build 10 132503403 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 8 144334 CASAVA_Build 10 132510655 1I TCACAGTATA -/T TTTTTTCACA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 6 7 144335 CASAVA_Build 10 132515985 1I TTAAAAAAGA -/T AAAAAGAAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 1 144336 CASAVA_Build 10 132526529 1D ATTACACTAG A/- AAAACTCTAG 3070 hom 141 het 55 0 48 7 A 5 4 144337 CASAVA_Build 10 132529794 1I ACCACCTGTT -/C CCCCAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 4 5 144338 CASAVA_Build 10 132541345 1I CTGTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 40 2 32 6 T 10 11 144339 CASAVA_Build 10 132544290 4D CACTACAAAG TACA/---- TACACTGCAA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 TACA 2 1 144340 CASAVA_Build 10 132561316 1I AATCTCATCT -/A AGGACAGTTA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 A 1 2 144341 CASAVA_Build 10 132561824 2I27M13I GTGTGTGTAC --ATATATGTATACACATACATATATATG-------------/ATATATATATATACACATACATATATATGGAGAGAGAGAGGA GAGAGAGAGA 3070 hom 78 het 26 0 27 4 N/A 0 0 144342 CASAVA_Build 10 132567421 3I AGGGAGTGGA ---/AGG AGGAGGACGC 3070 hom 87 het 34 0 26 8 AGG 2 3 144343 CASAVA_Build 10 132568978 1I ATTCCATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 T 10 11 144344 CASAVA_Build 10 132580518 1D GATTAAATAC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 1242 hom 27 5 11 11 T 9 8 144345 CASAVA_Build 10 132580796 1D CTCTTTCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 10 9 144346 CASAVA_Build 10 132582155 1D TTTTAGAGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 9 8 144347 CASAVA_Build 10 132595756 1D AGGAAATGCA T/- TTTTCCAGAA 3070 hom 66 het 27 0 24 4 T 5 4 144348 CASAVA_Build 10 132608356 1I GAGTTTGATA -/C CAGCCTGGCA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 C 1 2 144349 CASAVA_Build 10 132611303 1D GCTTGGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 548 hom 47 3 38 6 T 13 12 144350 CASAVA_Build 10 132612609 1I CCTGGGGAGG -/A GGCCACATCA 2897 hom 54 het 23 0 15 8 A 0 1 144351 CASAVA_Build 10 132614519 2I GTGAATGGGT --/GA GTGTGGTTGT 3070 hom 253 het 97 0 79 18 GA 0 1 144352 CASAVA_Build 10 132626112 12I GTGCAAACCG ------------/GTGGAGAAGTCT GTGCAAGCCT 3070 hom 102 het 42 0 32 10 GTGGAGAAGTCT 0 1 144353 CASAVA_Build 10 132628631 1I TACAAGGGAG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 7 8 144354 CASAVA_Build 10 132633204 3D TATTTCCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 41 0 31 10 T 15 12 144355 CASAVA_Build 10 132638628 3I TTTTACCACC ---/AGT AGTACATTGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGT 1 2 144356 CASAVA_Build 10 132644566 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 52 het 19 0 17 5 A 9 8 144357 CASAVA_Build 10 132662415 1D TGGGCATGTG T/- TTTTTGGAAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 6 5 144358 CASAVA_Build 10 132668581 4D CTATATCTAT ATAG/---- ATAGATATTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 ATAG 2 1 144359 CASAVA_Build 10 132671112 20D ATGGATAGAG AGATAGATAGATAGATAGAT/-------------------- AGATAGATAG 3070 hom 102 het 39 0 35 10 AGAT 10 5 144360 CASAVA_Build 10 132674956 11I GCCTGGGGCA -----------/CTCCGGGCTTT CTCATCCCTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 CTCCGGGCTTT 0 1 144361 CASAVA_Build 10 132677043 1D TGAGGCTATG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 9 8 144362 CASAVA_Build 10 132682944 1D TCTGGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1381 het 1381 ref 28 21 3 4 A 12 11 144363 CASAVA_Build 10 132684834 1I CCACAGACTC -/G CCAGAGCTGA 3070 hom 135 het 49 0 43 6 G 0 1 144364 CASAVA_Build 10 132693850 1D GATGATAAAA G/- CTATCATTGC 3070 hom 123 het 42 0 42 0 G 1 0 144365 CASAVA_Build 10 132698662 1D TCAGAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 11 10 144366 CASAVA_Build 10 132704558 3D ATTATTTTTG AGA/--- AGTTTTCTAG 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 AGA 1 0 144367 CASAVA_Build 10 132710079 1D TCTGCCGCAT G/- GGGGGTTTCC 1276 het 1276 ref 23 12 5 6 G 6 5 144368 CASAVA_Build 10 132716778 1D GGCGCTCCCC T/- GTCTCTCCCC 2998 het 2998 ref 27 13 9 5 T 1 0 144369 CASAVA_Build 10 132721536 1I CACTGAGGAC -/A GGGGCGTGGG 3070 hom 101 het 37 0 31 6 A 0 1 144370 CASAVA_Build 10 132733455 5D ATGATGGGTG GATAT/----- GATATGCCCC 2827 het 2827 ref 29 15 8 7 GATAT 2 1 144371 CASAVA_Build 10 132735551 1I CACTGCTCCA -/T TACATAACTT 3070 hom 119 het 49 0 43 6 T 1 2 144372 CASAVA_Build 10 132735849 4I ATCAATTACA ----/CTCT CTCTCCTGCA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 CT 2 4 144373 CASAVA_Build 10 132736851 4D CATCACTGGT GAGA/---- GAGACATGAG 2554 het 2554 ref 29 18 7 6 GA 4 2 144374 CASAVA_Build 10 132739195 1D AGTCAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 11 10 144375 CASAVA_Build 10 132739698 1I TCTGGTGGAT -/C CCACATCATT 3070 hom 123 het 44 0 38 6 C 2 3 144376 CASAVA_Build 10 132741164 1I TTTTCTGCTG -/T TAACTCAGGA 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 T 1 2 144377 CASAVA_Build 10 132749076 1D GGTCCATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 34 10 A 12 11 144378 CASAVA_Build 10 132767919 1D AGTTGGCAGA G/- GAAGAGTGGA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 G 2 1 144379 CASAVA_Build 10 132768603 1D CCTGAGCTAC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 8 7 144380 CASAVA_Build 10 132778545 19D AGGAACATCT GCCTCTGGGGAGGTAATCG/------------------- AATGAGAAGA 3070 het 3070 hom 41 20 19 9 GCCTCTGGGGAGGTAATCG 1 0 144381 CASAVA_Build 10 132784694 1I ATTCATGCTA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 6 7 144382 CASAVA_Build 10 132788625 2D AATGCCTGCT TC/-- TCTCTCTCTG 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 TC 5 4 144383 CASAVA_Build 10 132795978 2D GATTGCACAC AT/-- GTGTGTGACT 3070 het 3070 ref 39 21 9 9 AT 1 0 144384 CASAVA_Build 10 132812170 1D TTTCCTTGGT G/- GATTTTTGAA 3070 het 3070 ref 48 22 20 8 G 2 1 144385 CASAVA_Build 10 132812912 4I CTCATCATCG ----/CTGC CTGCCTGTCC 1796 het 1796 ref 37 19 8 10 CTGC 1 2 144386 CASAVA_Build 10 132813462 15I GGTGATGAAC ---------------/ATGATGATGATGGTG ATGATGATGA 3070 hom 104 het 44 0 32 12 ATGATGATGATGGTG 1 2 144387 CASAVA_Build 10 132817462 1I CTCTAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 10 11 144388 CASAVA_Build 10 132837568 29I GCAGACTCCA -----------------------------/GGTAGCTGCTCCAGGTAGCAGACTCCAGG CACCCAGGTA 3070 hom 70 het 26 0 19 8 GGTAGCTGCTCCAGGTAGCAGACTCCAGG 0 1 144389 CASAVA_Build 10 132839654 1I TATAGGCCCC -/T ATGCAAGTCC 3070 hom 87 het 37 0 28 9 T 0 1 144390 CASAVA_Build 10 132847958 2I ACCCCATGGC --/AA AGAGAGCTTT 3070 hom 111 het 40 0 36 4 A 1 3 144391 CASAVA_Build 10 132851546 1I AGGAATAAAC -/A AAATCTCCTG 3070 hom 77 het 30 0 23 7 A 3 4 144392 CASAVA_Build 10 132857558 1I AACCCTCATT -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 A 6 7 144393 CASAVA_Build 10 132858195 1D TTGATCTTGT A/- AAAAATCAGA 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 A 6 5 144394 CASAVA_Build 10 132863433 2I GGCTTCTGAC --/AA AGAGGCCAGC 3070 hom 99 het 37 0 30 7 A 1 3 144395 CASAVA_Build 10 132864557 18D ATGCACACAC AGAGACACATGCACACAG/------------------ AGACACGTGT 2891 het 2891 ref 67 55 16 16 AGAGACACATGCACACAG 1 0 144396 CASAVA_Build 10 132865099 6D22M6D27M16D ACACAGGCAC ATAGGAACACACAGAGACACGTGCACACACACCAAAACACATGCACACACAGACACATTCACACACCAAGATACATG/------ACACACCAAGACATGTGTACAC------AGACACATGCACACAGAGACACGTGCA---------------- CACACAGACA 1390 het 1390 ref 49 32 11 96 N/A 0 0 144397 CASAVA_Build 10 132865319 2I ATACACACAC --/AG AGACACATAC 3070 hom 133 het 88 0 59 29 AG 1 2 144398 CASAVA_Build 10 132869479 1I GCCAGAAAGA -/G GAGAGTGGGG 3070 hom 72 het 29 0 19 10 G 1 2 144399 CASAVA_Build 10 132871004 4D CAGTGCTCAC CTAA/---- CTGATTTATT 3070 het 3070 hom 41 13 23 7 CTAA 1 0 144400 CASAVA_Build 10 132886298 1D AGAATTGCTG T/- TTTTTACAAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 2 T 6 5 144401 CASAVA_Build 10 132887035 1D6M1D CACCACCCCT GGCAGATG/-GCAGAT- GGGCCCCGAG 3070 hom 51 het 17 0 18 4 N/A 0 0 144402 CASAVA_Build 10 132887074 1I4M1D CTTCTTTTGC -ATCTG/AATCT- GGGTGGAAGA 2949 hom 58 het 27 0 17 12 N/A 0 0 144403 CASAVA_Build 10 132915998 3I ATACACGTCT ---/TGA TGATTACAAA 3070 het 3070 hom 17 8 8 1 TGA 1 2 144404 CASAVA_Build 10 132916102 4I TCCCGTGGTC ----/TCTG TCTAATATTT 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 TCTG 0 1 144405 CASAVA_Build 10 132919372 13D GGTGAATTGG CCTCCAAGTGTAC/------------- CGAGTTCCAA 3070 het 3070 ref 30 13 14 5 CCTCCAAGTGTAC 1 0 144406 CASAVA_Build 10 132921679 6D ACACACACAT ATATAC/------ ACACATATGC 1475 het 1475 ref 29 16 5 8 ATATAC 1 0 144407 CASAVA_Build 10 132922940 4D TTTGTTGTCG TTGT/---- TTGTTTGTTT 1649 het 1649 ref 29 19 6 6 TTGT 3 2 144408 CASAVA_Build 10 132930722 1I GGGAGCACTC -/A AGAGAGTGGT 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 A 1 2 144409 CASAVA_Build 10 132936252 2I AGGTGCACAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 181 het 82 0 60 22 AC 5 6 144410 CASAVA_Build 10 132936534 2D CACCCACAGG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 166 het 73 0 49 24 AC 8 7 144411 CASAVA_Build 10 132942644 1I CACTATGTTG -/C CTAGGCTGGA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 1 2 144412 CASAVA_Build 10 132952312 1I19M1I7M1D GGGAGGGCTG -AAACACGCAAAGCCCCTCA-GCCACTGA/TAAACACGCAAAGCCCCTCAGGCCACTG- TAACATCCCC 1412 hom 12 het 5 0 5 0 N/A 0 0 144413 CASAVA_Build 10 132973834 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAATGA 2829 het 2527 hom 18 8 9 1 A 8 7 144414 CASAVA_Build 10 132977594 4I CTGATTATAA ----/AAGT AATACAGACT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAGT 0 1 144415 CASAVA_Build 10 132977720 4D TCTCTTATCG GTGT/---- GTGTGTGAGT 3070 het 3070 ref 59 31 23 6 GT 5 3 144416 CASAVA_Build 10 132979039 5I ACACTTACCA -----/CATTG CATTGGAGGT 3070 hom 72 het 33 0 25 9 CATTG 1 2 144417 CASAVA_Build 10 132981042 1D ATTTAATGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 10 9 144418 CASAVA_Build 10 132986402 1I GAGGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 323 hom 40 3 32 5 T 11 12 144419 CASAVA_Build 10 132994674 1I TCCGTAAATT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 A 8 9 144420 CASAVA_Build 10 133000981 1D CCATCCCGGG T/- CCACAGCTTC 3070 hom 66 het 26 0 15 11 T 1 0 144421 CASAVA_Build 10 133004299 1D GCACATCGCT C/- CCCCCAAGCC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 C 6 5 144422 CASAVA_Build 10 133007764 2D GCCCTCCCTC TG/-- TGTGTGCAGG 3070 het 3070 hom 39 17 16 9 TG 4 3 144423 CASAVA_Build 10 133011387 1D TACCTGTGTG A/- AAAAAAAAAA 1567 het 1567 ref 35 20 6 9 A 13 12 144424 CASAVA_Build 10 133013715 1I CTAGAGAAAG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 7 8 144425 CASAVA_Build 10 133019271 1D ACCACTTAGG C/- AATGGAGATT 3070 hom 111 het 44 0 38 7 C 1 0 144426 CASAVA_Build 10 133021407 1I GACTTCCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 13 14 144427 CASAVA_Build 10 133033022 1I CTACAGCAGG -/T TTGTCTGACA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 2 3 144428 CASAVA_Build 10 133035124 9D TCCTTCCTCC CTCCCTTCA/--------- TTCCTTCCTT 1436 het 1436 ref 34 16 13 17 CTCCCTTCA 1 0 144429 CASAVA_Build 10 133049152 2D GATGTCCCTC AG/-- GGGGGGGGCA 3070 hom 33 het 30 0 13 17 AG 1 0 144430 CASAVA_Build 10 133057766 4D TATCCTGCAC TAGT/---- TAAATACTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 TAGT 1 0 144431 CASAVA_Build 10 133065032 3D GATGAGGGAT GAA/--- GAAGAGCAGC 3070 hom 117 het 46 0 35 14 GAA 2 1 144432 CASAVA_Build 10 133074586 12D AGGGAGGAGC GGAGGGAGGAAT/------------ GGAGGGAGAA 2045 het 2045 ref 24 11 10 8 GGAGGGAGGAAT 1 0 144433 CASAVA_Build 10 133079860 1I CTTGCGTTTA -/C CCCCTGGTTC 3070 hom 114 het 40 0 37 3 C 4 5 144434 CASAVA_Build 10 133080850 1D AGTGTCAAAT C/- CCCAACGCTG 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 C 4 3 144435 CASAVA_Build 10 133084208 1I CCACCACAAT -/G GACCTTAGTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 1 2 144436 CASAVA_Build 10 133084707 2D AGAAGGCAAC TG/-- TGGAAGCAGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TG 2 1 144437 CASAVA_Build 10 133088600 1D GTTCTGGCAT G/- TGGGTTCCCC 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 G 1 0 144438 CASAVA_Build 10 133089186 1D GAAACTAACA T/- TTTGAATGGG 3070 het 3070 hom 34 13 20 2 T 4 3 144439 CASAVA_Build 10 133104389 1D AATTTAAATT C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 C 1 0 144440 CASAVA_Build 10 133109198 1I CTCTCAGAAT -/A AAAAATAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 5 6 144441 CASAVA_Build 10 133129174 1I TGAGTAGCTG -/T TCATTCTGCC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 T 1 2 144442 CASAVA_Build 10 133135193 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 2333 hom 19 7 10 2 A 11 9 144443 CASAVA_Build 10 133136797 1D GCTCTCAGCC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 86 het 30 0 28 2 T 8 7 144444 CASAVA_Build 10 133139016 1I ATTAAAAAAA -/C CAAAACATTA 3070 het 2976 hom 27 9 13 5 C 1 2 144445 CASAVA_Build 10 133155023 1I CATTTGTCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 200 hom 31 1 23 7 T 9 10 144446 CASAVA_Build 10 133155845 1I TTTGTATATT -/A ACCTTGTATC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 2 144447 CASAVA_Build 10 133171263 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 23 1 13 9 A 15 14 144448 CASAVA_Build 10 133173797 1I GATTTTTACC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 8 9 144449 CASAVA_Build 10 133181385 1D AGGCAACAGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 9 8 144450 CASAVA_Build 10 133187462 2I AAAGAAAAAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 19 0 16 3 A 9 11 144451 CASAVA_Build 10 133188696 1I GCATGCAATT -/C CCCCTTATTC 3070 hom 115 het 44 0 37 7 C 4 5 144452 CASAVA_Build 10 133192663 1I CTCATCCTCC -/T TGATGTTCTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 1 2 144453 CASAVA_Build 10 133202089 7I ATCCAGAACA -------/CTAGAGC CTAGAGCCCA 3070 hom 46 het 22 0 14 8 CTAGAGC 1 2 144454 CASAVA_Build 10 133209162 2I ACAGGCCCGG --/GT GTGTGTTGTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 GT 3 4 144455 CASAVA_Build 10 133212960 1I GAGTTTTGCC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 7 8 144456 CASAVA_Build 10 133215274 4D TAAGGCAGGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 14 10 144457 CASAVA_Build 10 133222966 4D TAAGTTGGAT TCTG/---- TCAAGTTTTG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TCTG 1 0 144458 CASAVA_Build 10 133235077 1I TTCCCCCAGC -/A CCCCCTGATT 3070 hom 156 het 57 0 48 9 A 0 1 144459 CASAVA_Build 10 133245882 1I CAATGTATAG -/A ATTAGTGATC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 2 144460 CASAVA_Build 10 133246670 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2542 het 1724 hom 20 9 10 1 A 13 12 144461 CASAVA_Build 10 133247655 1I ATTTTCATGA -/G GAAGCATGAG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 G 1 2 144462 CASAVA_Build 10 133253589 1D TACAGAAAAA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 20 20 1 T 2 1 144463 CASAVA_Build 10 133263692 1D GGCCAGTGCT G/- GGACATGCAC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 3 2 144464 CASAVA_Build 10 133263953 4D AGAAGGGAGG GAGT/---- GAGGAGAGGT 3070 het 3070 ref 36 20 13 5 GAGT 1 0 144465 CASAVA_Build 10 133264985 2D AGCGGTGTGA CT/-- CTGGCCTAGG 3070 het 1948 hom 21 7 10 4 CT 2 1 144466 CASAVA_Build 10 133283467 11I TGACAAAGCA -----------/ATCACAAAAGC CCTCACAACA 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 ATCACAAAAGC 0 1 144467 CASAVA_Build 10 133284115 2I CATCAATGAC --/AG AGACTGGATA 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 AG 1 2 144468 CASAVA_Build 10 133285394 1I CAGGGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 1175 het 1175 ref 36 13 4 19 T 17 18 144469 CASAVA_Build 10 133286930 1D ATCCAACTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 14 12 8 A 10 9 144470 CASAVA_Build 10 133299784 7D GTGGGCAGAG GGCAGAA/------- GGCAGAAGTG 3070 het 1646 hom 21 6 10 9 GGCAGAA 2 1 144471 CASAVA_Build 10 133302497 3D GAGAGGAGGC GGG/--- GGGGGGGGGC 2730 het 23 hom 20 1 13 6 G 12 9 144472 CASAVA_Build 10 133320672 1I GGGTCTGATC -/A CCAGCCTCAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 0 1 144473 CASAVA_Build 10 133329913 1I AAACCTCTCC -/T AACAGATCCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 0 1 144474 CASAVA_Build 10 133338760 1D CAGCCCTGAG C/- CTGGAGAACA 3070 hom 63 het 25 0 19 6 C 2 1 144475 CASAVA_Build 10 133382145 3D GTCTGTGTTT TCA/--- TGAAACATAT 3070 hom 129 het 47 0 42 8 TCA 1 0 144476 CASAVA_Build 10 133385238 1I GAGATCATGG -/C CCTGGGCTCT 3070 hom 113 het 47 0 35 12 C 2 3 144477 CASAVA_Build 10 133391908 2D CACCACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 107 het 43 0 34 9 AC 7 6 144478 CASAVA_Build 10 133394206 3I ACCCACAGTT ---/CAC CACTCCTTCT 3070 hom 141 het 50 0 45 5 CAC 1 2 144479 CASAVA_Build 10 133397150 1I TGGAGTTTTG -/A GAAGGATTGC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 0 1 144480 CASAVA_Build 10 133398564 2I AGTCTCAGGG --/TT TTTTTTTTTT 2936 hom 42 het 27 0 15 12 T 14 16 144481 CASAVA_Build 10 133399150 3I AGCCACATAC ---/AGA AGATTAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AGA 1 2 144482 CASAVA_Build 10 133421482 1I GTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTC 2896 het 1088 hom 12 3 7 2 T 9 10 144483 CASAVA_Build 10 133427486 24D CAGGAGGATG GGAGCACAGGAAGAAGGGAGGATA/------------------------ GGAGCACAGG 3070 het 3070 ref 36 13 16 18 GGAGCACAGGAAGAAGGGAGGATA 1 0 144484 CASAVA_Build 10 133446839 1I GGTAAATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 60 21 23 16 A 11 12 144485 CASAVA_Build 10 133452830 1D CAAAGGAGAC T/- TTTTAGAGGA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 5 4 144486 CASAVA_Build 10 133458739 5I TTTCCCCTGC -----/ATTTT ATTTATTGAT 3070 het 3070 hom 49 23 20 6 ATTTT 0 1 144487 CASAVA_Build 10 133502560 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 10 11 A 11 10 144488 CASAVA_Build 10 133522506 1D CTTCTTTAAA C/- CCCCCCCCGG 2312 het 2039 hom 31 10 9 12 C 9 8 144489 CASAVA_Build 10 133527220 1I TCCTGGAGAA -/G CCTTGGGCAG 3070 hom 66 het 28 0 20 8 G 0 1 144490 CASAVA_Build 10 133583489 2D GGGTGGAATG AC/-- ACAGTGTTTG 3070 het 3070 ref 36 17 12 9 AC 2 1 144491 CASAVA_Build 10 133588319 1I AGGTCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 12 13 10 T 11 12 144492 CASAVA_Build 10 133599002 3D AGGGGAGCCT GGA/--- GGAGGACTGT 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 GGA 3 2 144493 CASAVA_Build 10 133605036 2I GTGGTTGGGT --/GG GGTTTGGTTG 2427 het 2427 ref 25 14 8 3 G 2 4 144494 CASAVA_Build 10 133611838 1D GAGAGTTACG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 25 het 27 1 21 5 T 8 7 144495 CASAVA_Build 10 133626865 1I CCCCAGAGGA -/G GGTGACAAAG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 G 2 3 144496 CASAVA_Build 10 133630731 3D GTGGTTGGCT TTG/--- TTGTGTGCTA 3070 het 3070 ref 42 20 15 10 TTG 2 1 144497 CASAVA_Build 10 133633757 2D AGCAGGTAAC TG/-- AGACCCTCCA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 TG 1 0 144498 CASAVA_Build 10 133635148 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 17 14 6 A 9 10 144499 CASAVA_Build 10 133635534 2I AAGAAAACAC --/TG ATCGCGCATC 3070 hom 148 het 55 0 50 5 TG 0 1 144500 CASAVA_Build 10 133642403 1I TTTTACCTTT -/A AAAGCTTCTC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 3 4 144501 CASAVA_Build 10 133644089 1I AAAAAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 2172 het 2017 hom 19 7 8 4 A 11 12 144502 CASAVA_Build 10 133650295 3D TGTGGCCTGC TGA/--- TGATATTTAA 2770 het 2770 ref 26 14 9 3 TGA 2 1 144503 CASAVA_Build 10 133651849 2I TGGTGGTAAC --/AT AAAGTGGTAC 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 AT 0 1 144504 CASAVA_Build 10 133652042 4I GAGAATGGAT ----/AAAC AAATTACAGT 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 AAAC 0 1 144505 CASAVA_Build 10 133671166 8I GCTATACACC --------/GAGTAAGT GACTTTGTAA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 GAGTAAGT 0 1 144506 CASAVA_Build 10 133674808 1D CTCTGCAAAC T/- GGTGAATCTC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 1 0 144507 CASAVA_Build 10 133681935 2D GCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2310 hom 28 9 12 9 T 12 10 144508 CASAVA_Build 10 133695200 1D34M1D TGGGATTACA GGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCGAATTTTTCTTCT/-GCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCGAATTTTTCTTC- TTTTTTAATA 2641 het 2641 ref 13 7 7 5 N/A 0 0 144509 CASAVA_Build 10 133704133 2D CCCGATGAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3036 hom 27 10 11 6 T 13 11 144510 CASAVA_Build 10 133706432 3I AAAAAAAAAA ---/AAT ACAAAAATTA 3070 het 2703 hom 27 10 12 5 AAT 0 1 144511 CASAVA_Build 10 133709956 2I TCTCAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 2726 het 1461 hom 17 7 7 3 A 10 12 144512 CASAVA_Build 10 133712298 1D CCCCGACTAA T/- TTTTTTTTGT 1139 het 1139 ref 10 5 4 1 T 9 8 144513 CASAVA_Build 10 133714130 1I AAGGAGATTT -/G GGGGGGGGTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 G 8 9 144514 CASAVA_Build 10 133726907 6I TGGCTGGGAG ------/GCCCCT GCTCAAAGCT 3070 hom 91 het 35 0 30 5 GCCCCT 0 1 144515 CASAVA_Build 10 133728937 3D AGTTCGTTCC TAT/--- TATTGACCCG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TAT 2 1 144516 CASAVA_Build 10 133737497 5I GCGTACAAGA -----/GTTCC GTTCCCTTTT 1908 het 1908 ref 28 21 4 3 GTTCC 1 2 144517 CASAVA_Build 10 133739418 7D TTGTAGTGTA GGTCTGT/------- GGGCCACAAC 3070 het 3070 hom 35 13 22 2 GGTCTGT 1 0 144518 CASAVA_Build 10 133741693 1I AACTTATTGG -/T TTTGTTATTA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 3 4 144519 CASAVA_Build 10 133741839 1I TGCTGGGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 9 10 144520 CASAVA_Build 10 133742300 1I CCCTTGGCCC -/G GGCCGCCAGA 815 het 815 ref 12 3 4 5 G 2 3 144521 CASAVA_Build 10 133744691 1I TCATTTATTG -/A AAAGACTATC 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 3 4 144522 CASAVA_Build 10 133745664 2D TTGTTTGTTT GG/-- GGGGGGGGGC 3070 hom 33 het 13 0 12 2 G 11 9 144523 CASAVA_Build 10 133747668 16D TGGGTAGAAT GTTTGTGTTTCCACTC/---------------- GTTTGTGTTA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 GTTTGTGTTTCCACTC 1 0 144524 CASAVA_Build 10 133761352 8D CAGAGATTGC CCTTCCTT/-------- CCTTCCTTCC 1274 het 1274 ref 22 12 7 5 CCTT 5 3 144525 CASAVA_Build 10 133763379 1I CTCACCCTGG -/T TGATGGTGGT 3070 het 3070 ref 41 18 10 13 T 1 2 144526 CASAVA_Build 10 133763939 3D TCTGCCTCCC AGG/--- AGGGTGTCAG 2731 het 2731 ref 32 21 9 3 AGG 2 1 144527 CASAVA_Build 10 133769852 1D AAAATGATTT A/- AAAAAAAAAA 1055 het 1055 ref 33 27 3 3 A 11 10 144528 CASAVA_Build 10 133790246 1I TGATCATGTG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 7 8 144529 CASAVA_Build 10 133792225 3D ATTTGAGTGC CTA/--- CTTCTTTTTT 3070 hom 108 het 42 0 37 8 CTA 1 0 144530 CASAVA_Build 10 133799046 1D CCAGTAGGCT G/- GGTGGTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 G 3 2 144531 CASAVA_Build 10 133801492 1D GTGTGGGGAC A/- AGCCAGCCCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 2 1 144532 CASAVA_Build 10 133802699 6I TATGAGTGTG ------/TGTGTT TGTGTGTATG 3070 hom 75 het 37 0 25 12 TGTGTT 0 1 144533 CASAVA_Build 10 133802868 4D CTGTACGTGT GTGA/---- GTATGTGAGT 3070 hom 123 het 48 0 40 14 GTGA 1 0 144534 CASAVA_Build 10 133805560 2I TGACTTCCAC --/CG CGCGCGTTCC 3070 hom 30 het 15 0 11 4 CG 3 4 144535 CASAVA_Build 10 133807048 1D GTAAAAAAAA G/- TTTAATGTCA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 G 1 0 144536 CASAVA_Build 10 133807638 1D GCCACTGTGG C/- CCCATGGTTC 1451 het 1451 ref 28 13 6 9 C 4 3 144537 CASAVA_Build 10 133818493 3D49M4I GATGGTGATT ATGATGATGATGATAATGGTTATGGTGATGATGATGGCAATGATCATGATGA----/---ATGATGATGATAATGGTTATGGTGATGACGGTGGTGGTGATGATGATGATCAT CATGGTGGTA 3070 het 3070 ref 43 68 17 22 N/A 0 0 144538 CASAVA_Build 10 133832365 17D CAGCCCTGCA GGCCATGGACCCCGGCG/----------------- GGCACCGAAG 1439 het 1439 ref 25 14 6 10 GGCCATGGACCCCGGCG 1 0 144539 CASAVA_Build 10 133837316 3D GGTATGTTCA TGG/--- TGGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 62 32 10 24 TGG 2 1 144540 CASAVA_Build 10 133846998 3D CACAGTTCTG TAA/--- TAATAATAAG 3070 het 3070 ref 55 23 21 13 TAA 4 3 144541 CASAVA_Build 10 133869692 2I GCTGTGTCTC --/AT AAAGGGTGCG 3070 het 2865 hom 31 9 13 9 AT 0 1 144542 CASAVA_Build 10 133871022 2I AGGTGAAAAC --/TA TACAGAAATT 3070 het 3070 ref 33 17 16 0 TA 1 2 144543 CASAVA_Build 10 133877642 1D CCAAACCACA G/- GATCTAAGAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 G 2 1 144544 CASAVA_Build 10 133880498 2D CCCACTGGGG CA/-- CACTGCCTAG 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 CA 2 1 144545 CASAVA_Build 10 133891128 6I TGGTGATGGT ------/GATGGG GATGACAGTG 3070 het 3070 hom 55 22 19 14 GATGGG 0 1 144546 CASAVA_Build 10 133894789 1I AAACAAACTG -/C CCTGGATGGT 3070 hom 105 het 38 0 32 6 C 2 3 144547 CASAVA_Build 10 133895700 1I TGGGGAGCCT -/G GTCCTGCCCC 2803 hom 33 het 15 0 11 4 G 1 2 144548 CASAVA_Build 10 133899403 1D CTTTAAAGAT A/- ACACACTAAA 3070 het 3070 ref 46 26 9 11 A 2 1 144549 CASAVA_Build 10 133899668 1D GCCTCAGTCA G/- GAGCACAGAA 3070 het 2134 hom 27 9 12 6 G 2 1 144550 CASAVA_Build 10 133900683 1D TGTGCTCCCT G/- GACTGTGCTC 381 het 381 ref 31 15 6 11 G 2 1 144551 CASAVA_Build 10 133911579 4I TATGCACGCC ----/CAAA CAGAGATTAT 3070 hom 69 het 25 0 20 5 CAAA 0 1 144552 CASAVA_Build 10 133921004 4D ATCACACCCC CCAG/---- CCAAAGAGAT 2153 het 1776 hom 22 9 9 5 CCAG 1 0 144553 CASAVA_Build 10 133926420 2D GACTGTTATT AA/-- AAAGTCATAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 A 5 3 144554 CASAVA_Build 10 133931003 4D GTCCCACATC GTGT/---- GTGTGTCAGT 3070 het 3070 ref 66 38 16 16 GT 5 3 144555 CASAVA_Build 10 133931887 4I GTCCCACATC ----/ATGT GTGTGTGTGT 1732 het 1732 ref 72 57 5 10 ATGT 0 1 144556 CASAVA_Build 10 133932451 2D GTCTCACATC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 62 21 14 27 GT 8 7 144557 CASAVA_Build 10 133937345 11I TGAACGCACA -----------/GTGAGTGAATG GTGAGTGAAT 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 GTGAGTGAATG 1 2 144558 CASAVA_Build 10 133940113 1I CCCATCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1876 hom 27 7 14 6 A 11 12 144559 CASAVA_Build 10 133941958 1D CACAGTTTTT A/- AAAAATCAAA 3070 het 2322 hom 21 7 11 4 A 6 5 144560 CASAVA_Build 10 133978986 4D AAATAAATAA ATAG/---- ATAGCACAAA 3070 het 3070 hom 31 13 17 6 ATAG 2 1 144561 CASAVA_Build 10 133983387 1I CTTAGATGGA -/T TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 37 22 4 12 T 13 14 144562 CASAVA_Build 10 133993477 1I GCAGTCGCTG -/C CCCGGAGGAA 3070 hom 97 het 39 0 27 12 C 3 4 144563 CASAVA_Build 10 133996245 1D ACTGCGCCCC T/- GGAACAGTTC 3070 het 3070 ref 39 16 16 8 T 1 0 144564 CASAVA_Build 10 133999100 1D TGGATGTCGT C/- TATTGGTTGT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 C 1 0 144565 CASAVA_Build 10 134001334 1D AGCTAAGAGG T/- TGCGACGGCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 2 1 144566 CASAVA_Build 10 134009800 1I CTCTTTTCTA -/T TTAGGTTTTA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 T 2 3 144567 CASAVA_Build 10 134032176 2I TAAACGTAAC --/AT GTGTTACCGT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 AT 0 1 144568 CASAVA_Build 10 134033070 1D AGCAGAACAC A/- AAAGGGTTTT 3070 het 3070 ref 40 25 13 3 A 4 3 144569 CASAVA_Build 10 134041544 7I GGCGTGGTGG -------/CGGGCAC CTGTAGTCGC 1777 het 1777 ref 13 7 5 1 CGGGCAC 0 1 144570 CASAVA_Build 10 134043791 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3058 hom 21 8 10 3 A 13 12 144571 CASAVA_Build 10 134056554 1I TCCTTTGAGA -/T TACTGCCTCA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 1 2 144572 CASAVA_Build 10 134084448 1D AAAGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2960 hom 28 9 12 7 A 12 11 144573 CASAVA_Build 10 134091030 5D CCATCATCAT CACAC/----- CATCACTGTC 153 het 153 ref 72 41 4 32 CACAC 1 0 144574 CASAVA_Build 10 134091262 4D11M17D4M15D CCATCATCAT CACCATCACTATCACTGTCGTCATCATCATCACATTCATCATCAGATCACA/----AACACAATCAC-----------------CATT--------------- ATCACCATCA 3070 het 3070 ref 100 77 28 41 N/A 0 0 144575 CASAVA_Build 10 134098323 4I ACATACATAC ----/ATAT ACTGTGTATA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 AT 0 2 144576 CASAVA_Build 10 134117222 4I GCCCCTCTCC ----/GAGT GAGGCACCAG 3070 hom 45 het 17 0 14 3 GAGT 0 1 144577 CASAVA_Build 10 134137530 3D AAAAGAAAAT GGG/--- GGGGGGGGGT 2570 het 237 hom 23 1 6 16 G 12 9 144578 CASAVA_Build 10 134138411 5D ATTGATATAA TTAAG/----- TTATTAGATT 3070 het 3070 ref 27 17 8 3 TTAAG 1 0 144579 CASAVA_Build 10 134153078 1D TCCCCAGACA G/- GGCCCCGAGA 3070 het 2417 hom 30 8 12 11 G 3 2 144580 CASAVA_Build 10 134153557 5D TCACTGCAGT CGTCC/----- CGTCCCGCGG 1565 het 1565 ref 21 8 6 8 CGTCC 2 1 144581 CASAVA_Build 10 134175242 1D TTCTCAGCAA T/- TCAACAAGAG 3070 hom 126 het 44 0 42 3 T 2 1 144582 CASAVA_Build 10 134175387 1I AAACTCGCCC -/A AAGTGACAGA 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 A 2 3 144583 CASAVA_Build 10 134178076 8D35M17D GGTGTGCGTA TGTGAGTGTGTGTGGTGTGTGGTGAGTGTGTCTGTGGCATGTATATGTATGAATGTGTCC/--------TGTGTGGTATATGTTGTGTGTGTGTGTGGTATGTA----------------- TGTATGGATG 2967 het 2967 ref 70 63 10 10 N/A 0 0 144584 CASAVA_Build 10 134179149 1I AGTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 10 11 144585 CASAVA_Build 10 134182292 3I GCACGTGGGC ---/CGG CGGTGCCGTA 3070 hom 57 het 24 0 16 8 CGG 1 2 144586 CASAVA_Build 10 134195950 2I GGACAATGTC --/TT TTTCTGTTTT 3070 hom 141 het 56 0 46 10 T 3 5 144587 CASAVA_Build 10 134201769 9I AACCTCCAGA ---------/CCCAGAGGC CCCAGAGGCC 2814 het 854 hom 13 4 7 2 CCCAGAGGC 1 2 144588 CASAVA_Build 10 134224724 1D ACCTGGCTAG T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 117 het 43 0 37 7 T 8 7 144589 CASAVA_Build 10 134245737 1I TGCCAGGCCA -/T TGAAGACCTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 1 2 144590 CASAVA_Build 10 134260421 2D GTGTGCGCGC AT/-- GTGCACGCAT 3070 het 3070 hom 60 15 28 19 AT 1 0 144591 CASAVA_Build 10 134352529 3D ATATATGTGT TAA/--- TGTTTGCAAG 3070 het 3070 hom 72 32 33 8 TAA 1 0 144592 CASAVA_Build 10 134376025 2D GGGGTTGCAT TG/-- TGTGTGCACA 3070 het 3070 hom 65 20 31 17 TG 4 3 144593 CASAVA_Build 10 134378193 2I AAACCTAAAC --/AG GCATTCCAGA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 AG 0 1 144594 CASAVA_Build 10 134420152 2D AACAAACAAC TG/-- TGTTACTGGT 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 TG 2 1 144595 CASAVA_Build 10 134430844 4I ATGTGTCCTC ----/AGGG AGCTTGGGGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AGGG 0 1 144596 CASAVA_Build 10 134458622 1I TGGAGTGTTG -/C CCCCCCAGCC 3070 hom 49 het 18 0 12 6 C 6 7 144597 CASAVA_Build 10 134468954 2I1M5D GGTGTGGCTT --TGGGTG/CCT----- AAAAACCCTC 3070 het 3070 ref 33 22 11 1 N/A 0 0 144598 CASAVA_Build 10 134487465 3D GTGTGAGTGC TAA/--- TGTGTGCTGT 3070 het 3070 hom 55 20 19 20 TAA 1 0 144599 CASAVA_Build 10 134495153 12D GAAGCATATT TTGAACGCTGAA/------------ TTTTCATTTA 3070 het 3070 ref 40 26 12 6 TTGAACGCTGAA 1 0 144600 CASAVA_Build 10 134500130 1D CTCTGGACGG C/- CCCCCCCCCT 3070 het 239 hom 20 1 15 4 C 10 9 144601 CASAVA_Build 10 134516587 1D GTCAACACGG A/- ACACAGGTGA 3070 het 3070 ref 55 27 22 7 A 2 1 144602 CASAVA_Build 10 134518412 3D ATCTTTTAAA ATT/--- ATTGAGACTT 3070 het 3070 ref 31 20 10 2 ATT 2 1 144603 CASAVA_Build 10 134518660 5D CTCCGTTGCA ATTTT/----- ATTTTATCAG 3070 het 3070 hom 43 15 23 8 ATTTT 2 1 144604 CASAVA_Build 10 134550656 3I TCTCTCCTCT ---/CTC CTCTTCTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 CTC 1 2 144605 CASAVA_Build 10 134561490 2I CCCCACTCCC --/CT GTCCTCCTCC 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 CT 0 1 144606 CASAVA_Build 10 134567900 1D TCCCGCTGGG A/- CGCAATGACA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 A 1 0 144607 CASAVA_Build 10 134568652 4D GTCAAAATGC TTCT/---- TTCTTTGTCA 3070 het 3070 hom 49 15 21 13 TTCT 2 1 144608 CASAVA_Build 10 134592021 10I AAACCATTTC ----------/CAGATCAGCA CAGATCAGCA 3070 het 1716 hom 39 8 18 13 CAGATCAGCA 1 2 144609 CASAVA_Build 10 134611516 4D TGTGTACATG TGTA/---- TGTGTGTGCC 3070 het 3070 ref 77 39 34 7 TGTA 1 0 144610 CASAVA_Build 10 134611738 6I GCATGTGTGC ------/ATGTGT ATGTGTATGT 3070 hom 220 het 87 0 73 14 ATGTGT 2 3 144611 CASAVA_Build 10 134614565 1I CCAGTCAACT -/G GGGGGGGGGG 1082 het 324 hom 18 1 4 13 G 11 12 144612 CASAVA_Build 10 134648202 22I CGGGTCAGCA ----------------------/TTCCGACGGCATTCCGACGGCT TTCCGACGCT 3070 hom 75 het 31 0 21 10 TTCCGACGGCATTCCGACGGCT 0 1 144613 CASAVA_Build 10 134653167 1I TGTGTGTCGT -/G GGGTGGATCT 3070 hom 64 het 30 0 18 12 G 3 4 144614 CASAVA_Build 10 134660969 2I AAAATGAACA --/CT TTCTGCAGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CT 0 1 144615 CASAVA_Build 10 134661195 2I12M19D11M2D CACACATGCA --CACACACAACACACATGCACACACACAGGCAACACACATGCACG/CGCACAGACAACAC-------------------ACTCATATGCA-- CACAGACAAC 3070 het 3070 hom 58 23 22 34 N/A 0 0 144616 CASAVA_Build 10 134701349 1D AGAATTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 T 11 10 144617 CASAVA_Build 10 134718624 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1121 het 1121 ref 31 12 8 13 T 12 11 144618 CASAVA_Build 10 134773950 1I TCAGGCAGTG -/A CGTGGGGAAT 3070 het 3070 ref 47 16 12 19 A 0 1 144619 CASAVA_Build 10 134778152 1D CAAATGGACA T/- AAATAGCTCT 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 T 1 0 144620 CASAVA_Build 10 134785044 4D CAGTGTGTGT GTGA/---- GTGTGCTTGT 3070 het 3070 ref 97 47 30 21 GTGA 1 0 144621 CASAVA_Build 10 134814851 1D GACTCTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 8 A 12 11 144622 CASAVA_Build 10 134814948 1D ATACTTTTGC G/- AAACACAGTA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 G 1 0 144623 CASAVA_Build 10 134815032 51D CAAGAAACAG GAGACGCGTGGGGCCACAGCTCAGGGAGGTAAGAAACAGCAGACAACAGGA/--------------------------------------------------- GAGACGCGTG 3070 hom 75 het 24 0 26 4 GAGACGCGTGGGGCCACAGCTCAGGGAGGTAAGAAACAGCAGACAACAGGA 1 0 144624 CASAVA_Build 10 134815641 1D GTCTGTGTTA T/- CCGGATGGCT 3070 hom 138 het 51 0 46 6 T 1 0 144625 CASAVA_Build 10 134818959 1D AGGCTGCAAA T/- TGTAGAAGCC 3070 hom 75 het 30 0 23 8 T 2 1 144626 CASAVA_Build 10 134825795 10I CTCCATCGGG ----------/GCAAGTGGCT GCACCTGACT 3070 hom 115 het 45 0 36 9 GCAAGTGGCT 0 1 144627 CASAVA_Build 10 134826530 3I AGGGCTTCCT ---/GGA GGAGGTGTCC 3070 hom 139 het 53 0 44 9 GGA 1 2 144628 CASAVA_Build 10 134829946 8D GGTGTGTGCG GGTGTGCA/-------- TGTCTGTGCG 3070 hom 132 het 46 0 40 10 GGTGTGCA 1 0 144629 CASAVA_Build 10 134836986 1D TTCCTTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 40 2 31 7 T 11 10 144630 CASAVA_Build 10 134838831 4D CATGTGGTTG GATA/---- GATAAGTGGA 2589 het 2589 ref 41 12 10 19 GATA 2 1 144631 CASAVA_Build 10 134840673 2I ATACAGTATA --/GT GTGTGTCATG 3070 het 3070 hom 67 17 24 26 GT 3 4 144632 CASAVA_Build 10 134840698 2D GTGTATGTAG TA/-- TAGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 61 15 26 20 TA 2 1 144633 CASAVA_Build 10 134840937 3D TGAATGTAAT GTG/--- GTATGCATCT 3070 het 3070 hom 92 35 46 14 GTG 1 0 144634 CASAVA_Build 10 134841029 2I CATGCACATA --/GT GTGTGTGTCA 3070 het 3070 hom 94 35 41 18 GT 4 5 144635 CASAVA_Build 10 134842729 1D TTCCTGCCCC G/- AAATCTGATC 2577 het 2577 ref 29 13 9 7 G 1 0 144636 CASAVA_Build 10 134847515 4I CGTGCATCCT ----/CTTG CATGCACATA 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 CTTG 0 1 144637 CASAVA_Build 10 134847840 2I ACATGTGCTG --/CA CACACACGCT 3070 het 3070 ref 78 29 19 30 CA 3 4 144638 CASAVA_Build 10 134847883 8D28M2I ATGCTGCGCA CACACACGCACACACGCACACACCCACTCACACATT--/--------CACACACGCACACACCCACTCACACATTCA CAGAGATCAC 3070 het 545 hom 71 8 49 51 N/A 0 0 144639 CASAVA_Build 10 134856596 1D ATACACATAT G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 G 8 7 144640 CASAVA_Build 10 134872773 5I TGTGTGTGGT -----/GTGTG GTGTGGAGTA 3070 het 3070 ref 72 29 25 18 GTGTG 1 2 144641 CASAVA_Build 10 134872920 2D GGCGGGTATA GT/-- GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 77 27 17 34 GT 5 4 144642 CASAVA_Build 10 134882022 1D GAAGCTGCCT G/- GGGAGGTGCA 2226 het 2226 ref 23 12 6 7 G 4 3 144643 CASAVA_Build 10 134884910 1I GGCACAGGGG -/C CCAGCCTCTC 1862 het 1862 ref 32 13 10 9 C 2 3 144644 CASAVA_Build 10 134906206 1D TGGACATCTT A/- ACAAGCACTG 3070 hom 57 het 21 0 18 3 A 2 1 144645 CASAVA_Build 10 134916735 1I GCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1348 hom 19 het 8 0 7 2 A 13 14 144646 CASAVA_Build 10 134919170 2I GGGTGGGGGC --/CA CACCCTGCCA 3070 hom 52 het 22 0 14 8 CA 1 2 144647 CASAVA_Build 10 134924683 11I AGGGAGGTAT -----------/GGGCGGTTGGA GGGCTTGAGA 3070 hom 73 het 27 0 22 5 GGGCGGTTGGA 0 1 144648 CASAVA_Build 10 134934223 3I GGGCGGTCTC ---/AGA AGCTCACCTG 3070 hom 87 het 36 0 26 10 AGA 0 1 144649 CASAVA_Build 10 134942272 1D AGCTGCCCAC A/- ACCCTTGTTC 3070 hom 39 het 21 0 12 9 A 2 1 144650 CASAVA_Build 10 134947864 1D TTCTAATTTC T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 7 6 144651 CASAVA_Build 10 134951143 1I GGCTGAGGTA -/G GAGCATCACT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 G 1 2 144652 CASAVA_Build 10 134976867 1D ACACCACTTA G/- GGAGTAGACC 2244 het 2244 ref 16 7 7 2 G 3 2 144653 CASAVA_Build 10 134992887 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2995 het 2995 ref 29 8 7 14 T 12 13 144654 CASAVA_Build 10 135000803 4D AAACACACCC CAGA/---- CACACACACC 3070 het 1370 hom 35 7 14 14 CAGA 1 0 144655 CASAVA_Build 10 135002502 5D CCCCATACAC ACCTT/----- ACAGACACAC 3070 het 3070 hom 48 19 20 10 ACCTT 1 0 144656 CASAVA_Build 10 135003271 2I CCTCCAAACA --/CT CCCCTCACAC 3070 hom 179 het 72 0 53 19 CT 0 1 144657 CASAVA_Build 10 135003664 1D TGGTCTGGGG C/- CCCCCCCAGA 3070 het 2908 hom 35 12 11 12 C 8 7 144658 CASAVA_Build 10 135005665 1I GTCGCCCTAG -/T TGACAAGTGG 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 T 1 2 144659 CASAVA_Build 10 135006342 2D ACAGGCTAGT CA/-- CAGTGGCTCA 2809 het 2809 ref 24 11 8 6 CA 2 1 144660 CASAVA_Build 10 135031893 1D GCTCCCCTCA G/- GGTCTCAGCT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 3 2 144661 CASAVA_Build 10 135033042 1D GATCACATTG C/- CTTCCCTATA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 2 1 144662 CASAVA_Build 10 135037815 1I GCGTGGTGGT -/G GCACGCCTGT 1185 het 1185 ref 11 7 4 0 G 1 2 144663 CASAVA_Build 10 135040392 1I TGCAGCTCTT -/G GGGTCCATGT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 G 3 4 144664 CASAVA_Build 10 135040450 3D AGTCACTACA ATC/--- ACCCCTCCTT 3070 het 2032 hom 25 7 10 8 ATC 1 0 144665 CASAVA_Build 10 135045488 1I GGTCAGGCCT -/G GGGGTGACCT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 G 4 5 144666 CASAVA_Build 10 135046567 1D TAGTCCCAGC T/- ACTCAGGAGG 2429 het 2429 ref 13 6 5 2 T 1 0 144667 CASAVA_Build 10 135048960 2D TGGTGGGACC CT/-- GTCTGTGGCA 3070 het 3070 ref 25 11 7 7 CT 1 0 144668 CASAVA_Build 10 135056256 1D GCCCTGACTG C/- CCCCACTCAG 2574 het 2574 ref 26 12 6 8 C 5 4 144669 CASAVA_Build 10 135067573 1D TCCTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 13 12 144670 CASAVA_Build 10 135067983 4I TTTGTAAATA ----/CTTT CTTTAAGTCT 3070 hom 134 het 50 0 44 6 CTTT 1 2 144671 CASAVA_Build 10 135074707 1I GACAGTTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 9 10 144672 CASAVA_Build 10 135089810 6D ATGGATTGGA TAAAAC/------ TCCAATCCAT 1343 het 1343 ref 9 4 3 2 TAAAAC 1 0 144673 CASAVA_Build 10 135092154 1D CACAAGAGAA C/- AAGGATACCA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 1 0 144674 CASAVA_Build 10 135093195 2I ATGGAAAAAC --/CG TGAAATCAAG 1816 het 1816 ref 47 34 5 8 CG 0 1 144675 CASAVA_Build 10 135099344 3D CCACGATAAA TTG/--- TTATTATTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 TTG 1 0 144676 CASAVA_Build 10 135101232 3D GATTATAGAT ATG/--- ATGATATATG 3070 het 2850 hom 19 8 8 4 ATG 2 1 144677 CASAVA_Build 10 135103531 1D GAGGAGGTCT G/- GGTGTGTCCA 963 het 963 ref 14 9 3 3 G 3 2 144678 CASAVA_Build 10 135113560 1I GGGTTTCCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 99 hom 26 2 19 5 A 9 10 144679 CASAVA_Build 10 135114964 1D GTTTTTAGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 102 het 43 0 33 10 T 9 8 144680 CASAVA_Build 10 135128235 7D TGCAAGCAGC TGGGGTG/------- TGGGGTGTGG 1879 het 1038 hom 17 3 8 6 TGGGGTG 2 1 144681 CASAVA_Build 10 135138770 4D AGCCACACTC CTCA/---- CTCAGTGAGT 3070 hom 108 het 38 0 35 3 CTCA 2 1 144682 CASAVA_Build 10 135146063 1D AAATCGGGTA C/- CCGTGTGTGA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 C 3 2 144683 CASAVA_Build 10 135150366 1D TAGTTGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 41 1 29 11 T 13 12 144684 CASAVA_Build 10 135156796 2I AAGAACAAAA --/AG AAGAGAAGGA 3070 het 28 hom 28 1 17 10 AG 0 1 144685 CASAVA_Build 10 135172516 1D AAGAAATGAT G/- GGGAAAAACC 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 G 4 3 144686 CASAVA_Build 10 135183051 4I AGACAGAGAT ----/AGAG AGGGAGAGAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 AG 1 3 144687 CASAVA_Build 10 135184755 2D TTTATAAAAC AG/-- AAGTATATTT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 AG 1 0 144688 CASAVA_Build 10 135190857 1I ACAGGATTGT -/C CTCCCGGGCT 3070 hom 55 het 33 1 29 3 C 1 2 144689 CASAVA_Build 10 135197866 3I CTGGACCCTT ---/GTC GTTCCTTCCA 3070 hom 75 het 27 0 23 4 GTC 0 1 144690 CASAVA_Build 10 135198363 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 21 0 12 9 T 11 10 144691 CASAVA_Build 10 135201597 3D GGGAATGAAG TGT/--- TGTTGTAGGT 3070 het 1494 hom 39 7 19 13 TGT 3 2 144692 CASAVA_Build 10 135201613 1I TGTAGGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1251 hom 36 4 16 16 T 10 11 144693 CASAVA_Build 10 135204606 5D CGAGAGACTT AAGAA/----- AAGAAAGAGA 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 AAGAA 2 1 144694 CASAVA_Build 10 135205272 7I TGGTGATGAC -------/TCTTAAT AAGCATGCTG 1594 het 1594 ref 14 10 4 0 TCTTAAT 0 1 144695 CASAVA_Build 10 135213459 1I AAACCTGGCC -/A AAAAAAAAAA 2408 het 2408 ref 29 16 11 2 A 13 14 144696 CASAVA_Build 10 135223262 2D CCTAGCGAGC AA/-- AGAGGGAGTA 3070 het 3070 hom 27 10 11 9 A 3 1 144697 CASAVA_Build 10 135225253 1D TTAACTGGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 9 8 144698 CASAVA_Build 10 135226463 6D ACCATATCAC AGGCCA/------ AGGCCAAGGC 3070 het 3070 hom 31 11 14 10 AGGCCA 2 1 144699 CASAVA_Build 10 135259556 4I AAAATTGGTA ----/TTTC TTTCTTAAAT 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 TTTC 1 2 144700 CASAVA_Build 10 135268027 1D ACTTACATAA G/- GGCTACTCTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 G 3 2 144701 CASAVA_Build 10 135271654 2I ATCAGTTGTC --/TG TGTGGGTGCC 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 TG 2 3 144702 CASAVA_Build 10 135276817 3D CTAAGAAGCA TCC/--- TCCTCATCAG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 TCC 2 1 144703 CASAVA_Build 10 135288950 1D GGGCCCGAGA C/- CTATGCCGCT 2850 het 2850 ref 51 37 9 6 C 2 1 144704 CASAVA_Build 10 135289378 7I CAAAAACAAA -------/AACAAAC AAAACCACCA 3070 het 3070 ref 69 45 13 12 AACAAAC 0 1 144705 CASAVA_Build 10 135290771 1I AAATGCAGAG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 59 39 16 4 A 6 7 144706 CASAVA_Build 10 135290992 1D CTTTATTCAG C/- CCTCCCTAGT 2163 het 2163 ref 47 34 6 7 C 3 2 144707 CASAVA_Build 10 135291070 1I ATTCTGAACA -/T TCAGCTCCTG 3070 het 3070 ref 65 43 16 6 T 1 2 144708 CASAVA_Build 10 135293350 2D TAAAAAAAAA AT/-- TTAATAAAGA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 AT 1 0 144709 CASAVA_Build 10 135296916 1I CTTTATCCCT -/C TCATCTGTCG 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 C 0 1 144710 CASAVA_Build 10 135298101 1I AAAGACCACC -/A AAAAAACTCT 1791 het 1791 ref 56 41 5 11 A 6 7 144711 CASAVA_Build 10 135298994 4D ACAAGAACTC AATT/---- AAACTAAAAA 3070 het 3070 ref 79 41 29 12 AATT 1 0 144712 CASAVA_Build 10 135300537 2D AATATGTAAC AG/-- AGTAAAATAA 812 het 812 ref 56 50 2 5 AG 2 1 144713 CASAVA_Build 10 135300679 1I CATTAAAAAG -/T TTGGCTAATT 3070 het 3070 ref 23 10 11 3 T 2 3 144714 CASAVA_Build 10 135301531 1D GAAACGTCCC T/- TTTCTCCACA 3070 het 42 hom 24 1 15 8 T 4 3 144715 CASAVA_Build 10 135302364 1I CCATTTTATT -/A AAAATGTAGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 4 5 144716 CASAVA_Build 10 135302881 4D AAGGAAACAA TCAG/---- CAAAATATAA 3070 het 2807 hom 15 7 8 0 TCAG 1 0 144717 CASAVA_Build 10 135303392 4I12M2I TCTGATACAG ----ATAAACTGAGAG--/ATAAATAAACTGAGAGAT ACATAATTTC 3070 het 3070 ref 74 45 14 17 N/A 0 0 144718 CASAVA_Build 10 135305103 6I GAAAAGAAAG ------/GATCCA GATTCTTCTA 3070 het 3070 ref 57 35 16 6 GATCCA 0 1 144719 CASAVA_Build 10 135305476 1I AAAAGTGTGG -/C CCTCATATAT 3070 het 3070 ref 90 66 17 7 C 2 3 144720 CASAVA_Build 10 135306285 12I AAACAAGAAC ------------/AACAACAACAAG AACAACAACT 2682 het 2682 ref 51 40 6 5 AACAACAACAAG 0 1 144721 CASAVA_Build 10 135306423 1I AAACTCAAGC -/T TTTTTTATAA 2479 het 2479 ref 27 17 6 4 T 6 7 144722 CASAVA_Build 10 135306656 1I TTTATCAAAC -/T TTACTATTTT 3070 het 3070 ref 85 43 38 4 T 2 3 144723 CASAVA_Build 10 135307567 2D GTTTCAAATG AA/-- AAAAACTTGG 2848 het 2848 ref 28 18 8 3 A 7 5 144724 CASAVA_Build 10 135309408 1D ATTTTGCATT A/- AAATGGTGAA 2717 het 2717 ref 33 23 6 4 A 4 3 144725 CASAVA_Build 10 135313079 4I TATTTATGAT ----/ATTA ATTCATGATA 3070 het 3070 ref 94 29 29 37 ATTA 0 1 144726 CASAVA_Build 10 135313811 4D GGATTTTCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 17 16 25 T 15 11 144727 CASAVA_Build 10 135318442 1I AGTAACTAAA -/C CCAATCCATT 3070 het 3070 ref 78 36 30 12 C 2 3 144728 CASAVA_Build 10 135320181 1I CTGACTCCCT -/C CCCCTCACCT 3070 het 1595 hom 16 4 11 1 C 4 5 144729 CASAVA_Build 10 135320326 4D AAAATCCTCT TATC/---- TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 46 32 11 4 TATC 1 0 144730 CASAVA_Build 10 135321063 1I AAGCAAGCCC -/A AGCAGCTCAG 3070 het 3070 ref 93 51 29 13 A 1 2 144731 CASAVA_Build 10 135321388 5D ACCGAGCCCA AAGCC/----- AGGCCAGGCA 3070 het 3070 ref 77 52 14 18 AAGCC 1 0 144732 CASAVA_Build 10 135322083 1D CCACTTTGCA G/- GGCTGCTGCA 3070 het 3070 ref 66 29 26 11 G 3 2 144733 CASAVA_Build 10 135322998 3D AGCCTGTGCC CCA/--- CAACCTGCTC 1446 het 1446 ref 87 58 4 26 CCA 1 0 144734 CASAVA_Build 10 135363245 1I TTTTTATGTT -/C CCCCCCCCCA 1174 het 1174 ref 13 7 3 3 C 9 10 144735 CASAVA_Build 10 135364165 1I AATTCCAGTC -/T TTGTGGATCT 3070 het 3070 ref 34 24 8 4 T 2 3 144736 CASAVA_Build 10 135366919 1I CCATGAATCA -/G GCATAAATAT 3070 het 3070 hom 64 27 29 8 G 1 2 144737 CASAVA_Build 10 135369535 2I GGATTTAGGC --/TT TTATACAAAC 3070 het 3070 ref 58 42 13 3 T 2 4 144738 CASAVA_Build 10 135371545 1I TTTGTTAGCA -/T TTTTTTTTTT 2619 het 2619 ref 67 35 6 26 T 10 11 144739 CASAVA_Build 18 1555 1D TTAATCCTCC A/- AACAACCTTG 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 A 3 2 144740 CASAVA_Build 18 2866 2D CGGGCCAGAG AC/-- ACTGAGTAGG 3070 het 3070 hom 72 30 34 10 AC 2 1 144741 CASAVA_Build 18 3080 3D GTGCCTCAGC CCT/--- CCTCATCACA 3070 het 3070 ref 78 46 15 18 CCT 2 1 144742 CASAVA_Build 18 4338 1D CAAATCTTTT A/- AAAAAAACAC 1837 het 1837 ref 51 42 5 5 A 8 7 144743 CASAVA_Build 18 11020 4D TACACCAAAT AAAC/---- AGAATTTAAA 3070 het 3070 ref 26 18 8 1 AAAC 1 0 144744 CASAVA_Build 18 17696 2D34M6I TAGCAATTTT TATATCACACTGAGACAAAATATTATTTGTGATAAA------/--TATCACATTGAAACAAAATATTATTTTTGATAAATATCAT TATTGTTATG 3070 het 3070 ref 76 45 24 34 N/A 0 0 144745 CASAVA_Build 18 17939 1I GCGAGGAAAA -/G CAAGTGGGGC 2441 het 2441 ref 35 22 8 5 G 0 1 144746 CASAVA_Build 18 21992 1I ATTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 11 12 144747 CASAVA_Build 18 23152 1I GTCAATGGGG -/A AAAAAAACAT 967 het 967 ref 28 15 3 10 A 7 8 144748 CASAVA_Build 18 25711 1D TGGATATGAC A/- GTGAAAGCAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 1 0 144749 CASAVA_Build 18 36219 3D AGAGCCAGGG AGA/--- AGAACACTGT 1292 het 1292 ref 13 8 3 4 AGA 2 1 144750 CASAVA_Build 18 39961 1I TTGTAATGGA -/T GATTCATTTC 494 het 494 ref 43 30 2 11 T 0 1 144751 CASAVA_Build 18 41047 1I TAAATCCTTT -/C CCAACTGCAG 3070 het 3070 hom 85 37 43 5 C 2 3 144752 CASAVA_Build 18 42019 4D ATGTCTGGAG GGTC/---- GGTCTAGCAA 2504 het 2504 ref 60 46 8 8 GGTC 2 1 144753 CASAVA_Build 18 42388 1D GGCAAACATC T/- TGTTTAGCCA 2183 het 2183 ref 44 30 5 9 T 2 1 144754 CASAVA_Build 18 43382 2I TATAAAGTAA --/AC CAAATGATTA 1817 het 1817 ref 33 21 4 8 AC 0 1 144755 CASAVA_Build 18 47826 1D TATTTGAAGT A/- AAGGTGGAGG 2175 het 2175 ref 60 49 6 5 A 3 2 144756 CASAVA_Build 18 47993 1D CCAGGATGCA G/- GGAGCCATGT 989 het 989 ref 40 35 3 2 G 3 2 144757 CASAVA_Build 18 48968 1D AAGCAGGAGC A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 46 29 14 4 A 7 6 144758 CASAVA_Build 18 50099 3D GGAAATGTTC TTT/--- CCTTCTCTAT 2790 het 2790 ref 43 35 6 7 T 3 0 144759 CASAVA_Build 18 52999 3I46M2I TTTCAATCTC ---GTTAAATTTATCTGATAGAATTTTGAATTCCTTCTCTGCATTATAT--/ATTGTTAAATTTATCTGATAGAATTTTGAATTCCTTCTCTGTGTTATATTA TGAATTTCTT 3070 het 3070 ref 46 38 10 11 N/A 0 0 144760 CASAVA_Build 18 112066 1I GAAGCACTGG -/A AAAACCGATC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 4 5 144761 CASAVA_Build 18 173321 1D GGGTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1016 het 1016 ref 39 25 3 11 T 12 11 144762 CASAVA_Build 18 209268 1I TGAGCGGTAC -/A AAAATAACCA 1484 het 1484 ref 29 19 5 5 A 4 5 144763 CASAVA_Build 18 290138 1D TTTGCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 31 0 21 10 T 11 10 144764 CASAVA_Build 18 301863 4I GCACTGGCAG ----/GAGA GAGAGAGTGC 3070 hom 110 het 43 0 33 10 GA 3 5 144765 CASAVA_Build 18 304782 1I TCATTCACTG -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 A 6 7 144766 CASAVA_Build 18 308101 19D CTCAGCCTCC CGAGTAGCTGGGACTACAG/------------------- GCGCCCGCCA 823 hom 5 het 2 0 2 2 CGAGTAGCTGGGACTACAG 1 0 144767 CASAVA_Build 18 308967 1D ATGTGACGCC A/- TACGTTCCTG 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 A 1 0 144768 CASAVA_Build 18 314486 4I TAAGCTGGAA ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 AC 7 9 144769 CASAVA_Build 18 314694 1I CCGGGCCTGG -/T TGGCAGGTGC 3047 het 2751 hom 17 7 9 1 T 1 2 144770 CASAVA_Build 18 328985 9D ATTGTCTTAA TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 38 0 36 4 T 20 11 144771 CASAVA_Build 18 370496 5I GTATCTTTTC -----/TTTTT ATCAACGGTG 3070 hom 123 het 51 0 41 10 T 0 5 144772 CASAVA_Build 18 372004 1I TTACAGACTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 8 9 144773 CASAVA_Build 18 388071 1D AAAAAAACAC A/- AAAAAACAGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 6 144774 CASAVA_Build 18 391512 3D TGAAAGTATA ATT/--- ATTATCATCA 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 ATT 2 1 144775 CASAVA_Build 18 398612 2D GAGAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 12 10 144776 CASAVA_Build 18 400789 1I GAGCACAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 A 10 11 144777 CASAVA_Build 18 402490 5D AGAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 5 AAAAG 1 0 144778 CASAVA_Build 18 402630 4I ATTATAAAAC ----/TGTT TGGTCTGGTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 TGTT 0 1 144779 CASAVA_Build 18 403512 1I TATTCTAGAG -/A AAGGATGATT 3070 het 3070 hom 47 19 26 2 A 2 3 144780 CASAVA_Build 18 405548 4I TGAACTATAA ----/TTAT TTGTTTACCT 3070 het 3070 ref 51 31 18 2 TTAT 0 1 144781 CASAVA_Build 18 407113 2D ATGCATGGTT AA/-- GTGATTTCAT 3070 het 3070 ref 50 30 13 7 A 2 0 144782 CASAVA_Build 18 410887 3I CACACCTCCT ---/CTA CTACCTGGCC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CTA 1 2 144783 CASAVA_Build 18 413114 1I CTAAAAAAAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 95 het 37 0 31 6 A 7 8 144784 CASAVA_Build 18 416295 1I GATTAATGGG -/T TGTTGTCAAT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 T 1 2 144785 CASAVA_Build 18 420334 1I ATTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2608 hom 27 6 14 7 A 13 14 144786 CASAVA_Build 18 422732 4I CATCTGATAT ----/TATA ACTGTCTATC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TA 0 2 144787 CASAVA_Build 18 425599 2D TAAATCCAAA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 90 het 36 0 31 7 TC 8 7 144788 CASAVA_Build 18 429992 2D TGTATGAATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 123 het 53 0 42 14 CA 8 7 144789 CASAVA_Build 18 431093 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTGGC 1862 hom 10 het 4 0 4 0 A 6 5 144790 CASAVA_Build 18 434165 1D TGAAACAACC T/- CATCAGAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 1 0 144791 CASAVA_Build 18 440916 1D GTAAAGGCCA C/- TTTTTCCATG 3070 het 3070 hom 54 27 24 3 C 1 0 144792 CASAVA_Build 18 444157 3I ATATTCTAGC ---/CCT CCTATTTCTT 3070 hom 86 het 34 0 26 8 CCT 1 2 144793 CASAVA_Build 18 450058 1I AGGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 10 11 144794 CASAVA_Build 18 450791 10D TCTGCAGTGT CTACCGGTCA/---------- CTCTCCTGGG 3070 hom 120 het 45 0 38 9 CTACCGGTCA 1 0 144795 CASAVA_Build 18 451694 1D GGCTAAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 10 9 144796 CASAVA_Build 18 460984 2I CCTTGGGAAT --/AA AAGAATGCAG 3070 het 3070 ref 41 27 9 5 A 2 4 144797 CASAVA_Build 18 461288 1D CAATGTTTCA T/- TGTGGCAAGA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 2 1 144798 CASAVA_Build 18 463352 13I TCCAAATGAA -------------/CAGCTCAAATCTC CAGCTCAAAT 3070 het 3070 ref 26 10 10 8 CAGCTCAAATCTC 1 2 144799 CASAVA_Build 18 463496 10I CCCGAGAAGC ----------/TGGGATTACA TGGGATTACA 2517 het 1713 hom 14 5 6 3 TGGGATTACA 1 2 144800 CASAVA_Build 18 471326 12D TGGGTAACTG GGACCAACCGAT/------------ GGTTTCGCAG 3070 het 3070 ref 37 27 9 5 GGACCAACCGAT 1 0 144801 CASAVA_Build 18 478882 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 11 144802 CASAVA_Build 18 489877 4I CCAGTGGGCA ----/CACC CACCCCAAGG 3070 hom 57 het 22 0 18 4 CACC 1 2 144803 CASAVA_Build 18 491832 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 21 1 16 5 T 15 14 144804 CASAVA_Build 18 492616 1D CGCCCTGCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 19 8 A 11 10 144805 CASAVA_Build 18 493039 2I AAAACAAAAC --/AG AAAATAAGTG 3070 hom 138 het 50 0 45 5 AG 0 1 144806 CASAVA_Build 18 493755 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2630 het 31 hom 12 1 7 5 A 19 18 144807 CASAVA_Build 18 504529 1I GACCTCCGGA -/C CCCTCCTCGG 1129 het 848 hom 16 5 6 5 C 3 4 144808 CASAVA_Build 18 516052 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 34 2 25 8 T 11 10 144809 CASAVA_Build 18 517158 1D ATTTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 20 1 15 5 T 11 10 144810 CASAVA_Build 18 517755 1I GTCATGCACG -/C TGAATTTGAA 3070 hom 135 het 51 0 44 7 C 0 1 144811 CASAVA_Build 18 532410 2I TCGTAAGAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 12 7 A 10 12 144812 CASAVA_Build 18 539446 1I TTATTCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2249 hom 35 9 14 12 T 10 11 144813 CASAVA_Build 18 543258 4D AAATGATTGG ATAA/---- ATAAATTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATAA 2 1 144814 CASAVA_Build 18 544837 1D ATTTATTTCA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 7 144815 CASAVA_Build 18 550144 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1321 hom 13 3 9 2 A 20 19 144816 CASAVA_Build 18 551144 1I AGAAGGCATT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 8 9 144817 CASAVA_Build 18 562581 1I CCTAATTGCA -/C CCCCCTTTCC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 C 5 6 144818 CASAVA_Build 18 579340 1I TCAGACTGCG -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 6 7 144819 CASAVA_Build 18 581098 1I CTTGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 2901 het 2901 ref 29 9 10 10 T 12 13 144820 CASAVA_Build 18 581427 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 10 11 144821 CASAVA_Build 18 582438 6D TTTTCCGAGT ATTTAC/------ ATTTTCCTCT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 ATTTAC 1 0 144822 CASAVA_Build 18 582564 2D TTATCTTGGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 81 het 37 0 28 11 AT 9 8 144823 CASAVA_Build 18 603148 1D TTTTATTGTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 61 het 26 0 21 5 T 8 7 144824 CASAVA_Build 18 607776 2D ACTGTCGTGA AG/-- AGTTTAAACC 3070 hom 27 het 14 0 10 4 AG 2 1 144825 CASAVA_Build 18 616904 2D22M1D9M1D6M62D9M1I12M1D AGAAAGAAAG AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGGAAAGAAGGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAG-AAAGAAAGAAAGA/--AGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAG-AGAAAAGAA-GAAAGA--------------------------------------------------------------GAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAG- AAAGAAAGAA 1673 het 64 hom 3 2 4 1 N/A 0 0 144826 CASAVA_Build 18 620862 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 1108 het 1108 ref 16 7 5 4 T 13 14 144827 CASAVA_Build 18 638582 2D ATTGTTCTGG AT/-- ATATATATAT 2299 het 2299 ref 34 23 6 5 AT 8 7 144828 CASAVA_Build 18 650442 1D TAGAAGGGGG A/- CAGCAGGTAG 3070 hom 104 het 38 0 35 3 A 1 0 144829 CASAVA_Build 18 656165 4I TCTTTGTAGG ----/TCAC TCAGATGATT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TCAC 0 1 144830 CASAVA_Build 18 657617 1D TGATGGAGAT G/- GGTGATGGTG 3070 hom 70 het 49 1 37 13 G 3 2 144831 CASAVA_Build 18 657993 1D TTCACAGGAA T/- TTTTTTTTTT 1550 het 1550 ref 27 12 4 11 T 19 18 144832 CASAVA_Build 18 658239 4I CTTTTTAAAA ----/TCTT TCTTTGATGT 3070 hom 126 het 47 0 41 6 TCTT 1 2 144833 CASAVA_Build 18 659761 4D TCGCTGCCAC CTCA/---- CTAACATTTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 CTCA 1 0 144834 CASAVA_Build 18 661786 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 122 het 47 0 43 4 T 10 11 144835 CASAVA_Build 18 669376 1I TGCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 T 5 6 144836 CASAVA_Build 18 669562 1D AAAATCCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 35 0 22 15 A 13 12 144837 CASAVA_Build 18 672923 2I ACCAAAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 22 0 12 10 A 12 14 144838 CASAVA_Build 18 675027 1I ACCTGGTTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 8 9 144839 CASAVA_Build 18 677010 4D42M4I CTGACTCACC AGATACACTGCTGCAGCCTCCCCCGGGTATGCAGAGGGAGGGCAAA----/----ACATTGCTGCAGCCTCCCCCGGGTATGCAGAGGGAGGGCAAACAGC CAGCACTTAC 3070 hom 71 het 23 0 23 15 N/A 0 0 144840 CASAVA_Build 18 682630 5D AAAAAAAGAA AAAAG/----- AAAAGAGTAC 3070 hom 49 het 19 0 13 9 AAAAG 2 1 144841 CASAVA_Build 18 683987 2D GCGTTGGCAG CT/-- CTAATGCTGG 3070 hom 89 het 38 0 28 10 CT 2 1 144842 CASAVA_Build 18 684809 4I CTCTCTTCTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 86 het 33 0 29 4 TC 5 7 144843 CASAVA_Build 18 685559 3I TCAGCTGTAA ---/TGG TGGGCTTGAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TGG 1 2 144844 CASAVA_Build 18 687378 2D GATTGAACTC TT/-- GTTTATGCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 2 0 144845 CASAVA_Build 18 693389 1D TGGCCTAACA T/- TATCTTGTAA 3070 hom 90 het 36 0 29 8 T 2 1 144846 CASAVA_Build 18 694956 3I GGCAGCACTC ---/AGG AGAAGTCTGC 3070 hom 88 het 37 0 30 8 AGG 0 1 144847 CASAVA_Build 18 696323 4I ACCATGAAAC ----/ACTG TTTTTACTCA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 ACTG 0 1 144848 CASAVA_Build 18 697852 3D AAATAATGTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 TTA 7 6 144849 CASAVA_Build 18 705247 1I TAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 30 hom 27 1 25 1 A 9 10 144850 CASAVA_Build 18 705946 1D GCTTCTTTGG A/- AAATAGGTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 4 3 144851 CASAVA_Build 18 707048 12D GTGTCTCTCC AAGTATCTCTGG/------------ AAGTACTTGG 3070 hom 95 het 37 0 31 7 AAGTATCTCTGG 1 0 144852 CASAVA_Build 18 707402 7D TTATTTCTAA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 25 0 21 5 T 17 10 144853 CASAVA_Build 18 709132 1D TAGTTTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 30 1 19 10 A 12 11 144854 CASAVA_Build 18 709287 1D TTTGAGCAGT G/- TAATCAGACA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 1 0 144855 CASAVA_Build 18 709736 2D ACTCTTAAGT CA/-- CTTTTTTTTT 1286 hom 43 het 28 0 14 14 CA 1 0 144856 CASAVA_Build 18 712010 2D AATACACATT AA/-- GTTAGTGTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 0 144857 CASAVA_Build 18 713395 2I AAACTTTCAC --/AT TTTCTTTTCT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AT 0 1 144858 CASAVA_Build 18 717596 3I TTTTGTCTTC ---/TCT TCTTGTTATT 3070 hom 96 het 33 0 32 1 TCT 1 2 144859 CASAVA_Build 18 720958 9I GAAGGGTGAA ---------/GGGCAAGGT ATCAGCAAAG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 GGGCAAGGT 0 1 144860 CASAVA_Build 18 726177 3D20M17D TATCTCGAAA AACAACAACAACAACAAACATTACAGATAGGAAGGCATTC/---AACAACAACAACAAACATTA----------------- CAGATGGAGG 3070 hom 83 het 23 0 28 3 N/A 0 0 144861 CASAVA_Build 18 729919 1D TAGCTTTTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 32 0 23 10 T 8 7 144862 CASAVA_Build 18 738798 1D CATTTTAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 39 1 29 13 A 11 10 144863 CASAVA_Build 18 739859 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 12 2 8 3 A 17 16 144864 CASAVA_Build 18 741881 1I ATTGCCAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 594 hom 30 3 18 9 A 12 13 144865 CASAVA_Build 18 746283 1I TGCCTACAGT -/G GGGGGGGGGC 3070 het 872 hom 19 3 12 4 G 9 10 144866 CASAVA_Build 18 749704 2I AATTTATTTA --/TT TTTCTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 3 5 144867 CASAVA_Build 18 753532 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 het 2027 hom 23 6 13 4 A 6 7 144868 CASAVA_Build 18 754214 1D GGCTGACTCC A/- AAAGTTTCCA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 4 3 144869 CASAVA_Build 18 755250 28D GAGTTACAAC TATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATA 3070 hom 39 het 16 0 13 7 TA 22 8 144870 CASAVA_Build 18 759423 5D TTTTTCCCTG CTTAC/----- CTTATTCACT 3070 hom 87 het 34 0 29 6 CTTAC 1 0 144871 CASAVA_Build 18 771766 1D CTGAATTTCC T/- TTTTTTTTTG 939 het 939 ref 37 29 3 5 T 10 9 144872 CASAVA_Build 18 775447 14D GTAAAGCTGG GCTTGTTCTAAGTA/-------------- GCTTGTTCTA 3070 hom 87 het 38 0 28 12 GCTTGTTCTAAGTA 2 1 144873 CASAVA_Build 18 800011 1I TCCTTGCAGG -/T TTTTTTTTTT 2795 het 820 hom 26 3 14 9 T 15 16 144874 CASAVA_Build 18 808336 1I TTCATTTCAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 52 hom 50 1 44 5 A 8 9 144875 CASAVA_Build 18 826635 3I GCTGCGCTGG ---/TCT CCAACTCCTG 3070 hom 37 het 16 0 9 7 TCT 0 1 144876 CASAVA_Build 18 828445 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 39 het 18 0 14 8 T 9 8 144877 CASAVA_Build 18 828621 7D ATGGGGTTTC TCTACTG/------- GCCATGTTGG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 TCTACTG 1 0 144878 CASAVA_Build 18 837420 1D TAAATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 32 3 16 13 T 15 14 144879 CASAVA_Build 18 840207 1I ACTTAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 11 12 144880 CASAVA_Build 18 840969 1D CCAACGTAGC A/- AATCAATTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 2 144881 CASAVA_Build 18 844260 1D AGCAGAGAAC G/- GAAGTTCAGA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 G 2 1 144882 CASAVA_Build 18 850205 2D GGGATTAAAC AT/-- AGTTTGATTA 3070 het 2500 hom 24 6 15 3 AT 1 0 144883 CASAVA_Build 18 855292 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 9 8 144884 CASAVA_Build 18 865331 2D TGAGTTAGGT AC/-- ATTTCTTTCC 2793 het 2793 ref 30 19 8 3 AC 1 0 144885 CASAVA_Build 18 871491 2I TCTCTCTTTT --/TG TGAGTGTGTG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TG 1 2 144886 CASAVA_Build 18 877247 2I CAGCGTCAAC --/TT TTGCTCAAGA 3070 hom 96 het 35 0 30 5 T 2 4 144887 CASAVA_Build 18 881562 5I AGTCTTTGCA -----/AGCAC AGTGATTTTT 3070 hom 120 het 45 0 40 6 AGCAC 0 1 144888 CASAVA_Build 18 886198 1D ATACTAGTAG T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 T 8 7 144889 CASAVA_Build 18 892875 1I CAAAACTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 10 21 9 T 11 12 144890 CASAVA_Build 18 893640 1D ACGCTACAAG A/- GGGAAAGGAT 3070 het 3070 ref 37 25 12 0 A 1 0 144891 CASAVA_Build 18 901419 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 10 9 144892 CASAVA_Build 18 905354 1D AATGTCCTTT C/- TCTACCCACC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 1 0 144893 CASAVA_Build 18 905728 3I TATTTCTCCC ---/TTG TTGTAACAGG 3070 hom 132 het 50 0 44 6 TTG 1 2 144894 CASAVA_Build 18 910284 19D TTAATATAAA ACTCAAATTCCTTGGAGTT/------------------- ACTCAAAGCC 2204 het 2204 ref 24 18 6 6 ACTCAAATTCCTTGGAGTT 1 0 144895 CASAVA_Build 18 913986 4I TGTGTGTGTG ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 TA 5 7 144896 CASAVA_Build 18 914668 1D GAAAGAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 12 11 144897 CASAVA_Build 18 916789 2D GGGGCAAGTC AG/-- AGAGCTCAAT 3070 hom 45 het 20 0 16 5 AG 3 2 144898 CASAVA_Build 18 926748 5D ATAGGCAGTT CTTAA/----- CTTGTGATAC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 CTTAA 1 0 144899 CASAVA_Build 18 935888 1I GAGGTCTTTA -/T TTTTCTGGAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 4 5 144900 CASAVA_Build 18 952151 1I GAAGAAAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 661 hom 27 2 25 0 T 9 10 144901 CASAVA_Build 18 957797 1D AAATATTAAG A/- AGGGAAAGGA 3070 het 3070 ref 52 28 19 5 A 2 1 144902 CASAVA_Build 18 972180 1I AACCTTCTCC -/A GGTCTACTCG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 0 1 144903 CASAVA_Build 18 973014 1I ACCATGGCCG -/C CCCCCCACCC 2271 het 4 hom 24 0 14 10 C 6 7 144904 CASAVA_Build 18 979744 1D TTGAATTACA T/- TTTTTTTTTT 1525 het 1525 ref 22 12 5 5 T 13 12 144905 CASAVA_Build 18 979790 1D GGGAGCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 19 0 12 9 T 11 10 144906 CASAVA_Build 18 987371 1I TACAAAAAAT -/G CAAAAATTAG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 0 1 144907 CASAVA_Build 18 1057997 1I TAATTTTCTC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 7 8 144908 CASAVA_Build 18 1064484 8D ATTACAGAAT GTAAATAA/-------- GTAAGAATTT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 GTAAATAA 1 0 144909 CASAVA_Build 18 1087529 1I ATAAGTCTTG -/T TTGTCGGGGG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 2 3 144910 CASAVA_Build 18 1090676 1I GGCAGGTATG -/T TCTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 T 1 2 144911 CASAVA_Build 18 1095925 1I AGAAATGAGC -/T TGCAGGATAA 3070 het 3070 ref 53 31 17 5 T 1 2 144912 CASAVA_Build 18 1101578 1D CACATAGTTA C/- CCACTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 15 22 6 C 3 2 144913 CASAVA_Build 18 1127123 1D TTGAATTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 26 4 14 9 T 17 16 144914 CASAVA_Build 18 1134063 1D CTTCTGATAA G/- GGTCCAACAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 3 2 144915 CASAVA_Build 18 1146536 1D GGTCACATGT C/- CCCCCAGTCC 3070 hom 162 het 59 0 51 9 C 6 5 144916 CASAVA_Build 18 1150739 2I GAGAGAGAGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 121 het 44 0 38 6 GA 5 6 144917 CASAVA_Build 18 1154132 7D ATGTAGCTGT AGGGGAG/------- AAAGACTAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AGGGGAG 1 0 144918 CASAVA_Build 18 1159541 5D TTGTATCTAT TAAAA/----- TAAAAAATGT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 TAAAA 2 1 144919 CASAVA_Build 18 1160721 4D ATATAGAGAG ACAA/---- ACAGACATGC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 ACAA 1 0 144920 CASAVA_Build 18 1165362 1D CTGAATCAAA G/- CCACATCTTC 3070 hom 77 het 28 0 27 1 G 1 0 144921 CASAVA_Build 18 1170723 5D AATTTCAAAA TATGT/----- TATAAGTATA 3070 hom 105 het 38 0 35 6 TATGT 1 0 144922 CASAVA_Build 18 1185023 1I CAACATATAA -/T TTTTTTTTTT 1071 het 1071 ref 31 21 3 7 T 13 14 144923 CASAVA_Build 18 1189844 1I TTTTTCGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 28 2 19 7 T 11 12 144924 CASAVA_Build 18 1190197 4I AGCTGCGCCT ----/AATA AATACAGGAG 2608 het 807 hom 9 2 6 1 AATA 1 2 144925 CASAVA_Build 18 1190498 1D TATTAATTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 9 144926 CASAVA_Build 18 1206881 4D AGAGTAAGAG ATTA/---- ATTAATCATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 ATTA 2 1 144927 CASAVA_Build 18 1209390 55D TGATGTGGGA TGCAGCCAGGGCATTGGTGTTTTTAAAAACACCAACTTCCCTTGTGGTGTTAATG/------------------------------------------------------- TGCAGCCAGG 2456 hom 23 het 28 0 7 30 TGCAGCCAGGGCATTGGTGTTTTTAAAAACACCAACTTCCCTTGTGGTGTTAATG 2 1 144928 CASAVA_Build 18 1217169 1D CTCTTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 11 10 144929 CASAVA_Build 18 1221214 1D ATTGTTTTTT C/- CCCCCCTCTA 3070 hom 141 het 50 0 47 5 C 7 6 144930 CASAVA_Build 18 1223081 1D CAACCTTGCA T/- TACCAGGGAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 1 144931 CASAVA_Build 18 1224539 2D GCAACCATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 45 1 32 12 T 13 11 144932 CASAVA_Build 18 1226345 4D ATTATGTCTT TAAA/---- TATTTTTGTA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 TAAA 1 0 144933 CASAVA_Build 18 1230662 1D GTTCTGAATA T/- TTTTTGGCAG 3070 hom 96 het 38 0 32 7 T 6 5 144934 CASAVA_Build 18 1239200 2D TGAAACTGTT AC/-- AACAAATGTT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AC 1 0 144935 CASAVA_Build 18 1241164 4I TAAAAAATAG ----/ATAA ATAAATAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATAA 2 3 144936 CASAVA_Build 18 1252975 1I TCCATTGCTG -/T CATTTTTTAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 0 1 144937 CASAVA_Build 18 1253111 4D TATAGAAATT TTTC/---- TTTATTTTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 2 TTTC 1 0 144938 CASAVA_Build 18 1254744 5I GCCAAGGATT -----/GTTAA GTTAAGTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GTTAA 1 2 144939 CASAVA_Build 18 1255404 3D TGTTTTAATT CTA/--- CATTATATCA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 CTA 1 0 144940 CASAVA_Build 18 1256427 3I AGATAAGGCA ---/GAT GATGGCTGAC 3070 hom 108 het 47 0 37 10 GAT 1 2 144941 CASAVA_Build 18 1283175 1I TTCTTCCCTT -/C CCCCCCAGGA 3070 hom 117 het 44 0 38 6 C 6 7 144942 CASAVA_Build 18 1296431 3D GAAGGCTAGT GTG/--- GTGGCTGGAG 3070 hom 112 het 45 0 35 10 GTG 2 1 144943 CASAVA_Build 18 1299992 1I CTGCAAGAGT -/A AACCTGACAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 2 3 144944 CASAVA_Build 18 1302630 1D ATCAGTTTGC A/- CTCCCTCCAC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 1 0 144945 CASAVA_Build 18 1314095 1D CCAAGATGCC T/- TTTTTTTTTA 1772 het 1772 ref 61 49 5 7 T 10 9 144946 CASAVA_Build 18 1316067 2I AACATGGCAC --/AT GTTTACATAT 1802 hom 15 het 6 0 4 2 AT 0 1 144947 CASAVA_Build 18 1332375 2D TTAATTTAAT GG/-- TGTGTAACTT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 G 2 0 144948 CASAVA_Build 18 1340425 4I TAAAAGAAAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 AC 6 8 144949 CASAVA_Build 18 1355011 2D TTATTATTAT TA/-- TTTTTTTTTT 1332 het 1330 ref 25 5 5 15 TA 1 0 144950 CASAVA_Build 18 1356976 1I ACATTATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1430 hom 25 4 15 6 T 15 16 144951 CASAVA_Build 18 1361691 3I TATGGCAGCA ---/GCT GCTGTCTTGA 3070 hom 126 het 49 0 38 11 GCT 1 2 144952 CASAVA_Build 18 1365183 5I TGGAGACTTT -----/AGGAA AGGAGAGAGG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 AGGAA 0 1 144953 CASAVA_Build 18 1367216 1I AATCTCAACA -/C CCCATAACGG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 3 4 144954 CASAVA_Build 18 1367694 1I GGACTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 2497 het 65 hom 16 1 11 4 C 0 1 144955 CASAVA_Build 18 1368455 4D AAATGTTTCT ATAA/---- ATGTTTTGTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATAA 1 0 144956 CASAVA_Build 18 1379774 3D TCCAAATGCA CCC/--- CCCAGATACC 3070 hom 117 het 42 0 39 6 C 6 3 144957 CASAVA_Build 18 1381443 1D CTGTTAAACA T/- TTTTTTTTTT 1399 het 1399 ref 38 27 3 8 T 11 10 144958 CASAVA_Build 18 1386043 1I AGATTTGAAT -/G GGCAATTCAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 2 3 144959 CASAVA_Build 18 1386399 2I ACACATCCTT --/TC TCTCTTTTCC 3070 hom 114 het 46 0 38 8 TC 2 3 144960 CASAVA_Build 18 1392545 1D GCAAGGAGAA G/- AAGAGGAGAG 3070 hom 58 het 29 0 25 5 G 1 0 144961 CASAVA_Build 18 1396998 3I AGAAACTGAC ---/AGA AGAAGAGATC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AGA 2 3 144962 CASAVA_Build 18 1397249 1D GAATGACGTG A/- ACCCGGGAGG 1563 het 525 hom 10 2 5 3 A 2 1 144963 CASAVA_Build 18 1398231 5D AAAGACAAAA TAAAT/----- TAAGTTACAT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 TAAAT 1 0 144964 CASAVA_Build 18 1401546 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 9 8 144965 CASAVA_Build 18 1405626 6D ACTGACAAGT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 hom 78 het 39 0 27 13 TTTTTC 4 3 144966 CASAVA_Build 18 1406504 1D TTTTTCTTGT G/- GTAGTTATTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 2 1 144967 CASAVA_Build 18 1417141 8D TTTAATTTTA TTATTTAT/-------- TTATTTATTT 3070 hom 50 het 21 0 17 7 TTAT 5 3 144968 CASAVA_Build 18 1417802 1D AGAAGAGCCA G/- GGGCCCTGTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 4 3 144969 CASAVA_Build 18 1421866 1D TGGTTCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 11 10 144970 CASAVA_Build 18 1422925 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 24 0 15 9 A 14 13 144971 CASAVA_Build 18 1423506 1D CCCACAAAGA T/- TTTTTCATGA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 6 5 144972 CASAVA_Build 18 1428237 1I GATTTTGAAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 52 21 25 6 A 7 8 144973 CASAVA_Build 18 1432250 1D CCAGTTAAAT A/- AAAAGGGATA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 5 4 144974 CASAVA_Build 18 1432530 2D ATTATGTGTT AA/-- GATATATTTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 2 0 144975 CASAVA_Build 18 1434682 1I CAATACTCTC -/A AAAAAAAAAC 3053 hom 48 het 26 0 17 9 A 9 10 144976 CASAVA_Build 18 1434712 1I AACCAAAAAC -/A AAAAAAAGTC 3070 het 49 hom 37 1 26 10 A 7 8 144977 CASAVA_Build 18 1435913 1I CCGATATCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 7 9 T 9 10 144978 CASAVA_Build 18 1435962 1D GATTTTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 15 9 3 A 13 12 144979 CASAVA_Build 18 1437498 1I GTATCTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 939 hom 43 3 30 10 A 11 12 144980 CASAVA_Build 18 1460149 1D CTGGTTAAAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 144981 CASAVA_Build 18 1469514 6I TCTTTTTATA ------/TCTTCT TGCTTTGAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TCT 0 2 144982 CASAVA_Build 18 1470956 1I GAACACTCGT -/A ACACTGTTGA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 A 1 2 144983 CASAVA_Build 18 1471662 4I GCAATGACTT ----/TATC TAAGTGCCTT 3070 hom 175 het 63 0 58 5 TATC 0 1 144984 CASAVA_Build 18 1481654 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3023 het 3023 ref 41 16 11 15 T 13 12 144985 CASAVA_Build 18 1486917 3D TCATGACCTT CAG/--- CAGTTCATAA 3070 hom 143 het 56 0 44 13 CAG 2 1 144986 CASAVA_Build 18 1490790 1D GGAAGCAGAA C/- TAACACTTTG 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 C 1 0 144987 CASAVA_Build 18 1498664 1I CCTGACTACG -/A AATATATATA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 2 3 144988 CASAVA_Build 18 1499642 1D ACTTTATTTC T/- CCTTCATTTT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 T 1 0 144989 CASAVA_Build 18 1506191 1I TTCTATTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1908 hom 18 6 9 3 T 9 10 144990 CASAVA_Build 18 1526940 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 729 het 729 ref 18 6 6 6 T 15 14 144991 CASAVA_Build 18 1539320 1D GAAGATGTGG A/- AAAATTTGAA 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 A 5 4 144992 CASAVA_Build 18 1548987 1D AAACATTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2083 hom 30 9 16 5 T 10 9 144993 CASAVA_Build 18 1549876 1I TGATCCACTT -/C CCTATTACAC 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 C 2 3 144994 CASAVA_Build 18 1552217 2D GGCCTGACTG GA/-- GTCAGTACTA 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 GA 1 0 144995 CASAVA_Build 18 1556248 1D AAATAAAAGA T/- TTCCCCCTCC 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 T 3 2 144996 CASAVA_Build 18 1557520 1I GCTTAGACAG -/A AAAAAAGAAG 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 A 6 7 144997 CASAVA_Build 18 1561103 1D CTTTAAAATA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 T 8 7 144998 CASAVA_Build 18 1566161 2D GAAAGAACTC TT/-- TTGGACAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 21 4 T 4 2 144999 CASAVA_Build 18 1577751 6D42M1D CAATAGATTC TTCTTTTTCTTTTTCAGTGCCATAGGAGATCAGAAGAAAATTCAATATA/------TTCTTTTTCAGTGCCATAGGAGATCAGAAGAAAATTCAATAT- AAAAAAAAAA 2153 het 2153 ref 28 28 5 7 N/A 0 0 145000 CASAVA_Build 18 1578928 1I TTGAGCCATC -/A AAAAAAAAAT 3067 het 3067 ref 21 10 7 4 A 9 10 145001 CASAVA_Build 18 1586677 4I ATGCAAGAGG ----/TATC TATCTATCTA 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 TATC 2 3 145002 CASAVA_Build 18 1591608 2D CAAAAAATAA CT/-- CTGGTAACAG 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 CT 2 1 145003 CASAVA_Build 18 1594687 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 2937 het 2937 ref 29 13 9 7 T 10 11 145004 CASAVA_Build 18 1597768 1D GGCCAAGAGT A/- AAAAAAAAAA 1293 het 1293 ref 43 32 3 8 A 11 10 145005 CASAVA_Build 18 1599625 2I TATGTGAAAA --/TG TGTGTTCTCC 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 TG 2 3 145006 CASAVA_Build 18 1600658 1I AGCTATTGTT -/A TAGGTGTATA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 0 1 145007 CASAVA_Build 18 1602056 9I TAAATGAAAA ---------/TAATAGTGT TAATAGTGTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TAATAGTGT 1 2 145008 CASAVA_Build 18 1609399 1I ACAACTGGGG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 86 het 37 0 26 11 T 7 8 145009 CASAVA_Build 18 1624175 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 16 0 16 2 A 10 9 145010 CASAVA_Build 18 1624477 1I TAGCTCCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1293 hom 34 4 25 5 A 13 14 145011 CASAVA_Build 18 1629206 2I AAAAATTCTT --/CA CCCATGTAAT 3070 hom 148 het 51 0 50 1 CA 0 1 145012 CASAVA_Build 18 1631436 1D CGCTGTTTGG T/- TTTTTTGTCC 3003 hom 21 het 10 0 7 3 T 7 6 145013 CASAVA_Build 18 1634973 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 6 7 145014 CASAVA_Build 18 1638127 28D GTTTGACTCC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------------- TTTTTTTTTT 2304 hom 21 het 14 0 8 7 T 40 12 145015 CASAVA_Build 18 1639957 1D CAATTCTCAC T/- TCGTTTTCTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 2 1 145016 CASAVA_Build 18 1646912 1D AAGTACACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 48 0 39 10 A 10 9 145017 CASAVA_Build 18 1653919 1I CAATTCTCTC -/A ATTCATATGA 3070 hom 151 het 57 0 51 6 A 1 2 145018 CASAVA_Build 18 1658775 1D AATAAGGATT A/- AAAAAACTAA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 7 6 145019 CASAVA_Build 18 1659083 1I ATTACATTCC -/T TTTTTTCACT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 6 7 145020 CASAVA_Build 18 1674025 2I ACAGAACTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 10 12 145021 CASAVA_Build 18 1674259 1D TCTTGACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 43 1 36 6 T 11 10 145022 CASAVA_Build 18 1675801 13I GTCGGGTCTC -------------/TTGAGGCCTAGTG CATGAGGTCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTGAGGCCTAGTG 0 1 145023 CASAVA_Build 18 1680887 1D AACCAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 798 hom 30 4 17 10 A 15 14 145024 CASAVA_Build 18 1687951 2D TCCACACTTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 87 het 38 0 29 11 CT 8 7 145025 CASAVA_Build 18 1690356 1D AGCTGCAGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 54 het 20 0 17 3 T 9 8 145026 CASAVA_Build 18 1696595 5I AGAAAATACA -----/TTACT TTATTTTAGG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTACT 0 1 145027 CASAVA_Build 18 1699921 1I TTAGTGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 10 11 145028 CASAVA_Build 18 1715147 3D ATCACTTCCC ATT/--- ATTATAGGAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 ATT 2 1 145029 CASAVA_Build 18 1722058 1D GAAATAATAT A/- AATGGATACT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 3 2 145030 CASAVA_Build 18 1727167 2D GTCCCTTTAA CT/-- AGTATTAGTC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 CT 1 0 145031 CASAVA_Build 18 1746007 3D TCCCTAAGAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 4 A 14 11 145032 CASAVA_Build 18 1746177 1D AGCTAGAATT G/- GTGAAGCAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 G 2 1 145033 CASAVA_Build 18 1750249 1I GAGATATTGG -/T TCAGTGGAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 1 2 145034 CASAVA_Build 18 1750573 6D GCAACTTGTC AAAATT/------ AAAACTTTTT 3070 hom 96 het 33 0 33 4 AAAATT 1 0 145035 CASAVA_Build 18 1751478 9I AACGTGGACA ---------/ACCTTGTCC ACATGGTGAA 3070 hom 81 het 29 0 27 5 ACCTTGTCC 0 1 145036 CASAVA_Build 18 1761971 1I TGTAATGTAA -/C CACGGTTATT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 1 2 145037 CASAVA_Build 18 1777720 1D TCAAGGAGAT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 2841 hom 25 9 14 3 G 1 0 145038 CASAVA_Build 18 1781189 4D ACACCACTCC ATCT/---- GTCTATGCAT 2403 het 2403 ref 15 8 7 0 ATCT 1 0 145039 CASAVA_Build 18 1784627 8D CATGCACGTA TTACTACT/-------- TGCAATTATA 3070 hom 93 het 31 0 31 2 TTACTACT 1 0 145040 CASAVA_Build 18 1790017 3I GGTTTTCAAG ---/TTA TTATACTCCG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTA 1 2 145041 CASAVA_Build 18 1800628 1I AGTAATTGCG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 T 8 9 145042 CASAVA_Build 18 1823757 2D ATGAACAAAC AA/-- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 10 8 145043 CASAVA_Build 18 1825327 4D AAGAGGACAC CAAA/---- CAATGAAAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 CAAA 1 0 145044 CASAVA_Build 18 1825946 1D GTAACTAAAG A/- AAAAAATGGG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 7 6 145045 CASAVA_Build 18 1849861 1I TAATTGAATC -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 6 7 145046 CASAVA_Build 18 1862735 34D TTCAACATAT TCAAAAATATGGTCATTCAGAAAATATATATTTC/---------------------------------- AAAGTGCCTA 3070 hom 81 het 24 0 28 3 TCAAAAATATGGTCATTCAGAAAATATATATTTC 1 0 145047 CASAVA_Build 18 1908454 1D TCATTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 T 15 14 145048 CASAVA_Build 18 1915403 2D TTTAAGACTC AA/-- TTCTTGCTCT 3070 het 3070 hom 33 10 18 7 A 2 0 145049 CASAVA_Build 18 1922000 3D AAATTAATAT TAC/--- TACATAATTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TAC 2 1 145050 CASAVA_Build 18 1922167 1I AAAAATGGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 9 145051 CASAVA_Build 18 1925741 5D TCCCAGAGCT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 26 1 19 6 A 17 12 145052 CASAVA_Build 18 1926170 1D GTGATAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 11 10 145053 CASAVA_Build 18 1927770 17D ACCACATTTT ATGTTGTATATGTACCA/----------------- CATTATCCAG 3070 hom 111 het 35 0 35 9 ATGTTGTATATGTACCA 1 0 145054 CASAVA_Build 18 1932952 1D TGGGGGGTCA G/- GGGTAAACTG 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 G 4 3 145055 CASAVA_Build 18 1935800 1I TGTATTCCAC -/T CCAGCAAATC 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 0 1 145056 CASAVA_Build 18 1937743 1I CTGAATTAGC -/A AATACTGTTC 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 A 2 3 145057 CASAVA_Build 18 1945949 1I TAATTTTTTT -/G GGGGGGGGAC 3070 het 2857 hom 20 7 10 3 G 8 9 145058 CASAVA_Build 18 1949872 1I TCCTGTCTTT -/C TTTTTTGGCG 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 C 0 1 145059 CASAVA_Build 18 1951032 5I TGGTGTTTTT -----/AAATA AATTCAACTT 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 AAATA 0 1 145060 CASAVA_Build 18 1953281 8D TGTGTGTGTG TATATATA/-------- TATATATATA 3070 het 568 hom 16 2 13 2 TA 13 9 145061 CASAVA_Build 18 1956286 4D TGGAGGAATA AGAC/---- AGACTTTATA 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 AGAC 2 1 145062 CASAVA_Build 18 1956627 1D AAGTTCATTT G/- GGCAGCTAAT 3070 het 3070 hom 47 18 24 6 G 3 2 145063 CASAVA_Build 18 1957910 1D TTAAAAAGAG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 23 7 13 3 A 8 7 145064 CASAVA_Build 18 1961415 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 20 6 11 4 T 25 24 145065 CASAVA_Build 18 1963124 3I TTCAGATGTT ---/ATC ATCAATAAGA 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 ATC 1 2 145066 CASAVA_Build 18 1964367 12D TCCTTTACAG TCATTCATTTAT/------------ TCATTCATTC 3070 hom 96 het 33 0 33 3 TCATTCATTTAT 1 0 145067 CASAVA_Build 18 1967006 4D TAGACTCGTG AATA/---- AATAAAGTGA 3070 het 3070 ref 41 23 16 3 AATA 2 1 145068 CASAVA_Build 18 1967687 3D54M2D GTTGTCTGAT ATGATATTTTCTGTAGTTTTATGTTCGAAAACTTCATTAACGCTGTATATATATATATG/---ATATTTTCTGTAGTTTTATGTTCGAAAACTTTATTAACGCTGTATATATATATA-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 44 46 26 7 N/A 0 0 145069 CASAVA_Build 18 1967978 6D AACCCCTCCA CTTCCT/------ CTTCCTCTTC 3070 het 3070 ref 47 22 16 11 CTTCCT 3 2 145070 CASAVA_Build 18 1974412 1I CCTCTCTATA -/C CTGATAATTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 2 145071 CASAVA_Build 18 1976104 4D ATCTCTCTCC CTCT/---- CTCTCTCTCT 486 het 174 hom 13 3 2 9 CT 8 6 145072 CASAVA_Build 18 1979659 5I8M1I GTCAGAAGGG -----CTCGTTAT-/CCACACTCGTTATG GAGGCTCGAG 3070 hom 108 het 37 0 37 3 N/A 0 0 145073 CASAVA_Build 18 1980087 1D AATTAAATTT G/- TTTGACCTGT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 G 1 0 145074 CASAVA_Build 18 1984580 1I TGCATTTCTC -/T TCAACTCTCA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 1 2 145075 CASAVA_Build 18 1988194 5I CAAAGAGCAC -----/AAATA AAATTAAAAA 3070 hom 147 het 56 0 49 7 AAATA 0 1 145076 CASAVA_Build 18 1991730 3D CCTATGTCTA CTT/--- CTTTCTACAC 3070 het 656 hom 16 2 11 3 CTT 2 1 145077 CASAVA_Build 18 1996767 1I AAACTCTCTC -/A AAAAAACTAT 1724 het 1724 ref 21 13 4 4 A 6 7 145078 CASAVA_Build 18 2010753 1I CAAAGTTGTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 8 9 145079 CASAVA_Build 18 2012503 1I ATTGAAAATA -/C TTTTTCCCCA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 0 1 145080 CASAVA_Build 18 2021236 2I GATTTTAAAT --/AC TTGACTTAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AC 0 1 145081 CASAVA_Build 18 2022942 5I TTAAATAACA -----/TAGAG TAATGTGTAG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TAGAG 0 1 145082 CASAVA_Build 18 2032585 1I ATTTTGTTTA -/C CAGTATTAGC 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 C 1 2 145083 CASAVA_Build 18 2041523 1D TCTAAGCAAG A/- GAGCTGAATG 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 1 0 145084 CASAVA_Build 18 2055458 1I CACAGGTACA -/G GGGTTGGGGG 3070 hom 57 het 28 0 20 8 G 3 4 145085 CASAVA_Build 18 2055815 1I TCAAAATATT -/A AATTATAATG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 3 145086 CASAVA_Build 18 2056011 1I CTTTCCTGTT -/A AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 5 6 145087 CASAVA_Build 18 2057793 3D ATGGGTAACC AGA/--- AGAAGTTCTA 3070 het 3070 ref 35 20 12 5 AGA 2 1 145088 CASAVA_Build 18 2060194 4D GAGACTAACA AACT/---- AACTGTCAAC 3070 het 3070 hom 44 15 22 10 AACT 2 1 145089 CASAVA_Build 18 2061874 1I GTGGAGATCA -/T TCTTCATCCT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 1 2 145090 CASAVA_Build 18 2064080 2I AAAAAAAGAA --/AG AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AG 0 1 145091 CASAVA_Build 18 2064162 4I AATGGCAAAA ----/TCTC TCTATTTATG 3070 het 2004 hom 19 5 11 3 TC 1 3 145092 CASAVA_Build 18 2065084 2I ATACCACAAG --/AT ATGGGAGATA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AT 1 2 145093 CASAVA_Build 18 2066829 1I CCAAAAAGAA -/C AAAGCTGGAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 0 1 145094 CASAVA_Build 18 2071618 3D ATGTTGAAGT TAA/--- TAAACTTATT 3070 hom 108 het 38 0 36 3 TAA 2 1 145095 CASAVA_Build 18 2074752 4D18M9I ATAGCTAGAA GATTGATTGATTAGGATTTTTC---------/----GATTGATTAGGATTTTTCTTTCTTTTT TTTCTTTTTC 3070 het 42 hom 14 2 13 5 N/A 0 0 145096 CASAVA_Build 18 2075264 9I AATTTTGTTG ---------/TTGTTGTGA TTGTTGTTGT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TTGTTGTGA 0 1 145097 CASAVA_Build 18 2077142 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 83 het 32 0 27 5 T 9 10 145098 CASAVA_Build 18 2079466 1D CTGCCCCCCC A/- CCCACTCACC 3070 hom 47 het 22 0 14 8 A 1 0 145099 CASAVA_Build 18 2081529 1D TAATCAATCA T/- TCCTGTAAGG 3070 het 3070 ref 61 27 25 10 T 2 1 145100 CASAVA_Build 18 2085652 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1727 het 1539 hom 15 8 4 3 A 16 15 145101 CASAVA_Build 18 2088742 1I ATCATATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 10 11 145102 CASAVA_Build 18 2091539 3D CTTCTTATTG ATA/--- ACAATTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 ATA 1 0 145103 CASAVA_Build 18 2095083 1D CTTCGCTTCT C/- CCCCCCAACT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 C 7 6 145104 CASAVA_Build 18 2096033 7D CTCTACCTAC TAGCTGT/------- GCGACCTTGC 3070 het 3070 ref 36 21 11 6 TAGCTGT 1 0 145105 CASAVA_Build 18 2098941 1I CTACGGCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1826 hom 23 8 10 5 T 11 12 145106 CASAVA_Build 18 2100248 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 A 9 8 145107 CASAVA_Build 18 2100653 2D AAAGAAACGT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 TA 1 0 145108 CASAVA_Build 18 2106162 1D CAGATCAAAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 A 8 7 145109 CASAVA_Build 18 2106523 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1108 het 1108 ref 11 7 3 2 A 13 14 145110 CASAVA_Build 18 2107819 3D AGGGCCCAAG TTC/--- TTCTTCCTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 4 TTC 3 2 145111 CASAVA_Build 18 2110930 1I CAGGAAATGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 8 9 145112 CASAVA_Build 18 2132327 1I ATCAGGTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2535 hom 30 8 16 6 A 12 13 145113 CASAVA_Build 18 2138785 1D GAGCTTGGCT C/- TGACAGGTGA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 C 1 0 145114 CASAVA_Build 18 2146047 1I CTCTGCCCAC -/T TGCCAAGTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 2 145115 CASAVA_Build 18 2150084 1I GTTCCAGCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 9 10 145116 CASAVA_Build 18 2160813 2I TGCTTTTTTT --/TC CCCCCTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 TC 0 1 145117 CASAVA_Build 18 2228996 1D AAGCTACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 565 hom 40 3 28 9 A 12 11 145118 CASAVA_Build 18 2254405 3I CATGAATGAA ---/ATT ATTAGTGCCC 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 ATT 1 2 145119 CASAVA_Build 18 2255642 5D GCATTGTTTT CTTTA/----- CTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 CTTTA 2 1 145120 CASAVA_Build 18 2261121 1I CGTCAGGCAG -/T TTGTTATAGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 3 145121 CASAVA_Build 18 2270431 1D AACTTCTGAC A/- AATGCCATCT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 3 2 145122 CASAVA_Build 18 2274779 1D AAGTTTCAAA G/- CACATTAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 G 1 0 145123 CASAVA_Build 18 2276536 1D CAGACACTTA T/- TTTTTTTTTT 2599 het 1625 hom 29 7 7 17 T 14 13 145124 CASAVA_Build 18 2287141 1D TTGACTGAAG T/- TTTTTTTTTT 1387 het 1387 ref 33 25 3 5 T 13 12 145125 CASAVA_Build 18 2293634 11D GCTGAGGTGG GAGGATCCCTT/----------- GAGCCTGGGA 3070 het 2905 hom 29 10 17 2 GAGGATCCCTT 1 0 145126 CASAVA_Build 18 2295415 1D GATTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 13 12 145127 CASAVA_Build 18 2296925 1I TTAACTTCCC -/T TTTTCCCATT 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 T 4 5 145128 CASAVA_Build 18 2298262 1D AGAATGACAG A/- ATTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 5 A 2 1 145129 CASAVA_Build 18 2300351 7I TGAATTCCAA -------/CTGAGGG TTAACCTCAG 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 CTGAGGG 0 1 145130 CASAVA_Build 18 2303931 4D AGAAAGGAAA TTGT/---- TTGTTATTTA 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 TTGT 2 1 145131 CASAVA_Build 18 2325453 1D GCATTTTGGG A/- AGACCAAGAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 2 1 145132 CASAVA_Build 18 2332700 1I TTCCTAATGA -/C CCTACAGAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 C 2 3 145133 CASAVA_Build 18 2336870 1D TGTACAAAAA C/- CCACAGCTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 3 2 145134 CASAVA_Build 18 2343457 1I AATGAGACAG -/A AAAGTTAAGT 3070 hom 87 het 40 0 29 11 A 3 4 145135 CASAVA_Build 18 2345266 1I GACTGTCTTT -/C CCCCCCACTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 6 7 145136 CASAVA_Build 18 2362091 1D ATTATTTCAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 38 0 33 6 T 9 8 145137 CASAVA_Build 18 2362526 1I ATGCTGAGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 8 9 145138 CASAVA_Build 18 2366014 1I GATTGTACAC -/A AAAAAACTGC 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 A 6 7 145139 CASAVA_Build 18 2367622 1D CTACTAAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 A 9 8 145140 CASAVA_Build 18 2368197 6I TCAGAGGTCT ------/GTAACA GTTTTCCTTA 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 GTAACA 0 1 145141 CASAVA_Build 18 2368946 1I TTTATCACAG -/T TGCTGGAGGC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 1 2 145142 CASAVA_Build 18 2378637 1D AACTAGATTG A/- AAAAAAAAAA 3053 het 3053 ref 33 14 11 8 A 13 12 145143 CASAVA_Build 18 2380046 1D GATATATGAC A/- AAAATCCAAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 5 4 145144 CASAVA_Build 18 2381093 2D ATACCATTGT AC/-- ACACACACAG 3070 hom 126 het 48 0 43 6 AC 5 4 145145 CASAVA_Build 18 2381554 1D GTTTTGTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 432 hom 32 4 14 14 A 10 9 145146 CASAVA_Build 18 2385650 1I TGCACACCAC -/A AGGCTGCACA 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 A 1 2 145147 CASAVA_Build 18 2386518 1I AAAACTCTCT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 8 145148 CASAVA_Build 18 2386871 1D TTAAAAGGAG A/- AAAAAATGTA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 7 6 145149 CASAVA_Build 18 2390700 1I ACAAAGTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 192 hom 38 1 36 1 A 10 11 145150 CASAVA_Build 18 2394380 1I GCCAAGGGGG -/C CAGATCATTT 1868 het 1868 ref 21 8 6 8 C 1 2 145151 CASAVA_Build 18 2398260 4I ACTGAAACAA ----/TTCT TTCTGATATG 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 TTCT 1 2 145152 CASAVA_Build 18 2399504 1D AATTATGTGA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 7 6 145153 CASAVA_Build 18 2438213 3D TATGAAGTCT CTC/--- CTCCTCACTC 3070 het 3070 hom 26 11 13 5 CTC 3 2 145154 CASAVA_Build 18 2439215 1D AATAATCTCA G/- GGAAATAAAT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 G 3 2 145155 CASAVA_Build 18 2441499 1D ATAGCCAAAA G/- GTAGACGCAA 3070 het 3070 hom 42 14 16 13 G 2 1 145156 CASAVA_Build 18 2442002 2D AATTAATCAC AT/-- GAGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 26 15 10 3 AT 1 0 145157 CASAVA_Build 18 2449832 1D GAAATACCAT C/- CAGAATCCAA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 C 2 1 145158 CASAVA_Build 18 2462724 114D TTGGTACCAG TCTCTTGCGTTTTTGGCTGTGAAAAGTGGAAGGGCCACATCTCTCTTTCTGGAAAAGGTTTAAAAAATGTGCTACAAAGGAATTATTTATTTGGGATTTTGGTCTTGTATGATA/------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ TAGTCAGGAA 3070 hom 21 het 7 0 8 2 TCTCTTGCGTTTTTGGCTGTGAAAAGTGGAAGGGCCACATCTCTCTTTCTGGAAAAGGTTTAAAAAATGTGCTACAAAGGAATTATTTATTTGGGATTTTGGTCTTGTATGATA 1 0 145159 CASAVA_Build 18 2464325 1I ACTAATGATG -/A CAAAGAAGAG 3070 hom 117 het 45 0 38 7 A 0 1 145160 CASAVA_Build 18 2464731 3I AATGTCAGGA ---/GAT GATCGAGACC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 GAT 1 2 145161 CASAVA_Build 18 2466898 5D CTCTATTATA TAAGT/----- TAAGAATAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TAAGT 1 0 145162 CASAVA_Build 18 2471123 1I TCCAGAAAGT -/A CTATGTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 145163 CASAVA_Build 18 2471263 9I CTATAGTGAA ---------/ATTAAGCAG ATTAAGCAGT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 ATTAAGCAG 1 2 145164 CASAVA_Build 18 2473056 1I GAACCTTTAG -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 118 het 48 0 40 8 A 0 1 145165 CASAVA_Build 18 2473638 3I ATCTGGCCCA ---/AAT ACCTTACATA 3070 hom 45 het 17 0 16 3 AAT 0 1 145166 CASAVA_Build 18 2487349 1D TAACAGAAGG A/- AAAAAGGTAA 3070 hom 92 het 35 0 31 4 A 6 5 145167 CASAVA_Build 18 2487915 5D AGCAGAACTC CACTT/----- CAGCACCATG 3070 hom 117 het 42 0 39 8 CACTT 1 0 145168 CASAVA_Build 18 2510070 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 14 12 145169 CASAVA_Build 18 2510165 1D TGGAACACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 3 A 10 9 145170 CASAVA_Build 18 2511409 1D AACTTGAGAG T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 7 6 145171 CASAVA_Build 18 2513134 5I CTCTTATATA -----/TAAAG TAGTCTAATG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 TAAAG 0 1 145172 CASAVA_Build 18 2514028 1D AAAATAAAGC T/- TTCAAAATTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 2 145173 CASAVA_Build 18 2519745 1D AATCATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 12 11 145174 CASAVA_Build 18 2520421 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 55 het 20 0 14 6 A 6 7 145175 CASAVA_Build 18 2520574 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 882 hom 29 2 17 10 A 12 13 145176 CASAVA_Build 18 2531745 1I AATTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 247 hom 32 2 22 8 A 12 13 145177 CASAVA_Build 18 2538371 1D CCACCTTTGC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 9 8 145178 CASAVA_Build 18 2544372 1D AAAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 10 9 145179 CASAVA_Build 18 2552453 1D GCAGGGACTC A/- AAACAGATAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 4 3 145180 CASAVA_Build 18 2552955 1I AAAGAAAGGG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 117 het 45 0 40 6 A 8 9 145181 CASAVA_Build 18 2558452 3I GGAAGAACCT ---/GAA GAAGGTTAGA 3070 hom 65 het 28 0 20 8 GAA 1 2 145182 CASAVA_Build 18 2563941 1D AGCAGGCTCT A/- AAAAAAAAAA 1823 het 1823 ref 53 40 5 8 A 12 11 145183 CASAVA_Build 18 2565999 2I5M2I TCAAGAGGCT --TAGGC--/AGTAAACTT AGGAGGTTTA 3070 het 3070 ref 25 12 8 10 N/A 0 0 145184 CASAVA_Build 18 2570055 8D GCAAGTTTTA TTTCACCT/-------- TTGCTTTTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TTTCACCT 1 0 145185 CASAVA_Build 18 2576729 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 22 het 34 1 28 6 A 10 9 145186 CASAVA_Build 18 2577105 1D CAGGGTACTC A/- CTTCAAGGTC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 1 0 145187 CASAVA_Build 18 2579829 1D GCAATTGTGG T/- TTTTTTTTTT 2877 het 2877 ref 24 9 8 7 T 13 12 145188 CASAVA_Build 18 2583924 5I TTTATTTTCC -----/CAAGA GGGAGTCTCA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 CAAGA 0 1 145189 CASAVA_Build 18 2585229 4I CTTTGAAATT ----/TATA TATATATATA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TA 6 8 145190 CASAVA_Build 18 2587729 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 13 12 145191 CASAVA_Build 18 2596597 2D AATCAAAATC TT/-- TAAGCTATAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 3 1 145192 CASAVA_Build 18 2612061 2D AATTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 12 10 145193 CASAVA_Build 18 2618402 1I ATAGTAAATT -/A AAATAACATC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 3 4 145194 CASAVA_Build 18 2621154 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 25 1 20 4 A 14 15 145195 CASAVA_Build 18 2625989 1D AAGGAGGGGC T/- TTTTTTTTTT 1753 het 1531 hom 19 6 8 5 T 15 14 145196 CASAVA_Build 18 2629535 9D CTACAGAGCC CATGTGTAA/--------- CATGTGTAAA 3070 het 3070 ref 36 20 10 7 CATGTGTAA 2 1 145197 CASAVA_Build 18 2635219 1D AGACAATTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 10 9 145198 CASAVA_Build 18 2635293 1D GGACTAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2920 hom 34 9 16 9 T 13 12 145199 CASAVA_Build 18 2637017 5I GCCTGCCTCG -----/ACCTC ACTGAGTGCT 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 ACCTC 0 1 145200 CASAVA_Build 18 2661601 1I TTTCTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 15 3 8 4 C 0 1 145201 CASAVA_Build 18 2663597 2D CATTGTTAAC AT/-- GTGTCATATC 3070 het 3070 ref 34 17 16 2 AT 1 0 145202 CASAVA_Build 18 2667148 18I TATTATGAAC ------------------/TTTAGTATTTTATTCTGT ATTTAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 TTTAGTATTTTATTCTGT 0 1 145203 CASAVA_Build 18 2668027 1I TGTAGTATAC -/A AAAACCGCTC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 A 4 5 145204 CASAVA_Build 18 2668821 2D CCGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 22 1 14 7 T 16 14 145205 CASAVA_Build 18 2669278 1I19M1I GAGATCAAGA -CATCCTGGCTAACACAGTG-/CCATCCTGGCTAACACAGTGA AACCCCATCT 1739 hom 10 het 4 0 4 0 N/A 0 0 145206 CASAVA_Build 18 2670101 4D ATTTCTTATA CTTT/---- CTTTTAGTTC 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 CTTT 2 1 145207 CASAVA_Build 18 2670321 3I TCCCCAAGAC ---/TTG TTGTTGCATC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TTG 2 3 145208 CASAVA_Build 18 2680577 1I TGAAGCAATT -/C CCCCTGCTTC 3070 het 1722 hom 19 4 13 2 C 4 5 145209 CASAVA_Build 18 2685056 3I ATATTTATTT ---/TTG TTGTTGTTAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTG 2 3 145210 CASAVA_Build 18 2688679 1D ACCTTTTTTT C/- CCCCCCCAGT 3070 het 2009 hom 23 5 12 7 C 8 7 145211 CASAVA_Build 18 2688852 1D TACTATTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 9 8 145212 CASAVA_Build 18 2695085 1D TGTGCGTAGG T/- TAAGTGCAGA 3070 het 3070 ref 49 25 20 5 T 2 1 145213 CASAVA_Build 18 2697351 1D TTCCAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 627 het 627 ref 17 11 2 4 T 11 10 145214 CASAVA_Build 18 2698616 2D ACCTTCCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 29 3 14 12 T 13 11 145215 CASAVA_Build 18 2699331 6D CCTGTTGTCT ATCGTG/------ AAGAATGCTC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 ATCGTG 1 0 145216 CASAVA_Build 18 2700930 8I ATTATGTAGG --------/TTTTTTCC TTTATTCTCT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 TTTTTTCC 0 1 145217 CASAVA_Build 18 2703527 1I ACTAAGAAGT -/A AAAAAAATTA 3070 het 2896 hom 21 7 12 2 A 7 8 145218 CASAVA_Build 18 2705562 1I GAGCTTCTTT -/A AAAAATCAGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 5 6 145219 CASAVA_Build 18 2707949 1D GAGTTTATAA G/- ACTTGAAATA 3070 het 3070 ref 34 17 17 2 G 1 0 145220 CASAVA_Build 18 2708898 1D TAATCATATT C/- CTTCTGAATT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 C 2 1 145221 CASAVA_Build 18 2709676 1I CTGCACCTAA -/T TTTTTTTTTT 2574 het 423 hom 19 1 9 9 T 13 14 145222 CASAVA_Build 18 2709978 1I TGGCCCTGTC -/T TAATTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 1 2 145223 CASAVA_Build 18 2712947 3D AATGTCTCTT AAC/--- AATTCATTAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AAC 1 0 145224 CASAVA_Build 18 2718741 1D TTGCCAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 39 1 15 24 T 12 11 145225 CASAVA_Build 18 2718950 1I TACTTTAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 26 1 14 11 A 13 14 145226 CASAVA_Build 18 2725067 1D GACTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 18 1 15 2 A 11 10 145227 CASAVA_Build 18 2725169 4D TTCACCACAT AAAC/---- AAAATTAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 7 AAAC 1 0 145228 CASAVA_Build 18 2726600 3D50M6D AATAGATAAC TTGTTAAGAGAAGACATACATGTGGTCAGCAAATATGTGAAAAAATGTTCAACATCATA/---TTAAGAGAAGACATACATGTGGTCAGCAAATATGTGAAAAAATGTTCAAC------ ATCATAATCA 3070 het 3070 ref 38 36 19 6 N/A 0 0 145229 CASAVA_Build 18 2727576 1I GCAGACCTGG -/T GGTGCATGCC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 0 1 145230 CASAVA_Build 18 2728353 4I AGAGAACATT ----/AGAC AGACGAAGCT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 AGAC 1 2 145231 CASAVA_Build 18 2728930 2D TGTAGAACTC AT/-- ATTGAAGGGA 3070 het 3070 hom 45 18 23 5 AT 2 1 145232 CASAVA_Build 18 2733405 2D AAAGACAAAC AG/-- TGTGTATATC 3070 het 3070 hom 57 23 28 7 AG 1 0 145233 CASAVA_Build 18 2735185 22I GAAACAAGTT ----------------------/TTATTTTAAAAAATTAAAAAAA TTATTTATTT 3070 hom 33 het 15 0 11 4 TTATTTTAAAAAATTAAAAAAA 0 1 145234 CASAVA_Build 18 2738478 33D TGCAACCTCT GCCTCCCAGGTTCAAAGCAATTCTCCTGCCTCC/--------------------------------- GCCTCCTGAG 1106 het 722 hom 6 3 3 2 GCCTCCCAGGTTCAAAGCAATTCTCCTGCCTCC 1 0 145235 CASAVA_Build 18 2741167 2I TTTAAATAAC --/AT GTGTGCTTTA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 AT 0 1 145236 CASAVA_Build 18 2757583 12D ACCTATTTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3024 het 1215 hom 22 4 10 8 T 23 11 145237 CASAVA_Build 18 2761644 1I ACGTGAAAGA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 6 7 145238 CASAVA_Build 18 2765323 5I ATTTATGTTT -----/AATTG AACTGCATTA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 AATTG 0 1 145239 CASAVA_Build 18 2766388 2I CCCAGCTAAA --/TT TTTTTTTTTT 2815 het 2815 ref 26 9 8 9 T 12 14 145240 CASAVA_Build 18 2767514 7I CATTTGGAAC -------/CAGCTTT AGAGGCTTCT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 CAGCTTT 0 1 145241 CASAVA_Build 18 2774946 1D TCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2664 het 2664 ref 33 16 8 10 A 13 12 145242 CASAVA_Build 18 2776324 1D ATACACATAG A/- AAAATGTGCA 3070 het 3070 ref 27 16 7 4 A 5 4 145243 CASAVA_Build 18 2776945 4D GAAATGTACA ATTT/---- ATTTATTCTA 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 ATTT 2 1 145244 CASAVA_Build 18 2777520 1D TCTACAATGA G/- TGAATATCTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 G 1 0 145245 CASAVA_Build 18 2779014 4D TTTTTCTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 18 9 8 TTTG 4 3 145246 CASAVA_Build 18 2779514 3I GAGAGTAGAC ---/CTT CTGTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTT 0 1 145247 CASAVA_Build 18 2785036 1I AAAAATTCTG -/T GGTTTTTTTT 2011 het 2011 ref 23 15 6 2 T 0 1 145248 CASAVA_Build 18 2785309 2D CCCGCCTTGG AA/-- CCTTGCAACG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 2 0 145249 CASAVA_Build 18 2791998 3D AAAAATATGT ATC/--- ATCTTCTATT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 ATC 2 1 145250 CASAVA_Build 18 2792134 2I TGAATATTAA --/AT ATGTTTTATT 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 AT 1 2 145251 CASAVA_Build 18 2793688 4D TGATGTTAAC CTAT/---- CTATCTTTAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CTAT 2 1 145252 CASAVA_Build 18 2794545 1D TAAAAGAAGG T/- TTTTAAGTAT 3070 hom 126 het 45 0 41 4 T 5 4 145253 CASAVA_Build 18 2795987 1D ACTGACTTTT A/- AAAAAAGAGC 3070 hom 81 het 32 0 27 7 A 7 6 145254 CASAVA_Build 18 2796947 4D ATATATATAT AGAG/---- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 AG 6 4 145255 CASAVA_Build 18 2801078 1I AGTAGCCATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 44 18 25 1 A 8 9 145256 CASAVA_Build 18 2803565 1D AGATTATGAT A/- AAAATATACA 3070 het 3070 hom 27 10 12 6 A 5 4 145257 CASAVA_Build 18 2803904 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 11 8 A 13 14 145258 CASAVA_Build 18 2804782 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 18 3 9 7 A 15 14 145259 CASAVA_Build 18 2807472 1D AAGATATCTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 40 13 15 12 A 9 8 145260 CASAVA_Build 18 2807831 1I TACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2720 hom 24 7 13 4 A 9 10 145261 CASAVA_Build 18 2809103 1I AGGGGCACAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 2428 hom 30 7 16 7 A 7 8 145262 CASAVA_Build 18 2810242 1I TTTGACAGGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 8 9 145263 CASAVA_Build 18 2810623 1I ACACGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1811 hom 35 9 12 14 A 16 17 145264 CASAVA_Build 18 2810772 1D TGATGGGAAT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 8 7 145265 CASAVA_Build 18 2812085 7D GGCATGCCTT GATGGAA/------- GATAAGGCAT 3070 het 3070 ref 50 26 21 7 GATGGAA 1 0 145266 CASAVA_Build 18 2819032 4I TGGGAAAAAT ----/AGAA AGAACATTAG 3070 hom 66 het 24 0 22 2 AGAA 1 2 145267 CASAVA_Build 18 2835853 1I GGTTTCTCCA -/T TGTTGGTCAG 1252 het 1252 ref 12 3 5 4 T 1 2 145268 CASAVA_Build 18 2838681 1D GCAAGTCTTT G/- GGGGTTTTGT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 G 5 4 145269 CASAVA_Build 18 2859279 2D TTACATAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 20 24 8 A 12 10 145270 CASAVA_Build 18 2862830 1I ACACATAGGG -/A AATTATTTTA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 2 3 145271 CASAVA_Build 18 2864122 1D TTCCTTCTTA C/- CCCCGCATGG 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 C 5 4 145272 CASAVA_Build 18 2865518 2D CTTTAGGAGG GT/-- GTGTGGGCCT 3070 hom 114 het 42 0 38 5 GT 3 2 145273 CASAVA_Build 18 2868143 1D CATAACAACG T/- TAAGTGTGCT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 2 1 145274 CASAVA_Build 18 2872882 1D ACATCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 10 5 A 13 12 145275 CASAVA_Build 18 2873226 18I CTCGGGGAGG ------------------/ATGTCAAAGGTCCCTCAC ATGTCAAAGG 3070 hom 78 het 33 0 25 8 ATGTCAAAGGTCCCTCAC 0 1 145276 CASAVA_Build 18 2874419 1D AAGTTTCGTA T/- TTTTTGTAGA 3070 hom 83 het 30 0 25 5 T 6 5 145277 CASAVA_Build 18 2877503 2I GTTAGTACAC --/AT GAGAGCTGGT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 AT 0 1 145278 CASAVA_Build 18 2883379 4I GTTTCCAGAC ----/ACAG ACAGGACCGT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 ACAG 1 2 145279 CASAVA_Build 18 2887863 1D CTGTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2594 het 1647 hom 27 9 10 9 A 15 14 145280 CASAVA_Build 18 2889080 1I TGGGATCTTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 8 9 145281 CASAVA_Build 18 2890131 1D AGCTTGAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 133 hom 36 1 29 6 T 10 9 145282 CASAVA_Build 18 2890678 1I CCCGGGCCCA -/T TTTAGCACCA 3070 hom 103 het 42 0 33 9 T 3 4 145283 CASAVA_Build 18 2896490 1I GGGAATTGTT -/G GATGCCGGAG 2959 hom 33 het 12 0 11 1 G 1 2 145284 CASAVA_Build 18 2900178 2I CATTGCACCC --/CT CTCTCTCAGG 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 CT 3 4 145285 CASAVA_Build 18 2904074 1D ATTTCCAGTT A/- ACTTTTGTTA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 2 1 145286 CASAVA_Build 18 2904779 1D TCAGAGTTCC T/- TATTTACTCC 3070 het 3070 ref 34 14 12 9 T 2 1 145287 CASAVA_Build 18 2909344 1I TTCACTGTGC -/T TTCCCTGACA 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 2 3 145288 CASAVA_Build 18 2916551 1D GCTGGTGATG T/- TTTTTAGAAA 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 6 5 145289 CASAVA_Build 18 2930161 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAATTTA 3070 hom 84 het 35 0 27 8 A 7 6 145290 CASAVA_Build 18 2937314 1D TCTTCCCTCC A/- AAAGGCTACA 3070 het 3070 ref 59 28 26 5 A 4 3 145291 CASAVA_Build 18 2941448 2D TCACCATGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 32 1 26 5 A 14 12 145292 CASAVA_Build 18 2945387 13D AGAGACTGGG GGTGCCACACAAA/------------- GGTGCCACAC 3070 het 3070 hom 39 11 19 11 GGTGCCACACAAA 1 0 145293 CASAVA_Build 18 2946073 4D TATGTTACTC CAAA/---- CAAACATTGT 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 CAAA 2 1 145294 CASAVA_Build 18 2950970 6D TCATTAGCCT TATTAA/------ TTTTCAACCT 3070 het 3070 ref 60 28 28 8 TATTAA 1 0 145295 CASAVA_Build 18 2958587 2D ATCTACTTGG GA/-- GAGTTAGGTA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 GA 2 1 145296 CASAVA_Build 18 2975502 1I TAACTCTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 10 145297 CASAVA_Build 18 2979618 3I TTTCAAAACT ---/TAC TTCAAAGTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TAC 0 1 145298 CASAVA_Build 18 2979918 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2564 het 271 hom 16 2 9 6 A 17 16 145299 CASAVA_Build 18 2983613 1D ACAAAAAGTT A/- ACGTGTAACT 3070 hom 123 het 46 0 42 7 A 2 1 145300 CASAVA_Build 18 2985195 1D TAGTTCCAAG A/- CCTATGCCAC 3070 hom 154 het 56 0 52 5 A 1 0 145301 CASAVA_Build 18 2986994 6I TTTCTTTTTC ------/TTTTTT TTTTGAGACA 3070 hom 44 het 20 0 13 7 T 4 10 145302 CASAVA_Build 18 2987377 81D CACCCTCCTC AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACTGCACCTGGCAGAGGCTTGTATTTTTCTAAACATAACAAATTCA/--------------------------------------------------------------------------------- AAGGAACATT 2796 het 2796 ref 17 21 7 5 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACTGCACCTGGCAGAGGCTTGTATTTTTCTAAACATAACAAATTCA 1 0 145303 CASAVA_Build 18 2988683 1I ACATGACAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 749 hom 31 2 24 5 T 9 10 145304 CASAVA_Build 18 2990029 1I CTCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1499 het 449 hom 12 1 6 5 T 11 12 145305 CASAVA_Build 18 2990925 1I GAAAGGTGCT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 59 het 28 0 19 9 A 8 9 145306 CASAVA_Build 18 2991428 1D GCAAAGAAAT A/- AAAATCACTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 5 4 145307 CASAVA_Build 18 3001451 1I GGGAGGCCGA -/G GGGGGGCGGA 811 het 811 ref 15 8 3 4 G 6 7 145308 CASAVA_Build 18 3002494 1D ACCGGGGGCT G/- GGGGGCTTTG 3070 hom 64 het 26 0 21 5 G 6 5 145309 CASAVA_Build 18 3003691 1D ATCTCCACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 12 11 145310 CASAVA_Build 18 3007963 8I4M3I9M2D TAGTAGAATA --------AGAA---AAAAAATTACT/TTTTCTACAGAATTGAGAGAAGTA-- TCTCAAGCCG 3070 het 3070 ref 38 23 15 3 N/A 0 0 145311 CASAVA_Build 18 3009329 1I TAAAAAGTTA -/G AAAAAGAACA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 G 0 1 145312 CASAVA_Build 18 3011371 2I TCTCAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 976 het 976 ref 14 6 5 3 A 12 14 145313 CASAVA_Build 18 3014531 1D TTAATTGTTA G/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 G 1 0 145314 CASAVA_Build 18 3017352 1I GGAGGAGAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 6 7 145315 CASAVA_Build 18 3029402 31D AATACAGAAC TAGGAAACATTTAATATCTATTATGCAGTAT/------------------------------- AACCAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 22 10 7 TAGGAAACATTTAATATCTATTATGCAGTAT 1 0 145316 CASAVA_Build 18 3035503 4D CTAGATGCAA AAAC/---- AAGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 61 30 24 8 AAAC 1 0 145317 CASAVA_Build 18 3038920 1D ATGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 12 11 145318 CASAVA_Build 18 3041108 7D ATGCCCAGCT AATTTTA/------- AAATTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 AATTTTA 1 0 145319 CASAVA_Build 18 3042752 1D CTCCCCAGTC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 20 8 8 5 A 9 8 145320 CASAVA_Build 18 3044616 1I TCAAAGAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 10 11 145321 CASAVA_Build 18 3065504 3I ACAAACAGAC ---/AAA GAAGAATTTT 3070 hom 72 het 28 0 23 5 A 0 3 145322 CASAVA_Build 18 3068415 5D CAGTATAGAC TATTT/----- TATTTTATTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TATTT 3 2 145323 CASAVA_Build 18 3100739 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 30 1 14 15 T 15 14 145324 CASAVA_Build 18 3103192 20D ACACACATAC ATATATACACACATGTATAT/-------------------- ATATATACAC 3070 hom 45 het 17 0 16 5 ATATATACACACATGTATAT 2 1 145325 CASAVA_Build 18 3103504 1I CTAAAAACAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 37 het 14 0 13 1 T 8 9 145326 CASAVA_Build 18 3103752 5I AGCTATGTTA -----/TGTTT TAAGAAGGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TGTTT 0 1 145327 CASAVA_Build 18 3104379 2D CTATTTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 30 0 18 13 T 14 12 145328 CASAVA_Build 18 3107479 4D GACAATTAAC AGAA/---- AGAAAGCTCA 3070 hom 111 het 38 0 37 2 AGAA 2 1 145329 CASAVA_Build 18 3108351 1I ACTGCATCAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 398 hom 38 1 34 3 T 8 9 145330 CASAVA_Build 18 3108508 1I TTAAAAAACA -/T TTTTTTAAGA 2956 het 2956 ref 21 12 7 3 T 6 7 145331 CASAVA_Build 18 3124954 2I TATTTTACGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 11 13 145332 CASAVA_Build 18 3126124 2I TCTCCTTCTG --/TC TCTTGCCTGC 3070 het 3070 hom 21 8 12 2 TC 1 2 145333 CASAVA_Build 18 3170924 1D CGAGATGATC T/- TTTTTTTTTT 1606 het 1606 ref 37 29 5 3 T 15 14 145334 CASAVA_Build 18 3171731 2D AACTGAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 1305 het 914 hom 18 8 3 7 T 20 18 145335 CASAVA_Build 18 3217973 1D TTTAAAAAAA G/- GAACGCAGGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 1 145336 CASAVA_Build 18 3238244 1I GGGTTTGCGC -/A AAAAACGTAG 3070 hom 93 het 33 0 26 7 A 5 6 145337 CASAVA_Build 18 3248550 4D CATAAGAGAC AAGT/---- AACAGCAAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 4 AAGT 1 0 145338 CASAVA_Build 18 3250757 1D TTCTAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 12 11 145339 CASAVA_Build 18 3256577 6D CAGATAACAA ACTAAT/------ ACCAGCTGGG 3070 hom 102 het 35 0 35 4 ACTAAT 1 0 145340 CASAVA_Build 18 3260663 5D TGACTGATTC TGATT/----- TGATTTGATT 3070 hom 114 het 42 0 39 6 TGATT 4 3 145341 CASAVA_Build 18 3263545 4I TTTTAATAAC ----/TAAA TAAAATGTAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TAAA 1 2 145342 CASAVA_Build 18 3264464 1I AATCAGGTAA -/C CCCCAGAATC 3070 hom 141 het 49 0 48 1 C 4 5 145343 CASAVA_Build 18 3266718 1I CTGACTCCCC -/T GATGGACCAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 0 1 145344 CASAVA_Build 18 3268459 2I TGCCATTGTT --/TC TTTCACGCTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TC 0 1 145345 CASAVA_Build 18 3268878 2D TAAAATAATC TT/-- GGGGTAATTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 0 145346 CASAVA_Build 18 3269786 15I GCGAGGCTGT ---------------/CCACTCCAAGGCGCA CGTGTGGTAG 3070 hom 81 het 29 0 28 2 CCACTCCAAGGCGCA 0 1 145347 CASAVA_Build 18 3270826 3I GTAGGTATTG ---/TTA TTATCCCTGT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TTA 1 2 145348 CASAVA_Build 18 3301908 1I CTATCTCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 80 het 29 0 27 2 T 9 10 145349 CASAVA_Build 18 3302074 1I AATTTTTGTA -/T TTATTTTTTA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 2 3 145350 CASAVA_Build 18 3305174 1I GTTTCTTTTC -/T TTTTTTTACT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 8 145351 CASAVA_Build 18 3316813 1D CTAAAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 40 0 35 7 T 12 11 145352 CASAVA_Build 18 3333886 1D TTCTTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 237 hom 29 2 21 6 T 16 15 145353 CASAVA_Build 18 3335417 4D TTAATCAATC AATT/---- GATATTCTAT 3070 hom 123 het 44 0 41 4 AATT 1 0 145354 CASAVA_Build 18 3339313 1D ATCGCTTGAG C/- CCCAGGAGCT 3070 hom 63 het 22 0 21 1 C 4 3 145355 CASAVA_Build 18 3351987 1I AAGAAATCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 11 12 145356 CASAVA_Build 18 3354326 5I AAGAGTTTGA -----/AAGAG AAGAGAGAAC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AAGAG 1 2 145357 CASAVA_Build 18 3356765 1D GGGACTGCTC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 9 8 145358 CASAVA_Build 18 3362073 1I TTAAACACAG -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 T 7 8 145359 CASAVA_Build 18 3362166 1D GCGGAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1704 hom 25 6 14 5 T 15 14 145360 CASAVA_Build 18 3365096 5I TGAAGCTGAG -----/TATCT TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TATCT 0 1 145361 CASAVA_Build 18 3373016 1I TGTGCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 T 11 12 145362 CASAVA_Build 18 3379791 1I CATTTGAAAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 8 9 145363 CASAVA_Build 18 3386758 7I GACCTTATCT -------/AAAAAGA AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 AAAAAGA 1 2 145364 CASAVA_Build 18 3410004 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 32 1 25 6 A 11 10 145365 CASAVA_Build 18 3411758 1I TCTGTTTAAT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 7 8 145366 CASAVA_Build 18 3425972 2D GATCTTCCTG TC/-- TCTCTGCCAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TC 3 2 145367 CASAVA_Build 18 3432284 1I TGGGAAGAAG -/T TAACTGTGAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 145368 CASAVA_Build 18 3433868 3D TAGTAAATAA AAT/--- AAAAGAAGGA 3070 hom 57 het 21 0 19 3 AAT 1 0 145369 CASAVA_Build 18 3437338 1D TATATACTTT A/- AAAAAAAAAA 1730 het 1730 ref 29 21 5 3 A 15 14 145370 CASAVA_Build 18 3444494 1I AACTTAACAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 7 8 145371 CASAVA_Build 18 3451526 2I TCTGAAGCTC --/TT TTTTCTTCAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 4 6 145372 CASAVA_Build 18 3452572 1D CTAGAAAGCT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 9 8 145373 CASAVA_Build 18 3453854 3D TGGTCTTGAA CTC/--- CTCCTGACCT 3070 hom 39 het 17 0 10 8 CTC 2 1 145374 CASAVA_Build 18 3456446 1D GGCTAGTACC T/- TTTTTTTTTT 1423 het 1423 ref 43 30 4 9 T 15 14 145375 CASAVA_Build 18 3457710 1D TGGCTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 33 0 21 12 A 13 12 145376 CASAVA_Build 18 3458603 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 34 1 27 6 A 10 11 145377 CASAVA_Build 18 3460816 2I AATGTGTAAC --/AT GTGCAGTCAG 3070 hom 151 het 56 0 51 5 AT 0 1 145378 CASAVA_Build 18 3462673 1D GTCGGCACCG T/- TTTTCCAGTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 5 4 145379 CASAVA_Build 18 3477781 4I TTTTTCTGCT ----/CAAA CAGTTTTTAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CAAA 0 1 145380 CASAVA_Build 18 3485858 1D GGTATTGAAA C/- CCCTTTAAAC 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 C 4 3 145381 CASAVA_Build 18 3486741 1I GTCAGTTTCA -/G GGGGTCAAGC 3070 het 3070 hom 39 20 19 0 G 4 5 145382 CASAVA_Build 18 3487312 1I CACAAAGCAC -/T TTTGAGTGCT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 3 4 145383 CASAVA_Build 18 3489572 1D AAAGATGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1918 hom 30 7 12 13 A 11 10 145384 CASAVA_Build 18 3495131 17I GCAGCTGTGG -----------------/ACCTAAGCAGTGCCGCC ACCAGGCCAC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 ACCTAAGCAGTGCCGCC 0 1 145385 CASAVA_Build 18 3502064 1D CTGGTCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 T 13 12 145386 CASAVA_Build 18 3508524 2D CAATTTGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 9 12 A 14 12 145387 CASAVA_Build 18 3515101 3D AAAAAAAAAA ATC/--- AACAACATTA 3070 het 3070 hom 32 12 13 8 ATC 1 0 145388 CASAVA_Build 18 3533164 11D CATGACTCCA ATTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1603 het 1015 hom 15 5 7 3 ATTTTTTTTTT 1 0 145389 CASAVA_Build 18 3533985 8D CCTCTTTAGA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 7 AAAC 5 3 145390 CASAVA_Build 18 3536413 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 274 hom 36 3 18 15 A 17 16 145391 CASAVA_Build 18 3536650 1D TGGGTTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 A 10 9 145392 CASAVA_Build 18 3537598 1I GCCATAAGGG -/A AAAAAATTTA 3070 hom 53 het 36 1 31 4 A 6 7 145393 CASAVA_Build 18 3538276 1D TAATTTTTCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 15 15 7 A 9 8 145394 CASAVA_Build 18 3541163 26D71M1I ATACATATAT ATATATATATATACACATACATATAAATGCTTTTTTTCTGAAATTTATCTTCCAAGTCCTTTTGAATTTTTCAGTTCTGCTACTATTTCTTTTTTTC-/--------------------------ATGCTTTTTTTCTGAAATTTATCTTCCAAGTCCTTTTGAATTTTTCAGTTCTGCTACTATTTCTTTTTTTCT TTTTTTTGTA 2753 hom 12 het 10 0 10 25 N/A 0 0 145395 CASAVA_Build 18 3543744 1I GTTGGCCAGG -/C TGGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 C 0 1 145396 CASAVA_Build 18 3546304 2I GTCATTATCA --/CC CCCAAAGTCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 3 5 145397 CASAVA_Build 18 3553474 1D GTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 18 0 12 6 T 11 10 145398 CASAVA_Build 18 3595824 1D CGGCAGGAGA T/- TTTTTTTGCC 3070 het 2576 hom 25 11 10 4 T 8 7 145399 CASAVA_Build 18 3596463 1D CTTTCCCTAA T/- TGTAATATGT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 2 1 145400 CASAVA_Build 18 3598298 1D CCCGTCTGGG C/- CAATGAGAGT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 2 1 145401 CASAVA_Build 18 3599155 15I CTTGCAGTGT ---------------/CCTCAGCCTCTCCTG CCTCAGCCTC 2706 het 2706 ref 39 16 8 15 CCTCAGCCTCTCCTG 0 1 145402 CASAVA_Build 18 3601386 1D GCAAAGTTGC A/- AGCTTGCTCA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 2 1 145403 CASAVA_Build 18 3604199 2I GATTACAGGC --/GT GAGCCACCGT 1535 het 1221 hom 11 4 4 3 GT 0 1 145404 CASAVA_Build 18 3605011 1I ACCTCCGCCT -/C CCAGGTTCAA 1167 hom 10 het 4 0 3 1 C 2 3 145405 CASAVA_Build 18 3611297 2I TGCTAATGAC --/CT CTCCCCTCCT 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 CT 1 2 145406 CASAVA_Build 18 3621767 3I TAAATTAAAT ---/AAA AAAATTCACA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 4 7 145407 CASAVA_Build 18 3626586 2I AAATTTTGTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 2405 hom 17 6 10 1 T 9 11 145408 CASAVA_Build 18 3628381 1D TGAGTGTCTA G/- GACTATGGAC 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 G 2 1 145409 CASAVA_Build 18 3634294 1D TGTTATTGTA T/- GCAAAACGTA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 1 0 145410 CASAVA_Build 18 3642508 1I TTACAAAATA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 6 7 145411 CASAVA_Build 18 3645019 3D CATAACTGAC CTA/--- CTACTCTCCC 3070 het 3070 hom 50 22 24 5 CTA 2 1 145412 CASAVA_Build 18 3652109 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 T 8 7 145413 CASAVA_Build 18 3656369 1D GTAAGGATTT C/- CACCTTTGCC 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 C 2 1 145414 CASAVA_Build 18 3666693 1D ACTTCTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 36 0 30 6 T 12 11 145415 CASAVA_Build 18 3669221 1D CCCCCATGGA T/- TTTTTATCTT 2851 het 111 hom 15 1 8 6 T 6 5 145416 CASAVA_Build 18 3669833 4D TTCTTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 105 het 48 0 34 14 TTTC 5 4 145417 CASAVA_Build 18 3674167 4D ATTGGGTAAG GTTT/---- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 22 0 22 4 GTTT 1 0 145418 CASAVA_Build 18 3674776 1D ATGAAACAGG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 92 het 38 0 30 9 A 8 7 145419 CASAVA_Build 18 3676176 8D CTCCATTTCA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 75 het 34 0 25 14 AAAC 6 4 145420 CASAVA_Build 18 3676328 12I TCCCTAACAG ------------/TAGGGATCCATA ATTCCTTCAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 TAGGGATCCATA 0 1 145421 CASAVA_Build 18 3680012 1I TTGATTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 10 11 145422 CASAVA_Build 18 3682279 1I TTTTGGAGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 8 9 145423 CASAVA_Build 18 3685898 3I GTTTGTAGTT ---/CTC CTTGAAGAGG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 CTC 0 1 145424 CASAVA_Build 18 3697610 1I TCTCAAAGAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 2371 hom 34 12 16 6 G 0 1 145425 CASAVA_Build 18 3706539 1I CTGTCTCAAA -/T TTTTTTTTTC 1377 het 1377 ref 24 16 4 4 T 9 10 145426 CASAVA_Build 18 3720297 4I GATTCATAAA ----/TTGT TTATTAATGT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTGT 0 1 145427 CASAVA_Build 18 3770872 8D TGCAATCTTA GCTCACTG/-------- GCTCACTGCA 3070 het 3070 ref 21 13 9 0 GCTCACTG 2 1 145428 CASAVA_Build 18 3772017 19D CGGGAGATTC TATTCCAAGCTTGGAACAG/------------------- TATTCCAAGC 3070 hom 42 het 25 0 15 12 TATTCCAAGCTTGGAACAG 2 1 145429 CASAVA_Build 18 3777140 1D AATAGGAACA T/- CATGAAATGG 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 1 0 145430 CASAVA_Build 18 3780274 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 27 5 13 9 T 12 11 145431 CASAVA_Build 18 3781516 6D GCACATGTGC GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 51 21 23 11 GT 8 5 145432 CASAVA_Build 18 3784431 1I TCTCCGTGTC -/T AAAGTCTTGC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 0 1 145433 CASAVA_Build 18 3786341 4I GTCCTGGGCT ----/ACAC TTTGGTTCTG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 AC 0 2 145434 CASAVA_Build 18 3789500 1I ACGTAGTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1834 hom 29 7 12 10 T 14 15 145435 CASAVA_Build 18 3797661 1D AAACGTGTGC T/- CTGGTGGTTT 3070 het 3050 hom 24 8 13 3 T 1 0 145436 CASAVA_Build 18 3805396 1D4M2D TTATTTTTTC TTGGCCT/-TGGC-- CTGCACACCC 3070 het 3070 ref 36 18 18 2 N/A 0 0 145437 CASAVA_Build 18 3807121 1D GTACAGCTGA G/- GGTCATAGAT 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 G 3 2 145438 CASAVA_Build 18 3811441 1I CCAATAAACT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 8 9 145439 CASAVA_Build 18 3832584 1I AGATTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 1431 het 1431 ref 44 24 7 13 T 13 14 145440 CASAVA_Build 18 3848478 2I AAAGGGAAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 680 hom 26 2 22 2 AT 6 7 145441 CASAVA_Build 18 3866026 1D AATAGAGCTG A/- AAAAAAAAAA 1869 het 1869 ref 33 16 9 8 A 15 14 145442 CASAVA_Build 18 3868163 1I AGCTCAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1602 hom 27 4 11 12 T 15 16 145443 CASAVA_Build 18 3893191 1I GGGATGTACT -/G GAGGGAAGGA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 1 2 145444 CASAVA_Build 18 3897173 1D GGGACCAATA C/- CCCCCCAAAT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 C 7 6 145445 CASAVA_Build 18 3904390 1I GATTTCTTTC -/T TTTTTAAGAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 5 6 145446 CASAVA_Build 18 3907855 1D AAAATTTCAG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 8 7 145447 CASAVA_Build 18 3909094 1I GGATATAGGT -/A AAGTTGATCA 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 A 2 3 145448 CASAVA_Build 18 3910770 1I GCACATCTTA -/T TTTCCAGAAA 3070 hom 157 het 58 0 53 5 T 3 4 145449 CASAVA_Build 18 3929181 4I CCAGCACTTT ----/GGGA GGCCAAGGTG 3070 hom 108 het 37 0 35 2 GGGA 0 1 145450 CASAVA_Build 18 3935791 1I ATAATAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 9 145451 CASAVA_Build 18 3943570 1D CTACATTTTC T/- TTATCCAATA 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 T 3 2 145452 CASAVA_Build 18 3953282 1D GCCCCCCTCA C/- CCCCCAGGGT 3070 hom 92 het 42 0 29 15 C 6 5 145453 CASAVA_Build 18 3966358 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 8 9 145454 CASAVA_Build 18 3969241 1D ATTTTTACCA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 57 22 27 8 T 8 7 145455 CASAVA_Build 18 3969460 4I CTCCCATGAT ----/TAAG TGACACATGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TAAG 0 1 145456 CASAVA_Build 18 3972386 1D ATACACACAC T/- TGTGCTCCAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 2 1 145457 CASAVA_Build 18 3979576 2D TCAACTAGTT TG/-- TGTTAATGAT 3070 het 3070 ref 51 25 17 10 TG 2 1 145458 CASAVA_Build 18 3985127 1D TAGCTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 T 14 13 145459 CASAVA_Build 18 3988485 2I TTCCACAGAC --/CT CTGTAATCAG 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 CT 1 2 145460 CASAVA_Build 18 3989723 1I TATTGGGGGG -/A AAAAGTGGCC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 4 5 145461 CASAVA_Build 18 3990238 3I TTACTTTTCT ---/CCC CATCCTACTA 3070 het 3036 hom 25 7 16 2 C 1 4 145462 CASAVA_Build 18 3991117 5D AAAATATTCA TTCTT/----- TTCTTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 11 11 7 TTCTT 2 1 145463 CASAVA_Build 18 3991348 1D TTTTCAGCTT G/- AGTTAAAATA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 1 0 145464 CASAVA_Build 18 3992041 3I ACACATATTT ---/GGA GGTTTATAGG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GGA 0 1 145465 CASAVA_Build 18 3996649 1D AACCCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1609 het 1609 ref 27 10 5 12 T 15 14 145466 CASAVA_Build 18 4000875 1D CACAAGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1547 hom 26 8 15 3 A 12 11 145467 CASAVA_Build 18 4002719 1I GCTCCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 1128 het 1128 ref 27 12 5 10 T 15 16 145468 CASAVA_Build 18 4006668 1I TCCTTGAATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 A 8 9 145469 CASAVA_Build 18 4009641 1D TTTGGGGGAA T/- TTTTTTGTTC 2197 het 2197 ref 19 12 5 2 T 7 6 145470 CASAVA_Build 18 4015324 1I CCAATGAGCA -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 C 0 1 145471 CASAVA_Build 18 4041756 1I AGTCTCATCT -/A AGACAATGCA 3070 hom 101 het 39 0 35 4 A 1 2 145472 CASAVA_Build 18 4045543 1I GCAGTATTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 T 8 9 145473 CASAVA_Build 18 4051386 1I TTAATCTTAT -/A AAAAATCTGT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 5 6 145474 CASAVA_Build 18 4060528 2I TTTTTGCATA --/AC AGGTTTTCCC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AC 0 1 145475 CASAVA_Build 18 4062299 2D ATGATGAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 12 10 145476 CASAVA_Build 18 4062475 1D CATCATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 253 hom 18 1 15 3 T 14 13 145477 CASAVA_Build 18 4069692 4D TTGAAATTAA ATAT/---- ATATATATAT 2796 hom 15 het 8 0 6 4 AT 11 9 145478 CASAVA_Build 18 4070891 2D TTGAATGCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 25 0 21 4 T 15 13 145479 CASAVA_Build 18 4074232 3D GCAGTGGTTA TAG/--- TAGCATTCAC 3070 het 3070 ref 27 18 8 2 TAG 2 1 145480 CASAVA_Build 18 4074961 6I AGCAGGCATC ------/AGATAA GTCCAGGATG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AGATAA 0 1 145481 CASAVA_Build 18 4077860 4D TGGGCTTTGC TTTG/---- TTTGAGTTGA 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 TTTG 2 1 145482 CASAVA_Build 18 4078010 1I TCTTTTTCTG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 145483 CASAVA_Build 18 4078093 2D18M6I TTTATTTTTT TCCTATAGAAAACATTTCCT------/--CTATAGAAAACATTTCCTATTTTA ATTTTAATTT 3070 het 698 hom 14 3 10 6 N/A 0 0 145484 CASAVA_Build 18 4081892 1D CTTGATCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 46 1 42 3 T 11 10 145485 CASAVA_Build 18 4083584 1D AACATTAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 11 10 145486 CASAVA_Build 18 4090018 1I ATGCCTGGCT -/A AATTTATTTC 3070 hom 68 het 26 0 23 3 A 2 3 145487 CASAVA_Build 18 4090715 1D GCCACCTTCA C/- TAGTGACTTT 3070 hom 123 het 42 0 42 0 C 1 0 145488 CASAVA_Build 18 4091660 2I TGTGTACTGC --/AG AGTCTTGCTG 3070 hom 57 het 27 0 20 7 AG 1 2 145489 CASAVA_Build 18 4147650 2D ATAGGACAGT GA/-- GCATCAAGGG 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 GA 1 0 145490 CASAVA_Build 18 4204312 1I AGGAAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 827 hom 41 3 26 12 T 12 13 145491 CASAVA_Build 18 4206292 1D GATTAAATTA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 62 het 29 0 19 10 C 10 9 145492 CASAVA_Build 18 4210274 6D ACAGTACATA AAATCT/------ AAATCTCTCT 3070 hom 81 het 28 0 27 3 AAATCT 2 1 145493 CASAVA_Build 18 4215675 2I GAATGTATCA --/GT GTCTCTTACC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 GT 1 2 145494 CASAVA_Build 18 4236875 5I CAGAAAAAGA -----/AAAGG AAAGAAAAAG 3070 hom 108 het 37 0 36 1 AAAGG 0 1 145495 CASAVA_Build 18 4242512 1I GTCAGAAAAG -/A AAAAAAGCAG 3070 het 3070 ref 50 22 22 6 A 6 7 145496 CASAVA_Build 18 4245502 1D TATACAGATG A/- AAAAAAAAAT 1938 het 869 hom 11 2 6 3 A 10 9 145497 CASAVA_Build 18 4257279 1I GTCTTACCTG -/C CCCACCTGTG 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 C 3 4 145498 CASAVA_Build 18 4257543 1I TCTTGCACCC -/A AAAGGAAATA 3070 het 3070 ref 53 29 21 3 A 3 4 145499 CASAVA_Build 18 4265600 1D ATTTTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 35 1 17 17 T 11 10 145500 CASAVA_Build 18 4268748 4I18M4I AAAATGTTAT ----ACACACACACACACATAT----/ACACACACACACACACACATATTTTC TTTATCTAAT 3070 het 3070 ref 47 27 20 12 N/A 0 0 145501 CASAVA_Build 18 4272364 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2502 het 2502 ref 24 11 10 4 A 17 16 145502 CASAVA_Build 18 4273815 1I ACTCTTTTTT -/A ATAAAACTAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 1 2 145503 CASAVA_Build 18 4275034 1D20M1I32M3I TGTAAAACTA TTTTTTTTTACAAAAATAATG-ATAAAGTAATAATTTCTACTTTTTGTAAAGCC---/-TTTTTTTTACAAAAGTAATGTATAAAGTAATAATTTTTACTTTTTGTAAAGCCATT ATTATTTTTG 3070 het 3070 ref 34 21 16 9 N/A 0 0 145504 CASAVA_Build 18 4278067 2I GCTTGACAAA --/TT TTTTTTATTA 3070 hom 64 het 33 0 19 14 T 6 8 145505 CASAVA_Build 18 4278865 5D CATTTTTAAC TTTAA/----- TTTCTTTGGG 3070 het 3070 ref 37 19 15 6 TTTAA 1 0 145506 CASAVA_Build 18 4283620 1I TTTGGTATTT -/G GTAAAGAGGT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 G 1 2 145507 CASAVA_Build 18 4286287 2D CTCACAGCCT AA/-- AGCTGATGTA 3070 het 3070 hom 47 16 27 5 A 3 1 145508 CASAVA_Build 18 4293273 1I TATTATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 10 11 T 10 11 145509 CASAVA_Build 18 4295535 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2250 het 315 hom 17 2 9 6 A 17 18 145510 CASAVA_Build 18 4295912 1I GATTATTATT -/A TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 0 1 145511 CASAVA_Build 18 4311965 1D TGGGAGGCCT A/- GGGGGGTGGA 3070 het 2102 hom 33 8 19 7 A 1 0 145512 CASAVA_Build 18 4314711 70D AGGTTGGTTC AACATACACAAATCAATGAATGTGATTAATCACATAAACAACTAAAAACAAAAACCACATGATTACCTTA/---------------------------------------------------------------------- ATTGATGCAG 1315 het 1315 ref 25 38 3 2 AACATACACAAATCAATGAATGTGATTAATCACATAAACAACTAAAAACAAAAACCACATGATTACCTTA 1 0 145513 CASAVA_Build 18 4317091 8D AATTAAAGAA TACAAATT/-------- TACAAATTTT 3070 het 3070 ref 41 21 17 6 TACAAATT 2 1 145514 CASAVA_Build 18 4320967 6D TGGACTTGTC TCTTTT/------ TCTTTGTAGC 3070 het 3070 ref 37 23 10 5 TCTTTT 1 0 145515 CASAVA_Build 18 4322486 2D ATAAAAACAC AT/-- GTTAATGATA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 AT 1 0 145516 CASAVA_Build 18 4337926 3I TAATAATTAA ---/TAT TGTTAATTCC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TAT 0 1 145517 CASAVA_Build 18 4358782 4I GTTTTAAATA ----/AAGT AAGTATTAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AAGT 1 2 145518 CASAVA_Build 18 4360768 1D TATGTGTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 47 hom 48 1 42 5 T 10 9 145519 CASAVA_Build 18 4360976 3I TTAACAACAT ---/AAC AACAAGAAGA 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 AAC 1 2 145520 CASAVA_Build 18 4361747 1I GCAAAATGGT -/A AAAAAGGCAA 3070 het 3070 hom 53 25 27 1 A 5 6 145521 CASAVA_Build 18 4365901 1I ACAGATATGC -/A AAAACAACTG 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 4 5 145522 CASAVA_Build 18 4380167 1I AAATTGTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 41 1 33 7 A 11 12 145523 CASAVA_Build 18 4385382 1D AAAATCAAAT A/- GGGGGTATAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 A 1 0 145524 CASAVA_Build 18 4388334 1I CATAAAGCAA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 8 145525 CASAVA_Build 18 4398981 4D ACACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 51 het 23 0 17 8 AC 10 8 145526 CASAVA_Build 18 4400686 2D TTCCCCCCAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 22 8 9 7 AT 9 8 145527 CASAVA_Build 18 4404183 3I GAATACAAAC ---/ATT ATTCAATAAT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 ATT 1 2 145528 CASAVA_Build 18 4405059 2D ACACATACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 AT 7 6 145529 CASAVA_Build 18 4406122 1I GAACCTAAAT -/G TGTAGTGACA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 G 0 1 145530 CASAVA_Build 18 4406395 8I ATTAATAACA --------/AATTTTAC ATTTTGAATT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 AATTTTAC 0 1 145531 CASAVA_Build 18 4406704 2I TTGGAAGACC --/AA AATATGAGAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 2 4 145532 CASAVA_Build 18 4408864 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 9 145533 CASAVA_Build 18 4409664 5I GGAAATTCAG -----/AATAT ATTATTTAAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AATAT 0 1 145534 CASAVA_Build 18 4410405 1D TGAAACATTC A/- ACCAAAATAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 2 1 145535 CASAVA_Build 18 4410589 2D GTCCTCACCT AA/-- GTTTTCTCAC 3070 het 3070 ref 49 25 19 6 A 2 0 145536 CASAVA_Build 18 4415327 2D TGACTAACCA TG/-- TTCATGCTTT 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 TG 1 0 145537 CASAVA_Build 18 4422489 4I AATAAATTTT ----/TTTA TTTAAAAATT 3070 hom 33 het 16 0 11 5 TTTA 1 2 145538 CASAVA_Build 18 4424180 1D TACAACAGCA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 9 8 145539 CASAVA_Build 18 4427812 1D TACAGTTGGA G/- GGTTATATTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 3 2 145540 CASAVA_Build 18 4432604 1I CAGAAAGGAC -/A AAAGAATGAG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 3 4 145541 CASAVA_Build 18 4432693 1D ATTTAAAAAG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 8 7 145542 CASAVA_Build 18 4434225 1I TGCCTCTTCA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 43 0 34 9 T 7 8 145543 CASAVA_Build 18 4435299 1I ACCAATCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 35 0 25 10 T 11 12 145544 CASAVA_Build 18 4437260 2D CCATCAACAA AG/-- ATTGATACCT 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 AG 1 0 145545 CASAVA_Build 18 4442479 1I TTTTATATTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 8 9 145546 CASAVA_Build 18 4443365 2D AAGAAAACTT TA/-- TATTCTTCTG 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 TA 2 1 145547 CASAVA_Build 18 4447314 4I TCCCTCACCT ----/CAAA CATTTATCTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 CAAA 0 1 145548 CASAVA_Build 18 4453302 4D AGACAGACAG ACAA/---- ACAAGTAAGG 3070 het 3070 ref 42 23 19 3 ACAA 2 1 145549 CASAVA_Build 18 4455884 1I TTTGCAACTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 A 8 9 145550 CASAVA_Build 18 4459300 1I CCATTAAAAT -/G CCATTTAGAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 G 0 1 145551 CASAVA_Build 18 4461941 1I AAAAAAACTG -/T TATCTAGAAT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 T 1 2 145552 CASAVA_Build 18 4473343 1D TTATTTTGAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 3 T 9 8 145553 CASAVA_Build 18 4484738 3I TATCTCATTG ---/TTA TTATTATTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 TTA 2 3 145554 CASAVA_Build 18 4490711 2D ATGCTGGGGC TT/-- TCTCTCTATT 3070 het 3070 hom 27 14 13 1 T 3 1 145555 CASAVA_Build 18 4491670 1D CCAAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 12 8 T 11 10 145556 CASAVA_Build 18 4498636 1I CATGGTCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 796 hom 12 3 8 1 T 10 11 145557 CASAVA_Build 18 4554903 2D CTATCTAAGA CT/-- CTGAGTTACA 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 CT 2 1 145558 CASAVA_Build 18 4557998 3D CACATCTTTT ATG/--- ATTCTATTTA 3070 het 3070 ref 46 24 17 8 ATG 1 0 145559 CASAVA_Build 18 4562105 3I TTCAATATGA ---/TGT TGGTAGTTTG 3070 het 3070 ref 54 27 20 7 TGT 0 1 145560 CASAVA_Build 18 4571074 2I AGTGAAAAAC --/TT AGGAGTTTCC 3070 het 3070 hom 39 19 20 0 T 0 2 145561 CASAVA_Build 18 4573123 1D GAGAACAGTA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 32 8 13 11 T 8 7 145562 CASAVA_Build 18 4577910 6I ATAAAGGTGT ------/AATCTG AACCTGACAG 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 AATCTG 0 1 145563 CASAVA_Build 18 4579198 1D GCTATCAAGA C/- TTTTCCAAAC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 1 0 145564 CASAVA_Build 18 4580613 1D GTTGCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 18 11 T 11 10 145565 CASAVA_Build 18 4588140 2D AGGCAACATG CA/-- CACACACACA 858 het 858 ref 35 23 3 11 CA 9 8 145566 CASAVA_Build 18 4593229 1D TACATTTTTT A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 A 7 6 145567 CASAVA_Build 18 4599506 1I GATAGTTTAC -/A AAATATTTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 3 4 145568 CASAVA_Build 18 4610373 2I TGCTATAAAC --/AT GTGTGCAATT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 AT 0 1 145569 CASAVA_Build 18 4614432 5D AAGACTGTAT CTTTC/----- CTTTATTTAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 5 CTTTC 1 0 145570 CASAVA_Build 18 4615103 1D ATTTTGTATC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 8 145571 CASAVA_Build 18 4630412 1I TAGACCCCCC -/A AAAAAAGGCC 3070 hom 116 het 47 0 38 9 A 6 7 145572 CASAVA_Build 18 4632064 1D AGCCCTTCAG A/- AATCTATGGT 3070 hom 105 het 42 0 34 8 A 3 2 145573 CASAVA_Build 18 4637208 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 114 hom 17 1 13 4 AC 6 5 145574 CASAVA_Build 18 4646754 1D ATACCAATAC T/- TTGGAGAATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 2 145575 CASAVA_Build 18 4657540 1I GGTGAGCCTT -/G GACCCTTAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 1 2 145576 CASAVA_Build 18 4659840 1I AGCCAGGCAT -/G GCAGCACATG 1618 hom 13 het 13 0 4 9 G 1 2 145577 CASAVA_Build 18 4680616 1D CTCAAGGGGA C/- CTTTTAGAGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 2 1 145578 CASAVA_Build 18 4696973 1D ACATTTACTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 48 het 27 0 17 10 A 9 8 145579 CASAVA_Build 18 4697072 2I AAAAACAAAA --/AT ATAAATACTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 2 145580 CASAVA_Build 18 4699634 3I TGTTAGAAAA ---/TAT TATTCCCAGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TAT 1 2 145581 CASAVA_Build 18 4703057 2I TACACATTTG --/AT ATATATATAT 3070 het 677 hom 29 2 25 2 AT 7 8 145582 CASAVA_Build 18 4703550 1D AGCTCTAGGA C/- CCCCCCAATC 3070 hom 108 het 38 0 33 5 C 7 6 145583 CASAVA_Build 18 4704312 2D AAAAGTCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 32 0 25 9 A 12 10 145584 CASAVA_Build 18 4705281 1I TAAGAGGAAG -/A AAAAAAACAC 3070 het 354 hom 39 1 32 6 A 7 8 145585 CASAVA_Build 18 4707713 1I TGAAATTTAC -/T TTATTCCTTC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 3 145586 CASAVA_Build 18 4713551 1I ATAATTTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 145587 CASAVA_Build 18 4717601 2I GAAAAATTAT --/AG AGAGAGAAAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 AG 3 4 145588 CASAVA_Build 18 4728358 1I AAATTCTGCA -/T TTTATGTAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 3 4 145589 CASAVA_Build 18 4729143 3I CTTTTCTATC ---/TAT TGTTTTCCAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TAT 0 1 145590 CASAVA_Build 18 4733858 2I CTGCACACAC --/AT GTCTATAGCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 145591 CASAVA_Build 18 4734697 1D CCTTAATGCT A/- AAAAAAAAAA 1352 het 1352 ref 51 38 3 10 A 13 12 145592 CASAVA_Build 18 4736895 8D CAAAGATCAC TGATCACA/-------- TGATCACAGC 3070 hom 57 het 22 0 20 7 TGATCACA 2 1 145593 CASAVA_Build 18 4741540 1D AGGAAAGTAA C/- CCAGACGCAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 3 2 145594 CASAVA_Build 18 4753106 1D TACACTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 41 2 33 6 T 11 10 145595 CASAVA_Build 18 4769665 1I TATGTTGTTG -/A AAAATATTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 4 5 145596 CASAVA_Build 18 4770163 5D CTCTGTCTCC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 149 het 149 ref 16 6 3 7 A 21 16 145597 CASAVA_Build 18 4770417 1D CTCTCAAACC T/- CATTCATTCA 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 1 0 145598 CASAVA_Build 18 4772005 2D TAAGATTCTC AT/-- AGAGTCCCCC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AT 1 0 145599 CASAVA_Build 18 4785514 1D AAAACCAAAT C/- GCCACAGGTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 1 0 145600 CASAVA_Build 18 4806380 19D AATTTCCCCC ATTCATGGGGTCCCTCTGA/------------------- ATTATTACAC 3070 het 3070 hom 34 14 21 3 ATTCATGGGGTCCCTCTGA 1 0 145601 CASAVA_Build 18 4811807 1I AGCTCAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 10 11 145602 CASAVA_Build 18 4828870 3D GTATATATAA CAC/--- CACAATACAG 3070 hom 93 het 36 0 32 7 CAC 2 1 145603 CASAVA_Build 18 4834600 2I ATTGCCCTGC --/AA AGTCTCTTGT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 1 3 145604 CASAVA_Build 18 4838142 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 9 145605 CASAVA_Build 18 4853061 1I ACTTTGAAAA -/T GCTAGAAGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 145606 CASAVA_Build 18 4855907 1D TCACCATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 28 2 13 13 T 17 16 145607 CASAVA_Build 18 4882022 1D GAACCAGGGG A/- AAAAACACTT 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 A 6 5 145608 CASAVA_Build 18 4882207 6D TCTAGAGCTT TACTAA/------ TACTATCAAA 3070 het 3070 ref 37 22 11 7 TACTAA 1 0 145609 CASAVA_Build 18 4902596 1I GCAATTAGAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 A 8 9 145610 CASAVA_Build 18 4902699 1D AAGACTCCAC A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 A 7 6 145611 CASAVA_Build 18 4918584 1D TTGTCTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 312 hom 28 1 22 5 T 12 11 145612 CASAVA_Build 18 4928762 2D GACATTGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 37 5 14 20 A 13 11 145613 CASAVA_Build 18 4929363 4I ATGTGTTGTA ----/TGTG TGTGTGTATT 3070 hom 43 het 19 0 14 5 TG 3 5 145614 CASAVA_Build 18 4929421 4D TAGATATATG AGAT/---- AGATAGATAT 3070 het 3070 ref 22 9 9 5 AGAT 3 2 145615 CASAVA_Build 18 4933410 1D CCAGGGGTAG A/- AAAAGCGAGT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 5 4 145616 CASAVA_Build 18 4933623 2I GGTAATATTT --/AG AGTGAAGTCC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 AG 1 2 145617 CASAVA_Build 18 4937274 1D TAAGACAGAC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 8 7 145618 CASAVA_Build 18 4941413 1D TTTTTTCTGT A/- AAAAACTGCC 3070 hom 144 het 53 0 47 6 A 6 5 145619 CASAVA_Build 18 4952961 2D AACAAATGCT GA/-- GAGATTTTAG 3070 het 3070 ref 23 10 11 5 GA 3 2 145620 CASAVA_Build 18 4960970 1D TTCCAGTGGG C/- AGACTGACTA 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 C 1 0 145621 CASAVA_Build 18 4962233 1D CTAATAGTAA T/- TGAATCTGAA 3070 het 3070 ref 33 20 11 4 T 2 1 145622 CASAVA_Build 18 4964051 1D TTACTTATTA C/- CACGAGAACA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 2 1 145623 CASAVA_Build 18 4967607 1I TACAAAACTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 31 het 44 1 38 5 A 7 8 145624 CASAVA_Build 18 4978203 1D TGCCATCAAT C/- CCCCCCCCTG 3070 het 2868 hom 38 15 12 12 C 9 8 145625 CASAVA_Build 18 4981673 4D AGAAAGAGAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 1505 het 1505 ref 22 10 7 5 AGAA 5 4 145626 CASAVA_Build 18 4992489 1D72M1D ACATTCTTTT CCACAGCACATGGATCATTCTTAAGAATAGACTATATGTTAGGTAAAAAAAAGTCTTTTTTGTTGTTATTTAGT/-CGCAGCACATGGATCATTCTTAAGAATAGACTATATGTTAGGTAAAAAAAAGTCTTTTTTGTTGTTATTTAG- TTTTATTTCA 3070 het 3070 ref 42 35 17 30 N/A 0 0 145627 CASAVA_Build 18 4994060 1D TCTCCCAGTT A/- AAAAAAAAAA 2221 het 2221 ref 33 17 6 10 A 15 14 145628 CASAVA_Build 18 5018275 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1237 het 307 hom 4 1 3 0 A 6 7 145629 CASAVA_Build 18 5022638 1I TTTTTTCATG -/A AACCTGTTGT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 2 3 145630 CASAVA_Build 18 5022965 2D AGCTTTCTTC TA/-- TGTTTTCTTC 2092 het 2092 ref 36 20 7 9 TA 1 0 145631 CASAVA_Build 18 5023428 2D GTCTCACCAC AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 10 8 145632 CASAVA_Build 18 5024226 1I AGCTGCTGCA -/C CACTTTACAC 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 C 1 2 145633 CASAVA_Build 18 5030538 1I TTGAAATCAA -/T TAGGGAAGCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 1 2 145634 CASAVA_Build 18 5031994 2D TAAGAAGTGC CT/-- GTCACCTCCC 3070 het 3070 ref 29 12 9 9 CT 1 0 145635 CASAVA_Build 18 5032564 1I TAAATTGTCC -/A AAAAACCATA 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 5 6 145636 CASAVA_Build 18 5067383 1I AGTTGTGAAT -/A AAAAGGGCAG 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 4 5 145637 CASAVA_Build 18 5067618 1D TACAAAAAAA T/- ATATAAAAAA 1843 het 1843 ref 11 5 4 2 T 1 0 145638 CASAVA_Build 18 5099357 2D AAAAGTAAAC TT/-- AAGATATATG 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 T 2 0 145639 CASAVA_Build 18 5100793 4I CAAATGCCAT ----/TCTA TCTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TCTA 0 1 145640 CASAVA_Build 18 5169415 2D TGTATGTATG TA/-- TGTGTGTATA 1787 het 1787 ref 46 25 9 14 TA 1 0 145641 CASAVA_Build 18 5170399 2D GGTTCATGGG GA/-- GAGACCTGCC 3070 het 3070 hom 46 16 23 9 GA 3 2 145642 CASAVA_Build 18 5173582 1D AGCAAAATTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 A 9 8 145643 CASAVA_Build 18 5179756 1I TACAGCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1910 het 1910 ref 34 17 7 10 T 11 12 145644 CASAVA_Build 18 5185148 1I AGAAGTGATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 9 10 145645 CASAVA_Build 18 5203738 1I ATATTAGGGC -/G GGGGGGTGAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 G 6 7 145646 CASAVA_Build 18 5206344 1D CTTATTCCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 53 27 21 5 T 9 8 145647 CASAVA_Build 18 5206547 1D GATTTTCTGT A/- GAGATGAGGT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 1 0 145648 CASAVA_Build 18 5212166 1D CAAATTAAAA C/- CAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 C 2 1 145649 CASAVA_Build 18 5213453 1I ACAAAACAAT -/A AAAAAACCTA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 6 7 145650 CASAVA_Build 18 5217130 1D TTGTTTTTGG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 T 9 8 145651 CASAVA_Build 18 5217602 1I TGCAAGTATG -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 6 7 145652 CASAVA_Build 18 5219634 1I TGATACTGGC -/T TCATAGAACG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 1 2 145653 CASAVA_Build 18 5233942 5D CAAGAAAAAA AAAAC/----- AAAAACAAAA 136 het 136 ref 26 13 3 13 AAAAC 1 0 145654 CASAVA_Build 18 5234933 3I30M2I AATAATGAAT ---GTGTAAATGCTATGAAAATAGTTACTACAC--/GTAGTGTAAATGCTATGAAAATAGTTACTACACTG TATTGTTTAT 3070 het 3070 hom 34 15 19 11 N/A 0 0 145655 CASAVA_Build 18 5236007 2I ACACACATGT --/AC ACACACCCTA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 AC 3 4 145656 CASAVA_Build 18 5238581 3I TTTCTCAAAT ---/AGG AGTTTTTACG 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 AGG 0 1 145657 CASAVA_Build 18 5239692 4I ACTTTTTAAC ----/TTTG TTTGTATTTC 3070 het 3070 ref 53 23 18 12 TTTG 1 2 145658 CASAVA_Build 18 5243187 1I TACAAAAATC -/A TAAGTAAAAT 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 A 0 1 145659 CASAVA_Build 18 5261304 1I TGGGCATCCA -/G GTGTTTCCAT 3070 het 2937 hom 22 8 8 6 G 1 2 145660 CASAVA_Build 18 5263273 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 A 10 9 145661 CASAVA_Build 18 5271159 4D TTTGATGGGG TTGT/---- TTGTTTTTTT 2300 het 411 hom 8 1 6 1 TTGT 2 1 145662 CASAVA_Build 18 5272261 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 10 11 145663 CASAVA_Build 18 5273746 1D AATCAAAGTG T/- TATTACCTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 2 1 145664 CASAVA_Build 18 5274842 3I GACATCTCCG ---/TCA TCCTATTTGA 3070 het 3070 ref 38 25 10 3 TCA 0 1 145665 CASAVA_Build 18 5282208 1D AAACTCCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 13 12 145666 CASAVA_Build 18 5283760 1I AGTATATACC -/T TTACAAATAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 2 3 145667 CASAVA_Build 18 5286878 1D CTCTGTCCTT A/- ACATCCCTGC 2416 het 2416 ref 29 16 7 6 A 2 1 145668 CASAVA_Build 18 5290377 1I CCTCTAAGTC -/T TTTTTACTTA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 T 5 6 145669 CASAVA_Build 18 5298090 22D TGTACATGCA TATATATACCTATACATATATG/---------------------- TATATATACC 3070 het 342 hom 43 3 20 23 TATATATACCTATACATATATG 1 0 145670 CASAVA_Build 18 5300745 1D AGCAAATCAT G/- GGCTGTAGTC 3070 hom 148 het 55 0 50 5 G 3 2 145671 CASAVA_Build 18 5319661 1I AAACTAACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 52 0 40 12 A 9 10 145672 CASAVA_Build 18 5321436 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 49 het 21 0 17 4 A 9 8 145673 CASAVA_Build 18 5324997 2I CCTTCAAGAC --/TT TTCCTCATTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 4 145674 CASAVA_Build 18 5332660 1D TACATAATCA T/- TGAGATCTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 2 1 145675 CASAVA_Build 18 5337534 2D ACACAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 14 12 145676 CASAVA_Build 18 5353980 2I GACTTAACTC --/TG AATATAATAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TG 0 1 145677 CASAVA_Build 18 5358861 1D TAAAAATGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 10 9 145678 CASAVA_Build 18 5362419 3D AATTTCCAAA TGT/--- TGTTAGACAA 3070 het 3070 ref 44 23 19 3 TGT 2 1 145679 CASAVA_Build 18 5365887 1I ATATTATTTT -/A AAAATCATAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 4 5 145680 CASAVA_Build 18 5398276 1I TTTTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 C 0 1 145681 CASAVA_Build 18 5399712 2I AGGATGATGC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 9 11 145682 CASAVA_Build 18 5411307 1I GATATTCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 A 9 10 145683 CASAVA_Build 18 5412459 4D ACTTGTAACT TTTG/---- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 TTTG 1 0 145684 CASAVA_Build 18 5427962 1I TAAGCACGCT -/C CTTTCCGGAG 3070 hom 110 het 39 0 37 2 C 1 2 145685 CASAVA_Build 18 5431462 5D CGAATTCCAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2320 het 39 hom 17 1 8 8 T 21 16 145686 CASAVA_Build 18 5440465 1D TAGAGAAACT G/- GGGGGGGTGA 3070 het 21 hom 32 1 21 10 G 8 7 145687 CASAVA_Build 18 5442687 5I CAAATGAGAA -----/ATAAT AAACCACTAA 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 ATAAT 0 1 145688 CASAVA_Build 18 5442782 6D AAAAATTTGT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TG 11 8 145689 CASAVA_Build 18 5445294 1D TACTCTTACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 11 10 145690 CASAVA_Build 18 5447106 100D CAATCACATA AAAACTGAAACCATAAGGCAAACCGCACTCTCAACATGGCTTCAAGATAGGTACAGCCTTTTCCTGTAAGCAACAACTCTACCGTTCTTTTATCTGTAGG/---------------------------------------------------------------------------------------------------- AAAATCGCAA 3070 het 3070 ref 34 56 8 8 AAAACTGAAACCATAAGGCAAACCGCACTCTCAACATGGCTTCAAGATAGGTACAGCCTTTTCCTGTAAGCAACAACTCTACCGTTCTTTTATCTGTAGG 1 0 145691 CASAVA_Build 18 5448709 2D TCTTGTACCT AA/-- AAAGACTGTT 3070 het 3070 hom 54 19 28 8 A 5 3 145692 CASAVA_Build 18 5456782 1D ATGTAGAAAC T/- TTTCCTAGGA 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 T 4 3 145693 CASAVA_Build 18 5457380 1D TGATACTCTG C/- CCACTGACTA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 C 3 2 145694 CASAVA_Build 18 5459446 16D AGCAGCCAGC ATGCCTGGCTGTGTGT/---------------- ATGCCTGGCT 3070 het 3070 ref 37 21 15 9 ATGCCTGGCTGTGTGT 2 1 145695 CASAVA_Build 18 5465389 1I ATGGGTTACC -/A ATTAGCCCTC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 1 2 145696 CASAVA_Build 18 5469760 1D GTTTTAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3046 het 3046 ref 27 13 9 6 A 12 11 145697 CASAVA_Build 18 5474519 1I AAATTGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 10 11 145698 CASAVA_Build 18 5483574 2I TATTTGCATG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 9 11 A 9 11 145699 CASAVA_Build 18 5485429 3I TAAATGAAAC ---/AAT AGTAAGGCCA 3070 het 2023 hom 35 8 11 16 AAT 0 1 145700 CASAVA_Build 18 5489105 1D CTAGTCACTC G/- GAAGACACAG 3070 het 3070 hom 51 24 22 5 G 2 1 145701 CASAVA_Build 18 5497465 1D AATCTCCTAC A/- AAAGTGATGA 3070 het 3070 hom 41 13 26 3 A 4 3 145702 CASAVA_Build 18 5504526 5D TCTCCTTTTT ACAAG/----- ACAAGTCCAC 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 ACAAG 2 1 145703 CASAVA_Build 18 5505560 3D TTTTACATAA TTC/--- TTCTTCCCAG 3070 het 3070 hom 30 12 17 3 TTC 3 2 145704 CASAVA_Build 18 5514617 1D GAGATCTCAA G/- GGATTCCACT 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 G 3 2 145705 CASAVA_Build 18 5518009 1D ACATTAAAAA C/- AATACCACAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 C 1 0 145706 CASAVA_Build 18 5518174 4D TTGTTTTTAT TTTA/---- TTTATTTGAG 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 TTTA 2 1 145707 CASAVA_Build 18 5519325 4D AAATACATAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 12 10 8 AT 8 6 145708 CASAVA_Build 18 5537053 7I TGTATCACCT -------/CTTACTA CTTACTAAGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CTTACTA 1 2 145709 CASAVA_Build 18 5538673 14I ACTTTTAAAC --------------/GGAATAATTTTAAT GATAAAATTG 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 GGAATAATTTTAAT 0 1 145710 CASAVA_Build 18 5542743 1I ATCACCAGAA -/C CCCTCCAAGG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 C 3 4 145711 CASAVA_Build 18 5544797 2D CTCTTTGCTC AT/-- GTGTACAAAC 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 AT 1 0 145712 CASAVA_Build 18 5549100 1I GAATAAACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 9 18 10 T 9 10 145713 CASAVA_Build 18 5549746 10D CCTTAGAAAA AAATCCTACG/---------- AAAGCTAAAC 3070 het 3070 ref 37 21 16 3 AAATCCTACG 1 0 145714 CASAVA_Build 18 5594028 4I ACGTGCACAC ----/ACAA ACACACAGAC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 ACAA 0 1 145715 CASAVA_Build 18 5599807 2D GTGTCAAGAC AT/-- GTGGGATATC 3070 hom 126 het 47 0 43 7 AT 1 0 145716 CASAVA_Build 18 5625712 1D TTGTCTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1818 hom 38 13 12 13 T 16 15 145717 CASAVA_Build 18 5626325 1D CAAACATGTC T/- TTTTCAGTGA 3070 het 3070 hom 61 25 26 10 T 5 4 145718 CASAVA_Build 18 5630506 22D TTCCTCTTTC CCATCTCTTCATTTTGCTAAGG/---------------------- CCTGTTTTAT 3051 het 3051 ref 36 23 9 7 CCATCTCTTCATTTTGCTAAGG 1 0 145719 CASAVA_Build 18 5637348 1I AAAAGAGTGA -/T TTTTTTCACA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 6 7 145720 CASAVA_Build 18 5647255 1I AAGTATTGCA -/C TACTTGCCAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 0 1 145721 CASAVA_Build 18 5647925 4D ATTTTATTTC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 66 het 38 0 23 15 ATTT 6 5 145722 CASAVA_Build 18 5654956 3I ATGCTAAATT ---/AAC TACCTCATTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AAC 0 1 145723 CASAVA_Build 18 5656950 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 25 8 T 10 11 145724 CASAVA_Build 18 5659947 1I AGGAGTTAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 8 9 145725 CASAVA_Build 18 5660053 18I AACAGAAATG ------------------/TAGCAAGCTTTGGGCTGC TAGCAAGCTT 3070 het 3070 ref 43 15 13 16 TAGCAAGCTTTGGGCTGC 0 1 145726 CASAVA_Build 18 5662380 1I TAAGTCATAT -/C CCCACCATGA 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 C 3 4 145727 CASAVA_Build 18 5662893 1I TAGCTAAAGG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 T 7 8 145728 CASAVA_Build 18 5665857 3I ACCCATGAGG ---/TGT TGTGGTCAAG 3070 hom 150 het 56 0 49 7 TGT 1 2 145729 CASAVA_Build 18 5666552 1D CGTGGAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1622 hom 46 7 19 20 A 15 14 145730 CASAVA_Build 18 5686251 1D TACTGGGGCA G/- AAGCAGAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 G 1 0 145731 CASAVA_Build 18 5690545 6D ATTAATGTTA TATCTT/------ TATGGTATTA 3070 het 3070 ref 41 21 20 5 TATCTT 1 0 145732 CASAVA_Build 18 5690665 26D AGTGCAGGAT TCTTTACAGTCTTATTGACTGCTACA/-------------------------- TCCCCAGTGC 3070 het 3070 ref 39 26 11 8 TCTTTACAGTCTTATTGACTGCTACA 1 0 145733 CASAVA_Build 18 5691747 7D GACATTACTG TGCATAC/------- TGCTCTGTTC 3070 het 3070 ref 41 21 17 7 TGCATAC 1 0 145734 CASAVA_Build 18 5695555 2D GACACACATG CA/-- CACACACACA 2515 het 2515 ref 55 38 6 12 CA 8 7 145735 CASAVA_Build 18 5720589 1I TAAAAAAAAA -/C ACACACACAT 3070 het 3070 hom 42 11 27 4 C 0 1 145736 CASAVA_Build 18 5720842 24I ATCATTTGCC ------------------------/CTAAGCAATAATGTATCATTTGCA CTAAGCAATA 3070 het 3070 hom 65 22 33 10 CTAAGCAATAATGTATCATTTGCA 0 1 145737 CASAVA_Build 18 5723313 2I CCCTTCACTG --/AT AAGGACATGA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 AT 0 1 145738 CASAVA_Build 18 5724488 1D CTCAGCCATC A/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 A 7 6 145739 CASAVA_Build 18 5727171 1I TCTCCCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 10 5 A 10 11 145740 CASAVA_Build 18 5736276 2D ATGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 36 1 21 14 T 14 12 145741 CASAVA_Build 18 5738262 2D GTTTTTTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 T 12 10 145742 CASAVA_Build 18 5739245 1I TAAGAATTGA -/T TTTTTAATGT 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 T 5 6 145743 CASAVA_Build 18 5744286 1I GATTTACTCT -/C TAACTATTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 145744 CASAVA_Build 18 5763656 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 9 8 145745 CASAVA_Build 18 5782640 3D CAAAGAGGAA AAC/--- AACAGGCACT 3070 het 3070 ref 45 21 17 8 AAC 2 1 145746 CASAVA_Build 18 5788989 1I AAGAAAAATA -/T TTTTTCTATA 3070 het 2516 hom 18 7 11 0 T 5 6 145747 CASAVA_Build 18 5801575 3D AAAAATAAAT ATG/--- ATCAGTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 ATG 1 0 145748 CASAVA_Build 18 5814820 2D GCCCAGGTAT CA/-- GTTCCTATTC 3070 het 3070 hom 46 22 22 3 CA 1 0 145749 CASAVA_Build 18 5815662 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 10 T 11 10 145750 CASAVA_Build 18 5845215 1D AAAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2166 hom 17 6 8 3 A 13 12 145751 CASAVA_Build 18 5860201 5I GAACACCAGT -----/TGACA TGACATTTTG 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 TGACA 1 2 145752 CASAVA_Build 18 5873042 1D GCATTTCCAA T/- TTTTAATCTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 5 T 5 4 145753 CASAVA_Build 18 5873300 1D AATAAAATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 10 9 145754 CASAVA_Build 18 5876043 1D ATGTATTTTT A/- TATCGTGGCA 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 A 1 0 145755 CASAVA_Build 18 5880005 1I TAGTTTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 11 12 145756 CASAVA_Build 18 5893508 2I CAGTTACCTC --/AA GAGCTTACTC 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 0 2 145757 CASAVA_Build 18 5894339 1I TGAAAATCTC -/A AGAGTGCTTC 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 A 1 2 145758 CASAVA_Build 18 5916003 8I AAATAAATAA --------/AATAAAAT AATAAAAGGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AATAAAAT 0 1 145759 CASAVA_Build 18 5917222 1D AAAAAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 33 2 14 17 T 11 10 145760 CASAVA_Build 18 5935869 1D AAAAAAAAAA T/- AAAAATAAAT 924 het 325 hom 32 2 6 25 T 1 0 145761 CASAVA_Build 18 5939488 1I ATCCAGGGGG -/A AAAAAGATCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 5 6 145762 CASAVA_Build 18 5944813 3I CAAAAAGCAA ---/AAC AACAAACAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 AAC 1 2 145763 CASAVA_Build 18 5946503 2D CCGTGTTGAG CT/-- CACCAGTGAG 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 CT 1 0 145764 CASAVA_Build 18 5946910 1D GATTTAGGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 T 10 9 145765 CASAVA_Build 18 5951757 1I GGAAGCCGAG -/T CTGTTTGTTG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 0 1 145766 CASAVA_Build 18 5964432 3I AGAGGCAATA ---/AAC AACACACTGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAC 1 2 145767 CASAVA_Build 18 5970141 4I CTGACAGACA ----/TAGT TAGAAAAGTC 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 TAGT 0 1 145768 CASAVA_Build 18 5974983 1D AACTTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 1322 het 1322 ref 28 20 3 5 T 11 10 145769 CASAVA_Build 18 5983544 1I TCTAGAGCAA -/G GTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 2 145770 CASAVA_Build 18 5991636 1D AAAATCAACA G/- AAAAATAACT 3070 het 3070 ref 38 23 12 4 G 1 0 145771 CASAVA_Build 18 5992158 1D GTGCTGAAAG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 7 6 145772 CASAVA_Build 18 5995345 15I ACACTGTCTC ---------------/AAAAACACACAAAAA ACAAACACAA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 AAAAACACACAAAAA 0 1 145773 CASAVA_Build 18 5996012 1I ACCATAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1341 hom 28 4 18 6 A 11 12 145774 CASAVA_Build 18 5997327 1I TAAACATATG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 7 8 145775 CASAVA_Build 18 6000026 1I ATCACCAGTC -/T TTTTTTGGCT 3070 hom 132 het 51 0 45 7 T 6 7 145776 CASAVA_Build 18 6001316 1D GATAAACAAT A/- AAAAAAAAGG 1195 het 1195 ref 47 38 3 6 A 9 8 145777 CASAVA_Build 18 6004513 11D TGGCTGCAGG GTAAGTGAAGT/----------- CTGCACTGGC 3070 het 3070 ref 40 25 14 4 GTAAGTGAAGT 1 0 145778 CASAVA_Build 18 6004976 1D GGACTGAAGT G/- GGGTGGATAT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 G 4 3 145779 CASAVA_Build 18 6007332 2D AGAGATGCTG GC/-- GCGCCACAGC 3070 hom 65 het 31 0 26 5 GC 3 2 145780 CASAVA_Build 18 6013863 1D CAGTGGTAGA T/- TTATTATTTG 3070 het 3070 ref 40 19 19 3 T 3 2 145781 CASAVA_Build 18 6021811 1D AGATTCATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 860 hom 38 4 23 13 T 15 14 145782 CASAVA_Build 18 6021984 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1632 hom 34 8 23 3 T 11 10 145783 CASAVA_Build 18 6039297 5I AAATTATCAA -----/TAGAG TAAACAGACA 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 TAGAG 0 1 145784 CASAVA_Build 18 6053648 3D AGTTTGTATG TCT/--- TCTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 TCT 2 1 145785 CASAVA_Build 18 6054598 1I TATTCCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 667 hom 33 2 21 10 T 14 15 145786 CASAVA_Build 18 6066675 1D CTGCACTGGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 11 23 5 A 9 8 145787 CASAVA_Build 18 6075265 1I TGAATGAGTT -/A CGGTATGCCT 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 A 0 1 145788 CASAVA_Build 18 6078558 4D CGATGATGGG GAGT/---- GAGTGGGGCC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 GAGT 2 1 145789 CASAVA_Build 18 6080632 2D CATATATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 358 het 151 hom 11 1 3 7 T 13 11 145790 CASAVA_Build 18 6114801 1D ACTGGAATCA G/- TAAAGGTGCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 G 1 0 145791 CASAVA_Build 18 6118152 2D CAAATCAGAG AA/-- TAAGAATGTG 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 A 2 0 145792 CASAVA_Build 18 6170307 4I GGCTACTGAG ----/ATAC ACAGGGATTA 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 ATAC 0 1 145793 CASAVA_Build 18 6172792 1D TTATTGAATA G/- GGGAGTCCTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 G 4 3 145794 CASAVA_Build 18 6178002 1I AGATCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 A 11 12 145795 CASAVA_Build 18 6317824 1D ATTCAACATT A/- GGGGTAGGTT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 1 0 145796 CASAVA_Build 18 6329591 1I AAGAAAATCA -/T TTTTTATAAG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 5 6 145797 CASAVA_Build 18 6355886 2D TATTACACTC TT/-- ATATTAAATA 3070 hom 132 het 54 0 45 9 T 2 0 145798 CASAVA_Build 18 6383077 1D TGATTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 11 10 145799 CASAVA_Build 18 6394852 1D GCCTGGATAA T/- TTTTTTTTTT 1765 het 1765 ref 28 16 6 6 T 16 15 145800 CASAVA_Build 18 6402921 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 52 33 5 14 A 13 14 145801 CASAVA_Build 18 6414876 1I TTAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 10 11 145802 CASAVA_Build 18 6427633 3D TACATGTGTA CAT/--- CATCATATAC 3070 het 3070 hom 40 18 18 7 CAT 3 2 145803 CASAVA_Build 18 6432100 1I CGACTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 10 11 145804 CASAVA_Build 18 6438381 3D CTATAGATGT GAA/--- GAACATCCTT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 GAA 2 1 145805 CASAVA_Build 18 6439932 1D GGCTGATGGC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 7 145806 CASAVA_Build 18 6441170 1D CGGTCACACC A/- TGGTTCCCAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 0 145807 CASAVA_Build 18 6442790 1I TAAAATGAAA -/T GTTTCAGAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 145808 CASAVA_Build 18 6447803 15I ATTTCTTTAA ---------------/GCAATGTTTTTAAGT TTTAGGTGTT 3070 hom 75 het 21 0 26 0 GCAATGTTTTTAAGT 0 1 145809 CASAVA_Build 18 6460688 1D TGTCCATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 13 5 T 11 10 145810 CASAVA_Build 18 6461138 5I GAGGAAGTTG -----/CTGCT CTGCTGCAAG 3070 het 3070 ref 60 30 19 11 CTGCT 1 2 145811 CASAVA_Build 18 6462133 1D GATTTTGTTT A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 7 6 145812 CASAVA_Build 18 6465260 1D ATCATCCTCT G/- GGGGGGTCTT 2629 het 2629 ref 30 16 8 8 G 7 6 145813 CASAVA_Build 18 6466783 1D TTTTCAACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 10 9 145814 CASAVA_Build 18 6470661 2I ATAAAGAAAC --/TG TGTAATATTC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 TG 1 2 145815 CASAVA_Build 18 6471696 1D TGAAGAGAAG A/- AAAAGAAACC 3070 het 3070 hom 50 24 22 5 A 5 4 145816 CASAVA_Build 18 6481932 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 11 10 145817 CASAVA_Build 18 6488607 3I AGACTTAATA ---/TAT ATCTGTAGCA 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 TAT 0 1 145818 CASAVA_Build 18 6489813 1D TTTTAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 36 3 20 13 T 12 11 145819 CASAVA_Build 18 6498096 1D TTTTTCACTT A/- ATAAACAACC 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 A 2 1 145820 CASAVA_Build 18 6500380 1I GGCATGGAGC -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 7 8 145821 CASAVA_Build 18 6501760 1I TTACAGCATT -/A CAACCTGTGA 3070 het 3070 hom 48 16 26 6 A 0 1 145822 CASAVA_Build 18 6507604 1I TTCTCTTTTT -/C CCCCTCGCAA 3070 het 3070 ref 36 18 18 0 C 4 5 145823 CASAVA_Build 18 6511884 1I TGGGCATTTG -/A AAAAATCAAC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 5 6 145824 CASAVA_Build 18 6530236 38D GTGTGTGTGT GTGTGTGAGAGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGA/-------------------------------------- GAGAGAGAGA 2779 het 2779 ref 26 18 12 7 GTGTGTGAGAGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGA 1 0 145825 CASAVA_Build 18 6536882 1I AAGATGTCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 9 10 145826 CASAVA_Build 18 6537547 1I CCTTTTTAAC -/A TAAGCACAAT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 0 1 145827 CASAVA_Build 18 6553725 1D TTAGTCACCA T/- TTTTTGGTAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 6 5 145828 CASAVA_Build 18 6555606 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 8 10 145829 CASAVA_Build 18 6560572 2I GCCCCAGCCT --/AA AAGAAAGGGA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 2 4 145830 CASAVA_Build 18 6563443 8D AGGGAATATG AGAACACT/-------- ACATACTAAC 3070 het 3070 hom 56 26 27 8 AGAACACT 1 0 145831 CASAVA_Build 18 6574526 1D AGCAGAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 46 19 23 6 A 9 8 145832 CASAVA_Build 18 6591839 1D TAATTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1276 het 1276 ref 43 32 3 8 T 11 10 145833 CASAVA_Build 18 6601123 1I ACAAGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 T 11 12 145834 CASAVA_Build 18 6606266 1I AAATAACCAA -/G GATTTTCAGC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 G 1 2 145835 CASAVA_Build 18 6607817 1D GCAAATAAAC A/- AGAGGAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 17 6 A 2 1 145836 CASAVA_Build 18 6609061 1I CAACAAAGGC -/A AAAAATAGAC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 5 6 145837 CASAVA_Build 18 6610435 2I TTCTTACTGC --/AA AAAAAAAAAA 2986 het 2986 ref 28 15 7 6 A 13 15 145838 CASAVA_Build 18 6610996 1D TCACAATGTC T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 T 7 6 145839 CASAVA_Build 18 6617509 2D37M11D TGATCGTACC CTGAGTCCCCAGAAAAGAGACAAGCAGTCTTCAACCAGCCAAAAAACAAA/--GAGTCCCCAGAAAAGAGACAAGCAGTCTTCAACCAGC----------- CAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 17 17 9 11 N/A 0 0 145840 CASAVA_Build 18 6619523 1I ATGGGATGAC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 7 8 145841 CASAVA_Build 18 6620896 2D GATCGCACCA CT/-- GCACTCCAGC 2531 hom 20 het 10 0 7 3 CT 1 0 145842 CASAVA_Build 18 6620945 1D GGGAAAAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 10 9 145843 CASAVA_Build 18 6622758 1D CTTTTTTTTT C/- CCCTTTTTTA 3070 het 1902 hom 27 8 17 2 C 4 3 145844 CASAVA_Build 18 6641679 1D CTTTAGCTGG T/- TGGCAAAATA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 2 1 145845 CASAVA_Build 18 6656872 7D TTATCTAGGA CATTGTC/------- CATTGTCCAT 3070 het 3070 ref 32 17 8 8 CATTGTC 3 2 145846 CASAVA_Build 18 6660015 1I TCAACCATCA -/G GCAGTTAGAT 2409 het 2409 ref 26 19 5 2 G 1 2 145847 CASAVA_Build 18 6660809 1D CATAGCTAAC T/- TTTCGTTGGA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 4 3 145848 CASAVA_Build 18 6667364 2D AGCAAGAGAA AG/-- AGAGGAGAAA 3070 hom 74 het 29 0 25 5 AG 3 2 145849 CASAVA_Build 18 6669635 1D AAGAAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 9 8 145850 CASAVA_Build 18 6682510 2D TTGTAGAAAT TA/-- TCGTTGGAGT 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 TA 1 0 145851 CASAVA_Build 18 6682906 1D ACTTTTTTTT C/- CCATTGGATA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 C 3 2 145852 CASAVA_Build 18 6686206 2D TAGGTTAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 251 hom 27 3 10 14 T 14 12 145853 CASAVA_Build 18 6687387 2D CGGAGTGAGA CT/-- CTATCTCAAA 1318 het 941 hom 20 4 6 10 CT 2 1 145854 CASAVA_Build 18 6688817 1I TTTTTATCTC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 T 7 8 145855 CASAVA_Build 18 6703516 1D TGTAAAAAAA T/- AAATTGATTA 3070 het 3070 ref 36 21 12 5 T 1 0 145856 CASAVA_Build 18 6706277 1D TTGTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 30 1 18 11 T 13 12 145857 CASAVA_Build 18 6709079 11D GAGAAAGCCA CAGTAAGGTAT/----------- CAGTCCTGTA 3070 het 3070 ref 51 28 22 4 CAGTAAGGTAT 1 0 145858 CASAVA_Build 18 6713170 1I CCTTTGGAAT -/C CCTGGGTCCA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 C 2 3 145859 CASAVA_Build 18 6713232 2D49M3I AAGGGCTGAG ACAGAGGACAGCTGACAAGGGAGAGTGAAAGACAGAGAAGGGAACCAACAT---/--AGAGGACAGCTGACAAGGGAGAGTGAAAGACAGAGAAGGGAACCAACATCTA CTGAACATCT 3070 het 3070 ref 32 34 22 8 N/A 0 0 145860 CASAVA_Build 18 6715736 25D ATAATAATGC TTTGGTATGGGGGCTCAGAAAACAA/------------------------- TTTGGTATTG 2801 het 2801 ref 22 13 9 4 TTTGGTATGGGGGCTCAGAAAACAA 1 0 145861 CASAVA_Build 18 6715840 1D TGTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 11 10 145862 CASAVA_Build 18 6717737 2D TCAATATTCA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 17 het 35 1 18 16 T 10 8 145863 CASAVA_Build 18 6722102 1D GTTTTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 33 1 25 8 T 11 10 145864 CASAVA_Build 18 6726578 1D ATTTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 2732 het 1757 hom 12 5 7 0 A 12 11 145865 CASAVA_Build 18 6728608 1D TCAACATCCT A/- AAATGACATT 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 4 3 145866 CASAVA_Build 18 6736935 9I CAAAAAACAG ---------/CACTGTATA CACTGTATAT 3070 het 3070 ref 28 15 7 6 CACTGTATA 1 2 145867 CASAVA_Build 18 6742950 1I TTGGCAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 35 1 29 5 T 10 11 145868 CASAVA_Build 18 6749295 2I AAGTGTAATC --/AA AAAAGGCAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 4 6 145869 CASAVA_Build 18 6749807 1I TTAAATTTCA -/C CCCCAAGTCT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 C 4 5 145870 CASAVA_Build 18 6779835 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2215 het 1550 hom 13 4 7 2 T 10 11 145871 CASAVA_Build 18 6784703 1I TATGTTTGGT -/A CAGGGTCTTG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 0 1 145872 CASAVA_Build 18 6788067 5D CACTAATGAT AAAAA/----- TAGGAAATAA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 5 0 145873 CASAVA_Build 18 6789323 1D AAGTAATTTG T/- AGATTCAGTG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 1 0 145874 CASAVA_Build 18 6801116 3I AGTCAAATAT ---/TAC TACAGAGTTC 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 TAC 1 2 145875 CASAVA_Build 18 6805905 1I TGTGTCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 T 13 14 145876 CASAVA_Build 18 6807332 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 A 10 11 145877 CASAVA_Build 18 6824162 1I TAGAGTGATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 9 10 145878 CASAVA_Build 18 6848549 1I AATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 17 0 13 4 T 11 12 145879 CASAVA_Build 18 6849090 2D AACAACAACA AC/-- AACAAAAAAC 2613 het 548 hom 35 6 9 20 AC 1 0 145880 CASAVA_Build 18 6858611 1D GAGCAGCTTG C/- CCCCTGACAA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 C 5 4 145881 CASAVA_Build 18 6878368 1D GAGATGGTAA T/- TTTGAGGCCA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 4 3 145882 CASAVA_Build 18 6890294 3I AAGCAAAATC ---/ACA ACATGAATGA 3070 hom 141 het 50 0 48 3 ACA 1 2 145883 CASAVA_Build 18 6890696 3D TGAGCTAAAT ATC/--- ATACAATCAG 3070 het 3070 ref 45 23 17 8 ATC 1 0 145884 CASAVA_Build 18 6890913 2D ATCCAGAGAG AA/-- ATGAGGACAC 3070 het 3070 ref 34 17 14 5 A 3 1 145885 CASAVA_Build 18 6897394 1I CAAAAACTGG -/A AAAAAAAAAA 2605 het 1398 hom 35 8 14 13 A 15 16 145886 CASAVA_Build 18 6900828 5D AGTTTTGTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TTTTG 3 2 145887 CASAVA_Build 18 6901393 10D ATGATGAGTT TATATGCTAA/---------- TATACCTGAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TATATGCTAA 1 0 145888 CASAVA_Build 18 6903627 1D GTATATACTA T/- TATTACACCT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 T 2 1 145889 CASAVA_Build 18 6903734 1I CATCTGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 32 1 28 3 T 11 12 145890 CASAVA_Build 18 6904589 1D TTTTTGCCTT A/- TCAAGAGTTG 3070 hom 114 het 45 0 39 7 A 1 0 145891 CASAVA_Build 18 6905519 1I23M4D TAATTAAAAA -TTTTTTTCTGTCAGACATTTACCAACT/TTTTTTTTCTGTCAGACATTTACC---- ATTTTCTAAA 3070 hom 123 het 42 0 41 12 N/A 0 0 145892 CASAVA_Build 18 6912334 4D TGTGTGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 20 17 8 TG 8 6 145893 CASAVA_Build 18 6912910 1I TTGGCAAGGA -/C ATACAACAAC 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 C 0 1 145894 CASAVA_Build 18 6917801 4I CAATGCAGGC ----/TCTG GAGAAAACTC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 TCTG 0 1 145895 CASAVA_Build 18 6922082 4D ACTATCTTGG GAGC/---- GATCACAAAC 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 GAGC 1 0 145896 CASAVA_Build 18 6924287 3I AGTTCATCTA ---/TTC TTCTACTGAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TTC 1 2 145897 CASAVA_Build 18 6928049 3D ACAACTAAGT AAC/--- AACATAGCTT 3070 hom 58 het 32 0 26 6 AAC 2 1 145898 CASAVA_Build 18 6929363 3D AGGCTGAAGC AGG/--- AGAATTGCTT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 AGG 1 0 145899 CASAVA_Build 18 6938630 3D TCCTTCCACT TCA/--- TCAGACTGGT 3070 het 3070 hom 53 21 26 9 TCA 2 1 145900 CASAVA_Build 18 6941662 1D TCAGGGGGTC A/- GGGGTGAAGC 1911 het 1911 ref 20 11 6 3 A 1 0 145901 CASAVA_Build 18 6942537 3D ACAGCAGTCC CTT/--- CTTATTTGCG 3070 het 3070 ref 45 21 16 10 CTT 2 1 145902 CASAVA_Build 18 6946263 1D GAATTGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 13 12 145903 CASAVA_Build 18 6974009 2D ACTTTGTGTT AA/-- ATCACAACAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 8 A 3 1 145904 CASAVA_Build 18 6978926 4D CGTGGCGGGC TGGA/---- TGGAGTCTGC 3070 hom 60 het 23 0 21 3 TGGA 2 1 145905 CASAVA_Build 18 6979275 3D CTGTGTCCTT TTG/--- TTCCATCTGG 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 TTG 1 0 145906 CASAVA_Build 18 6984186 1I ACCTGATTCT -/G CCAGGCTGTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 145907 CASAVA_Build 18 6991322 1D GTTTTCCCCC T/- ATTCCTCATG 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 T 1 0 145908 CASAVA_Build 18 6992885 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2157 hom 26 7 14 6 T 12 11 145909 CASAVA_Build 18 6997759 1D GATTAACGAA T/- AAGCAAAATG 3070 het 3070 hom 47 18 26 4 T 1 0 145910 CASAVA_Build 18 7004555 18D CAAGAGGTCA AGGATACAGTGAGCTTTG/------------------ AGGATACAGT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 AGGATACAGTGAGCTTTG 2 1 145911 CASAVA_Build 18 7004643 1I TGTCTCAATT -/A AAAAAAAAAA 1567 het 1567 ref 20 12 4 4 A 15 16 145912 CASAVA_Build 18 7052265 21D GAAGGCAGAT AGTCAGGGAAGTCTTCCCTGA/--------------------- AGGTAAGAGA 3070 hom 119 het 40 0 38 6 AGTCAGGGAAGTCTTCCCTGA 1 0 145913 CASAVA_Build 18 7063849 41D GTGTGTGTGT TTATGAGAAGGAGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCA/----------------------------------------- GTGGCGTGAT 1013 hom 12 het 6 0 5 3 TTATGAGAAGGAGTCTTGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCA 1 0 145914 CASAVA_Build 18 7064854 4I CTAAAATAAA ----/CACT CAGTAGTTAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 CACT 0 1 145915 CASAVA_Build 18 7076926 4I CCCACCATGA ----/TCTC TCTCTCTATT 3070 hom 99 het 36 0 32 4 TC 3 5 145916 CASAVA_Build 18 7079357 1D CAGCCTGGGC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 93 het 34 0 29 7 A 8 7 145917 CASAVA_Build 18 7083774 2D GTTTCTCAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2413 het 59 hom 34 2 9 24 T 20 18 145918 CASAVA_Build 18 7087270 1I ATACTTGAAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 8 9 145919 CASAVA_Build 18 7089491 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2179 het 2179 ref 20 10 8 2 A 11 12 145920 CASAVA_Build 18 7115496 3I TGTTGGTCCA ---/GCT GGTCTCGAAC 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 GCT 0 1 145921 CASAVA_Build 18 7117042 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 A 11 12 145922 CASAVA_Build 18 7120512 4D TGCAAGACAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2257 hom 40 13 8 19 T 18 14 145923 CASAVA_Build 18 7121631 1D GGTGTAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 A 10 9 145924 CASAVA_Build 18 7124299 1D GTTACAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 11 10 145925 CASAVA_Build 18 7153185 1I CCCTGTCCTC -/G GGGAGCCTTC 3070 hom 105 het 40 0 33 7 G 3 4 145926 CASAVA_Build 18 7157581 12D AAATAAATAA ATAAATAAATAG/------------ GAGATGAGAA 3070 het 1440 hom 18 7 12 1 ATAAATAAATAG 1 0 145927 CASAVA_Build 18 7159666 1I GGATGGGGGA -/C CCCTACCTCA 3070 hom 85 het 33 0 25 8 C 3 4 145928 CASAVA_Build 18 7200210 1I AAAAAGAGAC -/G AAGCAAGCCA 3070 hom 70 het 30 0 25 5 G 0 1 145929 CASAVA_Build 18 7201396 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 26 het 14 0 9 5 A 9 10 145930 CASAVA_Build 18 7207135 1D TAAATCACAA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 8 7 145931 CASAVA_Build 18 7208817 1D TCAAAAAAAA T/- TTTTTGTGAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 6 5 145932 CASAVA_Build 18 7211222 1I AGAGTTTCTG -/T GTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 0 1 145933 CASAVA_Build 18 7214937 2I ACAGAGTGAG --/AT AGTAAACAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AT 0 1 145934 CASAVA_Build 18 7216529 12I CTCCTGATGC ------------/TCCCCCGCATGT CTCCCTCATT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TCCCCCGCATGT 0 1 145935 CASAVA_Build 18 7218951 1D CACAGCTAGC T/- TTTTTTTTTT 2800 het 377 hom 26 2 8 16 T 19 18 145936 CASAVA_Build 18 7230588 1D CCATCTCTAC A/- ACTCCATTAG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 2 1 145937 CASAVA_Build 18 7245291 1D GAGCAGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 38 1 26 11 T 15 14 145938 CASAVA_Build 18 7246051 5D TTTTCTTTTC CCTCT/----- CCTCTCCTCT 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 CCTCT 4 3 145939 CASAVA_Build 18 7246308 4D TCAGCCTGAG CTGA/---- CTTCTGATGG 3070 het 3070 ref 36 22 10 5 CTGA 1 0 145940 CASAVA_Build 18 7255274 1D GGACGGCCTC G/- GGGAATCATT 3070 hom 69 het 24 0 23 1 G 4 3 145941 CASAVA_Build 18 7258945 1I ATTCTTAAAT -/A TTTTTTGAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 0 1 145942 CASAVA_Build 18 7259915 1I ATAAGTTCCA -/C ATGAAATAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 0 1 145943 CASAVA_Build 18 7260850 2I ATGCAGAAAC --/AG GTAAGCAAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AG 0 1 145944 CASAVA_Build 18 7270118 5I AAAAAAATAG -----/ATAAA ATAAAATAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 ATAAA 3 4 145945 CASAVA_Build 18 7288192 1I TGGCTCTCTC -/T TTAGTACTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 3 145946 CASAVA_Build 18 7298038 1D CATTTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 20 0 15 5 T 12 11 145947 CASAVA_Build 18 7331682 1D GCTTGAGTTG C/- ACACAGCTTC 3070 het 3070 hom 62 26 27 9 C 1 0 145948 CASAVA_Build 18 7339060 1D CAGATACTCT A/- AGCTCCTCAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 1 145949 CASAVA_Build 18 7374025 1D AGCCCGGGTA T/- TTTTTTGTGT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 7 6 145950 CASAVA_Build 18 7374257 8I TGTGTGAAAT --------/GTGATAAG AAACAAAAGC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 GTGATAAG 0 1 145951 CASAVA_Build 18 7377103 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 12 0 9 3 A 15 12 145952 CASAVA_Build 18 7385526 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 A 11 10 145953 CASAVA_Build 18 7387248 2I CGCTAGTATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 35 0 21 14 T 10 12 145954 CASAVA_Build 18 7387788 1D GTAAGTGTGG T/- TTCTTTTTTT 3070 hom 92 het 41 0 35 6 T 3 2 145955 CASAVA_Build 18 7388093 1D TGGACTGTGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 2292 hom 29 7 17 5 T 9 8 145956 CASAVA_Build 18 7393960 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 641 hom 22 3 14 5 A 13 14 145957 CASAVA_Build 18 7395901 1D TCCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1287 hom 18 4 13 1 T 12 11 145958 CASAVA_Build 18 7396372 1D TTGCTGGGGA T/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 T 7 6 145959 CASAVA_Build 18 7400942 4D ATTTTCCTGT TGTC/---- TGTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 TGTC 1 0 145960 CASAVA_Build 18 7401261 1D TCACTTCTTG T/- TTTTTTTTTG 630 het 630 ref 25 12 3 10 T 10 9 145961 CASAVA_Build 18 7402499 3D GTTGGACCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2849 het 1567 hom 23 7 10 6 T 21 18 145962 CASAVA_Build 18 7410741 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 16 2 A 13 12 145963 CASAVA_Build 18 7412729 1D TAGAATTAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 30 0 23 8 A 9 8 145964 CASAVA_Build 18 7420530 1I GGTCAAAGTA -/C AGGTGCAGTC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 C 0 1 145965 CASAVA_Build 18 7424811 3D CACGACTTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 28 0 22 6 T 15 12 145966 CASAVA_Build 18 7425890 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 24 1 23 1 A 13 12 145967 CASAVA_Build 18 7427114 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 7 8 145968 CASAVA_Build 18 7429184 6D GTCCTTTCCT GAGTAG/------ GAGAGGGAAG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 GAGTAG 1 0 145969 CASAVA_Build 18 7445793 4D GTGTGCGTGA GTGT/---- GTGTGTGAAT 3070 het 3070 ref 45 23 18 6 GT 5 3 145970 CASAVA_Build 18 7447788 2I AGTTAACAAC --/AT ATATTATTAA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 AT 2 3 145971 CASAVA_Build 18 7447911 1I TTTAGTATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 10 145972 CASAVA_Build 18 7448483 2I CAGGAAACAA --/GG GGATGTGGGC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 2 4 145973 CASAVA_Build 18 7449714 1I AAATTCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 13 14 145974 CASAVA_Build 18 7475398 17D TAATCCCAAC ACTTTGGGAGGCCAAGG/----------------- GGGGCAGATC 3070 het 1168 hom 20 4 14 3 ACTTTGGGAGGCCAAGG 1 0 145975 CASAVA_Build 18 7493100 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1167 het 384 hom 13 4 4 5 A 17 16 145976 CASAVA_Build 18 7494122 2D CAATAAAGAC TT/-- TTTGAATTCC 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 T 5 3 145977 CASAVA_Build 18 7496890 2D GCATAAAATT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 TC 11 10 145978 CASAVA_Build 18 7501701 1I GGCCCATTAC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 7 8 145979 CASAVA_Build 18 7503162 3I ACCCAGAGGC ---/TAT TATTGCATGA 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 TAT 1 2 145980 CASAVA_Build 18 7503466 1D ATTAAATGTA T/- TTTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 6 5 145981 CASAVA_Build 18 7505051 2I CACCCCCCCC --/CA CCACCCCTTT 2039 het 2039 ref 22 7 6 9 CA 0 1 145982 CASAVA_Build 18 7505529 2I TCAGGGGTTG --/CT CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 CT 1 2 145983 CASAVA_Build 18 7506040 1I GAGGTGATTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 8 9 145984 CASAVA_Build 18 7517279 1D GTGTGAGCCA C/- CGCGCACCCA 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 C 2 1 145985 CASAVA_Build 18 7525618 1I GGAGGTGGCT -/A GGGGGTATAG 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 A 0 1 145986 CASAVA_Build 18 7528068 2I ACAGAGCCAA --/AC CACATCATTC 3070 het 2869 hom 21 9 10 2 AC 0 1 145987 CASAVA_Build 18 7534478 1D CTGTCACACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 10 9 145988 CASAVA_Build 18 7537547 1D GATTATTTTT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 8 7 145989 CASAVA_Build 18 7538484 1I GGGGTTTCAT -/A TGCGTCACGG 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 A 0 1 145990 CASAVA_Build 18 7539001 9I TTGAATACAT ---------/CTGTTTCTC CTGTTTCTCC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 CTGTTTCTC 1 2 145991 CASAVA_Build 18 7539213 1D TCAAGGGGGG A/- AAAAAAAAGC 2531 het 2531 ref 21 7 8 7 A 9 8 145992 CASAVA_Build 18 7540130 1I TATAGTGGAG -/A AAAAGGCAGG 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 4 5 145993 CASAVA_Build 18 7556068 1D AATCCATTTA T/- TTTTTTACGT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 7 6 145994 CASAVA_Build 18 7560940 1D AAATTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 22 0 12 10 T 15 14 145995 CASAVA_Build 18 7597407 3D10M4D3M1D8M5D CTGCACATCT CTCCTCTCCTACTTAAGGAGAGGAGGCAGCTAGC/---CTCTCCTAGT----GAG-GGAGGCAG----- CTAGCCTAGC 3070 hom 109 het 29 0 29 12 N/A 0 0 145996 CASAVA_Build 18 7657899 2I ATGAGAACTC --/GA AGAAAATTAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 GA 0 1 145997 CASAVA_Build 18 7662502 3D AATGAGAAAC AAA/--- GAAGAAGATG 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 A 3 0 145998 CASAVA_Build 18 7689726 1I AACTTACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 15 16 145999 CASAVA_Build 18 7775439 2D TGTGTATGTT GA/-- GAGAGAGAGA 658 het 658 ref 44 36 2 8 GA 7 6 146000 CASAVA_Build 18 7841641 2D ACAAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 A 11 9 146001 CASAVA_Build 18 7844730 2D ATGTTAGGAG TT/-- TTTTTTTTTT 1297 het 1297 ref 22 9 4 10 T 18 16 146002 CASAVA_Build 18 7892833 1D CTTCTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 2613 het 2597 hom 37 13 9 15 T 17 16 146003 CASAVA_Build 18 7966918 1D AAACTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 15 14 146004 CASAVA_Build 18 7979194 1D GTGTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2066 het 2066 ref 37 24 5 8 T 12 11 146005 CASAVA_Build 18 7986797 1D AGTAGTTACC A/- AAAAAAAAAA 2588 het 2588 ref 38 18 7 13 A 15 14 146006 CASAVA_Build 18 8119240 1D AATTTTTAAG T/- AAAATTAAAC 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 T 1 0 146007 CASAVA_Build 18 8126792 1I GAACAGCTGG -/A AAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 6 7 146008 CASAVA_Build 18 8128214 1I TTTTTTTTTT -/C TCCCTCCTCT 2360 het 2360 ref 34 14 11 9 C 0 1 146009 CASAVA_Build 18 8129786 1D CTTGCCTTCA C/- CCCCCAGCCC 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 C 6 5 146010 CASAVA_Build 18 8131770 1D ATGGAATGGC T/- TTCCAGTATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 3 2 146011 CASAVA_Build 18 8137618 15D TCTCTTCCTG TTTGAATACCCTTTA/--------------- TTTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 14 8 7 1 TTTGAATACCCTTTA 1 0 146012 CASAVA_Build 18 8139685 3D TGATCCTGTC ATT/--- ATGATGATAG 3070 het 2046 hom 13 6 7 0 ATT 1 0 146013 CASAVA_Build 18 8149928 3D GTAGTGTAGA TAT/--- TATAATGGAC 2906 het 2906 ref 23 14 7 2 TAT 2 1 146014 CASAVA_Build 18 8154906 2I GGCACATGCC --/TG TAATCCCAGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TG 0 1 146015 CASAVA_Build 18 8157726 10I CAAGTGAAAT ----------/ATAGGCTCTC ATTGTGGGCT 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 ATAGGCTCTC 0 1 146016 CASAVA_Build 18 8162696 1D TAAACACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 848 hom 48 3 35 10 A 12 11 146017 CASAVA_Build 18 8171866 1I GTGAAAAAAA -/G AAAATACCTT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 G 0 1 146018 CASAVA_Build 18 8174327 1I TGCTGCAACT -/A ATGTAAAAGG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 146019 CASAVA_Build 18 8202431 1I CTTTGTCACT -/C CCCAGTGTGT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 C 3 4 146020 CASAVA_Build 18 8214230 1I TTCTAAGAAT -/C CATGCAACTG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 C 1 2 146021 CASAVA_Build 18 8215389 1D TGTCTCTTGT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 20 4 A 1 0 146022 CASAVA_Build 18 8216147 1D ATGTGTGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 A 10 9 146023 CASAVA_Build 18 8217388 1D CACACATAAA T/- TAATCAGCAT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 2 1 146024 CASAVA_Build 18 8218676 2D AAACTCTACT AA/-- AAAAAAAAAA 1703 het 98 hom 15 1 5 9 A 18 16 146025 CASAVA_Build 18 8224737 1I TCTTTTTTTT -/A ATCAAGTTGA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 A 1 2 146026 CASAVA_Build 18 8225815 1I TCTCTTGAGA -/T TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 27 1 T 3 4 146027 CASAVA_Build 18 8227944 1I AAGTAACGTG -/T TTTTCCCCCC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 4 5 146028 CASAVA_Build 18 8228977 2I ATAGCTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 2435 hom 24 het 14 0 9 5 T 12 14 146029 CASAVA_Build 18 8231395 5D TTTGGTGATA ATTAT/----- ATTATAACTT 2601 het 2601 ref 22 12 6 5 ATTAT 2 1 146030 CASAVA_Build 18 8237106 1D TTTGAAGAGG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 31 het 28 1 25 3 T 9 8 146031 CASAVA_Build 18 8239961 7D GTGAATCTAT GTATTGA/------- GTAACAAGGA 3070 het 3070 ref 48 22 22 9 GTATTGA 1 0 146032 CASAVA_Build 18 8270409 2D GGTCGGGGGT GG/-- GGGGGGGGTC 3070 hom 45 het 21 0 15 7 G 10 8 146033 CASAVA_Build 18 8285401 9D TTCTGTTTGG GAGAGAACT/--------- GAGAGAACTT 3070 het 3070 ref 58 30 23 9 GAGAGAACT 2 1 146034 CASAVA_Build 18 8290502 1I TTACTTCATT -/A AAAAAAAAAA 2257 het 2257 ref 35 13 11 11 A 15 16 146035 CASAVA_Build 18 8319714 1I CCAGTGTGGA -/G GTATAAATAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 2 146036 CASAVA_Build 18 8320966 6D ATATTGTTGC CACACA/------ CTACCTACCC 3070 het 3070 hom 41 21 19 3 CA 3 0 146037 CASAVA_Build 18 8321101 2D AATAGAAACC TT/-- TTTGCATTCC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 5 3 146038 CASAVA_Build 18 8326025 4D GTCTCATAAA AAAT/---- AAATAAATAA 1507 het 1507 ref 14 6 4 5 AAAT 6 5 146039 CASAVA_Build 18 8330401 1D ATCTTTTTTT A/- GCGTAGGTCA 3070 het 3070 hom 40 14 24 3 A 1 0 146040 CASAVA_Build 18 8331067 10I GTTTAATTCC ----------/AGAGCTCCAA GGCTGTGCTG 3070 hom 99 het 43 0 33 11 AGAGCTCCAA 0 1 146041 CASAVA_Build 18 8332935 1D AGTCAAGCAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 9 8 146042 CASAVA_Build 18 8333864 1I TCCCAAACTC -/A CCAAAATTGG 3070 hom 157 het 57 0 53 4 A 0 1 146043 CASAVA_Build 18 8334429 4D GATATATATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 714 hom 24 het 13 0 9 4 TG 9 7 146044 CASAVA_Build 18 8336807 1I ATGACTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 248 hom 36 1 26 9 A 10 11 146045 CASAVA_Build 18 8340930 1D CTACACAGTC G/- CCTGCAGAGC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 G 1 0 146046 CASAVA_Build 18 8344617 4I ATTTTTAAAC ----/TAAG TAAGTAAGGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TAAG 2 3 146047 CASAVA_Build 18 8346206 20D GACTTGACAG AAGCTTAGCTCTGCAGGGAA/-------------------- AAGAGAGGAG 3070 het 3070 ref 42 30 20 2 AAGCTTAGCTCTGCAGGGAA 1 0 146048 CASAVA_Build 18 8349101 2I TTTAAAAAGA --/AC CAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 44 19 19 7 AC 0 1 146049 CASAVA_Build 18 8350396 1I AAATCTATGC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 52 20 21 11 A 8 9 146050 CASAVA_Build 18 8362720 1D GCAGAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 13 12 146051 CASAVA_Build 18 8371359 1D TCTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1286 hom 32 6 12 14 A 19 18 146052 CASAVA_Build 18 8377734 4I AGGACCTGGA ----/GAGT GTGTGTGTGT 1956 het 1956 ref 44 17 11 16 GAGT 0 1 146053 CASAVA_Build 18 8398764 8I ATGGTCCTGC --------/CCCCGACT CCCTGGCACG 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 CCCCGACT 0 1 146054 CASAVA_Build 18 8402856 3D TTACTAGTTC AGA/--- AGAAGAAACA 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 AGA 3 2 146055 CASAVA_Build 18 8404906 18D TACTAAGCCA ACAAAAAAGATATAATGG/------------------ AATCTAAAAG 3070 het 3070 ref 35 21 12 5 ACAAAAAAGATATAATGG 1 0 146056 CASAVA_Build 18 8407060 1I AAACACCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 11 12 146057 CASAVA_Build 18 8407731 2D ACCTGAGCCC CA/-- CAGCCTACAC 3070 hom 93 het 36 0 30 6 CA 2 1 146058 CASAVA_Build 18 8414060 1I ACAGCCAACT -/G GGGGGGCTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 6 7 146059 CASAVA_Build 18 8415436 1I CCTCCCACGC -/G GAAAGACAGC 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 G 1 2 146060 CASAVA_Build 18 8417206 4D CTAGAGTCGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2187 het 2187 ref 25 12 8 6 TTTG 4 3 146061 CASAVA_Build 18 8417697 1I TTTATTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 25 0 15 10 T 14 15 146062 CASAVA_Build 18 8422618 2D CACGCCTCGC TG/-- TGTGCGCAGA 2047 het 2047 ref 27 11 7 10 TG 3 2 146063 CASAVA_Build 18 8436464 1I CAATCATATG -/A AAAAAATCTC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 6 7 146064 CASAVA_Build 18 8436592 1D TGTTGCAGAG A/- AAAAGGAATG 3070 hom 114 het 45 0 38 8 A 5 4 146065 CASAVA_Build 18 8455308 1I AACAAAGAAC -/A AAAAAACCAA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 6 7 146066 CASAVA_Build 18 8464636 3D TCATCATTGT TCA/--- TCATATTTTA 3070 hom 87 het 35 0 29 8 TCA 2 1 146067 CASAVA_Build 18 8469726 1D TCATTAATCC A/- GTGGTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 A 1 0 146068 CASAVA_Build 18 8480781 1D CATATATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 11 10 146069 CASAVA_Build 18 8493739 1D TCCCCAGCTG T/- TTTCTAAATG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 4 3 146070 CASAVA_Build 18 8508242 1D CGAATTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 25 7 T 11 10 146071 CASAVA_Build 18 8522778 1D GAGACACAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 10 9 146072 CASAVA_Build 18 8524588 1I ATAACAGATG -/C TGGTGAGGTT 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 C 0 1 146073 CASAVA_Build 18 8531613 1D TTTCTGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 11 10 146074 CASAVA_Build 18 8536385 1I TCTCAATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 16 1 11 4 A 10 11 146075 CASAVA_Build 18 8538111 4I AAACAACATG ----/AACA GACAGAGAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AACA 0 1 146076 CASAVA_Build 18 8540041 1D CCAAGCAAGC A/- AAAGTCTTAT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 4 3 146077 CASAVA_Build 18 8543021 1D TGTCACACAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 9 13 4 A 10 9 146078 CASAVA_Build 18 8550779 1I TTCTAAATAA -/G AAAGCAATCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 146079 CASAVA_Build 18 8551432 2I AAGGGGGTGT --/GG GGGGGAAGGA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 G 5 7 146080 CASAVA_Build 18 8552676 1D AAAAAACCTT A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 A 7 6 146081 CASAVA_Build 18 8557887 1I GCAGAACCAC -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 7 8 146082 CASAVA_Build 18 8566378 1I TCTACCCACA -/G CCTTGAATGT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 0 1 146083 CASAVA_Build 18 8576574 1D GGAGAAGCAT C/- CCCCCGAGTT 3070 het 3070 ref 43 25 10 8 C 6 5 146084 CASAVA_Build 18 8592132 1I GAAACTGGCT -/G GGGGGTATTG 3070 het 2387 hom 28 8 12 8 G 5 6 146085 CASAVA_Build 18 8592696 4D CAGTTCATAC ACAG/---- ACAGCAAAGC 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 ACAG 2 1 146086 CASAVA_Build 18 8595442 1I TAAGTATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 11 12 146087 CASAVA_Build 18 8596407 1D AGGAGGGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 11 10 146088 CASAVA_Build 18 8604271 1D GTCACTTGCC T/- TTTGAATTAA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 4 3 146089 CASAVA_Build 18 8610558 1I CTCAGATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 11 12 146090 CASAVA_Build 18 8611818 2I TCTTTTTGTC --/TA TGAGTACTCA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 TA 0 1 146091 CASAVA_Build 18 8631839 3D TATTGTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 TTG 7 6 146092 CASAVA_Build 18 8648464 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 2990 hom 26 8 15 5 A 9 8 146093 CASAVA_Build 18 8653219 10I AAAACGCCTA ----------/GTTAATGATT GTTAAGAGGC 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 GTTAATGATT 0 1 146094 CASAVA_Build 18 8654702 3I GCTACAAACT ---/ATC ATCAAGAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 ATC 1 2 146095 CASAVA_Build 18 8655093 1D CCACTTTGGG A/- AAAAAAATCG 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 A 8 7 146096 CASAVA_Build 18 8656241 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 755 hom 20 2 14 6 A 14 12 146097 CASAVA_Build 18 8661284 1D TTTAACTGGT A/- AGTAACACTA 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 A 2 1 146098 CASAVA_Build 18 8670619 1D GCTAAAAAAA C/- ACTGAGGAAG 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 C 1 0 146099 CASAVA_Build 18 8683656 4D ACAATTTATC CTGA/---- CTATTATGAC 3070 hom 114 het 42 0 39 5 CTGA 1 0 146100 CASAVA_Build 18 8687058 1I ATTTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 14 1 9 4 T 12 13 146101 CASAVA_Build 18 8692690 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 6 TTTC 1 0 146102 CASAVA_Build 18 8700325 4D GTGTGAAAAC ACAG/---- ACAGAAAAGC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 ACAG 2 1 146103 CASAVA_Build 18 8707117 10D ACCTACCGTG TGCTCCATGC/---------- TGCTCGGGAT 3070 het 3070 hom 42 17 24 5 TGCTCCATGC 1 0 146104 CASAVA_Build 18 8710020 4D CTTTAAAAAC AATT/---- TATTTATTTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 4 AATT 1 0 146105 CASAVA_Build 18 8711442 3D GCCCACAGAT AAC/--- AAAACAAACA 3070 het 3070 hom 37 13 20 5 AAC 1 0 146106 CASAVA_Build 18 8712133 1D TTACTTCCCT C/- CTGTTCCTTT 3070 het 3070 ref 52 28 20 4 C 2 1 146107 CASAVA_Build 18 8713955 1D ATATAGACGG A/- AAACAGATTC 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 4 3 146108 CASAVA_Build 18 8714966 2D AATTTTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 2225 het 2225 ref 23 10 9 4 T 13 11 146109 CASAVA_Build 18 8715713 1D TTATAATTGC G/- CATTTTAATT 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 G 1 0 146110 CASAVA_Build 18 8716116 1I AGTGAAAACA -/C GATTTAGGAC 1977 het 1977 ref 23 15 5 3 C 0 1 146111 CASAVA_Build 18 8729740 1D TGTTCGTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 9 8 146112 CASAVA_Build 18 8753974 1D TTATATACTT G/- GTGAAGTTAG 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 G 2 1 146113 CASAVA_Build 18 8764253 4D TCTTTTCGAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 449 hom 31 7 9 15 TG 10 8 146114 CASAVA_Build 18 8764444 9D ATTTCTGGTC TTTCTTTCT/--------- TTTCTTTCTT 2990 het 2990 ref 35 15 9 13 TTTCTTTCT 3 2 146115 CASAVA_Build 18 8773258 1I CCACGTGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 10 19 12 T 10 11 146116 CASAVA_Build 18 8778015 1I AATTCTGGGG -/A GCAGAACTCT 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 A 0 1 146117 CASAVA_Build 18 8781886 6I CTGAACTTGG ------/TGAATC TGAATCCCCA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 TGAATC 1 2 146118 CASAVA_Build 18 8782524 1I GGAAAAACTC -/T TAATAAGAAA 3070 het 3070 ref 45 23 13 9 T 1 2 146119 CASAVA_Build 18 8791311 1I TCTGCCTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 637 hom 36 3 21 12 T 15 16 146120 CASAVA_Build 18 8806714 1I TTAAAACCTG -/T TTACAAAGTG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 2 3 146121 CASAVA_Build 18 8808293 1D ACTACCGCTT C/- TTGAGTTCAA 3070 het 3070 hom 45 19 18 10 C 1 0 146122 CASAVA_Build 18 8816493 1D GTCACCAGTC T/- TAAGTGATTG 3070 hom 147 het 52 0 49 5 T 2 1 146123 CASAVA_Build 18 8833041 1D ATCTTGGGCA T/- TGTTCCTTGC 3070 het 3070 ref 44 19 17 10 T 2 1 146124 CASAVA_Build 18 8834386 6D GGCTCCACCA TGAACG/------ TGAACAAGGC 3070 het 3070 hom 51 20 21 12 TGAACG 1 0 146125 CASAVA_Build 18 8840389 2I AGGTTGAAAT --/AC AAACAAAATG 3070 het 3070 hom 57 27 27 3 AC 0 1 146126 CASAVA_Build 18 8842014 12I GGACTTCATG ------------/CCAATCTAAACA CAGATTCTAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 CCAATCTAAACA 0 1 146127 CASAVA_Build 18 8842839 2I GAATATAATC --/AG AACCCCTCAG 3070 het 3070 hom 58 26 25 7 AG 0 1 146128 CASAVA_Build 18 8843194 1I AGGATTAAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 9 10 146129 CASAVA_Build 18 8848493 1D GCTATCCATC A/- AAAAAAACGG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 8 7 146130 CASAVA_Build 18 8859336 2I GAACACTGAC --/TT AATTCTAAAT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 0 2 146131 CASAVA_Build 18 8869897 1D AAAACAAAAT A/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 1 0 146132 CASAVA_Build 18 8891997 1I AAAAACAATT -/A ACAACTTCTG 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 1 2 146133 CASAVA_Build 18 8903246 1D TTCCCCATTC T/- TTTTTTTTAT 3047 het 3047 ref 26 14 8 4 T 9 8 146134 CASAVA_Build 18 8905641 2D TAATTGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 13 11 146135 CASAVA_Build 18 8906213 1I AGAATGTAAA -/T TTTTACCTAC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 4 5 146136 CASAVA_Build 18 8912416 1D TCAGCTTACT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 9 8 146137 CASAVA_Build 18 8914949 3I ATTAATTAGT ---/TTG TTATCTTTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTG 0 1 146138 CASAVA_Build 18 8932336 1D TTATTGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 10 9 146139 CASAVA_Build 18 8933478 1D TTATCCACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 10 9 146140 CASAVA_Build 18 8934666 18D CTTTTCCACC TCTCTGCCTGCCTTTGAA/------------------ TCTCTGCCTG 3070 het 3070 ref 30 13 11 10 TCTCTGCCTGCCTTTGAA 2 1 146141 CASAVA_Build 18 8937613 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 30 2 26 2 A 10 11 146142 CASAVA_Build 18 8938506 1I GAGGAGCTGC -/T TGCCTCTGCC 3070 het 2364 hom 36 10 20 6 T 1 2 146143 CASAVA_Build 18 8939270 1I CAGCAGGGGT -/G GGGGCAGGGA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 G 4 5 146144 CASAVA_Build 18 8941318 1D GTATGATTCT G/- GGGAAGTGTT 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 G 4 3 146145 CASAVA_Build 18 8958642 1D4M3D2M1D GACAAGTACA TAGAATGTCAT/-AGTA---CA- ACTAAGGGAA 3070 het 3070 hom 37 17 21 2 N/A 0 0 146146 CASAVA_Build 18 8962711 5D ATTATACTCT TTAAG/----- TTATTTTAAA 2232 het 2232 ref 23 15 6 3 TTAAG 1 0 146147 CASAVA_Build 18 8969617 2I AAAGAAAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 AG 6 7 146148 CASAVA_Build 18 8975198 6D AATCTAGAGA TGATTT/------ TGATTTAAGT 2632 het 2632 ref 23 16 6 3 TGATTT 2 1 146149 CASAVA_Build 18 8977893 4I ACGTGCAATG ----/ATCT ATCTATCACC 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 ATCT 1 2 146150 CASAVA_Build 18 8987468 2I AATCAAATGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 TG 6 7 146151 CASAVA_Build 18 8998156 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 9 8 146152 CASAVA_Build 18 9001473 1D GGGGACCGAA G/- GAGAGTTAGC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 G 2 1 146153 CASAVA_Build 18 9008044 2I GAACCATACT --/AA AAGATGTCCC 3070 hom 150 het 55 0 49 6 A 2 4 146154 CASAVA_Build 18 9062237 1D AATTATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 24 0 20 4 A 12 11 146155 CASAVA_Build 18 9073869 4D ATATATTTTA ATGT/---- ACACATGGAA 3070 hom 123 het 46 0 41 7 ATGT 1 0 146156 CASAVA_Build 18 9094005 1I TAGTCTCATG -/T TAAGAGGAAC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 1 2 146157 CASAVA_Build 18 9094205 1I GTATGAGAAG -/C CCACCCTCTG 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 C 2 3 146158 CASAVA_Build 18 9096912 3I TTCGACCCTC ---/CTT CTGGCATTCA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 CTT 0 1 146159 CASAVA_Build 18 9100125 1I ACTCAAAGAA -/G GGGGGTGGGT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 G 5 6 146160 CASAVA_Build 18 9104444 4D TGTTTGGATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 26 0 14 13 T 20 16 146161 CASAVA_Build 18 9106355 3I AAAATTAATC ---/CTT CTTTTATTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTT 1 2 146162 CASAVA_Build 18 9110672 3I ATAACACTGG ---/TAT TTTTTCCCTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TAT 0 1 146163 CASAVA_Build 18 9125173 1D GTAATTATGC T/- TTTTTTTTTT 1125 het 1125 ref 30 22 3 5 T 11 10 146164 CASAVA_Build 18 9125465 1I GTCTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 10 11 146165 CASAVA_Build 18 9130836 3I GGTACTAATA ---/ATC ATCATAGATA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 ATC 1 2 146166 CASAVA_Build 18 9132881 1D TACTGCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 11 10 146167 CASAVA_Build 18 9133821 2D GCCCTCTTTA GT/-- GTGTTTCTAT 3070 het 3070 ref 43 27 14 2 GT 3 2 146168 CASAVA_Build 18 9138332 2D ACACACACAC GT/-- ATGTATGTAT 793 het 793 ref 33 17 4 13 GT 1 0 146169 CASAVA_Build 18 9138911 1I TTCAGCCTCA -/T TTTTCTGTCC 3070 het 3070 hom 55 23 24 8 T 4 5 146170 CASAVA_Build 18 9140963 1I TTTTGTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 10 7 A 10 11 146171 CASAVA_Build 18 9152807 1I TGATATTGAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 8 9 146172 CASAVA_Build 18 9162929 1I AGACAGAGTC -/T TCGCCCTGTT 3070 het 2513 hom 22 7 11 4 T 1 2 146173 CASAVA_Build 18 9164850 1D TAATCCCAGT G/- CTTTGTGAAA 2615 het 2615 ref 24 10 6 8 G 1 0 146174 CASAVA_Build 18 9167432 2I TATTTTAAAA --/TT TTAATCGTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 2 4 146175 CASAVA_Build 18 9168324 10I CAAGATTCTC ----------/TCTCTCTCTG TCTCTCTCTC 3070 het 287 hom 33 5 14 14 TCTCTCTCTG 0 1 146176 CASAVA_Build 18 9169039 3D GTACTTCTGA TGT/--- TGTTGTAGGT 3070 het 3070 ref 44 17 17 11 TGT 3 2 146177 CASAVA_Build 18 9172332 13I TGGTGCGTAA -------------/ACTTCAGGTAGGT CCTATTGTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ACTTCAGGTAGGT 0 1 146178 CASAVA_Build 18 9173672 3D GATAATTTTA CTT/--- CTTTTCCAGT 3070 het 3070 hom 35 16 18 4 CTT 2 1 146179 CASAVA_Build 18 9174391 1I GATATGGCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 T 9 10 146180 CASAVA_Build 18 9182708 1I TTTTTCCTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1638 hom 24 6 12 6 T 9 10 146181 CASAVA_Build 18 9187552 4D CCAATAACAT AAAC/---- AGTCAATTAA 3070 het 3070 ref 41 23 17 4 AAAC 1 0 146182 CASAVA_Build 18 9188354 1I AATAGTAATC -/A AAGAAATACA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 2 3 146183 CASAVA_Build 18 9191826 1D TTTTTTTCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 T 13 12 146184 CASAVA_Build 18 9195258 1I TAGTTAAATG -/T TTTTTGATTG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 5 6 146185 CASAVA_Build 18 9195321 1D AAAAATATGA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 T 9 8 146186 CASAVA_Build 18 9202477 9D ATATTTCTAT ATATTCTTA/--------- CAGTATATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 6 ATATTCTTA 1 0 146187 CASAVA_Build 18 9202684 1I ATGGAAATTG -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 34 16 17 1 C 8 9 146188 CASAVA_Build 18 9204359 1D ATAGCTGCAT A/- AAATTTACTG 3070 het 3070 hom 50 24 22 4 A 4 3 146189 CASAVA_Build 18 9204667 1I ACATTAAAAG -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 A 6 7 146190 CASAVA_Build 18 9205742 1I CAGATGTTGT -/A CATGACGTCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 0 1 146191 CASAVA_Build 18 9216432 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 9 10 146192 CASAVA_Build 18 9216696 1I TGTGTGAACT -/C CCATTTACAT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 C 2 3 146193 CASAVA_Build 18 9218910 1D TTCCATGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 12 11 146194 CASAVA_Build 18 9221913 11I GGAATATCTT -----------/TTTCCATCCCC TTATTTTCAA 3070 het 3070 ref 25 17 7 1 TTTCCATCCCC 0 1 146195 CASAVA_Build 18 9222848 3I AGACCTGATT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TTG 5 6 146196 CASAVA_Build 18 9224069 1I AGTCCCAGAC -/A ACAACTCTCA 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 A 1 2 146197 CASAVA_Build 18 9225113 2D CTGATATCTC TA/-- TAGTCTGCCA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 TA 2 1 146198 CASAVA_Build 18 9226415 1D CAACAACAAC A/- AAAAATGGGC 3070 hom 148 het 53 0 50 3 A 6 5 146199 CASAVA_Build 18 9226656 2I CAGAACTAAC --/AT GTGTATAATA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AT 0 1 146200 CASAVA_Build 18 9232462 1I ATATGCATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 9 10 146201 CASAVA_Build 18 9236163 2D CTATAGAAAC TT/-- TTAAAAATTA 3070 het 3070 ref 40 20 19 2 T 4 2 146202 CASAVA_Build 18 9238726 4I CAGTGTAGGA ----/AGAC AGACAGGCAA 3070 het 3070 ref 57 28 24 5 AGAC 1 2 146203 CASAVA_Build 18 9253398 1D ACAGACCTCA C/- TATATAGATA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 C 1 0 146204 CASAVA_Build 18 9254520 1D ACATGATTGA T/- TTTCCTGGCA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 4 3 146205 CASAVA_Build 18 9254765 1D ATTTCAACTA T/- TAAGACGTTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 2 1 146206 CASAVA_Build 18 9262957 3I AATGGGAAAC ---/ATG GTGGGGGTGG 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 ATG 0 1 146207 CASAVA_Build 18 9268249 1D GTAGCATGCG T/- TATTTCCTAT 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 T 2 1 146208 CASAVA_Build 18 9269081 18D AAGTGTTGAT AAAGAATTTCTTCATGAG/------------------ AAAGAATTTC 3070 hom 90 het 40 0 31 13 AAAGAATTTCTTCATGAG 2 1 146209 CASAVA_Build 18 9274401 2D AGAAAATTAT TG/-- TCTCTGATAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 TG 1 0 146210 CASAVA_Build 18 9276373 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 A 10 11 146211 CASAVA_Build 18 9277558 1I AATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2948 het 2227 hom 19 7 8 4 T 10 11 146212 CASAVA_Build 18 9277753 4D GGTTTCACCG TGTT/---- TGTTAGCCAG 1687 het 1203 hom 7 3 4 0 TGTT 2 1 146213 CASAVA_Build 18 9299901 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2846 het 2846 ref 27 10 9 8 T 9 10 146214 CASAVA_Build 18 9303383 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2046 het 2046 ref 22 13 5 4 A 11 12 146215 CASAVA_Build 18 9321645 1I TAATTTTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 9 10 146216 CASAVA_Build 18 9324223 1I GGCCTCGCAT -/A CGCTAGAACC 3070 het 1380 hom 25 8 12 5 A 0 1 146217 CASAVA_Build 18 9333209 32D TGTTTTTTGT TATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------- TATATATATA 3070 hom 24 het 8 0 9 1 TA 25 9 146218 CASAVA_Build 18 9340271 3I AGAATACATC ---/ATT GTTTCCCTCC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 ATT 0 1 146219 CASAVA_Build 18 9343217 18D TTGCCTAAGG ATGCATTTTTCAGAATGT/------------------ ATCCCTATCC 3070 het 3070 ref 45 31 17 3 ATGCATTTTTCAGAATGT 1 0 146220 CASAVA_Build 18 9347839 1D GAGCAGGGAA G/- GGGGGGGATG 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 G 8 7 146221 CASAVA_Build 18 9353326 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 9 10 146222 CASAVA_Build 18 9355856 4D35M1D AACAAAAAAT TGACTGGGCATAATGATGCATGCCTGTAGTCCTAGCTACT/----TGGGCATAATGATGCATGCCTGTAGTCCTAGCTAC- TGGAGGGCTG 3070 het 3070 ref 26 21 8 7 N/A 0 0 146223 CASAVA_Build 18 9361036 1I GATTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2697 hom 26 12 12 2 A 12 13 146224 CASAVA_Build 18 9362369 5I TAATAAAATA -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AAAAT 3 4 146225 CASAVA_Build 18 9371864 2D TTACACACCC CT/-- GTTACTAGCA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 CT 1 0 146226 CASAVA_Build 18 9373189 2I11M1I ACGTTTTTTT --TTTGTTTTTTT-/TGTTTGTTTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 1396 hom 26 11 11 6 N/A 0 0 146227 CASAVA_Build 18 9377609 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1955 hom 15 5 10 0 A 10 11 146228 CASAVA_Build 18 9384706 3D AAAACATTTT ATC/--- ATTGCATTTG 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 ATC 1 0 146229 CASAVA_Build 18 9386734 1I AGGATAAGAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 8 9 146230 CASAVA_Build 18 9390302 1I ATTAGCAAGC -/A AAAGCGTTTC 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 3 4 146231 CASAVA_Build 18 9395809 4D CATTTGTCTG CTTT/---- CTTTAACAGC 2641 het 2641 ref 32 17 9 9 CTTT 2 1 146232 CASAVA_Build 18 9397740 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 25 0 20 6 A 10 9 146233 CASAVA_Build 18 9398596 1I TGATTGCCTG -/T ATACTTGGCT 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 T 0 1 146234 CASAVA_Build 18 9399720 1D AATTAGTACC T/- TAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 2 1 146235 CASAVA_Build 18 9400565 2D AGCTCAGGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 14 13 A 14 12 146236 CASAVA_Build 18 9402018 1I ATGGGCAACC -/A AAAAATGTAA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 A 5 6 146237 CASAVA_Build 18 9403737 1D GCTGGAGCAA C/- TTCCTTCTCA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 C 1 0 146238 CASAVA_Build 18 9421804 6D TTTTCTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2089 het 2089 ref 21 9 6 6 T 16 10 146239 CASAVA_Build 18 9421942 5D CTTGGATTAC AGGTG/----- CTGGCCACCA 2200 het 2200 ref 14 8 5 1 AGGTG 1 0 146240 CASAVA_Build 18 9428472 1D TAAAAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 T 11 10 146241 CASAVA_Build 18 9441415 3I AAATTAAGTT ---/AAA AAATTTTAAA 2089 het 2089 ref 16 9 5 2 A 3 6 146242 CASAVA_Build 18 9441832 1I AGCTGAAGTG -/T TTTAGGGATA 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 T 3 4 146243 CASAVA_Build 18 9443093 1I13M4D ATTGTATTAC -TTTTTTTGCATGTTGTA/TTTTTTTTGCATGT---- TGTATTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 17 2 N/A 0 0 146244 CASAVA_Build 18 9443408 1I TCACAGCTGA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 6 7 146245 CASAVA_Build 18 9460289 2I AATGATGTTT --/GA TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 GA 0 1 146246 CASAVA_Build 18 9461122 4I TTTTAAGATT ----/TTTG TTTGTTTGCA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 TTTG 2 3 146247 CASAVA_Build 18 9468243 1D CATGGAACAC T/- TTTTTTTTTC 1533 het 1533 ref 56 45 4 7 T 10 9 146248 CASAVA_Build 18 9473132 1D AAGCGACTGC A/- CCATTTTATA 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 A 1 0 146249 CASAVA_Build 18 9474524 1I TTTATTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 10 11 146250 CASAVA_Build 18 9489682 19I TTATATACCA -------------------/AGGTGTTACAGTTGCTGAC AGTATTCAGT 3070 het 3070 hom 43 17 21 7 AGGTGTTACAGTTGCTGAC 0 1 146251 CASAVA_Build 18 9502722 1D TGATGAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 T 12 11 146252 CASAVA_Build 18 9517597 1D TATTGAACCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 10 9 146253 CASAVA_Build 18 9525420 1I AAAATAACGG -/T TTTCTGTTGG 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 3 4 146254 CASAVA_Build 18 9530929 2D CGTGGCAAAG AT/-- AAAATCCTAC 3070 het 3070 hom 38 18 17 5 AT 1 0 146255 CASAVA_Build 18 9538252 5D AGTAGCAGTG AAAGA/----- AAAATGCTTC 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 AAAGA 1 0 146256 CASAVA_Build 18 9538408 1I GGCAGGCGGC -/G GGGGGGGTCG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 7 8 146257 CASAVA_Build 18 9548698 1I AATCAGACTG -/C TTTTTTTTTT 155 het 155 ref 36 14 3 19 C 0 1 146258 CASAVA_Build 18 9554822 1D ACACTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1444 hom 33 6 20 8 T 13 12 146259 CASAVA_Build 18 9566753 4I AATGATTGAC ----/TAGA TAAATAATGT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TAGA 0 1 146260 CASAVA_Build 18 9570350 2D GAGAGTCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1352 het 524 hom 16 3 6 7 T 16 14 146261 CASAVA_Build 18 9571167 1D CAAGGCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 14 13 146262 CASAVA_Build 18 9572321 4I GACTCAAATT ----/AGGG ACTCAAATAG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 AGGG 0 1 146263 CASAVA_Build 18 9576575 4D AACTGGTAAC TGAG/---- TATCTAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 5 TGAG 1 0 146264 CASAVA_Build 18 9586613 5I CTCCTTTAGC -----/TCTTT TCTTAAGAGA 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 TCTTT 0 1 146265 CASAVA_Build 18 9588858 1D CCTTGCCTCT A/- AAAAAAAATA 2745 het 2290 hom 18 6 6 7 A 9 8 146266 CASAVA_Build 18 9603641 1I CACCTTCTAA -/C CCTTCTCGTA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 C 2 3 146267 CASAVA_Build 18 9606251 1I AAATCAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 T 13 14 146268 CASAVA_Build 18 9607720 1D AAACAAACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2099 hom 28 7 17 4 A 10 9 146269 CASAVA_Build 18 9607852 2D TTCCTGAAAC TG/-- AAAGTATATA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TG 1 0 146270 CASAVA_Build 18 9608455 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 11 10 146271 CASAVA_Build 18 9611587 1I ATTCTACATA -/T TTTTTTTTTT 1582 het 1582 ref 31 12 5 16 T 13 14 146272 CASAVA_Build 18 9612877 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 A 7 6 146273 CASAVA_Build 18 9633037 1D CAAGACTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2668 hom 41 12 22 7 A 15 14 146274 CASAVA_Build 18 9635657 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 24 1 17 8 A 15 14 146275 CASAVA_Build 18 9650500 1I TATAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 10 11 146276 CASAVA_Build 18 9652448 9D GGCTCATGCC ACCACTTTG/--------- GGTCATCCAA 3070 hom 66 het 24 0 21 4 ACCACTTTG 1 0 146277 CASAVA_Build 18 9653174 1D GTCAATTCTG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 7 146278 CASAVA_Build 18 9657861 1I AAGGAAGAAA -/C CATGGGAGAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 1 2 146279 CASAVA_Build 18 9668167 1D CTTCTTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 25 1 13 11 T 16 15 146280 CASAVA_Build 18 9671104 1D GTTGTCTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 22 7 T 10 9 146281 CASAVA_Build 18 9674273 1I GTTTTGAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 T 9 10 146282 CASAVA_Build 18 9681893 18D TGAACTCCTG ACCTCAGGAGATCCGCCT/------------------ ACCTCAGCCA 3070 het 22 hom 26 1 23 3 ACCTCAGGAGATCCGCCT 1 0 146283 CASAVA_Build 18 9682167 1D TAGGAGGAAA C/- AAGCAGTCAA 3070 hom 105 het 41 0 36 7 C 1 0 146284 CASAVA_Build 18 9682708 1D TTATTTTATT A/- TTTTTTTCTT 2447 hom 18 het 8 0 7 1 A 1 0 146285 CASAVA_Build 18 9684218 1I ATGCCTATTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 408 hom 46 2 42 2 T 8 9 146286 CASAVA_Build 18 9686834 5D2M5D TTGGTGGCAG TTTGTCACGGGC/-----CA----- AACTTGGGAG 3070 hom 70 het 23 0 24 2 N/A 0 0 146287 CASAVA_Build 18 9702724 17D GGTATTTGTG TGCGTGCACTTAAAAAC/----------------- TGCGTGCACT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TGCGTGCACTTAAAAAC 2 1 146288 CASAVA_Build 18 9705412 2D CTTTGCCCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2838 hom 30 9 12 9 T 13 11 146289 CASAVA_Build 18 9722340 6I GAAACCTCCC ------/CAGTGG CAGAGGCCCA 1997 het 1997 ref 28 11 5 12 CAGTGG 0 1 146290 CASAVA_Build 18 9736181 3D3M3I AGAATAACAT TTAACC---/---ACCTAG AAATACATTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 N/A 0 0 146291 CASAVA_Build 18 9738597 4I TGATATTTAA ----/AAAT AAATATAAGG 3070 het 1155 hom 18 3 13 2 AAAT 1 2 146292 CASAVA_Build 18 9740168 1I TTTTGTGAAG -/A AGGGAAGAAA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 1 2 146293 CASAVA_Build 18 9746528 1D CGGCAAAGCC T/- TGAGCATTAA 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 2 1 146294 CASAVA_Build 18 9749483 1D53M1I AGTAGATCTT AAAACTATTTAGGTCATAGATTGCTTTGCGAATCTCATGAGGGACCCTCTCACC-/-AAACTATTTAGGTCATAGATTGCTTTGCGAATCTCATGAGGGACCCTCTCACCA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 21 12 8 N/A 0 0 146295 CASAVA_Build 18 9750165 1D TTTTCTTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 1 0 146296 CASAVA_Build 18 9765548 1I CTGTCGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 20 19 14 T 10 11 146297 CASAVA_Build 18 9767168 1I GTGAAACCCC -/G TCTCTACTAA 1957 het 1957 ref 16 8 5 3 G 0 1 146298 CASAVA_Build 18 9771151 1I GCTTTAGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 9 10 146299 CASAVA_Build 18 9776044 4I TCAGACTCTG ----/AGAA AGAAAGAAAG 2997 het 2997 ref 33 17 9 7 AGAA 2 3 146300 CASAVA_Build 18 9780403 1I AAAAAAAAAA -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2985 hom 30 10 17 3 G 0 1 146301 CASAVA_Build 18 9794821 1D CCCTCACTCC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 56 het 23 0 17 6 A 8 7 146302 CASAVA_Build 18 9796186 1D AAAAAAAAAA G/- AAGAGCTGTG 1830 het 1759 hom 19 7 8 4 G 1 0 146303 CASAVA_Build 18 9799053 2D GTGTGTGTGT GC/-- GCGCGCACGC 1078 het 1078 ref 48 26 7 17 GC 4 3 146304 CASAVA_Build 18 9816204 1I TGAAACCCCC -/T CTCTACTAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 0 1 146305 CASAVA_Build 18 9843878 3D CAATTAAAAA AAG/--- AAAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 AAG 1 0 146306 CASAVA_Build 18 9847254 1I TTGGTGACTG -/T TCTATACCAT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 1 2 146307 CASAVA_Build 18 9847545 1D TACCACAACC A/- AAAAAAAAAA 1556 het 1556 ref 33 21 4 8 A 12 11 146308 CASAVA_Build 18 9849135 6I GCACAGCCCA ------/AATATT AAGCAGGAGT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 AATATT 0 1 146309 CASAVA_Build 18 9850647 1I GCTTATATTA -/G GGGGGTGATT 3070 het 3070 hom 43 13 25 5 G 5 6 146310 CASAVA_Build 18 9851746 1D TCCTTCTCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 16 27 4 T 10 9 146311 CASAVA_Build 18 9855970 1D TTTGGGTACC T/- TTTCAGCAGC 2089 het 2089 ref 26 17 5 4 T 4 3 146312 CASAVA_Build 18 9856141 1D AAGGAGCAAG T/- CACATCTTAC 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 T 1 0 146313 CASAVA_Build 18 9856980 1I TTAGAGAGTG -/A AAAGGGCTGC 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 3 4 146314 CASAVA_Build 18 9860961 4D TCCTGCGCTG CATT/---- CATTCTCTCA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 CATT 2 1 146315 CASAVA_Build 18 9863795 1I AAATTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 2817 het 270 hom 17 2 10 5 A 14 15 146316 CASAVA_Build 18 9867926 1I ATGTAGTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2623 hom 23 7 9 7 A 11 12 146317 CASAVA_Build 18 9869834 1D TTCAAATTAA T/- TTTTTTTTTT 2517 het 1988 hom 17 8 7 3 T 11 10 146318 CASAVA_Build 18 9871535 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 AAAC 4 3 146319 CASAVA_Build 18 9876569 4D TATTTTATTT TATG/---- TTTTTTGGTA 3070 het 3070 ref 33 21 11 2 TATG 1 0 146320 CASAVA_Build 18 9879566 1I ATCAGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 34 1 26 7 A 10 11 146321 CASAVA_Build 18 9880755 3D ATAGAGAGAC CTT/--- CTTCTGACTT 3070 het 3070 ref 47 28 16 3 CTT 2 1 146322 CASAVA_Build 18 9883681 1I CAATTCAACA -/T TTTTTTTTTT 2410 het 2125 hom 25 9 9 7 T 11 12 146323 CASAVA_Build 18 9893377 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 T 10 9 146324 CASAVA_Build 18 9894280 1D ATGATCAAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 9 8 146325 CASAVA_Build 18 9894618 3D TAGTTGACAA ATG/--- ATAATTGTGT 3070 het 3070 ref 34 20 12 5 ATG 1 0 146326 CASAVA_Build 18 9904977 1D TAGAACTCGG C/- CGTCAGGTGT 1331 het 1228 hom 18 4 4 10 C 2 1 146327 CASAVA_Build 18 9905982 1I GTATGGTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 57 24 28 5 T 9 10 146328 CASAVA_Build 18 9907805 1I AGCACGGGGC -/G GGGGGGGAAA 2188 het 2188 ref 19 10 5 4 G 7 8 146329 CASAVA_Build 18 9913625 2I AAATCATACA --/GT GTGTTTCCTG 3070 hom 86 het 35 0 28 7 GT 2 3 146330 CASAVA_Build 18 9917472 1D ACAGTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 15 14 146331 CASAVA_Build 18 9920688 1I ATATGTATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 9 10 146332 CASAVA_Build 18 9926345 1I AATTTCTTCA -/T TTATAGATAA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 2 3 146333 CASAVA_Build 18 9932426 1I AACTTTATGA -/T TTTTTTTTTA 2091 het 2091 ref 29 12 6 11 T 9 10 146334 CASAVA_Build 18 9937220 2I AAAAAGCATA --/AC ACAGTAAATA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AC 1 2 146335 CASAVA_Build 18 9944234 1I GTGCTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 13 14 146336 CASAVA_Build 18 9945898 1D AAAATCCCCC T/- CTCCCCTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 13 8 T 1 0 146337 CASAVA_Build 18 9951245 2I TAGTTGACAT --/CC CACTGAAAAT 3070 het 3070 ref 62 29 25 8 C 1 3 146338 CASAVA_Build 18 9958861 1I AACAATGGCA -/C CCGTCCCTTC 3070 hom 60 het 23 0 19 4 C 2 3 146339 CASAVA_Build 18 9986118 1I ATAAATGATG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 7 8 146340 CASAVA_Build 18 9986729 12D AAAATCTGGG AACAACTTCTAA/------------ AACAACTTCT 3070 het 3070 hom 41 17 23 6 AACAACTTCTAA 1 0 146341 CASAVA_Build 18 9986955 2D AACTCACATG CA/-- CACACACATA 3070 het 3070 ref 64 29 21 17 CA 5 4 146342 CASAVA_Build 18 9989245 2D TAACATAAAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 TG 6 5 146343 CASAVA_Build 18 9989596 24I GAATTACTTT ------------------------/AAATGTAAAGAGATTAATTACTTG AAATGTAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 AAATGTAAAGAGATTAATTACTTG 0 1 146344 CASAVA_Build 18 10001317 1D GATAGAGGCC T/- GCCAGGAGGA 3070 het 3070 hom 33 14 13 8 T 1 0 146345 CASAVA_Build 18 10014600 1D AGTCACAAGT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 8 7 146346 CASAVA_Build 18 10014774 2I CAAAGAATTG --/GA GAGAGAGATA 3070 het 1577 hom 28 7 13 8 GA 4 5 146347 CASAVA_Build 18 10019206 1I ATATCTGAGG -/T TGTTTTAGTG 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 T 1 2 146348 CASAVA_Build 18 10038236 1D AGATGCTATG T/- AATGGTGTGG 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 T 1 0 146349 CASAVA_Build 18 10042137 1D ACAAAGACTC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 85 het 33 0 27 6 T 8 7 146350 CASAVA_Build 18 10043582 2I ATATATGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 AC 8 9 146351 CASAVA_Build 18 10053499 1I AGGTCAACAG -/T TTTTTTTTTT 2683 het 61 hom 14 1 8 5 T 12 13 146352 CASAVA_Build 18 10055539 8D GTTTGCATTA ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 13 15 10 AC 9 5 146353 CASAVA_Build 18 10078088 1I TTCTGCATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 18 20 11 A 9 10 146354 CASAVA_Build 18 10080901 2D CTGCTGGGGA AG/-- AGGCTGAGCC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 AG 2 1 146355 CASAVA_Build 18 10082314 3I TCTCACATAA ---/TCT TCTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 TCT 1 2 146356 CASAVA_Build 18 10089142 3I TTCTGGCAAA ---/TCG CTGGTTTTCA 3070 hom 18 het 11 0 7 4 TCG 0 1 146357 CASAVA_Build 18 10089182 1I TGAGCACTTC -/G GGAGCCCTTC 2936 het 1840 hom 22 5 8 9 G 2 3 146358 CASAVA_Build 18 10089466 3I GTTGCACTTT ---/GAA GAAGAAGATA 3070 het 3070 hom 42 11 23 8 GAA 2 3 146359 CASAVA_Build 18 10094144 3D TTTCATTTAT TTA/--- TTTTTTTTTT 212 het 212 ref 24 16 1 7 TTA 1 0 146360 CASAVA_Build 18 10095368 2D GGATTATTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 12 10 146361 CASAVA_Build 18 10098882 1I ATCCATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1610 hom 26 4 13 9 T 10 11 146362 CASAVA_Build 18 10108953 1D AAAGAAATAA G/- TAGCGGCCGG 2646 hom 15 het 6 0 6 0 G 1 0 146363 CASAVA_Build 18 10109940 1D CACCATATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 12 11 146364 CASAVA_Build 18 10111514 4I ACTGCATCCC ----/GTAA GTATGTACAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 GTAA 0 1 146365 CASAVA_Build 18 10114104 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTGTATTT 3070 hom 74 het 26 0 25 1 T 5 4 146366 CASAVA_Build 18 10132289 1I GATTTCAGTG -/C CCGATACTGG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 C 2 3 146367 CASAVA_Build 18 10133384 1D TTAAAAAAAA T/- AATAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 1 0 146368 CASAVA_Build 18 10172729 1D TAGTGGGGGG C/- GTGTGTTCAG 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 C 1 0 146369 CASAVA_Build 18 10175165 2I CCAAATACAA --/AG AGACAGAAAA 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 AG 1 2 146370 CASAVA_Build 18 10178525 1D AAAAAAAAAA T/- GGATAAATCC 3070 het 550 hom 22 4 15 3 T 1 0 146371 CASAVA_Build 18 10187269 1D GAGGAGAAGT G/- GAAGGGCGTT 3070 hom 92 het 39 0 30 9 G 2 1 146372 CASAVA_Build 18 10188950 1D AGCAATTGAC A/- AGCTTGGCTT 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 A 2 1 146373 CASAVA_Build 18 10189527 2D ATTCCCAGGC AG/-- AGTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 49 25 22 3 AG 2 1 146374 CASAVA_Build 18 10227550 1D TCGGAGGCTG C/- CAAAGTGTGC 3070 het 3070 ref 43 20 12 13 C 2 1 146375 CASAVA_Build 18 10230785 1D GAAAAGCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 11 10 146376 CASAVA_Build 18 10231255 1D TTAAACCTTA T/- TTTCCTCATT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 4 3 146377 CASAVA_Build 18 10237880 1D AGCAGGGGAA G/- GGGGCCCCCA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 5 4 146378 CASAVA_Build 18 10241468 1I CGGGCGTGGT -/G GCGGGCGCCT 1573 hom 10 het 4 0 4 0 G 1 2 146379 CASAVA_Build 18 10259931 7I GTGGGGTCAG -------/CCACCAC CCACCACCCA 3070 hom 111 het 50 0 37 13 CCACCAC 2 3 146380 CASAVA_Build 18 10263009 1I ATCCATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 T 10 11 146381 CASAVA_Build 18 10265295 1I TTTACAGCAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 38 het 33 1 27 5 T 7 8 146382 CASAVA_Build 18 10271982 10D AGATCACATT TGACAACTGA/---------- TGATAATCTG 3070 het 3070 ref 43 24 17 5 TGACAACTGA 1 0 146383 CASAVA_Build 18 10272870 1D CCTAGAACCA G/- GCATAGATTC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 G 2 1 146384 CASAVA_Build 18 10273062 4D TTTAAAGCAC TAAG/---- TGTTAGTTCA 3070 het 3070 hom 37 12 21 5 TAAG 1 0 146385 CASAVA_Build 18 10283434 1I TACTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 10 11 146386 CASAVA_Build 18 10284318 12D CCGGGGTGTT TAGGGCCGCTGG/------------ CAGGGCCGCT 3070 het 2950 hom 36 12 16 10 TAGGGCCGCTGG 1 0 146387 CASAVA_Build 18 10284596 1I AGGCTTTCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 9 10 146388 CASAVA_Build 18 10284875 1I ACATGGATGA -/T GGCTCCTCCA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 T 0 1 146389 CASAVA_Build 18 10288021 3I GACCCTCAGG ---/TCA GTGCACTGGT 3070 hom 90 het 34 0 26 8 TCA 0 1 146390 CASAVA_Build 18 10290719 1I CAGCTCCCCC -/G AGTTGGAATA 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 G 0 1 146391 CASAVA_Build 18 10299552 1I GAGGGGAGGA -/G GGGACAGTTC 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 G 3 4 146392 CASAVA_Build 18 10318749 18D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 26 0 15 13 A 34 16 146393 CASAVA_Build 18 10321581 1D ACTAAAGGAA G/- GAGACTTTGA 3070 het 3070 ref 53 25 22 7 G 2 1 146394 CASAVA_Build 18 10324116 1D AAAAAAAAAA C/- GATAATAATG 2834 het 2834 ref 33 14 11 8 C 1 0 146395 CASAVA_Build 18 10328492 1D TAAAAGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 20 1 13 7 T 12 11 146396 CASAVA_Build 18 10332607 1I GGAGTCGTCC -/T TTCTGGTGTC 3070 het 3070 ref 59 32 13 14 T 2 3 146397 CASAVA_Build 18 10347720 3I GAAAGCAGAC ---/TAA TACAAACCTC 2057 het 2057 ref 36 21 6 9 TAA 0 1 146398 CASAVA_Build 18 10348329 4D TCTAGGATAG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 9 A 15 11 146399 CASAVA_Build 18 10349174 1D ATAAATTATA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 T 9 8 146400 CASAVA_Build 18 10349947 3I ACATTTTACT ---/ATA ATGTTTTATA 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 ATA 0 1 146401 CASAVA_Build 18 10350123 1I GTTTTAATAC -/T TTTTTTTTTG 1609 het 1609 ref 25 14 5 6 T 9 10 146402 CASAVA_Build 18 10351239 1D ACCCAGCCTA T/- TTTTTTCTAG 1603 het 1603 ref 19 6 4 9 T 7 6 146403 CASAVA_Build 18 10351291 1I GAAATGTTCA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 24 12 12 0 T 6 7 146404 CASAVA_Build 18 10352021 1I AAAAATACAG -/A AAAAAATATT 2643 het 2643 ref 17 9 6 2 A 6 7 146405 CASAVA_Build 18 10356599 3D TAATAATGAT AAG/--- AAGAAAATTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 AAG 2 1 146406 CASAVA_Build 18 10358758 6D AGACTGAGGA AGAGGG/------ AGAGGAAGAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 9 AGAGGG 1 0 146407 CASAVA_Build 18 10368100 1D AAACATCAAT G/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 42 17 21 5 G 1 0 146408 CASAVA_Build 18 10373088 3D AGATGTCCTT GTG/--- GTGGTTTTGA 3070 het 3070 hom 56 28 26 3 GTG 2 1 146409 CASAVA_Build 18 10379458 1I GTGGCTGCCC -/T GTCTATATTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 T 0 1 146410 CASAVA_Build 18 10388963 11D CTGCAATGTG GGTCTTGACAC/----------- GGACACACAC 1354 het 1354 ref 38 12 5 24 GGTCTTGACAC 1 0 146411 CASAVA_Build 18 10400756 5I AACTTATGTT -----/AAACA AAACAAGTAG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 AAACA 1 2 146412 CASAVA_Build 18 10401866 1I CTGGAGCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 10 11 146413 CASAVA_Build 18 10405288 1I AAATGAAAAT -/A AAAAAGAAAG 3070 hom 57 het 20 0 19 1 A 5 6 146414 CASAVA_Build 18 10406680 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 11 12 146415 CASAVA_Build 18 10407881 1I GTCCCCCCCC -/T AGCACAGCAT 3070 hom 109 het 43 0 35 8 T 0 1 146416 CASAVA_Build 18 10413781 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2106 hom 26 7 14 5 A 13 14 146417 CASAVA_Build 18 10422172 4I ATTACAAAGG ----/GTGT GTGTGTCCTA 3070 het 3070 ref 54 22 20 12 GT 3 5 146418 CASAVA_Build 18 10427403 1I TTCTGTATGA -/T TTTTTCATGT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 T 5 6 146419 CASAVA_Build 18 10427756 1D ATTATCACTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 10 9 146420 CASAVA_Build 18 10428453 1D CTTCCTTCCT C/- CCCCCCCTTC 3070 het 3070 hom 34 10 13 11 C 8 7 146421 CASAVA_Build 18 10438414 2D CTCTGGGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2400 hom 27 8 16 3 T 13 11 146422 CASAVA_Build 18 10447003 1I AAGATAAGAT -/A AAAAAGGGAG 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 5 6 146423 CASAVA_Build 18 10449857 2I CAATTCTAAC --/TT GAGAACACTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 0 2 146424 CASAVA_Build 18 10452915 1D ATGTCCCTCC A/- AAAAAACCAG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 7 6 146425 CASAVA_Build 18 10470705 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2776 het 1874 hom 20 7 9 4 A 10 11 146426 CASAVA_Build 18 10471823 1D TCCACAAGAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 2849 hom 26 8 15 3 A 8 7 146427 CASAVA_Build 18 10538537 1D GTTTTACACC T/- TTTTTTTTTT 1658 het 1658 ref 43 28 5 10 T 12 11 146428 CASAVA_Build 18 10556367 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 9 10 146429 CASAVA_Build 18 10558642 1D AAAAAAAAAA T/- TAATTAATTT 3070 het 1952 hom 22 7 13 3 T 2 1 146430 CASAVA_Build 18 10559799 6I ATGATTGAGG ------/TTTTAT TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 TTTTAT 2 3 146431 CASAVA_Build 18 10560123 7I AGGACATGAT -------/CTCATCC CTCATCCCTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 CTCATCC 1 2 146432 CASAVA_Build 18 10561129 1I AAAGATGCAC -/T TTGTACCTAA 2288 hom 15 het 11 0 6 5 T 2 3 146433 CASAVA_Build 18 10562665 5I CCGTCTTATT -----/TTTTA TTTTATTTTT 3070 het 2547 hom 25 11 11 3 TTTTA 1 2 146434 CASAVA_Build 18 10572202 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2848 het 2019 hom 19 5 7 7 A 13 14 146435 CASAVA_Build 18 10574019 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2839 het 197 hom 8 1 7 0 A 11 10 146436 CASAVA_Build 18 10579630 8I TTTGTTTTTT --------/TGTTTTTG TTGTTGTTGT 2437 het 2437 ref 16 9 5 2 TGTTTTTG 0 1 146437 CASAVA_Build 18 10585092 4I ACTTAGAAAT ----/TAAG TAACACTTCA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 TAAG 0 1 146438 CASAVA_Build 18 10586619 4D AGCTGCTCTT CCTC/---- CCAGCTGCCA 2680 het 2680 ref 38 23 8 7 CCTC 1 0 146439 CASAVA_Build 18 10587208 2D CCATCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 665 hom 14 4 10 0 A 12 10 146440 CASAVA_Build 18 10588409 5D TTGGGGTATT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 TTTTG 6 5 146441 CASAVA_Build 18 10593469 1D TACCAAGTTT C/- AGATGTCTGC 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 C 1 0 146442 CASAVA_Build 18 10594656 1D ACATAATCAC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 25 8 10 7 T 9 8 146443 CASAVA_Build 18 10595750 2D CCCGATTAAA AG/-- AGAGAGCATT 3070 het 3070 ref 44 22 14 9 AG 4 3 146444 CASAVA_Build 18 10599295 2I8M1D TCCTTTCAGG --GAGGGACCA/AAGAGAGACC- CCCCTCCACT 2104 het 2104 ref 21 12 5 6 N/A 0 0 146445 CASAVA_Build 18 10601427 2I11M4I33M2D ACAATAACAC --GTGTTTCTTAT----GTAATTAAAAACAATTTACTTTTTTTTTTTTTTTC/ATGTGTTTCTTATGTGAGTAATTAAAAACAATTTACTTTCTTTTTTTTTT-- TTCTTGAGAT 1269 het 1269 ref 34 38 3 4 N/A 0 0 146446 CASAVA_Build 18 10604172 1I TATTATCAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 A 7 8 146447 CASAVA_Build 18 10605511 1D GAGGACAGAC A/- GACTGAGGGG 3070 het 2140 hom 29 5 23 2 A 1 0 146448 CASAVA_Build 18 10612102 1I CTCATTGGCT -/C TTTTACTATA 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 C 0 1 146449 CASAVA_Build 18 10617903 1D TTTTATTTTT A/- TTTTTTGAAG 3070 het 3070 ref 31 17 9 6 A 1 0 146450 CASAVA_Build 18 10623696 1D GGTAATACAC A/- AAAAATATGT 1108 het 1108 ref 44 36 3 5 A 6 5 146451 CASAVA_Build 18 10628798 1D CTCGGGCCTG T/- TAGCTGTCTG 698 het 698 ref 32 23 4 5 T 2 1 146452 CASAVA_Build 18 10634856 1D ATATTTACTT A/- ACATATATGC 3070 het 3070 ref 43 30 7 6 A 2 1 146453 CASAVA_Build 18 10639799 1D CACAGAGTGG C/- AAGCTGGATA 3070 het 3070 ref 24 16 8 0 C 1 0 146454 CASAVA_Build 18 10640613 4I ACAGCTTTGA ----/AGAG AGTAGTGGTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AG 1 3 146455 CASAVA_Build 18 10641316 1D CAGTGACCAA T/- TCGATCAAGT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 2 1 146456 CASAVA_Build 18 10653794 1D GCTGTAAATA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 8 7 146457 CASAVA_Build 18 10656998 1D ACAAAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 11 10 146458 CASAVA_Build 18 10660163 1D TCAGTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 34 1 29 5 A 11 10 146459 CASAVA_Build 18 10667881 1D TTCTGTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 A 11 10 146460 CASAVA_Build 18 10669535 1D TCTAAAAACC A/- GTATTAATTT 3070 hom 114 het 45 0 39 7 A 1 0 146461 CASAVA_Build 18 10674833 1D CCTAGGCCAT G/- TCAACTCTTT 3070 hom 89 het 35 0 29 6 G 1 0 146462 CASAVA_Build 18 10675960 2D CTCACTTGTG CC/-- TCTGACTCTA 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 C 2 0 146463 CASAVA_Build 18 10677291 1I CACTCCCCGC -/A AACCCATGAC 3070 het 3070 ref 47 19 16 12 A 2 3 146464 CASAVA_Build 18 10677489 6D TAAGAATGTG CTTAGT/------ CTTAGTCAAT 3070 het 3070 ref 54 31 18 7 CTTAGT 2 1 146465 CASAVA_Build 18 10680107 5D TGTTCATGTT ACGAG/----- ACCCTTGGCC 3070 het 3070 hom 40 16 21 6 ACGAG 1 0 146466 CASAVA_Build 18 10684840 4D CCCTAAAAAC AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 hom 24 10 14 3 AATA 4 3 146467 CASAVA_Build 18 10688011 25I GAGTATGCAC -------------------------/GGATGCATTTGTGAACAATTACTGA GGCCTTGGGA 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 GGATGCATTTGTGAACAATTACTGA 0 1 146468 CASAVA_Build 18 10701614 1I TTCAGGTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 9 10 146469 CASAVA_Build 18 10701984 4D AAAATAAATG AACA/---- AACAAATAAA 3070 het 3070 hom 36 12 21 5 AACA 2 1 146470 CASAVA_Build 18 10719004 2I ACCTGCATAC --/AT GTGTGTGCAC 3070 het 3069 hom 24 7 14 3 AT 0 1 146471 CASAVA_Build 18 10721666 1I TGAGATTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 11 12 146472 CASAVA_Build 18 10723015 2I TTGTGAATAT --/AA GAGGCGCACA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 0 2 146473 CASAVA_Build 18 10726294 2I TTTTTCACTT --/CC TGCTTGCAAG 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 C 0 2 146474 CASAVA_Build 18 10726477 1I ATTGCAGATG -/T TAAATCAGAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 1 2 146475 CASAVA_Build 18 10730087 8I GACATCATGT --------/AAGATATA AAAGACTGAA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 AAGATATA 0 1 146476 CASAVA_Build 18 10731996 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 1814 het 436 hom 6 1 5 0 A 8 9 146477 CASAVA_Build 18 10741596 1I GACACAGTGA -/T TACACGTGCC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 1 2 146478 CASAVA_Build 18 10748342 1I CACAGACACT -/C CCAGGAGCTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 C 2 3 146479 CASAVA_Build 18 10755736 13I AGCAAGTGCA -------------/GGGCAACTGAACC GGAGTCCTGT 3070 het 3070 ref 47 26 15 7 GGGCAACTGAACC 0 1 146480 CASAVA_Build 18 10757517 3D GGGGATGCAG GGA/--- GGAGAACGTC 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 GGA 2 1 146481 CASAVA_Build 18 10760571 4D TTGACATTAT CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 hom 84 het 39 0 29 13 CTTC 5 4 146482 CASAVA_Build 18 10762536 1I TGAGATGAGT -/G GGGGAAAGAA 3070 het 3070 hom 59 26 26 7 G 4 5 146483 CASAVA_Build 18 10764461 1I TGTGCCATGG -/A AAGCTAAGTG 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 2 3 146484 CASAVA_Build 18 10765918 1D ACAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 216 hom 40 1 31 8 A 11 10 146485 CASAVA_Build 18 10771472 1I CGTTTCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2245 hom 16 5 10 1 A 11 12 146486 CASAVA_Build 18 10774734 1D AGGGTTGAAG A/- GCTGCCTTCC 3070 hom 120 het 44 0 38 6 A 1 0 146487 CASAVA_Build 18 10777200 2D TCAGACATTG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 12 7 A 11 9 146488 CASAVA_Build 18 10783090 1I CGTCTCTGCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 2078 hom 16 5 10 1 A 8 9 146489 CASAVA_Build 18 10786368 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 27 1 19 8 A 15 14 146490 CASAVA_Build 18 10786956 2D ACATACCATC AT/-- ATCTTATATA 1233 het 1233 ref 80 66 3 11 AT 2 1 146491 CASAVA_Build 18 10787079 2D ACATACCATC AT/-- ATCTTATATA 3070 het 3070 ref 72 46 23 5 AT 2 1 146492 CASAVA_Build 18 10787339 3I TATTATACAT ---/ATC ATCATATTAT 3070 het 3070 ref 41 19 16 8 ATC 1 2 146493 CASAVA_Build 18 10789220 3I CACTAAAGGC ---/ACG ACGACAAGGT 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 ACG 1 2 146494 CASAVA_Build 18 10789525 2D AATCAAATCT GA/-- GAGTGAAACT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 GA 2 1 146495 CASAVA_Build 18 10789853 1D CACCTGTAGT C/- CCAACTACTA 2772 het 1970 hom 11 4 7 0 C 3 2 146496 CASAVA_Build 18 10789971 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2998 het 6 hom 20 1 13 6 A 18 16 146497 CASAVA_Build 18 10790784 1I GGAGGCCTTC -/A AAGATTTGGT 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 A 2 3 146498 CASAVA_Build 18 10791663 6I AGATAAGCAA ------/CCACAT GTCTATAAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 CCACAT 0 1 146499 CASAVA_Build 18 10794664 1D CTAACTCCCT G/- GGAGGGGCGT 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 G 3 2 146500 CASAVA_Build 18 10797776 3I GAAAGTCAAA ---/TAT TATACAGTAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TAT 1 2 146501 CASAVA_Build 18 10798397 1I GCCTGTTTGC -/A ACTTTTATAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 146502 CASAVA_Build 18 10799578 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 21 1 20 0 T 11 10 146503 CASAVA_Build 18 10806668 3D ACCCAAAAGG AAA/--- AAAAATTGGT 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 A 8 5 146504 CASAVA_Build 18 10812346 1D TAGCTGAAAC T/- TTTCCTCCCA 3070 het 3070 ref 47 23 18 7 T 4 3 146505 CASAVA_Build 18 10829553 3D ACTTTGCCAG ACC/--- ACTTCATGTG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 ACC 1 0 146506 CASAVA_Build 18 10829776 2I AGGAGTATCA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 9 11 146507 CASAVA_Build 18 10830398 1I CACATTAACC -/A GTTCCAAATC 3070 het 3070 hom 42 20 22 0 A 0 1 146508 CASAVA_Build 18 10830630 1D TTTTGACAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 10 9 146509 CASAVA_Build 18 10863622 4I GGACAGACGG ----/TATT TATTTAACTA 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 TATT 1 2 146510 CASAVA_Build 18 10899529 3I GATGGCACTA ---/GGG TTCTGGAAGA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 0 3 146511 CASAVA_Build 18 10904268 1D AAACATGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3001 hom 31 8 13 10 T 12 11 146512 CASAVA_Build 18 10907137 4D AAAGGTCGGT CACC/---- CACCAATATG 3070 hom 72 het 29 0 25 6 CACC 2 1 146513 CASAVA_Build 18 10913813 1I CTCTTGCAGC -/A AAATTAATTT 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 A 3 4 146514 CASAVA_Build 18 10915897 1I GTGTTTTTTG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 6 7 146515 CASAVA_Build 18 10939495 2I TGGATTCCCA --/CT CTCTGTCTAC 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 CT 2 3 146516 CASAVA_Build 18 10942881 4D TCCTTCCTTC CTTT/---- CATCCCTCCC 1917 het 1917 ref 32 13 13 6 CTTT 1 0 146517 CASAVA_Build 18 10951289 2I GATTGGAGAC --/TG TTATTCTAAG 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 TG 0 1 146518 CASAVA_Build 18 10951398 1I AATGGACTTT -/G GGGACTTGTG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 G 3 4 146519 CASAVA_Build 18 10959382 1D TCGGCATGGT G/- GGGAGCAGAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 4 3 146520 CASAVA_Build 18 10959999 1D CTCAGGTTAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 A 9 8 146521 CASAVA_Build 18 10984399 1D TTGTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2964 het 1471 hom 16 7 8 1 T 17 16 146522 CASAVA_Build 18 10987843 1I ATTGGTTCAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 7 8 146523 CASAVA_Build 18 10988429 1D TAGAAAAAAA T/- CTCTCTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 T 1 0 146524 CASAVA_Build 18 10989183 1D AGGCAACAGC A/- AAAAAAAAAA 2789 het 2789 ref 38 18 9 12 A 17 16 146525 CASAVA_Build 18 11002070 1D TGCAAAAGCG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 9 8 146526 CASAVA_Build 18 11007456 1D CATGAATGCC T/- TTTTTTTTTG 1205 het 1205 ref 38 26 3 9 T 10 9 146527 CASAVA_Build 18 11017822 8D TCAGCTTATG ACTTGGTA/-------- AGTGGTTTTT 3070 het 3070 ref 43 26 15 12 ACTTGGTA 1 0 146528 CASAVA_Build 18 11030237 3I CTATTTCTTC ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 TAT 4 5 146529 CASAVA_Build 18 11034159 2D ACTAATATAC TA/-- TATATATATA 1639 het 1639 ref 15 6 5 4 TA 7 6 146530 CASAVA_Build 18 11042082 1I AGCTTCATAA -/T TTTTTTTTTT 905 het 905 ref 30 22 3 5 T 11 12 146531 CASAVA_Build 18 11053434 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2047 hom 16 5 9 3 A 9 8 146532 CASAVA_Build 18 11078517 1I TATGTTCTAG -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 54 24 27 3 T 6 7 146533 CASAVA_Build 18 11081383 11D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 14 3 A 16 5 146534 CASAVA_Build 18 11096846 2D TTTTTGGGCT GA/-- GCCACTTACA 3070 het 3070 ref 33 16 12 7 GA 1 0 146535 CASAVA_Build 18 11098459 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAGTAGC 1093 het 295 hom 5 1 3 1 A 5 6 146536 CASAVA_Build 18 11108759 1I TTAATTACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 133 hom 39 1 33 5 A 9 10 146537 CASAVA_Build 18 11109147 4D19M1I AAATATTTGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC-/----TTTTTTTTTTTTTTGAGACA AGAGTCTTGC 3070 hom 42 het 16 0 15 2 N/A 0 0 146538 CASAVA_Build 18 11111242 2D CACAGCAAGA CT/-- CTGTCTGAAA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 CT 2 1 146539 CASAVA_Build 18 11112997 1I TAATGTGCGG -/T CTTTTTCCCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 146540 CASAVA_Build 18 11113898 14D AAGATTGCTG AAAGAGTAGATTTT/-------------- AAAGAGTAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 AAAGAGTAGATTTT 2 1 146541 CASAVA_Build 18 11116631 1D GCCTTACATA T/- TTTTTTTTTT 2033 het 2033 ref 28 16 5 7 T 13 12 146542 CASAVA_Build 18 11116791 1D TACATTACTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 73 het 36 0 27 9 T 10 9 146543 CASAVA_Build 18 11125038 1D TTAAGTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 A 15 14 146544 CASAVA_Build 18 11135360 1I ACGGAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 80 het 31 0 26 5 A 8 9 146545 CASAVA_Build 18 11178611 1I GGATATGGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 100 het 41 0 33 8 T 8 9 146546 CASAVA_Build 18 11203942 1I GAGAAGTGGT -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 A 6 7 146547 CASAVA_Build 18 11207022 1I ACCAGTCAAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 46 21 14 11 A 7 8 146548 CASAVA_Build 18 11207445 1D ATGACGTCTG T/- TGGGGGGGGG 1773 het 137 hom 16 3 6 7 T 2 1 146549 CASAVA_Build 18 11216312 3I AAACAAAAAC ---/AAA AACAAAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 2 5 146550 CASAVA_Build 18 11228167 3I TTTTACACAG ---/AGT AGAAGCTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AGT 0 1 146551 CASAVA_Build 18 11229862 1D AGATTTTTTT C/- TTTTTTGAAA 3070 het 541 hom 35 2 29 4 C 1 0 146552 CASAVA_Build 18 11240545 2I ACTTCCCCTA --/AC ACACACACAC 3070 het 595 hom 61 2 49 10 AC 7 8 146553 CASAVA_Build 18 11243208 4I AGTTTTTACT ----/TCTA TCTATGTAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TCTA 1 2 146554 CASAVA_Build 18 11243558 1I AATCTAATTG -/A AAAAAATGCT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 6 7 146555 CASAVA_Build 18 11245050 5I CAAAAAATAC -----/ATATT ATAAGAGCCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATATT 0 1 146556 CASAVA_Build 18 11248061 1D CTGATGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 11 10 146557 CASAVA_Build 18 11250284 19D GGGGCCAGGC ATGGCAGCTCACGCCTGTA/------------------- ATCCCAGCAC 3070 hom 78 het 25 0 25 3 ATGGCAGCTCACGCCTGTA 1 0 146558 CASAVA_Build 18 11254313 1I TCAGTCCTTA -/T CTCAACTGCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 0 1 146559 CASAVA_Build 18 11262897 3D CCGTTAAAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 33 0 25 8 T 14 11 146560 CASAVA_Build 18 11269956 2D ATCTGCCTGG TT/-- TCTAGGGAGG 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 3 1 146561 CASAVA_Build 18 11275838 1D ATACTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 1597 het 1597 ref 53 38 5 10 T 11 10 146562 CASAVA_Build 18 11282718 1D TTATAATTGT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 A 9 8 146563 CASAVA_Build 18 11284620 4I ACCTAAATTA ----/ATTT ATTTGTGTGC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 ATTT 1 2 146564 CASAVA_Build 18 11286906 1D ACAAGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 48 2 43 4 A 11 10 146565 CASAVA_Build 18 11294007 3I CTCCAGCTAC ---/TAT TATTGTATTG 3063 het 3063 ref 29 17 8 5 TAT 1 2 146566 CASAVA_Build 18 11301530 2D CATCTCTCAC AG/-- AGAGTCTTCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 AG 3 2 146567 CASAVA_Build 18 11301622 1I CCAGAAAGCT -/G TTCCTTTTGA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 0 1 146568 CASAVA_Build 18 11304515 2I59M5I TAATGTTGTC --AGAGATTTAAGCCCTTAATCTATTTATGCTCTTTTAAAGGAACAGCCAGCTATGAAATT-----/AGAGAGATTTAAGCCCTTAATCTATTTATGCTCTTTTAAAGGAACAGCCAGCTATGAAATTAAAGA AAACAGAGTT 3070 hom 78 het 32 0 27 31 N/A 0 0 146569 CASAVA_Build 18 11304747 1I ACCATAAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 9 10 146570 CASAVA_Build 18 11305096 1D CTTATGTATT A/- ACAGTTAACT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 2 1 146571 CASAVA_Build 18 11328110 1I AATTAAATTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 9 146572 CASAVA_Build 18 11335451 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 13 1 10 4 A 15 14 146573 CASAVA_Build 18 11362234 1I CAATTCTATC -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 146574 CASAVA_Build 18 11362588 5D TGTTTGTTTG TAATA/----- TAATATATTA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 TAATA 2 1 146575 CASAVA_Build 18 11363565 1D TGAAGTTAAT A/- GTTTTGTACC 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 1 0 146576 CASAVA_Build 18 11379711 1I TAAAAGTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 11 12 146577 CASAVA_Build 18 11381115 3D2M6I AAAAAGCAAC AAAAG------/---AGTTCCTT AATTTGCTTT 3070 hom 93 het 31 0 32 3 N/A 0 0 146578 CASAVA_Build 18 11381260 1I CTTGAACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 10 11 146579 CASAVA_Build 18 11401533 2I GCAACATCAT --/AA GAGTGTCAGA 3070 het 3070 hom 43 19 23 1 A 0 2 146580 CASAVA_Build 18 11471887 1D GTAAGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 39 0 33 7 A 12 11 146581 CASAVA_Build 18 11476078 1D AGCAATTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 40 0 28 12 A 13 12 146582 CASAVA_Build 18 11477422 1I GTTGTGAGGA -/G GCCCAAGCCA 3070 hom 126 het 45 0 40 5 G 1 2 146583 CASAVA_Build 18 11478534 1I GTCATTAAGG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 7 8 146584 CASAVA_Build 18 11527324 4I GGCCATGAGC ----/TTTA TAAAATACAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 TTTA 0 1 146585 CASAVA_Build 18 11533712 1D AGAAAAAAAA C/- ATTCACTTAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 0 146586 CASAVA_Build 18 11546081 1I CTTTTCTTTT -/G TTTTTAGCTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 0 1 146587 CASAVA_Build 18 11548898 1D GTGATGTGTT G/- GGAGTGGAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 3 2 146588 CASAVA_Build 18 11557906 17D AAGGAGGAGA AGGAGGAGGAGGAGGAG/----------------- AGGAGGAGGA 2242 het 101 hom 17 1 8 10 AGGAGGAGGAGGAGGAG 2 1 146589 CASAVA_Build 18 11561055 1I ATTTTGCGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2625 hom 31 9 13 9 T 9 10 146590 CASAVA_Build 18 11573411 1I GTTGATAGAT -/C ACATCTGAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 C 0 1 146591 CASAVA_Build 18 11577380 1D AACCCTACAA C/- CCTACAGTTG 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 C 3 2 146592 CASAVA_Build 18 11591784 1D AACGATGGGG A/- AAGAACTCCC 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 A 3 2 146593 CASAVA_Build 18 11593616 4D57M5D ATTAAAAGAC ACTGACTATCAGAGTAGATCTGAAAAAACAATCCAACTATATCTTGTTTTTAAAAATCCACTTTAT/----ACTATCAGAGTAGATCTGAAAAAACAATCCAACTATATCTTGTTTTTAAAAATCCAC----- TTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 46 30 27 8 N/A 0 0 146594 CASAVA_Build 18 11615379 1I TCTTCCCCCG -/A AAAAATGACA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 A 5 6 146595 CASAVA_Build 18 11623563 3I CAGGTCACGG ---/AGA AGATCAGGGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AGA 1 2 146596 CASAVA_Build 18 11634275 4D CCCTGTGGGC AGGG/---- AGGGAGGGGC 2362 het 2362 ref 26 13 9 6 AGGG 3 2 146597 CASAVA_Build 18 11648770 8I ATCTCTCCTT --------/CCCTCCTC CCCTCCTCCT 2528 het 2528 ref 31 11 10 10 CCCTCCTC 1 2 146598 CASAVA_Build 18 11656471 8I AAGGACTTTA --------/ATCATCTG ATCATCTGAT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 ATCATCTG 1 2 146599 CASAVA_Build 18 11663012 8D GTGATGACCA AGGTGTGC/-------- AGGTGTGCAG 3070 het 2952 hom 34 10 17 7 AGGTGTGC 3 2 146600 CASAVA_Build 18 11677336 1D ATCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1907 hom 24 7 13 4 A 11 10 146601 CASAVA_Build 18 11694781 1I CCATTATCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 T 9 10 146602 CASAVA_Build 18 11780984 8I CAAAACTATT --------/GATTGAAA CCAATACTTA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 GATTGAAA 0 1 146603 CASAVA_Build 18 11805361 2D TAATTGACTC AT/-- AGTTCTGCAG 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AT 1 0 146604 CASAVA_Build 18 11809875 3D ATGACAACAG ACA/--- ACAAGAGAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ACA 2 1 146605 CASAVA_Build 18 11812808 1D ATTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 712 het 161 hom 37 2 10 25 T 11 10 146606 CASAVA_Build 18 11814262 5D TGGCTGAGAT GGGGG/----- GGGGGTTCAA 3070 hom 76 het 27 0 25 2 G 10 5 146607 CASAVA_Build 18 11814694 3I7M1I CTCAAAAAAA ---AAACAAA-/AATAAATAAAT AAACTTTTGC 3070 hom 87 het 30 0 30 5 N/A 0 0 146608 CASAVA_Build 18 11826743 1D GAGAGACTAC T/- TTAGATTAAA 3070 hom 134 het 49 0 45 4 T 3 2 146609 CASAVA_Build 18 11835438 1I TCTTGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 A 10 11 146610 CASAVA_Build 18 11839501 8D ATTTCATCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 176 hom 32 3 21 10 A 20 12 146611 CASAVA_Build 18 11842613 2D TTGGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 14 12 146612 CASAVA_Build 18 11845043 2D CCTCAGCCCC CT/-- GAGTAGCTGG 3070 het 3070 hom 30 11 15 6 CT 1 0 146613 CASAVA_Build 18 11846762 1I CCGTCTCTAC -/T TAAAAATGCA 3070 het 1360 hom 11 3 8 2 T 1 2 146614 CASAVA_Build 18 11847133 1I CCCAGATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 11 12 146615 CASAVA_Build 18 11848260 1I GGAAATAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 9 10 146616 CASAVA_Build 18 11848746 2I GCATGAACTC --/AG GGTACCATTC 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 AG 0 1 146617 CASAVA_Build 18 11855236 1D AAGAAGGTTC G/- GGGCTCACTA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 G 4 3 146618 CASAVA_Build 18 11860649 15D TGTTTGAAAC TACTAGCATTGCAGA/--------------- TTGGCAGAAG 3070 het 3070 ref 24 15 8 2 TACTAGCATTGCAGA 1 0 146619 CASAVA_Build 18 11864602 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAGC 2214 het 1163 hom 15 6 5 4 A 9 8 146620 CASAVA_Build 18 11864651 1D TAGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2004 hom 28 8 11 9 A 11 10 146621 CASAVA_Build 18 11867630 1D CCCAAGGGCG A/- TGTTCCCGGT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 1 0 146622 CASAVA_Build 18 11867920 1D GAGCTTCTGC A/- GCTGAATAAA 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 A 1 0 146623 CASAVA_Build 18 11869102 5D CTTACAGTAT AATAA/----- AATATATATA 1429 het 218 hom 7 2 3 3 AATAA 1 0 146624 CASAVA_Build 18 11871516 1D CGTTCGTGCA G/- TGCCCTGAGC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 1 0 146625 CASAVA_Build 18 11873163 3I54M1I8M1I ATGAAGAAAG ---GATAACTTTATAGACAGTCAGTGCAACACACACATTTTATCTCATCACCGTCTT-ACTGCCTC-/GATGATAACTTTATAGACAGTCAGTGCAACACACACATTTTATCTCATCACCGTCTTAACTGCCCCT CCCATCCACT 3070 het 3070 ref 39 35 21 6 N/A 0 0 146626 CASAVA_Build 18 11873819 6I CCTCAGCCTC ------/CCAAGT AGCTGGTATT 2731 het 2731 ref 16 9 7 0 CCAAGT 0 1 146627 CASAVA_Build 18 11877354 2I CTTCCATGCA --/GG GGGCTAAGAA 3070 het 3070 hom 59 22 28 9 G 3 5 146628 CASAVA_Build 18 11894171 1D4M12D GTAGAAAAGG AGAGAAGAGCAGAAGGG/-GTTA------------ GATGGGGGAG 3070 het 3070 ref 26 19 8 2 N/A 0 0 146629 CASAVA_Build 18 11894311 1I ATCTTTTTTA -/T TTTATTTATT 478 het 478 ref 27 17 4 6 T 3 4 146630 CASAVA_Build 18 11897526 1D TTTTATAGAG T/- TTTGACTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 4 3 146631 CASAVA_Build 18 11899288 2D TAAGTGCTCT CA/-- CATCCGTTCA 3070 het 2471 hom 22 6 13 4 CA 2 1 146632 CASAVA_Build 18 11901004 1I GGCCTCTCAA -/G GGTGGAAAAG 3070 hom 114 het 41 0 36 5 G 2 3 146633 CASAVA_Build 18 11901304 1D CAGATCACAA T/- GTCAGGAGTT 3070 het 844 hom 18 3 12 3 T 1 0 146634 CASAVA_Build 18 11901517 2I GATTCTGTCT --/AA AAAAAAAAAA 2079 het 2079 ref 23 6 10 7 A 14 16 146635 CASAVA_Build 18 11902793 1I CATTAACCAA -/T TTTTTTTTTT 1996 het 1996 ref 27 16 7 4 T 13 14 146636 CASAVA_Build 18 11903763 4D GGCCTGGCTC CTCA/---- CCCACCCGTC 3070 hom 62 het 26 0 18 8 CTCA 1 0 146637 CASAVA_Build 18 11906803 1I AAAATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 10 11 146638 CASAVA_Build 18 11910422 1I AGATGAATCG -/T TGAGATCACA 3070 het 3070 ref 42 31 7 4 T 1 2 146639 CASAVA_Build 18 11917814 1I CAGGGACAAC -/A GACCAAATAT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 0 1 146640 CASAVA_Build 18 11927253 2I GAAAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1416 hom 30 8 10 13 A 10 12 146641 CASAVA_Build 18 11927764 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2393 het 1622 hom 14 5 6 3 A 15 14 146642 CASAVA_Build 18 11930456 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 18 7 T 14 12 146643 CASAVA_Build 18 11930810 1D GTGTTGGGGA G/- GGGGGGTGCT 3070 hom 47 het 19 0 15 4 G 7 6 146644 CASAVA_Build 18 11943175 3I ACTGATGTCA ---/TAC TGGGTATGAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TAC 0 1 146645 CASAVA_Build 18 11953372 4D TCCTTCCAGG TTAC/---- TTACTTTCTT 3070 het 3070 ref 46 23 15 9 TTAC 2 1 146646 CASAVA_Build 18 11965911 1I ATCTAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 A 9 10 146647 CASAVA_Build 18 11969282 2D AGAAAGTTAA CT/-- CTTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 CT 2 1 146648 CASAVA_Build 18 11976969 5D CGTTAAAGAA TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 42 23 13 8 TGTTT 3 2 146649 CASAVA_Build 18 11978001 6D GTTTATTGGC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2102 het 13 hom 15 1 8 7 T 22 16 146650 CASAVA_Build 18 11980358 1I GTCTTTAGAA -/G AAAAAGCAGG 3070 hom 65 het 24 0 18 6 G 0 1 146651 CASAVA_Build 18 11980731 1D GAGCTGGAGA G/- GGATTAGGAA 3070 hom 119 het 45 0 35 10 G 3 2 146652 CASAVA_Build 18 11983075 6D TGTTCTCACA ACTGAT/------ ACTGGTGAGG 3070 hom 108 het 37 0 37 5 ACTGAT 1 0 146653 CASAVA_Build 18 11987484 1I CATATATCTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 8 9 146654 CASAVA_Build 18 11993650 1D19M5D ACTCCATCTT AAAAAAAAAAAAAAGAAAAGGAAAA/-AAAAAAAAAAAAAGAAAAG----- AAAAAAAAAA 2865 hom 45 het 18 0 15 8 N/A 0 0 146655 CASAVA_Build 18 11995488 1D TGTCTCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1274 hom 27 3 11 13 A 14 13 146656 CASAVA_Build 18 12009875 1D TCAAAAAAAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 7 6 146657 CASAVA_Build 18 12011463 1I CCAGCTTGTG -/C CCACAGGCAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 2 3 146658 CASAVA_Build 18 12014389 2D AGGCTGAGAC AA/-- GAGAACTGCG 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 A 2 0 146659 CASAVA_Build 18 12023238 1D CTTGCCCTCA T/- TTTTTTTTCC 1129 het 1129 ref 38 29 3 6 T 9 8 146660 CASAVA_Build 18 12029500 4I CAAGAGGGTG ----/TTTT TTGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 2 6 146661 CASAVA_Build 18 12030658 2D TACTAGCTAT GA/-- GAGAGACCTT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 GA 4 3 146662 CASAVA_Build 18 12034339 2D ATTGACCAAG AA/-- AGTCTCATCT 3070 het 3070 hom 52 17 26 9 A 3 1 146663 CASAVA_Build 18 12045684 1D ATAAAGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 11 10 146664 CASAVA_Build 18 12051120 1I CACTATCAGC -/T GTTGCACTGC 1175 het 1175 ref 14 7 4 3 T 0 1 146665 CASAVA_Build 18 12052118 12I AGCTTCGGGT ------------/GCTGTACCATGG GCCTCAGTGG 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 GCTGTACCATGG 0 1 146666 CASAVA_Build 18 12052909 29I TCACTCACTG -----------------------------/GGTGTCCCAGGAGCCCAGATTCCTCACCA GGTGTCCTGG 3070 hom 104 het 38 0 32 6 GGTGTCCCAGGAGCCCAGATTCCTCACCA 0 1 146667 CASAVA_Build 18 12053450 2I AGTAGGACTC --/AG GGGATTTATT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 AG 0 1 146668 CASAVA_Build 18 12072400 2I TTTTCTTTTT --/TC TCTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TC 3 4 146669 CASAVA_Build 18 12079513 1D CATTGACCCC T/- GTTCCTGACC 3070 het 2832 hom 27 9 11 8 T 1 0 146670 CASAVA_Build 18 12081085 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 153 hom 44 1 35 8 A 9 8 146671 CASAVA_Build 18 12081773 1I CCGTACCCCC -/T GTCTTCCTTC 3070 het 1279 hom 26 8 13 5 T 0 1 146672 CASAVA_Build 18 12089426 1D AGTTATACTG T/- CCTCACTTCA 3070 het 3070 hom 49 21 23 6 T 1 0 146673 CASAVA_Build 18 12095714 2D AGAAATAGGC TG/-- TTTCTCAATT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 TG 1 0 146674 CASAVA_Build 18 12097131 5D CAATAAAAAT TATAA/----- TATAATTATA 3070 het 1622 hom 21 5 14 2 TATAA 2 1 146675 CASAVA_Build 18 12098723 4D AAATCAAAAA TTAG/---- TTAGTTAGTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 9 TTAG 3 2 146676 CASAVA_Build 18 12101058 4I TGAGACCATC ----/CTGA CTAACATGAT 2414 het 2414 ref 17 8 6 3 CTGA 0 1 146677 CASAVA_Build 18 12113031 1I AATTAACCAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1710 hom 19 6 8 5 T 8 9 146678 CASAVA_Build 18 12114717 1I TATCTTCTTT -/G GAGTTTTGAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 G 1 2 146679 CASAVA_Build 18 12120202 1I AAACAAAGGT -/A AAAAAAATAA 1422 het 1422 ref 21 14 3 4 A 7 8 146680 CASAVA_Build 18 12145200 1I GAAATGTAAC -/T TTATTTTCCC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 3 146681 CASAVA_Build 18 12148535 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTTGA 2869 het 2869 ref 17 7 7 3 T 8 9 146682 CASAVA_Build 18 12151479 4I AATGCATAAT ----/AGTC AGCATGGAGA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 AGTC 0 1 146683 CASAVA_Build 18 12155480 5I TTAAAACCCA -----/TTATT TTAAACTGAT 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 TTATT 0 1 146684 CASAVA_Build 18 12160958 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTTTT 1683 het 397 hom 8 3 5 0 T 15 16 146685 CASAVA_Build 18 12185808 1I ATGACGTGTG -/A GAGCCTGTTG 3070 het 3070 ref 55 34 16 5 A 0 1 146686 CASAVA_Build 18 12186306 1D GTAGCCACTG C/- ATGGAATCAG 3070 het 2763 hom 23 7 13 3 C 1 0 146687 CASAVA_Build 18 12187495 2I TACAATAGAC --/TG TTTTGCCTGG 2323 het 2323 ref 22 14 5 3 TG 0 1 146688 CASAVA_Build 18 12188679 1I GGTAGTGGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 11 10 T 9 10 146689 CASAVA_Build 18 12190759 3D AGTTTGATTC TAG/--- TAGTACACTG 3070 het 3070 hom 42 19 20 5 TAG 2 1 146690 CASAVA_Build 18 12191718 1D CTTCAAAAAA T/- AAAAATAAAA 1256 het 1256 ref 29 19 5 5 T 1 0 146691 CASAVA_Build 18 12198515 1D CTCTATGGGC T/- TATGAGGGTG 1834 het 1834 ref 41 34 4 4 T 2 1 146692 CASAVA_Build 18 12199701 4I TTTTTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 2700 hom 21 het 20 0 8 12 TTTG 3 4 146693 CASAVA_Build 18 12200220 2D GGCATTCAGT AA/-- GAGTTTGGAC 2543 het 2543 ref 55 41 6 9 A 2 0 146694 CASAVA_Build 18 12202029 1D CGATTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 12 11 146695 CASAVA_Build 18 12203238 3I AGGCAAACAA ---/TTT TTTTTTTTTG 2973 het 2973 ref 26 11 9 6 T 9 12 146696 CASAVA_Build 18 12205317 38I GCTGCATTTG --------------------------------------/TAGGTATTTCTGTAGGTATTTTGTAGGCTGCATTTGTA GTGACATTTC 2659 het 2659 ref 36 16 10 10 TAGGTATTTCTGTAGGTATTTTGTAGGCTGCATTTGTA 0 1 146697 CASAVA_Build 18 12206337 3D ACAGAGTCTT CTC/--- TTTCTCCTTC 2746 het 2746 ref 54 37 7 11 CTC 1 0 146698 CASAVA_Build 18 12207676 1D ACATTAGAAA T/- TTTTTTTCCA 2232 het 2232 ref 28 19 6 3 T 8 7 146699 CASAVA_Build 18 12208031 1D ACGATTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 T 12 11 146700 CASAVA_Build 18 12209066 1I CCACATAAAA -/T TTTTTTAAAG 1881 het 1881 ref 36 26 4 6 T 6 7 146701 CASAVA_Build 18 12210149 1D CCCCTCAGTC T/- GTCTGTCCTC 3070 het 3070 ref 58 43 9 6 T 1 0 146702 CASAVA_Build 18 12215011 3I TGAGTTTTTT ---/TTC TTAAGGTCTG 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 TTC 0 1 146703 CASAVA_Build 18 12215423 1I CAATGTTTTT -/G GGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 G 2 3 146704 CASAVA_Build 18 12216570 1I CATAGAGACA -/G GGTTTCACTA 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 G 2 3 146705 CASAVA_Build 18 12223046 2I AAAAAAAAAA --/AC ACAAAAAAAC 2570 het 2105 hom 21 10 7 4 AC 1 2 146706 CASAVA_Build 18 12224647 1I TCAGTGACAA -/C CCCCAACCAG 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 C 4 5 146707 CASAVA_Build 18 12225092 1I GCAGAATTGT -/G GGGGGGCTGG 3070 het 3070 hom 44 20 16 8 G 6 7 146708 CASAVA_Build 18 12235595 1D AGATTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2869 het 512 hom 18 2 11 5 A 12 11 146709 CASAVA_Build 18 12237785 3D AGTTAAGATG TTA/--- TTAAAACCTT 3070 het 3070 hom 41 16 23 3 TTA 2 1 146710 CASAVA_Build 18 12238780 14D GTCTACACTG AGTTTCCTCACACA/-------------- AGTTTCCTCA 3070 het 3070 ref 51 27 16 17 AGTTTCCTCACACA 2 1 146711 CASAVA_Build 18 12239281 1I TGTGAAAATT -/C CACCTTAGTT 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 C 1 2 146712 CASAVA_Build 18 12240030 1I CATTACTGGG -/T ATATACCCAA 1399 het 1399 ref 10 6 3 1 T 0 1 146713 CASAVA_Build 18 12241279 1D TTCCTCCACC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 45 20 17 9 A 9 8 146714 CASAVA_Build 18 12241980 5D5M11D TATGCTGGAA GGCTGGGCATGACTCGCACTG/-----GGCAT----------- TTGTCTTCTC 3070 het 3070 hom 49 25 23 6 N/A 0 0 146715 CASAVA_Build 18 12244199 1I GCGGGAGCCA -/G GGACGACCGG 1905 hom 27 het 11 0 9 2 G 2 3 146716 CASAVA_Build 18 12250375 1I GTAAAGATGA -/G GGGTCTCACT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 3 4 146717 CASAVA_Build 18 12254550 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 30 2 19 9 T 13 12 146718 CASAVA_Build 18 12265831 1I GAGAGCTTCC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 9 146719 CASAVA_Build 18 12267676 1I TCAGAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 933 hom 24 3 12 9 A 15 16 146720 CASAVA_Build 18 12271085 1I TCAACATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 11 12 146721 CASAVA_Build 18 12279411 1D TTTTGTTTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3027 hom 32 12 17 3 G 2 1 146722 CASAVA_Build 18 12285214 1D GTTTTTTGCG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 T 9 8 146723 CASAVA_Build 18 12293317 1I ATTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 10 11 1 A 9 10 146724 CASAVA_Build 18 12294088 5D ATAAATAAAT AAATA/----- AATATGAAAC 3070 het 3070 hom 26 8 15 5 AAATA 1 0 146725 CASAVA_Build 18 12297079 1I CCCAAGGGTT -/A AAAAAAAAAA 2002 het 960 hom 14 3 6 5 A 11 12 146726 CASAVA_Build 18 12303151 3I CTGGTGAAAC ---/ATT AGAAGCATTT 3070 hom 138 het 49 0 46 3 ATT 0 1 146727 CASAVA_Build 18 12304963 2D TAAACTTTGC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 11 9 146728 CASAVA_Build 18 12307471 5D TGTCTCAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 AAAAG 2 1 146729 CASAVA_Build 18 12310273 4I TAATATTCAC ----/TTGA TTATCATAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTGA 0 1 146730 CASAVA_Build 18 12321808 42D AAATAAATAA ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------------ ATATATATAT 2039 het 77 hom 7 1 5 4 AT 26 5 146731 CASAVA_Build 18 12322681 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTGT 3070 het 2931 hom 17 7 9 1 A 1 0 146732 CASAVA_Build 18 12324061 1D TACACAGGTG T/- TGGGTGAATG 3070 het 3070 hom 43 14 26 4 T 2 1 146733 CASAVA_Build 18 12330596 1D CCTTAGAGTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 8 7 146734 CASAVA_Build 18 12333006 1D CAATTTCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 235 hom 31 5 11 16 A 12 11 146735 CASAVA_Build 18 12339248 3D TGGCTGTAAT AAA/--- AAGACAGTGA 3070 het 3070 hom 41 19 21 2 A 5 2 146736 CASAVA_Build 18 12345208 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 19 2 13 4 A 15 14 146737 CASAVA_Build 18 12348020 3I AAATCAAGGA ---/AAT AATGATTATC 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 AAT 1 2 146738 CASAVA_Build 18 12368090 1D GACAGGAGAC A/- AAACCAGGTG 3070 het 3070 ref 39 16 14 11 A 4 3 146739 CASAVA_Build 18 12373498 4D AATGGAGGAC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TG 11 9 146740 CASAVA_Build 18 12378575 4D CCTTGGAAAC AAAG/---- AAATCAGACA 3070 het 3070 ref 43 20 18 7 AAAG 1 0 146741 CASAVA_Build 18 12381172 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 13 12 146742 CASAVA_Build 18 12381390 1I CACCGTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 10 11 146743 CASAVA_Build 18 12383085 1D TTTAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 18 7 T 15 14 146744 CASAVA_Build 18 12415130 1I ACTCCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2999 hom 23 9 8 6 A 11 12 146745 CASAVA_Build 18 12420352 2D GCGTGGTATG TA/-- TATATGTGTG 618 het 618 ref 61 33 8 21 TA 3 2 146746 CASAVA_Build 18 12420366 4D TATGTGTGTG TGGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 62 35 22 7 TGGT 1 0 146747 CASAVA_Build 18 12420428 9D GTTGCATGTT TGTGTGCTG/--------- TGTGTGCTGT 3070 het 3070 ref 61 23 28 16 TGTGTGCTG 2 1 146748 CASAVA_Build 18 12420502 1D TGTGTATGCT G/- GTGTGTGATG 3070 het 3070 hom 69 31 30 11 G 2 1 146749 CASAVA_Build 18 12420678 4I ATGATGTGTA ----/TGTG TGTGATTGGT 3070 het 3070 hom 91 35 36 20 TG 2 4 146750 CASAVA_Build 18 12421087 2D GGTTTATGTC TT/-- GAGTGTGGTG 3070 hom 163 het 61 0 53 10 T 2 0 146751 CASAVA_Build 18 12429332 3I AGTATCAGTC ---/CCT ATTTCACACT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 CCT 0 1 146752 CASAVA_Build 18 12430617 4D CAAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 1930 het 1930 ref 19 11 5 4 AAAC 5 4 146753 CASAVA_Build 18 12436733 1D AAACAGCAAT A/- AACTTTTGTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 3 2 146754 CASAVA_Build 18 12437283 1I AGAAGTAAAA -/G CTGAACAAGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 0 1 146755 CASAVA_Build 18 12437423 1I GAAGTGTGGA -/G GGGGGGTGGT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 G 6 7 146756 CASAVA_Build 18 12439985 1D AGTAAATTTG T/- TGTCAAAACA 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 T 2 1 146757 CASAVA_Build 18 12447699 1D AATTGTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 35 1 27 8 T 12 11 146758 CASAVA_Build 18 12454265 4I45M3I CAATTGTGGA ----TAGTCAGTACCTACTGTTTTTGATATAATCTGTGTAAATAATAAA---/TAACTAGTCAGTACCTACTGTTTTTGATATAATCTGTGTAAATAATAAAACC ACTACTTAAA 3070 hom 123 het 35 0 42 4 N/A 0 0 146759 CASAVA_Build 18 12469159 1D CATATATGTA T/- TTTTTTTTTC 2890 het 257 hom 23 3 17 3 T 10 9 146760 CASAVA_Build 18 12473399 1D GGCATTTCTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 9 8 146761 CASAVA_Build 18 12485950 2D TCTAGAGATG AC/-- ACCCTAGAGT 3070 het 2894 hom 23 7 13 3 AC 2 1 146762 CASAVA_Build 18 12489718 3I AAATCACAAG ---/CAA CAACAGAAGG 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 CAA 1 2 146763 CASAVA_Build 18 12493118 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 831 hom 22 4 15 4 A 13 12 146764 CASAVA_Build 18 12495561 1I CAAAAAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 het 1499 hom 25 11 11 3 C 0 1 146765 CASAVA_Build 18 12516717 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 14 9 T 10 9 146766 CASAVA_Build 18 12531855 1D TAGCCACATC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 8 146767 CASAVA_Build 18 12551864 1I ATATCAGTTC -/A GGTTAAATTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 0 1 146768 CASAVA_Build 18 12553099 1I CAGTTGAATG -/A AATGTTTAAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 2 3 146769 CASAVA_Build 18 12553338 1I TTTAAGAGAT -/G GGGGGTCTCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 5 6 146770 CASAVA_Build 18 12559340 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 572 hom 35 4 14 18 A 17 16 146771 CASAVA_Build 18 12559636 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAA 1270 het 341 hom 38 2 4 33 A 12 10 146772 CASAVA_Build 18 12571468 1D ATGAAAATTT A/- AAAAGTAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 4 146773 CASAVA_Build 18 12578716 1I AATTGTCCTT -/A ACGGGCAAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 2 146774 CASAVA_Build 18 12579188 1I CTGCACCCAA -/T TTTCAGAGAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 3 4 146775 CASAVA_Build 18 12580056 1D GCAGTAACTG A/- AAAAGCCATC 3070 hom 54 het 24 0 19 7 A 5 4 146776 CASAVA_Build 18 12580618 1I TCCACCTTAC -/A AACCCCTGAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 2 3 146777 CASAVA_Build 18 12590865 1I AAGGACCACA -/G GTGTACGCAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 1 2 146778 CASAVA_Build 18 12595289 1D AGGCCGAGGT G/- GGCGGACCAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 3 2 146779 CASAVA_Build 18 12596361 1I AAGACAGAAG -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 6 7 146780 CASAVA_Build 18 12601835 2I GCTACTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 11 13 146781 CASAVA_Build 18 12613116 3I TTTTTACATT ---/CTC CTTTTACCCT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 CTC 0 1 146782 CASAVA_Build 18 12613159 1D CAAATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 28 0 13 15 T 12 11 146783 CASAVA_Build 18 12621486 1D CGAGGCATGA G/- GACTGCTTGA 685 het 685 ref 15 10 2 3 G 2 1 146784 CASAVA_Build 18 12622045 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 26 2 15 9 A 12 11 146785 CASAVA_Build 18 12624935 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 21 0 14 7 A 15 14 146786 CASAVA_Build 18 12626517 1I GAGTTGGTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 420 hom 31 1 28 2 A 9 10 146787 CASAVA_Build 18 12629264 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 28 1 21 6 A 11 10 146788 CASAVA_Build 18 12635105 1I AGAATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 A 11 12 146789 CASAVA_Build 18 12641368 1I AGAGCAGACC -/A AAAAAAAATG 3070 het 385 hom 36 1 31 4 A 8 9 146790 CASAVA_Build 18 12715773 4D TAATTTCAGA CTCT/---- CTATTAGCTT 3070 het 3070 ref 30 18 11 3 CT 3 1 146791 CASAVA_Build 18 12722924 1I AAATACAAAG -/T TTAACTGGGC 3070 hom 56 het 22 0 15 7 T 2 3 146792 CASAVA_Build 18 12727260 1I TTTGCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 11 12 146793 CASAVA_Build 18 12736957 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAACAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 6 5 146794 CASAVA_Build 18 12753975 2D CATGATGACC AT/-- ATCTACCTCT 3070 hom 66 het 26 0 22 5 AT 2 1 146795 CASAVA_Build 18 12755314 1I AGGGAGGGAC -/A GGGGCGCTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 1 146796 CASAVA_Build 18 12759284 1D CCACCGAGGT C/- CCCCAGTCAG 3070 het 3070 ref 42 21 14 9 C 5 4 146797 CASAVA_Build 18 12761755 4D AATGTCCCTT TGTC/---- TGTGGCTTGG 3070 het 3070 ref 46 25 14 9 TGTC 1 0 146798 CASAVA_Build 18 12765482 7I ACGAGTACAA -------/TTATTAT TCCTATTGTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TTATTAT 0 1 146799 CASAVA_Build 18 12770862 3D TTTATTGTGG TAT/--- TATTTGTTTT 3070 hom 70 het 32 0 23 11 TAT 2 1 146800 CASAVA_Build 18 12774515 6D AACCTAAGTC ATTTAA/------ ATTTAAAGAT 3070 hom 66 het 24 0 23 3 ATTTAA 2 1 146801 CASAVA_Build 18 12794433 1D TAAAGTGACC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 120 het 42 0 40 3 A 8 7 146802 CASAVA_Build 18 12795642 1I TCCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 2212 het 80 hom 19 1 11 7 C 0 1 146803 CASAVA_Build 18 12798317 4D AATATATAAT TAAA/---- TAGAGATTTC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 TAAA 1 0 146804 CASAVA_Build 18 12803021 1D CACAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 30 1 21 8 A 13 12 146805 CASAVA_Build 18 12807107 1I GAAGCAATTT -/A AAAAAAAAAA 1614 het 1614 ref 21 10 6 5 A 11 12 146806 CASAVA_Build 18 12824326 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 734 hom 18 2 12 4 A 15 16 146807 CASAVA_Build 18 12828767 1D TATTTAGAAC T/- GACTACAAAT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 1 0 146808 CASAVA_Build 18 12837048 1I TTGTCAGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1157 hom 32 3 19 10 A 13 14 146809 CASAVA_Build 18 12839562 4I CTGTCTCAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AAAT 3 4 146810 CASAVA_Build 18 12848552 2I AATTAAAAAT --/TG TGTTTATAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TG 1 2 146811 CASAVA_Build 18 12850799 1I GACATTCTGT -/A AAGGCTATGT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 2 3 146812 CASAVA_Build 18 12852128 1I GCATATTAGC -/T GTTTATTCCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 0 1 146813 CASAVA_Build 18 12852595 1D CCACTGGGTT G/- GGGCTGCAGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 4 3 146814 CASAVA_Build 18 12852915 4I ATCAGGTCTG ----/TAAC TAATATACGC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TAAC 0 1 146815 CASAVA_Build 18 12854976 2D AGGGACTCTC AA/-- AAGTCTCAGG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 4 2 146816 CASAVA_Build 18 12884955 2D2M15D GAGATTTGAG TCCATTTGAGATTTGAGAT/--CA--------------- GGAGTCTTAC 3070 hom 39 het 16 0 13 4 N/A 0 0 146817 CASAVA_Build 18 12887837 2D CCTGGGTGAC AG/-- AGTGAGTCTC 2270 het 2270 ref 14 9 5 0 AG 2 1 146818 CASAVA_Build 18 12887996 10D AGAAAAAGTA AGTCAGTCTC/---------- AGTGTGAACA 3070 hom 30 het 13 0 10 6 AGTCAGTCTC 1 0 146819 CASAVA_Build 18 12905805 5I TTATTTTTTA -----/TTATT TTATTTCTTT 3070 hom 21 het 10 0 8 4 TTATT 1 2 146820 CASAVA_Build 18 12942192 1D GTTTTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2959 het 2959 ref 30 13 11 6 A 12 11 146821 CASAVA_Build 18 12945440 1D TGTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 12 11 146822 CASAVA_Build 18 12947428 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2226 het 2226 ref 32 22 6 5 A 13 12 146823 CASAVA_Build 18 12953147 1D ATTGTTATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 10 9 146824 CASAVA_Build 18 12959211 10D TCTGTACCCG CCCCCCCCCC/---------- CCCCCCCACC 3070 hom 36 het 13 0 12 2 C 17 7 146825 CASAVA_Build 18 12962900 1D ACATAAGCCC A/- AAAACGTAAA 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 A 5 4 146826 CASAVA_Build 18 12976803 1I TTTTCTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 10 11 146827 CASAVA_Build 18 12979152 3I TTTTGAGTAT ---/TGG TGGCTGAGGC 3070 het 3070 ref 47 26 13 8 TGG 1 2 146828 CASAVA_Build 18 12981920 2I GTTAACTTAA --/TG CTTAATGCCC 3070 het 3070 hom 62 26 29 7 TG 0 1 146829 CASAVA_Build 18 12998246 2I TTTGGTAGAC --/TG TGTATCACTG 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 TG 1 2 146830 CASAVA_Build 18 13039949 1I AGGAACTGGG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 7 8 146831 CASAVA_Build 18 13050929 1D TCTTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 A 12 11 146832 CASAVA_Build 18 13075383 1D TGCTGTGCAG A/- AGCTCTTTAG 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 2 1 146833 CASAVA_Build 18 13081471 1I AGATCACCTG -/T GAGTATAATG 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 T 0 1 146834 CASAVA_Build 18 13094330 4D TATGGCAGTA GTCT/---- CCACCAGGGT 3070 het 3070 hom 44 20 22 3 GTCT 1 0 146835 CASAVA_Build 18 13108293 4D TATTGTAAAG TCTC/---- TCATTTTAGC 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 TC 3 1 146836 CASAVA_Build 18 13112580 1D AATCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 11 10 146837 CASAVA_Build 18 13123333 2D CAGGATTCAC AT/-- GTGTCATCTT 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 AT 1 0 146838 CASAVA_Build 18 13137672 1D TGTGTTTTTA T/- TGTCATTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 T 2 1 146839 CASAVA_Build 18 13138982 2I TCTAGTCTAG --/CA CATTGATGGG 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 CA 1 2 146840 CASAVA_Build 18 13146272 1I CATTTTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2533 hom 24 7 13 4 T 10 11 146841 CASAVA_Build 18 13151433 3I GGGTGCCAGA ---/GCT GGTTAGCGGC 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 GCT 0 1 146842 CASAVA_Build 18 13168279 3D TTTCCAGGTT GAG/--- ATTATCTGTT 3070 hom 69 het 26 0 23 4 GAG 1 0 146843 CASAVA_Build 18 13187633 1D TTAATTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 31 0 24 7 T 12 11 146844 CASAVA_Build 18 13189279 1D GGCTGACAGT C/- CCCCCCCCCG 3070 hom 42 het 19 0 15 4 C 10 9 146845 CASAVA_Build 18 13192493 1D CCCTCATTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 59 23 25 11 T 9 8 146846 CASAVA_Build 18 13195601 1D TGATTTTTTC A/- GCTTACTCTA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 1 0 146847 CASAVA_Build 18 13201509 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 27 1 16 10 A 15 14 146848 CASAVA_Build 18 13201848 1D AAATGTGGTG T/- TATAATATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 2 1 146849 CASAVA_Build 18 13224427 30D CTTCTTGTCC CTGTCCTGGCCCAGCATCGGGCTGCCAGGA/------------------------------ CTGTTTGTTG 3070 het 3070 ref 25 15 12 3 CTGTCCTGGCCCAGCATCGGGCTGCCAGGA 1 0 146850 CASAVA_Build 18 13225251 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2897 hom 21 9 9 3 A 14 13 146851 CASAVA_Build 18 13236940 1D TCTACAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2698 hom 35 7 11 17 T 15 14 146852 CASAVA_Build 18 13265771 1I AATTAAGAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 A 8 9 146853 CASAVA_Build 18 13313936 1I GTGGTGTCAC -/A TGCCTCTAGT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 0 1 146854 CASAVA_Build 18 13347413 1D TGGATGCAGG A/- AAAAAAAAAA 2608 het 2608 ref 33 24 6 4 A 12 11 146855 CASAVA_Build 18 13376373 1D TATTATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1605 hom 20 4 11 5 T 12 11 146856 CASAVA_Build 18 13379983 1I CCAGCTCACG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 T 9 10 146857 CASAVA_Build 18 13381682 3I GAGTCAAAAG ---/AAT AAAAATAATT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 AAT 0 1 146858 CASAVA_Build 18 13401344 1I AGTTTTGCCG -/T TAAGTGCTTA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 1 2 146859 CASAVA_Build 18 13414135 9D ACTCCATCTC AAAGAAAAA/--------- AAAGAAAGAA 3070 hom 61 het 21 0 21 5 AAAGAAAAA 1 0 146860 CASAVA_Build 18 13419739 1I AGGGAAGCCT -/C CCCCTGCATG 2802 het 2802 ref 24 12 10 2 C 4 5 146861 CASAVA_Build 18 13435558 4D TCTATGTGTG TGTT/---- TGTGCATGTG 3070 hom 261 het 92 0 86 8 TGTT 1 0 146862 CASAVA_Build 18 13444751 7I4M4I CTGGTCCAGA -------AGGT----/CCTGTGGAGGTCAGA GCTGGAGGGC 3070 het 3070 ref 53 29 15 10 N/A 0 0 146863 CASAVA_Build 18 13445235 1I GTTTCCAGGC -/T TTTTTGGGGG 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 5 6 146864 CASAVA_Build 18 13451094 1D TTGCTGTCTC T/- TGAGTACCGT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 2 1 146865 CASAVA_Build 18 13460885 1D GTTAGGACGC A/- ATGCCTAGCA 3070 hom 34 het 29 0 14 15 A 2 1 146866 CASAVA_Build 18 13471716 4I GGTCCTGAGC ----/TGGG TGGGCCTGAG 3070 het 2980 hom 29 10 11 8 TGGG 1 2 146867 CASAVA_Build 18 13471867 2D AGGAAATGAC AG/-- AGCGTGAGAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 AG 2 1 146868 CASAVA_Build 18 13480611 2D TTATGAAAAC TG/-- TAAGTTATGT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 TG 1 0 146869 CASAVA_Build 18 13486752 1D GTGTGATTTC A/- AGGTTTGTGG 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 A 2 1 146870 CASAVA_Build 18 13487351 1I AATTTGTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2862 hom 18 7 8 3 T 8 9 146871 CASAVA_Build 18 13490255 1D AATAGCAGCT G/- TCTTGTGACT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 G 1 0 146872 CASAVA_Build 18 13491275 3D TAAAACTGGC AGT/--- AGCATCAAAT 3070 het 3070 hom 35 17 15 5 AGT 1 0 146873 CASAVA_Build 18 13493472 1D GGAGACTTTG A/- AAAAAATCTT 3070 hom 75 het 32 0 25 8 A 7 6 146874 CASAVA_Build 18 13496222 1I TTCCTCTTTT -/A TTTTTTTTAT 1715 het 1715 ref 23 11 6 11 A 0 1 146875 CASAVA_Build 18 13504981 4I CCACCCCCAC ----/GTCT ATTACCACTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 GTCT 0 1 146876 CASAVA_Build 18 13505504 6I CAGATGAGCA ------/AATGCT AATGCTAAAT 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 AATGCT 1 2 146877 CASAVA_Build 18 13505794 5I ACCTGAAATT -----/TTTTG TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 TTTTG 2 3 146878 CASAVA_Build 18 13507744 3D TTCTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTTTG 3070 het 2165 hom 23 9 9 5 TTG 1 0 146879 CASAVA_Build 18 13510850 1D AGACTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 42 1 25 18 A 11 10 146880 CASAVA_Build 18 13522512 1D GTCTTCCACA T/- TTTCCTAAAG 3070 hom 98 het 38 0 31 7 T 4 3 146881 CASAVA_Build 18 13545554 1D TGTTTTCATT G/- TAAAATGGGC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 G 1 0 146882 CASAVA_Build 18 13545886 4I GAAAGCAGTT ----/TTTG TGTGTGAATT 3070 hom 35 het 35 1 26 8 TTTG 0 1 146883 CASAVA_Build 18 13547304 3I CTCAAAAGAA ---/AAT AATAAGCAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AAT 1 2 146884 CASAVA_Build 18 13548914 1I GCAAGTCATC -/A GGGGGCCACC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 0 1 146885 CASAVA_Build 18 13549440 1D CCAATATGCT A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 7 6 146886 CASAVA_Build 18 13549869 2D39M1D CACAGCTGGT ACACAGCCTCTGCTTGTATCCAGACAGCACTTTGCTGCCCCT/--ACAGCCTCTGCTTGTATCCAGACAGCACTTTGCTGCCCC- GACCAAGAAG 3070 hom 137 het 31 0 42 7 N/A 0 0 146887 CASAVA_Build 18 13551064 1I TGGCTTATGA -/T TGTGTCACTT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 1 2 146888 CASAVA_Build 18 13551148 1I ATATTCAGGG -/C CCCACACTGG 3070 hom 91 het 39 0 33 6 C 3 4 146889 CASAVA_Build 18 13554405 1I CTGAAGCCAT -/C CCCCAGCGCT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 C 4 5 146890 CASAVA_Build 18 13554700 1I TGCGCTGCCG -/C CCCCCCTTCC 1939 hom 32 het 16 0 9 7 C 6 7 146891 CASAVA_Build 18 13559290 5I GGCTCAGACT -----/CAGAA CTGAACTATT 2478 het 2478 ref 19 11 6 2 CAGAA 0 1 146892 CASAVA_Build 18 13567079 1I CGGTTTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1905 hom 46 6 34 6 T 10 11 146893 CASAVA_Build 18 13578933 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2318 het 653 hom 24 7 10 7 T 13 12 146894 CASAVA_Build 18 13593072 3I TTTAAGTTTT ---/TAA TAAAGTACCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TAA 1 2 146895 CASAVA_Build 18 13598158 1D CAAACATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 19 0 11 8 A 13 12 146896 CASAVA_Build 18 13599028 1D GTGACTGCAC A/- AAACTCATAT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 4 3 146897 CASAVA_Build 18 13605939 1I GTGTTAGGCG -/T TGTAGCATCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 2 146898 CASAVA_Build 18 13607805 1I TATTTTTGCC -/T ATCAGATTGT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 0 1 146899 CASAVA_Build 18 13627974 1D AAGAGCTACC T/- GTTTGCTGAA 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 T 1 0 146900 CASAVA_Build 18 13634993 1D TCCTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 11 10 146901 CASAVA_Build 18 13645278 22D CCTAGAGCAA GCCACTCCACGCAGGCCCGGGG/---------------------- GCCACTCCAC 2283 het 1774 hom 24 10 10 7 GCCACTCCACGCAGGCCCGGGG 1 0 146902 CASAVA_Build 18 13654099 3D AATATGCTAG CAA/--- CAACATTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 CAA 2 1 146903 CASAVA_Build 18 13661977 1D ACTCCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 12 11 146904 CASAVA_Build 18 13687235 12D TAAAACTCAA CAATAAGAAAAC/------------ AACCCATTTA 3070 het 3070 ref 39 20 21 7 CAATAAGAAAAC 1 0 146905 CASAVA_Build 18 13688813 1I AGGCATACCG -/C CCCAGACCCC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 C 3 4 146906 CASAVA_Build 18 13696352 1D AAATGAAAAT G/- GGGGGGGGTC 1144 het 1144 ref 23 9 4 11 G 9 8 146907 CASAVA_Build 18 13708526 1I ATTAAAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 A 10 11 146908 CASAVA_Build 18 13715497 3D GCCTACTGAC AAG/--- AAGGAAGGCT 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 AAG 2 1 146909 CASAVA_Build 18 13737219 1D TTTTTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2581 hom 37 10 18 9 T 13 12 146910 CASAVA_Build 18 13763588 1D GTATGGCTAT A/- AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 41 14 22 6 A 7 6 146911 CASAVA_Build 18 13775284 1I TAACAGGAGT -/C TGCAAACTAC 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 C 0 1 146912 CASAVA_Build 18 13782608 4I TGGCATTGTC ----/GACA AGTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 GACA 0 1 146913 CASAVA_Build 18 13795607 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 8 7 146914 CASAVA_Build 18 13797235 2D GTGGAATGAA AT/-- ATATGTCTTA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 AT 3 2 146915 CASAVA_Build 18 13813671 3D CCTACCCAAT CAA/--- CGAACCCCCC 3070 het 3070 hom 40 13 16 14 CAA 1 0 146916 CASAVA_Build 18 13814807 1D TAAATTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 11 10 146917 CASAVA_Build 18 13818076 4D GGCTTGTGTG GTCC/---- TTCTCTGAAG 3070 het 3070 ref 41 26 13 3 GTCC 1 0 146918 CASAVA_Build 18 13820645 1D TCTATCATTG T/- TTAAGGTCAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 3 2 146919 CASAVA_Build 18 13829305 1I TCTGGCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1925 hom 31 5 12 14 A 13 14 146920 CASAVA_Build 18 13834348 1I CACATCTGTC -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 6 7 146921 CASAVA_Build 18 13835411 2D GGACAAAAAC TT/-- TGCAAATTTG 3070 het 3070 ref 45 22 19 8 T 3 1 146922 CASAVA_Build 18 13838531 1D AGGCACCCCC G/- CCTTATATGG 3070 het 2964 hom 36 11 19 6 G 1 0 146923 CASAVA_Build 18 13839470 2D ATACACTCAT GG/-- GTCTTCAAAA 3070 het 3070 hom 19 10 9 1 G 3 1 146924 CASAVA_Build 18 13840326 1D ACTGAGGTTG T/- TTTAGTCCAG 3070 het 3070 hom 22 10 12 1 T 4 3 146925 CASAVA_Build 18 13843586 1D CTGAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 11 10 146926 CASAVA_Build 18 13852095 1D TCTTGTGCTG T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 T 7 6 146927 CASAVA_Build 18 13873729 4I TCTACATTGT ----/AACA AACACACATA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 AACA 1 2 146928 CASAVA_Build 18 13883756 1I TGGATATGGA -/T TTTTTCTCAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 5 6 146929 CASAVA_Build 18 13892119 5D ACAATGTGAT ATATC/----- ATATCAAGGA 3070 het 3070 ref 42 21 14 9 ATATC 2 1 146930 CASAVA_Build 18 13893991 1D GAATTGTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 T 10 9 146931 CASAVA_Build 18 13903182 4I AAGCCCAGGC ----/TGGA TGGAGTGTTC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 TGGA 1 2 146932 CASAVA_Build 18 13917438 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1338 hom 22 4 15 4 A 11 10 146933 CASAVA_Build 18 13919425 2D GGGAACCACT CC/-- CAGCTAGTGG 3070 het 3070 ref 48 20 18 11 C 3 1 146934 CASAVA_Build 18 13926644 1I CCTTCCATGA -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 49 18 21 10 T 5 6 146935 CASAVA_Build 18 13944340 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 743 hom 36 3 21 12 T 13 12 146936 CASAVA_Build 18 13944613 2D ATTTTTCTCA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 15 15 6 T 11 9 146937 CASAVA_Build 18 13953657 5I ACCATGCTGT -----/TTTGG TTACTGTAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTTGG 0 1 146938 CASAVA_Build 18 13961082 2I CATAGAAAAC --/AT GAGGTTGTGA 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 AT 0 1 146939 CASAVA_Build 18 13963896 1I25M1I CCTTACTGTT -AAAAAATAAAACCTTTTAAAAAATA-/AAAAAAAAAAAACCTTTTAAAAAATAT TTTTATGCTG 3070 het 235 hom 32 2 31 4 N/A 0 0 146940 CASAVA_Build 18 13979898 2I TAAAGTAGTC --/TT GAGCAAGAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 2 146941 CASAVA_Build 18 13983778 1I GGGTGATGGT -/C ACTGTGGCTC 3070 het 3070 ref 56 30 19 7 C 0 1 146942 CASAVA_Build 18 14011030 4D TTCTTAGAAA TAAT/---- TAATAAAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TAAT 2 1 146943 CASAVA_Build 18 14020307 1I ATAGAGTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 44 0 32 12 T 11 12 146944 CASAVA_Build 18 14027597 1D AAAGAAGGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 10 9 146945 CASAVA_Build 18 14037041 1D TCTTTTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 293 hom 37 1 28 8 T 12 11 146946 CASAVA_Build 18 14071353 2I CATTATAAAC --/TA TGTGCATATT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 TA 0 1 146947 CASAVA_Build 18 14075093 1D ATAAAAAAAA G/- AAACAGCTAA 3070 hom 89 het 36 0 28 9 G 1 0 146948 CASAVA_Build 18 14079554 5I TGGAGTTGAA -----/AAAAT AAAATAATGT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 AAAAT 1 2 146949 CASAVA_Build 18 14087983 1D ATCCAGACTC A/- AGAGTCACAT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 2 1 146950 CASAVA_Build 18 14097000 1I TCTGGGCCCT -/A AAAAAACTTG 3070 hom 93 het 35 0 29 6 A 6 7 146951 CASAVA_Build 18 14114061 1D AATCCCAGCT A/- TTCGGGAGGT 1768 het 1197 hom 8 3 4 1 A 1 0 146952 CASAVA_Build 18 14117422 1D12M2D GATCAATGTG CCTCTGCATTCTTGG/-TGCTGCATTCTT-- GGGTTACAGC 1727 het 1727 ref 48 47 4 3 N/A 0 0 146953 CASAVA_Build 18 14120194 1I TCCGATGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 722 hom 28 2 17 9 A 14 15 146954 CASAVA_Build 18 14128479 1D TCACACACAC T/- CCATTTTTAT 1744 het 1744 ref 40 34 4 2 T 1 0 146955 CASAVA_Build 18 14128575 2D TAGAGCAGGT AG/-- AGAGTCTTGC 3017 het 3017 ref 45 32 7 7 AG 3 2 146956 CASAVA_Build 18 14129617 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2869 hom 21 het 10 0 7 4 A 12 11 146957 CASAVA_Build 18 14135018 2D GGAGGCAGCG TA/-- CCCCCCCCAC 735 hom 15 het 8 0 4 4 TA 1 0 146958 CASAVA_Build 18 14141506 3I CCTGTATACA ---/ATG ATGAACTTTA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 ATG 1 2 146959 CASAVA_Build 18 14144855 1I TTATGATCCA -/C CCACCTCAGC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 C 2 3 146960 CASAVA_Build 18 14145113 1I TTATTTGTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 9 10 146961 CASAVA_Build 18 14149669 1I CAACAACAAC -/A AAAAAATCAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 6 7 146962 CASAVA_Build 18 14151772 3D ACTTAAAAAA AAG/--- AAATTCTTCA 3070 hom 24 het 14 0 9 5 AAG 1 0 146963 CASAVA_Build 18 14152476 1I TTAAATAGAC -/A AGAGATAGAT 3070 het 3070 ref 46 31 9 6 A 1 2 146964 CASAVA_Build 18 14154309 3I CACAAAGATA ---/CTC CTCAAGAAGA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CTC 1 2 146965 CASAVA_Build 18 14164770 9I CCCTTCAAAG ---------/TCCAGACTC TCCTTTTGGC 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 TCCAGACTC 0 1 146966 CASAVA_Build 18 14170600 1I TGTGTTTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 9 10 146967 CASAVA_Build 18 14171219 1I AACTCTAAAA -/T TGGGCAAAGT 3070 het 3070 hom 85 27 55 3 T 1 2 146968 CASAVA_Build 18 14171658 2D24M4D AGCTAGTGAG GAAAAAAAATCAATTAAATTATACATACAC/--AAAAAAATCAATTAAGTTATACAT---- ACAAACATAC 3070 het 3070 ref 48 29 18 18 N/A 0 0 146969 CASAVA_Build 18 14171774 5I TTAAGTAAAG -----/TTCTT TTCCTTTTTC 3070 het 3070 hom 64 25 37 2 TTCTT 0 1 146970 CASAVA_Build 18 14172017 1I ATATATTTTA -/T TATGTACATA 3070 het 3070 hom 75 22 39 14 T 1 2 146971 CASAVA_Build 18 14172073 4I ATGATAGATT ----/AATC ATTTCATTTT 590 het 590 ref 56 25 4 27 AATC 0 1 146972 CASAVA_Build 18 14172150 1I TTTATAGGAG -/T TTATTTAAAA 3070 het 3070 ref 72 33 23 16 T 2 3 146973 CASAVA_Build 18 14172815 2I ATAATAATAT --/AA GTGTCATTCC 3070 het 3070 hom 69 24 32 13 A 0 2 146974 CASAVA_Build 18 14172914 1D AAATGTTTTT G/- TTAAGTAGTA 3070 het 3070 ref 64 42 15 7 G 1 0 146975 CASAVA_Build 18 14173580 2I TTCAGTTTTT --/AC AATTACATGA 3070 het 3070 ref 72 36 29 7 AC 0 1 146976 CASAVA_Build 18 14174361 1I ATGCAGGGTT -/G ATCTTTCCTT 1056 het 1056 ref 41 22 7 12 G 0 1 146977 CASAVA_Build 18 14174639 4I AGTTTTTTTT ----/TTTC TTCTCTTAGT 2104 het 2104 ref 47 25 8 15 TTTC 0 1 146978 CASAVA_Build 18 14175127 4I CTGAAGTGAT ----/TGTC TGCTGCACTA 3070 het 3070 ref 66 51 11 4 TGTC 0 1 146979 CASAVA_Build 18 14176150 2D TTGGTAAAAC AT/-- ATGATACTAG 3070 het 3070 ref 44 32 8 4 AT 2 1 146980 CASAVA_Build 18 14186889 1I GTGAATGCTA -/T TAGGTAAATA 1284 het 1284 ref 49 40 3 6 T 1 2 146981 CASAVA_Build 18 14187032 3D TGAGGTGAAA AAG/--- AATTTTTTTC 3070 het 3070 ref 57 36 17 4 AAG 1 0 146982 CASAVA_Build 18 14194305 1D ATGAAAGACC A/- GAAGGCTCTG 1715 het 1715 ref 31 25 4 2 A 1 0 146983 CASAVA_Build 18 14198250 8D AGGTACCTAT TCAATACA/-------- AATGGAATGC 1611 het 1611 ref 52 47 5 2 TCAATACA 1 0 146984 CASAVA_Build 18 14205593 1I TTGTGAAAAA -/G GGAATCTATC 3070 hom 17 het 14 0 12 2 G 2 3 146985 CASAVA_Build 18 14207180 2D AAAATCACCA CT/-- CTCCAATATT 2451 het 2451 ref 28 21 6 2 CT 2 1 146986 CASAVA_Build 18 14211214 5D GTAATCATGA TATGT/----- TATTTTATTG 3070 het 3070 ref 59 34 16 11 TATGT 1 0 146987 CASAVA_Build 18 14229663 3I ACATTTACTA ---/CTT CAACCATTTT 3070 het 3070 ref 59 45 11 3 CTT 0 1 146988 CASAVA_Build 18 14229780 3I ACCAGAACTC ---/ATT CTTCTTATCT 1842 het 1842 ref 43 37 4 2 ATT 0 1 146989 CASAVA_Build 18 14233615 1I ACCTAAACCC -/A AAGTGTCAAG 854 het 854 ref 37 31 2 6 A 2 3 146990 CASAVA_Build 18 14236372 4I CATATTTGTC ----/AATT AATTTATGGC 2875 het 2875 ref 35 21 7 7 AATT 1 2 146991 CASAVA_Build 18 14238866 1I TTGCTCTAGC -/A CCAAACTGGA 1668 het 1668 ref 47 41 4 2 A 0 1 146992 CASAVA_Build 18 14241430 7I TCATTAGGGG -------/TCTCATC CCTCATCACT 3070 het 3070 ref 43 21 13 9 TCTCATC 0 1 146993 CASAVA_Build 18 14245046 1I AGACTGGAGC -/A TTGCTATAAA 3070 het 3070 ref 49 35 12 2 A 0 1 146994 CASAVA_Build 18 14257840 5D CTTTGGAAGT AGTTA/----- ACTTGCTTTG 1099 het 1099 ref 46 29 3 18 AGTTA 1 0 146995 CASAVA_Build 18 14257869 2I TCAGAAGCTC --/AG AGGTAGAACG 2154 het 2154 ref 45 30 6 9 AG 1 2 146996 CASAVA_Build 18 14275068 1I CATGTTTGTA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 7 8 146997 CASAVA_Build 18 14276870 1I AGGCTTTGGT -/G GCTTCCACGT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 1 2 146998 CASAVA_Build 18 14301248 2D AGGAAAAGGG GT/-- GGATAGGGTG 1200 het 1200 ref 23 16 3 4 GT 1 0 146999 CASAVA_Build 18 14313438 1I TGAAAGAAGA -/G GATTGGGGGC 1839 het 1839 ref 19 8 4 7 G 1 2 147000 CASAVA_Build 18 14313738 2D GAGATGAGAC TT/-- TGAATTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 3 1 147001 CASAVA_Build 18 14318913 3I GGCCTAGGAG ---/AGA AGAATGGTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AGA 1 2 147002 CASAVA_Build 18 14323641 1I AGGAAAAGGA -/G GGGTAGTGTG 1791 het 1791 ref 41 32 7 2 G 3 4 147003 CASAVA_Build 18 14333076 1I TATTCTTCTA -/T TTTTTTTTCT 2017 het 2017 ref 16 8 6 2 T 8 9 147004 CASAVA_Build 18 14345283 1D CCAACCACTA G/- GTTAGATAGC 3070 het 3070 ref 37 23 9 6 G 2 1 147005 CASAVA_Build 18 14347879 1D AGCAACGGGG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 40 het 19 0 14 5 A 9 8 147006 CASAVA_Build 18 14348330 11I GTATTTATTA -----------/TTAGCCCACCC TGGGAAATCT 1239 het 1239 ref 34 28 3 3 TTAGCCCACCC 0 1 147007 CASAVA_Build 18 14348564 4I TTCATGTCTT ----/AGTC AGCTAAAAGT 3070 het 421 hom 32 1 27 4 AGTC 0 1 147008 CASAVA_Build 18 14358290 6I AATTTTAGGC ------/GATTTA GATTTACTTT 2702 het 2702 ref 31 16 7 8 GATTTA 1 2 147009 CASAVA_Build 18 14358564 1I TCATTTTTTT -/C TCCTGTGTAA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 C 0 1 147010 CASAVA_Build 18 14366492 22D TTTTAAAACA ATTATTTCGATTTTTTTTTTAG/---------------------- ATTCAGGGAA 2044 het 2044 ref 19 16 5 3 ATTATTTCGATTTTTTTTTTAG 1 0 147011 CASAVA_Build 18 14369575 1D AAAGAAGACC T/- TTGAAAGAGT 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 T 3 2 147012 CASAVA_Build 18 14377136 1I ATTGCAAATG -/T TTTAGCTCAG 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 3 4 147013 CASAVA_Build 18 14391795 1I CTTTAAAAAT -/A ATCTCTCCAT 3070 het 3070 ref 32 19 13 0 A 1 2 147014 CASAVA_Build 18 14396462 2D ATAGAGACGT TG/-- AGTACTCTTT 3070 het 3070 ref 72 56 11 5 TG 1 0 147015 CASAVA_Build 18 14402133 1D AAAATAAGAT A/- AACTTTTGTA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 3 2 147016 CASAVA_Build 18 14408643 2I29M1D TAGCCTCTCA --CTCTGTCATTTCCCATCTCCCCAGGAGGTA/CTCTCTGTCATTTACCGTCTCCCCAGGAGGT- AAATAGCTCA 2639 het 2639 ref 35 28 7 6 N/A 0 0 147017 CASAVA_Build 18 14416214 1I AGTTTCCATG -/T CATTGTGCAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 0 1 147018 CASAVA_Build 18 14418449 4I TCAGAGCTGT ----/CAGA CAGGGATGTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CAGA 0 1 147019 CASAVA_Build 18 14421836 1I TTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 2459 het 1135 hom 17 3 9 5 C 0 1 147020 CASAVA_Build 18 14434117 1I GAAGCAATGT -/C AAGTCCAATG 2633 hom 21 het 8 0 7 1 C 0 1 147021 CASAVA_Build 18 14434416 1D ATAGTTTAGG A/- AAAAAACGGC 2557 het 2557 ref 37 25 6 9 A 7 6 147022 CASAVA_Build 18 14446676 2I AGTTAAACAC --/AT AAAAAAGCTG 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 AT 0 1 147023 CASAVA_Build 18 14451903 1I CAAACTGCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 9 147024 CASAVA_Build 18 14458979 1D TGCATGCCCT G/- GAAGTGTCAG 1296 het 1296 ref 41 33 3 6 G 2 1 147025 CASAVA_Build 18 14462862 1I GTGATGAATA -/T TTGAACCTGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 2 3 147026 CASAVA_Build 18 14470688 6I CTCAAGAAAT ------/TGTAAG TATATTTACC 1223 het 1223 ref 42 36 3 3 TGTAAG 0 1 147027 CASAVA_Build 18 14471338 1D GAAAATGGGG A/- AAGATTGCTA 1379 het 1379 ref 35 28 3 4 A 3 2 147028 CASAVA_Build 18 14479232 5D3M17D CAGCCTCATC GCTGGTGAAACATCAAACATTGGGC/-----TGA----------------- ACATTCTGCC 119 het 119 ref 51 48 1 9 N/A 0 0 147029 CASAVA_Build 18 14480630 1I TAAGTGAATA -/T TTTGGTAACA 3070 het 3070 ref 59 36 17 6 T 3 4 147030 CASAVA_Build 18 14481332 3I TATCTCTAAG ---/TAC TACATATTTT 3070 het 3070 ref 40 21 7 12 TAC 1 2 147031 CASAVA_Build 18 14481473 4I TGAGAAATGT ----/ATAC ATATTGTATA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 ATAC 0 1 147032 CASAVA_Build 18 14482181 2I49M1I TCAAACATTC --TATCATGCCACTTCTATGAGTTACTTAGTGAAATTTGTAGAGACAGAAA-/TGTATCATGCCATTTCTATGAGTTACTTAGTGAAATCTGTAAAGACAGAAAG TAGAATGGTG 2300 het 2300 ref 45 55 5 8 N/A 0 0 147033 CASAVA_Build 18 14482620 1I AGATTTACTA -/G AAAAATTTTA 2077 het 2077 ref 28 19 5 4 G 0 1 147034 CASAVA_Build 18 14486461 2I AAATTGGGAG --/AC ACATAAAAGC 3070 het 3070 ref 38 24 8 6 AC 1 2 147035 CASAVA_Build 18 14487474 4I TCTAAAGATA ----/ATTG ATTGTCTAAT 1870 het 1870 ref 32 26 4 2 ATTG 1 2 147036 CASAVA_Build 18 14488477 1I CCATTCTGTA -/G GCTGTCTGTT 3070 het 3070 ref 56 38 11 7 G 1 2 147037 CASAVA_Build 18 14489435 3D ATTCTTTACT ATC/--- ATCATCTTCG 2910 het 2910 ref 18 12 6 2 ATC 3 2 147038 CASAVA_Build 18 14498479 3D TGCCCACACA TAC/--- TACAATAATA 1587 het 1587 ref 41 34 4 5 TAC 2 1 147039 CASAVA_Build 18 14505296 6D CCTGACTTCA AATTAT/------ ACTCTAAGGC 1317 het 1317 ref 56 49 3 5 AATTAT 1 0 147040 CASAVA_Build 18 14505948 5I AATCATCAGG -----/GAAAT GTACAATAAA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 GAAAT 0 1 147041 CASAVA_Build 18 14506663 1D CCAAACTACT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 60 het 30 0 23 8 G 9 8 147042 CASAVA_Build 18 14507563 1D TTTTTTTTTT A/- AAATAAAATA 2971 het 359 hom 13 1 9 3 A 4 3 147043 CASAVA_Build 18 14512184 4D TCATCATGAA TATT/---- AGCCCAAATT 3070 het 3070 ref 58 34 21 5 TATT 1 0 147044 CASAVA_Build 18 14517251 1D TTTCTCTTAC T/- TCTTTTTTGT 1412 het 1412 ref 24 17 3 4 T 2 1 147045 CASAVA_Build 18 14526707 1D CATCTCTCAT C/- CACATAAACA 1848 het 1848 ref 46 39 4 3 C 2 1 147046 CASAVA_Build 18 14527606 1I AAGTGCACTG -/A AAAAAACTGT 832 het 832 ref 39 23 3 13 A 6 7 147047 CASAVA_Build 18 14534800 4D TGTCAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 40 het 15 0 13 2 AG 9 7 147048 CASAVA_Build 18 14535810 4I TTTAATATAT ----/TTAA TTGTTTCCCT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTAA 0 1 147049 CASAVA_Build 18 14535902 4I AATGCCCATC ----/GGTA GGTAATACAC 3070 het 1583 hom 34 4 23 7 GGTA 1 2 147050 CASAVA_Build 18 14536154 1I GGGAGGGAGA -/G GGAGAGCATC 1133 het 1133 ref 27 17 3 7 G 2 3 147051 CASAVA_Build 18 14542110 4I AACAATAGTA ----/TATT TCTCACAGAT 3070 het 3070 ref 58 41 12 5 TATT 0 1 147052 CASAVA_Build 18 14542705 2D CTCAGATTTG CA/-- CCATAAAGTT 2822 het 2822 ref 45 34 6 6 CA 1 0 147053 CASAVA_Build 18 14542907 1I AAAAAAACCC -/A CAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 45 30 10 5 A 0 1 147054 CASAVA_Build 18 14544261 9D ATTGCAAATG CAGATGAGA/--------- AGGAGAAGAT 3070 het 3070 ref 42 37 8 7 CAGATGAGA 1 0 147055 CASAVA_Build 18 14544828 1D ATGTAGGGGG A/- AAAGATCACT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 4 3 147056 CASAVA_Build 18 14551532 1D TGATGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1073 hom 19 6 8 5 T 15 14 147057 CASAVA_Build 18 14553809 1I ACTCAACAGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 47 het 21 0 17 4 A 8 9 147058 CASAVA_Build 18 14566853 1D CTAAGCAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 10 9 147059 CASAVA_Build 18 14576607 2I TTCTGTATAT --/AC ATATATATAT 3070 het 430 hom 14 1 13 0 AC 0 1 147060 CASAVA_Build 18 14593142 2I TTTTGTACAC --/AT GTGTGTATGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AT 0 1 147061 CASAVA_Build 18 14597630 7D TATGGTACTA GAGTCTT/------- GAGTTTTGTA 3070 hom 29 het 12 0 10 3 GAGTCTT 1 0 147062 CASAVA_Build 18 14598122 1D ATCCCTGATT A/- AAGGTATTTC 2322 het 2322 ref 47 36 5 7 A 3 2 147063 CASAVA_Build 18 14598286 1I TGAAGTCTGG -/A AAAGACATGG 2748 het 2748 ref 44 31 6 7 A 3 4 147064 CASAVA_Build 18 14600602 1D GTCTAAATAA G/- GAAAGGGTTA 1226 het 1226 ref 41 31 3 8 G 2 1 147065 CASAVA_Build 18 14601445 1I GAGAGAGAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 7 8 147066 CASAVA_Build 18 14611312 3D TATCTGGGAG ATT/--- ATTAGTAAGT 3070 het 3070 ref 33 25 8 0 ATT 2 1 147067 CASAVA_Build 18 14614675 1I AATGTGAAAT -/A AAAAAAAAAT 1883 het 1883 ref 33 27 4 2 A 9 10 147068 CASAVA_Build 18 14616599 1D TTGACTCCAA T/- TTTTAACAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 5 4 147069 CASAVA_Build 18 14618034 1D GTGGTTGCCC T/- TGCAACTTTT 2378 het 2378 ref 36 29 5 2 T 2 1 147070 CASAVA_Build 18 14630300 9I CAACACCCAC ---------/ATGTACAAG AATACATGTA 1126 het 1126 ref 38 27 3 8 ATGTACAAG 0 1 147071 CASAVA_Build 18 14630742 3D GCCACCCTTT TTC/--- TTCATCTACC 3070 het 1446 hom 24 7 8 10 TTC 2 1 147072 CASAVA_Build 18 14630858 1D GAAAACTTTT C/- CCCCCTCACT 3070 hom 51 het 23 0 16 7 C 6 5 147073 CASAVA_Build 18 14630902 2D TGCTCTCATT CC/-- CCTTTTGTTC 2476 hom 15 het 18 0 6 12 C 4 2 147074 CASAVA_Build 18 14634680 1D ATAGCTATGC T/- TTTCATGATC 1767 het 1767 ref 44 35 5 5 T 4 3 147075 CASAVA_Build 18 14637456 2I TTTCAGTCTA --/TG TATGTCTTTA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 TG 0 1 147076 CASAVA_Build 18 14643437 2D ACCAATTAAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 TA 7 6 147077 CASAVA_Build 18 14654385 1I ATGGTTTGGA -/T CTTTAACTCC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 147078 CASAVA_Build 18 14654569 2D ACCTTTCCCA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 24 14 8 3 TC 6 5 147079 CASAVA_Build 18 14655494 2I TTGTTCCTGT --/GG TGGCAGCTTG 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 G 0 2 147080 CASAVA_Build 18 14657327 3I84M1D ACTGATGGGC ---TGGGTTGGTTTTACCTTTTGGCCACTGTGAATAATGCTGCTATTAAACAGGTGTACAAATACCTGTTTGAGTCTCTGCTGTCAGT/ATTTGGGTTGGTTTTACCTTTTGGCCACTGTGAATAATGTTGCTATTAAACAGGTGTACAAATACCTGTTTGAGTCTCTGCTGTCAG- TTTTTTGGGC 3070 het 3070 ref 17 20 11 6 N/A 0 0 147081 CASAVA_Build 18 14658711 1I TAATGAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 768 hom 39 2 29 8 T 11 12 147082 CASAVA_Build 18 14658982 6I CTTTTTGGGT ------/TGAATC GTTTGCTAAA 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 TGAATC 0 1 147083 CASAVA_Build 18 14660441 1I TGAGCCACAG -/C CACCCGGCCC 2551 het 2551 ref 14 7 6 1 C 1 2 147084 CASAVA_Build 18 14665119 1I TTAGTGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1439 hom 25 4 15 6 T 14 15 147085 CASAVA_Build 18 14668979 2D TTTATAGGTT AC/-- AGTGAGCTAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AC 1 0 147086 CASAVA_Build 18 14670315 4D TGCATTTTAT TAAA/---- TAAGATAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 9 2 TAAA 1 0 147087 CASAVA_Build 18 14670919 1I TTGATGGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 12 11 A 11 12 147088 CASAVA_Build 18 14675515 2I TGTGCGTGTG --/TA TATATATAAT 3044 het 3044 ref 22 8 8 6 TA 4 5 147089 CASAVA_Build 18 14675815 8D GGTATATACC AAATAATG/-------- AAATAATGGA 1972 het 1972 ref 29 19 6 5 AAATAATG 2 1 147090 CASAVA_Build 18 14680332 1D TTGTACAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1629 hom 37 5 26 6 T 11 10 147091 CASAVA_Build 18 14689148 4D TCTTAGTGAA AGTC/---- AGTAAGTAAT 2816 het 2816 ref 26 19 7 1 AGTC 1 0 147092 CASAVA_Build 18 14692724 1D TTTTGTAGGG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 9 8 147093 CASAVA_Build 18 14698231 1D TAATTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 2969 het 763 hom 21 7 8 6 T 17 16 147094 CASAVA_Build 18 14704147 1I TTGAGTTATT -/A AAAACTGATG 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 A 4 5 147095 CASAVA_Build 18 14706679 1D TAGCATATAA C/- CATACATTCA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 C 2 1 147096 CASAVA_Build 18 14714831 1D ATTTTTATAT A/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 1 0 147097 CASAVA_Build 18 14717626 1I TCCTCTTTGC -/A GAATAAAATA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 0 1 147098 CASAVA_Build 18 14719127 3D TTTAAAGTAA GTT/--- GTTAACAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 GTT 2 1 147099 CASAVA_Build 18 14720864 1D ATTTTTCTTT A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 7 6 147100 CASAVA_Build 18 14722561 2I AATGGTGCTG --/AT ATATATATAT 2769 het 2769 ref 38 25 7 6 AT 6 7 147101 CASAVA_Build 18 14722636 1D CTGTATGCCT A/- AAACCATTGG 3070 het 3070 ref 42 25 8 9 A 4 3 147102 CASAVA_Build 18 14723350 2I AAAATACAGT --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 TA 4 5 147103 CASAVA_Build 18 14723505 2D CTCCCAACTC TA/-- TAGAGTTGTT 3070 het 3070 hom 24 8 12 5 TA 2 1 147104 CASAVA_Build 18 14725936 1D GCTGAGAATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 A 9 8 147105 CASAVA_Build 18 14727596 1D TTTTAAGGAG A/- AAAAAATAAG 2011 het 2011 ref 16 9 5 3 A 7 6 147106 CASAVA_Build 18 14728012 1D TCCTTTTTTT C/- CATCTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 23 12 7 C 2 1 147107 CASAVA_Build 18 14729050 1I CTGGTGCATA -/T TTTTTTTCTG 1428 het 1428 ref 17 12 3 2 T 7 8 147108 CASAVA_Build 18 14729164 1I GCTTTAACTT -/A ACCACAGTCT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 1 2 147109 CASAVA_Build 18 14729895 5D GAAAACAATT ATGAG/----- ATAATTGTGA 3070 het 3070 ref 32 17 14 2 ATGAG 1 0 147110 CASAVA_Build 18 14731038 1I TCATATTTGA -/T TTGGTTCATA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 2 3 147111 CASAVA_Build 18 14732118 3D TTTAAATTTA TAT/--- TATTATCTGT 2304 het 2304 ref 35 28 5 4 TAT 3 2 147112 CASAVA_Build 18 14736629 2D CTTGTTAGAC TG/-- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 41 22 18 2 TG 1 0 147113 CASAVA_Build 18 14741547 1I ACCAACCAGG -/T TTTTGGAAAT 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 T 4 5 147114 CASAVA_Build 18 14741864 1D ATATACCGTA T/- TCCACTTCTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 T 2 1 147115 CASAVA_Build 18 14745017 1I ATGGTAGTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 9 10 147116 CASAVA_Build 18 14751464 1D GGTGATCAAA G/- GGGAGTCTTA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 G 4 3 147117 CASAVA_Build 18 14757710 7I GACCATTTTG -------/ATGACTA ATGGGCAGAT 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 ATGACTA 0 1 147118 CASAVA_Build 18 14762384 2D ATTTAAACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2464 hom 26 9 10 8 T 14 12 147119 CASAVA_Build 18 14763360 1I CCTATAAAAA -/G GATTTTAAGA 3070 het 3070 ref 30 19 11 0 G 1 2 147120 CASAVA_Build 18 14770776 1D CTTATTGACA T/- ACGTGTATTG 3070 het 3070 ref 45 32 10 3 T 1 0 147121 CASAVA_Build 18 14774843 1I AACTCTAACT -/C TTTTTAGTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 0 1 147122 CASAVA_Build 18 14796230 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 1719 het 1719 ref 21 9 4 8 A 10 9 147123 CASAVA_Build 18 14797296 1D GAAATGTCTG T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 7 6 147124 CASAVA_Build 18 14801115 4D TCTCAAAAAG CAAA/---- CAAACAACCA 1335 het 1335 ref 25 21 3 4 CAAA 2 1 147125 CASAVA_Build 18 14814110 1D TGGAACTTCC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 454 hom 29 2 16 11 T 9 8 147126 CASAVA_Build 18 14814192 6D TTTGCGATTT TAACTC/------ TAAAACACAT 2884 het 2884 ref 28 20 8 0 TAACTC 1 0 147127 CASAVA_Build 18 14814436 1D CACTACCCCC T/- CTGCCTCCTG 3070 het 3070 ref 32 23 8 1 T 1 0 147128 CASAVA_Build 18 14825892 3I TTGCAGAATC ---/TTG TTGTTTTAGA 1884 het 1884 ref 33 27 4 2 TTG 1 2 147129 CASAVA_Build 18 14827169 1D TTTTCTGAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 19 14 6 T 10 9 147130 CASAVA_Build 18 14836068 1D TACTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 28 1 20 7 T 15 14 147131 CASAVA_Build 18 14837188 2D TTAGGTATAA CT/-- CTTTGCTTTG 1850 het 1850 ref 31 24 4 3 CT 2 1 147132 CASAVA_Build 18 14843535 1I TAGTCCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1279 hom 27 7 10 10 T 14 15 147133 CASAVA_Build 18 14851713 1D TAAGCAGATT A/- GTTAGGCAGA 2518 het 2518 ref 54 44 7 3 A 1 0 147134 CASAVA_Build 18 14852621 2I GCCTCCACAC --/AG AGTCCCCACT 3070 het 3070 ref 56 31 20 5 AG 1 2 147135 CASAVA_Build 18 14853250 3D TCTTAAACGT TGG/--- TGGTGGGCCT 3070 het 3070 ref 46 20 15 13 TGG 3 2 147136 CASAVA_Build 18 14856976 1D GGCAGGCAGT C/- CGGGGGTGCT 2642 hom 24 het 10 0 7 3 C 2 1 147137 CASAVA_Build 18 14866164 1I ATAGATCTGG -/A AAAAAAAAAA 2535 het 2535 ref 25 10 7 8 A 11 12 147138 CASAVA_Build 18 14866942 5D AATTCAGTGC ATTCT/----- ATTCTCAAGG 3070 hom 87 het 31 0 30 2 ATTCT 2 1 147139 CASAVA_Build 18 14868379 1D AAGGCACCTA C/- CCCATTTACA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 C 4 3 147140 CASAVA_Build 18 14873020 15I TCTAGTGCCT ---------------/ACATTTCCTGTGAGC ACATTTCCTG 2224 het 2224 ref 30 14 6 10 ACATTTCCTGTGAGC 1 2 147141 CASAVA_Build 18 14880549 1D AGAAACTAAG A/- AATTTGCCCA 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 A 3 2 147142 CASAVA_Build 18 14882261 5D TATTTGCTGG CTTTT/----- CTTTTACAGA 3070 het 3070 ref 53 33 19 4 CTTTT 2 1 147143 CASAVA_Build 18 14884878 1I CAACAATAAG -/A AAAAAAACCT 3070 hom 33 het 24 1 22 1 A 7 8 147144 CASAVA_Build 18 14885119 4I TGGCAACAAC ----/TTTA TGACACTGGG 2845 het 2845 ref 25 13 9 3 TTTA 0 1 147145 CASAVA_Build 18 14896041 1D GGCTTAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1509 het 1509 ref 38 23 5 10 T 12 11 147146 CASAVA_Build 18 14897918 2D TGTAGAAAAG TT/-- TGAATTTTCC 3070 het 3070 hom 40 17 18 7 T 3 1 147147 CASAVA_Build 18 14901611 2D ATTCAGGCTC TT/-- TTTTGGTTTC 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 T 6 4 147148 CASAVA_Build 18 14906487 11D GGGAGATGCC TCCAGCTGGAA/----------- GAAGAGCAGA 3070 het 3070 hom 35 11 15 10 TCCAGCTGGAA 1 0 147149 CASAVA_Build 18 14911564 1I GTAAAAAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 58 26 24 8 A 9 10 147150 CASAVA_Build 18 14923746 4I AGAGGTGTTT ----/GAGA GACTCAGAGG 3070 het 3070 ref 48 23 13 12 GA 1 3 147151 CASAVA_Build 18 14940736 1D TTCATCTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 36 1 20 15 A 12 11 147152 CASAVA_Build 18 14951067 2D ATGCATTTCT CA/-- CAGTTATGAA 1662 het 1662 ref 60 49 4 7 CA 2 1 147153 CASAVA_Build 18 14952831 1D GGCCACGTTC T/- GGCCACAGGC 3070 hom 51 het 20 0 14 6 T 1 0 147154 CASAVA_Build 18 14953597 1I GGCTCTGAGC -/A ACCCACTGCA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 1 2 147155 CASAVA_Build 18 14962834 1I ATTTAATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 23 0 16 7 T 11 12 147156 CASAVA_Build 18 14965545 1I CGAGCAGGGA -/G GGAGCCCACC 3070 hom 63 het 22 0 20 2 G 2 3 147157 CASAVA_Build 18 14970738 1I GGTGATTCTG -/C CCCCCATCCT 685 het 685 ref 64 53 3 8 C 5 6 147158 CASAVA_Build 18 14979064 3D TCAAGAAGCC AAA/--- AAAAAAAATA 1637 het 1637 ref 24 17 4 3 A 11 8 147159 CASAVA_Build 18 14993199 1I GGGAGAAGAA -/C CAGACATGCA 2031 hom 21 het 9 0 6 3 C 1 2 147160 CASAVA_Build 18 15000517 1I GGCGGCGGGG -/A GCAAAAAGCC 1731 het 40 hom 14 1 7 6 A 0 1 147161 CASAVA_Build 18 15004375 1I AATCATTTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 12 10 A 9 10 147162 CASAVA_Build 18 15006980 1D CATTGCCAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 337 hom 29 3 22 4 A 10 9 147163 CASAVA_Build 18 15020090 4D TTAAATTTTC AATT/---- AATGTTTATA 3070 hom 24 het 12 0 9 4 AATT 1 0 147164 CASAVA_Build 18 15021154 1I TCTTTTTTTT -/G TGGGGGGGGG 2754 hom 9 het 20 0 13 7 G 0 1 147165 CASAVA_Build 18 15028414 2I ATAATAAATC --/AT ATATATATAT 3070 hom 21 het 13 0 8 5 AT 7 8 147166 CASAVA_Build 18 15031107 1D AACCATCACA G/- GCAAGGTGGG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 G 2 1 147167 CASAVA_Build 18 15044744 1D ATCTTGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 26 1 17 8 T 11 10 147168 CASAVA_Build 18 15048468 1D TGAGAAAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 147169 CASAVA_Build 18 15050999 1I CGTGGGCCTG -/C CCATGGCTGC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 2 3 147170 CASAVA_Build 18 15052214 3I GATTCCAGTA ---/TCC TCAAGATAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TCC 0 1 147171 CASAVA_Build 18 15053704 1D TTCAATTTTT G/- TATAAGCACA 2327 het 2327 ref 51 41 5 5 G 1 0 147172 CASAVA_Build 18 15054376 1D TTAGTCTACT G/- GGACTCTACC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 G 3 2 147173 CASAVA_Build 18 15059475 1I GTGGGTCCCT -/G GGGTCCAGGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 3 4 147174 CASAVA_Build 18 15062067 1I TGCTTTTTTC -/T TTTCTTTTTT 1126 het 1126 ref 38 31 3 4 T 3 4 147175 CASAVA_Build 18 15062752 1I CCACCACTTA -/T TGAATTAACT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 2 147176 CASAVA_Build 18 15063759 4I AATCACTGTT ----/AATC AATATTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 AATC 0 1 147177 CASAVA_Build 18 15063887 1D GTTAATCAAT A/- TTTTTTTAAT 3070 het 337 hom 15 1 12 2 A 1 0 147178 CASAVA_Build 18 15065465 1I ACAAGCTCTC -/T CTCTTTTTTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 0 1 147179 CASAVA_Build 18 15066055 1I GGCCATATAA -/C TAAATCCATA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 0 1 147180 CASAVA_Build 18 15066559 3D AGTGACAAAA AAG/--- AAGGAGAAGC 3070 hom 39 het 17 0 13 5 AAG 2 1 147181 CASAVA_Build 18 15069788 4D TTTTAGAAAT AAAC/---- AAATGATTAT 3070 hom 36 het 13 0 13 1 AAAC 1 0 147182 CASAVA_Build 18 15069922 1I TTCTGATGGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 8 9 147183 CASAVA_Build 18 15070344 3I TAATATTAAT ---/ATA ATAATAGTTT 2450 hom 12 het 5 0 5 0 ATA 2 3 147184 CASAVA_Build 18 15070938 5I TTTCTAAAGA -----/AGAGT GTGTGTGTGT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AGAGT 0 1 147185 CASAVA_Build 18 15076749 3D TAGTTGACAC ATA/--- ATAATTGTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 ATA 2 1 147186 CASAVA_Build 18 15076913 1D TATTACTTGC T/- GTTTGTTTGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 0 147187 CASAVA_Build 18 15078380 4I TTCTTACATA ----/TGAG TGAGAACATT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 TGAG 1 2 147188 CASAVA_Build 18 15078509 6D TTCCATTGTG TATATA/------ TATATATATA 1452 hom 10 het 4 0 4 0 TA 9 6 147189 CASAVA_Build 18 15078980 3D GGATTGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 92 het 42 0 29 15 TTG 7 6 147190 CASAVA_Build 18 15080069 8D TATGCCTGTA ATCCCAGC/-------- ATTTTGGGAG 3070 hom 39 het 14 0 14 2 ATCCCAGC 1 0 147191 CASAVA_Build 18 15081588 1D TTTATGCATT A/- AAAATATTAT 2936 het 198 hom 7 1 6 0 A 5 4 147192 CASAVA_Build 18 15082091 1D TTAGTAAAAT A/- AAAAAACAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 A 7 6 147193 CASAVA_Build 18 15083172 1I ATATTAAAAC -/T TTTAAGACAT 3070 het 1652 hom 21 4 15 2 T 3 4 147194 CASAVA_Build 18 15084572 1D TTTATCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 13 12 147195 CASAVA_Build 18 15085597 2D AAAATCAAAA AC/-- ACATATTATG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AC 2 1 147196 CASAVA_Build 18 15086411 4I TCAGTAATGG ----/TGGT GGTTGTAGCA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 TGGT 0 1 147197 CASAVA_Build 18 15089268 1I AATTGAGGGG -/C TTTTTTCCAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 0 1 147198 CASAVA_Build 18 15092570 1D ATGTGTTACA T/- TCTCCTTATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 2 1 147199 CASAVA_Build 18 15095801 1I CCAGTATAGC -/A AAATATACAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 3 4 147200 CASAVA_Build 18 15096785 13D AAAAACCAAG ATCTTGAATAAGT/------------- ATCTGCACTC 3070 hom 78 het 27 0 27 5 ATCTTGAATAAGT 1 0 147201 CASAVA_Build 18 15102325 1I CTATCATGTA -/T TTTTTTTGTC 2717 hom 15 het 7 0 6 1 T 7 8 147202 CASAVA_Build 18 15103412 2D TGTATGATCT CA/-- GTCATTTACA 2706 hom 15 het 6 0 6 0 CA 1 0 147203 CASAVA_Build 18 15103565 4D83M1D14M2D CTACAACTGA GAGTGAGGTACTGAAACTTCCAACTATTGTCAAATTGTTTATTTCTCTATCATTTCTGTGTATTTTTGCTTTATGTTTTTTAACTTATTTTTTATTTTTTGATT/----GAGGTACTGAAACCTCCAACTATTGTCAAATTGTTTATTTCTCTATCATTTCTGTGTATTTTTGCTTTATGTTTTTTAACCTA-ATTTTATTTTTTGA-- TTTTTTGATA 3070 het 166 hom 5 1 8 5 N/A 0 0 147204 CASAVA_Build 18 15105458 1I ACCACACTAA -/T TTTTTTTTAT 2116 hom 18 het 10 0 7 3 T 8 9 147205 CASAVA_Build 18 15106442 1D TTCATTGAGT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 G 2 1 147206 CASAVA_Build 18 15106866 1I12M3I GACTTCAATC -TAATAAAGGTAC---/ATAATAAAGGTACTCA TGATAATATT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 N/A 0 0 147207 CASAVA_Build 18 15107149 1D AAAAAACAAC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 8 7 147208 CASAVA_Build 18 15107731 3D TATTTCCTTT TTA/--- TTTTTTTTCC 3070 hom 69 het 27 0 24 5 TTA 1 0 147209 CASAVA_Build 18 15111582 2D AAATCAGGTC AG/-- TGATTTAGAT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AG 1 0 147210 CASAVA_Build 18 15111833 1D AGGTATAAAA C/- ACTGAACCAA 3070 hom 36 het 16 0 13 4 C 1 0 147211 CASAVA_Build 18 15112215 1I ATTGTGCTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 33 hom 14 1 11 2 T 7 8 147212 CASAVA_Build 18 15116039 1D CCAATCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 11 10 147213 CASAVA_Build 18 15122744 3D TACAACAAAG GAA/--- GAAGGAGAGA 1873 het 1873 ref 26 19 4 3 GAA 2 1 147214 CASAVA_Build 18 15129893 1D GGCTATTATC A/- AAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 19 2 A 5 4 147215 CASAVA_Build 18 15130968 3D GTAAAGAGCA AAG/--- AAGATTATAA 3070 hom 54 het 22 0 19 5 AAG 2 1 147216 CASAVA_Build 18 15133541 1D TTTTCTAAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2499 hom 33 9 19 5 T 10 9 147217 CASAVA_Build 18 15136659 1D ATATTTTCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1574 hom 35 5 27 3 T 9 8 147218 CASAVA_Build 18 15140789 1I TTGGGATTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 17 0 10 7 A 9 10 147219 CASAVA_Build 18 15148393 3I AAACCTTCCC ---/CTT CTTCTATAGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CTT 1 2 147220 CASAVA_Build 18 15151124 1I GCAGAGAAAG -/A AAAGGCAGAC 3070 het 3070 ref 65 33 28 4 A 3 4 147221 CASAVA_Build 18 15151182 4D ACCAATAATC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 418 hom 35 3 16 18 GT 10 8 147222 CASAVA_Build 18 15151352 3I ACAGCTCTAT ---/AAG AAGGTCAGTC 2295 het 2295 ref 25 17 5 3 AAG 1 2 147223 CASAVA_Build 18 15152299 2D AGAAAGCTGA TT/-- TTTTTTTGTG 1586 het 1586 ref 69 50 5 15 T 9 7 147224 CASAVA_Build 18 15152874 2D CTTCCAAGAA TT/-- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 T 9 7 147225 CASAVA_Build 18 15154635 4I TTTCTCCCTT ----/CCTC CCTCCCTACT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 CCTC 1 2 147226 CASAVA_Build 18 15155703 5I28M2D AGCAGATAAA -----TAAGTAAAATAACAACAATGAAACAAACTT/TACTGTAAGCAAAATAACAACAATGAAAGAAAC-- AGACTTAGAG 3070 het 3070 ref 50 39 7 26 N/A 0 0 147227 CASAVA_Build 18 15155858 2D GAAGTATCAC TA/-- TTTTTAGTAA 1756 het 1756 ref 89 61 4 25 TA 1 0 147228 CASAVA_Build 18 15155916 4I GTGTTTCATT ----/AATC AAGCTATCCA 3070 het 3070 ref 98 44 38 16 AATC 0 1 147229 CASAVA_Build 18 15155973 5D GTCAATAAAA TGTCT/----- TAAATTATAT 3070 het 3070 ref 84 46 15 29 TGTCT 1 0 147230 CASAVA_Build 18 15156295 3D AATTAAGAAA TAT/--- TATTGTAATA 2089 het 2089 ref 51 41 5 9 TAT 2 1 147231 CASAVA_Build 18 15156586 1D TTTTTTTTTT C/- ACCAAATAGA 3070 het 3070 ref 58 23 21 16 C 1 0 147232 CASAVA_Build 18 15158552 4I GTTCATTGAC ----/AAAG AAAAATAAAG 3070 het 3070 ref 58 33 19 6 AAAG 0 1 147233 CASAVA_Build 18 15160588 2D ATTTTCTTTC AT/-- ATAATGATGC 1561 het 1561 ref 82 71 4 8 AT 2 1 147234 CASAVA_Build 18 15160852 1I TCATATACAT -/A AGCAGGAAAT 3070 het 3070 ref 57 29 16 12 A 1 2 147235 CASAVA_Build 18 15161334 8I TCCATTTGTA --------/TAAGGGAC TTAAAGTGGA 3070 het 3070 hom 91 34 52 6 TAAGGGAC 0 1 147236 CASAVA_Build 18 15162250 1D AAGTGGGAAA G/- AAATCTAGTA 3070 het 3070 ref 52 36 9 7 G 1 0 147237 CASAVA_Build 18 15163123 3I CAATTAAAAT ---/TAA TAATGTTTAT 3070 het 3070 hom 72 26 33 13 TAA 1 2 147238 CASAVA_Build 18 15165245 3D TAATTATTAT TTC/--- TTTTTTGATG 1598 het 1598 ref 88 32 5 57 TTC 1 0 147239 CASAVA_Build 18 15166633 1D CCTCAATAAA T/- TTGCTTTCAT 1134 het 1134 ref 50 41 3 14 T 3 2 147240 CASAVA_Build 18 15166780 5I TGTAAGTGGC -----/CATTT CATTTTGCCT 3070 het 3070 ref 52 18 15 19 CATTT 1 2 147241 CASAVA_Build 18 15167384 1D AAAAGTATGT A/- AAAATATGTA 1315 het 1315 ref 42 36 3 3 A 5 4 147242 CASAVA_Build 18 15167848 1D ATATTTACCC T/- TACCTACAAG 1681 het 1681 ref 61 48 5 9 T 2 1 147243 CASAVA_Build 18 15168106 4I ATTAATGTGA ----/ATTG ATTCTTAAAT 3070 het 3070 hom 102 29 68 13 ATTG 0 1 147244 CASAVA_Build 18 15168255 10D AAATTAAATA ACATTCATAT/---------- TCTGAATCAC 1325 het 1325 ref 49 46 3 9 ACATTCATAT 1 0 147245 CASAVA_Build 18 15168538 1D TAATGGGGAT C/- AAATCTTGAG 3070 het 3070 ref 87 57 13 17 C 1 0 147246 CASAVA_Build 18 15168819 1I TCATCAGAAG -/T TTAACTAATT 3070 het 3070 ref 89 39 22 28 T 2 3 147247 CASAVA_Build 18 15169504 2I GAGCACCTTG --/TA TATAAATTCA 2320 het 2320 ref 84 73 7 4 TA 2 3 147248 CASAVA_Build 18 15170392 1D GTGGGAAGAA G/- AGGTGAGGGT 2586 het 2586 ref 45 32 6 11 G 1 0 147249 CASAVA_Build 18 15170937 1I TGCTTGATGA -/T TTTTTCACAT 2585 het 2585 ref 63 49 6 8 T 5 6 147250 CASAVA_Build 18 15171431 2I GATAATACAC --/AG ACTTTAATTA 2699 het 2699 ref 55 34 7 14 AG 0 1 147251 CASAVA_Build 18 15171603 1D ACTAAATAAA G/- AAAAATCAGG 1538 het 1538 ref 47 37 5 5 G 1 0 147252 CASAVA_Build 18 15172294 1D TATGTTCACA C/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 93 37 42 14 C 1 0 147253 CASAVA_Build 18 15173058 1I AAAAACATAG -/T TATTTTAAAT 1063 het 1063 ref 27 19 3 6 T 1 2 147254 CASAVA_Build 18 15173149 1D TTACAGAAAA T/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 T 5 4 147255 CASAVA_Build 18 15174046 1D CACCATGCCT G/- GGCTAATTTT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 G 3 2 147256 CASAVA_Build 18 15174431 1I AAAGATTGGC -/A AAATTAAAAA 3070 het 3070 hom 60 15 24 21 A 3 4 147257 CASAVA_Build 18 15174547 3I CATACAAATA ---/TAC TACATGAATA 2344 het 2344 ref 55 25 7 23 TAC 1 2 147258 CASAVA_Build 18 15176780 1I GAATCTGAAT -/A ATTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 A 1 2 147259 CASAVA_Build 18 15181759 2I AGTTTCATAT --/AC AGTGATATTA 2152 het 2152 ref 35 21 6 8 AC 0 1 147260 CASAVA_Build 18 15183014 1D GGATGCCAAG A/- AAAAAAATGA 2351 het 2351 ref 44 31 5 8 A 8 7 147261 CASAVA_Build 18 15183695 5D CTTCATTTCA TCATT/----- TCATTTCATC 954 het 954 ref 75 48 6 22 TCATT 2 1 147262 CASAVA_Build 18 15184974 2I AAGTGAGCCA --/AC AGTTTCTTGC 1873 het 1873 ref 37 30 4 3 AC 0 1 147263 CASAVA_Build 18 15185947 2D AAATACAGAC TT/-- ATATAAATAG 2675 het 2675 ref 55 30 10 15 T 2 0 147264 CASAVA_Build 18 15185963 2D AAATAGATTT TA/-- TATGTGACAG 3039 het 3039 ref 51 25 10 17 TA 2 1 147265 CASAVA_Build 18 15185975 1D26M1I TATGTGACAG CAGTTTGAATGGAGACTTTTTCAATGC-/-TGTTTGAATGGAGACTTTTTCAATGCA AATGAGAAAC 3070 het 3070 ref 50 28 12 39 N/A 0 0 147266 CASAVA_Build 18 15186041 1D TGACAACGAA T/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 53 24 9 24 T 7 6 147267 CASAVA_Build 18 15186219 3D ATGCACAAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 2577 het 2577 ref 66 29 7 31 T 14 11 147268 CASAVA_Build 18 15186762 1D AAAATTAAGG T/- TTTTCCCACC 1848 het 1848 ref 47 31 8 8 T 5 4 147269 CASAVA_Build 18 15187154 3D TTCTTTAATA ACC/--- ACACTTTGTT 3070 het 3070 ref 76 58 9 11 ACC 1 0 147270 CASAVA_Build 18 15191846 2D AAAAGAAAAA AG/-- AGAAAGGGAG 1782 het 1782 ref 47 32 5 10 AG 2 1 147271 CASAVA_Build 18 15195869 2I TAAAATGGTT --/AA GTTATTAATT 2022 het 2022 ref 43 24 6 13 A 0 2 147272 CASAVA_Build 18 15195988 3I CCAAAATACT ---/ATA ATATTTAAGG 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 ATA 1 2 147273 CASAVA_Build 18 15198200 1D GCTTTCTTTC T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 62 38 10 16 T 7 6 147274 CASAVA_Build 18 15201073 1D CTAGAAAAAA G/- TATGGTCTTC 3070 het 3070 ref 47 35 9 3 G 1 0 147275 CASAVA_Build 18 15211378 5I ATATGCAAAT -----/TAATC TATCCACTTC 1529 het 1529 ref 20 13 4 3 TAATC 0 1 147276 CASAVA_Build 18 15212987 2I AAGTAAACTC --/TT TGAATTACAT 2444 het 2444 ref 45 29 8 8 T 1 3 147277 CASAVA_Build 18 15217574 3I CAGGGAAGTG ---/TTC TTCTTCCAAC 3070 het 3070 ref 78 45 28 5 TTC 2 3 147278 CASAVA_Build 18 15218264 1D GAGTCCATTT A/- AAAAATCTGG 3070 het 3070 ref 50 36 12 2 A 6 5 147279 CASAVA_Build 18 15218513 2I TTCTTTCATT --/AA AAAAAAAGCG 2699 het 2699 ref 63 44 8 11 A 7 9 147280 CASAVA_Build 18 15230065 4D TGCTGGTTTC TGTT/---- TGTTTGTCCC 2563 het 2563 ref 43 30 7 6 TGTT 2 1 147281 CASAVA_Build 18 15242399 1I AAATTTTGAT -/C TTTGTGGAGG 3070 het 3070 ref 55 34 12 9 C 0 1 147282 CASAVA_Build 18 15244126 2D GAACTTATAC TG/-- TGTATGATTA 1337 het 1337 ref 45 39 3 3 TG 2 1 147283 CASAVA_Build 18 15250790 1D ATTTTCCCTA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 T 7 6 147284 CASAVA_Build 18 15250924 1I GTTGAAGATA -/T TTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 39 29 8 3 T 4 5 147285 CASAVA_Build 18 15251865 1D AGTTTTTTGA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 7 6 147286 CASAVA_Build 18 15254834 1I10M1I GTGTTTTTAG -TTTTTATTTT-/TTTTTTATTTTG TATGACAATT 1615 het 1615 ref 48 35 6 13 N/A 0 0 147287 CASAVA_Build 18 15255139 2D AATTTTGTCC CT/-- TTTTTAAGGT 1846 het 1846 ref 34 27 4 4 CT 1 0 147288 CASAVA_Build 18 15255477 1I GAATATTTCC -/T TTTTTTTTAG 1217 het 1217 ref 39 24 4 11 T 8 9 147289 CASAVA_Build 18 15263642 1D TGGAGAGGCT C/- TTTATGGCTG 2904 het 2904 ref 21 12 7 2 C 1 0 147290 CASAVA_Build 18 15270675 1I AAAATTAGAC -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 35 23 7 5 A 7 8 147291 CASAVA_Build 18 15271646 14I CAAATAAATT --------------/TTTCTACCAAAAAG ACACCTGCAC 3070 het 3070 ref 45 32 7 6 TTTCTACCAAAAAG 0 1 147292 CASAVA_Build 18 15271904 1I GGAAGCTAAA -/C ATTGGGTACA 3070 het 3070 ref 37 25 8 4 C 0 1 147293 CASAVA_Build 18 15273977 3D ATTTGTTTTT ATA/--- TGTGTCTTTT 1828 het 1828 ref 39 31 4 5 ATA 1 0 147294 CASAVA_Build 18 15283801 1I CTTTTAATAA -/T TTTTTTTATA 2440 het 2440 ref 16 9 5 2 T 7 8 147295 CASAVA_Build 18 15289281 2D GCTTGAGCCC CA/-- GAGTTTGAGG 3070 het 3070 ref 70 44 17 9 CA 1 0 147296 CASAVA_Build 18 15291638 5I TATATTGGCA -----/CTTCT TTTCTTCTCT 3070 het 3070 ref 45 26 11 8 CTTCT 0 1 147297 CASAVA_Build 18 15296254 1I TTTTATCTGT -/C CCCTAGCTTT 2762 het 2762 ref 37 27 6 4 C 3 4 147298 CASAVA_Build 18 15300292 1D GGACCAACTA T/- GTCATAAAAG 2218 het 2218 ref 36 27 5 4 T 1 0 147299 CASAVA_Build 18 15302538 1I GTTGTTTCTA -/C CCTGAATGGG 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 C 2 3 147300 CASAVA_Build 18 15306313 1D TTGGCTATTT C/- AAAGAGGGCA 1532 het 1532 ref 43 31 4 8 C 1 0 147301 CASAVA_Build 18 15307007 1D ATGAAATTCT C/- CTACCTCAGC 1350 het 1350 ref 23 19 3 1 C 2 1 147302 CASAVA_Build 18 15310220 4D AAAAAAACAA AAAC/---- AAAAAAATGT 129 het 129 ref 33 19 3 14 AAAC 1 0 147303 CASAVA_Build 18 15310862 1D ACCTTACAGA T/- TTCTATGTCA 1005 het 1005 ref 45 34 3 8 T 3 2 147304 CASAVA_Build 18 15316266 19D AAAGTCTTTC ACCTTCTAGCTATCACTTA/------------------- ACCTTTCTGT 3070 het 3070 ref 36 26 14 11 ACCTTCTAGCTATCACTTA 1 0 147305 CASAVA_Build 18 15318202 1D TTAAATTAGA G/- GGTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 48 33 8 7 G 3 2 147306 CASAVA_Build 18 15328567 1D AGAAGGAGTA T/- TAATTACACA 1704 het 1704 ref 35 29 4 2 T 2 1 147307 CASAVA_Build 18 15338939 2I CAAGTGTACC --/CT TTTTTTTTTT 203 het 203 ref 51 35 3 13 CT 0 1 147308 CASAVA_Build 18 15340559 1D TAAAAGACCA G/- GCTGGGTGCG 1101 het 1101 ref 37 28 3 6 G 2 1 147309 CASAVA_Build 18 15343460 1D ATATCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1647 het 1647 ref 21 15 4 2 T 12 11 147310 CASAVA_Build 18 15344174 1D TGCTGTTTTA T/- TTTTTCTCCC 2619 het 2619 ref 36 21 6 9 T 6 5 147311 CASAVA_Build 18 15347959 3I TCTGCACTTA ---/GAT GAAATTTTAT 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 GAT 0 1 147312 CASAVA_Build 18 15349012 2D TGAAAAAGGC AA/-- AATCATGTGT 3070 het 3070 ref 52 38 8 6 A 4 2 147313 CASAVA_Build 18 15349184 1D CATAAAAAAA C/- AGGTTTACTT 3070 het 3070 ref 48 30 11 8 C 1 0 147314 CASAVA_Build 18 15354115 2D TTACAAAACA TG/-- TGGAGAATTA 3070 het 3070 ref 34 20 8 6 TG 2 1 147315 CASAVA_Build 18 15356148 1D TGATTTCTTC A/- AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 29 14 9 7 A 7 6 147316 CASAVA_Build 18 15365262 1I CGGAAATTTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 33 23 7 3 A 7 8 147317 CASAVA_Build 18 15367111 2I55M8D25M6D AATATATAGC --ATATATATAGTATATAGCATGTCTATACTTATACTATATACATACATATAGTGTGTATGTATATATGTATATATAGTATGTATATATAGTATAT/ATATATATATAGTATATAGCATGTCTATACTTATACTATATACATACATATAGTGTG--------TATGTATATATAGTATGTATATATA------ GTATATGTAT 3070 het 3070 ref 38 39 21 13 N/A 0 0 147318 CASAVA_Build 18 15369584 1D TAAAGTTATT C/- TTTTACGGTT 3070 het 3070 ref 88 52 27 9 C 1 0 147319 CASAVA_Build 18 15369612 4D CTAGAAATCT TAAA/---- TGAAGGAGTT 3070 het 3070 ref 85 47 8 32 TAAA 1 0 147320 CASAVA_Build 18 15374999 1D TCATCTCATA G/- AGTTGAACAT 2168 het 2168 ref 84 74 5 5 G 1 0 147321 CASAVA_Build 18 15375208 2D TTTTGAAACA CT/-- CTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 CT 2 1 147322 CASAVA_Build 18 15377367 1I40M1I AACTTCTTTG -GATGTGTGCAGTCATCTCACAGAGTTGAACATTTCAAAAG-/TGATGTGTGCAGTCATCTCACAGAGTTGAACATTTCTGTTGA TTGAGCACCT 3070 het 3070 ref 60 42 24 6 N/A 0 0 147323 CASAVA_Build 18 15377841 3I ATCTTCACAT ---/AAC AACAAGACAG 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 AAC 1 2 147324 CASAVA_Build 18 15379771 1D CACCTCACAG T/- GTTGAACCTT 3070 het 3070 ref 40 28 7 6 T 1 0 147325 CASAVA_Build 18 15380296 1D TTGAACTTTA C/- TTTTGATTGA 3070 het 3070 ref 101 89 7 5 C 1 0 147326 CASAVA_Build 18 15381617 8D AACATTCCAT GCTCATGG/-------- GTTGGAAGAA 1415 het 1415 ref 18 16 3 6 GCTCATGG 1 0 147327 CASAVA_Build 18 15383853 1D23M3I TAAAAACTAT AACAGAAACATTCTGATAAACTTC---/-ACAGAAACATTCTGATAAACTTCTTT GTTATGTGTG 3070 het 3070 ref 60 47 21 7 N/A 0 0 147328 CASAVA_Build 18 15385990 2D CTTTGAAACA CT/-- CTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 CT 2 1 147329 CASAVA_Build 18 15386505 1I TGAAACACTC -/T TTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 T 6 7 147330 CASAVA_Build 18 15389424 4I CAGTTTGGAA ----/ACAC ACTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 45 32 11 2 AC 1 3 147331 CASAVA_Build 18 15389989 1I GACAAACTTC -/T TTGTTATGTG 3052 het 3052 ref 57 42 9 6 T 2 3 147332 CASAVA_Build 18 15393732 1D ATAAAATCTA G/- ACAGAAGCAA 2311 het 2311 ref 60 48 5 7 G 1 0 147333 CASAVA_Build 18 15394526 1D CTGCAAGTGG A/- ACTTTGGAGC 1958 het 1958 ref 44 28 5 11 A 2 1 147334 CASAVA_Build 18 16766568 1I CACTCTTTTT -/G TTGTATCTGG 3070 het 3070 ref 105 44 47 14 G 0 1 147335 CASAVA_Build 18 16789324 3D ATCATCAGTC ATT/--- AGAGAAATGC 3070 het 3070 hom 28 14 14 1 ATT 1 0 147336 CASAVA_Build 18 16856974 1D TATGATTCCA C/- CTCATATGAG 3070 het 3070 ref 45 30 13 4 C 2 1 147337 CASAVA_Build 18 16887238 1D TTGCAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 985 het 985 ref 43 32 3 8 T 12 11 147338 CASAVA_Build 18 16895040 1I AATGCTTTTA -/T TTTTTTTTTT 1867 het 1641 hom 22 6 8 8 T 15 16 147339 CASAVA_Build 18 16911571 1D GGGGCGAGAC T/- TTTTTGGGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 5 147340 CASAVA_Build 18 16918215 1I CACAGGCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 30 0 20 10 A 10 11 147341 CASAVA_Build 18 16924831 1D CAAAGTACAA T/- AGATCAGAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 1 0 147342 CASAVA_Build 18 16925010 1I TATATGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 10 11 147343 CASAVA_Build 18 16925499 1D GAGGCAGAGG T/- TGCAGTGAGT 2778 hom 15 het 7 0 6 1 T 2 1 147344 CASAVA_Build 18 16928542 1I ACAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 384 hom 24 1 18 5 A 9 10 147345 CASAVA_Build 18 16932595 1D GAAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 25 0 14 11 A 15 14 147346 CASAVA_Build 18 16934358 1D TTACTGCAGC A/- AAAAAAAAAA 1362 het 1362 ref 28 20 3 6 A 13 12 147347 CASAVA_Build 18 16974794 1I CTTCTCACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 624 hom 38 2 24 12 A 12 13 147348 CASAVA_Build 18 17026426 1I AATTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 11 12 147349 CASAVA_Build 18 17077794 11I ATGAATGAAT -----------/ATTGAAAAGTA ATATAAGTAG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 ATTGAAAAGTA 0 1 147350 CASAVA_Build 18 17114351 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2574 het 2574 ref 49 24 9 16 T 15 14 147351 CASAVA_Build 18 17203444 1I CTGGCATTTC -/A AAGGAAAAGT 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 2 3 147352 CASAVA_Build 18 17235916 1D GGTGCTGAGA T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 7 6 147353 CASAVA_Build 18 17242108 4D AAAAGATAGA TGTT/---- TGAGGTGATG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TGTT 1 0 147354 CASAVA_Build 18 17291234 1D TAGAATCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 11 10 147355 CASAVA_Build 18 17295056 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 19 1 14 4 A 13 14 147356 CASAVA_Build 18 17305580 13D CTTTTGTTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTGA 3070 hom 77 het 31 0 25 9 T 21 8 147357 CASAVA_Build 18 17338027 1I CTGAGTAGCT -/G GGACTACAGG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 G 2 3 147358 CASAVA_Build 18 17338241 1D CACCTGTAAT C/- CCCTGTGCTT 3070 hom 45 het 18 0 9 9 C 4 3 147359 CASAVA_Build 18 17348730 1I AAAAGGAAAG -/T TCATCTCACC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 1 2 147360 CASAVA_Build 18 17354757 3I TAGGTGCTGA ---/TCT TCTTAAGAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TCT 1 2 147361 CASAVA_Build 18 17359834 5I GAATTTGACA -----/TAGAT TAGATTCCAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TAGAT 1 2 147362 CASAVA_Build 18 17359978 3I TTGAAAAGAC ---/TAT TATTAATTAA 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 TAT 1 2 147363 CASAVA_Build 18 17369340 2D CGCCTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTC 1607 het 36 hom 8 1 5 2 T 11 9 147364 CASAVA_Build 18 17397879 1D GAGCAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 287 hom 31 1 15 15 A 15 14 147365 CASAVA_Build 18 17398517 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1517 hom 10 het 5 0 4 1 T 12 11 147366 CASAVA_Build 18 17402862 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 16 0 14 3 A 15 14 147367 CASAVA_Build 18 17422059 1D GATCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 715 hom 23 3 12 8 A 16 15 147368 CASAVA_Build 18 17428663 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 17 2 14 1 A 11 12 147369 CASAVA_Build 18 17432505 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 7 6 147370 CASAVA_Build 18 17455127 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 25 0 22 3 A 10 11 147371 CASAVA_Build 18 17458661 2D AAAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 2167 hom 22 het 9 0 8 1 AT 9 8 147372 CASAVA_Build 18 17477092 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 41 het 15 0 14 1 A 10 9 147373 CASAVA_Build 18 17480265 1I TACTGGCCCC -/A GGGGAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 0 1 147374 CASAVA_Build 18 17483367 1D GCGGATCACG A/- AGTCAGGAGT 1277 hom 9 het 5 0 3 2 A 2 1 147375 CASAVA_Build 18 17493616 2I GGAATCACCT --/AG AGAGTTTTTT 3070 het 175 hom 32 1 30 2 AG 2 3 147376 CASAVA_Build 18 17501058 1I TTTTGAGACA -/G AGTCTCGCTC 3070 hom 36 het 14 0 10 4 G 0 1 147377 CASAVA_Build 18 17506824 1I TTAAATGACC -/A ATTGTCTAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 147378 CASAVA_Build 18 17508188 2I AAACATTCTT --/TC TCTTTTATTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 TC 1 2 147379 CASAVA_Build 18 17511634 12D TTGTTTTTGG TTATTTATTTAT/------------ TTATTTATTT 2902 hom 18 het 15 0 7 8 TTAT 6 3 147380 CASAVA_Build 18 17512588 3I TTTGTAAATT ---/ACC ATTCCTAAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 ACC 0 1 147381 CASAVA_Build 18 17523718 1D AAACACACTA C/- AAGCAACCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 1 0 147382 CASAVA_Build 18 17536514 5I CATGTCTTAA -----/TTTTG TTTTAATTCT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TTTTG 0 1 147383 CASAVA_Build 18 17539515 2I AATGGTTAGA --/AG ATTTAATAGC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 AG 0 1 147384 CASAVA_Build 18 17554451 1I TTTCAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2583 hom 35 11 15 9 T 13 14 147385 CASAVA_Build 18 17568438 4D TCTCTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 2595 het 1983 hom 25 9 11 5 TC 9 7 147386 CASAVA_Build 18 17585649 10D CCTTCCTTTC TTTCTTCCCT/---------- TTTCTTCCCT 3070 het 3070 hom 31 13 18 3 TTTCTTCCCT 2 1 147387 CASAVA_Build 18 17589294 1D AACAACTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 916 hom 21 3 9 9 T 15 14 147388 CASAVA_Build 18 17595908 2D TGGAAACCCC CA/-- CCAAACTGCT 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 CA 1 0 147389 CASAVA_Build 18 17600346 3D TAGTATTCTT AAG/--- GAGTTTACAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 6 AAG 1 0 147390 CASAVA_Build 18 17627961 3I CGGCAAGGAT ---/ATG GTGACCTCCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 ATG 0 1 147391 CASAVA_Build 18 17639692 1I TTTTTAAAGT -/A TGCTTTCAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 0 1 147392 CASAVA_Build 18 17647551 23I GTAGGTCCCT -----------------------/ACTGTTTCATAAATGATTGTCAA ACTGTTGTGG 3070 het 3070 hom 31 13 21 2 ACTGTTTCATAAATGATTGTCAA 0 1 147393 CASAVA_Build 18 17656664 1I TTAAGGTTGA -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 5 6 147394 CASAVA_Build 18 17658769 4I GTTTGTCTCT ----/ATTA ATTAAATAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATTA 1 2 147395 CASAVA_Build 18 17677962 1D CTTCAGTAGG T/- CCAGGGTGTT 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 T 1 0 147396 CASAVA_Build 18 17696164 1D CCGGCTTTTT A/- AAAATCTAAA 3070 hom 85 het 39 0 28 11 A 5 4 147397 CASAVA_Build 18 17703755 1D AAATGAGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 55 hom 29 1 23 5 A 10 9 147398 CASAVA_Build 18 17713021 4D TGGGAGGCTG AGAC/---- AGACAGATCG 1860 het 1860 ref 16 9 5 3 AGAC 2 1 147399 CASAVA_Build 18 17714776 1D AGATTCCATC T/- TAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 13 15 2 T 2 1 147400 CASAVA_Build 18 17726755 1I AGTTCAAGAG -/T TTTTTATAGA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 5 6 147401 CASAVA_Build 18 17727447 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 16 1 13 2 A 15 16 147402 CASAVA_Build 18 17732230 3D CACCACCTCC TTT/--- CAAAGTGCTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 3 0 147403 CASAVA_Build 18 17739978 1I AGGGGTGGGA -/G GGGGAAAAAG 1742 hom 11 het 7 0 4 3 G 4 5 147404 CASAVA_Build 18 17740315 1D GTGTGAGCCA C/- CGCGCCTGGC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 C 2 1 147405 CASAVA_Build 18 17743503 1I AGTTGGTAAG -/T TAGTAGGGTC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 1 2 147406 CASAVA_Build 18 17753074 2I TGTATAATAT --/AA GAGTTAACTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 0 2 147407 CASAVA_Build 18 17753902 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 292 hom 28 1 25 2 A 9 10 147408 CASAVA_Build 18 17778505 1D TTATTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 30 0 25 5 T 12 11 147409 CASAVA_Build 18 17826727 1D CCCTTTCACC T/- TTTTTTTTTT 2114 het 1701 hom 31 14 5 12 T 15 14 147410 CASAVA_Build 18 17836529 1D ATTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 13 12 147411 CASAVA_Build 18 17838705 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1195 het 1195 ref 43 24 4 15 A 13 14 147412 CASAVA_Build 18 17876280 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 18 1 15 2 T 12 11 147413 CASAVA_Build 18 17890456 1D GTAATATAAA C/- GTAACAAAAT 3070 hom 69 het 30 0 23 8 C 1 0 147414 CASAVA_Build 18 17905731 1D CAAAATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 12 11 147415 CASAVA_Build 18 17924485 1I AAGAAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 25 1 16 8 A 12 13 147416 CASAVA_Build 18 17929132 14D GCAGTGACTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTGA 3070 hom 63 het 22 0 22 3 T 22 8 147417 CASAVA_Build 18 17939424 1D TTGTATACAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 7 6 147418 CASAVA_Build 18 17945704 24D GACATGATAC ATATATATACATATATATATATAT/------------------------ ATATATATAT 2295 het 87 hom 13 1 7 5 ATATATATACATATATATATATAT 1 0 147419 CASAVA_Build 18 17949296 1D GTGTGGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 T 12 11 147420 CASAVA_Build 18 17958376 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 657 hom 15 3 11 1 A 7 6 147421 CASAVA_Build 18 17959472 1I CTGTTTTGTC -/T GTTTCTTTGA 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 0 1 147422 CASAVA_Build 18 17960899 1I AAATGGGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 12 13 147423 CASAVA_Build 18 17964408 4D TCTTTTTAAA AAAC/---- AAACAAAGAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 AAAC 2 1 147424 CASAVA_Build 18 17990313 1I TCCTGTATAA -/G AAAGGAGGGG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 0 1 147425 CASAVA_Build 18 18028292 1D TGTCTGTGGG A/- AGGGTGGAGG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 2 1 147426 CASAVA_Build 18 18032035 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 13 12 147427 CASAVA_Build 18 18034526 1D GCTGCACAGA C/- CCCGTTCATT 3070 hom 51 het 26 0 22 4 C 4 3 147428 CASAVA_Build 18 18042787 1D GTTTGCATTG T/- TTTTTAAATC 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 6 5 147429 CASAVA_Build 18 18048767 1D AACTTATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 46 2 32 12 T 14 13 147430 CASAVA_Build 18 18050282 1D TCCTGAGTAC G/- TGTGCCCCTC 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 G 1 0 147431 CASAVA_Build 18 18082315 1D TGGGATTGCA G/- GTGTGAGCCA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 G 2 1 147432 CASAVA_Build 18 18083779 1I TATTTTTTTT -/G GAATAGATAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 1 2 147433 CASAVA_Build 18 18092422 3I CATCCTTCCT ---/CTC CTCCTCCTTT 3070 hom 100 het 40 0 31 9 CTC 2 3 147434 CASAVA_Build 18 18096973 4I TTGTTCATGT ----/TTCA TTCCTATTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TTCA 0 1 147435 CASAVA_Build 18 18098796 2I TGACCTCAGG --/GA GAGACATCCC 2493 het 2493 ref 30 14 8 8 GA 2 3 147436 CASAVA_Build 18 18099399 2I TTGTGATGGC --/AG AGAGTTCTGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AG 2 3 147437 CASAVA_Build 18 18103747 1I GGATCAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 10 11 147438 CASAVA_Build 18 18110751 2D TCCTCAGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2041 het 789 hom 24 4 6 14 T 14 12 147439 CASAVA_Build 18 18121239 1I TGATGATGGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 7 8 147440 CASAVA_Build 18 18121405 1I AGGGAGGGGG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 6 7 147441 CASAVA_Build 18 18123266 1I TTATCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 36 1 28 7 T 11 12 147442 CASAVA_Build 18 18129228 2D TGCCTCTTAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 TC 6 5 147443 CASAVA_Build 18 18135036 1I TCTCAAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 9 10 147444 CASAVA_Build 18 18135126 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 691 het 691 ref 17 6 3 8 T 12 11 147445 CASAVA_Build 18 18139346 1D CTTGGGGGAG A/- GGGGGTTAGA 3070 het 3070 ref 41 17 19 5 A 1 0 147446 CASAVA_Build 18 18146850 1D CTATTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 55 23 22 10 A 11 10 147447 CASAVA_Build 18 18168020 1I GCTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 2067 hom 19 het 22 0 10 12 T 12 13 147448 CASAVA_Build 18 18180950 7D CTTCCTCTCT CCCCTCC/------- CCCTGGCCGA 3070 het 3070 ref 49 22 22 9 CCCCTCC 1 0 147449 CASAVA_Build 18 18214482 12D CCTCTCTCGC TCCCTCCCTCCT/------------ TCCCTCCCTC 3070 hom 75 het 35 0 25 12 TCCCTCCCTCCT 1 0 147450 CASAVA_Build 18 18219684 11D CAAAAAAAAA AAAAGAAAAAG/----------- AAAAAAAGAA 1105 het 1105 ref 13 10 5 3 AAAAGAAAAAG 1 0 147451 CASAVA_Build 18 18255481 1D AATAAAGGGG A/- AAAAAATATC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 7 6 147452 CASAVA_Build 18 18256104 1I GTTCTTTCTG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 38 0 29 9 A 8 9 147453 CASAVA_Build 18 18267870 2D TGATTGTATG CA/-- CACACAGTGC 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 CA 4 3 147454 CASAVA_Build 18 18285677 1I AAATTATAAC -/A AAGCAAAACA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 2 3 147455 CASAVA_Build 18 18289017 3D CTTTTCTCTC CTT/--- CTTTGTTACG 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 CTT 2 1 147456 CASAVA_Build 18 18293834 3I ATAAAATAAG ---/GAA GAAGGAGAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 GAA 1 2 147457 CASAVA_Build 18 18303249 1D TTTTGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1344 hom 31 4 26 2 T 15 14 147458 CASAVA_Build 18 18316517 1D TAAGCCCCAG T/- TTTGGGGGTT 3070 hom 77 het 30 0 23 7 T 4 3 147459 CASAVA_Build 18 18318273 1I CCTGAGAATT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 7 8 147460 CASAVA_Build 18 18334116 1D TGATAGCTCC A/- AAATGCAAAG 3070 het 3070 hom 45 22 21 3 A 4 3 147461 CASAVA_Build 18 18334755 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 18 2 13 7 A 11 10 147462 CASAVA_Build 18 18335279 1D AAGAGGACAC A/- AAACCAATTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 4 3 147463 CASAVA_Build 18 18340454 2D TTTCTTAAAT AA/-- GTTTGCTCAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 2 0 147464 CASAVA_Build 18 18357392 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 2923 het 513 hom 23 8 9 6 G 0 1 147465 CASAVA_Build 18 18358386 1I AGTCCTATCC -/A AAAAAAAAAA 1750 het 1750 ref 25 8 12 7 A 15 16 147466 CASAVA_Build 18 18359804 3I GTGAGTCTAA ---/CTT CTTGTTCTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CTT 1 2 147467 CASAVA_Build 18 18374568 15D TTACCTCTTT AAAGACCCTATCTCC/--------------- AAATAAAGTC 3070 het 3070 ref 30 20 13 5 AAAGACCCTATCTCC 1 0 147468 CASAVA_Build 18 18378358 1D GCAGTGCTTC A/- AAACACCCCA 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 A 4 3 147469 CASAVA_Build 18 18382829 1D GAAACAAGGG T/- AGTAATATCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 1 0 147470 CASAVA_Build 18 18396608 1D GAAAGCTACT G/- TGGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 G 1 0 147471 CASAVA_Build 18 18403107 4D AGACACTGTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 17 16 8 TC 8 6 147472 CASAVA_Build 18 18406390 1D AGACCCCCCA G/- GGTTCACAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 G 3 2 147473 CASAVA_Build 18 18408539 1D AACCCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1775 hom 41 10 11 20 T 13 12 147474 CASAVA_Build 18 18409246 2D TGTAATTCTT AA/-- ACTTTCAAAT 3070 het 3070 hom 25 12 11 3 A 3 1 147475 CASAVA_Build 18 18413348 1D ACACAACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 14 12 T 13 12 147476 CASAVA_Build 18 18414035 1D TTTTGCTCTA C/- CCATGGAACC 3070 het 3070 ref 51 27 22 2 C 3 2 147477 CASAVA_Build 18 18416887 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2506 het 794 hom 17 3 8 7 A 17 16 147478 CASAVA_Build 18 18423476 1I AGTATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 11 12 147479 CASAVA_Build 18 18425564 8D GGGAGAGAAT TCATTGAC/-------- TCATTGACTG 3070 het 3070 hom 45 19 21 7 TCATTGAC 2 1 147480 CASAVA_Build 18 18426048 54D3M1D4M2I CATTATCTGA TTCCATTCAACAGTCTATCTCGTACCAGTGGAAGCTGGGGAGACAGGATTAGTTCTTGTTGC--/------------------------------------------------------CTT-TTGCCT TTGCCTTTGA 3070 het 3070 ref 43 44 13 4 N/A 0 0 147481 CASAVA_Build 18 18427862 1D AATACCATAC T/- TTTTTGCATA 3070 hom 138 het 47 0 47 0 T 6 5 147482 CASAVA_Build 18 18433875 1I CTAATATGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 A 9 10 147483 CASAVA_Build 18 18436710 1D TGATGTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 T 11 10 147484 CASAVA_Build 18 18444586 1D CTAATTTTCA G/- AAAAAAAGGG 3070 hom 132 het 45 0 45 1 G 1 0 147485 CASAVA_Build 18 18445958 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAGAG 1419 het 56 hom 22 2 11 9 A 7 8 147486 CASAVA_Build 18 18446679 1D GGGATGCCTG C/- CAATCAGCCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 2 1 147487 CASAVA_Build 18 18457256 1D TCCCCCGGTG C/- CCCCAGTAGG 3070 het 3070 hom 31 15 14 3 C 5 4 147488 CASAVA_Build 18 18461137 1D TAAAATGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2466 hom 35 17 11 7 A 13 12 147489 CASAVA_Build 18 18470444 20I AAGAGTATGT --------------------/ACTACCTTTATTTCTACTAC GTAAATTTCT 3070 het 3070 hom 20 7 14 0 ACTACCTTTATTTCTACTAC 0 1 147490 CASAVA_Build 18 18472868 1D CTTTCCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1957 hom 42 12 12 18 T 17 16 147491 CASAVA_Build 18 18473069 1D CCAAAAACAT G/- CCACATCTGC 3070 het 3070 hom 50 14 24 12 G 1 0 147492 CASAVA_Build 18 18473901 1I GGCGGATCAC -/A AGGTCAGGAG 1289 hom 10 het 5 0 4 1 A 1 2 147493 CASAVA_Build 18 18498724 1D TTTTTAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 300 hom 22 4 9 9 T 11 10 147494 CASAVA_Build 18 18509641 1D AGAGAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 11 10 147495 CASAVA_Build 18 18510429 1D GTAAAGGCAT A/- AAGTTTCCAA 3070 hom 147 het 55 0 49 6 A 3 2 147496 CASAVA_Build 18 18511649 22I AATGGGTATA ----------------------/ACATGGAGAATAAAGCAAATCC CTACAGCTCT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 ACATGGAGAATAAAGCAAATCC 0 1 147497 CASAVA_Build 18 18521701 2D GTAGGCAGTG CC/-- CTGGGGGGAA 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 C 3 1 147498 CASAVA_Build 18 18528006 1I CATCATTTAC -/T TCCCAAAAAA 3070 hom 102 het 43 0 34 9 T 1 2 147499 CASAVA_Build 18 18533636 4D TTTGAAGAAG AAGA/---- AAGGAAATTT 3070 het 3070 ref 59 27 28 5 AAGA 1 0 147500 CASAVA_Build 18 18536777 1D AATTCTCCCT C/- CCCCCTGAGA 3070 het 2261 hom 33 8 18 7 C 6 5 147501 CASAVA_Build 18 18537863 1I CCTATTAACT -/G GGTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 2 3 147502 CASAVA_Build 18 18540541 2D AATAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 21 3 15 4 A 17 15 147503 CASAVA_Build 18 18573073 1D ATTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 9 A 13 12 147504 CASAVA_Build 18 18578891 2I TCAAATATAT --/AA AAAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 3 5 147505 CASAVA_Build 18 18589658 2D ACAATTATAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1184 hom 15 4 8 3 AT 7 6 147506 CASAVA_Build 18 18600298 1I TTTTTCTCAG -/T TTTTGTTTCA 3070 het 3070 ref 51 15 14 22 T 4 5 147507 CASAVA_Build 18 18603325 1I AATAGCAACA -/T ATAAAATTAA 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 T 0 1 147508 CASAVA_Build 18 18607083 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1745 hom 21 5 11 6 A 13 12 147509 CASAVA_Build 18 18607948 1I CTTAAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 11 12 147510 CASAVA_Build 18 18622945 1I CTAAGTAGTC -/T TGATAAGTGT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 1 2 147511 CASAVA_Build 18 18630508 2I AATGACTGAC --/AT ATATTTCTCA 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 AT 2 3 147512 CASAVA_Build 18 18633574 1I CAGGGATTAT -/A AATGTTCTGC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 2 3 147513 CASAVA_Build 18 18641553 1D ATGAGGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 11 10 147514 CASAVA_Build 18 18647773 2D GTTTCTGCAC AT/-- GTGATACACT 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 AT 1 0 147515 CASAVA_Build 18 18652377 1D ACATAAGACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 T 10 9 147516 CASAVA_Build 18 18652649 13I ACTTACCATA -------------/ATAAATAACTCTT ATAAATAAGA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 ATAAATAACTCTT 0 1 147517 CASAVA_Build 18 18655912 1I TGGTCTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 9 10 147518 CASAVA_Build 18 18663206 1I GCTTTCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 T 11 12 147519 CASAVA_Build 18 18670735 1D GATACACTAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 9 8 147520 CASAVA_Build 18 18676075 1D AATTCACTGC T/- TAGAATGGCT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 2 1 147521 CASAVA_Build 18 18683454 1D ATGGCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 22 6 T 12 11 147522 CASAVA_Build 18 18698666 3I AGTGGAAAAC ---/CTT CTAGTTTCTC 3070 het 3070 hom 51 18 30 3 CTT 0 1 147523 CASAVA_Build 18 18699813 2D TCCTACTGTT TA/-- TGCTTGTATA 3070 het 3070 hom 48 18 20 11 TA 1 0 147524 CASAVA_Build 18 18707244 13D TTCATTAAAG ACAATGAGATTAT/------------- ACTGAAAACA 3070 het 3070 ref 47 32 15 4 ACAATGAGATTAT 1 0 147525 CASAVA_Build 18 18709710 1D ATTCCCAGCC A/- GGGCCATGTG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 1 0 147526 CASAVA_Build 18 18711849 1I TTAAACTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 10 11 147527 CASAVA_Build 18 18713728 4D ACCAGTTAAT ATAC/---- ATACATACAT 3070 hom 105 het 40 0 35 7 ATAC 4 3 147528 CASAVA_Build 18 18741479 4D TTCATTGCTA TTAT/---- TTATTATTGT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 TTAT 2 1 147529 CASAVA_Build 18 18750232 4D CTTTCCCTCC TGAA/---- TATCTTCATG 3070 het 3070 hom 47 20 23 6 TGAA 1 0 147530 CASAVA_Build 18 18774282 2D TCTATATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2165 het 133 hom 22 3 10 9 T 18 16 147531 CASAVA_Build 18 18793684 2D TATATTTATA TG/-- TGTGTGTGTG 1376 het 1376 ref 23 11 9 3 TG 6 5 147532 CASAVA_Build 18 18817620 11D TCTTCTTTGT ATGAAAGCAGC/----------- ATGTAACTAT 3070 het 3070 ref 22 19 7 2 ATGAAAGCAGC 1 0 147533 CASAVA_Build 18 18818799 3D ATAATGCTTT TCA/--- TCATCATTGT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 TCA 3 2 147534 CASAVA_Build 18 18836618 2D TTTCTCCTTG TT/-- TTATTAAATT 3070 het 1481 hom 33 4 24 7 T 4 2 147535 CASAVA_Build 18 18842216 5I ATTTTTTTCT -----/TTAAG TTAAGATGTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 TTAAG 1 2 147536 CASAVA_Build 18 18846529 2D AAGCCTCTAA CT/-- CTATTTAGTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 CT 2 1 147537 CASAVA_Build 18 18848819 6D CATAAGGTAA TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 18 7 TTTTTC 2 1 147538 CASAVA_Build 18 18856870 1I ATCAAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 777 hom 29 2 21 6 T 11 12 147539 CASAVA_Build 18 18868631 1I AGTTTCACTC -/T TGTCACCCAG 3070 het 3070 hom 30 8 20 2 T 1 2 147540 CASAVA_Build 18 18869295 1D TTTTTTCAAA T/- TTTTTTTTTT 2123 het 970 hom 13 4 7 2 T 14 13 147541 CASAVA_Build 18 18871616 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2460 het 1818 hom 21 6 7 8 A 15 14 147542 CASAVA_Build 18 18875334 1I TAATAATTTA -/T TTTTTTTTTT 2890 het 1705 hom 22 6 7 9 T 12 13 147543 CASAVA_Build 18 18879579 1D CCTCAAAAAT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 5 A 7 6 147544 CASAVA_Build 18 18881160 2I TATTAAGAAA --/AT ATGTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 2 147545 CASAVA_Build 18 18890389 2I AAATTGGGAG --/AT TGGAGTGTTC 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 AT 0 1 147546 CASAVA_Build 18 18893467 1D GAGGCTTCTG C/- CCCAGAAACA 3070 hom 66 het 34 0 29 5 C 4 3 147547 CASAVA_Build 18 18906945 1D TCCTCTACAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 9 8 147548 CASAVA_Build 18 18912349 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 13 14 147549 CASAVA_Build 18 18913889 6I AATATTTTAT ------/CCTGTC CCGAACTCTA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 CCTGTC 0 1 147550 CASAVA_Build 18 18914329 2I TGGAATAAAC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 9 11 147551 CASAVA_Build 18 18939520 1I TTCTTACAGG -/T TTCCTTACAC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 2 3 147552 CASAVA_Build 18 18947396 3D GTACATTCAC ATT/--- GTTGTGCAAC 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 ATT 1 0 147553 CASAVA_Build 18 18949502 1I GAGCAGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 935 hom 41 3 30 8 T 11 12 147554 CASAVA_Build 18 18951458 2I CACCCAGGCT --/GC AGTGCAGTGG 3070 hom 9 het 16 0 13 3 GC 0 1 147555 CASAVA_Build 18 18959647 5D CGCCTCCCGG GTTCA/----- AGCAATTCTC 3070 hom 33 het 12 0 12 2 GTTCA 1 0 147556 CASAVA_Build 18 18961971 1I GAGACAGAGG -/T TGCAGAGAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 2 147557 CASAVA_Build 18 18965340 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 17 6 A 11 12 147558 CASAVA_Build 18 18966818 1D CCAGCTACTC G/- GGGGGGGCTG 1827 het 39 hom 9 1 5 3 G 8 7 147559 CASAVA_Build 18 18977792 1D GTCAATCCCT C/- CCCCCCTGGG 3070 hom 89 het 37 0 29 8 C 7 6 147560 CASAVA_Build 18 18980724 2I TGAAAGTCAC --/TG TATGTGGTAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TG 0 1 147561 CASAVA_Build 18 18991640 3D TATCTCTTCT TAA/--- TAATTTCTAT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TAA 2 1 147562 CASAVA_Build 18 18996142 4I AAAAAACAAC ----/AAAG AAAGAGAATC 3070 hom 80 het 33 0 26 7 AAAG 1 2 147563 CASAVA_Build 18 18998620 1D ACACTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 21 2 13 6 T 13 12 147564 CASAVA_Build 18 19027447 1D AGCCACCACG C/- CCCAGCCCAG 3070 hom 49 het 22 0 19 3 C 4 3 147565 CASAVA_Build 18 19043765 15I GGCTGGTGAG ---------------/AGACGTTGCCTTTTT AGACATTGCC 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 AGACGTTGCCTTTTT 0 1 147566 CASAVA_Build 18 19044122 1D TCCTTTGCTA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 7 147567 CASAVA_Build 18 19056453 2D CGAGAATTGC TA/-- TGTTTATGAA 2857 het 2857 ref 16 9 6 1 TA 1 0 147568 CASAVA_Build 18 19060364 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 18 1 8 9 A 17 16 147569 CASAVA_Build 18 19089294 1D TATGTCTCAC T/- TGTCTAGCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 T 2 1 147570 CASAVA_Build 18 19100970 3D AGCATCCGAC CAA/--- CAGACCACAG 1719 het 1719 ref 29 18 6 7 CAA 1 0 147571 CASAVA_Build 18 19108988 13D21M2D TGCTTGTGTG TCTGCTTGTATTTTGTGTGTGAGTGTGTTTGTGTAG/-------------AGTGTGCGTATGCGCTTGTGT-- GTGTGCTTGT 2919 het 2919 ref 55 42 11 23 N/A 0 0 147572 CASAVA_Build 18 19138459 3D TATAAATGAC ATT/--- ATATATCTAT 1920 het 1162 hom 7 3 4 0 ATT 1 0 147573 CASAVA_Build 18 19141558 2D GCCTGTTTCC TG/-- TCTCAGATGA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 TG 1 0 147574 CASAVA_Build 18 19150628 3D GAGGAACAAA AGG/--- AGATTAGGTT 3070 het 3070 hom 54 17 32 6 AGG 1 0 147575 CASAVA_Build 18 19154032 6D ATTCTCAGCC AGCAAA/------ AGCATCCCTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 AGCAAA 1 0 147576 CASAVA_Build 18 19166407 1I AGCTTTGGTA -/T CTTCTAAAGC 3070 het 3070 ref 48 32 14 2 T 0 1 147577 CASAVA_Build 18 19175956 1D TATACACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 11 10 147578 CASAVA_Build 18 19183760 1D AGTTCAGTTA T/- TGTACTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 2 1 147579 CASAVA_Build 18 19185396 2D AAACAAAAAC AA/-- AAACAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 5 3 147580 CASAVA_Build 18 19192415 1I AGAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 9 10 147581 CASAVA_Build 18 19201260 2D AGGCCATTCA GC/-- GCACTTGAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 GC 2 1 147582 CASAVA_Build 18 19201724 1I CCCTGGATAC -/T TTTTTTTTTT 2856 het 2329 hom 29 9 11 9 T 14 15 147583 CASAVA_Build 18 19212809 2D CAAGAGAAAC AT/-- GTGGCTTACT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 AT 1 0 147584 CASAVA_Build 18 19216528 1I AGGGAGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 9 10 147585 CASAVA_Build 18 19217385 3D GGAGAGGCCA GAG/--- GAGAAAGCGG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 GAG 2 1 147586 CASAVA_Build 18 19222590 1I CCATTTGCTT -/A CTCCAGTAAT 3070 hom 117 het 49 0 40 9 A 0 1 147587 CASAVA_Build 18 19236770 1I TTGTCTTTTT -/A AAAAAAATAT 2843 het 2843 ref 17 9 6 2 A 7 8 147588 CASAVA_Build 18 19256777 1D AAACACCCCT C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 37 11 17 10 C 9 8 147589 CASAVA_Build 18 19262164 4D TTAAATTAAT AAGA/---- AAAACACTAA 2627 het 2627 ref 15 8 6 1 AAGA 1 0 147590 CASAVA_Build 18 19264209 1D TTCTTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 2293 het 2293 ref 24 11 9 5 T 10 9 147591 CASAVA_Build 18 19267830 1I TACTTTAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 10 9 10 A 10 11 147592 CASAVA_Build 18 19269212 1D ATTTGTCTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 T 10 9 147593 CASAVA_Build 18 19270286 1D CACCACGCCC G/- GGCCACAACA 3070 hom 22 het 15 0 10 5 G 3 2 147594 CASAVA_Build 18 19278442 1I GTGGTGGCTC -/A ACGCGTGTAA 2857 het 1225 hom 14 5 7 2 A 1 2 147595 CASAVA_Build 18 19282869 3I TTTCACATTC ---/CTA CAAGCCATGT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 CTA 0 1 147596 CASAVA_Build 18 19284042 8D TAAATGTGTA TTTACAGT/-------- TTTACAGTTT 3070 het 3070 ref 34 17 9 11 TTTACAGT 2 1 147597 CASAVA_Build 18 19300254 1I GATTTATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2302 hom 34 9 16 9 T 11 12 147598 CASAVA_Build 18 19318308 2D GCACGGGAGA CT/-- CTAAGGAAGA 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 CT 2 1 147599 CASAVA_Build 18 19320058 2I TTATAAAGTT --/TA TATATCTTCT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 TA 2 3 147600 CASAVA_Build 18 19323453 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 26 1 15 10 T 15 14 147601 CASAVA_Build 18 19323872 1D CCAGCACTCT G/- GAAGGCCGAG 1598 het 913 hom 10 2 4 4 G 2 1 147602 CASAVA_Build 18 19326455 4I AAAAAAAGAT ----/AGAA AGAAAGAAAG 2111 hom 27 het 14 0 10 4 AGAA 3 4 147603 CASAVA_Build 18 19330550 1I AGTCTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 2994 het 2994 ref 30 13 9 8 T 13 14 147604 CASAVA_Build 18 19331687 4I AGACTCCATC ----/ACAA ACAAACAAAC 3070 hom 51 het 28 0 17 11 ACAA 3 4 147605 CASAVA_Build 18 19333373 2I CACACACGCG --/CA CACACACGCG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 CA 3 4 147606 CASAVA_Build 18 19350474 1D CCACGTGATG C/- CCTGACCCCT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 C 3 2 147607 CASAVA_Build 18 19356309 1D CTGGTGAATT G/- GGGGAAAAAA 3070 het 2832 hom 26 9 14 3 G 5 4 147608 CASAVA_Build 18 19356843 1I TGCCACTGGG -/T TGGGCGTGCT 3070 hom 105 het 39 0 34 5 T 1 2 147609 CASAVA_Build 18 19365429 1D TTTTGTATTT G/- TCTCTCAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 G 1 0 147610 CASAVA_Build 18 19383621 1I AATAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 2422 het 2422 ref 19 9 6 4 T 10 11 147611 CASAVA_Build 18 19400551 3I TCCAAAAAAT ---/AAA AAAATACTTA 3070 hom 77 het 31 0 27 4 A 4 7 147612 CASAVA_Build 18 19405616 2D AGTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 22 1 15 6 A 15 13 147613 CASAVA_Build 18 19406614 2D16M4I TAGGCAACAT GGTGAAGCCCCATCTCCC----/--TGAAGCCCCATCTCCCCAAA CAAATTTTTA 3070 het 163 hom 34 1 22 15 N/A 0 0 147614 CASAVA_Build 18 19407814 4D TGTAAGAAAT ACTC/---- AATCACAGTA 3070 het 3070 ref 40 21 18 4 ACTC 1 0 147615 CASAVA_Build 18 19416769 1D CCTGGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 30 1 15 14 A 15 14 147616 CASAVA_Build 18 19443130 1I GATTTGCTCC -/T GGGGGTAACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 0 1 147617 CASAVA_Build 18 19455443 2D GTGCTGAAAC AA/-- AGGATAGAGG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 3 1 147618 CASAVA_Build 18 19467850 1I GTTTCTATAT -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 7 8 147619 CASAVA_Build 18 19536681 2I CCCAAATCTC --/TG TGGTGCCCAA 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 TG 1 2 147620 CASAVA_Build 18 19538811 15I GTGAATTCTA ---------------/AAGTATTACACGTGG AAGGCTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 AAGTATTACACGTGG 0 1 147621 CASAVA_Build 18 19544134 3I GACGTGCAGA ---/TCT TCTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 TCT 1 2 147622 CASAVA_Build 18 19544346 1D AACCTTGTTG C/- TTGGTGCCAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 C 1 0 147623 CASAVA_Build 18 19548116 1D TAATTATTGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 10 9 147624 CASAVA_Build 18 19565742 1D GAGGGAGGGA G/- GGGAAAGGGT 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 G 4 3 147625 CASAVA_Build 18 19567443 4I TGTGAGACTT ----/ACTC ACTACCATGA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 ACTC 0 1 147626 CASAVA_Build 18 19582711 2D GAGCCAAGAC TG/-- TGCCACAGCA 3070 het 1375 hom 24 6 12 6 TG 2 1 147627 CASAVA_Build 18 19582759 1I TCCATCTTGG -/A AAAAAAAAAA 1198 het 1198 ref 32 16 4 12 A 15 16 147628 CASAVA_Build 18 19592514 1D GTGGCCTTCT C/- CCCCCTCTCC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 6 5 147629 CASAVA_Build 18 19611215 1I ATTTTATGTT -/A AAAAAAAAAA 2900 het 2900 ref 30 15 10 5 A 11 12 147630 CASAVA_Build 18 19647228 1I GATTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 10 11 147631 CASAVA_Build 18 19667356 1D AAAACTTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 A 10 9 147632 CASAVA_Build 18 19682849 2D AGGTATTCCT GG/-- GGGAGTCCCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 G 5 3 147633 CASAVA_Build 18 19688963 4D AATAAATAAA AAAT/---- AAAAAAATTT 3070 het 2370 hom 19 7 11 1 AAAT 1 0 147634 CASAVA_Build 18 19698188 1I CTTTCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 1520 het 1520 ref 31 18 4 9 T 15 16 147635 CASAVA_Build 18 19750964 1D CAATAGGTAA T/- TTTTTCTGTC 3070 hom 85 het 31 0 29 2 T 6 5 147636 CASAVA_Build 18 19770148 2D AAACTTAAGA CT/-- CTTTTTTTTC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CT 2 1 147637 CASAVA_Build 18 19772782 3I ATGCTCCCCA ---/AAG AAGGAGGGAG 3070 hom 111 het 41 0 35 6 AAG 1 2 147638 CASAVA_Build 18 19774808 1D GTTGTCCCCT C/- CCCTGGCTAC 3070 hom 71 het 28 0 24 4 C 4 3 147639 CASAVA_Build 18 19781775 1D TCCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2656 het 331 hom 25 1 11 13 T 17 16 147640 CASAVA_Build 18 19795805 1I CCTCTTTGGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 8 9 147641 CASAVA_Build 18 19798927 2I AAAACCAAAG --/AC AGGCAGCCTG 3070 hom 24 het 10 0 8 2 AC 0 1 147642 CASAVA_Build 18 19816009 2D AGGACAGCCA AG/-- AGAGAGGGCT 3070 het 3070 ref 45 21 16 9 AG 4 3 147643 CASAVA_Build 18 19822174 1I AAAAAAAAAA -/C CCCACACATT 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 C 3 4 147644 CASAVA_Build 18 19824058 7D GTGGATGAAT GCTCATA/------- GCAGCTTTAT 3070 het 3070 hom 48 22 25 4 GCTCATA 1 0 147645 CASAVA_Build 18 19825410 1I TATCTATGAC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 7 8 147646 CASAVA_Build 18 19832773 16I CATGAAGCTG ----------------/GTTCTAAATAGAGACA GTGGAGCTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 GTTCTAAATAGAGACA 0 1 147647 CASAVA_Build 18 19832922 1D TTACACAGCT G/- CCAGGTGAAA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 G 1 0 147648 CASAVA_Build 18 19835795 6I GTTTTTTTTT ------/TTTTGG TTTTTTTTTT 2134 hom 21 het 11 0 7 4 TTTTGG 0 1 147649 CASAVA_Build 18 19837654 1D AGACAAATAC T/- TTTTTAAATG 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 T 6 5 147650 CASAVA_Build 18 19839978 1D CTACAGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 776 hom 25 4 15 6 T 15 14 147651 CASAVA_Build 18 19841346 4D TTTTACTATC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 47 13 23 12 TTTA 3 2 147652 CASAVA_Build 18 19841859 4I CACACTGACT ----/TTAA TTAATATCTG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TTAA 1 2 147653 CASAVA_Build 18 19846132 10I ATTTGGAGGC ----------/CCATTTTGAA TCTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 49 20 27 2 CCATTTTGAA 0 1 147654 CASAVA_Build 18 19852346 2I GCTCCCCCTC --/CA CACACACACA 3070 het 86 hom 58 1 40 17 CA 6 7 147655 CASAVA_Build 18 19857780 8D4M1D TTGCTAACAA TTCCCCTTTTATG/--------ATAT- ATTGTAATTC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 N/A 0 0 147656 CASAVA_Build 18 19861853 1I AAGGCTGCAT -/G GGGGTGGGCT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 4 5 147657 CASAVA_Build 18 19863652 2I CAAAGTCTAT --/TG TGTCATTGTT 3070 hom 109 het 38 0 30 8 TG 1 2 147658 CASAVA_Build 18 19865228 4I2M1I CCTCCGAGGA ----TA-/CTTTTAC AGTCTTTTAC 3070 hom 87 het 30 0 28 2 N/A 0 0 147659 CASAVA_Build 18 19868608 1D TCCCATTTCT C/- CCTAGCCCCA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 3 2 147660 CASAVA_Build 18 19869009 1I TATTTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 10 11 147661 CASAVA_Build 18 19869673 1D TCAGACATTT C/- CCCCCCCATT 3070 hom 99 het 42 0 33 9 C 8 7 147662 CASAVA_Build 18 19886504 1D ATCTTGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 10 9 147663 CASAVA_Build 18 19890541 5I GTGTTTCAGG -----/AAATA AAATCATCAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AAATA 0 1 147664 CASAVA_Build 18 19891070 4D AGTCTTGCTT TATC/---- TATCTTCTGT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 TATC 2 1 147665 CASAVA_Build 18 19891485 2I CATTAGAAGT --/CA GAATAGTGGT 2138 hom 20 het 39 0 6 33 CA 0 1 147666 CASAVA_Build 18 19896582 1I ACCCCCTCAC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 7 8 147667 CASAVA_Build 18 19907495 1D ATCCTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 11 10 147668 CASAVA_Build 18 19912701 13I GATCATGTAG -------------/GCACCCCTACCTT GCACATAGAC 3070 hom 120 het 43 0 40 6 GCACCCCTACCTT 0 1 147669 CASAVA_Build 18 19913769 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 26 2 16 8 T 13 14 147670 CASAVA_Build 18 19913895 27D TCCCAGGTAG CTGGGACTACAGGTGTGCACTACCACA/--------------------------- CCTGGCTAAA 3070 het 3070 ref 20 13 8 6 CTGGGACTACAGGTGTGCACTACCACA 1 0 147671 CASAVA_Build 18 19917722 3D GAGTCTACTT CTC/--- CTTTGCATAT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 CTC 1 0 147672 CASAVA_Build 18 19949947 9D CAGAAGGAAG CTTAGAAAT/--------- CACCCAACCC 3070 het 3070 ref 35 21 12 11 CTTAGAAAT 1 0 147673 CASAVA_Build 18 19953088 1D CTGTTTTGAA T/- TAAGTGTTTT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 2 1 147674 CASAVA_Build 18 19953592 1I GACAGGCGTG -/T TTCTCATGGC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 2 3 147675 CASAVA_Build 18 19953926 1D AACATTAATT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2754 hom 27 9 10 8 C 10 9 147676 CASAVA_Build 18 19954818 2D ATGTTGTAAC AT/-- GTGTCAGGAT 3070 het 3070 hom 55 18 32 7 AT 1 0 147677 CASAVA_Build 18 19962029 1D CCCCTGTGCC T/- TTGCACTTGC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 3 2 147678 CASAVA_Build 18 19972051 1I AGAGTGGGCG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 2443 hom 22 6 14 2 T 7 8 147679 CASAVA_Build 18 19974473 3I TAATCACATT ---/GTG GGGAATGGGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 GTG 0 1 147680 CASAVA_Build 18 19976352 1D AGAAAAAAAC T/- TATCTTGTAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 2 1 147681 CASAVA_Build 18 19980097 1I CCATAGAATA -/T TCCTGATACT 3070 het 3070 hom 57 21 28 8 T 1 2 147682 CASAVA_Build 18 19985120 2I CTGAATCTCC --/AT ATGAGTTGTG 3070 hom 132 het 53 0 44 9 AT 1 2 147683 CASAVA_Build 18 19992283 1D GTATTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1710 het 1710 ref 23 11 6 6 T 15 14 147684 CASAVA_Build 18 19994312 4I TCCATTGTCT ----/AACA AACAAACACA 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 AACA 2 3 147685 CASAVA_Build 18 19997038 1D TGTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 11 10 147686 CASAVA_Build 18 19997588 1I CCACAAGGCA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 T 7 8 147687 CASAVA_Build 18 20000050 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTATAAAA 3070 het 1929 hom 27 6 19 3 CT 2 1 147688 CASAVA_Build 18 20004110 2I TCCTATACAA --/GT GGCTATGCCG 3070 het 3070 hom 48 22 20 6 GT 0 1 147689 CASAVA_Build 18 20005906 1I TGCCTGATCC -/T TTTTTTTTTT 2808 het 1716 hom 30 7 11 12 T 15 16 147690 CASAVA_Build 18 20008178 1I GGGATGAACG -/T TAAGTTTCCA 3070 het 3070 ref 66 33 26 7 T 1 2 147691 CASAVA_Build 18 20012443 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGTTTCAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 G 5 4 147692 CASAVA_Build 18 20016040 5D TTGAAATGAC AATGA/----- AATGAAATGA 3070 het 3070 hom 39 17 19 6 AATGA 4 3 147693 CASAVA_Build 18 20018211 1I AATGCTTTCC -/A AAAACACCTT 3070 het 3070 hom 36 10 23 3 A 4 5 147694 CASAVA_Build 18 20025505 1I ACATTTTACC -/T TTTGTTAATA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 3 4 147695 CASAVA_Build 18 20038521 1D AAGCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3040 hom 32 12 10 10 T 15 14 147696 CASAVA_Build 18 20044921 1D CCCAAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 11 10 147697 CASAVA_Build 18 20046197 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1199 het 1199 ref 17 9 5 3 T 13 14 147698 CASAVA_Build 18 20066787 2I AAAGATGAAT --/GA GATATGGCTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GA 1 2 147699 CASAVA_Build 18 20068488 1I AGCGATCCCA -/G GGGGGGACGC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 G 6 7 147700 CASAVA_Build 18 20071049 1D TTCATGACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 103 het 42 0 34 8 A 10 9 147701 CASAVA_Build 18 20081660 1D TTGAACTCCC G/- GGACTCAAAC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 3 2 147702 CASAVA_Build 18 20086481 1D27M1D CCTTCCCAGG AAAAAAAAAAATGCTGAGGGATTTCATCA/-AAAAAAAAAATGCTGAGGGATTTCATC- ACACCAGACG 3070 hom 93 het 29 0 32 6 N/A 0 0 147703 CASAVA_Build 18 20089750 1D ATGGAGTCTC G/- CTCTCTCGCC 1289 het 30 hom 12 1 4 8 G 1 0 147704 CASAVA_Build 18 20101807 1D GAGGTATGCC T/- TTTTTTTTTT 1446 het 1446 ref 40 24 7 9 T 15 14 147705 CASAVA_Build 18 20102488 1I ATGTACCCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 38 0 28 10 T 9 10 147706 CASAVA_Build 18 20117927 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1413 het 1413 ref 34 25 4 6 TA 7 6 147707 CASAVA_Build 18 20118591 1D ATCCTAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 32 0 28 5 A 12 11 147708 CASAVA_Build 18 20151484 1D ACTGAACAGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 44 0 37 9 A 9 8 147709 CASAVA_Build 18 20161074 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1245 het 1245 ref 30 21 3 6 T 14 13 147710 CASAVA_Build 18 20175414 2D GCTGGTTATC CT/-- CTGTTTTGTC 3070 het 3070 ref 35 21 14 1 CT 2 1 147711 CASAVA_Build 18 20188384 1I GCAGGAACAC -/G GGGGGAACAC 3070 het 3070 ref 64 30 25 9 G 5 6 147712 CASAVA_Build 18 20190143 2D ATCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 37 1 34 3 A 12 10 147713 CASAVA_Build 18 20193657 1I TAAATAAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 1813 hom 26 5 21 0 T 2 3 147714 CASAVA_Build 18 20195970 13D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAG/------------- ACATAGACAA 2772 het 2354 hom 27 10 9 14 AAAAAAAAAAAAG 1 0 147715 CASAVA_Build 18 20201893 4I TTGTTTTTTC ----/TTTT TTTTTAATTT 3070 het 2872 hom 31 9 19 3 T 5 9 147716 CASAVA_Build 18 20217110 1D CTGGAAAATG T/- TAAGTTATTA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 2 1 147717 CASAVA_Build 18 20228786 4I TTAAAGACTG ----/TACA CTTTCACTAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 TACA 0 1 147718 CASAVA_Build 18 20229578 1D ATGGGGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 25 1 23 1 T 11 10 147719 CASAVA_Build 18 20242027 13D GACTCCATCT AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAT 3070 het 42 hom 9 1 14 0 A 22 9 147720 CASAVA_Build 18 20242292 1D ATCAATAAAT G/- GTTGTTGAAT 3070 hom 99 het 42 0 34 9 G 2 1 147721 CASAVA_Build 18 20243722 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 7 147722 CASAVA_Build 18 20243896 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 742 het 177 hom 17 1 6 10 A 10 11 147723 CASAVA_Build 18 20245590 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2355 hom 24 het 10 0 6 5 A 12 11 147724 CASAVA_Build 18 20249211 4D ATTATTTTCA TACT/---- TACAGGGAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TACT 1 0 147725 CASAVA_Build 18 20249891 1D AAGTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 13 12 147726 CASAVA_Build 18 20250932 1I TTATTTCAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 10 147727 CASAVA_Build 18 20260073 3I CAAAATATTC ---/AAG GAGACTAAAG 3070 hom 151 het 54 0 51 3 AAG 0 1 147728 CASAVA_Build 18 20260231 4I TTAAAAACAG ----/ACAA ACAAACAAAC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 ACAA 2 3 147729 CASAVA_Build 18 20274106 6D5M19D TCAGTATGGA CTCATGTATATTATTTCAGTCCATGGGTTA/------TATAT------------------- AAATGCCATC 3070 hom 81 het 24 0 28 1 N/A 0 0 147730 CASAVA_Build 18 20292196 6D ATTTGTGACT TATACA/------ TATACTTAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 3 TATACA 1 0 147731 CASAVA_Build 18 20307940 1I GCCTGGTTCC -/G GATTCAAGCA 3070 hom 115 het 43 0 35 8 G 1 2 147732 CASAVA_Build 18 20308226 1I AGCAGAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 42 1 35 6 A 10 11 147733 CASAVA_Build 18 20308659 1I ACCTTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 39 0 25 14 T 13 14 147734 CASAVA_Build 18 20322952 1I ACCACATGTT -/A AAGTATCCAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 2 3 147735 CASAVA_Build 18 20326173 2I GCCTCTTCAC --/CT CTCATCACAT 3070 hom 108 het 38 0 35 3 CT 1 2 147736 CASAVA_Build 18 20330546 1D TACCAGTTCC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 111 het 47 0 37 10 T 8 7 147737 CASAVA_Build 18 20373356 2I TATATATATA --/TT TTAAACATAC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 2 4 147738 CASAVA_Build 18 20378158 3D AGGTTGGGGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 14 11 147739 CASAVA_Build 18 20383523 1D ATTATTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 38 3 25 10 A 17 16 147740 CASAVA_Build 18 20383636 1D TTTAAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 10 9 147741 CASAVA_Build 18 20387081 2D AAGCAAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2201 hom 25 11 8 7 A 13 11 147742 CASAVA_Build 18 20388371 1D CCAAACTGAG T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 8 7 147743 CASAVA_Build 18 20388850 2D CTTTTGGAAA CT/-- CTACCTAGAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CT 2 1 147744 CASAVA_Build 18 20397058 1D GACTCTGGGT C/- CATGCTCTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 2 1 147745 CASAVA_Build 18 20397543 1I TTTCTTTTTT -/A AAATATATTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 3 4 147746 CASAVA_Build 18 20406068 1D CTTTCTCTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 10 9 147747 CASAVA_Build 18 20409104 1D TCTCAGTCTT A/- ACTAGGAACC 3070 hom 132 het 47 0 43 4 A 2 1 147748 CASAVA_Build 18 20424765 1D AGGCGTGAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 138 het 55 0 45 10 T 10 9 147749 CASAVA_Build 18 20440408 5D CTGGGGAAAA TAACT/----- TAAAGCATAT 3070 hom 76 het 32 0 26 9 TAACT 1 0 147750 CASAVA_Build 18 20462924 3D ACAGGTAGAG ATA/--- ATAATAATTC 3070 hom 75 het 30 0 26 7 ATA 3 2 147751 CASAVA_Build 18 20486011 1I CTTTGCCACG -/C TCCCCATCAA 3070 het 3070 ref 58 30 19 9 C 0 1 147752 CASAVA_Build 18 20498498 2I GGCGAGGAAA --/CC CTTCAGCCAG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 C 1 3 147753 CASAVA_Build 18 20499521 3I GCTATCACTT ---/CTG CTACCACTTG 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 CTG 0 1 147754 CASAVA_Build 18 20501100 1I AATAACTGTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 8 9 147755 CASAVA_Build 18 20501292 3I CCAGAGTCTG ---/CAT CATTGGTTGC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 CAT 1 2 147756 CASAVA_Build 18 20512993 4I CTTTCTCTCT ----/CACA CACACTCTGG 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 CA 2 4 147757 CASAVA_Build 18 20516975 2I CATATTTTCT --/GG GTACCTTTGA 2783 het 2783 ref 33 19 8 6 G 1 3 147758 CASAVA_Build 18 20524924 3D GGCAAAACCA AGG/--- AACTGGTGAA 3070 het 3070 ref 53 26 23 7 AGG 1 0 147759 CASAVA_Build 18 20532860 1D GACACCATTT G/- GGCAAAAAGA 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 G 3 2 147760 CASAVA_Build 18 20538210 1D GAGTTTGAGA C/- CAGCCTGGGA 1822 het 1822 ref 17 7 5 5 C 2 1 147761 CASAVA_Build 18 20554519 2I AGAAAAAAAC --/AT ATATGATCTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 AT 2 3 147762 CASAVA_Build 18 20554996 8D43M17I AAGTTAATGA TTTTCAAGTTTTCAAGTTTTGGGAGATTTCAGCCATTATTTCTTCAGTGAA-----------------/--------TTTTCAAGTTTTGGGAGATTTCAGCCATTATTTCTTCAGTGAATTTTCTGGACCTTTCCC TTGTCTTCTG 3070 het 3070 ref 46 27 24 11 N/A 0 0 147763 CASAVA_Build 18 20560313 3D CCCCGATCAT TGC/--- TGCTATCTCC 3070 het 3070 ref 27 17 7 6 TGC 2 1 147764 CASAVA_Build 18 20567624 4D GAAGTGGCAT TTGC/---- TTGCCAGCTG 3070 het 3070 ref 50 25 12 14 TTGC 2 1 147765 CASAVA_Build 18 20586805 1I CAATATGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 11 12 147766 CASAVA_Build 18 20591402 3I GGGGCTGCTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TTG 3 4 147767 CASAVA_Build 18 20665724 2I ACCAGCCACA --/CT CTCTTGGCAC 3070 hom 86 het 33 0 26 7 CT 2 3 147768 CASAVA_Build 18 20672820 3D AATGCTCTGG TTA/--- TTATTTATAG 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TTA 2 1 147769 CASAVA_Build 18 20674744 4D TGTACGTATG TGTA/---- TGTGTCTATG 3070 hom 162 het 60 0 54 8 TGTA 1 0 147770 CASAVA_Build 18 20698983 3D TCAGACTCTG TTC/--- TTCTGTTGTG 3070 het 3070 ref 49 22 21 8 TTC 2 1 147771 CASAVA_Build 18 20701231 4D TGGAGTTGTC TGAG/---- TGACCACCAG 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 TGAG 1 0 147772 CASAVA_Build 18 20702422 3I TGTTGTTTCT ---/ACC ACCGGACAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 ACC 1 2 147773 CASAVA_Build 18 20703211 2I TCACTACACC --/AG AGTCTTCACA 3070 het 3070 hom 32 16 16 0 AG 1 2 147774 CASAVA_Build 18 20715319 1D CTGGAAAAGT G/- TTTTTAACAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 G 1 0 147775 CASAVA_Build 18 20745746 11D CTGTCCCTGG GCTCTTGGAGC/----------- ACCCTGGTGC 3070 het 3070 ref 34 20 15 2 GCTCTTGGAGC 1 0 147776 CASAVA_Build 18 20748392 2D TGTCCTTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 T 12 10 147777 CASAVA_Build 18 20749115 3D ATTTAGAAAC AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 het 3070 hom 46 18 16 12 AGG 7 6 147778 CASAVA_Build 18 20750592 2D CTGATCTATA AT/-- ATTATAGTCT 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 AT 2 1 147779 CASAVA_Build 18 20751661 3D GGACACAGAA AGG/--- AGACGGGAGA 2071 het 2071 ref 18 8 6 5 AGG 1 0 147780 CASAVA_Build 18 20752729 4D ATGAATTAAC AAAT/---- AAATGAATGA 3070 het 3070 hom 36 15 20 3 AAAT 2 1 147781 CASAVA_Build 18 20754560 2I TTATAAACAC --/AT GATTACATGA 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 AT 0 1 147782 CASAVA_Build 18 20756985 1D TTTCAATTTG T/- TTTTTAACCA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 6 5 147783 CASAVA_Build 18 20757402 1D CAAATGGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 10 9 147784 CASAVA_Build 18 20764297 3D TCTATGCACT TTA/--- TTGTCTGAAT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 TTA 1 0 147785 CASAVA_Build 18 20766084 3D AGAGCTCCAC TGA/--- TGATAGAATC 3070 het 3070 ref 50 27 19 6 TGA 2 1 147786 CASAVA_Build 18 20766849 3D GAGTAGCATT TGA/--- TGATAAATAT 3070 hom 117 het 43 0 40 4 TGA 2 1 147787 CASAVA_Build 18 20769690 1D AATCCAGACA T/- TGGAGGATGG 3070 het 3070 ref 43 21 17 7 T 2 1 147788 CASAVA_Build 18 20778874 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 10 9 147789 CASAVA_Build 18 20781803 1D TCCATTGTAA T/- TATCATTTAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 2 1 147790 CASAVA_Build 18 20788013 1D TAGTATATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 16 7 A 14 13 147791 CASAVA_Build 18 20815918 1D GAACTGGCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 A 10 9 147792 CASAVA_Build 18 20820952 1I CTGAGCTTGC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 8 9 147793 CASAVA_Build 18 20823547 4I AGAGAAGAGA ----/AAAG AAAGAGAGAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AAAG 1 2 147794 CASAVA_Build 18 20832245 4D AATAGCAAAC CAAA/---- CAAAGATAAA 3070 het 3070 ref 37 21 14 4 CAAA 2 1 147795 CASAVA_Build 18 20832806 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2174 hom 15 5 9 1 A 13 14 147796 CASAVA_Build 18 20834445 1D GTTTCTGAGT A/- ATTTGGACTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 2 1 147797 CASAVA_Build 18 20836142 1D TCTCCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 12 11 147798 CASAVA_Build 18 20843580 6D AATTGTTGCC TGGGCA/------ TGGTGGCTCA 2278 het 2278 ref 32 24 6 2 TGGGCA 1 0 147799 CASAVA_Build 18 20853212 3D CCACAGACGG AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 66 27 27 12 AAC 4 3 147800 CASAVA_Build 18 20857954 1D CAACAAAAAA T/- ATTAACAAAG 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 T 1 0 147801 CASAVA_Build 18 20868846 1I GCAAACCATA -/G CCAAGAAGCA 3070 het 3070 ref 56 25 24 7 G 0 1 147802 CASAVA_Build 18 20889144 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 12 7 A 11 9 147803 CASAVA_Build 18 20889370 1I AGCAAAAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 10 11 147804 CASAVA_Build 18 20893227 1D TGGATGTTTT C/- CCCCCCTCTA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 C 7 6 147805 CASAVA_Build 18 20898274 1D GCCATTGGGG A/- ATGGTTCCAA 3070 het 3070 ref 41 15 13 14 A 2 1 147806 CASAVA_Build 18 20922686 1I CTCTGACTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 8 9 147807 CASAVA_Build 18 20923014 1D TTCTTTTCTT C/- CCCTCTCCCT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 C 4 3 147808 CASAVA_Build 18 20937747 4D GAAGGGTGAG AGGA/---- AGGAAGGGAG 1962 hom 27 het 11 0 8 4 AGGA 2 1 147809 CASAVA_Build 18 20942733 1I ACTACAGGCG -/T TGTGTCACCA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 1 2 147810 CASAVA_Build 18 20947952 1D TAAAAAAGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 147811 CASAVA_Build 18 20959593 2D GGCACTAATG GT/-- GTGTGTGTGT 1065 het 1065 ref 51 40 4 8 GT 6 5 147812 CASAVA_Build 18 20963254 2D TTAATTAATC TG/-- TGTCTAGATT 3070 het 2157 hom 17 6 7 4 TG 2 1 147813 CASAVA_Build 18 20976725 1I TTGTAAGTTA -/T TTTTTTGCAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 7 147814 CASAVA_Build 18 20981194 1D AAACCAGTCA T/- TAACAAGGGT 3070 hom 120 het 50 0 41 9 T 2 1 147815 CASAVA_Build 18 20983001 1D AGGACTTTTC T/- TTTTTCACCA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 6 5 147816 CASAVA_Build 18 20993476 1I TAACACTAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 38 0 28 10 A 9 10 147817 CASAVA_Build 18 21026653 1D TTGATTAGAC A/- AAAAAAAAAA 1312 het 1312 ref 49 35 4 11 A 12 11 147818 CASAVA_Build 18 21029535 1I CATGCGTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 10 147819 CASAVA_Build 18 21063299 1I ACCAAACACC -/G ATTCCTGGAT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 G 0 1 147820 CASAVA_Build 18 21140817 1I ACAATTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1029 hom 39 4 28 7 A 13 14 147821 CASAVA_Build 18 21151830 3D GAATTCTCAT CTA/--- CTGCTGGTGG 3070 het 3070 ref 36 28 8 1 CTA 1 0 147822 CASAVA_Build 18 21158361 1D CAACAGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 11 13 A 15 14 147823 CASAVA_Build 18 21162518 1D TTTTTATTAA T/- TTTTTTTTTT 1072 het 400 hom 6 1 3 2 T 15 14 147824 CASAVA_Build 18 21164150 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 3070 het 2449 hom 26 6 17 3 AG 2 1 147825 CASAVA_Build 18 21165281 1I TAAAACTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 11 12 147826 CASAVA_Build 18 21166045 1D CTTTCTTTTT C/- CCCTTCAGCA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 C 4 3 147827 CASAVA_Build 18 21168169 1I TGCTACCATA -/C TTTTTCTTGG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 C 0 1 147828 CASAVA_Build 18 21182666 2I AAACAGATGC --/TG TGTCTTTGTG 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 TG 1 2 147829 CASAVA_Build 18 21184602 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1626 hom 31 7 14 10 C 0 1 147830 CASAVA_Build 18 21185419 2D AACAAATCCG CC/-- CCCCCCCCCA 1878 het 1878 ref 18 7 5 6 C 11 9 147831 CASAVA_Build 18 21204653 2I ATTTTAAGAC --/CT CTGTTTTAAA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 CT 1 2 147832 CASAVA_Build 18 21206299 1D CGTCTAAGTA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 9 8 147833 CASAVA_Build 18 21208732 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 14 1 12 1 A 12 13 147834 CASAVA_Build 18 21230325 1I TCTTCAAAAA -/G GTGGGGGTCA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 1 2 147835 CASAVA_Build 18 21233420 1D ATAAAATGTG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 7 6 147836 CASAVA_Build 18 21236840 1I AACTTTCCCT -/C CCTGAAGGAC 3070 het 3070 ref 60 32 24 4 C 2 3 147837 CASAVA_Build 18 21237109 3D GCTATATTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 28 1 24 4 T 15 12 147838 CASAVA_Build 18 21242601 1I TTAGGTTTCA -/T TTTTTTATGC 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 T 6 7 147839 CASAVA_Build 18 21244535 1D TACAATTCAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 9 8 147840 CASAVA_Build 18 21245860 1I GTCTTCTGTA -/T TATCTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 1 2 147841 CASAVA_Build 18 21250683 1D GCAGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 636 hom 25 3 14 8 A 15 14 147842 CASAVA_Build 18 21273414 1D TCATTATGAC T/- TTTTTTGCTG 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 7 6 147843 CASAVA_Build 18 21280852 1D TGTTTTTTCG T/- TTTGTTTGCT 3070 hom 85 het 34 0 28 8 T 4 3 147844 CASAVA_Build 18 21283063 1I AAGAGGGACT -/G ACAGAAGGTT 3070 hom 151 het 53 0 51 2 G 0 1 147845 CASAVA_Build 18 21286902 2D AAACTCTGTG AC/-- ACACACTCTA 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 AC 4 3 147846 CASAVA_Build 18 21288018 1D GGTGGACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 10 12 T 15 14 147847 CASAVA_Build 18 21305632 1D CTTTAGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 37 1 31 5 T 12 11 147848 CASAVA_Build 18 21308473 1I CCTTCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 10 11 147849 CASAVA_Build 18 21313896 2D GCCACAGAAA AT/-- CTAGTTCTGA 3070 het 3070 hom 40 14 19 10 AT 1 0 147850 CASAVA_Build 18 21321394 3D TAAAAATAAA AAT/--- AAAAAAAAAA 2419 het 102 hom 8 1 5 3 AAT 1 0 147851 CASAVA_Build 18 21322769 1D TATAATTTGC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 9 8 147852 CASAVA_Build 18 21345812 1D TGTTTATTCA T/- TTAAAAACTA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 3 2 147853 CASAVA_Build 18 21362406 1I AAGAAATTTT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 A 7 8 147854 CASAVA_Build 18 21371141 2D TGGGGGAGGC TG/-- TGTGTGTGTG 1537 het 1537 ref 45 33 4 9 TG 6 5 147855 CASAVA_Build 18 21386498 1I AATAAGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2049 hom 28 8 11 9 T 12 13 147856 CASAVA_Build 18 21411512 1D AACAGTAAAA C/- CTTTTTTGTC 2608 het 739 hom 11 2 7 2 C 2 1 147857 CASAVA_Build 18 21413788 1D TTTTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 32 2 13 17 T 12 11 147858 CASAVA_Build 18 21421586 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 2905 hom 25 7 16 2 A 7 8 147859 CASAVA_Build 18 21431917 3I AGAGGAACTG ---/ATC ATCATTGAAT 3070 het 3070 ref 58 25 25 8 ATC 1 2 147860 CASAVA_Build 18 21441964 1I CAGTAGGTTA -/T TATCATCTTT 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 T 1 2 147861 CASAVA_Build 18 21448428 1I CAAACCCAAA -/C TTTGATAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 C 0 1 147862 CASAVA_Build 18 21457695 1I TGTCTCTTTG -/T TTCTTAATCT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 2 3 147863 CASAVA_Build 18 21459268 1I TCCTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1246 hom 23 4 12 7 T 11 12 147864 CASAVA_Build 18 21461104 1I ACACCCAGCC -/T TTTCTATTCT 3070 het 3070 ref 22 8 7 7 T 3 4 147865 CASAVA_Build 18 21464304 1D GAATTTACCC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 9 8 147866 CASAVA_Build 18 21480232 2D CAGTGTGGTG GT/-- GTTGGGAGGT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 GT 2 1 147867 CASAVA_Build 18 21481916 1I CATTTTTCCT -/C ACTGTATTCT 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 C 0 1 147868 CASAVA_Build 18 21494964 35D TGTGTGTCTG TGTGTGTGTATATATATATATATATATACACACAT/----------------------------------- TCACTCACAC 2660 het 2660 ref 22 21 6 2 TGTGTGTGTATATATATATATATATATACACACAT 1 0 147869 CASAVA_Build 18 21495425 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2062 het 1830 hom 17 7 6 4 A 13 14 147870 CASAVA_Build 18 21499967 1D AACAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 12 11 147871 CASAVA_Build 18 21507119 3D GCACGTTTAT GAA/--- GAAGAAGTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 GAA 3 2 147872 CASAVA_Build 18 21507204 4I CTAGTAAAGC ----/TTAA TTGTTTTCAT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 TTAA 0 1 147873 CASAVA_Build 18 21507570 5I ATAGTTTTAC -----/TGAGA TATCACATAA 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 TGAGA 0 1 147874 CASAVA_Build 18 21522706 1I CAAACCCTTC -/A ACGTGCATTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 1 2 147875 CASAVA_Build 18 21526015 2D TTTTAAGATG AT/-- ATGATTTCTT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 AT 2 1 147876 CASAVA_Build 18 21532142 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 A 10 9 147877 CASAVA_Build 18 21545071 1D TGTGTCTACA T/- TTCAGAGCTT 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 T 3 2 147878 CASAVA_Build 18 21569478 2D AAGTCTTTAA AC/-- AGTTTCCACC 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 AC 1 0 147879 CASAVA_Build 18 21569605 1I GGTCTAAGTT -/C TGCACCGCCC 3070 hom 102 het 39 0 30 9 C 0 1 147880 CASAVA_Build 18 21573572 6D GGGTGAGAAC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 16 22 14 A 16 10 147881 CASAVA_Build 18 21580129 1D AGGGACTCCT C/- CCCTAACTCA 3070 hom 68 het 27 0 21 7 C 4 3 147882 CASAVA_Build 18 21582503 1D GGTTGTGGGG A/- AGGGAGAGCA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 2 1 147883 CASAVA_Build 18 21585673 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 19 9 7 3 A 9 10 147884 CASAVA_Build 18 21586083 1D TGTAGCACCA C/- CCCCCTTCAC 3070 het 77 hom 49 1 40 10 C 6 5 147885 CASAVA_Build 18 21586752 1D TAATAGATGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 9 8 147886 CASAVA_Build 18 21588983 1D CTCTTACCAC A/- AAAAATGATA 3070 het 3070 ref 36 23 13 1 A 6 5 147887 CASAVA_Build 18 21593123 2D AAATCAAAAC AG/-- AATGTTAAAT 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 AG 1 0 147888 CASAVA_Build 18 21595595 1D CCCAATTTTG A/- AAAAAAAAAA 2210 het 1647 hom 26 12 8 7 A 13 12 147889 CASAVA_Build 18 21609802 5D GAAAACCAGC ACAAG/----- ACAAGGATGC 2404 het 1429 hom 9 3 5 1 ACAAG 2 1 147890 CASAVA_Build 18 21635110 2D ACAAAAATTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 24 0 21 5 A 14 12 147891 CASAVA_Build 18 21636254 1I TCGAATTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 36 2 28 6 T 11 12 147892 CASAVA_Build 18 21646988 2D ACGTGCATGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 AC 8 7 147893 CASAVA_Build 18 21668584 1I TGTTGTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 959 hom 40 3 29 8 T 11 12 147894 CASAVA_Build 18 21678901 1D TTATTATCTT C/- CCCCCTGGGG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 C 6 5 147895 CASAVA_Build 18 21681464 5D CCTCACCTGA AGAGC/----- AAGTCCCAAG 3070 hom 213 het 72 0 68 5 AGAGC 1 0 147896 CASAVA_Build 18 21683063 1I TTATTAAACT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 9 10 147897 CASAVA_Build 18 21695086 1D ACTCACCCCC T/- GTTGAGAAAA 3070 hom 111 het 42 0 32 10 T 1 0 147898 CASAVA_Build 18 21701454 1D GCTTGGCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 10 9 147899 CASAVA_Build 18 21701659 23I TAAAGTATAA -----------------------/TAAAAAAAAATTTTTTTTTTAAT TAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 11 0 10 1 TAAAAAAAAATTTTTTTTTTAAT 0 1 147900 CASAVA_Build 18 21713040 1D ATAATCTGGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 111 het 46 0 37 9 A 9 8 147901 CASAVA_Build 18 21715024 1D CAAAGCAGGG A/- ATGACATGAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 1 147902 CASAVA_Build 18 21727580 69D CGCTGTGGGC AGAAGTAATGAGTAATGAGTATGGGAATTCCTCCTACTTATAACTAACTTCTTTTCCTTTCTTGGGGTT/--------------------------------------------------------------------- TAAGAATAGG 3070 hom 99 het 36 0 34 6 AGAAGTAATGAGTAATGAGTATGGGAATTCCTCCTACTTATAACTAACTTCTTTTCCTTTCTTGGGGTT 1 0 147903 CASAVA_Build 18 21729628 4I ACAGAAAAGA ----/AACT AACTAACAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AACT 1 2 147904 CASAVA_Build 18 21729739 1I CTGTAGAGAC -/T TTTTTTTTTT 1416 het 1416 ref 33 18 5 10 T 15 16 147905 CASAVA_Build 18 21731028 1D ATCTCCCAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 9 8 147906 CASAVA_Build 18 21790647 1D GTTGGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 631 hom 28 5 14 9 T 17 16 147907 CASAVA_Build 18 21792170 1I CCCCGTGTAT -/C CCCCCTAAAA 3070 hom 84 het 33 0 26 7 C 5 6 147908 CASAVA_Build 18 21793964 2D ACAAACAAAC AA/-- ACATATATAG 1072 het 335 hom 20 4 6 10 A 3 1 147909 CASAVA_Build 18 21802567 1I GGGTAATAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 49 het 23 0 17 6 T 8 9 147910 CASAVA_Build 18 21804123 1D GAGCTGTGAG A/- AATAAATGTC 3070 hom 80 het 32 0 27 5 A 3 2 147911 CASAVA_Build 18 21830648 1I CATTTCATAG -/C CATGAAACAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 1 2 147912 CASAVA_Build 18 21858915 1I14M1I CAAATATGTT -AAAGGATGAAAAAT-/AAAAGGATGAAAAATA TATTATTCTA 3070 hom 72 het 25 0 25 4 N/A 0 0 147913 CASAVA_Build 18 21881443 1I AATTGGGAAA -/T AATCACATTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 0 1 147914 CASAVA_Build 18 21913395 1D CTTTCTTAAA T/- ATTTCATTTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 1 0 147915 CASAVA_Build 18 21913904 1D GTTTCACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 T 12 11 147916 CASAVA_Build 18 21949094 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 8 7 147917 CASAVA_Build 18 21956005 1D AGGAGAACTT C/- CCCCAACCTA 3070 hom 87 het 32 0 29 5 C 5 4 147918 CASAVA_Build 18 21968236 1D AGATTTCCCC T/- ATCTCTGCTG 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 1 0 147919 CASAVA_Build 18 22022303 1I AAAGGACACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1507 hom 26 4 16 6 A 14 15 147920 CASAVA_Build 18 22025542 1I GAACCCGGCA -/G GCAGAGGTTG 3070 hom 61 het 24 0 18 6 G 1 2 147921 CASAVA_Build 18 22055770 1D AAAAAAAAAC T/- TTTTTTTAGC 3070 hom 112 het 48 0 38 11 T 8 7 147922 CASAVA_Build 18 22056233 5I CAGTGATGCC -----/CACAT TGTGTTGCTC 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 CACAT 0 1 147923 CASAVA_Build 18 22062587 1I ATAAATAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 596 hom 24 2 15 7 A 11 12 147924 CASAVA_Build 18 22068094 1D CCCCATTCTG T/- TTCAGTCAGG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 3 2 147925 CASAVA_Build 18 22070893 1D GTCGGGTGAC A/- GGGGAGTATA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 1 0 147926 CASAVA_Build 18 22079024 1D CAAAGAGTCT G/- GGGTTGTTAG 2421 het 2421 ref 18 9 6 3 G 4 3 147927 CASAVA_Build 18 22083440 1I TCTCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 12 13 147928 CASAVA_Build 18 22086611 1D CCTACCTATT A/- GTTACTTAGT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 1 0 147929 CASAVA_Build 18 22088266 1I GTTTTGTTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 8 9 147930 CASAVA_Build 18 22089149 1D GAAGGGGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 12 8 8 A 10 9 147931 CASAVA_Build 18 22093134 1D ATTTCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 16 8 T 13 12 147932 CASAVA_Build 18 22095204 19D AGTGCAGTGG CGGGATCTCGGCTCACTGC/------------------- CGGGATCTCG 1365 het 1061 hom 6 3 4 0 CGGGATCTCGGCTCACTGC 2 1 147933 CASAVA_Build 18 22096239 8D TAGCCTTAGA TTGGGAGG/-------- TTAGGAGAGA 3070 het 3070 hom 37 16 19 4 TTGGGAGG 1 0 147934 CASAVA_Build 18 22100834 2I AAAACAAAAC --/AA AAAAAAAACA 3070 het 2471 hom 24 7 14 3 A 8 10 147935 CASAVA_Build 18 22103679 3I TGCCTTACAT ---/TCA TCATCTCATT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TCA 1 2 147936 CASAVA_Build 18 22104802 12D GAACCATGGA GTATTACATTGT/------------ GTTAGTACAT 3070 het 3070 ref 38 20 18 6 GTATTACATTGT 1 0 147937 CASAVA_Build 18 22106853 4I CATTTGAGGC ----/TCTA TCTATATTTA 3070 het 3070 hom 45 19 25 1 TCTA 1 2 147938 CASAVA_Build 18 22115233 1I AAAAGCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 10 11 147939 CASAVA_Build 18 22120583 1D GACCAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 34 1 21 12 T 15 14 147940 CASAVA_Build 18 22123140 2I AATATTACTC --/GA GTTTGAAAGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 GA 0 1 147941 CASAVA_Build 18 22128597 2D ATAACATTTG TA/-- TATATATGTA 1904 het 357 hom 14 2 4 8 TA 4 3 147942 CASAVA_Build 18 22128616 4D GTATCATACA TATT/---- TATTTATGAA 3070 het 569 hom 14 3 7 4 TATT 2 1 147943 CASAVA_Build 18 22130414 1I TTTCCATCTC -/T TTTTTGCCTG 1578 het 1578 ref 22 13 5 4 T 5 6 147944 CASAVA_Build 18 22130888 1I GATCACTTGA -/T GTCAAGAGTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 0 1 147945 CASAVA_Build 18 22150056 1I AGTCTTAGCT -/A ACTCGGGAGG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 1 2 147946 CASAVA_Build 18 22150338 3D GACCAGGGTT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 TTC 5 4 147947 CASAVA_Build 18 22152319 1I TTAGCTAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2574 hom 35 11 12 12 T 13 14 147948 CASAVA_Build 18 22153559 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 41 het 20 0 14 6 T 10 9 147949 CASAVA_Build 18 22155511 1D TTCCTGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3040 het 2136 hom 30 9 8 14 T 13 12 147950 CASAVA_Build 18 22159423 1D GTTTAAATAA G/- GTTATAGACT 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 G 2 1 147951 CASAVA_Build 18 22161588 1I GCTGGAATGC -/A AGTGGCATGA 3070 het 2599 hom 20 7 10 3 A 1 2 147952 CASAVA_Build 18 22173113 1D CTGTTGCCTG A/- AAAAACATTA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 6 5 147953 CASAVA_Build 18 22173545 1D TGCCTCAGCC T/- CCATAAGTTC 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 1 0 147954 CASAVA_Build 18 22175061 1D ATGCCTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 A 10 9 147955 CASAVA_Build 18 22175859 1I TGTTTAGTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 T 9 10 147956 CASAVA_Build 18 22178761 4D CTAGAATGTC AGAG/---- AGAGCGCTGG 3070 het 3070 ref 55 28 21 8 AG 4 2 147957 CASAVA_Build 18 22195707 11D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 1297 hom 20 6 14 2 A 21 10 147958 CASAVA_Build 18 22206806 1I GTGGCGGGTG -/C CTGTAGTCCC 2289 hom 21 het 9 0 7 2 C 1 2 147959 CASAVA_Build 18 22210482 1D TGTACATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 T 13 12 147960 CASAVA_Build 18 22215940 2I TATTTCATTC --/TA GAGTTATTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TA 0 1 147961 CASAVA_Build 18 22223078 2I CCAACCAGAG --/CA CTTACTTTAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CA 0 1 147962 CASAVA_Build 18 22223406 1I ATTTGATAGA -/T TTTTTATGTA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 5 6 147963 CASAVA_Build 18 22224145 4D TGGGACTCTT ACAG/---- ACTCAGATTC 3070 het 3070 ref 59 33 21 5 ACAG 1 0 147964 CASAVA_Build 18 22227074 21D TTTTAGATAT AGGGTCTTACTCTTTAGATCC/--------------------- AGGGTCTCAC 2905 het 2905 ref 31 18 10 9 AGGGTCTTACTCTTTAGATCC 1 0 147965 CASAVA_Build 18 22227901 4D AATGTTTATA TTAG/---- TTAGTCGTGG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 TTAG 2 1 147966 CASAVA_Build 18 22241645 1I CGAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2873 hom 26 9 13 4 T 13 14 147967 CASAVA_Build 18 22259590 2D28M4I TCTGCAGAAT CCCCCCCCCCCCTTTTTTTTCATAAGAAAT----/--CCCCCCCCCCTTTTTTTTCATAAGAAATAAAC ATACATAAAT 3070 het 14 hom 21 1 13 13 N/A 0 0 147968 CASAVA_Build 18 22293963 1D TAAGAGGTGA T/- TTTTTTCCAC 3070 hom 123 het 49 0 42 8 T 7 6 147969 CASAVA_Build 18 22297504 1D TAGAATACGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 16 8 T 12 11 147970 CASAVA_Build 18 22301099 1D GTATAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1574 het 1574 ref 26 17 4 5 T 13 12 147971 CASAVA_Build 18 22303133 1D CATGCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 43 2 25 16 T 13 12 147972 CASAVA_Build 18 22304243 1I ATAAGCGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 79 het 44 0 32 12 A 9 10 147973 CASAVA_Build 18 22321403 1D CTAATTGCTT C/- TTCAAATCAC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 C 1 0 147974 CASAVA_Build 18 22327374 1D TTTTGGGGGG A/- AAAACATGTA 3070 hom 103 het 40 0 35 5 A 5 4 147975 CASAVA_Build 18 22348512 10D ACCTTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 21 5 A 22 12 147976 CASAVA_Build 18 22357586 4D TCTCTCAAAC AAAT/---- AAATAATAAA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 AAAT 2 1 147977 CASAVA_Build 18 22361841 1D AATCCAGTAA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 75 het 32 0 24 11 T 8 7 147978 CASAVA_Build 18 22389997 1I ACTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 9 10 147979 CASAVA_Build 18 22394104 1D CCCCCACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1958 hom 24 7 10 8 A 12 11 147980 CASAVA_Build 18 22395131 1D CCATTTGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 32 1 24 7 A 11 10 147981 CASAVA_Build 18 22397982 2I AGAGAGGGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 24 18 12 T 12 14 147982 CASAVA_Build 18 22399685 1I TTAGTGCCAA -/T TTTTTTTTTT 1220 het 1220 ref 40 22 6 12 T 15 16 147983 CASAVA_Build 18 22403031 3D AAAGCACTTG TAA/--- TAATAATATG 3070 het 3070 hom 30 12 14 6 TAA 3 2 147984 CASAVA_Build 18 22420764 1D CAAAGCAGGG C/- CCTAACTGTC 3070 hom 83 het 32 0 28 5 C 3 2 147985 CASAVA_Build 18 22432779 4D TCTCTTTAAA TTCT/---- TTGCCTATTT 3070 hom 66 het 24 0 23 4 TTCT 1 0 147986 CASAVA_Build 18 22465855 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 1377 hom 7 het 3 0 3 0 A 8 9 147987 CASAVA_Build 18 22489398 2I CACTCAGGAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 12 11 19 AC 8 9 147988 CASAVA_Build 18 22494741 1D TCACAGTCAC T/- GAACCCTCAG 3070 het 3070 hom 50 21 21 9 T 1 0 147989 CASAVA_Build 18 22495650 3I CTAATTTTTG ---/TAT TATTATTATT 3070 het 1014 hom 11 3 8 0 TAT 5 6 147990 CASAVA_Build 18 22499678 5I TAAAATAATG -----/AACTA AACTGGTTAT 3070 het 3070 ref 46 18 10 18 AACTA 0 1 147991 CASAVA_Build 18 22514399 1D AATTTAGGTC T/- GTGTATCTCT 3070 het 3070 ref 63 29 29 5 T 1 0 147992 CASAVA_Build 18 22521671 4D TGATTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 49 23 16 12 TTTG 6 5 147993 CASAVA_Build 18 22522649 2D GCTTTTTTTT TA/-- TTTTTTATTT 162 het 162 ref 19 11 1 8 TA 1 0 147994 CASAVA_Build 18 22529997 2D AAAGAGAAAG AA/-- AGAGAACACA 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 A 3 1 147995 CASAVA_Build 18 22547719 1I AGACCTGGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 9 10 147996 CASAVA_Build 18 22589716 1I CTGTTCTCTC -/T TAACTGTAGA 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 1 2 147997 CASAVA_Build 18 22594297 5D GGGGCAGAGC GTTAT/----- GTTATTTTAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 GTTAT 2 1 147998 CASAVA_Build 18 22598063 1D CACAGGAGTA T/- TGTATTTCCA 3070 het 3070 ref 47 22 14 14 T 2 1 147999 CASAVA_Build 18 22604124 1I TGGTAAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 8 9 148000 CASAVA_Build 18 22630278 1I GAGAGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 34 1 26 7 A 10 11 148001 CASAVA_Build 18 22630887 1I GAAGCAAGAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 8 9 148002 CASAVA_Build 18 22634081 1D CAAGAGAAAG A/- AATAAAGGAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 2 148003 CASAVA_Build 18 22637856 1D CAGAACAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 24 6 T 11 10 148004 CASAVA_Build 18 22649603 1I TATTTTCTAC -/T TTTTTTCAAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 6 7 148005 CASAVA_Build 18 22659285 3D CTATTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TTG 4 3 148006 CASAVA_Build 18 22669678 15I CCACGATTTT ---------------/TTTTCCACGGACAAA AAATTGTCCA 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 TTTTCCACGGACAAA 0 1 148007 CASAVA_Build 18 22676304 1D TAGGGCAAAC T/- TTTGTAGAGC 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 T 4 3 148008 CASAVA_Build 18 22683316 8D GTCTTCCTGT CTTCCTTC/-------- CTTCCTTCCT 2343 het 909 hom 36 10 10 19 CTTC 6 4 148009 CASAVA_Build 18 22699876 3D ATTTACTTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 28 4 14 11 T 13 10 148010 CASAVA_Build 18 22702981 1D GGTTGTTGAA C/- CTTTCACAAA 3070 hom 123 het 48 0 42 7 C 2 1 148011 CASAVA_Build 18 22703955 5D ACCTCTGTGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 39 3 14 24 T 17 12 148012 CASAVA_Build 18 22704898 15I TTCCTCCTCT ---------------/CACCATGTGGTCTCC CACATGCCAG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 CACCATGTGGTCTCC 0 1 148013 CASAVA_Build 18 22713818 4D CATTGGAACG AATT/---- AGACACTATG 3070 het 3070 ref 37 19 12 8 AATT 1 0 148014 CASAVA_Build 18 22722570 3D GCAGGAGAGC ATG/--- ATATTAGTTT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 ATG 1 0 148015 CASAVA_Build 18 22724437 1D AGAAAGTAGA T/- TTTAAGTGTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 6 T 4 3 148016 CASAVA_Build 18 22739902 1I CCCATAGAAA -/G GCCCTGAGGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 2 148017 CASAVA_Build 18 22742380 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 11 12 148018 CASAVA_Build 18 22744286 8D GAATGGGATA ACCTCACT/-------- ACCTGCACAA 3070 hom 135 het 46 0 44 5 ACCTCACT 1 0 148019 CASAVA_Build 18 22745828 1D TTTCATGGTG T/- TTTTTCAGTC 3070 hom 138 het 52 0 47 6 T 6 5 148020 CASAVA_Build 18 22757505 6D ACTGTTGATA AGTGTT/------ GTACATTTGT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 AGTGTT 1 0 148021 CASAVA_Build 18 22759258 4I11M2D GTTTGCCTAG ----TTAATAGACTAGG/TTAATTAATAGACTA-- GGGCATGGAG 3070 het 3070 ref 39 29 9 6 N/A 0 0 148022 CASAVA_Build 18 22759931 1D AATGAGTGAG A/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 47 36 8 3 A 7 6 148023 CASAVA_Build 18 22761683 9D ATTCCATTGC TCAGGGATG/--------- ACAGGGATGA 1577 het 1577 ref 29 19 8 5 TCAGGGATG 1 0 148024 CASAVA_Build 18 22761963 1I GACTTTTAAC -/A AGCACGCTGC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 1 2 148025 CASAVA_Build 18 22762483 1D ATTTGTGGCT C/- CCTAGAATCA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 C 3 2 148026 CASAVA_Build 18 22772049 1D CCAACCACTA T/- TTTCTTCTTG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 4 3 148027 CASAVA_Build 18 22785524 2D AGTCTTTTTG TT/-- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 10 8 148028 CASAVA_Build 18 22791529 1I ACTACACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 A 15 16 148029 CASAVA_Build 18 22803337 16D TCTCTCTCTC TCTGTGTGTGTGTGTG/---------------- TGTGTGTGTG 3070 het 1798 hom 18 7 9 4 TCTGTGTGTGTGTGTG 1 0 148030 CASAVA_Build 18 22805215 4D AGTCATAGAA CACT/---- CACTCAATGG 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 CACT 2 1 148031 CASAVA_Build 18 22805867 1D AGTCTCTGAA G/- GGGAACACAG 3070 het 3070 ref 29 16 11 4 G 4 3 148032 CASAVA_Build 18 22806497 5I TTTAGGCAGC -----/AAGGA AAGGAAGCCA 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 AAGGA 1 2 148033 CASAVA_Build 18 22825468 2I GCTGGGATCC --/AG AGAGAGAGAT 3070 het 3070 ref 45 30 12 3 AG 4 5 148034 CASAVA_Build 18 22838306 1D CTTTTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2957 hom 29 12 11 6 T 12 11 148035 CASAVA_Build 18 22842663 2D ACTGCTCCCC CT/-- GTCCTCTTGT 1954 het 1954 ref 19 11 4 5 CT 1 0 148036 CASAVA_Build 18 22844893 3D CACTCAGCAG ACC/--- ACCAGCCTCT 2335 het 2335 ref 30 11 9 11 ACC 2 1 148037 CASAVA_Build 18 22855938 9I CATGCCCCTA ---------/TGCCCAGCT TGCCCAGCTT 3070 het 3070 hom 42 17 16 9 TGCCCAGCT 1 2 148038 CASAVA_Build 18 22873420 2D AGTAGTCAAA TT/-- TATTGAGACA 3070 het 3070 hom 42 21 17 6 T 3 1 148039 CASAVA_Build 18 22878023 1I GCGAGCCCTT -/C CCCCCCCCTT 3070 het 3070 hom 45 12 15 18 C 8 9 148040 CASAVA_Build 18 22880110 1D GGGTGCCCAA C/- CCCCTGCACA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 C 5 4 148041 CASAVA_Build 18 22888769 2D AAATTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 1226 het 1226 ref 50 42 3 6 TG 7 6 148042 CASAVA_Build 18 22898685 2I TCTGGCTAGT --/CC CCAGAGACTT 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 C 2 4 148043 CASAVA_Build 18 22904654 2I TGTCACCCCC --/CT GTTAGAGGTA 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 CT 0 1 148044 CASAVA_Build 18 22908983 1I TCTTTTTTTT -/A ATGTGTAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 1 2 148045 CASAVA_Build 18 22909475 1D CCAAGTAGTC T/- GACATTCTTA 3070 het 3070 ref 42 23 16 5 T 1 0 148046 CASAVA_Build 18 22909652 16D CTTCCACACA CATACTCCCAGATGTG/---------------- CAAAACTTCT 3070 het 3070 hom 32 18 18 4 CATACTCCCAGATGTG 1 0 148047 CASAVA_Build 18 22912436 2I GTATGTAAAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 46 19 16 11 TA 7 8 148048 CASAVA_Build 18 22914899 5I CATGACCAAG -----/AAGTA AAGAAATGGA 3070 hom 66 het 28 0 22 7 AAGTA 0 1 148049 CASAVA_Build 18 22918927 3I TTTGGAGAGA ---/TCT TCTTATTATT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 TCT 1 2 148050 CASAVA_Build 18 22923248 1D TCCCTCCCCC A/- GCCCCCCACC 2175 het 1420 hom 15 4 8 4 A 1 0 148051 CASAVA_Build 18 22927844 1D CTTCCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 32 2 26 4 T 12 11 148052 CASAVA_Build 18 22933983 2D ATATATAATG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AT 7 6 148053 CASAVA_Build 18 22935609 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAATCT 1997 het 1643 hom 15 6 5 4 A 8 7 148054 CASAVA_Build 18 22936822 1D GATTCAACAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 T 10 9 148055 CASAVA_Build 18 22939788 1D CTGTTTTTTT A/- AAATTTAAGG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 4 3 148056 CASAVA_Build 18 22950944 1I TTAATTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 T 10 11 148057 CASAVA_Build 18 22951081 3D GAAAAATAGA AAT/--- AATAATGAAG 3070 het 3070 ref 30 15 13 5 AAT 3 2 148058 CASAVA_Build 18 22952375 3I TTATCAATTA ---/CTT CTTCTCCCTA 3070 hom 78 het 31 0 25 6 CTT 1 2 148059 CASAVA_Build 18 22952876 4D TAATGAAATC ATTA/---- ATTATTTCTA 3070 het 3070 hom 45 19 19 8 ATTA 2 1 148060 CASAVA_Build 18 22953616 2D TTGTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1185 hom 41 7 17 17 T 15 13 148061 CASAVA_Build 18 22954544 1D AATCCACGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 10 9 148062 CASAVA_Build 18 22968351 1D AATCAGAAGC T/- TGCAGCTACT 3070 het 3070 ref 48 23 21 5 T 2 1 148063 CASAVA_Build 18 22973445 4D GTTATTTGAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 AC 9 7 148064 CASAVA_Build 18 22974908 1I TTTTCACAAA -/G GTTACTATAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 148065 CASAVA_Build 18 22977565 1I TATTTTTTTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 7 8 148066 CASAVA_Build 18 22979634 1D GGTAGTAAAG A/- AAGTTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 19 18 6 A 3 2 148067 CASAVA_Build 18 22984065 1D GGCTTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2989 hom 27 12 13 2 T 12 11 148068 CASAVA_Build 18 22986304 1I GTGTAGAGTC -/T TTTTTTTTTT 2857 het 2857 ref 28 16 7 5 T 10 11 148069 CASAVA_Build 18 22990123 1D AAATATGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 12 13 A 11 10 148070 CASAVA_Build 18 23012623 5D ATATTGCACA AAGAG/----- AAGAGATGTT 3070 het 3070 ref 55 28 21 7 AAGAG 2 1 148071 CASAVA_Build 18 23013373 4D TAAAGATAGA TAGG/---- TAGGGGCATG 3070 het 3070 ref 38 16 19 3 TAGG 2 1 148072 CASAVA_Build 18 23016101 1D CTCATTAACA T/- GAATAATTCA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 T 1 0 148073 CASAVA_Build 18 23016297 4D CATTCTTCTA AGTT/---- AGGAGAATCT 3070 het 3070 ref 32 16 15 4 AGTT 1 0 148074 CASAVA_Build 18 23026362 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1374 het 1065 hom 23 9 6 9 A 17 16 148075 CASAVA_Build 18 23026987 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1293 het 1293 ref 25 13 4 8 A 17 16 148076 CASAVA_Build 18 23031372 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1824 het 1824 ref 30 17 6 7 A 17 16 148077 CASAVA_Build 18 23103259 1D AGCCAATACA T/- TTTTTTTTTT 1349 het 1349 ref 30 16 4 10 T 15 14 148078 CASAVA_Build 18 23133940 1D ATCTGATTTG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 8 7 148079 CASAVA_Build 18 23172475 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1202 het 425 hom 25 7 5 13 A 20 18 148080 CASAVA_Build 18 23206220 1D AGAGGAAGTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 42 21 12 11 A 9 8 148081 CASAVA_Build 18 23210461 2I GCCTTCTCTC --/TT GTTACCTCTA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 T 0 2 148082 CASAVA_Build 18 23219977 4I GATAAAACTG ----/TCAA TCAATCAATC 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 TCAA 3 4 148083 CASAVA_Build 18 23227511 1I GGCACATCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 T 9 10 148084 CASAVA_Build 18 23238340 1D TTCCATGAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 18 26 8 T 10 9 148085 CASAVA_Build 18 23254663 1D ACGCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 1408 het 1408 ref 53 35 4 14 T 13 12 148086 CASAVA_Build 18 23282710 1D TTAGCTAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 10 9 148087 CASAVA_Build 18 23283698 1I TTCCTGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 9 12 T 11 12 148088 CASAVA_Build 18 23285168 1I CCTTTTTAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 9 10 148089 CASAVA_Build 18 23286530 3D TCTGGGAGGC CTT/--- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 CTT 2 1 148090 CASAVA_Build 18 23295320 1I CTGGTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 12 13 148091 CASAVA_Build 18 23301173 2I GTAATCTTAA --/GT GTGGTAGACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 GT 1 2 148092 CASAVA_Build 18 23307311 1I GATTGTATCA -/T TGAAGTAGGA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 1 2 148093 CASAVA_Build 18 23308024 1D TTCTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 25 1 15 9 T 14 13 148094 CASAVA_Build 18 23309455 1D AATTAAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 9 148095 CASAVA_Build 18 23312349 4D CTCTGTCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AAAT 4 3 148096 CASAVA_Build 18 23381546 30I ATCATCCAAA ------------------------------/CCAAGGTATCTTTTAGAGCTAAAGGAAAAG CTATTAAGTA 3070 het 3070 hom 40 19 21 2 CCAAGGTATCTTTTAGAGCTAAAGGAAAAG 0 1 148097 CASAVA_Build 18 23383180 1D TCAAAGAGGT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 A 8 7 148098 CASAVA_Build 18 23385360 4I TGGATATGAG ----/CATT CATTCATTCA 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 CATT 2 3 148099 CASAVA_Build 18 23398305 2D AGCATTTCTC TT/-- GGGATAATCA 3070 het 3070 ref 34 21 12 2 T 2 0 148100 CASAVA_Build 18 23399482 2I AAAATTGAGG --/AA GAGAAGTAAG 3070 hom 111 het 39 0 36 3 A 0 2 148101 CASAVA_Build 18 23400291 2I TAACTGGGAG --/TT GTATCTTGAC 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 T 0 2 148102 CASAVA_Build 18 23458350 2D TTATTATTAT TA/-- TTTTTTTTTT 1052 het 1052 ref 30 10 3 17 TA 1 0 148103 CASAVA_Build 18 23475793 3I GAGAATGCTG ---/TGA TGATCCATGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TGA 1 2 148104 CASAVA_Build 18 23478193 1I AAAGTCAAAA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 7 8 148105 CASAVA_Build 18 23483068 1I CTACGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 11 12 148106 CASAVA_Build 18 23485923 1D GAATCATGTC T/- TTTTTGTTCA 3070 het 3070 hom 49 22 25 4 T 6 5 148107 CASAVA_Build 18 23487657 1I TTAAATTCTA -/T TTTTTATGAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 5 6 148108 CASAVA_Build 18 23488205 1I TATGTCTTTG -/A AAAAAAAAAA 2121 het 2121 ref 28 14 7 7 A 12 13 148109 CASAVA_Build 18 23502686 2D AGAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AG 7 6 148110 CASAVA_Build 18 23514728 1D ATTTCTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 11 10 148111 CASAVA_Build 18 23516564 1I ATCCCCAACC -/T TTTTTGGCAC 3070 het 3070 ref 55 29 21 5 T 5 6 148112 CASAVA_Build 18 23521314 1D TTAAGAATGG A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 8 7 148113 CASAVA_Build 18 23522917 22D AATGCCATTG AGAATTTTCATGGGTATTCTTT/---------------------- AGAATTTTCA 3070 het 3070 hom 24 11 13 8 AGAATTTTCATGGGTATTCTTT 2 1 148114 CASAVA_Build 18 23531766 6D CTTTTTTCTC CTGCCT/------ CTGCTTGCTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 CTGCCT 1 0 148115 CASAVA_Build 18 23547373 1D TGGAGGATGA C/- CCAGATCATT 3070 hom 102 het 35 0 35 1 C 3 2 148116 CASAVA_Build 18 23551257 1D AGAGCCAAAG A/- GGGGCGTAAT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 A 1 0 148117 CASAVA_Build 18 23551880 2D CACTCAACTG AA/-- AAGTAATTGT 3070 hom 108 het 42 0 37 8 A 4 2 148118 CASAVA_Build 18 23553690 12D AACAGAGTCC ACATCCTGATCG/------------ ACTTGAGTCT 3070 hom 68 het 25 0 23 5 ACATCCTGATCG 1 0 148119 CASAVA_Build 18 23598137 1D GTGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1364 het 1364 ref 39 30 3 7 A 11 10 148120 CASAVA_Build 18 23615782 1I ACAATAAAAA -/C GCAGTAGGTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 0 1 148121 CASAVA_Build 18 23626446 1I CTTCGTTAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 7 8 148122 CASAVA_Build 18 23634589 1D TACTCTTGCG T/- TTTTTTATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 6 148123 CASAVA_Build 18 23661917 1I GCCCCGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 9 10 148124 CASAVA_Build 18 23662302 1D AGGAATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 33 2 26 5 A 13 12 148125 CASAVA_Build 18 23664615 1I GTAGGAAAAT -/G GGGGAGATCT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 G 4 5 148126 CASAVA_Build 18 23694064 2I16M2I GAGTTGCAAC --TATATTCAGATGTGCC--/TATATATTCAGATGTGCCCT GAGTCACTTA 3070 hom 214 het 74 0 70 8 N/A 0 0 148127 CASAVA_Build 18 23694630 2D CCAGCCTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 1328 het 575 hom 21 5 6 10 T 20 18 148128 CASAVA_Build 18 23697187 4D TTCAACTATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 36 1 26 9 A 16 12 148129 CASAVA_Build 18 23700223 2I AGCAATCCTA --/CT CTGTTATTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 CT 1 2 148130 CASAVA_Build 18 23745354 4D ATTTGTATCT TCTC/---- TCTCTCTCTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TC 6 4 148131 CASAVA_Build 18 23752391 3I CATGTATAGA ---/AGG AGAAGAAAGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AGG 0 1 148132 CASAVA_Build 18 23754649 1D70M4I TTGATGACAG TTTTATCACTGAAGTTATTCCTTGAGGAATTTAATACTGATTGATGTAGGCAAACATGTTTAATTCCACAA----/-TTTATCACTGAAGTTATTCCTTGAGGAATTTAATACTGATTGATGTAGGCAAACATGTTTAATTCCACAAGTAT GTTTGAATGA 3070 hom 211 het 49 0 71 6 N/A 0 0 148133 CASAVA_Build 18 23758896 1D CAGGTTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 35 0 19 17 T 15 14 148134 CASAVA_Build 18 23768678 4D TTAATTAAAT TAAC/---- TAATCAATTA 3070 hom 63 het 26 0 22 6 TAAC 1 0 148135 CASAVA_Build 18 23773066 1I TTCCCATGTC -/T TTTTATTTCC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 5 148136 CASAVA_Build 18 23785124 1D TTTCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 207 hom 30 1 16 13 T 15 14 148137 CASAVA_Build 18 23785585 1I GATTTTAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2102 hom 35 5 25 5 A 13 14 148138 CASAVA_Build 18 23787626 1D AAGGTCAGAA T/- CAGTATGGTG 3070 hom 154 het 55 0 51 4 T 1 0 148139 CASAVA_Build 18 23791385 1I CTAATTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 10 148140 CASAVA_Build 18 23794993 1I AAAAAAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 739 hom 56 3 49 4 A 10 11 148141 CASAVA_Build 18 23795892 4I TGGTGAGACC ----/CTGT CTGTCTCTAC 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 CTGT 1 2 148142 CASAVA_Build 18 23797919 2D CCTTCTTCCT TC/-- TCTCTCTCCC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 TC 5 4 148143 CASAVA_Build 18 23811128 3I GAGACTAGAT ---/ATG ATACTAAAAG 3070 hom 148 het 51 0 50 1 ATG 0 1 148144 CASAVA_Build 18 23811419 1D ACTTATACAG A/- CAGAGACTCC 3070 hom 120 het 45 0 41 6 A 1 0 148145 CASAVA_Build 18 23812574 1D ATATGTAGTT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 43 het 18 0 14 4 G 10 9 148146 CASAVA_Build 18 23814757 1D GGCTGGGGTC A/- AAAAAAAAAA 1729 het 1729 ref 36 13 11 12 A 19 18 148147 CASAVA_Build 18 23834843 2D GAAAGGAAAC TG/-- TGAATTCTAA 3070 het 3070 ref 36 18 17 3 TG 2 1 148148 CASAVA_Build 18 23843341 1D GACCTCTATA T/- ATTTTACATG 3070 het 3070 ref 41 23 17 2 T 1 0 148149 CASAVA_Build 18 23850428 1D ACCCAGGGAC T/- TCAAAAAATT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 2 1 148150 CASAVA_Build 18 23852836 2D CACACACGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 1250 hom 17 3 10 4 TA 9 8 148151 CASAVA_Build 18 23857473 1I TTTTTAGTAG -/A GACAGGGTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 0 1 148152 CASAVA_Build 18 23878741 1D GTTACTTGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 A 10 9 148153 CASAVA_Build 18 23880738 1D ATAGTCCTTT A/- AAAAATGTGG 3070 het 3070 ref 47 23 20 5 A 6 5 148154 CASAVA_Build 18 23886480 2D TTTGGAAAGG GA/-- GAGAGAAATT 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 GA 4 3 148155 CASAVA_Build 18 23887185 1D TTCCACCATG T/- AATTGTAGAG 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 T 1 0 148156 CASAVA_Build 18 23906549 1I CAATTAAGAG -/T TTCTGAATAA 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 T 2 3 148157 CASAVA_Build 18 23908653 1I AAAGGAGGCC -/T CTTTTTTTTT 2945 het 2945 ref 27 14 10 3 T 0 1 148158 CASAVA_Build 18 23920680 1I CACTCAGTTT -/C CAGCCTATGC 3070 hom 138 het 53 0 47 6 C 1 2 148159 CASAVA_Build 18 23927532 1D AAGCAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 7 A 11 10 148160 CASAVA_Build 18 23928842 1D TTTAAAAAAT G/- AAAGCAAGGA 3070 het 3070 hom 30 13 11 7 G 1 0 148161 CASAVA_Build 18 23930370 1D AGGCAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 1928 het 1687 hom 24 10 7 7 T 15 14 148162 CASAVA_Build 18 23932318 1D TAAAGTTGCC A/- AAAAACACTG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 6 5 148163 CASAVA_Build 18 23937396 4D TACATATATG AAGT/---- ATGTTTATAT 310 het 310 ref 15 10 2 3 AAGT 1 0 148164 CASAVA_Build 18 23937443 2D GTATATATAT AC/-- ACACACACAC 1952 het 1168 hom 15 5 5 5 AC 9 8 148165 CASAVA_Build 18 23974858 2I TCCAAACAAG --/AT ATATATATAT 1782 het 1782 ref 18 12 5 1 AT 7 8 148166 CASAVA_Build 18 23977650 2I TTATACCATA --/AT AGTTTTTTAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 AT 0 1 148167 CASAVA_Build 18 24018385 3D TCCCTCTTTC TCT/--- TCTTCTTTCC 3070 het 3070 ref 26 12 9 8 TCT 3 2 148168 CASAVA_Build 18 24018637 1D TCTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 897 het 897 ref 23 7 3 13 T 13 12 148169 CASAVA_Build 18 24045198 12D TGTGGGGCAG AGATGAGACTTA/------------ GTACACTGTG 3070 het 3070 ref 47 31 13 6 AGATGAGACTTA 1 0 148170 CASAVA_Build 18 24050196 1D GTCAGGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 7 T 11 10 148171 CASAVA_Build 18 24055448 4I CCTGAATTGT ----/TTTA TTTGTTTATG 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 TTTA 0 1 148172 CASAVA_Build 18 24055593 1D GCATTGCAAA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 T 8 7 148173 CASAVA_Build 18 24061892 1I CCTTTTACTC -/T TTTTTCTCTA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 T 5 6 148174 CASAVA_Build 18 24063183 3I TTTCATAATA ---/ACT ACTTATTTTA 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 ACT 1 2 148175 CASAVA_Build 18 24063311 2I TATAACTCTA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 AT 5 6 148176 CASAVA_Build 18 24067182 1I TACTGTATGA -/T TTTCATTTAT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 T 3 4 148177 CASAVA_Build 18 24068103 2D TGTCACAATC CA/-- ATTGAGAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 CA 1 0 148178 CASAVA_Build 18 24086967 1D TTTATTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1929 hom 19 6 10 3 T 11 10 148179 CASAVA_Build 18 24096229 1I TTACAAGTAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 A 7 8 148180 CASAVA_Build 18 24105892 1I TGAGATATTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 8 9 148181 CASAVA_Build 18 24107160 2D AAAATAAAAA AT/-- ATATATATAT 1131 het 1131 ref 11 4 3 4 AT 7 6 148182 CASAVA_Build 18 24110972 24D AGCTGGGAAT GATCCATGGCCAATAGCCGGGAAA/------------------------ GATCCATGGC 3070 het 3070 ref 38 23 14 8 GATCCATGGCCAATAGCCGGGAAA 1 0 148183 CASAVA_Build 18 24112111 4I AAAATTATTG ----/GTCT GTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 GTCT 0 1 148184 CASAVA_Build 18 24112247 1D TCCTTTTTTA C/- CAAGTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 C 2 1 148185 CASAVA_Build 18 24112923 11D CTCCTTTGCC TTCCACTATGA/----------- TTGTGAGGCT 1204 het 1204 ref 21 14 4 5 TTCCACTATGA 1 0 148186 CASAVA_Build 18 24114527 12D GACTAGAGCC AAGAGGTAGAAT/------------ AACACTAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 AAGAGGTAGAAT 1 0 148187 CASAVA_Build 18 24118608 4I GCAAAAACAT ----/TTTC TTTCTTTATC 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 TTTC 1 2 148188 CASAVA_Build 18 24118660 2D TTTTTATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 10 12 T 13 11 148189 CASAVA_Build 18 24120169 1I AGCACCTCAC -/A AAACACTGAA 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 A 3 4 148190 CASAVA_Build 18 24126060 1D AGTCTTTCCC T/- GCTAATATTC 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 1 0 148191 CASAVA_Build 18 24126137 1D TAACTTTTGA C/- TTTTTTTAGT 2978 het 2978 ref 23 13 8 2 C 1 0 148192 CASAVA_Build 18 24126427 1D CAAGTGATAG C/- TGGTGATATA 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 C 1 0 148193 CASAVA_Build 18 24151793 1I ATCTGCCAGC -/A GATTTATTTT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 A 0 1 148194 CASAVA_Build 18 24156981 1I GGTTAGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 844 hom 34 3 15 16 T 16 17 148195 CASAVA_Build 18 24167389 1D GTATTTTTTT A/- AATGGATAAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 3 2 148196 CASAVA_Build 18 24185644 1D GTGTATAAGC T/- TTTGTACCTT 3070 het 3070 ref 50 25 16 9 T 4 3 148197 CASAVA_Build 18 24188387 2D ACAAATATCC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 129 het 53 0 44 10 GT 6 5 148198 CASAVA_Build 18 24188981 1I CCATTATTGA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 148199 CASAVA_Build 18 24190278 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 1926 hom 10 het 5 0 4 1 T 14 13 148200 CASAVA_Build 18 24191759 2I TGTGCTCTTG --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 54 23 20 11 CT 5 6 148201 CASAVA_Build 18 24193471 1D AAATCGGTAA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 T 8 7 148202 CASAVA_Build 18 24193954 1D TTTCCCAAAA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 8 7 148203 CASAVA_Build 18 24199942 1I TCTCTGTTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 T 7 8 148204 CASAVA_Build 18 24207354 1D TGATATACTC A/- AAACTATCAG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 4 3 148205 CASAVA_Build 18 24211645 1D TCTGTGCCTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 T 9 8 148206 CASAVA_Build 18 24215327 1D TTCAAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 873 hom 40 2 17 21 A 12 11 148207 CASAVA_Build 18 24215716 2I ATTACAAGAC --/TT AATATTATTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 0 2 148208 CASAVA_Build 18 24229089 2D GGTGGTGTGT AC/-- CTGTGGTCCT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 AC 1 0 148209 CASAVA_Build 18 24233651 1D ACCTAGTGTC A/- GGGGGAACAA 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 A 1 0 148210 CASAVA_Build 18 24243214 1D TTTGACAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 36 1 26 9 T 13 12 148211 CASAVA_Build 18 24271789 1D TTGGCCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 T 12 11 148212 CASAVA_Build 18 24272023 2D ATTTGAAGCA TT/-- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 9 7 148213 CASAVA_Build 18 24290688 1I AGATTTATGG -/A AAAAAATATG 3070 hom 51 het 29 0 17 12 A 6 7 148214 CASAVA_Build 18 24291344 4D CAAGCATATC ACAA/---- ACAAACAATA 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 ACAA 3 2 148215 CASAVA_Build 18 24300992 1I TTTGGGGGGG -/C GGGGGCAGAA 3070 hom 44 het 18 0 14 4 C 0 1 148216 CASAVA_Build 18 24302604 1I AGACCCAATA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 62 hom 40 1 35 4 T 8 9 148217 CASAVA_Build 18 24356002 1D AAGATCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 11 10 148218 CASAVA_Build 18 24357787 1D AAAGATTTTT A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 7 6 148219 CASAVA_Build 18 24366620 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 9 8 148220 CASAVA_Build 18 24369190 1D AGAGTTACCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 31 18 9 5 T 9 8 148221 CASAVA_Build 18 24390027 2D TAATTGTGAG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 227 hom 30 4 10 16 C 12 10 148222 CASAVA_Build 18 24419743 1I TCAACATAAC -/A AAAAACTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 5 6 148223 CASAVA_Build 18 24428379 1I AATGCTTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 11 12 148224 CASAVA_Build 18 24430769 16D ACAGGGCATC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2081 hom 27 11 11 10 T 30 14 148225 CASAVA_Build 18 24434825 2D ATGTCTACTG GT/-- GTGTGTGTGT 513 het 513 ref 42 34 3 6 GT 7 6 148226 CASAVA_Build 18 24438736 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 30 1 21 8 A 12 11 148227 CASAVA_Build 18 24441195 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 1575 het 1575 ref 9 5 4 3 T 10 9 148228 CASAVA_Build 18 24455917 1D GTTGGTGAAT A/- AAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 7 6 148229 CASAVA_Build 18 24463612 45I TTCTTCTCCG ---------------------------------------------/ATTGAACCTGACTAATATGAAAGCTAATAACAGTGTTTTAGGATA ATTGAATATT 3070 het 3070 ref 18 11 7 2 ATTGAACCTGACTAATATGAAAGCTAATAACAGTGTTTTAGGATA 0 1 148230 CASAVA_Build 18 24464729 1D AAAGAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2911 hom 25 11 11 3 A 12 11 148231 CASAVA_Build 18 24467051 1D AATGTTTTTT G/- TTTGTTTGGT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 G 1 0 148232 CASAVA_Build 18 24476459 1I GAGTTCTTAA -/T TTTATCCTCA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 3 4 148233 CASAVA_Build 18 24485605 1D TTACAGAAAA C/- AAAAATACTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 C 1 0 148234 CASAVA_Build 18 24487575 1D ATTGGAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 A 12 11 148235 CASAVA_Build 18 24489217 1D AATATTCCCA T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 T 7 6 148236 CASAVA_Build 18 24491058 1I CCTTATGTGC -/T TTTTGCTTTC 3070 het 3070 hom 53 21 21 11 T 4 5 148237 CASAVA_Build 18 24495030 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAAAAA 2547 het 2547 ref 21 14 6 1 A 11 12 148238 CASAVA_Build 18 24500709 1D TTCATTTTGT A/- AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 44 23 15 7 A 6 5 148239 CASAVA_Build 18 24503318 2I CCTCTACAGC --/TG TGTTTATGAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TG 1 2 148240 CASAVA_Build 18 24503811 1I TGTGTCCAAC -/T CATGCTGCCA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 0 1 148241 CASAVA_Build 18 24505800 8I TACTCTGATG --------/CTACAGGT CATTTCAGCA 3070 het 3070 ref 33 16 15 3 CTACAGGT 0 1 148242 CASAVA_Build 18 24506240 2D CAAAATGGCA CT/-- CTCTTTCTGC 3070 het 3070 hom 44 14 23 8 CT 3 2 148243 CASAVA_Build 18 24509688 1I TGAGGGTTTG -/T TTTACCAGAT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 3 4 148244 CASAVA_Build 18 24514657 1I CTGGCTATTT -/A AAAAAAACAT 2614 het 2614 ref 35 18 10 7 A 7 8 148245 CASAVA_Build 18 24521774 1D ACACACGGAC A/- ACAGGGAGGG 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 2 1 148246 CASAVA_Build 18 24521973 1D AACTTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2610 hom 37 10 21 6 A 12 11 148247 CASAVA_Build 18 24525241 1I CCCTCTACGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 10 11 148248 CASAVA_Build 18 24528390 3I CTGCGGTGGC ---/CTT CTCAGACCCT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 CTT 0 1 148249 CASAVA_Build 18 24541049 14D CACTGCATGA GGTTGAAACTAACT/-------------- GATTGTAATT 3070 het 3070 hom 54 24 28 6 GGTTGAAACTAACT 1 0 148250 CASAVA_Build 18 24542353 3I TCTTATTAAC ---/ATT ATAATAATTA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 ATT 0 1 148251 CASAVA_Build 18 24547742 2D TCAGAATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 31 1 12 21 A 14 12 148252 CASAVA_Build 18 24551189 1D TTTGACACCT C/- CCCACCAGAC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 C 4 3 148253 CASAVA_Build 18 24557003 2I ATTCTGACTC --/TA TGTTTTTCCC 3070 hom 166 het 59 0 56 3 TA 0 1 148254 CASAVA_Build 18 24562443 1D TAGAAAACTT C/- CAGCCTGCTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 9 C 2 1 148255 CASAVA_Build 18 24563059 1D CTACAGGCTT A/- GCATTTTAAC 3070 hom 137 het 49 0 45 5 A 1 0 148256 CASAVA_Build 18 24565918 3I AGCCCCAAAA ---/CAT CAAGGATTAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CAT 0 1 148257 CASAVA_Build 18 24578922 1I TTGACACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 24 1 17 6 A 12 13 148258 CASAVA_Build 18 24585530 2I AATTATTATT --/AC ATTTACTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AC 0 1 148259 CASAVA_Build 18 24586087 1I AGTACATAAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 T 7 8 148260 CASAVA_Build 18 24586637 2D TATCACATGC AA/-- AAAAGTTTCT 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 6 4 148261 CASAVA_Build 18 24589974 1D CTACTAGAAC T/- TTTTTTTTTA 1368 het 1368 ref 41 32 3 6 T 10 9 148262 CASAVA_Build 18 24590307 3D TGAAATTACG TTA/--- TTAATAGTCT 3070 het 3070 ref 36 20 11 6 TTA 2 1 148263 CASAVA_Build 18 24591460 2I TATTGTGACC --/TG TGTGGCAGGT 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 TG 2 3 148264 CASAVA_Build 18 24595091 3I ATATTTATAA ---/TTG TTCTATAATA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TTG 0 1 148265 CASAVA_Build 18 24602481 5D CTTGATGAAC TCCTA/----- TTTTATCACT 3070 het 3070 ref 36 20 14 5 TCCTA 1 0 148266 CASAVA_Build 18 24606787 4D TTAGAAACAC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 TA 8 6 148267 CASAVA_Build 18 24610399 1D AGGAACTGTA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 8 7 148268 CASAVA_Build 18 24611062 5D ATTTTGCTAA AGAAT/----- AGGAGAAAAT 3070 het 3070 hom 23 9 12 6 AGAAT 1 0 148269 CASAVA_Build 18 24621065 2I TTTTACAGAC --/TG AGTCATTACA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 TG 0 1 148270 CASAVA_Build 18 24632346 10I GACACTTTAT ----------/TGCCAAAACC TGCCAAAAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TGCCAAAACC 0 1 148271 CASAVA_Build 18 24632974 1D AGTACAGACA T/- TAGGGGCCTG 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 2 1 148272 CASAVA_Build 18 24637319 1I CTGACTGACA -/G GCTTCAATGC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 1 2 148273 CASAVA_Build 18 24639942 1D TTGCAGGAAC A/- AGATTGTCTG 3070 het 3070 ref 64 31 23 11 A 2 1 148274 CASAVA_Build 18 24650840 2I24M6I ATGAAGAGCA --TGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATG------/TGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATGTATACA TATACATATA 2783 het 1137 hom 21 5 10 9 N/A 0 0 148275 CASAVA_Build 18 24656811 1I TTATTCAATG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 8 9 148276 CASAVA_Build 18 24662204 1D GCAAAACCAC T/- TTCTTAATAC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 3 2 148277 CASAVA_Build 18 24663183 1D TATTTTAAAC A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 35 19 14 2 A 8 7 148278 CASAVA_Build 18 24663365 1I AGAACAGGGA -/T TTTTTTTTTT 1109 het 1109 ref 45 19 3 23 T 13 14 148279 CASAVA_Build 18 24665678 2I TCATCCCAGA --/TC TACTGAATCA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TC 0 1 148280 CASAVA_Build 18 24666620 1I GAAAGCTCAC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 7 8 148281 CASAVA_Build 18 24680233 2D TTGCCTTCAG AC/-- ACACACACAC 2326 het 2326 ref 29 20 6 3 AC 9 8 148282 CASAVA_Build 18 24684898 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAATA 2122 het 2122 ref 12 6 5 1 A 8 9 148283 CASAVA_Build 18 24686146 2D CCAGAATTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 A 12 10 148284 CASAVA_Build 18 24703928 1D AGTTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1494 hom 26 4 14 8 T 12 11 148285 CASAVA_Build 18 24710667 1I ATTTGTACCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 7 8 148286 CASAVA_Build 18 24717358 1D TATTTTGAAG T/- TCTTTCATTA 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 T 2 1 148287 CASAVA_Build 18 24738291 1I ATTCAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 10 11 148288 CASAVA_Build 18 24740575 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 A 11 10 148289 CASAVA_Build 18 24741089 6I TTCTGTGAAA ------/TAGTCT TAGGATTAGG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TAGTCT 0 1 148290 CASAVA_Build 18 24741163 3I GTTATATGAC ---/ATT ATTATTATTA 3007 het 2279 hom 20 9 7 4 ATT 4 5 148291 CASAVA_Build 18 24742465 3D AAGTGTTAAT AAA/--- ATGGGCATTA 3070 het 3070 ref 45 26 16 5 A 4 1 148292 CASAVA_Build 18 24744611 3I TTTAAGACCA ---/CAT TGGTGCCTAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 CAT 0 1 148293 CASAVA_Build 18 24748801 1I GCTTTAAGTG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 8 9 148294 CASAVA_Build 18 24749304 9D GTTGGCTCCA TGTGGTCTT/--------- TATTGGTTCT 2833 het 2833 ref 23 13 8 6 TGTGGTCTT 1 0 148295 CASAVA_Build 18 24749683 3I19M5D TAAGATTCCT ---ATATCATATGTCTGATATCATATT/ATAATATCATATGTCTGATATC----- ATGTTTCAGT 3070 het 3070 ref 33 21 13 3 N/A 0 0 148296 CASAVA_Build 18 24749962 1D ATTGGAATAG A/- GAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 1 0 148297 CASAVA_Build 18 24754766 5I GCTGAAAATA -----/ATTGT ATTGTATACT 3070 hom 94 het 38 0 32 6 ATTGT 1 2 148298 CASAVA_Build 18 24767396 1D TATGGAGTCC T/- TTTTTTTTTT 1016 het 1016 ref 44 34 3 7 T 11 10 148299 CASAVA_Build 18 24773405 4D CAAAAATAAC TAAA/---- TAAATATATA 1449 hom 7 het 3 0 3 0 TAAA 2 1 148300 CASAVA_Build 18 24777330 1D TATATATATA T/- AAAAAAAGAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 1 0 148301 CASAVA_Build 18 24785750 1D TAGCATGAGG A/- AAACTGCCCC 3070 het 3070 hom 64 26 31 10 A 4 3 148302 CASAVA_Build 18 24789405 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 A 10 11 148303 CASAVA_Build 18 24789483 1I GTCAACAATT -/A TATGAAATAA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 0 1 148304 CASAVA_Build 18 24798184 3D AGAAGGTGTG TTA/--- TTATAGATGT 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 TTA 2 1 148305 CASAVA_Build 18 24811282 8I TAGAGATCTG --------/CAGTACAA CAGTACAACA 3070 het 3070 hom 52 21 19 12 CAGTACAA 1 2 148306 CASAVA_Build 18 24813795 1I AACCAGGTTC -/T TTGAGATCAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 2 3 148307 CASAVA_Build 18 24815274 1D AATTTATAAG A/- AAAAAAAACA 753 het 753 ref 9 3 3 4 A 9 8 148308 CASAVA_Build 18 24818714 1D AAGGGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 11 10 148309 CASAVA_Build 18 24822061 1D TTCTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3063 hom 33 11 14 8 T 11 10 148310 CASAVA_Build 18 24823127 1D CCTCCCAAGT C/- AGCATCTGGG 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 C 1 0 148311 CASAVA_Build 18 24823914 1I CCATCTAGTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 180 hom 30 1 26 3 T 8 9 148312 CASAVA_Build 18 24824436 1I TATACAGTGT -/G GGCGGGGGGG 1426 het 157 hom 19 2 5 12 G 2 3 148313 CASAVA_Build 18 24828508 4D TATACCACAC ATGG/---- ATGGATTCCT 3070 het 3070 ref 41 22 15 6 ATGG 2 1 148314 CASAVA_Build 18 24830705 1I TAATTTAAAG -/T TTATAAAACT 2102 het 2102 ref 27 14 7 6 T 2 3 148315 CASAVA_Build 18 24836000 3I TATTTCAAAT ---/AAA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 8 11 148316 CASAVA_Build 18 24836332 1I GACTCGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 12 13 148317 CASAVA_Build 18 24836805 5I TTAGAACGTA -----/TAGAG TATTTTCCTG 2644 het 2644 ref 27 19 7 1 TAGAG 0 1 148318 CASAVA_Build 18 24837609 1D TTTTTTTTTT A/- AAATAAAAGA 3070 het 296 hom 33 1 28 5 A 4 3 148319 CASAVA_Build 18 24838235 1D CCTTCGACCT G/- CTTGTCAAAG 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 G 1 0 148320 CASAVA_Build 18 24839981 2D CTCTCTCTCT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 AC 7 6 148321 CASAVA_Build 18 24840160 1D TAATTTATAC A/- AGTAACTCAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 A 2 1 148322 CASAVA_Build 18 24847347 1D GATAAGAAGC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 7 6 148323 CASAVA_Build 18 24849115 2D GATACTTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 52 20 23 9 TG 10 9 148324 CASAVA_Build 18 24850150 1I ATACGTTTAC -/T TGAATGAATG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 1 2 148325 CASAVA_Build 18 24866530 1I ACATAGTTTC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 6 7 148326 CASAVA_Build 18 24877624 1I AGGGAAAAAG -/A AAAAAAAACA 3004 het 3004 ref 27 14 8 5 A 8 9 148327 CASAVA_Build 18 24891470 2I TGAAAAAAAC --/TT AACGCTTAAA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 0 2 148328 CASAVA_Build 18 24898228 4D CATTACTATT TCTG/---- TCTAAATTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 TCTG 1 0 148329 CASAVA_Build 18 24912218 1I AGGCAATCTG -/C CCCCCCCTCG 2276 het 1576 hom 14 6 5 3 C 7 8 148330 CASAVA_Build 18 24915695 1D AAGTCCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 131 hom 32 3 9 21 T 13 12 148331 CASAVA_Build 18 24916486 1D CAGCCTTGTA T/- CAAAACATGT 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 T 1 0 148332 CASAVA_Build 18 24917231 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 8 9 148333 CASAVA_Build 18 24920233 5D GTTGATGTAA TTATT/----- TTATCTTGAT 3070 het 3070 hom 38 16 21 3 TTATT 1 0 148334 CASAVA_Build 18 24924769 1D ACTAAAAAAA T/- AATGCATACA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 1 0 148335 CASAVA_Build 18 24926951 1D TAGGAATAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 T 10 9 148336 CASAVA_Build 18 24929608 1I ATGGCAAAAA -/T AAGTAATTAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 1 148337 CASAVA_Build 18 24930354 6D AGCACAGACC ATTCAA/------ ATATTTAGGT 3070 het 3070 ref 53 25 27 3 ATTCAA 1 0 148338 CASAVA_Build 18 24932270 1D TCTGATATGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 T 9 8 148339 CASAVA_Build 18 24935595 1D TTGTTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 21 3 T 11 10 148340 CASAVA_Build 18 24943471 1D ATTTGGGCTC T/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 7 T 7 6 148341 CASAVA_Build 18 24950873 1D TGTTGTAGGG A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 47 14 19 14 A 7 6 148342 CASAVA_Build 18 24951521 19I GGCAGCAGCA -------------------/GCAGTCTAGAGCAGCAGTG GCGTGCTGGC 3032 het 3032 ref 29 13 8 8 GCAGTCTAGAGCAGCAGTG 0 1 148343 CASAVA_Build 18 24953635 1D CCTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2796 hom 43 13 12 18 T 15 14 148344 CASAVA_Build 18 24955273 2D GTTACTGGAG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 30 13 11 7 CA 8 7 148345 CASAVA_Build 18 24956609 1D AATAGCAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 10 9 148346 CASAVA_Build 18 24958269 4D CTGTGCTGAG GTAT/---- GTATCATGCT 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 GTAT 2 1 148347 CASAVA_Build 18 24961776 5D GCTAGTTTAC AAAGA/----- AAAGAGGTTA 3070 het 3070 ref 44 20 14 15 AAAGA 2 1 148348 CASAVA_Build 18 24968410 1D CTTATTTGGT G/- GGGATCTTGA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 G 4 3 148349 CASAVA_Build 18 24971517 1D AATTTGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 11 10 148350 CASAVA_Build 18 24972211 4D GAGGTAAAAA AGAC/---- AGAATTTGCT 3070 het 3070 ref 48 22 22 6 AGAC 1 0 148351 CASAVA_Build 18 24981049 1D TTGACATGTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 A 9 8 148352 CASAVA_Build 18 24987237 4D AGAGGCGGGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 2712 het 1378 hom 18 5 8 9 GA 9 7 148353 CASAVA_Build 18 24993194 5D CTTGTGTGAC TTTAA/----- TTTATTGTTG 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 TTTAA 1 0 148354 CASAVA_Build 18 24994646 1I TTGCTGCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 10 11 148355 CASAVA_Build 18 24997406 1D ACATATTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2536 hom 33 7 21 6 A 11 10 148356 CASAVA_Build 18 24999944 4D GTGTTATTTA TTCT/---- TTCTATTTTT 3070 het 3070 ref 30 19 11 2 TTCT 2 1 148357 CASAVA_Build 18 25003992 1I CAACTCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 10 11 148358 CASAVA_Build 18 25021921 1I AAAAATTATG -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 5 6 148359 CASAVA_Build 18 25033770 2D ATGGGGAAAT AA/-- AAAGAGTATT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 A 5 3 148360 CASAVA_Build 18 25036761 5I ATCCTTGGTT -----/AAGTC AAGTCATAAA 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 AAGTC 1 2 148361 CASAVA_Build 18 25037981 4I CAGGCTTGTC ----/TGTG TATTACTTTG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 TG 0 2 148362 CASAVA_Build 18 25039192 1I AAAAAGTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 11 12 148363 CASAVA_Build 18 25041005 4D AAGTTAAAAA TTAC/---- TTATTTATTA 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 TTAC 1 0 148364 CASAVA_Build 18 25051896 4D GTAAACACTT GTGA/---- GTATTAGATA 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 GTGA 1 0 148365 CASAVA_Build 18 25055168 1D GAACATAACA C/- TGGGGCCTGT 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 C 1 0 148366 CASAVA_Build 18 25055632 11D AATACAACAT AGCCACAGGAC/----------- AGTGTCTAGG 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 AGCCACAGGAC 1 0 148367 CASAVA_Build 18 25057840 4I AGAGGAAGTC ----/TTAA TTGTTTCTCT 3070 het 3070 ref 58 28 22 8 TTAA 0 1 148368 CASAVA_Build 18 25065318 1I TAGATTATAG -/A AAAAATAATA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 5 6 148369 CASAVA_Build 18 25097563 4D GTTAATTATG TTAA/---- TTATTTAAAT 2346 het 2346 ref 22 13 7 2 TTAA 1 0 148370 CASAVA_Build 18 25124608 1I AATGCCAAGG -/A AAAGTTATTG 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 3 4 148371 CASAVA_Build 18 25126318 1D CATAGTACAG A/- AAAAATCTTT 3070 het 3070 hom 46 14 25 9 A 6 5 148372 CASAVA_Build 18 25128130 2D TACAACTCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 12 3 A 12 10 148373 CASAVA_Build 18 25130646 1D ATCAAAGTTA T/- TTAATATTGA 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 T 3 2 148374 CASAVA_Build 18 25139982 1I ATTTGACACT -/C CGTATTCTGG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 C 1 2 148375 CASAVA_Build 18 25143007 1I AGATAAATTT -/C CCCTACCATG 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 3 4 148376 CASAVA_Build 18 25154105 1I TGTATATTGG -/T TAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 T 1 2 148377 CASAVA_Build 18 25165115 2I GATCCATTGT --/GA GAGACTTTAT 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 GA 2 3 148378 CASAVA_Build 18 25187593 1D CCTTGAGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 17 15 6 T 10 9 148379 CASAVA_Build 18 25194796 3I GTTACTGGGT ---/TAA TAATTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 TAA 1 2 148380 CASAVA_Build 18 25217233 2D AAATCTAATA AT/-- ATTCTATGTA 3070 het 3070 hom 33 13 11 10 AT 2 1 148381 CASAVA_Build 18 25219295 1I GCTGGGGGCA -/G GAACCCTGCT 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 G 1 2 148382 CASAVA_Build 18 25221319 2D TGCTCCCTCC CT/-- CTCTCTCTCT 2985 het 2985 ref 33 16 8 11 CT 7 6 148383 CASAVA_Build 18 25222354 1I GAAAAAAAAA -/T GAAGACTTTC 3070 het 2941 hom 29 11 13 5 T 0 1 148384 CASAVA_Build 18 25240397 1I ACTTATTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 T 11 12 148385 CASAVA_Build 18 25241692 5D ATTTAATAAA TGTAT/----- TGTCTTTAAT 3070 het 3070 hom 34 11 22 3 TGTAT 1 0 148386 CASAVA_Build 18 25242544 2D TGTAGTCAAG AC/-- ACAGAGTGGC 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 AC 2 1 148387 CASAVA_Build 18 25246137 4I TCTTTTCCAA ----/ATAG ATAGAAGTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ATAG 1 2 148388 CASAVA_Build 18 25248799 1D AAAAGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 18 10 A 14 13 148389 CASAVA_Build 18 25255943 1D CAAGTAAAAA G/- GTCGAAGAAA 1556 het 1556 ref 23 16 5 2 G 2 1 148390 CASAVA_Build 18 25259491 2I AACTGTCTCC --/AA AAAAAAAAAA 2852 het 358 hom 23 1 13 9 A 14 16 148391 CASAVA_Build 18 25267133 4D ATGTGAAGTT AATA/---- GTCATAGCTG 3070 het 3070 ref 41 18 18 8 AATA 1 0 148392 CASAVA_Build 18 25272884 2D GTTACCCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3038 het 1931 hom 42 10 11 22 A 18 16 148393 CASAVA_Build 18 25272901 2D AAAAAAAAAA AC/-- AGATTCTAAG 2794 het 2078 hom 44 13 13 19 AC 1 0 148394 CASAVA_Build 18 25273961 1D GCTTGTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 37 1 25 11 T 13 12 148395 CASAVA_Build 18 25279361 5I ATCTTTTTAG -----/ATATA ATAGATGAAT 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 ATATA 0 1 148396 CASAVA_Build 18 25279406 1D TATTTGCAGC A/- AAAAAAATGT 3070 het 2391 hom 38 5 20 13 A 8 7 148397 CASAVA_Build 18 25280948 1I AAAGATAAAT -/A AAAAAACAAT 3070 hom 59 het 26 0 20 6 A 6 7 148398 CASAVA_Build 18 25282295 1I AATAAGTTAT -/A AAAAGAAGAT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 4 5 148399 CASAVA_Build 18 25285956 2D TTTATAGCAC AG/-- AGTGTCTTAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AG 2 1 148400 CASAVA_Build 18 25295493 1I AGTATAAAAA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 2984 hom 20 8 12 0 T 6 7 148401 CASAVA_Build 18 25304925 8D CAATTATTAT TTTATGTA/-------- TTTATGTATT 2362 het 2362 ref 21 10 9 6 TTTATGTA 3 2 148402 CASAVA_Build 18 25313231 1D TCTTGCAACT A/- AAAAAAAAAA 1392 het 1392 ref 31 23 3 5 A 11 10 148403 CASAVA_Build 18 25316500 1I AATGAATGAA -/T TTATTTATAA 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 T 2 3 148404 CASAVA_Build 18 25318079 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 1011 hom 37 11 15 12 AC 9 8 148405 CASAVA_Build 18 25325775 2D AATTGGTGAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 31 0 21 11 TA 8 7 148406 CASAVA_Build 18 25332732 1I TTCCATATAC -/T TTTTTTTTTT 2579 het 2264 hom 26 7 8 11 T 13 14 148407 CASAVA_Build 18 25337344 2D AAAAGAAAAC TA/-- TGAAAATTAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 5 TA 1 0 148408 CASAVA_Build 18 25342156 1D TTTTCATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 11 10 148409 CASAVA_Build 18 25349714 1D TTTTTAAAAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 9 8 148410 CASAVA_Build 18 25351645 1D CCCTTTGAAT A/- AATGGAGAGA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 3 2 148411 CASAVA_Build 18 25352576 1D ACATTTGGTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 70 het 45 1 34 10 A 9 8 148412 CASAVA_Build 18 25353623 1I CTACTTTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 9 10 148413 CASAVA_Build 18 25354937 1D AACCTGGAAG A/- ATCTTGCTTA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 2 1 148414 CASAVA_Build 18 25356843 8I4M1I TGCTACTGAA --------TGGT-/ACAGCTCTTGTTA GGACTATCAG 3070 het 3070 ref 38 18 16 6 N/A 0 0 148415 CASAVA_Build 18 25358680 19I ACAGGCATGA -------------------/GCCACTGCGCCCGGCCACC GCAAACTTCT 3070 het 1747 hom 15 5 9 1 GCCACTGCGCCCGGCCACC 0 1 148416 CASAVA_Build 18 25360938 2I ATGATCTGAC --/AG AGAGTGCCTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AG 2 3 148417 CASAVA_Build 18 25367029 1I AGTGATTCCT -/A AAAAAGCTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 5 6 148418 CASAVA_Build 18 25371054 1D GCTAATGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2637 hom 37 10 16 11 T 12 11 148419 CASAVA_Build 18 25371277 1D CCACCAAATT A/- AAAAAAAAAA 1357 het 1357 ref 23 9 6 8 A 11 10 148420 CASAVA_Build 18 25381154 3D TTGTTGTTTT TGG/--- TGGTGGTGGT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 TGG 4 3 148421 CASAVA_Build 18 25384036 1I AGATGGTGAA -/C CCCCCCGTCT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 C 6 7 148422 CASAVA_Build 18 25386303 1I GAATATTTTC -/T TTTTTTCATT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 T 6 7 148423 CASAVA_Build 18 25389457 4D ATTAACTCAT TAAG/---- TATTTATATA 2056 het 2056 ref 21 10 7 4 TAAG 1 0 148424 CASAVA_Build 18 25389635 1I AGAGGAGGAG -/A AAAAAACCCC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 6 7 148425 CASAVA_Build 18 25400382 2I ATATATTGAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 9 11 148426 CASAVA_Build 18 25412020 1I AGAAATATGC -/T TGGTAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 T 1 2 148427 CASAVA_Build 18 25412965 1I CAATATCATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 8 9 148428 CASAVA_Build 18 25414567 1I TAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 A 9 10 148429 CASAVA_Build 18 25418062 1I TCCCTGTGTG -/C CCATACTGCC 3070 het 3070 hom 65 23 25 17 C 2 3 148430 CASAVA_Build 18 25418612 8I TTGTCAAAGA --------/ATTTAAAT TAATAGTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 ATTTAAAT 0 1 148431 CASAVA_Build 18 25424330 2D TTCAACATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 19 8 0 T 14 12 148432 CASAVA_Build 18 25425480 1I CAGACTGGAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 A 8 9 148433 CASAVA_Build 18 25426321 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 7 8 148434 CASAVA_Build 18 25431722 1D ATTAAAGTAG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 A 8 7 148435 CASAVA_Build 18 25434019 1I CAGAAGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2028 hom 24 6 11 7 T 11 12 148436 CASAVA_Build 18 25437911 1D CAAATAGACC T/- TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 9 8 148437 CASAVA_Build 18 25443366 1I TTAAAATGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 8 9 148438 CASAVA_Build 18 25446243 1I TTTTTTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 10 11 148439 CASAVA_Build 18 25454887 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 1959 het 1959 ref 23 15 8 1 AC 6 5 148440 CASAVA_Build 18 25458101 1I TAAGACATTT -/A AAAAAACCAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 6 7 148441 CASAVA_Build 18 25458705 17D2M8D3M5D10M5D AACAATGTGG CTCTGATATTATTCTCTAATTTATTGGGGTATTAGTACAGTTATTAGTTA/-----------------AA--------GGT-----TAGAGGAATT----- GAGGAAGCTG 3070 het 3070 ref 32 26 19 2 N/A 0 0 148442 CASAVA_Build 18 25462259 1I AAAAACTGGT -/A AAAAACCCCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 5 6 148443 CASAVA_Build 18 25464549 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAACA 2861 het 1629 hom 20 6 9 5 A 8 9 148444 CASAVA_Build 18 25465861 2I CTTTCTTCAC --/AT GTTTCCTATT 3070 het 3070 ref 40 21 19 0 AT 0 1 148445 CASAVA_Build 18 25467200 1I CACCCAGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 9 10 148446 CASAVA_Build 18 25469881 1I TTTTGTGGAA -/G GGTGAATTGT 3070 het 3070 hom 52 25 24 3 G 2 3 148447 CASAVA_Build 18 25470286 1D TTTTCATTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 9 8 148448 CASAVA_Build 18 25473897 1I TGTTTTCCTG -/T ATTTCTCTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 1 148449 CASAVA_Build 18 25474989 2D GTAACTTTTT TA/-- TATTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 TA 2 1 148450 CASAVA_Build 18 25476224 2I TAATTTAACT --/TA TATATATATA 1845 het 382 hom 6 2 4 0 TA 7 8 148451 CASAVA_Build 18 25483343 1I TCCACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 10 11 148452 CASAVA_Build 18 25485731 2D TTTGTTAAAT AA/-- GTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 2 0 148453 CASAVA_Build 18 25486244 1I AAGAGGATAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 8 9 148454 CASAVA_Build 18 25489451 1I CCAAAGGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 11 12 148455 CASAVA_Build 18 25490358 1I ACAGATATAT -/A AAAGCAAAAT 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 A 3 4 148456 CASAVA_Build 18 25498295 14D GCAAACGATA GAAAGGGGTGTGTC/-------------- GTTCTTCTGT 3070 het 3070 hom 35 16 20 1 GAAAGGGGTGTGTC 1 0 148457 CASAVA_Build 18 25499592 1I AAAATACACA -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 6 7 148458 CASAVA_Build 18 25500331 1I CAACAACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 9 10 148459 CASAVA_Build 18 25501104 36D TGTCTGCTCA TTTCCTTTGCCCATTTTTTTAAAGTGGTTATTCATT/------------------------------------ TTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 30 21 12 1 TTTCCTTTGCCCATTTTTTTAAAGTGGTTATTCATT 1 0 148460 CASAVA_Build 18 25510082 1D TGTTTTTTTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 8 148461 CASAVA_Build 18 25523133 1D CACTGTAGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 10 9 148462 CASAVA_Build 18 25537671 1I AGTAATATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2746 hom 25 7 13 5 A 11 12 148463 CASAVA_Build 18 25541940 1I CTTCATTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 10 11 148464 CASAVA_Build 18 25542893 1D TTATCCTGAA T/- TTTTTTTTAT 2989 het 2989 ref 25 10 7 8 T 9 8 148465 CASAVA_Build 18 25545279 4I ACTAGGACAC ----/TAGT TAAATGATTG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 TAGT 0 1 148466 CASAVA_Build 18 25548038 1I GAAATACAGT -/A AAAAAAAAAA 2686 het 2686 ref 29 16 6 7 A 10 11 148467 CASAVA_Build 18 25549245 1I GCTGGAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 8 9 148468 CASAVA_Build 18 25549719 2D GCTATCAGAA TC/-- TCTTCATTAG 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 TC 2 1 148469 CASAVA_Build 18 25579189 4D AAGATGTCAG AGTA/---- AGTAAGTATG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 AGTA 3 2 148470 CASAVA_Build 18 25583236 6D TGCACTTATC TTCATT/------ TTCATTTTAA 3070 het 3070 ref 36 19 17 2 TTCATT 2 1 148471 CASAVA_Build 18 25584345 1D TAGAAATATG A/- AAAAAATAGC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 7 6 148472 CASAVA_Build 18 25584473 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTACAA 3070 het 3070 hom 31 17 12 2 T 7 6 148473 CASAVA_Build 18 25585005 1D AATTAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 952 hom 27 2 17 8 T 12 11 148474 CASAVA_Build 18 25586633 1I ATGTGTTACA -/T GGGCAAGTAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 0 1 148475 CASAVA_Build 18 25589943 1I AAATTGAACT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 8 9 148476 CASAVA_Build 18 25590456 1D TCTCATACTC T/- TAAATGGGAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 1 148477 CASAVA_Build 18 25617825 2D ATATATACAC AT/-- GTTAAATGTG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AT 1 0 148478 CASAVA_Build 18 25621958 1D TCCTATGTCA T/- TTTTTTATCC 3070 hom 76 het 34 0 27 7 T 7 6 148479 CASAVA_Build 18 25630561 4D TAGTATAAAT TATA/---- TATATACATA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TA 5 3 148480 CASAVA_Build 18 25633648 4I AGTTTTATTC ----/CATA CATACATATA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 CATA 2 3 148481 CASAVA_Build 18 25640624 1I AATTATAGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 9 148482 CASAVA_Build 18 25643028 1I TTAGGAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 33 1 31 1 A 10 11 148483 CASAVA_Build 18 25650512 1I CAATTGCAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 8 9 148484 CASAVA_Build 18 25652158 3D TCATTGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 TTG 4 3 148485 CASAVA_Build 18 25670215 1D AATTACCTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 80 het 38 0 34 4 T 10 9 148486 CASAVA_Build 18 25675530 1D CAACCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 30 0 24 6 T 12 11 148487 CASAVA_Build 18 25677574 1D CTATATGTGG A/- AAAAATATAG 3070 hom 67 het 26 0 23 3 A 6 5 148488 CASAVA_Build 18 25681348 1I AATTCCACTC -/T TTTTTTGGTT 3070 hom 148 het 50 0 50 0 T 6 7 148489 CASAVA_Build 18 25744800 1I TGATTAGTTT -/G TTTTTATTAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 0 1 148490 CASAVA_Build 18 25755104 3I AGGCTATTAG ---/AAT AATGACCTAT 3070 hom 99 het 38 0 31 7 AAT 1 2 148491 CASAVA_Build 18 25772728 1I TGGCATTGCC -/A AAAAGAGGAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 4 5 148492 CASAVA_Build 18 25795857 1D GAGAGAACAT G/- TAGCATTCAC 3070 het 3070 hom 46 20 25 2 G 1 0 148493 CASAVA_Build 18 25811442 1D ATTTATTTAC T/- TTTTTTTTTT 618 het 618 ref 15 5 2 8 T 13 12 148494 CASAVA_Build 18 25815125 4I TTTTCCAACT ----/TCAA TCAAATCTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TCAA 1 2 148495 CASAVA_Build 18 25824725 1D GCTCTGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 11 10 148496 CASAVA_Build 18 25827718 2D TTCAATGAGC AG/-- AGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 AG 2 1 148497 CASAVA_Build 18 25827800 1I GAAATAAGCG -/T TAACGATAAA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 T 1 2 148498 CASAVA_Build 18 25829831 1D TTGCAGCTCC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 9 8 148499 CASAVA_Build 18 25830204 1D TTATTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 11 10 148500 CASAVA_Build 18 25831073 33I GTGACCAAAA ---------------------------------/TGCTGACAGTGATATAAACAATGAAGTCCAGGC TGCTGAGGTC 3070 hom 96 het 42 0 40 8 TGCTGACAGTGATATAAACAATGAAGTCCAGGC 0 1 148501 CASAVA_Build 18 25837057 1I AGTTACATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 37 0 29 8 T 10 11 148502 CASAVA_Build 18 25846145 4I ACATTTTGCA ----/GTAT GTATGTATAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 GTAT 2 3 148503 CASAVA_Build 18 25849529 1I ATATATAACA -/T TATCAAGGAT 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 1 2 148504 CASAVA_Build 18 25852274 1D TTCTTAATTT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 8 7 148505 CASAVA_Build 18 25854207 1I CTAGCTATGG -/A AACACCAATT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 2 3 148506 CASAVA_Build 18 25864867 1I CATACAAATA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 7 8 148507 CASAVA_Build 18 25867206 3D AGAAACATCA TTG/--- TTGTTTTCAA 3070 het 3070 hom 46 17 20 10 TTG 2 1 148508 CASAVA_Build 18 25874348 1D TGCACCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 18 7 A 13 12 148509 CASAVA_Build 18 25874423 10D GGTGAGAGAA TCACTTGAGC/---------- TCACTTGAGC 3070 hom 57 het 21 0 20 6 TCACTTGAGC 2 1 148510 CASAVA_Build 18 25876818 1I GCATGAGTAT -/A AGTATTTCTT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 1 2 148511 CASAVA_Build 18 25877294 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2935 het 2935 ref 19 9 7 3 A 10 11 148512 CASAVA_Build 18 25878054 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 920 het 197 hom 5 1 2 2 T 12 11 148513 CASAVA_Build 18 25878195 2I CCTGGCCTAG --/TA TATATATATA 1160 hom 7 het 6 0 3 3 TA 6 7 148514 CASAVA_Build 18 25878208 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTTT 2438 het 704 hom 10 2 6 2 A 0 1 148515 CASAVA_Build 18 25879293 5D AGAGTTATTT TATTA/----- TGTTACTGAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 7 TATTA 1 0 148516 CASAVA_Build 18 25880967 3I GATTTCTCTC ---/TCA ATTTTTTTTT 3070 hom 84 het 39 0 29 10 TCA 0 1 148517 CASAVA_Build 18 25893594 2D TTATGAGCTG TA/-- TATATATAGG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 TA 5 4 148518 CASAVA_Build 18 25898406 1D CCCATCATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 A 11 10 148519 CASAVA_Build 18 25905572 18D AGACGTATAC ATATATATATATATATAT/------------------ ATATATATAT 2440 hom 24 het 13 0 9 9 AT 15 6 148520 CASAVA_Build 18 25905805 4D TACAGGATAC AAAT/---- AAATTATTCT 3070 het 3070 hom 29 11 17 4 AAAT 2 1 148521 CASAVA_Build 18 25908128 7D GAGGGCCCCA CCATACT/------- CCATACTCCA 3070 hom 35 het 30 1 26 6 CCATACT 3 2 148522 CASAVA_Build 18 25911008 1D TGTATATATG C/- TTTCATCATC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 C 1 0 148523 CASAVA_Build 18 25912846 1I GTTTTGGTTA -/C TATATCCTTG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 0 1 148524 CASAVA_Build 18 25915003 1D GTCATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 12 11 148525 CASAVA_Build 18 25917445 1D CATATTTCAC A/- AAAAAAGCAA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 7 6 148526 CASAVA_Build 18 25920857 17D AAGGCAAAGA TAATTTTCTCATTAGTT/----------------- TCCCTTCTGC 3070 het 3070 ref 41 24 23 2 TAATTTTCTCATTAGTT 1 0 148527 CASAVA_Build 18 25925866 16D TTACATTAAT AGACCATTATCTCAAC/---------------- AGCCTCATGT 3070 het 3070 ref 29 17 14 4 AGACCATTATCTCAAC 1 0 148528 CASAVA_Build 18 25926065 1I TACTTAATCT -/C CCCAAAACAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 C 3 4 148529 CASAVA_Build 18 25931690 3D AACACATCCC AAA/--- AAAAAAAAAA 2593 het 2593 ref 29 16 6 8 A 14 11 148530 CASAVA_Build 18 25935281 1D ACCTGAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 9 21 7 T 11 10 148531 CASAVA_Build 18 25937215 1D CAGGGGTACA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 T 7 6 148532 CASAVA_Build 18 25937842 9I GATTTGCAAT ---------/ACGTAACCA GAAGATGAAG 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 ACGTAACCA 0 1 148533 CASAVA_Build 18 25938880 2I AAGGGGAAAC --/AT GAGCAGTTGT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 AT 0 1 148534 CASAVA_Build 18 25938989 6I AGACATGTAT ------/TTTAAG TTTAAGTTCA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 TTTAAG 1 2 148535 CASAVA_Build 18 25939999 1I GACAAAAAGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 8 9 148536 CASAVA_Build 18 25940973 1D CTCTTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 11 10 148537 CASAVA_Build 18 25955153 1I GTCCACATGT -/A AAAATCACAC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 4 5 148538 CASAVA_Build 18 25955481 1D TGGATTTATG C/- CAGGAAAATA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 C 2 1 148539 CASAVA_Build 18 25956307 2D AAAACAAATG TA/-- TATATATATG 2594 het 1816 hom 15 6 6 4 TA 5 4 148540 CASAVA_Build 18 25969103 2D ATGTATTCTC TT/-- TTGTTTTCTA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 4 2 148541 CASAVA_Build 18 25974984 1I GATTTTATTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 1334 hom 34 8 17 9 A 0 1 148542 CASAVA_Build 18 25977156 3D GCCTCATGGA CCT/--- CTCCATATTT 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 CCT 1 0 148543 CASAVA_Build 18 25981501 1D ACAACTGAAA T/- TTTAAGGAGC 3070 het 3070 ref 51 26 23 3 T 4 3 148544 CASAVA_Build 18 25986350 1I ATGGTTGCCA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 56 29 23 4 T 7 8 148545 CASAVA_Build 18 25993033 2I GTAATTGAAC --/AG AGTCTTACAA 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 AG 1 2 148546 CASAVA_Build 18 25996287 6I AGGATTTCAT ------/TATAAA TATAATCTCC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 TATAAA 0 1 148547 CASAVA_Build 18 26005580 1I42M4I TAAGTGGAAA -AAAAAAGATTGGATATTTGCCAATCTTTGGTATGTGGTTTTA----/GAAAAAAGATTGGATATTTGCCAATCTTTGGCATGTGGTTTTATTTC TTTAATTTTA 3070 het 3070 ref 27 17 15 4 N/A 0 0 148548 CASAVA_Build 18 26006609 2D TTTATTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 48 17 18 14 T 11 9 148549 CASAVA_Build 18 26010101 4D AGATCTACAT AGAC/---- AGATACATAG 3070 het 3070 ref 36 14 14 10 AGAC 1 0 148550 CASAVA_Build 18 26020825 1I GATATATGGG -/A TATAATCTTC 3070 het 3070 ref 55 32 18 5 A 0 1 148551 CASAVA_Build 18 26025523 1D GAATATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2211 hom 18 6 9 3 T 12 11 148552 CASAVA_Build 18 26029668 1I TATGAAACTT -/G CTTTATTTAG 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 G 0 1 148553 CASAVA_Build 18 26037636 11D ATCAATCAAT GGCATTTTGTA/----------- GGCATTTTGT 3070 het 3070 ref 36 20 13 6 GGCATTTTGTA 2 1 148554 CASAVA_Build 18 26037890 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2289 het 809 hom 14 3 7 7 A 15 14 148555 CASAVA_Build 18 26038022 4D ATTCTATAAT TGAC/---- TGAGAATAAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 TGAC 1 0 148556 CASAVA_Build 18 26055683 1D ACAAAAAAAA C/- ATAAATAATA 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 C 1 0 148557 CASAVA_Build 18 26061800 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 26 1 21 4 A 12 11 148558 CASAVA_Build 18 26062761 1I AAATTTGTAT -/G GGAGCTACAA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 G 2 3 148559 CASAVA_Build 18 26066244 3D TAAAATATAT TAA/--- TGTTTCTATA 3070 het 3070 ref 28 18 9 2 TAA 1 0 148560 CASAVA_Build 18 26072048 1I CTGAAATTAA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 2612 hom 30 6 22 2 T 7 8 148561 CASAVA_Build 18 26078013 1D TGCTAAAAAA T/- GTCATGCTGC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 T 1 0 148562 CASAVA_Build 18 26081169 1D AATGCAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 38 0 28 11 A 13 12 148563 CASAVA_Build 18 26093647 1D CTTTGGGCAA T/- GGGGAATTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 T 1 0 148564 CASAVA_Build 18 26095535 2D TCCAAAGGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 48 1 37 11 T 13 11 148565 CASAVA_Build 18 26106981 1I TATGTTATCT -/C CCCCCCCTCC 3070 hom 62 het 30 0 24 6 C 7 8 148566 CASAVA_Build 18 26116044 1D TGAGAAGTAA T/- TTAAATATTA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 3 2 148567 CASAVA_Build 18 26124340 1D AAGTGCAACA T/- TCATGGAGAT 3070 hom 126 het 53 0 42 11 T 2 1 148568 CASAVA_Build 18 26162550 2D CTTAAAAAAA GG/-- GGGGGGGGTG 3070 het 77 hom 28 2 14 12 G 10 8 148569 CASAVA_Build 18 26173446 2I TCCCATGTAG --/AA AAAAAAAAGT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 8 10 148570 CASAVA_Build 18 26175515 2I GAAAGAAAGA --/CT CACGAAGTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CT 0 1 148571 CASAVA_Build 18 26177070 1D TAATAAGCCC A/- GGGGGGAACT 3070 hom 114 het 41 0 38 4 A 1 0 148572 CASAVA_Build 18 26177173 1D CAGCTTCATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 10 9 148573 CASAVA_Build 18 26185975 1I CTGTCACCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 38 1 34 3 T 10 11 148574 CASAVA_Build 18 26199919 4I TGTATATATA ----/TATT TATATATACG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TATT 0 1 148575 CASAVA_Build 18 26202113 1I TTCTGTTTTC -/T TTTTTTTTTC 2605 het 2605 ref 26 12 8 6 T 9 10 148576 CASAVA_Build 18 26202786 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2610 hom 16 6 9 1 A 11 12 148577 CASAVA_Build 18 26207600 2I TAAATTAAAC --/TT ATATCCTTCA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 0 2 148578 CASAVA_Build 18 26207969 4I TTTTAGTGGA ----/TTCT TTAAGATTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TTCT 0 1 148579 CASAVA_Build 18 26208676 1I TCATTTGATC -/T TCTTTTCTCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 2 148580 CASAVA_Build 18 26214072 1I ATAGCATGAG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 6 7 148581 CASAVA_Build 18 26214329 5D CAAATACGTC CTTCT/----- CTTCTTTTCT 3070 hom 126 het 47 0 42 7 CTTCT 2 1 148582 CASAVA_Build 18 26218276 4D AGATGTTTTC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 TTAT 3 2 148583 CASAVA_Build 18 26218909 1D CACAAATTAG A/- AAAAAAAAAA 2866 het 2866 ref 26 12 7 7 A 11 10 148584 CASAVA_Build 18 26218970 1I ACATATGCTA -/C ATATTTAATG 3070 hom 95 het 45 0 31 14 C 0 1 148585 CASAVA_Build 18 26220431 3D CTTTAAGTGA AAG/--- AATAACATAC 3070 het 3070 hom 33 15 18 2 AAG 1 0 148586 CASAVA_Build 18 26224616 1D GTAATCCTCA C/- ATATGATTTG 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 C 1 0 148587 CASAVA_Build 18 26225399 1I TCTACAGGTG -/C CCCCCCCCTC 2401 het 2401 ref 36 21 7 8 C 8 9 148588 CASAVA_Build 18 26225951 1D TTTAATCTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 50 25 24 1 T 8 7 148589 CASAVA_Build 18 26227670 2I TATTATACTC --/TT GAGTTTTTTT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 0 2 148590 CASAVA_Build 18 26228815 1D AAAATATTAC A/- ATGCATTTTA 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 2 1 148591 CASAVA_Build 18 26231777 2I GCCACTCTAA --/GT GTCAAGTCCC 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 GT 1 2 148592 CASAVA_Build 18 26233225 1I CCTCAGGCAT -/G AAGAGCTAGT 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 G 0 1 148593 CASAVA_Build 18 26233543 1D AAGGAAAACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 10 9 148594 CASAVA_Build 18 26233610 1D TCTTTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 12 11 148595 CASAVA_Build 18 26233874 4I ATAATTTAGT ----/TTAA TTAACTTTAT 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 TTAA 1 2 148596 CASAVA_Build 18 26234898 3D ATAGAGTAAG AAT/--- AAAAACCTAC 2103 het 402 hom 13 1 5 8 AAT 1 0 148597 CASAVA_Build 18 26234914 1I AACCTACCTA -/T TTTTTGTACA 3070 het 510 hom 13 2 8 3 T 5 6 148598 CASAVA_Build 18 26240778 1I TCACTGTGGG -/A TACCACACAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 148599 CASAVA_Build 18 26249600 3D TCCAGCACAC AAT/--- GAGGTACAGA 3070 het 3070 hom 45 20 22 5 AAT 1 0 148600 CASAVA_Build 18 26293291 1D AATTCTACCA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 T 8 7 148601 CASAVA_Build 18 26302960 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 11 15 11 AC 6 5 148602 CASAVA_Build 18 26311627 1I TTTTATATAT -/A TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 A 0 1 148603 CASAVA_Build 18 26311957 1I AAATATTTGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 32 0 21 11 A 8 9 148604 CASAVA_Build 18 26313776 8I TACCTGCAAG --------/GGTCATCC GTAATAGCCT 3070 hom 132 het 46 0 44 3 GGTCATCC 0 1 148605 CASAVA_Build 18 26314099 1I TTTTTATGAA -/G AAAAAAATGT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 G 0 1 148606 CASAVA_Build 18 26314435 2I AAAAAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 11 13 148607 CASAVA_Build 18 26315434 1D TAGTTAGTAA T/- TAGAACCAGA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 2 1 148608 CASAVA_Build 18 26318708 5D49M2I TCCTACAAGT AAAGGAATGTTCAATTGATACAACATTTTGAAGAGGAGACACACACACACACAC--/-----AATGTTCAATTGATACAACATTTTGAAGAGGAGACACACACACACACACAT GCACACATGT 3070 het 3070 hom 46 16 25 34 N/A 0 0 148609 CASAVA_Build 18 26323511 1D CTGGACTTCA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 7 6 148610 CASAVA_Build 18 26326161 4I AGAAAGAAAG ----/AGAA AGGAAGAAAG 3070 hom 66 het 31 0 22 9 AGAA 0 1 148611 CASAVA_Build 18 26333369 1D TTTCAAAGTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 T 9 8 148612 CASAVA_Build 18 26333916 2I1M4D TCCTATCTCT --AGCTT/GAA---- TGTACTAGCT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 N/A 0 0 148613 CASAVA_Build 18 26337351 1I TTTGTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 1063 het 1063 ref 36 22 3 11 T 15 16 148614 CASAVA_Build 18 26343665 4D AGCAGAAAAA TGTC/---- TGGGAAAAAG 3070 hom 148 het 53 0 50 4 TGTC 1 0 148615 CASAVA_Build 18 26344004 1I ATTTTTTAAT -/G TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 28 0 26 5 G 0 1 148616 CASAVA_Build 18 26350163 2I TACACCATGG --/AA TACTATGCAG 2042 het 725 hom 9 3 5 1 A 0 2 148617 CASAVA_Build 18 26351829 2I TCATTTATAG --/AT ATGACAAAAA 2862 het 2862 ref 22 11 6 5 AT 1 2 148618 CASAVA_Build 18 26351955 1D CCTAGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 12 11 148619 CASAVA_Build 18 26353925 1D CATCAGTTCA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 T 8 7 148620 CASAVA_Build 18 26357048 3I TTCCCCCAAG ---/GTA GTTAGCAGTT 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 GTA 0 1 148621 CASAVA_Build 18 26358268 1I TTTGTTTGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 148622 CASAVA_Build 18 26364810 10I GAAACAAAGA ----------/TTTTTGTTTC GGGACATTTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TTTTTGTTTC 0 1 148623 CASAVA_Build 18 26373949 1I TCAGGGAGGG -/A AAAAATAATT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 5 6 148624 CASAVA_Build 18 26374883 2D GCCCATACTC TT/-- TAAGGATGAT 3070 het 3070 ref 44 23 16 9 T 3 1 148625 CASAVA_Build 18 26398037 1D TATGCATAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 45 18 17 11 A 9 8 148626 CASAVA_Build 18 26398806 12D ATATATATAC ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 3070 hom 24 het 11 0 9 3 AT 15 9 148627 CASAVA_Build 18 26399013 1I TTTTCAATTT -/G GGTCTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 2 3 148628 CASAVA_Build 18 26399459 1D CATTTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 35 1 18 16 T 15 14 148629 CASAVA_Build 18 26399534 1D ACGTCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2169 hom 40 11 15 21 T 14 13 148630 CASAVA_Build 18 26424434 1D TTTTTAAACG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 46 het 38 1 29 9 A 10 9 148631 CASAVA_Build 18 26431821 1I CCTTTTTCCC -/G TTTTTTCTTT 3070 hom 76 het 36 0 22 14 G 0 1 148632 CASAVA_Build 18 26431927 4D CTCTTTTCTG TTTA/---- TTTCTTTCCA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 TTTA 1 0 148633 CASAVA_Build 18 26433198 5I AGTACTTGAA -----/TAAAT TAAATATAAT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 TAAAT 1 2 148634 CASAVA_Build 18 26442227 1I CTTATCTTAA -/T TGAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 1 2 148635 CASAVA_Build 18 26442830 4D AGTTAAACTT TGAC/---- TGTTCTAATT 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 TGAC 1 0 148636 CASAVA_Build 18 26443416 1I GTATTGGAAA -/C CCCATGAGCA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 C 3 4 148637 CASAVA_Build 18 26456051 1D TTACGTTTTT A/- TGTAAAGTGA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 1 0 148638 CASAVA_Build 18 26458698 2D GGCAGAGCCT TC/-- TCATGAATAG 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 TC 2 1 148639 CASAVA_Build 18 26491362 1I ATCTATACGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 15 11 A 11 12 148640 CASAVA_Build 18 26494505 1I TTCTTAAATT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 8 9 148641 CASAVA_Build 18 26503312 1D TACCTCCCCC T/- GGGTCCCTCC 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 T 1 0 148642 CASAVA_Build 18 26507975 2D TATTTCTCTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 TA 6 5 148643 CASAVA_Build 18 26510637 6D AGAAATACTC TAAAAT/------ TAAATGTATT 3070 het 3070 ref 34 20 14 0 TAAAAT 1 0 148644 CASAVA_Build 18 26511645 1D TTTTACTCTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 T 9 8 148645 CASAVA_Build 18 26516000 1I TACCTCCTTC -/A AGCAGTCATT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 A 1 2 148646 CASAVA_Build 18 26516809 1I GACACATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 24 5 A 10 11 148647 CASAVA_Build 18 26539533 1D ATTTATTGAG T/- TTTTACCTGA 3070 het 3070 ref 49 23 13 13 T 5 4 148648 CASAVA_Build 18 26541895 9D63M1I TGAGATTACA AAGATGAATAAGATGAATAAGATGCAGTCCTTATTTTAAGAGACCCACTGGTGAAGGAAGCAAATACTCTGT-/---------AAGATGAATAAGATGCAGTCCTTGTTTTAAGAGACCCACTGGTGAAGGAAGCAAATACTCTGTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 35 12 25 N/A 0 0 148649 CASAVA_Build 18 26546793 1I GCCAAATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 480 hom 21 2 17 2 A 9 10 148650 CASAVA_Build 18 26549202 2I TTTTTGACTC --/TT TTGTAATAAC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 2 4 148651 CASAVA_Build 18 26560961 2I GAAGAATGAG --/CT CTGTCTCATG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 CT 1 2 148652 CASAVA_Build 18 26569862 1D CAGAAAACAG A/- AACTGTACCC 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 A 3 2 148653 CASAVA_Build 18 26591816 3I CAGGAAAATT ---/AAA AAGCAAATTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 2 5 148654 CASAVA_Build 18 26598024 3I CTTCCTTTTC ---/TTA TTAGAGCATT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 TTA 1 2 148655 CASAVA_Build 18 26609236 1D TTTTATTTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 8 148656 CASAVA_Build 18 26634224 4D AATGTAACCT TAAA/---- TAAGTATAAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 TAAA 1 0 148657 CASAVA_Build 18 26644108 1D ACCTTAGGGG A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 58 26 26 7 A 7 6 148658 CASAVA_Build 18 26662039 1D GTTGTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 15 28 9 T 12 11 148659 CASAVA_Build 18 26673833 1D TTTGGATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 10 14 T 11 10 148660 CASAVA_Build 18 26688875 1D CAAACCTATC A/- AATTGCATTA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 3 2 148661 CASAVA_Build 18 26729629 1D ATAGTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2320 hom 38 10 11 17 A 17 16 148662 CASAVA_Build 18 26769230 1I TAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3029 het 3029 ref 24 12 10 2 A 9 10 148663 CASAVA_Build 18 26769582 1I AACTTATACC -/T TATGGCTCAA 3070 het 3070 hom 53 20 24 9 T 1 2 148664 CASAVA_Build 18 26775442 4I TATTTTGTCT ----/AATA AATAAGTCCC 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 AATA 1 2 148665 CASAVA_Build 18 26780884 6D AAGAAAATGA GTGTAT/------ GTGTATGTGT 3070 het 3070 ref 51 21 18 17 GTGTAT 4 3 148666 CASAVA_Build 18 26788287 1D ACATACATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 13 12 148667 CASAVA_Build 18 26811779 1D GGTATGGTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 9 12 13 T 10 9 148668 CASAVA_Build 18 26811960 1I TGCCTTACAC -/A AAAAAACTCT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 6 7 148669 CASAVA_Build 18 26815990 3I AAAAAAAAAA ---/GAG AGAGAGAGAA 2887 het 535 hom 34 3 12 19 GAG 0 1 148670 CASAVA_Build 18 26823889 5I TCCTGGAACT -----/TAAAA TAAAATAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 7 TAAAA 2 3 148671 CASAVA_Build 18 26824939 4I AAGACATAAT ----/TGAG TATTTCTATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TGAG 0 1 148672 CASAVA_Build 18 26836665 2D ACTCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1965 het 754 hom 14 4 8 3 A 15 13 148673 CASAVA_Build 18 26838698 1I GAAGTTTACG -/T TTTCTTATCC 3070 het 3070 ref 59 33 18 8 T 3 4 148674 CASAVA_Build 18 26843226 4I CTGCCATCTT ----/AGTC AGGCTGGTCT 3070 het 3070 ref 30 15 15 0 AGTC 0 1 148675 CASAVA_Build 18 26847216 5I CAAAACATGA -----/ATTGT ATTGGAACAG 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 ATTGT 0 1 148676 CASAVA_Build 18 26847299 4I AATTTAACTG ----/GATA GATAGATAAT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 GATA 2 3 148677 CASAVA_Build 18 26849512 6I CAAAAAAACT ------/TACAAA TAGAAATGTA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 TACAAA 0 1 148678 CASAVA_Build 18 26852865 2D CACACACATC TG/-- TGTGTTTCCG 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 TG 3 2 148679 CASAVA_Build 18 26853721 1I TGCCACAGCA -/C TGCAGCCTGA 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 C 0 1 148680 CASAVA_Build 18 26862042 1D AAATACAAAG T/- TTTAAGTATT 2606 het 2606 ref 26 17 6 3 T 4 3 148681 CASAVA_Build 18 26864900 1I TATTTTAATG -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 6 7 148682 CASAVA_Build 18 26874966 2D GGAATTATTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 20 6 TA 1 0 148683 CASAVA_Build 18 26894258 1D GCATCACATC T/- TGTGTATATT 3070 het 3070 hom 46 18 21 9 T 2 1 148684 CASAVA_Build 18 26897295 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1073 hom 18 7 9 2 A 19 18 148685 CASAVA_Build 18 26920525 3I CAGGTTTTAT ---/TAA TGTTTATGTT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 TAA 0 1 148686 CASAVA_Build 18 26925380 1D AGCAAAACTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 47 20 19 9 A 9 8 148687 CASAVA_Build 18 26949142 1D ATAAACCACT C/- CCATCCTACC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 3 2 148688 CASAVA_Build 18 26955610 1I CTCTGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 2069 het 369 hom 18 2 9 7 T 17 18 148689 CASAVA_Build 18 26966736 1D CATATGTCTC A/- AAAAATTCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 5 148690 CASAVA_Build 18 26972579 1D TTTTGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 11 10 148691 CASAVA_Build 18 26972716 1I TAGACACAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 934 hom 28 2 24 2 A 9 10 148692 CASAVA_Build 18 26975640 2I TTTCTTCTTT --/TG TGTGTTCTTA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 TG 2 3 148693 CASAVA_Build 18 26976635 1D AAAGTTTTCC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 9 8 148694 CASAVA_Build 18 26984272 6D15M6D CATCACCACC ACTACTACCATCATCACCACCACCACT/------ACCATCATCACCACC------ ACCATCACCA 1786 het 1786 ref 64 57 4 8 N/A 0 0 148695 CASAVA_Build 18 26984456 3D GCACCATCAT CAC/--- CACACTACCA 3070 hom 60 het 72 1 53 18 CAC 2 1 148696 CASAVA_Build 18 26988238 3I AAAGGGATGC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 29 0 19 10 A 12 15 148697 CASAVA_Build 18 26992493 2I TTTCTGTATT --/CA GTTTGTAATT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 CA 0 1 148698 CASAVA_Build 18 26993494 2I TTAAAACCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 33 0 19 14 A 13 15 148699 CASAVA_Build 18 26999911 1D ATTTCTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 19 2 15 2 T 13 12 148700 CASAVA_Build 18 27002055 1D GCATATGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 31 1 21 9 T 13 12 148701 CASAVA_Build 18 27002334 43D GCTGGGATTA CAGGTGTGAGCCACAGCACCTGGCCTCTATGCACTTTTAATAC/------------------------------------------- CTCAGCAGGT 3070 hom 36 het 13 0 12 5 CAGGTGTGAGCCACAGCACCTGGCCTCTATGCACTTTTAATAC 1 0 148702 CASAVA_Build 18 27004952 9D TTAATTCAAC TGGTTTTAT/--------- TGAGTGGCTA 3070 hom 102 het 36 0 35 6 TGGTTTTAT 1 0 148703 CASAVA_Build 18 27005584 2D CTATAGTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AT 6 5 148704 CASAVA_Build 18 27007271 9I AAGGAAAATA ---------/AGGAACAAG TACCCCATGA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 AGGAACAAG 0 1 148705 CASAVA_Build 18 27007352 4D TTTATTCATT TTTG/---- TTTGTTTTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTTG 2 1 148706 CASAVA_Build 18 27012978 2I CTAATTTTTG --/TA TGTGTGTGTG 3070 hom 30 het 12 0 10 2 TA 0 1 148707 CASAVA_Build 18 27019482 4D AGCAGCTGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 96 het 36 0 32 7 AG 9 7 148708 CASAVA_Build 18 27025803 1D ATGGAGCCAG A/- AAAAATGATG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 6 5 148709 CASAVA_Build 18 27037815 1D GCCTTAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 40 1 34 5 T 12 11 148710 CASAVA_Build 18 27070148 2I TTCTACTGAA --/AT ACATTTTAAC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 AT 0 1 148711 CASAVA_Build 18 27146754 1D TATTACAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2977 hom 36 10 12 15 A 15 14 148712 CASAVA_Build 18 27202458 1I AAAGTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 1472 het 1472 ref 33 19 8 6 A 10 11 148713 CASAVA_Build 18 27208772 4D41M5I5M9I ACTGTAAAAT CATCCATCCCCTGTGGGAAACAGTAGCTCACACCTGTAATCTCAG-----TACTT---------/----CATCCCCTGTGGGAAACAGTAGCTCACACCTGTAAGCTGTGTGAGCTACTTGGTCTCCTG TAGGAGACCA 3070 hom 96 het 21 0 28 12 N/A 0 0 148714 CASAVA_Build 18 27218290 1I TAATTCAGAG -/A AAAAATGTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 6 148715 CASAVA_Build 18 27236669 1I AAAAAGAAGC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 9 148716 CASAVA_Build 18 27248830 4D AATGTAAATG AAAT/---- AAACTTATTT 3070 hom 129 het 46 0 44 3 AAAT 1 0 148717 CASAVA_Build 18 27252902 2D TGCTCTTTTA TT/-- TTTCGAGATG 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 5 3 148718 CASAVA_Build 18 27257242 1I TAAAAAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 402 hom 33 1 32 0 A 9 10 148719 CASAVA_Build 18 27262220 1D TGAGTTGTGG T/- TAAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 16 2 T 2 1 148720 CASAVA_Build 18 27266880 2I ATTTTTAAAA --/AT ATACACCAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AT 1 2 148721 CASAVA_Build 18 27267128 1I GTAAGATCAG -/A AAAAAAGGCA 3070 hom 156 het 56 0 52 4 A 6 7 148722 CASAVA_Build 18 27267809 1D ATCTCTACTC A/- AAAAAAAAAA 1918 het 1156 hom 19 6 6 7 A 17 16 148723 CASAVA_Build 18 27268326 1D ACACAAACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2372 hom 25 7 12 6 T 10 9 148724 CASAVA_Build 18 27272379 1I TGTATCTATT -/C CTAGCATAAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 C 1 2 148725 CASAVA_Build 18 27274409 1I ATAAGGCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 9 10 148726 CASAVA_Build 18 27280764 1D ACCCCGATTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 10 9 148727 CASAVA_Build 18 27282056 4I TTTGTTGTTT ----/TTTG TTTATGTTGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TTTG 0 1 148728 CASAVA_Build 18 27282781 1I TTTCTTCATG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 A 7 8 148729 CASAVA_Build 18 27287379 5I TCGGCCAAAC -----/TAAAG TAAAGAGCAG 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 TAAAG 1 2 148730 CASAVA_Build 18 27316325 1D TAAAGTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 22 1 15 6 A 13 12 148731 CASAVA_Build 18 27316388 4D TCCATCTGTT AATC/---- AATCAAAATA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AATC 2 1 148732 CASAVA_Build 18 27325361 2D TATCTGTGTA TG/-- TGTGTGAAGC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TG 4 3 148733 CASAVA_Build 18 27327587 10I CAAGATAGGA ----------/ATCAGCTGCT ACAATAAAAA 294 het 294 ref 59 34 4 21 ATCAGCTGCT 0 1 148734 CASAVA_Build 18 27330237 2I ACCTTACTGC --/AT ACTGGATGTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 0 1 148735 CASAVA_Build 18 27341111 1D TTGTTCAACT C/- CCCACTTATA 3070 hom 58 het 24 0 18 6 C 4 3 148736 CASAVA_Build 18 27343394 2I AATATTGCTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 11 148737 CASAVA_Build 18 27352687 1I TTGTTCAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 11 12 148738 CASAVA_Build 18 27358201 4D TTGAAGAATT TGAC/---- TATCTACAAC 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 TGAC 1 0 148739 CASAVA_Build 18 27367953 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1583 het 357 hom 24 2 10 12 T 17 16 148740 CASAVA_Build 18 27371112 1D CAATAGTCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 T 10 9 148741 CASAVA_Build 18 27382417 2I TCCCACTAAC --/TG TGTACAGATC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 TG 1 2 148742 CASAVA_Build 18 27394450 1I CATCAAGCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 8 9 148743 CASAVA_Build 18 27398577 1I AGATCCATGA -/G GCTGTTAGCT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 G 1 2 148744 CASAVA_Build 18 27399442 2D TGAGAGTATC AG/-- AGAAAACTCA 3070 hom 130 het 47 0 39 8 AG 2 1 148745 CASAVA_Build 18 27403140 1I TTTTTATTTT -/A TATTTTTTTT 2238 het 1367 hom 15 6 8 1 A 0 1 148746 CASAVA_Build 18 27403776 1I CTAGGAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 22 1 14 7 A 11 12 148747 CASAVA_Build 18 27405166 1D GCGGAATACA G/- GGGGATTTTA 3070 hom 121 het 44 0 39 7 G 5 4 148748 CASAVA_Build 18 27414325 1D TCTTAGAAAA G/- AGACAAATAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 G 1 0 148749 CASAVA_Build 18 27423212 1I ATTTGAAGAG -/A AACTTTGACC 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 A 2 3 148750 CASAVA_Build 18 27441484 1I TAATAAATGA -/T ATGGAGTCAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 0 1 148751 CASAVA_Build 18 27453830 4I ATTGATAGAA ----/AGAG AGGGCGAGTG 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 AG 1 3 148752 CASAVA_Build 18 27454112 1D GACTGACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 690 hom 24 5 12 7 T 15 14 148753 CASAVA_Build 18 27455303 1D TTTCACACCG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 9 8 148754 CASAVA_Build 18 27464379 1I AAGATTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 12 13 148755 CASAVA_Build 18 27471229 1I ACGAATAAGC -/T TTTTTTGACA 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 T 6 7 148756 CASAVA_Build 18 27471362 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTTTGAC 3070 het 862 hom 34 6 20 8 C 0 1 148757 CASAVA_Build 18 27471474 1I GATGACTTTG -/A AAAATGAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 4 5 148758 CASAVA_Build 18 27483278 2D AACATAAGAC AG/-- AGCATTAGTC 3070 het 3070 hom 37 15 20 4 AG 2 1 148759 CASAVA_Build 18 27486340 2D GGTGTGTGAC AA/-- GACACAGCAG 3070 hom 115 het 47 0 37 11 A 2 0 148760 CASAVA_Build 18 27498124 16I AAGTTCAAAC ----------------/ACCAAAATGGCACCCA AGCAGCCATC 3070 hom 90 het 35 0 30 6 ACCAAAATGGCACCCA 0 1 148761 CASAVA_Build 18 27503997 1D TGTAGGTAAC A/- AAACTGTTAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 4 3 148762 CASAVA_Build 18 27504390 4I TATTCATTAG ----/ATGA ATGAAGACCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATGA 1 2 148763 CASAVA_Build 18 27515078 4I TTCCATACCT ----/CAAA CAATGTCCAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 CAAA 0 1 148764 CASAVA_Build 18 27526515 2I GATATTAAAA --/CT CTTCATAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 CT 1 2 148765 CASAVA_Build 18 27529253 1I CCCTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1658 hom 30 4 18 8 A 15 16 148766 CASAVA_Build 18 27582945 9D TTTAGTGCTA CAAATTTCT/--------- CTCTTAACAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CAAATTTCT 1 0 148767 CASAVA_Build 18 27587603 1D TAAATATATG T/- TTTACATAGT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 4 3 148768 CASAVA_Build 18 27593327 3D CCCTGAGGAC CTT/--- CTCTCTGGCC 3070 hom 60 het 22 0 19 3 CTT 1 0 148769 CASAVA_Build 18 27604245 1I GGTATACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 178 hom 35 1 24 10 A 9 10 148770 CASAVA_Build 18 27628462 4D GGGGGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 1355 het 1355 ref 12 5 3 5 TTTG 3 2 148771 CASAVA_Build 18 27656902 1D CTGTAGTCCT A/- AGCTACTTGA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 A 2 1 148772 CASAVA_Build 18 27659591 2I AGATGAAATG --/AC ACAGACACAC 3070 hom 89 het 35 0 29 6 AC 1 2 148773 CASAVA_Build 18 27659720 1D AGAGAGGAGA C/- CCCCAAGTGC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 5 4 148774 CASAVA_Build 18 27671286 1D GTTACTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 11 10 148775 CASAVA_Build 18 27686366 1D TATGCTATAA C/- TATGACTTAA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 C 1 0 148776 CASAVA_Build 18 27690422 8D TAAGTGATCT TAAGTGAG/-------- GCCCACCTCA 3070 hom 75 het 27 0 26 5 TAAGTGAG 1 0 148777 CASAVA_Build 18 27692214 1I CATGTCAAAA -/C TTTCACAACT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 0 1 148778 CASAVA_Build 18 27693057 4D CCATCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 AAAC 5 4 148779 CASAVA_Build 18 27693505 2D AAAAAGTGAA AT/-- AGAGTATTCA 3070 hom 117 het 46 0 38 10 AT 1 0 148780 CASAVA_Build 18 27704053 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 17 1 13 4 A 14 13 148781 CASAVA_Build 18 27705201 6D TCTTGCCTAT TTCTAA/------ TTCTGAGTGA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 TTCTAA 1 0 148782 CASAVA_Build 18 27713944 1D AAAAAAAAAA T/- AAATAAACAA 3070 hom 45 het 17 0 16 5 T 1 0 148783 CASAVA_Build 18 27723581 4D GTAATAGTTA TTTC/---- TTTAAGTTTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TTTC 1 0 148784 CASAVA_Build 18 27726978 1D GCCTTGTCTC A/- AAAAAAGGGA 664 het 432 hom 38 3 11 24 A 7 6 148785 CASAVA_Build 18 27726999 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAACAT 3070 het 260 hom 32 2 24 6 C 0 1 148786 CASAVA_Build 18 27731696 1D ACATCTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 10 9 148787 CASAVA_Build 18 27735077 1I AAATTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 48 1 43 4 T 10 11 148788 CASAVA_Build 18 27735231 1D AGAATTCAAG T/- TAAGTAATGA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 2 1 148789 CASAVA_Build 18 27740137 1D TAAAAATACG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 17 0 8 9 A 16 15 148790 CASAVA_Build 18 27746456 1I CTTTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 A 10 11 148791 CASAVA_Build 18 27751073 31D TCCTACCTCT TAACTTTCGTCAGTAACCGCATTAAGAAAAC/------------------------------- TAAGCCACAA 3070 het 3070 ref 22 17 10 2 TAACTTTCGTCAGTAACCGCATTAAGAAAAC 1 0 148792 CASAVA_Build 18 27751720 1D TAAAAGGTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 107 het 45 0 39 6 A 10 9 148793 CASAVA_Build 18 27759237 4I AAACTTAAAA ----/AAAC AAACAGCCAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AAAC 1 2 148794 CASAVA_Build 18 27760434 2D TTTGTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 36 1 25 11 T 13 11 148795 CASAVA_Build 18 27762046 2I GAACCCAGGG --/GA GGAAGAGGTT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 GA 0 1 148796 CASAVA_Build 18 27765501 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAACTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 6 148797 CASAVA_Build 18 27767767 1I ATTTTTTACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 415 hom 30 1 23 6 A 9 10 148798 CASAVA_Build 18 27773106 1I CAAAAAGTAG -/C CTGTTCTAGG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 1 2 148799 CASAVA_Build 18 27788202 8D CTCCGTCTCC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 2838 hom 33 het 12 0 7 7 A 26 18 148800 CASAVA_Build 18 27789384 9D GGATTATAGG CACATGCCC/--------- CACATGCCCC 3070 hom 48 het 18 0 17 3 CACATGCCC 2 1 148801 CASAVA_Build 18 27795683 1I GCTAGGGTTC -/T TTTTTTTTTT 1452 het 5 hom 11 0 7 4 T 15 16 148802 CASAVA_Build 18 27796096 4D TCAGACTCTT CCTC/---- CATGCCTCGC 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 CCTC 1 0 148803 CASAVA_Build 18 27799046 1I GAGGCAGAGG -/T TTGCAGTGAG 982 hom 7 het 3 0 3 0 T 2 3 148804 CASAVA_Build 18 27800592 1I ATTCACAGGC -/A AAAAGGCATC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 4 5 148805 CASAVA_Build 18 27800992 1D AAGTCCAGGA G/- GCCACCTCCA 3070 hom 69 het 28 0 21 7 G 2 1 148806 CASAVA_Build 18 27802653 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 30 1 27 2 A 12 11 148807 CASAVA_Build 18 27802889 1I4M30D TGTATTTAAT -TTAGAATTTAACTTAGAATTTAACTTAGAATTTA/GGCAG------------------------------ ACTTAGAATT 1735 hom 12 het 7 0 5 6 N/A 0 0 148808 CASAVA_Build 18 27805032 1D CAATCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 148809 CASAVA_Build 18 27812283 1D GGGATAAAGG A/- AGACTGGGGG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 2 1 148810 CASAVA_Build 18 27815952 2D TAATATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1571 het 54 hom 12 1 5 6 T 13 11 148811 CASAVA_Build 18 27820366 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2291 hom 26 7 12 7 T 12 11 148812 CASAVA_Build 18 27820901 1D CCTATTGGTG C/- CCGGGCGTGG 3070 het 2702 hom 21 8 11 2 C 3 2 148813 CASAVA_Build 18 27828072 3I GGCAGCAGTT ---/ATC ATCTCACCAC 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 ATC 1 2 148814 CASAVA_Build 18 27843316 1I CTTTTAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 13 14 148815 CASAVA_Build 18 27851807 5I TAATTATCTC -----/AAAAT AAAGTTTTGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAAAT 0 1 148816 CASAVA_Build 18 27853964 16D CTCTGTTTAC TGTGTGTGTGTGTGTG/---------------- TGTGTGTGTG 3070 het 2725 hom 25 11 12 6 TG 15 7 148817 CASAVA_Build 18 27855422 3D CTATTACTGA TGT/--- TGTTGCTCAG 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 TGT 2 1 148818 CASAVA_Build 18 27858260 9I GCCTCCCAGG ---------/TTCAAGCGA TTCTCCTGCC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 TTCAAGCGA 0 1 148819 CASAVA_Build 18 27859181 2I ATGTGTAAAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 AT 4 5 148820 CASAVA_Build 18 27863581 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 651 hom 35 2 23 10 A 12 13 148821 CASAVA_Build 18 27868718 1I TACTAGAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2214 hom 16 5 10 1 A 9 10 148822 CASAVA_Build 18 27875794 12D GGTTTCACCG TGTTAGCCGGGA/------------ TGGTCTCGAT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TGTTAGCCGGGA 1 0 148823 CASAVA_Build 18 27877101 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 2677 het 2008 hom 13 5 7 1 CT 2 1 148824 CASAVA_Build 18 27879523 1I CTCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1619 hom 29 7 15 7 A 11 12 148825 CASAVA_Build 18 27890673 4D AAAAAAATTT AAAA/---- AAAAGAGCAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 4 A 8 4 148826 CASAVA_Build 18 27893757 1D ATTTTGACTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 T 9 8 148827 CASAVA_Build 18 27896731 1D ATTCAAGCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 T 9 8 148828 CASAVA_Build 18 27904666 1I TCTTTCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1886 hom 24 7 9 8 T 15 16 148829 CASAVA_Build 18 27929142 1I AATTATCGTT -/A TTTTTTTGAG 2836 het 2836 ref 22 13 7 2 A 0 1 148830 CASAVA_Build 18 27931026 1D TTAAGACAAA T/- TAATATGAAA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 2 1 148831 CASAVA_Build 18 27932523 1I ATTATATAAT -/A AAAGGTTGAG 3070 hom 57 het 26 0 19 7 A 3 4 148832 CASAVA_Build 18 27934163 2D AGTGATTGAG AT/-- ATATATATAT 1817 het 1817 ref 19 8 4 7 AT 10 9 148833 CASAVA_Build 18 27947329 1D AGGAACTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 9 8 148834 CASAVA_Build 18 27948975 1I GCTCTTATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 T 9 10 148835 CASAVA_Build 18 27955104 1D CAAAAAAAAA C/- AAAACAAAAA 2141 het 2141 ref 20 7 8 7 C 1 0 148836 CASAVA_Build 18 27962043 5I TCCGTCTCAA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 2696 het 2696 ref 17 9 6 2 AAAAG 2 3 148837 CASAVA_Build 18 27962847 4D TGATCCTCTC TGTT/---- TGTTTGTTAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 7 TGTT 3 2 148838 CASAVA_Build 18 27964879 2I CTCCTTTTTA --/AG AGACTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 AG 1 2 148839 CASAVA_Build 18 27965338 2I TGGGGAAAAG --/TT TTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 3 5 148840 CASAVA_Build 18 27970022 3D AAAAAAAAAA GGG/--- GGAATTGACA 703 het 703 ref 28 14 5 10 G 5 2 148841 CASAVA_Build 18 27977600 1I GGCCAGTGAT -/G GGTGTGACCA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 G 2 3 148842 CASAVA_Build 18 27978201 3D TTCCTCTCTA CTT/--- CTTCTTTGCT 3070 het 3070 hom 51 27 22 5 CTT 3 2 148843 CASAVA_Build 18 28001521 1I TCAGAAAAGA -/T TTTTTTTTTG 2543 het 2543 ref 26 13 7 6 T 9 10 148844 CASAVA_Build 18 28006486 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1769 het 1299 hom 21 7 6 8 T 15 14 148845 CASAVA_Build 18 28006789 1I ATATCAGTCA -/G ATTTTTTTTT 2695 het 2695 ref 24 12 9 3 G 0 1 148846 CASAVA_Build 18 28023746 1I TTTACTAGTC -/T TAAGGACCAG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 1 2 148847 CASAVA_Build 18 28043672 1D TGCTGTAGTT A/- ACAATATCTT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 2 1 148848 CASAVA_Build 18 28106589 1D TTCTGGGGTC T/- TTTTTTTTTT 1924 het 1924 ref 23 8 5 10 T 12 11 148849 CASAVA_Build 18 28116581 1I ACTGTTGGCC -/A AACTGGTCTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 2 3 148850 CASAVA_Build 18 28220985 1D GTTTATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 26 0 18 8 T 11 10 148851 CASAVA_Build 18 28286815 1I AACTTCTACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2505 hom 28 9 10 9 T 13 14 148852 CASAVA_Build 18 28291139 1I TGTGGGGGGT -/G GGGGGAGAGA 3070 het 3007 hom 19 8 9 2 G 5 6 148853 CASAVA_Build 18 28319489 1I TTTTTTTTTT -/A ACATATTTCT 3070 het 3070 ref 40 16 18 6 A 1 2 148854 CASAVA_Build 18 28335648 1D TTCATGCCCT C/- CCCCGAGTTC 3070 hom 92 het 34 0 31 3 C 5 4 148855 CASAVA_Build 18 28385858 1D TGTTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 11 10 148856 CASAVA_Build 18 28385951 1D TCTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2112 hom 36 10 17 10 T 15 14 148857 CASAVA_Build 18 28393567 3D GGTTGAAAGA AAG/--- AAGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 AAG 3 2 148858 CASAVA_Build 18 28398187 3D CTTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2377 het 1474 hom 18 7 7 4 T 17 14 148859 CASAVA_Build 18 28401764 2D GTGAATGGAG CC/-- CCCCCCCCTT 3070 het 357 hom 41 3 16 22 C 10 8 148860 CASAVA_Build 18 28402761 3I AATATATCTC ---/ATT ATCTGTCTCT 3070 het 3070 ref 36 24 9 3 ATT 0 1 148861 CASAVA_Build 18 28407688 8I GTTGTAATGG --------/GCAGTAAT GCAGTAATGG 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 GCAGTAAT 1 2 148862 CASAVA_Build 18 28415237 3I CATTTTTGCA ---/AGG AGAAGTCATA 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 AGG 0 1 148863 CASAVA_Build 18 28415592 1I ACGTCATTGG -/T TTCTTCTGAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 3 148864 CASAVA_Build 18 28419450 1I ATATCTAGCA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 2 3 148865 CASAVA_Build 18 28424500 2D TTAAAATAAC TG/-- AAATCAATTC 3070 het 3070 ref 45 23 21 3 TG 1 0 148866 CASAVA_Build 18 28465377 1D TGTGGTGGTT C/- TCTGTGCTCT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 C 1 0 148867 CASAVA_Build 18 28486377 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1378 het 1378 ref 14 7 4 3 T 13 12 148868 CASAVA_Build 18 28488805 3D CCAAATATTC AGA/--- AGGACTTGGG 3070 het 3070 hom 56 22 32 3 AGA 1 0 148869 CASAVA_Build 18 28491291 1I TGCTTTTTAG -/A AGTATGTATA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 1 2 148870 CASAVA_Build 18 28493920 3D CACTACAAGG CTA/--- CAAGTAACCA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 CTA 1 0 148871 CASAVA_Build 18 28499853 1I AGTTTGTTTG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 7 8 148872 CASAVA_Build 18 28576268 1D TAGAACGACC T/- TTTTCTTATA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 5 4 148873 CASAVA_Build 18 28577368 1D ATCTCCATGT G/- GAAGGAAGGG 3070 hom 105 het 43 0 36 9 G 2 1 148874 CASAVA_Build 18 28578439 1D ACTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 24 0 16 8 A 17 16 148875 CASAVA_Build 18 28598477 5D TATCCCAAGT GCCTA/----- GCCTAGTACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 GCCTA 2 1 148876 CASAVA_Build 18 28601326 1D AAATGCTACC T/- TTACTAATAA 3070 het 3070 hom 53 23 25 7 T 3 2 148877 CASAVA_Build 18 28611856 1D AGCTCGCCTC T/- TAACTTCCTC 3070 hom 111 het 45 0 37 10 T 2 1 148878 CASAVA_Build 18 28615150 2I AAGGTGAAAT --/TG TGTGTGTTTG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TG 3 4 148879 CASAVA_Build 18 28619525 3D TTTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 2452 hom 24 het 13 0 9 5 T 20 17 148880 CASAVA_Build 18 28628105 1D ATCTTGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 29 4 17 8 T 15 14 148881 CASAVA_Build 18 28631381 1D AAACCCTAGA G/- GAAAACCTAT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 G 2 1 148882 CASAVA_Build 18 28639371 1D TTTCCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 10 6 T 13 12 148883 CASAVA_Build 18 28640373 1I TTTGAATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 40 0 33 7 T 10 11 148884 CASAVA_Build 18 28644275 15I TCCCTGGGAG ---------------/CCAGATTAATAAGCA CATGTCCAAT 3070 hom 126 het 44 0 40 5 CCAGATTAATAAGCA 0 1 148885 CASAVA_Build 18 28645360 1I ACTGATAGTA -/T TTTTTAAATA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 T 5 6 148886 CASAVA_Build 18 28645949 1I ATTTATGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 36 1 31 4 T 10 11 148887 CASAVA_Build 18 28647942 12I CTTCCATAAA ------------/TACCTTTGGTTG GTTCCACTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TACCTTTGGTTG 0 1 148888 CASAVA_Build 18 28650774 1I CCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 8 9 148889 CASAVA_Build 18 28655863 1D TTCCTAGTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 7 148890 CASAVA_Build 18 28656461 1I TGCTGACCAG -/T TTGTGTTAAT 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 2 3 148891 CASAVA_Build 18 28660808 5D TTTCTTCTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 116 hom 32 2 25 5 T 16 11 148892 CASAVA_Build 18 28662352 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 16 0 12 4 A 16 15 148893 CASAVA_Build 18 28664083 1D CCAAGCAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 10 9 148894 CASAVA_Build 18 28668800 1I TAGGATGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 199 hom 43 1 26 16 T 11 12 148895 CASAVA_Build 18 28673833 5I TGAAGTAAGA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 3070 hom 36 het 23 0 13 10 AAAAG 2 3 148896 CASAVA_Build 18 28674404 1D TGTCCTAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 10 9 148897 CASAVA_Build 18 28674778 2I TACCAGAAAT --/AA AAAATTTTCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 4 6 148898 CASAVA_Build 18 28677662 1D ACTGAGTGTG A/- AAGACCCCAC 3070 hom 168 het 61 0 52 9 A 3 2 148899 CASAVA_Build 18 28685285 1I TTGAGAGAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 10 148900 CASAVA_Build 18 28686746 1D GAAAGGGGAT A/- AAATAGACTA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 A 4 3 148901 CASAVA_Build 18 28690619 1I TATTTTTTTA -/T TTTTTTTAAT 2463 hom 15 het 7 0 6 1 T 7 8 148902 CASAVA_Build 18 28699124 2I GGGCAGGCAG --/TT TTTTTTTGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 9 148903 CASAVA_Build 18 28708526 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 10 11 148904 CASAVA_Build 18 28711825 1I AGCTAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 37 1 29 7 A 11 12 148905 CASAVA_Build 18 28712548 1D GCATAGCACT C/- CCCATTGTGC 3070 hom 152 het 59 0 50 10 C 4 3 148906 CASAVA_Build 18 28712627 1D ACTCTGATTT G/- GCTATAAAGT 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 G 2 1 148907 CASAVA_Build 18 28716769 2D AGTGAAGGAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 104 het 45 0 33 12 GT 8 7 148908 CASAVA_Build 18 28718423 4I TATATGTTTG ----/TCTA TCTATGCATC 3070 hom 120 het 48 0 41 7 TCTA 1 2 148909 CASAVA_Build 18 28722147 1I CTGCAAGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1637 hom 25 5 12 8 A 13 14 148910 CASAVA_Build 18 28729629 1D AAGATGGTAA T/- TTTTTTACAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 6 148911 CASAVA_Build 18 28729739 7D ATTGGCATCA AATTGGG/------- AATAAGGAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AATTGGG 1 0 148912 CASAVA_Build 18 28786026 1D CAGGGTACAG C/- CCCCCCTCCC 3070 het 198 hom 22 3 14 5 C 7 6 148913 CASAVA_Build 18 28790948 5I GCTAAAGAGA -----/AAGAG AAGAGATGAA 3070 hom 92 het 34 0 27 7 AAGAG 1 2 148914 CASAVA_Build 18 28795962 1I CTTTACTGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 9 10 148915 CASAVA_Build 18 28814126 1D CTTCTAATGG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 8 7 148916 CASAVA_Build 18 28890913 1I AAGTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 13 14 148917 CASAVA_Build 18 28986982 1I TAGACTTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 28 1 22 5 A 10 11 148918 CASAVA_Build 18 29017343 1D TATACCACAT G/- GGAGATTTCA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 G 3 2 148919 CASAVA_Build 18 29031588 1D TTGCTTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 25 1 13 11 A 15 14 148920 CASAVA_Build 18 29076579 1I GATATTTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 358 hom 58 1 45 12 A 9 10 148921 CASAVA_Build 18 29084405 2I CCTAAAAAAT --/AA AGACTGGGGA 3070 hom 62 het 23 0 21 2 A 1 3 148922 CASAVA_Build 18 29090015 4I ATTTTGCACT ----/TAAG TAAGATAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TAAG 1 2 148923 CASAVA_Build 18 29121054 1I73M1D TCATAGATCC -ATGACACAAATTAGAGAAAAGTGTATGTTAATGAGGTAAAGACTCAATTGAAAGCACAAAATGCCTTGAAATTA/AATGACACAAATTAGAGAAAAGTGTATGTTAATGAGGTAAAGACTCAATTGAAAGCACAAAATGCCTTGAAATT- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 28 N/A 0 0 148924 CASAVA_Build 18 29125984 1I GAGATTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 472 hom 39 2 27 10 A 13 14 148925 CASAVA_Build 18 29127459 1D ATGCCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 28 1 22 5 A 12 11 148926 CASAVA_Build 18 29132003 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 22 1 18 4 A 13 12 148927 CASAVA_Build 18 29140163 1I TAAAAGAGCC -/T TTTTCAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 4 5 148928 CASAVA_Build 18 29191799 2D TGTGTATGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 12 hom 26 1 16 9 TG 7 6 148929 CASAVA_Build 18 29194230 7D ATCAAATCCT TATATAA/------- TATATAATTA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 TATATAA 2 1 148930 CASAVA_Build 18 29196153 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 951 hom 27 3 19 5 AT 7 8 148931 CASAVA_Build 18 29205236 4D CTCTCATATA TGTG/---- TGTGTGTGTA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TG 6 4 148932 CASAVA_Build 18 29211285 35D TTTTAAGTTC CTTAGAGATTTGGGATATTAGGCTTTTGTCAGATG/----------------------------------- CATAGTTTGT 3070 hom 42 het 16 0 15 4 CTTAGAGATTTGGGATATTAGGCTTTTGTCAGATG 1 0 148933 CASAVA_Build 18 29214943 1D CTCCATTTAA C/- CTCTTTTCTT 3070 hom 123 het 42 0 41 2 C 2 1 148934 CASAVA_Build 18 29245513 5I TGCAAAAAAA -----/TAGAG TAAAGTAATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TAGAG 0 1 148935 CASAVA_Build 18 29246436 4D CTTTACTACC ATCT/---- ATCTCTTCTT 3070 hom 63 het 25 0 22 5 ATCT 2 1 148936 CASAVA_Build 18 29247493 1I GGGTAAATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 A 9 10 148937 CASAVA_Build 18 29250390 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 442 hom 18 2 10 6 A 13 12 148938 CASAVA_Build 18 29250894 1I GACTAAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 8 9 148939 CASAVA_Build 18 29262989 1I GTTTAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 497 hom 35 2 31 2 A 11 12 148940 CASAVA_Build 18 29266287 2I GTTTCTGGGC --/TA TGATCCATGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TA 0 1 148941 CASAVA_Build 18 29275579 1I GAAGATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 339 hom 39 2 32 5 A 12 13 148942 CASAVA_Build 18 29277970 1I ATTTTCAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 9 10 148943 CASAVA_Build 18 29278791 21D GTTGTCACCC TCTGTAAGTTGTAGTCATTTA/--------------------- TCCAGGCCAG 3070 hom 96 het 30 0 31 3 TCTGTAAGTTGTAGTCATTTA 1 0 148944 CASAVA_Build 18 29280159 16D38M6D TAGATACATG TGTATATATATATATATATATATATATAGATAGATAGATAGATAGATACATGTGTGTATA/----------------TATATATATATATATAGATAGATAGATAGATACATGTG------ TATATATATA 3070 hom 45 het 16 0 16 5 N/A 0 0 148945 CASAVA_Build 18 29281877 1I AGAAATGAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 10 148946 CASAVA_Build 18 29285402 1I24M2I CAAGCAGAAG -AAAAATAATCATAATAATTGAAAC--/AAAAAATAATCATAATAATTGAAACAG AAATCAGTGA 3070 hom 90 het 27 0 31 3 N/A 0 0 148947 CASAVA_Build 18 29317371 4I TTATTTTAAT ----/TGTG TGTGTCTGTG 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 TG 2 4 148948 CASAVA_Build 18 29324672 3I GTTTAGCAAA ---/ACT ACTCTTCAGG 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 ACT 1 2 148949 CASAVA_Build 18 29325528 3I AAAGAAAATA ---/GAG GAGGAGTCAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 GAG 2 3 148950 CASAVA_Build 18 29331349 1I CAAAAATACT -/A TACAATAACA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 A 0 1 148951 CASAVA_Build 18 29332197 1D TCGCATTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 10 9 148952 CASAVA_Build 18 29334315 1I TTATCACCCC -/T TACTTTATAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 1 2 148953 CASAVA_Build 18 29334598 2D TTATTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 55 18 20 17 TG 9 8 148954 CASAVA_Build 18 29431756 1D TCTCATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1715 hom 31 8 14 10 A 13 12 148955 CASAVA_Build 18 29462717 1D AAAAATTTTT C/- TATGTGGAAC 3070 het 3070 ref 43 23 16 5 C 1 0 148956 CASAVA_Build 18 29474815 2I TGAATTTGTT --/CA GTTTTTATGC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 CA 0 1 148957 CASAVA_Build 18 29479717 1I TACATGTGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 9 10 148958 CASAVA_Build 18 29488666 1D AATAAATAAG C/- CTCTGATGTC 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 C 2 1 148959 CASAVA_Build 18 29495860 2I AATCTGTGAT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 9 11 148960 CASAVA_Build 18 29517088 1I ACAATTAAAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 7 8 148961 CASAVA_Build 18 29522966 1I TCTTTTTATC -/T TTTTTTTTTT 2849 het 2849 ref 25 12 7 6 T 10 11 148962 CASAVA_Build 18 29531802 1I TCTGTCTCTC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 7 8 148963 CASAVA_Build 18 29540070 1D CTTGATGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 8 T 12 11 148964 CASAVA_Build 18 29541490 1D TATATATTGA T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 T 7 6 148965 CASAVA_Build 18 29550860 1I TTTGCTGGTT -/A AAAAAAAAAA 2158 het 2158 ref 36 13 8 15 A 15 16 148966 CASAVA_Build 18 29565173 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 6 7 148967 CASAVA_Build 18 29569966 5D CTTTGCAAAT ATTTC/----- ATTTAATCCT 3070 het 3070 ref 35 20 13 5 ATTTC 1 0 148968 CASAVA_Build 18 29582082 1D AAGCAAACAT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 38 14 9 16 G 8 7 148969 CASAVA_Build 18 29584531 2D GTTTGTACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 9 T 12 10 148970 CASAVA_Build 18 29586899 2D AAGGAGCCCC CT/-- GAGTCTGCTT 3070 het 3070 ref 36 21 14 2 CT 1 0 148971 CASAVA_Build 18 29589153 1I TCCACTAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 A 9 10 148972 CASAVA_Build 18 29600935 1D TTCCCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2962 hom 28 11 11 6 T 11 10 148973 CASAVA_Build 18 29602630 1D ATTGGGATCT C/- CCTTCAGTTA 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 C 3 2 148974 CASAVA_Build 18 29609355 1D ATTTCTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 11 10 148975 CASAVA_Build 18 29629823 1I ACAGAGAGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 8 9 148976 CASAVA_Build 18 29642092 1I CAAACAATAC -/A AAAAATAGGC 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 A 5 6 148977 CASAVA_Build 18 29644065 4D GATAAATGCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 AAAC 3 2 148978 CASAVA_Build 18 29645013 2I CAACAACAAC --/AA AAAAAACCCA 3070 het 2922 hom 24 10 11 3 A 6 8 148979 CASAVA_Build 18 29646927 1D CCAAAACCAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 8 7 148980 CASAVA_Build 18 29651814 4D ATATATAGAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 15 8 10 AT 7 5 148981 CASAVA_Build 18 29656069 3D AACTGAAGGC TGT/--- TAAGTTTCAC 3070 het 3070 ref 47 23 21 5 TGT 1 0 148982 CASAVA_Build 18 29657827 1D CGCATAACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 10 9 148983 CASAVA_Build 18 29659681 1D GGGGAGCTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 9 8 148984 CASAVA_Build 18 29663434 7D ACCATCTCCT AGAAATA/------- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AGAAATA 1 0 148985 CASAVA_Build 18 29665065 1D CTGTAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2484 hom 18 6 7 5 A 11 10 148986 CASAVA_Build 18 29666863 2D TATCTTTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 34 4 14 16 T 14 12 148987 CASAVA_Build 18 29678331 15D GCAAAACCTT CTGCTTTTATATTTA/--------------- CTGCTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 15 11 10 CTGCTTTTATATTTA 1 0 148988 CASAVA_Build 18 29678599 1I TGAAAAAGAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 8 9 148989 CASAVA_Build 18 29681156 1D TCCCTCTCTT C/- CATTAGACGT 3070 het 3070 ref 57 28 23 6 C 2 1 148990 CASAVA_Build 18 29689775 15D TTCATTTTAC TTCTTCATTTTCTTT/--------------- TTCTTCATTT 3070 hom 66 het 31 0 23 11 TTCTTCATTTTCTTT 2 1 148991 CASAVA_Build 18 29726612 3I TCTCCTTCTC ---/CTT CTTCTTCTTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 CTT 4 5 148992 CASAVA_Build 18 29759104 2I ATATACAATA --/AC ACACAAATAT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AC 2 3 148993 CASAVA_Build 18 29777996 1D AATATAGAAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 T 8 7 148994 CASAVA_Build 18 29788500 1I ATCTGAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 24 9 8 T 10 11 148995 CASAVA_Build 18 29790846 3D GAAAATGGTA TTC/--- CTAGGTAGAT 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 TTC 1 0 148996 CASAVA_Build 18 29795090 3D AAATATATAC ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 ATA 4 3 148997 CASAVA_Build 18 29803721 1I GTGCTTGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 575 hom 39 3 18 18 A 15 16 148998 CASAVA_Build 18 29809046 1I GCAAATACTG -/T ATAATTTCAC 3070 het 3070 ref 52 29 13 10 T 0 1 148999 CASAVA_Build 18 29810349 1I GAGAGAGTTT -/G ACATATATTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 G 0 1 149000 CASAVA_Build 18 29815257 1I GACTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 11 12 149001 CASAVA_Build 18 29831470 1I GTAATGTGAT -/G CGTCTGGCTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 G 0 1 149002 CASAVA_Build 18 29864894 1I CAAAATATGT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 7 8 149003 CASAVA_Build 18 29868257 1D AATGTAAATG A/- ATTAGATTCT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 A 2 1 149004 CASAVA_Build 18 29870329 1I AAATGAAGGG -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 47 21 23 3 A 6 7 149005 CASAVA_Build 18 29871369 1I TCACAGAAAT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 7 8 149006 CASAVA_Build 18 29878451 1D TAAAAGACAA T/- TTTTTGTTAT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 6 5 149007 CASAVA_Build 18 29886241 1I TGGAGTAATA -/C CATGGTTGAT 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 C 1 2 149008 CASAVA_Build 18 29898881 12D GTATTTTTTA ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 11 20 8 AC 17 11 149009 CASAVA_Build 18 29901768 1D GGATGTGTTT A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 A 1 0 149010 CASAVA_Build 18 29904524 1I CACAATCTTT -/A AAAGTACTCG 3070 het 3070 hom 54 18 31 5 A 3 4 149011 CASAVA_Build 18 29906396 2I TATTAATAAC --/AG AACTTCAGTA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 AG 0 1 149012 CASAVA_Build 18 29942376 1D AAATGAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 10 9 149013 CASAVA_Build 18 29979429 5D AAGAGGAGAT AATAA/----- AATAAATATA 3070 het 3070 hom 28 12 14 5 AATAA 2 1 149014 CASAVA_Build 18 29980693 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTTTTT 2600 het 2600 ref 19 7 6 6 T 11 12 149015 CASAVA_Build 18 30008274 1I CTTCATAAAA -/C AATTTTAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 0 1 149016 CASAVA_Build 18 30015683 1D CTTAACACTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 9 8 149017 CASAVA_Build 18 30023949 2I AGATATATGC --/AT ATATATATAT 1565 het 1565 ref 18 10 5 3 AT 6 7 149018 CASAVA_Build 18 30027571 1D GATGTGGAGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 A 9 8 149019 CASAVA_Build 18 30031069 1D AAAGGGTGCT A/- AACTTATATA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 A 3 2 149020 CASAVA_Build 18 30031677 3D GGTGGTGGAA GGT/--- GGTTTGAATT 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 GGT 2 1 149021 CASAVA_Build 18 30033108 1D GACAGAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 647 hom 40 4 21 15 T 17 16 149022 CASAVA_Build 18 30069450 4I ACAGGGAGTT ----/AAAG GAACTAGAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AAAG 0 1 149023 CASAVA_Build 18 30143519 1D TTTGCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 40 3 23 14 T 17 16 149024 CASAVA_Build 18 30144059 1D TTTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 26 0 15 11 T 14 13 149025 CASAVA_Build 18 30164652 6D AAAAAATTAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 8 AAAAAC 3 2 149026 CASAVA_Build 18 30228797 1D CAGAGACTGC A/- AATATGAGGA 3070 hom 102 het 40 0 32 8 A 3 2 149027 CASAVA_Build 18 30236556 4D AATTTTAAGA TTGT/---- TTGATAACTG 3070 het 3009 hom 30 7 20 5 TTGT 1 0 149028 CASAVA_Build 18 30246518 1I CTCTGTCTTC -/A CCCCCCAGCT 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 A 0 1 149029 CASAVA_Build 18 30251414 2D TAAGAGCATG AA/-- AAGTCTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 A 4 2 149030 CASAVA_Build 18 30261156 1I AAAGAACATC -/T TTATTTCTGC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 2 3 149031 CASAVA_Build 18 30266361 1D TAGTATTCCA T/- TTTTTTTGCG 2906 het 1727 hom 12 5 6 1 T 8 7 149032 CASAVA_Build 18 30319017 4D GCGAGCGAGC GAGA/---- GAGAGACTAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 GA 5 3 149033 CASAVA_Build 18 30320286 1D TCCTAGCGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 10 9 149034 CASAVA_Build 18 30322151 1D CAAATTAAAG C/- TTTTGGTTTT 3070 het 3070 ref 51 23 21 8 C 1 0 149035 CASAVA_Build 18 30327091 2D ATCTGAAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 13 11 149036 CASAVA_Build 18 30366733 4I TATATATATA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 86 het 37 0 29 8 TG 6 8 149037 CASAVA_Build 18 30370934 1I AGCCAGCTGC -/T TTTTATACTA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 4 5 149038 CASAVA_Build 18 30376633 1D CTGTTCTGTG A/- AAAAAAAAAA 1801 het 1801 ref 26 19 5 2 A 12 11 149039 CASAVA_Build 18 30376859 2I ATTTTGAAAA --/AC ATGTATGTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AC 0 1 149040 CASAVA_Build 18 30417988 2D TAGTAACAAA CT/-- CTACTTTCCC 3070 het 3070 ref 49 22 22 7 CT 2 1 149041 CASAVA_Build 18 30464774 1D CCAAACTGTC A/- AAAAAAAAAG 1236 het 1236 ref 56 51 3 2 A 10 9 149042 CASAVA_Build 18 30507486 1I AGTCCTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 13 13 14 A 14 15 149043 CASAVA_Build 18 30581067 2D TATCTGTATC TA/-- TATATATATA 3070 hom 40 het 21 0 13 8 TA 8 7 149044 CASAVA_Build 18 30582199 1I TTTGAGAAGA -/T TTTTCTCCCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 4 5 149045 CASAVA_Build 18 30595089 16D CTCCATCCTT CACACACACACACACA/---------------- CACACACACA 3070 hom 61 het 31 0 22 11 CA 22 14 149046 CASAVA_Build 18 30598197 2I ACTTTATATC --/TG TGTATTACCA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 TG 1 2 149047 CASAVA_Build 18 30600448 6I CAATGAGAAC ------/ACATGG ACACAGGAAG 1793 hom 10 het 7 0 4 6 ACATGG 0 1 149048 CASAVA_Build 18 30601193 1I GGTAGAAACC -/A GGCATCTCCA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 0 1 149049 CASAVA_Build 18 30601663 4I TATAAGGCCA ----/CCAG CCTCACTCCT 3070 hom 126 het 45 0 39 7 CCAG 0 1 149050 CASAVA_Build 18 30605920 1I TCAGCAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 11 12 149051 CASAVA_Build 18 30606535 1D TGGCAGGAGT A/- GCCTTGAGCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 7 A 1 0 149052 CASAVA_Build 18 30612756 1I AAAAGCTATA -/T TATATAGGGA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 1 2 149053 CASAVA_Build 18 30614066 2D CAAAATCAAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 93 het 36 0 31 6 TA 7 6 149054 CASAVA_Build 18 30619793 4I GATTAGGGAC ----/CTGT CTATTTTGTA 3070 hom 157 het 55 0 53 2 CTGT 0 1 149055 CASAVA_Build 18 30626056 1D TAACCTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 35 1 29 5 T 13 12 149056 CASAVA_Build 18 30645435 1I GTGTCTTTGA -/T TTTTCAAATA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 4 5 149057 CASAVA_Build 18 30651544 1I CTCAGGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 9 10 149058 CASAVA_Build 18 30656807 3I ACAAAATGTG ---/TCT TCTTCTGAGA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 TCT 2 3 149059 CASAVA_Build 18 30661240 1D AAGTAAAGCC A/- CTACCTTCTT 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 A 1 0 149060 CASAVA_Build 18 30675049 1D AGTCCTTAAA G/- TAAGCCCATG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 G 1 0 149061 CASAVA_Build 18 30678518 21I ATTTGAGTTA ---------------------/ACTAATAATGCTTTCTCAGGT ACTAATCCTC 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 ACTAATAATGCTTTCTCAGGT 0 1 149062 CASAVA_Build 18 30697485 1I TTTTCTAAAT -/C ATATTTCCAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 C 0 1 149063 CASAVA_Build 18 30704166 1D CTAACTTGGT G/- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 18 5 G 4 3 149064 CASAVA_Build 18 30786848 1I AACCTGAGGG -/A AAAGCACTTT 3070 het 3070 hom 65 27 30 8 A 3 4 149065 CASAVA_Build 18 30789839 13D CAATAGACAC AGGGGCCTGCTTG/------------- AGGGTAAAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 AGGGGCCTGCTTG 1 0 149066 CASAVA_Build 18 30798274 1I TCTTATTACT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 9 10 149067 CASAVA_Build 18 30808204 1D AAAAAAATAA C/- AAATGTTGGC 3070 hom 54 het 21 0 19 3 C 1 0 149068 CASAVA_Build 18 30817978 1D TACTAAAAGG A/- TATACACGGT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 1 0 149069 CASAVA_Build 18 30818436 1I ATAATTAACG -/T TAAGTTTTGA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 T 1 2 149070 CASAVA_Build 18 30828363 1I TGTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 10 11 149071 CASAVA_Build 18 30837530 1D ACCTAGCAAT G/- GACCGTTGTC 3070 het 2537 hom 26 7 17 3 G 2 1 149072 CASAVA_Build 18 30841785 1D TTATAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 11 10 149073 CASAVA_Build 18 30842934 2D GTGCATGCAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 GT 6 5 149074 CASAVA_Build 18 30852433 1I TGTTTTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 34 1 24 9 T 11 12 149075 CASAVA_Build 18 30853016 1I TTTTTTAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 10 149076 CASAVA_Build 18 30854514 2D TTGGCTTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 45 0 24 22 A 14 12 149077 CASAVA_Build 18 30856363 5D ATTTTTTATC ATAAG/----- ATAACGGTAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ATAAG 1 0 149078 CASAVA_Build 18 30863118 1D CATTTCTGAT G/- GGAAACTTAG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 3 2 149079 CASAVA_Build 18 30871127 1I AGCCTGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 43 1 33 9 T 12 13 149080 CASAVA_Build 18 30871625 1I TTTTAGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 763 hom 55 2 43 10 T 10 11 149081 CASAVA_Build 18 30876887 1D TTGTTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 909 hom 39 2 31 7 A 13 12 149082 CASAVA_Build 18 30879407 1I TGAATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 40 1 34 5 A 11 12 149083 CASAVA_Build 18 30886971 2D AAGTCCCCCC CA/-- CACACACACA 3054 hom 38 het 16 0 12 4 CA 7 6 149084 CASAVA_Build 18 30892760 1D ACAAAATGGC T/- TTATTAAAGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 3 2 149085 CASAVA_Build 18 30895058 1D GTTAGGAGTT C/- TGATTGTCAG 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 C 1 0 149086 CASAVA_Build 18 30930552 4I AAAGAACATG ----/ACTC ACTCTGAACT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 ACTC 1 2 149087 CASAVA_Build 18 30940320 2I AAATTAGCTT --/GC ATGTCCTAAC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 GC 0 1 149088 CASAVA_Build 18 30975624 4D GCCTCTTTTT TTTC/---- TTTATTTTTA 1159 het 1159 ref 25 16 6 5 TTTC 1 0 149089 CASAVA_Build 18 30975905 4D AGTCTCTCCA AAAT/---- AAATCTTTTG 3070 het 3070 ref 41 19 20 3 AAAT 2 1 149090 CASAVA_Build 18 30978650 4D TAAAACACAC ACAG/---- ACAACTTGGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 7 ACAG 1 0 149091 CASAVA_Build 18 30980969 10D TTTGATGGTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 2153 het 2153 ref 22 13 5 4 TTTTG 4 2 149092 CASAVA_Build 18 30982498 1D GATCGTGAGG T/- TGTAAGCTTT 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 T 2 1 149093 CASAVA_Build 18 30982970 2D GGGGTCAGTG GT/-- GTGATATCCC 3070 het 3070 ref 24 16 8 0 GT 2 1 149094 CASAVA_Build 18 30988405 1I ATCATTATCC -/T TTTTTTTTTT 3001 het 3001 ref 38 16 11 11 T 11 12 149095 CASAVA_Build 18 30991916 4I CCCTGTCTCT ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 A 11 15 149096 CASAVA_Build 18 30994229 3D CTAAAAATAC AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 37 10 15 14 AAT 7 6 149097 CASAVA_Build 18 31004301 2D GTGATTCCTC AA/-- AGAGCTAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 19 2 A 3 1 149098 CASAVA_Build 18 31004847 1D CCTAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 38 1 33 4 A 12 11 149099 CASAVA_Build 18 31011212 1D ACAATAGTGA G/- CGTTAGGGAT 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 G 1 0 149100 CASAVA_Build 18 31011781 4I GCTCATTATC ----/TTGA TTGTGTTGAT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 TTGA 0 1 149101 CASAVA_Build 18 31012131 1D CCTTCCTTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 9 8 149102 CASAVA_Build 18 31015440 3D CCCCGAGTAG AAA/--- CTATTATATA 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 A 3 0 149103 CASAVA_Build 18 31021753 1D ATTACCTTAT G/- TATAGCCTTG 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 G 1 0 149104 CASAVA_Build 18 31025966 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 11 10 149105 CASAVA_Build 18 31035949 1I CAGTGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 10 11 149106 CASAVA_Build 18 31037900 1I AAGGTAGAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 8 9 149107 CASAVA_Build 18 31049055 1D CAAAAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 38 4 21 13 A 14 13 149108 CASAVA_Build 18 31056939 1I AACAAATAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 11 14 4 A 9 10 149109 CASAVA_Build 18 31075323 12D ATAGAAGGGC TAGTTAGTTAGT/------------ TAGTTAGTGC 3070 hom 93 het 36 0 32 7 TAGT 5 2 149110 CASAVA_Build 18 31075726 1D AGCAAAAATC T/- TAATGCTCAG 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 T 2 1 149111 CASAVA_Build 18 31084486 4I TGTGCAATTT ----/AGGC AGTGTACTTA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 AGGC 0 1 149112 CASAVA_Build 18 31090738 4D GTTGTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 TTGT 3 2 149113 CASAVA_Build 18 31095618 1D TCTGGTTGTC T/- TATTGTTGTT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 2 1 149114 CASAVA_Build 18 31104218 4I TCTCTCTGTA ----/CTAT CTATCTTTGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CTAT 1 2 149115 CASAVA_Build 18 31112062 2D TTATTTATAT TA/-- TGTTATTTAA 3070 hom 108 het 39 0 35 4 TA 1 0 149116 CASAVA_Build 18 31116461 5D CCTAGAATTA TTTAT/----- TTTATGTTTA 3070 het 3070 ref 49 22 24 5 TTTAT 2 1 149117 CASAVA_Build 18 31119250 5I AGAATAGACA -----/AAACC AAACCACAAT 3070 hom 84 het 41 0 29 12 AAACC 1 2 149118 CASAVA_Build 18 31129949 3D GGTTGCTGAC AGA/--- AGAAGATGTG 3070 hom 131 het 50 0 43 8 AGA 3 2 149119 CASAVA_Build 18 31140527 4I CAAACATTTT ----/AGTC AGAGTTCTGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AGTC 0 1 149120 CASAVA_Build 18 31142400 2I AAAAAGAAAA --/AG AAAAACTCTG 3070 hom 65 het 31 0 23 8 AG 0 1 149121 CASAVA_Build 18 31147930 1D GGCCATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 13 12 149122 CASAVA_Build 18 31150965 4I TGGCAAAAAT ----/ATAA ATATTCTTAA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 ATAA 0 1 149123 CASAVA_Build 18 31151612 1I ATGATTCCTT -/A ACTGCATCTG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 1 2 149124 CASAVA_Build 18 31153470 1D AAGTGATGTG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 39 0 33 7 T 9 8 149125 CASAVA_Build 18 31154399 1I CAAAATACAA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 37 19 16 2 T 7 8 149126 CASAVA_Build 18 31163443 1I GTTGTCCTTG -/T TTTTTTGTTA 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 T 6 7 149127 CASAVA_Build 18 31165221 3D CTGCCACCCT CAC/--- CACATTTGTC 3070 het 3070 ref 45 23 16 9 CAC 2 1 149128 CASAVA_Build 18 31168623 1I ACTGCTTGGC -/A ACTGCCATAT 3070 hom 138 het 54 0 47 7 A 1 2 149129 CASAVA_Build 18 31171779 1I CTATTAAGGG -/A AAAAGAAACC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 4 5 149130 CASAVA_Build 18 31175134 1D TAGATGGCCT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 118 het 46 0 39 9 A 8 7 149131 CASAVA_Build 18 31178979 1I GAAAACTAGA -/T TAAGACAGGT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 1 2 149132 CASAVA_Build 18 31186782 4D TTGGAGCCCC CATA/---- CAGACTCCCA 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 CATA 1 0 149133 CASAVA_Build 18 31192173 1D CCGCATGCAG A/- ACTTGAGGGC 3070 hom 30 het 13 0 9 4 A 2 1 149134 CASAVA_Build 18 31194224 1D GGAAATTGCT G/- GGGCAGGTGG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 4 3 149135 CASAVA_Build 18 31194663 3D TGTAGAAGAA AAT/--- AAGGCATTTA 2834 het 2678 hom 16 7 7 2 AAT 1 0 149136 CASAVA_Build 18 31194737 1I GCTAAGGGAG -/A AGGAGGAATG 3070 het 901 hom 19 4 12 3 A 1 2 149137 CASAVA_Build 18 31197314 3D ATTCAACTAT CAC/--- CACTTTACAT 3070 hom 114 het 42 0 37 6 CAC 2 1 149138 CASAVA_Build 18 31201615 6I GATTCAGTAA ------/TTTTAT TTTTAAACAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTTAT 0 1 149139 CASAVA_Build 18 31209267 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAACAACA 64 het 64 ref 18 2 2 14 A 6 5 149140 CASAVA_Build 18 31216694 1D TTGTCTCAAA G/- AAAAAAAATC 772 het 772 ref 29 20 4 5 G 1 0 149141 CASAVA_Build 18 31222602 10I GTTGCTTTGT ----------/TGATGTACAG TGATGTACAG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 TGATGTACAG 1 2 149142 CASAVA_Build 18 31224100 14D AAGGATTTGA TAGTATCGTACATT/-------------- TAGTACCTAA 3070 het 3070 ref 39 24 13 6 TAGTATCGTACATT 1 0 149143 CASAVA_Build 18 31225629 1I TTTGCCTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 9 10 149144 CASAVA_Build 18 31230545 1I CAATCTATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 9 10 149145 CASAVA_Build 18 31239193 2I CAGTGGGGAA --/AC AGTCTTTTCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AC 0 1 149146 CASAVA_Build 18 31287281 1I TGCACCCTCC -/A AAAAAAAAAA 1856 het 79 hom 18 1 8 9 A 15 16 149147 CASAVA_Build 18 31302411 1D AACACACACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 29 1 15 13 A 14 13 149148 CASAVA_Build 18 31305796 2I AATTCCCACC --/TA TGAGTGACAA 3070 hom 29 het 11 0 10 1 TA 0 1 149149 CASAVA_Build 18 31313638 1D ATATGCACGT A/- AAAAAAAAAG 1346 het 1346 ref 41 33 3 5 A 10 9 149150 CASAVA_Build 18 31322464 1I GCCCCTTTTA -/G CCATGGCTGG 3070 hom 71 het 30 0 18 12 G 0 1 149151 CASAVA_Build 18 31324722 3I TTTTATTATT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 70 het 31 0 23 8 TTG 5 6 149152 CASAVA_Build 18 31326507 1D TTTAAAAATG A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 7 149153 CASAVA_Build 18 31335844 5I CCTTTTTTTC -----/TTTTT TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 9 14 149154 CASAVA_Build 18 31356604 1I GGTGACAATC -/T TGCCTGATGG 3070 hom 111 het 44 0 36 8 T 1 2 149155 CASAVA_Build 18 31357543 1I TTCACCTGCT -/C CCCCCCAGGC 3070 hom 33 het 13 0 10 3 C 6 7 149156 CASAVA_Build 18 31357648 16D AGGATTGGAG ACATGCCTGGCACACT/---------------- ACATGCCTGG 3070 hom 51 het 26 0 18 8 ACATGCCTGGCACACT 2 1 149157 CASAVA_Build 18 31363311 1D TTCTCAGATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 4 hom 27 1 19 9 A 10 9 149158 CASAVA_Build 18 31368995 2D35M2D CCCCATCTCT AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAAAG/--AAAAAAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAA-- AGAGAAAAGA 3070 hom 75 het 19 0 25 7 N/A 0 0 149159 CASAVA_Build 18 31369485 10I ATAGCCCTCC ----------/TCACTGGTAA TCACACATGG 3070 hom 108 het 42 0 35 7 TCACTGGTAA 0 1 149160 CASAVA_Build 18 31370279 1I GGTGTCATGG -/T GAGTAGGATG 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 0 1 149161 CASAVA_Build 18 31370762 1D AGCTAGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 38 0 36 2 T 15 14 149162 CASAVA_Build 18 31378523 1I GGAGTGTTTC -/T TCTTATTTTA 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 T 1 2 149163 CASAVA_Build 18 31382283 1D TTTCACAATT A/- AATGACTAAC 3070 hom 108 het 42 0 36 7 A 3 2 149164 CASAVA_Build 18 31384441 1D GTTTGAACTG A/- AAAAAAAAAA 1344 het 1344 ref 41 28 3 10 A 12 11 149165 CASAVA_Build 18 31387047 1I CTGTTTTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 26 1 21 4 A 11 12 149166 CASAVA_Build 18 31395966 2D GCTCCATCCT CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 335 hom 20 3 10 7 C 11 9 149167 CASAVA_Build 18 31447310 3I TGGCAGCGTG ---/GCA GCAGAGTAGA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 GCA 1 2 149168 CASAVA_Build 18 31461922 4D CCCACGGAGC CTCG/---- CTCATTGCTA 1603 het 1603 ref 17 11 5 2 CTCG 1 0 149169 CASAVA_Build 18 31494194 10I AGTCATATAA ----------/CTTTATACCG CTTTAGTCTA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 CTTTATACCG 0 1 149170 CASAVA_Build 18 31503194 2I CAGAGAGAGA --/CT CCATCTCGAA 3070 hom 83 het 32 0 24 8 CT 0 1 149171 CASAVA_Build 18 31546590 1D AGATTGCCAA G/- CATTTGCTTG 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 G 1 0 149172 CASAVA_Build 18 31550888 1D TAAAGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1105 hom 28 5 12 11 A 13 12 149173 CASAVA_Build 18 31552186 1I GTGGACTGTT -/A ACACTCATTG 3070 het 3070 ref 38 25 10 3 A 1 2 149174 CASAVA_Build 18 31560528 1I CCAAAAGTTG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 35 24 7 4 T 7 8 149175 CASAVA_Build 18 31601057 1D AAACGGCATT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 8 7 149176 CASAVA_Build 18 31601794 1D TTATAATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 12 11 149177 CASAVA_Build 18 31605965 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 30 0 24 6 T 9 10 149178 CASAVA_Build 18 31658578 1I TTAGTCACAT -/A AATAAGTAGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 3 149179 CASAVA_Build 18 31664583 1D TGACTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 19 0 18 1 A 13 12 149180 CASAVA_Build 18 31664858 4D AGAGAGAAAA AGAG/---- AAAGAGAGAG 1344 het 1192 hom 27 10 9 8 AG 2 0 149181 CASAVA_Build 18 31666583 1I AAAAGCTGTT -/G GGGGGGGGGT 3070 hom 56 het 37 0 22 15 G 9 10 149182 CASAVA_Build 18 31674331 1D TGTTAGGGAT A/- AAAAAAACTC 3070 het 159 hom 36 1 26 9 A 8 7 149183 CASAVA_Build 18 31681489 1I TATAAACTCA -/C ATAAAAGAAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 0 1 149184 CASAVA_Build 18 31688832 1I AAATTGCAAG -/T ACTTTTCCTT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 0 1 149185 CASAVA_Build 18 31795668 2I CATTCACATG --/AT ATATATATAT 3070 het 410 hom 35 1 31 3 AT 7 8 149186 CASAVA_Build 18 31799049 3D39M3I TTTAACGCTC CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTTGTTTTCTTCTTCC---/---CCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTTGTTTTCTTCTTCCCTT CTTCTTTTTT 3070 het 54 hom 37 1 24 22 N/A 0 0 149187 CASAVA_Build 18 31821901 1I TGCTATGTAC -/T TTTTTTTTTT 1223 het 1223 ref 23 13 3 7 T 13 14 149188 CASAVA_Build 18 31888168 1D AGTAAATCTA T/- TGGCTGGGCA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 2 1 149189 CASAVA_Build 18 31918485 1D AACAAATCTA C/- AGGCATCACA 3070 hom 69 het 27 0 23 5 C 1 0 149190 CASAVA_Build 18 31922734 1D TTATAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1796 het 1796 ref 30 21 4 5 T 12 11 149191 CASAVA_Build 18 31923624 1D GAAGAGGGGA G/- GGAGGGAACA 3070 hom 72 het 27 0 23 5 G 3 2 149192 CASAVA_Build 18 31928086 1D CGGCCCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 18 1 14 3 T 13 12 149193 CASAVA_Build 18 31931693 1D AAATTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 28 2 16 10 T 15 14 149194 CASAVA_Build 18 31932181 13I ATAAAGTTTT -------------/GTACAGGTATAAA GTTTGGATTT 3070 hom 48 het 14 0 17 1 GTACAGGTATAAA 0 1 149195 CASAVA_Build 18 31932610 2D TCATTCAGCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 39 3 15 21 T 18 16 149196 CASAVA_Build 18 31936655 1I CAACTTTTTA -/T TTTTTTTTCG 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 8 9 149197 CASAVA_Build 18 31937447 1D ATCTTATTTG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 8 7 149198 CASAVA_Build 18 31939955 6D TTGCCCACCT TACAAC/------ TACAAGTTAG 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 TACAAC 1 0 149199 CASAVA_Build 18 31942115 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGACAC 3070 het 1140 hom 43 12 18 13 G 0 1 149200 CASAVA_Build 18 31944498 1I AATCTTTTTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3010 hom 27 10 16 1 A 7 8 149201 CASAVA_Build 18 31947062 1I GCATATATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 0 1 149202 CASAVA_Build 18 31951992 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1314 het 1292 hom 12 5 3 4 A 15 14 149203 CASAVA_Build 18 31954207 1D AATGAGTAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 13 24 8 T 10 9 149204 CASAVA_Build 18 31955118 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 13 12 149205 CASAVA_Build 18 31955643 4I ACTGGGTGAC ----/TAAT TGGAAATTAA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 TAAT 0 1 149206 CASAVA_Build 18 31956612 2D AAGAAGCCTA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 GT 7 6 149207 CASAVA_Build 18 31958270 1D GAACCCAGAG A/- AGTCATAATT 3070 het 3070 hom 36 12 19 6 A 2 1 149208 CASAVA_Build 18 31961726 1I GTATACTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 332 hom 29 1 20 8 T 10 11 149209 CASAVA_Build 18 31967698 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 21 0 14 7 T 10 9 149210 CASAVA_Build 18 31970979 1D CAGACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 11 10 149211 CASAVA_Build 18 31972200 1I TCCTTTTTTT -/C CACAATGCTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 1 2 149212 CASAVA_Build 18 31986158 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 663 hom 32 3 25 5 A 13 12 149213 CASAVA_Build 18 31999238 1I GCATAAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1176 hom 40 4 25 11 A 13 14 149214 CASAVA_Build 18 32019450 1I AGGACCAACT -/C CACCCCTCTC 3070 hom 130 het 51 0 40 11 C 1 2 149215 CASAVA_Build 18 32028168 3I ATTCTAAAAT ---/TGG TGGTATTTAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TGG 1 2 149216 CASAVA_Build 18 32031412 1I TGAGGAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 39 0 28 11 T 11 12 149217 CASAVA_Build 18 32036268 4I ATTGTCAATC ----/AATT AATAACTGGC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AATT 0 1 149218 CASAVA_Build 18 32042273 1D TTTAGAATAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 T 9 8 149219 CASAVA_Build 18 32058619 1D TGTATGATCC T/- TTTAATGTAC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 4 3 149220 CASAVA_Build 18 32067882 1D TTCCTTGTAG A/- ATTCTGGATA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 2 1 149221 CASAVA_Build 18 32092116 3D GTGGAAAGAT AGG/--- AGGTGGGGAG 2820 het 2820 ref 27 12 10 5 AGG 2 1 149222 CASAVA_Build 18 32093515 1D TTTAATACCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1840 hom 33 9 11 13 A 14 13 149223 CASAVA_Build 18 32095339 1D TTCCAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 26 16 6 A 10 9 149224 CASAVA_Build 18 32099702 2D GTACGTATGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 AT 10 9 149225 CASAVA_Build 18 32102662 5I ATTTTTAGCA -----/TACAT TAAAGTTTCT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 TACAT 0 1 149226 CASAVA_Build 18 32104943 1D ATCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 10 9 149227 CASAVA_Build 18 32110887 3D TAAATGAAAA ATC/--- ATATGGAAGA 3070 het 3070 ref 38 23 11 5 ATC 1 0 149228 CASAVA_Build 18 32115414 1D CAATATTTCC T/- CATCAGAATT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 1 0 149229 CASAVA_Build 18 32120506 1I CTCCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 11 12 149230 CASAVA_Build 18 32123707 1D TATTTCAACC A/- AAAAAAAAAA 1273 het 1273 ref 35 23 4 8 A 13 12 149231 CASAVA_Build 18 32126054 1I CTCCTGCCTC -/A AAAAATGTGG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 5 6 149232 CASAVA_Build 18 32163784 1I AGAGAACTAA -/G GCAGGGTGCC 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 G 1 2 149233 CASAVA_Build 18 32177609 1D CCTCTCTACC G/- TGTGATCTCT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 G 1 0 149234 CASAVA_Build 18 32179170 1I ACAGAGTATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 9 10 149235 CASAVA_Build 18 32207408 1D TCTATACCCG A/- AAACATATTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 4 3 149236 CASAVA_Build 18 32216761 1I ACTGTCTCTA -/T TATTTTGACT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 1 2 149237 CASAVA_Build 18 32249138 1D GGCAAGACCC T/- GATGACTAGG 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 1 0 149238 CASAVA_Build 18 32257078 1D TCGATTCACA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 109 het 41 0 36 7 C 8 7 149239 CASAVA_Build 18 32282695 1I AACTCAGGAT -/G GGGAGCCTGC 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 G 3 4 149240 CASAVA_Build 18 32289538 1D ACCTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 13 12 149241 CASAVA_Build 18 32293120 1D TATGGCCACA C/- CCCCATCTAC 3070 hom 106 het 40 0 34 6 C 5 4 149242 CASAVA_Build 18 32303423 1I TGTTGCTCCC -/T CTGATCCCAT 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 T 0 1 149243 CASAVA_Build 18 32312469 4D CTCTTACTCA TTCT/---- TTCTATTTTT 2429 het 2429 ref 28 19 7 5 TTCT 2 1 149244 CASAVA_Build 18 32313559 2D TACTATAAAG TA/-- TATATATATA 3070 het 2487 hom 28 7 15 7 TA 8 7 149245 CASAVA_Build 18 32319119 1D GTTCCCCTTT C/- CCCACCCATA 3070 hom 101 het 40 0 33 7 C 4 3 149246 CASAVA_Build 18 32323201 4D GAGAGAATGG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 38 13 10 16 GTTT 4 3 149247 CASAVA_Build 18 32336202 1D44M2D TTACTTCTAG TTTTTTTTTTTTTTAACTATTATTATACTTTAAGTTCTGGGACACAT/-TTTTTTTTTTTTTAACTATTATTATACTTTAAGTTCTGGGACAC-- GTGCAAAATG 3070 het 3070 hom 30 13 16 9 N/A 0 0 149248 CASAVA_Build 18 32346652 9D AAACATCTGC CATAGGTAA/--------- AACAGGTTTT 3070 het 3070 ref 50 26 21 5 CATAGGTAA 1 0 149249 CASAVA_Build 18 32357104 1D TCCTTGAAAC A/- ACTGCTGGGG 2601 het 2601 ref 29 10 8 11 A 2 1 149250 CASAVA_Build 18 32360241 1I GAAATCATTC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 7 8 149251 CASAVA_Build 18 32360390 1I ATAATTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 10 11 149252 CASAVA_Build 18 32361746 24D TGGGTGGATT TATATTTGAGTGACATGGAATATC/------------------------ TATATTTGAG 3070 het 3070 ref 54 37 15 18 TATATTTGAGTGACATGGAATATC 1 0 149253 CASAVA_Build 18 32363407 1I TGCTGTCTGA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 19 12 7 0 T 6 7 149254 CASAVA_Build 18 32400829 1D GACCTACAGG A/- AAAAAAAAAT 1288 het 1288 ref 47 41 3 3 A 10 9 149255 CASAVA_Build 18 32406692 1I CTGAGCTCTT -/A GGGGGGAGGC 3070 het 3070 hom 44 16 16 12 A 0 1 149256 CASAVA_Build 18 32424369 1D GGAATGTACC T/- TTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 6 5 149257 CASAVA_Build 18 32425716 1D CTATCTCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 32 0 26 6 A 9 8 149258 CASAVA_Build 18 32458658 1D GAAAGGCAAA G/- GGTAAGAAAG 3070 hom 105 het 40 0 33 7 G 3 2 149259 CASAVA_Build 18 32470948 1D TGAGATCAGG A/- AAAAACAACT 3070 hom 123 het 46 0 42 6 A 6 5 149260 CASAVA_Build 18 32473776 2I GAATAAAGTG --/TT TTTTTTTTTT 2159 het 2159 ref 25 11 11 3 T 14 16 149261 CASAVA_Build 18 32480232 2I AAATAAAATT --/TA GAGTTCAATA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 TA 0 1 149262 CASAVA_Build 18 32483141 1I AGCTGGGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2637 hom 32 11 10 11 T 12 13 149263 CASAVA_Build 18 32512906 1D AATGGGTTGT G/- GGAGATTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 8 G 3 2 149264 CASAVA_Build 18 32515580 1D AAAAATTAAA G/- GCATGTGACT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 G 2 1 149265 CASAVA_Build 18 32522942 1I AGCCTGGACA -/C CAGGAGTGTG 2922 het 2922 ref 28 15 11 2 C 1 2 149266 CASAVA_Build 18 32524694 1I CCCGCCATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 10 11 149267 CASAVA_Build 18 32525551 9D ATTCCTTTTG TTGCCTCTC/--------- TTACCCCTCA 3070 het 3070 ref 35 18 17 3 TTGCCTCTC 1 0 149268 CASAVA_Build 18 32536835 3I TTATGTACTT ---/CTC CTTGATTGCT 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 CTC 0 1 149269 CASAVA_Build 18 32538966 1I CTCTCTCTAA -/G GGTTTGCTTC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 2 3 149270 CASAVA_Build 18 32546430 1D CAGTAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 A 12 11 149271 CASAVA_Build 18 32546805 1D ACTAAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1531 hom 37 6 16 15 A 15 14 149272 CASAVA_Build 18 32547993 2D GGGGAAAAAG TC/-- TGTAGGACTA 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 TC 1 0 149273 CASAVA_Build 18 32553382 1D TAATTTACAC T/- GATAAACTGC 3070 het 3070 ref 53 26 24 4 T 1 0 149274 CASAVA_Build 18 32572928 1D GAGAGCAGCA G/- GACTTGTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 G 2 1 149275 CASAVA_Build 18 32575734 1D CTCCATCTCT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 A 8 7 149276 CASAVA_Build 18 32577071 1I GGAGATCGAG -/A CCATCCTGGC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 0 1 149277 CASAVA_Build 18 32579011 2D CATGAGAGGA AG/-- AGAGAGAGTG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 AG 5 4 149278 CASAVA_Build 18 32622200 1D GAAATTTGAG T/- TTTTTCTGAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 5 149279 CASAVA_Build 18 32639912 1I TTTCATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 37 2 29 6 A 10 11 149280 CASAVA_Build 18 32747650 1I TTTTCCCTTT -/A AAAAATCTTT 3070 het 3070 hom 51 23 21 7 A 5 6 149281 CASAVA_Build 18 32749348 1I GAGAATGGGG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 7 8 149282 CASAVA_Build 18 32750169 2I GATTCCAATT --/TA TATATATATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TA 5 6 149283 CASAVA_Build 18 32765794 1I AGCTATTTCA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 7 8 149284 CASAVA_Build 18 32768485 1D TGTGTTCTCA T/- TGTTCAATTC 3070 hom 60 het 23 0 18 5 T 2 1 149285 CASAVA_Build 18 32773985 1I ATCCATTGTG -/A TCCAAAGACA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 149286 CASAVA_Build 18 32783804 1D TTATTACCCT C/- CCCCAATGGA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 C 5 4 149287 CASAVA_Build 18 32789732 1D AAGGAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 12 11 149288 CASAVA_Build 18 32804478 2I AGTCAAATTG --/TC TCTGTTTGCA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 TC 1 2 149289 CASAVA_Build 18 32821472 3I AATAAATAAA ---/AAT AATAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AAT 1 2 149290 CASAVA_Build 18 32822773 16D ATTTATACTG TTTATATAATTTACAA/---------------- CTTACTGTTA 3070 hom 99 het 34 0 34 7 TTTATATAATTTACAA 1 0 149291 CASAVA_Build 18 32839394 1D GCTATTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 8 A 14 13 149292 CASAVA_Build 18 32852749 1D CACTGAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 91 hom 39 1 33 6 T 10 9 149293 CASAVA_Build 18 32853093 1I TGTTGTTTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 92 het 35 0 31 4 T 7 8 149294 CASAVA_Build 18 32873381 1D TTGTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 14 8 T 12 11 149295 CASAVA_Build 18 32882559 1I TATAATAATG -/T GTGCTTTACG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 0 1 149296 CASAVA_Build 18 32884272 4D AATCTTAGTA TTAG/---- TTGGCTTTAT 3070 het 3070 hom 39 18 21 3 TTAG 1 0 149297 CASAVA_Build 18 32885194 1D AATTGAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 11 10 149298 CASAVA_Build 18 33014599 1I AACAAAACCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 10 11 149299 CASAVA_Build 18 33049321 1I TTAGTATGAA -/G GGCTGTTGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 2 3 149300 CASAVA_Build 18 33076651 2D CACATAACTT CC/-- CCCCCCAACC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 8 6 149301 CASAVA_Build 18 33087187 1D GCTTTGTTTC T/- TAGTAAAGTT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 2 1 149302 CASAVA_Build 18 33104153 1D AGACTATTTG A/- AAAAATAGTC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 6 5 149303 CASAVA_Build 18 33113319 1D GGTGAGCAAC T/- GGAGGCTGGC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 1 0 149304 CASAVA_Build 18 33114236 4I AAAACCCCTG ----/ACAT ACTTTGCATC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ACAT 0 1 149305 CASAVA_Build 18 33123315 2D CAGAATGCAA AG/-- AGCTTCGTTA 3070 het 3070 ref 26 14 9 6 AG 2 1 149306 CASAVA_Build 18 33125997 3D GCACCCTTAT AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 het 2922 hom 33 11 18 6 A 12 9 149307 CASAVA_Build 18 33126139 2I GAAATCGATT --/TA TATTGTTGAT 3070 het 2403 hom 33 6 20 7 TA 1 2 149308 CASAVA_Build 18 33127869 2D CACATCAAAC AT/-- ATGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 31 10 18 6 AT 2 1 149309 CASAVA_Build 18 33138410 1I ACAGCCAAAA -/G GGCCCATGGT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 G 2 3 149310 CASAVA_Build 18 33138534 6I TAAAGAAATG ------/AGCTTC AGCTTCAGCT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 AGCTTC 2 3 149311 CASAVA_Build 18 33141020 1D GTGAGACAGA G/- GGGGCCACCA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 G 5 4 149312 CASAVA_Build 18 33142732 1I GATTTTCCCC -/T GATAAGGGTC 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 T 0 1 149313 CASAVA_Build 18 33143398 1D AGGATTGAGG C/- CCCACTGGCT 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 C 4 3 149314 CASAVA_Build 18 33146226 4I TCAGATAGGT ----/GACA GACAGAACTT 3070 het 3070 ref 46 18 14 14 GACA 1 2 149315 CASAVA_Build 18 33159129 1D CAACGGGGGA G/- TGAGGCCATT 3070 het 3070 hom 44 19 16 10 G 1 0 149316 CASAVA_Build 18 33170637 1D CAGCAGGGAT G/- GGATGTGGCC 3070 hom 75 het 31 0 23 8 G 3 2 149317 CASAVA_Build 18 33189636 1D TCCATCCCCA C/- CCACCCCACC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 C 3 2 149318 CASAVA_Build 18 33192792 1D GGCTGGGCAT G/- GGTGGTTCAT 3070 hom 102 het 36 0 33 3 G 3 2 149319 CASAVA_Build 18 33201657 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1381 het 1381 ref 39 21 4 15 T 12 11 149320 CASAVA_Build 18 33231256 2I ATCTTGGCAG --/AC ACCTCATTTA 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 AC 1 2 149321 CASAVA_Build 18 33241564 4D GTGTATATAT ATAC/---- ACACATATAC 3070 het 3070 ref 44 22 18 6 ATAC 1 0 149322 CASAVA_Build 18 33241893 1D AATCTGCTCT G/- TACCACAGAA 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 G 1 0 149323 CASAVA_Build 18 33255517 2D TGTGTCATGC GT/-- GTGAGTCATG 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 GT 2 1 149324 CASAVA_Build 18 33298244 7I TGGAGAGGGG -------/TCTGGGC TCTGGGCTGA 3070 hom 101 het 39 0 33 6 TCTGGGC 1 2 149325 CASAVA_Build 18 33331613 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 30 1 19 10 A 15 16 149326 CASAVA_Build 18 33339947 1D TGCGGGCAAG T/- TGCCCCTCCC 3070 hom 55 het 20 0 16 4 T 2 1 149327 CASAVA_Build 18 33343121 1I GAATGTTATC -/A ACTTTATATC 3070 het 100 hom 27 1 24 2 A 1 2 149328 CASAVA_Build 18 33344698 1I CTTGGCTCCT -/A GGGCTTCCTT 3070 hom 105 het 39 0 34 5 A 0 1 149329 CASAVA_Build 18 33353101 1D GCTGGGAATG C/- CCCTCCAACC 3070 hom 79 het 31 0 27 5 C 4 3 149330 CASAVA_Build 18 33360842 1I ATTATGAAAA -/C CTCGATTTGC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 C 1 2 149331 CASAVA_Build 18 33374393 1I TCATGGCTCT -/G GGGGGCCAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 5 6 149332 CASAVA_Build 18 33399659 4I GCTCCTCTCT ----/CTCG CTCGCTCGCT 3070 hom 101 het 41 0 31 10 CTCG 3 4 149333 CASAVA_Build 18 33404805 1I AGAGGTGGCC -/T TTCAGGTTGA 3070 hom 117 het 50 0 35 15 T 2 3 149334 CASAVA_Build 18 33405277 1D CTCAGAGCTG T/- TTTTTCTTGC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 6 5 149335 CASAVA_Build 18 33405823 1D AAGAATTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 13 12 149336 CASAVA_Build 18 33430055 1I TCCTTGTCCC -/T TGACTGCCCA 3070 het 1980 hom 28 6 18 4 T 1 2 149337 CASAVA_Build 18 33435175 5D GGTAAAATAC ACATA/----- ACATAAAATT 3070 het 3070 hom 27 9 16 3 ACATA 2 1 149338 CASAVA_Build 18 33443292 2D CAGGATAAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 86 het 33 0 29 5 TA 6 5 149339 CASAVA_Build 18 33450194 2D TCTCTTTGAT TG/-- TTAGATGAAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TG 1 0 149340 CASAVA_Build 18 33465415 1I ATAAATAATG -/A AAAAATGGAC 3070 het 3070 ref 40 19 20 1 A 5 6 149341 CASAVA_Build 18 33465732 1I ATAATGTTCA -/T TTTAAAGGGG 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 3 4 149342 CASAVA_Build 18 33467219 3I AATCAACCTG ---/ACA ACAACAAGTC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 ACA 2 3 149343 CASAVA_Build 18 33467932 7I CCATCTGGGT -------/GACCTTG GACCTTGTGC 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 GACCTTG 1 2 149344 CASAVA_Build 18 33468993 1I GGAGATCCAG -/C CCTGGACTGG 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 C 2 3 149345 CASAVA_Build 18 33487547 1I CTCCTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 15 9 T 11 12 149346 CASAVA_Build 18 33488592 2D GTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2184 het 2184 ref 29 8 11 10 T 15 13 149347 CASAVA_Build 18 33498240 1D GAAACAAACC A/- AAAAAATATA 3070 hom 30 het 25 1 20 5 A 7 6 149348 CASAVA_Build 18 33511480 4D ATAAATTATT AATC/---- TTTTATTTAG 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 AATC 1 0 149349 CASAVA_Build 18 33516376 1I CACGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 C 2 3 149350 CASAVA_Build 18 33520396 1I TTTTCCTTCC -/T TTTATATAAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 3 4 149351 CASAVA_Build 18 33521902 1D TCCTTTCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 10 9 149352 CASAVA_Build 18 33526977 1I TACATAGGTA -/T ACATGTGCCA 2387 hom 12 het 6 0 5 1 T 0 1 149353 CASAVA_Build 18 33528258 1I CAGGTGTGAG -/C CCACCGTGCC 3070 het 2753 hom 34 7 19 8 C 2 3 149354 CASAVA_Build 18 33528942 1D GAACATAGCC A/- AACCATAGAA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 3 2 149355 CASAVA_Build 18 33531004 2D GTGTAGTTCC CT/-- CTCTCTATAA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 CT 4 3 149356 CASAVA_Build 18 33552256 1I TTTAATTACA -/T AAGGAATTCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 149357 CASAVA_Build 18 33577347 1D CTGTCTTATC T/- TACCTTTGTT 3070 hom 111 het 41 0 35 7 T 2 1 149358 CASAVA_Build 18 33583199 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 25 1 17 7 T 13 12 149359 CASAVA_Build 18 33593157 1D GCACAGTGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 18 18 8 A 10 9 149360 CASAVA_Build 18 33597641 8D CTCCCTTGAA ATGAATTG/-------- ATGAATTGCA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 ATGAATTG 2 1 149361 CASAVA_Build 18 33604541 1I TATGCTCCTC -/A AAATTCTTCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 3 4 149362 CASAVA_Build 18 33614242 1D TGCACATACA C/- CACCCCACAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 2 1 149363 CASAVA_Build 18 33614325 1I12M7I14M4I CACATGCACC -CACAGACGCACA-------CACAGAACTCACAC----/TCACAGACACACACGGAACTCACGGAACTCACACATAT ACACCACCCC 75 het 75 ref 61 55 1 23 N/A 0 0 149364 CASAVA_Build 18 33614383 3I53M1D16M1I CATGCACCCC ---GCAGACACATAGAACTCACACACACCACTCCGCAGAGTTCACACATGCACCCCACAGACACACAGAACTC-/CAGACACACACACACAACTCACACACACTGCCTCACAGAGCTCACACATGTACCCC-CAGACACACAGAACTCA ACACACATAC 1796 het 1796 ref 72 87 5 31 N/A 0 0 149365 CASAVA_Build 18 33618444 1I6M2D TACTCCTGGA -CCTTATTC/GCCTTAT-- GGGGGTTTCC 3070 hom 111 het 39 0 34 6 N/A 0 0 149366 CASAVA_Build 18 33618720 3D CACAATACAT TGC/--- TGCTATTTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TGC 2 1 149367 CASAVA_Build 18 33618922 1I AGTTTTCACA -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 G 0 1 149368 CASAVA_Build 18 33621288 1D GTAGACAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 57 hom 23 1 18 4 T 13 12 149369 CASAVA_Build 18 33621527 1D CTAGAGCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 370 hom 52 1 44 7 T 10 9 149370 CASAVA_Build 18 33621991 1D GATTAGCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 995 hom 36 4 25 7 T 13 12 149371 CASAVA_Build 18 33623246 2D CCACTATGTA AG/-- AGAAGAGATG 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 AG 2 1 149372 CASAVA_Build 18 33623779 1I AGGTCAGAAG -/T TTTGAGACCA 3070 hom 84 het 31 0 25 6 T 3 4 149373 CASAVA_Build 18 33626519 1D AATATAAGGA G/- AATGGGAAGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 0 149374 CASAVA_Build 18 33626932 2D TCTTGTCCTC TT/-- TGCACCCATA 3070 hom 120 het 47 0 36 11 T 3 1 149375 CASAVA_Build 18 33635056 1I GGTCCAGTTT -/C AGTTTTCTGC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 0 1 149376 CASAVA_Build 18 33644152 3I CCCTCATTCC ---/TTG TTACCCACTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TTG 0 1 149377 CASAVA_Build 18 33679400 1D ATATATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3032 het 2718 hom 31 11 12 8 T 15 14 149378 CASAVA_Build 18 33680324 1I TACAGAGTTT -/G TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 G 0 1 149379 CASAVA_Build 18 33703762 1D CCTGAGCTTG T/- TTTTTTTTTT 2935 het 2935 ref 26 13 9 4 T 16 15 149380 CASAVA_Build 18 33706920 1D CGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 10 9 149381 CASAVA_Build 18 33784579 1I AGTTTTACTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 8 9 149382 CASAVA_Build 18 33786780 1D ACCAAAATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 10 9 149383 CASAVA_Build 18 33791262 2I TCAGGATATG --/GC TTCTAGGCAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 GC 0 1 149384 CASAVA_Build 18 33832699 1I ATATTGATTG -/T TTTGAGCTGA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 3 4 149385 CASAVA_Build 18 33895582 1I GAGAGTATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 29 0 21 8 A 13 14 149386 CASAVA_Build 18 33936855 1D AGGTAATACT A/- AAAAAAAAAA 1266 het 1266 ref 37 23 3 12 A 13 12 149387 CASAVA_Build 18 34030386 1I TATAATTGTG -/A TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 0 1 149388 CASAVA_Build 18 34048444 2D AATACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 22 10 9 4 CA 8 7 149389 CASAVA_Build 18 34054865 1I ACCCCCTTAA -/C CCTTTCATGT 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 C 2 3 149390 CASAVA_Build 18 34060985 1D TTTTTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 13 12 149391 CASAVA_Build 18 34061616 1D TTTTTTTCTA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 1810 hom 20 6 9 5 T 8 7 149392 CASAVA_Build 18 34062499 1D AAGAGAGGGA G/- GGGGGAGGGA 2569 het 2569 ref 32 13 9 11 G 6 5 149393 CASAVA_Build 18 34062549 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 7 6 149394 CASAVA_Build 18 34064157 5D TATCAGTCTT AAGAA/----- AAGACAACAA 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 AAGAA 1 0 149395 CASAVA_Build 18 34067627 1D ACTTCCCACA G/- GGCCCAGTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 G 3 2 149396 CASAVA_Build 18 34076818 1D CTTTAGTCCC T/- GCTACTTGGG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 1 0 149397 CASAVA_Build 18 34078637 1D AAACAGCCTG T/- TTTTTTTTTT 884 het 884 ref 44 31 3 10 T 11 10 149398 CASAVA_Build 18 34081702 1D AACACCAAAC T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 T 8 7 149399 CASAVA_Build 18 34083294 1D CCTCTAGTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 9 8 149400 CASAVA_Build 18 34084123 2I ACAAAAAGAC --/TT TTTTTTTTTT 1693 het 1693 ref 25 9 13 3 T 13 15 149401 CASAVA_Build 18 34089657 1I CTTCCTACAA -/G AAGATTTTGT 3070 hom 79 het 33 0 27 6 G 0 1 149402 CASAVA_Build 18 34094336 3D TTTTATCATT CTC/--- CTATCAAAGC 3070 het 3070 hom 33 9 18 8 CTC 1 0 149403 CASAVA_Build 18 34095844 1I CTTTTCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1647 hom 16 4 8 4 T 10 11 149404 CASAVA_Build 18 34114089 1D TCAGAATTCT C/- CCACATTGAG 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 C 3 2 149405 CASAVA_Build 18 34126623 1D CTGTAGTGAG T/- TTTTTTTTTG 1171 het 1171 ref 42 36 3 3 T 10 9 149406 CASAVA_Build 18 34132811 2D AAACCTGTAC AT/-- ATATATATAT 1540 hom 15 het 8 0 6 2 AT 8 7 149407 CASAVA_Build 18 34138332 2I18M1I TTCCAGATAG --CTTTGTTTCATTATAAGC-/CCCTTTGTTTCATTATAAGCT TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 14 17 4 N/A 0 0 149408 CASAVA_Build 18 34162424 1D GTTTAATTAC A/- AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 50 35 5 11 A 15 14 149409 CASAVA_Build 18 34219634 5I GTAATAAATA -----/TAAAG TATTTTGGAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TAAAG 0 1 149410 CASAVA_Build 18 34224073 2D AAAAACATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 24 0 18 7 A 12 10 149411 CASAVA_Build 18 34225707 4I TGGAAAAAAA ----/AGAT AGAAGCAATC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AGAT 0 1 149412 CASAVA_Build 18 34225953 2D TCTAATACTG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 A 10 8 149413 CASAVA_Build 18 34229268 6I AAACGAGGAC ------/TGTAAT TGTCATGAGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TGTAAT 0 1 149414 CASAVA_Build 18 34231981 3I AGTCACAAAC ---/ATT ATTGATCTGA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 ATT 1 2 149415 CASAVA_Build 18 34236388 11I CTGAAAAAAA -----------/TGGCTTCCTTT TGCTAGAACC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 TGGCTTCCTTT 0 1 149416 CASAVA_Build 18 34238149 1I ATGCATTATT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 7 8 149417 CASAVA_Build 18 34238879 1D ATTGTAATTG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 8 149418 CASAVA_Build 18 34262848 1D GGGCAAGATT A/- AAAAAAAAAA 2475 het 2475 ref 37 18 7 12 A 16 15 149419 CASAVA_Build 18 34264210 1I TCTTGTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3067 hom 35 10 16 9 T 11 12 149420 CASAVA_Build 18 34271283 1D GGAACTGCTA C/- CCTTATAACC 3070 het 3070 hom 39 13 22 5 C 3 2 149421 CASAVA_Build 18 34277145 1I CTTTCCGGAG -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 60 24 27 9 T 6 7 149422 CASAVA_Build 18 34281644 5I AATTGTAACT -----/ATATA CAAGCACATC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 ATATA 0 1 149423 CASAVA_Build 18 34285601 1D TGTTTCTAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 T 9 8 149424 CASAVA_Build 18 34287385 2I TGTGTGTATC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 63 23 25 15 TG 7 8 149425 CASAVA_Build 18 34292160 1I AGGTCACTGC -/T TTTAATTCCT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 3 4 149426 CASAVA_Build 18 34292991 1D TTGGCCTTTA T/- TTTTTTATAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 6 149427 CASAVA_Build 18 34298143 3D TTCCATTCAG CAT/--- CATCACTTTC 3070 hom 139 het 55 0 46 11 CAT 2 1 149428 CASAVA_Build 18 34300535 1D GAAAGAGGAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 57 24 30 4 A 8 7 149429 CASAVA_Build 18 34301331 1D AGTTTTAAGT A/- AAAAAAAAAT 949 het 949 ref 34 22 3 9 A 10 9 149430 CASAVA_Build 18 34304338 1I TATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 11 12 149431 CASAVA_Build 18 34308163 2I ATGTGACGTA --/TC TCTGTTCCTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TC 1 2 149432 CASAVA_Build 18 34312712 1D TTTTTTTTTT C/- CCATTTTAGT 3070 het 3070 hom 47 23 24 0 C 3 2 149433 CASAVA_Build 18 34314081 3I AAATGGAAGA ---/TGT TGTTCCCTAT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 TGT 1 2 149434 CASAVA_Build 18 34324226 1I CTTGGAGAAA -/T TGTAGTTACA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 2 149435 CASAVA_Build 18 34333524 6I CTTGTTGTGA ------/ATAGAC ATAGAGTTTC 3070 het 3070 hom 38 12 20 7 ATAGAC 0 1 149436 CASAVA_Build 18 34346767 2D AACAACACAC AT/-- GTGTTTATAC 3070 het 3070 ref 45 25 15 6 AT 1 0 149437 CASAVA_Build 18 34351164 4D ACAAAGAGTT AAAA/---- AAAGTCAAGA 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 A 7 3 149438 CASAVA_Build 18 34351329 2D ATATACATAT AC/-- ACACACACAC 1611 het 1611 ref 26 15 5 6 AC 6 5 149439 CASAVA_Build 18 34351629 2D ATCTGTTTAC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 179 hom 35 4 15 17 A 10 8 149440 CASAVA_Build 18 34356057 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 12 11 149441 CASAVA_Build 18 34357279 1D TGTCTGTGTC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 40 17 22 3 T 7 6 149442 CASAVA_Build 18 34358091 5D GGAAGAAAAC ATAAT/----- ATATGGTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 13 5 ATAAT 1 0 149443 CASAVA_Build 18 34358513 5I ACCCATAGAG -----/GAAGA GAAGTTTGAA 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 GAAGA 0 1 149444 CASAVA_Build 18 34361126 1I AGTGAAAATG -/A AAAAAAAACA 3070 het 339 hom 37 1 32 4 A 8 9 149445 CASAVA_Build 18 34361316 1I AAAGAAACTG -/A AAAGGGTGAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 3 4 149446 CASAVA_Build 18 34362298 1D AGAAAACCGT A/- AAAAATATAT 3070 hom 89 het 35 0 30 5 A 6 5 149447 CASAVA_Build 18 34379050 2I TCATCATGTC --/AG AGATTATTTA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 AG 1 2 149448 CASAVA_Build 18 34381690 1I TTTGTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 47 1 41 5 T 10 11 149449 CASAVA_Build 18 34383868 2D AATAAGCAAC AA/-- AGATATGTCA 3070 hom 93 het 39 0 32 9 A 3 1 149450 CASAVA_Build 18 34384418 3D CTTTTTCATT TTC/--- TTTTTCTTTA 3070 hom 114 het 40 0 39 3 TTC 1 0 149451 CASAVA_Build 18 34396154 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 10 149452 CASAVA_Build 18 34400080 1I26M1I TATGGTAAGA -GGAAGAGTACACTGCACTGAACACCC-/GGGAAGAGTACACTGCACTGAACACCCA AAGGGTGCAA 3070 hom 81 het 29 0 28 7 N/A 0 0 149453 CASAVA_Build 18 34406715 1I GGGATCAGGA -/G GGGGGAGGGC 3070 hom 114 het 44 0 36 8 G 5 6 149454 CASAVA_Build 18 34407463 3I CAAGGGAGGC ---/AGG AGGAGAAGTG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AGG 1 2 149455 CASAVA_Build 18 34408269 2I GTCAAAATAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 11 13 149456 CASAVA_Build 18 34472875 1D AATTTTTTTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 8 149457 CASAVA_Build 18 34478822 2D AGTGATCCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 128 hom 30 3 14 13 T 13 11 149458 CASAVA_Build 18 34485677 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 23 0 14 9 A 14 15 149459 CASAVA_Build 18 34511455 1I ATAATTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 44 0 31 13 T 10 11 149460 CASAVA_Build 18 34526960 1I ATACTATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 25 0 18 7 A 10 11 149461 CASAVA_Build 18 34546659 1D ACGAATCTGC A/- AAGGTATAGA 3070 hom 141 het 49 0 47 2 A 3 2 149462 CASAVA_Build 18 34552689 1I GCTGGCCCAC -/A AGCGCATGTG 3070 hom 38 het 15 0 11 4 A 1 2 149463 CASAVA_Build 18 34559177 1I AGTTGGATTT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 9 149464 CASAVA_Build 18 34563090 2D AATATTTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 A 14 12 149465 CASAVA_Build 18 34585141 1I TTAACATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 A 10 11 149466 CASAVA_Build 18 34589191 1D CCACTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 13 10 A 11 10 149467 CASAVA_Build 18 34596355 3D CTCAAGTAGG ACA/--- ACAACAGGCA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 ACA 3 2 149468 CASAVA_Build 18 34596947 3I CCAGTGAATT ---/TCA TATCAGGGAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TCA 0 1 149469 CASAVA_Build 18 34605286 4D TTTCTCTCGC TCTT/---- TCTTTCACAA 2826 het 2826 ref 23 13 9 5 TCTT 2 1 149470 CASAVA_Build 18 34612354 2I ATCTATAAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 10 12 149471 CASAVA_Build 18 34615016 2I TGTCTCTCTC --/TG TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 TG 0 1 149472 CASAVA_Build 18 34618981 5I AATTGGGTAA -----/TAGAG TATTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 TAGAG 0 1 149473 CASAVA_Build 18 34620634 1D TCTCAGAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 30 0 27 4 A 9 8 149474 CASAVA_Build 18 34629635 1I TTCTCAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 38 1 28 9 T 11 12 149475 CASAVA_Build 18 34634782 1D CCCAATAGAA T/- TAATAATCAG 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 2 1 149476 CASAVA_Build 18 34641870 5D TACAATAGAG TTAAC/----- TTAATTTTAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 7 TTAAC 1 0 149477 CASAVA_Build 18 34645787 1D GAATACTAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 9 8 149478 CASAVA_Build 18 34659770 2I GCTGCAAAAG --/AC ACAATTTTAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AC 1 2 149479 CASAVA_Build 18 34661586 1I CTATCTACTT -/G TTGAAAATGC 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 G 0 1 149480 CASAVA_Build 18 34673976 1I GTTAACAGGG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 45 21 23 1 A 7 8 149481 CASAVA_Build 18 34676685 1D AGTCACAAGG T/- TTTCTTCAGA 3070 het 3070 ref 53 23 24 6 T 4 3 149482 CASAVA_Build 18 34677194 1D GTAAATATTA G/- TTAAACACAA 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 G 1 0 149483 CASAVA_Build 18 34679520 8I TGTGTGTGTG --------/TGTGTGTC TGTGTGTGTG 3070 het 60 hom 31 3 19 9 TGTGTGTC 0 1 149484 CASAVA_Build 18 34685962 1I ACTCTGAGAA -/G GCACATGCTC 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 G 1 2 149485 CASAVA_Build 18 34693381 1D TAGAATTCTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 8 7 149486 CASAVA_Build 18 34695664 1D GCTTTAAGCA T/- TTAAGTGAAT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 T 3 2 149487 CASAVA_Build 18 34698254 1D AGCCTAGTGT G/- GGGGGAGATC 3070 hom 63 het 27 0 22 7 G 6 5 149488 CASAVA_Build 18 34716913 4D CCACACACAT ACAC/---- ACACATGGTA 3070 hom 90 het 34 0 31 7 AC 4 2 149489 CASAVA_Build 18 34739021 2I TATTTTTTTA --/AT TTTTTTTGTA 719 het 83 hom 30 2 6 22 AT 0 1 149490 CASAVA_Build 18 34749288 1D AATTTACACT C/- CCCACCCACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 4 3 149491 CASAVA_Build 18 34751652 1D TGCATTTGCT G/- GGGGAGTGTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 G 5 4 149492 CASAVA_Build 18 34756804 14I CTGATCCATG --------------/CTTTATGATGAGAT CTCTTTCTGT 3070 hom 68 het 29 0 24 6 CTTTATGATGAGAT 0 1 149493 CASAVA_Build 18 34769103 1I TTTTTTTTTT -/C CTCTACCACA 3070 het 1317 hom 45 4 36 5 C 1 2 149494 CASAVA_Build 18 34775600 1D GAATCTTCTA G/- GGGAGATTGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 4 3 149495 CASAVA_Build 18 34778103 4D CACAGAGCAC TGAT/---- TGGTGCATTT 3070 het 3070 hom 30 12 18 1 TGAT 1 0 149496 CASAVA_Build 18 34784447 1I TCTCTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 0 1 149497 CASAVA_Build 18 34786674 1I AAATCAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1212 hom 36 5 26 5 T 13 14 149498 CASAVA_Build 18 34791039 1I GATGAGGAGA -/G TGGAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 149499 CASAVA_Build 18 34794216 1I ATTCGCCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 11 12 149500 CASAVA_Build 18 34795454 1D GAGAGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 12 11 149501 CASAVA_Build 18 34796140 2D TCTCTTTCTA TC/-- TGTCAGCCTC 3070 het 3070 ref 31 14 16 3 TC 1 0 149502 CASAVA_Build 18 34797944 1I TCAAAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 335 hom 28 3 13 12 T 11 12 149503 CASAVA_Build 18 34810334 4I TTAAATACTC ----/AGTT GGTGTCATCT 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 AGTT 0 1 149504 CASAVA_Build 18 34811854 1I TTTTACACAA -/T TTTGTTTGTC 3009 het 3009 ref 30 17 8 5 T 3 4 149505 CASAVA_Build 18 34813189 1D AAAAAGTGAT G/- GGGGGGGGCA 3070 het 2353 hom 27 7 11 9 G 9 8 149506 CASAVA_Build 18 34813687 1D CAGGGTTTCA C/- CGTGTTAGCC 3070 het 185 hom 10 1 8 1 C 2 1 149507 CASAVA_Build 18 34814640 1D CTTGGTTACT G/- GGCCACAGCT 3070 het 3070 hom 43 21 22 0 G 3 2 149508 CASAVA_Build 18 34817202 2D GTCCATCAAT AA/-- GTTTATTTGC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 A 2 0 149509 CASAVA_Build 18 34818752 6D CTGTGGGACT TTGAAC/------ TTGAGAGAGA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 TTGAAC 1 0 149510 CASAVA_Build 18 34820061 1I ACCAGGGGCA -/G AATGATATGT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 G 0 1 149511 CASAVA_Build 18 34820966 1I TAGTTCTATG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 35 0 27 8 A 8 9 149512 CASAVA_Build 18 34822899 1D AGACCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 32 0 20 12 T 13 12 149513 CASAVA_Build 18 34827908 1D CATGACTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 36 2 26 8 T 13 12 149514 CASAVA_Build 18 34829357 1D AACTTCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 664 hom 37 2 28 7 A 11 10 149515 CASAVA_Build 18 34837485 1I ACTATTATAC -/T TCAAAAAGCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 1 2 149516 CASAVA_Build 18 34839060 1D AATTAACAAA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 8 7 149517 CASAVA_Build 18 34839459 6D TGCTATCTTC TTTTTT/------ TTAACATCCT 3070 hom 75 het 29 0 26 6 T 8 2 149518 CASAVA_Build 18 34841467 2D TAATCAAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 318 hom 32 7 11 14 T 12 10 149519 CASAVA_Build 18 34870356 1D TTGCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2892 hom 41 13 17 11 T 17 16 149520 CASAVA_Build 18 34872971 1I TTAAAATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 13 15 11 A 14 15 149521 CASAVA_Build 18 34873604 1D CTTTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 12 4 A 15 14 149522 CASAVA_Build 18 34903736 1I ACATTTTATT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 149523 CASAVA_Build 18 34908830 1D AGACCAAAGC T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 6 5 149524 CASAVA_Build 18 34915969 2D TGCATTTATC AA/-- ACCCATAGAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 3 1 149525 CASAVA_Build 18 34941407 1D GAAATGAGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 10 9 149526 CASAVA_Build 18 34948136 2D AGTTTTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 41 1 21 21 T 16 14 149527 CASAVA_Build 18 34968825 2D CAGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1394 het 1394 ref 30 23 3 4 GT 6 5 149528 CASAVA_Build 18 34970390 1I ACCTTTTTGT -/A AAGATGAGGT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 2 3 149529 CASAVA_Build 18 34973279 1D GTAAATTACC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 7 149530 CASAVA_Build 18 34976317 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 1784 het 248 hom 10 2 8 0 AT 5 6 149531 CASAVA_Build 18 34977625 1D TAGCAGTCAT A/- ACCTTTTAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 2 1 149532 CASAVA_Build 18 34980672 4D TAGCCACTCA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GT 10 8 149533 CASAVA_Build 18 34981349 2D TCAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 12 10 149534 CASAVA_Build 18 34981776 2I CAGTGCACCC --/TG TGTGTATGGG 3070 hom 108 het 42 0 34 8 TG 2 3 149535 CASAVA_Build 18 34989904 1D CTCCTGACCT C/- CATGATCCGC 3070 hom 44 het 16 0 14 2 C 2 1 149536 CASAVA_Build 18 34996204 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1958 hom 20 9 8 3 A 14 13 149537 CASAVA_Build 18 35000694 1I AAAAGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 44 1 29 14 T 11 12 149538 CASAVA_Build 18 35002308 3I TATCTATATT ---/ATC ATCTATTTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 ATC 1 2 149539 CASAVA_Build 18 35011567 1D GTTTTAGAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 10 9 149540 CASAVA_Build 18 35017841 1I GCAATTTATT -/A TTTTTTTGAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 0 1 149541 CASAVA_Build 18 35023414 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 TA 7 8 149542 CASAVA_Build 18 35024492 1I TGAAATGACA -/G GGGAATCGAT 3070 het 3070 hom 57 26 25 6 G 3 4 149543 CASAVA_Build 18 35046453 1I CTGTTTCAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 A 8 9 149544 CASAVA_Build 18 35064920 1I AGAATGTAAG -/A AAAGCTGAGG 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 3 4 149545 CASAVA_Build 18 35116864 1D TTCCAGACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 10 9 149546 CASAVA_Build 18 35117655 1D CTGCTGCACT A/- TTTTGGCTTG 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 1 0 149547 CASAVA_Build 18 35124229 4I TTTAACATAT ----/ATAG AAAAACCTTT 3070 het 3070 ref 49 31 14 4 ATAG 0 1 149548 CASAVA_Build 18 35141357 3D CATGTAGGAT GTG/--- GTGACATGAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 GTG 2 1 149549 CASAVA_Build 18 35153795 1D TTGATTTTTG C/- ATATTAGCAA 3070 het 3070 ref 57 28 24 7 C 1 0 149550 CASAVA_Build 18 35164116 2D TTTATTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 35 1 10 24 T 13 11 149551 CASAVA_Build 18 35186535 1I ATGAAGCCAA -/T TGGCAATTTT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 1 2 149552 CASAVA_Build 18 35190533 1D AGAATGATCT C/- CCCCCATGTC 3070 het 3070 hom 51 23 22 6 C 6 5 149553 CASAVA_Build 18 35191469 1I ACTTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 0 1 149554 CASAVA_Build 18 35205503 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2875 hom 27 7 15 5 A 9 10 149555 CASAVA_Build 18 35206710 1I AAGTCTGAAG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 7 8 149556 CASAVA_Build 18 35211486 1I ATTTTCAGCC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 9 149557 CASAVA_Build 18 35211614 4D TTCAGTCTTT TCTC/---- TCTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 TC 3 1 149558 CASAVA_Build 18 35211813 2I TTTCATTTTT --/TC TCTCATCATT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TC 2 3 149559 CASAVA_Build 18 35224013 1D CATTTCTATA G/- GCTCCAGGCC 3070 hom 62 het 23 0 19 4 G 2 1 149560 CASAVA_Build 18 35261585 2D ATACCAGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 9 11 A 16 14 149561 CASAVA_Build 18 35284488 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 8 7 149562 CASAVA_Build 18 35287368 1D AAACCTTTAG T/- TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 7 6 149563 CASAVA_Build 18 35290768 1I TCTATAAGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 9 10 149564 CASAVA_Build 18 35294706 1D ATACCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 2608 het 2608 ref 33 15 7 11 A 16 15 149565 CASAVA_Build 18 35297502 1I TCACTGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 A 14 15 149566 CASAVA_Build 18 35321013 58D TTTCCTTGTC AATGAACAAAGGGAAAACTATTTTTTGAAGGAGTGCCTTTTTAAATAATATAAGAAAA/---------------------------------------------------------- GGTTTTTAAT 1659 het 1659 ref 22 21 5 3 AATGAACAAAGGGAAAACTATTTTTTGAAGGAGTGCCTTTTTAAATAATATAAGAAAA 1 0 149567 CASAVA_Build 18 35325677 1D GAGAACAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 A 11 10 149568 CASAVA_Build 18 35326644 1I CAAAAGCAAA -/C CCCCCCCAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 C 7 8 149569 CASAVA_Build 18 35343354 4D ATGAACTACC TAAT/---- TAAGTTCCTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 TAAT 1 0 149570 CASAVA_Build 18 35344284 1D ATTCTTCCAG A/- ACCCGGTTAT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 2 1 149571 CASAVA_Build 18 35350672 2I GTGGTGAAAC --/TG TACTTTTCCT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 TG 0 1 149572 CASAVA_Build 18 35355423 1D CACATAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 35 0 18 17 A 12 11 149573 CASAVA_Build 18 35355591 1D TGCCAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 T 16 15 149574 CASAVA_Build 18 35379034 2D TGTTATTATT TC/-- TGTCTTAGAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 6 TC 1 0 149575 CASAVA_Build 18 35388241 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 2516 het 2516 ref 29 12 9 8 A 9 10 149576 CASAVA_Build 18 35394675 6D AGCACCATTC CATTTA/------ CATTTACAAC 3070 het 3070 ref 53 24 22 10 CATTTA 2 1 149577 CASAVA_Build 18 35397865 2I GTCCAACAAT --/AA AAGTGTTAAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 2 4 149578 CASAVA_Build 18 35405901 1I AAGTAATATG -/A AAACTGTCTG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 3 4 149579 CASAVA_Build 18 35411246 1D TCTTAAAACC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 A 1 0 149580 CASAVA_Build 18 35417200 1I TTTTTATTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 8 9 149581 CASAVA_Build 18 35419011 1D CCAGAGACTG A/- TTGTGTCACC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 A 1 0 149582 CASAVA_Build 18 35434027 1D GCAGTGGGAA T/- TTTTTTTTTT 1029 het 1029 ref 35 24 4 8 T 15 14 149583 CASAVA_Build 18 35434481 11D ATGTCTGCTC CACAATATCTA/----------- CAGCCTTCCA 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 CACAATATCTA 1 0 149584 CASAVA_Build 18 35468092 1I CAATTTTATT -/G TTTCCCCTGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 0 1 149585 CASAVA_Build 18 35468898 1D TTAGCTGGAG A/- AAAATAACTT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 A 5 4 149586 CASAVA_Build 18 35472075 1D ATTTTATGTG A/- ATAAAATATG 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 A 2 1 149587 CASAVA_Build 18 35474297 1I ACTAATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2319 hom 34 11 15 8 T 12 13 149588 CASAVA_Build 18 35477746 1D TATTTTGAAA T/- TTATTCATCT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 3 2 149589 CASAVA_Build 18 35479914 1D GGTAATTTTG T/- TTTGTGATAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 4 3 149590 CASAVA_Build 18 35480916 1I GCACCTGCCG -/C CCCCCCCAAC 967 het 967 ref 20 15 5 0 C 7 8 149591 CASAVA_Build 18 35482684 4D TTCCTTCCTT CCTC/---- CCTCCCTCCC 3070 hom 83 het 35 0 27 10 CCTC 4 3 149592 CASAVA_Build 18 35482749 4D TCCTTCCTTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 1686 het 1686 ref 26 15 9 2 CTTT 3 2 149593 CASAVA_Build 18 35486014 1I CAGGGCACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 9 10 149594 CASAVA_Build 18 35486179 1I GATTTATAAC -/A ATATTGAAGT 3070 hom 117 het 40 0 40 0 A 1 2 149595 CASAVA_Build 18 35487447 1D CTTTCCCATA T/- TACAATATGG 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 2 1 149596 CASAVA_Build 18 35489270 2I CACAAAAGAC --/AT ATTTTGCAAC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AT 1 2 149597 CASAVA_Build 18 35497062 1I CCCTCTACAG -/A CACCTCTCTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 0 1 149598 CASAVA_Build 18 35502602 1I TTTAATAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 10 11 149599 CASAVA_Build 18 35505077 2I CTACAGTGTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 AT 6 7 149600 CASAVA_Build 18 35519265 1D GGCAGGGGAC T/- TTAAGGCCAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 3 2 149601 CASAVA_Build 18 35520053 4D AGAAATTAAG CTTT/---- CTTATTAATA 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 CTTT 1 0 149602 CASAVA_Build 18 35532242 1D ACTAAAAAAA C/- AAGCTTAAAT 3070 hom 54 het 25 0 19 7 C 1 0 149603 CASAVA_Build 18 35532440 1I ACTCCAACCG -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 7 8 149604 CASAVA_Build 18 35534839 2I AGGTAGAGGA --/TG TGTGAAGAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 TG 2 3 149605 CASAVA_Build 18 35542695 1I TTCCTCCATG -/T TTTTTTCATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 6 7 149606 CASAVA_Build 18 35562598 2I GTAGAAAAAC --/TG TGGTGTTAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TG 1 2 149607 CASAVA_Build 18 35564544 1I TCTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1996 hom 18 5 9 4 A 11 12 149608 CASAVA_Build 18 35592409 1I CACATGTACT -/C CCAGAAGGTA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 C 2 3 149609 CASAVA_Build 18 35614347 1D CCAGCGTTCC A/- AACTAAGAAA 3070 hom 144 het 55 0 48 7 A 3 2 149610 CASAVA_Build 18 35618368 1D CCCATCCCTA C/- CCCCAATCTA 3070 hom 116 het 45 0 37 8 C 5 4 149611 CASAVA_Build 18 35621435 4I TTATTTGTTG ----/AATT AATTAATTAA 3070 hom 84 het 40 0 28 12 AATT 3 4 149612 CASAVA_Build 18 35634850 1I GGGTAGAAGG -/A AAAAAATATA 3070 hom 108 het 47 0 37 10 A 6 7 149613 CASAVA_Build 18 35635891 2D TATGTGTCAC AT/-- GTGTCCTTTG 3070 hom 220 het 80 0 73 8 AT 1 0 149614 CASAVA_Build 18 35636219 4I TATATGACAT ----/GTAA GTGTCATGTG 3070 hom 196 het 70 0 66 4 GTAA 0 1 149615 CASAVA_Build 18 35636337 2I TCTTTTGTGA --/TG TGTTTCATGT 3070 hom 239 het 88 0 78 10 TG 1 2 149616 CASAVA_Build 18 35640408 1I TCTTCCCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 A 13 14 149617 CASAVA_Build 18 35654382 1I TCTCTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1143 het 1143 ref 30 14 4 12 T 13 14 149618 CASAVA_Build 18 35660947 16D TCGTATAGAT GATGGATGGATAAATG/---------------- GATGGATGGA 3070 het 3070 hom 46 16 20 17 GATGGATGGATAAATG 2 1 149619 CASAVA_Build 18 35665373 2I TCGTGAACTT --/CA GTTTCCTCTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 CA 0 1 149620 CASAVA_Build 18 35672576 1I AAGAATCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 10 11 149621 CASAVA_Build 18 35678198 4D ATGCAAAGAT AGAG/---- AGAGTTTCTG 3070 het 3070 ref 46 24 16 9 AG 4 2 149622 CASAVA_Build 18 35683279 1I CACAAGTGAT -/C CTCTCACTCC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 1 2 149623 CASAVA_Build 18 35691489 4I CCACTCTTCT ----/CAGA CAGTGTTAGC 3070 hom 93 het 35 0 28 7 CAGA 0 1 149624 CASAVA_Build 18 35704613 2I TACTTAAATC --/AG AGAGAGCATT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AG 3 4 149625 CASAVA_Build 18 35712071 1D AATCCAGATT A/- AAAAAAAAAG 995 het 995 ref 33 27 3 4 A 10 9 149626 CASAVA_Build 18 35714303 1I CTTCTACGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 23 hom 35 1 28 6 A 9 10 149627 CASAVA_Build 18 35735014 1D GCAGAGAGTA T/- TTAAACATAT 3070 hom 127 het 53 0 43 10 T 3 2 149628 CASAVA_Build 18 35749227 2I TGCTCTATCC --/CT GTCTTGAATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CT 0 1 149629 CASAVA_Build 18 35764386 1D AAAGTATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 2 A 11 10 149630 CASAVA_Build 18 35767616 2D GATATTCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 31 2 16 14 A 16 14 149631 CASAVA_Build 18 35777530 1D AGCCGCGTGC T/- TTTTTTTTTT 2818 het 603 hom 23 4 10 9 T 15 14 149632 CASAVA_Build 18 35795916 1I CCTTGTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 37 1 27 9 A 10 11 149633 CASAVA_Build 18 35807938 1D TTTTCATAAT G/- TATCTGTGCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 1 0 149634 CASAVA_Build 18 35813615 3I AACAAAGCAT ---/ATC ATCAATTGGC 3070 hom 131 het 50 0 44 6 ATC 1 2 149635 CASAVA_Build 18 35825763 1D CCTAAGTAGG T/- TTATAACAAG 3070 hom 111 het 46 0 36 10 T 3 2 149636 CASAVA_Build 18 35834052 1I ATTGTAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 27 1 19 7 T 10 11 149637 CASAVA_Build 18 35845905 1I CCACCCCCCC -/G CCCTTGGCCT 2615 het 66 hom 13 2 9 2 G 0 1 149638 CASAVA_Build 18 35850215 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 12 0 8 4 TA 8 7 149639 CASAVA_Build 18 35851285 1D ACATGGAGGC G/- TGCTAATGGC 3070 hom 117 het 43 0 38 6 G 1 0 149640 CASAVA_Build 18 35860877 7I GAACAGGAAA -------/TTCTTTT TTCTTTTTTC 3070 hom 6 het 22 1 14 8 TTCTTTT 2 3 149641 CASAVA_Build 18 35875920 5I AAGGTAGGTA -----/GATTT GATATGAAAG 3070 hom 135 het 47 0 44 3 GATTT 0 1 149642 CASAVA_Build 18 35883635 2D CACCCCACAC CA/-- CACACACACA 2789 het 2751 hom 28 9 12 7 CA 8 7 149643 CASAVA_Build 18 35893135 1D TATCTGAGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 A 9 8 149644 CASAVA_Build 18 35910877 1D AACCTGTGAA G/- GGGGGGGATG 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 G 8 7 149645 CASAVA_Build 18 35922746 1I GAAAAAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1197 hom 31 3 20 8 T 14 15 149646 CASAVA_Build 18 35937359 3I TGCTTCCCAC ---/CCT CCGTCTCCCT 2395 het 2395 ref 20 11 6 3 CCT 0 1 149647 CASAVA_Build 18 35940261 1I TCTCAAGGTG -/C CCAAGGGCTA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 2 3 149648 CASAVA_Build 18 35944100 1I GGTTGTTAAA -/T GCATAGTGAG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 0 1 149649 CASAVA_Build 18 35944160 1D ATTTAAAAAA G/- AAACGTTTCT 2102 het 2102 ref 25 15 6 4 G 1 0 149650 CASAVA_Build 18 35944774 2D CTGTCTTATC TA/-- TATATATATA 2940 het 2940 ref 20 9 7 5 TA 7 6 149651 CASAVA_Build 18 35945397 2I TTGTGTGTTT --/TG TTTTTGTCTT 3070 het 3070 hom 57 26 28 3 TG 0 1 149652 CASAVA_Build 18 35956105 1I TTTCCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 10 11 149653 CASAVA_Build 18 35963181 1I CTGAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 A 12 13 149654 CASAVA_Build 18 35963282 1I TAAAAGGGCA -/G GGGAAGAATA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 G 3 4 149655 CASAVA_Build 18 35966836 1I TATATACTTT -/A ATGCAATAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 1 2 149656 CASAVA_Build 18 36018224 1D ATTTTTACGA T/- TTTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 52 23 27 4 T 6 5 149657 CASAVA_Build 18 36063942 1I CCTCCCCCCA -/C CCCACAACAG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 C 3 4 149658 CASAVA_Build 18 36077008 1D TTTATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 549 hom 34 2 22 11 T 11 10 149659 CASAVA_Build 18 36080772 1D TGTACCTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 41 0 35 6 T 11 10 149660 CASAVA_Build 18 36088401 1D CTGAGTTATG T/- TTTTTCCCAC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 6 5 149661 CASAVA_Build 18 36088894 2D GAGGAGTGAG AA/-- GAGACAAATA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 0 149662 CASAVA_Build 18 36091835 1I TCTGCTTAAA -/T TTTTTATTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 5 6 149663 CASAVA_Build 18 36107116 1D TTGCAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 11 10 149664 CASAVA_Build 18 36112565 5I AGGTGGATTG -----/AAAGA AAAGAAAAGG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAAGA 1 2 149665 CASAVA_Build 18 36113833 2I AACATCAACT --/AA GTTTTCAGTT 3070 hom 154 het 61 0 52 9 A 0 2 149666 CASAVA_Build 18 36116703 11D TTTTTTAATG AGGAAGAAAAA/----------- CCTGTTAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 AGGAAGAAAAA 1 0 149667 CASAVA_Build 18 36119136 4I AAATAGACAT ----/AAAC ATACATGACC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AAAC 0 1 149668 CASAVA_Build 18 36122618 18I AATAAAATGG ------------------/ATAACTTATAGAAAATGA ATAAATTTCT 3070 hom 63 het 21 0 22 2 ATAACTTATAGAAAATGA 0 1 149669 CASAVA_Build 18 36131960 1D CCATTTTTTT A/- ATTTTGTTTT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 2 1 149670 CASAVA_Build 18 36140009 1D CTTCTATCAG T/- TTTTTATTTG 3070 hom 94 het 40 0 29 13 T 6 5 149671 CASAVA_Build 18 36148467 1D TCACTCTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 12 11 149672 CASAVA_Build 18 36150262 2D CCCACAAAAC AG/-- AGAGAGTACC 3070 het 3070 ref 60 28 26 7 AG 4 3 149673 CASAVA_Build 18 36160285 2I GAGATGATGA --/AT ATGTTTCTGA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 AT 1 2 149674 CASAVA_Build 18 36168096 2I GATGCATGAA --/TT TATTTTTAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 3 149675 CASAVA_Build 18 36169788 1D GTTCACTTTC T/- TTTTTTTTTC 1059 het 1059 ref 43 33 3 7 T 10 9 149676 CASAVA_Build 18 36174396 1I AAGATAACTT -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 A 6 7 149677 CASAVA_Build 18 36176098 1I GATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 T 10 11 149678 CASAVA_Build 18 36177701 1D TAACTATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 A 11 10 149679 CASAVA_Build 18 36184903 6I CCTGTAGGTG ------/ATAATT ATAATTATAC 3070 het 3070 ref 38 24 13 1 ATAATT 1 2 149680 CASAVA_Build 18 36185098 13D ACTGTCTTTT TCATGTGTGCTGG/------------- TCTTTGTTCT 3070 het 3070 ref 47 33 16 3 TCATGTGTGCTGG 1 0 149681 CASAVA_Build 18 36186578 1I TACGGTACCT -/A AAAACCTTAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 4 5 149682 CASAVA_Build 18 36194104 1D GTAGCCATTT A/- ACATAAGCAC 3070 het 3070 ref 54 27 20 7 A 2 1 149683 CASAVA_Build 18 36195195 1D AACTGTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 A 12 11 149684 CASAVA_Build 18 36203202 1I AGTCACACTT -/A ACTGATTGAA 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 A 1 2 149685 CASAVA_Build 18 36214703 1I CAGCCTAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 T 9 10 149686 CASAVA_Build 18 36216197 1D GTCATATCTG C/- TTGTTTATTG 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 C 1 0 149687 CASAVA_Build 18 36217653 1D TGTAAAAAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 9 8 149688 CASAVA_Build 18 36219017 3D ATACTTATGC CAA/--- CAACAAGTGT 3070 het 3070 hom 31 15 14 4 CAA 3 2 149689 CASAVA_Build 18 36220098 1I TTTATATTTT -/C CCCCCCCAAC 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 C 7 8 149690 CASAVA_Build 18 36228676 2I AGACTAAATA --/AT ATATATATAC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AT 4 5 149691 CASAVA_Build 18 36235108 4D ACAAACAAAA CTTC/---- CTTAATAATA 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 CTTC 1 0 149692 CASAVA_Build 18 36241244 5I TTAATCCAGG -----/GTGGC GTGGCAGTGT 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 GTGGC 1 2 149693 CASAVA_Build 18 36249444 2D AGACAAGGAC AT/-- GTGTGTCCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 1 0 149694 CASAVA_Build 18 36262627 1I TATTGTCTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 7 8 149695 CASAVA_Build 18 36263430 36I CCCAAGACCT ------------------------------------/TCTTTTTCTTTATGAGGTGTGAGGTTTGAGATAATA TCTATTAATT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TCTTTTTCTTTATGAGGTGTGAGGTTTGAGATAATA 0 1 149696 CASAVA_Build 18 36284444 3I AGGCAAAAAT ---/CTC CTTGTCAGCT 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 CTC 0 1 149697 CASAVA_Build 18 36292985 2D CATGGCAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 1417 het 1417 ref 50 29 4 17 AG 9 8 149698 CASAVA_Build 18 36293762 1I TTTTTTTCTC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 6 7 149699 CASAVA_Build 18 36295602 1D TTTTTTTTTT A/- AAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 21 2 A 5 4 149700 CASAVA_Build 18 36295794 4D CGTGTGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 11 15 13 TG 11 9 149701 CASAVA_Build 18 36303542 2I GAATCTCATC --/TG TCTGTCAGCA 3070 het 3070 hom 32 8 18 6 TG 0 1 149702 CASAVA_Build 18 36304600 1D ATTCATTAGC T/- TTTTTTTTTT 1880 het 1880 ref 39 23 5 11 T 12 11 149703 CASAVA_Build 18 36312682 1I ACTTGGAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 8 9 149704 CASAVA_Build 18 36315060 1I TACACAGAAG -/A AAAAAATAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 6 7 149705 CASAVA_Build 18 36316833 1I TAGTAAGACG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 T 7 8 149706 CASAVA_Build 18 36321947 1I CAACAAAGAG -/A AAAAACTAAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 5 6 149707 CASAVA_Build 18 36322970 28D ATCTATTAAG TATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATA 2533 het 267 hom 9 1 6 4 TA 22 8 149708 CASAVA_Build 18 36328671 3I AAGAAAAAGA ---/AAG AAAAGAAGGA 1766 het 1766 ref 20 11 5 4 AAG 0 1 149709 CASAVA_Build 18 36329921 3I TTTTCTTTCT ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 TTC 2 3 149710 CASAVA_Build 18 36332019 3I CTTAAGCAAA ---/CTG CTATTTTATG 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 CTG 0 1 149711 CASAVA_Build 18 36334921 1D CCAGAGATTC A/- AAAAATACAC 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 A 6 5 149712 CASAVA_Build 18 36335977 1D AACTCTTACC T/- TTTTCCGTGT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 5 4 149713 CASAVA_Build 18 36336353 2I ATTTCAACTC --/TT ATTTTTATTC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 0 2 149714 CASAVA_Build 18 36339741 2D ATCTCTATAC AT/-- ATATATATAT 1220 het 1220 ref 9 3 3 4 AT 6 5 149715 CASAVA_Build 18 36343261 1D ATAGCCTCAA C/- AAATTAAAAT 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 C 1 0 149716 CASAVA_Build 18 36352388 1D TCCTCACTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 10 9 149717 CASAVA_Build 18 36359404 2D TTGCTTTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 27 1 12 15 A 12 10 149718 CASAVA_Build 18 36366660 1D ATTACTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 11 8 T 14 13 149719 CASAVA_Build 18 36380033 1D GAAAGAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1019 hom 39 3 30 6 A 12 11 149720 CASAVA_Build 18 36391447 1I TTCGACTATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 8 9 149721 CASAVA_Build 18 36440527 1D GTCAAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 44 2 33 9 T 13 12 149722 CASAVA_Build 18 36441298 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 10 11 149723 CASAVA_Build 18 36447572 1D TTTTTTTAAT C/- CCATTTATAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 7 C 3 2 149724 CASAVA_Build 18 36478080 1I CTCAATGATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 9 10 149725 CASAVA_Build 18 36479590 1I CACAATTTCC -/A AACAATCTTA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 2 3 149726 CASAVA_Build 18 36484335 1D AGGCTACTTT A/- AAAAAAAAAA 1324 het 1324 ref 43 31 5 7 A 13 12 149727 CASAVA_Build 18 36493492 1I TGAAATGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 10 11 149728 CASAVA_Build 18 36511430 1I CTTTCAAAAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 8 9 149729 CASAVA_Build 18 36518282 1D TGCTAATGAC A/- AAAAAAAAAA 1884 het 1884 ref 39 25 7 7 A 15 14 149730 CASAVA_Build 18 36522510 1D AGCCCTCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 10 9 149731 CASAVA_Build 18 36570390 4I TTAGAGATAC ----/ATAG ATAAAGGACA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 ATAG 0 1 149732 CASAVA_Build 18 36571634 1I TCTGAAACCC -/T TTTTATATCA 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 T 4 5 149733 CASAVA_Build 18 36584432 1I GTACTCAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 10 11 149734 CASAVA_Build 18 36588899 1I AGACTAACAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 103 het 41 0 35 6 A 7 8 149735 CASAVA_Build 18 36598247 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 22 1 13 8 T 16 15 149736 CASAVA_Build 18 36613551 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 10 11 149737 CASAVA_Build 18 36622013 1I TTCTTCAATG -/T GTTGATTGGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 0 1 149738 CASAVA_Build 18 36655525 1I GGTGCAGCGG -/C CCACCTGAGA 3070 hom 126 het 48 0 39 9 C 2 3 149739 CASAVA_Build 18 36663583 1I GAAACCACTG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 8 9 149740 CASAVA_Build 18 36663880 2I TGGAACACTC --/TT CTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 26 4 T 0 2 149741 CASAVA_Build 18 36667840 2D GCATAATAAT AA/-- AAAAAAATAC 336 het 30 hom 14 1 2 12 A 9 7 149742 CASAVA_Build 18 36670614 1I TCAATTTGAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 132 het 47 0 45 3 T 8 9 149743 CASAVA_Build 18 36682218 1I AGAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2129 hom 12 het 5 0 5 0 A 13 14 149744 CASAVA_Build 18 36687310 3D TAATGGATAT CTC/--- TGAGGTAGCC 3070 het 3070 hom 56 24 29 3 CTC 1 0 149745 CASAVA_Build 18 36695130 1D CTAACGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 11 10 149746 CASAVA_Build 18 36696926 2D TTCTCTGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 1480 het 1480 ref 21 7 5 9 T 16 14 149747 CASAVA_Build 18 36698690 1I TAGGTTTTTT -/A TTATGATTAT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 0 1 149748 CASAVA_Build 18 36700138 1I TACAAGTTGT -/A AATGATTTAT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 2 3 149749 CASAVA_Build 18 36736893 5D GAGAAAAAAA AAAAG/----- AGAGAAAGAG 3070 hom 33 het 40 1 35 5 AAAAG 1 0 149750 CASAVA_Build 18 36737914 5I AAGTTTTTAA -----/TCTTT TCTTTCCTTT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TCTTT 1 2 149751 CASAVA_Build 18 36738659 4D ACCTTGCCAC AGAG/---- AAAGAATATA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 AG 2 0 149752 CASAVA_Build 18 36739610 1D ATTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 13 12 149753 CASAVA_Build 18 36748251 1I TACTTCTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 34 1 28 5 A 11 12 149754 CASAVA_Build 18 36751775 3I CTCCATCTTA ---/AAG AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 AAG 0 1 149755 CASAVA_Build 18 36754835 1I CTGTGCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 11 149756 CASAVA_Build 18 36761534 1I TCTAATGGGG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 6 7 149757 CASAVA_Build 18 36765723 1I CCAGCACTTT -/G GGGGGGGCCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 7 8 149758 CASAVA_Build 18 36770721 1I TCTCTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 27 2 19 6 T 13 14 149759 CASAVA_Build 18 36772642 1I AATCTTAGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 9 149760 CASAVA_Build 18 36774459 1I CAGAGGGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 9 10 149761 CASAVA_Build 18 36774715 1D TCAATAGCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 77 het 32 0 26 6 T 10 9 149762 CASAVA_Build 18 36799054 1D CCATGGAATA C/- TACACAGCCA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 C 1 0 149763 CASAVA_Build 18 36801606 1I AAAGATAAAT -/C AAATTGATAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 0 1 149764 CASAVA_Build 18 36803288 1D GGAAAGGATG C/- CCCTATTCAA 3070 hom 104 het 37 0 33 5 C 4 3 149765 CASAVA_Build 18 36809387 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 10 9 149766 CASAVA_Build 18 36818702 1D CATACTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 32 2 15 15 T 17 16 149767 CASAVA_Build 18 36819869 2D TAGTAATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 783 hom 49 7 25 18 A 13 11 149768 CASAVA_Build 18 36833366 1D AAGGGAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 9 149769 CASAVA_Build 18 36858366 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 2380 het 2380 ref 25 15 8 2 T 9 10 149770 CASAVA_Build 18 36867137 1D TAAATATAGA C/- CCTTGAGTAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 C 3 2 149771 CASAVA_Build 18 36869070 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 8 14 5 T 10 9 149772 CASAVA_Build 18 36870925 3I TTGGAAATTT ---/TTA TTGTATTCAA 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 TTA 0 1 149773 CASAVA_Build 18 36873528 1I CCAACCAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 10 11 149774 CASAVA_Build 18 36883220 1D TCTAGTCTTG A/- AAAATAAAGT 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 A 5 4 149775 CASAVA_Build 18 36883774 1D ATGGCTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 16 2 A 14 13 149776 CASAVA_Build 18 36884627 1D GTCCCTGTGC G/- GGCAGGCCAG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 G 3 2 149777 CASAVA_Build 18 36886449 1D TTTGTCCCCC A/- TGTATAGGAG 3070 hom 88 het 42 0 27 16 A 1 0 149778 CASAVA_Build 18 36894556 1D ACAGAAAAAG A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 6 5 149779 CASAVA_Build 18 36899110 1I TTCATTAATA -/T TAATGAAAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 1 2 149780 CASAVA_Build 18 36901520 4D AATGAGGCTG ATTA/---- ATTAATTAAG 3070 het 3070 ref 45 24 17 8 ATTA 3 2 149781 CASAVA_Build 18 36902795 1I CAACATTCTC -/G CTAACCCCTT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 G 0 1 149782 CASAVA_Build 18 36903657 1I TATATGGGCA -/C TTCTTTGTAT 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 C 0 1 149783 CASAVA_Build 18 36920297 1D TTCAAGATTT A/- AAAAAAAAAT 994 het 994 ref 40 32 3 6 A 10 9 149784 CASAVA_Build 18 36928692 1D GAAAAGGTAA T/- TTTGTCTGGG 1888 het 1888 ref 21 15 4 2 T 4 3 149785 CASAVA_Build 18 36944348 1D AAAATAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 630 hom 39 3 29 9 A 12 11 149786 CASAVA_Build 18 36968120 2I TGAAAGAGAT --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 74 het 29 0 24 5 AG 5 6 149787 CASAVA_Build 18 36978681 3I CTGTTGTGGT ---/ATC ATCACAGTGC 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 ATC 1 2 149788 CASAVA_Build 18 36986070 6D TTCCCTCATT TATAAA/------ TATAAAGTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 TATAAA 2 1 149789 CASAVA_Build 18 36992200 1D AATTACAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 13 12 149790 CASAVA_Build 18 37013875 1I TTTCGATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 32 1 25 6 T 12 13 149791 CASAVA_Build 18 37016406 1D TCAAGTGTTC T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 T 7 6 149792 CASAVA_Build 18 37059234 4I GAAAGCAGCT ----/GGGA GGGAGGCTGT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 GGGA 1 2 149793 CASAVA_Build 18 37064097 1D GATTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 33 0 20 15 A 11 10 149794 CASAVA_Build 18 37068967 1I TTTAGGCTCA -/T TTTTCCCCAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 4 5 149795 CASAVA_Build 18 37072300 1I AATTTTCTTC -/T TTTTTAAGGC 3070 hom 175 het 71 0 59 12 T 5 6 149796 CASAVA_Build 18 37077453 1D ATTTCTTATA C/- TTTGGGAAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 1 0 149797 CASAVA_Build 18 37091053 22I TGTGTAGCAT ----------------------/GTATCTTAGCAAAAGTTTCTCA GTGAATTTAG 3070 hom 84 het 31 0 29 5 GTATCTTAGCAAAAGTTTCTCA 0 1 149798 CASAVA_Build 18 37093840 1I CACCAGCCTA -/T TTGTCAAGGG 3070 hom 122 het 49 0 39 10 T 2 3 149799 CASAVA_Build 18 37102181 5D GCCAATACTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3021 het 378 hom 21 5 9 8 T 19 14 149800 CASAVA_Build 18 37102363 1D TTTGTGGGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 9 8 149801 CASAVA_Build 18 37107718 4D CTGGATTCTG AGAC/---- AGACATAACT 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 AGAC 2 1 149802 CASAVA_Build 18 37111071 5I GTCTAAGATT -----/ATATA ATATATCATT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 ATATA 1 2 149803 CASAVA_Build 18 37118411 4I ATGACATGAT ----/TGTC TGTGTAGAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TGTC 0 1 149804 CASAVA_Build 18 37122440 3D AAGAAAAGGG TAT/--- GTAAGTAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 7 TAT 1 0 149805 CASAVA_Build 18 37124412 1D ATCTTCTGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 T 9 8 149806 CASAVA_Build 18 37126428 2D AAGTGTTTAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 67 21 29 19 AC 8 7 149807 CASAVA_Build 18 37127285 1I AGTTCCCCCA -/C TTCCCTTGAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 C 0 1 149808 CASAVA_Build 18 37131947 1I ATCTTTTTTT -/A ATCTAAGTTC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 1 2 149809 CASAVA_Build 18 37151463 7D CCTGTCTCAA AAAAAAT/------- AAAAAATAAA 3070 het 1972 hom 23 4 12 7 AAAAAAT 3 2 149810 CASAVA_Build 18 37153873 1D TTTGTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 34 1 24 12 T 14 13 149811 CASAVA_Build 18 37165279 1D TCGCTTGAAG T/- TTTTTGGTGA 3070 het 3070 hom 42 13 24 6 T 6 5 149812 CASAVA_Build 18 37175428 1D GTACCTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 11 10 149813 CASAVA_Build 18 37177192 1D ACTACATGAC T/- TTTTGAAAGA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 T 5 4 149814 CASAVA_Build 18 37183952 1I AAAAAGCAAT -/A AAAAAAAATC 2654 het 2654 ref 18 8 6 4 A 8 9 149815 CASAVA_Build 18 37184407 1D AAATGTTAGC T/- GCTCTTGTTT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 1 0 149816 CASAVA_Build 18 37187095 1I ATTTTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 247 hom 31 2 25 4 A 12 13 149817 CASAVA_Build 18 37203063 1I AGTCACATGC -/T TTTGCCTAAC 3070 het 3070 ref 58 30 22 6 T 3 4 149818 CASAVA_Build 18 37208146 10I TTAATTTTTA ----------/GAGACAGGGT GAGACAGGGT 3070 het 3070 hom 33 9 13 11 GAGACAGGGT 1 2 149819 CASAVA_Build 18 37210924 2D TTTATGTGAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 49 16 22 12 AC 9 8 149820 CASAVA_Build 18 37212481 1D TCATTCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 38 0 32 7 A 10 9 149821 CASAVA_Build 18 37214075 1D CTCAGGATGT A/- GGAAGTCCAT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 1 0 149822 CASAVA_Build 18 37228433 1I AAATTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 11 12 149823 CASAVA_Build 18 37241942 1I CTGACCTTAG -/T TTTTTCCCCA 3070 hom 114 het 43 0 37 6 T 5 6 149824 CASAVA_Build 18 37246003 1I AATGGGGTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 8 9 149825 CASAVA_Build 18 37252624 3I TAGATGAGAA ---/AAG AAGAAGAAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAG 2 3 149826 CASAVA_Build 18 37263766 1I TCCCCTATCC -/G GGATTTCTCC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 2 3 149827 CASAVA_Build 18 37266076 1D CCTGAAACTG A/- GTAATTATAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 1 0 149828 CASAVA_Build 18 37269469 3I AGTAGAAAGT ---/AAG AAGAAGGGTG 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 AAG 2 3 149829 CASAVA_Build 18 37270470 1D CCTGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 12 11 149830 CASAVA_Build 18 37278639 2D CTGTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 het 394 hom 34 4 20 10 TG 1 0 149831 CASAVA_Build 18 37300978 1D GTGGACAAAC T/- TTTTTTTTTT 1055 het 1055 ref 30 20 3 8 T 13 12 149832 CASAVA_Build 18 37310392 2D AAAGAAAATC AA/-- AAGAGTGGTA 2616 het 973 hom 13 3 7 3 A 4 2 149833 CASAVA_Build 18 37317301 9I CTCACTATGC ---------/AGTGAATGG AGTACAGGTG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AGTGAATGG 0 1 149834 CASAVA_Build 18 37318324 3I4M6D CCAGGAAAGC ---ACAACTGTTT/CAGAGAA------ ACATTGCACA 3070 hom 114 het 37 0 39 1 N/A 0 0 149835 CASAVA_Build 18 37323154 1I TGCTCAGAAA -/G CACCTGGCAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 0 1 149836 CASAVA_Build 18 37325142 2D CATTTCACTC AT/-- ACATATTTCT 3070 het 3070 ref 41 21 19 3 AT 1 0 149837 CASAVA_Build 18 37330054 6I CTCTTTTTTC ------/TTTTCT TTTTCTTTTC 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TTTTCT 1 2 149838 CASAVA_Build 18 37331522 2I GCTTCTTCTG --/CT CTTCTAGTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CT 1 2 149839 CASAVA_Build 18 37336135 1D CAGCCATGTA C/- CCACAGGGAG 3070 het 3070 ref 50 17 15 19 C 3 2 149840 CASAVA_Build 18 37336507 1I ACCTGCATGT -/G CAATGGAGAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 0 1 149841 CASAVA_Build 18 37341469 1I TTTAAAGGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 17 15 9 T 9 10 149842 CASAVA_Build 18 37348697 1D ATTCTTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 35 0 17 18 T 16 15 149843 CASAVA_Build 18 37353825 1D TCTGGCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1801 hom 32 7 10 15 T 15 14 149844 CASAVA_Build 18 37365358 1I GTTTAACCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2555 hom 31 8 13 10 T 10 11 149845 CASAVA_Build 18 37365855 1D CAAGGGTGAG A/- AAAAAATGGC 3070 hom 132 het 52 0 43 10 A 7 6 149846 CASAVA_Build 18 37368972 1I TGATCAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 162 het 62 0 54 8 A 8 9 149847 CASAVA_Build 18 37371086 7I8M8D AAAGACAAAC -------ACACACACAAAAAAAA/AAAAAAAACACACAC-------- ACACACACAC 3070 het 368 hom 26 3 19 7 N/A 0 0 149848 CASAVA_Build 18 37373217 1D AGGTCCTGGG A/- GGCTTCATTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 1 0 149849 CASAVA_Build 18 37374304 3D GTAACACTTT AGA/--- AGAAGAGAGG 3070 het 3070 hom 51 20 24 10 AGA 3 2 149850 CASAVA_Build 18 37379382 11D CAGAAAATAA TATATTTAGCT/----------- GGAGATTTTA 3070 het 3070 hom 36 19 19 5 TATATTTAGCT 1 0 149851 CASAVA_Build 18 37381627 3I ATTTTTTGAG ---/CTA CTACTACCAT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 CTA 2 3 149852 CASAVA_Build 18 37385016 3D GGCCGGGCAC GGT/--- GGCTCACACC 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 GGT 1 0 149853 CASAVA_Build 18 37393005 1I TATAATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 17 17 10 A 13 14 149854 CASAVA_Build 18 37398297 1D45M1I CATTCAGAAT AAAAAAAAAAAGTGAAGAACTCATGTAAATAAATGTGACACTGTTA-/-AAAAAAAAAAGTGAAGAACTCATGTAAATAAATGTGACACTGTTAT TTCCCCCCCC 3070 het 1761 hom 22 5 13 16 N/A 0 0 149855 CASAVA_Build 18 37398878 13D TGGATTATTC AGGCAAGTGAAAA/------------- AGGCAAGTGA 3070 het 3070 ref 24 12 7 10 AGGCAAGTGAAAA 2 1 149856 CASAVA_Build 18 37400573 2D CTCTAATCAC CT/-- GTTTGGTGTT 3070 het 3070 hom 52 21 26 6 CT 1 0 149857 CASAVA_Build 18 37401001 3D CCTTTTCTGA GTT/--- CCTATGTTAC 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 GTT 1 0 149858 CASAVA_Build 18 37402171 1D ATTCTACACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 10 9 149859 CASAVA_Build 18 37406758 6I54M2D TACAGATATA ------TACATGTACATGTATATATACATATATGCATATACATATATACATATATGTATTTA/TACATGTACATGTACATGTATATATACATATATGCATATACATATATACATATATGTATT-- TATGTCTATA 3070 het 3070 hom 36 24 23 6 N/A 0 0 149860 CASAVA_Build 18 37407372 4D AGAGAAAGAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 33 16 15 6 AG 8 6 149861 CASAVA_Build 18 37407600 2D ATTTTTTGTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 AT 6 5 149862 CASAVA_Build 18 37410423 2I CCACATGTCT --/AC ACACACTTTA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 AC 3 4 149863 CASAVA_Build 18 37413591 2D GGGAATTAGC TG/-- TGTGCAATTC 3070 het 3070 hom 55 23 29 3 TG 3 2 149864 CASAVA_Build 18 37413754 5D GTCCTCATCA TTTCT/----- TTTAAGTTCA 3070 het 3070 ref 42 18 20 6 TTTCT 1 0 149865 CASAVA_Build 18 37415637 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 T 8 7 149866 CASAVA_Build 18 37430089 4D AGAGGTTTTC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 41 21 12 9 GT 8 6 149867 CASAVA_Build 18 37439493 1D TCTATCTCAG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 T 9 8 149868 CASAVA_Build 18 37440004 1I GATGGGAGAA -/G GACTTGGGTA 3070 het 3070 hom 60 26 27 7 G 1 2 149869 CASAVA_Build 18 37443818 1D TTGCCTCCTT G/- GAAGTCTTCC 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 G 2 1 149870 CASAVA_Build 18 37479864 1D TGAGATTACA C/- TATAGGATGG 3070 het 3070 ref 41 19 17 7 C 1 0 149871 CASAVA_Build 18 37481680 1D ATAATTATCG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 8 7 149872 CASAVA_Build 18 37501941 1I CTGTTAACTG -/T CTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 T 0 1 149873 CASAVA_Build 18 37504617 4D TAATTCTAGG ATTT/---- ATTTGTTACT 3070 het 3070 hom 56 24 26 6 ATTT 2 1 149874 CASAVA_Build 18 37507946 1D AAAGAAGGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 8 149875 CASAVA_Build 18 37508578 1D AACCTGTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 387 hom 37 1 32 4 T 10 9 149876 CASAVA_Build 18 37515450 1D TGACTCTAGC A/- AAAAAAAAAA 2842 hom 28 het 20 0 8 12 A 17 16 149877 CASAVA_Build 18 37550516 1D GAAAAAGAAT A/- AAAAAAAAAA 2829 het 916 hom 27 4 9 16 A 15 14 149878 CASAVA_Build 18 37566346 1I AGGTTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 64 het 29 0 21 8 A 9 10 149879 CASAVA_Build 18 37606030 1I GCACATCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 51 2 44 5 A 11 12 149880 CASAVA_Build 18 37606196 1D CTGGGAACTA C/- CCCAGTGCAG 3070 hom 128 het 50 0 41 10 C 4 3 149881 CASAVA_Build 18 37615009 2I AAAAAAAAAA --/AT TTAAAAAAAA 1475 hom 10 het 4 0 4 0 AT 0 1 149882 CASAVA_Build 18 37616643 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 908 hom 40 3 27 10 A 11 12 149883 CASAVA_Build 18 37621881 1D GATGTAATAT A/- AAAAACTAAG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 6 5 149884 CASAVA_Build 18 37632714 1I AGCCGATTCA -/T TTTTTTTTTT 2709 het 2709 ref 26 10 8 8 T 11 12 149885 CASAVA_Build 18 37634183 1D CCTCAGGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 9 149886 CASAVA_Build 18 37645449 1D GCCATCATGT A/- AAAAAAAAAA 2943 het 2457 hom 35 14 9 12 A 17 16 149887 CASAVA_Build 18 37655226 1D ACTGGCAATT A/- AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 A 7 6 149888 CASAVA_Build 18 37667586 2I AGTTTTAAAA --/CT CTCATTTTCC 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 CT 1 2 149889 CASAVA_Build 18 37671706 1I GGGATGTGCC -/T TGCTTCTCTT 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 T 1 2 149890 CASAVA_Build 18 37673867 1D TCAATGGTGC A/- AAAATTAAAT 3070 het 3070 hom 47 21 23 5 A 5 4 149891 CASAVA_Build 18 37677533 26D TATATTCTAA ATTTAAAAATATTATTTTTAAATGTC/-------------------------- ATTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 20 7 9 4 ATTTAAAAATATTATTTTTAAATGTC 1 0 149892 CASAVA_Build 18 37683857 1D GAACAAATTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 8 7 149893 CASAVA_Build 18 37684453 1I CTTTAACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 A 9 10 149894 CASAVA_Build 18 37685656 3I ATGAAAAACA ---/ACG AGTATCCTCA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 ACG 0 1 149895 CASAVA_Build 18 37687226 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3002 het 2332 hom 28 11 16 1 TCTT 5 4 149896 CASAVA_Build 18 37687559 1I AAAATACAAG -/A AAAAATAGTT 3070 het 3070 hom 52 19 31 2 A 5 6 149897 CASAVA_Build 18 37689032 1I GACCAGACTC -/A AAAAAAAAAA 2641 het 2641 ref 31 14 9 8 A 13 14 149898 CASAVA_Build 18 37689850 3D GAGAAGGAGA ATT/--- ATTAGTAAGA 3070 het 3070 ref 44 27 15 3 ATT 2 1 149899 CASAVA_Build 18 37691234 2I7M3D ACGAAAGGAG --CAAATAGTGT/CCCGTCTAG--- TCTCCTCTAG 3070 het 3070 ref 37 24 14 4 N/A 0 0 149900 CASAVA_Build 18 37692401 1I CAAGAAAGCC -/A AAAAAACTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 8 A 6 7 149901 CASAVA_Build 18 37693032 2D AGTGAAAAAC AT/-- GATTGACAAA 3070 het 3070 ref 51 27 13 11 AT 1 0 149902 CASAVA_Build 18 37694327 1I CGGCCACTCC -/A ACTGAAGTTT 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 A 1 2 149903 CASAVA_Build 18 37694907 1I CACCTCCTGA -/C TACAAACTCC 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 C 0 1 149904 CASAVA_Build 18 37697784 1I GTAAATTGTC -/A AACTTGACTT 2942 het 2942 ref 26 11 6 9 A 2 3 149905 CASAVA_Build 18 37700783 4D TGAGCTATAA CACT/---- CACCGAGAAG 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 CACT 1 0 149906 CASAVA_Build 18 37704706 1D TTTTGCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 195 hom 27 1 25 2 A 13 12 149907 CASAVA_Build 18 37706171 1I TTTAAGCTTA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 7 8 149908 CASAVA_Build 18 37709424 4D ATAGATAAAT GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 45 16 22 9 GAAA 3 2 149909 CASAVA_Build 18 37722313 1D CCCAATTCCA T/- TTTTGCTTCT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 5 4 149910 CASAVA_Build 18 37747750 1D TAGTGTCTGG C/- CGAGGGCTGC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 C 2 1 149911 CASAVA_Build 18 37748852 1I ATAGTGTTGT -/A ACATCACTGA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 1 2 149912 CASAVA_Build 18 37750323 4D GCCCCAATGC AAAT/---- AAATACAGGT 3070 hom 78 het 28 0 26 3 AAAT 2 1 149913 CASAVA_Build 18 37760461 1I TCTATAATTT -/A AAAAAAAAAA 2875 het 2875 ref 30 14 7 9 A 11 12 149914 CASAVA_Build 18 37769419 1D TGTTTCCTCA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 9 8 149915 CASAVA_Build 18 37799583 1I GTGAGTCTGT -/G AAAGGGAGCC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 G 0 1 149916 CASAVA_Build 18 37811463 3D TATATGTGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 13 10 149917 CASAVA_Build 18 37817319 1D GGCAGGAATC T/- TTTTTTTTTT 1541 het 1541 ref 37 18 6 13 T 12 11 149918 CASAVA_Build 18 37838512 4D AGGTGCATTA TTAT/---- TTATTATTCT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 TTAT 2 1 149919 CASAVA_Build 18 37919352 1I AATAGTCTAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 A 7 8 149920 CASAVA_Build 18 37929610 1I TTCCTCATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 12 13 149921 CASAVA_Build 18 37951535 1I ATTCAGAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 31 1 20 10 T 14 15 149922 CASAVA_Build 18 37954530 1D ATTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 18 8 T 11 10 149923 CASAVA_Build 18 37956717 2D GATGCCAGAC AT/-- TGTGGATTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 AT 1 0 149924 CASAVA_Build 18 37957026 1D CCACGTGGTG T/- TTGGTTTTCT 3070 hom 83 het 36 0 24 12 T 3 2 149925 CASAVA_Build 18 37959251 1I AGACTCTTAT -/A AAGTATTCTC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 2 3 149926 CASAVA_Build 18 37962337 1I TTGGGGTAAC -/T TTTTTATATT 3070 hom 144 het 50 0 49 1 T 5 6 149927 CASAVA_Build 18 37962933 3I GGAAAACATC ---/CTT CTTGTTAAAA 3070 hom 56 het 24 0 19 5 CTT 1 2 149928 CASAVA_Build 18 37963514 1D ATAAGGGAAG C/- GGGAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 1 0 149929 CASAVA_Build 18 37964902 1D AATCTAAAAA T/- TTGTGATCAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 3 2 149930 CASAVA_Build 18 37965011 1D TAATTTTCTT A/- AAAAAACTAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 7 6 149931 CASAVA_Build 18 37991808 1I AAGGCAGAAG -/T TTTTTTATTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 149932 CASAVA_Build 18 37998385 1D GTGCTTTATC T/- CTTTTCATTT 3070 hom 111 het 45 0 38 10 T 1 0 149933 CASAVA_Build 18 38003169 1D AAAAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 503 hom 36 2 22 12 T 13 12 149934 CASAVA_Build 18 38013042 1D CAAAGACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 12 11 149935 CASAVA_Build 18 38018290 1D CTCCTGGGGA G/- GGGGAAGTCA 3070 hom 109 het 40 0 37 4 G 5 4 149936 CASAVA_Build 18 38024391 11D ACTTAAATGC AATCCGTTGTT/----------- AACATCTTGC 3070 hom 72 het 24 0 24 4 AATCCGTTGTT 1 0 149937 CASAVA_Build 18 38031813 5I TTTGTTAGCC -----/CTTTT CTTTATTACT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CTTTT 0 1 149938 CASAVA_Build 18 38034612 1I GCTATTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1092 hom 29 3 16 10 T 13 14 149939 CASAVA_Build 18 38045465 4D TCTAGAGCTG TTAA/---- TTAATTAAAT 3070 hom 95 het 36 0 32 4 TTAA 3 2 149940 CASAVA_Build 18 38049602 1D ACAGGCCTCA C/- CCAGTTCCCA 3070 hom 112 het 40 0 34 7 C 3 2 149941 CASAVA_Build 18 38056237 1I AGATGTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 33 0 26 7 T 11 12 149942 CASAVA_Build 18 38063672 1I CCACTAGTTA -/C ACCACATGAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 C 0 1 149943 CASAVA_Build 18 38075700 3D AAGACTTTGG ACC/--- TGTGTGCTGT 3070 hom 96 het 35 0 31 5 ACC 1 0 149944 CASAVA_Build 18 38078708 1D CCTGGGAGAC A/- AGAGCGAAAC 2804 het 2682 hom 15 6 6 4 A 2 1 149945 CASAVA_Build 18 38081324 2D TGCCTCAGTT TA/-- CTTATCCATT 3070 het 3070 hom 44 18 20 7 TA 1 0 149946 CASAVA_Build 18 38086126 3D TTGAAGTATT TTG/--- TTGTTGTTGT 2664 het 2664 ref 37 15 10 14 TTG 6 5 149947 CASAVA_Build 18 38097510 1D ACTCAGGATG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 9 8 149948 CASAVA_Build 18 38101869 1D TTTTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 11 10 149949 CASAVA_Build 18 38104455 1D42M1D GCACATTACG AAAAAGCAAAGCTTCTGGACACCATACTCTCAAAGCCTACTGAG/-AAAAGCAAAGCTTCTGGGCACCATACTCTCAAAGCCTACTGA- GACCTAGTTT 3070 hom 163 het 40 0 55 8 N/A 0 0 149950 CASAVA_Build 18 38115637 1I AACTTGAGCG -/T TAACGGAGGA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 1 2 149951 CASAVA_Build 18 38116660 1I GTGTTTTTTT -/C TTAACCTTGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 0 1 149952 CASAVA_Build 18 38119127 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 27 1 18 8 A 10 11 149953 CASAVA_Build 18 38119498 1I TGTCTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1097 hom 31 3 24 4 T 12 13 149954 CASAVA_Build 18 38130431 1D AGTCATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 815 hom 49 2 38 9 A 13 12 149955 CASAVA_Build 18 38137456 1D GTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 12 11 149956 CASAVA_Build 18 38138723 1D TCTTTTTAGT A/- AAAAAAAAAA 1715 het 1715 ref 29 18 4 8 A 12 11 149957 CASAVA_Build 18 38150987 1I AAAAGGTTTT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 7 8 149958 CASAVA_Build 18 38152158 1D CTCCACCTCC A/- AAAAGCAGAT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 5 4 149959 CASAVA_Build 18 38187764 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 871 het 871 ref 30 12 5 13 T 17 16 149960 CASAVA_Build 18 38190860 1D ATTTTTTGAC T/- TTTTTTTTTG 1439 het 1439 ref 40 28 4 8 T 10 9 149961 CASAVA_Build 18 38206189 13I TGTACATGCA -------------/TAATACATTTTAG TAATACTGCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TAATACATTTTAG 0 1 149962 CASAVA_Build 18 38210149 3D45M2D4M1D TCCATTTCTC TGATGATTAGTAATTATGAGCCCTTTTTCATATGTTTGTTGGTGTTTGTAAGTCT/---TGATTAGTAATTATGAGCCCTTTTTCATATGTTTGTTGGTGTTTG--AGAC- TCTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 48 16 20 22 N/A 0 0 149963 CASAVA_Build 18 38210300 2I AGAGATTCTG --/GA TATGAGTCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 GA 0 1 149964 CASAVA_Build 18 38217409 1D TCCAGCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 12 11 149965 CASAVA_Build 18 38221490 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 7 T 13 12 149966 CASAVA_Build 18 38223447 1D TCCTGTAGGT A/- AAAGGTAGTA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 A 4 3 149967 CASAVA_Build 18 38224106 1D GCAGAGCTGG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 105 het 43 0 36 8 A 8 7 149968 CASAVA_Build 18 38226507 1D GTAGCTGTGC T/- TTTTTTTTTT 1808 het 1808 ref 45 32 5 8 T 12 11 149969 CASAVA_Build 18 38227904 1D GAGAAAAAAA T/- AACTTAGTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 0 149970 CASAVA_Build 18 38229971 1I AAGAGGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 48 1 41 6 T 10 11 149971 CASAVA_Build 18 38231235 7I TTCACTTCAT -------/TCTAAAA TCTAAAATAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TCTAAAA 1 2 149972 CASAVA_Build 18 38242961 1D TCTGAAATCT A/- AGGTGGAGGC 3070 hom 90 het 33 0 27 6 A 2 1 149973 CASAVA_Build 18 38243329 1I17M1D GAATTTCTAT -CCCCCACAAAAATGGGAT/CCCCCCACAAAAATGGGA- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 39 0 35 4 N/A 0 0 149974 CASAVA_Build 18 38246059 1I GTCATGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1702 hom 39 5 26 8 T 12 13 149975 CASAVA_Build 18 38252577 1I TAAGCAACGT -/G GCTTACAGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 1 2 149976 CASAVA_Build 18 38257720 1D7M1D12M1D GTTTTTTTTG AATGTGTCTTTTTTCTGGTTTG/-ATGTGTC-TTTTTCTGGTTT- TGGTGTAAAG 3070 hom 66 het 19 0 23 0 N/A 0 0 149977 CASAVA_Build 18 38257865 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 22 0 14 9 T 12 10 149978 CASAVA_Build 18 38276441 11I ACTTCTAGAT -----------/GGTTTGTTGGA TCACAATTGA 3070 hom 138 het 50 0 46 5 GGTTTGTTGGA 0 1 149979 CASAVA_Build 18 38280911 1I ATAGGAAGCA -/C AGCTTGGAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 0 1 149980 CASAVA_Build 18 38284717 1I AACACATAAA -/T TTTTTTCAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 7 149981 CASAVA_Build 18 38290170 3D CCTGCCATAA TCT/--- TCTTTCATAG 3070 hom 48 het 24 0 16 11 TCT 2 1 149982 CASAVA_Build 18 38298447 1D CTCTACTCCC T/- TTCCTGGCAA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 3 2 149983 CASAVA_Build 18 38299657 1I TACCGCTCTG -/C CCCCCTCCAC 3070 hom 72 het 29 0 20 9 C 5 6 149984 CASAVA_Build 18 38300633 1I CTCAATCTTC -/A GGAAAGGTAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 0 1 149985 CASAVA_Build 18 38312779 3D ATTTGAACTC CTT/--- CTGCAGGTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTT 1 0 149986 CASAVA_Build 18 38313334 1I TTAATTTACT -/A AAACAACTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 3 4 149987 CASAVA_Build 18 38319276 2I ATATTCCATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 93 het 41 0 28 13 GT 7 8 149988 CASAVA_Build 18 38347127 1I AGGGGAGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 10 149989 CASAVA_Build 18 38347724 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAATTATA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 7 5 149990 CASAVA_Build 18 38374569 1D30M2D ACTCCATCTC AAAAAAAAACAAAAAACAAACAAACAAAAAAAC/-AAAAAAAACAAAAAACAAACAAACAAAAAA-- ACACACACAC 3070 hom 102 het 27 0 34 3 N/A 0 0 149991 CASAVA_Build 18 38380269 2I ATATTACAAC --/TT ATATAAATCA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 0 2 149992 CASAVA_Build 18 38384108 1I CATTCTTTCT -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 22 het 37 1 26 10 C 8 9 149993 CASAVA_Build 18 38390870 1I TTTTAGGTCA -/G GTGTGAGTTG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 1 2 149994 CASAVA_Build 18 38395515 2D GAGTTACAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 42 0 27 15 A 14 12 149995 CASAVA_Build 18 38401373 1D ATTGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1136 hom 24 3 17 5 A 13 12 149996 CASAVA_Build 18 38403510 1I ATTTTAAACA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 7 8 149997 CASAVA_Build 18 38404022 4D ATGTAGGGAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 22 10 T 18 14 149998 CASAVA_Build 18 38422418 8D CTATAAATCT ATCTATAA/-------- ATCTATCATC 1307 het 1307 ref 32 10 7 17 ATCTATAA 1 0 149999 CASAVA_Build 18 38429309 1I TAAGGATCTC -/T TTTAATGCTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 3 4 150000 CASAVA_Build 18 38430204 3I TTTCTTTCCC ---/ATT ATTATTTTCT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 ATT 2 3 150001 CASAVA_Build 18 38434138 1D TCAGGTATAC T/- TTTTTCCCCT 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 T 6 5 150002 CASAVA_Build 18 38435143 1D CAACCTCACC A/- ACTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 2 1 150003 CASAVA_Build 18 38439040 6I TTTAAGACAT ------/ATATAA GCTAGAAGTA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 ATATAA 0 1 150004 CASAVA_Build 18 38442062 1I CTTCATGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 10 11 150005 CASAVA_Build 18 38445637 1D AGTTTCAGTA T/- GGTCACAGTC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 1 0 150006 CASAVA_Build 18 38472155 1I CAATTAAAAT -/A AAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 61 27 28 6 A 6 7 150007 CASAVA_Build 18 38529740 1D TAATTCCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 655 hom 31 5 17 9 A 16 15 150008 CASAVA_Build 18 38529756 1D AAAAAAAAAA C/- CTGGCTTCAT 3070 het 762 hom 28 8 15 5 C 2 1 150009 CASAVA_Build 18 38561366 2D TGTCTTGTAA CT/-- CTGAGAGGAA 3070 hom 121 het 47 0 39 8 CT 2 1 150010 CASAVA_Build 18 38584804 2D CCCTGAAAAC TT/-- TTGAATCATA 3070 hom 84 het 29 0 29 2 T 4 2 150011 CASAVA_Build 18 38590858 2I GTAAAAATAG --/AA AAAAAAAACT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 8 10 150012 CASAVA_Build 18 38607120 6D AATAAATATT TATGTG/------ TATGTAAATA 3070 hom 78 het 28 0 27 4 TATGTG 1 0 150013 CASAVA_Build 18 38612658 2I ATCCTTTCTC --/TT GAGTCCTAGC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 0 2 150014 CASAVA_Build 18 38615162 5I ATGTATTGTA -----/GTATG TAAGGAGTAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 GTATG 0 1 150015 CASAVA_Build 18 38630439 7I TCCGGACACA -------/GCACTAT GCTGGGTGCT 3070 hom 75 het 26 0 25 1 GCACTAT 0 1 150016 CASAVA_Build 18 38650104 1I ATCTCCAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 13 14 150017 CASAVA_Build 18 38736574 1D ATGGGAATGG A/- AAAAAATTGG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 7 6 150018 CASAVA_Build 18 38741390 1D GACTGTTGAA G/- GGGTTGAGCA 3070 het 3070 hom 53 18 30 6 G 4 3 150019 CASAVA_Build 18 38741715 3D AGGCCAAGGC AGG/--- AGGATTCTTG 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 AGG 2 1 150020 CASAVA_Build 18 38748968 1D GAGTTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 12 11 150021 CASAVA_Build 18 38757734 1D TGCCTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 2848 het 2848 ref 39 22 9 8 A 15 14 150022 CASAVA_Build 18 38766815 1I ATTCTTCCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 9 10 150023 CASAVA_Build 18 38776067 1D TTGTTCAAGT A/- AAAAAAAAAA 1888 het 1888 ref 50 41 6 3 A 12 11 150024 CASAVA_Build 18 38779308 1D TGCATCTAGC T/- TTTTTTTTTT 1393 het 1393 ref 36 24 4 8 T 12 11 150025 CASAVA_Build 18 38782984 1I AGCTCTACTT -/C CCCATCTGTG 867 het 867 ref 37 28 3 6 C 3 4 150026 CASAVA_Build 18 38784863 1I TTAAAACATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1867 hom 26 7 11 8 A 15 16 150027 CASAVA_Build 18 38785563 1D AAGAAAAAAA T/- ATATATATAT 2106 het 2106 ref 15 9 5 2 T 1 0 150028 CASAVA_Build 18 38820331 1D AATCATTCAC A/- AAAAGGCAAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 5 4 150029 CASAVA_Build 18 38824766 1I TTTAAATATG -/A AAAAAGAGGT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 5 6 150030 CASAVA_Build 18 38826118 2D TCCATTCCTC CA/-- CTTCTTCTCC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CA 1 0 150031 CASAVA_Build 18 38835794 1D TTTTAAGCTG T/- TCTGTGTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 1 150032 CASAVA_Build 18 38836498 1I CCCTCTACCT -/A AAGCTAAAGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 2 3 150033 CASAVA_Build 18 38837218 1D CAAGCACAAC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 120 het 52 0 40 13 T 8 7 150034 CASAVA_Build 18 38846709 1D TTATAAAGTC T/- TGCACATATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 1 150035 CASAVA_Build 18 38848625 1D TTTCAAAAGC A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 7 6 150036 CASAVA_Build 18 38852324 1D CTGTTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 31 8 T 11 10 150037 CASAVA_Build 18 38859201 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2379 het 2379 ref 30 12 7 11 A 11 10 150038 CASAVA_Build 18 38866661 1I TTGCATGTAC -/T TAAATCTATC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 1 2 150039 CASAVA_Build 18 38892974 1D AGCTGCTCTT C/- CCTACTGGCC 3070 het 3070 hom 30 15 13 3 C 3 2 150040 CASAVA_Build 18 38893741 1I ATTCTTACAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 38 0 29 9 T 9 10 150041 CASAVA_Build 18 38900774 1D TGAGGTGGAG C/- TTTTAAAGAA 3070 het 3070 hom 62 21 30 11 C 1 0 150042 CASAVA_Build 18 38902748 1D TCATAAATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 351 hom 47 1 37 9 A 10 9 150043 CASAVA_Build 18 38923544 1D AATCCTAAGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 8 150044 CASAVA_Build 18 38943799 2I GATGTATGTT --/AA GACAACATTT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 0 2 150045 CASAVA_Build 18 39022424 8I AGTGGGAAAG --------/AAATGAAA AAATGAAAGT 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 AAATGAAA 1 2 150046 CASAVA_Build 18 39028028 2D CTAGGGAATC AA/-- AGTCTGAAGG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 3 1 150047 CASAVA_Build 18 39039681 1I TGCATTTTAG -/T TTTTCAATTC 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 T 4 5 150048 CASAVA_Build 18 39061330 1I TGTGATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 11 14 T 13 14 150049 CASAVA_Build 18 39063821 1D CTGCAGTTAC T/- TTTTGCACCA 3070 hom 57 het 35 0 26 10 T 5 4 150050 CASAVA_Build 18 39084642 1I AGGTCTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 15 16 150051 CASAVA_Build 18 39090374 1D ATGGAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 11 10 150052 CASAVA_Build 18 39095381 1D ACTTTTTGAT G/- GGGGTTGTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 1 G 5 4 150053 CASAVA_Build 18 39099613 1D ATGGCAGACT C/- CCCCTCCCCC 2637 hom 35 het 15 0 12 3 C 5 4 150054 CASAVA_Build 18 39102375 1D GTTCCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 13 12 150055 CASAVA_Build 18 39162297 4I TGTGTTTGTG ----/TGTT TGTTTGTGTG 3070 het 2957 hom 38 16 16 6 TGTT 1 2 150056 CASAVA_Build 18 39176343 1I TATATGGCAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 441 hom 23 1 21 1 A 8 9 150057 CASAVA_Build 18 39183395 1I AGATAAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 13 16 8 A 11 12 150058 CASAVA_Build 18 39197560 1I AAATCATGAT -/A TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 0 1 150059 CASAVA_Build 18 39208514 2D AACAAGGTAT CA/-- CACTCTGTCT 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 CA 2 1 150060 CASAVA_Build 18 39224343 4I ATTAAACACC ----/TAAG TATTAAGTTA 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 TAAG 0 1 150061 CASAVA_Build 18 39265580 1I TTTGCCAGAG -/A AATAAGTACA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 2 3 150062 CASAVA_Build 18 39270378 3I TCACTGCATC ---/ATT ATCTCTCTCA 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 ATT 0 1 150063 CASAVA_Build 18 39270757 3D TTAAGGTGTC TTT/--- TAATTTTAAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 T 4 1 150064 CASAVA_Build 18 39282623 1I CTACACCACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 A 9 10 150065 CASAVA_Build 18 39285278 1I ATACGCTACT -/A AAAAATTGAG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 5 6 150066 CASAVA_Build 18 39323086 1I GTTGGGGGGG -/A AAAATGAGTA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 4 5 150067 CASAVA_Build 18 39328968 1D CATTGATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 A 11 10 150068 CASAVA_Build 18 39331464 18D TGCCATTTTT GAGAGGGGTAAAGAACAG/------------------ GAGAAGGCTC 3070 het 3070 ref 29 21 9 7 GAGAGGGGTAAAGAACAG 1 0 150069 CASAVA_Build 18 39353849 1I CACTTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 11 12 150070 CASAVA_Build 18 39396873 4D TTAAGTTTTG ATTA/---- ATTAAAGGCG 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 ATTA 2 1 150071 CASAVA_Build 18 39419484 2D CCATGTGAAC AG/-- AGACTACAAT 3070 het 3070 hom 45 20 20 6 AG 2 1 150072 CASAVA_Build 18 39436904 1D GAATAAACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 T 10 9 150073 CASAVA_Build 18 39438391 2D AAAACAACTC CT/-- AGATTTGTTG 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 CT 1 0 150074 CASAVA_Build 18 39440263 1I AGGTCTGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 25 24 2 T 9 10 150075 CASAVA_Build 18 39455118 1I CAAAAGAAAG -/A ATTTTCCTAG 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 1 2 150076 CASAVA_Build 18 39468853 8I CTTATTCAAC --------/TCTGTATT TCTGTATTCC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 TCTGTATT 1 2 150077 CASAVA_Build 18 39476144 1I TCTGCAAATA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 7 8 150078 CASAVA_Build 18 39480320 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAGAT 2918 het 2918 ref 26 16 7 3 A 8 7 150079 CASAVA_Build 18 39497632 1D CATATGACCC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 9 8 150080 CASAVA_Build 18 39497861 1I ATTATCTGAT -/A AGTATAAAAG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 1 2 150081 CASAVA_Build 18 39499017 4I AGGTGACTAG ----/ATTA ATTAAACAAT 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 ATTA 1 2 150082 CASAVA_Build 18 39500468 1D TCTCTACAAT A/- AAAAAAAAAA 2537 het 2537 ref 24 15 7 3 A 13 12 150083 CASAVA_Build 18 39504574 2I ATAACTATTA --/TT TTTTTTTTTT 3015 het 1118 hom 22 5 9 8 T 13 15 150084 CASAVA_Build 18 39506386 3D GTCACAGGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 13 10 150085 CASAVA_Build 18 39510495 2I GTCAAGAGAA --/AT AAATAAAATG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 AT 0 1 150086 CASAVA_Build 18 39513802 6I TTAAAAACAT ------/ATATTC ATATTATTCA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 ATATTC 0 1 150087 CASAVA_Build 18 39514195 1I GTTCTGACAA -/G GTTTGACTAT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 G 1 2 150088 CASAVA_Build 18 39516937 2D TTTCCCAGCT AG/-- AGAGAGTCTT 3070 het 3070 ref 24 11 9 6 AG 4 3 150089 CASAVA_Build 18 39517627 1D AAACTACTAG A/- AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 A 7 6 150090 CASAVA_Build 18 39521099 16D TAGGGATGTG CACACACACACACACA/---------------- CACACACACA 3070 het 1882 hom 31 6 16 15 CA 17 9 150091 CASAVA_Build 18 39521307 1I GATGGACAAA -/C TGTGATACAT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 C 0 1 150092 CASAVA_Build 18 39525136 1I AAACTGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2302 hom 18 6 10 2 A 9 10 150093 CASAVA_Build 18 39525289 13D AATGTGACAC TGGGAATTAATAG/------------- TTTAGCAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 7 TGGGAATTAATAG 1 0 150094 CASAVA_Build 18 39527134 3D AATTTAGGCC AAA/--- AATAGTAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 5 2 150095 CASAVA_Build 18 39527493 1I AGAATATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 18 18 11 T 11 12 150096 CASAVA_Build 18 39530422 1I GATAACAAAA -/T AAAATTAATA 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 T 0 1 150097 CASAVA_Build 18 39531766 1I TTGGTATTCC -/T TTTTTTTTTT 2367 het 603 hom 18 4 8 6 T 16 17 150098 CASAVA_Build 18 39533701 1D CAGAAATGGA T/- TTTTCTCATT 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 T 5 4 150099 CASAVA_Build 18 39539447 1D ATTAAAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 T 11 10 150100 CASAVA_Build 18 39541315 3D CTCTTAAAAG AAC/--- AACATTTTAG 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 AAC 2 1 150101 CASAVA_Build 18 39543977 8D TTATTTTTTA TTTTTTAT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 2505 hom 27 10 14 4 TTTTTTAT 1 0 150102 CASAVA_Build 18 39547588 2D GTTATTTGAT AA/-- GAGAGTATAT 3070 het 3070 hom 37 11 20 8 A 2 0 150103 CASAVA_Build 18 39550034 6D GGGTAAAAAA TACTAT/------ TAGATAAGAA 3070 het 3070 ref 24 11 12 4 TACTAT 1 0 150104 CASAVA_Build 18 39550976 15D CACCAACAGT CAAATAAAAAGTGGG/--------------- CAAAATATGT 3070 het 3070 ref 31 22 8 4 CAAATAAAAAGTGGG 1 0 150105 CASAVA_Build 18 39552106 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 7 8 150106 CASAVA_Build 18 39553975 1I AAACAAAACC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 A 7 8 150107 CASAVA_Build 18 39559283 3D AATAATAAAA ACT/--- ACTATGATAG 3070 het 1924 hom 15 4 8 3 ACT 2 1 150108 CASAVA_Build 18 39560541 2I CATCTCAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 2683 hom 24 8 11 5 AT 6 7 150109 CASAVA_Build 18 39561609 6D ATTAGGAGAT TTAGTA/------ TTAGTAAATA 3070 het 3070 ref 35 15 18 4 TTAGTA 2 1 150110 CASAVA_Build 18 39564707 1I GGTTATTAGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 8 9 150111 CASAVA_Build 18 39566625 1D AGGATAGAGA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 36 18 18 0 T 8 7 150112 CASAVA_Build 18 39571126 9D TTAATAATAA AGCTTTGAC/--------- AGCACGTTGA 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 AGCTTTGAC 1 0 150113 CASAVA_Build 18 39572505 3I AAAATACAAA ---/TAG TAGCACAGAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 TAG 1 2 150114 CASAVA_Build 18 39573273 1I ATAGAGAAGG -/A AAAGCACCAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 3 4 150115 CASAVA_Build 18 39577971 5D ATTAAAAAAT AAATG/----- AAAGAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 9 18 1 AAATG 1 0 150116 CASAVA_Build 18 39579543 1D TGGATGACAC A/- TCCAATTTGT 3070 het 3070 ref 51 23 17 11 A 1 0 150117 CASAVA_Build 18 39581159 1D AGATCATGCC T/- TTTGCAGGAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 4 3 150118 CASAVA_Build 18 39582316 1D GAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 13 12 4 T 1 0 150119 CASAVA_Build 18 39585885 1D AAGATGTCTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 A 8 7 150120 CASAVA_Build 18 39586884 1I ATTAAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 A 10 11 150121 CASAVA_Build 18 39591555 1D CTTCTTCCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 10 9 150122 CASAVA_Build 18 39591773 1I TATTACAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 13 14 150123 CASAVA_Build 18 39592759 2D CTAAGGTAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 248 hom 32 4 10 18 AC 9 8 150124 CASAVA_Build 18 39593983 2I AGTGTGGCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 35 1 14 20 A 10 12 150125 CASAVA_Build 18 39594188 1I AGCCAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 26 15 8 T 10 11 150126 CASAVA_Build 18 39594789 2D TTTATCAAAC AG/-- AAGTCATAAT 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 AG 1 0 150127 CASAVA_Build 18 39595327 1I CTTATTGATG -/T TATTAAAATT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 1 2 150128 CASAVA_Build 18 39599351 2D AAAAAAAAAC TT/-- ATACATGAAT 2803 het 2803 ref 26 13 8 6 T 2 0 150129 CASAVA_Build 18 39605872 1D ACAGGCTTTA C/- CCTACCATTG 3070 het 3070 hom 65 25 34 6 C 3 2 150130 CASAVA_Build 18 39607523 1I GAGGGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 10 11 150131 CASAVA_Build 18 39612356 3D CTAAAGACTT ATC/--- ATCACTGCAT 3070 het 3070 hom 46 21 23 3 ATC 2 1 150132 CASAVA_Build 18 39616053 1I AGGCCAATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 9 10 150133 CASAVA_Build 18 39616686 1D TAATTAAAGG A/- TTGTTTCAAA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 1 0 150134 CASAVA_Build 18 39621547 1I TGACTCACCT -/G ATCACGAGGT 3070 het 3070 ref 54 33 12 9 G 0 1 150135 CASAVA_Build 18 39624301 2D CACTGTTTCT GA/-- GGTACAAAAA 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 GA 1 0 150136 CASAVA_Build 18 39624699 1D AGCTTTGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 25 3 A 11 10 150137 CASAVA_Build 18 39632281 2I ATTTGGAAAC --/TT ATTAATAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 T 0 2 150138 CASAVA_Build 18 39637278 1I TCATTGTGTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 8 9 150139 CASAVA_Build 18 39641649 1I GACTGGGCAT -/C CTTGTATTTT 2888 het 2888 ref 32 20 6 7 C 1 2 150140 CASAVA_Build 18 39645295 1D AAAGCCGCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 5 T 9 8 150141 CASAVA_Build 18 39648997 1D CTAGTTCTCA G/- GCCTTTGAAC 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 G 2 1 150142 CASAVA_Build 18 39649977 3I CAAACAGACA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 AAC 3 4 150143 CASAVA_Build 18 39668975 2D TTTTTTTGAG AA/-- AAAGTCTCAC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 5 3 150144 CASAVA_Build 18 39669237 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 34 1 27 6 T 13 12 150145 CASAVA_Build 18 39675892 1I AAAAAAGGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 9 10 150146 CASAVA_Build 18 39676056 4D AGTCAATTAC ATTG/---- ATTAATATTT 3070 het 3070 ref 29 16 13 4 ATTG 1 0 150147 CASAVA_Build 18 39684710 1I TAATAGCCAC -/A TAACTGTTAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 0 1 150148 CASAVA_Build 18 39686388 1D CTTTTCTAAT G/- GTTTACATTT 3070 hom 114 het 40 0 39 2 G 2 1 150149 CASAVA_Build 18 39694517 1D AGCATTTGCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 T 9 8 150150 CASAVA_Build 18 39713183 4I TGACAGAATT ----/TAAC TATTTCAGAG 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 TAAC 0 1 150151 CASAVA_Build 18 39713701 2I AACACATTTA --/AT AGTTTCATGG 3070 het 3070 hom 56 26 26 4 AT 0 1 150152 CASAVA_Build 18 39722344 1I TTCGTTTGTC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 T 7 8 150153 CASAVA_Build 18 39724459 1I AATTTACAGG -/A AAAAAAAAAT 1865 het 1865 ref 23 11 6 6 A 9 10 150154 CASAVA_Build 18 39745067 1D TTGTGTCTCT G/- GCCAGGCTTT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 G 2 1 150155 CASAVA_Build 18 39759392 1D GTTTTTATGA T/- TTTTAAGGTT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 5 4 150156 CASAVA_Build 18 39766521 4D TGAATGATTG AAAT/---- AAATAACTAC 3070 het 3070 ref 50 25 20 8 AAAT 2 1 150157 CASAVA_Build 18 39770443 1D CTTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 A 12 11 150158 CASAVA_Build 18 39772039 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2795 hom 24 het 9 0 8 1 A 9 8 150159 CASAVA_Build 18 39772266 4D ACAAAAAAAC ACAA/---- ACAAAACTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 3 ACAA 2 1 150160 CASAVA_Build 18 39799404 3I CTTAATAAAA ---/TCT TCTTATTATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TCT 1 2 150161 CASAVA_Build 18 39799658 1D ATGGCTAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 35 0 28 7 T 12 11 150162 CASAVA_Build 18 39799837 1D GGCCCAATTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 9 8 150163 CASAVA_Build 18 39802640 1I TTCTCAAAAA -/G CTCACACACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 0 1 150164 CASAVA_Build 18 39803885 3D CTTTTCACTC TGT/--- TGTTGTTTCC 3070 hom 97 het 37 0 33 5 TGT 3 2 150165 CASAVA_Build 18 39806980 1I TCTTTCTTTC -/T TTTCTTTCTT 3070 het 190 hom 26 1 24 1 T 3 4 150166 CASAVA_Build 18 39810413 1D ATTTAAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 33 0 31 4 A 10 9 150167 CASAVA_Build 18 39811290 1D ATAAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 11 10 150168 CASAVA_Build 18 39811779 1I AATATTATCC -/A AAATCTTACA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 3 4 150169 CASAVA_Build 18 39815048 1I GGGAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 981 hom 34 4 26 4 A 11 12 150170 CASAVA_Build 18 39822658 1I TCATGGAACC -/A AAAAAAGAGC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 6 7 150171 CASAVA_Build 18 39830516 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 13 1 10 2 A 13 12 150172 CASAVA_Build 18 39838738 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACTAA 3070 het 552 hom 30 2 24 4 C 0 1 150173 CASAVA_Build 18 39842862 2I AAATCCATCT --/CA CTGACTAAAA 3070 hom 159 het 57 0 51 6 CA 0 1 150174 CASAVA_Build 18 39851045 1I GCAGTATTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 25 11 2 T 7 8 150175 CASAVA_Build 18 39854263 1I TTGTTTCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 38 1 33 4 A 11 12 150176 CASAVA_Build 18 39859113 1D TGCAGTGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 91 het 35 0 30 5 A 10 9 150177 CASAVA_Build 18 39865343 3I ACATATTCTT ---/CTC AAGCACACAC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 CTC 0 1 150178 CASAVA_Build 18 39871259 1I TGACCAGGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 9 10 150179 CASAVA_Build 18 39876594 2I ATCCAATCAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 AT 6 7 150180 CASAVA_Build 18 39881729 1D GCTGGCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 A 11 10 150181 CASAVA_Build 18 39892942 1I CTCTTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 12 13 150182 CASAVA_Build 18 39908524 1I TGAAAATTAA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 1977 hom 24 6 17 1 T 6 7 150183 CASAVA_Build 18 39915863 2D ATGGTTCATT AA/-- TGACTGGATA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 2 0 150184 CASAVA_Build 18 39942160 1D TGAATATGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 10 9 150185 CASAVA_Build 18 39947946 1I TTTTCTTTCC -/G CCCCCCCGCC 2890 het 1724 hom 18 8 8 2 G 0 1 150186 CASAVA_Build 18 39951455 2D TCTAGGTTTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 15 14 9 AC 8 7 150187 CASAVA_Build 18 39952991 1D CTGTCACTTT A/- AAAAAAAAAA 2638 het 759 hom 27 8 10 9 A 15 14 150188 CASAVA_Build 18 39961374 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1664 hom 24 6 15 3 A 12 11 150189 CASAVA_Build 18 39980208 2D CAGATTAGAC AT/-- TGCTAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 AT 1 0 150190 CASAVA_Build 18 39991708 1I CTTAACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 10 11 150191 CASAVA_Build 18 39994700 1I ATTCACTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 11 12 150192 CASAVA_Build 18 40002318 1D TTATTAGAGG C/- CTTATTCATG 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 C 2 1 150193 CASAVA_Build 18 40004694 2D TGTTTCCTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 53 14 23 16 TG 9 8 150194 CASAVA_Build 18 40018113 1I CATAGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 A 13 14 150195 CASAVA_Build 18 40022111 1D GGAGGGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 10 9 150196 CASAVA_Build 18 40040167 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 9 10 150197 CASAVA_Build 18 40040309 1D ACACGGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 18 20 9 A 10 9 150198 CASAVA_Build 18 40064822 9D GTATTTTACA TGCATAAAG/--------- TGCATAAAGT 3070 het 3070 ref 56 34 17 9 TGCATAAAG 2 1 150199 CASAVA_Build 18 40066731 4D TTGTCATGTC ATAA/---- ACTGCCAAAG 3070 het 3070 hom 37 12 20 6 ATAA 1 0 150200 CASAVA_Build 18 40078192 1D TTGCTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 A 10 9 150201 CASAVA_Build 18 40081258 10I TCAGGAAAAA ----------/CAAAGAAACC CTCAGGGGAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 CAAAGAAACC 0 1 150202 CASAVA_Build 18 40086840 1D GGTCCTGGAC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 8 7 150203 CASAVA_Build 18 40092993 1I CTGACCTAGG -/A ACATATCATT 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 A 1 2 150204 CASAVA_Build 18 40100129 1D AATATCTGAT A/- AAAAAATGAG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 7 6 150205 CASAVA_Build 18 40107548 4D AACCAATATT TTTG/---- TTTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 TTTG 2 1 150206 CASAVA_Build 18 40120887 2D TATAAATGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 4 A 14 12 150207 CASAVA_Build 18 40141530 4I TCTTGTTGAG ----/TTAT TTGAGTTAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTAT 0 1 150208 CASAVA_Build 18 40147367 3I AGTCAGAAAT ---/ATC ATACATAACT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 ATC 0 1 150209 CASAVA_Build 18 40160529 1D GGCAATGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 12 11 150210 CASAVA_Build 18 40177685 2D GTATGAAACA CT/-- CTTCTTCTTC 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 CT 2 1 150211 CASAVA_Build 18 40192713 1D AATGGCATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 45 16 17 12 T 9 8 150212 CASAVA_Build 18 40221208 4D TTAAATTTTT TTTG/---- TTTGTTTCAA 3070 het 3070 ref 31 15 15 2 TTTG 2 1 150213 CASAVA_Build 18 40221382 1I TGCCAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2298 hom 35 10 17 8 A 13 14 150214 CASAVA_Build 18 40224430 1D GGAAGAAGAT A/- TTTAAAGTCT 3070 het 3070 hom 45 14 22 9 A 1 0 150215 CASAVA_Build 18 40225654 2D CCAATTTGTC TA/-- TGTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 TA 1 0 150216 CASAVA_Build 18 40236510 1I GTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1362 het 1362 ref 40 29 4 7 T 10 11 150217 CASAVA_Build 18 40249476 1I TACCATATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 A 10 11 150218 CASAVA_Build 18 40262279 7D AGCATTGTTT CATATGC/------- TTATTTGCCA 3070 het 3070 ref 36 22 10 7 CATATGC 1 0 150219 CASAVA_Build 18 40284716 1D TTCTTCGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 T 11 10 150220 CASAVA_Build 18 40289788 1D GTGTCAGTTT G/- GGCTGAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 G 3 2 150221 CASAVA_Build 18 40294377 21D TGCAGCCTAG ATAAAGAGATAGTTTTATAAA/--------------------- AAATATCTTC 3070 het 3070 ref 46 25 17 10 ATAAAGAGATAGTTTTATAAA 1 0 150222 CASAVA_Build 18 40295542 1D TTGTAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 A 10 9 150223 CASAVA_Build 18 40300386 3D GGGGACCAAA GAG/--- GAGGGTGGAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 GAG 2 1 150224 CASAVA_Build 18 40308584 1D GAAGGAAAAG A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 36 13 21 4 A 7 6 150225 CASAVA_Build 18 40308888 1I AATGGCAATT -/C TGAAACTTTC 3070 hom 131 het 49 0 43 6 C 0 1 150226 CASAVA_Build 18 40312078 1D AAGAGCCCCC T/- ATCACACAGG 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 T 1 0 150227 CASAVA_Build 18 40318122 1I TTTCTATTCC -/T TTTTTTGCAA 3070 het 2781 hom 24 7 12 5 T 6 7 150228 CASAVA_Build 18 40325673 1D ATTATAGGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 9 8 150229 CASAVA_Build 18 40332509 1D CTAGGTCCTG A/- CTTTCTCACT 3070 het 3070 hom 52 21 28 6 A 1 0 150230 CASAVA_Build 18 40341140 1I GCTACATTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 8 9 150231 CASAVA_Build 18 40343742 1I CATTTTCGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 20 15 17 T 10 11 150232 CASAVA_Build 18 40345720 2I ATTTTTTTAA --/AT ATGTTTGGTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AT 1 2 150233 CASAVA_Build 18 40349739 1I AAAAAAAAAA -/C CTCAAAACTG 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 C 1 2 150234 CASAVA_Build 18 40375878 1I TCCTCAGTAC -/A ATGTTGTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 1 2 150235 CASAVA_Build 18 40388350 4I AGTCCTAGAT ----/TAGC TAGCATTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 TAGC 1 2 150236 CASAVA_Build 18 40394793 1D CTTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 43 2 30 11 T 16 15 150237 CASAVA_Build 18 40407673 1D TCCTAACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1543 hom 19 5 12 3 A 13 12 150238 CASAVA_Build 18 40412748 1D GATTGCCCAT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 A 8 7 150239 CASAVA_Build 18 40414159 1D CCAGGAAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 10 9 150240 CASAVA_Build 18 40416827 3I GCTACACAAC ---/CTT CTGTTATTTA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 CTT 0 1 150241 CASAVA_Build 18 40438178 7I AAACTGACTG -------/AGCTGTT AGCTGTTAGT 3070 het 3070 ref 53 24 22 7 AGCTGTT 1 2 150242 CASAVA_Build 18 40442351 1D AGATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 17 12 T 12 11 150243 CASAVA_Build 18 40451200 11I ATTAAAAATT -----------/CTTAGACATGA ATTAGACATG 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 CTTAGACATGA 0 1 150244 CASAVA_Build 18 40456884 1D ATCTTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2792 hom 25 7 14 4 T 11 10 150245 CASAVA_Build 18 40458612 1I AATATTTGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 9 10 150246 CASAVA_Build 18 40458643 1I GATAACATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 872 hom 26 3 8 15 A 11 12 150247 CASAVA_Build 18 40497629 13D TTACTGTAGT CTTCAGCAGTAGG/------------- CTTCTGGGAG 3070 het 3070 ref 44 22 20 6 CTTCAGCAGTAGG 1 0 150248 CASAVA_Build 18 40497927 7I TGCCAGGCTG -------/GAGTGCA GAGTGCAGTG 3070 het 3070 hom 19 7 9 4 GAGTGCA 1 2 150249 CASAVA_Build 18 40501203 1D CTGCTTAGCC A/- GCAAAGTCAT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 1 0 150250 CASAVA_Build 18 40501406 1D AGGTCTCTTT C/- CCCCCCAAGG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 C 7 6 150251 CASAVA_Build 18 40554870 1D TCCAACCCCC A/- CCCCCCACCC 1065 hom 7 het 6 0 3 3 A 1 0 150252 CASAVA_Build 18 40570185 1I CCTTCTCTAT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 7 8 150253 CASAVA_Build 18 40590180 1D ACTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 36 1 20 15 A 15 14 150254 CASAVA_Build 18 40604785 1D AAGAAAAGTT G/- GATTCCAGAA 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 G 2 1 150255 CASAVA_Build 18 40608867 1D TTACTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 T 12 11 150256 CASAVA_Build 18 40612892 7D TCAGAGCCTT CGAGCTG/------- CGAGCTGAGC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 CGAGCTG 2 1 150257 CASAVA_Build 18 40616276 1D AAATAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 43 2 35 6 T 12 11 150258 CASAVA_Build 18 40624806 4I AAGCCTAAAC ----/TTTG TTTGGGGAGA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 TTTG 1 2 150259 CASAVA_Build 18 40628230 11I GATACAGCTG -----------/TTTGAAAAAAA TATTCTTAAA 3070 het 3070 hom 59 22 29 8 TTTGAAAAAAA 0 1 150260 CASAVA_Build 18 40648951 3D TCCCTCTAAT ATC/--- ATAAGCATAT 3070 het 3070 ref 59 33 22 8 ATC 1 0 150261 CASAVA_Build 18 40653918 1D CATTCTTTAC A/- AAAAAAAAAG 386 het 386 ref 51 42 2 7 A 10 9 150262 CASAVA_Build 18 40672797 1I ACCCCCTCAG -/C CCCCACCCCA 3070 hom 72 het 28 0 21 7 C 4 5 150263 CASAVA_Build 18 40673051 1D AAAAAAAAAA C/- CCAGCCTTCT 3070 het 528 hom 24 3 18 3 C 3 2 150264 CASAVA_Build 18 40678317 2D CACACGCGCG CA/-- CACACACACA 3070 het 1905 hom 27 8 13 7 CA 9 8 150265 CASAVA_Build 18 40691518 1I TGGGCCCTTC -/A TTTGTGCTAT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 A 0 1 150266 CASAVA_Build 18 40699725 1D AGAAAGGCAA G/- GGGGTTGTGA 3070 hom 105 het 38 0 33 5 G 5 4 150267 CASAVA_Build 18 40710669 4I CGGTTCTCTC ----/TCTT ACTCTTCCTT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 TCTT 0 1 150268 CASAVA_Build 18 40712297 1I TTTTCATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 10 11 150269 CASAVA_Build 18 40725606 1I TCTATTCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 9 10 150270 CASAVA_Build 18 40736196 2D TCTCTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 2060 hom 32 9 14 9 TC 10 9 150271 CASAVA_Build 18 40754808 1I AGCTACTGGC -/T ATCGGCATAG 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 0 1 150272 CASAVA_Build 18 40757141 16D AACATAGAGA GATGAAGTGACTCACT/---------------- GAGGGTCAAA 3070 het 3070 ref 57 33 24 5 GATGAAGTGACTCACT 1 0 150273 CASAVA_Build 18 40760730 2D CAAACAAACA AC/-- AACAACAACA 1583 het 992 hom 38 5 9 25 AC 1 0 150274 CASAVA_Build 18 40769066 4I CACAAGGCCA ----/GCCT GTCATCCTGG 3070 hom 120 het 43 0 39 4 GCCT 0 1 150275 CASAVA_Build 18 40779508 4D CATGAATTTC ACAA/---- ACAATCAACT 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 ACAA 2 1 150276 CASAVA_Build 18 40791346 1D TCAGATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 16 17 10 A 12 11 150277 CASAVA_Build 18 40798555 1D TTATTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2847 hom 31 9 19 3 A 13 12 150278 CASAVA_Build 18 40847993 1D TGTTCGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 A 11 10 150279 CASAVA_Build 18 40855810 1D TCTTCTGAGC A/- AAAAACATAA 3070 het 3070 hom 46 20 23 6 A 6 5 150280 CASAVA_Build 18 40874287 3I CTTGATGGAT ---/TAG TAGTAGCACC 3070 het 3070 ref 52 22 23 7 TAG 2 3 150281 CASAVA_Build 18 40885998 1I TGATTTCAAG -/T TAAGTCAGCT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 1 2 150282 CASAVA_Build 18 40887729 1I CTTCCCTCTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 8 9 150283 CASAVA_Build 18 40914132 1D TTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1741 het 26 hom 10 1 6 3 T 12 11 150284 CASAVA_Build 18 40919731 4D ACCATCATAG GACA/---- GACACAGTGA 3070 het 3070 ref 40 20 17 4 GACA 2 1 150285 CASAVA_Build 18 40927812 1D AAAATAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 13 12 150286 CASAVA_Build 18 40928272 2D TTTGTCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 A 13 11 150287 CASAVA_Build 18 40943926 1D TGAAAACATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 56 25 22 9 A 10 9 150288 CASAVA_Build 18 40958571 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 11 10 150289 CASAVA_Build 18 40959533 1D TTTTTAAAAA T/- AACATTAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 T 1 0 150290 CASAVA_Build 18 40959833 3D TTAAAGATCT TTC/--- TTCTTGTTTA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 TTC 2 1 150291 CASAVA_Build 18 40964863 1I AGGTAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 37 1 22 14 A 13 14 150292 CASAVA_Build 18 40966090 3I TTTTCAGAAA ---/AAC AACAACCCTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAC 2 3 150293 CASAVA_Build 18 40967890 2D TCGCTGTACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 18 0 9 9 T 14 12 150294 CASAVA_Build 18 40972897 1D CCAGGCTGGT C/- CGTGAACTCA 3070 hom 105 het 37 0 34 3 C 2 1 150295 CASAVA_Build 18 40973379 1I TGGACACCTA -/G GTTGATTCCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 2 150296 CASAVA_Build 18 40977628 1I TGTGAATATA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 8 9 150297 CASAVA_Build 18 40980055 4D TTTTGTATAC TTAA/---- TTTGTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 9 19 1 TTAA 1 0 150298 CASAVA_Build 18 40983210 8D TGAGCCCAGC AATATTCA/-------- AATATTCAAA 3070 hom 63 het 23 0 20 6 AATATTCA 2 1 150299 CASAVA_Build 18 40986080 2I ATTTTTAAAA --/CT CTTTTTTTGT 1114 het 822 hom 7 3 4 0 CT 1 2 150300 CASAVA_Build 18 40986460 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 2929 hom 30 het 12 0 11 1 TA 11 10 150301 CASAVA_Build 18 40986850 4I ATGTTTTCTC ----/CTGT CTGTCTGTAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 CTGT 2 3 150302 CASAVA_Build 18 40987280 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 7 6 150303 CASAVA_Build 18 40989536 1I GACTAGAAAG -/A GAACAAACTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 0 1 150304 CASAVA_Build 18 41005797 1I AAATTCTGTC -/A TGAATCACTC 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 A 0 1 150305 CASAVA_Build 18 41009380 1I GAAAACGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 9 10 150306 CASAVA_Build 18 41011219 1I CTAGCTGGTC -/T AACTGTGTCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 0 1 150307 CASAVA_Build 18 41012750 3D TTGCAAAAGA TTC/--- TTCAACTTAC 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 TTC 2 1 150308 CASAVA_Build 18 41015763 5D AGAAAAACAG TTTAC/----- TTTAATATAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 5 TTTAC 1 0 150309 CASAVA_Build 18 41016041 5D TAAGCAATAA GAAAT/----- GAAAGTAATT 3070 het 3070 hom 23 10 13 1 GAAAT 1 0 150310 CASAVA_Build 18 41017609 4I TTCTTTTCCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 101 het 36 0 34 2 TTTC 2 3 150311 CASAVA_Build 18 41023682 1D AAGCAGTGCC T/- TAGTGGCATA 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 T 2 1 150312 CASAVA_Build 18 41032832 1D GAGAAGCATA T/- TTTCTCAATT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 4 3 150313 CASAVA_Build 18 41033126 1I AAGCTGCCAA -/C CCAGATTGAT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 C 2 3 150314 CASAVA_Build 18 41040394 2I ACACACACGT --/AC ACACACACAC 2459 het 2459 ref 40 19 8 13 AC 8 9 150315 CASAVA_Build 18 41042991 2D ACAGGCATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1709 hom 19 7 10 2 A 14 12 150316 CASAVA_Build 18 41047680 1D ACATGCTATT A/- AAAACCAGTC 3070 het 3070 hom 52 23 22 8 A 5 4 150317 CASAVA_Build 18 41049806 2I TATAATGGTA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 19 17 13 T 9 11 150318 CASAVA_Build 18 41050677 1D TCTTGGACAT A/- GGGGGGCCGA 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 A 1 0 150319 CASAVA_Build 18 41051291 1D ATGTATATAT A/- ATGTACATAT 2639 het 2639 ref 15 8 6 1 A 2 1 150320 CASAVA_Build 18 41052860 1I TTGCTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 2073 het 2073 ref 25 11 7 7 A 13 14 150321 CASAVA_Build 18 41053462 3D TAGAGAGTAA GAG/--- GAGGTGAAAG 3070 het 3070 hom 50 17 25 9 GAG 2 1 150322 CASAVA_Build 18 41054074 20I GACTTAGATC --------------------/ACATTATTGGATTAAAAAAA TGATATTGCT 3070 het 3070 ref 57 32 18 7 ACATTATTGGATTAAAAAAA 0 1 150323 CASAVA_Build 18 41056653 1D TCAGGTCTGC A/- AAAGATCACC 3070 het 3070 ref 67 33 29 6 A 4 3 150324 CASAVA_Build 18 41060766 3I CTAGAACTTA ---/AAT AATAATAATA 2150 het 2150 ref 12 5 5 2 AAT 5 6 150325 CASAVA_Build 18 41061858 7I TTAATTTGCT -------/AAATTTC AAAGTATTTA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 AAATTTC 0 1 150326 CASAVA_Build 18 41063831 1D ATGATTAAAA G/- TGTAAGTTCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 G 1 0 150327 CASAVA_Build 18 41066000 1D TTGCAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 22 21 9 A 12 11 150328 CASAVA_Build 18 41072533 1I TTTAATGGGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 7 8 150329 CASAVA_Build 18 41116798 12I CTCCCTTCCT ------------/TTCTTTTCTTCC TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 TTCTTTTCTTCC 0 1 150330 CASAVA_Build 18 41129266 1D TTTTAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 2767 het 2767 ref 37 24 7 6 T 12 11 150331 CASAVA_Build 18 41130776 5D AATGTATTTT TCCCA/----- GGGTAGCCGT 870 het 870 ref 35 23 3 10 TCCCA 1 0 150332 CASAVA_Build 18 41131629 1I GGCTCACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 A 10 11 150333 CASAVA_Build 18 41134348 4I CAGAGCCTGC ----/TCTG TCTATCTCAA 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 TCTG 0 1 150334 CASAVA_Build 18 41143516 2D AAATCAACCC CT/-- GACTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 CT 1 0 150335 CASAVA_Build 18 41161211 1D AATTAGTATA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 8 7 150336 CASAVA_Build 18 41169441 5D TGAGAATGCA AAGTG/----- AAGTGTTTTG 3070 hom 139 het 49 0 46 3 AAGTG 2 1 150337 CASAVA_Build 18 41195765 1I CTTGCAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 22 7 T 11 12 150338 CASAVA_Build 18 41196879 1I TCCCCCATGC -/T TAGGGACAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 150339 CASAVA_Build 18 41210024 1D TTGGGCCACA C/- CCCCGACATG 3070 hom 105 het 41 0 34 7 C 5 4 150340 CASAVA_Build 18 41212189 3I TAGCATAGTG ---/CCT TAAAGGCTCC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CCT 0 1 150341 CASAVA_Build 18 41260508 2D GAGATCAGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 54 het 36 0 19 18 TG 10 9 150342 CASAVA_Build 18 41270761 1I GATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 9 10 150343 CASAVA_Build 18 41330095 3D TGATCCCTAA TAG/--- TAGCGGCAAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 TAG 2 1 150344 CASAVA_Build 18 41337789 5D8M23I TAATTATCCC TGAATTATCAAAG-----------------------/-----CATCAAAGACCGTGTTCTCATGATGCTTCCC ATACCACTGG 3070 hom 129 het 40 0 41 3 N/A 0 0 150345 CASAVA_Build 18 41345061 1I TTTATTGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 113 het 43 0 38 5 T 9 10 150346 CASAVA_Build 18 41352630 4D GGCCACTGAT AGTC/---- AGGGATAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 6 AGTC 1 0 150347 CASAVA_Build 18 41357156 6D AAGAAAGTTC CTCCAG/------ CTCCAGCCCC 3070 hom 74 het 29 0 24 6 CTCCAG 2 1 150348 CASAVA_Build 18 41392614 1I AAAGTCAGGT -/G TGGGTCACCT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 0 1 150349 CASAVA_Build 18 41395882 4I TTTCTTTATT ----/TAAC TAACTGCTCT 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 TAAC 1 2 150350 CASAVA_Build 18 41413070 1I CAAGGCCTTT -/G GGGGACTAGA 3070 hom 120 het 44 0 39 5 G 4 5 150351 CASAVA_Build 18 41415848 1I GCCCTCATTT -/C CCCCATTGTG 3070 hom 128 het 46 0 42 4 C 4 5 150352 CASAVA_Build 18 41419102 3D TGACACCATG TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 hom 111 het 52 0 37 15 TCC 6 5 150353 CASAVA_Build 18 41422938 1D GTTGGTGGGT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 70 het 27 0 23 4 G 9 8 150354 CASAVA_Build 18 41440580 3I GGCAAGAAAA ---/CAT CATATGCCCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CAT 1 2 150355 CASAVA_Build 18 41443331 3D TCATAACTAC ATT/--- ATTTCCCTTC 3070 het 3070 ref 56 32 20 5 ATT 2 1 150356 CASAVA_Build 18 41444181 1I ATTCTGTTAT -/G GGGGGTGGGG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 G 5 6 150357 CASAVA_Build 18 41446996 1D TCTTTGGCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 9 8 150358 CASAVA_Build 18 41462406 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 18 1 13 4 A 17 16 150359 CASAVA_Build 18 41466099 10D AGGGTGTGTG TGTGTGTGTT/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 2077 hom 48 13 22 14 TGTGTGTGTT 1 0 150360 CASAVA_Build 18 41481745 2I TTTAGGAATC --/TT TTGATTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 2 4 150361 CASAVA_Build 18 41482025 4I TGTTTCATTA ----/GTTT ATCTTTGCAT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 GTTT 0 1 150362 CASAVA_Build 18 41482705 4D ATGTAATAAC TAAT/---- ATACTAGTTT 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 TAAT 1 0 150363 CASAVA_Build 18 41483144 6I CTCAAAAACA ------/AAAAAC AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 AAAAAC 2 3 150364 CASAVA_Build 18 41484135 8D ATTTGACCTT CCATTTGA/-------- CCAGGCCAGT 3070 hom 93 het 34 0 31 6 CCATTTGA 1 0 150365 CASAVA_Build 18 41484710 1D TCTTGTTTTG T/- TTTGTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 4 3 150366 CASAVA_Build 18 41484877 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTAGCAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 5 6 150367 CASAVA_Build 18 41490294 1I AGGGCCAGTG -/A ATAAGGCCAG 3070 het 3070 ref 59 30 22 7 A 1 2 150368 CASAVA_Build 18 41502943 1D ACAGCCACTC A/- AAAAAACATT 2534 het 2534 ref 23 10 10 3 A 7 6 150369 CASAVA_Build 18 41504151 1D AAACTCAGGG C/- TTTTTCTACT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 C 1 0 150370 CASAVA_Build 18 41568400 1I TGCCTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 10 11 150371 CASAVA_Build 18 41581496 1D CTAACAATAC A/- AAAAAAAAAA 1684 het 615 hom 9 3 5 1 A 13 12 150372 CASAVA_Build 18 41597520 1D TTTCTTTGCC A/- AAAAAAAAAA 1784 het 1784 ref 29 15 9 5 A 17 16 150373 CASAVA_Build 18 41608012 3D TCCTTTGAAG TGA/--- TGATATTACA 3070 het 3070 ref 39 18 17 6 TGA 2 1 150374 CASAVA_Build 18 41616412 2I GTTCCTTGAG --/AA CAGAGACTGT 3070 het 3070 ref 56 25 22 9 A 0 2 150375 CASAVA_Build 18 41625065 2I AATGAATAAG --/AC ATAACAAATG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 AC 0 1 150376 CASAVA_Build 18 41634357 1D TCACAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2997 het 2997 ref 23 10 8 5 A 11 10 150377 CASAVA_Build 18 41642781 1I AAATACAATT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 A 6 7 150378 CASAVA_Build 18 41681956 1I AGTATAATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 9 10 150379 CASAVA_Build 18 41696568 1D TGCAACATCT C/- CCCCCTTGCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 6 5 150380 CASAVA_Build 18 41703892 1D GAGTGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 15 18 14 A 14 13 150381 CASAVA_Build 18 41729408 1D CACTCTCCAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 52 28 22 2 A 9 8 150382 CASAVA_Build 18 41738701 1D GAAAATAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 10 9 150383 CASAVA_Build 18 41747054 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 598 hom 18 4 13 1 A 14 13 150384 CASAVA_Build 18 41748934 1D TTTTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 1464 het 913 hom 12 4 5 3 A 15 14 150385 CASAVA_Build 18 41751997 1D GGATGAGGAA G/- GGTGAAGTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 G 3 2 150386 CASAVA_Build 18 41760781 1I GTCTTGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 30 1 19 10 A 12 13 150387 CASAVA_Build 18 41766705 1I AGAACATAGT -/A AGGCAGATGA 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 A 1 2 150388 CASAVA_Build 18 41769557 18D GCACACAGGC TACTAAGGCGCACACAGG/------------------ TACTAAGGCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 13 TACTAAGGCGCACACAGG 1 0 150389 CASAVA_Build 18 41770420 1D GGCTGGATGC G/- GTGGCTCACG 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 G 2 1 150390 CASAVA_Build 18 41790426 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 1033 het 1033 ref 31 20 3 9 T 13 14 150391 CASAVA_Build 18 41790864 1I GCTGTTCACT -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 6 7 150392 CASAVA_Build 18 41792434 4I TTGGCACATG ----/GACA GACAAATAGA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 GACA 1 2 150393 CASAVA_Build 18 41796032 1D TTCTTTGGGG T/- TTTTTCTCTT 3070 het 3004 hom 27 9 16 3 T 6 5 150394 CASAVA_Build 18 41801126 1D TCGGGAGGGT G/- GGGGAGATCC 3070 hom 51 het 24 0 16 8 G 5 4 150395 CASAVA_Build 18 41803424 13D TGCGCCTGTA GTCCCAGCTACTT/------------- GTCCCAGCTA 2743 het 1294 hom 15 3 7 6 GTCCCAGCTACTT 2 1 150396 CASAVA_Build 18 41812637 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 7 8 150397 CASAVA_Build 18 41812799 1I GCATGGCTAA -/T TTTTTGTATT 2512 het 2512 ref 18 9 8 1 T 5 6 150398 CASAVA_Build 18 41821462 38D GTTCAGAAGT GTAGCTCAGTCCACACTGAGATCAGGAATATGTAAGTG/-------------------------------------- GATCAACCCT 3070 het 3070 ref 38 24 13 7 GTAGCTCAGTCCACACTGAGATCAGGAATATGTAAGTG 1 0 150399 CASAVA_Build 18 41822262 8I AGCTGGGTGT --------/GGTGGTGC GGTGGTGCAT 3070 het 3070 hom 30 16 11 3 GGTGGTGC 1 2 150400 CASAVA_Build 18 41824389 4D TTGGGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 1539 het 1539 ref 24 13 6 6 TTTG 6 5 150401 CASAVA_Build 18 41824430 1I AGTTTGACTC -/T TGTCACCAGG 2188 het 2188 ref 23 10 5 8 T 1 2 150402 CASAVA_Build 18 41826177 3I CTAATAAAAA ---/AAG AAGGTCAATT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 AAG 1 2 150403 CASAVA_Build 18 41834865 4I AGCTGTGAAT ----/CAAA CAGTTAGCTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 CAAA 0 1 150404 CASAVA_Build 18 41836745 1I CATTGTGAGA -/C CCCCCCCATC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 7 8 150405 CASAVA_Build 18 41841627 5D GAGCTGCTAC TATAT/----- TATATTTTGT 3070 het 3070 hom 43 21 20 6 TATAT 2 1 150406 CASAVA_Build 18 41848279 1I AGCCACCGCA -/C CAGGCCAAAA 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 1 2 150407 CASAVA_Build 18 41849849 1D TACATTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 10 9 150408 CASAVA_Build 18 41852637 1I TTTACTGAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 T 8 9 150409 CASAVA_Build 18 41857524 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAGAAAA 3070 het 1962 hom 17 6 10 1 A 5 6 150410 CASAVA_Build 18 41863193 2D TTGAAAGAAG AT/-- AGTGAGGAGC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AT 1 0 150411 CASAVA_Build 18 41879636 8D AATAATAAAG TAAATAAA/-------- TAAATAAATA 1699 het 1699 ref 8 4 4 2 TAAA 6 4 150412 CASAVA_Build 18 41886532 1I ATGTTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 11 12 150413 CASAVA_Build 18 41908884 4D TGGCATACTC TCTT/---- TCAACTATAT 3070 het 3070 hom 25 11 13 4 TCTT 1 0 150414 CASAVA_Build 18 41910805 4I TAATCCTTGT ----/TATA TATATGATCA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 TA 2 4 150415 CASAVA_Build 18 41914606 4I GAGTCAGGGT ----/CTCA CTCTGTCACC 3070 het 3070 hom 51 21 28 2 CTCA 0 1 150416 CASAVA_Build 18 41918800 2D CTGACAGAAA AC/-- AGTTATTTCT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 AC 1 0 150417 CASAVA_Build 18 41919898 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2921 het 2921 ref 34 12 11 11 A 15 16 150418 CASAVA_Build 18 41920279 24D ATACAAATAT AGTTAATATATTAATACCTTAAGA/------------------------ TGCTAATCTA 3070 het 3070 hom 54 27 32 6 AGTTAATATATTAATACCTTAAGA 1 0 150419 CASAVA_Build 18 41930643 2D AAAAACAACA AC/-- AACAACAACG 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 AC 1 0 150420 CASAVA_Build 18 41933019 2I TTTACCTGTG --/TT TAACAAACCT 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 T 1 3 150421 CASAVA_Build 18 41933277 1D CTGGATGGGC T/- TTTTTTTTTT 1355 het 1355 ref 40 29 3 8 T 11 10 150422 CASAVA_Build 18 41938734 1D CACATCTGAA C/- TGCTTCCGCG 2333 het 2065 hom 24 10 10 4 C 1 0 150423 CASAVA_Build 18 41947476 4I TTTCTTACAA ----/TTTC TTTCTCTTCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTTC 1 2 150424 CASAVA_Build 18 41960593 1D CTATGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1783 het 1783 ref 26 9 7 10 T 14 13 150425 CASAVA_Build 18 41966541 1I CAAATATGTG -/T TATGTGGGTA 2866 het 2866 ref 19 10 6 3 T 1 2 150426 CASAVA_Build 18 41989925 1D TATTGTGTCT G/- GGGTTTCCTG 3070 het 3070 ref 37 16 14 8 G 4 3 150427 CASAVA_Build 18 42000844 1I CAAATGCGTA -/T TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 6 7 150428 CASAVA_Build 18 42006219 1D GCTTGAACTC G/- GGGGGCAGAG 2195 het 2195 ref 22 11 6 6 G 6 5 150429 CASAVA_Build 18 42015451 1I AGGCTGAGGC -/G GGCGGATCAT 3047 het 1716 hom 14 4 8 2 G 2 3 150430 CASAVA_Build 18 42021313 1I GATAACTGTC -/T TTTTTTTTTT 2646 het 1506 hom 20 5 9 6 T 11 12 150431 CASAVA_Build 18 42024647 4D GCTAATTCAT AGTA/---- AGATTATGCT 3070 het 3070 ref 33 14 14 6 AGTA 1 0 150432 CASAVA_Build 18 42038894 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1545 hom 21 7 12 2 T 11 10 150433 CASAVA_Build 18 42068519 1I ATAAAACTGC -/T TTTTTTTTTT 1829 het 1829 ref 39 26 5 8 T 12 13 150434 CASAVA_Build 18 42069870 6D GAACATACTT GAAAAG/------ GAAACTAATT 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 GAAAAG 1 0 150435 CASAVA_Build 18 42087700 3I GACAAAACAT ---/CTG CTGGCAATGC 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 CTG 1 2 150436 CASAVA_Build 18 42090380 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2284 hom 21 7 13 1 A 9 10 150437 CASAVA_Build 18 42091628 1I AGGCCAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 11 12 150438 CASAVA_Build 18 42091891 1D CAGTTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1540 hom 34 7 13 14 T 15 14 150439 CASAVA_Build 18 42099879 2D TGCCACTGAC TT/-- GGTTAAGTTT 3070 het 3070 ref 57 27 23 9 T 2 0 150440 CASAVA_Build 18 42116957 2D TGGGGAGCTT AA/-- GAGTCGCAAG 3070 het 3070 hom 34 10 16 9 A 2 0 150441 CASAVA_Build 18 42118951 1I CTTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 2957 hom 26 het 29 0 16 13 T 14 15 150442 CASAVA_Build 18 42131615 1I GTCCAGCATT -/G TTATTAACTA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 G 0 1 150443 CASAVA_Build 18 42153702 15D TTATCTTCTG CAGAGACTAGACCTC/--------------- CAGACCCCCA 3070 hom 75 het 24 0 26 3 CAGAGACTAGACCTC 1 0 150444 CASAVA_Build 18 42159367 1D AAGAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 7 T 11 10 150445 CASAVA_Build 18 42172577 1I TTAAAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 T 10 11 150446 CASAVA_Build 18 42175168 1I AGGCCTCTGG -/A AGAGTTTGGA 3070 hom 51 het 20 0 15 5 A 1 2 150447 CASAVA_Build 18 42180405 1I CTTGGGTTTA -/G GGGCCTCCTC 3070 hom 78 het 31 0 25 6 G 3 4 150448 CASAVA_Build 18 42189705 4D CTCTATCTCT CCAC/---- CCATCATGTG 3070 hom 88 het 36 0 27 10 CCAC 1 0 150449 CASAVA_Build 18 42208591 1D CCTTCTCTTT G/- TGCTCTAATT 3070 hom 69 het 26 0 23 4 G 1 0 150450 CASAVA_Build 18 42223708 1I TTTTTTTTTT -/C CAGACAAGGT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 C 1 2 150451 CASAVA_Build 18 42226533 1I ACACGGCTCA -/G GAGGAGAGGC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 1 2 150452 CASAVA_Build 18 42236293 1I CTAAATCTGA -/T TTTTCTCAAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 4 5 150453 CASAVA_Build 18 42236999 1I CGAGACTCAC -/T TTCCTTTCAG 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 T 2 3 150454 CASAVA_Build 18 42240035 2I CATACACACT --/CA CACACACTGA 3070 het 3070 ref 66 29 23 14 CA 3 4 150455 CASAVA_Build 18 42273666 1D CTTTTTTATT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 82 het 31 0 28 4 A 8 7 150456 CASAVA_Build 18 42279864 1D CTCCATATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 848 hom 38 2 29 7 T 12 11 150457 CASAVA_Build 18 42300992 1D CTCTACATAA T/- TTTTTTTTTT 2806 het 2223 hom 24 7 7 10 T 12 11 150458 CASAVA_Build 18 42305339 1D TGCTTGCCAC T/- TTTTCCCCAG 3070 het 3070 ref 40 26 11 3 T 5 4 150459 CASAVA_Build 18 42326070 1D6M6I CATGCAACTA TGAAACA------/-GGAACAGGTGGC TCTGGCAGGC 3070 het 3070 hom 38 15 19 6 N/A 0 0 150460 CASAVA_Build 18 42329409 2I AATCACCATT --/TG TGTAACCTTA 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 TG 1 2 150461 CASAVA_Build 18 42337987 1I CCTCACTAGA -/C CTCAATATTA 3070 het 3070 ref 48 24 15 9 C 1 2 150462 CASAVA_Build 18 42356905 1D TGGGGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1889 hom 28 7 9 12 T 12 11 150463 CASAVA_Build 18 42361097 1D GAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 26 10 10 A 13 12 150464 CASAVA_Build 18 42368770 1D AGTTCTGGCT G/- TGCCATGCTC 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 G 1 0 150465 CASAVA_Build 18 42373422 2D ACTCTCTCTT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 119 hom 20 2 9 9 A 10 8 150466 CASAVA_Build 18 42379907 1D CTAAGAATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 150467 CASAVA_Build 18 42383316 3I AAAATGGAAT ---/GAG GAGATTGCAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 GAG 1 2 150468 CASAVA_Build 18 42399222 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 11 10 150469 CASAVA_Build 18 42403059 2I CCTGCGTTCA --/GT GTCTCCTTCT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 GT 1 2 150470 CASAVA_Build 18 42412510 1D GCTCAGATTA T/- TTTTTGCCAC 3070 hom 108 het 40 0 34 6 T 6 5 150471 CASAVA_Build 18 42417808 2D GTATATATCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 36 1 33 3 A 12 10 150472 CASAVA_Build 18 42420393 2D ATAGCTGTTG TT/-- TTTTTTGTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 6 150473 CASAVA_Build 18 42420584 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 5 4 150474 CASAVA_Build 18 42424844 6D ATATTCTTCA TTCTTC/------ TTAAGAATGA 3070 hom 120 het 42 0 41 4 TTC 2 0 150475 CASAVA_Build 18 42426241 1I AGAATGCAAG -/C CCCCCCAAAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 6 7 150476 CASAVA_Build 18 42427160 1D GCTGAATTTT A/- AAAAAAGTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 7 6 150477 CASAVA_Build 18 42430183 1D ACTAGGTAGT C/- CAGAACTAGG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 C 2 1 150478 CASAVA_Build 18 42432471 1I TTTGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 31 1 22 8 A 11 12 150479 CASAVA_Build 18 42464732 1D AAGTGGGTAT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 hom 35 16 12 7 G 9 8 150480 CASAVA_Build 18 42471122 4D CAAAAACAGG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 41 9 18 16 AAAC 4 3 150481 CASAVA_Build 18 42476409 1I GGCCTTCTTG -/C CCACTCCCCA 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 C 2 3 150482 CASAVA_Build 18 42484665 4D GTGTGAGGGA GAAT/---- GGGGGAGGAA 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 GAAT 1 0 150483 CASAVA_Build 18 42496185 1I CCTATGATCA -/T AAAACTCTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 1 150484 CASAVA_Build 18 42505359 2I GTCCTGGTGC --/TG TGTGTTTCCT 3070 hom 149 het 55 0 49 6 TG 2 3 150485 CASAVA_Build 18 42528798 1I TCCATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 11 12 150486 CASAVA_Build 18 42540407 4I TCACTGTCTC ----/TTAG TTAGAGCAAA 3070 hom 69 het 25 0 22 3 TTAG 1 2 150487 CASAVA_Build 18 42544241 3I GGCATCAGTT ---/CTC CTCTCCCTGC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 CTC 1 2 150488 CASAVA_Build 18 42544621 1I CCCGAAGAGG -/C CTCCTTTCAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 1 2 150489 CASAVA_Build 18 42549515 1D AAGTGATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 39 0 28 11 T 15 14 150490 CASAVA_Build 18 42552433 4D TAGCTCACAC CTTT/---- CTAATTCAGC 3070 hom 87 het 34 0 30 6 CTTT 1 0 150491 CASAVA_Build 18 42563354 24I GTGGGTGCCT ------------------------/TGAGGTTCCAGAACTATGGGATCC TGAACTCCAC 3070 hom 50 het 18 0 17 1 TGAGGTTCCAGAACTATGGGATCC 0 1 150492 CASAVA_Build 18 42563826 1D CAGGTGGGGT C/- CTCGGAAGAG 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 C 2 1 150493 CASAVA_Build 18 42566859 2I CGGGAGGGCT --/GC GGTGGAAGTG 3070 hom 80 het 32 0 26 6 GC 0 1 150494 CASAVA_Build 18 42569741 1D ACCTGGATAA T/- TTTTTTTTTT 1293 het 1293 ref 31 23 3 5 T 13 12 150495 CASAVA_Build 18 42572213 1I TAGAAATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 662 hom 29 3 12 14 A 14 15 150496 CASAVA_Build 18 42580735 1I AATCCTAAGC -/A AAAAAAAAAC 2208 het 1672 hom 18 5 6 7 A 9 10 150497 CASAVA_Build 18 42582690 1I GCTATAATCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 9 10 150498 CASAVA_Build 18 42604964 3D ACAGTCTATC CTT/--- CTTTTCAGGA 3070 het 3070 hom 37 19 18 0 CTT 2 1 150499 CASAVA_Build 18 42605645 2I GAGGCACCTC --/AG GGGGAATCAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 AG 0 1 150500 CASAVA_Build 18 42609002 1D AATCTTTGAG A/- ATTGTTTTGC 3070 het 3070 hom 35 13 19 6 A 2 1 150501 CASAVA_Build 18 42619342 1I ACTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 752 hom 29 3 18 8 A 13 14 150502 CASAVA_Build 18 42619851 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 23 4 15 4 T 11 12 150503 CASAVA_Build 18 42640997 16D GAAAACAGGC AATGTTTGCCTGTTTT/---------------- TATAGCTTTT 3070 hom 81 het 27 0 27 3 AATGTTTGCCTGTTTT 1 0 150504 CASAVA_Build 18 42644150 1I CAGAAAATAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 679 hom 30 2 23 5 A 9 10 150505 CASAVA_Build 18 42667983 1D CTTAATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 132 het 55 0 44 11 T 12 11 150506 CASAVA_Build 18 42678104 1I AAAAGAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 35 0 25 10 A 11 12 150507 CASAVA_Build 18 42713347 1I TGGTCACTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 9 10 150508 CASAVA_Build 18 42722325 1I AAAATCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 29 1 26 2 T 12 13 150509 CASAVA_Build 18 42726868 1I TCAGTGGGAT -/A TTTTTTTATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 150510 CASAVA_Build 18 42733817 2I ATGAAGTAAC --/AG TATCAAATTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 AG 0 1 150511 CASAVA_Build 18 42734637 1I ACCTCATCTG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 7 8 150512 CASAVA_Build 18 42742503 1D GAGAAAAGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 10 9 150513 CASAVA_Build 18 42767737 1D ATCCCCTAAT G/- GCTATCCCTC 983 het 183 hom 5 1 3 1 G 2 1 150514 CASAVA_Build 18 42773300 1D TCTCACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 32 1 24 7 A 14 13 150515 CASAVA_Build 18 42776160 5D TAATACAGCC TTTTG/----- TTTTGTTCTC 3070 hom 60 het 27 0 21 8 TTTTG 2 1 150516 CASAVA_Build 18 42787718 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 29 0 24 5 A 11 10 150517 CASAVA_Build 18 42840367 1I GTTCTCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1534 hom 32 7 12 13 T 15 16 150518 CASAVA_Build 18 42856815 1D AGCCCACCCT C/- ATAGTCACTC 3070 hom 105 het 42 0 34 9 C 1 0 150519 CASAVA_Build 18 42883892 1I TCTAAGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 28 1 18 9 T 13 14 150520 CASAVA_Build 18 42894120 1D CTGAAGAAAG T/- TTTTTTTTTT 1205 het 1205 ref 36 22 3 11 T 11 10 150521 CASAVA_Build 18 42908425 2I CAATATGCAA --/AG AAAGGGAAGA 3070 hom 169 het 59 0 57 2 AG 0 1 150522 CASAVA_Build 18 42919673 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1317 hom 10 het 4 0 4 0 A 13 12 150523 CASAVA_Build 18 42921212 1I CTAAAATAAG -/A AAAAATAGAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 5 6 150524 CASAVA_Build 18 42922026 1D TAGTTTGTTG C/- TAAAATTGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 1 0 150525 CASAVA_Build 18 42922648 1I TTCATTTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 12 13 150526 CASAVA_Build 18 42928356 12D TTGTTTTTTC TTTCTTTTTTTT/------------ TTTTTTTGGA 3070 het 1766 hom 36 9 21 7 TTTCTTTTTTTT 1 0 150527 CASAVA_Build 18 42932185 1I GTGTAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 31 2 16 13 T 15 16 150528 CASAVA_Build 18 42934006 2D AAGTAATAAC AT/-- GTGGTATTTG 3070 hom 69 het 26 0 22 4 AT 1 0 150529 CASAVA_Build 18 42935803 1I TACGCTGTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 8 9 150530 CASAVA_Build 18 42942787 2D GAAATGGAGA CT/-- CTAAGGAAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 CT 2 1 150531 CASAVA_Build 18 42951442 1I TTGTTGAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 35 3 28 4 T 10 11 150532 CASAVA_Build 18 42955850 1I TTTTGTTTTG -/T TTAGACGGAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 2 3 150533 CASAVA_Build 18 42956944 1D ATCCCAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 22 0 18 4 T 13 12 150534 CASAVA_Build 18 42969165 77D CCATCATCAT GAAATTTCAAAGCATCTTATTAAAGAGAAGATGCTGAAAGCTTCAAAGGGGGAAAAATGTTATCTATAAAGAAATAA/----------------------------------------------------------------------------- GAAATCAACT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 GAAATTTCAAAGCATCTTATTAAAGAGAAGATGCTGAAAGCTTCAAAGGGGGAAAAATGTTATCTATAAAGAAATAA 1 0 150535 CASAVA_Build 18 42995364 1I ACTGGAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 36 0 27 9 A 11 12 150536 CASAVA_Build 18 42999768 1D CATCTTCCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 10 9 150537 CASAVA_Build 18 43004990 1I ACCATTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 12 13 150538 CASAVA_Build 18 43020352 1I GCTTTTTTTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 55 25 21 9 A 7 8 150539 CASAVA_Build 18 43022008 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 10 9 150540 CASAVA_Build 18 43026367 4I3M2I TTCAGTTGGT ----ACT--/GGAGACTGA TTTCCGAGAA 3070 het 3070 ref 48 28 16 5 N/A 0 0 150541 CASAVA_Build 18 43077605 2I TATATACGTA --/TG TGTGTCCACA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 TG 2 3 150542 CASAVA_Build 18 43081316 2I AATGAGGCAT --/TA AATTTACATA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 TA 0 1 150543 CASAVA_Build 18 43090365 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAACAT 593 het 593 ref 38 29 3 6 A 8 7 150544 CASAVA_Build 18 43155634 1D AATATGGAAG C/- TCTGAAAGGA 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 C 1 0 150545 CASAVA_Build 18 43199931 1I ATACCTGCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 54 hom 33 1 22 10 A 9 10 150546 CASAVA_Build 18 43200745 1I TCTTGCCCAA -/C CCCCTCTTCT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 4 5 150547 CASAVA_Build 18 43208887 1I TTTGTGGTGG -/A AATGCTCCTC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 2 3 150548 CASAVA_Build 18 43212211 4I TGAAACACAA ----/TAGT TACTCAGTAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TAGT 0 1 150549 CASAVA_Build 18 43238548 1D AATGACAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 11 10 150550 CASAVA_Build 18 43248997 1D GTAGGTACTT A/- AGAGTATGGT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 2 1 150551 CASAVA_Build 18 43284339 1D CCCAGCCCCA G/- GGGAATAAAT 3070 hom 90 het 37 0 30 8 G 4 3 150552 CASAVA_Build 18 43293137 1I CCATATTTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 41 0 35 6 T 8 9 150553 CASAVA_Build 18 43294800 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 19 2 15 4 A 13 12 150554 CASAVA_Build 18 43296980 1I ATTTCATTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 375 hom 29 1 26 2 A 9 10 150555 CASAVA_Build 18 43300739 3D CCTCAGAGAA CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 hom 74 het 28 0 20 8 C 14 11 150556 CASAVA_Build 18 43303152 1I TATTTTTTTT -/A ATCCCCTACA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 1 2 150557 CASAVA_Build 18 43306490 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2526 hom 36 het 14 0 10 4 T 13 12 150558 CASAVA_Build 18 43307164 4D TGTTTTTCGC GGGG/---- GGGGGGGGGG 1116 het 45 hom 13 1 6 6 G 15 11 150559 CASAVA_Build 18 43317336 4I ACATCCCCTT ----/TGAA TGGCTAAAAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TGAA 0 1 150560 CASAVA_Build 18 43319193 1I AACAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 10 11 150561 CASAVA_Build 18 43325193 1D ACCCTATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 943 hom 50 4 29 19 A 13 12 150562 CASAVA_Build 18 43326910 4D TGGCTGGAAG AGGC/---- AGGCATTGGA 3070 hom 130 het 49 0 41 13 AGGC 2 1 150563 CASAVA_Build 18 43329618 1I CCCAAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 53 1 38 14 A 10 11 150564 CASAVA_Build 18 43332947 2I TATTTACTTC --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 141 het 50 0 47 3 CT 5 6 150565 CASAVA_Build 18 43347895 1I TTTTCGTGAA -/C CCATCCTCAT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 C 2 3 150566 CASAVA_Build 18 43351256 3D TTTCTTTGAA AAG/--- AAGGTTTCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AAG 2 1 150567 CASAVA_Build 18 43353184 4I TACAGTATTA ----/AAAT AAATCTCATC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AAAT 1 2 150568 CASAVA_Build 18 43358866 1I AGTTTTGTAG -/A AAATAATATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 4 150569 CASAVA_Build 18 43370422 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 27 1 15 13 A 13 12 150570 CASAVA_Build 18 43374647 2D ATTTTTCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2029 hom 33 het 32 0 14 18 T 18 16 150571 CASAVA_Build 18 43405631 1I TTGGTAGCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 A 9 10 150572 CASAVA_Build 18 43434148 1D ATTCATCTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 91 het 38 0 31 7 T 9 8 150573 CASAVA_Build 18 43435888 7D TTTCAACCTC CCTGACT/------- CCTGACTCCA 3070 hom 103 het 38 0 32 10 CCTGACT 2 1 150574 CASAVA_Build 18 43436667 4D TTCTATGCCC CAGA/---- CAAAGTATTG 3070 hom 114 het 39 0 39 0 CAGA 1 0 150575 CASAVA_Build 18 43470157 1D ACTGCGCAAG T/- TTCACAGCAG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 3 2 150576 CASAVA_Build 18 43479913 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 13 10 3 A 14 13 150577 CASAVA_Build 18 43482271 5D AAAGAAAAAA GAAGG/----- GAAGGGAAGG 1769 het 1724 hom 21 4 6 13 GAAGG 4 3 150578 CASAVA_Build 18 43490529 1D CTAAAAGAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 45 29 11 7 A 9 8 150579 CASAVA_Build 18 43498875 3D CATGGCATTG CCT/--- TCTTCTTGGA 3070 hom 91 het 35 0 31 4 CCT 1 0 150580 CASAVA_Build 18 43501928 8D GGAGGAAGAC AGGGAGGA/-------- AGACAGGGAG 2040 het 2040 ref 20 10 6 5 AGGGAGGA 1 0 150581 CASAVA_Build 18 43515364 3D CCACCTCCCC CAG/--- CAGCGCCCAC 3070 hom 62 het 25 0 19 7 CAG 2 1 150582 CASAVA_Build 18 43524652 1I TGTATTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 10 11 150583 CASAVA_Build 18 43530841 1I ATGCACACAT -/G CTCATATATA 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 G 0 1 150584 CASAVA_Build 18 43543283 1I CAATAGCTGC -/A AAAAAAAAAA 1307 het 1307 ref 30 8 6 16 A 17 18 150585 CASAVA_Build 18 43547237 4D GTGCTGGAAC AACT/---- AACTGGACAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 AACT 2 1 150586 CASAVA_Build 18 43551394 1I ATTCATTTTA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 6 7 150587 CASAVA_Build 18 43559489 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 11 12 150588 CASAVA_Build 18 43562505 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2654 het 1124 hom 16 5 8 3 A 11 12 150589 CASAVA_Build 18 43565861 1D TCTCTTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 11 10 150590 CASAVA_Build 18 43569001 1I ACGAGGTGGC -/T TTTTATCTTG 3070 het 3070 ref 53 25 26 2 T 4 5 150591 CASAVA_Build 18 43582724 4D TCTGTCTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 2624 hom 27 7 13 10 TC 10 8 150592 CASAVA_Build 18 43610001 1I TAGGGGGGTT -/A GGGGTAGAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 1 150593 CASAVA_Build 18 43612289 4I TTGGGCTTAC ----/TGTG TATTTTGATG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TG 0 2 150594 CASAVA_Build 18 43615015 4I CAGAAATACC ----/TTAT TTAAACGTGT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 TTAT 0 1 150595 CASAVA_Build 18 43619395 1D GGCAGAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 34 0 26 8 A 10 9 150596 CASAVA_Build 18 43628000 1D TTTCCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 24 6 A 14 13 150597 CASAVA_Build 18 43634458 1D AGAAGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2149 hom 33 8 19 6 A 13 12 150598 CASAVA_Build 18 43635010 2D TTCACCCAGG TT/-- TTTTTTTAAA 3070 hom 65 het 28 0 22 8 T 9 7 150599 CASAVA_Build 18 43636511 1D ATATGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 12 11 150600 CASAVA_Build 18 43643684 1D CATACAGTAA T/- TTTTAAACCT 3070 hom 160 het 57 0 53 4 T 5 4 150601 CASAVA_Build 18 43650468 1I TAAGTATGTA -/T TTTATTAGTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 3 4 150602 CASAVA_Build 18 43652258 6I CTTCTGAGTC ------/TGAGTT TATTAAAGAA 3070 hom 123 het 47 0 40 7 TGAGTT 0 1 150603 CASAVA_Build 18 43661460 9D AAACAGAAAA TTCGCCTAC/--------- GCCATTTCCT 3070 hom 138 het 48 0 45 7 TTCGCCTAC 1 0 150604 CASAVA_Build 18 43671887 1I TTTAAGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 13 14 150605 CASAVA_Build 18 43672568 1D TACCTAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 20 19 150606 CASAVA_Build 18 43673025 3D GTTCTTTATT AAA/--- GAAACTAAAG 3070 hom 75 het 27 0 25 3 A 3 0 150607 CASAVA_Build 18 43677756 2D TTTTTAACAC AT/-- GTTTTTTTCA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 AT 1 0 150608 CASAVA_Build 18 43679031 1I GGAAGAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 11 12 150609 CASAVA_Build 18 43679769 1D AAGTTCAGTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 140 het 52 0 46 7 A 9 8 150610 CASAVA_Build 18 43681945 2I TTCATTTGTT --/AC ACATTCTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AC 1 2 150611 CASAVA_Build 18 43690754 1D AGCTATATAT A/- ATATAGGGTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 2 1 150612 CASAVA_Build 18 43695043 4I AAATTCCTAC ----/TAAA TAAAGGTCTG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TAAA 1 2 150613 CASAVA_Build 18 43699107 10I TCTTGCATAG ----------/CTTGATAGCT CTTGACAGCA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 CTTGATAGCT 0 1 150614 CASAVA_Build 18 43703425 1D AGACTACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 3 T 13 12 150615 CASAVA_Build 18 43705940 1D TTTGAGATGT A/- AATCTAGAAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 3 2 150616 CASAVA_Build 18 43707689 1I TGACACTGAG -/T TAACACTTCA 3070 hom 119 het 50 0 38 12 T 1 2 150617 CASAVA_Build 18 43712820 2D GTCCTCACAC AT/-- AGAGGAACTT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 AT 1 0 150618 CASAVA_Build 18 43714803 1D TCTTGAGCAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 350 hom 39 1 36 3 T 9 8 150619 CASAVA_Build 18 43735304 1I ACTAATGATC -/A GGAGATAAGT 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 A 0 1 150620 CASAVA_Build 18 43746902 18D AGGTCATCTG GAAAGGTTTTCCAGTTAT/------------------ GAAATTGAGT 3070 het 3070 hom 40 18 22 9 GAAAGGTTTTCCAGTTAT 1 0 150621 CASAVA_Build 18 43764758 1I GTTTCCACCA -/C CCAGAGCCCC 3070 hom 101 het 38 0 33 5 C 2 3 150622 CASAVA_Build 18 43769066 1I CCAATTCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 10 11 150623 CASAVA_Build 18 43769923 1I GTCTTTTGAG -/A AAAAAAAAAC 1236 het 1236 ref 51 39 3 9 A 9 10 150624 CASAVA_Build 18 43772161 7I CTCCAGCCCA -------/GCTGGAG GCTCATCAGC 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 GCTGGAG 0 1 150625 CASAVA_Build 18 43787714 1D CACAAAAAAA C/- ACATTCGTAC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 C 1 0 150626 CASAVA_Build 18 43791094 4D CCCCAAATTA TTTG/---- TTTATCTGAA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 TTTG 1 0 150627 CASAVA_Build 18 43807731 1I TCATGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2465 het 1797 hom 27 8 12 7 T 15 16 150628 CASAVA_Build 18 43816049 6D AAGCATAGCA GTGTCC/------ CTGTGCATGA 3070 het 3070 hom 39 17 21 4 GTGTCC 1 0 150629 CASAVA_Build 18 43823433 3D TAGTGGCTAA AAT/--- AATAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 22 23 8 AAT 2 1 150630 CASAVA_Build 18 43831405 1I CAAACCTCCT -/G GCTGGTCACC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 1 2 150631 CASAVA_Build 18 43831947 1D15M5I CTAAAGTGAA GGTGAGGCTAAGGTCA-----/-GTGAGGCTAAGGTCACAAAG CAAAGTGATG 3070 het 3070 ref 40 26 17 5 N/A 0 0 150632 CASAVA_Build 18 43852722 2D ATATGAAGCC TG/-- GCGCTCAGGG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TG 1 0 150633 CASAVA_Build 18 43857432 2D TGTTATATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 34 1 25 8 A 17 15 150634 CASAVA_Build 18 43861820 11D TTCTTTTTCT TTTTCTTTTTC/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TTTTCTTTTTC 1 0 150635 CASAVA_Build 18 43862346 7I TAATGTTAAC -------/TATTTCT TTGTATTTTT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 TATTTCT 0 1 150636 CASAVA_Build 18 43869043 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 1311 hom 25 7 14 4 A 7 6 150637 CASAVA_Build 18 43873988 2I AAAAAAAAAC --/AA AAAAAAAACA 1992 het 1992 ref 25 13 7 5 A 8 10 150638 CASAVA_Build 18 43881264 22D CCTGCCTGTA GGGGCGGTAGGGGACTGGTGGG/---------------------- GGGGCTGGAA 3070 het 2178 hom 19 9 9 9 GGGGCGGTAGGGGACTGGTGGG 1 0 150639 CASAVA_Build 18 43890426 1D AGGATCCTTA C/- ATTCAGCTCA 3070 het 3070 ref 57 27 21 9 C 1 0 150640 CASAVA_Build 18 43890700 1I CCCTACCCCC -/A CCACCTGGTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 0 1 150641 CASAVA_Build 18 43895785 1D ACCTAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 2774 hom 21 het 8 0 8 0 T 8 7 150642 CASAVA_Build 18 43901769 1D CTTAATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 35 2 26 7 T 14 13 150643 CASAVA_Build 18 43909233 1D TTGAAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 28 2 8 19 T 11 10 150644 CASAVA_Build 18 43914460 3D AAACCCAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3046 het 1553 hom 43 10 14 19 T 21 18 150645 CASAVA_Build 18 43914809 1I AATGGCATTG -/T TAAGTGGAGA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 1 2 150646 CASAVA_Build 18 43917791 1D GTTTCCCCCC A/- CTCTCCTTCT 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 A 1 0 150647 CASAVA_Build 18 43930175 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2852 hom 30 het 19 0 10 10 T 16 14 150648 CASAVA_Build 18 43946574 3I CAACCCAAAC ---/AAA AACTCTGTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 5 150649 CASAVA_Build 18 43950149 1I CCCTTTTTTT -/C TCTTAAAGAT 3070 hom 120 het 46 0 41 6 C 0 1 150650 CASAVA_Build 18 43962551 1D GGAAATGAGA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 T 8 7 150651 CASAVA_Build 18 43965555 1D CATCCACCCC T/- GTTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 T 1 0 150652 CASAVA_Build 18 43968656 1D ACAGTTCTGC A/- TGGCTGGGGA 3070 het 2472 hom 23 6 13 4 A 1 0 150653 CASAVA_Build 18 43973335 1D TTTCTTAATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 2659 hom 20 6 10 4 A 9 8 150654 CASAVA_Build 18 43977611 15D GCTCCTGAAG ATCATCCTGCCTCCA/--------------- ATCATCCTGC 3070 hom 102 het 42 0 34 12 ATCATCCTGCCTCCA 2 1 150655 CASAVA_Build 18 43990126 2D CTTGTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 10 7 A 14 12 150656 CASAVA_Build 18 44000532 1D GAAGGTGCCA G/- CCCCAGTTCC 3070 het 3070 ref 42 21 20 1 G 1 0 150657 CASAVA_Build 18 44013012 4D AATTTTGGGG TACT/---- TAGTTTTGCA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TACT 1 0 150658 CASAVA_Build 18 44017733 1I AAACAGCTGA -/G GAACCTAGGA 3070 hom 126 het 45 0 38 7 G 1 2 150659 CASAVA_Build 18 44042417 1D CACAGGGCTA G/- GGATTCACAT 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 G 3 2 150660 CASAVA_Build 18 44044763 2D CAGCTGGCTC TG/-- TGTCACTGCA 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 TG 2 1 150661 CASAVA_Build 18 44049121 1D ATGTAAATGT G/- GGGTGTAGAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 4 3 150662 CASAVA_Build 18 44067548 3D AAATTAAAAA CAC/--- CAATCAGAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 CAC 1 0 150663 CASAVA_Build 18 44074240 1D TCCAGCCTAA G/- CCTCTCAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 G 1 0 150664 CASAVA_Build 18 44083346 1D ATGCAAGACA G/- GGGAGGATGG 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 G 4 3 150665 CASAVA_Build 18 44121011 1I AGCACATTCA -/T TTTTTGTTGG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 5 6 150666 CASAVA_Build 18 44131046 2D CCTTCCACCC CT/-- GTCGCCCACC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 CT 1 0 150667 CASAVA_Build 18 44136436 1I GGGCCCAGCA -/C CCTGTTTTGG 3070 hom 93 het 38 0 28 10 C 2 3 150668 CASAVA_Build 18 44139715 3D AAACTATGAA GAT/--- GATCAAAACA 3070 het 3070 hom 37 15 18 6 GAT 2 1 150669 CASAVA_Build 18 44143086 2D CTAAAACAAG AC/-- GCATGGGTTA 3070 het 3070 ref 38 20 12 9 AC 1 0 150670 CASAVA_Build 18 44143573 1I TCTTGCTGCT -/C CGGGAGGGAG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 C 1 2 150671 CASAVA_Build 18 44147752 3I AAATACAAAC ---/ATA AGAAGACTCT 891 het 891 ref 14 6 3 5 ATA 0 1 150672 CASAVA_Build 18 44149176 22I TGTGAAAAGA ----------------------/AAGAAAAGAATTATCCACCCAG AATCCTATTT 3070 hom 114 het 37 0 39 1 AAGAAAAGAATTATCCACCCAG 0 1 150673 CASAVA_Build 18 44166793 4D11M2D AAGTACAGTG CTTACCCTAGACAGTGA/----CGGTAAGCACT-- GTGGATGTCA 3070 het 3070 ref 50 28 22 10 N/A 0 0 150674 CASAVA_Build 18 44168200 3I TTGGTTTGGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 63 het 38 0 21 17 TTG 5 6 150675 CASAVA_Build 18 44168215 1D GTTGTTGTTG T/- TTGTTTGTTT 3070 hom 48 het 30 0 15 15 T 3 2 150676 CASAVA_Build 18 44169738 2D AAGATAGACC AA/-- AAAAAAAAAA 1777 het 1667 hom 30 12 7 11 A 17 15 150677 CASAVA_Build 18 44170659 1D TGGAATCATA C/- CCCCAAAAGT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 C 5 4 150678 CASAVA_Build 18 44195869 2D CCATTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 105 hom 39 2 16 22 T 18 16 150679 CASAVA_Build 18 44202340 2I TCCCATGCAT --/TG TGAGCCTACA 3070 hom 81 het 36 0 27 9 TG 1 2 150680 CASAVA_Build 18 44203230 1I TAGCAACGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 9 10 150681 CASAVA_Build 18 44212847 1I TTCATGGGGC -/T TTTTTTTTTT 2350 hom 10 het 10 0 7 3 T 12 13 150682 CASAVA_Build 18 44216824 2D AATTGTGTGG AA/-- AAAAAAGTCA 3070 het 116 hom 32 2 17 13 A 8 6 150683 CASAVA_Build 18 44226715 1D TTTCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2848 het 562 hom 15 2 8 5 A 15 14 150684 CASAVA_Build 18 44233976 1I CAGAACGTCC -/G GTCCGAGAAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 G 1 2 150685 CASAVA_Build 18 44240648 1I ATTAAACTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 8 9 150686 CASAVA_Build 18 44244148 4I TTAGCGTGAG ----/ATTT GCATTACCCA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 ATTT 0 1 150687 CASAVA_Build 18 44246631 1I AAATACTTTC -/T TTTTTTTTTT 1219 het 279 hom 10 2 5 3 T 15 16 150688 CASAVA_Build 18 44254342 1I ACAGAACCAA -/G GGGGTAAGGT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 G 4 5 150689 CASAVA_Build 18 44261872 2I66M2I ATAAAGAAAA --TGTGTGTGTGTACATATACGTACATACATATATATATGTATTCCATCGTGTATATATATGTGTGTG--/TGTGTGTGTGTGTACATATACGTACATACATATATATATGTATTCCATCGTGTATATATATGTGTGTGTA TATATATATA 3070 het 151 hom 40 2 36 28 N/A 0 0 150690 CASAVA_Build 18 44278091 1I GGCCAAATGT -/G GGATAGCACA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 2 3 150691 CASAVA_Build 18 44306708 1I ACACCTAATC -/T TTTTTTTTTT 2606 hom 24 het 14 0 9 5 T 14 15 150692 CASAVA_Build 18 44307969 1D CTGCTATAAA C/- ATTTATGTGT 3070 het 3070 ref 47 28 13 6 C 1 0 150693 CASAVA_Build 18 44312930 2D GTTTTTAATA AC/-- ACAGAAAATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AC 2 1 150694 CASAVA_Build 18 44314818 1D TCCCCTCCCA T/- TTTTTTTAGA 3070 het 345 hom 39 1 32 8 T 8 7 150695 CASAVA_Build 18 44317234 2I CTCTCCTCAC --/CT CTGAGGGTGC 3070 hom 90 het 34 0 29 5 CT 1 2 150696 CASAVA_Build 18 44334201 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 11 12 150697 CASAVA_Build 18 44339591 1D TTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 31 1 27 3 T 11 10 150698 CASAVA_Build 18 44345175 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGGGTCTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 6 7 150699 CASAVA_Build 18 44345473 4D TTTTGCATAT TTAA/---- TTAACTCGGG 3070 hom 117 het 42 0 39 4 TTAA 2 1 150700 CASAVA_Build 18 44376847 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1564 het 1564 ref 41 29 5 7 T 13 12 150701 CASAVA_Build 18 44398238 1D GCTGAGCTCA G/- GGGGCCCAGA 3070 hom 92 het 34 0 29 5 G 5 4 150702 CASAVA_Build 18 44411904 1I ATTTTCATTG -/T TTTTTTATTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 6 7 150703 CASAVA_Build 18 44413350 78D CAAGGAGGGT AGGGTTGCATACGGATGTGCACGAAGCCTCAGGGTCTGATTTGTGCGTGCCCATCAGGAGGCCCCATCCTGCCAAGGC/------------------------------------------------------------------------------ CCGTGCTGAC 3070 hom 80 het 22 0 21 12 AGGGTTGCATACGGATGTGCACGAAGCCTCAGGGTCTGATTTGTGCGTGCCCATCAGGAGGCCCCATCCTGCCAAGGC 1 0 150704 CASAVA_Build 18 44413816 1I TTATGCCTGT -/A ATCCCAGCAC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 1 2 150705 CASAVA_Build 18 44426817 1D TGGCAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 29 1 19 9 A 12 11 150706 CASAVA_Build 18 44438792 7I TATGTGTGTT -------/TGGTGTG TGGTGTGTAT 3070 hom 169 het 66 0 57 9 TGGTGTG 1 2 150707 CASAVA_Build 18 44441764 1I GCATGTATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 10 150708 CASAVA_Build 18 44442740 7I TTACTTAGAC -------/CTGCAGG CTGCAGGCTG 3070 hom 121 het 49 0 36 13 CTGCAGG 1 2 150709 CASAVA_Build 18 44450855 1D TACGGGAGGA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 286 hom 30 2 20 9 C 10 9 150710 CASAVA_Build 18 44453798 3I TGAGACACAT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 TTG 5 6 150711 CASAVA_Build 18 44532864 1D AAACACAAAT C/- TGAGTTCCAG 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 C 1 0 150712 CASAVA_Build 18 44533971 1I TCCATTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 28 16 6 A 11 12 150713 CASAVA_Build 18 44537762 1D ACAATGTTCC A/- AAAAAAAAAA 1978 het 1978 ref 47 30 5 12 A 12 11 150714 CASAVA_Build 18 44540882 1I GGTCTGTGCC -/T TTCTAGGCCA 3070 het 3070 ref 49 29 16 4 T 2 3 150715 CASAVA_Build 18 44546281 1I CAGACATTTC -/T TTTTTTTTTT 1711 het 1711 ref 12 7 5 0 T 11 12 150716 CASAVA_Build 18 44555336 1D TCTGAGTATT A/- AAAAAAAAAA 2839 het 2839 ref 25 10 7 8 A 11 10 150717 CASAVA_Build 18 44563775 1D ATGAAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 1656 het 1656 ref 34 26 4 4 A 11 10 150718 CASAVA_Build 18 44568897 3D CCCAGGGCCA CAC/--- CACCTGAAGC 2487 het 2487 ref 35 16 9 11 CAC 2 1 150719 CASAVA_Build 18 44588886 1D TTTTTGGTCC T/- TTTTTTTTTT 1650 het 1650 ref 42 20 8 14 T 17 16 150720 CASAVA_Build 18 44603001 1I TGAGAGTGCT -/A ATATCTCTTC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 1 2 150721 CASAVA_Build 18 44604748 1D GAGCAAAGGG T/- TGTCATCTCC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 1 150722 CASAVA_Build 18 44608052 1D CTTCCTAGGG C/- CAGGTACCCA 3070 hom 106 het 40 0 32 8 C 2 1 150723 CASAVA_Build 18 44609910 1D GTCTGCAGAG C/- CCCCCGACCT 3011 het 1483 hom 23 8 10 5 C 6 5 150724 CASAVA_Build 18 44618438 1I GAAGAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 11 12 150725 CASAVA_Build 18 44638840 4I GAATAGCTCT ----/CACA CAGAGAGTAG 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 CA 1 3 150726 CASAVA_Build 18 44640823 1I CTGCCCCGGC -/G GGGGGGTCCC 2211 het 1269 hom 23 5 11 7 G 6 7 150727 CASAVA_Build 18 44645124 4D CATTTTAGAG TGTT/---- TGTTTACATT 3070 het 3070 ref 49 25 21 6 TGTT 2 1 150728 CASAVA_Build 18 44647722 1D AAATATATAT A/- TTTTTAACTA 3070 het 3070 hom 23 9 10 5 A 1 0 150729 CASAVA_Build 18 44649314 3I AGCAGAACAT ---/ACA ACGACACAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 ACA 0 1 150730 CASAVA_Build 18 44650371 1D TGTGTTGTGT G/- GGGGTGCGGG 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 G 5 4 150731 CASAVA_Build 18 44650615 1D TGTGTTGTGT G/- GGGGTGGGGG 3070 het 2664 hom 52 9 18 28 G 5 4 150732 CASAVA_Build 18 44657378 1I GAGGGGCAAT -/G GGGTTTGTTC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 G 3 4 150733 CASAVA_Build 18 44673448 1D CTGATGTGTG T/- CTGAGATGTC 3070 het 3070 hom 59 26 28 5 T 1 0 150734 CASAVA_Build 18 44679897 1D AGCAAATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 25 8 A 12 11 150735 CASAVA_Build 18 44689446 12D CTCCTCTTCC TCTTCCTCCTCT/------------ TCTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 43 16 11 18 TCTTCCTCCTCT 2 1 150736 CASAVA_Build 18 44690538 1I AGAGTCTCAC -/T TGTGTCACCC 3070 het 3024 hom 21 8 11 2 T 1 2 150737 CASAVA_Build 18 44691363 26I GTAAAATAAA --------------------------/ATCTTCTATCCTCCACCCCCATTACC ATCACTCACC 3070 het 3070 hom 38 16 22 3 ATCTTCTATCCTCCACCCCCATTACC 0 1 150738 CASAVA_Build 18 44702876 4I CATGAGGAAC ----/CTCT CTATCTGGTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 CT 1 3 150739 CASAVA_Build 18 44705804 1I GGTGTTGCCC -/G CCCCCCAACC 2990 het 10 hom 14 1 9 4 G 0 1 150740 CASAVA_Build 18 44706121 1D AATGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 962 hom 21 5 9 7 T 12 11 150741 CASAVA_Build 18 44707680 1I GAACACTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3061 hom 32 13 14 5 T 12 13 150742 CASAVA_Build 18 44709467 1D TATTGACAGT A/- AAGGGCCTCT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 3 2 150743 CASAVA_Build 18 44711086 1D TCGGTGTGTG C/- CGACACATGA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 2 1 150744 CASAVA_Build 18 44712348 1I CAGAAAACAG -/C CCCCCCCAGC 1796 het 1122 hom 16 5 7 4 C 7 8 150745 CASAVA_Build 18 44714822 1I ACCCCCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 A 11 12 150746 CASAVA_Build 18 44724207 1I CTGCTGTCTG -/C CCCTCTTAAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 3 4 150747 CASAVA_Build 18 44728261 1D GAGGAACCTA C/- CCCCCCCCCC 1068 het 1068 ref 33 7 5 21 C 12 11 150748 CASAVA_Build 18 44750262 1D AAAATGCTCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 A 10 9 150749 CASAVA_Build 18 44768943 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2924 het 2474 hom 28 10 13 5 A 13 14 150750 CASAVA_Build 18 44775340 1D TGCCCTCCAG T/- TTCGTGCCAT 3070 het 6 hom 25 1 20 4 T 3 2 150751 CASAVA_Build 18 44779587 19D TGACAAATCT CCAGAACTTTCTCATCTCA/------------------- CCAGAACTTT 3070 hom 54 het 28 0 18 15 CCAGAACTTTCTCATCTCA 2 1 150752 CASAVA_Build 18 44782384 1D ACAAAGGTGC G/- GGGCAGGTTA 3070 hom 80 het 33 0 26 7 G 4 3 150753 CASAVA_Build 18 44786174 1I TTTCTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 10 11 150754 CASAVA_Build 18 44811882 1I TCGATGTTCC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 7 8 150755 CASAVA_Build 18 44817089 2D TCAGCTAATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 TG 8 7 150756 CASAVA_Build 18 44856512 1I AATATTTTCA -/T TTTGGGGAAT 3070 hom 83 het 32 0 28 4 T 3 4 150757 CASAVA_Build 18 44863456 1D TTTGTGAGCC A/- ATATGATCTT 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 A 2 1 150758 CASAVA_Build 18 44902752 1I TACAGAGAAA -/T TACACTGTTA 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 T 1 2 150759 CASAVA_Build 18 44907028 1I TATTATTTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 8 9 150760 CASAVA_Build 18 44910942 1D ACTAAAACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 T 10 9 150761 CASAVA_Build 18 44944256 1D TATTCTAAAA T/- ATACTTGTAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 6 T 1 0 150762 CASAVA_Build 18 44946383 2I TACATAAGAG --/CA CACACACTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CA 3 4 150763 CASAVA_Build 18 44953382 2D GGTTTGGGTG TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 T 10 8 150764 CASAVA_Build 18 44954606 3I GATGATGTAG ---/ATA ATAAGAATGA 3070 hom 126 het 45 0 42 3 ATA 1 2 150765 CASAVA_Build 18 44963590 3D TTTTATTTGC ACA/--- ACTAGTCTCT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 ACA 1 0 150766 CASAVA_Build 18 44964608 1D AAAAACAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 29 2 24 4 T 13 12 150767 CASAVA_Build 18 44971710 1D CCTAAAACTT A/- ACCTTTTGGG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 2 1 150768 CASAVA_Build 18 44984316 1I ACATTAGCTC -/A TACTTTTACT 3070 hom 54 het 22 0 20 2 A 0 1 150769 CASAVA_Build 18 44985836 1D AGTAGATGAG A/- AAAAAATACA 1440 het 1440 ref 13 8 3 2 A 7 6 150770 CASAVA_Build 18 44988184 2D TCTGTCTCCA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 123 het 47 0 40 8 TC 7 6 150771 CASAVA_Build 18 45002355 1D GTTATTTTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 10 9 150772 CASAVA_Build 18 45009444 3I TAAACACGAA ---/AAC AACAAGACAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AAC 1 2 150773 CASAVA_Build 18 45015834 1D AAAAAAATTT A/- AAAATAGATG 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 5 4 150774 CASAVA_Build 18 45016144 1I ACTGTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1039 hom 35 4 26 5 A 11 12 150775 CASAVA_Build 18 45038052 1I TTGGCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1113 hom 30 5 18 7 A 15 16 150776 CASAVA_Build 18 45039350 1I GGGAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 26 9 A 11 12 150777 CASAVA_Build 18 45043213 1D GCTACATTTT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 8 7 150778 CASAVA_Build 18 45047569 1D GTAACTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 12 11 150779 CASAVA_Build 18 45053383 1I GAAAACAGGC -/A AAAAAAAAAA 657 het 657 ref 48 42 3 3 A 11 12 150780 CASAVA_Build 18 45078535 1D CATCCTGTCT C/- CCAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 61 34 21 6 C 3 2 150781 CASAVA_Build 18 45086164 2D TCTGCCTATA CT/-- CTGACTTCCT 3070 het 3070 ref 30 19 9 5 CT 2 1 150782 CASAVA_Build 18 45088659 2D CTTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2243 hom 29 8 16 5 TA 9 8 150783 CASAVA_Build 18 45102123 1I ATCCTGAAAA -/G GGGGGGGAAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 G 7 8 150784 CASAVA_Build 18 45131761 1I CAAATAAAAA -/T TACATTTAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 1 2 150785 CASAVA_Build 18 45136614 1D GTATTAATAA C/- AGTAAACAAA 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 C 1 0 150786 CASAVA_Build 18 45139219 6D AGCAACAAAA ACAGAT/------ ACAAAGACAA 3070 het 3070 hom 35 16 18 4 ACAGAT 1 0 150787 CASAVA_Build 18 45150130 1D GTTTATATTG A/- AACTGTTTTG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 3 2 150788 CASAVA_Build 18 45155326 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2222 het 2222 ref 28 12 8 8 A 13 14 150789 CASAVA_Build 18 45222773 1D AACAAATTAG C/- CCAGACATGG 3070 hom 78 het 34 0 24 11 C 3 2 150790 CASAVA_Build 18 45242474 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1430 het 979 hom 32 7 7 18 A 15 16 150791 CASAVA_Build 18 45249208 1D TTGACAAGAT C/- ACTGAAATTG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 C 1 0 150792 CASAVA_Build 18 45251697 1I ACTCTCTAGA -/T TTTTAGAAAT 3070 het 3038 hom 23 8 15 0 T 4 5 150793 CASAVA_Build 18 45254821 2D GGCTCATGCC CT/-- GTTACAGCAT 3070 het 3070 ref 55 28 22 6 CT 1 0 150794 CASAVA_Build 18 45256207 8D AGACAGGGTT TCCTTCTA/-------- TTGCCCAGGC 3070 het 3070 ref 20 12 9 1 TCCTTCTA 1 0 150795 CASAVA_Build 18 45261337 3I CAACAACAAC ---/AAA AAAAAAACAA 3070 hom 47 het 40 1 30 9 A 7 10 150796 CASAVA_Build 18 45268373 3D GAGTGCTGTT ATC/--- ATACTCAAAG 3070 het 3070 hom 35 12 21 3 ATC 1 0 150797 CASAVA_Build 18 45268952 3I AAGAAAAATG ---/TGT TGTTAAGTTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TGT 1 2 150798 CASAVA_Build 18 45269608 1I AAGACAGGTG -/A AAAGGGTTGC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 3 4 150799 CASAVA_Build 18 45270720 2I AAAATCCTAA --/AT GAGTTAATTA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 AT 0 1 150800 CASAVA_Build 18 45274306 8I GCTACAATGT --------/GTTAAAAA GAAGAAGAAA 3070 het 3070 hom 40 18 15 7 GTTAAAAA 0 1 150801 CASAVA_Build 18 45290380 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2721 het 2344 hom 21 9 7 6 T 12 11 150802 CASAVA_Build 18 45290538 1I TGTGAGTTAC -/T TTCGCATTTG 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 T 2 3 150803 CASAVA_Build 18 45291371 1D AGGTGGGCAA T/- TTTTTTTTCT 1899 het 1899 ref 19 9 5 5 T 9 8 150804 CASAVA_Build 18 45294207 1I ATTATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2661 hom 28 11 13 4 T 12 13 150805 CASAVA_Build 18 45295946 1D CAATTCCTAT G/- GGGGGGCAAG 3070 hom 123 het 45 0 42 4 G 7 6 150806 CASAVA_Build 18 45341066 1I GTAACAAAAG -/T TAATGAGGCG 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 1 2 150807 CASAVA_Build 18 45366850 4I TGGCCTTGAG ----/CCAT AGGCAGGTGG 3070 het 3070 ref 40 23 17 0 CCAT 0 1 150808 CASAVA_Build 18 45367767 2D TGAAACCTCA TC/-- TCTCTAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 TC 3 2 150809 CASAVA_Build 18 45368158 1I TTGAAGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 11 12 T 11 12 150810 CASAVA_Build 18 45380877 1D AGGGTATGTG C/- CCCCCCCTTT 3070 het 3070 ref 35 16 11 9 C 8 7 150811 CASAVA_Build 18 45387083 1D TAGAAAAAAA C/- ATAGGAATGA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 1 0 150812 CASAVA_Build 18 45389991 1D CTTCTTAATT G/- ACATCACTTG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 G 1 0 150813 CASAVA_Build 18 45390133 4D GGGTGCTAAC TCTG/---- TCTGCTGCTA 3070 het 3070 ref 37 21 14 4 TCTG 2 1 150814 CASAVA_Build 18 45401980 3I AGCTCAAGCC ---/AGA AGAAGGAGTC 3070 het 3070 ref 48 20 14 14 AGA 1 2 150815 CASAVA_Build 18 45402088 1D GAGCAGGTTT G/- GAAAGGAGAG 3070 het 3070 hom 43 15 15 13 G 2 1 150816 CASAVA_Build 18 45405547 1I GTGACTGTGT -/G CTTAGCTTAA 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 G 0 1 150817 CASAVA_Build 18 45413451 1I AGTTTTGAAA -/T TCCCTTTCTC 3070 hom 112 het 44 0 37 7 T 1 2 150818 CASAVA_Build 18 45415338 1I GTGTAGCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 210 hom 38 1 29 8 T 10 11 150819 CASAVA_Build 18 45423158 1I TAACAACATC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 8 9 150820 CASAVA_Build 18 45424138 4I TCGTGATCCA ----/CCTG CCTCGGCCTC 3070 hom 61 het 25 0 20 5 CCTG 0 1 150821 CASAVA_Build 18 45428261 1I TTTCAGACAG -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 6 7 150822 CASAVA_Build 18 45429350 1I GGTACAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 38 1 28 9 A 10 11 150823 CASAVA_Build 18 45429612 1I CTGGATGTCA -/C CTGTGAAAGA 3070 hom 63 het 30 0 22 8 C 1 2 150824 CASAVA_Build 18 45430234 2I CCATCTCGAT --/AA AAAAAAAAAA 2979 hom 42 het 21 0 14 7 A 12 14 150825 CASAVA_Build 18 45430512 13D TGCCAGGACT AGGGGAAGAGGGA/------------- AGGGGAAGGA 3070 hom 97 het 37 0 29 11 AGGGGAAGAGGGA 1 0 150826 CASAVA_Build 18 45436396 12D CCTAGTGGAG TTAATGAGTGAA/------------ TAAATGACTA 3070 hom 147 het 52 0 48 6 TTAATGAGTGAA 1 0 150827 CASAVA_Build 18 45441421 1D TTCAGCCCCA C/- CCCCCGACCT 3070 hom 85 het 33 0 26 7 C 6 5 150828 CASAVA_Build 18 45448878 1D TCTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1520 hom 35 5 15 15 T 13 12 150829 CASAVA_Build 18 45450329 1D CAAAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 17 10 T 13 12 150830 CASAVA_Build 18 45452737 2D AGACAGACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 19 19 10 AC 9 8 150831 CASAVA_Build 18 45485396 4I ACTTTTTCAA ----/TTTT TTTTTTTTTT 2410 het 2410 ref 25 14 7 4 T 10 14 150832 CASAVA_Build 18 45509326 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 10 9 150833 CASAVA_Build 18 45514745 1I GGTTTTTGGC -/T GAGGAGGCTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 0 1 150834 CASAVA_Build 18 45521178 2I AGATGGAGGC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 1977 hom 25 7 12 6 AG 7 8 150835 CASAVA_Build 18 45525280 3I TGAGTCTCTT ---/CTC CTGATGTTAA 3070 het 3070 hom 53 19 27 7 CTC 0 1 150836 CASAVA_Build 18 45526566 1I TTGAGAAGGA -/T TTTTGCCGTG 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 T 4 5 150837 CASAVA_Build 18 45531460 1D ATTGTTTTTA C/- AAGGAACATG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 150838 CASAVA_Build 18 45532279 1I AAAGCCTGGG -/C TGTAGCAGGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 0 1 150839 CASAVA_Build 18 45532588 1I CCAGAGGCCC -/T GCAGAGCCCT 3070 hom 90 het 38 0 29 9 T 0 1 150840 CASAVA_Build 18 45533098 1D CCCCAATCAG A/- GACAGGCTCC 3070 hom 122 het 43 0 40 4 A 1 0 150841 CASAVA_Build 18 45533302 4D GTTTCTGCAC TCTG/---- TCTAACTAGA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TCTG 1 0 150842 CASAVA_Build 18 45534750 2I ACATACAATA --/AC ACACACACTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AC 4 5 150843 CASAVA_Build 18 45537634 1I AAGTCAGCTT -/G GGGTGTTCTG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 G 3 4 150844 CASAVA_Build 18 45542854 1I GGAAGCTTGG -/C CCCGGGGGTG 3070 het 2440 hom 26 7 11 8 C 3 4 150845 CASAVA_Build 18 45546737 1D GCTTTTTTTT C/- CCCCCTCATT 3070 het 3070 hom 38 15 22 2 C 6 5 150846 CASAVA_Build 18 45562570 1D GAAATTATAC A/- GGGCTCTTAC 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 1 0 150847 CASAVA_Build 18 45563216 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1780 het 231 hom 16 1 4 11 A 17 16 150848 CASAVA_Build 18 45564485 1I GTTTTTAATC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 A 8 9 150849 CASAVA_Build 18 45565911 2D CTAAATAATA CT/-- TTTAGTCAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 CT 1 0 150850 CASAVA_Build 18 45574559 4I GTATGATTTG ----/TAAA TAAATATTAT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TAAA 1 2 150851 CASAVA_Build 18 45574849 2D TTTAAAAGTA AT/-- ATGTTATAAT 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 AT 2 1 150852 CASAVA_Build 18 45592752 1D CTCACTCTGT A/- AAGTGGCATC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 3 2 150853 CASAVA_Build 18 45603545 1I TTTATAATAA -/T AAAAAACCCT 3070 het 3070 ref 48 31 11 6 T 0 1 150854 CASAVA_Build 18 45604675 1I ACAATTCCAG -/T GATATACCTT 3070 het 3070 ref 59 35 15 9 T 0 1 150855 CASAVA_Build 18 45604957 6I TTTTGGTCTT ------/TAAAGA TTAAGGATGG 2290 het 2290 ref 42 33 6 3 TAAAGA 0 1 150856 CASAVA_Build 18 45610514 14D TGAAAGAATC CACACACACACACA/-------------- CACACACACA 3070 het 766 hom 25 4 10 14 CA 13 6 150857 CASAVA_Build 18 45611356 1I AAAAAAAAAA -/C CCCTCATATT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 C 3 4 150858 CASAVA_Build 18 45613859 4D ATTGATTACT GAGG/---- AAGATTCAGA 3070 het 3070 ref 56 32 22 6 GAGG 1 0 150859 CASAVA_Build 18 45628935 6I TGCAGGCAAT ------/AAGGCA AAGGCAAAGG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 AAGGCA 2 3 150860 CASAVA_Build 18 45632056 1D CACAGACCCC T/- TTCCCCACCA 3070 hom 108 het 44 0 32 12 T 3 2 150861 CASAVA_Build 18 45638710 1I ACTGTAGGCA -/C CCACTGCAGT 3070 hom 101 het 39 0 30 9 C 2 3 150862 CASAVA_Build 18 45648135 2D TCTATAACTC TG/-- TAAGATTTTA 3070 het 3070 hom 29 10 15 5 TG 1 0 150863 CASAVA_Build 18 45648468 4I AAAAAAGCAG ----/AATA AAAAATTATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AATA 0 1 150864 CASAVA_Build 18 45652893 1D TTGAATTTTG C/- CCCCCCAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 C 7 6 150865 CASAVA_Build 18 45653742 1D AGTGTTAAGT C/- CTCCCACTGT 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 C 2 1 150866 CASAVA_Build 18 45657872 1I TCAAGAGGAA -/T TCAGAGATCC 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 T 1 2 150867 CASAVA_Build 18 45658795 1D TCAGCTTTTC T/- TTCCTGGCTT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 T 3 2 150868 CASAVA_Build 18 45659424 3I CTTTCTTCAT ---/GAG GAGATTTTCC 3070 het 3070 ref 48 27 14 7 GAG 1 2 150869 CASAVA_Build 18 45662093 1D TGGCGTGAAC T/- CCAGGAAGAA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 1 0 150870 CASAVA_Build 18 45662722 4D GGCCAGGTAC CGTG/---- CGTGGCTCAC 3070 hom 30 het 29 0 16 13 CGTG 2 1 150871 CASAVA_Build 18 45667009 3I TATTTTGCCA ---/AAG AATAACATTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAG 0 1 150872 CASAVA_Build 18 45668216 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 951 het 951 ref 11 5 5 1 T 10 9 150873 CASAVA_Build 18 45670746 1D TTTTTTGGAC T/- GGGGGAGTGG 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 T 1 0 150874 CASAVA_Build 18 45672370 1I CTGCACCAAG -/C TAAGCCTTGC 3070 hom 65 het 28 0 23 5 C 0 1 150875 CASAVA_Build 18 45675765 9D ACACTGACAT TCAAAGAGC/--------- TCAAGGAGCT 3070 het 3070 ref 40 19 14 12 TCAAAGAGC 1 0 150876 CASAVA_Build 18 45680296 1I GCTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 10 11 150877 CASAVA_Build 18 45682664 3I AGGACCCCTG ---/TGA TTATATCAAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TGA 0 1 150878 CASAVA_Build 18 45694337 1D CCCACTCTAA C/- CCCTGCTTCC 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 C 4 3 150879 CASAVA_Build 18 45697831 27D AATGTTTGTA AAACGTTTACTCCAGACCATGGTTTGT/--------------------------- AAACGTTTAC 3070 het 3070 ref 47 28 17 11 AAACGTTTACTCCAGACCATGGTTTGT 1 0 150880 CASAVA_Build 18 45707728 1I TCACAGAACT -/A AAAAAAAAAA 2962 het 2962 ref 34 19 11 4 A 13 14 150881 CASAVA_Build 18 45709979 1D GCCAAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1319 hom 30 4 11 16 A 16 15 150882 CASAVA_Build 18 45715805 1D GGTTAGAGAG A/- ACTTCTAGTA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 A 2 1 150883 CASAVA_Build 18 45719281 1I GTCTGTGTCT -/C CCCACAGGCT 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 C 3 4 150884 CASAVA_Build 18 45720334 3D ATCATCTTCA TGT/--- ATGGCTACAG 3070 het 3070 ref 50 28 17 6 TGT 1 0 150885 CASAVA_Build 18 45722186 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 6 7 150886 CASAVA_Build 18 45725822 1I CATGCAGTCC -/T TTTTTTTTTT 1443 het 1443 ref 25 10 7 8 T 10 11 150887 CASAVA_Build 18 45726132 1D GGGAGGAGGA G/- GAGGAGGAGA 2724 het 2426 hom 25 10 8 7 G 2 1 150888 CASAVA_Build 18 45727042 1I ATAATCTGGA -/T ATCAACATAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 0 1 150889 CASAVA_Build 18 45727200 1D AAAGGAGGTA C/- CAGTATGCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 8 C 2 1 150890 CASAVA_Build 18 45727354 1I ATACAAATTA -/C TGGTTCCATC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 1 150891 CASAVA_Build 18 45728646 1D AATAAACACA T/- TTTTCCTTTC 3070 hom 84 het 32 0 27 5 T 5 4 150892 CASAVA_Build 18 45728773 1I CAGTACTTCA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 8 9 150893 CASAVA_Build 18 45737047 1I CACATACAGC -/T TATATGAACT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 1 2 150894 CASAVA_Build 18 45737618 2D CAGAAACTGT AC/-- ACTCTCTATC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 AC 2 1 150895 CASAVA_Build 18 45741713 1D TCAGGAGGTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 48 19 25 5 A 9 8 150896 CASAVA_Build 18 45743061 1I13M1I AAATACCCTA -ACACCTACGCTCA-/GACACCTAGGCTCAG AGGAATGGGA 3070 hom 126 het 43 0 42 3 N/A 0 0 150897 CASAVA_Build 18 45744733 1D TTTTCTTAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 9 8 150898 CASAVA_Build 18 45775626 1I ACTTATATCC -/T TTTTTTTTTT 3063 het 128 hom 30 2 12 17 T 15 16 150899 CASAVA_Build 18 45775801 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 13 0 10 3 T 9 10 150900 CASAVA_Build 18 45804730 7D CAGAGAAGTC CTGGGTG/------- CTGGGATTCC 3070 het 3070 hom 50 24 23 5 CTGGGTG 1 0 150901 CASAVA_Build 18 45806674 5D2M2D TTACAGTGTC TGTAAACTG/-----AC-- TAAAAGGGCA 3070 hom 129 het 45 0 43 2 N/A 0 0 150902 CASAVA_Build 18 45817620 1D CACAAATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 42 2 33 7 A 12 11 150903 CASAVA_Build 18 45830222 4I ACAATAAATT ----/AGAA AGAGCTTCAA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 AGAA 0 1 150904 CASAVA_Build 18 45832929 7D GTTGTGGGGT GGGGGGA/------- GGGGGGAGGG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 GGGGGGA 2 1 150905 CASAVA_Build 18 45833073 1I TAAAGTATAA -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 1 2 150906 CASAVA_Build 18 45834029 6D AATGTGAGGG GTGCAC/------ ACCTCAGTAC 3070 het 3070 ref 52 27 23 8 GTGCAC 1 0 150907 CASAVA_Build 18 45842534 1D ATTACACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 21 18 10 A 11 10 150908 CASAVA_Build 18 45862153 1I AATCTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 16 5 A 10 11 150909 CASAVA_Build 18 45871446 2D AGAATTCCCC CA/-- GTTAGTGGAG 3070 het 3070 hom 37 12 16 10 CA 1 0 150910 CASAVA_Build 18 45874137 1D TTAATATGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 11 11 A 10 9 150911 CASAVA_Build 18 45874829 1D AAGTACTGAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 T 9 8 150912 CASAVA_Build 18 45875207 1I AACCTGTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 18 20 7 T 9 10 150913 CASAVA_Build 18 45883102 1I CCAATGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 11 12 150914 CASAVA_Build 18 45901936 4I TTCAGGAACT ----/CTCA CTCAATTTAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 CTCA 1 2 150915 CASAVA_Build 18 45904895 5I GTGAATGTTA -----/AAGAG AAAAGAAAAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AAGAG 0 1 150916 CASAVA_Build 18 45905316 1I GACTACAGTA -/C TGGAAACCAG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 0 1 150917 CASAVA_Build 18 45913631 2I GTCTTCTCTA --/GT GTGCTCTCCT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 GT 1 2 150918 CASAVA_Build 18 45917495 1I AGTTTCAAGC -/A ATTGCAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 1 2 150919 CASAVA_Build 18 45918232 1D TATCCCTGGC A/- AAAAAAATGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 8 7 150920 CASAVA_Build 18 45920393 2I ACCTAGGGGG --/AA AAAAAAACTT 3070 het 1973 hom 21 6 12 3 A 7 9 150921 CASAVA_Build 18 45943756 1D TTCCAGTTTT C/- CCCTCCATCA 3070 hom 88 het 40 0 29 13 C 4 3 150922 CASAVA_Build 18 45944959 1I CAAATTGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 9 10 150923 CASAVA_Build 18 45945855 4D TTCAAAAAAT AAAG/---- AAAGGCCAGG 3070 hom 68 het 26 0 23 3 AAAG 2 1 150924 CASAVA_Build 18 45957522 1I GGCCATCTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 8 150925 CASAVA_Build 18 45970996 1D CCGACCTACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 9 8 150926 CASAVA_Build 18 45972049 1D TTAGCCTCAT A/- TGAGCACTAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 1 0 150927 CASAVA_Build 18 45972444 2D CATTTGAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 38 0 23 16 A 14 12 150928 CASAVA_Build 18 45991662 4D ATGTTGTTTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 hom 108 het 47 0 36 12 TGTT 5 4 150929 CASAVA_Build 18 45995970 1I TCCTTGAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 251 hom 40 2 28 10 A 9 10 150930 CASAVA_Build 18 46010109 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 17 6 T 13 14 150931 CASAVA_Build 18 46015918 1D CCTTGACAAG A/- GCGAAATTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 1 0 150932 CASAVA_Build 18 46023550 1I GGATACATTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 8 9 150933 CASAVA_Build 18 46032479 1D ACTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 39 1 24 14 T 11 10 150934 CASAVA_Build 18 46034502 1I GAAAAAACCA -/T TTTAAAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 3 4 150935 CASAVA_Build 18 46035945 1I AATTAAATAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 429 hom 27 1 25 1 A 9 10 150936 CASAVA_Build 18 46057697 1D CCCTGCCCAG C/- CCCCACCTCA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 C 5 4 150937 CASAVA_Build 18 46057942 1I CCAAGTATAT -/A ATCAAGTAAA 3070 hom 76 het 29 0 26 3 A 1 2 150938 CASAVA_Build 18 46062345 1D CATCAACCCC A/- GGGGGGGTCG 2290 hom 24 het 20 0 10 10 A 1 0 150939 CASAVA_Build 18 46070153 1I AATCAGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 10 11 150940 CASAVA_Build 18 46075203 1I TCCAGTTTGT -/G GTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 G 1 2 150941 CASAVA_Build 18 46088723 1I ACATGGAGTA -/T TAAAGCCTTT 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 T 1 2 150942 CASAVA_Build 18 46089872 4D ATTTACAGGG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 30 het 22 0 10 12 TC 8 6 150943 CASAVA_Build 18 46090363 1I CACTGTGCCT -/G GCTTCATTGC 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 G 1 2 150944 CASAVA_Build 18 46096815 1I GAAAAAACTA -/G CTGAGTGTGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 0 1 150945 CASAVA_Build 18 46102479 5D TATTTGTCAG TATAT/----- TATAATTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 4 TATAT 1 0 150946 CASAVA_Build 18 46103499 1D GAAGGGATGA G/- ATGATGTCGG 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 G 1 0 150947 CASAVA_Build 18 46103651 1D GGTTCAGCTT A/- CACAATTCTG 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 A 1 0 150948 CASAVA_Build 18 46117550 1I TTGTGGCAGA -/G GGGGCAAGCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 4 5 150949 CASAVA_Build 18 46118940 11D TGGTACTTCT GTGTGCTGAAG/----------- AGGGCTTTGT 3070 het 3070 hom 38 15 20 7 GTGTGCTGAAG 1 0 150950 CASAVA_Build 18 46121496 4I TAAATAAATA ----/AATT AATACACAAA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 AATT 0 1 150951 CASAVA_Build 18 46133361 3I GGTAATTGCT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 40 15 15 10 TTC 5 6 150952 CASAVA_Build 18 46134820 1I GTGCTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 20 11 A 12 13 150953 CASAVA_Build 18 46141017 1I GATAAGCAAG -/A AAAAATGCCT 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 5 6 150954 CASAVA_Build 18 46141912 1I52M3D AAGGAAGCAT -GGGCAAAAGGTGCTGAAATACAATCTCTGCTTATTAAAACAAACAAATAAACAAA/GGGGCAAAAGGTGCTGAAATACAATCTCTGCTTATTAAAACAAACAAATAAAC--- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 44 14 23 20 N/A 0 0 150955 CASAVA_Build 18 46143129 4D AAGAGGAAGA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 409 hom 48 9 14 26 TC 11 9 150956 CASAVA_Build 18 46143176 5I GACACAATGA -----/GAAGG CAGCTACCTG 2473 het 2473 ref 42 11 6 25 GAAGG 0 1 150957 CASAVA_Build 18 46144396 2I GGTTATCTCT --/TC TGTTTCTCTC 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 TC 0 1 150958 CASAVA_Build 18 46149989 1D TCCAGCCTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 T 7 6 150959 CASAVA_Build 18 46150272 5D TTGTATTTGC TTTAA/----- TTTATTTTCT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 TTTAA 1 0 150960 CASAVA_Build 18 46150935 2I TTTTAAAGTT --/TA TTGCATTCCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TA 0 1 150961 CASAVA_Build 18 46156927 4I TGGGTGAGAC ----/AGTG AGTGACTGTG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AGTG 1 2 150962 CASAVA_Build 18 46157181 1I TTTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 9 10 150963 CASAVA_Build 18 46158286 2I CTAAAGGGAC --/TG TGGGTTCATC 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 TG 1 2 150964 CASAVA_Build 18 46159263 3I GAATGATATA ---/CTC CTCATGATGA 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 CTC 1 2 150965 CASAVA_Build 18 46160142 7D CAGTTCCCTC TTCATAT/------- TGGAACCCCT 3070 het 3070 ref 53 26 24 6 TTCATAT 1 0 150966 CASAVA_Build 18 46168904 3D AGGTGTTGGA GAG/--- GAGAAGCATT 3070 het 3070 ref 37 25 12 0 GAG 2 1 150967 CASAVA_Build 18 46175894 1D CATGCCTGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 22 0 17 6 T 10 9 150968 CASAVA_Build 18 46178792 4I CTGAGACGTG ----/TTCA TTGTCTTTGT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TTCA 0 1 150969 CASAVA_Build 18 46182979 1D AGGTCATGAA T/- TTCTCTGTCC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 3 2 150970 CASAVA_Build 18 46187320 1I GATATCATCC -/A GCCACTTGTC 1909 het 1909 ref 15 7 7 1 A 0 1 150971 CASAVA_Build 18 46187854 2I CAACCTGCCG --/GT CATAGAAGCG 3070 het 3070 hom 39 10 26 3 GT 0 1 150972 CASAVA_Build 18 46211090 5I TCATTGATCC -----/TTGGA TTGGATGGCA 3070 het 3070 ref 45 18 11 16 TTGGA 1 2 150973 CASAVA_Build 18 46213988 1I TAACTTGTGA -/T TTTTTAGGAA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 5 6 150974 CASAVA_Build 18 46250804 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2075 het 2075 ref 41 25 6 10 A 13 12 150975 CASAVA_Build 18 46258405 1I TCATGCATTT -/G TTTCCATTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 150976 CASAVA_Build 18 46267119 1D AAATATTCTG T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 6 150977 CASAVA_Build 18 46282561 1D TTTCTGCTCT G/- GGTTTCTCCT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 3 2 150978 CASAVA_Build 18 46284634 1I CTTTATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 908 hom 31 2 21 8 T 12 13 150979 CASAVA_Build 18 46310685 1I CTCTGCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 23 1 17 5 A 12 13 150980 CASAVA_Build 18 46333541 2D TGAGTGTGTC TG/-- TGTGTTATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 3 2 150981 CASAVA_Build 18 46333860 3I AGTTCCTGTA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 AAC 5 6 150982 CASAVA_Build 18 46348564 1D ACGCTGTCCC A/- AAAAAAAAAA 1736 het 1736 ref 17 10 4 3 A 15 14 150983 CASAVA_Build 18 46352993 2I TTTCTGAACT --/AG AGAGGCAGTA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 AG 2 3 150984 CASAVA_Build 18 46356508 1I CTTTTTTTTT -/G GGGTATATAC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 G 3 4 150985 CASAVA_Build 18 46368493 1I CCCAAAACTT -/G GTGCCTTAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 1 2 150986 CASAVA_Build 18 46372891 1D TTAATTACAA C/- CCCCCCCGCT 3070 hom 71 het 31 0 24 7 C 8 7 150987 CASAVA_Build 18 46397606 8D TTGAACAGAA GACATCGG/-------- GACATCGGGG 3070 hom 60 het 26 0 21 9 GACATCGG 2 1 150988 CASAVA_Build 18 46414684 2I TTTTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 34 0 25 9 T 12 14 150989 CASAVA_Build 18 46450372 1I CTAAAAATAT -/A AAAAAATTAG 1850 het 643 hom 10 3 5 3 A 6 7 150990 CASAVA_Build 18 46452029 3I GGAGGCTTTG ---/GCA GGAAGACTGC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 GCA 0 1 150991 CASAVA_Build 18 46474199 1D TGGGCTTATG A/- AACGAGTGAG 3070 het 3070 hom 44 18 20 7 A 3 2 150992 CASAVA_Build 18 46488550 1I ATTCCTTTTT -/A AAAAAAGGTT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 A 6 7 150993 CASAVA_Build 18 46493090 1D GACTCTGAGG A/- GAGGCAGATG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 1 0 150994 CASAVA_Build 18 46499407 2I AGCCGAGATC --/GT GTGCCACTGC 3070 het 2864 hom 21 7 10 4 GT 1 2 150995 CASAVA_Build 18 46499724 3D TTAAAAACAA AAC/--- AAAAAAAAAT 2954 het 2954 ref 37 23 8 8 AAC 1 0 150996 CASAVA_Build 18 46502534 1D TTGCGGGGTA G/- GGGGCAGGCA 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 G 5 4 150997 CASAVA_Build 18 46502746 1D CTCTCTTTCC T/- TCATCCTCCC 3070 het 2924 hom 39 8 23 8 T 2 1 150998 CASAVA_Build 18 46519767 28D CATATATATA TACACATACATATATATATGTATATGTG/---------------------------- TACACATACA 3070 hom 54 het 21 0 19 5 TACACATACATATATATATGTATATGTG 2 1 150999 CASAVA_Build 18 46522560 1I GATCTCGCAT -/G GACTCGCTCA 3070 hom 93 het 32 0 31 1 G 1 2 151000 CASAVA_Build 18 46523969 2I TTACAGACAC --/TA TATACAGCCA 3070 het 3070 hom 48 21 19 8 TA 2 3 151001 CASAVA_Build 18 46524985 6I AAGGTGGGTG ------/GATCAC GATCACTTGA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 GATCAC 1 2 151002 CASAVA_Build 18 46545934 1D CGTGTAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 10 9 151003 CASAVA_Build 18 46553770 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAACAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 7 6 151004 CASAVA_Build 18 46565337 1I GCTTTGGTGT -/C CCCCCCCTCT 3070 hom 108 het 43 0 33 10 C 7 8 151005 CASAVA_Build 18 46576767 2I CTAACAGGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 30 6 A 11 13 151006 CASAVA_Build 18 46615552 1I CCCGCTTCAG -/C CCCCGCAAAG 3022 het 3022 ref 31 16 8 7 C 4 5 151007 CASAVA_Build 18 46620872 3I GACAGGCTCT ---/CTC GGTTGCCTGC 3070 hom 134 het 51 0 41 11 CTC 0 1 151008 CASAVA_Build 18 46621637 1I TTACTATTAC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 6 7 151009 CASAVA_Build 18 46641712 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1712 het 1663 hom 21 11 4 8 A 16 14 151010 CASAVA_Build 18 46647701 1D CTTTTGGAAG T/- TTAAAGAGCA 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 T 3 2 151011 CASAVA_Build 18 46647793 1D GCACTTCAGA G/- GGTCCTCCGT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 G 3 2 151012 CASAVA_Build 18 46648877 1D TATGTCTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1706 hom 36 8 14 14 A 17 16 151013 CASAVA_Build 18 46655702 1D TACATGTGTC T/- TTTTCCTGCC 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 5 4 151014 CASAVA_Build 18 46659173 1D CAGGAGTGCT G/- GGGGGCGCGG 2812 hom 38 het 15 0 7 9 G 6 5 151015 CASAVA_Build 18 46666536 3I TTTAAAATTT ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 9 12 151016 CASAVA_Build 18 46675621 4D GTAATTACAA TTAC/---- TTTATATGTT 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 TTAC 1 0 151017 CASAVA_Build 18 46678234 6D TCTCAAAAAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 AAAAAG 3 2 151018 CASAVA_Build 18 46698776 1I ACCCATGGTC -/T TGCCTTGCTT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 T 1 2 151019 CASAVA_Build 18 46699430 8I3M3D CTCCGTCAGT --------CAGATT/CTCCCGTGCAG--- TCAGATATTC 3070 hom 174 het 61 0 57 7 N/A 0 0 151020 CASAVA_Build 18 46717532 1D CAATTACTTG A/- AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 45 32 3 11 A 12 11 151021 CASAVA_Build 18 46719497 1D AAGAGAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 27 5 16 6 A 11 10 151022 CASAVA_Build 18 46751063 1I ACACATTTCC -/A AAAAAAAAAA 1788 het 1788 ref 29 12 4 13 A 15 16 151023 CASAVA_Build 18 46812106 1I ATTTAGTATC -/A AAAAAAAAAA 1399 het 1399 ref 30 23 3 4 A 13 14 151024 CASAVA_Build 18 46818622 1I GAGACTGTGG -/A GGGGGGGGGC 3070 het 646 hom 32 2 19 11 A 0 1 151025 CASAVA_Build 18 46836076 1D TTTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1596 het 1596 ref 31 22 6 3 T 12 11 151026 CASAVA_Build 18 46861540 5D ATTTTATGTC TACTT/----- TAAGGGTAAA 3070 het 3070 hom 22 11 10 3 TACTT 1 0 151027 CASAVA_Build 18 46862587 1D AAGTAATGCA T/- TTTTTTTTCC 1333 het 1333 ref 53 42 3 9 T 9 8 151028 CASAVA_Build 18 46868377 1I AGATCATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1260 hom 33 3 24 6 A 12 13 151029 CASAVA_Build 18 46917081 1I CATCTCAATT -/A AAAAAAAAAA 346 het 139 hom 10 1 2 7 A 15 16 151030 CASAVA_Build 18 46917111 5D GAAAAAAAAA TGTGT/----- TGGGGTGAGG 2901 hom 33 het 13 0 11 4 TGTGT 1 0 151031 CASAVA_Build 18 46924346 9I GCTGAGGTAG ---------/GAGGATCAC GAGGATCACC 3070 hom 30 het 10 0 11 1 GAGGATCAC 1 2 151032 CASAVA_Build 18 46946337 1I GTGAATTTAG -/A GATTTTTTTT 2552 het 49 hom 20 1 12 7 A 0 1 151033 CASAVA_Build 18 46960396 1I AGAATTAGTC -/T TAAGGGTCTA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 1 2 151034 CASAVA_Build 18 46961882 1D CAATGCTAGT A/- AAGAGTGGGG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 3 2 151035 CASAVA_Build 18 46968966 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 14 13 151036 CASAVA_Build 18 46971059 4I TAACTTAAAA ----/TTTT TTCTCAAAGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 6 151037 CASAVA_Build 18 46986785 1D ATTGATGTTT A/- TAGATGACTC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 1 0 151038 CASAVA_Build 18 47018794 1I ACTCCACCCT -/G GGTGACAGAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 2 3 151039 CASAVA_Build 18 47033766 1I ATGATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1061 hom 36 4 24 8 A 13 14 151040 CASAVA_Build 18 47038224 4D AAAACTTTAT ATCC/---- ATTGCATAGC 3070 hom 129 het 45 0 44 2 ATCC 1 0 151041 CASAVA_Build 18 47041407 5I AAGAAGTGTG -----/TTTTC TTTTGTTTTG 3070 hom 82 het 30 0 24 6 TTTTC 0 1 151042 CASAVA_Build 18 47054879 1I GCCTGCTTCA -/G CCTCCCAAAG 3070 hom 30 het 15 0 10 5 G 0 1 151043 CASAVA_Build 18 47056088 1I CGGAAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 38 1 27 10 A 12 13 151044 CASAVA_Build 18 47069173 1D TATCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 13 12 151045 CASAVA_Build 18 47076398 4I GTCATAACTC ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTTA 2 3 151046 CASAVA_Build 18 47098349 1I GTGCTGCTTC -/T TCCTAGAGTC 3070 hom 144 het 51 0 48 3 T 1 2 151047 CASAVA_Build 18 47125588 1I CATCTCCTGC -/T TTTCTTCTCT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 3 4 151048 CASAVA_Build 18 47140514 4D CTTTTATTAT TGAA/---- TGATTGATTG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 TGAA 1 0 151049 CASAVA_Build 18 47149477 1D TTCCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 41 2 17 24 T 15 14 151050 CASAVA_Build 18 47165628 1D CTCCCCACTA T/- TTTTTTTTTG 1690 het 1690 ref 34 16 9 9 T 10 9 151051 CASAVA_Build 18 47167723 1D ATAGGATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 10 9 151052 CASAVA_Build 18 47171866 4D CTGGCTAAAT AAAG/---- AAAGGGTACT 3070 het 3070 ref 46 26 14 9 AAAG 2 1 151053 CASAVA_Build 18 47172821 1D ATCAGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 2064 het 2064 ref 23 13 5 5 T 11 10 151054 CASAVA_Build 18 47176379 4I CCCCAGAGAT ----/GAAA GACTTTATTA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 GAAA 0 1 151055 CASAVA_Build 18 47185638 4I ATGGGCTGAA ----/TGTT TGTGTGCCCC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TGTT 0 1 151056 CASAVA_Build 18 47191282 6I GAAACGATAG ------/AAAGGC AAAGGCAAAG 3070 hom 105 het 47 0 34 13 AAAGGC 2 3 151057 CASAVA_Build 18 47195849 1I TTAGACTTAT -/A AAAAATATTT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 A 5 6 151058 CASAVA_Build 18 47197609 1D AAGCTAAAGC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 8 151059 CASAVA_Build 18 47208754 1D CAAATTCAAT G/- ATCATTTCAA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 G 1 0 151060 CASAVA_Build 18 47210414 1D CTTATTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 42 0 38 5 A 11 10 151061 CASAVA_Build 18 47214373 1I CTTTCCAAAA -/G AAACAAGATT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 0 1 151062 CASAVA_Build 18 47215176 1I AATAGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 10 11 151063 CASAVA_Build 18 47215516 21D ATGGTGTTAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/--------------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 35 het 28 1 27 1 T 30 9 151064 CASAVA_Build 18 47216239 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 A 15 14 151065 CASAVA_Build 18 47217264 2D AAACAAACAA AC/-- AAAAAACACA 1871 het 751 hom 28 7 7 15 AC 1 0 151066 CASAVA_Build 18 47221696 1D GAAGATAGTG C/- TAAATGATTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 0 151067 CASAVA_Build 18 47222872 2I GGTGGCTATA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 40 1 29 10 T 12 14 151068 CASAVA_Build 18 47224101 8I CTGACTCTTC --------/GCGTGCGT GCGTGCGCGT 3070 hom 134 het 51 0 42 9 GCGT 1 3 151069 CASAVA_Build 18 47225872 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAACCCA 3070 hom 7 het 21 1 17 3 A 7 6 151070 CASAVA_Build 18 47226331 1D CATTCATTAA C/- TTTGCTGGCT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 C 1 0 151071 CASAVA_Build 18 47226685 1D TATAGATGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 399 hom 35 1 25 10 A 10 9 151072 CASAVA_Build 18 47231934 9D ACATATATAT GTATATATG/--------- TATATATTAT 1269 hom 7 het 3 0 3 0 GTATATATG 1 0 151073 CASAVA_Build 18 47233613 14D ATGAAGAGTG CTGATTAATGGATC/-------------- CTTGTCAGCT 3070 hom 117 het 41 0 40 2 CTGATTAATGGATC 1 0 151074 CASAVA_Build 18 47275250 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 13 12 151075 CASAVA_Build 18 47290217 2I TTAGCTATCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 10 12 151076 CASAVA_Build 18 47290974 1D TTAAAAACTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 8 7 151077 CASAVA_Build 18 47295155 1I GCGTTGTTCA -/G GTAGACAATC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 G 1 2 151078 CASAVA_Build 18 47297604 1I CTGAGTTGCA -/C TAGGATGTGA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 C 0 1 151079 CASAVA_Build 18 47304000 1I CCAGCCACCT -/C CCATGTCACT 3070 het 3070 ref 68 34 25 9 C 2 3 151080 CASAVA_Build 18 47322645 4I TACTGAAGTG ----/ATAC ATAGCTTGGA 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 ATAC 0 1 151081 CASAVA_Build 18 47323488 2D CTCTCATCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2166 het 2166 ref 38 20 8 10 T 13 11 151082 CASAVA_Build 18 47324101 5I CTAAAAATCA -----/TTTTC TTTTATGTGT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 TTTTC 0 1 151083 CASAVA_Build 18 47326123 1I TGTTCTATGT -/C CTTTTACCTA 3070 het 3070 ref 26 13 7 6 C 1 2 151084 CASAVA_Build 18 47329398 2I TATTGCTGAC --/AA AAGAGTAAAT 3070 het 3070 ref 58 26 24 8 A 2 4 151085 CASAVA_Build 18 47329656 1I TTATAGTCAG -/T CATGAAATTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 0 1 151086 CASAVA_Build 18 47338428 1I TCCTTTTTTT -/G TTTTTTTAAA 3070 hom 49 het 24 0 17 7 G 0 1 151087 CASAVA_Build 18 47348606 1D TGGGACTAAG A/- AAAAAAAAAG 1226 het 1226 ref 45 36 3 6 A 10 9 151088 CASAVA_Build 18 47367526 1D CAAAAAAAAA G/- AAGAAGAAGA 364 het 364 ref 27 18 3 6 G 1 0 151089 CASAVA_Build 18 47380661 5D TTTGGTTTAC AGTTA/----- AGTTAAGTTA 3070 het 3070 hom 45 16 22 8 AGTTA 3 2 151090 CASAVA_Build 18 47383852 1I GGGAAATAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 9 10 151091 CASAVA_Build 18 47384456 1D CAAAATCCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 10 9 151092 CASAVA_Build 18 47397825 1I CACCCAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2429 hom 38 11 12 15 A 14 15 151093 CASAVA_Build 18 47409636 4D AGAAATCCTT AGAG/---- AGAAACAAGC 3070 het 3070 ref 31 13 14 6 AG 3 1 151094 CASAVA_Build 18 47416213 1D CCCTGGCTAC A/- AGTCTCCAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 A 2 1 151095 CASAVA_Build 18 47443951 1D CAATACAATT A/- TACTCTCTAG 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 1 0 151096 CASAVA_Build 18 47448914 1D GGGGGGCGGT G/- GGGGGGTCAT 3070 hom 99 het 36 0 29 9 G 7 6 151097 CASAVA_Build 18 47470178 1D GCTCATTTCC A/- AAGTTGCTTA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 3 2 151098 CASAVA_Build 18 47560829 1D GAGAGGAAAC A/- ACTCTGGGCT 3070 hom 114 het 41 0 35 6 A 2 1 151099 CASAVA_Build 18 47612881 1D ATTCCTATTG T/- TTTTTTTTAA 2921 hom 15 het 7 0 6 1 T 9 8 151100 CASAVA_Build 18 47617963 1I AGGTTATGTT -/G TATACTATAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 151101 CASAVA_Build 18 47621236 1D TGTTTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 11 10 151102 CASAVA_Build 18 47621849 1I GGGCCAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1663 hom 31 6 11 14 T 17 18 151103 CASAVA_Build 18 47622200 1D ACTTTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 44 0 31 13 T 12 11 151104 CASAVA_Build 18 47628229 6I TCCCTTATAT ------/AAGGGA GCCAATTTTG 3070 hom 42 het 19 0 14 5 AAGGGA 0 1 151105 CASAVA_Build 18 47631738 1D CTTTTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 29 0 18 11 T 13 12 151106 CASAVA_Build 18 47643737 1I GAATACATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 794 hom 33 2 23 9 T 11 12 151107 CASAVA_Build 18 47649029 1D TGCAGCCTCA C/- CCAACATCTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 3 2 151108 CASAVA_Build 18 47649141 1I ATGTAGAGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 189 hom 32 1 28 3 T 8 9 151109 CASAVA_Build 18 47649210 1I CCCATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 34 2 25 7 T 11 12 151110 CASAVA_Build 18 47650032 12I CATCTGTGAT ------------/TTCTTTTAGTAC TTCTTTTAGT 3070 hom 66 het 31 0 22 9 TTCTTTTAGTAC 1 2 151111 CASAVA_Build 18 47654211 2D ACCTCAGGCA GT/-- GTGGGCTGAT 3070 hom 93 het 34 0 29 5 GT 2 1 151112 CASAVA_Build 18 47669008 1I AGGGTCCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 52 hom 36 1 31 4 A 9 10 151113 CASAVA_Build 18 47672092 1D TTATGAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 35 2 20 13 T 13 12 151114 CASAVA_Build 18 47680847 1D TACATTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 10 151115 CASAVA_Build 18 47683817 3D AAAGAAACGA TTT/--- TTTAAAAAGC 3070 hom 105 het 36 0 35 1 T 6 3 151116 CASAVA_Build 18 47705272 4D GGTCATTAAA AATC/---- AAGTTCTCAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AATC 1 0 151117 CASAVA_Build 18 47705535 1D GATCTTAGAG A/- TAAATTACAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 0 151118 CASAVA_Build 18 47710695 2D CCAGCCTGTG AA/-- AGCAGCTGGT 3070 hom 77 het 29 0 22 8 A 3 1 151119 CASAVA_Build 18 47726909 1D TAGTGGGGTA G/- GGGGGATAGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 6 5 151120 CASAVA_Build 18 47737231 1I AATGGATTGA -/T TTTTTTTTTG 3069 het 3069 ref 30 18 8 4 T 9 10 151121 CASAVA_Build 18 47740384 1I AATGGCCCTT -/G ATTTTATTTC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 G 0 1 151122 CASAVA_Build 18 47747279 1I TTGATTTTTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 151123 CASAVA_Build 18 47751984 1D ACATGTATAC A/- AAAAAAATTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 8 7 151124 CASAVA_Build 18 47765380 5D AAGTGAGACC AATTA/----- AATTATTTCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 AATTA 2 1 151125 CASAVA_Build 18 47766125 1I TGACATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 24 2 15 7 T 14 15 151126 CASAVA_Build 18 47770857 1D CAAGGAATGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 A 10 9 151127 CASAVA_Build 18 47796126 1D TTTCTCGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 289 hom 32 3 14 16 T 17 16 151128 CASAVA_Build 18 47801802 4D ATATATTCTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 TA 11 9 151129 CASAVA_Build 18 47827129 1I AGGTGTGATT -/A AAAAAAAATC 2830 het 2830 ref 23 16 6 1 A 8 9 151130 CASAVA_Build 18 47830575 1I TATTGGAAAC -/A AAATGGTTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 3 4 151131 CASAVA_Build 18 47834513 1I CCCATGGTGA -/G GAAGCAGAAC 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 G 1 2 151132 CASAVA_Build 18 47836115 1D TTTTCCATAA C/- CAGAGAAAGT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 C 2 1 151133 CASAVA_Build 18 47837174 1I TGTGTTTTTT -/G CCTAATAGCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 151134 CASAVA_Build 18 47850388 1D CCATTCCCCC T/- GTCCAAGTGC 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 1 0 151135 CASAVA_Build 18 47853330 8D TCGGTTACTA TAGCTCTG/-------- TAGTGTAATT 3070 het 3070 hom 36 19 16 8 TAGCTCTG 1 0 151136 CASAVA_Build 18 47864424 1I ATTCTGAGGT -/C CCCCAACCGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 4 5 151137 CASAVA_Build 18 47870620 3I AATGAGTAGT ---/AGA AGAAGATCCT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AGA 2 3 151138 CASAVA_Build 18 47872791 1D CCTGTGTGTG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 151139 CASAVA_Build 18 47873224 1I ACACTCCAGT -/A AGGAAAATGC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 1 2 151140 CASAVA_Build 18 47878028 1I GATAACCTTT -/C CTTTTTCTCA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 1 2 151141 CASAVA_Build 18 47885760 1I TAATAGCTTT -/A AAAATGTGAA 3070 hom 120 het 51 0 41 10 A 4 5 151142 CASAVA_Build 18 47887657 1I CAGAAGACTC -/A ACAAGTCTAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 2 151143 CASAVA_Build 18 47902538 1I CTGTGCATTT -/C CCCCCCTCTT 3070 hom 69 het 29 0 25 4 C 6 7 151144 CASAVA_Build 18 47911338 2D AATTTCCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 30 10 A 13 11 151145 CASAVA_Build 18 47913993 1I CACACTGAAA -/G TATCAGGTAT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 0 1 151146 CASAVA_Build 18 47920872 1D CTTAATTAGG A/- AAAAAAGACT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 7 6 151147 CASAVA_Build 18 47921797 2D TCTCAGATTT AC/-- AGTCTCTCCT 3070 hom 163 het 57 0 54 3 AC 1 0 151148 CASAVA_Build 18 47928221 1D CACCTTGCAC T/- TTTATATTAT 3070 hom 123 het 42 0 42 1 T 4 3 151149 CASAVA_Build 18 47935471 5D CCTTTTTATA AGGAC/----- AGCAGTCCTA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AGGAC 1 0 151150 CASAVA_Build 18 47935614 1D TTTGAGGAGG A/- ATACTATTCA 3070 hom 87 het 32 0 28 4 A 2 1 151151 CASAVA_Build 18 47936088 1D GTTATGTGCA T/- TTTTTCACCT 3070 hom 90 het 39 0 31 9 T 6 5 151152 CASAVA_Build 18 47952531 3D AGGATGACTT GTA/--- GTCTTTGTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 GTA 1 0 151153 CASAVA_Build 18 47952835 5D TCTTTCTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2782 het 180 hom 23 4 8 12 T 19 14 151154 CASAVA_Build 18 47953671 11D TAATGGCTAA TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 20 9 151155 CASAVA_Build 18 47965557 1D TTTAATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 12 11 151156 CASAVA_Build 18 47965706 3I AATAGCACTT ---/ATA ATTATGATTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 ATA 0 1 151157 CASAVA_Build 18 47972859 16D CACTTTCTTC CCTCCCTCCCTCCCTT/---------------- CCTCCCTCCC 2104 hom 29 het 13 0 8 8 CCTCCCTCCCTCCCTT 2 1 151158 CASAVA_Build 18 47998844 1D TCCTTCAACT G/- ACTTCCTCAC 3070 hom 138 het 52 0 45 7 G 1 0 151159 CASAVA_Build 18 48015925 1D CCATATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 19 1 13 6 A 13 12 151160 CASAVA_Build 18 48020494 1D CAAAACACGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 10 9 151161 CASAVA_Build 18 48030536 1I CAGTCAGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 10 11 151162 CASAVA_Build 18 48047303 1D TGGAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2006 hom 24 9 10 5 A 13 12 151163 CASAVA_Build 18 48049645 1D TTAGTGGAAA G/- GGTTGAACAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 3 2 151164 CASAVA_Build 18 48054708 1I GCAAGTATAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 114 het 42 0 37 5 A 8 9 151165 CASAVA_Build 18 48061171 2D TACAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 27 7 A 14 12 151166 CASAVA_Build 18 48063999 1I4M2I GTTGGAACTT -AGTT--/AAGTTTC AACTTCATTA 3070 hom 96 het 33 0 31 2 N/A 0 0 151167 CASAVA_Build 18 48070257 1I CATTTCTGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 50 30 13 7 T 8 9 151168 CASAVA_Build 18 48071361 5I TTATAGAAAC -----/TTATG TTAAATAAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTATG 0 1 151169 CASAVA_Build 18 48074526 3D CCGCAGAAGT AGA/--- AGAACATACT 3070 het 3070 hom 37 14 22 3 AGA 2 1 151170 CASAVA_Build 18 48076152 3D GCAATCAAAA AGG/--- AGCCCATGTT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 AGG 1 0 151171 CASAVA_Build 18 48077493 1I AATACCCAAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 7 8 151172 CASAVA_Build 18 48077808 1D AAGCACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2656 hom 34 11 13 10 A 13 12 151173 CASAVA_Build 18 48080436 1I GAAATTTGGG -/T GGGAACACAG 3070 hom 123 het 47 0 40 7 T 0 1 151174 CASAVA_Build 18 48083427 1I AACAATGGCT -/A AAATCTTCCC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 3 4 151175 CASAVA_Build 18 48086740 4D ATATTACCTA TTAG/---- TTCTGTCCCT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 TTAG 1 0 151176 CASAVA_Build 18 48087835 5D16M1D CCCTAAAACT TAAAGTATAGTAAAAAAAATTA/-----TATAGTAAAAAAAATT- AAAAAAAAGA 3070 het 393 hom 20 2 13 11 N/A 0 0 151177 CASAVA_Build 18 48088763 1I CAAGTGATTC -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 7 8 151178 CASAVA_Build 18 48095075 1D CACATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2198 het 1252 hom 15 5 7 3 T 11 10 151179 CASAVA_Build 18 48109308 2D TCAGAGTGAA AG/-- AGAGGGAGGA 3070 het 3070 ref 32 14 11 9 AG 3 2 151180 CASAVA_Build 18 48113097 1D CCAGATATGA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 43 13 24 6 T 8 7 151181 CASAVA_Build 18 48122008 4D ATGGCAAAAC TGTT/---- TGGGGATTGG 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 TGTT 1 0 151182 CASAVA_Build 18 48122251 2D ATGAGCATTC AG/-- AGAGCCCTTC 2768 het 2768 ref 26 14 9 4 AG 3 2 151183 CASAVA_Build 18 48124317 1I AATCACCAGT -/G ACCTGTCAGT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 G 0 1 151184 CASAVA_Build 18 48125029 1I TTAAAAGCAG -/T TGCTGAAGTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 1 2 151185 CASAVA_Build 18 48125151 3D GCATGTGAAA CTT/--- CTTCTTCATG 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 CTT 3 2 151186 CASAVA_Build 18 48129550 1D TGTGCACCAT C/- CCCCCCAATT 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 C 7 6 151187 CASAVA_Build 18 48131534 1I AATATCAGGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 49 16 23 10 A 8 9 151188 CASAVA_Build 18 48131801 1I TTTTCCTTGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 7 8 151189 CASAVA_Build 18 48133652 1I TCAATACTCA -/G TATAAGAACG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 G 0 1 151190 CASAVA_Build 18 48137157 1D ACCTAAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 12 11 151191 CASAVA_Build 18 48151525 1I TGGCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 7 15 3 A 11 12 151192 CASAVA_Build 18 48152988 1D CTTTTTGTCA T/- TTAACGTGAG 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 3 2 151193 CASAVA_Build 18 48158004 1I CAATTATGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3040 hom 23 8 10 5 T 9 10 151194 CASAVA_Build 18 48187385 3D TCTCTGACTT CTC/--- CTACTAGATT 3070 het 3070 hom 48 23 23 3 CTC 1 0 151195 CASAVA_Build 18 48188147 2D AAAAGTACAT TC/-- TCTATTTCTA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 TC 2 1 151196 CASAVA_Build 18 48188682 1I GACATTTTAA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 81 het 36 0 27 9 T 7 8 151197 CASAVA_Build 18 48193967 3I GTTCTGATAG ---/TTT TTATTATTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 2 5 151198 CASAVA_Build 18 48200021 1I GCATTTGTCA -/T TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 T 6 7 151199 CASAVA_Build 18 48200961 1I TGAACACGTG -/A AAATCAATGA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 3 4 151200 CASAVA_Build 18 48205291 5D TTTCCTTTTC TTTTT/----- TATTTTCTTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 6 1 151201 CASAVA_Build 18 48210763 1D ACAGTACAAG A/- AAAAATGCAT 3070 het 3070 ref 57 33 20 5 A 6 5 151202 CASAVA_Build 18 48223818 1D AATGATGGTG T/- TTGTGGGACT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 3 2 151203 CASAVA_Build 18 48237318 1D TTCATACTTG T/- TTTTTTTTTA 1294 het 1294 ref 45 32 4 9 T 10 9 151204 CASAVA_Build 18 48247413 1D TGGTTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2008 hom 19 6 12 1 A 10 9 151205 CASAVA_Build 18 48247750 1D GAACTCATCC T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 19 10 9 0 T 7 6 151206 CASAVA_Build 18 48259482 4D CCTCATAGAC TTGT/---- TTGTGAAAGT 3070 het 3070 hom 41 18 18 8 TTGT 2 1 151207 CASAVA_Build 18 48259949 1D CCTCCCTCCA C/- CCCCCCCCCG 3070 het 54 hom 21 2 13 6 C 10 9 151208 CASAVA_Build 18 48288468 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 12 11 151209 CASAVA_Build 18 48301547 1D GAATTGTGAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 T 9 8 151210 CASAVA_Build 18 48341657 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTATG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TG 3 4 151211 CASAVA_Build 18 48369104 1D TGTATAAAGA C/- CCAGTGGAAG 3070 hom 129 het 46 0 44 3 C 3 2 151212 CASAVA_Build 18 48377481 1D TTCTATTTTT G/- CCAGAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 G 1 0 151213 CASAVA_Build 18 48383058 1D AAGAGACGAC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 T 9 8 151214 CASAVA_Build 18 48384254 2D TTTCCTCTCA TT/-- TTATGTATGT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 4 2 151215 CASAVA_Build 18 48385395 1D TCTGGAATCT A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 7 6 151216 CASAVA_Build 18 48389791 1I TGGCTTAAGC -/T AACATTCACT 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 T 0 1 151217 CASAVA_Build 18 48390093 1I CGGGGACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2814 hom 40 11 16 13 A 11 12 151218 CASAVA_Build 18 48391220 1D TTACAAATGT A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 7 6 151219 CASAVA_Build 18 48396634 1D TTTTGGTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 T 10 9 151220 CASAVA_Build 18 48400085 1D CTGTCATATT C/- AGAGTTTCCT 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 C 1 0 151221 CASAVA_Build 18 48416185 1I GAATTAAACT -/C CCCCCCAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 C 6 7 151222 CASAVA_Build 18 48416759 1I GGCAGGGGAA -/G AACCAAGCCC 3070 hom 78 het 28 0 24 4 G 0 1 151223 CASAVA_Build 18 48421971 2D GCTAACAAAC AT/-- ATGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 7 5 AT 2 1 151224 CASAVA_Build 18 48424327 1I AGTATTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1109 hom 36 3 29 4 T 10 11 151225 CASAVA_Build 18 48429799 1D AGATTATATC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 28 11 11 7 T 9 8 151226 CASAVA_Build 18 48436912 1D TTGCATTCTA C/- TTACATGTTG 3070 het 3070 hom 48 22 23 5 C 1 0 151227 CASAVA_Build 18 48438972 2D TGAATCTGAG AA/-- ATATGATGAG 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 A 3 1 151228 CASAVA_Build 18 48439262 7I AATGTTTTTA -------/CCAGATT CCTTTGATCC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 CCAGATT 0 1 151229 CASAVA_Build 18 48448427 2I AAACAACAAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 9 11 151230 CASAVA_Build 18 48462267 1D CTTCCCTTCT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 A 8 7 151231 CASAVA_Build 18 48463100 4I AGAAAACAAA ----/ACAG ACAGACAGAG 3070 het 3070 hom 55 23 23 9 ACAG 2 3 151232 CASAVA_Build 18 48464755 1D TTCTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 47 0 38 10 T 11 10 151233 CASAVA_Build 18 48465117 1D AAATATTCAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 9 8 151234 CASAVA_Build 18 48473558 1I GTGAGCTTTT -/G ATCAGTTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 151235 CASAVA_Build 18 48477252 10D TTGCATCAGA AATAAAAGTT/---------- AATAAAAGTT 3070 het 3070 hom 36 17 19 6 AATAAAAGTT 2 1 151236 CASAVA_Build 18 48480417 1D CTGTTTATGC A/- AAAAAAAAAA 1035 het 1035 ref 36 17 3 16 A 13 12 151237 CASAVA_Build 18 48480726 2D CACTCACATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 61 21 26 14 CA 6 5 151238 CASAVA_Build 18 48482088 1I TTATGTTGGA -/C CTTTGTCACC 3070 hom 159 het 61 0 53 8 C 1 2 151239 CASAVA_Build 18 48484098 1D TTGCAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 T 11 10 151240 CASAVA_Build 18 48484169 1D AGTTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 947 hom 34 3 18 13 A 11 10 151241 CASAVA_Build 18 48488810 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2368 hom 31 het 14 0 6 8 A 18 16 151242 CASAVA_Build 18 48498596 1I AGAAGGTGCT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 7 8 151243 CASAVA_Build 18 48499570 8I CACAGGATGA --------/TTTCATCC TTTCATCCTG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 TTTCATCC 1 2 151244 CASAVA_Build 18 48499979 1I TCTAAGGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1324 hom 33 5 24 4 A 12 13 151245 CASAVA_Build 18 48510205 1D GAACACTAGA C/- CTGGAAGGAT 3070 het 3070 ref 50 23 25 2 C 2 1 151246 CASAVA_Build 18 48519269 2D CTGGCTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 2079 hom 14 het 19 0 11 8 A 18 16 151247 CASAVA_Build 18 48527159 2I AAACTAAAAC --/AA ATAGATAATA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 1 3 151248 CASAVA_Build 18 48527469 1I TTCAACCAAA -/G ATTTAGAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 0 1 151249 CASAVA_Build 18 48545401 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1381 het 1381 ref 28 20 4 4 T 13 12 151250 CASAVA_Build 18 48553891 4I TCTATCTATT ----/TATC TATCTATCTA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 TATC 3 4 151251 CASAVA_Build 18 48555142 1D AGGAGAGGTG C/- CCCTGAACCA 3070 hom 100 het 42 0 31 11 C 4 3 151252 CASAVA_Build 18 48557685 3I TGAAGGCCAT ---/GAG GAGAACTCAG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 GAG 1 2 151253 CASAVA_Build 18 48559839 1I ACGTCCCTGC -/A AAGGACATGA 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 A 2 3 151254 CASAVA_Build 18 48561786 3I TATCTGAGCT ---/TGA TGATTACAAG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 TGA 1 2 151255 CASAVA_Build 18 48579136 1I TTTTTTTTTT -/C TTAAGGTGGA 3070 hom 12 het 35 2 28 5 C 0 1 151256 CASAVA_Build 18 48582849 1D CTCCCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 2328 het 2328 ref 21 8 7 6 T 12 11 151257 CASAVA_Build 18 48584619 7I GTATACAACT -------/TTAGAAG TTAGTTCTCA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 TTAGAAG 0 1 151258 CASAVA_Build 18 48587901 4D AGCACAGCTA TTAG/---- TTTAGTAATG 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 TTAG 1 0 151259 CASAVA_Build 18 48588771 1I AAGATTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 17 17 16 T 13 14 151260 CASAVA_Build 18 48593613 28I TAGTTCACTA ----------------------------/AAGACAGAGTTGTCTAGCCTTAACATTT AATGCCACAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AAGACAGAGTTGTCTAGCCTTAACATTT 0 1 151261 CASAVA_Build 18 48596922 1I GAACCTGCTG -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 44 29 10 5 T 6 7 151262 CASAVA_Build 18 48598160 2I ATAAAATGTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 TA 6 7 151263 CASAVA_Build 18 48606059 1D GGTTTGTTTT A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 A 7 6 151264 CASAVA_Build 18 48612820 4I TGTGCACCCT ----/CAAA CAAAAACCCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CAAA 1 2 151265 CASAVA_Build 18 48615278 6I GCATACACTA ------/TATATG TATATGTATA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 TATATG 2 3 151266 CASAVA_Build 18 48618549 2D TGAAGGAGCA CT/-- CTCTATTTGT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 CT 3 2 151267 CASAVA_Build 18 48621333 2D TGCTATGATG AA/-- AAAAAAAAGC 3070 het 275 hom 41 4 12 25 A 10 8 151268 CASAVA_Build 18 48622374 2D ATTTTTGCGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 36 0 27 12 AT 8 7 151269 CASAVA_Build 18 48631555 1I TTTGAAACTT -/A ACAATATTTT 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 A 1 2 151270 CASAVA_Build 18 48637480 1D TCCATTTTGG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 A 8 7 151271 CASAVA_Build 18 48642034 1D AAAATCATTT A/- AAAAAAGCGT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 7 6 151272 CASAVA_Build 18 48653587 3I CTCCAAGTCT ---/TTC TTCTTCAACA 3070 hom 129 het 44 0 43 1 TTC 2 3 151273 CASAVA_Build 18 48655598 1D ACAGCGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 12 11 151274 CASAVA_Build 18 48657209 1D TGACGTTTGC T/- TTTGGGCTGC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 4 3 151275 CASAVA_Build 18 48658073 1D GAGACAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 11 10 151276 CASAVA_Build 18 48658180 1I TCATGAGATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 9 151277 CASAVA_Build 18 48664094 3D TCTACTTAAG AGT/--- AGTAGTTTAT 3070 hom 90 het 38 0 31 9 AGT 3 2 151278 CASAVA_Build 18 48674276 1I AATACAATTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 8 9 151279 CASAVA_Build 18 48677251 1D ATTTACTGGG T/- TGATTCTGTG 3070 hom 112 het 45 0 38 8 T 2 1 151280 CASAVA_Build 18 48678085 2I AGATCACATA --/TT GGGTGAACAT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 0 2 151281 CASAVA_Build 18 48678233 1I GTGGGAGAAT -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 7 8 151282 CASAVA_Build 18 48687224 1D TACAGGGCTG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 9 8 151283 CASAVA_Build 18 48688978 1D TGAAATGCAG T/- TTTAAAAGAC 3070 het 3070 hom 33 15 13 6 T 4 3 151284 CASAVA_Build 18 48691807 4I TAAGATAAAT ----/AAAG ATTCAGATTA 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 AAAG 0 1 151285 CASAVA_Build 18 48692099 1D ATATTTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 11 11 T 11 10 151286 CASAVA_Build 18 48692687 1D GCTATTATAA T/- TATCTTAGCA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 2 1 151287 CASAVA_Build 18 48694590 1I ATCTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 480 het 480 ref 30 17 3 10 A 9 10 151288 CASAVA_Build 18 48694911 1D CTCCATGTCC A/- AAAGCTCCTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 4 3 151289 CASAVA_Build 18 48696578 3D ATTAGCTACC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 276 hom 39 4 19 16 T 14 11 151290 CASAVA_Build 18 48698354 1D AAAAAATCCA T/- TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 T 7 6 151291 CASAVA_Build 18 48700004 1D TCGATGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 15 14 T 11 10 151292 CASAVA_Build 18 48701518 2D AAAGTAAAGG GT/-- GTAAATAATG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 GT 2 1 151293 CASAVA_Build 18 48702447 2I AGGAAATGAA --/GC GCATACCATC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 GC 1 2 151294 CASAVA_Build 18 48705343 1I TTATCTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 T 10 11 151295 CASAVA_Build 18 48711399 1D TTTTAAGGGA T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 53 het 30 0 26 4 T 8 7 151296 CASAVA_Build 18 48711797 1D TTTATTAGAC T/- CTTGTTTTGC 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 T 1 0 151297 CASAVA_Build 18 48715561 3D CATTTACAAT AGC/--- AGTGGATCAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 8 AGC 1 0 151298 CASAVA_Build 18 48715741 1I CCTATATCAA -/T TTTAATAGTA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 3 4 151299 CASAVA_Build 18 48718204 1I CACTTGTGAC -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 T 7 8 151300 CASAVA_Build 18 48721871 4I TGTGTGTGTG ----/TGTA TATATATATA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 TGTA 0 1 151301 CASAVA_Build 18 48724115 1I GGTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 860 hom 27 3 22 2 G 0 1 151302 CASAVA_Build 18 48726139 1D CTTGTCAACC A/- TGGGTCACAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 1 0 151303 CASAVA_Build 18 48760380 11D TATCCCCTGA GACATAGGCAC/----------- GGCTTTCGTG 3070 het 3070 ref 46 22 21 7 GACATAGGCAC 1 0 151304 CASAVA_Build 18 48768633 1D GTGTTTCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 12 11 151305 CASAVA_Build 18 48771308 1I ATGAAAACTC -/T TTGATAAGTA 3070 het 3070 hom 53 22 27 4 T 2 3 151306 CASAVA_Build 18 48775854 1D AAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 27 19 8 T 11 10 151307 CASAVA_Build 18 48783017 4D ACATGCCAGA TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 2320 hom 26 5 15 6 TATT 5 4 151308 CASAVA_Build 18 48783591 1I CCTGAATGAC -/T TAATTAGAAG 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 1 2 151309 CASAVA_Build 18 48792117 1D CCTACCTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 10 9 151310 CASAVA_Build 18 48794067 1D CCCAGAACTT A/- AAAAAAAAAA 1976 het 1976 ref 29 18 6 5 A 17 16 151311 CASAVA_Build 18 48797427 1I TCATGGTATG -/T TTTTTTTTTT 1913 het 1913 ref 30 15 10 5 T 10 11 151312 CASAVA_Build 18 48809985 1I TCTATGTGTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 70 het 28 0 24 4 T 8 9 151313 CASAVA_Build 18 48815069 1D CTGCTCCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 T 13 12 151314 CASAVA_Build 18 48819036 4D CCATGACCAC TAAG/---- TGTTTATAAA 3070 het 3070 ref 40 27 10 3 TAAG 1 0 151315 CASAVA_Build 18 48821479 21I TCTTTGCCCG ---------------------/TGCCTATGTCCTGAATGGTAT TGCCTAGGTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 TGCCTATGTCCTGAATGGTAT 0 1 151316 CASAVA_Build 18 48824808 1D TGCTGCTGAT A/- TATATGAACT 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 A 1 0 151317 CASAVA_Build 18 48826848 1I TTAAAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 667 hom 36 2 28 6 A 10 11 151318 CASAVA_Build 18 48829545 5D GCAGAGGCTC TTTAG/----- TTTAATTAGG 3070 het 3070 ref 38 23 13 4 TTTAG 1 0 151319 CASAVA_Build 18 48840447 1I TAGCGGCTCA -/C CTGCAAACTC 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 C 1 2 151320 CASAVA_Build 18 48843651 1D ACTCACTCAC T/- TTTTTTTTTC 984 het 984 ref 32 25 3 5 T 10 9 151321 CASAVA_Build 18 48843904 1I TTATTTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 11 12 151322 CASAVA_Build 18 48846722 28D TACATGTGTG TATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATA 3070 hom 24 het 15 0 9 6 TA 22 8 151323 CASAVA_Build 18 48863390 1D TCTAAGGTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 11 13 8 T 10 9 151324 CASAVA_Build 18 48872392 2D GTGAACTATC TT/-- TATATGACAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 T 3 1 151325 CASAVA_Build 18 48873346 1I ATTACTATTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 A 8 9 151326 CASAVA_Build 18 48881338 1D TCCAGACCAT G/- GGGGAGGAAG 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 G 5 4 151327 CASAVA_Build 18 48887910 1D AAAAGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 1355 het 153 hom 23 3 4 17 A 13 12 151328 CASAVA_Build 18 48891800 3D AGACAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAT 2501 het 1894 hom 19 7 9 5 AAG 1 0 151329 CASAVA_Build 18 48894082 1D AAAAACCTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 151330 CASAVA_Build 18 48894619 1I TTAATGAACA -/C CCCCCCCCAC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 C 8 9 151331 CASAVA_Build 18 48897081 3D ATATCATACA CTT/--- CTTCTACTTC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 CTT 2 1 151332 CASAVA_Build 18 48898060 1D ACTTTTTTTT G/- TAAAGACCAG 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 G 1 0 151333 CASAVA_Build 18 48916489 1D CTGCAGTTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 10 9 151334 CASAVA_Build 18 48918354 1I CTGCTAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 10 11 151335 CASAVA_Build 18 48925911 4D TCGACTCTGA TGGT/---- TGGTGCCTTA 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 TGGT 2 1 151336 CASAVA_Build 18 48932952 1D TTCTTAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 18 18 2 A 9 8 151337 CASAVA_Build 18 48942667 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1498 het 1498 ref 25 16 5 5 A 17 16 151338 CASAVA_Build 18 48952989 2D CATACCCAAG GT/-- GTTTGATAGG 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 GT 2 1 151339 CASAVA_Build 18 48964371 3D CATCTCATTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 32 2 16 14 A 20 17 151340 CASAVA_Build 18 48967498 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2662 hom 25 8 14 4 T 11 10 151341 CASAVA_Build 18 48971818 1D TTTTGCCAAT C/- TTCTTAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 C 1 0 151342 CASAVA_Build 18 48972130 2D TTACTCAGTG TT/-- TACTCAGCAT 3070 het 3070 ref 56 30 21 6 T 3 1 151343 CASAVA_Build 18 48973854 1D GCACTGCCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 9 8 151344 CASAVA_Build 18 48978801 8D AACTGAGCAG CTCTCTCT/-------- CTCTCTCTCT 3070 hom 84 het 33 0 29 6 CT 11 7 151345 CASAVA_Build 18 48984557 1I GGGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 437 hom 17 1 11 5 A 9 10 151346 CASAVA_Build 18 48984918 3D CTGTTTCTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 14 12 14 A 15 12 151347 CASAVA_Build 18 48987399 2D TTTTCAACTT TC/-- TGTTTTATCT 3070 het 3070 ref 33 15 14 6 TC 1 0 151348 CASAVA_Build 18 48988874 1D GGTGTAAATG A/- TAGACAATCC 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 A 1 0 151349 CASAVA_Build 18 48992792 4D GCATCTATTG TATC/---- TATCTATCTC 3070 het 3070 ref 40 18 16 7 TATC 3 2 151350 CASAVA_Build 18 48993036 12D CAATTCTTGT TTTTTTTTTTTC/------------ TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 12 10 9 TTTTTTTTTTTC 1 0 151351 CASAVA_Build 18 48994266 4I TTTAACTTAA ----/AAAT AAATTTACAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AAAT 1 2 151352 CASAVA_Build 18 49000366 1D GGATTTTGAT G/- GAAGTCTCTA 3070 het 3070 hom 33 14 19 0 G 2 1 151353 CASAVA_Build 18 49003038 2I ACAGGCGTGA --/AC ACCACCACGC 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 AC 1 2 151354 CASAVA_Build 18 49011359 1I AAAATTGGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 24 14 9 T 9 10 151355 CASAVA_Build 18 49060016 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 14 2 9 5 A 17 16 151356 CASAVA_Build 18 49062434 1D AAACAAATGG C/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 C 1 0 151357 CASAVA_Build 18 49064284 4I GCTAAAAAAC ----/AAAT AAACAGATCA 3070 hom 128 het 49 0 43 6 AAAT 0 1 151358 CASAVA_Build 18 49069524 1D TCTGCATGAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 9 8 151359 CASAVA_Build 18 49075920 4D GATAGATACT GTAA/---- GTTAAACATT 3070 het 3070 hom 38 16 19 6 GTAA 1 0 151360 CASAVA_Build 18 49089209 9D AGTTCAGGAG GCCAGAAGT/--------- CTGACATTAA 3070 het 3070 hom 39 17 22 4 GCCAGAAGT 1 0 151361 CASAVA_Build 18 49092898 1D ATATACATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 8 het 19 1 17 2 A 10 9 151362 CASAVA_Build 18 49100235 1I ACATATGGAC -/T TTATTCCCAT 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 T 2 3 151363 CASAVA_Build 18 49104327 1D CTGACAAGAC A/- AAGTTAAGAA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 3 2 151364 CASAVA_Build 18 49108866 3D TTTGATACAT AAG/--- AAGATCTCAG 3070 het 3070 ref 66 36 27 4 AAG 2 1 151365 CASAVA_Build 18 49113176 1I ATAGAGCTAT -/G TACCACTAAG 3070 hom 67 het 24 0 20 4 G 0 1 151366 CASAVA_Build 18 49113438 1I AACCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1843 hom 30 6 9 15 A 15 16 151367 CASAVA_Build 18 49126130 1I CATTGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 10 11 151368 CASAVA_Build 18 49129365 1D ATGCAACTTT C/- TGCAGCTGGT 3070 het 3070 ref 25 14 10 3 C 1 0 151369 CASAVA_Build 18 49133791 4I ATAGATAAAT ----/AAAC AAATATCCTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AAAC 0 1 151370 CASAVA_Build 18 49142197 1D AAATTATGTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 8 7 151371 CASAVA_Build 18 49147646 2D AAAGAAAAAA AT/-- GAGTATAGCC 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 AT 1 0 151372 CASAVA_Build 18 49148842 4D TTTCCTTTTG TTAC/---- TTACCTCTTC 3070 het 3070 hom 44 20 22 3 TTAC 2 1 151373 CASAVA_Build 18 49151510 4I GCCAAATCTT ----/ATAA ATAAGATGAG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 ATAA 1 2 151374 CASAVA_Build 18 49153145 1I CCACGGCCTT -/C CCACTCTCTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 2 3 151375 CASAVA_Build 18 49154257 1I TCAAGTGTGA -/T TATATGTATG 3070 het 3070 hom 57 21 28 8 T 1 2 151376 CASAVA_Build 18 49155600 6D AGCCTCTCTG TATCTT/------ TATCTTTATA 3070 het 3070 hom 49 22 25 3 TATCTT 2 1 151377 CASAVA_Build 18 49161513 42I TGATGACTGC ------------------------------------------/TACTCAAGAGGATCCATGTAACAGCTAGATGACATGTTGTCT TTCAGATTAA 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 TACTCAAGAGGATCCATGTAACAGCTAGATGACATGTTGTCT 0 1 151378 CASAVA_Build 18 49164488 1D TCTGGTCATC G/- TATATGCCTA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 1 0 151379 CASAVA_Build 18 49165214 1D TTACCTCAAT A/- ATTTTTTTTT 3070 het 2214 hom 31 11 17 3 A 2 1 151380 CASAVA_Build 18 49169649 2D GGAAGAGAAA AG/-- AAAAAAGTTC 2167 het 2167 ref 35 28 5 2 AG 1 0 151381 CASAVA_Build 18 49171534 1I AGCAACAATG -/A AAAACAGAGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 4 5 151382 CASAVA_Build 18 49172703 1D GTTGAAGATA T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 7 6 151383 CASAVA_Build 18 49173526 1D TTCGAGGATG T/- TTTTTAACCC 3070 hom 93 het 36 0 30 6 T 6 5 151384 CASAVA_Build 18 49176478 1I TAGTAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 11 12 151385 CASAVA_Build 18 49178344 1D CTTTATGCAA T/- TTTAAATAGT 3070 het 3070 hom 43 14 26 3 T 4 3 151386 CASAVA_Build 18 49181651 3D ATGTTTTCTT CTC/--- CTTCATTCCC 3070 het 3070 hom 32 10 18 5 CTC 1 0 151387 CASAVA_Build 18 49183097 3D AATTTCCAAC AAT/--- GTTTATTTTC 3070 het 3070 hom 41 18 19 7 AAT 1 0 151388 CASAVA_Build 18 49183656 10D GCTTAATGAC TGTGTTTGTG/---------- TGTGTTTGTG 3070 het 3070 ref 36 24 9 6 TGTGTTTGTG 2 1 151389 CASAVA_Build 18 49184077 1D TTTTTTCCTT C/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 C 1 0 151390 CASAVA_Build 18 49184630 2I16M1I ATAGAAAAAG --ATGTTTTTGGCAAAGG-/ATATGTTTTTGGCAAAGGA AAAAATAAGT 3070 het 3070 ref 26 15 10 3 N/A 0 0 151391 CASAVA_Build 18 49185126 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1090 hom 22 8 9 5 A 10 9 151392 CASAVA_Build 18 49187072 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 134 hom 24 2 11 11 A 13 12 151393 CASAVA_Build 18 49191257 2I GCTAGAAGTT --/TG TATTGATGTC 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 TG 0 1 151394 CASAVA_Build 18 49191499 1I TAGAAACTAT -/A AAAAAAGTTG 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 6 7 151395 CASAVA_Build 18 49193020 1I CCCAGTACTC -/T ACTGGGTAAT 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 T 0 1 151396 CASAVA_Build 18 49196182 1D TTGCATGCAG T/- TTTTTTTTAC 3070 het 498 hom 31 2 14 15 T 9 8 151397 CASAVA_Build 18 49197771 2D CCTACTTGCT TC/-- CACTGAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 5 TC 1 0 151398 CASAVA_Build 18 49200194 1D TCCAAAAGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2910 hom 28 8 16 4 T 10 9 151399 CASAVA_Build 18 49205013 1I TTACCGGGGG -/A AAGAGTAGCT 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 A 2 3 151400 CASAVA_Build 18 49207019 1I GTTTGTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 8 9 151401 CASAVA_Build 18 49207942 1I GGAGATAGTC -/T AAGTGTAGTT 3070 het 3070 hom 48 23 23 2 T 0 1 151402 CASAVA_Build 18 49209580 2D TACTTTGGTG CT/-- TGCAAAAAAT 1195 het 1195 ref 24 18 3 5 CT 1 0 151403 CASAVA_Build 18 49209778 1D TATCCTGGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 T 8 7 151404 CASAVA_Build 18 49213109 3D ATCTTTTATC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 29 11 10 9 ATT 7 6 151405 CASAVA_Build 18 49214031 3I ATGCATCACA ---/GTT GTTATATAAA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 GTT 1 2 151406 CASAVA_Build 18 49220868 1D TGCAAACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 13 12 151407 CASAVA_Build 18 49221183 1D GTCCTAGTCT A/- AACCCAGATT 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 A 3 2 151408 CASAVA_Build 18 49230489 8D TCATAGGGGG ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 1897 hom 29 7 17 8 AT 11 7 151409 CASAVA_Build 18 49233915 1D CTTATTCAGG T/- TAAGTGTCTA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 T 2 1 151410 CASAVA_Build 18 49254395 9D AATTTTTGTT ATTTTTGTA/--------- ATTATCAGAT 3070 het 3070 ref 31 17 13 3 ATTTTTGTA 1 0 151411 CASAVA_Build 18 49263086 6D CATTGTCACA TTTATG/------ AGTAAAAAGT 3070 het 3070 ref 30 19 9 5 TTTATG 1 0 151412 CASAVA_Build 18 49276833 4D CACCAACATC AAAG/---- AAAGACCAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAAG 2 1 151413 CASAVA_Build 18 49282253 4I TTTTTACTAG ----/TTAT TTATTTTCTT 3070 het 3070 ref 50 28 20 2 TTAT 1 2 151414 CASAVA_Build 18 49285598 4D CACCTGTCCA GTCT/---- GTCTGTCGAG 3070 hom 121 het 46 0 39 9 GTCT 2 1 151415 CASAVA_Build 18 49287454 5I CCTTTCTCCT -----/TTTTG TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 TTTTG 2 3 151416 CASAVA_Build 18 49288390 1I GCCTCCCGAG -/T AGCTGGGACT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 0 1 151417 CASAVA_Build 18 49300130 4D CTCCAAAGTG AATA/---- AATAAATATG 3070 het 3070 hom 35 11 15 10 AATA 3 2 151418 CASAVA_Build 18 49306495 4I ATGATAGTCT ----/ATCA ATCAAATTAG 3070 het 3070 ref 41 27 12 2 ATCA 1 2 151419 CASAVA_Build 18 49352111 5D TTGCTTCCTC TTTTT/----- GTTTGCTGTC 3070 het 3070 ref 40 18 18 7 T 5 0 151420 CASAVA_Build 18 49356485 1D GATGGCATAA T/- TTTTTTTTTT 2451 het 2451 ref 34 14 8 12 T 17 16 151421 CASAVA_Build 18 49359444 1I GGTTTGGAAG -/A AAAGAAATTT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 A 3 4 151422 CASAVA_Build 18 49360421 1D TTGTGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 32 1 22 9 T 12 11 151423 CASAVA_Build 18 49361817 1D AAGTCAGGAA T/- TTTTAAAACT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 5 4 151424 CASAVA_Build 18 49369352 1D TCACATAATC A/- GAGCGACTCT 3070 het 3070 hom 51 24 26 3 A 1 0 151425 CASAVA_Build 18 49379504 1I TCCTCATCTG -/A AAGGGGGTAT 3070 hom 121 het 48 0 41 7 A 2 3 151426 CASAVA_Build 18 49384559 14D TTATTGCTTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2728 hom 31 12 12 8 T 24 10 151427 CASAVA_Build 18 49398865 1I ACCTAGGAGA -/T CTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 T 0 1 151428 CASAVA_Build 18 49400951 1I CATGGGGGGG -/A AAAAGACAAA 3070 het 2465 hom 20 7 9 4 A 4 5 151429 CASAVA_Build 18 49401511 1I TCTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 10 11 151430 CASAVA_Build 18 49405847 4I TAATCTAGCT ----/CAGA CAAACTTGTC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 CAGA 0 1 151431 CASAVA_Build 18 49410114 1D CTACTATGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 10 9 151432 CASAVA_Build 18 49412898 1I CAGGAGTTGG -/T TTTTTTGAAA 3070 het 1490 hom 17 3 10 4 T 6 7 151433 CASAVA_Build 18 49419184 4D ACGTTGGCTT GTAC/---- GTAATGATTA 3070 hom 148 het 50 0 50 1 GTAC 1 0 151434 CASAVA_Build 18 49421677 1D GCAGAAGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 285 hom 16 2 9 5 A 17 16 151435 CASAVA_Build 18 49431962 3I CCATTTTGTC ---/TAT TATAATTTAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TAT 1 2 151436 CASAVA_Build 18 49437353 17D GGCACATGTA ACATATGTAACATATGT/----------------- AACATATGTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 ACATATGTAACATATGT 1 0 151437 CASAVA_Build 18 49438003 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2524 het 2524 ref 20 12 7 1 T 9 10 151438 CASAVA_Build 18 49447178 1D GATTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 18 13 T 13 12 151439 CASAVA_Build 18 49455522 1I TTTCCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1136 hom 35 4 22 9 T 15 16 151440 CASAVA_Build 18 49464748 4I TTCATAACAT ----/ACTA ACACTCGGTG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 ACTA 0 1 151441 CASAVA_Build 18 49471603 5I CCTAGTCACT -----/GTATA TTCTCATTCC 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 GTATA 0 1 151442 CASAVA_Build 18 49474148 3D ACTATAATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 61 het 34 0 21 13 TTG 7 6 151443 CASAVA_Build 18 49480712 2D ATCACCTCAC AT/-- AGTTACCCTC 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 AT 1 0 151444 CASAVA_Build 18 49483717 17D TTTTTTACCT TAATAAAGGTAAATAGC/----------------- TAATAAGCTA 3070 hom 90 het 30 0 31 1 TAATAAAGGTAAATAGC 1 0 151445 CASAVA_Build 18 49484243 4I AATCATATAG ----/TTTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 9 13 151446 CASAVA_Build 18 49485588 3I AGTCATATGG ---/TCT TCTTTCTTGG 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 TCT 1 2 151447 CASAVA_Build 18 49492529 2I GCTGTTTTTT --/TC TCTTTTTACA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 TC 1 2 151448 CASAVA_Build 18 49498954 1I GTAAAATAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 8 9 151449 CASAVA_Build 18 49505073 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 33 1 27 5 T 11 12 151450 CASAVA_Build 18 49506860 1I GGTAATTTAT -/A AAAAAAACCG 3070 het 3029 hom 24 9 10 5 A 7 8 151451 CASAVA_Build 18 49510626 4D TTAAAATGAA AATC/---- AATCTATATA 1981 het 1981 ref 16 7 7 2 AATC 2 1 151452 CASAVA_Build 18 49517235 2D CTTGGCCATG AT/-- GGGAATGGAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 AT 1 0 151453 CASAVA_Build 18 49522402 1I CTGATGAGAC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3057 hom 23 9 10 4 T 7 8 151454 CASAVA_Build 18 49526002 1D AAGAAGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 25 16 13 A 12 11 151455 CASAVA_Build 18 49531056 3I AAGAAAATGG ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 41 12 17 12 CAA 4 5 151456 CASAVA_Build 18 49545756 1I CCTGTTTCTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 7 8 151457 CASAVA_Build 18 49547659 1D AATGCTATCG C/- CAAGTATTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 2 1 151458 CASAVA_Build 18 49561185 1D CAACAAGCAC T/- TTTTAAGGAA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 5 4 151459 CASAVA_Build 18 49564019 3D CAAAAATGCA TCT/--- ATTTTCTGTT 3070 hom 151 het 56 0 51 8 TCT 1 0 151460 CASAVA_Build 18 49567252 2D TCTTTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 TC 5 4 151461 CASAVA_Build 18 49580825 2D TTTTATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 162 het 63 0 54 10 AC 6 5 151462 CASAVA_Build 18 49585789 3I AAACCTTTAA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 AAC 0 1 151463 CASAVA_Build 18 49586925 1D AAACAAAGAT A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 8 7 151464 CASAVA_Build 18 49589843 1D AATATAGAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 9 8 151465 CASAVA_Build 18 49596865 1D AATTATATTT C/- TTATGTAATA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 C 1 0 151466 CASAVA_Build 18 49596960 1D CAATAAAACC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 7 6 151467 CASAVA_Build 18 49600532 1D AAAGCCAGAG T/- GTTGTCTTAC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 1 0 151468 CASAVA_Build 18 49603511 1I TATTTAGAAA -/T ACCCATCGTC 1489 het 1489 ref 22 15 4 3 T 0 1 151469 CASAVA_Build 18 49605405 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 13 1 8 4 A 13 12 151470 CASAVA_Build 18 49614764 22I TGACAAGCCC ----------------------/CAGTGAGATGAACCCGGTACCT CAGTTGGAAA 3070 hom 35 het 12 0 12 1 CAGTGAGATGAACCCGGTACCT 0 1 151471 CASAVA_Build 18 49615556 2D TGTAACCTGC AG/-- AGTCCCAGGA 2766 het 2766 ref 24 16 7 2 AG 2 1 151472 CASAVA_Build 18 49625847 1D AGAACAATTA G/- GCAAGTAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 G 2 1 151473 CASAVA_Build 18 49626697 1D CAGCAATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2713 hom 30 10 11 9 A 15 14 151474 CASAVA_Build 18 49630081 3I ACATAAAGGT ---/AAC AACAGTGCCC 3070 het 3070 hom 56 22 23 11 AAC 1 2 151475 CASAVA_Build 18 49639484 1I ATACCCAGGG -/A GGGGCTGTAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 0 1 151476 CASAVA_Build 18 49642237 1D TCCATTTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 A 10 9 151477 CASAVA_Build 18 49642504 1D TCAAGATGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 10 9 151478 CASAVA_Build 18 49645251 1I ATCTATTTTA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 T 7 8 151479 CASAVA_Build 18 49653113 4I CTAGCCTGAA ----/TAAC TAACTGGGTG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 TAAC 1 2 151480 CASAVA_Build 18 49653341 2D ACATACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 56 het 28 0 19 9 AC 9 8 151481 CASAVA_Build 18 49654407 1I CCACCCCTCC -/A AAAAAAAAAA 684 het 684 ref 15 5 3 7 A 10 11 151482 CASAVA_Build 18 49657879 1I CCCACATGAG -/A AAAATGCAAT 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 A 4 5 151483 CASAVA_Build 18 49661419 10D GCTTGCCTGG AAAGGATTTT/---------- ATTTCTCCTT 1685 het 1685 ref 24 17 4 3 AAAGGATTTT 1 0 151484 CASAVA_Build 18 49667253 1I ATTAGAGAAT -/A AAATTTATGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 3 4 151485 CASAVA_Build 18 49667913 1I ACAATTCTCA -/G GTTATTGCTG 3070 hom 111 het 46 0 38 8 G 1 2 151486 CASAVA_Build 18 49674049 2D TTTTTTTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 2735 het 102 hom 23 3 7 13 A 14 12 151487 CASAVA_Build 18 49674441 1D AATGGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 11 10 151488 CASAVA_Build 18 49681613 2I13M2D CTATTTTCAC --GTTTAGTTATATCAT/ATGTTTAGTTATATC-- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 26 10 17 1 N/A 0 0 151489 CASAVA_Build 18 49681695 2D TGTATATATT TG/-- TCTTTATTCC 3070 het 2852 hom 22 10 9 5 TG 1 0 151490 CASAVA_Build 18 49682286 4D TGAATTCATG GTTT/---- GTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 GTTT 3 2 151491 CASAVA_Build 18 49683947 1D AGTCCCCCCC A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 7 6 151492 CASAVA_Build 18 49684351 1D33M1D AGTAGGGCAC AAAAAAAAAATCACTCTTCTTTTTTTACCACTGCT/-AAAAAAAAATCACTCTTCTTTTTTTACCACTGC- TTTTCAAGTA 3070 het 3070 ref 38 31 13 2 N/A 0 0 151493 CASAVA_Build 18 49685827 1I ATGAAGGACT -/C CATGAGATAA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 C 1 2 151494 CASAVA_Build 18 49687095 1I TTAATGAGTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 7 8 151495 CASAVA_Build 18 49687881 2I TTAATAAACT --/AC ACTCAGCCAA 3070 het 3070 ref 64 32 31 1 AC 1 2 151496 CASAVA_Build 18 49688722 1I ATAAAAGAAA -/T TAGGTTGGTC 3070 het 3070 ref 54 23 24 7 T 1 2 151497 CASAVA_Build 18 49699944 1D TTTGAGCAAG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 T 8 7 151498 CASAVA_Build 18 49700167 2I GAAATATTGA --/TC TCTTAGCTTT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 TC 1 2 151499 CASAVA_Build 18 49700909 2D GGTGTGCGCA TG/-- TGTGTGAATG 3070 het 3070 ref 59 18 21 22 TG 4 3 151500 CASAVA_Build 18 49701203 1D GTGAGTGTGT G/- GGGGGGCATG 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 G 7 6 151501 CASAVA_Build 18 49701285 2I GTGTGTGCAC --/GT GTGTGAGTGT 3070 het 3070 hom 55 23 19 13 GT 2 3 151502 CASAVA_Build 18 49701693 4I44M1D TCTTTAATAA ----TAGTGCTGTTTTGAAAAAGTGAAGAAAAGGAAGCATTTTGTTTAG/TAGTTAGTGCTGTTTTGAAAAAGTGAAGAAAAGGAAGCATTTTGTTTA- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 48 39 31 5 N/A 0 0 151503 CASAVA_Build 18 49704199 3I GACAAAATAA ---/ATC ATCTGCTGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATC 1 2 151504 CASAVA_Build 18 49721114 1I GGCAGCAAAA -/G TAACAGCAGT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 G 0 1 151505 CASAVA_Build 18 49734442 2D TAACAATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 2440 het 2440 ref 45 21 8 16 A 18 16 151506 CASAVA_Build 18 49737933 1I GAAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2761 hom 35 9 18 8 A 9 10 151507 CASAVA_Build 18 49770006 10I TCACCCAGGC ----------/TGGAGTGCAA TGGCGTGATC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TGGAGTGCAA 0 1 151508 CASAVA_Build 18 49778421 1I TAGGTGATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2242 hom 38 9 16 13 A 15 16 151509 CASAVA_Build 18 49780592 2D AAAATCATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 39 9 10 20 A 16 14 151510 CASAVA_Build 18 49808641 1D GGGATTTTAC A/- AAGTCACCTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 3 2 151511 CASAVA_Build 18 49822095 1D AAAACCATCC T/- TGGGAGGACA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 T 2 1 151512 CASAVA_Build 18 49830124 4I TACCTGAGAT ----/TGAG TAATTTATTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TGAG 0 1 151513 CASAVA_Build 18 49858997 4D AAATAATAAA TAAG/---- TATTAATTCA 3070 hom 45 het 16 0 16 2 TAAG 1 0 151514 CASAVA_Build 18 49860565 1I TAGTTCAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 9 10 151515 CASAVA_Build 18 49910244 1D AAGATTACTA G/- GGGGTTGAGT 3070 hom 114 het 42 0 38 5 G 5 4 151516 CASAVA_Build 18 49927886 1I TGATTGTGAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 7 8 151517 CASAVA_Build 18 49937632 1D ATTGAAATGA T/- TTTTTTTTTT 2473 het 2473 ref 35 17 7 11 T 15 14 151518 CASAVA_Build 18 49942246 2I TGAGTCAATC --/AA GAGAGAGATT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 0 2 151519 CASAVA_Build 18 49947462 1D TACTGCAGCC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 85 het 34 0 28 6 A 9 8 151520 CASAVA_Build 18 49948760 2D GTACCACCAC AT/-- GTCATCTGAT 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 AT 1 0 151521 CASAVA_Build 18 49960266 1D GAAAAAGGAC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 51 het 31 0 18 14 A 7 6 151522 CASAVA_Build 18 49973190 1D TCTGTGCAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 141 het 53 0 47 6 A 9 8 151523 CASAVA_Build 18 49974596 1I AATGCTAATA -/C TTTAATAATA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 C 0 1 151524 CASAVA_Build 18 49987144 2D GAACAATACA AG/-- AAAAAACCAG 3070 hom 153 het 57 0 49 9 AG 1 0 151525 CASAVA_Build 18 49993235 1D CAGTCTCTAC A/- AAAAAAACAC 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 8 7 151526 CASAVA_Build 18 50016289 1D GGGCAGATGA T/- TTTCAGCCCC 3070 hom 117 het 41 0 39 3 T 4 3 151527 CASAVA_Build 18 50017310 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2469 hom 20 7 12 1 A 13 14 151528 CASAVA_Build 18 50018016 1I GAGAGGGAAA -/G GAACCCCAGG 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 G 1 2 151529 CASAVA_Build 18 50029125 1D TCTGTCACGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 25 4 11 12 A 17 16 151530 CASAVA_Build 18 50034781 1D CAGCAGCGTG C/- GAGGGCAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 C 1 0 151531 CASAVA_Build 18 50035143 3I TTTTTTTTTT ---/TTA ACGAGGTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 TTA 0 1 151532 CASAVA_Build 18 50036894 1D AGCCTAAATT A/- GGCAAGTGAC 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 A 1 0 151533 CASAVA_Build 18 50037246 1D AAAAAGAAGG A/- AAAAAATCCC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 7 6 151534 CASAVA_Build 18 50038312 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 11 12 151535 CASAVA_Build 18 50038999 1I TCTAGATAAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 9 10 151536 CASAVA_Build 18 50049956 3D AAGGCGGCGG CGA/--- CGACGACGAG 1621 het 888 hom 14 3 6 5 CGA 4 3 151537 CASAVA_Build 18 50051525 4I CGCAGTGCAC ----/AAAG AAACAGTAAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 AAAG 0 1 151538 CASAVA_Build 18 50051619 2I AGGAGAAAAC --/TA ACGTCACTCT 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 TA 0 1 151539 CASAVA_Build 18 50059493 1D ATCCCAAAAA G/- GGAAATGTGG 3070 het 3070 hom 25 13 11 2 G 3 2 151540 CASAVA_Build 18 50061399 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTGTATACT 3070 het 2993 hom 27 7 14 6 TA 0 1 151541 CASAVA_Build 18 50088962 1I ATCTTTGTGG -/T GTTCTCTGTA 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 T 0 1 151542 CASAVA_Build 18 50134585 1D AAGAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 T 1 0 151543 CASAVA_Build 18 50144186 1D GATTCTTTTT G/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 ref 35 15 16 5 G 1 0 151544 CASAVA_Build 18 50144513 2D ATATATATAC AT/-- ATTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 AT 2 1 151545 CASAVA_Build 18 50145075 1D GTGTACTCTT C/- AACAATCTGG 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 C 1 0 151546 CASAVA_Build 18 50147912 1I AATGTATCAT -/C CCATCCTCTC 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 C 2 3 151547 CASAVA_Build 18 50150300 1I TGGCCCTCTG -/T ATGTGTGGGT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 0 1 151548 CASAVA_Build 18 50151583 1D TGTTACTATA G/- GAACCTCGTG 3070 het 3070 hom 65 26 31 8 G 2 1 151549 CASAVA_Build 18 50154787 4I AGCACACTGT ----/TTAA TTACACTAAA 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 TTAA 0 1 151550 CASAVA_Build 18 50158460 4I AATAGTCAAC ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 TTTA 2 3 151551 CASAVA_Build 18 50160718 2D CAATCCTTTG CT/-- CTCTTTTAGA 3070 het 3070 ref 20 13 7 0 CT 3 2 151552 CASAVA_Build 18 50160810 1D AAAACATAAC A/- AAAAAAGCCT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 7 6 151553 CASAVA_Build 18 50161705 1D CCCTTCTGTG T/- TAACAGTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 T 2 1 151554 CASAVA_Build 18 50162624 3D CCCACACTGA ATC/--- ATCATAATCA 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 ATC 2 1 151555 CASAVA_Build 18 50165707 3I TTGCTAAAGA ---/TGT TGTGCTTTTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 TGT 1 2 151556 CASAVA_Build 18 50166045 2I TGGTAAGTTG --/TT TTTTAATTGT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 4 6 151557 CASAVA_Build 18 50168989 2I GCAGACCACA --/GT TGTGGTTTTG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 GT 0 1 151558 CASAVA_Build 18 50170232 1D TAGCTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 T 12 11 151559 CASAVA_Build 18 50172079 1D ACTAAAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 31 1 25 5 T 11 10 151560 CASAVA_Build 18 50173307 7D AGCCTTGGCA TATGCTT/------- TTTGCTAGTC 3070 het 3070 ref 47 25 20 4 TATGCTT 1 0 151561 CASAVA_Build 18 50174597 1I AAAGATGGGA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 6 7 151562 CASAVA_Build 18 50177649 2I AGTACCTATC --/TG TGTACAAAAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TG 1 2 151563 CASAVA_Build 18 50185702 1I ATTCTATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 9 10 151564 CASAVA_Build 18 50187114 1D CTTATTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 34 2 18 14 T 11 10 151565 CASAVA_Build 18 50188179 1D CTTTGTACTT G/- CCAAATTTAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 G 1 0 151566 CASAVA_Build 18 50190504 1I GGGTACTGGT -/A AAATAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 3 4 151567 CASAVA_Build 18 50193406 5D TCTTTTTTAA ATTTT/----- ATTTTATTAT 3070 het 1700 hom 19 5 12 2 ATTTT 2 1 151568 CASAVA_Build 18 50194741 1I GAATGTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 29 1 22 6 A 12 13 151569 CASAVA_Build 18 50195987 3I GGAGAGTTGC ---/GTT GTTGTTGACC 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 GTT 2 3 151570 CASAVA_Build 18 50199995 1D ATTTCTTAGC T/- TGTGAGGACC 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 T 2 1 151571 CASAVA_Build 18 50200189 8I ATTGTATGAA --------/TTGCTAAG TTGCTAAGTA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 TTGCTAAG 1 2 151572 CASAVA_Build 18 50202464 1I GTGGGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2557 hom 25 8 9 8 A 10 11 151573 CASAVA_Build 18 50204097 4D ATGCCCACAT ACAG/---- ACAGACCTAT 3070 het 3070 hom 51 23 22 8 ACAG 2 1 151574 CASAVA_Build 18 50204248 4I CAGGAAAGAA ----/ACTC AGAAAGGTAG 3070 hom 163 het 59 0 55 4 ACTC 0 1 151575 CASAVA_Build 18 50212018 1I TAGTAATATA -/C TTGAAGTCTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 0 1 151576 CASAVA_Build 18 50214267 1I CTTGTATTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 729 hom 39 4 23 12 T 12 13 151577 CASAVA_Build 18 50214665 1I CCTTTTTTCA -/G GAAATTGGGC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 2 151578 CASAVA_Build 18 50216540 11I TAGCTCTGTA -----------/ATTTTTGTCAT GTTTTTGTGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 ATTTTTGTCAT 0 1 151579 CASAVA_Build 18 50229740 9D AGATGACTAG CAAAATATA/--------- CAAAATATAC 3070 het 3070 hom 32 15 16 4 CAAAATATA 2 1 151580 CASAVA_Build 18 50234002 4D AAACACAAAC ACAT/---- ACAGCTGTAC 3070 het 3070 hom 21 11 9 3 ACAT 1 0 151581 CASAVA_Build 18 50248780 11D ATCACTATCT TTTGAATGGAA/----------- TTTGTAACAT 3070 het 3070 hom 52 24 29 4 TTTGAATGGAA 1 0 151582 CASAVA_Build 18 50253477 1I GTTTTTTTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 7 8 151583 CASAVA_Build 18 50263848 1I GATAAGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 39 2 24 13 T 11 12 151584 CASAVA_Build 18 50264129 2I TTCTACTGTC --/TT TACACATTTT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 1 3 151585 CASAVA_Build 18 50275149 1I TCAAAGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 9 10 151586 CASAVA_Build 18 50278089 1I ATTTGATGTA -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 6 7 151587 CASAVA_Build 18 50291465 1D AGGTGTCAAG A/- ACATCCAGTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 A 2 1 151588 CASAVA_Build 18 50293354 2I GAAAACACAG --/TA TATATATATA 2881 het 2881 ref 31 15 8 8 TA 7 8 151589 CASAVA_Build 18 50296426 4I CTTTATAGAC ----/ACTT TATATACTAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 ACTT 0 1 151590 CASAVA_Build 18 50361073 1I GCAAGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 543 hom 24 2 14 8 A 13 14 151591 CASAVA_Build 18 50379574 14D TTCTTTTGGC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 9 A 24 10 151592 CASAVA_Build 18 50384087 6I TAGTTTTGAG ------/ACTTAA ACTTAAGAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 ACTTAA 1 2 151593 CASAVA_Build 18 50394874 1I CAAAAACAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 9 10 151594 CASAVA_Build 18 50397611 4D TTCAAAACTC AAAT/---- AATTCTGTTA 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 AAAT 1 0 151595 CASAVA_Build 18 50406436 2D TTGGGAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 1550 het 1550 ref 31 12 4 15 T 18 16 151596 CASAVA_Build 18 50410447 5I AAGTCTGCTT -----/GGTCA GGTCAGTTGC 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 GGTCA 1 2 151597 CASAVA_Build 18 50415905 1D ATGAAAACAT G/- GACTTCAAGC 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 G 2 1 151598 CASAVA_Build 18 50418661 1I TATAAAGTAT -/A ATGTACACAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 151599 CASAVA_Build 18 50419260 2D ATGAAAAAAA AT/-- AAAACATGTT 2128 het 2128 ref 21 12 5 5 AT 1 0 151600 CASAVA_Build 18 50423726 1I TTCCTTGAGG -/A AGTACTTTCT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 1 2 151601 CASAVA_Build 18 50442656 1D AACGTAAATA T/- AAATAAAGCA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 T 1 0 151602 CASAVA_Build 18 50443546 4D TACATATATA ACAT/---- ATATAATAAT 926 het 926 ref 24 5 4 16 ACAT 1 0 151603 CASAVA_Build 18 50444276 1D ATCATCCCCC T/- CAGTACTATC 3070 het 3070 ref 42 21 20 2 T 1 0 151604 CASAVA_Build 18 50451676 1D ATTCAATATG A/- TATTGGCTGT 2959 het 184 hom 10 1 7 2 A 1 0 151605 CASAVA_Build 18 50452315 1I GTTCAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 24 0 20 4 A 10 11 151606 CASAVA_Build 18 50452650 2I ATAACAACTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 9 11 151607 CASAVA_Build 18 50458058 6I GGGGAGTTAC ------/TATTAA TATTATTTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TATTAA 0 1 151608 CASAVA_Build 18 50463719 5D AATGGGTTCT TTATC/----- TTATCTTATT 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 TTATC 2 1 151609 CASAVA_Build 18 50470546 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1529 hom 18 5 10 3 A 11 10 151610 CASAVA_Build 18 50472892 2D AACTAATAGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 53 het 24 0 18 10 AT 9 8 151611 CASAVA_Build 18 50477461 2I AAGATTCCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 415 hom 38 1 17 20 AC 8 9 151612 CASAVA_Build 18 50478164 1I CTTTCTAAAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 7 8 151613 CASAVA_Build 18 50491441 1I TAGCGATTCT -/A CCTGAAAACA 3070 hom 154 het 54 0 52 2 A 0 1 151614 CASAVA_Build 18 50494664 1D TTCCTCTGAA T/- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 T 7 6 151615 CASAVA_Build 18 50499765 1D GCATATGTAG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 T 8 7 151616 CASAVA_Build 18 50500732 1I TATGGATATT -/A AAATCGCTTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 3 4 151617 CASAVA_Build 18 50506838 1I ACTCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 A 13 14 151618 CASAVA_Build 18 50510137 1I TGGAAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 10 11 151619 CASAVA_Build 18 50523562 15D AAGTGAGAAC TCTTTGTGTTCCTAT/--------------- TTATTTTTGC 3070 het 3070 ref 24 12 12 5 TCTTTGTGTTCCTAT 1 0 151620 CASAVA_Build 18 50524222 1I TTATCCTTCC -/A AAACAATAAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 3 4 151621 CASAVA_Build 18 50526860 2D GTAGTAAGGG CT/-- ATAGTGTCAT 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 CT 1 0 151622 CASAVA_Build 18 50531842 1D AAAGAAACAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 T 10 9 151623 CASAVA_Build 18 50548250 1I ATAATTTGGG -/T TTTTTTTAGG 3070 het 14 hom 22 1 19 2 T 7 8 151624 CASAVA_Build 18 50552794 1I TTGATCAATG -/T TTTTCTCTGA 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 4 5 151625 CASAVA_Build 18 50557798 6D TTTTTTGCTG CTATGA/------ ATAAAGTTGC 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 CTATGA 1 0 151626 CASAVA_Build 18 50572390 1D AGGGCAATTT C/- CCCCACGCTG 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 C 5 4 151627 CASAVA_Build 18 50572556 4D CCAGCCATGG CTAA/---- CTGTGAGTCA 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 CTAA 1 0 151628 CASAVA_Build 18 50578297 2I GCTAAAAGAG --/CA CACACTGTAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 CA 2 3 151629 CASAVA_Build 18 50579225 1D AGAGGTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 T 15 14 151630 CASAVA_Build 18 50596090 1D CATCCTCTCT C/- CCCCCCCACC 3070 het 228 hom 29 3 20 6 C 8 7 151631 CASAVA_Build 18 50598556 1I GAAGGCTTCG -/C CCTCACCGTG 3070 hom 69 het 26 0 20 6 C 2 3 151632 CASAVA_Build 18 50603338 1I CTGAATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 24 0 17 7 T 11 12 151633 CASAVA_Build 18 50603495 4I CATGTCTGGC ----/TAAT TTTTTTTTGT 2659 hom 23 het 9 0 8 1 TAAT 0 1 151634 CASAVA_Build 18 50605958 1I TGACTGGATT -/A AAAAAAAAAA 2475 het 1397 hom 39 11 15 13 A 15 16 151635 CASAVA_Build 18 50607052 4D CATCCCAAAA CTGT/---- CTGTCAGGGA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 CTGT 2 1 151636 CASAVA_Build 18 50608847 1D AACAAAAATA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 32 9 18 6 T 8 7 151637 CASAVA_Build 18 50611326 1D TCAACTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 689 hom 30 3 23 4 T 14 13 151638 CASAVA_Build 18 50611715 2D GACAGTCAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 108 het 49 0 35 16 AG 7 6 151639 CASAVA_Build 18 50613157 4D TTACTATATA TTTG/---- TTACTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 TTTG 1 0 151640 CASAVA_Build 18 50623214 1D CCTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 11 10 151641 CASAVA_Build 18 50637398 3D TATTAACATA ATT/--- ATTAATGAAT 1771 het 1771 ref 9 5 4 1 ATT 2 1 151642 CASAVA_Build 18 50642211 5I TAGCAGCTTT -----/TTAAC TGTACTTTTA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 TTAAC 0 1 151643 CASAVA_Build 18 50650011 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 12 9 8 T 9 8 151644 CASAVA_Build 18 50655251 3D CATTAAGTGC CTA/--- CTATCTGTCA 3070 het 3070 hom 43 18 24 2 CTA 2 1 151645 CASAVA_Build 18 50655342 4D CTAGTAAAAT AGAG/---- AGTTACATGA 3070 het 3070 hom 34 14 17 7 AG 3 1 151646 CASAVA_Build 18 50658849 3I GGGTTAAATA ---/AAT AATAAATATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAT 1 2 151647 CASAVA_Build 18 50660543 4I TGATATTCTT ----/AGAG AGAATTTATG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AG 1 3 151648 CASAVA_Build 18 50660751 1I CAAGCCCATC -/A AAGTTTAGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 3 151649 CASAVA_Build 18 50661590 1D AATAAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 47 0 36 11 T 11 10 151650 CASAVA_Build 18 50666085 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 9 151651 CASAVA_Build 18 50677716 1D TCAATTAACC A/- AAAAAAAAAA 2036 het 2036 ref 47 31 7 9 A 15 14 151652 CASAVA_Build 18 50680289 1D GCATTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 36 1 28 7 A 12 11 151653 CASAVA_Build 18 50690855 1D ACTCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1843 hom 28 7 12 9 A 15 14 151654 CASAVA_Build 18 50695253 1D AATCCCCATG T/- TTCATGGGAG 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 T 3 2 151655 CASAVA_Build 18 50696990 1I GAATTTTTTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 151656 CASAVA_Build 18 50698337 1D CCACCTTGTC A/- TGAAATGAAC 3070 het 3070 ref 46 28 15 3 A 1 0 151657 CASAVA_Build 18 50702323 2D TGTTACAAAC TG/-- TGTGTATAAA 2541 het 2541 ref 34 25 6 6 TG 3 2 151658 CASAVA_Build 18 50706846 1D ATGGCAGCTT A/- AAAAAAAAAA 1288 het 1288 ref 34 27 3 5 A 11 10 151659 CASAVA_Build 18 50708990 1D AAGGACTTCT G/- ATCTTATCTC 3070 hom 69 het 25 0 24 2 G 1 0 151660 CASAVA_Build 18 50709217 1I TATATTTTCG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 258 hom 32 1 27 4 T 9 10 151661 CASAVA_Build 18 50713350 4D TTATCCTGCT TTAG/---- TTAGTGTGTT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 TTAG 2 1 151662 CASAVA_Build 18 50714478 5D ATATTGAGGA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AAAAT 3 2 151663 CASAVA_Build 18 50718788 1I GGGGAAAGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 9 151664 CASAVA_Build 18 50720367 4I GCAAGATAGA ----/TAGT TAGTTAGGTC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TAGT 1 2 151665 CASAVA_Build 18 50722314 1D AAGATTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 39 1 22 17 T 15 14 151666 CASAVA_Build 18 50724412 1I TGAAACTGGA -/C CCCTGGTTCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 3 4 151667 CASAVA_Build 18 50730660 1I TAGGGAGAGG -/A AAAAAAACTG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 7 8 151668 CASAVA_Build 18 50731870 1D GTCTCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 11 10 151669 CASAVA_Build 18 50738466 3D TTCTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 631 hom 37 8 15 17 T 17 14 151670 CASAVA_Build 18 50759692 28D CTTAGTAATC ACTACAAAATAATTACTACCTAGTAATT/---------------------------- ACTACAAAAT 3070 het 3070 ref 28 20 17 5 ACTACAAAATAATTACTACCTAGTAATT 1 0 151671 CASAVA_Build 18 50761510 3D CCATGCCAAC AAG/--- AAGAGGATAG 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 AAG 2 1 151672 CASAVA_Build 18 50763768 1I GCTAGGCTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 A 9 10 151673 CASAVA_Build 18 50777970 1I AATTTTGTTG -/T TTTTTTTAAA 2470 het 2470 ref 25 14 6 5 T 7 8 151674 CASAVA_Build 18 50779220 1I AGGAATGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 18 5 T 12 13 151675 CASAVA_Build 18 50785505 1D AATGACTAAG T/- TATTTTATGC 3070 het 3070 hom 32 10 20 3 T 2 1 151676 CASAVA_Build 18 50792892 4I ATTAAAACAT ----/AAAG AAAGATATTA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AAAG 1 2 151677 CASAVA_Build 18 50801344 1D TAACTGGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 30 0 19 11 T 13 12 151678 CASAVA_Build 18 50807774 1D ATTATGAGGG T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 T 8 7 151679 CASAVA_Build 18 50813095 4D ATATATACAC ACAT/---- ACATACATAC 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 ACAT 6 5 151680 CASAVA_Build 18 50820394 1D ACTGCATAAA G/- GGCAGAACCA 3070 het 3070 ref 34 19 14 3 G 3 2 151681 CASAVA_Build 18 50825042 1D ATCATTGGGG A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 A 7 6 151682 CASAVA_Build 18 50827863 7D27M4I TCTAGGGAGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACTACTCAGTC----/-------TTTTTTTTTTTTTTTGACTACTCAGTCCAGT CAGTCAATAT 3070 het 3070 hom 41 17 12 20 N/A 0 0 151683 CASAVA_Build 18 50834488 1I GAAAAAAAAA -/C TTGATTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 0 1 151684 CASAVA_Build 18 50837183 1D ATTTTTCTAA T/- ATTCACCTCA 3070 het 3070 hom 34 7 23 4 T 1 0 151685 CASAVA_Build 18 50846844 1I AGATAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 10 11 151686 CASAVA_Build 18 50854706 1D CCGAGAAGCT G/- GGGGTCTCAA 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 G 5 4 151687 CASAVA_Build 18 50862901 1D CATAAAAAGG A/- ATGAGATCAT 1042 het 1042 ref 31 24 3 4 A 2 1 151688 CASAVA_Build 18 50862973 3D AATACAGGAA CAG/--- AAGACCAAAT 1257 het 1257 ref 77 71 4 3 CAG 1 0 151689 CASAVA_Build 18 50863660 1D GTAAAGTGAA G/- CAATTGCTAA 3070 het 3070 hom 49 20 19 10 G 1 0 151690 CASAVA_Build 18 50864631 2D ATTTTGACTC TT/-- AATGCTGTCT 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 T 2 0 151691 CASAVA_Build 18 50867305 5D TTTGGTAAGT ATGTC/----- ATGGCAACTG 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 ATGTC 1 0 151692 CASAVA_Build 18 50867780 2D AAAAAAAAAA AC/-- CACAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 14 16 6 AC 1 0 151693 CASAVA_Build 18 50868572 1D CTTAGGACTA T/- TCATGTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 2 1 151694 CASAVA_Build 18 50879275 2D TTTATGTAAT AA/-- ATTCCAAATC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 3 1 151695 CASAVA_Build 18 50886472 1I GCTGGGTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 11 12 151696 CASAVA_Build 18 50895887 3D CTATGTGGAA AAT/--- AATAAGAAGA 3070 het 3070 hom 29 14 11 5 AAT 2 1 151697 CASAVA_Build 18 50899079 1I CCAGTCTCTG -/C CTTTGCTATC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 1 2 151698 CASAVA_Build 18 50900215 1D CCATATGTGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 8 151699 CASAVA_Build 18 50901171 3I AGCTCTAGAA ---/AAC AACAATTCCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AAC 1 2 151700 CASAVA_Build 18 50903653 4D TTTCAAGAAG ATAA/---- ATAAATGAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATAA 2 1 151701 CASAVA_Build 18 50905528 1D TCCTAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 12 11 151702 CASAVA_Build 18 50908252 1D ATCTAACCAA G/- CATATTTGAC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 G 1 0 151703 CASAVA_Build 18 50919613 1I CCAGGAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 10 11 151704 CASAVA_Build 18 50920734 1I GCAGTTGTGG -/C CCAGGGAGTA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 C 2 3 151705 CASAVA_Build 18 50938150 1D TTAATGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2224 hom 25 8 9 8 T 16 15 151706 CASAVA_Build 18 50939017 4I TCTGTAAAGA ----/TAGT TAGTTCAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 TAGT 1 2 151707 CASAVA_Build 18 50944083 1I GTCGGGGGTT -/G GGGGGTGACT 3070 het 3070 ref 58 27 23 8 G 5 6 151708 CASAVA_Build 18 50944502 1I TACAGGGGGG -/A CACAAGCACT 3070 het 3070 hom 41 20 17 4 A 0 1 151709 CASAVA_Build 18 50949736 4D GAAAAATAAA TAAG/---- TATTGAGCAC 3070 het 3070 hom 56 24 28 6 TAAG 1 0 151710 CASAVA_Build 18 50957651 1D AGAGATGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 T 11 10 151711 CASAVA_Build 18 50957875 4D TTGTCTTATC TCTT/---- TAATTGTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 TCTT 1 0 151712 CASAVA_Build 18 50963891 1I TTCTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2746 hom 31 12 11 8 T 13 14 151713 CASAVA_Build 18 50971704 1D CAGGTCAGTC T/- TGAGAATCCA 3070 het 3070 hom 60 22 32 6 T 2 1 151714 CASAVA_Build 18 50972240 1D AAACAAAAAT C/- TAATTTGGTA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 C 1 0 151715 CASAVA_Build 18 51014059 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2420 het 2420 ref 32 13 6 13 A 17 16 151716 CASAVA_Build 18 51055857 1I CACCACCACG -/C CCGGCTAATT 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 C 2 3 151717 CASAVA_Build 18 51097057 1I TTGGCCTCCC -/A AAGTGTTGGG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 2 3 151718 CASAVA_Build 18 51115436 1D TTCCAAATAG A/- AAAAAAAAAA 1264 het 1264 ref 20 9 5 6 A 15 14 151719 CASAVA_Build 18 51117681 2D ATGTTTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 686 het 686 ref 20 4 2 14 T 18 16 151720 CASAVA_Build 18 51140335 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2600 het 1427 hom 21 9 10 3 T 17 16 151721 CASAVA_Build 18 51153041 3D TTCAGTGACT AAG/--- AAGCTCAGAG 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 AAG 2 1 151722 CASAVA_Build 18 51219820 1I TTGTGTTTGG -/A AAAAAAAAAA 1048 het 1048 ref 42 28 4 10 A 13 14 151723 CASAVA_Build 18 51243746 1I GAAGTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1004 hom 40 3 28 9 A 11 12 151724 CASAVA_Build 18 51244976 5I GAGTATGCAC -----/AAAGT AAATTAAACA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAGT 0 1 151725 CASAVA_Build 18 51248871 1D AGAAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 11 10 151726 CASAVA_Build 18 51265526 2D AGACCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 31 1 18 12 A 16 14 151727 CASAVA_Build 18 51271470 1I GAAGCTGTGA -/C CCCCCATCTT 3070 hom 124 het 44 0 37 7 C 5 6 151728 CASAVA_Build 18 51292996 4D TTTTGGGGTT TTTG/---- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 45 17 27 1 TTTG 2 1 151729 CASAVA_Build 18 51294404 1D GCTGACGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 11 10 151730 CASAVA_Build 18 51327564 2D ACACAGACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 20 17 12 AC 10 9 151731 CASAVA_Build 18 51331599 2D AGCCCTCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 36 3 13 21 T 16 14 151732 CASAVA_Build 18 51344028 1I TGCCCTCGGC -/T GGAACCTAGG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 0 1 151733 CASAVA_Build 18 51348792 1I CCCTGAAAAG -/C GGGGGGGGAA 3029 het 8 hom 14 1 8 5 C 0 1 151734 CASAVA_Build 18 51352755 15D AGACAAAGCT TAGGCTTCTGACCAC/--------------- TAGAATGTCC 3070 het 3070 ref 34 23 10 6 TAGGCTTCTGACCAC 1 0 151735 CASAVA_Build 18 51355801 2D CAGCCTGAGT GA/-- GAGTGAGACC 3070 het 3070 hom 39 16 14 9 GA 2 1 151736 CASAVA_Build 18 51358276 1I ACAGAGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 10 11 151737 CASAVA_Build 18 51374386 1I TTCAGTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 T 9 10 151738 CASAVA_Build 18 51389970 1I GTAGAGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 11 12 151739 CASAVA_Build 18 51397684 1D CATAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 6 A 11 10 151740 CASAVA_Build 18 51401992 2D ACTGTCAAAA AC/-- AGTTAGTTTT 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 AC 1 0 151741 CASAVA_Build 18 51402750 2D ACTTTTAATA AG/-- AGATATTCGA 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 AG 2 1 151742 CASAVA_Build 18 51407799 1D TATTGTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2118 hom 23 7 11 8 A 11 10 151743 CASAVA_Build 18 51421619 2D TTTGCTTCAT AG/-- AGTTATTATA 3070 het 3070 hom 42 19 22 2 AG 2 1 151744 CASAVA_Build 18 51422456 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 9 8 151745 CASAVA_Build 18 51428142 2D CACTCACCCC CT/-- GTTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 CT 1 0 151746 CASAVA_Build 18 51436982 4D GGCTAATTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2701 het 69 hom 23 1 10 13 T 15 11 151747 CASAVA_Build 18 51440420 3D ACACACACCC TCT/--- TCTTTTCTTT 3070 het 86 hom 21 2 10 9 TCT 2 1 151748 CASAVA_Build 18 51449805 1D CACTTCTATC T/- GCTGCAAATA 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 T 1 0 151749 CASAVA_Build 18 51454582 1I TGGGATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 603 hom 28 2 25 1 A 11 12 151750 CASAVA_Build 18 51455163 1D GGAATGTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 256 hom 42 1 22 19 T 15 14 151751 CASAVA_Build 18 51459060 1D AAATAGAAGA T/- TGTAAAGATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 2 1 151752 CASAVA_Build 18 51470486 4D TTGTTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 1260 het 898 hom 27 5 9 13 TTTG 1 0 151753 CASAVA_Build 18 51476001 4D CTGAGAAACC ATCA/---- ATCGCAGTGG 3070 hom 138 het 49 0 46 3 ATCA 1 0 151754 CASAVA_Build 18 51476377 1D TAGGTCACAC A/- AGGGAATGTG 3070 hom 117 het 46 0 37 9 A 2 1 151755 CASAVA_Build 18 51484332 4D GCCCGGCTAA TTGT/---- TTGTATTTTT 1614 hom 12 het 7 0 5 2 TTGT 2 1 151756 CASAVA_Build 18 51502538 5D GGTCTTTTTT CTTTA/----- CTTAGTTCAT 3070 het 3070 hom 53 25 26 2 CTTTA 1 0 151757 CASAVA_Build 18 51503556 4D TTGAAATGTG TTTA/---- TTTATTAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TTTA 2 1 151758 CASAVA_Build 18 51513579 2D TTCCATGAGC AG/-- GAAGCAAAGA 3070 het 3070 ref 44 24 16 8 AG 1 0 151759 CASAVA_Build 18 51528312 9I GACTCCTTAG ---------/TCCTAAGTA TTTAACTTAT 3070 hom 66 het 22 0 23 1 TCCTAAGTA 0 1 151760 CASAVA_Build 18 51556748 1I CTAGGGTTGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 T 6 7 151761 CASAVA_Build 18 51567835 1D CAGATGAGTC A/- AAAAAAAAAA 1165 het 1165 ref 38 29 3 6 A 11 10 151762 CASAVA_Build 18 51570432 3D TCCCATTAAC AAT/--- GAAGAAGCGA 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 AAT 1 0 151763 CASAVA_Build 18 51571401 1I GCATCCTGTT -/G AGAAAACTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 0 1 151764 CASAVA_Build 18 51588108 1D TATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 31 3 22 6 T 13 12 151765 CASAVA_Build 18 51589399 5I TATAAAACTT -----/AACTC AAGACCAATT 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 AACTC 0 1 151766 CASAVA_Build 18 51609084 1D TGGTGATAAC A/- AAAAAAAAAA 2195 het 2195 ref 29 9 11 11 A 13 12 151767 CASAVA_Build 18 51609101 1D AAAAAAGAGG A/- AGCCCCTGCT 3070 het 2420 hom 37 12 17 8 A 2 1 151768 CASAVA_Build 18 51609576 1D TGTTGAAATG A/- AAAAAAAAAG 1234 het 1234 ref 47 37 3 9 A 10 9 151769 CASAVA_Build 18 51611445 3I AGGATTACTT ---/TTG TTGTTAAACT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TTG 1 2 151770 CASAVA_Build 18 51613540 5D TTCCACCTCT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 94 het 38 0 30 8 AAAAC 3 2 151771 CASAVA_Build 18 51614279 3I CACAGCCATA ---/ATG ATAATTCAGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 ATG 0 1 151772 CASAVA_Build 18 51623394 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 8 9 151773 CASAVA_Build 18 51625903 1D TTTTTTTCTA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 92 het 42 0 36 7 T 9 8 151774 CASAVA_Build 18 51641510 4I AGAATATTTG ----/TTTA TTTATAAGAA 3070 het 3070 hom 33 8 19 6 TTTA 1 2 151775 CASAVA_Build 18 51644668 7I AGTTTTAGCT -------/TGATCCA GTTCTATTTA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 TGATCCA 0 1 151776 CASAVA_Build 18 51645944 1D AGTTAGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 T 11 10 151777 CASAVA_Build 18 51651533 1I GTGCTACAGA -/C CCCATCGTAT 3070 hom 113 het 46 0 35 11 C 3 4 151778 CASAVA_Build 18 51665544 2I ACACACATGA --/AC ACACACACAC 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AC 7 8 151779 CASAVA_Build 18 51678693 2D TTCTAATTTG AC/-- ACACTCTACA 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 AC 3 2 151780 CASAVA_Build 18 51684469 1I TTTTTACCGG -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 38 9 21 8 A 6 7 151781 CASAVA_Build 18 51686390 1D GCTATGAAAA G/- TTTCTTGCTC 3070 het 3070 hom 38 14 18 8 G 1 0 151782 CASAVA_Build 18 51695515 1I ACCAAACTTT -/A AAAAAATTTC 3070 hom 122 het 48 0 41 7 A 6 7 151783 CASAVA_Build 18 51696875 2I AGGAAGAAAA --/AG AGAGAAAGAC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AG 2 3 151784 CASAVA_Build 18 51702453 1D AAGTGATTCT C/- CTGCTTCAGC 3070 het 2195 hom 14 5 9 0 C 2 1 151785 CASAVA_Build 18 51727837 7I GCCAGACTTC -------/CAGCTTT CAGCTTTCAC 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 CAGCTTT 1 2 151786 CASAVA_Build 18 51756819 1D TACTATAAGC A/- CTGTACCCAG 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 A 1 0 151787 CASAVA_Build 18 51771818 1D GGTTCATCTC A/- AGGCGCTTGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 2 1 151788 CASAVA_Build 18 51777327 3D TTAATAAAAT AGA/--- AGAAGTAGCT 3070 het 3070 ref 35 17 17 4 AGA 2 1 151789 CASAVA_Build 18 51780270 4D CAATGCTAGC ATTA/---- ATTAATATTA 3070 het 3070 ref 31 15 15 2 ATTA 2 1 151790 CASAVA_Build 18 51782676 1D GCAGACCATG T/- GTGCAGTACA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 1 0 151791 CASAVA_Build 18 51786461 2D TGAGGGGAAT AA/-- AAGCTTGGGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 4 2 151792 CASAVA_Build 18 51800669 1D AATCTGCTTG C/- CAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 44 2 38 4 C 2 1 151793 CASAVA_Build 18 51810855 1I CTTTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 984 het 984 ref 37 29 3 5 T 11 12 151794 CASAVA_Build 18 51814217 4I AGTTTTTTTT ----/TCTG CTGTTGTTGT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 TCTG 0 1 151795 CASAVA_Build 18 51817109 2D TGCACATTTA TG/-- TGTGTGTGTG 1456 het 1456 ref 52 39 4 11 TG 8 7 151796 CASAVA_Build 18 51823693 8D ATCCTAGAAC TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 31 0 24 10 TG 13 9 151797 CASAVA_Build 18 51826111 1D TATGTACCTC A/- ATAAAGTATT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 2 1 151798 CASAVA_Build 18 51840440 1I CCCCCCCATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 A 9 10 151799 CASAVA_Build 18 51842318 4D AGCTATAAAT CTCC/---- CTGTAGGTTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 CTCC 1 0 151800 CASAVA_Build 18 51855766 1I AATTTTCCTC -/T TGCTTAAATA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 T 1 2 151801 CASAVA_Build 18 51856375 2D TTCTCATCTT TA/-- TTGAAATGGA 3070 het 3070 hom 43 14 24 7 TA 1 0 151802 CASAVA_Build 18 51858304 1I TTTCAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 10 11 151803 CASAVA_Build 18 51858433 1I TGTAGGTATT -/A AATGGCATTC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 2 3 151804 CASAVA_Build 18 51861933 1D CGTGTGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 T 11 10 151805 CASAVA_Build 18 51868286 1D TTTTGGAAAT A/- ACTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 2 1 151806 CASAVA_Build 18 51870843 1D ATGAAGTTGA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 8 7 151807 CASAVA_Build 18 51871255 2D CCCTCTATCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 29 2 19 8 T 16 14 151808 CASAVA_Build 18 51879895 2D TTGAACACTG AA/-- GTTTCAGGAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 A 2 0 151809 CASAVA_Build 18 51882526 1I AGTACTGTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 8 9 151810 CASAVA_Build 18 51884767 1I GATTAAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1412 hom 24 4 10 10 T 10 11 151811 CASAVA_Build 18 51911268 4I TCCTGAATTA ----/ATTT ATTTCTATCC 3070 hom 105 het 45 0 36 9 ATTT 1 2 151812 CASAVA_Build 18 51916178 1I ATTGGATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 804 hom 36 2 31 3 T 11 12 151813 CASAVA_Build 18 51943154 1D AGGATGTGCA G/- GTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 G 2 1 151814 CASAVA_Build 18 51980153 1D AAAAAAGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 9 151815 CASAVA_Build 18 51984325 1D AAATCTCTGC T/- TTTTTTTTTT 1317 het 1317 ref 48 40 3 5 T 11 10 151816 CASAVA_Build 18 52003025 1I AAGCATTCTC -/T TTTTTCCCCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 6 151817 CASAVA_Build 18 52003293 1D CTTTTGCAAT G/- TCAGTTGTCA 3070 hom 132 het 48 0 44 5 G 1 0 151818 CASAVA_Build 18 52011372 1I TGTCTTGGTG -/C TGTTCTCGTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 0 1 151819 CASAVA_Build 18 52012139 4D TTGCTGTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 hom 89 het 36 0 31 9 T 13 9 151820 CASAVA_Build 18 52012798 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2548 hom 21 het 13 0 8 5 T 12 11 151821 CASAVA_Build 18 52013874 1I AAGGGCTCTG -/C CCAACCATCT 3070 hom 123 het 51 0 42 9 C 2 3 151822 CASAVA_Build 18 52022624 1D TAAAAGCAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 46 0 41 6 A 10 9 151823 CASAVA_Build 18 52032983 2D CTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 hom 102 het 39 0 35 6 CA 9 8 151824 CASAVA_Build 18 52034423 1D AAGACTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 52 2 38 12 T 12 11 151825 CASAVA_Build 18 52035771 1D GGAATGATAG A/- AAAAAATTTA 3070 hom 105 het 36 0 36 1 A 7 6 151826 CASAVA_Build 18 52038249 1D ACTCCACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 11 10 151827 CASAVA_Build 18 52049852 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 31 9 A 10 11 151828 CASAVA_Build 18 52076596 1D CTTTACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 34 0 30 4 T 12 11 151829 CASAVA_Build 18 52093411 1D TATAAAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 38 0 33 5 A 11 10 151830 CASAVA_Build 18 52102368 1I ACATCATTAC -/T TTGGCTCTGT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 2 3 151831 CASAVA_Build 18 52124011 1D AACAAAAAAA C/- ATAAGTAGAG 3070 het 3070 ref 45 28 11 6 C 1 0 151832 CASAVA_Build 18 52129839 1D GCTAAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 992 hom 42 5 27 10 T 15 14 151833 CASAVA_Build 18 52149881 1I CAGCTCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 541 hom 28 2 15 11 T 14 15 151834 CASAVA_Build 18 52152733 7D TGTTTTTTTG TTTTTGA/------- TTTTTGATTT 3070 het 3070 hom 43 19 22 7 TTTTTGA 2 1 151835 CASAVA_Build 18 52154382 8D CTTTTTTTCT TTTCTTTC/-------- TTTCTTTTTT 2654 het 2486 hom 21 9 9 9 TTTC 3 1 151836 CASAVA_Build 18 52184659 1D TTCAACTTTT C/- CCCACTCAAT 3070 het 3070 ref 36 18 17 4 C 4 3 151837 CASAVA_Build 18 52188767 1D GGAACAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 11 10 151838 CASAVA_Build 18 52190025 1D TAAGAGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 15 14 151839 CASAVA_Build 18 52190529 4D TTTCGGTTTC TTTG/---- TTTTTTTTTT 1728 het 1728 ref 33 15 12 6 TTTG 1 0 151840 CASAVA_Build 18 52196581 1I ATCAGTACTT -/A AGTCAGTTTC 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 1 2 151841 CASAVA_Build 18 52201193 1D TTACTTTACT C/- CTGAGAAAGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 2 1 151842 CASAVA_Build 18 52202395 6D TCATTTGGCT CTCTCA/------ CTTTGAACCC 3070 het 3070 hom 40 15 22 7 CTCTCA 1 0 151843 CASAVA_Build 18 52216319 5I ATCACAATAC -----/TTAAG TTATTGTTTT 3070 hom 70 het 26 0 24 2 TTAAG 0 1 151844 CASAVA_Build 18 52222150 25D TATAGTGTCA CCCACGAATGTCTCCAGCCATTTCC/------------------------- CCTGTTCATC 3070 het 3070 ref 44 34 13 5 CCCACGAATGTCTCCAGCCATTTCC 1 0 151845 CASAVA_Build 18 52222282 2I AATTGACTCT --/AA GATTGCTCAT 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 A 0 2 151846 CASAVA_Build 18 52230043 10D19M2D TGTCATTCTT TCTCTCTTCCTCTCTCTTCCCCCTCAGTGTC/----------TCTCTCTTCCCCCTCAGTG-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 29 19 13 9 N/A 0 0 151847 CASAVA_Build 18 52232048 1D4M13I TAATTTAGAA TTATC-------------/-TATCTGGCAGAATAAAT TTGAACGCAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 N/A 0 0 151848 CASAVA_Build 18 52241861 1I ACAAAAAAAA -/T GTCTATAAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 0 1 151849 CASAVA_Build 18 52248634 1D AATCCTAAGC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 92 het 39 0 29 10 A 9 8 151850 CASAVA_Build 18 52261013 1D TCTAAATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 7 A 12 11 151851 CASAVA_Build 18 52275717 1D TTATTATGGA C/- CCTCTGCTAA 3070 het 3070 ref 44 19 17 9 C 3 2 151852 CASAVA_Build 18 52276881 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 12 12 A 12 13 151853 CASAVA_Build 18 52277150 2D GCCTGAGCCG CT/-- CTCTGCCACC 3070 het 3070 ref 38 18 15 7 CT 3 2 151854 CASAVA_Build 18 52279172 1I CCTGCCTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 30 0 25 5 A 11 12 151855 CASAVA_Build 18 52282044 1I GAAGATCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1396 hom 43 3 36 4 A 10 11 151856 CASAVA_Build 18 52298178 1D GTATCAGTTT C/- CCCTCTGACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 4 3 151857 CASAVA_Build 18 52304355 7D GCTTTCTTTA GCTAGAG/------- CAAGTATCAA 3070 het 3070 ref 34 24 9 6 GCTAGAG 1 0 151858 CASAVA_Build 18 52304720 1I CTGGCTTTAA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 361 hom 42 1 36 5 T 0 1 151859 CASAVA_Build 18 52315522 1D ATACTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 32 1 28 3 A 12 11 151860 CASAVA_Build 18 52331338 1I CCACGCCCGG -/C TAATTTTTTG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 0 1 151861 CASAVA_Build 18 52335889 1I AAAATGAAGG -/A AAAAAGTTCC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 5 6 151862 CASAVA_Build 18 52337237 4I CTGTAGTCCC ----/AGCT AGCTACTCAG 3070 het 386 hom 22 2 15 5 AGCT 1 2 151863 CASAVA_Build 18 52338254 1D AAAAGCCAAA G/- GGTTGTTACT 3070 het 3070 hom 26 13 10 4 G 3 2 151864 CASAVA_Build 18 52355514 1D TTCCTCTCAA G/- ATTATGTAAC 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 G 1 0 151865 CASAVA_Build 18 52355758 1D AATGGGCTGG A/- AAAAATCTCT 3070 hom 127 het 48 0 42 6 A 6 5 151866 CASAVA_Build 18 52364749 2D TTACATAAAT TG/-- TGATACATTC 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 TG 2 1 151867 CASAVA_Build 18 52374971 1I CTTTTATCTA -/T TTTTTTAATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 151868 CASAVA_Build 18 52375724 3D TGGTGGCACA CAC/--- CTGTGATCCC 2086 het 1712 hom 10 4 6 0 CAC 1 0 151869 CASAVA_Build 18 52398174 3I GTTTGTTAAA ---/AAT AATAATGCCA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AAT 2 3 151870 CASAVA_Build 18 52398698 1I CCACACTTAC -/A AAACATTTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 3 4 151871 CASAVA_Build 18 52399406 4D TATTTAAAAG ATAA/---- ATAAAAAGAT 3070 hom 99 het 36 0 34 5 ATAA 2 1 151872 CASAVA_Build 18 52399967 2D ATTAAGAAAA CT/-- CTGAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 18 17 6 CT 2 1 151873 CASAVA_Build 18 52402095 3D ACTTCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 29 3 22 6 A 14 11 151874 CASAVA_Build 18 52414086 4I TTACCAGCTT ----/TATG ATCAGGTTAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TATG 0 1 151875 CASAVA_Build 18 52419345 2D CATATACATA TG/-- TGTGTATATA 3070 hom 120 het 43 0 41 4 TG 3 2 151876 CASAVA_Build 18 52421504 2D TTTTTGGTTT CA/-- CACAGTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 CA 3 2 151877 CASAVA_Build 18 52423754 2D CCTATAATTT TC/-- TCATTTTTGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TC 2 1 151878 CASAVA_Build 18 52428265 1I TCTGTAGATG -/C CACCAAAAAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 2 151879 CASAVA_Build 18 52439434 1D TATATATGTA T/- TTTTTTTTTT 2839 het 1744 hom 23 6 9 8 T 18 17 151880 CASAVA_Build 18 52461987 4D31M16D TAGTTGTTTC ATATATATATATATATGTGTGTGTGTATATATATATGTATATATGTGTATG/----ATATATATATATGTGTGTGTGTATATATATA---------------- TATATATGTA 2589 het 2490 hom 23 15 14 9 N/A 0 0 151881 CASAVA_Build 18 52466011 1I TTTTATACGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 33 3 19 11 A 12 13 151882 CASAVA_Build 18 52473848 7D ACCCTGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 29 1 21 11 A 19 12 151883 CASAVA_Build 18 52474813 1I CCGGCCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 723 hom 25 2 21 2 T 14 15 151884 CASAVA_Build 18 52477423 3I GGAAAAAAAC ---/AAT AATATGTTAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAT 1 2 151885 CASAVA_Build 18 52478086 1D CACAGCATGA T/- TTTTTTTTTT 961 het 961 ref 55 45 5 5 T 11 10 151886 CASAVA_Build 18 52478888 3D TTTAAAGGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 28 0 18 12 A 15 12 151887 CASAVA_Build 18 52481568 3D GAGGGAAAAC ATT/--- ATAAAAAGCA 3070 hom 123 het 45 0 42 6 ATT 1 0 151888 CASAVA_Build 18 52483522 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 223 het 52 hom 13 1 1 11 A 16 15 151889 CASAVA_Build 18 52483625 2D GGGCAAAAAC AA/-- ACAAACAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 3 1 151890 CASAVA_Build 18 52483722 1I AAGGCAGTCA -/T TATTACTGAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 2 151891 CASAVA_Build 18 52492918 2I GTTCAGTTTA --/TC TCTTTTTCCT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TC 1 2 151892 CASAVA_Build 18 52495062 1I ACCCCAGCCT -/C CCAAGTATCT 3070 hom 78 het 28 0 25 3 C 2 3 151893 CASAVA_Build 18 52496713 6I18M1I TTTAGGGGAG ------ACCCAGTAACACTGTGGT-/CCCCAAGCCCAGTAACACTGTGGTA CTTTTTTTTT 2216 hom 20 het 13 0 6 8 N/A 0 0 151894 CASAVA_Build 18 52497744 1I TAGCGAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1368 hom 41 3 29 9 T 10 11 151895 CASAVA_Build 18 52505075 2I TACAAATCTT --/TC TCTTTTCAGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TC 1 2 151896 CASAVA_Build 18 52509047 2D TTGTCTCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 31 0 17 16 A 13 11 151897 CASAVA_Build 18 52512560 3D TACACATGAG TTA/--- TTATAAAGTG 3070 hom 108 het 40 0 35 5 TTA 2 1 151898 CASAVA_Build 18 52515298 1I ATAACAGTAC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 8 9 151899 CASAVA_Build 18 52515793 4I AACTGCTATG ----/TATT TATTTAACCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TATT 1 2 151900 CASAVA_Build 18 52522611 1I ATCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 23 1 18 4 A 11 12 151901 CASAVA_Build 18 52525218 1I CAAATTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2965 het 45 hom 15 1 9 5 T 11 12 151902 CASAVA_Build 18 52525656 1D TTGCGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1464 het 1464 ref 23 12 4 7 T 15 14 151903 CASAVA_Build 18 52557243 1I GACTGCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 29 1 25 3 T 10 11 151904 CASAVA_Build 18 52561173 1I TTCAAACTTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 A 8 9 151905 CASAVA_Build 18 52578019 8D AGTCAAACAG TAGTTTTA/-------- CAAGGTTTGT 3070 het 3070 ref 40 20 19 2 TAGTTTTA 1 0 151906 CASAVA_Build 18 52601392 1I AAATTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 23 1 20 2 A 11 12 151907 CASAVA_Build 18 52673464 1I CTTTTGCCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1234 hom 34 3 27 4 T 9 10 151908 CASAVA_Build 18 52679355 3I GTACAGTTTA ---/TAT TATTCTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TAT 1 2 151909 CASAVA_Build 18 52709791 1D TATAGTTTTT A/- ATCTTCGTAA 3070 hom 102 het 41 0 35 7 A 2 1 151910 CASAVA_Build 18 52713718 1D TTTTTAAAAA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 T 8 7 151911 CASAVA_Build 18 52715638 2I GCAAAAAAAG --/AA AATGGAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 4 151912 CASAVA_Build 18 52715746 1I TAGGGAATGA -/T AACCACACAA 3070 hom 94 het 35 0 32 3 T 0 1 151913 CASAVA_Build 18 52722304 1I CTCAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 T 13 14 151914 CASAVA_Build 18 52723853 2D ATTATGAAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TA 9 8 151915 CASAVA_Build 18 52724277 1D TTGCCACCCC T/- AATGTATTAA 3070 hom 93 het 35 0 32 5 T 1 0 151916 CASAVA_Build 18 52725550 1D GGTTGTGATC A/- AAAATGGTTA 3070 hom 160 het 56 0 54 3 A 5 4 151917 CASAVA_Build 18 52727474 2D CTGGAGAGAG AA/-- AGAAGGGTAG 3070 hom 101 het 42 0 34 9 A 3 1 151918 CASAVA_Build 18 52731853 8D CCATCTCTAC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 17 1 12 6 A 22 14 151919 CASAVA_Build 18 52732052 4I ATCCAGAATT ----/CAGA CAGTTATCAC 3070 hom 48 het 21 0 15 6 CAGA 0 1 151920 CASAVA_Build 18 52737742 1D GAGATGCTCG T/- TAACTCAGCT 3070 hom 117 het 46 0 40 7 T 2 1 151921 CASAVA_Build 18 52780347 1D TCATATTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 9 8 151922 CASAVA_Build 18 52800235 1I ATATGCCATG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 7 8 151923 CASAVA_Build 18 52801798 10D ACACACACAC ACAGAGAGAG/---------- AGAGAGAGAG 3070 hom 93 het 33 0 32 5 ACAGAGAGAG 1 0 151924 CASAVA_Build 18 52805133 1D AGCAGAGGCC T/- TTTTTAAAAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 6 5 151925 CASAVA_Build 18 52807313 2D TGGTTTTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 13 3 A 14 12 151926 CASAVA_Build 18 52811921 5D GCTTTTGTCT AGGGA/----- AGATGGTGGG 3070 het 3070 hom 34 13 20 3 AGGGA 1 0 151927 CASAVA_Build 18 52812246 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 38 3 21 15 T 15 14 151928 CASAVA_Build 18 52815684 1D ATTGTAAATA T/- TATGTGGGTG 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 2 1 151929 CASAVA_Build 18 52819277 26D TCTCTACAAA AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG/-------------------------- AGAGAGAGAG 3070 hom 57 het 22 0 19 10 AG 20 7 151930 CASAVA_Build 18 52821452 1D TTTTGTGCTT C/- TTCAGTGTTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 C 1 0 151931 CASAVA_Build 18 52827259 6D GTGGATAGTC TAAGTA/------ TAAGTCAGAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 6 TAAGTA 1 0 151932 CASAVA_Build 18 52827762 1D ACTAATCTAA T/- TTTTCAGTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 5 4 151933 CASAVA_Build 18 52830039 2D TTTTCAATAC TA/-- GAGAGTTTTA 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 TA 1 0 151934 CASAVA_Build 18 52830681 4I GGAGTCTAGG ----/GGTT GGTTCTGCGA 3070 het 3070 ref 39 15 11 13 GGTT 1 2 151935 CASAVA_Build 18 52831698 5D ACTTTTTGTT TTAAA/----- TTAAAGTATT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TTAAA 2 1 151936 CASAVA_Build 18 52832892 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 A 10 11 151937 CASAVA_Build 18 52849109 2D TTTGCTGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2074 het 143 hom 34 4 6 25 A 16 14 151938 CASAVA_Build 18 52855176 2D TCTTTTCCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 13 11 151939 CASAVA_Build 18 52858177 14D ATGCACACAT GCGCATGCACACAC/-------------- GCGCATGCAC 3070 hom 133 het 41 0 42 10 GCGCATGCACACAC 2 1 151940 CASAVA_Build 18 52869302 1D GAGCCTAGGT G/- GGGGTGAGGA 3070 hom 81 het 31 0 25 6 G 5 4 151941 CASAVA_Build 18 52873895 1D GAGTGTTGCA G/- GTGCTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 14 25 9 G 2 1 151942 CASAVA_Build 18 52883089 1I GGTCGCAAGG -/T GCTCAGTGGG 1202 het 1202 ref 9 5 3 1 T 0 1 151943 CASAVA_Build 18 52886314 1D GAAATGTCTA C/- CCTAGACTAA 3070 hom 81 het 29 0 27 3 C 3 2 151944 CASAVA_Build 18 52894441 1D TGGGGAAGGC A/- GCAAGGTGGA 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 A 1 0 151945 CASAVA_Build 18 52903062 1D GGAGTCTCTG T/- TTAGCCTCTG 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 T 3 2 151946 CASAVA_Build 18 52912725 1D TCTTATGCTC T/- TATTGATTGC 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 2 1 151947 CASAVA_Build 18 52915006 2D ATTTTCTACC CT/-- CTCTCTCTCT 1177 het 1177 ref 43 32 4 9 CT 6 5 151948 CASAVA_Build 18 52915854 4I GCATTCTCTC ----/TGTT TGGTCGAGTG 3070 het 3070 hom 48 13 27 8 TGTT 0 1 151949 CASAVA_Build 18 52949162 2D GCCTTCTTCC CT/-- CTCTCACTGT 3070 het 3070 hom 46 19 21 7 CT 3 2 151950 CASAVA_Build 18 52964097 1D TGATTAATTT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 7 6 151951 CASAVA_Build 18 52966705 2D CATTTGCAGA CT/-- CTCTGTCCAA 3070 het 3070 hom 52 19 29 4 CT 3 2 151952 CASAVA_Build 18 52968547 4D GAGCTCATTA CGTG/---- CGTGCGTGCA 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 CGTG 3 2 151953 CASAVA_Build 18 52974779 1I AGGAAAACCT -/G GGGATGGGGA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 G 3 4 151954 CASAVA_Build 18 52981771 4I TGCAAATCTC ----/CTGA CTATTTCAGT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 CTGA 0 1 151955 CASAVA_Build 18 52983148 4I TCAGATCAAT ----/TCTC TCTAACAACT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 TC 1 3 151956 CASAVA_Build 18 52998678 5D AGCGTATCCA TCACC/----- TCAAATATTT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 TCACC 1 0 151957 CASAVA_Build 18 53010432 2D CCTGTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1468 hom 27 7 9 11 T 18 16 151958 CASAVA_Build 18 53010646 1I ACTATAGGGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 8 9 151959 CASAVA_Build 18 53031648 1I TGTAATATGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 8 9 151960 CASAVA_Build 18 53036992 23D ATGTCAGCAT TCCCATTTTACAGGTGAGGATGC/----------------------- TGAGGCACAG 3070 het 3070 ref 30 21 15 5 TCCCATTTTACAGGTGAGGATGC 1 0 151961 CASAVA_Build 18 53041505 1I GGGCCTTCTC -/T TCAAAACAGC 3070 hom 93 het 35 0 29 6 T 1 2 151962 CASAVA_Build 18 53055619 2D CCAAAATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2552 hom 25 7 12 7 A 14 12 151963 CASAVA_Build 18 53058644 1D TGCCTGCAGA C/- AGTACTAACT 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 C 1 0 151964 CASAVA_Build 18 53105384 1I AGTTTGACCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 9 10 151965 CASAVA_Build 18 53112297 2I AACTTTTTTT --/AA AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 7 9 151966 CASAVA_Build 18 53122037 1I TGACAACCCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 9 10 151967 CASAVA_Build 18 53133054 1D GTGCCCATCA C/- CCACTCCTGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 3 2 151968 CASAVA_Build 18 53133628 1D GCTGTTCAGA G/- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 26 21 6 G 1 0 151969 CASAVA_Build 18 53150303 1D GACTAATAGT A/- AAAAAAAAAA 2451 het 2451 ref 42 25 9 8 A 15 14 151970 CASAVA_Build 18 53199154 1D AAGAAATCTA T/- TTTCACAACA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 4 3 151971 CASAVA_Build 18 53207914 2D CAGGGTGAGA CT/-- CTTTCTGCTT 3070 hom 71 het 28 0 23 5 CT 2 1 151972 CASAVA_Build 18 53237698 4I TAAAAAAAAA ----/AAAC AAAAAAACCC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAAC 0 1 151973 CASAVA_Build 18 53238736 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 22 2 11 9 T 11 10 151974 CASAVA_Build 18 53239991 1D CTGAGCATGT G/- GGGGGAAAGG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 6 5 151975 CASAVA_Build 18 53295023 1D AAAACAAAGG A/- AAAAGACACC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 5 4 151976 CASAVA_Build 18 53295499 9I GTTCACAGCC ---------/ATAACATAA ACAACATCAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 ATAACATAA 0 1 151977 CASAVA_Build 18 53295548 1I TATGGACGTT -/A AAAAAAAAAA 2574 het 2574 ref 33 11 9 13 A 11 12 151978 CASAVA_Build 18 53295636 1D CAGCTTACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 10 9 151979 CASAVA_Build 18 53298807 2D ATAATTGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2117 hom 23 7 8 9 A 14 12 151980 CASAVA_Build 18 53299362 1I AGGAAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 17 19 3 A 9 10 151981 CASAVA_Build 18 53307133 2I CCTCACTCTC --/CA TCTGGACTCC 3070 het 3070 ref 48 27 18 3 CA 0 1 151982 CASAVA_Build 18 53307904 4I AGTCCGAAGA ----/CTAT CTAGCAATCG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 CTAT 0 1 151983 CASAVA_Build 18 53309488 7I AGTGCTGTAA -------/ATTCTGC ATTCTGCAAT 3070 het 3070 hom 45 15 17 13 ATTCTGC 1 2 151984 CASAVA_Build 18 53312979 1I TCACACAGAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 A 8 9 151985 CASAVA_Build 18 53322079 1I ATTAAAGTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 9 10 151986 CASAVA_Build 18 53325378 1D GTATATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2968 hom 26 11 11 5 T 13 12 151987 CASAVA_Build 18 53327646 2D AGGCAAGAAA TT/-- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 26 4 10 14 T 2 0 151988 CASAVA_Build 18 53329816 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3032 hom 21 7 14 0 A 9 8 151989 CASAVA_Build 18 53334308 2D AGGGCCACAA AT/-- TTAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 AT 1 0 151990 CASAVA_Build 18 53337237 1D TCCATGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 30 1 13 17 A 12 11 151991 CASAVA_Build 18 53353356 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 TG 1 0 151992 CASAVA_Build 18 53394023 1D TAAGGCAGCA G/- GGTATGTCAA 3070 het 3070 ref 43 29 12 3 G 3 2 151993 CASAVA_Build 18 53395892 2I GACAAGTATT --/TA TATGATGATA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 TA 1 2 151994 CASAVA_Build 18 53396188 1I TGTTTTAAGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 T 8 9 151995 CASAVA_Build 18 53398790 1I GGGGCTGCAG -/A AAAAGTGAAA 1467 het 1467 ref 30 8 6 16 A 4 5 151996 CASAVA_Build 18 53400237 1D54M1I TTGGTGTTTT AAAAAAAAAAAAATTCAATTCCAAGGCTCAAACCAACTCACATCTCCTTTTTTAC-/-AAAAAAAAAAAATTCAATTCCAAGGCTCAAACCAACTCACATCTCCTTTTTTACA TAAGTTTAAT 3070 het 3070 ref 39 27 19 7 N/A 0 0 151997 CASAVA_Build 18 53400585 1I AATCTGTAAG -/T TAAGTATATT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 1 2 151998 CASAVA_Build 18 53400967 2D CACGGTGAAA CC/-- CCATCTCTAC 1140 het 13 hom 6 0 3 3 C 4 2 151999 CASAVA_Build 18 53402409 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1347 het 238 hom 25 5 7 13 A 16 14 152000 CASAVA_Build 18 53409909 1I TTAATGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1791 hom 32 6 14 12 T 10 11 152001 CASAVA_Build 18 53426072 7I TTTCTGGATA -------/AATACAC AATACACACT 2798 het 1184 hom 11 3 7 1 AATACAC 1 2 152002 CASAVA_Build 18 53437635 1D AGAAGTTAAA T/- TTTTTGTAGA 3070 het 2082 hom 17 5 10 2 T 6 5 152003 CASAVA_Build 18 53441700 1I AAAGAAAACC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 8 9 152004 CASAVA_Build 18 53441734 2D AAAATAACTC TA/-- TATATAGGTT 467 het 467 ref 25 5 3 17 TA 4 3 152005 CASAVA_Build 18 53444535 1D ACTCCGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 874 hom 18 3 13 2 A 13 12 152006 CASAVA_Build 18 53446740 13I CCATCTTGAG -------------/ACTAACAAGGCAC ACTCCTTGCC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 ACTAACAAGGCAC 0 1 152007 CASAVA_Build 18 53448284 1I GAACGGCATT -/G ATCGTCTGTC 3070 hom 69 het 24 0 22 2 G 0 1 152008 CASAVA_Build 18 53453320 1D CAGGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 779 hom 32 3 15 14 T 13 12 152009 CASAVA_Build 18 53456220 1D AGTTTTCTCA T/- GTATTTCCCT 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 T 1 0 152010 CASAVA_Build 18 53464703 1D TACTAAATCA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 7 6 152011 CASAVA_Build 18 53477887 3D AAGCACATGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1026 hom 35 12 12 13 A 17 14 152012 CASAVA_Build 18 53479851 6D GTATATATAT GTGTGC/------ GTGTGTATGT 678 het 678 ref 11 6 4 1 GTGTGC 1 0 152013 CASAVA_Build 18 53480936 1D AAATTGTGAC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 7 6 152014 CASAVA_Build 18 53487885 2D TAAATGTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 T 13 11 152015 CASAVA_Build 18 53503469 3D GCTAAAATAT TTA/--- TTATCTGGCA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 TTA 2 1 152016 CASAVA_Build 18 53516578 1I TATTTATTAA -/T TTTTTTTTTT 2902 het 2465 hom 14 5 8 1 T 10 11 152017 CASAVA_Build 18 53517959 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 2872 het 728 hom 10 2 7 1 A 9 10 152018 CASAVA_Build 18 53532820 1I AGAGGAGGGA -/G GGGGGGAAGG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 G 6 7 152019 CASAVA_Build 18 53535203 2I ATATCAAACA --/TC TCTGACTGAC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 TC 1 2 152020 CASAVA_Build 18 53548081 1D GTGCCCGGCA G/- GGAATTTCAC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 G 3 2 152021 CASAVA_Build 18 53548623 3D GAACACTATG ATA/--- ATGATTTCTG 3070 hom 102 het 36 0 32 7 ATA 1 0 152022 CASAVA_Build 18 53549045 26D ATATATATAT ATATATATATATATATATATACACAC/-------------------------- ACACACACAC 3070 hom 60 het 21 0 21 7 ATATATATATATATATATATACACAC 1 0 152023 CASAVA_Build 18 53550560 2D TGTGTATATA TG/-- TGTGTATATA 778 hom 10 het 4 0 4 0 TG 3 2 152024 CASAVA_Build 18 53551073 8I GATTACAGGC --------/GTGAGCCA CCGCGCCCGG 3070 hom 66 het 25 0 21 5 GTGAGCCA 0 1 152025 CASAVA_Build 18 53552128 7D CACAAATGGA CACTTAG/------- GAAATTTTCA 3070 hom 96 het 33 0 33 2 CACTTAG 1 0 152026 CASAVA_Build 18 53554023 10D CCTACTAAGT CTTTATTTTA/---------- CTTTATTTTA 3070 hom 33 het 20 0 12 8 CTTTATTTTA 2 1 152027 CASAVA_Build 18 53555498 1D CCTACTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 67 het 29 0 23 6 T 10 9 152028 CASAVA_Build 18 53555808 1D TTCTTTCTTT C/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 33 0 32 5 C 1 0 152029 CASAVA_Build 18 53556862 5D ATAAATAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 18 het 15 0 7 9 AAATA 5 4 152030 CASAVA_Build 18 53567598 1I TTTCCACATT -/C CCCCTTCTCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 4 5 152031 CASAVA_Build 18 53569554 2D GCTGTACAAA AT/-- ATATATATAT 962 het 962 ref 40 34 3 4 AT 7 6 152032 CASAVA_Build 18 53569685 1D TGCTGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1804 hom 38 5 25 8 A 13 12 152033 CASAVA_Build 18 53573602 3D CTACCAAGAT AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 12 9 152034 CASAVA_Build 18 53576709 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2008 het 147 hom 9 1 7 1 A 13 14 152035 CASAVA_Build 18 53577386 13D ATTCCATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 16 0 15 5 A 27 14 152036 CASAVA_Build 18 53578056 1I CTCGGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 1958 het 49 hom 22 1 7 14 A 15 16 152037 CASAVA_Build 18 53580372 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTC 1321 hom 10 het 9 0 4 5 T 10 9 152038 CASAVA_Build 18 53581628 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 33 0 25 8 A 12 11 152039 CASAVA_Build 18 53588298 3D CTGAACTGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 27 2 12 13 T 19 16 152040 CASAVA_Build 18 53611011 1I TGTTTAAAAC -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 A 7 8 152041 CASAVA_Build 18 53613468 1I CACACACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2525 hom 33 13 12 8 T 10 11 152042 CASAVA_Build 18 53614107 1I TTTTACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 30 0 22 8 A 11 12 152043 CASAVA_Build 18 53616643 2I CTGTCTCTAC --/AA AAAAAAAAAA 2576 hom 24 het 11 0 9 3 A 11 13 152044 CASAVA_Build 18 53618219 1D AGCAAATTAA T/- TTTTTACTTA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 6 5 152045 CASAVA_Build 18 53622147 1I CGCTATCGAG -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 7 8 152046 CASAVA_Build 18 53629243 1D CCGCGGCACA T/- TTCATTTTCT 3070 hom 36 het 15 0 11 4 T 3 2 152047 CASAVA_Build 18 53630717 1D TCTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 10 8 T 13 12 152048 CASAVA_Build 18 53647627 1D CTTAAGAGGA T/- TTTTTTTTCG 3070 het 22 hom 26 2 19 5 T 9 8 152049 CASAVA_Build 18 53648892 3D CAGGTGTAAA CTT/--- CTTCCTCAGG 3070 hom 84 het 31 0 27 4 CTT 2 1 152050 CASAVA_Build 18 53656162 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1011 hom 14 3 8 3 A 11 12 152051 CASAVA_Build 18 53657054 1D GAAAAATAAA G/- AGCTACAGAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 G 1 0 152052 CASAVA_Build 18 53657483 1I TGGATAATGG -/C ACTAGACAGC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 0 1 152053 CASAVA_Build 18 53660074 1I TTTGCATGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 53 24 24 5 T 8 9 152054 CASAVA_Build 18 53660717 2D CATTCATTCA TC/-- TCTCCTTTTC 3070 het 3070 ref 49 27 19 4 TC 3 2 152055 CASAVA_Build 18 53663767 2D AGTCTTCAAA AC/-- AAAGTTTATA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 AC 1 0 152056 CASAVA_Build 18 53682367 3D GCTGGGTCTT ATC/--- TTATCTCGCT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 ATC 1 0 152057 CASAVA_Build 18 53684057 2D GGCCCTATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 23 0 19 4 A 12 10 152058 CASAVA_Build 18 53684356 5I CTGGGATGCC -----/AGGGG CCTGCCATCC 1026 hom 7 het 3 0 3 0 AGGGG 0 1 152059 CASAVA_Build 18 53686003 1D GGCTGTAATG A/- AAGCATCACA 2528 hom 15 het 7 0 6 1 A 3 2 152060 CASAVA_Build 18 53686853 4D CTGGGTGCCC TTCA/---- AGGTATGTAA 3070 hom 169 het 61 0 57 6 TTCA 1 0 152061 CASAVA_Build 18 53687280 2I ACCCCATATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1585 hom 22 8 9 5 A 12 14 152062 CASAVA_Build 18 53688673 2D ATTTTTAAAT AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 8 152063 CASAVA_Build 18 53689545 1D AGAGAACCCC T/- TCCTAACCCC 3070 hom 117 het 45 0 39 7 T 2 1 152064 CASAVA_Build 18 53696327 1D TGCAGTGGCT G/- GGGGCAGTCA 3070 hom 73 het 45 0 23 22 G 5 4 152065 CASAVA_Build 18 53714327 1D TCTACAACTG C/- CGAGACAAGC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 2 1 152066 CASAVA_Build 18 53717232 2D CAGCACACTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 93 het 38 0 29 9 GT 9 8 152067 CASAVA_Build 18 53718621 4D AATAAAATAA AAAT/---- TTTTTAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 AAAT 1 0 152068 CASAVA_Build 18 53719041 5I ACACGCCTGT -----/AATCC AATCCCAGGC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 AATCC 1 2 152069 CASAVA_Build 18 53723247 5I CTACGTGCTT -----/GAACA TGTGGGCTCG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 GAACA 0 1 152070 CASAVA_Build 18 53723940 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 A 10 9 152071 CASAVA_Build 18 53797925 9D GGTTGATCTT GAACTCCTG/--------- GAACTCCTGG 3070 hom 112 het 39 0 32 13 GAACTCCTG 2 1 152072 CASAVA_Build 18 53811939 1I TCCATCTCTA -/C AAAAAAATAC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 C 0 1 152073 CASAVA_Build 18 53821735 1D GTTTTGTTTT G/- TTTTGAGACA 3070 hom 60 het 21 0 21 2 G 1 0 152074 CASAVA_Build 18 53828583 1I CTCTACAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 9 10 152075 CASAVA_Build 18 53845628 1D TAAAAGGACA G/- GAAAAAAAAA 2118 het 420 hom 26 2 15 9 G 2 1 152076 CASAVA_Build 18 53851332 2I TTTGTTTATG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 9 11 152077 CASAVA_Build 18 53852401 2I CCCACCCCTG --/GC ACACACACAG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 GC 0 1 152078 CASAVA_Build 18 53853480 1D TAAGAAGAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 8 152079 CASAVA_Build 18 53854793 4D AAATAGAAAA TAAT/---- TAGTTATGAA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TAAT 1 0 152080 CASAVA_Build 18 53854919 1I ATTAATTAAA -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 6 7 152081 CASAVA_Build 18 53856317 1I AGGCATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 27 1 23 3 A 10 11 152082 CASAVA_Build 18 53856572 4D GTTGGCCTCT TTGA/---- TTGGCCGAAA 3070 hom 150 het 56 0 50 6 TTGA 1 0 152083 CASAVA_Build 18 53857346 3I AGCCCACAGA ---/ACC ACCGTGAGCC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 ACC 1 2 152084 CASAVA_Build 18 53859276 1I17M1I TCTCTCGGGG -AAAAGGAAAAGAAAAAG-/AAAAAGGAAAAGAAAAAGA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 24 0 28 1 N/A 0 0 152085 CASAVA_Build 18 53859707 2I ACAAAAGGGA --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 8 10 152086 CASAVA_Build 18 53860673 12D GTGTGTGTGT GTGTGTGTGAGA/------------ GAGAGAGAGA 3070 het 755 hom 26 6 14 9 GTGTGTGTGAGA 1 0 152087 CASAVA_Build 18 53860965 1I ACATTGGCCA -/G GCTGGTCTTG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 G 1 2 152088 CASAVA_Build 18 53861517 1I GAATGTTCTG -/C CGTCTGTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 2 152089 CASAVA_Build 18 53864642 1I TGTGGGGGGT -/G GGGGGTGAGG 3070 hom 99 het 37 0 32 5 G 5 6 152090 CASAVA_Build 18 53865195 10D TTTTTCATGG GCAGTTTCAT/---------- GCTGTCACGT 3070 hom 157 het 56 0 53 4 GCAGTTTCAT 1 0 152091 CASAVA_Build 18 53871540 1D GTGTTAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2350 hom 25 9 13 3 T 12 11 152092 CASAVA_Build 18 53879711 3D CTGTGGGTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 81 hom 41 3 26 12 T 14 11 152093 CASAVA_Build 18 53880171 1D CTTTTACTGG T/- TATTTTCCAG 3070 hom 111 het 41 0 36 5 T 2 1 152094 CASAVA_Build 18 53937216 1I GTTACCCAGG -/C CCCGGGGTCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 C 3 4 152095 CASAVA_Build 18 53944709 1D TCCTTTTTAT G/- GCAGATAATA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 G 2 1 152096 CASAVA_Build 18 53950475 3D TTTGATGGTA GTG/--- GTGGTGGTTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 GTG 3 2 152097 CASAVA_Build 18 53953296 1I TCACATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 28 10 11 T 11 12 152098 CASAVA_Build 18 53960444 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 1018 hom 7 het 4 0 3 1 T 10 9 152099 CASAVA_Build 18 53960564 2D AGGCGTGAAC CA/-- CACCGCGCCC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 CA 2 1 152100 CASAVA_Build 18 53964128 1I AAAATGTACA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 7 8 152101 CASAVA_Build 18 53966546 1I CAGGCACATG -/C CACTGTGTCT 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 C 1 2 152102 CASAVA_Build 18 53973500 1D TTGTGTTTTG A/- AAAAAAAAAA 2691 het 2691 ref 31 11 10 10 A 12 11 152103 CASAVA_Build 18 53975416 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1143 het 1143 ref 21 13 4 4 A 17 16 152104 CASAVA_Build 18 53987781 1I AAAACAGCTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 8 9 152105 CASAVA_Build 18 53996683 1D GCTTTGTGTT A/- ATAAATGCAT 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 2 1 152106 CASAVA_Build 18 53997708 1I GTGTAGAGCA -/G GGGGTCTCCA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 G 4 5 152107 CASAVA_Build 18 54010932 4I GGTACCTGTC ----/TCTT TCTTTGAGGG 3070 het 3070 ref 57 26 21 10 TCTT 1 2 152108 CASAVA_Build 18 54011729 1D CTCTTCCCCC T/- GATCTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 1 0 152109 CASAVA_Build 18 54018624 1D ACTTGTCCCA T/- TTTTTTGCTG 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 T 7 6 152110 CASAVA_Build 18 54021845 1D ACAGATGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 T 13 12 152111 CASAVA_Build 18 54023565 1D AGAGAATAAC A/- AGAGATTAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 2 1 152112 CASAVA_Build 18 54025548 1I ATTTTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 13 14 152113 CASAVA_Build 18 54025729 1D GTTAACCTCT A/- AGTGCAACAG 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 A 2 1 152114 CASAVA_Build 18 54027929 2D CTAAGTAAAC AA/-- AAAAATATAA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 7 5 152115 CASAVA_Build 18 54030700 1D CATGAGATGT A/- ATTCACTATC 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 A 2 1 152116 CASAVA_Build 18 54030989 10I TAGCCTGAAT ----------/ATATATTTTA ATATATTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 ATATATTTTA 0 1 152117 CASAVA_Build 18 54031170 4D AAATGCAGAC AGCT/---- AGCTGGCAAA 3070 het 3070 ref 41 24 12 7 AGCT 2 1 152118 CASAVA_Build 18 54031361 2D2M4D AATTATGGGC AGTTGGGA/--TT---- AATTGAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 N/A 0 0 152119 CASAVA_Build 18 54032380 1D TCACCTGATC G/- CTGCCCCAGG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 G 1 0 152120 CASAVA_Build 18 54037808 1I34M2D ACTTGCAGAT -GCTCCTCTGGGTCTTCCCAGGTCATTTGTGTACCTG/GGCTCCTCTGGGTCTTCCCAGGTCATTTGTGTACC-- TGTCCGTGTC 3070 het 3070 hom 31 20 21 8 N/A 0 0 152121 CASAVA_Build 18 54046477 4I ACAACTGCGC ----/TACT TACTGATAGG 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 TACT 1 2 152122 CASAVA_Build 18 54048192 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 446 hom 16 2 12 2 CT 2 1 152123 CASAVA_Build 18 54052156 6D CGTCTTTCCT CTGTGC/------ CTGTGCCTGT 3070 het 3070 ref 45 22 18 8 CTGTGC 2 1 152124 CASAVA_Build 18 54068455 1I TCTGCCTCCC -/A AGGTTCAAGT 3070 het 906 hom 16 2 13 1 A 1 2 152125 CASAVA_Build 18 54072204 1I GGTGTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 1925 het 1925 ref 35 20 6 9 T 13 14 152126 CASAVA_Build 18 54089313 1D ATTATTATTG T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 T 7 6 152127 CASAVA_Build 18 54094412 2I TTTCGTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 1626 het 663 hom 33 10 11 12 TG 0 1 152128 CASAVA_Build 18 54095461 1D TGGAGAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 19 7 A 11 10 152129 CASAVA_Build 18 54101914 12D TTTTGAAAAG GTAACTTACCTC/------------ GTCACTTCAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 8 GTAACTTACCTC 1 0 152130 CASAVA_Build 18 54108650 16I CTTGATGCTA ----------------/TTGGCAAATCTCACTC TTGGCAAATG 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 TTGGCAAATCTCACTC 0 1 152131 CASAVA_Build 18 54110352 7I TGAGGCGTGC -------/AGGAGGG ACTGGCTGGT 3070 het 3070 hom 43 10 19 14 AGGAGGG 0 1 152132 CASAVA_Build 18 54110439 3I GCTGCCAGGA ---/CTC CTTGGAGGCA 3070 het 3070 hom 48 15 22 11 CTC 0 1 152133 CASAVA_Build 18 54112822 1I ACCATGTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 9 10 152134 CASAVA_Build 18 54135165 27D GTGACTTTAC TTTATTTACTTTATTTAAAGCTATTTA/--------------------------- AAGCTAGCAT 3070 het 3070 ref 40 31 12 2 TTTATTTACTTTATTTAAAGCTATTTA 1 0 152135 CASAVA_Build 18 54148910 4D GGATCCCTAC TTCT/---- TTCTAGTGTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 TTCT 2 1 152136 CASAVA_Build 18 54159808 3D TGCTGTTTGC GTT/--- GTTGTTTGGG 2601 het 2601 ref 30 15 7 9 GTT 3 2 152137 CASAVA_Build 18 54166177 1I TTGATAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 10 11 152138 CASAVA_Build 18 54176849 2D CTCTCTGCTT TC/-- TGTTAATAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 TC 1 0 152139 CASAVA_Build 18 54180099 1D TCCAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 21 17 10 A 13 12 152140 CASAVA_Build 18 54184816 1D TCTGAGGTCT C/- CTGTGTAAAG 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 C 2 1 152141 CASAVA_Build 18 54186466 1I CCCCAAATTA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 T 6 7 152142 CASAVA_Build 18 54189332 6I TTGGCTCACT ------/GCAACC TCCGCCTTGC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 GCAACC 0 1 152143 CASAVA_Build 18 54190496 1I AGCTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 2824 het 2824 ref 39 17 13 9 T 13 14 152144 CASAVA_Build 18 54191043 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1939 het 615 hom 18 4 7 7 A 17 16 152145 CASAVA_Build 18 54191223 5I TGTTTATAGT -----/TTAAA TTAAAGAGGA 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 TTAAA 1 2 152146 CASAVA_Build 18 54198285 4D CTTTCAAAAA TTAT/---- TTATTTATCT 3070 het 2053 hom 21 6 11 4 TTAT 3 2 152147 CASAVA_Build 18 54205597 1D TCCTGTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 12 11 152148 CASAVA_Build 18 54208040 4D CAAATTTATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 1220 hom 17 3 10 5 TTTA 5 4 152149 CASAVA_Build 18 54220035 2D AATACAAAAA AT/-- ATATATATAT 1898 het 1898 ref 16 7 6 4 AT 7 6 152150 CASAVA_Build 18 54239848 1I AAATATATAA -/T ATATAAATAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 0 1 152151 CASAVA_Build 18 54239948 1I CTCATATTTC -/T TTTTTTTTTT 2944 het 1334 hom 17 5 11 1 T 13 14 152152 CASAVA_Build 18 54241035 1I TCTCAGTGGC -/A AAAAAAAAAA 2254 het 1442 hom 22 6 11 5 A 16 17 152153 CASAVA_Build 18 54241782 1I GTCCTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 876 hom 48 2 34 12 T 10 11 152154 CASAVA_Build 18 54251952 1I CCCGGCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 10 11 152155 CASAVA_Build 18 54254593 1D AGAAATGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 21 9 A 12 11 152156 CASAVA_Build 18 54260868 1D CAGTTAGTCC G/- TACAGTCCAT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 G 1 0 152157 CASAVA_Build 18 54265571 1D AGCACCCAAA C/- CCCCTATGGG 3070 hom 84 het 36 0 28 8 C 5 4 152158 CASAVA_Build 18 54266536 1D ATTGGATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 11 10 152159 CASAVA_Build 18 54280453 2D CTTAGATAAC TT/-- TATTTTTTGA 3070 hom 105 het 42 0 36 7 T 3 1 152160 CASAVA_Build 18 54281113 4D TCTGAAGGCC GAGA/---- GAGAGCCTAG 3070 hom 57 het 22 0 20 5 GA 4 2 152161 CASAVA_Build 18 54283269 2D CATGGAGAAA CT/-- CTAAAGATAG 3070 hom 59 het 22 0 20 3 CT 2 1 152162 CASAVA_Build 18 54284415 6I TTGGCGGGGG ------/GATGCT GATGCTGGCA 3070 hom 92 het 39 0 28 11 GATGCT 1 2 152163 CASAVA_Build 18 54285486 5I CTTGATGAAA -----/CATCT CATAAGCACC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 CATCT 0 1 152164 CASAVA_Build 18 54289405 1I AGGATTTCAA -/C ATATGTACTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 0 1 152165 CASAVA_Build 18 54289968 1I GCTATTGATC -/A AAGCTGCATT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 2 3 152166 CASAVA_Build 18 54290738 5I CTCAAAAAAA -----/AAAGT AAAAAAATAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAAGT 0 1 152167 CASAVA_Build 18 54292040 4I CTCGAGCAGT ----/CAAA CAGAGAAAGT 3070 hom 31 het 26 0 11 15 CAAA 0 1 152168 CASAVA_Build 18 54294015 1D GTATCAAAAT A/- AAATAAGGAG 3070 hom 96 het 36 0 31 6 A 4 3 152169 CASAVA_Build 18 54294807 1D GTCTCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 26 11 T 14 13 152170 CASAVA_Build 18 54297375 1I TATATATATA -/T TATTTTTTTT 1724 het 289 hom 10 2 7 1 T 1 2 152171 CASAVA_Build 18 54298811 2D CGGGAAAATC GT/-- AGAGTGGGGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 GT 1 0 152172 CASAVA_Build 18 54301939 5D ATTTTTTGTA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1994 hom 15 het 6 0 5 1 T 17 12 152173 CASAVA_Build 18 54303999 1D ACCTGCCACT G/- GGGGGGGACC 3070 hom 66 het 31 0 18 13 G 8 7 152174 CASAVA_Build 18 54304176 4D CAGAGAAAAA TAAC/---- TAATTCACAC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TAAC 1 0 152175 CASAVA_Build 18 54306088 2D AAACAAAAAC AA/-- AAAATATGAA 2747 het 2747 ref 22 12 7 4 A 6 4 152176 CASAVA_Build 18 54318992 1D CAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 22 1 15 6 A 15 14 152177 CASAVA_Build 18 54329803 1I TTAACTTGAG -/C CCAAAGGTGC 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 C 2 3 152178 CASAVA_Build 18 54352519 1D AATTTGGAAG A/- AAAAACCAAG 3070 hom 95 het 36 0 31 5 A 6 5 152179 CASAVA_Build 18 54355368 15D GCAATGGTAA CAGTTGATGTGTCCT/--------------- CAGTCTCCCT 3070 het 3070 ref 49 23 24 9 CAGTTGATGTGTCCT 1 0 152180 CASAVA_Build 18 54365222 35D AGTAGGGTGA TGGAAAAATGATTTGAGTCTCAGAAAACTGGGGTT/----------------------------------- TGGTCTTGGA 3070 het 3070 ref 38 32 13 4 TGGAAAAATGATTTGAGTCTCAGAAAACTGGGGTT 1 0 152181 CASAVA_Build 18 54368621 1I ACAACCCCAT -/C CCCATTTCCA 3070 het 3070 ref 88 47 24 17 C 3 4 152182 CASAVA_Build 18 54369323 2I ACAAAAATGG --/AA AAAAAAAAAA 2597 het 2119 hom 22 8 10 4 A 11 13 152183 CASAVA_Build 18 54385437 1D GTCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 1314 het 570 hom 8 2 4 2 A 12 11 152184 CASAVA_Build 18 54404966 1D GGGCATTTGT A/- AAAAAAAAAA 2240 het 2240 ref 29 15 6 8 A 15 14 152185 CASAVA_Build 18 54410480 1D AGGGATGAGA C/- TTTTGGGTAT 3070 het 3070 hom 37 11 24 2 C 1 0 152186 CASAVA_Build 18 54421960 1I AATTTGCTTT -/C ATTATGAGGT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 0 1 152187 CASAVA_Build 18 54429504 3D AAAAAAAAAA AAG/--- TCAATTAAAG 3070 het 19 hom 25 1 23 1 AAG 1 0 152188 CASAVA_Build 18 54432890 3I CCCACCTCAG ---/CCT CCTCCTGAGT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 CCT 2 3 152189 CASAVA_Build 18 54445017 7I GTGTTATGTT -------/TGTTTGA GTATTGCACT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TGTTTGA 0 1 152190 CASAVA_Build 18 54445096 1D AAGTTTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 A 12 11 152191 CASAVA_Build 18 54445679 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 21 het 10 0 8 5 A 8 7 152192 CASAVA_Build 18 54450261 1I ATCTTACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 635 hom 31 3 15 13 A 12 13 152193 CASAVA_Build 18 54452543 2I AACCAAAGAC --/AT ATAACAATTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AT 1 2 152194 CASAVA_Build 18 54454136 2I GGCTATAATA --/AT AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AT 0 1 152195 CASAVA_Build 18 54466092 1D CACTTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 11 10 152196 CASAVA_Build 18 54480357 1I GTACAATGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 9 10 152197 CASAVA_Build 18 54492163 1D GCAAAAAAAA C/- AAATACAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 1 0 152198 CASAVA_Build 18 54495401 1D GAAAATCAGT A/- AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 5 4 152199 CASAVA_Build 18 54507471 1I TTTACAATGT -/A AAAAAAAAAA 1651 het 1596 hom 31 5 9 17 A 15 16 152200 CASAVA_Build 18 54516254 1D GGGGTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 1 0 152201 CASAVA_Build 18 54519359 2D GCACACACAC AT/-- ATATGTGTGT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 AT 3 2 152202 CASAVA_Build 18 54533013 4D GGAACCTGTG GATA/---- GATCTGAAAA 3070 het 3070 ref 53 24 24 6 GATA 1 0 152203 CASAVA_Build 18 54540803 1I CTCTGATGGG -/A ATTCTTCCTG 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 1 2 152204 CASAVA_Build 18 54545490 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 10 9 152205 CASAVA_Build 18 54546624 1D GAGACCAGCC T/- TGGACAATAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 2 1 152206 CASAVA_Build 18 54550890 1D ACACACAAAT A/- AATAAATGTA 3070 het 3070 ref 46 27 18 1 A 3 2 152207 CASAVA_Build 18 54553278 2D GCTGTCCCCA CC/-- CCCCCCCAGC 3070 hom 50 het 31 0 19 12 C 9 7 152208 CASAVA_Build 18 54558609 1I CATCGTAGTT -/C ATTCACTTTT 3070 hom 123 het 49 0 41 8 C 0 1 152209 CASAVA_Build 18 54558719 1D TTTAGTTGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 9 8 152210 CASAVA_Build 18 54564218 3D AATTAGTAAC ATT/--- AGAGTATATT 3070 hom 54 het 25 0 18 7 ATT 1 0 152211 CASAVA_Build 18 54564942 1D TAAAACCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 11 10 152212 CASAVA_Build 18 54567007 4I ATTTTAAAAG ----/TCTC TCTCACAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 TC 2 4 152213 CASAVA_Build 18 54569609 1I GTATATTTGA -/T TTTTTTTTTT 2425 het 2425 ref 20 9 7 4 T 13 14 152214 CASAVA_Build 18 54589960 1D ACTTGATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 7 A 11 10 152215 CASAVA_Build 18 54596970 1I CCTCCAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 A 9 10 152216 CASAVA_Build 18 54599616 1D AAGCCCTTTC T/- TTGGCTATTC 3070 het 3070 ref 67 33 19 16 T 3 2 152217 CASAVA_Build 18 54600021 1D TGTGTATGCC T/- TGGTGGTGGT 3070 hom 204 het 75 0 66 9 T 2 1 152218 CASAVA_Build 18 54600117 2D TGATGTTGTA TG/-- TGTGTGGCAT 3070 het 3070 ref 70 38 26 10 TG 4 3 152219 CASAVA_Build 18 54609774 1I GATTATGTCA -/T TAAGTGGAGC 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 1 2 152220 CASAVA_Build 18 54611612 2I CTTGAGATAA --/CT CTGATCACAC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 CT 1 2 152221 CASAVA_Build 18 54617167 1D TTCCAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 33 1 16 16 T 15 14 152222 CASAVA_Build 18 54620530 1I CGCTTCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 9 10 152223 CASAVA_Build 18 54621245 2I GGGGCATGGT --/GG GGTGTGCACC 3070 hom 135 het 46 0 45 1 G 2 4 152224 CASAVA_Build 18 54625098 4D CGCACCCGGC CTCT/---- CTATTTTCTA 3070 hom 39 het 14 0 12 2 CT 3 1 152225 CASAVA_Build 18 54626698 5D ACCTCCTGAG ATCTT/----- ATCCGGAAGC 3070 hom 46 het 17 0 13 4 ATCTT 1 0 152226 CASAVA_Build 18 54631570 2I CCCCTATAAC --/TA TGTCTTCTTC 3070 hom 150 het 57 0 50 7 TA 0 1 152227 CASAVA_Build 18 54635051 1I AAAAAATTCT -/C CGGGCGTGGT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 1 2 152228 CASAVA_Build 18 54635157 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 8 3 A 10 11 152229 CASAVA_Build 18 54695275 1D TTGTCTCGAG A/- AAAAAAAAAA 1361 het 1361 ref 38 27 3 8 A 11 10 152230 CASAVA_Build 18 54765926 1D GTCTGATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 A 11 10 152231 CASAVA_Build 18 54769170 1D TTTCAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 1360 het 1360 ref 36 26 3 7 T 12 11 152232 CASAVA_Build 18 54801969 1I CCCCACTGGC -/T AGAGCAATGC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 0 1 152233 CASAVA_Build 18 54811895 1D TTAAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 1362 het 1362 ref 38 30 3 5 T 11 10 152234 CASAVA_Build 18 54819516 1I TGTGTATTGG -/T TTGGTCTGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 2 3 152235 CASAVA_Build 18 54826276 1D CTTGAACCCA G/- GAAGTGGAGG 2629 het 2629 ref 19 10 6 3 G 2 1 152236 CASAVA_Build 18 54830223 1I ATTTTTTGTA -/T CTTTTGTAGA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 0 1 152237 CASAVA_Build 18 54836147 1D TTTTGGAGGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 A 9 8 152238 CASAVA_Build 18 54836654 2D AGCAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2573 het 1914 hom 21 5 9 8 A 16 14 152239 CASAVA_Build 18 54837783 1I CAGGCTGGGA -/T TCATACATGG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 1 2 152240 CASAVA_Build 18 54842959 1D TATTCGTTTC A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 7 6 152241 CASAVA_Build 18 54843383 1D CAACCAAAAC A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 A 8 7 152242 CASAVA_Build 18 54849060 1D ACCCTGAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 A 12 11 152243 CASAVA_Build 18 54849995 9D CAAAGCTGGA AGCAGCTCT/--------- AGCAGCCGGG 3070 het 3070 hom 36 17 19 3 AGCAGCTCT 1 0 152244 CASAVA_Build 18 54854717 2D ATTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2148 het 417 hom 29 7 9 13 T 18 16 152245 CASAVA_Build 18 54858508 2I AATGTGTGTG --/TT ACCCACACAG 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 T 0 2 152246 CASAVA_Build 18 54858923 1I AATCTAGTGT -/G ATAGTTTCTT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 0 1 152247 CASAVA_Build 18 54867129 2D AAAATTAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1520 hom 24 5 13 7 T 13 11 152248 CASAVA_Build 18 54875597 1I TTCCCAGAGG -/A AAGGAGCGCC 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 2 3 152249 CASAVA_Build 18 54877102 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1926 het 1926 ref 25 10 8 7 T 13 12 152250 CASAVA_Build 18 54883265 3D GTAATCTCAG CTT/--- CTTGGGATGC 3070 het 3070 hom 27 9 16 4 CTT 2 1 152251 CASAVA_Build 18 54907785 10D CATCTCAGAA GAAACAAAAC/---------- AAAACAAAAC 3070 hom 33 het 13 0 12 3 GAAACAAAAC 1 0 152252 CASAVA_Build 18 54916913 1D ACCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1026 het 1026 ref 34 27 4 3 A 12 11 152253 CASAVA_Build 18 54919291 7D AAGAGACAAG ATCCATT/------- TCAAACAGAA 3070 het 3070 ref 57 28 27 5 ATCCATT 1 0 152254 CASAVA_Build 18 54922794 1I CCTGTTGGGA -/T TTTTGACTTG 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 T 4 5 152255 CASAVA_Build 18 54939884 1I CTCCTGGCTT -/C AAGTAATCCT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 C 0 1 152256 CASAVA_Build 18 54940138 1I TACTTTGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 13 11 A 13 14 152257 CASAVA_Build 18 54945967 1I ATAGGCAAAT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 7 8 152258 CASAVA_Build 18 54963196 1I AATACTTAAC -/T TTTTGCCAAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 T 4 5 152259 CASAVA_Build 18 54966832 1D CCTGTGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 866 hom 30 3 14 13 T 12 11 152260 CASAVA_Build 18 54999292 2D22M1D ACACTGGCTC TATCTCCATTTTAAAATTCCACACA/--TCTCCATTTTAAAATTCCACAC- AAAAAAAAGA 3070 hom 135 het 43 0 46 4 N/A 0 0 152261 CASAVA_Build 18 55004944 3D CCAAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 11 8 152262 CASAVA_Build 18 55012923 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1061 het 1061 ref 24 8 6 11 A 17 16 152263 CASAVA_Build 18 55024873 9D CCTCACATAC CCCGAGTAT/--------- CTGCTAGGAA 3070 het 3070 ref 52 28 19 11 CCCGAGTAT 1 0 152264 CASAVA_Build 18 55025184 1D CCAACATGCC A/- GCAAAAGGGT 3070 het 3070 ref 36 23 13 0 A 1 0 152265 CASAVA_Build 18 55049612 1D ACTAGTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 49 1 43 6 T 11 10 152266 CASAVA_Build 18 55050048 1I AAAAAACACC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 A 8 9 152267 CASAVA_Build 18 55056058 3D AGAAGAAGAG GAA/--- GAAGAAGGAA 2398 het 2398 ref 23 11 9 4 GAA 3 2 152268 CASAVA_Build 18 55063564 1I TTGCTGGGGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 8 9 152269 CASAVA_Build 18 55066013 1D CCAAGGCAAA T/- TCTAATTTAC 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 2 1 152270 CASAVA_Build 18 55071485 11D GAGGTCAAAT TCAGGAGAAGC/----------- TCACATGTCA 3070 het 3070 hom 28 13 16 4 TCAGGAGAAGC 1 0 152271 CASAVA_Build 18 55072399 1I ATCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 334 het 334 ref 35 17 7 11 C 0 1 152272 CASAVA_Build 18 55100615 4D CACGTTTCTT ACTC/---- AGTTCCATTT 3070 hom 153 het 53 0 48 6 ACTC 1 0 152273 CASAVA_Build 18 55112324 1D AAGGGGACAG C/- ATTGCTGCCT 3070 hom 129 het 57 0 40 17 C 1 0 152274 CASAVA_Build 18 55113780 1D CAGAGTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 11 11 A 17 16 152275 CASAVA_Build 18 55125966 2D GTTTTTCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2237 het 154 hom 17 2 7 9 T 16 14 152276 CASAVA_Build 18 55161267 1D TACAACAGCT A/- AAAAAAAAAA 1769 het 1769 ref 41 20 6 15 A 15 14 152277 CASAVA_Build 18 55172719 2D AATGTAAAAA AC/-- ACACACTTAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AC 4 3 152278 CASAVA_Build 18 55174883 1D TTCAAAGGAT G/- GGGTGTGGGC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 G 4 3 152279 CASAVA_Build 18 55208882 1D TTTTGGACTT G/- TAGCCTCCAG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 G 1 0 152280 CASAVA_Build 18 55216030 1D GAGTCTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 A 10 9 152281 CASAVA_Build 18 55229168 1I GCCCGGCCCC -/T GATTCCTAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 0 1 152282 CASAVA_Build 18 55235737 4D TATATATATA TATT/---- TTTTTAAGCA 879 het 65 hom 20 1 5 14 TATT 1 0 152283 CASAVA_Build 18 55237151 1D CTTATTGATG T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 6 5 152284 CASAVA_Build 18 55248905 8I CGGTTTGAAA --------/ATCTCACC ATCTCACCCT 3070 hom 71 het 27 0 23 4 ATCTCACC 1 2 152285 CASAVA_Build 18 55249694 1D GGTTGTTTCT G/- GGGCACAGGC 3070 het 3070 ref 40 20 12 9 G 4 3 152286 CASAVA_Build 18 55251168 1I GTTTTGTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 9 10 152287 CASAVA_Build 18 55251482 1D ATAAAACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 29 1 23 5 T 13 12 152288 CASAVA_Build 18 55251822 1I AAAAGGGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 17 0 8 9 T 13 14 152289 CASAVA_Build 18 55254503 1I ACAGGAGCCT -/G GGGGGTCCTC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 G 5 6 152290 CASAVA_Build 18 55259696 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2805 het 434 hom 22 3 8 11 A 16 15 152291 CASAVA_Build 18 55261223 1I TTGTTTTTTT -/A AATTCTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 2 3 152292 CASAVA_Build 18 55261682 1D ATTTGCCAAC T/- TTTTTTTTTT 2388 het 572 hom 17 2 9 6 T 15 14 152293 CASAVA_Build 18 55261846 1D CCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 2439 hom 17 6 9 2 T 7 6 152294 CASAVA_Build 18 55263298 1D CTATGCTTTT G/- GGGGTCATAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 G 5 4 152295 CASAVA_Build 18 55264809 2D TGGAGAGAAA AC/-- ACACAAATCC 3070 het 3070 ref 54 33 18 4 AC 3 2 152296 CASAVA_Build 18 55267595 1D GCAATTTGGG A/- GGCCAAGGCA 1320 het 1320 ref 25 17 4 4 A 1 0 152297 CASAVA_Build 18 55267838 2D GACTCTGTCC AA/-- AAAAAAAAAA 2078 het 111 hom 24 3 10 12 A 16 14 152298 CASAVA_Build 18 55270155 4D AGTCACCACT TTCC/---- TTTCATAGTA 3070 het 3070 ref 30 15 11 7 TTCC 1 0 152299 CASAVA_Build 18 55276597 1I TTGGCAGAGC -/G GGGGCCGCCA 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 G 4 5 152300 CASAVA_Build 18 55283557 1I TTTCTTCTTC -/T TCTCTTTCCT 3070 hom 68 het 36 1 33 2 T 1 2 152301 CASAVA_Build 18 55286085 1I TCTGGACGCT -/C CCCCGGCAGT 3070 hom 93 het 39 0 30 9 C 4 5 152302 CASAVA_Build 18 55286643 4D CTATAAAGTG AAGT/---- AAGAGCCTTG 3070 hom 90 het 32 0 30 7 AAGT 1 0 152303 CASAVA_Build 18 55287064 1I13M1I TTTTTTTTTT -CCCCAAACGAGGA-/CCCCCAAACAAGGAC CCCCAGATGT 3070 hom 72 het 33 0 24 12 N/A 0 0 152304 CASAVA_Build 18 55291796 1D CTTTTTTTTT C/- CCTATTGTTA 3070 het 355 hom 42 1 34 7 C 3 2 152305 CASAVA_Build 18 55312735 1D TGAGGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 13 12 152306 CASAVA_Build 18 55332831 1I TGCTCTCCTG -/T TTTTTTTTTT 1575 het 1460 hom 27 7 6 14 T 13 14 152307 CASAVA_Build 18 55337726 1I TTTAAAACTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 8 9 152308 CASAVA_Build 18 55366949 11I AGATTACCTG -----------/AGGTGTTCAAT AGGTGTTCAA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 AGGTGTTCAAT 0 1 152309 CASAVA_Build 18 55371445 2D CTCATTTCAT CA/-- CAGTCATTAA 3070 hom 141 het 54 0 48 7 CA 2 1 152310 CASAVA_Build 18 55375192 2D AGGGGTATCT TG/-- TGTGTGATTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TG 4 3 152311 CASAVA_Build 18 55381110 2I TTTCGATCTC --/TT GTTTGTTTCA 3070 hom 119 het 45 0 37 8 T 0 2 152312 CASAVA_Build 18 55386384 1I AAGAGGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 9 15 5 T 13 14 152313 CASAVA_Build 18 55396915 5D ACAGAAAACC ACTGA/----- AAACACTGCA 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 ACTGA 1 0 152314 CASAVA_Build 18 55402716 1I GTATAATAAT -/A AATAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 A 2 3 152315 CASAVA_Build 18 55404416 1D GGACTCAAAG T/- TTTTAAAACA 3070 het 3070 hom 45 18 24 4 T 5 4 152316 CASAVA_Build 18 55433714 1I ACTGTCGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 11 12 152317 CASAVA_Build 18 55453617 11D AAAACTGAAA TAAGGGAAAAC/----------- TGAAATAAGG 141 het 141 ref 38 27 2 11 TAAGGGAAAAC 1 0 152318 CASAVA_Build 18 55459764 1D CCCGTGACAC A/- AGATTTACCT 3070 het 3070 hom 44 21 21 5 A 2 1 152319 CASAVA_Build 18 55462931 1D TCCTATTTCT C/- CCCCCACACC 3070 het 3070 hom 49 20 23 7 C 6 5 152320 CASAVA_Build 18 55471176 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2171 het 2171 ref 23 13 6 4 A 11 12 152321 CASAVA_Build 18 55477508 1I AATTTACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2841 hom 42 8 22 12 T 12 13 152322 CASAVA_Build 18 55479214 1I CTGGGAGGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 T 9 10 152323 CASAVA_Build 18 55479443 1D ACAAAAGGAG T/- TTGGTAATTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 3 2 152324 CASAVA_Build 18 55480179 2I ACTCAGTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 10 13 8 A 12 14 152325 CASAVA_Build 18 55481245 1D74M6D AAAAAAAGTG AAAATACAATTCAACAAATTACTTTAACAAAGATTTACTGAATATTTCCCATGTGCTAGGCACCAGGCTTGGTGCTAGGGA/-AAATACAATTCAACAAATTGCTTTAACAAAGATTTACTGAATATTTCCCATGTGCTAGGCACCAGGCTTGGTGC------ TAGGGATAGG 3070 het 3070 ref 26 25 19 6 N/A 0 0 152326 CASAVA_Build 18 55483394 1I GAGTCCCCCC -/T GAGACAAAAG 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 T 0 1 152327 CASAVA_Build 18 55488367 4I GAAGAGAAGC ----/CTTA ATGTGCCTTA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 CTTA 0 1 152328 CASAVA_Build 18 55495911 1D TTATCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 7 A 12 11 152329 CASAVA_Build 18 55501910 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 7 8 152330 CASAVA_Build 18 55505198 2I TTATCGTCTG --/CT CTCTCATACA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 CT 2 3 152331 CASAVA_Build 18 55505626 4D TGTGCCTGTG TTTT/---- TTTCTCTACA 3070 het 3070 hom 62 23 33 8 T 7 3 152332 CASAVA_Build 18 55509609 4D TCTTCACAAG ATTT/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 101 het 38 0 34 4 ATTT 1 0 152333 CASAVA_Build 18 55512657 1I TGGTCAACTG -/C AAAGGCCTCC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 C 0 1 152334 CASAVA_Build 18 55517466 1D ATGAGGTCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 36 0 34 3 A 10 9 152335 CASAVA_Build 18 55521711 2D GCAAAAATAA CT/-- CTCTTCAAAT 3070 hom 66 het 25 0 22 5 CT 3 2 152336 CASAVA_Build 18 55527849 11D GCTCACATTA GATTTCTTTTG/----------- GACAGTGCTG 3070 het 3070 ref 38 21 15 3 GATTTCTTTTG 1 0 152337 CASAVA_Build 18 55527954 3I GGCTGGAATT ---/GTG GTGCTGGCAT 3070 hom 108 het 38 0 33 5 GTG 1 2 152338 CASAVA_Build 18 55539448 2D AGACAGTGTC TG/-- TGTGTAACTG 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 TG 3 2 152339 CASAVA_Build 18 55568961 2D TAGTACACCC CA/-- GTTTCAGAAA 3070 hom 111 het 42 0 36 7 CA 1 0 152340 CASAVA_Build 18 55572362 1D TGTAAGTCCA T/- TTAAACCTCT 3070 hom 66 het 25 0 21 4 T 3 2 152341 CASAVA_Build 18 55575425 5D12M4I TGATTTACTT ATTTATTTTTTGTCATC----/-----TTTTTTGTCATCTTAT TTGTTTGTAA 3070 hom 111 het 37 0 37 5 N/A 0 0 152342 CASAVA_Build 18 55581173 1D TCTTCTATCC A/- AAAAAATCCA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 7 6 152343 CASAVA_Build 18 55595664 1D AAGAAAACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 13 12 152344 CASAVA_Build 18 55597913 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 12 10 152345 CASAVA_Build 18 55599981 10D ACTCTGCCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 1937 hom 21 het 8 0 6 3 A 26 16 152346 CASAVA_Build 18 55601563 1I TCCAAAGAGC -/A AAGTATTAGT 3070 hom 150 het 56 0 46 10 A 2 3 152347 CASAVA_Build 18 55603770 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 564 hom 28 2 23 4 A 12 11 152348 CASAVA_Build 18 55603904 1D CTGCACTCCA G/- GCCTGGGTGA 3070 hom 99 het 35 0 31 5 G 2 1 152349 CASAVA_Build 18 55621232 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1313 het 751 hom 11 3 5 3 T 15 16 152350 CASAVA_Build 18 55621319 1D AGGTGATCCA C/- CCCCCCTCGG 3070 het 2159 hom 24 8 13 3 C 7 6 152351 CASAVA_Build 18 55621763 3D AATTTAAGCA TAT/--- TATTAAAGAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TAT 2 1 152352 CASAVA_Build 18 55626608 3I TCTGAGAGGC ---/AGA AGAAGCAAGA 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 AGA 1 2 152353 CASAVA_Build 18 55632034 1I AAGAACTGTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 9 152354 CASAVA_Build 18 55633160 1D TGTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 24 1 16 8 A 14 13 152355 CASAVA_Build 18 55645514 1D ATAAAAAAAA G/- AGTTTGCGGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 1 0 152356 CASAVA_Build 18 55661524 5I AAATTAGCCG -----/GGTAT GGTATGGTGG 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 GGTAT 1 2 152357 CASAVA_Build 18 55663484 3D CAGGTGTGAG CCA/--- CCACGACCAG 3070 het 1340 hom 15 4 9 4 CCA 2 1 152358 CASAVA_Build 18 55664643 2I GAAACCCAGA --/CT CTCTACTAAA 3070 het 1095 hom 15 3 11 1 CT 2 3 152359 CASAVA_Build 18 55671946 12D TTATTGTTTG TTTTGTTTTTGT/------------ TTTTGTTTTT 1571 het 1571 ref 28 14 6 10 TTTTGT 4 2 152360 CASAVA_Build 18 55673004 4D ATGGTGAGAT CAAA/---- CAAAGTAGCT 3070 het 3070 ref 32 21 10 6 CAAA 2 1 152361 CASAVA_Build 18 55674418 12D TTCATGCGTG CACACACACACA/------------ CACACACACA 3070 het 397 hom 33 3 15 15 CA 12 6 152362 CASAVA_Build 18 55676869 1D TCCTGTCACA G/- AAATAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 1 0 152363 CASAVA_Build 18 55677334 1D TATTTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 2193 het 1488 hom 15 4 6 5 A 11 10 152364 CASAVA_Build 18 55680571 1D TTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1068 hom 25 4 13 8 T 15 14 152365 CASAVA_Build 18 55684720 1I36M1D TGGCCAGGCT -GGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCACAAC/GGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCACAA- CCCCCCCCAT 2670 het 2670 ref 15 11 9 2 N/A 0 0 152366 CASAVA_Build 18 55686719 1I TCTGTCACCC -/T TGGCTAGAGT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 1 2 152367 CASAVA_Build 18 55689243 19D CTCCTCTTCC AAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAA 2957 het 2957 ref 38 20 10 11 A 32 13 152368 CASAVA_Build 18 55689897 2D ACCCTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2709 het 961 hom 14 3 7 5 A 16 14 152369 CASAVA_Build 18 55693736 1I ACAGAATGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 20 0 16 5 T 9 10 152370 CASAVA_Build 18 55693893 1D CCCGGCTAAC T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 40 het 18 0 13 5 T 8 7 152371 CASAVA_Build 18 55703090 2I AACAACAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 119 hom 18 1 13 4 AT 7 8 152372 CASAVA_Build 18 55712221 1D AAGTCCTAGA C/- CCCCCCCCAC 1622 het 1622 ref 26 15 4 7 C 9 8 152373 CASAVA_Build 18 55728214 6D TTGAACCAGG GAGGCA/------ GAGGTTGCAG 3070 hom 54 het 20 0 17 4 GAGGCA 1 0 152374 CASAVA_Build 18 55729059 1D CACCACACCC G/- GGCCCCCACT 3070 hom 66 het 26 0 23 7 G 3 2 152375 CASAVA_Build 18 55729742 1D TCAAAATAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 131 het 49 0 44 5 A 9 8 152376 CASAVA_Build 18 55731698 1D GATTCTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 39 2 27 11 T 11 10 152377 CASAVA_Build 18 55732523 1D ATACATTTAG A/- ATGTGAGAAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 2 1 152378 CASAVA_Build 18 55734465 4D TTTTTTCTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TTTC 3 2 152379 CASAVA_Build 18 55736383 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2578 hom 5 het 26 0 9 17 A 21 18 152380 CASAVA_Build 18 55737177 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 33 1 27 5 T 11 12 152381 CASAVA_Build 18 55737566 1I TGGGATAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1147 hom 41 3 35 3 T 10 11 152382 CASAVA_Build 18 55743932 1I TAGTCCCAGC -/T TACTCGGGAG 2503 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 2 152383 CASAVA_Build 18 55754763 1I ATGTTTTGCT -/A AAATTTTTCT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 3 4 152384 CASAVA_Build 18 55756671 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTGTAG 1626 het 159 hom 25 2 11 12 T 6 7 152385 CASAVA_Build 18 55762057 1D CTCTTCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1376 hom 30 4 9 17 T 17 16 152386 CASAVA_Build 18 55765810 4D CATTCTGAAA TTAC/---- TTAATAAAAT 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 TTAC 1 0 152387 CASAVA_Build 18 55765925 1D ATCCTGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1980 hom 30 8 14 8 T 15 14 152388 CASAVA_Build 18 55766999 2D ATACTTTTAA CT/-- CTCTCATTAG 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 CT 3 2 152389 CASAVA_Build 18 55771919 1D AAAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAT 1246 het 1207 hom 29 9 8 12 A 10 9 152390 CASAVA_Build 18 55790964 1D TTTTTTTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 661 hom 36 2 26 8 A 13 12 152391 CASAVA_Build 18 55791333 2I TGAGCAGATC --/AA AAAACTCCAG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 4 6 152392 CASAVA_Build 18 55795418 1D CCTTATCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1711 hom 22 6 14 2 T 13 12 152393 CASAVA_Build 18 55806749 1D GGGTTTTTTT A/- AAATTACACT 3070 hom 42 het 27 0 15 12 A 4 3 152394 CASAVA_Build 18 55811466 1I ATAATTGAAT -/C ATGGGGGTGT 3070 hom 75 het 27 0 24 3 C 0 1 152395 CASAVA_Build 18 55832482 1I TCACCCCCCC -/T CCTTCTCAAT 3070 hom 72 het 31 0 22 9 T 0 1 152396 CASAVA_Build 18 55834466 1D GAAGGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 12 11 152397 CASAVA_Build 18 55847023 2D TCTCTCTCTC TT/-- GTTATTTCTC 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 T 2 0 152398 CASAVA_Build 18 55866275 1I TGATAATATT -/A AGGTATTATT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 1 2 152399 CASAVA_Build 18 55868403 6I CTTTTCTTTT ------/TTTTTC TTTTTTCAAT 3070 hom 95 het 36 0 33 3 TTTTTC 0 1 152400 CASAVA_Build 18 55868478 1D GAGCATGGTT A/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 1 0 152401 CASAVA_Build 18 55869620 1I125M3I ACAAAAATAC -TCTTGAAAATATTCTCAGAGGAAAAGAGTATACAGATATAGAGAATAAAAACAGTAGTCTGAATAGTGACAGAAATTACAGTAACAATTAAATTATGATTACAGATTTAAAGATAATCCCAAAAG---/TTCTTGAAAATATTCTCAGAGGAAGAGAGTATACAGATATAGAGAATAAAAACAGTAGTCTGAATAGTGTCAGAAATTACAGTAACAATTAAATTATGATTACAGATTTAAAGATAATCCCAAAAGTCT TCTTCTTCTC 3070 het 1293 hom 25 3 29 41 N/A 0 0 152402 CASAVA_Build 18 55876817 1D GTAAGGGAAG A/- AAAAAATTAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 7 6 152403 CASAVA_Build 18 55886587 1I GTTAGATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 13 15 T 15 16 152404 CASAVA_Build 18 55889537 1I TCATGCACAG -/T TTGCCTTCAC 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 T 2 3 152405 CASAVA_Build 18 55897796 1I TGCAGATGAC -/A TGATCTTGTA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 0 1 152406 CASAVA_Build 18 55902413 1D TCCTTGACTG A/- AAAAGGCTCC 3070 hom 84 het 29 0 28 1 A 5 4 152407 CASAVA_Build 18 55970461 1D CTCAACAACA G/- GATATGTGCA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 G 2 1 152408 CASAVA_Build 18 56071043 1I TCTAGTCAAA -/T TGGTTATTTG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 1 2 152409 CASAVA_Build 18 56072169 1I ATATTGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3004 hom 43 12 14 17 T 15 16 152410 CASAVA_Build 18 56076861 1D TATCTTATGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 10 9 152411 CASAVA_Build 18 56077257 1I CTTCTTCAGC -/A TTAAATAATT 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 0 1 152412 CASAVA_Build 18 56091515 1I TATTAAAAAA -/G TTTAAAAAAA 1962 het 66 hom 7 1 4 2 G 0 1 152413 CASAVA_Build 18 56124809 1D ACTACCATGT G/- GGGGATGAGA 3070 hom 105 het 42 0 36 9 G 5 4 152414 CASAVA_Build 18 56155924 4D GGTGGCTATC TTCA/---- TTCTTTTGCA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TTCA 1 0 152415 CASAVA_Build 18 56160090 1I AAAATTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2172 het 2172 ref 32 13 10 9 A 16 17 152416 CASAVA_Build 18 56177363 1I TTTGAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 14 15 152417 CASAVA_Build 18 56200661 1D TTTTGGTGTT A/- ACTGCATTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 1 152418 CASAVA_Build 18 56232847 1D CAACAGCACC A/- GCAATTAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 A 1 0 152419 CASAVA_Build 18 56248472 2I ACAAATATAT --/AA GTGTTAATAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 2 152420 CASAVA_Build 18 56248624 5D CTATTGTTAT TTTTA/----- TTTTATTTTA 2667 hom 15 het 10 0 6 4 TTTTA 5 4 152421 CASAVA_Build 18 56252618 1D CTTGCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 11 10 152422 CASAVA_Build 18 56255094 1D CTTAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 24 1 18 5 A 13 12 152423 CASAVA_Build 18 56257893 2D TTTATGGCAC TA/-- TATATATATA 2294 het 2294 ref 24 14 8 2 TA 7 6 152424 CASAVA_Build 18 56262571 1D TGTGATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 16 8 T 12 11 152425 CASAVA_Build 18 56266671 1D CCTGTAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 10 9 152426 CASAVA_Build 18 56266866 1D CCAGGCCTCT G/- GGCCTGTGAT 3070 het 3070 hom 31 14 10 7 G 3 2 152427 CASAVA_Build 18 56270602 2I TACTACAAAC --/TG AGAGAAAACA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TG 0 1 152428 CASAVA_Build 18 56271191 2D TGTATATATA TT/-- TATTTATTTA 2491 hom 30 het 11 0 11 4 T 3 1 152429 CASAVA_Build 18 56272112 1I TGTAAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 30 1 22 7 T 10 11 152430 CASAVA_Build 18 56280680 1D TATTAGGGCT A/- AAAAAGGATT 3070 hom 102 het 37 0 33 4 A 6 5 152431 CASAVA_Build 18 56283621 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 20 2 13 5 A 15 16 152432 CASAVA_Build 18 56294200 3I TATACAATAC ---/GTT GTTGTTAACT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 GTT 2 3 152433 CASAVA_Build 18 56294404 1D GTGAGAACAT A/- ACGATATTTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 2 1 152434 CASAVA_Build 18 56297061 1D TTTACTTTAC A/- AAAGATACAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 4 3 152435 CASAVA_Build 18 56302288 1D TAGAACACAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 24 0 20 5 A 9 8 152436 CASAVA_Build 18 56303254 1I AATGTGAAAT -/G GCAGCAATAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 1 2 152437 CASAVA_Build 18 56319457 6D TTACTTTTAT AACTTA/------ AACTTAAATA 3070 het 3070 ref 30 16 14 2 AACTTA 2 1 152438 CASAVA_Build 18 56321433 1I TTTATCCTTG -/T ATTTTACTTA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 T 0 1 152439 CASAVA_Build 18 56322516 1I ACTGCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 A 10 11 152440 CASAVA_Build 18 56329292 4I TACTAAAAAT ----/ACAA ACAATTAGCC 3070 het 1278 hom 19 4 10 5 ACAA 1 2 152441 CASAVA_Build 18 56334218 1I GGAAACTATG -/T TCTAATTTGT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 1 2 152442 CASAVA_Build 18 56336411 1D TGAAGAATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 106 hom 38 3 17 18 A 10 9 152443 CASAVA_Build 18 56337243 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTC 2396 hom 8 het 20 0 8 12 A 1 0 152444 CASAVA_Build 18 56342209 1D GGTGGCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1135 hom 33 7 12 14 T 12 11 152445 CASAVA_Build 18 56342449 1D TTTTTTTTTT A/- ATGGCTTCAA 3070 hom 65 het 26 0 21 6 A 2 1 152446 CASAVA_Build 18 56343637 1D CAAACCTCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 9 8 152447 CASAVA_Build 18 56350200 1I TTAGAGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 11 12 152448 CASAVA_Build 18 56354786 3I GAGGGGTCTT ---/TGG TGACCTAATA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TGG 0 1 152449 CASAVA_Build 18 56356328 2D AAAAAATAAC AT/-- AAACAATTGT 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 AT 1 0 152450 CASAVA_Build 18 56360611 1D TACTTTACTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 T 10 9 152451 CASAVA_Build 18 56366120 2D TGGGAAGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 9 9 T 14 12 152452 CASAVA_Build 18 56368978 3D ATTATAAATG GTT/--- GTTATTTTTA 3070 het 2908 hom 16 7 8 2 GTT 2 1 152453 CASAVA_Build 18 56372133 1I AAGCCAAAGG -/A AAAAAAACAT 3070 het 2565 hom 30 9 15 6 A 7 8 152454 CASAVA_Build 18 56374967 3I AAAAATAAAA ---/AAG AAATTAGTCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAG 0 1 152455 CASAVA_Build 18 56441980 1D AAATAATAAC T/- TTTCGATGCT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 4 3 152456 CASAVA_Build 18 56446866 1D AACAGGCCCT G/- GTGTGTGATG 3070 het 2817 hom 18 8 9 1 G 2 1 152457 CASAVA_Build 18 56450783 12I TCATTGTGGT ------------/TCAGTAGTGATC TCAGTAAGAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 6 TCAGTAGTGATC 0 1 152458 CASAVA_Build 18 56455523 5D GGCACTCATT TTCTC/----- TTCTAACTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 7 TTCTC 1 0 152459 CASAVA_Build 18 56456791 2D TAAGAATGGC AA/-- AAAGTGCACA 3070 het 3070 hom 64 29 30 6 A 5 3 152460 CASAVA_Build 18 56460629 2D TTGTTCTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 14 12 152461 CASAVA_Build 18 56463308 2D43M2I TTGAATTGTA TGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATGAGATTGTATTGTGTGTG--/--TGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATGAGATTGTATTGTGTGTGTA TATATATATA 3070 het 3070 ref 25 17 9 7 N/A 0 0 152462 CASAVA_Build 18 56464486 2D TATACACACG TA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TA 1 0 152463 CASAVA_Build 18 56464559 8I CTTAGGATAC --------/ATCAGTAA ATAAGAGACA 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 ATCAGTAA 0 1 152464 CASAVA_Build 18 56464813 4I TGGGCTGACA ----/TATT TATTTGCCTT 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 TATT 1 2 152465 CASAVA_Build 18 56469689 5D AAACAGAAAT AAATC/----- CATGTTCATT 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 AAATC 1 0 152466 CASAVA_Build 18 56470682 4I TATGAAAGAA ----/AGAC AGTCCAATTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 AGAC 0 1 152467 CASAVA_Build 18 56479409 2D TACTCTGTTG TT/-- TTTTTTGTTG 691 het 691 ref 39 21 5 13 T 8 6 152468 CASAVA_Build 18 56484041 1D ATTTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3006 het 3006 ref 22 10 8 5 A 11 10 152469 CASAVA_Build 18 56486936 1D TCCAGTGTGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 52 26 19 8 T 8 7 152470 CASAVA_Build 18 56489759 1I AAGCCAAAAT -/A TAGTTATTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 152471 CASAVA_Build 18 56491441 1I ATGAAAACTC -/A AAACACTCCA 3070 het 3070 hom 61 26 28 7 A 3 4 152472 CASAVA_Build 18 56497485 2D TCCAACTAAA AG/-- AGATATTTTG 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 AG 2 1 152473 CASAVA_Build 18 56503171 1D TTAACAATCC T/- TTTACAATTT 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 T 4 3 152474 CASAVA_Build 18 56506124 3D CTCACTGGCA AAG/--- AAGAAACAGC 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 AAG 2 1 152475 CASAVA_Build 18 56506811 1I TGGTTTACAG -/T TTTGGTTTTG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 3 4 152476 CASAVA_Build 18 56508310 4I TTTGATTTTA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 TTTG 2 3 152477 CASAVA_Build 18 56509784 1I ATTAATAAAA -/G GTTTAATATT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 G 1 2 152478 CASAVA_Build 18 56510189 1D ATAATTTGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 9 8 152479 CASAVA_Build 18 56515421 4I CACACACACA ----/TATG TATGTATCTG 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 TATG 1 2 152480 CASAVA_Build 18 56518243 2D TAAAACAAAC AT/-- AGAGAAGGCT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 AT 1 0 152481 CASAVA_Build 18 56522089 2D ATCCCAGCAC TT/-- TGGGAGGCCG 1844 het 204 hom 7 2 5 0 T 3 1 152482 CASAVA_Build 18 56531931 1D CTTGCAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 A 13 12 152483 CASAVA_Build 18 56553945 1D AGTTGTTGCT C/- CACTACTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 C 2 1 152484 CASAVA_Build 18 56555539 1D GATAGCATGG T/- TTTTCCTTTA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 5 4 152485 CASAVA_Build 18 56566651 1D GCACAGGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 12 11 152486 CASAVA_Build 18 56569333 1I GGGCTTTTTA -/C TTGCCTCCTC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 C 0 1 152487 CASAVA_Build 18 56569964 1D TTCTAAACCT A/- ATAAGTTGAC 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 A 2 1 152488 CASAVA_Build 18 56572117 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 9 7 152489 CASAVA_Build 18 56573130 14I CATCCTTATA --------------/GAGGAAGGCATTAT TCTCTCTTTG 3070 het 3070 hom 64 25 33 7 GAGGAAGGCATTAT 0 1 152490 CASAVA_Build 18 56576471 1D AAAATGAAAG A/- AAAAATGAGA 3070 het 3070 hom 40 19 19 3 A 6 5 152491 CASAVA_Build 18 56585714 1I TATATATATG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 8 9 152492 CASAVA_Build 18 56600996 4D TTAACAAAAT AAAG/---- AAATCCTCAG 3070 het 3070 ref 34 17 16 5 AAAG 1 0 152493 CASAVA_Build 18 56603668 4D TCTTATGATC GTGA/---- GTGAGTTCTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 6 GTGA 2 1 152494 CASAVA_Build 18 56614279 4D GTATGAAATT TTTG/---- TTTGTCAATT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TTTG 2 1 152495 CASAVA_Build 18 56614754 1I ACTGAATGTG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 8 9 152496 CASAVA_Build 18 56631790 1D GTAGGCATAG C/- GTAATTAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 C 1 0 152497 CASAVA_Build 18 56634927 1I CATTATACTC -/T TTTTGTACTT 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 T 4 5 152498 CASAVA_Build 18 56635411 2D39M1I TTCATTGTGA ATGTGAAAAATATATTTTATATAATTTCAATATTTTTAACA-/--TTGAAAAATATATTTTATATAATTTCAATATTTTTAACAT TTTTAAGTCA 3070 het 3070 ref 27 15 16 2 N/A 0 0 152499 CASAVA_Build 18 56636112 1I GAACTTGCTC -/T TTATAGGATG 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 T 2 3 152500 CASAVA_Build 18 56638004 4D71M1D ATCTCTATTT ATTATATTATTTTTCATATTAAGGTTTGCAATATTTATATGTTCTGTCAACACATTTCAGAGTTATTTCCTCTTAT/----TATTATTTTTCATATTAAGGTTTGCAATATTTATATGTTCTGTCAACACATTTCAGAGTTATTTCCTCTTA- TTTCATATTT 3070 het 3070 ref 30 18 19 12 N/A 0 0 152501 CASAVA_Build 18 56638918 3I CTTCATTTAG ---/AAT AATAGTCTAC 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 AAT 1 2 152502 CASAVA_Build 18 56639099 2D TATACACATA TG/-- TATTACATAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 TG 1 0 152503 CASAVA_Build 18 56640166 5D AATTATCCCA GCACT/----- ATTTGTTGAA 3070 het 3003 hom 15 7 8 1 GCACT 1 0 152504 CASAVA_Build 18 56643953 1D GATAAATAAA G/- GAGAAGAATA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 G 2 1 152505 CASAVA_Build 18 56644417 1I AAAAAATAAT -/G GCAAACCCTT 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 G 1 2 152506 CASAVA_Build 18 56655797 1I CCTTGATTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 7 8 152507 CASAVA_Build 18 56663611 2D ACTGCAGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 13 5 T 15 13 152508 CASAVA_Build 18 56691336 1D TTTGAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 29 1 21 7 T 12 11 152509 CASAVA_Build 18 56700150 1D TATGATTTTG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 104 het 40 0 34 6 A 9 8 152510 CASAVA_Build 18 56740684 1I AGACAAGTTT -/A AAAGTTACAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 3 4 152511 CASAVA_Build 18 56759954 1D TTTATTTTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 9 8 152512 CASAVA_Build 18 56762493 1D AACCTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1543 hom 50 7 24 20 A 17 16 152513 CASAVA_Build 18 56779642 1D AGATACCATT A/- AAAAAAAAAA 466 het 466 ref 20 16 2 3 A 12 11 152514 CASAVA_Build 18 56792881 1D ATACAGGCTA T/- CAATTAGAAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 T 1 0 152515 CASAVA_Build 18 56793057 4I TAAGTTCACA ----/ACTT GTTTTGGAAC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 ACTT 0 1 152516 CASAVA_Build 18 56803542 1D GATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 29 18 8 T 10 9 152517 CASAVA_Build 18 56807576 1D AAATGTGTGT G/- GGGGGTAGGG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 6 5 152518 CASAVA_Build 18 56809452 1I TTTCTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 34 1 27 6 A 0 1 152519 CASAVA_Build 18 56814749 1D TGTGACAGCA T/- ATAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 35 22 9 5 T 1 0 152520 CASAVA_Build 18 56834480 5D CAACTGATTT TTAAA/----- TTTAATTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 TTAAA 1 0 152521 CASAVA_Build 18 56836554 2D GAGATAAAAT AC/-- GTTTGACATA 3070 het 3070 ref 32 17 15 3 AC 1 0 152522 CASAVA_Build 18 56839851 1I TGGGAGGATA -/T TTTTCCCCAC 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 T 4 5 152523 CASAVA_Build 18 56842041 2D CTTTAAACAC AT/-- ATTATTTTGC 3070 het 3070 hom 22 8 12 4 AT 2 1 152524 CASAVA_Build 18 56844211 2I ATGTGTGAGT --/GC GTGTGTGTGT 3070 hom 30 het 31 1 23 7 GC 0 1 152525 CASAVA_Build 18 56845094 1D TTTTTTTTTT G/- TAGAGACAGG 1735 het 231 hom 20 4 8 8 G 1 0 152526 CASAVA_Build 18 56864108 1D AATCAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 9 A 11 10 152527 CASAVA_Build 18 56864696 4D GTATATTCTC ACTT/---- ATAAGTGGAA 3070 het 3070 hom 35 12 19 6 ACTT 1 0 152528 CASAVA_Build 18 56879159 2I GAGGTTATCA --/AG AGAGAGTTTT 3070 het 3070 hom 49 22 20 7 AG 3 4 152529 CASAVA_Build 18 56882859 1I CATGAAAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 9 10 152530 CASAVA_Build 18 56883625 1D TTTGTTCAAT A/- AAAAAACAGG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 7 6 152531 CASAVA_Build 18 56894315 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 2353 het 436 hom 7 1 6 0 A 11 10 152532 CASAVA_Build 18 56896490 4I38M1D AAGTGAAGAC ----AGAAATATAGATTAAACAATAGAGTAAAATAAGCAAAAT/AGAGAGAAATATAGATTAAACAATAGAGTAAAATAAGCAAAA- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 27 18 15 5 N/A 0 0 152533 CASAVA_Build 18 56908683 4D ATAACATTGA TTGT/---- TTGGATGTAT 3070 het 3070 ref 32 15 8 10 TTGT 1 0 152534 CASAVA_Build 18 56909085 1D TTTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 T 10 9 152535 CASAVA_Build 18 56933435 2D TATGCATGTG TA/-- TATATATATG 2493 het 2493 ref 29 21 8 0 TA 5 4 152536 CASAVA_Build 18 56935028 2D AGACAGAGCA AG/-- AGAGAGAGAG 1577 het 1577 ref 35 14 5 16 AG 10 9 152537 CASAVA_Build 18 56947042 6I TTTAAAGTGA ------/CCAGCT CTGAGCCATC 3070 het 3070 ref 41 25 11 5 CCAGCT 0 1 152538 CASAVA_Build 18 56949633 5I AGCAATATCT -----/TAAAG TAAAGACAAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 TAAAG 1 2 152539 CASAVA_Build 18 56954593 1I CCCTGGCAAC -/A ATCTGTGGTC 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 A 1 2 152540 CASAVA_Build 18 56958870 5I TATTTATTTA -----/TTTAT TTTTTTTTAT 3070 het 957 hom 20 4 15 1 TTTAT 0 1 152541 CASAVA_Build 18 56966224 7I ATATTGAAGA -------/ACAGGTC ACTGCATTTA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 ACAGGTC 0 1 152542 CASAVA_Build 18 56967437 1I ATCATTCATG -/T TTTTTTTCTG 2627 het 2627 ref 21 11 7 3 T 7 8 152543 CASAVA_Build 18 57041475 1I ATGAGAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 31 1 24 6 T 10 11 152544 CASAVA_Build 18 57046919 1I TTTGAGGAAA -/C CTCAAGAAAT 3070 hom 166 het 62 0 55 7 C 1 2 152545 CASAVA_Build 18 57054102 3I AGTAAAGTTG ---/TTA TTATTTTATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTA 1 2 152546 CASAVA_Build 18 57110505 1I TATTTTATAT -/A AAAAAATATA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 6 7 152547 CASAVA_Build 18 57128716 1D TCCTGAAGTA T/- TTTAAGGATG 3070 het 3070 hom 43 21 19 3 T 4 3 152548 CASAVA_Build 18 57147221 24D AAGACTGCAC ACACACACACATGCACACACACAT/------------------------ ACACACACAC 3070 hom 87 het 30 0 28 7 ACACACACACATGCACACACACAT 1 0 152549 CASAVA_Build 18 57153089 1I CCAGGAACAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 T 8 9 152550 CASAVA_Build 18 57159636 1D CTGCCTTGAG C/- CCCCCCCCCG 3070 het 2648 hom 33 13 14 6 C 10 9 152551 CASAVA_Build 18 57169855 1D AAGTCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2864 hom 31 9 19 4 A 12 11 152552 CASAVA_Build 18 57172255 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 36 2 23 11 A 13 12 152553 CASAVA_Build 18 57177012 1D ATAAGCATGA T/- TTTTTTGGTC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 7 6 152554 CASAVA_Build 18 57177142 1I TGCAATGGAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 8 9 152555 CASAVA_Build 18 57182882 1D CTGGCACCCC T/- TCCCCACCAC 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 2 1 152556 CASAVA_Build 18 57187105 1D CAAATAAGTT G/- GGGAGTTCTA 3070 het 326 hom 26 3 13 10 G 4 3 152557 CASAVA_Build 18 57190026 2D ACGGTATAGG AA/-- AATACATGCC 3070 het 3070 ref 44 23 19 6 A 4 2 152558 CASAVA_Build 18 57199033 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 8 9 152559 CASAVA_Build 18 57206178 1D TATAGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 A 11 10 152560 CASAVA_Build 18 57207615 2I TGGTGAAGTT --/AC ACAAATATTA 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 AC 1 2 152561 CASAVA_Build 18 57222994 1D16M1D TTGTTTAATT AAAAAAAAATTGTCAACT/-AAAAAAAATTGTCAAC- TTTTTTTTTT 3070 het 2120 hom 31 8 18 5 N/A 0 0 152562 CASAVA_Build 18 57229258 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1505 het 642 hom 8 2 5 1 A 6 7 152563 CASAVA_Build 18 57249883 1D AGCCCTATTA T/- TTTTTACAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 6 5 152564 CASAVA_Build 18 57256593 2I GAGGGTATAA --/CT CTCTCCCAAA 3070 hom 70 het 30 0 23 7 CT 2 3 152565 CASAVA_Build 18 57261127 1D CGGGATCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 A 11 10 152566 CASAVA_Build 18 57274863 1I ACTTTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 A 10 11 152567 CASAVA_Build 18 57280927 1D AATATCTTAC A/- AAAAAAAAAA 1060 het 881 hom 22 7 6 9 A 11 10 152568 CASAVA_Build 18 57283812 1D TTACATGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 A 13 12 152569 CASAVA_Build 18 57291761 8I AAATTTTGCA --------/AAAGATAC ATAACAGCAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 AAAGATAC 0 1 152570 CASAVA_Build 18 57297881 1D CACTATTTTT C/- CCCCCTAATG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 C 6 5 152571 CASAVA_Build 18 57300227 2D ATAGACAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 13 11 152572 CASAVA_Build 18 57300283 2D CCAGGTTAGC CA/-- CAGAGAAGCC 2826 het 2826 ref 21 7 9 7 CA 2 1 152573 CASAVA_Build 18 57300863 1D74M11D TTAACTTTAC TTTTTTTTTACATATATATATTTTAAATAGAGACGGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCCTAACCATAAGCAAT/-TTTTTTTTACATATATATATTTTAAATAGAGACGGGGTCTTGCCCTGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCCTAA----------- CCTCCCCCAA 3070 het 191 hom 25 2 24 19 N/A 0 0 152574 CASAVA_Build 18 57304286 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2066 hom 18 5 10 5 A 10 9 152575 CASAVA_Build 18 57304849 5I ATAAAGTCTC -----/TCTTT TCTTTTAAGT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 TCTTT 1 2 152576 CASAVA_Build 18 57309450 7I TGAAAAAAAT -------/AAAAATA AAACATTTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAAAATA 0 1 152577 CASAVA_Build 18 57316613 12D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 30 7 A 24 12 152578 CASAVA_Build 18 57317743 2I CTATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 15 15 14 AC 7 8 152579 CASAVA_Build 18 57322247 1D TGAATGGAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 10 9 152580 CASAVA_Build 18 57326740 1I AAGAGTGGAT -/A AAAAAAACTG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 A 7 8 152581 CASAVA_Build 18 57334151 1I TAATAATTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 9 152582 CASAVA_Build 18 57338832 1D TCTCCACCCC A/- AAATCAACAG 2728 hom 18 het 8 0 7 1 A 4 3 152583 CASAVA_Build 18 57352787 4D CAGCTTTAGA AAAG/---- AAAGAAATTC 3070 het 3070 hom 41 19 16 8 AAAG 2 1 152584 CASAVA_Build 18 57357178 1I ACCATTACTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 152585 CASAVA_Build 18 57361741 1D CATGGTCTCC A/- CAGACTTCAT 3070 hom 102 het 38 0 34 6 A 1 0 152586 CASAVA_Build 18 57367954 1D AGACAGACTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 9 152587 CASAVA_Build 18 57370389 2D ACTTCCTGGG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 11 9 152588 CASAVA_Build 18 57371477 2I AGCACACCAG --/AA AAAAAAAAAA 1740 het 1740 ref 37 7 9 21 A 12 14 152589 CASAVA_Build 18 57385077 1D ATATGGGTAT C/- CAACTGCTCT 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 C 2 1 152590 CASAVA_Build 18 57386218 2D GTTTTTTGAC TT/-- TTTAATTATC 3070 het 3070 ref 32 15 8 9 T 5 3 152591 CASAVA_Build 18 57399037 2I CACCTGAAAC --/AA AGCTTTTTGA 3070 hom 42 het 29 0 14 15 A 1 3 152592 CASAVA_Build 18 57401187 1D GTTATGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 14 22 12 T 12 11 152593 CASAVA_Build 18 57404852 3D TTCAAAAAAG AAC/--- AACTAAATAT 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 AAC 2 1 152594 CASAVA_Build 18 57413512 1D TATTTACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 11 10 152595 CASAVA_Build 18 57420324 1D CATATATATA T/- TTTTTTTTTT 1422 het 1422 ref 9 4 5 0 T 13 12 152596 CASAVA_Build 18 57426263 2D TGAGGCTGTG AT/-- AAAGGCCAGC 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 AT 1 0 152597 CASAVA_Build 18 57427899 1D AAATATGTCG C/- CCCCCCCACC 3070 hom 63 het 25 0 21 5 C 8 7 152598 CASAVA_Build 18 57428269 3I ATGAATCTCA ---/ATC ATCTGGCTGC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 ATC 1 2 152599 CASAVA_Build 18 57439086 1I GGAAAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 10 11 152600 CASAVA_Build 18 57444304 6D ACACACTATA TATATG/------ TATATGTGTG 3070 het 3070 hom 22 8 12 4 TATATG 2 1 152601 CASAVA_Build 18 57458706 2I ATATCTATGG --/AT ATATATATAT 2807 het 1734 hom 19 6 9 4 AT 6 7 152602 CASAVA_Build 18 57463982 3D CCAAGATCAC ACA/--- ACAAGTAGGA 3070 het 3070 ref 41 27 13 1 ACA 2 1 152603 CASAVA_Build 18 57473056 1D CATTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2386 hom 25 7 14 4 A 12 11 152604 CASAVA_Build 18 57474947 2D TATAATTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 13 11 152605 CASAVA_Build 18 57476122 1I AACAATATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 A 9 10 152606 CASAVA_Build 18 57477087 1D AATTTACCCC T/- GGTCATATAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 7 T 1 0 152607 CASAVA_Build 18 57483285 1D GTTTTGTTTG T/- TTTTTTGCAG 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 T 7 6 152608 CASAVA_Build 18 57486199 1D GTAGAGGGAG T/- TCCGGGCCCA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 T 2 1 152609 CASAVA_Build 18 57498425 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 10 11 152610 CASAVA_Build 18 57508205 1D TTAAACAACC A/- AGACAGGACA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 2 1 152611 CASAVA_Build 18 57509683 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1469 hom 20 5 11 4 A 14 13 152612 CASAVA_Build 18 57516922 4D ACAACACCTG ATTA/---- ATTATTTTAT 3070 het 3070 hom 47 24 19 6 ATTA 2 1 152613 CASAVA_Build 18 57518260 1D ATGACAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 T 12 11 152614 CASAVA_Build 18 57522248 4I3M2D AGCAAAACTT ----TTAGG/CAAAATA-- ATTTTAGGGG 3070 het 3070 ref 42 25 12 8 N/A 0 0 152615 CASAVA_Build 18 57530613 1D ACTAAAGAGG A/- AAAAGAAAGG 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 A 5 4 152616 CASAVA_Build 18 57531408 1I TCAAGCTACA -/G AATTATGTGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 0 1 152617 CASAVA_Build 18 57545558 3I TTTATTGAAT ---/TTC ACATAAGCAA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 TTC 0 1 152618 CASAVA_Build 18 57551599 10D TACTAGATAC TACTAGATAA/---------- TGCATTCTTG 3070 het 3070 ref 31 22 11 4 TACTAGATAA 1 0 152619 CASAVA_Build 18 57553438 1D TGGTTAAGGC T/- GCAGTGAGCC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 1 0 152620 CASAVA_Build 18 57572035 1I TGGGACCACA -/G GCACGTGCCA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 G 1 2 152621 CASAVA_Build 18 57583317 1D TTTCGTACAG A/- ATACAGCCTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 2 1 152622 CASAVA_Build 18 57590417 1I CTCAATTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 324 hom 41 1 33 7 T 9 10 152623 CASAVA_Build 18 57592581 2D AAGTGATCTC AG/-- GGGTTTTGTA 3070 hom 127 het 50 0 42 8 AG 1 0 152624 CASAVA_Build 18 57597127 1D TCTCTTTGTA T/- AACTGGAGTT 3070 hom 102 het 35 0 34 2 T 1 0 152625 CASAVA_Build 18 57597548 2I TGCTCTCTCA --/CT CTCTCTCTCA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 CT 4 5 152626 CASAVA_Build 18 57604618 4I ACCAACATCA ----/AGAT AGATACAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 AGAT 1 2 152627 CASAVA_Build 18 57609808 5I TTTTCACCAG -----/GTTGA GTTATCTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 GTTGA 0 1 152628 CASAVA_Build 18 57620142 1D CAATATGGGA T/- TTTTAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 5 4 152629 CASAVA_Build 18 57684669 1I CCACACTCTC -/G GCCCGCGTTT 3070 hom 126 het 49 0 41 8 G 1 2 152630 CASAVA_Build 18 57686929 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 9 10 152631 CASAVA_Build 18 57694669 1I CTCAGCCCAC -/A AAAAAAAAAT 1321 het 1321 ref 44 33 3 8 A 9 10 152632 CASAVA_Build 18 57702457 1I GAAGAACAAA -/G CTCAGTCAGA 3070 het 3070 ref 47 27 19 1 G 0 1 152633 CASAVA_Build 18 57702658 2D TTGCCATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 8 A 14 12 152634 CASAVA_Build 18 57705622 1D CAAGGAGCAG A/- AACAGCAATA 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 A 3 2 152635 CASAVA_Build 18 57709649 1D TCTTTCTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 A 10 9 152636 CASAVA_Build 18 57740592 1D GCACTTGAAT C/- ATCCTGAAAC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 C 1 0 152637 CASAVA_Build 18 57742891 1I AGGCAGGACC -/T TAAGCTTGTG 3070 hom 186 het 67 0 61 6 T 1 2 152638 CASAVA_Build 18 57747050 45I CCTCCCATCC ---------------------------------------------/CAGTCAAGCCTTCAGATGACAGCAGCCCTGGCTAACATCTTCGGG CAACCTCCTC 3070 hom 123 het 41 0 42 6 CAGTCAAGCCTTCAGATGACAGCAGCCCTGGCTAACATCTTCGGG 0 1 152639 CASAVA_Build 18 57755308 1I TGAACCACAT -/A AAATCGCACC 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 A 3 4 152640 CASAVA_Build 18 57775301 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2236 het 1847 hom 19 5 6 8 A 11 12 152641 CASAVA_Build 18 57781102 1I CTCCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 3007 het 1541 hom 26 7 12 7 A 14 15 152642 CASAVA_Build 18 57792604 5I GCTAAAGCAG -----/TGGTT CTTGACAAGG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 TGGTT 0 1 152643 CASAVA_Build 18 57793475 1D TACATCCATG A/- TTTCTTATTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 A 1 0 152644 CASAVA_Build 18 57794155 4I GTAACACAAT ----/ACTA ACTATCTGTG 3070 hom 135 het 48 0 46 2 ACTA 1 2 152645 CASAVA_Build 18 57795573 6D GATATCAAGG TTGTAC/------ TTGCCTCATA 3070 het 3070 hom 30 16 15 1 TTGTAC 1 0 152646 CASAVA_Build 18 57799953 4D CCTTTGTGTT ACAA/---- ACAATCTAAT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 ACAA 2 1 152647 CASAVA_Build 18 57806447 2D CAAACTGAGG GT/-- GGTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 GT 1 0 152648 CASAVA_Build 18 57814181 2D GGCTCAGAGC TG/-- TGTGCACTGT 3070 het 3070 ref 71 37 28 7 TG 3 2 152649 CASAVA_Build 18 57835243 1D CATAAATGAT A/- ACGATTTTTA 3070 het 3070 hom 31 9 18 5 A 2 1 152650 CASAVA_Build 18 57838721 1D TTTAAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 499 hom 34 4 14 16 T 12 11 152651 CASAVA_Build 18 57860871 1I TTCCTTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3061 het 3061 ref 24 13 7 4 T 10 11 152652 CASAVA_Build 18 57861137 1D AACAAAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 19 4 A 13 12 152653 CASAVA_Build 18 57862837 2I TGATTTCTGA --/CT CTTTTAAATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CT 1 2 152654 CASAVA_Build 18 57863891 1I CAAAACCTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 A 9 10 152655 CASAVA_Build 18 57866836 1D TTCACAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 11 10 152656 CASAVA_Build 18 57872384 13D ATATACCTGA TATCACCACACCC/------------- TATCAGTGTG 3070 het 3070 hom 37 19 18 4 TATCACCACACCC 1 0 152657 CASAVA_Build 18 57874735 1D GCTTTTTTTT A/- AACCGAGAAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 3 2 152658 CASAVA_Build 18 57880801 5D ATAAATCAGG AAGTC/----- TCCGGGAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 AAGTC 1 0 152659 CASAVA_Build 18 57883134 1I TGACACTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 33 1 15 17 A 11 12 152660 CASAVA_Build 18 57884232 1D GCAAAAGCCC T/- TTTGGGTCTT 3070 het 3070 hom 44 20 21 5 T 4 3 152661 CASAVA_Build 18 57889739 1I TAAGTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 9 10 152662 CASAVA_Build 18 57905105 3D GTTAAATATG ACA/--- ACAAGTTGGA 3070 het 3070 hom 43 20 21 4 ACA 2 1 152663 CASAVA_Build 18 57913673 1D ATGTAAGATT A/- AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 A 7 6 152664 CASAVA_Build 18 57917719 1I TTAAGCTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 43 18 18 8 A 7 8 152665 CASAVA_Build 18 57926811 1D TTTAAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 717 hom 14 3 8 3 T 11 10 152666 CASAVA_Build 18 57928495 1I TTTTAGGAAT -/A ATTTTATAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 152667 CASAVA_Build 18 57938057 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2132 hom 18 5 11 2 A 12 11 152668 CASAVA_Build 18 57940115 1D AGTGGAATTG T/- TGGATCATAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 2 1 152669 CASAVA_Build 18 57942140 1D TATAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 11 10 152670 CASAVA_Build 18 57945900 1D TTTTTGTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 10 9 152671 CASAVA_Build 18 57946882 1D TTATCCTTTG T/- TTTCACATTA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 4 3 152672 CASAVA_Build 18 57947912 1I TTTCCAACAT -/C CAGTATAGTG 3070 hom 132 het 53 0 45 8 C 1 2 152673 CASAVA_Build 18 57949666 3D GTTTTTCCTC CTT/--- TTACAGATGG 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 CTT 1 0 152674 CASAVA_Build 18 57950222 1I TTCTAAGAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 9 10 152675 CASAVA_Build 18 57960660 1D TTGACAGTGA T/- TTTTAATGGC 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 5 4 152676 CASAVA_Build 18 57963222 5D GGAAACTGGC GGGGG/----- GGGGGGGGCA 3070 hom 57 het 27 0 18 12 G 13 8 152677 CASAVA_Build 18 57965472 1I GTTAAAATAA -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 6 7 152678 CASAVA_Build 18 57971082 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2032 hom 21 5 12 4 T 11 10 152679 CASAVA_Build 18 57978021 1I TTCATGATGG -/T AAGTACTATA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 0 1 152680 CASAVA_Build 18 57980103 1D ATATTTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 19 0 T 10 9 152681 CASAVA_Build 18 57985858 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 2495 het 973 hom 17 5 9 4 A 10 9 152682 CASAVA_Build 18 57986279 10I TGGTGGCGCA ----------/TGTCTGTAAT CCCAACCACT 804 het 804 ref 15 12 2 2 TGTCTGTAAT 0 1 152683 CASAVA_Build 18 57986398 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1263 het 1263 ref 28 21 3 4 A 13 14 152684 CASAVA_Build 18 57988589 2I TCACTTCATG --/TC TCTGTGTCAT 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 TC 1 2 152685 CASAVA_Build 18 57993151 3D AGGATCTGAA AAC/--- AACTCCCCTA 2995 het 2995 ref 21 10 7 4 AAC 2 1 152686 CASAVA_Build 18 57994185 1I ATTAATCTTT -/C CAATTAGGAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 1 2 152687 CASAVA_Build 18 57995181 1D AATAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 13 12 152688 CASAVA_Build 18 57997498 3D TGTAAATGTT CCC/--- CCATTTCATA 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 C 5 2 152689 CASAVA_Build 18 58000542 1I AAAGACACTC -/A AACTAAGTAG 3070 het 3070 ref 57 25 25 7 A 2 3 152690 CASAVA_Build 18 58001438 4I36M1I AAAATCGTAT ----ATTAAAAAATAAATTTAAAAATGAAGTCACAGCTGG-/GTTAATTAAAAAATAAATTTAAAAATGAAGTCACAGCTGGA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 27 19 7 N/A 0 0 152691 CASAVA_Build 18 58002057 1I AAAATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 13 14 152692 CASAVA_Build 18 58003879 49I TGTCACTTAC -------------------------------------------------/CTGATAGCACTAATTACTACTGCCTATGTACTTCGGCATTTACTGGAAG CTGTACACTA 3070 het 3070 ref 33 19 7 8 CTGATAGCACTAATTACTACTGCCTATGTACTTCGGCATTTACTGGAAG 0 1 152693 CASAVA_Build 18 58005456 1D GAGAGGGGCA G/- GGGCACGCTC 851 hom 14 het 8 0 5 3 G 4 3 152694 CASAVA_Build 18 58018187 3D ATAATTACTA TTG/--- TTGTCATCAC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 TTG 2 1 152695 CASAVA_Build 18 58027861 1I CAATTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 16 9 A 12 13 152696 CASAVA_Build 18 58035072 2I CTTCTAATTT --/TA TGTTTCTCCC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 TA 0 1 152697 CASAVA_Build 18 58072724 1I GACATTCAAA -/C CATTCTACTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 C 1 2 152698 CASAVA_Build 18 58078859 4D TATTCATAAT AGTC/---- AGGATATAGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 6 AGTC 1 0 152699 CASAVA_Build 18 58081104 3I GGCAGGGTAG ---/GCC TCTTAGGGAA 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 GCC 0 1 152700 CASAVA_Build 18 58122295 2D ACTGGCAAAA AG/-- AGGGGGGAGT 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 AG 2 1 152701 CASAVA_Build 18 58128306 1D ATATAAATAT A/- ATAATTTCTC 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 A 2 1 152702 CASAVA_Build 18 58129540 1I CATAATTGAT -/G AAAAATTGCA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 G 0 1 152703 CASAVA_Build 18 58129637 2I TTAGCAAGGT --/TA TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TA 0 1 152704 CASAVA_Build 18 58130974 2I AGACCAACAC --/AG AGCCTACTTA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 AG 1 2 152705 CASAVA_Build 18 58131212 3I CAAGGAACTG ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 27 21 5 A 9 12 152706 CASAVA_Build 18 58134248 1D ACCACAGGTT A/- AGGAAGAAAT 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 A 2 1 152707 CASAVA_Build 18 58137573 1D GTAAAAAAAA T/- ATATATATTT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 1 0 152708 CASAVA_Build 18 58138200 1D GACTCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 26 1 19 6 A 17 16 152709 CASAVA_Build 18 58145254 1D GATTTTGGGG C/- GGGTTTGGGG 3070 het 2019 hom 23 7 12 4 C 1 0 152710 CASAVA_Build 18 58157019 1I GCAAATTTTG -/T TATCTATTTT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 T 1 2 152711 CASAVA_Build 18 58157687 4D GTCCACGATC AGGG/---- AGGATCTTTC 3070 het 3070 hom 47 20 19 10 AGGG 1 0 152712 CASAVA_Build 18 58160343 2D ACTGGGTGTG GT/-- GTCTCACGCC 3070 het 3070 hom 25 8 16 1 GT 2 1 152713 CASAVA_Build 18 58166116 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 23 1 17 5 A 11 10 152714 CASAVA_Build 18 58173938 3D AAAGTAAAAA CTT/--- CTGACCTCCA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 CTT 1 0 152715 CASAVA_Build 18 58176439 1D GTCTGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 2851 het 438 hom 28 8 10 11 T 15 14 152716 CASAVA_Build 18 58179490 1D GACCAGCAAA C/- CCCTGGTGCC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 C 4 3 152717 CASAVA_Build 18 58180951 1D AATATCTCTT A/- AATCTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 3 2 152718 CASAVA_Build 18 58190207 1I CATCAAATAG -/T TTCTGGAGAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 2 3 152719 CASAVA_Build 18 58193128 1I TTTTTTTAAG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 8 9 152720 CASAVA_Build 18 58197268 4I TTTTCATCCT ----/TGAA TGAACAGTGT 3070 het 3070 hom 63 25 30 8 TGAA 1 2 152721 CASAVA_Build 18 58199019 1D AATAATATTC T/- TTTTTTTTTT 285 het 285 ref 22 13 2 7 T 15 14 152722 CASAVA_Build 18 58249789 13I CAGAGAGTAA -------------/TCTCTGAGAGTAC AAAGAATGTA 2363 het 2363 ref 27 20 5 2 TCTCTGAGAGTAC 0 1 152723 CASAVA_Build 18 58254847 4I TCCATCTCAA ----/AAAC AAACAAAAAC 3070 het 2533 hom 19 6 12 1 AAAC 1 2 152724 CASAVA_Build 18 58280182 2D CCCAGCTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 30 0 19 12 T 18 16 152725 CASAVA_Build 18 58282184 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 30 0 21 9 A 10 11 152726 CASAVA_Build 18 58283526 1I TTCCCTATTT -/C CACCAACATC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 1 2 152727 CASAVA_Build 18 58286678 3I CCTCCTCCTT ---/CCA CCATGATTGT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 CCA 1 2 152728 CASAVA_Build 18 58305496 1D TTTGTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 11 10 152729 CASAVA_Build 18 58305763 5I TGCCCATAAC -----/TTTTT TTTAAGAAAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 3 8 152730 CASAVA_Build 18 58319195 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 24 1 14 9 A 15 16 152731 CASAVA_Build 18 58320474 1D CCATCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 21 0 15 6 A 15 14 152732 CASAVA_Build 18 58325731 7D TATAACTATA TATAAAT/------- TATAAATTTA 2761 hom 15 het 7 0 6 1 TATAAAT 2 1 152733 CASAVA_Build 18 58331219 8D AATATCTTTC TTTTTTCT/-------- TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 TTTTTTCT 2 1 152734 CASAVA_Build 18 58332354 1I AAAATCAATT -/A AATTAAAAGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 3 152735 CASAVA_Build 18 58334982 3D GATCATTTCG CTA/--- CTTTTACTTT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 CTA 1 0 152736 CASAVA_Build 18 58335439 1I CTTTCATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 704 hom 34 2 28 4 T 13 14 152737 CASAVA_Build 18 58343558 3I GGGAAGGTGG ---/GGA GGAGTAGGTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GGA 1 2 152738 CASAVA_Build 18 58346804 2I AGAGTGAGAC --/TT TGTCTCGGGA 1252 hom 26 het 24 0 6 18 T 1 3 152739 CASAVA_Build 18 58357214 4I TTACTTACTT ----/AATC AATATGATGT 3070 hom 108 het 45 0 36 9 AATC 0 1 152740 CASAVA_Build 18 58359776 1D TGTACCCCCC A/- CACCCATTCT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 1 0 152741 CASAVA_Build 18 58395965 2D TGCTGTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 38 0 25 13 A 14 12 152742 CASAVA_Build 18 58398216 2I AGTGCTGAGA --/TT TTACAGGCGT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 T 2 4 152743 CASAVA_Build 18 58401556 1D GCCGAGTCAT A/- ACGGTCATGA 3070 hom 105 het 47 0 35 12 A 2 1 152744 CASAVA_Build 18 58401865 8D ATCTTAAAAG AATAAAAA/-------- AATACTGACC 3070 hom 66 het 25 0 20 8 AATAAAAA 1 0 152745 CASAVA_Build 18 58407137 3I AAAGCCAGGT ---/GTG GTGGTGCATG 3070 hom 47 het 18 0 16 2 GTG 2 3 152746 CASAVA_Build 18 58416743 4D5M2I GTGAGCCACC CCCAATGCT--/----ATGCTGG GCCCTAATAT 3070 hom 69 het 24 0 24 2 N/A 0 0 152747 CASAVA_Build 18 58439194 3I ATTAATATAC ---/TAA TAATAACTTG 3070 het 3070 ref 35 20 15 0 TAA 2 3 152748 CASAVA_Build 18 58441794 1D CCTTCTCATG T/- TTTTTTTTTT 1054 het 1054 ref 35 24 3 8 T 11 10 152749 CASAVA_Build 18 58463688 1I CTTGAACCCA -/G CACTTCAAGG 2681 het 2681 ref 19 11 7 1 G 0 1 152750 CASAVA_Build 18 58491600 1D CTCTTCTCCG A/- AGAGTTGTCT 3070 het 3070 hom 34 13 15 8 A 2 1 152751 CASAVA_Build 18 58513871 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1101 het 1101 ref 20 11 3 6 A 14 13 152752 CASAVA_Build 18 58519576 1D AGTATTTGTT A/- ACATCTTCTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 1 152753 CASAVA_Build 18 58528388 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1323 het 1323 ref 22 15 3 4 A 13 14 152754 CASAVA_Build 18 58536057 1D TGATACTTTT C/- CCCAGCGCTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 C 4 3 152755 CASAVA_Build 18 58541624 2I ATAATGAGTG --/AA AAATCTAATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 5 152756 CASAVA_Build 18 58543822 4D TTGAATACTT TCTC/---- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 21 7 TC 5 3 152757 CASAVA_Build 18 58549430 1D TTGTTTATAA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 T 6 5 152758 CASAVA_Build 18 58550210 1D GGAAATAAGC T/- TGTGTCCATA 3070 het 3070 ref 42 25 16 2 T 2 1 152759 CASAVA_Build 18 58553254 1D GATGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2499 hom 38 12 16 10 T 13 12 152760 CASAVA_Build 18 58555404 1D AAATGAGAGA C/- TAGCATTGCA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 C 1 0 152761 CASAVA_Build 18 58565490 1D CTTCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1543 hom 36 12 12 12 T 21 20 152762 CASAVA_Build 18 58568931 1D TTCCTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2808 hom 31 10 13 9 T 13 12 152763 CASAVA_Build 18 58576753 1D GCAAGCAAAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 A 8 7 152764 CASAVA_Build 18 58578490 4D TCCGTAGATG ATAC/---- ATACACATGG 3070 het 3070 ref 42 25 14 4 ATAC 2 1 152765 CASAVA_Build 18 58597896 3I TGGCTGGAGC ---/TGG TATGCAGATT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 TGG 0 1 152766 CASAVA_Build 18 58601905 2D TCTTGATGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 36 2 29 7 T 12 10 152767 CASAVA_Build 18 58602662 1D TATAACTCAT G/- GTAGGTTTTG 2408 het 2408 ref 36 16 8 12 G 2 1 152768 CASAVA_Build 18 58606779 1I GGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 T 9 10 152769 CASAVA_Build 18 58610164 1D ATGAGTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 12 11 152770 CASAVA_Build 18 58611395 2D CTCAGAAAAG AA/-- AACAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 4 2 152771 CASAVA_Build 18 58615032 2D ATCTGCTGGA AG/-- AGAGAATAAA 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 AG 3 2 152772 CASAVA_Build 18 58622578 1D TGTATGTGTA G/- GGGGAAGGTG 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 G 5 4 152773 CASAVA_Build 18 58630930 1D GCCTGTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 14 10 T 12 11 152774 CASAVA_Build 18 58642519 1D ATCAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 1356 het 1356 ref 38 29 3 7 A 11 10 152775 CASAVA_Build 18 58649556 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 480 hom 22 1 14 7 T 13 12 152776 CASAVA_Build 18 58650963 1I TCTGTTGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 9 10 152777 CASAVA_Build 18 58656277 2D ATTGAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 10 21 3 AT 7 6 152778 CASAVA_Build 18 58656976 2D TGTTTCTGCT TC/-- TCTCTGTTTG 3070 hom 129 het 48 0 44 5 TC 3 2 152779 CASAVA_Build 18 58665728 1D TATCTTTAAT A/- AAATAACTTC 3070 het 3046 hom 26 8 17 1 A 4 3 152780 CASAVA_Build 18 58675324 3D AATGAAAATG AAA/--- AAAAGTACAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 7 4 152781 CASAVA_Build 18 58681263 2D TGTGGTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 283 hom 33 4 13 16 T 16 14 152782 CASAVA_Build 18 58682203 1D19M4I TTATTTTTTT AATTTTTAAAAATTTATTTG----/-ATTTTTAAAAATTTATTTGTTTA TTTATTTATT 2272 hom 12 het 4 0 5 0 N/A 0 0 152783 CASAVA_Build 18 58698846 1I TGAGAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 9 10 152784 CASAVA_Build 18 58708301 5D ACGTAAAGCT AGTAG/----- AGTAGTGTTT 3070 hom 83 het 31 0 26 6 AGTAG 2 1 152785 CASAVA_Build 18 58746553 1D TAGCTGAATG A/- AAAATATGCT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 5 4 152786 CASAVA_Build 18 58748678 1I CAACAACAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2811 hom 20 6 12 2 A 9 10 152787 CASAVA_Build 18 58762279 1I AATACAGTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 9 10 152788 CASAVA_Build 18 58781031 4I TTAGTCTTAG ----/CATA CATACTTGGC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 CATA 1 2 152789 CASAVA_Build 18 58784051 1D ACTATACTTT A/- AAAAAAAAAA 2356 het 2356 ref 30 12 7 11 A 14 13 152790 CASAVA_Build 18 58796039 2D TTGCTACCTC AG/-- AGTCTTCCTA 3070 het 3070 ref 52 23 20 9 AG 2 1 152791 CASAVA_Build 18 58800440 2I TGGAGTGAGA --/CT CTGCCCTTTG 3070 het 3070 hom 53 17 28 8 CT 1 2 152792 CASAVA_Build 18 58805765 1I GCTCAGCAAG -/C CCCCGCCGTG 3035 het 1809 hom 34 6 15 13 C 4 5 152793 CASAVA_Build 18 58807936 1I CAGCTCTTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 9 10 152794 CASAVA_Build 18 58814108 2I GTAATGTAGA --/TT TTTTTTTTCC 3070 hom 94 het 36 0 30 6 T 8 10 152795 CASAVA_Build 18 58825209 2I AAAAGCAAAC --/TT TGCCTTATGA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 T 1 3 152796 CASAVA_Build 18 58825343 1D TGACCAATAA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 38 24 11 4 T 8 7 152797 CASAVA_Build 18 58826232 2D GGCATTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 1855 het 1392 hom 19 8 6 6 T 15 13 152798 CASAVA_Build 18 58827780 2I GTAAGAAACT --/GG AACTGTCTTC 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 G 0 2 152799 CASAVA_Build 18 58835893 2D GCTTCAGAAC AG/-- AGTGTGATGT 3070 het 3070 ref 51 25 20 7 AG 2 1 152800 CASAVA_Build 18 58836514 4I GGAATATTAA ----/ACTT AAGAAACTTA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 ACTT 0 1 152801 CASAVA_Build 18 58842230 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 502 hom 19 5 11 5 T 21 19 152802 CASAVA_Build 18 58844553 1D CTACGATAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 10 9 152803 CASAVA_Build 18 58845145 5I43M1I ATGGTAATAA -----TTTTCTTTTCTGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTC-/TTTTCTTTTCTTTTCTGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 13 N/A 0 0 152804 CASAVA_Build 18 58848657 4I ATAAATAGGC ----/CTAT CTGTTTACAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTAT 0 1 152805 CASAVA_Build 18 58859444 4I CAGCAGAACA ----/AAAG AAAGAACCAA 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 AAAG 1 2 152806 CASAVA_Build 18 58893920 10I TGTAGGAGTC ----------/TAGTTATAGT TTTTATATGA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TAGTTATAGT 0 1 152807 CASAVA_Build 18 58894651 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 T 7 8 152808 CASAVA_Build 18 58900296 3D TTTATGTTTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 45 25 12 8 TTG 7 6 152809 CASAVA_Build 18 58908772 3I CCCAAGCACA ---/TAT TATATTATTT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 TAT 1 2 152810 CASAVA_Build 18 58913547 2I GCTTCGTGGA --/CC AGCTGTCCCC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 C 0 2 152811 CASAVA_Build 18 58914646 2D AGTTATCAGA TC/-- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 25 9 9 7 TC 5 4 152812 CASAVA_Build 18 58932504 1D CCTTAGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 A 12 11 152813 CASAVA_Build 18 59017503 4D AGACACATGC ACAG/---- ACACAGAGAC 3070 het 3070 ref 76 36 29 16 ACAG 1 0 152814 CASAVA_Build 18 59030566 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 8 9 152815 CASAVA_Build 18 59031096 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 9 8 152816 CASAVA_Build 18 59039033 1I CTTCAAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 11 12 152817 CASAVA_Build 18 59040630 1D TGATAAAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 10 9 152818 CASAVA_Build 18 59046742 1D TGTGATCTCC A/- AATAAAATAT 3013 het 3013 ref 34 17 11 7 A 3 2 152819 CASAVA_Build 18 59052696 16D CTTTATCTAG TCTATCACCGATCATT/---------------- TCCCCAACAT 3070 hom 105 het 33 0 35 4 TCTATCACCGATCATT 1 0 152820 CASAVA_Build 18 59053358 1D TTGGCAAAGG A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 55 30 24 2 A 7 6 152821 CASAVA_Build 18 59054648 4D1M3I TATTGTCCCA TAATG---/----GGGC TCAACGCCCT 3070 hom 102 het 36 0 34 3 N/A 0 0 152822 CASAVA_Build 18 59058552 4D CCACAGAAGC CTTT/---- CTTTAAGACC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 CTTT 2 1 152823 CASAVA_Build 18 59060340 1I AGGAAAAAAA -/G AATGAAATTT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 G 0 1 152824 CASAVA_Build 18 59063608 1I TGCCAATACA -/T TTTCAACCAA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 3 4 152825 CASAVA_Build 18 59066438 1D AAAATCCAGT G/- GTGAAATAAT 3070 het 3070 hom 60 27 26 7 G 2 1 152826 CASAVA_Build 18 59067522 2D AGTCCTGTCC AT/-- TTAACACCCT 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 AT 1 0 152827 CASAVA_Build 18 59076118 16I AAGGAAGGCA ----------------/ATGAAGTCAAATGTTT ATAAACTGAG 3070 het 3070 ref 60 30 27 4 ATGAAGTCAAATGTTT 0 1 152828 CASAVA_Build 18 59080295 1I GCCCAGCCAA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 7 8 152829 CASAVA_Build 18 59088364 7D CTAGCAGAAT TGTTAAC/------- TGTTAACGTC 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 TGTTAAC 2 1 152830 CASAVA_Build 18 59095676 1D GTCTCTATAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 17 het 23 1 18 4 A 10 9 152831 CASAVA_Build 18 59101695 4D AACCACTAAT TTAG/---- TTGTTTATTA 3070 het 3070 ref 44 24 16 7 TTAG 1 0 152832 CASAVA_Build 18 59103045 1I GTTTTTATTC -/A AAAATCCTCC 3070 het 2976 hom 27 8 10 9 A 4 5 152833 CASAVA_Build 18 59103906 3I ACAGGCTCAT ---/CTC CTCTCATCTC 3070 het 3070 hom 47 21 19 7 CTC 1 2 152834 CASAVA_Build 18 59113212 1I TGAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 15 1 11 3 A 17 18 152835 CASAVA_Build 18 59119524 3D AATGGCTTAC ATA/--- ATAATGGTTT 3070 hom 148 het 53 0 50 5 ATA 2 1 152836 CASAVA_Build 18 59129371 2D GAAGACTAAG TT/-- TATGTGTCTC 3070 hom 69 het 28 0 24 6 T 3 1 152837 CASAVA_Build 18 59139830 1D ATGCTATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 10 12 T 15 14 152838 CASAVA_Build 18 59142909 1I CCAGTCATGC -/T TTTTTTTTTT 1978 het 1978 ref 23 11 8 4 T 11 12 152839 CASAVA_Build 18 59143114 1I AAAACAAGAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 8 9 152840 CASAVA_Build 18 59146569 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2694 hom 24 het 16 0 9 7 T 15 14 152841 CASAVA_Build 18 59149023 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1245 het 1245 ref 35 22 3 10 T 15 16 152842 CASAVA_Build 18 59160936 1I TTTGAAACAA -/G GTCTTACTCT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 1 2 152843 CASAVA_Build 18 59161959 1I TCTAAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 13 14 152844 CASAVA_Build 18 59169510 1D TTGAAGACTG T/- TTCAGTCTAG 3070 het 3070 ref 54 25 25 4 T 3 2 152845 CASAVA_Build 18 59178415 1D TCAATACTGC T/- TTTTGTCCAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 5 4 152846 CASAVA_Build 18 59188361 1D CCAAGTATCC T/- ATAGTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 1 0 152847 CASAVA_Build 18 59288521 1D TGGGATTACA G/- GCACCCGCCA 1574 hom 12 het 6 0 5 1 G 2 1 152848 CASAVA_Build 18 59289143 10I ATGGTACAGA ----------/GGAGGAGAAG GGAGGAGAAG 3070 het 5 hom 37 0 12 25 GGAGGAGAAG 1 2 152849 CASAVA_Build 18 59289153 3D GGAGGAGAAG GGA/--- GGAGGAGGGA 3070 het 644 hom 37 5 16 16 GGA 3 2 152850 CASAVA_Build 18 59290748 4D AGAGCGAGAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 32 hom 42 2 27 14 AG 10 8 152851 CASAVA_Build 18 59301150 1D TTGCAAATCT C/- CTTAATATTT 3070 het 2222 hom 21 7 12 2 C 2 1 152852 CASAVA_Build 18 59303510 4D ATTTTCCTGA TTGT/---- TCCGTTTTAA 3070 hom 87 het 30 0 30 1 TTGT 1 0 152853 CASAVA_Build 18 59314346 3D CAGAAGATAT GTC/--- GTCTCAACAT 3070 hom 66 het 26 0 22 5 GTC 2 1 152854 CASAVA_Build 18 59316959 2I AGAGCAAATT --/TG TGTGTATATA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 TG 2 3 152855 CASAVA_Build 18 59317070 2I GTATATATAA --/GT GTGTGTATAT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 GT 3 4 152856 CASAVA_Build 18 59319219 3D ATCAATTATT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 TTC 5 4 152857 CASAVA_Build 18 59320739 1I AATTCCCATT -/A AAAAAAAAAA 2525 het 2525 ref 31 15 9 7 A 11 12 152858 CASAVA_Build 18 59323173 1I TGTATTTACC -/A AAAAATTTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 5 6 152859 CASAVA_Build 18 59324853 1I CCCTGACAGG -/C GGTCACTGAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 152860 CASAVA_Build 18 59325285 2I TTTGAGGCAG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 TC 5 6 152861 CASAVA_Build 18 59328716 5D GTGCGCCGCC CCCCT/----- CCCCCCAACT 3070 het 3070 hom 48 21 23 7 CCCCT 1 0 152862 CASAVA_Build 18 59333080 3D TAAAAAAAAA AAC/--- AACAAAAAGA 3070 hom 52 het 37 1 34 2 AAC 2 1 152863 CASAVA_Build 18 59333522 1D CATTGAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 13 13 A 17 16 152864 CASAVA_Build 18 59336400 6I TATGCAACTT ------/TATCTC TAGCTCTATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TATCTC 0 1 152865 CASAVA_Build 18 59337096 4D GTGTAACTTC CTAA/---- CTAATTTTCA 3070 het 3070 hom 25 9 13 4 CTAA 2 1 152866 CASAVA_Build 18 59352119 4I GAAATAGGCA ----/TAGT TAAAGAGAAT 3070 hom 111 het 44 0 36 8 TAGT 0 1 152867 CASAVA_Build 18 59382124 5D AAAAAAAAAA AAAAT/----- TATCTACACA 3070 het 103 hom 26 1 21 5 AAAAT 1 0 152868 CASAVA_Build 18 59387351 1I GGTAAACACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 9 10 152869 CASAVA_Build 18 59387946 1I GCTGAGTAGC -/T GGGATTACAG 3070 hom 39 het 18 0 14 6 T 0 1 152870 CASAVA_Build 18 59389500 1I AAATTTCCCA -/T TTTAAATACT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 3 4 152871 CASAVA_Build 18 59395503 4I ATCTACTGCC ----/TGAG TAATAATCAA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 TGAG 0 1 152872 CASAVA_Build 18 59398394 1D GGACCATTGT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 8 7 152873 CASAVA_Build 18 59398736 1I CCAGTTGCCA -/T TAAGAAAATA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 152874 CASAVA_Build 18 59401244 3D GTTGTCCAGT TTG/--- TTAATTTTTA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TTG 1 0 152875 CASAVA_Build 18 59403109 1D GGCAGCTGTC T/- TTTTTTTTCT 2704 hom 42 het 17 0 13 4 T 9 8 152876 CASAVA_Build 18 59403489 1D CACGGGGGAT G/- GGAGTGGTAC 3070 hom 66 het 26 0 22 6 G 3 2 152877 CASAVA_Build 18 59405506 1I TGGGCATAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 241 hom 31 1 25 5 T 8 9 152878 CASAVA_Build 18 59407098 1D ATTCATTTGG C/- GGGGGGGTTG 3070 hom 40 het 17 0 14 3 C 1 0 152879 CASAVA_Build 18 59411923 1D TCAGAATGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 29 0 22 8 T 10 9 152880 CASAVA_Build 18 59426371 1D GCTTTCCTTG T/- TTTTCATGAC 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 T 5 4 152881 CASAVA_Build 18 59427593 1D CATGTTTTCA T/- TTCTTTTGGG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 3 2 152882 CASAVA_Build 18 59437344 1I CGATTCCTAG -/T TTTTTTTTTG 2843 het 1084 hom 14 3 7 4 T 9 10 152883 CASAVA_Build 18 59439045 13D ACATATTAGA ATGTTAGAATTAT/------------- ATGTTAGAAT 3070 het 3070 ref 37 20 19 6 ATGTTAGAATTAT 1 0 152884 CASAVA_Build 18 59446164 1D TGAAATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 9 21 9 A 11 10 152885 CASAVA_Build 18 59477609 1I CCAGGTGAAA -/T TTACCTGTAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 2 3 152886 CASAVA_Build 18 59497980 2D TGACCTTTAA AT/-- TAATAATAAT 52 het 52 ref 12 8 1 3 AT 1 0 152887 CASAVA_Build 18 59501333 5D TCTTTCTCTC TCTTT/----- TCTTTTTCTC 1920 het 1920 ref 16 8 5 6 TCTTT 2 1 152888 CASAVA_Build 18 59505695 1D ATCTTTTTTT A/- AGTGCCGAAT 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 A 2 1 152889 CASAVA_Build 18 59522181 3I TCATTTGCTT ---/GAA GAAGATTTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 GAA 1 2 152890 CASAVA_Build 18 59543876 1I ACACTATGGA -/G GGTAATCTGC 3070 het 3070 hom 49 15 24 10 G 2 3 152891 CASAVA_Build 18 59546852 8I GCCCCCCACC --------/CCCCACCA AAAAAAAATT 2037 het 1776 hom 14 5 6 3 CCCCACCA 0 1 152892 CASAVA_Build 18 59548076 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2729 hom 21 8 9 4 T 13 14 152893 CASAVA_Build 18 59551087 1D AAAAAAGAGT A/- AAAAAGAATG 2726 het 2726 ref 33 19 8 7 A 6 5 152894 CASAVA_Build 18 59552955 1D TAACATTGAA T/- GTAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 38 25 12 1 T 1 0 152895 CASAVA_Build 18 59553200 4I CTTATTATAT ----/AATG AATGGTAAAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 AATG 1 2 152896 CASAVA_Build 18 59554834 3I2M5I GGGACAGATA ---AA-----/CCCAATTTTT AATGATGTGA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 N/A 0 0 152897 CASAVA_Build 18 59554921 1I GTACCCACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 8 9 152898 CASAVA_Build 18 59555104 2D GATTAATAAA TT/-- TTTTTTTTCC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 10 8 152899 CASAVA_Build 18 59558182 4D GTTAATTAAA TGTT/---- TGTATCACCC 3070 hom 81 het 33 0 28 7 TGTT 1 0 152900 CASAVA_Build 18 59560605 1D TGAACGACAC T/- AGTTTAGATG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 0 152901 CASAVA_Build 18 59560812 4I AGTGCTTGTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 hom 70 het 29 0 24 6 TCTT 2 3 152902 CASAVA_Build 18 59562699 1D TATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2894 het 1020 hom 18 6 6 6 T 13 12 152903 CASAVA_Build 18 59568668 1I AGCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 1942 het 1942 ref 33 21 8 4 A 9 10 152904 CASAVA_Build 18 59568827 1I CATACTTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 10 152905 CASAVA_Build 18 59582866 1I TTTAATTGGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 8 9 152906 CASAVA_Build 18 59586481 1D CTGTTCTTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 T 9 8 152907 CASAVA_Build 18 59604519 2I TGGATTACAC --/AT GTTTGGATTA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 AT 0 1 152908 CASAVA_Build 18 59604831 1D TCATAGTATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 8 T 9 8 152909 CASAVA_Build 18 59612934 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1824 hom 19 5 13 2 A 10 9 152910 CASAVA_Build 18 59616727 1D ATGTGTTAAG A/- AAAAAACTTC 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 A 7 6 152911 CASAVA_Build 18 59616803 1I TTTCCCTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 9 10 152912 CASAVA_Build 18 59651678 2I AGGCACTAAC --/TT TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 7 9 152913 CASAVA_Build 18 59651999 4D ACTTGAAATC ACTT/---- AGGGGGCAAA 3070 het 3070 hom 45 19 24 3 ACTT 1 0 152914 CASAVA_Build 18 59655569 1I AAAAAAAAAA -/G GATACATTTC 3070 het 2696 hom 24 10 11 3 G 1 2 152915 CASAVA_Build 18 59689459 1D AATTTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1315 hom 27 6 9 12 T 17 16 152916 CASAVA_Build 18 59707959 1I GAAGCAAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 10 152917 CASAVA_Build 18 59728975 2D GATGAACACT TG/-- TGTGTGTGTG 1359 het 1359 ref 47 30 3 17 TG 10 9 152918 CASAVA_Build 18 59732180 9D CGTTTAGTAT AGTTAAGTC/--------- AGTTAAGTCT 3070 hom 86 het 37 0 29 11 AGTTAAGTC 2 1 152919 CASAVA_Build 18 59790213 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2110 hom 21 7 8 6 T 11 12 152920 CASAVA_Build 18 59792935 1D AAAGTTCCAA C/- CCTTTCAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 3 2 152921 CASAVA_Build 18 59797094 1I AAGTGGGTTA -/T TTTTAGTGCA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 T 4 5 152922 CASAVA_Build 18 59803095 2I TACCAAACTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 10 12 152923 CASAVA_Build 18 59805810 9I GGAGCCAGCC ---------/CTCTATGTG CTCTTCCATC 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 CTCTATGTG 0 1 152924 CASAVA_Build 18 59809885 1D TTTAGATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 11 10 152925 CASAVA_Build 18 59822365 1D TGCCTATATC T/- TTTTTGGAGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 6 5 152926 CASAVA_Build 18 59823635 11D5M2I TCAGTATTAA GAGGTGGGACCTTTGG--/-----------TTTGGAT GAGGTGATTA 3070 hom 102 het 35 0 33 8 N/A 0 0 152927 CASAVA_Build 18 59841216 2I TACATTTAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 41 0 27 14 T 12 14 152928 CASAVA_Build 18 59852868 10I AAAAGAAACC ----------/AAACAGTAGT AAACAGTAAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AAACAGTAGT 0 1 152929 CASAVA_Build 18 59871375 1D ATGTTCTATG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 95 het 60 1 54 5 A 10 9 152930 CASAVA_Build 18 59872269 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2899 het 267 hom 30 5 11 14 T 18 17 152931 CASAVA_Build 18 59876485 1D TAACTTGGAC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 94 het 37 0 32 5 T 9 8 152932 CASAVA_Build 18 59884298 1D TAACTGTATG T/- TTTGCACCCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 4 3 152933 CASAVA_Build 18 59886505 2D TTTGCTCACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 7 A 15 13 152934 CASAVA_Build 18 59888030 1I TATATATTTT -/A AAAAACTTGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 5 6 152935 CASAVA_Build 18 59888614 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 562 hom 25 2 21 2 A 15 16 152936 CASAVA_Build 18 59889006 1I CATTTGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 41 1 34 6 T 10 11 152937 CASAVA_Build 18 59889530 1D GCTGCTTTTG C/- CCCATGATGG 3070 hom 93 het 35 0 30 6 C 4 3 152938 CASAVA_Build 18 59938671 1D AACTAGGGTA T/- TTTTTTTTTT 980 het 980 ref 51 44 4 4 T 11 10 152939 CASAVA_Build 18 59955121 6I TACGTAAGAC ------/ATGAGG ATGAAGGATA 3070 hom 156 het 58 0 51 7 ATGAGG 0 1 152940 CASAVA_Build 18 59966622 2D GAAAAATGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 38 1 29 10 T 13 11 152941 CASAVA_Build 18 59968256 1D GCGCTCCTGG C/- CTTACCTTCC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 2 1 152942 CASAVA_Build 18 59968682 1D TCCTTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 1939 het 1939 ref 37 22 6 10 T 15 14 152943 CASAVA_Build 18 59973389 1I TCAGCTTGTG -/T TTTTTGCACA 3070 hom 138 het 49 0 46 3 T 5 6 152944 CASAVA_Build 18 59984165 1D ACTGAGGTAA G/- TAATTCATTA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 G 1 0 152945 CASAVA_Build 18 59985948 1D ACCTCCAAAG C/- CCCTTTATAA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 C 4 3 152946 CASAVA_Build 18 59992340 4I CAGTTTTTTT ----/TCTG TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 25 21 4 TCTG 0 1 152947 CASAVA_Build 18 60003744 1D ACTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 11 10 152948 CASAVA_Build 18 60004212 1D TTTTTTTTTT A/- ATCTAAATTA 3070 het 3070 ref 26 13 9 6 A 2 1 152949 CASAVA_Build 18 60006492 1D CCCCAAGTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 10 9 152950 CASAVA_Build 18 60007539 1D AAATGATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 13 12 152951 CASAVA_Build 18 60008876 1D CACTGCAGAC T/- TTGGGGGGGC 2612 het 2612 ref 28 11 12 6 T 3 2 152952 CASAVA_Build 18 60027446 1D TTCCAAAAGT A/- ATAATAGCAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 2 1 152953 CASAVA_Build 18 60033635 5D ACACACAAAT AAAAC/----- AAAACTTTTA 3070 hom 90 het 32 0 29 6 AAAAC 2 1 152954 CASAVA_Build 18 60038626 2I CAGTTCCTTT --/AA AAAAAAAAAA 2492 het 43 hom 24 1 14 9 A 14 16 152955 CASAVA_Build 18 60040697 1D ACTGCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2229 hom 15 het 11 0 6 7 A 17 16 152956 CASAVA_Build 18 60049882 4D GCAAATGTTG CTGC/---- CTATCGTTCC 2692 hom 15 het 6 0 6 0 CTGC 1 0 152957 CASAVA_Build 18 60051437 5D TTGTTTTTTA TTTTG/----- TTTAAACTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 5 TTTTG 1 0 152958 CASAVA_Build 18 60052948 4D TTATTATAAT ACTA/---- ACCCATGCAA 3070 hom 120 het 41 0 41 1 ACTA 1 0 152959 CASAVA_Build 18 60062362 5D TAGTTTTGGG ATATA/----- ATATAACAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 6 ATATA 2 1 152960 CASAVA_Build 18 60080560 1D TATGCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 35 0 30 5 A 12 11 152961 CASAVA_Build 18 60092406 1D TGTTTATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 10 9 152962 CASAVA_Build 18 60111253 1I GTAAGATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 23 0 19 4 A 13 14 152963 CASAVA_Build 18 60123981 20I GCAAAACATA --------------------/CATACATACTTATGTACATG CATACCTAAT 3070 hom 129 het 49 0 43 8 CATACATACTTATGTACATG 0 1 152964 CASAVA_Build 18 60137232 4D TCCTTCCTTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 1738 hom 25 het 12 0 7 5 CTTT 6 5 152965 CASAVA_Build 18 60137294 27D TTTTCTTTCC TTTCTCTCTCTCTTTCTGTCATACTTT/--------------------------- GGTGACAGAG 3070 hom 34 het 15 0 13 5 TTTCTCTCTCTCTTTCTGTCATACTTT 1 0 152966 CASAVA_Build 18 60144492 1D AAAGGGGGGG A/- AACAGGGATC 3070 hom 57 het 24 0 14 10 A 3 2 152967 CASAVA_Build 18 60166113 1I AGCAGTACCC -/T TCTCCACAAT 3070 hom 129 het 50 0 42 8 T 1 2 152968 CASAVA_Build 18 60168776 1I AGGGAAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 502 hom 34 2 21 11 T 10 11 152969 CASAVA_Build 18 60172929 1I TAAAAAAGGA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 7 8 152970 CASAVA_Build 18 60174337 5I TATAAGAGGC -----/ATGTT ATGATATGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATGTT 0 1 152971 CASAVA_Build 18 60177341 4I TATTTTACCA ----/TTTG TTTGTGTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTG 1 2 152972 CASAVA_Build 18 60177797 6D CTTGGCAAAA AGCAAT/------ TCTCAACAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 6 AGCAAT 1 0 152973 CASAVA_Build 18 60180009 1D TCAAAGTTCC A/- CAGATCTCTG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 1 0 152974 CASAVA_Build 18 60182249 1I GAGGCCAAGG -/C CAGGAGTATT 3070 het 3070 hom 29 10 15 5 C 1 2 152975 CASAVA_Build 18 60187861 1D CACAGTCAGA G/- GGCTAATCCT 1354 het 1354 ref 19 11 3 5 G 3 2 152976 CASAVA_Build 18 60197242 1D GCACATAAAG T/- TTTTTAAACA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 6 5 152977 CASAVA_Build 18 60199135 1D CCTTTATTCT C/- TCTCCGCCAC 3070 hom 117 het 45 0 40 7 C 1 0 152978 CASAVA_Build 18 60200333 8D CTCAGACACT TAGTCTAC/-------- CAGTCTAATC 3070 hom 66 het 31 0 23 11 TAGTCTAC 1 0 152979 CASAVA_Build 18 60200379 1D TCTTTCAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 18 0 11 9 A 11 10 152980 CASAVA_Build 18 60204044 4I GGAAATACTC ----/AGTG AGCTAGGCTA 3070 hom 132 het 52 0 44 8 AGTG 0 1 152981 CASAVA_Build 18 60205251 1I GTAGATGGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 9 152982 CASAVA_Build 18 60205657 4D TCTGATTATA ATTT/---- AGACAGTTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ATTT 1 0 152983 CASAVA_Build 18 60207310 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3025 hom 30 12 14 5 A 11 10 152984 CASAVA_Build 18 60209934 1I TTACATATAT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 0 1 152985 CASAVA_Build 18 60211201 1D TAATGAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 10 9 152986 CASAVA_Build 18 60211970 2I ATATTAAAAC --/TT TTAAAATTAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 2 4 152987 CASAVA_Build 18 60218240 1D GTTTCAAGAT C/- ATCTATAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 C 1 0 152988 CASAVA_Build 18 60227969 1D TAGGGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 2901 het 57 hom 19 2 10 7 T 17 16 152989 CASAVA_Build 18 60228202 6I AGTAATAATG ------/ATAAAT ATAATGTATT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 ATAAAT 0 1 152990 CASAVA_Build 18 60232333 1D TTGATCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 11 10 152991 CASAVA_Build 18 60239965 3I AGCAGATGTT ---/AAA AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 11 152992 CASAVA_Build 18 60241685 1D CTTTATGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 11 10 152993 CASAVA_Build 18 60241869 4D GCTTTGGCAC TGTT/---- TGTTCCAGGT 3070 hom 72 het 26 0 24 5 TGTT 2 1 152994 CASAVA_Build 18 60245075 2D TCCATGAGAC AG/-- AGTTAACAAG 2479 hom 12 het 5 0 5 0 AG 2 1 152995 CASAVA_Build 18 60250805 1I CAGAATCGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 32 1 23 8 T 10 11 152996 CASAVA_Build 18 60262170 1I8M3I GTTTTTTTTG -TTTTGTTT---/TTTTTGTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 32 0 25 9 N/A 0 0 152997 CASAVA_Build 18 60268959 1I TCATACCATT -/C CCCCCAAATT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 C 5 6 152998 CASAVA_Build 18 60275150 1D TCTGCACAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 52 het 24 0 23 1 A 10 9 152999 CASAVA_Build 18 60288496 1D ATATGGAACA C/- TGCACCATGG 3070 het 3070 ref 51 26 22 4 C 1 0 153000 CASAVA_Build 18 60291307 3D TTTGTTGTTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 75 het 31 0 25 7 TTG 4 3 153001 CASAVA_Build 18 60292703 1D GCTCTGAGTT A/- ACCGACACTT 3070 hom 98 het 38 0 31 7 A 2 1 153002 CASAVA_Build 18 60296770 1I AAGACAAAGG -/A TAGAAAAATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 153003 CASAVA_Build 18 60299022 3D ACAGAGTAAT AAC/--- AAGTAATAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAC 1 0 153004 CASAVA_Build 18 60302266 1I19M1D ATTTGATTTT -TTTTTGTAGCTCTTATAATA/CTTTTTGTAGCTCTTATAAT- AAAAATGACT 3070 hom 129 het 43 0 44 10 N/A 0 0 153005 CASAVA_Build 18 60306805 2I CACTGACAGA --/CT CTCTCCCGTG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CT 2 3 153006 CASAVA_Build 18 60310532 4D AAACTCTTTG AAGT/---- AAGCCATGCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAGT 1 0 153007 CASAVA_Build 18 60313927 1I AAACTAGCCT -/G GTACGGTGAT 3070 hom 105 het 42 0 34 8 G 1 2 153008 CASAVA_Build 18 60319935 1D TTTAAAAAAG A/- AAACCAATGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 4 3 153009 CASAVA_Build 18 60323195 4I AGCATAACTA ----/AAAG AAAGACAAAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AAAG 1 2 153010 CASAVA_Build 18 60336044 1D ACTGATTTTC A/- ATGTGAAAAC 3070 hom 87 het 30 0 30 1 A 2 1 153011 CASAVA_Build 18 60344045 4D CTCAAGAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 99 het 40 0 34 8 AAAC 5 4 153012 CASAVA_Build 18 60346843 1I GAAGATGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 43 1 36 6 T 10 11 153013 CASAVA_Build 18 60357166 1D TTTGTGTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 10 9 153014 CASAVA_Build 18 60357233 2D TTTAAATCAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 11 9 153015 CASAVA_Build 18 60357612 1D AATAAATAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 26 0 20 7 T 9 8 153016 CASAVA_Build 18 60362168 2I TACAATTACC --/CA CACACACATG 3070 hom 45 het 23 0 16 23 CA 4 5 153017 CASAVA_Build 18 60364811 2D ATATCCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 33 het 18 0 12 6 TC 8 7 153018 CASAVA_Build 18 60365322 1D GGGTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 47 1 35 12 T 12 11 153019 CASAVA_Build 18 60372863 1I CAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 100 het 43 0 33 10 A 9 10 153020 CASAVA_Build 18 60377852 1I TCTCTATAGA -/T TTTTGACAAA 3070 hom 132 het 53 0 45 8 T 4 5 153021 CASAVA_Build 18 60378320 1I GAAATAACAC -/A AACCATTTAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 3 153022 CASAVA_Build 18 60380153 1D TTAAGATTGA T/- TTAGAATATC 3070 hom 135 het 49 0 46 4 T 3 2 153023 CASAVA_Build 18 60381001 1I TGATAATATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 10 153024 CASAVA_Build 18 60382088 1I CTGGTTTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 10 153025 CASAVA_Build 18 60383210 3D CCCTATCGAA GAG/--- GAGAGGAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 GAG 2 1 153026 CASAVA_Build 18 60384102 4I AGTAAATGAC ----/TCTA TCTCTCACTC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TCTA 0 1 153027 CASAVA_Build 18 60388786 4D AAAAAAGCTG AAAT/---- AAATTAAAGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAAT 2 1 153028 CASAVA_Build 18 60396901 1D AAGAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 11 10 153029 CASAVA_Build 18 60401473 1D CATATATATA T/- TTTTTTCAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 6 153030 CASAVA_Build 18 60408040 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 710 hom 41 2 30 9 A 14 13 153031 CASAVA_Build 18 60414892 2I GAGGGCAAGG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 782 hom 38 2 22 14 GA 6 7 153032 CASAVA_Build 18 60422531 3D TCCAACTCTG CAA/--- CAACAGACAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 CAA 2 1 153033 CASAVA_Build 18 60425826 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 10 9 153034 CASAVA_Build 18 60427791 1I TTGGCATCCG -/T TCACATGGAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 T 1 2 153035 CASAVA_Build 18 60428636 4I CATAATTCTT ----/TGTG TGTGTCTATG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TG 2 4 153036 CASAVA_Build 18 60430351 2I GATCATAGAC --/AT ATGTTCAAAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AT 1 2 153037 CASAVA_Build 18 60433240 1D ACATTTTTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 27 0 22 7 A 10 9 153038 CASAVA_Build 18 60433501 3I AGAGAGAGAA ---/TTG TTGTCTTTAT 3070 hom 98 het 38 0 33 5 TTG 1 2 153039 CASAVA_Build 18 60434264 4I TTTTTTTAAC ----/TATT TAATAATTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TATT 0 1 153040 CASAVA_Build 18 60443064 1D ACAACAACCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 13 12 153041 CASAVA_Build 18 60446482 1I CTTAATATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 27 1 24 2 T 10 11 153042 CASAVA_Build 18 60448333 2D GTGAACAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 37 1 26 10 T 17 15 153043 CASAVA_Build 18 60448349 2D TTTTTTTTTT TC/-- AGAAATTTCA 3070 hom 69 het 34 0 22 12 TC 1 0 153044 CASAVA_Build 18 60455103 1I TTTCCCCCCC -/A CCCAGTTTGA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 0 1 153045 CASAVA_Build 18 60455834 4I ATTTAAAAAT ----/AAAG AAGGAAAGAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAG 0 1 153046 CASAVA_Build 18 60457077 1D48M1D AGAATTGTGC ATTTAGTGAAGACAGTTTCATTTTAATGGAAGTATTTATCATAATGATTA/-TTTAGTGAAGACAGTTTCATTTTAATGGAAGTATTTATCATAATGATT- AATTTAAGAG 3070 hom 81 het 19 0 28 3 N/A 0 0 153047 CASAVA_Build 18 60488238 3D TGAAAAAAAA AAC/--- AGACAAATTT 3070 hom 63 het 22 0 22 1 AAC 1 0 153048 CASAVA_Build 18 60490626 2I TCCCTGCAAC --/CT CTACCTCCCG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 CT 1 2 153049 CASAVA_Build 18 60491403 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAACACATT 3070 hom 112 het 44 0 36 8 AC 0 1 153050 CASAVA_Build 18 60498636 1D CTTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 30 2 21 7 A 13 12 153051 CASAVA_Build 18 60507068 6D TTTTACACAC TTATAG/------ TTATTGAACT 3070 hom 114 het 41 0 39 6 TTATAG 1 0 153052 CASAVA_Build 18 60508610 2D TCACAATAGC AA/-- AGACTTGGAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 3 1 153053 CASAVA_Build 18 60509917 28D GGAAAAATAT AAACTATGCACTTGAAACTATGAAATAG/---------------------------- AAACTATGCA 3070 hom 58 het 21 0 17 14 AAACTATGCACTTGAAACTATGAAATAG 3 2 153054 CASAVA_Build 18 60510748 2I ATTAGGTCCT --/AC ACATTTTCTA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 AC 1 2 153055 CASAVA_Build 18 60511341 1D AGATTTTACA G/- GTTATTGGAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 2 1 153056 CASAVA_Build 18 60514547 1D TAGTCGTGGT A/- AAAGGTGAAG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 4 3 153057 CASAVA_Build 18 60514947 2D ATAAAGCATA AC/-- ACATAAAATA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AC 2 1 153058 CASAVA_Build 18 60517141 1D AGAACTCACT A/- AATCACCCAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 3 2 153059 CASAVA_Build 18 60517344 1D TACTTTTGAA T/- TCATAGGTGT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 2 1 153060 CASAVA_Build 18 60520913 2D CAACTCAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 321 hom 17 1 12 5 A 13 11 153061 CASAVA_Build 18 60522008 1D GCTCTAAACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 9 153062 CASAVA_Build 18 60523728 1I TTATATATAT -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 6 7 153063 CASAVA_Build 18 60524383 11D ACAAAACAAA ACAAAAAAAAC/----------- AAAAGAAACA 3070 hom 29 het 10 0 10 5 ACAAAAAAAAC 1 0 153064 CASAVA_Build 18 60527660 10D AATAGTGAGT TGATAATTAA/---------- TGATAATTAA 3070 hom 48 het 19 0 16 4 TGATAATTAA 2 1 153065 CASAVA_Build 18 60529151 1I CTTAAAGATT -/G GGGGGGAACA 3070 hom 118 het 45 0 39 6 G 6 7 153066 CASAVA_Build 18 60537344 1I GTGAGACTGA -/T TTTTGTTTTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 4 5 153067 CASAVA_Build 18 60537720 10D ATACAGACAG ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 hom 78 het 32 0 26 9 AC 14 9 153068 CASAVA_Build 18 60538292 1I TTTTTGGTAC -/A AAAAATTTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 5 6 153069 CASAVA_Build 18 60539648 1D CTGGTGTGCA G/- TGGCGTGATC 3070 hom 33 het 22 0 11 11 G 1 0 153070 CASAVA_Build 18 60540749 1D CTTTTTTTTT A/- AATTTTTTGA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 3 2 153071 CASAVA_Build 18 60541753 1I CCCATATAAG -/T TTTTTGCATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 5 6 153072 CASAVA_Build 18 60545392 1I AATAAACACA -/T TTTTTCACAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 5 6 153073 CASAVA_Build 18 60551087 1D AAGTTTGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 45 0 37 9 T 10 9 153074 CASAVA_Build 18 60551492 5D ATAAGAATAG AATAA/----- AACAATAATG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AATAA 1 0 153075 CASAVA_Build 18 60551584 4I ACATGTTTGC ----/ATAG ATAGATGAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATAG 1 2 153076 CASAVA_Build 18 60552673 3I GAAGAGCCCT ---/ATG TTTATACTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ATG 0 1 153077 CASAVA_Build 18 60552762 1D GTTCTTATGA T/- AGTAGGGGCC 3070 het 1406 hom 31 6 22 3 T 1 0 153078 CASAVA_Build 18 60555160 1D TCTTGGACAT C/- CCCTACATGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 4 3 153079 CASAVA_Build 18 60555799 2I GCATTTTTAT --/AC ACACACATAC 3070 hom 93 het 52 0 39 13 AC 3 4 153080 CASAVA_Build 18 60557226 2D ATATTCACAC AT/-- AAATATTTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 1 0 153081 CASAVA_Build 18 60561980 1I GTTTGCAAAA -/T TTTTCTTCCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 4 5 153082 CASAVA_Build 18 60564189 1I TTGCTACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 40 1 30 9 T 12 13 153083 CASAVA_Build 18 60565152 1I TAATCATGTA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 8 153084 CASAVA_Build 18 60569454 1D TAGCCCTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 10 9 153085 CASAVA_Build 18 60571573 1I AGAGGTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 11 12 153086 CASAVA_Build 18 60584424 1I GCTAGGGCAA -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 7 8 153087 CASAVA_Build 18 60585401 3D CTGTATAAAA CAG/--- CAGCAACAAC 3070 hom 60 het 23 0 20 4 CAG 2 1 153088 CASAVA_Build 18 60589193 1D TCGCATTCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 153089 CASAVA_Build 18 60591866 1D ATAAAAAGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 10 9 153090 CASAVA_Build 18 60604872 1I GCTCCCAACT -/A ATCTTCCACA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 2 153091 CASAVA_Build 18 60615721 1D AGTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1574 het 1574 ref 34 29 4 1 A 12 11 153092 CASAVA_Build 18 60739074 1D TAAGAAAGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 A 10 9 153093 CASAVA_Build 18 60743151 5D CATCAAATAT CTTTA/----- CTTAATATGC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 CTTTA 1 0 153094 CASAVA_Build 18 60745235 6I AATATATAAA ------/ATTATT ATTATTACAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 ATT 2 4 153095 CASAVA_Build 18 60746349 4I GGAGTCACTT ----/AGAC AGCATAACTG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AGAC 0 1 153096 CASAVA_Build 18 60748871 3I AATGTTTATA ---/TTC TTCTTCCAAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 TTC 2 3 153097 CASAVA_Build 18 60770597 1I ATATACACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 40 2 33 5 A 10 11 153098 CASAVA_Build 18 60771374 1D TCTCCCAAAA G/- CAACACTCCC 3070 het 3070 ref 27 14 10 5 G 1 0 153099 CASAVA_Build 18 60798590 5D AGCACATAAT ATAAA/----- ATATGTTAGG 3070 het 3070 hom 27 11 14 4 ATAAA 1 0 153100 CASAVA_Build 18 60804217 1I CATTAATACA -/T TTTTACTGTT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 4 5 153101 CASAVA_Build 18 60838320 1I ATTAAGCATA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 153102 CASAVA_Build 18 60849260 4I2M2D TAATGTTTAC ----TTAG/CAGGTT-- CATCCATGTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 N/A 0 0 153103 CASAVA_Build 18 60849831 1I TACTGGGGTG -/T TTTTTTTTTT 2213 het 2213 ref 36 21 7 8 T 12 13 153104 CASAVA_Build 18 60863472 1D GTGACCATAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 101 het 37 0 34 4 A 10 9 153105 CASAVA_Build 18 60865202 1D AATCAACCGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 31 0 23 9 A 10 9 153106 CASAVA_Build 18 60865368 1D ATTACTGTGA C/- CTATAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 2 1 153107 CASAVA_Build 18 60871603 1I ACTGAGTGTG -/A AAAAAACAGT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 6 7 153108 CASAVA_Build 18 60875414 5I TATTGATACT -----/TTACA TTAATACATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTACA 0 1 153109 CASAVA_Build 18 60875782 4D TTTTCAGTCA TAGT/---- TGGTGATATG 3070 hom 90 het 31 0 31 3 TAGT 1 0 153110 CASAVA_Build 18 60883840 2D TTGGGTGGCT TA/-- TATATATATT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TA 5 4 153111 CASAVA_Build 18 60890156 4D TAGAGTGCTT TGTC/---- TGCCAAATAT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 TGTC 1 0 153112 CASAVA_Build 18 60905267 1I TCCAGTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1114 hom 32 4 15 13 T 12 13 153113 CASAVA_Build 18 60907847 4D TATATTAACT TTTA/---- TTTTTCTCCA 3070 hom 141 het 49 0 48 1 TTTA 1 0 153114 CASAVA_Build 18 60919366 3I CAGTGAGTGA ---/ACT GTGAACCAGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ACT 0 1 153115 CASAVA_Build 18 60933626 1D ATTATCTAAG A/- AAAATGAGGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 5 4 153116 CASAVA_Build 18 60938337 1D GTGTCAAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 9 8 153117 CASAVA_Build 18 60938813 1I GTGCTTTAAG -/A AAAAATCCTT 3070 hom 138 het 56 0 45 11 A 5 6 153118 CASAVA_Build 18 60942781 1I CTTCCAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 32 1 26 5 A 11 12 153119 CASAVA_Build 18 60948576 1D AGACCTGACC T/- TTTTTTTTTT 1472 het 1472 ref 39 27 4 8 T 13 12 153120 CASAVA_Build 18 60951980 1I TTATGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 30 1 22 7 T 11 12 153121 CASAVA_Build 18 60958814 2D AAGGCAAGAC AT/-- GTGTTTATTT 3070 het 3070 ref 49 23 22 5 AT 1 0 153122 CASAVA_Build 18 60977928 1D GTCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1099 het 1099 ref 42 29 3 10 A 13 12 153123 CASAVA_Build 18 61018335 1I CATAAGTTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 8 9 153124 CASAVA_Build 18 61049807 1D AGTTTTCAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 8 153125 CASAVA_Build 18 61058612 4D ACATACACAT ACAC/---- ACACAACATA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AC 4 2 153126 CASAVA_Build 18 61059825 2D TTTTATACAC TT/-- ATATACAATG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 0 153127 CASAVA_Build 18 61061190 1I TAGGCTTTTG -/A ATGAGTCAAG 3070 hom 159 het 60 0 53 7 A 1 2 153128 CASAVA_Build 18 61062764 2D CATGGTAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 12 10 153129 CASAVA_Build 18 61073008 2D AAGTCCATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 28 0 20 9 T 14 12 153130 CASAVA_Build 18 61077925 2D TTATTTTCAC AT/-- GTTTAAAAGA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AT 1 0 153131 CASAVA_Build 18 61094884 6I CAAGTGAATC ------/TTTCTA TTTCTTTCTC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TTTCTA 0 1 153132 CASAVA_Build 18 61103904 1I GATTAACATT -/G GAGTCAGTGA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 G 1 2 153133 CASAVA_Build 18 61111835 1I AACAAAACAT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 7 8 153134 CASAVA_Build 18 61113031 1I CATTTACATG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 7 8 153135 CASAVA_Build 18 61117287 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2583 hom 36 10 13 13 TG 10 9 153136 CASAVA_Build 18 61124361 1D AACCATTTGT A/- TTTTTGACTT 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 A 1 0 153137 CASAVA_Build 18 61125735 1D AAATATACAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 25 0 19 7 A 9 8 153138 CASAVA_Build 18 61125879 1D AGTTACATTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 9 8 153139 CASAVA_Build 18 61135840 1I TGACTATTTC -/T TTTTTTGCTG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 6 7 153140 CASAVA_Build 18 61146004 3D AGTTCATAGT ATA/--- ATAACAAAGA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 ATA 2 1 153141 CASAVA_Build 18 61147826 81D CTGATAAAGA AAACATTAAATCTGAATGGCAATGCTATTTCACATCTTCTGTGGCTTTTCCACAAGTGGTGTGTAATTTATTTAGCTTTCT/--------------------------------------------------------------------------------- ACTTTACATG 848 het 848 ref 32 38 2 5 AAACATTAAATCTGAATGGCAATGCTATTTCACATCTTCTGTGGCTTTTCCACAAGTGGTGTGTAATTTATTTAGCTTTCT 1 0 153142 CASAVA_Build 18 61150633 1D AGGGAAGAGA T/- AAAATCCAAT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 T 1 0 153143 CASAVA_Build 18 61151665 4I ACTATGATAT ----/GTAA GTAAGTGAAG 3070 het 3070 ref 37 13 10 14 GTAA 1 2 153144 CASAVA_Build 18 61154432 1D ATTTCCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2419 hom 30 8 14 8 T 11 10 153145 CASAVA_Build 18 61162748 2D TTCATTTTCC TT/-- TCAAGAAACA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 3 1 153146 CASAVA_Build 18 61165200 9D TCATTGTTTA CATAATAAT/--------- CATAATAATT 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 CATAATAAT 2 1 153147 CASAVA_Build 18 61165733 1D ATACGAGGAG T/- TCCAGCTCTA 3070 het 3070 ref 60 26 27 8 T 2 1 153148 CASAVA_Build 18 61165970 8I TCTGCATCAG --------/GAGATTCA GAGATTCAGT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 GAGATTCA 1 2 153149 CASAVA_Build 18 61166753 2I ATATTTATTC --/AT ATATATATAC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AT 4 5 153150 CASAVA_Build 18 61170257 1D ATCAGAACTA G/- GGTGTGTCTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 G 3 2 153151 CASAVA_Build 18 61178229 6I ATTTTGATCC ------/TTTATT TTTATTACAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTTATT 1 2 153152 CASAVA_Build 18 61217369 4I TTTAAAACTG ----/TTTA TTTATGTAGC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TTTA 1 2 153153 CASAVA_Build 18 61220275 2D GGTTTATACA AC/-- ATTTATTTCT 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 AC 1 0 153154 CASAVA_Build 18 61221046 1I AAGAGAAGAC -/A AAAAAAAATA 1972 het 1972 ref 15 9 5 1 A 8 9 153155 CASAVA_Build 18 61222341 1I TATCTTAAAG -/T TTTTCAATTA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 4 5 153156 CASAVA_Build 18 61225871 1D AGCAGTGTGT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 8 7 153157 CASAVA_Build 18 61234470 1I GGAGGGGCAG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 8 153158 CASAVA_Build 18 61245776 1I ATTACACCTC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 7 8 153159 CASAVA_Build 18 61253631 1I TGAACACAAA -/G AAATGATAAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 0 1 153160 CASAVA_Build 18 61263405 1I GTATTTCTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2120 hom 25 6 14 5 T 9 10 153161 CASAVA_Build 18 61266683 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGGAGAATTG 3070 het 842 hom 14 2 11 1 AGG 2 1 153162 CASAVA_Build 18 61268574 1I ACAGGAAAGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 47 27 18 2 A 7 8 153163 CASAVA_Build 18 61268858 1I AAGCCACATA -/G AGAAGAACAG 3070 het 3070 ref 51 28 17 6 G 0 1 153164 CASAVA_Build 18 61285341 6D CTTTAAAATG GAAAAA/------ GAAAAATATA 3070 het 3070 ref 35 16 17 3 GAAAAA 2 1 153165 CASAVA_Build 18 61288119 1I AGGAGTTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 9 10 153166 CASAVA_Build 18 61293221 1D AAAAGAGCCA G/- GATTTCCCAC 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 G 2 1 153167 CASAVA_Build 18 61294590 1I TCTTTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 10 11 153168 CASAVA_Build 18 61296743 1I ATTAAAAATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 13 10 5 A 8 9 153169 CASAVA_Build 18 61307286 11I GAATAAATCT -----------/AAATGCCCATC AACAGTAGAT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 AAATGCCCATC 0 1 153170 CASAVA_Build 18 61321961 5D AATAATATAC TTAAT/----- TTAGTAAGTC 3070 het 3070 ref 32 16 12 6 TTAAT 1 0 153171 CASAVA_Build 18 61327765 1D CACATATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 A 11 10 153172 CASAVA_Build 18 61344637 1I ATCACAGTTT -/A AAAAATTAAC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 5 6 153173 CASAVA_Build 18 61350243 2D ATAGGTGCTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 37 0 31 8 T 11 9 153174 CASAVA_Build 18 61352438 1I AAAGCTTTTT -/A TAAAAATCTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 153175 CASAVA_Build 18 61358046 1D AATCTGTTAG T/- TTTTGTATTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 5 4 153176 CASAVA_Build 18 61362265 1I AGTTTAATAG -/T TTTTTTAGGA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 6 7 153177 CASAVA_Build 18 61387970 2I ATAGGTAAAC --/AT GTGTCATGAG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 AT 0 1 153178 CASAVA_Build 18 61404208 1D TTTCTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 30 1 25 4 A 11 10 153179 CASAVA_Build 18 61419838 2D TAGTAGAGAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1291 hom 20 5 9 7 AT 10 9 153180 CASAVA_Build 18 61427841 1D GATTCCAAAG T/- TTTTTTTTTT 1853 het 621 hom 21 6 7 8 T 19 18 153181 CASAVA_Build 18 61429147 1D TTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 A 11 10 153182 CASAVA_Build 18 61453745 1I TTCTCGTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 10 11 153183 CASAVA_Build 18 61465921 4I ATTGAATCTC ----/AGAT ATATGAAAAG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AGAT 0 1 153184 CASAVA_Build 18 61492530 2D TATGTATAGG TA/-- TATATATATA 1383 het 1383 ref 24 14 3 7 TA 9 8 153185 CASAVA_Build 18 61624130 1D TATTAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 22 hom 38 1 34 3 A 10 9 153186 CASAVA_Build 18 61628298 1D TTAAGTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 25 1 19 5 A 13 12 153187 CASAVA_Build 18 61628870 1I CCCATCACCT -/A AGTATTAAGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 153188 CASAVA_Build 18 61632460 1D ATCGATGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 11 10 153189 CASAVA_Build 18 61640780 2D CTAAGAATTA CT/-- CTTTTTATAT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CT 2 1 153190 CASAVA_Build 18 61642252 1I TCTCTTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 12 13 153191 CASAVA_Build 18 61644770 2D AAACTTTTAC AA/-- AGTCTTTCAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 3 1 153192 CASAVA_Build 18 61650026 1I AATTCTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 833 hom 32 2 25 5 A 12 13 153193 CASAVA_Build 18 61650431 5D AATAATGTAC TATTA/----- TATTATATGT 3070 hom 66 het 26 0 23 5 TATTA 2 1 153194 CASAVA_Build 18 61658619 1I GAAGCAGCGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 23 7 T 10 11 153195 CASAVA_Build 18 61665243 6I GGTTGTCTTG ------/TACTCA TACTCACGCG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TACTCA 1 2 153196 CASAVA_Build 18 61666779 1I GCCAAGAAAA -/C ATCATGCAAA 3070 hom 129 het 50 0 43 7 C 0 1 153197 CASAVA_Build 18 61667058 1D ATTTACCCGT G/- GGCTTTTTCA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 G 3 2 153198 CASAVA_Build 18 61669316 1I CACAGTGCCC -/G GGCCTCAATA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 2 3 153199 CASAVA_Build 18 61671618 1D AATCAGCCAT C/- CTACATTACT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 2 1 153200 CASAVA_Build 18 61672731 1I TCAACTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 56 het 24 0 19 5 T 8 9 153201 CASAVA_Build 18 61673569 1I TTGACAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 525 hom 27 2 21 4 A 10 11 153202 CASAVA_Build 18 61673745 1D CAAAAAGTGT A/- AACTCTCAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 3 2 153203 CASAVA_Build 18 61680099 1I CTATTAATTT -/A AAAAAATCTC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 6 7 153204 CASAVA_Build 18 61686273 14I ATCACTGAAG --------------/GAAAAATACGTTAA ATTGTGGAGA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 GAAAAATACGTTAA 0 1 153205 CASAVA_Build 18 61687441 1D GTCCAGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 32 1 25 7 T 11 10 153206 CASAVA_Build 18 61700259 2D CTCCAAAGAC GA/-- TTTCAAGAAC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 GA 1 0 153207 CASAVA_Build 18 61702879 3D ATGCAAATAG TGT/--- TGTTAGCATT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 TGT 2 1 153208 CASAVA_Build 18 61704629 4D TCAAATACAG TTAT/---- TTATAAGATC 3070 hom 103 het 38 0 34 6 TTAT 2 1 153209 CASAVA_Build 18 61709025 1I TTATCTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 154 hom 38 1 31 6 T 9 10 153210 CASAVA_Build 18 61713374 6D TTCCAACTGA CAGACT/------ CAGAGTATAG 3070 hom 90 het 34 0 31 5 CAGACT 1 0 153211 CASAVA_Build 18 61716238 9D ACTGGAGATT TGTAAGACA/--------- TGTCCACAAA 3070 het 3070 hom 35 14 19 6 TGTAAGACA 1 0 153212 CASAVA_Build 18 61718168 5D AAAAAAGATT TAATC/----- TAATGACAAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TAATC 1 0 153213 CASAVA_Build 18 61723174 2D CATATATATC TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 24 0 17 8 TA 7 6 153214 CASAVA_Build 18 61727419 1I ATCTATCAAC -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 6 7 153215 CASAVA_Build 18 61731501 3D TCTCTCTTCT TAA/--- TGCTGCTTGG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 TAA 1 0 153216 CASAVA_Build 18 61733212 1I GTCCACATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 903 hom 44 2 34 8 T 9 10 153217 CASAVA_Build 18 61740922 1D AAATAAGATT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 8 153218 CASAVA_Build 18 61741473 1I GCTCAGCTAA -/T TTTTTTGATT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 6 7 153219 CASAVA_Build 18 61744138 2D TGATGTCTTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 1535 hom 21 5 12 5 AT 7 6 153220 CASAVA_Build 18 61754670 1D CCCCATCTGG A/- AAAAAAAAAA 901 het 901 ref 25 15 3 7 A 17 16 153221 CASAVA_Build 18 61768629 1D GATATTCTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 G 2 1 153222 CASAVA_Build 18 61788368 1I AGACTTTCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 9 10 153223 CASAVA_Build 18 61798484 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2967 het 2967 ref 31 16 7 8 T 10 11 153224 CASAVA_Build 18 61804545 1I ATGATAGTTG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 6 7 153225 CASAVA_Build 18 61805387 1I TACAATACTT -/A ATCAATGGCT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 1 2 153226 CASAVA_Build 18 61806960 1D TTTTTCAAAA T/- ATATTGTGTG 3070 het 3070 hom 47 20 23 5 T 1 0 153227 CASAVA_Build 18 61807670 4D TCTCATTTTC ATTG/---- ATTGATTAAT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 ATTG 2 1 153228 CASAVA_Build 18 61895905 1D TCTGAATATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 10 9 153229 CASAVA_Build 18 61915198 1I TATTGTTAGG -/T TTTTTTTTTA 2435 het 2435 ref 21 11 6 4 T 9 10 153230 CASAVA_Build 18 61936572 1D GCAAAAAACA C/- CTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 2 1 153231 CASAVA_Build 18 61947678 1D AGGGTAGGTT A/- ATGCAATATG 3070 hom 86 het 32 0 28 4 A 2 1 153232 CASAVA_Build 18 61952315 1D GAGAACTGGA G/- CGAAAGGAGT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 G 1 0 153233 CASAVA_Build 18 61956461 1D ACAAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 22 1 16 5 T 15 14 153234 CASAVA_Build 18 61960843 1D CAGTGTGAAG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 8 153235 CASAVA_Build 18 61970177 2D ATACTATGTA AG/-- AGCTCTCAAA 3070 het 3070 hom 55 26 26 5 AG 2 1 153236 CASAVA_Build 18 61973540 2I GAAAGAATAC --/TA TGTTGTTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TA 0 1 153237 CASAVA_Build 18 61978125 1I ATCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 493 hom 25 2 17 6 A 11 12 153238 CASAVA_Build 18 61979267 4D TCTCTCTCTC CTCT/---- CTCTCTCTGT 3070 hom 78 het 38 0 25 15 CT 6 4 153239 CASAVA_Build 18 61983009 1D TAGTAAACTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 62 het 26 0 22 4 A 10 9 153240 CASAVA_Build 18 61988665 1D GTTGACAACG T/- TTTCAGTGCC 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 4 3 153241 CASAVA_Build 18 61989972 1I CTCTGTAAGA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 8 9 153242 CASAVA_Build 18 61990545 3I ATTTTAAAAC ---/ATT ATGTTAAGTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATT 0 1 153243 CASAVA_Build 18 61991175 4D GAAGTGGAAG GTAA/---- GTGAGTGTGG 3070 hom 65 het 30 0 22 8 GTAA 1 0 153244 CASAVA_Build 18 61992513 2I AATTGTTATT --/AA GTTTTAAATT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 0 2 153245 CASAVA_Build 18 61992593 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 8 7 153246 CASAVA_Build 18 61996965 1I27M1I GTAAGGGAAA -GTTTTTTTTTTTCTAGTGAGTAGTAGA-/GGTTTTTTTTTTTCTAGTAAGTAGTAGAG AGAAAGCTGT 3070 hom 117 het 38 0 40 7 N/A 0 0 153247 CASAVA_Build 18 61997314 5D AAAAACAGAT TAGAA/----- TAGAATGTTA 3070 hom 117 het 41 0 38 6 TAGAA 2 1 153248 CASAVA_Build 18 62000783 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 25 1 17 9 A 15 14 153249 CASAVA_Build 18 62001794 2D TGTGTGATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 TA 7 6 153250 CASAVA_Build 18 62005573 2I CGATGAAACC --/CT GTCTCTACTA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CT 0 1 153251 CASAVA_Build 18 62007456 1I TGTTTCCGTG -/A GAAAAAAACT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 0 1 153252 CASAVA_Build 18 62013855 3I ACTTTTTTTT ---/TTC TTTTTTGAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTC 0 1 153253 CASAVA_Build 18 62020320 1I TAGGTATATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 417 hom 33 1 29 3 A 9 10 153254 CASAVA_Build 18 62023597 2D ATTTTATATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 148 het 51 0 50 1 TA 7 6 153255 CASAVA_Build 18 62029379 10D CAGGCAAAAT GCAGTAACTA/---------- TCCAAAGCCA 3070 hom 102 het 36 0 35 4 GCAGTAACTA 1 0 153256 CASAVA_Build 18 62041610 1I CTGCACTCTC -/T TTTGGTCCGT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 T 3 4 153257 CASAVA_Build 18 62043016 1D GAGGTAACAC A/- AAAGTAATAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 4 3 153258 CASAVA_Build 18 62064857 5D AACCTTTTCC TTATT/----- TTATTTTATT 3070 hom 81 het 38 0 27 13 TTATT 5 4 153259 CASAVA_Build 18 62066000 3D ATCAAGGTAA CAT/--- TCATGCCCCC 3070 hom 87 het 34 0 29 6 CAT 1 0 153260 CASAVA_Build 18 62066398 1D AGGTGATCCA C/- CCCACCTTGG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 C 4 3 153261 CASAVA_Build 18 62070627 1I TCTTCTCAAC -/T TTTTTTGTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 6 7 153262 CASAVA_Build 18 62070853 1D TGTTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 38 0 25 13 A 11 10 153263 CASAVA_Build 18 62070898 1I ATTGGATATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 9 8 15 A 8 9 153264 CASAVA_Build 18 62074419 1D ACACAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 583 hom 35 2 28 6 A 12 11 153265 CASAVA_Build 18 62078399 4D32M4I AAGAAAAAAG GAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGAAAGGAAAGAAAGAG----/----GAAAGAAAGGAAGGAAGAAAGGAAAGAAAGAGAAGA AAGAAAGAGA 3070 hom 71 het 25 0 22 8 N/A 0 0 153266 CASAVA_Build 18 62079965 4I AAAAAAACCC ----/CAGA CAGATAATTG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 CAGA 1 2 153267 CASAVA_Build 18 62103739 1D ATGAAAAAAA C/- GTAACCATTA 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 C 1 0 153268 CASAVA_Build 18 62109603 1D AAATATAATT A/- AAAAAAAAAA 2877 het 2621 hom 26 10 10 6 A 13 12 153269 CASAVA_Build 18 62111844 1D AGAAGAGAGT G/- GGGGGCCAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 G 6 5 153270 CASAVA_Build 18 62115895 1D ACTGAGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1055 het 1055 ref 39 30 3 6 A 12 11 153271 CASAVA_Build 18 62122367 4I ATAAAGAGTA ----/TAAC TAGGAAAAAA 3070 hom 105 het 39 0 35 5 TAAC 0 1 153272 CASAVA_Build 18 62123864 3D AAAATAACTG ACA/--- ACATGCTGTG 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 ACA 2 1 153273 CASAVA_Build 18 62125549 2I ATATGTATTT --/TA TATATATATA 2445 het 2445 ref 16 7 5 4 TA 6 7 153274 CASAVA_Build 18 62129500 1I ATTTTGGGTA -/C AGTAGCACTC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 C 0 1 153275 CASAVA_Build 18 62139256 1I TGCTAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 1769 het 1769 ref 34 19 6 9 A 11 12 153276 CASAVA_Build 18 62157946 37D AATCCTAATT TGTTAAGTGTTTAACATAAAACACTTAACAAATTTTA/------------------------------------- TGTTAAGTGT 2837 het 2837 ref 36 17 11 13 TGTTAAGTGTTTAACATAAAACACTTAACAAATTTTA 1 0 153277 CASAVA_Build 18 62159803 4D TAAATATGTC AAAT/---- AAATAAGAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 AAAT 2 1 153278 CASAVA_Build 18 62163965 4D TAATATTTAG TTCT/---- TTATTTAGTG 3070 het 3070 hom 33 13 19 4 TTCT 1 0 153279 CASAVA_Build 18 62181584 1D AGGCTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1390 hom 23 7 12 4 A 12 11 153280 CASAVA_Build 18 62196385 1D TTTCTTTCTT A/- AACTTTCAGA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 3 2 153281 CASAVA_Build 18 62196814 1D AATTTTATAC A/- AAAATAAGCT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 A 5 4 153282 CASAVA_Build 18 62238768 2I GGATTGGGAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 TG 5 6 153283 CASAVA_Build 18 62242684 1D AAAGGATTAA T/- ATCAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 1 0 153284 CASAVA_Build 18 62243671 1D AATAAATATT G/- GGGTTGGCAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 4 3 153285 CASAVA_Build 18 62246126 4I TTTGAGTAAA ----/AATT AATTAATTTA 3070 het 2668 hom 26 7 12 7 AATT 2 3 153286 CASAVA_Build 18 62247647 4D TTATAAATGA ATTT/---- ATTTAATTAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 5 ATTT 2 1 153287 CASAVA_Build 18 62253416 2D GTAATGGGAG AT/-- ATATATATAT 2070 hom 18 het 8 0 7 1 AT 7 6 153288 CASAVA_Build 18 62253790 12D GCCTCTCCTT TTCACATTTTTC/------------ TACCTGCTTT 3070 het 3070 ref 28 15 14 6 TTCACATTTTTC 1 0 153289 CASAVA_Build 18 62263678 1D TACTAAAAAT C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 58 het 23 0 20 3 C 8 7 153290 CASAVA_Build 18 62265911 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 404 het 404 ref 17 8 2 7 T 1 0 153291 CASAVA_Build 18 62274000 1D TCTGTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3057 hom 32 13 13 6 T 16 15 153292 CASAVA_Build 18 62276544 1I TAGAGTATAT -/A AAAATTTTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 4 5 153293 CASAVA_Build 18 62281955 1I TTAATGAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 8 9 153294 CASAVA_Build 18 62284418 4I TAAAAGATCA ----/AAAC AAACAGACAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAAC 1 2 153295 CASAVA_Build 18 62294007 4D AAATAGCAAA CTAT/---- CTATTTCACA 3070 het 3070 ref 40 20 19 3 CTAT 2 1 153296 CASAVA_Build 18 62305295 1D TAACCAAGCT A/- AGTTAAAGCA 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 A 2 1 153297 CASAVA_Build 18 62309500 2I TTTTCTATCC --/AA AATATACAAA 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 2 4 153298 CASAVA_Build 18 62317704 4I CAACAAAAAG ----/TTAA TTAAAGTGAA 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 TTAA 1 2 153299 CASAVA_Build 18 62323853 1D AAATCTGTTT C/- TTCTCAAATA 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 C 1 0 153300 CASAVA_Build 18 62325503 1I AATGGTAGGT -/G GTAAATGAGG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 G 1 2 153301 CASAVA_Build 18 62326971 8I ATGTGTACAT --------/ACACACTC ACATACTCAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ACACACTC 0 1 153302 CASAVA_Build 18 62329416 2I CTAATATGAC --/TG TAACTAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TG 0 1 153303 CASAVA_Build 18 62336065 1D AAACATTACT A/- AAATTAACAT 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 A 4 3 153304 CASAVA_Build 18 62339301 1D GCTGAAATTT C/- TATACACACA 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 C 1 0 153305 CASAVA_Build 18 62347784 4D TAAAAGCATG TAAT/---- TAATATAAAT 3070 het 1061 hom 14 3 9 2 TAAT 2 1 153306 CASAVA_Build 18 62348871 1I AAATTGATAT -/A AAAAAAGACA 2922 het 2922 ref 19 11 6 2 A 6 7 153307 CASAVA_Build 18 62350496 1I TCTTTTTCAT -/A AAAAAAAAAA 2886 het 2886 ref 39 22 7 10 A 10 11 153308 CASAVA_Build 18 62351843 4I CACCTTAAAA ----/TAGT TAGTAGTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 TAGT 1 2 153309 CASAVA_Build 18 62364166 1I TGCTGGGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 10 11 153310 CASAVA_Build 18 62366600 1D CCAGAGGTGG T/- TATGTAAAGC 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 2 1 153311 CASAVA_Build 18 62366709 6I AAAGTATACA ------/AAGAAG AAGAAAAGGC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 AAG 1 3 153312 CASAVA_Build 18 62373608 1D TCTCATCGTA G/- CCCAATTTTA 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 G 1 0 153313 CASAVA_Build 18 62377895 2I TAATATATGA --/AT ATATATATAT 2610 het 2610 ref 21 14 7 0 AT 5 6 153314 CASAVA_Build 18 62384498 1D TGACCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1618 het 1618 ref 36 18 7 11 T 17 16 153315 CASAVA_Build 18 62391849 1I TGAAAAAGAT -/A TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 A 0 1 153316 CASAVA_Build 18 62399429 1D TATTTTCAAA G/- TTGTAAATAT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 G 1 0 153317 CASAVA_Build 18 62407925 2I ATTTTATAAA --/AC ACACAATCCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AC 2 3 153318 CASAVA_Build 18 62408194 4I CTATTATTAT ----/TTTA TTTGTTAGAC 3070 het 3070 hom 39 9 20 10 TTTA 0 1 153319 CASAVA_Build 18 62408744 2D GTATATCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 29 0 16 14 A 13 11 153320 CASAVA_Build 18 62420038 2I GAGAGTGGGT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 A 9 11 153321 CASAVA_Build 18 62421726 1D TCTGTATATA T/- TTTTTCTCAT 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 6 5 153322 CASAVA_Build 18 62430471 1D GCAGAGAAAA T/- TCAGGCAGAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 2 1 153323 CASAVA_Build 18 62432941 2I AGAGAGAAAT --/AA AAAGAACTGT 3070 het 920 hom 35 5 18 12 A 3 5 153324 CASAVA_Build 18 62435768 1I TTACAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 9 10 153325 CASAVA_Build 18 62438559 1D TTATTCTTCA T/- TTTTTAAGAT 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 T 6 5 153326 CASAVA_Build 18 62439188 1D TATTTCATGA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 8 7 153327 CASAVA_Build 18 62441070 4D CCTCTATAAT TTTA/---- TTTTAGTCTT 3070 het 3070 hom 39 18 21 2 TTTA 1 0 153328 CASAVA_Build 18 62441238 1I ATTCCGCACA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 6 7 153329 CASAVA_Build 18 62450769 1I AGAAGTAGGA -/T TTTTTTTTTT 1830 het 1830 ref 46 24 6 16 T 13 14 153330 CASAVA_Build 18 62453589 3D TTCATAATTC ACA/--- ACATTTTCAT 3070 het 3070 hom 46 18 22 8 ACA 2 1 153331 CASAVA_Build 18 62480887 4I AAGTACAAAC ----/TAAT TGTGATAAGT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 TAAT 0 1 153332 CASAVA_Build 18 62483072 1I ACAGCTGAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 8 9 153333 CASAVA_Build 18 62494528 2D ATATATACAC AT/-- ATATATGTGT 3070 het 3070 hom 34 17 15 3 AT 4 3 153334 CASAVA_Build 18 62496962 1I AGTATTATGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 A 9 10 153335 CASAVA_Build 18 62500904 1D GTAGTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 32 1 16 15 A 11 10 153336 CASAVA_Build 18 62501092 1D TTTCTGCCTT C/- CCCCCATCAA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 C 6 5 153337 CASAVA_Build 18 62509467 8D TAGTATTCTC GACTTATG/-------- GAAATATGGC 3070 het 3070 ref 37 28 9 5 GACTTATG 1 0 153338 CASAVA_Build 18 62513135 1D TTTATAGCAA T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 T 7 6 153339 CASAVA_Build 18 62514640 4D GCCTCAAAAA TAAT/---- TAAAGAAAAC 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 TAAT 1 0 153340 CASAVA_Build 18 62551942 1D GCTCAGCTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 41 het 17 0 14 4 T 9 8 153341 CASAVA_Build 18 62552629 2I31M2I AGTGTGTGTA --TGTGTGTGTGTGTGTGTAGGGTAGTGGTGAC--/TGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGGTAGTGGTGACTT TGTAACATTT 3070 hom 65 het 42 0 30 22 N/A 0 0 153342 CASAVA_Build 18 62554282 3D62M4D TCTCTCTCTC TCTTTTCTTTCTTTCTCTTTTTCTCTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTCTTTTTCTTTCTTTTGTTCTCTT/---TTTCTTTCTTTCTCTTTTTCTCTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTTCTTTTTCTTTCTTTTGTTC---- TCTTTTTTCC 3070 hom 116 het 26 0 39 9 N/A 0 0 153343 CASAVA_Build 18 62566399 1D CATCAACAGG T/- TTTTTTTTTT 1338 het 1338 ref 42 33 4 7 T 12 11 153344 CASAVA_Build 18 62578994 3D ATTCATATAT TTA/--- TTAATATATA 2935 hom 15 het 6 0 6 1 TTA 2 1 153345 CASAVA_Build 18 62580272 2D TGGAATAAAG AT/-- ATAAGGAAAG 3070 hom 45 het 17 0 16 2 AT 2 1 153346 CASAVA_Build 18 62607070 6I ATCAGGTATT ------/CAAGAC CAGCCTGGTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CAAGAC 0 1 153347 CASAVA_Build 18 62609458 3D TTGGGCTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 75 het 35 0 24 11 TTG 7 6 153348 CASAVA_Build 18 62612389 4I TATTTTTGTG ----/TAAC TTTCTTAATT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 TAAC 0 1 153349 CASAVA_Build 18 62624606 2D ACATTATCTC AT/-- AGTTATTATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 1 0 153350 CASAVA_Build 18 62627641 1I TTATGACCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 31 1 27 3 A 11 12 153351 CASAVA_Build 18 62628941 10D23M7I CCTTAGTTTC AGTACTCACAAGTACTCACAAGTGCTCAAAATA-------/----------AGTACTCACAAGTGCTCAAAATAGTGTATG GCTAGCGGCT 3070 hom 81 het 27 0 28 8 N/A 0 0 153352 CASAVA_Build 18 62633602 1D TTACAGATTT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 8 7 153353 CASAVA_Build 18 62637010 1I CCACAAACAT -/A AATTTTTCTA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 2 3 153354 CASAVA_Build 18 62639462 1I CAACTTTTCA -/T TTCATTGATC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 3 153355 CASAVA_Build 18 62640893 2D TTGACAGGTT CA/-- TATTTACTCT 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 CA 1 0 153356 CASAVA_Build 18 62644580 8D AGAAGCCTTT ATAACAAA/-------- TGTGTTCACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATAACAAA 1 0 153357 CASAVA_Build 18 62646214 2D CACAACTAGT CA/-- CAGTTTACTC 3070 hom 114 het 43 0 39 5 CA 2 1 153358 CASAVA_Build 18 62653908 1I TTAAATACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1175 hom 32 3 24 5 A 12 13 153359 CASAVA_Build 18 62658494 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 29 2 13 14 A 13 14 153360 CASAVA_Build 18 62664198 2D TTTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 15 13 153361 CASAVA_Build 18 62674616 1D CAGGATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 107 het 57 1 42 15 A 13 12 153362 CASAVA_Build 18 62675367 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 15 2 11 2 A 15 14 153363 CASAVA_Build 18 62680346 2I TACAAAAAAA --/AT AAAACAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 0 1 153364 CASAVA_Build 18 62680531 3D AGTTAAAAAC TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 TAT 6 5 153365 CASAVA_Build 18 62681816 1D ATCATTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 593 hom 45 3 27 15 A 17 16 153366 CASAVA_Build 18 62693491 1D AAGCTTCGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 32 1 23 8 T 13 12 153367 CASAVA_Build 18 62710211 1D TAAACAAAGG A/- AAAAAATAGG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 6 153368 CASAVA_Build 18 62727332 1I TCTCTGTATG -/T TAAAGTTGAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 2 153369 CASAVA_Build 18 62727439 4D TAGAAAGTTA TTTG/---- TTTGCATCAT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TTTG 2 1 153370 CASAVA_Build 18 62743872 1I TCACCCATCG -/C CTGGCACTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 1 2 153371 CASAVA_Build 18 62750869 1I TTCTGGATAT -/A AAAAAAAAAA 1287 het 1287 ref 39 30 4 5 A 11 12 153372 CASAVA_Build 18 62753553 1I AATTGCCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 11 12 153373 CASAVA_Build 18 62760752 2D CGGATGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 127 het 58 0 41 17 TG 9 8 153374 CASAVA_Build 18 62764194 1D GGAAAACCTA T/- TATGCATTAT 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 T 2 1 153375 CASAVA_Build 18 62769464 1D AGACTGTGGT A/- AAAAAAAAAA 1124 het 1124 ref 28 16 4 8 A 15 14 153376 CASAVA_Build 18 62774649 1I AACTTTCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 10 11 153377 CASAVA_Build 18 62788943 1I AATGGGGTTG -/T TTTGTTTCTT 3070 hom 97 het 43 0 37 6 T 3 4 153378 CASAVA_Build 18 62793137 1I ATGTTGAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 10 153379 CASAVA_Build 18 62814886 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2142 het 360 hom 20 5 7 8 A 17 16 153380 CASAVA_Build 18 62816283 2D ATAATGACAC AT/-- GTGTGTGTAT 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 AT 1 0 153381 CASAVA_Build 18 62831222 1I AGACCCTGAA -/G GGCAAGCCCC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 G 2 3 153382 CASAVA_Build 18 62863915 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2971 hom 22 9 10 3 T 11 10 153383 CASAVA_Build 18 62865112 1I AAAAAGAAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 9 10 153384 CASAVA_Build 18 62867347 1I AATTAAAAAA -/G AAAACCTTGT 3070 het 3070 hom 43 11 30 2 G 0 1 153385 CASAVA_Build 18 62871937 1I AAAGAAGAAA -/C CCTTGTGAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 2 3 153386 CASAVA_Build 18 62877816 1D TTATCGGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 32 1 26 5 T 12 11 153387 CASAVA_Build 18 62878809 2I CCCCTGAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 45 1 34 10 A 12 14 153388 CASAVA_Build 18 62879271 2D TAATTTAAAC AG/-- ATCTTAGACC 3070 hom 108 het 39 0 36 5 AG 1 0 153389 CASAVA_Build 18 62882845 4D AGATGGATGA ATAG/---- ATAGATAGGT 2900 het 500 hom 23 7 13 4 ATAG 3 2 153390 CASAVA_Build 18 62883098 1I AAAATTCTTC -/A GATGAATAGA 3070 het 41 hom 40 1 36 3 A 0 1 153391 CASAVA_Build 18 62884912 2D TATTTTGCTT TA/-- TGTTATTTTA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 TA 1 0 153392 CASAVA_Build 18 62885981 3I CAGGTAAAAA ---/AGG AGGAGTAGCC 3070 hom 49 het 23 0 18 5 AGG 1 2 153393 CASAVA_Build 18 62886182 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 33 het 12 0 12 5 T 6 7 153394 CASAVA_Build 18 62888809 1D CTTCTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1203 hom 40 4 27 9 T 16 15 153395 CASAVA_Build 18 62888923 1D TTTGTTTTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 52 het 22 0 18 4 T 9 8 153396 CASAVA_Build 18 62889031 1D TCCAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 11 10 153397 CASAVA_Build 18 62889498 1D TTAATATACG T/- TAAGGAAGTA 3070 hom 129 het 52 0 44 9 T 2 1 153398 CASAVA_Build 18 62890604 10D CTCTTAAAAG ATATTTTAAT/---------- ATATTTTAAT 2871 hom 27 het 11 0 10 2 ATATTTTAAT 2 1 153399 CASAVA_Build 18 62890968 3D GTAAATTCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 13 10 153400 CASAVA_Build 18 62891062 1I TTAGGTTAAC -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 1 2 153401 CASAVA_Build 18 62893105 1D CTTTGATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 11 10 153402 CASAVA_Build 18 62896146 1D CTGAAGTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 9 10 T 11 10 153403 CASAVA_Build 18 62899909 1I TCAGCAGGAC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 48 22 19 7 T 8 9 153404 CASAVA_Build 18 62914426 1D TGAAGTGGTA T/- TTTTTGTTAC 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 T 6 5 153405 CASAVA_Build 18 62915145 2I AGAATTATAC --/AT GTCTTCTTGA 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 AT 0 1 153406 CASAVA_Build 18 62917413 1I CACAGAAAGG -/A GGGGTGTTTG 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 A 0 1 153407 CASAVA_Build 18 62917848 1I AAAGTATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 46 3 26 17 A 11 12 153408 CASAVA_Build 18 62919916 1D AGTGATAGCA C/- CCCCTGAATG 3070 hom 89 het 40 0 29 12 C 5 4 153409 CASAVA_Build 18 62922826 10I TGTTAAGTTA ----------/ATGACTTCTG AGTCTCTTTC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 ATGACTTCTG 0 1 153410 CASAVA_Build 18 62931725 3I TTTTTGGGTT ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 hom 69 het 37 0 27 10 TTC 2 3 153411 CASAVA_Build 18 62940060 4I TCTCAAAAGA ----/AGAC AGACAAGCAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AGAC 1 2 153412 CASAVA_Build 18 62963699 2I TAACAACAGA --/CT CTCTCGCTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CT 2 3 153413 CASAVA_Build 18 62968135 4D AAAAATAAAC CAGT/---- CAATCTTTAT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 CAGT 1 0 153414 CASAVA_Build 18 62969049 1D TTGTTCAGGA T/- TTTTTGAGTT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 T 6 5 153415 CASAVA_Build 18 62983672 4D ATATAAACAC AAAT/---- AAAGCTCCCA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AAAT 1 0 153416 CASAVA_Build 18 62987070 1I CTGGTGTGGG -/A AAGGGCAGCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 2 3 153417 CASAVA_Build 18 62998974 1I TAACACTTTA -/G TTTTTTAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 153418 CASAVA_Build 18 63002121 4I ATGAAAACGG ----/AGAA AGAGAGTAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AGAA 0 1 153419 CASAVA_Build 18 63013685 4D GAAATACCCT CTAA/---- CTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 CTAA 1 0 153420 CASAVA_Build 18 63016969 1I TATACAAGAG -/A ATTAGTAGAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 1 2 153421 CASAVA_Build 18 63018154 2I TGTTTTCTGC --/CT CTCTGTGTGT 3070 het 131 hom 42 3 29 10 CT 2 3 153422 CASAVA_Build 18 63025951 5D TATGTTAGAA CTTTC/----- CTTTCACTCC 3070 hom 84 het 35 0 29 8 CTTTC 2 1 153423 CASAVA_Build 18 63028762 4I TACAGGCCAC ----/AAAT AGTGTGCTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAAT 0 1 153424 CASAVA_Build 18 63037191 14I GTGTTTAAGT --------------/GTTATTACAAAAGA GTCAAAAGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 GTTATTACAAAAGA 0 1 153425 CASAVA_Build 18 63039534 2D TGTGCAAGAA GT/-- GTGTGTGTCT 3070 hom 105 het 43 0 35 9 GT 5 4 153426 CASAVA_Build 18 63039739 1D GAATATCTTC T/- GTCCTGGTCT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 1 0 153427 CASAVA_Build 18 63063305 2D TACTTGTAAA AT/-- ATATCTTAAT 3070 hom 84 het 29 0 27 2 AT 3 2 153428 CASAVA_Build 18 63064570 4D TAGAAGTTTC TTGT/---- TTATTATGTT 3070 hom 84 het 32 0 29 6 TTGT 1 0 153429 CASAVA_Build 18 63064803 1D TGTAAGAGAG A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 8 7 153430 CASAVA_Build 18 63067612 1I TGTCTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 153431 CASAVA_Build 18 63069816 1D TCACCCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 196 hom 27 1 23 3 T 12 11 153432 CASAVA_Build 18 63093315 2D AAAAATAAAA AC/-- AAACGTGTGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AC 1 0 153433 CASAVA_Build 18 63094060 1D AACAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 17 4 A 13 12 153434 CASAVA_Build 18 63094899 1D AATTTGCAGC A/- AAAAAACATT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 6 153435 CASAVA_Build 18 63103078 1I TCCAAAGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 71 het 29 0 25 4 T 9 10 153436 CASAVA_Build 18 63106521 1D AAGCAATCTG A/- AAAAAACACA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 7 6 153437 CASAVA_Build 18 63107174 3D CTAAAGAAAG AGA/--- AGAAGGAAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 5 AGA 2 1 153438 CASAVA_Build 18 63107374 1I AGAAAGATAT -/A AAAAATATTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 5 6 153439 CASAVA_Build 18 63108790 1D GACTGATTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 10 9 153440 CASAVA_Build 18 63109702 3I TTCTACCCTA ---/CTT CTACTTTAAG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 CTT 0 1 153441 CASAVA_Build 18 63110402 9D TCATAATCAT GCCAAGAGC/--------- AATGCTAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GCCAAGAGC 1 0 153442 CASAVA_Build 18 63112683 4D TTTCTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 69 het 29 0 22 8 TTTC 4 3 153443 CASAVA_Build 18 63121707 1D TCAGCAAAAT A/- AAAAAATATA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 7 6 153444 CASAVA_Build 18 63123375 1D TGAGTATTTT A/- AATAAACTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 3 2 153445 CASAVA_Build 18 63128672 7I GGGGTTACTG -------/ATTGATA GATATAGTGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATTGATA 0 1 153446 CASAVA_Build 18 63130510 1D ATTATTGTAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 7 153447 CASAVA_Build 18 63133216 2D AACTCCGTCT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 33 0 29 6 A 10 8 153448 CASAVA_Build 18 63136167 1D TAATATGTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 7 153449 CASAVA_Build 18 63138328 1D CCTGCTATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 874 hom 41 3 29 9 A 13 12 153450 CASAVA_Build 18 63142695 1D TATGTTTAGT A/- GGCTATTAGT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 1 0 153451 CASAVA_Build 18 63143045 1I TAAATGTTGA -/T ATTTTTTCCT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 0 1 153452 CASAVA_Build 18 63145248 1D TACAACAACA C/- ATACATCCAA 3070 hom 184 het 68 0 62 8 C 1 0 153453 CASAVA_Build 18 63151903 1I CACTTGTAGT -/C CCAGCTACTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 2 3 153454 CASAVA_Build 18 63156240 1D CTCCTTGTCC T/- TTCTTTCTTT 2690 het 46 hom 33 1 16 16 T 3 2 153455 CASAVA_Build 18 63158066 1D CTCATAATAT G/- TTATATACCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 1 0 153456 CASAVA_Build 18 63163806 3D CCCGTCAGAT CAG/--- CAGCAGCATT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 CAG 3 2 153457 CASAVA_Build 18 63164836 6D GTGGTGACAG GCAGAT/------ GCACAGGTGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 GCAGAT 1 0 153458 CASAVA_Build 18 63166852 2I TGACACATAT --/TC TTTCTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TC 0 1 153459 CASAVA_Build 18 63167099 1D GTCACCAATG T/- TTAAAATAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 3 2 153460 CASAVA_Build 18 63174064 1D TTGAAAAAAA T/- ATTAACCATT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 1 0 153461 CASAVA_Build 18 63177991 1I CATTTCCCCT -/G CTTGCATTCT 3070 hom 101 het 40 0 32 8 G 0 1 153462 CASAVA_Build 18 63179857 4D ATATTATCTC TCTT/---- TCATGAGTAT 3070 het 3070 ref 23 13 9 4 TCTT 1 0 153463 CASAVA_Build 18 63191348 6D ATAAATGGAG TCATTA/------ TCATTATTTT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 TCATTA 2 1 153464 CASAVA_Build 18 63196535 1I TCTCTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1946 hom 36 5 23 8 T 11 12 153465 CASAVA_Build 18 63203051 1I GCAAAATAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 797 hom 34 2 25 7 A 9 10 153466 CASAVA_Build 18 63204599 1I CAAAACTTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 7 8 153467 CASAVA_Build 18 63205926 1I TAACATACTC -/A ACATATCCTC 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 A 1 2 153468 CASAVA_Build 18 63209297 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 T 9 8 153469 CASAVA_Build 18 63211326 1I GCCTGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 11 12 153470 CASAVA_Build 18 63223980 1I TTCCTTAATC -/T TTCTCTTTCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 153471 CASAVA_Build 18 63237490 1D AAAATCTTGA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 8 7 153472 CASAVA_Build 18 63239533 1D ATTGTTTTTC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 9 8 153473 CASAVA_Build 18 63240713 2D CAGAAAGTAC AA/-- AGAGTTCCCA 3070 het 3070 hom 47 18 25 5 A 3 1 153474 CASAVA_Build 18 63266813 1D TTTTGAAGGG T/- TTTTTTGTGT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 7 6 153475 CASAVA_Build 18 63274893 1D ATTTTCAAAC T/- TTTATATCAT 3070 het 3070 ref 38 22 16 0 T 4 3 153476 CASAVA_Build 18 63292005 1D AAGAGTCTGT C/- TATCATGATT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 C 1 0 153477 CASAVA_Build 18 63296204 1I TTTAATTGTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 166 hom 30 1 27 2 A 9 10 153478 CASAVA_Build 18 63307519 1D GAGAAAACTC T/- TAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 2 1 153479 CASAVA_Build 18 63314565 1D AATGGGAATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 9 8 153480 CASAVA_Build 18 63316967 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAACAT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 8 7 153481 CASAVA_Build 18 63317820 2I AAAAATCAAG --/AA AACATAAGCC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 2 4 153482 CASAVA_Build 18 63329084 2I TACACGCGTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 CA 8 9 153483 CASAVA_Build 18 63338702 1I ATGACAGGGA -/T TTTTGCCTGC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 4 5 153484 CASAVA_Build 18 63348159 2D TTTTAATCCC CT/-- GTCTCATTAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 CT 1 0 153485 CASAVA_Build 18 63353487 1D CCTCATGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2217 hom 31 8 13 10 A 15 14 153486 CASAVA_Build 18 63355730 1I AAAAAGGAAG -/A AGACACTGGC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 2 153487 CASAVA_Build 18 63356792 1D AAAATATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 38 3 20 15 A 16 15 153488 CASAVA_Build 18 63364380 1I GTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 40 2 27 11 T 11 12 153489 CASAVA_Build 18 63366211 1D TGTAAAATCT A/- AAATAGTCAA 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 A 4 3 153490 CASAVA_Build 18 63367052 4D AAGTAGGTAA CTAT/---- CTATTCTGTA 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 CTAT 2 1 153491 CASAVA_Build 18 63370704 1I TAATTCTGTA -/T TTTTTTTTAA 2328 het 2328 ref 22 10 7 5 T 8 9 153492 CASAVA_Build 18 63382107 1I AAATGATAAT -/A AAAAATAGTA 3070 hom 97 het 35 0 33 2 A 5 6 153493 CASAVA_Build 18 63385585 1D CTTCCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 11 10 153494 CASAVA_Build 18 63390360 2I ATAAAACGCA --/AT ATTTCTCCAT 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 AT 1 2 153495 CASAVA_Build 18 63398402 1D ACCTGTGCTG C/- CCTTGGGCCT 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 C 3 2 153496 CASAVA_Build 18 63399420 2D TATAAATGAT TA/-- TATATATATG 1307 het 1307 ref 9 4 4 2 TA 5 4 153497 CASAVA_Build 18 63401596 1I GCCTTACTTG -/A AATCTTAGCC 3070 het 3070 hom 58 23 29 6 A 2 3 153498 CASAVA_Build 18 63407609 3D ATTGTACTTG TCA/--- TCATGTCATA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 TCA 2 1 153499 CASAVA_Build 18 63413035 1D GATTTCATTC T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 47 24 15 9 T 7 6 153500 CASAVA_Build 18 63417594 1D ATCTTCAGTA G/- CTGTTGGTTC 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 G 1 0 153501 CASAVA_Build 18 63419216 1D AAATGAGCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 53 16 26 12 T 10 9 153502 CASAVA_Build 18 63420435 1I ATTACTAGCA -/T TTTTTTGGCA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 6 7 153503 CASAVA_Build 18 63429058 1D CATTATGTAG A/- AATTCTAAGG 3070 het 3070 hom 44 15 24 6 A 3 2 153504 CASAVA_Build 18 63439820 1D TTGAGTAATC A/- AAAAAAAAAA 1211 het 1211 ref 39 26 4 9 A 15 14 153505 CASAVA_Build 18 63453125 1I CAATTTCATG -/T CTAGCTTACT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 0 1 153506 CASAVA_Build 18 63456209 1D TGCAACCTCC A/- CCTCCCGGGT 1266 het 1266 ref 11 5 4 2 A 1 0 153507 CASAVA_Build 18 63462829 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 35 2 26 7 A 15 14 153508 CASAVA_Build 18 63467461 1I TAAACATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2437 hom 19 7 9 3 T 10 11 153509 CASAVA_Build 18 63473212 1D GAAATCTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 34 1 23 10 A 13 12 153510 CASAVA_Build 18 63477069 14D CTGTATGGAA TCTTTGAGGCTTCT/-------------- TATTTGTTGA 3070 het 3070 ref 38 20 15 10 TCTTTGAGGCTTCT 1 0 153511 CASAVA_Build 18 63479410 1I AATACTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 12 17 15 A 10 11 153512 CASAVA_Build 18 63482237 1D TATGAACATG C/- CCAGTGCACT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 C 3 2 153513 CASAVA_Build 18 63485194 25D AGAGTACATG TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------------- TTTTTTTTTT 1912 het 859 hom 19 4 5 10 T 39 14 153514 CASAVA_Build 18 63489213 1I GGATCATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 8 9 153515 CASAVA_Build 18 63496833 1I CTGTACAGAA -/T TTTTTTTTTT 2221 hom 37 het 32 0 12 20 T 13 14 153516 CASAVA_Build 18 63499256 1D AATAATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 5 A 12 11 153517 CASAVA_Build 18 63500689 1D AAACTCATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 12 11 153518 CASAVA_Build 18 63513589 6I CTTTGTCGTT ------/TGGACA CACCTTTGGT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 TGGACA 0 1 153519 CASAVA_Build 18 63514601 1D TTTTTAGTAG A/- GACAGGGTTT 2433 het 1732 hom 9 4 5 0 A 1 0 153520 CASAVA_Build 18 63516422 1D ATTTTATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1295 hom 24 8 9 7 T 15 14 153521 CASAVA_Build 18 63522165 1I CGAATTCCTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 8 9 153522 CASAVA_Build 18 63530675 2I ATTATGAAAC --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 9 11 153523 CASAVA_Build 18 63532925 4I GCATAAAGGG ----/ATAA ATAGAGATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ATAA 0 1 153524 CASAVA_Build 18 63533140 1I TTTTACTTTT -/C TTTTTGTATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 0 1 153525 CASAVA_Build 18 63533686 1I AGAAAACTTA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 6 7 153526 CASAVA_Build 18 63533880 3D TAATCCATGC ATT/--- ATTATTAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 ATT 3 2 153527 CASAVA_Build 18 63534557 1I AATTAACTTG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 7 8 153528 CASAVA_Build 18 63535963 1I AAGTTGGAAG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 7 8 153529 CASAVA_Build 18 63565125 1I GCCATACTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 9 10 153530 CASAVA_Build 18 63580621 1D TACTGCCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 37 1 19 17 A 15 14 153531 CASAVA_Build 18 63582996 9D GTAAAGACTG CCTAATATT/--------- CCTAATATTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 8 CCTAATATT 2 1 153532 CASAVA_Build 18 63586670 1D GGAATTGTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 T 9 8 153533 CASAVA_Build 18 63590022 4D ATTGTCTGGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 TTTG 4 3 153534 CASAVA_Build 18 63591042 1I GCATATACCC -/T AGGTAATAGC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 0 1 153535 CASAVA_Build 18 63607809 5I TTTTCTTTCT -----/ATTTC TTTTTTTTTT 3070 het 3006 hom 34 13 16 5 ATTTC 0 1 153536 CASAVA_Build 18 63611916 1D AAGACATTTC T/- TCCAAATATC 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 2 1 153537 CASAVA_Build 18 63613369 1I AGTTCTTTAG -/A ACCTAGAGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 1 2 153538 CASAVA_Build 18 63613543 1D TTTAGAGCAA G/- TATTAAGGAC 3070 het 3070 ref 44 30 13 1 G 1 0 153539 CASAVA_Build 18 63618412 1I GAAAGAACAA -/G ATCCAAGTGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 G 0 1 153540 CASAVA_Build 18 63623985 1D CTTATAGACC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 9 8 153541 CASAVA_Build 18 63625518 1D ACAACAACAA C/- AAAAAACAGC 3070 hom 75 het 35 0 26 10 C 1 0 153542 CASAVA_Build 18 63626481 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1036 het 1036 ref 19 10 6 3 A 12 13 153543 CASAVA_Build 18 63631639 3D TCAGTGGAAA TGT/--- TATGCGGGAT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 TGT 1 0 153544 CASAVA_Build 18 63631717 1D TTCCCTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 20 6 T 12 11 153545 CASAVA_Build 18 63636096 4D ACCTGCAATG ACTA/---- ACTAATTCAC 3070 hom 123 het 46 0 42 6 ACTA 2 1 153546 CASAVA_Build 18 63636642 1D TTTTCTATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 10 9 153547 CASAVA_Build 18 63637965 2I AATATTTTAT --/AA GAGCCATTAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 0 2 153548 CASAVA_Build 18 63638458 3I TCCATTACAC ---/TTT TTTTTCTCAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 5 8 153549 CASAVA_Build 18 63655231 3D ACACTGTCTT CTC/--- CTCAATGTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 3 CTC 2 1 153550 CASAVA_Build 18 63658931 1D GAATTCCTCG T/- ATGTATAGTT 3070 hom 160 het 60 0 54 6 T 1 0 153551 CASAVA_Build 18 63662358 3D ATTGTTTATA ATT/--- GTTTCTACCA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 ATT 1 0 153552 CASAVA_Build 18 63664392 9I CAAAGACTCT ---------/TGGGAAAGG TGTGAGTTGA 3070 hom 141 het 54 0 44 10 TGGGAAAGG 0 1 153553 CASAVA_Build 18 63667377 9I TTTGACACTT ---------/GATCAAATG GATCAAATGG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 GATCAAATG 1 2 153554 CASAVA_Build 18 63669674 1I TCATAGACAT -/A AGATTGAAAT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 A 1 2 153555 CASAVA_Build 18 63677483 1D CAGTGTGGAA T/- TGTGAGCCGT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 T 2 1 153556 CASAVA_Build 18 63680799 1D AGTTTACTAT A/- TAGGTTGTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 0 153557 CASAVA_Build 18 63682583 1I TCACGCCTGT -/A AATCCCAGCA 3070 hom 27 het 10 0 10 1 A 2 3 153558 CASAVA_Build 18 63689365 2I CATATTTAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 447 hom 27 1 19 7 AT 5 6 153559 CASAVA_Build 18 63706516 1D GAGGATCAGG A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 A 7 6 153560 CASAVA_Build 18 63706641 2D AGTGACAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 13 12 T 16 14 153561 CASAVA_Build 18 63709028 12D CAAGAACAAC AGTTGTGGGTAG/------------ AAGAAGCAAG 1764 het 701 hom 29 6 9 18 AGTTGTGGGTAG 1 0 153562 CASAVA_Build 18 63727130 1D AATATAAATG A/- AAAAAAAAAG 1270 het 1270 ref 36 28 3 7 A 10 9 153563 CASAVA_Build 18 63728534 1D TATTGTTTTC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 7 6 153564 CASAVA_Build 18 63734902 1D TACTATTATT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 8 153565 CASAVA_Build 18 63735076 1D TTTTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 36 1 19 16 T 15 14 153566 CASAVA_Build 18 63735091 1D TTTTTTTTTT C/- TCACAGTTCT 3070 het 297 hom 30 3 20 7 C 1 0 153567 CASAVA_Build 18 63736318 2D CCATTCAATC AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 10 8 153568 CASAVA_Build 18 63737032 1D TTTGGCAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 205 hom 47 1 39 8 A 10 9 153569 CASAVA_Build 18 63739896 1D17M2I TGTATATATG TATATATGTATATATGTG--/-ATATATGTATATATGTGTA TATATATATG 3070 hom 48 het 17 0 17 5 N/A 0 0 153570 CASAVA_Build 18 63740376 1I CTTCACTATA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 392 hom 33 1 25 7 T 8 9 153571 CASAVA_Build 18 63740919 5I GATAAATAGG -----/TTATT TTAATTATGG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TTATT 0 1 153572 CASAVA_Build 18 63741467 4D TACAAATGCT AAGA/---- AAGACTGATT 3070 hom 90 het 32 0 30 5 AAGA 2 1 153573 CASAVA_Build 18 63744671 1D CATGCCTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 A 10 9 153574 CASAVA_Build 18 63745918 1I GAAAGGGGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 9 10 153575 CASAVA_Build 18 63747482 1I AAAACAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 35 1 29 5 A 10 11 153576 CASAVA_Build 18 63748128 4I TGATTTCTTC ----/TTCT TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTCT 0 1 153577 CASAVA_Build 18 63749668 1D TCCGCCTCCC A/- GGTTTCACGC 2775 het 153 hom 7 1 6 1 A 1 0 153578 CASAVA_Build 18 63750854 1D GAATCGAGAT C/- TTTTTTGTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 C 1 0 153579 CASAVA_Build 18 63753527 1D AAATTAATAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 T 9 8 153580 CASAVA_Build 18 63758257 1I ATCTTTAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 9 10 153581 CASAVA_Build 18 63760683 4D CAATGGTAAT GATG/---- GATGCATAAT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 GATG 2 1 153582 CASAVA_Build 18 63761769 1I ATGAAGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 23 1 17 5 A 10 11 153583 CASAVA_Build 18 63762644 2D ATCAGATAAC TG/-- TGCCAGATGT 3070 hom 102 het 41 0 35 9 TG 2 1 153584 CASAVA_Build 18 63763677 9I CAATGCTGTT ---------/AGATATAGC ATTTTACCCA 3070 hom 151 het 50 0 51 2 AGATATAGC 0 1 153585 CASAVA_Build 18 63763739 1D AAAATTGGAG T/- TAATCCTCTC 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 T 2 1 153586 CASAVA_Build 18 63765533 4D TGACAGAGGT AATC/---- AGTCAACTTA 3070 hom 66 het 26 0 21 6 AATC 1 0 153587 CASAVA_Build 18 63767416 1I ATTTTGTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 9 10 153588 CASAVA_Build 18 63771073 1D GAGCTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 121 het 48 0 39 9 A 13 12 153589 CASAVA_Build 18 63772489 5I CCTGGACACT -----/TGGAA TATAAGGGCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TGGAA 0 1 153590 CASAVA_Build 18 63775052 1D AAGACCAGGG T/- TGACGACTAG 3070 het 3070 hom 52 22 24 7 T 2 1 153591 CASAVA_Build 18 63775554 1D ATGGCTGACT G/- TCCCTCTACA 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 G 1 0 153592 CASAVA_Build 18 63778338 3D AAAAAAAATA AAT/--- AATAATAAAA 345 het 130 hom 7 1 4 2 AAT 3 2 153593 CASAVA_Build 18 63780459 2I TAAAATTGCG --/TC TAAGATTCAA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 TC 0 1 153594 CASAVA_Build 18 63785384 5D AAAGGATAAA TAAAT/----- TAAAGCCAAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 3 TAAAT 1 0 153595 CASAVA_Build 18 63793229 8D TTTTTGTTTG TTTGTTTT/-------- TTTTTTTTTG 3070 het 1937 hom 34 12 15 9 TTTGTTTT 1 0 153596 CASAVA_Build 18 63793654 1I AAAGTATATA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 7 8 153597 CASAVA_Build 18 63800294 1I TGTAAGGTAT -/A TTAAATAGGC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 0 1 153598 CASAVA_Build 18 63804851 1D AAAAATAAGT A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 7 6 153599 CASAVA_Build 18 63810548 1I GATTTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 10 11 153600 CASAVA_Build 18 63828726 1I AACCATTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 34 1 20 13 T 13 14 153601 CASAVA_Build 18 63829884 1D AATGTCCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 146 hom 35 1 28 6 T 12 11 153602 CASAVA_Build 18 63830673 1D AGGTTAGAGC T/- TTTTTTTTTT 2931 het 2845 hom 22 10 8 4 T 13 12 153603 CASAVA_Build 18 63837889 1D AAGTTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 6 T 11 10 153604 CASAVA_Build 18 63838652 13D GGGGCAGAAT TTGGTAGATCGCA/------------- TTGTTTTTCC 3070 het 3070 ref 47 29 20 3 TTGGTAGATCGCA 1 0 153605 CASAVA_Build 18 63844454 2I CCTACATATC --/TA TTTTGGGGGG 3070 hom 69 het 31 0 24 7 TA 0 1 153606 CASAVA_Build 18 63851458 2D TTTTTTTTTT TG/-- TGAAAAGAAA 3070 het 957 hom 48 7 28 15 TG 2 1 153607 CASAVA_Build 18 63854355 1D TGCCTCAGAG C/- CTATCTTCAG 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 C 2 1 153608 CASAVA_Build 18 63856941 1I ATAAAACATG -/T GTGTTTCATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 0 1 153609 CASAVA_Build 18 63857282 1D TATGCACAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 11 10 153610 CASAVA_Build 18 63857947 1I GTGTTATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 10 11 153611 CASAVA_Build 18 63864819 2I TATTAATTTA --/AT ATATAAATTT 2413 hom 15 het 6 0 6 0 AT 2 3 153612 CASAVA_Build 18 63876703 1I TATTAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 14 11 A 10 11 153613 CASAVA_Build 18 63887952 1I AGAGTAAACG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 7 8 153614 CASAVA_Build 18 63900284 1D ATTTGAGATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 A 9 8 153615 CASAVA_Build 18 63901604 1I TCACAGCCAC -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 50 32 12 6 A 7 8 153616 CASAVA_Build 18 63903199 1D CAGGGAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 A 10 9 153617 CASAVA_Build 18 63903573 1D TTGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 13 12 153618 CASAVA_Build 18 63904094 9D CCACTGTATG CACCTGCTC/--------- CACCTGCTCT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 CACCTGCTC 2 1 153619 CASAVA_Build 18 63905862 1D CTGCACATAC T/- TTTGCATTCA 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 T 4 3 153620 CASAVA_Build 18 63911656 2I TACTGCATTT --/CA GTTACATGGA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 CA 0 1 153621 CASAVA_Build 18 63917470 1D AAAAACCACA T/- TTTTTTTTTA 1958 het 1958 ref 12 5 6 1 T 10 9 153622 CASAVA_Build 18 63917874 2I AAATTAAGTA --/CT CTCTTGAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 CT 2 3 153623 CASAVA_Build 18 63920003 4I TACTAAATTT ----/AAAA CTGATAAAAT 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 A 0 4 153624 CASAVA_Build 18 63921601 5D TTCTTTTTCT TTCTC/----- TTCTTCCTCC 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 TTCTC 1 0 153625 CASAVA_Build 18 63922751 1I GATTGCATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 20 17 4 A 9 10 153626 CASAVA_Build 18 63941869 6D GCCTTTTCAG TGTTTT/------ TGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 5 TGTTTT 3 2 153627 CASAVA_Build 18 63944598 1I TAATGATACA -/T TTTTTGATAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 5 6 153628 CASAVA_Build 18 63944954 4D ACTTGAAATG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 13 9 A 15 11 153629 CASAVA_Build 18 63949320 1I TTTACTCTCC -/T CCATTTATAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 0 1 153630 CASAVA_Build 18 63951576 2I TATTTTCCCC --/CT GTTACCTACT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CT 0 1 153631 CASAVA_Build 18 63958213 1D AGAGGTGTTT G/- TGGTATTCTC 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 G 1 0 153632 CASAVA_Build 18 63958357 1D TAATCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2328 hom 20 7 11 2 A 12 11 153633 CASAVA_Build 18 63959505 4D AGAGGATAAT CAAC/---- CAAATGTGCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 CAAC 1 0 153634 CASAVA_Build 18 63960448 4D GAACAGAGGA TGGT/---- TTAACAGCCA 3070 het 3070 ref 37 21 15 3 TGGT 1 0 153635 CASAVA_Build 18 63961303 5D ATTGTGAGGT TCTTA/----- TCTTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 19 20 5 TCTTA 1 0 153636 CASAVA_Build 18 63964975 1D GGCAAAAGAT A/- AGAGAGTTCA 3070 het 3070 hom 33 12 19 4 A 2 1 153637 CASAVA_Build 18 63967216 1D TGAAGAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 A 13 12 153638 CASAVA_Build 18 63975657 2I CATGTGAGGA --/TC TCTGTTTATT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 TC 1 2 153639 CASAVA_Build 18 63977362 1D TTTGTTAATT A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 7 6 153640 CASAVA_Build 18 63977717 1D GACTGGCAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 7 153641 CASAVA_Build 18 63978296 1D TCAAATCATG A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 A 2 1 153642 CASAVA_Build 18 63980148 2D AAATTATAAC TT/-- TAACATTAAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 3 1 153643 CASAVA_Build 18 63988634 1I CTAAAAAGTT -/C TTTTTTTTTT 2798 het 2644 hom 18 9 8 1 C 0 1 153644 CASAVA_Build 18 63989543 2I GGATAATATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 12 14 153645 CASAVA_Build 18 63990452 1I ATATTTAGCC -/T TTGTTTTTAC 3070 hom 160 het 57 0 54 3 T 2 3 153646 CASAVA_Build 18 64006963 3D CTTTATGACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 16 0 10 6 A 14 11 153647 CASAVA_Build 18 64007799 1D ATAAAACAAC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 8 7 153648 CASAVA_Build 18 64010199 3D ATAAAGATAG TTT/--- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 10 7 153649 CASAVA_Build 18 64020848 1D ATTAATACAT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 A 8 7 153650 CASAVA_Build 18 64023551 1D CAGGAAGGGG A/- ACATCACGCT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 2 1 153651 CASAVA_Build 18 64023726 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 400 hom 23 1 20 2 A 8 9 153652 CASAVA_Build 18 64024130 11D AGTGCCTGGC CTCTCTCACAG/----------- TGCCATCAGG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 CTCTCTCACAG 1 0 153653 CASAVA_Build 18 64028688 1I ATGGAGCTAG -/A CGCCATTATC 3070 hom 63 het 22 0 21 1 A 0 1 153654 CASAVA_Build 18 64030625 5D CTACCAATCC GTAAA/----- GTAAAGTATA 3070 het 3070 hom 53 22 24 8 GTAAA 2 1 153655 CASAVA_Build 18 64032476 4I TAAACATGAA ----/TAAC TATGTTACAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 TAAC 0 1 153656 CASAVA_Build 18 64033696 1D CTGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 A 13 12 153657 CASAVA_Build 18 64055905 1I TGGATAAAAT -/A AAAATCAGTG 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 A 4 5 153658 CASAVA_Build 18 64057658 2I TTGAAATAAC --/AT TGCCTTTCCA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 AT 0 1 153659 CASAVA_Build 18 64058196 1D ATAAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 8 8 A 11 10 153660 CASAVA_Build 18 64058612 1D ACAAGCTATC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 9 8 153661 CASAVA_Build 18 64062664 10I GGGCCACTCT ----------/GGATAGAAAA GGAAGGCTGC 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 GGATAGAAAA 0 1 153662 CASAVA_Build 18 64063452 2I CAAAATCAGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 9 11 153663 CASAVA_Build 18 64066115 1I TCTTTTTCTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 8 9 153664 CASAVA_Build 18 64070460 1D TATCGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 23 0 19 4 T 13 12 153665 CASAVA_Build 18 64070991 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1906 het 431 hom 11 2 5 4 T 10 11 153666 CASAVA_Build 18 64073855 1D TTATTTAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 10 9 153667 CASAVA_Build 18 64083803 1D CTTTAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2510 hom 34 10 12 12 A 13 12 153668 CASAVA_Build 18 64084880 2D CTACAAACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 23 19 4 AC 10 9 153669 CASAVA_Build 18 64087241 1I TTTATAATAA -/T TTTTAAATTC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 4 5 153670 CASAVA_Build 18 64092462 1D TGATTCTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 9 8 153671 CASAVA_Build 18 64095347 1D TAAAACTCTT A/- ATCCATTATT 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 A 2 1 153672 CASAVA_Build 18 64096845 1I CAACTGAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 9 10 153673 CASAVA_Build 18 64098475 4I AGTTTACATG ----/GAGA GAGAGACATT 2954 hom 18 het 8 0 7 1 GA 3 5 153674 CASAVA_Build 18 64099143 1D ATAGTCTGTC A/- GCAATGTCTG 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 1 0 153675 CASAVA_Build 18 64099434 2D AAACTCTATC AA/-- GTCTTATTAA 3070 het 3070 hom 58 22 31 7 A 2 0 153676 CASAVA_Build 18 64099795 1D AATTAAAGGA C/- ATAGGCAATT 3070 het 3070 ref 65 32 29 4 C 1 0 153677 CASAVA_Build 18 64105354 1I CTTTAGCTTG -/T TTTTTTTGAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 8 153678 CASAVA_Build 18 64109474 1I TTCAGTTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 11 12 153679 CASAVA_Build 18 64110415 2D TCCAATCTTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 11 9 153680 CASAVA_Build 18 64110649 1D AGACCATTAG T/- TTTAGCAACT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 4 3 153681 CASAVA_Build 18 64117237 4I CTTTTTGGGT ----/GTAA GTGTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 GTAA 0 1 153682 CASAVA_Build 18 64119165 1I TTTTATAATA -/T TTATCTACTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 2 3 153683 CASAVA_Build 18 64129009 1I AGGATCTTTT -/G GGGGGGAAGG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 G 6 7 153684 CASAVA_Build 18 64129661 1D TTAGCAGTCT G/- CCATTTTTAA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 G 1 0 153685 CASAVA_Build 18 64148886 10D CAAAACAAAC AAACAAAAAA/---------- AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 7 AAACAAAAAA 2 1 153686 CASAVA_Build 18 64159707 2I GCCAACTTCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 1459 hom 22 4 15 3 T 9 11 153687 CASAVA_Build 18 64164279 1I CAGAAAATGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 8 9 153688 CASAVA_Build 18 64175355 1D TGCTGATTAA C/- CCCCCCCGAT 3070 het 3070 hom 47 20 19 9 C 8 7 153689 CASAVA_Build 18 64176104 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTCATC 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 T 7 6 153690 CASAVA_Build 18 64183396 1I TTGGTGTTAC -/A AAAAAAAAAA 1822 het 1822 ref 23 13 6 4 A 10 11 153691 CASAVA_Build 18 64210770 1I CAACTTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 11 12 153692 CASAVA_Build 18 64227606 1D TTAAGCTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 10 9 153693 CASAVA_Build 18 64243686 2I TAAAATATGG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 AT 6 7 153694 CASAVA_Build 18 64250154 1I TCACGGTTTG -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 103 het 40 0 35 5 T 5 6 153695 CASAVA_Build 18 64265984 2I AGAGCAGTTA --/AG AGAGTGCCAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 AG 2 3 153696 CASAVA_Build 18 64266796 1I AATATAGGTC -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 A 6 7 153697 CASAVA_Build 18 64269139 1I CAGGAACATC -/A ACCAGTTAGA 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 A 1 2 153698 CASAVA_Build 18 64276578 1I TATATATATA -/T TATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 1 2 153699 CASAVA_Build 18 64283273 1I ACTTCCTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 19 9 8 T 9 10 153700 CASAVA_Build 18 64307824 1I AAGGGTGTGT -/G GGGGGGGGCA 3070 hom 73 het 35 0 24 11 G 8 9 153701 CASAVA_Build 18 64353397 1I AGGAAAAAGG -/T TTAATTGACT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 2 3 153702 CASAVA_Build 18 64354913 1D GTCCCAGTAA T/- AGCAGTAAGA 963 het 963 ref 35 28 3 4 T 1 0 153703 CASAVA_Build 18 64364503 2D CAAATAAGCC CA/-- GAGTGTGATG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CA 1 0 153704 CASAVA_Build 18 64374818 1D CAGAATTTGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 7 153705 CASAVA_Build 18 64390670 1I GCAGAATTAG -/A AAAAAACTGC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 6 7 153706 CASAVA_Build 18 64402058 1D TTACCATCAC A/- AAAAAAGCAC 3070 hom 154 het 62 0 52 12 A 7 6 153707 CASAVA_Build 18 64406158 1D TTACCTCGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 24 0 11 14 A 13 12 153708 CASAVA_Build 18 64410215 1D CAGCGTTTTT G/- TTGTTGGCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 G 1 0 153709 CASAVA_Build 18 64411006 1D AAACAGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1203 hom 42 6 21 15 A 16 15 153710 CASAVA_Build 18 64417192 1I TGACTAACAC -/A AGTGCTAACA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 1 2 153711 CASAVA_Build 18 64418836 2D ACCCCCCCCC TT/-- TTTTTTTTTT 1863 het 41 hom 14 2 9 3 T 16 14 153712 CASAVA_Build 18 64420791 2I GATTTTTTTT --/TC CTATTGTTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TC 0 1 153713 CASAVA_Build 18 64426058 1I GATTGACGCC -/A AAAAAAATGC 3070 hom 114 het 45 0 38 7 A 7 8 153714 CASAVA_Build 18 64426318 5I AAGCATTGTA -----/AGAAT AGAATATTTC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AGAAT 1 2 153715 CASAVA_Build 18 64427441 1I TCAACCTCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 181 hom 47 1 39 7 A 9 10 153716 CASAVA_Build 18 64430105 1D AGACGTCATC T/- TTTTGGTGGG 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 T 5 4 153717 CASAVA_Build 18 64435701 1I TTCCTAAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 109 het 47 0 40 7 T 9 10 153718 CASAVA_Build 18 64436353 1D GTGAGCCACC G/- GTACCCGGCA 3070 hom 42 het 20 0 14 6 G 2 1 153719 CASAVA_Build 18 64437972 1I GAGAAAGAAA -/G GGTATTCAAA 3070 het 267 hom 22 3 14 5 G 2 3 153720 CASAVA_Build 18 64439118 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 25 het 20 0 18 4 A 9 8 153721 CASAVA_Build 18 64439194 1I CAAACTTATT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 A 8 9 153722 CASAVA_Build 18 64451537 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 T 7 8 153723 CASAVA_Build 18 64459925 1D TTTCCGGTGA T/- TTTTTTTTTT 2859 het 2859 ref 26 13 8 6 T 11 10 153724 CASAVA_Build 18 64464869 1I GAGTGTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 42 1 37 4 A 10 11 153725 CASAVA_Build 18 64465298 1D GATAGACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 318 hom 35 1 31 3 T 13 12 153726 CASAVA_Build 18 64518707 1I TTTAATCTTT -/A AAAAAAAAAA 1788 het 1788 ref 28 12 8 8 A 15 16 153727 CASAVA_Build 18 64523462 4I AACCCCACAG ----/AATT AATTATCTGG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AATT 1 2 153728 CASAVA_Build 18 64534507 1D CCATATTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 11 10 153729 CASAVA_Build 18 64550267 6I TTAGTACTCT ------/AAGAGC ACTCTGAGGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AAGAGC 0 1 153730 CASAVA_Build 18 64553444 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2378 het 9 hom 12 1 9 2 T 12 11 153731 CASAVA_Build 18 64555666 3D ACTGGCGCTT GTG/--- GTGGTGGTGG 3070 hom 83 het 38 0 24 15 GTG 7 6 153732 CASAVA_Build 18 64572390 1D TCAAAATTAT A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 7 6 153733 CASAVA_Build 18 64576413 2I ACATGTAGAC --/AT ATGTGTGTTG 3070 het 2404 hom 19 6 12 1 AT 1 2 153734 CASAVA_Build 18 64577700 2D AGGTGACAGT CA/-- CATACAAAGG 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 CA 2 1 153735 CASAVA_Build 18 64597775 3D ACAATACGTC ATT/--- ATATTTATAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 ATT 1 0 153736 CASAVA_Build 18 64598688 1D TCAACACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2787 hom 29 10 9 11 T 14 13 153737 CASAVA_Build 18 64599556 2I GTGGGTGGAC --/AG AAAGAAATTT 2862 het 2862 ref 31 20 6 5 AG 0 1 153738 CASAVA_Build 18 64609747 1D TGTAACAATG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 9 8 153739 CASAVA_Build 18 64609862 4D TGTGTATGTG AGAA/---- AGAGAGATTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AGAA 1 0 153740 CASAVA_Build 18 64612653 1D CATAGGCTTC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 93 het 48 0 39 9 A 8 7 153741 CASAVA_Build 18 64615975 1I CTTCCTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 916 hom 27 2 18 7 T 14 15 153742 CASAVA_Build 18 64632495 1D AATTAATCAC T/- TTTTTTCTAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 6 153743 CASAVA_Build 18 64652246 2D ACTTTAGTGC AT/-- ATGCATATGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 2 1 153744 CASAVA_Build 18 64653607 4D CATATTACAT AATA/---- AATAAAGTTA 3070 hom 126 het 49 0 43 9 AATA 2 1 153745 CASAVA_Build 18 64662188 1D TCTAAATACT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 9 8 153746 CASAVA_Build 18 64663191 1D ATGTTAATAA G/- GGATTCCGGA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 G 3 2 153747 CASAVA_Build 18 64664870 3D TATATTGGTC ATT/--- ATTTATTTTC 3070 het 3070 ref 35 21 10 6 ATT 2 1 153748 CASAVA_Build 18 64665639 1I AAATTTAAGT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 A 8 9 153749 CASAVA_Build 18 64671578 5I TGTGAGCTTA -----/CTTCT CTCAATTTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CTTCT 0 1 153750 CASAVA_Build 18 64672309 5D CTTTTTCTTG TTTTT/----- TTTTTTTTTC 3070 het 753 hom 21 5 11 5 T 14 9 153751 CASAVA_Build 18 64674028 1I ATACATGATG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 7 8 153752 CASAVA_Build 18 64678999 1I GCACTTACCA -/C TTTATAGCAC 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 C 0 1 153753 CASAVA_Build 18 64679220 1D ATCAGATAGA T/- TTGGGCTTGA 3070 het 3070 ref 47 30 15 2 T 3 2 153754 CASAVA_Build 18 64679355 1D AAAACATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 11 10 153755 CASAVA_Build 18 64679515 1D AGTTTAAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 T 10 9 153756 CASAVA_Build 18 64690283 1I13M1D CATGTGAGAG -AATAAAGAACATAT/AAATAAAGAACATA- TCAATAATTT 3070 het 3070 hom 45 17 29 6 N/A 0 0 153757 CASAVA_Build 18 64692679 1I GATTTGCTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 9 10 153758 CASAVA_Build 18 64702801 4D CAATACAAAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 32 9 10 13 AC 11 9 153759 CASAVA_Build 18 64702887 2D ATATACACAC AT/-- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 24 10 10 5 AT 5 4 153760 CASAVA_Build 18 64704662 1D TAACAGCAAC A/- AAAAAGTGAT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 6 5 153761 CASAVA_Build 18 64705187 5D ATGACTTATG AGGCA/----- ATCCCATAAT 189 het 189 ref 34 13 2 20 AGGCA 1 0 153762 CASAVA_Build 18 64717339 1D TGAGGGTGGT G/- GTTGGTGATT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 G 2 1 153763 CASAVA_Build 18 64722335 5D TTTTACTGTT ATAAA/----- ATAGAAATTA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 ATAAA 1 0 153764 CASAVA_Build 18 64723802 10D TTATGGGACC GCCCTGTCTA/---------- GCCCTGTCTA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 GCCCTGTCTA 2 1 153765 CASAVA_Build 18 64725140 8I TTTATTTCTG --------/ATACTTTT ATACTTTTAT 2386 het 2386 ref 27 19 7 1 ATACTTTT 2 3 153766 CASAVA_Build 18 64727401 1D GGAGGAAGGG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 114 het 45 0 39 10 A 9 8 153767 CASAVA_Build 18 64729141 1D AAAAAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 270 hom 36 5 11 20 A 12 11 153768 CASAVA_Build 18 64730395 4I TTTTCTACAA ----/AGTT AGTAAGGTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AGTT 0 1 153769 CASAVA_Build 18 64736228 2D ATATAGTTTA CT/-- CTCTCTTCAC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 CT 4 3 153770 CASAVA_Build 18 64741043 2D GATATTTATT GA/-- GCACCTATTA 3070 het 3070 ref 42 20 15 8 GA 1 0 153771 CASAVA_Build 18 64741387 1I ACACATACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 10 11 153772 CASAVA_Build 18 64742347 1I TTCCCTTCTT -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 C 7 8 153773 CASAVA_Build 18 64750194 3D ACACAAACTG TAT/--- TATTCTATAA 3070 het 3070 ref 57 25 26 8 TAT 2 1 153774 CASAVA_Build 18 64751314 1D TTACTCCTCA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 T 1 0 153775 CASAVA_Build 18 64754425 1D ATGCCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 13 8 A 12 11 153776 CASAVA_Build 18 64754976 10D ATATATATAT ATATACACAC/---------- ATACATACAT 3070 het 209 hom 16 4 10 3 ATATACACAC 1 0 153777 CASAVA_Build 18 64759482 2D GCACAAAAAT AA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 10 8 153778 CASAVA_Build 18 64760947 1D CATTGCCCAG T/- CGACAAGCAG 562 het 562 ref 24 19 2 4 T 1 0 153779 CASAVA_Build 18 64762865 2I TGATTAGGTT --/TC AACATTATAG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TC 0 1 153780 CASAVA_Build 18 64782619 1D AAGTTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 26 1 19 6 T 13 12 153781 CASAVA_Build 18 64785395 1D AACACCCCTC T/- TCCCCTCCTG 3070 hom 62 het 23 0 21 2 T 2 1 153782 CASAVA_Build 18 64795774 1D CTATAGCACT A/- AAAAAAAAAA 1712 het 1712 ref 32 22 4 6 A 13 12 153783 CASAVA_Build 18 64806627 1D GAGGGTGGGA G/- GGTATGGGTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 3 2 153784 CASAVA_Build 18 64812327 3I GTAATTTTTA ---/TTG TTATTTTATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTG 0 1 153785 CASAVA_Build 18 64816067 3I CATTTAATAA ---/TAT TATGTGTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TAT 1 2 153786 CASAVA_Build 18 64816808 3I2M2D13M2D TACCAAAACC ---CCCAAAGTAGGGAAGCCAA/AGTCC--GAGTACTGAAAGC-- CAGTTCAGCT 3070 hom 42 het 13 0 12 5 N/A 0 0 153787 CASAVA_Build 18 64819710 1D GACAAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 971 hom 28 3 20 5 A 13 12 153788 CASAVA_Build 18 64824259 1D TAATTATGTA T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 T 8 7 153789 CASAVA_Build 18 64836213 2D TAAATATTTC TG/-- TGTGTGTGTG 1173 het 1173 ref 53 40 3 10 TG 10 9 153790 CASAVA_Build 18 64840411 14D TCCTTTAGCC TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 hom 42 het 22 0 15 11 TA 15 8 153791 CASAVA_Build 18 64845884 1D AAGGTGATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 12 11 153792 CASAVA_Build 18 64847718 1D CATGTGAGAA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 8 7 153793 CASAVA_Build 18 64856569 1D GTGCAAAATG T/- TTTGTGTGTT 3070 hom 135 het 51 0 46 6 T 4 3 153794 CASAVA_Build 18 64868289 1D GCCTCTGAAA G/- TGTTGGTATT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 G 1 0 153795 CASAVA_Build 18 64870273 1D CTCTTAAATG A/- AAAAAAAATG 3070 het 363 hom 31 1 25 5 A 9 8 153796 CASAVA_Build 18 64876613 5I ATAGCAGCTC -----/TGTTT TAAGTTTTTT 3070 hom 89 het 34 0 29 5 TGTTT 0 1 153797 CASAVA_Build 18 64886439 1D TTAATAAATA T/- TTTTTGACAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 6 5 153798 CASAVA_Build 18 64886974 2D TGAAAGTATC CT/-- CTTTTTTCTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 CT 2 1 153799 CASAVA_Build 18 64902377 1D TTATCTCAGT C/- CACCTGTTTT 3070 hom 123 het 45 0 41 5 C 2 1 153800 CASAVA_Build 18 64902649 1I CTGTTACACA -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 6 7 153801 CASAVA_Build 18 64903846 1I AGAAAAAAAA -/G AAGAAGTAAA 3070 hom 64 het 25 0 22 3 G 0 1 153802 CASAVA_Build 18 64904758 1D CTTCTGATAG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 8 7 153803 CASAVA_Build 18 64921067 12D TGGAAGAGAG AAAGACTAAGGT/------------ ACTGATCCCT 3070 hom 135 het 45 0 42 8 AAAGACTAAGGT 1 0 153804 CASAVA_Build 18 64934033 1D TCCACAAATT A/- AAAAAAAAAA 1343 het 1343 ref 39 29 3 8 A 12 11 153805 CASAVA_Build 18 64939045 1D ACCTGACTTC A/- TAGGCCTCTT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 1 0 153806 CASAVA_Build 18 64945222 13I GAGCTAAATA -------------/AATCCTTCTTAAT AATCCTTCTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 AATCCTTCTTAAT 1 2 153807 CASAVA_Build 18 64946176 4D TCATGAGTCT CAAA/---- CAGACTGAAT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 CAAA 1 0 153808 CASAVA_Build 18 64957693 2I AAAGAGGAAA --/AC CAATAATACA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AC 0 1 153809 CASAVA_Build 18 64971059 1D TCTTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 36 1 25 10 A 15 14 153810 CASAVA_Build 18 64974550 1I AATCAACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 34 1 23 10 A 13 14 153811 CASAVA_Build 18 64978859 8D CAGAATTAAC TGTAGTTA/-------- TGTATAACTA 3070 hom 54 het 19 0 19 2 TGTAGTTA 1 0 153812 CASAVA_Build 18 64979541 1D CTGGGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 181 hom 33 1 25 8 A 12 11 153813 CASAVA_Build 18 64980200 5D TGATCCTTTG GCTAT/----- GCTATGCTAT 3070 het 3070 hom 43 16 23 7 GCTAT 3 2 153814 CASAVA_Build 18 64983037 23D TAAAGTGTTT AATTAAGTATTTAATTAAGTATA/----------------------- AATTAAGTAT 3070 hom 96 het 35 0 33 5 AATTAAGTATTTAATTAAGTATA 1 0 153815 CASAVA_Build 18 64988226 4I TTTGATAGAT ----/AACA AACATAGTTT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 AACA 1 2 153816 CASAVA_Build 18 64990174 1I CCTAACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 A 12 13 153817 CASAVA_Build 18 64991033 3D ACAAACAAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 287 hom 26 4 10 14 A 13 10 153818 CASAVA_Build 18 64995554 1I CAGAGAGAGG -/C CTGGAACTAG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 C 1 2 153819 CASAVA_Build 18 65001093 3D AAATCTGTAT TAA/--- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 17 17 2 TAA 1 0 153820 CASAVA_Build 18 65005314 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 A 6 7 153821 CASAVA_Build 18 65014643 1I GAAATTTTTT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 7 8 153822 CASAVA_Build 18 65020210 2I GTGTCATAAC --/AT GTGATAGAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 0 1 153823 CASAVA_Build 18 65022895 1D TCTTATATAT A/- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 1 0 153824 CASAVA_Build 18 65029543 1D TCAGCCAATG A/- AGATAGACAC 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 2 1 153825 CASAVA_Build 18 65036008 1I AAAGCTCTCC -/T TTTTTTGACC 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 T 6 7 153826 CASAVA_Build 18 65037811 4D GGGAAAGCTT TACC/---- CTAAAGAATG 3070 het 3070 ref 36 16 18 4 TACC 1 0 153827 CASAVA_Build 18 65040724 1D AGTTTTTGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 9 8 153828 CASAVA_Build 18 65045312 1D CAAACATGCC T/- TTGTATGTGC 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 3 2 153829 CASAVA_Build 18 65053720 3D26M1D TCTGGGTCTT TTGTTGTTGTTGCTGTTGCTTTCTTTTTTA/---TTGTTGTTGCTGTTGCTTTCTTTTTT- AAAAAAAAAA 3070 het 854 hom 33 5 16 19 N/A 0 0 153830 CASAVA_Build 18 65055976 1D AGCCTCTTCC T/- TTTTGGAATC 3070 het 3070 ref 42 25 17 1 T 5 4 153831 CASAVA_Build 18 65062144 35D TTTTAAGAAG AATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAA/----------------------------------- AATAAAATAA 3070 het 211 hom 26 2 16 9 AATAA 11 4 153832 CASAVA_Build 18 65062262 1I CTCTTAACAA -/G AGTTTGCAGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 0 1 153833 CASAVA_Build 18 65063807 1D ATTGGATCAG C/- ATTTTGCAAT 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 C 1 0 153834 CASAVA_Build 18 65076975 12D AGAGAAAGAT TAGAAGCAATAC/------------ TCACACGCTT 3070 het 3070 ref 47 24 21 3 TAGAAGCAATAC 1 0 153835 CASAVA_Build 18 65078061 1D ATTAGAACTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 46 0 36 10 T 9 8 153836 CASAVA_Build 18 65078539 2D AATACAAAAT AA/-- GTTTCAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 24 3 A 2 0 153837 CASAVA_Build 18 65084599 1I TCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2706 het 2706 ref 26 10 9 7 A 13 14 153838 CASAVA_Build 18 65086974 4I AAATTAGAGA ----/AAGT AATATCTGAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 AAGT 0 1 153839 CASAVA_Build 18 65089479 2I GTTATATATT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 TC 7 8 153840 CASAVA_Build 18 65089785 1D CTTGCCCCCC G/- CAAAAAAAAA 2227 het 2227 ref 24 10 7 7 G 1 0 153841 CASAVA_Build 18 65090035 1D ACAGAAATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 38 het 32 1 27 4 A 10 9 153842 CASAVA_Build 18 65090552 1D ATTCCTCCCC T/- CCCCATGTAG 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 T 1 0 153843 CASAVA_Build 18 65090649 4I TTTTCTTGGT ----/TGAG TGACATTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 TGAG 0 1 153844 CASAVA_Build 18 65093082 12D AGGTCTGCCT GGAGTCCATTAA/------------ GTTCAATTGT 3070 het 3070 hom 32 13 17 6 GGAGTCCATTAA 1 0 153845 CASAVA_Build 18 65093860 1I CTCAACTAGA -/C CCCAGTGTCT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 C 3 4 153846 CASAVA_Build 18 65095086 1D AAGAAATTTT A/- AAAAATATAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 6 5 153847 CASAVA_Build 18 65096654 1D ATGACAGACA T/- TTTTTTGCTA 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 T 7 6 153848 CASAVA_Build 18 65103218 3I TTGATTTGAC ---/TAA TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAA 0 1 153849 CASAVA_Build 18 65107618 2D CCTTGTGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 36 2 15 19 T 12 10 153850 CASAVA_Build 18 65110751 1D TACATTGATC T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 7 6 153851 CASAVA_Build 18 65114270 4D AGCATTTGTC CTTT/---- CTTTATGTTA 3070 het 3070 ref 23 9 9 6 CTTT 2 1 153852 CASAVA_Build 18 65117827 8I AGATTATTTG --------/TTTTTTGT TTTTTTGTTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TTTTTTGT 1 2 153853 CASAVA_Build 18 65119116 1D TTAATCTTTC A/- AAAAAAGTAC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 7 6 153854 CASAVA_Build 18 65119133 3D GTACAAATTA GTT/--- GTTCTTGTAT 1681 het 1681 ref 29 5 5 23 GTT 2 1 153855 CASAVA_Build 18 65123363 1I TTTATAAGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 T 9 10 153856 CASAVA_Build 18 65125407 1I TAAAGTACAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 7 8 153857 CASAVA_Build 18 65134635 1D GCTGATTCTC T/- TGTTCCTTCT 3070 het 3070 hom 45 17 20 10 T 2 1 153858 CASAVA_Build 18 65135378 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2944 hom 30 10 10 10 T 13 14 153859 CASAVA_Build 18 65137827 4I AATGTGTCTT ----/TGTC TGGTTTTGGT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TGTC 0 1 153860 CASAVA_Build 18 65140028 2I AGGTTTTTTT --/TA ATTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 TA 0 1 153861 CASAVA_Build 18 65140342 1I TTTTTTTCTC -/T TTTTTTTTGA 3047 het 2911 hom 24 8 11 5 T 8 9 153862 CASAVA_Build 18 65140453 1I GGCAAGAGCC -/A ACTGTGTCCA 3070 het 3070 hom 20 8 12 0 A 1 2 153863 CASAVA_Build 18 65153975 4I TGAATCTTCA ----/ACTT ACTTCTTGTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 ACTT 1 2 153864 CASAVA_Build 18 65158045 1I AACTTAGGAG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 42 17 24 1 T 6 7 153865 CASAVA_Build 18 65160954 1I CTACTTTAAC -/T TTTTTTTGCC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 7 8 153866 CASAVA_Build 18 65172329 4I AGAAAAAAGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAAC 2 3 153867 CASAVA_Build 18 65173307 2D AACCTGAGGG GA/-- GGGGGGGCTG 3070 hom 25 het 22 0 10 13 GA 1 0 153868 CASAVA_Build 18 65179987 1D ATTTTGGGGA G/- GGGGGGGTCA 3070 hom 11 het 16 0 12 4 G 8 7 153869 CASAVA_Build 18 65205288 1D AAGTTGCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 A 11 10 153870 CASAVA_Build 18 65212878 1D AACAATTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 15 8 A 11 10 153871 CASAVA_Build 18 65214291 1I ATGTGACCAT -/A AAAATCATTG 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 4 5 153872 CASAVA_Build 18 65226656 1D CTCTCCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2780 hom 46 16 19 11 A 15 14 153873 CASAVA_Build 18 65242843 2D15M4D TCTTTGTGAC TTATAATTTTTTGTCTTACTC/--ATAATTTTTTGTCTT---- AAGAAGGCTC 3070 het 3070 ref 40 27 18 8 N/A 0 0 153874 CASAVA_Build 18 65245231 6D CCTCCAAAAG GTGCTA/------ GTGTGTGTTG 3070 het 3070 hom 44 21 20 6 GTGCTA 1 0 153875 CASAVA_Build 18 65245616 4D TCATTAGAGA TCAT/---- TGTGCAAATC 3070 het 3070 ref 50 32 16 5 TCAT 1 0 153876 CASAVA_Build 18 65257288 1I CTCAAAAAAC -/A AAACAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 3 4 153877 CASAVA_Build 18 65260370 3D GCTTAATTCT CTC/--- TTCTAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 CTC 1 0 153878 CASAVA_Build 18 65277756 1I GAATATCACA -/T TTTTAAAACA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 4 5 153879 CASAVA_Build 18 65281858 4I TGACCTTTGT ----/TGTG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 53 21 22 12 TG 4 6 153880 CASAVA_Build 18 65287660 1D TAATTACGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 712 hom 34 3 17 15 T 12 11 153881 CASAVA_Build 18 65289358 3I CCAGCTACTC ---/GGG GGGAAGCTGG 1148 het 1148 ref 11 6 3 2 G 3 6 153882 CASAVA_Build 18 65290956 2D GCACAGATAG AC/-- ACACACACAC 875 het 875 ref 48 36 3 11 AC 8 7 153883 CASAVA_Build 18 65291060 1I AGACAAGTTA -/T TCAATTCAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 1 2 153884 CASAVA_Build 18 65294208 4I TCCCATCACC ----/CAGG CAGTAAGCAT 3070 het 3070 ref 49 23 24 2 CAGG 0 1 153885 CASAVA_Build 18 65297307 3I GAGGTAAGGA ---/AGC AGCATGTAAC 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 AGC 1 2 153886 CASAVA_Build 18 65298459 1D TATATAATTT A/- AAAGATTAAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 A 4 3 153887 CASAVA_Build 18 65304301 1I TTTCATAGGT -/A AAAAAGGTTT 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 A 5 6 153888 CASAVA_Build 18 65312695 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 23 8 14 2 AAAC 3 2 153889 CASAVA_Build 18 65316215 1I CCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 A 9 10 153890 CASAVA_Build 18 65317492 3D GCGATGGGCT AAG/--- AAGATTACTT 3070 het 3070 ref 37 20 15 7 AAG 2 1 153891 CASAVA_Build 18 65324134 1I AAACTTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 10 11 153892 CASAVA_Build 18 65331328 4I TTAAAATAAC ----/AATA AAAGCTCGTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AATA 0 1 153893 CASAVA_Build 18 65332468 1I GTAAATGAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 106 het 46 0 36 10 A 9 10 153894 CASAVA_Build 18 65332932 2I AGGTTTTTTG --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 9 11 153895 CASAVA_Build 18 65334113 3I TGCAAACAGA ---/TCT TCTGAATTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TCT 1 2 153896 CASAVA_Build 18 65334899 1I AGTACTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 695 hom 36 3 27 6 T 10 11 153897 CASAVA_Build 18 65336804 1I GAGTTTAGAA -/T TTTTTGTATC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 5 6 153898 CASAVA_Build 18 65341875 1I AAAGAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 10 11 153899 CASAVA_Build 18 65343198 2I GATTTTCAGT --/AA AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 7 9 153900 CASAVA_Build 18 65356889 7I GTGAGCTACC -------/ATCCTTG GCCTCCATTT 3070 hom 135 het 47 0 46 1 ATCCTTG 0 1 153901 CASAVA_Build 18 65357684 1I CAAAAACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 21 0 15 6 T 15 16 153902 CASAVA_Build 18 65358251 10D GTTGGAGGAA CTGTCAAATG/---------- CTGTCAAATG 3070 het 3070 hom 42 13 21 15 CTGTCAAATG 2 1 153903 CASAVA_Build 18 65360505 1I GACCGACCCA -/T TTTTGTAAGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 5 153904 CASAVA_Build 18 65363333 1I GAGACACCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 19 0 16 3 A 13 14 153905 CASAVA_Build 18 65366170 2I TATATATAAA --/AT ATATATATAT 2318 hom 15 het 6 0 6 0 AT 6 7 153906 CASAVA_Build 18 65368994 3D TGTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 959 het 328 hom 33 5 4 24 T 21 18 153907 CASAVA_Build 18 65378632 1D TTTTCTTTTC T/- TTTCAGTCAT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 T 4 3 153908 CASAVA_Build 18 65379150 1I CTTTCTATTT -/A AAAAAATTAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 6 7 153909 CASAVA_Build 18 65379519 2D AAGTTTCCAC TA/-- TATCAAACTG 3070 hom 144 het 54 0 49 7 TA 2 1 153910 CASAVA_Build 18 65382335 4I GATAGATAAT ----/TGAG TATTATGTAA 3070 hom 65 het 27 0 21 6 TGAG 0 1 153911 CASAVA_Build 18 65388289 1D AGGTTTCAGG A/- AAAAAAAAAC 1107 het 1107 ref 41 31 3 7 A 10 9 153912 CASAVA_Build 18 65397099 4I TCACTATAAA ----/TATC TATCTAGCAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TATC 1 2 153913 CASAVA_Build 18 65397788 1I CCAACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1116 het 1116 ref 22 15 3 4 T 11 12 153914 CASAVA_Build 18 65401969 9D CCATCCATAC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 2066 het 151 hom 18 2 6 12 A 21 12 153915 CASAVA_Build 18 65403229 1D TTTGTTTAGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 8 153916 CASAVA_Build 18 65403473 1D TTTAACTCAT G/- TTTTTTAGAA 2892 het 2892 ref 24 12 7 6 G 1 0 153917 CASAVA_Build 18 65407049 1I ATATAATTCA -/T TTTTAGATGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 4 5 153918 CASAVA_Build 18 65409819 1D GATATTAAAT A/- TTTTTTTAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 1 0 153919 CASAVA_Build 18 65410466 1D TTTTTTTTTT A/- AACTTACCCT 3070 het 3070 hom 30 13 14 5 A 3 2 153920 CASAVA_Build 18 65412399 1D TTGATGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2364 hom 35 11 13 11 T 12 11 153921 CASAVA_Build 18 65412436 4D GAATGTTTTC AGAT/---- AGATGGATGG 3070 het 2442 hom 32 5 15 14 AGAT 2 1 153922 CASAVA_Build 18 65414818 1D TTAAAGGGGG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 A 8 7 153923 CASAVA_Build 18 65415749 1I GTATCACAGT -/C CTCTTTAACT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 C 1 2 153924 CASAVA_Build 18 65418393 1I TGCAAGATGT -/A GAACTTAAAC 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 A 0 1 153925 CASAVA_Build 18 65421528 1D AGCGCAAAAA C/- CTACCCTTGT 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 C 2 1 153926 CASAVA_Build 18 65425554 5D TCTGATATTA TTTTG/----- TTTTAACATA 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 TTTTG 1 0 153927 CASAVA_Build 18 65425724 1I TATAAAAAAA -/T ATTAAAATAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 0 1 153928 CASAVA_Build 18 65427886 4D ATCCCATTTC TGAG/---- TATTTATCCA 2342 het 2342 ref 25 16 6 3 TGAG 1 0 153929 CASAVA_Build 18 65429320 2I CAAAAAAGAA --/AG AGAAGATAAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AG 1 2 153930 CASAVA_Build 18 65429712 22D AAGTACACGT ACACACACACACACACACACAC/---------------------- ACACACACAC 3070 hom 135 het 49 0 43 15 AC 17 6 153931 CASAVA_Build 18 65430434 4I TATTTAAGTT ----/AAAA AAAAAAAACC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 8 12 153932 CASAVA_Build 18 65432231 3D GTTTTCTGAG TAT/--- TATTACCTCA 3070 hom 40 het 17 0 14 4 TAT 2 1 153933 CASAVA_Build 18 65432761 2D ATTTTTTCTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 18 hom 35 1 20 14 TG 15 14 153934 CASAVA_Build 18 65435309 2I TATATTTGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 10 12 153935 CASAVA_Build 18 65435721 13D AGAAAGAAAG AGAAAGAAAGAAA/------------- AGAAAGAAAG 3070 hom 33 het 18 0 12 7 AGAAAGAAAGAAA 1 0 153936 CASAVA_Build 18 65435807 4I AGAGAGAGAC ----/AGAG AGAAAAGACT 3070 hom 33 het 20 0 11 9 AG 1 3 153937 CASAVA_Build 18 65449627 1I GTGACCAGCT -/G GGCCCAGGAG 3070 hom 171 het 60 0 57 3 G 2 3 153938 CASAVA_Build 18 65452283 1D CTCCCAAATC A/- AAAAAAAAAA 768 het 768 ref 32 26 3 3 A 12 11 153939 CASAVA_Build 18 65453922 3D GGTGCAGGTG GAA/--- GAAGATGTGT 3070 hom 171 het 62 0 52 11 GAA 2 1 153940 CASAVA_Build 18 65455953 1D ATTCTCTCTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 9 8 153941 CASAVA_Build 18 65458728 1I CCTTTTTGCA -/T TGCTGGCAAC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 1 2 153942 CASAVA_Build 18 65470153 5D AAAAGGAAAC TAATT/----- TAAGTTAGCC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 TAATT 1 0 153943 CASAVA_Build 18 65471526 1D AGACTGGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2475 hom 33 12 12 9 A 13 12 153944 CASAVA_Build 18 65474062 2D GAAAAATAAA AT/-- ATGACATATG 3070 het 3070 ref 27 11 9 8 AT 2 1 153945 CASAVA_Build 18 65491164 1D AATAAATATG A/- AAACAACCTT 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 A 4 3 153946 CASAVA_Build 18 65495587 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1082 hom 23 6 15 3 TA 7 6 153947 CASAVA_Build 18 65497083 2D TTGAGGAAAC TT/-- GACATTATTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 T 2 0 153948 CASAVA_Build 18 65502697 1I AAGATGCAGA -/T TTTTGAAAGT 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 4 5 153949 CASAVA_Build 18 65504954 5D ATAAAACAAG ATAAT/----- ATAAGACACT 3070 het 3070 ref 29 18 10 5 ATAAT 1 0 153950 CASAVA_Build 18 65509651 1D TGTAGAATTT G/- GGTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 42 12 23 8 G 3 2 153951 CASAVA_Build 18 65512686 6D AGCATAATTA TATATT/------ TATAATATTT 2824 het 1586 hom 11 5 6 0 TATATT 1 0 153952 CASAVA_Build 18 65521269 1D TCCGAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 11 10 153953 CASAVA_Build 18 65539945 1D GAATTTACTT A/- AAAGTATAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 2 A 4 3 153954 CASAVA_Build 18 65546540 1I TGCTTTCTAA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 63 26 31 6 T 7 8 153955 CASAVA_Build 18 65547719 1I GACTTTAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 8 23 10 T 9 10 153956 CASAVA_Build 18 65549314 1I AATCCCAACT -/A AAAAAAAATG 2666 het 2666 ref 24 8 7 9 A 8 9 153957 CASAVA_Build 18 65551949 2D TAATTTTTTC AT/-- AGAGTTCTTT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 AT 1 0 153958 CASAVA_Build 18 65552301 1I CTTGTAGTGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 T 8 9 153959 CASAVA_Build 18 65554532 4D ACAATGTTGA AAAC/---- AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 19 16 7 AAAC 2 1 153960 CASAVA_Build 18 65562044 1I ATTAAAAAAA -/C AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 38 0 35 3 C 0 1 153961 CASAVA_Build 18 65562666 1I ATATTTGTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 8 9 153962 CASAVA_Build 18 65569554 3I AAATTATAAT ---/ATC ATGTGCCCCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ATC 0 1 153963 CASAVA_Build 18 65572041 1I TGTTTGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 10 11 153964 CASAVA_Build 18 65572697 4I CTGGTTAAAT ----/CAGA CAGATTCTGC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 CAGA 1 2 153965 CASAVA_Build 18 65576696 2D AGCTAGCAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 12 10 153966 CASAVA_Build 18 65577121 1I AGTAATGTGT -/C TTTTTATAGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 1 153967 CASAVA_Build 18 65585764 1D TGCAGAGGAG A/- ATGCCCCCAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 1 153968 CASAVA_Build 18 65595359 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 12 11 153969 CASAVA_Build 18 65596610 1D CATAGCAAAT A/- AAATTGCGTC 3070 hom 121 het 44 0 40 4 A 4 3 153970 CASAVA_Build 18 65600316 4D AAGATTAGCT ATAG/---- AGACTACAGA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 ATAG 1 0 153971 CASAVA_Build 18 65618309 1D ACGTTCTATT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 9 8 153972 CASAVA_Build 18 65626650 2D AATAAAGATC AG/-- ACTCAAAGTA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 AG 1 0 153973 CASAVA_Build 18 65640005 2I CATGCTATTG --/TT TTTTTTTTTT 2339 het 80 hom 25 2 9 14 T 11 13 153974 CASAVA_Build 18 65640680 1I GATGTAAAAA -/G GTTCAGGTGG 3070 het 3070 ref 42 21 10 11 G 1 2 153975 CASAVA_Build 18 65642261 1I GTTATTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3010 het 1784 hom 13 5 7 1 T 9 10 153976 CASAVA_Build 18 65642655 19D CTCCTCCTGG GCTCAAGCAATCCTCCTGC/------------------- GCTCAAGCAA 3070 het 3070 ref 22 13 9 3 GCTCAAGCAATCCTCCTGC 2 1 153977 CASAVA_Build 18 65647471 1D TTCCTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 A 12 11 153978 CASAVA_Build 18 65650700 1I TGGCCTGTAG -/T TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 4 5 153979 CASAVA_Build 18 65656314 1I TTTAAAAAAA -/C GTGTTAATAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 0 1 153980 CASAVA_Build 18 65660358 2D ATAGTGCTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 36 1 21 14 A 18 16 153981 CASAVA_Build 18 65667739 1I GCCCTCAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 9 10 153982 CASAVA_Build 18 65668996 4I AAATGGATAG ----/AAGT AAGGAAGGAA 3070 hom 114 het 50 0 46 5 AAGT 0 1 153983 CASAVA_Build 18 65669115 1I TCTCTTCCCC -/T GCCCCGGCCA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 0 1 153984 CASAVA_Build 18 65670169 4I CAAAAAAATA ----/AATT AAGACCACTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AATT 0 1 153985 CASAVA_Build 18 65672329 1I TCATGTTAAG -/A GCATGGAAGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 153986 CASAVA_Build 18 65673957 4I ACAGAAAAAG ----/GAGT GAGGATAAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 GAGT 0 1 153987 CASAVA_Build 18 65678296 1D CTCAAAAAAA T/- AATAATAAAA 3059 het 3059 ref 22 12 7 3 T 1 0 153988 CASAVA_Build 18 65684235 1D CTAACTTGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 10 9 153989 CASAVA_Build 18 65696505 5I AAAACCATTA -----/CTTTT CCTTACATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CTTTT 0 1 153990 CASAVA_Build 18 65697769 1I TTGTTCTCTG -/A AAAATCACAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 4 5 153991 CASAVA_Build 18 65704922 1D AACCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 10 9 153992 CASAVA_Build 18 65705539 2D ACCTACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 65 het 34 0 27 8 AC 10 9 153993 CASAVA_Build 18 65707704 3D TGGAATCCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 15 12 153994 CASAVA_Build 18 65711033 2D GTCCTAAAAA TC/-- TCTCTTTTAG 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 TC 3 2 153995 CASAVA_Build 18 65715844 4D AAAAAGAAAT AGAG/---- AAAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 7 AG 2 0 153996 CASAVA_Build 18 65748745 1I CAGTCTAAGC -/A AACGTGAACT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 2 3 153997 CASAVA_Build 18 65754446 1D AAACTTTCTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 9 8 153998 CASAVA_Build 18 65765655 1I TGGTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 43 1 37 5 A 11 12 153999 CASAVA_Build 18 65768381 4D CACGTACTCT CAAA/---- CACACTCGTA 3070 hom 223 het 78 0 74 7 CAAA 1 0 154000 CASAVA_Build 18 65774889 7D GTTTCACTGG CAGCCCC/------- CACCCTTTCG 3070 hom 113 het 46 0 33 14 CAGCCCC 1 0 154001 CASAVA_Build 18 65777861 2D AAAAACAATC AT/-- AGTTATTTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AT 1 0 154002 CASAVA_Build 18 65800062 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 66 het 37 0 25 14 CA 9 8 154003 CASAVA_Build 18 65815091 1I29M2I AAAAATATTG -TTTTTTTTCTCCCTCTTCACTGAACTAAA--/TTTTTTTTTCTCCCTCTTCACTGAACTAAAAG AGAGTTTAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 7 N/A 0 0 154004 CASAVA_Build 18 65818874 1I CCCCAGTTAG -/C CTTGAGCCTG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 C 1 2 154005 CASAVA_Build 18 65823086 1D CCCTGATGTT A/- GATCCAGGTT 3070 hom 130 het 48 0 43 5 A 1 0 154006 CASAVA_Build 18 65829979 1I ATAAATAAAT -/A AAGGGTACTA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 2 3 154007 CASAVA_Build 18 65834050 1D GCCCTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 125 het 46 0 43 3 A 10 9 154008 CASAVA_Build 18 65834433 2D ACACCACAAA AT/-- ATAAGAAGAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 2 1 154009 CASAVA_Build 18 65856215 11D CCGTGGTATT GGTGGCCAAAA/----------- GGAGAGTCTC 3070 hom 114 het 40 0 36 8 GGTGGCCAAAA 1 0 154010 CASAVA_Build 18 65858270 3I GAAGGAATTA ---/AAG AAGAATGAGA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 AAG 1 2 154011 CASAVA_Build 18 65858521 1I CAATGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 122 het 48 0 41 7 A 10 11 154012 CASAVA_Build 18 65870915 1D GCAATTCATA T/- AAAAACAACA 2315 hom 12 het 11 0 5 6 T 1 0 154013 CASAVA_Build 18 65877013 1I TAGGTACAGT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 7 8 154014 CASAVA_Build 18 65895128 2I CCAAAATCAC --/AG AGTCAATCTT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 AG 1 2 154015 CASAVA_Build 18 65898335 5I CATAACAAAC -----/ATATT AAAAGATAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 ATATT 0 1 154016 CASAVA_Build 18 65900639 1I TGAACTGAGA -/C AAATTACATC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 0 1 154017 CASAVA_Build 18 65902122 1I AGACCCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 37 0 23 14 T 13 14 154018 CASAVA_Build 18 65902447 1D TCTCTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 12 11 154019 CASAVA_Build 18 65902840 1D AAAAATAACC A/- AAAAAAAAAA 1461 het 1461 ref 32 21 6 5 A 13 12 154020 CASAVA_Build 18 65908638 2D ATAAATGTGG TC/-- TCTCTCTCAA 3070 hom 126 het 49 0 43 7 TC 5 4 154021 CASAVA_Build 18 65912315 2D GTTTATAACA CT/-- CTCTGACGGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CT 3 2 154022 CASAVA_Build 18 65913280 1I TAATGCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 11 12 154023 CASAVA_Build 18 65913344 1I CAACTCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1162 hom 30 3 21 6 T 10 11 154024 CASAVA_Build 18 65916278 5D AAAAATGCTA TAAAC/----- TAGGTACTTA 3070 hom 105 het 39 0 35 6 TAAAC 1 0 154025 CASAVA_Build 18 65923084 1D GCTTCGTCTC A/- AGAGGGGCAC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 2 1 154026 CASAVA_Build 18 65926493 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 18 1 14 5 A 13 12 154027 CASAVA_Build 18 65927082 1I CTTAATTGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 260 hom 42 1 32 9 A 9 10 154028 CASAVA_Build 18 65933737 1I GCACTGTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 10 11 154029 CASAVA_Build 18 65935133 1I AACTTCCATC -/A AAAAAAATGC 3070 hom 87 het 39 0 30 9 A 7 8 154030 CASAVA_Build 18 65935231 3D GTGCAATAAA CTC/--- CTAAATTGCC 3070 hom 108 het 39 0 36 4 CTC 1 0 154031 CASAVA_Build 18 65937541 1I AATAGCTACC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 28 0 19 9 A 8 9 154032 CASAVA_Build 18 65938442 2D GGGACTCTTC AG/-- AGAGTCCCCA 3070 hom 55 het 25 0 18 8 AG 3 2 154033 CASAVA_Build 18 65947861 1I TTAAAGACTT -/A AATGTAAGAC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 2 3 154034 CASAVA_Build 18 65951834 1I GAGCAAAAAG -/C CAATATAATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 2 154035 CASAVA_Build 18 65954442 1I AATAAATAAG -/A AATTACAGCA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 2 3 154036 CASAVA_Build 18 65954642 6D TAATAATAAA TAAATT/------ TAAAGGATAG 3070 hom 45 het 18 0 16 4 TAAATT 1 0 154037 CASAVA_Build 18 65969097 4D AAAGATTCTC CTGT/---- CTAACAGTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTGT 1 0 154038 CASAVA_Build 18 65970432 8D CATCTCTAAG CTGATGAC/-------- TGAAAATTTT 3070 hom 120 het 41 0 39 4 CTGATGAC 1 0 154039 CASAVA_Build 18 65976133 1D AAAAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 40 0 39 3 A 11 10 154040 CASAVA_Build 18 65977126 1I CCTAAATATA -/T ATGCACCCAG 3070 hom 126 het 47 0 42 5 T 0 1 154041 CASAVA_Build 18 65978580 1D ACAGAAAAGG C/- TTTTGATAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 1 0 154042 CASAVA_Build 18 65982767 1I TATCACCATC -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 154043 CASAVA_Build 18 65998808 1I TGGGGAAGAG -/A AAAAAAAAAA 2196 het 1509 hom 25 6 11 8 A 17 18 154044 CASAVA_Build 18 66007082 1I GACTTTCCCA -/C CCCCGCATCC 3070 hom 87 het 40 0 29 11 C 4 5 154045 CASAVA_Build 18 66014513 2D TCTTATCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 1403 het 238 hom 35 4 4 27 A 13 11 154046 CASAVA_Build 18 66014831 3I TGCTTTCCAT ---/CTC CTCCAAAGGC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 CTC 1 2 154047 CASAVA_Build 18 66026233 1I AATTTTTCCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 A 9 10 154048 CASAVA_Build 18 66027583 4D ATTTTATACC CTTT/---- CTTTCTGTTA 3070 het 3070 ref 51 29 14 9 CTTT 2 1 154049 CASAVA_Build 18 66038868 14I ATTTTATCAC --------------/AATTTTTAAAAACA AATTTTTTAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AATTTTTAAAAACA 0 1 154050 CASAVA_Build 18 66109013 2D TTTGAAACAC TG/-- TTTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 TG 1 0 154051 CASAVA_Build 18 66109305 1D CTTTTAATGG C/- CCCCCTTTTT 2700 het 2700 ref 27 14 8 5 C 6 5 154052 CASAVA_Build 18 66115573 1D GTTTTTTTTT C/- CCTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 3 2 154053 CASAVA_Build 18 66115954 1D TAATTATTGC T/- TTCCAAGATT 3070 het 3070 hom 33 7 22 4 T 3 2 154054 CASAVA_Build 18 66116384 4I TTTTAATCTT ----/AAAA AAAGCAATGA 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 A 3 7 154055 CASAVA_Build 18 66119884 1I TGGGAGTGTA -/G GGGCACATCG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 G 3 4 154056 CASAVA_Build 18 66120470 1D CCAAGGTCTT C/- TGATGTCGTT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 C 1 0 154057 CASAVA_Build 18 66120988 1D ACACCAGTAT A/- AAAAAAAAAT 2322 het 2322 ref 21 15 6 1 A 10 9 154058 CASAVA_Build 18 66122459 3I GTAAAGAAAA ---/AAG AGAAAAGACA 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 AAG 0 1 154059 CASAVA_Build 18 66123355 1D GCCGGGAGGT G/- GGAGGTTGCA 3070 hom 53 het 21 0 18 4 G 3 2 154060 CASAVA_Build 18 66132565 1D TTTTTCCCCC T/- GATACAGTCA 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 T 1 0 154061 CASAVA_Build 18 66133082 2D ATTTTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TA 10 9 154062 CASAVA_Build 18 66174257 1I TATTTTGTTC -/A AAAATATAGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 4 5 154063 CASAVA_Build 18 66174717 4D AGGCCAATAT TTGG/---- TTGGTCAGTG 3070 het 3070 ref 45 24 20 4 TTGG 2 1 154064 CASAVA_Build 18 66178519 4I AAAACTGCAA ----/TTAC TTGTGCACTA 3070 het 2404 hom 24 6 12 6 TTAC 0 1 154065 CASAVA_Build 18 66180303 1D ATAGCAACAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 T 9 8 154066 CASAVA_Build 18 66193792 1D AAGTGCAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 10 9 154067 CASAVA_Build 18 66196804 1I GCTCACACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1896 hom 37 11 10 16 T 13 14 154068 CASAVA_Build 18 66209775 1I ATTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 1785 hom 21 het 8 0 8 0 T 10 11 154069 CASAVA_Build 18 66211243 3D TTATTTCATT AAA/--- AAAAAAAAAT 1357 hom 15 het 9 0 6 3 A 12 9 154070 CASAVA_Build 18 66214069 1D GCTCACAATG A/- AAAAGGTGAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 8 A 5 4 154071 CASAVA_Build 18 66219164 1D TTTGTCTGAT A/- AAAATAATTT 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 A 5 4 154072 CASAVA_Build 18 66220657 1I ATGTCACTTT -/G GTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 G 1 2 154073 CASAVA_Build 18 66226752 4D GAGCAAAACG CTCT/---- CTCTAAATAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 4 CT 4 2 154074 CASAVA_Build 18 66228573 3I TCACCATGAC ---/CAT CATCATCATT 3070 hom 96 het 41 0 32 9 CAT 3 4 154075 CASAVA_Build 18 66233236 10D GTATAAACAG TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 2743 hom 32 12 11 10 T 21 11 154076 CASAVA_Build 18 66250398 6I TGGCAGCTCA ------/TACTGC TATGGTAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TACTGC 0 1 154077 CASAVA_Build 18 66255564 4I ACAAAACAAC ----/AACA AAAAAAAAAT 3070 het 2983 hom 19 7 11 1 AACA 0 1 154078 CASAVA_Build 18 66256336 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTG 2720 het 2428 hom 14 6 6 2 T 10 9 154079 CASAVA_Build 18 66268964 1D AAAACTAACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 10 9 154080 CASAVA_Build 18 66281834 1D GTAATAATTA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 T 9 8 154081 CASAVA_Build 18 66285882 1D CTTTGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 12 18 16 T 13 12 154082 CASAVA_Build 18 66290358 1I TCTTCCACCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 47 0 38 9 T 8 9 154083 CASAVA_Build 18 66297449 3D TTTGCTGAGA TGT/--- TGTTAATATG 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 TGT 2 1 154084 CASAVA_Build 18 66301831 4I ATATTGGTGA ----/TAGT TGGGATCTGC 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 TAGT 0 1 154085 CASAVA_Build 18 66304543 1D AATACTTCGC A/- GAGTCAAGTC 3070 het 3070 ref 40 20 20 1 A 1 0 154086 CASAVA_Build 18 66311203 8D TCCACCACTG TAATATTA/-------- TACAGAATAT 3070 het 3070 hom 39 18 21 4 TAATATTA 1 0 154087 CASAVA_Build 18 66311539 1D TTTCCTGTGG C/- GCCCACTACT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 C 1 0 154088 CASAVA_Build 18 66322214 1I CATGGATTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 34 2 24 8 T 14 15 154089 CASAVA_Build 18 66362578 1I GTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2496 het 2496 ref 29 13 9 7 T 13 14 154090 CASAVA_Build 18 66366682 1D CTTCACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3012 hom 29 9 16 4 A 11 10 154091 CASAVA_Build 18 66368899 3I GAGAGGATGT ---/GGA GAAATAGGAA 2512 het 2512 ref 19 11 7 1 GGA 0 1 154092 CASAVA_Build 18 66375564 3D AATGTGCACC TCT/--- TCTTAGGTAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 TCT 2 1 154093 CASAVA_Build 18 66380415 1I CTGCAGAGTA -/T TCCCCAGTAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 1 2 154094 CASAVA_Build 18 66384100 4D GCCACAGGAA ACAG/---- ACAGTGTGGC 3070 het 3070 hom 23 10 12 2 ACAG 2 1 154095 CASAVA_Build 18 66397529 1I ATGGAGGTTT -/G TTGTATAGAT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 G 0 1 154096 CASAVA_Build 18 66401834 5I TTAATTCAGA -----/AAAAG ATCATGGCAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 AAAAG 0 1 154097 CASAVA_Build 18 66403170 2D CAGTCAGTAA AC/-- ACTAGAGAAA 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 AC 2 1 154098 CASAVA_Build 18 66408421 1I TTGCTGTTTT -/A AAAATTCTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 5 154099 CASAVA_Build 18 66419642 1D TCCCACTAGC A/- AATACACAAG 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 3 2 154100 CASAVA_Build 18 66432988 2D CATGACTGTG TA/-- TGTGTATGTG 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 TA 1 0 154101 CASAVA_Build 18 66433266 3D CATTATATCA GTT/--- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 GTT 2 1 154102 CASAVA_Build 18 66450963 1I AATTGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 627 het 627 ref 37 27 3 7 T 10 11 154103 CASAVA_Build 18 66453695 1I GAACTTGGGT -/G TAAGAGCTCA 3070 het 3070 hom 56 20 19 17 G 0 1 154104 CASAVA_Build 18 66462265 11I ATTTTATTAA -----------/TCTATTAATTT TCTATTAATT 1942 hom 12 het 6 0 4 2 TCTATTAATTT 1 2 154105 CASAVA_Build 18 66464069 2D GCACACGTAT AC/-- ACACACACAC 1015 het 1015 ref 60 49 3 9 AC 6 5 154106 CASAVA_Build 18 66471175 1I ATGCTGATAT -/A AATCAATAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 3 154107 CASAVA_Build 18 66493024 1D TTTTGTGCAT A/- AAAAATTGTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 A 6 5 154108 CASAVA_Build 18 66498303 2I TATAGGATTG --/GA TAAATATGAT 3070 het 3070 ref 51 26 24 1 GA 0 1 154109 CASAVA_Build 18 66506721 1D AACAGTGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 A 10 9 154110 CASAVA_Build 18 66506966 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 TA 6 7 154111 CASAVA_Build 18 66507725 2D ATAACAGAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 196 hom 27 3 11 13 A 14 12 154112 CASAVA_Build 18 66507821 1D AAAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2471 hom 24 7 11 6 T 12 11 154113 CASAVA_Build 18 66509293 1D TAATTCAGAG A/- AGACAGAACA 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 A 2 1 154114 CASAVA_Build 18 66510224 1D TTTTGCTGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 9 8 154115 CASAVA_Build 18 66514819 1D TCTCCAGCCA T/- TTGGAACTGT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 3 2 154116 CASAVA_Build 18 66517836 3I CTACTGAGAT ---/GAC GACAGGTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 GAC 1 2 154117 CASAVA_Build 18 66538652 2D AAGTATGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 36 1 29 8 A 15 13 154118 CASAVA_Build 18 66540994 1I GGTGGCGTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 2966 hom 34 8 17 9 A 8 9 154119 CASAVA_Build 18 66544011 2I CCTAGCATTC --/CT CTGTCATATA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CT 1 2 154120 CASAVA_Build 18 66545283 2I CCCGTTAGCT --/AC ACAGACACCA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AC 1 2 154121 CASAVA_Build 18 66553681 1I AGAGTGGGTT -/A AAAAGGCAGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 4 5 154122 CASAVA_Build 18 66556687 1I AACTCAGCTC -/T ACCCCAAGCA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 0 1 154123 CASAVA_Build 18 66593997 1D TGTGTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 11 11 11 T 12 11 154124 CASAVA_Build 18 66595499 1D TCTCCAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 10 9 154125 CASAVA_Build 18 66599619 3D CGTCTCTACT AAA/--- AAAAAAAAAA 1422 het 9 hom 16 1 6 10 A 21 18 154126 CASAVA_Build 18 66611348 1D TATTTACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 12 11 154127 CASAVA_Build 18 66620381 1I AAAATGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 14 3 T 11 12 154128 CASAVA_Build 18 66630375 1I TATTCGGTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 8 9 154129 CASAVA_Build 18 66632521 1D ATCCATGGAG A/- AAGAAGTGAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 3 2 154130 CASAVA_Build 18 66632940 1I ATTTGTTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 41 2 27 12 A 13 14 154131 CASAVA_Build 18 66635289 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 10 0 9 1 A 17 16 154132 CASAVA_Build 18 66645139 1I TATTACAGAC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 7 8 154133 CASAVA_Build 18 66650567 1D AGAGGTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 55 0 39 16 T 12 11 154134 CASAVA_Build 18 66651223 1D TTTAATGTCT A/- ATTTTGTGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 2 1 154135 CASAVA_Build 18 66654460 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 6 A 12 11 154136 CASAVA_Build 18 66664073 5D CTTCTTTTTG TTTAA/----- TTTATTATTT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 TTTAA 1 0 154137 CASAVA_Build 18 66685006 2D TATTTTCTTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 30 het 16 0 10 7 TA 9 8 154138 CASAVA_Build 18 66715103 1D GAAATCCAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 10 9 154139 CASAVA_Build 18 66721584 1I TGACATATCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 396 hom 41 1 35 5 A 9 10 154140 CASAVA_Build 18 66723323 1I CTACATTTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 8 9 154141 CASAVA_Build 18 66727528 2D AAACTTTTGG CA/-- CACACATGTA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 CA 4 3 154142 CASAVA_Build 18 66730289 1D CTGATGGTAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 9 8 154143 CASAVA_Build 18 66735989 1I TGTTTTAAAG -/C TCTATTTCTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 C 0 1 154144 CASAVA_Build 18 66739975 3D CCAGAGTGCC TCT/--- TCTTCTTCAA 3070 hom 116 het 44 0 39 5 TCT 3 2 154145 CASAVA_Build 18 66742348 1D ATAGAGACAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 69 het 25 0 24 3 A 9 8 154146 CASAVA_Build 18 66747191 1D TGTTTCAAAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 8 7 154147 CASAVA_Build 18 66748290 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 33 2 16 15 T 15 14 154148 CASAVA_Build 18 66751084 1D AAATAGATAG A/- AAAAAAGTTA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 A 7 6 154149 CASAVA_Build 18 66753229 1I CATATAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 36 1 27 8 T 10 11 154150 CASAVA_Build 18 66754020 1I TTGTTTTAAG -/C TACTAAATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 154151 CASAVA_Build 18 66756569 6I CTTGTAGGAA ------/ACAATT ACAATCTCAG 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 ACAATT 0 1 154152 CASAVA_Build 18 66771954 4D TCTATGGGGT GGGC/---- GGGGGAGGGC 1737 het 1737 ref 18 9 8 2 GGGC 1 0 154153 CASAVA_Build 18 66793228 2D AAAGGAAGAC AG/-- TGTTTGCATG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AG 1 0 154154 CASAVA_Build 18 66793515 2D CAGTAGAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 13 11 154155 CASAVA_Build 18 66794829 2D CATATGTGTA TT/-- TTATATATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 4 2 154156 CASAVA_Build 18 66798303 1I ATATAATATA -/C CCAGAATATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 3 154157 CASAVA_Build 18 66814932 1I GTTTTTGAGG -/C CCCCCCACCC 2660 het 2660 ref 25 15 9 1 C 6 7 154158 CASAVA_Build 18 66843851 1D CTTGATGAAT G/- GGGCTCTGTC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 G 4 3 154159 CASAVA_Build 18 66852401 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1355 hom 23 4 13 7 A 9 10 154160 CASAVA_Build 18 66856471 1I GAGCACAATA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 42 21 16 5 T 7 8 154161 CASAVA_Build 18 66864923 1I TGCCCTAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 9 10 154162 CASAVA_Build 18 66867510 1D GATATGTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 228 hom 39 1 33 5 A 10 9 154163 CASAVA_Build 18 66871562 1I ATAACAGGAA -/T TTTTTGTATG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 5 6 154164 CASAVA_Build 18 66878759 1I AACAATGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1426 hom 48 4 35 9 A 11 12 154165 CASAVA_Build 18 66892018 2D ATGTTTATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 14 12 154166 CASAVA_Build 18 66892348 2D GTTATACAAA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 T 10 8 154167 CASAVA_Build 18 66892835 3D TGTAAATAAT ATA/--- ATGATTATCA 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 ATA 1 0 154168 CASAVA_Build 18 66894090 6D TATACTTTTT GCTTAA/------ TGATGTTTGC 3070 hom 135 het 49 0 46 4 GCTTAA 1 0 154169 CASAVA_Build 18 66898796 1I AACTTGCATT -/A AAAATTGCAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 4 5 154170 CASAVA_Build 18 66899857 2D TTCAGTTAAC AG/-- ATTGTTTTCC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AG 1 0 154171 CASAVA_Build 18 66901398 1D TGAGTACCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 95 het 41 0 32 9 T 10 9 154172 CASAVA_Build 18 66907076 1D TTTTTTAACC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 7 154173 CASAVA_Build 18 66917314 1I GTTTCATGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 950 hom 50 3 38 9 T 9 10 154174 CASAVA_Build 18 66924471 1I AATTCACAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 9 10 154175 CASAVA_Build 18 66944879 1I GAATAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 0 1 154176 CASAVA_Build 18 66945878 1I TTGTGTTCAA -/T TATTTTAACT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 1 2 154177 CASAVA_Build 18 66946470 1I66M1D CGTTCTCTAA -TTCCTAAGATGCAAGCTTCAGTTATTAATTTTAGGTCTTTCTTCTTTCTAAATATTTGTATTTAGCA/TTTCCTAAGATGCAAGCTTCAGTTATTAATTTTAGGTCTTTCTTCTTTCTAAATATTTGTATTTAGC- CTATAAATTT 3070 het 3070 ref 42 42 12 9 N/A 0 0 154178 CASAVA_Build 18 66947369 3D ATCTCCATTT ATA/--- ATGATTATTG 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 ATA 1 0 154179 CASAVA_Build 18 66947506 1D TTTCTACTAA T/- TTTTAATTTA 2953 het 1826 hom 12 5 6 1 T 5 4 154180 CASAVA_Build 18 66959069 4D AAAAAAGAGA TAAT/---- TAAGAATGAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 TAAT 1 0 154181 CASAVA_Build 18 66964932 1D GCTGTGCATA T/- TTTTTTGAAC 3070 het 3070 hom 37 15 18 6 T 7 6 154182 CASAVA_Build 18 66965694 1D ATTCCAAATA T/- TAATGAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 2 1 154183 CASAVA_Build 18 66965897 1D CAATAATAAT A/- AAAAAAACCC 2279 het 2279 ref 18 10 6 3 A 8 7 154184 CASAVA_Build 18 66966208 1D CATAATTCTA T/- TTTTTATAAA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 6 5 154185 CASAVA_Build 18 66966853 3D GCTTGTTTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 31 1 22 8 T 15 12 154186 CASAVA_Build 18 66970112 6D TACTCTTGCA ATTATG/------ ATTTGACAAC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 ATTATG 1 0 154187 CASAVA_Build 18 66970196 5I CTAACTTGTC -----/TTATG TTATATTTTC 3070 hom 89 het 36 0 30 6 TTATG 0 1 154188 CASAVA_Build 18 66970423 8D AGAGACAGCA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 3070 het 811 hom 20 3 11 7 AAAT 8 6 154189 CASAVA_Build 18 66970606 1I TGGATAGAAG -/A AAAAAAAAAG 2104 het 2104 ref 23 13 5 5 A 9 10 154190 CASAVA_Build 18 66971042 1I ACACACTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 8 9 154191 CASAVA_Build 18 66973895 2I CCCTGATAAC --/TG TCACTCCACT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TG 0 1 154192 CASAVA_Build 18 66982411 2D ATTTGGAAAC AT/-- ATTTTTAATA 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 AT 2 1 154193 CASAVA_Build 18 66982663 3D ATTTCATAAT ATC/--- ATGACAATTA 3070 het 3070 hom 26 13 13 1 ATC 1 0 154194 CASAVA_Build 18 66984579 1D TATTATAGAC T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 8 7 154195 CASAVA_Build 18 66985518 1I AATGGAAGGT -/A AAGGGTCACT 3070 hom 147 het 56 0 49 7 A 2 3 154196 CASAVA_Build 18 66986774 1D AGTCAATTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 9 8 154197 CASAVA_Build 18 66991747 2D GAGTCTGAGA GT/-- GTGTTTTTGA 3070 hom 126 het 45 0 43 3 GT 3 2 154198 CASAVA_Build 18 67005285 2I TAATATATAT --/AA TATTTCTGTA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 A 0 2 154199 CASAVA_Build 18 67009302 4D TTGTGTAAAA TCTT/---- TCTTTTGGGA 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 TCTT 2 1 154200 CASAVA_Build 18 67009674 1I ATTAATATTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 8 9 154201 CASAVA_Build 18 67012242 1D GACCACTGAA G/- TGTGGTACCT 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 G 1 0 154202 CASAVA_Build 18 67015499 1I TTAGAATGTA -/C ACATATGTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 0 1 154203 CASAVA_Build 18 67015989 10D AGTGGGTTTC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 1721 hom 15 het 10 0 6 4 AT 11 6 154204 CASAVA_Build 18 67017896 2D TTTGTTTCTA CC/-- CCTTAATATC 3070 het 3070 hom 45 15 22 9 C 4 2 154205 CASAVA_Build 18 67021612 1I AGAGACCCAG -/A AAAAAATGCC 3070 hom 69 het 37 0 31 6 A 6 7 154206 CASAVA_Build 18 67028155 5D TGAAATACTT ATGAG/----- ATATTATTTG 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 ATGAG 1 0 154207 CASAVA_Build 18 67031863 3D GCATGACAGA TGT/--- TGTAAATTTG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TGT 2 1 154208 CASAVA_Build 18 67031944 1D TTTCAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 30 1 25 4 T 11 10 154209 CASAVA_Build 18 67038448 5I CAAAACCAAT -----/GTAGA GTATTTAGAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GTAGA 0 1 154210 CASAVA_Build 18 67038945 1I TGCACTCCAG -/C CCAGGCGACA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 2 3 154211 CASAVA_Build 18 67052101 2I TGTTTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 TA 5 6 154212 CASAVA_Build 18 67052330 2I TATTTTAAAC --/AG AGAACTTTTA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 AG 1 2 154213 CASAVA_Build 18 67054273 1D ATGTTTACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 T 11 10 154214 CASAVA_Build 18 67055114 2D AGTGGGAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 5 T 14 12 154215 CASAVA_Build 18 67056647 4I TTTAGATAAT ----/ACTG ACAGTAAAAT 3070 hom 105 het 45 0 36 9 ACTG 0 1 154216 CASAVA_Build 18 67059283 1I ACCTTAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 9 10 154217 CASAVA_Build 18 67090276 3I CTATAAACAT ---/AAA AACCTGTTAA 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 2 5 154218 CASAVA_Build 18 67092362 2I TGTACTTATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 52 18 24 10 TG 6 7 154219 CASAVA_Build 18 67127188 4I CATATTATCT ----/CTAA CCAAGATTAA 3070 het 1593 hom 20 4 11 5 CTAA 0 1 154220 CASAVA_Build 18 67129105 1I31M1I ATTTTATGAT -AAAAAAAAAACAAGAAGAAAGAAAAACAGGC-/AAAAAAAAAAACAAGAAGAAAGAAAAACAGGCA AAAAAATAGG 3070 het 3070 ref 23 17 8 13 N/A 0 0 154221 CASAVA_Build 18 67150511 3I AGGCTATAGT ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 60 27 19 14 AAC 5 6 154222 CASAVA_Build 18 67152610 1I CCATGAAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 9 10 154223 CASAVA_Build 18 67152824 2D TCCTACTAAC AG/-- AGCTGCTGTG 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 AG 2 1 154224 CASAVA_Build 18 67154194 3I TAGAAGATAA ---/TAT TATGCTTCTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TAT 1 2 154225 CASAVA_Build 18 67156139 1I AAAACTTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 12 13 A 13 14 154226 CASAVA_Build 18 67164491 1D AATACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 11 10 154227 CASAVA_Build 18 67164963 1D CTTATCTTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 9 8 154228 CASAVA_Build 18 67170655 1D AGTAGTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 11 10 154229 CASAVA_Build 18 67218486 1I CCAAAAGGCT -/C CCCCCTTCAT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 C 5 6 154230 CASAVA_Build 18 67222548 7I GGGATTTAAA -------/TACAGTT TACAGTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 28 8 TACAGTT 1 2 154231 CASAVA_Build 18 67224990 10I TTCTGACACG ----------/TGGGCTAACA TTATGAACAG 3070 hom 39 het 15 0 14 2 TGGGCTAACA 0 1 154232 CASAVA_Build 18 67227328 3I TCAGCTTAAT ---/AAC AGGTCCTCAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AAC 0 1 154233 CASAVA_Build 18 67230009 2D23M1I GGTTGCGAAA ATGTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCC-/--GTTTACTGAGAATGATGGTTTCCA TGTTCACTCT 2429 hom 12 het 4 0 5 0 N/A 0 0 154234 CASAVA_Build 18 67232911 3D ACCTGTAATT AAA/--- AAGGCAAAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 A 5 2 154235 CASAVA_Build 18 67233003 1I AAATTCATAG -/A AAAAAATTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 6 7 154236 CASAVA_Build 18 67234033 6D TCTATATCTA TATATC/------ TATATTTATG 3070 hom 69 het 25 0 24 3 TATATC 1 0 154237 CASAVA_Build 18 67275614 3D TCTCTTTCTG TTC/--- TTCTCTGGAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TTC 2 1 154238 CASAVA_Build 18 67278951 1I GAGGTGGGGT -/G GGGGGGTGTT 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 G 6 7 154239 CASAVA_Build 18 67284618 1D ATCCATGCCC A/- GGGCCTCAGT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 1 0 154240 CASAVA_Build 18 67291097 8I AACAAATACC --------/AATCTGTA AATTTGTGTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AATCTGTA 0 1 154241 CASAVA_Build 18 67292565 5I TCTAAGACTT -----/ATATG ATAATATTGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 ATATG 0 1 154242 CASAVA_Build 18 67294393 2D ATAAAATGGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 76 het 30 0 26 4 AT 7 6 154243 CASAVA_Build 18 67297758 1D ATCTATCCCA T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 35 19 15 1 T 8 7 154244 CASAVA_Build 18 67305403 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 2643 het 60 hom 10 2 8 1 AC 9 8 154245 CASAVA_Build 18 67305736 2I ATAGAAAGCT --/GG GGGGGCCAAG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 G 5 7 154246 CASAVA_Build 18 67310370 4D TGGTCTCAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 38 14 14 11 AAAC 5 4 154247 CASAVA_Build 18 67313013 1I TTATATTTTC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 8 154248 CASAVA_Build 18 67316208 1I CATCTCTCTG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 7 8 154249 CASAVA_Build 18 67318075 1D AATTCGAGTA G/- GACCTGTAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 4 G 2 1 154250 CASAVA_Build 18 67321485 2I AAATTCAGAA --/AG AGATGGGTGG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AG 1 2 154251 CASAVA_Build 18 67328465 2I TTTAATAAAA --/TG TAATTATTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TG 0 1 154252 CASAVA_Build 18 67331738 1D CATATGAGCA T/- AATCACTCTA 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 1 0 154253 CASAVA_Build 18 67332138 1I AAACTCAGCA -/T TAAGGAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 2 154254 CASAVA_Build 18 67335954 2I AATGAGTAAC --/AT AAAGAAAGAA 1670 het 134 hom 25 3 7 15 AT 0 1 154255 CASAVA_Build 18 67338924 1I AATTTAATAA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 6 7 154256 CASAVA_Build 18 67340874 4I ATAAAATAAC ----/AATT AAGCTTAGTG 3070 hom 117 het 45 0 40 8 AATT 0 1 154257 CASAVA_Build 18 67352284 6I ACTGTCAAAC ------/TATAAG TATATTCCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TATAAG 0 1 154258 CASAVA_Build 18 67356890 1I CTTTGGAATA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 5 6 154259 CASAVA_Build 18 67360998 3I GTAAACAAAT ---/ATA AGAAGAGAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATA 0 1 154260 CASAVA_Build 18 67368320 1D TGAATATAAG A/- ATGTCAAACA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 2 1 154261 CASAVA_Build 18 67369438 2I ATAGGTATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 AC 6 7 154262 CASAVA_Build 18 67371059 3I AAGCATTATC ---/AGG AGAAGAATCC 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 AGG 0 1 154263 CASAVA_Build 18 67385967 4I CATAGACATC ----/AGTT AATTAATTAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AGTT 0 1 154264 CASAVA_Build 18 67386371 1I CAAAAAAAGG -/A AAAACTTCAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 4 5 154265 CASAVA_Build 18 67386523 2I TATTCATATA --/AT ATATATGTTA 1905 hom 10 het 4 0 4 0 AT 3 4 154266 CASAVA_Build 18 67390504 1D AATTAAAAAA T/- ATATACACTA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 1 0 154267 CASAVA_Build 18 67396991 4D TGTGTATGTG TATA/---- TATATATATA 1224 hom 10 het 6 0 4 2 TA 8 6 154268 CASAVA_Build 18 67401029 1D15M1D TTCAGCATGC TTTTTTTTTTTATAAAG/-TTTTTTTTTTATAAA- GACTCAGTAG 3070 hom 96 het 33 0 33 4 N/A 0 0 154269 CASAVA_Build 18 67405934 1D TCCTGTGAGA T/- TTATTCTGTG 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 T 3 2 154270 CASAVA_Build 18 67407170 1D CCTGTGACTG C/- CAATTGCCTG 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 C 2 1 154271 CASAVA_Build 18 67409876 1I AGACACTAAA -/C AAAGCAAGTC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 0 1 154272 CASAVA_Build 18 67410991 1D TGAACAAAGA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 T 9 8 154273 CASAVA_Build 18 67414823 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 16 0 T 13 14 154274 CASAVA_Build 18 67434250 1D ACCTACAATC T/- TAACAAGTTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 2 1 154275 CASAVA_Build 18 67435063 4I GACGTATGAT ----/TTTC TTTCTTTATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTTC 1 2 154276 CASAVA_Build 18 67443357 1I AAAATAAATA -/G ACTGGGCACG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 0 1 154277 CASAVA_Build 18 67456454 1D GAATAAAGTA T/- GGGCTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 0 154278 CASAVA_Build 18 67461246 1I ATGCTTTTGT -/G CAAGAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 154279 CASAVA_Build 18 67461815 4I TTTTTCTTTG ----/TTTC TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 TTTC 0 1 154280 CASAVA_Build 18 67473254 4I AAGAGTAGAT ----/ATTC ATTCAGTGCT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 ATTC 1 2 154281 CASAVA_Build 18 67476146 4I TCCACATCTC ----/TAAT TATGCATAGA 2082 het 2082 ref 26 17 5 4 TAAT 0 1 154282 CASAVA_Build 18 67476374 1D TCTCTGCCTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 50 19 28 4 T 8 7 154283 CASAVA_Build 18 67482110 1I AAAAAAAAAA -/T ATATATATGA 3070 het 206 hom 24 3 12 9 T 0 1 154284 CASAVA_Build 18 67482324 1I CCATAATTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 9 10 154285 CASAVA_Build 18 67483028 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 18 2 14 2 A 12 11 154286 CASAVA_Build 18 67484396 4I TTTATTTCAG ----/TCTT TCTTCAAAGA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TCTT 1 2 154287 CASAVA_Build 18 67484538 1I TATAGTTAAT -/A TTTTTGGCTC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 0 1 154288 CASAVA_Build 18 67484838 3D AACTCTCAAG TAC/--- TACTATGCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TAC 2 1 154289 CASAVA_Build 18 67485423 3D TGAAAAGAGG TCC/--- CCTCGGAGCT 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 TCC 1 0 154290 CASAVA_Build 18 67494451 1I GAACATATGT -/G TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 0 1 154291 CASAVA_Build 18 67501251 1I AGAGAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 10 11 154292 CASAVA_Build 18 67504157 5D ATAAATGTGA TATAT/----- TATATTAACA 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 TATAT 2 1 154293 CASAVA_Build 18 67504393 1I AGGAGGCCCA -/C TTTTTCTACT 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 C 0 1 154294 CASAVA_Build 18 67504486 1I GGAAATAAAG -/A AGTCAAATTA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 1 2 154295 CASAVA_Build 18 67504741 1I GACACTGATG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 7 8 154296 CASAVA_Build 18 67506197 4D ATACACACAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 101 hom 11 1 10 0 AT 10 8 154297 CASAVA_Build 18 67510568 1D AAATTGAAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 10 9 154298 CASAVA_Build 18 67510664 5D TCTGCAACTG GTCAC/----- GTGGGAGTAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 6 GTCAC 1 0 154299 CASAVA_Build 18 67513339 2D TGTTTTTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 172 hom 37 3 20 14 A 12 10 154300 CASAVA_Build 18 67521933 4D ATCTCTTCTC CCTT/---- CCTTTTTTTC 2093 het 2093 ref 20 9 7 4 CCTT 2 1 154301 CASAVA_Build 18 67522038 1I3M1I42M4D TCTATCACTT -ATA-TGATATCTGCATAATACCGTGCACTTAAATAGAATAGTTTTTATTA/AATATTGATATCTGCATAATACCGTGCACTTAAATAAAATAGTTTTT---- ATTTCAGGTT 3070 het 3070 ref 28 17 16 3 N/A 0 0 154302 CASAVA_Build 18 67522179 1D CATTCATTCA T/- TTTTTTCCAC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 7 6 154303 CASAVA_Build 18 67523019 1D TAGCTTTGCT A/- AAAAAAGTTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 7 6 154304 CASAVA_Build 18 67528418 3I GAGCTAAAAA ---/ATG ATCGTCAGGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATG 0 1 154305 CASAVA_Build 18 67530759 4D CTTGAACACA CAGT/---- CAATTTTTAC 3070 hom 135 het 48 0 46 3 CAGT 1 0 154306 CASAVA_Build 18 67532224 1I TAATATATCA -/T TTTTCCCAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 5 154307 CASAVA_Build 18 67532550 1D CAAGCATCAT A/- AAAACATATT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 5 4 154308 CASAVA_Build 18 67532836 4I ATTCTAAGAA ----/AATT AATTCCTAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AATT 1 2 154309 CASAVA_Build 18 67546770 2I TAGAGTAACC --/AT AGAGAAAAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 0 1 154310 CASAVA_Build 18 67549719 3D ATGAAAAATG ATT/--- ATATTAATAT 2175 hom 18 het 7 0 7 1 ATT 1 0 154311 CASAVA_Build 18 67565641 2I TAAAATCAGG --/AT ATATATGTTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AT 3 4 154312 CASAVA_Build 18 67576267 1I ACTTATTTGT -/G GGATCTAAAA 3070 hom 126 het 46 0 40 6 G 2 3 154313 CASAVA_Build 18 67587887 4D TAAAATAAAG ACTT/---- ACTTACAGAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 ACTT 2 1 154314 CASAVA_Build 18 67590090 5D GACACAGCAA AGGAT/----- AGGCACTGCC 3070 het 3070 ref 53 25 25 5 AGGAT 1 0 154315 CASAVA_Build 18 67593388 1I TAAAATTACA -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 T 7 8 154316 CASAVA_Build 18 67594876 4D TCAAGTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1768 hom 24 5 12 7 TTTG 4 3 154317 CASAVA_Build 18 67615053 1I AGTGAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 A 9 10 154318 CASAVA_Build 18 67618684 1I TTGTTGATAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 7 8 154319 CASAVA_Build 18 67619435 4I AGCAATTAAC ----/AAAT AAGTAAACAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AAAT 0 1 154320 CASAVA_Build 18 67621052 2I GTCAATACTT --/TA TATATATATA 2191 hom 21 het 9 0 8 1 TA 8 9 154321 CASAVA_Build 18 67621400 8D CTTATATATA CATATATG/-------- CATATATGCA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 CATATATG 2 1 154322 CASAVA_Build 18 67622897 3I TCAAAAAAAA ---/AAT AAAAATAATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AAT 0 1 154323 CASAVA_Build 18 67624576 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 A 6 7 154324 CASAVA_Build 18 67625607 2D AAAAATAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2281 hom 18 het 12 0 7 6 A 14 12 154325 CASAVA_Build 18 67629292 1D CAGCATTGTC A/- TATAATGTTA 3070 het 3070 ref 60 31 25 6 A 1 0 154326 CASAVA_Build 18 67632737 1D TTAAAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 794 hom 36 5 14 17 A 12 11 154327 CASAVA_Build 18 67660366 4D TTGACAAAAT AAGG/---- AAGTCTCATG 2959 het 2959 ref 22 14 8 1 AAGG 1 0 154328 CASAVA_Build 18 67668609 1D AATAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 306 hom 32 3 11 18 T 12 11 154329 CASAVA_Build 18 67670006 10D TTTTAATTAC TTTGTAAATT/---------- GTCTAAATCT 3049 het 3049 ref 22 16 7 4 TTTGTAAATT 1 0 154330 CASAVA_Build 18 67670895 1I GTTTCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 10 12 A 11 12 154331 CASAVA_Build 18 67672896 1I AATATTTGTC -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 6 7 154332 CASAVA_Build 18 67673955 2D ACAAGAGAGA GT/-- GTGTGTGAGC 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 GT 4 3 154333 CASAVA_Build 18 67674219 1D AAAATATTTT G/- GTTTTTTTTT 2583 het 2440 hom 21 9 7 5 G 2 1 154334 CASAVA_Build 18 67675413 1I AAATAGAAAC -/A AAAAAATGTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 7 154335 CASAVA_Build 18 67675925 1I CTTGTATTAG -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 6 7 154336 CASAVA_Build 18 67679855 12D AGAGAAACTC CCAATTTTAACA/------------ CCATCAGATC 3070 het 3070 hom 35 14 19 5 CCAATTTTAACA 1 0 154337 CASAVA_Build 18 67681907 1D CTCACCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 463 hom 32 2 22 8 T 15 14 154338 CASAVA_Build 18 67683871 1I GGTTGGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2571 hom 43 11 16 16 T 16 17 154339 CASAVA_Build 18 67684831 1I AGTTGTTTAA -/T TTTCATGTAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 4 154340 CASAVA_Build 18 67691207 1I TTTTTGTGGA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 52 29 15 8 T 8 9 154341 CASAVA_Build 18 67693973 2I GTCAATGATG --/GT TATAAGACAG 3070 hom 154 het 55 0 52 3 GT 0 1 154342 CASAVA_Build 18 67704721 1I TGTTGACCAC -/T TTTTTTATAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 6 7 154343 CASAVA_Build 18 67705100 4D AATAAATAAA TAAG/---- TAAGTAAGTA 3070 hom 57 het 23 0 20 5 TAAG 3 2 154344 CASAVA_Build 18 67710076 4D ATATATCATC TATA/---- TATATATATA 3070 het 12 hom 23 1 10 13 TA 10 8 154345 CASAVA_Build 18 67710262 1I ATGTGTTCTT -/A ACAATTTCTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 1 2 154346 CASAVA_Build 18 67711947 2D AAAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 3070 hom 40 het 19 0 14 6 AT 1 0 154347 CASAVA_Build 18 67736260 1I AATTTTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 133 hom 39 1 37 1 T 9 10 154348 CASAVA_Build 18 67739760 1D TAAGCACTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 10 9 154349 CASAVA_Build 18 67754700 1D GTGAGTACAT G/- GGTGTTTGTA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 G 3 2 154350 CASAVA_Build 18 67762474 4I TGTGTATATT ----/ATAA ATAATCACTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 ATAA 1 2 154351 CASAVA_Build 18 67778033 1D TTTACATATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 A 9 8 154352 CASAVA_Build 18 67778671 3D AGGGCTGAGA CTT/--- CTTAACACCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CTT 2 1 154353 CASAVA_Build 18 67789393 1D TATCTTCCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 9 8 154354 CASAVA_Build 18 67790851 1I GTTGTGATGT -/G GAAAAAAACA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 G 1 2 154355 CASAVA_Build 18 67797111 5I AATCTGCCTA -----/CATTT TTTACATGTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 CATTT 0 1 154356 CASAVA_Build 18 67798784 11I AGCCAACACT -----------/CAGCCTGCACA CAGCCTGCAC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 CAGCCTGCACA 1 2 154357 CASAVA_Build 18 67805897 1D TTCTTCTACT A/- AAAAAAGCCA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 7 6 154358 CASAVA_Build 18 67809054 5I TTTGTAAGAT -----/TAAAA TAATATAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TAAAA 0 1 154359 CASAVA_Build 18 67809588 1I TAACATCAAA -/T GTACATATAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 154360 CASAVA_Build 18 67818557 1D CCCGCCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 10 8 A 13 12 154361 CASAVA_Build 18 67820819 2I GTCATTCCAC --/AT GTTAAATTTT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 AT 0 1 154362 CASAVA_Build 18 67835262 1D TGAAGGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 T 12 11 154363 CASAVA_Build 18 67846038 1I TTTATACATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 9 10 154364 CASAVA_Build 18 67846169 1I AAGTCTTTAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 8 9 154365 CASAVA_Build 18 67851326 1I AGTGGCCCGT -/C CTGCTGTGGT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 C 1 2 154366 CASAVA_Build 18 67852902 2D TCCCAAGCCT CA/-- GTTTTTGACT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 CA 1 0 154367 CASAVA_Build 18 67860913 2I AGTTCATATG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 54 22 23 9 AT 6 7 154368 CASAVA_Build 18 67861542 1D ACACAGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3057 het 3057 ref 33 15 8 10 T 11 10 154369 CASAVA_Build 18 67871219 1I TTAAAAATAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 8 9 154370 CASAVA_Build 18 67874207 1D TTGGGAGAGT A/- AAAAAAAAAA 2996 het 2996 ref 37 13 11 14 A 17 16 154371 CASAVA_Build 18 67877077 1I GTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 T 8 9 154372 CASAVA_Build 18 67902774 3I TAAATGTCAA ---/TAT TAATATAAAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TAT 0 1 154373 CASAVA_Build 18 67922085 1D GTGTATCTAT C/- TACATGTCAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 C 1 0 154374 CASAVA_Build 18 67922495 1D AAAAGTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 10 9 154375 CASAVA_Build 18 67929094 3D ATATTATATA AAT/--- ATTATGTAAC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AAT 1 0 154376 CASAVA_Build 18 67931011 1I AAGACCTGTC -/A ACAACTAGTG 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 A 1 2 154377 CASAVA_Build 18 67951746 3D AAAGAGGAAC AAG/--- AAGGATAGAG 3070 hom 72 het 29 0 25 13 AAG 2 1 154378 CASAVA_Build 18 67956141 2I ATCATACAAA --/AC AGTTTAAATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AC 0 1 154379 CASAVA_Build 18 67957402 1I ATTTATGGGG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 14 het 37 1 34 2 T 8 9 154380 CASAVA_Build 18 67986144 2I TACCCTAAAC --/TT TGCATCACAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 1 3 154381 CASAVA_Build 18 67986245 5I CACCATGAAT -----/CTAAA CTAAAGTAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CTAAA 1 2 154382 CASAVA_Build 18 67990220 38D AGACTCTTTT ATTATCTTTTCTCTGTCTTGCAATGAAGTCTTTTATTA/-------------------------------------- ATTATCTTTT 3070 hom 48 het 27 0 17 17 ATTATCTTTTCTCTGTCTTGCAATGAAGTCTTTTATTA 1 0 154383 CASAVA_Build 18 67997269 1D AGCTAAAGGG A/- AAAAATATGT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 6 5 154384 CASAVA_Build 18 67999235 1D TTCTAGGTAG T/- TTGCAGATTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 3 2 154385 CASAVA_Build 18 68005530 2I TGAATCAACT --/AA AAGAGTTAGA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 2 4 154386 CASAVA_Build 18 68007250 2I CACAGTTTGG --/TT TTCCATTCAC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 2 4 154387 CASAVA_Build 18 68007706 3I GTGTTGCTTG ---/TCT TCTTCTTGTT 3070 hom 151 het 58 0 51 7 TCT 2 3 154388 CASAVA_Build 18 68023758 1I AATACAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 514 hom 48 3 34 11 A 13 14 154389 CASAVA_Build 18 68031495 1D TATCAACAAA G/- GGTCTTACAA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 G 3 2 154390 CASAVA_Build 18 68031554 1D TTTGATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 28 0 21 8 T 13 12 154391 CASAVA_Build 18 68032271 1I GTGCAGGACA -/T TTTTTGTTGC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 5 6 154392 CASAVA_Build 18 68034119 1D ACAATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 12 11 154393 CASAVA_Build 18 68034326 1D CATAATGTGT A/- AAATTCCATC 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 A 4 3 154394 CASAVA_Build 18 68040382 1I AATCTCTCTT -/A AAAAAATCTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 7 154395 CASAVA_Build 18 68048881 2D TAAAATTAGA AT/-- ATATATATAT 1771 hom 27 het 12 0 10 2 AT 6 5 154396 CASAVA_Build 18 68050830 1D TGAGGTCTTC T/- TTCCCTTTAC 3070 hom 115 het 48 0 39 9 T 3 2 154397 CASAVA_Build 18 68051108 1D GGGGCCCTCT C/- CCTGCCCTGC 3070 hom 82 het 32 0 25 7 C 3 2 154398 CASAVA_Build 18 68051197 1D ATTTGGATTG T/- TTAAAGTTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 3 2 154399 CASAVA_Build 18 68054521 1D GTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 12 11 154400 CASAVA_Build 18 68063679 1D GCGATAGCTG A/- AAAAAAAAAG 1359 het 1359 ref 32 22 3 12 A 10 9 154401 CASAVA_Build 18 68067970 1D ATGTTTAGAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 2190 hom 33 7 21 6 A 8 7 154402 CASAVA_Build 18 68068739 2D CTGTTACAGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 AT 6 5 154403 CASAVA_Build 18 68073694 4D ATAAATAAAC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AAAT 5 4 154404 CASAVA_Build 18 68075077 4D TCGGAATTAT TCTG/---- TCTATTAGGC 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 TCTG 1 0 154405 CASAVA_Build 18 68080794 1I ACATGAAGTG -/A AAAAAAAAAA 1057 het 1057 ref 31 23 3 5 A 10 11 154406 CASAVA_Build 18 68084313 1D ATTATTCCTG T/- TTTTATGTGC 3070 het 3070 ref 37 20 11 7 T 5 4 154407 CASAVA_Build 18 68109973 11I TGAATCCCTT -----------/TGGACCCCTAC CTACTCCCCC 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TGGACCCCTAC 0 1 154408 CASAVA_Build 18 68110063 1D ATTTGGTGTA T/- TTGTGGCTAG 3070 hom 108 het 38 0 35 3 T 3 2 154409 CASAVA_Build 18 68110203 17I TCTGCATTTC -----------------/AAAGGCTCTATGCTTTT ACAGTTTTAG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AAAGGCTCTATGCTTTT 0 1 154410 CASAVA_Build 18 68122576 1I GGATGGCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 25 0 18 7 A 9 10 154411 CASAVA_Build 18 68122795 1I CTAACAACAA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 6 7 154412 CASAVA_Build 18 68123400 1D TTTTTTCATG T/- TTGATAGTGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 2 154413 CASAVA_Build 18 68124624 3D AAAATTTTAA TTG/--- TTGTATGTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 10 TTG 2 1 154414 CASAVA_Build 18 68125656 1I AATACCACTG -/T TTTTTGGTAT 3070 hom 120 het 42 0 40 2 T 5 6 154415 CASAVA_Build 18 68125790 1D TAGGTCTGAA G/- GTCAGACGTT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 G 2 1 154416 CASAVA_Build 18 68128071 1D GAAAATTAAG A/- AGAGTAAAGA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 2 1 154417 CASAVA_Build 18 68136456 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 32 2 12 18 T 15 14 154418 CASAVA_Build 18 68137714 1I TGGTTACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 A 10 11 154419 CASAVA_Build 18 68138061 5I ACAAAAACAA -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 AAAAC 3 4 154420 CASAVA_Build 18 68142632 4I CTTCTTCCTC ----/CCTT CCTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 CCTT 1 2 154421 CASAVA_Build 18 68147896 1D AAGGAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2363 hom 34 11 10 14 T 11 10 154422 CASAVA_Build 18 68151178 1I AATGTTGCTA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 31 26 4 G 1 2 154423 CASAVA_Build 18 68151449 1I TCACTAGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 9 10 154424 CASAVA_Build 18 68152020 1D GTGTGAAGAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 47 21 16 11 A 9 8 154425 CASAVA_Build 18 68152160 2D CAGCACTGGT GG/-- AAAATGTGAC 3070 het 3070 ref 54 29 22 3 G 2 0 154426 CASAVA_Build 18 68152969 1D ACATGTACAC T/- GTCTTGTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 1 0 154427 CASAVA_Build 18 68153852 1D CTTATTGACT A/- TAAATTCAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 5 A 1 0 154428 CASAVA_Build 18 68154507 4I TAATTAAGGA ----/CTGT CTGACACAGA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 CTGT 0 1 154429 CASAVA_Build 18 68155053 1I CTTGTTTTCA -/G TAAGCTGGGA 3070 het 3070 ref 47 29 17 1 G 0 1 154430 CASAVA_Build 18 68158687 12D GCAATTTCAC CTGGAGTCTTGA/------------ CTGGTGGGGA 3070 het 3070 ref 31 19 12 4 CTGGAGTCTTGA 1 0 154431 CASAVA_Build 18 68160518 5D AGTAATCTAC TTTAT/----- TTTATTTTGT 3070 het 3070 hom 40 10 23 7 TTTAT 2 1 154432 CASAVA_Build 18 68161389 2I GATAAATAAC --/AG ATGTTGGCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AG 0 1 154433 CASAVA_Build 18 68161663 1I ATGAGTGGAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 37 10 23 4 A 7 8 154434 CASAVA_Build 18 68169744 6D CTGAATGCAC CAGAGG/------ CAGAGGCAGA 3070 het 3070 hom 41 15 18 10 CAGAGG 3 2 154435 CASAVA_Build 18 68170877 3D AAAAAAAACT ATG/--- ATTTGTCCCC 3070 hom 138 het 51 0 47 5 ATG 1 0 154436 CASAVA_Build 18 68177684 1D ATCTCACCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 63 27 26 10 A 10 9 154437 CASAVA_Build 18 68185762 2D GTGTATGTGC GT/-- GTGTGTGTTT 897 het 897 ref 31 13 9 9 GT 5 4 154438 CASAVA_Build 18 68185781 2I TTTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 850 het 850 ref 23 5 8 10 TG 6 7 154439 CASAVA_Build 18 68201079 2D ATCAATATGT AA/-- AAGACTCAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 4 2 154440 CASAVA_Build 18 68204528 1D AGGGTCATTT C/- AAGTCCATCT 3070 hom 108 het 41 0 35 7 C 1 0 154441 CASAVA_Build 18 68206326 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 10 0 8 2 A 11 10 154442 CASAVA_Build 18 68223050 1I CTAAAAATAC -/A AAAATATTAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 4 5 154443 CASAVA_Build 18 68230467 1D ATTTACTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 289 hom 43 1 34 8 T 10 9 154444 CASAVA_Build 18 68230825 3D TTTGAAATAT ACG/--- ACAAGTTATA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ACG 1 0 154445 CASAVA_Build 18 68236157 1D TAATCTACTA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 8 7 154446 CASAVA_Build 18 68241830 1D ACCTAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 30 2 18 11 A 13 12 154447 CASAVA_Build 18 68245506 3I GTAAGACAAA ---/ACT ACTGACTTCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ACT 1 2 154448 CASAVA_Build 18 68256291 1I GCTCTTGCAA -/C AAAGTCTATC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 0 1 154449 CASAVA_Build 18 68263641 1D TGTCTAAAAC A/- TAATAAATGC 3070 het 3070 hom 47 21 23 4 A 1 0 154450 CASAVA_Build 18 68267479 4D CCACTTTAAA GTAC/---- GTAGGTTACC 3070 hom 116 het 45 0 37 10 GTAC 1 0 154451 CASAVA_Build 18 68271480 1D GTTGGGAAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 44 het 33 1 29 3 T 9 8 154452 CASAVA_Build 18 68271881 8D TAAAAGTGTG TGGCATCT/-------- TGCTCTCTCT 3070 hom 138 het 49 0 45 6 TGGCATCT 1 0 154453 CASAVA_Build 18 68274174 36I CAGCAGCAAA ------------------------------------/ATGTGTGTGTGCATTTGTGTATGCACACACACACGC ATGTGTGTAC 3070 hom 98 het 39 0 31 13 ATGTGTGTGTGCATTTGTGTATGCACACACACACGC 0 1 154454 CASAVA_Build 18 68285792 4D AGATAAATAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 1803 het 1803 ref 15 5 6 5 AG 10 8 154455 CASAVA_Build 18 68291937 1D GCTATTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 A 10 9 154456 CASAVA_Build 18 68294223 3D GTAACATATA ATG/--- ATGGATTAAC 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 ATG 2 1 154457 CASAVA_Build 18 68294389 4D AAAGTTAGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 hom 24 8 11 7 TA 8 6 154458 CASAVA_Build 18 68296805 5I GTCTAGTACC -----/TAAAG TATAGAGTCA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 TAAAG 0 1 154459 CASAVA_Build 18 68300753 1I GGTAATTGAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 613 hom 49 2 43 4 A 8 9 154460 CASAVA_Build 18 68301144 1I GTATTAGCAA -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 25 4 G 3 4 154461 CASAVA_Build 18 68302906 1I AAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 17 0 9 8 T 12 13 154462 CASAVA_Build 18 68303272 1I TATCAAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 528 hom 36 2 30 4 T 11 12 154463 CASAVA_Build 18 68310229 2D ACATCTCAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 13 11 154464 CASAVA_Build 18 68310867 4I TACATAATAC ----/TTAG TTAGAGGATC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TTAG 1 2 154465 CASAVA_Build 18 68331517 1I TTCTCACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 28 1 21 6 A 10 11 154466 CASAVA_Build 18 68333682 2D TTTACAGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 33 0 20 13 T 16 14 154467 CASAVA_Build 18 68336763 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 182 hom 29 2 23 4 A 8 7 154468 CASAVA_Build 18 68346523 1I CCACCAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 het 221 hom 32 1 28 3 C 0 1 154469 CASAVA_Build 18 68346878 1D TCTGTCTAAC T/- ATCTATCTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 1 0 154470 CASAVA_Build 18 68347490 1D12M1D GGACTCTGTC TTCAAAGAAAAAGA/-TCAAAGAAAAAG- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 17 0 19 4 N/A 0 0 154471 CASAVA_Build 18 68362470 1I GTTCCAGAGT -/C CCCAGTTGGG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 3 4 154472 CASAVA_Build 18 68366879 1I TTTAAGAAAT -/G ATTATTGATC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 154473 CASAVA_Build 18 68378687 1I ATTAACTTGC -/T TTTTGGATCA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 4 5 154474 CASAVA_Build 18 68394035 2I CTGATTGGCT --/GA GAGTAATCAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 GA 1 2 154475 CASAVA_Build 18 68397949 1I TCCGTCTCGC -/A AAAAAACAAA 3066 het 2733 hom 25 10 10 10 A 6 7 154476 CASAVA_Build 18 68398312 2D TTATAGCATA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2346 hom 18 6 10 2 AT 7 6 154477 CASAVA_Build 18 68426864 1D TCATGTATAA G/- GGACCATTTT 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 G 3 2 154478 CASAVA_Build 18 68430721 1D CTTACCTCCC T/- CCCTCCTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 10 15 T 1 0 154479 CASAVA_Build 18 68431714 13D CTTTAGTTGA AAGATTAACCTGC/------------- AATTCCATTT 159 het 159 ref 37 23 2 13 AAGATTAACCTGC 1 0 154480 CASAVA_Build 18 68449649 1D AGTGTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 13 15 A 13 12 154481 CASAVA_Build 18 68455497 1D CAGAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 673 hom 34 10 14 10 A 12 11 154482 CASAVA_Build 18 68479677 1D ATTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 21 7 T 11 10 154483 CASAVA_Build 18 68483714 8D ATTACCCATA CTCCACAT/-------- CTTCCTGGTC 3070 het 3070 ref 25 11 13 1 CTCCACAT 1 0 154484 CASAVA_Build 18 68484214 1I GTGATTTTTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 8 9 154485 CASAVA_Build 18 68487621 3I TACAGATTGC ---/AGA CACACACACA 3070 hom 129 het 46 0 43 3 AGA 0 1 154486 CASAVA_Build 18 68497012 1I AGAGTCTGAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 10 154487 CASAVA_Build 18 68497962 1D ACTTCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 6 A 11 10 154488 CASAVA_Build 18 68504013 2I AATCAGACTC --/TT TTAATAATTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 2 4 154489 CASAVA_Build 18 68508632 4I CAGTTTTAAC ----/TATT TACTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 TATT 0 1 154490 CASAVA_Build 18 68520704 24D GTAATATTGC TAATATTAATATAAGTAATATTAT/------------------------ TAATATTAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 9 TAATATTAATATAAGTAATATTAT 1 0 154491 CASAVA_Build 18 68521072 13D TATTGAGGGT TATAATAATAATA/------------- ATAATATTAG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TATAATAATAATA 1 0 154492 CASAVA_Build 18 68522114 1I CTTAAAGATT -/A AAAAAATATA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 6 7 154493 CASAVA_Build 18 68523854 1I TTTGTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 10 11 154494 CASAVA_Build 18 68526692 5I TGCTCCATGT -----/AGACA AGACAAGTGC 3070 hom 132 het 51 0 44 7 AGACA 1 2 154495 CASAVA_Build 18 68527732 1D GGAGAGTAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 301 hom 29 1 24 4 A 10 9 154496 CASAVA_Build 18 68528446 2D18M1D ACTTTATAAC ATGTGAAAATATATAAGCAAT/--GTGAAAATATATAAGCAA- TAAGCATGAA 3070 het 3070 ref 41 28 15 1 N/A 0 0 154497 CASAVA_Build 18 68529243 1D TGGTTCTTGC A/- AACAGTGATT 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 A 3 2 154498 CASAVA_Build 18 68531135 3I TGCTTTTAAC ---/TTA TTATTATTAT 2923 het 2923 ref 20 9 6 5 TTA 5 6 154499 CASAVA_Build 18 68540660 1D AAAACAATTC T/- TTTTTTTTTA 2573 het 1938 hom 17 6 6 5 T 10 9 154500 CASAVA_Build 18 68542416 1D GATGTGTTCA C/- CTTCACCTCC 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 C 2 1 154501 CASAVA_Build 18 68549594 1I GGCAGAGGTT -/G GCCGTGAGCC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 G 1 2 154502 CASAVA_Build 18 68550717 2D TGAGAGAGAG AA/-- AGAGTCTGGG 3070 hom 117 het 40 0 40 1 A 3 1 154503 CASAVA_Build 18 68556672 2D AAATTAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 14 12 154504 CASAVA_Build 18 68557686 4D ACTAAAAAAG TGTA/---- TGACCACAAT 3070 het 3070 hom 32 11 18 7 TGTA 1 0 154505 CASAVA_Build 18 68558182 4D TCTAAGTTAA TAGT/---- TAGTGATTTA 3070 het 3070 ref 31 18 11 5 TAGT 2 1 154506 CASAVA_Build 18 68565695 1D TGGTAAAATA C/- CTGACTTCAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 2 1 154507 CASAVA_Build 18 68595656 2D CAAAACAACA AC/-- AAAAAAAAAA 1376 het 1375 ref 13 6 5 3 AC 1 0 154508 CASAVA_Build 18 68595801 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 1483 het 1483 ref 15 8 6 1 A 8 7 154509 CASAVA_Build 18 68600085 5I TGTTTCAGAT -----/ACATG TCGGGGTACA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 ACATG 0 1 154510 CASAVA_Build 18 68602431 1D TTACACACTG T/- TTTACTTTGA 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 T 4 3 154511 CASAVA_Build 18 68602570 4D TGATACTGAA AGAC/---- AGTCTCTCTG 3070 het 3070 hom 24 11 13 2 AGAC 1 0 154512 CASAVA_Build 18 68619471 4I CTGATTAGAC ----/TCTT TCTTCCTCAG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 TCTT 1 2 154513 CASAVA_Build 18 68620394 1D AAACAGTATA T/- TTTTAAACGT 3070 het 202 hom 39 2 33 4 T 5 4 154514 CASAVA_Build 18 68644744 1I CTTATACCAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 8 9 154515 CASAVA_Build 18 68657836 3I TTCAATAAAA ---/CTC CTCATTTGCC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 CTC 1 2 154516 CASAVA_Build 18 68658009 5D TGTTTAAGAC ATGTT/----- ATAAGTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 ATGTT 1 0 154517 CASAVA_Build 18 68658856 1D AATTCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 11 10 154518 CASAVA_Build 18 68659638 3I GCAATTGGCA ---/GAT GAGAAATCAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 GAT 0 1 154519 CASAVA_Build 18 68660286 1I AGGGAAGATA -/T CTGCACTGTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 0 1 154520 CASAVA_Build 18 68663150 1D AGCAGCACTG A/- AGCGCAGGTC 3070 het 3070 ref 55 25 21 9 A 2 1 154521 CASAVA_Build 18 68671049 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1539 het 824 hom 21 4 7 11 T 17 16 154522 CASAVA_Build 18 68672149 1D AATTTAGAAA C/- TTTCGAAATG 3070 het 3049 hom 19 10 9 0 C 1 0 154523 CASAVA_Build 18 68672355 1D GAAGTCCATC A/- AAGCATGCAG 3070 het 3070 hom 34 14 19 3 A 3 2 154524 CASAVA_Build 18 68678145 1I GAAAATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1064 hom 29 3 23 3 A 11 12 154525 CASAVA_Build 18 68678962 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTGG 2496 het 2496 ref 31 15 7 9 T 8 9 154526 CASAVA_Build 18 68692880 1I GGTGGGCCGG -/C GGGGGGAAGC 1209 het 314 hom 10 2 5 3 C 0 1 154527 CASAVA_Build 18 68694398 7D AAAAAATACT TAGATGA/------- TATATTATAG 3070 hom 81 het 28 0 28 1 TAGATGA 1 0 154528 CASAVA_Build 18 68705738 1D TCATGTGAAG A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 7 6 154529 CASAVA_Build 18 68714137 1I ATCCATGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 9 8 T 11 12 154530 CASAVA_Build 18 68714399 1D TTTATATATG A/- AAAAATATAT 3070 het 2462 hom 14 6 7 1 A 6 5 154531 CASAVA_Build 18 68717341 7I ATGGCCGTGA -------/GTCTGTC GTCTTTTATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GTCTGTC 0 1 154532 CASAVA_Build 18 68725931 12D GAACAGAAGT GAAAGAAAAACA/------------ GAAAGAAACT 3070 het 3070 ref 57 31 24 7 GAAAGAAAAACA 1 0 154533 CASAVA_Build 18 68738266 2I CTGCACTGAC --/TG GGGTTGGGGG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TG 0 1 154534 CASAVA_Build 18 68739007 1D TTTTGGCCAT G/- GTTTTCGGAA 3070 hom 86 het 33 0 28 6 G 2 1 154535 CASAVA_Build 18 68739188 3D GACTTCATCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 16 6 A 15 12 154536 CASAVA_Build 18 68740042 1D ACTTAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 891 hom 41 2 26 14 A 12 11 154537 CASAVA_Build 18 68743266 2D TGGCAGCAGC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 69 het 28 0 23 6 AG 8 7 154538 CASAVA_Build 18 68746339 1D ACCCAGTGTT G/- GTTACCCATA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 2 1 154539 CASAVA_Build 18 68754251 1D CCTGGGTGGA G/- GTGACACAAT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 G 2 1 154540 CASAVA_Build 18 68766295 1D CCAAAACGAT A/- AAAAAAGGGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 7 6 154541 CASAVA_Build 18 68767315 1I CTTTTGTGGG -/T GTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 0 1 154542 CASAVA_Build 18 68768417 12I GTCAGGACGC ------------/CCCACGGGAAGT CCCTCTGTGG 3070 hom 87 het 33 0 28 5 CCCACGGGAAGT 0 1 154543 CASAVA_Build 18 68769339 1D CCATAAGATT C/- CCCCCCCCCG 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 10 9 154544 CASAVA_Build 18 68772604 1D CAAAATCAAC A/- TACAAAAATA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 1 0 154545 CASAVA_Build 18 68772808 4I ATTTAAAAAT ----/AATC AAGAATGACC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AATC 0 1 154546 CASAVA_Build 18 68784367 8D TGTGTATATA TATATAAT/-------- TATATATAAT 117 het 117 ref 13 3 2 9 TATATAAT 1 0 154547 CASAVA_Build 18 68784513 2D TATATATTAT AC/-- ATGTAATATA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AC 1 0 154548 CASAVA_Build 18 68792731 3I CTCATGTCTC ---/CTT CTCCACAGCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTT 0 1 154549 CASAVA_Build 18 68793260 1D TTCCACTGAT G/- GCTGCAGAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 4 G 2 1 154550 CASAVA_Build 18 68795291 1I AATAAAAAAA -/C ATTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 C 0 1 154551 CASAVA_Build 18 68799306 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 19 0 18 12 A 8 9 154552 CASAVA_Build 18 68808268 1I ACTAATTCTT -/A ATAGCAAGTG 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 1 2 154553 CASAVA_Build 18 68809552 4D ATAATTTTGT TGGG/---- TGGGTGGCTG 3070 hom 93 het 35 0 31 5 TGGG 2 1 154554 CASAVA_Build 18 68811014 2I ATTTTGTATC --/AA AAAAAACATC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 6 8 154555 CASAVA_Build 18 68820022 38D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATATACAC/-------------------------------------- ACATACCAAA 3070 het 68 hom 16 1 11 9 ATATATATATATATATATATATATATATATATATACAC 1 0 154556 CASAVA_Build 18 68833081 1D CCCAAATAAC T/- TTGGTGAAGG 3070 het 3070 hom 46 19 26 1 T 3 2 154557 CASAVA_Build 18 68834669 1I AAGATTTGGG -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 T 6 7 154558 CASAVA_Build 18 68839963 2I GCCAACAGAC --/AT ATGAAAAAGT 2612 het 2612 ref 20 13 6 1 AT 1 2 154559 CASAVA_Build 18 68843233 1D GAAAACAGAC T/- AATACAGAAA 3070 het 3070 hom 20 7 8 5 T 1 0 154560 CASAVA_Build 18 68846679 1D ATCAGTGATT A/- AAAAAATTGG 3070 hom 88 het 32 0 30 2 A 7 6 154561 CASAVA_Build 18 68847467 4I CAAGAGCAAC ----/AAAT AAAAAGCAGT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AAAT 0 1 154562 CASAVA_Build 18 68847841 1I ATAAATGGAT -/G GAAAAAAAGG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 G 1 2 154563 CASAVA_Build 18 68848593 2D GATAAAATAA AC/-- ACAGAGTAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AC 2 1 154564 CASAVA_Build 18 68849723 1I GATTAATCAA -/C AGACTTCTCA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 C 0 1 154565 CASAVA_Build 18 68851106 1D AAATTGCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 528 hom 29 2 26 2 A 10 9 154566 CASAVA_Build 18 68851626 1D CTGGAGAAAG A/- AAAAAACGTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 7 6 154567 CASAVA_Build 18 68851995 1I CATTCAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1746 hom 47 4 33 10 A 9 10 154568 CASAVA_Build 18 68852951 1I GGTAGTAACA -/T TTACCTTACA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 2 3 154569 CASAVA_Build 18 68853271 1I GACAGTTACC -/T TTTTTTATAA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 T 6 7 154570 CASAVA_Build 18 68859098 3D TGAATCATGC AGA/--- ATGAGAATGA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AGA 1 0 154571 CASAVA_Build 18 68863773 1D ATCCTACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 29 1 17 12 A 14 13 154572 CASAVA_Build 18 68865736 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 13 12 154573 CASAVA_Build 18 68879301 1D GGCAATTTTT G/- TTGGCCAGAA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 G 1 0 154574 CASAVA_Build 18 68882334 1I CTGCCTATAC -/T TTTTTTTTTT 2496 het 2496 ref 32 11 9 12 T 11 12 154575 CASAVA_Build 18 68885228 1I ATTAGTGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 36 1 29 6 A 11 12 154576 CASAVA_Build 18 68885966 1I AAAAACAATA -/G TTTTTCAGAC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 G 0 1 154577 CASAVA_Build 18 68886679 1D ACTTACAGTT G/- TTTATAAAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 0 154578 CASAVA_Build 18 68909550 1D ACCACATGAC T/- TTTTTCACTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 5 154579 CASAVA_Build 18 68919167 1D TTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 13 6 T 10 9 154580 CASAVA_Build 18 68920727 1I AAATGATGCA -/T TTTCAAAATG 3070 het 3070 hom 48 15 29 4 T 3 4 154581 CASAVA_Build 18 68925022 3D CAAGTAGGTA GTT/--- TTTTTTTTAT 2425 het 2425 ref 21 14 5 4 GTT 1 0 154582 CASAVA_Build 18 68927212 2D TTTTTGACTC AT/-- GTATTCTTTA 2413 het 2413 ref 28 16 6 7 AT 1 0 154583 CASAVA_Build 18 68927588 1I GGTTCTGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 9 10 154584 CASAVA_Build 18 68929143 1I AAAAGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 A 10 11 154585 CASAVA_Build 18 68937251 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 8 9 154586 CASAVA_Build 18 68939095 1D GGCCTTCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 12 10 1 T 11 10 154587 CASAVA_Build 18 68954278 2I TTCAACTATA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 17 8 8 AT 5 6 154588 CASAVA_Build 18 68968207 1D ACAATATAGG A/- AAAAAAATAC 3070 het 2716 hom 23 7 13 4 A 8 7 154589 CASAVA_Build 18 68971982 1D TCATTTTTAA T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 7 6 154590 CASAVA_Build 18 68972145 1I TAAATTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 9 10 154591 CASAVA_Build 18 68988356 7I AAACCAAAGT -------/TAAAAAG TAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 TAAAAAG 1 2 154592 CASAVA_Build 18 68991274 3I CAAGGTAGAA ---/AAG AAGAAGGCCA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 AAG 2 3 154593 CASAVA_Build 18 68992317 1D CAGAGAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 13 12 154594 CASAVA_Build 18 69008043 1D TGAGGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 18 12 T 12 11 154595 CASAVA_Build 18 69014505 4D39M6D ACATTAAGTT TAACTAATGTCAAATTTGACCCATGGAAACAACAATTAAGGACATTATA/----TAATGTCAAATTTGACCCATGGAAACAACAATTAAGGAC------ ATTATAAGCT 3070 het 3070 ref 19 16 11 2 N/A 0 0 154596 CASAVA_Build 18 69016687 4D ATATTGAAAT AATC/---- AAAATTATCT 3070 het 3070 hom 28 8 19 5 AATC 1 0 154597 CASAVA_Build 18 69024287 1D TATATTTCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 9 8 154598 CASAVA_Build 18 69029731 32D ACAGATAGAT GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA/-------------------------------- GATAGATAGA 3070 het 2904 hom 27 10 10 13 GATA 12 4 154599 CASAVA_Build 18 69040179 1D TGAATATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 9 19 9 T 12 11 154600 CASAVA_Build 18 69049187 1I GGATGCCCTT -/A ATTTTTGCAG 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 A 1 2 154601 CASAVA_Build 18 69050821 2D ACACATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 AT 7 6 154602 CASAVA_Build 18 69050985 2D GTGAGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 42 21 13 10 GT 6 5 154603 CASAVA_Build 18 69061272 1D AATTTTTAGG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 8 7 154604 CASAVA_Build 18 69067793 1I GCAGAAACCA -/G AAATTCCTAG 1866 het 1702 hom 18 6 6 6 G 0 1 154605 CASAVA_Build 18 69069005 1I TTGAATAGAC -/A AAAACATAGG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 4 5 154606 CASAVA_Build 18 69080763 2I ATATTTTCTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 9 11 154607 CASAVA_Build 18 69090411 3D GTTGGAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 40 0 31 11 A 14 11 154608 CASAVA_Build 18 69094523 3I ATAAAGAAAA ---/ACT ACTACTTTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 ACT 2 3 154609 CASAVA_Build 18 69098845 1D GCCCGGCTAC T/- TTTTTGTATT 1775 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 5 154610 CASAVA_Build 18 69099439 2I AATCACGGCC --/TT TTATCATACA 3070 hom 113 het 43 0 40 3 T 2 4 154611 CASAVA_Build 18 69099761 1I AGTTGTCAAA -/C AAGTCCTGCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 0 1 154612 CASAVA_Build 18 69100496 1D GCCAGGAGTT C/- CAGAGTAGCC 1383 het 1383 ref 12 6 3 3 C 2 1 154613 CASAVA_Build 18 69101521 2D TCTTTATTCC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TG 6 5 154614 CASAVA_Build 18 69102828 5D GGAGCTTCTG CAACA/----- CAACACAGAA 3070 hom 66 het 25 0 23 6 CAACA 2 1 154615 CASAVA_Build 18 69106481 1I GCATGAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 A 11 12 154616 CASAVA_Build 18 69108221 1D ATATTTTGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 A 10 9 154617 CASAVA_Build 18 69111095 5I GGCTAGACAA -----/AAAGT AAAGTAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 AAAGT 1 2 154618 CASAVA_Build 18 69111699 1D TACTATAATT A/- AAAAAAAAAA 549 het 280 hom 15 2 6 7 A 14 13 154619 CASAVA_Build 18 69111901 4I GTATGGTCTC ----/ACTT ACTTGTGAGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 ACTT 1 2 154620 CASAVA_Build 18 69113472 1D GCAAGCAGCT A/- AAAACTAATT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 5 4 154621 CASAVA_Build 18 69121576 1I TGCTATGTTT -/C CCCAGGCTGG 2983 het 1406 hom 20 4 7 9 C 3 4 154622 CASAVA_Build 18 69123150 2D AGCCCCAAAG TC/-- TATATACTGT 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 TC 1 0 154623 CASAVA_Build 18 69124169 1D TTTAATCCAA T/- TTTCGTTTAC 3070 het 3070 hom 43 18 20 6 T 4 3 154624 CASAVA_Build 18 69125310 1I AATTCATTGA -/T TTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 59 24 30 5 T 6 7 154625 CASAVA_Build 18 69128169 1D GAATTTTTTG A/- AAAATCAATC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 5 4 154626 CASAVA_Build 18 69133108 1I ATAATTTCCC -/T TTCTTAAGGT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 2 3 154627 CASAVA_Build 18 69135837 4D TATAAATATC TAAT/---- TATTTTAATT 3070 het 3070 ref 30 15 13 6 TAAT 1 0 154628 CASAVA_Build 18 69138951 2D AAATAGTTAA AT/-- AGAGATACTG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 AT 1 0 154629 CASAVA_Build 18 69139413 1I AAATTAAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 497 hom 42 2 34 6 A 9 10 154630 CASAVA_Build 18 69140353 5I TCAGCACATA -----/AATAT AATAATTATA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AATAT 0 1 154631 CASAVA_Build 18 69140430 2D TAATCAAAAA AG/-- AAAGTACAAA 2539 het 2539 ref 17 9 6 2 AG 1 0 154632 CASAVA_Build 18 69141595 1D TTTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 853 hom 34 2 22 11 T 12 11 154633 CASAVA_Build 18 69148968 2I TAAATCAAAC --/TT ATCTTTATAG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 0 2 154634 CASAVA_Build 18 69150416 2I CATTGCAAAA --/AG CACATTTTCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AG 0 1 154635 CASAVA_Build 18 69152048 1I ATTAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 22 1 19 2 A 10 11 154636 CASAVA_Build 18 69156244 1D TACCTTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 12 11 154637 CASAVA_Build 18 69163613 1D GACGTAGATC A/- CATTATAGTA 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 A 1 0 154638 CASAVA_Build 18 69176848 1I CAGTAAGTTA -/T TTTGGTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 T 3 4 154639 CASAVA_Build 18 69177670 1I CAATGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1542 hom 37 6 27 4 T 11 12 154640 CASAVA_Build 18 69180401 3D AGTTAAAAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 A 13 10 154641 CASAVA_Build 18 69183206 4D TTACATTTTA TAAG/---- TAAGTGTATT 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 TAAG 2 1 154642 CASAVA_Build 18 69185578 1D TTACTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1464 hom 22 6 10 6 T 15 14 154643 CASAVA_Build 18 69186052 2I TAAGAATCTC --/AT AATTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 AT 0 1 154644 CASAVA_Build 18 69189964 1D AGACCCCCCC T/- AGCCATGTGG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 1 0 154645 CASAVA_Build 18 69216279 1D AGTCTCTGTT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 8 7 154646 CASAVA_Build 18 69216717 3D GTCTCCATCC TCA/--- TCATCTTCAC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 TCA 2 1 154647 CASAVA_Build 18 69219680 1D AAATTTCATC T/- TGAATTGTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 1 154648 CASAVA_Build 18 69221102 1D GTTTAGTTGC A/- AAGGGCTGGA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 3 2 154649 CASAVA_Build 18 69221609 1D CACTGAGATG A/- ACAGCACCAC 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 2 1 154650 CASAVA_Build 18 69227978 1I TCCAATGAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 T 9 10 154651 CASAVA_Build 18 69233710 4D AGGAAAACTT TAAA/---- TATGTTTGGA 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 TAAA 1 0 154652 CASAVA_Build 18 69236960 1D ATAGCTTTTG T/- TAGGAACTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 1 154653 CASAVA_Build 18 69237419 1I TTATAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 A 11 12 154654 CASAVA_Build 18 69237924 1I TAAACTGTGG -/T TTAGCGAATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 3 154655 CASAVA_Build 18 69238995 1I GGGTAAATAC -/A AAAAAAGATG 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 A 6 7 154656 CASAVA_Build 18 69240949 1I TAAGAGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1108 hom 39 3 22 14 T 15 16 154657 CASAVA_Build 18 69242629 1D AAATGACAAA G/- TATAGATGGC 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 G 1 0 154658 CASAVA_Build 18 69243269 1D CTGTCTGTCA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 8 7 154659 CASAVA_Build 18 69243878 2D TGTTACCACC TT/-- TGTATCATGC 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 T 3 1 154660 CASAVA_Build 18 69243985 2I CAACTTCCTG --/TT TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 T 7 9 154661 CASAVA_Build 18 69246307 1D CTCCACGTTA T/- TAGAACTGCT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 T 2 1 154662 CASAVA_Build 18 69250743 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2962 hom 35 10 22 4 A 10 9 154663 CASAVA_Build 18 69251510 1I TTAAAATAAC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 7 8 154664 CASAVA_Build 18 69252836 1D TTCATCTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 10 9 154665 CASAVA_Build 18 69254133 2D ATCAGATTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 32 3 16 14 A 13 11 154666 CASAVA_Build 18 69254540 1D CCAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 12 11 154667 CASAVA_Build 18 69259533 1D TCAATTACAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 A 8 7 154668 CASAVA_Build 18 69260803 1I GAATCTGGAC -/T TTTTTTTTTT 2857 het 2171 hom 20 6 9 5 T 11 12 154669 CASAVA_Build 18 69265728 1D CATTTTAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 16 10 T 11 10 154670 CASAVA_Build 18 69266969 2D AAAATATTTC AG/-- AGTTTAGAAT 3070 het 3070 ref 47 29 14 7 AG 2 1 154671 CASAVA_Build 18 69271681 2I ACATATTTTG --/TA TATATATTTA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 TA 3 4 154672 CASAVA_Build 18 69278995 4D TAATTTATTA CTTT/---- GTGTAGAGAC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 CTTT 1 0 154673 CASAVA_Build 18 69291218 1D AGAACATCAT G/- TGATCATGTG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 G 1 0 154674 CASAVA_Build 18 69293116 1I GGAATTTATA -/T TTCAAAAAAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 2 3 154675 CASAVA_Build 18 69293358 1D ATAATAATTA C/- ATACATAAAA 3070 het 7 hom 19 1 15 3 C 1 0 154676 CASAVA_Build 18 69296621 1D GCAAAAATGC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 24 het 25 0 17 8 A 9 8 154677 CASAVA_Build 18 69297108 1D AACATATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 30 1 20 9 A 11 10 154678 CASAVA_Build 18 69303656 1I ATCTAGGAGG -/A AAAAAAAAAT 2399 het 2399 ref 28 17 5 6 A 9 10 154679 CASAVA_Build 18 69311931 2D ACAGACTTGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 11 9 154680 CASAVA_Build 18 69313937 1I TCATTAAATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 8 9 154681 CASAVA_Build 18 69317544 1I TGCTTTCCTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 7 8 154682 CASAVA_Build 18 69317803 4I TATTGAAAAA ----/TAAC TAATTCAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TAAC 0 1 154683 CASAVA_Build 18 69324068 12D ATATATATAT ATACACACACAC/------------ ACACACACAC 1866 hom 15 het 10 0 6 7 ATACACACACAC 1 0 154684 CASAVA_Build 18 69326170 1D GTACAATGGG C/- CAACAATGAT 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 C 2 1 154685 CASAVA_Build 18 69329727 1D AATGCCACTT A/- AATGGAATAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 3 2 154686 CASAVA_Build 18 69330613 14D ATGTGTAAGC CAACATCCATATTA/-------------- CACTCACTAG 3070 het 3070 ref 38 22 14 4 CAACATCCATATTA 1 0 154687 CASAVA_Build 18 69332346 1I TCTTTCTTCC -/T TTTTCTTTTC 3070 het 1336 hom 45 7 22 16 T 4 5 154688 CASAVA_Build 18 69332424 4D TGTCTTTCTC TCTT/---- TCTTTCTTCC 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 TCTT 3 2 154689 CASAVA_Build 18 69341564 4I GGAAGGAAAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 het 2353 hom 35 10 10 15 AGAA 3 4 154690 CASAVA_Build 18 69350636 1D AGACACGGCA C/- CCGTATTGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 3 2 154691 CASAVA_Build 18 69353570 13D ACAGCCTGAG CAGCTGCCCTCCC/------------- CAGCCGCCCT 3070 het 86 hom 27 4 17 9 CAGCTGCCCTCCC 1 0 154692 CASAVA_Build 18 69366843 1D CAAGCAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 29 1 24 5 T 12 11 154693 CASAVA_Build 18 69374530 1I TAGATGAATT -/C ATATAATTGA 3070 hom 123 het 44 0 40 4 C 0 1 154694 CASAVA_Build 18 69383111 1D GTGAGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 880 hom 34 2 25 7 T 15 14 154695 CASAVA_Build 18 69385627 1D TTAGTATATC A/- GGGGCTGGAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 1 0 154696 CASAVA_Build 18 69387854 1D ATATGCATGT C/- CCCCCTTCAT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 C 6 5 154697 CASAVA_Build 18 69387913 1D ACTTGGCCGA C/- CCTTTCAACA 3070 het 3070 hom 40 14 13 13 C 3 2 154698 CASAVA_Build 18 69416546 20D CATGGCCATT AGTAAGGGGGTGTGGCCATA/-------------------- AGTGGGGCTT 3070 het 3070 ref 49 28 20 13 AGTAAGGGGGTGTGGCCATA 1 0 154699 CASAVA_Build 18 69432589 1D TCAATTTAGC T/- TCTCTTTGGG 3070 het 3070 ref 45 24 18 5 T 2 1 154700 CASAVA_Build 18 69435068 1D TTGTATTTTG T/- TTTCCTTTGT 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 T 4 3 154701 CASAVA_Build 18 69437933 4D ATGCTCATTT CTCA/---- CTCACTCAAG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 CTCA 3 2 154702 CASAVA_Build 18 69440350 1D AAATTGAGAT A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 22 10 10 3 A 7 6 154703 CASAVA_Build 18 69440677 2D TGAAACTGAG TA/-- AGTAATAAAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 2 TA 1 0 154704 CASAVA_Build 18 69443286 5D GAAACTAGAA AAAAT/----- AAAGTCTTGC 3070 het 3070 ref 33 15 16 5 AAAAT 1 0 154705 CASAVA_Build 18 69444193 3D ACAGGGATTA AAG/--- AAGGAGAGAC 3070 het 3070 ref 42 27 12 5 AAG 2 1 154706 CASAVA_Build 18 69444316 2I GAGGGATGGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 51 16 21 14 GA 8 9 154707 CASAVA_Build 18 69452530 3D GATTATCATA TTT/--- TATTTAACAT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 T 4 1 154708 CASAVA_Build 18 69453670 9D AAGCTTGCTG CCATCTCAA/--------- AATGGTGTAT 3070 het 3070 ref 22 14 10 3 CCATCTCAA 1 0 154709 CASAVA_Build 18 69455738 2D AATATAAAAC AT/-- AATATAGAGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 AT 1 0 154710 CASAVA_Build 18 69471737 1D AGTGAAGTGT G/- TGACCCAGGA 3070 het 3070 ref 65 32 26 7 G 1 0 154711 CASAVA_Build 18 69472013 2D GGATTTAAAC AT/-- GTGGAATTTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 AT 1 0 154712 CASAVA_Build 18 69472248 1I AGCTGTGGAG -/A AAGGGGCTGT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 A 2 3 154713 CASAVA_Build 18 69478493 1D CTACACACCG T/- TTCGGAACCG 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 T 3 2 154714 CASAVA_Build 18 69486999 2D24M1D GAGCAAAATG TATAATTATTCTCCTTATTAAATGGAT/--TAATTATTCTCCTTATTAAATGGA- TTATAAATTG 3070 het 3070 ref 37 23 18 6 N/A 0 0 154715 CASAVA_Build 18 69495480 1D CTTCAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 20 5 T 11 10 154716 CASAVA_Build 18 69499301 2D TTTTTTTTTT TC/-- TTTTCTTTTC 209 het 209 ref 22 9 3 10 TC 1 0 154717 CASAVA_Build 18 69511725 2D GAATTCTGGG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 11 9 154718 CASAVA_Build 18 69522139 2D CATTCTAGTT TC/-- TCTCCTCTAT 3070 het 3070 hom 54 22 28 5 TC 3 2 154719 CASAVA_Build 18 69551548 1I GAAACCATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 10 154720 CASAVA_Build 18 69553314 1I GCTCAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 21 1 13 7 A 13 14 154721 CASAVA_Build 18 69563114 1D TTAAAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 28 1 21 6 A 13 12 154722 CASAVA_Build 18 69580988 2D CCGACAAAGT TA/-- TGTGCTGAGG 3070 het 3070 hom 44 18 22 6 TA 1 0 154723 CASAVA_Build 18 69583094 1D TATAATGAAT A/- AGCACTAGTA 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 A 2 1 154724 CASAVA_Build 18 69598228 1I AGTAAAACTT -/A ACCCATATAT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 1 2 154725 CASAVA_Build 18 69602220 1D TTCACACACA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 0 154726 CASAVA_Build 18 69633878 1D CATTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 479 hom 27 4 17 6 A 16 15 154727 CASAVA_Build 18 69644018 1D AACAATTTAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 9 8 154728 CASAVA_Build 18 69653675 1D CAAGTGGGAA C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 103 het 38 0 31 7 C 8 7 154729 CASAVA_Build 18 69659389 1I ACATATTCAC -/A GGATTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 0 1 154730 CASAVA_Build 18 69661262 5D TCCACAGCAG GAAAA/----- GAAAACTTTA 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 GAAAA 2 1 154731 CASAVA_Build 18 69663982 9I AAAAAATGGG ---------/GAGAATTAA TGGGGAGAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 GAGAATTAA 0 1 154732 CASAVA_Build 18 69667120 1I AGCTGAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 A 13 14 154733 CASAVA_Build 18 69703591 5D CATGGTTGCG GGCAC/----- CTGTAATCCC 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 GGCAC 1 0 154734 CASAVA_Build 18 69703721 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1798 het 1798 ref 21 13 5 3 A 15 14 154735 CASAVA_Build 18 69705619 1D CAAAAAATAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 T 10 9 154736 CASAVA_Build 18 69713748 2I TTCTTTATCA --/TT TTTTTTTTGT 3070 hom 98 het 39 0 32 7 T 8 10 154737 CASAVA_Build 18 69714209 13I TGCCCACACT -------------/CCAGGTGGCCTCC CTAGAGTAAG 3070 hom 135 het 46 0 45 3 CCAGGTGGCCTCC 0 1 154738 CASAVA_Build 18 69716336 1D ATAATTAGCA C/- CCCATATGCA 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 C 4 3 154739 CASAVA_Build 18 69718582 1D ATTTTATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 13 13 A 15 14 154740 CASAVA_Build 18 69718653 1D TAAAAATTCA T/- TTTTTAATGC 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 T 6 5 154741 CASAVA_Build 18 69720274 1I GTAGATTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 10 11 154742 CASAVA_Build 18 69720608 5D GTTTATGTGA TATCT/----- TTTTTTATAG 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 TATCT 1 0 154743 CASAVA_Build 18 69720699 3I TTAAGTGGTA ---/TTG TTGTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 TTG 1 2 154744 CASAVA_Build 18 69729130 1D TCAAACAGCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 9 8 154745 CASAVA_Build 18 69730043 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2007 het 2007 ref 26 9 7 10 A 15 16 154746 CASAVA_Build 18 69730948 2I GATTATCAAC --/TA TATATATATA 1668 het 1668 ref 23 12 5 6 TA 6 7 154747 CASAVA_Build 18 69739768 1D TTCAAATAAG A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 49 17 29 3 A 7 6 154748 CASAVA_Build 18 69741589 1D CCTGCTTTCA C/- TACCTGCTCC 3070 het 3070 ref 42 26 15 1 C 1 0 154749 CASAVA_Build 18 69744476 1I TCAACCAAAT -/A AGGGAGATGA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 A 1 2 154750 CASAVA_Build 18 69747173 1I TGCTTAATAT -/A AATTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 2 3 154751 CASAVA_Build 18 69757456 1I CTGCCATCGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 T 9 10 154752 CASAVA_Build 18 69765610 1D CTTTTTTTTT G/- TTGTTTGCTT 3070 het 3070 ref 32 10 14 9 G 1 0 154753 CASAVA_Build 18 69766426 1I GGAGTGACTT -/G GGGGGGGTGC 3070 het 3070 ref 45 16 19 10 G 7 8 154754 CASAVA_Build 18 69766927 2D ATGTTTCTTA TG/-- TGGCCTGAGC 3070 hom 75 het 31 0 24 8 TG 2 1 154755 CASAVA_Build 18 69794839 8I ACATGGAATA --------/CATTTCAT CCTTTCAGCA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 CATTTCAT 0 1 154756 CASAVA_Build 18 69799491 1I GTATTTCAGA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 7 8 154757 CASAVA_Build 18 69815494 2D GGGTGAAATG AT/-- ATGTTTTGGC 2165 het 2165 ref 21 13 5 3 AT 2 1 154758 CASAVA_Build 18 69815888 1D GTTCCATTAG T/- CTGTGTGTCT 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 T 1 0 154759 CASAVA_Build 18 69816122 2I ATTGCTTTGG --/GT ACTATGGACA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 GT 0 1 154760 CASAVA_Build 18 69817509 1I TTTCTGGTTG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 7 8 154761 CASAVA_Build 18 69825435 4I2M6I CAGAATTTAT ----TA------/GCTATAAAACAG AAATAACAAC 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 N/A 0 0 154762 CASAVA_Build 18 69829302 1I AATAAGAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 9 10 154763 CASAVA_Build 18 69829537 1I GCATTCCCCC -/T AGGGGAGGTT 3070 het 3070 ref 53 29 17 7 T 0 1 154764 CASAVA_Build 18 69845530 1D AGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 27 1 19 7 T 12 11 154765 CASAVA_Build 18 69849481 1D GTGTTCTTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 A 9 8 154766 CASAVA_Build 18 69850655 4D CTCTCTCTCT CCCC/---- CCCACACACA 868 het 868 ref 15 7 3 5 C 7 3 154767 CASAVA_Build 18 69854385 2D AACAAAGGGT TA/-- TAGCTGGAAA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 TA 2 1 154768 CASAVA_Build 18 69864157 1D ACAAAAAGTA G/- AAAAGTGTTA 3070 het 3070 hom 59 23 29 7 G 1 0 154769 CASAVA_Build 18 69903568 1I CCAGCACTTT -/G GGAGGCCAAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 2 3 154770 CASAVA_Build 18 69932720 1D TCTATTTACA T/- TTCCAAAAGA 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 T 3 2 154771 CASAVA_Build 18 69969633 1I TCATCAACTC -/T TGTTGCTTTC 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 T 1 2 154772 CASAVA_Build 18 69987653 1I AAGTTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 35 2 26 7 A 11 12 154773 CASAVA_Build 18 69989928 1D TTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 10 20 8 T 9 8 154774 CASAVA_Build 18 70002774 1I ACGCTCTTCT -/G GGGTGTTACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 3 4 154775 CASAVA_Build 18 70004601 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTAT 3042 hom 21 het 11 0 8 3 T 9 8 154776 CASAVA_Build 18 70020540 1D TATCATCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 37 1 27 9 T 11 10 154777 CASAVA_Build 18 70033738 26D TGGTGAGAAT GGCAACCAGCAGTTGCCATTCTTGAG/-------------------------- GGCAACCAGC 3070 het 3070 hom 40 20 20 9 GGCAACCAGCAGTTGCCATTCTTGAG 1 0 154778 CASAVA_Build 18 70038429 1I AGAGTTATTC -/T TCCCCTAGAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 1 2 154779 CASAVA_Build 18 70040914 2I CTACTGAAAC --/AT GTGGCCATCC 3070 het 3070 hom 37 19 18 0 AT 0 1 154780 CASAVA_Build 18 70046058 1D GCAGCAGAAA G/- GTGACAAGAG 3070 het 3070 ref 47 19 15 13 G 2 1 154781 CASAVA_Build 18 70048606 9D TAAAATCAAC ATGGTCAAA/--------- ATTTTGGAGT 3070 het 3070 hom 28 13 12 8 ATGGTCAAA 1 0 154782 CASAVA_Build 18 70054239 1D ACCAGTTCCC G/- GGACATAGGG 3070 het 3070 hom 34 15 15 6 G 3 2 154783 CASAVA_Build 18 70060637 10D CATCTGTGAA TTCTGCAAGT/---------- TTCTGCAAGT 3070 hom 144 het 50 0 48 6 TTCTGCAAGT 2 1 154784 CASAVA_Build 18 70061456 11D TAACAATCAC CTCCTTTGTCT/----------- CAGGAACTGG 3070 het 3070 ref 39 26 13 7 CTCCTTTGTCT 1 0 154785 CASAVA_Build 18 70066256 1D GGCTGTGTGT G/- GGGGGTACTA 3070 hom 89 het 35 0 25 10 G 6 5 154786 CASAVA_Build 18 70078162 1D GAGAGAATAT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 7 het 33 1 26 6 A 8 7 154787 CASAVA_Build 18 70081815 2I AACAGGAGAC --/TG TAACTTGTCC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 TG 0 1 154788 CASAVA_Build 18 70082708 2I CAAGAGGCAC --/AT GTGTGTCACT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 AT 0 1 154789 CASAVA_Build 18 70083168 1D CTTTTGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 11 10 154790 CASAVA_Build 18 70084966 1D ATTTTCTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 16 0 13 3 A 12 11 154791 CASAVA_Build 18 70085066 2D AAAAAAAAAA AC/-- ATAGCTTAGA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 AC 1 0 154792 CASAVA_Build 18 70122198 1D GAGAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 1227 het 1227 ref 32 20 3 9 T 12 11 154793 CASAVA_Build 18 70148284 1D CTGGGTGAAT G/- GGTTCATTAC 3070 hom 175 het 64 0 59 5 G 3 2 154794 CASAVA_Build 18 70158383 4D GCAAGAAAAC AAAT/---- AACCTGATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 AAAT 1 0 154795 CASAVA_Build 18 70164193 4I ACACACACAT ----/AGAG AGAGACAGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AG 2 4 154796 CASAVA_Build 18 70166598 4D ATTCAACTTG AAGC/---- AAGCAAGAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AAGC 2 1 154797 CASAVA_Build 18 70170702 1D TAATGTATCT G/- ACAAATTTCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 1 0 154798 CASAVA_Build 18 70173542 1D CATCTTAATA T/- TTTAATGCAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 3 154799 CASAVA_Build 18 70174924 3I ATCATGTAGT ---/CTC CTGCAGATCT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 CTC 0 1 154800 CASAVA_Build 18 70175893 2I GCAAAAGTAA --/AC ACAAACTCTC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 AC 1 2 154801 CASAVA_Build 18 70176500 5I CCTGCCATGT -----/TAATA TTAGTGTATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TAATA 0 1 154802 CASAVA_Build 18 70177140 1D GTAAAAAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 10 9 154803 CASAVA_Build 18 70177569 2I TCTCAAAAGT --/CC TTTATTCTTT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 C 0 2 154804 CASAVA_Build 18 70180541 4D ACTCATAAGT AGTC/---- AGTTTATTGA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 AGTC 1 0 154805 CASAVA_Build 18 70181198 2D ACAGAACAAC AA/-- AGTTTTATTT 3070 hom 45 het 18 0 16 3 A 3 1 154806 CASAVA_Build 18 70182506 1I ATATTTATTC -/T TACAAAATTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 1 2 154807 CASAVA_Build 18 70186059 4D AAACACTGAT CTAA/---- CTGTTATCTC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 CTAA 1 0 154808 CASAVA_Build 18 70189606 1I ATTCTGGGTG -/A ACATGTAGTG 3070 het 3070 hom 47 19 18 10 A 1 2 154809 CASAVA_Build 18 70204434 2D TTTTAGAGAG AC/-- AGTGTGATAA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 AC 1 0 154810 CASAVA_Build 18 70208062 1D ACTAAGTGGC T/- TTTTTTTTAT 2500 het 2422 hom 18 7 6 6 T 9 8 154811 CASAVA_Build 18 70217522 6D CCTTTCCCTC CACCCG/------ CAGCTGCATT 3070 het 3070 hom 53 21 25 9 CACCCG 1 0 154812 CASAVA_Build 18 70227093 1D TTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 10 9 154813 CASAVA_Build 18 70227447 1I TTGTCTCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 9 10 154814 CASAVA_Build 18 70229901 1D CGGGTGCCCA T/- CCCCCTCCCC 3070 hom 45 het 17 0 14 3 T 1 0 154815 CASAVA_Build 18 70234945 2D GCTTAGAAAA CT/-- CTCTCAGGTT 3070 hom 85 het 33 0 29 5 CT 3 2 154816 CASAVA_Build 18 70246007 20D27M2D TGTGTGTGCA TGTGTGGGCTTGCACGAGTGTGTGTGCATGTACAAATGTGCACGTGAGT/--------------------TGTGTGCATGTACAAATGTGCACGTGA-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 56 50 15 18 N/A 0 0 154817 CASAVA_Build 18 70251344 1D CACAGATAGC T/- TTTTTTTTTT 1183 het 1183 ref 38 28 3 8 T 13 12 154818 CASAVA_Build 18 70252590 1D AAACAAAAAC A/- ATTTGTTTCC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 2 1 154819 CASAVA_Build 18 70257332 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 T 11 10 154820 CASAVA_Build 18 70280882 1D TGTTTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2862 hom 49 16 26 7 A 16 15 154821 CASAVA_Build 18 70310797 1D CAGTGCCCAA G/- GGGAGGGCCA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 G 4 3 154822 CASAVA_Build 18 70311553 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 4 A 12 10 154823 CASAVA_Build 18 70312055 18D GAACTGAGCA CACAGGCTCCAATACCAG/------------------ CTACTTGCAT 3070 het 3070 hom 53 21 28 6 CACAGGCTCCAATACCAG 1 0 154824 CASAVA_Build 18 70321291 3I CCCTTTCGTT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 30 4 14 12 TTG 0 1 154825 CASAVA_Build 18 70327848 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 676 hom 24 6 12 6 A 15 14 154826 CASAVA_Build 18 70329923 1I ACTCCACTTC -/A AAAAAAAAAA 1586 het 1293 hom 23 4 10 9 A 15 16 154827 CASAVA_Build 18 70334839 4D GGCCTTTGAC CTCA/---- CTCACCTCAA 3070 het 3070 ref 49 23 19 9 CTCA 2 1 154828 CASAVA_Build 18 70337156 1I TATTTCATTT -/C CCCCCCAGTT 3070 hom 86 het 31 0 27 4 C 6 7 154829 CASAVA_Build 18 70339555 1D TCTGCTCCTT A/- ACGGCTGTGG 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 2 1 154830 CASAVA_Build 18 70342191 1D TGACAGTACC T/- TTAGGGGGAG 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 3 2 154831 CASAVA_Build 18 70342801 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 33 1 14 18 T 15 14 154832 CASAVA_Build 18 70343673 3I GTGGACACAT ---/CTC CTCATTTCTC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 CTC 1 2 154833 CASAVA_Build 18 70345591 1I AAACAAATAG -/A AAAAAAAAAA 1780 het 1780 ref 27 14 6 7 A 10 11 154834 CASAVA_Build 18 70351444 5D TTACTTATCT TTAGA/----- TAAGGTCACA 3070 hom 117 het 42 0 40 4 TTAGA 1 0 154835 CASAVA_Build 18 70353220 1I TTTTCTCTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 2678 hom 29 7 18 4 A 8 9 154836 CASAVA_Build 18 70357394 1I CCCTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1413 hom 27 3 17 7 A 12 13 154837 CASAVA_Build 18 70369480 1I ATTAACCCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 9 10 154838 CASAVA_Build 18 70374572 3I CTGCTGGCTG ---/TGC TGCTGCTGCT 3070 hom 77 het 34 0 22 12 TGC 5 6 154839 CASAVA_Build 18 70392116 4I CAAATCAAAT ----/AATC AATCCACAGC 3070 het 3070 ref 53 26 17 10 AATC 1 2 154840 CASAVA_Build 18 70393922 4D TAAAAATGAG TCTT/---- TATTATAATA 3070 het 3070 hom 30 8 22 1 TCTT 1 0 154841 CASAVA_Build 18 70396641 1I TACCATTGGA -/G GTATCATTTT 3070 het 3070 hom 54 23 26 5 G 1 2 154842 CASAVA_Build 18 70402331 4I GAAACACAAA ----/TGTT TATTTAGTGC 3070 hom 111 het 45 0 37 8 TGTT 0 1 154843 CASAVA_Build 18 70403780 1I TGTAAACAAC -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 7 8 154844 CASAVA_Build 18 70409908 2D TCTTTATTGC AG/-- AGTCGTTGGC 3070 het 3070 ref 54 25 25 4 AG 2 1 154845 CASAVA_Build 18 70411005 2I55M6I ATAACTTACT --AGTTTTCAATTTTTTTACCCTAGTTAACACAAAGTCCTTGAAGTGAATATCATCT------/ACAGTTTTCAATTTTTTTACCCTAGTTAACACAAAGTCCTTGAAGTGAATATCATCTTTATCA TTATTTTATT 3070 hom 90 het 32 0 31 23 N/A 0 0 154846 CASAVA_Build 18 70411710 1I TTCTGTGGAA -/C CAGGTGGTTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 C 1 2 154847 CASAVA_Build 18 70412890 1D AAGAAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 136 hom 28 1 15 12 T 17 16 154848 CASAVA_Build 18 70415205 5I AAGTCCTGCC -----/TTTTT TTTTTTTTTT 2056 hom 32 het 19 0 10 9 T 11 16 154849 CASAVA_Build 18 70422587 1D TATGTCCACC A/- GGGGTCTTAG 3070 het 3070 hom 51 20 23 9 A 1 0 154850 CASAVA_Build 18 70434209 1D24M1D5M1D CCTCCCTAGT AAGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCCAAGC/-AGCTGGGATTACAGGCATGAGCCA-CCAAG- CCCAGCCCCT 3070 hom 27 het 7 0 10 0 N/A 0 0 154851 CASAVA_Build 18 70463440 1D CATCACTTCT G/- GGATTCGTCC 3070 het 3070 ref 32 11 10 11 G 3 2 154852 CASAVA_Build 18 70463981 2D14M2I GTGTGAGTGC ATATGTGTGTGTGAAT--/--ATGTGTGTGTGAATGA GTGCATGTGA 3070 het 3070 ref 81 41 43 13 N/A 0 0 154853 CASAVA_Build 18 70464105 2I GTGTGAGTGC --/GT GTGTGTGTAC 3070 het 3070 hom 74 28 34 12 GT 4 5 154854 CASAVA_Build 18 70478442 1D GTTAGCATAG T/- TTTTTTTTTT 2103 het 2103 ref 28 13 8 7 T 13 12 154855 CASAVA_Build 18 70482967 1I TTATATTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 40 1 35 4 T 10 11 154856 CASAVA_Build 18 70486067 4I CATGTGTTGA ----/TAAT TTATTGCATT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TAAT 0 1 154857 CASAVA_Build 18 70493696 1I GGCAAAACTT -/A TCCTAAGTCA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 0 1 154858 CASAVA_Build 18 70507852 4I GTTTTTGGTC ----/ACTT ACAGAATATT 3070 het 3070 hom 50 13 30 7 ACTT 0 1 154859 CASAVA_Build 18 70508850 1D AACTGAAAGA T/- TTTTTTTTTA 764 het 764 ref 31 22 2 8 T 10 9 154860 CASAVA_Build 18 70509310 2D ACTGGAAAAC AT/-- ATGAAATCTG 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 AT 2 1 154861 CASAVA_Build 18 70521345 1I ACCTTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 27 0 16 11 A 16 17 154862 CASAVA_Build 18 70531396 1I TTTTTTGGGG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 0 1 154863 CASAVA_Build 18 70544893 1D GAAGGATCTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 19 10 10 T 9 8 154864 CASAVA_Build 18 70546017 9D CAAGTTATGC CTTGCTGAG/--------- TTTCTTCCAC 3070 het 3070 ref 46 23 23 2 CTTGCTGAG 1 0 154865 CASAVA_Build 18 70560115 4I ACATTTATCA ----/TTTG TTTGTATTGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTTG 1 2 154866 CASAVA_Build 18 70561121 1D GCATTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 16 10 T 11 10 154867 CASAVA_Build 18 70585732 16I TGTATTAGTG ----------------/TGTAATACATTGCTAA TGTAATACAT 3070 hom 14 het 45 1 35 9 TGTAATACATTGCTAA 0 1 154868 CASAVA_Build 18 70586320 1D CTTCAGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 31 0 27 5 A 11 10 154869 CASAVA_Build 18 70588106 1D GTTTTTTTTT C/- ATTTAATTAT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 C 1 0 154870 CASAVA_Build 18 70596115 1D AGGATTGCAA C/- CCCCTGCTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 5 4 154871 CASAVA_Build 18 70597691 1D TTGTAGAAGG T/- TTTTTTGACT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 154872 CASAVA_Build 18 70602143 3D GAATTTTGAT AGG/--- TTTTATTATA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 AGG 1 0 154873 CASAVA_Build 18 70612488 4I9M5I AAGTCTTTAA ----TAATTTCAG-----/TAATTAATTTCAGTTTTA TTTTATATTA 3070 hom 72 het 24 0 25 4 N/A 0 0 154874 CASAVA_Build 18 70620969 1I ATTTTTGTAC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 8 9 154875 CASAVA_Build 18 70626728 2D TGGCACACAC AT/-- GTCACCCACA 3070 het 3070 hom 82 35 34 14 AT 1 0 154876 CASAVA_Build 18 70626814 11D GCACACACGT CACTCACATGG/----------- CACGCACATG 3070 het 3070 hom 62 26 30 8 CACTCACATGG 1 0 154877 CASAVA_Build 18 70630800 1D TTGTATCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 879 hom 41 3 23 15 T 15 14 154878 CASAVA_Build 18 70651300 1D GCACCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 17 12 T 13 12 154879 CASAVA_Build 18 70654415 1I ACCCCCTTCA -/C CCCCACACCC 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 C 4 5 154880 CASAVA_Build 18 70687938 1D ACTTAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 4 A 11 10 154881 CASAVA_Build 18 70691271 1D CTTTCCTTTG A/- TTTGTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 1 0 154882 CASAVA_Build 18 70712456 1D TACCTGTCAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 9 8 154883 CASAVA_Build 18 70712811 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2169 hom 19 7 10 2 T 13 14 154884 CASAVA_Build 18 70714044 1I TCAAAAATAG -/A AAAAATGCTC 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 5 6 154885 CASAVA_Build 18 70715688 1I TGGCATTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 9 10 154886 CASAVA_Build 18 70721218 1D GAAAATGCTT A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 48 24 18 7 A 7 6 154887 CASAVA_Build 18 70727365 12I TACCCAAGGG ------------/ATGAGGAAATAT ATGTTCATAT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 ATGAGGAAATAT 0 1 154888 CASAVA_Build 18 70742631 3I TTTTAATTGC ---/ATG TTCCTTCCAA 3070 hom 83 het 34 0 26 8 ATG 0 1 154889 CASAVA_Build 18 70742860 2D ATTTTTAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 38 5 15 19 T 13 11 154890 CASAVA_Build 18 70744492 1D CTTAAAGATC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 8 7 154891 CASAVA_Build 18 70749406 2I TCCTAATTGA --/TC TGAAATGACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TC 0 1 154892 CASAVA_Build 18 70750002 2I TTATATAAAC --/AT GTATAATATT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 AT 0 1 154893 CASAVA_Build 18 70750068 1I TAAACAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 18 1 15 2 A 10 11 154894 CASAVA_Build 18 70757497 2D CGAATCGGGA GT/-- GTGTGTGTGT 1052 het 1052 ref 66 34 5 28 GT 10 9 154895 CASAVA_Build 18 70843749 1D ACTCCGGCTC A/- AAAAAAAAAA 2867 het 529 hom 17 2 8 7 A 17 16 154896 CASAVA_Build 18 70848175 5I TTTCTATTTC -----/TCTTA TCTTTTCTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TCTTA 0 1 154897 CASAVA_Build 18 70853629 1I GCTGTGGAAC -/T TTTCTTTTTT 3070 het 335 hom 32 1 26 5 T 3 4 154898 CASAVA_Build 18 70857454 5I GCCATATTGA -----/ACTGC ACTGCACTGC 3070 hom 108 het 52 0 37 15 ACTGC 3 4 154899 CASAVA_Build 18 70880811 1I CCCTAGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 T 11 12 154900 CASAVA_Build 18 70900746 1I ATCAAAGTTT -/A ACAAGACAAC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 1 2 154901 CASAVA_Build 18 70915999 1D GGGGCCAGGA G/- GGAGGCTCAG 3070 hom 81 het 29 0 22 9 G 3 2 154902 CASAVA_Build 18 70939662 2I GTATGTTGGG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 AT 5 6 154903 CASAVA_Build 18 70940508 5I TGCAAAGGTC -----/TTATA TTATATTATT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTATA 1 2 154904 CASAVA_Build 18 70956620 2D GGGCAGACTC TG/-- TGTGGCAAAG 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 TG 3 2 154905 CASAVA_Build 18 70959301 1I TGTTAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 10 11 154906 CASAVA_Build 18 70969525 1I ACCTAAAGAC -/A ACCAGAAGGC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 1 2 154907 CASAVA_Build 18 70975917 18D GCTTCCCAGC GGTGTAGTTCATCAATCT/------------------ ATCTTTTCCC 3070 het 3070 ref 28 15 11 5 GGTGTAGTTCATCAATCT 1 0 154908 CASAVA_Build 18 70980201 3I GCAACTCAGT ---/TGA TGAGCTCCTG 3070 hom 109 het 43 0 34 9 TGA 1 2 154909 CASAVA_Build 18 70983608 1D AGTAAATATG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 A 8 7 154910 CASAVA_Build 18 70997222 14D ACGTCCGCGA GCACACACACGTCT/-------------- GCACACACAC 3070 het 2484 hom 38 9 26 11 GCACACACACGTCT 1 0 154911 CASAVA_Build 18 71000877 1D GCGCCCTCCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 9 8 154912 CASAVA_Build 18 71002043 1D AATTTATGGG A/- AAATTGACAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 4 3 154913 CASAVA_Build 18 71002171 2I TCATTCTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 40 1 22 17 T 14 16 154914 CASAVA_Build 18 71016444 2I TTATTCTTCA --/AT ATATTATTGG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AT 2 3 154915 CASAVA_Build 18 71016837 1D AGTTGAACAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 9 8 154916 CASAVA_Build 18 71022459 1D TTTTCGTTTG T/- CTGAAAATAT 3070 het 3070 hom 44 21 22 1 T 1 0 154917 CASAVA_Build 18 71027497 16D CCCAAGCTCC TGGCAGTATTGTTACG/---------------- TGGCAAAACA 3070 het 3070 ref 34 22 11 9 TGGCAGTATTGTTACG 1 0 154918 CASAVA_Build 18 71042174 1D TATTAGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 T 11 10 154919 CASAVA_Build 18 71044692 1D CTACGTTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 T 10 9 154920 CASAVA_Build 18 71046315 1D CCTCCTTGTA C/- CCCCACCCCC 3070 het 2366 hom 24 10 12 2 C 5 4 154921 CASAVA_Build 18 71051840 1D AGGAGTTTGA G/- GGGGGGGGGG 3070 het 593 hom 33 6 13 14 G 11 10 154922 CASAVA_Build 18 71096479 2I ACTGTAACTC --/TT TTTGATTTTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 3 5 154923 CASAVA_Build 18 71117236 1I GTTTCTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 34 1 27 6 T 11 12 154924 CASAVA_Build 18 71135155 1I GTAACTCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 A 11 12 154925 CASAVA_Build 18 71144991 1I GTGAGCAAAG -/C CCTAGATGGT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 C 2 3 154926 CASAVA_Build 18 71147139 1D CGGCAACCAC T/- CATTCTTCCT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 T 1 0 154927 CASAVA_Build 18 71148515 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1416 hom 29 4 20 5 A 12 13 154928 CASAVA_Build 18 71166792 3I TGACTTTGGA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 11 14 154929 CASAVA_Build 18 71167612 6D GGTACATGAG TATGAT/------ TATGATAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 5 TATGAT 2 1 154930 CASAVA_Build 18 71169441 1D AAAGACAGCC T/- TTTTTTTTTT 1680 het 1680 ref 33 18 5 10 T 13 12 154931 CASAVA_Build 18 71170779 1I TATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 T 8 9 154932 CASAVA_Build 18 71176687 1I ATGCACTCAT -/G TGTTATGTGC 3070 hom 226 het 86 0 75 11 G 0 1 154933 CASAVA_Build 18 71183875 1D AGATGCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 13 12 154934 CASAVA_Build 18 71189834 1D CAATTTGGGT A/- AAAAATTTTT 3070 het 66 hom 27 1 20 6 A 6 5 154935 CASAVA_Build 18 71202150 1D AGGCCATGTC G/- GGGGGGCATT 3070 hom 110 het 45 0 36 10 G 7 6 154936 CASAVA_Build 18 71208518 1D GTCGTCACGT G/- GCCTTCTCCT 3070 hom 108 het 40 0 34 8 G 2 1 154937 CASAVA_Build 18 71221211 4I GATGTACAAT ----/AAAG TTACATTCCA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 AAAG 0 1 154938 CASAVA_Build 18 71227875 5D AAAGACATAA AATGG/----- AATTATTGCT 3070 het 3070 ref 54 27 22 7 AATGG 1 0 154939 CASAVA_Build 18 71229400 1I ATTCCATTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 69 25 31 13 T 9 10 154940 CASAVA_Build 18 71235324 7I TACCTGTTTT -------/CTTCTCA CTTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 CTTCTCA 0 1 154941 CASAVA_Build 18 71245728 1D GATTTGTGAT A/- GGGGCAAATG 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 1 0 154942 CASAVA_Build 18 71247021 1I GCATGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 2566 het 2566 ref 33 13 10 10 T 12 13 154943 CASAVA_Build 18 71248816 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 29 1 16 13 T 15 14 154944 CASAVA_Build 18 71249745 5I TTTAACTAGG -----/TGATT TCTGAGAAGT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TGATT 0 1 154945 CASAVA_Build 18 71264982 4D GCTTCAAGAA TGTT/---- TGACCATTTT 3070 het 3070 ref 49 27 18 5 TGTT 1 0 154946 CASAVA_Build 18 71267235 4D TATTTATTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2271 hom 26 8 13 5 TTTG 7 6 154947 CASAVA_Build 18 71269511 3I CGCACAGTAT ---/GAC GACTAAGAAA 3070 het 3070 hom 56 21 27 8 GAC 1 2 154948 CASAVA_Build 18 71277864 5I GATTCAGCAG -----/ACAAC ACAACGGAAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 ACAAC 1 2 154949 CASAVA_Build 18 71286710 1I AGACTTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 38 2 25 11 A 11 12 154950 CASAVA_Build 18 71286721 1I AAAAAAAAAA -/T TTGAGCATGT 3070 hom 96 het 39 0 30 9 T 2 3 154951 CASAVA_Build 18 71290818 1D TAGACAACAC T/- TTAACCAAGT 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 T 3 2 154952 CASAVA_Build 18 71294085 1D TGGAAAAAAA C/- AAACAGATTA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 C 1 0 154953 CASAVA_Build 18 71297213 1I AGACCTGCGG -/T TTTTTTCCAG 2427 het 2427 ref 20 12 5 3 T 6 7 154954 CASAVA_Build 18 71302451 6D AAAACAGAAG CAAGTC/------ CAAGTCACCT 2121 het 2121 ref 22 13 7 2 CAAGTC 2 1 154955 CASAVA_Build 18 71318572 4D TGTCTGTCTG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 hom 54 het 40 0 18 22 TCTA 5 4 154956 CASAVA_Build 18 71328726 1I AGCTGTTGAC -/A AAAATTTATG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 4 5 154957 CASAVA_Build 18 71334465 1I TCTCAGCTCT -/C CCTTGCTTAA 3070 hom 123 het 50 0 39 11 C 2 3 154958 CASAVA_Build 18 71344974 1D AGAAAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 T 11 10 154959 CASAVA_Build 18 71350430 2I GTCTGAGTGT --/CC CCCCCCCGCT 2429 het 2429 ref 39 16 10 13 C 7 9 154960 CASAVA_Build 18 71351196 1D GCTTTGCAGA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 53 het 24 0 18 6 C 9 8 154961 CASAVA_Build 18 71351954 1D TGCCTACCCA G/- GGTTACCTCC 3070 het 3070 hom 48 16 24 9 G 3 2 154962 CASAVA_Build 18 71354012 1D AACAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 13 12 154963 CASAVA_Build 18 71359615 1D GTGATGGGGT G/- GGGGGGTTCC 3070 hom 108 het 43 0 31 12 G 7 6 154964 CASAVA_Build 18 71362944 1D TGGAAACCAG A/- ATGCCTTCGC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 2 1 154965 CASAVA_Build 18 71366739 1I TTTTGTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 9 10 154966 CASAVA_Build 18 71372676 1D TGCCTGGTTA G/- GGGGTTGTGT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 G 5 4 154967 CASAVA_Build 18 71377259 1D TTGCTCCACA C/- CCCCCAACAA 3070 hom 69 het 30 0 22 8 C 6 5 154968 CASAVA_Build 18 71379604 1I TTTAATTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 T 9 10 154969 CASAVA_Build 18 71401660 1D AATCCTTTTG C/- TATTTTGGAA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 C 1 0 154970 CASAVA_Build 18 71402348 1I TCTCTCTCCG -/C CCCCCCCCCT 3070 het 262 hom 23 1 15 7 C 9 10 154971 CASAVA_Build 18 71418409 1I GTGATTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 26 1 18 7 T 12 13 154972 CASAVA_Build 18 71421642 2D TAACCTATAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TA 7 6 154973 CASAVA_Build 18 71425908 1D AGGAGGAGGT A/- AAAAAGCTAA 3070 hom 99 het 40 0 30 10 A 6 5 154974 CASAVA_Build 18 71438562 1D GCAGAACTGG T/- TTTAAACAAC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 4 3 154975 CASAVA_Build 18 71447505 1I TTGCCATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 39 1 24 14 A 10 11 154976 CASAVA_Build 18 71447734 1I CACTTAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 30 2 23 5 T 14 15 154977 CASAVA_Build 18 71454652 4D CATGTGTATG TATA/---- TATATGTAAA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 TA 4 2 154978 CASAVA_Build 18 71457673 1I TCATAAATGT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 8 154979 CASAVA_Build 18 71475901 1D AAACCTTTTT C/- CCCCCACTAA 3070 hom 92 het 34 0 31 4 C 6 5 154980 CASAVA_Build 18 71478467 1I ATAACTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 742 hom 32 3 15 14 A 15 16 154981 CASAVA_Build 18 71482319 2D GTGTGCACAC GT/-- GTGTGTGTGT 1163 het 1163 ref 52 30 3 19 GT 10 9 154982 CASAVA_Build 18 71483494 1D TGTAGGATTT G/- GAAGCTGATG 3070 hom 131 het 46 0 42 6 G 2 1 154983 CASAVA_Build 18 71500921 1D CTTATTCCAT C/- CCCATCCCCA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 C 4 3 154984 CASAVA_Build 18 71514589 4D TTTTATTGGG TTGT/---- TTGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 19 2 TTGT 2 1 154985 CASAVA_Build 18 71521451 1D AGTCCAATTT C/- CCCCTCTCCT 3070 hom 138 het 52 0 45 7 C 5 4 154986 CASAVA_Build 18 71531185 1I ACTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 719 hom 38 3 29 6 T 11 12 154987 CASAVA_Build 18 71535093 1D GAGATTCCCG C/- CCCCACCCTC 3070 hom 83 het 32 0 27 5 C 5 4 154988 CASAVA_Build 18 71564156 4I ATGAGACTCT ----/GTAA GTGTCTAAGA 3070 hom 154 het 55 0 52 3 GTAA 0 1 154989 CASAVA_Build 18 71564698 1I TGACAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 38 2 30 6 A 10 11 154990 CASAVA_Build 18 71567648 2D TTTGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 27 0 19 9 T 12 10 154991 CASAVA_Build 18 71568706 1D CCTAAAGAGA G/- GGTCAAACTG 3070 hom 127 het 48 0 39 9 G 3 2 154992 CASAVA_Build 18 71569453 11D TTCATTCTAT GTCATAGCAAC/----------- TTGACATAGA 3070 hom 57 het 22 0 20 7 GTCATAGCAAC 1 0 154993 CASAVA_Build 18 71572928 1D AGTGAGAAAG C/- CCCACCCTGC 3070 hom 90 het 31 0 25 6 C 4 3 154994 CASAVA_Build 18 71574712 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 29 0 23 7 T 10 9 154995 CASAVA_Build 18 71575125 6I TCAAAGGAAA ------/TACTTT TACTTTTCTT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TACTTT 1 2 154996 CASAVA_Build 18 71583862 3I AAAGAAATGA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AAT 3 4 154997 CASAVA_Build 18 71607545 3D TATGAAGAAT TTA/--- TTATCATTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 4 TTA 2 1 154998 CASAVA_Build 18 71611800 1D TAAATTAGGG T/- TTTTTCTTTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 6 5 154999 CASAVA_Build 18 71612336 24I GTGGCACCCA ------------------------/TGTGTAAAATGAAGAAATGGAAAG CTCATTTACC 3070 hom 81 het 29 0 27 3 TGTGTAAAATGAAGAAATGGAAAG 0 1 155000 CASAVA_Build 18 71622333 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2682 het 2682 ref 26 13 8 5 A 10 11 155001 CASAVA_Build 18 71626661 1D AGGCTATTGC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 53 24 22 9 A 8 7 155002 CASAVA_Build 18 71637357 2D CAAATCATAG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 T 11 9 155003 CASAVA_Build 18 71647809 1I ACTAAAGGCT -/G GGGGGGGTAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 7 8 155004 CASAVA_Build 18 71654279 5D GAGACAGACA TGATT/----- TGATTTGATT 3070 hom 135 het 47 0 46 3 TGATT 3 2 155005 CASAVA_Build 18 71658957 2I GACTGACAAC --/CT CCACCATTCC 3070 hom 123 het 42 0 37 5 CT 0 1 155006 CASAVA_Build 18 71662922 1I CCATTATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 11 12 155007 CASAVA_Build 18 71668189 1D TTAATGTAGG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 8 7 155008 CASAVA_Build 18 71670641 1I TTCTTTCCTC -/T TTTTTTACCA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 T 6 7 155009 CASAVA_Build 18 71672811 1I CCAGACTTGA -/G CGCAATGGCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 0 1 155010 CASAVA_Build 18 71673464 11D CCATAGAAAA ATTTGAGAGAC/----------- ATTTGAGAGG 2804 het 2804 ref 32 22 7 4 ATTTGAGAGAC 1 0 155011 CASAVA_Build 18 71677080 1I CAGTTTAACA -/T TTTTGCATTT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 4 5 155012 CASAVA_Build 18 71684268 1D AAATACTCAT A/- ACCAAAATAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 2 1 155013 CASAVA_Build 18 71710857 1I ATAGATTGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 9 10 155014 CASAVA_Build 18 71739278 1I AAATGAAATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 2273 hom 24 7 16 1 A 8 9 155015 CASAVA_Build 18 71741543 1D TTTAACTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 15 12 A 13 12 155016 CASAVA_Build 18 71756171 16D GGAGAGGATT AATAAATCACTGGACA/---------------- AATAAATGAA 3070 het 3070 ref 44 29 12 10 AATAAATCACTGGACA 1 0 155017 CASAVA_Build 18 71766766 1D AAGCATTAAG T/- TTAAACAGTG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 3 2 155018 CASAVA_Build 18 71777812 1D TCTTGGTTTT G/- GGTGGGTTTT 3070 hom 87 het 38 0 28 10 G 3 2 155019 CASAVA_Build 18 71791535 5I AAATCCACTT -----/ATAAA TATAATATGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ATAAA 0 1 155020 CASAVA_Build 18 71818240 2D GCAACTAAAC AT/-- ATAAAATAAC 3070 het 3070 hom 45 21 23 1 AT 2 1 155021 CASAVA_Build 18 71837075 3D TGCTTTGTTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 52 25 14 15 TTG 5 4 155022 CASAVA_Build 18 71838696 21D TAATATGTGC TGAATTTTGTAAAGTGCGTGT/--------------------- TGAATTTTGT 3070 hom 93 het 37 0 31 7 TGAATTTTGTAAAGTGCGTGT 1 0 155023 CASAVA_Build 18 71844217 2D78M1D AGTCTGTCTC AAAAAAAAAATAAAAAGAATTAATAAAGGAATACAAACATTACAAACATTTGGTTGCAATGTTTTTAATTAGCTCCCCCCA/--AAAAAAAATAAAAAGAATTAATAAAGGAATACAAACATTACAAACATTTGGTTGCAATGTTTTTAATTAGCTCCCCCC- AAAAAAATCC 3070 het 19 hom 13 1 13 19 N/A 0 0 155024 CASAVA_Build 18 71856393 2D TTCAGCGGGT TC/-- TGAGTGGAAT 3070 hom 86 het 35 0 28 7 TC 1 0 155025 CASAVA_Build 18 71857808 3I TTTTGCTTGT ---/TGG TAAAATAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TGG 0 1 155026 CASAVA_Build 18 71865437 14D ATACTTCCAC CAGCTCTATTTCTA/-------------- CAAGAACACC 3070 hom 135 het 46 0 46 3 CAGCTCTATTTCTA 1 0 155027 CASAVA_Build 18 71876829 5I CAAAAAGCAT -----/CTTTA CTTTAAGGCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 CTTTA 1 2 155028 CASAVA_Build 18 71878917 1I TCACAGTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 9 10 155029 CASAVA_Build 18 71880881 4D CAGGGGAAGG GGCT/---- GGCTGCTCTG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 GGCT 2 1 155030 CASAVA_Build 18 71881429 4I TTGTCCTCAC ----/CCTA CCTACCCTCG 3070 hom 132 het 50 0 43 7 CCTA 1 2 155031 CASAVA_Build 18 71884010 2I TTTGGCTTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 11 13 155032 CASAVA_Build 18 71885408 2I GGAGAGCATC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 10 12 155033 CASAVA_Build 18 71885596 2D AGATAGAGAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 47 het 37 1 29 7 AG 10 9 155034 CASAVA_Build 18 71894778 2D ACTAAAAAAC TG/-- TGTATTGCTG 3070 hom 129 het 48 0 41 8 TG 2 1 155035 CASAVA_Build 18 71898664 8D3M8D CACACCCTGA TTTAGCACGAGGAACACGA/--------GAG-------- GGAACAAAAA 3070 het 3070 ref 30 20 10 5 N/A 0 0 155036 CASAVA_Build 18 71902745 4D TTCCTTTTTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 31 0 26 5 T 14 10 155037 CASAVA_Build 18 71903746 1D AAAAAACTCC T/- TCTCCAGGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 1 155038 CASAVA_Build 18 71904983 1D CATGTTAGCA G/- GGGTTGATCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 4 3 155039 CASAVA_Build 18 71908294 3D ATTATTTTAG TTA/--- TTATTTAGTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 TTA 2 1 155040 CASAVA_Build 18 71914807 2D TGGCAAGTCC CT/-- GTTATCTATG 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 CT 1 0 155041 CASAVA_Build 18 71929966 1I AAATGCAGAA -/G TAGGCCAGGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 155042 CASAVA_Build 18 71930162 1I ACTGCTCAAC -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 6 7 155043 CASAVA_Build 18 71940151 1I AATTTTACTG -/A AGAGTACAGA 3070 het 3070 hom 64 16 36 12 A 1 2 155044 CASAVA_Build 18 71942735 1I TTTGTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1548 hom 44 4 34 6 A 11 12 155045 CASAVA_Build 18 71945209 1I GTAGAAAATA -/T AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 0 1 155046 CASAVA_Build 18 71945861 1D TTAGAGTCAC A/- GGGGGTTACA 3070 het 3070 ref 32 19 12 4 A 1 0 155047 CASAVA_Build 18 71946330 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 24 8 15 5 A 10 8 155048 CASAVA_Build 18 71947118 1I ATGTACATTC -/T GTAACCACTG 3070 hom 96 het 41 0 32 9 T 0 1 155049 CASAVA_Build 18 71948950 1I AGACTTGTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 14 16 2 T 8 9 155050 CASAVA_Build 18 71950331 1I TCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 46 het 18 0 16 2 T 8 9 155051 CASAVA_Build 18 71955897 1D GAAGAATCCG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 57 25 28 5 A 10 9 155052 CASAVA_Build 18 71961735 1D TCTGGCATTA C/- CCCCGCTTGC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 5 4 155053 CASAVA_Build 18 71963992 10D AAAACAAGAC AGAGAGAGAG/---------- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 40 16 14 13 AG 14 9 155054 CASAVA_Build 18 71966474 1I GACTTCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 735 hom 39 2 16 21 T 14 15 155055 CASAVA_Build 18 71979106 1I AGCCAATTTC -/A CTTTTAAAAC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 0 1 155056 CASAVA_Build 18 71999037 4D TCTTTCATTC ATTA/---- CTTATTTACT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 ATTA 1 0 155057 CASAVA_Build 18 72009555 7I TAAAAATCAA -------/GCAGCTT GCAGCTTAGT 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 GCAGCTT 1 2 155058 CASAVA_Build 18 72017582 2I TGTATGTCTC --/TG TGCGTGCATG 3070 hom 152 het 57 0 51 6 TG 1 2 155059 CASAVA_Build 18 72021897 1D TCCAAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 11 10 155060 CASAVA_Build 18 72027874 8I GTGTGCATGA --------/GTGTATGT GTGTGTATGT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 GTGTATGT 0 1 155061 CASAVA_Build 18 72036575 1I TGTAGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1272 hom 32 4 18 10 T 13 14 155062 CASAVA_Build 18 72039320 1I AAATTTCAAT -/A AGCAATTACA 3070 hom 90 het 41 0 31 10 A 1 2 155063 CASAVA_Build 18 72039520 1I AAGATAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 24 1 17 6 A 13 14 155064 CASAVA_Build 18 72051490 6D TATTTTATAT ATATAG/------ ATATAGATAT 2247 hom 15 het 6 0 6 1 ATATAG 4 3 155065 CASAVA_Build 18 72053626 1D CTTTATGTAC A/- AAAAAAATCG 3070 hom 129 het 47 0 41 7 A 8 7 155066 CASAVA_Build 18 72053830 2I CCCCTTCTCC --/CT CTCTTTCTCT 3070 hom 68 het 32 0 21 11 CT 2 3 155067 CASAVA_Build 18 72054360 1D TTCTATGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 591 hom 25 2 17 7 A 13 12 155068 CASAVA_Build 18 72060123 2D TGTATGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 2902 het 2902 ref 75 50 8 18 TG 9 8 155069 CASAVA_Build 18 72060328 1D GCCTGGCAAG A/- AAAAAAAAAG 1456 het 1456 ref 49 36 4 10 A 10 9 155070 CASAVA_Build 18 72060692 1D AGGCCAGCCA C/- CCCCAAAATG 3070 hom 87 het 32 0 29 4 C 5 4 155071 CASAVA_Build 18 72077156 3I CATCATCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 108 het 46 0 36 10 AAC 3 4 155072 CASAVA_Build 18 72080126 5I3M2D TAACTGAAAT -----AAGCC/AAAGAAAG-- ACATAAAGAA 3070 hom 118 het 43 0 42 2 N/A 0 0 155073 CASAVA_Build 18 72080868 4I ATTATGTGTG ----/TATA TATATATATA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TA 5 7 155074 CASAVA_Build 18 72084415 6D TCAAGCTAAA TCTCTC/------ TCTCACTTCT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 TC 5 2 155075 CASAVA_Build 18 72101436 1I GCCCATCGTG -/C CTCAGCACAC 2810 het 2810 ref 22 15 6 1 C 1 2 155076 CASAVA_Build 18 72111715 3I TATTTCATAT ---/TAA TAATATGTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAA 1 2 155077 CASAVA_Build 18 72143178 2I CCACAGAGAC --/TG TTAGACTGGA 3070 hom 123 het 44 0 40 4 TG 0 1 155078 CASAVA_Build 18 72152947 1I CAGTCTCTGA -/C CCCCCCAGAC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 C 6 7 155079 CASAVA_Build 18 72153558 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 2915 hom 18 7 10 2 A 9 8 155080 CASAVA_Build 18 72155085 2I ACTAAATAAC --/AG AACTTTCTGT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AG 0 1 155081 CASAVA_Build 18 72167361 1D TCCCATAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 41 0 34 9 A 12 11 155082 CASAVA_Build 18 72174240 1D ATGGTACTAG A/- AAAAAAAAAA 1467 het 1467 ref 34 26 5 4 A 12 11 155083 CASAVA_Build 18 72195872 1D TTAGAACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 35 0 19 16 T 17 16 155084 CASAVA_Build 18 72196531 1D GTTTTATTTT G/- AGGCACCATC 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 G 1 0 155085 CASAVA_Build 18 72200773 1I TACCATTCGG -/A AAAAAAAAAG 735 het 735 ref 63 55 3 5 A 9 10 155086 CASAVA_Build 18 72217269 5I AATAATGCAC -----/CTACT CTACTAACAG 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 CTACT 1 2 155087 CASAVA_Build 18 72229501 1I CATGAGCCAT -/C CATGTACATT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 C 1 2 155088 CASAVA_Build 18 72238446 2I CTGAGTACAC --/AT GTTTTCATTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AT 0 1 155089 CASAVA_Build 18 72240130 15I CACTTTTCAA ---------------/CAACAGGCATTTATC CAACAGGCAT 3070 hom 71 het 32 0 22 10 CAACAGGCATTTATC 1 2 155090 CASAVA_Build 18 72242193 2D TCAATTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 28 1 19 8 T 18 16 155091 CASAVA_Build 18 72243360 1I ACATTTCCTT -/G TCATCCAAGC 3070 hom 114 het 42 0 37 5 G 0 1 155092 CASAVA_Build 18 72245308 1I CTACGTGTAA -/G TGTGCATGTG 3070 hom 192 het 68 0 62 6 G 0 1 155093 CASAVA_Build 18 72245685 2I CATGTGCGTT --/GA GTGTGTGCAT 3070 hom 274 het 103 0 92 11 GA 0 1 155094 CASAVA_Build 18 72264396 2D TCCTCCTGAA AC/-- ACACACATGC 3070 het 3070 ref 53 18 18 18 AC 4 3 155095 CASAVA_Build 18 72278388 1I CTTGACCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 881 hom 42 2 30 10 T 10 11 155096 CASAVA_Build 18 72281152 1I CATAACACAC -/T TGTGTAAGAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 2 155097 CASAVA_Build 18 72281687 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 59 het 25 0 19 6 TG 10 9 155098 CASAVA_Build 18 72287015 33D GGAACCCTGG TCCCAGCCCTCATGCTCCCAGTCACCAGCCACA/--------------------------------- TGCCTTTCTA 3070 het 3070 ref 41 28 15 10 TCCCAGCCCTCATGCTCCCAGTCACCAGCCACA 1 0 155099 CASAVA_Build 18 72297697 1D GCTGGGGGGT G/- GGGGGGGGCC 3070 het 28 hom 24 1 17 6 G 9 8 155100 CASAVA_Build 18 72319014 1I CCCCTAACTT -/A AAAGTGTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 3 4 155101 CASAVA_Build 18 72321030 1I CCTATAAGGC -/T TGCCAAGTGG 2198 het 490 hom 15 1 7 7 T 1 2 155102 CASAVA_Build 18 72325994 2I TTATTAACAC --/TG TTTTATTTTT 3070 het 2608 hom 41 8 25 8 TG 0 1 155103 CASAVA_Build 18 72327319 4I TTTCTGAAAC ----/AAAG AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 AAAG 0 1 155104 CASAVA_Build 18 72328715 2I CAAACTCACT --/GG GGTTCCTGGG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 G 2 4 155105 CASAVA_Build 18 72372399 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1679 het 254 hom 16 1 9 6 A 11 12 155106 CASAVA_Build 18 72392595 1I GTACAAAATC -/A ATTGTATTTC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 1 2 155107 CASAVA_Build 18 72395133 1D GTGGGCGAAC T/- TTATGGCATG 3070 het 3070 hom 55 23 25 8 T 3 2 155108 CASAVA_Build 18 72400836 18D AAATGATAAT ATAACAACAACAATAATA/------------------ ATAGCTAACA 3070 het 3070 hom 43 22 22 5 ATAACAACAACAATAATA 1 0 155109 CASAVA_Build 18 72401938 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1341 hom 7 het 3 0 3 0 A 6 7 155110 CASAVA_Build 18 72403648 1D GGCAAGGCCT G/- GAGAAACGTC 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 G 2 1 155111 CASAVA_Build 18 72407110 6D AGATAAAGAT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 18 hom 24 1 10 13 TTG 8 6 155112 CASAVA_Build 18 72414496 10I TTCCCAGGCC ----------/AGTGGACTCG AGTTGGCCAG 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 AGTGGACTCG 0 1 155113 CASAVA_Build 18 72417638 1D AAACTGCTCT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 67 het 26 0 23 4 A 8 7 155114 CASAVA_Build 18 72417953 5D AAAAAAAAAA AAAAT/----- AAAAAATAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 3 AAAAT 1 0 155115 CASAVA_Build 18 72419022 1D TAGATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 T 11 10 155116 CASAVA_Build 18 72419132 1I CTAGTTCTGC -/A CAAGGGCTCT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 0 1 155117 CASAVA_Build 18 72428816 1I TACACAACTT -/G GTCTTATATC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 1 2 155118 CASAVA_Build 18 72430994 6D ATTACACCTA GACGGC/------ GACTCCTCCT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 GACGGC 1 0 155119 CASAVA_Build 18 72431343 1D TTCCCGTTTG T/- TTTTTTCAAA 3070 hom 81 het 31 0 23 8 T 7 6 155120 CASAVA_Build 18 72432515 3D GTCACTGGAA GGT/--- AGAGGCTCTT 3070 het 3070 hom 42 19 21 4 GGT 1 0 155121 CASAVA_Build 18 72442562 3D AGCACCCTGC AGA/--- AGAGCTTCCC 3070 hom 82 het 30 0 23 8 AGA 2 1 155122 CASAVA_Build 18 72462905 1I AACAGACGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 12 155123 CASAVA_Build 18 72468909 4D17M5I TAATGTAATT TTTGTTTGTAACTTCTCTCTT-----/----TTTGTAACTTCTCTCTTTTCTC TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 4 N/A 0 0 155124 CASAVA_Build 18 72470439 1D GTTATCTTCT A/- GAATTTTTAT 3070 het 2695 hom 20 6 12 2 A 1 0 155125 CASAVA_Build 18 72472841 1I AGACACTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 9 155126 CASAVA_Build 18 72474366 1D TGGCTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 13 12 155127 CASAVA_Build 18 72481134 1I TGATGAAACT -/C CCTCTGTACT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 2 3 155128 CASAVA_Build 18 72482178 2D ATATAACACC AT/-- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 52 27 21 5 AT 5 4 155129 CASAVA_Build 18 72487993 2I GTAGAGAAAC --/TT TTGCTTTAAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 2 4 155130 CASAVA_Build 18 72493541 1D CTATACCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 18 12 T 12 11 155131 CASAVA_Build 18 72498084 3D TCTGTGGACA TCT/--- TCTTTTCACT 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 TCT 2 1 155132 CASAVA_Build 18 72502888 1I ATCTTTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 T 11 12 155133 CASAVA_Build 18 72511387 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATAGC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 7 6 155134 CASAVA_Build 18 72513157 1D GATATGGTCT A/- AAAGGGGAAG 3070 het 3070 hom 50 16 25 9 A 4 3 155135 CASAVA_Build 18 72517304 1D ATCTTTACTG A/- AAAAAAAAAA 1990 hom 24 het 11 0 7 4 A 15 14 155136 CASAVA_Build 18 72521778 22I AAGCCGGAGG ----------------------/GTAGAGCATGAGCTGTGCCAGC ACCTGGTCTT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 GTAGAGCATGAGCTGTGCCAGC 0 1 155137 CASAVA_Build 18 72527513 1D CTTTCATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 33 1 23 9 T 11 10 155138 CASAVA_Build 18 72530161 1D TGATGAGCAA G/- GGTATAGTTC 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 G 3 2 155139 CASAVA_Build 18 72532253 1I9M1I AAGCAATCCT -CTGCCTCAG-/CCTGCCTCAGC CTCCAGACTA 3070 hom 63 het 21 0 22 0 N/A 0 0 155140 CASAVA_Build 18 72532367 1I AAGCATATTT -/C CTGAGTGATT 3070 hom 82 het 34 0 26 8 C 1 2 155141 CASAVA_Build 18 72537403 1D GGGGCATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 36 2 23 11 T 11 10 155142 CASAVA_Build 18 72547670 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 9 8 155143 CASAVA_Build 18 72562832 1D CTGGAACCAC A/- AGGCCCCCAT 3070 hom 83 het 33 0 29 5 A 2 1 155144 CASAVA_Build 18 72563316 1D TCTTCCAGCT C/- CCTGCCCCAC 3070 hom 90 het 33 0 29 5 C 3 2 155145 CASAVA_Build 18 72571775 1I TCTTCAACCT -/A AAAAAAAAAA 2807 het 2807 ref 27 11 7 9 A 10 11 155146 CASAVA_Build 18 72600534 1D CAGGCCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 20 7 T 12 11 155147 CASAVA_Build 18 72628386 1I CAGGACAGGG -/A AAGGCCCGTT 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 2 3 155148 CASAVA_Build 18 72628975 2D GTGCTGACTC AA/-- AGAGTGAGCA 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 A 3 1 155149 CASAVA_Build 18 72631617 1D16M2D AAGGCAGGAG AAAAAAGAAAAAGAAAAAG/-AAAAAGAAAAAGAAAA-- AAATTGAAAG 3070 het 933 hom 34 9 13 18 N/A 0 0 155150 CASAVA_Build 18 72640024 2D GTATAGAGAG AA/-- AAAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 A 5 3 155151 CASAVA_Build 18 72642430 8D CTGGGTGTGA TGGCGGGG/-------- CCCTGTAGTC 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 TGGCGGGG 1 0 155152 CASAVA_Build 18 72642576 1D GCCTCCCTCG C/- CCCCCAAAGA 2728 het 1128 hom 23 5 11 7 C 6 5 155153 CASAVA_Build 18 72666553 1D AACCATTCTT A/- ACTATTTTTG 3070 het 3070 hom 27 14 12 1 A 2 1 155154 CASAVA_Build 18 72666715 1D CTAGGGCCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 9 8 155155 CASAVA_Build 18 72672086 1D ATCCCATGGG T/- TTGGACAAAT 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 T 3 2 155156 CASAVA_Build 18 72673387 1D AAGGTCAGGA T/- TTTTTTTTTT 1611 het 1611 ref 45 34 4 8 T 15 14 155157 CASAVA_Build 18 72676466 2I ATAGTAACTC --/TT TTATCATTAT 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 2 4 155158 CASAVA_Build 18 72711213 1D ATTTCAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 10 9 155159 CASAVA_Build 18 72714046 5D CATTGTGTCT GTAGA/----- GTATTCAGCT 3070 het 3070 hom 34 17 16 4 GTAGA 1 0 155160 CASAVA_Build 18 72715724 2D CCCGGAAGTG GA/-- GAAACCTGCC 3070 hom 94 het 35 0 25 10 GA 2 1 155161 CASAVA_Build 18 72733413 1D CCTTTTCCTG T/- TTTTAGACCT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 5 4 155162 CASAVA_Build 18 72746487 26D ATATGGGCTC AAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------------- AAGAAATGTA 3070 hom 14 het 30 1 27 3 AAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 155163 CASAVA_Build 18 72752255 3I GTGATGAGAA ---/ATG ATTGACCAAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 ATG 0 1 155164 CASAVA_Build 18 72777096 2D TGACAGGCGC GT/-- GTTTCTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 10 13 GT 2 1 155165 CASAVA_Build 18 72790657 1I GGCTAGAGTG -/C CAGTGGTGCA 3070 hom 14 het 12 0 8 4 C 1 2 155166 CASAVA_Build 18 72790910 1D CAGCATTACG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 416 hom 22 1 16 5 T 10 9 155167 CASAVA_Build 18 72802673 1D GCATGTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 41 1 37 3 T 11 10 155168 CASAVA_Build 18 72808301 1I TTTGTGATTT -/G GTTGTTGGAG 3070 het 3070 ref 79 45 19 15 G 1 2 155169 CASAVA_Build 18 72818640 4I ATGTTACATT ----/AAGA TAGACTTGCC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 AAGA 0 1 155170 CASAVA_Build 18 72838848 16D GGATGGTCTC GATCTCCTGACCTCGT/---------------- GATCCGCCCG 1049 het 206 hom 8 2 3 3 GATCTCCTGACCTCGT 1 0 155171 CASAVA_Build 18 72839281 7D GTCAGAATCC CCTTCCA/------- CCTTCCACCG 2823 hom 41 het 18 0 12 7 CCTTCCA 2 1 155172 CASAVA_Build 18 72841931 1I TGGAGTTGGT -/A AAAAAAAGAG 2929 het 2929 ref 20 10 7 3 A 7 8 155173 CASAVA_Build 18 72844172 1I GGCATCGTCT -/A GGACTGTCCT 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 A 0 1 155174 CASAVA_Build 18 72844940 1D TGGAAACTGG A/- ACCAGCAGCT 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 A 2 1 155175 CASAVA_Build 18 72845222 1D ATATATGTGT C/- CCCCCCCACT 2671 het 2671 ref 29 12 9 9 C 8 7 155176 CASAVA_Build 18 72856210 1D TTTAAGTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 21 15 11 T 10 9 155177 CASAVA_Build 18 72860426 1I AGCACTTCTG -/A GCACCACCAG 3070 hom 90 het 37 0 29 8 A 0 1 155178 CASAVA_Build 18 72863493 1I TTTTGCAGGG -/A TGCAATGCTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 155179 CASAVA_Build 18 72867401 1D AATCACACTA C/- CCAATTTAAC 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 C 3 2 155180 CASAVA_Build 18 72868525 2D GAGCTCACAA CT/-- CTCATTTGGC 2836 het 2836 ref 26 11 8 7 CT 2 1 155181 CASAVA_Build 18 72876605 1D TGCAGGTGAA G/- GGGGGGGGAC 3070 het 3070 ref 38 20 10 10 G 9 8 155182 CASAVA_Build 18 72884538 2I GCGTGACACT --/CA CAGCAGCGTG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 CA 1 2 155183 CASAVA_Build 18 72889511 5I CTCCTGGGTT -----/CAAGC AATTCTCTTG 3070 hom 54 het 20 0 17 3 CAAGC 0 1 155184 CASAVA_Build 18 72897084 1I ACCCCGTGCG -/C CCCGGGGCTG 3070 het 1952 hom 24 7 12 5 C 3 4 155185 CASAVA_Build 18 72899959 1I CGTGCTGGGG -/A AAATAGGCAT 3070 hom 69 het 25 0 22 3 A 3 4 155186 CASAVA_Build 18 72902067 2D TCCTCTGATG GC/-- TAGACACAGG 3070 het 3070 ref 42 20 20 4 GC 1 0 155187 CASAVA_Build 18 72909343 3D TAGCCCAGAT GAC/--- GAGGAAGTCC 3070 het 3070 hom 49 13 28 9 GAC 1 0 155188 CASAVA_Build 18 72921634 1D TTATTTATTA T/- TTATTTTTTT 3070 het 2511 hom 15 6 9 0 T 3 2 155189 CASAVA_Build 18 72923922 1D GGATAGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 36 2 25 9 T 12 11 155190 CASAVA_Build 18 72924954 1D AATAAAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 41 0 31 10 T 11 10 155191 CASAVA_Build 18 72926020 1D TCATGTAAGG T/- TAAGGGCCGT 3070 hom 120 het 42 0 41 2 T 2 1 155192 CASAVA_Build 18 72928409 1I CGCGGAGCTC -/G GCCAGCCCTA 2996 hom 44 het 17 0 14 3 G 1 2 155193 CASAVA_Build 18 72929611 2I TAAAACAAAC --/TA TGGTTTTTAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TA 0 1 155194 CASAVA_Build 18 72945681 1I TAAAAATGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 A 8 9 155195 CASAVA_Build 18 72945995 3I ATAAATCATA ---/ATT ATTAATTATT 3070 hom 52 het 20 0 17 3 ATT 1 2 155196 CASAVA_Build 18 72959992 2D CCTTGCACCC TG/-- TCTGTGAGGG 3070 hom 93 het 34 0 28 8 TG 1 0 155197 CASAVA_Build 18 72962254 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 A 13 12 155198 CASAVA_Build 18 72966833 1I TCAAGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 28 1 23 4 A 10 11 155199 CASAVA_Build 18 72975102 5D GCTGGAACAC TAAAA/----- TGGGTCCCAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 5 TAAAA 1 0 155200 CASAVA_Build 18 72975274 1I GACAGCTGCA -/G CACGCGGCCT 3070 hom 84 het 31 0 25 6 G 0 1 155201 CASAVA_Build 18 72976087 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 32 0 24 8 T 12 11 155202 CASAVA_Build 18 72980523 1D ACTACTCCAG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 8 7 155203 CASAVA_Build 18 72981155 1D ACCGCCATGT A/- AGACTTGCCT 3070 het 3070 ref 48 22 19 9 A 2 1 155204 CASAVA_Build 18 72991949 4D CATCCATGCA ATAC/---- ATACTTTCAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 ATAC 2 1 155205 CASAVA_Build 18 73011543 1D AGAATCAGTG T/- CTGAAACATC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 1 0 155206 CASAVA_Build 18 73012589 4I TTTGAAACAA ----/AAAC AATCAGTGAT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 AAAC 0 1 155207 CASAVA_Build 18 73012872 2I ACTTTTAAAA --/CT CTTTTATATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CT 1 2 155208 CASAVA_Build 18 73016286 3D ATAATTAACA TTG/--- TTGTTATAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTG 2 1 155209 CASAVA_Build 18 73018995 8D TTGCTCCCCT CCTCCTTC/-------- CCCCTCCCCT 595 het 595 ref 25 6 5 17 CCTCCTTC 1 0 155210 CASAVA_Build 18 73022550 1D CAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 13 12 155211 CASAVA_Build 18 73022630 3D CCATTCAGAT AAG/--- AAATTATTAT 3070 het 3070 ref 42 22 16 6 AAG 1 0 155212 CASAVA_Build 18 73031551 1D GTGCTCTCCC A/- GAAGTACAAA 3070 het 3070 hom 54 25 26 5 A 1 0 155213 CASAVA_Build 18 73034725 1I31M1D TTTCTGTTTG -AAAAAAAAAATCATGACCCGTCTGCTATTTCT/AAAAAAAAAAATCATGACCCGTCTGCTATTTC- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 21 16 3 N/A 0 0 155214 CASAVA_Build 18 73034938 1I GGTGTCTGTT -/C GTCCCTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 C 0 1 155215 CASAVA_Build 18 73035046 1I TTCCAGCTTG -/A AAAAACATTG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 5 6 155216 CASAVA_Build 18 73042771 2D ACAGCACCAA TC/-- TCTCTCCATC 3070 het 3070 ref 45 22 13 12 TC 4 3 155217 CASAVA_Build 18 73056756 2D TCCAATTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 26 3 T 12 10 155218 CASAVA_Build 18 73068569 4D GTCTGCTGTT AGTC/---- AGTTGGGGGA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 AGTC 1 0 155219 CASAVA_Build 18 73078527 1D TATTTCTGTG A/- ATAAACTTGT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 2 1 155220 CASAVA_Build 18 73099778 12D GTGCTGGTGA TGGTGGTGATGG/------------ TGGTGGTGAT 3070 het 39 hom 63 2 20 48 TGGTGGTGATGG 3 2 155221 CASAVA_Build 18 73110230 1D ATTTATTTAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 9 8 155222 CASAVA_Build 18 73133088 2D GGTGGCCGGC GA/-- GAGAGAGAGA 1562 het 1562 ref 37 30 4 3 GA 8 7 155223 CASAVA_Build 18 73145014 6D33M2I TGCACACATG CACACACGCACACATGCACACACATGTACAAATGTACAC--/------TGCACACATGCATACACATGTACAAATGTACACAT GCACACACAA 2252 het 2252 ref 57 22 6 48 N/A 0 0 155224 CASAVA_Build 18 73149876 1I TGTGCAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 37 1 31 5 T 10 11 155225 CASAVA_Build 18 73154017 1I CATGGGAAAA -/C TTTTATACAA 3070 het 291 hom 22 1 19 2 C 0 1 155226 CASAVA_Build 18 73155579 12I AAAAAGAGAG ------------/GAAAAAACCCAT GAAAAAACCC 3070 hom 83 het 33 0 27 6 GAAAAAACCCAT 0 1 155227 CASAVA_Build 18 73156424 1D TTTTAATTTC G/- GGGGTACATG 3070 hom 90 het 35 0 31 6 G 5 4 155228 CASAVA_Build 18 73156573 1I CTGCAGTAGG -/T CCTAGTGTCT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 0 1 155229 CASAVA_Build 18 73160601 1D TGGCTCAGGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 29 het 25 1 20 4 T 9 8 155230 CASAVA_Build 18 73178751 14I ATTAATCAAA --------------/GTCTATAACACAGT GCAATGCTAG 3070 hom 108 het 43 0 33 10 GTCTATAACACAGT 0 1 155231 CASAVA_Build 18 73179329 1D TTTAATGAAG T/- AATTAAGCAG 3070 hom 102 het 37 0 34 4 T 1 0 155232 CASAVA_Build 18 73180767 8I CCCTGGACCT --------/CCAGTCAC CCATAGCAGT 3070 hom 98 het 35 0 29 6 CCAGTCAC 0 1 155233 CASAVA_Build 18 73202347 4I TTTGTTGGAC ----/ATGA ATGAAGTGAG 3070 hom 109 het 40 0 36 4 ATGA 1 2 155234 CASAVA_Build 18 73209617 19I TTCATTTATA -------------------/GTAAAATCTTAGATACTTT GTACATGCTC 3008 het 2564 hom 22 7 8 7 GTAAAATCTTAGATACTTT 0 1 155235 CASAVA_Build 18 73211486 3D TTCCCAGTAA GTT/--- GTTGTTTCTT 2865 het 2865 ref 34 13 10 11 GTT 3 2 155236 CASAVA_Build 18 73215460 13D CCAATCAATA CACGGCACATTTC/------------- CACGGCCCCA 2902 het 2902 ref 25 15 9 6 CACGGCACATTTC 1 0 155237 CASAVA_Build 18 73218713 2I TCTGGGCAGC --/TT AGAACCATTT 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 T 0 2 155238 CASAVA_Build 18 73219921 1D GGGATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 31 0 18 13 T 17 16 155239 CASAVA_Build 18 73228143 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2677 hom 39 12 22 5 T 8 9 155240 CASAVA_Build 18 73228514 1D AACTTCTGTT G/- TTTTATGCTA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 G 1 0 155241 CASAVA_Build 18 73228939 3D TGATGTAGAA TTG/--- TTGTTAATTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 TTG 2 1 155242 CASAVA_Build 18 73236585 1D GAAACAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 A 10 9 155243 CASAVA_Build 18 73238713 7I CACCACTTCA -------/TGGTGAG TAAACTGGGC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 TGGTGAG 0 1 155244 CASAVA_Build 18 73243828 1I TGCTGGAAGT -/C CTAGCCAGAG 3070 het 3070 hom 58 23 26 9 C 1 2 155245 CASAVA_Build 18 73251815 3D CAACCTGGGG AGT/--- TTAAAACCCC 3070 hom 112 het 41 0 34 8 AGT 1 0 155246 CASAVA_Build 18 73263499 2D GGTATGTAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 AC 7 6 155247 CASAVA_Build 18 73272313 1D GTTTCATCAA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 7 6 155248 CASAVA_Build 18 73272891 1I GTTTTCTGGG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 8 9 155249 CASAVA_Build 18 73274462 2I ACTTTATTTT --/TA TTTTTTTATT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TA 0 1 155250 CASAVA_Build 18 73278024 1D AAAAGGAATA T/- TGGCTTTTAT 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 T 2 1 155251 CASAVA_Build 18 73278386 1D TTGGATCTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 228 hom 42 1 37 5 T 10 9 155252 CASAVA_Build 18 73279026 3D AAGGGCACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2466 hom 39 11 16 12 T 15 12 155253 CASAVA_Build 18 73286788 1I CTTTTTTAAA -/T ATTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 0 1 155254 CASAVA_Build 18 73289191 6I AGGCACTTCC ------/TGTTCA TGTTGACGTC 3070 het 3070 hom 49 17 24 8 TGTTCA 0 1 155255 CASAVA_Build 18 73299568 1I CACATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 T 11 12 155256 CASAVA_Build 18 73301601 1D TATTTTTGAC A/- AGAGTCTCAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 2 1 155257 CASAVA_Build 18 73302618 23D TAAGGCCCTC ACTGTGTTGGCTTTGTTTTATAT/----------------------- ACTGTGTTGG 3070 het 3070 hom 44 17 21 14 ACTGTGTTGGCTTTGTTTTATAT 2 1 155258 CASAVA_Build 18 73307491 1I TATATGTTAG -/C CCTATATTGG 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 C 2 3 155259 CASAVA_Build 18 73308529 15I TCTATTGATA ---------------/CGGTAATACATTTTT TCTTCTTTAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 CGGTAATACATTTTT 0 1 155260 CASAVA_Build 18 73308936 8D ATTCAGATGA GAAGTCCT/-------- GAAGTCCTAA 3070 het 3070 ref 46 29 14 5 GAAGTCCT 2 1 155261 CASAVA_Build 18 73312992 1I AGCATTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 25 24 8 T 10 11 155262 CASAVA_Build 18 73318308 2I ATATATATAT --/AC ACATGTATAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AC 1 2 155263 CASAVA_Build 18 73321106 1D GTGCATTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 7 155264 CASAVA_Build 18 73323729 3D CACTAGAGTC GTT/--- GTGTTGACTT 2504 het 2504 ref 37 23 8 6 GTT 1 0 155265 CASAVA_Build 18 73324196 5D CAAAGGAATT ATCTC/----- AGGAAGACAT 3070 het 3070 ref 25 15 9 3 ATCTC 1 0 155266 CASAVA_Build 18 73324508 2D ACATGCACAA AG/-- AGGCAAAACG 3070 het 3070 hom 54 24 28 3 AG 2 1 155267 CASAVA_Build 18 73330944 13D TTTTCTCCTC CCCTTACCTCCTT/------------- CCCATGAATC 3070 het 1079 hom 25 3 17 5 CCCTTACCTCCTT 1 0 155268 CASAVA_Build 18 73332609 2D GTGAAATGTT TA/-- TGTTATCTGT 3070 het 3070 ref 39 21 17 4 TA 1 0 155269 CASAVA_Build 18 73335393 4I AATCCATTTA ----/TTTG TTTGTTTATT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TTTG 1 2 155270 CASAVA_Build 18 73337345 4I76M2I TATGGGAAAA ----TTCCTGGTTTCTGGGTAAATTTTCTTAAAAGGATGTGATACTATGAAAATGTCATTCCTCACCAGGGTTTTGTCAC--/TCTCTTCCTGGTTTCTGGGTAAATTTTCTTAAAAGGATGTGATACTATGAAAATGTCATTCCTCACCAGGGTTTTGTCACTT ATATTCTATA 3070 hom 132 het 44 0 45 19 N/A 0 0 155271 CASAVA_Build 18 73338100 3I CTTCTCAATC ---/CTT CTAAAAATGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CTT 0 1 155272 CASAVA_Build 18 73339325 1I TCGAGACCAT -/C CTGGCTAACA 3070 hom 14 het 10 0 8 2 C 1 2 155273 CASAVA_Build 18 73342679 1D GATTATAAAT A/- AAAAGATTAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 A 5 4 155274 CASAVA_Build 18 73345292 1I GACTACAGGC -/A ACCCGCCACC 3070 hom 24 het 11 0 8 3 A 1 2 155275 CASAVA_Build 18 73350646 4D ATTGAATGAG ACTT/---- ACTGTAAGTA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 ACTT 1 0 155276 CASAVA_Build 18 73356232 1D ATTCTTTATT C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 61 het 25 0 21 4 C 9 8 155277 CASAVA_Build 18 73358023 1D11M4D TGTAATACGG AAAAAAAAAATATCAG/-AAAAAAAAATA---- TAAGGGAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 3 N/A 0 0 155278 CASAVA_Build 18 73359074 4D GGCCAAGAAG GTGA/---- GTGAGCACGG 3070 hom 77 het 27 0 22 8 GTGA 2 1 155279 CASAVA_Build 18 73366455 4I GCTGTGAAAT ----/AAAC AAACAAAAGA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 AAAC 1 2 155280 CASAVA_Build 18 73367576 2I70M4I CGTGAATGTG --TCTGTGTGTGTGCACGTGTGCATGTGTCTCTGTGCGTGTGCATGTGTCTCTGTGTGTGCACGTATGCATT----/TCTCTGTGTGTGTGCACGTGTGCATGTGCCTCTGTGCGTGTGCATGTGTCTCTGTGTGTGCACGTATGCATTTGTC TGTGAGTGTG 3070 het 242 hom 76 2 67 64 N/A 0 0 155281 CASAVA_Build 18 73367718 2D42M11D TGCATGTGTC TGTGTGTGCATGTGCGCATGTCTGTGTGTGCATCTATGAATGTGTGCATGTGTCT/--TGTGTGCATGTGCGCATGTCTGTGTGTGCATCTATGAATGTG----------- TGTGTGCATG 3070 het 3070 ref 67 28 17 68 N/A 0 0 155282 CASAVA_Build 18 73372446 1D CCCAATTCAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 9 8 155283 CASAVA_Build 18 73385884 15I GTGTAGCTCT ---------------/CAGAAGCATGAACTA CATGCTTTCA 3070 hom 138 het 53 0 46 8 CAGAAGCATGAACTA 0 1 155284 CASAVA_Build 18 73390642 1D GAATATAAGA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 6 5 155285 CASAVA_Build 18 73407093 4I TTATTCACAC ----/ACAG AGGCACACAC 3070 het 3070 ref 54 30 20 4 ACAG 0 1 155286 CASAVA_Build 18 73411181 1D GTATAAAGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 10 9 155287 CASAVA_Build 18 73411429 1I GTCTCTACAA -/T TTTTTTTTTT 2759 het 480 hom 16 1 8 7 T 13 14 155288 CASAVA_Build 18 73418811 4D ATCTCACTGG GACT/---- GACTGGTTGG 3070 hom 55 het 20 0 19 1 GACT 2 1 155289 CASAVA_Build 18 73419055 2I CCATGCCCAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 99 het 38 0 31 7 AG 1 2 155290 CASAVA_Build 18 73425351 2I TTTCTAAAAT --/AA GTTTCTTAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 0 2 155291 CASAVA_Build 18 73425544 1I AATGGACCTC -/T TTAAACTATC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 3 155292 CASAVA_Build 18 73427579 1D GATGGTTTTA T/- AAGGGGAACC 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 T 1 0 155293 CASAVA_Build 18 73428311 4D AATAAAAAAT GATA/---- GATAGGTAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 GATA 2 1 155294 CASAVA_Build 18 73438109 7I AGTTACATTT -------/CAGAAAA CATGTTGAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CAGAAAA 0 1 155295 CASAVA_Build 18 73438186 1I ATACTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2958 hom 24 het 21 0 9 12 T 11 12 155296 CASAVA_Build 18 73444845 1I CCTCTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 583 hom 35 2 22 11 T 14 15 155297 CASAVA_Build 18 73459943 1I TTCCGCCACT -/G GGGGAGGTGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 4 5 155298 CASAVA_Build 18 73464469 1D AAACATCAAG A/- GTTAGCATGG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 1 0 155299 CASAVA_Build 18 73481690 1I AGGGAATCCT -/C CCCTCACTCA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 3 4 155300 CASAVA_Build 18 73484259 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 11 12 155301 CASAVA_Build 18 73485075 1D TACTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 634 hom 34 3 27 5 T 12 11 155302 CASAVA_Build 18 73490221 1D GGTATGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 31 1 23 7 T 12 11 155303 CASAVA_Build 18 73491643 3D CTATCCATTT ATC/--- ACCCATTTAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 ATC 1 0 155304 CASAVA_Build 18 73496831 1D GAGAGCTCAT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 577 hom 39 2 25 12 G 2 1 155305 CASAVA_Build 18 73503724 1I ATGGTTCCTT -/A AAAAAAACCC 3070 hom 93 het 41 0 32 9 A 7 8 155306 CASAVA_Build 18 73504108 1D AATTTCATGA G/- GAAAAAAAAT 3070 hom 85 het 32 0 29 7 G 2 1 155307 CASAVA_Build 18 73508691 4D GCACGGGTTC TGCA/---- TACTCCCTAC 3070 hom 117 het 41 0 38 3 TGCA 1 0 155308 CASAVA_Build 18 73509837 4I CACGGAAGAG ----/GAGA GAGAGAGGGG 3070 hom 56 het 22 0 17 5 GA 3 5 155309 CASAVA_Build 18 73517359 1D AAAAAAAAAA T/- TTATCATCAC 3070 hom 3 het 29 1 24 4 T 3 2 155310 CASAVA_Build 18 73521230 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTGAAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 7 6 155311 CASAVA_Build 18 73527461 1D GAAGGTACAC A/- AAAAGTTTAC 3070 het 3070 hom 52 19 26 8 A 5 4 155312 CASAVA_Build 18 73532583 1D CCCAAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 473 hom 34 2 22 10 T 15 14 155313 CASAVA_Build 18 73537124 1D TTTTCTGGGG A/- AAAAGGATGT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 5 4 155314 CASAVA_Build 18 73537904 1I TGAATACATA -/T TTCAAAAATA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 2 3 155315 CASAVA_Build 18 73548360 1I TTCCAATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 9 10 T 10 11 155316 CASAVA_Build 18 73549059 5D AAACTCAAAC AACTT/----- AACAAATAAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 AACTT 1 0 155317 CASAVA_Build 18 73552048 1I ACTTCTTATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 8 9 155318 CASAVA_Build 18 73552489 1D AATCTTGTCC T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 7 6 155319 CASAVA_Build 18 73553884 1D CAGGCTGAGT G/- CAGTGGCTCA 3070 het 3070 ref 47 23 21 5 G 1 0 155320 CASAVA_Build 18 73556984 1D AATTCGCTCC T/- TCTGTCTCTC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 2 1 155321 CASAVA_Build 18 73562662 3D AAGTAGCAAA TCT/--- TCCGCTGCCC 1629 het 1629 ref 25 15 5 6 TCT 1 0 155322 CASAVA_Build 18 73562767 1D GGCATTTAAG T/- TTTTTTTTTT 2862 het 2862 ref 26 13 7 6 T 11 10 155323 CASAVA_Build 18 73563834 2I ATTGCTTTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 T 10 12 155324 CASAVA_Build 18 73564928 2D GTATACAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 33 0 28 6 A 13 11 155325 CASAVA_Build 18 73565701 1D AAGTAATATA T/- TTTTTCAAAA 3070 het 3070 hom 23 7 13 3 T 6 5 155326 CASAVA_Build 18 73567857 4I ATATTAGAGA ----/ACAC ACACAGAGTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 AC 2 4 155327 CASAVA_Build 18 73576089 1D AGTCGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 15 17 T 13 12 155328 CASAVA_Build 18 73584538 2D TCTCTCTCTC TT/-- GTGGGTGTGT 3070 hom 129 het 46 0 41 8 T 2 0 155329 CASAVA_Build 18 73604023 1D ATAGTAGGGC T/- TTTGGAAATA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 4 3 155330 CASAVA_Build 18 73605567 2I TATATCAATA --/AT ATATATATAT 2822 het 2822 ref 16 8 6 2 AT 7 8 155331 CASAVA_Build 18 73605880 1I TTTATTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 T 12 13 155332 CASAVA_Build 18 73615463 2I ACAGAAAGCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 68 het 27 0 20 7 TG 8 9 155333 CASAVA_Build 18 73665738 1I TAAGATCTCA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 361 hom 37 1 32 4 T 7 8 155334 CASAVA_Build 18 73674499 1D CCTGCTCGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 10 9 155335 CASAVA_Build 18 73676026 1I GATGGCAAAT -/A ACTTTCTAGG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 2 155336 CASAVA_Build 18 73679324 1D CCAGCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 285 hom 22 1 17 5 A 12 11 155337 CASAVA_Build 18 73683100 1I CTATTACACT -/A AAAAAGGAAG 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 5 6 155338 CASAVA_Build 18 73692679 8D CCCTCCTTCC TTCTTTCA/-------- TTCCCTCCTT 1712 hom 12 het 8 0 5 3 TTCTTTCA 1 0 155339 CASAVA_Build 18 73700621 1D TTATCTTTAT A/- GGGGGAGAGG 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 1 0 155340 CASAVA_Build 18 73700688 14D AAGAGAGAGA CTGAGAGAGAGAGG/-------------- CTGAGAGAGA 2712 het 2712 ref 23 8 11 7 CTGAGAGAGAGAGG 2 1 155341 CASAVA_Build 18 73732451 1I GTTTACTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 9 10 155342 CASAVA_Build 18 73733122 1I TCTGTAAGTA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 8 155343 CASAVA_Build 18 73743755 3I TTATGGAAAA ---/AAC AACAACAAAT 3070 hom 111 het 50 0 38 12 AAC 2 3 155344 CASAVA_Build 18 73744831 1D TCACCGGGAA G/- CAGTAATTTC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 G 1 0 155345 CASAVA_Build 18 73753990 1I TTCAGAACAG -/T TTTTTTACCT 3070 hom 96 het 43 0 33 10 T 6 7 155346 CASAVA_Build 18 73756160 3I GAGGGGAGTT ---/CAC CACCACGGCG 3070 hom 126 het 53 0 41 12 CAC 2 3 155347 CASAVA_Build 18 73759439 5D AAACTTAGAA TTATT/----- TTTTAAAATG 3070 hom 108 het 37 0 37 1 TTATT 1 0 155348 CASAVA_Build 18 73764899 1I CTTTCCTCTA -/G TCTAGAGAGC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 0 1 155349 CASAVA_Build 18 73769768 38I CTAATACTGT --------------------------------------/AGAATATTTATTCTAATACTATAGAATATTAAATATTC TATAACTTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 AGAATATTTATTCTAATACTATAGAATATTAAATATTC 0 1 155350 CASAVA_Build 18 73776653 2D TCTTTTTTAT AC/-- ATCAAGTGTA 3070 hom 117 het 45 0 40 6 AC 1 0 155351 CASAVA_Build 18 73778669 15D GGTGCATTCT GAGGACTTGTCAGAG/--------------- GAGGACTTGT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 GAGGACTTGTCAGAG 2 1 155352 CASAVA_Build 18 73780019 1D GTGGCACATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 138 het 53 0 46 8 A 9 8 155353 CASAVA_Build 18 73780286 2D TACTTTTAAA AG/-- AGTTATTTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AG 2 1 155354 CASAVA_Build 18 73781838 1D AAACCTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 32 7 T 12 11 155355 CASAVA_Build 18 73782635 1D TGGACCCACC T/- CCCCACCCCT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 T 1 0 155356 CASAVA_Build 18 73783461 1I TGTTGACGAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 7 8 155357 CASAVA_Build 18 73783799 2I CAATCATAAC --/AA AAAAGCATAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 4 6 155358 CASAVA_Build 18 73784772 1I TCCATAAAAT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 155359 CASAVA_Build 18 73798067 3D CACCAATACT ACC/--- ACCACCATCA 3070 het 2446 hom 51 12 18 23 ACC 3 2 155360 CASAVA_Build 18 73798383 3D ACTATCACCC CAA/--- CAACTCCAAC 3070 hom 110 het 43 0 35 8 CAA 2 1 155361 CASAVA_Build 18 73799939 2I GCGTGTGCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 286 hom 62 2 44 16 AC 8 9 155362 CASAVA_Build 18 73814351 4I TCATTCTTTT ----/CACA TGTCTAATCA 3070 hom 120 het 45 0 39 6 CA 0 2 155363 CASAVA_Build 18 73830930 2I TATATTCTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 11 13 155364 CASAVA_Build 18 73832297 10I ATTGGGCTAG ----------/CACACACTCT GGTTTCCCAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CACACACTCT 0 1 155365 CASAVA_Build 18 73832463 1I TCACAGGGGA -/G CCACAAGAAC 3070 hom 70 het 28 0 23 5 G 0 1 155366 CASAVA_Build 18 73848202 1I GGGGTCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 139 hom 29 2 13 14 T 15 16 155367 CASAVA_Build 18 73888557 1D ACTGTCCCAG A/- AAAAAAAAAG 908 het 908 ref 48 36 3 10 A 10 9 155368 CASAVA_Build 18 73904246 1I ATGGGTGCAG -/T TTTTTTTTTT 1813 het 1813 ref 39 14 13 12 T 15 16 155369 CASAVA_Build 18 73939662 1I AGCTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 25 1 19 5 T 10 11 155370 CASAVA_Build 18 73952785 1D TAGCTTCTTT A/- AAAATGAAAA 3070 het 320 hom 34 1 27 6 A 5 4 155371 CASAVA_Build 18 73954145 4D TTTTGTTTTG TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 hom 64 het 29 0 22 10 TGTT 3 2 155372 CASAVA_Build 18 73954318 1I ACTTTTTGTG -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 86 het 36 0 32 4 T 7 8 155373 CASAVA_Build 18 73968725 1I TTGGGTTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 12 21 12 A 9 10 155374 CASAVA_Build 18 73972164 3I TATCTTTGAG ---/ATA ATAATGCTCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ATA 1 2 155375 CASAVA_Build 18 73973933 2D TGGTCGAGGG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 53 18 22 15 AC 10 9 155376 CASAVA_Build 18 73974045 2D ACACCTGTAG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 48 19 19 11 TA 6 5 155377 CASAVA_Build 18 73980645 2D TTACATTGTA TG/-- TGTGTGAGTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 TG 4 3 155378 CASAVA_Build 18 73982821 3I CGGGACACAT ---/CTC CTCTCATCAA 3070 het 3070 ref 53 29 18 6 CTC 1 2 155379 CASAVA_Build 18 73986524 4I GTCATGTGCC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 65 29 27 9 TG 5 7 155380 CASAVA_Build 18 73986675 4I GTGTGTGCAC ----/GTGA GTGTGTGCCT 3070 het 3070 hom 94 38 43 13 GTGA 0 1 155381 CASAVA_Build 18 74016108 1D GAGGGCACAG C/- CTCTCTCCAG 2921 het 2921 ref 34 21 8 5 C 2 1 155382 CASAVA_Build 18 74031404 1D GCTCTCTGTG C/- CCCTTCCCCC 3070 hom 76 het 30 0 25 5 C 4 3 155383 CASAVA_Build 18 74040492 4D AGGCTATATT AGTC/---- AGTAATGTAC 3070 het 3070 ref 25 14 9 4 AGTC 1 0 155384 CASAVA_Build 18 74042803 2I CAAAATATTT --/TA TAAAGTGTCA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 TA 1 2 155385 CASAVA_Build 18 74043042 1I TATATTTAGA -/T GAAGACCTCA 3070 het 3070 hom 37 13 24 0 T 0 1 155386 CASAVA_Build 18 74046231 2I CAGAGTTTTG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 8 10 155387 CASAVA_Build 18 74047045 1D TGAGTTTGGG A/- ACAAGACAAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 2 1 155388 CASAVA_Build 18 74048659 1I CCGGCTGGCT -/C TGGGTGTTGT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 155389 CASAVA_Build 18 74049179 1D CAGAATATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2442 hom 30 7 18 5 A 12 11 155390 CASAVA_Build 18 74066412 1D AGTTCTCCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 T 10 9 155391 CASAVA_Build 18 74086736 7I GCAGGAGTGA -------/ACCCTCT TGTAAGCTAT 3070 hom 143 het 53 0 46 7 ACCCTCT 0 1 155392 CASAVA_Build 18 74086926 1D AAAGTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 23 2 16 5 T 13 12 155393 CASAVA_Build 18 74092720 1D TTGCTTTCTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 1143 hom 30 5 19 6 C 1 0 155394 CASAVA_Build 18 74093779 1I AGCTACGTTG -/T TTACTGAACA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 2 3 155395 CASAVA_Build 18 74098241 1I AGGCCGGGGT -/G GGGGGGGGAC 1794 het 1794 ref 21 9 5 7 G 8 9 155396 CASAVA_Build 18 74099174 20I TAAGCGCAGG --------------------/TGTGTGTGGTGTGTACGTGA TGTGTGTGGT 3070 het 3070 ref 66 33 19 14 TGTGTGTGGTGTGTACGTGA 0 1 155397 CASAVA_Build 18 74114933 1I GCAAACTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 9 10 155398 CASAVA_Build 18 74119071 2D GGTCAGATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 13 11 155399 CASAVA_Build 18 74120296 1D TTATTGGTTT A/- AATAGAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 21 0 A 3 2 155400 CASAVA_Build 18 74123296 52D TACAAATGAT CCACACTAAATCACAAATAATAACAACAATGGCAAAAACAGTGATAACAAGA/---------------------------------------------------- CCACACTAAA 2593 het 2593 ref 38 15 9 30 CCACACTAAATCACAAATAATAACAACAATGGCAAAAACAGTGATAACAAGA 1 0 155401 CASAVA_Build 18 74126725 1D TATCTACAGC T/- TTTTTGTAGC 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 T 6 5 155402 CASAVA_Build 18 74127041 3I ATTCATTACA ---/CAT CATCAACGGC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 CAT 1 2 155403 CASAVA_Build 18 74127514 1I GTAGAATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 A 10 11 155404 CASAVA_Build 18 74131931 1D TGTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1961 hom 27 7 10 10 T 16 15 155405 CASAVA_Build 18 74134733 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2777 het 2777 ref 31 11 11 9 T 14 13 155406 CASAVA_Build 18 74135419 3I ATACTGATAC ---/ATT ATTATTAACT 3070 het 3070 ref 60 29 28 3 ATT 2 3 155407 CASAVA_Build 18 74139328 1D TAATAGGGTA T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 7 6 155408 CASAVA_Build 18 74141483 1I TCTTTCTATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 9 10 155409 CASAVA_Build 18 74143144 1I AAAATAACCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 A 11 12 155410 CASAVA_Build 18 74153397 1I TTTTGGACTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 9 155411 CASAVA_Build 18 74155055 3D ATGATCCAGA GCT/--- GCTGCTCGGC 3070 hom 120 het 46 0 38 8 GCT 3 2 155412 CASAVA_Build 18 74162000 8I TCCCCTTCTT --------/AGTACACA AGTACACACA 3070 hom 74 het 30 0 24 6 AGTACACA 1 2 155413 CASAVA_Build 18 74172441 1I GGTTAAAATG -/T TTAATAAATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 3 155414 CASAVA_Build 18 74176748 9I GAGCTCAGGG ---------/TGTGGAGGT TGCAGTGAGC 3070 hom 65 het 23 0 22 1 TGTGGAGGT 0 1 155415 CASAVA_Build 18 74182600 2I GCACACATGG --/CA CACACACACA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 CA 6 7 155416 CASAVA_Build 18 74188873 1D TCTCTTCAAA C/- CCCCCAGCTG 3070 hom 72 het 33 0 23 11 C 6 5 155417 CASAVA_Build 18 74192393 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 26 0 23 5 T 18 16 155418 CASAVA_Build 18 74192697 1I CGCCTGGCCC -/T TTTCGCTTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 3 4 155419 CASAVA_Build 18 74205691 1I TTTATTTTGA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 93 het 43 0 32 11 T 6 7 155420 CASAVA_Build 18 74219039 7D71M1I AAAGGCATTT TAAAAAAATAAAAGAACAAAGAATATATTAGCGTTCTATCTTCTTGAGCTTTTAGTGAATTACATTGCTCTAGGTTGA-/-------AAAAAAGAACAAAGAATATATTAGCGTTCTATCTTCTTGAGCTTTTAGTGAATTACATTGCTCTAGGTTGAT TTTTTTTTTA 3070 het 201 hom 35 1 36 16 N/A 0 0 155421 CASAVA_Build 18 74220271 1I AGTGTGCAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 9 10 155422 CASAVA_Build 18 74220687 9D TCACAATAGC AAACTCATG/--------- AAACTCATGG 3070 hom 42 het 17 0 14 4 AAACTCATG 2 1 155423 CASAVA_Build 18 74222810 1D CGAGAAGAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 9 8 155424 CASAVA_Build 18 74230497 1D TTAGCCCTCC G/- CATGGTGGCC 3070 het 3070 ref 46 19 16 11 G 1 0 155425 CASAVA_Build 18 74236470 4I ATTAGCTGAA ----/TTTT AATCTTGCAT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 0 4 155426 CASAVA_Build 18 74243259 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 13 1 11 2 A 15 14 155427 CASAVA_Build 18 74251158 2I GATAATAAAA --/TG TGTTATTGTA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TG 1 2 155428 CASAVA_Build 18 74261709 48D TTCATTCACT AGGAATTCAAATCAGGGCATAGAAGCAACACGATGTCCATAATGCATA/------------------------------------------------ AGGAATTCAA 3070 hom 33 het 26 0 12 19 AGGAATTCAAATCAGGGCATAGAAGCAACACGATGTCCATAATGCATA 1 0 155429 CASAVA_Build 18 74266075 1I AAATAGTAGG -/A GAAAAAATGA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 0 1 155430 CASAVA_Build 18 74266278 2I ATGGCAGCAG --/GC AGAGAGAAAG 3070 hom 78 het 27 0 27 1 GC 0 1 155431 CASAVA_Build 18 74271681 1D AGTGGCAAGT C/- CATGTCTCTA 3070 hom 128 het 46 0 41 5 C 2 1 155432 CASAVA_Build 18 74272991 4D CATGTCCTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 7 T 16 12 155433 CASAVA_Build 18 74277026 1I CTTGTTACTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 44 2 36 6 C 0 1 155434 CASAVA_Build 18 74277151 6I GTTGATGATC ------/GTGGTG GTGGTGGAGT 3070 hom 99 het 39 0 31 8 GTG 2 4 155435 CASAVA_Build 18 74277484 1D TAAGACTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 67 het 26 0 24 2 T 9 8 155436 CASAVA_Build 18 74278605 1I TTTTGGTGGG -/T TTTTTTTTGA 3014 hom 30 het 14 0 11 3 T 8 9 155437 CASAVA_Build 18 74296474 1D ATTATGAAAA G/- TGTCTGTTTC 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 G 1 0 155438 CASAVA_Build 18 74300223 1I ACGTAGCTTT -/G GGGGGTCAAG 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 G 5 6 155439 CASAVA_Build 18 74302225 4I GTAAACCACT ----/AGAC AGACAAATAA 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 AGAC 1 2 155440 CASAVA_Build 18 74304576 1D53M4D AAATCATTAC AAAAATAACATTTTCTATTAAAAATCTACCACCAAAACAACAAAACCCCCAATAAAAT/-AAAATAACATTTTCTATTAAAAATCTACCACCAAAACAACAAAACCCCCAATA---- AAACACACAC 3070 het 3070 ref 37 46 13 6 N/A 0 0 155441 CASAVA_Build 18 74308058 1D AATCTAGGTA G/- ATGGGAGGCG 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 G 1 0 155442 CASAVA_Build 18 74308254 1I GCAGTCTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 10 11 155443 CASAVA_Build 18 74310678 14D CAATGACAAC CACACACAACCACT/-------------- CACACACAAC 3070 het 3070 hom 57 26 26 13 CACACACAACCACT 1 0 155444 CASAVA_Build 18 74343239 2D GTATTTGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 12 10 155445 CASAVA_Build 18 74343719 1I AGAAGAATCT -/C CAGAATCGTG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 1 2 155446 CASAVA_Build 18 74358899 1D CCAGCACACA C/- CTGCCCAGGT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 C 2 1 155447 CASAVA_Build 18 74359290 9I AGGGCGCAGA ---------/GCCGACAGT GCCCAGCCCC 3070 hom 110 het 41 0 33 8 GCCGACAGT 0 1 155448 CASAVA_Build 18 74377311 1I GTTTTCCCTT -/C TGGGGACTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 0 1 155449 CASAVA_Build 18 74380975 4I GGGCACACGC ----/ACAG ACAGACATGT 3070 hom 239 het 94 0 76 18 ACAG 1 2 155450 CASAVA_Build 18 74389767 1D TCCACTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 34 0 22 12 T 12 11 155451 CASAVA_Build 18 74390818 1D CAAACTACTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 27 0 21 7 A 9 8 155452 CASAVA_Build 18 74398473 1I TGAAAACACA -/G GGACACCAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 2 3 155453 CASAVA_Build 18 74399244 1I CGGGCATGGT -/G GCGGGCGCCT 1923 hom 12 het 5 0 5 0 G 1 2 155454 CASAVA_Build 18 74402842 1I TTTCCTTGCC -/A GGGGTGACTG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 0 1 155455 CASAVA_Build 18 74405181 1D CAAGCCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 39 0 36 3 T 11 10 155456 CASAVA_Build 18 74406642 1D GGATCCTGTT A/- AAAAAAAAAA 1897 het 98 hom 19 1 6 12 A 17 16 155457 CASAVA_Build 18 74409617 5I9M4I CTGCACACAC -----GTACACACT----/ACTCTGTACACACTGCAC ACACACATAC 2852 het 2852 ref 46 26 9 13 N/A 0 0 155458 CASAVA_Build 18 74409839 4I CACACACCAC ----/ACAG ACAGATACAC 3070 hom 215 het 76 0 69 7 ACAG 1 2 155459 CASAVA_Build 18 74410757 2D CTATACACAA AC/-- ACACACTACA 3070 hom 199 het 76 0 67 10 AC 4 3 155460 CASAVA_Build 18 74412352 3D AGTGAACAGA TGT/--- TGTTTGCAGG 3070 hom 144 het 50 0 49 4 TGT 2 1 155461 CASAVA_Build 18 74422086 4D GGACCATGGA CCAG/---- CCAGCCTTCC 3070 hom 143 het 51 0 43 8 CCAG 2 1 155462 CASAVA_Build 18 74437038 4D CCCAGTCGAT TCAG/---- TCAAACAGCC 3070 hom 126 het 46 0 40 9 TCAG 1 0 155463 CASAVA_Build 18 74437229 1D AGAAAGTGGA G/- GGTCTGGTTC 3070 hom 108 het 43 0 37 8 G 3 2 155464 CASAVA_Build 18 74439537 54D TAGTCTAATG AACAGTCTCATGTCTGATGGTCTAATGAACAGTCATGTCTGATGGTCTAACATC/------------------------------------------------------ TAACATCTAA 1807 het 1807 ref 68 98 5 7 AACAGTCTCATGTCTGATGGTCTAATGAACAGTCATGTCTGATGGTCTAACATC 1 0 155465 CASAVA_Build 18 74439690 2D TGGTCTAACA TC/-- TAACATCTAA 3070 het 310 hom 75 3 59 14 TC 1 0 155466 CASAVA_Build 18 74446918 5D4M1D CAAAAAAAAA AAAGGAGAAG/-----AGAA- GAAGGAAGGG 3070 hom 39 het 16 0 14 4 N/A 0 0 155467 CASAVA_Build 18 74448139 1D TCCACCGCCC G/- CCCCCCCAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 1 0 155468 CASAVA_Build 18 74451514 2D TCCAGGGATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 7 T 14 12 155469 CASAVA_Build 18 74452237 9I TAGTAAACAA ---------/ATTAAGTTG ATATTAACCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATTAAGTTG 0 1 155470 CASAVA_Build 18 74473803 1D AAGCGTGTGC T/- TTGGATTTCT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 3 2 155471 CASAVA_Build 18 74482670 14D TATGGAAGCC TCTCTATGGAAGTT/-------------- TCTCTATGGA 1754 het 1754 ref 21 6 7 11 TCTCTATGGAAGTT 2 1 155472 CASAVA_Build 18 74496865 4D GTGTCTGTGT GTAA/---- GTGTGTCCAA 3070 het 3070 ref 50 26 21 5 GTAA 1 0 155473 CASAVA_Build 18 74496924 2D TGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGAGTG 3070 het 3070 ref 56 31 18 8 TG 4 3 155474 CASAVA_Build 18 74497903 4I GTGTGCCTGC ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 70 28 15 27 GT 7 9 155475 CASAVA_Build 18 74509648 19D CCATGAACAT CACAGCCAAACCCAAAGAC/------------------- CACAGCCATG 3070 het 3070 ref 52 34 17 5 CACAGCCAAACCCAAAGAC 1 0 155476 CASAVA_Build 18 74510814 1I AATTTCTGTG -/C ATTTTATCTC 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 C 0 1 155477 CASAVA_Build 18 74511718 1D TCATTCCTTT G/- TGTGACCCAC 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 G 1 0 155478 CASAVA_Build 18 74514817 1D TCCCAAGAGA C/- CCCCTCAGTC 1304 het 1304 ref 11 5 4 3 C 5 4 155479 CASAVA_Build 18 74519105 1D TAGCTTAAAT G/- GTAGGAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 G 2 1 155480 CASAVA_Build 18 74525912 8D TCAAAAAAAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 1905 het 983 hom 11 4 7 5 AAAG 6 4 155481 CASAVA_Build 18 74527344 1D ACAAATCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 T 11 10 155482 CASAVA_Build 18 74534930 1D TGGGGAGGCT G/- GGGGGGAGTC 3070 het 2287 hom 35 13 12 11 G 7 6 155483 CASAVA_Build 18 74544561 1I AGGAGCATAG -/C CCCCGAAGAA 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 C 4 5 155484 CASAVA_Build 18 74552211 1I ACTAGCTATG -/T TTACATACTA 3070 het 3070 ref 46 20 21 5 T 2 3 155485 CASAVA_Build 18 74553071 1I TTGCTTTTAC -/A AAAAAAAAAA 1422 het 1422 ref 47 14 8 25 A 12 13 155486 CASAVA_Build 18 74565192 2D TGTTTGTGAA GT/-- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 ref 63 20 12 33 GT 5 4 155487 CASAVA_Build 18 74565247 2I TGTGTGTGCA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 85 31 23 31 GT 6 7 155488 CASAVA_Build 18 74570796 17D CTCAGGGCCC TGTCCAGCCCCCAGGTG/----------------- TGAGGGAGGC 3070 het 3070 ref 30 19 8 8 TGTCCAGCCCCCAGGTG 1 0 155489 CASAVA_Build 18 74576097 1I AGATATGCTT -/A TTTTTGTCTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 0 1 155490 CASAVA_Build 18 74577040 1I CTGCCCAGTG -/A AATGTTTTCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 2 3 155491 CASAVA_Build 18 74577440 2D AGAGAGAAAG AA/-- AATAAAGGAA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 A 4 2 155492 CASAVA_Build 18 74583804 1D AGGATTGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 13 12 155493 CASAVA_Build 18 74590029 1D ACTGCTGAGT G/- GGGGGGGGGG 2493 het 911 hom 42 9 13 20 G 11 10 155494 CASAVA_Build 18 74597324 2D TACATAGCAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2806 hom 21 9 10 2 AT 9 8 155495 CASAVA_Build 18 74599767 2D12M2D TCCACACACA ACCCACACACAGCCCA/--CCCCACGCAGCC-- CACACAGTCC 1383 het 1383 ref 37 17 3 23 N/A 0 0 155496 CASAVA_Build 18 74606030 1I CTAATAGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 9 10 155497 CASAVA_Build 18 74611272 1I CTTCAGAACA -/T TTGAGTGTCT 3070 hom 129 het 52 0 43 9 T 2 3 155498 CASAVA_Build 18 74624162 1D GATTATTATA T/- ACGTGGTATT 3070 het 79 hom 52 1 45 7 T 1 0 155499 CASAVA_Build 18 74631288 1D TGCGTGCCCC G/- GTGAGCAGCT 913 het 913 ref 25 14 3 8 G 2 1 155500 CASAVA_Build 18 74640555 4I TCTGGTCCAG ----/GGCA GGCTATTTGT 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 GGCA 0 1 155501 CASAVA_Build 18 74649932 1I GCTCTACAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 8 9 155502 CASAVA_Build 18 74652814 1D2M1D GCTCCCAGGC TCAT/-CA- GGAGCAGTGG 2240 het 2240 ref 24 14 7 4 N/A 0 0 155503 CASAVA_Build 18 74658603 1I AAAAAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2393 hom 34 8 12 14 T 13 14 155504 CASAVA_Build 18 74665232 1D GGTGGGATCT G/- GGGAGGGGCC 3070 hom 53 het 23 0 14 9 G 4 3 155505 CASAVA_Build 18 74673993 1D TGAGAAGGGG A/- AAGAAAACGC 3070 het 3070 ref 38 23 11 5 A 3 2 155506 CASAVA_Build 18 74674950 1D ATTCTGTTTT A/- AAAAAAAAAA 1224 het 1224 ref 38 25 3 10 A 12 11 155507 CASAVA_Build 18 74699250 1I TTTTCATGAG -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 A 6 7 155508 CASAVA_Build 18 74769417 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 21 0 16 6 A 12 11 155509 CASAVA_Build 18 74770327 6D TAATTTAGAC ATACTT/------ ATAATTCCAA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 ATACTT 1 0 155510 CASAVA_Build 18 74774067 2I GAGTCTAAAC --/TG AGAGTTCCGT 3070 hom 66 het 23 0 22 1 TG 0 1 155511 CASAVA_Build 18 74776239 3D CTTGAATGTA CAG/--- CTCAGGTGTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 CAG 1 0 155512 CASAVA_Build 18 74778490 4D TGATAGATAC ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 hom 114 het 46 0 38 12 ATAG 5 4 155513 CASAVA_Build 18 74779086 4I GATAAATGAT ----/GATA GATAGATAGA 3070 hom 132 het 55 0 45 10 GATA 3 4 155514 CASAVA_Build 18 74779219 4I ATGATAGATG ----/GATA GATACTTGAT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 GATA 1 2 155515 CASAVA_Build 18 74781340 4I GCCAGCTGTC ----/GATA TATCAAGTCT 3070 hom 90 het 32 0 29 3 GATA 0 1 155516 CASAVA_Build 18 74792351 2D ACATTAATCT TC/-- TTTTAAAAAA 3070 hom 96 het 42 0 33 9 TC 1 0 155517 CASAVA_Build 18 74801383 1D CATGGTCACC A/- GACTCCTGCA 3070 hom 117 het 49 0 31 19 A 1 0 155518 CASAVA_Build 18 74819530 2I TGACAATAAA --/AT ATGACATGGT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AT 1 2 155519 CASAVA_Build 18 74819703 1I CTAGTCAAAA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 7 8 155520 CASAVA_Build 18 74823846 3I TGCTCACGCA ---/CAC CCCACTCTCG 3070 hom 184 het 69 0 61 8 CAC 0 1 155521 CASAVA_Build 18 74823995 2D13M1I AAACACACAC ATGCTCACACTCATA-/--GCTCACACTCATAT TTTTTCACAT 3070 hom 184 het 59 0 62 6 N/A 0 0 155522 CASAVA_Build 18 74824403 10D GCTCACACAG ACATACTCAC/---------- ACTCATATAC 3070 het 2377 hom 63 11 13 50 ACATACTCAC 1 0 155523 CASAVA_Build 18 74845401 2D GAAGCATAAC TT/-- TTAAATATAA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 T 4 2 155524 CASAVA_Build 18 74845614 1D ACTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1842 hom 25 5 15 6 A 11 10 155525 CASAVA_Build 18 74856691 2I TGTATGGGTC --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 140 het 62 0 34 28 GT 5 6 155526 CASAVA_Build 18 74858877 1D GGCTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 32 1 28 3 T 11 10 155527 CASAVA_Build 18 74866177 4I GAAAAAAAAA ----/AAAG AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 41 20 14 9 AAAG 0 1 155528 CASAVA_Build 18 74866445 1I TGGCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1925 het 1925 ref 18 9 7 2 T 10 11 155529 CASAVA_Build 18 74892287 1D TCACGATTAC T/- TTTTTTTTTT 1671 het 1671 ref 26 14 5 7 T 15 14 155530 CASAVA_Build 18 74902673 1I GACTGGGAAA -/G GGGGGGGCCC 3070 hom 47 het 20 0 13 7 G 7 8 155531 CASAVA_Build 18 74908433 2I CTGAGAGAGT --/CC CCCCAGGCTT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 C 4 6 155532 CASAVA_Build 18 74909136 4I ATTTTATGCC ----/TTCT TTCTCATTGA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TTCT 1 2 155533 CASAVA_Build 18 74918710 1I GTCTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 1150 het 1150 ref 44 31 3 10 A 13 14 155534 CASAVA_Build 18 74921058 1I GGCACATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 29 1 22 6 T 11 12 155535 CASAVA_Build 18 74924719 1D CATATAGTTG T/- TTTTTTTTTT 768 het 768 ref 30 24 3 3 T 11 10 155536 CASAVA_Build 18 74932038 1D TTCCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1968 het 1968 ref 45 22 5 19 T 17 16 155537 CASAVA_Build 18 74933131 1D TCCCTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 11 10 155538 CASAVA_Build 18 74933570 4D ATCTGATCTC TCTT/---- TCTTTTCCCG 3070 hom 33 het 13 0 10 4 TCTT 2 1 155539 CASAVA_Build 18 74945994 1D GGTAATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 973 hom 30 3 17 10 A 14 13 155540 CASAVA_Build 18 75113421 1D TTCCCTCTCA T/- TCCCCCAGCC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 T 2 1 155541 CASAVA_Build 18 75125527 1D ATATATGAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 10 9 155542 CASAVA_Build 18 75127405 1I TAATAACAGC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 8 9 155543 CASAVA_Build 18 75131505 3I CCTCTTAAAT ---/ATA ATGAGGATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATA 0 1 155544 CASAVA_Build 18 75136248 2D ATTTCTTGGC CA/-- CCTTGCCCCT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 CA 1 0 155545 CASAVA_Build 18 75145695 1I GTGCCATGCT -/G GTGTGCTGCA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 1 2 155546 CASAVA_Build 18 75156100 2D ACAGACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 102 het 47 0 33 14 AC 8 7 155547 CASAVA_Build 18 75179388 1I ACAGCCCCAG -/T TCTACTCGTG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 1 2 155548 CASAVA_Build 18 75185687 1I AGTAAAGGCT -/C CTTTTCCCTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 1 2 155549 CASAVA_Build 18 75193254 1D CATCTCTACT A/- AAAATACAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 5 4 155550 CASAVA_Build 18 75195390 9I AAAAATTGAT ---------/AGTTTGGAC AGTTATACAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AGTTTGGAC 0 1 155551 CASAVA_Build 18 75211760 1D CATTAGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 33 1 18 16 T 15 14 155552 CASAVA_Build 18 75222508 1D CATCCCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1454 hom 37 4 25 9 T 15 14 155553 CASAVA_Build 18 75234040 1I ACATGGGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1304 hom 40 4 26 10 T 12 13 155554 CASAVA_Build 18 75244027 16I GGGGCACTGG ----------------/CTGTCTCTGGCTCTGC CTGTTTCTAG 3070 hom 71 het 28 0 18 10 CTGTCTCTGGCTCTGC 0 1 155555 CASAVA_Build 18 75258421 7D CGGGCTCCCC CAGCTCT/------- GGAAAACTCG 3070 hom 62 het 24 0 19 5 CAGCTCT 1 0 155556 CASAVA_Build 18 75268981 1D GCTCTGTTTC T/- TTTCTCTTTG 3070 het 3070 ref 30 10 10 10 T 4 3 155557 CASAVA_Build 18 75270321 4D TCCATTCATT CATC/---- CATCCATCCA 3070 het 3070 ref 65 28 11 28 CATC 6 5 155558 CASAVA_Build 18 75292625 1I GTGATCTGTT -/C CCCCTTGGCC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 C 4 5 155559 CASAVA_Build 18 75316378 3D CCGGCGTCTC CTT/--- CTCCAGGTAA 1088 het 1088 ref 11 5 3 3 CTT 1 0 155560 CASAVA_Build 18 75359055 1D GGAGGGGGAT G/- GGGGGGGGGG 2077 het 306 hom 22 4 6 12 G 11 10 155561 CASAVA_Build 18 75402883 4D ATCCATCCAC CCAT/---- CCATCTACCC 3020 hom 36 het 16 0 11 5 CCAT 2 1 155562 CASAVA_Build 18 75403592 4I ACCCACCCAC ----/CCAT CCATTATCCA 3070 hom 120 het 43 0 38 5 CCAT 1 2 155563 CASAVA_Build 18 75418062 1I6M1I TCTGGAGGCC -TTGCTG-/TTTGCGGC GAGTCTTGGG 3070 hom 48 het 18 0 10 12 N/A 0 0 155564 CASAVA_Build 18 75443568 2D ACTGCACACG CA/-- CACACAGGAT 3070 het 3070 hom 89 39 39 12 CA 4 3 155565 CASAVA_Build 18 75445941 3D CTTGTTCCTC CTT/--- TCCACTAAAG 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 CTT 1 0 155566 CASAVA_Build 18 75451151 4D GACCCCAGGC CTCT/---- CTCTCCCACT 2783 het 1338 hom 16 4 8 4 CT 4 2 155567 CASAVA_Build 18 75452977 4I TAGAAGACAA ----/AAAT AAATAAGAAC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AAAT 1 2 155568 CASAVA_Build 18 75453093 4I ACCAGTTAAA ----/AGAT AGATAGACTG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 AGAT 1 2 155569 CASAVA_Build 18 75454213 2D TACATAACAC AT/-- GAGACAAGAA 3070 het 3070 ref 33 21 12 0 AT 1 0 155570 CASAVA_Build 18 75486132 3D TTTAATAATG ACA/--- ACAACAATAT 3070 hom 75 het 34 0 25 10 ACA 3 2 155571 CASAVA_Build 18 75490121 1I TGCAGGGATC -/G GCATTCCGGA 3070 hom 96 het 37 0 29 8 G 1 2 155572 CASAVA_Build 18 75492078 2D GTGTCCGTGC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 46 24 13 12 AT 1 0 155573 CASAVA_Build 18 75492265 4I TATGTGTGTG ----/TGTC TGTGTGTGCG 3070 hom 123 het 55 0 36 19 TGTC 0 1 155574 CASAVA_Build 18 75504997 1D TAATGTATAA T/- AATACGTAAG 3070 het 2157 hom 31 6 18 7 T 1 0 155575 CASAVA_Build 18 75507738 1I TCTTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 856 het 287 hom 10 2 4 4 C 0 1 155576 CASAVA_Build 18 75507900 1D ACCTGGGTAA T/- TTTTTTTTGT 1174 het 1126 hom 8 4 3 1 T 9 8 155577 CASAVA_Build 18 75526251 1D TGACTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 11 12 T 15 14 155578 CASAVA_Build 18 75556810 1D TGTCTGTGGA G/- AATGTTTCCA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 G 1 0 155579 CASAVA_Build 18 75564668 4I ACGTATCAGC ----/ATTT GAGGAAACAA 3070 het 3070 ref 58 26 23 9 ATTT 0 1 155580 CASAVA_Build 18 75572658 1D CTAATAATTT A/- CAAAATCCTA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 1 0 155581 CASAVA_Build 18 75572980 36I CTCGGTGGCC ------------------------------------/ACCCTCCTCCCAGCGCTTCGGTTTTTACATTTAGGG AGTCCCCACA 1205 het 1205 ref 27 15 4 10 ACCCTCCTCCCAGCGCTTCGGTTTTTACATTTAGGG 0 1 155582 CASAVA_Build 18 75587590 1D CCATCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 8 9 T 12 11 155583 CASAVA_Build 18 75591455 17I GGTTCTTAAT -----------------/CATTCGATATCAAAGGG GGTTGAATTC 3070 het 3070 hom 32 10 19 4 CATTCGATATCAAAGGG 0 1 155584 CASAVA_Build 18 75597736 1D GTGCAGGTGT G/- GGGGGGGATC 3070 hom 81 het 35 0 25 10 G 8 7 155585 CASAVA_Build 18 75597895 3I TTCTGCAGGT ---/GTG GGGGGGTCTG 3070 hom 126 het 51 0 40 11 GTG 0 1 155586 CASAVA_Build 18 75616930 1I CCTGGGTGTT -/C CGCCTGTTCT 3070 hom 72 het 26 0 19 7 C 1 2 155587 CASAVA_Build 18 75624073 1I ATGGTAAGTA -/G GGGAGGGAAC 3070 hom 135 het 49 0 44 5 G 3 4 155588 CASAVA_Build 18 75636049 1D GCTGGGGAGA G/- GGTTGGTGGA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 G 3 2 155589 CASAVA_Build 18 75643595 1D CGGGCTTCTA C/- CCCCCAGCGT 3070 het 3070 hom 23 12 10 2 C 6 5 155590 CASAVA_Build 18 75643710 4D TTGACCTGCC TGTT/---- TGTTTTCTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TGTT 2 1 155591 CASAVA_Build 18 75645785 4D CGCCTGTCAC CTGT/---- CTCTGTGCTG 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 CTGT 1 0 155592 CASAVA_Build 18 75655578 4I GAGCGTGCAC ----/GTGT GTGTGTATGA 3070 hom 212 het 75 0 68 7 GT 3 5 155593 CASAVA_Build 18 75658489 4D ATGCATGTAC GTGA/---- GTATGAATGA 3070 het 3070 ref 70 42 23 6 GTGA 1 0 155594 CASAVA_Build 18 75663718 1D AGTTCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 2926 het 323 hom 19 3 8 8 T 12 11 155595 CASAVA_Build 18 75666852 2I GGTCCACATG --/CA CACACACACA 2309 het 2309 ref 38 20 8 10 CA 8 9 155596 CASAVA_Build 18 75678197 11D ACATGGTTGT CACACGGCTGC/----------- CACACGGCTG 3070 het 3070 ref 83 33 28 32 CACACGGCTGC 1 0 155597 CASAVA_Build 18 75686084 1I TAGTGCTTTG -/T ATAGGACAGT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 0 1 155598 CASAVA_Build 18 75689435 2I67M4I CAAGTGTGTG --GTGTGTGTGCAAATGTGTGTCTGTGTGTGCATGAATGTGTGCATATGTGTCTACATGAGTCTGTGTA----/GTGTGTGTGTGCAAATGTGTGTCTGTGTGTGCATGAATGTGTGCATATGTGTCTACATGAGTCTGTGTAGTGT GTGTAACGTG 3070 hom 328 het 80 1 120 20 N/A 0 0 155599 CASAVA_Build 18 75691123 1I ATTCTGCAGG -/T TCCACGGAGC 3070 hom 123 het 45 0 39 6 T 1 2 155600 CASAVA_Build 18 75694023 1D ATTTTATAAC T/- TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 7 6 155601 CASAVA_Build 18 75707467 2D ATGTGAACTC AT/-- ATGTGTATCA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 AT 2 1 155602 CASAVA_Build 18 75712606 4D GTGTGTGAGA GTGT/---- GTGTGTATGT 3070 het 3070 hom 88 38 40 13 GT 5 3 155603 CASAVA_Build 18 75722262 4D TCTCTCTCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1525 het 750 hom 21 7 6 8 T 22 18 155604 CASAVA_Build 18 75738980 4I GTCCTGAGAC ----/GTGT TGTTGTCAGA 3070 het 3070 ref 44 19 14 11 GT 0 2 155605 CASAVA_Build 18 75743383 1D TAAGAGAATG A/- AAAAACAAGC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 6 5 155606 CASAVA_Build 18 75750466 5D TTTTTTGTTC TTTTG/----- TTTTAGTTAT 3070 het 3070 ref 46 23 21 3 TTTTG 1 0 155607 CASAVA_Build 18 75751933 2I AATGGAATTT --/TC TCTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TC 1 2 155608 CASAVA_Build 18 75752308 1I AGCCACAACC -/T TTTTAGACTC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 4 5 155609 CASAVA_Build 18 75758119 1D TAAAAAATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 375 hom 40 1 31 10 T 10 9 155610 CASAVA_Build 18 75762420 2D CAGTGGGCCG CT/-- CTCTCACACA 2253 hom 46 het 20 0 10 10 CT 3 2 155611 CASAVA_Build 18 75764059 2I CCCGAGACCG --/TC TCTCTCCTGG 3070 hom 61 het 24 0 14 10 TC 3 4 155612 CASAVA_Build 18 75766446 1D GGCTTCGGAA T/- TCCCCCCTGC 3070 hom 64 het 30 0 17 13 T 2 1 155613 CASAVA_Build 18 75775556 3I AGGGGAGAGA ---/CAC CACCCCCTTG 1948 het 1948 ref 19 11 6 2 CAC 1 2 155614 CASAVA_Build 18 75782822 1D6M2D44M4D GGGTCAGAGG AGGAGAGACAGGAACCGAGGGAGAGGTCAAGGTCAGTGAGGAGAGACGGGAACCGAG/-GGAGAG--ATGGACCAAGTGAGAAGTCAAGGTCACGGAGGAGAGTTGGGAAC---- GGAGAGGTCA 3070 het 1284 hom 24 6 17 10 N/A 0 0 155615 CASAVA_Build 18 75787649 1I GAAATTGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 12 13 155616 CASAVA_Build 18 75795117 1D GCATTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 30 1 18 13 A 13 12 155617 CASAVA_Build 18 75799134 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 778 hom 27 2 17 8 A 14 13 155618 CASAVA_Build 18 75800752 1D GGAACACTTA C/- ATACTGTTGG 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 C 1 0 155619 CASAVA_Build 18 75807228 6D GGGTGAAGAC AAAGAA/------ AAACACAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 7 AAAGAA 1 0 155620 CASAVA_Build 18 75815729 4I TTCTTTTTAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 TTTA 3 4 155621 CASAVA_Build 18 75816220 1D AAACAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 A 10 9 155622 CASAVA_Build 18 75820055 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCCATCT 3070 het 2796 hom 26 7 15 4 C 6 7 155623 CASAVA_Build 18 75822483 1D GTGGTCCTAC T/- CGGGCTGCCC 3070 het 2715 hom 25 10 11 4 T 1 0 155624 CASAVA_Build 18 75830740 4D CCTTCTGCCC CTTG/---- CTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 56 29 23 5 CTTG 1 0 155625 CASAVA_Build 18 75831574 1D TGCTCTCCCC T/- CCGTGCCTGC 2524 het 2524 ref 24 7 12 6 T 1 0 155626 CASAVA_Build 18 75837955 1D AGGTTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 11 10 155627 CASAVA_Build 18 75838799 5D TCAGGGCAAT TTTTG/----- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 TTTTG 2 1 155628 CASAVA_Build 18 75843203 3D AGGGCAAGGA AGC/--- AGAAGTGCAG 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 AGC 1 0 155629 CASAVA_Build 18 75845390 1I GAGACCAGCC -/T GGCCAATATG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 0 1 155630 CASAVA_Build 18 75854309 1D TTTGCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 6 A 13 12 155631 CASAVA_Build 18 75858437 3I GAGGGCAATA ---/AAT AATATGGCAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AAT 1 2 155632 CASAVA_Build 18 75872512 2I ATTGTGGGAA --/AG AGAGTTTCTG 2688 het 2688 ref 30 10 8 12 AG 2 3 155633 CASAVA_Build 18 75887729 2D CAGGTCCCAC AT/-- GTCTCTTATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 AT 1 0 155634 CASAVA_Build 18 75889584 1I TAAGAGGAGA -/G GATGGAAATT 2667 het 2667 ref 33 21 6 6 G 1 2 155635 CASAVA_Build 18 75893961 52D ATTCCCCACG TTTTTCCTCTGCCCGTTTGTTTGTGAAAACTCTGCTTCTCAATACTCCGCCC/---------------------------------------------------- TTTCCCCTTT 2951 het 2951 ref 36 36 9 7 TTTTTCCTCTGCCCGTTTGTTTGTGAAAACTCTGCTTCTCAATACTCCGCCC 1 0 155636 CASAVA_Build 18 75896250 2D CGATATTGAT AA/-- GAGTGTTGCT 3070 het 3070 ref 49 24 23 2 A 2 0 155637 CASAVA_Build 18 75898877 6D ACTCCATCTC AAAAAA/------ AAAAAAAGCC 3070 het 695 hom 13 3 9 1 A 13 7 155638 CASAVA_Build 18 75902720 4D TTTTTTTTTT TTTC/---- TTTTTTTTTG 2590 het 825 hom 29 9 10 11 TTTC 1 0 155639 CASAVA_Build 18 75908688 1D TAGGAGAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 A 10 9 155640 CASAVA_Build 18 75922943 1I GTCCAGGGAC -/T TATATAGACA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 1 2 155641 CASAVA_Build 18 75936049 2D AAATATTCTA AT/-- ATGTTTATTT 2620 het 2620 ref 24 13 7 4 AT 2 1 155642 CASAVA_Build 18 75950383 2I TAAATAAAAC --/TT AACACAAATT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 0 2 155643 CASAVA_Build 18 75957489 3D ATTTGGTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 269 hom 24 4 14 6 T 15 12 155644 CASAVA_Build 18 75975384 1D TATGAGAGTT C/- CAATTTCTCC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 C 2 1 155645 CASAVA_Build 18 75976113 3D TATCTAGGAA TTC/--- TTCCTTGCCG 3070 hom 112 het 43 0 38 6 TTC 2 1 155646 CASAVA_Build 18 75985130 3D GCCTTTGTTC TGT/--- TGTTGTTATA 3070 het 3070 hom 29 11 15 5 TGT 3 2 155647 CASAVA_Build 18 75991548 1I TCTCCCCTCT -/C TCCTCCCCTC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 C 0 1 155648 CASAVA_Build 18 75998276 1I CTAATAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2214 hom 34 6 24 4 T 11 12 155649 CASAVA_Build 18 75999311 1I TTTATTTTCT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 7 8 155650 CASAVA_Build 18 76002938 1D ATAAAATTCA T/- AAAAACATCC 3070 het 3070 ref 39 17 18 5 T 1 0 155651 CASAVA_Build 18 76003182 3D ACGTCTCATT ACA/--- ACAAGGAAAG 3070 het 3070 ref 55 28 25 5 ACA 2 1 155652 CASAVA_Build 18 76006335 9I GAGCCCTGCG ---------/CTGTGGTGC CTGTGTGCGT 2374 het 2201 hom 20 9 7 4 CTGTGGTGC 0 1 155653 CASAVA_Build 18 76011553 2D TGCACGGACC TT/-- TTTTTTTTTT 2101 het 127 hom 40 3 12 25 T 20 18 155654 CASAVA_Build 18 76016425 4I ATCAGCAATA ----/ACTT ACTTAGTAAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 ACTT 1 2 155655 CASAVA_Build 18 76022323 2D ACTGACTCAC AG/-- AGTTTGAGGT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 AG 2 1 155656 CASAVA_Build 18 76027787 9I ATATTTTCTT ---------/ACAAATAAC ACAAATAACC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 ACAAATAAC 1 2 155657 CASAVA_Build 18 76032498 1D GACTTCATCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 8 11 6 A 10 9 155658 CASAVA_Build 18 76037705 1D TGCCCCATCA C/- TTCCTCCCAT 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 C 1 0 155659 CASAVA_Build 18 76045534 6D TGAGGGCTAC ATATAA/------ TCACACGTGA 3070 het 3070 hom 43 19 23 4 ATATAA 1 0 155660 CASAVA_Build 18 76049146 1D GTGCACCGGC A/- AACAATCCGG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 3 2 155661 CASAVA_Build 18 76053919 3I CCCACCTTGG ---/ACT ACGAATCACT 3070 hom 92 het 40 0 27 13 ACT 0 1 155662 CASAVA_Build 18 76055881 1D CCCAGAGGGC A/- AAGCCCACGT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 A 3 2 155663 CASAVA_Build 18 76061001 3D ATTATTTTGA AAC/--- AACAAGGTTC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AAC 2 1 155664 CASAVA_Build 18 76061513 1I GTAATGACAG -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 6 7 155665 CASAVA_Build 18 76070821 1D TGAGTTTTAC A/- AGATGAAAAG 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 A 2 1 155666 CASAVA_Build 18 76072821 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2215 het 488 hom 27 2 14 11 A 17 18 155667 CASAVA_Build 18 76073901 1D GCTTCTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 31 2 27 2 A 13 12 155668 CASAVA_Build 18 76083721 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 10 11 155669 CASAVA_Build 18 76091516 21D CCCTCCCACA ACACGTGGGAGTTATGAGAGT/--------------------- ACAATTCAAG 3070 het 3070 ref 23 17 7 4 ACACGTGGGAGTTATGAGAGT 1 0 155670 CASAVA_Build 3 49812 1D GTGCAAGTTC G/- GGGGTCATGG 3070 het 183 hom 29 1 27 1 G 5 4 155671 CASAVA_Build 3 65844 8D GGATGATCAA CCCTTAAG/-------- GGGTGAAAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 4 CCCTTAAG 1 0 155672 CASAVA_Build 3 70727 2D ATGAACAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 9 A 12 10 155673 CASAVA_Build 3 100308 1D TAAACCCACA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 9 8 155674 CASAVA_Build 3 112225 1D8M1D TTGAGAACAC TTGTGATTAC/-TGTGATTA- ATTGGACAAT 3070 hom 93 het 33 0 30 5 N/A 0 0 155675 CASAVA_Build 3 121481 1I23M1D GAGTGTTTTG -AAAAAAAACTCTTATTACATGTAT/AAAAAAAAACTCTTATTACATGTA- TTTTTAATTC 3070 hom 162 het 50 0 54 9 N/A 0 0 155676 CASAVA_Build 3 133350 2D CGACACATTT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 68 het 29 0 23 8 AC 8 7 155677 CASAVA_Build 3 140582 1I TTAAACAGAT -/G TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 155678 CASAVA_Build 3 145443 1I TCAAGGTGCC -/T TGGGGGCAAT 3070 hom 117 het 42 0 37 5 T 1 2 155679 CASAVA_Build 3 158058 1I TTCCTTGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 9 10 155680 CASAVA_Build 3 169424 2D CACATTTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 44 0 37 9 TG 7 6 155681 CASAVA_Build 3 179711 1I CTATGCTCGC -/T TCCTTCCAGT 3070 het 3070 hom 51 23 19 9 T 1 2 155682 CASAVA_Build 3 181102 2D CATTTAACGA GT/-- GTGTGTGCTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GT 4 3 155683 CASAVA_Build 3 184343 3D TACCTTTTTT ACC/--- TTTTTTTTTT 10 het 10 ref 41 14 2 26 ACC 1 0 155684 CASAVA_Build 3 193132 2I ACATCCTCTC --/AT ATAATGTAAA 3070 hom 91 het 32 0 31 1 AT 1 2 155685 CASAVA_Build 3 199546 1D TGATCCGCCC G/- CCTCGGCCTC 3070 hom 57 het 22 0 19 4 G 1 0 155686 CASAVA_Build 3 200981 3D TTTCCCCTGA TTC/--- TTTATTTGCA 3070 hom 110 het 43 0 37 8 TTC 1 0 155687 CASAVA_Build 3 205224 2D ATATATTCAG TC/-- TATAGCACCC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TC 1 0 155688 CASAVA_Build 3 211890 1I TTTTTAAAAA -/G GCTACTGGCC 3070 hom 117 het 43 0 38 5 G 1 2 155689 CASAVA_Build 3 212005 1I TATTGTCAAG -/A AAACAAATCA 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 3 4 155690 CASAVA_Build 3 221486 1D TTTCTATTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 9 8 155691 CASAVA_Build 3 242283 4I CACAGTTCAA ----/TTAC TTACACAGAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTAC 1 2 155692 CASAVA_Build 3 250875 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTATATATA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TA 0 1 155693 CASAVA_Build 3 255110 1D GAAAAAAAAT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 8 7 155694 CASAVA_Build 3 255454 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 1728 hom 12 het 6 0 5 1 A 14 12 155695 CASAVA_Build 3 255647 1I ACAAAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 34 1 27 6 T 10 11 155696 CASAVA_Build 3 257462 3D TGTATAAGGT AGG/--- AGATGAGGAT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 AGG 1 0 155697 CASAVA_Build 3 257543 1D GGTGTTCTTT C/- CCCCACTTTA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 5 4 155698 CASAVA_Build 3 258267 1I CTTCTCTCTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 174 hom 35 1 29 5 T 0 1 155699 CASAVA_Build 3 258556 4D TAACAGAGAA TAAG/---- TAAGACGTTA 3070 hom 96 het 34 0 32 5 TAAG 2 1 155700 CASAVA_Build 3 258998 1I TACAGAGACT -/G GGCTGAGCGC 3070 hom 66 het 24 0 23 5 G 2 3 155701 CASAVA_Build 3 259292 6D67M4D ATAAATAAAT AAAATAAAATAAAATAAAATAATACAGAGATAATTCTTCATTTACAATAAACACTAAGAACACATGCACACAAACAC/------AAATAAAATAAAATAATACAGAGATAATTCTTCATTTACAATAAACACTAAGAACACACGCACACAA---- ACACACACAC 3070 het 1756 hom 10 7 9 15 N/A 0 0 155702 CASAVA_Build 3 296896 1D AGTCTAGGCA T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 36 27 5 4 T 13 12 155703 CASAVA_Build 3 313118 1I TCTCTCATGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 8 9 155704 CASAVA_Build 3 344107 1I ACTGTGTACA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 155705 CASAVA_Build 3 362006 2D GAGCCCTATT TA/-- TATCTATTTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 TA 2 1 155706 CASAVA_Build 3 364237 1D ATTAGACTAG T/- TTTCAAAGAC 3070 het 3070 ref 47 21 19 8 T 4 3 155707 CASAVA_Build 3 366662 1D ACTCTCCGTA C/- CTCAGGCTCT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 C 2 1 155708 CASAVA_Build 3 367293 1I AAATTAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1425 hom 40 5 27 8 A 10 11 155709 CASAVA_Build 3 377284 1I TTTTTTTTTT -/A TTATTATACT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 0 1 155710 CASAVA_Build 3 379307 1D GCTTATCCTT A/- AAAAAAAAAA 2753 het 2753 ref 24 10 7 7 A 12 11 155711 CASAVA_Build 3 402892 1D ACATAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 195 hom 26 2 14 10 A 17 16 155712 CASAVA_Build 3 405234 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 24 0 19 5 A 17 16 155713 CASAVA_Build 3 405383 1D AGGAGCTACT G/- TTTTTTTGTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 1 0 155714 CASAVA_Build 3 405730 1D TTACTTGGGG A/- GTTAAGGGAT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 1 0 155715 CASAVA_Build 3 409644 10I TTGATGTACA ----------/TCGAGTATAC TCAGAGTCAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TCGAGTATAC 0 1 155716 CASAVA_Build 3 417165 1D CCCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 92 het 35 0 31 5 A 10 9 155717 CASAVA_Build 3 426225 2I56M1D TAAAAATAAG --ATAAATAAAATATTTTGATTTCAATTACTTTATAAATATACAATATCATCATCTATA/ACATAAATAAAATATTTTGATTTCAATTACTTTATAAATATACAATATCATCATCTAT- AAAAAGAATA 3070 hom 81 het 27 0 28 9 N/A 0 0 155718 CASAVA_Build 3 436717 1I CAATTCTTCA -/T TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 T 3 4 155719 CASAVA_Build 3 438176 1D ACAAAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 86 hom 24 1 17 6 A 12 11 155720 CASAVA_Build 3 450264 20I TGGTTCCTGC --------------------/CTTCTGCAGGGTTCTTTCTA TGGACAAGTT 3070 hom 97 het 38 0 29 10 CTTCTGCAGGGTTCTTTCTA 0 1 155721 CASAVA_Build 3 456648 1D AGAGGGACAG A/- ACGAATGGAA 3070 hom 15 het 13 0 10 3 A 2 1 155722 CASAVA_Build 3 464326 4D CATTCTCTTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 16 1 11 4 A 17 13 155723 CASAVA_Build 3 478819 1D AATAGTTTTT A/- AAAAAATATT 3070 hom 75 het 31 0 25 8 A 7 6 155724 CASAVA_Build 3 479550 4D AAGGTATCAT AGAC/---- AGATGACAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 6 AGAC 1 0 155725 CASAVA_Build 3 480172 1I TCTGCCTAAA -/C TCAAGCAGAT 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 0 1 155726 CASAVA_Build 3 480946 1D AGCAGCCGAA T/- AAGAACAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 0 155727 CASAVA_Build 3 482966 1I AAGTCTGGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 35 1 26 8 A 11 12 155728 CASAVA_Build 3 489228 1I GCTAGTGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 T 10 11 155729 CASAVA_Build 3 494441 1D CAATAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 43 0 37 7 A 10 9 155730 CASAVA_Build 3 502263 2D TGTTGAGAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2904 hom 23 9 10 4 T 13 11 155731 CASAVA_Build 3 505009 1D TGTAGGTTAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 8 7 155732 CASAVA_Build 3 505186 1I AAGTAAGTGA -/T TTTTGGATTA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 4 5 155733 CASAVA_Build 3 507887 6D AAAAAAAAAT AAAATA/------ AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 26 11 13 3 AAAATA 1 0 155734 CASAVA_Build 3 508639 1D TATTGCTGTT C/- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 19 1 C 1 0 155735 CASAVA_Build 3 509441 3D ACTTCCGGGG CTA/--- CTACTGCTTG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 CTA 2 1 155736 CASAVA_Build 3 517992 3D TATAATAATA ATG/--- ATGATGATGA 3070 hom 60 het 22 0 21 3 ATG 4 3 155737 CASAVA_Build 3 542013 1I AGCCCAGGTG -/C CTGGATTTCT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 C 1 2 155738 CASAVA_Build 3 549014 1D GATAGTCAAC A/- AAAGTGTGAG 3070 het 3070 ref 41 26 10 5 A 4 3 155739 CASAVA_Build 3 560294 1D ACCTCTTAGA T/- TTGTGTTATT 3070 hom 129 het 49 0 43 7 T 3 2 155740 CASAVA_Build 3 588705 5I ATATATATAA -----/TATAT TATATATAAA 3070 het 2527 hom 49 7 33 9 TATAT 1 2 155741 CASAVA_Build 3 596644 1D GTGTGGTGCT G/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 61 11 42 8 G 1 0 155742 CASAVA_Build 3 612027 5I TTTTAATAAA -----/AAATT AAAAGATTGA 3070 het 3070 hom 84 13 60 14 AAATT 0 1 155743 CASAVA_Build 3 643454 1D ATGTCAATTA C/- GGCCTATCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 0 155744 CASAVA_Build 3 658539 1I GCAAAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 13 12 T 13 14 155745 CASAVA_Build 3 688934 6D CAGTAGCATT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 290 hom 35 5 15 17 TTG 6 4 155746 CASAVA_Build 3 703247 1D GAAATGTTTG A/- AAAATATAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 5 4 155747 CASAVA_Build 3 703577 1I TATTTATTTA -/T TTATTATTAT 448 het 100 hom 13 1 2 10 T 2 3 155748 CASAVA_Build 3 705426 6D TATTATAGTG TTCTTA/------ TTCTTATTCT 3070 hom 87 het 41 0 30 14 TTCTTA 4 3 155749 CASAVA_Build 3 708533 1I GACAAAGTTG -/A AACTAAATCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 3 155750 CASAVA_Build 3 708760 1D AAAAAAGAAG T/- TTTTAAATGA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 5 4 155751 CASAVA_Build 3 708990 4D CAACGCATAT AGTC/---- ATCAAATTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 AGTC 1 0 155752 CASAVA_Build 3 722123 1I AAGGTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2173 hom 37 5 14 18 A 17 18 155753 CASAVA_Build 3 726350 4D TGAGTAATTC TCTG/---- TCTCCTTTTT 3070 het 3070 ref 51 22 24 5 TCTG 1 0 155754 CASAVA_Build 3 739086 1D ATAGTGAGCA C/- CTGTAGTCCT 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 C 2 1 155755 CASAVA_Build 3 750637 1D TGATTGAAGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 9 8 155756 CASAVA_Build 3 754040 1D TTTGAGATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1001 hom 32 6 14 12 A 17 16 155757 CASAVA_Build 3 755856 27I TGTTTATGCC ---------------------------/TTAAGTAACATATGTTTACTTGTTTAT GACTTAAGTA 3070 hom 93 het 26 0 32 1 TTAAGTAACATATGTTTACTTGTTTAT 0 1 155758 CASAVA_Build 3 757141 1I TGTCGGTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 11 14 5 T 9 10 155759 CASAVA_Build 3 760397 3D AGAAGTAAGT ATC/--- ATAAAAATAA 3070 hom 47 het 19 0 16 3 ATC 1 0 155760 CASAVA_Build 3 763256 1I ATTTCAGAAC -/A CTGTCCATAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 155761 CASAVA_Build 3 766754 8D GTGAGACTTG TTTTCCCA/-------- TTTTTGACAT 3070 het 3070 hom 43 18 18 9 TTTTCCCA 1 0 155762 CASAVA_Build 3 786239 1D AGTATATTTT G/- CCAATAGAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 G 1 0 155763 CASAVA_Build 3 805142 8D AGTCAACCTT TATTTTTA/-------- ATGCCAATTC 3070 het 3070 ref 32 19 12 4 TATTTTTA 1 0 155764 CASAVA_Build 3 806382 6D CAGGTTGAGT AGGAGG/------ AGGAGGAGGA 3070 het 3070 hom 36 18 16 3 AGG 5 3 155765 CASAVA_Build 3 809497 1I ATCTGGAGAT -/A ACGGCAGGGC 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 A 1 2 155766 CASAVA_Build 3 811065 7D GGGTAATGTC TAGGTCA/------- TAGGGCTCCG 3070 het 3070 hom 29 14 15 4 TAGGTCA 1 0 155767 CASAVA_Build 3 814801 2I TTAATTGCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 96 het 47 0 32 15 TC 6 7 155768 CASAVA_Build 3 814980 1D CAATTTTTAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 8 7 155769 CASAVA_Build 3 818887 2D ACCATACATT GA/-- GTTACTGTAG 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 GA 1 0 155770 CASAVA_Build 3 822310 1D GCTTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 10 A 13 12 155771 CASAVA_Build 3 832677 2I TCAACTTGAC --/TT TCCTAGAAAC 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 T 1 3 155772 CASAVA_Build 3 837229 3D TGTGCAAAAA CTG/--- GAAGCATTCC 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 CTG 1 0 155773 CASAVA_Build 3 841448 1I AGGAAGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1659 hom 24 4 16 4 A 10 11 155774 CASAVA_Build 3 842742 2D ATTTACACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 A 12 10 155775 CASAVA_Build 3 846388 1D ATTCTGCCCC T/- GTCACACCCA 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 T 1 0 155776 CASAVA_Build 3 846478 1I TCCCAGCATT -/A AACCAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 2 3 155777 CASAVA_Build 3 847885 3D ACTGGGTAAT TTA/--- TAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 32 15 16 2 TTA 1 0 155778 CASAVA_Build 3 847984 1D GCAAAATACC T/- TCTTCACAAG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 2 1 155779 CASAVA_Build 3 855156 3I ATGGAGAGAA ---/ATG ATGAGAAGGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 ATG 1 2 155780 CASAVA_Build 3 855277 1D CATTCTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 11 10 155781 CASAVA_Build 3 859969 1I AGTTGTATAC -/T TTTTTTTATG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 7 8 155782 CASAVA_Build 3 861383 3D CACAAAATGA TAT/--- TATCTCGATC 3070 hom 111 het 40 0 38 3 TAT 2 1 155783 CASAVA_Build 3 863767 1I ATCTGAGGGG -/T TTTTGTCTGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 4 5 155784 CASAVA_Build 3 866553 1I CACTCAGTAC -/A CTTGGACCCA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 A 0 1 155785 CASAVA_Build 3 866600 1D CACCATCTTT G/- GGGGGGTGCT 3070 het 3070 ref 27 11 10 9 G 7 6 155786 CASAVA_Build 3 868689 2D ACTTACCGAC CA/-- CAGAGTTCTG 3070 hom 75 het 28 0 23 6 CA 2 1 155787 CASAVA_Build 3 871456 1D GAGGCTGAGG C/- CTGCAGTGAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 C 2 1 155788 CASAVA_Build 3 872666 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGCCACAAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 CT 1 2 155789 CASAVA_Build 3 876136 12D TAGAACACCA TGAGCTCCTCCC/------------ TGGGTCTCCA 3070 het 3070 ref 49 30 18 7 TGAGCTCCTCCC 1 0 155790 CASAVA_Build 3 876538 7I3M1I AAACTAGAAC -------CCT-/ATCAGCTCCTC CCCCCGTCTT 3070 hom 75 het 26 0 21 6 N/A 0 0 155791 CASAVA_Build 3 880864 1D48M10I TTTATTTTGG TTTTTTTCTAGCTTTATTGCTGTATAATTGACAAATAGAAATTGTGTGC----------/-TTTTTTCTAGCTTTATTGCTGTATAATTGACAAATAGAAATTGTGTGCATTTACACTG TACGAGTTGA 3070 het 3070 hom 35 9 16 27 N/A 0 0 155792 CASAVA_Build 3 891593 2D GCAGAGGAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 26 1 9 16 T 16 14 155793 CASAVA_Build 3 909301 1D TGAAGGAGCC G/- GGGGAGCAGA 3070 het 2770 hom 15 6 8 1 G 5 4 155794 CASAVA_Build 3 916223 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAC 1030 het 1030 ref 17 14 3 0 A 10 9 155795 CASAVA_Build 3 917019 1I AGGGGAGTGA -/T AAAAATCCCT 3070 het 3070 ref 57 26 25 6 T 0 1 155796 CASAVA_Build 3 918841 1D GTGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAT 1266 het 1266 ref 47 39 3 5 A 10 9 155797 CASAVA_Build 3 930593 1I GTATAAAACC -/A AACTGTGCCC 3070 hom 96 het 36 0 29 7 A 2 3 155798 CASAVA_Build 3 933479 3I TATATCCATC ---/TTG TTGTGCTAAG 3070 het 3070 ref 41 18 10 13 TTG 1 2 155799 CASAVA_Build 3 933875 1D TGACACTCCT C/- CCCCCACCAC 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 C 6 5 155800 CASAVA_Build 3 942586 1I49M1I GATTCTGTAC -AACCCTGTATAAATGTGACTGCATTTGGACTTTCTAAAAGAATATAAGC-/AAACACTGTATAAATGTGACTGCATTTGGACTTTCTAAAAGAATATAAGCA ATGTATGCTT 3070 hom 235 het 52 0 79 3 N/A 0 0 155801 CASAVA_Build 3 945260 1D ATCAATAAAA C/- CGGGAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 2 1 155802 CASAVA_Build 3 951429 1D GAGGAAAAAC T/- TGAAGATGGT 3070 hom 85 het 33 0 27 6 T 2 1 155803 CASAVA_Build 3 957931 1D TCAGAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 2845 het 181 hom 9 1 7 1 T 13 12 155804 CASAVA_Build 3 972705 1D TTAGTGGGTT C/- CCCAGTTTGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 C 4 3 155805 CASAVA_Build 3 989978 1I AGACAGTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 437 hom 28 1 22 5 A 9 10 155806 CASAVA_Build 3 1001696 7D TCCAGTTTAG TGGGATC/------- TGGGATCGTT 3070 hom 48 het 20 0 14 6 TGGGATC 2 1 155807 CASAVA_Build 3 1012220 1I81M2D GGTAAACAGA -TTTTTTTAAAGACATCCAAATCTAAGACACCTTGTATTTTTCAGTTTTACCAATAGATGACACTAGTGATACACACGCACGCA/TTTTTTTTAAAGACATCCAAATCTAAGACACCTTGTATTTTTCAGTTTTACCAATAGATGACACTAGTGATACACACGCACG-- CGCACACACA 3070 het 819 hom 44 4 39 22 N/A 0 0 155808 CASAVA_Build 3 1013567 4I TGGTTCATAT ----/ATAA GTGATATATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATAA 0 1 155809 CASAVA_Build 3 1016489 2D TGGAGGCCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 41 3 18 20 T 18 16 155810 CASAVA_Build 3 1021821 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 22 2 15 5 A 14 15 155811 CASAVA_Build 3 1038875 1I ACTATGACAA -/C CCTACAGAAT 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 C 2 3 155812 CASAVA_Build 3 1046525 1I ATGATACTTT -/A TTTATATGTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 0 1 155813 CASAVA_Build 3 1058086 1I TTCCTTATGA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 6 7 155814 CASAVA_Build 3 1060790 1I TATATGGAGG -/T TATTGAGGAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 1 2 155815 CASAVA_Build 3 1062464 1I ATATAAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2471 hom 23 8 8 7 T 11 12 155816 CASAVA_Build 3 1067348 1I AATCTCTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 48 0 37 11 T 10 11 155817 CASAVA_Build 3 1071730 1I AAACCATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 10 11 155818 CASAVA_Build 3 1074378 1I AAATAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 620 hom 31 2 17 12 T 16 17 155819 CASAVA_Build 3 1084938 1I CAGATGCCTC -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 44 13 16 15 A 7 8 155820 CASAVA_Build 3 1095955 1I AGGAATACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 11 20 11 T 9 10 155821 CASAVA_Build 3 1099195 1D TTGATGATTA T/- AATAGACATT 3070 het 3070 ref 39 28 10 1 T 1 0 155822 CASAVA_Build 3 1100346 1I ATAAGAAGCC -/T TATTTGCTGC 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 1 2 155823 CASAVA_Build 3 1102130 4D TTCATAAATT ACAA/---- ACAAACAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 20 3 ACAA 3 2 155824 CASAVA_Build 3 1102403 1I GCTTTATGGT -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 6 7 155825 CASAVA_Build 3 1130541 4D GTTAAATACT CTCA/---- CTCACTCAAA 3070 hom 125 het 45 0 41 4 CTCA 3 2 155826 CASAVA_Build 3 1148107 6D GGGTTGCTCT CCTTGA/------ CCTTGAGTTA 3070 hom 169 het 59 0 56 4 CCTTGA 2 1 155827 CASAVA_Build 3 1159719 4D CACTTATCAT CAAC/---- CAACATCTCT 2366 het 2366 ref 17 11 5 2 CAAC 2 1 155828 CASAVA_Build 3 1161269 1D16M2D CATTAAAAAA TAATAATAATAAAAAATAA/-AATAATAATAAAAAAT-- AAAATAAAAA 245 het 245 ref 12 8 3 10 N/A 0 0 155829 CASAVA_Build 3 1162168 6D AGAAGGAGAC AGAATT/------ ATTGGGTAAA 3070 het 3070 hom 44 20 23 2 AGAATT 1 0 155830 CASAVA_Build 3 1162694 1I AGAGATCCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 9 10 155831 CASAVA_Build 3 1163257 1D ATCATATTTA C/- TACACAAATA 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 C 1 0 155832 CASAVA_Build 3 1167162 7D ACTTCTAGTG CTTTTAC/------- TATAGTCATG 3070 het 3070 ref 40 22 16 6 CTTTTAC 1 0 155833 CASAVA_Build 3 1175262 2I ACAGACTCAA --/TT TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 8 10 155834 CASAVA_Build 3 1178974 5D AGAACCTTGT TTGTA/----- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 hom 44 15 25 6 TTGTA 1 0 155835 CASAVA_Build 3 1184276 4I CCCAGGTGAT ----/TAGA TAGATATATA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 TAGA 1 2 155836 CASAVA_Build 3 1192123 2D ATGGGAGAAA AC/-- ACAGTCTACT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 AC 2 1 155837 CASAVA_Build 3 1193692 5D TCTGGATGAC AAAAG/----- AAAGCATAGA 3070 hom 160 het 58 0 54 6 AAAAG 1 0 155838 CASAVA_Build 3 1199270 5I ATTTGCCCAC -----/ATTCT ATTCTCCTTT 3070 hom 98 het 42 0 31 11 ATTCT 1 2 155839 CASAVA_Build 3 1210806 3D AGAAATTATA AAG/--- AAGAAAAAGC 3070 het 3070 ref 29 14 12 5 AAG 2 1 155840 CASAVA_Build 3 1212992 1D AGAGGCAGTG T/- GCTTTGAGTA 3070 het 3070 hom 44 18 21 6 T 1 0 155841 CASAVA_Build 3 1215409 1D TGTCTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 22 0 13 9 A 12 11 155842 CASAVA_Build 3 1217607 4D GTTTCTTTCG TTCT/---- TTTTTTCTTT 786 het 786 ref 36 18 8 11 TTCT 1 0 155843 CASAVA_Build 3 1218164 3I TGTCAAAAAT ---/ATC ATCATCACTC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 ATC 2 3 155844 CASAVA_Build 3 1218583 1D GATAGTATAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 9 8 155845 CASAVA_Build 3 1219228 12D CCGTCTCAAA AAATAAATAAAT/------------ AAATAAATAA 1791 hom 12 het 6 0 4 2 AAAT 11 8 155846 CASAVA_Build 3 1221250 2D ACCTCTCCCT TC/-- TCTTTGCTGT 3070 het 3070 ref 56 28 24 5 TC 2 1 155847 CASAVA_Build 3 1225487 1D ATAATTCATA T/- TACAAGTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 2 1 155848 CASAVA_Build 3 1226372 1D CCCAGCCCTT A/- AATACTGAGC 3070 hom 57 het 28 0 20 8 A 3 2 155849 CASAVA_Build 3 1226412 19D5M1I GTTGGTTGGA CAGGTAAAACTGTGAGCCCCAGCA-/-------------------CAGCAC CCATCAAAAT 2283 het 2283 ref 17 6 7 8 N/A 0 0 155850 CASAVA_Build 3 1227110 11I AAAAGGAAAG -----------/GAAAAAGGAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 8 GAAAAAGGAAA 0 1 155851 CASAVA_Build 3 1229403 2D ATATTGTCAC AT/-- GTTTTCAGCT 3070 het 3070 ref 37 16 18 4 AT 1 0 155852 CASAVA_Build 3 1230155 1D TTCATTTTTT A/- AAAAATCTGA 3070 het 3070 hom 22 7 10 5 A 6 5 155853 CASAVA_Build 3 1230510 4I TGAGACAAAA ----/AAAG AAATTTTTTA 2811 het 2811 ref 19 10 6 3 AAAG 0 1 155854 CASAVA_Build 3 1235682 1I ACATGCCAAA -/G GGCAAGCCAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 2 3 155855 CASAVA_Build 3 1239259 4I GTGAAAAAAT ----/ACAC AGAATGAAGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AC 0 2 155856 CASAVA_Build 3 1241264 1D AATAAAACTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 A 9 8 155857 CASAVA_Build 3 1250112 3D TAAGGATGTT GAA/--- GTTGTTTATA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 GAA 1 0 155858 CASAVA_Build 3 1251387 4D ATCAGAAAAG AACT/---- AACTGAACAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 4 AACT 2 1 155859 CASAVA_Build 3 1256113 4I ATATCTGCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AAAC 4 5 155860 CASAVA_Build 3 1264138 1I TATATGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 A 10 11 155861 CASAVA_Build 3 1266595 2I TTCTGAAAGG --/CT CTCTGTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CT 2 3 155862 CASAVA_Build 3 1267596 19D CTCCTCCGTG CCATTTCCAGATGATCCCT/------------------- CCTCCCTCAT 3070 het 3070 ref 44 28 21 3 CCATTTCCAGATGATCCCT 1 0 155863 CASAVA_Build 3 1292488 2D CTGATCTAAC AG/-- GGGGCAGAGC 3070 hom 139 het 54 0 45 11 AG 1 0 155864 CASAVA_Build 3 1296064 4I CCAATATCAC ----/ACTA ACTATATTAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ACTA 1 2 155865 CASAVA_Build 3 1298959 1D TTCCACCCAG T/- TTTGAAGCAC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 4 3 155866 CASAVA_Build 3 1305020 1I GGATTTTAAA -/G GTGTTAGGCA 3070 hom 126 het 53 0 42 11 G 1 2 155867 CASAVA_Build 3 1319630 4I TTTAAAATTT ----/TTAA TTATTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 TTAA 0 1 155868 CASAVA_Build 3 1319903 3I TTACAGTCTG ---/ATA ATAACTGTTC 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 ATA 1 2 155869 CASAVA_Build 3 1320979 1D TTTTTTTTTT C/- CATATATTTG 3070 het 3070 ref 47 19 20 9 C 2 1 155870 CASAVA_Build 3 1328877 3D ACTCCGAATC TAA/--- TGTCAAACAT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 TAA 1 0 155871 CASAVA_Build 3 1329299 1D CCTCTTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2965 hom 39 14 13 12 A 16 15 155872 CASAVA_Build 3 1352746 1D ACAAACAAAC A/- AACAACAACA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 3 2 155873 CASAVA_Build 3 1352857 10D AAAATCAAAT AAATAAAATA/---------- AAATAAAATA 609 het 609 ref 11 7 2 7 AAATA 4 2 155874 CASAVA_Build 3 1352989 1I TTAAAGCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 97 hom 29 1 26 2 T 9 10 155875 CASAVA_Build 3 1357871 1D AGTTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 12 11 155876 CASAVA_Build 3 1370936 5D TCCTAGTACT TATGA/----- TAGAAATAAG 3070 het 3070 ref 40 21 17 4 TATGA 1 0 155877 CASAVA_Build 3 1379472 3I ACTGAAAATG ---/ATA ATAAGTATCC 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 ATA 1 2 155878 CASAVA_Build 3 1390812 5D TACAGTTCTT AAAAC/----- AAAACAAGTA 3070 het 3070 hom 45 20 23 5 AAAAC 2 1 155879 CASAVA_Build 3 1395870 1I ATGAATTACC -/A AAAGAATACT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 A 3 4 155880 CASAVA_Build 3 1398655 1I AAGTGGCAAG -/A TAGATAGTGT 3070 hom 117 het 47 0 37 10 A 0 1 155881 CASAVA_Build 3 1398790 1I AATATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 12 13 155882 CASAVA_Build 3 1400325 6D CCAGTGGTAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 49 16 19 15 AAAAAC 4 3 155883 CASAVA_Build 3 1400973 1I ATTGCAGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 11 22 8 T 9 10 155884 CASAVA_Build 3 1401366 8D57M4D ATATATATAT ATATATACACACACACACACGTATACATATACATACTATATATACACACATATATATACATATATACAC/--------ACACACACACACGTATACATATACATACTATATATACACACATATATATACACATAT---- ATATATATAC 3070 het 270 hom 14 1 8 12 N/A 0 0 155885 CASAVA_Build 3 1402950 3I AAATGGTTTT ---/TTG TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 54 27 25 2 TTG 0 1 155886 CASAVA_Build 3 1403505 4I TGCCGTAGTC ----/TAAT TAATTACACC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 TAAT 1 2 155887 CASAVA_Build 3 1417801 4D AATGGAATCC TAGA/---- TAAAGAGACC 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 TAGA 1 0 155888 CASAVA_Build 3 1429941 3I AGTTTGGGAC ---/ATG ATAAGTTAGA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 ATG 0 1 155889 CASAVA_Build 3 1436078 1I ATCCAGAGTT -/A AAAAGCTCCA 3070 het 3070 ref 52 29 16 7 A 4 5 155890 CASAVA_Build 3 1437115 6I AAAGTGCCTC ------/CTCTGT CTCTGTCTCA 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 CTCTGT 1 2 155891 CASAVA_Build 3 1442970 4D TATTCATTAT TCTC/---- TCTGAGAGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 5 TC 3 1 155892 CASAVA_Build 3 1450129 1I GATATAAAAG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 6 7 155893 CASAVA_Build 3 1450314 1I CCCCATTAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 A 8 9 155894 CASAVA_Build 3 1453273 4D AAAAAAAGAC AGAG/---- AGACACAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 22 9 AG 3 1 155895 CASAVA_Build 3 1457173 1D AGCCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 21 1 16 6 A 13 12 155896 CASAVA_Build 3 1461305 3I TGGGGTTAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAC 5 6 155897 CASAVA_Build 3 1468158 1D TGAGACCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1109 hom 25 6 12 7 A 12 11 155898 CASAVA_Build 3 1468976 2D CAACTAAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 29 0 15 15 A 14 12 155899 CASAVA_Build 3 1474836 1D ACCCCCCCCC G/- CCCATGACCC 3070 het 186 hom 20 2 13 6 G 1 0 155900 CASAVA_Build 3 1477849 1I TGCTTCCAGT -/A TTTTGCGCAT 2085 het 2085 ref 16 8 6 2 A 0 1 155901 CASAVA_Build 3 1484124 6I CTATTTCGTC ------/ATTTGG AGTACTCTCA 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 ATTTGG 0 1 155902 CASAVA_Build 3 1485757 1D GATCAATGGC A/- AAATCACCGT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 4 3 155903 CASAVA_Build 3 1486336 4D TTTATGTTTT TTTC/---- TTTCTTTGTG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 TTTC 2 1 155904 CASAVA_Build 3 1489374 4D TATATTTATA TATG/---- TATGTATGTG 2549 het 2549 ref 40 18 12 11 TATG 3 2 155905 CASAVA_Build 3 1491689 5D CCAAGACCTG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 AAACA 4 3 155906 CASAVA_Build 3 1500374 1D CCACATTCAC A/- GCCCACATCC 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 A 1 0 155907 CASAVA_Build 3 1503914 3D TCTTTTTGTG TTA/--- TTATAAGCTA 3070 het 3070 hom 30 13 17 1 TTA 2 1 155908 CASAVA_Build 3 1518881 2D AAGAGATAAT TA/-- TATATATATA 1720 het 74 hom 10 1 4 5 TA 7 6 155909 CASAVA_Build 3 1527440 1I GTCTCACTGA -/G GGCCCTGTGT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 G 2 3 155910 CASAVA_Build 3 1530048 1D AGATAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 1 0 155911 CASAVA_Build 3 1530231 3D GGCTACAGAC AGT/--- AGAATAGCTC 3070 het 3070 hom 41 19 20 7 AGT 1 0 155912 CASAVA_Build 3 1531375 1D CGTGTGTGGA G/- GGGGAAAAGG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 G 5 4 155913 CASAVA_Build 3 1532728 1I ACAGAGCAGA -/T TTTTTGGCCA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 5 6 155914 CASAVA_Build 3 1538485 9D TAGAACTTTA CATTCTAAC/--------- CACACATGCT 3070 het 3070 hom 52 26 28 3 CATTCTAAC 1 0 155915 CASAVA_Build 3 1541519 1D TTAAACCTAC A/- AAGACAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 A 3 2 155916 CASAVA_Build 3 1569472 5I AAAAATATTA -----/AACAT AACATAAGAT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 AACAT 1 2 155917 CASAVA_Build 3 1577498 1D TTTCCTAAGA T/- TTTTGGAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 5 4 155918 CASAVA_Build 3 1583262 1I AAAAAAATAC -/T AATAATAATG 70 het 70 ref 13 4 1 10 T 0 1 155919 CASAVA_Build 3 1589023 2D26M2I GCTGATAAAG ACACTATGCTAACAGCAGTCAGAAAAAG--/--ACTATGCTAACAGCAGTCAGAAAAAGAA AAAAGACACA 3070 het 3070 hom 40 23 29 3 N/A 0 0 155920 CASAVA_Build 3 1591112 1D CAGGCATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 40 0 28 13 T 11 10 155921 CASAVA_Build 3 1593348 1I CTGGAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 A 8 9 155922 CASAVA_Build 3 1594587 4D63M6D GGAAAAACTG TTCCTTCTTTTCTCTCTGTATTTCTTTCTCTCCGTCTCTGTCTCTCAAAGACACACATACATGCACACACATG/----TTCTTTTCTCTCTGTATTTCTTTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCAAAGACACACATACATGCACA------ CACACACGCA 3070 hom 137 het 33 0 45 17 N/A 0 0 155923 CASAVA_Build 3 1599299 10D ATCTGTCTCA AAAATAAAAT/---------- AAAATAAAAT 2950 het 2360 hom 13 5 7 1 AAAAT 5 3 155924 CASAVA_Build 3 1603428 2D AAAAAAACAC TA/-- TTTCTATCAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 TA 1 0 155925 CASAVA_Build 3 1603871 1D TTAACTGTAT A/- AACTGATTGT 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 A 3 2 155926 CASAVA_Build 3 1605335 1I AAATTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 13 14 155927 CASAVA_Build 3 1607783 2D GGCTGAAATG AA/-- AAGACTTTAG 3070 het 3070 ref 33 15 13 7 A 4 2 155928 CASAVA_Build 3 1616023 1D TAAGCTTGGT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 8 155929 CASAVA_Build 3 1620771 1D TAAAATAGCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 9 8 155930 CASAVA_Build 3 1629319 3D TCTACATGCT ATC/--- ATCATTTATA 3070 het 3070 ref 32 19 10 6 ATC 2 1 155931 CASAVA_Build 3 1629893 6I GGAACATTAC ------/AGAACA AGAACAAGGA 3070 het 3070 hom 48 17 25 7 AGAACA 1 2 155932 CASAVA_Build 3 1630607 4D TAAACTCAGT TCTA/---- TCTAATAATA 3070 het 3070 hom 46 20 20 8 TCTA 2 1 155933 CASAVA_Build 3 1631714 1D TTTCTAGGTC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 8 7 155934 CASAVA_Build 3 1635259 16D GCAGGCAGGC AGGCAGGCAGGCAGGA/---------------- AGGAAGGAAG 2417 het 721 hom 15 6 7 3 AGGCAGGCAGGCAGGA 1 0 155935 CASAVA_Build 3 1639964 2D AGCAGGTGGT AA/-- AAAAAAAAAA 2663 hom 18 het 8 0 7 2 A 16 14 155936 CASAVA_Build 3 1640162 8I TGAAATAAAC --------/ATGAAACT ATGAAACTTA 2442 het 2442 ref 14 8 5 1 ATGAAACT 1 2 155937 CASAVA_Build 3 1640444 3D TTATTATTAA TAT/--- TATTATTATT 3063 het 2998 hom 21 9 10 3 TAT 4 3 155938 CASAVA_Build 3 1641145 3I CTTTGATGAT ---/GAA GAATGGATGA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 GAA 1 2 155939 CASAVA_Build 3 1651848 2D ACACTAAACA GC/-- CTATTCCATA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 GC 1 0 155940 CASAVA_Build 3 1652504 1D TGAGGGAGGA G/- GGGGTGAAAA 3070 hom 91 het 32 0 30 2 G 5 4 155941 CASAVA_Build 3 1654181 1D TATTCATTTA C/- CCCTTATTTA 3070 hom 81 het 31 0 26 6 C 4 3 155942 CASAVA_Build 3 1655960 1D CTCCCATAAT C/- CCCACGTGTT 3070 hom 56 het 21 0 18 5 C 4 3 155943 CASAVA_Build 3 1663090 1I TTATAGTCAC -/A AAAATCATAG 3070 hom 51 het 19 0 18 4 A 4 5 155944 CASAVA_Build 3 1679474 1I GTCACAGAGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 7 8 155945 CASAVA_Build 3 1681107 1I GATGGTGGAG -/A ACCACAGAAA 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 A 1 2 155946 CASAVA_Build 3 1681994 4I AGACAGAAAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AG 5 7 155947 CASAVA_Build 3 1692891 2D ATGGTTTATG TC/-- TCTCTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 TC 3 2 155948 CASAVA_Build 3 1695181 5I AAAGAACTGA -----/TAAGT TAAGTGATCA 3070 hom 90 het 39 0 30 9 TAAGT 1 2 155949 CASAVA_Build 3 1696860 1D AGCCCCTGCT A/- ATTCAGGTCA 3070 hom 66 het 23 0 22 2 A 2 1 155950 CASAVA_Build 3 1706896 5D ACTGCAACAA AGACT/----- AGACTAGACC 3070 hom 117 het 48 0 40 10 AGACT 2 1 155951 CASAVA_Build 3 1714757 1D TTTGCTCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 11 10 155952 CASAVA_Build 3 1720115 1D AATCACACTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 15 14 7 A 9 8 155953 CASAVA_Build 3 1721186 2D TTGTTTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 33 5 16 13 T 14 12 155954 CASAVA_Build 3 1730309 1I ATTTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3006 het 2558 hom 25 10 9 6 A 13 14 155955 CASAVA_Build 3 1731004 4I TAATTTTATA ----/TTTG TTTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 TTTG 0 1 155956 CASAVA_Build 3 1733359 1D GGCAGAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 24 24 4 A 11 10 155957 CASAVA_Build 3 1741998 5D AATTTCATAG CTTTC/----- CTTTGTCAGT 3070 het 3070 ref 43 23 18 3 CTTTC 1 0 155958 CASAVA_Build 3 1754558 7D TTTTTTTGTG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 2407 hom 26 11 11 5 T 18 11 155959 CASAVA_Build 3 1758806 1D AGATAGTGTC T/- TTTACAAATA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 4 3 155960 CASAVA_Build 3 1775406 1I ACAGGAGGAA -/C AAGCAAAGGT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 C 0 1 155961 CASAVA_Build 3 1777999 5D ATAGGAAGAG AAGAA/----- GTCAAAATAT 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 AAGAA 1 0 155962 CASAVA_Build 3 1795132 3D ACATGTCAAT ATA/--- ATGAGTCTTC 3070 het 3070 hom 30 11 18 4 ATA 1 0 155963 CASAVA_Build 3 1796817 6D ATTTTGGACT TAAATA/------ TAATGGTTTA 3070 het 3070 hom 37 18 19 2 TAAATA 1 0 155964 CASAVA_Build 3 1799258 1I ATTTTCCATC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 66 28 23 15 T 7 8 155965 CASAVA_Build 3 1802423 4I TTCTATCACT ----/AACA AACAGAGGAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AACA 1 2 155966 CASAVA_Build 3 1803289 4D CATGTATTTC TTTG/---- TTTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 14 15 5 TTTG 2 1 155967 CASAVA_Build 3 1807375 1D11M1D8M1D CAGCCACGGA GGGGTAAAAGAAGGGCCAGATG/-GGGTAAAAGAA-GGCCAGAT- GTTTTCTTTA 3070 hom 75 het 30 0 27 6 N/A 0 0 155968 CASAVA_Build 3 1823235 1D GTGTGGCACC A/- AGCACTCCCC 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 A 2 1 155969 CASAVA_Build 3 1823863 2D GCCTCCTCCC AA/-- GTTACACCTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 2 0 155970 CASAVA_Build 3 1824258 5I AAAATGAAAG -----/AGGAA AGGAAAGGAA 3070 het 3070 hom 36 13 23 0 AGGAA 2 3 155971 CASAVA_Build 3 1825358 1I GAGAGAAATG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 A 8 9 155972 CASAVA_Build 3 1827022 1I TCTACGTGAG -/T TTGGGGAAAC 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 T 2 3 155973 CASAVA_Build 3 1827537 1D CAAAGATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 T 12 11 155974 CASAVA_Build 3 1840020 1I AAATTTTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 10 11 155975 CASAVA_Build 3 1850021 12I TTGGGTTTAA ------------/TTAGAGTGTTTT TTAGAGTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTAGAGTGTTTT 0 1 155976 CASAVA_Build 3 1854790 1D TGTTTGTACA T/- TTTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 T 6 5 155977 CASAVA_Build 3 1860825 1I GTATTTCGTC -/A AAAAAAAATT 3003 het 3003 ref 28 16 8 4 A 8 9 155978 CASAVA_Build 3 1861315 1D AATTTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 708 hom 27 2 16 9 T 15 14 155979 CASAVA_Build 3 1866665 5D TTTTCTTCTT TTTTC/----- TTTTATTATA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 TTTTC 1 0 155980 CASAVA_Build 3 1870036 1D TGCTTTTTTT A/- AAAAGTTATG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 5 4 155981 CASAVA_Build 3 1872103 1D CAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 53 hom 37 1 33 3 A 10 9 155982 CASAVA_Build 3 1872427 1D ATGAAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 21 17 6 T 11 10 155983 CASAVA_Build 3 1873904 1I AGAGGAAAAC -/T TTGGTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 T 2 3 155984 CASAVA_Build 3 1874294 6D TTATGTCTAG TAAATA/------ TAAAATAAGA 3070 het 1407 hom 19 5 14 2 TAAATA 1 0 155985 CASAVA_Build 3 1874356 4D AATTTGATAT GATA/---- AATATCAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 12 3 GATA 1 0 155986 CASAVA_Build 3 1875072 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1742 hom 26 6 14 8 T 12 11 155987 CASAVA_Build 3 1876796 4D AACACAAGAA AATT/---- AATTCTCAGA 3070 het 3070 ref 39 20 16 6 AATT 2 1 155988 CASAVA_Build 3 1883237 1D AGGTTTCAGA C/- TTTTGCTTGT 3070 het 3070 hom 45 14 23 9 C 1 0 155989 CASAVA_Build 3 1883626 3D TTTAAATTTG TCT/--- TCTTCTTAAA 3070 het 3070 hom 37 12 16 10 TCT 3 2 155990 CASAVA_Build 3 1884502 2D TGGTGAAACC CT/-- GTCTCTACTA 3070 het 1736 hom 15 6 9 0 CT 1 0 155991 CASAVA_Build 3 1886089 1I TAGAGAAATG -/A AAAATCAGAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 A 4 5 155992 CASAVA_Build 3 1889449 2D ACAACCTAAC AT/-- GTGTGATTGG 3070 het 3070 ref 46 25 12 9 AT 1 0 155993 CASAVA_Build 3 1896293 4D TTGTATTTTT TTTC/---- TATAGAGATG 3070 hom 57 het 23 0 20 4 TTTC 1 0 155994 CASAVA_Build 3 1910067 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1878 het 998 hom 21 3 10 8 A 15 16 155995 CASAVA_Build 3 1912598 1I AGCATTTGGG -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 A 7 8 155996 CASAVA_Build 3 1915278 14I AGAAGAATCA --------------/GGGGGAGAGACTTC GGGAGGAAAG 2912 het 2912 ref 33 25 7 1 GGGGGAGAGACTTC 0 1 155997 CASAVA_Build 3 1918101 1D TAAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1393 het 1393 ref 27 23 3 1 T 12 11 155998 CASAVA_Build 3 1935597 1I ATGAGGTGTC -/T TCTCAGCCCC 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 1 2 155999 CASAVA_Build 3 1952414 4D GATTAACAAA ATAG/---- ATAGACCACT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 ATAG 2 1 156000 CASAVA_Build 3 1966978 1I GCTGTTAATA -/T TATCACATTG 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 1 2 156001 CASAVA_Build 3 1978062 2I TGCCACTGTG --/TT TTTTTGCATG 3070 hom 139 het 54 0 44 10 T 5 7 156002 CASAVA_Build 3 1979905 1D ACTGTGCTAA T/- TTTTTTCACA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 7 6 156003 CASAVA_Build 3 1991205 1D ATCGGAGCAG A/- AAAAATGAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 5 156004 CASAVA_Build 3 1991372 1D AAAACTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 44 0 37 7 A 12 11 156005 CASAVA_Build 3 1996307 1I TTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 2961 het 1146 hom 10 3 7 0 A 5 6 156006 CASAVA_Build 3 1996556 1D AGGGGGACAC A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 7 6 156007 CASAVA_Build 3 1998903 8D GAGAACAAAA AGGGGAGT/-------- AGGGGAGAAG 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 AGGGGAGT 1 0 156008 CASAVA_Build 3 1999998 4D ACATGTGAAG GAGA/---- GAGAGTGAGT 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 GA 4 2 156009 CASAVA_Build 3 2003369 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 705 hom 7 het 3 0 3 0 A 5 6 156010 CASAVA_Build 3 2004523 4D TTACTGAGAT TAAG/---- TTTTTCTACC 3070 het 3070 ref 36 19 14 6 TAAG 1 0 156011 CASAVA_Build 3 2005266 1I AACCAGGTTG -/C GTTTTTTTTT 3070 het 776 hom 42 4 35 3 C 0 1 156012 CASAVA_Build 3 2009614 1I TCAAAAATCA -/G GAAACTTGTC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 156013 CASAVA_Build 3 2010245 1I CCAAGAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 36 0 26 10 A 10 11 156014 CASAVA_Build 3 2012596 1I TTAAATATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 10 11 156015 CASAVA_Build 3 2014121 1D ATCTCACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 47 0 35 12 T 11 10 156016 CASAVA_Build 3 2022797 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 C 0 1 156017 CASAVA_Build 3 2031303 1D ATACAGAATT A/- AAAAAAAAAA 881 het 881 ref 32 24 3 5 A 11 10 156018 CASAVA_Build 3 2043476 4D AAATAATCAA AATT/---- AATCATTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 19 4 AATT 1 0 156019 CASAVA_Build 3 2057320 1I GGAAGAATTA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 T 6 7 156020 CASAVA_Build 3 2058833 1I GCATGTGCTA -/T TTTGATACAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 3 4 156021 CASAVA_Build 3 2066229 4I AATTATGAAT ----/TTTA GTAAAATTAG 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 TTTA 0 1 156022 CASAVA_Build 3 2067169 1D TGGAGTGAGT A/- AAACATCTAT 3070 het 3070 hom 56 20 33 3 A 4 3 156023 CASAVA_Build 3 2074398 1D GCAATGTTTA T/- CAAGTAAGAC 3070 hom 99 het 37 0 33 5 T 1 0 156024 CASAVA_Build 3 2082215 4I AAGTCTTTCT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 48 25 11 12 TTTG 3 4 156025 CASAVA_Build 3 2084817 1I AATGGTTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 11 12 156026 CASAVA_Build 3 2089270 1I GACATCTGCT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 A 7 8 156027 CASAVA_Build 3 2089895 1I GAAATATGGC -/T TTGGAGCTTC 3070 hom 100 het 38 0 33 5 T 2 3 156028 CASAVA_Build 3 2105321 5I AAGAATATAA -----/TAAAG TAACTTGGAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TAAAG 0 1 156029 CASAVA_Build 3 2108562 1I CCTCCACTTA -/T GCTTGTTTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 1 156030 CASAVA_Build 3 2110682 5I AGAGAACTGA -----/TTGAG TTATCTGTAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTGAG 0 1 156031 CASAVA_Build 3 2118236 1I TACACACTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 8 9 156032 CASAVA_Build 3 2120405 4D ATTTTTTATT TATC/---- TATTTATTTA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 TATC 1 0 156033 CASAVA_Build 3 2127424 3I CTTTTTTTTG ---/GTT GTTGTTGTTG 3070 hom 91 het 41 0 25 16 GTT 3 4 156034 CASAVA_Build 3 2130358 2D AATGATGATC AG/-- AGTCTATATA 3070 hom 120 het 46 0 41 7 AG 2 1 156035 CASAVA_Build 3 2136473 3D TAGAAAAGAA AAG/--- AAGTGGATAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 AAG 2 1 156036 CASAVA_Build 3 2138839 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1052 het 504 hom 7 2 3 2 A 15 16 156037 CASAVA_Build 3 2144322 12D ATGCCCCACA ACCCCACCCATT/------------ ACAGAAGGAT 3070 het 3070 hom 30 14 16 3 ACCCCACCCATT 1 0 156038 CASAVA_Build 3 2150445 4D TGTTAGGAAA TTAC/---- TTGTATGCCT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 TTAC 1 0 156039 CASAVA_Build 3 2162499 3I TGTTATTATT ---/ATC ATTCCCACTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 ATC 0 1 156040 CASAVA_Build 3 2162632 2I TCATTCTTAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 12 14 156041 CASAVA_Build 3 2162780 6I CATTATTTCA ------/ATTTAT ATTTATTTTA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 ATTTAT 1 2 156042 CASAVA_Build 3 2162909 2I TTTAATTGAC --/TG TTCTATTAAT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 TG 0 1 156043 CASAVA_Build 3 2165514 2D AGAGACAAGC AA/-- AAGTCAAGGA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 4 2 156044 CASAVA_Build 3 2191956 1I TGACCTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 10 11 156045 CASAVA_Build 3 2195137 1D TGTGATTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 A 10 9 156046 CASAVA_Build 3 2199151 2D ATTCCAAGTT AA/-- GTCTTTTCAT 3070 het 3070 hom 39 13 26 2 A 2 0 156047 CASAVA_Build 3 2199890 1D CTTATACATG A/- TATGACAGCC 3070 hom 57 het 25 0 20 6 A 1 0 156048 CASAVA_Build 3 2206393 1I37M1D AAAAATACGA -TTTCCATAGAACTCTGTGTCCATTCCTATGTTATTCAT/CTTTCCATAGAACTCTGTGTCCATTCCTATGTTATTCA- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 40 13 15 19 N/A 0 0 156049 CASAVA_Build 3 2207940 1D TTAATGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 12 11 156050 CASAVA_Build 3 2216060 1D TGATTGTGAG T/- TTTTCTACTG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 5 4 156051 CASAVA_Build 3 2223562 1D CAGATACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1475 hom 30 7 15 8 T 16 15 156052 CASAVA_Build 3 2244740 5I CTAACAGAAT -----/TTAAG TTAAGTAAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTAAG 1 2 156053 CASAVA_Build 3 2244924 1D TCTCTTCTTC T/- TTTTTGTGTT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 6 5 156054 CASAVA_Build 3 2249801 1I TTTTTAAACT -/A AATGGGGGTC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 A 2 3 156055 CASAVA_Build 3 2265838 2D AATAAATTAT AA/-- AAAAACATTG 3070 hom 108 het 38 0 37 2 A 7 5 156056 CASAVA_Build 3 2270560 1D TGCTTTCTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 9 8 156057 CASAVA_Build 3 2281891 1I CTTTTTATGG -/T TTAAGTAGTA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 2 3 156058 CASAVA_Build 3 2282450 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTGT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 0 1 156059 CASAVA_Build 3 2288852 1D AAATTACAAG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 7 156060 CASAVA_Build 3 2289501 1I AGCCTTTTTT -/G TTTTTATTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 156061 CASAVA_Build 3 2291204 1I CCTTATTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 417 hom 33 1 28 4 T 9 10 156062 CASAVA_Build 3 2291579 4I GGATCATATC ----/CTAA CTGAGTACTG 3070 hom 154 het 58 0 52 6 CTAA 0 1 156063 CASAVA_Build 3 2306666 1D GTATTTAGTA T/- TTTTTAGATT 3070 het 3070 hom 45 20 19 7 T 6 5 156064 CASAVA_Build 3 2315703 2I TTCACCTGTC --/AG GGGGGGTTTT 3070 hom 131 het 50 0 43 7 AG 0 1 156065 CASAVA_Build 3 2319546 3I ACACTGTATG ---/TGC TGCTTCATTA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 TGC 1 2 156066 CASAVA_Build 3 2323585 1I AAATTTTTTT -/A ATTTCATGTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 1 2 156067 CASAVA_Build 3 2324298 1I TCCTTGAGTG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 7 8 156068 CASAVA_Build 3 2336284 2I TGAAAAGTAA --/AT ATGTTTCCTC 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 AT 1 2 156069 CASAVA_Build 3 2340972 3I AAATAACTGG ---/ACA ATGTGTCTGC 3070 het 3070 hom 57 26 26 5 ACA 0 1 156070 CASAVA_Build 3 2342737 1D TTTGATCACA T/- TATTAGTCTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 T 2 1 156071 CASAVA_Build 3 2346420 1I TATTGAGGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 9 10 156072 CASAVA_Build 3 2347302 1I AAGGGAGGCA -/T TTTATAAGAC 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 T 3 4 156073 CASAVA_Build 3 2350593 2I ACTACCTGTG --/AA AAGGAAGTAG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 2 4 156074 CASAVA_Build 3 2351254 1D TGCAGCAAAT A/- ACGTGGTAAA 3070 het 3070 ref 39 16 16 8 A 2 1 156075 CASAVA_Build 3 2352005 4I ATTATAATGA ----/TAGC TAGCATTTAT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 TAGC 1 2 156076 CASAVA_Build 3 2367261 6D AAAGAAAAAA ATAGAG/------ TAGAATTCTA 3070 het 3070 ref 36 22 14 1 ATAGAG 1 0 156077 CASAVA_Build 3 2377942 1D CACTGAGCAC A/- AGGAATATTT 3070 het 3070 ref 53 22 23 8 A 2 1 156078 CASAVA_Build 3 2379646 1I TTACAGACTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 T 8 9 156079 CASAVA_Build 3 2384883 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1273 hom 7 het 4 0 3 1 T 7 6 156080 CASAVA_Build 3 2388151 4D TATCCTTGCA TCTG/---- TCTGTCTCAG 3070 hom 66 het 29 0 23 8 TCTG 2 1 156081 CASAVA_Build 3 2397129 1D CTATTTTACC T/- TTATATAGCT 3070 het 3070 hom 56 22 30 4 T 3 2 156082 CASAVA_Build 3 2409945 1I GCACACCCTA -/G TGACCATATC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 G 0 1 156083 CASAVA_Build 3 2410852 1D AAGGAAGTTG T/- TTTTTTTTTA 1254 het 1254 ref 35 25 3 7 T 10 9 156084 CASAVA_Build 3 2440165 1D TGAAAACTTG T/- TTTTTTTTTT 1488 het 1488 ref 37 19 6 12 T 16 15 156085 CASAVA_Build 3 2440644 1I GTTTTTTTTG -/C ATTAGGCAAC 3070 hom 47 het 22 0 19 3 C 0 1 156086 CASAVA_Build 3 2457551 8D TATATCTAAC ATATATGT/-------- ATATATGTAT 842 het 336 hom 6 2 3 1 ATATATGT 2 1 156087 CASAVA_Build 3 2459278 1I CACACACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 10 11 156088 CASAVA_Build 3 2460893 3D GTATTCTAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1684 hom 34 9 17 10 A 17 14 156089 CASAVA_Build 3 2462081 1D ATTTTTAATT C/- TTTGATAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 C 1 0 156090 CASAVA_Build 3 2463038 4I CCATGCCACA ----/CTGG TGCAAAGATA 3070 het 3070 hom 48 21 26 1 CTGG 0 1 156091 CASAVA_Build 3 2468133 1D GGGAGGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2854 het 2854 ref 19 9 7 3 A 13 12 156092 CASAVA_Build 3 2477585 1I GTGAGAGTTC -/T TCATGTAGCT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 1 2 156093 CASAVA_Build 3 2495172 1D CATAGGTAAA C/- ATGTGCCATG 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 C 1 0 156094 CASAVA_Build 3 2496823 1I AAGAATATCT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 A 8 9 156095 CASAVA_Build 3 2506842 8D GGAAAAAAGA AAACAAGC/-------- AAACAAGCAA 3070 hom 85 het 32 0 29 4 AAACAAGC 2 1 156096 CASAVA_Build 3 2507209 1D AAAGTTGTTC A/- AAAATGCATG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 5 4 156097 CASAVA_Build 3 2515194 1D AGGATCTCGC T/- TTGTCACCCA 3070 het 3070 hom 42 16 18 9 T 3 2 156098 CASAVA_Build 3 2522700 1D AGACACTCGC T/- TTTTTTTTTC 1752 het 1752 ref 39 28 4 8 T 10 9 156099 CASAVA_Build 3 2527060 1D TTGTTTGGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 9 8 156100 CASAVA_Build 3 2538028 6I CTCTACCCAT ------/CGCCCA CCCCCCCACC 1516 het 1516 ref 21 12 6 3 CGCCCA 0 1 156101 CASAVA_Build 3 2550185 2D CCATAGGGTG TA/-- TATGTACCAC 1397 het 1397 ref 9 6 3 0 TA 2 1 156102 CASAVA_Build 3 2583323 1D CAAGTTTAAA T/- AAACGATGAT 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 T 1 0 156103 CASAVA_Build 3 2587743 1D CTGTATTTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 9 8 156104 CASAVA_Build 3 2593236 1D TGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2522 het 130 hom 25 2 7 16 T 14 13 156105 CASAVA_Build 3 2596220 1D CATGGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 15 9 T 11 10 156106 CASAVA_Build 3 2599588 2D GTTCTGATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 662 hom 35 3 14 19 A 14 12 156107 CASAVA_Build 3 2610915 1D GAGAAACTGG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 T 9 8 156108 CASAVA_Build 3 2611342 2I CTGACCTCAG --/GT AATCGGCCAG 3070 hom 60 het 25 0 18 7 GT 0 1 156109 CASAVA_Build 3 2611459 4D TGTGTATGTG TGTT/---- TGTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 42 18 22 5 TGTT 2 1 156110 CASAVA_Build 3 2613272 1I ACATTTTGTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 8 9 156111 CASAVA_Build 3 2616782 1I ACATTCAGTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 T 7 8 156112 CASAVA_Build 3 2619800 1D ATTTTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 2017 het 2017 ref 23 12 6 5 A 11 10 156113 CASAVA_Build 3 2625390 1D TGATCTCGAA C/- TCCTGACCTC 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 C 1 0 156114 CASAVA_Build 3 2628697 2I AAATATTCTC --/AG AGGTGGTAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 AG 1 2 156115 CASAVA_Build 3 2628792 18D TACATATAAT ACACACACACACACACAC/------------------ ACACACACAC 3070 het 1331 hom 23 7 17 4 AC 16 7 156116 CASAVA_Build 3 2629860 1D CTAAGCACAC G/- TGGAGACTCC 3070 het 3070 hom 54 23 23 10 G 1 0 156117 CASAVA_Build 3 2632265 1D ATTTCACTCT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 9 8 156118 CASAVA_Build 3 2634927 2I TTAAATGTGG --/TT GTATATATAT 3070 het 3070 hom 46 23 17 6 T 0 2 156119 CASAVA_Build 3 2636698 3D TATGTACCCA AGT/--- AGTAGTAATA 3070 hom 108 het 41 0 37 7 AGT 3 2 156120 CASAVA_Build 3 2637845 1I ACGTTAAGCA -/G CCCCCTGTTC 3070 het 3070 ref 53 35 13 5 G 0 1 156121 CASAVA_Build 3 2639916 1I TGGAGACTAA -/T TTTTTTTTTT 2638 het 2638 ref 31 11 9 11 T 13 14 156122 CASAVA_Build 3 2640468 2D AGAACAGAGC AG/-- AGTGTCCCCT 3070 het 3070 hom 46 21 20 7 AG 2 1 156123 CASAVA_Build 3 2715708 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2885 het 2885 ref 26 14 7 5 A 12 11 156124 CASAVA_Build 3 2717338 1I TTCCCCTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 32 2 21 9 A 11 12 156125 CASAVA_Build 3 2724335 1I GTTTTATTTG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 T 6 7 156126 CASAVA_Build 3 2725412 22D ACGCGCGCAT CACACACACACACACACACACA/---------------------- CACACACACA 3070 het 3014 hom 31 11 17 7 CA 20 9 156127 CASAVA_Build 3 2734480 3I CACTCCAATA ---/ATT CTTGCCATCA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 ATT 0 1 156128 CASAVA_Build 3 2734920 1D ACATTTTCTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 G 2 1 156129 CASAVA_Build 3 2735964 1D AAACAAGGTT C/- ATAAGGACAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 C 1 0 156130 CASAVA_Build 3 2757348 5I TGAAAAACTT -----/TAGTC TAACAACTAC 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 TAGTC 0 1 156131 CASAVA_Build 3 2759241 24D GATTTTGCTA CAGCGAATCCTATAGATACCCTCC/------------------------ CAGCAAAGCC 3070 het 3070 ref 39 26 15 13 CAGCGAATCCTATAGATACCCTCC 1 0 156132 CASAVA_Build 3 2767832 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2273 het 762 hom 10 4 6 0 A 11 10 156133 CASAVA_Build 3 2786700 4D TCTGTCTCTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 16 hom 37 1 20 16 TTTG 5 4 156134 CASAVA_Build 3 2795100 1D CCACTCATGA T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 6 5 156135 CASAVA_Build 3 2814751 8I TTTTTTAATC --------/CCTCCCAT CCTCCCACCC 3070 hom 17 het 23 0 13 10 CCTCCCAT 0 1 156136 CASAVA_Build 3 2814976 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATATATA 2884 het 383 hom 16 5 9 3 TGTA 1 0 156137 CASAVA_Build 3 2824405 1D TTTAATGAGT C/- CAGCAATCCC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 C 2 1 156138 CASAVA_Build 3 2824902 1D ACTGTGGTCC T/- TATGTCTCCA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 2 1 156139 CASAVA_Build 3 2828493 1I TGGGACTACA -/G GCACATGTCA 3070 het 3070 hom 27 13 14 1 G 1 2 156140 CASAVA_Build 3 2850144 7D TGTAATCAAT GTAATTG/------- GTAAAGACAG 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 GTAATTG 1 0 156141 CASAVA_Build 3 2850318 1D AATAATTAAA G/- AAGAAAGGAT 1830 het 1830 ref 22 10 5 7 G 1 0 156142 CASAVA_Build 3 2863851 1I CAAATGTTGC -/A AAAAAAAAAA 2736 het 2736 ref 27 15 7 5 A 12 13 156143 CASAVA_Build 3 2870490 5D TCTGATTGGC TGATT/----- TAAGTCATGT 3070 het 3070 hom 45 15 27 4 TGATT 1 0 156144 CASAVA_Build 3 2871124 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 1398 het 943 hom 9 3 4 2 T 5 6 156145 CASAVA_Build 3 2880450 1D TTCAAGGACA T/- TGGCATGACA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 T 2 1 156146 CASAVA_Build 3 2881563 2D TAAAACTCTC TT/-- ATAAATAATT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 2 0 156147 CASAVA_Build 3 2888817 2D CACAGATCTC AA/-- AGAGTTATCC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 3 1 156148 CASAVA_Build 3 2893125 1I AAGTCAATGT -/G GGAACTTTTC 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 G 2 3 156149 CASAVA_Build 3 2923529 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 2263 het 1778 hom 16 6 5 6 A 15 14 156150 CASAVA_Build 3 2927886 1D GAACAAAGTC T/- TATCAACATG 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 T 2 1 156151 CASAVA_Build 3 2931528 2I TACAGACCAT --/AA AACCCTGATG 3070 het 3070 ref 56 30 25 1 A 2 4 156152 CASAVA_Build 3 2931759 1I ATACCATGTC -/T TTTTTTGTTT 3070 het 2820 hom 37 9 22 6 T 6 7 156153 CASAVA_Build 3 2937502 2I TCATAATAAC --/TT GCCCAAAGGA 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 T 0 2 156154 CASAVA_Build 3 2941626 1D CTACACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 11 10 156155 CASAVA_Build 3 2943465 1I GTATTCATAC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 50 15 25 10 T 7 8 156156 CASAVA_Build 3 2951674 1I TAAAATAGTT -/A ACGGCGTTGA 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 A 1 2 156157 CASAVA_Build 3 2957424 3I TTAAGGGTAA ---/AAG AAGGAGTTGA 3070 het 3070 ref 52 28 24 0 AAG 1 2 156158 CASAVA_Build 3 2959893 1D TTCCTGTCCA C/- AAAGTCAACA 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 C 1 0 156159 CASAVA_Build 3 2960840 1D TTTTGGGGGG T/- TTTTTTTTTG 1756 het 1756 ref 26 20 4 2 T 10 9 156160 CASAVA_Build 3 2974468 1I TCTTTTATAT -/G GCCGCATAGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 1 2 156161 CASAVA_Build 3 3000906 1I GCAGGAAGCA -/G GGATGGAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 2 3 156162 CASAVA_Build 3 3022426 1I CCATTCATGA -/G GGGATCTACC 3070 hom 63 het 24 0 20 4 G 3 4 156163 CASAVA_Build 3 3056435 1I ATGTCCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 12 12 T 11 12 156164 CASAVA_Build 3 3064916 1I AATATTCAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 8 9 156165 CASAVA_Build 3 3066527 1D ACCAACTGCA G/- AGTTTGTGAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 G 1 0 156166 CASAVA_Build 3 3070956 1I32M1D TCTATTGTAG -CCCCAGAATTACAGTTTAGAAAGTGAAAAGCAT/CCCCCAGAATTACAGTTTAGAAAGTGAAAAGCA- TGACTCAGTC 3070 hom 169 het 43 0 57 3 N/A 0 0 156167 CASAVA_Build 3 3071947 4I GATTGGGGCT ----/TATC TATCTCGCTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TATC 1 2 156168 CASAVA_Build 3 3076969 5D CGCAAAGAAT GTTGA/----- GTTATAAAAA 3070 het 3070 ref 50 23 21 8 GTTGA 1 0 156169 CASAVA_Build 3 3081001 4D TGCTTTTCTT AAAA/---- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 21 4 A 8 4 156170 CASAVA_Build 3 3093006 2D AGGGCTGCAT TG/-- TGTGCTCTGT 3070 het 3070 hom 37 17 19 3 TG 3 2 156171 CASAVA_Build 3 3098757 1D TTATTTATGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 9 8 156172 CASAVA_Build 3 3103357 1I CATCTCTTAA -/G AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 G 0 1 156173 CASAVA_Build 3 3111399 14D TTATTTTAGT TTTTTGTTTTTTTG/-------------- TTTTTGTTTT 2713 het 2713 ref 22 7 7 8 TTTTTGTTTTTTTG 1 0 156174 CASAVA_Build 3 3112156 1I AGATCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 209 hom 31 1 23 7 T 10 11 156175 CASAVA_Build 3 3117046 1I TTGCACAGAC -/A AAAAAGAAGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 5 6 156176 CASAVA_Build 3 3120476 1D ATTCGTTATG T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 7 6 156177 CASAVA_Build 3 3122144 3I AAAAGAAATA ---/AAC AACATTACCT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 AAC 1 2 156178 CASAVA_Build 3 3123572 2D AAAGTAAAAC TA/-- TGTTATAAAT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 TA 1 0 156179 CASAVA_Build 3 3123934 1D AAGAATGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 32 1 14 17 T 13 12 156180 CASAVA_Build 3 3128967 3I GAACTCCTGA ---/CCT CAGGTGATCC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CCT 0 1 156181 CASAVA_Build 3 3134604 1D GATCTTAAAC T/- TTAGTTGCCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 3 2 156182 CASAVA_Build 3 3141851 4I CTCAAAAAAA ----/AAAG AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 21 1 19 2 AAAG 0 1 156183 CASAVA_Build 3 3145461 3I TACTGAAACA ---/GTT GTTATGGAGG 1965 hom 35 het 14 0 8 6 GTT 1 2 156184 CASAVA_Build 3 3146714 7I TAGCTAAGTG -------/CCTGACT CCAGTAGCTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 CCTGACT 0 1 156185 CASAVA_Build 3 3153343 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2701 hom 30 13 15 2 T 14 13 156186 CASAVA_Build 3 3156980 1I CATGATGGAT -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 156187 CASAVA_Build 3 3157995 2D GCACACACAC AT/-- GGTACATGTA 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 AT 1 0 156188 CASAVA_Build 3 3160387 1D CTTGCCGAAA C/- CCTGTCTCTA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 C 3 2 156189 CASAVA_Build 3 3161984 1I GTCAGGAGAT -/C GAGACCATGC 3070 hom 33 het 15 0 12 5 C 0 1 156190 CASAVA_Build 3 3165655 19I TATATTCTCT -------------------/AAAGATTTATTCTCTAAAG AAAGATTTGA 3070 het 199 hom 26 1 14 11 AAAGATTTATTCTCTAAAG 0 1 156191 CASAVA_Build 3 3166132 4I ATCAGAAAAT ----/TTTA TTTATTTGCT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 TTTA 1 2 156192 CASAVA_Build 3 3167525 4I ATTTGTTAGA ----/TAAC TAACTTTATC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 TAAC 1 2 156193 CASAVA_Build 3 3168187 8I TAAATATTTA --------/AAAACTAC TATTCTAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 AAAACTAC 0 1 156194 CASAVA_Build 3 3169108 1I GTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 10 11 156195 CASAVA_Build 3 3171064 4D ATAAACAGAT AAAG/---- AGAGTATCTA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 AAAG 1 0 156196 CASAVA_Build 3 3171274 1D AAAATACTCA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 78 het 34 0 27 8 T 8 7 156197 CASAVA_Build 3 3172495 1I TTGTGATACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 9 10 156198 CASAVA_Build 3 3180140 1I GTGGCAACCC -/A AGTTGCATGG 3070 het 3070 hom 47 15 26 6 A 1 2 156199 CASAVA_Build 3 3182849 2D CAATTCCCAC AT/-- GTCATGGGAG 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 AT 1 0 156200 CASAVA_Build 3 3183620 1D TTTCCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1913 hom 22 7 10 5 A 11 10 156201 CASAVA_Build 3 3186159 3I ACTACTCTAA ---/TAG TAGGAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TAG 1 2 156202 CASAVA_Build 3 3186581 1I TGTTTTTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 38 0 29 9 A 9 10 156203 CASAVA_Build 3 3191369 4D ACAAACACTT AATA/---- AACGTGGTAT 2916 het 2916 ref 26 16 6 5 AATA 1 0 156204 CASAVA_Build 3 3192129 1D TCAGTAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 19 0 13 6 T 12 11 156205 CASAVA_Build 3 3196574 6I CCGGGGACAG ------/AACGCC AACGCCGTCC 3070 het 1430 hom 25 7 10 8 AACGCC 1 2 156206 CASAVA_Build 3 3207269 9D ATCCCAGCAC TTCCAGCAA/--------- TTCGGGAGAG 3070 het 3070 ref 56 45 8 7 TTCCAGCAA 1 0 156207 CASAVA_Build 3 3207366 1D CTATTAAAAA T/- AAATTAGCCA 3070 het 3070 ref 48 31 15 2 T 1 0 156208 CASAVA_Build 3 3211599 4I TTTCTGCTTA ----/GTTG GTTATTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 GTTG 0 1 156209 CASAVA_Build 3 3215740 3D CAGGGCTCCT CTG/--- CTGCACCTCA 3070 hom 98 het 36 0 31 6 CTG 2 1 156210 CASAVA_Build 3 3217273 2D ATTCCAGTGA GT/-- GTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 GT 2 1 156211 CASAVA_Build 3 3227071 1I CCCATATCTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 42 15 26 1 A 7 8 156212 CASAVA_Build 3 3235170 1D CCAACACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 T 11 10 156213 CASAVA_Build 3 3241127 22D TACATATATA TACCTATATGTGTACCTATATG/---------------------- TGTACACATA 2300 het 2300 ref 21 15 6 1 TACCTATATGTGTACCTATATG 1 0 156214 CASAVA_Build 3 3243239 1I GTTTGTGAAT -/A GGGGCTAATT 3070 het 3070 ref 49 28 19 2 A 0 1 156215 CASAVA_Build 3 3243370 4I CTTCTCTGCT ----/TGAG TGAGTGTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TGAG 1 2 156216 CASAVA_Build 3 3244755 1D GCCCCTCCTG T/- TTGAGTACTG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 3 2 156217 CASAVA_Build 3 3245639 1D TCTTTTCAGG T/- TTTTTACATG 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 6 5 156218 CASAVA_Build 3 3257638 1D GCGATGTGAA G/- GGGGTTAGGA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 5 4 156219 CASAVA_Build 3 3272078 1I ATGCATCATG -/A AAAAAAGCCA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 6 7 156220 CASAVA_Build 3 3274063 2D TTTCAACTGT TA/-- TTTGGATTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TA 1 0 156221 CASAVA_Build 3 3275222 1I CTGGTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 11 18 12 T 10 11 156222 CASAVA_Build 3 3285214 1D TATACACTCC A/- ATAATGCATT 3070 het 3070 hom 52 21 26 7 A 2 1 156223 CASAVA_Build 3 3285615 1I AAATAATGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 8 9 156224 CASAVA_Build 3 3287522 3D AAAAAAAAAG GAA/--- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 GAA 1 0 156225 CASAVA_Build 3 3310682 1D GAGACACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 23 4 A 11 10 156226 CASAVA_Build 3 3339712 1D GGGTTAAGTG T/- TTGTATTAAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 3 2 156227 CASAVA_Build 3 3359069 4I TTCCTATAAA ----/AAGG AAGGATAAAT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 AAGG 1 2 156228 CASAVA_Build 3 3359804 4D GGTATAGAGT TTCA/---- GTTTCAGTTT 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 TTCA 1 0 156229 CASAVA_Build 3 3363933 1D TTGAGTCAGT G/- GACTGGGAGA 2430 het 2430 ref 31 14 8 9 G 2 1 156230 CASAVA_Build 3 3365451 1D AATAAGCACT A/- ACCTAAGTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 2 1 156231 CASAVA_Build 3 3367238 5I TTTCTTTTTC -----/ATTTT ATTTACAGTG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 ATTTT 0 1 156232 CASAVA_Build 3 3367686 1D10M8D CTAATAGAAT GGTTTATGACCATAATTTT/-GTTTAGCAAC-------- ATCTCCTCTT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 N/A 0 0 156233 CASAVA_Build 3 3372179 1D TGCTGTTTAG A/- AACCACTCAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 A 3 2 156234 CASAVA_Build 3 3375814 1I CATTCAAATA -/T CGTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 0 1 156235 CASAVA_Build 3 3376711 1D TATGCAAACC T/- TTTTTTTTTT 2591 het 2591 ref 29 18 8 3 T 11 10 156236 CASAVA_Build 3 3383134 1D GCTTAGGAGT G/- GGAGATATGA 3070 het 3070 ref 53 32 13 8 G 3 2 156237 CASAVA_Build 3 3392568 1I25M1D ATGTGGGGGG -AAAAAAACCCTTGACCTCTAGCCCAT/AAAAAAAACCCTTGACCTCTAGCCCA- TATCATACAC 3070 het 512 hom 46 4 22 25 N/A 0 0 156238 CASAVA_Build 3 3392875 1I ACAAAGTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 9 10 156239 CASAVA_Build 3 3406472 1D TCTGTGTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 21 1 16 5 A 12 11 156240 CASAVA_Build 3 3413805 1I GGTGGGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 11 12 156241 CASAVA_Build 3 3467746 1I CTTTTGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1279 hom 31 5 17 9 T 14 15 156242 CASAVA_Build 3 3481901 1D39M1D GAGGTTTGGT AAAGGGAAAAGTTCCTGAGCAGCTGCTCTGTGTGGGGAAAC/-AAGGGAAAAGTTCCTGAGCAGCTGCTCTGTGTGGGGAAA- CAGAAGAGGA 3070 hom 75 het 27 0 26 9 N/A 0 0 156243 CASAVA_Build 3 3487656 1D20M1I AATACTCTGC ATTAACTTTTCTCCAGAGATC-/-TTAACTTTTCTCCAGAGATCT TATTCCTAAC 3070 hom 94 het 41 0 43 7 N/A 0 0 156244 CASAVA_Build 3 3488776 5D ATATGATAGA TATGT/----- TATGTGATAT 3070 het 3070 hom 47 21 26 2 TATGT 2 1 156245 CASAVA_Build 3 3500387 1D TGGAGGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 6 A 11 10 156246 CASAVA_Build 3 3501970 3D CATCGTCATG ATC/--- ATCATCAAAA 3070 het 3070 hom 55 20 29 8 ATC 3 2 156247 CASAVA_Build 3 3510390 2I GAGAGTTATC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 33 0 20 13 A 10 12 156248 CASAVA_Build 3 3511267 1I GTCTATAATT -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 7 8 156249 CASAVA_Build 3 3512987 1I AGGGATTTTT -/A TTAAAAAAAA 3070 het 295 hom 30 1 23 6 A 0 1 156250 CASAVA_Build 3 3513943 1I AAAAAAAAGT -/G GGGGGGGAGA 3070 hom 76 het 38 0 26 12 G 7 8 156251 CASAVA_Build 3 3529088 5D AATCATTCTT AAATG/----- AAGAAAACAA 3070 hom 81 het 29 0 28 6 AAATG 1 0 156252 CASAVA_Build 3 3532990 1D CCAAACAAAT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 9 8 156253 CASAVA_Build 3 3539264 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 T 12 11 156254 CASAVA_Build 3 3539765 1D ATAATTTTCA G/- GGTGATGCAG 3070 het 3070 hom 52 18 22 13 G 3 2 156255 CASAVA_Build 3 3540801 1I AAAAGTTCAA -/T TTTCCCCAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 3 4 156256 CASAVA_Build 3 3542089 1D GAAATATGTG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 56 30 20 6 T 8 7 156257 CASAVA_Build 3 3549059 1I TGTCTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 18 10 A 11 12 156258 CASAVA_Build 3 3550335 1I AAATGTATGT -/G GGTTGAATTC 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 G 2 3 156259 CASAVA_Build 3 3552959 18D TAGGGATGTC TCTTTAGTTGGGCCTCTG/------------------ TCTTTAGTTG 3070 het 3070 ref 36 20 14 10 TCTTTAGTTGGGCCTCTG 1 0 156260 CASAVA_Build 3 3555925 3D ACTAAGTCTG TGC/--- TGCTGCTAGG 3070 het 3070 ref 38 23 11 5 TGC 3 2 156261 CASAVA_Build 3 3577584 2D GAAATGGACC AT/-- ATATATATAT 1954 het 1954 ref 32 24 5 3 AT 8 7 156262 CASAVA_Build 3 3583525 1I TTTTGTTCTC -/A AAAAAAAAAA 1807 het 1807 ref 32 17 5 10 A 17 18 156263 CASAVA_Build 3 3605973 1D GGTGCTATTA T/- GTATGGCCTG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 1 0 156264 CASAVA_Build 3 3609991 1I AGCACTGAAA -/T TCAGCCTAGG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 156265 CASAVA_Build 3 3611397 2I AATTACTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2487 hom 34 11 13 10 T 12 14 156266 CASAVA_Build 3 3614991 1I TACGTACACC -/T GCCCTAGGAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 T 0 1 156267 CASAVA_Build 3 3616564 1I AGCCTTTCAG -/T TTTTCCTGGA 3070 het 3070 hom 50 15 31 4 T 4 5 156268 CASAVA_Build 3 3625318 1D AGAAGATAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 1500 hom 16 5 7 4 A 9 8 156269 CASAVA_Build 3 3637077 1D AAGAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 12 11 156270 CASAVA_Build 3 3638285 1D GGTGGACAAG A/- AAAAAAAAAG 1048 het 1048 ref 39 30 3 6 A 10 9 156271 CASAVA_Build 3 3645154 3I ATGGAGATAT ---/TAG TAGTAGTTAC 3070 het 3070 hom 49 18 22 9 TAG 2 3 156272 CASAVA_Build 3 3648776 1D CTACTCCGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 10 T 15 14 156273 CASAVA_Build 3 3650371 10I AACTATTCAT ----------/TGTATCTGAG TGTATCTGAG 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 TGTATCTGAG 1 2 156274 CASAVA_Build 3 3655863 1D ATTAAAACAT C/- AAAAATACTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 C 1 0 156275 CASAVA_Build 3 3691982 1I TGCACAAAAA -/G ATTCAGCAAG 3070 het 3070 hom 42 11 25 6 G 0 1 156276 CASAVA_Build 3 3698308 74D TGACTGTAAA TGTGCATGCGGTGATGGAAATATACTAAAACTAGACTGTGGGGACAGTTGAACAATTCTGGAAATACACATAAG/-------------------------------------------------------------------------- TGCATTGACT 1697 het 1697 ref 26 35 5 9 TGTGCATGCGGTGATGGAAATATACTAAAACTAGACTGTGGGGACAGTTGAACAATTCTGGAAATACACATAAG 1 0 156277 CASAVA_Build 3 3701919 1D TATTGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 A 13 12 156278 CASAVA_Build 3 3703601 1D AAATCAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 717 hom 47 3 34 10 T 13 12 156279 CASAVA_Build 3 3710689 1I TTTAGCAACT -/G GGTCGCACAG 3070 hom 135 het 48 0 45 3 G 2 3 156280 CASAVA_Build 3 3721686 2I CAGAACTTTG --/AC ACACAGGCAC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AC 2 3 156281 CASAVA_Build 3 3731955 1D CTTATTTATC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 10 9 156282 CASAVA_Build 3 3736328 1I GACGGACGGC -/A CCTGGAAAAT 2301 hom 15 het 7 0 5 2 A 0 1 156283 CASAVA_Build 3 3742062 2I ATAATAAAAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 2022 hom 28 7 18 3 A 9 11 156284 CASAVA_Build 3 3743986 3D GACAACTATC GAG/--- ATCATCGCTC 3070 het 3070 hom 62 26 31 7 GAG 1 0 156285 CASAVA_Build 3 3744528 1D GGATACAGCA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 17 25 11 G 2 1 156286 CASAVA_Build 3 3747545 1D TTTCGCCCAT A/- AAAAGTGGGG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 5 4 156287 CASAVA_Build 3 3748142 2I TACCCTGACT --/GA GTCTCCCTTT 3070 hom 129 het 48 0 42 6 GA 0 1 156288 CASAVA_Build 3 3749190 1D GCCTCAGGCA T/- TTTTCTCCCT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 5 4 156289 CASAVA_Build 3 3753445 2D AGTAGATCAC TT/-- TGGGAGGCTG 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 T 3 1 156290 CASAVA_Build 3 3753697 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 10 11 156291 CASAVA_Build 3 3761285 1I ATTTGGGTTT -/G GTGCTGCTAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 1 2 156292 CASAVA_Build 3 3764711 3D GCCTCTCTCC CTT/--- CTTGTTCCTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 CTT 2 1 156293 CASAVA_Build 3 3772222 1D TTCATACAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 T 9 8 156294 CASAVA_Build 3 3776037 2D AAATTTGCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1498 hom 30 10 10 12 A 13 11 156295 CASAVA_Build 3 3777358 1D AGGAAATTAA G/- GCATCGTAGC 3070 het 3070 ref 36 22 12 3 G 2 1 156296 CASAVA_Build 3 3778540 1I TCACATGTGA -/G TAATCTGCCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 0 1 156297 CASAVA_Build 3 3778685 4D CTCTCTTTCC TCCT/---- TCCTTCCTTC 3070 hom 128 het 54 0 37 17 TCCT 5 4 156298 CASAVA_Build 3 3779057 4I GGCACTGACC ----/GTCA ATCCCTTTCC 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 GTCA 0 1 156299 CASAVA_Build 3 3780105 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 27 2 18 8 A 12 11 156300 CASAVA_Build 3 3780342 1D TTTGACACTT A/- ACACCGTTGT 3070 hom 117 het 41 0 39 3 A 2 1 156301 CASAVA_Build 3 3781968 1D AAGCTGAAGG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 A 8 7 156302 CASAVA_Build 3 3785918 1D AGTTTGAACC A/- AGGTCTGTAT 3070 het 3070 hom 49 16 28 6 A 2 1 156303 CASAVA_Build 3 3787614 1D CATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 T 14 13 156304 CASAVA_Build 3 3793884 2D ACCCTCAATA TC/-- TCTGAGGCGT 3070 het 3070 ref 50 26 20 6 TC 2 1 156305 CASAVA_Build 3 3809370 4D TCCTTTATTA TCTT/---- TCTTTCTCTA 3070 het 3070 ref 49 25 20 8 TCTT 2 1 156306 CASAVA_Build 3 3815819 12D ACGTGTATTT TCTTTTGGTCTG/------------ TCTTTTGCTA 1858 hom 21 het 9 0 8 2 TCTTTTGGTCTG 1 0 156307 CASAVA_Build 3 3819674 4D GATAAAGTGT TTAA/---- TTATTAGAAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 TTAA 1 0 156308 CASAVA_Build 3 3821480 5I AATGTACATG -----/TGACA TGACATCCTT 3070 hom 124 het 51 0 41 10 TGACA 1 2 156309 CASAVA_Build 3 3822763 1I TTTTGTCATC -/T GCTGTCACAA 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 0 1 156310 CASAVA_Build 3 3824897 3D TCCCCAGAGC CCA/--- CCATTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 19 19 3 CCA 2 1 156311 CASAVA_Build 3 3825475 1D AATAAATCAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 9 8 156312 CASAVA_Build 3 3825832 1I TATTGAATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 T 9 10 156313 CASAVA_Build 3 3832595 4I CCTTTCTTAG ----/TCTT TCTAAGAGAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TCTT 0 1 156314 CASAVA_Build 3 3841217 4D TTCGGCTGAC CTGA/---- CTAATTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 CTGA 1 0 156315 CASAVA_Build 3 3852775 1D AATTTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 11 10 156316 CASAVA_Build 3 3854017 1D ATTACTCCTT C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 118 het 42 0 38 4 C 9 8 156317 CASAVA_Build 3 3854393 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTAA 3069 het 3069 ref 29 15 9 5 T 9 8 156318 CASAVA_Build 3 3858041 1I ATTCTTTTGG -/T TTTTCTATTT 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 4 5 156319 CASAVA_Build 3 3859632 1I TTATTGAAAC -/T CAATAGATGA 3070 het 3070 hom 55 20 34 1 T 0 1 156320 CASAVA_Build 3 3864082 1D TTTTTTTTTT G/- TTGTAATAGT 3070 hom 12 het 37 1 27 10 G 1 0 156321 CASAVA_Build 3 3868591 2I TCCTCAATAA --/CT CTGTAAAGTA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 CT 1 2 156322 CASAVA_Build 3 3873486 1I GAACTCCTGA -/C CTCAGGTGAT 3070 het 960 hom 16 3 12 1 C 1 2 156323 CASAVA_Build 3 3885870 4D TGCACACCAC TCTT/---- TCTAATTATC 3070 hom 105 het 38 0 36 5 TCTT 1 0 156324 CASAVA_Build 3 3889602 1D CAAAAAAAAA C/- AATCTTGACC 2249 het 2249 ref 37 24 5 8 C 1 0 156325 CASAVA_Build 3 3892500 2D TAACATTTTC GA/-- AAAGACATCC 3070 hom 103 het 38 0 34 4 GA 1 0 156326 CASAVA_Build 3 3894546 1D TTTATCATAT G/- ATAAATTAGG 3070 het 3070 hom 50 19 22 10 G 1 0 156327 CASAVA_Build 3 3900009 1D GAAAAGGTAA T/- TTTTTTCTCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 6 156328 CASAVA_Build 3 3905526 1D TTCAAAGACA T/- TTATTTCTGC 3070 hom 44 het 18 0 14 5 T 3 2 156329 CASAVA_Build 3 3913448 1D AATGCTTGTG C/- ATTTTTGTAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 1 0 156330 CASAVA_Build 3 3916147 1I CCCATATGGT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 32 0 21 11 A 8 9 156331 CASAVA_Build 3 3934755 1D TAAAGAGACC A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 81 het 36 0 26 10 A 6 5 156332 CASAVA_Build 3 3936844 1I ATCTCAAAAC -/A AAGCTGATTC 3070 hom 95 het 52 1 46 5 A 2 3 156333 CASAVA_Build 3 3939501 1I CTTTCCAATG -/A AACCACTCTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 2 3 156334 CASAVA_Build 3 3939548 2D CAAATGATCA TC/-- TCTCTCTTCA 3070 het 3070 ref 42 18 10 16 TC 4 3 156335 CASAVA_Build 3 3941548 1I40M1I TAACGGTTAT -AAAAAAAAGGGAAGATGTATGTACTGTTCTTCTCATAAAG-/AAAAAAAAAGGGAAGATGTATGTACTGTTCTTCTCATAAAGA AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 40 25 13 16 N/A 0 0 156336 CASAVA_Build 3 3942086 1I CTCTTGGTTT -/G GGGGTGGTCA 3070 het 3070 ref 51 24 24 3 G 4 5 156337 CASAVA_Build 3 3942696 1I TAGCATGTCT -/A ATGATTCCCT 3070 het 3070 ref 60 33 18 9 A 1 2 156338 CASAVA_Build 3 3943545 4I ACTCTCTTCT ----/TGTG TAAGACCAGT 3070 hom 118 het 46 0 38 8 TG 0 2 156339 CASAVA_Build 3 3948732 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 A 9 8 156340 CASAVA_Build 3 3950152 1D48M1D TAAATTCATT AAAAAACATACACTCAGGCATATGATATTCAAACTGCAGAAAATAAATTA/-AAAAACATACACTCAGGCATATGATATTCAAACTGCAGAAAATAAATT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 24 4 N/A 0 0 156341 CASAVA_Build 3 3954345 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTGTTAA 1932 het 1932 ref 14 10 4 0 TGTT 1 0 156342 CASAVA_Build 3 3960374 10I TATTATAGCT ----------/ATGCAGTATA ATTTGAAGTC 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 ATGCAGTATA 0 1 156343 CASAVA_Build 3 3961731 4I CATTTGTCTT ----/TGTC TGGTTTTGGT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 TGTC 0 1 156344 CASAVA_Build 3 3962097 3I AGAATGTCTC ---/CTT CTTCATTTCT 3070 het 3070 ref 35 24 11 0 CTT 1 2 156345 CASAVA_Build 3 3963828 3I TTATTGACAA ---/TGT TATTATTGAC 3070 het 3070 ref 46 25 11 10 TGT 0 1 156346 CASAVA_Build 3 3969026 1I ACATCTGGCT -/A AGTTTTTGTA 1460 hom 7 het 3 0 3 1 A 1 2 156347 CASAVA_Build 3 3975661 2I GCCCACTACA --/TT TGTAAAATAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 3 156348 CASAVA_Build 3 3977030 1I CAATGGGTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 86 het 35 0 25 10 A 9 10 156349 CASAVA_Build 3 3989062 1D ACAAATAACC A/- ACCTAGTCTT 3070 het 3070 ref 46 21 21 5 A 2 1 156350 CASAVA_Build 3 3992458 1I TTCCATTTGA -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 6 7 156351 CASAVA_Build 3 3996934 3I GTCAGGAGTG ---/TTC CTCTTTTCAT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TTC 0 1 156352 CASAVA_Build 3 4004725 1I GACATAGAGG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 7 8 156353 CASAVA_Build 3 4008059 1D TTTTTTCATA C/- TTTTGCTAGC 2434 het 2434 ref 29 19 7 3 C 1 0 156354 CASAVA_Build 3 4012536 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTATAA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 T 7 6 156355 CASAVA_Build 3 4017754 3I GAACACTCAA ---/GAG CCCAAGAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GAG 0 1 156356 CASAVA_Build 3 4018421 1I CGCATGCCTG -/A TAATCCCAGC 3070 het 2215 hom 16 6 9 1 A 0 1 156357 CASAVA_Build 3 4031548 1D ATTTTGATGC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 9 8 156358 CASAVA_Build 3 4046547 1D TCATTTCGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 10 9 156359 CASAVA_Build 3 4052570 2I GAGATATGTT --/AA AGAGACACTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 3 156360 CASAVA_Build 3 4060656 13I TAGGCACATA -------------/GGCTGCTAACTGT TTCCAAGGCT 3070 hom 106 het 38 0 36 2 GGCTGCTAACTGT 0 1 156361 CASAVA_Build 3 4067814 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 39 2 31 6 A 11 10 156362 CASAVA_Build 3 4074083 1D CAGGTTTGGC A/- AAAAACCGCA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 A 6 5 156363 CASAVA_Build 3 4080303 4I AGAGAGCACC ----/TTCA TTCAGTCCAT 3070 hom 123 het 51 0 42 9 TTCA 1 2 156364 CASAVA_Build 3 4095011 1I TTGCTAAACT -/G CAAACTATCC 3070 hom 111 het 47 0 33 14 G 0 1 156365 CASAVA_Build 3 4132258 3D ACCTGCCAGT ATG/--- ATGCATGTTC 3070 het 3070 hom 40 16 13 11 ATG 2 1 156366 CASAVA_Build 3 4141491 1D ATCTAATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2359 hom 23 7 11 5 A 11 10 156367 CASAVA_Build 3 4142777 1I CCTTTCAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 66 hom 24 1 21 2 A 9 10 156368 CASAVA_Build 3 4154599 2D CACTAATAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 80 het 39 0 29 11 AC 9 8 156369 CASAVA_Build 3 4166814 4I TCAAGGTCTG ----/TCTC TGTCTCCCAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TC 0 2 156370 CASAVA_Build 3 4167234 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 20 1 10 9 A 13 12 156371 CASAVA_Build 3 4168386 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 925 hom 28 2 15 11 A 14 15 156372 CASAVA_Build 3 4170207 1D GCCTTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 30 2 19 9 T 14 13 156373 CASAVA_Build 3 4175958 1I TCTGGTGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1819 hom 35 5 19 11 T 11 12 156374 CASAVA_Build 3 4182547 1D TTGTTTGTTT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 32 het 22 0 13 9 C 13 12 156375 CASAVA_Build 3 4189378 1D GATGGGGTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 8 7 156376 CASAVA_Build 3 4191241 2D ACACACACAC AT/-- GGGGGGCGTT 3070 hom 75 het 31 0 22 10 AT 1 0 156377 CASAVA_Build 3 4206402 6I AGAAGAAAAC ------/TAAAAA TAAATGACCC 3070 hom 114 het 45 0 38 7 TAAAAA 0 1 156378 CASAVA_Build 3 4216859 1D AGCATCAAGA T/- TTTTTTTTTT 2698 het 2698 ref 42 15 8 20 T 19 18 156379 CASAVA_Build 3 4221513 2I CTCTGCTTGA --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 10 156380 CASAVA_Build 3 4231469 1I AAAATAAGCT -/A AAAAAACCTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 6 7 156381 CASAVA_Build 3 4234439 1D TTCTTAGCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 8 156382 CASAVA_Build 3 4234565 1D GACTTCATAT G/- GTCTTTGAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 2 1 156383 CASAVA_Build 3 4235174 2D AAGAATAAAC AT/-- GTGTGAAGCC 3070 hom 99 het 37 0 32 6 AT 1 0 156384 CASAVA_Build 3 4243559 6D TGACCTTCTC ACTTCT/------ CCCGTCCCCT 161 het 161 ref 24 4 1 20 ACTTCT 1 0 156385 CASAVA_Build 3 4244069 2D TACATTTCAA AT/-- TGGTCAAGTG 3070 hom 120 het 45 0 40 8 AT 1 0 156386 CASAVA_Build 3 4252742 1D TTCCCCTACC T/- TAGCCCCCCA 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 T 2 1 156387 CASAVA_Build 3 4253263 1D CATAGTGAGA C/- CCCCCATCTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 6 5 156388 CASAVA_Build 3 4254485 1D TTTTAAATAC T/- TTAAGTGCTG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 3 2 156389 CASAVA_Build 3 4257201 3I CTTTGCTTTT ---/AGA AGATGATTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AGA 1 2 156390 CASAVA_Build 3 4276570 1D TTTGTTTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 68 het 25 0 23 3 T 9 8 156391 CASAVA_Build 3 4276709 1D GAAAAAGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 20 9 A 13 12 156392 CASAVA_Build 3 4276975 3D CAACAGGTAC TAG/--- TAGTCAGTTC 3070 hom 111 het 39 0 38 4 TAG 2 1 156393 CASAVA_Build 3 4293080 6D TACTATGACA AAGTAC/------ AAGTTTTGAG 3070 hom 93 het 34 0 32 5 AAGTAC 1 0 156394 CASAVA_Build 3 4300183 1D ACCCTTTGTT A/- AAATTCAAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 4 3 156395 CASAVA_Build 3 4305489 1I CTCTGTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 A 13 14 156396 CASAVA_Build 3 4311570 3D CTATATGTGT GAG/--- GAGAGTAAAA 3070 hom 87 het 37 0 29 8 GAG 2 1 156397 CASAVA_Build 3 4312798 1D ATGCCTTTGC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 6 5 156398 CASAVA_Build 3 4312991 1I CAAAATAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1484 hom 25 4 15 6 A 14 15 156399 CASAVA_Build 3 4313148 1I TAATGGACTC -/A ACAGTTTCAC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 1 2 156400 CASAVA_Build 3 4313906 1I AGCCCACCCC -/T GTTAGACGGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 0 1 156401 CASAVA_Build 3 4317696 2D CCCTCCACCA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 AT 7 6 156402 CASAVA_Build 3 4319164 2I GGTAAATTTC --/AG AGAGAACAGA 3070 hom 102 het 41 0 33 8 AG 2 3 156403 CASAVA_Build 3 4331252 6D CATTGTAAAT TTTTCA/------ TTTTCATTAT 3070 het 3070 hom 47 21 24 3 TTTTCA 2 1 156404 CASAVA_Build 3 4346450 2D TTAGAAAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 12 10 156405 CASAVA_Build 3 4347908 1D CCTTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 12 11 156406 CASAVA_Build 3 4348802 1D AAGCACTTCC T/- TTTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 6 5 156407 CASAVA_Build 3 4353868 8D30M12D CTCTTTTCTG TCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTA/--------TCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTTCTTCCTTC------------ CTTCCTTCCC 3070 het 2096 hom 22 8 10 13 N/A 0 0 156408 CASAVA_Build 3 4354569 1I CCTTTCCTCT -/C CAGTAATCAC 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 C 1 2 156409 CASAVA_Build 3 4367910 1I AGGTCTCCCC -/A ACCCTCCCTG 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 A 1 2 156410 CASAVA_Build 3 4368156 5D GCAGCACACT TTTCC/----- TTTCATTCTT 3070 het 3070 hom 47 23 22 4 TTTCC 1 0 156411 CASAVA_Build 3 4371130 1I TAAACCTGCT -/A AGAGGTTCTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 1 2 156412 CASAVA_Build 3 4373095 11D AATGGTTTTC CGTGGGGACAG/----------- CGTGGGGACA 3070 hom 74 het 29 0 23 7 CGTGGGGACAG 3 2 156413 CASAVA_Build 3 4373684 2I CTGAAAAACT --/GA GAGTGCAGAT 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 GA 1 2 156414 CASAVA_Build 3 4374024 6I TATTCCTGAA ------/GTCAAC TATGGATTTT 3059 het 3059 ref 24 11 8 5 GTCAAC 0 1 156415 CASAVA_Build 3 4378365 4D ATAATAAATT CTCA/---- CTATGAAGTC 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 CTCA 1 0 156416 CASAVA_Build 3 4385728 11D TGGCATGCAA AAGGTTTTTTT/----------- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 51 18 27 7 AAGGTTTTTTT 1 0 156417 CASAVA_Build 3 4389888 4D CGAAAAGAAG ACAA/---- ACAGAGAACA 3070 het 3070 ref 38 16 17 7 ACAA 1 0 156418 CASAVA_Build 3 4390348 1D AAACTCTTGC A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 A 7 6 156419 CASAVA_Build 3 4390492 1D AATCAAATCC A/- AAAATGTATA 3070 hom 87 het 34 0 30 6 A 5 4 156420 CASAVA_Build 3 4390679 1I CATTGCTGAT -/A AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 6 7 156421 CASAVA_Build 3 4399023 9I CATACATGCA ---------/CACACACAC CACACACACA 1010 het 1010 ref 34 19 6 9 CACACACAC 1 2 156422 CASAVA_Build 3 4399762 1D TAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 11 10 156423 CASAVA_Build 3 4402721 3I ACTGTAGCTA ---/AGT AGTAGTAAGT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 AGT 2 3 156424 CASAVA_Build 3 4409296 12D TGTGTGTGTG TGTGTATATATA/------------ TATATATATA 3070 het 1783 hom 14 5 10 2 TGTGTATATATA 1 0 156425 CASAVA_Build 3 4421167 12D GTGGGCCAGG TGCAGTGGCTCA/------------ TGCCTGTAAT 3070 het 3070 ref 31 18 10 8 TGCAGTGGCTCA 1 0 156426 CASAVA_Build 3 4433421 2D AAATGCCTTG GC/-- GCACAATGCC 3070 het 3070 hom 50 18 24 10 GC 2 1 156427 CASAVA_Build 3 4439633 2D ATCACTTCCC CT/-- GAGTCCCCAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 8 CT 1 0 156428 CASAVA_Build 3 4441275 23D TATAGTTTCT AACTTAAAATTACAAAATAACCC/----------------------- AACTGTCCTT 3070 het 3070 hom 40 22 25 4 AACTTAAAATTACAAAATAACCC 1 0 156429 CASAVA_Build 3 4445073 1I GGTCTTGCTC -/T TGTCACCCAG 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 T 1 2 156430 CASAVA_Build 3 4445458 4I GAAAAAACAA ----/AAGT AAGCAATATC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AAGT 0 1 156431 CASAVA_Build 3 4447304 1D TACTTGGTGA G/- CATCTTCTCT 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 G 1 0 156432 CASAVA_Build 3 4453285 1D GTTGTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 A 13 12 156433 CASAVA_Build 3 4454914 1D CTATAAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 214 hom 24 2 12 10 A 13 12 156434 CASAVA_Build 3 4457669 1I AATACTATCC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 46 20 22 4 T 7 8 156435 CASAVA_Build 3 4459310 28D TAGAGGGACA AGAGAGAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAG/---------------------------- AGAGAGAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 5 AGAGAGAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAG 1 0 156436 CASAVA_Build 3 4464732 2I TAAAAAAAAA --/AG AGTAGGGCGG 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 AG 1 2 156437 CASAVA_Build 3 4477953 1I CACTATACTC -/T TAAGTGCTGG 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 1 2 156438 CASAVA_Build 3 4480961 2D AAATGTGGCC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 11 9 156439 CASAVA_Build 3 4492070 2D TAGCAGCATT AC/-- AGGCATTGTG 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 AC 1 0 156440 CASAVA_Build 3 4507553 1D CTTAACAAAC T/- TTTTTTTTTT 2286 het 2286 ref 40 13 10 17 T 17 16 156441 CASAVA_Build 3 4513000 4D TTCAAGTTCA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 30 13 10 8 TG 10 8 156442 CASAVA_Build 3 4513744 2D GTCCATGCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 12 10 156443 CASAVA_Build 3 4514015 3I ACCTGTTCAA ---/GTT GTTGTGTGCG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 GTT 1 2 156444 CASAVA_Build 3 4514516 4I ATGAACAGAT ----/AAAC AAAATGTGAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AAAC 0 1 156445 CASAVA_Build 3 4517060 1D ATCTTTTTTG T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 108 het 40 0 35 5 T 7 6 156446 CASAVA_Build 3 4517172 1D AGGCGTGAGA C/- CATCATGCCT 3070 het 3070 hom 46 14 25 8 C 2 1 156447 CASAVA_Build 3 4517718 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2600 hom 22 7 10 5 T 9 8 156448 CASAVA_Build 3 4519853 1D CTTTTGATAG C/- TTTTGAGGTG 3070 het 3070 ref 39 22 12 7 C 1 0 156449 CASAVA_Build 3 4536463 1I GACACTTTGA -/T TTTACCCACC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 3 4 156450 CASAVA_Build 3 4540115 2I ATGCTTATTA --/TT TTTTTTTTGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 10 156451 CASAVA_Build 3 4559369 2I GTGTGTGGCG --/GT GGGGGGTGGG 3070 hom 99 het 35 0 32 3 GT 0 1 156452 CASAVA_Build 3 4563589 1D CACTGAAGGC T/- TAACTTTGAG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 2 1 156453 CASAVA_Build 3 4575518 1I GTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 10 11 156454 CASAVA_Build 3 4583289 22D GGGACACATG CACACACACACACACACACACA/---------------------- CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 24 17 5 CA 19 8 156455 CASAVA_Build 3 4584683 3D TGCTCAGTAG ATT/--- ATTTATCAGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 ATT 2 1 156456 CASAVA_Build 3 4601244 1D AGTTAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 965 hom 29 3 17 9 T 13 12 156457 CASAVA_Build 3 4604661 1I CCTAAGCATA -/T TTTACTGCCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 3 4 156458 CASAVA_Build 3 4656482 1D ATTCTTCCTA C/- TTCGGTGAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 C 1 0 156459 CASAVA_Build 3 4660283 1D TTGTTTTTTT G/- GGGGGGGGGT 2893 het 2605 hom 21 10 9 2 G 10 9 156460 CASAVA_Build 3 4674402 1D CCTGCCTTGG C/- CCTCCCAAAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 3 2 156461 CASAVA_Build 3 4677117 1D ATGATGGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 10 9 156462 CASAVA_Build 3 4690262 12D GTTTTTGGTT TTTGTTTGTTTG/------------ TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 TTTG 6 3 156463 CASAVA_Build 3 4691522 1I TGATGAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 T 13 14 156464 CASAVA_Build 3 4700620 1D CCAAGATCAC A/- AGCTGTTTGC 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 2 1 156465 CASAVA_Build 3 4704824 1I CAAGTGATCC -/A ACCCAAAGGG 3070 hom 51 het 19 0 17 3 A 1 2 156466 CASAVA_Build 3 4704950 1I TATTAGCCTT -/C ACTCTGCAGT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 0 1 156467 CASAVA_Build 3 4706000 4D TGCATGCACA CACT/---- CACTCACTCA 3070 hom 132 het 50 0 43 8 CACT 3 2 156468 CASAVA_Build 3 4708348 1I GAGCCAGAAC -/A GCTTCCATTC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 0 1 156469 CASAVA_Build 3 4708967 1I ATGAAGATAC -/A GCAGATTTCA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 0 1 156470 CASAVA_Build 3 4709449 1D AAGTAATTTG T/- TGATTGAAGA 3070 hom 67 het 27 0 22 5 T 2 1 156471 CASAVA_Build 3 4711125 4I ATATCATATA ----/TATT ATGTTTTTAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TATT 0 1 156472 CASAVA_Build 3 4714792 1I GCCACATAAC -/A AAGCATACCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 3 156473 CASAVA_Build 3 4714981 1I AGTGTGAGAC -/A AGAAGCCTAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 1 2 156474 CASAVA_Build 3 4716045 1D TATCTCAAAA C/- AAAAAAAGGA 3070 het 380 hom 30 2 20 8 C 1 0 156475 CASAVA_Build 3 4718816 10I TACTCAGAAA ----------/TTAAAAATTT GTCAGTGTCA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 TTAAAAATTT 0 1 156476 CASAVA_Build 3 4728201 1I CTCTCCATTG -/T TATGTGGCTG 3070 hom 110 het 42 0 37 5 T 1 2 156477 CASAVA_Build 3 4738242 4I GCCTGTTCAC ----/TGTT TGTTGGTCTC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TGTT 1 2 156478 CASAVA_Build 3 4739433 13I4M1I CCATGCCTGG -------------CCCA-/AAATGTTTTATGTCCCAG TGGGTTGGAT 3070 hom 78 het 27 0 26 4 N/A 0 0 156479 CASAVA_Build 3 4744091 1D ACCAAGTAAA C/- TTTTCATGTC 3070 hom 111 het 38 0 38 1 C 1 0 156480 CASAVA_Build 3 4749171 1D CTATGTTGGG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 9 8 156481 CASAVA_Build 3 4752411 1I CAAGATGACC -/A AAAGAGTTTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 3 4 156482 CASAVA_Build 3 4758232 1D CACCACACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 49 3 36 10 T 13 12 156483 CASAVA_Build 3 4763233 3I TGAGGCAGAG ---/ATA ATAATGGGTT 3070 hom 82 het 33 0 26 7 ATA 1 2 156484 CASAVA_Build 3 4765130 2I TGGAAGCACA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 9 11 156485 CASAVA_Build 3 4770734 1I ACAGAAAATG -/T GGGGGGGGGT 3070 het 104 hom 22 3 14 5 T 0 1 156486 CASAVA_Build 3 4772089 1D ATTAAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 25 1 12 12 T 17 16 156487 CASAVA_Build 3 4778735 3D CGCCCCTTCT AAG/--- AAGAAGTATG 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 AAG 3 2 156488 CASAVA_Build 3 4802257 2I AGCAAATATC --/TT TGATTTATCA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 1 3 156489 CASAVA_Build 3 4812984 1I CCAGGGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 T 10 11 156490 CASAVA_Build 3 4862339 1D TGGTAGGTAA T/- TTTTTTTTTC 3049 het 3049 ref 28 13 9 7 T 10 9 156491 CASAVA_Build 3 4866463 5I CATAAGACAG -----/AATAT AATAACAAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 3 AATAT 0 1 156492 CASAVA_Build 3 4871591 1I TTTGAGGGGT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 8 9 156493 CASAVA_Build 3 4876299 2I TCAAAACCAC --/AT GAGATATCAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 0 1 156494 CASAVA_Build 3 4898505 3I GGTACCTAAA ---/AGG AGCCTAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AGG 0 1 156495 CASAVA_Build 3 4898956 3D AATAAAATTT TAC/--- ATTTTATATA 744 het 49 hom 9 1 3 5 TAC 1 0 156496 CASAVA_Build 3 4899607 1D AAAAGATTTG T/- TGGTATGTGC 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 T 2 1 156497 CASAVA_Build 3 4900914 1I TTCTGGTAGC -/A TTCAAGGATA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 0 1 156498 CASAVA_Build 3 4902004 1D TTTCTACTTT A/- AAAAAAAAAA 1373 het 1373 ref 33 23 3 7 A 12 11 156499 CASAVA_Build 3 4904015 18D TGACTTGGCC TGGTAAATAATCATTATT/------------------ TGGTAAATAA 3070 het 3070 ref 35 21 13 6 TGGTAAATAATCATTATT 1 0 156500 CASAVA_Build 3 4913520 1D TATTGAAGCA T/- TATCATACAC 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 2 1 156501 CASAVA_Build 3 4915289 1D CCTGAAGACA G/- GTTTATCCAC 3070 hom 134 het 53 0 43 10 G 2 1 156502 CASAVA_Build 3 4922561 1I ACCTTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 A 12 13 156503 CASAVA_Build 3 4930278 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 24 8 12 5 A 7 6 156504 CASAVA_Build 3 4931466 1D TTCAAGGAAT A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 61 31 22 8 A 7 6 156505 CASAVA_Build 3 4931717 1I CTTCCTTAAG -/C CCCTTTTTTT 2267 het 1400 hom 30 13 10 8 C 3 4 156506 CASAVA_Build 3 4932970 5I GTTAGGACTT -----/GAACA CATCAATCTG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 GAACA 0 1 156507 CASAVA_Build 3 4940195 1D ATTTTAGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 9 156508 CASAVA_Build 3 4945444 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1834 het 85 hom 27 1 11 15 T 13 14 156509 CASAVA_Build 3 4946609 2D CAGCCCTAAT AA/-- CCCAGACAAC 3070 hom 96 het 40 0 32 8 A 2 0 156510 CASAVA_Build 3 4953492 8I TAGAAAGGTG --------/TGGCTGCA TAGCTGCATG 3070 het 3070 hom 67 21 37 9 TGGCTGCA 0 1 156511 CASAVA_Build 3 4954353 5D TTTGTTTGCC TGTTT/----- TGTTTATTAA 3070 het 3070 ref 38 23 13 4 TGTTT 2 1 156512 CASAVA_Build 3 4959431 4D CTTCATATAC ACAA/---- ACAATGACCG 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 ACAA 2 1 156513 CASAVA_Build 3 4966942 4I TTTGTTGTTG ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 TTGT 2 3 156514 CASAVA_Build 3 4967273 1D TTTCTTCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 46 hom 36 1 14 21 T 10 9 156515 CASAVA_Build 3 4969421 1I ATTCCATCTC -/T TTTTGGTATT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 4 5 156516 CASAVA_Build 3 4970412 4D CCCAGGTATT ACTA/---- ACTATTAACA 3070 het 3070 hom 51 21 27 4 ACTA 2 1 156517 CASAVA_Build 3 4971558 1D TAAATAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 13 12 156518 CASAVA_Build 3 4977328 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1535 het 1416 hom 12 4 4 6 A 17 14 156519 CASAVA_Build 3 4979761 1I ATCCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 11 12 156520 CASAVA_Build 3 4986997 1I CAATATCGTG -/A AAAATGGCCA 2410 het 986 hom 9 4 5 0 A 4 5 156521 CASAVA_Build 3 4997982 1D ACTATTCCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2660 hom 24 7 16 1 T 10 9 156522 CASAVA_Build 3 4999416 1I AGTAAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 11 12 156523 CASAVA_Build 3 5013407 1I CAGTTTTCCA -/G GCAGAGGAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 G 1 2 156524 CASAVA_Build 3 5013748 2D GGTGTGTGAC TT/-- TGGGAAAATG 3070 het 3070 ref 52 29 19 6 T 3 1 156525 CASAVA_Build 3 5014625 1I8M1I TGACAGGCTG -CCCAGAGA-/ACCCAGAGAG AGACAAGAGG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 N/A 0 0 156526 CASAVA_Build 3 5023957 1D6M1D8M1D4M2D7M1D5M1I CTCTCTTCCC TTTTGAACCAGTGATCTAAGGGACTCCTCCTCAAGT-/-TTTGAA-CAGTGATC-AAGG--ATCCTCC-CAAGTC CTTCTCTAAT 3070 hom 130 het 41 0 38 12 N/A 0 0 156527 CASAVA_Build 3 5026571 4I AACTCTGTCA ----/AGTT TAAAACCACA 3070 hom 75 het 26 0 24 2 AGTT 0 1 156528 CASAVA_Build 3 5035650 14D ATGTGGCCAG GCCTGGAGGCTCAT/-------------- GCCTGGAGGC 3070 hom 67 het 33 0 19 17 GCCTGGAGGCTCAT 2 1 156529 CASAVA_Build 3 5039430 6D TTTCTTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 14 8 156530 CASAVA_Build 3 5045791 1D TGGTGATCTA C/- CCCCCCCCCC 2845 hom 30 het 19 0 10 10 C 13 12 156531 CASAVA_Build 3 5054281 2I ATGTGTGTGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 61 28 28 5 TG 8 9 156532 CASAVA_Build 3 5057533 2I TTTTTTGGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 30 0 20 10 T 13 15 156533 CASAVA_Build 3 5058471 1D TGTTTAAGAA C/- CTTGTTTTGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 2 1 156534 CASAVA_Build 3 5061685 1D ATTTGCCTTG T/- TTTAAGCCAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 3 156535 CASAVA_Build 3 5064315 34I AAAGAGGGCA ----------------------------------/TGGAAAATTATACTGGCACATACAAGCTTTCACT TGGAAAGACA 3070 hom 60 het 25 0 21 6 TGGAAAATTATACTGGCACATACAAGCTTTCACT 0 1 156536 CASAVA_Build 3 5068906 1I TAATAACAGC -/A AGCAGCTAAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 1 2 156537 CASAVA_Build 3 5069637 1D GGGAGGAATC T/- TGTTTTTTGG 3070 hom 94 het 45 0 32 19 T 2 1 156538 CASAVA_Build 3 5071610 1D CTAAAAATAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 15 0 15 1 A 9 8 156539 CASAVA_Build 3 5077460 1D CTCAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 11 10 156540 CASAVA_Build 3 5087272 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 T 7 8 156541 CASAVA_Build 3 5092660 1I AGGGGTTTTA -/G GGCAGTGAAA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 G 2 3 156542 CASAVA_Build 3 5112481 1I ATGAACTCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 11 12 156543 CASAVA_Build 3 5113231 1D7M1D12M2D ACAGGGCCTC GCTTCGAGCTTAATAATGATACC/-CTTCGAG-TTAATAATGATA-- CAGTAAGGGA 3070 hom 117 het 40 0 39 6 N/A 0 0 156544 CASAVA_Build 3 5118691 1D AACTCAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 10 11 A 13 12 156545 CASAVA_Build 3 5121149 1I AAATTTTGTA -/T TTTTTTTCTT 2830 het 2830 ref 19 8 8 3 T 7 8 156546 CASAVA_Build 3 5121215 8I GAATGCAATG --------/GCGCGACC TCGGCTCACT 2814 hom 27 het 13 0 7 6 GCGCGACC 0 1 156547 CASAVA_Build 3 5145698 2D ATTTGAGGGA TT/-- TTTCCTATGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 T 5 3 156548 CASAVA_Build 3 5146880 1I AAAATATATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 831 hom 14 2 10 2 T 10 11 156549 CASAVA_Build 3 5148080 1D AATTAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1738 het 1645 hom 15 8 4 3 T 14 13 156550 CASAVA_Build 3 5149787 1I TCATGTGGGG -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 A 6 7 156551 CASAVA_Build 3 5149909 1I GAAAAGTAGA -/T TCAGTCAGCT 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 T 1 2 156552 CASAVA_Build 3 5150793 1I TTCAGGAGTA -/G TAAGAGATAC 3070 het 3070 hom 48 15 26 7 G 0 1 156553 CASAVA_Build 3 5151985 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3007 het 3007 ref 26 11 7 8 T 9 10 156554 CASAVA_Build 3 5152832 2I TGTTCTGTTG --/CA CAGGCTGGAG 2036 het 2036 ref 15 7 5 3 CA 1 2 156555 CASAVA_Build 3 5153446 2D GGTAATGATG GA/-- GAGACTGAGA 3070 het 3070 hom 42 20 19 4 GA 3 2 156556 CASAVA_Build 3 5161773 1D ATTATCTCTC T/- TTGCCATCTA 3070 het 3070 ref 47 24 16 8 T 3 2 156557 CASAVA_Build 3 5162513 1D AAAAGGTAGA C/- CCCTCTATTC 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 C 4 3 156558 CASAVA_Build 3 5163708 1I TTTCTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 11 12 156559 CASAVA_Build 3 5170614 1D ACTGATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 13 11 T 11 10 156560 CASAVA_Build 3 5172353 1D ATTCCCCGTG C/- CCCCCCACCC 2549 het 2511 hom 20 10 8 2 C 7 6 156561 CASAVA_Build 3 5172529 1D TTTCTCAGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 10 9 156562 CASAVA_Build 3 5172576 2I AGATAATTTT --/TG TGTGTGTGTG 2981 het 2484 hom 29 8 9 12 TG 8 9 156563 CASAVA_Build 3 5197489 11I ACTTTTTTGG -----------/AAGGGGATAGT AAGTTTCCGA 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 AAGGGGATAGT 0 1 156564 CASAVA_Build 3 5201915 1D AAACAAGTCC T/- AGAAAAGTAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 0 156565 CASAVA_Build 3 5206685 1D TTTTTTTTTT G/- GGGGGGGGGA 2036 het 70 hom 19 2 6 11 G 10 9 156566 CASAVA_Build 3 5206772 3D TTTAAATCAA CAT/--- CATTAAAGTT 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 CAT 2 1 156567 CASAVA_Build 3 5209606 1D CTGCAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3015 hom 39 16 9 14 T 17 16 156568 CASAVA_Build 3 5240269 5I AGTTATTAAC -----/AAAAT AAAAATTTAT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AAAAT 0 1 156569 CASAVA_Build 3 5245964 2I AGGAGGGGCC --/TG GTGGGAGGTG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TG 0 1 156570 CASAVA_Build 3 5248771 2D AGTTTTTTTT TC/-- CCCCTAATCC 3070 hom 78 het 33 0 27 7 TC 1 0 156571 CASAVA_Build 3 5260234 6I AGAGCGAGAA ------/CGAGAG CGAGAGCGAG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 CGAGAG 2 3 156572 CASAVA_Build 3 5265011 2D ATGACTGAAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 84 het 40 0 28 12 GT 9 8 156573 CASAVA_Build 3 5279581 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 10 11 156574 CASAVA_Build 3 5282818 2D ATTTTTAGAC AG/-- AGTCTTACTC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AG 2 1 156575 CASAVA_Build 3 5293091 1I TTTTTACCAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 37 0 26 11 A 9 10 156576 CASAVA_Build 3 5299591 1I TTAGTCAGCA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 7 8 156577 CASAVA_Build 3 5303884 5D AGGTGTCTGC CACCA/----- CACCTGGCTA 129 hom 5 het 3 0 2 1 CACCA 1 0 156578 CASAVA_Build 3 5304994 2I AATTTTAGGG --/TT TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 8 10 156579 CASAVA_Build 3 5310028 6D TGCCAATGTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 142 hom 33 3 17 16 A 20 14 156580 CASAVA_Build 3 5315130 1I34M1I TTTAATTGCA -TGTCAAAGCAGATGGACTTAACAAAGAGCTAACA-/TTGTCAAAGCAGATGGACTTAACAAAGAGCTAACAT TGTAATCTCA 3070 hom 151 het 42 0 51 8 N/A 0 0 156581 CASAVA_Build 3 5317873 1I ACCTTTGCTC -/T TTTTTTTTTT 2990 hom 37 het 33 0 10 23 T 11 12 156582 CASAVA_Build 3 5322315 1D TTCTGGGTGC T/- TAAACCTATC 3070 het 3070 ref 53 24 22 9 T 2 1 156583 CASAVA_Build 3 5325258 1I GTGGAAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 14 11 T 13 14 156584 CASAVA_Build 3 5325633 3D AAAAATAGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 30 9 T 14 11 156585 CASAVA_Build 3 5326151 1D TTGTTATTTA T/- TTTTTGATGT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 6 5 156586 CASAVA_Build 3 5333201 3I GAAAAGATAG ---/ATA ATAATAAAAA 3055 het 3055 ref 37 15 9 13 ATA 2 3 156587 CASAVA_Build 3 5333240 4I TAGCTAAATT ----/GATA GATTGATTAT 2897 het 2897 ref 37 16 10 12 GATA 0 1 156588 CASAVA_Build 3 5333600 4D CAATTTTCTT TCTG/---- TCTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 19 4 TCTG 1 0 156589 CASAVA_Build 3 5337956 14D ACACTGCTTA GTAGGCACTGCTTT/-------------- ACCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 25 9 10 GTAGGCACTGCTTT 1 0 156590 CASAVA_Build 3 5338746 1D GAAAAAAAAA T/- TTTTTTGGTC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 7 6 156591 CASAVA_Build 3 5339310 2D CTCAAAATTT AG/-- GTTTGCATAC 3070 het 3070 ref 47 29 16 3 AG 1 0 156592 CASAVA_Build 3 5341210 1D TTTTAGAACT G/- GGAAAGTCCT 3070 het 3070 ref 56 28 23 5 G 3 2 156593 CASAVA_Build 3 5342567 1I CTGGAAGATT -/G CCTTTTCATT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 G 0 1 156594 CASAVA_Build 3 5343179 1I CTGGAAGCCA -/T TTTTTTTTTT 2009 het 2009 ref 17 7 5 5 T 10 11 156595 CASAVA_Build 3 5344957 1I AAATACTGGC -/A AACCGAATCC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 2 3 156596 CASAVA_Build 3 5347497 4D CCATGGGACA TTCT/---- TTCTATTGCT 3070 het 3070 ref 49 30 13 7 TTCT 2 1 156597 CASAVA_Build 3 5349279 1I TACCACAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 0 1 156598 CASAVA_Build 3 5352460 3D TGATTGTTGT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 58 27 28 4 TTC 3 2 156599 CASAVA_Build 3 5353135 2I CGGGCACGCA --/CG AGCGTGCGCG 1009 het 1009 ref 29 14 6 10 CG 0 1 156600 CASAVA_Build 3 5353675 4D AGTTGCTCTC CATT/---- CAGGGGATGC 3070 het 3070 hom 39 16 18 7 CATT 1 0 156601 CASAVA_Build 3 5353933 13D TATAAAAAAT CCCCTTTAAAAGA/------------- CCCCTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 14 19 6 CCCCTTTAAAAGA 1 0 156602 CASAVA_Build 3 5355229 1D CATCCAGGAA C/- TCTTGGGTAC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 C 1 0 156603 CASAVA_Build 3 5356739 2D TGTTGAGGTT AA/-- AGTCACTCAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 7 A 3 1 156604 CASAVA_Build 3 5360421 1I TTGTCTGTTC -/T TTTTTTAGCT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 T 6 7 156605 CASAVA_Build 3 5364687 1I CAAATAATCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 8 9 156606 CASAVA_Build 3 5364924 1I AGTGCTAAGC -/T CAGAAGAGAG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 0 1 156607 CASAVA_Build 3 5370894 1D TTTCAACCTC T/- TAGACCACAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 6 T 2 1 156608 CASAVA_Build 3 5373001 1I AGTGGAAAAA -/C TGACAATGGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 0 1 156609 CASAVA_Build 3 5373595 1I ATGGGTGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 A 9 10 156610 CASAVA_Build 3 5374253 3D GATATCCTCC TCT/--- TCTTCTTCCC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 TCT 3 2 156611 CASAVA_Build 3 5381358 1I TGGAAAATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 T 9 10 156612 CASAVA_Build 3 5384431 1D GCAGCTGGTT A/- AGGTTGCATC 3070 het 3070 hom 38 15 16 8 A 2 1 156613 CASAVA_Build 3 5386081 1D CATCTACCAT C/- CTTTTTGGGT 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 C 2 1 156614 CASAVA_Build 3 5386840 1D TCTTAACCTT A/- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 51 23 23 6 A 1 0 156615 CASAVA_Build 3 5387857 2D CTTCTGTGAG TT/-- TATTTTAGAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 3 1 156616 CASAVA_Build 3 5388170 1D CTGTTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 41 1 38 2 T 11 10 156617 CASAVA_Build 3 5393823 1D AAACATCCCT G/- GTCTAACAGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 2 1 156618 CASAVA_Build 3 5403853 1D TTTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 36 1 25 10 T 13 12 156619 CASAVA_Build 3 5409015 1D TCCAAAGATC A/- CTAGTTTTCA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 1 0 156620 CASAVA_Build 3 5410050 2I GTGGTAATGT --/AG AGAGGAGGGA 3070 hom 102 het 39 0 33 6 AG 2 3 156621 CASAVA_Build 3 5420201 4I GTAAAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAAC 3 4 156622 CASAVA_Build 3 5420551 1I AATGAGGTAG -/A AAACAACCAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 3 4 156623 CASAVA_Build 3 5423161 2D ACTCTTTGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2187 hom 41 10 13 18 A 18 16 156624 CASAVA_Build 3 5428888 1D ATTACTATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 A 12 11 156625 CASAVA_Build 3 5444334 1I CACTCCAGGT -/A AAAAAAAAAA 1776 het 1776 ref 34 12 9 13 A 15 16 156626 CASAVA_Build 3 5448718 1I CCTACAGCCC -/A TTTAGACTTT 3070 het 3070 ref 69 40 23 6 A 0 1 156627 CASAVA_Build 3 5449229 2D ACTTGATGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 35 5 15 15 T 13 11 156628 CASAVA_Build 3 5451882 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 A 10 9 156629 CASAVA_Build 3 5460596 4I3M10I TATATATTTT ----TTT----------/GATGTTTCTGTAAATGG ATTTGTTTTA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 N/A 0 0 156630 CASAVA_Build 3 5461459 4D TTTTATTTAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 TTTA 5 4 156631 CASAVA_Build 3 5464625 1D AATATATAAA T/- TTTTTTTCCA 1803 het 1803 ref 19 10 4 5 T 8 7 156632 CASAVA_Build 3 5479331 1D GATGTTGGTC A/- AAAAGGCACA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 5 4 156633 CASAVA_Build 3 5488426 2D TCAAATTTTT TC/-- TCTCTCCGAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 TC 4 3 156634 CASAVA_Build 3 5498861 8I TACATTTATT --------/ATTGTACA AGTATAAACA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 ATTGTACA 0 1 156635 CASAVA_Build 3 5501693 1D GGATGATATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 40 1 35 4 A 10 9 156636 CASAVA_Build 3 5502873 1D AAAGTAAATT A/- AAAAAAAAAC 3056 het 2644 hom 21 9 9 3 A 10 9 156637 CASAVA_Build 3 5511277 1I AATGGCATGT -/G GCCTCAGCCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 1 2 156638 CASAVA_Build 3 5513168 1I TGAGACATGT -/G GCATCTCTGC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 G 1 2 156639 CASAVA_Build 3 5515571 2D GAATTGTCTC TT/-- GATGTAATAA 3070 het 3070 hom 47 18 25 5 T 2 0 156640 CASAVA_Build 3 5520898 1I CCTGGGTGCT -/G GCAAGCCACT 3070 hom 105 het 43 0 33 10 G 1 2 156641 CASAVA_Build 3 5528356 6I AGAAAAAAAT ------/GAAAAG GAACAAATAA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 GAAAAG 0 1 156642 CASAVA_Build 3 5532583 1I CTAATGCTAT -/C CCCCCCCCTC 1210 het 962 hom 10 4 4 2 C 8 9 156643 CASAVA_Build 3 5537807 2I ATGTGGACAA --/GT GTAACTTTAA 3070 het 3070 hom 57 23 29 5 GT 1 2 156644 CASAVA_Build 3 5540837 1I ACATGTGCAC -/A ACGTGCAGGT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 1 2 156645 CASAVA_Build 3 5544833 2I AACTCATCCA --/TT TTTATGGCTG 3070 het 2233 hom 23 7 11 5 T 3 5 156646 CASAVA_Build 3 5546709 15D TCCCTTGTTG TTGAGTTGTGAACCT/--------------- TTGGAGGAGA 3070 het 3070 ref 24 17 11 1 TTGAGTTGTGAACCT 1 0 156647 CASAVA_Build 3 5547079 1D TTGGAGCTCT C/- CTGTATGAGG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 2 1 156648 CASAVA_Build 3 5552440 1I CTTTGACACA -/C CCCCTGGGGA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 C 4 5 156649 CASAVA_Build 3 5565871 1I CACCGATGTA -/C CCCTCACAGG 3070 hom 119 het 46 0 33 13 C 3 4 156650 CASAVA_Build 3 5569753 1I AGCTGTACTG -/C CTCCTGTACC 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 C 1 2 156651 CASAVA_Build 3 5570547 1D AGGTAGAGGA G/- GGTGGTACAG 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 G 3 2 156652 CASAVA_Build 3 5570706 1D GCATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2941 hom 31 12 13 6 T 12 11 156653 CASAVA_Build 3 5579034 1I AAGGCTGAAG -/C CCACTTATGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 2 3 156654 CASAVA_Build 3 5582567 1D TGCATTGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 853 hom 33 4 13 16 T 16 15 156655 CASAVA_Build 3 5588413 1D TATAACTTTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 A 10 9 156656 CASAVA_Build 3 5591476 1I GCCATCAGGA -/G GGGGCATTAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 4 5 156657 CASAVA_Build 3 5598043 2I TGTAAAACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 17 17 12 AC 6 7 156658 CASAVA_Build 3 5599114 1D ACATTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 35 0 28 7 A 11 10 156659 CASAVA_Build 3 5604663 2D1M3I GAAAAAAAAA TGA---/--AACG AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 N/A 0 0 156660 CASAVA_Build 3 5605308 1D GAACCATGTA T/- TTTGCTTTTT 3070 het 3070 hom 61 23 29 9 T 4 3 156661 CASAVA_Build 3 5605752 2I TGGGCAGGCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 T 9 11 156662 CASAVA_Build 3 5607489 5I CTATCTGTTC -----/TTTAT TTTATTTTAT 3070 het 1962 hom 18 6 10 2 TTTAT 2 3 156663 CASAVA_Build 3 5607667 1D AACAGGCCCC A/- GTGTGTGATG 1967 het 657 hom 10 4 5 1 A 1 0 156664 CASAVA_Build 3 5615588 4D TCCCAGCCAA AATG/---- AATGAGACTC 3070 het 3070 hom 38 14 19 8 AATG 2 1 156665 CASAVA_Build 3 5618120 4I AAATAAAGAT ----/AAAC AAAGTCTCTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 AAAC 0 1 156666 CASAVA_Build 3 5624580 2I ATGTTGAGGC --/GA GAGAGAGAAT 3070 het 2874 hom 29 8 16 5 GA 4 5 156667 CASAVA_Build 3 5628857 1I CCTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 9 10 156668 CASAVA_Build 3 5641205 4I ATGATATTAT ----/TTTC TTTATTTAAA 3070 het 3070 hom 31 8 20 3 TTTC 0 1 156669 CASAVA_Build 3 5641305 1I ATTCCAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 T 14 15 156670 CASAVA_Build 3 5644189 1I GGACTGAGAA -/C ACCCTTTGTA 3070 het 3070 ref 37 17 19 1 C 0 1 156671 CASAVA_Build 3 5646335 2D CCCAAATTTC AT/-- ATATATATAT 2927 het 1020 hom 12 3 7 2 AT 7 6 156672 CASAVA_Build 3 5664747 4I TAAGTAAAAA ----/AAAC AAAAAAAAAA 3070 het 506 hom 21 3 13 5 AAAC 0 1 156673 CASAVA_Build 3 5665298 8I TATATGTTAA --------/TATATTAT TATATTATTA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TATATTAT 1 2 156674 CASAVA_Build 3 5665308 8I TATATTATTA --------/TATTATTG TATGTTCAAA 3070 het 46 hom 18 2 12 4 TATTATTG 0 1 156675 CASAVA_Build 3 5672468 1D GATTTGGAGT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 8 7 156676 CASAVA_Build 3 5674483 2I TTTACCCCAC --/AG AGGGCTATGA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AG 1 2 156677 CASAVA_Build 3 5675647 2I TTTGCAGTGA --/GT GTTACTGTTC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 GT 1 2 156678 CASAVA_Build 3 5676181 3I GGCTTTCCAA ---/TTC TTCTTCCACC 3070 het 3070 ref 42 20 10 12 TTC 2 3 156679 CASAVA_Build 3 5676281 2I AAAATGCCCT --/TC TGTCTTCACC 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 TC 0 1 156680 CASAVA_Build 3 5678360 10I CTGGACCATC ----------/CCCAAAGTAG GCTGCCAGGG 3070 het 3070 ref 51 26 22 4 CCCAAAGTAG 0 1 156681 CASAVA_Build 3 5681248 2I AGCAGGAGCA --/AG AGAGAAGGGG 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 AG 2 3 156682 CASAVA_Build 3 5681345 1I GGATCGACTG -/C CATGACCCAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 C 1 2 156683 CASAVA_Build 3 5686502 13D ACTATTTACT TAGAAGAGACTCC/------------- TAGAATGTAT 3070 het 3070 ref 38 23 16 2 TAGAAGAGACTCC 1 0 156684 CASAVA_Build 3 5697682 1I ATTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 122 hom 25 1 17 7 T 11 12 156685 CASAVA_Build 3 5700393 1D TCCTCTCTTT G/- GGGGAAATTA 3070 hom 108 het 40 0 36 6 G 5 4 156686 CASAVA_Build 3 5707349 4I GGCCCTTTTT ----/ATAA ATAAAGTTTT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 ATAA 1 2 156687 CASAVA_Build 3 5710558 1D AAACTGATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 26 13 T 11 10 156688 CASAVA_Build 3 5710655 1D TCCAAGGAGC T/- TGTTCAGATT 3070 hom 92 het 35 0 30 5 T 2 1 156689 CASAVA_Build 3 5723239 1D CCCAACCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2435 hom 20 8 9 3 T 11 10 156690 CASAVA_Build 3 5724217 1I TCTTTCTCTC -/T TTGACTTTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 3 156691 CASAVA_Build 3 5742385 3D TAGTCTGTGT TTA/--- TTATATTTCC 3070 hom 102 het 38 0 35 6 TTA 2 1 156692 CASAVA_Build 3 5758566 1I ATTAAAAATG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 A 8 9 156693 CASAVA_Build 3 5770891 3D ATTAAAGCTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2605 hom 27 7 13 7 A 13 10 156694 CASAVA_Build 3 5776701 1I CACACACACT -/C CCCCTTCCAG 1806 het 1247 hom 8 3 5 0 C 4 5 156695 CASAVA_Build 3 5786557 4I AACAGATAAA ----/TGAT TGAATGAATA 2104 het 2104 ref 34 16 9 11 TGAT 0 1 156696 CASAVA_Build 3 5807941 1D TCTTACCACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 79 het 35 0 27 8 T 10 9 156697 CASAVA_Build 3 5811741 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 27 1 20 7 A 16 15 156698 CASAVA_Build 3 5811757 1D AAAAAAAAAA G/- AATTTTGAAT 3070 het 329 hom 30 7 14 10 G 1 0 156699 CASAVA_Build 3 5812352 2D GGTACAATTT TA/-- TAGTTTTAAA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 TA 2 1 156700 CASAVA_Build 3 5813065 8D27M8D ATTTCCTTCC TTCCTTCATTCCTTCATTCCTTCCTTCCTTCCTATCTACCTAC/--------TTCCTTCATTCCTTCCTTCCTTCCTAT-------- CTACCTACCT 3070 hom 110 het 39 0 35 18 N/A 0 0 156701 CASAVA_Build 3 5816173 1I TAAATACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 988 hom 32 4 18 10 T 15 16 156702 CASAVA_Build 3 5817875 1D GAATTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 33 0 24 10 A 12 11 156703 CASAVA_Build 3 5820060 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTGTTAC 1991 hom 13 het 9 0 4 5 TGTT 1 0 156704 CASAVA_Build 3 5820126 2D ATCCTGAGAC TT/-- TGCTGAAGTT 1453 hom 7 het 3 0 3 0 T 3 1 156705 CASAVA_Build 3 5822702 1D AAGTCATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 42 0 33 10 T 12 11 156706 CASAVA_Build 3 5824820 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 9 156707 CASAVA_Build 3 5827861 1D GTCATTCAAG C/- CTTATAAACA 3070 hom 116 het 44 0 39 6 C 2 1 156708 CASAVA_Build 3 5837545 1D TGGACCTATA G/- GACAAATCTC 2056 het 2056 ref 32 16 7 9 G 2 1 156709 CASAVA_Build 3 5848873 4I GCCCATTTTT ----/AATC AATCAGACTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AATC 1 2 156710 CASAVA_Build 3 5860124 1D AAATGAAGCA T/- TTTTTTGTGC 3070 hom 86 het 34 0 29 5 T 7 6 156711 CASAVA_Build 3 5868561 3I TAGGGCTGTT ---/GTA TGGGCTCTGT 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 GTA 0 1 156712 CASAVA_Build 3 5873558 1D GCTTATTTAT C/- ATTACCCTAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 C 1 0 156713 CASAVA_Build 3 5874437 1I CCAGTAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 10 11 156714 CASAVA_Build 3 5878878 1D CATTCCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 22 16 12 T 12 11 156715 CASAVA_Build 3 5882143 1D TGCAAAACAG C/- CCAGCCTCCG 3070 hom 90 het 34 0 30 5 C 3 2 156716 CASAVA_Build 3 5899385 1D GCTTGGCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 14 13 156717 CASAVA_Build 3 5902215 1D AGCATTAACT A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 2 1 156718 CASAVA_Build 3 5908910 3I TGACCATATG ---/GCC GCCACAGTAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 GCC 1 2 156719 CASAVA_Build 3 5910237 3D AGGGGGTTAT CAA/--- GGTTTATGAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 CAA 1 0 156720 CASAVA_Build 3 5911588 1D CTAAAAATAT A/- AAATGGTTCA 3070 het 3070 hom 44 13 27 5 A 4 3 156721 CASAVA_Build 3 5915622 1I CTACACAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 9 10 156722 CASAVA_Build 3 5921027 1D CATTATGCTA C/- CAATCTGCTA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 C 2 1 156723 CASAVA_Build 3 5923830 1D TCTATTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 13 9 T 12 11 156724 CASAVA_Build 3 5924616 1D TTCAGTGTCA T/- AGATTTTGCT 3070 het 3070 hom 52 22 26 5 T 1 0 156725 CASAVA_Build 3 5926195 1D TGTTGTTTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 383 hom 43 1 36 7 T 10 9 156726 CASAVA_Build 3 5926508 1D TTCCTAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 12 11 156727 CASAVA_Build 3 5927701 21D ACTTTTGGTT TTGTTGGTTTTTTGGTATAAA/--------------------- TTTTTGGGCC 3070 het 3070 ref 39 20 13 8 TTGTTGGTTTTTTGGTATAAA 1 0 156728 CASAVA_Build 3 5927765 5I ATTTTAGTTA -----/TTTCT TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 TTTCT 1 2 156729 CASAVA_Build 3 5928694 1D TTCCTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 935 hom 17 2 9 6 T 11 10 156730 CASAVA_Build 3 5930531 3D TGTCTGTTGT TGG/--- TGTATAAGAA 2938 het 282 hom 8 2 6 1 TGG 1 0 156731 CASAVA_Build 3 5931511 2D ATTTGAGAGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 19 16 5 T 11 9 156732 CASAVA_Build 3 5933492 4D TTTGTACTCT TTAA/---- TTCTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 TTAA 1 0 156733 CASAVA_Build 3 5949236 1D GGTAATGTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 T 10 9 156734 CASAVA_Build 3 5958059 1I CTGATGGTAG -/T TTGTTTTTCT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 2 3 156735 CASAVA_Build 3 5981519 1D TTGGCATCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 8 156736 CASAVA_Build 3 5984169 16I GATAAATTTT ----------------/CCTTCCTCCCTCCCTC CCTTCCTCCC 3070 hom 49 het 22 0 13 9 CCTTCCTCCCTCCCTC 0 1 156737 CASAVA_Build 3 5985337 1D GTGAAGTATT A/- GCTGAAACCT 3070 het 3070 hom 34 10 21 4 A 1 0 156738 CASAVA_Build 3 5994155 1D TTTTTCCCCC T/- CCCGCCAACT 3070 het 3070 ref 41 21 15 7 T 1 0 156739 CASAVA_Build 3 5994793 1D GGATTACTGC T/- TCTGCAGATT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 2 1 156740 CASAVA_Build 3 5995643 20D TCAGGGGCTC CTGAATGGTTCTAGAAGATT/-------------------- CTGAATGTAT 3070 het 3070 ref 36 19 17 4 CTGAATGGTTCTAGAAGATT 1 0 156741 CASAVA_Build 3 5995833 1I TCTTAGGATC -/A AAGGAGAATT 3070 hom 126 het 46 0 41 5 A 2 3 156742 CASAVA_Build 3 5997211 22D AGGCCAGATA GTAAATATTTTCAGCTTTGCTG/---------------------- GTAAATATTT 2078 het 2078 ref 27 23 6 11 GTAAATATTTTCAGCTTTGCTG 2 1 156743 CASAVA_Build 3 6006453 2I ACACTCACAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 108 het 52 0 36 16 AC 5 6 156744 CASAVA_Build 3 6007798 2I TTTAGAGGTT --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 86 het 32 0 30 2 A 8 10 156745 CASAVA_Build 3 6009833 4I ATGTAAAGAA ----/AGAG AGAGATTTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AG 2 4 156746 CASAVA_Build 3 6010409 1D TATATAAAAA T/- ATATATATAG 1728 het 1728 ref 12 6 4 2 T 1 0 156747 CASAVA_Build 3 6012386 1D TGGGCTTTGC A/- AATACCACAT 3070 het 3070 hom 52 20 26 6 A 3 2 156748 CASAVA_Build 3 6022328 1I72M1I TGCCTAAATC -ATCTGTACAGCAGATTCCTCTAATCCAAATTGATTATGCTGATTTGTTCATAGATGGTCTATAACCCAATGC-/AATCTGTACAGCAGATTCCTCTAATCCAAATTGATTATGCTGATTTGTTCATAGATGGTCTATAACCCAATGCA AAGCTATGCA 3070 hom 184 het 47 0 62 6 N/A 0 0 156749 CASAVA_Build 3 6032279 1I CCTTCTTTTG -/T TAAAAAGATG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 2 156750 CASAVA_Build 3 6032860 4D AGTTGAAATC ATTA/---- AATAAATATA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 ATTA 1 0 156751 CASAVA_Build 3 6036764 1I AATGGGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2456 hom 33 8 16 9 A 13 14 156752 CASAVA_Build 3 6046019 1I CTCCATCCAG -/T TTTGTTCCCT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 3 4 156753 CASAVA_Build 3 6054007 1I CATCTCCAAT -/G GGCAGTGCCC 3070 hom 98 het 39 0 32 7 G 2 3 156754 CASAVA_Build 3 6055536 1I15M1I10M1I TGCAAAAGGC -AGGGAGAAAATAAAG-AAAACAGGAC-/AAGGGAGAAAATAAAGAAAAACAGGACA ATTGAGTACT 3070 hom 66 het 24 0 23 7 N/A 0 0 156755 CASAVA_Build 3 6057921 1I CTGTTTTTGA -/T TCCCCCCACC 3070 hom 151 het 57 0 50 7 T 1 2 156756 CASAVA_Build 3 6059449 1D ACTGTAGTAT A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 7 6 156757 CASAVA_Build 3 6060120 3I TGAGAGGCAG ---/TAA AGGTTGTTTA 3070 het 3070 hom 45 23 21 1 TAA 0 1 156758 CASAVA_Build 3 6069784 3I AAAAAATGTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 32 0 17 15 A 12 15 156759 CASAVA_Build 3 6077837 3I ATTAAACTCT ---/GTC GTCTTAAGAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 GTC 1 2 156760 CASAVA_Build 3 6080891 5D AATACATTTA TTATG/----- TTATATATTT 2771 hom 24 het 9 0 8 1 TTATG 1 0 156761 CASAVA_Build 3 6080958 5I13M4D TATAATTTGT -----TATATACATATGCATAG/TATAATATATACATATGC---- ATAATGTACA 3070 hom 36 het 13 0 13 1 N/A 0 0 156762 CASAVA_Build 3 6081703 1D AATCGCCCAT C/- CCAATGGAAA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 3 2 156763 CASAVA_Build 3 6081937 1I AACTTGATGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 260 hom 37 1 33 3 A 8 9 156764 CASAVA_Build 3 6085639 1D TTTTTTTTTT A/- AACTATATCA 2821 het 2821 ref 32 14 12 6 A 3 2 156765 CASAVA_Build 3 6091868 1D CCAGCAAGGA T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 47 0 38 11 T 2 1 156766 CASAVA_Build 3 6093855 2D GTGATACAAA GT/-- GTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 GT 2 1 156767 CASAVA_Build 3 6094686 1D AGATTTTCCT G/- GATTATCTGG 3070 hom 126 het 50 0 42 8 G 2 1 156768 CASAVA_Build 3 6098190 4D ATACCAAGAA AGAC/---- AGCCAAATCC 3070 het 3070 hom 52 23 27 3 AGAC 1 0 156769 CASAVA_Build 3 6115122 1I GGATCAGTTA -/G GGACTAGGGC 3070 het 3070 hom 36 9 21 6 G 2 3 156770 CASAVA_Build 3 6121922 4D TTTTTCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 2956 hom 27 11 8 10 TCTT 3 2 156771 CASAVA_Build 3 6134670 14D AGCAATAAAT CAAGTTATTATGTC/-------------- CAAACAGCAA 3070 het 3070 ref 47 25 22 5 CAAGTTATTATGTC 1 0 156772 CASAVA_Build 3 6136019 3D TAAAATAACA AAG/--- AAGAAGAATA 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 AAG 3 2 156773 CASAVA_Build 3 6145688 2I AAGATATGTA --/CT CTCTCTTTCT 3070 het 3070 hom 52 19 30 3 CT 3 4 156774 CASAVA_Build 3 6145794 1I CAGACTGTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 9 10 156775 CASAVA_Build 3 6148350 3D TTTTCTTTTC TTA/--- TTATTTGTAT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 TTA 2 1 156776 CASAVA_Build 3 6152036 1I TGTATATATA -/C CCCGTAGTGG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 C 3 4 156777 CASAVA_Build 3 6155352 1D ATTGATCTGT A/- AATCTTCAGG 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 A 3 2 156778 CASAVA_Build 3 6182429 1D GAGAAAATGA T/- TTTTTTTTTT 850 het 850 ref 39 28 3 8 T 12 11 156779 CASAVA_Build 3 6185955 4D TGTGGAAAAT CATA/---- CATACACTGT 3070 het 3070 ref 64 30 31 7 CATA 2 1 156780 CASAVA_Build 3 6189334 1I GTGAGAAAAG -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 6 7 156781 CASAVA_Build 3 6190797 5D AGTTTTTTTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1907 hom 28 10 9 9 A 21 16 156782 CASAVA_Build 3 6194071 1D CATTATAGTT C/- TCAATAATAA 3070 het 3070 ref 32 21 8 4 C 1 0 156783 CASAVA_Build 3 6194660 1D ATCATGGTGA T/- TTTTAGAGGA 3070 het 3070 ref 43 28 13 3 T 5 4 156784 CASAVA_Build 3 6196263 1D CCATCAGAGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 A 9 8 156785 CASAVA_Build 3 6200130 1D GAGCTTCACA T/- TGCAATGCTT 3070 hom 126 het 53 0 43 11 T 2 1 156786 CASAVA_Build 3 6210093 1I CTAAGGATGA -/C CCCCCCATGA 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 C 6 7 156787 CASAVA_Build 3 6211714 2D AGTATGCATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2312 hom 29 9 11 10 T 12 10 156788 CASAVA_Build 3 6213250 5D CTATTTTGGT ACTTA/----- ACTTATTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 ACTTA 2 1 156789 CASAVA_Build 3 6215330 1D ATAATGAAAG T/- TCTTTTCTAA 3070 hom 75 het 37 0 25 12 T 2 1 156790 CASAVA_Build 3 6215387 1D TTTCTGGAAA T/- TGCCTTTATT 3070 hom 85 het 45 0 29 22 T 2 1 156791 CASAVA_Build 3 6215655 4D AGGACTGAGC GATT/---- GATTACCTGG 3070 het 3070 hom 51 22 23 7 GATT 2 1 156792 CASAVA_Build 3 6217449 1I AAGATGTTAC -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 6 7 156793 CASAVA_Build 3 6220526 1D AGGACAGAGA G/- GGGAAAAAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 4 3 156794 CASAVA_Build 3 6227853 13D TGGAAATGAT AAAAATGAAAAAA/------------- GAAAAAATAA 756 het 756 ref 36 18 4 17 AAAAATGAAAAAA 1 0 156795 CASAVA_Build 3 6228895 4D CAATAATCTT ATTA/---- ATTATGTGAG 3070 het 2550 hom 18 6 11 2 ATTA 2 1 156796 CASAVA_Build 3 6235571 1I TCTTTCAAAC -/A AAAATGTTCT 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 A 4 5 156797 CASAVA_Build 3 6244064 6I CACTAGTGCT ------/CTCTCC CTCTCCCTCT 3070 het 2392 hom 41 11 12 18 CTCTCC 1 2 156798 CASAVA_Build 3 6247793 4D CTCTCTCTAT TCTG/---- TCTGTCTTCC 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 TCTG 2 1 156799 CASAVA_Build 3 6261997 5I CTTGCTTTTC -----/TGATA TAAGAATACA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 TGATA 0 1 156800 CASAVA_Build 3 6264813 6D TCAGATGAGT CACGTA/------ CACGTACACG 3070 het 3070 ref 60 24 22 19 CACGTA 3 2 156801 CASAVA_Build 3 6267104 3D CCATTTCTAT CTG/--- CTGCTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 CTG 2 1 156802 CASAVA_Build 3 6270746 1D CAAAAGAAAC T/- TATCAATGGC 3070 het 3070 ref 47 27 14 6 T 2 1 156803 CASAVA_Build 3 6274702 2I TAATACATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 AC 7 8 156804 CASAVA_Build 3 6281133 4D AAGTAGCAAA ATTT/---- ATTCAGCACC 3070 het 3070 ref 41 23 16 5 ATTT 1 0 156805 CASAVA_Build 3 6282187 1D CCGATTGCAG A/- AAATTTAGGA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 4 3 156806 CASAVA_Build 3 6283548 1D CTTTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 1956 het 1956 ref 22 11 5 6 A 13 12 156807 CASAVA_Build 3 6289506 1D AAAGGGAACT C/- CCCTGACCCC 3070 het 766 hom 20 4 14 2 C 4 3 156808 CASAVA_Build 3 6301417 1D CTCAAAAACC A/- GGGTGTCTCC 3070 het 3070 hom 38 17 17 7 A 1 0 156809 CASAVA_Build 3 6305077 5I CCAACTTCAA -----/ACTAT ACTATAAGAC 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 ACTAT 1 2 156810 CASAVA_Build 3 6310054 1I CATATCCCAT -/A AAACCTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 3 4 156811 CASAVA_Build 3 6312188 1D GCACTCCAGC A/- CTGGGTGACA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 1 0 156812 CASAVA_Build 3 6312980 1I CATATACAAA -/T TGTGAAGTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 2 156813 CASAVA_Build 3 6314844 1D TTCAAGGAGA T/- TTTGTCCTAT 3070 het 3070 ref 51 24 26 1 T 4 3 156814 CASAVA_Build 3 6319017 3I TAATTTTGTT ---/TTA TTTATATATG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TTA 0 1 156815 CASAVA_Build 3 6321410 1I ACTAAGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 11 12 156816 CASAVA_Build 3 6329547 3I CTCTTTCATC ---/TAT TATTAATTGC 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 TAT 1 2 156817 CASAVA_Build 3 6332087 1D AAAGTGTAAC A/- AAAAAAAAAA 2783 het 1271 hom 25 5 10 10 A 14 13 156818 CASAVA_Build 3 6340536 1D CTTGATAAAC A/- ATACAATTTC 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 A 2 1 156819 CASAVA_Build 3 6364589 28D GTGTGTATGC ATATGCATATGTATATACGTATGTATGT/---------------------------- ATACACACAC 2534 het 2534 ref 20 16 8 2 ATATGCATATGTATATACGTATGTATGT 1 0 156820 CASAVA_Build 3 6384345 1D GCCTGGGCAG T/- TGGAAGGATT 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 T 2 1 156821 CASAVA_Build 3 6399452 1D TTGACCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 36 0 26 11 A 11 10 156822 CASAVA_Build 3 6400412 3D TGAATTTAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 37 16 14 10 AAG 5 4 156823 CASAVA_Build 3 6414482 1I CATCCTGGCT -/C AAAAAGCTAC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 C 0 1 156824 CASAVA_Build 3 6420487 1D CTGAGGCGGG T/- GGATCACGAG 3070 hom 48 het 20 0 17 4 T 1 0 156825 CASAVA_Build 3 6433861 1D CTGTGGGGGC G/- GGGGGGGGCA 3070 het 143 hom 20 1 18 1 G 9 8 156826 CASAVA_Build 3 6437881 1I TTCTAATTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 10 156827 CASAVA_Build 3 6440130 1D TGTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 331 hom 27 1 19 7 T 11 10 156828 CASAVA_Build 3 6447317 1D CTTTCATGAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 9 8 156829 CASAVA_Build 3 6449205 1D AAGAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 2796 het 2796 ref 30 15 10 5 A 11 10 156830 CASAVA_Build 3 6449595 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1384 hom 13 3 9 1 A 11 10 156831 CASAVA_Build 3 6449858 1D GCTTTTTAAA T/- GAACTTGTCT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 1 0 156832 CASAVA_Build 3 6460413 1D CAGATGTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 A 13 12 156833 CASAVA_Build 3 6461416 1D CCCACTGAAG T/- TTTCGCTTCT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 4 3 156834 CASAVA_Build 3 6465876 1D AACAGAAGAA T/- TAGGGGAATA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 2 1 156835 CASAVA_Build 3 6467272 1D GACAGGATTT A/- AAAAAAAAAA 1441 het 1441 ref 34 18 8 8 A 15 14 156836 CASAVA_Build 3 6468984 1D CTTAGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 11 10 156837 CASAVA_Build 3 6474865 1D TCTTTCACTT A/- AGCATTATGT 3070 hom 141 het 57 0 48 9 A 2 1 156838 CASAVA_Build 3 6478662 3I CAGTATTGTT ---/ATC ATATATTTAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 ATC 0 1 156839 CASAVA_Build 3 6481625 1D CCAACTAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 A 12 11 156840 CASAVA_Build 3 6487848 4D CTCCCACTTA TTTC/---- TTTCTGTCTT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 TTTC 2 1 156841 CASAVA_Build 3 6488629 4D3M4D GGGTCATTTC ACAGCCCGACA/----CTC---- AGTAAATCCT 3070 het 3070 hom 35 15 20 5 N/A 0 0 156842 CASAVA_Build 3 6501599 1D TTACATTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1599 hom 14 4 9 1 T 10 9 156843 CASAVA_Build 3 6512909 24D TTTTGAAGAA GAGCACATTTGAATGAGGCTCTAG/------------------------ GTGTGAGGAG 3070 het 3070 ref 44 36 12 7 GAGCACATTTGAATGAGGCTCTAG 1 0 156844 CASAVA_Build 3 6517349 1D ATAATGCAAC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 A 8 7 156845 CASAVA_Build 3 6518499 3D TTTTAAAATT TAA/--- TAATACCAAT 3070 het 2972 hom 19 6 13 1 TAA 2 1 156846 CASAVA_Build 3 6519108 4D ACATATCCAA TCAT/---- TCATATCTCA 3070 het 3070 hom 33 10 20 5 TCAT 2 1 156847 CASAVA_Build 3 6534499 1D GTTTATTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 9 8 156848 CASAVA_Build 3 6574795 2I TCCACTCGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 A 12 14 156849 CASAVA_Build 3 6583898 2I AAAACTCCGG --/AA AAAAAAAAAA 2459 het 2378 hom 24 7 10 7 A 14 16 156850 CASAVA_Build 3 6585900 1D TTGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 12 16 17 T 15 14 156851 CASAVA_Build 3 6595316 1I TAAATAAATT -/C CAGAAATAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 1 2 156852 CASAVA_Build 3 6598138 4D AAATAAAAAT AAAA/---- AAAACTTTAT 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 A 8 4 156853 CASAVA_Build 3 6602411 5I TGATAATATC -----/TTTCA TTTCTGGTAT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 TTTCA 0 1 156854 CASAVA_Build 3 6617247 4I AAGAAAAAAA ----/AGAG AGAAAAGTTG 3070 het 3070 hom 48 22 18 8 AG 1 3 156855 CASAVA_Build 3 6630694 1I CACAAATTTT -/G TATGTCTTTT 3070 het 3070 ref 37 24 8 5 G 0 1 156856 CASAVA_Build 3 6637621 1I TCTTGCATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 9 10 156857 CASAVA_Build 3 6641356 1I CAGGAGACTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 8 9 156858 CASAVA_Build 3 6651664 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 49 28 14 7 A 9 10 156859 CASAVA_Build 3 6651905 1I AAAAGTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 44 0 33 11 T 13 14 156860 CASAVA_Build 3 6653297 2D AATGAATATC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 13 14 13 T 11 9 156861 CASAVA_Build 3 6655146 1D TGTGGATTAC A/- AAAATTTCTA 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 A 5 4 156862 CASAVA_Build 3 6655871 2I ACAAAACCAG --/AC ACACAAATAG 3070 het 3070 ref 48 31 14 3 AC 2 3 156863 CASAVA_Build 3 6668198 1I GGGGCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 2023 het 2023 ref 45 27 6 12 T 14 15 156864 CASAVA_Build 3 6703425 4D CTTCAAAGAA AACT/---- AACTCAGAGG 3070 hom 102 het 36 0 34 4 AACT 2 1 156865 CASAVA_Build 3 6711598 2D GCCAGAAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 29 6 12 12 T 12 10 156866 CASAVA_Build 3 6712384 5I AGGTACAAAA -----/TAAAG TATTGTTTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TAAAG 0 1 156867 CASAVA_Build 3 6716273 1D CCTAAAGGGG C/- CAGAGAACAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 C 2 1 156868 CASAVA_Build 3 6718840 6D GGGTAAAAAA TAAAAT/------ TAAGGCAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 10 4 TAAAAT 1 0 156869 CASAVA_Build 3 6719135 9D ACAAAAAGTT TGTTCTTTG/--------- TGTTCTTTGA 3070 het 3070 ref 29 15 14 6 TGTTCTTTG 2 1 156870 CASAVA_Build 3 6719463 1I AAAGAAAAAA -/C CTGCCAACCA 3070 het 3070 ref 37 24 9 4 C 1 2 156871 CASAVA_Build 3 6722467 3D TTGTCAACAA AAT/--- GTTTGTTAGT 2931 het 2687 hom 15 8 6 2 AAT 1 0 156872 CASAVA_Build 3 6734626 2D AAGGAAAAGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 102 het 46 0 33 13 TC 10 9 156873 CASAVA_Build 3 6738868 4D ATTTAACCAA TTGT/---- TTGTGTGTGT 3070 hom 168 het 58 0 56 2 TTGT 2 1 156874 CASAVA_Build 3 6743421 1I GGGCTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 38 1 32 5 A 10 11 156875 CASAVA_Build 3 6746599 1I ACCAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 31 0 24 7 A 10 11 156876 CASAVA_Build 3 6760920 1I AGTTTTGTGT -/C ATTTTTTGAA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 0 1 156877 CASAVA_Build 3 6766372 2I GTTTTTTTCT --/TA GTTTTAGATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TA 0 1 156878 CASAVA_Build 3 6769206 1I CTAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 396 hom 41 1 36 4 A 9 10 156879 CASAVA_Build 3 6774042 1I AAAAAATGAC -/A AAGGTATGAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 2 3 156880 CASAVA_Build 3 6776002 4I AATAGAAAAA ----/AAAC AAACAATGTC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AAAC 1 2 156881 CASAVA_Build 3 6777092 8D CCCGTTGACG TACCTATT/-------- TATATTTGAA 3070 hom 129 het 46 0 43 3 TACCTATT 1 0 156882 CASAVA_Build 3 6784282 1D TGTGGTGCTG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 8 7 156883 CASAVA_Build 3 6798190 1I TGGTCTCCAA -/G GGAGAGGAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 2 3 156884 CASAVA_Build 3 6813252 1D TGTGGTTTAC A/- AAAAAAAAAA 1832 het 1832 ref 38 27 4 8 A 11 10 156885 CASAVA_Build 3 6814511 2D TAGGGCCCCA CC/-- CCCAATGGTT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 C 5 3 156886 CASAVA_Build 3 6816053 1D GCATTCATTG A/- AAAAAAAAAA 1363 het 1363 ref 48 29 4 15 A 15 14 156887 CASAVA_Build 3 6818325 1D TTAGTCCGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 33 0 27 7 T 11 10 156888 CASAVA_Build 3 6852952 1D CAGATTAACT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 9 156889 CASAVA_Build 3 6860254 1I GCTTCTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 536 hom 33 3 23 7 T 12 13 156890 CASAVA_Build 3 6879415 1I CTCCTCCCCC -/A CCGCCCCCCT 742 het 584 hom 14 4 3 7 A 0 1 156891 CASAVA_Build 3 6882235 1D TTCAGGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 511 hom 40 2 26 13 T 15 14 156892 CASAVA_Build 3 6937243 1D ACTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1439 hom 28 5 9 14 A 15 14 156893 CASAVA_Build 3 6940014 1D CACGAACATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 10 9 156894 CASAVA_Build 3 6949590 1I CACAGGCACC -/T TACCACCATG 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 T 1 2 156895 CASAVA_Build 3 6950461 2I CAGTTATTCT --/CA GAGTCAGGTA 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 CA 0 1 156896 CASAVA_Build 3 6952098 1D ATATGGCAAA G/- CTCAAAGAAT 3070 het 3070 hom 38 16 15 9 G 1 0 156897 CASAVA_Build 3 6958831 1I TTTTCAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 T 10 11 156898 CASAVA_Build 3 6965744 6I CCATTTACAT ------/TTAACA TTAAGGTTAG 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 TTAACA 0 1 156899 CASAVA_Build 3 6970753 1D AAAAAATTGG T/- ATATTATGTA 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 T 1 0 156900 CASAVA_Build 3 6972529 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 13 13 A 14 15 156901 CASAVA_Build 3 6974927 1D GGTATCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1567 hom 26 9 10 7 T 12 11 156902 CASAVA_Build 3 6980270 1D CCTCCAGCCT G/- GGTGACAGAG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 G 3 2 156903 CASAVA_Build 3 6986899 10I AACTGCTCCA ----------/AAACTTTCCC AGACTTTCCC 3070 hom 98 het 36 0 33 3 AAACTTTCCC 0 1 156904 CASAVA_Build 3 6994743 2D TTATTGGGCT CA/-- CAATAGAGTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 CA 2 1 156905 CASAVA_Build 3 7000491 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 10 9 156906 CASAVA_Build 3 7003095 2I AATGAAAAAT --/GA AATGAACATT 3070 het 3070 hom 39 11 24 4 GA 0 1 156907 CASAVA_Build 3 7012745 1I CTACAATATA -/T TTTTTTTTTG 2156 het 1333 hom 11 4 5 2 T 9 10 156908 CASAVA_Build 3 7018384 1I AATTAATTTA -/T TTTTTGAACA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 5 6 156909 CASAVA_Build 3 7024803 1D TGAGAATGCG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 41 0 33 9 T 10 9 156910 CASAVA_Build 3 7028121 1D ATGTTCCACC A/- AAAGCCTTAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 4 3 156911 CASAVA_Build 3 7029833 1I AAAAAAAAAA -/C GTTCAGAAAC 3070 het 862 hom 30 2 22 6 C 0 1 156912 CASAVA_Build 3 7032808 2D AGGGCTTTGA TC/-- TATCTGGGCT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TC 1 0 156913 CASAVA_Build 3 7036338 4I GCATCTCTTC ----/TACT TACTTTTTAT 1295 het 1295 ref 51 41 3 7 TACT 1 2 156914 CASAVA_Build 3 7039723 1D GGGAGAATGG A/- TGGACATGGG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 1 0 156915 CASAVA_Build 3 7053487 8D TTTATATAAC TTGCTATA/-------- TATAACTATT 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TTGCTATA 1 0 156916 CASAVA_Build 3 7059357 1I CTAAAAGTTA -/T TATTTTCATC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 1 2 156917 CASAVA_Build 3 7152983 1I TGGTTCCTGA -/G GGGGAGAGGA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 G 4 5 156918 CASAVA_Build 3 7154437 1I TTGGAGTGGT -/G GCAATTCAGG 3070 hom 161 het 63 0 52 11 G 1 2 156919 CASAVA_Build 3 7203888 6D GGAAGTGAGA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 AC 12 9 156920 CASAVA_Build 3 7214387 1D TTACGACAAG T/- TTTTTTTTTT 1500 het 1500 ref 35 23 5 7 T 13 12 156921 CASAVA_Build 3 7234555 5I AAAAATAAAA -----/TAAAT TCTACATTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TAAAT 0 1 156922 CASAVA_Build 3 7240213 1D GTTCTTTATC A/- AAAAAAGCTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 7 6 156923 CASAVA_Build 3 7267091 1D AAATATATTT G/- GTGTTGATAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 2 1 156924 CASAVA_Build 3 7279425 1D GCTTTGTCAC A/- CCAGGCTGGA 3070 hom 74 het 29 0 24 5 A 1 0 156925 CASAVA_Build 3 7279637 1I CACCCACCAT -/G GCCTCTCAAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 G 1 2 156926 CASAVA_Build 3 7281241 1D GCCCCATGCA G/- GAGTTGCCAG 3070 hom 129 het 51 0 39 14 G 2 1 156927 CASAVA_Build 3 7281467 1D11M1I19M1I CTCTCTATGG TATCTTCCAGTA-CTGCGGTACTTCCAGTACA-/-ATCTTCCAGTACCTGCGGTACTTCCAGTACAG GGCCACAAAG 3070 hom 126 het 43 0 40 10 N/A 0 0 156928 CASAVA_Build 3 7281563 1I TTAAAGCAGA -/T TGCATTACAC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 1 2 156929 CASAVA_Build 3 7286132 2D GATGCCTGAA CC/-- CCCCCCCCAG 3070 hom 99 het 37 0 32 5 C 10 8 156930 CASAVA_Build 3 7286944 6D ATCTGTGCAC TTATAA/------ TTATGTTAAC 3070 hom 117 het 44 0 40 5 TTATAA 1 0 156931 CASAVA_Build 3 7289919 1D29M1D9M1I TATGATTTCT AATTTTAAAATAATGTGTTGAGATGTGTTTGTATGGCCCA-/-ATTTTAAAATAATGTGTTGAGATGTGTTT-TATGGCCCAG AATATGATCT 3070 hom 123 het 32 0 42 3 N/A 0 0 156932 CASAVA_Build 3 7293507 2I GTGGTGGCAT --/TG GTTGTTGTAC 2523 hom 15 het 6 0 6 0 TG 0 1 156933 CASAVA_Build 3 7311252 1D AGAGCTCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 40 0 28 12 A 12 11 156934 CASAVA_Build 3 7338982 1I TGGGTTAAAC -/A ATTTGCCCAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 156935 CASAVA_Build 3 7350395 1I TAAAGAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 A 9 10 156936 CASAVA_Build 3 7351167 1D10M6D AGGGACCCAC AAAAAAAATAGAAAAAC/-AAAAAAATAG------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 17 5 N/A 0 0 156937 CASAVA_Build 3 7352788 1D CAAAAAAAAA C/- ACAGACCAAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 C 1 0 156938 CASAVA_Build 3 7363359 6I CTTCCTATTG ------/TACTAT TACTAAGTGA 3070 het 3070 hom 57 20 30 7 TACTAT 0 1 156939 CASAVA_Build 3 7375845 1D CTTAGGTCTA G/- GTCTATGTAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 G 2 1 156940 CASAVA_Build 3 7383554 1D7M1D18M1D24M1D TATTTAATAA GAAATAAAGTTTTAATAGGAACTGGTAGAGATAAATTATAATTCTTGGTCATG/-AAATAAA-TTTTAATAGGAACTGGTA-AGATAAATTATAATTCTTGGTCAT- GTTATACTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 6 N/A 0 0 156941 CASAVA_Build 3 7383664 1D3M1D AAGTACTTTT GTCTA/-TCT- TACTCTGACT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 N/A 0 0 156942 CASAVA_Build 3 7383916 1I ATGTAGTGCC -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 6 7 156943 CASAVA_Build 3 7384674 1I CTACACAGAC -/A AATGAAAAAT 3070 hom 56 het 35 0 18 17 A 2 3 156944 CASAVA_Build 3 7384715 3D AAAAAATTCT AAG/--- AAGTCTTATG 3070 het 3070 hom 31 8 13 11 AAG 2 1 156945 CASAVA_Build 3 7385592 3D GAGTGATGGT TAA/--- AATCAGTGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAA 1 0 156946 CASAVA_Build 3 7385689 1I AATTCTTCAG -/T TTGTTGTTGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 3 156947 CASAVA_Build 3 7386100 2D CACACATTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 18 15 T 14 12 156948 CASAVA_Build 3 7393456 1D TTACAGAAAA G/- AAAATTGCTG 3070 het 3070 ref 44 28 12 4 G 1 0 156949 CASAVA_Build 3 7393907 1D GTTCCTAATA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 50 23 17 11 T 8 7 156950 CASAVA_Build 3 7397055 5D TTCAGAGGAC CAAAA/----- TTTGCTTTCT 3070 hom 132 het 47 0 45 5 CAAAA 1 0 156951 CASAVA_Build 3 7404191 1I TTCTGCTACA -/T TTTGGTTATT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 3 4 156952 CASAVA_Build 3 7408460 1D GGAAAAAAAA C/- AAGAGCTGGC 3070 het 3070 hom 23 9 11 4 C 1 0 156953 CASAVA_Build 3 7411341 1D GGATCTTGCA G/- GCAGCACTCA 3070 hom 45 het 19 0 15 5 G 2 1 156954 CASAVA_Build 3 7419493 1D GTTGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2990 het 1793 hom 27 7 14 7 T 15 14 156955 CASAVA_Build 3 7436968 2D TACTGATTAG TT/-- TTTTTATACT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 T 7 5 156956 CASAVA_Build 3 7448610 1D TAGCAGGATG T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 T 7 6 156957 CASAVA_Build 3 7450706 1I TGTTTTCTTA -/T TTTCATTATA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 3 4 156958 CASAVA_Build 3 7459204 1I AAACTTTGAT -/A AAAACTGATG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 5 156959 CASAVA_Build 3 7462686 1D CCTGACTCTC T/- TTTTCAAAGC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 5 4 156960 CASAVA_Build 3 7463684 1D53M2I CAACTGACAA TTTATTCAACAGAAGGTTAAAAGAGTGTGCCTTTTAAAGATAAATACTGGACTC--/-TTATTCAACAGAAGGTTAAAAGAGTGTGCCTTTTAAAGATAAATACTGGACTCTT TGGGTAAAAG 3070 hom 132 het 23 0 44 2 N/A 0 0 156961 CASAVA_Build 3 7464415 1D CAGCAAACTC T/- TTTTTTTTTA 2768 hom 18 het 7 0 7 0 T 10 9 156962 CASAVA_Build 3 7466332 1D GATTTTAAAA T/- ATCCAGAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 1 0 156963 CASAVA_Build 3 7466810 1I TTTATCAGAA -/T TGGCTTATTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 2 156964 CASAVA_Build 3 7467638 4I TCTGGAAAAG ----/TCTC TCAGTGAAGC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TC 1 3 156965 CASAVA_Build 3 7469717 1D GAAATAGAGA T/- TTTTTTTTTT 2570 het 2570 ref 37 12 8 17 T 16 15 156966 CASAVA_Build 3 7473138 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 37 1 26 10 T 11 12 156967 CASAVA_Build 3 7473383 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 31 7 T 11 10 156968 CASAVA_Build 3 7477078 1I CTATAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 33 1 28 4 T 11 12 156969 CASAVA_Build 3 7479808 1D AAATAAAGGT A/- AGAGAATCAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 2 1 156970 CASAVA_Build 3 7480942 1I GATACATATG -/T TAACGTGAGG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 1 2 156971 CASAVA_Build 3 7482184 1D CCAGAGCCAC A/- GCCCAGTTGC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 1 0 156972 CASAVA_Build 3 7508100 4D ATTTAGATGG TATA/---- TATATATATA 3070 het 2608 hom 27 8 14 6 TA 10 8 156973 CASAVA_Build 3 7526527 1I CAGGGGATTG -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 6 7 156974 CASAVA_Build 3 7534057 3D CTATTATTAT TAG/--- TAGTAGTAGT 3070 hom 71 het 31 0 25 6 TAG 5 4 156975 CASAVA_Build 3 7536104 4D CTGCTGGAAA TCTG/---- TCTGTTGATC 3070 het 3070 hom 30 11 15 6 TCTG 2 1 156976 CASAVA_Build 3 7537200 2D TGAAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 20 13 10 A 11 9 156977 CASAVA_Build 3 7539014 5I CTAAAAACAG -----/GCAAT GAACAACAGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GCAAT 0 1 156978 CASAVA_Build 3 7539586 2D TCAAGGAAAC AA/-- GAGAGAGGTA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 A 2 0 156979 CASAVA_Build 3 7555673 3D GAGGAACTCT CAG/--- CAGCCCCACA 3070 het 3070 hom 39 13 22 5 CAG 2 1 156980 CASAVA_Build 3 7556174 1D CTAGCCTGGC A/- AAAGATGGTG 2383 het 2383 ref 19 7 7 6 A 4 3 156981 CASAVA_Build 3 7575063 1D TATGGCTAAG T/- TTTTAGTTCT 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 T 5 4 156982 CASAVA_Build 3 7583345 1D GACACTGAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 8 156983 CASAVA_Build 3 7589946 1D GCATTTTAAT A/- AAAAAAGTTC 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 7 6 156984 CASAVA_Build 3 7590849 2D TTAGGCTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2366 het 936 hom 24 7 6 11 T 16 14 156985 CASAVA_Build 3 7591629 4D CCTGTCTGTC TGAG/---- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 17 6 TGAG 1 0 156986 CASAVA_Build 3 7603072 1D ACATGAGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2795 hom 27 9 13 5 T 11 10 156987 CASAVA_Build 3 7612961 1I AGAGGGAAGG -/T TTGGCAGGAA 3070 hom 144 het 55 0 49 6 T 2 3 156988 CASAVA_Build 3 7622945 1I CTAGCTCCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 9 10 156989 CASAVA_Build 3 7624230 1I TATAGTTTCA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 7 8 156990 CASAVA_Build 3 7624748 1I AAAGACATGA -/T CTCATGCTTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 0 1 156991 CASAVA_Build 3 7646999 1D AGTTGTCTGA T/- TAGATGCAAA 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 2 1 156992 CASAVA_Build 3 7648062 1D TTCAACAGAG A/- CCACCACAGG 3070 het 2760 hom 29 7 10 12 A 1 0 156993 CASAVA_Build 3 7651481 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 17 0 15 2 A 13 11 156994 CASAVA_Build 3 7653606 1I TCAGTGGTTT -/C CATAAGATGC 3070 hom 103 het 40 0 34 6 C 1 2 156995 CASAVA_Build 3 7658641 1D AACCGTCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 255 hom 55 1 45 10 A 10 9 156996 CASAVA_Build 3 7659969 6D4M1D39M2I GAACTGGTTG CAACTTCAGTATTCACAAGGGCTACGCAGGGAGCCCAATGAAAAACAAAC--/------CAGT-TCCACAAGGGCTACGCAGGGAGCCCAATGAAAAACAAACAA AAAAAAAACA 2959 het 2959 ref 35 18 10 22 N/A 0 0 156997 CASAVA_Build 3 7664515 1I CTTTTTAAAG -/A GAGGGGGTAG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 0 1 156998 CASAVA_Build 3 7666509 1I CTGGCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2584 het 2584 ref 20 10 6 4 A 10 11 156999 CASAVA_Build 3 7667732 2D AGGCAGCCTC TT/-- TTTCTTATTC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 5 3 157000 CASAVA_Build 3 7670784 3D CAAATTCTCC CCT/--- CACTTCCTCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 CCT 1 0 157001 CASAVA_Build 3 7676165 1I ATATGTAAAT -/C CAACAGCACC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 C 1 2 157002 CASAVA_Build 3 7677482 5D67M1I CATTAGAACT GAGTAGAGTCCAGAACTAAACCCACAAATGTGTGAACAACTGGTCTTGGCAAAGGCAGAAGGGCAATACAAT-/-----GAGTCCAGAACTAAACCCACAAATGTGTGAACAACTGGTCTTGGCAAAGGCGGAAGGGCAATACAATG GAATAAGAAT 3070 het 83 hom 30 1 34 16 N/A 0 0 157003 CASAVA_Build 3 7681566 3I CTACTCTTGA ---/TCT TCTCAAATTA 3070 hom 68 het 28 0 20 8 TCT 1 2 157004 CASAVA_Build 3 7682364 1I ATTAAATAAG -/C TTTTTAATTG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 0 1 157005 CASAVA_Build 3 7687347 1I16M1I4M1I5M1I24M1I10M1I6M2I8M1I TTTGGCAAGA -TTGACAGCATTGTACT-ATAC-AATGG-ATATTTCACATCTTTAGAAACTGA-TAAGCTCAGA-TTAATT--CTTTAAAC-/TTTGACAGCATTGTACTAATACAAATGGAATATTTCACATCTTTAGAAACTGATTAAGCTCAGATTTAATTTCTTTTAAACT TACTGGGTGA 3070 hom 129 het 28 0 44 13 N/A 0 0 157006 CASAVA_Build 3 7695642 1D CTTTGCAGAC A/- ATAATAATGT 3070 hom 114 het 40 0 39 3 A 2 1 157007 CASAVA_Build 3 7700623 2D GGACAAAGTC AA/-- AACTCAAAGA 3070 hom 68 het 28 0 23 6 A 4 2 157008 CASAVA_Build 3 7703781 8D AACCAACTTT AGTCATCA/-------- AGTCATCACA 3070 hom 99 het 38 0 34 8 AGTCATCA 2 1 157009 CASAVA_Build 3 7707727 1D ACTTTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 128 het 52 0 39 14 T 11 10 157010 CASAVA_Build 3 7727197 1D AAAAGGAGCA T/- TATCAGGAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 1 157011 CASAVA_Build 3 7734352 1D AACCTCTAGC T/- TAGCCAGGTG 3070 hom 141 het 49 0 46 3 T 2 1 157012 CASAVA_Build 3 7741631 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 92 het 36 0 30 6 T 10 9 157013 CASAVA_Build 3 7745744 4D TTTTTTTTTT TTTC/---- CCCATAGTTT 3070 hom 108 het 44 0 34 11 TTTC 1 0 157014 CASAVA_Build 3 7757693 1D GCACATCATG T/- TTTTTTTTTT 1239 het 1239 ref 36 31 3 2 T 11 10 157015 CASAVA_Build 3 7769951 1D TAGAAGGAAT G/- GGTAATACAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 3 2 157016 CASAVA_Build 3 7789233 1I TTAGTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 1007 het 1007 ref 42 32 3 7 T 13 14 157017 CASAVA_Build 3 7808620 1I CAGCTTGGAG -/A AAGGCATTTC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 2 3 157018 CASAVA_Build 3 7825787 9D AATGGCTTTA CCCCTTGGT/--------- CCCCTTGGTC 3070 hom 111 het 48 0 35 13 CCCCTTGGT 3 2 157019 CASAVA_Build 3 7831219 2D CGAAGCCTGA CT/-- CTTGTTATTT 3070 het 3070 ref 53 25 23 7 CT 2 1 157020 CASAVA_Build 3 7838650 1D GAATTTCAGG A/- AAAAACTGTA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 6 5 157021 CASAVA_Build 3 7838835 1D GGGATTTAGC A/- AAAAAAAAAT 2695 het 2695 ref 18 10 6 2 A 10 9 157022 CASAVA_Build 3 7840119 1I TGGCCTGCCC -/A AAGGCCCTGT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 A 2 3 157023 CASAVA_Build 3 7854858 4I TCCTACAAAT ----/TTAA TTAGACTACT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 TTAA 0 1 157024 CASAVA_Build 3 7860107 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1111 hom 31 6 14 11 A 15 14 157025 CASAVA_Build 3 7860866 1I AGATCTTGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 A 8 9 157026 CASAVA_Build 3 7864877 4D TTGGTCCTCT GTAG/---- GTAGGCATAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 GTAG 2 1 157027 CASAVA_Build 3 7878000 2D CTTGATGAAC CT/-- CTCTAATTTG 3070 het 3070 ref 52 26 23 5 CT 3 2 157028 CASAVA_Build 3 7899040 1D TTGAGGATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 11 9 A 10 9 157029 CASAVA_Build 3 7900526 2D AGAAAAAGAG GA/-- GAGAGTGATA 3070 het 3070 hom 42 16 19 9 GA 3 2 157030 CASAVA_Build 3 7901674 1I TGGTAATATG -/A AAAAAAAAAC 1591 het 1591 ref 14 6 4 4 A 9 10 157031 CASAVA_Build 3 7902897 1I TTAAGGTAAA -/G AGTTGGAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 G 0 1 157032 CASAVA_Build 3 7905482 5I ATTGATCAAT -----/CTGTA GGAACAGAAT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 CTGTA 0 1 157033 CASAVA_Build 3 7909440 4I CACTCATTTA ----/TTCT TTAACTATTA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 TTCT 0 1 157034 CASAVA_Build 3 7909699 5D50M1I GGCCCCGGTG TGTGATGTGATGTTCCCTGCCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTGAATTCCCAT-/-----TGTGATGTTCCCTGCCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTGAATTCCCATC TATGAGTGAG 3070 het 3070 ref 25 26 7 5 N/A 0 0 157035 CASAVA_Build 3 7939833 4D ATTCTCTTGC CTCA/---- CTCAGCCTCC 3070 het 2488 hom 15 6 8 3 CTCA 2 1 157036 CASAVA_Build 3 7948060 1I TGGAGGGGTG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 A 6 7 157037 CASAVA_Build 3 7951872 1D GTAGGTCACC A/- ACATCAAAGA 3070 het 2832 hom 22 7 10 5 A 2 1 157038 CASAVA_Build 3 7952481 26D34M1I CCCCAACCTA GCTTCCTATTCAACATTCAAATTCAGGAAATCCAGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATAC-/--------------------------GGAAGGCAGGCCAACATTCAAATTCAGGAAATACA GAGAACACTA 2502 het 2502 ref 16 20 6 5 N/A 0 0 157039 CASAVA_Build 3 7959668 1D CTCCTTTGCA G/- GGGGCATGGA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 G 5 4 157040 CASAVA_Build 3 7960650 1D ACATTTTTCT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 G 2 1 157041 CASAVA_Build 3 7962542 2D AGACAAATTA AT/-- AGAGGCATGG 3070 het 3070 ref 44 27 14 5 AT 1 0 157042 CASAVA_Build 3 7964594 1I TTTTAAAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 9 10 157043 CASAVA_Build 3 7965329 1I GTAAATGGAT -/A GAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 0 1 157044 CASAVA_Build 3 7985749 3D GATATTTCTT AGC/--- AGATAATAGT 3070 hom 141 het 50 0 47 4 AGC 1 0 157045 CASAVA_Build 3 8026138 1I CATGAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 10 11 157046 CASAVA_Build 3 8053887 1D GCACCAGAAC A/- AAAAAGAACA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 A 6 5 157047 CASAVA_Build 3 8068857 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 13 11 7 A 1 0 157048 CASAVA_Build 3 8075712 23D AAATACACAG AGCTCCTTTAAAAAAATACACAT/----------------------- AGCTCCTATA 3070 hom 90 het 27 0 31 9 AGCTCCTTTAAAAAAATACACAT 1 0 157049 CASAVA_Build 3 8088436 1D CGCTTGCAGG A/- AAAGGGTAGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 4 3 157050 CASAVA_Build 3 8096250 1I TTTCTTATAA -/T TTTTTTACTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 6 7 157051 CASAVA_Build 3 8100244 1I CCACCTCCCC -/T ATTTTTACTT 3070 hom 114 het 43 0 37 6 T 0 1 157052 CASAVA_Build 3 8102303 2D AAATCAGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 2285 het 126 hom 45 3 6 36 T 13 11 157053 CASAVA_Build 3 8110259 1D AAATTTAGAG A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 69 het 24 0 24 1 A 8 7 157054 CASAVA_Build 3 8115220 1D CTTTTGCCCA T/- TTTTTTATTG 3070 hom 118 het 46 0 39 7 T 7 6 157055 CASAVA_Build 3 8122428 2I CCATCTCGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 31 1 23 7 A 13 15 157056 CASAVA_Build 3 8123515 3D ATGCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 220 het 96 hom 16 1 3 15 A 15 12 157057 CASAVA_Build 3 8139304 8I61M1D ACTTCTTTTA --------CTGTTTTAGTTTGTTTTCTGTTTCTATAACAGAATACCACAGACTTGGTAATATATAAAGGA/CTAGATCTCTGTTTTAGTTTGTTTTCTGTTTCTATAACAGAATACCACAGACTTGGTAATATATAAAGG- AAAAAACGTT 3070 hom 184 het 36 0 62 5 N/A 0 0 157058 CASAVA_Build 3 8141562 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 9 157059 CASAVA_Build 3 8145550 1D TATCTAAGAA T/- TTGTTTTTGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 3 2 157060 CASAVA_Build 3 8145862 4D ACAAGAAATG AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 151 het 53 0 51 5 AATA 3 2 157061 CASAVA_Build 3 8146442 1I TTCTTAGATA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 T 8 9 157062 CASAVA_Build 3 8146991 5D GTTTACTTCC TAATT/----- TAATTTAATT 3070 hom 63 het 22 0 22 1 TAATT 3 2 157063 CASAVA_Build 3 8155312 6I AAAAAAAAAA ------/AAAAGG AAAAGGAAAA 1480 hom 18 het 8 0 7 1 AAAAGG 1 2 157064 CASAVA_Build 3 8174019 1D CTAAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 18 3 12 3 A 15 14 157065 CASAVA_Build 3 8178516 1D GTACAGTATG C/- CCGGATTCTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 3 2 157066 CASAVA_Build 3 8179202 9D ACAGGAGAAT CGCTTGAAC/--------- CCAGGAGGTG 3070 hom 36 het 13 0 13 2 CGCTTGAAC 1 0 157067 CASAVA_Build 3 8179358 1I TGCAATTAAT -/A TGATGCACCT 3070 hom 48 het 21 0 15 6 A 0 1 157068 CASAVA_Build 3 8187571 1D ATTTAAAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 10 9 157069 CASAVA_Build 3 8263217 3I CCTCTCACTC ---/CTT CTACCATGGG 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 CTT 0 1 157070 CASAVA_Build 3 8266042 4D TGTGTGTTTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 24 20 9 TG 11 9 157071 CASAVA_Build 3 8270247 2I CCATCAGGAA --/AC ACATACTGTT 3070 het 3070 ref 55 26 21 8 AC 1 2 157072 CASAVA_Build 3 8273230 1D TCCAAAAGTC T/- TAGGACTCAG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 2 1 157073 CASAVA_Build 3 8276052 1D GGTGCGATCT C/- GGCTCACTGC 1796 het 729 hom 8 3 5 0 C 1 0 157074 CASAVA_Build 3 8283224 1D CTATGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2663 hom 26 8 8 10 A 12 11 157075 CASAVA_Build 3 8302894 1D GCAATAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 12 11 157076 CASAVA_Build 3 8304471 1D AAACAACAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 A 9 8 157077 CASAVA_Build 3 8306998 1D AAAAAAGGAA T/- AGAAACAGAA 1536 hom 49 het 27 0 13 14 T 1 0 157078 CASAVA_Build 3 8310814 1D GAAATATTCC A/- AATCCTTCTT 3070 hom 114 het 45 0 39 7 A 3 2 157079 CASAVA_Build 3 8311196 1I TCTGACAAAA -/C AACCACACAG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 0 1 157080 CASAVA_Build 3 8311567 8D CAGGCAGCTA CATTTCTG/-------- CATTTCTGTA 3070 hom 72 het 29 0 22 11 CATTTCTG 2 1 157081 CASAVA_Build 3 8315912 1D ACAAGGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 7 A 11 10 157082 CASAVA_Build 3 8316709 1D TTGCCCCTGA C/- CCCCCTCCTC 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 C 6 5 157083 CASAVA_Build 3 8325721 4I TGGCATAAAA ----/ACAG ACAAAGACTA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 ACAG 0 1 157084 CASAVA_Build 3 8326148 3I AATAAAAGCC ---/TGT ATTTGCAAAC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 TGT 0 1 157085 CASAVA_Build 3 8327815 1D CTCCCACCTT C/- CCCCCACCAC 3070 het 3070 hom 45 21 17 7 C 6 5 157086 CASAVA_Build 3 8330947 1I GCTTGTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 A 11 12 157087 CASAVA_Build 3 8335069 1I CTAGAACATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 9 10 157088 CASAVA_Build 3 8341354 1D CAAGAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 8 T 13 12 157089 CASAVA_Build 3 8345573 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 46 17 12 17 AC 10 9 157090 CASAVA_Build 3 8353085 3I13M1I GGGGAGGGAT ---ACTTGGAGATATA-/AGCATTGGGAGATATAC CTAATGCTAG 2329 hom 12 het 6 0 5 1 N/A 0 0 157091 CASAVA_Build 3 8355658 1I GTCCTAAATC -/A ATTCAAGACT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 1 2 157092 CASAVA_Build 3 8356302 1I TGATGTTCCC -/T TGCAAACCCA 3070 hom 175 het 68 0 59 9 T 1 2 157093 CASAVA_Build 3 8360212 1I CAGTGTTTCC -/A AAAATAATAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 4 5 157094 CASAVA_Build 3 8363303 2D AAGAGAACTA AC/-- ACAGTCTCAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 11 AC 2 1 157095 CASAVA_Build 3 8363689 1I CTTGTAATAT -/A AAGACACAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 3 157096 CASAVA_Build 3 8367116 1I AATGTAATTG -/T GGACATATAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 157097 CASAVA_Build 3 8369512 2D TTGATGGGGT GG/-- GGGGGCTCTA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 G 7 5 157098 CASAVA_Build 3 8398514 2I GTGAAATTCT --/CA CAGCCATTTA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 CA 1 2 157099 CASAVA_Build 3 8410251 1D GAGAACTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 4 T 8 7 157100 CASAVA_Build 3 8411127 1D AATCACCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 A 13 12 157101 CASAVA_Build 3 8417879 4D AATTCCTGTT TATC/---- TAAGAAAATT 3070 het 3070 ref 41 18 19 5 TATC 1 0 157102 CASAVA_Build 3 8419299 1D TTTCTCCAGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 9 8 157103 CASAVA_Build 3 8419933 4D CTTGGCGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1953 hom 23 6 12 6 TTTG 4 3 157104 CASAVA_Build 3 8429867 1D ATATTTGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2514 hom 32 7 13 12 A 16 15 157105 CASAVA_Build 3 8443273 2I2M8D GGAGACTCAG --GACCACGCGT/TTGA-------- CTCAGCTGCC 3070 het 3070 ref 45 23 20 5 N/A 0 0 157106 CASAVA_Build 3 8509202 1D GTCTGCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 41 1 29 12 T 11 10 157107 CASAVA_Build 3 8509213 1D TTTTTTTTTT C/- TAGAAAATGA 3070 het 140 hom 37 5 24 8 C 1 0 157108 CASAVA_Build 3 8511937 2I CTCCAGGACC --/AT ATAGCTAGAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AT 1 2 157109 CASAVA_Build 3 8518714 1I CTTTTTCTTG -/T TTCCCCTTCC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 3 157110 CASAVA_Build 3 8543182 4D AAACCAGGAC AGTT/---- AGTTACCCTT 3070 hom 87 het 33 0 29 7 AGTT 2 1 157111 CASAVA_Build 3 8545039 1D CCACACCTAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 8 157112 CASAVA_Build 3 8546158 1I ACTAGGCCAG -/A TCGCCTGTGT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 0 1 157113 CASAVA_Build 3 8564433 7I AAAAAAATTA -------/GCCGGGC GCAGTGGCGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 GCCGGGC 0 1 157114 CASAVA_Build 3 8567414 1D TAAACTGGTC T/- TTTCCCGCCC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 4 3 157115 CASAVA_Build 3 8578558 3I TTCCATCATC ---/ATT ATCGGGGCTT 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 ATT 0 1 157116 CASAVA_Build 3 8590563 1D GTTTAAACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 28 1 19 8 A 14 13 157117 CASAVA_Build 3 8591708 2I ACAGGGAGAA --/AG AGCAGACGGG 3070 hom 72 het 27 0 23 4 AG 1 2 157118 CASAVA_Build 3 8614242 1D GGAATCAGAG T/- TTCCTGAGAA 3070 hom 78 het 30 0 19 12 T 3 2 157119 CASAVA_Build 3 8614583 1I ATATGCACAC -/T TGTCTGTGTC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 1 2 157120 CASAVA_Build 3 8616160 4I CCATGGTGTA ----/GAGT GAGTATCACT 3070 hom 184 het 65 0 62 3 GAGT 1 2 157121 CASAVA_Build 3 8617033 1I CCAACTTTTC -/A AATTCCAAAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 2 3 157122 CASAVA_Build 3 8620549 2I AAAACAAGTA --/AG AGAATTATTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 AG 1 2 157123 CASAVA_Build 3 8627595 1D CTATTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 10 7 T 12 11 157124 CASAVA_Build 3 8634145 1D CCAGCATGGC T/- ACATGTATAC 3070 het 203 hom 18 1 17 0 T 1 0 157125 CASAVA_Build 3 8644368 1D CCGCGGTGCT G/- GGGAGATGCC 3070 hom 87 het 35 0 24 11 G 4 3 157126 CASAVA_Build 3 8673989 1I ATTTGTTGAA -/T TAGGTGAGTG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 1 2 157127 CASAVA_Build 3 8674171 1D TGACAGGCCA C/- CCTCCATGAG 3070 hom 105 het 41 0 33 8 C 3 2 157128 CASAVA_Build 3 8675558 1D AACAAAACAT A/- ATAAAGGCTA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 2 1 157129 CASAVA_Build 3 8677364 9I TTTTTCTTTC ---------/AATGCAGCT ACAAGGCCAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AATGCAGCT 0 1 157130 CASAVA_Build 3 8686560 1I GGAGGAGAAC -/A GGGGGACATG 3070 het 3070 hom 63 25 35 3 A 0 1 157131 CASAVA_Build 3 8688278 2D TCCCGCTAGG AT/-- ATACTGTGAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 AT 2 1 157132 CASAVA_Build 3 8689410 1D CCGGATATTA G/- GAACAATGTC 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 G 2 1 157133 CASAVA_Build 3 8692289 1I GATCAGAAAG -/A AAGCAGGTCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 2 3 157134 CASAVA_Build 3 8693407 3D ACACAGCCTG CGA/--- TGCTGGAATT 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 CGA 1 0 157135 CASAVA_Build 3 8701215 1D TCATCCTCTT C/- CCCCCCTGGA 2819 het 2819 ref 29 12 7 11 C 7 6 157136 CASAVA_Build 3 8703965 1I TCAGGAGCAA -/T TATCTCCCTA 3070 het 3070 ref 24 12 7 5 T 1 2 157137 CASAVA_Build 3 8716415 2I AACACAACCC --/CT GTGACAATAG 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 CT 0 1 157138 CASAVA_Build 3 8716526 1I TAATATCACA -/G GGGTGTACAC 2764 het 2503 hom 16 6 7 3 G 3 4 157139 CASAVA_Build 3 8717315 1D GGTGTACCCT C/- CGGTGGGTTA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 C 2 1 157140 CASAVA_Build 3 8725632 2D GTGCAGAGGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 AG 7 6 157141 CASAVA_Build 3 8738782 8D ATAAAAGAAA AAAAAAAC/-------- AAAAAAACAA 1717 het 1642 hom 12 6 5 2 AAAAAAAC 3 2 157142 CASAVA_Build 3 8744371 1D TTCATCACTG T/- TTTTTCTTGT 3070 het 3070 hom 49 18 24 8 T 6 5 157143 CASAVA_Build 3 8746544 3I CATATAGCAG ---/TTC TTCTGTCTCC 3070 het 3070 hom 52 21 21 10 TTC 1 2 157144 CASAVA_Build 3 8746742 1D TAGGAAAAAC A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 A 8 7 157145 CASAVA_Build 3 8748353 1D AGCAATGTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 T 9 8 157146 CASAVA_Build 3 8754734 2I TTCTCTCTCT --/CC CTCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 C 1 3 157147 CASAVA_Build 3 8763733 1D CTATCTGACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 10 9 157148 CASAVA_Build 3 8764801 1D AAGATACATA G/- GGGACCACCA 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 G 4 3 157149 CASAVA_Build 3 8777591 1I GTATTAGTTT -/A AAAAAGCAGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 5 6 157150 CASAVA_Build 3 8780870 2D GCGTGACATT CC/-- CCACCCACTC 2615 het 2615 ref 35 18 8 9 C 4 2 157151 CASAVA_Build 3 8783429 1I GGACAAATTG -/C CCACTCCTGC 3070 het 3070 ref 47 22 23 2 C 2 3 157152 CASAVA_Build 3 8805216 2I TAATGCTTTT --/TA TATGTTTGTG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 TA 1 2 157153 CASAVA_Build 3 8817481 1D CAGACTCTTG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 9 8 157154 CASAVA_Build 3 8819357 1I AGTTACTAAG -/C CCAGTCCACA 3070 het 3070 ref 55 26 19 10 C 2 3 157155 CASAVA_Build 3 8839926 1I TACGTCTGTC -/T GCAAAGAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 157156 CASAVA_Build 3 8847126 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1475 het 558 hom 11 3 4 4 A 15 14 157157 CASAVA_Build 3 8851885 1I CTGAGTCTAA -/T TTGCAAACTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 2 3 157158 CASAVA_Build 3 8864353 2D CATTAAAGAC AT/-- ATATTATTTA 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 AT 3 2 157159 CASAVA_Build 3 8864940 7I TTTAATGAGC -------/CTGTTTT CTGTTTTCCA 3070 hom 132 het 55 0 44 12 CTGTTTT 1 2 157160 CASAVA_Build 3 8866441 1D ACAACCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 26 0 17 9 T 11 10 157161 CASAVA_Build 3 8872106 1D AGTAAAAAAA G/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 1 0 157162 CASAVA_Build 3 8875878 1I TGGGCTCATT -/A AAATAAACAG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 3 4 157163 CASAVA_Build 3 8877945 4D TATCTATCTC TCTA/---- TCTATCTGTC 3070 het 98 hom 39 2 25 12 TCTA 2 1 157164 CASAVA_Build 3 8877999 4I CCATCCATCC ----/ATCT ATCTATCCTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATCT 1 2 157165 CASAVA_Build 3 8901313 1I TTTCAGTAAT -/A TTTTCTTTCC 3070 het 2633 hom 24 8 14 2 A 0 1 157166 CASAVA_Build 3 8923381 2D GTTTTCTAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 T 13 11 157167 CASAVA_Build 3 8924473 1I ACTACCCACT -/A ATCGGTTTGT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 1 2 157168 CASAVA_Build 3 8926203 1I ATGGGCAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 27 14 3 A 11 12 157169 CASAVA_Build 3 8928273 20D ATCACACCTA CATCCAGCGCAGGTGTGCTT/-------------------- CATCCTCCCT 3070 het 3070 ref 47 26 20 7 CATCCAGCGCAGGTGTGCTT 1 0 157170 CASAVA_Build 3 8929394 4D CGACACTTAG CTGA/---- CTATTAGTAA 3070 het 3070 hom 40 19 21 2 CTGA 1 0 157171 CASAVA_Build 3 8929721 1D AATGGCCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 21 9 A 11 10 157172 CASAVA_Build 3 8930648 5I TAACCACAAG -----/AGTCA AGTCAAGTCA 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 AGTCA 2 3 157173 CASAVA_Build 3 8934386 1D ATCCAAAAAA C/- AGCAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 25 11 4 C 1 0 157174 CASAVA_Build 3 8936536 2D AATAATGGGG GT/-- GTATGTCATG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 GT 2 1 157175 CASAVA_Build 3 8937350 1D AACATCACTT A/- TATAGTATTC 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 A 1 0 157176 CASAVA_Build 3 8945646 1D AGAAATAACC A/- AAATCTTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 4 3 157177 CASAVA_Build 3 8960021 1I CATGTTAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 9 10 157178 CASAVA_Build 3 8962749 1D GGTAAGGGCC T/- TAGGCCTTCA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 2 1 157179 CASAVA_Build 3 8987118 3D CTACCAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 1841 hom 24 7 10 9 A 12 9 157180 CASAVA_Build 3 8988788 5D GAGACAGGGG TGTGA/----- TCCTGCAGTC 3070 het 3070 ref 42 21 13 9 TGTGA 1 0 157181 CASAVA_Build 3 9012970 1D GATGGCATGG A/- AAAATCAAAG 3070 het 3070 hom 47 15 17 15 A 5 4 157182 CASAVA_Build 3 9014563 1I TTCATAGAGG -/T TTTTTTTTTT 2004 het 2004 ref 23 9 6 8 T 11 12 157183 CASAVA_Build 3 9015240 1D ATATATATAC T/- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 1 0 157184 CASAVA_Build 3 9022790 1D TTAATTTCTT A/- TGAAAAGGAG 2403 het 2403 ref 23 14 5 4 A 1 0 157185 CASAVA_Build 3 9025127 2D ACAGGAGTAG GA/-- GAGAGAGAGA 1702 het 1702 ref 29 16 4 10 GA 10 9 157186 CASAVA_Build 3 9027726 1D AATCAGCCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 10 9 157187 CASAVA_Build 3 9047359 1D ATATATAGGA C/- CCCTCTATTA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 C 4 3 157188 CASAVA_Build 3 9047635 1D TCTGAACTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 27 0 23 5 T 9 8 157189 CASAVA_Build 3 9054127 1I TGGTCTGCTC -/A AGGAAAAAGC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 1 2 157190 CASAVA_Build 3 9056362 2D CCCTAATCTA CT/-- CTCTGTCTCT 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 CT 3 2 157191 CASAVA_Build 3 9077429 1D GGCCCAGTGG T/- TTTTTTTTTC 2402 het 1966 hom 27 8 8 11 T 10 9 157192 CASAVA_Build 3 9078769 1D ATGCACCTGA C/- CCCCCACAGA 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 C 6 5 157193 CASAVA_Build 3 9081546 8D AAAAAATAAT AATAAATA/-------- AATAAATAAA 3006 het 3006 ref 15 8 7 2 AATA 7 5 157194 CASAVA_Build 3 9083937 1D AACTAATGTG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 A 8 7 157195 CASAVA_Build 3 9092059 2I ATGTATGCAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 818 hom 57 8 31 18 GT 8 9 157196 CASAVA_Build 3 9092075 2D GTGTGTGTGT GC/-- GCGCGCACAT 3070 het 1084 hom 60 14 20 26 GC 4 3 157197 CASAVA_Build 3 9093137 3I GGCAACAAAG ---/AGA AGGAGAGCCA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AGA 0 1 157198 CASAVA_Build 3 9102160 1D TACCCAAAGG A/- AATATAAATT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 3 2 157199 CASAVA_Build 3 9106334 1D CTCTTTAGCT A/- CACCTGCTCT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 A 1 0 157200 CASAVA_Build 3 9107091 1I TTCTTTGCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 16 13 A 12 13 157201 CASAVA_Build 3 9107714 1D CTCTATGTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 14 10 A 10 9 157202 CASAVA_Build 3 9118589 1I TTGAAGTGCT -/G CCTCTAGTCA 3070 het 2840 hom 23 7 11 5 G 0 1 157203 CASAVA_Build 3 9135376 1D GATTGCCAGG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 1128 hom 19 4 10 6 C 10 9 157204 CASAVA_Build 3 9140082 10D TACATACACA ATACACATAC/---------- ATACACATAC 1571 hom 12 het 13 0 5 10 ATACACATAC 2 1 157205 CASAVA_Build 3 9149534 1D AAATATAGGG T/- TTTTTTTAAT 2252 het 2252 ref 23 14 6 3 T 8 7 157206 CASAVA_Build 3 9149598 4I TACTCCCACC ----/TCTG TCTATCAACC 1613 het 1613 ref 23 16 5 2 TCTG 0 1 157207 CASAVA_Build 3 9156825 2I ACACACACAC --/AT ACACACACAC 3070 het 3070 hom 55 13 30 12 AT 0 1 157208 CASAVA_Build 3 9169543 9I CAACATGAGG ---------/GTATAACTT GTATAACTTG 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 GTATAACTT 1 2 157209 CASAVA_Build 3 9176332 1D CGTATACCCC T/- GATCCTAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 1 0 157210 CASAVA_Build 3 9221336 1D CCCTAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 25 8 T 12 11 157211 CASAVA_Build 3 9228756 13I ATATAGAAAA -------------/GTATATTCTGTAT CTAGGTATAC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 GTATATTCTGTAT 0 1 157212 CASAVA_Build 3 9230013 1D GCATCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 9 A 12 11 157213 CASAVA_Build 3 9231671 7I TATTCCTGGG -------/AGGATAA AGGATAAAGT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 AGGATAA 1 2 157214 CASAVA_Build 3 9232054 3I CAGAGGTGGG ---/AGA AGATTTTCTC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AGA 1 2 157215 CASAVA_Build 3 9232792 2I TGACTAATGC --/AA ACACTCAGAG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 1 3 157216 CASAVA_Build 3 9234775 4D AAAGACAGTG CTTA/---- CTTAGCTTGG 3070 het 3070 ref 31 17 12 5 CTTA 2 1 157217 CASAVA_Build 3 9242598 1D AAAAGCTGCT G/- GGAAGTCCAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 3 2 157218 CASAVA_Build 3 9253127 10D CAGTGTTGGA GGTGGGGGCT/---------- GGTGGGAGGT 3070 hom 66 het 23 0 21 8 GGTGGGGGCT 1 0 157219 CASAVA_Build 3 9261125 1I AATATGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 42 1 37 4 A 10 11 157220 CASAVA_Build 3 9271707 4I AAAAAGAAAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AGAA 2 3 157221 CASAVA_Build 3 9274028 2D ACCAAAGCGA AC/-- TCTCTCTCTT 3070 hom 111 het 39 0 37 3 AC 1 0 157222 CASAVA_Build 3 9275898 1I TCCCTGTTTC -/A TTTTTTTTCA 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 0 1 157223 CASAVA_Build 3 9280092 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 9 10 157224 CASAVA_Build 3 9284632 1I TTTACATGTT -/A AAAAGGGTTG 3070 hom 87 het 37 0 28 9 A 4 5 157225 CASAVA_Build 3 9289491 1D ATTCTGTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 10 9 157226 CASAVA_Build 3 9303595 1I CTATCTTGTG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 27 het 13 0 9 4 T 7 8 157227 CASAVA_Build 3 9312331 2D TACACATAAC AT/-- AAATTTTACC 3070 hom 93 het 38 0 32 7 AT 1 0 157228 CASAVA_Build 3 9319649 4I TTGTCACCAC ----/TTTA TTTTGAAATA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 TTTA 0 1 157229 CASAVA_Build 3 9345686 1D CCCCATCCAG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 7 157230 CASAVA_Build 3 9359035 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 21 1 15 5 A 13 12 157231 CASAVA_Build 3 9363438 2D CAATTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 25 1 15 9 T 18 16 157232 CASAVA_Build 3 9410401 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3058 hom 35 11 14 10 A 11 12 157233 CASAVA_Build 3 9508195 1D TCTCTTGACC A/- AAAAAAAAAA 1439 het 1439 ref 39 30 4 6 A 12 11 157234 CASAVA_Build 3 9521959 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 12 11 157235 CASAVA_Build 3 9523358 1D TCCACCTCCC G/- GGCTCAAGCA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 G 3 2 157236 CASAVA_Build 3 9534485 1D GGGTTTTTTT G/- TTTTTTGTTT 429 het 429 ref 42 21 8 13 G 1 0 157237 CASAVA_Build 3 9535367 2D AATTTGTGTT CA/-- CAGAGTTGTT 3070 het 3070 ref 30 13 14 5 CA 2 1 157238 CASAVA_Build 3 9538392 1I CAGCCTCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2323 hom 23 7 9 7 T 10 11 157239 CASAVA_Build 3 9556300 7I AAAAGAGGGA -------/ATTGATG ATTTGCTTAT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 ATTGATG 0 1 157240 CASAVA_Build 3 9558421 1I GCACCACTGC -/A ACTCCAGCGT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 A 1 2 157241 CASAVA_Build 3 9577790 4D CTTCTGACTC TTCA/---- TTGTCTATCA 3070 het 2536 hom 20 6 9 7 TTCA 1 0 157242 CASAVA_Build 3 9580398 1I GACAGGGTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 15 1 T 9 10 157243 CASAVA_Build 3 9593568 2D AGACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 15 7 A 17 15 157244 CASAVA_Build 3 9594611 2I GTATGTTTTT --/TA TTTTTCTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TA 0 1 157245 CASAVA_Build 3 9596317 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 21 19 11 A 11 12 157246 CASAVA_Build 3 9600817 1D GACCTACAGG A/- AAAAAAAAAA 1375 het 1375 ref 30 16 3 12 A 11 10 157247 CASAVA_Build 3 9626495 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCCATCT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 C 6 7 157248 CASAVA_Build 3 9644168 3D TGTCTCTACG AAA/--- AAAAAAAAAA 1906 het 553 hom 22 6 5 11 A 19 16 157249 CASAVA_Build 3 9649038 5D CTCAAAAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 3070 het 1714 hom 18 4 11 4 AAATA 5 4 157250 CASAVA_Build 3 9655461 1I TCCTGAGAAG -/A AAAAAAACTG 3003 het 3003 ref 24 14 7 3 A 7 8 157251 CASAVA_Build 3 9668517 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 524 het 501 hom 9 4 2 3 T 17 16 157252 CASAVA_Build 3 9718399 4D CAGGTGGTAT GGAG/---- GGAGGGAGGA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 GGAG 3 2 157253 CASAVA_Build 3 9791093 10D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 28 1 19 9 A 20 10 157254 CASAVA_Build 3 9837771 4I GATTAAGCAG ----/TTAA TTAAAGAGGC 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TTAA 1 2 157255 CASAVA_Build 3 9840174 1D TAAAATACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 9 157256 CASAVA_Build 3 9844503 1I AGGCAAGCAA -/T GAACACAAGT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 0 1 157257 CASAVA_Build 3 9844963 1D AAGCCTTGTT A/- AAGCCTGAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 8 A 3 2 157258 CASAVA_Build 3 9847865 1D CCTTGCACTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 126 hom 23 1 20 3 T 9 8 157259 CASAVA_Build 3 9852762 2I GAGAGGCCAA --/GG GGCAGGAGAT 3070 hom 93 het 38 0 30 8 G 2 4 157260 CASAVA_Build 3 9861567 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 810 het 476 hom 8 2 2 4 A 16 15 157261 CASAVA_Build 3 9865691 1I AGACTCATTA -/T CAACTTGGGG 2501 het 2501 ref 49 37 6 6 T 0 1 157262 CASAVA_Build 3 9871823 1D GGATATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2366 hom 27 10 12 5 A 12 11 157263 CASAVA_Build 3 9909143 8I AGAGTTGTGA --------/GCCACCAT GCCCAGCCTC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 GCCACCAT 0 1 157264 CASAVA_Build 3 9910473 1D TCCCTTGGCA G/- GCTGTGGTCT 3070 hom 84 het 34 0 26 8 G 2 1 157265 CASAVA_Build 3 9911428 3D TGCTCTCGAT CTC/--- CTGACCTCAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CTC 1 0 157266 CASAVA_Build 3 9914662 5I ACAGTGCACT -----/CTAAA CTAAGCATGT 3070 hom 72 het 29 0 22 7 CTAAA 0 1 157267 CASAVA_Build 3 9916290 3D TCCTTCCTTC CTT/--- TTTTTCCCTT 3070 hom 60 het 22 0 19 3 CTT 1 0 157268 CASAVA_Build 3 9917031 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 13 14 157269 CASAVA_Build 3 9921024 1I TTATGAAGGT -/A TTTTTTTCAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 0 1 157270 CASAVA_Build 3 9936953 1D ATGTCTAGGG C/- CTTTTCCCGC 3070 hom 122 het 50 0 41 9 C 2 1 157271 CASAVA_Build 3 9939993 1D CCAGCACTTT G/- GGGAAGCTGA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 4 3 157272 CASAVA_Build 3 9941923 1D CCTCAGCCTC G/- CTGAGTAGCT 3070 hom 62 het 22 0 19 3 G 1 0 157273 CASAVA_Build 3 9943927 1D GGTGCTTACA C/- AAGTGATTGT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 C 1 0 157274 CASAVA_Build 3 9944052 1D ACCAGCCTGG C/- CTAACATAGT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 C 2 1 157275 CASAVA_Build 3 9948138 8D TTATATATTT CACACACA/-------- CACACACACA 1355 hom 27 het 15 0 10 5 CA 9 5 157276 CASAVA_Build 3 10009556 14I TGCATATTTA --------------/TTGACAATAGGTTT TTGACCTGGT 3070 het 3070 ref 44 27 12 5 TTGACAATAGGTTT 0 1 157277 CASAVA_Build 3 10009695 4D122M3D TTCATTACTT AGTAAGTGTCAGAGACTATTGATTTTTAATCTAAAACAGAAAGCTTTACAGCTCTCATGTAAAATTTCATCTTATTTCAGTCCATTGTTCAAACCCATTGAAATTTTTGAATTTTATTTTTGCATTAAC/----ATTGTCAGAGATTATTGATTTTTAATCTAAAAAGGAAAGCTTTACAGCTCCCATGTAAAATTTCATCTTATTTCAGTCCATTGTTCAAACCCATTGAGATTTTCGAATTTTATTTTTGCATT--- ATTTTAATTG 3070 het 3070 ref 32 72 8 14 N/A 0 0 157278 CASAVA_Build 3 10010042 1I CAAACTGGAA -/T TTTATAAACT 3070 het 3070 ref 59 42 10 7 T 3 4 157279 CASAVA_Build 3 10010779 5D GGGGAAGAGA AGTCT/----- GATCTGACAT 3070 het 3070 ref 76 50 22 9 AGTCT 1 0 157280 CASAVA_Build 3 10011669 3I ATATTCTTCC ---/TAT TATTAGCAAT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 TAT 1 2 157281 CASAVA_Build 3 10011789 5I TTGTAATTGA -----/AAATG GAATTCTGTT 1445 het 1445 ref 43 34 4 5 AAATG 0 1 157282 CASAVA_Build 3 10060494 2D ATTTTTGTGA CT/-- CTCTCCTGTT 3070 het 3070 ref 37 25 9 3 CT 3 2 157283 CASAVA_Build 3 10063407 4D TTCATTACTT AGTA/---- AGTGTCAGAG 3070 het 3070 ref 53 33 12 12 AGTA 1 0 157284 CASAVA_Build 3 10063533 4D TTTTTGCATT AATC/---- ATTTTAATTG 3070 het 3070 ref 54 31 17 7 AATC 1 0 157285 CASAVA_Build 3 10063994 1I ATTTTCTAGA -/G TGCAGAAACC 3070 het 3070 ref 44 32 9 3 G 0 1 157286 CASAVA_Build 3 10065544 2D CTGTTATGAC TA/-- TTATGGAGTG 3070 het 3070 ref 59 41 13 8 TA 1 0 157287 CASAVA_Build 3 10103109 1D TTCCCTTGGT A/- ACCTAGACCA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 A 2 1 157288 CASAVA_Build 3 10141010 1I TGGGCATGGT -/G GGCGCACACC 1195 hom 10 het 6 0 4 2 G 2 3 157289 CASAVA_Build 3 10162690 3I CATGTCACTT ---/CTC CTCTCAGACT 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 CTC 1 2 157290 CASAVA_Build 3 10163011 1D GCGCTCGCCA C/- CACACCTGGC 2620 het 1508 hom 13 4 6 3 C 2 1 157291 CASAVA_Build 3 10170989 10D AAAGAAAAAA AAAAAAAAAT/---------- ATATATATAT 1936 hom 15 het 5 0 6 1 AAAAAAAAAT 1 0 157292 CASAVA_Build 3 10183293 11D CACCTAAGTG TTAAATATTCT/----------- TATAAGTCAT 3070 het 3070 ref 39 24 17 4 TTAAATATTCT 1 0 157293 CASAVA_Build 3 10183780 1I CCTATGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 10 11 157294 CASAVA_Build 3 10203652 1D CCCAGCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 37 2 23 12 T 15 14 157295 CASAVA_Build 3 10228089 1D17M1D GCCTCCCACA TATGGTGAGATTACAAGCA/-ATGGTGAGATTACAAGC- GTGAATCACT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 N/A 0 0 157296 CASAVA_Build 3 10229052 3I CCCAAGACAA ---/TTC TTCTTCTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 TTC 3 4 157297 CASAVA_Build 3 10248829 1D CAACAAAAAG A/- CTCTTATTCT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 1 0 157298 CASAVA_Build 3 10249446 1D AGTACACTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 A 10 9 157299 CASAVA_Build 3 10251991 1D CTGCTTGATC T/- TTTTTTTTTT 1150 het 1150 ref 27 17 3 7 T 12 11 157300 CASAVA_Build 3 10262219 4D GCTGAGAAAA TTAT/---- TTATGTTCAA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 TTAT 2 1 157301 CASAVA_Build 3 10264383 1I TTGTCTTTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 8 9 157302 CASAVA_Build 3 10265509 1I TCTGAAGCGC -/T TTGACAGTTC 3070 hom 60 het 24 0 18 6 T 2 3 157303 CASAVA_Build 3 10266943 1I TTTGAGCAGA -/C CCAAGGAGTG 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 C 2 3 157304 CASAVA_Build 3 10272295 1D CTAGGTCCTT A/- ACAGTATTTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 2 1 157305 CASAVA_Build 3 10273808 1D TAAAAATACC A/- AAAAAAAATT 3070 het 1616 hom 14 5 8 1 A 9 8 157306 CASAVA_Build 3 10275561 1D CAATTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 11 10 157307 CASAVA_Build 3 10278050 1D CATCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3020 het 576 hom 28 6 10 12 T 17 16 157308 CASAVA_Build 3 10290283 1D TTATTACATT A/- AAAAAAAAAA 2971 het 2110 hom 24 7 10 7 A 12 11 157309 CASAVA_Build 3 10298805 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 2775 het 2775 ref 25 11 8 6 T 10 9 157310 CASAVA_Build 3 10310034 4I CATGAAGGCA ----/CATG CATGAGTGAC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 CATG 1 2 157311 CASAVA_Build 3 10310630 1I ACCCAGTTAA -/T TTTTTGTATT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 5 6 157312 CASAVA_Build 3 10316699 1D TGATCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2285 hom 31 9 14 8 T 15 14 157313 CASAVA_Build 3 10321997 1I CCCCAGCTGT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 8 9 157314 CASAVA_Build 3 10323738 1I TTATTAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2758 hom 30 7 19 4 T 11 12 157315 CASAVA_Build 3 10323995 6D CAGGTTCAAG TGATTC/------ TCCTGCCTCA 3062 het 3062 ref 16 8 8 1 TGATTC 1 0 157316 CASAVA_Build 3 10325969 2I GTTTCAAATC --/TT TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 T 3 5 157317 CASAVA_Build 3 10330807 1D AGTAATCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2536 hom 32 11 13 8 T 11 10 157318 CASAVA_Build 3 10342223 1D TTCAGAGTCC T/- TTGAGCCAGT 3070 hom 111 het 39 0 36 4 T 3 2 157319 CASAVA_Build 3 10342783 1I CTTTATTTAC -/A ATTATTGTCT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 A 1 2 157320 CASAVA_Build 3 10344224 1D GTTACTAAAT A/- AAAAAAAAAA 1149 het 1149 ref 48 40 4 5 A 11 10 157321 CASAVA_Build 3 10348343 1D AAACTATGGG A/- AAAAAAAAAA 1891 het 1891 ref 26 8 6 12 A 12 11 157322 CASAVA_Build 3 10351499 1I CTTGGCTGCA -/G GGGGTTGTGT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 4 5 157323 CASAVA_Build 3 10352154 1D TAGGTGGCCT G/- GGGATCCCTG 3070 hom 113 het 42 0 32 10 G 4 3 157324 CASAVA_Build 3 10360184 1I33M1I GTAGGAAATA -TGGCAAATGAGGAATAGCAAAAGCAACTAAAAC-/TTGGCAAATGAGGAATAGCAAAAGCAACTAAAACT TGTCAAGGAC 3070 hom 117 het 33 0 39 6 N/A 0 0 157325 CASAVA_Build 3 10382274 2D CCAGTGCAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 49 15 13 23 GT 9 8 157326 CASAVA_Build 3 10384870 1D GCAAATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 11 10 157327 CASAVA_Build 3 10393543 1I GAGGAGGGCA -/G GGATGGATTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 2 3 157328 CASAVA_Build 3 10410447 1I AAGCTTCTGT -/C CCTGTCCTGG 3070 hom 134 het 49 0 41 8 C 2 3 157329 CASAVA_Build 3 10441816 2I CTCTACTAAA --/AT ATATATATAT 1800 het 1800 ref 19 12 5 2 AT 6 7 157330 CASAVA_Build 3 10453594 2D GGTGTTGCCA TT/-- GTCAGGACAT 3070 het 3070 ref 54 29 17 8 T 2 0 157331 CASAVA_Build 3 10456538 16I CTCCCGGGTT ----------------/CAAGTGATTCTTGTGC CAAGTGATTC 3070 het 2887 hom 23 8 9 6 CAAGTGATTCTTGTGC 1 2 157332 CASAVA_Build 3 10469340 1D TGCAGTGGCT G/- GGGCTTGTAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 G 4 3 157333 CASAVA_Build 3 10469789 4D TTTACAGAAA TATC/---- TATCTCAGAG 3070 het 3070 hom 53 25 26 3 TATC 2 1 157334 CASAVA_Build 3 10474254 2D GTGTGTGTGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 166 het 62 0 55 7 GA 7 6 157335 CASAVA_Build 3 10474493 1I AGGAAAATCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 54 24 15 15 A 9 10 157336 CASAVA_Build 3 10500618 1D GTCCAGGGAT A/- AAGGGGTCTC 3070 hom 80 het 30 0 25 5 A 3 2 157337 CASAVA_Build 3 10589836 1I GCCAAATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 920 hom 27 2 21 4 T 13 14 157338 CASAVA_Build 3 10607177 1D TCCAGGGCCA C/- CCTCCTGGGC 3070 hom 56 het 24 0 18 6 C 3 2 157339 CASAVA_Build 3 10612339 1D ACCACATTGC G/- CTTCCATTAA 3070 hom 126 het 47 0 43 5 G 1 0 157340 CASAVA_Build 3 10633368 2I TAGCAAAATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 CA 8 9 157341 CASAVA_Build 3 10639175 1I GTGAAATTGG -/A AAAAATCCCC 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 5 6 157342 CASAVA_Build 3 10640239 1D CTTCATTGAA G/- ATGAAAATAC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 1 0 157343 CASAVA_Build 3 10646838 1D ACACAATTTC A/- TTTTAAAATT 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 A 1 0 157344 CASAVA_Build 3 10658670 8D CCCACACACT CATCCACC/-------- CATCCACCCA 3070 hom 105 het 49 0 34 19 CATCCACC 4 3 157345 CASAVA_Build 3 10671465 1D GGAAGCTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 30 0 18 12 A 15 14 157346 CASAVA_Build 3 10675025 1D AAGCTAAAAA C/- CTTGAGAAAA 3070 het 192 hom 10 1 9 0 C 2 1 157347 CASAVA_Build 3 10688393 1D TGCTTGGGGT G/- GATGCCCTGG 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 G 2 1 157348 CASAVA_Build 3 10702210 2D AGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1017 het 1017 ref 62 37 4 21 TG 9 8 157349 CASAVA_Build 3 10727533 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 41 14 15 14 GT 7 6 157350 CASAVA_Build 3 10735477 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 22 0 20 2 A 12 11 157351 CASAVA_Build 3 10745969 1D GAGATGCTCA G/- GCCGCTGACT 3070 hom 132 het 51 0 44 7 G 2 1 157352 CASAVA_Build 3 10755826 6D TTCTGCCCGC CCGATT/------ CCGATTCCCA 3070 hom 111 het 41 0 34 8 CCGATT 2 1 157353 CASAVA_Build 3 10759421 1D TCAAAAATGT A/- AATCCGATCA 2800 het 2800 ref 36 21 9 6 A 3 2 157354 CASAVA_Build 3 10764831 1D TAAGGGCCAT A/- ACACTCTCTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 1 157355 CASAVA_Build 3 10767436 1D CCCTACTGTT C/- CCCCCCACTC 3070 het 3070 ref 61 30 18 13 C 7 6 157356 CASAVA_Build 3 10771109 9I ATCACATGAT ---------/CACCACCTG CAGTGGTCAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 CACCACCTG 0 1 157357 CASAVA_Build 3 10774630 9D TGGGTCTGGG AGGGGTGGA/--------- AGGGGTGGAT 3070 het 3070 ref 53 28 19 9 AGGGGTGGA 2 1 157358 CASAVA_Build 3 10791923 2I CCAGAAATAC --/AA AGGAGGCAGG 3070 hom 97 het 37 0 31 6 A 1 3 157359 CASAVA_Build 3 10793182 1D CAGCCCCTGG C/- TCAGCCAGTG 3070 hom 58 het 25 0 18 8 C 1 0 157360 CASAVA_Build 3 10796609 1D CTGTTTCTTA C/- CCATCTTCAC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 C 3 2 157361 CASAVA_Build 3 10798072 1D AACTTCCTGC T/- AGGTAGGTAC 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 1 0 157362 CASAVA_Build 3 10800492 4I ATTTGCCTCT ----/TTCC TTCTTTATCT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 TTCC 0 1 157363 CASAVA_Build 3 10808724 1D CTCCTGCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 16 19 12 A 12 11 157364 CASAVA_Build 3 10820032 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 13 14 157365 CASAVA_Build 3 10823897 4I ATTAATTTAC ----/TTAA TTATTTAACC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 TTAA 0 1 157366 CASAVA_Build 3 10830880 1D TGCCATTGCA C/- CTCCAGCCTG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 2 1 157367 CASAVA_Build 3 10834770 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAAGG 3070 het 1830 hom 31 11 13 8 TA 1 0 157368 CASAVA_Build 3 10841866 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2026 het 2026 ref 27 12 6 9 A 17 16 157369 CASAVA_Build 3 10845129 1D AATTGATTTT C/- TTTGGACATG 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 C 1 0 157370 CASAVA_Build 3 10872380 4D AGACTAGTAA ACAG/---- ACAGTTACAA 2950 het 2950 ref 39 24 10 9 ACAG 2 1 157371 CASAVA_Build 3 10902447 1D TGTGGCAGGG T/- TGGGAGCCCC 3070 hom 53 het 25 0 16 9 T 2 1 157372 CASAVA_Build 3 10926058 1I AGCAAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 10 11 157373 CASAVA_Build 3 10935518 1D TGCAGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 9 6 T 11 10 157374 CASAVA_Build 3 10936994 1D TTAACAGAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 9 8 157375 CASAVA_Build 3 10940556 1I ATGTACCCCC -/T GATATAATAC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 0 1 157376 CASAVA_Build 3 10941943 1D AAGCATTTAC G/- CTGCTTCAGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 0 157377 CASAVA_Build 3 10960195 1D CCCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2589 hom 22 9 13 0 T 12 11 157378 CASAVA_Build 3 10963977 1I CCATGCTTGG -/T TGAGGGCTGA 3070 hom 132 het 47 0 39 8 T 1 2 157379 CASAVA_Build 3 10968412 4I TCCCCCAGGC ----/TCCT TCCTTTCCTC 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 TCCT 1 2 157380 CASAVA_Build 3 10975897 4I TCCGTCACCT ----/TCAG TCAACTGCAG 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 TCAG 0 1 157381 CASAVA_Build 3 10985247 2D CCCTCCACCC CT/-- GTGTTTCCGC 3070 het 3070 ref 43 17 13 14 CT 1 0 157382 CASAVA_Build 3 10995806 1D TTTGGAATAC T/- TCACAGCAGT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 2 1 157383 CASAVA_Build 3 11004431 1I TGTAGTTGGG -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 A 6 7 157384 CASAVA_Build 3 11013432 1I CTCTGCCACT -/G AAAAGCCCCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 0 1 157385 CASAVA_Build 3 11033041 6D CAGCACTTTG GGAGGC/------ GGAGGCGGAG 2423 het 423 hom 14 2 6 8 GGAGGC 3 2 157386 CASAVA_Build 3 11033279 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2336 het 2336 ref 21 11 7 4 A 13 12 157387 CASAVA_Build 3 11036068 3D TGTCAAGTGA AAT/--- AAGCCGGTCA 3070 het 3070 hom 58 24 29 7 AAT 1 0 157388 CASAVA_Build 3 11045543 1D GGTGAGGGCG C/- CCCCCCCGCA 2382 het 2009 hom 19 8 8 3 C 8 7 157389 CASAVA_Build 3 11049260 2I GAATAAACAC --/AT GAGTGCAAAT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 AT 0 1 157390 CASAVA_Build 3 11056072 2D GGACTTCCCC AG/-- AGTCTTAAAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 AG 2 1 157391 CASAVA_Build 3 11063961 1I GAAAGGTACA -/G GGTTTGGAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 2 3 157392 CASAVA_Build 3 11070351 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2650 het 455 hom 20 3 6 12 T 13 12 157393 CASAVA_Build 3 11101523 1D AGGCCCTCCA C/- AGTTGCATTG 3070 hom 81 het 28 0 26 3 C 1 0 157394 CASAVA_Build 3 11116016 1D TATTGAACTA T/- TTTAACATTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 4 3 157395 CASAVA_Build 3 11137571 4D ATTTCCTCAT CCAG/---- CCAGCCAGCC 3070 het 3070 hom 59 20 19 25 CCAG 5 4 157396 CASAVA_Build 3 11140067 1D CCTGTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 13 16 A 15 14 157397 CASAVA_Build 3 11162451 1I CTCCAGAGGT -/A ACCACTTCTA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 1 2 157398 CASAVA_Build 3 11201722 1D ACAGTACTAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 164 hom 30 2 18 10 T 3 2 157399 CASAVA_Build 3 11209030 1I TTTATGCTGG -/T TTTTTTTCGC 3070 het 3070 hom 61 24 26 11 T 7 8 157400 CASAVA_Build 3 11210011 4D AATTAAAAAC TATT/---- AATATCAGGC 3070 het 3070 ref 31 20 10 2 TATT 1 0 157401 CASAVA_Build 3 11224840 7D CAGTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1884 hom 19 9 9 1 T 17 10 157402 CASAVA_Build 3 11229530 2D GATCTAACCC CT/-- GTCACCTAAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 CT 1 0 157403 CASAVA_Build 3 11240185 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2498 hom 24 het 16 0 8 9 A 12 11 157404 CASAVA_Build 3 11241386 9D ACTCCATCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAGA 3070 het 1190 hom 19 5 12 4 A 17 8 157405 CASAVA_Build 3 11245598 1D AGAGTATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2085 hom 32 14 13 5 A 17 16 157406 CASAVA_Build 3 11248681 1D TTTGAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 1282 het 1282 ref 33 12 6 15 T 17 16 157407 CASAVA_Build 3 11252082 1I GGGGAGAGTA -/T TGCTGCCTCA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 1 2 157408 CASAVA_Build 3 11257326 3I1M7D GGCTGACTCT ---TAAGCCAG/GGGT------- AACTCCTCCA 3070 het 3070 ref 34 20 14 2 N/A 0 0 157409 CASAVA_Build 3 11257968 4D CAAACAAACC ACGT/---- ACGTCTTCTA 3070 het 3070 ref 37 27 9 2 ACGT 2 1 157410 CASAVA_Build 3 11258364 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2220 het 2220 ref 16 9 5 2 A 9 8 157411 CASAVA_Build 3 11262038 1D GACTTCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 31 0 28 4 A 12 11 157412 CASAVA_Build 3 11262692 6I ACACTTACAC ------/ACACAT ATACACACAT 3070 het 3070 hom 81 32 35 14 ACACAT 0 1 157413 CASAVA_Build 3 11264252 16D AAGGCATATC TGGATTTGTCTGGACG/---------------- TGGCAAAGGC 3070 het 3070 ref 32 26 12 2 TGGATTTGTCTGGACG 1 0 157414 CASAVA_Build 3 11285175 1D CATTTGTATT A/- AAAAAAAAAT 2518 het 26 hom 9 1 7 1 A 10 9 157415 CASAVA_Build 3 11303596 3D CAACCTTTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 45 het 17 0 15 3 TTA 5 4 157416 CASAVA_Build 3 11310862 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTA 2471 het 1247 hom 18 4 8 6 T 9 10 157417 CASAVA_Build 3 11312234 13D ACTGGTTCTA TTTCTTTCTTTCT/------------- TTTCTTTCTT 1249 het 1249 ref 15 6 5 4 TTTCTTTCTTTCT 2 1 157418 CASAVA_Build 3 11320928 12D GACAAAGAAG CATGACCCCCAA/------------ CATGACCCCC 3070 hom 147 het 54 0 49 7 CATGACCCCCAA 2 1 157419 CASAVA_Build 3 11330889 3I TAAATTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 102 het 45 0 34 11 TTG 3 4 157420 CASAVA_Build 3 11331254 1D ATAAAAAATA C/- CAAAAAAGTT 1706 hom 24 het 18 0 8 10 C 2 1 157421 CASAVA_Build 3 11335855 1D CTTGATTCTG C/- CCCCTCCTCC 3070 het 3070 ref 45 25 19 2 C 5 4 157422 CASAVA_Build 3 11337897 2I AGTTTTGACC --/GT GTGACCAGCA 3070 hom 119 het 45 0 34 11 GT 1 2 157423 CASAVA_Build 3 11338702 1D TACACATAAC A/- AAACAAGACT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 4 3 157424 CASAVA_Build 3 11342761 1I GTAAATGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 10 11 157425 CASAVA_Build 3 11348669 1I AATGTCATAT -/A ACAATGAATC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 157426 CASAVA_Build 3 11351105 2D TGCCTTAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 20 11 8 TG 7 6 157427 CASAVA_Build 3 11352674 1D CACATGGCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 60 hom 21 1 18 2 T 8 7 157428 CASAVA_Build 3 11354973 1D AAAAACAATT C/- TGAAGTCTTA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 C 1 0 157429 CASAVA_Build 3 11365714 1D GAAAAGTTCT C/- CCAAGTCCCC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 C 3 2 157430 CASAVA_Build 3 11368326 1D GTATAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 20 1 11 8 T 13 12 157431 CASAVA_Build 3 11389276 4D TAAGGGCTGG GTGT/---- GTGTGTGTGT 1522 het 1379 hom 28 9 9 11 GT 7 5 157432 CASAVA_Build 3 11389302 6D GCGCGTGTGC GTGTGT/------ GTGCGTGCGT 2381 het 212 hom 21 3 11 8 GT 4 1 157433 CASAVA_Build 3 11389326 4I GTGCGTGTGC ----/GTGT GTGTGTGTGT 2176 hom 27 het 19 0 9 10 GT 6 8 157434 CASAVA_Build 3 11392031 1D GCTAGTGAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 9 8 157435 CASAVA_Build 3 11397775 1I GTGGAGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 T 10 11 157436 CASAVA_Build 3 11404907 1D ATGTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 1106 het 1103 ref 32 12 8 12 T 17 16 157437 CASAVA_Build 3 11407147 1D GTGGGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 481 hom 27 2 17 8 T 13 12 157438 CASAVA_Build 3 11407233 3D TAAAAAACTG CAA/--- GTTAAAGTAC 3070 hom 126 het 44 0 43 2 CAA 1 0 157439 CASAVA_Build 3 11410160 1I GTTTTGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 10 11 157440 CASAVA_Build 3 11412591 1I CAGAAGTATA -/G GGAAAAAAAA 311 het 311 ref 24 13 2 9 G 2 3 157441 CASAVA_Build 3 11413861 1D CCAGGTAGAA T/- TTCTAAATTT 3070 hom 57 het 24 0 20 9 T 3 2 157442 CASAVA_Build 3 11415047 4D AGCAGTACTT AATA/---- AAAATGTGGC 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 AATA 1 0 157443 CASAVA_Build 3 11416859 1D ATGAGCAGAG A/- AGGACTAGCT 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 A 2 1 157444 CASAVA_Build 3 11417315 2D AACGTCACTC AG/-- GGTAATAATT 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 AG 1 0 157445 CASAVA_Build 3 11419810 2I AAGGGTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1724 hom 31 9 15 7 T 12 14 157446 CASAVA_Build 3 11422475 2I TTTGTTTTTG --/TT TTTTTTGTAG 3070 hom 49 het 22 0 17 5 T 6 8 157447 CASAVA_Build 3 11428452 1I AAGACTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 11 11 11 T 11 12 157448 CASAVA_Build 3 11430071 5D ACTTAATAAA TGAAT/----- TCAGCAAAGT 3070 het 3070 ref 21 13 8 2 TGAAT 1 0 157449 CASAVA_Build 3 11430475 1I AGGTTATGGT -/A ATTAGGTTTG 3070 het 3070 ref 48 30 16 2 A 1 2 157450 CASAVA_Build 3 11441450 1I AAAATATCCC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 8 9 157451 CASAVA_Build 3 11443966 1I CATTGCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2108 hom 34 8 13 13 T 16 17 157452 CASAVA_Build 3 11444873 1D GATTGTGAGA T/- TTTTCAGGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 5 4 157453 CASAVA_Build 3 11448938 1I AGCCTTGCAT -/A AAGAATGATA 3070 hom 71 het 40 1 34 5 A 2 3 157454 CASAVA_Build 3 11455065 1I AAAATAAAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 9 157455 CASAVA_Build 3 11461343 1I ATTTACAAGG -/A AAAAAACCCC 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 6 7 157456 CASAVA_Build 3 11466673 1I GGAACCTAAG -/T TGTTCAAGGT 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 1 2 157457 CASAVA_Build 3 11475973 1D GAGCCAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 27 10 T 13 12 157458 CASAVA_Build 3 11480097 3I TATCATAGGT ---/GGA GGAGAGTGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GGA 1 2 157459 CASAVA_Build 3 11483619 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAACTG 3070 hom 66 het 27 0 23 7 A 8 7 157460 CASAVA_Build 3 11484788 1I GTAAGTGGAG -/C CTAGTGGGAG 3070 hom 93 het 34 0 30 4 C 1 2 157461 CASAVA_Build 3 11490551 16D GTTCAGACTT ACCAAGTGTGTAGTAA/---------------- GCCAAGTGCC 3070 het 3070 ref 34 18 12 8 ACCAAGTGTGTAGTAA 1 0 157462 CASAVA_Build 3 11511931 1I CTGGCAGAGA -/C CCCCCAGACA 3070 het 3070 hom 47 22 19 6 C 5 6 157463 CASAVA_Build 3 11512154 1I TTTAAAACTC -/T CTGAAGCTGT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 0 1 157464 CASAVA_Build 3 11515732 5D CCACATTCCT CTATC/----- CTTTCCTGTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CTATC 1 0 157465 CASAVA_Build 3 11516928 1I CAATACAACT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 6 7 157466 CASAVA_Build 3 11518018 11I4M2I GATAATGATA -----------TTAA--/TTGCATTGATGTTAATT TAGATAGGTG 3070 hom 102 het 36 0 35 4 N/A 0 0 157467 CASAVA_Build 3 11518512 4I ATACACACAT ----/ACAC ACACACATAT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 AC 3 5 157468 CASAVA_Build 3 11524810 1D TGATGAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 8 A 15 14 157469 CASAVA_Build 3 11534737 1D AACCTGAGCC G/- AGGCTGGGCA 3070 hom 57 het 24 0 19 6 G 1 0 157470 CASAVA_Build 3 11538032 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 25 0 14 11 T 13 12 157471 CASAVA_Build 3 11538952 1D TGAGATGAGC G/- GATGAGCCTC 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 G 2 1 157472 CASAVA_Build 3 11555572 1I TCAACTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 853 hom 61 2 44 15 T 11 12 157473 CASAVA_Build 3 11555992 4D AATAAGACCT CTAA/---- CTAAATGAGT 3070 hom 66 het 27 0 20 9 CTAA 2 1 157474 CASAVA_Build 3 11557115 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 A 11 12 157475 CASAVA_Build 3 11562563 1D AGTGAGTTAT A/- GATGGCACCA 2662 hom 11 het 8 0 6 2 A 1 0 157476 CASAVA_Build 3 11569741 23D GTTTCCATCT TCACCTCACAGGTAGATGTGAGG/----------------------- TCACCTCACA 3070 hom 84 het 36 0 25 18 TCACCTCACAGGTAGATGTGAGG 2 1 157477 CASAVA_Build 3 11603475 2D AGACAACAAA CT/-- CTGTGTAGCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CT 2 1 157478 CASAVA_Build 3 11612299 1D20M5D ATCACACTCT GGGGACTGTTGTGGTGTGGGGGGGGC/-GGGACTGTTGTGGTGTGGGG----- GGGGAATAGC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 N/A 0 0 157479 CASAVA_Build 3 11614129 5D TCCTCCCAAG TTCCT/----- ATTTGTTAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTCCT 1 0 157480 CASAVA_Build 3 11614506 1D CTCTGTTGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 31 0 29 2 T 10 9 157481 CASAVA_Build 3 11616000 1D AATTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2714 hom 27 het 13 0 8 5 T 12 11 157482 CASAVA_Build 3 11623587 1D AAATGAAAAC A/- ATGTCCACAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 2 1 157483 CASAVA_Build 3 11628799 1I GTATCTTGAT -/A AGACTATGTA 3070 hom 102 het 47 0 35 12 A 1 2 157484 CASAVA_Build 3 11633537 1D AAATAAAAAA T/- AAAAAGAGAT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 1 0 157485 CASAVA_Build 3 11640223 1I TGAAAATTTT -/C CTTTTTTTTT 1991 het 1991 ref 38 20 8 10 C 1 2 157486 CASAVA_Build 3 11647736 3I GAATGCTCTC ---/CCT CCTCTTGATC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 CCT 1 2 157487 CASAVA_Build 3 11648793 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 9 157488 CASAVA_Build 3 11651153 1D AGGACTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 569 hom 27 2 17 8 T 12 11 157489 CASAVA_Build 3 11653531 1I TATACAGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2516 hom 42 8 16 18 A 15 16 157490 CASAVA_Build 3 11653844 7I ATAACAGAAT -------/GGATTTG GGATAACAAA 3070 het 3070 hom 43 12 26 5 GGATTTG 0 1 157491 CASAVA_Build 3 11654235 1D GAAAGCAAAA T/- CATTTTCAGG 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 1 0 157492 CASAVA_Build 3 11660761 2D TGCATAAGCC AT/-- ATATATATAT 1395 het 1395 ref 36 23 3 11 AT 7 6 157493 CASAVA_Build 3 11664217 11D TTTCGAGGTC AGTCTGGCAGA/----------- AGTCTGGCAG 3070 het 3070 hom 39 15 15 13 AGTCTGGCAGA 2 1 157494 CASAVA_Build 3 11665294 8I ATATAAATTT --------/TAAGAAAG TAAGTGATTT 3070 het 3070 ref 34 14 12 9 TAAGAAAG 0 1 157495 CASAVA_Build 3 11674008 1D GGTGAGAGGA T/- CTTAACTAAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 0 157496 CASAVA_Build 3 11674499 6D TCCGGGACTT TAAAAA/------ AGGCGATCCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TAAAAA 1 0 157497 CASAVA_Build 3 11676134 4I AGGGACTTGG ----/GTAT GGATTTCATA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 GTAT 0 1 157498 CASAVA_Build 3 11685391 2I CACATTTTAC --/AG ATTTCATGCC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AG 0 1 157499 CASAVA_Build 3 11686668 1D CTTTTTCTAC G/- CCCCTCCCAC 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 G 1 0 157500 CASAVA_Build 3 11688852 1D CTATTTAGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 8 T 9 8 157501 CASAVA_Build 3 11691836 1I TAAAAAATAA -/T AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 0 1 157502 CASAVA_Build 3 11692875 11D TCTCAAAAAA AAAAAAAAAAT/----------- AAAATAATAA 125 het 3 hom 4 0 1 3 AAAAAAAAAAT 1 0 157503 CASAVA_Build 3 11693087 1D GCATGATAAA T/- TTATTACAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 3 2 157504 CASAVA_Build 3 11699687 1D TCAAAAAAAT A/- AAAACAAACC 2952 het 2952 ref 18 8 7 3 A 5 4 157505 CASAVA_Build 3 11703510 2I TTTGTAGCTC --/AA AAAGTTTAAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 3 5 157506 CASAVA_Build 3 11706605 1I GGTGGTTGTT -/A AGTCACTGTA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 1 2 157507 CASAVA_Build 3 11714084 1I AAAGAAATCA -/G TAAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 G 0 1 157508 CASAVA_Build 3 11717837 1D AGCCAAGCAG A/- CACTCATGCC 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 A 1 0 157509 CASAVA_Build 3 11719545 1I ATAAAAGGGG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 A 6 7 157510 CASAVA_Build 3 11723243 3D CATCCTGAGT CAA/--- CAACAGTCTG 3070 het 3070 ref 39 20 15 6 CAA 2 1 157511 CASAVA_Build 3 11764920 1I CACGTCTGGC -/T TTTTTTTTTG 1772 het 1772 ref 19 8 6 5 T 9 10 157512 CASAVA_Build 3 11771011 1I GCTGATTTTT -/A AAAAAAATTT 2951 het 2951 ref 17 7 8 2 A 7 8 157513 CASAVA_Build 3 11776060 1D GCAATTGCTC A/- AATACATACC 3070 het 3070 hom 42 17 20 6 A 3 2 157514 CASAVA_Build 3 11777640 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1318 het 1201 hom 16 7 3 6 A 16 14 157515 CASAVA_Build 3 11784620 1I AACTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 10 11 157516 CASAVA_Build 3 11790562 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 7 8 157517 CASAVA_Build 3 11791700 1I GGGGACACAC -/A AAATTCAGAC 3070 het 55 hom 28 1 21 6 A 3 4 157518 CASAVA_Build 3 11792491 1D AATTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 1204 hom 12 het 10 0 4 6 T 15 14 157519 CASAVA_Build 3 11796127 2I GTCTCTTCTC --/TT TGTGCTCCAC 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 T 1 3 157520 CASAVA_Build 3 11810630 1I CAATTTTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 28 6 17 5 A 0 1 157521 CASAVA_Build 3 11813359 1I GCCAAGAGCC -/A AATTAAGAAC 3070 het 3070 ref 30 15 15 0 A 2 3 157522 CASAVA_Build 3 11824913 2D GGTGACCTAA AC/-- ACACACTCTG 3070 het 3070 hom 51 21 22 9 AC 4 3 157523 CASAVA_Build 3 11843187 1D AAAGGTTCAA G/- ATACCTTTAG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 G 1 0 157524 CASAVA_Build 3 11843784 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 15 17 17 T 13 12 157525 CASAVA_Build 3 11847356 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2658 het 2658 ref 37 17 12 8 A 15 16 157526 CASAVA_Build 3 11859182 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2217 hom 30 6 18 6 A 10 11 157527 CASAVA_Build 3 11871113 1I TACTTTACCC -/A ATTTGTTATA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 1 2 157528 CASAVA_Build 3 11874510 1I GAATTAATTT -/C TGTATAGGCT 3070 hom 84 het 39 0 28 11 C 0 1 157529 CASAVA_Build 3 11891456 1D ATCATAACTT G/- TAACTCATTT 2966 hom 15 het 6 0 6 0 G 1 0 157530 CASAVA_Build 3 11899614 1D CCCTGGTAAA G/- GCCAATTGTC 3070 hom 56 het 20 0 18 3 G 2 1 157531 CASAVA_Build 3 11903234 1I GAGAATGTAA -/T TTGTACTTTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 3 157532 CASAVA_Build 3 11904643 1D ACAGATTCAA G/- GGCAATCCCC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 3 2 157533 CASAVA_Build 3 11905710 1I GTATATACCC -/A AAAGAAAGGA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 3 4 157534 CASAVA_Build 3 11908248 1D7M1D GCCACACACT GGTTGACTG/-GTTGACT- GTTTTTTCTA 3070 hom 51 het 20 0 18 4 N/A 0 0 157535 CASAVA_Build 3 11911200 3D AATTCTCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 42 het 16 0 14 4 TTG 4 3 157536 CASAVA_Build 3 11916145 1D CCTTGAGCAG C/- TTTCCTGCTG 3070 hom 51 het 21 0 18 4 C 1 0 157537 CASAVA_Build 3 11921750 1I ACATGGCCCT -/G GAACTCTTCC 3070 hom 74 het 33 0 21 12 G 1 2 157538 CASAVA_Build 3 11922804 1D21M1D AGCTGGCACT CACCACAGGGCTGCCAGGATATC/-GCCACAGGGCTGCCAGGATAT- GCATTTCCAT 3070 hom 117 het 34 0 36 9 N/A 0 0 157539 CASAVA_Build 3 11948310 1D CCCTATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 11 10 157540 CASAVA_Build 3 11957873 1D TGGCAATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 26 1 18 7 T 13 12 157541 CASAVA_Build 3 11960833 2I AAGGACAGAC --/TT TGGGTTTGTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 1 3 157542 CASAVA_Build 3 11964483 1D GATGGCCCAT A/- AACCAAATAC 3070 hom 95 het 40 0 30 10 A 3 2 157543 CASAVA_Build 3 11992374 1I TCCATCACCC -/A AACCTACTGT 3070 hom 114 het 46 0 38 8 A 2 3 157544 CASAVA_Build 3 11996001 3I TCTGTCTCAA ---/AAC AACAACTAAA 3070 het 3070 ref 48 25 23 0 AAC 2 3 157545 CASAVA_Build 3 12003681 3D CCATCGCTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 6 A 15 12 157546 CASAVA_Build 3 12004464 2D AAAAAAAAAC AA/-- AAAACAAAAA 3070 hom 86 het 32 0 27 6 A 6 4 157547 CASAVA_Build 3 12008916 1D AAATGTTGCT A/- AAAAATGTTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 5 157548 CASAVA_Build 3 12011772 3D ACTCTATCCC CAT/--- CAGCTGCACA 3070 hom 68 het 28 0 23 6 CAT 1 0 157549 CASAVA_Build 3 12039429 3I AATATGAGAG ---/CAA CAACACCCTG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 CAA 1 2 157550 CASAVA_Build 3 12050006 1D TGGGACTCTC T/- TTTTTCCCAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 5 157551 CASAVA_Build 3 12062103 5D AGTACTTTCA CTATG/----- CTGTAGCCCG 3070 hom 129 het 46 0 44 6 CTATG 1 0 157552 CASAVA_Build 3 12066027 1I TCAAAAAAAA -/T AAAAATAATA 604 het 23 hom 16 1 4 11 T 0 1 157553 CASAVA_Build 3 12067909 1I3M12D4M2I AGGCACAGAG -CTACTGCTGGTCTTCTAGT--/ACTA------------AAATAA TTTGTCCTCC 3070 hom 93 het 27 0 32 5 N/A 0 0 157554 CASAVA_Build 3 12071167 1I ATCCTGGGAC -/T TTTTTTTTTT 1778 het 523 hom 26 3 10 13 T 15 16 157555 CASAVA_Build 3 12072919 2I AGCAATACTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 9 11 157556 CASAVA_Build 3 12080506 1D TACATTGGAG A/- AACCTGACAA 3070 hom 120 het 49 0 41 8 A 3 2 157557 CASAVA_Build 3 12084731 1I10M1I CTTTATACTA -CCTTGTACTT-/TCCTTGTACTTA ATTGATAGTT 3070 hom 78 het 25 0 27 1 N/A 0 0 157558 CASAVA_Build 3 12101499 1I ATTAACTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 38 1 32 5 A 10 11 157559 CASAVA_Build 3 12101609 4D CTGACTGGGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 41 0 38 4 A 16 12 157560 CASAVA_Build 3 12105163 2D ATGGACGGAT AA/-- ACAAAAATGT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 A 3 1 157561 CASAVA_Build 3 12106883 1I ACACAAACAC -/T TAAGTTAATG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 157562 CASAVA_Build 3 12110360 1I TGCCCTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 27 2 15 10 T 15 16 157563 CASAVA_Build 3 12111951 2I GGGAGACTGA --/GG GGCAGGAGAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 2 4 157564 CASAVA_Build 3 12125309 1D GGTTGGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 26 1 16 9 A 13 12 157565 CASAVA_Build 3 12146738 2I CTCTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 23 hom 46 1 33 12 GT 7 8 157566 CASAVA_Build 3 12171370 1D CCCAGCACAG T/- TGTGGTCCCA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 2 1 157567 CASAVA_Build 3 12171518 55D CCTATGAAGC TCCTTTTCACCTTTCAGACGAGATCGGGCGCGTTCAGGGTGGTATGGCCGTAGAT/------------------------------------------------------- TCCTTTTCAC 3070 hom 51 het 28 0 17 14 TCCTTTTCACCTTTCAGACGAGATCGGGCGCGTTCAGGGTGGTATGGCCGTAGAT 1 0 157568 CASAVA_Build 3 12185356 1D ATGCAGGAGA T/- TTCTTCTTAG 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 3 2 157569 CASAVA_Build 3 12190760 1D ACATCCTTAC T/- TTGCATATCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 3 2 157570 CASAVA_Build 3 12195771 1D AATAACCCTA G/- GGGTCTTGCT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 4 3 157571 CASAVA_Build 3 12196749 1D CCCAGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 21 1 14 7 T 13 12 157572 CASAVA_Build 3 12204516 2D18M1I TGTGTGTGTT TCTTTCTTTGTAAAAAAAAA-/--TTTCTTTGTAAAAAAAAAT TTTTTAATCT 3070 hom 84 het 24 0 29 2 N/A 0 0 157573 CASAVA_Build 3 12205114 1D CAAAGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 11 10 157574 CASAVA_Build 3 12206298 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 8 157575 CASAVA_Build 3 12215886 1D AATCTATAGC T/- TTATTGTCAA 3070 hom 151 het 57 0 50 8 T 3 2 157576 CASAVA_Build 3 12220395 1D TAAATGAATT A/- AATGTGCAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 3 2 157577 CASAVA_Build 3 12220515 1D AAAAAGTTAA C/- CAAAAATAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 C 2 1 157578 CASAVA_Build 3 12227151 1I TTTCCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 30 1 24 5 T 11 12 157579 CASAVA_Build 3 12228499 1I AATCCCACAC -/T TTGGGACACC 3070 hom 99 het 38 0 31 7 T 2 3 157580 CASAVA_Build 3 12235697 1D TCGGCTCACT A/- GCAAGCTCCG 1475 hom 17 het 8 0 5 3 A 1 0 157581 CASAVA_Build 3 12235796 1D AATTTTTTTG T/- TATTAAGACG 2330 hom 18 het 8 0 6 2 T 2 1 157582 CASAVA_Build 3 12252592 1I TTTATCTCCT -/A AATTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 2 3 157583 CASAVA_Build 3 12255078 1I AGCTAACAGG -/T TATCTACTAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 1 2 157584 CASAVA_Build 3 12257088 1D GTCTGGCTAA T/- TTTGTTTATT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 4 3 157585 CASAVA_Build 3 12262766 1D TCCTGACACA T/- TTTTTTTTTT 1908 het 1908 ref 32 18 5 9 T 13 12 157586 CASAVA_Build 3 12264310 1I TGTCTGTCCA -/T TTGTAGTGTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 3 157587 CASAVA_Build 3 12270054 5D TGAGGGAGAG TTTGT/----- TTTATCGTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TTTGT 1 0 157588 CASAVA_Build 3 12274000 2D CTTCTCAAAG AA/-- GAGATAAGCA 3070 het 3070 ref 40 18 17 6 A 2 0 157589 CASAVA_Build 3 12290664 1D CGCTTGAACC T/- TGGAAGGCAG 3070 hom 96 het 36 0 32 5 T 2 1 157590 CASAVA_Build 3 12324005 2D AAAAAGAATT AG/-- AGAATGAGTA 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 AG 2 1 157591 CASAVA_Build 3 12329243 4D TTTTTCTACT TAAG/---- TAATAATTAC 3070 het 3070 ref 41 20 18 6 TAAG 1 0 157592 CASAVA_Build 3 12335358 1I ACTGTTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 14 12 T 10 11 157593 CASAVA_Build 3 12335885 1D CAATCATTTT G/- TAGGAGTATA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 G 1 0 157594 CASAVA_Build 3 12342885 2I TTAATACTTC --/AA ATACAGTGGA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 1 3 157595 CASAVA_Build 3 12360915 1I AGACTGAACC -/A ATCTACTATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 2 157596 CASAVA_Build 3 12363909 3D ACTATCCGGC TTG/--- TTGTGATGGT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 TTG 2 1 157597 CASAVA_Build 3 12379997 1I TGTCACATGG -/T TTTGCCAGAC 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 3 4 157598 CASAVA_Build 3 12380530 1D TACACTTGTT A/- ACAGTCAATA 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 A 2 1 157599 CASAVA_Build 3 12398240 1D AGAAAGTGGA T/- AAAAGTTGGG 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 T 1 0 157600 CASAVA_Build 3 12402802 8D CACTTGGTTA TCATGAAC/-------- TCGGTGTAAA 3070 het 3070 ref 43 23 19 7 TCATGAAC 1 0 157601 CASAVA_Build 3 12403020 1D CTTAATTCTC T/- TTTTTTTTTT 1853 het 1853 ref 44 32 4 8 T 13 12 157602 CASAVA_Build 3 12404386 1I CTTGAGTTAA -/T TTTTGTATAT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 4 5 157603 CASAVA_Build 3 12416169 1D GGAGGGAGGG A/- AAAAAGGAAA 1888 hom 24 het 11 0 8 3 A 6 5 157604 CASAVA_Build 3 12418116 1D TGAAAGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2485 hom 31 11 10 10 A 15 14 157605 CASAVA_Build 3 12425340 1D AAAGACTGAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 A 9 8 157606 CASAVA_Build 3 12425916 1I ATATGGGAAA -/G GGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 G 2 3 157607 CASAVA_Build 3 12426118 14D GTATATAAAA GTGGCTATGGCTGT/-------------- GCAGCAGAGC 3070 het 3070 ref 39 20 19 5 GTGGCTATGGCTGT 1 0 157608 CASAVA_Build 3 12428296 4I ACCAACGAGA ----/CGTT GGCTGAGGAA 3070 het 3070 ref 56 28 25 3 CGTT 0 1 157609 CASAVA_Build 3 12432917 4I AACAATGAAG ----/ACTC ACTCCCCAAA 3070 het 2378 hom 24 6 15 3 ACTC 1 2 157610 CASAVA_Build 3 12438465 1D GGGAATTGTT C/- TCATTGCTAT 3070 het 3070 hom 46 14 25 7 C 1 0 157611 CASAVA_Build 3 12439381 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2254 hom 21 7 12 2 A 12 11 157612 CASAVA_Build 3 12443711 30I CTTTGCTGAA ------------------------------/TTCCGTTTAGGCCCACTGTGATTCTGATGG TTGGATCAGA 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 TTCCGTTTAGGCCCACTGTGATTCTGATGG 0 1 157613 CASAVA_Build 3 12459788 1I ACTCTGCCCC -/G GGGGAGGTAA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 G 4 5 157614 CASAVA_Build 3 12463737 4D GGAGAAAGAA AGAG/---- AGAGAAAGAA 3070 het 1141 hom 18 4 10 5 AG 4 2 157615 CASAVA_Build 3 12473417 1D TTCAAGCTAT C/- CCCAATAGCC 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 C 4 3 157616 CASAVA_Build 3 12479276 1I AAAAAAATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 8 9 157617 CASAVA_Build 3 12481919 2D CCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2487 het 1616 hom 30 11 8 11 T 18 16 157618 CASAVA_Build 3 12483517 1D ATGAATGGAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 9 8 157619 CASAVA_Build 3 12494045 1D AAAAGAAGGT G/- GTAAAGGGTG 3070 hom 141 het 51 0 46 6 G 2 1 157620 CASAVA_Build 3 12495370 1I GTCTCCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2189 hom 19 6 9 4 A 10 11 157621 CASAVA_Build 3 12499050 1I AATTTACAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 8 9 157622 CASAVA_Build 3 12501906 1I GGAGTCAGGT -/G TGCGCAGGTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 0 1 157623 CASAVA_Build 3 12507489 1D TTGCTGGGTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 44 16 21 8 T 8 7 157624 CASAVA_Build 3 12510752 1D TTAATCCATA T/- AATGAAGGAC 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 1 0 157625 CASAVA_Build 3 12537271 4I CCTGGGTGAC ----/AGAG AGAGACTCCA 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 AG 2 4 157626 CASAVA_Build 3 12538516 13D AAAAAATAAT AATAAAAAATAAA/------------- AATAAAAAAT 3070 het 1995 hom 13 7 9 1 AATAAAAAATAAA 2 1 157627 CASAVA_Build 3 12547705 5I GTGGGAACTA -----/CAATT CAAGATGAGA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 CAATT 0 1 157628 CASAVA_Build 3 12553504 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2117 hom 23 8 9 6 A 13 12 157629 CASAVA_Build 3 12555637 1D TGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 11 13 10 T 11 10 157630 CASAVA_Build 3 12557738 1D TTTTGTTTTT G/- GTGAGACGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 2 1 157631 CASAVA_Build 3 12559748 1I ACAAGGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 61 29 21 11 T 9 10 157632 CASAVA_Build 3 12567317 16D ACATATTTTG TTATGTTGGGTTATAT/---------------- GTGTTGGGTA 3070 het 3070 hom 27 15 17 2 TTATGTTGGGTTATAT 1 0 157633 CASAVA_Build 3 12570848 1D CTGCTTGCAT C/- CTTCGGGAAA 2123 het 2123 ref 19 7 6 9 C 2 1 157634 CASAVA_Build 3 12572881 1D AATAATAATT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 851 hom 12 2 8 3 A 9 8 157635 CASAVA_Build 3 12582954 2D CAAGTTTGTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 49 18 21 10 TC 9 8 157636 CASAVA_Build 3 12585756 9I CGCCTCCAGG ---------/GTTCAAGCA GTTCTCCTGC 1282 het 1282 ref 14 10 4 0 GTTCAAGCA 0 1 157637 CASAVA_Build 3 12587614 8I TGTTGTGTTT --------/TTTGTTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 TTTG 2 4 157638 CASAVA_Build 3 12594179 1D AAAGTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 13 12 157639 CASAVA_Build 3 12600265 4D GAAACAAGGC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 TGTT 5 4 157640 CASAVA_Build 3 12606855 1D60M1D AGAGTCTCGC TTCTGCAGCCAAGGTTGGAGTGCAGTAACGTGATCTAAGCTCCCCGCAACCTCTGCTTTCCA/-TCTGCAGCCCAGGCTGGAGTGCAGTAACGTGATCTTAGCTCACCGCAACCTCTGCCTTCC- ATGTTCAAGC 1379 hom 8 het 8 0 3 7 N/A 0 0 157641 CASAVA_Build 3 12610300 3I TTTTTTTTTT ---/TTC TTTTTCTTTT 1631 het 1631 ref 32 14 8 10 TTC 0 1 157642 CASAVA_Build 3 12622548 1I TCTACCTTTT -/G CTGTACCACC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 G 0 1 157643 CASAVA_Build 3 12631202 1D TGGGATTACA G/- GGAAGAGCCT 3070 het 3070 ref 24 14 7 3 G 3 2 157644 CASAVA_Build 3 12642199 4D AGTGAAAGAA TATT/---- TACCCCCAGC 3070 het 3070 ref 45 27 18 0 TATT 1 0 157645 CASAVA_Build 3 12643089 1D GACCTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 A 12 11 157646 CASAVA_Build 3 12644222 2D TATTTGCTTT AA/-- AATCAAGCAA 3070 het 3070 ref 42 26 11 6 A 4 2 157647 CASAVA_Build 3 12648638 2I CAGCCTGGCC --/AA CATGGTGAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 0 2 157648 CASAVA_Build 3 12649990 1I TGGAAATTAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 2987 hom 36 13 16 7 G 0 1 157649 CASAVA_Build 3 12650653 1D CCTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2909 het 263 hom 33 6 9 18 T 13 12 157650 CASAVA_Build 3 12653847 1I TCTATTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 39 0 31 8 T 10 11 157651 CASAVA_Build 3 12660236 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2515 hom 25 8 13 6 A 13 12 157652 CASAVA_Build 3 12662871 5D ATATTACCGG TTTCT/----- TTTAAGTCTT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 TTTCT 1 0 157653 CASAVA_Build 3 12663965 2D GGTGTAGCAC AT/-- GTGTAGTCCC 2744 het 2744 ref 25 14 7 5 AT 1 0 157654 CASAVA_Build 3 12670676 1I TTTTAGAGAT -/G GGGGTCTCAC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 4 5 157655 CASAVA_Build 3 12676070 12I TACACATACC ------------/AATAAAAGACCT AAACAACCTC 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 AATAAAAGACCT 0 1 157656 CASAVA_Build 3 12676148 2D TTTCCACCTC AT/-- AGTCATTTGT 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 AT 1 0 157657 CASAVA_Build 3 12676659 2I AGCAACTGTA --/AT ATATAATACT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 AT 2 3 157658 CASAVA_Build 3 12676803 1D GAAGGCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 T 11 10 157659 CASAVA_Build 3 12680160 1D CCCAACGCTA C/- CCCAGGGTGA 2172 hom 23 het 9 0 7 2 C 4 3 157660 CASAVA_Build 3 12684025 2D GGGAATAATA AC/-- ACTTTCCTTG 3070 het 2602 hom 24 6 9 10 AC 2 1 157661 CASAVA_Build 3 12687573 2D CATGGATAAC TG/-- TGCGAGGGGC 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 TG 2 1 157662 CASAVA_Build 3 12690180 1D7M1D CTCAAAAAAA TAAATAAAT/-AAAGAAA- AAAATGGTCT 3070 hom 90 het 30 0 29 8 N/A 0 0 157663 CASAVA_Build 3 12691910 1I GGTCTTGAAG -/A AAAAAAACAC 3070 hom 104 het 43 0 32 11 A 7 8 157664 CASAVA_Build 3 12705305 1D AGATCACTTG A/- AGTCCAGGAG 3070 het 35 hom 16 1 15 0 A 2 1 157665 CASAVA_Build 3 12711266 1I TCCACCCATC -/T TGGCCTCCTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 1 2 157666 CASAVA_Build 3 12711973 1I CAATAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 8 9 157667 CASAVA_Build 3 12725263 3I TGAGAGGAGA ---/CAT CATTCATCTG 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 CAT 1 2 157668 CASAVA_Build 3 12734530 3D GAGAAAATAA ACT/--- ACCTCTCCAT 3070 het 3070 hom 21 10 9 3 ACT 1 0 157669 CASAVA_Build 3 12735147 1I CCAAAGTCCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 2 3 157670 CASAVA_Build 3 12747575 1D GTACAGAGAT C/- CCTTCAAGTC 3070 het 3070 hom 34 16 15 4 C 3 2 157671 CASAVA_Build 3 12747693 1D GTGGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 1930 het 1930 ref 26 10 7 9 A 15 14 157672 CASAVA_Build 3 12749898 4D GTCTCAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 AAAG 6 5 157673 CASAVA_Build 3 12750399 2D TTTATTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2254 hom 34 11 14 9 T 16 14 157674 CASAVA_Build 3 12776487 1I GCAAGGCCCA -/G GGAGCTGTGG 3070 hom 95 het 34 0 31 3 G 2 3 157675 CASAVA_Build 3 12778105 1I ATCTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 22 1 19 2 A 10 11 157676 CASAVA_Build 3 12784882 1I TCTTATGTGG -/C CCCCACTCAC 3070 hom 57 het 24 0 17 7 C 4 5 157677 CASAVA_Build 3 12789921 4I GAGATGGAAG ----/CTCA CTCAGTCTCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTCA 1 2 157678 CASAVA_Build 3 12792906 3I GGTTATTTGT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 36 0 27 9 TTG 0 1 157679 CASAVA_Build 3 12793231 1I ATCTGATGGA -/G GGGGGTATGT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 5 6 157680 CASAVA_Build 3 12794038 1D TTTCTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 12 11 157681 CASAVA_Build 3 12796442 2D CTTAACCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 24 0 19 5 T 16 14 157682 CASAVA_Build 3 12797181 21D AGCCAGACAT CAACTGTGTTGATGATAAACA/--------------------- CAGTTAGAGC 3070 hom 120 het 37 0 41 5 CAACTGTGTTGATGATAAACA 1 0 157683 CASAVA_Build 3 12801309 1D21M1D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAACCCAAAACCA/-AAAAAAAAAAAACCCAAAACC- AAAAAACAAA 3070 hom 63 het 19 0 22 3 N/A 0 0 157684 CASAVA_Build 3 12807976 1I TTCTCCCCTG -/A TGCAACTGAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 0 1 157685 CASAVA_Build 3 12808235 1I AAATTATTAC -/A AAAATATTAT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 4 5 157686 CASAVA_Build 3 12808841 1D GATGTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 10 5 A 15 14 157687 CASAVA_Build 3 12809713 1I TCAAGACCAG -/C CTTCTGGCCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 157688 CASAVA_Build 3 12810566 19D GCTTACTGCA ACCTCTGCCTCCCAGGCTC/------------------- ACCTCTGCCT 3070 hom 51 het 20 0 15 5 ACCTCTGCCTCCCAGGCTC 1 0 157689 CASAVA_Build 3 12812066 2D TTAATAAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 1655 het 325 hom 15 1 7 7 T 16 14 157690 CASAVA_Build 3 12812231 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3067 hom 18 het 7 0 7 0 T 7 6 157691 CASAVA_Build 3 12814237 2D35M2I ATAGGGAAAC TGAGTCTCAGAGACATGAAGGGCGTAGGTTCAGTCAC--/--AGTCTCAGAGACATGAAGGGCGTAGGTTCAGTCACAA AGCGAGGAAG 3070 hom 154 het 45 0 51 11 N/A 0 0 157692 CASAVA_Build 3 12814606 1D TCTGAGGGTT G/- GGGTAAGGAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 4 3 157693 CASAVA_Build 3 12815398 2I AAACTGAGAC --/TG TGTCCTCTGG 3070 hom 57 het 27 0 20 7 TG 1 2 157694 CASAVA_Build 3 12824012 1D19M1I AGTTTATGGT AAAAAAACAAACGAAAAAAC-/-AAAAAACAAACGAAAAAACA AAAAAAAAAA 3070 hom 145 het 41 0 48 5 N/A 0 0 157695 CASAVA_Build 3 12834762 1D TGCCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 39 0 30 9 A 11 10 157696 CASAVA_Build 3 12840468 6I CCCCATCCTT ------/AATTTC ATTTCTTTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AATTTC 0 1 157697 CASAVA_Build 3 12842936 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 9 8 157698 CASAVA_Build 3 12847514 1D51M3I AGTTGTTGTT AAAAGTTTTTGTTTGGTTTTGAAATCAGGTGTCAACATTTAAAAATCGAGAC---/-AAAGTTTTTGTTTGGTTTTGAAATCAGGTGTCAACATTTAAAAATCGAGACCTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 20 11 11 N/A 0 0 157699 CASAVA_Build 3 12848122 14D CTATGGAGTC CTCGGCCAGTCGTT/-------------- CAGTTACCCT 3070 het 3070 ref 44 22 18 9 CTCGGCCAGTCGTT 1 0 157700 CASAVA_Build 3 12852831 1I GGCTGCTTGG -/T TAAGTGGCTG 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 T 1 2 157701 CASAVA_Build 3 12855016 1I GTTTCCTCCT -/G GTTCTCCATC 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 G 1 2 157702 CASAVA_Build 3 12856586 8I ATGTCAGAAA --------/CTGGCGGC CTGTTGGAAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 CTGGCGGC 0 1 157703 CASAVA_Build 3 12860434 1D TTTATATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 26 0 22 4 A 12 11 157704 CASAVA_Build 3 12872633 2I GTTTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 1076 hom 23 7 12 4 TG 0 1 157705 CASAVA_Build 3 12878152 1D AGTTTCCACC A/- TCCCCGCAAA 2276 het 2276 ref 34 18 7 9 A 1 0 157706 CASAVA_Build 3 12882431 1D GAGTTTTCCA G/- TTTTCAGTGA 3070 hom 150 het 54 0 48 6 G 1 0 157707 CASAVA_Build 3 12898521 3D TCAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGTGAC 1743 het 1743 ref 21 14 6 1 AAG 3 2 157708 CASAVA_Build 3 12904226 3D CCAGCTAATG TTT/--- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 6 3 157709 CASAVA_Build 3 12907823 1D GGCTTGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 49 0 34 16 T 11 10 157710 CASAVA_Build 3 12907914 2D AATAGGACAA AC/-- ACACACACTC 3070 het 3070 ref 40 26 11 3 AC 5 4 157711 CASAVA_Build 3 12912178 1I AGATGACATG -/T TGGAAGCCAG 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 1 2 157712 CASAVA_Build 3 12915367 2I ATTGCGAGAC --/AA AGAGTGCTTT 3070 hom 126 het 51 0 42 9 A 1 3 157713 CASAVA_Build 3 12935609 1I GTAGAGGAGG -/C CCCGGCCTCC 3070 hom 54 het 20 0 16 4 C 3 4 157714 CASAVA_Build 3 12940142 1I CCTTGGTTTC -/A CCCACCCATG 2913 het 1997 hom 22 8 11 3 A 0 1 157715 CASAVA_Build 3 12942810 2D ACTCCATGTC AA/-- AAAAAAAAAA 2603 het 163 hom 19 4 9 6 A 14 12 157716 CASAVA_Build 3 12950122 1I ACTGTGGGAC -/G GGGGGGTTAT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 G 6 7 157717 CASAVA_Build 3 12991321 1D AGCAGCACCC T/- CAGGGAGGGA 2966 het 2966 ref 36 22 9 5 T 1 0 157718 CASAVA_Build 3 12993449 1D GAAGGGCTGG A/- AAAATGGTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 5 4 157719 CASAVA_Build 3 12993853 1D GTCTCCAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 30 0 24 6 A 13 12 157720 CASAVA_Build 3 12995205 1D GCTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2241 hom 18 6 10 2 A 11 10 157721 CASAVA_Build 3 13012671 1I TTAAAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2164 hom 28 7 11 10 T 11 12 157722 CASAVA_Build 3 13019383 2I ACTGGTGGGA --/AT ACAAAAAGAT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 AT 0 1 157723 CASAVA_Build 3 13026168 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2859 hom 27 8 14 6 TG 10 9 157724 CASAVA_Build 3 13028454 1D GGACTCACTT A/- AGAAGGGTGG 3070 hom 96 het 40 0 30 10 A 2 1 157725 CASAVA_Build 3 13029598 1D GTAGCTGGGA T/- TACCGGCATG 3070 hom 45 het 17 0 13 4 T 2 1 157726 CASAVA_Build 3 13033700 10D CACTCTGTCA TCCCTCCCTG/---------- TTTTATTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 12 10 TCCCTCCCTG 1 0 157727 CASAVA_Build 3 13049599 1I GATTATTGAG -/T TTTTTGGCAC 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 5 6 157728 CASAVA_Build 3 13057722 1D GCCTGGGGGC G/- GGGGGTGGGG 3070 hom 10 het 23 0 11 12 G 6 5 157729 CASAVA_Build 3 13080502 2D TTGCAGTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 11 8 A 14 12 157730 CASAVA_Build 3 13085891 2I TTTCTTGGAG --/GC GTGTGTGTGT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 GC 0 1 157731 CASAVA_Build 3 13090854 1I GTGGTGCAGT -/G GTGCGACAGG 3070 hom 92 het 36 0 24 12 G 1 2 157732 CASAVA_Build 3 13100825 1I TCCTTCCACA -/C CCCCACATCC 3070 het 3070 hom 38 12 13 13 C 4 5 157733 CASAVA_Build 3 13109724 1D ACTCACTTAT A/- AAGGAGACAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 A 3 2 157734 CASAVA_Build 3 13124542 1D AGCATAAAGG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 63 het 22 0 20 3 A 8 7 157735 CASAVA_Build 3 13138620 1D GCAATGCCCA C/- CCCCGAAGGG 3070 hom 73 het 29 0 21 8 C 5 4 157736 CASAVA_Build 3 13142682 4D TCCATGCCCT CAAA/---- CATTCTCTCA 3070 hom 129 het 45 0 44 4 CAAA 1 0 157737 CASAVA_Build 3 13180033 1I TGACACCCCA -/G GGTACTGTCT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 G 2 3 157738 CASAVA_Build 3 13194073 3I CCCCCATTCC ---/CCA CCATCCCTGT 3070 hom 53 het 22 0 15 7 CCA 1 2 157739 CASAVA_Build 3 13197770 12D GACTCCGTCT CAAACAAACAAA/------------ CAAACAAACA 3070 hom 61 het 25 0 19 8 CAAA 8 5 157740 CASAVA_Build 3 13216345 1D CAGCCCCCGC A/- AGGGAAACCA 3070 hom 47 het 29 0 15 16 A 2 1 157741 CASAVA_Build 3 13216560 2D GCACACACAC CA/-- CACACATACA 3070 hom 152 het 56 0 46 11 CA 4 3 157742 CASAVA_Build 3 13223946 1D CCAGACCCCC T/- GCTGCCATTC 3070 hom 82 het 35 0 26 9 T 1 0 157743 CASAVA_Build 3 13242379 1D AATTCATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 33 1 27 5 T 11 10 157744 CASAVA_Build 3 13246811 1I ATTTCCCCTC -/A AAACGCTCAC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 3 4 157745 CASAVA_Build 3 13248059 1I CTCCCAACGG -/C CCCCACCTTC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 4 5 157746 CASAVA_Build 3 13260557 1D TTTCAGGCAG A/- GGGGTGGCCT 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 A 1 0 157747 CASAVA_Build 3 13282391 2D ACGGGCATTT AA/-- AAAAAAAAAA 2888 het 2483 hom 35 9 10 16 A 13 11 157748 CASAVA_Build 3 13305996 1I TGGGTCAGAG -/C CCTAGATGCA 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 C 2 3 157749 CASAVA_Build 3 13318756 1D TCCTATGGCC T/- TGTCTTATCT 2500 het 2500 ref 34 17 7 10 T 2 1 157750 CASAVA_Build 3 13336041 3I CTGCTGAGCA ---/GAG GAGGGGCACA 3070 het 3070 ref 32 12 9 11 GAG 1 2 157751 CASAVA_Build 3 13342861 1I CCTTTTTAGC -/A AACAGACAGC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 2 3 157752 CASAVA_Build 3 13343040 1I TAGTAAGGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 9 10 157753 CASAVA_Build 3 13349243 2D ACACACACAC AT/-- GGCCAAAGAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 AT 1 0 157754 CASAVA_Build 3 13368167 1D TTGATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 10 11 T 11 10 157755 CASAVA_Build 3 13384584 1D AAAATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 2553 het 2553 ref 24 10 8 6 T 10 9 157756 CASAVA_Build 3 13392388 1I GATGTGGTGT -/C CCCCCCCAAC 2176 het 2176 ref 20 8 9 3 C 7 8 157757 CASAVA_Build 3 13396457 1D TAAGCTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2847 hom 27 8 17 2 A 10 9 157758 CASAVA_Build 3 13402289 12D TCTGCTGATG GATGAATGGGTA/------------ GATGAATGGG 3070 het 3070 ref 58 30 25 6 GATGAATGGGTA 2 1 157759 CASAVA_Build 3 13417696 1D CAGGCGGAGG C/- CTGCAGTGAG 2765 hom 23 het 9 0 6 3 C 2 1 157760 CASAVA_Build 3 13419461 1D CATGTCCTGT A/- AGTTTGGACA 3070 het 3070 hom 56 17 26 13 A 2 1 157761 CASAVA_Build 3 13431014 1I AACCCTGCCC -/A ACATCTGACC 3070 hom 98 het 36 0 31 5 A 1 2 157762 CASAVA_Build 3 13438426 2D ATGCACACAC AT/-- ATGTATATAT 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 AT 2 1 157763 CASAVA_Build 3 13439197 1D GGAAGACAAC A/- AAATGGGCCG 2810 het 2810 ref 20 11 8 1 A 4 3 157764 CASAVA_Build 3 13449953 11I ACAGTGAAAG -----------/AGATCCAACTT AATTGACTCC 3070 het 3070 ref 35 27 7 2 AGATCCAACTT 0 1 157765 CASAVA_Build 3 13456082 5D CCGTAAAAAA AAAAC/----- AAAAACAAAA 782 het 782 ref 32 17 6 11 AAAAC 1 0 157766 CASAVA_Build 3 13457855 6I TGTGAATAGC ------/TTTTTA TTTTTAATTG 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 TTTTTA 1 2 157767 CASAVA_Build 3 13459073 1D TTTGTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 12 11 157768 CASAVA_Build 3 13478803 1I TATGAAAAAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 7 8 157769 CASAVA_Build 3 13502490 1D GAAGTAGGCC G/- GGTGCAGTGA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 G 3 2 157770 CASAVA_Build 3 13527949 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 659 hom 35 3 22 11 A 15 14 157771 CASAVA_Build 3 13531080 1D GATTCTCCAC A/- ACCCCTTTGC 3070 hom 109 het 44 0 35 9 A 2 1 157772 CASAVA_Build 3 13549069 1D TTCCCCATAA C/- CCCCCCATCC 3070 het 2487 hom 33 11 15 8 C 7 6 157773 CASAVA_Build 3 13554277 3D TGCATCTCAT CTC/--- CTCAGTGCAA 3070 hom 148 het 54 0 50 6 CTC 2 1 157774 CASAVA_Build 3 13555046 1D GTGACTGGTT C/- CAGGCCTGGG 3070 hom 112 het 43 0 34 11 C 2 1 157775 CASAVA_Build 3 13556629 1I TGAAGCACCT -/G GGGGGAAAGC 3070 hom 90 het 34 0 25 9 G 5 6 157776 CASAVA_Build 3 13557454 1D ACACCCAGTG T/- TTAACCTTCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 3 2 157777 CASAVA_Build 3 13558651 2I TTTTTCTTTC --/CT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 23 10 CT 0 1 157778 CASAVA_Build 3 13559132 4D TGTGGGCAGG CATA/---- CATACATACA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 CATA 3 2 157779 CASAVA_Build 3 13562230 2D AATCTGGCAG CA/-- CATCTTACAA 3070 hom 33 het 29 0 12 17 CA 2 1 157780 CASAVA_Build 3 13568726 1I GGGCAGCTGT -/G GGGGATCCAT 3070 hom 57 het 30 0 19 11 G 4 5 157781 CASAVA_Build 3 13571099 24I AACTTCCCTA ------------------------/GTCCTTGGAGCAGAGACACTCACT GTCCTCGTGG 3070 hom 117 het 40 0 38 7 GTCCTTGGAGCAGAGACACTCACT 0 1 157782 CASAVA_Build 3 13575756 3I TTAATCAAAA ---/GGG GGGGTTCATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 4 7 157783 CASAVA_Build 3 13575850 9I CCTGTTTCTC ---------/TTTCTTGGA TTTCTTGGCT 3070 hom 95 het 41 0 30 11 TTTCTTGGA 0 1 157784 CASAVA_Build 3 13584301 1I GACCCTTGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 8 9 157785 CASAVA_Build 3 13585168 2D CGCCCTCCTC AG/-- AGAAGCCCTC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 AG 2 1 157786 CASAVA_Build 3 13586336 2D TGCGTGGGAC TG/-- TGCGTGTGAG 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 TG 2 1 157787 CASAVA_Build 3 13589690 4D ATGGCTCCCT CCGG/---- CCGGCCCCTC 3070 hom 62 het 23 0 17 8 CCGG 2 1 157788 CASAVA_Build 3 13595167 1D GTGTAAGTTT A/- TTATATGGAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 0 157789 CASAVA_Build 3 13605429 1I GATTCATCTA -/T TAAGTAACAC 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 T 1 2 157790 CASAVA_Build 3 13623817 1I TAAGCTTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 9 10 157791 CASAVA_Build 3 13625386 1D TGCTTCCTAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 8 7 157792 CASAVA_Build 3 13629127 3I CGTGATCCAC ---/CCA CCACCTCGGC 2120 hom 18 het 7 0 7 0 CCA 1 2 157793 CASAVA_Build 3 13629621 2I TGTTCAGTTA --/GT TGATGTGCAG 3070 het 3070 hom 47 14 26 7 GT 0 1 157794 CASAVA_Build 3 13654852 2D ACATGTACAT TA/-- TATAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 8 6 TA 3 2 157795 CASAVA_Build 3 13658563 2D GCCCCACCAC CT/-- CTGTTTTAGA 3070 het 3070 hom 61 31 23 8 CT 2 1 157796 CASAVA_Build 3 13660326 2D GCAGGCACTT CA/-- CAGAGAATTT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 CA 2 1 157797 CASAVA_Build 3 13660445 1I TTCGCTGACA -/G GGTTTGGAAT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 G 2 3 157798 CASAVA_Build 3 13661288 1I AGTGTACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 19 21 12 A 13 14 157799 CASAVA_Build 3 13668086 4D TGGGTGTGTG TGTA/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 55 28 14 15 TGTA 1 0 157800 CASAVA_Build 3 13674177 1D GTTAGACAGC G/- GGGCTGCCAT 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 G 4 3 157801 CASAVA_Build 3 13681163 1D GAAATCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2993 hom 36 13 13 11 T 11 10 157802 CASAVA_Build 3 13686717 1D GCGAGACAGT G/- TGTGAATGGG 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 G 1 0 157803 CASAVA_Build 3 13690670 1I CCTCCCACCA -/C CCCTGGCCAG 3070 hom 95 het 36 0 30 6 C 3 4 157804 CASAVA_Build 3 13693324 1D AAAGGGCTTG T/- GCAGGGTTGG 3070 hom 107 het 44 0 33 12 T 1 0 157805 CASAVA_Build 3 13695931 1I CTGGCAGGGA -/C CATGTGGCCT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 C 1 2 157806 CASAVA_Build 3 13697124 1I6M1I GGTATTTCCA -GTGCTT-/GGTGCTTG TTGGTGCTTC 3070 hom 117 het 37 0 37 6 N/A 0 0 157807 CASAVA_Build 3 13699658 1I AACCCTCACA -/C CCACACAACT 3070 hom 160 het 61 0 53 8 C 2 3 157808 CASAVA_Build 3 13699824 10D CCACACAACT CTCACACACA/---------- CACTCACACA 3070 het 3070 ref 57 31 22 13 CTCACACACA 1 0 157809 CASAVA_Build 3 13703042 7D GCTGGTGAGT GGTGAGC/------- GGTGAGCGTA 3070 het 3070 ref 46 23 17 10 GGTGAGC 2 1 157810 CASAVA_Build 3 13707233 2D CTGGGAAGAC AG/-- AGCATACCAG 3070 het 3070 hom 49 20 21 9 AG 2 1 157811 CASAVA_Build 3 13708850 4D GAATGAGCTT TATC/---- TATGTGTGGG 3070 het 3070 ref 45 25 14 7 TATC 1 0 157812 CASAVA_Build 3 13715606 1I TCCCTGAAGG -/C CACGCCCCAA 2394 hom 28 het 15 0 9 6 C 1 2 157813 CASAVA_Build 3 13719149 1I AAGGGACTGA -/G GGGGACTCTC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 G 4 5 157814 CASAVA_Build 3 13721567 1D CGCCACATAG A/- AGGGAACTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 5 A 2 1 157815 CASAVA_Build 3 13722687 3D CTTGGGGTGG TGT/--- GTGCCTTGGA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 TGT 1 0 157816 CASAVA_Build 3 13726268 1D GTGGAGGGAA C/- CTGAGGGGAT 3070 hom 90 het 37 0 30 9 C 2 1 157817 CASAVA_Build 3 13728250 1D GTGAGCACAT G/- GGAGGGAACT 3070 hom 72 het 33 0 23 10 G 3 2 157818 CASAVA_Build 3 13734140 1D TGTCCGATCT G/- AATCTCTGGC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 G 1 0 157819 CASAVA_Build 3 13736038 1I AAAGACGGGT -/A AACTGAGGCT 3070 hom 101 het 38 0 33 5 A 2 3 157820 CASAVA_Build 3 13738343 1I27M1I ACAAGTATAT -CGTATAGCTTTTGTTATGTTACCCTTC-/GTTTATAGCTTTTGTTATGTTACCCTTCT TGGTGGGCAT 3070 hom 45 het 14 0 16 0 N/A 0 0 157821 CASAVA_Build 3 13738642 3D GAATCAAATA ATC/--- ATCAGGGGTC 3070 het 3070 ref 42 23 15 6 ATC 2 1 157822 CASAVA_Build 3 13740715 1D AATAAAGTGA T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 7 6 157823 CASAVA_Build 3 13746309 2I TTTCTTTCAA --/TT TTTTATTAGT 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 T 4 6 157824 CASAVA_Build 3 13747755 1I TGTTTTTTTC -/T TGTAAATTTG 1470 hom 7 het 3 0 3 0 T 1 2 157825 CASAVA_Build 3 13747815 1I GATGGATAGA -/T TGCAAAAATT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 1 2 157826 CASAVA_Build 3 13752924 1D CTGGGGTATG A/- AAAAAAAAAA 2626 het 785 hom 13 4 8 1 A 16 15 157827 CASAVA_Build 3 13758134 1I GTTTCCTTTA -/G TTCATGTCTG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 0 1 157828 CASAVA_Build 3 13758734 1I TAACCCATCC -/A TTGTGTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 157829 CASAVA_Build 3 13760808 2D AAAACATACC TG/-- TGAGACTGGG 3070 het 3070 ref 28 17 9 4 TG 2 1 157830 CASAVA_Build 3 13764291 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 66 29 17 21 CA 9 8 157831 CASAVA_Build 3 13765716 4I CCACGGCGTC ----/CTCA CTATTTCCTG 3070 hom 63 het 27 0 20 8 CTCA 0 1 157832 CASAVA_Build 3 13768938 1I GTTTAATTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 10 157833 CASAVA_Build 3 13784027 8D GAAGACAAAA AAAAAAAG/-------- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 29 17 12 3 AAAAAAAG 1 0 157834 CASAVA_Build 3 13786694 7D GAGAGACCAG GGGTTCT/------- GAGTATCCCA 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 GGGTTCT 1 0 157835 CASAVA_Build 3 13794297 1I GACAGAGTGT -/G GTCGTGTTGG 3070 het 3070 ref 61 26 25 10 G 1 2 157836 CASAVA_Build 3 13814314 3I GCAGGATTTT ---/GGA GGAGATGAGT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 GGA 1 2 157837 CASAVA_Build 3 13815666 2I GACTTGTGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 24 0 15 10 T 10 12 157838 CASAVA_Build 3 13819961 2I ACCTGTAACT --/GG GTAATGAGGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 3 157839 CASAVA_Build 3 13832053 2D GTCCAGAGGC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 98 het 52 0 30 22 TG 10 9 157840 CASAVA_Build 3 13834711 4D ATTATTTTTC CTCT/---- CTATTTATTC 2675 het 2675 ref 25 17 7 3 CT 3 1 157841 CASAVA_Build 3 13849152 1D AAAAAATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 24 2 21 1 T 12 11 157842 CASAVA_Build 3 13854652 1I CAGAGCAGGT -/G GGGGGGCATG 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 G 6 7 157843 CASAVA_Build 3 13858575 1D GGAAGGAGAC A/- GGGGTGAGGG 2962 het 2962 ref 27 12 9 6 A 1 0 157844 CASAVA_Build 3 13860189 1I AAAGATGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1404 hom 30 4 21 5 A 11 12 157845 CASAVA_Build 3 13869601 7I TTCTGCCCCA -------/GAACCAT CAGTGGCTCC 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 GAACCAT 0 1 157846 CASAVA_Build 3 13871873 2I GAGGGAGAAT --/AA GAGTTTGTCC 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 A 0 2 157847 CASAVA_Build 3 13881918 1D CTAGTCAACA T/- TTTTTATCCC 3070 hom 119 het 46 0 38 8 T 6 5 157848 CASAVA_Build 3 13885717 1I AGAGAGAAAG -/A AAAAGAGAGA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 A 4 5 157849 CASAVA_Build 3 13885938 4I AGAAGAAAGA ----/AAAG AAAGAAAAAG 3070 hom 63 het 28 0 23 7 AAAG 1 2 157850 CASAVA_Build 3 13886148 4I44M4I ACAGAAAAGT ----AGAAAGAAAGAGGGAAGGAGGGAGGGAGGGAGGAAGGGAAAGAT----/AGAAAGAAAGAAAGAGGGAAGGAGGGAGGGAGGGAGGAAGGGAAAGATAGAG AGAGAAAGAA 3070 het 415 hom 26 3 21 15 N/A 0 0 157851 CASAVA_Build 3 13886221 4D GAAAGAAAAA AAGG/---- AAGGAAGGAA 1312 het 1312 ref 37 15 11 12 AAGG 4 3 157852 CASAVA_Build 3 13889508 2D CCAGGAATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 80 het 34 0 27 8 TG 7 6 157853 CASAVA_Build 3 13891235 8I TGGTTTGCAC --------/CTCTGTCA CTCTGTCAAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 CTCTGTCA 1 2 157854 CASAVA_Build 3 13902650 1D ACTGGGAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1873 hom 24 5 11 8 T 10 9 157855 CASAVA_Build 3 13905558 1D TCAAATGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 13 12 157856 CASAVA_Build 3 13910336 1I ATTAATTCTA -/G GGTTTGGGGA 3070 hom 128 het 53 0 43 10 G 2 3 157857 CASAVA_Build 3 13924874 1I AAAGGCGAAG -/A TGGTGGGTAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 157858 CASAVA_Build 3 13927289 1I ATAATACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 A 10 11 157859 CASAVA_Build 3 13936866 1D TTATCATGAA G/- GGATGTTTGA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 G 3 2 157860 CASAVA_Build 3 13938871 1I GCCATAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2417 hom 28 7 14 7 A 13 14 157861 CASAVA_Build 3 13942474 4I ACATCTCTAG ----/AAGT AAGTAACATG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAGT 1 2 157862 CASAVA_Build 3 13952530 1D GCATTGGATG A/- CCCTGGGTGG 3070 hom 100 het 42 0 31 11 A 1 0 157863 CASAVA_Build 3 13989101 1I CAGAGAATTA -/C CTGGTCACTG 3070 hom 27 het 22 0 10 12 C 1 2 157864 CASAVA_Build 3 13999843 1D AATTGCATTG A/- AACCTGTGGA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 A 3 2 157865 CASAVA_Build 3 14002663 1D TATTTGTCAA T/- TTTTGGCTTT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 T 5 4 157866 CASAVA_Build 3 14016483 1I TCCTGCCTCA -/G CCTCCCAAGT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 G 0 1 157867 CASAVA_Build 3 14017865 1D ATAAGATTCA C/- CCCCTTAAAG 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 C 5 4 157868 CASAVA_Build 3 14054199 1D GAGAACTTTT A/- ATGCCTAGCT 1458 hom 17 het 7 0 4 3 A 2 1 157869 CASAVA_Build 3 14125355 1D TTTTGGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 11 10 157870 CASAVA_Build 3 14148558 2I TGCTCTACTT --/AA ACAGCTTATC 2081 het 2081 ref 31 17 7 7 A 1 3 157871 CASAVA_Build 3 14160226 2I TAGTTTCAGA --/TT TTTTTTTTTT 2331 het 2331 ref 21 12 7 2 T 12 14 157872 CASAVA_Build 3 14171016 1I AACCCTGAGG -/C CATTATGCTA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 C 1 2 157873 CASAVA_Build 3 14171297 78D TAAATTTTAT AATATTTATAAATATTATAAATTTATTTATATATATAAATATATATAATTTATAAATATTATAAATTATTATAAAAAA/------------------------------------------------------------------------------ TTTATAAATA 3070 het 2909 hom 13 7 10 2 AATATTTATAAATATTATAAATTTATTTATATATATAAATATATATAATTTATAAATATTATAAATTATTATAAAAAA 1 0 157874 CASAVA_Build 3 14172877 1D CAAGGATGGC G/- AGCTGTCTCG 3070 hom 123 het 44 0 41 4 G 1 0 157875 CASAVA_Build 3 14174970 1D CCTCTGAGGA T/- CCGGGGGCTT 3070 hom 66 het 23 0 22 1 T 1 0 157876 CASAVA_Build 3 14175043 1D TTCTCCACTG C/- GAGAGCTCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 0 157877 CASAVA_Build 3 14193604 5D AATAAAAAAT AAATA/----- AAATATTTAT 3070 het 1906 hom 20 6 14 0 AAATA 2 1 157878 CASAVA_Build 3 14194365 1D AAATACACTC T/- TGAGGCTGAA 3070 het 3070 ref 51 31 16 6 T 2 1 157879 CASAVA_Build 3 14201872 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAAAAC 562 het 562 ref 28 13 3 12 AAAC 1 0 157880 CASAVA_Build 3 14211960 1D AAAGGGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3009 hom 29 10 12 7 A 10 9 157881 CASAVA_Build 3 14229276 1I GTGCCTGGCA -/G GGGATGCCTG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 G 3 4 157882 CASAVA_Build 3 14236906 1D TCCCTTGTGA T/- TTTTTTATTG 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 7 6 157883 CASAVA_Build 3 14258821 1D GGTTTACCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2871 hom 36 8 21 7 T 10 9 157884 CASAVA_Build 3 14268520 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 25 2 11 12 A 11 10 157885 CASAVA_Build 3 14271078 17I ATTCTGAGAG -----------------/CCTTGGGTGCACCTGGC CCTGTGCCTA 3070 hom 114 het 41 0 37 4 CCTTGGGTGCACCTGGC 0 1 157886 CASAVA_Build 3 14271159 4D ATGTGTTGGA GTAT/---- GTGTTTGTTG 3070 het 3070 hom 49 17 22 12 GTAT 1 0 157887 CASAVA_Build 3 14271187 2I GTGTGTGTGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1218 hom 56 7 21 28 TG 6 7 157888 CASAVA_Build 3 14276796 1I CATTATCTGA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 7 8 157889 CASAVA_Build 3 14282560 7D TCTAAAAATT AAAAATA/------- AACTAGCCAG 2142 het 2142 ref 20 13 7 5 AAAAATA 1 0 157890 CASAVA_Build 3 14292853 3D TTCTCAGGAG CCA/--- TTCTCATCCT 3070 hom 129 het 48 0 40 8 CCA 1 0 157891 CASAVA_Build 3 14301848 1D TGTGTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2896 hom 32 11 16 5 A 13 12 157892 CASAVA_Build 3 14305475 1D CAAAGGTGCG C/- CCCCTGGCAT 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 C 5 4 157893 CASAVA_Build 3 14308506 4D TCATCCATTC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 38 10 16 12 TTGT 6 5 157894 CASAVA_Build 3 14313261 1I ACACAATATG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 800 hom 31 3 22 6 T 0 1 157895 CASAVA_Build 3 14316222 1D CCCAGCTGGC A/- CAGGGTAGAA 3070 hom 71 het 26 0 22 4 A 1 0 157896 CASAVA_Build 3 14323742 1I GGGCTGGGGT -/G GGGGATGCAG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 4 5 157897 CASAVA_Build 3 14327932 2D45M1I CCTGCAGATC CACGGGGACAGGAGGTGAGCTTTCTTCAGACAGCTTTAGGTTTGCAC-/--AGGGGACAGGAGGTGAGCTTTCTTCAGACAGCTTTAGGTTTGCACA ATCACACATT 3070 hom 163 het 41 0 55 3 N/A 0 0 157898 CASAVA_Build 3 14328402 1I GTCTCTCCCA -/T TTTGTCAATA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 3 4 157899 CASAVA_Build 3 14351197 2D TTATCTCTCA AC/-- ACACACACAC 305 het 305 ref 56 40 2 15 AC 8 7 157900 CASAVA_Build 3 14351245 4D AGACACACAA ACAC/---- ACACACGTAC 3070 het 3070 ref 58 32 21 6 AC 5 3 157901 CASAVA_Build 3 14362174 1I ATGCCCTTTA -/G GTAGCCGAGC 3070 hom 102 het 44 0 33 11 G 1 2 157902 CASAVA_Build 3 14396965 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 27 1 19 7 A 15 14 157903 CASAVA_Build 3 14404234 1D ATCATTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1350 hom 19 5 10 4 T 15 14 157904 CASAVA_Build 3 14410505 7D TCTGGGCCAC CGGAATG/------- CTTGGAGGCC 2063 het 2063 ref 28 17 8 5 CGGAATG 1 0 157905 CASAVA_Build 3 14411189 1D CCTGATCTCG T/- GAAGCTAAGC 3070 hom 126 het 44 0 42 3 T 1 0 157906 CASAVA_Build 3 14419323 1D7M1D2M1D TGGCACAGCC TGAGCAGATGCT/-GAGCAGA-GC- GCGGGCGGCG 901 hom 21 het 8 0 7 2 N/A 0 0 157907 CASAVA_Build 3 14423569 1D TTTCTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 2931 het 2757 hom 20 9 8 3 T 11 10 157908 CASAVA_Build 3 14424465 1I CAGGAGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 T 11 12 157909 CASAVA_Build 3 14434421 1D AGGATCGTCA T/- TATGTTTTTA 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 T 2 1 157910 CASAVA_Build 3 14442475 1D ATGGGAAGAT G/- CCTTGCAAGC 3070 hom 56 het 22 0 19 4 G 1 0 157911 CASAVA_Build 3 14447600 2I AGGAATGGAC --/AT ATCGTTTAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AT 1 2 157912 CASAVA_Build 3 14449591 22D CTTCTCTAGT CGTTAGTGCTGTGAAGGTGGGA/---------------------- CGTTAGTGCT 3070 hom 64 het 28 0 21 9 CGTTAGTGCTGTGAAGGTGGGA 2 1 157913 CASAVA_Build 3 14453044 41D AACAACTCCC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------------------------------- TTTTTTTTTG 2409 het 2409 ref 21 12 7 3 T 50 9 157914 CASAVA_Build 3 14453573 1I CTTTTCCTCA -/C TGTGTGACTG 3070 hom 72 het 27 0 22 5 C 0 1 157915 CASAVA_Build 3 14454731 1D AATGTGGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2962 hom 33 13 9 11 T 12 11 157916 CASAVA_Build 3 14463132 1D CAGGTTCAGG A/- GGCTTTCTGT 3070 het 3070 ref 54 27 19 8 A 1 0 157917 CASAVA_Build 3 14470796 2I GGGCAGAGAC --/AG TGTGCTGGGA 2113 het 2113 ref 32 15 9 8 AG 0 1 157918 CASAVA_Build 3 14476391 23D ATGCTAATTC TCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------------- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 33 15 19 6 TCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 1 0 157919 CASAVA_Build 3 14484892 1I38M1D CAAAGAGTAC -AAAGCCAAATTTTAAACATTTGTATTGCAATTTGGCCCT/AAAAGCCAAATTTTAAACATTTTTATTGCAATTTGGCCC- GATGGGTGGC 3070 hom 34 het 14 0 8 14 N/A 0 0 157920 CASAVA_Build 3 14503089 1D CCTTTCAAAT C/- CCCAGGGCAG 3070 hom 86 het 34 0 29 5 C 4 3 157921 CASAVA_Build 3 14506654 1D TATGTGTACT G/- GGCCATGTGG 3070 hom 93 het 35 0 31 10 G 3 2 157922 CASAVA_Build 3 14508140 1I GAGGAGGGAG -/A GGGGGTATTA 3070 het 3070 hom 34 15 10 9 A 0 1 157923 CASAVA_Build 3 14512720 1D CTACTTAAAG A/- AAAATAATAG 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 A 5 4 157924 CASAVA_Build 3 14513077 1D GGATGCCTGC A/- AGGAACACGG 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 A 2 1 157925 CASAVA_Build 3 14515132 1I CAAAAGGAAA -/G ATCCAAGACT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 G 0 1 157926 CASAVA_Build 3 14536394 1I AACCAGCTTT -/G GGGGCATCTA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 G 4 5 157927 CASAVA_Build 3 14536632 1I CTGCCTCTGA -/G GGCCTCAGTG 3070 hom 56 het 26 0 14 12 G 2 3 157928 CASAVA_Build 3 14544216 6D ATCTGGCCAA CAGAGG/------ CATGGCAAAA 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 CAGAGG 1 0 157929 CASAVA_Build 3 14545208 1I CTCCCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 A 11 12 157930 CASAVA_Build 3 14545790 15D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAG 2272 het 2272 ref 17 9 6 5 A 24 9 157931 CASAVA_Build 3 14546918 1I TTTCTCTCCA -/T TTTTTTGAGT 3070 het 3070 hom 53 17 28 8 T 6 7 157932 CASAVA_Build 3 14551038 1D TTTATCCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 11 10 157933 CASAVA_Build 3 14579224 24D ACAGAGGGAT GAGGCAGACGGTCCTCGGACTCCC/------------------------ GAGGCAGACG 3070 het 3070 hom 51 23 18 17 GAGGCAGACGGTCCTCGGACTCCC 2 1 157934 CASAVA_Build 3 14596199 15I CCTTCACAAC ---------------/CCGCTCTGCCACCTG CCTGGGGAAA 3070 het 3070 ref 39 13 14 12 CCGCTCTGCCACCTG 0 1 157935 CASAVA_Build 3 14611413 3I TGGTTAGCTG ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 39 12 12 15 TTA 5 6 157936 CASAVA_Build 3 14613282 1D GTTGTATAGA T/- TTTTTTTTTT 754 het 754 ref 43 30 3 10 T 12 11 157937 CASAVA_Build 3 14614996 6I TTGGTTAACT ------/ACGTTG ACGTTGACAG 3070 het 3070 hom 59 23 22 14 ACGTTG 1 2 157938 CASAVA_Build 3 14619852 1D TCTCCCCCAC A/- CACAGGGCTC 3070 hom 49 het 20 0 16 4 A 1 0 157939 CASAVA_Build 3 14625161 3I TGGGGAGGGT ---/GAG GAGGAGGATG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 GAG 2 3 157940 CASAVA_Build 3 14629032 1D TTTCAGTCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 9 het 34 1 15 19 T 9 8 157941 CASAVA_Build 3 14640108 1I GAGGCTCAAG -/A ATAAACTGCT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 1 2 157942 CASAVA_Build 3 14657941 1D ATGTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1748 hom 32 11 14 8 A 14 13 157943 CASAVA_Build 3 14661434 2I AATTGCTAAA --/AG AGTAAATTTT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 AG 1 2 157944 CASAVA_Build 3 14661564 3I AATATGTACA ---/GTT ATTATTTGTC 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 GTT 0 1 157945 CASAVA_Build 3 14664725 3I GCTGAGTAAT ---/TTA TTGTTAGAGC 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 TTA 0 1 157946 CASAVA_Build 3 14667575 1D GCTCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 782 het 766 hom 7 3 2 3 T 12 11 157947 CASAVA_Build 3 14667749 1I TGAAATATGT -/A AAAGTGGCCC 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 3 4 157948 CASAVA_Build 3 14677023 1I TCAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2810 hom 23 7 13 3 A 9 10 157949 CASAVA_Build 3 14677853 1I TTTTTCAAGA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 T 7 8 157950 CASAVA_Build 3 14678406 9D AAATGAAGAC ATAATTACA/--------- ATAATTACAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 ATAATTACA 3 2 157951 CASAVA_Build 3 14680566 1D ATTTGGGGGG A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 A 7 6 157952 CASAVA_Build 3 14685196 2D TGTTAAATGC TA/-- TGTCAGACTA 3070 het 3070 hom 51 20 24 9 TA 1 0 157953 CASAVA_Build 3 14689279 1I AAGAGGACTC -/A ACACTTCCTG 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 A 1 2 157954 CASAVA_Build 3 14692628 1I CCCCCCCGCC -/T TTTTTTTTTT 1399 het 1399 ref 21 6 7 8 T 11 12 157955 CASAVA_Build 3 14697159 3D ATTCTATCTC AAT/--- AAAGCTGTTC 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 AAT 1 0 157956 CASAVA_Build 3 14712631 1D AAATTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 12 11 157957 CASAVA_Build 3 14714734 1D AAAACAGCTA T/- TTTAAATTCT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 T 4 3 157958 CASAVA_Build 3 14716441 1D ATGCAGCCAC T/- TGGGATGGGT 3070 hom 95 het 36 0 29 8 T 2 1 157959 CASAVA_Build 3 14716761 1I TTGAAGACGC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 90 het 39 0 30 10 T 7 8 157960 CASAVA_Build 3 14717997 1I TAGGGTGGGA -/G TATCACTGCC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 0 1 157961 CASAVA_Build 3 14727409 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 478 hom 30 2 12 16 T 14 13 157962 CASAVA_Build 3 14732506 4D TTAATAAAGC AACT/---- AACTGTGCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AACT 2 1 157963 CASAVA_Build 3 14749383 22I AGTTAATTTT ----------------------/TATATTAACTATACCTTATATA TATATAAGGT 3070 hom 54 het 19 0 19 2 TATATTAACTATACCTTATATA 0 1 157964 CASAVA_Build 3 14779327 1I TTCTAGGAGT -/C CTTATGCCCT 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 C 1 2 157965 CASAVA_Build 3 14790069 1I TAAGGAGGGA -/G GGGGCAGGAA 3070 het 1019 hom 27 6 8 13 G 4 5 157966 CASAVA_Build 3 14854764 4D GTGAGTTGAC TCTT/---- TCTCGTGCTC 3070 het 3070 hom 54 22 25 8 TCTT 1 0 157967 CASAVA_Build 3 14856658 2D TGTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2315 hom 39 12 14 13 T 14 12 157968 CASAVA_Build 3 14858073 1I AGGATCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1000 hom 46 5 23 18 T 15 16 157969 CASAVA_Build 3 14864901 1D TCCTTCCCCC T/- GGCCCTCACT 3070 het 2983 hom 32 9 14 9 T 1 0 157970 CASAVA_Build 3 14867675 1I AATTCAGACT -/G GCCTGTAGCT 3070 hom 111 het 44 0 36 8 G 1 2 157971 CASAVA_Build 3 14872163 1I CATTTGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 T 10 11 157972 CASAVA_Build 3 14873667 1D AATGTCATCC T/- TTTTTTTTTT 2702 het 2702 ref 25 8 8 9 T 12 11 157973 CASAVA_Build 3 14876394 1D TCGAACCACT C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 41 21 19 2 C 8 7 157974 CASAVA_Build 3 14879895 3I TTGTGCATGA ---/GTT GTTCACATTT 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 GTT 1 2 157975 CASAVA_Build 3 14882587 2I CCATGCACAA --/CT CTCTGTACCT 3070 het 3070 hom 33 17 14 2 CT 2 3 157976 CASAVA_Build 3 14885822 4D CAACAACAAT ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 9 11 ACAA 6 5 157977 CASAVA_Build 3 14886637 19D TGAGGGAACG GAATGGCATGAGGGAGCCC/------------------- GAATGGCATG 3070 hom 61 het 27 0 20 11 GAATGGCATGAGGGAGCCC 2 1 157978 CASAVA_Build 3 14897807 12I GACTTGGGGA ------------/CAGCCTGAACAT CAGGCACTGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CAGCCTGAACAT 0 1 157979 CASAVA_Build 3 14904514 1I CCATCACTAC -/A AAAAAAAAAA 2504 hom 24 het 16 0 8 9 A 11 12 157980 CASAVA_Build 3 14911436 3I AGATGATACC ---/TTG TTGTAGTTTT 3070 hom 135 het 46 0 46 0 TTG 1 2 157981 CASAVA_Build 3 14944752 1I ACCTGGCCAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 T 7 8 157982 CASAVA_Build 3 14974439 4I CACACCACAT ----/TGCC TGCCATTCCT 3070 hom 114 het 42 0 36 6 TGCC 1 2 157983 CASAVA_Build 3 14981015 7D TTTTATTTTC TATTTTA/------- TATTTTTTAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TATTTTA 1 0 157984 CASAVA_Build 3 15016181 1D TCCATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 9 T 12 11 157985 CASAVA_Build 3 15019479 1D CACAATACAC T/- TTTTTTTTTT 1744 het 1744 ref 14 7 5 2 T 12 11 157986 CASAVA_Build 3 15025589 1I AAAAATTAGC -/G GGGGCATGGT 2659 het 742 hom 10 2 6 2 G 4 5 157987 CASAVA_Build 3 15029056 10I TTTCAAAAGT ----------/CTGTCAAGAG GTGGTACAGA 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 CTGTCAAGAG 0 1 157988 CASAVA_Build 3 15043217 1D TGCACCTCTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 9 8 157989 CASAVA_Build 3 15062477 4I GGGTTAAGAC ----/AGAT AGATAGATGT 3070 het 3070 hom 58 22 34 2 AGAT 2 3 157990 CASAVA_Build 3 15102527 3D TGAGGGAGCC TAG/--- TCTCTACCTT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 TAG 1 0 157991 CASAVA_Build 3 15105888 1I TGAAGTGAGA -/G GATCACTTGA 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 G 1 2 157992 CASAVA_Build 3 15125768 1D AAGGACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2375 hom 41 12 19 10 A 15 14 157993 CASAVA_Build 3 15136457 5I TCTTTAAAAA -----/AAAAG AAAAGAAACA 3070 het 2351 hom 21 7 12 2 AAAAG 1 2 157994 CASAVA_Build 3 15138363 4D CAATCCCCTG AACC/---- AAGGAATGTG 3070 het 3070 ref 40 20 18 4 AACC 1 0 157995 CASAVA_Build 3 15141417 1D TTTTCAAACA C/- ATTTTACTGT 1704 het 1704 ref 28 20 4 4 C 1 0 157996 CASAVA_Build 3 15142038 1D GTCACAGCAA C/- CCCCTGTTAT 3070 het 3070 ref 49 26 19 5 C 5 4 157997 CASAVA_Build 3 15146598 1I GATTATTTTT -/C TCTTTGAGCA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 C 0 1 157998 CASAVA_Build 3 15147072 1D TCTACTGAAC A/- AAAACCATGG 3070 het 3070 ref 56 37 18 3 A 5 4 157999 CASAVA_Build 3 15149052 1D ACTTTTTTTT A/- AAAAAGAGCT 3070 het 2993 hom 24 8 11 5 A 6 5 158000 CASAVA_Build 3 15150543 1D GGAGTATGTG A/- AAAGAAAAAC 1744 het 1744 ref 34 24 4 6 A 4 3 158001 CASAVA_Build 3 15161766 1I GCGCTGGAGC -/A AAATGTATTC 1363 het 1363 ref 29 25 3 1 A 3 4 158002 CASAVA_Build 3 15176983 1D CTAAAACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2307 hom 35 11 11 13 A 17 16 158003 CASAVA_Build 3 15263495 4D GAAAATTCAG AGAA/---- AGAAGATGAA 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 AGAA 2 1 158004 CASAVA_Build 3 15273792 15D GACCAGCCTC TAAAGCAGCTGGAAG/--------------- GGAAGCAGCT 3070 het 3070 ref 46 27 18 9 TAAAGCAGCTGGAAG 1 0 158005 CASAVA_Build 3 15312482 6I GAAACACACT ------/AAATAA AAATAAGGGG 3070 het 3070 hom 54 23 22 9 AAATAA 1 2 158006 CASAVA_Build 3 15317015 4D AAGGAAGCGG GGGC/---- GGGGGGACAA 3070 hom 61 het 34 0 28 8 GGGC 1 0 158007 CASAVA_Build 3 15321164 1D CATCTCTACT A/- AAAATACAAA 3070 hom 39 het 16 0 11 6 A 5 4 158008 CASAVA_Build 3 15328081 1I AAAGAAAAAC -/A AAAGAAAACT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 3 4 158009 CASAVA_Build 3 15331711 1D ACCAAGACTG C/- CCAGGGCCAA 3070 hom 132 het 51 0 45 8 C 3 2 158010 CASAVA_Build 3 15333242 1D TATGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1009 hom 39 4 19 16 A 12 11 158011 CASAVA_Build 3 15335433 7D GTGGTTTTAA CAAGTTC/------- CAAGTGGGGA 1814 het 1814 ref 25 16 6 4 CAAGTTC 1 0 158012 CASAVA_Build 3 15338159 3I CAGCAGCTAG ---/CAA CAACAACTGG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 CAA 2 3 158013 CASAVA_Build 3 15341114 1I GGTCTATCTA -/T TGCTTCAAAC 3070 hom 95 het 37 0 30 7 T 1 2 158014 CASAVA_Build 3 15341332 2D TAAGCTCAAA AC/-- AGAGTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 AC 1 0 158015 CASAVA_Build 3 15362334 1D CAAAACGTCA T/- AAACTTAATG 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 1 0 158016 CASAVA_Build 3 15375405 2D GAAAAACTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2621 het 542 hom 27 4 10 13 T 18 16 158017 CASAVA_Build 3 15440662 1I CTGCATTTCA -/G ACTGGGTGAC 3070 hom 89 het 32 0 29 3 G 0 1 158018 CASAVA_Build 3 15446533 1D GTTTATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 42 0 31 12 T 11 10 158019 CASAVA_Build 3 15471871 1D GATTAAAAAC A/- AAAACAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 5 4 158020 CASAVA_Build 3 15479789 1D ACCAATCCCA T/- TGCCCCTGGA 3070 hom 105 het 39 0 33 6 T 2 1 158021 CASAVA_Build 3 15500713 1I GGAGCATTTA -/G CCCATTTACA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 0 1 158022 CASAVA_Build 3 15547435 3I GGAATTTGGA ---/AGG AGGAGTGCCA 3070 hom 130 het 49 0 44 5 AGG 1 2 158023 CASAVA_Build 3 15639255 1D TTGTTGGCAC A/- ATGCACATTA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 2 1 158024 CASAVA_Build 3 15653391 1I TCAACCAAGA -/C CAACTTTTGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 2 158025 CASAVA_Build 3 15664786 4I AGGACAAAAT ----/AGAA AGGCATAAAA 3070 hom 102 het 35 0 34 1 AGAA 0 1 158026 CASAVA_Build 3 15666949 2D TTGTTTGAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 7 A 12 10 158027 CASAVA_Build 3 15674013 1D CCCAGAGCTG T/- ATGTGAGCTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 0 158028 CASAVA_Build 3 15675039 1D TTCAGACCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 38 1 35 3 T 11 10 158029 CASAVA_Build 3 15681239 1I GAAGGGATTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 295 hom 26 1 21 4 A 8 9 158030 CASAVA_Build 3 15682920 2I TCATCTCCCC --/CT CTTTCCTCAT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 CT 1 2 158031 CASAVA_Build 3 15683198 3D TTGTATATTT TCA/--- TCATCTTTCC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 TCA 2 1 158032 CASAVA_Build 3 15689540 1D ACTCGCCTTG T/- GCCTCCCAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 0 158033 CASAVA_Build 3 15690912 1D TGAGCCACTG T/- TAAGAATGAG 3070 hom 105 het 44 0 33 12 T 2 1 158034 CASAVA_Build 3 15709940 1D AAGGGTGGGG T/- AGAATACAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 0 158035 CASAVA_Build 3 15710726 1I ATTGACACTG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 119 het 45 0 40 5 A 8 9 158036 CASAVA_Build 3 15722559 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAACCCC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 6 7 158037 CASAVA_Build 3 15723770 1D GTGCAAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 386 hom 47 1 39 7 A 10 9 158038 CASAVA_Build 3 15726548 1I TGCTTATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1492 hom 37 4 23 11 T 13 14 158039 CASAVA_Build 3 15728377 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 119 hom 16 1 15 2 T 10 11 158040 CASAVA_Build 3 15744804 4D ACATATTTTG TAAT/---- TAATTAATTA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 TAAT 3 2 158041 CASAVA_Build 3 15751425 2D TTTTGCAGAC TG/-- TAAGATTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TG 1 0 158042 CASAVA_Build 3 15762234 2D AATTTCAGAA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 10 8 158043 CASAVA_Build 3 15771003 1I AGTTCTCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 A 10 11 158044 CASAVA_Build 3 15781053 1D ATAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 11 10 158045 CASAVA_Build 3 15793783 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2947 hom 5 het 17 1 11 6 A 17 15 158046 CASAVA_Build 3 15801113 16I AGAATGGACG ----------------/ACCAATAGGAACAAAA ACCAATGGTA 3070 hom 114 het 42 0 36 8 ACCAATAGGAACAAAA 0 1 158047 CASAVA_Build 3 15810840 2I GTATTATATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 32 0 24 8 A 10 12 158048 CASAVA_Build 3 15811101 1D GAAAAAACAT A/- ACAGAGAGAG 3070 hom 114 het 44 0 38 7 A 2 1 158049 CASAVA_Build 3 15813155 2I CACAGCTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 48 0 33 15 T 14 16 158050 CASAVA_Build 3 15820741 3D AGATAAAAGA CAG/--- TAAAAGACAG 1818 het 1818 ref 47 15 7 28 CAG 1 0 158051 CASAVA_Build 3 15828824 1D CTTAATTTCA T/- TTGTTTTTTA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 3 2 158052 CASAVA_Build 3 15833776 1I AGTACCATGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 9 10 158053 CASAVA_Build 3 15853371 16D CGAGGCGGGC AGATCACAAGGTCAGG/---------------- AGATCACAAG 3070 hom 43 het 18 0 15 3 AGATCACAAGGTCAGG 1 0 158054 CASAVA_Build 3 15860284 3D CAAAAATAAT AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 4 A 12 9 158055 CASAVA_Build 3 15861822 2D ATTTCTAAAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TA 8 7 158056 CASAVA_Build 3 15862670 1I CATCTGAGAC -/A AAGGCAAGTC 3070 hom 51 het 22 0 16 6 A 2 3 158057 CASAVA_Build 3 15879825 1D TATGTTGGTG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 8 7 158058 CASAVA_Build 3 15880122 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 27 het 20 0 10 11 A 9 8 158059 CASAVA_Build 3 15882899 4I CACCAAAATA ----/AAAG AACTAGTATG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAAG 0 1 158060 CASAVA_Build 3 15884907 4D TGAATCAGAA GAAT/---- GAATATTGTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 GAAT 2 1 158061 CASAVA_Build 3 15890837 1I ATTTATCAAT -/G TATCCACTGT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 G 0 1 158062 CASAVA_Build 3 15895225 3D CCACTCCGAC CTG/--- AAGAAGAACA 3070 het 310 hom 31 3 18 10 CTG 1 0 158063 CASAVA_Build 3 15896816 4D CCAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AAAC 6 5 158064 CASAVA_Build 3 15899181 1I AGCCAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 31 2 20 9 A 11 12 158065 CASAVA_Build 3 15906979 4D2M2I TGGTGTACCT GTAGTC--/----TCTG TGAACTACTC 3070 hom 138 het 51 0 45 6 N/A 0 0 158066 CASAVA_Build 3 15914220 1I GGTTACTCCT -/C CCCCAGTTGC 3070 hom 120 het 42 0 38 4 C 4 5 158067 CASAVA_Build 3 15917283 3I GCAGCCTCGA ---/CCT CCTGGGCTCA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CCT 1 2 158068 CASAVA_Build 3 15923847 1D CATATTGGTG T/- GCTGCACCCA 3070 hom 36 het 19 0 15 4 T 1 0 158069 CASAVA_Build 3 15935190 2D TAAAGGTTAA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 AG 5 4 158070 CASAVA_Build 3 15945339 4I CCCAAAGAAG ----/CAAT CAATATCTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 CAAT 1 2 158071 CASAVA_Build 3 15976792 1I GTGACTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 31 0 21 10 T 13 14 158072 CASAVA_Build 3 15981923 5I GCTGTATCTC -----/AAGTT AAATGATGCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AAGTT 0 1 158073 CASAVA_Build 3 15982089 5I TAAGTTATCA -----/TTATT TTATTTTATT 3070 hom 81 het 39 0 28 11 TTATT 3 4 158074 CASAVA_Build 3 15982880 4I CAAATGCCAT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 TTTC 3 4 158075 CASAVA_Build 3 15985074 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 71 het 30 0 26 4 T 10 9 158076 CASAVA_Build 3 15993306 3D CCACCCTCAC CTT/--- CTGGAATGTT 3070 hom 90 het 45 1 40 5 CTT 1 0 158077 CASAVA_Build 3 15993680 1I AAAAAAACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 9 10 158078 CASAVA_Build 3 15999421 2D ATTAATAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 29 2 17 10 A 13 11 158079 CASAVA_Build 3 16001367 5D TATTCCTAGA TATTT/----- TATTTTATTT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 TATTT 4 3 158080 CASAVA_Build 3 16003040 1D CCAAGACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 8 A 11 10 158081 CASAVA_Build 3 16014180 1D ATTTTGCCAA G/- CAGATGTACT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 G 1 0 158082 CASAVA_Build 3 16025334 1D CCAGAATTTT G/- GGAGGCCGAG 3070 hom 50 het 21 0 17 4 G 3 2 158083 CASAVA_Build 3 16025740 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 562 hom 28 4 16 9 A 15 14 158084 CASAVA_Build 3 16036236 1I TGGTTGAACC -/T TTGTATGCTA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 2 3 158085 CASAVA_Build 3 16057309 4I GCGGTCTATC ----/TTAT TTATTCTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTAT 1 2 158086 CASAVA_Build 3 16061383 20D CTTAGTTGAC AGAGAGAGAGAGAGAGAGAG/-------------------- AGAGAGAGAG 3070 hom 21 het 33 1 24 13 AG 22 12 158087 CASAVA_Build 3 16063103 3D GTGGTGGTGG TGC/--- TGTGTGTGTG 3070 hom 144 het 52 0 46 9 TGC 1 0 158088 CASAVA_Build 3 16071590 1D CCCAGCCAAA C/- CCAGTGAAGT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 C 3 2 158089 CASAVA_Build 3 16086635 12I GAAGTATCCC ------------/ATACTTCATAGT AGGGGCTTTT 3070 het 3070 hom 48 22 24 3 ATACTTCATAGT 0 1 158090 CASAVA_Build 3 16091377 1I CTTAAAGAAG -/T CTTTTGCCTC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 0 1 158091 CASAVA_Build 3 16111849 2I CTATTTCCCC --/CT GTTAGATTTC 3070 het 3070 hom 57 25 25 7 CT 0 1 158092 CASAVA_Build 3 16115075 1D ATGTGAACCT A/- TTATTAATAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 1 0 158093 CASAVA_Build 3 16122633 1I CAGAGTCATT -/C ATGTCAAGAT 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 0 1 158094 CASAVA_Build 3 16133960 4D TGTGTGTATG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 33 het 14 0 11 3 TA 9 7 158095 CASAVA_Build 3 16136930 2I TGATGAAAAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 102 het 45 0 35 10 AG 8 9 158096 CASAVA_Build 3 16137222 1D GGGCTTTGTT A/- CGTATGCGAC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 1 0 158097 CASAVA_Build 3 16139495 1D ACTAGGTCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 T 9 8 158098 CASAVA_Build 3 16151042 4I3M1I GGAATAGCAT ----GAT-/GTAGGATC AAAAGTATAG 3070 hom 96 het 34 0 33 4 N/A 0 0 158099 CASAVA_Build 3 16158344 1D GACTGGCCAG A/- ACCTTGATCT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 2 1 158100 CASAVA_Build 3 16160224 4I ACATCTCTTC ----/CTAA CTGTTTAGTG 3070 het 3070 hom 48 19 28 1 CTAA 0 1 158101 CASAVA_Build 3 16162126 2D AGTGAGTCTT GC/-- GCTGACCCCG 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 GC 2 1 158102 CASAVA_Build 3 16163135 1D TGCGAGTGGA G/- GGGGGGCTTA 3070 hom 73 het 32 0 22 10 G 7 6 158103 CASAVA_Build 3 16163188 1I TGCTTTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 T 10 11 158104 CASAVA_Build 3 16165764 2I GAATTCTCAC --/AT GAGTCCCCAG 3070 hom 132 het 47 0 42 5 AT 0 1 158105 CASAVA_Build 3 16166203 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 871 het 36 hom 20 1 9 10 C 0 1 158106 CASAVA_Build 3 16187540 1I AAAAATTTCA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 76 het 28 0 26 2 T 7 8 158107 CASAVA_Build 3 16217676 12D TGGCAATTTT TTTTTCTTTTTC/------------ TTTTTCTTTT 3070 hom 34 het 22 0 13 12 TTTTTC 5 3 158108 CASAVA_Build 3 16224057 1D AAAAAAAATT G/- GGCCTAAAAT 3070 hom 51 het 23 0 15 8 G 3 2 158109 CASAVA_Build 3 16244206 2D TGGCTGCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 49 0 33 18 A 15 13 158110 CASAVA_Build 3 16254838 3D TCATAGTAAT AAC/--- AACAACCATA 3070 hom 99 het 37 0 34 6 AAC 3 2 158111 CASAVA_Build 3 16256778 1D ATTACTTTGC A/- GATTTAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 1 0 158112 CASAVA_Build 3 16266322 3D GAACTGCTGG CTT/--- CTTCTGGCCT 3070 het 3070 ref 35 13 16 6 CTT 2 1 158113 CASAVA_Build 3 16274875 2D TTACGAAGCT AA/-- AAAGAGACAT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 5 3 158114 CASAVA_Build 3 16279668 3I TGATCCACAA ---/CTT CTTCTTACGC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 CTT 2 3 158115 CASAVA_Build 3 16280161 1D AGTAATAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 10 9 158116 CASAVA_Build 3 16284033 1I TTTCTGTGTT -/G GGACCTTTGC 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 G 2 3 158117 CASAVA_Build 3 16287721 1D TTGTTAACCG T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 T 8 7 158118 CASAVA_Build 3 16293437 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1947 hom 28 11 12 5 T 15 14 158119 CASAVA_Build 3 16298879 1D CACCCAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2883 hom 35 11 12 12 A 15 14 158120 CASAVA_Build 3 16312791 1D CAAATAGTCC A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 8 7 158121 CASAVA_Build 3 16316059 2D CAAAAAAGAC AT/-- GTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 AT 1 0 158122 CASAVA_Build 3 16323061 4D GTCTTTTATT TTAA/---- TTAATTAATG 3070 het 3070 hom 39 10 26 6 TTAA 3 2 158123 CASAVA_Build 3 16323422 3D TTCATCCAAT ATA/--- ATGGTCTTCA 3070 het 3070 ref 64 30 28 7 ATA 1 0 158124 CASAVA_Build 3 16324250 5D35M5D TTTTTAAACT TTTTGTTTTGAAGTAATTTTAGATTTACAGAAGAGTTGCAAAGAC/-----TTTTGAAGTAATTTTAGATTTACAGAAGAGTTGCA----- AAGACAGGGT 3070 het 3070 ref 34 24 14 10 N/A 0 0 158125 CASAVA_Build 3 16327724 1I64M1D50M1D TATTTTTTTC -AAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACTATCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTGTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCTG/AAAACGGAGTCTTGCTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACT-TCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTGTCCTGCCTCAGCTTCCCGAGTAGCT- GGGATTACAG 3070 hom 87 het 9 0 30 1 N/A 0 0 158126 CASAVA_Build 3 16331629 6I ATGTTTGTGG ------/TTTTGT TTTTGTTTTG 2828 het 2828 ref 24 10 8 6 TTTTGT 1 2 158127 CASAVA_Build 3 16335123 1D TAATACATTA T/- AGGATTCTTG 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 T 1 0 158128 CASAVA_Build 3 16340616 1I GAAGATCACT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 G 1 2 158129 CASAVA_Build 3 16344273 1D TTCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1830 hom 22 8 12 2 A 11 10 158130 CASAVA_Build 3 16348858 1I CTTCCAACTT -/G TTATGTTTTT 3070 het 3070 ref 26 16 9 2 G 0 1 158131 CASAVA_Build 3 16348929 1D TGATTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 7 T 12 11 158132 CASAVA_Build 3 16367004 1D GATGAATCAC T/- TTTTTTTTTT 2929 het 2929 ref 36 16 13 7 T 15 14 158133 CASAVA_Build 3 16373005 3D CGCAGGTATG CCC/--- CCCAACAGCC 3070 het 3070 ref 49 26 15 9 C 6 3 158134 CASAVA_Build 3 16374942 1I TAGGTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 10 11 158135 CASAVA_Build 3 16381696 1I GTGGTGTCCC -/A AAGGGAGTGG 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 A 2 3 158136 CASAVA_Build 3 16382338 1I ACCATCATGC -/A AGGCCATTCT 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 1 2 158137 CASAVA_Build 3 16395317 1I TCCACACCAT -/C CAGCAGCGAG 3070 hom 107 het 38 0 33 5 C 1 2 158138 CASAVA_Build 3 16402712 3D ATGATTTGGG AGA/--- AGGATTCCTA 3070 hom 108 het 39 0 34 5 AGA 1 0 158139 CASAVA_Build 3 16406007 1D GTTTTTTTTC G/- GGGGGGAGGG 3070 hom 125 het 47 0 40 8 G 7 6 158140 CASAVA_Build 3 16452589 1D TTCTCAGTGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 1957 hom 18 6 10 2 A 9 8 158141 CASAVA_Build 3 16454386 13I GAAACCAGGG -------------/GCAGGTTTCATCT GCTGTCAACA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 GCAGGTTTCATCT 0 1 158142 CASAVA_Build 3 16486742 2D TGCACACACG CA/-- CACACACACA 1009 het 1009 ref 34 20 3 12 CA 10 9 158143 CASAVA_Build 3 16512098 1D TTTGCTGGAC A/- GATCCCAAAT 3070 het 3070 ref 43 21 14 9 A 1 0 158144 CASAVA_Build 3 16520640 1D GCCCTAGACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 A 10 9 158145 CASAVA_Build 3 16525345 1D ACTGAAGGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 10 9 158146 CASAVA_Build 3 16531940 1D TTTTTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 T 11 10 158147 CASAVA_Build 3 16532832 1I GTTAAAGGAA -/C CCCCCCGCTG 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 C 6 7 158148 CASAVA_Build 3 16543089 1D CTTCCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 10 13 16 A 12 11 158149 CASAVA_Build 3 16550639 1D GAGGAATCTG C/- CCCCCCCGAC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 C 8 7 158150 CASAVA_Build 3 16560983 2I TCGCCACCCA --/CT CTGTTGTGCC 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 CT 1 2 158151 CASAVA_Build 3 16572873 1I TAAAAGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1743 hom 28 7 15 6 T 13 14 158152 CASAVA_Build 3 16575425 1I CTTATATTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 8 9 158153 CASAVA_Build 3 16592642 4D AAACACTACA TTTT/---- AATGAGAGTA 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 T 4 0 158154 CASAVA_Build 3 16600787 1D TCATGTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2699 hom 32 9 16 7 A 12 11 158155 CASAVA_Build 3 16602822 3D GATGAAATAT AGA/--- AGCAGTGTCT 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 AGA 1 0 158156 CASAVA_Build 3 16604036 1I GAAAGACTGT -/G GGTATAGCAA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 G 2 3 158157 CASAVA_Build 3 16606917 3I AAAAGCTAGT ---/CTA CTTTCTGTTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 CTA 0 1 158158 CASAVA_Build 3 16619862 1D ATTCATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 13 12 158159 CASAVA_Build 3 16622022 1I GGTGGCAGCG -/C CCCCGCCCCC 2188 hom 39 het 17 0 10 7 C 4 5 158160 CASAVA_Build 3 16624626 1D AGTATTTTTT C/- CCCCCTCAGA 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 C 6 5 158161 CASAVA_Build 3 16625931 5I CTGTCTCAAA -----/AAAAT AAAATAAAAA 3070 het 3022 hom 23 7 13 3 AAAAT 1 2 158162 CASAVA_Build 3 16626445 1D TCTTGCAGCT A/- ACAGCTTGGG 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 A 2 1 158163 CASAVA_Build 3 16629070 1D TTAATTTTTT G/- TTTCCTATCC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 G 1 0 158164 CASAVA_Build 3 16630261 2D GGCTTCCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2226 het 1186 hom 31 11 9 11 T 16 14 158165 CASAVA_Build 3 16630782 9D TGAACCCATC AACTTCACT/--------- GGACCTCTTC 3070 het 3070 ref 42 25 15 4 AACTTCACT 1 0 158166 CASAVA_Build 3 16631434 1D ATATACATAC T/- TTTTTTAAAA 1918 het 1918 ref 21 11 8 3 T 7 6 158167 CASAVA_Build 3 16644126 8D CATGAACAGC GAAAACAT/-------- GAAAACATGG 3070 het 3070 ref 59 28 27 6 GAAAACAT 2 1 158168 CASAVA_Build 3 16647014 1I CATAAAAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 9 10 158169 CASAVA_Build 3 16649732 3I TTCCTGCTTA ---/AAT AATAATATTA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 AAT 2 3 158170 CASAVA_Build 3 16650266 1I ACCTTCTCCA -/G GCCTCAGCCC 3070 hom 104 het 41 0 32 9 G 1 2 158171 CASAVA_Build 3 16653744 1I TGGCTAATTT -/C TTTTTTTGTT 3070 het 543 hom 13 2 11 0 C 0 1 158172 CASAVA_Build 3 16658298 6I GGATGTGATT ------/GGTTCA GGTTCATGGG 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 GGTTCA 1 2 158173 CASAVA_Build 3 16668348 1I TTATTAGTGA -/C CTTAATAAGA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 C 1 2 158174 CASAVA_Build 3 16690728 1I TAAGGATTTA -/T TTTAAAAAAA 3070 hom 8 het 21 1 17 3 T 3 4 158175 CASAVA_Build 3 16702040 13I AAGGTGGGTT -------------/ATAGAAACTAGCA ATACTACTCT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 ATAGAAACTAGCA 0 1 158176 CASAVA_Build 3 16716228 3I AGAAAAATAC ---/ATG GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 ATG 0 1 158177 CASAVA_Build 3 16723052 1I TCCAAGGAAC -/A AAACTAGAGT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 3 4 158178 CASAVA_Build 3 16725147 5D TGTTTTTAAC TTTTG/----- TTTTAAGTTT 3070 het 3070 ref 44 27 16 1 TTTTG 1 0 158179 CASAVA_Build 3 16725456 1D CCATGTTCCT G/- GCAAAGAACA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 2 1 158180 CASAVA_Build 3 16732616 1I GGACCAGGCC -/T TGGAGGACCT 3070 het 3070 hom 46 16 17 13 T 1 2 158181 CASAVA_Build 3 16735057 3D GTAGTGGGCA GTT/--- GCTGACTGCT 3070 het 3070 ref 39 26 10 4 GTT 1 0 158182 CASAVA_Build 3 16736398 1D CTGTTGTCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 9 8 158183 CASAVA_Build 3 16738426 1I ATGGCCAGTT -/C CTTTCCCCAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 2 158184 CASAVA_Build 3 16739036 3I GGCAACCCCA ---/GAG GAGAAGAAAC 3070 hom 22 het 25 1 21 3 GAG 1 2 158185 CASAVA_Build 3 16740319 1I CATGACCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 25 0 11 14 T 14 15 158186 CASAVA_Build 3 16744280 2D GACATTTACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 20 0 11 9 T 16 14 158187 CASAVA_Build 3 16745365 1D CAGATCTAAC G/- TTGTGTCTCA 3070 het 3070 hom 48 17 19 12 G 1 0 158188 CASAVA_Build 3 16745532 1D CAGTTTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 44 2 34 8 A 11 10 158189 CASAVA_Build 3 16746482 43D TTAAATGAAT TCATTTTGAATAATTAAGGTTTTCACTACTCAATCAGGCCTAA/------------------------------------------- TAGCATGATT 3070 het 3070 ref 31 26 16 2 TCATTTTGAATAATTAAGGTTTTCACTACTCAATCAGGCCTAA 1 0 158190 CASAVA_Build 3 16747942 11I TCATACAGGA -----------/GAGCTCCAGCT GGCATCTGGC 3070 hom 39 het 15 0 12 3 GAGCTCCAGCT 0 1 158191 CASAVA_Build 3 16756172 2I CATAATGTTT --/TC CAGGGATATC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 TC 0 1 158192 CASAVA_Build 3 16767461 1D AGATTATCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 9 8 158193 CASAVA_Build 3 16768208 56D TATATATATA TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATG/-------------------------------------------------------- GTAGTTAATT 3070 het 138 hom 8 2 10 1 TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATG 1 0 158194 CASAVA_Build 3 16769054 4D TTTTTTCTTT CTTG/---- ATCAATCTAG 3070 hom 81 het 29 0 28 3 CTTG 1 0 158195 CASAVA_Build 3 16769287 4D TGCTATTTAC TGTT/---- TATTATTTAC 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 TGTT 1 0 158196 CASAVA_Build 3 16772960 1D TCTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 2564 het 1576 hom 19 6 6 7 T 12 11 158197 CASAVA_Build 3 16778677 3D TCAGAGTAGA TCT/--- TCTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 TCT 2 1 158198 CASAVA_Build 3 16781810 1D TTGGGAAAAT G/- GGGGGAAATG 3070 het 3070 hom 52 20 26 6 G 6 5 158199 CASAVA_Build 3 16782824 1D CGTCTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 20 5 A 11 10 158200 CASAVA_Build 3 16783656 1I13M4I CCTGCTATGT -ACCTGCTATGTAA----/AAGCTGCAAGCTCAGATT GTCTGTAATC 3070 hom 123 het 41 0 41 5 N/A 0 0 158201 CASAVA_Build 3 16798659 1D GTTTTGAAAG A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 7 6 158202 CASAVA_Build 3 16800120 2I CACCTCTAAC --/AA ACTCAATAAA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 1 3 158203 CASAVA_Build 3 16808850 2I AAGAAATGCT --/AC ACAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 51 29 17 5 AC 1 2 158204 CASAVA_Build 3 16811226 1I CCTAGACCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 9 10 158205 CASAVA_Build 3 16818770 1D AACATCTCAG C/- CGCTACAATT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 2 1 158206 CASAVA_Build 3 16861833 9I AATGCCAATC ---------/TAAGATGAT TAGACATCAT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 TAAGATGAT 0 1 158207 CASAVA_Build 3 16865638 1D TTTCAACAAG A/- ACTACCTAAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 2 1 158208 CASAVA_Build 3 16868454 1I ATTAGTAATG -/T TTTTTGATGA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 5 6 158209 CASAVA_Build 3 16886077 1D CAACATTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 A 10 9 158210 CASAVA_Build 3 16898528 5I GCCATGAAAA -----/CACTT CAGCAAGAAT 3070 het 3070 ref 49 29 19 1 CACTT 0 1 158211 CASAVA_Build 3 16908943 1I GGATTTAATC -/T GTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 0 1 158212 CASAVA_Build 3 16915337 1D TTCCACACCA C/- GATCACACAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 0 158213 CASAVA_Build 3 16939263 2D AAATAATGTT AG/-- AGACAGCTAA 2245 het 2245 ref 19 9 6 5 AG 2 1 158214 CASAVA_Build 3 16940450 1I TGGCTCCCTT -/C TAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 C 0 1 158215 CASAVA_Build 3 16945454 1I GAAGTGAAAC -/A GTAGAGGCTG 3070 hom 22 het 27 0 11 16 A 0 1 158216 CASAVA_Build 3 16945559 1D20M1D GAGTGCTGGC TTTGAACGTACACCACAGCCGC/-TTAAAAGAACGCCACAGGAG- AGCATAGAGA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 N/A 0 0 158217 CASAVA_Build 3 16947654 1I TTGCCATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 11 12 158218 CASAVA_Build 3 16961736 4D ACAAACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 AC 11 9 158219 CASAVA_Build 3 16977076 1D TTTAGTTACG T/- TAAGTCCTTC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 2 1 158220 CASAVA_Build 3 16999722 1D ATTCAGCAGT C/- CCTAACTAAT 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 C 3 2 158221 CASAVA_Build 3 17001428 1I ACTACGTCTT -/A AAAAAAAAAA 1762 het 1762 ref 27 9 7 11 A 10 11 158222 CASAVA_Build 3 17005514 4D CTGTTTTTGT TCTC/---- TCTCTCTCAC 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 TC 6 4 158223 CASAVA_Build 3 17014696 1I AGGAAAATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 9 10 158224 CASAVA_Build 3 17037049 1I TTTTCAGTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 T 9 10 158225 CASAVA_Build 3 17051408 3I ACTCACTCTC ---/CTT CCAGCACCTC 3070 het 3070 ref 56 28 22 6 CTT 0 1 158226 CASAVA_Build 3 17051920 1I GACCAGTTTT -/C CTCTCTTATC 3070 het 3070 ref 56 31 24 1 C 1 2 158227 CASAVA_Build 3 17057087 1I CTGCCGCTTG -/C CAAGTGTCTT 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 C 1 2 158228 CASAVA_Build 3 17063878 17I GAGGATGAGA -----------------/GCGTCGTTCCTCTTCTG GCAGGAGAAT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 GCGTCGTTCCTCTTCTG 0 1 158229 CASAVA_Build 3 17065597 1I TTGTGCAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 9 10 158230 CASAVA_Build 3 17068733 1D TGAATATGGC A/- AAAAAAAAAA 1198 het 500 hom 29 6 5 20 A 17 16 158231 CASAVA_Build 3 17110073 2D TGAATTCCAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 43 hom 23 1 13 9 AT 10 9 158232 CASAVA_Build 3 17118442 1I AATGAAAACC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 420 hom 37 1 28 8 A 8 9 158233 CASAVA_Build 3 17119255 6I GGTTTTAGTA ------/AAGGTC AGAGCAGAAA 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 AAGGTC 0 1 158234 CASAVA_Build 3 17126222 3I ACATTAAAAG ---/TGC TGTTAGGACC 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 TGC 0 1 158235 CASAVA_Build 3 17127796 1I CTTACCTTAC -/T GTCTGCTGCT 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 T 0 1 158236 CASAVA_Build 3 17135545 1D CTGGCAGGGC T/- TAGTGGATAC 3070 hom 44 het 19 0 14 5 T 2 1 158237 CASAVA_Build 3 17135603 1D AGGGGAGAGA G/- TACAGGGGGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 G 1 0 158238 CASAVA_Build 3 17135700 1I GTGTCTGCTG -/A ACCAAGAGTG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 1 2 158239 CASAVA_Build 3 17163617 2D TGTAAATAAC AG/-- AGCAATGGCT 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 AG 2 1 158240 CASAVA_Build 3 17169179 1D CCACCCCACC G/- TTCTGGGCTC 3070 hom 38 het 26 0 17 10 G 1 0 158241 CASAVA_Build 3 17169468 12D CCAGCCCCCA GCACAGTGTTTG/------------ GCACATGGTA 3070 het 3070 ref 47 26 21 9 GCACAGTGTTTG 1 0 158242 CASAVA_Build 3 17174070 1D GGCAGGGGCC A/- GGGGCCAGGT 1248 het 1248 ref 27 15 6 6 A 1 0 158243 CASAVA_Build 3 17174417 3I AGTCAACTGG ---/TCA TCATCTGCAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TCA 1 2 158244 CASAVA_Build 3 17175678 2I TGGCAAAACC --/AG AGTTATTATT 3070 hom 135 het 49 0 43 6 AG 1 2 158245 CASAVA_Build 3 17179761 2D ACCCCCCCCC CT/-- TCCTTGCCCC 3070 hom 26 het 32 1 21 10 CT 1 0 158246 CASAVA_Build 3 17191805 4I TCTTGAGGCC ----/AATA AATAGTTCTC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 AATA 1 2 158247 CASAVA_Build 3 17202199 1I TTGTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 536 hom 36 2 29 5 A 10 11 158248 CASAVA_Build 3 17216557 1I AATTGTTTTT -/C CAAGTAGAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 1 2 158249 CASAVA_Build 3 17230498 1I ATGATGCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 39 hom 19 1 14 4 T 12 13 158250 CASAVA_Build 3 17235976 1D TTTCCTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 40 0 26 14 T 12 11 158251 CASAVA_Build 3 17237700 1I GCAGGTGTGA -/T TAAGGTTAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 2 158252 CASAVA_Build 3 17248964 1D AGCTAAAGAG A/- AATCATGTAG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 3 2 158253 CASAVA_Build 3 17254467 1D TATAAATGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 9 158254 CASAVA_Build 3 17256264 1D TTTGTTAGAT G/- AACAATTCCC 3070 hom 141 het 56 0 48 9 G 1 0 158255 CASAVA_Build 3 17281757 1I AACTGACAAA -/G TTCTATAGCA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 G 0 1 158256 CASAVA_Build 3 17288588 5D AGAGAGTTAT GGAAA/----- GGAGAGGTGC 3070 hom 111 het 39 0 38 2 GGAAA 1 0 158257 CASAVA_Build 3 17290509 1D GTATTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 30 1 20 9 A 16 15 158258 CASAVA_Build 3 17291603 1D GAGGAAACAA T/- TATTTCCAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 1 158259 CASAVA_Build 3 17301745 18D TTTTAGATTC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 1784 hom 21 het 14 0 6 8 T 30 12 158260 CASAVA_Build 3 17306129 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 736 hom 25 3 13 9 A 15 14 158261 CASAVA_Build 3 17308909 4I AATATTTACC ----/TTGA TTATTATGCA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 TTGA 0 1 158262 CASAVA_Build 3 17311491 2D CTAATCTGTA AT/-- AGTGTTCTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 5 AT 1 0 158263 CASAVA_Build 3 17317503 1I12M1I GGAGGTGGAA -TTGCAGTGAGCC-/GTTGCAGTGAGCCA AGATGGCACC 3070 hom 53 het 18 0 18 4 N/A 0 0 158264 CASAVA_Build 3 17318786 2D CTTCTCCCTG TA/-- TATACCTTCA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TA 3 2 158265 CASAVA_Build 3 17321386 1D CTTCTTCCTT A/- ACTCAAAGAT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 2 1 158266 CASAVA_Build 3 17322607 9D GCTGCTTTTC ACTTCCAGG/--------- CCTTTGTTCA 3070 hom 132 het 46 0 45 3 ACTTCCAGG 1 0 158267 CASAVA_Build 3 17335932 1D AATTTATAGG T/- TTTTTTTTTT 2647 het 2647 ref 39 23 8 8 T 16 15 158268 CASAVA_Build 3 17339037 1D TTTTACCTGG A/- TGTGCTTTTG 3070 het 3070 hom 43 13 22 9 A 1 0 158269 CASAVA_Build 3 17341765 1D GTACTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 23 0 11 12 A 16 15 158270 CASAVA_Build 3 17346030 1I TATGGAGGAT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 6 7 158271 CASAVA_Build 3 17350421 9D GCAAGTAACA GGGAGAATG/--------- GGCAAGGGTT 3070 hom 131 het 43 0 44 2 GGGAGAATG 1 0 158272 CASAVA_Build 3 17353207 1D AGCATCACTG A/- AAAAAAAAAA 551 het 551 ref 40 31 2 7 A 11 10 158273 CASAVA_Build 3 17364152 1D TCTATCACTT A/- AAAAAAAAAA 868 het 868 ref 26 21 3 2 A 11 10 158274 CASAVA_Build 3 17364505 1I TCTCTACAAC -/A ATAAAAAGTC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 1 2 158275 CASAVA_Build 3 17367227 1D TTAACTATGA G/- GAAATTTTTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 G 2 1 158276 CASAVA_Build 3 17372145 1D AAGTAATAAA T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 6 158277 CASAVA_Build 3 17373491 2D GTTTTGTGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 12 10 158278 CASAVA_Build 3 17374665 1I CAATGTTCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 424 hom 35 1 26 8 T 9 10 158279 CASAVA_Build 3 17399060 1D CTTGAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 42 1 31 10 T 15 14 158280 CASAVA_Build 3 17403896 1D TAAAATTCCA T/- TGACTTTAGA 3070 hom 105 het 41 0 35 7 T 2 1 158281 CASAVA_Build 3 17415241 1I TGCATTGTAA -/C TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 C 0 1 158282 CASAVA_Build 3 17427701 1D ATCCTTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 12 11 158283 CASAVA_Build 3 17434379 1I TTTAGAAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 9 10 158284 CASAVA_Build 3 17437774 2D AATATTAAGA CT/-- CTGATTTCTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CT 2 1 158285 CASAVA_Build 3 17442530 1I TATGTTGGTG -/A TAGGTTTCAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 1 158286 CASAVA_Build 3 17446461 1I TACAACACTT -/A AAAAATGGTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 5 6 158287 CASAVA_Build 3 17449526 4D TTGCCCTTGC CCCA/---- CCCACCCCAT 3070 hom 104 het 40 0 36 5 CCCA 2 1 158288 CASAVA_Build 3 17462670 1I TCCCAACCCC -/T ATTCCTCCTG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 0 1 158289 CASAVA_Build 3 17496754 1I AGCTCAAAAA -/G CCTGGGCGCC 3070 hom 96 het 34 0 31 3 G 0 1 158290 CASAVA_Build 3 17539588 3I GTTTTATGTG ---/TAT TATTATCCCA 3070 hom 129 het 52 0 43 9 TAT 2 3 158291 CASAVA_Build 3 17556157 1I TGCCTGATCA -/C CCCCCTCCCC 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 C 5 6 158292 CASAVA_Build 3 17577116 1D CCTTGTCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 14 0 9 5 A 10 9 158293 CASAVA_Build 3 17612191 4I TTAGAAAAGC ----/AAGT AAGTGATAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAGT 1 2 158294 CASAVA_Build 3 17614504 1I CTGCCCCCCC -/G GCCCCCCAAC 3009 hom 39 het 18 0 10 8 G 1 2 158295 CASAVA_Build 3 17623767 1D TGTGTACAGC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 117 het 46 0 40 7 A 9 8 158296 CASAVA_Build 3 17718864 1I ATATAAATGG -/T TGTTTTTTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 2 158297 CASAVA_Build 3 17755032 3D CAGAATTTGT AAA/--- AATATTAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 5 2 158298 CASAVA_Build 3 17827612 1I AATGGATGAG -/A AAAAGAGGTA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 4 5 158299 CASAVA_Build 3 17855316 1D AGATCCAATC T/- TTTTTTTTTT 1683 het 1683 ref 33 21 4 8 T 11 10 158300 CASAVA_Build 3 17891222 1I CATGGCAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 11 12 158301 CASAVA_Build 3 17892241 4I GTATCCTCAC ----/TGTA TGTATTTTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TGTA 1 2 158302 CASAVA_Build 3 17893884 1D TGCTTTTTCC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 7 158303 CASAVA_Build 3 17899587 2D GTGTGGTGGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 44 0 33 11 TG 9 8 158304 CASAVA_Build 3 17904050 1D TGTGATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 38 0 27 11 T 11 10 158305 CASAVA_Build 3 17913183 2I ATTGAGCCTC --/TT TTTTTTTTTT 1484 het 164 hom 25 1 7 17 T 14 16 158306 CASAVA_Build 3 17939304 2D AGTTTAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 2640 het 434 hom 23 4 9 10 A 18 16 158307 CASAVA_Build 3 17963603 1I CAGCTGATTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 8 9 158308 CASAVA_Build 3 17969277 1D TTTCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2307 het 583 hom 18 2 6 10 T 17 16 158309 CASAVA_Build 3 18030554 1D GGGTCCCCAA C/- CCCCCAGGCC 3070 hom 99 het 36 0 33 4 C 6 5 158310 CASAVA_Build 3 18037826 2D AATCTTACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 21 1 15 6 A 15 13 158311 CASAVA_Build 3 18057844 1D AACTTTGACC T/- TTTTTTTTTT 1761 het 1761 ref 38 27 4 7 T 12 11 158312 CASAVA_Build 3 18109216 1I CAGAGAAGAC -/T TTTTTTTTTT 2675 het 2675 ref 28 12 11 5 T 13 14 158313 CASAVA_Build 3 18112087 1I TCTAGTAATG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 7 8 158314 CASAVA_Build 3 18129797 3D ACAACAACAG CAA/--- CAACAACAAC 2672 het 2672 ref 41 17 10 15 CAA 6 5 158315 CASAVA_Build 3 18142778 1I CTTTTTCCCC -/T TCTTGCCACT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 1 2 158316 CASAVA_Build 3 18147200 1I TTTAGATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 9 10 158317 CASAVA_Build 3 18147482 3D TGAATATCTT CTC/--- CTATGTTTTG 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 CTC 1 0 158318 CASAVA_Build 3 18148595 1I CAAATACATT -/A TCCTTGGATA 3070 het 3070 ref 54 25 20 9 A 0 1 158319 CASAVA_Build 3 18164791 1D ATCTTATTTG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 A 8 7 158320 CASAVA_Build 3 18165876 4D ACTCCCAGGC AACT/---- AACTGTCTCT 3070 hom 98 het 37 0 33 6 AACT 2 1 158321 CASAVA_Build 3 18166521 2D AAAAAAAAAA CC/-- ACCACCAACA 786 het 451 hom 29 5 6 18 C 2 0 158322 CASAVA_Build 3 18172585 2D TTCTTTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 24 2 9 14 A 13 11 158323 CASAVA_Build 3 18191713 1D AGCCAAATCC A/- AAAGCAAGGC 3070 het 3070 ref 47 25 14 10 A 4 3 158324 CASAVA_Build 3 18197785 1D TTCTTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 11 10 158325 CASAVA_Build 3 18203173 1I TATGTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 16 29 5 T 10 11 158326 CASAVA_Build 3 18203733 1I TTATTATGTA -/T TTTTTGTAAA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 5 6 158327 CASAVA_Build 3 18219858 1D GTTTAACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 11 10 158328 CASAVA_Build 3 18231119 1D AGGACAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 T 11 10 158329 CASAVA_Build 3 18237066 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2557 het 2557 ref 39 21 6 12 T 17 16 158330 CASAVA_Build 3 18248724 1I GACTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 11 12 158331 CASAVA_Build 3 18256595 1D TGCCATCAGG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 7 6 158332 CASAVA_Build 3 18258686 1I TAGAGTGTGG -/T TTTTACTCTA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 4 5 158333 CASAVA_Build 3 18259944 2I CCTATTTGCC --/TT TTGACATATT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 2 4 158334 CASAVA_Build 3 18260627 1D TGACACAAAT G/- GAAAGGGACA 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 G 2 1 158335 CASAVA_Build 3 18263902 1I AGTTCTTGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 9 10 158336 CASAVA_Build 3 18267378 1I ATGGTGATTT -/C CCCCCGGGGA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 C 5 6 158337 CASAVA_Build 3 18283122 1D TGCCATGGTC T/- TACCTGCAAG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 2 1 158338 CASAVA_Build 3 18284412 1D CAGGGGAATC T/- CCTGCAGGTT 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 T 1 0 158339 CASAVA_Build 3 18285886 1I TCTAATTAAA -/G GTTTTATTCT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 G 1 2 158340 CASAVA_Build 3 18302527 1I GTTGTTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 8 9 158341 CASAVA_Build 3 18304057 1D GCTTAGCTAA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 8 7 158342 CASAVA_Build 3 18313313 4D AGATCAAAAA AAAG/---- AAAGAATCTC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AAAG 2 1 158343 CASAVA_Build 3 18355326 1I GTTTTCCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 43 2 31 10 T 10 11 158344 CASAVA_Build 3 18363608 3I TCAGTTTCTA ---/AAG AAGTACAAGT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 AAG 1 2 158345 CASAVA_Build 3 18369435 1D CAAGGCCCAG T/- TTTTTTACCC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 7 6 158346 CASAVA_Build 3 18377022 1I CTTTCTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 522 hom 32 2 21 9 T 11 12 158347 CASAVA_Build 3 18381343 1D ACAAATTTCC T/- TTTTTTTTTG 1044 het 1044 ref 45 37 3 5 T 10 9 158348 CASAVA_Build 3 18392770 1I AAATGATGGC -/A GGGGGTGGGG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 0 1 158349 CASAVA_Build 3 18395408 1D TTAATTATCA T/- AAAGGCTGGT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 1 0 158350 CASAVA_Build 3 18397218 1D TAGAATCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 11 10 158351 CASAVA_Build 3 18400955 1D TGGCTAGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 15 14 158352 CASAVA_Build 3 18407877 1D TTTACATTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 10 9 158353 CASAVA_Build 3 18409059 10D ATACATATAT ATACACACAC/---------- ATACACACAC 1559 het 1559 ref 16 10 6 1 ATACACACAC 2 1 158354 CASAVA_Build 3 18421297 6D AACCTAACTC AAACCA/------ AATGAATATA 3070 het 3070 hom 38 13 17 9 AAACCA 1 0 158355 CASAVA_Build 3 18421340 1D CTATAAAATA T/- TTTTAAAAGG 3070 het 2186 hom 37 7 22 8 T 5 4 158356 CASAVA_Build 3 18432081 1D CATATGAATT A/- AAAATCATAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 5 4 158357 CASAVA_Build 3 18435786 1I GTGTTTGGCG -/A AGAGTTCCAA 3070 hom 120 het 45 0 38 7 A 1 2 158358 CASAVA_Build 3 18440239 1D TTTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 16 7 A 13 12 158359 CASAVA_Build 3 18495177 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 1248 hom 36 6 12 19 AC 9 8 158360 CASAVA_Build 3 18561116 1D TGCGTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 1169 het 1169 ref 40 18 3 19 T 19 18 158361 CASAVA_Build 3 18588185 1D AAAATGTTGA T/- TTTTTATAAC 3070 het 3070 ref 38 17 19 3 T 6 5 158362 CASAVA_Build 3 18599449 2I AATAATTATG --/TA TATATATATA 2514 het 821 hom 15 3 8 4 TA 6 7 158363 CASAVA_Build 3 18599673 1I AGAAAGTGAT -/A AAAAAAAAAA 2778 het 2778 ref 23 7 10 6 A 10 11 158364 CASAVA_Build 3 18606006 1D GTTAAATCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 T 10 9 158365 CASAVA_Build 3 18638732 1I TTAATGGCCC -/T GCTTCATATC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 0 1 158366 CASAVA_Build 3 18645928 1I TAACACCTTT -/A AAAAAAGGTG 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 A 6 7 158367 CASAVA_Build 3 18665012 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2987 het 1973 hom 28 9 12 7 T 11 12 158368 CASAVA_Build 3 18674894 1D TCATTCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 11 10 158369 CASAVA_Build 3 18675932 1I TTCATTTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 11 12 158370 CASAVA_Build 3 18679132 3I GCTGAGGAAC ---/TGT TGTTTGTTGA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 TGT 1 2 158371 CASAVA_Build 3 18680976 1I GGGCAGTTCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 48 14 29 5 T 7 8 158372 CASAVA_Build 3 18681795 1I ACAAAACAAG -/T TAGAAGAATG 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 1 2 158373 CASAVA_Build 3 18686935 1D TAAAATGTCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 T 8 7 158374 CASAVA_Build 3 18723447 1I TACAAAAAAA -/C AATCCTAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 C 0 1 158375 CASAVA_Build 3 18745785 5I AATAATAAAC -----/ATAAT ATAAGAGATA 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 ATAAT 0 1 158376 CASAVA_Build 3 18767654 1D ATTTTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 14 9 T 12 11 158377 CASAVA_Build 3 18769318 4I CTAGCACAAA ----/TTTC TTTCAGGGCT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 TTTC 1 2 158378 CASAVA_Build 3 18770940 1D TTGACAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 13 12 158379 CASAVA_Build 3 18774566 2D CAAAAAAAAG AT/-- AAAATCTAGT 3070 het 3070 hom 38 15 23 2 AT 1 0 158380 CASAVA_Build 3 18776261 7I AGAGAAGGAA -------/CATGAAT GTTGATTAGC 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 CATGAAT 0 1 158381 CASAVA_Build 3 18777789 2I CTTCAGATAA --/AC ACATATATTA 1155 het 1155 ref 20 10 5 5 AC 1 2 158382 CASAVA_Build 3 18779350 3I TAACATTCCT ---/CAC CAAACAGAAT 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 CAC 0 1 158383 CASAVA_Build 3 18784408 2D GCATCCTGAC AG/-- AGTTTGTGCT 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 AG 2 1 158384 CASAVA_Build 3 18787847 23D CATAAAAATC AATCCTAAGGGCACATAAAGATT/----------------------- AATCCTAAGG 3070 het 3070 ref 35 27 13 5 AATCCTAAGGGCACATAAAGATT 1 0 158385 CASAVA_Build 3 18793385 1I GAATCAGAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 9 10 158386 CASAVA_Build 3 18794955 1I GCCTAATAAC -/A AAGACCCTTT 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 A 2 3 158387 CASAVA_Build 3 18796932 1I TTTTTGACTC -/T ATTAATAATT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 0 1 158388 CASAVA_Build 3 18802394 1D AGATGGGGAA G/- GGGGAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 25 10 4 G 5 4 158389 CASAVA_Build 3 18822320 1D CCATGAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 11 10 158390 CASAVA_Build 3 18825232 3D CTTAAGAACA GTT/--- TCTCCCCAGA 3070 het 3070 hom 48 17 28 4 GTT 1 0 158391 CASAVA_Build 3 18826420 3I TCAGACTTAG ---/TGA TGATAACTGG 3070 het 3070 ref 59 36 19 4 TGA 1 2 158392 CASAVA_Build 3 18828439 1D ACAGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1969 het 1969 ref 38 23 6 10 T 17 16 158393 CASAVA_Build 3 18861724 1I TTGCTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 10 11 158394 CASAVA_Build 3 18863979 3I TGTACTTTTC ---/TCT TCTTTTAAGT 3070 het 2536 hom 23 6 12 5 TCT 1 2 158395 CASAVA_Build 3 18885497 3D CATTTCACCT TAC/--- TTGAGCAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 TAC 1 0 158396 CASAVA_Build 3 18889796 1D CATTGGTAAG T/- TGGAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 8 15 8 T 2 1 158397 CASAVA_Build 3 18904467 1I AACAGTAGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 A 8 9 158398 CASAVA_Build 3 18904709 2I TCAGAAGAAG --/TA TATCTGATTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 TA 1 2 158399 CASAVA_Build 3 18905045 1D TTCACAGTGA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 6 5 158400 CASAVA_Build 3 18939396 4I AGGTCAAGGT ----/CATA CATACTTTTA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 CATA 1 2 158401 CASAVA_Build 3 18946964 1I ATTATATTTC -/T TTTTTTCTTT 3026 het 1274 hom 17 3 9 6 T 6 7 158402 CASAVA_Build 3 18956919 1I TAAGGTTTAA -/G GAAGGGATCC 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 G 1 2 158403 CASAVA_Build 3 18957886 1I ATATATATAT -/A CATATATTTA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 0 1 158404 CASAVA_Build 3 18965004 1D TTCCTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3014 het 2774 hom 27 11 14 2 T 11 10 158405 CASAVA_Build 3 18968134 1I TCATCTGCTA -/T TTTTTTTTTT 899 het 899 ref 37 22 3 12 T 13 14 158406 CASAVA_Build 3 19003814 4D TTTTCTTAAT AAAA/---- AAAGTGTTCA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 7 3 158407 CASAVA_Build 3 19006880 1D AAGCTTCCTG T/- GGATTTAATG 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 1 0 158408 CASAVA_Build 3 19026057 1I TTTTTTTCTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 2 T 7 8 158409 CASAVA_Build 3 19028049 1D ATTATGCCAA C/- AAGCATCATC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 1 0 158410 CASAVA_Build 3 19033056 1D TTATACAGGA G/- GGGAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 4 3 158411 CASAVA_Build 3 19042030 2D ATACATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 114 het 55 0 38 17 AC 9 8 158412 CASAVA_Build 3 19048430 1D TATTTGTTAG T/- TTTTTTTTTT 2466 het 740 hom 27 4 10 13 T 17 16 158413 CASAVA_Build 3 19052468 9I TAATAATTGA ---------/TTAAAAACT TTAAGACCTC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TTAAAAACT 0 1 158414 CASAVA_Build 3 19058838 1I TACATTTCCC -/A AGTATATTAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 2 158415 CASAVA_Build 3 19058959 1D AAAAAAACAT G/- GTTAACCTAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 2 1 158416 CASAVA_Build 3 19064396 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 6 158417 CASAVA_Build 3 19065289 3I CACATAAAAT ---/TTC TTTATCAAAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTC 0 1 158418 CASAVA_Build 3 19086832 1D TGTTAAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 20 0 14 6 T 13 12 158419 CASAVA_Build 3 19097789 2D ACCAGTTAAC CA/-- CAGAGCCTAA 3070 hom 126 het 48 0 42 8 CA 2 1 158420 CASAVA_Build 3 19162660 1I GAACATTAGG -/T TTTCGGGCTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 3 4 158421 CASAVA_Build 3 19251185 1I GAAAGGGGCT -/C CCACAGTGCA 1677 hom 21 het 8 0 6 2 C 2 3 158422 CASAVA_Build 3 19296065 1D CCATAGGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 327 hom 28 1 15 12 A 16 15 158423 CASAVA_Build 3 19327189 1I AAGGGGTGAG -/T TGTTACAATC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 2 158424 CASAVA_Build 3 19346011 1I TTTTTCTAGG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 22 het 41 1 35 5 T 7 8 158425 CASAVA_Build 3 19347746 24D TTTAATTATT TTTATTTATTTATTTATTTATTTA/------------------------ TTTATTTATT 3070 het 272 hom 14 1 14 1 TTTA 9 3 158426 CASAVA_Build 3 19360469 4I GTACCACTGT ----/GGAG GGTCACGCTT 3070 het 3070 ref 40 13 9 18 GGAG 0 1 158427 CASAVA_Build 3 19365395 1I GTAGTAGTTG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 T 7 8 158428 CASAVA_Build 3 19375877 4I GTATATACAT ----/AGAG AGAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 AG 2 4 158429 CASAVA_Build 3 19414035 2I ATATACACAC --/GT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 GT 0 1 158430 CASAVA_Build 3 19429646 2D TTGGATAAAG AA/-- AATGTAGTAA 3070 het 3070 ref 48 27 12 9 A 4 2 158431 CASAVA_Build 3 19448524 3I TATTTTTTAA ---/CTT CTGCTAGTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 CTT 0 1 158432 CASAVA_Build 3 19503079 1D GTAACTGCCA T/- TTTTTTTCTT 2732 het 2732 ref 16 8 7 1 T 8 7 158433 CASAVA_Build 3 19531995 1D GTTATGGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1347 hom 44 3 30 11 T 13 12 158434 CASAVA_Build 3 19566497 1D TTTCAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 1378 het 1378 ref 34 28 3 3 T 11 10 158435 CASAVA_Build 3 19637551 1I ATCGTTTGTA -/T TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 6 7 158436 CASAVA_Build 3 19647188 1D CAACAATATC T/- CCAGACATTG 3070 het 3070 ref 52 25 16 11 T 1 0 158437 CASAVA_Build 3 19667223 1I TAGGCATGGA -/C AAAGACTTCA 2335 het 2335 ref 22 16 5 1 C 0 1 158438 CASAVA_Build 3 19692254 4D ATCAAATTCT CAAA/---- CAAATTACAC 3070 het 3070 hom 53 21 30 2 CAAA 2 1 158439 CASAVA_Build 3 19713602 1D TTGTGAGATG T/- TTTTTTTTTT 1261 het 1261 ref 49 33 4 13 T 13 12 158440 CASAVA_Build 3 19718469 2D ACGTGTGAAA AG/-- AGAGAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AG 3 2 158441 CASAVA_Build 3 19724106 1I AGCAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 2983 het 2983 ref 30 17 8 5 A 11 12 158442 CASAVA_Build 3 19732473 2I CTACTCAGGT --/CC CCCCTCCCCA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 C 4 6 158443 CASAVA_Build 3 19736070 1D AGAAACAAAG A/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 A 1 0 158444 CASAVA_Build 3 19756930 4D TTGCCTGCAC TTGT/---- TTGTTTTCAC 3070 het 3070 hom 47 17 27 4 TTGT 2 1 158445 CASAVA_Build 3 19763999 1I65M1I AGAGATGGGG -AATTTAATGAGATGGAAGAAAGCAAATAGCCCTGCTTTTACAGCACAAGCTTGGTTTTCTTCTAG-/AAATTTAATGAGATGGAAGAAAGCAAATAGCCCTGCTTTTACAGCACAAGCTTGGTTTTCTTCTAGA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 35 25 16 N/A 0 0 158446 CASAVA_Build 3 19805878 1I ACTCTTCCTA -/G CCAACAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 158447 CASAVA_Build 3 19901719 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1610 het 1610 ref 31 18 6 7 A 15 14 158448 CASAVA_Build 3 19937792 2D TCCTTTTAGT GA/-- GAGAGTCTTT 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 GA 3 2 158449 CASAVA_Build 3 19955671 1I CCAAAGTGCT -/G GGATTACATG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 G 2 3 158450 CASAVA_Build 3 19961265 1D GCATCAAATG T/- TTTTCATTGT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 T 5 4 158451 CASAVA_Build 3 19969247 1I ATCTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 T 10 11 158452 CASAVA_Build 3 19970521 1I TGTTGGTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 8 9 158453 CASAVA_Build 3 19974227 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 590 hom 27 4 11 12 A 15 14 158454 CASAVA_Build 3 19978960 1D GTTACTCGGG A/- AGGCTGAGGC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 2 1 158455 CASAVA_Build 3 19981429 4D TACTTACTTA CTTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 CTTT 1 0 158456 CASAVA_Build 3 19983644 1D CCTTTGTCCA T/- TTTTTTTTTT 2264 het 1587 hom 33 11 5 17 T 15 14 158457 CASAVA_Build 3 19992393 1I ATCTGGTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 9 10 158458 CASAVA_Build 3 19993668 1I TCCTGGGCTT -/A ACGCCATTCT 1660 het 1660 ref 17 9 5 3 A 1 2 158459 CASAVA_Build 3 20000670 1I GTCACCTGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 9 10 158460 CASAVA_Build 3 20010540 1I ATTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2756 het 474 hom 17 3 10 4 A 13 14 158461 CASAVA_Build 3 20011947 1D CAAGGAAGGA T/- TTCTACCCTA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 T 3 2 158462 CASAVA_Build 3 20014826 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2964 het 1158 hom 13 4 8 1 A 13 12 158463 CASAVA_Build 3 20021267 1I TAGAGACCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 A 9 10 158464 CASAVA_Build 3 20028296 4D CTCTGTCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 481 het 481 ref 16 3 3 11 AAAT 4 3 158465 CASAVA_Build 3 20037188 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCCATCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 C 6 7 158466 CASAVA_Build 3 20042520 1D ATGAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 A 11 10 158467 CASAVA_Build 3 20044175 2D AAGAAGGAGG AA/-- GGGAAATGAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 7 A 2 0 158468 CASAVA_Build 3 20049960 1D AAAGGAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1386 het 804 hom 23 5 6 12 T 15 14 158469 CASAVA_Build 3 20050607 1D ATATTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 15 14 158470 CASAVA_Build 3 20059401 1D TTTTAACGTC T/- TTTTTTTTTT 2672 het 2672 ref 27 16 7 5 T 13 12 158471 CASAVA_Build 3 20060566 1I ATAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2657 hom 26 12 12 2 A 12 13 158472 CASAVA_Build 3 20061085 1D TCACCTAGTC G/- GGGGTGAGGT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 G 5 4 158473 CASAVA_Build 3 20063570 1I TTTTGTTTTG -/C CCCCCCCCTT 1619 het 1305 hom 21 6 8 7 C 8 9 158474 CASAVA_Build 3 20070717 3D TCTCCGCCTC CTG/--- GGTTCAAGCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CTG 1 0 158475 CASAVA_Build 3 20086806 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1700 het 1700 ref 34 19 6 9 T 14 15 158476 CASAVA_Build 3 20115543 1D GTAAAAGTTA C/- AGAAGATTCA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 1 0 158477 CASAVA_Build 3 20120496 3D GGGAAGATGC TCA/--- TCATCATTTT 3070 hom 144 het 57 0 48 11 TCA 3 2 158478 CASAVA_Build 3 20122949 4I ACACACACAC ----/ACAG ACACACACAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 ACAG 0 1 158479 CASAVA_Build 3 20124776 3I AAAAGTTAAA ---/CTT CTCAGTCATA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 CTT 0 1 158480 CASAVA_Build 3 20130441 3I GGGAAAAAAT ---/GAA GAAGAAGACC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GAA 2 3 158481 CASAVA_Build 3 20149926 1I TGTGACTAAT -/C ATTACCATAT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 C 0 1 158482 CASAVA_Build 3 20152150 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 192 hom 35 2 24 10 A 13 12 158483 CASAVA_Build 3 20154897 4I CATTTTTGAC ----/TATT TAGGTGTTTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TATT 0 1 158484 CASAVA_Build 3 20155556 1D TGCCCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 1381 het 1381 ref 34 26 4 4 T 12 11 158485 CASAVA_Build 3 20157368 16D TTTAAATTTG TGTAAAATACAAAATA/---------------- TGTAAAATAC 3070 hom 84 het 40 0 28 16 TGTAAAATACAAAATA 2 1 158486 CASAVA_Build 3 20163592 1I TTGAATATCA -/T TTGGCAATTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 2 3 158487 CASAVA_Build 3 20218015 1I CTGCCACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 34 2 22 10 A 14 15 158488 CASAVA_Build 3 20277189 1D AAAATCATTT A/- AAAAACAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 5 158489 CASAVA_Build 3 20288333 1I CAACCCCCCC -/A CCCCGGGCTA 3070 het 209 hom 22 1 16 5 A 0 1 158490 CASAVA_Build 3 20289297 4I CACACTGCCC ----/CAGA CAGAGGTCTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CAGA 1 2 158491 CASAVA_Build 3 20300427 1D TATACTAGAA G/- GGGGGGAAAA 3070 het 329 hom 25 1 20 4 G 7 6 158492 CASAVA_Build 3 20306374 1D TCTAATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 171 hom 48 2 39 8 T 13 12 158493 CASAVA_Build 3 20314854 1I AAGGTAATAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 88 het 38 0 29 9 T 8 9 158494 CASAVA_Build 3 20318854 1I ATGACCACTG -/T GGGTTGACAC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 158495 CASAVA_Build 3 20320205 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAAACA 843 hom 10 het 8 0 4 5 AAAC 1 0 158496 CASAVA_Build 3 20326763 1D AATCTTATGC T/- TTTTTTTTTT 1704 het 1704 ref 36 28 5 3 T 13 12 158497 CASAVA_Build 3 20352613 1D TTTACTGGAC A/- GAACTGCTGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 0 158498 CASAVA_Build 3 20359524 1D TAATTGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 27 5 T 13 12 158499 CASAVA_Build 3 20362133 5D TCTCCAAATC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 34 0 25 9 T 16 11 158500 CASAVA_Build 3 20389178 4D CCTCCCAGGG CTCA/---- CTATCTTTGT 3070 hom 126 het 44 0 42 5 CTCA 1 0 158501 CASAVA_Build 3 20398653 2D ACAGTGCTTT TC/-- TCTCTCTCCT 3070 hom 45 het 17 0 14 4 TC 5 4 158502 CASAVA_Build 3 20399362 21D TTCCAGGGAA CAGGAATTTTAGGGTTTATGT/--------------------- CATAGTTAGC 3070 hom 114 het 36 0 39 3 CAGGAATTTTAGGGTTTATGT 1 0 158503 CASAVA_Build 3 20405317 1I AATTCATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 964 hom 22 4 18 0 T 13 14 158504 CASAVA_Build 3 20410481 1D CCATCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 1280 hom 15 het 6 0 6 0 A 11 10 158505 CASAVA_Build 3 20412180 14D ACTGAGCTTG AGCCATCTGCAAAC/-------------- AGCCATCTGC 3070 hom 68 het 34 0 23 13 AGCCATCTGCAAAC 2 1 158506 CASAVA_Build 3 20412635 1I GTCATATTTT -/C CTGATTTTTG 3070 hom 159 het 57 0 52 5 C 1 2 158507 CASAVA_Build 3 20417623 1I GAAACCATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 29 1 21 7 T 11 12 158508 CASAVA_Build 3 20420674 1I ATCAAAGAGT -/A ATGAATGCAT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 1 2 158509 CASAVA_Build 3 20434185 2D GCTATAACAC TT/-- TTAACGCTAT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 4 2 158510 CASAVA_Build 3 20435336 1I AATGAGGCTT -/C ATTTTTTTAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 0 1 158511 CASAVA_Build 3 20438950 8D TATCCTGCCA TATTTAAT/-------- TAAACATCCT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TATTTAAT 1 0 158512 CASAVA_Build 3 20442186 2I AAAATTGTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 10 12 158513 CASAVA_Build 3 20452785 1I GTAAACTTTT -/C CAGGGACTTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 1 2 158514 CASAVA_Build 3 20453879 1I ATTTTTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 10 11 158515 CASAVA_Build 3 20457831 4I TATCAATGAA ----/AAAC AAGAAAAGAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 AAAC 0 1 158516 CASAVA_Build 3 20459510 3I CACAGCTAAT ---/ATC ATTTCAAATG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATC 0 1 158517 CASAVA_Build 3 20468112 1D12M1D GACCGAGAAG AAAAAAAAAAACAT/-AAAAAAAAAACA- TTTTTTTTCC 3070 hom 57 het 20 0 18 7 N/A 0 0 158518 CASAVA_Build 3 20477709 1D AATTTTCTAA T/- TTACTGCCCA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 3 2 158519 CASAVA_Build 3 20478482 1D TAATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 11 10 158520 CASAVA_Build 3 20478864 1D AATTAGCATT A/- GCAAGCATAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 0 158521 CASAVA_Build 3 20479154 2D TGACCTGTAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 75 het 33 0 26 8 TA 7 6 158522 CASAVA_Build 3 20484477 1D GGATATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 12 11 158523 CASAVA_Build 3 20488017 1D CTTCTGAGTA T/- AAAAGGGATG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 0 158524 CASAVA_Build 3 20557926 2D ATACATATAA AT/-- ATAAAATGAA 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 AT 2 1 158525 CASAVA_Build 3 20558930 1I GAAAATTTTT -/A AATACAGTAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 2 3 158526 CASAVA_Build 3 20585233 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 6 7 158527 CASAVA_Build 3 20605277 1D ATGTAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 21 25 9 T 11 10 158528 CASAVA_Build 3 20608536 4D ATAAACCTAC TTGA/---- TTATATTGGA 3070 het 3070 ref 37 22 11 6 TTGA 1 0 158529 CASAVA_Build 3 20615359 1D ATCTTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 11 10 158530 CASAVA_Build 3 20615707 1D AAAGTATTTT C/- TTATTTCTTC 3070 het 3070 ref 37 19 9 9 C 1 0 158531 CASAVA_Build 3 20621839 2I AATCCAGAAA --/TT TAAATGAGAG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 1 3 158532 CASAVA_Build 3 20628586 1D CACAAATCAC T/- TTTTAACTCT 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 T 5 4 158533 CASAVA_Build 3 20641480 1I CTTCAACAAA -/T TTTCGAAAAC 3070 het 3070 ref 40 27 10 3 T 3 4 158534 CASAVA_Build 3 20654571 1I AGGAGTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 10 11 158535 CASAVA_Build 3 20667176 2I CTCATTTACA --/CT CTGGGGGAGT 3070 het 3070 hom 50 16 21 13 CT 1 2 158536 CASAVA_Build 3 20681204 1I CCAGCAACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 9 10 158537 CASAVA_Build 3 20681382 3D TTTTAAAGGA GTT/--- GTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 24 14 4 GTT 2 1 158538 CASAVA_Build 3 20685540 1D TCTTATTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 12 11 158539 CASAVA_Build 3 20693156 1I GCAGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 1812 het 1812 ref 25 11 5 9 T 11 12 158540 CASAVA_Build 3 20711103 1I TCTTCCAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 11 12 158541 CASAVA_Build 3 20714719 3D TTAAGAACAA AGT/--- ATGTCAATCT 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 AGT 1 0 158542 CASAVA_Build 3 20717639 17D TTGTTTTGTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1255 hom 21 8 12 6 T 28 11 158543 CASAVA_Build 3 20719647 1D GGGAACAAAC A/- AAAGTATACA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 4 3 158544 CASAVA_Build 3 20720854 1I GTTTTTATGG -/T TTTTAGGTGT 3070 het 756 hom 15 3 11 1 T 4 5 158545 CASAVA_Build 3 20734350 1I TTATTTGGTC -/T TATTTTATCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 1 2 158546 CASAVA_Build 3 20736625 1I GGAGGGTAGG -/C AGGGATAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 C 0 1 158547 CASAVA_Build 3 20742302 2I AGAGAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 35 0 23 12 A 11 13 158548 CASAVA_Build 3 20778493 1D CATCATGAGA C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 74 het 27 0 22 6 C 9 8 158549 CASAVA_Build 3 20785051 3I TTCTATTGAG ---/ATA ATAAAATGTT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 ATA 1 2 158550 CASAVA_Build 3 20823733 1I GTTCCTGTAG -/A AAAAAAAAAA 1760 het 1760 ref 36 15 11 10 A 15 16 158551 CASAVA_Build 3 20887518 1I TAAATCAGTT -/A AGGCTGGAAG 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 1 2 158552 CASAVA_Build 3 20917341 1D TAAGATGGAC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 8 158553 CASAVA_Build 3 20928747 11D CATTAGATTT GCCTATCTGAA/----------- GCTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 37 17 19 5 GCCTATCTGAA 1 0 158554 CASAVA_Build 3 20929583 1D CGTTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 T 13 12 158555 CASAVA_Build 3 20943930 1I CCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2575 het 1560 hom 19 6 8 5 A 16 17 158556 CASAVA_Build 3 20945813 1I GCAACTGCAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 8 9 158557 CASAVA_Build 3 20956051 1I AAATAAGACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 9 10 158558 CASAVA_Build 3 20956995 1D AATAAAAAAA C/- ATTCTCAGGT 3070 het 3070 hom 44 15 28 2 C 1 0 158559 CASAVA_Build 3 20968234 3I TTTTTCCTCT ---/ATC ATCTATCTAC 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 ATC 1 2 158560 CASAVA_Build 3 20977935 1I GTTGTCGTGG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 T 6 7 158561 CASAVA_Build 3 20986219 3I AAGGAAAGGA ---/GTT ATTGTTTTGT 2840 het 2840 ref 23 17 6 0 GTT 0 1 158562 CASAVA_Build 3 20992321 1D TCATTACCAT A/- ATGAATCTTT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 2 1 158563 CASAVA_Build 3 20995249 4I TAATATATAT ----/AGAG AGAGAGACAG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 AG 3 5 158564 CASAVA_Build 3 20998909 1D TATCATTTTG T/- TTTCCCTGTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 4 3 158565 CASAVA_Build 3 21002569 2D TTTGTTGATG AA/-- AAGAGTCAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 5 A 4 2 158566 CASAVA_Build 3 21019046 4I TTTCATAATA ----/TCTG TCTATCTAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TCTG 0 1 158567 CASAVA_Build 3 21019297 1D TAAATTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 9 8 158568 CASAVA_Build 3 21025023 2D TCAAGCCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 11 13 A 16 14 158569 CASAVA_Build 3 21027855 1D GGTTCTATTG T/- TTTTTACCTT 3070 het 3070 ref 38 23 12 4 T 6 5 158570 CASAVA_Build 3 21046030 1I GCTTTAGGTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 8 9 158571 CASAVA_Build 3 21056726 5D ATATATAGTT TATTC/----- TAAGCTCATT 3070 het 3070 ref 39 25 11 4 TATTC 1 0 158572 CASAVA_Build 3 21059662 1D ATTAAGAATT A/- AAGGAATAAA 2730 het 2730 ref 32 20 6 7 A 3 2 158573 CASAVA_Build 3 21060044 1D TGTATCTTGT G/- GCTGACCTCC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 G 2 1 158574 CASAVA_Build 3 21071420 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 9 8 158575 CASAVA_Build 3 21074414 1I TTCACTGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 A 10 11 158576 CASAVA_Build 3 21083969 2D TTAGACCAAA AG/-- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 50 28 19 5 AG 1 0 158577 CASAVA_Build 3 21084131 1D CTCCGTTGAA T/- TGCACCACCA 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 T 2 1 158578 CASAVA_Build 3 21087087 1I GAACCCCCCC -/A CCATAATTCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 1 158579 CASAVA_Build 3 21087254 1I ATTGGCTGTT -/A ACATTTCCAT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 1 2 158580 CASAVA_Build 3 21087380 1I TTTGGTGCCA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 8 158581 CASAVA_Build 3 21094074 1I GCACATGATA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 6 7 158582 CASAVA_Build 3 21096349 4I ACCTTGAAGA ----/TTAC TTACTGATCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTAC 1 2 158583 CASAVA_Build 3 21121535 1I TAGCAAGGTT -/G GGGATGTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 3 4 158584 CASAVA_Build 3 21142471 3I AGGATCACAT ---/CTC CTCGCCAGCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CTC 1 2 158585 CASAVA_Build 3 21144568 1I AAAACCCTTC -/A GAAAAATCAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 0 1 158586 CASAVA_Build 3 21158285 3D AATTTCAAAT ATC/--- ATCCATTTCT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 ATC 2 1 158587 CASAVA_Build 3 21164817 2I TATATATATG --/TA TATATATATC 516 hom 12 het 13 0 5 8 TA 4 5 158588 CASAVA_Build 3 21164909 1D TCTTGAGGAC T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 69 het 26 0 22 4 T 7 6 158589 CASAVA_Build 3 21167309 4D AAATACTAGT GATA/---- GATTTTACAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GATA 1 0 158590 CASAVA_Build 3 21182770 1D CTGAGATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 12 11 158591 CASAVA_Build 3 21194266 1I TTAATGATCC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 118 het 44 0 40 4 T 7 8 158592 CASAVA_Build 3 21212460 1D TTTTAAAGCG T/- TTTCCCCTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 4 3 158593 CASAVA_Build 3 21251899 1I ATTGCTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 A 10 11 158594 CASAVA_Build 3 21260941 2D TAGATGGGGT TG/-- TTTATTTTCT 2172 hom 15 het 8 0 6 2 TG 1 0 158595 CASAVA_Build 3 21265808 1D GTAAAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 11 10 158596 CASAVA_Build 3 21272897 2D TATTCCAAAA AT/-- GTTTTTTACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AT 1 0 158597 CASAVA_Build 3 21279036 2I AATTTCACTT --/AA GTCTTAATGG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 0 2 158598 CASAVA_Build 3 21302201 9D AATACAGCAA ATTGGTACC/--------- AGTAGAGTGG 3070 hom 108 het 40 0 37 6 ATTGGTACC 1 0 158599 CASAVA_Build 3 21314134 1D57M1I AAGGTAAAGG AAAAAAACCAATAATATTATATGAAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAAATCCCACCCATAC-/-AAAAAACCAATAATATTATATGAAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAAATCCCACCCATACA AAAAAATAAT 3070 hom 141 het 31 0 47 6 N/A 0 0 158600 CASAVA_Build 3 21316254 3I CTAGAAAACA ---/AAG AAGAACAAAC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 AAG 1 2 158601 CASAVA_Build 3 21345516 1D ATTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 A 12 11 158602 CASAVA_Build 3 21348131 2I TGAGATACCT --/CC CCTTGGATCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 2 4 158603 CASAVA_Build 3 21352195 1D CTGTAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 9 A 13 12 158604 CASAVA_Build 3 21356198 1I TTAGGTCTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 8 9 158605 CASAVA_Build 3 21356899 1D AAGAGCTAGA T/- TTTTTTTTAA 3062 het 3062 ref 37 23 8 7 T 9 8 158606 CASAVA_Build 3 21386329 1I CAGTAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 11 12 158607 CASAVA_Build 3 21408165 2I TAATAATTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2291 hom 28 6 10 12 T 12 14 158608 CASAVA_Build 3 21411440 1I GTTGCTATTA -/C AGGTGTGAGC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 C 0 1 158609 CASAVA_Build 3 21411682 1D TTAGGCTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 9 8 158610 CASAVA_Build 3 21418580 1D AATATAGACT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 A 8 7 158611 CASAVA_Build 3 21418809 1D ATCCCAGCTA T/- TCGAGAGGCT 2852 het 2798 hom 18 8 7 3 T 2 1 158612 CASAVA_Build 3 21423965 1D TATAAAAAAA T/- ATCACATGTA 3070 het 3070 ref 43 21 19 5 T 1 0 158613 CASAVA_Build 3 21424248 4I ATTCCCTCAT ----/AAAC AATCTGTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 AAAC 0 1 158614 CASAVA_Build 3 21424365 1D TTAAACAAAT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 8 7 158615 CASAVA_Build 3 21429214 4D ATCACTGGTG TCTT/---- TCTTTTACTA 3070 het 3070 ref 28 16 12 3 TCTT 2 1 158616 CASAVA_Build 3 21446020 1D CCTACTCATT A/- AATCTTTCAT 3070 het 3070 ref 48 27 19 3 A 3 2 158617 CASAVA_Build 3 21448765 3I AATCAATCTT ---/CTC ATCCTTCTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTC 0 1 158618 CASAVA_Build 3 21449287 1D TTTCCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 922 hom 25 2 18 5 A 13 12 158619 CASAVA_Build 3 21449481 2I TCATGACATA --/AT ATTTGATCCT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 AT 1 2 158620 CASAVA_Build 3 21461307 1D TTATCCAAAA T/- TTAGGCAATT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 3 2 158621 CASAVA_Build 3 21463304 1I AAACTTTTCT -/A TTGAGAGATG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 158622 CASAVA_Build 3 21463854 1I GGGCAGAATG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 A 8 9 158623 CASAVA_Build 3 21465360 1I AAACTGCCCC -/T AGCACCAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 T 0 1 158624 CASAVA_Build 3 21465589 1D TATATTTAAG A/- AAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 A 7 6 158625 CASAVA_Build 3 21470803 3I AGTAAAGGCC ---/TGT TGTTTGTATA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TGT 1 2 158626 CASAVA_Build 3 21475311 1I AATGCGGGGT -/A GGGGGGGCGG 3070 hom 38 het 18 0 16 2 A 0 1 158627 CASAVA_Build 3 21479721 1I AGCAAAAAAA -/T ATTCAATAGC 3070 hom 76 het 37 0 30 7 T 0 1 158628 CASAVA_Build 3 21490615 1I TGGAACAAAT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 0 1 158629 CASAVA_Build 3 21495647 1I AGAAGTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 939 hom 27 2 22 3 T 11 12 158630 CASAVA_Build 3 21503792 1I TTGTAGTGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 8 9 158631 CASAVA_Build 3 21504843 2D AGACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 AC 9 8 158632 CASAVA_Build 3 21507712 1D GATAAAGGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 11 10 7 T 10 9 158633 CASAVA_Build 3 21515087 1I TGGCCAAAAA -/G CATAGGAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 G 0 1 158634 CASAVA_Build 3 21517703 4D TGGAGACCCA CTCC/---- CTCTATCGCT 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 CTCC 1 0 158635 CASAVA_Build 3 21523459 4I TGGCATAATT ----/AGAG AGAGAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 AG 2 4 158636 CASAVA_Build 3 21533578 1D AAAAAAGCTT A/- AAATTTTATC 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 A 4 3 158637 CASAVA_Build 3 21563333 1D TATTCTCTAG C/- CCCCCCCGCT 3070 hom 87 het 31 0 27 4 C 8 7 158638 CASAVA_Build 3 21572045 1D GAATTCATCC T/- TTTTTATGGC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 6 5 158639 CASAVA_Build 3 21572565 6D TTTGTTTTTG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2686 het 972 hom 24 8 6 11 T 19 13 158640 CASAVA_Build 3 21574837 6I TCCCAGAGAT ------/TCTGTC TCTGGTACAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TCTGTC 0 1 158641 CASAVA_Build 3 21579334 1D ACTCTTTTTT A/- ACAACAGCTT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 2 1 158642 CASAVA_Build 3 21581032 1D GCAAAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 12 11 158643 CASAVA_Build 3 21582051 4I TTGATCTTAA ----/TTCT TTCTTTCATG 3070 hom 107 het 39 0 34 5 TTCT 1 2 158644 CASAVA_Build 3 21583607 4I TGAACACATG ----/TATT TATTTATCCA 3070 hom 123 het 49 0 41 8 TATT 1 2 158645 CASAVA_Build 3 21584691 2I ACAATAAATC --/AT ATTCACACGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AT 1 2 158646 CASAVA_Build 3 21590557 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2498 het 235 hom 15 1 9 5 A 15 16 158647 CASAVA_Build 3 21596272 24I TTCCTTGCCA ------------------------/TTCCTAGCTGCTAGTGTTTTGCCG GCCGTCTCTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TTCCTAGCTGCTAGTGTTTTGCCG 0 1 158648 CASAVA_Build 3 21597294 2D TGTTTGTGTC TA/-- TGTGTGTGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 TA 1 0 158649 CASAVA_Build 3 21600695 1D GGCTGGTCTC A/- AAGTCCTGAC 3070 hom 33 het 16 0 11 5 A 3 2 158650 CASAVA_Build 3 21604942 3I TGTGTAAAGA ---/CCT CCTGATTTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CCT 1 2 158651 CASAVA_Build 3 21608894 4I TTTGAATCAT ----/AAAC AAACAGCAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAAC 1 2 158652 CASAVA_Build 3 21617377 3I ATTTAAAAAT ---/AAA AATAAGTCAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 5 158653 CASAVA_Build 3 21646513 4D TATATTTTTC CTCA/---- CTATGTCCTC 3070 hom 54 het 22 0 19 4 CTCA 1 0 158654 CASAVA_Build 3 21652058 3D TTTGTTTGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 105 het 39 0 34 6 TTG 5 4 158655 CASAVA_Build 3 21655937 1D AATTTTTAAC A/- AAATTGGAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 4 3 158656 CASAVA_Build 3 21675106 4D TATTCCACTC TATT/---- CATTCATTCA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TATT 1 0 158657 CASAVA_Build 3 21693290 1D CCCATATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 33 0 29 4 T 11 10 158658 CASAVA_Build 3 21698324 1I AGGGAAAGAG -/A AGGCAAAGAT 3070 het 3070 hom 54 16 33 5 A 1 2 158659 CASAVA_Build 3 21706383 2D GAAAAATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 28 3 13 12 A 16 14 158660 CASAVA_Build 3 21709896 2D TAGTCCCACA CT/-- CTTTTATTCT 3070 het 3070 hom 56 24 24 8 CT 2 1 158661 CASAVA_Build 3 21714894 6D CTAAACAATG AACACA/------ AATACAAAGT 3070 het 3070 hom 45 19 21 7 AACACA 1 0 158662 CASAVA_Build 3 21717797 8D TGGCAAGAGA AAAATGAG/-------- AAAATGAGGA 3070 hom 74 het 26 0 23 5 AAAATGAG 2 1 158663 CASAVA_Build 3 21720161 3D ATCCTCTTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 7 10 A 13 10 158664 CASAVA_Build 3 21728600 1I ACAGCCCTTT -/C CCCTCGATGG 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 C 3 4 158665 CASAVA_Build 3 21730708 1I AGTGGGCCTT -/A CCGGCAGACC 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 A 0 1 158666 CASAVA_Build 3 21750782 1I ACACTCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 684 hom 27 2 18 7 T 10 11 158667 CASAVA_Build 3 21750857 2D AGATTTTTTT TG/-- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 TG 1 0 158668 CASAVA_Build 3 21758129 1D TTTTGCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 11 10 158669 CASAVA_Build 3 21761344 1D16M1D GACTTGGGTT AAAAAAAATAAAAAAAAT/-AAAAAAATAAAAAAAA- AATAATAAAA 3070 het 3070 hom 35 21 19 2 N/A 0 0 158670 CASAVA_Build 3 21766454 8I TTGCATCTTG --------/GATACATT GATACATTTC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 GATACATT 1 2 158671 CASAVA_Build 3 21778258 1D GGATTCTTCC T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 105 het 40 0 35 6 T 8 7 158672 CASAVA_Build 3 21780267 1I CTGTGAACAG -/T TAAGTCCATT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 T 1 2 158673 CASAVA_Build 3 21782140 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 8 21 5 A 10 11 158674 CASAVA_Build 3 21783875 1D TTACTCATTC T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 46 20 22 6 T 8 7 158675 CASAVA_Build 3 21785399 1D TTAAAGACTA G/- GAAAACTACT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 G 2 1 158676 CASAVA_Build 3 21788872 3I CCTAAAACTT ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AAC 4 5 158677 CASAVA_Build 3 21790258 1D TTAAAAAGTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 10 9 158678 CASAVA_Build 3 21790830 1I TGGGATTAAT -/A CCTAGGTGAT 3070 hom 105 het 39 0 34 5 A 0 1 158679 CASAVA_Build 3 21795864 4D TGGAAAGATA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 140 hom 30 3 13 14 AT 7 5 158680 CASAVA_Build 3 21798335 1D GTGAATCAAA T/- AATTGACCAC 3070 het 3070 hom 44 15 26 4 T 1 0 158681 CASAVA_Build 3 21802519 1I TACTTTACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 19 23 13 T 11 12 158682 CASAVA_Build 3 21803622 1I AGAATGGAGG -/A AAAAAACACC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 6 7 158683 CASAVA_Build 3 21806756 1D TTTTTTTCAA T/- TAAAAAAGTG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 2 1 158684 CASAVA_Build 3 21821276 1D GGTTAAGTAA T/- TTGTTCAAGA 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 T 3 2 158685 CASAVA_Build 3 21821358 7D ATATACTTTA CCACTAT/------- TATAAGAAAG 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 CCACTAT 1 0 158686 CASAVA_Build 3 21825879 1I AACTGAAAAC -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 A 6 7 158687 CASAVA_Build 3 21826651 1D AAATATTAAC A/- AATCAAATCT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 3 2 158688 CASAVA_Build 3 21829734 1D CCACAAAGAT G/- GGGAGAAACC 3070 het 3070 ref 29 21 8 0 G 4 3 158689 CASAVA_Build 3 21830196 2D TATGGGACTC TG/-- TGAAAAGACC 2190 het 939 hom 7 2 5 0 TG 2 1 158690 CASAVA_Build 3 21846127 1D GGTGAACTGT A/- AGGGGTCAAG 3070 het 3070 ref 57 32 17 9 A 2 1 158691 CASAVA_Build 3 21846618 1I ACACTCTGTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 8 9 158692 CASAVA_Build 3 21848586 3I ATAATTTGTT ---/CTC CACGTATTTC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTC 0 1 158693 CASAVA_Build 3 21851266 7I GGGAGATGAA -------/TGGATCT TGGATCTTGG 3070 hom 123 het 47 0 41 7 TGGATCT 1 2 158694 CASAVA_Build 3 21851714 1D AGAAGGAAAG A/- AAAAAACTAG 3070 het 3070 hom 46 10 13 23 A 7 6 158695 CASAVA_Build 3 21851749 1I GTTTGCTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 45 0 26 19 T 9 10 158696 CASAVA_Build 3 21852017 1I GATACTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 A 13 14 158697 CASAVA_Build 3 21852675 2D AGTCTTCTGA CT/-- CTTCAAAAAC 3070 hom 105 het 41 0 36 7 CT 2 1 158698 CASAVA_Build 3 21857075 1D TTTTGTTTTT A/- ATCCAACGTT 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 A 2 1 158699 CASAVA_Build 3 21857935 1I ATTTCATTTT -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 40 11 23 6 A 7 8 158700 CASAVA_Build 3 21866662 1I TAATAGATAT -/A AAAAATGTAT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 5 6 158701 CASAVA_Build 3 21867602 1I AAATTTTAAG -/A AAAACATAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 4 5 158702 CASAVA_Build 3 21869552 6D GTTCTCCATA CATTTC/------ CATTTCAAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 3 CATTTC 2 1 158703 CASAVA_Build 3 21870002 1D AAATTGCAGT C/- CTTTTTTTTT 2858 het 704 hom 34 7 15 12 C 2 1 158704 CASAVA_Build 3 21870691 1D TTCTCATCTT G/- GGCCGCTCCA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 G 3 2 158705 CASAVA_Build 3 21872361 1D TATCCTATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 10 9 158706 CASAVA_Build 3 21876367 1D GGCTCAGATC T/- TCCCGAAGAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 2 1 158707 CASAVA_Build 3 21876980 9I TATAAGCTGA ---------/TTATTACCC TTATTAATAC 3070 hom 107 het 42 0 37 5 TTATTACCC 0 1 158708 CASAVA_Build 3 21878790 1I ATATCTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 12 18 10 T 14 15 158709 CASAVA_Build 3 21884239 2D TAGGAAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 39 0 29 10 A 14 12 158710 CASAVA_Build 3 21890480 1D CCTGATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 43 0 25 18 T 11 10 158711 CASAVA_Build 3 21891750 1I TCTTTTTTTT -/A AACCTAATTT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 2 3 158712 CASAVA_Build 3 21892328 2D AGCACTACTC AA/-- AGAGTAGATC 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 A 3 1 158713 CASAVA_Build 3 21895034 3I CATGAAGTCC ---/TTT TTATTTTTCA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 5 158714 CASAVA_Build 3 21898918 1D ATTGAGATAT A/- AAACATTGTT 3070 het 3070 ref 31 21 7 3 A 4 3 158715 CASAVA_Build 3 21901407 1I TTATCTGCAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 8 9 158716 CASAVA_Build 3 21902855 11I GCTGTGATTA -----------/ATGGAGTAAAG ATGAGGAAGA 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 ATGGAGTAAAG 0 1 158717 CASAVA_Build 3 21911413 2D CTCATGGCAA AG/-- AGAGGACACA 3070 het 3070 hom 62 26 31 5 AG 3 2 158718 CASAVA_Build 3 21931566 1I GTAGAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 682 hom 28 2 23 3 A 10 11 158719 CASAVA_Build 3 21933929 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 7 8 158720 CASAVA_Build 3 21938655 1D ATGGAAAAAT A/- GTCCATGCTC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 1 0 158721 CASAVA_Build 3 21950434 1D68M1I AGGTACTTAG CAAAGTTGCCTGGTGCATTGTTGCCTCTCAATTAGTCACTATTATTTACATAGTAACTCACTGGTAATT-/-AAAGTTGCCTGGTGCATTGTTGCCTCTCAATTAGTCACTATTATTTACATAGTAACTCACTGGTAATTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 29 13 23 N/A 0 0 158722 CASAVA_Build 3 21952244 4I AGTAGATACA ----/ACAC ACACTGGACT 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 AC 2 4 158723 CASAVA_Build 3 21955975 1I ACTTGTTCAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 A 8 9 158724 CASAVA_Build 3 21958304 5I CTTTAATTTC -----/TTTTA TGTGTTATGG 2415 het 1358 hom 12 3 6 3 TTTTA 0 1 158725 CASAVA_Build 3 21961239 1I GAGAGAGGAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 7 8 158726 CASAVA_Build 3 21962962 1I TTTTTCTTTG -/T TTTCTCTAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 3 4 158727 CASAVA_Build 3 21963496 1D TGACCCTTCT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 41 17 14 11 A 9 8 158728 CASAVA_Build 3 21965181 2I TTGCCTTCTC --/TA TGTTTTCCAA 2466 het 2466 ref 26 15 6 5 TA 0 1 158729 CASAVA_Build 3 21967852 1I TTGTCTATTA -/T TTGGTGTATA 1687 het 1687 ref 16 9 4 3 T 2 3 158730 CASAVA_Build 3 21976954 1D TGGATGCAGT A/- AAAAACGGAT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 A 6 5 158731 CASAVA_Build 3 21980817 1I ATACAAATGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 A 9 10 158732 CASAVA_Build 3 21986298 1D CAGTGGTGGT G/- GGTGGCTTCA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 G 3 2 158733 CASAVA_Build 3 21989198 1I AGAAAAAAAC -/A AAAAAAGACC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 6 7 158734 CASAVA_Build 3 21999315 1I ATTGAAAGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 9 10 158735 CASAVA_Build 3 22011011 1I CCATTTTATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 9 10 158736 CASAVA_Build 3 22016801 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3038 hom 27 10 12 5 A 11 10 158737 CASAVA_Build 3 22017261 1I CTGAAAGAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 9 10 158738 CASAVA_Build 3 22017400 1I TTTAAGGGAG -/T TTTTTTTTTT 1005 het 1005 ref 30 18 3 9 T 11 12 158739 CASAVA_Build 3 22017831 1I CAAGCAGGAG -/T ATACTAGTAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 0 1 158740 CASAVA_Build 3 22018240 1I AGTCTCAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 9 10 158741 CASAVA_Build 3 22018617 1D ATAAAGACTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 A 9 8 158742 CASAVA_Build 3 22025250 4D TACACACACT GTGA/---- GTAACAAGGA 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 GTGA 1 0 158743 CASAVA_Build 3 22025473 1I GAAGAAAATT -/A ATAAAACAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 1 2 158744 CASAVA_Build 3 22026131 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2376 het 2376 ref 23 14 7 2 A 12 11 158745 CASAVA_Build 3 22034082 5D TTCCTTATTC TCTTT/----- TATCAATTTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TCTTT 1 0 158746 CASAVA_Build 3 22057670 1D TGATATTTTA C/- CCCTCTCTGG 3070 hom 107 het 42 0 36 6 C 4 3 158747 CASAVA_Build 3 22060590 1D TGGGAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 37 1 30 6 T 15 14 158748 CASAVA_Build 3 22074689 5D TGGCACCATC TAATT/----- TGATTTCTTG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TAATT 1 0 158749 CASAVA_Build 3 22088840 1D ACGGAAAAAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 50 1 42 7 A 9 8 158750 CASAVA_Build 3 22095782 1I TGATATATCT -/G GCTTTGTAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 G 1 2 158751 CASAVA_Build 3 22098619 1I GTCTGCAGCT -/G CCCAGAGTGA 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 G 0 1 158752 CASAVA_Build 3 22101674 1D CTAGAGAAGC A/- AGAGCGAACA 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 A 2 1 158753 CASAVA_Build 3 22110723 1I TCAAGTAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 9 10 158754 CASAVA_Build 3 22112352 2D TTAATTCAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2108 hom 19 5 11 3 AT 6 5 158755 CASAVA_Build 3 22112624 1I GGTAAAAAAA -/T ATATATATAC 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 T 0 1 158756 CASAVA_Build 3 22112825 1I GTTGAAACTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 7 8 158757 CASAVA_Build 3 22113598 6D ATGAATTGTC CATCTT/------ CAGCTAAGCA 3070 het 3070 ref 68 39 26 6 CATCTT 1 0 158758 CASAVA_Build 3 22116419 1I TCAAAAATGT -/C CAGGATTAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 2 158759 CASAVA_Build 3 22122420 5D TGAATTTATC TAATT/----- TAATAGTACA 3070 het 3070 hom 33 12 21 2 TAATT 1 0 158760 CASAVA_Build 3 22122898 1I CTGAAAGGAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 A 7 8 158761 CASAVA_Build 3 22136492 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 14 13 158762 CASAVA_Build 3 22136825 1I AGATGACACC -/T TTCCCACTGG 3070 het 3070 hom 53 24 21 8 T 2 3 158763 CASAVA_Build 3 22140992 1I TTTTTTGTGG -/A ACCTCTATAC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 1 2 158764 CASAVA_Build 3 22152883 1I GACTTTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2853 hom 21 9 8 4 A 13 14 158765 CASAVA_Build 3 22157772 1I ATATTTCATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 A 8 9 158766 CASAVA_Build 3 22180399 1D AAAAAGGATG A/- TGTGCTTACT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 1 0 158767 CASAVA_Build 3 22187610 1I CATTTATTAT -/G GAAAAAATAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 G 1 2 158768 CASAVA_Build 3 22191561 28D GTACTGTATG GGAAGATATCAGTCTAGTCCATTTCACA/---------------------------- GAAGGGGAGT 3070 het 3070 ref 33 20 14 4 GGAAGATATCAGTCTAGTCCATTTCACA 1 0 158769 CASAVA_Build 3 22191955 1I AAAAAATGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 9 10 158770 CASAVA_Build 3 22200883 2I TCATTTCAAC --/AT ATGTTTTATC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 1 2 158771 CASAVA_Build 3 22201701 1I AAGTAATAAA -/T TGTATAGATC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 1 2 158772 CASAVA_Build 3 22204951 1D GTGTATACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1368 hom 31 3 18 11 T 13 12 158773 CASAVA_Build 3 22208415 1I TATAAAAAAA -/T CAATGGTAAT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 0 1 158774 CASAVA_Build 3 22225214 1D AGTAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 10 9 158775 CASAVA_Build 3 22226260 2D AGAACAATCA TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 18 hom 36 1 17 18 T 10 8 158776 CASAVA_Build 3 22229776 4D CATATTCTTC TGTT/---- TTTGTTTTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TGTT 1 0 158777 CASAVA_Build 3 22236923 1D ATAGCAACAA T/- TACAAAGTAA 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 2 1 158778 CASAVA_Build 3 22242693 1I GATCCTATAT -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 6 7 158779 CASAVA_Build 3 22248818 2D TGATTACACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 39 4 17 18 T 12 10 158780 CASAVA_Build 3 22249675 3D GAAATCTATG TAT/--- TATTATAGCT 3070 het 3070 ref 22 12 9 3 TAT 3 2 158781 CASAVA_Build 3 22249824 1D ACAAAAGGGT A/- AGTACTATAT 3065 het 3065 ref 29 19 8 3 A 2 1 158782 CASAVA_Build 3 22253692 1D GTTAATATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 10 9 158783 CASAVA_Build 3 22265074 1D GAGGCAAGGC T/- TTTGGATTTT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 4 3 158784 CASAVA_Build 3 22266864 1I AATGACATAA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 45 het 23 0 16 7 T 6 7 158785 CASAVA_Build 3 22270332 4D AAAAATCCAG AAAC/---- AAACAAAACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AAAC 2 1 158786 CASAVA_Build 3 22271495 1I TGGCACACGA -/T TTCATCACAT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 T 2 3 158787 CASAVA_Build 3 22271767 1I ATCATGTATT -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 52 het 25 0 17 8 C 9 10 158788 CASAVA_Build 3 22272286 1I CTTAACTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 36 0 25 11 T 13 14 158789 CASAVA_Build 3 22275520 1D TGACATGTGG T/- AATTTTGTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 0 158790 CASAVA_Build 3 22281359 6D ATTCTCCCTC TTAGTA/------ TAAGACAAAG 3070 hom 150 het 54 0 50 8 TTAGTA 1 0 158791 CASAVA_Build 3 22287715 8I TAGTCAGGAG --------/ACAGCAAT ACAGCAATAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 ACAGCAAT 1 2 158792 CASAVA_Build 3 22288872 12D GAATTCTAAA TTAATTCTAAAT/------------ TTAATTCTAA 3070 hom 126 het 45 0 42 6 TTAATTCTAAAT 1 0 158793 CASAVA_Build 3 22291160 1D TTTTAGTAAA T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 8 T 6 5 158794 CASAVA_Build 3 22291982 5D CTTTTAAGAC ACTTT/----- ACTTGTGCTG 3070 hom 111 het 40 0 38 4 ACTTT 1 0 158795 CASAVA_Build 3 22296135 2D GTGTATATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TA 7 6 158796 CASAVA_Build 3 22300673 4D ACACAGGATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TTTG 4 3 158797 CASAVA_Build 3 22311973 1I AATAAAAAAA -/T GTTTGCAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 0 1 158798 CASAVA_Build 3 22325787 4I CTTGTAATTA ----/TTTG TTTATCTCTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TTTG 0 1 158799 CASAVA_Build 3 22342328 1I AAGAATCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 9 10 158800 CASAVA_Build 3 22345748 1D TTTGAAATAT C/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 C 1 0 158801 CASAVA_Build 3 22352564 6D ACTAAACTAC TGATCT/------ AGATTAAGTA 3070 het 3070 ref 33 20 10 5 TGATCT 1 0 158802 CASAVA_Build 3 22360082 2D TTTGGCCTTG GC/-- CATGTTCCTT 3070 het 3070 hom 49 20 22 9 GC 1 0 158803 CASAVA_Build 3 22366275 1I ACTTAGCATG -/A AAATGAAAGA 3070 het 3070 ref 50 20 20 10 A 3 4 158804 CASAVA_Build 3 22381077 1I TAGCTACTAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 49 24 23 2 A 8 9 158805 CASAVA_Build 3 22384093 1I AAAATCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 10 11 158806 CASAVA_Build 3 22387913 3I ATGTCAGATG ---/TTC TTCTCAGTCA 3070 het 3070 ref 62 29 25 8 TTC 1 2 158807 CASAVA_Build 3 22393275 1I27M1I AGATTTTGTG -AAAAAAAAATAAAAGAGGAAAAACAAG-/AAAAAAAAAATAAAAGAGGAAAAACAAGT TTGCAAGAAG 2646 het 2646 ref 30 24 6 9 N/A 0 0 158808 CASAVA_Build 3 22398902 3D TGAAGAGGAT GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 hom 48 het 17 0 13 4 GAG 4 3 158809 CASAVA_Build 3 22399410 1D TTTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 20 8 A 12 11 158810 CASAVA_Build 3 22403958 1I TCTAATCTAC -/A AAAAAACATG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 6 7 158811 CASAVA_Build 3 22415281 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 71 het 26 0 23 3 T 9 8 158812 CASAVA_Build 3 22418942 1I CTTGTTACAG -/A AAAAAAAAAA 1852 het 1852 ref 40 27 4 9 A 13 14 158813 CASAVA_Build 3 22420085 1I TTTCAGGGTT -/A AAATTGTAAA 3070 hom 52 het 22 0 18 4 A 3 4 158814 CASAVA_Build 3 22421684 1I ATTGATGGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 9 158815 CASAVA_Build 3 22421973 11D CAGGCAAAAT AAGACAGGAAA/----------- ACTCTTCTGT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 AAGACAGGAAA 1 0 158816 CASAVA_Build 3 22426862 4I TTTGGCTCTC ----/TGTT TGTCTATTAT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 TGTT 0 1 158817 CASAVA_Build 3 22428633 1I TTCTGTCTCA -/C TGAAATGTCT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 0 1 158818 CASAVA_Build 3 22433043 1D GATTTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 12 11 158819 CASAVA_Build 3 22438705 15I2M8I2M1I GTTTTAGGTG ---------------TG--------AT-/ATCACACCTAAAACATGTATTTAGTATC ACTAAATACA 3070 hom 72 het 24 0 25 4 N/A 0 0 158820 CASAVA_Build 3 22439992 2I TTATTTGCAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 6 7 158821 CASAVA_Build 3 22452441 1D TAATGGATGC T/- TTTTAGGTAG 3070 het 3070 ref 41 23 17 2 T 5 4 158822 CASAVA_Build 3 22466381 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1494 hom 20 7 10 3 A 11 12 158823 CASAVA_Build 3 22473560 1I TGCTTGTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 A 13 14 158824 CASAVA_Build 3 22487066 4I CTGTCTTGGG ----/GTCT GTCTGATTCC 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 GTCT 1 2 158825 CASAVA_Build 3 22489431 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 T 8 9 158826 CASAVA_Build 3 22493954 2D TTCACAAAGC AA/-- AATATTTTTA 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 A 4 2 158827 CASAVA_Build 3 22496001 1D GCACTGGGAC T/- TTACATCACT 3070 hom 126 het 45 0 42 4 T 3 2 158828 CASAVA_Build 3 22514888 1D CTTGAGATCA C/- TAAAGTACAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 C 1 0 158829 CASAVA_Build 3 22529067 2D AAGGGAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 A 14 12 158830 CASAVA_Build 3 22529179 1D GTGCCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 A 15 14 158831 CASAVA_Build 3 22531705 1D CATCCTTCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 10 9 158832 CASAVA_Build 3 22532961 1D CCAGCCTACA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 114 het 48 0 38 10 T 8 7 158833 CASAVA_Build 3 22535706 1I AACCACCCCC -/T GTACCCCCCA 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 T 0 1 158834 CASAVA_Build 3 22538123 1D TTTCAGATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 10 158835 CASAVA_Build 3 22539128 1D TTATATTTTT G/- TTAATTTTAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 1 0 158836 CASAVA_Build 3 22540066 4D ATTTATATAA ATTG/---- ATTGATTAGA 3070 hom 72 het 26 0 24 4 ATTG 2 1 158837 CASAVA_Build 3 22540877 2D ATATATTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 30 11 13 6 AT 7 6 158838 CASAVA_Build 3 22547369 1D AATTTTAATT A/- AAAAAATAAT 2687 het 2687 ref 19 10 6 3 A 7 6 158839 CASAVA_Build 3 22548090 1D GCTTCACCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2813 hom 16 8 7 1 A 10 9 158840 CASAVA_Build 3 22550166 1D ATAATGGATC A/- AAAAACACTA 2919 het 2919 ref 21 12 8 2 A 6 5 158841 CASAVA_Build 3 22556393 1I GGTCTGCTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 9 10 158842 CASAVA_Build 3 22560619 3D ATTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 23 0 20 3 T 14 11 158843 CASAVA_Build 3 22570499 1I TCTTGGTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2716 hom 25 6 11 8 T 9 10 158844 CASAVA_Build 3 22575553 2D TGAAGCATGC CT/-- GTATTGCTAC 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 CT 1 0 158845 CASAVA_Build 3 22575979 1D TTATTTACAG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 T 8 7 158846 CASAVA_Build 3 22576415 1D GTATGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 22 19 10 A 12 11 158847 CASAVA_Build 3 22577498 1I GTGTATTATG -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 7 8 158848 CASAVA_Build 3 22582871 1D TTTTAAGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 10 9 158849 CASAVA_Build 3 22586490 1D TTAATGGGCC T/- TTACGGGATC 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 3 2 158850 CASAVA_Build 3 22589269 1D TAATACCTTG T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 7 6 158851 CASAVA_Build 3 22599963 1I TGGGGTAGAA -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 6 7 158852 CASAVA_Build 3 22602493 1I ATATTTTGGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 8 9 158853 CASAVA_Build 3 22604698 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATAAATG 1663 het 1663 ref 18 9 5 4 TA 3 4 158854 CASAVA_Build 3 22608510 3D CACTCCCCTT CTC/--- CTCTTGCAAA 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 CTC 2 1 158855 CASAVA_Build 3 22609381 1I CTCAAATCAA -/G GTATCTCCAG 3070 het 3070 hom 47 23 20 4 G 1 2 158856 CASAVA_Build 3 22616621 1I CACACCTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 10 11 158857 CASAVA_Build 3 22618896 4D TCTTAAATAG ATCT/---- ATTATGAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 ATCT 1 0 158858 CASAVA_Build 3 22625890 3I ATGATAAATG ---/TCT TCTTCTATTG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 TCT 2 3 158859 CASAVA_Build 3 22627213 1D TATTTTGTTT C/- CCCCCCCATT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 8 7 158860 CASAVA_Build 3 22645225 1I TCTAACATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 40 2 32 6 T 10 11 158861 CASAVA_Build 3 22653498 2I GAACATACAC --/AT ATGTCTTTAT 1562 hom 10 het 11 0 4 7 AT 1 2 158862 CASAVA_Build 3 22682755 1I AGCTTTAGTC -/A AAAAATTCAG 3070 hom 134 het 47 0 44 3 A 5 6 158863 CASAVA_Build 3 22682910 1I AGCCTTACAA -/G GTGATTGCCT 3070 hom 150 het 56 0 49 7 G 1 2 158864 CASAVA_Build 3 22685339 1I CCCTCTCTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 9 158865 CASAVA_Build 3 22689582 2D AAACTGCTAT AA/-- AAAAAAGTCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 8 6 158866 CASAVA_Build 3 22689832 1D GCACCTCCCC T/- CTCTCTTCCT 3070 hom 83 het 32 0 28 4 T 1 0 158867 CASAVA_Build 3 22690298 2D GCTACTCCTA CT/-- CTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 9 CT 2 1 158868 CASAVA_Build 3 22690796 1D ACCTCATCCT C/- CCCCTTTTAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 5 4 158869 CASAVA_Build 3 22691024 2I CATTAACATC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 11 158870 CASAVA_Build 3 22691296 1I CCTTTGTATG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 211 hom 33 2 28 3 T 8 9 158871 CASAVA_Build 3 22693758 1D GATGAGGGAT A/- GGGGTGGGGT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 1 0 158872 CASAVA_Build 3 22693901 1D TATAAAGGTG C/- TTTTTTGTGT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 C 1 0 158873 CASAVA_Build 3 22696874 3D ATTACACGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 4 A 17 14 158874 CASAVA_Build 3 22698372 1D TTAGAGATGC T/- TTAAAAAAGG 3070 het 149 hom 34 1 30 3 T 3 2 158875 CASAVA_Build 3 22698642 1D GTCATTAGTG C/- CATGAATATT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 2 1 158876 CASAVA_Build 3 22702897 4I CACTGATTCA ----/AAAC AAACAAACAG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 AAAC 2 3 158877 CASAVA_Build 3 22706683 2D AAAAAAGTTG AC/-- ACACACACAC 1802 hom 18 het 8 0 7 4 AC 10 9 158878 CASAVA_Build 3 22714181 2D AAAAAAAAAA CC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 17 2 12 3 C 2 0 158879 CASAVA_Build 3 22719625 1I GAAATAGAAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 7 8 158880 CASAVA_Build 3 22760633 2I TGACCAGCTG --/AA AAGAGATTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 2 4 158881 CASAVA_Build 3 22763204 1I TCTTGTGAAT -/A AATTTTGTGG 3070 hom 144 het 54 0 49 5 A 2 3 158882 CASAVA_Build 3 22767955 1D AAATGTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1406 hom 31 5 21 5 A 13 12 158883 CASAVA_Build 3 22797251 1I AAAGATTGTG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 576 hom 42 2 34 6 A 0 1 158884 CASAVA_Build 3 22801356 1I AAAAAAAAAA -/C ACACCTATAC 3070 het 1442 hom 43 4 33 6 C 0 1 158885 CASAVA_Build 3 22823892 2D ATAAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 15 5 A 14 12 158886 CASAVA_Build 3 22854197 4D CCCTGAATAC TTCT/---- TTCTTTATCT 3070 hom 102 het 40 0 34 7 TTCT 2 1 158887 CASAVA_Build 3 22880425 1D TAAAACAGAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 9 8 158888 CASAVA_Build 3 22900590 1I GTTTTAACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 758 hom 36 2 30 4 A 9 10 158889 CASAVA_Build 3 22901589 1D CTCTGCAAAA T/- CTCAGAGATA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 1 0 158890 CASAVA_Build 3 22904435 1I TTTTGCTCAA -/T TAACCTGAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 2 158891 CASAVA_Build 3 22912416 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 710 hom 38 2 30 6 A 10 11 158892 CASAVA_Build 3 22921350 1D GTTTTGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 A 11 10 158893 CASAVA_Build 3 22940482 5I AAAAACAAAC -----/AAACA AAACACAACT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAACA 1 2 158894 CASAVA_Build 3 22942615 1I CATGAAAGTG -/A AAAATTCTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 4 5 158895 CASAVA_Build 3 22983626 1D AACATAAGTT A/- GAGCCAGTCA 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 A 1 0 158896 CASAVA_Build 3 22988774 1I TACAACAATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 9 10 158897 CASAVA_Build 3 22989227 2D AAAATCCTCT AC/-- ATTGTTTTCC 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 AC 1 0 158898 CASAVA_Build 3 23000487 1I TCATTATAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 A 9 10 158899 CASAVA_Build 3 23008850 1D GTTTTCTTAC A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 8 7 158900 CASAVA_Build 3 23012659 17D CATTTCTATT AAAGCATTATGTGAAAA/----------------- AAAGCATTAT 3070 het 3070 ref 39 11 11 21 AAAGCATTATGTGAAAA 2 1 158901 CASAVA_Build 3 23030330 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 28 2 19 7 A 12 11 158902 CASAVA_Build 3 23034942 5D TCTCATAATC TAAGA/----- TAAGGGCAAT 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 TAAGA 1 0 158903 CASAVA_Build 3 23040534 1I AGAGGACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3047 hom 34 8 17 9 A 10 11 158904 CASAVA_Build 3 23046845 3D ACTCAAACTA CAC/--- CATTTTTACT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 CAC 1 0 158905 CASAVA_Build 3 23068989 1D AGTCCCTAAA C/- CCATTTCTGG 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 C 3 2 158906 CASAVA_Build 3 23072255 1I GGGTCATAGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 7 8 158907 CASAVA_Build 3 23073011 1I ATATTTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 C 0 1 158908 CASAVA_Build 3 23103392 1D CTCCGTTAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 10 9 158909 CASAVA_Build 3 23103923 1I TTGTCATTTA -/G CATTAGGTAT 2438 hom 12 het 6 0 5 1 G 0 1 158910 CASAVA_Build 3 23111983 4I AAAAGGAAGC ----/CAAA CAGTTTGAAA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 CAAA 0 1 158911 CASAVA_Build 3 23113350 1D GGAGTACAAT G/- GGTGTGATCT 2760 het 2760 ref 16 8 7 1 G 3 2 158912 CASAVA_Build 3 23115266 1D TTTTTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 27 1 24 2 A 11 10 158913 CASAVA_Build 3 23115504 1I AAAGATCAAA -/G TTTAGAGCAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 G 0 1 158914 CASAVA_Build 3 23116880 2I GAGCAGGACT --/GA GAGAGAGGGG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 GA 3 4 158915 CASAVA_Build 3 23122851 12I AAGGAGACTG ------------/AGCTGGGTTTAA AGCCACATAG 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 AGCTGGGTTTAA 0 1 158916 CASAVA_Build 3 23126241 1I AAACAATTAA -/T AAAGACAAGA 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 T 0 1 158917 CASAVA_Build 3 23144204 13D ATACTCGTAA TCCTATGAAGTAG/------------- TATTCTGTAA 3070 het 3070 ref 47 31 18 5 TCCTATGAAGTAG 1 0 158918 CASAVA_Build 3 23146890 32D GGAATGGAAA CATTGGAATCAAGTCAAACAGACTATATACTC/-------------------------------- CAATAATAAA 3070 het 3070 ref 42 37 12 4 CATTGGAATCAAGTCAAACAGACTATATACTC 1 0 158919 CASAVA_Build 3 23149018 1D ATTTGTTTTC T/- TTTTTTAGCA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 7 6 158920 CASAVA_Build 3 23151146 8I GAATCAGAAA --------/TCTGAAGT TAAATGGCTC 3070 hom 46 het 37 0 17 20 TCTGAAGT 0 1 158921 CASAVA_Build 3 23161516 1I AGTATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 11 12 158922 CASAVA_Build 3 23162439 1D ATTCCTTTTT A/- TTGCAGAGAG 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 A 1 0 158923 CASAVA_Build 3 23163625 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 6 7 158924 CASAVA_Build 3 23166238 1D AATTGAAAAC T/- TATGTCTACA 3070 het 3070 ref 40 21 11 10 T 2 1 158925 CASAVA_Build 3 23166987 31D AGATACAACT TAGGTAAATTGTAAGGAAATTGTAAAGGTAG/------------------------------- GTTGTAAGGA 3070 het 3070 ref 24 18 12 2 TAGGTAAATTGTAAGGAAATTGTAAAGGTAG 1 0 158926 CASAVA_Build 3 23168198 3D GATTACCTAA CAT/--- CATTATTCAC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 CAT 2 1 158927 CASAVA_Build 3 23168394 1D CATGGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 38 0 26 12 A 11 10 158928 CASAVA_Build 3 23171725 1I AGCCAACTGA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 37 17 19 1 T 7 8 158929 CASAVA_Build 3 23176467 1D CCCCGGTTTG T/- TTTAAATCTA 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 T 4 3 158930 CASAVA_Build 3 23177850 2D ATAAAGGAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 58 32 20 7 AC 8 7 158931 CASAVA_Build 3 23180875 1I CCTTTTCTAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 8 9 158932 CASAVA_Build 3 23181433 12D CCTGCCTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 het 2125 hom 26 8 14 9 A 23 11 158933 CASAVA_Build 3 23182110 1D GGGTCATGTT G/- AGTTTGAGTA 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 G 1 0 158934 CASAVA_Build 3 23184157 1D AAATAGAGAT G/- AAAGGAAAAC 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 G 1 0 158935 CASAVA_Build 3 23184608 2D GCACAGACAC TG/-- TGTCATCAGG 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 TG 2 1 158936 CASAVA_Build 3 23185774 1D TAAGTAGGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 9 8 158937 CASAVA_Build 3 23187213 6I4M1I GTTTAATGGA ------CACA-/CAGTTCCACAT GGCTGGGGAG 3070 hom 75 het 27 0 26 3 N/A 0 0 158938 CASAVA_Build 3 23189786 1I AATAAAAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 9 10 158939 CASAVA_Build 3 23193224 1I TTATGTACTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 7 8 158940 CASAVA_Build 3 23199636 1D TGGGGGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 A 12 11 158941 CASAVA_Build 3 23207610 2I CATAGGTGAC --/AG AGCAGACATG 3070 hom 116 het 43 0 39 4 AG 1 2 158942 CASAVA_Build 3 23213216 1D AAATTGTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 11 10 158943 CASAVA_Build 3 23213834 2I ATGTAAATAA --/AT ATGTTTTATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AT 1 2 158944 CASAVA_Build 3 23222804 1D TGAAAAAAAA T/- ATTAAATCCA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 1 0 158945 CASAVA_Build 3 23223924 1D GAATGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 13 12 158946 CASAVA_Build 3 23229110 2I TGGTTTCAGA --/CT CTAAATTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CT 1 2 158947 CASAVA_Build 3 23239336 3I AACAACAGTG ---/TAC TACGAGCCTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TAC 1 2 158948 CASAVA_Build 3 23241042 1D GTTCTAACAG C/- TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 39 1 33 6 C 1 0 158949 CASAVA_Build 3 23241532 7I TGCATTATTC -------/TGATGGA TGATGGATGA 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 TGATGGA 2 3 158950 CASAVA_Build 3 23241738 1D ATTCTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 45 1 33 11 T 13 12 158951 CASAVA_Build 3 23242042 1D CCATTCGTTG A/- AAAGACTATT 3070 het 3070 hom 41 13 22 7 A 4 3 158952 CASAVA_Build 3 23242369 1D GAAGAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2937 hom 29 8 13 8 T 12 11 158953 CASAVA_Build 3 23245476 2D GTATCGACCA TT/-- TTTCCTCCAC 3070 hom 120 het 44 0 39 6 T 5 3 158954 CASAVA_Build 3 23247288 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1299 het 1299 ref 23 11 5 7 A 17 16 158955 CASAVA_Build 3 23260244 1D ATAGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 22 10 T 13 12 158956 CASAVA_Build 3 23260631 1I TTTCATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 782 hom 32 3 25 4 A 11 12 158957 CASAVA_Build 3 23266149 1I TTAACTCAGA -/T TTTTTTTTTT 2559 het 2559 ref 21 9 6 6 T 13 14 158958 CASAVA_Build 3 23271398 1D TCTTTAAGGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 T 9 8 158959 CASAVA_Build 3 23272968 4D AATTTTTGAC AAAA/---- AAAACTGTAG 3070 hom 90 het 32 0 31 5 A 8 4 158960 CASAVA_Build 3 23280754 5I AGAGAAAGAA -----/CATTT CATTTTACTG 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 CATTT 1 2 158961 CASAVA_Build 3 23293342 6D AACAAAGATT GACAAA/------ GACAAAGTTG 3070 het 3070 ref 31 20 9 4 GACAAA 2 1 158962 CASAVA_Build 3 23293452 3D ATTCTTTAAA AAC/--- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 AAC 1 0 158963 CASAVA_Build 3 23297697 4D CAGAGGTAAC ACTT/---- ACGTTAGTGA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 ACTT 1 0 158964 CASAVA_Build 3 23301417 1D ATCTTATTCA T/- TTTTTTTTCA 2344 het 2344 ref 15 10 5 1 T 9 8 158965 CASAVA_Build 3 23345158 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2997 het 2997 ref 43 15 11 17 T 13 14 158966 CASAVA_Build 3 23348613 5I GTATATTTTG -----/TATAT TATATTCAGT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TATAT 1 2 158967 CASAVA_Build 3 23359596 2I TATTAGTATG --/TA TATATATATA 3070 het 496 hom 42 2 31 9 TA 5 6 158968 CASAVA_Build 3 23361167 4D TGGGCAACAT AGTG/---- AGACAAACCT 1890 het 1890 ref 21 10 4 7 AGTG 1 0 158969 CASAVA_Build 3 23365324 1I AACCCACAGA -/C CTTTTGGAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 2 158970 CASAVA_Build 3 23377876 2D ATGCACACAC AT/-- GTTTATAGTA 3070 hom 93 het 37 0 32 7 AT 1 0 158971 CASAVA_Build 3 23379435 6D AACAGTGAAA ACAGGC/------ TTTTCAGCAA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 ACAGGC 1 0 158972 CASAVA_Build 3 23389809 2D TAATGAGACA CT/-- CACTGTCCTG 3070 het 3070 ref 55 24 25 6 CT 1 0 158973 CASAVA_Build 3 23395753 6D TTTTTTTTTA TTATAC/------ TTTAAGTTTT 2599 hom 15 het 7 0 6 1 TTATAC 1 0 158974 CASAVA_Build 3 23396712 1D CTTCTTTATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 10 9 158975 CASAVA_Build 3 23397919 1I TTAGTTTATG -/C AAGTGTCTCA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 C 0 1 158976 CASAVA_Build 3 23405338 2D CGTCTCTACT AA/-- AAATACAAAA 3070 het 854 hom 11 2 8 1 A 5 3 158977 CASAVA_Build 3 23409659 1I ATGATAGCTT -/G GGACTAAGGT 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 G 2 3 158978 CASAVA_Build 3 23425498 10D ATCCAAAGCA GATTATTAAT/---------- GATTATTACA 3070 het 3070 ref 34 24 13 3 GATTATTAAT 1 0 158979 CASAVA_Build 3 23426292 1D CTTGCCTCTT C/- CTGTCTTCTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 C 2 1 158980 CASAVA_Build 3 23429704 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 9 10 158981 CASAVA_Build 3 23438135 1D ACTCCTGACC T/- CATGACCCGC 912 het 912 ref 12 5 2 5 T 1 0 158982 CASAVA_Build 3 23439028 1I ATAGATTATC -/T TTTTCTGTCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 4 5 158983 CASAVA_Build 3 23445610 2D AGTAGGCCTT AC/-- ATATATATTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 AC 1 0 158984 CASAVA_Build 3 23450147 1I TCTTTATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 T 11 12 158985 CASAVA_Build 3 23452685 1D GGTTAGATCA T/- TCAAGGCCTT 3070 het 3070 ref 50 19 21 10 T 2 1 158986 CASAVA_Build 3 23456914 1D TCTTATCTTC T/- TTATATAGAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 3 2 158987 CASAVA_Build 3 23458312 1I AAATATATCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 8 9 158988 CASAVA_Build 3 23469324 4I CTATGATCTA ----/ACAG ACAGAGTTAG 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 ACAG 1 2 158989 CASAVA_Build 3 23469843 1I TTTGTTTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 9 10 158990 CASAVA_Build 3 23483890 2D TGCTAGAAAC AA/-- TGTGAATTTT 3070 het 3070 ref 46 25 20 5 A 2 0 158991 CASAVA_Build 3 23487317 1D AAATATATAT A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 1 0 158992 CASAVA_Build 3 23506499 1I TGGAAAAGGG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 7 8 158993 CASAVA_Build 3 23508451 2D AGGAGAAAAA AG/-- AGGCATGGTC 3070 het 3070 hom 40 11 21 9 AG 2 1 158994 CASAVA_Build 3 23512420 3D TCCTTTTTTA AAC/--- AAGAGAAATC 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 AAC 1 0 158995 CASAVA_Build 3 23518730 1D TCTTTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 27 1 20 6 T 13 12 158996 CASAVA_Build 3 23521574 2D CTAATTTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 1856 het 1856 ref 27 11 9 8 T 11 9 158997 CASAVA_Build 3 23534734 2D GTCAGAAATC AT/-- AGAGTGGTAG 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 AT 1 0 158998 CASAVA_Build 3 23541102 1I GATCATGGAA -/C CTAGAATAAG 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 C 1 2 158999 CASAVA_Build 3 23543104 2I GATGGCAGGA --/CC CCCCCAAAGA 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 C 5 7 159000 CASAVA_Build 3 23548557 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2213 het 1266 hom 23 6 7 10 A 15 16 159001 CASAVA_Build 3 23551170 1I TTTTGCTTAA -/T TGGACTTATT 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 T 1 2 159002 CASAVA_Build 3 23554606 1D GCAGGACTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 13 4 A 10 9 159003 CASAVA_Build 3 23560043 1D AAACACTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 29 2 22 5 A 13 12 159004 CASAVA_Build 3 23569591 6D AAAATGAGAG AGAAAT/------ AGAAATTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 AGAAAT 2 1 159005 CASAVA_Build 3 23575060 2D TTTCTGAAAT AA/-- AGACTCTCTT 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 A 3 1 159006 CASAVA_Build 3 23585545 1I TGCAGCATTA -/T TTTGTAATAG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 3 4 159007 CASAVA_Build 3 23593417 1I GTTGTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 12 13 159008 CASAVA_Build 3 23593826 2D GGAATGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2199 hom 27 7 12 8 A 14 12 159009 CASAVA_Build 3 23601702 1I CGTCTCTACC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 A 8 9 159010 CASAVA_Build 3 23602400 1I TGATAACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 17 11 18 T 12 13 159011 CASAVA_Build 3 23603403 2D AATTAATCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 32 1 13 19 T 13 11 159012 CASAVA_Build 3 23605923 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2003 het 2003 ref 27 10 6 11 A 13 12 159013 CASAVA_Build 3 23612501 3I GTCAGAGTGC ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TAT 4 5 159014 CASAVA_Build 3 23613849 1D CTAAAAATGC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 9 8 159015 CASAVA_Build 3 23614340 1D ACTATTAATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 14 12 4 A 9 8 159016 CASAVA_Build 3 23626111 1D TTGTGTTAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 T 10 9 159017 CASAVA_Build 3 23628583 1I CCCAAAGGTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 8 9 159018 CASAVA_Build 3 23640277 2D AGACCCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 1575 het 1575 ref 28 15 6 7 A 18 16 159019 CASAVA_Build 3 23644975 1D GTACAGCTTG T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 44 24 14 7 T 8 7 159020 CASAVA_Build 3 23656089 2I GGACTACAGA --/TG TGTGCACCAC 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 TG 2 3 159021 CASAVA_Build 3 23657639 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 A 10 9 159022 CASAVA_Build 3 23666895 5D CATGGCTTCA CCTCT/----- CCTTCCTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 19 2 CCTCT 1 0 159023 CASAVA_Build 3 23667919 3D CCATCTCTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2525 hom 19 9 8 2 A 14 11 159024 CASAVA_Build 3 23680204 1D TTACCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1324 het 1324 ref 33 16 3 14 A 15 14 159025 CASAVA_Build 3 23680951 1I CTTCCTACTC -/T TGTAAGAGCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 159026 CASAVA_Build 3 23730406 1I ATATCTGCTC -/T TATGTGTCTC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 1 2 159027 CASAVA_Build 3 23747264 1D ATCTCAAAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 27 0 23 6 A 10 9 159028 CASAVA_Build 3 23747845 1D TGGCATGTGG C/- CACATCTCTT 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 C 2 1 159029 CASAVA_Build 3 23757981 8I CCCTCAACTT --------/GTAAGTAG GTTTTACTGA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 GTAAGTAG 0 1 159030 CASAVA_Build 3 23759172 1D AAACAGCGGA G/- TAACTGAGTG 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 G 1 0 159031 CASAVA_Build 3 23760522 1D GGGGAAGGAT G/- GTGCCTGGGC 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 G 2 1 159032 CASAVA_Build 3 23761868 1D TCTACTAAAA T/- TTAAAAAAAA 3059 het 2802 hom 16 8 7 1 T 3 2 159033 CASAVA_Build 3 23762034 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 1483 het 61 hom 14 1 5 9 A 17 16 159034 CASAVA_Build 3 23766236 1D GTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 11 10 159035 CASAVA_Build 3 23772420 1D GCTTCCAAGC A/- AAAAAATCCC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 7 6 159036 CASAVA_Build 3 23780034 1I TTGAAGCATG -/A AAAAATAAAA 3070 hom 59 het 24 0 20 4 A 5 6 159037 CASAVA_Build 3 23785366 1I GTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 8 9 159038 CASAVA_Build 3 23787291 2I CATAAAATCA --/TT TTTTTTTTGG 2876 het 2876 ref 22 15 6 1 T 8 10 159039 CASAVA_Build 3 23808132 1D TAAAACTGCA T/- TTTATAACTC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 4 3 159040 CASAVA_Build 3 23845820 1D AAAGTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 2197 het 4 hom 13 0 9 4 T 15 14 159041 CASAVA_Build 3 23852100 4D9M1D TATACTTTTA AAGTAATGTATACG/----AATGTATAC- TTTTAAAATT 354 het 354 ref 26 10 2 18 N/A 0 0 159042 CASAVA_Build 3 23855372 1D TTGGGTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 23 1 17 5 T 13 12 159043 CASAVA_Build 3 23860231 1I GTTTGGACAA -/T TGACAATCCA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 1 2 159044 CASAVA_Build 3 23864965 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 249 hom 28 1 20 7 A 13 12 159045 CASAVA_Build 3 23867010 1D ACTCCTCTTT A/- TTATTATTAT 1390 hom 15 het 21 0 5 16 A 1 0 159046 CASAVA_Build 3 23883165 3D GAGTTGTCAC ATT/--- ATTATCGAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 7 ATT 2 1 159047 CASAVA_Build 3 23885847 12D TATGGTATCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 6 T 24 12 159048 CASAVA_Build 3 23887178 6I TCTTTTTTTA ------/TTTTAT TTTTATTTTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TTTTAT 1 2 159049 CASAVA_Build 3 23887318 1I AGGACCCTGC -/G GGCCTTCCGC 1211 hom 10 het 4 0 4 0 G 2 3 159050 CASAVA_Build 3 23889946 1I AGCAGCAAAA -/T TGTCAGAATT 3070 hom 118 het 47 0 39 8 T 1 2 159051 CASAVA_Build 3 23896841 1D TGGCACCACT G/- CACTCTAGCC 3070 hom 57 het 20 0 19 3 G 1 0 159052 CASAVA_Build 3 23900730 2I CAAACAGATT --/AC AGAGAGATAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AC 0 1 159053 CASAVA_Build 3 23921491 1D TGAATCTTTT A/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 1 0 159054 CASAVA_Build 3 23926360 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 28 1 19 8 T 13 12 159055 CASAVA_Build 3 23930667 1D ACTTGAGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 30 0 18 12 A 15 14 159056 CASAVA_Build 3 23939716 1D AGGAACTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 35 5 15 15 T 17 16 159057 CASAVA_Build 3 23946959 1D TAAATAAGCC G/- CCAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 1 0 159058 CASAVA_Build 3 23947562 1D TAATGAAGTT G/- TAAGATGGTG 3070 hom 144 het 51 0 49 2 G 1 0 159059 CASAVA_Build 3 23950145 1D TACTCCCCAC T/- TTTTTTTTGG 950 het 950 ref 51 38 3 10 T 9 8 159060 CASAVA_Build 3 23951329 1I TGCTCTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 36 2 29 5 A 11 12 159061 CASAVA_Build 3 23951707 1I TATTATTGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 405 hom 29 1 25 3 A 9 10 159062 CASAVA_Build 3 23951875 2I CTGATTAGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 19 1 14 4 A 12 14 159063 CASAVA_Build 3 23953411 2D GTGACCACAC TT/-- TTTGAGAATT 3070 hom 45 het 18 0 15 4 T 5 3 159064 CASAVA_Build 3 23953685 1D ACCAGCCTGG C/- CAATGTGGCG 3070 hom 75 het 26 0 26 5 C 2 1 159065 CASAVA_Build 3 23956842 1I ACCTGTTTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 9 10 159066 CASAVA_Build 3 23957217 4D AAAATTAAGT ACAG/---- ACAAAGTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ACAG 1 0 159067 CASAVA_Build 3 23958077 1I CAGGATTAAT -/A AAATGAGGCT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 3 4 159068 CASAVA_Build 3 23958478 9D TTATTTATTT ATTTATTTA/--------- TTTTTGAGAC 3070 hom 45 het 18 0 16 5 ATTTATTTA 1 0 159069 CASAVA_Build 3 23981910 1D ATTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 730 het 730 ref 25 16 3 7 T 13 12 159070 CASAVA_Build 3 23988201 5I54M2I AGTTTTTGAC -----CTTATACATAATGTCTTTTGGATAGTTTAGATAGAATCTCTTAATTGTTCAAAG--/CTTTACTTATACATAATGTCTTTTGGATAGTTTAGATAGAATCTCTTAATTGTTCAAAGAC ACAGTTTTTT 3070 hom 36 het 19 0 13 20 N/A 0 0 159071 CASAVA_Build 3 23993508 1I TGATCAAATG -/T TTTTATGTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 4 5 159072 CASAVA_Build 3 23997257 2D TATGTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 42 0 35 8 TG 6 5 159073 CASAVA_Build 3 24001481 1I AATAAACCTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 8 9 159074 CASAVA_Build 3 24026997 1D TGCTGCACTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 A 9 8 159075 CASAVA_Build 3 24086548 2D AAAAGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1344 het 1344 ref 46 35 3 8 GT 7 6 159076 CASAVA_Build 3 24094055 2D TCTGTTTTGA TG/-- TGTTTCCAGG 3070 het 3070 ref 29 18 9 4 TG 2 1 159077 CASAVA_Build 3 24115767 1I CTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 916 het 916 ref 29 13 4 12 T 12 13 159078 CASAVA_Build 3 24118353 1D GTTCAAACAC T/- TTTTTTTTTT 2127 het 2127 ref 31 13 8 10 T 15 14 159079 CASAVA_Build 3 24122817 1I GCTGAGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 39 1 28 10 A 10 11 159080 CASAVA_Build 3 24172402 1D TAACCCTCCA G/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 41 19 19 4 G 1 0 159081 CASAVA_Build 3 24196611 13D TTACTTACAC AGTTTTGACCTTT/------------- AGTTTTGACC 3070 hom 84 het 35 0 29 8 AGTTTTGACCTTT 2 1 159082 CASAVA_Build 3 24198724 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 8 9 159083 CASAVA_Build 3 24210845 1D AGAAGTAATA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 5 T 9 8 159084 CASAVA_Build 3 24240390 1I TGTGTGTGTG -/T GGGGGGGTAT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 0 1 159085 CASAVA_Build 3 24260400 4D TGCTGAATGG AGGA/---- AGGGAGGCCC 3070 hom 96 het 36 0 32 7 AGGA 1 0 159086 CASAVA_Build 3 24261761 1I TGGCAAGGGG -/A AAGAGTTAGA 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 A 2 3 159087 CASAVA_Build 3 24262602 3D CTTACGGAGA TGT/--- TGTAGGAATT 3070 het 3070 ref 63 32 24 12 TGT 2 1 159088 CASAVA_Build 3 24266243 1I GTCTGCTCTA -/T TAAGGAGTGG 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 1 2 159089 CASAVA_Build 3 24272787 1D TTAGTGGAAG A/- GGGCCTGAAG 3070 het 3070 hom 58 24 29 5 A 1 0 159090 CASAVA_Build 3 24281057 43D AATCACTTAG ACTGTCCTAAGTGATTTTTCATATATTATCTCATTTAGTTTAC/------------------------------------------- GACAGTGGTT 3070 hom 84 het 25 0 29 2 ACTGTCCTAAGTGATTTTTCATATATTATCTCATTTAGTTTAC 1 0 159091 CASAVA_Build 3 24281291 1D ATCTTGTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 A 13 12 159092 CASAVA_Build 3 24281802 1I CTTTGAACTC -/T TGAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 1 2 159093 CASAVA_Build 3 24285387 6D AGTGACATCT TAAAAA/------ TAAAAAGAAA 2708 het 2708 ref 19 7 6 8 TAAAAA 2 1 159094 CASAVA_Build 3 24286095 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2279 het 1029 hom 26 7 10 9 T 17 16 159095 CASAVA_Build 3 24309516 4I CTGCAAAGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTTG 2 3 159096 CASAVA_Build 3 24320541 1I TTAGCTCATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 910 hom 36 2 27 7 T 9 10 159097 CASAVA_Build 3 24340784 4I TTCATTCATT ----/TCCA TCCATCCATC 3070 hom 106 het 48 0 34 14 TCCA 3 4 159098 CASAVA_Build 3 24358649 3D TGTTGCGCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 38 1 22 16 A 17 14 159099 CASAVA_Build 3 24393141 1I CTGAGACTCC -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 7 8 159100 CASAVA_Build 3 24393437 2D TGTCTCATAC TT/-- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 8 6 159101 CASAVA_Build 3 24393940 1I GTAAGGGTGA -/G GGGGCTGATG 3070 het 3070 ref 55 34 19 2 G 4 5 159102 CASAVA_Build 3 24396122 1D TGAGAAAGGT G/- ACTCGGCAAG 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 G 1 0 159103 CASAVA_Build 3 24399052 1D GGAGCTCATT A/- AAAAAGGCAT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 6 5 159104 CASAVA_Build 3 24412886 1I AAACACTGAG -/T TTCCTTTCAA 3070 hom 157 het 57 0 53 4 T 2 3 159105 CASAVA_Build 3 24420024 1D ACTTTTTCAC T/- GTGTTGACAT 3070 hom 126 het 46 0 42 5 T 1 0 159106 CASAVA_Build 3 24423110 1D TTGTACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 11 10 159107 CASAVA_Build 3 24423842 1I ATTGCAAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 10 159108 CASAVA_Build 3 24425479 1D TTGAAAAAAA T/- TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 T 7 6 159109 CASAVA_Build 3 24434742 1I TATAGGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 9 20 8 A 13 14 159110 CASAVA_Build 3 24445212 9D ACCCACAGCT TGAGCCAGA/--------- TGGTGCAATG 3070 het 3070 ref 50 28 20 2 TGAGCCAGA 1 0 159111 CASAVA_Build 3 24445383 2D AAGGTAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 42 0 34 9 A 14 12 159112 CASAVA_Build 3 24454582 1D GCAGGCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 30 0 27 3 T 11 10 159113 CASAVA_Build 3 24459320 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 15 0 14 3 A 16 14 159114 CASAVA_Build 3 24460995 1D CATATCACAT A/- AGACTTGAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 7 A 2 1 159115 CASAVA_Build 3 24469463 2D AAGCCCGACA TC/-- TCTCCACTCA 3070 hom 96 het 37 0 32 7 TC 3 2 159116 CASAVA_Build 3 24478659 1D CATAATGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 13 20 12 A 12 11 159117 CASAVA_Build 3 24484391 1I TGAAGATTTG -/A AACCAGGCAT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 A 2 3 159118 CASAVA_Build 3 24492030 4I CAACATATAT ----/ATAG ATAGATAGAT 3070 het 2729 hom 22 7 8 7 ATAG 3 4 159119 CASAVA_Build 3 24495097 3D AAGAGAGGGG AGA/--- AGGATAGGAA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 AGA 1 0 159120 CASAVA_Build 3 24531973 1D AGTGATACTT C/- TTTCTAACAT 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 C 1 0 159121 CASAVA_Build 3 24569129 1D TAGCTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 12 11 159122 CASAVA_Build 3 24645422 1I TAATATTAGT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 8 9 159123 CASAVA_Build 3 24699271 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1642 het 90 hom 7 1 5 1 A 15 16 159124 CASAVA_Build 3 24700087 1I GTACTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 732 hom 46 3 34 9 A 12 13 159125 CASAVA_Build 3 24706688 2I CTCTTTAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 10 12 159126 CASAVA_Build 3 24707156 3I GTAAATTGGA ---/GAT GATAATTGTG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 GAT 1 2 159127 CASAVA_Build 3 24718724 4D AGCCATTACT TTTG/---- TTTTGTTTTG 1018 het 55 hom 14 1 7 6 TTTG 1 0 159128 CASAVA_Build 3 24755572 1I CCGCCCAGGC -/T TGGAGTGCTG 854 het 854 ref 9 4 2 4 T 1 2 159129 CASAVA_Build 3 24759884 1I CCAATGAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 9 10 159130 CASAVA_Build 3 24762767 1I GCCGAGGTGA -/T AAGGCTCGCT 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 T 0 1 159131 CASAVA_Build 3 24765773 1I AAAATTAACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 A 9 10 159132 CASAVA_Build 3 24768920 1D TCTGCTGGGA T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 50 24 18 9 T 7 6 159133 CASAVA_Build 3 24770765 2I GGAAAGTTAC --/TT AGCTTCCTTC 3070 het 3070 ref 49 28 20 1 T 0 2 159134 CASAVA_Build 3 24788744 2I ATCCATGATT --/TC TTTCTTTAAT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 TC 0 1 159135 CASAVA_Build 3 24789650 1D CTATCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 A 11 10 159136 CASAVA_Build 3 24810132 1I CCCACCTCAA -/C CCCTGCCCAA 3070 hom 108 het 43 0 35 8 C 3 4 159137 CASAVA_Build 3 24816491 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 9 159138 CASAVA_Build 3 24817598 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 8 9 159139 CASAVA_Build 3 24817704 4D TTATTGAGTC ACTT/---- ACTTTTCATG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 ACTT 2 1 159140 CASAVA_Build 3 24827046 1D CCAGGTGGAG T/- TTCCCTGCCT 3070 het 3070 ref 27 15 7 6 T 3 2 159141 CASAVA_Build 3 24834243 2D TCTTTAAATA TT/-- GTTTACTGCT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 T 2 0 159142 CASAVA_Build 3 24835894 4D TGTTGTAAAA TATG/---- TATTTCTTTA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 TATG 1 0 159143 CASAVA_Build 3 24841156 1I GATCTTATAA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 70 het 26 0 24 2 T 7 8 159144 CASAVA_Build 3 24855423 1I AATCTCCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 13 14 159145 CASAVA_Build 3 24872559 3D ATCTGCATTT ACA/--- ACAAGTTTTC 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 ACA 2 1 159146 CASAVA_Build 3 24881218 1D TTTTTAAGTA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 T 8 7 159147 CASAVA_Build 3 24894706 2D AGCCAAACCA TT/-- TTTTTTTTTT 2819 het 2819 ref 40 25 6 9 T 14 12 159148 CASAVA_Build 3 24896497 9I CAGAGCCCCT ---------/AATGCAGTA AATAGTCAAA 3070 het 3070 hom 51 23 26 2 AATGCAGTA 0 1 159149 CASAVA_Build 3 24908372 1D CCGGGGCATA C/- CCATAGGGTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 C 3 2 159150 CASAVA_Build 3 24912120 1I CTTTTTTTTT -/A TTTCCTTGAG 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 0 1 159151 CASAVA_Build 3 24916420 1I TTGGGATTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 9 10 159152 CASAVA_Build 3 24976809 1D TACTACCTGC T/- TAAAGTAAGT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 2 1 159153 CASAVA_Build 3 24980385 1I CATTTTGGTA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 G 1 2 159154 CASAVA_Build 3 24982605 3D TTTTTTTTTT TTG/--- GTTATTTTAG 3070 het 3070 hom 33 15 13 6 TTG 1 0 159155 CASAVA_Build 3 24988488 5I TATTTTTCTT -----/TACTC TAGGAACATT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TACTC 0 1 159156 CASAVA_Build 3 25001264 1D AGTTGCTGTG T/- TGGGGAAACA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 2 1 159157 CASAVA_Build 3 25003466 3I GATTTCAACG ---/GTC GTCGTCATCT 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 GTC 2 3 159158 CASAVA_Build 3 25003740 1D AAATCAACAT C/- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 C 1 0 159159 CASAVA_Build 3 25010809 4I ATTTGAGAAA ----/TGTT TGTTCGGATT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TGTT 1 2 159160 CASAVA_Build 3 25011727 1I TTTCCAGGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 9 10 159161 CASAVA_Build 3 25013646 2I CATTGGGTGC --/AT ATATATGTAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 AT 3 4 159162 CASAVA_Build 3 25014425 3D GAAATTCTAA ATT/--- ATTTAAATCT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 ATT 2 1 159163 CASAVA_Build 3 25014773 1I TTGTAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 13 14 159164 CASAVA_Build 3 25015317 3I ATAGTGTTTC ---/AAA AAACTTGGTT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 3 6 159165 CASAVA_Build 3 25016499 2I TGAGATCTGT --/CA CCAGGAGAAG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 CA 0 1 159166 CASAVA_Build 3 25019244 2I AGACATATTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 TG 6 7 159167 CASAVA_Build 3 25034747 5D AAATACAGTT AGATC/----- AGATTTCCTG 3070 het 3070 ref 52 26 24 5 AGATC 1 0 159168 CASAVA_Build 3 25040000 1I ACGCAGCTGA -/G GTTTGCTTCA 3070 hom 99 het 44 0 33 11 G 1 2 159169 CASAVA_Build 3 25043125 1D TCACATTCTG A/- AGTACTTAGG 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 2 1 159170 CASAVA_Build 3 25043489 3D ATTTAATTTT TAA/--- TAATAGCTGT 3070 het 2826 hom 25 7 15 4 TAA 2 1 159171 CASAVA_Build 3 25043725 5D CAAAATTAAT AAGAG/----- AAGGATGGAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 AAGAG 1 0 159172 CASAVA_Build 3 25044121 1I GAAAAAAAAA -/C CCACAATTCT 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 C 2 3 159173 CASAVA_Build 3 25044185 1D ATCAAAATGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 9 8 159174 CASAVA_Build 3 25044470 2D GGCTCATGGA TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 10 8 159175 CASAVA_Build 3 25054882 2I CAGTAAAGTC --/TT TGGGGGAATG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 3 159176 CASAVA_Build 3 25060311 1I CATGGTAGGA -/G GGTTAGACAT 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 G 2 3 159177 CASAVA_Build 3 25060522 1I GGTTTTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 T 10 11 159178 CASAVA_Build 3 25063882 1D AATTAGGTCA G/- GGGCACAATC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 G 4 3 159179 CASAVA_Build 3 25068040 1I AAGGAAAAAG -/T TTTTATTGTT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 4 5 159180 CASAVA_Build 3 25068091 4I TAAGACTACA ----/CATT CATTCAATTT 3070 het 3053 hom 34 7 20 7 CATT 1 2 159181 CASAVA_Build 3 25070742 1D CATTCAGATG T/- TTTTTTGACA 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 T 7 6 159182 CASAVA_Build 3 25071196 14D AGCTGGAAAA TGGAGCACAAACTG/-------------- TGGAGCACAA 3070 het 3070 ref 44 19 15 13 TGGAGCACAAACTG 2 1 159183 CASAVA_Build 3 25081618 1D TAGAACTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 10 10 T 13 12 159184 CASAVA_Build 3 25085706 1I GTGAGAAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 9 10 159185 CASAVA_Build 3 25087034 1D AGACCCCCCA C/- CCATTGTTTA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 C 3 2 159186 CASAVA_Build 3 25092170 1D TGTCCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 37 2 29 6 A 14 13 159187 CASAVA_Build 3 25095028 2I TCCAACTTTC --/TT TATTTTTTTT 2318 het 123 hom 25 4 12 12 T 1 3 159188 CASAVA_Build 3 25099635 1I ATGATTTTTC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 8 159189 CASAVA_Build 3 25099937 2D CATCCAGTGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 109 het 40 0 37 3 T 11 9 159190 CASAVA_Build 3 25101041 4D ATCATTAATC CCTT/---- CTCTATGCAA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 CCTT 1 0 159191 CASAVA_Build 3 25105990 1D CCAAAAAAAA G/- TCCCAAATTA 3070 het 189 hom 33 1 30 2 G 1 0 159192 CASAVA_Build 3 25109992 1D AATAGCCCTT C/- CCCCCAAACT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 C 6 5 159193 CASAVA_Build 3 25122757 30I GAGAAATGCA ------------------------------/TGGTAATGTATCACAATTTTAGAAATTTGC TGTTTCATAC 3070 hom 102 het 33 0 35 6 TGGTAATGTATCACAATTTTAGAAATTTGC 0 1 159194 CASAVA_Build 3 25123149 1I GGCTGCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 45 0 36 9 T 10 11 159195 CASAVA_Build 3 25123396 1I TCCTTCTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 9 10 159196 CASAVA_Build 3 25132927 1D TAAAGTTTAC A/- AAAAAAACGA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 8 7 159197 CASAVA_Build 3 25147492 7D TTATCAATAT TTATTTA/------- TTATTTATCA 2156 het 1161 hom 11 4 5 2 TTATTTA 2 1 159198 CASAVA_Build 3 25149439 3I TAACTGATGC ---/TAG TATCTATGCC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 TAG 0 1 159199 CASAVA_Build 3 25150327 1I ACACAAGGAG -/A GGGGGAAGGA 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 A 0 1 159200 CASAVA_Build 3 25151326 1I ACCGTCACTG -/C CCTCTACCTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 C 2 3 159201 CASAVA_Build 3 25151550 1D TCCTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1796 het 1796 ref 32 18 6 8 T 12 11 159202 CASAVA_Build 3 25152440 1I ATTAAAAAAA -/T GAAATATAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 0 1 159203 CASAVA_Build 3 25161996 1I TGTAAATTTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 24 11 9 A 8 9 159204 CASAVA_Build 3 25162337 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 A 9 8 159205 CASAVA_Build 3 25164757 5D AAACACACCG TTCAA/----- TTCACTGGCT 3070 het 3070 ref 43 18 19 8 TTCAA 1 0 159206 CASAVA_Build 3 25165441 4I CATTCCTCTC ----/TCTG TCTGGCCTAT 3070 het 3070 ref 55 30 21 4 TCTG 1 2 159207 CASAVA_Build 3 25168413 1D TTTTTATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 11 10 159208 CASAVA_Build 3 25174065 1I GCTAATTTTT -/G TATTTTTAGT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 G 0 1 159209 CASAVA_Build 3 25174408 11I ACTTTAAATC -----------/AAACACACCAG AACTGATGCA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 AAACACACCAG 0 1 159210 CASAVA_Build 3 25180000 22D CTATCTCAAA ATATATATATATATATATATAT/---------------------- ATATATATAT 3070 hom 39 het 16 0 14 4 AT 17 6 159211 CASAVA_Build 3 25186485 8D CTTATTTCTT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 1225 hom 27 8 10 10 A 19 11 159212 CASAVA_Build 3 25202625 1I GCAAGTCAGA -/T AAAAAAGACA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 0 1 159213 CASAVA_Build 3 25205257 1D CACAATAGAT A/- ATATGAGGTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 1 159214 CASAVA_Build 3 25206704 1D TTCAAGAGTT A/- AATTTTCCTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 2 159215 CASAVA_Build 3 25210406 4D GTAATTAATC AGTT/---- AGTAAGATGA 3070 hom 108 het 41 0 36 7 AGTT 1 0 159216 CASAVA_Build 3 25210744 2I GGGTAGGAAG --/GA GAGAGAAGGT 3070 hom 111 het 45 0 36 9 GA 3 4 159217 CASAVA_Build 3 25229251 1D TATTTTCCAC T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 7 6 159218 CASAVA_Build 3 25235761 1I CCTCTAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 11 12 159219 CASAVA_Build 3 25241802 2I TAGGCCTTCT --/GA GAGAGGAGAG 3070 het 3070 hom 51 16 27 8 GA 2 3 159220 CASAVA_Build 3 25284886 1D CAGAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 15 23 12 A 13 12 159221 CASAVA_Build 3 25287543 1D TAGTGAAATA C/- AAATGATATT 3070 het 3070 hom 36 14 17 7 C 1 0 159222 CASAVA_Build 3 25298976 4I TTCATAGCAC ----/TTAA TTTTTATGAT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 TTAA 0 1 159223 CASAVA_Build 3 25305264 2I TCTTCTGTTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 9 11 159224 CASAVA_Build 3 25334422 2I AAATGCGGAA --/TT TTAGTGGAAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 2 4 159225 CASAVA_Build 3 25336145 1I GCAGTTTTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 8 9 159226 CASAVA_Build 3 25342064 1D TTTGTGGGGG T/- TTTTTTTTTA 1034 het 1034 ref 40 32 3 5 T 10 9 159227 CASAVA_Build 3 25343324 1D GACACAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 22 0 18 4 T 11 10 159228 CASAVA_Build 3 25371298 1D AATTGTTGAA G/- GGGTCCTCCC 3070 hom 114 het 41 0 39 3 G 4 3 159229 CASAVA_Build 3 25371378 1D TTGCAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 32 2 26 4 T 13 12 159230 CASAVA_Build 3 25384148 1D CCATCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 25 2 16 7 A 16 15 159231 CASAVA_Build 3 25398907 1I GGTGGGAGAA -/C TTTCCCCTGC 3070 hom 108 het 39 0 33 6 C 0 1 159232 CASAVA_Build 3 25404550 1I GAAGTTAAAG -/A AAATGGAAAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 3 4 159233 CASAVA_Build 3 25413845 1I AGAAGTGGAC -/T TTCCCCCATC 3070 hom 75 het 42 0 28 14 T 2 3 159234 CASAVA_Build 3 25414383 1I TTTTGATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1276 hom 31 3 24 4 A 12 13 159235 CASAVA_Build 3 25422461 5I CATGTTTGGT -----/GTTGA CATTAGTAGC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 GTTGA 0 1 159236 CASAVA_Build 3 25424254 1D GCATGAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 47 1 36 10 T 13 12 159237 CASAVA_Build 3 25429772 4D ATTTTTGTAA CATT/---- CATTCACTCT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CATT 2 1 159238 CASAVA_Build 3 25430571 1I GCTCCCTTTT -/C CCCTAAGCCC 3070 hom 99 het 37 0 32 5 C 3 4 159239 CASAVA_Build 3 25435440 1D CAGACTAACC A/- AAAAAAAAAA 2273 het 2273 ref 31 17 6 9 A 13 12 159240 CASAVA_Build 3 25435540 2I AGCCTGTGTA --/TT TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 T 8 10 159241 CASAVA_Build 3 25449788 18I AACATCTCCT ------------------/AGGCTGCCCCTTGAACCC AGGAGTGGCA 3070 hom 111 het 37 0 38 1 AGGCTGCCCCTTGAACCC 0 1 159242 CASAVA_Build 3 25453613 1D AAAAGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1153 hom 44 10 17 17 T 17 16 159243 CASAVA_Build 3 25456589 10D AATAAGACAA TGTATTTGAC/---------- ACATGATGCT 3070 het 3070 ref 53 28 25 4 TGTATTTGAC 1 0 159244 CASAVA_Build 3 25459917 1D CCACCACCCC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 32 13 13 7 T 9 8 159245 CASAVA_Build 3 25460118 1D AAATATATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 A 13 12 159246 CASAVA_Build 3 25463514 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 A 11 10 159247 CASAVA_Build 3 25465898 5D TTTCTGTCTC CTTAA/----- CTTCTTTCTT 3070 hom 117 het 40 0 40 2 CTTAA 1 0 159248 CASAVA_Build 3 25468923 2I ACAACACAGA --/GT GTGATTAGTG 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 GT 1 2 159249 CASAVA_Build 3 25469160 1D TTTAAAAAGC G/- GGGGGGGTTT 3070 het 3070 hom 34 15 12 8 G 8 7 159250 CASAVA_Build 3 25482326 1I AAGCAATATT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 7 8 159251 CASAVA_Build 3 25483999 39D CAATCACCAT ACAATCATAGCAAGCCAACGCCACTTATCCAGTGAACCA/--------------------------------------- GCTCAAACAA 3070 hom 93 het 26 0 31 3 ACAATCATAGCAAGCCAACGCCACTTATCCAGTGAACCA 1 0 159252 CASAVA_Build 3 25485051 1D TTTTCCTGTT A/- AAAAAAACAC 3070 het 1844 hom 22 7 12 4 A 8 7 159253 CASAVA_Build 3 25490009 1I TAGCACTATT -/G CCTGGGGCAT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 G 0 1 159254 CASAVA_Build 3 25495651 1D GTCTGTCTTC T/- TTTTTTTTTG 1631 het 1631 ref 45 34 4 9 T 10 9 159255 CASAVA_Build 3 25507195 1D TTTTGTTGCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 29 9 16 5 T 9 8 159256 CASAVA_Build 3 25509164 1D TCTCGAAAGA T/- TAGCTTTACA 3070 het 3070 hom 54 23 28 3 T 2 1 159257 CASAVA_Build 3 25516152 4D CTCTTTCAAG TGTT/---- TGTTTAGTAA 3070 het 3070 ref 37 22 14 2 TGTT 2 1 159258 CASAVA_Build 3 25519600 8I ATGGGTCACT --------/TGGCCACA TTTCATCCAG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 TGGCCACA 0 1 159259 CASAVA_Build 3 25523803 1D TCTCCCTGGC T/- TTACTTTCTG 3070 het 3070 hom 48 23 20 5 T 3 2 159260 CASAVA_Build 3 25527121 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 10 9 159261 CASAVA_Build 3 25527629 8D GTTTTTTGTT TTGGTTTG/-------- TTTTTTTTTG 84 het 84 ref 18 11 1 7 TTGGTTTG 1 0 159262 CASAVA_Build 3 25545897 7I GAGGCTTAGG -------/ATTCATC ATTCATCCTA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 ATTCATC 1 2 159263 CASAVA_Build 3 25556077 1I CCTTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 24 1 14 9 T 11 12 159264 CASAVA_Build 3 25557455 1D TCTGCAGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 10 9 159265 CASAVA_Build 3 25564597 2D TTCATTTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 32 2 10 20 T 18 16 159266 CASAVA_Build 3 25569241 6I GAATTTTGAA ------/ATACTT ATGGGTGTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATACTT 0 1 159267 CASAVA_Build 3 25569650 1D CATCTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1116 hom 28 3 16 9 T 14 13 159268 CASAVA_Build 3 25572503 1I ACATCTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 41 0 31 10 T 11 12 159269 CASAVA_Build 3 25575025 3D TTCCTGGCCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 25 2 13 11 T 19 16 159270 CASAVA_Build 3 25578731 1D ATACTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 T 12 11 159271 CASAVA_Build 3 25580443 1D TGTATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1064 hom 34 7 13 14 T 17 16 159272 CASAVA_Build 3 25587440 1D TACCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 126 hom 25 1 18 7 A 12 11 159273 CASAVA_Build 3 25593271 1D CTCCTGTCTA C/- CCAGAGCTAC 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 C 3 2 159274 CASAVA_Build 3 25594364 2D GCGACCCTCC AT/-- ATATGGGCCA 2914 hom 38 het 17 0 11 7 AT 3 2 159275 CASAVA_Build 3 25650012 6D AACTCAGTCA CCAGCC/------ CCCTCTCCTC 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 CCAGCC 1 0 159276 CASAVA_Build 3 25720085 1I TCACAGCATG -/C CACAATCTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 1 2 159277 CASAVA_Build 3 25736378 1I GTTTATTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 36 2 28 6 T 13 14 159278 CASAVA_Build 3 25737464 4I TTGTTTGAAA ----/TAAT TCTTGGAAAG 3070 hom 123 het 48 0 40 8 TAAT 0 1 159279 CASAVA_Build 3 25740079 1I TCTGATCCCA -/T CTATGTATAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 1 159280 CASAVA_Build 3 25766440 2D AAAAACTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 40 0 28 12 A 16 14 159281 CASAVA_Build 3 25769913 1D TATTATAGCC A/- AAAAAAATAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 8 7 159282 CASAVA_Build 3 25771160 1D AACTGTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 26 1 19 6 A 12 11 159283 CASAVA_Build 3 25771280 2I GAGATGACTC --/AT GTGCTTTTTT 2565 hom 45 het 26 0 12 14 AT 0 1 159284 CASAVA_Build 3 25784412 3D GCTGACCAGC CTG/--- CTGGCCAACA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CTG 2 1 159285 CASAVA_Build 3 25789189 1D GAATACTTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 9 8 159286 CASAVA_Build 3 25802166 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 59 het 23 0 19 4 A 10 9 159287 CASAVA_Build 3 25811491 1D CATCAGCATT C/- TTTGAGTTAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 1 0 159288 CASAVA_Build 3 25811865 6I TAACACGGAG ------/GGATCT TGTTCATCCG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 GGATCT 0 1 159289 CASAVA_Build 3 25813949 1D AAATTATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 40 0 28 12 T 12 11 159290 CASAVA_Build 3 25814644 2I GAAATAAAAC --/TT AAGATAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 0 2 159291 CASAVA_Build 3 25839327 4D TAAAATGAGA TAGT/---- TAGTTCCTAT 3070 hom 123 het 42 0 42 4 TAGT 2 1 159292 CASAVA_Build 3 25844510 1D CAGGTAACAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 80 het 35 0 29 7 A 9 8 159293 CASAVA_Build 3 25849605 1I TCTTGTTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 9 10 159294 CASAVA_Build 3 25850909 1D GTAGTCACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 12 11 159295 CASAVA_Build 3 25851455 2D AATATACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 33 0 25 8 TG 9 8 159296 CASAVA_Build 3 25855112 1D GAAAATACTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 921 hom 32 2 28 2 A 10 9 159297 CASAVA_Build 3 25864069 1D AGTTTTCGTA T/- GATCTATGAG 3070 hom 141 het 54 0 48 7 T 1 0 159298 CASAVA_Build 3 25873734 3D TTTTTGAATT TTA/--- TTATTATTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TTA 4 3 159299 CASAVA_Build 3 25877447 4D CCATATATGT TTAA/---- TTAAGTAATA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TTAA 2 1 159300 CASAVA_Build 3 25900014 1D GGAAAATACA T/- TTTTGAGCAG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 5 4 159301 CASAVA_Build 3 25902717 2I GAGAAGAGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 21 8 A 13 15 159302 CASAVA_Build 3 25912986 1I CTTTCTTTTC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 7 8 159303 CASAVA_Build 3 25921903 4D TTCAACAAAT ACTG/---- TCCTCCAAAC 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 ACTG 1 0 159304 CASAVA_Build 3 25931291 2D GTTACATGAA GT/-- GTGGTGACAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 GT 2 1 159305 CASAVA_Build 3 25931560 1D CTTGGGCAAG T/- TTTTTTTTTT 2952 het 2935 hom 30 12 9 9 T 15 14 159306 CASAVA_Build 3 25933776 1D GTACCACTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 9 8 159307 CASAVA_Build 3 25933948 1D GTAGCTCTGC T/- TTTAGGTTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 4 3 159308 CASAVA_Build 3 25939867 3D CTCTCTCTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 572 het 572 ref 29 12 9 8 CTC 1 0 159309 CASAVA_Build 3 25942257 1I GAAATAAAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 8 9 159310 CASAVA_Build 3 25946346 4D CAAAGTACAC CGTG/---- TGTATGTACT 3070 hom 87 het 30 0 29 3 CGTG 1 0 159311 CASAVA_Build 3 25955715 4D CAAAAGCATG CTCC/---- CTCCCTTTCC 3070 hom 129 het 47 0 40 8 CTCC 2 1 159312 CASAVA_Build 3 25958330 5D CCCCTCCCTC CTTAT/----- CTTTTCTCCT 2221 het 2221 ref 27 15 7 5 CTTAT 1 0 159313 CASAVA_Build 3 25959996 1D TTTTTTTTTT C/- CTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 31 1 27 3 C 2 1 159314 CASAVA_Build 3 25980557 4D AGCAGGACAA AAAG/---- AAACTAGCTA 3070 hom 96 het 34 0 33 3 AAAG 1 0 159315 CASAVA_Build 3 25983359 1I TTAGACAATT -/A AAGGAGGGAT 3070 hom 59 het 29 0 20 9 A 2 3 159316 CASAVA_Build 3 25996849 1I TGTATATATA -/T TTTTTTAATA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 7 159317 CASAVA_Build 3 26012080 1I AAAATTCTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 478 hom 14 1 8 5 T 9 10 159318 CASAVA_Build 3 26022259 3D AACCAGTTTT TCC/--- TCCTCCTCTG 3070 hom 93 het 37 0 32 8 TCC 3 2 159319 CASAVA_Build 3 26022625 19I AGTGTAAAAT -------------------/TAAGCACATCATTATTTCC TAATATGATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAAGCACATCATTATTTCC 0 1 159320 CASAVA_Build 3 26025630 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TTTTTCTCTC 3070 hom 54 het 24 0 19 6 TCTT 1 0 159321 CASAVA_Build 3 26034806 1D TTCTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 36 1 29 6 T 12 11 159322 CASAVA_Build 3 26038314 1D TCTATCTTGC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 7 159323 CASAVA_Build 3 26042786 1I CCTTTAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 462 hom 19 1 14 4 T 10 11 159324 CASAVA_Build 3 26049209 2I TTGAACAGAC --/TA TATAAAAAGG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 TA 2 3 159325 CASAVA_Build 3 26064587 1D AGGAAACAAT A/- AAAACATGAA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 5 4 159326 CASAVA_Build 3 26076095 1D TCAATAAACA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 9 8 159327 CASAVA_Build 3 26087948 1I AGCGTAGCTA -/G GCTAAAGGAA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 G 1 2 159328 CASAVA_Build 3 26089534 3D AATTGGAGTC TTA/--- TTATTAATTA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TTA 3 2 159329 CASAVA_Build 3 26097510 4I AAGAATAAAA ----/ATAG ATAGGTTCAC 3070 hom 111 het 41 0 35 6 ATAG 1 2 159330 CASAVA_Build 3 26101080 1I CAAGTTGTAT -/A AATATGATTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 3 159331 CASAVA_Build 3 26102807 1I CCCACCACGC -/A GTTCCCAGTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 159332 CASAVA_Build 3 26107385 1I GGCTGCACTA -/G GAATTTCTTT 3070 hom 92 het 35 0 26 9 G 1 2 159333 CASAVA_Build 3 26110066 1I TAAGGAACTC -/A AAACAGCTCA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 3 4 159334 CASAVA_Build 3 26113126 5D GGGGACCCTG GGCCT/----- GGCCTGGCCC 3070 hom 96 het 34 0 31 4 GGCCT 2 1 159335 CASAVA_Build 3 26114723 5I AGGCACTGTG -----/GACTT GACTTAACTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GACTT 1 2 159336 CASAVA_Build 3 26125820 3I ATATTGTATT ---/ATA ATATATTGAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 ATA 1 2 159337 CASAVA_Build 3 26140080 1I ATAAGTGGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 9 10 159338 CASAVA_Build 3 26152569 1I ACTGTCAGAG -/T TTATGAGAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 2 3 159339 CASAVA_Build 3 26280553 1I TATGACATGT -/G GGGGTCTCAG 3070 het 3070 ref 54 24 23 7 G 4 5 159340 CASAVA_Build 3 26343504 1D GGGAAAAAAA G/- AATGAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 G 1 0 159341 CASAVA_Build 3 26352122 1I TCCTGTTGGT -/C GTGTTGCCAT 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 C 0 1 159342 CASAVA_Build 3 26411348 2D ACCTGATTGC TT/-- TTTAAAAAGC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 T 5 3 159343 CASAVA_Build 3 26414331 1D TTTCTGGTGT A/- AATGCCTCCT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 3 2 159344 CASAVA_Build 3 26429002 2I AAAATGTTGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 11 159345 CASAVA_Build 3 26435316 3D GGAGGAGGAA TTG/--- TTGTGTTCTG 3070 hom 147 het 56 0 46 10 TTG 2 1 159346 CASAVA_Build 3 26530800 3I GAGGTAGTTT ---/AGC AGCTTGAAGC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AGC 1 2 159347 CASAVA_Build 3 26534545 10I CACAGAGTCC ----------/TTAGTGGGGT CACACCTAGT 3070 hom 60 het 22 0 18 5 TTAGTGGGGT 0 1 159348 CASAVA_Build 3 26535127 1D TTGGCTGTGT C/- CCCACCAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 4 3 159349 CASAVA_Build 3 26537761 1I TGAAATCTGC -/T TTTTTCTGAT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 5 6 159350 CASAVA_Build 3 26538991 4I TCTTTCTCTA ----/CTTT CTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 37 21 9 7 CTTT 1 2 159351 CASAVA_Build 3 26539733 1I CCTTTCCTTT -/G CCCCAAACAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 G 0 1 159352 CASAVA_Build 3 26541186 2D TGTTATGAAG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 13 7 T 11 9 159353 CASAVA_Build 3 26543044 4D CTTATTTTTC TCTT/---- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 41 17 23 2 TCTT 1 0 159354 CASAVA_Build 3 26545374 19D AGATGGCATC CTTGTCTTGTGCTGGTATT/------------------- CAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 20 15 7 2 CTTGTCTTGTGCTGGTATT 1 0 159355 CASAVA_Build 3 26545564 1I CTATTGAGAT -/A AATCATGTGG 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 2 3 159356 CASAVA_Build 3 26549593 1D ATTTTCAGCC T/- TTTTTGTGCT 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 T 6 5 159357 CASAVA_Build 3 26551357 1I TGCGTAATTC -/T ACTTAGGTAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 T 0 1 159358 CASAVA_Build 3 26560509 1D ATTAAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 15 5 T 11 10 159359 CASAVA_Build 3 26561948 1I GACAAGTATC -/A GGAAATTTTG 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 A 0 1 159360 CASAVA_Build 3 26593107 1D TTGGATTCAT C/- TTCATTCTCA 3070 het 3070 ref 42 20 19 5 C 1 0 159361 CASAVA_Build 3 26594326 1D GAGACCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1945 hom 27 7 12 9 T 11 10 159362 CASAVA_Build 3 26596394 1D GTAATGATCT A/- TTATCATTAC 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 1 0 159363 CASAVA_Build 3 26597111 1D TCTCACCCCC T/- AGTGGAAAAT 3070 het 3070 hom 60 24 27 9 T 1 0 159364 CASAVA_Build 3 26599250 1D TTCAGCTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 10 9 159365 CASAVA_Build 3 26622840 1D GAGAAGAAGA T/- GTTATTTGGC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 1 0 159366 CASAVA_Build 3 26625217 4D GCTTATAAGC AAGT/---- GTTAGAGATA 3070 hom 111 het 42 0 38 7 AAGT 1 0 159367 CASAVA_Build 3 26631721 2I TCCATATATC --/TA TATATATATA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 TA 5 6 159368 CASAVA_Build 3 26646971 3D TGCCTCTTAC ATA/--- ATAATGCCTC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 ATA 2 1 159369 CASAVA_Build 3 26652732 1I GAAGTCCTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3065 hom 27 8 14 5 A 8 9 159370 CASAVA_Build 3 26665966 2D TGTGTGACTC TT/-- TTTCCCCAGA 3070 hom 159 het 60 0 53 7 T 5 3 159371 CASAVA_Build 3 26671113 2D AAGCAAAAAC AG/-- AGATGAGAAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 AG 2 1 159372 CASAVA_Build 3 26702153 7I TTTTAAAAAC -------/AACTATT TACTATTACT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 AACTATT 0 1 159373 CASAVA_Build 3 26718978 1D GCTGGATTGG T/- TTCTGATAAA 3070 het 3070 ref 51 28 16 7 T 3 2 159374 CASAVA_Build 3 26724272 3D TCCACACCTG TTT/--- TTTTTTTTCT 3070 hom 97 het 36 0 33 5 T 11 8 159375 CASAVA_Build 3 26728005 2I TACACAGTTC --/TA TGAGTTTTAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TA 0 1 159376 CASAVA_Build 3 26730670 1I TCAACAACAA -/C AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 C 0 1 159377 CASAVA_Build 3 26731972 1D CAAAACCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 31 0 21 10 T 11 10 159378 CASAVA_Build 3 26741755 1D CCTTTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 A 12 11 159379 CASAVA_Build 3 26748334 4D AATTTATTTC TTAT/---- TATTATTGCA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 TTAT 1 0 159380 CASAVA_Build 3 26749362 1D CCTTCTAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 10 9 159381 CASAVA_Build 3 26759640 1I CACACAGATA -/C ATTCAGCCAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 0 1 159382 CASAVA_Build 3 26767702 1D TACTCAAGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 10 9 159383 CASAVA_Build 3 26777181 7D GTTGTGGGGT GGGGGGA/------- GGGGGGAGGG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 GGGGGGA 2 1 159384 CASAVA_Build 3 26781213 1I TTGGCCAGTT -/C ACTGGAATGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 C 0 1 159385 CASAVA_Build 3 26787677 1D TGTATGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 11 10 159386 CASAVA_Build 3 26790118 1I TATACATTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 20 17 5 A 9 10 159387 CASAVA_Build 3 26792904 7I AAGTCACACA -------/ATTACCT ATAATCCAAG 3070 hom 144 het 55 0 48 7 ATTACCT 0 1 159388 CASAVA_Build 3 26793690 2I TTGGATAAAG --/AA AAAATATGGT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 4 6 159389 CASAVA_Build 3 26796143 18D AGGAGTTCGA GACCAGCCTGGCCAACAT/------------------ GGTGAAACCC 2051 het 2051 ref 14 10 5 1 GACCAGCCTGGCCAACAT 1 0 159390 CASAVA_Build 3 26799108 2D TCAGCCAGTC TA/-- TGTCTTTTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 TA 1 0 159391 CASAVA_Build 3 26806271 1D AACTCTTAGA T/- TTTTCCCTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 5 4 159392 CASAVA_Build 3 26811852 6D ATCCAATTAC TATTAA/------ TATTAACAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 6 TATTAA 2 1 159393 CASAVA_Build 3 26823565 1D TGTACATTCC T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 8 7 159394 CASAVA_Build 3 26832606 1D GCCCAGGAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 372 hom 39 1 33 5 A 10 9 159395 CASAVA_Build 3 26846260 1I AAGTAACCGA -/T TTATAAATCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 2 3 159396 CASAVA_Build 3 26866721 1D TTGAACATTT C/- AAGTCTTGCT 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 C 1 0 159397 CASAVA_Build 3 26868287 1I ATACATGGAA -/C TTTTTGTACC 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 C 0 1 159398 CASAVA_Build 3 26868467 1D TTTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 9 18 8 A 10 9 159399 CASAVA_Build 3 26870207 4I40M1I GTGAAGGATG ----GAGAACTGCACTCTCACATTTTCATATTTCCTTTGTCTGC-/AATAGAGAACTGCACTCTCACATTTTCATATTTCCTTTGTCTGCA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 30 21 6 N/A 0 0 159400 CASAVA_Build 3 26881729 1D GCCTGCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 A 10 9 159401 CASAVA_Build 3 26884245 7D TGGAGCAGTG GTTTTCA/------- GAGTTTAACT 3070 het 3070 ref 39 19 19 6 GTTTTCA 1 0 159402 CASAVA_Build 3 26884716 10I AATATTTGTG ----------/TGTGTGTGTC TGTGTGTGTA 3070 hom 45 het 28 0 17 11 TGTGTGTGTC 0 1 159403 CASAVA_Build 3 26885917 1D ATCTCATCAC A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 A 8 7 159404 CASAVA_Build 3 26887523 1D AGAGAGTTTT A/- ACAGAGCCTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 1 159405 CASAVA_Build 3 26895151 2D AGAAATCATA AC/-- AGTCTCTCAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AC 1 0 159406 CASAVA_Build 3 26899009 3D ATGAATTGAG AGA/--- AGAAGGCTTC 3070 het 2715 hom 17 7 8 2 AGA 2 1 159407 CASAVA_Build 3 26904703 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 8 9 159408 CASAVA_Build 3 26908110 2I TAATATGAAA --/TC TTTATATATA 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 TC 0 1 159409 CASAVA_Build 3 26909475 1I GAACAACTGT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 6 7 159410 CASAVA_Build 3 26910480 1D AATCTTCCAC A/- AAAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 A 6 5 159411 CASAVA_Build 3 26928873 1I ATTTAAAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 A 8 9 159412 CASAVA_Build 3 26932492 1I AGAGCATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 11 10 A 11 12 159413 CASAVA_Build 3 26941903 1D TAAGTAACAA G/- GGGGAAATCA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 G 5 4 159414 CASAVA_Build 3 26943818 1D TAGATGGTTA T/- TCAAACCCTC 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 T 2 1 159415 CASAVA_Build 3 26944259 1D CTCACTCTGT C/- CCCCTGGCTG 3070 het 3070 hom 34 11 23 0 C 5 4 159416 CASAVA_Build 3 26944616 1I TCAGAGAGTA -/C TATTCTCCTA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 C 0 1 159417 CASAVA_Build 3 26946504 5I CTCCATTTAC -----/TTCCT TTCATTTTAT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 TTCCT 0 1 159418 CASAVA_Build 3 26948074 1D ATGCTGCTGG T/- TTTTTTTTTT 2867 het 2867 ref 16 7 7 2 T 11 10 159419 CASAVA_Build 3 26991338 12I TTTTTTGGGG ------------/GGTAGGGAGGTA GGTAAAACAG 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 GGTAGGGAGGTA 0 1 159420 CASAVA_Build 3 26993896 2D TGAGATACCA TC/-- TCTCACACCA 3070 het 336 hom 17 1 13 3 TC 3 2 159421 CASAVA_Build 3 26994710 4D AGGATAGAGG TTTA/---- TTTGAGGCCA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTTA 1 0 159422 CASAVA_Build 3 26994942 1D TCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 18 1 14 4 A 16 15 159423 CASAVA_Build 3 27001952 1I AGTTTGGTAC -/A AAAAAATCCA 3070 hom 122 het 49 0 41 8 A 6 7 159424 CASAVA_Build 3 27004182 4I GACAAGAAAC ----/AAGT AAGCCAAATA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AAGT 0 1 159425 CASAVA_Build 3 27004643 1I GTCTGCTGTT -/G TTTTAACCTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 G 0 1 159426 CASAVA_Build 3 27015529 2D GCCAGTGAGA AC/-- ACAGTTAGCT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 AC 2 1 159427 CASAVA_Build 3 27018177 1I AGACAGTAAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 7 8 159428 CASAVA_Build 3 27022741 1D GGGGAACCTG T/- TTTTTTTTTT 1155 het 1155 ref 40 30 3 7 T 12 11 159429 CASAVA_Build 3 27027076 4D TTTCTGTGTG TTTA/---- TTTAAAGCAT 3070 het 2768 hom 16 6 9 1 TTTA 2 1 159430 CASAVA_Build 3 27032015 2I GTTACCATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 12 14 159431 CASAVA_Build 3 27035809 1D ATATGAAAGT G/- GGAACATAAC 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 G 3 2 159432 CASAVA_Build 3 27036450 1D AAGAGCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 27 7 8 13 A 12 11 159433 CASAVA_Build 3 27043371 3D TCCCTGTGAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1565 hom 30 11 12 7 A 17 14 159434 CASAVA_Build 3 27043721 1D TTCCAGGATA T/- TTCTAATTAG 3070 het 3070 ref 44 26 16 4 T 3 2 159435 CASAVA_Build 3 27049107 2I TACTTCATAC --/CT CTTTTAATCT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 CT 1 2 159436 CASAVA_Build 3 27049250 1I ATGTGTTACC -/T TAATTTTTTA 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 T 1 2 159437 CASAVA_Build 3 27049633 4D TCTGTCTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 2885 het 99 hom 25 3 11 11 TC 11 9 159438 CASAVA_Build 3 27050040 4I TGGTTAATAT ----/TGAG TGTCAACTTG 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 TGAG 0 1 159439 CASAVA_Build 3 27050608 1D ATTTCACCCC T/- TTCCTCATAT 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 T 3 2 159440 CASAVA_Build 3 27054805 1D ATGACTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 10 9 159441 CASAVA_Build 3 27057095 1I CATCCAGAAA -/G CCAGGCATTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 159442 CASAVA_Build 3 27057982 2I ACACTTAAAG --/TT TATCAGGAAG 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 T 1 3 159443 CASAVA_Build 3 27058356 5I TACTAATACA -----/CAATT CAATATCCAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CAATT 0 1 159444 CASAVA_Build 3 27061313 3I TGTATTAAAA ---/AAG TAGTTACCAA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 AAG 0 1 159445 CASAVA_Build 3 27062620 1I GCAGCTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 7 13 8 A 8 9 159446 CASAVA_Build 3 27066714 1I AAGCAGTCAA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 112 het 42 0 38 4 T 7 8 159447 CASAVA_Build 3 27069395 1D ATTTTCTTTA G/- CCAATCCACC 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 G 1 0 159448 CASAVA_Build 3 27070101 1I TTTTCTGGGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 8 9 159449 CASAVA_Build 3 27072528 1I AATTTCTTTG -/T TAGTTTTCTC 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 T 1 2 159450 CASAVA_Build 3 27081284 1D TCCAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 2065 het 2065 ref 35 18 5 13 A 15 14 159451 CASAVA_Build 3 27100234 1D CTATTTTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 13 12 159452 CASAVA_Build 3 27104910 1I CAGTGAGTGG -/A AATTAAAATA 3070 het 3070 hom 41 11 23 7 A 2 3 159453 CASAVA_Build 3 27105848 1D GTCTGAGTAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 414 hom 48 2 39 7 T 9 8 159454 CASAVA_Build 3 27106617 2D CAGCTTGCAT AA/-- AGTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 41 19 19 6 A 3 1 159455 CASAVA_Build 3 27116485 5D CCTGAGACTG GGTTA/----- TGAAATCTAC 3070 het 3070 hom 46 22 24 2 GGTTA 1 0 159456 CASAVA_Build 3 27117562 1I TATTTGGAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 8 9 159457 CASAVA_Build 3 27117850 1I AGGACAGGAA -/G GGAAGAGCCC 2816 het 2816 ref 32 14 11 7 G 2 3 159458 CASAVA_Build 3 27179611 1I TTAAAAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 43 11 25 7 A 8 9 159459 CASAVA_Build 3 27184752 1D ACAGAATAGG A/- AAAAAAAAAA 2623 het 2623 ref 27 12 9 6 A 12 11 159460 CASAVA_Build 3 27197747 4D CCAATAACAT AAAC/---- AATTAATACA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 AAAC 1 0 159461 CASAVA_Build 3 27222471 1D AAGGGCTAAT A/- TCCAGAATCT 3070 het 1866 hom 15 5 10 0 A 1 0 159462 CASAVA_Build 3 27231053 1D TCTTTTTTTT G/- TTTTTCCTAT 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 G 1 0 159463 CASAVA_Build 3 27239264 1D ATTTTCATGT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 33 13 15 5 A 9 8 159464 CASAVA_Build 3 27242348 1I TCAGCTGCAA -/G GGAGGCTAAG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 G 2 3 159465 CASAVA_Build 3 27250778 1D GCAAGAGAAA G/- TAATAAAGGA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 G 1 0 159466 CASAVA_Build 3 27271999 1D GGCTAGATTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 9 8 159467 CASAVA_Build 3 27274284 10D TTCTTTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTGA 3070 het 1455 hom 27 6 17 6 T 18 8 159468 CASAVA_Build 3 27307414 8D TAAGCTCAGC TCAAAACA/-------- TCAAAACACT 3070 het 3070 hom 36 12 18 8 TCAAAACA 2 1 159469 CASAVA_Build 3 27322121 2I AAAAAAAAAA --/AT AAAAATAATA 3070 het 2822 hom 33 13 12 8 AT 0 1 159470 CASAVA_Build 3 27329760 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 12 11 159471 CASAVA_Build 3 27333286 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 329 hom 30 1 23 6 A 9 10 159472 CASAVA_Build 3 27338642 1I TATAACAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 11 12 159473 CASAVA_Build 3 27344430 1D TGCAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2239 hom 32 9 11 12 A 13 12 159474 CASAVA_Build 3 27346539 1D TATGTAAGTA C/- TTTTTATTGT 3070 het 3070 ref 37 25 9 3 C 1 0 159475 CASAVA_Build 3 27346638 2D AAGGGCTGAC TG/-- TGCCTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 17 18 5 TG 2 1 159476 CASAVA_Build 3 27353941 1I32M5I ACAGAAATAG -AAAAAAAAGAAATAAAATTCATATGAAACAAA-----/AAAAAAAAAGAAATAAAATTCATATGAAACAAAAAAAG AACCAGAAGA 3070 hom 81 het 26 0 28 8 N/A 0 0 159477 CASAVA_Build 3 27362467 4I TTAAGAATCG ----/GTAA CTATGGTAAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 GTAA 0 1 159478 CASAVA_Build 3 27378393 2D TGGGCACTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 12 10 159479 CASAVA_Build 3 27386841 2D CTAAACGCTC GT/-- GTGTGTGTCT 3070 het 3070 hom 45 16 20 10 GT 5 4 159480 CASAVA_Build 3 27396206 1I TTATACATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 A 9 10 159481 CASAVA_Build 3 27398158 1I ATAAATAGCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 10 159482 CASAVA_Build 3 27402606 1D TAAATCTTAT A/- AAAAATGCTT 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 A 6 5 159483 CASAVA_Build 3 27402697 2D ACTTTGTGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 9 A 16 14 159484 CASAVA_Build 3 27402826 4D AGCAAAAAAC AATT/---- AATTTTTAAG 3070 het 3070 ref 38 20 16 4 AATT 2 1 159485 CASAVA_Build 3 27403356 1D TACTGAATTC A/- ATTTTGATTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 2 1 159486 CASAVA_Build 3 27419195 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2299 hom 24 6 13 5 A 12 11 159487 CASAVA_Build 3 27419350 4D GATCAGTTGC CAAT/---- CAAATTTAAA 3070 het 3070 ref 37 24 12 3 CAAT 1 0 159488 CASAVA_Build 3 27423606 1D TATGAAGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 30 0 17 13 T 17 16 159489 CASAVA_Build 3 27429222 5D TTTTTAATTT AATTA/----- ATCATTTAAC 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 AATTA 1 0 159490 CASAVA_Build 3 27436659 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 848 hom 23 3 19 1 A 11 10 159491 CASAVA_Build 3 27443382 2D AGCAAATTAC AA/-- AAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 30 10 18 3 A 7 5 159492 CASAVA_Build 3 27443813 1D AATTCACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 31 1 21 9 T 13 12 159493 CASAVA_Build 3 27464136 11D TTTACAGCCC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 2295 hom 29 9 13 9 T 23 12 159494 CASAVA_Build 3 27465543 1I AAAAGATATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 9 10 159495 CASAVA_Build 3 27471506 1I ATGACATGTT -/A AAAAAAAAAA 2672 het 2672 ref 33 16 9 8 A 13 14 159496 CASAVA_Build 3 27475903 5D ACATTATTTG ATAAA/----- ATAAAAATAT 3070 het 3070 hom 29 11 15 5 ATAAA 2 1 159497 CASAVA_Build 3 27476482 6D ATATATATAT ATATAC/------ ACACACACAC 1787 het 70 hom 7 1 5 4 ATATAC 1 0 159498 CASAVA_Build 3 27478579 1I GCAAAACAAA -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 6 7 159499 CASAVA_Build 3 27479221 2I AAAGCAACTC --/AT AGACTTGGAG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AT 0 1 159500 CASAVA_Build 3 27485610 1I TCAATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 11 12 159501 CASAVA_Build 3 27487148 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAACAG 2320 het 233 hom 21 2 8 11 C 0 1 159502 CASAVA_Build 3 27494698 2D AAAAATGAGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 A 11 9 159503 CASAVA_Build 3 27495919 1I CCTCAGCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 11 17 14 A 11 12 159504 CASAVA_Build 3 27497748 1I ACAAGTTACA -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 6 7 159505 CASAVA_Build 3 27508166 1D CTCTCACCCA G/- GCTGGAGTGT 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 G 2 1 159506 CASAVA_Build 3 27511789 4I GCACAGAAAA ----/AGAT ATAATAGACT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 AGAT 0 1 159507 CASAVA_Build 3 27514525 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAATTATT 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 A 6 5 159508 CASAVA_Build 3 27516319 1I AAAAAAGTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2953 hom 39 14 17 8 G 0 1 159509 CASAVA_Build 3 27524355 1D CCTAGTCCAC A/- CTGAAATGCT 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 A 1 0 159510 CASAVA_Build 3 27527348 1I CCTCTCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 824 hom 37 2 28 7 T 13 14 159511 CASAVA_Build 3 27530052 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1484 hom 27 8 10 9 A 15 14 159512 CASAVA_Build 3 27533519 1I ATCTCAAAAA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 2298 hom 23 8 9 6 T 1 2 159513 CASAVA_Build 3 27541162 1D TACATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 11 10 159514 CASAVA_Build 3 27546383 1D ACTCTGTATC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 9 8 159515 CASAVA_Build 3 27561351 2D CTGTTAAAAC AG/-- AGAGAGAGAG 1358 het 1358 ref 49 29 3 20 AG 9 8 159516 CASAVA_Build 3 27580379 1I TGCCATATGG -/T TAAAATTCAG 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 1 2 159517 CASAVA_Build 3 27595164 2I ATGGTGTGGG --/GT GGGTGTGTGT 2980 het 2980 ref 39 21 14 4 GT 0 1 159518 CASAVA_Build 3 27603098 2I ATTTTTTTTT --/AG TAGTTGTTTT 3070 het 1998 hom 20 6 10 4 AG 0 1 159519 CASAVA_Build 3 27612739 2D GATTCTGGGC AT/-- ATTTACACAT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 AT 2 1 159520 CASAVA_Build 3 27620771 1D CAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 10 9 159521 CASAVA_Build 3 27624778 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1713 hom 10 het 10 0 4 6 T 13 12 159522 CASAVA_Build 3 27625624 1D AAATGAAGAC G/- GATTCAATAG 2482 het 2482 ref 24 17 6 2 G 2 1 159523 CASAVA_Build 3 27639262 1I TAGTAACTCA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 7 8 159524 CASAVA_Build 3 27644415 12D ACACATAGAG AGAGACACACAT/------------ AGAGACAAAA 930 het 930 ref 43 27 7 12 AGAGACACACAT 1 0 159525 CASAVA_Build 3 27646674 20D AATAATTACC AAATTGTGACAAATAGTTAA/-------------------- ATGGTAGGAC 2950 het 2950 ref 22 10 9 6 AAATTGTGACAAATAGTTAA 1 0 159526 CASAVA_Build 3 27648913 1D GGACAAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 T 13 12 159527 CASAVA_Build 3 27689246 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2697 het 1301 hom 9 3 6 0 A 11 12 159528 CASAVA_Build 3 27703108 1I AAAATAAAAA -/G TACAATCCAA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 G 0 1 159529 CASAVA_Build 3 27715556 1I ATAAAGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 12 13 159530 CASAVA_Build 3 27722428 1D TTTCTTTGCA T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 T 7 6 159531 CASAVA_Build 3 27728979 1D CGTGTCTCTT A/- ATGTGTATTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 2 1 159532 CASAVA_Build 3 27734327 1D AGAAACACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 15 14 159533 CASAVA_Build 3 27755643 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1400 het 1400 ref 30 14 4 13 T 15 14 159534 CASAVA_Build 3 27816261 1D TTATTTCAGC A/- AAAAAAATGT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 8 7 159535 CASAVA_Build 3 27816402 1I AACATTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 10 11 159536 CASAVA_Build 3 27819360 3D GTCACTTCTG GTC/--- CCATCATCAG 3070 hom 93 het 35 0 32 5 GTC 1 0 159537 CASAVA_Build 3 27819688 1I AAATCATTCA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 8 9 159538 CASAVA_Build 3 27826343 6I CTCAAAACAC ------/ATGGTT CCTTTTACAG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 ATGGTT 0 1 159539 CASAVA_Build 3 27829764 1D TTCTGAATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 9 8 159540 CASAVA_Build 3 27850897 1I TCTTATTTTC -/T TTTTTTAATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 6 7 159541 CASAVA_Build 3 27854308 1I TAGTTGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 31 1 27 3 A 11 12 159542 CASAVA_Build 3 27861750 1I CTTCCTGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 321 hom 28 2 21 5 T 11 12 159543 CASAVA_Build 3 27864648 1D CCCTATCCCA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 43 het 17 0 13 4 C 9 8 159544 CASAVA_Build 3 27930531 1D TACTAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 9 8 159545 CASAVA_Build 3 27935040 1I CTTATACTAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 8 9 159546 CASAVA_Build 3 27940729 5D AATAGCTATC TGATA/----- TAATTGTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TGATA 1 0 159547 CASAVA_Build 3 27941057 19I GTGTCTTATT -------------------/CATCTTTGTGTACCTAGCA CATCACACAA 3070 hom 99 het 40 0 34 7 CATCTTTGTGTACCTAGCA 0 1 159548 CASAVA_Build 3 27944955 1I TCATTGGGTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 7 8 159549 CASAVA_Build 3 27947585 3I GTGAAATCAT ---/TGA TTTTTTCTTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TGA 0 1 159550 CASAVA_Build 3 27962419 1I CTTTTCGTGG -/T TAAGAGTCGC 3070 het 3070 ref 66 33 28 5 T 1 2 159551 CASAVA_Build 3 27973678 1D TACCTACCTT C/- TAATTACTAG 3070 het 3070 hom 42 16 25 1 C 1 0 159552 CASAVA_Build 3 27991323 1D TAGTGCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 31 1 22 8 T 11 10 159553 CASAVA_Build 3 28006804 1D TGGTTTGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 11 10 159554 CASAVA_Build 3 28017381 1D ACTGGTAAGG A/- AAAAAATGCC 3070 het 3070 hom 47 18 21 9 A 7 6 159555 CASAVA_Build 3 28018834 1D ATAATACCAT A/- AAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 56 31 22 4 A 7 6 159556 CASAVA_Build 3 28022364 1I ATAAATGTAA -/T TGCCATCCTA 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 T 1 2 159557 CASAVA_Build 3 28028332 1D GGTGCGGGCC A/- AAAAAAAAAA 2287 het 119 hom 11 2 7 2 A 11 10 159558 CASAVA_Build 3 28052536 1I AAATATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 13 14 159559 CASAVA_Build 3 28054265 3I AAAAAGAAAT ---/GGA AGAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 GGA 0 1 159560 CASAVA_Build 3 28059968 1D CACAGAGGAT A/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 A 7 6 159561 CASAVA_Build 3 28061636 2D GTTGGCCGCT TA/-- TATGTCTTCT 3070 het 3070 ref 32 13 16 3 TA 2 1 159562 CASAVA_Build 3 28085221 2I CTGTGAGTGC --/AA AGACACTGTG 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 1 3 159563 CASAVA_Build 3 28087325 1I GGATTAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 10 11 159564 CASAVA_Build 3 28102363 1D ATAAGCAATA T/- TAAAATTTCT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 2 1 159565 CASAVA_Build 3 28103406 7I TGTTTTCCAG -------/CTGTCTC CTGTCTCGGT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 CTGTCTC 1 2 159566 CASAVA_Build 3 28107930 2I TCCATCCGGG --/TT TTTTTTTTCC 3070 hom 92 het 39 0 31 8 T 8 10 159567 CASAVA_Build 3 28108361 3D ATGTGAGGCT ACA/--- ACAAGAAGGT 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 ACA 2 1 159568 CASAVA_Build 3 28109684 4D TTTGGCAAAA TTAG/---- TTAGGATTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 9 TTAG 2 1 159569 CASAVA_Build 3 28116655 1I TGTTGCCCTC -/T TTTTTTCCTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 6 7 159570 CASAVA_Build 3 28117358 1I TCTGGTTTGG -/C CTATCTGCTT 3070 hom 129 het 51 0 43 8 C 1 2 159571 CASAVA_Build 3 28117701 1D CTCATGAAAC T/- TATAATCCAG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 1 159572 CASAVA_Build 3 28124434 4D CTTAAATACC TCTT/---- TCTTTTAATG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TCTT 2 1 159573 CASAVA_Build 3 28125380 1I ATTAAATGTC -/A TATCCCTTAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 159574 CASAVA_Build 3 28169869 2D TAAAATAAAC AT/-- TGATATATCA 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 AT 1 0 159575 CASAVA_Build 3 28183032 1D TTTTCTTTTT C/- TTTTTCTTTT 3070 het 3061 hom 27 7 16 4 C 1 0 159576 CASAVA_Build 3 28190257 1I TCCCTTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 17 20 10 T 9 10 159577 CASAVA_Build 3 28208298 1D ATATGCTCTA C/- TTTATTTACA 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 C 1 0 159578 CASAVA_Build 3 28210024 1I ACAGAAATTC -/T TTTATTATTA 3070 het 2268 hom 20 6 11 3 T 3 4 159579 CASAVA_Build 3 28222091 6D CTCCTGAATG ACTCCT/------ ACTCCTGGGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 ACTCCT 2 1 159580 CASAVA_Build 3 28225689 2D GAAACAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 38 18 15 7 AT 6 5 159581 CASAVA_Build 3 28225987 1I TTTAAACATG -/A AAAAAAAAAA 2032 hom 21 het 12 0 8 4 A 14 15 159582 CASAVA_Build 3 28241492 4I ACTTTCAAAG ----/TAGT TACTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TAGT 0 1 159583 CASAVA_Build 3 28256508 1I TTTTTAAAAA -/G TGTGTTGATT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 G 0 1 159584 CASAVA_Build 3 28264350 1D TAAGCTGTAC T/- TTTTTTTTTG 1976 het 1976 ref 66 48 5 13 T 10 9 159585 CASAVA_Build 3 28323140 1D AAATGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 1028 het 1028 ref 20 9 5 6 T 17 16 159586 CASAVA_Build 3 28325486 1D CAAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 het 220 hom 18 2 14 3 T 1 0 159587 CASAVA_Build 3 28392472 1I GATCTCATTC -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 0 1 159588 CASAVA_Build 3 28455539 1I TAGTATATAT -/C CTATGGTGTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 1 2 159589 CASAVA_Build 3 28501628 1D TAAAATTTTT C/- TTGAGTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 C 1 0 159590 CASAVA_Build 3 28541961 20I CCTTCTAGAT --------------------/CTTGCTTTACATACACTGAA ATGTGTGGGC 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 CTTGCTTTACATACACTGAA 0 1 159591 CASAVA_Build 3 28552448 4D AAAATGAGGC CATT/---- CAAATTATAA 3070 het 3070 hom 24 12 12 1 CATT 1 0 159592 CASAVA_Build 3 28566555 1I ATCTGCTTGC -/G ATAAATGTTA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 G 0 1 159593 CASAVA_Build 3 28570709 1D GATCTTTTTG C/- CATTGCATGT 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 C 2 1 159594 CASAVA_Build 3 28577753 1I CTCTTCTTTC -/T TTTGTGGTTG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 3 4 159595 CASAVA_Build 3 28581133 2D GTTCAGAAAC TA/-- TCTCTTGGCC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 TA 1 0 159596 CASAVA_Build 3 28583746 1D TGATCATAGT A/- AAATCCATGG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 4 3 159597 CASAVA_Build 3 28609843 1I AAATCAGGTT -/G AAAAAAAAAA 3070 het 1290 hom 42 3 30 9 G 0 1 159598 CASAVA_Build 3 28619312 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAATAC 1972 het 1972 ref 12 5 5 2 A 7 8 159599 CASAVA_Build 3 28622556 1D AAGCTCAGTA G/- GAAATCAAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 2 1 159600 CASAVA_Build 3 28623297 1D TGCTGACATT A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 4 A 7 6 159601 CASAVA_Build 3 28697464 2I ATGACCATGC --/AT ATGTTTGCAT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 AT 1 2 159602 CASAVA_Build 3 28697637 4D ATTCACAGTG TTTC/---- TTTTACCAAA 3070 hom 135 het 50 0 46 5 TTTC 1 0 159603 CASAVA_Build 3 28697759 1D CTAATAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 37 1 26 11 A 14 13 159604 CASAVA_Build 3 28698295 2I GAAGATGTAT --/GA GAGAGTGCAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 GA 2 3 159605 CASAVA_Build 3 28702328 6D AAAAAACATT ATAGTC/------ ATAAAGTCTT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 ATAGTC 1 0 159606 CASAVA_Build 3 28709029 3D ACTTTGTATA TAC/--- TACTTCCTTT 3070 hom 58 het 24 0 19 8 TAC 2 1 159607 CASAVA_Build 3 28709532 1I ACTATTAGTA -/T TTTTTTATAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 6 7 159608 CASAVA_Build 3 28712892 1I AAAAATTCAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 9 10 159609 CASAVA_Build 3 28722620 1D TTATCCCCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 10 9 159610 CASAVA_Build 3 28723618 1D ACTTGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 11 10 159611 CASAVA_Build 3 28724500 7D ACATACTCAC AGGTTCT/------- GGGGAGTATG 3070 het 3070 hom 40 19 21 3 AGGTTCT 1 0 159612 CASAVA_Build 3 28725169 3I AAGAAAAAAA ---/AAG AACAGAAATC 3070 hom 113 het 44 0 38 6 AAG 0 1 159613 CASAVA_Build 3 28740981 1I CCTCCATATT -/A AAAAAAATGC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 7 8 159614 CASAVA_Build 3 28741403 1I GCCATATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 31 0 24 7 A 11 12 159615 CASAVA_Build 3 28742202 1D AATGTATGTA T/- TAGTATCTTG 3070 het 3070 ref 37 20 15 5 T 2 1 159616 CASAVA_Build 3 28761399 1D ATTGGCACCA T/- TTATTATCAG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 3 2 159617 CASAVA_Build 3 28761719 1D GATAAATATT C/- CCGTATCCAT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 C 3 2 159618 CASAVA_Build 3 28762357 2I GTTCTGGCTC --/TT GTGTCTATTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 2 159619 CASAVA_Build 3 28774098 1D GTTGGATTTC T/- TTTTTTTTTT 974 het 974 ref 42 28 3 12 T 12 11 159620 CASAVA_Build 3 28787427 12I TTGGCCACAG ------------/ACTGAAGGCTAC AATGTTTGCT 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 ACTGAAGGCTAC 0 1 159621 CASAVA_Build 3 28800155 1I ACATGACCAT -/A AAAAAAAAAA 1827 het 1827 ref 18 10 4 4 A 10 11 159622 CASAVA_Build 3 28800891 1D ATCTATTTTA C/- CCCCCCCCTC 2113 het 1613 hom 20 8 7 5 C 9 8 159623 CASAVA_Build 3 28801287 1I CCCATGCAGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 8 9 159624 CASAVA_Build 3 28803653 3I TTTAAGAGTT ---/CTC AGTTTGCTCC 3070 het 3070 hom 46 15 25 6 CTC 0 1 159625 CASAVA_Build 3 28805781 3I TTGACACAAA ---/TCT TCTTAGTGGT 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 TCT 1 2 159626 CASAVA_Build 3 28810144 1I AAGGGAGCCC -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 6 7 159627 CASAVA_Build 3 28824660 1I AATATTTACC -/T TATGCCAATG 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 1 2 159628 CASAVA_Build 3 28833519 1I TTAATGTCTA -/G TTGCTTTAGC 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 G 0 1 159629 CASAVA_Build 3 28841586 1I TTAGATGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 9 10 159630 CASAVA_Build 3 28861335 1I TTGTATTGAG -/A AGCCACAGGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 1 2 159631 CASAVA_Build 3 28862476 1D ACCATCCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 16 17 13 A 15 14 159632 CASAVA_Build 3 28869863 1D GAAAGAAAAA T/- GAAAAGATCA 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 T 1 0 159633 CASAVA_Build 3 28880735 1D AATTAATCCA T/- TTTTTTTTTT 2752 het 2302 hom 24 8 10 6 T 13 12 159634 CASAVA_Build 3 28883072 1D ATTTGTCAAT A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 A 8 7 159635 CASAVA_Build 3 28884524 1I TCTCTTGGAC -/T GCCTGGTATG 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 0 1 159636 CASAVA_Build 3 28885422 1D ATTCCTCGCC T/- TTTTTTCCTT 2569 het 2569 ref 33 19 7 7 T 7 6 159637 CASAVA_Build 3 28886765 1I AAACCAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 T 9 10 159638 CASAVA_Build 3 28890762 2D GGAGGTTCTT TA/-- TATGTTATTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TA 2 1 159639 CASAVA_Build 3 28912755 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 TA 6 7 159640 CASAVA_Build 3 28915626 1D TTTCACCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 18 11 T 13 12 159641 CASAVA_Build 3 28935433 2D CTCCACCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 14 12 159642 CASAVA_Build 3 28942311 1I ATATAAATGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 9 10 159643 CASAVA_Build 3 28943932 4D TTAATAATTA AATT/---- AATTTTTTAT 3070 het 3070 hom 25 10 14 3 AATT 2 1 159644 CASAVA_Build 3 28971648 4D TAGGTACTTT AAAA/---- TAGGTGCTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 4 0 159645 CASAVA_Build 3 28979731 4I TTTCCTTGTC ----/ATTT ATTTTACTAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ATTT 1 2 159646 CASAVA_Build 3 28982348 1I CATTTGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 28 1 22 5 T 13 14 159647 CASAVA_Build 3 28984483 1I GTCTAACAAT -/A GTTTATTAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 1 159648 CASAVA_Build 3 28986734 1I GGTATACATT -/G GGCACCTGTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 2 3 159649 CASAVA_Build 3 28987423 1I CATAACCTGC -/T CATGTTCTGT 3070 hom 150 het 58 0 50 8 T 0 1 159650 CASAVA_Build 3 28991355 1I CTCCCCCTCC -/A GAAAAAAAAA 1330 het 1330 ref 23 18 3 2 A 0 1 159651 CASAVA_Build 3 29000357 1I GTATGTGTAG -/A AAAAAATCTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 6 7 159652 CASAVA_Build 3 29005318 4I CACTGATTTC ----/TTAA TTTCAGTGAT 3070 hom 104 het 36 0 35 1 TTAA 0 1 159653 CASAVA_Build 3 29017343 1I TTGATGGGCA -/T TTTTGGTTGA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 4 5 159654 CASAVA_Build 3 29038018 1I AAAATCAACA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 7 8 159655 CASAVA_Build 3 29038803 1I CTTTATATAA -/T TTTTTTTTAG 2379 het 2379 ref 29 17 6 6 T 8 9 159656 CASAVA_Build 3 29039317 4D TTCTTCTCTA ACTG/---- TGATCTGATA 3070 het 3070 ref 25 13 12 3 ACTG 1 0 159657 CASAVA_Build 3 29043602 7I AACTAAGAAC -------/TGTCTTA TGTCTTACCA 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 TGTCTTA 1 2 159658 CASAVA_Build 3 29049318 1D GATTAGCGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 T 10 9 159659 CASAVA_Build 3 29054059 3I ATATTAAAGT ---/AGC AGCTACATCT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AGC 1 2 159660 CASAVA_Build 3 29055740 1D CACCTGCCAT C/- ATATAAGATG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 C 1 0 159661 CASAVA_Build 3 29063283 2D CTATGGACAC TG/-- TGTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 TG 2 1 159662 CASAVA_Build 3 29078800 4I TTGCAGCAAC ----/CTGG ATGGAACCGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 CTGG 0 1 159663 CASAVA_Build 3 29083993 3D CCATCTCAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 30 15 10 8 AAC 4 3 159664 CASAVA_Build 3 29095713 3D ATTAAATGAA ATC/--- ATACACTCAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 ATC 1 0 159665 CASAVA_Build 3 29101020 1D ATTCATTGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 10 9 159666 CASAVA_Build 3 29102125 4D AAATGAAATC TTTG/---- TTTGTTTCTA 2938 het 2938 ref 23 13 7 4 TTTG 2 1 159667 CASAVA_Build 3 29102265 1D GCCACCCAGG C/- CTGGAGTGCA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 C 2 1 159668 CASAVA_Build 3 29103426 5D AGAGGGCATC CTTGT/----- CTTGTGCTGG 3070 het 3070 ref 32 15 14 5 CTTGT 2 1 159669 CASAVA_Build 3 29103717 5D TGGAAATTAA ACAAT/----- ACAATATGTC 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 ACAAT 2 1 159670 CASAVA_Build 3 29110709 1D AATTATTTGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 8 7 159671 CASAVA_Build 3 29115768 1D TTCCCAGCAG T/- GAGTAGCAGC 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 1 0 159672 CASAVA_Build 3 29117185 1I AGCCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 A 12 13 159673 CASAVA_Build 3 29123015 1D CCATTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 574 het 574 ref 42 29 3 10 A 13 12 159674 CASAVA_Build 3 29132700 1D TATGGTGAAA C/- CCCGACTCTA 3070 hom 27 het 19 0 10 9 C 4 3 159675 CASAVA_Build 3 29163803 1I AAAACAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2219 hom 38 9 23 6 A 10 11 159676 CASAVA_Build 3 29196530 2I GGGAGTTGAA --/AG AGAGATAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AG 2 3 159677 CASAVA_Build 3 29200008 1D AGCCAGTGGC G/- GGGGGGGATC 3070 het 11 hom 31 1 16 14 G 8 7 159678 CASAVA_Build 3 29211344 1I GTTTTTCTGA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 121 het 53 0 46 7 T 8 9 159679 CASAVA_Build 3 29237775 1D TTTTTTTTTT A/- AACTTTAAGT 3070 hom 64 het 25 0 21 4 A 3 2 159680 CASAVA_Build 3 29255056 1D TCATGAGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 57 hom 33 1 14 18 T 15 14 159681 CASAVA_Build 3 29263645 1D ATTGTCGTTC T/- TTTTTTTTTT 2118 het 534 hom 38 7 9 22 T 19 18 159682 CASAVA_Build 3 29272405 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 1199 het 1199 ref 24 13 5 6 A 19 18 159683 CASAVA_Build 3 29275145 1D AACCTAATGT A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 8 7 159684 CASAVA_Build 3 29297807 1I AGGACTTTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 7 8 159685 CASAVA_Build 3 29309759 6D CCAGGAGCAA TGTTGT/------ TGTTGTTCTG 3070 het 3070 ref 45 22 20 7 TGT 4 2 159686 CASAVA_Build 3 29310375 1I CAGTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 11 12 159687 CASAVA_Build 3 29313375 1I AAAGATGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 11 12 159688 CASAVA_Build 3 29339779 1D CTTTAGCTTA T/- TTTTTCACAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 6 5 159689 CASAVA_Build 3 29340492 1D GCCCACTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 19 1 14 4 A 15 14 159690 CASAVA_Build 3 29347025 2D TATTGTCTAT AA/-- AAAATCCATT 3070 hom 88 het 37 0 29 8 A 6 4 159691 CASAVA_Build 3 29350579 1I TGTGAGAGTG -/A AAAATTTAAA 3070 het 3070 ref 52 28 21 3 A 4 5 159692 CASAVA_Build 3 29372054 1D ATACAGCAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 9 19 7 A 10 9 159693 CASAVA_Build 3 29381813 2D AAATTAGGAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 AT 7 6 159694 CASAVA_Build 3 29383050 2D TAATTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 18 21 6 T 11 9 159695 CASAVA_Build 3 29386201 1I AAGGGACAAA -/G AAGAGACAGA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 G 0 1 159696 CASAVA_Build 3 29389016 1D GAAACTATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 88 het 36 0 30 6 A 10 9 159697 CASAVA_Build 3 29394991 4D TTAAAAAAAA AAAC/---- AAAAAACAAC 3070 hom 9 het 12 0 10 6 AAAC 1 0 159698 CASAVA_Build 3 29399325 3D CATCCTGGAT TTG/--- TTATTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 TTG 1 0 159699 CASAVA_Build 3 29407050 1D AAGTTTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 10 9 159700 CASAVA_Build 3 29415717 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 TA 6 7 159701 CASAVA_Build 3 29416209 1D AAAAGTAATA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 40 22 17 2 T 8 7 159702 CASAVA_Build 3 29425668 1D AGAAATAGAT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 8 7 159703 CASAVA_Build 3 29425831 1I ACCTGGACTC -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 6 7 159704 CASAVA_Build 3 29432858 3I TTGTATTCTT ---/CTC CTCAAAAATG 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 CTC 1 2 159705 CASAVA_Build 3 29433036 1D CCTATTTGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2597 hom 29 7 17 5 T 10 9 159706 CASAVA_Build 3 29434291 3I TTTTCAGAAG ---/TGA TGACACAATC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 TGA 1 2 159707 CASAVA_Build 3 29445069 1D GCTTTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1872 hom 36 7 15 14 A 15 14 159708 CASAVA_Build 3 29447274 22I TTTTAAAGGC ----------------------/TATGCAATGGGAAAAACTGCTT TAAACAAAGT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 TATGCAATGGGAAAAACTGCTT 0 1 159709 CASAVA_Build 3 29449610 1D TTTCTTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 15 13 T 11 10 159710 CASAVA_Build 3 29460710 1D GTTCTAAGTA T/- TTTGCACGTG 3070 het 3070 hom 46 16 28 2 T 4 3 159711 CASAVA_Build 3 29461908 1D CTGCTGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 A 12 11 159712 CASAVA_Build 3 29468071 1I TTTTGTGGTT -/G TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 G 0 1 159713 CASAVA_Build 3 29472299 1D ACACACGCAC A/- AAAAAAAAAA 2544 het 2544 ref 45 29 7 10 A 13 12 159714 CASAVA_Build 3 29474059 1I TCTACTAAAT -/A ATACAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 1 2 159715 CASAVA_Build 3 29480110 1D TGGTTAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1798 hom 33 8 11 14 A 17 16 159716 CASAVA_Build 3 29486160 2I AAACTAAACC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 AT 7 8 159717 CASAVA_Build 3 29487358 3I ATTTAATAAC ---/TAA TAATAACTAC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 TAA 2 3 159718 CASAVA_Build 3 29499637 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAATA 2232 hom 15 het 6 0 6 0 A 8 9 159719 CASAVA_Build 3 29504918 2D TGGGTTTTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 TC 6 5 159720 CASAVA_Build 3 29523508 4I TTGTTTGTTT ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 A 12 16 159721 CASAVA_Build 3 29523589 1I CTGATCTTTG -/T TTTTTTTTTA 1828 het 1828 ref 22 14 5 3 T 9 10 159722 CASAVA_Build 3 29525305 3D ATTTACACTC CCA/--- CCAACAGTGT 2463 het 489 hom 7 1 5 2 CCA 2 1 159723 CASAVA_Build 3 29527064 1I AGATTTCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 9 10 159724 CASAVA_Build 3 29530185 2I CAGAGTTTGT --/GA GAGAAGTATG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 GA 2 3 159725 CASAVA_Build 3 29530264 1D CTTCTATTTG A/- AAAAAAATAT 1338 het 1338 ref 42 34 3 6 A 8 7 159726 CASAVA_Build 3 29543386 1I CACCCCTCCC -/T TTTATCTCTT 3070 hom 121 het 50 0 43 7 T 3 4 159727 CASAVA_Build 3 29557788 4I ACCAATAGGC ----/CTCT CTAACAAGCC 3070 hom 135 het 47 0 43 4 CT 1 3 159728 CASAVA_Build 3 29557929 1I TCTTTCATTC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 T 7 8 159729 CASAVA_Build 3 29558036 3D ACCTTCACTG CCA/--- CAACCTCGTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 7 CCA 1 0 159730 CASAVA_Build 3 29560883 2D CTTACAAATT TG/-- TTTTTTTTTA 2587 het 2587 ref 30 19 7 4 TG 1 0 159731 CASAVA_Build 3 29564951 1D AAACAAAAAA C/- AAAACGACGT 2490 het 2490 ref 22 11 7 4 C 1 0 159732 CASAVA_Build 3 29568504 1I ACAAATGCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 9 10 159733 CASAVA_Build 3 29572383 1I ATTTCAAAAG -/C CTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 C 1 2 159734 CASAVA_Build 3 29572623 1I AATAAAGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 9 10 159735 CASAVA_Build 3 29577618 1I ACCACATTTT -/G CTTATCCAGT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 G 0 1 159736 CASAVA_Build 3 29584194 2I ATCAGCCCTC --/AT GTGCTTATCC 3070 het 3070 ref 45 30 12 3 AT 0 1 159737 CASAVA_Build 3 29586472 9I AAGAAAAGCA ---------/GTTGCATGT GTTGCTTAGG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 GTTGCATGT 0 1 159738 CASAVA_Build 3 29591779 1D AGGGTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 1375 het 1375 ref 36 28 3 5 T 13 12 159739 CASAVA_Build 3 29600394 2D TGGGAAATAG AC/-- ACACACACAC 2193 het 2193 ref 65 49 5 11 AC 8 7 159740 CASAVA_Build 3 29600782 2D TCCTCTCTGA CT/-- CTCCAGCTTT 3070 het 3070 ref 56 31 21 6 CT 2 1 159741 CASAVA_Build 3 29606586 1I AGTTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 26 hom 27 1 16 10 T 9 10 159742 CASAVA_Build 3 29608592 2D16M1I CGAAAAAAAA ATAAAAAAAACCAGTGGA-/--TAAAAAAACCAGTGGAT TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 29 23 10 2 N/A 0 0 159743 CASAVA_Build 3 29610019 1D GGGTGGGAAA C/- AATCAATACT 3070 het 3070 hom 56 28 23 6 C 1 0 159744 CASAVA_Build 3 29618037 9D CCAAGGTCAA ATGATGAAC/--------- ACTATGCATT 3070 het 3070 ref 34 20 14 5 ATGATGAAC 1 0 159745 CASAVA_Build 3 29619480 1I GTTCTCATAG -/A AACCTTCTTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 2 3 159746 CASAVA_Build 3 29622464 2D AACAAGGTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 12 13 T 15 13 159747 CASAVA_Build 3 29635765 1I TATTTTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 15 16 159748 CASAVA_Build 3 29637683 1I TGTCTGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 12 13 159749 CASAVA_Build 3 29643221 1D CAATGTTTAA T/- AAATATTACA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 1 0 159750 CASAVA_Build 3 29648516 1I ACTTCCTTGC -/A AAATGAATGA 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 A 3 4 159751 CASAVA_Build 3 29656989 1I GACCAAGAGC -/T TTGCTTCACT 3070 het 3070 ref 43 27 16 0 T 2 3 159752 CASAVA_Build 3 29657207 1I GTCCTTGGCA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 6 7 159753 CASAVA_Build 3 29663020 1D AGTTCTTTTT G/- TTTCACTACC 3070 het 3070 ref 37 17 17 4 G 1 0 159754 CASAVA_Build 3 29663108 1I AATTTTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 9 10 159755 CASAVA_Build 3 29663167 1D TTTTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1727 het 1727 ref 40 30 4 6 T 11 10 159756 CASAVA_Build 3 29664096 1I AGTATCTTAA -/G GGCTTAGGAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 G 2 3 159757 CASAVA_Build 3 29665210 1I AATTACAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 9 10 159758 CASAVA_Build 3 29668410 1D CATACTTATA T/- TTTTCAGCCT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 5 4 159759 CASAVA_Build 3 29679757 1I ACAGATAGTG -/C CTTTAATTTC 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 C 1 2 159760 CASAVA_Build 3 29680252 1D TTTCTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3048 hom 24 9 10 5 A 9 8 159761 CASAVA_Build 3 29683135 1D GCAAAACCAA T/- TTTTATCATT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 5 4 159762 CASAVA_Build 3 29705596 18D CTATATAGAA ATAGATATAGATATAGAT/------------------ ATAGATATAG 3070 het 3070 hom 27 10 15 6 ATAGAT 5 2 159763 CASAVA_Build 3 29716014 4I ATAATTTTAC ----/CATA CAATTTATTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 CATA 0 1 159764 CASAVA_Build 3 29717356 2I ATTATAAGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 760 hom 27 2 23 2 TG 5 6 159765 CASAVA_Build 3 29720825 2D AATCAAACAC AT/-- GTGTGTATTC 3070 het 3070 hom 32 15 13 8 AT 1 0 159766 CASAVA_Build 3 29733405 6I ATCATTGTAG ------/TACATA TACATGCATA 3070 het 3070 ref 54 23 20 11 TACATA 0 1 159767 CASAVA_Build 3 29736600 6I TGCCATTACC ------/CGCTAG CGCTAGCTCC 3070 het 3070 ref 43 15 17 11 CGCTAG 1 2 159768 CASAVA_Build 3 29746323 1I AATCCTAAGC -/A AAAAAGAACA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 5 6 159769 CASAVA_Build 3 29749863 1I AGTTATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 T 10 11 159770 CASAVA_Build 3 29753054 1I CAAGGGCAAA -/G GGGGTATTGA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 4 5 159771 CASAVA_Build 3 29762394 1I TTCATTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 11 12 159772 CASAVA_Build 3 29764444 4D CTAGGTAATT TGTC/---- TGCCTGCTGC 3070 het 3070 ref 37 20 13 6 TGTC 1 0 159773 CASAVA_Build 3 29764984 1D AGCAGTTTTT A/- AGTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 A 2 1 159774 CASAVA_Build 3 29776209 1D TCTCTTTCCT C/- CCCCCCCAGA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 C 8 7 159775 CASAVA_Build 3 29777155 1I TTTTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 13 14 159776 CASAVA_Build 3 29778821 4I AATGTCATAA ----/TTTT TGCTGACGAC 3070 het 3070 hom 61 25 31 5 T 1 5 159777 CASAVA_Build 3 29780619 1D CTTTTTTTAA G/- GGGGGATGTC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 G 6 5 159778 CASAVA_Build 3 29780878 1D GCAGAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 60 25 25 10 T 13 12 159779 CASAVA_Build 3 29795794 2I ATATGTAAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 AT 5 6 159780 CASAVA_Build 3 29796815 1D GTCAGATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 13 12 159781 CASAVA_Build 3 29809726 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 11 12 159782 CASAVA_Build 3 29816718 1I AAGGCCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1403 hom 23 5 11 7 T 12 13 159783 CASAVA_Build 3 29817312 1I AGAACACACA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 T 8 9 159784 CASAVA_Build 3 29818047 6I ACAGGCATGA ------/GCCACC GCACCTGACC 3070 het 2763 hom 29 7 19 4 GCCACC 0 1 159785 CASAVA_Build 3 29825833 1I TGATCAGTGG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 957 hom 31 3 18 10 A 0 1 159786 CASAVA_Build 3 29827956 1I GAACACCTTC -/T TATAAGCTGG 3070 hom 78 het 45 1 43 1 T 1 2 159787 CASAVA_Build 3 29848376 1I TAAAAAAAAA -/T TAACATGGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 159788 CASAVA_Build 3 29848997 3I TGAAGGGAAT ---/AAG AAGAACGGTT 3070 hom 156 het 58 0 51 7 AAG 1 2 159789 CASAVA_Build 3 29853277 2D ACCATTTCAC TA/-- TATATATATA 1317 het 1317 ref 31 16 4 11 TA 10 9 159790 CASAVA_Build 3 29881531 1I GAAGGAGGGA -/G GGGAGGAAGG 1538 het 1487 hom 19 7 5 7 G 3 4 159791 CASAVA_Build 3 29893327 1I TCTAGAGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 10 11 159792 CASAVA_Build 3 29919047 1I CCTAAAACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 9 10 159793 CASAVA_Build 3 29931651 1D GAGTGTTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 13 12 159794 CASAVA_Build 3 29938989 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1748 het 321 hom 18 4 5 9 A 21 19 159795 CASAVA_Build 3 29941100 1I TGGGAGGCCA -/G GGGGGCGGAT 1774 het 1774 ref 20 10 5 5 G 5 6 159796 CASAVA_Build 3 29944866 4I TTTCTTTCTA ----/TCTT AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 TCTT 0 1 159797 CASAVA_Build 3 30021692 1D TACATAGTGC A/- AAAAAAAAAA 2890 het 2890 ref 26 12 9 5 A 11 10 159798 CASAVA_Build 3 30033488 2D GTGTGTATAT AC/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 20 9 9 3 AC 1 0 159799 CASAVA_Build 3 30042889 2I AAAATAAAAC --/TT AGCATCAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 0 2 159800 CASAVA_Build 3 30046062 5I TCAAATAAAT -----/AAAAG AAATTTATCA 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 AAAAG 0 1 159801 CASAVA_Build 3 30047557 5I TGGAGAGCTC -----/AGAGT AGAGTGGAAT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AGAGT 1 2 159802 CASAVA_Build 3 30065842 1D AGTCCTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 10 9 159803 CASAVA_Build 3 30089768 1D TGGATGGCTT A/- TCTGGATAGA 3070 het 3070 hom 52 24 25 3 A 1 0 159804 CASAVA_Build 3 30095709 1D CTTCCTCCCT C/- CCTCCCTCCC 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 C 3 2 159805 CASAVA_Build 3 30095792 4D AGTGTGTGAA AAAT/---- AAATAGATAG 3070 het 3070 hom 25 9 14 4 AAAT 2 1 159806 CASAVA_Build 3 30096849 2D CCAACTGCAC AT/-- GTTTCACATA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 AT 1 0 159807 CASAVA_Build 3 30097449 4D ATACATATAT ACAC/---- ACACACACAC 1277 het 1277 ref 22 12 4 6 AC 12 10 159808 CASAVA_Build 3 30097630 1D TCGGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 1053 het 1053 ref 24 9 5 11 A 12 11 159809 CASAVA_Build 3 30097697 1D TAGATCAAAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 9 8 159810 CASAVA_Build 3 30099795 3D TTCTTTGTCC CTT/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 49 24 21 5 CTT 1 0 159811 CASAVA_Build 3 30104053 1D CTCCGTCGCC A/- AAAAAAAAAT 1862 het 324 hom 8 1 5 2 A 10 9 159812 CASAVA_Build 3 30107420 1D CTCTTAACAA T/- TTTTAAGTGA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 5 4 159813 CASAVA_Build 3 30111349 10D ATTATATATT TGATAAGTAC/---------- TTTTTATGTG 3070 het 3070 ref 35 24 11 4 TGATAAGTAC 1 0 159814 CASAVA_Build 3 30111815 7D CCGTGCTACC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 1692 hom 34 7 22 8 A 17 10 159815 CASAVA_Build 3 30113661 1D ATAGGCCTTG C/- CCAAAACTGA 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 C 3 2 159816 CASAVA_Build 3 30114606 1I CTTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 10 11 159817 CASAVA_Build 3 30115886 3D AAGACTGCTG TAA/--- TAATTATTGT 3070 het 3070 ref 50 29 17 6 TAA 2 1 159818 CASAVA_Build 3 30137532 1I ATTAAGTAGT -/A AAAAAAAAAG 2857 het 2857 ref 25 14 9 2 A 9 10 159819 CASAVA_Build 3 30151531 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1381 hom 23 5 11 11 A 15 16 159820 CASAVA_Build 3 30153178 8I CCCAGAAAGG --------/TTATACAT TAGTAGATGA 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 TTATACAT 0 1 159821 CASAVA_Build 3 30153238 1D TAATGAAGCT A/- AAAAAAAAAA 2092 het 2092 ref 46 30 5 11 A 11 10 159822 CASAVA_Build 3 30154669 2I ACTCACTGTG --/AT ATTATTTGTA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 AT 1 2 159823 CASAVA_Build 3 30156389 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2825 het 1790 hom 29 8 11 10 A 17 18 159824 CASAVA_Build 3 30243232 1D GCTAGAGTAA C/- CTAAACTTTA 3070 het 3070 hom 46 20 20 7 C 2 1 159825 CASAVA_Build 3 30272657 1I ATTTTGAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 9 10 159826 CASAVA_Build 3 30275385 1I CCTTCCATTA -/G CCTGCGCTGG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 G 0 1 159827 CASAVA_Build 3 30278559 4D TTGGGAAGCC CAAT/---- CCCAGAACTA 3070 het 3070 ref 30 16 13 3 CAAT 1 0 159828 CASAVA_Build 3 30279924 1D TCTCACAGGG T/- TCCTTGGGGA 3070 het 3070 hom 38 17 15 7 T 2 1 159829 CASAVA_Build 3 30281406 1D TAGATATAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 A 9 8 159830 CASAVA_Build 3 30326533 1D GAACTCTTAA C/- CCCAAAGTAA 3070 hom 117 het 42 0 34 8 C 4 3 159831 CASAVA_Build 3 30328891 1I AGATGTTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 9 10 159832 CASAVA_Build 3 30347240 1I TCTTCCTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 A 10 11 159833 CASAVA_Build 3 30349759 1D AATTTGTGTG T/- TAAAAAGAGT 3070 het 3070 hom 55 25 24 6 T 2 1 159834 CASAVA_Build 3 30351158 2I TAGAAGATTT --/AG AGAGTGCGAG 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 AG 2 3 159835 CASAVA_Build 3 30355675 1D GAAGACAGAG A/- AAAAAAAAAA 1778 het 1778 ref 37 21 6 10 A 17 16 159836 CASAVA_Build 3 30359222 2D ATATATATAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 12 hom 26 2 21 4 AG 10 9 159837 CASAVA_Build 3 30361697 8D CATATACACA ACACATAT/-------- ACACATGTAT 2646 het 2646 ref 19 9 6 4 ACACATAT 1 0 159838 CASAVA_Build 3 30362636 3D GATGTTTCAC AAA/--- AAAAAAAAAA 2805 het 2805 ref 25 13 9 4 A 16 13 159839 CASAVA_Build 3 30407056 30D GTGGAAAAAT TTATAATAAATTTTGTTTTATGTGCAAAAG/------------------------------ CATGTTATGC 3070 hom 105 het 33 0 36 8 TTATAATAAATTTTGTTTTATGTGCAAAAG 1 0 159840 CASAVA_Build 3 30408389 2I AATGCAGTAA --/AT GTGTTGGGGA 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 AT 0 1 159841 CASAVA_Build 3 30444378 1D TCTTCTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 T 13 12 159842 CASAVA_Build 3 30453441 2D AAAGAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1012 hom 32 4 13 16 A 12 10 159843 CASAVA_Build 3 30469576 1D GAATCCCTCA G/- GAAAGACTTC 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 G 2 1 159844 CASAVA_Build 3 30472484 1D AAATTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 T 15 14 159845 CASAVA_Build 3 30480399 1D ATCCATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 20 8 T 13 12 159846 CASAVA_Build 3 30484154 1I TAGATACACA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 8 9 159847 CASAVA_Build 3 30494724 1D TACATGTGAC T/- TTGGTTAGTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 3 2 159848 CASAVA_Build 3 30497948 4I TGTGAAGAGG ----/TGCC TTTGGCTATG 3070 hom 71 het 30 0 21 9 TGCC 0 1 159849 CASAVA_Build 3 30498701 1D TTTCTTTTTA T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 T 8 7 159850 CASAVA_Build 3 30499273 1D TATTTTCAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 10 9 159851 CASAVA_Build 3 30505313 2D ACTCATACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 66 het 29 0 22 7 AC 9 8 159852 CASAVA_Build 3 30505509 2D ATACTCTGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 28 11 A 14 12 159853 CASAVA_Build 3 30507448 1I TTTCATGAAA -/C CCTCCTGTGC 3070 hom 60 het 28 0 21 7 C 2 3 159854 CASAVA_Build 3 30520889 1I AACAGCTTAG -/A AAAAAAAAAG 2883 het 2883 ref 41 28 7 6 A 9 10 159855 CASAVA_Build 3 30525131 1I GTACATAACC -/A AAAAAAAAAA 2633 het 2633 ref 36 13 11 12 A 14 15 159856 CASAVA_Build 3 30529073 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 41 15 19 8 AT 6 5 159857 CASAVA_Build 3 30546940 1I GATAGTATGG -/C CATCCTAACT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 C 1 2 159858 CASAVA_Build 3 30559424 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 21 0 18 3 A 13 12 159859 CASAVA_Build 3 30564351 12D TGTATCATGC TGACAGTGCCAT/------------ TTGTTAAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TGACAGTGCCAT 1 0 159860 CASAVA_Build 3 30567014 2D CCTAGGTTGC AG/-- AGTGTCTCAC 3070 hom 109 het 45 0 39 7 AG 2 1 159861 CASAVA_Build 3 30577698 1I TTTGTTTTTC -/T TTGCTTTACT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 2 3 159862 CASAVA_Build 3 30578277 1D CAGATTATGC T/- TTTTTTTTTT 1382 het 1382 ref 33 22 3 8 T 11 10 159863 CASAVA_Build 3 30579019 1I TTTTATCACC -/A AAAAATCATT 3070 hom 143 het 52 0 48 4 A 5 6 159864 CASAVA_Build 3 30579629 1I AAGCATTTAG -/C CTGCTAGTGA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 1 2 159865 CASAVA_Build 3 30585928 1I GACAGGAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 8 9 159866 CASAVA_Build 3 30607673 1D ATTAATCTTT A/- ATTTTTTTTG 3070 hom 120 het 42 0 40 4 A 2 1 159867 CASAVA_Build 3 30610483 1D GGCTGTGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 51 0 40 11 T 10 9 159868 CASAVA_Build 3 30612067 1D TTATTAGTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 29 0 28 1 T 10 9 159869 CASAVA_Build 3 30615902 11I TGTCTCCTGC -----------/TTTGAGAGACA TAGAATATCT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TTTGAGAGACA 0 1 159870 CASAVA_Build 3 30626822 1I AAAAGCCTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 9 10 159871 CASAVA_Build 3 30628110 21D GGGTGTCGGA AAGAGAATTTTATTACGAATG/--------------------- AAGTGCTAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 10 AAGAGAATTTTATTACGAATG 1 0 159872 CASAVA_Build 3 30629243 4I GTGTACAATC ----/AATT GTGTACAACT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 AATT 0 1 159873 CASAVA_Build 3 30632390 1I GACCGGCCAG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 2611 hom 32 8 15 9 T 6 7 159874 CASAVA_Build 3 30657155 1D CAATTTTTTT A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 40 17 17 8 A 7 6 159875 CASAVA_Build 3 30677790 2D AGGTGTGAAA CT/-- CTCTTTGTGG 3070 het 3070 ref 49 23 17 11 CT 3 2 159876 CASAVA_Build 3 30679681 2I ACTCTCTTTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 49 20 15 14 TG 8 9 159877 CASAVA_Build 3 30679784 1D CTTCAAGGTT A/- ATGGGTCTAT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 2 1 159878 CASAVA_Build 3 30685078 1I CAAGAGCATC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 58 27 25 6 T 8 9 159879 CASAVA_Build 3 30686298 1D TCTTTGTTAG A/- AAATGATTTG 3070 het 3070 ref 25 9 8 8 A 4 3 159880 CASAVA_Build 3 30690069 5D GCTTTTATAC AATTT/----- AATTTAGTAG 3070 het 3070 hom 36 13 22 2 AATTT 2 1 159881 CASAVA_Build 3 30690221 1D TTTCAGGAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 9 8 159882 CASAVA_Build 3 30700597 1D TCCTACAAGT C/- CTAATGGAGG 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 C 2 1 159883 CASAVA_Build 3 30708406 2D AGCTATGTTT TA/-- TATATATATA 2459 het 2080 hom 20 9 7 4 TA 9 8 159884 CASAVA_Build 3 30710335 1I TTTGTTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 T 9 10 159885 CASAVA_Build 3 30713496 1D AACTAGTTTC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 T 9 8 159886 CASAVA_Build 3 30720911 3I ATGGTGTCAG ---/GGA GGAGGACGAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 GGA 2 3 159887 CASAVA_Build 3 30725886 4D AAACTTAGAT TAAA/---- TAAATCTGTT 3070 het 3070 ref 43 25 17 3 TAAA 2 1 159888 CASAVA_Build 3 30730175 1I TAGAAATGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 8 9 159889 CASAVA_Build 3 30733395 1I TACCTGGTCT -/C CCCAGTGTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 3 4 159890 CASAVA_Build 3 30743672 12I ACATATATAT ------------/TTCCCAAATTTG TTCCCAAATT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 TTCCCAAATTTG 0 1 159891 CASAVA_Build 3 30756989 2D GATACACGTC AA/-- GTTATGTTCA 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 A 2 0 159892 CASAVA_Build 3 30758863 1D ATTTAATATA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 T 8 7 159893 CASAVA_Build 3 30762251 4I ATACCTGAAC ----/TAAA TTTTTCTTTT 3070 het 2446 hom 22 7 11 4 TAAA 0 1 159894 CASAVA_Build 3 30767143 1D TTGCAGCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 33 1 10 23 T 11 10 159895 CASAVA_Build 3 30767948 1I TTTTATTCCT -/C TCGTGTCTTC 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 C 0 1 159896 CASAVA_Build 3 30768295 1I CATAGTTTTT -/A AGAGGAAAGT 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 1 2 159897 CASAVA_Build 3 30768488 4D11M2I GATGGCTGTC TAAATAAGATAGGAC--/----TAAGATAGGACGA GATTCTGAAA 3070 het 3070 ref 37 21 14 10 N/A 0 0 159898 CASAVA_Build 3 30768678 4I TGTAGTGCTG ----/TTTA TTAAGTTCTC 3070 het 3070 ref 55 25 25 5 TTTA 0 1 159899 CASAVA_Build 3 30769319 2I GAAGACAAGA --/GT GTTTTCTATT 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 GT 1 2 159900 CASAVA_Build 3 30769453 6D GTTTTTTAAC TTGGTT/------ TTGAACACTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TTGGTT 1 0 159901 CASAVA_Build 3 30770006 1D GGATAGTTTC T/- TTGTAGAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 9 8 T 3 2 159902 CASAVA_Build 3 30770104 3I29M2I TAAAGATAAC ---TTGTTTTCTTACAGTACTTAAGATCACTC--/TTGTTGTTTTCTTACAGTACTTAAGATCACTCTT TTGTTTACTT 3070 het 3070 hom 46 21 28 3 N/A 0 0 159903 CASAVA_Build 3 30770865 2I CCTTCAGGAA --/AG AGAATATGTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 AG 1 2 159904 CASAVA_Build 3 30770991 1I TCTTCAGGAG -/T TTCTGGGAGC 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 T 2 3 159905 CASAVA_Build 3 30771129 1D CCAAGAATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 20 16 7 A 10 9 159906 CASAVA_Build 3 30771357 3I AGGGCACTGA ---/TTT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 8 11 159907 CASAVA_Build 3 30772082 2D CATTTTTGCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 TG 7 6 159908 CASAVA_Build 3 30772225 4D GGAAATGTTC AATA/---- AATAATTGTT 3070 het 3070 ref 44 20 19 8 AATA 2 1 159909 CASAVA_Build 3 30772321 3I CCAAAGGTAC ---/TTT TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 7 10 159910 CASAVA_Build 3 30773400 2I GGGGGTAGTT --/TG TATGTAGCAA 3070 het 3070 hom 53 23 25 5 TG 0 1 159911 CASAVA_Build 3 30774913 3I GCCTTTTATC ---/TTT TTTCCCGTCT 3070 hom 74 het 31 0 24 7 T 3 6 159912 CASAVA_Build 3 30775515 7I CATACCTGCA -------/CATAAGC CATAATTTCA 3070 het 3070 hom 52 21 22 9 CATAAGC 0 1 159913 CASAVA_Build 3 30775753 4D ATGTAAATCT TTAA/---- TTATCTATAA 3070 het 3070 ref 40 18 16 8 TTAA 1 0 159914 CASAVA_Build 3 30776139 1D CCTAAACCTG T/- TTTTTAAAAG 3070 hom 163 het 61 0 55 6 T 6 5 159915 CASAVA_Build 3 30777536 1I CCACAAAACA -/T TTTTGCAACT 3070 het 3070 hom 44 12 23 9 T 4 5 159916 CASAVA_Build 3 30777763 1D25M3D GTCTCCAGGG AAGAAGACAGCTAGAGCCTCTCAGAGCTC/-AGAAGACAGCTAGAGCCTCTCAGAG--- CTCAACAAGC 3070 het 3070 ref 38 28 16 7 N/A 0 0 159917 CASAVA_Build 3 30777977 4D GATAGATATG TTTA/---- TTTTTACTGC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TTTA 1 0 159918 CASAVA_Build 3 30778218 2I GGAAGTAGAC --/AG AAAGTAACAT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 AG 0 1 159919 CASAVA_Build 3 30779340 4D GTGATGTTAG TCTT/---- TCTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 TCTT 2 1 159920 CASAVA_Build 3 30779999 12D CTCCGTCTCG GCGGCGGGGGGT/------------ GGGGGTGGGG 174 het 174 ref 6 1 4 5 GCGGCGGGGGGT 1 0 159921 CASAVA_Build 3 30780275 4I ACCATATCTT ----/TATA TATCTATCTC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TA 1 3 159922 CASAVA_Build 3 30780664 2D52M7I TTTTATACTT AAAGTTTTTCAAAACTTAGTTCTTAAGTAACTGAGGACATGAAGAAAAATTCTC-------/--AGTTTTTCAAAACTTAGTTCTTAAGTAACTGAGGACATGAAGAAAAATTCTCTTAATAG TTAAGAGATT 3070 het 3070 ref 24 17 16 6 N/A 0 0 159923 CASAVA_Build 3 30781427 2D AACATCCTGC AA/-- AGAGGGGGGA 3070 het 3070 ref 48 24 20 6 A 3 1 159924 CASAVA_Build 3 30781533 4I GCAAATTGAC ----/TTTT TTTTTCCTTC 3070 het 3070 ref 57 30 16 11 T 5 9 159925 CASAVA_Build 3 30781619 3I ACGCAAGACA ---/GAG GAGGTAGTTC 3070 het 3070 ref 61 29 24 8 GAG 1 2 159926 CASAVA_Build 3 30781812 4I GCAGACCAAC ----/TCAA TCACACTTTC 3070 hom 185 het 67 0 62 5 TCAA 0 1 159927 CASAVA_Build 3 30781969 1D AAATTATTTT C/- TATGCATCTA 3070 het 3070 hom 47 22 22 4 C 1 0 159928 CASAVA_Build 3 30782443 2I CTGGCAAGAC --/GG GGGAAGAAAA 3070 het 3070 hom 54 14 28 12 G 3 5 159929 CASAVA_Build 3 30783061 1I GATTTTTTTT -/C CTCTTAATGA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 C 1 2 159930 CASAVA_Build 3 30783273 1I70M2D TAGCAGAGGA -CAAGGTAAGAAGGTTGAGTAAATCAGATCACTGTAGTCCCTGAATGATCATAGACTTTCCTATGGGACAAGG/CCAAGGTAAGAAGGTTGAGTAAATCAGATCACTGTAGTCCCTGAATGATCATAGACTTTCCTATGGGACAA-- GGGGAAACAT 3070 het 3070 ref 39 32 18 11 N/A 0 0 159931 CASAVA_Build 3 30783913 2D GCACAAAAAC AG/-- AAACGCAGAT 3070 het 3070 ref 44 22 22 0 AG 1 0 159932 CASAVA_Build 3 30784532 3D ACTCCCCATA CCC/--- CCCCCCCCCT 3070 het 416 hom 28 4 15 11 C 12 9 159933 CASAVA_Build 3 30786062 1D CTTAGGCTAC A/- AAGAACATCT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 3 2 159934 CASAVA_Build 3 30786438 45I TTTAGGTAAG ---------------------------------------------/AATTACAAGCTAAAAGCCTGAAGGCCAGATCCCACTGGCAAATGT ATATTACACA 3070 het 3070 ref 38 22 14 6 AATTACAAGCTAAAAGCCTGAAGGCCAGATCCCACTGGCAAATGT 0 1 159935 CASAVA_Build 3 30787095 3I GTTTACTGTT ---/GTG AGCTGTGGGT 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 GTG 0 1 159936 CASAVA_Build 3 30787310 5D CAACAGAAAC AAGAG/----- AAGAGAGGCT 3070 het 3070 hom 41 16 23 5 AAGAG 2 1 159937 CASAVA_Build 3 30788127 1I ATACTATAAA -/T TTCTGTAGCA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 2 3 159938 CASAVA_Build 3 30788394 1D TCTAGCCGCT C/- CTAAGTCCAG 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 C 2 1 159939 CASAVA_Build 3 30789516 1I TTAGGAAGGA -/G GGGGAGAGAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 G 4 5 159940 CASAVA_Build 3 30789923 1D CACAAACATA C/- ATTATAGAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 C 1 0 159941 CASAVA_Build 3 30791086 4D AATCTTATCA CTTC/---- CTTATGTATT 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 CTTC 1 0 159942 CASAVA_Build 3 30800145 3D GTGTAATAAA AAG/--- AAAAGCGGCA 3070 hom 120 het 46 0 41 8 AAG 1 0 159943 CASAVA_Build 3 30810294 3D TTTCTTACTT CAG/--- CAGCCGCTTA 3070 hom 94 het 38 0 31 7 CAG 2 1 159944 CASAVA_Build 3 30810795 3I CCTGAGCTGT ---/TTG TTGTTGTTGA 3070 hom 109 het 43 0 37 6 TTG 3 4 159945 CASAVA_Build 3 30815262 1I CTGTAAGGTC -/A AAAAGCAGGC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 4 5 159946 CASAVA_Build 3 30817602 1I AAAGAAAAGA -/T TTACAAGACT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 3 159947 CASAVA_Build 3 30822231 12D GTCCCCAGCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2547 het 2547 ref 32 11 10 14 T 24 12 159948 CASAVA_Build 3 30842177 1I ACAGAAAACC -/A AACGCTGCAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 3 159949 CASAVA_Build 3 30856568 2I CTGAGAAATA --/GT GACAAGAATA 3070 het 3070 hom 54 22 27 5 GT 0 1 159950 CASAVA_Build 3 30935049 1D TGACCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 884 het 884 ref 46 31 3 12 A 13 12 159951 CASAVA_Build 3 30994959 1D GTCCCCACCC A/- AATCTCATGT 3070 het 3070 ref 35 20 8 8 A 3 2 159952 CASAVA_Build 3 31010764 4D ATAGAAAGAG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 TA 8 6 159953 CASAVA_Build 3 31023804 8I AACAAGCAAA --------/CAAAAAAC CAAAAAACGC 3070 het 3070 hom 53 21 22 10 CAAAAAAC 1 2 159954 CASAVA_Build 3 31024529 4I TGATGATGAT ----/GATA GATAGATAGA 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 GATA 3 4 159955 CASAVA_Build 3 31027515 1D AAAGTTTCTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 9 8 159956 CASAVA_Build 3 31030366 3D CCAGTGACTC AAT/--- GATAGGTAAG 3070 het 3070 ref 43 20 17 8 AAT 1 0 159957 CASAVA_Build 3 31034118 1D GAAATTAAGA T/- TGCTAATCAG 3070 het 3070 ref 46 28 15 4 T 2 1 159958 CASAVA_Build 3 31065025 1D CCTCTGCTGC T/- TGATAGAAGG 3070 het 3070 ref 38 20 17 2 T 2 1 159959 CASAVA_Build 3 31106562 1D GCAATCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 12 11 159960 CASAVA_Build 3 31134225 4D TGACACGGAA ATAG/---- ATAGGTAATA 3070 het 3070 hom 36 10 23 4 ATAG 2 1 159961 CASAVA_Build 3 31135100 1D GCTTGACTAT G/- GGGGGGATAA 3070 het 3070 hom 46 19 19 9 G 7 6 159962 CASAVA_Build 3 31138440 1D CTAGCAGGAG T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 T 7 6 159963 CASAVA_Build 3 31139230 1D TGATTATATC A/- GGGGTTGACA 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 A 1 0 159964 CASAVA_Build 3 31140588 1I AGCAGAGATC -/G GGGGGGAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 6 7 159965 CASAVA_Build 3 31142630 1I TGGGCTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1620 hom 38 7 17 14 T 17 18 159966 CASAVA_Build 3 31157532 12I GACATACACA ------------/ATGATACCATTT ATGTCAGCCC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 ATGATACCATTT 0 1 159967 CASAVA_Build 3 31170198 1D GAAAATCAGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 9 8 159968 CASAVA_Build 3 31173059 1D GAACGCACCT G/- GGTTTCTGCA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 G 3 2 159969 CASAVA_Build 3 31193964 2D CTTGATTCTA TC/-- TCTCTCTCTC 1373 het 1373 ref 36 30 3 3 TC 9 8 159970 CASAVA_Build 3 31238061 6D ATTCCATCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2676 het 23 hom 32 1 12 23 A 20 14 159971 CASAVA_Build 3 31250422 1I ACAGCAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 11 12 159972 CASAVA_Build 3 31252174 1I CAACAGCCCT -/G GGAAAGTAGG 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 G 2 3 159973 CASAVA_Build 3 31254997 2D GTCCCTCCCT AG/-- GGAAACCTTA 3070 het 3070 ref 42 20 18 5 AG 1 0 159974 CASAVA_Build 3 31256073 1D TGAAGCTGAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 8 7 159975 CASAVA_Build 3 31256870 23I TGCTAACTAA -----------------------/TGTGGAAGTTTCAGAGAAGTTAT TGTGGCAGTT 3070 het 3070 ref 39 23 11 6 TGTGGAAGTTTCAGAGAAGTTAT 0 1 159976 CASAVA_Build 3 31259260 13D ATAATGGTAC ATTATTATTATAA/------------- AATAATAATT 3070 het 1881 hom 17 4 13 2 ATTATTATTATAA 1 0 159977 CASAVA_Build 3 31265453 1D TATTTGGAAC A/- AAGGTCTTCA 3070 het 3070 hom 57 25 27 6 A 3 2 159978 CASAVA_Build 3 31268723 1D AAGGGGAATT G/- GGGGGGTCAA 3070 het 3070 ref 49 19 17 14 G 7 6 159979 CASAVA_Build 3 31274093 1I TTTGTGTGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 9 10 159980 CASAVA_Build 3 31275557 1I TCACTGGGCC -/A AAAACATTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 4 5 159981 CASAVA_Build 3 31283631 8I CAAATGCTTT --------/TCCAAGAA CATTGGTACA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 TCCAAGAA 0 1 159982 CASAVA_Build 3 31293835 3I CATTTCCTCC ---/TTG TTGTGGCTTC 3070 het 3070 ref 51 27 15 9 TTG 1 2 159983 CASAVA_Build 3 31306893 2D GGTCAGATCA TT/-- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 9 7 159984 CASAVA_Build 3 31320915 1I ACCGGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 2748 het 637 hom 20 7 9 4 G 0 1 159985 CASAVA_Build 3 31321098 1I TTTTTATGGA -/G GTTCCATTAC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 G 1 2 159986 CASAVA_Build 3 31330944 1D AAATTAATTT G/- CTGAGTCATC 3070 het 3070 ref 42 21 15 8 G 1 0 159987 CASAVA_Build 3 31334517 1D AAAAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 2672 het 2672 ref 30 14 8 9 A 14 13 159988 CASAVA_Build 3 31342106 1I TTACTGGAGT -/A GATGGAGCAG 3070 het 3070 ref 61 30 26 5 A 0 1 159989 CASAVA_Build 3 31356193 1I AAATTTAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 A 14 15 159990 CASAVA_Build 3 31371043 1D ATCTGCCTGG T/- TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 7 6 159991 CASAVA_Build 3 31391269 1D TGCATACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 A 11 10 159992 CASAVA_Build 3 31393299 1I ACTCTGTGTA -/C CTGCAATTTT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 C 1 2 159993 CASAVA_Build 3 31396365 1D ATAAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 512 hom 25 5 10 10 T 13 12 159994 CASAVA_Build 3 31398342 1D GAGAGATAGA T/- TAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 40 16 17 8 T 2 1 159995 CASAVA_Build 3 31408280 1D TTAATGCATT C/- TACAGCACTG 3070 het 3070 hom 53 21 23 10 C 1 0 159996 CASAVA_Build 3 31467771 1D TGCCTACACC A/- AAAAAAAAAA 2730 het 2586 hom 33 13 8 12 A 17 16 159997 CASAVA_Build 3 31551622 1I AATGGAAGGC -/T TAACGACTGT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 1 2 159998 CASAVA_Build 3 31562128 24D CCTGTCCCCT TAGTTTCCCCCTTAGCACTAGGCA/------------------------ ACATTATGCT 3070 het 3070 ref 31 23 12 5 TAGTTTCCCCCTTAGCACTAGGCA 1 0 159999 CASAVA_Build 3 31562790 3D TGAGATGATT GTA/--- GTCACCTGGA 3070 het 3070 hom 45 17 23 6 GTA 1 0 160000 CASAVA_Build 3 31575846 7I TTGCTATAAA -------/CTTATCT CTTAGCATGG 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 CTTATCT 0 1 160001 CASAVA_Build 3 31596233 3I ATGTAATGAT ---/AAA GAAGAGTACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 3 160002 CASAVA_Build 3 31602824 4I TATATTTTGG ----/AAAT AAATACTTTA 3070 hom 144 het 54 0 48 6 AAAT 1 2 160003 CASAVA_Build 3 31603764 4I AACACTCCAA ----/AAAG AAAGCCTCGC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 AAAG 1 2 160004 CASAVA_Build 3 31621998 4D TCTCATGGTG GTGA/---- GTAAGTCTCA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 GTGA 1 0 160005 CASAVA_Build 3 31622998 1D CAGTTCAGAC A/- ATGGCTTCAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 2 1 160006 CASAVA_Build 3 31624918 1D GGGTTGGGGG A/- AACTGAAAGT 3070 het 3070 ref 28 13 14 1 A 3 2 160007 CASAVA_Build 3 31626977 5I CAATGTAAGC -----/TGCAA TGCAATGCCT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TGCAA 1 2 160008 CASAVA_Build 3 31630164 1D TGCATGGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 T 10 9 160009 CASAVA_Build 3 31631218 2I GTATTAAGTC --/AT GTGTATTTTG 3070 het 3070 ref 45 20 12 13 AT 0 1 160010 CASAVA_Build 3 31634784 9I ATTTGTCTTT ---------/TACCTAACA TATAACATTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TACCTAACA 0 1 160011 CASAVA_Build 3 31638520 5I TGGTTTTATA -----/GTGTG GTTTTAAGTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 GTGTG 0 1 160012 CASAVA_Build 3 31641167 1D CAGAATCGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1400 hom 40 15 10 15 T 17 16 160013 CASAVA_Build 3 31641261 1D ATTGTTTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 T 10 9 160014 CASAVA_Build 3 31649166 2D TTTTGGTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2030 hom 37 11 13 13 T 16 14 160015 CASAVA_Build 3 31650112 1D TAAGATAATT A/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 1 0 160016 CASAVA_Build 3 31654308 3D TCAGGTTTTT TTG/--- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 TTG 1 0 160017 CASAVA_Build 3 31657679 1D ACCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 A 10 9 160018 CASAVA_Build 3 31659286 2D TGGTTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1295 hom 23 7 9 7 T 16 14 160019 CASAVA_Build 3 31663064 4I TCATAAAAAG ----/AAAT AAATACAAGG 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 AAAT 1 2 160020 CASAVA_Build 3 31663209 1D ATGTATACAT A/- ACTGTTAAAG 3070 het 3070 hom 48 20 24 5 A 2 1 160021 CASAVA_Build 3 31667376 1D TCATCTAGAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 9 8 160022 CASAVA_Build 3 31668263 1I TTGGTTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 10 11 160023 CASAVA_Build 3 31676983 2D TGTTCCACTT TC/-- TCTGTCAGAA 3070 het 3070 ref 38 23 12 5 TC 2 1 160024 CASAVA_Build 3 31688582 1D TGGTTAGCGA C/- CGGCACCTTC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 2 1 160025 CASAVA_Build 3 31691673 7D TCGGGATACC TTGGGAA/------- TTGGGAACTC 3070 het 3070 ref 35 16 14 11 TTGGGAA 2 1 160026 CASAVA_Build 3 31692761 5D TAGTACATAC TCTTT/----- TTTTTCAGGG 3070 het 3070 ref 37 19 17 4 TCTTT 1 0 160027 CASAVA_Build 3 31697503 1D ATTGATGAGG T/- TTATCTAAAG 3070 het 3070 hom 46 13 28 7 T 3 2 160028 CASAVA_Build 3 31707416 1D CACCCTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 35 1 22 12 T 12 11 160029 CASAVA_Build 3 31713888 1D AAAAAAAATT G/- GGGGGGGGTT 3070 het 171 hom 23 3 13 8 G 9 8 160030 CASAVA_Build 3 31716641 4D CTTCCAAGTA AAGT/---- AAGTTAATAA 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 AAGT 2 1 160031 CASAVA_Build 3 31726771 3D GAACACAGTG GCT/--- GGCACACAAG 3070 het 3070 hom 58 28 25 5 GCT 1 0 160032 CASAVA_Build 3 31729426 1I TTTCTTGCTT -/A ACGCACTGTT 3070 het 3070 hom 58 24 27 7 A 1 2 160033 CASAVA_Build 3 31741123 1D TGGAGGAAAG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 105 het 42 0 36 7 A 8 7 160034 CASAVA_Build 3 31758932 1D AGGAAAGTAT A/- TTAAATTCTG 3070 het 3070 ref 53 28 16 10 A 1 0 160035 CASAVA_Build 3 31760169 1I GAAAAAAAAA -/G CAGTGCAAGG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 G 0 1 160036 CASAVA_Build 3 31761283 2I GAAAATTAGG --/GA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 10 9 GA 0 1 160037 CASAVA_Build 3 31767872 15D ACAAACAAAC AAATAAAATAAAATA/--------------- AAATAAAATA 3070 het 1266 hom 16 4 10 2 AAATA 6 3 160038 CASAVA_Build 3 31770646 1D ACAACATACA C/- CTAAAATGAT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 C 2 1 160039 CASAVA_Build 3 31781993 4D AGTGAGTGAG TGAA/---- TGAATGAATG 3070 hom 108 het 43 0 37 7 TGAA 6 5 160040 CASAVA_Build 3 31784081 2I AGTCCCCGTG --/TC CCCCAAGTCT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 TC 0 1 160041 CASAVA_Build 3 31785050 3I AATAAACACA ---/TGT TGTAATTCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TGT 1 2 160042 CASAVA_Build 3 31786397 4I TGGATCCCCT ----/AAGA AAGAAGGTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAGA 1 2 160043 CASAVA_Build 3 31790659 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1205 het 981 hom 12 4 5 3 A 17 16 160044 CASAVA_Build 3 31792004 1D GAAATTTTTA G/- TAATGTTAAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 1 0 160045 CASAVA_Build 3 31807584 1D AATGTCATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 392 hom 47 1 36 10 A 10 9 160046 CASAVA_Build 3 31817502 1I TTAAGTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 110 hom 38 1 30 7 T 10 11 160047 CASAVA_Build 3 31831566 2D TCCTGCATGA CT/-- CTGTAAGAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 CT 2 1 160048 CASAVA_Build 3 31835294 1I AGGCAGTGAC -/A AGCTGGTCTC 3070 hom 101 het 36 0 34 2 A 1 2 160049 CASAVA_Build 3 31851883 1I GCTGGTCCTC -/A AAAACCTCTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 4 5 160050 CASAVA_Build 3 31861627 1D TTCATATCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 68 het 24 0 23 2 T 9 8 160051 CASAVA_Build 3 31863271 1D TGCCCCTCTC T/- TTCTCTGCAG 3070 het 3070 ref 31 14 15 3 T 3 2 160052 CASAVA_Build 3 31865807 2D TTACAAAGCA AT/-- ATAGACAGTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AT 2 1 160053 CASAVA_Build 3 31870637 1I CTCAGTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 30 3 13 14 T 15 16 160054 CASAVA_Build 3 31871692 1I AATTTTTAAG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 T 7 8 160055 CASAVA_Build 3 31889629 2D GGTTACTCGA CT/-- CTATATATTT 3070 het 3070 ref 28 16 11 3 CT 2 1 160056 CASAVA_Build 3 31890609 1I CTTCAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 13 14 160057 CASAVA_Build 3 31894952 1I TTCCTGAAAG -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 6 7 160058 CASAVA_Build 3 31903435 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2060 hom 25 9 9 8 A 12 11 160059 CASAVA_Build 3 31912688 14D TCACGTGTTG CCATCACACTAAAA/-------------- CCATCACACT 3070 het 3070 hom 45 23 24 5 CCATCACACTAAAA 1 0 160060 CASAVA_Build 3 31915549 21I CCTCTGCCTC ---------------------/CTTACAGGTTTAAGCGAGTCT CCTGCCTCAG 3070 het 3070 hom 20 11 10 0 CTTACAGGTTTAAGCGAGTCT 0 1 160061 CASAVA_Build 3 31915894 1I AAGATGGGGT -/G GGGGTGGAAA 2825 het 2825 ref 35 22 9 4 G 4 5 160062 CASAVA_Build 3 31922392 1I TCAAAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 13 14 160063 CASAVA_Build 3 31932258 1I ATAAAAGTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 8 9 160064 CASAVA_Build 3 31933930 3D TACATGATGG GTA/--- GTTTAGCACA 3070 het 3070 ref 53 28 23 3 GTA 1 0 160065 CASAVA_Build 3 31934058 2I ACCAGCTTTT --/GA GAGAGTCTCT 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 GA 2 3 160066 CASAVA_Build 3 31934595 4D TATTTTAATA AACT/---- AATAATTGAA 2571 het 2571 ref 23 15 6 3 AACT 1 0 160067 CASAVA_Build 3 31935010 1D TTTGGAATGG A/- AAATCACCTC 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 A 4 3 160068 CASAVA_Build 3 31941979 1D ATGCAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 1889 het 957 hom 18 5 8 5 T 15 14 160069 CASAVA_Build 3 31949336 5D ATTCTCTCAT TAATC/----- AAAGCAAAAC 3070 het 3070 hom 37 17 19 3 TAATC 1 0 160070 CASAVA_Build 3 31988273 1I TAAAGTTTTA -/T TAGAACACAG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 1 2 160071 CASAVA_Build 3 32022120 2D AGTTTCACTC TG/-- TTGCCAGGCT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 TG 1 0 160072 CASAVA_Build 3 32038451 1D ACTCCAGCCT G/- GGCAACAGGA 3070 hom 25 het 17 0 11 7 G 3 2 160073 CASAVA_Build 3 32048298 1I TGATGTTAGT -/A ACTTTTTTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 2 160074 CASAVA_Build 3 32053320 1I CTCGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 735 hom 31 2 23 6 A 12 13 160075 CASAVA_Build 3 32058136 10D TTTCTTTCTC TTTCTTTCTT/---------- TTTCTTTCTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTTCTTTCTT 2 1 160076 CASAVA_Build 3 32060400 5D ACACTGGGGA CTATT/----- AGAGGGGGAA 3070 hom 81 het 28 0 27 2 CTATT 1 0 160077 CASAVA_Build 3 32064807 4D ACTACTACTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 28 1 19 9 T 18 14 160078 CASAVA_Build 3 32067158 1D TACAAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 26 3 9 14 T 17 16 160079 CASAVA_Build 3 32069467 1I CAGAACAATC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 9 10 160080 CASAVA_Build 3 32096029 5D GGTATACACT TACGA/----- TATTTCTTTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TACGA 1 0 160081 CASAVA_Build 3 32114816 2I TGAAACCCCG --/TC TCTACTGAAA 3070 hom 35 het 18 0 12 6 TC 1 2 160082 CASAVA_Build 3 32115035 1D27M1I GTCCTATCCA TTTTTTTTTTTTTATGACAGTCTTGCTG-/-TTTTTTTTTTTTATGACAGTCTTGCTGT TGTTGCCCAG 2442 hom 15 het 8 0 6 4 N/A 0 0 160083 CASAVA_Build 3 32119882 1D ACCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 27 0 24 3 A 12 11 160084 CASAVA_Build 3 32122023 3I TCTATTTGTC ---/AAG AAGGAGGAGA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 AAG 1 2 160085 CASAVA_Build 3 32166445 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1130 het 1130 ref 15 11 3 2 A 15 14 160086 CASAVA_Build 3 32207272 3D TCCTACAAAT GAA/--- GGAGGAGGAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 7 GAA 1 0 160087 CASAVA_Build 3 32212102 2D TGGGTTTTGT GG/-- GGGGGTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 7 5 160088 CASAVA_Build 3 32212154 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1217 het 1217 ref 15 6 4 5 T 11 10 160089 CASAVA_Build 3 32214096 2D TCAAGGGATT CC/-- CCCCCCTTCA 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 C 8 6 160090 CASAVA_Build 3 32226406 3D CAGGATGGTT AAG/--- AAGATGCCAT 3070 het 3070 hom 46 18 20 9 AAG 2 1 160091 CASAVA_Build 3 32239034 1I ATTTTGTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 167 hom 34 1 26 7 T 9 10 160092 CASAVA_Build 3 32245203 4D CTCAAAACAC ACAA/---- ACAAACAAAA 2885 het 2885 ref 30 19 6 5 ACAA 3 2 160093 CASAVA_Build 3 32247608 1D TTCCATCTGC T/- TTGTCATTTA 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 3 2 160094 CASAVA_Build 3 32263757 1D CTACAACTCA G/- GGGTTTTTAG 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 G 4 3 160095 CASAVA_Build 3 32271215 1I TCTCTGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 A 10 11 160096 CASAVA_Build 3 32272730 1D GCCTGGATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 65 het 23 0 22 1 T 9 8 160097 CASAVA_Build 3 32293390 1D TCCTGAGAAA T/- TTTTTTTTTT 1070 het 1070 ref 32 22 3 7 T 12 11 160098 CASAVA_Build 3 32299508 1D GTATGTACTG T/- TTTTTTGGTC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 7 6 160099 CASAVA_Build 3 32305005 2I ACAGCTATCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 17 8 T 10 12 160100 CASAVA_Build 3 32331355 2D GTTGGGTGGC GG/-- GGGGGGTCCA 3070 hom 60 het 24 0 18 7 G 8 6 160101 CASAVA_Build 3 32363111 1D GGAAGCTCTC T/- TGGTGTCCCT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 2 1 160102 CASAVA_Build 3 32368716 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAACTA 1488 het 999 hom 28 5 8 15 A 8 7 160103 CASAVA_Build 3 32369372 2D ATAGGTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 27 1 10 16 T 14 12 160104 CASAVA_Build 3 32379522 9D AGAAAAGTAA GTTACTGTG/--------- TATACTTTAT 3070 het 3070 hom 45 22 21 5 GTTACTGTG 1 0 160105 CASAVA_Build 3 32385324 1I TTTTCTAATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 8 9 160106 CASAVA_Build 3 32385651 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 1433 het 518 hom 11 3 5 3 A 10 9 160107 CASAVA_Build 3 32393526 9I GTGAAGAGCT ---------/GAATCTGTG GATGCATCTG 3070 hom 126 het 48 0 41 7 GAATCTGTG 0 1 160108 CASAVA_Build 3 32402838 1I GGTGCCTGTA -/G GTCCCAGCTA 990 het 191 hom 5 1 3 1 G 1 2 160109 CASAVA_Build 3 32410821 1D GCCACCCATT G/- GGGCTTTCTT 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 G 4 3 160110 CASAVA_Build 3 32411822 1D TTAATAGCTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 9 8 160111 CASAVA_Build 3 32428097 1D TGCTAAGTGA C/- CCCCTGAGTC 2656 het 2541 hom 23 7 6 10 C 5 4 160112 CASAVA_Build 3 32429107 1I AGACCTAGCG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3031 hom 19 7 9 3 T 9 10 160113 CASAVA_Build 3 32441990 1D ACTTTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 521 hom 25 2 18 7 A 13 12 160114 CASAVA_Build 3 32450960 1I GCCTGGCCAA -/T TTTTAAAAAT 3070 hom 54 het 26 0 17 9 T 4 5 160115 CASAVA_Build 3 32462628 4I AGCAGTGACA ----/CCAT CTGGGTCTCA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CCAT 0 1 160116 CASAVA_Build 3 32473379 1I TATCTAAGCC -/A GGGGGGCAGT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 0 1 160117 CASAVA_Build 3 32474441 1I TGGGGAACCT -/C CATAGTCCCT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 C 1 2 160118 CASAVA_Build 3 32486398 2D GGTGGTGTGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 286 hom 55 6 16 33 TG 8 7 160119 CASAVA_Build 3 32486416 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 43 hom 49 1 27 22 TG 7 6 160120 CASAVA_Build 3 32487342 2I CACCACTGAC --/GA GAAAGACAGG 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 GA 1 2 160121 CASAVA_Build 3 32497228 2D TTTAAGACAC AT/-- TTAATTAGAT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 AT 1 0 160122 CASAVA_Build 3 32501725 1I CTTCTGAATT -/A AAAAAAAAAA 2648 het 2032 hom 31 12 8 11 A 13 14 160123 CASAVA_Build 3 32502912 2I AAGACTACTT --/AC AGTCTTTTCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AC 0 1 160124 CASAVA_Build 3 32503851 1D TTTTCTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 13 9 T 11 10 160125 CASAVA_Build 3 32506739 1D AAGACTTCTC A/- AAAAAAAAAA 1911 het 1911 ref 24 10 7 7 A 15 14 160126 CASAVA_Build 3 32511093 1I TTATTCATAG -/T TAGCCCCAAA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 T 1 2 160127 CASAVA_Build 3 32516330 3D TACAGGCTCC ACT/--- CTCTATCCCT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 ACT 1 0 160128 CASAVA_Build 3 32521514 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2006 het 1997 hom 13 5 5 3 A 11 12 160129 CASAVA_Build 3 32522449 5D AAACATTCAC AAGAA/----- GAGAGAGCGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAGAA 1 0 160130 CASAVA_Build 3 32526386 1D AGCTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 498 het 498 ref 24 14 3 8 A 15 14 160131 CASAVA_Build 3 32530288 4D TCAATACTTT TTTG/---- TTTGTTTGGG 3070 hom 75 het 27 0 26 3 TTTG 3 2 160132 CASAVA_Build 3 32532469 1D GGCTGAGGCA G/- GAGAATGGTG 2091 hom 17 het 8 0 5 3 G 2 1 160133 CASAVA_Build 3 32540027 1D AAAATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 13 0 10 3 A 11 10 160134 CASAVA_Build 3 32543904 1I CTCATAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 11 12 160135 CASAVA_Build 3 32559895 1D ATTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1794 het 379 hom 21 6 10 5 T 19 18 160136 CASAVA_Build 3 32578125 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 894 het 894 ref 20 15 2 4 A 13 12 160137 CASAVA_Build 3 32596091 3D TTGCAATAAA TGT/--- TGTTGTTGCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 TGT 3 2 160138 CASAVA_Build 3 32596763 1D CACCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 1327 het 1327 ref 24 14 5 6 A 15 14 160139 CASAVA_Build 3 32597437 1I GGAAGCATTC -/T TTTAAGTGTT 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 T 3 4 160140 CASAVA_Build 3 32608863 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 30 1 17 12 T 15 14 160141 CASAVA_Build 3 32610066 2I AATTTTTTTT --/TC TTTCTTTCTG 1617 het 1617 ref 11 6 4 1 TC 0 1 160142 CASAVA_Build 3 32641754 1D CTCAGTTATT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 1 0 160143 CASAVA_Build 3 32667061 1D ATAAAGTCCA T/- TTTATCTATT 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 T 4 3 160144 CASAVA_Build 3 32679864 2I TGACAGTTTT --/GA GAGAGACATT 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 GA 3 4 160145 CASAVA_Build 3 32687411 1I TCTCATTATG -/T TGCCCAAGCT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 1 2 160146 CASAVA_Build 3 32694284 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2933 hom 31 10 11 10 A 12 13 160147 CASAVA_Build 3 32698865 1D TAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 919 het 919 ref 44 38 3 3 A 13 12 160148 CASAVA_Build 3 32707048 1I ATCCAGATAA -/T TTTTTTTTTT 1534 het 1534 ref 19 5 5 9 T 13 14 160149 CASAVA_Build 3 32717781 2D TTACATTACC TA/-- TATATAGTAT 3070 hom 87 het 30 0 30 2 TA 4 3 160150 CASAVA_Build 3 32741366 1D CACTCTGTTC T/- TTTCTATATA 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 T 4 3 160151 CASAVA_Build 3 32744476 12D CATTTCTCTT TTTATTTATTTA/------------ TTTATTTATT 3070 het 1435 hom 25 3 10 12 TTTA 7 4 160152 CASAVA_Build 3 32756118 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 7 8 160153 CASAVA_Build 3 32757833 5D ATCTAGCTTT ATTCC/----- ATTCCAGTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 8 ATTCC 2 1 160154 CASAVA_Build 3 32761966 2D2M12I CAATTAAGGA TTGA------------/--GATAACATACTCAC ATAAACATTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 N/A 0 0 160155 CASAVA_Build 3 32776623 5I5M3D GGTTGCAGTG -----AGATCTCT/AGCCAAGATC--- GCACCACTGC 3070 hom 45 het 15 0 15 2 N/A 0 0 160156 CASAVA_Build 3 32785080 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1224 hom 22 3 18 1 A 12 11 160157 CASAVA_Build 3 32792890 4I TCTGTGACTT ----/AAAC AAAGATTATT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AAAC 0 1 160158 CASAVA_Build 3 32805444 4D GCTCAAGAAA CAGT/---- CAGTCCCTAG 3070 het 3070 hom 37 12 23 3 CAGT 2 1 160159 CASAVA_Build 3 32805584 2D GGGTTCATGG AA/-- AAGTCTTGGA 3070 het 3070 ref 47 26 14 9 A 4 2 160160 CASAVA_Build 3 32810983 1I GGGGAGGGAA -/C CCTGCCGGAA 3070 het 3070 hom 54 16 27 11 C 2 3 160161 CASAVA_Build 3 32815683 1D ACATGGTAGC T/- CATGCCTGTA 3070 het 3070 ref 49 24 14 11 T 1 0 160162 CASAVA_Build 3 32825980 7D ACTTGTCTAC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2216 hom 18 het 8 0 7 2 A 19 12 160163 CASAVA_Build 3 32835765 6D GTAGACGTGG CCTGCT/------ CCTGCTCTTG 3070 hom 69 het 30 0 24 8 CCTGCT 2 1 160164 CASAVA_Build 3 32837971 1D ATCCCCTTGT A/- AAATGCCTTC 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 4 3 160165 CASAVA_Build 3 32839149 1I TGCATGCTTA -/T TTTTAAATTA 2956 het 2956 ref 27 14 8 5 T 4 5 160166 CASAVA_Build 3 32840553 2I CCTGGGCAAC --/AG AGTGAGACTT 3070 hom 48 het 20 0 15 5 AG 1 2 160167 CASAVA_Build 3 32847805 9D CTGACTTGAT TTCTGACCG/--------- TTAAGATGGG 3035 het 3035 ref 32 20 8 7 TTCTGACCG 1 0 160168 CASAVA_Build 3 32854310 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 8 7 160169 CASAVA_Build 3 32857276 7I AGTGGCTAAC -------/ACTGGTG ACTGGTGAAG 3070 het 3070 hom 41 11 21 9 ACTGGTG 1 2 160170 CASAVA_Build 3 32859217 4D GTCCCCTTAT ACAG/---- ACAGGCCTTA 3070 hom 79 het 31 0 26 5 ACAG 2 1 160171 CASAVA_Build 3 32862215 1D AGTTTGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 18 1 13 4 T 13 12 160172 CASAVA_Build 3 32863488 1I TCAGTTATTT -/G GGGGTATATA 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 G 4 5 160173 CASAVA_Build 3 32869617 3D TCTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 20 0 13 7 T 16 13 160174 CASAVA_Build 3 32877027 3D TTGCCCTACT CTC/--- CTCATTGCTC 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 CTC 2 1 160175 CASAVA_Build 3 32885133 1D AGAATAAAGC T/- TTTTTTTTTT 1242 het 1242 ref 36 22 4 10 T 12 11 160176 CASAVA_Build 3 32896169 2D TCAATTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 21 1 13 7 A 16 14 160177 CASAVA_Build 3 32901037 1D TCTCTATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 632 hom 25 2 14 9 A 14 13 160178 CASAVA_Build 3 32920619 1I AGACCACGAG -/C CCCCCCCAGG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 7 8 160179 CASAVA_Build 3 32924443 1I CACTTCTCAT -/A AATCATTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 2 3 160180 CASAVA_Build 3 32933668 1I CTCACAGCGG -/C CAGTGTCTCG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 C 1 2 160181 CASAVA_Build 3 32934289 1I ATACAAAATT -/A GCCAGGCGTG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 0 1 160182 CASAVA_Build 3 32934576 2D CTTGAAGGTT GG/-- GTTTCACCAG 3070 hom 84 het 34 0 27 8 G 3 1 160183 CASAVA_Build 3 32941911 1I TCTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 10 11 160184 CASAVA_Build 3 32978690 1I ACTACATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 37 0 28 9 A 10 11 160185 CASAVA_Build 3 32989152 4D9M3I CAGCCACTGC TGTTTAGAAGAAG---/----CAGAAGAAGAAA CAGCTCAGCT 135 het 135 ref 39 34 2 5 N/A 0 0 160186 CASAVA_Build 3 32994885 1D ATTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 22 8 A 11 10 160187 CASAVA_Build 3 32995991 1D CTTCCACATT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 84 het 31 0 28 4 A 8 7 160188 CASAVA_Build 3 33011417 12D ACTCTGTTTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 20 9 A 22 10 160189 CASAVA_Build 3 33049078 5D TTTTCTTTCC TAATT/----- TAAATTTTTA 3070 het 3070 ref 26 11 13 2 TAATT 1 0 160190 CASAVA_Build 3 33053222 6I GACACGTTAC ------/AACACA AACGTTGAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AACACA 0 1 160191 CASAVA_Build 3 33057087 2I AGCCTGGGCG --/AC AGAGTGAAAC 3070 hom 90 het 31 0 29 2 AC 0 1 160192 CASAVA_Build 3 33061522 1D TATCTGAAGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 8 7 160193 CASAVA_Build 3 33068123 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2542 het 1538 hom 18 8 8 2 A 9 10 160194 CASAVA_Build 3 33075334 3D CCATGGCAAT AAG/--- AAGAAGGGTG 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 AAG 3 2 160195 CASAVA_Build 3 33079747 1I AAGAAAGCAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 8 9 160196 CASAVA_Build 3 33083953 9I ACCTGGCTAA ---------/TTTTTAAAT TTTTTATAGA 3070 hom 50 het 20 0 17 3 TTTTTAAAT 0 1 160197 CASAVA_Build 3 33086453 7I CACCCTCCTC -------/CCACCCT CCACCCTCCA 1819 het 1819 ref 31 13 6 14 CCACCCT 2 3 160198 CASAVA_Build 3 33090679 1D ACCAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 11 10 160199 CASAVA_Build 3 33104379 1I AACTGAATTC -/A AACAGTACAT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 2 3 160200 CASAVA_Build 3 33111180 2D TCTGTCCTGA GG/-- GGGTGGAGTC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 G 5 3 160201 CASAVA_Build 3 33122521 5D ATTTAATTAA TTAAT/----- TTATTTATTT 1613 het 1613 ref 12 8 4 0 TTAAT 1 0 160202 CASAVA_Build 3 33139954 4I CTCCCCGCTC ----/TCTT TCTTCCTTCT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TCTT 1 2 160203 CASAVA_Build 3 33149502 1I TGAACCCAGG -/A GGCAGAGGTT 3070 hom 54 het 22 0 17 5 A 0 1 160204 CASAVA_Build 3 33150018 1D AGTGCTGGGA T/- TTACAGGCAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 3 2 160205 CASAVA_Build 3 33150164 4I CTTTTTGCAA ----/CTTT CTTTGTCTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CTTT 1 2 160206 CASAVA_Build 3 33153566 1I TAATATTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 10 11 160207 CASAVA_Build 3 33157499 1D AAGACTGCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 39 0 32 7 T 9 8 160208 CASAVA_Build 3 33160032 6I ATTGACCTGG ------/GAACTA GAACTAGAGA 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 GAACTA 1 2 160209 CASAVA_Build 3 33163389 1D TACTTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 1322 het 1322 ref 40 31 3 7 A 13 12 160210 CASAVA_Build 3 33168736 1D CAACATGGTG A/- AACTCCATCT 3070 het 2467 hom 18 5 13 0 A 3 2 160211 CASAVA_Build 3 33174481 1I TGAGCTGCTT -/G GGGGAGCAGG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 G 4 5 160212 CASAVA_Build 3 33176203 2D ACACACCCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 45 13 21 13 AC 9 8 160213 CASAVA_Build 3 33185581 1D CAGACTTGTG A/- AAGATTAAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 3 2 160214 CASAVA_Build 3 33186422 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1028 hom 22 3 14 5 T 10 11 160215 CASAVA_Build 3 33187842 1I ACTCCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2636 hom 21 8 13 0 A 11 12 160216 CASAVA_Build 3 33187961 2D TTGTAGGAAA TT/-- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 T 7 5 160217 CASAVA_Build 3 33192060 2I64M1D ACACACACAC --TATATATATATATACACACACACACATATATATACACACATATATACAAATACATACATATTTCT/TATATATATATATATACACACACACACATATATATACACACATATATACAAATACAGACATATTTC- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 23 18 14 11 N/A 0 0 160218 CASAVA_Build 3 33194476 1I TATTTTATTG -/A TATTAGCTAG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 A 0 1 160219 CASAVA_Build 3 33194932 1I TGGTCTGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 20 0 12 8 T 10 11 160220 CASAVA_Build 3 33196867 1I TTAAAAAAAA -/T ATTTTTTTGA 3070 het 2104 hom 32 8 18 6 T 0 1 160221 CASAVA_Build 3 33197547 2I AAGAAAGAAA --/AT ATGTTTGTAC 3070 het 2706 hom 17 6 10 1 AT 1 2 160222 CASAVA_Build 3 33201135 1I TGTTTTTCAG -/T TTTTGGAAGT 3070 hom 127 het 47 0 43 4 T 4 5 160223 CASAVA_Build 3 33209316 2I CTGTCAAAAA --/AT ATATATATAT 2654 het 2654 ref 27 13 7 7 AT 6 7 160224 CASAVA_Build 3 33209501 4I AGTACTTGTC ----/TGTT TGGGTCTCAG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 TGTT 0 1 160225 CASAVA_Build 3 33217012 1I CTCCAGCCTT -/A AGTGTTTTGG 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 1 2 160226 CASAVA_Build 3 33220361 3D TGTCTGCTGC TGT/--- TGTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 TGT 3 2 160227 CASAVA_Build 3 33227373 4D TTTTCTTTCT TTCA/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 TTCA 1 0 160228 CASAVA_Build 3 33229882 2D CCTGGTGGAC AG/-- AGTGAGACCC 3070 het 3070 hom 29 11 14 6 AG 2 1 160229 CASAVA_Build 3 33262545 1D TAGATCCAGC A/- GTTCCACTAC 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 1 0 160230 CASAVA_Build 3 33280812 1I TTCATTCGTC -/T TTTTTTTTTT 1310 het 1310 ref 39 24 3 12 T 10 11 160231 CASAVA_Build 3 33284562 1D GAAAGGCACC T/- CTTATATGGC 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 T 1 0 160232 CASAVA_Build 3 33307336 3D AAATCTTAAA AGG/--- AGGTAGAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 21 2 AGG 2 1 160233 CASAVA_Build 3 33310137 1D TGCTAGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 22 11 T 11 10 160234 CASAVA_Build 3 33317372 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1413 hom 12 het 6 0 5 1 T 13 12 160235 CASAVA_Build 3 33333383 2D TATAGAATTT TC/-- TCTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 TC 2 1 160236 CASAVA_Build 3 33335237 5D2M5D ACTGATGTTT TTTAAACATCTA/-----AC----- TTATTGCTCA 3070 het 3070 ref 48 24 22 6 N/A 0 0 160237 CASAVA_Build 3 33344455 1I AGAATCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 35 1 30 4 A 13 14 160238 CASAVA_Build 3 33347762 1D CAAGTAAAAC A/- GAGAAGTAAA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 A 1 0 160239 CASAVA_Build 3 33363150 1D AAGTGAAACC A/- AAAGCCAGTT 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 A 4 3 160240 CASAVA_Build 3 33363311 2D11M1I TCAACAACTC TGTGTTCAGATTT-/--TGTTCAGATTTA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 8 18 5 N/A 0 0 160241 CASAVA_Build 3 33379455 1D AAAGTATAAA T/- AAATGCTAGC 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 T 1 0 160242 CASAVA_Build 3 33381779 1D TTTATTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1176 hom 31 11 11 9 T 15 14 160243 CASAVA_Build 3 33384082 1I AATTGTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 16 16 T 11 12 160244 CASAVA_Build 3 33391293 4D TAATTTTGTG ATTT/---- ATTTAATTTT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 ATTT 2 1 160245 CASAVA_Build 3 33398143 1I ATAAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 2196 het 2196 ref 17 7 6 4 A 10 11 160246 CASAVA_Build 3 33403303 4I TTAAGAACCT ----/ATCA GTCAATCAGT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 ATCA 0 1 160247 CASAVA_Build 3 33404119 1D11M1D AAAACAAAAC AAACAAACAAACA/-AACAAACAAAC- AAACAAACCA 556 het 556 ref 31 20 3 10 N/A 0 0 160248 CASAVA_Build 3 33410585 8I CAATCACAGC --------/TCACTGTA TCACTGTAGC 2558 het 2558 ref 15 7 6 2 TCACTGTA 1 2 160249 CASAVA_Build 3 33411014 4I CCAGCCACAT ----/TCCA TCCAGTGTTC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 TCCA 1 2 160250 CASAVA_Build 3 33420982 1I TAATAGGATT -/A AAAAAAAAAA 1513 het 1513 ref 19 10 4 5 A 13 14 160251 CASAVA_Build 3 33429832 1D CACGAGGTCA G/- GGAGATTGGG 1968 het 1968 ref 21 8 5 8 G 3 2 160252 CASAVA_Build 3 33430593 3I TAAAATACTA ---/AAG AAGATAAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AAG 1 2 160253 CASAVA_Build 3 33431469 3D TCATTACGTC ATA/--- ATGAGGTGTC 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 ATA 1 0 160254 CASAVA_Build 3 33439542 1D AAAAAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2659 het 943 hom 22 8 10 4 T 14 13 160255 CASAVA_Build 3 33442369 5I TAGTTTTTTT -----/TTTAA TTTAAGATCA 3070 het 2368 hom 20 6 9 5 TTTAA 1 2 160256 CASAVA_Build 3 33444971 1I ATGGCTTTTT -/A TTAATAAATT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 0 1 160257 CASAVA_Build 3 33448240 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 950 hom 21 5 14 3 A 14 13 160258 CASAVA_Build 3 33464819 1D GGGGAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2542 hom 34 15 11 8 A 11 10 160259 CASAVA_Build 3 33472800 1D GTAGATTTAA T/- TTTTTTTTTT 1310 het 1310 ref 23 10 4 9 T 17 16 160260 CASAVA_Build 3 33491674 5I GTCTCAAAAA -----/AACTC AAATCAAACC 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 AACTC 0 1 160261 CASAVA_Build 3 33492746 5D TCTAATAAAG ACAAC/----- ACAGGAATTA 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 ACAAC 1 0 160262 CASAVA_Build 3 33495723 1D TGAAATTAGA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 2589 hom 26 8 7 11 C 9 8 160263 CASAVA_Build 3 33497930 2D ATCACCATAT AC/-- AGTTATTAGT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 AC 1 0 160264 CASAVA_Build 3 33506916 1I ATGCTATGTA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 6 7 160265 CASAVA_Build 3 33517257 1I ATTAAAAGAT -/A AAATTTGACC 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 A 3 4 160266 CASAVA_Build 3 33521413 2I CATGGATCAG --/TA TACCAGTCCA 2397 het 2397 ref 32 14 7 11 TA 1 2 160267 CASAVA_Build 3 33531318 2D ATATGTATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 19 16 9 AC 9 8 160268 CASAVA_Build 3 33538833 6I CTGAGAAGAC ------/TTTAAG TTTATACCTC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TTTAAG 0 1 160269 CASAVA_Build 3 33538998 1I AGTTTTCAAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 51 21 21 9 A 7 8 160270 CASAVA_Build 3 33546000 1I ATAGAGAGCC -/T AGAAATTAGA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 0 1 160271 CASAVA_Build 3 33567983 1I ATGATGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 T 11 12 160272 CASAVA_Build 3 33586655 5D ATGCACATTA CATAT/----- AAGTACTTAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 CATAT 1 0 160273 CASAVA_Build 3 33593556 1I GGGAGAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 9 10 160274 CASAVA_Build 3 33627094 1D CGGGTTGGTT A/- AAACTGTTCT 3070 het 3070 hom 40 14 23 4 A 4 3 160275 CASAVA_Build 3 33632058 1D AAGCAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 9 A 11 10 160276 CASAVA_Build 3 33635037 1I CCCGCTACTT -/G GGAGGCTGAG 2781 het 2781 ref 24 11 7 6 G 2 3 160277 CASAVA_Build 3 33643667 6D CTTTCACCTA TTAAGT/------ TTATTTCCCA 3070 het 3070 ref 39 23 14 4 TTAAGT 1 0 160278 CASAVA_Build 3 33647055 1I TAAAGAGCGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 10 11 160279 CASAVA_Build 3 33648358 1D TAAAAAAAAA G/- CACTGAGTAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 G 1 0 160280 CASAVA_Build 3 33649099 1D ATTCAAACTG T/- TAAGAACACA 3070 het 3070 ref 29 12 12 6 T 2 1 160281 CASAVA_Build 3 33658304 1I CAAACCCAGT -/G GGCTGTGTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 2 3 160282 CASAVA_Build 3 33664530 1D TTCCGTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 11 10 160283 CASAVA_Build 3 33665601 1D TCTATGATTC A/- ATGGCAGGGC 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 A 2 1 160284 CASAVA_Build 3 33670070 3I ATGTGAACAC ---/ATT ATTTGACACT 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 ATT 1 2 160285 CASAVA_Build 3 33673307 2I GAAATAACAC --/AT GATAGTATTT 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 AT 0 1 160286 CASAVA_Build 3 33698543 4D AGAGGCCCTC ACCA/---- GAAGCCTAGC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 ACCA 1 0 160287 CASAVA_Build 3 33728172 1D ATCAGCAAGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 9 8 160288 CASAVA_Build 3 33750613 2D TTAGTTGTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 111 het 45 0 38 8 TG 7 6 160289 CASAVA_Build 3 33758465 4D TGAGTTCTTG TTCA/---- TTTTCTTATT 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 TTCA 1 0 160290 CASAVA_Build 3 33772723 3D TTAAAATGTT CTA/--- CTCTTCAAGA 3070 het 3070 hom 30 11 13 8 CTA 1 0 160291 CASAVA_Build 3 33773609 2D ACACATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 20 21 8 AC 7 6 160292 CASAVA_Build 3 33776267 1I TGCCTGTAAT -/C CCCAGCACTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 3 4 160293 CASAVA_Build 3 33800752 5D TTATTACTCT TATAA/----- TAGAAAGCAC 3070 het 3070 ref 32 17 12 5 TATAA 1 0 160294 CASAVA_Build 3 33801410 1I CTCTTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 A 11 12 160295 CASAVA_Build 3 33805868 1D AGGACACCCA G/- GGTGAGATCA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 G 3 2 160296 CASAVA_Build 3 33812165 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTTT 1904 het 1304 hom 9 4 4 1 A 0 1 160297 CASAVA_Build 3 33836784 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 7 8 160298 CASAVA_Build 3 33945891 1I TGGACACATG -/T TTTCTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 23 21 5 T 3 4 160299 CASAVA_Build 3 33946550 2D GTGTGTGTAC AT/-- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 65 30 24 12 AT 2 1 160300 CASAVA_Build 3 34062261 1I ACTGTTGTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 18 18 10 T 9 10 160301 CASAVA_Build 3 34071332 1I TCTATTCATA -/T TTTTTGTCCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 5 6 160302 CASAVA_Build 3 34075579 1I AAGTTAGGTA -/T TGATGGAACA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 1 2 160303 CASAVA_Build 3 34091508 1I CTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 2330 het 255 hom 29 5 11 13 C 0 1 160304 CASAVA_Build 3 34093942 1D CTTGGTAGAT A/- AAAAGAACAT 3070 hom 111 het 47 0 36 11 A 5 4 160305 CASAVA_Build 3 34107976 1D TAATTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 11 10 160306 CASAVA_Build 3 34109116 1D CAAAGTAAAA G/- TCTGTACCCA 3070 het 3070 hom 24 12 12 0 G 1 0 160307 CASAVA_Build 3 34121632 1I GCCAGGAGAA -/G GGGGGGGGGT 3070 het 213 hom 34 2 22 10 G 9 10 160308 CASAVA_Build 3 34140344 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 T 9 8 160309 CASAVA_Build 3 34148192 1D TCCTTATATA C/- CAAAATGTGT 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 C 2 1 160310 CASAVA_Build 3 34154290 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 105 het 40 0 31 9 A 9 8 160311 CASAVA_Build 3 34157361 3D TATTTATAGA CAC/--- TTGGATTGCT 3070 het 3070 hom 40 18 21 3 CAC 1 0 160312 CASAVA_Build 3 34157449 1I CTTGCTTTCA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 7 8 160313 CASAVA_Build 3 34179454 1D CTATATACAC G/- GGGGGGTGTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 7 6 160314 CASAVA_Build 3 34214625 1D ATTTTTACTC T/- TTTTCCTTCC 3070 hom 124 het 45 0 39 6 T 5 4 160315 CASAVA_Build 3 34221154 4I CATAGAAATA ----/TTAT TTATTAAGCA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 TTAT 1 2 160316 CASAVA_Build 3 34223026 12D ACACATCCAT CCACCCACCCAC/------------ CCACCCACCC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 CCAC 6 3 160317 CASAVA_Build 3 34225375 1D TATTTGGGGT C/- CCCTTACATT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 C 4 3 160318 CASAVA_Build 3 34226140 4D ATATCATAAT AGTC/---- AGGCCTTTTA 3070 het 3070 ref 27 13 13 2 AGTC 1 0 160319 CASAVA_Build 3 34231043 4I TCTCTCTCTC ----/TCTA TATATATATA 3026 het 187 hom 16 4 7 6 TCTA 0 1 160320 CASAVA_Build 3 34231106 2I ATATGTATAT --/AC ACACACACAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AC 4 5 160321 CASAVA_Build 3 34237533 2D TGCTTCAATA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 27 3 13 11 T 12 10 160322 CASAVA_Build 3 34242164 3I GATCCCTGTC ---/ATA ATAAGCACTT 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 ATA 1 2 160323 CASAVA_Build 3 34246469 3D CACTCATGTA TCT/--- GTGGTAGCTG 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 TCT 1 0 160324 CASAVA_Build 3 34246944 1I TCACATTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 8 9 160325 CASAVA_Build 3 34270289 4D TTAAGCTAAT TAAC/---- ATATGCATTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 TAAC 1 0 160326 CASAVA_Build 3 34270730 12D AAACTCCTTT AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 het 741 hom 18 4 9 9 A 23 11 160327 CASAVA_Build 3 34271341 1D27M16D TTCAGTACCA TTTATTATGCTGAAGTACCCATCCCCCAGCTGCTGCAAGTGTGG/-TTATTATGCTGAAGTACCCATCCCCCA---------------- GCTGCTGAAG 3070 het 3070 ref 45 26 28 6 N/A 0 0 160328 CASAVA_Build 3 34274537 1D TTCAGTGCAG A/- TACAGGGAGG 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 1 0 160329 CASAVA_Build 3 34276692 2D TTTGAAACTC TG/-- TGAATTTCTC 3070 het 3070 ref 48 26 19 7 TG 2 1 160330 CASAVA_Build 3 34283410 2D ATTCAAGGAA GG/-- GGGGATATGG 3070 hom 115 het 48 0 37 11 G 6 4 160331 CASAVA_Build 3 34291821 28I TCTAAAATGA ----------------------------/ATTCTGAACCCTAATGGAACTCTGGCTG ATCCAGGGTC 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 ATTCTGAACCCTAATGGAACTCTGGCTG 0 1 160332 CASAVA_Build 3 34292928 1D TGACTGTGAG A/- AAATCAATTT 3070 het 3070 ref 41 24 16 3 A 4 3 160333 CASAVA_Build 3 34297493 4I ACACACACAC ----/ACAA ACACACCACA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 ACAA 0 1 160334 CASAVA_Build 3 34306772 1D CAGCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 1050 het 1050 ref 41 30 3 8 A 13 12 160335 CASAVA_Build 3 34345095 2I TTAAAATCTA --/CT CTCTGCACTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CT 2 3 160336 CASAVA_Build 3 34372472 1I CTTTCTCCAC -/T TTTTTTTTTT 756 het 756 ref 29 22 3 4 T 10 11 160337 CASAVA_Build 3 34407506 1I GGATTTCGTC -/T TTTTTTTTAT 2773 het 2773 ref 41 23 10 11 T 8 9 160338 CASAVA_Build 3 34412034 10D CAGGTGCTGG CTGTAGTGGT/---------- CAGCATAGAG 3070 het 3070 ref 33 16 13 7 CTGTAGTGGT 1 0 160339 CASAVA_Build 3 34425035 1D AGAAGACTCT G/- AGATAAGGAT 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 G 1 0 160340 CASAVA_Build 3 34436226 2D CTCCAAACTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 478 hom 38 4 16 18 T 11 9 160341 CASAVA_Build 3 34437788 1D AGATACCCTG A/- AATTTTCTCA 3070 het 3070 ref 49 28 20 1 A 3 2 160342 CASAVA_Build 3 34441363 1I AACAAATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 10 11 160343 CASAVA_Build 3 34454059 1D AGGATATACC A/- AAAAAAAAAA 2325 het 204 hom 37 3 12 22 A 19 18 160344 CASAVA_Build 3 34462111 1I TGATCATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 34 0 22 12 T 10 11 160345 CASAVA_Build 3 34464904 1D2M2D TGGTGTCATC ATGGT/-TG-- GTTATTTTGC 3070 hom 117 het 40 0 40 1 N/A 0 0 160346 CASAVA_Build 3 34474023 5D TTTTCTAGTC TTTAT/----- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 49 21 23 7 TTTAT 2 1 160347 CASAVA_Build 3 34478394 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3027 hom 34 14 16 4 T 14 12 160348 CASAVA_Build 3 34483023 1I CTGTGTCCAC -/G TGATCTCATT 3070 hom 66 het 27 0 21 7 G 0 1 160349 CASAVA_Build 3 34495308 1I TTCTTGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 T 11 12 160350 CASAVA_Build 3 34498268 4D ATTTGCTTGC TTGT/---- TTGTTTTAAA 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 TTGT 2 1 160351 CASAVA_Build 3 34504074 1I TTTTGAATTC -/A GGGGGTACAT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 A 0 1 160352 CASAVA_Build 3 34514534 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAT 2827 het 2827 ref 18 10 8 0 A 10 9 160353 CASAVA_Build 3 34515960 1I ATGAATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 A 11 12 160354 CASAVA_Build 3 34522123 2I TGTATTTATG --/TA TATATATATC 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 TA 4 5 160355 CASAVA_Build 3 34525334 1D GTAGATGAAG A/- AACAGATTAA 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 A 3 2 160356 CASAVA_Build 3 34526324 5D AGAGCGAGAG AAGTT/----- AAGTTAACAT 3070 het 3070 ref 60 26 27 8 AAGTT 2 1 160357 CASAVA_Build 3 34528323 13D GAGTTCCTTA ACAATTTTTTTTT/------------- TCTTAAACAA 3070 het 3070 hom 48 21 25 7 ACAATTTTTTTTT 1 0 160358 CASAVA_Build 3 34533820 12D CCAAATAGCA TGTAATCTCACT/------------ TGTAAGTGGG 3070 het 3070 ref 51 23 24 9 TGTAATCTCACT 1 0 160359 CASAVA_Build 3 34550555 3D TAAGTGATTA TTG/--- TTGTGTCTGG 3070 hom 141 het 49 0 48 2 TTG 2 1 160360 CASAVA_Build 3 34557807 12D TACAGATATG CTGAGGTTTGTA/------------ CTTAGAACTT 3070 het 3070 ref 29 21 12 4 CTGAGGTTTGTA 1 0 160361 CASAVA_Build 3 34582724 4D AGAGGCTCCA TCTT/---- TCTTGATGAT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 TCTT 2 1 160362 CASAVA_Build 3 34584586 2I TGTTATAAAC --/AT ATATATATAT 1595 het 1095 hom 13 3 4 6 AT 8 9 160363 CASAVA_Build 3 34586263 2D AGTCTTGAAT AG/-- AGTCTTCCTT 3070 het 3070 ref 43 21 14 10 AG 2 1 160364 CASAVA_Build 3 34593640 1D ATAAGTTAAC A/- AAAAAATGGC 3070 hom 154 het 58 0 52 7 A 7 6 160365 CASAVA_Build 3 34619547 3I TACAACCACC ---/ACA ACAAAAAAAC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 ACA 1 2 160366 CASAVA_Build 3 34622784 5D CCCGTACAAT TCTTC/----- TCTTCTTTTC 3070 hom 90 het 38 0 30 8 TCTTC 2 1 160367 CASAVA_Build 3 34623033 2D CTCTGTTAGC CT/-- CTCTCTCTCT 1257 het 1257 ref 37 24 3 10 CT 8 7 160368 CASAVA_Build 3 34648782 1D TTATCTTATG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 10 9 160369 CASAVA_Build 3 34660200 5D ACAACAACAA AAAAC/----- AGACAGCCCT 3070 hom 96 het 34 0 33 3 AAAAC 1 0 160370 CASAVA_Build 3 34660655 3I CTTAAAAAAT ---/AAA AACTTCTAGA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 2 5 160371 CASAVA_Build 3 34661063 2I CTTTTAACTA --/TC TCTACATTAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TC 1 2 160372 CASAVA_Build 3 34663880 1I GCAATTAGAT -/A ATGATATAGT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 A 1 2 160373 CASAVA_Build 3 34668029 2I TTTTGTGGCT --/CA CAGTTATTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CA 1 2 160374 CASAVA_Build 3 34668234 4D ACTCTGTAAA AATC/---- AATCAGAGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AATC 2 1 160375 CASAVA_Build 3 34673209 9I AAGATATATC ---------/TGTTTAAAT TGTTTAAATT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TGTTTAAAT 1 2 160376 CASAVA_Build 3 34674251 4I TAGTACTCGA ----/TAGT TAGTTATTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TAGT 1 2 160377 CASAVA_Build 3 34676371 4D AATGTACCAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 TTTA 3 2 160378 CASAVA_Build 3 34681419 13I TGGATAGAAT -------------/TATGTAAGCACAA TATACTGAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TATGTAAGCACAA 0 1 160379 CASAVA_Build 3 34682196 9D ATGGAGTTTC GCCATGCTG/--------- GCCATGCTGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 GCCATGCTG 2 1 160380 CASAVA_Build 3 34683119 2I23M2D TGACTTAGAA --ACAATAAACCAATGGGCCAGAGTAG/CTACTCTGGCCCATTGGTTTATTGT-- TACTATCATT 3070 hom 60 het 19 0 21 4 N/A 0 0 160381 CASAVA_Build 3 34686118 1D GGAAGAACAT A/- AAGTCTGGCT 3070 hom 145 het 54 0 45 9 A 3 2 160382 CASAVA_Build 3 34687379 6D AGCTACTCGG GAGGCT/------ GAGGCTGAGG 3070 hom 48 het 19 0 17 8 GAGGCT 2 1 160383 CASAVA_Build 3 34687981 4D TTCAAGACAT AGAC/---- AGTAAAATAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AGAC 1 0 160384 CASAVA_Build 3 34689535 1D GTACCTACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 34 2 24 8 A 14 13 160385 CASAVA_Build 3 34693648 3D TACTTATGAA TAT/--- TATAAAATTC 3070 hom 51 het 19 0 18 4 TAT 2 1 160386 CASAVA_Build 3 34693955 6D TATCATGCAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AC 10 7 160387 CASAVA_Build 3 34694044 4D GGAGGAGGGG TGTT/---- TGTTTGCAGC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TGTT 2 1 160388 CASAVA_Build 3 34694637 2D TGATCATAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TA 7 6 160389 CASAVA_Build 3 34695183 1I CATTAGGCAA -/T AAAACAAGTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 0 1 160390 CASAVA_Build 3 34695852 3D ATGTAAGAAA TGT/--- TGTAATGCTG 3070 hom 114 het 43 0 38 8 TGT 2 1 160391 CASAVA_Build 3 34708370 2D TATGTATATT TA/-- TATATATATA 2316 hom 18 het 11 0 7 4 TA 7 6 160392 CASAVA_Build 3 34718236 1D GGGGCTCACA C/- CCCCACATAT 3070 hom 89 het 36 0 29 9 C 5 4 160393 CASAVA_Build 3 34731004 1I TTACTTCATG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 103 het 42 0 35 7 T 7 8 160394 CASAVA_Build 3 34737316 1I TGTGTCCTGG -/A AACACTGCCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 3 160395 CASAVA_Build 3 34750356 1D CAGCCACTGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 10 9 160396 CASAVA_Build 3 34760269 4I AACTAGTGAC ----/AAAT AATCTGCTTG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 AAAT 0 1 160397 CASAVA_Build 3 34763343 1I TAATGAGATC -/T TTTTTTTATA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 7 8 160398 CASAVA_Build 3 34764965 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 hom 38 het 14 0 13 1 T 6 5 160399 CASAVA_Build 3 34769159 1D TAAATGTAAG C/- CCTCAAACTA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 C 3 2 160400 CASAVA_Build 3 34778008 1I AGAATATATA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 160401 CASAVA_Build 3 34785721 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 15 0 14 4 A 12 10 160402 CASAVA_Build 3 34789355 1D GAGCATAAAA G/- TTTGAAAAAT 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 G 1 0 160403 CASAVA_Build 3 34797128 1D TTGAAGAAAG T/- TGAGAGTTCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 1 160404 CASAVA_Build 3 34823932 1D GTCACTTTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 52 23 18 11 T 10 9 160405 CASAVA_Build 3 34829499 1D CACCCCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 10 6 A 11 10 160406 CASAVA_Build 3 34830052 1I TTTTGGTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 T 9 10 160407 CASAVA_Build 3 34838233 1I AAATACAGGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 T 8 9 160408 CASAVA_Build 3 34856081 2D GAGTTATAAC AG/-- AGACTCCCTC 3070 het 3070 ref 30 13 11 8 AG 2 1 160409 CASAVA_Build 3 34875057 1I TCTCTAAAGA -/T TGTTTCCTCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 2 160410 CASAVA_Build 3 34876001 1D AAATGACCTT A/- TACCTGTTAG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 1 0 160411 CASAVA_Build 3 34877017 1I GTAGGAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 T 10 11 160412 CASAVA_Build 3 34886608 1D TTAATTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 10 T 13 12 160413 CASAVA_Build 3 34891882 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 8 A 13 12 160414 CASAVA_Build 3 34895810 1D CTGAGTTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 T 10 9 160415 CASAVA_Build 3 34897805 1D CTTTTGCAAA C/- TAGACCTTCT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 C 1 0 160416 CASAVA_Build 3 34898400 2D CCAATAACTC AA/-- GACTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 19 24 3 A 2 0 160417 CASAVA_Build 3 34914505 1D CATATTGCCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 8 7 160418 CASAVA_Build 3 34918686 6I TCCAGGCAGT ------/AGAGTC AGAGTCAGCA 3070 het 3070 hom 67 27 28 12 AGAGTC 1 2 160419 CASAVA_Build 3 34924686 1D CTGGCACAAG C/- ACAGGGATGC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 1 0 160420 CASAVA_Build 3 34927173 3I TAGTCCTTAT ---/TTC TTCAACTAAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TTC 1 2 160421 CASAVA_Build 3 34937035 1D ATGTCTGCAT C/- TTGTTTTTAC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 C 1 0 160422 CASAVA_Build 3 34941389 3I TATATCAAAA ---/CAT CATATTGTAC 3070 het 3070 ref 52 25 23 4 CAT 1 2 160423 CASAVA_Build 3 34964064 4I GATACAATCT ----/CTTA CTTACTGTAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 CTTA 1 2 160424 CASAVA_Build 3 34973876 1I GCCACACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 T 12 13 160425 CASAVA_Build 3 34976862 1I CTTTCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 11 12 160426 CASAVA_Build 3 34994179 1I ATGTTGCTGC -/A AAAAAAACAT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 7 8 160427 CASAVA_Build 3 35001327 1I TTCTTTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 T 10 11 160428 CASAVA_Build 3 35009447 3I TCTCATTCTC ---/ATT GTTGTTCATA 3070 hom 157 het 55 0 53 2 ATT 0 1 160429 CASAVA_Build 3 35020631 1D CTTATGAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 10 9 160430 CASAVA_Build 3 35024336 5I CCCTGCTGAG -----/TGAGC TGCTGTTTTC 3070 het 3070 hom 53 17 31 5 TGAGC 0 1 160431 CASAVA_Build 3 35025431 1I AGAGTTGTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 8 9 160432 CASAVA_Build 3 35035492 4D AGTCAGCCTG ACTC/---- TTGAAGTCAC 3070 hom 129 het 50 0 43 8 ACTC 1 0 160433 CASAVA_Build 3 35037630 3I GGAGATAAAC ---/CTT CTTATTTAGT 3070 hom 157 het 56 0 53 3 CTT 1 2 160434 CASAVA_Build 3 35038190 1D TGAAGACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 15 12 T 11 10 160435 CASAVA_Build 3 35040536 1D TATTGCTAGT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 G 2 1 160436 CASAVA_Build 3 35043681 12I ACACATCTCA ------------/CATGGTGGAAGG CAAGAGAAGA 3070 hom 48 het 17 0 17 3 CATGGTGGAAGG 0 1 160437 CASAVA_Build 3 35048041 1I AGAAGACTGT -/G GAACTTACTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 G 1 2 160438 CASAVA_Build 3 35048525 6D TAATTTCATT TTATTA/------ TTATTATTTT 1973 het 1915 hom 12 6 6 0 TTA 4 2 160439 CASAVA_Build 3 35049394 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTCTTG 728 hom 7 het 4 0 3 1 T 6 7 160440 CASAVA_Build 3 35068573 1D GTTTCAAGTA T/- TTTTACCAAC 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 T 5 4 160441 CASAVA_Build 3 35070016 1D TGCTCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 13 10 T 13 12 160442 CASAVA_Build 3 35084450 3D ACACGTGCAC TTT/--- TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 11 T 7 4 160443 CASAVA_Build 3 35087365 25D GGGCTGGGGA CTGGTACCTGTCTCTGGCCTGTGGC/------------------------- CTGATAGGAA 2917 het 2917 ref 20 14 7 6 CTGGTACCTGTCTCTGGCCTGTGGC 1 0 160444 CASAVA_Build 3 35089560 3D TCTTTATACT TTA/--- TTATTATTAT 2044 het 1653 hom 12 4 6 2 TTA 4 3 160445 CASAVA_Build 3 35092277 2I TGTATATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 23 11 12 0 TG 5 6 160446 CASAVA_Build 3 35092566 2D TCTCAAAAAT AA/-- GTCAATAAAA 1920 het 1920 ref 21 15 4 2 A 2 0 160447 CASAVA_Build 3 35095846 3I AATTACAGAC ---/ATT ATATTTAGGG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 ATT 0 1 160448 CASAVA_Build 3 35096989 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1475 hom 10 het 22 0 9 13 T 15 16 160449 CASAVA_Build 3 35097584 2D TAGTGTCTAC AT/-- ATGTTTTGTG 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 AT 2 1 160450 CASAVA_Build 3 35102402 4D TATAAATAAG ATTA/---- ATTGAGATAC 3070 het 3070 hom 40 18 20 4 ATTA 1 0 160451 CASAVA_Build 3 35106227 1D GATTTACATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 10 9 160452 CASAVA_Build 3 35109743 1D ATAGAAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 A 12 11 160453 CASAVA_Build 3 35129046 1I CTGTGCCAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 9 10 160454 CASAVA_Build 3 35133057 1I GGTTATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 T 10 11 160455 CASAVA_Build 3 35142549 1I TTGTATGTAT -/A AAAAAACACG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 6 7 160456 CASAVA_Build 3 35144323 1I TTTTCATGTG -/T TTTTTGGCTG 3070 het 1731 hom 22 5 16 1 T 5 6 160457 CASAVA_Build 3 35145235 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 160458 CASAVA_Build 3 35148048 1D AAAAAAAAAA G/- ACTAGCTGAG 3070 het 247 hom 41 6 19 16 G 1 0 160459 CASAVA_Build 3 35154447 2I ATGAAGGCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 15 11 12 AC 7 8 160460 CASAVA_Build 3 35166872 1D ATTTTGTCTT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 1 0 160461 CASAVA_Build 3 35178942 1I TAAATGCTTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 A 7 8 160462 CASAVA_Build 3 35183535 2D CGATTCCTGC TG/-- TGTGTGTGTG 1681 het 1681 ref 19 9 6 4 TG 8 7 160463 CASAVA_Build 3 35185724 1D ATAATCATAT G/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 1 0 160464 CASAVA_Build 3 35220183 1I GGTTTCAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 9 10 160465 CASAVA_Build 3 35220535 1I TCAACTGATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 9 10 160466 CASAVA_Build 3 35234121 1D TTATGGCATA T/- TTTTTTCATG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 7 6 160467 CASAVA_Build 3 35235799 1I TGTTTTCTAC -/T TTTTTTTTTT 2401 het 2401 ref 24 10 6 8 T 14 15 160468 CASAVA_Build 3 35240117 2D GGGTTAAGCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 140 hom 38 3 13 22 GT 17 16 160469 CASAVA_Build 3 35243264 1I ACTAACAAAC -/A GAAAGGACAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 0 1 160470 CASAVA_Build 3 35263745 1I AAGCATTTCA -/T CCCCCACTGC 3070 hom 117 het 43 0 38 5 T 0 1 160471 CASAVA_Build 3 35276778 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 14 1 11 2 A 13 14 160472 CASAVA_Build 3 35279258 4D GATTTTGAGT TGAG/---- TGAGTGAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TGAG 2 1 160473 CASAVA_Build 3 35288383 2D GTACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 31 15 13 4 AC 10 9 160474 CASAVA_Build 3 35300563 1I TATGCAGACA -/T CAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 48 14 23 11 T 0 1 160475 CASAVA_Build 3 35302604 1D TCTCAACAGC T/- TTTTTTTTTT 1508 het 182 hom 24 2 6 16 T 19 18 160476 CASAVA_Build 3 35311925 3I AGAGAAGCAG ---/TTA TTAGTAATTT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 TTA 1 2 160477 CASAVA_Build 3 35314043 1I TTGTATTGCT -/G GGGGGGGGAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 G 8 9 160478 CASAVA_Build 3 35318236 1D AATAGAGAAT A/- AAGCCCATGT 3070 het 3070 ref 55 26 21 9 A 3 2 160479 CASAVA_Build 3 35321150 1I ATAAAAACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 11 160480 CASAVA_Build 3 35322545 14D TTACTTATGG GAATTTTATTTGCA/-------------- GAAATGCAAA 3070 het 3070 ref 38 19 17 5 GAATTTTATTTGCA 1 0 160481 CASAVA_Build 3 35331131 2D CAGCAAAAAA AG/-- AGTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 AG 2 1 160482 CASAVA_Build 3 35338344 1D TATGAAGCAA G/- TATTAAGAGT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 G 1 0 160483 CASAVA_Build 3 35345707 1I ACTTTTATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 9 10 160484 CASAVA_Build 3 35345788 1D CTAATGCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 14 13 160485 CASAVA_Build 3 35348717 1D GTGTCATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 15 14 160486 CASAVA_Build 3 35371400 2D CACCAATCTA AT/-- ATATATATAT 1586 het 1586 ref 18 12 4 2 AT 8 7 160487 CASAVA_Build 3 35373244 1D GAGAGATAAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 8 7 160488 CASAVA_Build 3 35378345 1D ACTCTGCCTG A/- AAAAAAAAAA 2702 het 1308 hom 19 7 7 5 A 15 14 160489 CASAVA_Build 3 35388742 1I ACATCACAGC -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 48 20 20 8 A 6 7 160490 CASAVA_Build 3 35390655 1D CAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2494 hom 26 11 12 4 A 12 11 160491 CASAVA_Build 3 35410236 8I TGCCCCCATG --------/ATTTAATT ATTTAATTAC 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 ATTTAATT 1 2 160492 CASAVA_Build 3 35425133 1D GGTGCATGCC T/- GTAATCCCAT 3070 het 1555 hom 15 5 7 3 T 1 0 160493 CASAVA_Build 3 35447762 1D CTTTAAGGTC T/- TTTAGTGGCT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 4 3 160494 CASAVA_Build 3 35470722 1D AGAAGATCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 10 9 A 17 16 160495 CASAVA_Build 3 35505941 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1133 het 690 hom 11 5 3 3 A 15 14 160496 CASAVA_Build 3 35511623 1I CTCTACAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 10 11 160497 CASAVA_Build 3 35514040 1I TAGCCTGGGT -/G ACAGAGTGAG 2248 het 547 hom 10 2 6 2 G 0 1 160498 CASAVA_Build 3 35524094 1I ACAAATTTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 25 0 17 8 A 9 10 160499 CASAVA_Build 3 35538607 2D AAAATAGAAC TG/-- TGTGTGTGTG 2216 het 2216 ref 34 20 5 10 TG 7 6 160500 CASAVA_Build 3 35544457 4D TTTAATTATT TAAA/---- TAAAAGGATT 3070 het 1579 hom 21 5 15 2 TAAA 2 1 160501 CASAVA_Build 3 35546129 4D TGGCTTTCAG CAAA/---- CAATTACAAG 3070 het 3070 hom 56 26 27 4 CAAA 1 0 160502 CASAVA_Build 3 35560156 1D23M1I TTAACTGCTA CCTTAAAAAACGATAATTTTTTTT-/-CTTAAAAAACGATAATTTTTTTTA AAAAAAATCA 3070 hom 99 het 34 0 34 3 N/A 0 0 160503 CASAVA_Build 3 35561944 1D CCAAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 2421 het 937 hom 30 4 13 13 A 17 16 160504 CASAVA_Build 3 35563176 1D CATTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 28 1 21 6 A 13 12 160505 CASAVA_Build 3 35563948 1D8M1I ACATAGACAA TTTTTGTCA-/-TTTTGTCAT TTTGTTAAAC 3070 hom 84 het 29 0 28 2 N/A 0 0 160506 CASAVA_Build 3 35566561 1D GCTTTGTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 32 2 17 13 A 12 11 160507 CASAVA_Build 3 35568093 1D ACCACTTGGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 9 8 160508 CASAVA_Build 3 35569726 3I TTTTGGGGGA ---/TAG TAGGGAGAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TAG 1 2 160509 CASAVA_Build 3 35570703 1D GGAGGAAAGT G/- GGGACAACAT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 G 4 3 160510 CASAVA_Build 3 35571665 1D TAAACATAAA G/- AATTGAGTAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 1 0 160511 CASAVA_Build 3 35573093 5I CAGCAAAAAC -----/TATTA TATTACAGCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TATTA 1 2 160512 CASAVA_Build 3 35583625 17I AAATTTAAAA -----------------/AAGACAGAGCAAGACAG ATATACAGAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AAGACAGAGCAAGACAG 0 1 160513 CASAVA_Build 3 35588695 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 12 11 160514 CASAVA_Build 3 35593373 1I TCCTGAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 197 hom 31 1 22 8 T 12 13 160515 CASAVA_Build 3 35595095 1I CTTCTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 34 0 26 8 T 10 11 160516 CASAVA_Build 3 35603925 1D TGTTATTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 10 9 160517 CASAVA_Build 3 35606963 4D AGAAATAAAA TAGT/---- TAGATTAAAG 2506 het 2506 ref 26 17 6 4 TAGT 1 0 160518 CASAVA_Build 3 35611569 1D CAGCCAAACT A/- AAAAAAAAAA 1061 het 1061 ref 22 15 3 6 A 12 11 160519 CASAVA_Build 3 35632746 1I CAATTAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 A 10 11 160520 CASAVA_Build 3 35636790 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 10 160521 CASAVA_Build 3 35655127 1D CGAGACAATG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 59 het 27 0 18 9 A 8 7 160522 CASAVA_Build 3 35658013 3I TTAAATATCT ---/TAA TAAGATTTTA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TAA 1 2 160523 CASAVA_Build 3 35669778 1I TGAAAGAAGT -/A TATTTCATCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 1 160524 CASAVA_Build 3 35677889 10D CAAAAAGAGG AAAAGAGATA/---------- AAGTGACTCT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AAAAGAGATA 1 0 160525 CASAVA_Build 3 35694112 1D TATTTCCACT A/- AAAAAAGATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 6 160526 CASAVA_Build 3 35697294 1D CTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 20 0 17 4 T 9 8 160527 CASAVA_Build 3 35705377 1I AGAACATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 37 1 28 8 T 13 14 160528 CASAVA_Build 3 35729744 1D TACTTTTTTT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 8 7 160529 CASAVA_Build 3 35730772 5I AAACTGAGAG -----/TGTTT AAACACCATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TGTTT 0 1 160530 CASAVA_Build 3 35732153 1D TCTAATTTGG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 3 A 8 7 160531 CASAVA_Build 3 35735525 4D GAAATTCTAG TTAC/---- TTACAAGAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TTAC 2 1 160532 CASAVA_Build 3 35745019 2D CAGCCCATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 17 0 15 2 T 16 14 160533 CASAVA_Build 3 35770462 1D ATTGAGAAGG T/- TTTTTTTTTT 1406 het 1406 ref 32 19 6 7 T 17 16 160534 CASAVA_Build 3 35773035 2I TTCCTGGTGG --/CA GTGATAGTTT 3070 hom 141 het 57 0 46 11 CA 0 1 160535 CASAVA_Build 3 35860626 1D GATAGGGATG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 50 24 21 6 A 8 7 160536 CASAVA_Build 3 35860846 1D GCCCTGAATG A/- AAAAAAAAAA 1653 het 1653 ref 30 17 4 10 A 11 10 160537 CASAVA_Build 3 35884402 1I GCTTGTAGCT -/C TGAGACAGCT 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 C 0 1 160538 CASAVA_Build 3 35898753 1D TCCGAGGTCT C/- CCATTCTCTA 3070 hom 123 het 42 0 39 3 C 3 2 160539 CASAVA_Build 3 35910718 1I GATCAATTAC -/A AAAGTATATC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 3 4 160540 CASAVA_Build 3 35916866 1D TAAGCAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2517 hom 22 7 12 3 T 11 10 160541 CASAVA_Build 3 35917022 10D CCTCCCACCT CCCCCCACCC/---------- CACAACAGTC 3070 het 420 hom 15 3 9 3 CCCCCCACCC 1 0 160542 CASAVA_Build 3 35926962 3D TTGATTTGAC TTT/--- TTATTATATA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 T 5 2 160543 CASAVA_Build 3 35930795 1I GTTAATTTTG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 25 12 9 4 A 6 7 160544 CASAVA_Build 3 35949354 1D TGAGTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 2326 het 2326 ref 47 33 6 9 T 12 11 160545 CASAVA_Build 3 35951031 1I TTTTTATGTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 8 9 160546 CASAVA_Build 3 35951520 1I CTCTGGTGGG -/C CATTCTGCTG 3070 het 3070 hom 49 21 20 8 C 1 2 160547 CASAVA_Build 3 35952515 23I CATTCAGAGC -----------------------/TGGCAGGTTTCTCTCAGCTGCTT TGGAAGGGTA 3070 het 3070 hom 39 15 24 3 TGGCAGGTTTCTCTCAGCTGCTT 0 1 160548 CASAVA_Build 3 35952749 1I CTGCCTCAAA -/C ACAGATAGTA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 C 0 1 160549 CASAVA_Build 3 35954708 1I ACAATGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 T 11 12 160550 CASAVA_Build 3 35966489 3I TTAAACCTCC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 31 9 T 11 14 160551 CASAVA_Build 3 35969045 4I CAGAAATGAC ----/AGTG AGTCATTGGT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AGTG 0 1 160552 CASAVA_Build 3 35974772 1D CGGAGTTTGG T/- TTTTTGTCCT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 6 5 160553 CASAVA_Build 3 35980915 1D CTATAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 11 10 160554 CASAVA_Build 3 35992794 5I AATATAAAAT -----/AAAAC AAAAACCAGA 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 AAAAC 0 1 160555 CASAVA_Build 3 35992892 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAACTAATA 3070 het 603 hom 34 6 15 13 AAAG 1 0 160556 CASAVA_Build 3 36001508 3D CTCTGCTCAT TTG/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 16 9 TTG 1 0 160557 CASAVA_Build 3 36025550 1D AGAAAAAAAA T/- CTAAGAATCC 3070 hom 42 het 16 0 15 2 T 1 0 160558 CASAVA_Build 3 36041551 5D TACCAAATAC ATAAA/----- ATAAAACATA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 ATAAA 2 1 160559 CASAVA_Build 3 36054453 2D AGTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2678 het 31 hom 20 0 8 12 A 18 16 160560 CASAVA_Build 3 36074830 1I TTTTAAAATG -/A AAAAAACAAA 3070 hom 157 het 56 0 53 3 A 6 7 160561 CASAVA_Build 3 36086380 1I GGGGTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1472 hom 32 6 18 8 T 12 13 160562 CASAVA_Build 3 36106699 1D CTGACACAGC T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 6 160563 CASAVA_Build 3 36118614 1I TCTAACGTAG -/A AAAATGGCAC 3070 hom 141 het 57 0 48 9 A 4 5 160564 CASAVA_Build 3 36125252 3I GTTTTATTGA ---/ATT ATTATAATTT 3070 hom 91 het 33 0 31 2 ATT 1 2 160565 CASAVA_Build 3 36135911 1I CCATTATGTA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 7 8 160566 CASAVA_Build 3 36141726 2I AGGAGCTCTG --/AT ATATGGCTAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AT 2 3 160567 CASAVA_Build 3 36149598 1I CAGTGAAGTA -/C CTAGGTCTAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 2 160568 CASAVA_Build 3 36224873 1D TATCAGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 8 A 13 12 160569 CASAVA_Build 3 36250264 1I TGAACCTGTT -/G GGTCCTATAA 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 G 2 3 160570 CASAVA_Build 3 36286710 2I CATCCAAGAA --/CT CTCTAATCAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CT 2 3 160571 CASAVA_Build 3 36290903 1D CGTGAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 11 10 160572 CASAVA_Build 3 36292179 23D TTCACTCGGC CTGTTCATATCTTTTCCTGTTCA/----------------------- CTCTGTTCTT 3070 hom 81 het 27 0 28 2 CTGTTCATATCTTTTCCTGTTCA 1 0 160573 CASAVA_Build 3 36316843 2I TATACATATA --/TG TGTGTGTATG 2058 hom 18 het 7 0 7 0 TG 3 4 160574 CASAVA_Build 3 36325852 1I ATGTAATGAG -/A AACGGCAAAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 2 3 160575 CASAVA_Build 3 36336425 1D GCTCCCCGCC T/- TTTTTTTTTT 2182 het 2182 ref 32 14 7 11 T 12 11 160576 CASAVA_Build 3 36348248 2I GTAACTTGCC --/AG AGTTTCCAGT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AG 1 2 160577 CASAVA_Build 3 36349333 1D GATGAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 1008 het 1008 ref 38 27 4 7 A 13 12 160578 CASAVA_Build 3 36359515 1I GGGACTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 296 hom 44 2 32 10 A 11 12 160579 CASAVA_Build 3 36368178 4I CCAAACCCAG ----/CAGA AGAAAAGAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 CAGA 0 1 160580 CASAVA_Build 3 36376877 1I GAATCCCAGC -/A GTCTCATTAC 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 A 0 1 160581 CASAVA_Build 3 36390337 1I TTTCCCCCCT -/C CCCCCCCGCT 3070 het 2328 hom 33 8 14 11 C 7 8 160582 CASAVA_Build 3 36399835 5I ACTGTGAAAA -----/TTTAT TTTATTATGG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TTTAT 1 2 160583 CASAVA_Build 3 36400061 11D AGGATAAGGG TTATTTTCATT/----------- TTATTTTCAT 3070 hom 111 het 39 0 38 5 TTATTTTCATT 1 0 160584 CASAVA_Build 3 36402063 1D GCTTGATGAA T/- TTTCAAAAAG 3070 hom 81 het 34 0 26 8 T 4 3 160585 CASAVA_Build 3 36402904 2I TTCTACACTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 A 10 12 160586 CASAVA_Build 3 36406468 1I TTTCATTTGG -/A GGGGGAAGGG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 0 1 160587 CASAVA_Build 3 36411377 1D AAATTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2067 het 2067 ref 13 6 5 2 A 12 11 160588 CASAVA_Build 3 36412429 1D CACAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 28 8 A 12 11 160589 CASAVA_Build 3 36421249 4I AAATTGGTAA ----/ATAG ATAGATGATA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 ATAG 1 2 160590 CASAVA_Build 3 36443364 3I TCACCTCTCG ---/ACA ACATTTTGTG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 ACA 1 2 160591 CASAVA_Build 3 36458442 1I GAGGTTTGTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 53 hom 42 1 37 4 T 8 9 160592 CASAVA_Build 3 36461279 1I ATTACTGATC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 T 7 8 160593 CASAVA_Build 3 36465398 3D AAACAGTGAA CCC/--- CCCCCCCCAC 3070 hom 29 het 17 0 9 8 C 11 8 160594 CASAVA_Build 3 36472564 2I CACACGTGCG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 CA 8 9 160595 CASAVA_Build 3 36480931 1I TGTCAGATTA -/T TTTTTAATTT 2428 het 2428 ref 19 13 5 1 T 5 6 160596 CASAVA_Build 3 36505123 1I CAGATATTGC -/A AAATCAGCAG 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 3 4 160597 CASAVA_Build 3 36566025 1I CCCCTTACCT -/C CTGCCCCTGC 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 C 1 2 160598 CASAVA_Build 3 36567516 1D GATGGCAGGG T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 8 7 160599 CASAVA_Build 3 36575952 1D AAGAGCATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 764 hom 34 2 20 12 T 15 14 160600 CASAVA_Build 3 36576142 1D TCACTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2719 hom 34 10 13 11 T 15 14 160601 CASAVA_Build 3 36581042 4D CTGCATTCTT GTCA/---- GTATTTGGTG 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 GTCA 1 0 160602 CASAVA_Build 3 36581830 4I TTTTTGTGGG ----/TTCT TTATTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TTCT 0 1 160603 CASAVA_Build 3 36611773 1D TATACTTGAA T/- TTTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 6 5 160604 CASAVA_Build 3 36619210 1I TAAAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 A 10 11 160605 CASAVA_Build 3 36629883 1I AAAATTTTTT -/A AAAAAAAAGA 2923 het 1525 hom 18 7 9 2 A 8 9 160606 CASAVA_Build 3 36637397 1I CAGTGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2191 het 2191 ref 34 16 9 9 T 11 12 160607 CASAVA_Build 3 36642369 20D ATGGGCTTTG CTCATCAGTTAGGCCAGCAC/-------------------- CTCATCAGGG 3070 het 3070 ref 40 28 12 9 CTCATCAGTTAGGCCAGCAC 1 0 160608 CASAVA_Build 3 36656346 1D CAGAAAAGGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 A 9 8 160609 CASAVA_Build 3 36678322 1I ATAAGCCCTG -/C CCTTTGGAAA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 2 3 160610 CASAVA_Build 3 36694581 2D GCTCCCATGT CC/-- CCCCCCCACC 3070 hom 82 het 32 0 27 6 C 9 7 160611 CASAVA_Build 3 36697826 1D GAAAATGGGG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 8 7 160612 CASAVA_Build 3 36705163 1D TTTGTCCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 9 160613 CASAVA_Build 3 36729758 1I GGTATAGGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 A 9 10 160614 CASAVA_Build 3 36731362 1I4M9D ATAATTCATT -TTTGAATTTTTGT/CCCTG--------- GCTGTCATCA 3070 het 3070 hom 39 19 19 6 N/A 0 0 160615 CASAVA_Build 3 36771424 1I GCTATAAGGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 8 9 160616 CASAVA_Build 3 36791394 1D ATTAATGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 12 11 160617 CASAVA_Build 3 36801202 2D GAGCTCCCTT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 10 8 160618 CASAVA_Build 3 36804915 2D CAGTTTGACT TC/-- TCTGTCTTCC 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 TC 2 1 160619 CASAVA_Build 3 36813569 1I TAGAACAGGG -/A AAAATGACTC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 4 5 160620 CASAVA_Build 3 36858398 1D AGATTAAAGC A/- AAAAAAAAAA 2137 het 2137 ref 45 30 5 10 A 12 11 160621 CASAVA_Build 3 36861554 1D ATACACAATT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 45 20 18 7 A 9 8 160622 CASAVA_Build 3 36890353 1D CATGCATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 A 12 11 160623 CASAVA_Build 3 36894538 10I CCCAACCCCC ----------/CAGCTGTGGA CAGGTGCTGG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 CAGCTGTGGA 0 1 160624 CASAVA_Build 3 36895312 1D TCACTAAAAG A/- AATCTTTTTA 1672 het 1672 ref 20 14 5 1 A 3 2 160625 CASAVA_Build 3 36900030 1D CTCTTCATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 9 8 A 12 11 160626 CASAVA_Build 3 36921022 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2800 het 2800 ref 24 10 8 7 A 11 10 160627 CASAVA_Build 3 36941992 1D AAAGTTAAAG A/- AAAAAAGGTA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 7 6 160628 CASAVA_Build 3 36952504 1D AAACAAAGGG A/- AAAGGTGTAT 3070 het 3070 hom 44 18 20 8 A 4 3 160629 CASAVA_Build 3 36953443 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCC 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 5 4 160630 CASAVA_Build 3 36956995 1I AATCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1407 hom 25 5 13 7 A 14 15 160631 CASAVA_Build 3 36958116 2I ACTCTTGGCT --/GG GGGCACTGTG 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 G 3 5 160632 CASAVA_Build 3 36968529 1D CATGGTGAAA C/- CCCATTTCTA 1977 het 1468 hom 9 3 5 1 C 4 3 160633 CASAVA_Build 3 37000609 1I AGCGAGACTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 8 9 160634 CASAVA_Build 3 37004113 1D ATCCTTCTCT C/- CTTTCATACA 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 C 2 1 160635 CASAVA_Build 3 37013875 1I GTGTGGTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 13 14 T 12 13 160636 CASAVA_Build 3 37064845 1D TGAAAAACTC T/- TTTTTAAGTG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 6 5 160637 CASAVA_Build 3 37067178 3D GTGGGATGTG TTC/--- TTCTTTCTCT 3070 het 3070 ref 43 23 14 8 TTC 2 1 160638 CASAVA_Build 3 37071114 3I CAAGTAATCT ---/AAC ACTAACAAGT 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 AAC 0 1 160639 CASAVA_Build 3 37104326 9D TCAGGTGATC CACCCACCT/--------- CAGCCTCCCC 3070 het 3070 ref 22 10 11 1 CACCCACCT 1 0 160640 CASAVA_Build 3 37107107 1D AGGCTTGAAC T/- TCAGAATGAC 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 T 2 1 160641 CASAVA_Build 3 37107724 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 12 11 160642 CASAVA_Build 3 37123402 1I GAAATGACTA -/T TTTTTTTTTT 2777 het 2093 hom 27 8 11 8 T 15 16 160643 CASAVA_Build 3 37141543 1D ACAACGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 31 7 A 11 10 160644 CASAVA_Build 3 37150677 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 956 het 956 ref 22 9 5 8 A 17 16 160645 CASAVA_Build 3 37153152 5D TATGAATCTC AAAGA/----- AGAGGATAGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 AAAGA 1 0 160646 CASAVA_Build 3 37157802 1I AATCAAATGT -/A AAATTCCTCA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 3 4 160647 CASAVA_Build 3 37191106 1D CACATCTGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 21 16 8 A 10 9 160648 CASAVA_Build 3 37193428 1I TGTGGGGGGG -/T GGGGCGGGGA 1102 het 7 hom 4 0 3 1 T 0 1 160649 CASAVA_Build 3 37197881 1I CTATGAAATT -/A ACTGATTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 1 2 160650 CASAVA_Build 3 37198220 1I GCTTTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 61 22 20 19 T 10 11 160651 CASAVA_Build 3 37240858 2D GTTTGACTTC TG/-- TGTTTCTCTC 2882 het 2882 ref 29 21 6 3 TG 2 1 160652 CASAVA_Build 3 37268121 1D ACAATTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 31 7 11 13 T 16 15 160653 CASAVA_Build 3 37268632 1I TATTTCCCAC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 99 het 39 0 32 7 T 7 8 160654 CASAVA_Build 3 37272247 1D AAAAAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 43 1 36 6 T 12 11 160655 CASAVA_Build 3 37284571 4D GTTTACTGTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 39 23 11 7 TTTA 4 3 160656 CASAVA_Build 3 37290882 1D AAAAAGGAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 9 8 160657 CASAVA_Build 3 37294647 1D TGTTAAACAT A/- AAAAAAAAGA 2435 het 2435 ref 15 9 5 1 A 9 8 160658 CASAVA_Build 3 37298935 1D AGACTCTCAA T/- ATCTAGTTAA 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 T 1 0 160659 CASAVA_Build 3 37309192 3I AAAAAAAAAG ---/GTT GTTTTAGTAC 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 GTT 1 2 160660 CASAVA_Build 3 37309801 1I TTTCTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 T 11 12 160661 CASAVA_Build 3 37313892 4D AGAAAGTTGC ACTT/---- ACCAGAACTC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 ACTT 1 0 160662 CASAVA_Build 3 37329052 1I AGGGTCTCAC -/T TTGTCACCTA 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 T 2 3 160663 CASAVA_Build 3 37351505 1I CTAATGCTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 8 9 160664 CASAVA_Build 3 37353675 1I CTAGTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 13 14 160665 CASAVA_Build 3 37356394 1D AATTTATGTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 41 19 22 2 T 7 6 160666 CASAVA_Build 3 37362859 1D TAGTTCCTTT A/- AAAAAAATCG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 8 7 160667 CASAVA_Build 3 37363582 1I ATATAAAAGC -/A ATGCCTCTCT 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 A 1 2 160668 CASAVA_Build 3 37368429 1I CACTAGCCTC -/T TAACAAGAGA 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 T 1 2 160669 CASAVA_Build 3 37387550 3D TAGTTAAGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2680 hom 34 14 13 8 A 17 14 160670 CASAVA_Build 3 37392713 1D GCTGTAAAGA T/- GATACCTGAA 2559 het 2559 ref 34 26 6 2 T 1 0 160671 CASAVA_Build 3 37394048 1D AGAACAGCAA G/- GGGGGAAGTC 3070 het 3070 ref 46 19 18 10 G 6 5 160672 CASAVA_Build 3 37397557 1D TCATTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 13 11 T 14 13 160673 CASAVA_Build 3 37405599 5D CCTTTTGTGA CTGGC/----- TTTTTAAACT 3070 het 3070 ref 45 29 15 4 CTGGC 1 0 160674 CASAVA_Build 3 37417503 1I TTCAGACAGG -/A CTTTATAGAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 0 1 160675 CASAVA_Build 3 37420469 5D GATGAGATGA TATCT/----- TATTATAATT 3070 het 3070 ref 41 24 15 6 TATCT 1 0 160676 CASAVA_Build 3 37459972 2D CATGTGTGTG CA/-- CACACACACG 3070 het 3070 ref 59 20 18 23 CA 5 4 160677 CASAVA_Build 3 37463315 1I AAGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 9 10 160678 CASAVA_Build 3 37478494 1D ATTTCTCTTG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 33 11 22 1 A 8 7 160679 CASAVA_Build 3 37513825 1D TCTATCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 13 12 160680 CASAVA_Build 3 37544272 1D GAAAACAGGC T/- TTTTTTTTTT 2601 het 2601 ref 27 15 7 5 T 11 10 160681 CASAVA_Build 3 37545514 2I GTATGGACTC --/TT TTGTTTCTGG 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 T 2 4 160682 CASAVA_Build 3 37549125 1D3M1D GGGGAGCCCA CAGGT/-AGG- GCTGTCCATT 3070 het 3070 ref 45 27 16 4 N/A 0 0 160683 CASAVA_Build 3 37550754 2D AAACACTAAC AG/-- GGACCTGAAC 3070 het 3070 hom 38 11 20 8 AG 1 0 160684 CASAVA_Build 3 37553836 1I CCTTTGCCCT -/C CTCCAGCCTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 1 2 160685 CASAVA_Build 3 37571862 1I CTGTCCAATA -/T TGGTGGCCAG 3070 het 3070 ref 36 21 15 0 T 1 2 160686 CASAVA_Build 3 37583961 19D CATTCCAAAA CCAATCATGCCTTCCCAAC/------------------- AGTCCCCCAA 1927 het 1927 ref 15 11 5 5 CCAATCATGCCTTCCCAAC 1 0 160687 CASAVA_Build 3 37595332 1I GAAAGAAGGT -/A AAGTCCTAAG 3070 hom 132 het 53 0 45 8 A 2 3 160688 CASAVA_Build 3 37599895 15D TATTATTGCT ATCATCATCAGCATC/--------------- ATCATCATCA 3070 hom 132 het 50 0 45 12 ATCATCATCAGCATC 1 0 160689 CASAVA_Build 3 37602292 1I AAGAAGGGGG -/C CCCCCCCAAT 3070 hom 54 het 25 0 17 8 C 7 8 160690 CASAVA_Build 3 37602521 9D CATGATGAGA GTGATGATG/--------- GTGATGGTGG 3070 het 3070 ref 45 26 17 8 GTGATGATG 1 0 160691 CASAVA_Build 3 37610377 6I CCTCTGCTCT ------/CCTTGG CCTTGGCCTT 3070 hom 84 het 39 0 28 11 CCTTGG 2 3 160692 CASAVA_Build 3 37610431 11D GCTCGAAACT GGCATGACTCA/----------- GGAGTCTGAC 3070 hom 84 het 40 0 26 16 GGCATGACTCA 1 0 160693 CASAVA_Build 3 37610998 1D GAAGTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 11 10 160694 CASAVA_Build 3 37613207 1D CAAAACACAA G/- GGGTCTGGGG 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 G 4 3 160695 CASAVA_Build 3 37618711 1D CAAAATTGAT G/- GCTTTATTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 G 2 1 160696 CASAVA_Build 3 37619742 1D AAAATATTCC A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 44 25 14 7 A 7 6 160697 CASAVA_Build 3 37624936 4D AAGATTTACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 59 25 29 5 AAAC 3 2 160698 CASAVA_Build 3 37639661 10I GTAAAATATG ----------/TCTTGTCTTC TCAGCACCTT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 TCTTGTCTTC 0 1 160699 CASAVA_Build 3 37645990 5D CTGCAAAATG ATAAA/----- ATAAACAGTC 3070 het 3070 ref 38 21 14 6 ATAAA 2 1 160700 CASAVA_Build 3 37646758 1I AGTGCTGAGA -/T TTTTTACCAA 3070 het 3070 hom 52 17 27 8 T 5 6 160701 CASAVA_Build 3 37660008 2I ATTTTTGCAA --/TT TTTGTGGGGG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 3 5 160702 CASAVA_Build 3 37664349 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 TA 5 6 160703 CASAVA_Build 3 37667313 1D TTTGCCAATG T/- TAAATAGTGA 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 T 2 1 160704 CASAVA_Build 3 37679625 1D AAAACGTCCA G/- GAACAGGGAT 3070 het 3070 hom 47 21 23 5 G 2 1 160705 CASAVA_Build 3 37696005 1I CCCTGCATGG -/C CCGGGTGACC 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 C 2 3 160706 CASAVA_Build 3 37728860 1I TTCCCACTTA -/G GGGAACCAGG 3070 hom 102 het 42 0 33 9 G 3 4 160707 CASAVA_Build 3 37785284 1I ACCTTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 2489 het 2254 hom 24 7 10 7 T 13 14 160708 CASAVA_Build 3 37785834 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 27 2 17 8 A 18 17 160709 CASAVA_Build 3 37790086 1I TTTAACTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1900 hom 22 7 10 5 T 11 12 160710 CASAVA_Build 3 37792141 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2829 het 779 hom 10 2 7 1 A 15 14 160711 CASAVA_Build 3 37795223 1I14M1D ATGACAATGC -TTTCCAAAGCCTCCT/TTTTCCAAAGCCTCC- TTTTTTTATC 3070 hom 99 het 34 0 34 3 N/A 0 0 160712 CASAVA_Build 3 37802506 10D TTGCAGGAGC AGGGGGGTTG/---------- AGGGGGGTTG 3070 hom 62 het 34 0 21 16 AGGGGGGTTG 2 1 160713 CASAVA_Build 3 37803783 1D TGTGTAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 103 het 49 0 35 14 A 11 10 160714 CASAVA_Build 3 37840767 3D CTAGACCATA TAC/--- TACGGTAACT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 TAC 2 1 160715 CASAVA_Build 3 37842882 1I TCCTTTGTGT -/C CCCCACCCTC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 C 4 5 160716 CASAVA_Build 3 37851666 1D ATCCACTGGT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 9 8 160717 CASAVA_Build 3 37869869 1I CTCAGCCTCC -/T GAGTAGCTGG 3070 het 2022 hom 16 5 9 2 T 0 1 160718 CASAVA_Build 3 37872514 1D GAGATCTCTA T/- CTCCTTGCTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 1 0 160719 CASAVA_Build 3 37921873 1I AAAGGATCTC -/A AATGATTCAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 2 3 160720 CASAVA_Build 3 37940808 1I ATTGGAAGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 9 10 160721 CASAVA_Build 3 37947641 1D CCTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 13 15 T 15 14 160722 CASAVA_Build 3 37948294 1I GCTATAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 T 11 12 160723 CASAVA_Build 3 37972338 1I AACCTAAAAT -/A AAAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 4 5 160724 CASAVA_Build 3 38004173 1I AGTTCTCATG -/C CCCCCCACTA 3070 het 2524 hom 22 7 12 3 C 6 7 160725 CASAVA_Build 3 38039447 2D TAGCAAAAAC TG/-- TGATTACTTT 1467 het 1467 ref 27 12 4 11 TG 2 1 160726 CASAVA_Build 3 38049905 13I TCGAGTGATT -------------/CTCCTGCCTCAGC CTCCTGAGTA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 CTCCTGCCTCAGC 0 1 160727 CASAVA_Build 3 38051810 1D GTGTTATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 665 hom 36 3 27 6 T 15 14 160728 CASAVA_Build 3 38057344 1I ATATTACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 11 8 T 11 12 160729 CASAVA_Build 3 38060451 1D TACATAAACT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 2718 hom 23 9 10 4 G 1 0 160730 CASAVA_Build 3 38063344 1D TCTCTTTTTG A/- GATGCCTTCA 3070 het 3070 ref 56 35 16 7 A 1 0 160731 CASAVA_Build 3 38065569 2I ACTATTTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 11 13 160732 CASAVA_Build 3 38068032 1D GTGAGTGACC A/- GGGGGCTACA 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 A 1 0 160733 CASAVA_Build 3 38069255 4D TTTGAAGTCC CTCT/---- CTCTCCCTCC 3070 hom 75 het 28 0 25 4 CT 4 2 160734 CASAVA_Build 3 38072040 1I TTATGGTAAA -/G GGCATTTCCA 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 G 2 3 160735 CASAVA_Build 3 38072758 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 75 hom 24 1 21 2 A 9 8 160736 CASAVA_Build 3 38075376 1I TAACTGGTCT -/A AAAAATAAAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 5 6 160737 CASAVA_Build 3 38077194 1I CCACTTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 T 13 14 160738 CASAVA_Build 3 38083318 1I GCTGAACATT -/A AGAGGAAGCA 3070 hom 160 het 59 0 53 6 A 1 2 160739 CASAVA_Build 3 38084719 1I ACTTCATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 9 10 160740 CASAVA_Build 3 38118002 4D TTCGTTAAAC TATA/---- TATATGTTTA 3070 het 3070 ref 30 20 9 2 TA 4 2 160741 CASAVA_Build 3 38119204 1D GAGCACACAG C/- TAGCCTGAAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 C 1 0 160742 CASAVA_Build 3 38121775 4I AGTGTTGCCT ----/GTTA GTTCTGTTTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GTTA 0 1 160743 CASAVA_Build 3 38132006 1I GAGTCTAAGA -/G GGAAGGGTAA 3070 het 1158 hom 20 5 9 6 G 2 3 160744 CASAVA_Build 3 38139075 3D CTAGGCCCTC ATG/--- ATATGTCCTC 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 ATG 1 0 160745 CASAVA_Build 3 38159864 3D CTCCTAATAA TCT/--- TCTTTGGGCA 3070 het 3070 ref 36 22 12 3 TCT 2 1 160746 CASAVA_Build 3 38160798 1D TGGAATGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 A 11 10 160747 CASAVA_Build 3 38163362 1D GAAAATAGAC T/- GGAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 1 0 160748 CASAVA_Build 3 38173099 1I CATTCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 1254 het 1254 ref 31 15 5 11 T 15 16 160749 CASAVA_Build 3 38179939 2D CTCAAGCTTA AT/-- ATATATATAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 AT 5 4 160750 CASAVA_Build 3 38184062 5I AATTTTTGTT -----/TTTAC TTTACTTGCC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 TTTAC 1 2 160751 CASAVA_Build 3 38184387 1D AAAAGAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 34 1 15 18 T 16 15 160752 CASAVA_Build 3 38198324 1I TGACATGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 15 12 T 13 14 160753 CASAVA_Build 3 38208254 9I CAAGTAATCT ---------/GTGAGATGA TACTTTGTAA 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 GTGAGATGA 0 1 160754 CASAVA_Build 3 38232572 1I GATACATAAC -/T TTTTTTTTTT 2914 het 2914 ref 33 13 10 10 T 15 16 160755 CASAVA_Build 3 38247831 1D TTGGGGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 21 9 A 11 10 160756 CASAVA_Build 3 38252743 1I TCATCTTCTA -/T TGTGGGAAGT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 1 2 160757 CASAVA_Build 3 38256933 10D TTTGTAAAGT ATGTGTGTGA/---------- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 47 24 17 10 ATGTGTGTGA 1 0 160758 CASAVA_Build 3 38258406 1D TAAAAGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 12 11 160759 CASAVA_Build 3 38263457 1D AAAGGTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 T 13 12 160760 CASAVA_Build 3 38272217 1D TGGATAGGAT G/- GGATATGGAA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 G 3 2 160761 CASAVA_Build 3 38296131 1D GGGAGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 13 12 160762 CASAVA_Build 3 38318243 1I CTTTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 11 12 160763 CASAVA_Build 3 38334998 1I CCTTGACATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 8 9 160764 CASAVA_Build 3 38343024 1D TGGTGCTACC T/- TTAAAGGCCA 3070 hom 116 het 42 0 35 9 T 3 2 160765 CASAVA_Build 3 38348203 2I ATATTTACTG --/AC ATGAAAAGAT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AC 0 1 160766 CASAVA_Build 3 38348683 1I GAGGGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 597 hom 37 2 28 7 A 10 11 160767 CASAVA_Build 3 38353047 3D CAAATTTTCC TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 38 hom 23 2 13 8 TCT 4 3 160768 CASAVA_Build 3 38361995 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1924 hom 12 het 6 0 5 1 A 15 14 160769 CASAVA_Build 3 38367279 1D TATAGTTTCA T/- TTTTTTTCGT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 T 8 7 160770 CASAVA_Build 3 38368664 1I TATGTAACTC -/A AATGAAAAGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 2 3 160771 CASAVA_Build 3 38372746 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 25 1 19 5 A 16 13 160772 CASAVA_Build 3 38374282 3D TTATCTAATG ATA/--- ATAATGATGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 ATA 2 1 160773 CASAVA_Build 3 38374361 1D44M1I GCCCTTTTTT AAAAAAAAACTGTGTTATTTCTCTTTTATTATTGAGTTGTAAAAG-/-AAAAAAAACTGTGTTATTTCTCTTTTATTATTGAGTTGTAAAAGT TTTTTTTTAA 3070 hom 129 het 32 0 44 3 N/A 0 0 160774 CASAVA_Build 3 38379940 7D GAGGACATTG ACTGAGC/------- ACTTAGTGCA 801 hom 25 het 38 0 8 36 ACTGAGC 1 0 160775 CASAVA_Build 3 38381212 10D CTGCAGCTCC ATAGGGTTTT/---------- ATAGTTGTAC 3070 hom 115 het 42 0 36 10 ATAGGGTTTT 1 0 160776 CASAVA_Build 3 38385351 1D TCAGTAGGGG A/- CGATCATGGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 1 0 160777 CASAVA_Build 3 38401182 8D TCCCAGACTC CTTTCCTT/-------- CTTTCCAGAC 3070 het 3070 ref 47 23 20 6 CTTTCCTT 1 0 160778 CASAVA_Build 3 38407733 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 96 het 33 0 33 1 A 9 8 160779 CASAVA_Build 3 38408135 1D TTCACATGTT A/- AAAACTTAAT 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 A 5 4 160780 CASAVA_Build 3 38415958 1I TTTAAGAGAG -/A AATTCAATAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 2 3 160781 CASAVA_Build 3 38419785 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1539 het 732 hom 16 3 6 7 A 17 18 160782 CASAVA_Build 3 38437222 1I AATATCCCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 9 10 160783 CASAVA_Build 3 38448621 1I CCCAAATCTC -/T TGTCCTCACA 3070 hom 83 het 31 0 26 5 T 1 2 160784 CASAVA_Build 3 38456257 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2218 het 1481 hom 18 7 7 4 A 15 16 160785 CASAVA_Build 3 38463710 3I TCAAAGCCAC ---/AAT CATATAATTA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 AAT 0 1 160786 CASAVA_Build 3 38473698 1I GCTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 9 10 160787 CASAVA_Build 3 38481071 1I GATTTTGGTA -/T TTTGAGTCTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 3 4 160788 CASAVA_Build 3 38482790 11D6M5D CTGTTGCACC GTAGGGTGCTTGTAGTTAGCAA/-----------GTAGTT----- GAATGTATGG 3070 het 3070 ref 36 28 11 9 N/A 0 0 160789 CASAVA_Build 3 38484088 2I TCTACAAAAA --/AT AAAAAAAATT 3070 het 1956 hom 29 7 20 2 AT 0 1 160790 CASAVA_Build 3 38484248 1D CCCTGTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2661 hom 26 8 10 8 A 12 11 160791 CASAVA_Build 3 38487949 3I TTTAGTCAGT ---/TGA TGATCTTTAG 3070 het 3070 ref 50 21 21 8 TGA 1 2 160792 CASAVA_Build 3 38501171 2D TTTTTCAAAC AA/-- AACACACACA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 4 2 160793 CASAVA_Build 3 38509138 1I TATCATGTTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 8 9 160794 CASAVA_Build 3 38511278 3I CATTGCAGGC ---/CTT CTCCACCTGT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 CTT 0 1 160795 CASAVA_Build 3 38530052 13I TTTTTAAAAA -------------/TGGAATATGTTTT TACTTTCTAA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 TGGAATATGTTTT 0 1 160796 CASAVA_Build 3 38548319 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCTCCCC 1108 hom 10 het 5 0 4 1 C 6 5 160797 CASAVA_Build 3 38557361 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 44 20 20 5 CT 2 1 160798 CASAVA_Build 3 38564671 25I GTCTGTCCTT -------------------------/CCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC CCCTCCTGCT 3070 hom 75 het 32 0 24 9 CCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC 0 1 160799 CASAVA_Build 3 38565363 1I GACAGTTCTC -/T TATGTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 1 2 160800 CASAVA_Build 3 38586371 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1077 het 1077 ref 35 28 4 3 T 12 11 160801 CASAVA_Build 3 38594279 2I TGTTTCTCTT --/TG ACTTTCTCCT 3070 hom 140 het 51 0 45 6 TG 0 1 160802 CASAVA_Build 3 38602011 1D GTGAGTGCAT G/- GGGGGGGTAG 3070 hom 95 het 40 0 33 7 G 8 7 160803 CASAVA_Build 3 38605734 3D CCTTTGCACT TGC/--- TGCTGCTCCC 3070 het 3070 hom 35 15 14 9 TGC 3 2 160804 CASAVA_Build 3 38613420 1I TGGTATCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 10 11 160805 CASAVA_Build 3 38633472 15I AAGAGCTCTG ---------------/GCTGGAGGGCTGCAA GCTGAGCCTG 3070 hom 81 het 33 0 23 10 GCTGGAGGGCTGCAA 0 1 160806 CASAVA_Build 3 38638392 15D AGCCCTGGGG TACCTCCTAGCTGCC/--------------- TACCTCCTAG 3070 hom 139 het 46 0 45 4 TACCTCCTAGCTGCC 2 1 160807 CASAVA_Build 3 38643183 1D CAGGGAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 42 0 33 9 A 11 10 160808 CASAVA_Build 3 38659695 1I CTTGTACCCC -/A ACACCAGCTG 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 1 2 160809 CASAVA_Build 3 38674270 1I TAATCTTAAA -/T TTGTTGTGTT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 2 3 160810 CASAVA_Build 3 38687043 1I GCTTGTCTCT -/A CAATCAAAGG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 0 1 160811 CASAVA_Build 3 38749059 1I GAAAAAAGGT -/A ATTGCCTTTT 3070 hom 132 het 50 0 44 6 A 1 2 160812 CASAVA_Build 3 38795592 1I AGAAATTCAT -/C CCTTAATTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 2 3 160813 CASAVA_Build 3 38805122 1I TGTTGGGGGG -/T GGGTGGGGGC 3070 hom 74 het 29 0 25 4 T 0 1 160814 CASAVA_Build 3 38809260 1I TTTTTGGCTC -/T GTAGAACATC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 0 1 160815 CASAVA_Build 3 38823309 5D GATCATTTGC AATTA/----- AATTAAATTA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AATTA 3 2 160816 CASAVA_Build 3 38824745 2D CATGCTTTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 107 het 44 0 34 11 TC 6 5 160817 CASAVA_Build 3 38833624 1D CAAGTCAAGC A/- AAAAAACAGC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 A 7 6 160818 CASAVA_Build 3 38834258 1D GTAATTCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 10 9 160819 CASAVA_Build 3 38862293 2D TTATTGAATT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 TA 8 7 160820 CASAVA_Build 3 38866514 4D AAAGGGGGCA CAGC/---- AGTGCCACAG 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 CAGC 1 0 160821 CASAVA_Build 3 38873484 1I TTTTAAATTT -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 6 7 160822 CASAVA_Build 3 38891240 1I CTCTGGGTTG -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 6 7 160823 CASAVA_Build 3 38898210 4D CATATAGTGG CAAA/---- CAACTTGATG 3070 het 3070 hom 64 24 34 11 CAAA 1 0 160824 CASAVA_Build 3 38910652 1I CAGCACTGCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 8 9 160825 CASAVA_Build 3 38913304 1I ATGTAGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1406 hom 40 5 28 7 T 14 15 160826 CASAVA_Build 3 38956553 2D ATGTACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 AT 9 8 160827 CASAVA_Build 3 39042464 8D ATTTTTGTTG ACAAAAAT/-------- ACTTAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 25 11 3 ACAAAAAT 1 0 160828 CASAVA_Build 3 39138818 3D AAAAAGAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 14 11 160829 CASAVA_Build 3 39149443 1I GGCACTTATG -/A TGTCATTTTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 0 1 160830 CASAVA_Build 3 39163542 4D CATACACAAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 142 hom 49 3 12 38 AC 11 9 160831 CASAVA_Build 3 39172598 16I GACGTTGCTG ----------------/TTCCCAAGGAATCCTT TTCCCAAGGA 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 TTCCCAAGGAATCCTT 1 2 160832 CASAVA_Build 3 39174389 1D TTTACCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 41 1 26 14 T 12 11 160833 CASAVA_Build 3 39182068 5D GGGATGCTGT ATCTC/----- ATCTCTTCTT 3070 het 3070 ref 50 25 21 6 ATCTC 2 1 160834 CASAVA_Build 3 39189009 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 11 12 160835 CASAVA_Build 3 39190482 1D TTATTCTGTC T/- GTCACTGATG 3070 het 3070 ref 43 20 14 11 T 1 0 160836 CASAVA_Build 3 39215605 1D CAAGTGGGGC A/- AAGATAGTAT 3070 het 3070 ref 51 27 19 7 A 3 2 160837 CASAVA_Build 3 39217651 8D CCATCTAGGG TGGTTTTA/-------- TGGTTTTATG 3070 het 3070 hom 44 19 17 10 TGGTTTTA 2 1 160838 CASAVA_Build 3 39245069 1D AATGATCAAT A/- AAAAAAAAAA 1688 het 107 hom 14 1 8 5 A 15 14 160839 CASAVA_Build 3 39245192 1I GATGTCACTA -/T TTTTTTTTTT 2293 het 2293 ref 29 11 10 8 T 11 12 160840 CASAVA_Build 3 39247283 1D CTGTTTATTA T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 7 6 160841 CASAVA_Build 3 39248561 3D CAGTAGGAAA AAT/--- AATAATGTAG 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 AAT 3 2 160842 CASAVA_Build 3 39253175 4I GTTGGCACTC ----/AGTT AGTGTGTCAC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AGTT 0 1 160843 CASAVA_Build 3 39262818 10I AGCATAGTAC ----------/CCAATAGGTA GTTTTTCGAT 3070 hom 172 het 63 0 58 5 CCAATAGGTA 0 1 160844 CASAVA_Build 3 39269454 1D GAGACTCAGG T/- GTGCAGGCGG 3070 hom 58 het 24 0 17 7 T 1 0 160845 CASAVA_Build 3 39270475 1I CCTGCGTGGC -/A AGCAGGGGAT 3070 hom 113 het 42 0 37 5 A 1 2 160846 CASAVA_Build 3 39270963 4D TTTTGTTCTT TTTA/---- TTTATTTTTT 1852 hom 15 het 9 0 6 3 TTTA 2 1 160847 CASAVA_Build 3 39275966 3I TAATTGAAAA ---/AAG AAGATATAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAG 1 2 160848 CASAVA_Build 3 39285650 1I TGCAATTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 A 10 11 160849 CASAVA_Build 3 39295074 1D TCAATTTTCC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 9 8 160850 CASAVA_Build 3 39318488 7I CAGGTTTTTT -------/TTTGATC TGAAATAAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTTGATC 0 1 160851 CASAVA_Build 3 39334557 2I ATGTCAGATT --/TC TCTTACTGTC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TC 1 2 160852 CASAVA_Build 3 39352691 1D TTAATGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 557 hom 26 3 20 3 T 13 12 160853 CASAVA_Build 3 39401299 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1675 het 1675 ref 22 7 5 10 T 15 14 160854 CASAVA_Build 3 39411458 1I AGTCAGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 10 11 160855 CASAVA_Build 3 39411906 1D TATTTAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 58 hom 18 1 14 3 A 10 9 160856 CASAVA_Build 3 39413649 1D AATTCTGGCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 9 8 160857 CASAVA_Build 3 39420926 4D TAAGCACATT AATA/---- AATGTGTATG 3070 het 2737 hom 20 8 12 0 AATA 1 0 160858 CASAVA_Build 3 39421631 6D GAAGCGGGAG GCATTT/------ GCATTTGCCG 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 GCATTT 2 1 160859 CASAVA_Build 3 39425281 2I ATTGTGAGAC --/AT ATAGAAAGAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 AT 1 2 160860 CASAVA_Build 3 39425623 1D CTCCACTGTT A/- AGAGATCTTA 2949 hom 24 het 12 0 9 3 A 2 1 160861 CASAVA_Build 3 39426332 5I CCTGTTTCTT -----/AAAAA AAAAAAGCCA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 6 11 160862 CASAVA_Build 3 39426725 1I ATTTTAATAA -/T TTTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 5 6 160863 CASAVA_Build 3 39427949 1D TGTCCAGGCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 9 8 160864 CASAVA_Build 3 39431999 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 7 8 160865 CASAVA_Build 3 39432340 6D ATCAAGAGAC TTAATG/------ TTAATATTCA 1812 het 1812 ref 25 8 6 15 TTAATG 1 0 160866 CASAVA_Build 3 39437452 1I TACAGGGAAA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 160867 CASAVA_Build 3 39437692 1D AGAGAGGAGG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 A 8 7 160868 CASAVA_Build 3 39438781 1D TAACAAAATT A/- ACGCAAGTGT 3070 het 3070 ref 24 10 9 6 A 2 1 160869 CASAVA_Build 3 39438929 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 13 12 160870 CASAVA_Build 3 39441931 3D GCCTGGCTAA TTT/--- TTTTATTTTT 2263 hom 21 het 8 0 8 0 T 7 4 160871 CASAVA_Build 3 39442099 5D51M14D CAGTCATGAA ACTTTACCCATATTTCCTCAAACATTGCTAACAAATTGGAACTACTTTTGTAGTGGTCAGGTAGCTTCTT/-----GCCCATATTTCCTCAAACATTGCTAACAAATTGGAACTACTTTTGTAGTGG-------------- TCAGACACAT 3070 het 3070 ref 29 26 16 0 N/A 0 0 160872 CASAVA_Build 3 39445751 8I CAGTCGGATT --------/CCTCCTCC CCCTTGGGGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 CCTCCTCC 0 1 160873 CASAVA_Build 3 39447942 1I CTAGCTGACA -/T TTTTTTTTTC 1677 het 1641 hom 14 5 4 5 T 9 10 160874 CASAVA_Build 3 39449286 15D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAGAAAGT 3070 het 739 hom 21 5 14 6 A 19 4 160875 CASAVA_Build 3 39454458 5D ACATTTTTGA TAGAT/----- TAGATTAGAT 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 TAGAT 3 2 160876 CASAVA_Build 3 39455439 4I GGAAGAAGGA ----/AAAG AAAGAAAGAA 1551 het 1551 ref 28 11 7 10 AAAG 4 5 160877 CASAVA_Build 3 39463943 1D CGCCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 2386 hom 26 7 16 3 C 3 2 160878 CASAVA_Build 3 39464017 1I CCAACATGGC -/A AAAACCCCTT 3070 het 1707 hom 12 4 8 0 A 4 5 160879 CASAVA_Build 3 39468725 1I TCCTAAAAAA -/T TTTTTATAAG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 5 6 160880 CASAVA_Build 3 39469462 2D TTTTATTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 31 0 27 5 T 12 10 160881 CASAVA_Build 3 39469699 1I ATGGGTAGGG -/C ATTTCATTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 0 1 160882 CASAVA_Build 3 39470244 2I GCAGAGAGAC --/AG AGGGAGAAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AG 1 2 160883 CASAVA_Build 3 39483238 5D GCCCCACATT TTAGG/----- TTAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 30 12 13 9 TTAGG 2 1 160884 CASAVA_Build 3 39492665 3D GCAACCAGAT ATC/--- ATGAGAACTC 3070 het 3070 ref 59 28 25 6 ATC 1 0 160885 CASAVA_Build 3 39495242 1D CTTCTGTATA T/- TTTTTCAGCT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 6 5 160886 CASAVA_Build 3 39495358 2D GGAGTCTCAC TT/-- TGTCACCCAG 1748 het 1748 ref 17 9 5 3 T 3 1 160887 CASAVA_Build 3 39496306 1D GACATATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 11 10 160888 CASAVA_Build 3 39496536 2D CACTTTTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1650 hom 41 6 24 13 A 13 11 160889 CASAVA_Build 3 39508037 1D ATATTTTGGG T/- TTTTGTAATT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 5 4 160890 CASAVA_Build 3 39511278 1I ATTTTCAAAG -/C CCCCCCCCCG 2120 het 747 hom 19 4 9 6 C 9 10 160891 CASAVA_Build 3 39511292 2I CCCCCGCCCC --/CA CCGAGTTACG 2491 het 869 hom 24 5 8 11 CA 0 1 160892 CASAVA_Build 3 39511806 5D TAATAACTGA TGAAT/----- TGAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 6 TGAAT 1 0 160893 CASAVA_Build 3 39514822 3I AGGAGGGCAG ---/TTT TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 6 9 160894 CASAVA_Build 3 39519768 1I CCCATCCATC -/T TCCCAACACA 3070 hom 147 het 55 0 48 7 T 1 2 160895 CASAVA_Build 3 39521023 2I AGTGGGTATC --/AG AGAAGGTGCC 3070 hom 102 het 40 0 34 7 AG 1 2 160896 CASAVA_Build 3 39536455 1D ATGACATCTG T/- TTTTTTTTTT 2611 het 1365 hom 31 9 8 14 T 17 16 160897 CASAVA_Build 3 39544890 2I CAAGCTAGGG --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 A 8 10 160898 CASAVA_Build 3 39549383 2I GCCATGAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 10 12 160899 CASAVA_Build 3 39551382 4D CCTTCCTTCG TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 het 3070 ref 35 14 15 7 TTCC 4 3 160900 CASAVA_Build 3 39556470 1D GAACTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 11 10 160901 CASAVA_Build 3 39563292 1I AAGGAATAAT -/A AAAAAAAAAA 1544 het 1544 ref 20 9 5 6 A 10 11 160902 CASAVA_Build 3 39574673 2D TCTTTGAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1035 hom 26 8 11 7 T 16 14 160903 CASAVA_Build 3 39575210 4I CAAGTGTATT ----/AAGA AAGTAAAGGA 3070 hom 93 het 36 0 29 7 AAGA 0 1 160904 CASAVA_Build 3 39591978 1I GGTTGTGATA -/T GTTGGAAAAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 0 1 160905 CASAVA_Build 3 39594161 1D TCACATAGCC A/- ACGAAAAACT 3070 hom 93 het 35 0 33 3 A 2 1 160906 CASAVA_Build 3 39610399 8I GGGCTGGGGA --------/AAGTGTGT AAGTGTGTAG 3070 hom 76 het 37 0 25 12 AAGTGTGT 1 2 160907 CASAVA_Build 3 39611392 1I CTCAAGTAAT -/C CTCATGCCTT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 1 2 160908 CASAVA_Build 3 39617545 11I TTTAACAATA -----------/ATCAACCCATT AGATGTTAAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 ATCAACCCATT 0 1 160909 CASAVA_Build 3 39621958 1D TAGTCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 13 12 160910 CASAVA_Build 3 39622520 1D GATTGGAAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 160911 CASAVA_Build 3 39623388 2D GAAAAGGATC TT/-- ATTTCTCCTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 2 0 160912 CASAVA_Build 3 39629259 1I CTTTATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 883 hom 39 3 25 11 T 14 15 160913 CASAVA_Build 3 39644620 1I TGGAACTGGA -/T GGATATTGTG 3070 hom 91 het 41 0 37 4 T 0 1 160914 CASAVA_Build 3 39655183 1I AAGAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 24 2 15 7 T 11 12 160915 CASAVA_Build 3 39660534 2D CTCAAAAAAA AG/-- AGAAACAGCC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 AG 2 1 160916 CASAVA_Build 3 39665714 1D CACTACAGTC A/- AACTGAAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 3 2 160917 CASAVA_Build 3 39672797 3I CTGAGAAAAA ---/TTC TTCTGCCTTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TTC 1 2 160918 CASAVA_Build 3 39676569 1D TTGCAACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 20 0 15 5 A 13 12 160919 CASAVA_Build 3 39676698 1D TAATAACAAG A/- TATTGACAAG 3070 hom 81 het 28 0 27 1 A 1 0 160920 CASAVA_Build 3 39682521 1I CGTATATAAA -/G GGAAAAGTAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 2 3 160921 CASAVA_Build 3 39689319 1I AGTCTTAATG -/C CACCATTTTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 1 2 160922 CASAVA_Build 3 39700609 1I CATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 10 11 160923 CASAVA_Build 3 39703125 1I ACATTAAATT -/A AAAAAATCTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 160924 CASAVA_Build 3 39707737 1I AACAAGACCC -/A ATTCTATGCT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 1 2 160925 CASAVA_Build 3 39712758 3I GTAATAGAAT ---/TTA TTAGTCCAAG 3070 hom 69 het 31 0 23 8 TTA 1 2 160926 CASAVA_Build 3 39720987 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2375 het 979 hom 28 5 6 17 T 16 15 160927 CASAVA_Build 3 39722070 4D TCTCTCTCCC TCTT/---- TCTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 41 18 19 7 TCTT 2 1 160928 CASAVA_Build 3 39735012 1D AGGCAGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 653 hom 31 2 24 5 T 11 10 160929 CASAVA_Build 3 39748099 1I TATTTTAGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 8 9 160930 CASAVA_Build 3 39752975 1D CCTACTTGAC A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 A 8 7 160931 CASAVA_Build 3 39760164 4D CAAATAAAAA TCTT/---- TCTGCTGAAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 TCTT 1 0 160932 CASAVA_Build 3 39767367 1D GGAGCCACCA C/- TTCTGTCTGC 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 C 1 0 160933 CASAVA_Build 3 39771434 2D GGGAAATTAC TA/-- TATACACACT 3070 het 3070 ref 38 20 16 4 TA 3 2 160934 CASAVA_Build 3 39771977 2D AGGTGGCAGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 60 19 25 16 AG 9 8 160935 CASAVA_Build 3 39790565 1I ATGTCTTTAC -/A AAAAAAAAAA 2525 het 2525 ref 28 10 12 6 A 13 14 160936 CASAVA_Build 3 39807893 2I GTTCCCACTC --/AT AAAAACTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 AT 0 1 160937 CASAVA_Build 3 39811076 2D GTGACTTGGC AA/-- AATACTTTGT 3070 het 3070 ref 60 26 26 8 A 4 2 160938 CASAVA_Build 3 39811864 6D AGAGTCACGC AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 3070 het 968 hom 42 10 17 15 AG 16 13 160939 CASAVA_Build 3 39812743 1D CCAGATCCAC T/- TTTTTTTTTT 1406 het 1406 ref 51 36 4 11 T 12 11 160940 CASAVA_Build 3 39828163 2D GGGGGGAGGC TG/-- TGTGTGTGTG 1261 het 1261 ref 55 38 3 15 TG 7 6 160941 CASAVA_Build 3 39830394 1D GTCTTATCTA T/- TTTTGTGATT 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 T 5 4 160942 CASAVA_Build 3 39832383 1D TCTAATAGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 22 0 11 11 T 13 12 160943 CASAVA_Build 3 39839364 1I GATTTGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 33 1 12 20 T 13 14 160944 CASAVA_Build 3 39844374 1I TGATTGGCAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 18 18 9 T 9 10 160945 CASAVA_Build 3 39850057 1D ATTGAGAATC A/- GTGCTGTGTT 3070 het 3070 ref 43 19 18 7 A 1 0 160946 CASAVA_Build 3 39852094 1D TATAAGTAAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 8 7 160947 CASAVA_Build 3 39854747 4I TATGTTGAAT ----/AGGA AGGAGTGTTG 2422 het 1867 hom 10 4 5 1 AGGA 1 2 160948 CASAVA_Build 3 39862699 1I GCTTCATTCC -/T TCTCTCCTAT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 1 2 160949 CASAVA_Build 3 39864961 1D TGCTTATTTT G/- ACTCCTCTTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 1 0 160950 CASAVA_Build 3 39867739 2I AGAGCCCAGA --/CT CTCTGCAGTG 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 CT 2 3 160951 CASAVA_Build 3 39883981 3I AAAGCTCACA ---/AAT AATCCCATTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAT 1 2 160952 CASAVA_Build 3 39886839 18D AGCACCATTG TTCCAATTTGTTCCATTC/------------------ TTCCAATTTG 3070 het 3070 ref 52 33 13 15 TTCCAATTTGTTCCATTC 2 1 160953 CASAVA_Build 3 39895873 1I CTTGGGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 10 11 160954 CASAVA_Build 3 39897726 4D TCTGTTATCC TGTT/---- TGTTAGTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 9 6 TGTT 2 1 160955 CASAVA_Build 3 39907132 1D GGTTAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1817 hom 27 7 12 9 T 17 16 160956 CASAVA_Build 3 39908403 1I ACCTTTTCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 8 9 160957 CASAVA_Build 3 39912019 1D CATATATATA T/- TTTTTTTTCG 3070 het 3070 hom 18 7 9 2 T 9 8 160958 CASAVA_Build 3 39912412 2D TGTGTGTGTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 112 hom 44 1 30 14 GT 10 9 160959 CASAVA_Build 3 39917038 1I TTATAAAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 9 10 160960 CASAVA_Build 3 39927791 2I TGTAGAAAAA --/AG GGAATCATGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AG 0 1 160961 CASAVA_Build 3 39928550 3I AAACCAGGTT ---/GAG GCCTTAAATT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 GAG 0 1 160962 CASAVA_Build 3 39929535 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 8 9 160963 CASAVA_Build 3 39931418 2D TTCCCCTTCC TA/-- TAAAGGCCCC 3070 hom 138 het 48 0 46 2 TA 2 1 160964 CASAVA_Build 3 39932254 2D ATGCCAGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 12 10 160965 CASAVA_Build 3 39932904 1D TATTGAGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1012 hom 31 5 17 9 A 13 12 160966 CASAVA_Build 3 39933968 3D ATAGGAAAAT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 27 0 24 3 TAA 1 0 160967 CASAVA_Build 3 39934219 8D CCAGATGATG CCCAAGAC/-------- CCCAAGTCTG 1379 het 87 hom 26 2 6 19 CCCAAGAC 1 0 160968 CASAVA_Build 3 39944789 3I CAGAAAATAT ---/AGA AGGAGGGACT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 AGA 0 1 160969 CASAVA_Build 3 39945146 1D AAAAATTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1077 hom 43 4 17 22 A 11 10 160970 CASAVA_Build 3 39947073 5I TTGCTTATGC -----/TTGAG TTATTTCTAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 TTGAG 0 1 160971 CASAVA_Build 3 39948864 1I AAAATGAGTC -/T TTTTTTTTTT 2993 het 2993 ref 24 9 10 5 T 10 11 160972 CASAVA_Build 3 39952454 1D TTGAAATATT A/- AAAAATTTCA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 A 6 5 160973 CASAVA_Build 3 39952591 2I CCCATTTTCC --/TG TGTTTGGATA 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 TG 1 2 160974 CASAVA_Build 3 39955625 1D CCATAGGCTG C/- CCCCAAATCT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 C 5 4 160975 CASAVA_Build 3 39958428 2I TGGATTTTAC --/AG AGTCATGTTG 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 AG 1 2 160976 CASAVA_Build 3 39962505 1I GGTAATGGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 10 160977 CASAVA_Build 3 39985958 2D TGGGTTTGTC AT/-- AGATGGTTCT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 AT 1 0 160978 CASAVA_Build 3 39993563 3I CTGTGTGTTT ---/TTG TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 TTG 0 1 160979 CASAVA_Build 3 39994507 1I ATTTATCAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 A 9 10 160980 CASAVA_Build 3 39996658 2I GAATGCTCTC --/AG GGGAAGAGGA 3070 het 3070 ref 45 20 14 11 AG 0 1 160981 CASAVA_Build 3 40006163 1I CCTCCCGCTA -/G GGGCTCAGGC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 G 3 4 160982 CASAVA_Build 3 40019539 4I ATCTATAGAT ----/ATAA ATAGAGACAG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 ATAA 0 1 160983 CASAVA_Build 3 40023839 1D AATATATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 12 11 160984 CASAVA_Build 3 40036804 5I ACCAATTATT -----/ACTTA ACTTCTAGAT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 ACTTA 0 1 160985 CASAVA_Build 3 40040006 3D GATGACATCA CTG/--- CTGCTGCTGC 3070 hom 82 het 36 0 24 12 CTG 4 3 160986 CASAVA_Build 3 40053503 2D GAAAAAACAC AG/-- AGAGCAAAGA 3070 het 3070 hom 36 15 20 3 AG 3 2 160987 CASAVA_Build 3 40054624 1D TCAAAATGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 9 160988 CASAVA_Build 3 40056222 1D CTGTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 31 2 23 6 T 12 11 160989 CASAVA_Build 3 40058629 1D TCAAATTACA C/- AGCTTTACAG 1877 het 1877 ref 19 13 4 2 C 1 0 160990 CASAVA_Build 3 40073273 1D AACTTAAAAA T/- CCATAGCGCA 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 T 1 0 160991 CASAVA_Build 3 40084257 3I GTCTAAGAGA ---/TGG TGGTAACATT 3070 het 3070 hom 67 30 32 5 TGG 1 2 160992 CASAVA_Build 3 40088069 1D GGTGTGAGGC T/- TTTAGGAATC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 4 3 160993 CASAVA_Build 3 40089329 1D GTTCTTTTTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 117 het 40 0 40 1 A 9 8 160994 CASAVA_Build 3 40097287 13D TCCTAACTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2572 hom 25 13 10 5 T 23 10 160995 CASAVA_Build 3 40104431 1I TACACCATTG -/T TCTTGTGTTT 3070 het 3070 ref 44 27 15 2 T 1 2 160996 CASAVA_Build 3 40132290 1I TTCACAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 12 11 12 T 14 15 160997 CASAVA_Build 3 40132914 1D TGGAAAACAT C/- CCCCTACTGT 3070 het 3070 ref 46 27 15 6 C 5 4 160998 CASAVA_Build 3 40134515 5D CCTACAAATC CAAAA/----- CAAAAAGCCC 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 CAAAA 2 1 160999 CASAVA_Build 3 40134725 2I GTATGTTGGC --/AA AGAGGCTAAT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 1 3 161000 CASAVA_Build 3 40136067 7D TCCCGTGGCA TATCTAT/------- TCAATTATTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 5 TATCTAT 1 0 161001 CASAVA_Build 3 40148924 1I TGCCCACCTG -/T AGCTCCTAAA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 0 1 161002 CASAVA_Build 3 40182252 1D GCCATATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1212 hom 41 7 23 12 A 17 16 161003 CASAVA_Build 3 40193569 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2061 het 1600 hom 22 12 5 5 A 15 14 161004 CASAVA_Build 3 40205273 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 35 1 30 4 A 10 11 161005 CASAVA_Build 3 40210386 1D ACATTTATAC T/- TTTTTTATCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 6 161006 CASAVA_Build 3 40212193 1D TTGATTATGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 9 8 161007 CASAVA_Build 3 40214718 3I CACCGAGGGC ---/AGT AGTTGGAAGT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 AGT 1 2 161008 CASAVA_Build 3 40217922 3I TAAATCAATG ---/TAA TAATATGAAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TAA 1 2 161009 CASAVA_Build 3 40227472 11D CATTTGTTGA GTGTCTCCTCT/----------- GTGTCTCCTC 3070 het 3070 ref 44 26 15 5 GTGTCTCCTCT 2 1 161010 CASAVA_Build 3 40228317 2I CTCCTGGAGG --/CA CAGTCACCAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 CA 1 2 161011 CASAVA_Build 3 40230182 1I TTCCAGAAGC -/T GCCACTGCGC 3070 hom 78 het 35 0 25 10 T 0 1 161012 CASAVA_Build 3 40239751 4I CATCTGATAG ----/AATA AATAGTCAAA 3070 hom 66 het 32 0 23 9 AATA 1 2 161013 CASAVA_Build 3 40240484 1D TCTAAAGGAA G/- GGCTTTCCAG 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 G 3 2 161014 CASAVA_Build 3 40262592 3D GAGAACTGTG GTC/--- GTCAATAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 9 5 GTC 2 1 161015 CASAVA_Build 3 40295411 1I ATGATGTCAC -/T GAGCACAACT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 0 1 161016 CASAVA_Build 3 40296264 3I GATGTATGAA ---/ATC ATCATTGTGG 3070 hom 157 het 57 0 53 4 ATC 1 2 161017 CASAVA_Build 3 40297076 1D CTCACTGGGG A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 A 6 5 161018 CASAVA_Build 3 40298371 4I GGGTATTAGC ----/TTTT TTGTTTCCTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 2 6 161019 CASAVA_Build 3 40299385 19D TATCTACTTT TTTCTTTTATTGATTGTAC/------------------- TTTGGTGAAA 2616 het 2616 ref 21 16 7 3 TTTCTTTTATTGATTGTAC 1 0 161020 CASAVA_Build 3 40314690 1I ATAACATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 A 11 12 161021 CASAVA_Build 3 40321441 4D GGTTTAACTC TTCT/---- TTTAGATTCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 TTCT 1 0 161022 CASAVA_Build 3 40326973 1I TGTAATCTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 9 10 161023 CASAVA_Build 3 40328430 2D TATATTTCTC AG/-- AGTTATTTTG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 AG 2 1 161024 CASAVA_Build 3 40328796 1I CTTGATTAAA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 87 het 40 0 29 11 T 7 8 161025 CASAVA_Build 3 40330596 1D TGATTCTCTT C/- CCTTCAGCCT 3070 het 3070 hom 47 19 26 3 C 3 2 161026 CASAVA_Build 3 40333462 1D AATTAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2574 het 2574 ref 26 13 9 4 A 11 10 161027 CASAVA_Build 3 40343283 1D TATAGCTCCA T/- TTTTTTTTTT 1497 het 582 hom 24 7 7 10 T 13 12 161028 CASAVA_Build 3 40347518 1I ACATGTTGAA -/T TTTTTTTTTT 1139 het 1139 ref 38 28 3 7 T 13 14 161029 CASAVA_Build 3 40361481 4D CAGGTCCCTG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 10 AAAC 5 4 161030 CASAVA_Build 3 40373751 3D ACACACAACT ACA/--- ACAACATTAG 2964 het 2964 ref 26 12 9 5 ACA 3 2 161031 CASAVA_Build 3 40377152 4D TCCGTCTCCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 30 9 14 8 AAAT 3 2 161032 CASAVA_Build 3 40389215 20I GGATAAACAA --------------------/ACTGAGTACCATTCAGCAAT AAAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 52 25 22 7 ACTGAGTACCATTCAGCAAT 0 1 161033 CASAVA_Build 3 40392844 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 2971 het 2971 ref 29 16 10 3 A 13 12 161034 CASAVA_Build 3 40398250 2D CACAAACAGG CA/-- CACACACACA 1197 het 1197 ref 49 38 3 9 CA 8 7 161035 CASAVA_Build 3 40400303 15D TAATGGGGGA AAGACTATCAAAGGC/--------------- AACCCTCAGG 3070 het 3070 ref 46 28 20 2 AAGACTATCAAAGGC 1 0 161036 CASAVA_Build 3 40417579 7D GAGGCCTGGA GAGGTCC/------- TGAGATGTTG 3070 het 3070 ref 46 21 19 9 GAGGTCC 1 0 161037 CASAVA_Build 3 40420149 1I TTTCCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2523 het 1570 hom 30 7 11 12 T 17 18 161038 CASAVA_Build 3 40420558 2D GCCATTTCCT CA/-- CCTTCAACCA 3070 het 3070 hom 42 16 17 10 CA 1 0 161039 CASAVA_Build 3 40421089 6D AGAGTCATGG AGGCCA/------ CAGCATATCC 3070 het 3070 hom 44 20 17 12 AGGCCA 1 0 161040 CASAVA_Build 3 40427806 4D AAAAAGAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAA 91 het 91 ref 20 11 2 8 AAAG 1 0 161041 CASAVA_Build 3 40435863 3D CAAAACATTC TAA/--- TAATAAGTAC 3070 het 3070 hom 44 16 24 5 TAA 3 2 161042 CASAVA_Build 3 40436780 2I ACCCAGGCTG --/GA GAGTGCAGTG 1428 het 993 hom 7 2 3 2 GA 1 2 161043 CASAVA_Build 3 40438759 4I GGGTAGTGAT ----/GGAG AGAATTTGCA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 GGAG 0 1 161044 CASAVA_Build 3 40456540 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2513 het 2513 ref 24 11 7 6 T 15 14 161045 CASAVA_Build 3 40460607 1I TAACATGTGT -/A AAGTAGTAAG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 2 3 161046 CASAVA_Build 3 40465586 2I TTCTATGTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 51 23 15 13 GT 6 7 161047 CASAVA_Build 3 40466989 2D CCTGAATGCC CT/-- GTCACTCATT 3070 het 3070 hom 58 27 26 5 CT 1 0 161048 CASAVA_Build 3 40470673 2I AGCAAGACCC --/CT GTCTCTAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CT 0 1 161049 CASAVA_Build 3 40477112 1I TTTTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 2996 het 2996 ref 34 14 11 9 T 10 11 161050 CASAVA_Build 3 40483453 1D AGCTAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 18 8 T 11 10 161051 CASAVA_Build 3 40485129 5D AATTTATAGA TATGT/----- TAGATAGAAC 3070 het 3070 hom 29 14 14 4 TATGT 1 0 161052 CASAVA_Build 3 40486504 1D TTTTAGTTGA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 1805 hom 23 7 13 3 T 8 7 161053 CASAVA_Build 3 40490312 1D GAACCCAGGA G/- GGGGAAGTTG 2377 het 2377 ref 18 7 6 5 G 5 4 161054 CASAVA_Build 3 40490383 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 11 10 161055 CASAVA_Build 3 40490664 1I ATGAAATATG -/A AAAAAACTAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 7 161056 CASAVA_Build 3 40503196 1I AACTCCACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2986 hom 33 8 13 12 A 15 16 161057 CASAVA_Build 3 40525514 23D TCTTGAAGGT TCTTCAAGCAATGTACTATCTTA/----------------------- AGCAGATAGT 3070 het 3070 ref 30 30 8 5 TCTTCAAGCAATGTACTATCTTA 1 0 161058 CASAVA_Build 3 40544272 2I TTATTCTCTG --/AT ATATGTCCTA 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 AT 2 3 161059 CASAVA_Build 3 40559126 1D TGTAATCCCA C/- GCTACTCAGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 1 0 161060 CASAVA_Build 3 40600079 1I TCTTAAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 2411 hom 20 5 14 1 A 6 7 161061 CASAVA_Build 3 40703441 2D GAAGGGTGTG TA/-- TGTGTGCCGG 3070 het 3070 hom 31 13 13 7 TA 1 0 161062 CASAVA_Build 3 40703501 1D TAGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1144 het 1144 ref 35 26 3 6 T 12 11 161063 CASAVA_Build 3 40722435 6I ATAGTGCTGT ------/TGAGTA TAACTATGTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TGAGTA 0 1 161064 CASAVA_Build 3 40724246 1I TCTGTGCTGG -/T TTTTTCCCCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 5 6 161065 CASAVA_Build 3 40730827 1D ATTATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 12 11 161066 CASAVA_Build 3 40753124 1D ATAAAATATA T/- TTTTTAATGT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 6 5 161067 CASAVA_Build 3 40755466 12D GGGGTTTAAT CTCTCTTGGGAA/------------ CTCTGGATGC 3070 het 3070 ref 45 27 13 6 CTCTCTTGGGAA 1 0 161068 CASAVA_Build 3 40761973 1I TGCCCACACT -/G GTGGAAAGCC 3070 hom 102 het 39 0 32 7 G 1 2 161069 CASAVA_Build 3 40765620 2D GCACCTTCTC GA/-- TCCTGTGAAA 3070 hom 135 het 48 0 46 3 GA 1 0 161070 CASAVA_Build 3 40766033 1D GTGAGCTTAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 9 8 161071 CASAVA_Build 3 40769894 2D ATTTTACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 55 25 22 9 TG 7 6 161072 CASAVA_Build 3 40771975 2I TTATTATTAT --/AC TGAAATTCTA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 AC 0 1 161073 CASAVA_Build 3 40774196 1I AATAGAAGCC -/A AAAAAAGAGC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 6 7 161074 CASAVA_Build 3 40814470 4D TTTGCCTTTT CTTA/---- CTTCTAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 14 6 CTTA 1 0 161075 CASAVA_Build 3 40839995 1I AGTTTTGCAT -/G TATTCATTCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 161076 CASAVA_Build 3 40848414 1D GTATCTATTG T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 63 het 28 0 22 8 T 8 7 161077 CASAVA_Build 3 40849913 8I CGCCTATCTA --------/ATTTTTGT ATTTTTGTGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATTTTTGT 1 2 161078 CASAVA_Build 3 40850190 1D AGTCCAGCCC A/- AAGGTTCAGC 3070 hom 124 het 49 0 42 8 A 3 2 161079 CASAVA_Build 3 40855323 1I GGGTAGGGCA -/C CCCTCAAAGA 3070 hom 92 het 33 0 29 4 C 3 4 161080 CASAVA_Build 3 40874324 2D AATTGCCCTC AT/-- GTGTGCAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 11 5 AT 1 0 161081 CASAVA_Build 3 40892608 1I TACTTGTCTT -/C CCTGTACGGC 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 C 2 3 161082 CASAVA_Build 3 40929014 1D CAGTAGGAAC T/- TTTTTTTTTT 1527 het 1527 ref 46 31 4 11 T 11 10 161083 CASAVA_Build 3 40996574 2D AATGTTAACT AA/-- CAGTTTCAGG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 2 0 161084 CASAVA_Build 3 40998138 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1786 het 1608 hom 17 6 7 4 T 17 16 161085 CASAVA_Build 3 41001696 2I CTGGATGGGC --/AT ATATTCTTTT 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 AT 2 3 161086 CASAVA_Build 3 41012923 1D AGCTTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3007 hom 34 8 23 4 A 12 11 161087 CASAVA_Build 3 41013961 1D AGTTAACAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 116 het 48 0 39 9 A 10 9 161088 CASAVA_Build 3 41019617 1I AATTAAGATA -/T TTTTCAGGTA 2235 het 2235 ref 20 8 7 5 T 4 5 161089 CASAVA_Build 3 41021360 4I GCAAGGAAAA ----/AGTT AGTCTTATTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AGTT 0 1 161090 CASAVA_Build 3 41022426 4D TGTGTATCAC ATTG/---- ATTGATGTGC 3070 het 3070 hom 47 23 22 3 ATTG 2 1 161091 CASAVA_Build 3 41026999 18D ATTGTGCCCA CCCAGATTAAGGGTGGGT/------------------ CTGCCTTTCC 3070 het 3070 ref 29 12 11 8 CCCAGATTAAGGGTGGGT 1 0 161092 CASAVA_Build 3 41028487 10I CAGGTGCCCC ----------/AGGGTGACCT AGGGCAGACA 3070 hom 80 het 34 0 27 7 AGGGTGACCT 0 1 161093 CASAVA_Build 3 41029356 3D TTTGATTTGA TAT/--- TATTTTTTAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 TAT 2 1 161094 CASAVA_Build 3 41034102 3I ATGATTATAC ---/ACG TGTGCTGTCC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 ACG 0 1 161095 CASAVA_Build 3 41035576 10D CAGAACAAAA TAAGAGGGCT/---------- TACAAGCTCC 3070 het 3070 ref 38 22 15 2 TAAGAGGGCT 1 0 161096 CASAVA_Build 3 41037287 1D TTTATATGGC T/- TCTCTTAAGT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 2 1 161097 CASAVA_Build 3 41037604 4I TTGGGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTTG 3 4 161098 CASAVA_Build 3 41061197 2I CCATCTCCTG --/TA TATTTCCTGG 3070 hom 72 het 31 0 23 8 TA 1 2 161099 CASAVA_Build 3 41061914 2I GATTTTCATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 26 1 18 7 A 10 12 161100 CASAVA_Build 3 41062229 1D CTGTTGTAGA C/- CCCCCCGGAG 3070 hom 64 het 29 0 18 11 C 7 6 161101 CASAVA_Build 3 41066429 1D TACTTATCGA T/- TTTTTGTCTG 3070 hom 75 het 26 0 26 1 T 6 5 161102 CASAVA_Build 3 41067117 1I AGGAGCCTCA -/C CCTGTGGCCG 3070 hom 96 het 42 0 29 13 C 2 3 161103 CASAVA_Build 3 41067213 5I GTTAGTGGTG -----/AATGT TGCCTGGCCT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 AATGT 0 1 161104 CASAVA_Build 3 41070610 1I AACGACACGC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 9 161105 CASAVA_Build 3 41075413 4D TTTTTTACAA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TATT 6 5 161106 CASAVA_Build 3 41076211 2I GCATTTTTTC --/AT ATGTTTGTTA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 AT 1 2 161107 CASAVA_Build 3 41076914 2D CTTTGGGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 44 0 22 22 T 18 16 161108 CASAVA_Build 3 41079781 1I TGGGTGACAA -/G GGGGGGCCCC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 G 6 7 161109 CASAVA_Build 3 41131576 1I ATTCATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 35 0 26 9 A 10 11 161110 CASAVA_Build 3 41166374 5I TCCAGGCCAA -----/TATCT TCATGTCATC 3070 hom 92 het 34 0 30 4 TATCT 0 1 161111 CASAVA_Build 3 41169860 1D CATCCAGCTA T/- TTTTTTTTGT 2511 hom 21 het 9 0 8 1 T 9 8 161112 CASAVA_Build 3 41170106 1D GTTTTCAAAC A/- AAAAAACGAT 3070 hom 67 het 29 0 23 6 A 7 6 161113 CASAVA_Build 3 41172227 6D CAAGAGAATA TGTAGG/------ TGTAGGTGGT 1412 hom 21 het 10 0 8 2 TGTAGG 2 1 161114 CASAVA_Build 3 41178865 1D ACTGGATGAG A/- AAAAAAGGTC 3070 het 3070 ref 53 31 11 12 A 7 6 161115 CASAVA_Build 3 41187790 1I GTACCAGGCG -/T TAAGTTATAC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 1 2 161116 CASAVA_Build 3 41214382 1D16M8I2M6I GCTACACTTA GATTCTACAGAATTAGT--------AG------/-ATTCTACAGAATTAGTGTACAGAAAGTCTACA GAAAGATACA 3070 het 3070 ref 30 23 12 2 N/A 0 0 161117 CASAVA_Build 3 41220589 1I ATAGTTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 T 13 14 161118 CASAVA_Build 3 41230890 1I CTTTATAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 40 1 32 7 A 13 14 161119 CASAVA_Build 3 41231050 1I AGATACTTAC -/G GGGGGGGAAC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 G 7 8 161120 CASAVA_Build 3 41231275 1D TTGGATAGCT A/- AAAAAAAAAA 1394 het 1394 ref 30 21 3 7 A 11 10 161121 CASAVA_Build 3 41256605 4I TGTAGAACAC ----/TAAT TAATTCATAA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 TAAT 1 2 161122 CASAVA_Build 3 41257225 4D CAGACTATCC ATCT/---- ATCTATCTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 ATCT 3 2 161123 CASAVA_Build 3 41259730 1D CAAAGGGGGG A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 48 19 20 9 A 8 7 161124 CASAVA_Build 3 41272110 42D CTATAATCGT AACTAGAGGTAAGGAGGGACATTTCATATTTATAAGAAAATA/------------------------------------------ AATTGGCCAG 3070 het 3070 ref 25 21 12 1 AACTAGAGGTAAGGAGGGACATTTCATATTTATAAGAAAATA 1 0 161125 CASAVA_Build 3 41275543 2D GTATACACAC AT/-- ATATGTATAT 2228 het 2228 ref 24 18 6 2 AT 3 2 161126 CASAVA_Build 3 41280092 1I AATATAAAGT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 60 25 25 10 A 7 8 161127 CASAVA_Build 3 41289079 1I CCTTGGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 12 13 161128 CASAVA_Build 3 41290369 2D CTCTCTTCAC AT/-- ATGTCTGCTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 7 AT 2 1 161129 CASAVA_Build 3 41294082 1D CGGCATAAAA G/- GGACATACCT 3070 het 3070 hom 45 22 20 3 G 3 2 161130 CASAVA_Build 3 41296077 1I TACCCCCAAA -/G GGAAGCCCAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 G 2 3 161131 CASAVA_Build 3 41300338 1I TAGAACTGAT -/A AAAAAAAATT 2927 het 2927 ref 19 8 7 4 A 8 9 161132 CASAVA_Build 3 41304965 1D GGTTGTCTTA G/- AGAGCCTTTG 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 G 1 0 161133 CASAVA_Build 3 41313414 3D CAGATGGCAG GAA/--- GAAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 64 37 23 5 GAA 2 1 161134 CASAVA_Build 3 41323655 2D TAAATAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2484 hom 25 10 9 6 A 14 12 161135 CASAVA_Build 3 41324327 13I CCCGTTTCAT -------------/TCATTCACTCATA ACATACATAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 TCATTCACTCATA 0 1 161136 CASAVA_Build 3 41324929 2D TAAAAACTAC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 22 17 4 A 11 9 161137 CASAVA_Build 3 41325329 1I TCCAAAACAC -/T TCTGGTCATT 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 T 1 2 161138 CASAVA_Build 3 41326394 2D CCTTTTAGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 13 11 161139 CASAVA_Build 3 41326626 2I TTTCTAAAAC --/AT AATAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 AT 0 1 161140 CASAVA_Build 3 41329140 8D AAAAAAACAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 12 AAAC 5 3 161141 CASAVA_Build 3 41334643 1D TAAAAAAAAA T/- AAGATAGAAA 2884 het 2884 ref 25 12 9 5 T 1 0 161142 CASAVA_Build 3 41342947 4D GCATATATAC ATAT/---- ATATATATAT 1896 het 1247 hom 15 5 6 4 AT 9 7 161143 CASAVA_Build 3 41345480 2I TGTTAATCTC --/AT ATTCACCACC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 AT 1 2 161144 CASAVA_Build 3 41346092 4I GAATCTCACC ----/ATAA ATAGTTGTAC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 ATAA 0 1 161145 CASAVA_Build 3 41348703 1I AGCCAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 A 11 12 161146 CASAVA_Build 3 41349550 1D TAATTTATGC A/- AAGCCATGAT 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 A 3 2 161147 CASAVA_Build 3 41349936 1I27M2D GATTTGGGGG -ATCTCTACTGGGCACTGGCTTGGGGAAAG/AATCTCTACTGGGCACTGGCTTGGGGAA-- AGAACCAAAA 3070 het 3070 ref 36 25 15 7 N/A 0 0 161148 CASAVA_Build 3 41350198 1D CTGTTTGCTA T/- GTAGGATATA 3070 het 3070 ref 43 26 14 4 T 1 0 161149 CASAVA_Build 3 41352230 1D GCATGAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 A 11 10 161150 CASAVA_Build 3 41377438 1D GTTGGAAATC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 96 het 38 0 31 7 A 9 8 161151 CASAVA_Build 3 41395699 1D TAAAGTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 10 9 161152 CASAVA_Build 3 41399585 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 23 5 13 5 T 11 10 161153 CASAVA_Build 3 41412832 1I TCTAAGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 A 10 11 161154 CASAVA_Build 3 41417616 1D TTTTGAAGAG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 A 8 7 161155 CASAVA_Build 3 41420722 1D AGCTCTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 828 hom 27 4 16 7 T 17 16 161156 CASAVA_Build 3 41422310 1D TTTTAATGAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 12 7 T 10 9 161157 CASAVA_Build 3 41427443 4I AACTTCATCT ----/TAAC TAACTATATC 3070 het 3070 ref 55 25 19 11 TAAC 1 2 161158 CASAVA_Build 3 41428783 4D AAAAAGGACT TAAA/---- TAAATGGAAA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 TAAA 2 1 161159 CASAVA_Build 3 41432742 1I GGTCTGGTAT -/A TTTTAAAGAT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 0 1 161160 CASAVA_Build 3 41435183 1I CTAAGAGGAT -/G GAGGTAGAGT 3070 het 3070 ref 49 31 15 3 G 1 2 161161 CASAVA_Build 3 41437618 5D TCTCAAAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 2962 het 2402 hom 18 6 10 3 AAAAG 5 4 161162 CASAVA_Build 3 41439084 1I CTGTATTTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 8 9 161163 CASAVA_Build 3 41443844 7D GAGAAGCTAG TACCATT/------- TACCATTTCT 2145 het 2145 ref 31 23 5 5 TACCATT 2 1 161164 CASAVA_Build 3 41444644 1I ACCAAATCAT -/G AATGAACTCT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 G 0 1 161165 CASAVA_Build 3 41450224 2I AATCCCAAAC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 11 161166 CASAVA_Build 3 41465731 1D TATTTAAAAA T/- TTTTTTTTTA 2196 het 2196 ref 13 6 6 1 T 10 9 161167 CASAVA_Build 3 41472898 3D CAAGTGCATT CTG/--- CTATGCTTTC 3070 het 3070 ref 49 29 16 5 CTG 1 0 161168 CASAVA_Build 3 41480502 1I CAGATGTTCT -/A AAAAAAAAAA 2916 het 2781 hom 34 13 11 10 A 15 16 161169 CASAVA_Build 3 41487555 1I ACAACAGAAC -/A AAAAAACCAC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 A 6 7 161170 CASAVA_Build 3 41503398 2D ATTTTGTACT CA/-- GATTTGGTTA 3070 het 3070 ref 41 19 19 4 CA 1 0 161171 CASAVA_Build 3 41504473 1I CCAAAGAAAT -/A ACAAATGATC 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 1 2 161172 CASAVA_Build 3 41507824 5D TAAAAAATAA AATAC/----- AACAGTAAGA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 AATAC 1 0 161173 CASAVA_Build 3 41508196 1I ATTTTTATAT -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 0 1 161174 CASAVA_Build 3 41508280 4D CAATGTGCAG GTTA/---- GTTACATATG 1956 het 757 hom 7 3 4 1 GTTA 2 1 161175 CASAVA_Build 3 41513560 4I GATATTAAAT ----/AGAA AGAGACACTA 2141 het 1216 hom 40 6 8 26 AGAA 0 1 161176 CASAVA_Build 3 41515072 3D CTTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 14 11 161177 CASAVA_Build 3 41516720 1I TCCTTCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 10 11 161178 CASAVA_Build 3 41517707 1I AGTAATGTTT -/A GGCTGGGCGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 0 1 161179 CASAVA_Build 3 41529498 4D TACTAATCAG CTAA/---- CTGATTTTGG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CTAA 1 0 161180 CASAVA_Build 3 41532581 5D AAGTAAATAA AATAT/----- AACAAAAGAT 3070 het 3070 ref 27 16 10 4 AATAT 1 0 161181 CASAVA_Build 3 41533726 1I AAATGCTGGC -/A AAAAATGTGC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 5 6 161182 CASAVA_Build 3 41542678 3D TATGTATGAT TCG/--- TCTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 54 30 20 5 TCG 1 0 161183 CASAVA_Build 3 41552861 4D CTAGGAACTG ACAA/---- ACATTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 19 17 4 ACAA 1 0 161184 CASAVA_Build 3 41553355 4I CATAATTTGT ----/CTGA CTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 CTGA 0 1 161185 CASAVA_Build 3 41553764 1I AGTTATGCAC -/A TCTGGACATA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 0 1 161186 CASAVA_Build 3 41554419 1I CTTTGTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 13 14 161187 CASAVA_Build 3 41554850 1I TTCCCTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 T 8 9 161188 CASAVA_Build 3 41555684 1I GTTCAAGGGT -/C CAACTGTATT 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 C 1 2 161189 CASAVA_Build 3 41556047 2D TTGTGAAAAC TG/-- AAGCATATAC 3070 het 3070 hom 34 15 18 4 TG 1 0 161190 CASAVA_Build 3 41556789 1I TGGTGTTTGG -/T TTTCTGTTCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 3 4 161191 CASAVA_Build 3 41557371 1D ACATTTTGAT G/- GGGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 G 4 3 161192 CASAVA_Build 3 41559896 3D CTAATCCTGT AAG/--- AAGATGAGAT 3070 het 3070 hom 48 23 23 4 AAG 2 1 161193 CASAVA_Build 3 41560696 3D TGCTATTTTA TTG/--- TTGTTTGTTC 3070 het 3070 hom 42 19 22 3 TTG 2 1 161194 CASAVA_Build 3 41561678 1I ACAGAGTAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 A 8 9 161195 CASAVA_Build 3 41565783 4D CAAATGAACA AAAC/---- AAATAGAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 AAAC 1 0 161196 CASAVA_Build 3 41566921 5I CACATAAACT -----/TAAAG TAAAGGTATG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TAAAG 1 2 161197 CASAVA_Build 3 41567548 8D AGAAATCAGG AAACAAAA/-------- AAACAAAAAA 2485 het 2485 ref 24 14 6 10 AAACAAAA 2 1 161198 CASAVA_Build 3 41567912 4I AGATCCAAAT ----/AAAC AAAATCAGAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AAAC 0 1 161199 CASAVA_Build 3 41569229 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 10 9 161200 CASAVA_Build 3 41570282 5D GAGTAAATGG GGCAT/----- CCATCCCATC 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 GGCAT 1 0 161201 CASAVA_Build 3 41571815 1I ACAAATGTAC -/A AAAAAAAAAA 1935 het 1935 ref 30 15 9 6 A 11 12 161202 CASAVA_Build 3 41586284 1D CTACCCTACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 10 9 161203 CASAVA_Build 3 41587013 1I AAATCTTTTA -/T TTTTGGTCCC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 4 5 161204 CASAVA_Build 3 41590583 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AGG 0 1 161205 CASAVA_Build 3 41591436 1I ACTGGTTCAC -/A GTAGGCCCAA 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 A 0 1 161206 CASAVA_Build 3 41592361 4D GCAGGAAGCT TCCA/---- TCCATCCTCT 3070 hom 128 het 46 0 41 6 TCCA 2 1 161207 CASAVA_Build 3 41605615 1D GACAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 11 10 161208 CASAVA_Build 3 41614792 1D TAAAATAATG T/- CTAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 T 1 0 161209 CASAVA_Build 3 41616061 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 933 het 933 ref 33 12 4 17 T 17 16 161210 CASAVA_Build 3 41649231 1D GGATTCTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 A 13 12 161211 CASAVA_Build 3 41649859 1I ATTAGTAAAA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 7 8 161212 CASAVA_Build 3 41676168 1I TGGCCATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 A 13 14 161213 CASAVA_Build 3 41683677 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 A 8 9 161214 CASAVA_Build 3 41719734 1I AAAATATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 401 hom 36 1 33 2 T 9 10 161215 CASAVA_Build 3 41738841 5I AAATGAAAGA -----/CAGAC CAGACCGGGC 3070 het 2909 hom 28 9 18 1 CAGAC 1 2 161216 CASAVA_Build 3 41809685 1I AAAAACCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 24 0 19 5 A 10 11 161217 CASAVA_Build 3 41818029 1D AGACTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 2748 het 2748 ref 59 43 7 9 A 13 12 161218 CASAVA_Build 3 41852478 1D CTGCAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 1683 het 1683 ref 35 24 4 8 A 13 12 161219 CASAVA_Build 3 41867153 4I TTTGATGGGG ----/TTGT TTGTTTTTTT 3070 hom 38 het 14 0 13 1 TTGT 1 2 161220 CASAVA_Build 3 41889070 1D TCAGCCAGGT C/- CACTTCCCTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 C 2 1 161221 CASAVA_Build 3 41893839 1I GCCAAGAGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 313 hom 37 1 31 5 T 9 10 161222 CASAVA_Build 3 41895427 1D ACTGAATCAA G/- GGTCCACATC 3070 hom 75 het 28 0 26 4 G 3 2 161223 CASAVA_Build 3 41898518 5D CAGTAGAATG AGGCC/----- ATCACATCAC 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AGGCC 1 0 161224 CASAVA_Build 3 41900265 17D ACAATCCCAC AGAGAAAAAACAAGTGA/----------------- AGGTCGGTGA 3070 hom 111 het 35 0 38 3 AGAGAAAAAACAAGTGA 1 0 161225 CASAVA_Build 3 41904277 3D AGATCATGCC ACT/--- ACTGCACTCC 1836 hom 15 het 7 0 5 2 ACT 2 1 161226 CASAVA_Build 3 41905273 1I AGGGAAGGGG -/T TAAATGAGGA 3070 hom 122 het 48 0 40 8 T 1 2 161227 CASAVA_Build 3 41917669 11D GCATGGCTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 30 0 18 12 T 25 14 161228 CASAVA_Build 3 41920085 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 311 hom 20 1 16 3 A 15 14 161229 CASAVA_Build 3 41921794 1I TGAAGCTATA -/C CCCCCTACTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 5 6 161230 CASAVA_Build 3 41926053 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 28 0 25 4 A 9 8 161231 CASAVA_Build 3 41927123 1I ATGAAAGAAT -/A AAAAAAGTAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 6 7 161232 CASAVA_Build 3 41930817 1I TCCTTTACAC -/A AAAGGTTCTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 3 4 161233 CASAVA_Build 3 41942546 1D GTGTCTCCTG A/- TTGGGAGACA 2550 het 2550 ref 32 15 10 8 A 1 0 161234 CASAVA_Build 3 41945033 3I29M1I AAAACCCTTC ---AAAAAAAAAATCAATGAATCTAGGAGCTG-/AAAAAAAAAAAAATCAATGAATCTAGGAGCTGT TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 17 0 15 5 N/A 0 0 161235 CASAVA_Build 3 41952493 2D CAGAGTGCCC CT/-- GAGAGGTTCC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 CT 1 0 161236 CASAVA_Build 3 41955660 3D ATGATTACCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 36 0 25 11 T 15 12 161237 CASAVA_Build 3 41956056 3I TATTATTTTT ---/ATA ATATTTAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 ATA 1 2 161238 CASAVA_Build 3 41959779 1D ATTTTTCAAT G/- TGGCTACTAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 1 0 161239 CASAVA_Build 3 41962528 1D AAGAAAGAGA C/- GGGCAGGGGG 3070 hom 64 het 27 0 22 5 C 1 0 161240 CASAVA_Build 3 41970856 2I TAAGGGAAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 39 0 25 14 A 9 11 161241 CASAVA_Build 3 41972292 1D ACCTTCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 575 hom 46 2 23 22 A 15 14 161242 CASAVA_Build 3 41976541 1D AAAATCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 30 0 21 9 T 14 13 161243 CASAVA_Build 3 41979697 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTGA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 1 0 161244 CASAVA_Build 3 41980602 2I GCCGAGCCAG --/GA GAACCAGCTT 3070 het 3070 ref 45 23 12 10 GA 1 2 161245 CASAVA_Build 3 41993361 1D AGTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 27 0 23 4 A 13 12 161246 CASAVA_Build 3 42015175 1D TTTTCTTTAC A/- AAACATTTTC 3070 hom 108 het 37 0 37 1 A 4 3 161247 CASAVA_Build 3 42018707 1D GTCAAGAGAG T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 7 6 161248 CASAVA_Build 3 42029469 3I CTGGGTTGAA ---/AAG AAGAAGTAGA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 AAG 2 3 161249 CASAVA_Build 3 42031303 1I GGACCGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 37 0 26 11 T 13 14 161250 CASAVA_Build 3 42034763 1D GACCCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 26 13 A 15 14 161251 CASAVA_Build 3 42039234 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 hom 53 het 21 0 19 2 AAAC 1 2 161252 CASAVA_Build 3 42045911 1I ATTTTGCTTG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 7 8 161253 CASAVA_Build 3 42048026 1I GCTACTATGG -/A GGCTGAGGGA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 0 1 161254 CASAVA_Build 3 42048129 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAATAGT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 7 161255 CASAVA_Build 3 42064044 4I AAAAGTGGAC ----/TTAT TTAAGATTTA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TTAT 0 1 161256 CASAVA_Build 3 42065824 1I ATGTCATTCA -/T TTTTTTTTTT 2605 het 2605 ref 32 18 6 8 T 10 11 161257 CASAVA_Build 3 42076429 4I AATGATACAA ----/TATT TAAAGCATGG 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 TATT 0 1 161258 CASAVA_Build 3 42077291 1D TCCTGGCTGA T/- TTTTTTTATA 1933 het 1933 ref 21 11 5 5 T 8 7 161259 CASAVA_Build 3 42084297 4D GCCTATCACG TAGT/---- TAGTTTTTTT 3070 hom 70 het 28 0 24 6 TAGT 2 1 161260 CASAVA_Build 3 42091173 1I CTCAGACTAG -/T TTTTTTTTTT 1328 het 1328 ref 31 14 7 10 T 16 17 161261 CASAVA_Build 3 42098940 1I ATCAAAAATA -/C AAAAATTAGC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 C 0 1 161262 CASAVA_Build 3 42119363 1D TCTGCCTAGG A/- AGAGTTCTCT 3070 hom 80 het 34 0 26 8 A 2 1 161263 CASAVA_Build 3 42129177 1D GTTGCAGTTA G/- GCCAAGATTA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 2 1 161264 CASAVA_Build 3 42129600 1D8M1I TTATAGGCCA GGGCGCTGT-/-GGCGCTGTG GCTTATGCCT 3070 hom 34 het 17 0 14 5 N/A 0 0 161265 CASAVA_Build 3 42134321 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 32 0 23 10 T 12 11 161266 CASAVA_Build 3 42140202 1D GTCACAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 45 0 33 12 T 12 11 161267 CASAVA_Build 3 42148399 4D ACAAAAAATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 1761 hom 13 het 12 0 5 7 A 19 15 161268 CASAVA_Build 3 42153588 1D TTTTTCTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 414 hom 37 1 30 8 T 10 9 161269 CASAVA_Build 3 42154521 1I CATTTCTTAA -/T TTTGAGTTTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 3 4 161270 CASAVA_Build 3 42160764 1D TATTTCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 11 10 161271 CASAVA_Build 3 42166544 2D GCCTGGAAGA CT/-- CTGCCCTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 CT 2 1 161272 CASAVA_Build 3 42175068 13D TTTCTACACC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTGG 3044 het 2686 hom 20 14 7 3 T 21 8 161273 CASAVA_Build 3 42185643 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 11 12 161274 CASAVA_Build 3 42194689 3D TTTATTCCAA GGC/--- GGCCACCACT 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 GGC 2 1 161275 CASAVA_Build 3 42197818 1D GGTGGGCAGA T/- TACTTGAGGT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 2 1 161276 CASAVA_Build 3 42202170 1I TATTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2041 het 2041 ref 26 8 6 12 T 15 16 161277 CASAVA_Build 3 42219698 1I TAAATGGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2912 hom 33 10 17 6 T 9 10 161278 CASAVA_Build 3 42220262 1D TTCCTAATCA C/- CCCCCAAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 C 6 5 161279 CASAVA_Build 3 42227366 1I GCATTAAAGG -/T TGTGGCCATG 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 T 1 2 161280 CASAVA_Build 3 42238500 2I TTGCAATTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 13 13 A 12 14 161281 CASAVA_Build 3 42240275 3D GACCCACGTT CTC/--- CTCTCTTGCT 3070 het 3070 hom 33 11 14 9 CTC 2 1 161282 CASAVA_Build 3 42245790 2D CTTTAAAAAA AT/-- ATATATATAT 2853 het 896 hom 13 3 9 1 AT 10 9 161283 CASAVA_Build 3 42261120 1D ACCCTAAAAC T/- TAAAGTATAA 3070 het 1449 hom 12 3 8 1 T 2 1 161284 CASAVA_Build 3 42279250 4I CATGCCACTC ----/GGCT GGCTAGTGAG 3070 het 3070 ref 42 24 10 8 GGCT 1 2 161285 CASAVA_Build 3 42280658 1D ATTTATAAAG T/- TTTTCTCAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 7 T 5 4 161286 CASAVA_Build 3 42285440 7D TTTTTTTTTT CTCTCTC/------- TCTCTCCCTC 2471 het 2471 ref 39 12 11 20 CTCTCTC 1 0 161287 CASAVA_Build 3 42298358 1D TTGTGTCCTG A/- AAAAAAACTT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 A 8 7 161288 CASAVA_Build 3 42309195 1D GTGTGTTAAC T/- TTTTTTTTTT 2526 het 20 hom 28 1 12 15 T 17 16 161289 CASAVA_Build 3 42328632 1D CATGGTGAAA C/- CCCTGTCTCT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 4 3 161290 CASAVA_Build 3 42350156 1D TATAATTTAC T/- TTTTTTTTTT 1354 het 1354 ref 30 24 3 3 T 11 10 161291 CASAVA_Build 3 42353831 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1428 het 528 hom 10 3 5 2 A 17 16 161292 CASAVA_Build 3 42363067 2D TTAATTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 634 het 634 ref 22 12 3 7 T 14 12 161293 CASAVA_Build 3 42387163 1D ACTACCACTA T/- TTCCTTCTAC 3070 het 3070 hom 48 21 22 7 T 3 2 161294 CASAVA_Build 3 42396116 1I GCTTCATCAC -/T TGGGAGTTAT 3070 het 3070 hom 48 20 27 1 T 1 2 161295 CASAVA_Build 3 42397807 1D AAATTTTGAA T/- TTTTTTCAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 6 161296 CASAVA_Build 3 42434881 2I GTCCTGGCTC --/TA CCACATCCTG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TA 0 1 161297 CASAVA_Build 3 42462386 1I TCCTGAGGCC -/T TCCCCAGCCA 3070 het 79 hom 13 1 9 3 T 1 2 161298 CASAVA_Build 3 42469367 1D GTCATATGAC T/- TAGTTCTGAC 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 2 1 161299 CASAVA_Build 3 42469922 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 T 10 11 161300 CASAVA_Build 3 42476893 2D TTATCCTGAC TG/-- TGAATAGCAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 5 TG 2 1 161301 CASAVA_Build 3 42487859 1I ATCAACCACA -/T TTTTTTTTTT 1984 het 1984 ref 21 9 7 5 T 15 16 161302 CASAVA_Build 3 42495781 1I AAGTAGACAA -/C ATAGCACAGT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 C 0 1 161303 CASAVA_Build 3 42515725 1D CACTCTGTGG C/- CCCCCCAGCC 3070 het 2632 hom 32 10 13 9 C 7 6 161304 CASAVA_Build 3 42715030 1D GATGATCTGG A/- TAGTTCCTCC 3070 het 3070 hom 40 19 15 6 A 1 0 161305 CASAVA_Build 3 42721576 4I ATCCTGTGTA ----/TTGC TTGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 53 21 24 8 TTGC 0 1 161306 CASAVA_Build 3 42727957 1I CTGAAAAAAA -/G GGATAATAGT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 G 2 3 161307 CASAVA_Build 3 42769986 3I TAGGGATTCA ---/GTG GTGGTGGATA 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 GTG 2 3 161308 CASAVA_Build 3 42785194 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 9 8 161309 CASAVA_Build 3 42790298 2D AAAATACTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 41 0 37 4 T 13 11 161310 CASAVA_Build 3 42798971 1D CTGATACTGT C/- CCCATTTTAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 4 3 161311 CASAVA_Build 3 42804524 1D ACATACCCCC A/- CCTCTAACCA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 1 0 161312 CASAVA_Build 3 42805998 1D CTGTGTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1974 hom 18 het 9 0 7 2 A 12 11 161313 CASAVA_Build 3 42816112 1D CCATGCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2959 hom 28 11 10 7 T 12 11 161314 CASAVA_Build 3 42817133 1I GTTACAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 221 hom 30 1 24 5 T 9 10 161315 CASAVA_Build 3 42842419 1D GTTTATTGAA T/- TTTTTTTTTT 2844 het 2844 ref 39 17 8 14 T 14 13 161316 CASAVA_Build 3 42847187 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 T 11 12 161317 CASAVA_Build 3 42850203 1I GAGATCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 10 11 161318 CASAVA_Build 3 42875128 1D AAATGATCAC A/- ACTCCTTGCA 3070 het 3070 ref 28 20 8 0 A 2 1 161319 CASAVA_Build 3 42904510 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 71 het 29 0 23 6 T 9 8 161320 CASAVA_Build 3 42910138 1D AAATCAAAAC A/- AAAATCAGTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 5 4 161321 CASAVA_Build 3 42919337 2I TCCGACAACT --/CA CATTGCAGGC 3070 hom 36 het 18 0 13 5 CA 1 2 161322 CASAVA_Build 3 42935133 6D CATCTAACTT AGAATA/------ AGGATAAGGA 3070 hom 111 het 39 0 33 9 AGAATA 1 0 161323 CASAVA_Build 3 42936172 1I AAAGGGAAGC -/A TACCCTTCCA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 0 1 161324 CASAVA_Build 3 42946695 1I TGAGGAGGGT -/G GATCACTTGA 3070 hom 30 het 11 0 8 3 G 1 2 161325 CASAVA_Build 3 42949489 1D TTACATTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 331 hom 28 1 19 8 T 18 17 161326 CASAVA_Build 3 42983271 1D TTATGGTGCT A/- GGGGGTGGAC 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 1 0 161327 CASAVA_Build 3 42984840 1D AAGGTTTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 40 het 21 0 14 7 T 10 9 161328 CASAVA_Build 3 42992098 1D GTTGCAGGAA T/- CCAGGGAGTT 3070 hom 102 het 42 0 34 9 T 1 0 161329 CASAVA_Build 3 43004098 5D AAATCACTTA TTATG/----- TTATATTCTT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 TTATG 1 0 161330 CASAVA_Build 3 43008795 1D TGAATTCAAA C/- CCTGCTCACC 3070 het 3070 hom 59 18 27 14 C 3 2 161331 CASAVA_Build 3 43010706 1D CATGGTCCCA G/- GGGTCTGGGT 1854 het 1854 ref 17 11 4 3 G 4 3 161332 CASAVA_Build 3 43012617 2D ACCAGCAAAC AG/-- GGGGACATAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 7 AG 1 0 161333 CASAVA_Build 3 43013935 1I ACAGAGAGAG -/A GGGGGGGGGA 3070 het 315 hom 32 5 20 7 A 0 1 161334 CASAVA_Build 3 43015468 1D GCTTTTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 T 11 10 161335 CASAVA_Build 3 43016735 16I GGGCCGAGTG ----------------/AGACCAATGTGGCCTT TCCAATGCTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 AGACCAATGTGGCCTT 0 1 161336 CASAVA_Build 3 43021553 4D CTTCTCTCTC ACTG/---- ACTCTGATTC 3070 het 3070 ref 50 27 18 6 ACTG 1 0 161337 CASAVA_Build 3 43022557 1D CTCTCTAGTT A/- GTAATCATCT 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 A 1 0 161338 CASAVA_Build 3 43038989 2D ATTGTAGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 8 A 13 11 161339 CASAVA_Build 3 43043314 1I AGAAAAAAGT -/A AAAATAAAGT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 4 5 161340 CASAVA_Build 3 43054109 1I TTTAAATGAT -/A ACATTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 A 1 2 161341 CASAVA_Build 3 43056773 2I GCTACCTTTA --/CC ATAGAGCCAA 3070 hom 105 het 46 0 35 11 C 0 2 161342 CASAVA_Build 3 43058802 7D TTGTCCCTAC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 27 0 13 14 A 21 14 161343 CASAVA_Build 3 43066099 1D GCTAAACTTG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 56 25 21 10 T 8 7 161344 CASAVA_Build 3 43066202 2I TGTATAAAAC --/AG AGAAAATAAT 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 AG 1 2 161345 CASAVA_Build 3 43066553 1I AGTCCAGAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 9 10 161346 CASAVA_Build 3 43073536 1D TGTTATTCAT G/- GTCACACTAC 3070 het 3070 ref 46 26 15 6 G 2 1 161347 CASAVA_Build 3 43073976 1I AGACTTTTGG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 T 0 1 161348 CASAVA_Build 3 43095119 2D AGTTTTTGAC CT/-- CTGATTGATA 3070 het 3070 ref 33 14 14 8 CT 2 1 161349 CASAVA_Build 3 43095470 1I TCTAGTTGAG -/C CCCAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 C 3 4 161350 CASAVA_Build 3 43102557 1I GGATAGGGAT -/A AAATTTGTCT 3070 het 3067 hom 28 9 14 5 A 3 4 161351 CASAVA_Build 3 43106838 1I ATATCACTGC -/A CATGCTCTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 0 1 161352 CASAVA_Build 3 43107765 1I TAAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 A 10 11 161353 CASAVA_Build 3 43131587 2D TATCCTGGCT TC/-- TCTCTCTCCT 3070 het 3070 ref 47 18 17 13 TC 5 4 161354 CASAVA_Build 3 43151194 1D CTGAGGCATT C/- TTGGCCAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 C 1 0 161355 CASAVA_Build 3 43153030 1I TTCATTCTGT -/G GGGTCATTTT 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 G 3 4 161356 CASAVA_Build 3 43153227 1I CTTATGCCCC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 T 7 8 161357 CASAVA_Build 3 43155663 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 32 1 15 16 T 17 16 161358 CASAVA_Build 3 43159959 2D GGGACAAAAC AG/-- AGAGCCCCAG 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 AG 3 2 161359 CASAVA_Build 3 43179656 2I TTGCAGAAAC --/TT TGGTATGTCC 3070 hom 111 het 45 0 37 8 T 1 3 161360 CASAVA_Build 3 43187782 19D GACTGCCATT AAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 24 0 20 9 A 32 13 161361 CASAVA_Build 3 43194132 3I ACCCCCCCCC ---/TCT CTCTGACTCC 3070 hom 67 het 30 0 22 8 TCT 0 1 161362 CASAVA_Build 3 43203696 3D TTCTCTGATG ATT/--- AATAATGTTA 3070 het 3070 hom 27 13 12 3 ATT 1 0 161363 CASAVA_Build 3 43216396 1D TGTCTGTTTT C/- CCCACTACAC 3070 hom 144 het 55 0 49 6 C 4 3 161364 CASAVA_Build 3 43233776 1D TTAGCTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 12 11 161365 CASAVA_Build 3 43238099 1I TCTCTCCTCA -/G GCCCCCCACA 3070 hom 123 het 42 0 40 2 G 1 2 161366 CASAVA_Build 3 43240139 1D CTTGTGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1097 hom 27 6 14 8 A 16 15 161367 CASAVA_Build 3 43266051 2I TGATACATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 123 het 54 0 42 12 AT 5 6 161368 CASAVA_Build 3 43267679 2D CTAAAGTCAC AG/-- AGTCAACAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 AG 2 1 161369 CASAVA_Build 3 43317105 1D TAGTTTCCTG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 49 het 22 0 17 5 C 10 9 161370 CASAVA_Build 3 43319135 1D ACAGAATGGA T/- TTTTTTTTTT 2484 het 1578 hom 26 7 7 12 T 17 16 161371 CASAVA_Build 3 43322765 1I GTTAATCTAC -/T ATTAGTTTAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 0 1 161372 CASAVA_Build 3 43351479 1I GTGCCTTATC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 8 9 161373 CASAVA_Build 3 43352776 16D TCCACCCTCT CTCCCTTGCTCTCTCC/---------------- CTCCCTTGCT 3070 hom 45 het 25 0 17 9 CTCCCTTGCTCTCTCC 2 1 161374 CASAVA_Build 3 43353245 6I TTGTTTGTTT ------/GTTTTG GTTTTGGTTT 3070 hom 36 het 20 0 12 8 GTTTTG 2 3 161375 CASAVA_Build 3 43359545 3I ATGCGTGCAC ---/TTA TTATCTTATG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTA 1 2 161376 CASAVA_Build 3 43365392 1I GAAAAAATGC -/T TTTTCTTTGT 3070 het 3070 ref 50 23 23 4 T 4 5 161377 CASAVA_Build 3 43385560 3D CAGTAGCCAG GGT/--- GGATGGGCCT 3070 hom 56 het 22 0 17 5 GGT 1 0 161378 CASAVA_Build 3 43389661 1D AAGCTGGGTG A/- AGGGGTGGGT 3070 hom 81 het 34 0 24 10 A 2 1 161379 CASAVA_Build 3 43392299 1I TGGGGGAGAA -/G GGTGTCTTCC 1938 het 1938 ref 21 8 7 6 G 2 3 161380 CASAVA_Build 3 43402882 6I GAAAGGAGGA ------/AAGGGG AAGGGGAAGG 3070 het 3070 ref 50 21 16 13 AAGGGG 1 2 161381 CASAVA_Build 3 43404451 4I TTCCAATTTC ----/TTTA TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 TTTA 0 1 161382 CASAVA_Build 3 43408765 1I CACTTTTATT -/C CCCCAGTTCC 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 C 4 5 161383 CASAVA_Build 3 43417965 1D CTTTGTTAAT G/- GGCTTCTACT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 G 3 2 161384 CASAVA_Build 3 43438346 1D AAAAAAAAAG T/- TTTTTTATTG 3070 het 609 hom 36 2 29 5 T 7 6 161385 CASAVA_Build 3 43443057 2I CCCTGGCTTC --/TG TGTGTGTTCT 3070 hom 60 het 27 0 18 9 TG 3 4 161386 CASAVA_Build 3 43445042 7I TCAGGGCAAG -------/CTATGAA CTATGAACGT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 CTATGAA 1 2 161387 CASAVA_Build 3 43457717 1I AAACAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 10 11 161388 CASAVA_Build 3 43461915 3D CAGTTCTAGC TTG/--- TTAACTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 TTG 1 0 161389 CASAVA_Build 3 43466230 4D GCCAGTCCTC TTTG/---- TTTTTCTTCA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 TTTG 1 0 161390 CASAVA_Build 3 43488473 1D CAAAGGCTGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 45 13 15 17 A 8 7 161391 CASAVA_Build 3 43489089 1I TTGACTAGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 9 10 161392 CASAVA_Build 3 43489527 2I TTCACTGAAC --/TT TTTTAGCATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 4 6 161393 CASAVA_Build 3 43489652 1I CCAAAATGTC -/T TTTTTTTTTT 2595 het 2595 ref 25 16 7 2 T 10 11 161394 CASAVA_Build 3 43491400 1D TTTTGTAGAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 T 9 8 161395 CASAVA_Build 3 43506366 1I CTGATTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 A 10 11 161396 CASAVA_Build 3 43544704 1I GAAAAAAACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 15 15 11 A 10 11 161397 CASAVA_Build 3 43565605 1I TTGAATAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 10 11 161398 CASAVA_Build 3 43574607 1I GTCTCACCAG -/A AAAAAAAAAA 1007 het 1007 ref 19 9 4 6 A 17 18 161399 CASAVA_Build 3 43598290 5D GGTGGTGAGT AGCTA/----- GCCTGTAGTC 3070 het 3070 hom 34 17 13 6 AGCTA 1 0 161400 CASAVA_Build 3 43605061 1I TTTACTTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1279 hom 27 3 14 10 A 14 15 161401 CASAVA_Build 3 43614290 2D AAAAGTAAAC AT/-- GTGGTCCCAG 3070 het 1879 hom 18 5 9 5 AT 1 0 161402 CASAVA_Build 3 43623144 1D TATAACTACT A/- AAAAAAAAAA 1110 het 1110 ref 35 24 3 9 A 12 11 161403 CASAVA_Build 3 43625638 3D AAAATTGAAT GAA/--- GAAGTTACTT 3070 het 3070 ref 35 23 11 3 GAA 2 1 161404 CASAVA_Build 3 43631864 2I ATCAAGCTAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 12 13 12 TG 7 8 161405 CASAVA_Build 3 43659342 1I TTCACAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 T 11 12 161406 CASAVA_Build 3 43683482 1D ATTTAAAGTG A/- AATTTATTGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 2 161407 CASAVA_Build 3 43710247 1D GTTTCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 34 1 22 12 T 14 13 161408 CASAVA_Build 3 43717073 1D CTTTCATGAA T/- TTTTTTTTTT 1357 het 1357 ref 37 23 3 11 T 15 14 161409 CASAVA_Build 3 43719679 1I TTTCTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 29 0 17 12 T 13 14 161410 CASAVA_Build 3 43753993 2D CCAGACTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 12 10 161411 CASAVA_Build 3 43754635 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 22 3 13 6 A 15 16 161412 CASAVA_Build 3 43756551 1D AAAGCCCCTT C/- CCCCCCACCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 7 6 161413 CASAVA_Build 3 43763257 1I TTCTTAACTC -/A CAGCACTATA 3070 hom 111 het 39 0 36 3 A 0 1 161414 CASAVA_Build 3 43766131 1D GCCTCCCCCA C/- CCCCCCCCCA 1037 het 1037 ref 18 7 4 7 C 10 9 161415 CASAVA_Build 3 43778820 3D AACACAAAAC AAA/--- AAACCAAAGC 3070 het 3070 ref 38 21 14 5 A 6 3 161416 CASAVA_Build 3 43779901 2D AAATTAGAAG AA/-- AAGATTTAGG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 4 2 161417 CASAVA_Build 3 43797857 1I CAAGGAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3064 het 712 hom 28 6 12 10 A 15 16 161418 CASAVA_Build 3 43813429 3D ACAGGTGGAT TAA/--- TATTCACCGA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 TAA 1 0 161419 CASAVA_Build 3 43824231 1D CAAGAGCTGG A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 8 7 161420 CASAVA_Build 3 43842502 1I GAAATCTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 9 10 161421 CASAVA_Build 3 43843941 1D AAGTATTGAG A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 7 6 161422 CASAVA_Build 3 43856207 1I CACACTCCCC -/A GGGGGACACA 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 A 0 1 161423 CASAVA_Build 3 43861956 4I ATTTTCGATT ----/CTTA CTTTTATTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CTTA 0 1 161424 CASAVA_Build 3 43876828 4D ATGTAGGGTA CAGT/---- CAGTGTACGG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 CAGT 2 1 161425 CASAVA_Build 3 43897551 1I AATACTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 T 13 14 161426 CASAVA_Build 3 43950040 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3054 hom 7 het 17 1 12 5 A 12 11 161427 CASAVA_Build 3 44038109 2D GGATTGGGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 15 8 T 15 13 161428 CASAVA_Build 3 44045232 1D CACCCAGCTG C/- TGGCAAGCAC 3070 hom 126 het 51 0 41 11 C 1 0 161429 CASAVA_Build 3 44056735 1D GAAAGACTGA T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 T 7 6 161430 CASAVA_Build 3 44071584 2I AAAAAAAAAA --/AG AGGAAAGCAT 2981 hom 60 het 24 0 18 6 AG 1 2 161431 CASAVA_Build 3 44081741 1D TCCAGGGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 148 hom 24 1 19 4 A 10 9 161432 CASAVA_Build 3 44087692 1D AAAATAAGAA T/- TAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 2 1 161433 CASAVA_Build 3 44092570 5I GGGGAGCGAC -----/TTGAG TTATTTCAGG 3070 hom 114 het 41 0 37 4 TTGAG 0 1 161434 CASAVA_Build 3 44098551 4I AGCCTTTTTT ----/CTCC CTGTTAGATG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 CTCC 0 1 161435 CASAVA_Build 3 44132407 1D ACCCTGTTTT A/- AAAAAAAAAA 1294 het 1294 ref 49 33 4 12 A 11 10 161436 CASAVA_Build 3 44187320 2D TGTGTTTTCA TT/-- TCTCTTGGGT 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 T 3 1 161437 CASAVA_Build 3 44190286 1D CCCCAGATTG C/- CCTCAAGACT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 C 3 2 161438 CASAVA_Build 3 44197167 1I AAGATGCAAC -/T TTTTTTATAT 3070 hom 138 het 55 0 47 8 T 6 7 161439 CASAVA_Build 3 44204564 1I ACATTTGCTG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 8 9 161440 CASAVA_Build 3 44206111 2I TGATCCACTC --/AG AATTAGAATC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 AG 0 1 161441 CASAVA_Build 3 44207038 1I GGACATCCCA -/G GAAAGATGTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 1 2 161442 CASAVA_Build 3 44210985 1I AGAGCTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 10 11 161443 CASAVA_Build 3 44212597 4I AAAGCCATAC ----/AACT AACAATAGCT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AACT 0 1 161444 CASAVA_Build 3 44217794 2D CTATATATAC AT/-- ATATATATTC 3070 hom 102 het 41 0 35 7 AT 5 4 161445 CASAVA_Build 3 44226353 1I ACTAATTCTT -/C CCCCCCACTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 6 7 161446 CASAVA_Build 3 44235696 2I CCCCACCTAT --/AC ACCCTCAAGT 3070 hom 126 het 44 0 42 2 AC 1 2 161447 CASAVA_Build 3 44242611 2I TACCTTGGGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 9 11 161448 CASAVA_Build 3 44250434 2I ATGTGGAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 11 13 161449 CASAVA_Build 3 44252284 2I TCCGTCTCTC --/TT TCAGACCAGA 3070 hom 69 het 30 0 21 9 T 1 3 161450 CASAVA_Build 3 44253282 1D AAAAAAAGAC T/- ATTATCAATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 0 161451 CASAVA_Build 3 44269323 1D GGTCTCCTTA G/- CTTGGAATAT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 G 1 0 161452 CASAVA_Build 3 44271871 1D ATAGTTGGCT A/- GGGGCGGTGG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 1 0 161453 CASAVA_Build 3 44273966 24D TATATATATA GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/------------------------ GTGTGTGTGT 3070 hom 30 het 11 0 11 2 GT 20 8 161454 CASAVA_Build 3 44295306 1D TTGATCCTCC T/- TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 45 30 4 11 T 12 11 161455 CASAVA_Build 3 44300613 1I TGTATGTGAT -/A AAAATATACA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 4 5 161456 CASAVA_Build 3 44302063 3D AGAAGGTATC ATT/--- ATTTGTTTTT 2818 hom 18 het 9 0 7 2 ATT 2 1 161457 CASAVA_Build 3 44302551 1D CTAAAAATGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 10 9 161458 CASAVA_Build 3 44304399 1D TTGTTTCCAT G/- GGGGGGTACC 3070 hom 87 het 31 0 28 3 G 7 6 161459 CASAVA_Build 3 44309048 1D ATAGCAGTAT C/- TGGTGCCCTG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 C 1 0 161460 CASAVA_Build 3 44314247 1I ACCAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1337 hom 37 3 28 6 A 10 11 161461 CASAVA_Build 3 44316927 4D TCTTAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAAGA 3070 hom 45 het 34 1 29 5 AAAG 2 1 161462 CASAVA_Build 3 44334652 5I TGGGGGCTCC -----/TTAAA ACCTACTGAG 3070 hom 83 het 30 0 15 15 TTAAA 0 1 161463 CASAVA_Build 3 44336785 4I TTTTTAAAAT ----/AGAC AGAAAGTGTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AGAC 0 1 161464 CASAVA_Build 3 44347831 1D ATAATATGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 421 hom 37 1 28 8 T 10 9 161465 CASAVA_Build 3 44353576 5I ACAAACATGT -----/TATCA TATAATCTTC 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TATCA 0 1 161466 CASAVA_Build 3 44355604 2I CTCATATAGC --/AA GAGATTTAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 0 2 161467 CASAVA_Build 3 44369734 6D TTAACTTAGT AGTATC/------ CAGTTAAGTT 2490 hom 15 het 6 0 5 3 AGTATC 1 0 161468 CASAVA_Build 3 44371743 1D TTGGATAGGT A/- AAAATGCAGG 3070 het 343 hom 39 1 35 3 A 5 4 161469 CASAVA_Build 3 44373890 4I ATATATAGAA ----/AGAG AGAGAATTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AG 2 4 161470 CASAVA_Build 3 44381613 5D ATGAGCTATT TTTTC/----- TTAACCTCCA 3070 hom 102 het 35 0 35 3 TTTTC 1 0 161471 CASAVA_Build 3 44383869 1I TAATAGAATG -/T TTTAAAAGAT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 3 4 161472 CASAVA_Build 3 44386580 3D TTGCTGTGAA TTC/--- TTGATTTCCT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TTC 1 0 161473 CASAVA_Build 3 44389989 1D CATCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 23 0 19 4 A 13 12 161474 CASAVA_Build 3 44422341 1D CCAGCTACTT G/- GGAGGCTGAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 3 2 161475 CASAVA_Build 3 44422978 4D7M2I CTAAGCAGCA TATTCTAAGTA--/----CTGTGTAGG AGAATAATCT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 N/A 0 0 161476 CASAVA_Build 3 44428582 1D TTTATTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1279 hom 29 5 16 8 T 13 12 161477 CASAVA_Build 3 44436360 1I TGTGCAGGGA -/G GGAAACTGAG 3070 hom 98 het 42 0 28 14 G 2 3 161478 CASAVA_Build 3 44453272 1I CAACAACTCA -/C AAGCAAATGA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 C 0 1 161479 CASAVA_Build 3 44470698 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 48 het 48 ref 35 23 2 12 AAAG 1 0 161480 CASAVA_Build 3 44477869 8D CAGACCGAGA ATAGGAGG/-------- ATAGCTTGGT 3070 hom 116 het 39 0 39 4 ATAGGAGG 1 0 161481 CASAVA_Build 3 44478556 4D CTCTGCAAGG GTTT/---- GTTTAATAGA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 GTTT 2 1 161482 CASAVA_Build 3 44499147 1I ATTTTACTCA -/C ACAGAGAAGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 0 1 161483 CASAVA_Build 3 44515796 2D ATAAGGTTTT TC/-- TCTCCAGTGT 3070 hom 84 het 36 0 28 9 TC 3 2 161484 CASAVA_Build 3 44538360 1I GCTGTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 499 hom 32 2 26 4 T 10 11 161485 CASAVA_Build 3 44543143 1I TTATTTTTCA -/T CCTCAATGTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 0 1 161486 CASAVA_Build 3 44577003 8D TTCCTGTATC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1476 het 270 hom 25 3 8 16 T 24 16 161487 CASAVA_Build 3 44577773 1D AGAGAATGCA G/- GGGGAAGTGA 3070 hom 133 het 48 0 42 6 G 5 4 161488 CASAVA_Build 3 44580156 1D CCTACCCCCA C/- CCCCCGTGAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 C 6 5 161489 CASAVA_Build 3 44629587 1D GCCCCCCACC A/- AAAAAAAAAA 2323 het 2323 ref 44 33 5 7 A 13 12 161490 CASAVA_Build 3 44681582 3D TATAAAAATA ATT/--- ATTATATTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 ATT 2 1 161491 CASAVA_Build 3 44712811 1D TTCAACAAAT G/- GTGCTGGCAT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 G 2 1 161492 CASAVA_Build 3 44714248 1D TTTGCAGCAA C/- CCTGGATGGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 3 2 161493 CASAVA_Build 3 44740021 1I CATTGGGGCT -/G CTTAAGAAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 0 1 161494 CASAVA_Build 3 44743231 4D TTTTTATAGA ACTG/---- ACTACTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 5 ACTG 1 0 161495 CASAVA_Build 3 44744542 1D GGAATGGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 24 0 13 11 T 15 14 161496 CASAVA_Build 3 44745371 5D CAAAGCAGTG TTTGA/----- TTTGTTTTGT 3070 hom 138 het 52 0 46 9 TTTGA 1 0 161497 CASAVA_Build 3 44766767 11D CAAGAGTGAC ATATTAGGCTT/----------- ATATTAGGCT 2251 het 2251 ref 43 39 5 6 ATATTAGGCTT 2 1 161498 CASAVA_Build 3 44778113 7D GCTCTGGGTA AAGACAG/------- AAGACAGGTT 3070 hom 65 het 27 0 21 7 AAGACAG 2 1 161499 CASAVA_Build 3 44785047 3D TTAGTCTGAG CCA/--- CTCCACATTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CCA 1 0 161500 CASAVA_Build 3 44789633 1I AAAACATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 795 hom 31 6 17 8 A 13 14 161501 CASAVA_Build 3 44791957 2D GAAACTTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 27 0 16 11 T 14 12 161502 CASAVA_Build 3 44800080 9I AACATACTAT ---------/ATCAAATTG ATCTTTATAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 ATCAAATTG 0 1 161503 CASAVA_Build 3 44801320 1I AAATCCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 10 11 161504 CASAVA_Build 3 44808562 2I GTTTGGAGGA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 438 hom 25 1 22 2 TC 7 8 161505 CASAVA_Build 3 44815617 1I TCTTTGGAGA -/T TATAGAACTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 161506 CASAVA_Build 3 44857332 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 19 0 19 2 T 9 8 161507 CASAVA_Build 3 44979997 1I GAAATATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 37 1 29 7 A 12 13 161508 CASAVA_Build 3 45000963 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 786 het 786 ref 36 23 4 10 A 15 14 161509 CASAVA_Build 3 45042706 1I GTTTGTTTTA -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 54 het 28 0 15 13 T 7 8 161510 CASAVA_Build 3 45079693 5D TATTAATTAA TTATT/----- TTATTTATTT 2082 het 1540 hom 9 4 5 0 TTATT 2 1 161511 CASAVA_Build 3 45086980 1D CACTCTGTTG C/- CCAGGCTGGA 2201 het 2201 ref 14 9 5 0 C 3 2 161512 CASAVA_Build 3 45090135 1I CATATATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 9 10 161513 CASAVA_Build 3 45096348 3I GGGCCTTCTT ---/CTC TCACCAGTAA 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 CTC 0 1 161514 CASAVA_Build 3 45098051 13D AACCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1891 hom 27 9 12 10 A 25 12 161515 CASAVA_Build 3 45110728 1D TCATCAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 34 1 26 7 T 12 11 161516 CASAVA_Build 3 45119462 1I TTGGTCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 12 13 161517 CASAVA_Build 3 45132198 1I TTAGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 10 11 161518 CASAVA_Build 3 45132911 1I GTGTTCCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 14 11 A 11 12 161519 CASAVA_Build 3 45137413 8D CCCCTCCCCC CACCACTT/-------- CAGTCCTCCT 3070 hom 96 het 33 0 32 2 CACCACTT 1 0 161520 CASAVA_Build 3 45139500 1I GACGTAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 508 hom 45 4 23 18 T 13 14 161521 CASAVA_Build 3 45146621 1D ATAAAACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 15 14 161522 CASAVA_Build 3 45149087 1I ATACTCCCTG -/T CTTCTGTGCC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 1 161523 CASAVA_Build 3 45151095 3D TTGTTGTTGC TGT/--- TGTTGTGTCC 2910 het 2910 ref 28 16 9 5 TGT 3 2 161524 CASAVA_Build 3 45151696 1I GATGAATATA -/C CAAAAATTCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 2 161525 CASAVA_Build 3 45157697 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2349 hom 27 9 15 3 A 11 12 161526 CASAVA_Build 3 45158336 1D TAAACTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 10 9 161527 CASAVA_Build 3 45160216 2D ACCCAGAAGA GT/-- GTGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 GT 5 4 161528 CASAVA_Build 3 45172264 1I TACTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 1956 het 1174 hom 14 6 7 1 C 0 1 161529 CASAVA_Build 3 45177024 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 6 7 161530 CASAVA_Build 3 45177180 1D ACTCCACCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 12 7 A 10 9 161531 CASAVA_Build 3 45180265 2D AATGTTCATC AG/-- AGTGTCTGTT 3070 het 3070 hom 52 20 31 2 AG 2 1 161532 CASAVA_Build 3 45184331 1I TGTCCGAGGG -/A AAAAACCACC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 5 6 161533 CASAVA_Build 3 45185012 2I TCAAAGAAAC --/AA AAGTCGCTGA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 4 161534 CASAVA_Build 3 45185688 1D ATAGGTGTTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 2953 hom 22 9 13 0 A 9 8 161535 CASAVA_Build 3 45186834 2D GCTGGGCTCC AA/-- GAGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 40 11 20 12 A 2 0 161536 CASAVA_Build 3 45187466 1D CTACTTTCTG T/- TTTTTTGTTT 2412 het 2412 ref 21 7 8 6 T 7 6 161537 CASAVA_Build 3 45190096 4D TGGGGAGGGT TTTC/---- TTTCCCTGCT 3070 het 3070 hom 44 15 26 5 TTTC 2 1 161538 CASAVA_Build 3 45191169 1I GGTCCATAAA -/G CCCAAGTGGC 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 G 0 1 161539 CASAVA_Build 3 45191736 1D ATAAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3054 hom 39 14 15 11 A 15 14 161540 CASAVA_Build 3 45196139 7D CTTCGCCAAG CCCAGGT/------- GGCTGGGACC 3070 het 3070 hom 39 16 22 3 CCCAGGT 1 0 161541 CASAVA_Build 3 45199918 8D ATTCTGATCC CAGGCAGG/-------- CAGGCAGGCA 3070 het 37 hom 27 2 18 7 CAGG 9 7 161542 CASAVA_Build 3 45200533 1I AGCCCTGTCC -/G GGGGGGTCTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 G 6 7 161543 CASAVA_Build 3 45231583 1D ATGGGGAGGG A/- AAGCCTGAAC 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 A 3 2 161544 CASAVA_Build 3 45233406 1I ACACAGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 10 11 161545 CASAVA_Build 3 45236703 2D CAATCCTTTT AG/-- CTCAAAACCT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 AG 1 0 161546 CASAVA_Build 3 45237223 1I CTGATGCCAG -/T TTTTCCTCTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 4 5 161547 CASAVA_Build 3 45237499 1D GGAAAAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 26 0 16 10 T 13 12 161548 CASAVA_Build 3 45245758 1D TACTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2424 hom 36 10 12 14 A 13 12 161549 CASAVA_Build 3 45247596 1D CGCCCCCCTG C/- CCCCCCCATG 3070 het 2027 hom 28 8 12 8 C 8 7 161550 CASAVA_Build 3 45257496 5I CTATGGATGG -----/CAGAC CAGACCAGAC 3070 het 3070 hom 44 16 15 13 CAGAC 3 4 161551 CASAVA_Build 3 45259184 1D TTTAGTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 19 19 15 T 14 13 161552 CASAVA_Build 3 45267559 1D CTCTTTTCTC T/- CTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 1 0 161553 CASAVA_Build 3 45280122 1D TTCTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1622 het 1622 ref 35 26 4 5 T 11 10 161554 CASAVA_Build 3 45280584 1D CCACCTCTGC A/- CCGACAGGAT 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 A 1 0 161555 CASAVA_Build 3 45294827 1I GTTATAAGAT -/G TTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 G 0 1 161556 CASAVA_Build 3 45295474 1D TATGAGTAGA G/- GACTTTAAAA 3070 het 3070 hom 53 22 26 6 G 2 1 161557 CASAVA_Build 3 45296551 1D TACTCCCAAA C/- TTTTCCTATG 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 C 1 0 161558 CASAVA_Build 3 45300757 1I TGTTTGTTTG -/T TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 15 11 T 3 4 161559 CASAVA_Build 3 45301533 2I ATATTTAAAC --/AG TAATTAAATT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 AG 0 1 161560 CASAVA_Build 3 45330111 1I AGGCGGGAGT -/G GGGGGGTCAC 3070 het 2241 hom 14 6 8 0 G 6 7 161561 CASAVA_Build 3 45332270 1I GACTCTCTCC -/T TTAACTGTTG 2818 het 2818 ref 32 17 10 5 T 2 3 161562 CASAVA_Build 3 45332950 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2885 het 2080 hom 14 5 8 1 A 13 14 161563 CASAVA_Build 3 45345576 1I TGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 9 10 161564 CASAVA_Build 3 45354149 3D AGCAACTGAG ACT/--- ACTATGTAAC 3070 het 3070 hom 34 15 19 0 ACT 2 1 161565 CASAVA_Build 3 45354646 1I AGGACAAAGG -/C TTGGTCACAA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 C 0 1 161566 CASAVA_Build 3 45360320 2I5M9D GTAGGGGTGA --GGTACAGTTTTAGT/GGGGTCC--------- GCTTGGGTAC 3070 hom 108 het 33 0 35 5 N/A 0 0 161567 CASAVA_Build 3 45363053 4I ATCTTCCAGG ----/TCAT TCATTGTACT 3033 hom 24 het 23 0 9 14 TCAT 1 2 161568 CASAVA_Build 3 45369167 1D AGTAAAATAT A/- ACAGTTAGGA 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 A 2 1 161569 CASAVA_Build 3 45369299 4D TCGAGAACTC TAAT/---- TGATACAGTC 3070 het 3070 ref 55 29 25 5 TAAT 1 0 161570 CASAVA_Build 3 45370913 4I AAAAAAAAAT ----/TTAA TTAGTCAAGC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TTAA 0 1 161571 CASAVA_Build 3 45371047 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2701 hom 23 8 13 2 A 10 9 161572 CASAVA_Build 3 45380351 3D CAGTTTTCTC CTT/--- CTTCTACTCC 3070 het 3070 ref 43 23 16 8 CTT 2 1 161573 CASAVA_Build 3 45381305 1D CATACACATG A/- AGTCGGGGGC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 2 1 161574 CASAVA_Build 3 45381382 1D ATTGATGGCA G/- AAATGTAAGA 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 G 1 0 161575 CASAVA_Build 3 45383473 1D AATCTTAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 331 hom 47 1 42 4 T 10 9 161576 CASAVA_Build 3 45401219 1I GCCTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 10 11 161577 CASAVA_Build 3 45409100 1D CTAAGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1253 het 1253 ref 35 30 4 2 T 11 10 161578 CASAVA_Build 3 45409762 3D TGCTAGTATG TAA/--- TAAGTGCTAC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TAA 2 1 161579 CASAVA_Build 3 45421639 1I TATACAAGAT -/G GGGGTCTCAC 3070 hom 77 het 33 0 26 7 G 4 5 161580 CASAVA_Build 3 45425698 5D TTATTTTTAT TTTTA/----- TTTTTTTTTA 383 het 383 ref 35 9 3 24 TTTTA 1 0 161581 CASAVA_Build 3 45436107 1I CAAAGTGTAG -/T TTGTGTATGG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 2 3 161582 CASAVA_Build 3 45444322 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 28 1 18 9 T 13 14 161583 CASAVA_Build 3 45448150 1D CAAAGAAAAT A/- GTTATAGAAT 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 A 1 0 161584 CASAVA_Build 3 45452449 1D ACCTCTGGTG A/- GATTCTGATC 3070 het 3070 ref 31 16 11 6 A 1 0 161585 CASAVA_Build 3 45454357 4I AGACAAAACC ----/CTTT CTTTCATAGG 3070 hom 109 het 44 0 37 7 CTTT 1 2 161586 CASAVA_Build 3 45470932 4D TAAGTGGGGA AACT/---- AACTACCTTC 3070 hom 126 het 44 0 42 4 AACT 2 1 161587 CASAVA_Build 3 45492561 2D AGTAGATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 30 2 13 15 T 16 14 161588 CASAVA_Build 3 45502513 3I TACTGAGAAT ---/AAG AAGAAGTATC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AAG 2 3 161589 CASAVA_Build 3 45504275 1I GGGGGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 A 9 10 161590 CASAVA_Build 3 45514971 1D TTTCACGAAG A/- AAAAAAGTGT 3070 het 3070 hom 31 15 12 4 A 7 6 161591 CASAVA_Build 3 45539389 1D ATCTCTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 9 161592 CASAVA_Build 3 45545370 1D CTACAACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 24 0 15 9 T 13 12 161593 CASAVA_Build 3 45547738 1I GTAGACTGAT -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 6 7 161594 CASAVA_Build 3 45552664 1D GTTGCCCAGG C/- CTGAGTGCAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 2 1 161595 CASAVA_Build 3 45553663 1I ATAGTTCTGT -/G GTGACTTTTC 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 G 1 2 161596 CASAVA_Build 3 45554114 1I AAGTGGCCTC -/A CTTCCTATTC 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 A 0 1 161597 CASAVA_Build 3 45556233 1I TGATATTATT -/A ACTATTTCCT 2640 het 2640 ref 25 14 7 4 A 1 2 161598 CASAVA_Build 3 45562350 3I CAGCCAGCTC ---/CTT CTATCCTGGC 3070 hom 120 het 42 0 40 2 CTT 0 1 161599 CASAVA_Build 3 45573801 2D AAACAAAAAC AG/-- AGTCTCCCTC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 AG 2 1 161600 CASAVA_Build 3 45578315 3D CTGGAGTTCT TTC/--- TTCTTCCTGT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 TTC 3 2 161601 CASAVA_Build 3 45585460 1I TTTATTACTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 A 8 9 161602 CASAVA_Build 3 45585977 2D AGTTTAACTA TT/-- TTTTTTTTTT 2967 het 89 hom 24 2 7 16 T 14 12 161603 CASAVA_Build 3 45587134 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 7 6 161604 CASAVA_Build 3 45587771 1D TTTGTCTGCA G/- CTTGTCCTGC 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 G 1 0 161605 CASAVA_Build 3 45590389 2I GTCAGAAGTG --/AA TTGAATTGTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 2 161606 CASAVA_Build 3 45593899 1D GCCAACATAG T/- GAAACCCCAT 3070 hom 44 het 17 0 14 3 T 1 0 161607 CASAVA_Build 3 45607955 1D GGTCGTGACA G/- TATCTGGGCT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 1 0 161608 CASAVA_Build 3 45615831 1I TGTTTCCCCC -/T ATCCCCTCCC 3070 hom 80 het 31 0 25 6 T 0 1 161609 CASAVA_Build 3 45624183 1I GGCACCCCTC -/T TTAGCAGGCA 3070 hom 140 het 55 0 47 8 T 2 3 161610 CASAVA_Build 3 45633084 1D GCACCCGGGT C/- CCCCTCCTGG 3070 hom 83 het 33 0 27 6 C 5 4 161611 CASAVA_Build 3 45654524 2I6M1I ATTGATGGTA --CAACAC-/ACAAACACA ATTCTTGTCT 3070 hom 54 het 34 0 19 15 N/A 0 0 161612 CASAVA_Build 3 45654676 1D CCCCATTAAA C/- CCATTAATTG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 3 2 161613 CASAVA_Build 3 45660444 1D TAGTGGGGAG A/- AAAAAGCAAA 3070 hom 117 het 44 0 38 6 A 6 5 161614 CASAVA_Build 3 45664600 1D CAGTTTTGGG A/- AAAATAGGGA 3070 hom 153 het 57 0 51 6 A 5 4 161615 CASAVA_Build 3 45665291 1D ATCTCATTGT G/- GGTTTTGATT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 G 3 2 161616 CASAVA_Build 3 45672719 3D TAAATGTCTA TTG/--- TTTAAGCTAC 3070 hom 120 het 48 0 40 9 TTG 1 0 161617 CASAVA_Build 3 45689529 1D ATGTTTAGTG A/- AAAAAAAAAA 1782 het 1782 ref 46 32 5 10 A 12 11 161618 CASAVA_Build 3 45690164 1D ATCCCACCCC T/- TTTAGGAGGC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 4 3 161619 CASAVA_Build 3 45707423 1I GTCTCAAATG -/T TGTTTAAGCC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 2 161620 CASAVA_Build 3 45708095 2I GAAATGCTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 10 12 161621 CASAVA_Build 3 45715953 12D ATAAATTTAT ATAAATTTTATA/------------ AAATTATAAA 640 het 429 hom 7 1 3 4 ATAAATTTTATA 1 0 161622 CASAVA_Build 3 45719698 1D GATTATGGCA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 96 het 42 0 32 10 T 7 6 161623 CASAVA_Build 3 45729307 3I GAAGGTGTGT ---/TAG TAGTTAGGCT 3070 hom 104 het 40 0 33 7 TAG 1 2 161624 CASAVA_Build 3 45730736 2D CTATTTTGTT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 25 0 20 5 TG 1 0 161625 CASAVA_Build 3 45734791 2D CTGTTATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 31 1 24 8 A 14 12 161626 CASAVA_Build 3 45741803 4I TAATATTGTT ----/TGTC AGTCCATCAA 3070 hom 66 het 34 0 23 11 TGTC 0 1 161627 CASAVA_Build 3 45742178 1D AATTTGGATG C/- CCTTTTTTTT 954 het 954 ref 27 16 3 8 C 3 2 161628 CASAVA_Build 3 45745780 2I ACAGGGTTTT --/GC CATGTTGGCC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 GC 0 1 161629 CASAVA_Build 3 45746846 2D TGCTAATCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 10 T 14 12 161630 CASAVA_Build 3 45759590 1I ATATTCTATT -/A AATTTTTTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 3 161631 CASAVA_Build 3 45759977 2D TGAAAACTGG GT/-- CTGATATCAA 3070 hom 141 het 52 0 48 6 GT 1 0 161632 CASAVA_Build 3 45761344 1I CCACTATTTT -/A AAATAATTCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 3 4 161633 CASAVA_Build 3 45764989 4D TCGATCTCGT TCTC/---- TCTCTCTCAC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TC 6 4 161634 CASAVA_Build 3 45771065 4D TAATCATATG ATTT/---- ATTTGTTATG 3070 hom 96 het 37 0 33 6 ATTT 2 1 161635 CASAVA_Build 3 45773687 2D AATGGTCAGC TT/-- TTTACACCGA 3070 hom 40 het 17 0 14 5 T 5 3 161636 CASAVA_Build 3 45790197 2I ACTTGGCCCT --/CC CCCTTCCTAT 3070 hom 125 het 50 0 39 11 C 3 5 161637 CASAVA_Build 3 45804337 4D GCTCAGTAAA TGTT/---- TGTTGAGTAA 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 TGTT 2 1 161638 CASAVA_Build 3 45811828 1D GAAAATACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 10 9 161639 CASAVA_Build 3 45830130 3D GCCTCCAGAA GTC/--- CTGCGAGAGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 GTC 1 0 161640 CASAVA_Build 3 45844372 1I AAATTTTTAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 2630 hom 20 8 10 2 T 7 8 161641 CASAVA_Build 3 45855590 3I TAAATACAGA ---/TTC TTCTTTTTTT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 TTC 1 2 161642 CASAVA_Build 3 45860587 3D ATTCTTTTTA TAT/--- TATTATGAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TAT 3 2 161643 CASAVA_Build 3 45868337 1I CTGTCTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 31 1 21 9 T 10 11 161644 CASAVA_Build 3 45876961 1D TTATAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 312 hom 45 1 28 16 T 12 11 161645 CASAVA_Build 3 45877708 1D AAGCAAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 28 0 18 10 A 15 14 161646 CASAVA_Build 3 45888171 1D TGTATGTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 T 11 10 161647 CASAVA_Build 3 45891706 9I CCTTTGAATG ---------/TGAGCTCTA TGAGCTCTAT 3070 hom 93 het 39 0 32 8 TGAGCTCTA 1 2 161648 CASAVA_Build 3 45901500 1I GCCGTTCCTT -/C AAGGCTGATG 3070 het 3070 ref 47 19 16 12 C 0 1 161649 CASAVA_Build 3 45909983 1D ATTGCCAGGA C/- ATCAGTGATT 2077 het 2077 ref 21 15 5 2 C 1 0 161650 CASAVA_Build 3 45912210 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3037 het 1383 hom 18 5 8 5 A 17 16 161651 CASAVA_Build 3 45935004 1D TCTCTGCTTT A/- ATTCCCAACA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 2 1 161652 CASAVA_Build 3 45955702 9D CCTTTGTGGG TGCCATCCT/--------- GGCATTCCTG 3070 het 3070 hom 41 19 23 6 TGCCATCCT 1 0 161653 CASAVA_Build 3 45991307 2I GGCTACCCAC --/CA CAGTCTCCAG 3070 het 3070 hom 44 19 14 11 CA 1 2 161654 CASAVA_Build 3 45993847 44D ACTGAATTAA ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------------- ATATATATAT 3070 het 345 hom 6 1 9 2 AT 28 6 161655 CASAVA_Build 3 45996850 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 20 1 18 2 A 13 12 161656 CASAVA_Build 3 45999132 1I GCAGAGATGG -/T TGGGATGTGC 3070 hom 120 het 41 0 39 2 T 1 2 161657 CASAVA_Build 3 46001214 1D CAAATATTTC A/- ATATGATGTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 1 161658 CASAVA_Build 3 46009408 1I CTTGGCCTTG -/C CCCCCTGCAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 C 5 6 161659 CASAVA_Build 3 46010715 1D AAGTAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 34 2 21 11 A 15 14 161660 CASAVA_Build 3 46032426 1I TGTGGACAAT -/C AAGCCAGGTC 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 C 0 1 161661 CASAVA_Build 3 46035468 1D CCACGCCAGA G/- CCAAATCAGG 3070 het 3070 hom 56 22 25 9 G 1 0 161662 CASAVA_Build 3 46039415 4D TATCAAAATG TAAC/---- TAACTATTAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 TAAC 2 1 161663 CASAVA_Build 3 46044075 2D GACAGCTAGT GA/-- GAGAGGAGGA 3070 het 2873 hom 32 12 12 8 GA 3 2 161664 CASAVA_Build 3 46044675 1I CTCCAGTGTC -/T TGTGTGCCTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 1 2 161665 CASAVA_Build 3 46050468 1D TTCATTGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 10 9 161666 CASAVA_Build 3 46050945 1D TTTTATTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 10 9 161667 CASAVA_Build 3 46063533 17I CCCTAACCAT -----------------/AGAACCGTGGATTTCAA AGAACCGTGG 3070 het 3070 ref 31 9 9 13 AGAACCGTGGATTTCAA 1 2 161668 CASAVA_Build 3 46068524 6I TCCATCTCAA ------/AAAAAC AAAAACAAAA 3070 hom 48 het 22 0 16 6 AAAAAC 2 3 161669 CASAVA_Build 3 46068537 5I AACAAAAACA -----/AAAAC AAAAAAAAAC 3070 hom 39 het 24 0 14 10 AAAAC 0 1 161670 CASAVA_Build 3 46070118 1I ACTGAAGAAT -/C AACTTTAAAA 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 C 0 1 161671 CASAVA_Build 3 46070399 2I CTCCCAGTAG --/CT CTCTTTAGGG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 CT 2 3 161672 CASAVA_Build 3 46073156 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTTTGT 3070 het 2014 hom 20 6 11 3 A 0 1 161673 CASAVA_Build 3 46083484 2D CCTGCAGTAC AG/-- AGTCAGACCT 3070 het 3070 hom 52 23 27 2 AG 2 1 161674 CASAVA_Build 3 46086405 1D TTGCGATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 11 10 161675 CASAVA_Build 3 46096566 1I TTGAACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 10 11 161676 CASAVA_Build 3 46096681 1I TCCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2462 het 2462 ref 30 11 10 9 A 13 14 161677 CASAVA_Build 3 46099156 1I CCAGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 2161 het 2161 ref 30 15 9 6 A 10 11 161678 CASAVA_Build 3 46112122 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 11 9 14 T 11 12 161679 CASAVA_Build 3 46117717 3I GTTTTCTCAA ---/AAC AAACAAATGA 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 AAC 0 1 161680 CASAVA_Build 3 46119294 2D AATTTGCAAA CT/-- CTGATAGTCA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 CT 2 1 161681 CASAVA_Build 3 46121264 1D ACCCAGAGAT G/- GGGGGCTGCA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 G 6 5 161682 CASAVA_Build 3 46122950 2I TGACCATTAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 9 11 161683 CASAVA_Build 3 46123640 1D GAAAATTTTT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 8 7 161684 CASAVA_Build 3 46135922 4I ACATGAAGAC ----/TCCA TCCAACCTTA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 TCCA 1 2 161685 CASAVA_Build 3 46136239 1D AGGGGGCCAG A/- TCACTCGTTA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 1 0 161686 CASAVA_Build 3 46142916 1I TAGAATGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 9 10 161687 CASAVA_Build 3 46145651 14D TACATTTGAT TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 het 529 hom 21 3 16 3 TA 13 6 161688 CASAVA_Build 3 46151091 8D GTGCCTATCT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCCA 2156 het 2156 ref 22 10 7 6 TC 8 4 161689 CASAVA_Build 3 46183936 3D18M1I AGTTCTTCTA GTTGTGATGTTAGGTTGTTAT-/---GTGATGTTAGGTTGTTATC TTGAGATCTT 3070 het 3070 ref 62 61 8 6 N/A 0 0 161690 CASAVA_Build 3 46217682 1I GGGGTGTAAG -/C CCAGGTGGCA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 C 2 3 161691 CASAVA_Build 3 46224948 3D AGGGACAAAG TTC/--- TTCTTTTTGT 3070 hom 102 het 37 0 33 6 TTC 2 1 161692 CASAVA_Build 3 46243835 2I GTAATATCCC --/CT GTTTTATTTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CT 0 1 161693 CASAVA_Build 3 46251125 1D CCACAAAATA C/- CCCCTGATTT 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 C 5 4 161694 CASAVA_Build 3 46253592 1D ATATACCACA T/- TTTCTTTATC 3070 het 3070 ref 36 17 10 10 T 4 3 161695 CASAVA_Build 3 46254750 1I TTGTCAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 30 1 25 4 A 10 11 161696 CASAVA_Build 3 46254956 5D GAAACTTAAC AAAGT/----- GTTGCAGCAG 3070 het 3070 ref 46 24 19 7 AAAGT 1 0 161697 CASAVA_Build 3 46259136 1I GAGGGAGGAG -/A AGGAAGGTAC 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 1 2 161698 CASAVA_Build 3 46262239 3D TCTGTTGTTC TCT/--- TCTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 TCT 2 1 161699 CASAVA_Build 3 46270171 1D CATGTTAACC T/- TTAAGGGAAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 3 2 161700 CASAVA_Build 3 46270947 1I AGCATAAAGG -/A GGAAGTATTT 2594 het 2594 ref 25 11 9 5 A 0 1 161701 CASAVA_Build 3 46270985 1I GTTCTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 9 10 161702 CASAVA_Build 3 46271127 5D TTATCCCTCA CTCCC/----- CTCCCATCCT 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 CTCCC 2 1 161703 CASAVA_Build 3 46271557 1D CCAACATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 11 10 161704 CASAVA_Build 3 46272919 1I TTTTAAATCC -/A AAAACCACAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 4 5 161705 CASAVA_Build 3 46273517 1D TCAAATTTGC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 47 25 16 8 A 9 8 161706 CASAVA_Build 3 46292830 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 A 10 9 161707 CASAVA_Build 3 46298656 1D TAAAACACAC G/- GCTGACAGAG 3070 het 3070 hom 60 24 32 4 G 2 1 161708 CASAVA_Build 3 46300985 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 7 6 161709 CASAVA_Build 3 46307629 1D CATATGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 6 T 11 10 161710 CASAVA_Build 3 46317068 1D ATAGGTGCAG A/- ACTAAGTCCA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 2 1 161711 CASAVA_Build 3 46320571 4D CATTTTTGTC ACTT/---- ACTTATTTGA 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 ACTT 2 1 161712 CASAVA_Build 3 46322497 4I55M1I TATAGCTAAT ----AAATCATAATGCCCTTTTAATTACAAGTGTCTATACCTTCAGAAATAAAAAAAAA-/AAAGAAATCATAATGCCCTTTTAATTACAAGTGTCTATACCTTCAGAAATAAAAAAAAAC AATTTAAATT 2641 het 2641 ref 18 17 7 8 N/A 0 0 161713 CASAVA_Build 3 46322749 1D CACAATTAGC A/- AAATTTTCTC 2387 het 2387 ref 30 22 5 3 A 4 3 161714 CASAVA_Build 3 46325240 1I ATTTCTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 10 11 161715 CASAVA_Build 3 46326756 1I CTGGCCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 10 11 161716 CASAVA_Build 3 46327119 8I TATGTTCCAA --------/ATTTCCAC TTGTTGCCAT 3070 het 3070 hom 64 21 32 11 ATTTCCAC 0 1 161717 CASAVA_Build 3 46330418 1D ATAAAATGTG A/- GGGACCAAAC 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 A 1 0 161718 CASAVA_Build 3 46335583 3D TTACAGGTGC CCA/--- CCACCACGCC 3070 het 3070 hom 22 10 10 3 CCA 3 2 161719 CASAVA_Build 3 46338512 4D TCTCCAGGGC TCTT/---- TTTTTCTGGA 3070 het 3070 hom 34 14 18 5 TCTT 1 0 161720 CASAVA_Build 3 46377562 1I CAGGCCACAC -/A ACCCCACGCC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 1 2 161721 CASAVA_Build 3 46385511 4D TGTATTTATG CTAT/---- CTATTTTCTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CTAT 2 1 161722 CASAVA_Build 3 46388267 2D GTGGCAACTC AG/-- AAACTACAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AG 1 0 161723 CASAVA_Build 3 46389024 3D ACCCTGTCTC ACA/--- ACAACAACAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 ACA 7 6 161724 CASAVA_Build 3 46395497 1D GGTAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1447 het 906 hom 11 4 5 2 T 17 16 161725 CASAVA_Build 3 46414701 1D GACCCCAAAA C/- CCAGGCGCGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 3 2 161726 CASAVA_Build 3 46430086 1D GCCTGACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 11 10 161727 CASAVA_Build 3 46449243 14I ACAAAGCTTG --------------/CAATTGCAGCAGCA ATTGCATTGT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 CAATTGCAGCAGCA 0 1 161728 CASAVA_Build 3 46460964 1I GCTCTGCCCC -/T ACTGAGCAAA 3070 het 3070 ref 52 22 22 8 T 0 1 161729 CASAVA_Build 3 46462792 17D TGTGAATTAT TTGCACCCTTAAAATTA/----------------- TTGCTCCTAG 3070 het 3070 ref 36 21 16 9 TTGCACCCTTAAAATTA 1 0 161730 CASAVA_Build 3 46465738 1I TGGAGAAGTT -/C CCTGGCTTCT 3070 hom 74 het 29 0 22 7 C 2 3 161731 CASAVA_Build 3 46470731 1D TAATTAGCTC A/- AAGGTCAGAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 3 2 161732 CASAVA_Build 3 46474439 2D GCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1953 het 230 hom 9 2 5 2 T 13 11 161733 CASAVA_Build 3 46476289 3I CTGAACACTC ---/CTT CTCCTACGGC 3070 hom 78 het 37 0 25 12 CTT 0 1 161734 CASAVA_Build 3 46478261 1I AAATAGGTGA -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 T 6 7 161735 CASAVA_Build 3 46482094 3D GCCCTACCAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 37 0 27 10 T 14 11 161736 CASAVA_Build 3 46482408 4D CTCAGAAAGA ATAT/---- CCTGTGTGTA 3070 hom 120 het 41 0 41 0 AT 2 0 161737 CASAVA_Build 3 46499297 4D AAGAAGGAAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 2318 hom 44 het 18 0 14 4 GAAA 5 4 161738 CASAVA_Build 3 46503213 3I GCAAGTTTGG ---/CCT CCTCACTATC 3070 hom 135 het 48 0 42 6 CCT 1 2 161739 CASAVA_Build 3 46524522 15D ACCTGAAAAC CCAAAGGCTCACAGA/--------------- CCAGGTGGCA 3070 hom 111 het 39 0 37 5 CCAAAGGCTCACAGA 1 0 161740 CASAVA_Build 3 46532447 14D TCTCTCTCTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 27 5 T 25 11 161741 CASAVA_Build 3 46535726 4D TTGTCACCAT TAAG/---- TAAGTCATCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TAAG 2 1 161742 CASAVA_Build 3 46545610 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 36 1 20 15 A 15 14 161743 CASAVA_Build 3 46547646 1D TATAGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 699 hom 32 6 11 15 T 17 16 161744 CASAVA_Build 3 46549099 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 74 het 26 0 24 3 A 9 8 161745 CASAVA_Build 3 46558827 1I CTCCATCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 70 het 31 0 23 8 A 9 10 161746 CASAVA_Build 3 46589171 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGCTTCAC 960 hom 7 het 3 0 2 1 G 4 5 161747 CASAVA_Build 3 46603348 5I ACTGTTTGCT -----/AAGGA AAGGAAAGAG 3070 hom 84 het 31 0 25 6 AAGGA 1 2 161748 CASAVA_Build 3 46603709 1D GATGGACAGA G/- TAGCATGCGG 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 G 1 0 161749 CASAVA_Build 3 46620917 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 7 8 161750 CASAVA_Build 3 46625599 3I GAAATATTTA ---/AAC AACATGTTTA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 AAC 1 2 161751 CASAVA_Build 3 46627532 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 6 7 161752 CASAVA_Build 3 46633520 1I CACCTATTAG -/T TTTTTGACTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 5 6 161753 CASAVA_Build 3 46637126 1D TGCATACTCT G/- GCAGAACAAA 2795 het 2795 ref 33 20 7 6 G 2 1 161754 CASAVA_Build 3 46637849 2I ACTTTATATT --/AA GTCTGTTAAT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 0 2 161755 CASAVA_Build 3 46638510 1I TTCTCTCATC -/T TTATCATTGT 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 T 2 3 161756 CASAVA_Build 3 46641458 2D ATGAATAAAT TA/-- TATATATATA 2078 het 2034 hom 11 5 5 1 TA 9 8 161757 CASAVA_Build 3 46642668 2I AGAGGCACTG --/TT TATGGCAGAC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 1 3 161758 CASAVA_Build 3 46643489 1D ATAGAGGTCG A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 7 6 161759 CASAVA_Build 3 46667275 1D TCTAGCCCAT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 A 8 7 161760 CASAVA_Build 3 46681758 1I AAGATGAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 27 1 18 8 A 13 14 161761 CASAVA_Build 3 46700902 3I CTCACAGACC ---/ACT ACTACGCCAT 3070 het 3070 hom 57 22 25 10 ACT 1 2 161762 CASAVA_Build 3 46795829 1I TTGGTTAAAA -/T TTCAGTTATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 2 3 161763 CASAVA_Build 3 46912687 4D AGATACACAA AGAC/---- AGACAGATAG 3070 hom 90 het 34 0 24 13 AGAC 2 1 161764 CASAVA_Build 3 46924040 4D TGCGAGCGTT TGTA/---- TGCGCGTGCT 3070 hom 136 het 53 0 43 13 TGTA 1 0 161765 CASAVA_Build 3 46928818 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 11 12 161766 CASAVA_Build 3 46930975 1D AACTGCTCTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 62 het 32 0 23 9 A 9 8 161767 CASAVA_Build 3 46932660 1I AGTTTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 A 11 12 161768 CASAVA_Build 3 46950421 1I CAATTGAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 28 1 18 9 T 13 14 161769 CASAVA_Build 3 46954690 2D CTGCGGTGAG AA/-- AAAACAAAAC 3070 hom 84 het 33 0 26 7 A 6 4 161770 CASAVA_Build 3 46958059 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 717 hom 23 5 17 2 A 14 13 161771 CASAVA_Build 3 46965425 16D CTCCCCTGTG GTACTCCATGCTGTAC/---------------- TCAGATACTC 3070 hom 75 het 22 0 23 4 GTACTCCATGCTGTAC 1 0 161772 CASAVA_Build 3 46966810 1I TACATTTGCA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 87 het 38 0 29 9 T 7 8 161773 CASAVA_Build 3 46970611 2D GTGGACAGTC AG/-- AGGAATCAGG 3070 hom 76 het 28 0 25 3 AG 2 1 161774 CASAVA_Build 3 46971714 1I GTCTGTTTTT -/C CCTGAGGAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 2 3 161775 CASAVA_Build 3 46973259 5I AGGCTGCAGT -----/GAGCC GAGATTGCAC 3070 hom 74 het 31 0 26 5 GAGCC 0 1 161776 CASAVA_Build 3 46973326 1I ACCCACCCCC -/G CCAAAATAAA 3070 hom 76 het 30 0 24 6 G 0 1 161777 CASAVA_Build 3 46975550 1D AAGTAAAGGT A/- AGACAGCTGT 3070 het 3070 ref 48 24 17 8 A 2 1 161778 CASAVA_Build 3 46975702 1D CTTTAGCTAC A/- AAGCGTTTTT 3070 hom 107 het 44 0 35 9 A 3 2 161779 CASAVA_Build 3 46984850 1I CACTGGAACC -/G GGGCCAGTTC 3070 hom 79 het 41 0 34 7 G 3 4 161780 CASAVA_Build 3 46986779 2I TTTTTTGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 10 12 161781 CASAVA_Build 3 46987317 2D AGCACTGTAA AG/-- AGATGCCAGA 3070 het 3070 hom 51 21 23 8 AG 2 1 161782 CASAVA_Build 3 46988135 2D ATTATGAGTT TA/-- TAGTCTGGTG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TA 2 1 161783 CASAVA_Build 3 46988557 1I TCACCTTAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 8 9 161784 CASAVA_Build 3 46989693 1I TACTAAAATA -/T AAAAATTAGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 0 1 161785 CASAVA_Build 3 46991064 4I AATTTAGGGG ----/CTAA CTGTCTGATA 3070 hom 108 het 40 0 29 11 CTAA 0 1 161786 CASAVA_Build 3 47013140 1I CTAGGGGTCC -/A GGGGGGAGAA 3070 hom 54 het 22 0 17 5 A 0 1 161787 CASAVA_Build 3 47022181 1I GGAGTGGCCA -/G GGGGGCAGTC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 G 5 6 161788 CASAVA_Build 3 47025913 1D GGGCAGCCCA G/- GGGGGTGAGC 950 het 950 ref 14 6 3 5 G 6 5 161789 CASAVA_Build 3 47043120 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 A 6 7 161790 CASAVA_Build 3 47043202 1D ACAAGAGAAC A/- CAAAACCAAA 3070 het 2751 hom 15 6 9 0 A 1 0 161791 CASAVA_Build 3 47045978 1I AATAAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 12 13 161792 CASAVA_Build 3 47056379 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1478 het 1478 ref 16 10 4 2 A 17 16 161793 CASAVA_Build 3 47080483 1D TCTCGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 26 2 20 4 A 11 10 161794 CASAVA_Build 3 47089276 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAATAC 2285 het 2285 ref 15 7 6 2 A 7 8 161795 CASAVA_Build 3 47095518 1D AGAAAACAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 8 7 161796 CASAVA_Build 3 47104369 3I ACGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 het 2619 hom 19 8 10 1 AGG 0 1 161797 CASAVA_Build 3 47117912 2D CAGCCTATTT CC/-- CCATCAGAAG 3070 het 3070 hom 39 14 21 5 C 4 2 161798 CASAVA_Build 3 47120239 2I CACACGCACG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 48 18 19 11 CA 7 8 161799 CASAVA_Build 3 47121905 1I CACTATCTCT -/A AAAAAAAAAA 1496 het 1496 ref 24 12 7 5 A 17 18 161800 CASAVA_Build 3 47129601 1I TCTTCTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 11 12 161801 CASAVA_Build 3 47133779 1D AAAAAACAAA C/- AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 32 16 8 8 C 1 0 161802 CASAVA_Build 3 47149159 1D ACTGAATTTC G/- TAACTACAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 G 1 0 161803 CASAVA_Build 3 47167415 1D CCCTATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 13 11 A 15 14 161804 CASAVA_Build 3 47189926 2D TGCCAAAACC CT/-- GTCTCTACTA 2788 het 2788 ref 23 10 9 4 CT 1 0 161805 CASAVA_Build 3 47190240 4D TGAAATTCAC TTTA/---- TTTATAATAC 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 TTTA 2 1 161806 CASAVA_Build 3 47200440 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 10 hom 16 1 11 4 A 1 0 161807 CASAVA_Build 3 47223233 26I CTGAGATCGT --------------------------/GCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACA GAGTGAGACT 3070 hom 54 het 21 0 17 4 GCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACA 0 1 161808 CASAVA_Build 3 47240882 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 2155 het 47 hom 15 2 9 4 G 0 1 161809 CASAVA_Build 3 47241450 6I TTAGGCAGAG ------/GGTTTA GAAACAGCCA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 GGTTTA 0 1 161810 CASAVA_Build 3 47262608 1I AAGAAGAGGA -/T GCTCTTGGAG 3070 hom 103 het 39 0 34 5 T 0 1 161811 CASAVA_Build 3 47266603 1I AAATCTCTAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 59 het 26 0 21 5 T 8 9 161812 CASAVA_Build 3 47266948 5I AGTGCTTTAA -----/AAAGT AAAGCACTTG 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 AAAGT 0 1 161813 CASAVA_Build 3 47269955 1D GGCCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 2674 het 2667 hom 19 8 7 4 T 13 12 161814 CASAVA_Build 3 47280933 5D ACTGAATGCT TTTTA/----- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 TTTTA 1 0 161815 CASAVA_Build 3 47285079 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1924 het 1924 ref 33 10 6 17 T 17 16 161816 CASAVA_Build 3 47291614 12I TTTTAATTTT ------------/CCTTTTAATCTA CCTATGAAGG 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 CCTTTTAATCTA 0 1 161817 CASAVA_Build 3 47293462 3D GCGATTATAC AAT/--- GACAGATCAA 3070 het 3070 ref 40 20 18 4 AAT 1 0 161818 CASAVA_Build 3 47316904 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1896 hom 27 het 13 0 8 5 TA 6 5 161819 CASAVA_Build 3 47330986 1I GTTTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2004 het 2004 ref 24 15 6 3 T 11 12 161820 CASAVA_Build 3 47345650 1I AAAAAAAAAG -/A ACAAGTATAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 1 2 161821 CASAVA_Build 3 47356298 1D GCTCACTCTT A/- ACAATCCCAG 3070 hom 117 het 43 0 38 5 A 2 1 161822 CASAVA_Build 3 47361064 1I GAGGCCTTTT -/C GATCTGTCCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 161823 CASAVA_Build 3 47361443 1D TAGAGAGTTA G/- GCTATCTGCT 3070 hom 106 het 41 0 36 5 G 2 1 161824 CASAVA_Build 3 47367903 3I AGCCTGTTAA ---/TGT TGTTATAACA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TGT 1 2 161825 CASAVA_Build 3 47373230 3I ACCCATGGGA ---/ATC CCATGCCCCA 3070 hom 33 het 12 0 10 2 ATC 0 1 161826 CASAVA_Build 3 47374201 2D GCTTACTAAC TG/-- TACAACCCTG 3070 het 3070 ref 58 33 25 1 TG 1 0 161827 CASAVA_Build 3 47378471 1I AACTTGTCTC -/A AAAAAAATAA 1843 het 1843 ref 16 10 4 2 A 7 8 161828 CASAVA_Build 3 47380575 5I TCACTAAAGT -----/TAACA ATGCTTATCT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 TAACA 0 1 161829 CASAVA_Build 3 47406874 3D TCTCCACGGG TCT/--- TCTTTTATTC 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 TCT 2 1 161830 CASAVA_Build 3 47412461 3D CACGGCTCTC GTG/--- GTCAGCATTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 GTG 1 0 161831 CASAVA_Build 3 47454924 6I ACGACTACAA ------/GAGAAT GTGATCAGAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 GAGAAT 0 1 161832 CASAVA_Build 3 47465219 5D TGATTTTCTG TTCAT/----- TTCAAGAGCA 3070 het 3070 ref 21 11 7 5 TTCAT 1 0 161833 CASAVA_Build 3 47469421 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 526 hom 37 2 27 8 A 14 13 161834 CASAVA_Build 3 47469892 1I TTTTTAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 27 2 21 4 A 10 11 161835 CASAVA_Build 3 47490759 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2152 het 1008 hom 16 2 6 8 A 11 12 161836 CASAVA_Build 3 47502838 2D ATATATACAC AT/-- ATATATATAT 420 het 77 hom 7 1 3 3 AT 6 5 161837 CASAVA_Build 3 47524536 1D GAATGCAACA T/- TATTTTCTTT 3070 hom 93 het 34 0 30 5 T 2 1 161838 CASAVA_Build 3 47578931 1I ATTTTAAGTA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 7 8 161839 CASAVA_Build 3 47586764 1D CTTAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 2199 het 2199 ref 25 12 7 7 T 15 14 161840 CASAVA_Build 3 47603806 1I TAGACTCATT -/G GGGGGTAATT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 G 5 6 161841 CASAVA_Build 3 47610655 1I ATGAAACTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2568 hom 33 11 15 7 A 15 16 161842 CASAVA_Build 3 47612035 5D ATAAATAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 3070 het 35 hom 15 2 12 1 AAATA 5 4 161843 CASAVA_Build 3 47624812 1I GAACTCCTGA -/C CTCAGGTGAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 1 2 161844 CASAVA_Build 3 47626000 1I CAAAAAAAAA -/G AAAAAGACTC 3070 het 777 hom 19 6 12 1 G 0 1 161845 CASAVA_Build 3 47629219 5D TAAAACTTAG AAGGT/----- AATTTAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 AAGGT 1 0 161846 CASAVA_Build 3 47649462 1D ATATGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2942 het 2638 hom 30 14 11 5 A 14 13 161847 CASAVA_Build 3 47651907 1I CCTTACCTCC -/A ACCACTATAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 1 2 161848 CASAVA_Build 3 47654206 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 15 19 9 A 12 13 161849 CASAVA_Build 3 47667311 1I CTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2254 hom 23 6 15 2 A 9 10 161850 CASAVA_Build 3 47681491 1I ACTTCAAAGA -/T TTTTTTTTTC 2801 het 2801 ref 29 13 9 7 T 9 10 161851 CASAVA_Build 3 47682956 2I AGTGTCTGTC --/AT AGTGTCCAAA 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 AT 0 1 161852 CASAVA_Build 3 47683812 4D ACTCCGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2640 het 1248 hom 14 4 10 1 A 16 12 161853 CASAVA_Build 3 47704801 1D ATAACTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 295 hom 35 1 24 10 T 15 14 161854 CASAVA_Build 3 47719957 1D TTTGTTATCA T/- TTTTTTTTTC 2363 het 2306 hom 14 5 5 4 T 10 9 161855 CASAVA_Build 3 47723814 1I TCAAAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3011 het 3011 ref 28 12 10 6 A 13 14 161856 CASAVA_Build 3 47729140 4D AAAACTTGGG CAAA/---- CAGTTTTAGT 3070 het 3070 ref 39 16 16 8 CAAA 1 0 161857 CASAVA_Build 3 47753014 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 2461 het 236 hom 7 1 5 1 A 7 8 161858 CASAVA_Build 3 47765028 1I TATTATAATA -/T TTTAATGACC 3070 hom 42 het 24 0 15 9 T 3 4 161859 CASAVA_Build 3 47767394 1D GACAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1819 hom 21 6 9 6 T 15 14 161860 CASAVA_Build 3 47768035 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAGAAAAC 2688 het 1487 hom 12 6 6 1 A 15 4 161861 CASAVA_Build 3 47784373 1D CAGTGAACTC T/- TTTTTTTTTT 1715 het 1715 ref 21 7 6 8 T 13 12 161862 CASAVA_Build 3 47806094 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1234 het 1234 ref 24 19 3 5 A 11 10 161863 CASAVA_Build 3 47815510 1I CTTCCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1388 het 1068 hom 30 6 6 18 T 15 16 161864 CASAVA_Build 3 47833412 1D CAATTTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 11 10 161865 CASAVA_Build 3 47838966 4D CAGACAAGAG AGAA/---- AGACAGAACC 3070 het 3070 ref 26 16 9 2 AGAA 1 0 161866 CASAVA_Build 3 47845227 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1391 hom 18 6 8 4 A 9 10 161867 CASAVA_Build 3 47850369 1D AGAAAAAAAA T/- GTATTCTCTT 3070 het 1554 hom 18 5 11 2 T 1 0 161868 CASAVA_Build 3 47853594 13I CTAAATAGAA -------------/GAGGCTTATGCTT GAGGCTTATT 3070 het 3070 hom 41 12 19 10 GAGGCTTATGCTT 0 1 161869 CASAVA_Build 3 47866749 2D ACGGTTCCCC AA/-- AGAGGAAGGA 3070 hom 87 het 33 0 28 7 A 3 1 161870 CASAVA_Build 3 47867169 2I GCAAAACGAG --/AC ACAGAAGCAC 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 AC 1 2 161871 CASAVA_Build 3 47867381 3I GTGGAGGATC ---/CTT CTTTGAGGGA 2204 het 2204 ref 28 13 7 8 CTT 1 2 161872 CASAVA_Build 3 47882011 2I GGGCAGGAAG --/GA GAGTTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 GA 1 2 161873 CASAVA_Build 3 47895342 2I TGAAATGCCA --/TT TTAATATTAA 3070 het 1606 hom 21 4 16 1 T 2 4 161874 CASAVA_Build 3 47896170 3D GCTTTGTGTA ACC/--- ACCACCACCA 3070 het 3070 hom 48 22 19 9 ACC 5 4 161875 CASAVA_Build 3 47919641 1D TTGGTTTCCA G/- GGGAACAACT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 G 4 3 161876 CASAVA_Build 3 47922186 1D GAAGAAGTCA C/- TAAAAAAAAA 2201 het 2201 ref 18 9 7 2 C 1 0 161877 CASAVA_Build 3 47924543 1I CCAATTGGTG -/T TTTTTTTTAA 2048 het 2048 ref 25 11 7 7 T 8 9 161878 CASAVA_Build 3 47966384 1D GGGATACCAC A/- ATGAGTGGCT 3070 het 3070 hom 44 15 21 9 A 2 1 161879 CASAVA_Build 3 47970229 1I ATTAGTGAGG -/C TGGGCATGGT 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 C 0 1 161880 CASAVA_Build 3 47972831 2D GAAAAAACTC AA/-- GTCTGGTTTA 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 A 2 0 161881 CASAVA_Build 3 48004752 2D TCAGACAGGA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 T 10 8 161882 CASAVA_Build 3 48007337 1I TTTCTTTTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 8 161883 CASAVA_Build 3 48022726 2I GCCAGGTACC --/CA CTTGAGAAAG 3070 het 2798 hom 22 9 8 5 CA 0 1 161884 CASAVA_Build 3 48029461 3D GTTAAAGTAC TGT/--- TGTTTTTTTT 3070 het 1806 hom 31 6 17 8 TGT 2 1 161885 CASAVA_Build 3 48029798 1I CATTTACTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 A 10 11 161886 CASAVA_Build 3 48039392 1D CTCAGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 A 11 10 161887 CASAVA_Build 3 48045266 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 631 hom 13 2 7 5 A 13 12 161888 CASAVA_Build 3 48065951 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 A 6 5 161889 CASAVA_Build 3 48069864 1I TCATTGAAAC -/A AACACTGCTA 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 A 2 3 161890 CASAVA_Build 3 48107147 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 8 6 161891 CASAVA_Build 3 48108274 4I CCTTGTATGC ----/CTGT CTATTACAAC 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 CTGT 0 1 161892 CASAVA_Build 3 48117022 1I GTGCCTGGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 13 0 9 4 T 9 10 161893 CASAVA_Build 3 48181927 1I GAATAACTGT -/A GCACAAGGTG 3070 hom 151 het 51 0 51 0 A 0 1 161894 CASAVA_Build 3 48182701 1I CGCTTGAATC -/A CAGGAGGCGG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 0 1 161895 CASAVA_Build 3 48193466 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1538 het 1538 ref 25 17 5 3 A 11 12 161896 CASAVA_Build 3 48194922 2D CAGTTCTGAC AG/-- GGGGGAATAA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 AG 1 0 161897 CASAVA_Build 3 48202087 1I GGGAGGCAGA -/G GTTGCCTGGG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 1 2 161898 CASAVA_Build 3 48208539 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 15 1 11 3 A 13 12 161899 CASAVA_Build 3 48231467 1D CTAAATTCAC A/- GGAGGCCATC 3070 hom 117 het 46 0 38 9 A 1 0 161900 CASAVA_Build 3 48236747 4I AGAGAGAGAT ----/AGAG AGAGAGACAG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AG 3 5 161901 CASAVA_Build 3 48252199 1I AAAAAAAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 9 10 161902 CASAVA_Build 3 48254277 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 T 7 8 161903 CASAVA_Build 3 48254819 1I CACAGTGAGA -/C CCCCGTCTCT 3070 hom 43 het 17 0 15 2 C 4 5 161904 CASAVA_Build 3 48255175 3D TGAAATCATA AGG/--- AGTTGAAGCT 3070 hom 75 het 27 0 26 3 AGG 1 0 161905 CASAVA_Build 3 48257656 4D GTGCGTGCGT GCGC/---- GCGCAGATGT 3070 hom 51 het 18 0 17 2 GC 4 2 161906 CASAVA_Build 3 48260287 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 159 hom 37 2 20 15 A 15 14 161907 CASAVA_Build 3 48261195 1D ATTTAGGGCC T/- TTTTTTTTTT 1370 het 1370 ref 31 20 3 8 T 11 10 161908 CASAVA_Build 3 48272997 1D TGGTTGAATT G/- GGGTTTGCCC 3070 hom 105 het 39 0 34 7 G 4 3 161909 CASAVA_Build 3 48291882 2D GTTTCTTAAC GA/-- GAGATCCAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 GA 3 2 161910 CASAVA_Build 3 48304097 4D AAAAAATAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAAT 4 3 161911 CASAVA_Build 3 48305564 2I TTAAAAATAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 15 6 T 12 14 161912 CASAVA_Build 3 48316072 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 354 hom 24 1 22 1 TA 6 7 161913 CASAVA_Build 3 48319239 2I GAATTCTGAC --/CT CTGATTCTCA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 CT 1 2 161914 CASAVA_Build 3 48321871 1D TGTATGTGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 8 161915 CASAVA_Build 3 48321960 4D TGGGCTCAAG CAAT/---- CAATCCTCCC 3070 hom 80 het 29 0 26 6 CAAT 2 1 161916 CASAVA_Build 3 48326990 3D CAAAAAAAAA ATT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 18 0 14 4 ATT 1 0 161917 CASAVA_Build 3 48327060 1D GGCACGATCT C/- AGCTCACTGC 2108 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 0 161918 CASAVA_Build 3 48340426 1I GTACTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2593 hom 38 9 15 14 T 16 17 161919 CASAVA_Build 3 48341900 1D TAAGTAAGTA T/- TTTTTTAATG 3070 hom 23 het 17 0 11 6 T 7 6 161920 CASAVA_Build 3 48341922 1D AACGTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 1798 het 185 hom 19 2 8 10 T 15 14 161921 CASAVA_Build 3 48349379 1I TCTGAGAGGG -/A AAAAAGGTAC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 5 6 161922 CASAVA_Build 3 48354792 1D GACCCTTGGC T/- GTCCCCATCA 3070 hom 110 het 45 0 34 12 T 1 0 161923 CASAVA_Build 3 48359294 2D CAAAAAAATG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AT 7 6 161924 CASAVA_Build 3 48363336 1I TGTCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 14 1 12 1 A 13 14 161925 CASAVA_Build 3 48365773 1I GTTCTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 10 11 161926 CASAVA_Build 3 48366992 1D TCAAGAGAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 T 9 8 161927 CASAVA_Build 3 48371226 8D AGTGCTGGGA TTACAGGC/-------- TTACAGGCAT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 TTACAGGC 2 1 161928 CASAVA_Build 3 48376008 1D GAAAAATGAA C/- CCTTGTACAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 C 3 2 161929 CASAVA_Build 3 48379998 2I ACTGCATGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 13 2 A 10 12 161930 CASAVA_Build 3 48380878 2D GTGTGTAGCA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 43 het 19 0 15 4 C 11 9 161931 CASAVA_Build 3 48382484 2I ACGGTTGCAC --/AA AAGAGTGAAA 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 A 2 4 161932 CASAVA_Build 3 48387269 1D GTAGCACCCC G/- CCACCACCAC 1489 het 1489 ref 19 11 5 3 G 1 0 161933 CASAVA_Build 3 48387676 2D TTATGTTTGC CT/-- CTTTCTCATC 3070 het 3070 ref 19 10 8 4 CT 2 1 161934 CASAVA_Build 3 48393382 1D TATTTTTCCA T/- TTTCACCTTT 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 T 4 3 161935 CASAVA_Build 3 48398955 1I AAAACAGGGG -/T TTTTTTTTTT 2151 het 2151 ref 21 11 7 3 T 11 12 161936 CASAVA_Build 3 48408503 1D CTTTTGTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 10 9 161937 CASAVA_Build 3 48413883 1I CTAATTTTTG -/T TGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 1 2 161938 CASAVA_Build 3 48415241 4D TATACATCAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 753 hom 27 5 13 9 AC 13 11 161939 CASAVA_Build 3 48425711 1D CCTCACCCAT C/- CCCCCCGTGT 3070 het 2167 hom 26 9 13 4 C 7 6 161940 CASAVA_Build 3 48448019 1D CTGTGGGAGA C/- CCCCCCCCTC 3070 het 2945 hom 29 12 11 6 C 9 8 161941 CASAVA_Build 3 48457900 1D CCTGGCCAAC T/- TTTTTTTTTT 2449 het 1581 hom 16 5 7 4 T 15 14 161942 CASAVA_Build 3 48458447 1I CTAGGAGTTC -/A CATCATCAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 0 1 161943 CASAVA_Build 3 48461596 4I AAAAAAAAAA ----/AATT AATTCAGAAG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AATT 1 2 161944 CASAVA_Build 3 48472844 1D CTAGAAAGAA T/- AAAAAGTTAG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 1 0 161945 CASAVA_Build 3 48487823 8D CGTCTCTACT AAAAATAC/-------- AAAAATTAGC 1885 het 1832 hom 12 5 6 1 AAAAATAC 1 0 161946 CASAVA_Build 3 48500653 1D GAAAACCAGT A/- AAAGCTGAGG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 4 3 161947 CASAVA_Build 3 48510325 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1681 hom 17 6 9 3 A 13 12 161948 CASAVA_Build 3 48543871 4D GAAGCAGAAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1478 het 1478 ref 14 7 5 2 T 18 14 161949 CASAVA_Build 3 48577528 3I GACCCCGCTG ---/GGC GCAGCCCCCC 3070 hom 65 het 24 0 16 8 GGC 0 1 161950 CASAVA_Build 3 48678593 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2157 het 769 hom 8 2 6 0 T 11 10 161951 CASAVA_Build 3 48684763 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 506 het 506 ref 20 14 2 4 A 13 12 161952 CASAVA_Build 3 48699604 13I AGCAGTCCTC -------------/CCACCTTGGCCTT CCAGTGTTGG 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 CCACCTTGGCCTT 0 1 161953 CASAVA_Build 3 48718496 1I5M7D TACAAAAAAT -TAGCCGTGCATG/ATAGCC------- GTGGTGGGCG 1850 het 1850 ref 9 5 5 1 N/A 0 0 161954 CASAVA_Build 3 48744412 4D AGACTATCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 TC 8 6 161955 CASAVA_Build 3 48813116 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2828 hom 21 8 7 6 T 10 9 161956 CASAVA_Build 3 48822662 4D GAGAAATAAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 10 13 12 TG 7 5 161957 CASAVA_Build 3 48835162 1D CAGGATGTTG T/- TTTTTTTTTT 1217 het 1217 ref 34 11 5 18 T 17 16 161958 CASAVA_Build 3 48842244 2D GTATATATAC AT/-- ATATATGTAT 3070 het 1133 hom 13 4 8 1 AT 4 3 161959 CASAVA_Build 3 48844077 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTG 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 AG 2 1 161960 CASAVA_Build 3 48852163 2D CTTGCTATAT AC/-- AGTTATTACA 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AC 1 0 161961 CASAVA_Build 3 48858384 1D TCCTGACTTT A/- AAAAAAAAAA 1130 het 1130 ref 40 26 3 11 A 13 12 161962 CASAVA_Build 3 48858657 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1845 het 1845 ref 26 8 7 11 T 15 14 161963 CASAVA_Build 3 48879128 28I ACAGGTTCCC ----------------------------/ACTCTGTTGCTCAGGCTCAAGTACAGTG GATGATCTCT 3070 het 3070 ref 26 11 10 6 ACTCTGTTGCTCAGGCTCAAGTACAGTG 0 1 161964 CASAVA_Build 3 48907482 2I AGTTTCACTC --/TT GTCGCCCAGG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 T 0 2 161965 CASAVA_Build 3 48937856 1D AGCTGATTTC T/- TTTTTTTTTT 2360 het 1113 hom 15 3 6 6 T 15 14 161966 CASAVA_Build 3 48959513 2D AAGTGATGTT GG/-- TAAGGAGCTG 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 G 2 0 161967 CASAVA_Build 3 48961551 8D TATGTTTAAC ATTTATTT/-------- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 36 13 12 12 ATTT 5 3 161968 CASAVA_Build 3 48978401 1I CCATCAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3024 het 3024 ref 30 17 9 4 A 10 11 161969 CASAVA_Build 3 48981929 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 30 21 3 6 T 12 11 161970 CASAVA_Build 3 48982629 4I GCGCCCGGCC ----/TTAT TTGTTATTTT 1737 het 1737 ref 12 5 4 3 TTAT 0 1 161971 CASAVA_Build 3 48984877 1D GTCAGGAGTT C/- CAAGACTAGC 2184 het 2184 ref 33 22 8 3 C 2 1 161972 CASAVA_Build 3 49005739 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2186 het 620 hom 21 4 7 10 A 18 17 161973 CASAVA_Build 3 49015740 10D GGCCGTGACC TGTGGCTGGA/---------- TGGCTGCCAC 3070 het 3070 ref 45 26 12 11 TGTGGCTGGA 1 0 161974 CASAVA_Build 3 49082476 1D TGTCACCAAA T/- TTTTTTTTTT 1122 het 1122 ref 33 20 3 10 T 15 14 161975 CASAVA_Build 3 49157326 1I GAGCCTGCCT -/G GGTGGAACTC 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 G 2 3 161976 CASAVA_Build 3 49164035 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 2829 het 2829 ref 34 18 10 7 A 9 8 161977 CASAVA_Build 3 49171673 1I ATGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 10 11 161978 CASAVA_Build 3 49248367 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1305 het 599 hom 17 2 8 7 A 17 18 161979 CASAVA_Build 3 49251729 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1135 het 1135 ref 14 8 4 2 T 11 10 161980 CASAVA_Build 3 49290580 1D AACGGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1774 hom 26 6 12 9 T 13 12 161981 CASAVA_Build 3 49290593 1D TTTTTTTTTT G/- TTTCCTTCTG 3070 het 1829 hom 28 9 12 7 G 1 0 161982 CASAVA_Build 3 49323614 1D AAAGGATCAC G/- GCCATCCACA 3070 het 3070 ref 50 23 17 10 G 2 1 161983 CASAVA_Build 3 49335225 1I GAACCCGGGA -/G GTGGGGGTGC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 G 1 2 161984 CASAVA_Build 3 49361318 11D CCAAAAAAAA AAAAGAAAAAG/----------- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 12 5 AAAAGAAAAAG 2 1 161985 CASAVA_Build 3 49379780 10D ACTCCCTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 2333 het 424 hom 15 2 9 4 A 24 14 161986 CASAVA_Build 3 49393378 2I CGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 41 22 9 10 TA 5 6 161987 CASAVA_Build 3 49398146 1D CTTTCTATAG T/- TTTAAGTCTT 3070 het 3070 ref 33 22 8 3 T 4 3 161988 CASAVA_Build 3 49398680 2D TCATCTTTCA TT/-- TTTTTACTTC 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 T 7 5 161989 CASAVA_Build 3 49408206 1I AGTGATTGAG -/T TGGTTAACTG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 1 2 161990 CASAVA_Build 3 49410641 9I CTACTAAAGT ---------/AGCCAAGTG AGCCAAGTGT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 AGCCAAGTG 1 2 161991 CASAVA_Build 3 49411807 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2260 het 1491 hom 14 5 5 4 A 13 14 161992 CASAVA_Build 3 49416751 3I CCAAAAAAAA ---/AAG GCCAGGCGCA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 AAG 0 1 161993 CASAVA_Build 3 49420603 2D CTCAAAAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 21 0 10 11 A 13 11 161994 CASAVA_Build 3 49421102 4I GAGCCCCATG ----/TATA TATAGCAAGG 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 TA 2 4 161995 CASAVA_Build 3 49421233 1D CTTAAGATCC T/- TTTTTTTTTT 2614 het 1395 hom 22 5 11 6 T 15 14 161996 CASAVA_Build 3 49442021 1D GCCCTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 11 1 9 2 T 13 12 161997 CASAVA_Build 3 49453173 1D TTTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 A 11 10 161998 CASAVA_Build 3 49453993 1D TAATCCCAGC T/- ACTTGGGAGG 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 T 1 0 161999 CASAVA_Build 3 49454105 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1714 het 46 hom 10 1 6 3 A 13 14 162000 CASAVA_Build 3 49456443 5D ACTAGCACTA GGACT/----- GCAGGCTCAG 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 GGACT 1 0 162001 CASAVA_Build 3 49480805 1D TAGCCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 1391 het 1391 ref 32 13 4 15 T 12 11 162002 CASAVA_Build 3 49496123 1I GTTTTCTTTG -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 98 het 38 0 33 5 T 6 7 162003 CASAVA_Build 3 49498095 12D GTTTTCTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 15 14 T 22 10 162004 CASAVA_Build 3 49502803 1I AAAAAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 2479 het 2091 hom 23 9 12 2 T 12 13 162005 CASAVA_Build 3 49506786 1D CTTTATTACA G/- GGGCTGCTGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 4 3 162006 CASAVA_Build 3 49522175 1I TATTTTATTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2372 hom 29 6 16 7 T 9 10 162007 CASAVA_Build 3 49535548 1D TTCTGCCCTT C/- CTGGCCTGGC 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 C 2 1 162008 CASAVA_Build 3 49539321 3D TGTTACATAA TAT/--- TAACATGTTT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 TAT 1 0 162009 CASAVA_Build 3 49550142 5D CATTTCTCTA TTTCT/----- TTTCTTTTCT 2322 het 2030 hom 24 9 9 6 TTTCT 3 2 162010 CASAVA_Build 3 49552051 2D CGATTATCCT AG/-- AGTCTCAGTT 3008 het 3008 ref 27 15 11 2 AG 2 1 162011 CASAVA_Build 3 49557128 1I CTTTGTTCCC -/A AATATACCAT 3070 het 3070 hom 54 20 26 8 A 2 3 162012 CASAVA_Build 3 49561974 1I TGTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 818 het 818 ref 45 35 2 9 T 10 11 162013 CASAVA_Build 3 49586665 1D TCAGCCTCCC A/- AAGTTTTGGG 3070 het 1167 hom 20 4 14 2 A 3 2 162014 CASAVA_Build 3 49591058 1I GTTAGCCATG -/A TGGTCTCAAT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 0 1 162015 CASAVA_Build 3 49592207 1D26M30D GTCTGTTAAA TTTTTTTAAGCATAAAAAGGTATTGAATTGGAAAAGGTATGAAATGCTTTCTGCATC/-TTTTTTAAGCATAAAAAGGTATTGAA------------------------------ TATCAAGATG 3070 het 1383 hom 21 5 17 6 N/A 0 0 162016 CASAVA_Build 3 49596723 1I GGCTTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 845 hom 32 2 21 9 T 10 11 162017 CASAVA_Build 3 49597637 1I TTTTTAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 21 1 18 2 T 10 11 162018 CASAVA_Build 3 49613089 5D AAAATAAAAA AAATT/----- AGTCGGTTGT 3070 het 3070 hom 40 15 19 8 AAATT 1 0 162019 CASAVA_Build 3 49631535 4D TGTGAATTCC TGAA/---- TGAATGAATG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TGAA 4 3 162020 CASAVA_Build 3 49632421 1D CACACAGAAC T/- GGCAGTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 1 0 162021 CASAVA_Build 3 49652482 2I CTGGAGCCAC --/AT GTGTGGGTAA 3070 hom 69 het 27 0 21 6 AT 0 1 162022 CASAVA_Build 3 49697910 1I CTCCTAACCT -/G GGGGGGTCCA 3059 het 3059 ref 50 31 9 10 G 6 7 162023 CASAVA_Build 3 49697986 2I CCAGCCTTTG --/GT GGTGGGGGCT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 GT 0 1 162024 CASAVA_Build 3 49698116 1D CCCATCTGGG T/- TCCGGCAGAA 2515 het 2515 ref 43 24 8 12 T 2 1 162025 CASAVA_Build 3 49700437 1D AAAGCTACAA G/- GCTTCTGGGA 3070 het 3070 ref 34 15 11 10 G 2 1 162026 CASAVA_Build 3 49707695 1D11M3I ACATGCCACA GCACCCAGCTAA---/-CACCCAGCTAAATT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 32 11 2 N/A 0 0 162027 CASAVA_Build 3 49732597 3I TACTAAAAAT ---/ACA ACAACAATTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 ACA 2 3 162028 CASAVA_Build 3 49758186 7I CAGCTACTTG -------/GGAGGCT GGAGGCTGAG 2899 hom 18 het 7 0 7 0 GGAGGCT 1 2 162029 CASAVA_Build 3 49766642 1D CACTTTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 13 12 162030 CASAVA_Build 3 49766813 1D ATCTTGTCTC A/- GGGGAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 21 9 A 1 0 162031 CASAVA_Build 3 49769352 1I TAAGAAGCCA -/C CTGGATTACC 3070 hom 108 het 37 0 36 1 C 1 2 162032 CASAVA_Build 3 49771396 1D AAAAAAAAAA T/- ACCCAACAGT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 1 0 162033 CASAVA_Build 3 49771514 1D ATAAACAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 10 9 162034 CASAVA_Build 3 49800483 4I CAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGGGAGGT 3070 het 2182 hom 30 9 12 9 AAAG 1 2 162035 CASAVA_Build 3 49829338 1D TTTTTAGAGC T/- TTTTTTTTTT 1413 het 1413 ref 29 10 5 14 T 17 16 162036 CASAVA_Build 3 49838932 1D AAATTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 1212 het 1212 ref 24 16 4 4 A 13 12 162037 CASAVA_Build 3 49862936 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1341 het 1341 ref 23 17 3 4 A 13 12 162038 CASAVA_Build 3 49876534 1I TGTTTACTAA -/T TTTTCTGTGC 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 4 5 162039 CASAVA_Build 3 49901039 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 968 hom 26 3 13 10 A 17 18 162040 CASAVA_Build 3 49947420 7D CATCAGTAAA GGCCTAG/------- GGCCTAGTTT 2430 het 2430 ref 17 10 6 2 GGCCTAG 2 1 162041 CASAVA_Build 3 49965502 1I TCTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1549 hom 26 5 11 10 T 9 10 162042 CASAVA_Build 3 49967783 1D AATTTTCGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 22 14 7 1 T 7 6 162043 CASAVA_Build 3 49995896 1I CAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 10 11 162044 CASAVA_Build 3 50001393 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 10 13 9 A 9 8 162045 CASAVA_Build 3 50007704 1D TCATTTGCCT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2901 hom 25 8 13 4 A 9 8 162046 CASAVA_Build 3 50016744 4D TTTCTCCCCT CCCC/---- CCCCTCCCCT 184 het 184 ref 26 16 2 9 C 8 4 162047 CASAVA_Build 3 50022139 1D GGACTACAGG T/- GTGCGCCACC 3070 het 2456 hom 25 8 9 8 T 1 0 162048 CASAVA_Build 3 50024277 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 T 13 12 162049 CASAVA_Build 3 50028942 1D CTCGTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 T 13 12 162050 CASAVA_Build 3 50040502 1D TTTGTACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 14 15 T 13 12 162051 CASAVA_Build 3 50051540 1D AGGAAAGAGG A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 7 6 162052 CASAVA_Build 3 50055925 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1322 het 1322 ref 14 7 5 2 A 12 13 162053 CASAVA_Build 3 50062270 4I GCTATCAACA ----/CTAT CTACTTCCTA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 CTAT 0 1 162054 CASAVA_Build 3 50073029 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2005 het 747 hom 10 3 6 1 A 13 11 162055 CASAVA_Build 3 50075330 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1430 het 1018 hom 28 8 7 13 T 17 16 162056 CASAVA_Build 3 50083953 4I GAAGGTGATG ----/AGTC AGTCTAGAAA 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 AGTC 1 2 162057 CASAVA_Build 3 50086284 1D CCATGCAGCC T/- TTTTTTTTTT 679 het 679 ref 26 12 2 12 T 12 11 162058 CASAVA_Build 3 50091517 1I AGGGAGAAAT -/A ACGGTATGCT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 A 1 2 162059 CASAVA_Build 3 50104379 1I CTATTTGGAT -/A TATCTTATAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 0 1 162060 CASAVA_Build 3 50108762 1D GCATCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 183 hom 28 3 15 11 A 15 14 162061 CASAVA_Build 3 50109120 1D TCCAACTTTT G/- GGGCTCAGGC 3070 hom 65 het 24 0 22 2 G 4 3 162062 CASAVA_Build 3 50113585 4D CTGTCTAATC TAGT/---- TAGAGTGGCA 3070 het 3070 hom 46 17 27 7 TAGT 1 0 162063 CASAVA_Build 3 50151264 1I TGAGGGGGGA -/G GGGGGAGACA 1487 het 50 hom 9 1 5 3 G 5 6 162064 CASAVA_Build 3 50217806 1D GGGAGTTCAT C/- CCACCCGCAC 2004 hom 26 het 15 0 6 9 C 3 2 162065 CASAVA_Build 3 50226838 1I TGTGCCTACA -/G GGTCGAGGAC 3070 hom 128 het 47 0 41 6 G 2 3 162066 CASAVA_Build 3 50236051 3I GGTTAGAAGA ---/TGC TGCTCAGTAC 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 TGC 1 2 162067 CASAVA_Build 3 50275702 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGGAGGATAA 3070 hom 110 het 38 0 35 4 AGG 3 2 162068 CASAVA_Build 3 50281757 1I CCGCCCCCAG -/C CCCCCACGCC 1995 hom 31 het 15 0 8 7 C 5 6 162069 CASAVA_Build 3 50395322 1D ACCCCACACG C/- GCTTACCCAT 3070 het 2373 hom 22 8 10 4 C 1 0 162070 CASAVA_Build 3 50418892 1D AGCCCTATCA C/- CCCCATCACC 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 C 5 4 162071 CASAVA_Build 3 50448614 2I TCATTCTGGG --/GT GTGTGTGGCC 3070 hom 152 het 60 0 47 13 GT 3 4 162072 CASAVA_Build 3 50463072 1D GCCTCCAATC T/- TCTTTTATTT 3070 hom 88 het 32 0 26 6 T 2 1 162073 CASAVA_Build 3 50602980 2I GACAGCAAGA --/CT CTGTTTCAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 CT 1 2 162074 CASAVA_Build 3 50623565 1I ACCATCAGGT -/G GCCAGCCTGA 3070 hom 86 het 32 0 25 7 G 1 2 162075 CASAVA_Build 3 50638516 1I TCCCCCGCCA -/C CCCCCCCATG 3070 hom 76 het 32 0 25 7 C 7 8 162076 CASAVA_Build 3 50645527 7I GCCATGGTGA -------/TGGGGTC CCAGTGGGAG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 TGGGGTC 0 1 162077 CASAVA_Build 3 50663714 2I CTGCACTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 23 11 T 11 13 162078 CASAVA_Build 3 50668550 1D GAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 24 7 A 12 11 162079 CASAVA_Build 3 50682373 1D ATAATTATTT C/- CCCCCAAGGG 3070 hom 78 het 31 0 26 6 C 6 5 162080 CASAVA_Build 3 50691244 1D GCCTGCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 22 0 20 2 T 11 10 162081 CASAVA_Build 3 50713109 2I ATCTTTATCC --/AT ATATCCATTG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AT 2 3 162082 CASAVA_Build 3 50716275 1I TCATCTGTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 8 162083 CASAVA_Build 3 50731704 1I AGATATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 32 1 25 6 T 12 13 162084 CASAVA_Build 3 50737427 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 841 hom 36 2 26 8 A 15 14 162085 CASAVA_Build 3 50741164 2I ATAAATAGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 12 14 162086 CASAVA_Build 3 50741347 1D TAGTGGAGAT G/- GGGGTTTCAC 2900 hom 18 het 7 0 7 0 G 5 4 162087 CASAVA_Build 3 50744035 5D CACCATTAAC AAAAT/----- AAAAGAGAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 3 AAAAT 1 0 162088 CASAVA_Build 3 50744474 1D TAATGTATTT A/- AAAAAAAAAA 1445 het 1445 ref 36 22 5 9 A 13 12 162089 CASAVA_Build 3 50746197 1D26M1I CTTTTGTTAA TTTTTTTTTAACTGTTTTGTTGTTCTA-/-TTTTTTTTAACTGTTTTGTTGTTCTAT TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 39 0 41 2 N/A 0 0 162090 CASAVA_Build 3 50753715 2D TTTTATTTTA TT/-- TTATTATTAT 3070 hom 36 het 16 0 13 4 T 4 2 162091 CASAVA_Build 3 50762675 2I GGGTCCATGG --/AA AAAAATGTCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 5 7 162092 CASAVA_Build 3 50767431 1D ATTAAAAATA T/- CAAAATTGCA 3070 het 3070 hom 41 12 26 3 T 1 0 162093 CASAVA_Build 3 50780351 4I TTTGGCTCTC ----/TGTT TGTCCGTTAT 1102 hom 10 het 5 0 4 2 TGTT 0 1 162094 CASAVA_Build 3 50781511 2D ATTAATTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 630 hom 22 2 8 14 T 14 12 162095 CASAVA_Build 3 50788287 3I TGCTTTCCCA ---/TTC TTGAGTTTCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTC 0 1 162096 CASAVA_Build 3 50802909 1I TATTTAGAGC -/T TTTTTTTTTT 1320 het 1320 ref 33 14 4 15 T 15 16 162097 CASAVA_Build 3 50803393 1D CTTTTTAATG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 8 162098 CASAVA_Build 3 50804558 1I TCATCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 2633 het 2633 ref 30 12 8 10 T 14 15 162099 CASAVA_Build 3 50806180 1D CCTTCTGTGC A/- ACCTCTGATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 2 1 162100 CASAVA_Build 3 50809195 1D GACCTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 2713 het 2713 ref 39 25 7 7 T 12 11 162101 CASAVA_Build 3 50819685 12D TGCCACGCTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 34 1 21 14 T 23 11 162102 CASAVA_Build 3 50823662 1I CTGTCTCTAT -/A AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 21 10 7 4 A 6 7 162103 CASAVA_Build 3 50826869 1D GCCAGACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 20 7 T 12 11 162104 CASAVA_Build 3 50831457 1D ATATTATTTG T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 50 22 22 7 T 6 5 162105 CASAVA_Build 3 50838394 1I GTTCTTCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 T 11 12 162106 CASAVA_Build 3 50851992 3D GTAGTATCTC ATT/--- GTTGTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 13 11 4 ATT 1 0 162107 CASAVA_Build 3 50860498 1I TTCTTTGTCC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 7 8 162108 CASAVA_Build 3 50875337 2D AAGCACAAAC AA/-- CACAAACAAC 3070 het 3070 ref 36 14 16 6 A 2 0 162109 CASAVA_Build 3 50880057 1I TAGTTACCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 611 hom 35 3 22 10 T 14 15 162110 CASAVA_Build 3 50882162 2D TGATTTGCTC TT/-- GCTTTGCTAG 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 T 2 0 162111 CASAVA_Build 3 50888307 1D TTTTTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 A 13 12 162112 CASAVA_Build 3 50892215 1D TCAGCTCTGC T/- ACCAAGTGGA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 T 1 0 162113 CASAVA_Build 3 50896765 3D TGGTCTTGAA CTC/--- CTGACCTCAG 2680 het 2680 ref 24 13 6 6 CTC 1 0 162114 CASAVA_Build 3 50906296 1D TACTTCTGAA T/- TTTATAATAA 3070 het 3070 hom 49 21 25 4 T 4 3 162115 CASAVA_Build 3 50913912 1D TCTGGCTTCA C/- CCCCCTTTCT 3070 hom 77 het 30 0 24 6 C 6 5 162116 CASAVA_Build 3 50921418 1I TTATCATTAT -/A GTAATGCCCT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 0 1 162117 CASAVA_Build 3 50923454 1I CATTTGTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 T 9 10 162118 CASAVA_Build 3 50925182 8D GCCACTGCTG CCACAGGC/-------- CCACAGGCCC 1167 het 1167 ref 38 24 5 10 CCACAGGC 2 1 162119 CASAVA_Build 3 50962578 1D TTCTATTTGG T/- TATTTTTCAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 2 1 162120 CASAVA_Build 3 50964263 1I GCTAAGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 23 25 5 A 10 11 162121 CASAVA_Build 3 50974471 1D CATGAACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 39 2 30 7 T 11 10 162122 CASAVA_Build 3 50975183 2D GCTAGGACTC TT/-- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 6 4 162123 CASAVA_Build 3 50977669 4D GTTTATAATG TACA/---- TACATCTGAA 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 TACA 2 1 162124 CASAVA_Build 3 50978502 1D CTAAGAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1193 hom 38 3 25 11 T 13 12 162125 CASAVA_Build 3 50983451 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTATT 909 hom 7 het 4 0 2 2 A 0 1 162126 CASAVA_Build 3 50984172 4D GATAAAGGAC TTTA/---- TTTACCAGAA 3070 het 3070 ref 41 20 19 6 TTTA 2 1 162127 CASAVA_Build 3 50985360 1D GCTTTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 19 22 8 T 13 12 162128 CASAVA_Build 3 51018724 1I CCAATCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 41 1 30 10 T 12 13 162129 CASAVA_Build 3 51018779 4D GTTATTCAGC TTAA/---- TTATCTTTTC 2253 het 2253 ref 36 12 6 19 TTAA 1 0 162130 CASAVA_Build 3 51027026 1D CTTCATAATC T/- CTTAAATATA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 1 0 162131 CASAVA_Build 3 51030913 1I CACAAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 35 1 28 6 T 12 13 162132 CASAVA_Build 3 51032195 3I GTGAGAACAT ---/GTG GTGTTTGGTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GTG 1 2 162133 CASAVA_Build 3 51032745 1D TCTCCTTTTG A/- GAAGTATCTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 1 0 162134 CASAVA_Build 3 51040344 1D TTGGATCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 130 het 47 0 43 4 T 10 9 162135 CASAVA_Build 3 51052683 1D AATGTGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 24 1 20 3 T 13 12 162136 CASAVA_Build 3 51059741 1I GGTTGGGGGA -/G GGGGGAGGGA 2473 hom 20 het 8 0 7 1 G 5 6 162137 CASAVA_Build 3 51059935 1D AAAACAATAG A/- AAAAAATCAA 3070 hom 21 het 9 0 8 2 A 7 6 162138 CASAVA_Build 3 51060657 1D CTTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 12 11 162139 CASAVA_Build 3 51061797 8D ACCGTGTCTC AGAAAGAA/-------- AGAAAGAAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 5 AGAA 7 5 162140 CASAVA_Build 3 51068229 1I ATCTCTAATA -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 40 23 9 8 T 6 7 162141 CASAVA_Build 3 51071284 1I TTTGGGCCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 8 9 162142 CASAVA_Build 3 51085791 3I AATTATCTTT ---/ATA ATGTCAGTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATA 0 1 162143 CASAVA_Build 3 51090539 18D AAAGAGAGAG ACAGAGAGAGAGAAAGAA/------------------ ACAGAGAGAG 3070 hom 81 het 30 0 28 4 ACAGAGAGAGAGAAAGAA 1 0 162144 CASAVA_Build 3 51106895 1I AATTTATCCA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 47 het 24 0 16 8 T 6 7 162145 CASAVA_Build 3 51112520 4I AAAACTAGAT ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 AAAG 4 5 162146 CASAVA_Build 3 51125493 6D GATTTGAGAT TATATC/------ TATAATATTC 3070 het 3070 ref 34 19 13 4 TATATC 1 0 162147 CASAVA_Build 3 51126582 1D CCTGTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 29 1 23 6 A 12 11 162148 CASAVA_Build 3 51149513 1D TAAATTAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2240 hom 19 5 12 3 A 10 9 162149 CASAVA_Build 3 51155731 2D TTGTTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 320 het 320 ref 24 3 4 17 T 12 10 162150 CASAVA_Build 3 51157699 6D GGATCTCTTT TTATTA/------ TTATTATTAT 3070 het 1922 hom 25 5 14 6 TTA 6 4 162151 CASAVA_Build 3 51169631 4I CAATTTATGT ----/TTAA TTATTTTGTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTAA 0 1 162152 CASAVA_Build 3 51170419 1D TGGGACTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 11 10 162153 CASAVA_Build 3 51182764 1D CTTCACTTCA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 T 9 8 162154 CASAVA_Build 3 51190480 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 778 het 778 ref 24 7 4 13 A 9 10 162155 CASAVA_Build 3 51201292 5D GTGTATCACA TTTTC/----- TTTTCTTATC 3070 hom 84 het 30 0 29 5 TTTTC 2 1 162156 CASAVA_Build 3 51208574 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 39 2 29 8 T 15 14 162157 CASAVA_Build 3 51212912 9I GTGATGGAAG ---------/ATGAAATGA ATGAAATGAA 1453 hom 7 het 5 0 3 2 ATGAAATGA 1 2 162158 CASAVA_Build 3 51229626 1I TTTGGAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 41 2 25 14 T 11 12 162159 CASAVA_Build 3 51237208 1D CGTTTTACTA T/- TTTTTTTTTT 2027 het 2027 ref 38 26 8 4 T 11 10 162160 CASAVA_Build 3 51243410 1D GGTAGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 T 11 10 162161 CASAVA_Build 3 51249943 1I CTGATGGCTT -/A ACTCTCCATA 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 A 1 2 162162 CASAVA_Build 3 51274942 1D AAACCAGTGC A/- AAAAGGCTGA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 5 4 162163 CASAVA_Build 3 51293746 20D ATGAGCTAAA ATATATATATATATATATAT/-------------------- ATATATATAT 3070 het 7 hom 22 1 19 7 AT 16 6 162164 CASAVA_Build 3 51294817 4D ATCAAGTTAA TAAT/---- TTAAGATTTC 3070 het 3070 hom 39 16 19 8 TAAT 1 0 162165 CASAVA_Build 3 51304548 4D AATTACATAT AGAA/---- AGAATGTTCT 3070 het 3070 hom 34 12 17 9 AGAA 2 1 162166 CASAVA_Build 3 51305326 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 T 6 7 162167 CASAVA_Build 3 51320272 1D TTCCTTATAA T/- TTTTTTTTTT 830 het 830 ref 26 18 3 5 T 12 11 162168 CASAVA_Build 3 51332335 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 9 10 162169 CASAVA_Build 3 51335422 8I TAGAGGCATG --------/GAGGAATA CTTACCAAGC 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 GAGGAATA 0 1 162170 CASAVA_Build 3 51346325 1D GGAATAAGAA T/- TTTTTTTTTT 2140 het 2140 ref 40 24 5 11 T 15 14 162171 CASAVA_Build 3 51368747 2I CTAGGAAAAC --/AG GGGCAGTACA 3070 hom 120 het 50 0 39 11 AG 0 1 162172 CASAVA_Build 3 51473321 4I ATTATATATA ----/TAAT TAATACAATA 2308 het 1871 hom 11 4 7 0 TAAT 1 2 162173 CASAVA_Build 3 51491666 1I ACTAAAAATA -/C CAAAAATTAG 2339 het 256 hom 10 1 6 3 C 1 2 162174 CASAVA_Build 3 51557115 1D ACTCGGTTAA T/- TTTTTTGTAT 1776 het 394 hom 10 2 4 5 T 7 6 162175 CASAVA_Build 3 51565641 1I TCTATCTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 9 10 162176 CASAVA_Build 3 51566237 15D TGTTGTTGGC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2228 hom 23 10 10 4 T 27 12 162177 CASAVA_Build 3 51582506 1I AATCTATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 12 13 162178 CASAVA_Build 3 51591444 3D ATTTTTTTCC TCT/--- TCTTATCACC 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 TCT 2 1 162179 CASAVA_Build 3 51619031 1D GATTTGGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 14 0 10 4 A 12 11 162180 CASAVA_Build 3 51664264 1D GTCTTAAGGG T/- TTTTTTTTTT 2747 het 2747 ref 31 15 9 7 T 11 10 162181 CASAVA_Build 3 51732717 1D AGGTTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 836 hom 28 5 12 11 T 13 12 162182 CASAVA_Build 3 51743587 1D TATTTCCCTA G/- CCCCCAGTTG 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 G 1 0 162183 CASAVA_Build 3 51824082 4I AAAAAAAAAT ----/CGAC AGCTGGAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 CGAC 0 1 162184 CASAVA_Build 3 51824400 1I ACAATACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 A 13 14 162185 CASAVA_Build 3 51837394 1D TATTTTGAGG T/- TATGTCCCTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 2 1 162186 CASAVA_Build 3 51841076 3I GGTCTCTGAT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 110 het 52 0 37 15 TTG 5 6 162187 CASAVA_Build 3 51842610 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2620 het 2620 ref 26 11 8 9 TTTC 4 3 162188 CASAVA_Build 3 51845351 1I CTTTTAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 24 7 10 7 A 8 9 162189 CASAVA_Build 3 51856985 3D CAGCAAACTG GAA/--- GAAGTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 GAA 2 1 162190 CASAVA_Build 3 51858721 1I GATATATTAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 8 9 162191 CASAVA_Build 3 51859635 1D TGAAGTCAGC T/- AAGACCAAGA 3070 het 3070 ref 41 26 11 5 T 1 0 162192 CASAVA_Build 3 51868717 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 2628 het 2180 hom 22 8 9 5 A 15 16 162193 CASAVA_Build 3 51873352 5I GAGTTGAATT -----/TTTTA TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 39 10 24 5 TTTTA 2 3 162194 CASAVA_Build 3 51878411 1I CACAGCAGCA -/T TAAGAACAGA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 1 2 162195 CASAVA_Build 3 51880870 2D GCCAGGTGAC AG/-- AGAGTGACTC 3070 het 1486 hom 14 3 7 5 AG 3 2 162196 CASAVA_Build 3 51883792 1I GCCCCTTGGT -/C CCTGCATTCC 3070 het 3070 ref 51 25 16 10 C 2 3 162197 CASAVA_Build 3 51886499 1D ACTTGTCCCC A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 43 17 25 1 A 7 6 162198 CASAVA_Build 3 51886968 27D TGAGCCTCCT GGAGCTGGGGTAAGGCATGCAGCACAG/--------------------------- GGAGCAAGAC 3070 het 3070 ref 31 19 13 7 GGAGCTGGGGTAAGGCATGCAGCACAG 1 0 162199 CASAVA_Build 3 51892753 4D AAGAATATTC TCAA/---- TCAAAGTCAT 3070 het 3070 hom 33 14 17 5 TCAA 2 1 162200 CASAVA_Build 3 51894499 4D AATCATTTTG AATT/---- AATTTTTATA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 AATT 2 1 162201 CASAVA_Build 3 51904401 1D GGCTTTCAAG A/- AAAAAAGAGG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 7 6 162202 CASAVA_Build 3 51906239 2D CACCCCATCA CT/-- CTCTTTAAAT 3070 hom 53 het 23 0 17 8 CT 3 2 162203 CASAVA_Build 3 51907313 2D AGAGGGAGTC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 54 hom 28 1 19 8 AG 10 9 162204 CASAVA_Build 3 51921740 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1353 het 63 hom 11 1 4 6 A 19 18 162205 CASAVA_Build 3 51923672 1D ATATAAAAGC T/- GAGATAATTT 3070 hom 84 het 32 0 28 7 T 1 0 162206 CASAVA_Build 3 51924239 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 2245 het 2245 ref 21 9 8 6 AG 1 0 162207 CASAVA_Build 3 51927844 1I CAATTAAAAG -/A GAGGTATTAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 162208 CASAVA_Build 3 51932782 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 1035 hom 14 5 9 0 A 7 8 162209 CASAVA_Build 3 51934406 2D GGATAATTGG AC/-- ATCTATCAGA 3070 het 3070 ref 32 21 9 4 AC 1 0 162210 CASAVA_Build 3 52045683 1I CAGAGCTTGC -/T TTTTTTTTTT 2211 het 1522 hom 27 5 13 9 T 15 16 162211 CASAVA_Build 3 52058034 2D TTGGTTCGGG AT/-- ATATATATAT 2092 het 2092 ref 39 30 5 5 AT 7 6 162212 CASAVA_Build 3 52110452 1D AGGCAGGGAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 99 het 41 0 34 8 A 9 8 162213 CASAVA_Build 3 52128061 1D AGGCAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 1049 het 1049 ref 44 33 4 7 T 12 11 162214 CASAVA_Build 3 52129308 2D AACTTTGTGT TA/-- TATATATATA 3070 hom 141 het 57 0 48 9 TA 6 5 162215 CASAVA_Build 3 52178349 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1090 het 1090 ref 26 15 3 8 A 17 16 162216 CASAVA_Build 3 52250857 1I TTGTAGAATC -/T TGGAGTGGAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 2 162217 CASAVA_Build 3 52264329 1I GAACATGGTG -/C CTCAGTTTTG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 1 2 162218 CASAVA_Build 3 52280152 1I AAGCTTTGAG -/A AAAAAATACA 3070 hom 146 het 53 0 49 4 A 6 7 162219 CASAVA_Build 3 52290549 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTGTATTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 4 5 162220 CASAVA_Build 3 52426082 1D AGTTTATCCA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 T 7 6 162221 CASAVA_Build 3 52463786 2D CAGCTGCTCT CA/-- GTTATTCAAC 3070 hom 114 het 41 0 38 4 CA 1 0 162222 CASAVA_Build 3 52464087 2I CTCGAGCACT --/GG ACTGCGTGCT 3070 hom 75 het 26 0 25 1 G 0 2 162223 CASAVA_Build 3 52477141 1I CATGGTGAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 3 4 162224 CASAVA_Build 3 52480799 2I GACAGAAAAG --/AT GTGGAAATCC 3070 hom 78 het 31 0 23 8 AT 0 1 162225 CASAVA_Build 3 52528666 4D ACATGCACGT GTAA/---- GTGTGTGCAA 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 GTAA 1 0 162226 CASAVA_Build 3 52535110 4I AGACTCCTAG ----/TGAC TGACTGACAG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 TGAC 2 3 162227 CASAVA_Build 3 52559472 3I TAGAAGGAAT ---/CTC CTTACCTGCC 3070 het 3000 hom 28 10 15 3 CTC 0 1 162228 CASAVA_Build 3 52566678 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 30 13 9 T 11 12 162229 CASAVA_Build 3 52589941 3D AACAGACATC ATT/--- ATTACTGTTG 3070 het 3070 ref 32 15 16 4 ATT 2 1 162230 CASAVA_Build 3 52596863 3I CAGCTACAGT ---/TTC TTAATATAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TTC 0 1 162231 CASAVA_Build 3 52649242 15D TGTAGCTACT CTGGTTATTATTCGC/--------------- CTGGTTATTA 2874 het 2874 ref 25 15 7 9 CTGGTTATTATTCGC 2 1 162232 CASAVA_Build 3 52651106 1D TTATTACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 17 12 A 13 12 162233 CASAVA_Build 3 52677853 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAAAAAA 3070 het 877 hom 37 10 17 10 AG 0 1 162234 CASAVA_Build 3 52692431 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1035 het 1035 ref 26 18 4 4 A 13 12 162235 CASAVA_Build 3 52697307 1D ACTCAAGTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 10 9 162236 CASAVA_Build 3 52700759 2D AGGAAGGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 720 hom 25 4 10 11 T 20 18 162237 CASAVA_Build 3 52719421 1D ACTGTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 13 5 A 15 14 162238 CASAVA_Build 3 52766612 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2321 het 723 hom 25 6 9 11 A 17 16 162239 CASAVA_Build 3 52792190 12D GGGTAAGGGT GGGGGTCTCAGG/------------ CAACCTTGAT 3070 het 3070 ref 45 22 23 4 GGGGGTCTCAGG 1 0 162240 CASAVA_Build 3 52798220 1I AGATAGTCCC -/T GCTTTCATAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 0 1 162241 CASAVA_Build 3 52822027 11D GTTCACTCTA TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 3070 het 2996 hom 30 12 12 8 T 20 9 162242 CASAVA_Build 3 52834488 1I TCTCTACTGG -/A AAAAAAAAAA 1006 het 767 hom 20 4 5 11 A 17 18 162243 CASAVA_Build 3 52841725 1D CCTAGTGCAG T/- GCAGGGAGAG 2664 het 2664 ref 53 25 13 17 T 1 0 162244 CASAVA_Build 3 52845770 1I ACCCACAACC -/A ACAACCACAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 162245 CASAVA_Build 3 52847041 18D TGTGTGTACA TGTGTGTGCACGTGCACG/------------------ TGCACACACA 3070 hom 37 het 21 0 17 13 TGTGTGTGCACGTGCACG 1 0 162246 CASAVA_Build 3 52847864 1I TTCATGCGCC -/A CAATTCGGAC 3070 hom 126 het 46 0 41 5 A 0 1 162247 CASAVA_Build 3 52848116 2D CAGCCCATTC CA/-- CAGTCACTCA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 CA 2 1 162248 CASAVA_Build 3 52852688 1I TGAGGGCTAC -/A AGGTGAGCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 162249 CASAVA_Build 3 52853787 2I GAGTTAAAAC --/AG AAGTTTGGTT 3070 hom 148 het 58 0 50 9 AG 0 1 162250 CASAVA_Build 3 52854995 1D TGGGGGTGGC G/- GGGGGGCGGG 1681 hom 12 het 7 0 5 2 G 7 6 162251 CASAVA_Build 3 52856675 1I AGAGAGCTGT -/G GGTACCTCTT 3070 hom 120 het 43 0 37 6 G 2 3 162252 CASAVA_Build 3 52857394 17D TGAGAAAGAG GCTGAAACAATATCACT/----------------- GCCTTCTTCC 3070 het 3070 ref 35 22 11 9 GCTGAAACAATATCACT 1 0 162253 CASAVA_Build 3 52858695 1D GAGGGTGTGC T/- CAAACCCAGA 3070 hom 65 het 23 0 16 7 T 1 0 162254 CASAVA_Build 3 52860719 5I TCTCAGATAC -----/TTTAA TTTGTGTCCA 3070 hom 119 het 49 0 38 11 TTTAA 0 1 162255 CASAVA_Build 3 52860884 4D AGATGATTCT GACA/---- GACAGCAAAG 3070 hom 126 het 44 0 41 3 GACA 2 1 162256 CASAVA_Build 3 52862712 1D AGCTAGGTCT C/- CCACCAGGTC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 C 3 2 162257 CASAVA_Build 3 52862902 1I AAAATGGCTA -/T TTTTGTTAGG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 4 5 162258 CASAVA_Build 3 52865562 1D CAGAGTGAGA C/- CACGTCTCTA 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 C 2 1 162259 CASAVA_Build 3 52872662 1D ACAGTCCCCC A/- AAAGTCTTAA 3070 hom 71 het 26 0 22 4 A 4 3 162260 CASAVA_Build 3 52879125 1I CACCTGCAGG -/A AAACAAGAAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 3 4 162261 CASAVA_Build 3 52893303 1D ACCCAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 2057 het 1252 hom 20 6 7 7 T 17 16 162262 CASAVA_Build 3 52900142 4I TTAAATAAAA ----/TTAC TTAAATAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTAC 0 1 162263 CASAVA_Build 3 52922352 1D TGTTTACGTG A/- ATGTTTCCTA 3070 het 3070 hom 58 21 28 9 A 2 1 162264 CASAVA_Build 3 52923206 1I CATCTCTAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 T 8 9 162265 CASAVA_Build 3 52926161 1D AAGGTCAGTC T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 8 7 162266 CASAVA_Build 3 52931431 2D CATCCGTGTC AA/-- AATGGACAAC 3070 het 3070 hom 57 25 21 12 A 4 2 162267 CASAVA_Build 3 52935026 1D27M1D TGGAAAGCAA GGGAAGCACAGCAGTCCCTGCAGCCCTGC/-GGAAGCACAGCAGTCCCTGCAGCCCTG- CATAGTGGCC 3070 het 2321 hom 40 8 16 20 N/A 0 0 162268 CASAVA_Build 3 52935297 1D TCATTTTAGA G/- GGGCGAAAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 4 3 162269 CASAVA_Build 3 52939674 1D6M1I AAAAACAAAA CACACAG-/-ACACAGA AAGTGCTTCT 3070 hom 60 het 24 0 21 6 N/A 0 0 162270 CASAVA_Build 3 52945545 1I TTGTCCTTAC -/T GACACTCTAT 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 T 0 1 162271 CASAVA_Build 3 52947696 1I AATAAAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 920 hom 44 3 35 6 T 11 12 162272 CASAVA_Build 3 52949892 17D CAAGTGATGG AAGTTAATTTTACCTGT/----------------- AATAAGGCAA 3070 het 3070 ref 50 31 24 6 AAGTTAATTTTACCTGT 1 0 162273 CASAVA_Build 3 52954706 1I CTAAAAACAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 8 9 162274 CASAVA_Build 3 52957313 1I ACTTTGTAAT -/A AATCAAGTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 3 162275 CASAVA_Build 3 52957974 1I CCCACCTTGG -/C CTCCCAAAGT 3070 hom 53 het 20 0 19 1 C 1 2 162276 CASAVA_Build 3 52958625 15D AATGTCCTTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2223 het 2223 ref 25 10 8 10 T 27 12 162277 CASAVA_Build 3 52960272 4I TCTAACACTC ----/TTTT TTTTTTCCTT 3070 hom 65 het 25 0 22 3 T 6 10 162278 CASAVA_Build 3 52960623 3I CAGGTGCTTG ---/CCA CTACGACTGG 2864 hom 21 het 9 0 8 1 CCA 0 1 162279 CASAVA_Build 3 52962503 1I CCCCCTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 26 0 17 9 A 10 11 162280 CASAVA_Build 3 52963915 1D TTACCTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 31 1 23 7 A 12 11 162281 CASAVA_Build 3 52967655 5D TCAAAAAAAA TAAAT/----- TAAATTAAAA 3070 het 2522 hom 17 6 10 2 TAAAT 2 1 162282 CASAVA_Build 3 52974264 1I CCAATTAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 9 10 162283 CASAVA_Build 3 52974484 1I AACTAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 10 12 A 14 15 162284 CASAVA_Build 3 52975982 4I TACTTCACTT ----/AAAG TAATAAAATG 3070 hom 39 het 19 0 14 5 AAAG 0 1 162285 CASAVA_Build 3 52979771 1I TGAGTGTGTA -/T TTAGAGCCCC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 2 3 162286 CASAVA_Build 3 52991913 3D AGTGCCAATA AAG/--- AAGAAGATGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 7 AAG 3 2 162287 CASAVA_Build 3 52998146 3D TCTTCCTGAT TTC/--- TTTTCTCCAC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TTC 1 0 162288 CASAVA_Build 3 52998849 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 11 10 162289 CASAVA_Build 3 53001101 1D CCTTCTAGGA T/- AATCTATTCC 3070 hom 126 het 44 0 38 6 T 1 0 162290 CASAVA_Build 3 53010645 13I ATTTCTAATA -------------/GAGGAACCACACT GCTCTAGCTA 3070 hom 38 het 19 0 11 8 GAGGAACCACACT 0 1 162291 CASAVA_Build 3 53024340 1I TGGTTATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 292 hom 39 1 30 8 A 10 11 162292 CASAVA_Build 3 53034068 1I GGGGAAAACT -/A AATTTATAAC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 2 3 162293 CASAVA_Build 3 53048424 4D TCACAAAAGG ATAA/---- ATACTGTATG 3070 het 3070 ref 34 21 10 6 ATAA 1 0 162294 CASAVA_Build 3 53049902 2I GGTCTCGCTA --/TG TGTCACCAGG 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 TG 1 2 162295 CASAVA_Build 3 53060130 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2341 het 1971 hom 28 11 8 10 A 14 13 162296 CASAVA_Build 3 53060966 5D TCCATTGCCA CTGAC/----- CTGACCAGCC 3070 hom 71 het 27 0 23 4 CTGAC 2 1 162297 CASAVA_Build 3 53062160 1D TAAGAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 A 9 8 162298 CASAVA_Build 3 53067320 1D GCCACATACT C/- CCAAAATGGG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 C 3 2 162299 CASAVA_Build 3 53093087 3I GATTCTGTGT ---/GGA GGAGAAGAGC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 GGA 1 2 162300 CASAVA_Build 3 53102176 1D GGACTTCTGA C/- CCCTAAGCTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 C 4 3 162301 CASAVA_Build 3 53105440 1I TGAGGTTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 9 10 162302 CASAVA_Build 3 53114467 5D AAGACTCTAT CCCCG/----- CCCCCCCCCC 3070 het 448 hom 21 3 15 3 CCCCG 1 0 162303 CASAVA_Build 3 53116193 4D TCTAAAAAGG TTTT/---- TTTTTTTTTT 2641 hom 21 het 13 0 7 7 T 17 13 162304 CASAVA_Build 3 53123789 1D CATTCCACTG C/- CCTCACTGTA 3070 hom 150 het 56 0 50 7 C 3 2 162305 CASAVA_Build 3 53144462 1I TCCTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 23 1 17 5 T 12 13 162306 CASAVA_Build 3 53145986 2D ATCTTTTCCC CT/-- GAGTCAGGCC 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 CT 1 0 162307 CASAVA_Build 3 53154562 7D TAATTTACCT GCCAGGA/------- GCCAGGAGGT 2488 het 2488 ref 23 16 6 3 GCCAGGA 2 1 162308 CASAVA_Build 3 53179204 2D GTGGGAACTC TG/-- TGGGAGAAAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 TG 2 1 162309 CASAVA_Build 3 53191330 2D TCATCTATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 20 1 14 5 T 13 11 162310 CASAVA_Build 3 53193031 1I CTTAAGTTGA -/C CCAGATGTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 2 3 162311 CASAVA_Build 3 53195804 8D GGGCTACTGG CTCAGAGC/-------- CCACTTCCAG 3070 hom 70 het 26 0 20 8 CTCAGAGC 1 0 162312 CASAVA_Build 3 53199943 20D GCTAGGCCAG CTGCAAGAAAATCACACAGC/-------------------- CTGCTTTCAG 3070 hom 60 het 21 0 19 6 CTGCAAGAAAATCACACAGC 1 0 162313 CASAVA_Build 3 53201595 2D ATACATAGAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 AT 7 6 162314 CASAVA_Build 3 53210001 1I ATGGCATGTT -/G GGGGGCTCTG 3070 hom 105 het 39 0 34 5 G 5 6 162315 CASAVA_Build 3 53215519 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTGAC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 0 1 162316 CASAVA_Build 3 53216384 5D AAACAACAAC AAAAA/----- AAAAAAAACA 574 het 414 hom 24 4 5 19 A 13 8 162317 CASAVA_Build 3 53217811 2I3M3I AGTGGAGGAA --CAG---/GGTAGTTT CCACCACCAA 3070 hom 63 het 25 0 20 5 N/A 0 0 162318 CASAVA_Build 3 53218882 4D CTCTGTCTGG AAAA/---- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 13 9 162319 CASAVA_Build 3 53222416 1D ATTTGTGGGG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 T 8 7 162320 CASAVA_Build 3 53226301 2I GAATTTTAAG --/TT TTTACCCTTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 3 5 162321 CASAVA_Build 3 53233073 9I TTTTTCAGCT ---------/CACTATGGC CTGGGATTCC 3070 hom 110 het 40 0 36 4 CACTATGGC 0 1 162322 CASAVA_Build 3 53236324 26D GCAGAGTGAT CAGAGGCCCACGTGCGGCCCCAGCAG/-------------------------- CAGAGGCACC 3070 hom 86 het 31 0 29 10 CAGAGGCCCACGTGCGGCCCCAGCAG 1 0 162323 CASAVA_Build 3 53239882 2I CCCGGCCCCT --/AG TCTGGCTGTG 3070 hom 51 het 18 0 15 3 AG 0 1 162324 CASAVA_Build 3 53257694 1D CCCACCCCCC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 55 het 28 0 19 9 A 8 7 162325 CASAVA_Build 3 53258241 1I TGGCTGGGCT -/G GTCTCGAACT 3070 hom 29 het 11 0 9 2 G 1 2 162326 CASAVA_Build 3 53272134 1D AAGTACAGAA T/- TTTTTTTTTT 1762 het 1762 ref 28 17 5 6 T 15 14 162327 CASAVA_Build 3 53280338 1I CTGTGCAAAA -/C AGAAAAGTGC 3070 hom 51 het 28 0 18 10 C 0 1 162328 CASAVA_Build 3 53280815 1D TGGCCGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 23 1 17 5 T 11 10 162329 CASAVA_Build 3 53304545 1D TTTACTTCTG A/- AAAAAACTGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 6 162330 CASAVA_Build 3 53313816 1I CTGGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2339 hom 16 het 11 0 8 3 T 11 12 162331 CASAVA_Build 3 53314418 2I GACAAAAATT --/TC TTTTTTTCTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TC 0 1 162332 CASAVA_Build 3 53329459 1I GGTAGAGTAG -/A AATACTGAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 3 162333 CASAVA_Build 3 53340686 1I CCTAATGGCG -/T CCTTTAGGAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 0 1 162334 CASAVA_Build 3 53343095 3I TTGGGAGGCC ---/AAG AAGACAGGAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AAG 1 2 162335 CASAVA_Build 3 53344449 1D CTCAAGTGAT C/- CAGCCTGCCT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 2 1 162336 CASAVA_Build 3 53372421 2I GCCTGTGTGC --/AT AGAGGTGGAC 3070 hom 129 het 52 0 42 10 AT 0 1 162337 CASAVA_Build 3 53383132 1D ATTGCAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 27 0 20 7 T 12 11 162338 CASAVA_Build 3 53385528 4I TATAAAAATG ----/TATT TATGTATAAT 2325 hom 12 het 6 0 5 1 TATT 0 1 162339 CASAVA_Build 3 53395200 1I GCTTTATAGG -/A AGCATGATGC 3070 hom 68 het 31 0 22 9 A 1 2 162340 CASAVA_Build 3 53398144 1D TTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 11 10 162341 CASAVA_Build 3 53401647 1D AAGTTTAGAG A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 8 7 162342 CASAVA_Build 3 53405068 1D GATCTTTGAC A/- AAACCTGACA 2966 hom 18 het 9 0 7 2 A 4 3 162343 CASAVA_Build 3 53419758 1D TTGTTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 29 2 15 12 T 13 12 162344 CASAVA_Build 3 53430314 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1549 het 1549 ref 47 16 6 25 T 17 16 162345 CASAVA_Build 3 53440828 1D TCATGTTACT G/- GTTCCCCAAA 3070 hom 162 het 61 0 53 9 G 2 1 162346 CASAVA_Build 3 53447382 1I AACAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 10 11 162347 CASAVA_Build 3 53466682 1D TAGATTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 13 12 T 12 11 162348 CASAVA_Build 3 53484821 2I CATTTTGAAG --/CT CTGTTATTAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 CT 1 2 162349 CASAVA_Build 3 53486997 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACAAAA 3070 het 198 hom 24 1 23 0 C 1 0 162350 CASAVA_Build 3 53500671 1D AAAAAAAAAA C/- CCCAAACCCT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 C 4 3 162351 CASAVA_Build 3 53501828 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2275 het 2191 hom 23 6 8 9 A 13 14 162352 CASAVA_Build 3 53517045 1I CAGCTGGAAA -/G GGGGGGGCTG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 7 8 162353 CASAVA_Build 3 53555446 1I ATTTGGGGTA -/G GGGTTCCCCA 3070 hom 66 het 29 0 20 9 G 3 4 162354 CASAVA_Build 3 53592299 1I ATAGAGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 10 11 162355 CASAVA_Build 3 53592890 1D TCCCTTGTGA C/- ATGGTCTGTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 C 1 0 162356 CASAVA_Build 3 53594184 1I TATTCACACG -/C CTTTGTCTCA 3070 het 3070 ref 32 20 12 0 C 1 2 162357 CASAVA_Build 3 53603521 1I CTCTTGGCAC -/T TAGAGATATT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 1 2 162358 CASAVA_Build 3 53608082 1D TTGGTGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 12 11 162359 CASAVA_Build 3 53622612 2D CACGGCCATC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 9 11 20 TG 10 9 162360 CASAVA_Build 3 53629651 1I AGCCATGATT -/C CCCCACCTGG 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 C 4 5 162361 CASAVA_Build 3 53632700 4D ACAGTGCTAT TTTG/---- TTTATCTTCT 3070 het 3070 hom 47 22 23 5 TTTG 1 0 162362 CASAVA_Build 3 53642519 6I CTCTGTCTTA ------/AAAAAC AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 AAAAAC 2 3 162363 CASAVA_Build 3 53650063 3I CTTAAAGGGT ---/GAA GAAGCAGGAT 3070 het 3070 hom 57 24 28 5 GAA 1 2 162364 CASAVA_Build 3 53662949 1I GCCACATCAA -/G GCACATCATA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 1 2 162365 CASAVA_Build 3 53670400 1I AATCCTCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 9 10 162366 CASAVA_Build 3 53676408 1I GAATGCAAAT -/G AAAGCTCACA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 G 0 1 162367 CASAVA_Build 3 53682630 1D TTATTTGCAG A/- AAAAAAAAAA 2505 het 1896 hom 30 9 9 13 A 15 14 162368 CASAVA_Build 3 53689414 1D GACCAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3025 hom 34 13 14 7 T 13 12 162369 CASAVA_Build 3 53691624 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 A 12 11 162370 CASAVA_Build 3 53706009 3I CTGGGTCTGC ---/AGT AGCGACCTGG 3070 het 3070 hom 38 19 18 1 AGT 0 1 162371 CASAVA_Build 3 53719781 1I GAACCAACTC -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 31 8 16 7 A 6 7 162372 CASAVA_Build 3 53725651 1D TTTTGTCCAG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 48 15 24 10 T 8 7 162373 CASAVA_Build 3 53735521 1I CCTGGCCAAC -/G TGCTGTAACA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 0 1 162374 CASAVA_Build 3 53749624 1I GTGCTTTTGA -/T TTTTTTATGG 3070 het 2702 hom 24 11 9 4 T 6 7 162375 CASAVA_Build 3 53782741 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 45 1 37 7 T 12 11 162376 CASAVA_Build 3 53784713 4D ATATGCAGAC AGTT/---- AGCGCGCTTG 3070 het 3070 ref 33 17 13 6 AGTT 1 0 162377 CASAVA_Build 3 53813133 4D AGGGGTCCAT CTTG/---- CTTCTGTCCT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 CTTG 1 0 162378 CASAVA_Build 3 53821658 4D CCACCCTCTG GTAA/---- GTAAGTAAGT 3070 hom 66 het 27 0 22 6 GTAA 3 2 162379 CASAVA_Build 3 53825064 1D CCCTCTCTTC G/- AACAAAAATT 2674 het 969 hom 12 3 7 2 G 1 0 162380 CASAVA_Build 3 53826348 4I GACACTGGGG ----/ACTT ACTTATGTGC 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 ACTT 1 2 162381 CASAVA_Build 3 53835383 1D ACATTACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 13 14 A 12 11 162382 CASAVA_Build 3 53835712 3D CTACAACTAA CAT/--- CATACCTGAC 3070 het 3070 hom 33 14 15 6 CAT 2 1 162383 CASAVA_Build 3 53849594 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 539 hom 34 2 27 5 A 11 12 162384 CASAVA_Build 3 53856871 1I CAGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 9 10 162385 CASAVA_Build 3 53857714 1I TGACGCTTGG -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 6 7 162386 CASAVA_Build 3 53858587 1I12M1I TACAAAAAAC -ATTTTTTTAATT-/AATTTTTTTAATTA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 7 N/A 0 0 162387 CASAVA_Build 3 53875431 1D ATCCTGGGTG A/- GAGCAGACCC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 1 0 162388 CASAVA_Build 3 53875722 9D CTAACTTTTT ATATTTTTA/--------- GTAGAGACGG 3070 hom 45 het 17 0 16 2 ATATTTTTA 1 0 162389 CASAVA_Build 3 53875902 1D AGCATAAATG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 7 162390 CASAVA_Build 3 53877254 1D ACAGAAAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 138 het 51 0 45 7 A 10 9 162391 CASAVA_Build 3 53879716 4D AGACTCTGAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 42 het 17 0 14 7 AAAT 3 2 162392 CASAVA_Build 3 53885162 1D GGGGGGAAAA G/- AAAAGGCAGA 3070 hom 80 het 30 0 26 5 G 1 0 162393 CASAVA_Build 3 53885940 1D TTTTATAAGG A/- AAAAAAAAAT 2699 het 508 hom 24 7 11 6 A 10 9 162394 CASAVA_Build 3 53886156 1D TGCCACCAAG A/- ATCCTCACCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 1 162395 CASAVA_Build 3 53890925 2D CTTCCGCACT CC/-- CCCCACCAGG 846 hom 18 het 8 0 4 4 C 6 4 162396 CASAVA_Build 3 53901134 2D GTTGCCAGTC CT/-- CTATCCGACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CT 2 1 162397 CASAVA_Build 3 53919569 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 6 7 162398 CASAVA_Build 3 53921740 2I GCTACCTGAC --/TT ATATGTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 2 162399 CASAVA_Build 3 53921966 1I GTACGAGTCT -/G CAGCAACCTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 162400 CASAVA_Build 3 53936925 2I TATCTAGTGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 11 162401 CASAVA_Build 3 53947934 1D AAGGGAAATG A/- AAGGCTGCAT 3070 hom 157 het 56 0 52 4 A 3 2 162402 CASAVA_Build 3 53956787 3D ATTGCTACTC CTT/--- CTGAGAATGG 3070 hom 119 het 45 0 39 10 CTT 1 0 162403 CASAVA_Build 3 53958282 1D AGCCCCTGCC A/- AAAAAAAAAA 2094 het 46 hom 24 1 12 11 A 17 16 162404 CASAVA_Build 3 53960805 1I CACAGGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 844 hom 30 2 24 4 T 10 11 162405 CASAVA_Build 3 53990989 4D CCTGCCACCA CGCC/---- CGCCCGGCTA 974 het 974 ref 14 10 3 1 CGCC 2 1 162406 CASAVA_Build 3 53997718 2I AAAGTTAAAC --/AT AGAATTACCA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AT 0 1 162407 CASAVA_Build 3 54006201 1D CCCGGGGCTC T/- TAAATTCTCT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 2 1 162408 CASAVA_Build 3 54006813 1I TTTAAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 10 11 162409 CASAVA_Build 3 54021896 1D TTCTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 1321 het 1321 ref 29 17 4 8 T 15 14 162410 CASAVA_Build 3 54034559 3I AGTCTCAGTC ---/ACT ATCTCCTCTG 3070 het 3070 hom 64 22 30 12 ACT 0 1 162411 CASAVA_Build 3 54035006 31D GCTCGATCTG ATTGGATCCTGGATCCTGCTGTGCAGTGTCC/------------------------------- ACTTCTTAAT 3070 het 3070 ref 57 49 21 10 ATTGGATCCTGGATCCTGCTGTGCAGTGTCC 1 0 162412 CASAVA_Build 3 54043084 15D GGGCTGCTGT GGGTCTGGTGTCTGG/--------------- CTCTGTGGCC 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 GGGTCTGGTGTCTGG 1 0 162413 CASAVA_Build 3 54051881 7I CAGGAACAGG -------/CTTTAGA CTTTAGACGG 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 CTTTAGA 1 2 162414 CASAVA_Build 3 54090307 2D AAGGAGCATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 41 12 14 15 CA 10 9 162415 CASAVA_Build 3 54097258 1I TTCCCAAGCA -/C CGACAGCGCG 2674 het 2165 hom 14 6 7 1 C 1 2 162416 CASAVA_Build 3 54106055 4D CTTCTTTCTC TTCT/---- TTCTTTCTTT 2168 het 1610 hom 27 10 12 5 TTCT 5 4 162417 CASAVA_Build 3 54107552 1I CCATTAGGAG -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 7 8 162418 CASAVA_Build 3 54107936 4I TGATGACAGT ----/TTAA TTAACATCTG 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 TTAA 1 2 162419 CASAVA_Build 3 54141040 11D GAGGTGGAAC AATATTGTAAA/----------- AAGAACAATA 3070 het 3070 ref 60 29 28 12 AATATTGTAAA 1 0 162420 CASAVA_Build 3 54146854 2D TTCTACTCTA CT/-- CTGTTTTCTA 3070 het 3070 hom 33 13 18 4 CT 2 1 162421 CASAVA_Build 3 54163598 1I TACTCTTTTT -/C CCCCCCCGAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 C 7 8 162422 CASAVA_Build 3 54166903 4D CCAACCAAAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 1283 hom 31 7 17 8 A 20 16 162423 CASAVA_Build 3 54178406 1I TGTAAAGGGA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 T 7 8 162424 CASAVA_Build 3 54183657 2D AGTGGCGCGA TC/-- TCAGCTCACT 3070 het 2639 hom 19 7 9 3 TC 2 1 162425 CASAVA_Build 3 54217814 1I TTAAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 20 18 12 T 10 11 162426 CASAVA_Build 3 54238262 1D AGCTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 1750 het 1160 hom 13 7 4 2 T 15 14 162427 CASAVA_Build 3 54255627 31D GGGCGTGGTT GCGGCTGTCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAG/------------------------------- GCGGCTGTCT 2846 hom 30 het 16 0 9 8 GCGGCTGTCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAG 2 1 162428 CASAVA_Build 3 54256928 12D CTCATATCTG CCATGCCTAGTA/------------ CCATGCCTAG 3070 hom 93 het 42 0 32 15 CCATGCCTAGTA 2 1 162429 CASAVA_Build 3 54262175 1D TAACCAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 578 hom 28 4 15 9 T 15 14 162430 CASAVA_Build 3 54271674 1I ATTTTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 10 11 162431 CASAVA_Build 3 54284533 4D CTATCAAAAT ATAA/---- AAAACCCAGA 3070 het 3070 hom 31 15 16 1 ATAA 1 0 162432 CASAVA_Build 3 54284720 1I AGTCTCACTC -/T TGTCACCCAG 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 T 1 2 162433 CASAVA_Build 3 54284952 1D GCCTTGGCCT C/- CCAAAGTGCT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 3 2 162434 CASAVA_Build 3 54302631 2D AATATTCTAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 TA 7 6 162435 CASAVA_Build 3 54303516 4D TCCTCTCCTT TGAG/---- TGGTTGCTCA 3070 het 3070 ref 45 30 11 5 TGAG 1 0 162436 CASAVA_Build 3 54304495 2I TCCTGAAGAC --/AT GTGCCCAAGG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 AT 0 1 162437 CASAVA_Build 3 54306525 4D TAGGAAAAGC GAGT/---- CGGCATGCAG 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 GAGT 1 0 162438 CASAVA_Build 3 54308012 31D TCTGTTTCTT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA/------------------------------- AGAAGAAAGA 2072 het 2072 ref 18 8 5 12 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA 1 0 162439 CASAVA_Build 3 54312886 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 512 hom 29 7 14 8 T 20 19 162440 CASAVA_Build 3 54325144 2D63M4I TCCTAGCAGG GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACGTGTGTGTGAGATTAGTGATTTAAAACAAAAAGTAAGCAGTTA----/--GTGTGTGTGTGTGTGTGCACGTGTGTGTGAGATTAGTGATTTAAAACAAAAAGTAAGCAGTTACTGT CTGTCATACG 3070 hom 219 het 43 0 72 8 N/A 0 0 162441 CASAVA_Build 3 54326605 1I CCAAACTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 10 11 162442 CASAVA_Build 3 54327197 5D ATCCAGAGAA ATCTT/----- TTGTGTCTGC 3070 het 3070 hom 48 19 26 4 ATCTT 1 0 162443 CASAVA_Build 3 54333989 3I AAGTCAGAGC ---/TCA TCTTTGATAT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 TCA 0 1 162444 CASAVA_Build 3 54400072 1I TTTCATACTG -/A AAAAATAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 5 6 162445 CASAVA_Build 3 54414921 1I ACTCAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 929 hom 47 2 34 11 A 11 12 162446 CASAVA_Build 3 54422983 1D TTTAAGTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 24 3 14 7 T 13 12 162447 CASAVA_Build 3 54423869 1D TTCTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 1768 het 1768 ref 24 12 6 6 T 17 16 162448 CASAVA_Build 3 54462573 9D CCACATTTAT ACAAACGAG/--------- ATCTTTTTGG 3070 het 3070 hom 50 22 24 9 ACAAACGAG 1 0 162449 CASAVA_Build 3 54463649 2D CACCTCAAAC AT/-- GTATCATTTC 3070 het 3070 ref 51 31 18 4 AT 1 0 162450 CASAVA_Build 3 54467860 1D TATTATACTC T/- TAAGTTTTAG 2312 het 2312 ref 13 7 6 0 T 2 1 162451 CASAVA_Build 3 54483722 2D GGAAAGATTA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 AG 5 4 162452 CASAVA_Build 3 54484587 1D GTCAACATAC T/- TGGGAGGTCT 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 T 2 1 162453 CASAVA_Build 3 54497222 4D66M1D TGGTTGAGTT AGAGAGGGAGGAAAGAGCTAGATCAAGCATGACCTTGGGTTATTCCATACCAATGGGATGGGTTGCTTAAG/----AGGGAGGAAAGAGCTAGATCAAGCATGACCTTGGGTTATTCCATACCAATGGGATGGGTTGCTTAA- CAAGGTAGTT 3070 het 3070 hom 44 35 36 5 N/A 0 0 162454 CASAVA_Build 3 54499399 3D CCATCCCTGC GCA/--- GCAGCAGGCT 3070 hom 72 het 27 0 23 5 GCA 3 2 162455 CASAVA_Build 3 54502579 1I TCTCTGAACT -/C CCCCATTACT 3070 het 3070 ref 25 12 13 0 C 4 5 162456 CASAVA_Build 3 54506354 1I CAAACAAATA -/T TTTGTGGTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 3 4 162457 CASAVA_Build 3 54516419 1D ATGGAAGTGA C/- TTTTGTTTAT 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 C 1 0 162458 CASAVA_Build 3 54518359 4D TGTGTGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 50 het 38 1 26 13 TG 10 8 162459 CASAVA_Build 3 54524470 2D TTACAAAGCT GC/-- GCCCATCTAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 GC 2 1 162460 CASAVA_Build 3 54530100 4D TTGGGTTGCT ACTA/---- ACTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 41 12 28 1 ACTA 1 0 162461 CASAVA_Build 3 54549162 3D TGAGCCTCAT CTC/--- CTCTAATCAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 6 CTC 2 1 162462 CASAVA_Build 3 54549777 2D CTTATGTCTC TT/-- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 T 8 6 162463 CASAVA_Build 3 54551006 1I TGTGTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 884 het 884 ref 40 26 3 11 T 13 14 162464 CASAVA_Build 3 54566048 1I TATTTAACTG -/T TTTTTTTTTA 3055 het 3055 ref 25 12 9 4 T 9 10 162465 CASAVA_Build 3 54576573 7D GGTGGAGGTG GTTTTTT/------- GTTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 42 22 14 7 GTTTTTT 1 0 162466 CASAVA_Build 3 54581144 3I GGCTGCCTTC ---/CCA TGCATAGGCG 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 CCA 0 1 162467 CASAVA_Build 3 54581205 3I TAAGTGACAT ---/GAA GGTGGCCGAG 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 GAA 0 1 162468 CASAVA_Build 3 54586705 1D ATATATTTTC T/- TTCTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 3 2 162469 CASAVA_Build 3 54596335 2I GATAAAAATG --/AA AAGAGAGGGG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 2 4 162470 CASAVA_Build 3 54615212 2D AATGTAACTT TA/-- TATATATATA 3070 het 1808 hom 25 5 13 7 TA 8 7 162471 CASAVA_Build 3 54617075 1D TAGGAGTGGA G/- GGGAGTATAG 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 G 4 3 162472 CASAVA_Build 3 54628867 1D CCTACAAGAT A/- ATATTGGCTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 2 1 162473 CASAVA_Build 3 54632257 3D GGCTCAAGCC TTG/--- TTGTCCCCAT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 TTG 2 1 162474 CASAVA_Build 3 54651482 1D TCTTGTTTTC A/- AAAAATGAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 6 5 162475 CASAVA_Build 3 54652197 2I ATCCTGACTG --/TC TCTATAGGTA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TC 1 2 162476 CASAVA_Build 3 54655487 1D CACAAAGGTG C/- CCCAGTATGT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 C 4 3 162477 CASAVA_Build 3 54674613 3D CAGCTCCATA TAC/--- TACTGTGTAA 3070 hom 96 het 35 0 32 6 TAC 2 1 162478 CASAVA_Build 3 54676296 1I CCTTGAACTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 2527 hom 30 12 12 6 T 8 9 162479 CASAVA_Build 3 54677015 2D CCCCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 22 1 17 4 A 14 12 162480 CASAVA_Build 3 54677684 1I AATACATTCA -/T TCCATTCCTT 3070 hom 156 het 54 0 51 3 T 1 2 162481 CASAVA_Build 3 54693823 1D TTGTCATGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 129 hom 34 1 30 3 A 10 9 162482 CASAVA_Build 3 54700965 2D ATTTTGACTC TG/-- TGAATAGCCC 3070 het 3070 hom 27 9 15 4 TG 2 1 162483 CASAVA_Build 3 54702089 1D AGCAAAATGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 39 0 33 6 A 10 9 162484 CASAVA_Build 3 54707211 1I AATTGACTAC -/T TATGGGTGCT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 1 2 162485 CASAVA_Build 3 54713529 1I TCTTTTTTTT -/A AATACCTGGC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 2 3 162486 CASAVA_Build 3 54714960 2D GTGATACTGA CT/-- CTCATGCCTC 3070 het 3070 ref 61 32 26 3 CT 2 1 162487 CASAVA_Build 3 54730133 5D TTAGTAAACA TTATT/----- TTATTATTTA 3070 het 3070 hom 32 11 15 9 TTATT 2 1 162488 CASAVA_Build 3 54732392 1I TTAGTTTGTT -/G GGCTCCATGG 3070 hom 24 het 10 0 7 3 G 2 3 162489 CASAVA_Build 3 54737056 2I TGCTTTTTAG --/TA TATGTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 TA 1 2 162490 CASAVA_Build 3 54737398 3D AGTTCATTAA TCT/--- TCTCTTCGGT 3070 het 3070 hom 32 10 18 6 TCT 2 1 162491 CASAVA_Build 3 54738534 1I TTTAAATTTA -/T TTGTAAGAGT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 2 3 162492 CASAVA_Build 3 54739558 4D TGAAACAGAA TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 TCTT 4 3 162493 CASAVA_Build 3 54748553 2D AAAAAATAAC AT/-- GGAGAGTGCC 3070 het 3070 hom 46 20 14 15 AT 1 0 162494 CASAVA_Build 3 54750669 1D TAAGAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2662 het 1926 hom 16 7 7 2 A 12 11 162495 CASAVA_Build 3 54759776 1I GAAAGTGAAC -/A GGGGGTGCAG 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 0 1 162496 CASAVA_Build 3 54760528 1I GTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 T 8 9 162497 CASAVA_Build 3 54761905 1D CCAAATTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 704 hom 32 6 12 14 T 12 11 162498 CASAVA_Build 3 54769306 5D GGAGGGCCTC TCTGA/----- TCTGAGCTGA 3070 hom 89 het 31 0 29 4 TCTGA 2 1 162499 CASAVA_Build 3 54770130 1D TGATTGTTTT C/- CCCCAACTCC 3070 het 3070 ref 35 23 9 4 C 5 4 162500 CASAVA_Build 3 54774101 1D TGGGAGTGGT G/- TTTTTCATTT 3070 het 3070 ref 54 33 17 5 G 1 0 162501 CASAVA_Build 3 54800108 1I CTTCTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 T 11 12 162502 CASAVA_Build 3 54804495 4I TTTTCCCATT ----/TCTA TATATAGTAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 TCTA 0 1 162503 CASAVA_Build 3 54845279 12D TCAAGGGCCA TTCTTTTTTTTT/------------ TTCTTTTTTT 3070 het 2854 hom 36 12 17 8 TTCTTTTTTTTT 2 1 162504 CASAVA_Build 3 54854234 1I TAACTCCAGG -/A GAAGACGTCT 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 A 0 1 162505 CASAVA_Build 3 54865323 3D ACTGACAAGA AGG/--- AGAATTTATG 3070 het 3070 hom 59 26 28 7 AGG 1 0 162506 CASAVA_Build 3 54872781 1D TTAATTGTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 9 8 162507 CASAVA_Build 3 54895232 20I CTATACTCTC --------------------/ACAGTATAGCTCCAGTAGCT ACAGTTTGGG 3070 hom 103 het 41 0 34 9 ACAGTATAGCTCCAGTAGCT 0 1 162508 CASAVA_Build 3 54895605 4D ATGAGACATT ATAG/---- ATAAAGTTGA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 ATAG 1 0 162509 CASAVA_Build 3 54902353 1D AAAAAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2313 hom 25 7 12 6 T 11 10 162510 CASAVA_Build 3 54902478 3I ATGGATGAAA ---/TCT TCTGTCTTCA 3070 hom 135 het 50 0 44 6 TCT 1 2 162511 CASAVA_Build 3 54902855 1D TAGTTATAAT A/- CATTCTGTGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 0 162512 CASAVA_Build 3 54906570 1I TTTCCTCGTA -/T TTTTTTTTTT 1310 het 1310 ref 48 34 3 11 T 10 11 162513 CASAVA_Build 3 54929478 1D GAATCACCCA C/- CACCAGAGTG 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 C 2 1 162514 CASAVA_Build 3 54930249 22D GATCACTAGT AGCTCTTCACCTCTGTCTTGGG/---------------------- AGAAACTAGA 3070 het 3070 hom 42 18 22 9 AGCTCTTCACCTCTGTCTTGGG 1 0 162515 CASAVA_Build 3 54938690 3D ATCTTTTGTC CTT/--- CTCTCCAACA 3070 het 3070 ref 40 25 13 3 CTT 1 0 162516 CASAVA_Build 3 54943474 1D CATCTCCTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 7 6 162517 CASAVA_Build 3 54949111 1D GAAGATGGAG A/- AGGTGGAGCT 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 A 2 1 162518 CASAVA_Build 3 54977186 1D ATCTTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 1011 het 1011 ref 37 27 3 7 T 11 10 162519 CASAVA_Build 3 55015764 3D AGCCTCAGCA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 53 18 20 15 TTG 7 6 162520 CASAVA_Build 3 55020634 1I TGATGAAATT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 7 8 162521 CASAVA_Build 3 55036059 2D CGCATGCACG CA/-- CACACACACA 2252 het 2252 ref 38 27 5 8 CA 7 6 162522 CASAVA_Build 3 55042652 6D TGTGTGTGTG TATATA/------ TATATATATA 3070 het 2152 hom 15 6 8 1 TA 11 8 162523 CASAVA_Build 3 55046108 1D CCAGGCTGGG A/- AAACCTCTGC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 4 3 162524 CASAVA_Build 3 55052496 4I GATTCTTTTC ----/ATGT ATGTAATTCC 3070 het 2537 hom 20 6 11 3 ATGT 1 2 162525 CASAVA_Build 3 55054860 7D TTTTACTTTG TAATAGA/------- TAAAACAGTC 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 TAATAGA 1 0 162526 CASAVA_Build 3 55063124 1I ACTTTTAAGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 8 9 162527 CASAVA_Build 3 55082402 21D AGTCTCCAAA ATTTGCTTTACAAAATATGGT/--------------------- AGTTGCTACC 3070 het 3070 ref 38 24 15 6 ATTTGCTTTACAAAATATGGT 1 0 162528 CASAVA_Build 3 55082712 4I AAATATTAGA ----/GAAG GAAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 GAAG 1 2 162529 CASAVA_Build 3 55083275 20D TCAAGGTGAC ACTGACTGAGATGTTCTCTT/-------------------- ACTGACTGAG 3070 het 3070 ref 44 28 10 15 ACTGACTGAGATGTTCTCTT 2 1 162530 CASAVA_Build 3 55083455 7D ACAAAAAGTT ATCTATC/------- ATCTTTTTAC 3070 het 3070 ref 36 25 11 6 ATCTATC 1 0 162531 CASAVA_Build 3 55083792 4D TTTAGATGCT TCAC/---- TCACTCTCAG 3070 het 32 hom 27 1 16 10 TCAC 2 1 162532 CASAVA_Build 3 55084030 8I AAAAGAACAA --------/TGATTGAT TGATTACAAA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 TGAT 1 3 162533 CASAVA_Build 3 55084233 3I GAATGCCTTA ---/CTT CTTTATAGGA 2395 het 2395 ref 31 15 7 9 CTT 1 2 162534 CASAVA_Build 3 55084275 4D CAGAGAATCC TACT/---- TACTTACTTA 3070 hom 4 het 35 1 14 21 TACT 3 2 162535 CASAVA_Build 3 55084379 7D TTCCACTACA TTGTTTG/------- TTGTTTGTTG 3070 hom 25 het 31 0 12 20 TTGTTTG 2 1 162536 CASAVA_Build 3 55084816 3D TTATAGGAAA ATT/--- ATTTAGGTGA 3070 het 3070 hom 30 12 17 2 ATT 2 1 162537 CASAVA_Build 3 55087601 1D GCAATATTTA T/- TGAGGGTAGA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 2 1 162538 CASAVA_Build 3 55093045 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1186 het 1186 ref 23 12 3 8 T 14 13 162539 CASAVA_Build 3 55097868 1D TGTACTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 9 2 A 12 11 162540 CASAVA_Build 3 55101361 1I AGAAAGGGGG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 36 hom 25 1 19 5 A 7 8 162541 CASAVA_Build 3 55110660 2D CTTGCATACT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 32 11 14 8 CA 9 8 162542 CASAVA_Build 3 55118868 1D TTACTTAATC A/- AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 A 6 5 162543 CASAVA_Build 3 55121502 1I GAGTGAGCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 9 10 162544 CASAVA_Build 3 55122605 1D TTTCCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 16 9 A 15 14 162545 CASAVA_Build 3 55124656 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2300 het 2149 hom 19 6 7 7 A 13 12 162546 CASAVA_Build 3 55126667 1D AAAACCATCC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 T 8 7 162547 CASAVA_Build 3 55146539 1D GTATAACTAG A/- ATAATCAATA 1959 hom 10 het 4 0 4 0 A 2 1 162548 CASAVA_Build 3 55151406 1I AAAGTATAAT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 10 1 9 0 A 0 1 162549 CASAVA_Build 3 55152875 5I ATTTCATGTT -----/AATTA CCTGTGCCTT 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 AATTA 0 1 162550 CASAVA_Build 3 55153955 1I CTGTGACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 886 hom 39 2 34 3 T 9 10 162551 CASAVA_Build 3 55162905 1D TTTGTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 14 10 A 11 10 162552 CASAVA_Build 3 55164345 1D GCATGTTCAC T/- TGAATAGCAA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 2 1 162553 CASAVA_Build 3 55167422 1D ATCGTTTCTA C/- CCCCAAACTC 3070 hom 114 het 45 0 37 9 C 5 4 162554 CASAVA_Build 3 55173233 6D GCCAGGGAGT ATGACC/------ AGCAGAACCA 3070 hom 129 het 45 0 44 5 ATGACC 1 0 162555 CASAVA_Build 3 55175821 1D GGGTGAGCAA T/- TTTTTTACAG 3070 het 3070 hom 46 13 27 6 T 7 6 162556 CASAVA_Build 3 55176199 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 6 7 162557 CASAVA_Build 3 55177372 1D ATGGTGGAGG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 55 22 26 7 A 8 7 162558 CASAVA_Build 3 55186725 2D TGATATATCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 TG 8 7 162559 CASAVA_Build 3 55194107 5D AAAAAATTAA ACCAT/----- ACCATATTTC 3070 hom 38 het 18 0 13 8 ACCAT 2 1 162560 CASAVA_Build 3 55196742 1I ATAAAGGAGA -/G GGGGGGAGGA 3070 hom 114 het 45 0 36 9 G 6 7 162561 CASAVA_Build 3 55201008 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 7 8 162562 CASAVA_Build 3 55205243 1I54M2D TGGTTCCCTC -TTTTTTGCCTGGCAAATTCCTACTCATTTTTCAGAACCTAGTTCAAAGACCCTCTT/TTTTTTTGCCTGGCAAATTCCTACTCATTTTTCAGAACCTAGTTCAAAGACCCTC-- GGGACTCTGT 3070 hom 132 het 35 0 45 7 N/A 0 0 162563 CASAVA_Build 3 55206547 1D TAAATTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 42 0 32 10 T 12 11 162564 CASAVA_Build 3 55207063 4I AGCATTTTTT ----/TATG TATGTATGTA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 TATG 4 5 162565 CASAVA_Build 3 55210867 2D GTTCAAGGAG TT/-- TAATAAATGG 3070 het 3070 hom 42 15 22 6 T 3 1 162566 CASAVA_Build 3 55212198 1I TGCTTGTCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 9 162567 CASAVA_Build 3 55214529 1I CTGCAGTTAG -/A AAAAAATTAA 3070 hom 61 het 26 0 20 6 A 6 7 162568 CASAVA_Build 3 55216740 1I TGCCATTGAT -/A ACAGTCTAGA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 A 1 2 162569 CASAVA_Build 3 55225513 1D AGTATGTGAT A/- TTTTGATACA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 1 0 162570 CASAVA_Build 3 55225997 4I ACTTTTCCTC ----/CTAT CTAACTGCTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CTAT 0 1 162571 CASAVA_Build 3 55227612 1I GCTTTCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 10 162572 CASAVA_Build 3 55228573 1I GTTGTTCATA -/T AGTCTCTAAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 0 1 162573 CASAVA_Build 3 55228794 3I ATATTTTCTC ---/CTT CTATTTATTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CTT 0 1 162574 CASAVA_Build 3 55230215 1I TTGTTCTTTC -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 6 7 162575 CASAVA_Build 3 55230404 1I TATATTGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 9 10 162576 CASAVA_Build 3 55233582 1I GCTATATAAT -/G TTGGAAAAAG 3070 hom 54 het 26 0 19 7 G 0 1 162577 CASAVA_Build 3 55248100 1I GGATTGGGTA -/T TGATTGTAAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 1 2 162578 CASAVA_Build 3 55283035 1D GAAATAGGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 48 het 45 2 42 2 A 9 8 162579 CASAVA_Build 3 55287872 1I AAAAAAATAG -/A AAAAAACATT 2258 hom 11 het 18 0 11 7 A 6 7 162580 CASAVA_Build 3 55312450 1D AACATGAAGA C/- TATAGTTAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 1 0 162581 CASAVA_Build 3 55317002 3I ACAGAAAAGT ---/AGA AGGTTTAAGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AGA 0 1 162582 CASAVA_Build 3 55321337 1D TACAACCACC T/- GATCTGGCCA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 1 0 162583 CASAVA_Build 3 55323053 1D TGTATTTTTT C/- CCCCTCCAGA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 C 5 4 162584 CASAVA_Build 3 55328197 4I GTGGCAACAC ----/TGTT TGTTCCAGCT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 TGTT 1 2 162585 CASAVA_Build 3 55350843 1D CTTTTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 52 1 43 8 A 11 10 162586 CASAVA_Build 3 55352158 20D GGGCAAGCAG ACAAGTATCAGAATACTTGA/-------------------- ACAAGTATCC 3070 het 3070 ref 44 24 19 6 ACAAGTATCAGAATACTTGA 1 0 162587 CASAVA_Build 3 55436819 1D CTATGTTAAA T/- TGGTTACAGC 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 T 2 1 162588 CASAVA_Build 3 55454583 49I AAACTAGTTG -------------------------------------------------/ATGTATTTTAAGTTAAGCCCTCTCTACCCTCAGCTGTAACTCCCAAATC AAATCTAGTT 3070 hom 54 het 17 0 19 2 ATGTATTTTAAGTTAAGCCCTCTCTACCCTCAGCTGTAACTCCCAAATC 0 1 162589 CASAVA_Build 3 55459214 1D AGTAAATATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 9 8 162590 CASAVA_Build 3 55469530 1I CACCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2932 hom 24 8 13 3 T 10 11 162591 CASAVA_Build 3 55475965 1D ATGCATTCTT G/- GCATCCTTAA 3070 het 3070 hom 50 21 26 4 G 2 1 162592 CASAVA_Build 3 55477207 2D TGTCCTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 26 5 12 9 A 18 16 162593 CASAVA_Build 3 55494729 1I TGTGCGAAGG -/T TGGCTGGGGG 3070 hom 88 het 32 0 23 9 T 1 2 162594 CASAVA_Build 3 55498078 1I CCCAGAGCAT -/C GAGGCGCGAT 3070 hom 76 het 36 0 23 13 C 0 1 162595 CASAVA_Build 3 55501295 2D AATGGTGCTT TG/-- TGGCGGGGGG 3070 hom 81 het 33 0 26 8 TG 2 1 162596 CASAVA_Build 3 55502639 1I AGGAGGGCAA -/G GACCTGGTTG 3070 hom 121 het 46 0 40 6 G 1 2 162597 CASAVA_Build 3 55505228 1I AATTTTGTAT -/A CTTTGCTGCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 162598 CASAVA_Build 3 55519335 1D CATTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 39 0 26 13 A 15 14 162599 CASAVA_Build 3 55524381 6D ATTAGAATAT TATTAA/------ TATTTATCTC 3070 het 3070 ref 23 12 9 5 TATTAA 1 0 162600 CASAVA_Build 3 55539535 2I CTGACCTGAC --/AT ATGTTCTCTC 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 AT 1 2 162601 CASAVA_Build 3 55570224 1I GCTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1150 het 1150 ref 28 15 6 7 A 15 16 162602 CASAVA_Build 3 55586334 1I CTTCCCTAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 9 10 162603 CASAVA_Build 3 55592957 1I AACTTGCTAG -/C CCCCCCTCCC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 6 7 162604 CASAVA_Build 3 55603537 1I TAGAGCAGGT -/A AGTTTTATTG 3070 hom 62 het 24 0 21 3 A 1 2 162605 CASAVA_Build 3 55607961 1D GCTAGAATAG A/- AAGTTTCCAC 3070 het 3070 ref 50 22 22 7 A 3 2 162606 CASAVA_Build 3 55612567 2D5M2I AGGCGTGGTG GTGGACG--/--GCACGTA CCTGTAGTCC 3070 hom 62 het 21 0 19 4 N/A 0 0 162607 CASAVA_Build 3 55616684 1I AATAGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2480 hom 41 9 21 11 G 0 1 162608 CASAVA_Build 3 55625377 1D TAGGAAAGGA G/- TTCCATTGGC 3070 het 3070 ref 38 23 15 0 G 1 0 162609 CASAVA_Build 3 55638029 16I CCTTTCTTAT ----------------/ATGAGGAATTTTTTAC ATGAATGAAG 3070 hom 107 het 39 0 36 3 ATGAGGAATTTTTTAC 0 1 162610 CASAVA_Build 3 55640024 1D ATCAGTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 A 11 10 162611 CASAVA_Build 3 55640820 1I ATAAAGATGT -/G GGGGATTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 G 4 5 162612 CASAVA_Build 3 55643960 1I TTATTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 29 1 19 9 T 12 13 162613 CASAVA_Build 3 55657937 1I AGAAGACAGC -/T TTTTTTGTGA 3070 het 2701 hom 34 10 16 8 T 6 7 162614 CASAVA_Build 3 55659910 1D TCATAGGGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 64 het 27 0 20 7 T 10 9 162615 CASAVA_Build 3 55662289 2I ATATATTTTA --/TG TGTGTGTAAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 TG 3 4 162616 CASAVA_Build 3 55664310 1D CTTCCCATTG C/- CTTATTGATG 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 C 2 1 162617 CASAVA_Build 3 55665894 1I TCCCATAGAC -/A ACGGCCTCTA 3070 hom 113 het 41 0 36 5 A 1 2 162618 CASAVA_Build 3 55675998 2D ACGCCTATTA AT/-- ATACATAATA 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 AT 2 1 162619 CASAVA_Build 3 55685703 1D CTCTGACCTC A/- ACTAGTGTTT 3070 hom 111 het 41 0 37 5 A 2 1 162620 CASAVA_Build 3 55698326 2D GCTTCCTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 12 10 162621 CASAVA_Build 3 55715445 1D TTTGTTTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 8 162622 CASAVA_Build 3 55716507 1D ATCTTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 9 8 162623 CASAVA_Build 3 55717931 2D AGAGAAAGAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 78 het 31 0 25 8 GA 7 6 162624 CASAVA_Build 3 55718019 4I GAGAGGAAAG ----/ACAA ACAGTGTTTG 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 ACAA 0 1 162625 CASAVA_Build 3 55723918 1D ATAAAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 11 3 A 11 10 162626 CASAVA_Build 3 55731305 1D TATGCATATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 126 het 47 0 40 7 A 9 8 162627 CASAVA_Build 3 55748667 1I CCACTTTTTG -/T TGGGGTTGTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 2 162628 CASAVA_Build 3 55761843 1I CCCGGGTATT -/C TATAATTTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 162629 CASAVA_Build 3 55763247 1D AAGAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 23 7 T 11 10 162630 CASAVA_Build 3 55772076 1D ATGATAGAGG T/- TAAATACATA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 T 2 1 162631 CASAVA_Build 3 55780779 8I ACTCTTGCTC --------/CCATTGCA CCATTGCACT 3070 het 3070 hom 62 25 30 7 CCATTGCA 1 2 162632 CASAVA_Build 3 55781146 1D TGCCCAAAGG T/- TAGTATGGTA 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 T 2 1 162633 CASAVA_Build 3 55786145 2I AAAAATACAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 10 12 162634 CASAVA_Build 3 55786356 1I CCTGCAGAAA -/G GCAGAAGTGT 3070 het 3070 hom 50 15 28 7 G 1 2 162635 CASAVA_Build 3 55788961 1D AGTCTTAGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 T 10 9 162636 CASAVA_Build 3 55805311 4D AAGGCCTGGC TTTG/---- TTTGAGAAGA 3070 het 3070 ref 39 20 13 9 TTTG 2 1 162637 CASAVA_Build 3 55807939 14I GCCAAGAAGA --------------/AAAGTTTAAGATGT AAGAAGGTAT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 AAAGTTTAAGATGT 0 1 162638 CASAVA_Build 3 55814743 3I ATTCACAACA ---/ACG ACAACAAAGA 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 ACG 0 1 162639 CASAVA_Build 3 55818838 1D AGAGGTTTGT G/- GTAAGAAATT 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 G 2 1 162640 CASAVA_Build 3 55819534 1D TCTCTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2467 hom 28 9 13 6 T 11 10 162641 CASAVA_Build 3 55820208 8I TAGGATTAAC --------/TTTTAATT TTTTAATTTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 TTTTAATT 1 2 162642 CASAVA_Build 3 55824281 3I ATGCACTGAG ---/ACA ACATCTACTC 3070 het 3070 hom 48 14 27 7 ACA 1 2 162643 CASAVA_Build 3 55847040 1I ACCAGGAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 9 10 162644 CASAVA_Build 3 55915258 1D AGTAGTGGCA G/- GGGGGGCCGG 2010 het 187 hom 11 3 7 1 G 7 6 162645 CASAVA_Build 3 55921777 1I AATCATGGGC -/T TCTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 16 0 T 1 2 162646 CASAVA_Build 3 55942291 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAATA 339 het 339 ref 42 20 3 19 G 1 0 162647 CASAVA_Build 3 55952590 1D ACTCTCAAGC T/- TTTGGTACCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 4 3 162648 CASAVA_Build 3 55965513 1I GATTATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 T 10 11 162649 CASAVA_Build 3 55966017 3I GTGCTTGGGG ---/CTA CTACACAAGG 3070 het 3070 ref 55 24 20 11 CTA 1 2 162650 CASAVA_Build 3 55970776 1D GTGAATTCTT A/- AAATTATTTA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 4 3 162651 CASAVA_Build 3 55973526 1I AGCTACAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 11 12 162652 CASAVA_Build 3 55986441 21I GTGACAAATG ---------------------/GGCAGGGGGAGCATTTAAAAC TCAGATCAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 GGCAGGGGGAGCATTTAAAAC 0 1 162653 CASAVA_Build 3 55989816 1D AAGGTTTTAG A/- AAAAAAAAAA 1197 het 1197 ref 49 36 4 9 A 12 11 162654 CASAVA_Build 3 56002749 1I TCAATTACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 10 11 162655 CASAVA_Build 3 56003276 1I AGAATTAATG -/A ACTGAGTAAT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 1 2 162656 CASAVA_Build 3 56006362 1I AAATATGATT -/C TCGATTGTGG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 C 0 1 162657 CASAVA_Build 3 56009962 1D TCTTAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 2995 het 2742 hom 24 11 8 6 A 15 14 162658 CASAVA_Build 3 56010096 1D CTAATAATGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 A 9 8 162659 CASAVA_Build 3 56012066 2I GAAGAAACTC --/AT AAATATTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 AT 0 1 162660 CASAVA_Build 3 56012282 1D7M1I TTAGCTCAAC AAAATCCA-/-AAATCCAG TGCATTCGCA 3070 hom 86 het 33 0 29 8 N/A 0 0 162661 CASAVA_Build 3 56019351 1D AGGAAGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 11 10 162662 CASAVA_Build 3 56023175 1D ATGAAAAGTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 A 9 8 162663 CASAVA_Build 3 56025496 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 13 14 162664 CASAVA_Build 3 56030644 5I GGGAGCTAAA -----/TTTTT TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 6 11 162665 CASAVA_Build 3 56051050 1D ATTTAAAGTG A/- AAAGAAGCAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 5 A 4 3 162666 CASAVA_Build 3 56068166 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2851 het 2851 ref 25 10 9 6 T 11 10 162667 CASAVA_Build 3 56084212 4I GACTTCCCTG ----/AGTA AGTGACATAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 AGTA 0 1 162668 CASAVA_Build 3 56090262 1I GTGATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 62 24 26 12 A 10 11 162669 CASAVA_Build 3 56095561 1D CAGGGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2285 hom 39 13 13 13 T 15 14 162670 CASAVA_Build 3 56101033 1I TTGACAAGAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 8 9 162671 CASAVA_Build 3 56113702 1D AGATCCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 30 1 25 4 T 14 13 162672 CASAVA_Build 3 56132564 1I TTTATGGTAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 7 8 162673 CASAVA_Build 3 56146471 4I TGTCAGCAAA ----/CTAT CTTTCTCCAT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 CTAT 0 1 162674 CASAVA_Build 3 56167148 1D TTAAACTTTG C/- AAGAATGTCA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 C 1 0 162675 CASAVA_Build 3 56167877 3I AACAAACTTG ---/TTT TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 T 8 11 162676 CASAVA_Build 3 56174302 5D TTGGAGAACA TATAT/----- TATATATGTT 3070 het 3070 hom 38 16 20 5 TATAT 2 1 162677 CASAVA_Build 3 56174850 1D AAAATACTGG C/- CAGCCATTTG 3070 het 3070 ref 50 25 22 4 C 2 1 162678 CASAVA_Build 3 56188749 1D TGGCTCCAAG C/- CTCTTAGCCT 3070 het 3070 hom 55 20 30 5 C 2 1 162679 CASAVA_Build 3 56194220 5D CTGATCTCAG AAGCT/----- AAGCAATATT 3070 het 3070 ref 47 29 13 6 AAGCT 1 0 162680 CASAVA_Build 3 56201207 1D TTATTACCTA C/- ATCTCTCCAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 1 0 162681 CASAVA_Build 3 56201634 2D AATTTTACTT AA/-- GTCACAGGGT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 2 0 162682 CASAVA_Build 3 56209146 8D ATGGATTGAA TACCTATC/-------- TCTCAAGAGT 3070 het 3070 ref 44 24 21 2 TACCTATC 1 0 162683 CASAVA_Build 3 56213965 1D AGAAAAAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 10 9 162684 CASAVA_Build 3 56217382 1D TTCTAACATT C/- ATAGAGGGAT 3070 het 3070 hom 56 20 29 8 C 1 0 162685 CASAVA_Build 3 56245347 1D TTTCGATACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 51 0 35 17 T 10 9 162686 CASAVA_Build 3 56246960 2D TATTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 239 hom 37 3 20 15 T 14 12 162687 CASAVA_Build 3 56256393 2D CAGGCTAATA AT/-- ATGTTATGAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 AT 2 1 162688 CASAVA_Build 3 56268045 1I AATTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 589 hom 20 4 12 4 T 14 15 162689 CASAVA_Build 3 56283583 1D CATTTGGTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 10 9 162690 CASAVA_Build 3 56286817 1D CCAAATTACC A/- AAAAAAAAAA 2789 het 2715 hom 32 12 10 10 A 17 16 162691 CASAVA_Build 3 56309349 1D CATGAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 28 3 17 8 A 15 14 162692 CASAVA_Build 3 56311582 1I AGGACCAGGA -/T TACAATACAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 1 2 162693 CASAVA_Build 3 56313622 3D ACACCAAAGC TAG/--- TAGGCATGAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TAG 2 1 162694 CASAVA_Build 3 56319680 1D TCCTTGCTAC T/- TTAAAGTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 3 2 162695 CASAVA_Build 3 56320468 1I CCCAGGTTCA -/C GCCATTCTCC 1607 hom 10 het 4 0 4 0 C 0 1 162696 CASAVA_Build 3 56327852 1I TGGCTGTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 11 12 162697 CASAVA_Build 3 56340720 3I TGATCTGATG ---/GAA GAAGAAGTAC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 GAA 2 3 162698 CASAVA_Build 3 56342767 1I CAAATGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 10 11 162699 CASAVA_Build 3 56347672 3D ACATGAAAAC AAA/--- GAAGAGTGAG 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 A 3 0 162700 CASAVA_Build 3 56350657 1D TTTTAGGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 12 11 162701 CASAVA_Build 3 56355251 2I AAGGACACGC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TA 5 6 162702 CASAVA_Build 3 56357406 5I TTCCAACACC -----/ATCAT ATCATATCTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 ATCAT 1 2 162703 CASAVA_Build 3 56362876 2D GTATAATAAA AT/-- ATATATATAT 1528 hom 10 het 5 0 4 1 AT 8 7 162704 CASAVA_Build 3 56376332 1D AATGGGCAGC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 A 1 0 162705 CASAVA_Build 3 56376544 2D CTCTCAACTC TT/-- CTCTTTGTCA 3070 het 3070 ref 38 19 17 4 T 2 0 162706 CASAVA_Build 3 56385528 1D AATTGCTCCC A/- AAAAAAAAAA 2579 het 2579 ref 34 8 11 16 A 13 12 162707 CASAVA_Build 3 56385831 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 912 het 449 hom 18 6 3 9 A 15 14 162708 CASAVA_Build 3 56386921 1D CCCTATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 A 11 10 162709 CASAVA_Build 3 56415205 1D AAGTGATCTG C/- CCACATCAGC 2558 het 2558 ref 26 15 7 5 C 3 2 162710 CASAVA_Build 3 56428305 1D TTCCTTGCTC T/- TATCACAAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 2 1 162711 CASAVA_Build 3 56442262 3D AAAAAAAAAA GAG/--- AGAGAGAGAG 446 het 446 ref 20 4 6 10 GAG 1 0 162712 CASAVA_Build 3 56454973 1I AGCGTAATGC -/T TTTTTTTTTT 1369 het 1369 ref 37 24 3 10 T 11 12 162713 CASAVA_Build 3 56466026 5D AATCATATCG AAGTA/----- AAGTAAGAGG 3070 hom 155 het 57 0 52 6 AAGTA 2 1 162714 CASAVA_Build 3 56473955 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 11 12 162715 CASAVA_Build 3 56485615 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAACATGA 3070 hom 81 het 31 0 23 9 C 1 0 162716 CASAVA_Build 3 56488714 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 75 hom 29 1 25 3 T 8 9 162717 CASAVA_Build 3 56525106 1D ATACATATGT G/- GTGTGTATAT 3070 hom 75 het 35 0 25 10 G 2 1 162718 CASAVA_Build 3 56526821 1D TTAGGGTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 T 10 9 162719 CASAVA_Build 3 56543949 2D AACAAACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 126 het 48 0 43 7 AC 8 7 162720 CASAVA_Build 3 56563128 4D TTTTATTATT TATC/---- TATTTGTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 TATC 1 0 162721 CASAVA_Build 3 56572462 1D TTTTTAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 14 13 162722 CASAVA_Build 3 56573332 1D TTGTTCTTTT A/- GAGGACTTTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 1 0 162723 CASAVA_Build 3 56574299 4I AAGATATTTG ----/TATT TATTCCCCTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TATT 1 2 162724 CASAVA_Build 3 56580445 1I AAAGCTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 26 0 19 7 A 11 12 162725 CASAVA_Build 3 56581640 23I GCTTCATTTG -----------------------/CCTTCATTTCTTTTTTACATTTA CTATCCCTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 6 CCTTCATTTCTTTTTTACATTTA 0 1 162726 CASAVA_Build 3 56582909 3I TTGGCCAAGA ---/GAT GATCCATTCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GAT 1 2 162727 CASAVA_Build 3 56615031 2D TTCAGAGATT CC/-- CTGTCCAAAG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 C 3 1 162728 CASAVA_Build 3 56617659 14I TTCATTTGTC --------------/TTTTGTATTTCTTT GTTTGTTTCA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TTTTGTATTTCTTT 0 1 162729 CASAVA_Build 3 56625092 3I AATTCTACGA ---/CTT CTTCTAAGAA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 CTT 1 2 162730 CASAVA_Build 3 56628065 1D GCAGGTGGAT C/- CACCTGAGGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 2 1 162731 CASAVA_Build 3 56628650 2D TGTAAACCCC GT/-- CAACAACTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GT 1 0 162732 CASAVA_Build 3 56629043 5D TGTTGAACGG TTTGT/----- TTTAAGTTAC 3070 hom 84 het 31 0 28 6 TTTGT 1 0 162733 CASAVA_Build 3 56636950 3D AAGCCACACA AAT/--- AATATTCCCA 3070 hom 126 het 46 0 41 9 AAT 2 1 162734 CASAVA_Build 3 56641543 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 A 11 10 162735 CASAVA_Build 3 56644558 1I GGGAAGAATC -/T TAAGTGTTCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 2 162736 CASAVA_Build 3 56646654 2I TCATGGTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 26 1 18 7 T 11 13 162737 CASAVA_Build 3 56648391 1I ATGTTTAGCT -/A AGAAAAGTGA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 1 2 162738 CASAVA_Build 3 56648479 2D GAATGCTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 13 11 162739 CASAVA_Build 3 56650181 3I AAGCTTTATC ---/ACA ACAAGTAAAC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 ACA 1 2 162740 CASAVA_Build 3 56653767 1I AAGAAGGTAG -/T TAAGTCAGGA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 1 2 162741 CASAVA_Build 3 56661467 1D ACAAAACATA C/- AAAAATCAGG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 C 1 0 162742 CASAVA_Build 3 56671040 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 9 10 162743 CASAVA_Build 3 56675221 1D AAGGGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 147 hom 29 1 22 6 A 13 12 162744 CASAVA_Build 3 56678119 1D TCACTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 A 12 11 162745 CASAVA_Build 3 56682954 1D TAACTCATTG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 120 het 43 0 40 4 A 8 7 162746 CASAVA_Build 3 56684642 5D CACAAAATAC TTTAA/----- TTTACTAATA 3070 hom 90 het 37 0 31 10 TTTAA 1 0 162747 CASAVA_Build 3 56689642 1I TGTTTTTGAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 8 162748 CASAVA_Build 3 56693908 1I TAAAAACACA -/T TTTTAGGCCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 4 5 162749 CASAVA_Build 3 56700840 12I GGGCTCCCAA ------------/TTTGGCGGCACT TTTGGCGGCA 3070 hom 31 het 17 0 10 7 TTTGGCGGCACT 1 2 162750 CASAVA_Build 3 56702161 12D CTGGTTAATG ACTGGAAGAAAA/------------ ACTTCCATGC 3070 hom 99 het 32 0 33 4 ACTGGAAGAAAA 1 0 162751 CASAVA_Build 3 56703491 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 1573 hom 21 het 8 0 6 2 A 17 14 162752 CASAVA_Build 3 56704914 4I GCTCCTACAG ----/ATTT ATTTATATAT 3070 hom 88 het 33 0 28 5 ATTT 1 2 162753 CASAVA_Build 3 56707669 1I CACCGCACCC -/G GCCAATGCTC 3070 hom 51 het 20 0 16 4 G 1 2 162754 CASAVA_Build 3 56715547 3D ACAGACAAAA ATG/--- ATACGGATGC 3070 hom 105 het 41 0 36 7 ATG 1 0 162755 CASAVA_Build 3 56717890 1D GCTAGATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 11 10 162756 CASAVA_Build 3 56719624 1D TGCTGGATTT A/- AAAAAAAAAA 2853 hom 21 het 9 0 8 1 A 13 12 162757 CASAVA_Build 3 56729421 1D ATCCAGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 11 10 162758 CASAVA_Build 3 56748465 1D ATTATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 21 3 16 2 T 17 16 162759 CASAVA_Build 3 56748970 1D GTTTCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 933 het 933 ref 23 11 3 9 T 15 14 162760 CASAVA_Build 3 56749256 1I ATGAGCCACC -/A ATGCCTGGCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 1 2 162761 CASAVA_Build 3 56749339 1I ACTTTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 571 hom 20 2 14 4 A 11 12 162762 CASAVA_Build 3 56757634 2D TTTTTTTTTT TG/-- CTTCCATGTA 3070 het 62 hom 31 2 16 15 TG 1 0 162763 CASAVA_Build 3 56791718 1D TTTCCTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 20 0 14 6 A 15 14 162764 CASAVA_Build 3 56804102 1I AATTCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 887 hom 32 4 20 8 T 14 15 162765 CASAVA_Build 3 56815915 2I GACAATGCTT --/TG TGTCCTATTA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 TG 1 2 162766 CASAVA_Build 3 56823734 1I TCCTTCTCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 T 9 10 162767 CASAVA_Build 3 56838799 1D ATGTTCTGAC A/- AACAGCAGGC 3070 het 3070 ref 47 28 13 8 A 3 2 162768 CASAVA_Build 3 56841587 1D TCTTTGGCCA C/- CCCCAGTGAC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 C 5 4 162769 CASAVA_Build 3 56842982 1D AATATTCTTT G/- TTTTCCCCCC 2672 het 223 hom 19 4 9 6 G 1 0 162770 CASAVA_Build 3 56845687 1I TACAACAATC -/A AGACAAGATA 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 A 1 2 162771 CASAVA_Build 3 56848023 2D CATAGTGAGA CC/-- CCCCTATCTC 3070 het 2961 hom 19 9 10 0 C 6 4 162772 CASAVA_Build 3 56848207 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 15 12 A 12 11 162773 CASAVA_Build 3 56852503 2D ACTTTTGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 57 hom 22 1 10 11 T 13 11 162774 CASAVA_Build 3 56854030 2D AAGATTGGGT TA/-- TGTACTCATA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 TA 1 0 162775 CASAVA_Build 3 56854193 3I TCCTTCAACC ---/ATA ACAAGAAGCT 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 ATA 0 1 162776 CASAVA_Build 3 56861772 1D CACATGCTGT A/- AAAAAACCCA 3070 hom 111 het 42 0 37 6 A 7 6 162777 CASAVA_Build 3 56865777 1D AGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 321 hom 21 2 14 5 T 12 11 162778 CASAVA_Build 3 56875063 1D TCTGCAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 12 11 162779 CASAVA_Build 3 56881119 4D TTGCCAGATG TTAC/---- TTAATGCATT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 TTAC 1 0 162780 CASAVA_Build 3 56882292 1I GCTATGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 578 hom 22 2 13 7 T 13 14 162781 CASAVA_Build 3 56889546 1I GGTTCTTCGA -/T TAGAAAGCAT 3070 het 3070 ref 47 27 19 1 T 1 2 162782 CASAVA_Build 3 56890103 1I TAAAAATAGC -/T TAAAAAAAAT 3070 hom 53 het 38 1 28 9 T 1 2 162783 CASAVA_Build 3 56900410 1D AGTACACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 24 1 11 12 T 15 14 162784 CASAVA_Build 3 56901659 2I AAATATTATC --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 TA 4 5 162785 CASAVA_Build 3 56922243 1I ACAACAACAA -/C AAAAAACTAT 3070 het 50 hom 22 1 20 1 C 0 1 162786 CASAVA_Build 3 56924368 1D ACGTCTCCAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 37 0 30 8 A 9 8 162787 CASAVA_Build 3 56927642 1D AAAGGGATGC A/- AGCCTGCAAA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 A 2 1 162788 CASAVA_Build 3 56932361 1I TTTTGTATAG -/A GTTTTAATTT 2858 het 2858 ref 20 13 6 1 A 0 1 162789 CASAVA_Build 3 56934681 25D TAATTTAATT CTATGACCACCCTATGAGATAAGTA/------------------------- CTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 40 24 17 3 CTATGACCACCCTATGAGATAAGTA 1 0 162790 CASAVA_Build 3 56935929 1I TGGATGAATA -/C CCCCGGGAGG 3070 het 2777 hom 27 9 14 4 C 4 5 162791 CASAVA_Build 3 56949766 1I GCTCACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 10 11 162792 CASAVA_Build 3 56963267 2I ACAATGCCTT --/GC TCACAGCAGG 3070 het 3070 ref 58 33 18 7 GC 0 1 162793 CASAVA_Build 3 56964428 1I CACGCCCAGC -/T TAATTTTGGG 1269 het 1269 ref 15 10 4 1 T 1 2 162794 CASAVA_Build 3 56969216 1D CAAAAGAGAT A/- AAATACAAGG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 4 3 162795 CASAVA_Build 3 56970199 1D18M10D AATCTTATAA GGTAGCTTATTATGTTATAATGTAAATAC/-GTAGCTTATTATGTTATA---------- ATGACATACA 3070 het 3070 ref 49 28 25 8 N/A 0 0 162796 CASAVA_Build 3 56970693 2I TAAGTGTCCC --/TG TGTCAGCTGG 3070 het 3070 ref 46 23 11 12 TG 1 2 162797 CASAVA_Build 3 56974714 10D AACTACATTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 1494 hom 23 7 11 7 T 21 11 162798 CASAVA_Build 3 56978211 4D ATGTATAAAG ATCT/---- ACTTGAACAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 ATCT 1 0 162799 CASAVA_Build 3 56987230 1I ATAAGCCTAC -/T TACCTTTATT 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 T 1 2 162800 CASAVA_Build 3 56992123 1D AGTAAGCAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 8 7 162801 CASAVA_Build 3 56993066 4I CCACACTGTA ----/CAGT CAGTCCCTCA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 CAGT 1 2 162802 CASAVA_Build 3 56993642 1I TCACAGGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 9 10 162803 CASAVA_Build 3 56994154 5D CAGAAACACA TGATT/----- TGATTTGATT 3070 het 3070 hom 34 12 19 6 TGATT 3 2 162804 CASAVA_Build 3 56995878 1D GCGAATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 94 hom 29 2 11 16 A 11 10 162805 CASAVA_Build 3 56995952 1D GGTCCATGGA T/- ATTGAATCCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 0 162806 CASAVA_Build 3 57025456 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 1198 het 1198 ref 11 6 3 2 A 12 10 162807 CASAVA_Build 3 57030384 5D AGAAACTTTT AACAA/----- AACAAGAATG 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 AACAA 2 1 162808 CASAVA_Build 3 57032613 21D CTTGGGACCC TTAGGACAGAGTCTAAGCTCT/--------------------- TTACTACCAA 3070 het 3070 ref 29 20 12 7 TTAGGACAGAGTCTAAGCTCT 1 0 162809 CASAVA_Build 3 57040834 3D GGCAGTTTTG GAA/--- GAAGAAAGGA 3070 het 3070 hom 40 18 22 1 GAA 3 2 162810 CASAVA_Build 3 57043368 2I CAAATGGCTT --/AA AAAAAAAAAA 2641 het 1238 hom 24 5 9 10 A 12 14 162811 CASAVA_Build 3 57049975 5D CCTCCTCTGT GAAGG/----- AGTACCTTCA 3070 hom 102 het 37 0 32 8 GAAGG 1 0 162812 CASAVA_Build 3 57051335 1I ACTGATTGGT -/G GTAGAATATG 3070 het 3070 ref 49 28 17 4 G 1 2 162813 CASAVA_Build 3 57056467 3I TCGTCTCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 32 11 10 11 AAC 5 6 162814 CASAVA_Build 3 57067275 1I AAGGAATGCC -/T TGGAAATTAG 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 T 1 2 162815 CASAVA_Build 3 57071239 4I TGGAGCAGCT ----/CAAA CAGTCATGTG 3070 het 3070 ref 55 26 19 10 CAAA 0 1 162816 CASAVA_Build 3 57078717 1D TAAACTAAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 21 20 1 T 10 9 162817 CASAVA_Build 3 57081186 3D GATGGATAAT AAC/--- AAGAGTTGAT 3070 het 3070 hom 44 15 23 7 AAC 1 0 162818 CASAVA_Build 3 57084582 1D TTTTTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3025 het 1395 hom 25 7 9 9 A 13 12 162819 CASAVA_Build 3 57086387 2I GAGATGTAAC --/AG GGGGCAAGAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 AG 0 1 162820 CASAVA_Build 3 57089004 4D TATGGGACTC TAAA/---- TAAAGCGAGT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TAAA 2 1 162821 CASAVA_Build 3 57089849 3D CAAAGGGCTT CTC/--- CTCTCTCTGA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 CTC 2 1 162822 CASAVA_Build 3 57093691 1D TCTGCAGCTT G/- GGGTGACACA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 G 4 3 162823 CASAVA_Build 3 57101657 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2023 hom 15 6 8 2 A 13 12 162824 CASAVA_Build 3 57111082 3I1M4D AATCCCAGCA ---TGAGA/CTTT---- GGGAGGCTGA 3070 het 3070 ref 35 17 16 4 N/A 0 0 162825 CASAVA_Build 3 57116454 1I CTCGAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 1393 hom 22 5 15 2 G 0 1 162826 CASAVA_Build 3 57125527 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 2109 het 1527 hom 13 4 5 4 T 6 5 162827 CASAVA_Build 3 57133594 1D TGGATGGAGG A/- AGGAGGAGCT 3070 hom 90 het 36 0 26 10 A 2 1 162828 CASAVA_Build 3 57153796 2I CTCAGGATAA --/GT GTTCTTGGAC 3070 hom 105 het 44 0 35 9 GT 1 2 162829 CASAVA_Build 3 57168192 1I ATATCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 1765 het 1765 ref 59 31 5 23 T 15 16 162830 CASAVA_Build 3 57177733 4I TTCCCATTGA ----/TTCT TTCTCCCATC 3070 het 3070 hom 51 18 29 4 TTCT 1 2 162831 CASAVA_Build 3 57178911 1I GTCCCTGAGA -/C CCCCACAAGA 3070 het 3070 ref 38 12 11 15 C 4 5 162832 CASAVA_Build 3 57193642 1D TTATTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 15 14 162833 CASAVA_Build 3 57199893 1I ATTTTGGGCA -/G ATAAAGGGTT 3070 het 2671 hom 27 8 12 7 G 0 1 162834 CASAVA_Build 3 57200698 1I TCTTTATGCA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 8 9 162835 CASAVA_Build 3 57202466 1D TTTAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2793 het 1793 hom 18 7 7 4 A 13 12 162836 CASAVA_Build 3 57203887 4D TGATGGGCTT TGTC/---- TGGCTGGCTT 3070 het 3070 ref 48 25 18 10 TGTC 1 0 162837 CASAVA_Build 3 57213867 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 10 15 A 17 16 162838 CASAVA_Build 3 57239510 1D TATTCTACTG T/- TTTTTTTTTC 1741 het 1741 ref 49 39 4 6 T 10 9 162839 CASAVA_Build 3 57251299 1D GTAATAATTG A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 36 13 18 7 A 8 7 162840 CASAVA_Build 3 57259039 2D AAATGTGAAT GG/-- GGGGGGGTTG 3070 het 3070 hom 50 22 18 12 G 9 7 162841 CASAVA_Build 3 57265397 1D TTAAATACCA T/- TTTTTATTTA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 6 5 162842 CASAVA_Build 3 57269925 5D AAATTCTTAC AAATT/----- AAATTAGTTA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 AAATT 2 1 162843 CASAVA_Build 3 57271580 1I CCTGCCTCAG -/C CTCCCAAGTA 3070 het 1857 hom 16 5 10 1 C 1 2 162844 CASAVA_Build 3 57276097 1I GGTAATGTGA -/T TGCCTCCAGC 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 1 2 162845 CASAVA_Build 3 57285355 1D CTTTAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 T 10 9 162846 CASAVA_Build 3 57292905 1D GCCAAAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 9 12 6 A 10 9 162847 CASAVA_Build 3 57300301 1I AAAGACATTT -/A TTCTAGTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 A 0 1 162848 CASAVA_Build 3 57300436 16I AGCAGGTGTG ----------------/CTTGACTGCAGACTGC CCATATCCAG 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 CTTGACTGCAGACTGC 0 1 162849 CASAVA_Build 3 57300717 2D TATCCTCCTT TC/-- TTTCTTCTGA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TC 1 0 162850 CASAVA_Build 3 57308867 1I CTCCAGAGCT -/G TGAGAAATAA 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 G 0 1 162851 CASAVA_Build 3 57355970 1I AGAATCTCCC -/A AAAACTCTCA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 A 4 5 162852 CASAVA_Build 3 57366325 4D AAAGAATATG TTCA/---- TTAAGAAATG 3070 het 3070 ref 34 18 13 6 TTCA 1 0 162853 CASAVA_Build 3 57385558 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1086 het 1086 ref 28 12 4 12 A 17 16 162854 CASAVA_Build 3 57392898 1D AAGGAATGTG A/- ATGACTAACC 3070 het 3070 hom 31 10 11 10 A 2 1 162855 CASAVA_Build 3 57392936 1D TCAGTATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 33 6 14 13 T 17 16 162856 CASAVA_Build 3 57393523 4D GGAGGAAGAT AAAC/---- AAACTAGGAA 3070 het 3070 ref 41 21 17 5 AAAC 2 1 162857 CASAVA_Build 3 57393942 1D TTCATTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2592 hom 41 9 19 13 A 15 14 162858 CASAVA_Build 3 57395604 1D ACTGGTTTCA C/- TTAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 C 1 0 162859 CASAVA_Build 3 57396641 2I TCTATTTTTG --/TA TATGTTTAAA 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 TA 1 2 162860 CASAVA_Build 3 57397917 1D TTTACTAGTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 9 8 162861 CASAVA_Build 3 57398158 1D TCCTGCACAC T/- TGTAGTAACC 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 2 1 162862 CASAVA_Build 3 57400511 3D CAACAGAAAA AAC/--- AACAACCTAC 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 AAC 3 2 162863 CASAVA_Build 3 57406332 1D TTAGTAGTAC T/- TTTAATATTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 T 4 3 162864 CASAVA_Build 3 57416058 1I CAAGGCCAGG -/T GTGGTGACTG 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 0 1 162865 CASAVA_Build 3 57424048 2I CTCTATTTAG --/AA AAAAAAAAAA 2208 het 2208 ref 19 8 6 5 A 12 14 162866 CASAVA_Build 3 57432996 5I AATGGAAGAA -----/ATGGG ATGGGAGCAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 ATGGG 1 2 162867 CASAVA_Build 3 57433809 1I TTCTTATAAA -/T TATTTTATTT 3004 het 3004 ref 20 9 8 3 T 1 2 162868 CASAVA_Build 3 57434473 2D TACATACATC TA/-- TATATATAAT 3070 het 2233 hom 17 5 10 3 TA 5 4 162869 CASAVA_Build 3 57435742 1D ACTCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 13 5 A 11 10 162870 CASAVA_Build 3 57439921 1I CAAGACCCAT -/C AGTGTGCTGT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 C 0 1 162871 CASAVA_Build 3 57446367 1I TGGGGTTTCA -/C CATGTTGGCC 3070 het 1811 hom 13 4 8 1 C 1 2 162872 CASAVA_Build 3 57448637 1D TTATAAAGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 10 9 162873 CASAVA_Build 3 57452541 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2968 hom 24 8 9 7 A 9 10 162874 CASAVA_Build 3 57455776 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 11 12 162875 CASAVA_Build 3 57456352 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAATATA 1040 het 495 hom 5 1 3 1 A 7 6 162876 CASAVA_Build 3 57457737 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1333 het 1333 ref 37 29 3 5 A 12 11 162877 CASAVA_Build 3 57459782 8I AAAAACAAAA --------/ACAAACAC ACACACACAC 3070 het 3036 hom 19 8 7 4 ACAAACAC 0 1 162878 CASAVA_Build 3 57460926 1I TACTCCTCAG -/C CCCCCCCTAG 3064 het 2549 hom 24 7 10 7 C 7 8 162879 CASAVA_Build 3 57463320 3I TGTAGATCTT ---/TTC TTTTTTTTTC 3070 het 2424 hom 31 9 18 4 TTC 0 1 162880 CASAVA_Build 3 57474282 4I TATAATAAAA ----/AAAG AAAATACTAC 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 AAAG 0 1 162881 CASAVA_Build 3 57488788 1I GATTTAAGTC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 20 10 9 2 T 7 8 162882 CASAVA_Build 3 57489392 1D CTCGGGAGGC T/- TGAGGCAGGA 1039 hom 7 het 4 0 3 3 T 2 1 162883 CASAVA_Build 3 57506078 2I ACCCGACTAA --/TT TTTTTTTTCT 2400 het 555 hom 14 4 10 0 T 8 10 162884 CASAVA_Build 3 57518960 3D TGTTCATAAT AAG/--- AAGAGCAGCT 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 AAG 2 1 162885 CASAVA_Build 3 57519298 8I GTCTCTGTCA --------/CCTAGGCT CCTAGGCTGG 3003 het 1514 hom 17 5 8 4 CCTAGGCT 1 2 162886 CASAVA_Build 3 57519615 1D ATCCTGAAAC T/- TTAAGTTGGA 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 T 3 2 162887 CASAVA_Build 3 57520210 1I TTGTTTAAAG -/C TGTTTTACAC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 C 0 1 162888 CASAVA_Build 3 57529626 1D TGTTATGGAC A/- AAAAAAAAAA 1539 het 1539 ref 29 11 8 12 A 17 16 162889 CASAVA_Build 3 57531195 3I ACCATGTTGC ---/CCA GGCTGGTCTT 1173 het 460 hom 11 2 3 6 CCA 0 1 162890 CASAVA_Build 3 57535176 1I GAAGTACAAA -/T TTTTTTTTTT 2918 het 73 hom 22 1 13 8 T 17 18 162891 CASAVA_Build 3 57536073 1D CTCTCCCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 31 3 23 5 A 15 14 162892 CASAVA_Build 3 57538161 1D GACCCTGGGG A/- AAAATTGTTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 5 4 162893 CASAVA_Build 3 57539658 1D AGCTAGAAAA G/- GGGGGGGGCA 2094 het 2094 ref 21 10 6 5 G 9 8 162894 CASAVA_Build 3 57543523 5I AAAAAAATTA -----/TTAAC TTAAGTAATA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTAAC 0 1 162895 CASAVA_Build 3 57547052 4D AGCAAGGACA CTTT/---- CTTAATATTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 CTTT 1 0 162896 CASAVA_Build 3 57551429 2D ATAATTATAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 GT 6 5 162897 CASAVA_Build 3 57552028 1D CTTGTTCATG A/- ATGTTGAAGA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 2 1 162898 CASAVA_Build 3 57561117 4D CTCTTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCCT 3070 hom 66 het 24 0 22 5 TTTC 3 2 162899 CASAVA_Build 3 57577249 3D AGGAAGAAGA AAG/--- AAGGAGGAAG 3070 het 2865 hom 31 10 13 11 AAG 2 1 162900 CASAVA_Build 3 57588855 2D CTTTCTACCC TG/-- TAACTAGCAT 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 TG 1 0 162901 CASAVA_Build 3 57598534 1D ATAAGACTTC A/- AAAAAAAAAA 2714 het 98 hom 26 2 8 16 A 13 12 162902 CASAVA_Build 3 57598581 1D ACAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 hom 48 het 26 0 17 9 T 1 0 162903 CASAVA_Build 3 57610398 2D TCAATGAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 2897 het 333 hom 18 3 10 5 A 12 10 162904 CASAVA_Build 3 57610436 2I TGTATGTGTG --/TA TATATATATA 2997 het 1186 hom 22 5 8 9 TA 5 6 162905 CASAVA_Build 3 57622798 1D TTTTTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 T 12 11 162906 CASAVA_Build 3 57641563 1I CAATAAGCAC -/A TGAAAAAACA 3070 hom 86 het 35 0 30 5 A 0 1 162907 CASAVA_Build 3 57663196 1D GTTATGAACT G/- AATGTTTGTG 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 G 1 0 162908 CASAVA_Build 3 57674466 1D GTGTCTGCCC G/- GGGCTAGAGG 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 G 4 3 162909 CASAVA_Build 3 57674950 1D CCTCGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2794 hom 32 8 14 10 T 11 10 162910 CASAVA_Build 3 57676120 1I TTTTATATCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 A 8 9 162911 CASAVA_Build 3 57683459 5D CACACCCATC TAAAT/----- TAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 TAAAT 1 0 162912 CASAVA_Build 3 57687790 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2796 hom 26 9 10 7 A 13 12 162913 CASAVA_Build 3 57710858 1I GGTCATACGC -/T TATGAAACCG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 1 2 162914 CASAVA_Build 3 57714394 1D TCCCAACCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 934 hom 36 3 23 10 T 14 13 162915 CASAVA_Build 3 57715901 1D GATTACAGGC A/- TGCGCCACCA 1386 het 480 hom 5 1 4 1 A 1 0 162916 CASAVA_Build 3 57720047 1D CTCGTAATCC T/- TTTTTTTTTT 1045 het 1045 ref 26 9 4 13 T 15 14 162917 CASAVA_Build 3 57738120 4I GAGGCTATAA ----/TAAG TAATTTACAG 3070 hom 60 het 24 0 21 4 TAAG 0 1 162918 CASAVA_Build 3 57741771 2D ATGTATGCAC AT/-- ATATATATAC 3022 het 2896 hom 21 10 9 2 AT 5 4 162919 CASAVA_Build 3 57752967 1D TTATTTTGAT G/- GTATTGATTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 G 2 1 162920 CASAVA_Build 3 57757786 1I GTCTCTATAA -/T TTTTTTTTTT 2165 het 2165 ref 17 9 7 1 T 11 12 162921 CASAVA_Build 3 57805438 1D AAGGTGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 10 9 162922 CASAVA_Build 3 57814836 2I TATAACACAT --/TA TATATATATA 1708 hom 10 het 4 0 4 0 TA 6 7 162923 CASAVA_Build 3 57815102 1D GGGGGCTCTT G/- GCCTGTAATC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 2 1 162924 CASAVA_Build 3 57821891 1D CCATGATATG T/- GCTGGGGAAT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 1 0 162925 CASAVA_Build 3 57853599 1D ACTTGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1287 het 251 hom 26 6 9 11 T 19 18 162926 CASAVA_Build 3 57854213 1D GAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 24 0 20 4 A 13 12 162927 CASAVA_Build 3 57856711 1I ACGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1763 hom 26 6 10 10 A 15 16 162928 CASAVA_Build 3 57856825 1I CTGATCGTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 411 hom 26 1 19 6 T 9 10 162929 CASAVA_Build 3 57883635 1D ATCTGCACAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 9 8 162930 CASAVA_Build 3 57918641 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 24 1 18 5 A 11 12 162931 CASAVA_Build 3 57925715 1I GTGCTTTTCA -/C CCTCTGGAGG 3070 hom 75 het 31 0 23 8 C 2 3 162932 CASAVA_Build 3 57939886 4I AAAAAAAAAG ----/TATT TATTTTTTTT 3070 het 2346 hom 20 8 12 0 TATT 1 2 162933 CASAVA_Build 3 57941142 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2280 hom 23 10 10 3 A 11 10 162934 CASAVA_Build 3 57952587 1I GGGGTTATGT -/A AAGATTAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 2 3 162935 CASAVA_Build 3 57967022 8I CTGGAGTGCA --------/ATGGCGCG ATCTTGGCTC 1220 het 1220 ref 12 4 3 5 ATGGCGCG 0 1 162936 CASAVA_Build 3 57977225 1D TTTGTATGTG C/- CCCTTCCTCA 1845 het 1845 ref 11 7 4 0 C 4 3 162937 CASAVA_Build 3 57989859 2D TTAAAATAAA TT/-- TGTGTCATTG 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 T 3 1 162938 CASAVA_Build 3 57990638 1D TGACTGAGTG T/- ACATGCTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 T 1 0 162939 CASAVA_Build 3 57994165 1D ATGCTGTTTT G/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 G 1 0 162940 CASAVA_Build 3 58012443 1D GGGAGGGCAG T/- TTTTTTGGGT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 7 6 162941 CASAVA_Build 3 58027959 1D TTTAGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 20 11 T 12 11 162942 CASAVA_Build 3 58029384 1I TTCAGCCATG -/T GTTTGTTTGG 3070 het 3070 ref 40 14 13 13 T 0 1 162943 CASAVA_Build 3 58030658 1I CTGCTTGCAC -/A AAAACACTTG 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 4 5 162944 CASAVA_Build 3 58032771 1D TCCTTCACCA G/- GACCAGAGAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 G 2 1 162945 CASAVA_Build 3 58034342 2D AAGTTCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 9 15 T 16 14 162946 CASAVA_Build 3 58040023 1I GGACTTAAAA -/T TTTTTTTTTT 2974 het 1188 hom 19 5 9 5 T 15 16 162947 CASAVA_Build 3 58045332 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 9 10 162948 CASAVA_Build 3 58046049 1I TTAAAGTAGG -/A AGACAAAATG 3070 het 3070 ref 42 25 12 5 A 1 2 162949 CASAVA_Build 3 58047230 1D ATTTCTAGCC T/- TTTTTCTATG 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 6 5 162950 CASAVA_Build 3 58052397 1I ATGATCCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 9 10 162951 CASAVA_Build 3 58075319 1I TTATAAACCC -/A GAAATGGAAT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 0 1 162952 CASAVA_Build 3 58085621 1I AACCATAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 8 9 162953 CASAVA_Build 3 58094321 3D CCTGCAAGTA GTT/--- TTCTGATTGG 3070 het 3070 hom 33 17 16 0 GTT 1 0 162954 CASAVA_Build 3 58143332 1D TAACAAATAA T/- TTTTTAGTGT 3070 het 2465 hom 18 5 9 4 T 6 5 162955 CASAVA_Build 3 58143653 1D ACTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1456 het 1456 ref 11 4 3 4 T 13 12 162956 CASAVA_Build 3 58153843 1D TCAACCCATC T/- TTTTTTTTTT 1707 het 69 hom 20 2 9 9 T 19 18 162957 CASAVA_Build 3 58171002 10D AAAGAAAAAG GAAGAAAGAA/---------- AAAGAAAGAA 1613 het 1613 ref 31 24 7 3 GAAGAAAGAA 1 0 162958 CASAVA_Build 3 58206595 4I AAAGAAAGAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 2966 het 2685 hom 21 9 9 3 AAAG 3 4 162959 CASAVA_Build 3 58207807 1D CTAATGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2738 hom 41 15 13 13 T 15 14 162960 CASAVA_Build 3 58213935 1D CACAGAGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 12 11 162961 CASAVA_Build 3 58217113 2D CTTTATAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 12 10 162962 CASAVA_Build 3 58218155 2I TTTTTGAAAC --/AG AGTCTCCCTC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 AG 1 2 162963 CASAVA_Build 3 58225771 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 8 9 162964 CASAVA_Build 3 58232101 2D TTTAAAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1255 hom 18 5 10 3 A 14 12 162965 CASAVA_Build 3 58249381 4I GGATAAACCC ----/ACTA ACTGACTGAC 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 ACTA 0 1 162966 CASAVA_Build 3 58249996 1I TAATTTTTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 467 hom 11 2 8 1 T 8 9 162967 CASAVA_Build 3 58256886 3I ATCCGAACCC ---/GGA AGGACAGTAG 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 GGA 0 1 162968 CASAVA_Build 3 58260133 1D GCTTTGTGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 10 9 162969 CASAVA_Build 3 58261039 4D TGCAGAGAAA AAAC/---- AAACAAGATA 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 AAAC 2 1 162970 CASAVA_Build 3 58263150 2I ACATAGGGGG --/TA TGTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 TA 0 1 162971 CASAVA_Build 3 58264064 1I CTGTTTCTAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 7 8 162972 CASAVA_Build 3 58264257 4D TTTAGTTGAA AAAC/---- AAAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 AAAC 1 0 162973 CASAVA_Build 3 58264386 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGCCTCAGC 2182 het 729 hom 10 3 6 1 CTC 1 0 162974 CASAVA_Build 3 58264586 5D CCAAAAAACA AGTTT/----- TTTGTCTTTA 3070 het 3070 hom 23 10 12 3 AGTTT 1 0 162975 CASAVA_Build 3 58269232 1D AGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 T 11 10 162976 CASAVA_Build 3 58270975 4D CCCTGCCTTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 8 AAAC 3 2 162977 CASAVA_Build 3 58271250 1D TTAATATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 17 8 T 12 11 162978 CASAVA_Build 3 58272450 6I ATTGGGAATA ------/GTACTG CAATAAATAT 2967 het 2967 ref 35 17 7 11 GTACTG 0 1 162979 CASAVA_Build 3 58280400 1D TGCTTATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 24 3 7 15 A 13 12 162980 CASAVA_Build 3 58282833 3I TAGACCTTTT ---/TTG TTGTTGTATG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TTG 2 3 162981 CASAVA_Build 3 58283684 2D ATTTCCACTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 23 14 10 T 11 9 162982 CASAVA_Build 3 58284755 1D AAAGAAGAAA T/- TGCTAAATGC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 2 1 162983 CASAVA_Build 3 58289728 1D TCCATTTTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 10 15 1 A 10 9 162984 CASAVA_Build 3 58290904 4D TATTTATTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 2924 het 2924 ref 31 13 9 9 TTTG 4 3 162985 CASAVA_Build 3 58312584 1I CTGCTTTTTG -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 T 6 7 162986 CASAVA_Build 3 58317670 1D GCCCGGCCTC T/- TTTTTTTTTT 2981 hom 15 het 10 0 7 5 T 13 12 162987 CASAVA_Build 3 58329854 1D TCAGTAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 10 9 162988 CASAVA_Build 3 58333909 1I GCAGTGGTGC -/A ATCTCTGCTC 3070 het 2406 hom 25 8 11 6 A 1 2 162989 CASAVA_Build 3 58334064 3I CCAGGATGGT ---/CTC GATCTCCTGA 2837 het 1449 hom 16 4 7 5 CTC 0 1 162990 CASAVA_Build 3 58335802 1I GCAGAGCAAT -/A ACATTTAAAA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 A 1 2 162991 CASAVA_Build 3 58336716 3D ACACCAAGTT AAC/--- AACAGCTACC 3070 het 3070 ref 24 13 9 4 AAC 2 1 162992 CASAVA_Build 3 58337628 4I GCTGGTATCT ----/AATC AACTCCTGAC 3070 het 2733 hom 31 8 19 4 AATC 0 1 162993 CASAVA_Build 3 58342740 1I TTATGTTTTT -/A ATGTAACTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 1 2 162994 CASAVA_Build 3 58345255 1D CCTTCACTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 169 het 63 0 57 7 T 8 7 162995 CASAVA_Build 3 58349432 7D GTATTTGGTC ATCACAT/------- ATCACATCAC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 ATCACAT 2 1 162996 CASAVA_Build 3 58350446 3I AAAACAAACA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 15 1 10 4 AAC 0 1 162997 CASAVA_Build 3 58352267 1I TGGAGTTTAC -/T TTCCCAAAAA 3070 het 1006 hom 36 4 25 7 T 2 3 162998 CASAVA_Build 3 58352966 1D ACTAATGAGG A/- ATTTAGATAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 2 1 162999 CASAVA_Build 3 58365697 1I AGTAGGAGAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 7 8 163000 CASAVA_Build 3 58366044 1I TACTTACAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 9 10 163001 CASAVA_Build 3 58368271 1I TTGAGTTGTC -/T TTTTACTCCG 2295 het 1486 hom 14 3 6 5 T 4 5 163002 CASAVA_Build 3 58370538 2I CAGTTTTTTT --/TG GGGGAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TG 0 1 163003 CASAVA_Build 3 58374059 1D CACAAATGCG C/- CGTGGCCCAG 2976 het 2976 ref 33 15 9 9 C 2 1 163004 CASAVA_Build 3 58374379 4I CATAATACTA ----/TCTT TCTTTTATTT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 TCTT 1 2 163005 CASAVA_Build 3 58374927 1D TTAGGCTGAT C/- AGAAATGTCT 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 C 1 0 163006 CASAVA_Build 3 58375384 1D ACCCAGCCTG A/- AGGGGAGTCT 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 A 2 1 163007 CASAVA_Build 3 58377365 3D GAGTGAGAGC AGG/--- AGGACTCTGA 3070 hom 80 het 30 0 25 5 AGG 2 1 163008 CASAVA_Build 3 58379383 4I TTCTTTGAGG ----/CTGT CTTTTAAAAG 3070 hom 123 het 44 0 41 3 CTGT 0 1 163009 CASAVA_Build 3 58380677 4D TTTATGGCCT TAAG/---- TAAGTTTCAC 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 TAAG 2 1 163010 CASAVA_Build 3 58384341 2I GAGTATTGTG --/TT TTGGTGATTC 3070 het 3070 ref 53 26 17 10 T 2 4 163011 CASAVA_Build 3 58384577 1D TTCTGAACTC G/- GGTGTTTATT 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 G 3 2 163012 CASAVA_Build 3 58386129 2D AGAAACATTC CT/-- CTTACAGTTC 3070 het 3070 hom 44 18 21 6 CT 2 1 163013 CASAVA_Build 3 58387460 4I GGTTTTTTGT ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 TTTG 1 2 163014 CASAVA_Build 3 58388380 1I ACATTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 780 hom 21 2 13 6 A 13 14 163015 CASAVA_Build 3 58391811 3I ATGTTTTTAT ---/TTA TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 TTA 0 1 163016 CASAVA_Build 3 58397739 1I GATTAATAAG -/T TATTCAGTTT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 1 2 163017 CASAVA_Build 3 58399344 4D AGGAATACTC AATT/---- AGTTTGACCA 3070 het 3070 ref 35 20 12 6 AATT 1 0 163018 CASAVA_Build 3 58410585 1I TTTTAAATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 9 10 163019 CASAVA_Build 3 58417762 1D ATAATGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 634 hom 31 5 15 12 T 20 19 163020 CASAVA_Build 3 58419268 1I GTTCTCTATT -/G GTTCCAGATT 3070 hom 75 het 30 0 22 8 G 1 2 163021 CASAVA_Build 3 58420840 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1558 hom 26 7 13 6 A 13 12 163022 CASAVA_Build 3 58429057 3D AAGTATCTTA CAG/--- TTTGTCTGAA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 CAG 1 0 163023 CASAVA_Build 3 58429818 2I GTAACAAAAG --/AC AGATTAACAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AC 0 1 163024 CASAVA_Build 3 58432976 9D TCAAGGGATC TGTTGGTCT/--------- TGCTAAGTGG 3070 het 3070 ref 46 25 13 8 TGTTGGTCT 1 0 163025 CASAVA_Build 3 58436567 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 9 10 163026 CASAVA_Build 3 58438730 1D CTCTCTTCAT C/- CCCCCTACCT 3070 hom 36 het 16 0 11 5 C 6 5 163027 CASAVA_Build 3 58442715 1D AAATTTTGGT A/- AAGGCAAAGC 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 A 3 2 163028 CASAVA_Build 3 58456277 1D TTTTTCATGC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 9 8 163029 CASAVA_Build 3 58456900 1I TTTTTTTGGT -/G GGGGGGGCCT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 7 8 163030 CASAVA_Build 3 58466568 1I CTTTTGACTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 9 10 163031 CASAVA_Build 3 58469996 1I AGGCTTGTTT -/A AAAAAAACAG 3070 het 2714 hom 30 6 19 5 A 7 8 163032 CASAVA_Build 3 58476772 1D TTTATTTCTA T/- TTTTTTCTAG 3070 hom 50 het 20 0 17 3 T 7 6 163033 CASAVA_Build 3 58532216 1I TTAACTTCCC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 T 7 8 163034 CASAVA_Build 3 58533456 2I TGGGATGTTT --/TA TGACTTTGGT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 TA 0 1 163035 CASAVA_Build 3 58533812 1D TCCAGGCCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 23 8 A 10 9 163036 CASAVA_Build 3 58536294 2I TACTTGTCTC --/AA GATACACAGA 3070 hom 110 het 43 0 37 6 A 0 2 163037 CASAVA_Build 3 58539246 1D GAGGCAGGAG A/- ATTGCTTGAA 3070 het 2836 hom 19 6 13 0 A 2 1 163038 CASAVA_Build 3 58543239 1D AGGATGCAGG T/- TAACGCCCCT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 2 1 163039 CASAVA_Build 3 58556336 1I CCCTGCCTGT -/A AAAAAATTGC 1360 het 1360 ref 21 16 3 2 A 6 7 163040 CASAVA_Build 3 58557446 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2003 hom 25 8 12 5 A 15 16 163041 CASAVA_Build 3 58562051 1I CTCCTCCCAG -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 6 7 163042 CASAVA_Build 3 58564606 3D GGATGTAGGT GGA/--- GGAGCACCAA 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 GGA 2 1 163043 CASAVA_Build 3 58568334 22D GATTTGTATA TGTGCATGTATGTGTGTATACG/---------------------- TGTGCATGTA 3070 het 3070 ref 70 30 19 28 TGTGCATGTATGTGTGTATACG 2 1 163044 CASAVA_Build 3 58572041 1I GGAGGCCCTG -/C CCAGGGGCCC 3070 hom 42 het 20 0 15 5 C 2 3 163045 CASAVA_Build 3 58573662 6D TGGAGTCATG TTTATT/------ TTTATTGTGC 3070 het 3070 hom 33 12 19 4 TTTATT 2 1 163046 CASAVA_Build 3 58583217 1D TACCCCTATG C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 C 8 7 163047 CASAVA_Build 3 58586962 4D GTGAGTAAAT GCAG/---- GCCCCTCTTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 6 GCAG 1 0 163048 CASAVA_Build 3 58597537 1D CCATACAGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 25 het 46 2 41 3 T 9 8 163049 CASAVA_Build 3 58610541 1I CTGTTTGAGA -/C CCATTAGAGT 3070 hom 163 het 59 0 55 4 C 2 3 163050 CASAVA_Build 3 58616841 1D TATTTAGCCC T/- CCTTCCCTTC 3070 het 3070 ref 49 25 18 7 T 1 0 163051 CASAVA_Build 3 58622922 1D TGGGTGGAGT A/- TCTGGGTTCA 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 A 1 0 163052 CASAVA_Build 3 58624859 8I AAAGCTTCTC --------/AGATAAAG TCTACCGTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AGATAAAG 0 1 163053 CASAVA_Build 3 58625191 1I AATCATTTCT -/A GAATGCCCAG 3070 het 3070 hom 56 20 31 5 A 0 1 163054 CASAVA_Build 3 58628885 1D GCCCTCCTGA C/- CCTCACTTCC 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 C 3 2 163055 CASAVA_Build 3 58651554 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 679 hom 36 4 23 13 A 15 14 163056 CASAVA_Build 3 58659508 1I TAATTTTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3022 hom 21 10 8 3 T 8 9 163057 CASAVA_Build 3 58668085 6D CTCTCTTTCC TTCTCT/------ TTCTCTTTCT 3070 het 3070 hom 27 10 13 6 TTCTCT 2 1 163058 CASAVA_Build 3 58668423 1I GCACTGGGCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 8 9 163059 CASAVA_Build 3 58708479 3D CAATGAAGAT GAC/--- ATTTTAGATA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 GAC 1 0 163060 CASAVA_Build 3 58762470 1I AGATTGCCTT -/G GCCAGGCCAG 3070 hom 105 het 39 0 32 7 G 1 2 163061 CASAVA_Build 3 58767121 1I TCCAACTAAG -/T TTTTTTTTTT 1333 het 1333 ref 34 27 3 4 T 11 12 163062 CASAVA_Build 3 58783354 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1188 het 1188 ref 22 15 3 4 A 12 11 163063 CASAVA_Build 3 58808935 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 14 2 11 1 A 11 12 163064 CASAVA_Build 3 58836577 4I TAGAAATCAT ----/ACTG ACACAGTTCC 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 ACTG 0 1 163065 CASAVA_Build 3 58877271 2I GGTATGCATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 52 16 26 10 TG 6 7 163066 CASAVA_Build 3 58956332 3I ATCAATTTTT ---/TTG TTTCAACTGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TTG 0 1 163067 CASAVA_Build 3 58970260 1I ACTTCTGGAA -/G TGAAAGACAC 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 G 0 1 163068 CASAVA_Build 3 59014178 1I TACATGCTCC -/A GGGGGTTGAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 0 1 163069 CASAVA_Build 3 59073456 1D TTGTTTTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 20 0 11 9 T 13 12 163070 CASAVA_Build 3 59127525 5D TCCTTAACTA TACTT/----- CTAATAAAGT 3070 het 3070 hom 43 17 23 5 TACTT 1 0 163071 CASAVA_Build 3 59144177 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1116 het 1116 ref 24 15 3 6 T 10 11 163072 CASAVA_Build 3 59185832 1D TTGTCTGTAA G/- GGATTTTATT 2213 het 1277 hom 11 4 6 1 G 3 2 163073 CASAVA_Build 3 59189409 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2846 het 1292 hom 23 8 10 5 T 13 14 163074 CASAVA_Build 3 59192708 3D AATACTAAAT ATA/--- ATAAGTAAGT 3070 het 3070 hom 23 8 13 4 ATA 2 1 163075 CASAVA_Build 3 59194389 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 2630 het 2630 ref 32 16 9 7 T 9 10 163076 CASAVA_Build 3 59203256 1I ACATGTGGGG -/A TTATGGGAAC 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 0 1 163077 CASAVA_Build 3 59203846 1D GTCACCCTGG A/- CTCCTCTCCC 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 1 0 163078 CASAVA_Build 3 59204493 2I AGAAAGCCCT --/AA GTGATTAAAT 3070 hom 168 het 59 0 55 4 A 0 2 163079 CASAVA_Build 3 59209716 5I AAATAATAAT -----/ATATA ATATATCTTT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 ATATA 1 2 163080 CASAVA_Build 3 59211487 9I ATCTCCCTAA ---------/ATCATACTG ATCATACTGA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 ATCATACTG 1 2 163081 CASAVA_Build 3 59219976 3D ATATGTGCTG CTA/--- CTGTTTATCT 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 CTA 1 0 163082 CASAVA_Build 3 59222932 2I TCAATCAGAT --/TC TCTCTCTCAG 3070 het 12 hom 38 1 32 5 TC 4 5 163083 CASAVA_Build 3 59227758 1I CTTGGCTACT -/G TTAATAATGC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 G 0 1 163084 CASAVA_Build 3 59230928 1I TTGCATACAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 9 10 163085 CASAVA_Build 3 59235008 3D ATTGTGAAAT ATC/--- ATGATACAAA 3070 het 3070 hom 55 23 25 8 ATC 1 0 163086 CASAVA_Build 3 59242915 3I GGAGAGCAGG ---/TGA TGGTCAGAGG 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 TGA 0 1 163087 CASAVA_Build 3 59246101 1I ACACTGTTCA -/C CCCCCCCGAC 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 C 7 8 163088 CASAVA_Build 3 59253459 1I TATATGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 12 14 T 10 11 163089 CASAVA_Build 3 59261974 1I GTTTCAAACG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 6 7 163090 CASAVA_Build 3 59269993 2I TTTTTCTTCT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 TC 0 1 163091 CASAVA_Build 3 59273895 1D ACCTGACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 21 1 11 10 T 15 14 163092 CASAVA_Build 3 59276819 1D ATTTTCTACA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 8 7 163093 CASAVA_Build 3 59281929 1D GAGCACACTC T/- TTATTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 T 3 2 163094 CASAVA_Build 3 59292480 7D TTTTTTATCA AACAATT/------- TTTATCAAAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 AACAATT 1 0 163095 CASAVA_Build 3 59297921 5D ACCTCATGCC TTTAT/----- TTTATTTTAT 3070 het 2505 hom 40 10 26 4 TTTAT 5 4 163096 CASAVA_Build 3 59298626 1D CAAAGAAACA T/- TTTTATTATA 3070 het 3070 ref 35 18 15 5 T 5 4 163097 CASAVA_Build 3 59299914 1I TGTCTGTGGC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 7 8 163098 CASAVA_Build 3 59304078 1D GCATTTTCTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 T 8 7 163099 CASAVA_Build 3 59305368 6D ATACATTCTC TCTCTG/------ TCTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 35 10 15 12 TCTCTG 4 3 163100 CASAVA_Build 3 59306049 1I AAGTCTATCA -/T TTTTATCATT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 4 5 163101 CASAVA_Build 3 59307891 1D AGCATTCAAA C/- TTTTACCATT 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 C 1 0 163102 CASAVA_Build 3 59321274 1I TGGTGGGCAA -/C CCCCCCCAGC 3070 hom 42 het 17 0 12 5 C 7 8 163103 CASAVA_Build 3 59342744 4I GTGTTTTGTC ----/AAAT AAATAAACAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AAAT 1 2 163104 CASAVA_Build 3 59352464 1I AAACTACCCC -/T ATTCATTAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 163105 CASAVA_Build 3 59365204 2D CCTTGTGTCT GA/-- GAGAGAGAGA 1721 het 1721 ref 38 25 6 7 GA 10 9 163106 CASAVA_Build 3 59375262 1D TTGCCCCAGG C/- CCTTAACCCC 3070 hom 88 het 34 0 30 5 C 3 2 163107 CASAVA_Build 3 59382555 1I TAGGGTTAGG -/C GTTAGGGTTA 3070 hom 113 het 43 0 38 5 C 0 1 163108 CASAVA_Build 3 59383811 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 8 7 163109 CASAVA_Build 3 59389484 9I GTTGTATAAG ---------/TTGAACAAA TTGAACAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 TTGAACAAA 1 2 163110 CASAVA_Build 3 59393090 13D GGCAAGGCTG GTCTTGAACTCCT/------------- GTCTTGAACT 1060 het 1060 ref 23 15 4 6 GTCTTGAACTCCT 2 1 163111 CASAVA_Build 3 59403491 2I TAAATTAATT --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 A 8 10 163112 CASAVA_Build 3 59416135 1D AAAAGTTTCA T/- GACTGTCTGT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 1 0 163113 CASAVA_Build 3 59426333 4I TCCTCTCTAC ----/TTTG TTTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 TTTG 1 2 163114 CASAVA_Build 3 59431544 22D TGCTTGGCTG AACTCTCTTTGCCACAAAGTCA/---------------------- AACTCTCTTT 3070 het 3070 ref 53 29 20 10 AACTCTCTTTGCCACAAAGTCA 1 0 163115 CASAVA_Build 3 59441339 3I CTGCCTTTGA ---/TGT TGTTTTTTTG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 TGT 1 2 163116 CASAVA_Build 3 59441969 1D TTAATATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 20 7 T 12 11 163117 CASAVA_Build 3 59443483 2D CCCCTATAAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 85 het 44 0 28 16 GT 8 7 163118 CASAVA_Build 3 59450939 20D CTTCCCATTT TTTTAACTTTTAAGTTCAGG/-------------------- GGTACAAGTA 3070 het 3070 ref 31 24 8 7 TTTTAACTTTTAAGTTCAGG 1 0 163119 CASAVA_Build 3 59454763 4D TATACCAATA ACAG/---- ACAGAGTGCC 1471 hom 7 het 3 0 3 0 ACAG 2 1 163120 CASAVA_Build 3 59457230 2D GTTTTGTGTC TT/-- TGAGTAGGAA 3070 het 3070 ref 46 23 19 6 T 3 1 163121 CASAVA_Build 3 59459624 18D GTATACGGCC ATTTCATGGTATTCGCCT/------------------ ATTTCATGGT 3070 hom 87 het 37 0 30 16 ATTTCATGGTATTCGCCT 2 1 163122 CASAVA_Build 3 59464143 1D GTACAGATTA T/- TTTTTTTACC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 8 7 163123 CASAVA_Build 3 59468102 97D3M11D7M2D TTCTAAATCT GGAAAACTCTCCTATATAGACCTATCTCAAATATCTGTTTCTTTATAAAGTTTTCCCCTGATGTTAATCCGCATTTTGGTTCCATCCTTCTTTGCAGAAACAACTCATCTGTCCTTATAC/-------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-----------TCCTTGT-- TCTTCATTTT 2518 het 2518 ref 23 40 8 3 N/A 0 0 163124 CASAVA_Build 3 59470420 4I ATAATTTCTA ----/AGAC AGAGCATGTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AGAC 0 1 163125 CASAVA_Build 3 59471069 2D GTGTGATCTA TC/-- TCTCTAAAGA 3070 het 3070 ref 48 25 20 5 TC 3 2 163126 CASAVA_Build 3 59474121 3D AGAAAGCACA AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 8 8 AAG 3 2 163127 CASAVA_Build 3 59474181 1D TTCCATATGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 T 9 8 163128 CASAVA_Build 3 59476485 2I CACTACATCC --/AT AGAGTGAGGA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 AT 0 1 163129 CASAVA_Build 3 59482731 1D CTGAACTCAC T/- TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 7 6 163130 CASAVA_Build 3 59486686 1D AAATCTGAAA C/- TTTTTGAGTG 3070 het 3070 ref 48 26 20 4 C 1 0 163131 CASAVA_Build 3 59505324 1D TAAATATGTG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 7 6 163132 CASAVA_Build 3 59515800 1D TGAACAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 14 0 10 4 A 13 12 163133 CASAVA_Build 3 59516455 1D ACTTATGTGA T/- TTTTTTATAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 7 6 163134 CASAVA_Build 3 59525479 1D TAAGAACTCA T/- TTAGCTCCTG 3070 het 3070 ref 31 12 10 10 T 3 2 163135 CASAVA_Build 3 59563029 1D CAGAATTTTG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 T 8 7 163136 CASAVA_Build 3 59563856 4D TGATTTTCTG ATTT/---- ATTATTTCAG 3070 het 3070 ref 43 25 17 2 ATTT 1 0 163137 CASAVA_Build 3 59567621 4D ATAATCGTGA TAGT/---- TAGTGTCAGA 3070 het 3070 ref 52 25 21 8 TAGT 2 1 163138 CASAVA_Build 3 59571817 1I CTATCTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 11 12 163139 CASAVA_Build 3 59600490 1D ACCCCTTAAT A/- AACATGGTTG 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 A 3 2 163140 CASAVA_Build 3 59607264 22D29M2D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGATTCTACAAATAG/----------------------AAAAAGAAAAAAAAAAGGATTCTACTATT-- TAGAATCCTT 3070 hom 96 het 22 0 31 10 N/A 0 0 163141 CASAVA_Build 3 59609545 5I CTGCTGGGAT -----/CAGCA CAGCATGGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CAGCA 1 2 163142 CASAVA_Build 3 59611018 1D AGATTCAGTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 9 8 163143 CASAVA_Build 3 59617876 1I CATCTCTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 9 10 163144 CASAVA_Build 3 59618158 1D ATTGCACATA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 7 T 7 6 163145 CASAVA_Build 3 59621579 1I CCAAATTCTT -/G GGACATAGAG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 G 2 3 163146 CASAVA_Build 3 59625492 15D ACTCCCACAC AATTCCCATCCCCAT/--------------- TTTGGGACTG 3070 het 3070 ref 49 28 20 5 AATTCCCATCCCCAT 1 0 163147 CASAVA_Build 3 59634139 1I AAACTCTCCA -/C TGCATTATCT 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 C 0 1 163148 CASAVA_Build 3 59636308 1I ATCCTCACAA -/G CAATCTGCAG 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 G 0 1 163149 CASAVA_Build 3 59673587 1I AGACAAGAAT -/C AGAAACATTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 0 1 163150 CASAVA_Build 3 59697141 1I AATTTAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 11 12 163151 CASAVA_Build 3 59710282 1I GGGGAGAGGC -/G GGGGGGCGGT 3070 het 2147 hom 30 10 9 11 G 6 7 163152 CASAVA_Build 3 59711999 4D TAGATACATT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 TC 8 6 163153 CASAVA_Build 3 59712363 5I CTTTCTACCA -----/GAGTC GAGTCTTAAA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 GAGTC 1 2 163154 CASAVA_Build 3 59712629 5D ATGTCACACC TTTAA/----- GTTAAGTTGG 3070 het 3070 ref 31 15 13 5 TTTAA 1 0 163155 CASAVA_Build 3 59724517 4I GTGGCAAGTG ----/CAAA CAAACACCCC 3070 hom 141 het 55 0 47 8 CAAA 1 2 163156 CASAVA_Build 3 59725494 1D TTTCAAATGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 50 1 48 1 T 10 9 163157 CASAVA_Build 3 59730498 1D CTAGTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 288 hom 36 2 24 10 T 16 15 163158 CASAVA_Build 3 59738535 1I CAACTCCTCT -/A GCCTGCTCAC 3070 hom 129 het 54 0 42 12 A 0 1 163159 CASAVA_Build 3 59742817 1I GGACAGAGAC -/A AGAGACTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 1 2 163160 CASAVA_Build 3 59743571 1I CTTTCTGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 9 10 163161 CASAVA_Build 3 59746079 1D CAATCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1706 het 394 hom 28 7 9 12 T 15 14 163162 CASAVA_Build 3 59756151 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 2375 het 2375 ref 18 9 6 3 A 12 11 163163 CASAVA_Build 3 59759875 1I TACTTAAATA -/T TTTTTTAACT 3070 hom 115 het 43 0 38 5 T 6 7 163164 CASAVA_Build 3 59762942 1D GACTTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 12 11 163165 CASAVA_Build 3 59764534 1D CTAAGGGAGA T/- TGCCAGGTAA 3070 het 3070 ref 40 23 14 4 T 2 1 163166 CASAVA_Build 3 59767375 2D TGAGCAAATC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 19 0 13 6 AT 7 6 163167 CASAVA_Build 3 59778879 1I TTCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 602 hom 30 2 22 6 A 9 10 163168 CASAVA_Build 3 59779299 1I TAAAATGTGA -/T TCTACACAGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 2 163169 CASAVA_Build 3 59796941 1D GAAGGAAAAA G/- TTTCTTGCTA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 G 1 0 163170 CASAVA_Build 3 59800085 1D CTTCATTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 600 hom 27 2 16 10 A 13 12 163171 CASAVA_Build 3 59800098 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAAGAAAA 3070 het 699 hom 28 4 15 9 C 1 0 163172 CASAVA_Build 3 59811974 1I GTAGAGTGGT -/G GTAATCCTCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 2 163173 CASAVA_Build 3 59816714 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2017 het 1348 hom 9 3 6 0 T 7 6 163174 CASAVA_Build 3 59818298 4I TAGGACAAGA ----/TTAT TTATACAAAT 3070 het 3070 ref 38 27 10 1 TTAT 1 2 163175 CASAVA_Build 3 59822781 1D TGCCTTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 17 2 A 11 10 163176 CASAVA_Build 3 59823651 1I ATGAGTCATT -/G CTGATAACTG 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 G 0 1 163177 CASAVA_Build 3 59824906 1I ACAGTACCTA -/G GCTAACCCAC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 G 1 2 163178 CASAVA_Build 3 59825589 2I ATTATATGAA --/AG AGAGAGAGAG 2656 het 2656 ref 37 14 11 12 AG 5 6 163179 CASAVA_Build 3 59826433 1D TGCAATCTAC T/- TTATGGCTCC 3070 het 3070 ref 53 26 20 8 T 3 2 163180 CASAVA_Build 3 59829104 1D TTCCACGCGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 18 10 A 10 9 163181 CASAVA_Build 3 59836724 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 A 10 9 163182 CASAVA_Build 3 59837223 1I GGGAGCAGCA -/C CCCCTCCCCA 3070 hom 84 het 32 0 20 12 C 4 5 163183 CASAVA_Build 3 59840750 3I AAGAGAGAAG ---/AGA AGGAGAAGTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AGA 0 1 163184 CASAVA_Build 3 59843252 1D CTGAGGTGGT A/- ACTCGGTAGA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 2 1 163185 CASAVA_Build 3 59846208 1D TACCTGATGC T/- TTTTTTTTTT 2361 het 2169 hom 35 12 8 15 T 17 16 163186 CASAVA_Build 3 59874969 1I AGATATTTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 T 9 10 163187 CASAVA_Build 3 59879280 1I GTTAAAAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 8 9 163188 CASAVA_Build 3 59882427 7I TGAAATCACC -------/TTATATT TTATAACAGC 3070 het 3070 ref 50 30 14 6 TTATATT 0 1 163189 CASAVA_Build 3 59892741 1I CTTTTCAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 A 9 10 163190 CASAVA_Build 3 59897223 5D ATTACAGTTC TTTAA/----- TTTATGTTTC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 TTTAA 1 0 163191 CASAVA_Build 3 59905281 1I CATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 34 1 27 6 T 10 11 163192 CASAVA_Build 3 59911316 4I AAAAAAACTG ----/TTTA TTTGTTTACT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 TTTA 0 1 163193 CASAVA_Build 3 59912058 1I GAAGTTGCTG -/T TTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 6 7 163194 CASAVA_Build 3 59912480 1I ACACAGGCCT -/C CCCCACTGCT 3070 het 3070 hom 60 26 30 4 C 4 5 163195 CASAVA_Build 3 59913206 2D CCTCCCTCTC TT/-- GTTACCATTC 3070 het 2925 hom 37 10 21 7 T 2 0 163196 CASAVA_Build 3 59922685 1D AACTGTGGGC T/- TTCCTAAGAG 3070 hom 118 het 45 0 40 5 T 3 2 163197 CASAVA_Build 3 59931605 1D ACTCCAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 23 1 13 10 T 13 12 163198 CASAVA_Build 3 59932267 1I ATAAACTCTC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 T 7 8 163199 CASAVA_Build 3 59936635 1D GAATCCAACC T/- ACATGACCTA 3070 het 3070 hom 55 24 26 5 T 1 0 163200 CASAVA_Build 3 59940255 1D AAGCATTTTG C/- AAAACACCAG 3041 het 3041 ref 21 11 8 3 C 1 0 163201 CASAVA_Build 3 59942731 1I CAGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 A 10 11 163202 CASAVA_Build 3 59943024 4D CTGAAGATGG TTGT/---- TTAAGTGGAA 3070 het 3070 ref 38 22 12 6 TTGT 1 0 163203 CASAVA_Build 3 59944721 2I TGAAGTGATA --/GG GGGCAAAGAA 3070 hom 148 het 56 0 50 6 G 3 5 163204 CASAVA_Build 3 59951712 2D AGAAGGACTC TA/-- TAGAGTTGAA 3070 hom 148 het 51 0 50 2 TA 2 1 163205 CASAVA_Build 3 59955916 2D AGGATAGTAC AA/-- ATCTGCTGCT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 3 1 163206 CASAVA_Build 3 59956637 1I TTAAAAGGGG -/T ACTGACACTA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 T 0 1 163207 CASAVA_Build 3 59961453 1D CTTAGAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 11 10 163208 CASAVA_Build 3 59972342 6D CATTTCCGCC TGAGAG/------ TAAGTGCGAA 3070 hom 117 het 41 0 39 3 TGAGAG 1 0 163209 CASAVA_Build 3 59976616 1D TCCAAAAATG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 T 8 7 163210 CASAVA_Build 3 59985034 2D AGAGTCACAC TT/-- AACACTAATT 3070 het 3070 hom 51 21 28 2 T 2 0 163211 CASAVA_Build 3 59988006 1I TATATAACTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 8 9 163212 CASAVA_Build 3 59993219 1I CCGTACCTTG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 33 14 17 2 A 7 8 163213 CASAVA_Build 3 59999467 1D CGCTACTGAT A/- AAAGAATTTA 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 4 3 163214 CASAVA_Build 3 60000924 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 444 hom 29 1 20 8 T 7 8 163215 CASAVA_Build 3 60010222 3D TCTTGATGAA TCT/--- TCTTTTTTCA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TCT 2 1 163216 CASAVA_Build 3 60035431 1I TCCAAAGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 682 hom 46 2 35 9 A 9 10 163217 CASAVA_Build 3 60037569 1D73M4D GATAAATAAG AAAAAAAAACCCAAACACTATGTTTTATTCCTAAGGCAAGCACAAAAAATAAAATAATCACCAAAGTGAGACACGACT/-AAAAAAAACCCAAACACTATGTTTTATTCCTAAGGCAAGCACAAAAAATAAAATAATCACCAAAGTGAAACAC---- GACTGAAAGG 3070 hom 147 het 42 0 49 14 N/A 0 0 163218 CASAVA_Build 3 60037835 1D CAGAAATATA T/- TTTTTTCATA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 T 7 6 163219 CASAVA_Build 3 60038295 1I ACAAATGGCT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 55 het 21 0 16 5 A 9 10 163220 CASAVA_Build 3 60038505 1D CATATATAGA G/- GGGGGGGGGA 908 het 40 hom 9 1 2 6 G 10 9 163221 CASAVA_Build 3 60061605 1D CAACATCTCC T/- TGTTTCATTT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 T 2 1 163222 CASAVA_Build 3 60069909 2I TAGGGGCAGG --/TA GAGAGAGAGA 3070 hom 39 het 23 0 21 2 TA 0 1 163223 CASAVA_Build 3 60071258 1D CAAATAGACA C/- CCAGTTTATG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 C 3 2 163224 CASAVA_Build 3 60076642 8D AAGACCTATC CATATATG/-------- CATATATGCA 3070 hom 99 het 37 0 34 6 CATATATG 2 1 163225 CASAVA_Build 3 60077630 1D24M1I AAAAAATTAA GGGGAGTAACAAAATTTCCCTTCTA-/-GGGAGTAACAAAATTTCCCTTCTAT TTTTTTGAGT 3070 hom 96 het 32 0 33 2 N/A 0 0 163226 CASAVA_Build 3 60078571 1I AGTGAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 129 het 48 0 41 7 A 9 10 163227 CASAVA_Build 3 60080148 6D CCTATATTTC TTTAAT/------ TTTAAGATGC 3070 hom 51 het 18 0 18 1 TTTAAT 1 0 163228 CASAVA_Build 3 60081613 1I AGCTAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 32 1 27 4 T 10 11 163229 CASAVA_Build 3 60089821 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 757 het 757 ref 21 6 4 11 T 17 16 163230 CASAVA_Build 3 60091413 1D TAAAGAAACA C/- CCCACATTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 4 3 163231 CASAVA_Build 3 60091662 2I ATACACACAT --/AC ACACATATAT 2417 het 2417 ref 34 20 11 3 AC 2 3 163232 CASAVA_Build 3 60091951 1I CCCTGATATG -/T AATGGTATAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 0 1 163233 CASAVA_Build 3 60094613 1I ATAAAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 A 11 12 163234 CASAVA_Build 3 60100166 1D GGGTTTAGCA C/- CCACTAAGTG 3070 hom 132 het 52 0 45 8 C 3 2 163235 CASAVA_Build 3 60100284 1D GCCTAAGCTA G/- GATATCCCTT 3070 hom 105 het 37 0 35 7 G 2 1 163236 CASAVA_Build 3 60107018 1I ATACTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 732 hom 34 3 25 6 A 11 12 163237 CASAVA_Build 3 60110111 1D TTCAACATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 952 hom 41 4 29 9 T 12 11 163238 CASAVA_Build 3 60123909 1I TGCCCTATGG -/C CCCGTAAGAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 3 4 163239 CASAVA_Build 3 60125378 1D GTAATTGGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 A 12 11 163240 CASAVA_Build 3 60126954 1I TTTGGGCTTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 A 8 9 163241 CASAVA_Build 3 60129644 1I GGTGAATCCT -/G TTTAAAGTTC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 G 0 1 163242 CASAVA_Build 3 60132640 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 T 10 9 163243 CASAVA_Build 3 60140455 1I GTAAGTGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 A 11 12 163244 CASAVA_Build 3 60144767 1D TTATTTTTCG T/- TTTTTTTTTT 2332 het 2332 ref 26 15 6 5 T 11 10 163245 CASAVA_Build 3 60157597 1I TTTTATTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 11 12 163246 CASAVA_Build 3 60158913 1D GAGGCAGGAA T/- TTCACTACAG 3070 het 3070 hom 47 19 22 7 T 3 2 163247 CASAVA_Build 3 60159307 1I TCGTGAGTTG -/A TTTAATTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 0 1 163248 CASAVA_Build 3 60161440 1I CTTTTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1618 hom 34 5 19 10 A 12 13 163249 CASAVA_Build 3 60162617 1D TCTCAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 13 12 163250 CASAVA_Build 3 60163771 1I CATTACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 20 19 8 A 10 11 163251 CASAVA_Build 3 60165213 1I AATATTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 13 14 163252 CASAVA_Build 3 60169147 1D ACCTCCCCCC A/- AATTGTAAAT 2869 het 2869 ref 30 20 9 2 A 3 2 163253 CASAVA_Build 3 60171301 1D CCAATATACA C/- CAGGGCTGCA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 C 2 1 163254 CASAVA_Build 3 60187668 4D TGGCTAGAAC ATCT/---- ATCTACCTAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 ATCT 2 1 163255 CASAVA_Build 3 60198031 1D TGTTTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 1793 het 1793 ref 32 12 8 12 T 19 18 163256 CASAVA_Build 3 60213596 1I TTCTCAACTT -/A AAAAAAAAAT 1573 het 596 hom 8 2 5 1 A 9 10 163257 CASAVA_Build 3 60225158 1D CATATAACAA G/- GACCAGTAGC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 2 1 163258 CASAVA_Build 3 60225619 1I TTTCTCAATC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 T 7 8 163259 CASAVA_Build 3 60226040 1I ATATTTAGCA -/C AGCAGGAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 0 1 163260 CASAVA_Build 3 60232005 1I CTGTCTCTCC -/A AAAAAAAACT 1215 het 1215 ref 18 10 3 5 A 8 9 163261 CASAVA_Build 3 60233378 1D AAAGAATACT C/- CTTGAAGTTC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 2 1 163262 CASAVA_Build 3 60236000 1D GGAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2459 het 2459 ref 27 9 8 11 A 15 14 163263 CASAVA_Build 3 60239490 1I ACCTCATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 20 10 A 11 12 163264 CASAVA_Build 3 60241934 1I GATCTGTAAG -/A GAAATATAAA 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 A 0 1 163265 CASAVA_Build 3 60244590 1D CGAAAGAGGT A/- AAAAAAGGAG 3070 het 3070 hom 39 13 16 11 A 7 6 163266 CASAVA_Build 3 60248591 1I TCAGCACCAG -/C TGGGTTCCCA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 C 0 1 163267 CASAVA_Build 3 60248704 1I TAAAATTCAG -/T GGCTTCAAAC 3070 hom 75 het 37 0 25 12 T 0 1 163268 CASAVA_Build 3 60250603 1I CGGAACCATT -/A CAGCAGATAT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 0 1 163269 CASAVA_Build 3 60253147 1D CCTCAACACG T/- TGGGAGTTCC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 2 1 163270 CASAVA_Build 3 60253642 1D ATTATTAAAT C/- CCTGATAGTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 3 2 163271 CASAVA_Build 3 60267808 1D CCACATTAAG A/- AAACCATGCC 3070 hom 93 het 37 0 30 8 A 4 3 163272 CASAVA_Build 3 60268632 4I GACACTGCTC ----/TTTT TGAGACACAT 3070 hom 196 het 71 0 66 5 T 1 5 163273 CASAVA_Build 3 60269113 1D TCCCACTATT G/- GGCCTGACTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 7 G 3 2 163274 CASAVA_Build 3 60274508 1D GCATTTTGCA C/- ATTAATTAAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 1 0 163275 CASAVA_Build 3 60274886 1D TGCATAAACA T/- TTTCCCTTCA 3070 hom 144 het 56 0 48 10 T 4 3 163276 CASAVA_Build 3 60275007 2D ATGATTAATA AG/-- AGATATAGGA 3070 het 3070 hom 31 11 15 6 AG 2 1 163277 CASAVA_Build 3 60284759 1D GGTAGGGCAG T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 7 163278 CASAVA_Build 3 60285114 1I14M2D CCAGAACTTT -GGAGGCTGAGGCTGGT/GGGAGGCTGAGGCTG-- GAATCATGAG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 N/A 0 0 163279 CASAVA_Build 3 60285884 1I GAGAAAACAA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 7 8 163280 CASAVA_Build 3 60287255 1D AGGCAGTAAT G/- GGAGTGATGG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 3 2 163281 CASAVA_Build 3 60288942 4D CTATTGGAAA AGTT/---- GGAAAGGGCA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 AGTT 1 0 163282 CASAVA_Build 3 60292619 1I TCTGTCTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 456 hom 25 1 15 9 A 13 14 163283 CASAVA_Build 3 60293108 1D GACTGAGCCT C/- CTGGCCTGAT 3070 hom 156 het 58 0 51 7 C 2 1 163284 CASAVA_Build 3 60294248 1D ATTTGAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 39 1 30 8 T 11 10 163285 CASAVA_Build 3 60294753 1D TTCTTCTCTG C/- CTACATAAAC 3070 hom 126 het 45 0 42 4 C 2 1 163286 CASAVA_Build 3 60307797 1D44M1D ATGATTTGAT AAAAAATAGATGGAGTTGCAAATATACTTTTATGATATTCTTGAAT/-AAAAATAGATGGAGTTGCAAATATACTTTTATGATATTCTTGAA- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 25 0 33 6 N/A 0 0 163287 CASAVA_Build 3 60308905 1I AAGTATACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 10 163288 CASAVA_Build 3 60311071 1D TCTGAGTAGT G/- GGAGATGGCA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 G 3 2 163289 CASAVA_Build 3 60318583 6D CGCTTAATCA CATGGC/------ CATCATAGTC 3070 hom 178 het 62 0 60 3 CATGGC 1 0 163290 CASAVA_Build 3 60320754 1D CATTCAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1830 het 303 hom 31 4 14 13 T 15 14 163291 CASAVA_Build 3 60326903 1D AAATCACTTT C/- CTTGCATAGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 2 1 163292 CASAVA_Build 3 60330990 1D5M1D CCAAGATTCA TAAATAC/-AAATA- ACTTTATGTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 N/A 0 0 163293 CASAVA_Build 3 60332139 1I TTCTTCTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 16 11 T 10 11 163294 CASAVA_Build 3 60333804 4D ATCATATGAA ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 ref 41 26 14 4 ATTT 3 2 163295 CASAVA_Build 3 60335878 1D GCTCCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 A 12 11 163296 CASAVA_Build 3 60336182 1D TCTCTACTTT A/- AAAAAAAAAA 764 het 764 ref 20 9 4 7 A 17 16 163297 CASAVA_Build 3 60341747 2D AAAGCCACAC AG/-- AGTGTTCCTA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 AG 2 1 163298 CASAVA_Build 3 60344432 1I TGAGCTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 A 11 12 163299 CASAVA_Build 3 60345456 13D TGTGAATCAC TACAGAAAATCAT/------------- TACAAAATCT 3070 het 3070 ref 44 27 19 4 TACAGAAAATCAT 1 0 163300 CASAVA_Build 3 60347797 1D CTATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 1275 het 1275 ref 33 18 3 12 T 12 11 163301 CASAVA_Build 3 60357316 2D AACCAGACAC AA/-- AAAGTTAATA 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 A 5 3 163302 CASAVA_Build 3 60359662 1D TAAAAATAAT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 7 163303 CASAVA_Build 3 60365100 1D TATTACCTAG A/- AAAACAAACA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 5 4 163304 CASAVA_Build 3 60376656 3D31M2D TACTATTATA TATTATTATTACATACAATATAATTATATATAACAT/---TATTATTACATACAATATAATTATATATAAC-- ATTAATTCCA 3070 hom 30 het 11 0 11 2 N/A 0 0 163305 CASAVA_Build 3 60381821 1D TTTTTTTTTT C/- TAAAGAGAGA 3070 het 1407 hom 31 7 14 10 C 1 0 163306 CASAVA_Build 3 60386583 5D GGAAATGAGG AAGTA/----- AAGTAAATGA 3070 hom 96 het 37 0 31 7 AAGTA 2 1 163307 CASAVA_Build 3 60391989 2D ATCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 42 0 32 10 A 14 12 163308 CASAVA_Build 3 60396216 1D ATAAAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 11 10 163309 CASAVA_Build 3 60397346 5D AAAGGAAATG TTTAC/----- TTTGATATTT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 TTTAC 1 0 163310 CASAVA_Build 3 60459818 4I TATAGTTCCT ----/ATAA ATAAATGCTT 3070 het 3070 hom 44 14 26 4 ATAA 1 2 163311 CASAVA_Build 3 60473354 2D AGAAAAAAAC TG/-- TGTCTTTTAC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TG 2 1 163312 CASAVA_Build 3 60475650 3D GAGGACTCTC CCA/--- CCAACAGCCA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 CCA 2 1 163313 CASAVA_Build 3 60476350 1D GCTTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 962 hom 39 6 22 11 A 16 15 163314 CASAVA_Build 3 60478209 1D ATAGGATACT A/- AGTAGCTACT 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 A 2 1 163315 CASAVA_Build 3 60480360 6D AACTAGAGAA AATATT/------ AATATTAAGA 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 AATATT 2 1 163316 CASAVA_Build 3 60481422 1I CTTCACTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 17 27 7 A 10 11 163317 CASAVA_Build 3 60482032 1D TATTATTATT A/- TTTTTTGAGG 2344 het 448 hom 9 2 5 2 A 1 0 163318 CASAVA_Build 3 60493736 3D TGCCATTTTT AAG/--- AAGAAGTCAT 3070 het 3070 hom 41 19 21 2 AAG 3 2 163319 CASAVA_Build 3 60498740 10I GCTATTTGTG ----------/ATACTGTGAA ATATGCATTT 3070 het 3070 hom 46 18 26 2 ATACTGTGAA 0 1 163320 CASAVA_Build 3 60505869 5D CTGATTTACT AAAGA/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AAAGA 1 0 163321 CASAVA_Build 3 60506640 2I CAAATCTCTC --/TT TTTGTCTCAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 3 5 163322 CASAVA_Build 3 60508574 1I TGTTCAGTCA -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 7 8 163323 CASAVA_Build 3 60511103 3D AGAGGATCCT AGA/--- AGAAGATAAC 3070 het 3070 hom 33 10 19 6 AGA 3 2 163324 CASAVA_Build 3 60511385 2D TGTTCTGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 581 hom 37 4 18 17 T 14 12 163325 CASAVA_Build 3 60515015 1D CTTAACGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2924 hom 32 10 18 5 A 13 12 163326 CASAVA_Build 3 60520523 11D1M7I TGAGAAAAAG CATGTCCCTCTT-------/-----------TGAGAAAA ACGGGCACTT 3070 het 3070 ref 30 19 12 5 N/A 0 0 163327 CASAVA_Build 3 60529752 1I CTAGAGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1666 hom 32 4 24 4 T 13 14 163328 CASAVA_Build 3 60537012 1I AAATTTTTTT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 A 6 7 163329 CASAVA_Build 3 60552166 2D TTAACAGACT GA/-- GACGTATTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 GA 2 1 163330 CASAVA_Build 3 60556306 2I ACACACACAC --/AT ATATATATGT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 AT 4 5 163331 CASAVA_Build 3 60561136 4I TTTCATTTGT ----/GTCA GTAAGAAAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GTCA 0 1 163332 CASAVA_Build 3 60562696 6D CATTAGAAAC AGAAAT/------ AGAAAAAGTC 3070 hom 138 het 47 0 47 5 AGAAAT 1 0 163333 CASAVA_Build 3 60573741 2I ATGACTTTGA --/CT CTGTTACCCT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 CT 1 2 163334 CASAVA_Build 3 60577398 2I TAAATCAAAC --/AT GTGAAAGATC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 0 1 163335 CASAVA_Build 3 60578816 1I CTCTGGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 26 0 18 8 A 10 11 163336 CASAVA_Build 3 60582363 1I GCATTATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 10 11 163337 CASAVA_Build 3 60582645 1D GACACTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2478 hom 39 14 11 15 A 15 14 163338 CASAVA_Build 3 60583141 1I CAAATCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 11 12 163339 CASAVA_Build 3 60586517 26D TTAATGCTTG TGTCTTTTTCCATTTGTTGCTTGTGT/-------------------------- TGTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 25 15 6 TGTCTTTTTCCATTTGTTGCTTGTGT 1 0 163340 CASAVA_Build 3 60589194 4D AGGTTTTATC TCTT/---- TCTCTGATAT 3070 het 3070 ref 34 17 16 3 TCTT 1 0 163341 CASAVA_Build 3 60589710 14D TGGCTTTCTT AGCTTGCCTCTCTC/-------------- AGCTTGCCTC 3070 hom 88 het 33 0 25 14 AGCTTGCCTCTCTC 2 1 163342 CASAVA_Build 3 60592858 1D GAAAGAAGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 83 het 35 0 29 6 T 10 9 163343 CASAVA_Build 3 60595065 1D CTAAAACAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 10 9 163344 CASAVA_Build 3 60596057 3I AAGCCAGAAT ---/CAC CACATTTTTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 CAC 1 2 163345 CASAVA_Build 3 60597224 1I CAGTTAAAAA -/G ACAGTTCACT 3070 hom 138 het 49 0 46 4 G 0 1 163346 CASAVA_Build 3 60614292 5D AAACTGGAGT GGAGG/----- GAATTATCAA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 GGAGG 1 0 163347 CASAVA_Build 3 60614441 1D CCTGAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 40 0 30 10 A 11 10 163348 CASAVA_Build 3 60614900 6I TTCCCCTTCC ------/CCTTCT GCCATAATTG 3070 hom 96 het 38 0 31 7 CCTTCT 0 1 163349 CASAVA_Build 3 60615345 1D CCAGCAAAAA C/- AAACAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 0 163350 CASAVA_Build 3 60617755 2I ATGTCCACAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 11 163351 CASAVA_Build 3 60619735 1I CTTCCTCAGC -/T TTTTTTTTTT 2357 het 2357 ref 30 10 7 13 T 15 16 163352 CASAVA_Build 3 60628522 2I TTTCGTTGTA --/AC AGTCAGTAAC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AC 0 1 163353 CASAVA_Build 3 60629906 1I GAACAAAGCA -/G GATTCTTCCT 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 G 1 2 163354 CASAVA_Build 3 60633556 5D TCCTTCTTCC TTCTT/----- TCTTGCCTTC 3070 het 3070 ref 40 28 11 4 TTCTT 1 0 163355 CASAVA_Build 3 60637637 9D ATTTTTTCTT TTGTTGTTA/--------- TTGTTGTTAT 2479 het 2479 ref 30 21 6 6 TTGTTGTTA 2 1 163356 CASAVA_Build 3 60644305 1I AGATAACATA -/T TTTTTTTATA 3070 het 425 hom 30 1 26 3 T 7 8 163357 CASAVA_Build 3 60647307 1I CTCTGGTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 T 9 10 163358 CASAVA_Build 3 60649207 2I GTGTTTTTTT --/TG TTTTGTTTTT 225 het 225 ref 21 8 3 10 TG 0 1 163359 CASAVA_Build 3 60651732 1D AAAAAAAAAA T/- ATCTGATTTT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 1 0 163360 CASAVA_Build 3 60659007 1I64M1D GGAGTGTGGC -TTTTTTTTTCCTTTCCAGGTTCAGCATAGATACAGCATTTGTACTGACATTCTACACCACTCCAT/TTTTTTTTTTCCTTTCCAGGTTCAGCATAGATACAGCATTTGTACTGACATTCTACACCACTCCA- AAGAATGCAG 3070 het 3070 ref 34 29 14 13 N/A 0 0 163361 CASAVA_Build 3 60661317 1I TTTGTCTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 60 28 25 7 T 9 10 163362 CASAVA_Build 3 60665643 1D CAGAGATATC T/- TGAGAGGCTG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 2 1 163363 CASAVA_Build 3 60697153 1I AAAATGTGGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 54 25 19 10 A 8 9 163364 CASAVA_Build 3 60705220 3I CACAACTTGC ---/TAA TAAGTGTCCA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 TAA 1 2 163365 CASAVA_Build 3 60706061 1D AAGCCAGGGG A/- AAAGCATCAT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 4 3 163366 CASAVA_Build 3 60710080 1D TCTGAGACGG T/- TTTTTTTCCG 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 8 7 163367 CASAVA_Build 3 60712519 1D GTATTTTATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 9 8 163368 CASAVA_Build 3 60714707 1D GATTACAAGG A/- AAAAAAAAAG 1771 het 1771 ref 37 26 4 7 A 10 9 163369 CASAVA_Build 3 60717951 4D GATAAACTTC AAGT/---- AAGCTATTTT 3070 het 3070 hom 39 18 18 5 AAGT 1 0 163370 CASAVA_Build 3 60721375 12D GCTTAAAACG AAAAGTTTCTCT/------------ ACTTAGCCCA 3070 het 3070 hom 27 13 14 1 AAAAGTTTCTCT 1 0 163371 CASAVA_Build 3 60727259 1I TGGGAGTTTA -/C CCAGGAAGCT 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 C 2 3 163372 CASAVA_Build 3 60727434 3I TCAAATGGTA ---/GAG GAGTCTCAAG 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 GAG 1 2 163373 CASAVA_Build 3 60731047 1D AAACATGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 21 16 6 A 11 10 163374 CASAVA_Build 3 60732928 1D TCTTCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 11 10 163375 CASAVA_Build 3 60733088 28D ACTTCTCATC TATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATA 3070 het 915 hom 22 5 15 10 TA 20 6 163376 CASAVA_Build 3 60734382 2D ACTTTAAGAC TT/-- TGGTTGTAAC 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 3 1 163377 CASAVA_Build 3 60739085 1D GTTGCTTTAA T/- TCTTTTTCAG 3070 hom 81 het 31 0 28 5 T 2 1 163378 CASAVA_Build 3 60739493 1D TGCATCAGTG C/- CAATAAGAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 2 1 163379 CASAVA_Build 3 60743926 1D AATTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 14 10 T 11 10 163380 CASAVA_Build 3 60744456 1I TCATCTGTGT -/A AAAAAGGGGG 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 A 5 6 163381 CASAVA_Build 3 60746024 3D GGATAATTTT AAG/--- AAGAAGGAGT 3070 het 3070 hom 39 14 19 9 AAG 3 2 163382 CASAVA_Build 3 60747778 2D AGACAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2034 het 1252 hom 21 6 8 8 A 13 11 163383 CASAVA_Build 3 60758908 1D ATAAGTGAAT G/- GGAGTGGCTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 3 2 163384 CASAVA_Build 3 60759002 1I AAAAAAAACC -/A CCTTGATTAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 0 1 163385 CASAVA_Build 3 60760251 10I ATAACATATG ----------/ATGCCCTCTA AAATCTTGTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 ATGCCCTCTA 0 1 163386 CASAVA_Build 3 60760835 1D ATATCAGGGT C/- CCCCCAACTA 3070 het 3070 hom 33 11 17 6 C 6 5 163387 CASAVA_Build 3 60763516 1D AAACAGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 18 9 A 11 10 163388 CASAVA_Build 3 60768585 2I AAATTTTACT --/AA AAAAAAAAAA 2724 het 2724 ref 26 11 7 8 A 10 12 163389 CASAVA_Build 3 60773455 1D GGGAGTCCAC A/- AAAATAGCAC 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 A 5 4 163390 CASAVA_Build 3 60782234 1I TTCCACTAGC -/A TTCTCAAAGT 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 A 0 1 163391 CASAVA_Build 3 60786296 1D GTGGGCAAGC G/- AGCATTACCG 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 G 1 0 163392 CASAVA_Build 3 60787503 10I ACAGGAACAC ----------/ACATTTACAG ACAAAGTAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 ACATTTACAG 0 1 163393 CASAVA_Build 3 60804372 9D GCTTCTCCAA ATGGACTGT/--------- ATATAATTTC 3070 het 3070 ref 41 24 16 2 ATGGACTGT 1 0 163394 CASAVA_Build 3 60830975 2D ACACACAAAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 A 11 9 163395 CASAVA_Build 3 60836419 1D TTTAAATATA T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 7 6 163396 CASAVA_Build 3 60849216 1D TCTTTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 11 10 163397 CASAVA_Build 3 60855390 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACA 2546 het 2546 ref 31 22 6 3 A 9 8 163398 CASAVA_Build 3 60856532 1I CAGGTCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 10 11 163399 CASAVA_Build 3 60861159 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2853 het 2853 ref 34 17 8 9 A 10 11 163400 CASAVA_Build 3 60865193 1D ATCCAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 33 1 25 7 A 11 10 163401 CASAVA_Build 3 60868338 1D GTGAAATGTC A/- GGGGGTAATA 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 A 1 0 163402 CASAVA_Build 3 60892308 2D GCTTCCACCC CT/-- GTTTGTAAAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 CT 1 0 163403 CASAVA_Build 3 60897723 3I TGAGCTGAAG ---/TCT TCTCAATTTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TCT 1 2 163404 CASAVA_Build 3 60902127 4I TCCAACACTT ----/AAAC AAAGAAATTA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAAC 0 1 163405 CASAVA_Build 3 60911198 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 797 hom 21 5 10 6 T 13 12 163406 CASAVA_Build 3 60914156 1D TATCCTACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2506 hom 34 7 23 4 A 10 9 163407 CASAVA_Build 3 60917626 1I TTTCAGTTTC -/G GGGGGGTCAC 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 G 6 7 163408 CASAVA_Build 3 60918251 3D GCCGGGCCCA TCT/--- TCTTTTCTGT 3015 het 1934 hom 21 7 9 6 TCT 2 1 163409 CASAVA_Build 3 60937594 1D TGAATACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 14 12 T 13 12 163410 CASAVA_Build 3 60942008 2D TCTTCCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1555 het 309 hom 28 5 8 15 T 16 14 163411 CASAVA_Build 3 60942497 1D TTTTTTTTTT A/- AGAGATGGGG 3070 hom 66 het 30 0 18 12 A 2 1 163412 CASAVA_Build 3 60969193 1I GGCTAGGAAG -/A AAAAAAAAAA 814 het 814 ref 41 28 4 9 A 11 12 163413 CASAVA_Build 3 61015074 1I AAATTATCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 9 10 163414 CASAVA_Build 3 61024507 1I AATCTATGAA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 T 7 8 163415 CASAVA_Build 3 61028238 1D GATTTTTATT G/- GGGGTCAGCC 3070 het 3070 hom 54 25 23 7 G 5 4 163416 CASAVA_Build 3 61034651 1D TGTAAATACA T/- GACTAAAACA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 1 0 163417 CASAVA_Build 3 61049485 1I AAATGCTGGG -/A AAGAACTACA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 2 3 163418 CASAVA_Build 3 61053216 2I TCCCTTAAAA --/AT ATATATATAT 2285 het 2285 ref 16 7 6 3 AT 8 9 163419 CASAVA_Build 3 61079122 4I TTTTGGAGCT ----/GTAA GTAACGAAAG 3070 het 3070 hom 42 12 26 4 GTAA 1 2 163420 CASAVA_Build 3 61084214 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 9 10 163421 CASAVA_Build 3 61100293 9I AGTTTTTTGC ---------/CTCAAGCAA TTGCCTCAAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 CTCAAGCAA 0 1 163422 CASAVA_Build 3 61102828 1D GCTTTCTCTT A/- AAAAAAATTT 2157 het 2157 ref 15 9 6 0 A 8 7 163423 CASAVA_Build 3 61105379 2D CCACCAAAAC AT/-- ATGAGGGTTT 3070 het 3070 ref 42 24 17 2 AT 2 1 163424 CASAVA_Build 3 61106476 1D TTTATTTTTT G/- GCTGCTATTA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 G 2 1 163425 CASAVA_Build 3 61108326 1I CGAAGATAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 A 8 9 163426 CASAVA_Build 3 61110835 4D AGATATAATG ATAA/---- ATGAGTCCAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 6 ATAA 1 0 163427 CASAVA_Build 3 61116120 4D GAACAGAAAT AAAC/---- AAACTCTAGC 3070 het 3070 ref 40 20 17 4 AAAC 2 1 163428 CASAVA_Build 3 61119348 4D TTTCCATTGC ATTA/---- ATTAATTAGA 3070 het 3070 ref 61 32 19 15 ATTA 3 2 163429 CASAVA_Build 3 61125345 1D GTGGTAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 121 hom 38 2 27 10 T 12 11 163430 CASAVA_Build 3 61129660 2I TAGCACACAT --/AC ATTGATCTCT 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 AC 0 1 163431 CASAVA_Build 3 61133987 1I TGCTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 10 11 163432 CASAVA_Build 3 61135734 1I GAAGAGAAGA -/C CCTGGATCCT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 C 2 3 163433 CASAVA_Build 3 61139279 1D ATTATAGGTT A/- ATTCACACAG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 2 1 163434 CASAVA_Build 3 61140556 1D GAAGATGGCA T/- CAGAGTGTCA 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 1 0 163435 CASAVA_Build 3 61144915 1D CACACACCTC T/- TCGGCTAACA 3070 hom 87 het 33 0 29 5 T 2 1 163436 CASAVA_Build 3 61159234 1I TACACGACAG -/A AAAAAAAAAA 70 het 70 ref 26 12 1 13 A 10 11 163437 CASAVA_Build 3 61160471 1D AAAATGACAG A/- AAAAAACCCT 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 A 7 6 163438 CASAVA_Build 3 61161706 4D AGTGTGACAT ACTC/---- AGTCTGACTA 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 ACTC 1 0 163439 CASAVA_Build 3 61165355 1D AAAACGAATG T/- TTTAAAATCT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 4 3 163440 CASAVA_Build 3 61181818 8D TCTCAGGGAG CTTGGCTC/-------- CCTGACCCTG 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 CTTGGCTC 1 0 163441 CASAVA_Build 3 61200476 12D AACAACTGGC CATATATATATA/------------ TATATATATA 3070 het 3070 hom 23 7 14 3 CATATATATATA 1 0 163442 CASAVA_Build 3 61217185 1D TAAATCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 12 11 163443 CASAVA_Build 3 61219049 1D AGACCCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1986 hom 19 6 11 2 T 12 11 163444 CASAVA_Build 3 61228787 1D ATCAGACACA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 31 10 11 11 T 9 8 163445 CASAVA_Build 3 61233414 4D ATTTTTATTC TTTG/---- TTTATGTTTA 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 TTTG 1 0 163446 CASAVA_Build 3 61273054 1D AATGAGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 15 14 163447 CASAVA_Build 3 61278963 1D GCTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 48 0 38 10 A 11 10 163448 CASAVA_Build 3 61281646 6I AAATTTCCTT ------/CTAACA CTATTATTAG 3070 hom 87 het 38 0 30 8 CTAACA 0 1 163449 CASAVA_Build 3 61284876 4I AGCAAAACAT ----/AAAG AAACAATTCT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AAAG 0 1 163450 CASAVA_Build 3 61285478 1I TGGCTCTTCT -/G GAGCCATAAT 3070 het 3070 ref 33 23 7 3 G 1 2 163451 CASAVA_Build 3 61295944 1I AGAGCTCCAG -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 7 8 163452 CASAVA_Build 3 61301448 1I AGAGATATTC -/T TTTTTTTTTT 2824 het 27 hom 31 1 19 11 T 13 14 163453 CASAVA_Build 3 61318831 1D ATCTACCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 11 10 163454 CASAVA_Build 3 61330754 1I29M4D TAGAGAGAAA -AAAAGAGTCACCACTAATTGAGTTTTCTTTTTA/CAAAAGAGTCACCACTAATTGAGTTTTCTT---- TTTATTTATC 3070 hom 78 het 19 0 27 0 N/A 0 0 163455 CASAVA_Build 3 61337604 1D TTGCTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 1001 het 1001 ref 38 22 5 11 T 15 14 163456 CASAVA_Build 3 61338027 1D TCCCACCAGT G/- GTGTATGAGT 3070 hom 81 het 34 0 27 9 G 2 1 163457 CASAVA_Build 3 61345508 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1137 het 681 hom 10 3 4 3 A 13 14 163458 CASAVA_Build 3 61350765 4D GGTAGATACT TTAA/---- TTACTTAATT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TTAA 1 0 163459 CASAVA_Build 3 61371476 3D CATGGCAAGA CCC/--- CCCCCCCGTC 3070 hom 48 het 19 0 15 4 C 10 7 163460 CASAVA_Build 3 61389595 2D GAGGGATGGG CA/-- CACAGTTGGC 3070 hom 117 het 47 0 39 9 CA 3 2 163461 CASAVA_Build 3 61399508 1D ATTAAATTTG C/- CCAAATTCCT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 C 3 2 163462 CASAVA_Build 3 61409038 1I ACCATATTTT -/A AAAAAAAAAT 2659 het 2659 ref 21 11 7 3 A 9 10 163463 CASAVA_Build 3 61420674 1D TCTTTTCCCA G/- ATAAGGCAAT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 G 1 0 163464 CASAVA_Build 3 61433358 3D AGGGCTGAGG AGA/--- AGGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 AGA 1 0 163465 CASAVA_Build 3 61434576 2D TTTCAATAAC TA/-- TTTATTAAGC 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 TA 1 0 163466 CASAVA_Build 3 61438105 1I CAAAGGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 12 13 163467 CASAVA_Build 3 61444767 15D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 4 A 25 10 163468 CASAVA_Build 3 61445512 1D CAGCTATAGT C/- CTTACAAAAT 3070 hom 45 het 17 0 14 4 C 2 1 163469 CASAVA_Build 3 61447582 1I AGGGAAGGGC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 8 9 163470 CASAVA_Build 3 61450669 1I ATCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1598 het 1006 hom 21 5 8 8 T 15 16 163471 CASAVA_Build 3 61451751 1D TGAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2883 hom 44 14 19 12 A 17 16 163472 CASAVA_Build 3 61454620 1I TTCTTCCCCA -/T CCCTAATGGT 3070 hom 157 het 57 0 53 4 T 0 1 163473 CASAVA_Build 3 61461396 2D TCCATCTCAA AG/-- AGATTTTTAT 1973 het 1973 ref 24 16 5 5 AG 2 1 163474 CASAVA_Build 3 61463087 1D CATCAGTAAT C/- CCCCCTTATC 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 C 6 5 163475 CASAVA_Build 3 61463217 1D TTTGAATGGC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 T 9 8 163476 CASAVA_Build 3 61465621 2D TGAATGGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 14 10 T 12 10 163477 CASAVA_Build 3 61466023 1I GCTAAGTCAC -/T CCAGCAGCAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 0 1 163478 CASAVA_Build 3 61468435 4D CTGAGGAAAA AGAT/---- AGCCTACGGT 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 AGAT 1 0 163479 CASAVA_Build 3 61469124 1D TCACTGATTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 9 8 163480 CASAVA_Build 3 61471937 1D CTTCTACACA G/- TTCCAAGATT 2633 het 2633 ref 21 13 6 2 G 1 0 163481 CASAVA_Build 3 61472494 1D AAACAAGAAC T/- TTTTTTTTTA 2861 het 2861 ref 20 8 8 4 T 10 9 163482 CASAVA_Build 3 61472837 1D ATCAAACTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 A 10 9 163483 CASAVA_Build 3 61473596 1I GATTTTATTT -/A TTTTTTTTTG 3070 het 161 hom 25 2 21 2 A 0 1 163484 CASAVA_Build 3 61473721 8D TGGATTCACC TACTTCTA/-------- TACTTCTATA 3070 hom 83 het 40 0 27 13 TACTTCTA 3 2 163485 CASAVA_Build 3 61474858 1I TCTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 A 10 11 163486 CASAVA_Build 3 61476887 2D CCTTCTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AT 8 7 163487 CASAVA_Build 3 61477280 2D CCATAGTCAA TT/-- GATTTTTTAC 3070 het 3070 ref 39 19 18 4 T 2 0 163488 CASAVA_Build 3 61478071 2D GCATTCAAAC AT/-- ATACTTGAAT 3070 het 3070 hom 45 16 26 4 AT 2 1 163489 CASAVA_Build 3 61482561 1I AAAGTAAAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 8 163490 CASAVA_Build 3 61483201 1I GTCCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 11 12 163491 CASAVA_Build 3 61484244 1D ATAAATGGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 9 163492 CASAVA_Build 3 61484958 2D ATATATGTAA AT/-- ATATATATAG 2044 het 2044 ref 11 6 5 0 AT 5 4 163493 CASAVA_Build 3 61489626 1I TTTTATCTTT -/A AAAAAAAAAA 1848 het 1848 ref 15 7 6 2 A 10 11 163494 CASAVA_Build 3 61508097 1D CATTTATACC T/- TTTTTTTTTT 1988 het 1988 ref 34 13 7 14 T 15 14 163495 CASAVA_Build 3 61516566 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2659 hom 31 11 16 4 A 14 13 163496 CASAVA_Build 3 61553647 4I GTGGTTCCTT ----/AGAG AGAATAAATA 3070 hom 99 het 36 0 31 5 AG 1 3 163497 CASAVA_Build 3 61554435 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAGAAAAAGC 3070 hom 78 het 31 0 27 6 AAAG 1 0 163498 CASAVA_Build 3 61556023 1I GCAGAAGGGG -/A AAAAAATCTG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 6 7 163499 CASAVA_Build 3 61557157 3I TCGGATGGAT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TTG 5 6 163500 CASAVA_Build 3 61568186 2I AGTCTGAGAC --/TG TGCTCAGCCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TG 1 2 163501 CASAVA_Build 3 61568896 3D TTCTATCTTC CTT/--- CTTCGTACAG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 CTT 2 1 163502 CASAVA_Build 3 61586007 1D TAGTCTCTCA C/- CCTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 C 3 2 163503 CASAVA_Build 3 61586744 2D TTTTGGGGGG GC/-- GGGAGAGATC 3070 het 2934 hom 39 12 17 10 GC 1 0 163504 CASAVA_Build 3 61587818 1I TAAAAGCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 T 11 12 163505 CASAVA_Build 3 61593033 4D ACACGCACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 13 14 13 AC 9 7 163506 CASAVA_Build 3 61598645 4I TTCAGACTGG ----/AATA ATCTCGTTAA 3070 het 3070 ref 39 18 19 2 AATA 0 1 163507 CASAVA_Build 3 61598989 1I TTGTATGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 10 11 163508 CASAVA_Build 3 61600294 1I TCATTTGTGA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 T 7 8 163509 CASAVA_Build 3 61600550 2D TTATACAGTC AT/-- ATCAGTGAAG 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 AT 2 1 163510 CASAVA_Build 3 61613322 3I ATATTGTTGT ---/TAA TAATGTTTCT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TAA 1 2 163511 CASAVA_Build 3 61614181 1D TTTGTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 T 11 10 163512 CASAVA_Build 3 61615356 10D CGCCTCAGCC TCCCAAAGTG/---------- CTGGGATTAC 544 het 544 ref 10 5 4 4 TCCCAAAGTG 1 0 163513 CASAVA_Build 3 61622035 1D AAAAGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 T 12 11 163514 CASAVA_Build 3 61626337 1I GCTGGAGTTT -/A AGGCCAGGCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 163515 CASAVA_Build 3 61626697 1D GCCTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 35 1 26 8 T 15 14 163516 CASAVA_Build 3 61630116 4D ACATTGGATG TGTC/---- TGTCCCTAGT 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 TGTC 2 1 163517 CASAVA_Build 3 61636180 1I AAAGTTGATT -/A AAAACATATC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 4 5 163518 CASAVA_Build 3 61641316 1D TCTGTCCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 23 0 18 5 A 11 10 163519 CASAVA_Build 3 61644149 1I CAAGGATGTG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 7 8 163520 CASAVA_Build 3 61652597 1I ACTTACATTT -/A AACCTTGGAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 3 163521 CASAVA_Build 3 61666226 1I ATGTTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 1113 het 1113 ref 42 33 3 6 A 10 11 163522 CASAVA_Build 3 61696244 1D ATTCCTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 765 hom 32 4 17 12 T 16 15 163523 CASAVA_Build 3 61705543 2D TTGGTTACTC AG/-- GGCCATTTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AG 1 0 163524 CASAVA_Build 3 61706765 3D TTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 20 1 12 7 T 16 13 163525 CASAVA_Build 3 61707837 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 44 0 36 8 A 10 9 163526 CASAVA_Build 3 61708019 1I ACTAACATAG -/C CAAGACAGTG 3070 hom 96 het 42 0 33 9 C 1 2 163527 CASAVA_Build 3 61708354 1D GGTTTCTTAA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 6 T 8 7 163528 CASAVA_Build 3 61709441 1D TTTCCTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 27 2 15 10 T 14 13 163529 CASAVA_Build 3 61718880 1D55M2D GCTAATTTTT GTAGAGTTGAGATTTCACCTTGTTGGCCAGGCCGATCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCC/-TAGAGTTGAGATTTCACCTTGTTGGCCAGGCCGATCTCAAACTCCTGGGCTCAAG-- CAGTATTCCC 3070 het 3070 ref 36 31 12 8 N/A 0 0 163530 CASAVA_Build 3 61727324 1D TATTAATGTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 2654 hom 43 8 27 8 A 8 7 163531 CASAVA_Build 3 61732098 1I ACTTTCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 39 1 29 9 A 12 13 163532 CASAVA_Build 3 61736804 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 11 12 163533 CASAVA_Build 3 61762026 1D GTGTGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 1970 het 1970 ref 30 15 6 12 T 17 16 163534 CASAVA_Build 3 61797458 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 7 8 163535 CASAVA_Build 3 61851138 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2439 het 408 hom 26 2 12 13 T 15 14 163536 CASAVA_Build 3 61887636 1I CGGGGGGAAG -/A AAAAAAAAAA 988 het 988 ref 49 40 3 6 A 10 11 163537 CASAVA_Build 3 61896593 6I AACTGCTTGG ------/TTTAAA TTTAAATGAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTTAAA 1 2 163538 CASAVA_Build 3 61901684 2D AACCAATGTG GT/-- CTGGTGGAAG 3070 hom 93 het 34 0 31 6 GT 1 0 163539 CASAVA_Build 3 61914572 14D CAAGGGAGTG TATTTTCTGCTGCT/-------------- GTACAATCTG 3070 hom 120 het 37 0 41 2 TATTTTCTGCTGCT 1 0 163540 CASAVA_Build 3 61926327 8D TTGGGTATGC TCATTCAT/-------- TCATTCATTC 3070 het 3070 ref 32 15 15 5 TCAT 4 2 163541 CASAVA_Build 3 61931393 4D GATGTTCAGA ATTT/---- ATTTGAACTC 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 ATTT 2 1 163542 CASAVA_Build 3 61931521 1I AATAAAGGAA -/T TTTGAACCAA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 3 4 163543 CASAVA_Build 3 61934946 1I TACATGGAAC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 T 7 8 163544 CASAVA_Build 3 61935781 1I TAGCATAACC -/T TTTCTGGCTG 3070 het 3070 hom 51 25 24 2 T 3 4 163545 CASAVA_Build 3 61936379 2D TGAAGAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 T 12 10 163546 CASAVA_Build 3 61952964 1I CATTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 25 6 T 11 12 163547 CASAVA_Build 3 61981847 4I TGCGTGATAA ----/TTAT GAGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 TTAT 0 1 163548 CASAVA_Build 3 61982572 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2011 het 2011 ref 31 14 6 11 T 19 18 163549 CASAVA_Build 3 61985120 4D GATTTTTGTT AAAG/---- AAAAAGGAAT 3070 het 3070 hom 50 20 27 3 AAAG 1 0 163550 CASAVA_Build 3 61986620 3D TTCCCATATT TTA/--- CTGATACATT 3070 het 3070 hom 40 14 21 7 TTA 1 0 163551 CASAVA_Build 3 61990912 1D TTTCCCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 T 15 14 163552 CASAVA_Build 3 61994245 2D TGCCTATCTT CC/-- CCCCCCCACC 1998 het 42 hom 15 1 6 9 C 9 7 163553 CASAVA_Build 3 61999960 1D23M1D AGAGTTATGG TTTTTTTTTTTGGTTTTGTTTTTGT/-TTTTTTTTTTGGTTTTGTTTTTG- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 25 0 21 9 N/A 0 0 163554 CASAVA_Build 3 62000554 1I TGCCTTTTTT -/C CCCCCAGCCA 3070 hom 65 het 26 0 21 5 C 5 6 163555 CASAVA_Build 3 62001384 11I GGCCAGGATG -----------/GTCTCCATCTC TTGACCTCAT 3070 hom 96 het 35 0 30 5 GTCTCCATCTC 0 1 163556 CASAVA_Build 3 62005253 1I ACTGTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3023 hom 26 10 13 3 A 10 11 163557 CASAVA_Build 3 62006976 4I TCCCCCAGAG ----/CGTA CGTATCCTTG 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 CGTA 1 2 163558 CASAVA_Build 3 62010282 3I TGCACCCAGT ---/AAA ATCATCAACT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 1 4 163559 CASAVA_Build 3 62022125 1D TTGGTTGACA C/- CATCTCCGGT 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 C 2 1 163560 CASAVA_Build 3 62022948 3I GGGAGGTGGA ---/AGT GGTTGCTGTG 2864 het 1439 hom 12 3 7 2 AGT 0 1 163561 CASAVA_Build 3 62023391 1D TTATGGCATT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 G 1 0 163562 CASAVA_Build 3 62024846 1I CAAGGGAGAC -/T TTTTTTTCCG 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 7 8 163563 CASAVA_Build 3 62025215 1I TTTCTTCCTT -/C CCCCTCCGTA 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 C 4 5 163564 CASAVA_Build 3 62027231 2D CAAAGAGCAC AA/-- ACACTGTGGT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 3 1 163565 CASAVA_Build 3 62027971 1D AATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 37 2 22 13 T 14 13 163566 CASAVA_Build 3 62039290 1I AGACTGATAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 9 10 163567 CASAVA_Build 3 62065785 1D CGCCTCAGTT A/- AAAGAACTGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 A 4 3 163568 CASAVA_Build 3 62068550 2D CCATTCTTCT TA/-- GTTACTGAGA 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 TA 1 0 163569 CASAVA_Build 3 62069681 6D GATTGCAGAA TTGCAG/------ AATTTCTCCA 1404 het 1404 ref 22 17 3 4 TTGCAG 1 0 163570 CASAVA_Build 3 62132389 1D CAGTAGGTCA T/- TTTTTTTTTA 1092 het 1092 ref 39 33 3 4 T 10 9 163571 CASAVA_Build 3 62157604 3D AGTTGTGGAC CAG/--- CAGCAGCAGC 3070 het 2580 hom 38 10 20 8 CAG 5 4 163572 CASAVA_Build 3 62172672 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 T 12 11 163573 CASAVA_Build 3 62184206 1I CTGGGCAATT -/G GGGGGGGCGG 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 G 7 8 163574 CASAVA_Build 3 62208615 1D GAGATAGCAG T/- TTTATAGGAG 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 4 3 163575 CASAVA_Build 3 62208736 1D GAACGAAGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 366 hom 51 1 46 4 T 10 9 163576 CASAVA_Build 3 62222500 1D ACTTCTCCCT G/- GGGAAGTACT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 G 4 3 163577 CASAVA_Build 3 62236072 1I GCCAGTGAGG -/A ATCACAGAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 2 163578 CASAVA_Build 3 62247278 1I CAGAGCACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 962 hom 19 2 14 3 A 9 10 163579 CASAVA_Build 3 62250414 1D CATTCATGAT C/- CCCCCCCCCC 2546 het 740 hom 23 3 8 12 C 11 10 163580 CASAVA_Build 3 62266126 1D AAACAAATGG A/- AAAAAAAATT 1978 het 1798 hom 10 5 5 0 A 9 8 163581 CASAVA_Build 3 62267766 1I AAAAAAAAAA -/T AAAATAAAGA 3070 het 1338 hom 33 5 19 9 T 0 1 163582 CASAVA_Build 3 62273449 1D CTACAATTTG T/- TTTTTTTTTT 2084 het 2084 ref 33 18 6 9 T 15 14 163583 CASAVA_Build 3 62275764 1I GCTGGGGAGG -/C CTCAGGAAAC 3070 hom 68 het 25 0 23 2 C 1 2 163584 CASAVA_Build 3 62279566 1D GCGCGCCGCG T/- TACCACACGC 3070 hom 45 het 18 0 13 6 T 2 1 163585 CASAVA_Build 3 62288205 25I AGCCACATGA -------------------------/GGCTAATGGCTATCATATGAGCAGT GAAGTTCTAG 3070 hom 96 het 34 0 33 4 GGCTAATGGCTATCATATGAGCAGT 0 1 163586 CASAVA_Build 3 62293465 4I CCAATATCTC ----/TAAT TAATTCCTGT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 TAAT 1 2 163587 CASAVA_Build 3 62301850 1D CTTTTATAGG A/- AAAATACATT 3070 het 3070 ref 49 29 19 2 A 5 4 163588 CASAVA_Build 3 62302217 1D CAAAATTACC G/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 G 1 0 163589 CASAVA_Build 3 62305816 1D ATATGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 12 11 163590 CASAVA_Build 3 62307873 1D AGGTCAGGAG T/- TTTGAGACTA 2218 het 2218 ref 21 10 5 6 T 4 3 163591 CASAVA_Build 3 62309511 1D TTCATAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 9 8 163592 CASAVA_Build 3 62316422 1D AAACAAAAAC A/- AAAACTCAGG 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 A 5 4 163593 CASAVA_Build 3 62330707 1I TCTGCTATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 9 10 163594 CASAVA_Build 3 62348881 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 955 het 955 ref 26 9 3 14 T 13 10 163595 CASAVA_Build 3 62349963 1I ATTGGAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1094 hom 24 4 11 9 T 11 12 163596 CASAVA_Build 3 62364797 1D GTGTCAGTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 12 24 2 A 9 8 163597 CASAVA_Build 3 62366164 4D ACCTTTCAGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 189 het 189 ref 18 8 3 7 A 16 12 163598 CASAVA_Build 3 62373037 2I GTGCTACAAC --/CA CAGTTTCAGA 2720 het 2720 ref 27 12 7 8 CA 1 2 163599 CASAVA_Build 3 62374605 1D AACATACTTT A/- AAAAAAAAAA 1204 het 1204 ref 29 5 4 21 A 17 16 163600 CASAVA_Build 3 62387627 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2170 hom 10 het 9 0 8 1 A 14 13 163601 CASAVA_Build 3 62396678 4D TTAATTTACT ATTA/---- ATTAATTAAT 3070 hom 57 het 31 0 20 13 ATTA 6 5 163602 CASAVA_Build 3 62405498 1D TTAGCTTCCT G/- GGGAAATGAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 8 G 4 3 163603 CASAVA_Build 3 62438030 1I GCAATCTGGG -/T TTTTTTTTTT 1823 het 1823 ref 33 8 9 16 T 15 16 163604 CASAVA_Build 3 62459594 1I AATGGTAACC -/A AGATGCTGCT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 A 1 2 163605 CASAVA_Build 3 62476090 3I CGTGGATGAA ---/TAG TAGGTCCCAA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 TAG 1 2 163606 CASAVA_Build 3 62491938 2D TAATGCAACT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 TC 10 9 163607 CASAVA_Build 3 62506301 4I CTCTGTAGAG ----/TTTC TCACACACAA 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 TTTC 0 1 163608 CASAVA_Build 3 62527142 1I CCTTTCCTTC -/A AGCAACCTGA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 1 2 163609 CASAVA_Build 3 62527309 1I AGGGGAGAAG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 6 7 163610 CASAVA_Build 3 62540531 1D TGTGTTTTTT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 35 13 13 10 A 8 7 163611 CASAVA_Build 3 62544494 1I AACCTTGGGC -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 92 het 38 0 31 7 T 7 8 163612 CASAVA_Build 3 62549787 1D TGTGCATGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 24 12 1 T 9 8 163613 CASAVA_Build 3 62550907 1D CCAGCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 2115 het 2115 ref 28 17 7 5 A 15 14 163614 CASAVA_Build 3 62565968 2I GGAAAAACAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 28 0 22 6 AC 0 1 163615 CASAVA_Build 3 62569947 1I TTTTTTTTTT -/C CTTTTTTGTG 2900 het 2900 ref 36 17 9 10 C 1 2 163616 CASAVA_Build 3 62584654 1I26M1I CTGTTGACAA -TTTTTTTTTTCTGGTTGTCACCACGA-/TTTTTTTTTTTCTGGTTGTCACCACGAG GGGTGGGGGT 3070 het 2019 hom 29 6 16 9 N/A 0 0 163617 CASAVA_Build 3 62584932 2D AGGTAGTTCT AA/-- GAGTTGCACA 3070 het 3070 ref 36 22 11 4 A 2 0 163618 CASAVA_Build 3 62588358 1I ATACAGAATT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 8 163619 CASAVA_Build 3 62588451 4I AGTTCTGGTA ----/ATTT ATTGAGTTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ATTT 0 1 163620 CASAVA_Build 3 62589341 1I ACCATGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 35 1 18 17 T 10 11 163621 CASAVA_Build 3 62620877 3D AGTTTCTTAA ATT/--- ATCATGTTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 ATT 1 0 163622 CASAVA_Build 3 62622081 1D AGGCTGAGTA G/- GTGAGTTTGC 3070 hom 93 het 37 0 31 7 G 2 1 163623 CASAVA_Build 3 62632924 1I CACAGAGTCC -/T GGGCCTCACC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 0 1 163624 CASAVA_Build 3 62635984 1I TTAGAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 10 11 163625 CASAVA_Build 3 62640933 1D GAGTCAGCCA T/- TTGGAAATTC 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 T 3 2 163626 CASAVA_Build 3 62645750 1D AGTAGACTGA T/- TTTACTACTT 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 T 4 3 163627 CASAVA_Build 3 62646445 1D GATGAAACTC T/- TTTCACCTCA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 4 3 163628 CASAVA_Build 3 62648961 9D CTGTCATGCT AACCAAAAA/--------- AACCAAAAAT 3070 hom 111 het 45 0 37 10 AACCAAAAA 2 1 163629 CASAVA_Build 3 62653010 3D TCCAAGGTAA TTC/--- TTCTGCTCAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 TTC 2 1 163630 CASAVA_Build 3 62653101 1I ATGAGTACGG -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 T 6 7 163631 CASAVA_Build 3 62653753 1D AATTTCTTGG C/- CATCAAGTTT 3070 het 3070 hom 55 23 25 7 C 2 1 163632 CASAVA_Build 3 62657993 2D ATCCTTTCCC CT/-- GAGTCCCCAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 CT 1 0 163633 CASAVA_Build 3 62659347 6D TGTTCTTGTT CTTCTC/------ CTTCTCCTTC 3070 het 3070 ref 41 24 14 5 CTTCTC 2 1 163634 CASAVA_Build 3 62668634 6D GACACAGTAC TGTTTT/------ TGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 16 12 12 TGTTTT 3 2 163635 CASAVA_Build 3 62668967 2I AAGTGGAGAG --/AA AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 42 20 16 6 A 8 10 163636 CASAVA_Build 3 62678748 1I CTTAGAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 10 11 163637 CASAVA_Build 3 62682536 1I TAAATCCGCA -/T TTTTGCAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 4 5 163638 CASAVA_Build 3 62685124 2D AGAAACAATA AC/-- AGTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 AC 1 0 163639 CASAVA_Build 3 62685889 3D ATCTAAAATC TAG/--- TAGAACTGTC 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 TAG 2 1 163640 CASAVA_Build 3 62688439 3I GGACAGAACT ---/ACC ACCATTCACT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 ACC 1 2 163641 CASAVA_Build 3 62698190 1D CTCTTACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 11 10 163642 CASAVA_Build 3 62698203 1D AAAAAAAAGC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 8 7 163643 CASAVA_Build 3 62699144 1I CTTACACATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 9 10 163644 CASAVA_Build 3 62705807 1D TTTTGCTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 24 10 8 6 T 9 8 163645 CASAVA_Build 3 62712167 1I TATCTTGTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2436 hom 24 7 13 4 T 9 10 163646 CASAVA_Build 3 62716773 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3067 het 3067 ref 27 9 9 9 T 14 15 163647 CASAVA_Build 3 62729942 1I AATTCTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 31 2 19 10 T 13 14 163648 CASAVA_Build 3 62731137 4D GAATTCCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2218 hom 31 8 18 6 TTTG 4 3 163649 CASAVA_Build 3 62739623 1D GAACATTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 35 0 23 12 T 13 12 163650 CASAVA_Build 3 62744586 2I TTATTTATCT --/AA GAGAGAAGGA 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 0 2 163651 CASAVA_Build 3 62751675 1D AAATGGTGAC T/- TTTTTTTTTA 877 het 877 ref 40 31 3 6 T 10 9 163652 CASAVA_Build 3 62753983 4D GTGGCATCAC TATT/---- TATTTAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 TATT 2 1 163653 CASAVA_Build 3 62762519 4D GGTCACACAT GAGG/---- GAGGTGAAGG 3070 hom 114 het 41 0 37 6 GAGG 2 1 163654 CASAVA_Build 3 62764048 2D AGATGCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 34 0 13 21 T 18 16 163655 CASAVA_Build 3 62767689 1D AAAAGAGATC G/- CTTTTTAAAA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 1 0 163656 CASAVA_Build 3 62768036 1I3M3D GAGGGCACTG -GCGTGA/AGAG--- TCTCAGCTCA 3070 hom 54 het 19 0 18 3 N/A 0 0 163657 CASAVA_Build 3 62768841 1I GCCAGCCTCA -/G GCCTCCCAAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 G 1 2 163658 CASAVA_Build 3 62768964 9I AATAAAAATA ---------/ATAAATGAG ATAAAAGATT 3070 hom 79 het 32 0 26 6 ATAAATGAG 0 1 163659 CASAVA_Build 3 62776009 1D ACTGCTACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 31 6 A 11 10 163660 CASAVA_Build 3 62784882 2D CTATAACTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 16 14 163661 CASAVA_Build 3 62832841 4I CATTTTTCCT ----/CTGA CTTTTTCTAG 3070 hom 123 het 49 0 42 8 CTGA 0 1 163662 CASAVA_Build 3 62837067 4D AAACAAACCA CCAG/---- CCAGCCACCT 3070 hom 127 het 48 0 42 6 CCAG 2 1 163663 CASAVA_Build 3 62848724 1D AATCCATGGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 104 het 37 0 34 3 A 9 8 163664 CASAVA_Build 3 62852350 1D TTATTTATTT A/- TTTTTGAGAC 3070 het 3070 hom 21 7 13 1 A 1 0 163665 CASAVA_Build 3 62859854 2I AGAGAGTGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AG 6 7 163666 CASAVA_Build 3 62880033 1I CTTGATGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 31 2 22 7 A 13 14 163667 CASAVA_Build 3 62887638 1D ACTTACAGGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 30 0 22 9 A 10 9 163668 CASAVA_Build 3 62889289 1I GAAAGTCTCA -/T TTTTTTATGG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 6 7 163669 CASAVA_Build 3 62890270 1D GAGAAGTAAC T/- TAAGTTTCAG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 2 1 163670 CASAVA_Build 3 62893427 3D CTCAGGCAGC TCT/--- TCTTATGCAG 3070 hom 92 het 34 0 31 3 TCT 2 1 163671 CASAVA_Build 3 62893891 5D TATCGTATAT AATAA/----- AATAATTTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 5 AATAA 2 1 163672 CASAVA_Build 3 62900489 1I GGACCAGTAA -/G GGGAAAAAAA 1975 het 7 hom 43 1 17 25 G 3 4 163673 CASAVA_Build 3 62903793 4I CAGTTTTGAT ----/TGTC TGTCAGCCAG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 TGTC 1 2 163674 CASAVA_Build 3 62905399 1I GTAAAAATCT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 3 het 34 1 26 7 A 9 10 163675 CASAVA_Build 3 62906239 16I TGTCTTATTT ----------------/GGTTTTTTGGTGAACA GAACTTATTG 3070 hom 138 het 46 0 46 3 GGTTTTTTGGTGAACA 0 1 163676 CASAVA_Build 3 62906542 1I TATGTGGGGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1184 hom 39 3 33 3 G 0 1 163677 CASAVA_Build 3 62907497 1I AGGCCCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 10 11 163678 CASAVA_Build 3 62911955 2I AGGAGGAAAC --/AA ATGGGTTTGT 3070 hom 42 het 15 0 12 3 A 1 3 163679 CASAVA_Build 3 62922108 1D CTGTATTCCA T/- TTTTTGGAAA 3070 hom 116 het 46 0 34 12 T 6 5 163680 CASAVA_Build 3 62928718 1I TAATTCCTGT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 36 2 27 7 G 1 2 163681 CASAVA_Build 3 62933907 1I ACATTTTACA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 163682 CASAVA_Build 3 62936312 1D GTAAATTAAC T/- TTTTTACAGC 3070 hom 125 het 44 0 42 2 T 6 5 163683 CASAVA_Build 3 62943487 2D GCTCTGACTC AT/-- GTGTGGGAAG 3070 hom 107 het 41 0 35 7 AT 1 0 163684 CASAVA_Build 3 62956923 1D TGCTTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 37 1 29 8 A 13 12 163685 CASAVA_Build 3 62957095 4D AGGGAGGAAG GGAC/---- GGACGGACGG 3070 hom 129 het 48 0 40 8 GGAC 4 3 163686 CASAVA_Build 3 62957700 1D TTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 30 0 15 15 T 16 15 163687 CASAVA_Build 3 62958612 1D ATGTAGTTTT C/- CCTTGGAGAA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 C 3 2 163688 CASAVA_Build 3 63000514 3I41M5D TGATGAAAAA ---ATGTAAGGAGAAAGAACCAATGTTTCTTTCTTTTTCTTTTCTTTTT/ATGATGTAAGGAGAAAGAACCAATGTTTCTTTCTTTTTCTTTTC----- TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 40 0 46 5 N/A 0 0 163689 CASAVA_Build 3 63004439 1D GAACTGGGGG A/- AAAAAAACTG 3070 hom 133 het 57 0 44 13 A 8 7 163690 CASAVA_Build 3 63020301 3D TTATGAACTT GGG/--- GGAGTATTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 G 5 2 163691 CASAVA_Build 3 63028681 4I AAAATAAAAC ----/AGAG AGGCTAAGGC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 AG 1 3 163692 CASAVA_Build 3 63038925 1D TTAGGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1673 hom 41 13 17 11 T 11 10 163693 CASAVA_Build 3 63049124 4I GTTGTCATTA ----/TTTT TTTTCCATTT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 4 8 163694 CASAVA_Build 3 63051039 1D AAGAAAAGAG A/- AAAAATATAG 3070 hom 111 het 39 0 37 2 A 6 5 163695 CASAVA_Build 3 63053149 1D TGTAGGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 21 17 3 A 12 11 163696 CASAVA_Build 3 63059320 2D TGGTTATCTC TT/-- TTGCTGTGCA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 4 2 163697 CASAVA_Build 3 63060652 6I GACGAAGAAA ------/TTGAAT TTGAATTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 TTGAAT 1 2 163698 CASAVA_Build 3 63068431 9D ACTTTGAGTA GTACTGCTT/--------- GCTCTAAGCA 3070 het 3070 hom 26 13 14 4 GTACTGCTT 1 0 163699 CASAVA_Build 3 63072689 3D TTTCTTTCTC TCT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TCT 1 0 163700 CASAVA_Build 3 63077000 1I GTGGAAAGAG -/A GTAATAAATA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 0 1 163701 CASAVA_Build 3 63130732 1D TCATTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 18 4 A 13 12 163702 CASAVA_Build 3 63135395 1I AAGTATATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 9 10 163703 CASAVA_Build 3 63139108 1D GACATGAACC A/- GAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 A 1 0 163704 CASAVA_Build 3 63143700 1I ATGAGAGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 T 9 10 163705 CASAVA_Build 3 63144427 1I TTCCTATTAG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 A 7 8 163706 CASAVA_Build 3 63155287 5I TCAGTTTGCC -----/TTCCT TTGAGTTAGG 3070 hom 88 het 33 0 29 4 TTCCT 0 1 163707 CASAVA_Build 3 63162442 1D TATTTAAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 28 13 9 7 A 8 7 163708 CASAVA_Build 3 63163319 1D GATTATTTTT A/- AAAAACCTCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 5 163709 CASAVA_Build 3 63172570 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCCTCCC 724 hom 7 het 3 0 3 0 C 6 7 163710 CASAVA_Build 3 63184331 1D TCAAGAAATT C/- CTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 C 2 1 163711 CASAVA_Build 3 63186936 1D GAAAAGATGT G/- GAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 43 17 21 8 G 2 1 163712 CASAVA_Build 3 63189649 4D CGCTTCTCCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 AAAC 6 5 163713 CASAVA_Build 3 63190543 6D GTTTTGGCCA TTACTT/------ TTAATGGTGA 3070 het 3070 ref 44 28 18 5 TTACTT 1 0 163714 CASAVA_Build 3 63194427 2D GATAAATGAC AG/-- AGCTAAGAGT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 AG 2 1 163715 CASAVA_Build 3 63204018 1I AGAAACAGGT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 6 7 163716 CASAVA_Build 3 63206063 1D AAATCTGTCA T/- TGACTATAAT 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 T 2 1 163717 CASAVA_Build 3 63209676 1D CTCAGTTTTG T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 8 7 163718 CASAVA_Build 3 63222744 1D TAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 11 10 163719 CASAVA_Build 3 63222824 1I TCTTAAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2535 hom 24 8 10 6 A 10 11 163720 CASAVA_Build 3 63225643 2I TCAGAATCAT --/GG GGGGGAGCCA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 5 7 163721 CASAVA_Build 3 63229417 1D TCTTGCTGTC T/- CAGGGGTGGT 3070 hom 90 het 33 0 29 4 T 1 0 163722 CASAVA_Build 3 63237618 2D CAAATACCCA CC/-- CCCCCCACCA 2458 het 2458 ref 28 18 6 5 C 8 6 163723 CASAVA_Build 3 63239576 1D AACCCTCAAG C/- CGGGGATTTC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 C 2 1 163724 CASAVA_Build 3 63244072 1I AGCCAATTTC -/A AAGACTTGCA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 2 3 163725 CASAVA_Build 3 63246093 1I CTCTTTTGTT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 A 7 8 163726 CASAVA_Build 3 63247022 1D AGGTGTGAAG A/- GATACTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 A 1 0 163727 CASAVA_Build 3 63247273 1D TTCTGCAGAC G/- ACCCACATCT 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 G 1 0 163728 CASAVA_Build 3 63251281 1D CTTGTGTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 10 9 163729 CASAVA_Build 3 63251941 1D ATCAAAGGTG T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 7 6 163730 CASAVA_Build 3 63252326 1I GATTCTATTT -/A TGAAGCAGTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 0 1 163731 CASAVA_Build 3 63254039 1D GGGTGGAGGG T/- TTTTTTGGAC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 7 6 163732 CASAVA_Build 3 63257002 4I GTTAGAAATG ----/TTTT CTATTTCTCA 3070 het 3070 ref 47 19 22 7 T 0 4 163733 CASAVA_Build 3 63259169 6D4M9D GAATGAAGAA CCAGCGTGATGTAATAGGG/------TGAT--------- AATGAGACAA 3070 het 3070 ref 51 33 22 5 N/A 0 0 163734 CASAVA_Build 3 63265488 4D ATTTCTGTTC TTTT/---- ATTTGATTAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 4 T 4 0 163735 CASAVA_Build 3 63267253 1D ACCAGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 11 10 163736 CASAVA_Build 3 63271722 1I3M1I GATGTCATTT -ATG-/AATGC TGGTATCCTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 N/A 0 0 163737 CASAVA_Build 3 63277803 2D TCCACTGTGA TC/-- TGACAGCGTG 3070 het 3070 ref 20 10 7 4 TC 1 0 163738 CASAVA_Build 3 63287055 1I GAAGCTGGCC -/T ACAGGACCTC 3070 hom 134 het 60 0 54 6 T 0 1 163739 CASAVA_Build 3 63291168 1I GTCTCCCCTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 8 9 163740 CASAVA_Build 3 63295545 1D TTGCCATCAC T/- TTCAATAGCG 3070 het 3070 hom 33 10 11 12 T 3 2 163741 CASAVA_Build 3 63296483 5D ATTAGCTTCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 705 hom 28 6 17 5 T 24 19 163742 CASAVA_Build 3 63300523 1I ACAGGCATGC -/A CCACCATGTC 3066 het 1443 hom 20 6 7 7 A 0 1 163743 CASAVA_Build 3 63306537 1D TTTCTGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2556 hom 23 8 9 6 T 12 11 163744 CASAVA_Build 3 63310054 1D CTGACCTTGT G/- ATCCGCCCAC 2834 het 900 hom 12 2 7 3 G 1 0 163745 CASAVA_Build 3 63316421 1I AGTACTCTGG -/C CCCCCCCAGC 3070 het 3070 ref 34 12 14 8 C 7 8 163746 CASAVA_Build 3 63319342 1D ATAATACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 A 11 10 163747 CASAVA_Build 3 63335022 1I AATTATGTGG -/T TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 T 4 5 163748 CASAVA_Build 3 63359442 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1424 het 1388 hom 12 5 6 1 A 12 11 163749 CASAVA_Build 3 63370753 1I GGACAAGAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 63 23 28 12 A 8 9 163750 CASAVA_Build 3 63382050 1D TTTGTAATAG C/- CAAAAAACTG 3070 het 2524 hom 21 9 10 2 C 2 1 163751 CASAVA_Build 3 63387530 1I AGACTAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2959 hom 25 7 13 5 A 9 10 163752 CASAVA_Build 3 63392552 1D TTCCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2214 het 2214 ref 35 16 9 11 T 13 12 163753 CASAVA_Build 3 63397867 2I TGCTGGGATT --/AC AGACATGAGC 2420 het 2420 ref 17 7 7 3 AC 0 1 163754 CASAVA_Build 3 63402968 2D GAAGGAAAGC GA/-- GAGAGAGAGA 1447 het 1447 ref 37 29 4 5 GA 7 6 163755 CASAVA_Build 3 63408963 1D CAGGTGATCC T/- CCTGCCTCGG 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 1 0 163756 CASAVA_Build 3 63481654 1I CGTTTTTTGT -/A AAGGCCAAAT 3070 hom 116 het 46 0 36 10 A 2 3 163757 CASAVA_Build 3 63483273 1I CATTGGCTTT -/A TAAACAAATC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 0 1 163758 CASAVA_Build 3 63483456 1I CAACCAAGCA -/T TCCCCAGCAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 2 163759 CASAVA_Build 3 63484800 1D TCATTTCTGT A/- AAAAAAAAAA 1627 het 1627 ref 40 30 4 6 A 11 10 163760 CASAVA_Build 3 63505744 1I GATTTAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1130 hom 39 3 29 7 A 12 13 163761 CASAVA_Build 3 63522318 5D GTCATAGAGG ATTTT/----- ATTTTATTTG 3070 hom 117 het 45 0 39 8 ATTTT 2 1 163762 CASAVA_Build 3 63546166 1I TATATCCATG -/C CCCCCCCCCT 3070 het 405 hom 22 1 13 8 C 9 10 163763 CASAVA_Build 3 63560078 4D GGTAACTGCC CTAT/---- CTAAGTGTAC 3070 het 3070 ref 53 29 19 6 CTAT 1 0 163764 CASAVA_Build 3 63612624 3I GCTCTAAGCT ---/ACC ACAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 39 25 11 3 ACC 0 1 163765 CASAVA_Build 3 63627674 1I GATAGAAAAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 9 10 163766 CASAVA_Build 3 63641286 1I GATCACCTGA -/G GTCAGGAGTT 1886 het 1886 ref 15 6 4 5 G 1 2 163767 CASAVA_Build 3 63641905 1I TCTCAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 985 het 985 ref 39 30 3 6 T 10 11 163768 CASAVA_Build 3 63643081 1I TAATCTGTCC -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 6 7 163769 CASAVA_Build 3 63674444 1D TGCATCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1660 het 1660 ref 34 17 5 14 A 14 13 163770 CASAVA_Build 3 63701713 1D AAGCACTGCC A/- AAGGTGGAAC 3070 het 3070 ref 58 32 23 3 A 3 2 163771 CASAVA_Build 3 63703548 2D CTCTGTATTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 T 13 11 163772 CASAVA_Build 3 63707455 1I GAAATGCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 10 11 163773 CASAVA_Build 3 63798055 1I ACACATTATA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 163774 CASAVA_Build 3 63808428 1D ACTCCAGTCT G/- GGCAACAGAG 3070 hom 48 het 20 0 17 4 G 3 2 163775 CASAVA_Build 3 63815999 4I ATACAAAATA ----/TCTG TCTTTCAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TCTG 0 1 163776 CASAVA_Build 3 63841971 3I TTTGTGATTG ---/AGT AGTAGTACCA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AGT 2 3 163777 CASAVA_Build 3 63854539 5I GGGAATACAG -----/TAGCA TAGCACCATT 3070 hom 111 het 43 0 35 9 TAGCA 1 2 163778 CASAVA_Build 3 63858938 1D AGTTCATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 121 hom 30 1 23 6 A 15 14 163779 CASAVA_Build 3 63859778 1I ATGGAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3033 het 323 hom 20 1 12 7 T 11 12 163780 CASAVA_Build 3 63952538 1D CCTTTCCTGT A/- AAAAAAAAAA 1194 het 1194 ref 46 30 4 12 A 13 12 163781 CASAVA_Build 3 64034527 10D CACCCTAAGG TACTTTTTCT/---------- TTAGCACACA 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 TACTTTTTCT 1 0 163782 CASAVA_Build 3 64036518 1D TTCAGTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 12 0 8 4 T 13 12 163783 CASAVA_Build 3 64041346 1I AGCTTTTTTT -/C CCCACATCTT 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 C 3 4 163784 CASAVA_Build 3 64042709 2D CCAGTGTATC AT/-- GTGTGTGCAC 3070 het 3070 hom 42 16 20 8 AT 1 0 163785 CASAVA_Build 3 64047941 2D GGTGAGAGAG AA/-- TTTTTAAATG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 2 0 163786 CASAVA_Build 3 64052582 2D GGGACTACAG GT/-- TTGCACCATT 3070 het 2759 hom 20 7 9 4 GT 1 0 163787 CASAVA_Build 3 64073685 2D GAGGCAAGAC AT/-- AGAAATCTGG 3070 het 3070 ref 46 22 18 8 AT 1 0 163788 CASAVA_Build 3 64079439 1D TTAAAAAGGC A/- AAAAAAATAT 2337 het 2337 ref 24 13 8 3 A 8 7 163789 CASAVA_Build 3 64079580 4I6M3I AACCCAGCAA ----ATAAAT---/CCCCATTACTGGG ATTATATCCA 2332 het 2332 ref 16 13 5 1 N/A 0 0 163790 CASAVA_Build 3 64082258 1I AAGGCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 12 13 163791 CASAVA_Build 3 64090985 1D ATGGCAAATA C/- TTTTGAGTGT 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 C 1 0 163792 CASAVA_Build 3 64103006 3I AGGAGCCTGC ---/AGG AGGAGTATTT 1518 het 1518 ref 22 8 5 9 AGG 1 2 163793 CASAVA_Build 3 64115931 1D AATTTAAATT A/- AAAAAATTTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 7 6 163794 CASAVA_Build 3 64116083 1I AGCTATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 A 11 12 163795 CASAVA_Build 3 64121842 2D AGTTAGAGAG AT/-- ATGAGACACC 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 AT 2 1 163796 CASAVA_Build 3 64135157 1D GCTTCGGTTG A/- CCGACATGTG 3070 het 3070 ref 58 30 21 7 A 1 0 163797 CASAVA_Build 3 64137204 1D TAAAGTTTAG A/- AAGCAAAGAC 3070 het 3070 ref 51 25 23 4 A 3 2 163798 CASAVA_Build 3 64141258 3I TTGAGAATGA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 11 14 163799 CASAVA_Build 3 64145358 1I TGACTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 A 11 12 163800 CASAVA_Build 3 64151118 1I ATGTTTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 8 9 163801 CASAVA_Build 3 64151832 1I AACAGAAAGG -/T TTCCCATATT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 2 3 163802 CASAVA_Build 3 64166325 1I GGATGAAGGC -/A AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 55 24 23 8 A 6 7 163803 CASAVA_Build 3 64181811 5I GTTGCAACTT -----/CACCC CACCCAAAGG 3070 het 3070 ref 41 24 10 7 CACCC 1 2 163804 CASAVA_Build 3 64193259 30D ACCCTCTGGC TGCTCCTTCTCAGGCTCTTTTGCTGGCTCA/------------------------------ TGCTCATCTC 3070 hom 91 het 32 0 30 5 TGCTCCTTCTCAGGCTCTTTTGCTGGCTCA 1 0 163805 CASAVA_Build 3 64195025 2I CCATTTCTTC --/AT ATCTTTGCCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 1 2 163806 CASAVA_Build 3 64206011 1D ACGGGAAAGC T/- TATCTCTGCA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 2 1 163807 CASAVA_Build 3 64220352 8D TTGAAAGGAA GAGATTAT/-------- GAGATTATGT 3070 hom 63 het 21 0 20 4 GAGATTAT 2 1 163808 CASAVA_Build 3 64226918 1D ACCGCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 121 het 46 0 38 8 A 12 11 163809 CASAVA_Build 3 64227677 2I AAAAAGTAAA --/CT CTGACCCTCT 3070 hom 94 het 42 0 29 13 CT 1 2 163810 CASAVA_Build 3 64239013 1I TTTGGGGAGC -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 5 6 163811 CASAVA_Build 3 64258061 1I TGGCCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2654 hom 39 10 14 15 A 13 14 163812 CASAVA_Build 3 64261882 2D GAAATGAGGG AA/-- AAAAAAAAAA 2623 het 2623 ref 30 14 10 6 A 12 10 163813 CASAVA_Build 3 64269083 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2299 hom 21 8 8 5 A 17 16 163814 CASAVA_Build 3 64269221 4I AATTCCGTTT ----/ATGG TGTGAGCTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATGG 0 1 163815 CASAVA_Build 3 64271483 1I GTTCACACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 T 10 11 163816 CASAVA_Build 3 64272821 1I GTTTTGGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 A 9 10 163817 CASAVA_Build 3 64287287 1D CCTGGACAGT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 8 7 163818 CASAVA_Build 3 64290727 1D ATGTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1759 het 1759 ref 25 16 5 4 A 11 10 163819 CASAVA_Build 3 64292020 4D AAGAAACCAC ACAG/---- ACAAACAGAA 1282 het 1282 ref 35 11 7 18 ACAG 1 0 163820 CASAVA_Build 3 64293380 1D AGTTCTTTTT A/- AAAAAGAATG 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 A 6 5 163821 CASAVA_Build 3 64298694 2I TATGCACACA --/TG TGTGTGTGCA 3070 het 3070 hom 58 26 25 7 TG 4 5 163822 CASAVA_Build 3 64304058 2I AGGTCTTGCT --/TC TCTCTCTCAT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TC 4 5 163823 CASAVA_Build 3 64314418 1D CAACACTAAC T/- TATTTTATCC 3070 het 3070 ref 49 26 22 1 T 2 1 163824 CASAVA_Build 3 64317501 3I GGCAAATGTT ---/CCA CCTGAAGGGG 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 CCA 0 1 163825 CASAVA_Build 3 64321452 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 T 9 8 163826 CASAVA_Build 3 64364405 1D GAGATATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1748 hom 34 7 12 15 A 17 16 163827 CASAVA_Build 3 64366781 1D AGTGTCTCCG A/- AAAAAAAAAA 1351 het 1351 ref 35 27 3 5 A 11 10 163828 CASAVA_Build 3 64370173 2D32M2D CCTGAGTGAC AGAGTGAGACCCTGCCTCAAAAACAAACAAACAAAC/--AGTGAGACCCTGTCTCAAAAACAAACAAACAA-- ACACACACAC 3070 hom 101 het 35 0 31 10 N/A 0 0 163829 CASAVA_Build 3 64372571 1D CCAGGACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 12 11 163830 CASAVA_Build 3 64383625 2I TCAGTAATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 35 0 31 4 A 10 12 163831 CASAVA_Build 3 64384403 4D CTAATTCAAC TGTT/---- TGTTTGTTTA 3070 hom 114 het 45 0 39 7 TGTT 3 2 163832 CASAVA_Build 3 64385163 1D ATAGAAGTGA T/- TTTTTTGATG 3070 hom 111 het 40 0 39 1 T 7 6 163833 CASAVA_Build 3 64386452 1D TTCCCAGGGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 8 163834 CASAVA_Build 3 64389977 1D ATGCACATTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 5 T 9 8 163835 CASAVA_Build 3 64390825 1I TTTTAATGGC -/A AAAAATCTAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 5 6 163836 CASAVA_Build 3 64391062 1D68M1D CATCATGGCA CATGTATACCTATGTAACAAACCTGCATATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTACAATAAATCTA/-ATGTATACCTATGTAACAAACCTGCATATTCTACACATGTATCCCAGAACTTAAAGTACAATAAATCT- AAAAAAAAAG 3070 het 234 hom 26 1 25 17 N/A 0 0 163837 CASAVA_Build 3 64391935 1D TTTTGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 11 10 163838 CASAVA_Build 3 64392252 1I AAATTTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 26 1 17 8 A 11 12 163839 CASAVA_Build 3 64409654 6D GGCTTTTCTA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2078 het 1858 hom 37 11 7 19 T 22 16 163840 CASAVA_Build 3 64421241 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2216 hom 35 11 19 7 A 14 13 163841 CASAVA_Build 3 64426240 1I TCTAAATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 11 12 163842 CASAVA_Build 3 64444915 1D GCCCCACCTT C/- CAAGGGCATT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 C 2 1 163843 CASAVA_Build 3 64449115 1D CTTTACAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 26 7 T 13 12 163844 CASAVA_Build 3 64465441 4I TCATTCTTTC ----/TCTT TCTTTCTTCT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TCTT 2 3 163845 CASAVA_Build 3 64474873 7I GGAGCTGCCA -------/TGCTAGT TCTGGATTGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TGCTAGT 0 1 163846 CASAVA_Build 3 64486648 5D TATATTTACC AATAT/----- AATATAATAT 2061 hom 15 het 8 0 6 2 AATAT 3 2 163847 CASAVA_Build 3 64486884 3D TAGCTAGAAG AGA/--- AGAATTGTAA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 AGA 2 1 163848 CASAVA_Build 3 64488284 1I TAATGATTAT -/A GGGGCTAAAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 0 1 163849 CASAVA_Build 3 64491009 1D GGAAATACAA T/- ATACTAGCAT 3070 het 3070 ref 47 27 12 8 T 1 0 163850 CASAVA_Build 3 64495493 1D TCACAACTGT G/- GGGGGGCAGG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 7 6 163851 CASAVA_Build 3 64501692 7D CCATACTAGC CAATGTG/------- CAATGTGCAA 3070 hom 138 het 56 0 49 11 CAATGTG 3 2 163852 CASAVA_Build 3 64508070 3D GAAGAGGAGA CAG/--- CAGCAGCTGA 3070 hom 81 het 34 0 26 10 CAG 3 2 163853 CASAVA_Build 3 64509313 1I CTATTTATGT -/G GGGGGGGAGC 3070 het 759 hom 35 3 23 9 G 7 8 163854 CASAVA_Build 3 64521782 4I GATACCATCC ----/TTCT TTTTTTTTTT 2711 hom 8 het 31 0 17 14 TTCT 0 1 163855 CASAVA_Build 3 64524211 2D AAATGAAAAC AT/-- ATTTAAAGAC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AT 2 1 163856 CASAVA_Build 3 64553489 1D GGTTAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1405 het 1405 ref 39 27 5 7 T 13 12 163857 CASAVA_Build 3 64575556 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 904 het 904 ref 29 22 3 4 T 13 12 163858 CASAVA_Build 3 64588102 1D TCATCAGATG A/- AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 38 30 3 6 A 11 10 163859 CASAVA_Build 3 64611584 1D GTCAGAGAGC T/- TTTTTTTTTT 1984 het 1984 ref 36 20 7 9 T 17 16 163860 CASAVA_Build 3 64614696 1D TGGGGGACCC T/- CCTAGACAAA 3070 het 3070 hom 29 15 13 2 T 1 0 163861 CASAVA_Build 3 64615247 1D AACATGTAGT A/- AAACGGTTTT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 A 4 3 163862 CASAVA_Build 3 64617673 1I CAGGGCTCGT -/C CTATTAAAAG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 C 1 2 163863 CASAVA_Build 3 64618226 1I GGCTAATTGG -/T TTTTTTTTTT 2250 het 1772 hom 21 8 6 7 T 11 12 163864 CASAVA_Build 3 64618410 1I AAATTAGGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 8 9 163865 CASAVA_Build 3 64627370 1D AATAACAGCA T/- ACTGCAAAGA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 1 0 163866 CASAVA_Build 3 64630850 6D CTCTGTCTCT GTCTCA/------ GTCTCATTGT 3070 hom 135 het 48 0 46 5 GTCTCA 2 1 163867 CASAVA_Build 3 64633390 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTCAAAACAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 CT 2 1 163868 CASAVA_Build 3 64634808 1D TAACACTAAA G/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 G 1 0 163869 CASAVA_Build 3 64637238 1I GTTTATCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 51 22 21 8 A 9 10 163870 CASAVA_Build 3 64645054 15D CAGGAGAGGC GGGCGACCCATCTCA/--------------- GATGAAATTC 1294 het 1294 ref 33 18 4 25 GGGCGACCCATCTCA 1 0 163871 CASAVA_Build 3 64655628 1I GGTACAGTTA -/C CTAAAGCGAG 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 C 1 2 163872 CASAVA_Build 3 64658477 4I AGATATTAAT ----/AGAG AATTTAAAGC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 AG 0 2 163873 CASAVA_Build 3 64664477 3I AAATTATTCT ---/AGG AGGTTGTACA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 AGG 1 2 163874 CASAVA_Build 3 64666506 3D CCCTACAATA TTG/--- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 TTG 1 0 163875 CASAVA_Build 3 64671937 2D TACTTAGCAT CA/-- GATGTGAGGA 3070 het 3070 hom 49 19 23 8 CA 1 0 163876 CASAVA_Build 3 64686724 2I ACACACAAGA --/TC TCTCCTTCCT 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 TC 2 3 163877 CASAVA_Build 3 64688447 1D TTGAGTCCTT G/- TACTGCCTCA 3070 het 3070 hom 56 25 25 8 G 1 0 163878 CASAVA_Build 3 64688735 4D TTTACACTTC TTCT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 9 TTCT 1 0 163879 CASAVA_Build 3 64704611 1I TTTCAAGAGA -/T TTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 6 7 163880 CASAVA_Build 3 64719039 10D AATAATGTTT AGACAAATAC/---------- AGACAAATGT 3070 hom 123 het 46 0 42 8 AGACAAATAC 1 0 163881 CASAVA_Build 3 64730655 1D TGAAAGAGAT G/- GGGGAAACCA 3070 hom 112 het 42 0 35 7 G 5 4 163882 CASAVA_Build 3 64734185 1I ACCAATATTT -/A AAATGACTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 3 4 163883 CASAVA_Build 3 64737609 1I GCCACAGAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 9 10 163884 CASAVA_Build 3 64745072 4D ATTTTTTAAG TCTC/---- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 TC 3 1 163885 CASAVA_Build 3 64750566 2D CAGTTCACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 51 0 28 23 AC 10 9 163886 CASAVA_Build 3 64754838 2I GTGAAGAGAC --/AG AGACACTGGT 3070 hom 57 het 22 0 20 4 AG 1 2 163887 CASAVA_Build 3 64754914 1D TCACATGCAC A/- GAAGTAATGT 1968 hom 15 het 13 0 6 7 A 1 0 163888 CASAVA_Build 3 64755415 1D AATGCTTGGG A/- AACAGAAGTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 2 163889 CASAVA_Build 3 64755793 1I TAACATTCTT -/A GGAAACCATT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 0 1 163890 CASAVA_Build 3 64759782 5I CATGGGTCCA -----/ACTTG ACTTATGTGT 3070 hom 99 het 40 0 32 8 ACTTG 0 1 163891 CASAVA_Build 3 64760869 1I TCTGCTCTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 8 9 163892 CASAVA_Build 3 64761801 13D TGTCTCAGAA AAAAAAAAAAAAC/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 26 7 18 2 AAAAAAAAAAAAC 1 0 163893 CASAVA_Build 3 64762058 1I AGAAGGTCTG -/T TTGGGCTTCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 3 163894 CASAVA_Build 3 64762261 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1098 hom 35 4 28 3 T 11 12 163895 CASAVA_Build 3 64763432 3D ATGAAAACAA AAC/--- AAAAAAAAGA 3070 hom 129 het 50 0 43 8 AAC 1 0 163896 CASAVA_Build 3 64765769 3I AGTTTTTCTA ---/TCC TGGAAAATGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCC 0 1 163897 CASAVA_Build 3 64768440 1I GGAGAGGCAA -/C CCTGGCTTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 C 2 3 163898 CASAVA_Build 3 64771660 2D ATTTTTATTT TA/-- TTTTATTTTT 1316 het 15 hom 18 1 10 7 TA 1 0 163899 CASAVA_Build 3 64776503 1D TGTATGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3032 het 747 hom 34 6 16 12 T 17 16 163900 CASAVA_Build 3 64777559 1I CAGCTCACTT -/A CTCAGAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 163901 CASAVA_Build 3 64781961 1D CAAATCCTAT A/- AAAAAAACTC 3070 hom 78 het 34 0 26 9 A 8 7 163902 CASAVA_Build 3 64783052 1I AAAGGCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 11 12 163903 CASAVA_Build 3 64800076 1I GGTTGAGTGC -/A AGAGACAGAT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 1 2 163904 CASAVA_Build 3 64807532 1I AGGCAATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 877 hom 39 2 28 9 T 10 11 163905 CASAVA_Build 3 64810220 1D GCTCAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2982 hom 26 9 10 7 T 13 12 163906 CASAVA_Build 3 64832432 2I TATATCTAGC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 TA 6 7 163907 CASAVA_Build 3 64855365 2D CCATTACTCT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 83 het 34 0 28 6 AG 8 7 163908 CASAVA_Build 3 64861681 1D GTTTTTTGGG A/- AAAAAATCCT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 7 6 163909 CASAVA_Build 3 64872890 2D CCGCCTCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 10 5 A 16 14 163910 CASAVA_Build 3 64877645 1D TTAGATAAAG C/- CCCCACTACA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 C 5 4 163911 CASAVA_Build 3 64886034 3I AAGATTAGCA ---/AAG AAGGCTGCAG 3070 hom 116 het 42 0 38 4 AAG 1 2 163912 CASAVA_Build 3 64899703 4I GATTAAAGGT ----/ATAG ATAGACCAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 ATAG 1 2 163913 CASAVA_Build 3 64906987 1D CCTGCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 15 14 163914 CASAVA_Build 3 64909455 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1933 hom 30 het 16 0 9 7 A 11 10 163915 CASAVA_Build 3 64909502 1D TGCTATAGGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 54 het 24 0 18 6 A 9 8 163916 CASAVA_Build 3 64919599 1D ATAGTACTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 89 het 57 1 44 12 T 9 8 163917 CASAVA_Build 3 64920616 1D CTGGCAACAT G/- GTAGCCTCTG 3070 hom 114 het 46 0 39 8 G 2 1 163918 CASAVA_Build 3 64923697 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 19 1 15 3 A 13 12 163919 CASAVA_Build 3 64929196 1D TTTTTTTCCG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 186 hom 42 1 39 2 T 10 9 163920 CASAVA_Build 3 64929301 2D TAAATTTTGT TA/-- TACTTAACTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TA 2 1 163921 CASAVA_Build 3 64936759 1D AAATTAAATT A/- AAAAAACTGG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 7 6 163922 CASAVA_Build 3 64946769 1I GTAATTTGTT -/G GGGGTGTGGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 4 5 163923 CASAVA_Build 3 64948203 1I ACAACGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 17 2 12 3 A 13 14 163924 CASAVA_Build 3 64949535 3I CAAACATGTC ---/CTT CTTCACATGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CTT 1 2 163925 CASAVA_Build 3 64951365 2D7M1I TGCAAGTTCA GTGTTACAG-/--GAAACAGA CCTGTGTTAC 3070 hom 117 het 39 0 39 5 N/A 0 0 163926 CASAVA_Build 3 64992320 1D TTCACTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1398 het 1398 ref 44 31 3 10 T 12 11 163927 CASAVA_Build 3 65020810 1I CTTATACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1497 hom 44 4 31 9 T 13 14 163928 CASAVA_Build 3 65021853 1D GTTACAGATA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 8 7 163929 CASAVA_Build 3 65049112 1D CTCTAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 23 15 15 T 13 12 163930 CASAVA_Build 3 65068907 3D GCTAAAAAAT AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 AAC 3 2 163931 CASAVA_Build 3 65090474 1D GAAGATATCT G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 G 8 7 163932 CASAVA_Build 3 65091026 1D GTTAGTGCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 18 15 8 T 10 9 163933 CASAVA_Build 3 65096175 1D CAATAGAGTA C/- TTTAAGTACA 3070 het 3070 ref 45 28 16 1 C 1 0 163934 CASAVA_Build 3 65115227 1D TTGGAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2602 hom 39 10 20 10 T 15 14 163935 CASAVA_Build 3 65118452 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1510 het 866 hom 22 4 7 11 A 17 16 163936 CASAVA_Build 3 65127343 18I TGCATCCTGA ------------------/GCATCCTGATTTCCATGT GGAACTGCCC 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 GCATCCTGATTTCCATGT 0 1 163937 CASAVA_Build 3 65138798 3D AATATTTACC ACA/--- AACAATAGCA 3070 hom 138 het 53 0 47 8 ACA 1 0 163938 CASAVA_Build 3 65140810 1D ATGCAGTAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 10 9 163939 CASAVA_Build 3 65145388 1D ATTTCTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 11 10 163940 CASAVA_Build 3 65152525 1I TTCCTGGGAG -/C AAAAAAAAAA 1514 het 757 hom 28 2 11 15 C 0 1 163941 CASAVA_Build 3 65156625 1D AGAAGGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 24 1 15 8 A 15 14 163942 CASAVA_Build 3 65160070 3D CCTCCCAGTG ACA/--- ACAACCAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 ACA 2 1 163943 CASAVA_Build 3 65172245 2I CAAAAAATAC --/AG AGTTTGCAAC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AG 1 2 163944 CASAVA_Build 3 65181727 1I AACTGCCTTA -/T TTTTTTAGCT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 6 7 163945 CASAVA_Build 3 65182602 3D AAATAGAGTA GAG/--- GATATGTATT 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 GAG 1 0 163946 CASAVA_Build 3 65190112 1I TGTGTCGCTT -/C CATGTTTTAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 1 2 163947 CASAVA_Build 3 65193144 2D GACTCCAATA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 31 3 17 14 T 17 15 163948 CASAVA_Build 3 65193309 1I AGCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1719 het 1719 ref 15 7 4 4 T 10 11 163949 CASAVA_Build 3 65194848 4I ATATGGATGT ----/TCTC TCTCTCTGTG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 TC 3 5 163950 CASAVA_Build 3 65195055 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 2050 het 41 hom 25 1 11 13 A 10 9 163951 CASAVA_Build 3 65197239 3D AGATTATGTT ATC/--- ATATCACATT 3070 het 3070 ref 44 22 15 9 ATC 1 0 163952 CASAVA_Build 3 65197664 2I GGGCAGCACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 10 12 163953 CASAVA_Build 3 65198726 5D TATTAATGGA CATTT/----- CATTTGGGTT 3070 het 3070 ref 30 21 9 1 CATTT 2 1 163954 CASAVA_Build 3 65216924 3D GCATGAAGGG ATA/--- ATAATAATAC 3070 hom 129 het 47 0 42 8 ATA 4 3 163955 CASAVA_Build 3 65220600 14D TATACTAATA GTGTGTGTGTGTGT/-------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 84 het 28 0 29 0 GT 15 8 163956 CASAVA_Build 3 65223755 1I CTACATAGCC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 8 9 163957 CASAVA_Build 3 65224084 8I ATTTAAAATT --------/TTAAAAAG TTTAAAAGGA 3070 hom 118 het 46 0 40 6 TTAAAAAG 0 1 163958 CASAVA_Build 3 65230148 50I TTGACAAGGA --------------------------------------------------/GATGATACTCAGAGCAGTGAGACACAGTCAAAGGACTAGCAAGTTAAAAG CCATATAACA 3070 hom 66 het 18 0 23 3 GATGATACTCAGAGCAGTGAGACACAGTCAAAGGACTAGCAAGTTAAAAG 0 1 163959 CASAVA_Build 3 65233324 1I CCCCAAACCT -/A AAAAAAAATT 3070 het 150 hom 18 1 17 0 A 8 9 163960 CASAVA_Build 3 65247042 2D CAATAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 25 11 A 14 12 163961 CASAVA_Build 3 65250730 1D ATCATTGTCC T/- TAACAGGCTC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 2 1 163962 CASAVA_Build 3 65259604 1I CTTATGTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 9 10 163963 CASAVA_Build 3 65292576 1D TGTTCCCCCC G/- CTATGTCCTC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 G 1 0 163964 CASAVA_Build 3 65293073 1I AGAGACTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 32 0 23 9 A 10 11 163965 CASAVA_Build 3 65346963 2D GGCCACATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 48 0 29 20 A 16 14 163966 CASAVA_Build 3 65348104 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 162 hom 36 1 23 12 T 11 12 163967 CASAVA_Build 3 65355398 1I TTCAAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2010 hom 36 6 22 8 T 10 11 163968 CASAVA_Build 3 65373800 1I CATGCTGATG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 8 9 163969 CASAVA_Build 3 65378233 1I ATATGGTTTC -/T TTTTTTTTTT 2586 het 2586 ref 35 18 8 9 T 12 13 163970 CASAVA_Build 3 65380005 2I TTTTATGAAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 13 20 12 TG 7 8 163971 CASAVA_Build 3 65398120 1D TATGAAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 451 hom 45 2 30 13 T 15 14 163972 CASAVA_Build 3 65401557 10D CATATACATA TATACATATG/---------- TATACATATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TATACATATG 1 0 163973 CASAVA_Build 3 65412824 19D TTCAGGAATC AAACAAAGCAACCAAGATA/------------------- AAACAAAGCA 3070 hom 96 het 41 0 32 14 AAACAAAGCAACCAAGATA 2 1 163974 CASAVA_Build 3 65413297 1I TCTGTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1433 hom 25 3 13 9 T 14 15 163975 CASAVA_Build 3 65425563 9D CTGTTTTATT TTTCTGGCC/--------- TTTCTGTGGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTTCTGGCC 1 0 163976 CASAVA_Build 3 65431238 1D GAGAGAGAGA G/- AAAAAAAAAA 1726 het 1726 ref 31 10 6 16 G 1 0 163977 CASAVA_Build 3 65434462 1D TTCCTGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 11 10 163978 CASAVA_Build 3 65437498 1I AAGTATGAGA -/T TTTTTTGAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 7 163979 CASAVA_Build 3 65449227 1D AATTTTTATA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 8 163980 CASAVA_Build 3 65456924 2I ACCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 19 10 T 13 15 163981 CASAVA_Build 3 65459004 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 25 1 17 7 A 10 11 163982 CASAVA_Build 3 65468612 1I TTAGAGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 10 11 163983 CASAVA_Build 3 65469884 4I CTCCAATGGG ----/TTTA TTGTTTCAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTTA 0 1 163984 CASAVA_Build 3 65477610 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1298 hom 10 het 4 0 4 0 T 7 6 163985 CASAVA_Build 3 65479484 1I TAGATGCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 554 hom 42 2 34 6 A 10 11 163986 CASAVA_Build 3 65482399 2I GTAATAAATG --/TT TTATACTCTT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 2 4 163987 CASAVA_Build 3 65504471 1I TGTCAGGGAT -/G GGGGGGGGGT 2014 het 1803 hom 17 6 6 5 G 9 10 163988 CASAVA_Build 3 65518924 1D AGTCCAAGTG C/- CCCCATCTGT 3070 hom 117 het 44 0 40 6 C 5 4 163989 CASAVA_Build 3 65522825 4D CATGTCACAG GTAT/---- GTATGTATGT 3070 hom 114 het 48 0 39 10 GTAT 4 3 163990 CASAVA_Build 3 65530275 1I CCTTCCACAA -/T TTTTAAAGGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 5 163991 CASAVA_Build 3 65530433 1I CTCTAAAAAC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 6 7 163992 CASAVA_Build 3 65541034 1I TTTTTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 22 1 13 8 T 10 11 163993 CASAVA_Build 3 65543325 1D AATAAGACTT A/- CTGTTGAAAG 3070 hom 135 het 52 0 46 7 A 1 0 163994 CASAVA_Build 3 65553884 1I GTTTACAGAC -/T TTTTTTGGCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 6 7 163995 CASAVA_Build 3 65556524 9D TAACTCTCTG GGGTGGGTA/--------- GGGTGGGTAG 3070 hom 33 het 16 0 10 7 GGGTGGGTA 2 1 163996 CASAVA_Build 3 65561366 1I GCTTATAGAG -/C CCAAGGGCAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 2 3 163997 CASAVA_Build 3 65562445 1D AAGCACAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 A 10 9 163998 CASAVA_Build 3 65562535 1I TGAAAAGACA -/C CCCATGGAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 C 3 4 163999 CASAVA_Build 3 65576927 3D GTTTCAATGG AGA/--- AGGACAGGTG 3070 hom 156 het 55 0 52 4 AGA 1 0 164000 CASAVA_Build 3 65581731 1I CATTTGCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 554 hom 42 2 31 9 T 10 11 164001 CASAVA_Build 3 65618149 2D CATCTCTATC AA/-- AAAAAAAAAA 1720 het 1720 ref 24 12 4 8 A 16 14 164002 CASAVA_Build 3 65624865 1D CAGTGCTGAA C/- AAATTGTCAC 3070 het 3070 ref 49 28 15 6 C 1 0 164003 CASAVA_Build 3 65639076 1I ATAAAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 10 11 164004 CASAVA_Build 3 65650896 2I CCACTGCAAA --/TG TAGAGTAGAC 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 TG 0 1 164005 CASAVA_Build 3 65654611 1I CTAATTTTTG -/T ATTTTAGTAG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 0 1 164006 CASAVA_Build 3 65655157 1I AGTAAGTGCT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 8 9 164007 CASAVA_Build 3 65656017 12D GGCATCACCC CCATTAAATAAT/------------ AGATGTGGCC 3070 het 3070 ref 48 27 18 5 CCATTAAATAAT 1 0 164008 CASAVA_Build 3 65664111 1D AAGACCCAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 A 9 8 164009 CASAVA_Build 3 65666016 1I GTTAACATTC -/A AGTGGCACAC 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 1 2 164010 CASAVA_Build 3 65669086 1D CTGTGCCTGA G/- GAAGAGAGAC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 G 2 1 164011 CASAVA_Build 3 65669431 1I GAAAGAAAAC -/A GGGGGAAGGA 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 A 0 1 164012 CASAVA_Build 3 65683187 1I TGTCTCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2972 hom 28 8 12 8 A 12 13 164013 CASAVA_Build 3 65684265 1D ATTCCTTTCC A/- AGTCCTTTCC 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 A 2 1 164014 CASAVA_Build 3 65689836 1D AAAATGGAAC G/- GGGGGGGGGG 3070 het 71 hom 25 2 10 13 G 16 15 164015 CASAVA_Build 3 65690328 1D ACAACCACTA C/- CCAGCAAGGC 3070 het 3070 hom 38 13 19 9 C 3 2 164016 CASAVA_Build 3 65690922 1D AATCTTTGCA T/- TAAGAGTAGC 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 T 2 1 164017 CASAVA_Build 3 65700714 1D TTCAAGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 A 11 10 164018 CASAVA_Build 3 65701894 1D CTATTATTGA T/- TTTTTTTTTT 2951 het 717 hom 19 5 8 6 T 15 14 164019 CASAVA_Build 3 65704680 1I ACTTTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 11 12 164020 CASAVA_Build 3 65705413 1I TTGTTTTCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2694 hom 26 7 17 2 T 8 9 164021 CASAVA_Build 3 65707526 4D AATCACTGAC TCAG/---- TAAGTATATT 3070 het 3070 ref 27 13 12 5 TCAG 1 0 164022 CASAVA_Build 3 65708227 1D ATTATTGTAA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 T 7 6 164023 CASAVA_Build 3 65716256 4D TTCTTCTAGA CAGT/---- CTGTGATAGG 3070 het 3070 hom 44 19 22 6 CAGT 1 0 164024 CASAVA_Build 3 65718624 4D AATTTCCCTT AAAC/---- AATAGAGACA 3070 hom 120 het 43 0 41 4 AAAC 1 0 164025 CASAVA_Build 3 65723443 1I GAATTCTTAC -/A ACCACCCACT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 1 2 164026 CASAVA_Build 3 65726813 1D TACATTTGCC T/- TCCTAACATA 3070 het 3070 hom 45 19 19 8 T 2 1 164027 CASAVA_Build 3 65732030 1D TCAATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2101 hom 22 7 9 8 A 13 12 164028 CASAVA_Build 3 65734047 10D CAGGAGTTCA AGACTGGTCT/---------- AGTCAACACA 3070 het 3070 hom 42 20 21 2 AGACTGGTCT 1 0 164029 CASAVA_Build 3 65734691 1D ACAGGAAGAG A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 7 6 164030 CASAVA_Build 3 65734822 1I CTGGCTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 528 hom 32 2 18 12 A 15 16 164031 CASAVA_Build 3 65736963 1D GTTGGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 23 3 12 8 T 15 14 164032 CASAVA_Build 3 65737494 9D GCTGAAAGAC ATTTGTGTG/--------- ATTTGTGTGA 3070 het 3070 ref 53 20 15 21 ATTTGTGTG 2 1 164033 CASAVA_Build 3 65739146 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 19 het 19 ref 18 1 1 17 A 14 11 164034 CASAVA_Build 3 65742609 1D CTGACTGGGG A/- ACCCCCCCTC 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 A 2 1 164035 CASAVA_Build 3 65743623 1D TTAAACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 A 13 12 164036 CASAVA_Build 3 65744838 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2749 hom 25 8 14 3 A 10 9 164037 CASAVA_Build 3 65745740 5D AAATGTTCTA AAATT/----- AGATTATACT 3070 het 3070 ref 48 26 21 5 AAATT 1 0 164038 CASAVA_Build 3 65749730 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 8 9 164039 CASAVA_Build 3 65755560 1D CCTCATCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2939 hom 33 9 13 11 A 16 15 164040 CASAVA_Build 3 65758889 6D CATGGTGGGG TGTGCC/------ TGTAATCCCA 3070 het 2899 hom 19 10 9 2 TGTGCC 1 0 164041 CASAVA_Build 3 65773746 1I TTTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 10 11 8 A 12 13 164042 CASAVA_Build 3 65777354 1D CTAACAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 18 19 12 A 15 14 164043 CASAVA_Build 3 65780882 1I TTCAAAGTGA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 G 1 2 164044 CASAVA_Build 3 65781766 3I CAAAGGAAAG ---/GGT GGTGGTGGTA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 GGT 3 4 164045 CASAVA_Build 3 65786297 4D AGGGAAATGT TAAA/---- TAAATTATGG 3070 het 3070 ref 38 21 11 9 TAAA 2 1 164046 CASAVA_Build 3 65787726 3I CTGCTGCTCC ---/TAT AACAATGTTT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 TAT 0 1 164047 CASAVA_Build 3 65791393 2D TATTATGCAA TC/-- TGTTAGACAG 3070 het 3070 hom 40 20 18 4 TC 1 0 164048 CASAVA_Build 3 65791736 1D TCTCTGAGCT C/- CAATTGCTAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 C 2 1 164049 CASAVA_Build 3 65793849 1D TTTTTTTTTT G/- GGAGACAGAA 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 G 3 2 164050 CASAVA_Build 3 65805967 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2906 het 1546 hom 13 4 6 4 A 11 10 164051 CASAVA_Build 3 65809295 1D AGTTGTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 T 14 13 164052 CASAVA_Build 3 65814892 1D TTAAAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 2626 het 2209 hom 24 8 9 8 A 16 15 164053 CASAVA_Build 3 65817034 2D CTCATAACTT TC/-- TCTATACCAA 3070 het 3070 ref 46 26 16 5 TC 2 1 164054 CASAVA_Build 3 65820610 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTGTTTT 3070 hom 59 het 24 0 20 4 T 5 6 164055 CASAVA_Build 3 65840964 1D CTCAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2677 hom 28 7 17 5 A 11 10 164056 CASAVA_Build 3 65850849 1I GGGAGGCCGA -/G GTGGACGGAT 3070 hom 43 het 17 0 13 4 G 1 2 164057 CASAVA_Build 3 65858613 1I AAAAGGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 10 11 164058 CASAVA_Build 3 65862638 1D AAATTCATTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 50 27 21 2 T 8 7 164059 CASAVA_Build 3 65866138 1I CTATGAAATA -/T TTTTTTTTTT 2563 het 2563 ref 24 12 6 6 T 10 11 164060 CASAVA_Build 3 65867771 1D TCTTGTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2648 hom 31 12 10 9 A 13 12 164061 CASAVA_Build 3 65876792 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTGA 1923 het 1782 hom 11 4 4 3 T 8 9 164062 CASAVA_Build 3 65878846 4D CAGAAAAATA AAAG/---- AATGAAACTA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 AAAG 1 0 164063 CASAVA_Build 3 65883185 1I GAAGAGGAGG -/T TAAAAACTGG 3070 hom 140 het 53 0 46 7 T 1 2 164064 CASAVA_Build 3 65883660 1D AAACATAACA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 7 6 164065 CASAVA_Build 3 65886405 1D ATGGACTAAC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 9 8 164066 CASAVA_Build 3 65889869 1I ACAATGCCGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 9 10 164067 CASAVA_Build 3 65890062 1I TCAAGGATGA -/T TTTTTTTTTT 2783 het 2783 ref 30 15 8 7 T 13 14 164068 CASAVA_Build 3 65898002 1D ACCTCAGCCA G/- CCCCACCCTG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 G 1 0 164069 CASAVA_Build 3 65923655 1D AAGTGTCAGC A/- AAAAAAAAAA 2854 het 2854 ref 32 13 9 10 A 15 14 164070 CASAVA_Build 3 65933176 4D AATTATAATA AATT/---- AATTAATTAG 3070 hom 42 het 17 0 15 5 AATT 3 2 164071 CASAVA_Build 3 65947586 2D AAGGAAGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 1441 het 1441 ref 33 12 6 15 T 18 16 164072 CASAVA_Build 3 65953176 3I AAAAACAGTG ---/AAC AACTGTGGTA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 AAC 1 2 164073 CASAVA_Build 3 65964321 3D TACAGACACA CAC/--- CACAACACCC 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 CAC 2 1 164074 CASAVA_Build 3 65978829 1D ACACTTTGGT G/- GGGGGGGGGG 1286 het 948 hom 22 5 6 11 G 12 11 164075 CASAVA_Build 3 65986093 1D GTCTCTACCC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 9 8 164076 CASAVA_Build 3 66015393 1I CCCAGGTTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 429 hom 28 1 25 2 T 8 9 164077 CASAVA_Build 3 66018746 3I CAACAGTTTA ---/ACT GTTGTTGCAC 3070 het 3070 hom 45 14 26 5 ACT 0 1 164078 CASAVA_Build 3 66018982 4I GTGGGGGGAA ----/TTTG TTTGTTTAAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TTTG 1 2 164079 CASAVA_Build 3 66020093 13D CTTAAGCAAT CCTCCTAACTCAG/------------- CCTCCCAAGT 2322 het 2322 ref 34 23 8 4 CCTCCTAACTCAG 1 0 164080 CASAVA_Build 3 66035137 32D CCCAGCTACT CAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGCCTTGAACC/-------------------------------- CAGGAAGCAG 1368 het 1368 ref 10 14 3 0 CAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGCCTTGAACC 1 0 164081 CASAVA_Build 3 66035258 4I AAAGATACTC ----/AATA AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 AATA 4 5 164082 CASAVA_Build 3 66045726 1I AGGGCTTAAA -/T TTTTTTTTTT 2524 het 386 hom 23 3 11 9 T 17 18 164083 CASAVA_Build 3 66046188 1I TCCTCCTCCT -/C CCAAAGGATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 2 3 164084 CASAVA_Build 3 66046426 1I AATTTTTGTG -/T TTTTTTGTAG 2935 het 2935 ref 35 20 8 7 T 6 7 164085 CASAVA_Build 3 66049206 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1361 hom 23 6 12 5 T 11 12 164086 CASAVA_Build 3 66050627 2D TCTGGCTAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 49 19 21 10 AG 10 9 164087 CASAVA_Build 3 66061446 1D CTTATCTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 7 164088 CASAVA_Build 3 66061883 11D TTCTATTTTT GGTTGAGACAG/----------- GGTTTCACCA 3070 het 3070 ref 21 9 10 2 GGTTGAGACAG 1 0 164089 CASAVA_Build 3 66062618 1I TCAGCCTTAC -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 38 9 22 7 A 7 8 164090 CASAVA_Build 3 66064866 1D AATACGTAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 A 10 9 164091 CASAVA_Build 3 66067506 1D ATTGTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2354 hom 22 6 12 4 T 13 12 164092 CASAVA_Build 3 66069416 1D AGAAATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1918 hom 23 7 9 7 T 17 16 164093 CASAVA_Build 3 66076869 1I GTTTTCTGTC -/A CTTGCGTCTC 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 A 0 1 164094 CASAVA_Build 3 66078236 1D ACATGTGGGT C/- CAGGCAGCAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 C 2 1 164095 CASAVA_Build 3 66089324 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2595 het 2595 ref 24 11 9 4 A 11 12 164096 CASAVA_Build 3 66099247 4D ACATTGGGGC CTTT/---- CTTTCCCATC 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 CTTT 2 1 164097 CASAVA_Build 3 66112432 1D CAACACACCC T/- TCTGGTCTTC 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 T 2 1 164098 CASAVA_Build 3 66378378 5D AAAAAAAAAA AAAAC/----- AAAACCTCAA 2079 het 2079 ref 35 12 8 16 AAAAC 2 1 164099 CASAVA_Build 3 66535664 23D TCTGACCTCT TGCATGGTGGGAAGGACCCAAGG/----------------------- TCCTTGAGTA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 TGCATGGTGGGAAGGACCCAAGG 1 0 164100 CASAVA_Build 3 66540738 2I CGCGTGCGTG --/CA CACACACACA 3070 hom 104 het 44 0 36 8 CA 5 6 164101 CASAVA_Build 3 66558665 1D AAGCTGCAAA G/- GGATCCACTT 3070 hom 181 het 64 0 60 4 G 3 2 164102 CASAVA_Build 3 66562749 1I GACACTGTAA -/T TGGTGGGCAC 3070 hom 151 het 56 0 51 5 T 1 2 164103 CASAVA_Build 3 66562983 2I TTCCACTCCA --/TT TTTCTGTAAA 3070 hom 86 het 33 0 27 6 T 3 5 164104 CASAVA_Build 3 66568186 4I GGTTAAAGTA ----/TGGC CGGCACATCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TGGC 0 1 164105 CASAVA_Build 3 66568896 2D CCCATATTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 130 het 54 0 43 11 T 13 11 164106 CASAVA_Build 3 66577984 2D TTTAGATAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 23 0 14 10 TA 9 8 164107 CASAVA_Build 3 66604493 1D ATAGCCCCCC T/- ATCCTCACCC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 1 0 164108 CASAVA_Build 3 66610349 1D TAACAGCTGG T/- TTTTTTAACT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 7 6 164109 CASAVA_Build 3 66610972 1I AGTGATGCAC -/A TACAGGATAG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 0 1 164110 CASAVA_Build 3 66613587 1D AAAGCTATTT A/- AAAAAAAAAA 1239 het 1239 ref 39 29 3 7 A 13 12 164111 CASAVA_Build 3 66623760 2D CCCATAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 12 10 164112 CASAVA_Build 3 66632317 2D TACCATGTTT AC/-- ACAGAAGTCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AC 2 1 164113 CASAVA_Build 3 66655580 1I AGTTTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 11 12 164114 CASAVA_Build 3 66676404 2I TTTTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 29 1 21 7 TG 0 1 164115 CASAVA_Build 3 66688255 1I TGATAAAGGG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 7 8 164116 CASAVA_Build 3 66708637 1D GAATGGCATG A/- ACTCGGGAGG 2941 het 521 hom 12 2 7 4 A 2 1 164117 CASAVA_Build 3 66724612 1I TGGAATCCCT -/A AGGTGCTCCC 3070 hom 105 het 43 0 35 8 A 1 2 164118 CASAVA_Build 3 66726049 1D CGGCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 16 9 T 11 10 164119 CASAVA_Build 3 66735269 3D ATTTAGATGG CCT/--- CCTCCTCTCT 3070 het 2415 hom 25 8 11 7 CCT 3 2 164120 CASAVA_Build 3 66757608 1I TGTGCAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 T 11 12 164121 CASAVA_Build 3 66758663 1I TTCTAATGGA -/T TTTTTATTTT 3070 hom 31 het 39 1 34 4 T 5 6 164122 CASAVA_Build 3 66760924 1D GTAAAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 11 10 164123 CASAVA_Build 3 66762663 1D AGATGTTTCC T/- TTAGTCAGTG 3070 het 3070 hom 31 8 12 11 T 3 2 164124 CASAVA_Build 3 66766073 2D ACTCAAACTC TG/-- TGTTGAATCC 3070 het 3070 ref 30 17 13 2 TG 2 1 164125 CASAVA_Build 3 66769437 2D TTCCTTTTTA AG/-- GCTGAGTAGT 3070 het 3070 ref 43 23 18 4 AG 1 0 164126 CASAVA_Build 3 66781008 1D GCCTTCTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 6 A 10 9 164127 CASAVA_Build 3 66782578 1I TCCACGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 27 1 22 4 A 11 12 164128 CASAVA_Build 3 66782720 13D TGTGGCCCCA CCTCTGAGGTTGG/------------- CCTCTATAGC 3070 hom 56 het 20 0 17 5 CCTCTGAGGTTGG 1 0 164129 CASAVA_Build 3 66793231 1I35M4I ATAAATAATA -TTTATCAGTAAAAAAATGGCAGAATAAAATTTGAG----/TTTTATCAGTAAAAAAATGGCAGAATAAAATTTGAGTAAC TAATTTTGTT 3070 hom 69 het 18 0 24 4 N/A 0 0 164130 CASAVA_Build 3 66795860 1D TCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 19 0 14 6 A 11 10 164131 CASAVA_Build 3 66797777 1I CTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2166 het 1806 hom 37 8 11 18 T 17 18 164132 CASAVA_Build 3 66801650 7D TTATCTCAGA AGGCCTC/------- AGGCCTTATG 1301 het 221 hom 40 4 7 31 AGGCCTC 1 0 164133 CASAVA_Build 3 66805629 1D CACACAGCTA T/- TAAGGGGTGA 3070 hom 128 het 46 0 42 5 T 2 1 164134 CASAVA_Build 3 66808263 1D GTGGAAAATG A/- AAATTGTTTT 3070 hom 162 het 59 0 54 5 A 4 3 164135 CASAVA_Build 3 66819199 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 24 0 22 2 T 11 10 164136 CASAVA_Build 3 66836045 8D AAAAAAAAAA AAAAAAAG/-------- AAAGAAAAAA 3070 het 7 hom 26 0 11 18 AAAAAAAG 1 0 164137 CASAVA_Build 3 66840985 1D AAAACAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2008 hom 28 7 18 3 A 12 11 164138 CASAVA_Build 3 66841687 1D CCATCTCCAC G/- TAAGAGACCA 3070 het 3070 hom 56 20 33 4 G 1 0 164139 CASAVA_Build 3 66845941 40D8M16D CATTTACTAT AATCCTCACAATCCAATAGAGTTATTTTTACGCTTTTACAAATGAGTAAAGTGATGCTCAGAGT/----------------------------------------AATGTGTA---------------- TCCAGTAATT 3070 het 3070 ref 40 44 12 2 N/A 0 0 164140 CASAVA_Build 3 66853004 2D TGTGTCTACT AC/-- AGTGTCCGGC 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 AC 1 0 164141 CASAVA_Build 3 66869875 1I AGGTCCCAGT -/G GGGGCCCTCC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 4 5 164142 CASAVA_Build 3 66871850 1D ATCGTCTCAC A/- TTCTGCTTTG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 1 0 164143 CASAVA_Build 3 66873811 1D ATAAATACTG T/- TGAAACATTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 2 1 164144 CASAVA_Build 3 66878038 1I GCATCCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 36 0 31 5 A 11 12 164145 CASAVA_Build 3 66885379 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1820 het 1006 hom 28 3 8 17 T 14 13 164146 CASAVA_Build 3 66885783 1D AAAGCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 2063 het 2063 ref 19 11 6 2 T 12 11 164147 CASAVA_Build 3 66900135 8D GGTCTGAGTG CAATTATA/-------- ACAGTTTGTT 1841 hom 10 het 4 0 4 0 CAATTATA 1 0 164148 CASAVA_Build 3 66905422 4D GTACTTACAT TCTC/---- TCTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 25 9 9 TC 4 2 164149 CASAVA_Build 3 66907504 2I TGTGACTATG --/TA TATATATATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TA 5 6 164150 CASAVA_Build 3 66928644 1I GGTAGGATTG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 6 7 164151 CASAVA_Build 3 66933361 1D GTTTTGTCTC T/- TTTTATGGGC 3070 het 3070 ref 55 33 18 5 T 5 4 164152 CASAVA_Build 3 66936226 3D AACAAAAGAA AAC/--- AACAAAACCA 3070 het 3070 ref 39 20 13 8 AAC 2 1 164153 CASAVA_Build 3 66936607 1D TCTAGCATCA G/- GGGTTTAAAG 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 G 4 3 164154 CASAVA_Build 3 66936796 2I TTCTCTTCCC --/CT GTTTCTACCC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 CT 0 1 164155 CASAVA_Build 3 66938229 1I AATCTGAAGG -/C CTGAGAACCA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 C 1 2 164156 CASAVA_Build 3 66938344 1D TGCTATTTGA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 52 26 23 4 T 8 7 164157 CASAVA_Build 3 66941384 1D ACCATGACAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 9 8 164158 CASAVA_Build 3 66947365 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATT 2980 het 2980 ref 22 10 8 5 A 9 8 164159 CASAVA_Build 3 66949881 1D CTTAGTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2843 hom 34 9 16 9 T 13 12 164160 CASAVA_Build 3 66951968 1D GTAGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 A 12 11 164161 CASAVA_Build 3 67002253 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2276 het 2276 ref 21 9 6 6 T 13 12 164162 CASAVA_Build 3 67002438 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 30 21 9 0 T 8 9 164163 CASAVA_Build 3 67005312 2D GCAAGAGCGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 35 15 13 8 GA 6 5 164164 CASAVA_Build 3 67015543 1D CAATTGAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 10 9 164165 CASAVA_Build 3 67016814 1I TCTGCTATTC -/A GGGGCTTTGA 3070 het 3070 ref 49 23 23 3 A 0 1 164166 CASAVA_Build 3 67021514 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1663 hom 26 5 9 12 T 13 12 164167 CASAVA_Build 3 67024409 1D ATGAATCTAC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 41 18 19 5 T 8 7 164168 CASAVA_Build 3 67034463 1I TAGTTGGCTC -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 T 6 7 164169 CASAVA_Build 3 67042727 1D GATATCCCAA T/- TTACCTTGAT 3070 het 3070 ref 62 30 25 7 T 3 2 164170 CASAVA_Build 3 67042937 1I AACCCATAAC -/T CCCCTGTCTT 3070 het 3070 hom 50 24 21 5 T 0 1 164171 CASAVA_Build 3 67043063 1D GTTACCCAGG C/- AACGTGGAAT 3070 het 3070 hom 40 12 23 6 C 1 0 164172 CASAVA_Build 3 67043383 2D GGGGGTGAAA AG/-- AGAGGAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 5 AG 3 2 164173 CASAVA_Build 3 67044581 1D TTTGGAAACT C/- CCCCCTGCTA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 C 6 5 164174 CASAVA_Build 3 67106440 4D AGCAGAAATA AGTC/---- AGTCAGGTGT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 AGTC 2 1 164175 CASAVA_Build 3 67112171 1D CTCTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 1170 het 1170 ref 25 15 3 7 T 11 10 164176 CASAVA_Build 3 67143879 1D AAGGCACAAT G/- GGTACTACAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 3 2 164177 CASAVA_Build 3 67186878 1D CTATATATCT G/- GTTTTGGTAC 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 G 2 1 164178 CASAVA_Build 3 67193993 1D ATTTTCAAAG C/- CCCCTAGGGA 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 C 5 4 164179 CASAVA_Build 3 67212990 4D CTGAGGTGCT CTAA/---- CTGAGTCTTT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 CTAA 1 0 164180 CASAVA_Build 3 67213689 7D AGATGGTAAA CTCTTTT/------- CTCTGTGAGA 3070 het 3070 hom 38 14 22 3 CTCTTTT 1 0 164181 CASAVA_Build 3 67214248 3I GTCCAATGAT ---/AGG AGAAGGTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AGG 0 1 164182 CASAVA_Build 3 67215666 8D AAGGACAAGG AAGTGAAT/-------- AAGTGAATAA 3070 het 3070 ref 36 22 14 4 AAGTGAAT 2 1 164183 CASAVA_Build 3 67220434 1I AGACCTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 7 8 A 11 12 164184 CASAVA_Build 3 67229283 1D GTTAAACAAC A/- AAAGAGTCTC 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 A 4 3 164185 CASAVA_Build 3 67241709 4I TTTGGTTACA ----/TGAG TAAGTTCTTT 3070 het 3070 hom 43 13 30 0 TGAG 0 1 164186 CASAVA_Build 3 67241797 1D TATTCCCCAA C/- CCCATCTCAC 3070 het 3070 hom 32 8 20 6 C 4 3 164187 CASAVA_Build 3 67242020 3D CTTAATAGGG ATA/--- ATAATATGGC 3070 het 3070 hom 53 21 30 2 ATA 3 2 164188 CASAVA_Build 3 67245062 2D TAGTTCTTCT TC/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TC 1 0 164189 CASAVA_Build 3 67246234 2I CCTGAAAGAA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 1676 hom 19 4 9 6 T 9 11 164190 CASAVA_Build 3 67250768 2D ACAGACAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 2372 het 1341 hom 24 6 12 8 AG 9 8 164191 CASAVA_Build 3 67267948 1D GGAATTACAC T/- TTTTTTTTTT 1898 het 1898 ref 25 14 6 5 T 15 14 164192 CASAVA_Build 3 67299413 1D CTACATTTTT C/- CTAGATATTA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 C 2 1 164193 CASAVA_Build 3 67305220 1I CCCAAGTCTG -/A AATTTTTTGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 2 3 164194 CASAVA_Build 3 67310071 1D ATTGGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 22 21 6 T 11 10 164195 CASAVA_Build 3 67312853 21D GCAATCTAAA ACAAGAAATGTTTTTTCTCTT/--------------------- TTAGAAAAAA 3070 hom 129 het 42 0 43 4 ACAAGAAATGTTTTTTCTCTT 1 0 164196 CASAVA_Build 3 67331524 2I GAACCAGTGA --/TC CCACTGCTTA 3070 hom 123 het 49 0 39 10 TC 0 1 164197 CASAVA_Build 3 67333790 1I AATGCTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 22 0 16 6 A 12 13 164198 CASAVA_Build 3 67333874 1D TACATATCTT A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 24 7 16 1 A 7 6 164199 CASAVA_Build 3 67339783 1D TCCCAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 10 9 164200 CASAVA_Build 3 67350707 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 41 0 31 10 A 12 11 164201 CASAVA_Build 3 67368365 1I TTTAAATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 25 0 17 8 T 11 12 164202 CASAVA_Build 3 67385313 1D CAGGCTCACC A/- AAAAAAACGT 2893 het 2893 ref 38 26 8 4 A 8 7 164203 CASAVA_Build 3 67385805 6D CCTGGCCTGA GATCTG/------ GATCTGATGG 2577 het 2577 ref 16 6 9 3 GATCTG 2 1 164204 CASAVA_Build 3 67386654 3I CATTTCAGAG ---/TTC TTCACTGCAG 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 TTC 1 2 164205 CASAVA_Build 3 67387162 1I CCAGCTTGTG -/A AAGCAACTAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 2 3 164206 CASAVA_Build 3 67389706 1I TGCTATGCTC -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 6 7 164207 CASAVA_Build 3 67394991 1I AATAAAATTG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 7 8 164208 CASAVA_Build 3 67408267 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1337 hom 20 4 15 1 A 10 9 164209 CASAVA_Build 3 67418895 2D AGACTCCTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1435 hom 28 8 11 9 A 16 14 164210 CASAVA_Build 3 67424005 1D TCCTTCCAGA T/- TGTAAGTTCC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 2 1 164211 CASAVA_Build 3 67428399 1D TTTCACTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 542 hom 44 2 29 13 T 12 11 164212 CASAVA_Build 3 67437039 5D TGAGAACCAA TAACT/----- TAAAGAATGA 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 TAACT 1 0 164213 CASAVA_Build 3 67438714 1D AACAATGAAA C/- CTTATTTTTC 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 C 2 1 164214 CASAVA_Build 3 67439266 7I ATTTCCATAA -------/CAAAGAC CAAAGACTGA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 CAAAGAC 1 2 164215 CASAVA_Build 3 67443120 3D ATTGCTCAGT TCA/--- TCATTACCAA 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 TCA 2 1 164216 CASAVA_Build 3 67445672 1I AAATTCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 10 11 164217 CASAVA_Build 3 67452524 2I CTTGTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 T 10 12 164218 CASAVA_Build 3 67454869 1I TGTTAGATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 8 9 164219 CASAVA_Build 3 67456822 2D ACAACTTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 541 hom 36 5 21 10 A 12 10 164220 CASAVA_Build 3 67459508 2D TTAAAAAATA CT/-- GACTCACAAG 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 CT 1 0 164221 CASAVA_Build 3 67470035 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 13 het 36 0 11 25 A 9 10 164222 CASAVA_Build 3 67470618 9I CAAGAAATGC ---------/ATATCCTAT CAAACTAAGC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ATATCCTAT 0 1 164223 CASAVA_Build 3 67475264 1D AATCAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 24 1 8 15 A 11 10 164224 CASAVA_Build 3 67479400 3I GAGGACACAC ---/AAT TCCCAATTTC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AAT 0 1 164225 CASAVA_Build 3 67479684 4I ATCAAAGCAC ----/TAAA TAAATGTAAG 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 TAAA 1 2 164226 CASAVA_Build 3 67480666 8I TCTATACAGA --------/AAGTAGAT AAGTAGATTA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 AAGTAGAT 1 2 164227 CASAVA_Build 3 67481587 1I CTATATCCAG -/T TTTTTTTACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 8 164228 CASAVA_Build 3 67485691 1D TGTACCACAA T/- TTGTTCTTAA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 3 2 164229 CASAVA_Build 3 67497542 1D AGGACTTCCA C/- CCCCCCCACC 1505 het 1505 ref 26 14 5 8 C 8 7 164230 CASAVA_Build 3 67505511 2D CTGCAGTCAC TT/-- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 50 24 20 7 T 10 8 164231 CASAVA_Build 3 67507944 1I GACATCATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 10 11 164232 CASAVA_Build 3 67509289 1I CCAGAAGTCA -/C CTTGTCTTAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 C 1 2 164233 CASAVA_Build 3 67510597 1I ATTTCCCAGG -/T CCCCCCTGCA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 0 1 164234 CASAVA_Build 3 67513280 1D TCAGGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3015 het 1580 hom 34 9 10 15 T 16 15 164235 CASAVA_Build 3 67535424 16I ATGAAAGTGG ----------------/GCAGGTTACCTAGAGA GCAAGTAAGA 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 GCAGGTTACCTAGAGA 0 1 164236 CASAVA_Build 3 67536652 1D CTCAGGGAAG A/- ATTCAAAGAC 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 A 2 1 164237 CASAVA_Build 3 67537570 2I TGAGGAAGAC --/AG AGGAACAGAA 3070 het 3070 hom 58 25 30 3 AG 1 2 164238 CASAVA_Build 3 67542200 19D TTGTGGACCA ATGGGTTTTAGTTCTTTAC/------------------- AATACAGATA 3070 het 3070 ref 33 27 8 4 ATGGGTTTTAGTTCTTTAC 1 0 164239 CASAVA_Build 3 67582669 1I TACCTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 12 13 164240 CASAVA_Build 3 67583146 1D AAAAACAGTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 8 7 164241 CASAVA_Build 3 67586338 1I TTCAGACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 30 1 23 6 T 10 11 164242 CASAVA_Build 3 67587531 4I AAAAAAAAAT ----/AGAG AGAAGGTGAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AG 1 3 164243 CASAVA_Build 3 67589180 3I TAATTCTTCT ---/TTC TTCATTAGTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTC 1 2 164244 CASAVA_Build 3 67590267 2D ATGGTCCTTC CT/-- CTCTCCAATC 3070 hom 84 het 38 0 29 9 CT 3 2 164245 CASAVA_Build 3 67605091 1I TCCTATGTTT -/A AGAGTCCTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 164246 CASAVA_Build 3 67606303 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 66 het 27 0 21 6 T 8 7 164247 CASAVA_Build 3 67608117 1D TTCCTGGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 A 13 12 164248 CASAVA_Build 3 67613258 1D CTCGGTTTGG T/- TAAGAATAGT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 2 1 164249 CASAVA_Build 3 67614140 1D TATGACACTG T/- TTTTTTTACA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 8 7 164250 CASAVA_Build 3 67615589 1D TACTTTTGTA T/- TTTTTTACTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 6 164251 CASAVA_Build 3 67629565 1I ATTGAACCAC -/A AGGCTTCCCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 164252 CASAVA_Build 3 67632303 3D CATCCATCTT CTC/--- ATATAGTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTC 1 0 164253 CASAVA_Build 3 67642548 1D TGAACAGCAC A/- AGTTCAAACT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 2 1 164254 CASAVA_Build 3 67695399 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1294 het 1294 ref 41 31 4 6 T 11 12 164255 CASAVA_Build 3 67710039 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 427 hom 30 1 22 7 T 9 10 164256 CASAVA_Build 3 67710427 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 8 A 10 9 164257 CASAVA_Build 3 67724020 2D TTGGACATTA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AG 6 5 164258 CASAVA_Build 3 67782662 3I CTTCTGCTAT ---/CCA CCACCTCTCC 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 CCA 1 2 164259 CASAVA_Build 3 67790030 1D CTATTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 11 10 164260 CASAVA_Build 3 67806002 2I TTTTTTTGAG --/AC ACAGTCTTGC 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 AC 1 2 164261 CASAVA_Build 3 67811390 1D AACAACAACC A/- AAAAAAAAAA 1351 het 1351 ref 16 5 4 7 A 12 11 164262 CASAVA_Build 3 67814577 1D TCTTCCCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 11 10 164263 CASAVA_Build 3 67823640 1D AACATGAAAA G/- GGGGTTTATG 3070 hom 115 het 47 0 38 10 G 5 4 164264 CASAVA_Build 3 67825975 1D CCCCACTCTG C/- CGGGGTCTGG 3070 hom 113 het 41 0 37 4 C 2 1 164265 CASAVA_Build 3 67850838 1I TAAAATTTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 8 9 164266 CASAVA_Build 3 67855720 1I TGAGAAGGTA -/G CCATCTGCAA 3070 hom 66 het 31 0 22 9 G 0 1 164267 CASAVA_Build 3 67856988 5I ATTTTGGGTT -----/TTATG TTATGAAGAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TTATG 1 2 164268 CASAVA_Build 3 67857958 11I CCAGCCACCT -----------/ATTCCATTTGG AATTAAAACC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATTCCATTTGG 0 1 164269 CASAVA_Build 3 67858843 1I CAAATCAAAC -/A AAAAAAGCCA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 6 7 164270 CASAVA_Build 3 67859073 1D GAAAGACAAT A/- AAAAAATCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 4 A 7 6 164271 CASAVA_Build 3 67859241 1I GCTTGTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 39 3 32 4 A 11 12 164272 CASAVA_Build 3 67859862 2D CGTATTTGTG GA/-- TATGCTTTAC 3070 hom 90 het 31 0 31 4 GA 1 0 164273 CASAVA_Build 3 67860105 6D TCTTTGACTA GGAAAG/------ GGAATTCCCT 3070 het 81 hom 23 1 20 4 GGAAAG 1 0 164274 CASAVA_Build 3 67862862 1I TAGAATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 28 1 17 10 T 13 14 164275 CASAVA_Build 3 67867237 1I AATTGTATGA -/T TTTTTCCTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 5 6 164276 CASAVA_Build 3 67867827 2D TATATATATA TG/-- TATATATGCA 3070 hom 56 het 22 0 18 4 TG 1 0 164277 CASAVA_Build 3 67875976 1D GTTTCAAGAC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 7 164278 CASAVA_Build 3 67878073 1D GAGAGAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 28 0 26 2 A 12 11 164279 CASAVA_Build 3 67878297 3D ACAGACAGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 29 2 22 6 T 25 22 164280 CASAVA_Build 3 67878422 2D AAAAGAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 20 1 16 4 A 12 10 164281 CASAVA_Build 3 67879034 3D ATTCAATCAT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 TTC 7 6 164282 CASAVA_Build 3 67887787 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2814 hom 8 het 18 0 10 8 A 15 16 164283 CASAVA_Build 3 67889613 9I ATTTGACAAA ---------/CTCCAACAT CTCCAACATC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 CTCCAACAT 1 2 164284 CASAVA_Build 3 67898971 3D TATAATCATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 41 4 14 25 A 21 18 164285 CASAVA_Build 3 67905950 1I TAATTAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 422 hom 37 1 23 13 A 9 10 164286 CASAVA_Build 3 67915457 2D AGATATAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 16 14 164287 CASAVA_Build 3 67917188 3D AGTTACGCAG GCT/--- GCTTTGTGCC 3070 het 3070 hom 50 25 24 4 GCT 2 1 164288 CASAVA_Build 3 67925600 1I GCTTCGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 20 0 15 5 T 15 16 164289 CASAVA_Build 3 67927521 3I AAATCTTTTC ---/ATA CTATGCCTAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 ATA 0 1 164290 CASAVA_Build 3 67951685 2I TAAAACAGTG --/GT AATAGTTTCT 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 GT 0 1 164291 CASAVA_Build 3 67952495 1D TCCTGAAAAA G/- GTCCATACTT 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 G 2 1 164292 CASAVA_Build 3 67954232 4I GAAGGAAGGA ----/AGGG AGGAAGGAAG 3070 hom 4 het 30 2 20 8 AGGG 0 1 164293 CASAVA_Build 3 67966885 2D CTGTGTTGTC AA/-- TTCACCCAAT 3070 het 3070 ref 36 19 17 1 A 2 0 164294 CASAVA_Build 3 67970668 1D CTCCACCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 114 hom 26 2 19 6 A 12 11 164295 CASAVA_Build 3 67995795 1I GATATTTAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 129 hom 37 1 33 3 T 9 10 164296 CASAVA_Build 3 67998264 1I GGTTTTGCTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 T 7 8 164297 CASAVA_Build 3 68022436 2I CTCCGTCTCC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 44 0 27 17 A 9 11 164298 CASAVA_Build 3 68028295 4D CAAAAAAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 AAAC 3 2 164299 CASAVA_Build 3 68029320 1I AATTCTTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 9 10 164300 CASAVA_Build 3 68032729 6D ATGGAAAGTG TCTGGA/------ TCTTGTGTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TCTGGA 1 0 164301 CASAVA_Build 3 68036086 2I TGTGATGAGC --/AG AGTGTTCTGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AG 1 2 164302 CASAVA_Build 3 68039156 1D TATGGAAGAA C/- TTTTGCCTAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 1 0 164303 CASAVA_Build 3 68039466 1D CATAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 13 12 164304 CASAVA_Build 3 68040039 1D CTTCAAATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 10 9 164305 CASAVA_Build 3 68045177 17D TAGCTATTCT TTATAATTAATTATTAA/----------------- TTATAATTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 TTATAATTAATTATTAA 2 1 164306 CASAVA_Build 3 68047740 1I GGGATAAGAC -/G GGGGGGCAGG 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 G 6 7 164307 CASAVA_Build 3 68051928 1I TAGTGGCACC -/A AGCTGGTAAA 3070 hom 163 het 59 0 55 4 A 1 2 164308 CASAVA_Build 3 68060996 1I CTTTTCACCA -/T TTTTTTTTTT 3045 het 1556 hom 25 6 12 7 T 13 14 164309 CASAVA_Build 3 68062855 2D AACATTTAAC TA/-- TATATATATA 3070 het 404 hom 19 1 14 4 TA 8 7 164310 CASAVA_Build 3 68064582 2D ACTCCATCGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 13 5 A 14 12 164311 CASAVA_Build 3 68073344 1I AGACACTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 11 164312 CASAVA_Build 3 68086089 1I TCTGCATAGC -/A AAAGAAACTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 3 4 164313 CASAVA_Build 3 68089605 1I TCTGTGAGTT -/A TATGTATTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 9 A 0 1 164314 CASAVA_Build 3 68091929 2I GCAAACAGAC --/AA GAGAAAGATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 0 2 164315 CASAVA_Build 3 68095512 6D AATTGAAAGA TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 1314 hom 12 het 13 0 5 8 TC 12 9 164316 CASAVA_Build 3 68103767 1D TTCAACATCA C/- TAATCACCAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 1 0 164317 CASAVA_Build 3 68110369 2D TTTAAGTAAC AT/-- AGAAAAGATT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AT 1 0 164318 CASAVA_Build 3 68114121 1I AACAGAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1248 hom 39 4 22 13 T 16 17 164319 CASAVA_Build 3 68114646 1D CAAAATATCC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 9 8 164320 CASAVA_Build 3 68128643 1D CAAAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 190 hom 38 1 33 5 A 11 10 164321 CASAVA_Build 3 68129570 3D TGTATGATTA CCT/--- TTTTTTTGTA 3070 hom 129 het 45 0 43 2 CCT 1 0 164322 CASAVA_Build 3 68129675 1D TTTACTACCA C/- AAAAGTAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 C 1 0 164323 CASAVA_Build 3 68131634 1I CTTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 903 het 903 ref 33 20 3 10 T 14 15 164324 CASAVA_Build 3 68135479 3I GTAGTAAGAG ---/GAA GAAGATGTTG 3070 hom 77 het 32 0 26 6 GAA 1 2 164325 CASAVA_Build 3 68136389 3D GAGAGTAACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 45 0 37 8 T 13 10 164326 CASAVA_Build 3 68149809 1I TCAGCTAGAA -/G GAACGGAAGG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 1 2 164327 CASAVA_Build 3 68160272 9D ATTATTTTTA ACCCAAAAT/--------- ACTTTATTGG 3070 hom 48 het 18 0 17 5 ACCCAAAAT 1 0 164328 CASAVA_Build 3 68174105 1I GTGTTTGAGA -/C CATAATAATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 2 164329 CASAVA_Build 3 68182951 2I TTTTCTCATC --/TG TAAAATAGGG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TG 0 1 164330 CASAVA_Build 3 68193851 1I CAATGCTTCC -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 6 7 164331 CASAVA_Build 3 68196561 1I TTTTGTGTAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 T 8 9 164332 CASAVA_Build 3 68208122 1I TTCCTACTTC -/T TTTTTTTTTT 3020 het 2062 hom 21 6 10 5 T 11 12 164333 CASAVA_Build 3 68225608 1I GCTACCAAAG -/T TTGGATAAAG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 T 2 3 164334 CASAVA_Build 3 68230098 1I GGTGTGACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 9 10 164335 CASAVA_Build 3 68240801 1I ATTCTACACA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 8 9 164336 CASAVA_Build 3 68243935 1I GCACTGGATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 52 het 21 0 18 3 A 9 10 164337 CASAVA_Build 3 68250720 11D ATTCTTTTTG GTATATACACA/----------- GAAATGGAAT 3070 het 3070 ref 29 17 11 4 GTATATACACA 1 0 164338 CASAVA_Build 3 68251420 1I TCGTTTTTTT -/C TTTCTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 C 0 1 164339 CASAVA_Build 3 68254845 1I AAAAAAACCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2975 hom 30 12 14 4 T 8 9 164340 CASAVA_Build 3 68263715 1I AAACTCCCTA -/T TTTTTTAACC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 6 7 164341 CASAVA_Build 3 68264704 1I TTGCTGTGCA -/G AAGCTCTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 0 1 164342 CASAVA_Build 3 68265931 1I AAACAATGAG -/A AAAAAAAAAA 2633 het 2344 hom 41 12 13 16 A 10 11 164343 CASAVA_Build 3 68274755 1I GAAATCGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 24 8 T 12 13 164344 CASAVA_Build 3 68288617 3D TGTGCCAGGG AAA/--- AAAATAATAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 7 4 164345 CASAVA_Build 3 68297953 1D AGCATAGCAC A/- TTGCCAATAC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 1 0 164346 CASAVA_Build 3 68303110 2I TAGAATGGGC --/TG TGAGTGAAGG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 TG 1 2 164347 CASAVA_Build 3 68305744 1I ATATTTAATT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 8 164348 CASAVA_Build 3 68309993 1I CCCCCTCCCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1655 hom 19 5 12 2 A 9 10 164349 CASAVA_Build 3 68312040 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 13 1 T 12 11 164350 CASAVA_Build 3 68324551 2D TCATTAGTAT TA/-- AAAAATAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 TA 1 0 164351 CASAVA_Build 3 68335791 1D ATGTCAAAGG C/- CCCCCCCACC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 8 7 164352 CASAVA_Build 3 68350846 1D CTAAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 12 11 164353 CASAVA_Build 3 68354033 1I AACCAAGCCT -/A AAAAACAGTT 3070 hom 160 het 61 0 54 7 A 5 6 164354 CASAVA_Build 3 68355374 2D GTTAGGACCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 32 2 21 10 T 13 11 164355 CASAVA_Build 3 68357726 1D CTGTAAGCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 222 hom 33 2 19 12 A 13 12 164356 CASAVA_Build 3 68371355 18D CTGAAATTCT GTGTGAACTACACCCCTA/------------------ GCCTGACCCA 3070 hom 90 het 31 0 30 3 GTGTGAACTACACCCCTA 1 0 164357 CASAVA_Build 3 68393771 1I ATAAAATTAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 8 9 164358 CASAVA_Build 3 68398791 8I ACCTTCGGTG --------/GATTAATA GACTCCAGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GATTAATA 0 1 164359 CASAVA_Build 3 68407998 1I TAACCCAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 11 12 164360 CASAVA_Build 3 68414261 1D AATGTGTCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 10 17 9 A 10 9 164361 CASAVA_Build 3 68420221 1I CAGTGAAAGC -/A GAAATGAGCC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 0 1 164362 CASAVA_Build 3 68424884 1I GGATGACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 A 10 11 164363 CASAVA_Build 3 68426950 12I CTCCTGAGCC ------------/CATATATTTGCT CTAACAGTTG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 CATATATTTGCT 0 1 164364 CASAVA_Build 3 68428415 1D ATACTTACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 12 11 164365 CASAVA_Build 3 68443151 12I TCAAATTTCA ------------/TATATTCACGTT TCAAAACCAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 TATATTCACGTT 0 1 164366 CASAVA_Build 3 68462750 1D TTCATATGTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 8 164367 CASAVA_Build 3 68462893 3D63M6D GTCCATCAGC TGATGAAGTATAACCAAAATGTGGTATATCCATTCAATGAAATATTATTCAATCTTAAAAATATTAAGTACT/---TGAAGTATAACCAAAATGTGGTATATCCATTCAATGAAATATTATTCAATCTTAAAAATATTA------ AGTACATGCT 3070 het 3070 ref 35 33 23 5 N/A 0 0 164368 CASAVA_Build 3 68466199 3I TTTCTTTTGT ---/TGG TGTTGTTGTT 435 het 435 ref 45 23 7 15 TGG 0 1 164369 CASAVA_Build 3 68485998 1I ATTTTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 10 11 164370 CASAVA_Build 3 68489222 1I TTGTTTTCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 9 10 164371 CASAVA_Build 3 68490728 7I TTTCTGTTTC -------/CAGACCT CAGCCTACCT 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 CAGACCT 0 1 164372 CASAVA_Build 3 68493495 1I AAAACAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 10 11 164373 CASAVA_Build 3 68500418 2D CATCTTGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 27 1 24 2 T 14 12 164374 CASAVA_Build 3 68501028 2I TTGGTGCAGG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 CA 7 8 164375 CASAVA_Build 3 68508164 1I GTGTCATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 10 11 164376 CASAVA_Build 3 68515121 1I AGGGGAAATG -/C TTCCAGCTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 0 1 164377 CASAVA_Build 3 68550464 6D GGCTTGGCTT GGGCTC/------ GGGCTCAGAG 1933 het 1933 ref 27 18 8 3 GGGCTC 2 1 164378 CASAVA_Build 3 68557887 1I GAATGAATTA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 6 7 164379 CASAVA_Build 3 68560785 1D AACCTAAACC T/- TTCTCAATAG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 3 2 164380 CASAVA_Build 3 68591340 1I GCACTAGAAG -/A AATAAGTAAT 3070 het 3070 ref 36 24 12 0 A 2 3 164381 CASAVA_Build 3 68612253 1I CAAAAAACAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 8 9 164382 CASAVA_Build 3 68615141 8I GTTGACCAAG --------/AGTCTACA TATGGTCTCT 3070 het 3070 ref 55 29 22 4 AGTCTACA 0 1 164383 CASAVA_Build 3 68622682 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 2667 het 2667 ref 27 11 8 8 T 10 9 164384 CASAVA_Build 3 68623516 6D ATGTACCCTA AAACTT/------ AAAGTATAAT 3070 het 1870 hom 13 5 8 0 AAACTT 1 0 164385 CASAVA_Build 3 68632549 1I TCTTTTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 A 10 11 164386 CASAVA_Build 3 68634466 1D GACCCAGTTA T/- TTTTTTCTGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 7 6 164387 CASAVA_Build 3 68637726 1I ATTCTATTTC -/T TTTTTTTTTT 2460 het 2460 ref 21 12 6 3 T 11 12 164388 CASAVA_Build 3 68638669 5D AAATATACCC TTTCA/----- TTTCATTTCA 3070 het 3070 hom 35 12 16 11 TTTCA 3 2 164389 CASAVA_Build 3 68640078 2I CCATATGATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 10 12 164390 CASAVA_Build 3 68640322 1D CTGTGGATAC T/- GTTAGTTTTC 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 T 1 0 164391 CASAVA_Build 3 68650136 1I ATGAATACAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 T 8 9 164392 CASAVA_Build 3 68654918 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAATAAAT 3070 het 2563 hom 22 6 11 5 A 6 5 164393 CASAVA_Build 3 68659708 1I TTTCAATCCT -/G CCCATTTCAC 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 G 0 1 164394 CASAVA_Build 3 68687692 1D AGACACCAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 T 9 8 164395 CASAVA_Build 3 68688226 4D ATTTATAATG AGTA/---- AGTATTAGAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 AGTA 2 1 164396 CASAVA_Build 3 68696445 1D AAGCTGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 A 14 13 164397 CASAVA_Build 3 68699569 1I GCTTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 10 11 164398 CASAVA_Build 3 68702995 1D CCCTGACACA C/- CACTGCTGCT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 C 2 1 164399 CASAVA_Build 3 68709418 1D CCCTGAACCT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 2850 hom 30 10 16 5 A 9 8 164400 CASAVA_Build 3 68711448 1I TTTCCAATAC -/T TTTTTTGGAA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 T 6 7 164401 CASAVA_Build 3 68712932 1I TCCCAATTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 T 9 10 164402 CASAVA_Build 3 68728425 2D AGTAAAAAAA AT/-- GTTTTCTTCC 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 AT 1 0 164403 CASAVA_Build 3 68730825 6D CACAAACAAA TTTTCT/------ TTTTGTTTAA 3070 het 3070 hom 35 12 21 4 TTTTCT 1 0 164404 CASAVA_Build 3 68757526 1I TTTTTTTGGT -/G GGGGGGGGGT 2345 het 2345 ref 28 11 11 6 G 9 10 164405 CASAVA_Build 3 68773663 1D TAAATTATGG T/- TGACTACAGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 2 1 164406 CASAVA_Build 3 68781409 2D CACGTGAAAC TG/-- TGAGTCTATT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TG 2 1 164407 CASAVA_Build 3 68782006 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCCTCCC 227 het 227 ref 7 4 3 0 C 6 7 164408 CASAVA_Build 3 68802361 28D CTTGGGCTAG AGCCCAAGCATTGTTCGTTACATGGTCC/---------------------------- ATCATAGTCC 3070 het 3070 ref 27 25 13 3 AGCCCAAGCATTGTTCGTTACATGGTCC 1 0 164409 CASAVA_Build 3 68894046 1D GCCTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 26 9 A 13 12 164410 CASAVA_Build 3 68927258 1I GATCATATGA -/C CCCCAACCTA 3070 het 3070 ref 49 19 17 13 C 4 5 164411 CASAVA_Build 3 68964201 1D ACAGATGGGG T/- TTTGGTGTGG 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 4 3 164412 CASAVA_Build 3 68986505 1D GTTTTTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 11 7 T 13 12 164413 CASAVA_Build 3 69012266 2I GACATGTATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 CA 7 8 164414 CASAVA_Build 3 69015798 16D GCAGGCAGGC AGGCAGGGAGGCAGGG/---------------- AGGGAAAGAC 1777 het 1777 ref 24 12 9 10 AGGCAGGG 2 0 164415 CASAVA_Build 3 69029246 1I GGGGGGCAGA -/T CACCTGAGAT 2137 het 2137 ref 19 11 5 3 T 0 1 164416 CASAVA_Build 3 69029479 2D AAAAAAAAAA AT/-- ATTTATTTTT 3070 het 2380 hom 36 8 21 8 AT 2 1 164417 CASAVA_Build 3 69029708 1D TGGTTACCTC A/- GGTGAAAGCA 3070 het 3070 ref 50 23 20 8 A 1 0 164418 CASAVA_Build 3 69030789 11D AATTGAAGTA GGGTAGTAAGT/----------- GGTCAGCCAA 2910 het 2910 ref 28 20 7 2 GGGTAGTAAGT 1 0 164419 CASAVA_Build 3 69034855 1I TGAAAAAATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 8 9 164420 CASAVA_Build 3 69040364 1D AGCAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 38 0 31 7 A 13 12 164421 CASAVA_Build 3 69045126 1D AGAGCTAACA T/- TTTTTTGCCC 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 7 6 164422 CASAVA_Build 3 69045613 4D AATTAGAGAC AGAG/---- AGAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 43 18 22 5 AG 4 2 164423 CASAVA_Build 3 69050753 4I CAATTCACTT ----/TGTG TGTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 TG 1 3 164424 CASAVA_Build 3 69060828 1I AAGTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2998 het 2998 ref 28 14 9 5 A 13 14 164425 CASAVA_Build 3 69067783 7D ATTTGTAGGT AGTGACA/------- CCACGTGACT 3070 het 3070 ref 53 24 24 9 AGTGACA 1 0 164426 CASAVA_Build 3 69070434 9I AAAGCCATCC ---------/TGGGCCATA TGCGGCCCAC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 TGGGCCATA 0 1 164427 CASAVA_Build 3 69087704 2I CAATGTCTGT --/AG ACATTTTTGA 3070 het 3070 ref 58 30 20 8 AG 0 1 164428 CASAVA_Build 3 69116047 2I ATCCCCTCCC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 2036 hom 29 9 14 6 CT 8 9 164429 CASAVA_Build 3 69119215 1D ACGTAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 17 11 A 13 12 164430 CASAVA_Build 3 69121257 1I AATGAAAAAT -/A CTTTGGAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 0 1 164431 CASAVA_Build 3 69134503 1I CATGAATTTC -/T TTTTTTTTTT 2467 het 1437 hom 16 5 7 4 T 11 12 164432 CASAVA_Build 3 69136903 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1302 het 1302 ref 28 10 5 14 A 17 16 164433 CASAVA_Build 3 69136957 1I TTATACTAGA -/T TGTTAACATT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 1 2 164434 CASAVA_Build 3 69144735 4D GCAATGTCGC AGAG/---- AGAGAGAGCT 3070 het 3070 ref 29 13 9 8 AG 6 4 164435 CASAVA_Build 3 69149037 2D CTGCAACATC TT/-- ACATCAGGAA 3070 het 3070 hom 59 27 27 5 T 2 0 164436 CASAVA_Build 3 69156110 2D GTGTGTGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2202 hom 26 8 13 6 T 16 14 164437 CASAVA_Build 3 69156260 4D ATAAATCCAA TTAT/---- TTGTTTGAAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 5 TTAT 1 0 164438 CASAVA_Build 3 69160565 1D GAACAGAGGG T/- TAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 35 18 13 6 T 2 1 164439 CASAVA_Build 3 69167854 11I TATCTATCCC -----------/AGTAATAGAGT AGCAGAAACA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 AGTAATAGAGT 0 1 164440 CASAVA_Build 3 69171609 1I TTTATCTAAT -/C AGTAACATAA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 C 0 1 164441 CASAVA_Build 3 69178145 2I TCAAAAAAAT --/AA AGTCTTACCT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 1 3 164442 CASAVA_Build 3 69188810 1I AAATTTTACA -/T TTGTTTTGTG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 2 3 164443 CASAVA_Build 3 69207572 1I TTAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 T 10 11 164444 CASAVA_Build 3 69219626 1I AAAAACTTAC -/A AAAAGATACA 3070 het 3070 hom 26 7 13 6 A 4 5 164445 CASAVA_Build 3 69226727 1I TTTTGTGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 T 9 10 164446 CASAVA_Build 3 69247172 1I ATTAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3017 het 3017 ref 27 18 8 2 A 9 10 164447 CASAVA_Build 3 69276514 1D CATAGGGGTT G/- GGGCATGGAG 3070 hom 101 het 39 0 34 5 G 4 3 164448 CASAVA_Build 3 69277363 8D TTTATTTCTA AATCTGGC/-------- AACCCTAACC 3070 hom 72 het 27 0 25 4 AATCTGGC 1 0 164449 CASAVA_Build 3 69279481 2D TAGATTATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TG 12 11 164450 CASAVA_Build 3 69283817 2D CAGTAAAATA TG/-- TGTTACATAA 3070 hom 78 het 32 0 27 7 TG 2 1 164451 CASAVA_Build 3 69286854 1D CCTGGGAACG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 8 7 164452 CASAVA_Build 3 69298485 4I1M2D ATCTGATATT ----CAA/TTGCC-- AAGCAAAAGG 3070 hom 111 het 40 0 37 4 N/A 0 0 164453 CASAVA_Build 3 69300844 4D CAAAACAAAC AAAA/---- AAAAATGTTG 2659 het 2659 ref 22 12 9 1 A 9 5 164454 CASAVA_Build 3 69300939 4D TACAATAAAT TAAC/---- TATTATATCT 3070 hom 77 het 30 0 26 7 TAAC 1 0 164455 CASAVA_Build 3 69302245 1I GAATAAGTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 9 10 164456 CASAVA_Build 3 69305984 1D TCTTGGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 22 0 16 7 A 13 12 164457 CASAVA_Build 3 69308807 4I ACTTGATACA ----/GAGT AAGTACTCAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 GAGT 0 1 164458 CASAVA_Build 3 69312088 8D TTGTTTCTAC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 1609 het 298 hom 21 5 7 10 A 24 16 164459 CASAVA_Build 3 69322248 1D AGAAAAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 33 3 22 9 T 13 12 164460 CASAVA_Build 3 69323400 1I AATATAATCC -/T TCAATGTAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 2 164461 CASAVA_Build 3 69325461 1D TAGGGGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 47 0 38 9 A 11 10 164462 CASAVA_Build 3 69327554 4D TTTAAAAAGT AAGC/---- AAGCAAGCAA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 AAGC 3 2 164463 CASAVA_Build 3 69329412 1D GAAAGGGGAC G/- GGGGAGGAGA 3070 hom 41 het 16 0 13 3 G 5 4 164464 CASAVA_Build 3 69331834 1I ACAGCAGAGA -/G GTTTCATTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 1 2 164465 CASAVA_Build 3 69333393 1I AGTATTATTA -/C CATTTTAATT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 C 1 2 164466 CASAVA_Build 3 69336901 1I TGTTTTTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 817 hom 34 4 21 9 A 15 16 164467 CASAVA_Build 3 69336912 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAGAAAAA 3070 het 971 hom 36 5 21 10 G 0 1 164468 CASAVA_Build 3 69338695 1D GCTTAATACA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 8 164469 CASAVA_Build 3 69342259 1D ACAAGGCTGC T/- TTTTTTTTTT 2398 het 2398 ref 50 30 6 14 T 12 11 164470 CASAVA_Build 3 69345503 1D TTTTCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 996 hom 34 3 15 16 T 17 16 164471 CASAVA_Build 3 69347995 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 9 164472 CASAVA_Build 3 69354615 11I TCCATCACAA -----------/AAACAAAAAAC AAACAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AAACAAAAAAC 1 2 164473 CASAVA_Build 3 69356741 2D TTTTCTGCAC AT/-- GTCTATTTTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AT 1 0 164474 CASAVA_Build 3 69360677 1D TCTCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 993 het 993 ref 29 19 3 7 A 15 14 164475 CASAVA_Build 3 69365324 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 862 het 862 ref 26 11 4 11 A 17 16 164476 CASAVA_Build 3 69369019 6I AGCACAAGAG ------/GAGGAA GAGGAAGAGG 3070 hom 65 het 32 0 20 12 GAGGAA 1 2 164477 CASAVA_Build 3 69407285 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 22 0 15 7 C 0 1 164478 CASAVA_Build 3 69417097 1D CAGATGAGGG A/- AACTGAAGAC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 3 2 164479 CASAVA_Build 3 69418310 2D AAGTTAAAAA TG/-- TGTATACTAT 3070 hom 108 het 39 0 37 6 TG 2 1 164480 CASAVA_Build 3 69418463 1D AATTCTGAGA T/- TCCCAGGCAT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 2 1 164481 CASAVA_Build 3 69421469 1D AAACTGTCTC T/- TACTAAAAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 T 2 1 164482 CASAVA_Build 3 69429762 1I TTATAACTGG -/A AAAAAAGAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 6 7 164483 CASAVA_Build 3 69434151 2D CAGCAAAAAA AG/-- AGGGATGCTA 3070 hom 132 het 52 0 44 9 AG 2 1 164484 CASAVA_Build 3 69442599 1D GGCAAAAGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 10 9 164485 CASAVA_Build 3 69444730 1D ACTCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 11 10 164486 CASAVA_Build 3 69452748 2I CCAGCTGGCC --/TG TGTTTGCTCC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 TG 1 2 164487 CASAVA_Build 3 69453561 1D TCACAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 30 12 T 12 11 164488 CASAVA_Build 3 69456705 1D AGGCTGAGGC G/- GGGGGGGATT 3070 het 3055 hom 29 11 10 9 G 8 7 164489 CASAVA_Build 3 69467947 1I AACTTCCCTT -/G GGGGGGTGAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 G 6 7 164490 CASAVA_Build 3 69472005 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 9 10 164491 CASAVA_Build 3 69474943 3D TGCAGAGGCA CAC/--- CACCACATCT 2981 het 2981 ref 27 16 7 4 CAC 3 2 164492 CASAVA_Build 3 69484934 1D TTTAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 14 10 A 11 10 164493 CASAVA_Build 3 69487877 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 8 9 164494 CASAVA_Build 3 69494751 3I TTGAATACTT ---/TTG TTGTTGTTGT 2167 het 2167 ref 28 15 6 7 TTG 5 6 164495 CASAVA_Build 3 69502981 2I TGACATTTGA --/AG AGAGACCTAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AG 2 3 164496 CASAVA_Build 3 69507326 2I TTTACAGCAG --/AA AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 7 9 164497 CASAVA_Build 3 69507507 5D TCATTTCTCT TAAAA/----- TAAAGCAGCA 3070 het 3070 ref 55 34 17 5 TAAAA 1 0 164498 CASAVA_Build 3 69508554 1I CAATATATCT -/A ATTACATATG 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 1 2 164499 CASAVA_Build 3 69555218 1D ATTTGAGTCA C/- CCAATGCTCC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 3 2 164500 CASAVA_Build 3 69583068 1D TTTTGAGAAT A/- AAAACTGTCC 3070 hom 109 het 52 0 37 27 A 5 4 164501 CASAVA_Build 3 69588088 4I GTGTTTGCAC ----/AAAG AAAGTAAGAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AAAG 1 2 164502 CASAVA_Build 3 69593225 3D CATAGTGAGA CCC/--- CCCCCATCTC 3070 hom 7 het 20 1 15 4 C 8 5 164503 CASAVA_Build 3 69600077 1D CTCATGAACT C/- CCAACAATCA 3070 het 3070 ref 29 18 8 4 C 3 2 164504 CASAVA_Build 3 69606543 2I CTGCCGATCT --/TG TGTGTGCTAT 3070 het 3070 ref 59 29 23 7 TG 3 4 164505 CASAVA_Build 3 69614764 2D ATTCTACCCC CT/-- GTTGTACAGA 3070 het 3070 ref 39 19 15 7 CT 1 0 164506 CASAVA_Build 3 69621363 1D AATGCAAATC A/- AAACCAGAGT 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 A 4 3 164507 CASAVA_Build 3 69628739 1I GCTATGGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 10 11 164508 CASAVA_Build 3 69636938 1D TGGCCAGCAT A/- AGTGGCTTAT 3070 hom 86 het 33 0 25 9 A 2 1 164509 CASAVA_Build 3 69637047 1I CCCATCTCTA -/T CAAAAAATTA 1202 het 1202 ref 19 13 3 4 T 0 1 164510 CASAVA_Build 3 69638668 1I TACGGGGTGA -/G GCTACAGTAC 2853 het 2853 ref 33 20 7 6 G 1 2 164511 CASAVA_Build 3 69643070 1I TTGCATTTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2866 hom 19 7 11 1 T 8 9 164512 CASAVA_Build 3 69665222 1I AGCTGTGTGA -/T TTTTGGACAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 4 5 164513 CASAVA_Build 3 69667575 1I ACGGGCACTT -/G GGGGGTCTCT 3070 hom 62 het 23 0 21 2 G 5 6 164514 CASAVA_Build 3 69672028 1I AGTTCGAAGG -/A AAAAAAAAAG 2118 het 2118 ref 13 6 5 2 A 9 10 164515 CASAVA_Build 3 69672983 1I GTAAATTTCT -/G GGGGCGACAT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 G 4 5 164516 CASAVA_Build 3 69674941 1D AGACAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1828 het 1828 ref 29 16 5 9 A 13 12 164517 CASAVA_Build 3 69676768 30D TCTTCTGAAA AATAAATATTTATAGAATAAATATTTATAG/------------------------------ AATAAATATT 2191 het 489 hom 8 1 5 4 AATAAATATTTATAG 3 1 164518 CASAVA_Build 3 69679585 5D GTGGAATCTT AAATC/----- AGAGTATTCA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 AAATC 1 0 164519 CASAVA_Build 3 69760822 1D GAAGCTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 23 8 A 17 16 164520 CASAVA_Build 3 69761747 1I GGGAAATGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 790 hom 35 3 23 9 A 11 12 164521 CASAVA_Build 3 69806485 1I TTCTTTTGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 10 164522 CASAVA_Build 3 69835264 1D AGACTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 147 hom 36 2 24 10 A 15 14 164523 CASAVA_Build 3 69843179 1I GCCTTGGCCC -/A AAAAACAGTG 3070 hom 115 het 47 0 39 8 A 5 6 164524 CASAVA_Build 3 69851900 1I TCATGCTTTG -/C CTCAAGGAGT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 C 1 2 164525 CASAVA_Build 3 69855541 2D CATTCTTTTT TC/-- TCTCTTTTCC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TC 3 2 164526 CASAVA_Build 3 69867691 1I ATACCCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 10 11 164527 CASAVA_Build 3 69876212 1I GTCTAATCTG -/C AGGGAACCAC 3070 het 3070 hom 48 19 19 10 C 0 1 164528 CASAVA_Build 3 69901313 1I ATGTGATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 407 hom 39 1 32 6 T 9 10 164529 CASAVA_Build 3 69915329 2I GATATGTAGG --/AT ATATATATAT 602 het 602 ref 16 10 2 4 AT 8 9 164530 CASAVA_Build 3 69921755 2D TGTGTGCATG TA/-- TATATATATA 1533 het 1533 ref 41 28 4 9 TA 8 7 164531 CASAVA_Build 3 69941468 1D ACTAAGTACA T/- TTTTTTTTTT 1066 het 1066 ref 38 24 5 9 T 17 16 164532 CASAVA_Build 3 69961514 12D GGTGTGGATG CACACACACACA/------------ CACACACACA 3070 het 3070 ref 44 22 15 13 CA 12 6 164533 CASAVA_Build 3 69975105 1I TGAGAAATCA -/T TTTCCAAAGT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 3 4 164534 CASAVA_Build 3 70082469 2D ATATGGTGTG TA/-- TATATATATA 1924 het 1924 ref 27 14 5 8 TA 10 9 164535 CASAVA_Build 3 70097656 2I TCTGTAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 10 12 164536 CASAVA_Build 3 70118190 1I TTGGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 26 16 13 T 12 13 164537 CASAVA_Build 3 70119341 4D AGGGGAAAGG CTAA/---- TAGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 CTAA 1 0 164538 CASAVA_Build 3 70135560 1I TTTACCATAT -/G TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 35 8 21 6 G 0 1 164539 CASAVA_Build 3 70136621 2D ATAATGAGAC AT/-- AAAGTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 AT 1 0 164540 CASAVA_Build 3 70142538 9I ATAAAGAACT ---------/GGGTAATTC TTTACTGCTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 GGGTAATTC 0 1 164541 CASAVA_Build 3 70155866 1D CTAATCATGG T/- TACCCAAACT 3070 het 3070 ref 51 27 17 7 T 2 1 164542 CASAVA_Build 3 70161091 1I TAATAAGAGT -/A AATTCTCTCC 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 2 3 164543 CASAVA_Build 3 70179175 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1416 het 1416 ref 21 14 3 4 T 13 12 164544 CASAVA_Build 3 70183588 3D AAATTTATGT TGG/--- TGGAGTTCTG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 TGG 2 1 164545 CASAVA_Build 3 70184026 1D ACTTATTCAC A/- AAAAAAGCAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 A 7 6 164546 CASAVA_Build 3 70222621 2D AATTAAACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 10 10 A 14 12 164547 CASAVA_Build 3 70247858 2D AATATGTACC AG/-- AATTCTACAT 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 AG 1 0 164548 CASAVA_Build 3 70253309 1I CAAGCAAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 9 10 164549 CASAVA_Build 3 70254473 1I ACAAATAGTG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 7 8 164550 CASAVA_Build 3 70267786 1I TCTCTAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 28 1 18 9 T 11 12 164551 CASAVA_Build 3 70268682 5I TGTCATTGAA -----/GTTTT GTTTTGATCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 GTTTT 1 2 164552 CASAVA_Build 3 70270298 1I CTCTAGAGGC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 7 8 164553 CASAVA_Build 3 70273973 1I GAGGTTCCCT -/A AAAATCTAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 A 4 5 164554 CASAVA_Build 3 70275140 1D GAATTTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 13 13 A 15 14 164555 CASAVA_Build 3 70277493 1D TGAACTAAAC A/- AAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 A 5 4 164556 CASAVA_Build 3 70282947 4I AGAATTTAAT ----/GGAG GGAACTGGTT 3070 hom 93 het 33 0 30 3 GGAG 0 1 164557 CASAVA_Build 3 70292046 2D ATGTTATATC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 2444 hom 18 7 9 3 A 11 9 164558 CASAVA_Build 3 70293724 1I GAGTAATTCA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 T 7 8 164559 CASAVA_Build 3 70294967 5D ATTGGATGCT TAATC/----- TATTCACATT 3070 het 3070 ref 28 15 13 1 TAATC 1 0 164560 CASAVA_Build 3 70300064 15D GACCTTCAGT ATTTCCTGGCCACAG/--------------- ATACCTGCCT 3070 het 3070 ref 47 28 20 5 ATTTCCTGGCCACAG 1 0 164561 CASAVA_Build 3 70303457 1D CACAGTCTTT G/- GGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 37 16 13 9 G 9 8 164562 CASAVA_Build 3 70305939 2I TCCAGCTTAA --/TC TCTCATATAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TC 2 3 164563 CASAVA_Build 3 70314751 1I ACTAATTGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 8 9 164564 CASAVA_Build 3 70321647 1I TGGTCCTGCA -/C CCGTAGGCAC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 2 3 164565 CASAVA_Build 3 70338875 2D TTATTTCTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2734 hom 31 11 10 11 T 16 14 164566 CASAVA_Build 3 70342626 1I TATTTCTTGG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 7 8 164567 CASAVA_Build 3 70362341 2D GAGATGAATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 AT 7 6 164568 CASAVA_Build 3 70368917 1D ATTTGGTTCC G/- TATTATCAGT 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 G 1 0 164569 CASAVA_Build 3 70371131 2D AAATGGTTTT CA/-- CAGTTTCTTT 3070 het 3070 hom 48 19 24 7 CA 2 1 164570 CASAVA_Build 3 70385994 1I CCAATTACAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 8 9 164571 CASAVA_Build 3 70401359 1I TATCATTTTC -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 6 7 164572 CASAVA_Build 3 70445324 1D GTCTGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1070 het 1070 ref 31 20 5 7 A 12 11 164573 CASAVA_Build 3 70456308 2I TATTTGAGAA --/AC ACTGAAATCA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AC 1 2 164574 CASAVA_Build 3 70470153 1D AAAAGCAAAC A/- GGAGGATAAT 3070 het 2356 hom 23 6 15 2 A 1 0 164575 CASAVA_Build 3 70473681 1I GCACTCCAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 9 10 164576 CASAVA_Build 3 70477603 1I TTTCAGACTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 8 9 164577 CASAVA_Build 3 70479302 1D AGTTTATATT A/- ACAAACACAG 3070 hom 99 het 35 0 34 3 A 2 1 164578 CASAVA_Build 3 70483533 4D AGCACAGATA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 96 het 41 0 33 9 AAAC 4 3 164579 CASAVA_Build 3 70483952 2D TCAATCTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 28 2 14 13 A 16 14 164580 CASAVA_Build 3 70552783 1I TTTTGCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 19 8 T 10 11 164581 CASAVA_Build 3 70553961 1D TAAGAATGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 10 9 164582 CASAVA_Build 3 70564238 2D CATTTGTCAA AT/-- ATATATATAT 1403 het 1403 ref 29 20 3 6 AT 8 7 164583 CASAVA_Build 3 70566412 1I AATAAAGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 9 10 164584 CASAVA_Build 3 70566885 2D TGCAGGTCAC AG/-- GGGATATGAT 2912 het 2912 ref 23 15 7 1 AG 1 0 164585 CASAVA_Build 3 70572472 1D TTTTTTTTTT A/- AAATATTCTA 3070 het 381 hom 30 6 18 6 A 4 3 164586 CASAVA_Build 3 70576455 4I GTCTGCAATC ----/AAAA AAACAAAGTG 3070 het 3070 ref 34 23 8 3 A 3 7 164587 CASAVA_Build 3 70594402 1D TTATCACAGG T/- TTCCACTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 18 7 T 3 2 164588 CASAVA_Build 3 70600393 1I ACGTTACTTA -/C GTAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 20 8 8 4 C 0 1 164589 CASAVA_Build 3 70611934 2I AATACAATTT --/TA TATATATATA 2967 het 2694 hom 17 7 7 3 TA 6 7 164590 CASAVA_Build 3 70628522 1D GTATTTGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 11 10 164591 CASAVA_Build 3 70629467 4I AATTAAAAAT ----/AATA AATATATTAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 AATA 1 2 164592 CASAVA_Build 3 70634923 4D16M4I AGAAATAAAA CAATCAAATAAGCAAAAAAC----/----CAAATAAGCAAAAAACAAAT AACTCCATTG 3070 het 3070 ref 35 27 12 3 N/A 0 0 164593 CASAVA_Build 3 70635884 2I GCTTCATGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 15 11 A 10 12 164594 CASAVA_Build 3 70643923 1I GTTGCTCTTG -/C CCCCCGCCAA 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 C 5 6 164595 CASAVA_Build 3 70647794 2D GCATAGAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 8 A 13 11 164596 CASAVA_Build 3 70649737 1D TTTTCTCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 11 10 164597 CASAVA_Build 3 70668282 8D GGCAGAGAAA GGTTAGAG/-------- GTGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 31 17 13 7 GGTTAGAG 1 0 164598 CASAVA_Build 3 70674402 1D TCCCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 28 5 11 12 A 17 16 164599 CASAVA_Build 3 70688660 1I GAAATACCTC -/A AATTGCAGTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 2 3 164600 CASAVA_Build 3 70691178 1I AAATCTATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 T 9 10 164601 CASAVA_Build 3 70700850 12D CAGACTTGAC AGGTAACACTGA/------------ AGAGAGATTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 8 AGGTAACACTGA 1 0 164602 CASAVA_Build 3 70718945 3D TGTAATATAA GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 G 13 10 164603 CASAVA_Build 3 70739021 1D AGTGATTTAA T/- TTCTTATACT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 T 3 2 164604 CASAVA_Build 3 70741275 8I AGCTCCCTTT --------/TTTATTTC TTTATTTCTT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 TTTATTTC 1 2 164605 CASAVA_Build 3 70753921 2I GGCAACAAAT --/TG GATCAAAGTC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 TG 0 1 164606 CASAVA_Build 3 70760542 1I AACTCTTCTG -/C CTTTTGCCTC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 C 1 2 164607 CASAVA_Build 3 70774785 4D AAAGTATCTC TGAT/---- TGGTGAGTGA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 TGAT 1 0 164608 CASAVA_Build 3 70778417 2I CAAACAATAC --/AT ATATATATAT 716 hom 12 het 8 0 5 3 AT 7 8 164609 CASAVA_Build 3 70835425 6D ACGCAGTAAT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2987 het 398 hom 23 6 8 11 A 16 10 164610 CASAVA_Build 3 70836496 1I TTTTTATTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 8 9 164611 CASAVA_Build 3 70852868 1D TGCTTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 12 11 164612 CASAVA_Build 3 70920139 1I TGTAGTTTTT -/A AATCAGTTGT 3070 het 3070 ref 30 19 7 4 A 2 3 164613 CASAVA_Build 3 70956655 2D CTAATGCTGA AT/-- ATATATATAT 2816 het 2816 ref 24 13 6 5 AT 9 8 164614 CASAVA_Build 3 70981491 4D TTTTATATAT TATA/---- TATATATATA 1748 hom 10 het 6 0 4 2 TA 10 8 164615 CASAVA_Build 3 70991680 1D GCACCCTCTT A/- AGAGTTGTGA 3070 hom 39 het 16 0 14 4 A 2 1 164616 CASAVA_Build 3 70994050 1I TTCTTTTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 8 9 164617 CASAVA_Build 3 70997608 1D AGAGTCATGG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 A 8 7 164618 CASAVA_Build 3 71005140 1I AGAAACCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 32 1 27 4 T 11 12 164619 CASAVA_Build 3 71049335 1D CCTACTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1047 het 1047 ref 17 7 4 6 T 15 14 164620 CASAVA_Build 3 71063960 1I GCCCATTCTG -/T TTTTTTCCTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 6 7 164621 CASAVA_Build 3 71070333 1D TCATTTACCA C/- CCCCCACCCC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 C 6 5 164622 CASAVA_Build 3 71111447 4I CACTTACCAT ----/AGTA AGTAAGTCTA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AGTA 1 2 164623 CASAVA_Build 3 71118593 3D TTTACTGTAA AAT/--- AATACACGGA 3070 het 3070 hom 41 18 19 8 AAT 2 1 164624 CASAVA_Build 3 71121143 1I TCACATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 17 13 3 T 10 11 164625 CASAVA_Build 3 71131566 1I CAACAAAAAG -/T TTTAAGTGTA 3070 het 1619 hom 22 6 13 3 T 3 4 164626 CASAVA_Build 3 71135930 1D AACCCTACAT C/- CCCCCCCAAG 3070 hom 110 het 40 0 37 3 C 8 7 164627 CASAVA_Build 3 71140997 6D TCATGGGGGC GGGGGG/------ GGGGGGGCGC 3070 het 51 hom 15 1 10 7 G 13 7 164628 CASAVA_Build 3 71147563 1I AGACGAGGAT -/A AAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 48 26 14 8 A 6 7 164629 CASAVA_Build 3 71151675 1D GAGACACGGT C/- CCCCCCCCAA 992 het 992 ref 24 10 5 9 C 9 8 164630 CASAVA_Build 3 71189311 2D AATATAAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 1086 het 1086 ref 22 17 3 3 A 16 14 164631 CASAVA_Build 3 71199776 1I AAAATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 1890 het 1877 hom 19 7 6 6 A 10 11 164632 CASAVA_Build 3 71207558 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2598 hom 32 12 14 6 T 13 12 164633 CASAVA_Build 3 71209981 1D CCTCCTCTGT A/- TATTTTCTCT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 1 0 164634 CASAVA_Build 3 71214471 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 10 11 164635 CASAVA_Build 3 71226538 1I TGTATACAAC -/A AGATATTCAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 1 2 164636 CASAVA_Build 3 71241269 1I GATTTGGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 155 hom 35 1 32 2 T 11 12 164637 CASAVA_Build 3 71253345 3D CATCATACTC CTA/--- CTCCCATTAA 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 CTA 1 0 164638 CASAVA_Build 3 71256497 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1440 het 1440 ref 48 21 11 16 A 10 11 164639 CASAVA_Build 3 71258697 1I AACCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2942 het 147 hom 23 2 16 5 A 11 12 164640 CASAVA_Build 3 71258732 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1097 het 1097 ref 24 13 7 4 A 11 10 164641 CASAVA_Build 3 71268661 1I GAAATACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 44 0 33 11 A 10 11 164642 CASAVA_Build 3 71273984 1D GTTGACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 11 10 164643 CASAVA_Build 3 71280228 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 47 het 26 0 23 3 A 10 9 164644 CASAVA_Build 3 71288349 1D GAGCCTGGGA G/- GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 G 7 6 164645 CASAVA_Build 3 71290243 1D GAAAGACAAG T/- TGCAGACAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 2 1 164646 CASAVA_Build 3 71295712 1D TTTTAATCAG T/- TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 6 5 164647 CASAVA_Build 3 71300143 1I AGTTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 A 10 11 164648 CASAVA_Build 3 71326435 1I TTCTTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 25 1 20 4 A 10 11 164649 CASAVA_Build 3 71336590 1I GGCTACTCTT -/G AAGAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 164650 CASAVA_Build 3 71338439 1D TGTGAAGACA G/- GAGACTTCAT 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 G 2 1 164651 CASAVA_Build 3 71339580 1D ACAATAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 70 het 29 0 23 6 A 10 9 164652 CASAVA_Build 3 71347506 1I CAACTTAAAG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 7 8 164653 CASAVA_Build 3 71351720 2I TCTCTCTCTC --/CT CTGTTTCCAC 3070 hom 57 het 25 0 15 10 CT 1 2 164654 CASAVA_Build 3 71352771 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTAAAGAA 3070 het 392 hom 17 1 14 3 C 1 0 164655 CASAVA_Build 3 71355170 1I CTTGGAGGCA -/C CTTTTTTCCT 3070 hom 73 het 30 0 24 6 C 1 2 164656 CASAVA_Build 3 71357378 2I TTTCTGAGCT --/AA GTCATAATTG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 0 2 164657 CASAVA_Build 3 71358288 22D CTCAACTCCA CCCGGCAGCCATCCTGAAAATG/---------------------- CCCGTCACCT 3070 het 3070 ref 39 19 20 5 CCCGGCAGCCATCCTGAAAATG 1 0 164658 CASAVA_Build 3 71359786 1I ATGTGTATGA -/G CTATGCAGCT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 G 0 1 164659 CASAVA_Build 3 71366973 1D TCTGATGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 10 9 164660 CASAVA_Build 3 71372392 2D TGTTTTTTTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 11 9 164661 CASAVA_Build 3 71374606 2D CCCAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2414 hom 32 13 11 9 A 16 14 164662 CASAVA_Build 3 71377840 1D ACGAAAACCA C/- CCCCCCCCCA 1101 het 1101 ref 34 20 3 11 C 10 9 164663 CASAVA_Build 3 71378941 1D CTAGCATCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 10 9 164664 CASAVA_Build 3 71383970 2D GAGATCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 TC 6 5 164665 CASAVA_Build 3 71395585 1D TCCATATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 11 10 164666 CASAVA_Build 3 71409621 1D TTCCCTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 11 10 164667 CASAVA_Build 3 71413083 1D TAAAAATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 17 15 1 A 11 10 164668 CASAVA_Build 3 71444674 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 32 0 25 7 A 9 8 164669 CASAVA_Build 3 71449996 1D CCCAGCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 34 1 21 13 T 17 16 164670 CASAVA_Build 3 71457329 1I TATGAACCTG -/A AAAACCATAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 4 5 164671 CASAVA_Build 3 71461302 1I ACCTCGTGAT -/C CACCCGTCTC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 2 164672 CASAVA_Build 3 71461427 1D CAAAATGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 21 7 A 15 14 164673 CASAVA_Build 3 71463727 1D TCTAGCTAAT C/- TAGTGGGGAG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 C 1 0 164674 CASAVA_Build 3 71465239 1D ACAAAGTGAT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 9 8 164675 CASAVA_Build 3 71468103 5D AAATTTTTAG TTTAT/----- TTTATTTTTA 3070 hom 26 het 15 0 10 5 TTTAT 2 1 164676 CASAVA_Build 3 71468328 1I CCATGTGTTC -/T GATAAAAACA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 0 1 164677 CASAVA_Build 3 71470171 1D AGTGTTATAG A/- AAGTGGATAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 3 2 164678 CASAVA_Build 3 71473885 4I TTTCTGCTAC ----/ATAA ATAACTAGTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ATAA 1 2 164679 CASAVA_Build 3 71476649 1I29M1I AGTCCAGCCT -GGGGGAAAGAGCGAGAGTCCGTCTCAATT-/GGGGGGAAAGAGCGAGAGTCCGTCTCAATTA AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 34 0 30 9 N/A 0 0 164680 CASAVA_Build 3 71479728 1D TCTGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 781 hom 23 5 12 6 A 12 11 164681 CASAVA_Build 3 71481013 1D AAATCAGCTA T/- AATTTCCAAG 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 1 0 164682 CASAVA_Build 3 71481483 1D ATGCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 11 10 164683 CASAVA_Build 3 71500405 1D45M1I GGAAGTATGC TTTATTTTGATCAAACCTCAGTAGCTAAAACCAAAGTAATCAATTG-/-TTATTTTGATCAAACCTCAGTAGCTAAAACCAAAGTAATCAATTGT TTGGGACTGT 3070 hom 144 het 41 0 49 13 N/A 0 0 164684 CASAVA_Build 3 71506436 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 701 hom 39 4 28 7 A 11 12 164685 CASAVA_Build 3 71510047 3I CGCTAGCTTC ---/TCT TCTTCCTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TCT 1 2 164686 CASAVA_Build 3 71511450 1D TGGTTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 11 10 164687 CASAVA_Build 3 71520344 1D AAAATTAACG T/- TAAGTACAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 2 1 164688 CASAVA_Build 3 71532205 1D TTATGTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 11 8 T 11 10 164689 CASAVA_Build 3 71541407 1I TGAAGAATGG -/C CTTGAATCTA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 C 1 2 164690 CASAVA_Build 3 71547169 1D TTCAGTATAA T/- TTTTTAATCT 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 6 5 164691 CASAVA_Build 3 71549407 1I CTTCTTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 9 10 164692 CASAVA_Build 3 71551449 1D ATGACATTTA G/- AGACTCGTCT 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 G 1 0 164693 CASAVA_Build 3 71568328 1I AATACCCCAT -/C CTATCGTCCC 3070 hom 126 het 48 0 44 4 C 1 2 164694 CASAVA_Build 3 71577531 3D TATTTATACC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 14 0 9 5 T 15 12 164695 CASAVA_Build 3 71578388 1I CCACACACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 26 1 20 5 A 10 11 164696 CASAVA_Build 3 71582649 2D AAGACCTAAT TA/-- TATATACTAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TA 4 3 164697 CASAVA_Build 3 71586644 1I TTAAAAAAAA -/C AAACAAAAAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 0 1 164698 CASAVA_Build 3 71588650 1D TTATTGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 649 hom 30 4 19 7 T 13 12 164699 CASAVA_Build 3 71634822 5D TTACAATTAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1477 hom 36 10 12 15 A 15 10 164700 CASAVA_Build 3 71639424 1I GCAAAACTGC -/T TTTTTTTTTT 2625 het 1932 hom 28 8 10 11 T 13 14 164701 CASAVA_Build 3 71671348 1D GATTTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 8 13 13 A 13 12 164702 CASAVA_Build 3 71673408 2D GAAATGTGAG GA/-- GAGAAGCATG 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 GA 3 2 164703 CASAVA_Build 3 71676690 1I ATAATAGGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 831 hom 44 2 37 5 T 9 10 164704 CASAVA_Build 3 71676946 2D ATTTTTTTTT TA/-- TTAAAAATAA 3070 het 3070 ref 53 26 25 2 TA 1 0 164705 CASAVA_Build 3 71688507 1D TGCCATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 12 11 164706 CASAVA_Build 3 71728787 1D CCATAGGGAA T/- TAAAGCCAGG 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 T 2 1 164707 CASAVA_Build 3 71735293 2I AGGTAAAATT --/CA CAGTGTCTGG 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 CA 1 2 164708 CASAVA_Build 3 71736527 1D GCTCTCCCCC T/- AAGATTAGGA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 1 0 164709 CASAVA_Build 3 71738047 1D TACATAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2400 het 1071 hom 38 10 14 14 A 16 15 164710 CASAVA_Build 3 71741717 1D CACAGTGAGA C/- CCCCCCCCAT 1580 het 1580 ref 21 12 5 5 C 9 8 164711 CASAVA_Build 3 71744639 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 9 10 164712 CASAVA_Build 3 71751652 1I TAGACTGGCA -/T TTTTTTTTTT 2813 het 2353 hom 29 9 8 12 T 13 14 164713 CASAVA_Build 3 71768065 1I ATTATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1950 hom 27 7 14 6 T 11 12 164714 CASAVA_Build 3 71771507 5D ATTTTCTCTT TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 TTTTA 3 2 164715 CASAVA_Build 3 71776218 3D GGCATGGTAG CTC/--- CTCACTCCTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 CTC 2 1 164716 CASAVA_Build 3 71787391 1D ACCCTAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 12 11 164717 CASAVA_Build 3 71790740 10D CAGTGATGCA GGAGAGTAAG/---------- GGAGACTCAA 3070 hom 153 het 53 0 47 11 GGAGAGTAAG 1 0 164718 CASAVA_Build 3 71827911 1D TGCTTTTGTT C/- CCCCTGTAGA 3070 het 3070 ref 58 30 25 3 C 5 4 164719 CASAVA_Build 3 71836541 1D AGGAGGGGTC A/- GGGGTATTTC 3070 het 3070 ref 38 19 13 8 A 1 0 164720 CASAVA_Build 3 71853906 1I AAAGCTTTAT -/G GGTTCCTGTA 3070 hom 62 het 24 0 19 5 G 2 3 164721 CASAVA_Build 3 71880049 1D TTATATGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 10 9 164722 CASAVA_Build 3 71894723 1D AGAAATCATG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 9 8 164723 CASAVA_Build 3 71899364 1D CTTCCACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2659 hom 19 9 8 2 T 13 12 164724 CASAVA_Build 3 71923178 8D ACTCTTTCTA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 63 het 28 0 22 8 AAAC 7 5 164725 CASAVA_Build 3 71936363 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 22 0 12 10 T 14 13 164726 CASAVA_Build 3 71943541 1D GAGAGGCATG C/- TTTTTATGGA 3070 het 3070 ref 33 17 16 0 C 1 0 164727 CASAVA_Build 3 71946039 1D ACAGACAGCA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 57 31 21 7 T 8 7 164728 CASAVA_Build 3 71947060 2D CATTCTTTGC AA/-- AAAGTTAAAA 3070 hom 117 het 44 0 39 6 A 5 3 164729 CASAVA_Build 3 71949189 1I TTGTAAAAAT -/G AGAAAACTTA 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 G 0 1 164730 CASAVA_Build 3 71951820 1D GTGAATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 27 1 20 6 T 13 12 164731 CASAVA_Build 3 71982251 3D TTATTTCTTG TTC/--- TTCTTAATCG 3070 hom 102 het 39 0 34 6 TTC 2 1 164732 CASAVA_Build 3 71987648 1I TTGACTCATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 8 9 164733 CASAVA_Build 3 71988693 3D CCTCCCCTGG TCC/--- TCCCCAGCCC 3070 hom 94 het 35 0 31 5 TCC 2 1 164734 CASAVA_Build 3 71990434 10I CAGCGCAGGA ----------/GACGGTGGAG GACCAGACTC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 GACGGTGGAG 0 1 164735 CASAVA_Build 3 72004738 2D CATAGCCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 16 14 164736 CASAVA_Build 3 72006191 1I TCGAGACCAG -/C CTGGCCAACG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 1 2 164737 CASAVA_Build 3 72013169 3I3M3I GTGGAGAAAA ---GGA---/CTGAGATCT CAGAGAAGAA 3070 hom 117 het 40 0 38 7 N/A 0 0 164738 CASAVA_Build 3 72033191 1D CCTACCCCCG C/- CCCCCAATAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 6 5 164739 CASAVA_Build 3 72034495 1D AGGAAAGAGT G/- GGGGGGAGGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 7 6 164740 CASAVA_Build 3 72037406 1D GCTAACATTT A/- AAGCAAGTAG 3070 hom 99 het 39 0 32 7 A 3 2 164741 CASAVA_Build 3 72068569 1D GCCTAAATGT A/- AAAGGCTACT 3070 het 3070 ref 32 22 9 3 A 4 3 164742 CASAVA_Build 3 72069502 1I GTACTGGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 9 10 164743 CASAVA_Build 3 72073853 1D TCCCTCCTTC T/- TTTTTTTTTC 1255 het 1255 ref 37 24 3 10 T 10 9 164744 CASAVA_Build 3 72080817 1I CAGCTGATTC -/T TTTTTTTTTT 1130 het 559 hom 25 3 6 16 T 17 18 164745 CASAVA_Build 3 72082668 1I ACTTAAACTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 A 8 9 164746 CASAVA_Build 3 72091664 1D GATGCAATTT A/- AAAAAAAAAA 2541 het 2541 ref 48 31 8 11 A 13 12 164747 CASAVA_Build 3 72093993 1I AATGTACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 18 15 T 10 11 164748 CASAVA_Build 3 72120578 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 712 hom 30 5 15 12 A 15 14 164749 CASAVA_Build 3 72122347 1D TAACTTAAAG A/- CCCATCATAT 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 A 1 0 164750 CASAVA_Build 3 72125652 17I TGGGAAGGAG -----------------/GAGAGAGAAAAAATGTA GAGACAGAAA 3070 hom 59 het 24 0 18 7 GAGAGAGAAAAAATGTA 0 1 164751 CASAVA_Build 3 72125815 1D CCCAAAATAC A/- AAAAAATTAG 1885 het 1885 ref 13 6 5 2 A 7 6 164752 CASAVA_Build 3 72126891 1I CCGTTGGCCC -/A AGGTTCCCAG 3070 hom 108 het 38 0 35 3 A 1 2 164753 CASAVA_Build 3 72129203 4D AGACAGAGAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 31 hom 50 2 34 14 AG 10 8 164754 CASAVA_Build 3 72131369 1I TTCCCTTGGG -/A AACCGGCCCT 3070 hom 54 het 27 0 19 8 A 2 3 164755 CASAVA_Build 3 72140965 1D GGTTTAAGGA T/- TTTTTTTTTT 2207 het 2207 ref 44 32 6 6 T 12 11 164756 CASAVA_Build 3 72146753 3D CTCTCCCCTG TTC/--- TTCTGGAAAC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 TTC 2 1 164757 CASAVA_Build 3 72158347 3I CCTTCTACAA ---/AAC AACAACTCCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AAC 2 3 164758 CASAVA_Build 3 72170104 1I CAGCATAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 275 hom 34 2 23 9 T 10 11 164759 CASAVA_Build 3 72171917 1I TTACGGGGGG -/A AAGACTTTCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 3 164760 CASAVA_Build 3 72191232 1D AAATAAAAAT A/- AAAATAAAAT 514 het 514 ref 13 4 3 6 A 5 4 164761 CASAVA_Build 3 72194400 2D TATCTATCTA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 405 hom 33 5 17 11 TC 10 9 164762 CASAVA_Build 3 72213747 2I AAAAAAACAA --/AC AAAAAAACAA 3070 het 60 hom 30 2 14 14 AC 0 1 164763 CASAVA_Build 3 72222349 4I ATAAAGTCAT ----/ACTC ACAGGTACTG 3070 hom 147 het 56 0 48 8 ACTC 0 1 164764 CASAVA_Build 3 72228206 1D CTAGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2153 hom 25 8 10 7 T 12 11 164765 CASAVA_Build 3 72254157 1D TCCTTACTAA T/- CTTGGTTTGG 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 T 1 0 164766 CASAVA_Build 3 72259137 2D GGTGGGAGCA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 92 het 37 0 30 8 AG 7 6 164767 CASAVA_Build 3 72266968 1I AAGTAAGAAC -/A AAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 A 6 7 164768 CASAVA_Build 3 72275738 1D ATTCCTCCTT C/- CCCCTCTCAT 3070 hom 78 het 34 0 25 9 C 5 4 164769 CASAVA_Build 3 72288234 1D GGGCCCGGTC A/- GCAAGAGTTA 3070 hom 33 het 13 0 9 4 A 1 0 164770 CASAVA_Build 3 72293169 4D GCCCGATGTT TAGC/---- TTCTACTTAT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TAGC 1 0 164771 CASAVA_Build 3 72309446 1I TTGTTATCCC -/G GGGGTCTCCT 2933 het 2933 ref 30 14 9 7 G 4 5 164772 CASAVA_Build 3 72313607 4D TCAGACACTT TGAG/---- TTACTAGAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 6 TGAG 1 0 164773 CASAVA_Build 3 72319647 23D CATTAACTGT CTGGATAGACTTGAGCAGAGTTG/----------------------- CATCTCAGAT 3070 hom 129 het 39 0 44 6 CTGGATAGACTTGAGCAGAGTTG 1 0 164774 CASAVA_Build 3 72322690 2I CTTTTTTTTT --/TG TGTGTTTTTT 3070 hom 64 het 27 0 16 11 TG 2 3 164775 CASAVA_Build 3 72323164 1I ACCTCATAAA -/T ATTATGAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 0 1 164776 CASAVA_Build 3 72334304 1D TGTATAGCCA T/- GACCACAATT 3070 het 3070 ref 46 23 22 1 T 1 0 164777 CASAVA_Build 3 72346830 1D CATTGTCCAA T/- GGTTGCCAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 0 164778 CASAVA_Build 3 72367747 1D CACTTAAGAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 9 8 164779 CASAVA_Build 3 72369961 2D ATTCTTTCGA TC/-- TCTTGGGCTG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 TC 2 1 164780 CASAVA_Build 3 72414293 1I ATGAGAAATA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 7 8 164781 CASAVA_Build 3 72415844 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 A 9 10 164782 CASAVA_Build 3 72427551 1I TAAATTAACC -/T AAAAGATTGG 3070 hom 45 het 26 0 17 9 T 0 1 164783 CASAVA_Build 3 72429510 3D CTTCCAAATT AAC/--- AAGAATTTCC 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 AAC 1 0 164784 CASAVA_Build 3 72438393 15D AAAAAAAAGA AAAAGAAAAGAAAAG/--------------- AAAAGAAAAG 1427 het 1427 ref 14 9 3 7 AAAAG 6 3 164785 CASAVA_Build 3 72469372 17D6M1D12M2I TGTATGTGTG GTGGGTGTGGGTCTGTATGTGTGTGATGTGTGTGGG--/-----------------TGAGCG-GATGTGTGTGGGCC TGTGTATGTG 1689 het 1689 ref 41 48 8 7 N/A 0 0 164786 CASAVA_Build 3 72488212 1I AATTTTAATT -/A AAAAAAACAG 3070 het 65 hom 29 1 24 4 A 7 8 164787 CASAVA_Build 3 72496434 4I TTCAAGCTGT ----/GAGC ATGTTAAGCA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 GAGC 0 1 164788 CASAVA_Build 3 72497828 1D TTTAAAACCT C/- CCCAGCAGCA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 4 3 164789 CASAVA_Build 3 72508752 3I GTGGTCTTTG ---/ATT ATTATTTTTT 3070 het 314 hom 27 1 20 6 ATT 2 3 164790 CASAVA_Build 3 72509943 1I GCACAGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 830 hom 21 2 13 6 T 13 14 164791 CASAVA_Build 3 72523785 2I TTAGGGATAT --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 46 20 21 5 TA 4 5 164792 CASAVA_Build 3 72529455 1D CTGTATTCTA T/- TAGACCCTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 164793 CASAVA_Build 3 72534243 2D GCTTCATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 27 2 10 15 A 14 12 164794 CASAVA_Build 3 72535579 1D TAAATGCAAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 96 het 39 0 31 8 T 9 8 164795 CASAVA_Build 3 72556626 1D CAGTACGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 A 11 10 164796 CASAVA_Build 3 72557739 1D AAGGCAAACC A/- AAAAAAAAAA 2286 het 1476 hom 32 8 9 15 A 17 16 164797 CASAVA_Build 3 72561267 3I TCTAAAGATT ---/CAA CAACAGGTTA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 CAA 1 2 164798 CASAVA_Build 3 72561863 3I ACATGTTCAG ---/GGA ACACTGAACA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 GGA 0 1 164799 CASAVA_Build 3 72567610 1D TTGATTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 38 1 32 5 A 12 11 164800 CASAVA_Build 3 72577784 1I CTAGTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 10 11 164801 CASAVA_Build 3 72580045 6D AGATGATAAA AGACAC/------ AGACGCGGCT 2477 het 2477 ref 23 11 8 7 AGACAC 1 0 164802 CASAVA_Build 3 72598202 1D AAACCAGAGG C/- CTTACAGAAT 3070 het 3070 ref 43 20 18 7 C 2 1 164803 CASAVA_Build 3 72603903 1I CTGACTGAGC -/A AAATGCATTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 3 4 164804 CASAVA_Build 3 72604356 1I GTGCCAAAAA -/G GTTGGGGACT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 1 2 164805 CASAVA_Build 3 72605119 4I TCTCAAACAT ----/AAAG AAAGAAAACT 3070 hom 60 het 29 0 20 9 AAAG 1 2 164806 CASAVA_Build 3 72608621 1I AAGGAAAGTG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 164807 CASAVA_Build 3 72610285 2I27M1I TTCTTGTAAT --TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAACGTGG-/TATTATTTTTTTTTTTTTTTGTAACGTGGC CCTAGCTCTT 3070 hom 81 het 33 0 25 13 N/A 0 0 164808 CASAVA_Build 3 72625382 1I TTAATAGCAA -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 C 8 9 164809 CASAVA_Build 3 72628151 1I ACTCAAGTGA -/G GCGGGGGGGC 3070 hom 45 het 22 0 12 10 G 1 2 164810 CASAVA_Build 3 72630163 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 8 9 164811 CASAVA_Build 3 72631347 1D GCAATATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 36 0 29 7 T 13 12 164812 CASAVA_Build 3 72639173 1I CAAAGCCCAG -/C CCCCCCTGGA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 C 6 7 164813 CASAVA_Build 3 72643680 1I TGGGGATCAC -/T TAAGGGCCAC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 1 2 164814 CASAVA_Build 3 72653837 1I TGGGCAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 39 1 26 12 A 12 13 164815 CASAVA_Build 3 72660361 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 6 7 164816 CASAVA_Build 3 72664301 1I CTATTTTCGC -/T TTTTCTCCCA 3070 hom 160 het 62 0 54 8 T 4 5 164817 CASAVA_Build 3 72665732 12I GTTGTGTGGG ------------/TGTGTGGTTGTA TGTGTGGTTG 3070 hom 112 het 53 0 32 21 TGTGTGGTTGTA 0 1 164818 CASAVA_Build 3 72665919 4D TGAGATTGTA TGTT/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 117 het 49 0 38 16 TGTT 1 0 164819 CASAVA_Build 3 72665941 2D10M20D TGGTTGTGTG GATGTGTGGTTGTATGTGTGATTGTGTGTGGT/--TGTGGGGTTG-------------------- TGTGTGTGTG 1969 het 1969 ref 61 18 15 38 N/A 0 0 164820 CASAVA_Build 3 72689274 13I AAGATGAGAT -------------/TCAGGAAGTACAG TTAGGAAATA 3070 hom 113 het 45 0 37 8 TCAGGAAGTACAG 0 1 164821 CASAVA_Build 3 72707898 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 6 5 164822 CASAVA_Build 3 72715170 1D AGCTTAAGTC T/- TCACACTTTT 3070 hom 92 het 40 0 35 6 T 2 1 164823 CASAVA_Build 3 72716649 5D AAATGTCAGC TCATG/----- TCATGTCAAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TCATG 2 1 164824 CASAVA_Build 3 72729370 1I CAAAGTGGTC -/G GGGGGGGGGC 2065 het 167 hom 23 1 10 12 G 9 10 164825 CASAVA_Build 3 72752960 1D GCCTCAGCCT C/- CCAAGTAGCT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 3 2 164826 CASAVA_Build 3 72775572 1D GTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 971 het 971 ref 38 22 4 12 T 13 12 164827 CASAVA_Build 3 72777407 2I GTGATAAATG --/AA GAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 0 2 164828 CASAVA_Build 3 72784678 1D CTTTCATGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 10 9 164829 CASAVA_Build 3 72791752 1D TATCTGGAAA C/- ATGCCAGGCA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 C 1 0 164830 CASAVA_Build 3 72807002 1I GGAAGAGTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 21 19 7 T 9 10 164831 CASAVA_Build 3 72818967 1I CCCATTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2796 hom 28 9 14 5 T 11 12 164832 CASAVA_Build 3 72826099 1I ACCCAGGTCA -/T TTTGTGGTCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 3 4 164833 CASAVA_Build 3 72862624 2D AATGTGTCAA TC/-- TCTCTCTCTC 1600 het 1600 ref 49 33 4 12 TC 10 9 164834 CASAVA_Build 3 73048156 1D AAACTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 1054 het 1054 ref 24 15 3 6 A 12 11 164835 CASAVA_Build 3 73060627 1I AAATAACTCC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 9 10 164836 CASAVA_Build 3 73062016 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 30 2 14 14 A 11 10 164837 CASAVA_Build 3 73063078 1I TTATTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 10 11 164838 CASAVA_Build 3 73064963 1D ATTATACCTA T/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 38 13 17 9 T 7 6 164839 CASAVA_Build 3 73068508 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 90 het 37 0 31 8 A 9 8 164840 CASAVA_Build 3 73075929 1I TATTCAAGTC -/T TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 T 5 6 164841 CASAVA_Build 3 73081905 14I AGGCCAGGCA --------------/TGGTGGCTTATGCC TGTAATCCCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TGGTGGCTTATGCC 0 1 164842 CASAVA_Build 3 73083033 1I CAAAAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 T 10 11 164843 CASAVA_Build 3 73094806 2I AAAAAAAAAA --/AC AACAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 15 13 AC 0 1 164844 CASAVA_Build 3 73098477 1I GGTTTGTTCG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 9 10 164845 CASAVA_Build 3 73101109 1I AAGCCTCATG -/C CTGTAATCTG 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 C 1 2 164846 CASAVA_Build 3 73103696 3D AGGCTGAGGT AGG/--- AGAATGGCTT 3070 het 2060 hom 19 5 12 3 AGG 1 0 164847 CASAVA_Build 3 73104228 5I GGGTCACACC -----/TGTAA TCCCAGCACT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 TGTAA 0 1 164848 CASAVA_Build 3 73107211 1I ATCTCTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 A 12 13 164849 CASAVA_Build 3 73117430 1D CCGTGTCCCT A/- AAAAAAAAAA 1382 het 1382 ref 40 27 3 10 A 11 10 164850 CASAVA_Build 3 73124118 4D CTTTCTTTCC CTTT/---- CTTTCTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 17 7 CTTT 3 2 164851 CASAVA_Build 3 73133325 1D GGAGGTAGGA G/- GATCACCTGA 3070 hom 60 het 23 0 17 7 G 2 1 164852 CASAVA_Build 3 73133869 3D GTCTCTAGTA ATC/--- ATCAGTCTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 8 ATC 2 1 164853 CASAVA_Build 3 73134960 1D GAATGTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 633 hom 30 2 17 11 T 13 12 164854 CASAVA_Build 3 73135059 1D TTCCCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 27 1 26 3 T 12 11 164855 CASAVA_Build 3 73136024 1D CCTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 22 6 T 13 12 164856 CASAVA_Build 3 73137179 1D TGGTGTGGTC T/- TTTTTTTTTT 2714 het 386 hom 27 3 11 13 T 15 14 164857 CASAVA_Build 3 73138787 1I TCCACTTTTT -/G GAGTCTGTGG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 G 1 2 164858 CASAVA_Build 3 73139326 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 25 0 19 6 T 9 8 164859 CASAVA_Build 3 73139770 4D ATCTGTACAA TTAC/---- TTCTTTAATG 2979 hom 21 het 9 0 8 4 TTAC 1 0 164860 CASAVA_Build 3 73139956 3I AAGCCATTGG ---/CTT CTTGGTATAG 2679 hom 21 het 9 0 8 1 CTT 1 2 164861 CASAVA_Build 3 73142406 1D TCTCGCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 12 11 164862 CASAVA_Build 3 73142867 3I GTTGTACAGC ---/TGA TAAGTAATGG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TGA 0 1 164863 CASAVA_Build 3 73145334 4I ATGTAAGAAA ----/AAAG AAAAATCAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAAG 0 1 164864 CASAVA_Build 3 73145488 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 26 1 20 5 T 12 11 164865 CASAVA_Build 3 73148114 1D TCTCGTTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 74 het 28 0 24 4 T 10 9 164866 CASAVA_Build 3 73149199 1I CTGCCTGTTG -/T TAGCCTGGAA 3070 hom 111 het 43 0 36 7 T 1 2 164867 CASAVA_Build 3 73150857 1I TTAGATAAAT -/G GAATAGAGAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 G 1 2 164868 CASAVA_Build 3 73154175 1I TTTCAGTTGA -/T TTTTTAAATA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 5 6 164869 CASAVA_Build 3 73154726 1D CAAGCAACTT G/- GAAGAGACAT 3070 hom 69 het 27 0 23 5 G 2 1 164870 CASAVA_Build 3 73155023 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 8 7 164871 CASAVA_Build 3 73155138 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 CTC 0 1 164872 CASAVA_Build 3 73158343 2I TTTGTTTAGA --/TT GTGAGTTCCC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 0 2 164873 CASAVA_Build 3 73158543 1D ATTTTTGCGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 122 het 47 0 41 6 T 9 8 164874 CASAVA_Build 3 73161416 2I GAGAGGTGAA --/AG AGGCTGTAGG 3070 hom 129 het 51 0 44 7 AG 1 2 164875 CASAVA_Build 3 73163395 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 7 6 164876 CASAVA_Build 3 73164237 13D TCAAGCGATT CTCCTGCCTCAGC/------------- CTCCTGAGTA 3070 hom 56 het 23 0 18 6 CTCCTGCCTCAGC 1 0 164877 CASAVA_Build 3 73168714 3D ATAGCAGACA TTG/--- TTAAGATACT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 TTG 1 0 164878 CASAVA_Build 3 73172859 3I TATGGATACA ---/TTT TACTTCTATG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 4 164879 CASAVA_Build 3 73174944 4I GCTATGAATT ----/AGTG GGTGATTATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AGTG 0 1 164880 CASAVA_Build 3 73175147 2D CTGTGAAATT AA/-- AAATTAAAAA 190 het 190 ref 18 2 1 15 A 5 3 164881 CASAVA_Build 3 73179282 4I GTCTGGTTGA ----/TAAT TGATTGATTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TAAT 0 1 164882 CASAVA_Build 3 73184425 3D AAGAGGCATT TTG/--- TTGAGGGATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TTG 2 1 164883 CASAVA_Build 3 73188138 2D CACTTTTTAT AC/-- AGTGTTGTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 AC 1 0 164884 CASAVA_Build 3 73188385 3D GAAAAGGAAG TGT/--- TGTGTGACAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TGT 2 1 164885 CASAVA_Build 3 73189943 9D AGCTCAAAAC TTAAAAATA/--------- TTTATAAAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 TTAAAAATA 1 0 164886 CASAVA_Build 3 73192435 7D AAAAAGGTTT GAGTCTC/------- TTTCTGTGGG 3070 hom 96 het 32 0 32 2 GAGTCTC 1 0 164887 CASAVA_Build 3 73195610 1I GATTTTTAAT -/A ACCTACAGAG 3070 hom 81 het 37 0 28 9 A 1 2 164888 CASAVA_Build 3 73200774 1D TTTTGATGAA G/- GTGAGGGTCA 3070 hom 95 het 37 0 32 5 G 2 1 164889 CASAVA_Build 3 73204367 3I GGATAATAAT ---/AGC AAGCACTAAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AGC 0 1 164890 CASAVA_Build 3 73212759 1D TTTCATTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 68 het 33 0 25 9 T 9 8 164891 CASAVA_Build 3 73212913 1I GTCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 18 1 12 5 T 11 12 164892 CASAVA_Build 3 73214913 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2559 het 19 hom 15 1 8 6 A 20 18 164893 CASAVA_Build 3 73215931 2I ACTCTGTGTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 22 1 18 3 A 14 16 164894 CASAVA_Build 3 73218720 1D TCATTGAAAG A/- AGTGGTTAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 2 1 164895 CASAVA_Build 3 73229078 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1665 het 19 hom 19 0 5 14 A 19 17 164896 CASAVA_Build 3 73229222 3I GGAGGAGAAG ---/AGA AGGAGAAAGG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 AGA 0 1 164897 CASAVA_Build 3 73240827 1I GAACCTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 39 3 27 9 T 13 14 164898 CASAVA_Build 3 73250820 2D TTAGGAAGCC AT/-- GTATATGTGT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 AT 1 0 164899 CASAVA_Build 3 73272629 1D AGTATACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 35 0 26 10 T 12 11 164900 CASAVA_Build 3 73300231 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 498 hom 20 1 10 9 T 17 16 164901 CASAVA_Build 3 73302728 5I ACAGTTAGGC -----/TATTA TATTAATTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TATTA 1 2 164902 CASAVA_Build 3 73315979 1I CTACCCTCCA -/C CCTCAAGTAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 2 3 164903 CASAVA_Build 3 73318754 1I TAATTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 1964 het 1964 ref 25 9 6 10 A 13 14 164904 CASAVA_Build 3 73320682 1D TCCTCCTCCT C/- CCCCTCTCCC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 C 5 4 164905 CASAVA_Build 3 73327134 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTAACT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 6 7 164906 CASAVA_Build 3 73329440 1I ATCTCGACTA -/C CCTTGTGCAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 2 3 164907 CASAVA_Build 3 73348236 2I CATGAGTTCA --/TT TTTTCTTCCT 3070 het 3070 hom 43 12 26 5 T 4 6 164908 CASAVA_Build 3 73352410 1I AAATATGTGG -/T TTTTTTTTTT 2188 het 2188 ref 31 8 8 15 T 13 14 164909 CASAVA_Build 3 73356860 1I AAAGGGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 35 1 26 8 T 11 12 164910 CASAVA_Build 3 73359596 1D CCCGCCCCCA C/- CCCCCCCGGT 2237 hom 23 het 12 0 7 6 C 8 7 164911 CASAVA_Build 3 73373095 3D13M3D AGTCTTTGTC ATTGTTGTTGTTTTTATTG/---GTTGTTGTTTTTA--- TTGTTGTTGT 3070 hom 69 het 25 0 23 5 N/A 0 0 164912 CASAVA_Build 3 73384688 1D ATAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 32 1 25 7 A 11 10 164913 CASAVA_Build 3 73394586 2I ATGATAACCA --/TT GTTATTATAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 2 164914 CASAVA_Build 3 73396509 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 8 7 164915 CASAVA_Build 3 73396602 1D CAGCATATCC G/- AAAGCTGATC 3070 het 3070 ref 33 23 9 3 G 1 0 164916 CASAVA_Build 3 73408092 1I CAATATGTAG -/T TTTTTTGTCC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 6 7 164917 CASAVA_Build 3 73417015 1I TCTGTTTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 28 1 22 5 A 10 11 164918 CASAVA_Build 3 73418043 1I ATTAAATAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 9 164919 CASAVA_Build 3 73426056 1I GCAAACACTT -/G TTTTTTTTTG 3070 hom 13 het 28 1 24 3 G 0 1 164920 CASAVA_Build 3 73426938 1I CTATATTCTT -/C CAGATTATTT 3070 hom 93 het 32 0 30 2 C 1 2 164921 CASAVA_Build 3 73436570 1I ATTACTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 11 12 164922 CASAVA_Build 3 73445884 1D GGTCATACCT A/- AGCAGCAAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 1 164923 CASAVA_Build 3 73446999 8I GTTGTTGTTG --------/TTGTTGTT TTGTTGTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTGTTGTT 1 2 164924 CASAVA_Build 3 73447545 1I GATAAGCCCC -/T TTTTTTTTCG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 164925 CASAVA_Build 3 73448103 1I GGGTAGCTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 172 hom 21 1 18 2 T 9 10 164926 CASAVA_Build 3 73448669 1D AAACTATATA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 7 6 164927 CASAVA_Build 3 73451575 1D AGGTTATATT A/- ATAAGGAAGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 2 1 164928 CASAVA_Build 3 73453975 8I TCACATCAGA --------/TCATATTG TCCCCTGGTC 3070 hom 113 het 43 0 36 7 TCATATTG 0 1 164929 CASAVA_Build 3 73476250 2I52M2I TTCGCAACTC --TATACCATTTCTTGTATTGATTTTTTATTATTGTATTTTAAATTTCTAGACA--/TTTGTACCATTTCTTGTATTGATTTTTTATTATTGTATTTTAAATTTCTAGACACT CTTTGTTATT 3070 het 3070 ref 43 34 29 4 N/A 0 0 164930 CASAVA_Build 3 73479070 4D TTTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 870 het 870 ref 29 15 5 9 TCTT 4 3 164931 CASAVA_Build 3 73480254 1I ATGGAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1347 hom 22 4 11 7 T 10 11 164932 CASAVA_Build 3 73484913 1D CAAGCCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 A 13 12 164933 CASAVA_Build 3 73489930 13D TGATCAAGTA GGCTTCATTACTG/------------- GGATGCAAGG 3070 het 3070 ref 36 19 15 6 GGCTTCATTACTG 1 0 164934 CASAVA_Build 3 73518704 3I TGTCTCTCGG ---/CTA CTTTTTCAAT 3070 hom 101 het 39 0 31 8 CTA 0 1 164935 CASAVA_Build 3 73519916 1I TTAATCTTTT -/A AAAAAAAAAG 2989 hom 31 het 19 0 14 5 A 9 10 164936 CASAVA_Build 3 73522799 2I GGTGAACATG --/AA AAAAAAAAAA 1346 het 1272 hom 47 3 8 36 A 10 12 164937 CASAVA_Build 3 73528748 1I TAGGGTACAC -/T TGGGTGTAAT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 1 2 164938 CASAVA_Build 3 73528880 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 31 1 20 10 T 13 14 164939 CASAVA_Build 3 73534783 4D CATGAAAAGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2971 hom 43 het 22 0 11 11 T 20 16 164940 CASAVA_Build 3 73557442 1D AAATAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 49 2 33 14 A 13 12 164941 CASAVA_Build 3 73575326 2I TTTTCTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 1687 het 83 hom 25 3 11 11 TC 0 1 164942 CASAVA_Build 3 73582772 1D CATGCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1933 het 1933 ref 37 26 5 6 A 12 11 164943 CASAVA_Build 3 73611231 1I TTCTCAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 24 2 14 8 A 13 14 164944 CASAVA_Build 3 73618241 1I AGGTGGAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 39 0 28 11 A 9 10 164945 CASAVA_Build 3 73618779 3I ATAAGCTAAA ---/TCT TCTTTGTCTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TCT 1 2 164946 CASAVA_Build 3 73627527 6I5M11I ACATAAGGCT ------AGAAC-----------/GTGTAAAGAGCCTTATGGCTCT TTCTCTAGGA 3070 het 3070 hom 28 14 15 0 N/A 0 0 164947 CASAVA_Build 3 73628225 1I AACATAGAGA -/G ACTAACTTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 G 0 1 164948 CASAVA_Build 3 73628413 1I AAGAGGACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 9 10 164949 CASAVA_Build 3 73638737 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 32 1 19 12 A 14 13 164950 CASAVA_Build 3 73639016 1D TTCATTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 11 10 164951 CASAVA_Build 3 73648637 14D ACACTTGTTA CAGGACACGGAGTC/-------------- CTGGACACCT 3070 het 3070 ref 36 15 17 10 CAGGACACGGAGTC 1 0 164952 CASAVA_Build 3 73659429 1I CTAGGACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 10 11 164953 CASAVA_Build 3 73662487 3I AGATCAAATG ---/TTC TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 TTC 0 1 164954 CASAVA_Build 3 73669448 1D TGTTATCTTC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 T 8 7 164955 CASAVA_Build 3 73689484 8D ATGGGCAATT TTCTGCCA/-------- TTCTGCCATT 3070 hom 99 het 40 0 34 9 TTCTGCCA 3 2 164956 CASAVA_Build 3 73690064 1I TGGGTATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 30 0 21 9 A 13 14 164957 CASAVA_Build 3 73691279 1D TTGACACAAG A/- ATCCAAACAA 3070 hom 106 het 38 0 36 4 A 2 1 164958 CASAVA_Build 3 73696959 17D TATCCACCAA TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 29 8 T 29 12 164959 CASAVA_Build 3 73697628 22D AAAATACAAA ACACACACACACACACACACAC/---------------------- ACACACACAC 3070 hom 36 het 14 0 12 3 AC 23 12 164960 CASAVA_Build 3 73703437 7D TTTTCAAAGA CCAATGC/------- CATTTGGTTG 3070 het 3070 ref 36 22 10 6 CCAATGC 1 0 164961 CASAVA_Build 3 73713814 13D GGTGGCACGT GCCTGTGGTACCA/------------- GCTACCCAGG 3070 hom 78 het 29 0 26 4 GCCTGTGGTACCA 1 0 164962 CASAVA_Build 3 73720891 1D GAAGATATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 29 4 12 13 T 16 15 164963 CASAVA_Build 3 73722003 1I CCAGCTACTT -/G GGGGGGCTGA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 6 7 164964 CASAVA_Build 3 73724239 4D CCTAGGAAAC CAAA/---- CACTCTTAGG 3070 hom 120 het 44 0 41 5 CAAA 1 0 164965 CASAVA_Build 3 73724936 1D AAACTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 599 hom 29 3 21 6 A 12 11 164966 CASAVA_Build 3 73726547 4I AGAGAAGTCT ----/CACC TACCTGTGTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CACC 0 1 164967 CASAVA_Build 3 73733737 1I GACGACAAAC -/G TAACAGAGAG 3070 hom 147 het 56 0 47 9 G 0 1 164968 CASAVA_Build 3 73734312 1D CCTTTGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 45 1 38 6 A 11 10 164969 CASAVA_Build 3 73748173 1I ATAGAAAGCA -/G AGGCTACTCA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 G 0 1 164970 CASAVA_Build 3 73766238 2D ATTTGGTACA TG/-- TGCCTTAGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 6 TG 2 1 164971 CASAVA_Build 3 73767462 2I TTTTAGACTC --/TT GTAATAGCTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 0 2 164972 CASAVA_Build 3 73774029 1D CTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 208 hom 30 2 19 9 A 13 12 164973 CASAVA_Build 3 73795124 3I CTGCACATTT ---/ATG ATGGCCAGAT 3070 hom 144 het 53 0 49 4 ATG 1 2 164974 CASAVA_Build 3 73799378 1I TGCCTGACTA -/T TTTTTTGTAT 1018 hom 10 het 6 0 4 6 T 6 7 164975 CASAVA_Build 3 73804452 13I AAATTCTGCT -------------/GCTTTAGAACAAG GCTTCTGTTT 3070 hom 123 het 48 0 41 8 GCTTTAGAACAAG 0 1 164976 CASAVA_Build 3 73809867 4D GCCACCACGC CTGT/---- CTAATTTTTG 3070 hom 95 het 36 0 29 7 CTGT 1 0 164977 CASAVA_Build 3 73816745 1D GTATTTTTAG T/- TAGAGATGGG 3070 hom 62 het 23 0 19 4 T 2 1 164978 CASAVA_Build 3 73818535 1D ATGTATTGGG T/- TTAACATAGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 3 2 164979 CASAVA_Build 3 73819716 3I CCAGACCTTA ---/TTC TTCTTTTCAC 3070 hom 99 het 42 0 32 10 TTC 1 2 164980 CASAVA_Build 3 73823280 1I TGCCTTTATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 468 hom 34 2 27 5 T 9 10 164981 CASAVA_Build 3 73831777 1I TTGGCACTGT -/G GGAGAGGCAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 2 3 164982 CASAVA_Build 3 73836014 1D ACAAACAAAC A/- AACAAAAAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 3 2 164983 CASAVA_Build 3 73849272 1I CAATGATTCC -/A TTACCTCCCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 164984 CASAVA_Build 3 73860354 1I ATATTTTACT -/C CCCCCTGCAG 3070 hom 106 het 44 0 36 8 C 5 6 164985 CASAVA_Build 3 73860652 1D ACACAGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 27 1 16 10 T 11 10 164986 CASAVA_Build 3 73860812 1I GCCCTGCTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 29 het 12 0 10 2 T 8 9 164987 CASAVA_Build 3 73875113 1D GTTTTTGAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 8 7 164988 CASAVA_Build 3 73885353 1I GAAAGAAAAA -/G GAAAGAAGAA 3070 hom 73 het 29 0 25 4 G 1 2 164989 CASAVA_Build 3 73887652 1I CTACCTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 41 1 26 14 T 11 12 164990 CASAVA_Build 3 73903378 1D TTTTTGAGAT G/- GGAGTCTTGC 2470 hom 25 het 12 0 7 5 G 3 2 164991 CASAVA_Build 3 73923626 2D GAAAAGTCAA AT/-- GAGTGGATTA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AT 1 0 164992 CASAVA_Build 3 73928312 1D AATTTAGGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 A 10 9 164993 CASAVA_Build 3 73945476 1I ACATAAGGCA -/G GCTTGAATTT 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 G 1 2 164994 CASAVA_Build 3 73952161 2I CACAGTTTTT --/TA TATATATATG 3070 hom 41 het 21 0 14 7 TA 4 5 164995 CASAVA_Build 3 73971758 2D AAGAGAAATC TT/-- TTACATGGTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 4 2 164996 CASAVA_Build 3 73974620 2D ATGGTGTATA TG/-- TGCCACATTT 3070 hom 42 het 19 0 13 8 TG 2 1 164997 CASAVA_Build 3 73981447 2I AGAAAGCCTG --/GA GAGACCTGTG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 GA 2 3 164998 CASAVA_Build 3 73982164 2I TCTCCATTAC --/CT TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 CT 0 1 164999 CASAVA_Build 3 74001226 1I CCACTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 733 hom 30 4 17 9 T 13 14 165000 CASAVA_Build 3 74007818 1D CCATGGTCTT C/- CTGGGCCCAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 C 2 1 165001 CASAVA_Build 3 74037884 1D CTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 39 0 30 9 T 13 12 165002 CASAVA_Build 3 74046237 2D TATTTATATT TA/-- GTGTTATTTC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 TA 1 0 165003 CASAVA_Build 3 74058642 1D GTTTTAGAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 9 8 165004 CASAVA_Build 3 74068201 1I CGTCTGACTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 967 hom 37 4 27 6 T 9 10 165005 CASAVA_Build 3 74069999 1D GGACCTGGGT G/- GGGCCTCATG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 G 4 3 165006 CASAVA_Build 3 74072167 1I TGGCTGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 44 0 32 12 A 10 11 165007 CASAVA_Build 3 74073285 1D GCCTTAGCCT C/- CCAAAGTGCT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 C 3 2 165008 CASAVA_Build 3 74077640 1I GCATAGAAAA -/T TTCACAGGTA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 2 3 165009 CASAVA_Build 3 74086153 1I ATTATTTGGC -/A AATACATTAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 2 3 165010 CASAVA_Build 3 74088611 15I GTGCAGATGT ---------------/GAGATGGGAACTACA GCTAGCTGTT 3070 het 3070 hom 51 20 24 8 GAGATGGGAACTACA 0 1 165011 CASAVA_Build 3 74089978 1D ATTCCCACGA C/- CCTCATTTCT 3070 het 3070 ref 43 28 14 2 C 3 2 165012 CASAVA_Build 3 74116984 1I TGAGGTAGTT -/A AAAAAAAAAA 2786 het 2786 ref 35 16 11 8 A 13 14 165013 CASAVA_Build 3 74143819 1I CTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2948 het 2948 ref 37 14 11 12 A 13 14 165014 CASAVA_Build 3 74146814 1D CTTACATGCC A/- AAAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 A 7 6 165015 CASAVA_Build 3 74147934 1I TAGAATTCGG -/C TTTGTGCTTC 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 C 0 1 165016 CASAVA_Build 3 74153657 1D GCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 37 0 20 17 T 13 12 165017 CASAVA_Build 3 74156462 1D CATTTATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 15 18 15 A 14 13 165018 CASAVA_Build 3 74156886 1I AAATGTATTT -/C GCTTTATAAA 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 C 0 1 165019 CASAVA_Build 3 74157651 3D TGAAGGAAAT AAC/--- AACAGAAATT 3070 het 3070 ref 46 21 21 7 AAC 2 1 165020 CASAVA_Build 3 74158948 1I CAATAAAGTC -/A AACAACCCCA 3070 het 3070 ref 47 29 17 1 A 2 3 165021 CASAVA_Build 3 74163396 30I TTCTGAGAGT ------------------------------/GTGACATTAGAACCAAGACTCTCCGTATGG GTGACATTAG 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 GTGACATTAGAACCAAGACTCTCCGTATGG 0 1 165022 CASAVA_Build 3 74175855 1D CTTTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 12 11 165023 CASAVA_Build 3 74176946 1I GCCTGGTGAT -/A AAAGTACAGT 3070 hom 92 het 32 0 30 2 A 3 4 165024 CASAVA_Build 3 74177270 1D TGTGTGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 180 hom 34 1 11 22 T 13 12 165025 CASAVA_Build 3 74188860 1I AGAGCTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 T 11 12 165026 CASAVA_Build 3 74196095 1I GTCAAAACCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 19 21 3 T 9 10 165027 CASAVA_Build 3 74196499 1I TGAACTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2662 hom 31 10 15 6 A 13 14 165028 CASAVA_Build 3 74196602 1I AAGAATAATA -/T TTGTTAATGT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 T 2 3 165029 CASAVA_Build 3 74198455 1D TCTGTCTCCC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 A 9 8 165030 CASAVA_Build 3 74205299 1I TCCACCACTT -/C AATCTCAAAA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 C 0 1 165031 CASAVA_Build 3 74218561 3I ATTAAAAAAC ---/AAA AAACCCTATC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 3 6 165032 CASAVA_Build 3 74233480 4D GGCTGATCTC ATAA/---- ATAATTTGGG 3070 hom 114 het 41 0 37 4 ATAA 2 1 165033 CASAVA_Build 3 74246713 1I TGTCATTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 41 1 36 4 A 0 1 165034 CASAVA_Build 3 74257314 1I CTGTTCTGTT -/A ACATATTTTA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 1 2 165035 CASAVA_Build 3 74257910 4D AAGAAAGAAG AAAA/---- AAAAATAAAT 3070 hom 9 het 23 1 18 7 A 9 5 165036 CASAVA_Build 3 74269429 1D TGCTTTGGTG A/- AAAAAAAAAA 1800 het 1800 ref 36 25 4 7 A 12 11 165037 CASAVA_Build 3 74274139 1I AAACCAAAAC -/A AAATCCATAG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 3 4 165038 CASAVA_Build 3 74277663 1D TTCGGCTCTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 8 165039 CASAVA_Build 3 74287779 2D GGAAATTATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 A 14 12 165040 CASAVA_Build 3 74288804 1D AACAACACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 13 12 165041 CASAVA_Build 3 74288955 2I CCCTCCCCCT --/CC CCCCACCCCA 2617 hom 11 het 9 0 6 3 C 4 6 165042 CASAVA_Build 3 74307908 10I GTATTGATTA ----------/CATTCTCTTT CATTCTCTTT 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 CATTCTCTTT 1 2 165043 CASAVA_Build 3 74316022 3I CTCTAGTGTT ---/AAG GAGGGGTATC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 AAG 0 1 165044 CASAVA_Build 3 74331063 1D GCTTAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 46 0 35 11 A 11 10 165045 CASAVA_Build 3 74343709 1I ATATAACGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2580 hom 29 8 11 10 T 15 16 165046 CASAVA_Build 3 74347648 1D GAAAAAATGG A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 6 165047 CASAVA_Build 3 74350547 1I GGCTAATTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 8 9 165048 CASAVA_Build 3 74393064 1I15M1D CTTGCCCCCC -CCCCCCATTAATGAGA/TCCCCCCATTAATGAG- ATTATTGTGA 3070 hom 10 het 17 0 11 8 N/A 0 0 165049 CASAVA_Build 3 74423942 4I CTAGGAAGGG ----/AAGT AAGTGTCTTG 3070 hom 123 het 50 0 42 8 AAGT 1 2 165050 CASAVA_Build 3 74424866 4I CTTCATACTC ----/TCTT TCTCTTCCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TCTT 0 1 165051 CASAVA_Build 3 74429226 1I TGCCCAGAAG -/A AAAAAAAAAA 2720 het 88 hom 41 2 18 21 A 10 11 165052 CASAVA_Build 3 74456961 1D TGTCTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 451 het 451 ref 38 32 2 4 A 12 11 165053 CASAVA_Build 3 74470337 2I ACACACGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 93 het 40 0 29 11 GT 6 7 165054 CASAVA_Build 3 74476404 1D GTTCACGCCA T/- TCTCCTGCCT 2480 hom 21 het 8 0 7 2 T 2 1 165055 CASAVA_Build 3 74517288 1D CACAAAAGTG T/- TTTGACTATT 3070 hom 129 het 57 0 44 13 T 4 3 165056 CASAVA_Build 3 74527578 1I TGTGCTTTGC -/T TTATTGTGCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 2 3 165057 CASAVA_Build 3 74528424 3I CATCTCTACT ---/AAA AAAAATACAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 5 8 165058 CASAVA_Build 3 74529350 10D CAACTGGTGT TCTCTCTCTC/---------- TCTCTCTCTC 1351 het 653 hom 35 9 4 23 TC 13 8 165059 CASAVA_Build 3 74533011 2D ATGAAAATGT CC/-- CCAAAAAAGG 3070 hom 111 het 44 0 37 8 C 4 2 165060 CASAVA_Build 3 74538608 2I CACATATATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 CA 5 6 165061 CASAVA_Build 3 74541311 1D CCATGAATCA T/- TTCTTTGCTC 3070 het 3006 hom 33 8 20 6 T 3 2 165062 CASAVA_Build 3 74543057 1I TAAAATAGGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 9 10 165063 CASAVA_Build 3 74551240 1I TTGGGTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 52 24 22 6 A 9 10 165064 CASAVA_Build 3 74556248 2I ATATATATAT --/AC ATATAAAATA 3069 het 2467 hom 21 8 9 4 AC 0 1 165065 CASAVA_Build 3 74560301 2I CTAGGTTAAC --/AT GTGTGTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 AT 0 1 165066 CASAVA_Build 3 74561282 1D GGAAGGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 11 10 165067 CASAVA_Build 3 74563905 1I AAACGTCTTT -/A AATGTTTAAT 3070 het 3070 hom 53 24 22 7 A 2 3 165068 CASAVA_Build 3 74571251 1D AGGAGGCTGA G/- GCAGGAGAGT 3070 het 3070 ref 23 10 10 4 G 2 1 165069 CASAVA_Build 3 74572325 1I AGCAAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 10 10 A 14 15 165070 CASAVA_Build 3 74581246 1I CTGCTGAATC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 8 9 165071 CASAVA_Build 3 74592614 32D TCTTATTTTC ATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------- ATATATATAT 3070 het 650 hom 14 2 14 4 AT 23 7 165072 CASAVA_Build 3 74630926 1I TTCCTTATAC -/T TTTGCATGAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 3 4 165073 CASAVA_Build 3 74633633 1I TTGCCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 37 1 29 7 A 11 12 165074 CASAVA_Build 3 74638879 2I TCATATCAAA --/CT CTAGTTCAAG 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 CT 1 2 165075 CASAVA_Build 3 74640493 1I GACTGTTAAC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 6 7 165076 CASAVA_Build 3 74642105 1D ATATATTATA T/- AAAAATATGA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 1 0 165077 CASAVA_Build 3 74644756 1I TATCGCTTGC -/A AAGTGTGCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 3 165078 CASAVA_Build 3 74644906 6I TAGGAGCTCT ------/GCTTCA AAAGCTTAAG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 GCTTCA 0 1 165079 CASAVA_Build 3 74658060 1I AATCTTCACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 404 hom 29 1 24 4 A 9 10 165080 CASAVA_Build 3 74673247 4D ACCACATAGC AGAA/---- AGAATCAATG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AGAA 2 1 165081 CASAVA_Build 3 74674665 1D TTTATAATGT A/- AAAAAATTAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 6 165082 CASAVA_Build 3 74684639 4I GGTTTTATAA ----/CTGT CTGACAGTTC 3070 hom 85 het 33 0 29 4 CTGT 0 1 165083 CASAVA_Build 3 74691459 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 33 1 22 10 A 11 10 165084 CASAVA_Build 3 74702339 1I TAAATGCGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 37 0 23 14 A 9 10 165085 CASAVA_Build 3 74703921 1I AAGAAAATAC -/T TTTATCATTT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 3 4 165086 CASAVA_Build 3 74711206 1D CACCCCCCTC A/- AAAAAAAAAA 1255 het 1255 ref 44 32 3 9 A 13 12 165087 CASAVA_Build 3 74714246 2D GACTCCGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2116 het 1764 hom 18 9 6 4 A 13 11 165088 CASAVA_Build 3 74722323 22D AGACAGGGAC GCAGTGCTCAGAGCAACTCTGG/---------------------- GCAGTGCTCA 3070 het 3070 ref 31 13 15 7 GCAGTGCTCAGAGCAACTCTGG 1 0 165089 CASAVA_Build 3 74742178 1I AACAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2117 hom 24 6 11 7 A 10 11 165090 CASAVA_Build 3 74768210 1I GAGATTGAAG -/A GAAGGCATTC 3070 het 3070 ref 54 26 19 9 A 0 1 165091 CASAVA_Build 3 74804533 5I CACCAAAAGT -----/GATAC GATACCCATG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 GATAC 1 2 165092 CASAVA_Build 3 74819693 1D CCATTCTAAC T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 T 8 7 165093 CASAVA_Build 3 74832588 1I AGAATACCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 10 11 165094 CASAVA_Build 3 74833386 1D GCACTAGCTC A/- TTTTGTCATT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 A 1 0 165095 CASAVA_Build 3 74835870 1I CTTTACTGTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 A 7 8 165096 CASAVA_Build 3 74857916 4D TCCTTCATAT ATAA/---- ATATTTATTT 3070 het 3070 ref 42 17 20 5 ATAA 1 0 165097 CASAVA_Build 3 74858970 1D ATGATTTAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 10 9 165098 CASAVA_Build 3 74861701 1I ACTTCGCTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 9 10 165099 CASAVA_Build 3 74872562 75D TTTATACCAG TAGAATGCTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGA/--------------------------------------------------------------------------- TAGAATGCTA 2423 het 2423 ref 25 19 9 9 TAGAATGCTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGA 1 0 165100 CASAVA_Build 3 74875723 16I TTCTAGCCAT ----------------/ATGGTGCTCTCACAAC ATGGCAACTT 3070 het 3070 hom 46 15 24 8 ATGGTGCTCTCACAAC 0 1 165101 CASAVA_Build 3 74895645 1D ACCATATGGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 A 8 7 165102 CASAVA_Build 3 74905179 2I TGTATGTGAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 89 het 47 0 30 17 AC 7 8 165103 CASAVA_Build 3 74912587 1I AAACACTTGA -/T TTTTGTGGGA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 4 5 165104 CASAVA_Build 3 74932017 4D ACACACACTG GGGC/---- CTGTCATGGG 3070 het 3070 hom 36 15 20 4 GGGC 1 0 165105 CASAVA_Build 3 74932923 1I AAATTCAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 35 0 26 9 T 9 10 165106 CASAVA_Build 3 74940098 4I CCTAGCTCAT ----/GTTC TGGGTTGATG 3070 het 3070 hom 57 26 27 4 GTTC 0 1 165107 CASAVA_Build 3 74946975 7D TTGAATTCCT AGTTTAA/------- AACATATGAT 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 AGTTTAA 1 0 165108 CASAVA_Build 3 74947655 2D AGCCAGAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 A 14 12 165109 CASAVA_Build 3 74961662 1D ACAATTTTTA G/- GTTCTAAAAG 3070 hom 54 het 22 0 19 4 G 2 1 165110 CASAVA_Build 3 74971167 13D TCTAAGAAAG GTTAAGTGTTTTA/------------- TCTAAAGTGA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 GTTAAGTGTTTTA 1 0 165111 CASAVA_Build 3 74971421 1I GGGATTTTTG -/C CATATTGAAC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 1 2 165112 CASAVA_Build 3 74986269 2D ACTCCATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 36 0 26 11 A 16 14 165113 CASAVA_Build 3 74998550 1I AGTGTGGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 178 hom 52 1 42 9 T 9 10 165114 CASAVA_Build 3 75001914 1D CTGCCAATAA C/- CCGCTCCCCC 3070 hom 87 het 32 0 29 4 C 3 2 165115 CASAVA_Build 3 75008185 1I TGGCCTTCTG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 62 het 29 0 20 9 T 7 8 165116 CASAVA_Build 3 75010721 1D GGAGTACTTA C/- ATTTAACAGG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 C 1 0 165117 CASAVA_Build 3 75012149 1D GCTTTAGATT A/- AAAAAAAAAC 1362 het 1362 ref 33 28 3 2 A 10 9 165118 CASAVA_Build 3 75024122 5D TAATAGATTC ATTAA/----- ATTAATCCAA 2113 hom 12 het 5 0 5 1 ATTAA 2 1 165119 CASAVA_Build 3 75030447 1I TTCCTACAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 603 hom 24 3 16 5 A 9 10 165120 CASAVA_Build 3 75030752 1I AAAACTGCGA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 6 7 165121 CASAVA_Build 3 75032934 1D GGATATTATC T/- TAAAGTGCCC 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 2 1 165122 CASAVA_Build 3 75055568 3I AAACATCTAT ---/CTG CTGCTGTTAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CTG 2 3 165123 CASAVA_Build 3 75056191 5D TAGGTTATAT GTAAA/----- GTAATTTCAA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 GTAAA 1 0 165124 CASAVA_Build 3 75060118 1D ATGCAGTCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 9 165125 CASAVA_Build 3 75077318 1I CACAGAGATG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 9 10 165126 CASAVA_Build 3 75080468 1D TATCTTTATA T/- TATATAGGTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 165127 CASAVA_Build 3 75082572 1I AAATGAATTG -/T TTTTTCAGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 5 6 165128 CASAVA_Build 3 75083316 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 41 hom 36 1 29 6 T 9 10 165129 CASAVA_Build 3 75087807 1I TAAAAAAAAA -/T AAAAATAATA 1775 het 603 hom 8 3 5 0 T 0 1 165130 CASAVA_Build 3 75101079 4D GACATCACTC AATT/---- AAGGAGACTG 3070 hom 147 het 54 0 49 11 AATT 1 0 165131 CASAVA_Build 3 75106635 1I AAAATACTGC -/T TTAAATATTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 2 3 165132 CASAVA_Build 3 75124150 1D CCAAAGGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 62 het 37 1 33 4 A 10 9 165133 CASAVA_Build 3 75129565 1D CAAAGTGCTA G/- GATTACAGGC 3070 hom 54 het 19 0 17 2 G 2 1 165134 CASAVA_Build 3 75130578 2I ATATAAGGAG --/TT TTTTTTTACC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 7 9 165135 CASAVA_Build 3 75135401 1I TGTTTCCTGA -/T TTTTTTAATG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 6 7 165136 CASAVA_Build 3 75137638 4D TGGCTAGTGG TCTA/---- TCTATTTTGT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TCTA 2 1 165137 CASAVA_Build 3 75162576 1D CAACCCACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 85 hom 52 1 44 7 T 10 9 165138 CASAVA_Build 3 75170027 1D TTTTTCTTCT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 A 9 8 165139 CASAVA_Build 3 75174277 1D TCTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 18 5 T 13 12 165140 CASAVA_Build 3 75178654 1D ACATCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 25 0 20 6 A 11 10 165141 CASAVA_Build 3 75185774 1D CCCTTGGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 10 9 165142 CASAVA_Build 3 75186565 1I AGCGCCACAC -/A ACACAGGATT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 2 165143 CASAVA_Build 3 75198011 1I TTGCTCTGAT -/C TTGGCTATTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 0 1 165144 CASAVA_Build 3 75210727 3I TGCTGTGATT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 11 14 165145 CASAVA_Build 3 75211443 6D GGGTACATGT GCACAA/------ CGTGCAGGTT 3070 hom 84 het 29 0 27 4 GCACAA 1 0 165146 CASAVA_Build 3 75237057 2D AAATGAACTG TA/-- TATATATATA 1402 het 1402 ref 25 17 3 5 TA 8 7 165147 CASAVA_Build 3 75305154 6D TGCCGGCTGA TTTTGT/------ TTTTGCATTG 3070 hom 93 het 35 0 31 7 TTTTGT 1 0 165148 CASAVA_Build 3 75354036 2D GAAAACACAC AT/-- ATATATGTTT 3070 het 3070 ref 80 49 26 11 AT 4 3 165149 CASAVA_Build 3 75354186 1I TCACATCCTT -/A ACCAGGATAA 3070 het 3070 ref 73 42 22 10 A 1 2 165150 CASAVA_Build 3 75354941 9D ACTCCATCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 2991 het 2991 ref 22 13 10 3 A 22 13 165151 CASAVA_Build 3 75356058 1I AATTCTTCTA -/T TTTATATTAT 3070 het 3070 ref 54 28 24 2 T 3 4 165152 CASAVA_Build 3 75357755 1I AATTCAGAGC -/A CTAATAAACC 3070 het 3070 ref 76 30 36 14 A 0 1 165153 CASAVA_Build 3 75358098 4D ACAATAACAT AGAA/---- AGAAGGTGAA 3070 het 3070 ref 61 30 24 8 AGAA 2 1 165154 CASAVA_Build 3 75358234 3I GTCTACCAAA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 28 10 8 AAC 0 1 165155 CASAVA_Build 3 75381110 1I ATATCAGATG -/A AATAGCAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 3 165156 CASAVA_Build 3 75473865 1I GATAATAGGT -/A AAAAATACTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 5 6 165157 CASAVA_Build 3 75475467 1D AGGCAAGAGG C/- CCCCGGTGGC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 C 5 4 165158 CASAVA_Build 3 75484551 1I GGTTTTTTGG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 6 7 165159 CASAVA_Build 3 75499427 2D GTGTACACTC TG/-- TGATATTATC 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 TG 2 1 165160 CASAVA_Build 3 75512058 2D ACATGCACAG AC/-- ACATACGCAC 3070 hom 144 het 66 0 49 20 AC 2 1 165161 CASAVA_Build 3 75512109 2I87M2I TGCACAGATG --CACACAGAGATACACATGTATGCACATACAGGCACACACATGCAAACATGCACACACAGATGCGCATGTACACACATGTACACACAA--/CACACACAGAGATACACATGTATGCACATACAGGCAAACACATGCAAACATGCACACACAGATGCGCATGTACACACATGTACACACAAAC ACACATGCAC 3070 het 699 hom 81 5 61 76 N/A 0 0 165162 CASAVA_Build 3 75529085 1I AGAATGAAAG -/A AAAATAAATG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 4 5 165163 CASAVA_Build 3 75534229 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1799 hom 13 het 6 0 5 2 A 13 11 165164 CASAVA_Build 3 75569256 4D CTAAAATATT AATA/---- AATCTAGGTT 2829 het 2829 ref 40 29 7 7 AATA 1 0 165165 CASAVA_Build 3 75570348 1D GGCATGGAAG T/- TTCAATCAGT 3070 het 3070 ref 52 39 10 4 T 3 2 165166 CASAVA_Build 3 75601222 3D TTGTTACATC GTT/--- GTTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 GTT 3 2 165167 CASAVA_Build 3 75603986 1D TTCAAGGAAC A/- GAAAGAGGAG 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 1 0 165168 CASAVA_Build 3 75618648 7I ATTGCACTGT -------/GGTCTGA GAGAGAGTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 GGTCTGA 0 1 165169 CASAVA_Build 3 75619596 1I TTCTCTTTAA -/G AATGTTGAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 0 1 165170 CASAVA_Build 3 75636023 4I GCTCTCCTTC ----/TACT TACTTGAGGA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 TACT 1 2 165171 CASAVA_Build 3 75640509 1D AGTAGAGATG T/- GATTTCACTA 1415 het 1415 ref 11 7 3 1 T 1 0 165172 CASAVA_Build 3 75642336 3I5M6I TGAGGTGTCC ---ATTGA------/TCAATGGACTCAAT GTCTCATCCC 2962 het 2962 ref 20 8 10 2 N/A 0 0 165173 CASAVA_Build 3 75643301 7I CTGGTTCTCT -------/TGTTTTC TGTTTTCTGT 3070 hom 12 het 25 1 18 6 TGTTTTC 1 2 165174 CASAVA_Build 3 75646103 1I AGTTCTAGCT -/G GGGCCACCAG 3070 hom 87 het 36 0 28 8 G 3 4 165175 CASAVA_Build 3 75652577 1D ATTCACAGAG C/- CTCAGCAACC 3070 hom 60 het 22 0 21 2 C 2 1 165176 CASAVA_Build 3 75658291 1D TACTACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 18 0 12 6 A 12 11 165177 CASAVA_Build 3 75660373 2D CCCTAAATCA TC/-- TCTCTCAAGT 2548 het 2548 ref 16 10 6 0 TC 4 3 165178 CASAVA_Build 3 75665397 1D GTATATATCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 21 hom 17 1 13 3 A 10 9 165179 CASAVA_Build 3 75668275 2I TATCAAAAAC --/AT GTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 51 37 9 5 AT 0 1 165180 CASAVA_Build 3 75668699 1I ATTGGTTAAC -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 62 het 27 0 21 6 A 7 8 165181 CASAVA_Build 3 75671359 1D CAAAGCTTCA C/- CCCGCCCTCT 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 C 4 3 165182 CASAVA_Build 3 75673117 6D GTGGTTATCA GGGGCT/------ GGGGTGGAGG 1670 het 1670 ref 29 21 6 4 GGGGCT 1 0 165183 CASAVA_Build 3 75673925 3D GCTTTTTTCA TTG/--- TTGTTTCTTG 2711 het 2711 ref 18 10 7 1 TTG 2 1 165184 CASAVA_Build 3 75676856 1D CCCAGTCATC T/- TTTTTTTTGA 2316 het 2316 ref 28 21 6 1 T 9 8 165185 CASAVA_Build 3 75683006 2D ACAAATTATC AA/-- AAGAGTATAA 2597 het 2597 ref 16 10 6 0 A 4 2 165186 CASAVA_Build 3 75685011 1D TAAAACATTT G/- GGGGGAAACT 1867 het 1867 ref 23 13 4 7 G 6 5 165187 CASAVA_Build 3 75685376 1I ATTTATGTTC -/T ACTCAGATTA 1647 het 1647 ref 21 14 4 3 T 0 1 165188 CASAVA_Build 3 75687070 1D AGAGGCAAAT A/- AAAAAATTAA 1858 het 1858 ref 38 19 4 15 A 7 6 165189 CASAVA_Build 3 75689294 4D TTGGTAGAAG TACC/---- TACTGTCAGT 2720 het 2720 ref 23 15 7 2 TACC 1 0 165190 CASAVA_Build 3 75692628 1I CAAAAAGATT -/C TTTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 0 1 165191 CASAVA_Build 3 75692829 4I AGTCAAAGAG ----/CCCA CCCAACTTGA 2449 het 2449 ref 37 26 7 4 CCCA 1 2 165192 CASAVA_Build 3 75694912 1D TGTTTCTTGG T/- TTTTTTACAA 2911 het 2911 ref 25 18 7 0 T 7 6 165193 CASAVA_Build 3 75695652 2D CTTTGCAGAT AC/-- ACAGAGGACA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 AC 2 1 165194 CASAVA_Build 3 75697538 1D GAAGAAGATC A/- GAGGGGCATG 3070 het 3070 ref 39 23 8 9 A 1 0 165195 CASAVA_Build 3 75700478 11D GAGAAAACTG AGGCCTGAAGA/----------- AGGCAAACAC 2998 het 2998 ref 15 8 8 1 AGGCCTGAAGA 1 0 165196 CASAVA_Build 3 75704164 1I AGGATCAGCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 T 8 9 165197 CASAVA_Build 3 75705234 1D AGATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 A 11 10 165198 CASAVA_Build 3 75705447 1D AGAGAGTAGA T/- TTTTTAAGTG 2744 het 2744 ref 42 33 6 3 T 6 5 165199 CASAVA_Build 3 75721719 3I8M14D4M12D ACCTCCTAAA ---AAAAATAATCCACATTCGTTTTAACCACATGTGGCACA/TTTAAAAATAA--------------AAAC------------ TTTGCAAAAA 1969 het 1969 ref 16 7 6 6 N/A 0 0 165200 CASAVA_Build 3 75722021 2D AACAAAACTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 16 het 22 1 18 3 TA 6 5 165201 CASAVA_Build 3 75722684 1D AACTAAATTG T/- ACTGTAACAC 3070 hom 75 het 27 0 25 3 T 1 0 165202 CASAVA_Build 3 75725851 3I ATCATCATGC ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 49 het 22 0 14 8 AAG 3 4 165203 CASAVA_Build 3 75727185 3I CCACTCCTGG ---/CTT CTAATTCTTT 3070 hom 59 het 24 0 19 5 CTT 0 1 165204 CASAVA_Build 3 75729586 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 17 0 9 9 A 13 12 165205 CASAVA_Build 3 75731610 2I TGACAATTCC --/AA AAAAATATCA 1836 het 1836 ref 37 28 4 5 A 5 7 165206 CASAVA_Build 3 75731716 2D CCAAAACGTC AT/-- ATATAACAAA 1304 het 1304 ref 44 36 3 9 AT 3 2 165207 CASAVA_Build 3 75742145 1I GGATATTAGG -/A AAAAATATCC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 5 6 165208 CASAVA_Build 3 75745567 1D TGTACACCCA C/- CCTGTGATAT 3070 het 3070 ref 22 14 7 1 C 3 2 165209 CASAVA_Build 3 75752040 5D ATAACCCGCA GTCAG/----- GAATGATTTT 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 GTCAG 1 0 165210 CASAVA_Build 3 75756314 2D ATAAAACAAC TA/-- TATCTTCAAA 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 TA 2 1 165211 CASAVA_Build 3 75759455 1I GGGATATTTT -/G GGGGCCTCAA 1314 het 1314 ref 47 32 8 7 G 4 5 165212 CASAVA_Build 3 75764256 2D CCTCACAGGG TA/-- TTGGTGAGGA 3070 het 3070 ref 81 47 9 26 TA 1 0 165213 CASAVA_Build 3 75764578 3D ACAGCATTTT AAG/--- AAGGTCTTAA 3070 het 3070 ref 89 54 22 16 AAG 2 1 165214 CASAVA_Build 3 75765053 1I GTTTGAAAAA -/C CCATCCCAAC 3070 het 3070 ref 57 30 18 9 C 2 3 165215 CASAVA_Build 3 75765855 1I TAGAGATGCA -/G AAGTGGTTGT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 G 0 1 165216 CASAVA_Build 3 75767167 1D AGCCAATTGG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 94 67 11 18 A 8 7 165217 CASAVA_Build 3 75769516 2I AATTTTTGCA --/AT ATCTATCCAT 1713 het 1713 ref 50 44 4 2 AT 1 2 165218 CASAVA_Build 3 75769996 1I AACAAATATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 56 27 16 13 A 8 9 165219 CASAVA_Build 3 75771722 2D GATTTGGCAG TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 83 36 14 36 T 10 8 165220 CASAVA_Build 3 75772708 1I TAAAAAATAA -/T TTTTAAATAA 3070 het 3070 ref 95 30 26 39 T 4 5 165221 CASAVA_Build 3 75773474 1I CGACTCTTTG -/C CAAGGAGAGT 3070 het 3070 ref 97 59 23 15 C 1 2 165222 CASAVA_Build 3 75775531 1I ATGTTCTGTC -/G ATTGCAGGAT 2605 het 2605 ref 98 74 9 17 G 0 1 165223 CASAVA_Build 3 75776054 2D CTTATGCTCC TT/-- TCCATCGGCC 1971 het 1971 ref 65 55 5 13 T 3 1 165224 CASAVA_Build 3 75776947 1D CTGGTTCCAC G/- AATTACATGG 3070 het 3070 ref 81 38 28 16 G 1 0 165225 CASAVA_Build 3 75778016 12D GAGCGCCAGT CCCCTGGGCTCA/------------ CTTTTCTTTC 1601 het 1601 ref 101 89 4 11 CCCCTGGGCTCA 1 0 165226 CASAVA_Build 3 75778499 1I AGGAGGCTGA -/G GCACGAGAAT 3070 het 3070 ref 71 34 35 4 G 1 2 165227 CASAVA_Build 3 75782752 2I TTTCACATGA --/GT GAGAGCAAGT 3070 het 3070 hom 98 38 52 8 GT 0 1 165228 CASAVA_Build 3 75782980 1D AGTACAATCA T/- TTCCCATTTC 3070 het 3070 ref 85 48 28 9 T 3 2 165229 CASAVA_Build 3 75783271 4I ACTGATTCTT ----/TGAC TGTCGCCTTC 3070 het 3070 ref 58 31 21 6 TGAC 0 1 165230 CASAVA_Build 3 75786523 1D CTATTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3047 het 3047 ref 69 37 13 19 T 11 10 165231 CASAVA_Build 3 75786622 1D CTTTTCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 12 11 30 T 15 14 165232 CASAVA_Build 3 75786668 1I CTTTTCTGAA -/T TTTTTTATTT 1509 het 1509 ref 58 28 7 24 T 6 7 165233 CASAVA_Build 3 75786931 2I GGACGTATCT --/TG TGCTGCTAAT 3070 het 3070 ref 76 41 31 7 TG 1 2 165234 CASAVA_Build 3 75787840 1D GTTACTCTTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 98 49 35 14 T 8 7 165235 CASAVA_Build 3 75787993 2I AATACGTTTC --/TG TGTGTGTGGT 3070 het 3070 ref 94 41 47 6 TG 4 5 165236 CASAVA_Build 3 75788323 4D TGTTGTAGAT GAAA/---- GAGTTTCATT 2679 het 2679 ref 40 31 6 4 GAAA 1 0 165237 CASAVA_Build 3 75788555 1I12M3D1M2I GTTCTCTTTT -TCTACACCCTAACACT--/CTCTGCACCCTAA---TGA TTTTATCTTT 3070 het 3070 ref 49 30 9 16 N/A 0 0 165238 CASAVA_Build 3 75788585 4D ATCTTTTGAC TGTT/---- TGATAATAGG 3070 het 3070 ref 47 24 15 10 TGTT 1 0 165239 CASAVA_Build 3 75788884 4D TTATATTTTG CTGA/---- TTGTTTCCTT 3070 het 3070 ref 66 45 10 14 CTGA 1 0 165240 CASAVA_Build 3 75789007 3D ACCAGTGTCA AGG/--- AGGTTCCCCC 3070 het 3070 hom 78 26 29 27 AGG 2 1 165241 CASAVA_Build 3 75789022 1D GTTCCCCCCC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 73 36 12 26 T 9 8 165242 CASAVA_Build 3 75789789 7D82M8D TGAATTCTGG TTAAACTTTAAATTGATAGTTGCTATTATCATTTCAAAATTATTTAAAATATGACCAGATGGATTCCTGCTTTCATGAATTCAATGGAATTCAAATC/-------TTAAATTGATAGTTGCTATTATCATTTCAAAATTATTTAAAATATGACCAGATGGATTCCTACTTTCATGAATTCAATGGAA-------- TTCCCATTTA 3070 het 3070 ref 65 67 9 14 N/A 0 0 165243 CASAVA_Build 3 75791466 1D TTTTCCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1715 het 1715 ref 26 16 4 6 T 12 11 165244 CASAVA_Build 3 75792021 1D AAAAATACAG A/- ATTAGATTTT 3070 het 3070 hom 63 25 34 7 A 2 1 165245 CASAVA_Build 3 75792153 1D GTATAGCACA T/- TTTCTTTATT 3070 het 3070 ref 75 55 12 9 T 4 3 165246 CASAVA_Build 3 75792572 2D CATCAGTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 26 8 25 T 12 10 165247 CASAVA_Build 3 75793234 2D GTGAATTTTA GT/-- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 83 18 28 37 GT 2 1 165248 CASAVA_Build 3 75793651 1I GTATATATGA -/T TATTATATAA 3070 het 3070 ref 98 66 18 15 T 1 2 165249 CASAVA_Build 3 75794434 5D GATTAAAGGA CAAAT/----- CAAAACACAT 3070 het 3070 ref 48 35 11 6 CAAAT 1 0 165250 CASAVA_Build 3 75794684 1I AGCAGACCCC -/T CTTCACACCT 3070 het 3070 ref 66 28 33 5 T 0 1 165251 CASAVA_Build 3 75794832 10I TTTTATATAT ----------/TATATCATAA CATATCAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 11 8 TATATCATAA 0 1 165252 CASAVA_Build 3 75795564 18I TTTCCACCTA ------------------/GACTTTTTGCTACCTCAG GAATCAGGGG 3070 het 3070 ref 56 22 19 17 GACTTTTTGCTACCTCAG 0 1 165253 CASAVA_Build 3 75795681 1I TTGGTATTTA -/T TTTTTTCTCT 1177 het 1177 ref 37 26 3 8 T 6 7 165254 CASAVA_Build 3 75795775 3D TTAAGAAATT ATA/--- ATATCTATGC 3070 het 3070 ref 55 41 11 3 ATA 2 1 165255 CASAVA_Build 3 75796349 2D TCAAAGGAAA AG/-- GCAAGACCGC 3070 het 3070 ref 104 79 13 15 AG 1 0 165256 CASAVA_Build 3 75797087 1I GGTGGTGGTT -/G TTTTTGTTTT 1940 het 1940 ref 56 42 6 8 G 0 1 165257 CASAVA_Build 3 75798230 1D TTATATGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 27 11 16 T 11 10 165258 CASAVA_Build 3 75798386 1I ATGCCTGGCT -/G AATGTTTTTT 1898 het 1898 ref 37 26 5 7 G 0 1 165259 CASAVA_Build 3 75798548 6I AGGTTGTAGG ------/CTCTCA CTCTTCCAGC 3070 het 3070 ref 66 36 25 5 CTCTCA 0 1 165260 CASAVA_Build 3 75798726 4D ATGATTGTAC TTAT/---- TTATTCATCT 3070 het 3070 ref 104 73 26 9 TTAT 2 1 165261 CASAVA_Build 3 75798915 4D GATCATACAA TCTT/---- TCATTATCTA 3070 het 3070 ref 96 66 21 15 TCTT 1 0 165262 CASAVA_Build 3 75799297 1I TTATGCTTAC -/A ACTATGCTGT 3070 het 3070 ref 100 74 10 16 A 1 2 165263 CASAVA_Build 3 75799373 3D ATGTCTAAAT AAC/--- AATATACATA 3070 het 3070 ref 96 50 28 20 AAC 1 0 165264 CASAVA_Build 3 75799558 1I AAAGTAGGGA -/G GGGGGAGGAA 1224 het 458 hom 36 3 6 29 G 5 6 165265 CASAVA_Build 3 75799979 23D4M2D ACACTCAGAC CGAGTGAACCATGATTCTGGGTTCCACGT/-----------------------CCAC-- TCCTTTGCCC 3070 het 3070 ref 101 74 20 33 N/A 0 0 165266 CASAVA_Build 3 75802278 1D37M1D AGGCAACAGC TTAGGTTTTCTAACCAGCCCAGGCGGAGCTCGCATCCCT/-CAAGTTTTCTAACCAGCCCAGGCGGAGCTCTCATCCC- TTTCCCCCCG 3070 het 3070 ref 101 98 14 43 N/A 0 0 165267 CASAVA_Build 3 75803363 1D GGGACGTTTC T/- TTTTCTCTGT 3070 het 3070 hom 80 26 39 17 T 5 4 165268 CASAVA_Build 3 75804566 1I GGCTTCCCCG -/A GCTCCCGAGC 833 het 833 ref 49 24 5 20 A 0 1 165269 CASAVA_Build 3 75804811 2I GCAGTGAGGA --/TT TTTTTTTACC 2756 het 2756 ref 57 13 8 36 T 7 9 165270 CASAVA_Build 3 75804849 21I GCTCATTAAT ---------------------/GTCCTTTTCTTCCTGATTGAA GTACTCTCTT 3070 hom 47 het 31 0 16 18 GTCCTTTTCTTCCTGATTGAA 0 1 165271 CASAVA_Build 3 75804930 3I AAGTCAGTAT ---/TTC TTCTTTTTAT 3070 het 3070 ref 81 46 22 14 TTC 1 2 165272 CASAVA_Build 3 75805347 1D TGTGAGGCTA T/- TTTTCTAGAT 3070 het 3070 ref 95 56 28 13 T 5 4 165273 CASAVA_Build 3 75805388 5D TTTTTATTCT TTTTC/----- TTTTGTCTCT 1407 het 1407 ref 91 49 4 42 TTTTC 1 0 165274 CASAVA_Build 3 75805732 3D TGAGGTCATG TTT/--- TTTTCCTGGA 3070 het 3070 hom 74 24 48 6 T 7 4 165275 CASAVA_Build 3 75805821 1D TGAGAGGTTT A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 102 70 13 19 A 6 5 165276 CASAVA_Build 3 75807152 1D GAAAGACAAA G/- TACTCCCTAT 3070 het 3070 ref 68 44 11 14 G 1 0 165277 CASAVA_Build 3 75807590 1D AATTGCTGTG T/- TCTCTCTCCC 3070 het 3070 ref 89 67 13 11 T 2 1 165278 CASAVA_Build 3 75807808 1I TGTCCTTGCA -/G GAGGGACAAT 3070 het 3070 ref 96 46 44 6 G 1 2 165279 CASAVA_Build 3 75808309 1I GCAAGCTTGT -/A AAAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 49 34 11 4 A 3 4 165280 CASAVA_Build 3 75808401 1D GAAAATTTTA T/- TTATTTATAG 3070 het 3070 hom 57 19 32 9 T 3 2 165281 CASAVA_Build 3 75808562 1D TTTTATCTAG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 45 11 13 21 T 8 7 165282 CASAVA_Build 3 75808607 9D ACTTCAAACC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAT 3070 het 1725 hom 42 8 16 23 A 18 9 165283 CASAVA_Build 3 75808943 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 48 25 7 16 A 6 7 165284 CASAVA_Build 3 75808983 2I TTATACACTC --/TG TATGCAGAAT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 TG 0 1 165285 CASAVA_Build 3 75809218 1D ACTAAACTAA T/- TTTTAATGGT 3070 het 3070 ref 50 25 11 14 T 5 4 165286 CASAVA_Build 3 75809276 4D TATTTTATGG CTAT/---- CTATTACTTA 3070 het 3070 hom 59 13 38 9 CTAT 2 1 165287 CASAVA_Build 3 75809545 1I AAGGGGCCGA -/T TTGGGCTTGA 3070 het 3070 ref 88 67 17 5 T 2 3 165288 CASAVA_Build 3 75809751 2D AGAACAAGCT TA/-- TTTACAAAAT 3070 het 3070 ref 61 36 17 11 TA 1 0 165289 CASAVA_Build 3 75809994 1D CTCCCACCTT C/- CCCCCCTCAA 3070 het 3070 hom 81 35 41 6 C 7 6 165290 CASAVA_Build 3 75811117 4D ATAATGCTGC AATA/---- AACATTTACG 3070 het 3070 ref 88 69 14 8 AATA 1 0 165291 CASAVA_Build 3 75811952 1I GTATAATGAC -/G TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 65 27 33 7 G 0 1 165292 CASAVA_Build 3 75812124 4D TCAACATCTA TTTT/---- TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 64 46 15 6 T 10 6 165293 CASAVA_Build 3 75812342 1D TCACAGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 63 17 30 17 A 11 10 165294 CASAVA_Build 3 75812372 1D TCATATGGAA C/- CAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 61 20 12 29 C 2 1 165295 CASAVA_Build 3 75817404 1D GGAAACAGAG T/- TTTTTAAATC 3070 het 3070 ref 90 46 24 20 T 6 5 165296 CASAVA_Build 3 75819124 1D CGGTATAAAA C/- CAAAACCAAC 1222 het 1222 ref 89 73 5 11 C 2 1 165297 CASAVA_Build 3 75820829 1I TTCTGAAAAC -/A AAATACAGCT 3070 het 3070 ref 95 40 46 9 A 3 4 165298 CASAVA_Build 3 75821855 1D TATAATTCCC T/- TCTTGTAACA 1167 het 1167 ref 93 87 3 3 T 2 1 165299 CASAVA_Build 3 75822250 3D GAGATAGAGA AGG/--- AGGGGAAACA 2284 het 2284 ref 82 37 9 39 AGG 2 1 165300 CASAVA_Build 3 75823917 1I TGGAGGGAGC -/A GTTGTATTGG 3070 het 3070 hom 103 48 45 10 A 0 1 165301 CASAVA_Build 3 75824181 1D TCCTCCCCCA C/- CCCCCACCCA 1071 het 1071 ref 73 46 8 22 C 6 5 165302 CASAVA_Build 3 75824231 15D TGAATTTGGG AGACGGAGAGCACAA/--------------- GGACTGGAGG 2187 het 2187 ref 69 49 8 27 AGACGGAGAGCACAA 1 0 165303 CASAVA_Build 3 75824307 1D GGCAGAATTC A/- TCACTTGCTG 3070 het 3070 ref 102 76 10 16 A 1 0 165304 CASAVA_Build 3 75824384 2I GGGCATTGGG --/CT CTGAGAAGTG 3070 het 3070 hom 94 30 50 18 CT 1 2 165305 CASAVA_Build 3 75825913 10I TAAACAATTC ----------/AACATTTGAT CTCAACATTT 3070 het 3070 ref 89 56 13 20 AACATTTGAT 0 1 165306 CASAVA_Build 3 75827112 3I AGAGATCAAT ---/TCA TCAAGAGGAT 3070 het 3070 ref 81 42 17 22 TCA 1 2 165307 CASAVA_Build 3 75827409 4I AAGGATAGAC ----/TATA CATATGTTAA 3070 het 3070 ref 103 71 21 11 TA 0 2 165308 CASAVA_Build 3 75827631 2I TAATGGAAAC --/AT AGCATAGCAA 3070 het 3070 hom 104 28 67 9 AT 0 1 165309 CASAVA_Build 3 75827864 1D GACTAATAAA C/- AAAAAGTTGA 3070 het 3070 ref 87 45 12 33 C 1 0 165310 CASAVA_Build 3 75827899 1D AAACAATTGA C/- CAATATTTAG 3070 het 3070 ref 102 57 18 28 C 2 1 165311 CASAVA_Build 3 75831072 1I TTTGTCTTAG -/A ATGAGACTTT 3070 het 3070 ref 84 61 17 7 A 1 2 165312 CASAVA_Build 3 75832230 3D TGAGACACCA TCG/--- AAAAAAAAAA 37 het 37 ref 49 10 2 38 TCG 1 0 165313 CASAVA_Build 3 75833375 23D CCAGGCATGG GGGCAAAATTTAGCTGGGTGTGC/----------------------- GGGCAGGTGC 1638 het 1638 ref 15 12 4 2 GGGCAAAATTTAGCTGGGTGTGC 1 0 165314 CASAVA_Build 3 75833632 1D ATATAGAAAA T/- ATATAATAAT 3070 het 3070 ref 55 31 10 18 T 1 0 165315 CASAVA_Build 3 75834282 1I TCATAGAGAT -/A GGAGAGTATA 3070 het 3070 ref 76 50 15 16 A 0 1 165316 CASAVA_Build 3 75834512 2I GGATACACCA --/AT TTTTTTATTA 2741 het 2741 ref 73 27 8 38 AT 0 1 165317 CASAVA_Build 3 75835021 1D TTAAGCCCAT G/- AATCTGTTGA 3070 het 3070 hom 100 40 49 13 G 1 0 165318 CASAVA_Build 3 75835110 25D GGTGGCTGAT GCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAG/------------------------- GCCAAGGTGG 2018 het 2018 ref 75 59 5 20 GCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAG 1 0 165319 CASAVA_Build 3 75835481 5I TATCATTTTG -----/TTTAC TTTATATCCA 3070 het 3070 hom 51 17 27 7 TTTAC 0 1 165320 CASAVA_Build 3 75836237 11D CAAGGAAAAC AATCCACACAG/----------- AATCAATCAG 996 het 996 ref 49 37 7 13 AATCCACACAG 1 0 165321 CASAVA_Build 3 75837589 3D CAGATGATAA TAG/--- GGACACTGTA 3070 het 3070 ref 71 42 15 19 TAG 1 0 165322 CASAVA_Build 3 75841651 5I CTTTCACGTT -----/TCCCC TCCCTTTTGT 3070 het 3070 ref 88 35 43 11 TCCCC 0 1 165323 CASAVA_Build 3 75842786 1D AAAACCTCTT G/- AGGCCAAAGC 3070 het 3070 hom 85 30 48 42 G 1 0 165324 CASAVA_Build 3 75842881 1D ACTGTCAGGC T/- GGAAGCACTG 3070 het 3070 ref 69 29 31 13 T 1 0 165325 CASAVA_Build 3 75843244 5D ATTTCATGTA ATTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 81 34 34 20 ATTGT 1 0 165326 CASAVA_Build 3 75843936 1I26M4D26M4D GGAACCACAG -AAAAAAAGTTACAAGAGTTGACAAAAGGTTGAAGGAAAGTTATCACCTCAGCCAAGCACA/AAAAAAAAGGTACAAGAGTTGACAAAA----AAAGAAAAGTTATCACCTCAGCCAAG---- ATGTTATGCC 3070 het 3070 ref 100 94 30 44 N/A 0 0 165327 CASAVA_Build 3 75844227 1D GGGGACCACA G/- TTTTTCAGGT 3056 het 3056 ref 65 49 7 9 G 1 0 165328 CASAVA_Build 3 75844286 40D AGAAAGACTT TTCTAATTTTATTTAGAAAACTAATAAATTAATTTTCAGA/---------------------------------------- AGAATTTAAT 3070 het 3070 ref 44 40 21 7 TTCTAATTTTATTTAGAAAACTAATAAATTAATTTTCAGA 1 0 165329 CASAVA_Build 3 75844634 2D ACTGTTTTTT TG/-- CTGAATCAAT 3070 het 3070 ref 93 41 49 3 TG 1 0 165330 CASAVA_Build 3 75844798 4D AATTATATAT ATTA/---- GTTAGGCTAG 3070 het 3070 ref 40 30 7 9 ATTA 1 0 165331 CASAVA_Build 3 75846389 3I AGTATAGCTA ---/TTC TTATTTTATA 742 het 742 ref 34 22 3 9 TTC 0 1 165332 CASAVA_Build 3 75846448 1D CTCTTGCCTC G/- GCACCTGGGT 3070 het 3070 ref 43 20 22 1 G 2 1 165333 CASAVA_Build 3 75846811 1D CAGATCTTAT G/- GTTCTTTTAT 3070 het 3070 ref 72 39 13 22 G 2 1 165334 CASAVA_Build 3 75846849 1I GAGATAGTAA -/T AATAATCCAC 3070 het 3070 ref 74 32 15 27 T 0 1 165335 CASAVA_Build 3 75846878 9D AAAGACAGTT GAACCCAAA/--------- TTATATTTTT 1519 het 1519 ref 63 44 4 19 GAACCCAAA 1 0 165336 CASAVA_Build 3 75846950 3I GTAATCTAAT ---/AAG AAGTGCTGTG 3070 het 3070 ref 85 57 16 12 AAG 1 2 165337 CASAVA_Build 3 75847020 5I ACTTTTTTCA -----/CCTTT GCTTAAGTTT 3070 het 3070 hom 89 39 44 13 CCTTT 0 1 165338 CASAVA_Build 3 75847477 1D14M3I TTTATATTTC TAAAGATTATCTCAC---/-AAAGATTATCTCACTTG TTGATATCAT 3070 het 3070 ref 61 29 27 20 N/A 0 0 165339 CASAVA_Build 3 75847797 5D5M6D7M1D TGCGATTCTG GTTTTTTTTGGTTTGTTTTTTTGT/-----TTTTG------TTTTTTG- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 26 20 4 N/A 0 0 165340 CASAVA_Build 3 75848509 3D11M17D9M1I TTGGTTTCTG AACAAGAACTCAGTGAAAAAATAAAGTCAGCAAGATTCTT-/---AAGAACTCAGT-----------------AAGATTCTTG GGGGGTGGTA 3070 het 3070 ref 89 54 35 34 N/A 0 0 165341 CASAVA_Build 3 75848996 1I TCTTGAGAGG -/A AAAAATCATG 3070 het 3070 ref 97 52 13 34 A 5 6 165342 CASAVA_Build 3 75849185 2I AAGAAATCTC --/TT TGTGAGCTGC 3070 het 3070 ref 87 39 40 16 T 1 3 165343 CASAVA_Build 3 75850384 3D TGTGATATAC AGT/--- TATATAAGTT 3070 het 3070 ref 90 40 17 37 AGT 1 0 165344 CASAVA_Build 3 75850700 1I GCCACGGGCA -/C ATACCTGTCC 3070 het 3070 ref 80 39 32 11 C 0 1 165345 CASAVA_Build 3 75851133 8D24M4D CTCAAAAAAA AAAAAAAGAATATTAAAACAGATACTGTGGTTTCTA/--------AATATTAAAACAGATACTGTGGTT---- TCTATCTTTT 3070 het 3070 hom 93 49 64 31 N/A 0 0 165346 CASAVA_Build 3 75851501 1I AAAATTCTAC -/T TTTAGAAAAC 3070 het 3070 hom 63 22 31 10 T 3 4 165347 CASAVA_Build 3 75852324 1I TAGGGACTTC -/A AAGGAGGGAG 3070 het 3070 ref 89 44 36 22 A 2 3 165348 CASAVA_Build 3 75852477 1I AATCTGAAAT -/A AATAAACAAA 3070 het 3070 ref 90 49 35 14 A 2 3 165349 CASAVA_Build 3 75852594 11D GAAGCCGAGG CAGGAGGATCA/----------- CTTGAGGCCA 3070 het 3070 ref 68 39 21 18 CAGGAGGATCA 1 0 165350 CASAVA_Build 3 75853626 10D ATAAGGTCTC TATTTTAATT/---------- TATGAGTTTT 3070 het 3070 hom 75 29 39 16 TATTTTAATT 1 0 165351 CASAVA_Build 3 75853693 2D AAGTTAAAAG GA/-- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 68 16 32 21 GA 1 0 165352 CASAVA_Build 3 75854100 1I ATTCCACTTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 47 15 28 4 A 8 9 165353 CASAVA_Build 3 75854642 3I GAAACTCCAT ---/CCG CTCAAAAAAA 1581 het 1395 hom 36 8 6 22 CCG 0 1 165354 CASAVA_Build 3 75854972 2I AAAAACCCGT --/AA GTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 58 34 16 8 A 0 2 165355 CASAVA_Build 3 75856960 1I CATTTTCCAT -/C GTTTCCATCA 3070 het 3070 ref 78 50 16 12 C 0 1 165356 CASAVA_Build 3 75857534 2D GGCAGCAGAC AA/-- GAGAGAGCAT 3070 het 3070 ref 94 54 26 21 A 2 0 165357 CASAVA_Build 3 75858719 1I AAAATGGTAT -/A TTTGCATATA 2644 het 2644 ref 80 32 12 36 A 0 1 165358 CASAVA_Build 3 75858772 1D CCTCATAATG A/- ACATTTTAAT 3070 het 3070 ref 78 34 36 8 A 2 1 165359 CASAVA_Build 3 75859073 2D TGTTTGTAAA AC/-- ATGTGTGTTC 1889 het 1889 ref 44 34 5 5 AC 1 0 165360 CASAVA_Build 3 75859497 1D GTCAGACTGG T/- TCTCTGCTCT 2743 het 2743 ref 45 32 7 8 T 2 1 165361 CASAVA_Build 3 75859850 1D GGGGCTGGTT C/- CCCCAATAAA 3070 het 3070 ref 62 45 8 13 C 5 4 165362 CASAVA_Build 3 75860241 1I CAAATTTAAA -/G GGGGAAAGGG 3070 het 3070 ref 99 75 16 11 G 4 5 165363 CASAVA_Build 3 75860486 7D GACATTTCAC TCATTGT/------- CTGCTTGCAC 3070 het 3070 ref 71 48 21 8 TCATTGT 1 0 165364 CASAVA_Build 3 75860971 1D ACAGGGAGGG T/- GAACAATCAG 3070 het 3070 ref 69 44 12 14 T 1 0 165365 CASAVA_Build 3 75861457 5D ACTCCATATC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 2778 hom 28 11 13 10 A 22 17 165366 CASAVA_Build 3 75861576 1D AAAAATATGA T/- GGAGGGGGCT 3070 het 3070 ref 69 36 20 13 T 1 0 165367 CASAVA_Build 3 75863603 1D51M1D AAAAAAATTT AAATAAAACAAAAGCTGAAGAGACTGAAAAATCAACAATCCTTTTTGGATTTG/-AATGAAACAAAAGCTGAAGAGACTGAAAAATCAACAATTCTTTTTGGATTT- AATGTGAAGA 3070 het 3070 ref 50 65 14 32 N/A 0 0 165368 CASAVA_Build 3 75863903 1D AAATTTACCT C/- CTGGAGCTCC 3070 het 3070 ref 99 61 20 19 C 2 1 165369 CASAVA_Build 3 75864776 1D CAGGGATTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 92 38 33 22 A 9 8 165370 CASAVA_Build 3 75865183 2D ACCAAAGATC CA/-- AGAAGCTCAG 3070 het 3070 ref 85 63 17 10 CA 1 0 165371 CASAVA_Build 3 75865455 1D CCATCTCCAC G/- AAAAAATACA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 1 0 165372 CASAVA_Build 3 75865864 2D ATTATCTAGA GG/-- AAAAAAAAAG 912 het 912 ref 30 22 4 4 G 2 0 165373 CASAVA_Build 3 75867488 16D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAGCAAC/---------------- GAGAGGAAAC 2440 het 2440 ref 47 38 10 15 AAAAAAAAAAAGCAAC 1 0 165374 CASAVA_Build 3 75867667 1I AATGCACCCA -/T GAAAAGACAA 3070 het 3070 hom 66 22 31 13 T 0 1 165375 CASAVA_Build 3 75867716 3I ATCTCACTTT ---/ATC GAGCTTCACT 3070 het 3070 ref 88 33 29 26 ATC 0 1 165376 CASAVA_Build 3 75867861 3I TTGGCAATCC ---/CAA CAATCTTTCA 2429 het 2429 ref 82 40 7 36 CAA 1 2 165377 CASAVA_Build 3 75868305 3D TGAATGATTT TTA/--- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 93 42 34 20 TTA 1 0 165378 CASAVA_Build 3 75868322 1D ACAAAACAGG C/- TTTTTACTGA 3070 het 3070 ref 89 41 20 37 C 1 0 165379 CASAVA_Build 3 75869957 2D GGTTTTTCCC CT/-- GTGTGAGTCC 3070 het 3070 ref 73 46 16 13 CT 1 0 165380 CASAVA_Build 3 75871197 1D CTGAAATGAG A/- AAAAAGGTAT 3070 het 3070 hom 99 32 58 12 A 6 5 165381 CASAVA_Build 3 75871305 1I AAAAATAAAT -/A ATGGGTATTG 3070 het 3070 ref 93 45 38 13 A 1 2 165382 CASAVA_Build 3 75871499 1I TGCTCATTAT -/C TGTCATATGT 3070 het 3070 ref 73 26 26 22 C 0 1 165383 CASAVA_Build 3 75872412 1D TACTCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 67 22 23 23 T 18 17 165384 CASAVA_Build 3 75873327 2I ACATTTCATT --/AC AGAGTAGTGA 3070 het 3070 hom 101 38 53 16 AC 0 1 165385 CASAVA_Build 3 75873463 11D AATGATACCA GGCTGCTGTAG/----------- GTCTCCAGCA 3070 het 3070 ref 102 55 19 43 GGCTGCTGTAG 1 0 165386 CASAVA_Build 3 75873501 1I CCTGTACAGG -/T GTCCTCTGAG 3070 het 3070 ref 88 47 20 21 T 0 1 165387 CASAVA_Build 3 75873748 7D CATCAGCCCA AAGATTC/------- TTGTCAAAAG 3070 het 3070 ref 90 54 11 27 AAGATTC 1 0 165388 CASAVA_Build 3 75873808 2I CCATGTGTCT --/TA TATGTATTTT 3070 het 3070 ref 78 39 28 13 TA 1 2 165389 CASAVA_Build 3 75874163 4D CCTACCTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 73 30 24 21 A 18 14 165390 CASAVA_Build 3 75876018 3D ATTCGGAAGT CTA/--- CTAATATAAT 3070 het 3070 ref 89 49 34 9 CTA 2 1 165391 CASAVA_Build 3 75876191 3I TAACAATCTT ---/AAC AACAAATTAA 3070 het 3070 ref 98 43 26 29 AAC 1 2 165392 CASAVA_Build 3 75876495 1I GAGTTATTGT -/G CGGGGAGGGG 3070 het 3070 hom 92 34 47 12 G 0 1 165393 CASAVA_Build 3 75877394 5I CACCTTGCTC -----/TACAA TACATCTCCT 3070 het 3070 hom 73 22 40 11 TACAA 0 1 165394 CASAVA_Build 3 75877641 3D CAGGGTTTTC TTT/--- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 10 7 165395 CASAVA_Build 3 75877694 1D27M1I TTTTAATATA TTTTCCATATTGAATTATTTATATATAT-/-TTTCTGTATTGAATTATTTATATACATA TTTTTTATTA 2435 het 2435 ref 22 10 5 9 N/A 0 0 165396 CASAVA_Build 3 75884298 5I TTCTGAATGT -----/TTGTC CCTCACATAG 3070 het 3070 ref 67 37 20 10 TTGTC 0 1 165397 CASAVA_Build 3 75884462 1I CCAGAGCACT -/C CTGCTGTGGT 3070 het 3070 ref 55 32 10 13 C 1 2 165398 CASAVA_Build 3 75884626 1D CTGAATGTTT G/- CCCTTAACAT 3070 het 3070 ref 85 59 9 17 G 1 0 165399 CASAVA_Build 3 75886148 1D TGGGTACTTC A/- TGCCTGGAAT 3070 het 3070 hom 41 15 14 12 A 1 0 165400 CASAVA_Build 3 75886266 1D GATTTTGGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 55 12 13 31 T 10 9 165401 CASAVA_Build 3 75886512 3I TAAAAAAGAA ---/AAT AAACACTGAA 3070 het 3070 ref 62 44 10 8 AAT 0 1 165402 CASAVA_Build 3 75887826 1I TTCACTGCAC -/T TTGCTTTATT 1553 het 1553 ref 62 45 4 15 T 2 3 165403 CASAVA_Build 3 75889228 1D ATTATAAAAC A/- GCTCTGCCTG 1996 het 1996 ref 41 35 5 2 A 1 0 165404 CASAVA_Build 3 75892593 2I TACACCTGAA --/AG GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 86 26 15 45 AG 0 1 165405 CASAVA_Build 3 75892675 4D AGACCAGAAA AAAG/---- AAAGGAAAAA 3070 het 3070 hom 74 27 25 24 AAAG 2 1 165406 CASAVA_Build 3 75892851 1D TAATGTGAGC A/- AACCATATGC 3070 het 3070 hom 95 27 62 10 A 3 2 165407 CASAVA_Build 3 75893921 1D GGAAAGAAAG A/- GAGAGAAAGA 2607 het 2607 ref 26 16 6 4 A 1 0 165408 CASAVA_Build 3 75894597 1D CAAATCAATC T/- TGAAACAGAA 1631 het 1631 ref 55 45 4 6 T 2 1 165409 CASAVA_Build 3 75895657 3D TGGAGTGACC AGA/--- AGATCAGAGT 3070 het 3070 ref 53 38 10 7 AGA 2 1 165410 CASAVA_Build 3 75896358 1D24M4I CCTGGCCCAA CGTAACGAGAATGAACTGTGAGATA----/-GTAAGGAGAATGAACTGTGAGATAAATG AATGATCATG 2349 het 2349 ref 84 63 7 25 N/A 0 0 165411 CASAVA_Build 3 75896436 1I TAAAGTGATT -/A AAAAAGTGGA 3070 het 3070 ref 80 53 9 22 A 5 6 165412 CASAVA_Build 3 75896962 1I17M1D ATCTGACACA -TAACATGAAACCTACTTA/TTAACATGGAACCTACTT- ACAAAACAAC 1380 het 1380 ref 32 20 3 13 N/A 0 0 165413 CASAVA_Build 3 75897124 2D TAAAAAAAAA AT/-- CTAGAAATCT 3070 het 3070 ref 86 45 31 11 AT 1 0 165414 CASAVA_Build 3 75897948 2D ACCCTGTCTT AA/-- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 94 47 20 27 A 9 7 165415 CASAVA_Build 3 75898091 1I AGCAAGACCC -/A ACAATATGGC 3070 het 3070 hom 97 37 45 15 A 1 2 165416 CASAVA_Build 3 75898734 1D CCTGTGAGTC A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 98 64 26 9 A 7 6 165417 CASAVA_Build 3 75898856 1I GAACCAATTC -/T CCCTGAACCT 3070 het 3070 ref 104 41 48 15 T 0 1 165418 CASAVA_Build 3 75899490 1D GAGGGACTGT G/- GGAAAACTAC 3067 het 3067 ref 50 37 7 9 G 3 2 165419 CASAVA_Build 3 75900734 1I CTGAGTGTGT -/C GGGTGAAGAT 85 het 85 ref 59 40 2 17 C 0 1 165420 CASAVA_Build 3 75900902 2I GTGGTTTATT --/AA AGACTGCTGC 3070 het 3070 ref 60 30 25 6 A 1 3 165421 CASAVA_Build 3 75904777 2I GTGTTTTGAG --/CT CTGAGTTTCT 2904 het 2904 ref 33 21 7 6 CT 1 2 165422 CASAVA_Build 3 75907807 1D12M1I TGCCAGATTT GCATGCTAAATCA-/-CACGCTAAATCAG CCAATACTGA 3070 het 3070 ref 40 29 10 6 N/A 0 0 165423 CASAVA_Build 3 75908222 1D AACATTTTAT A/- AAGGGATTTC 3070 het 3070 ref 59 43 12 5 A 3 2 165424 CASAVA_Build 3 75908576 1D GGACAGTTTC T/- CCCCCAGAAG 3070 het 3070 ref 51 31 13 8 T 1 0 165425 CASAVA_Build 3 75912867 1D AGTGACTGAA G/- TTTTGGCCAA 3070 het 3070 ref 54 34 17 3 G 1 0 165426 CASAVA_Build 3 75915437 1I GCACAATTTA -/T TTTTGAATAA 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 T 4 5 165427 CASAVA_Build 3 75916296 1D TTCACAATCT A/- ATGCTAAAGC 3070 het 3070 ref 56 35 11 11 A 2 1 165428 CASAVA_Build 3 75917314 1I GGATCCCCCG -/A GGCCCACGGG 3070 het 1814 hom 33 7 14 12 A 0 1 165429 CASAVA_Build 3 75917578 1I TGCCCAGCAG -/T TGAGTCCAGT 3070 het 3070 hom 93 38 36 19 T 1 2 165430 CASAVA_Build 3 75917697 1I GCACATTGTG -/A AAAATAATGG 3070 het 3070 ref 96 67 10 19 A 4 5 165431 CASAVA_Build 3 75919680 9D TATTTTTGTA TATCAATCT/--------- TATATAGTGT 2077 het 2077 ref 91 77 6 15 TATCAATCT 1 0 165432 CASAVA_Build 3 75920522 1D AAAGTTAATA T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 88 58 17 13 T 6 5 165433 CASAVA_Build 3 75921088 9D AAAGCCTGGA TCCAATGGC/--------- TTCACTGGCT 1571 het 1571 ref 78 72 4 18 TCCAATGGC 1 0 165434 CASAVA_Build 3 75921545 11I CACTTCCAAC -----------/ACTGTTACTTA ACACAGTACT 3070 het 3070 hom 97 18 55 25 ACTGTTACTTA 0 1 165435 CASAVA_Build 3 75923005 1I CAAACAACTC -/T ATAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 86 27 52 7 T 0 1 165436 CASAVA_Build 3 75924434 1I TCGGGGAGCT -/C CCAGGTCTGG 1509 het 1509 ref 52 21 8 23 C 2 3 165437 CASAVA_Build 3 75924553 1I CTCTTCCCTA -/G GATTTGCCAT 3070 het 3070 ref 68 39 17 12 G 1 2 165438 CASAVA_Build 3 75925731 2D GTCTGTAATA CT/-- TTTTTTTAAC 1611 het 1611 ref 34 21 5 10 CT 1 0 165439 CASAVA_Build 3 75931256 4D AGCCTTGATA AAAC/---- AAACAGTGTC 2194 het 2194 ref 84 76 5 7 AAAC 2 1 165440 CASAVA_Build 3 75933244 1D ATTAAAAAAA C/- AATAAAGGCA 3070 het 3070 ref 68 47 13 8 C 1 0 165441 CASAVA_Build 3 75933380 1D GGAAGTCAAA C/- CCGATGACAA 3070 het 3070 ref 102 54 34 16 C 3 2 165442 CASAVA_Build 3 75935333 4D ATATAAAACA CCTT/---- CAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 88 26 57 7 CCTT 1 0 165443 CASAVA_Build 3 75939649 1I ACTCCTGGCT -/G CTGCTTTCCA 3070 het 3070 ref 57 38 14 5 G 0 1 165444 CASAVA_Build 3 75942174 1I TCGAGGCGGG -/T CCCCCTTCCT 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 T 0 1 165445 CASAVA_Build 3 75942259 1I CTTTCTTACA -/C CAGGGACATA 3070 het 3070 ref 60 30 24 7 C 1 2 165446 CASAVA_Build 3 75942868 1D TGAGTTTGAG C/- TTCATCAGCC 3070 het 3070 ref 86 67 11 8 C 1 0 165447 CASAVA_Build 3 75944320 3I TAGAACTGAT ---/AAA AAACAACTTC 3070 het 3070 ref 77 30 15 38 A 3 6 165448 CASAVA_Build 3 75944694 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 36 15 13 9 A 7 6 165449 CASAVA_Build 3 75944759 6D AAACCTAAGC AAAAAA/------ AAAAAAAACA 2768 het 2152 hom 32 10 9 15 A 14 8 165450 CASAVA_Build 3 75945929 1I ACACAGAGAT -/A TAATTATAAC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 A 0 1 165451 CASAVA_Build 3 75946401 1D TTTGAAATTA G/- GGATCATGAT 1686 het 1686 ref 50 31 10 20 G 3 2 165452 CASAVA_Build 3 75946527 3D TAGGCCTGAT AAC/--- AAAAACTATC 3070 het 3070 ref 71 26 32 16 AAC 1 0 165453 CASAVA_Build 3 75947324 1I TATCTAAATT -/G TCTGAGTTAC 3070 het 3070 hom 85 29 48 8 G 0 1 165454 CASAVA_Build 3 75947680 2I ATTCAGGGCA --/AG AGAGTTTCCT 3070 het 3070 ref 65 40 15 10 AG 2 3 165455 CASAVA_Build 3 75948104 1D16M1D CAATGTCAAC TTTTTTCATGTTTTTTTA/-TTTTTCATGTTTTTTT- AAATCCACTT 3070 het 3070 ref 93 89 9 8 N/A 0 0 165456 CASAVA_Build 3 75949279 12D TATTTATTTA TTTGTTTGTTTG/------------ TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 9 11 19 TTTG 5 2 165457 CASAVA_Build 3 75949813 1I TTTGAAAAGC -/A GAGGAGTGGG 3070 het 3070 ref 46 31 12 3 A 0 1 165458 CASAVA_Build 3 75950026 5I21M5I ATAAGGTAAA -----ATTACTTTTACGGTAAAACAT-----/ATAAGATTACTTTTACAGTAAAACATACAAC ACATTGTCAC 3070 het 3070 ref 47 28 22 2 N/A 0 0 165459 CASAVA_Build 3 75950884 6I CAGCTGTATT ------/TCCTTC TCCTTCTCAC 3070 het 3070 hom 89 23 55 11 TCCTTC 1 2 165460 CASAVA_Build 3 75951792 4D CCTAATCAAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 730 hom 37 9 10 20 T 18 14 165461 CASAVA_Build 3 75952476 4I TGGCAGATGA ----/ATAG ATAAAGATAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 ATAG 0 1 165462 CASAVA_Build 3 75952799 3I TAATTTAAAA ---/ATT TTTTTTTTTT 1775 het 1775 ref 51 31 4 16 ATT 0 1 165463 CASAVA_Build 3 75952979 1I TTTTTTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 16 11 18 T 10 11 165464 CASAVA_Build 3 75953960 1D TGGACAATCT G/- GTGTTTTATT 3070 het 3070 hom 55 15 37 3 G 2 1 165465 CASAVA_Build 3 75954686 4I AAACCATCAG ----/TTGT TTGTTATAAA 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 TTGT 1 2 165466 CASAVA_Build 3 75954938 1I AGTTGACAGG -/T TTTTTTTTTT 2125 het 2125 ref 73 54 8 11 T 10 11 165467 CASAVA_Build 3 75955227 3D CTGTCTCATT TTG/--- TTCTTCTCTA 3070 het 3070 hom 82 29 42 14 TTG 1 0 165468 CASAVA_Build 3 75955951 1D TGTGACATTC T/- CCTCTGTAAC 3070 het 3070 ref 69 43 11 16 T 1 0 165469 CASAVA_Build 3 75956915 2D TAAATGAAAC TT/-- TGAAAATTCA 3070 het 3070 hom 90 19 65 8 T 3 1 165470 CASAVA_Build 3 75957034 3I TAGAACTATG ---/CAA TAATAACATA 3070 het 3070 ref 83 39 33 11 CAA 0 1 165471 CASAVA_Build 3 75958091 1I TGAAACATAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 51 26 17 8 T 8 9 165472 CASAVA_Build 3 75958665 6D ATAAATAAGT TATTTA/------ TATTTATGGT 3070 het 3070 ref 88 72 13 7 TATTTA 2 1 165473 CASAVA_Build 3 75959209 2D TTTACCAAAC AA/-- AGTGCAAATT 3070 het 3070 ref 27 15 7 6 A 3 1 165474 CASAVA_Build 3 75960062 1I GGTAAAAAAA -/T GGTACCACCA 2751 het 2751 ref 65 52 6 7 T 0 1 165475 CASAVA_Build 3 75960648 4D AGTATATCTA TGCT/---- TACTTATATC 3070 het 3070 ref 103 52 39 17 TGCT 1 0 165476 CASAVA_Build 3 75960771 3I TTGACCAAAA ---/TGT TGTTATGTGA 3070 het 3070 hom 91 40 44 7 TGT 1 2 165477 CASAVA_Build 3 75970380 1D30M1I14M1I ATCTCCTTAT CTGTGTCAAAATTTTAAGTCTCAGAGTCTCC-AAAAAAATTCCAGA-/-TTTGTCAAAATTTTAAGTCTCAGAGTCTCCAAAAAAAATTCCAGAC TAATCTCATC 3070 het 3070 ref 41 28 14 17 N/A 0 0 165478 CASAVA_Build 3 75973327 1I AAAAGACTTA -/T CATACTTCAG 3070 het 3070 ref 54 31 16 7 T 0 1 165479 CASAVA_Build 3 75974429 3I CTCATGTACA ---/TAG TTGTTTCATT 3070 het 3070 ref 65 32 18 15 TAG 0 1 165480 CASAVA_Build 3 75975974 3I AGGATGAAGG ---/TTC TTCTCTATAA 3070 het 3070 ref 54 32 20 2 TTC 1 2 165481 CASAVA_Build 3 75976307 2I CAGGAAAGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 12 15 22 T 10 12 165482 CASAVA_Build 3 75982296 3D GGACCCACTT GAG/--- GAGGCAGTCT 3070 het 2969 hom 20 10 10 1 GAG 2 1 165483 CASAVA_Build 3 75985517 3D AATTACAAAA AAT/--- AAATAATGAA 3070 het 3070 ref 79 30 9 40 AAT 1 0 165484 CASAVA_Build 3 75985886 1I AGGATTTGGT -/A GCCGAACTCT 597 het 597 ref 83 39 5 39 A 0 1 165485 CASAVA_Build 3 75986841 1I TATCAGCATG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 45 het 75 0 15 60 A 7 8 165486 CASAVA_Build 3 75989766 1I TCATTAAAAA -/T GATTAAGATT 3070 het 3070 hom 90 28 50 12 T 0 1 165487 CASAVA_Build 3 75989925 7I TTGTGCTTAA -------/GATAGTT GGCCATTCTT 3070 het 3070 ref 55 26 24 5 GATAGTT 0 1 165488 CASAVA_Build 3 75992272 2D ACCCAGGGGG AA/-- AAAAAGGCTC 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 A 7 5 165489 CASAVA_Build 3 75992365 3D CAAGAAAAAC TGA/--- TGATTGTGTG 3070 het 3070 ref 85 40 39 9 TGA 2 1 165490 CASAVA_Build 3 75992432 2D ATAACCTATA AG/-- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 98 32 27 44 AG 1 0 165491 CASAVA_Build 3 75993233 1D AAAATTTGAA C/- TTTGCATACT 3070 het 3070 ref 59 44 11 4 C 1 0 165492 CASAVA_Build 3 75995602 4D AGTTAAATTA AGTG/---- AGTAAGTGAA 1453 het 1453 ref 88 77 5 10 AGTG 1 0 165493 CASAVA_Build 3 75995889 4I ATCTCAACTT ----/ACAG TCATGAATTT 3070 het 3070 hom 54 20 28 9 ACAG 0 1 165494 CASAVA_Build 3 75995979 3D TCAAAATCTC CTT/--- ATTATGCTTT 3070 het 3070 hom 81 37 41 11 CTT 1 0 165495 CASAVA_Build 3 75996563 1D CTTGAATTCG A/- AAAGCCATTT 3070 het 3070 ref 50 32 16 4 A 4 3 165496 CASAVA_Build 3 75996663 5I GATAGACCAG -----/ATAAA ATATCACTTC 2636 het 2636 ref 54 39 9 6 ATAAA 0 1 165497 CASAVA_Build 3 75996801 1I GTAACTACAT -/A TTCAAACAGG 3070 het 3070 ref 45 25 10 10 A 0 1 165498 CASAVA_Build 3 75997205 3D ACATAAAAAT ATG/--- AGCCATATTT 3070 het 3070 ref 103 50 38 17 ATG 1 0 165499 CASAVA_Build 3 76000599 1D AAGTATGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 23 14 9 1 A 10 9 165500 CASAVA_Build 3 76007335 1D TGATCCTATA T/- TCTAGGAAAC 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 T 2 1 165501 CASAVA_Build 3 76024283 7I CCACCCACAG -------/TTCATCA TTCATCATAT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 TTCATCA 1 2 165502 CASAVA_Build 3 76025692 1D ATAGTTTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2143 hom 16 5 9 3 T 10 9 165503 CASAVA_Build 3 76026381 3D TATTCAGGAA ATT/--- ATTGACATTT 3070 het 3070 ref 51 25 17 14 ATT 2 1 165504 CASAVA_Build 3 76029133 2D GGAAGATGAC AA/-- GAGAATTCCA 3070 het 3070 ref 36 20 12 7 A 2 0 165505 CASAVA_Build 3 76032090 6I29M2I TATTATACTC ------TACATATCTACTGTATATTGTATATATAT--/TATATATACATATCTACTGTATATTGTATATATATAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 25 17 11 4 N/A 0 0 165506 CASAVA_Build 3 76040302 2D ATGTAGAGAC TG/-- TGTCACAGAA 3070 het 3070 ref 30 21 9 2 TG 2 1 165507 CASAVA_Build 3 76048665 5I TTCTTAGCTG -----/ATGAA ATGAATATAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 ATGAA 1 2 165508 CASAVA_Build 3 76048834 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAT 3070 hom 99 het 35 0 34 3 AC 5 4 165509 CASAVA_Build 3 76049723 4I TTTGATGGGG ----/TTGT TTGTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 TTGT 1 2 165510 CASAVA_Build 3 76053138 1D TGAAGCTTAG T/- TTGGCTGGTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 3 2 165511 CASAVA_Build 3 76059012 1I CTTTATGGTG -/A AAACAAACTT 2113 het 2113 ref 39 32 5 2 A 3 4 165512 CASAVA_Build 3 76060323 3I AGATGCTGTA ---/TCT TCTTGGCCAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TCT 1 2 165513 CASAVA_Build 3 76067362 4I AAATAAATAA ----/ATAT ATCACAAAAC 3070 het 3070 ref 50 31 11 10 AT 1 3 165514 CASAVA_Build 3 76067588 4D TTTTTTTCCC TCTT/---- CTCAGCATCA 3070 het 3070 ref 73 46 18 21 TCTT 1 0 165515 CASAVA_Build 3 76067727 1I AGAGTACCCA -/C TAACCTGATG 3070 het 3070 ref 88 43 39 6 C 0 1 165516 CASAVA_Build 3 76068512 2D TTTTTGACAC TT/-- ATCCATATTA 3070 het 3070 hom 82 23 51 10 T 2 0 165517 CASAVA_Build 3 76068673 6D23M1D CATTGTCATA TATATGTATAATATTTGTATATATGAAAGT/------TATAATATTTGTATATATGAAAG- TCCTGTGGGT 3070 het 3070 ref 66 47 21 18 N/A 0 0 165518 CASAVA_Build 3 76070692 4D TCTTTCATGC CATT/---- CAGAATTTAT 3070 het 3070 hom 73 22 37 14 CATT 1 0 165519 CASAVA_Build 3 76071677 2D ACTAAATATC TT/-- TTAAAATACA 2604 het 2604 ref 59 45 7 7 T 4 2 165520 CASAVA_Build 3 76071842 2D AAGTGTGACT CC/-- TGCAGCAAAT 1854 het 1854 ref 45 37 4 4 C 2 0 165521 CASAVA_Build 3 76072101 1I TATCATAGTA -/T TATCTCAACT 3070 het 3070 ref 70 33 27 10 T 1 2 165522 CASAVA_Build 3 76072380 4D TGACGTGGAC TCTG/---- TCTGTGTCTA 3070 het 3070 hom 102 34 64 6 TCTG 2 1 165523 CASAVA_Build 3 76073193 3D AAATAATTAT AAG/--- AAGAATGGAA 3070 het 3070 ref 65 38 22 11 AAG 2 1 165524 CASAVA_Build 3 76074856 1D TAAAAAATTA T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 129 het 50 0 44 7 T 7 6 165525 CASAVA_Build 3 76075085 1D CAATAGTAAC A/- AAAAAATCTT 3070 hom 36 het 60 0 14 49 A 7 6 165526 CASAVA_Build 3 76075290 2D ATTTGAAGAC TG/-- TACAAGCACT 3070 het 3070 hom 94 20 66 9 TG 1 0 165527 CASAVA_Build 3 76076092 1I CTTTATGTAC -/A AACTAAAGTA 3070 het 3070 ref 88 42 37 10 A 2 3 165528 CASAVA_Build 3 76077498 3D TTGAAATAGG TTT/--- TTATCTTTTT 3070 het 3070 ref 61 33 24 4 T 5 2 165529 CASAVA_Build 3 76078135 2I ATATACTATA --/AC ACAAAATAGT 3070 het 3070 hom 104 18 74 13 AC 1 2 165530 CASAVA_Build 3 76078530 1D GGGCAGATAT A/- AAAATTCTGT 2509 het 2509 ref 49 20 8 23 A 5 4 165531 CASAVA_Build 3 76078682 4I GAATATAAAT ----/TAAC TACATTGAAA 3070 het 3070 ref 59 29 15 19 TAAC 0 1 165532 CASAVA_Build 3 76078726 4D ATGAGGTTAG TTAC/---- CTCTTAGGAG 1310 het 1310 ref 64 40 7 18 TTAC 1 0 165533 CASAVA_Build 3 76079051 1I TGATTTTACA -/T TTTTTTAATC 3070 het 3070 hom 64 18 20 26 T 6 7 165534 CASAVA_Build 3 76079061 5D TTTTTTAATC TTAAA/----- TTAAGACGAT 3070 het 1657 hom 58 7 29 22 TTAAA 1 0 165535 CASAVA_Build 3 76079608 1D26M4I CTTCATCAGA CCATTCACTCCCTCATACAAAGATCTT----/-CTTTCACTCACTCATACAAACATCTTAGGC AGGAAATATA 3070 het 3070 ref 63 42 26 10 N/A 0 0 165536 CASAVA_Build 3 76081395 1I TGGTAGGATT -/A TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 82 27 29 26 A 0 1 165537 CASAVA_Build 3 76081620 2I CAGATTGCTC --/TT TACATTCCAC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 1 3 165538 CASAVA_Build 3 76098111 1I CTAAATAACG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 10 165539 CASAVA_Build 3 76112755 4I TGTTAAAATA ----/AATT AATATTTACA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AATT 0 1 165540 CASAVA_Build 3 76113426 2D TGTAACAAAC TG/-- TAATATAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TG 1 0 165541 CASAVA_Build 3 76119832 1I TGTTTTCTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 8 165542 CASAVA_Build 3 76132956 4D TTCATTGCTC TTTA/---- TTTAGTTATT 3070 het 3070 hom 59 28 27 6 TTTA 2 1 165543 CASAVA_Build 3 76140578 1D GTAGAAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 35 1 31 3 T 11 10 165544 CASAVA_Build 3 76147301 2D CCTCCATAAT AA/-- AGTGACAGAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 3 1 165545 CASAVA_Build 3 76148062 1D ATTTATGTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 9 8 165546 CASAVA_Build 3 76153755 1D TCGTGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 1799 het 1799 ref 49 26 6 18 T 15 14 165547 CASAVA_Build 3 76160097 2I GAGCAAATAT --/GA GAGAGGATAA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 GA 2 3 165548 CASAVA_Build 3 76164943 1D ATATAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 12 11 165549 CASAVA_Build 3 76170638 2D TGTGTATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 2752 hom 59 het 40 0 19 23 TG 9 8 165550 CASAVA_Build 3 76183106 8I GTACTTTGAT --------/ATGTATTC ATGTCACTAT 3070 hom 86 het 35 0 28 10 ATGTATTC 0 1 165551 CASAVA_Build 3 76189937 1D GAGCTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 95 hom 52 1 42 9 T 10 9 165552 CASAVA_Build 3 76191950 1D CTAGAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 11 10 165553 CASAVA_Build 3 76192145 1I TGTACATCAG -/A AATAGAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 2 3 165554 CASAVA_Build 3 76194177 1I TGAAACACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 10 11 165555 CASAVA_Build 3 76197835 1I TTTAGGATTG -/T TTTTCTTTTG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 4 5 165556 CASAVA_Build 3 76199341 1I GGAATTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 28 2 21 5 A 10 11 165557 CASAVA_Build 3 76199687 1I TAAAATATCA -/T TTTCTTCATT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 3 4 165558 CASAVA_Build 3 76200878 1D TCCTCTATTT A/- AATGCATTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 3 2 165559 CASAVA_Build 3 76201186 1D GTTATTTCTA T/- TTTTCCCAGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 5 4 165560 CASAVA_Build 3 76201367 2I TTATTGCTAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 35 0 24 11 T 13 15 165561 CASAVA_Build 3 76201464 1D ATACCTACAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 9 8 165562 CASAVA_Build 3 76204080 1I TTTCCCCCGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 23 hom 31 1 27 3 A 9 10 165563 CASAVA_Build 3 76205632 2D CTTACCATCT TA/-- TAAAATAAGT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TA 2 1 165564 CASAVA_Build 3 76210583 1D TAAAAATTAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 72 het 31 0 25 7 A 9 8 165565 CASAVA_Build 3 76217070 3I TAAAGTTCTT ---/AAG AATCATTGAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAG 0 1 165566 CASAVA_Build 3 76223835 3D TGATACACTA GTG/--- GTGAATATAC 3070 hom 117 het 43 0 39 5 GTG 2 1 165567 CASAVA_Build 3 76225342 5I ATAATATAAA -----/ATAAT ATATTTATAC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 ATAAT 0 1 165568 CASAVA_Build 3 76230402 5D50M4D AAGATAAATC AAATAAATATGAAAAAATAACAATTCCTGTCATCAATTTAGAGTTTTTATATTGTTTGA/-----AATATGAAAAAATAACAATTCCTGTCATCAATTTAGAGTTTTTATATTGT---- TTGATATATA 3070 hom 78 het 23 0 27 18 N/A 0 0 165569 CASAVA_Build 3 76231241 1D TTTTGTGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 11 10 165570 CASAVA_Build 3 76241078 1I ATGAAAATGC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 7 8 165571 CASAVA_Build 3 76244548 2I GCCCAGAAGC --/AA AAGAGATCAT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 2 4 165572 CASAVA_Build 3 76255958 2D TAAGAGAATC AG/-- AGTGCTTAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AG 2 1 165573 CASAVA_Build 3 76260430 1I ATTCTTTCCC -/T TGAAGGATAG 3070 het 3070 hom 44 13 17 14 T 1 2 165574 CASAVA_Build 3 76267804 1I ATTATTTACC -/A AAAAAAAATC 3070 het 56 hom 37 1 33 3 A 8 9 165575 CASAVA_Build 3 76271936 4D TTTGTGCCTT TAAC/---- TAGGCAGCTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAAC 1 0 165576 CASAVA_Build 3 76272902 2I TTTTACATAC --/AT ATATATATAT 1399 hom 10 het 7 0 4 3 AT 8 9 165577 CASAVA_Build 3 76290290 1D CTATACCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 38 1 32 5 A 13 12 165578 CASAVA_Build 3 76296712 1I GGACTGCCCC -/T GCAGGACACT 3070 hom 99 het 39 0 30 9 T 0 1 165579 CASAVA_Build 3 76296901 1D AGTCTACATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 26 8 T 10 9 165580 CASAVA_Build 3 76297188 1I TGGCTTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 28 1 18 9 T 11 12 165581 CASAVA_Build 3 76305118 4D CATACATACA TACT/---- TATGTATCAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 TACT 1 0 165582 CASAVA_Build 3 76313235 1D AGAAAGGAAA T/- TCAAATGAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 165583 CASAVA_Build 3 76317778 1I GAAACACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 24 2 13 9 T 15 16 165584 CASAVA_Build 3 76318365 2I TATCTGTTTT --/TC TCTCACAAGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TC 2 3 165585 CASAVA_Build 3 76318909 1I TTCAAGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 35 2 28 5 A 10 11 165586 CASAVA_Build 3 76319293 1I TTTTTTAATG -/T TTTTTTAGAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 6 7 165587 CASAVA_Build 3 76323345 4I AAAGCTTGTC ----/AGAA AGAATATGTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AGAA 1 2 165588 CASAVA_Build 3 76335434 1I CTCTCGGCTT -/C CCCCGTCAAG 3070 het 2283 hom 40 12 19 9 C 4 5 165589 CASAVA_Build 3 76338010 2I AAAAGCCTTT --/CA AGAACTTCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CA 0 1 165590 CASAVA_Build 3 76356586 5I ACATTCCTGT -----/TCTTG TCTTCTAGAC 3070 hom 154 het 58 0 52 6 TCTTG 0 1 165591 CASAVA_Build 3 76360302 4D ATAGCAAATT ACAG/---- ACAGACAGTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 ACAG 3 2 165592 CASAVA_Build 3 76361250 3D TATTAGTTGT ATC/--- ATCATTTCAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 ATC 2 1 165593 CASAVA_Build 3 76362545 10I CAACCCTCTC ----------/CTTCCTCTTT CTTCTCACAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CTTCCTCTTT 0 1 165594 CASAVA_Build 3 76371202 4I TACGTATATG ----/TATA TATATATATA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 TA 6 8 165595 CASAVA_Build 3 76374771 4D TGAATGAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 126 het 44 0 42 6 AAAC 3 2 165596 CASAVA_Build 3 76375770 1I AGTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 T 9 10 165597 CASAVA_Build 3 76411578 5D ATCAGGATCC ACATA/----- ACATAAGATA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 ACATA 2 1 165598 CASAVA_Build 3 76413480 1D GCTGGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 745 hom 41 3 30 9 A 11 10 165599 CASAVA_Build 3 76435450 1D ACTACTCTTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 9 8 165600 CASAVA_Build 3 76451460 8D CAAACCAAAA TCTCAATT/-------- TCTCAATTTA 3070 hom 78 het 32 0 27 7 TCTCAATT 2 1 165601 CASAVA_Build 3 76453342 6D CATCTCAAAA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 hom 78 het 27 0 26 9 AAC 8 6 165602 CASAVA_Build 3 76463375 4D TAGATTCCTC TGTT/---- TGGTTTTAAC 3070 het 3070 hom 30 9 20 2 TGTT 1 0 165603 CASAVA_Build 3 76468073 1I TAGCAAGAAG -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 A 7 8 165604 CASAVA_Build 3 76471927 2I AACCAATTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 12 14 165605 CASAVA_Build 3 76477269 4I AGGATATCTT ----/TTTC TTTTCTTTTC 2602 hom 16 het 29 0 14 15 TTTC 0 1 165606 CASAVA_Build 3 76539775 1I TCTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 438 hom 29 1 22 6 T 9 10 165607 CASAVA_Build 3 76545776 1D GACTGGGAGG A/- AAAAATAAAT 3070 hom 45 het 18 0 16 3 A 6 5 165608 CASAVA_Build 3 76545925 1D CCATCAGATC T/- TGTGAGACTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 2 1 165609 CASAVA_Build 3 76548927 3D CTTTTAAAGA TGT/--- TGTGTTCCTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TGT 2 1 165610 CASAVA_Build 3 76550166 3I CTCACTACAA ---/CCT CCTCATCCTG 3070 hom 61 het 27 0 19 8 CCT 1 2 165611 CASAVA_Build 3 76550840 1I TGCAACCACA -/T TTTTAATCAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 4 5 165612 CASAVA_Build 3 76553567 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 209 hom 35 1 30 4 A 11 12 165613 CASAVA_Build 3 76580826 1I ACATTCTTAC -/A AAAGCAATTT 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 A 3 4 165614 CASAVA_Build 3 76581935 1I ACATCAGACG -/T TTTGGAAGAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 T 3 4 165615 CASAVA_Build 3 76590619 3D AGAAAATGAG GAA/--- GAAGCAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 GAA 2 1 165616 CASAVA_Build 3 76595225 5I AAAAAAAAAC -----/AAAGT AAAATAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAAGT 0 1 165617 CASAVA_Build 3 76608684 1I GAAAAAATGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 387 hom 42 1 39 2 A 8 9 165618 CASAVA_Build 3 76611871 10D TAAATAGAAA AAGGAGGAAG/---------- AAGGAGGATG 3070 hom 109 het 35 0 35 8 AAGGAGGAAG 1 0 165619 CASAVA_Build 3 76620996 1I CTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2333 hom 27 11 11 5 T 11 12 165620 CASAVA_Build 3 76624403 1I GTGCATAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 10 11 165621 CASAVA_Build 3 76625287 2I GATGAGTCTC --/AG ATATCAAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 AG 0 1 165622 CASAVA_Build 3 76627434 1I CATTTTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 19 21 13 T 10 11 165623 CASAVA_Build 3 76632814 5D AATTCTAGAA GGCCT/----- GGCTTGACAC 3070 het 3070 ref 37 21 13 6 GGCCT 1 0 165624 CASAVA_Build 3 76637211 1D TTCAGCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 35 1 27 10 A 13 12 165625 CASAVA_Build 3 76647341 1D CTGCAAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 18 17 5 T 12 11 165626 CASAVA_Build 3 76648481 1D GGAAAATGAA T/- TCTTTAAGGA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 2 1 165627 CASAVA_Build 3 76682185 8D TAGCCAATAA AAGTAGTC/-------- AGCCCTCTGT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 AAGTAGTC 1 0 165628 CASAVA_Build 3 76689728 2D GGAATTACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 42 1 28 14 A 14 12 165629 CASAVA_Build 3 76690202 1D CTTAAGTTAG A/- AAAAAATATA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 7 6 165630 CASAVA_Build 3 76705365 1I TAGTTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 2428 het 2428 ref 38 14 7 17 T 16 17 165631 CASAVA_Build 3 76707754 1D TATGCTATCA T/- TTTTTTTAGA 2067 het 2067 ref 32 21 5 6 T 8 7 165632 CASAVA_Build 3 76737228 1D ACTGTATTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 10 9 165633 CASAVA_Build 3 76752986 1D TTTTTTTTTT C/- AGGCAAGGGA 3070 het 3070 hom 45 15 19 11 C 1 0 165634 CASAVA_Build 3 76753921 2D CTTGTGGCTC AT/-- GTGTGTAATC 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 AT 1 0 165635 CASAVA_Build 3 76754932 1I GCGTAAAAGT -/G AGTTATGGCT 3070 hom 87 het 38 0 29 9 G 0 1 165636 CASAVA_Build 3 76757098 1D GAAACCACGG C/- TTTTTTTCAT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 C 1 0 165637 CASAVA_Build 3 76759882 5I AGGAAAAAAG -----/GTACT GTATATTAGG 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 GTACT 0 1 165638 CASAVA_Build 3 76760824 4I AGGTATACTA ----/AGTC AGCATAATAT 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 AGTC 0 1 165639 CASAVA_Build 3 76763489 1D AAGAAAATGG A/- AAAAATCCTT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 A 6 5 165640 CASAVA_Build 3 76766506 4D GCTCTATCTC CAAA/---- CACAGTCACA 3070 het 3070 hom 32 16 14 3 CAAA 1 0 165641 CASAVA_Build 3 76768687 1D GCAGGGTGAC A/- ATAGGTGATT 3070 het 3070 ref 38 16 12 11 A 2 1 165642 CASAVA_Build 3 76768799 1I GGCCAACAAT -/G GGGGAAAACT 3070 het 3070 ref 60 28 23 9 G 4 5 165643 CASAVA_Build 3 76775510 1D TGTCTACCCC T/- GTTTCTGCTC 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 T 1 0 165644 CASAVA_Build 3 76776166 1I CATAAGGGGT -/A AAAAAAGCCT 3070 het 3070 hom 53 20 29 4 A 6 7 165645 CASAVA_Build 3 76798565 1D TTTTTCACTG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 8 7 165646 CASAVA_Build 3 76798801 2D ATTATATGAC AT/-- ATATATATGA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 AT 5 4 165647 CASAVA_Build 3 76799415 1I ATCAAATCAG -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 6 7 165648 CASAVA_Build 3 76800109 2I CCCAGCTATT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 2772 hom 29 10 13 6 A 9 11 165649 CASAVA_Build 3 76802775 1D ATGAACTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2606 hom 24 7 11 6 T 13 12 165650 CASAVA_Build 3 76806762 1D AAAAAGCAGC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 9 8 165651 CASAVA_Build 3 76807278 1D GGGGGAAAAA G/- AAACGAAAAC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 G 1 0 165652 CASAVA_Build 3 76808515 4I GATTTCATGC ----/CATG CATGCCCCAA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 CATG 1 2 165653 CASAVA_Build 3 76808926 1I TTCTAGGCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 9 10 165654 CASAVA_Build 3 76810947 1D TTAACAGAGC T/- TTTTTGTGAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 6 5 165655 CASAVA_Build 3 76812200 3D TGGATATATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 37 0 29 9 A 16 13 165656 CASAVA_Build 3 76814264 7I TAAAAATTTC -------/ATTTTTT TTTTGAGACG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 ATTTTTT 0 1 165657 CASAVA_Build 3 76816822 1D GTACAAATGC A/- AAAGTCTTTC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 4 3 165658 CASAVA_Build 3 76825116 2I TCTCTCTCTC --/TA TATATATAGT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TA 4 5 165659 CASAVA_Build 3 76825335 4I TGTATATATA ----/TATC CATATATAGA 3070 hom 45 het 32 1 28 3 TATC 0 1 165660 CASAVA_Build 3 76828223 2D AATGGATCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1314 hom 25 8 8 10 T 13 11 165661 CASAVA_Build 3 76829531 1D TGAAAATATT A/- GACAATTGTA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 1 0 165662 CASAVA_Build 3 76831263 1D TCATGAAGAC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 T 7 6 165663 CASAVA_Build 3 76834393 4I AGAAATAGAC ----/AGAG AGAGAAAGAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AG 2 4 165664 CASAVA_Build 3 76858980 1I ATATAACATG -/C CAGTATTTGT 3070 het 3070 ref 39 21 18 0 C 1 2 165665 CASAVA_Build 3 76860752 1D CCATAAGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 10 9 165666 CASAVA_Build 3 76861077 2D AGTAACTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 27 1 13 15 T 12 10 165667 CASAVA_Build 3 76869694 7D ACAGTATTAT TTAAGAA/------- ATGCAGACTG 3070 het 3070 hom 27 12 15 2 TTAAGAA 1 0 165668 CASAVA_Build 3 76870682 1D CTCTTGATTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 9 8 165669 CASAVA_Build 3 76871470 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2589 hom 20 6 10 4 A 10 9 165670 CASAVA_Build 3 76873555 1I TTTTCTCTAA -/T TTTTTATCCA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 5 6 165671 CASAVA_Build 3 76876617 1I AAAACTCAAA -/T TTTAAATAAA 2642 het 2642 ref 28 19 7 2 T 3 4 165672 CASAVA_Build 3 76884416 6D AAGACTAAAG CAGTCT/------ CAGTATTCAT 3070 het 3070 ref 52 34 16 3 CAGTCT 1 0 165673 CASAVA_Build 3 76884658 1I TGCAGCATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 A 9 10 165674 CASAVA_Build 3 76889450 1I GTGGTTTATT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 0 1 165675 CASAVA_Build 3 76892561 4I AGTCGGTAAG ----/TTAA TTAAAGAGTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTAA 1 2 165676 CASAVA_Build 3 76893854 1D AGAAAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 10 T 11 10 165677 CASAVA_Build 3 76895029 2D AGGTTTTGTC AT/-- ATACCTGTTG 3070 hom 129 het 48 0 44 5 AT 2 1 165678 CASAVA_Build 3 76895414 1D TTCCATCATC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 165679 CASAVA_Build 3 76905130 1D ATTTATTCTG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 8 7 165680 CASAVA_Build 3 76905419 1I ACAAGATTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 459 hom 19 1 15 3 T 9 10 165681 CASAVA_Build 3 76906656 1I GAATATCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 27 1 20 6 T 11 12 165682 CASAVA_Build 3 76907598 4I ATTGTTCACT ----/CTTA CTTACTAAGC 3070 hom 102 het 41 0 35 7 CTTA 1 2 165683 CASAVA_Build 3 76915263 2I GATGAAATCT --/CA CAGTGTTTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CA 1 2 165684 CASAVA_Build 3 76933420 1D ATCCATAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1643 hom 20 5 11 4 T 10 9 165685 CASAVA_Build 3 76942270 6D GACATATGTA ATAAAG/------ ATAAACAGAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 8 ATAAAG 1 0 165686 CASAVA_Build 3 76946435 1I AAAGGATCGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 8 9 165687 CASAVA_Build 3 76947499 4I ATCTTCTGGG ----/TAGT TAAATTGCAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TAGT 0 1 165688 CASAVA_Build 3 76949669 1D ATTTCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1351 hom 42 7 24 11 T 18 17 165689 CASAVA_Build 3 76957895 1D AGTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 T 13 12 165690 CASAVA_Build 3 76972451 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 638 hom 5 het 5 0 2 3 A 11 12 165691 CASAVA_Build 3 76974790 7D AGTTATTTTA TTACAAG/------- CCTTCTCATT 3070 het 3070 hom 46 19 25 3 TTACAAG 1 0 165692 CASAVA_Build 3 76994827 2D CATTGCAGAT AA/-- AGTCAGCTTT 3070 het 3070 hom 41 14 25 4 A 3 1 165693 CASAVA_Build 3 77000625 1I ATAGGAACTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 9 10 165694 CASAVA_Build 3 77010811 4D AAAGAAAAAG AATT/---- AACATATTCA 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 AATT 1 0 165695 CASAVA_Build 3 77022073 6I GTATGCTATT ------/TAACTC TAACAGTCCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 TAACTC 0 1 165696 CASAVA_Build 3 77029121 1I TGCTTTCACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 9 10 165697 CASAVA_Build 3 77036785 1I CTTGACAGTT -/A ATGAAAGTAT 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 A 1 2 165698 CASAVA_Build 3 77038867 1D GAAGACAGCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 10 22 1 T 9 8 165699 CASAVA_Build 3 77040053 1I CCAAATTAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 9 10 165700 CASAVA_Build 3 77049587 1I CTGGTGAGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 7 10 A 9 10 165701 CASAVA_Build 3 77052017 1D TCTCTTTTCC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 9 8 165702 CASAVA_Build 3 77063048 1I TGAAAATTAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 8 9 165703 CASAVA_Build 3 77064912 5D GAAGTGAAAC ATAAA/----- ATAAAATGTA 2967 het 2967 ref 34 23 7 12 ATAAA 2 1 165704 CASAVA_Build 3 77065897 1D GTTCAGCTCT A/- AAAGCTTTTG 3070 het 3070 hom 44 22 18 4 A 4 3 165705 CASAVA_Build 3 77066283 1D AATGGTTCAA T/- TAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 2 1 165706 CASAVA_Build 3 77066582 6I GACTCCATCT ------/CAAAAA CAAAAACAAA 2999 het 2999 ref 31 20 9 2 CAAAAA 2 3 165707 CASAVA_Build 3 77067452 1D TCTCATAGTT C/- TAGAGGCTGA 3070 het 3070 ref 61 35 21 5 C 1 0 165708 CASAVA_Build 3 77068868 4I CTCATTATTG ----/ACCT ACCTACCCCT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 ACCT 1 2 165709 CASAVA_Build 3 77069190 1D AGGGTTTTTG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 35 12 23 0 T 8 7 165710 CASAVA_Build 3 77095003 1I ATAAAGATTA -/T TTTTGTATAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 4 5 165711 CASAVA_Build 3 77103393 1D CTGTTTCTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 15 16 15 A 10 9 165712 CASAVA_Build 3 77114555 2D ATTTTGTGAC TA/-- TGTGAAATAT 3070 het 3070 hom 40 14 22 5 TA 1 0 165713 CASAVA_Build 3 77121930 1I AATTATTTTT -/G CTACTCTCTT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 G 0 1 165714 CASAVA_Build 3 77125943 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTGTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 TG 1 0 165715 CASAVA_Build 3 77126228 1I AACTTTAAAC -/T TTTTTACTGC 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 5 6 165716 CASAVA_Build 3 77128462 1I ATCCTCTTTT -/A TTTCATTGAG 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 0 1 165717 CASAVA_Build 3 77132423 1I TTTTCATGAC -/G TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 G 0 1 165718 CASAVA_Build 3 77134277 3D ATATTTTATC ATG/--- ATCTATTTTA 3070 het 3051 hom 23 7 12 5 ATG 1 0 165719 CASAVA_Build 3 77134819 2I AATCTCCCTA --/AG AGTCTTTCAT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 AG 1 2 165720 CASAVA_Build 3 77137888 1D GCTTATAGAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 20 11 8 2 T 9 8 165721 CASAVA_Build 3 77182410 1D CTTTTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 694 hom 28 2 22 4 T 12 11 165722 CASAVA_Build 3 77182499 1I TCTCAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 T 13 14 165723 CASAVA_Build 3 77182859 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3052 het 349 hom 26 2 12 12 A 17 18 165724 CASAVA_Build 3 77186778 4I TATGTGTGTG ----/TGTA TGTGTGTGTG 3070 hom 97 het 37 0 30 7 TGTA 0 1 165725 CASAVA_Build 3 77208351 1D GGAAAATAAA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 35 11 23 1 T 8 7 165726 CASAVA_Build 3 77238271 1I GTTGACATTA -/T GCTTAGGAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 0 1 165727 CASAVA_Build 3 77238421 1D AGTATATATG A/- TAAGGCCTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 A 1 0 165728 CASAVA_Build 3 77241215 1I ATGTTGTGCA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 165729 CASAVA_Build 3 77248406 1D GGACACTTAG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 A 7 6 165730 CASAVA_Build 3 77253799 1I GCAGGGTAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2303 hom 26 6 15 5 T 7 8 165731 CASAVA_Build 3 77262287 1D AGTAATTAGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 62 het 38 1 34 3 A 9 8 165732 CASAVA_Build 3 77264228 1I TTAATATGGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 8 9 165733 CASAVA_Build 3 77264539 1D TGGCCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 13 12 165734 CASAVA_Build 3 77270524 1I TAATGTTCCG -/T TTTTAGTTCT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 4 5 165735 CASAVA_Build 3 77281394 1I GTACATTCTC -/A AGAGGTCAAT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 1 2 165736 CASAVA_Build 3 77281638 1I CCTATTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 11 12 165737 CASAVA_Build 3 77289171 7D AGGTTAAAAT ATCTAAA/------- ATTCAATTGA 672 het 672 ref 38 13 5 25 ATCTAAA 1 0 165738 CASAVA_Build 3 77291958 1I ACAAAACATG -/A ATTATAGTTT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 1 2 165739 CASAVA_Build 3 77292181 5D AGAATGATAA TTATT/----- TTATAAAGTT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 TTATT 1 0 165740 CASAVA_Build 3 77294838 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 28 0 20 8 T 11 10 165741 CASAVA_Build 3 77298566 1I TCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 1574 het 569 hom 10 3 4 3 T 9 10 165742 CASAVA_Build 3 77305212 1D CACATTATAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 T 8 7 165743 CASAVA_Build 3 77308866 1I TTTTTGACTT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 7 8 165744 CASAVA_Build 3 77320175 1I AATATTAGTC -/A AAACAGAGCT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 3 4 165745 CASAVA_Build 3 77331642 1D TTTTTTTTTT G/- TTGTTTATAG 3070 het 7 hom 28 1 13 14 G 1 0 165746 CASAVA_Build 3 77331788 1I ATTCTTTATA -/T TTCCATTGAA 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 2 3 165747 CASAVA_Build 3 77342433 1D TCTCACAAAT A/- ATTTTTTTAT 3070 het 2347 hom 20 6 11 3 A 2 1 165748 CASAVA_Build 3 77355226 3D TTATTTTCCT AGG/--- AGAAGAGAAC 3070 het 3070 ref 38 20 17 2 AGG 1 0 165749 CASAVA_Build 3 77355712 4I GTTAGCTTGG ----/AATA AATATTGTTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 AATA 1 2 165750 CASAVA_Build 3 77357331 1D AGTCTTGTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 9 8 165751 CASAVA_Build 3 77360581 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 15 24 5 A 10 9 165752 CASAVA_Build 3 77361343 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 2573 het 2573 ref 17 9 8 0 A 9 10 165753 CASAVA_Build 3 77363467 1D TACATTATTA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 8 7 165754 CASAVA_Build 3 77365549 2D TGTAAATTTT TA/-- TATGTTACAT 2876 het 2876 ref 23 10 8 5 TA 2 1 165755 CASAVA_Build 3 77369924 1I TCTAATCAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 T 9 10 165756 CASAVA_Build 3 77381473 1I ACTTTTTTTT -/A TATTTAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 0 1 165757 CASAVA_Build 3 77395890 3D TATTCACCAC CAT/--- CATCATCACC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 CAT 3 2 165758 CASAVA_Build 3 77396380 1I GTTCATAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 T 9 10 165759 CASAVA_Build 3 77400966 1I AATTTTTTTT -/C TCCTAATGCA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 0 1 165760 CASAVA_Build 3 77401455 2I TTTTCCAAGA --/TG TGTGTGTGTA 3070 hom 117 het 48 0 39 9 TG 4 5 165761 CASAVA_Build 3 77402415 6I GTACAAAAAT ------/TTCAAG AAGATATAAG 3070 hom 63 het 27 0 21 6 TTCAAG 0 1 165762 CASAVA_Build 3 77405830 1I CTTTTTCCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 9 10 165763 CASAVA_Build 3 77408059 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 12 11 165764 CASAVA_Build 3 77409801 1D TGCAAACTCA C/- CAGCATCTGT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 C 2 1 165765 CASAVA_Build 3 77413991 1I TAATCAACCA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 8 165766 CASAVA_Build 3 77418283 1I TTTTTAGTAG -/A GATGGGGTTT 3070 hom 65 het 25 0 20 5 A 0 1 165767 CASAVA_Build 3 77418407 1I TATGGAGCAG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 6 7 165768 CASAVA_Build 3 77419146 1D ATTGATAGTT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 1 0 165769 CASAVA_Build 3 77419267 1I TAATACAACA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 8 9 165770 CASAVA_Build 3 77420601 3I TGGGGAAAAA ---/AAT AAAGGAGACG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 AAT 0 1 165771 CASAVA_Build 3 77430431 1D AACCACCATT A/- AGGGTTATTT 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 A 2 1 165772 CASAVA_Build 3 77432025 3D GGGAAATGAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2301 het 244 hom 29 4 8 18 T 19 16 165773 CASAVA_Build 3 77440053 1I GCAATCGTTC -/T TTTTCATGTG 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 4 5 165774 CASAVA_Build 3 77440906 3D CTATTTATTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 36 3 11 22 T 15 12 165775 CASAVA_Build 3 77442695 1D GCTTTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 22 0 14 8 A 12 11 165776 CASAVA_Build 3 77449116 1D GATTTTAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 10 9 165777 CASAVA_Build 3 77452399 1I TCTAGCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 11 12 165778 CASAVA_Build 3 77453886 3D TGAGGGAGAC TTG/--- TTGTTAATAA 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 TTG 2 1 165779 CASAVA_Build 3 77456503 2D CGCCTGTAGT CC/-- CCCAGCTACT 1736 het 1735 ref 9 5 4 0 C 5 3 165780 CASAVA_Build 3 77457031 1D ATTTTCAGGG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 55 31 16 8 A 7 6 165781 CASAVA_Build 3 77457643 3I ATCCAATTCT ---/AAC AACAGTTTCA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 AAC 1 2 165782 CASAVA_Build 3 77484065 1D11M1I ATGCTCTCTC TTTTTTTTTCTG-/-TTTTTTTTCTGA AAAAAAAAAT 1982 het 1982 ref 20 10 9 4 N/A 0 0 165783 CASAVA_Build 3 77484417 1D TAGAACATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 16 29 2 T 10 9 165784 CASAVA_Build 3 77484946 11I TCATAGTTTA -----------/TAATCAGTGTT AAAATTTATT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 TAATCAGTGTT 0 1 165785 CASAVA_Build 3 77486269 13D TATTTCGCGG CATGAATTTGCAT/------------- CATGAATTTG 3070 het 3070 ref 49 27 19 8 CATGAATTTGCAT 2 1 165786 CASAVA_Build 3 77492740 1I TTTGTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 T 10 11 165787 CASAVA_Build 3 77500097 1I AATACATTCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 7 8 165788 CASAVA_Build 3 77502606 4I CAGTGTCCAC ----/AAAT AAAGTTTTAT 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 AAAT 0 1 165789 CASAVA_Build 3 77512777 1I TTCTCTTTCT -/C CCCCGTGAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 C 4 5 165790 CASAVA_Build 3 77525376 4D GTGAATGAAT TAAC/---- TATTATATTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 TAAC 1 0 165791 CASAVA_Build 3 77530247 2I TTGAAACAAT --/GG CAGAGAGATA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 2 165792 CASAVA_Build 3 77539943 1I AAAACAAAAA -/C AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 C 0 1 165793 CASAVA_Build 3 77543980 2I TAAAAGTACC --/TT CCAGGCAGTG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 0 2 165794 CASAVA_Build 3 77550003 2D CAGAAAAGTA TG/-- TGAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 TG 2 1 165795 CASAVA_Build 3 77580514 5I TTATTGAATC -----/AAAAT GAAATGAAGT 3070 hom 157 het 60 0 53 7 AAAAT 0 1 165796 CASAVA_Build 3 77581873 1D GTAAACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 10 165797 CASAVA_Build 3 77583610 1I AAGCAAATCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 67 het 31 0 23 8 T 9 10 165798 CASAVA_Build 3 77585217 1D TTTTAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 12 7 17 T 11 10 165799 CASAVA_Build 3 77594605 1D CTTTCCAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 9 165800 CASAVA_Build 3 77596526 1I ATGTTGAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 9 10 165801 CASAVA_Build 3 77612144 1I AATGAGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 18 16 12 A 12 13 165802 CASAVA_Build 3 77618063 1D ATTGTGAATA G/- TGCTACAATG 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 G 1 0 165803 CASAVA_Build 3 77618377 2D ACTTTTTTTC AT/-- ATGTTTGTTA 2327 het 2327 ref 20 14 5 1 AT 2 1 165804 CASAVA_Build 3 77657266 1I AATATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2526 hom 25 8 15 2 A 11 12 165805 CASAVA_Build 3 77660267 1I GACTCACACA -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 5 6 165806 CASAVA_Build 3 77663244 1D TACAGGGACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 T 10 9 165807 CASAVA_Build 3 77663380 1D CAAGAAGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 21 5 A 11 10 165808 CASAVA_Build 3 77664650 1D ACCCTTTTTT C/- GTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 14 1 C 1 0 165809 CASAVA_Build 3 77675612 1D AGAAGGACTG T/- ATAGAGTATC 3070 het 3070 hom 34 12 15 8 T 1 0 165810 CASAVA_Build 3 77676221 1I TCATAAATCT -/G GGGTTTTCCA 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 G 3 4 165811 CASAVA_Build 3 77689761 1I TGTTAAAATA -/C CCTGAAAAGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 C 2 3 165812 CASAVA_Build 3 77720343 1I ATAAATCAAC -/A TACGTTGTGA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 0 1 165813 CASAVA_Build 3 77721063 2D ATAAACTCAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 57 22 21 16 AC 9 8 165814 CASAVA_Build 3 77728637 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 13 12 165815 CASAVA_Build 3 77729554 2D CAAAAGTATG GA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 GA 1 0 165816 CASAVA_Build 3 77731083 4I AATATATGAA ----/ATAG ATAGTCATAT 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 ATAG 1 2 165817 CASAVA_Build 3 77738061 1D GATATGGGGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 52 16 26 11 A 8 7 165818 CASAVA_Build 3 77748215 1I GTTGGAAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 22 17 13 T 9 10 165819 CASAVA_Build 3 77748972 3I TGGCATGTAA ---/TGT TGGTGCACAA 3070 het 3070 ref 53 24 26 3 TGT 0 1 165820 CASAVA_Build 3 77749072 4D ACATGAGTAA GTTT/---- GTTGGGAAGT 3070 het 3070 hom 38 14 22 5 GTTT 1 0 165821 CASAVA_Build 3 77752946 1D CAAGTCACTT A/- AATTTGACCT 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 A 3 2 165822 CASAVA_Build 3 77760289 1D CTCTTTTTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 G 10 9 165823 CASAVA_Build 3 77767117 1D TTGAGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 T 13 12 165824 CASAVA_Build 3 77775962 1I GACAATCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 15 11 A 12 13 165825 CASAVA_Build 3 77783359 1I CCTGTCTTAC -/A AAAAAAAAAA 2183 het 2183 ref 36 14 9 13 A 13 14 165826 CASAVA_Build 3 77789534 1I CAAAACAAAC -/A ACCAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 24 23 7 A 1 2 165827 CASAVA_Build 3 77794763 5D AAAGAAAAAT AAAAC/----- AAACAAACTA 3070 het 3070 ref 35 20 9 8 AAAAC 1 0 165828 CASAVA_Build 3 77798095 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAGGGATG 2912 het 2912 ref 19 10 7 2 A 4 5 165829 CASAVA_Build 3 77818444 1D TGTTACAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 T 13 12 165830 CASAVA_Build 3 77824638 3I CTGTGAACAG ---/ATT ATTATTATTA 3070 het 3070 ref 48 19 17 12 ATT 3 4 165831 CASAVA_Build 3 77825036 1D GTCTTTATTT C/- TAATTTAGAT 3070 het 3070 hom 40 14 21 6 C 1 0 165832 CASAVA_Build 3 77826617 2D TGAATAGCTC TT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 2 0 165833 CASAVA_Build 3 77827993 2I ATAAAAAATT --/AA AAAAAAAAAG 1808 het 1808 ref 20 10 7 3 A 9 11 165834 CASAVA_Build 3 77832833 1I TAATAAATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 1579 hom 14 4 10 0 T 7 8 165835 CASAVA_Build 3 77834164 1I GACTTCATGT -/A AGAGTTCAGC 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 1 2 165836 CASAVA_Build 3 77840220 1I TCCTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 10 11 165837 CASAVA_Build 3 77854809 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 21 1 18 2 A 12 13 165838 CASAVA_Build 3 77862990 34D TATGTATCTC ATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 27 het 23 0 9 14 AT 22 5 165839 CASAVA_Build 3 77874406 1I GTAATTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 23 1 18 4 A 13 14 165840 CASAVA_Build 3 77887755 2I6M4I AATAAAAAAA --AAAACA----/ACAAAACAAAAC AAACAAACAA 3070 hom 87 het 32 0 29 5 N/A 0 0 165841 CASAVA_Build 3 77904401 2I TATATCCTCC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 TA 5 6 165842 CASAVA_Build 3 77909800 4D ATGCATCATT TGTC/---- TGAGCTTTAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 7 TGTC 1 0 165843 CASAVA_Build 3 77911448 1I GCCATATCTC -/T CATTACATAT 1963 het 1963 ref 59 52 5 2 T 0 1 165844 CASAVA_Build 3 77911789 3I CATTCACTTG ---/CTC TAGAAAATTA 3070 het 3070 ref 61 36 16 10 CTC 0 1 165845 CASAVA_Build 3 77912433 1D CCCAACACAT C/- CCAGCTTCAA 3070 het 3070 ref 55 37 13 7 C 3 2 165846 CASAVA_Build 3 77913013 4I TTATGAAAAC ----/AATT TATTACAGTA 3070 het 3070 ref 63 29 28 6 AATT 0 1 165847 CASAVA_Build 3 77913112 1D TATAACGTAA C/- CTTCTCTACC 3070 het 3070 ref 41 30 9 3 C 2 1 165848 CASAVA_Build 3 77913340 2D22M1D AAATTTTAAT ACCTCTTGAGTAAATTTAGCTTTTC/--CTCTTGAGAAAATTTAGCTTTT- CTTTCCAAGG 1776 het 1776 ref 38 43 6 5 N/A 0 0 165849 CASAVA_Build 3 77913470 1I TGTGTGTTGG -/T GGGCGTTGTT 3070 het 3070 ref 51 31 17 3 T 0 1 165850 CASAVA_Build 3 77913625 1D ATGTTCTTGC T/- TTTAAACCCA 3070 het 3070 ref 65 32 23 10 T 4 3 165851 CASAVA_Build 3 77913967 7I16M4D ATTTTAATCA -------AACATTTAGAGCACAAGAAC/ACCCTGTATCATTTAGAGCACAA---- AAATACTTTC 3070 het 3070 ref 51 45 8 13 N/A 0 0 165852 CASAVA_Build 3 77915867 3D29M9D6M1D CAGACCAAAT AAAAAAAATTGTTTTTTTCACTACTTTTCTTTAAGGAAATGTAAGAGA/---AAAAATTTGTTTTTTCAATGTTTTTCTTT---------GAAGAG- AAAAAAAGAA 1290 het 1290 ref 46 58 3 6 N/A 0 0 165853 CASAVA_Build 3 77916372 4D TCAAGCACTG GGTA/---- GGTAGGCTTG 3070 het 3070 ref 44 32 7 7 GGTA 2 1 165854 CASAVA_Build 3 77919471 14D45M4I GTGTGTGCGC GTGTGTGTGTTTGTGTATTTGGGAAATAAAAGCGTATTATATTTTACTCAAACAACATC----/--------------ACATTTGGGAAATAAAAGAGTATTATATTTTACTCAAACAGCATCAAAA AAACATGCGG 842 het 842 ref 33 40 2 9 N/A 0 0 165855 CASAVA_Build 3 77920308 1I CTCTCTTAAT -/C TTTTGAGGAA 3070 het 3070 ref 48 35 11 2 C 0 1 165856 CASAVA_Build 3 77925528 1I TAAGGAAATA -/T TCTGGGATAT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 1 2 165857 CASAVA_Build 3 77928546 1D CTCCTTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 T 12 11 165858 CASAVA_Build 3 77930028 1D TTTAGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 12 11 165859 CASAVA_Build 3 77939497 1I ATATTCCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 10 11 165860 CASAVA_Build 3 77973648 3D TGCCAGTATT TTA/--- TTGAGGATTT 3070 het 3070 hom 20 7 9 4 TTA 1 0 165861 CASAVA_Build 3 77975924 1I ATTTTAATTC -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 6 7 165862 CASAVA_Build 3 77985411 3D44M1I CTTTTTGATT AACAACAACAACAACAACAACAAATCCAAAATTTTAAATACTCTGTT-/---AACAACAACAACAACAACAAATCCAAAATTTTAAATACTCTGTTA ACTGCAAAAC 3070 het 3070 ref 32 21 21 6 N/A 0 0 165863 CASAVA_Build 3 77986881 4D GCTGTTCTAA TTTG/---- TTTATTATCT 3070 het 3070 ref 38 19 16 8 TTTG 1 0 165864 CASAVA_Build 3 77992458 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 1269 het 58 hom 9 2 4 3 ATA 3 4 165865 CASAVA_Build 3 77996553 1D TTAGAGTCAG A/- AAACATATCA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 4 3 165866 CASAVA_Build 3 78003827 1D TCTCTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 9 8 165867 CASAVA_Build 3 78006263 1D TAATTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 38 1 30 7 T 12 11 165868 CASAVA_Build 3 78009106 1I CTGAAAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 21 1 19 1 T 10 11 165869 CASAVA_Build 3 78009543 2D TTGTTATTGT GA/-- ATAGTGCCGC 3070 het 3070 hom 23 7 15 1 GA 1 0 165870 CASAVA_Build 3 78012357 1D CCAGAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 13 12 165871 CASAVA_Build 3 78020845 1D TCTTCACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 10 9 165872 CASAVA_Build 3 78030769 1I ATTTTTTTTC -/T TTAATAATAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 2 3 165873 CASAVA_Build 3 78033018 1D AAGAAGAGGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 8 165874 CASAVA_Build 3 78035979 1D ATTTAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 11 10 165875 CASAVA_Build 3 78036665 1I GTGCAGGAAC -/T ACAATTTATT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 0 1 165876 CASAVA_Build 3 78037621 1I CTATGAGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 77 het 31 0 26 5 T 9 10 165877 CASAVA_Build 3 78039206 1I CTTCACAATA -/T TTTTTTTTTT 2514 het 2514 ref 29 17 8 4 T 10 11 165878 CASAVA_Build 3 78040217 3D GAAAGAAAAT ATC/--- ATATTATCTC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 ATC 1 0 165879 CASAVA_Build 3 78095851 4I ACATAATTAA ----/TTAT TTACTGAAAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TTAT 0 1 165880 CASAVA_Build 3 78100749 1I ATTGTTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 30 0 23 7 A 11 12 165881 CASAVA_Build 3 78113241 21D CTCTGTCTGA CCTTGGGGTCTGGTCATGTTC/--------------------- CCTTGACAAG 3070 hom 96 het 31 0 33 1 CCTTGGGGTCTGGTCATGTTC 1 0 165882 CASAVA_Build 3 78116339 4D CTGATTTTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TTTG 5 4 165883 CASAVA_Build 3 78128363 1I TCCCACAAAC -/A AGCCATATCT 3070 hom 71 het 30 0 22 8 A 1 2 165884 CASAVA_Build 3 78134305 1D CATTGGGTAG A/- ACATGCTCAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 2 1 165885 CASAVA_Build 3 78137704 1I AACTTGTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 95 hom 34 1 28 5 T 9 10 165886 CASAVA_Build 3 78138922 1D CTGTAGCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 653 hom 45 4 17 24 T 17 16 165887 CASAVA_Build 3 78149215 2I CAAACACCAC --/AT GTTTTTACTC 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AT 0 1 165888 CASAVA_Build 3 78157127 2I ACTAGCAACC --/AA AAATGAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 29 3 A 3 5 165889 CASAVA_Build 3 78172963 1I CTCCAAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 119 het 50 0 39 11 A 10 11 165890 CASAVA_Build 3 78183788 1D AAGGCTAGTA T/- TACAGCAGGG 3070 hom 123 het 51 0 41 11 T 2 1 165891 CASAVA_Build 3 78270774 1D AGTTAAGATG A/- AAAAAAAAAA 1467 het 1467 ref 37 29 4 4 A 11 10 165892 CASAVA_Build 3 78305990 1D CTCATCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 38 0 32 6 A 11 10 165893 CASAVA_Build 3 78320773 1D TATTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 12 11 165894 CASAVA_Build 3 78353263 1I CTGAGTTTCA -/C CCCCCAGCAG 3070 hom 54 het 22 0 17 5 C 5 6 165895 CASAVA_Build 3 78362809 21I TCCAGAGGCC ---------------------/AAAGGCAGTCTCAGAACCTAT ATCTCCTGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAAGGCAGTCTCAGAACCTAT 0 1 165896 CASAVA_Build 3 78371643 1I TACAGTGCAC -/A AAAAGCAGCC 3070 hom 93 het 39 0 30 9 A 4 5 165897 CASAVA_Build 3 78380048 1I CTAATGCTTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 393 hom 38 1 29 8 T 8 9 165898 CASAVA_Build 3 78383041 4I AGGTCATTCC ----/ATGA ATCAGTGAGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 ATGA 0 1 165899 CASAVA_Build 3 78389446 1D AATGTGAATG A/- AAAAAAAAAA 1816 het 1816 ref 35 28 4 3 A 12 11 165900 CASAVA_Build 3 78412431 10I CATGATGCAA ----------/AAAGAGCTCC AATTATCATT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 AAAGAGCTCC 0 1 165901 CASAVA_Build 3 78428603 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 7 6 165902 CASAVA_Build 3 78440204 1I AAGTATTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 11 12 165903 CASAVA_Build 3 78443746 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2113 hom 30 7 14 9 A 16 15 165904 CASAVA_Build 3 78483616 1I TATTCACGTA -/G GAACATAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 G 1 2 165905 CASAVA_Build 3 78484030 1D CTAGAGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 10 11 T 14 13 165906 CASAVA_Build 3 78489169 2I TATCTCTCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 35 0 25 10 T 11 13 165907 CASAVA_Build 3 78492430 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2834 het 2834 ref 48 11 16 21 A 16 18 165908 CASAVA_Build 3 78500957 2D TCTTGGCTAC AT/-- GTTTGCTAAA 3070 het 3070 ref 49 24 21 5 AT 1 0 165909 CASAVA_Build 3 78502691 4D GAATCTGTAT TGAC/---- TGACTGTATC 3070 hom 105 het 41 0 34 10 TGAC 2 1 165910 CASAVA_Build 3 78503387 1D CCACAAACTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 55 hom 20 1 11 9 G 10 9 165911 CASAVA_Build 3 78522464 1I GCAGCTGGGA -/G GGGGGGCTGT 3070 hom 99 het 39 0 31 8 G 6 7 165912 CASAVA_Build 3 78523707 1I ATTTTTTTTT -/A AAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 A 6 7 165913 CASAVA_Build 3 78526349 34D GCCTCAGCCT CCCAAGTAGGTGGGACTACAGGCGCACACAGCCA/---------------------------------- CACCCGGCTA 3070 hom 49 het 9 0 16 4 CCCAAGTAGGTGGGACTACAGGCGCACACAGCCA 1 0 165914 CASAVA_Build 3 78530607 1I AAAGGTAAAG -/T TCTGAAAGGA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 1 2 165915 CASAVA_Build 3 78531779 1I CACTGAAGTG -/T ATCGGAAAGC 3070 hom 156 het 54 0 52 2 T 0 1 165916 CASAVA_Build 3 78538941 1I ATAACTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 13 14 165917 CASAVA_Build 3 78539880 1D AACGCCTTGA T/- TTTTTTATGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 6 165918 CASAVA_Build 3 78555953 1D CAGTTTTGGA G/- TACATGTAAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 G 1 0 165919 CASAVA_Build 3 78557089 1D TCCTCCCATT A/- AAAAAAAAAA 1036 het 1036 ref 53 31 4 18 A 13 12 165920 CASAVA_Build 3 78568436 1D GTTAGGTCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 10 9 165921 CASAVA_Build 3 78578103 3D ATAAATATAA ATG/--- ATAATATAAC 687 het 687 ref 11 7 2 3 ATG 1 0 165922 CASAVA_Build 3 78580629 1D TTAAAATAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 T 9 8 165923 CASAVA_Build 3 78582393 1I CATATTTTGA -/T TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 T 4 5 165924 CASAVA_Build 3 78594133 1I AGAACAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 A 11 12 165925 CASAVA_Build 3 78634689 1D58M1I TAACCACAAC AAATCCATTATCATTTTCCCCCAAAGTCCTCCTTCTCTACATTTCTTTTCTCAGTCAAT-/-AATCCATTATCATTTTCCCCCAAAGTCCTCCTTCTCTACATTTCTTTTCTCAGTCAATG GGACCAGCAT 3070 het 3070 ref 58 50 28 9 N/A 0 0 165926 CASAVA_Build 3 78638379 1D TTTTTTTTTT A/- AAACAATCTA 1952 het 1952 ref 31 13 6 12 A 4 3 165927 CASAVA_Build 3 78645482 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2775 hom 25 9 11 5 A 12 11 165928 CASAVA_Build 3 78648641 2I CATGATCTTT --/TC TCTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 TC 3 4 165929 CASAVA_Build 3 78649051 3D CAGCAGGTTG GCA/--- GGTTTGGACT 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 GCA 1 0 165930 CASAVA_Build 3 78654065 2I ACTAATAAAC --/AT GTGATTGAGA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AT 0 1 165931 CASAVA_Build 3 78660186 1D CCAATCTGAA G/- AAAAGAGAAA 2968 het 2968 ref 20 12 7 1 G 1 0 165932 CASAVA_Build 3 78665483 1D CTTCTTTGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 T 9 8 165933 CASAVA_Build 3 78669581 1D GATTGTTTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 T 7 6 165934 CASAVA_Build 3 78674539 1I CTGAAAAGAG -/A AGATAAATAA 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 1 2 165935 CASAVA_Build 3 78676832 1D GGAAGCAGAG C/- TTTGGGAATC 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 C 1 0 165936 CASAVA_Build 3 78680877 1D GTGGCGTTGG T/- TTGAGGCCCC 3070 het 3070 hom 50 17 25 8 T 3 2 165937 CASAVA_Build 3 78681269 1D AACTATGTCA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 7 165938 CASAVA_Build 3 78686083 7D GGTTTCTTGT TTGTCAC/------- TTGTAACTAA 3016 het 3016 ref 35 20 9 8 TTGTCAC 1 0 165939 CASAVA_Build 3 78694768 1D GGTCTTACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 10 9 165940 CASAVA_Build 3 78695743 1I AATCCTGTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 85 hom 44 1 36 7 A 9 10 165941 CASAVA_Build 3 78696259 1D CTTGAGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 50 0 40 10 A 10 9 165942 CASAVA_Build 3 78698927 1I GGCTTCTGTT -/A ACGACCATGA 3070 hom 114 het 42 0 36 6 A 1 2 165943 CASAVA_Build 3 78709390 5I AAGAGAAGAG -----/AAGAC AATTGCTAGA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 AAGAC 0 1 165944 CASAVA_Build 3 78711082 1D GATAATTTTA G/- GTGGGGAAAG 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 G 2 1 165945 CASAVA_Build 3 78719814 3I GGGTAGAGAC ---/AAG GAGAGAAGGG 2614 hom 18 het 7 0 7 0 AAG 0 1 165946 CASAVA_Build 3 78724766 1D GAGCTAGTGA T/- TTATGTCAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 3 2 165947 CASAVA_Build 3 78725030 1D TGTTTGTTTG T/- TTGTTGTTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 2 165948 CASAVA_Build 3 78728285 2I ATGTCCCTCT --/AA AATTTTTCCT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 A 2 4 165949 CASAVA_Build 3 78729711 1D CTTCTCAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 10 9 165950 CASAVA_Build 3 78749347 2I TTAGGCAGCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1877 hom 38 8 17 13 A 15 17 165951 CASAVA_Build 3 78761148 1I CTTTTTTTTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 A 8 9 165952 CASAVA_Build 3 78777293 1I TGTTTTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 692 hom 31 2 22 7 A 10 11 165953 CASAVA_Build 3 78794085 1D TGTGATTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 45 1 33 11 A 15 14 165954 CASAVA_Build 3 78804086 3D CTTTGGTAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 AAC 5 4 165955 CASAVA_Build 3 78818395 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2004 het 1220 hom 17 5 8 4 A 17 16 165956 CASAVA_Build 3 78829103 4D AATAAAGGAA AGAG/---- GGAGGGAGGG 3070 het 1221 hom 29 7 10 14 AG 2 0 165957 CASAVA_Build 3 78832605 8D TCTTTTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 16 8 165958 CASAVA_Build 3 78835665 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1213 hom 23 4 11 8 AT 6 5 165959 CASAVA_Build 3 78857216 1D GTCTCAGGTT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 8 7 165960 CASAVA_Build 3 78860298 1D TCTAGGTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 28 0 19 9 A 12 11 165961 CASAVA_Build 3 78865240 1I GTACTATTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 9 10 165962 CASAVA_Build 3 78884015 8I ACATAGTCAT --------/TAATTTTG AGTACAGAAA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 TAATTTTG 0 1 165963 CASAVA_Build 3 78890628 2D TCACCTGAAC CT/-- CTCACTCTCA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 CT 2 1 165964 CASAVA_Build 3 78891681 1I CTTTTAACGT -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 A 6 7 165965 CASAVA_Build 3 78893102 1D CAAGAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 11 10 165966 CASAVA_Build 3 78899093 1D GGTCCTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 11 10 165967 CASAVA_Build 3 78904049 1D GATTACAATA G/- TCATTACCAT 3070 het 3070 ref 34 21 10 4 G 1 0 165968 CASAVA_Build 3 78906447 1D TGTTTTTAAT A/- AAAAAAAAAA 2663 het 2359 hom 18 7 6 5 A 13 12 165969 CASAVA_Build 3 78909269 2I TTTCCTTATG --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 AT 4 5 165970 CASAVA_Build 3 78916448 2D ATTGAAAAAA AG/-- GACACGTTCT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 AG 1 0 165971 CASAVA_Build 3 78924976 1D AAACAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1009 hom 30 4 20 6 A 13 12 165972 CASAVA_Build 3 78926726 1D CTAGCCGCAA T/- TGACAGTCTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 2 1 165973 CASAVA_Build 3 78936606 1D AAAAGGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 15 12 20 A 10 9 165974 CASAVA_Build 3 78939759 9I AACAAACATT ---------/TGCTCAAAC TGCTAAACAC 3070 hom 135 het 47 0 46 2 TGCTCAAAC 0 1 165975 CASAVA_Build 3 78945083 12D GTTTTACATG CACACACACACA/------------ CACACACACC 3070 het 650 hom 28 2 12 16 CA 10 4 165976 CASAVA_Build 3 78947467 2I AACTTGAGAG --/TA CAAGGTGAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TA 0 1 165977 CASAVA_Build 3 78948182 23D48M1D TATTACTGCT TATTGACAATGTACCCAGTCACCTGAGAACTCTGATGGAGAAGTACGAAAAGAGTAATGTTGTTTTCATGAT/-----------------------TGAGAACTCTGATGGAGAAGTACGAAAAGAGTAATGTTGTTTTCATGA- TTGCTAACAC 3070 hom 33 het 18 0 12 27 N/A 0 0 165978 CASAVA_Build 3 78955030 3D TTTAAAATGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1016 hom 36 7 15 15 T 17 14 165979 CASAVA_Build 3 78960113 1I ATGTTACACA -/T TATTTAATCT 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 T 1 2 165980 CASAVA_Build 3 78963857 19I TATCAGGTAT -------------------/ATATGAGATTAATAAGGGG GAGGAAATGA 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 ATATGAGATTAATAAGGGG 0 1 165981 CASAVA_Build 3 78967471 1D AGTTTTAAGC A/- GACAATTTGT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 1 0 165982 CASAVA_Build 3 78974444 1I ATATATATAT -/A TTTTATATAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 0 1 165983 CASAVA_Build 3 78997313 1D TGATGAACGC T/- TTTTTTTTTT 2222 het 1558 hom 23 10 5 8 T 17 16 165984 CASAVA_Build 3 79010577 1D TATGTGAAGC A/- ACTTATCTAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 2 1 165985 CASAVA_Build 3 79029469 5I TATCAGCCCT -----/TTTTA TTTTATTTAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TTTTA 1 2 165986 CASAVA_Build 3 79064433 4D TATGACATAG CTGA/---- CTATGTATTC 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 CTGA 1 0 165987 CASAVA_Build 3 79091127 4D CAATATGTGT GAAA/---- GAAAGAGATT 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 GAAA 2 1 165988 CASAVA_Build 3 79103588 3D AATATTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TTG 6 5 165989 CASAVA_Build 3 79127521 1D CCGGAGGATC A/- CATGAGCCCA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 1 0 165990 CASAVA_Build 3 79128181 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2246 het 287 hom 22 1 14 7 A 12 13 165991 CASAVA_Build 3 79138103 1D TAAATAGCTA C/- CAATAAAGGA 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 C 2 1 165992 CASAVA_Build 3 79138529 1I TTGGCCCTAA -/T TACAAGCACT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 1 2 165993 CASAVA_Build 3 79154998 2I ATGAGAAGCA --/GT GTGACACATG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 GT 1 2 165994 CASAVA_Build 3 79157492 2I GAGAACTAAC --/AG TGAATATCAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AG 0 1 165995 CASAVA_Build 3 79173316 1I TTGCAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 1494 het 1494 ref 35 27 5 3 T 13 14 165996 CASAVA_Build 3 79180408 1D CCATGTGCTG A/- CTGCCATTAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 1 0 165997 CASAVA_Build 3 79190547 1D TGTATTAACT C/- CCTATTTTGA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 C 3 2 165998 CASAVA_Build 3 79199481 1D TTTCAACTTG T/- TTCAGGGCAA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 T 3 2 165999 CASAVA_Build 3 79221784 2I TCTTTCTTTT --/TC TTTTTTTTTT 983 hom 33 het 33 0 12 21 TC 0 1 166000 CASAVA_Build 3 79223423 1I AATTTTAATA -/G GGGAGACAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 3 4 166001 CASAVA_Build 3 79266879 1I AGAGTATAAT -/A AAAAAAAAAC 133 het 133 ref 19 9 3 7 A 9 10 166002 CASAVA_Build 3 79269271 1D CATGTTACTG T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 82 het 34 0 28 6 T 8 7 166003 CASAVA_Build 3 79277879 2I TAAAGAAAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 33 0 26 7 A 11 13 166004 CASAVA_Build 3 79283352 8I AGCCCTCTAA --------/CCAGTATC CCAGCCTCTA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 CCAGTATC 0 1 166005 CASAVA_Build 3 79285848 5I ACTAGTCATT -----/CTTTA CTTTACTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 CTTTA 1 2 166006 CASAVA_Build 3 79290197 2I TATGTAACAC --/AT ATATTTTCTG 3070 het 1793 hom 14 4 8 2 AT 2 3 166007 CASAVA_Build 3 79318122 4I CCGGTTCTTC ----/CTCT CTGATTTATG 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 CT 1 3 166008 CASAVA_Build 3 79346573 2I ATATATTTGC --/TA TATATATATA 1284 het 1284 ref 12 5 4 3 TA 7 8 166009 CASAVA_Build 3 79347827 1D AGAAATTCAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 9 8 166010 CASAVA_Build 3 79365863 17D TTTGCCCACG TTTTAATGCAGTTGTTT/----------------- TTTGCTTATT 3070 het 3070 ref 36 24 16 1 TTTTAATGCAGTTGTTT 1 0 166011 CASAVA_Build 3 79369321 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 16 1 12 4 A 13 12 166012 CASAVA_Build 3 79373789 1D TAATTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 26 2 13 11 T 12 11 166013 CASAVA_Build 3 79383863 1D AATTTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 12 11 166014 CASAVA_Build 3 79389239 5D CTGGGGCAGC AGTAG/----- AGTAAATTAG 3070 het 3070 ref 37 17 17 5 AGTAG 1 0 166015 CASAVA_Build 3 79397137 1I GAAAAGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2298 hom 22 8 11 3 T 12 13 166016 CASAVA_Build 3 79405597 3D TGTTATCAAC AAG/--- AAGCACATTT 3070 het 3070 hom 44 22 18 4 AAG 2 1 166017 CASAVA_Build 3 79409631 1I CATTAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 9 10 166018 CASAVA_Build 3 79438224 1I AAGATATCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 9 10 166019 CASAVA_Build 3 79440905 1I AAAATTGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 9 10 166020 CASAVA_Build 3 79445027 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2179 het 580 hom 10 2 5 3 A 17 18 166021 CASAVA_Build 3 79463498 1D ATTATTGCAG A/- AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 7 6 166022 CASAVA_Build 3 79464042 1I TTGATGACCT -/A AAAAAAAAAA 2964 het 2755 hom 22 8 9 5 A 14 15 166023 CASAVA_Build 3 79474541 2D CAGTCAACAC AG/-- GGCTCGGGAA 3070 het 3070 ref 44 20 20 5 AG 1 0 166024 CASAVA_Build 3 79475559 3I TTTAAGTGGG ---/AGA AGAAGAAGAA 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 AGA 3 4 166025 CASAVA_Build 3 79547923 1D ATACCAACAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 8 7 166026 CASAVA_Build 3 79554831 1I TACTGTATAG -/A AAAAAACCAC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 6 7 166027 CASAVA_Build 3 79568190 1D TTGATTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 10 9 166028 CASAVA_Build 3 79569371 1D AGCTGAAAAC T/- TACACAAATG 3070 hom 77 het 27 0 25 2 T 2 1 166029 CASAVA_Build 3 79597872 1I AATCTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 9 17 11 A 11 12 166030 CASAVA_Build 3 79619196 1D CACAGTACTG T/- TTGCAATGGC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 3 2 166031 CASAVA_Build 3 79668954 1I CCTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2618 hom 25 11 8 6 T 10 11 166032 CASAVA_Build 3 79700321 1D TTCTACATTG A/- AAAAAAAAAA 1017 het 1017 ref 28 15 3 10 A 15 14 166033 CASAVA_Build 3 79732490 1D CGCCTGCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 10 9 166034 CASAVA_Build 3 79739443 1I TATTTCCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 12 13 166035 CASAVA_Build 3 79742204 8D CGTGGGCTCC CTTTCTCT/-------- CTTTCTCTCT 3070 het 3070 hom 29 12 13 7 CTTTCTCT 2 1 166036 CASAVA_Build 3 79743042 1D CTTTTAATAG A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 7 6 166037 CASAVA_Build 3 79743876 1D TTTTTTTATT A/- TTTTTTTATA 2904 het 2904 ref 16 9 7 0 A 1 0 166038 CASAVA_Build 3 79744971 1I CAAAAGGACT -/G GGGAAAGACT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 3 4 166039 CASAVA_Build 3 79749762 2D GAGATATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 20 0 12 8 A 14 12 166040 CASAVA_Build 3 79752372 2D TTCTTTTATA CT/-- CTCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 13 4 CT 3 2 166041 CASAVA_Build 3 79759475 1I GACAATAAAA -/G CCAAAATTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 166042 CASAVA_Build 3 79762732 1I ACGCACATAC -/A AAAAAACCTA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 6 7 166043 CASAVA_Build 3 79763018 1I AAAAAGAGCC -/T TGCATTACCT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 T 1 2 166044 CASAVA_Build 3 79765568 1D ATAGTGATTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 8 166045 CASAVA_Build 3 79769310 1D TTTACATTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 19 0 14 6 A 10 9 166046 CASAVA_Build 3 79773523 2I CCAATATAAC --/AT ACACACAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AT 0 1 166047 CASAVA_Build 3 79779407 12I GGTTGACACA ------------/AGTGGGAGGAGG TGTACTATCG 3070 hom 111 het 36 0 37 1 AGTGGGAGGAGG 0 1 166048 CASAVA_Build 3 79784178 8D CTCTTCCACA CTTGTTAG/-------- CTTTCTACTA 3070 het 3070 hom 27 10 15 4 CTTGTTAG 1 0 166049 CASAVA_Build 3 79786568 1D TTTCTAGTGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 8 7 166050 CASAVA_Build 3 79788741 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 1204 hom 31 3 21 7 A 8 9 166051 CASAVA_Build 3 79791462 1D AAAAAAAAAA C/- ACAATATTTT 3070 het 198 hom 40 1 31 8 C 1 0 166052 CASAVA_Build 3 79800265 2D TCTGTGAAGC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 83 het 31 0 28 4 A 11 9 166053 CASAVA_Build 3 79802254 1I TCTACACAGC -/A AAATAATATC 3070 het 3070 hom 56 17 36 3 A 3 4 166054 CASAVA_Build 3 79804181 9I CTTTGAATAA ---------/TGTTCTCCC TGTCAATCTT 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 TGTTCTCCC 0 1 166055 CASAVA_Build 3 79807075 1D ATTGATTGTG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 T 8 7 166056 CASAVA_Build 3 79810134 2D TATAAATCAC TA/-- TATATATATA 3070 het 1985 hom 23 6 11 6 TA 8 7 166057 CASAVA_Build 3 79814198 1I TATGACTTCC -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 6 7 166058 CASAVA_Build 3 79814823 2I TGTAAAAGAC --/AT ATATAGGATA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AT 2 3 166059 CASAVA_Build 3 79826145 1I CACAGTTTAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 A 8 9 166060 CASAVA_Build 3 79827777 1D CAGTTATAGG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 8 7 166061 CASAVA_Build 3 79830924 2I TTTATTAATT --/TA TATATATATA 1558 het 1558 ref 13 5 4 4 TA 7 8 166062 CASAVA_Build 3 79833671 3D TATATTTGAA ATG/--- ATAATATTTT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 ATG 1 0 166063 CASAVA_Build 3 79833912 4D TATTGCACAC AAAT/---- AAAACTAAAT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 AAAT 1 0 166064 CASAVA_Build 3 79837183 12I TTGTGATCCA ------------/TTTTTAGTTACC TTTTTTGAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TTTTTAGTTACC 0 1 166065 CASAVA_Build 3 79837261 1I AGCAACATTT -/G TTTAAAAGAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 0 1 166066 CASAVA_Build 3 79841358 1I AATGTTTCAG -/A AAAAAAGGTT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 A 6 7 166067 CASAVA_Build 3 79842227 3D CACACACGAA TAT/--- TATTAGCAAA 3070 hom 138 het 49 0 44 6 TAT 2 1 166068 CASAVA_Build 3 79854022 1I AAACTAATTT -/A AAATGTTAAA 3070 het 3070 hom 46 15 25 6 A 3 4 166069 CASAVA_Build 3 79855647 4D TTCTATAAGG TTTA/---- TTTATTTTCA 3070 hom 28 het 27 1 24 3 TTTA 2 1 166070 CASAVA_Build 3 79859135 1D ACTTTAAAAA T/- ATGTGAAATA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 T 1 0 166071 CASAVA_Build 3 79859976 2D TTAGATATAT CC/-- CCCCCCCCAC 3070 het 157 hom 29 2 15 12 C 10 8 166072 CASAVA_Build 3 79867728 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 2992 hom 33 het 14 0 12 2 A 10 9 166073 CASAVA_Build 3 79869497 2I TTGTCCTATC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 27 0 19 8 A 11 13 166074 CASAVA_Build 3 79872077 2D TTATATATAA AT/-- ATATATATAT 2777 hom 15 het 6 0 6 0 AT 8 7 166075 CASAVA_Build 3 79885131 1D ACTGGGATTT A/- AAAAAAAAAA 1159 het 1159 ref 28 22 3 3 A 13 12 166076 CASAVA_Build 3 79892454 1D AATTCACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 227 hom 37 5 15 18 A 12 11 166077 CASAVA_Build 3 79892590 69D TCACAAGTAT AAGAGATTATACAGTTTGTCTTAAAAAATGGTCTTTAATTCTGGCTAAACATAATTACAAATTATGTAA/--------------------------------------------------------------------- TTTTGCAAAT 3070 hom 72 het 17 0 25 0 AAGAGATTATACAGTTTGTCTTAAAAAATGGTCTTTAATTCTGGCTAAACATAATTACAAATTATGTAA 1 0 166078 CASAVA_Build 3 79895092 3D AGTGCGAAAA AAT/--- AATAAGGGCA 3070 het 3070 hom 49 22 25 3 AAT 2 1 166079 CASAVA_Build 3 79897945 3D CTTCATCTAT AGA/--- AGGAGCCTCC 3070 het 3070 ref 42 18 14 11 AGA 1 0 166080 CASAVA_Build 3 79917312 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 1820 hom 18 5 10 3 A 7 8 166081 CASAVA_Build 3 79920850 1D ACAAGTAAAG C/- AAAAGTTATA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 C 1 0 166082 CASAVA_Build 3 79922653 1D TCAAAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 28 2 19 7 T 11 10 166083 CASAVA_Build 3 79927085 1D GTGGGCCAAG A/- AAAAGATATT 3070 hom 78 het 34 0 27 8 A 5 4 166084 CASAVA_Build 3 79936868 4D ATATTACATG TTTA/---- TTTATATAAT 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 TTTA 2 1 166085 CASAVA_Build 3 79937233 2I GAAATGAACA --/CT GACTTCAACT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 CT 0 1 166086 CASAVA_Build 3 79953062 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 1184 hom 10 het 6 0 4 2 TA 7 8 166087 CASAVA_Build 3 79958109 1I TTTTTGCTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 8 9 166088 CASAVA_Build 3 79968936 4I TAATAATGAT ----/TAAC TATAGGATAT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TAAC 0 1 166089 CASAVA_Build 3 79969755 1D AAAAAAACTT A/- AAAAAAAAGA 2307 hom 15 het 10 0 6 4 A 9 8 166090 CASAVA_Build 3 79984216 3D TCTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 32 2 20 11 A 19 16 166091 CASAVA_Build 3 79985157 3D ATTATACACA AGT/--- ATCTCTAATG 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 AGT 1 0 166092 CASAVA_Build 3 79988502 1I CAGTTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 24 1 20 3 A 10 11 166093 CASAVA_Build 3 79994973 1D TTTGAAATAT A/- AAAAGAGCAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 5 4 166094 CASAVA_Build 3 80009676 6D TCTCTCTCAA TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 het 7 hom 21 1 16 6 TC 12 9 166095 CASAVA_Build 3 80025518 4D TACAAGGAAA TATT/---- TAGTCACTGT 3070 hom 132 het 45 0 45 2 TATT 1 0 166096 CASAVA_Build 3 80028266 1I TCCTTTATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 448 hom 29 1 22 6 A 9 10 166097 CASAVA_Build 3 80029785 2D AGCACTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 39 1 33 6 T 14 12 166098 CASAVA_Build 3 80035646 2I TGCATGGCCC --/AG AGAGTTAGCT 3070 het 3070 hom 58 24 29 5 AG 2 3 166099 CASAVA_Build 3 80039754 1D GTATTAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 10 9 166100 CASAVA_Build 3 80039873 1D ATAGAGAAGG C/- TCAATATGGT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 C 1 0 166101 CASAVA_Build 3 80040337 3I AAGCCCAAAA ---/CAT CATAGTTAGG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 CAT 1 2 166102 CASAVA_Build 3 80041607 2D AATACACCCC TT/-- TTTTTTAGCA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 T 8 6 166103 CASAVA_Build 3 80042204 1D TTTCCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 11 10 166104 CASAVA_Build 3 80042993 2D GTTTCATAAC AT/-- AGCTGATAAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 6 AT 1 0 166105 CASAVA_Build 3 80046383 1I CTATTTCCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 9 10 166106 CASAVA_Build 3 80049181 8D GTAGAAGGAA AAAGAAGG/-------- AAAGAAGGAA 3070 hom 67 het 30 0 22 9 AAAGAAGG 3 2 166107 CASAVA_Build 3 80051104 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 26 het 11 0 9 3 A 8 7 166108 CASAVA_Build 3 80054552 1I AAATAAAGTA -/T TTTTTCCCTG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 5 6 166109 CASAVA_Build 3 80084370 2I TCTTTCTGTT --/AC AGTTTGTATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AC 0 1 166110 CASAVA_Build 3 80086632 1D CGTCCTGAAA G/- ATAAGCCCAA 3070 hom 114 het 42 0 38 5 G 1 0 166111 CASAVA_Build 3 80098151 1D ATAAAAAAAA T/- ATTTAGATCT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 1 0 166112 CASAVA_Build 3 80098393 1D CACAAAGCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 10 9 166113 CASAVA_Build 3 80117527 1D ATCTAATAGT A/- GATGAAATAG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 1 0 166114 CASAVA_Build 3 80122265 4D GTAGAGAAAC TCAG/---- TCAGCAGAAA 3070 het 3070 hom 40 13 22 6 TCAG 2 1 166115 CASAVA_Build 3 80124808 1D GTTGTTGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 14 0 14 1 T 10 9 166116 CASAVA_Build 3 80131845 7I TGTCTTTACT -------/TAATCCC TTTTATGATG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TAATCCC 0 1 166117 CASAVA_Build 3 80151667 3D ATATTGATTT ATA/--- ATACTATTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 ATA 2 1 166118 CASAVA_Build 3 80156797 1I TATGTCCCTA -/T TTTTAAGTTT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 T 4 5 166119 CASAVA_Build 3 80163549 4I TAATGAATAA ----/ATAC ATGATTTATC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ATAC 0 1 166120 CASAVA_Build 3 80165615 5D AAAATATATT ATTAA/----- ATTATCTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 18 3 ATTAA 1 0 166121 CASAVA_Build 3 80186289 1I GGAAAATGTG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 9 166122 CASAVA_Build 3 80202095 7I AAGTTAGATT -------/ACAGAGA ACAAATAGCT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 ACAGAGA 0 1 166123 CASAVA_Build 3 80246446 1D CAGCAAGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 T 10 9 166124 CASAVA_Build 3 80252014 1D TCTAAAGGGG A/- AAAAATCAAT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 A 6 5 166125 CASAVA_Build 3 80278183 1D GTAATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2884 het 2844 hom 21 10 8 3 T 13 12 166126 CASAVA_Build 3 80290991 2I CATAATAAGT --/AC AGTCCCCGCT 3070 hom 79 het 32 0 27 5 AC 0 1 166127 CASAVA_Build 3 80307313 1D TCTTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 582 hom 25 2 18 6 T 14 13 166128 CASAVA_Build 3 80309190 1D TTTTTTATTT A/- AAAAAGTGTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 A 6 5 166129 CASAVA_Build 3 80310237 1D ATCCCTGAGG A/- ATCGCCCCAC 3070 het 3070 ref 15 7 7 1 A 2 1 166130 CASAVA_Build 3 80316329 2I TATCTTTTTA --/TC TTATTTTTTT 2800 het 982 hom 13 2 8 3 TC 0 1 166131 CASAVA_Build 3 80316846 3I CAGGATAATC ---/TTG TTGTTAATGT 3070 het 3070 ref 59 24 27 8 TTG 1 2 166132 CASAVA_Build 3 80318806 1D TCTTACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 13 12 166133 CASAVA_Build 3 80321212 1I TTAGCCAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 11 12 166134 CASAVA_Build 3 80321668 1D TGCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 A 10 9 166135 CASAVA_Build 3 80330266 1I TATTCATATA -/T AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 T 0 1 166136 CASAVA_Build 3 80342582 1D CAAAGCCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 11 10 166137 CASAVA_Build 3 80351041 1I AAGATTTGTT -/A AAAAATGATT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 5 6 166138 CASAVA_Build 3 80352609 1D TTTTCATAAA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 7 6 166139 CASAVA_Build 3 80359660 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 AC 9 8 166140 CASAVA_Build 3 80362844 1D ACCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 18 11 A 11 10 166141 CASAVA_Build 3 80370553 1I GATAATCTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 T 8 9 166142 CASAVA_Build 3 80372530 1D ACAGTTTTTA T/- TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 2 1 166143 CASAVA_Build 3 80372760 1I AGTAAAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 8 9 166144 CASAVA_Build 3 80373392 1D CACACATATA T/- TGGCTTTTAC 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 T 2 1 166145 CASAVA_Build 3 80389333 2D ATCACATTTG GT/-- GTCCTCAGTA 3070 het 3070 hom 62 23 35 6 GT 2 1 166146 CASAVA_Build 3 80390365 2I ATGTGTGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 AT 6 7 166147 CASAVA_Build 3 80395350 1D ATGTGGCAAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 T 8 7 166148 CASAVA_Build 3 80408129 1I ATTCAATTTA -/T GTTTAAATTA 2072 het 2072 ref 32 21 5 6 T 0 1 166149 CASAVA_Build 3 80408323 5I AATAAAAGTA -----/AAGTT AATTTGGCTC 3039 het 3039 ref 27 17 8 2 AAGTT 0 1 166150 CASAVA_Build 3 80408626 1I ATGAGCAAAA -/G TTTCTCTAAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 G 0 1 166151 CASAVA_Build 3 80416234 1D ATTTTGGTAA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 7 6 166152 CASAVA_Build 3 80417752 1I TTTGAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 A 11 12 166153 CASAVA_Build 3 80423025 1D CAAAATCATA T/- CACTCCACCC 3070 het 3070 hom 60 27 29 5 T 1 0 166154 CASAVA_Build 3 80429924 1I TATCTAACTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 T 8 9 166155 CASAVA_Build 3 80430983 1I TACATCTATA -/T TTTTAGTAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 4 5 166156 CASAVA_Build 3 80447905 1I CCAGGAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 700 hom 39 3 26 10 T 13 14 166157 CASAVA_Build 3 80452612 13D GGATAATTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 1543 het 17 hom 15 1 5 9 T 27 14 166158 CASAVA_Build 3 80454730 1D ATTATTTATC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 9 8 166159 CASAVA_Build 3 80455999 4D CATATCATAG AATA/---- AATCTAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AATA 1 0 166160 CASAVA_Build 3 80469853 2D TTTTTTTTCC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 31 13 9 10 TG 9 8 166161 CASAVA_Build 3 80470542 5D TATCCTCAGC AGGGT/----- AGGCTTATCC 3070 het 3070 ref 56 34 18 9 AGGGT 1 0 166162 CASAVA_Build 3 80471801 4I TTCTTTGTGG ----/AGTA AGTGAGTGCT 3070 hom 151 het 57 0 49 8 AGTA 0 1 166163 CASAVA_Build 3 80533700 12D ATAGGTAAGC AAGCTAGGAGCT/------------ TGCACGGAGG 3070 het 3070 hom 26 13 10 5 AAGCTAGGAGCT 1 0 166164 CASAVA_Build 3 80533885 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 7 6 166165 CASAVA_Build 3 80537934 1D TACTAATTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 10 9 166166 CASAVA_Build 3 80538038 1I TATACAACAT -/A GGGGGGCTGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 0 1 166167 CASAVA_Build 3 80548578 1D AGTAAGATAG A/- AGCAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 2 1 166168 CASAVA_Build 3 80552927 4D TGCTGTTGAT AGTC/---- AGGAAAAAGC 3070 het 3070 ref 49 28 15 10 AGTC 1 0 166169 CASAVA_Build 3 80554776 1D ATCTCTGGTG A/- ATTTTCATTT 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 A 2 1 166170 CASAVA_Build 3 80559914 1D ATTACAGGAA T/- TTTTCTGACA 3070 het 3070 hom 35 14 18 5 T 5 4 166171 CASAVA_Build 3 80562519 1I ATTCAGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 10 11 166172 CASAVA_Build 3 80568123 1D TTTCAGTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 18 15 4 T 9 8 166173 CASAVA_Build 3 80570943 1I ATTGATTATG -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 T 7 8 166174 CASAVA_Build 3 80577410 2I TATAACATTT --/TG TGTCATTTGT 3070 het 3070 ref 32 16 16 0 TG 1 2 166175 CASAVA_Build 3 80599903 1I CTGTTCACAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 T 8 9 166176 CASAVA_Build 3 80613200 1D TGAATTCCAC T/- TTTTTTTTTT 648 het 648 ref 23 14 3 6 T 13 12 166177 CASAVA_Build 3 80616991 2D AGACATAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 12 10 166178 CASAVA_Build 3 80620558 2D TATGTATGGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 TG 8 7 166179 CASAVA_Build 3 80628719 1D ACTAGGAAAA G/- CAGAGCCCCA 3070 het 3070 ref 51 25 13 14 G 1 0 166180 CASAVA_Build 3 80629532 2I ACCCTGAGCA --/TG TGCACACCCA 2803 het 2803 ref 33 14 9 10 TG 1 2 166181 CASAVA_Build 3 80631014 3D TTTAGATTCC AGA/--- AGAAGAATCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 AGA 3 2 166182 CASAVA_Build 3 80632604 3D CTTTTAAACC TTA/--- CACTGATTTC 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 TTA 1 0 166183 CASAVA_Build 3 80634184 1I TCCTTTCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 T 9 10 166184 CASAVA_Build 3 80634530 1D ACTGTCTCTC T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 8 7 166185 CASAVA_Build 3 80637292 4I CCATTTTCAG ----/TTTT TTTTTTTTTG 2253 het 2253 ref 24 11 7 6 T 9 13 166186 CASAVA_Build 3 80637351 1I ATTTGTTTAT -/A TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 0 1 166187 CASAVA_Build 3 80640041 1I ATTGTTCCTC -/A AATTTCTTAT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 2 3 166188 CASAVA_Build 3 80641670 5D TTTAATAAAC TGAAG/----- TGAAGAATGA 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 TGAAG 2 1 166189 CASAVA_Build 3 80643635 2D CATTACTCAC AG/-- GTTTGTGGTG 3070 het 3070 ref 52 29 21 2 AG 1 0 166190 CASAVA_Build 3 80653729 1I TTCCCAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 T 10 11 166191 CASAVA_Build 3 80661636 2I CTAACAATCT --/CC CCATCTTGCC 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 C 2 4 166192 CASAVA_Build 3 80666298 1I TAGCAGTGTG -/A AAATGGGCTA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 3 4 166193 CASAVA_Build 3 80666900 3D AAAAAAAAAT AAC/--- AACAGGTAGC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 AAC 2 1 166194 CASAVA_Build 3 80676259 2I TGACATCCAC --/AT GATTTCTTTG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 AT 0 1 166195 CASAVA_Build 3 80677810 1D TGTATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 312 hom 31 7 16 9 T 16 15 166196 CASAVA_Build 3 80681310 1I TTATGCCACA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 7 8 166197 CASAVA_Build 3 80694008 1I CCTAGGGGGG -/A AAAAATCTCT 3070 het 3070 ref 42 20 20 2 A 5 6 166198 CASAVA_Build 3 80717700 1D ACAATGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 11 10 166199 CASAVA_Build 3 80722423 1D ATTATTTCAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 9 8 166200 CASAVA_Build 3 80722805 4D AGATTAAAAA ACTG/---- ACTGATGAGA 3070 het 3070 hom 20 7 10 8 ACTG 2 1 166201 CASAVA_Build 3 80733183 1D AAATGAACTC A/- AAAATGAATC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 5 4 166202 CASAVA_Build 3 80733569 1I GCCACTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 10 11 166203 CASAVA_Build 3 80746804 5I TATTCAATAT -----/TATAA TATAATAAAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 TATAA 1 2 166204 CASAVA_Build 3 80754457 1D TTTGGAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 9 166205 CASAVA_Build 3 80758612 1I TCTTTCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 T 13 14 166206 CASAVA_Build 3 80762037 10D GATGATTCTT TACAACCCTG/---------- TATAGGAAGG 3070 het 3070 ref 42 23 19 4 TACAACCCTG 1 0 166207 CASAVA_Build 3 80775044 2I CTGTATAAAC --/AT GTGTGTATAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AT 0 1 166208 CASAVA_Build 3 80782476 8I ACAGACTTCT --------/AATTGTTG AATTGTTGTT 3070 het 3070 hom 51 17 25 9 AATTGTTG 1 2 166209 CASAVA_Build 3 80788818 1D AGCAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1237 het 1237 ref 37 30 3 4 A 13 12 166210 CASAVA_Build 3 80796563 1D CTGTAAAGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 9 8 166211 CASAVA_Build 3 80810387 1D AAATGGTCCA T/- TACAATGAAA 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 2 1 166212 CASAVA_Build 3 80830809 1D CAATTTTCTA C/- AAAAATATAA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 C 1 0 166213 CASAVA_Build 3 80833283 6D TTAGGTCAAG AGTGTT/------ TATGTTTAAG 3070 het 3070 ref 32 19 14 4 AGTGTT 1 0 166214 CASAVA_Build 3 80837487 1I CATAAATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2408 hom 29 6 20 3 T 10 11 166215 CASAVA_Build 3 80843726 2I TAACTCTCCA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 AT 5 6 166216 CASAVA_Build 3 80849298 2I TAATATATAC --/AT ATATATATAT 2989 het 2454 hom 22 7 9 6 AT 5 6 166217 CASAVA_Build 3 80849747 6I TAAAACATTA ------/TACGGC TGCTTTTTAC 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 TACGGC 0 1 166218 CASAVA_Build 3 80856951 4I GCAACTCTTC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 TTTG 3 4 166219 CASAVA_Build 3 80865175 6I ATGAATGAGA ------/TTTCAG TTAAAGTTCT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 TTTCAG 0 1 166220 CASAVA_Build 3 80865547 4I ATGGGTAGTT ----/AATC AATCACACTG 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 AATC 1 2 166221 CASAVA_Build 3 80868425 1I CTGGGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 14 13 15 A 15 16 166222 CASAVA_Build 3 80869668 1I TAGTTTTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 10 11 166223 CASAVA_Build 3 80876407 3D TTATTCTTAC AAT/--- AATGCAATGT 3070 het 3070 hom 34 12 20 5 AAT 2 1 166224 CASAVA_Build 3 80880061 4D TGTTAGAACA ATTT/---- ATTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 ATTT 2 1 166225 CASAVA_Build 3 80890197 3I TGTAGATAAA ---/CTT CTTGTTTGTA 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 CTT 1 2 166226 CASAVA_Build 3 80904036 4D AATGTTTCTT ACTC/---- AGCTTGATAA 3070 het 2768 hom 41 8 20 15 ACTC 1 0 166227 CASAVA_Build 3 80904058 2D AAGCATCACT AA/-- GTTTTTATGA 3070 het 1692 hom 44 5 21 20 A 2 0 166228 CASAVA_Build 3 80908006 1D TTAATGTGAG A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 7 6 166229 CASAVA_Build 3 80908273 1D AGGAATGAAA T/- TTCCAAATGC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 3 2 166230 CASAVA_Build 3 80910820 2D ATGTATATTC TA/-- TATGTCGCTA 3070 het 2475 hom 17 6 8 4 TA 2 1 166231 CASAVA_Build 3 80913894 1D TGGACATATG T/- TTTTCATTTG 3070 hom 75 het 33 0 26 8 T 5 4 166232 CASAVA_Build 3 80927090 4I ATTTTACTGA ----/TTAT TTTACTCCCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TTAT 0 1 166233 CASAVA_Build 3 80930820 1D CGTAGATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 121 het 44 0 40 4 A 11 10 166234 CASAVA_Build 3 80937273 1D GAAAACTCTT C/- CCAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 64 26 29 9 C 3 2 166235 CASAVA_Build 3 80945724 1D CAAAGGATAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 53 hom 33 2 11 21 A 9 8 166236 CASAVA_Build 3 80947557 1D ATATTTTTTA T/- AAAAAACCTC 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 1 0 166237 CASAVA_Build 3 80956261 1D TAAATACTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 10 9 166238 CASAVA_Build 3 80964744 1D CTTCTTGCTC A/- TTGTAGCAGA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 1 0 166239 CASAVA_Build 3 80968245 3D TATTTCTGTC ATT/--- ATTCAAAGAT 3070 het 3070 hom 37 17 20 2 ATT 2 1 166240 CASAVA_Build 3 80976354 1I TAAATTCCAC -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 6 7 166241 CASAVA_Build 3 80976837 1D TTTAAAATTG A/- AAAAAATGCT 2996 het 2996 ref 25 16 8 1 A 7 6 166242 CASAVA_Build 3 80985465 4I TTAAAAGGAA ----/AATT AATTATTAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 AATT 1 2 166243 CASAVA_Build 3 80987724 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2812 hom 38 10 24 4 TA 6 5 166244 CASAVA_Build 3 80996049 1D CTGGAGGTCA T/- TATGTTAAGT 3070 het 3070 hom 48 19 27 2 T 2 1 166245 CASAVA_Build 3 81003654 1I CTCTGTTCCT -/G GCTTACCCTT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 G 1 2 166246 CASAVA_Build 3 81007326 3I CTATTTAGTG ---/TAT TATTTATGCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TAT 1 2 166247 CASAVA_Build 3 81007853 3D TTAAAAAAAA TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TTC 1 0 166248 CASAVA_Build 3 81011420 1I AATTATCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 10 11 166249 CASAVA_Build 3 81011526 4D AAAAGATCTT TATG/---- TAGTGACAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 7 TATG 1 0 166250 CASAVA_Build 3 81014365 1D GAGACCCCGG A/- AAAAAAAAAA 2108 het 1818 hom 18 8 6 4 A 15 14 166251 CASAVA_Build 3 81018427 1I CTATCGTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 9 10 166252 CASAVA_Build 3 81022405 3I AAATCAAAGG ---/TAA TAATAACATA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 TAA 2 3 166253 CASAVA_Build 3 81023488 1D GTAGATGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 10 9 166254 CASAVA_Build 3 81036908 1I TTTTACATAT -/A AAAAAAAAAA 2816 het 2816 ref 24 14 7 3 A 10 11 166255 CASAVA_Build 3 81040119 5I ATTAAAAAAG -----/AAGAA AAGAGAGAAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 AAGAA 0 1 166256 CASAVA_Build 3 81058455 1I TCCCTCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 281 hom 26 1 19 6 A 11 12 166257 CASAVA_Build 3 81058835 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 986 het 986 ref 51 42 4 5 A 12 11 166258 CASAVA_Build 3 81059926 3D ATTAGCAAAC ATT/--- ATTAATTTTC 3070 het 3070 hom 60 25 29 6 ATT 2 1 166259 CASAVA_Build 3 81071896 22D GACTTAATTC ATATATATATATATATATATAT/---------------------- ATATATATAT 3070 hom 39 het 19 0 14 7 AT 16 5 166260 CASAVA_Build 3 81089626 13D AACATCACAA AGCATTTTCACAG/------------- AGAGATTGTT 3070 het 3070 ref 56 31 22 6 AGCATTTTCACAG 1 0 166261 CASAVA_Build 3 81100063 1I CTTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 47 het 34 1 26 7 T 9 10 166262 CASAVA_Build 3 81101558 8D GAGCTCCCTA TGCCAACC/-------- TGCCAACCAG 3070 hom 78 het 29 0 26 5 TGCCAACC 2 1 166263 CASAVA_Build 3 81113121 2D ACTTTCCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 2632 het 2632 ref 49 21 13 15 TC 8 7 166264 CASAVA_Build 3 81116695 2D TATGCGTGTG GC/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 38 0 36 4 GC 1 0 166265 CASAVA_Build 3 81117941 3D TTTCTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1808 het 116 hom 22 3 7 12 T 19 16 166266 CASAVA_Build 3 81120270 1I AAGAACTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 9 10 166267 CASAVA_Build 3 81123953 2D TTTCTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 28 6 15 7 T 15 13 166268 CASAVA_Build 3 81133133 5D TTGATTAATT GACTC/----- TCTTATTATT 3070 het 3070 ref 40 23 15 6 GACTC 1 0 166269 CASAVA_Build 3 81156696 1I CAAATCCATT -/G GGGCAGCTCC 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 G 3 4 166270 CASAVA_Build 3 81166142 1D ATATGCATGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 9 8 166271 CASAVA_Build 3 81169172 4D TTGCTTAATA AACT/---- AAGTTTATAT 3070 het 3070 hom 50 22 24 5 AACT 1 0 166272 CASAVA_Build 3 81176365 5I GAAGTATTTA -----/GAGTT ATTTATTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 GAGTT 0 1 166273 CASAVA_Build 3 81179792 2D AAGCAAAAAT AG/-- AGAGTGCTGG 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 AG 3 2 166274 CASAVA_Build 3 81190364 3D ATTTTGTTGC TGT/--- TGTTGTACTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TGT 3 2 166275 CASAVA_Build 3 81195058 1D AACAACTACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 10 9 166276 CASAVA_Build 3 81202312 9I AATTGGTAGG ---------/AAAAACAAT AAAAACAATG 3070 hom 111 het 46 0 38 9 AAAAACAAT 1 2 166277 CASAVA_Build 3 81205275 1D TACTCCTTTT A/- AAAAATTATT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 6 5 166278 CASAVA_Build 3 81206522 15D ATTCTGTGAT GGTTTCTTTCATCAC/--------------- TCTTCTACTT 3070 hom 132 het 46 0 45 6 GGTTTCTTTCATCAC 1 0 166279 CASAVA_Build 3 81214143 1I AAGTGATTTT -/A TAAATTTTGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 0 1 166280 CASAVA_Build 3 81215929 1D TTGTGGCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 10 9 166281 CASAVA_Build 3 81241689 1I ATTGGTCTGA -/C AGGTTTTTCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 166282 CASAVA_Build 3 81267285 2D ATCTATATTC AT/-- ATATATATAT 1945 het 1945 ref 26 16 6 4 AT 10 9 166283 CASAVA_Build 3 81272692 4D GGAAGGAAGA AAGG/---- AAGGAAGGGA 3070 het 1264 hom 39 9 18 13 AAGG 3 2 166284 CASAVA_Build 3 81272789 1D GAAAGAGAAA G/- GGGGGGAATA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 G 7 6 166285 CASAVA_Build 3 81278918 1I AAAATGTCTA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 7 8 166286 CASAVA_Build 3 81283401 1I AAAAAAATTC -/G GGGGGGGGCA 1293 het 1293 ref 14 5 5 4 G 8 9 166287 CASAVA_Build 3 81284415 2I TATTAGTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 10 12 166288 CASAVA_Build 3 81285911 1D GAAGAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1561 hom 26 6 14 7 A 12 11 166289 CASAVA_Build 3 81298746 1I TCTCAGTTTT -/A ATTTAAAAAT 3070 het 3053 hom 19 9 9 1 A 1 2 166290 CASAVA_Build 3 81311672 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1036 hom 16 4 9 3 A 13 12 166291 CASAVA_Build 3 81324695 2I GCAAACATGT --/AC ACATATATAC 3070 het 3070 ref 29 13 15 1 AC 1 2 166292 CASAVA_Build 3 81327041 1D ATTAAAACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 10 9 166293 CASAVA_Build 3 81329108 2D GGATTAAGAA AG/-- AGAATATCCA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 AG 2 1 166294 CASAVA_Build 3 81333091 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 6 7 166295 CASAVA_Build 3 81344710 2D ACAATTTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 34 0 22 13 A 14 12 166296 CASAVA_Build 3 81347676 1I TTAGGGCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 23 1 13 9 T 12 13 166297 CASAVA_Build 3 81351283 2I AGTAATAAAC --/AT ATGTCACATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 1 2 166298 CASAVA_Build 3 81357111 1I TTTGTGAATC -/A AAAACTATGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 4 5 166299 CASAVA_Build 3 81358098 2I TTTTTAGTGA --/CT CTCTCTTACT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CT 3 4 166300 CASAVA_Build 3 81359859 1D TCCTCAGGGG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 42 18 17 8 T 7 6 166301 CASAVA_Build 3 81361885 1I TTAATTATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 8 16 7 T 9 10 166302 CASAVA_Build 3 81365709 6D CCAGGTGGAG GTAATT/------ GAATCATGGG 3070 het 3070 ref 28 16 10 5 GTAATT 1 0 166303 CASAVA_Build 3 81370168 1I TATTTCTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 11 12 166304 CASAVA_Build 3 81370943 1I GTAATTCTGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 T 7 8 166305 CASAVA_Build 3 81373981 1D GAAAGTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 11 10 166306 CASAVA_Build 3 81375610 1I ACCACTGAAT -/G GGCTGAGCCA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 G 2 3 166307 CASAVA_Build 3 81379388 1D ATCTATCTGG A/- AAAAAAAAAA 1295 het 1295 ref 28 22 3 4 A 13 12 166308 CASAVA_Build 3 81390039 1I TGATGAGAAC -/T TTTTTTTTAT 1792 het 1792 ref 25 19 4 2 T 8 9 166309 CASAVA_Build 3 81394307 1I TCACAAGAGT -/A AAAATATTAA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 A 4 5 166310 CASAVA_Build 3 81396366 1D ATGAAATGTG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 45 18 20 7 A 9 8 166311 CASAVA_Build 3 81408610 5I AAATGTTTCT -----/TTATA TTATATTATA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 TTATA 3 4 166312 CASAVA_Build 3 81429915 1D AAGTTGGAGA T/- TTTTCCAGAA 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 T 5 4 166313 CASAVA_Build 3 81460923 1I GAACACAATT -/G ACCTAGGCCA 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 G 0 1 166314 CASAVA_Build 3 81476014 1I GGCTAACATA -/T CTTACTGATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 166315 CASAVA_Build 3 81493268 1D TGGAAATAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 10 9 166316 CASAVA_Build 3 81507650 1D CTATTCAAAT A/- AACATCTATT 3070 het 3070 ref 49 31 16 2 A 3 2 166317 CASAVA_Build 3 81508286 1I ACTGTAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 T 10 11 166318 CASAVA_Build 3 81508693 1D ATTTGAAGCC A/- AAAAAACAGT 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 A 7 6 166319 CASAVA_Build 3 81510582 1D CATTACGCAA T/- TAATTCAAAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 2 1 166320 CASAVA_Build 3 81514701 1I GATGACAATT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 7 8 166321 CASAVA_Build 3 81543625 1I TTATCCACTT -/C CCTTTTGGAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 2 3 166322 CASAVA_Build 3 81544096 1D CTATAATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 T 12 11 166323 CASAVA_Build 3 81549207 6I GCTAAACATA ------/TTAGAC TTAAATTTGT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 TTAGAC 0 1 166324 CASAVA_Build 3 81553561 1I AGAAGAAAAG -/A AAAAAAACGA 3070 hom 90 het 39 0 31 10 A 7 8 166325 CASAVA_Build 3 81560935 1I ATATCCATAA -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 81 het 35 0 26 9 T 7 8 166326 CASAVA_Build 3 81570905 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2172 het 2172 ref 19 7 7 5 A 11 12 166327 CASAVA_Build 3 81610703 1D ATATAAGGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 9 166328 CASAVA_Build 3 81639532 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TA 6 7 166329 CASAVA_Build 3 81646065 1I AACACATGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 542 hom 33 2 25 6 A 9 10 166330 CASAVA_Build 3 81650202 1D GGTCCCCCTT C/- AAGAAAAAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 C 1 0 166331 CASAVA_Build 3 81673300 1D TGCCCCCCCC G/- CCACCTCGCC 1864 het 1864 ref 28 14 7 8 G 1 0 166332 CASAVA_Build 3 81677068 1I ATTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 11 166333 CASAVA_Build 3 81687960 12D ACCTAAACTT GTAAATTTCCAA/------------ GTAAATTTCC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 GTAAATTTCCAA 2 1 166334 CASAVA_Build 3 81691302 1I TCTTCAGCCA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 60 het 40 1 35 4 T 8 9 166335 CASAVA_Build 3 81695678 1I GGTTTAGATA -/C TATAAGTAAC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 166336 CASAVA_Build 3 81718632 1D AGATAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 36 1 28 7 T 15 14 166337 CASAVA_Build 3 81719945 1D CAAATGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 13 12 166338 CASAVA_Build 3 81720436 1D AATCCTTTTG A/- AAAGCTTGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 4 3 166339 CASAVA_Build 3 81730246 1I ATAGAATGCC -/A AAAAAAGTCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 6 7 166340 CASAVA_Build 3 81736618 4D GAGGAAAACT TAAG/---- TAAGAAATTA 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 TAAG 2 1 166341 CASAVA_Build 3 81742846 1I CTGGGGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 11 12 166342 CASAVA_Build 3 81748947 1I TCTGGAGGGG -/T TTTGTTTAGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 3 4 166343 CASAVA_Build 3 81751025 1D ATTCTGCAGA C/- CCCTCAGCAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 4 3 166344 CASAVA_Build 3 81752027 1D ATGGAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 33 1 17 16 T 15 14 166345 CASAVA_Build 3 81759606 4D ATATATATAT ATAA/---- AAAACATATA 1965 hom 5 het 10 0 9 3 ATAA 1 0 166346 CASAVA_Build 3 81781354 1I ATTGTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 212 hom 36 1 31 4 A 10 11 166347 CASAVA_Build 3 81789234 1D AAAAAAAAAA T/- ATCTATTGAA 3070 het 157 hom 37 2 27 8 T 1 0 166348 CASAVA_Build 3 81792552 1I ACTGAAGTGC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 9 166349 CASAVA_Build 3 81797829 14I TTCTTTTTAT --------------/AATATTCATATCAA AGTCGAATGC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AATATTCATATCAA 0 1 166350 CASAVA_Build 3 81839761 11D ATCAAGAATG ATATACCCTTA/----------- ATATCAGTGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATATACCCTTA 1 0 166351 CASAVA_Build 3 81841264 4I ATAAAATGAT ----/CAAA CAGTGTGGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CAAA 0 1 166352 CASAVA_Build 3 81858079 1D TTGAGGGTGT G/- GGAGCTGGGC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 3 2 166353 CASAVA_Build 3 81863871 4D ACAAAACAAT AACA/---- AACAAAAACT 3070 het 3070 hom 51 21 26 6 AACA 2 1 166354 CASAVA_Build 3 81869579 1I AAAATGTGTG -/T TTTTTTATTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 6 7 166355 CASAVA_Build 3 81872125 5D ATTTATTATT TAATC/----- TATTCTTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 3 TAATC 1 0 166356 CASAVA_Build 3 81876132 2I ATCAGTACTC --/TT TTAAGTTACA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 2 4 166357 CASAVA_Build 3 81881958 1D TCAAAATGGT C/- AAGAGGATGG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 1 0 166358 CASAVA_Build 3 81917049 3I GCGTGGTACA ---/ATT ATTCATGTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ATT 1 2 166359 CASAVA_Build 3 81923902 1I ACCCTTTTTC -/T TGCTGTATTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 1 2 166360 CASAVA_Build 3 81924642 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 166361 CASAVA_Build 3 81953033 2I ACTAAAATTT --/TA GTTAGTGAAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TA 0 1 166362 CASAVA_Build 3 81953347 2I TGCAAAAATG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 10 hom 29 1 21 7 A 9 11 166363 CASAVA_Build 3 81960106 2I CACTGAGCAC --/AG GGGGAGATTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AG 0 1 166364 CASAVA_Build 3 81992220 2I GTAGGAAGAA --/AG AAATCTGAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AG 0 1 166365 CASAVA_Build 3 82017563 1I CATTATGAGA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 8 166366 CASAVA_Build 3 82025686 1I AGATTAAGTG -/T TTTTGTTAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 4 5 166367 CASAVA_Build 3 82048644 1D TGAGAATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 37 0 30 7 T 11 10 166368 CASAVA_Build 3 82050185 1D TCACATTCCT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 77 het 32 0 22 11 G 12 11 166369 CASAVA_Build 3 82060279 1I TTCTTCACTT -/A ATACATGTAA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 A 1 2 166370 CASAVA_Build 3 82067085 1D TCTTTCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 11 10 166371 CASAVA_Build 3 82075678 4D CTCTCTTCTG ACTT/---- ACAAGGTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 ACTT 1 0 166372 CASAVA_Build 3 82078110 1I ATCCCAGCAC -/T TTGGGGAGGC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 2 3 166373 CASAVA_Build 3 82084849 2I TTATTATTCC --/CA GTCATCTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CA 0 1 166374 CASAVA_Build 3 82085590 1D AAAAAATCGA T/- TTTTTTTTTT 2615 het 308 hom 22 2 9 11 T 15 14 166375 CASAVA_Build 3 82088327 4D CTGAAGAAAT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 108 het 44 0 36 10 GA 9 7 166376 CASAVA_Build 3 82094381 1D CATAGGTACT G/- GATTCACAGC 3070 hom 138 het 54 0 47 7 G 2 1 166377 CASAVA_Build 3 82095750 1D TTGTTTATAT G/- TAACACAATC 3070 hom 70 het 32 0 24 9 G 1 0 166378 CASAVA_Build 3 82111196 1I AATCTCCGAG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 7 8 166379 CASAVA_Build 3 82181494 4I AAAGGATGAT ----/ACTC AGGCAGAAAA 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 ACTC 0 1 166380 CASAVA_Build 3 82284238 1D GAATAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 1578 het 1578 ref 42 29 4 9 A 11 10 166381 CASAVA_Build 3 82334681 1I TTCCTAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 13 11 T 11 12 166382 CASAVA_Build 3 82343492 3I CAATTAGAGA ---/CTT CTTCTTTGAC 3070 hom 135 het 55 0 44 12 CTT 2 3 166383 CASAVA_Build 3 82346705 1D AAGAGCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 281 hom 37 1 28 8 T 12 11 166384 CASAVA_Build 3 82347674 2I ATATATATAT --/AC ACACACACGT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AC 4 5 166385 CASAVA_Build 3 82348496 1D ACTTTTTAAT G/- GGCAAAGTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 3 2 166386 CASAVA_Build 3 82355759 1D TTCTCAGGGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 8 166387 CASAVA_Build 3 82361128 10I GTTGGGATAG ----------/ATAAGGGGCC ATTTTGCAGG 2033 het 2033 ref 28 17 6 5 ATAAGGGGCC 0 1 166388 CASAVA_Build 3 82365967 1D TAAAAGAATG T/- CTTCAAATAG 3070 het 3070 ref 49 24 24 1 T 1 0 166389 CASAVA_Build 3 82373443 4I GAGAAAAACA ----/AAAT AAATAAACGT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 AAAT 1 2 166390 CASAVA_Build 3 82375748 4I TAACATTCTC ----/TGTT TGGCTACTTA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 TGTT 0 1 166391 CASAVA_Build 3 82377952 1D AACAGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 T 12 11 166392 CASAVA_Build 3 82378719 1D AAGACTTTGT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 A 8 7 166393 CASAVA_Build 3 82381418 1I CAAAATGCCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 7 8 166394 CASAVA_Build 3 82385383 1D TACAGTTTAC A/- AAAAAGTGTT 3070 hom 112 het 41 0 38 3 A 6 5 166395 CASAVA_Build 3 82407299 2D ACAGACACAC AT/-- GTGAGGCAAA 3070 het 3070 ref 36 23 10 6 AT 1 0 166396 CASAVA_Build 3 82411396 1D ATGTACCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 11 10 166397 CASAVA_Build 3 82412194 1D ACAACTGCTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 9 8 166398 CASAVA_Build 3 82414776 1D ATTGTTAGTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 9 8 166399 CASAVA_Build 3 82416595 1D TTAGCAAAAA T/- TTTAAAGCCT 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 T 4 3 166400 CASAVA_Build 3 82419849 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 53 23 22 9 A 8 7 166401 CASAVA_Build 3 82422805 2I CTACAACAGC --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 A 8 10 166402 CASAVA_Build 3 82423117 1I AAACTCTTGA -/G GAATTATTGC 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 G 1 2 166403 CASAVA_Build 3 82427852 2D AAATTATTAT TA/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 TA 1 0 166404 CASAVA_Build 3 82427945 7D ATTACAGAAC ACATACA/------- ACATACAAGT 3070 het 3070 hom 32 16 15 3 ACATACA 2 1 166405 CASAVA_Build 3 82436706 1D TGTGGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 T 12 11 166406 CASAVA_Build 3 82443714 12D TCTTTAGTTT CTTATTCATAAG/------------ CTTATCTCCA 3070 het 3070 ref 49 29 22 3 CTTATTCATAAG 1 0 166407 CASAVA_Build 3 82445486 1I ATTATGGGCA -/T TTTAACAATA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 3 4 166408 CASAVA_Build 3 82450863 1I CCAAAGGCAG -/A AAAAAAAAAA 1973 het 1973 ref 33 17 7 9 A 12 13 166409 CASAVA_Build 3 82459394 1D ACAATGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 12 11 166410 CASAVA_Build 3 82479041 1D ATTTTTTTTT G/- ATGGAGGTTC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 G 1 0 166411 CASAVA_Build 3 82481445 1D AAATACAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 11 10 166412 CASAVA_Build 3 82482295 1I AAAAAAAAAA -/G CCTCAAAATA 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 G 0 1 166413 CASAVA_Build 3 82493351 1D TTCTCCTGGA T/- TTTTTTTTTT 1085 het 1085 ref 43 34 3 6 T 12 11 166414 CASAVA_Build 3 82499024 1I GTTTATAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 9 10 166415 CASAVA_Build 3 82509414 1D TTATCACTTA T/- TTTTAAGGCA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 5 4 166416 CASAVA_Build 3 82509618 1D CCTCATCCAG T/- TTTTTTTTTT 2190 het 2190 ref 30 15 9 6 T 12 11 166417 CASAVA_Build 3 82521260 4I GGAACATGTA ----/TTCT TTCTTTCTCA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 TTCT 2 3 166418 CASAVA_Build 3 82523256 2D AAGGAATACA TG/-- TGTCTGTTCC 3070 het 3070 ref 36 20 10 7 TG 2 1 166419 CASAVA_Build 3 82528439 1D TACTATACAC A/- AAAAGCAATA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 5 4 166420 CASAVA_Build 3 82536769 1D TTATTATTTT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 7 6 166421 CASAVA_Build 3 82536832 1I ACCTTTTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2426 hom 29 7 15 7 T 8 9 166422 CASAVA_Build 3 82542873 1I TAGGAATGAT -/A AAGAAAAAAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 3 166423 CASAVA_Build 3 82549115 1D ATTACAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 32 2 24 6 T 11 10 166424 CASAVA_Build 3 82554728 1D CATCCTAAAG T/- TCCTGGGATT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 2 1 166425 CASAVA_Build 3 82565523 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2977 hom 21 8 10 3 A 9 8 166426 CASAVA_Build 3 82567887 1D AAAGGGAACA G/- GGGTAAGCTA 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 G 4 3 166427 CASAVA_Build 3 82569092 4I GTAATGAACA ----/AAGG AAGTGAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 AAGG 0 1 166428 CASAVA_Build 3 82570819 1D TTGTTTAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 10 9 166429 CASAVA_Build 3 82575170 2I CGTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 2838 het 1401 hom 29 8 10 11 TG 8 9 166430 CASAVA_Build 3 82579053 1I AGTCTTAGAG -/A AAAAGAGAGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 4 5 166431 CASAVA_Build 3 82585460 1D GAAATTTGAC G/- GGGGGGGGCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 G 9 8 166432 CASAVA_Build 3 82593027 5D GAGACTTTTC TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 hom 63 het 26 0 21 6 TGTTT 4 3 166433 CASAVA_Build 3 82599410 1D CACAATTCCT C/- CCAGGCTCCA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 C 3 2 166434 CASAVA_Build 3 82599835 1I TATTTCTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2921 hom 17 6 9 2 T 9 10 166435 CASAVA_Build 3 82603349 1D TTATTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 T 11 10 166436 CASAVA_Build 3 82606622 1I CTTCTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 10 11 166437 CASAVA_Build 3 82610129 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 10 11 166438 CASAVA_Build 3 82614480 6D ACTAAAAATC AAAACA/------ AAAACAACAA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 AAAACA 2 1 166439 CASAVA_Build 3 82615637 1D TATAATAGAA T/- TTTCAATTTA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 T 4 3 166440 CASAVA_Build 3 82618492 6D TCCCCCACCC CCCCAA/------ CACACACACA 2971 het 65 hom 15 1 8 7 CCCCAA 1 0 166441 CASAVA_Build 3 82620559 2D CTATTCACAC AG/-- AGATAATTTT 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 AG 2 1 166442 CASAVA_Build 3 82621821 1D ATAATATACA T/- TGTACCCATT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 2 1 166443 CASAVA_Build 3 82623256 1D ATACCCCTGC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 51 het 19 0 18 2 T 9 8 166444 CASAVA_Build 3 82624150 4D AAAGTTAAAA TGAT/---- TGATCACCTG 3070 hom 33 het 25 0 13 12 TGAT 2 1 166445 CASAVA_Build 3 82626478 5D TTTATTGAAG ATAAA/----- ATAATAAAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 6 ATAAA 1 0 166446 CASAVA_Build 3 82627314 2I CAGTGGTGCA --/GT GTTTCTGCAG 3070 hom 135 het 51 0 44 7 GT 1 2 166447 CASAVA_Build 3 82628480 1D AGAGAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 11 10 166448 CASAVA_Build 3 82644594 1D AAAACTTACA T/- TTTTTTTTTT 2814 het 2814 ref 32 12 7 13 T 17 16 166449 CASAVA_Build 3 82647516 1D CTTTCCTAGG C/- CACTTTGGAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 C 2 1 166450 CASAVA_Build 3 82651866 1I TTTTATCAGG -/A AAAAATAGCC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 5 6 166451 CASAVA_Build 3 82657727 3I TAGCTTTGTT ---/CTC CTGCACTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 CTC 0 1 166452 CASAVA_Build 3 82660548 1I CTCATATTCG -/T TTTTTTTTTT 3027 het 3027 ref 36 20 9 7 T 10 11 166453 CASAVA_Build 3 82676560 1D TGTGAAATGG A/- AAATAAAATA 3070 het 3070 hom 38 16 17 7 A 4 3 166454 CASAVA_Build 3 82677729 1D AAATATAAAT A/- AAAAAATCCC 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 7 6 166455 CASAVA_Build 3 82680043 1D CTTATGTAAC T/- GGATTCACAC 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 T 1 0 166456 CASAVA_Build 3 82680337 1I AAGAAACCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 A 9 10 166457 CASAVA_Build 3 82681869 1D TTTAATTCTG C/- TTCCATATTC 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 C 1 0 166458 CASAVA_Build 3 82691395 1D AAGCTCAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 A 12 11 166459 CASAVA_Build 3 82700337 1D TGATGACTGC A/- AAAAAAAAAA 1331 het 1331 ref 44 33 4 7 A 11 10 166460 CASAVA_Build 3 82702455 4D AAGGATTGTT AGTC/---- AGTTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 23 14 1 AGTC 1 0 166461 CASAVA_Build 3 82705963 3I62M2D ACCCAGAAAC ---AAGAAGAACATACACCTGCATAAACCAGGTGCTAAAATAAATTGCTCTTTCATAAATATTTAAT/AAGAAGAAGAACATACACCTGCATAAACCAGGTGCTAAAATAAATTGCTCTTTCATAAATATTTA-- ATGTGTCATC 3070 het 3070 ref 40 27 31 9 N/A 0 0 166462 CASAVA_Build 3 82706710 2D GCTGCTGCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1104 hom 44 15 14 15 A 18 16 166463 CASAVA_Build 3 82723065 11D TCTGATAACC CACTCTTTTTG/----------- CATTTAGGGA 3070 het 3070 ref 23 14 10 4 CACTCTTTTTG 1 0 166464 CASAVA_Build 3 82729088 1I GCATGAGGTG -/T TATGTCAGTA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 1 2 166465 CASAVA_Build 3 82742069 1I ATCAGAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 A 9 10 166466 CASAVA_Build 3 82742326 1I TAATAGGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 11 12 166467 CASAVA_Build 3 82751221 1I TGCCTCTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 T 9 10 166468 CASAVA_Build 3 82804817 1D TGGAGTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 12 9 T 13 12 166469 CASAVA_Build 3 82807007 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 395 het 395 ref 20 7 1 12 T 1 0 166470 CASAVA_Build 3 82808714 8I TGTGTGTGTG --------/TGTGTGTT TGTGTGTATG 3070 het 146 hom 32 5 15 12 TGTGTGTT 0 1 166471 CASAVA_Build 3 82811521 1I ATAAAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 hom 70 het 27 0 24 3 T 0 1 166472 CASAVA_Build 3 82821884 3I TGCATTGAAG ---/ATA ATGTCATAAA 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 ATA 0 1 166473 CASAVA_Build 3 82822276 2I TGGATTGTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 A 12 14 166474 CASAVA_Build 3 82822346 1I AACAAACATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 9 10 166475 CASAVA_Build 3 82824352 1I TTACTTGAAG -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 A 6 7 166476 CASAVA_Build 3 82824497 3I TTAAATGTAT ---/AGG CTTTCCTGCT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 AGG 0 1 166477 CASAVA_Build 3 82830205 2D GCACATGCAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 42 15 18 11 AT 8 7 166478 CASAVA_Build 3 82830353 2I TCTAATAGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 10 12 166479 CASAVA_Build 3 82833251 3D TTACATTTGT AAC/--- AACAGTGTAC 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 AAC 2 1 166480 CASAVA_Build 3 82834117 1I CATGGGGTTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 7 8 166481 CASAVA_Build 3 82839042 3I ACAGCCGGTG ---/TGT TGGGCTTTGG 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 TGT 0 1 166482 CASAVA_Build 3 82839198 1D TGCGGCTGCT G/- CCCCTCCCCT 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 G 1 0 166483 CASAVA_Build 3 82842378 1D ATTCCACCCC T/- GGTCCTTCCA 3070 het 3015 hom 21 7 14 1 T 1 0 166484 CASAVA_Build 3 82845690 1D GCTGGGAATA T/- GCTGATATTC 3070 het 3070 hom 57 23 33 1 T 1 0 166485 CASAVA_Build 3 82849893 1I AAACTTTTTT -/A TTTACTCCCC 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 0 1 166486 CASAVA_Build 3 82850773 1D TAGCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2852 hom 36 12 12 12 T 15 14 166487 CASAVA_Build 3 82858285 17D TTGCTAGGGC TGCCATTGTAATGGCAT/----------------- TACAATGTAA 3070 het 3070 ref 30 18 16 2 TGCCATTGTAATGGCAT 1 0 166488 CASAVA_Build 3 82885141 1I TGTTACTCTA -/T TTTTTTATCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 6 7 166489 CASAVA_Build 3 82889267 1D ACAGAGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 12 11 166490 CASAVA_Build 3 82904000 1I ACTTTGAAAG -/A AAAAAAGTAC 3070 het 3070 hom 46 24 20 2 A 6 7 166491 CASAVA_Build 3 82905475 4I ATTTGATTGT ----/CTAA CTAGGCTCTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 CTAA 0 1 166492 CASAVA_Build 3 82940409 4I TGTAACACAC ----/ATAT ATATATATAT 2330 het 2330 ref 23 9 7 7 AT 7 9 166493 CASAVA_Build 3 82942298 1I ACTGAAAAAC -/A AGATAGTAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 2 166494 CASAVA_Build 3 83023244 1I CAACCCAATG -/T TTTTTATCAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 5 6 166495 CASAVA_Build 3 83027682 1D ACATCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 11 10 166496 CASAVA_Build 3 83029340 4I GTTTTGCAGA ----/TTAT TTAAGAATTA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 TTAT 0 1 166497 CASAVA_Build 3 83032258 4D CAATTGTGAT ATAG/---- ATATAGTGCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 ATAG 1 0 166498 CASAVA_Build 3 83032643 1I CCCCTGCAGC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 7 8 166499 CASAVA_Build 3 83035544 1I AACTTTTAAG -/T ATTCCATTAT 3070 hom 72 het 30 0 25 8 T 0 1 166500 CASAVA_Build 3 83036698 2I TGCATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 109 het 45 0 36 9 TG 5 6 166501 CASAVA_Build 3 83036907 2D ATATAGATAT TA/-- TATATATATA 1319 hom 12 het 7 0 5 2 TA 8 7 166502 CASAVA_Build 3 83045674 1I TATTTCAAAC -/T TTTCATTATT 3070 hom 75 het 27 0 24 3 T 3 4 166503 CASAVA_Build 3 83046612 2I ATAATAAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 A 10 12 166504 CASAVA_Build 3 83058480 1D GTGTAATTGG T/- TTTTTTCTAG 3070 hom 129 het 51 0 44 8 T 7 6 166505 CASAVA_Build 3 83058656 1I ATTTAAAGTG -/A AAAAAACTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 7 166506 CASAVA_Build 3 83062030 1I TTATTATATA -/T TTTTCAAATT 2592 hom 15 het 7 0 6 1 T 4 5 166507 CASAVA_Build 3 83063201 2I CTTACAATGT --/AG AGAGATACAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AG 2 3 166508 CASAVA_Build 3 83074174 1D CCACTGCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 25 1 18 7 T 12 11 166509 CASAVA_Build 3 83097421 1D CCCTTATGAA T/- TTATTAGCTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 2 166510 CASAVA_Build 3 83111554 3I GTTTGTGGTC ---/ATT ATAGTATCAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATT 0 1 166511 CASAVA_Build 3 83112293 1I TTCTTTTTTT -/G TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 166512 CASAVA_Build 3 83113048 14D CTCTCTATAA CATAACAGTTCTTT/-------------- GTTCAAGGCC 3070 hom 81 het 29 0 27 4 CATAACAGTTCTTT 1 0 166513 CASAVA_Build 3 83115601 1D AAAAACACAT A/- GAGAGGAGAC 3070 hom 99 het 39 0 33 8 A 1 0 166514 CASAVA_Build 3 83126256 2D CCCATACATC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 AT 9 8 166515 CASAVA_Build 3 83157029 1I GAAATTGATG -/A ATACTAACCC 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 A 1 2 166516 CASAVA_Build 3 83165489 1I TTCACACTTT -/A AAAAAGACAA 3070 hom 126 het 44 0 42 2 A 5 6 166517 CASAVA_Build 3 83169528 1D CAATTATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 12 11 166518 CASAVA_Build 3 83182184 1D CTCCTTGTCT G/- GGTTCTCTTT 3070 hom 60 het 23 0 20 4 G 3 2 166519 CASAVA_Build 3 83186924 1D ATACTATTAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 33 0 23 11 A 9 8 166520 CASAVA_Build 3 83188229 2I ATTGTTCTTC --/TA TGTTTTTCTG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 TA 0 1 166521 CASAVA_Build 3 83202357 1D ATGACAAAGG A/- GACACCAAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 0 166522 CASAVA_Build 3 83203609 3D ACTAATGTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 37 1 15 21 A 20 17 166523 CASAVA_Build 3 83205889 1D ATAACACATT A/- AAAAAGTATT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 6 5 166524 CASAVA_Build 3 83216267 1I CTTGAGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 10 166525 CASAVA_Build 3 83216607 2D AACAACATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 44 1 22 21 T 18 16 166526 CASAVA_Build 3 83218945 4I CTAGAGAACC ----/CTAA CTAATACACC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CTAA 1 2 166527 CASAVA_Build 3 83220139 1D TATTGAAATC A/- TGGCCAACAC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 1 0 166528 CASAVA_Build 3 83223873 4D ACTTATAGAA CTGT/---- CTAATTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 4 CTGT 1 0 166529 CASAVA_Build 3 83238242 1I AAAAAGGACT -/C TGGTTTCTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 166530 CASAVA_Build 3 83238828 4D TTAACAATAC TGAG/---- TAATAATGAA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 TGAG 1 0 166531 CASAVA_Build 3 83255038 2D ACCAATGAAG TA/-- TGAGTAATCC 3070 hom 111 het 43 0 38 7 TA 1 0 166532 CASAVA_Build 3 83274360 4D TTTTCCAAAT AAAC/---- AAAGAGTAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 6 AAAC 1 0 166533 CASAVA_Build 3 83282934 7D TTCAAAGGTC ATAAAGG/------- ATAAAGTGTT 3070 hom 99 het 35 0 33 4 ATAAAGG 1 0 166534 CASAVA_Build 3 83289790 3I ATTAAACATT ---/TTA TTAACATAAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TTA 1 2 166535 CASAVA_Build 3 83304162 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 30 2 20 8 T 15 14 166536 CASAVA_Build 3 83307549 4I AAAAAAAAAT ----/AAAG ATTTAGCATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAAG 0 1 166537 CASAVA_Build 3 83308809 1I TTTACAACTT -/A ACAGCGTATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 166538 CASAVA_Build 3 83313353 5D ACATACATAT AAGAA/----- AAGAGGATGT 3070 het 3070 ref 54 30 20 6 AAGAA 1 0 166539 CASAVA_Build 3 83338282 1D CAGTACATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 626 hom 14 2 11 1 A 15 14 166540 CASAVA_Build 3 83340213 3D TTAAGCATAT AGA/--- AGAAGAACAT 3070 hom 105 het 43 0 35 9 AGA 3 2 166541 CASAVA_Build 3 83346270 2I AATCAGTTTG --/GA AATTGCTAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 GA 0 1 166542 CASAVA_Build 3 83371932 14D TTCAATGCTG TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 21 5 T 24 10 166543 CASAVA_Build 3 83393443 1D AAATACTCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 10 9 166544 CASAVA_Build 3 83396929 2D ATTATAGGTA AT/-- ATATATATAT 1817 het 1817 ref 11 5 4 2 AT 10 9 166545 CASAVA_Build 3 83441259 3I ATATAGGGAT ---/AGG GTATAGCCAG 3070 het 3070 ref 47 24 22 1 AGG 0 1 166546 CASAVA_Build 3 83450823 1I AACAAATAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 9 10 166547 CASAVA_Build 3 83535109 1D CAATATTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 A 10 9 166548 CASAVA_Build 3 83543042 3D TATAGTTAAC ATA/--- TAATGTTACT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 ATA 1 0 166549 CASAVA_Build 3 83559794 1D AAATAAAACC T/- TTTTTTTTTC 1605 het 1605 ref 46 35 4 7 T 10 9 166550 CASAVA_Build 3 83571166 1D AATATACCAG A/- AAAAAAAAAA 1788 het 1788 ref 31 18 4 9 A 16 15 166551 CASAVA_Build 3 83587375 1I GTGGTATTCC -/A AAAACAAATA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 4 5 166552 CASAVA_Build 3 83590195 1I GCTTAAACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 442 hom 28 1 18 9 A 12 13 166553 CASAVA_Build 3 83592572 1I TTAGGTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 9 10 166554 CASAVA_Build 3 83593753 1I ATCTATCAAA -/C ATTTTCTGGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 0 1 166555 CASAVA_Build 3 83596285 1I TAAAAAAAAA -/G CACATCAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 166556 CASAVA_Build 3 83598588 4D TGAGGATTAA ATAG/---- AAGGTAATAA 3070 hom 132 het 46 0 45 2 ATAG 1 0 166557 CASAVA_Build 3 83602314 4D GCAGTCCTAG CACA/---- CTAATATACC 3070 hom 108 het 42 0 36 7 CA 2 0 166558 CASAVA_Build 3 83605690 1D ATAAATCCAA T/- TTATCTATTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 3 2 166559 CASAVA_Build 3 83609208 1D TAAGCACTCT G/- GGTGTCAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 3 2 166560 CASAVA_Build 3 83609938 1I TTTTTTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 19 6 A 10 11 166561 CASAVA_Build 3 83611039 17D AATGGGAAGC TTTGTTAGTTAAGAAGT/----------------- TTTGTTAGTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TTTGTTAGTTAAGAAGT 2 1 166562 CASAVA_Build 3 83617698 1D ACATGGGGAG A/- AAAAAATTAC 3070 hom 138 het 49 0 46 3 A 7 6 166563 CASAVA_Build 3 83621796 3I TTTGAGTATT ---/ATC ATATTTTCTA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 ATC 0 1 166564 CASAVA_Build 3 83629920 3D TTTTCTCTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 22 8 T 17 14 166565 CASAVA_Build 3 83634717 1I TGGGCAGCTG -/C CTCCATTTAC 3070 hom 117 het 40 0 37 3 C 1 2 166566 CASAVA_Build 3 83634940 1I CCAGGAGTGG -/C CAAAGGCATA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 C 1 2 166567 CASAVA_Build 3 83638450 1D TGTCTCTACT A/- AAAAATACAA 3070 hom 66 het 24 0 22 3 A 6 5 166568 CASAVA_Build 3 83640641 30I ATTTATTCTT ------------------------------/AGAATGTCTTAGAATGTCTTAGACATTCTA ATGTCTTAGA 3070 hom 96 het 36 0 32 8 AGAATGTCTTAGAATGTCTTAGACATTCTA 0 1 166569 CASAVA_Build 3 83642689 1I CCTTCCACCA -/G GGGATATAAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 3 4 166570 CASAVA_Build 3 83643800 5D AGAGAAATAA ATCTT/----- ATCTTATATT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 ATCTT 2 1 166571 CASAVA_Build 3 83674522 1D GGTCTATGTG T/- TTTTTTTTTT 1632 het 1632 ref 36 20 5 11 T 17 16 166572 CASAVA_Build 3 83676094 1D AAGTTGTTCA T/- TTTTTTCATG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 7 6 166573 CASAVA_Build 3 83684488 1I TTAACAGTCC -/A AAAGCTGAAG 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 3 4 166574 CASAVA_Build 3 83688594 2I AATGGCCACT --/GA GAGTCTGCAC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 GA 1 2 166575 CASAVA_Build 3 83709334 2D AGTTGACTGG AT/-- ATATTTTAAA 3070 het 3070 hom 51 23 22 6 AT 3 2 166576 CASAVA_Build 3 83742698 16D TAGAACAGGG GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 84 het 28 0 28 4 GT 14 6 166577 CASAVA_Build 3 83756534 1D TGTACCCTAG A/- AATTAAAGTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 3 2 166578 CASAVA_Build 3 83756794 3D GGAAACAAAA AAC/--- AAAAATATAG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 AAC 1 0 166579 CASAVA_Build 3 83759897 1D AATGTTAATT A/- TAATTATTTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 1 0 166580 CASAVA_Build 3 83765476 1I CTTATCTAAA -/T TTTTTTAACT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 6 7 166581 CASAVA_Build 3 83777492 1D ATATGTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 T 11 10 166582 CASAVA_Build 3 83778938 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 8 7 166583 CASAVA_Build 3 83784161 1I GTCCTTTTTT -/G GGGGGGGGGC 3070 het 3056 hom 29 9 12 8 G 9 10 166584 CASAVA_Build 3 83803862 4D TATGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 TA 11 9 166585 CASAVA_Build 3 83810294 1I TGCACAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 A 10 11 166586 CASAVA_Build 3 83815310 1D TGAGAAATTA C/- CAAGAAGGCA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 C 2 1 166587 CASAVA_Build 3 83821149 1D TTAACGTTTA T/- TTTTTTATGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 7 6 166588 CASAVA_Build 3 83828585 1D AAAGGACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 10 9 166589 CASAVA_Build 3 83829891 1D AAACTACTAG A/- AAAAAAACAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 7 166590 CASAVA_Build 3 83846571 1D CAACGACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 11 10 166591 CASAVA_Build 3 83847611 2I TACATAATTA --/TG TGTGTGTGTG 1178 het 1178 ref 15 7 4 4 TG 5 6 166592 CASAVA_Build 3 83855525 4I TCTCTCTCTC ----/TCTT TGTCTCACAC 3070 hom 76 het 29 0 25 4 TCTT 0 1 166593 CASAVA_Build 3 83862048 4I GTTATTGACT ----/ACTG ACTAAGTATA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 ACTG 0 1 166594 CASAVA_Build 3 83865054 1D TATGAAACGA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 8 166595 CASAVA_Build 3 83867044 1D TGGTGAGGTT A/- AAATTTTTTC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 4 3 166596 CASAVA_Build 3 83881742 1D TGAGTTAGGG A/- AAAAAAAAAG 628 het 628 ref 46 37 3 6 A 10 9 166597 CASAVA_Build 3 83881918 1D CTTCTCTTTT C/- TGGTAGACTG 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 C 1 0 166598 CASAVA_Build 3 83883793 4D AAGGTAGCTG ACTT/---- TATAGAGTAA 3070 het 3070 ref 48 24 23 4 ACTT 1 0 166599 CASAVA_Build 3 83892677 1I CAGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 A 10 11 166600 CASAVA_Build 3 83893865 4I AAAATTATAA ----/AAGT AAGTAGAAAT 2619 het 2619 ref 20 13 6 1 AAGT 1 2 166601 CASAVA_Build 3 83905491 1D TAATTCTGGC T/- AACATTTTTA 3070 het 3070 ref 28 15 9 6 T 1 0 166602 CASAVA_Build 3 83910327 1D TAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 10 9 166603 CASAVA_Build 3 83910936 49D AGTTTTACAT GGTAGCTGGCACTTCCATAAAAATGGCTTAATATTACCTAATACTTAAC/------------------------------------------------- ACAATATTTT 3070 hom 51 het 15 0 18 2 GGTAGCTGGCACTTCCATAAAAATGGCTTAATATTACCTAATACTTAAC 1 0 166604 CASAVA_Build 3 83913345 1D AGAGTTAAGA T/- TGTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 2 1 166605 CASAVA_Build 3 83914967 1D TAGAAACTTG A/- AAAACAAGGC 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 A 5 4 166606 CASAVA_Build 3 83915563 1I GTTACTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 26 0 16 10 T 11 12 166607 CASAVA_Build 3 83941744 4I TACCAGTACC ----/ATTT ATTAAAGAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATTT 0 1 166608 CASAVA_Build 3 83942984 4D ATCAGGGTAA TGAT/---- TGATTCACAG 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 TGAT 2 1 166609 CASAVA_Build 3 83949744 1I TTGCCCCCCC -/A CCATTTTAAC 3070 hom 14 het 25 1 18 6 A 0 1 166610 CASAVA_Build 3 83963104 17D CTTTGGGAGC CTGAGGTGGGTATATCA/----------------- CTTGAGTGCA 3070 het 3070 ref 33 24 8 5 CTGAGGTGGGTATATCA 1 0 166611 CASAVA_Build 3 83969515 4I TACATACTAT ----/ATTC ATTAACTACC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 ATTC 0 1 166612 CASAVA_Build 3 83975306 1D TGTAATTATG T/- TTTTAAAGAT 2643 het 2643 ref 31 17 8 6 T 5 4 166613 CASAVA_Build 3 83976888 1I TGATTTGGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 9 10 166614 CASAVA_Build 3 83979234 1D GCCATATGAC T/- ATAGATCCCC 3070 het 3070 hom 42 14 23 6 T 1 0 166615 CASAVA_Build 3 83980933 4I CCTAGATAAC ----/AGAA AGTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 AGAA 0 1 166616 CASAVA_Build 3 83984139 1D GTGAATGTAT A/- AAAAAAAAAG 1787 het 1787 ref 30 22 4 5 A 10 9 166617 CASAVA_Build 3 83992337 1I GAAAATGATT -/G TAGGCTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 G 0 1 166618 CASAVA_Build 3 83994020 1D TCAGACTACC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 T 8 7 166619 CASAVA_Build 3 83995630 1D ATTGGGAAAA T/- GTTTGAAATA 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 T 1 0 166620 CASAVA_Build 3 83996101 1D GCTTTTTTTT A/- ATTTTTATCC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 2 1 166621 CASAVA_Build 3 83998171 2D CCTGAGTAGC GA/-- GGACTCAAGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 9 GA 1 0 166622 CASAVA_Build 3 84012875 1I AAAGAAACTC -/A AAAATAACCC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 4 5 166623 CASAVA_Build 3 84020304 4I TATTTTTATC ----/TATT TATTTTTTTT 3034 het 91 hom 21 3 11 7 TATT 1 2 166624 CASAVA_Build 3 84021900 2D ATTAGAAGGT GG/-- GGTCTTTGGG 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 G 4 2 166625 CASAVA_Build 3 84031815 5I ACCTTTCAGA -----/TCTTC TCTTCTAGCT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 TCTTC 1 2 166626 CASAVA_Build 3 84032908 2I ATTACATATT --/AA AAAAAAAAAA 735 het 735 ref 9 4 2 3 A 12 14 166627 CASAVA_Build 3 84037998 1D TAGCTTTGCC T/- TCAGGCCCAT 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 T 2 1 166628 CASAVA_Build 3 84038178 1D CTTTCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 11 T 13 12 166629 CASAVA_Build 3 84045955 1D GATCTCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 33 4 17 12 T 16 15 166630 CASAVA_Build 3 84048928 2I ATATGTGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 53 23 19 11 AC 6 7 166631 CASAVA_Build 3 84051097 1D TTTACATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 13 12 166632 CASAVA_Build 3 84052684 1I TTTCTTTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 9 10 166633 CASAVA_Build 3 84069667 1D AGAAAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 9 8 A 16 15 166634 CASAVA_Build 3 84073200 6I ATTACAGTAA ------/TATACT TATATTTTAA 2589 het 2589 ref 22 12 7 3 TATACT 0 1 166635 CASAVA_Build 3 84082841 16D GTACAGACCC TCAAAAACTTAAAATT/---------------- TCAGCAAGTT 3070 het 3070 ref 35 23 12 4 TCAAAAACTTAAAATT 1 0 166636 CASAVA_Build 3 84084617 10D GACACAGCAC ATTAATTTTA/---------- ATCTTAATAA 2840 het 2840 ref 25 16 7 3 ATTAATTTTA 1 0 166637 CASAVA_Build 3 84086159 1D GAAAGGTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 74 het 28 0 24 4 A 10 9 166638 CASAVA_Build 3 84088988 1I GTAATGGTAC -/T TTTTTATTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 5 6 166639 CASAVA_Build 3 84089971 2D TCTTTCCATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TA 7 6 166640 CASAVA_Build 3 84098366 1I ATACACTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 14 11 T 12 13 166641 CASAVA_Build 3 84103893 1I GTACCTTCAC -/T TTTCCATAAA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 3 4 166642 CASAVA_Build 3 84134782 1I TTATCAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 11 14 T 14 15 166643 CASAVA_Build 3 84147473 1I AAGAAGACAC -/A AATGATGAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 2 3 166644 CASAVA_Build 3 84149521 3I5M4I AGCTTCCACA ---AATGT----/TTTACTATTAAA ATAAAGTGGC 3070 het 3070 ref 25 15 11 0 N/A 0 0 166645 CASAVA_Build 3 84150430 3D ACATTTGATT AAG/--- TTTATTGAAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 6 AAG 1 0 166646 CASAVA_Build 3 84154009 1I ACAAATTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 9 10 166647 CASAVA_Build 3 84170154 1D TCTCATTTGA T/- TTTTTTTTTT 2554 het 800 hom 24 4 7 13 T 15 14 166648 CASAVA_Build 3 84199824 1D GAACTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 1990 het 1990 ref 45 24 6 15 A 15 14 166649 CASAVA_Build 3 84199870 1D48M1D TGTACTATAG TTTTTTCTTTTGAAGCACAATTTTTCTCTCTCCAGTTCCCGTTTTTTATA/-TTTTTCTTTTGAAGCACAATTTTTCTCTCTCCAGTTCCCGTTTTTTAT- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 36 0 37 13 N/A 0 0 166650 CASAVA_Build 3 84201999 1I AGGGGCATGG -/C TTTCCACATG 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 C 0 1 166651 CASAVA_Build 3 84210023 1I CACCACCCAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 62 het 26 0 21 5 A 8 9 166652 CASAVA_Build 3 84212077 2D AATAAATGAC AT/-- GTCATCTACT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 AT 1 0 166653 CASAVA_Build 3 84212999 1D GAAACTCATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 166654 CASAVA_Build 3 84216141 1D AAAGAGACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 A 10 9 166655 CASAVA_Build 3 84223373 1D ATGAATAAAT A/- AAGCCTGGAG 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 3 2 166656 CASAVA_Build 3 84226292 1D TAAACCCAGG A/- AATGTATAAG 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 A 3 2 166657 CASAVA_Build 3 84226957 1I TTCCATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 32 2 16 14 T 15 16 166658 CASAVA_Build 3 84235527 1I AGAAGACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 9 10 166659 CASAVA_Build 3 84238803 1D AAACTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 11 5 A 11 10 166660 CASAVA_Build 3 84244873 6D TTTATTGGAT ATTAAC/------ ATTAAGTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 17 6 ATTAAC 1 0 166661 CASAVA_Build 3 84255388 1D ATTATTTAAA T/- TTATCTAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 6 T 3 2 166662 CASAVA_Build 3 84258552 1D AGATATTGCT A/- AAATATGTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 4 3 166663 CASAVA_Build 3 84262889 1D AACGTTTTAG T/- TTTTCTACGT 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 T 5 4 166664 CASAVA_Build 3 84265583 7I GAGATGTGCA -------/GCTTAAT GCATATATAT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 GCTTAAT 0 1 166665 CASAVA_Build 3 84268860 1D ATATTTACTG T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 7 6 166666 CASAVA_Build 3 84273987 3I CAAATTGCTA ---/AAT AATAATATGA 3070 het 3070 ref 32 13 15 4 AAT 2 3 166667 CASAVA_Build 3 84284022 1D GGCATTTTTG T/- TGGAGAGTGA 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 T 2 1 166668 CASAVA_Build 3 84284689 1D AATGAAAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 9 8 166669 CASAVA_Build 3 84287406 5D TTCTAAAACT AGTTA/----- AGTTAATTCT 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 AGTTA 2 1 166670 CASAVA_Build 3 84303740 1D TCAATATGGA T/- TTTTTTTATA 1954 het 1661 hom 10 4 4 2 T 8 7 166671 CASAVA_Build 3 84305793 2I TGTAATTTGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 TG 8 9 166672 CASAVA_Build 3 84316840 1I TTTTCACTAG -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 6 7 166673 CASAVA_Build 3 84322660 1D AGGAGTGCAT A/- AAAAAATATT 2843 het 2843 ref 21 13 6 2 A 7 6 166674 CASAVA_Build 3 84341827 8D TATGTGTGTG TGTGTGTC/-------- TGTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 43 19 15 11 TGTGTGTC 3 2 166675 CASAVA_Build 3 84347988 1I ACTATATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 9 10 166676 CASAVA_Build 3 84360266 1D AGTGTTCCTA T/- AAGGTCAGAT 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 T 1 0 166677 CASAVA_Build 3 84365454 7I AGGGCAGTTA -------/TTAAACC TTAAAGTTCC 2405 het 2405 ref 29 19 6 4 TTAAACC 0 1 166678 CASAVA_Build 3 84376626 9I CATTAATTCC ---------/ATAATTAAT ATATTGATAC 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 ATAATTAAT 0 1 166679 CASAVA_Build 3 84377305 4I AGCAAAAATC ----/AAAT AAAAGCTGAC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AAAT 0 1 166680 CASAVA_Build 3 84388188 3D GTGTGAATAT ATA/--- ATATTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 ATA 2 1 166681 CASAVA_Build 3 84390322 1I GGAAATTCCA -/G AGACTTTGAA 3070 het 2878 hom 29 7 18 4 G 0 1 166682 CASAVA_Build 3 84392246 1D AATTCACCAG A/- AAAAAAGCAT 3070 hom 43 het 42 1 37 5 A 7 6 166683 CASAVA_Build 3 84396825 4D TTTCTTTTTC CTTT/---- CTTTCTTCCC 3070 het 2752 hom 20 8 9 3 CTTT 2 1 166684 CASAVA_Build 3 84397294 2D TATAAGAGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 40 0 32 9 TG 9 8 166685 CASAVA_Build 3 84398236 1D ACTCAGTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 10 9 166686 CASAVA_Build 3 84400538 3D TTTAATGTTA CCC/--- CCCCCCCCAT 3070 hom 77 het 34 0 24 10 C 11 8 166687 CASAVA_Build 3 84404218 1D AAACATATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 T 10 9 166688 CASAVA_Build 3 84410003 1I TTTCTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 32 1 26 5 A 12 13 166689 CASAVA_Build 3 84412478 1D TTTCTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 T 12 11 166690 CASAVA_Build 3 84427654 2D AAATACTCCA AC/-- ACACACACAC 3070 het 214 hom 22 3 9 10 AC 10 9 166691 CASAVA_Build 3 84429100 5D CAGGGGACTA AAAAG/----- AAAGAAATGA 3070 het 3070 hom 28 11 15 4 AAAAG 1 0 166692 CASAVA_Build 3 84434124 1D TAGAATCAAA T/- CTACAAAACC 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 1 0 166693 CASAVA_Build 3 84436278 1I CTGGATGCTT -/C CAGTTCTCAT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 C 1 2 166694 CASAVA_Build 3 84436334 1D TGGACTTACA C/- CAGTGGTTTG 3070 het 1994 hom 19 5 9 5 C 2 1 166695 CASAVA_Build 3 84452739 9I TCGTAAAAAG ---------/TCATTAGCT TCATTAGCTC 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 TCATTAGCT 1 2 166696 CASAVA_Build 3 84454769 1I GTCAGTTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 9 10 166697 CASAVA_Build 3 84457149 1D TCAGGGCAAA T/- TTTAGTTCCT 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 T 4 3 166698 CASAVA_Build 3 84479742 1I CCTGCTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 32 0 24 8 T 10 11 166699 CASAVA_Build 3 84484260 1D TGGATAAATT C/- TTTAGTTGTG 3070 het 3070 hom 48 20 24 6 C 1 0 166700 CASAVA_Build 3 84486194 5D GACATTCTGC TATTG/----- TATTATTTCT 3070 het 3070 ref 30 21 8 3 TATTG 1 0 166701 CASAVA_Build 3 84486295 2I TATTTTATTT --/TG TGTTATATTA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 TG 1 2 166702 CASAVA_Build 3 84486514 1D ATATTACATT A/- TTTTTAAATA 1757 het 1757 ref 16 11 4 1 A 1 0 166703 CASAVA_Build 3 84488823 3I AATAAAGCAG ---/AAC AACAAATATA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAC 1 2 166704 CASAVA_Build 3 84495083 1I TGGATTCATT -/G AATTTTTAAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 G 0 1 166705 CASAVA_Build 3 84495642 2I TGTTTGGTCT --/AG AGAGATGAGT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 AG 2 3 166706 CASAVA_Build 3 84495943 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2345 hom 16 5 10 1 T 9 10 166707 CASAVA_Build 3 84499572 1I AACATCAAAC -/A TCTACCATTT 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 A 0 1 166708 CASAVA_Build 3 84501057 1D ACTTCCAGAG T/- TTGAGTACAT 3070 het 3070 hom 44 20 19 6 T 3 2 166709 CASAVA_Build 3 84502522 1D ATAAAAAAAA T/- CACAGAGAAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 1 0 166710 CASAVA_Build 3 84504928 1I TAAAAGTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2202 hom 23 8 12 3 T 9 10 166711 CASAVA_Build 3 84506630 1I AACTGGAATG -/T TTTATACATT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 3 4 166712 CASAVA_Build 3 84507142 3I TTGGGGTGAT ---/AAC AATATTCTGG 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 AAC 0 1 166713 CASAVA_Build 3 84507663 1D TCTGGTAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 16 13 T 11 10 166714 CASAVA_Build 3 84510244 4I ATATGTTTGA ----/CACT CAATCTACTG 3070 hom 91 het 53 0 31 22 CACT 0 1 166715 CASAVA_Build 3 84524450 1D TTATTAAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 13 6 T 10 9 166716 CASAVA_Build 3 84525573 4D GATATGAGAT TGCC/---- TGAATTGCTG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TGCC 1 0 166717 CASAVA_Build 3 84526340 4I TCACTTTTTC ----/TGAT TAATTACCTG 3070 hom 96 het 35 0 31 4 TGAT 0 1 166718 CASAVA_Build 3 84528809 3D AAATGATAAA AAG/--- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 AAG 1 0 166719 CASAVA_Build 3 84548327 1I CCATATGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 10 11 166720 CASAVA_Build 3 84553995 1D TAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2679 hom 24 7 14 3 A 11 10 166721 CASAVA_Build 3 84563135 1I TCTCCTTGAA -/T TATTGTTGTC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 1 2 166722 CASAVA_Build 3 84572434 1D GGGTCGGGGA G/- GGGGGGAATG 2423 het 2423 ref 22 12 7 4 G 7 6 166723 CASAVA_Build 3 84574339 4I TTCCACTGAC ----/TATT CATATAACCT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 TATT 0 1 166724 CASAVA_Build 3 84575394 1I ATATAAATTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 8 9 166725 CASAVA_Build 3 84579613 1D TCTAAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2473 hom 20 5 12 3 A 10 9 166726 CASAVA_Build 3 84579778 1D GAATCAATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 T 10 9 166727 CASAVA_Build 3 84580808 2D CTGGCAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 7 A 12 10 166728 CASAVA_Build 3 84584370 1D ATTAAAATAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 T 9 8 166729 CASAVA_Build 3 84584592 1D TTGGAAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 10 9 166730 CASAVA_Build 3 84586185 1I TATTATAGGC -/T TTTATCAAAC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 3 4 166731 CASAVA_Build 3 84586760 9I AAAGTTTTAC ---------/TACTGAATG TAGTCTTTCA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 TACTGAATG 0 1 166732 CASAVA_Build 3 84587260 1D CTACATCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 10 9 166733 CASAVA_Build 3 84587541 1I CATATTATAC -/A AAATAAAGGA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 3 4 166734 CASAVA_Build 3 84587901 1I GCTACTTCTC -/T CTTTAGGTCA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 0 1 166735 CASAVA_Build 3 84592819 3D TTAAGCTAAA CAT/--- CATCAATTTA 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 CAT 2 1 166736 CASAVA_Build 3 84593442 1I GAATTCTGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 9 10 166737 CASAVA_Build 3 84594021 2I TTTCTCTCTC --/TT GTTAGAGACA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 0 2 166738 CASAVA_Build 3 84594801 4I GAAAGTAAAC ----/AGTT AGTAGAAACC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 AGTT 0 1 166739 CASAVA_Build 3 84595731 1D ACCTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 12 11 166740 CASAVA_Build 3 84596094 3D TTGAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 15 4 A 12 9 166741 CASAVA_Build 3 84596215 1I ATGGAAACCG -/A AAAAAAGAGG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 6 7 166742 CASAVA_Build 3 84596607 1D GGATCCTTTC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 42 19 14 10 T 8 7 166743 CASAVA_Build 3 84603381 1I TTTGTACTTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 7 8 166744 CASAVA_Build 3 84604959 1I AATATTGATG -/A AAAAATCCTC 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 5 6 166745 CASAVA_Build 3 84605174 1I AAACTATCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 10 11 166746 CASAVA_Build 3 84605457 1D TACCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 A 12 11 166747 CASAVA_Build 3 84606453 1I AGAAACTCAA -/C TGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 C 0 1 166748 CASAVA_Build 3 84609410 1I TGTGGAAACT -/C AGAGAAATAA 3070 het 2863 hom 17 7 9 1 C 0 1 166749 CASAVA_Build 3 84611130 4I TAAACAGCTA ----/TAAG TAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 TAAG 0 1 166750 CASAVA_Build 3 84613990 2I CTAGAAGAAA --/AT ATAGTGGGAG 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 AT 1 2 166751 CASAVA_Build 3 84616805 2D GTGTATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 12 13 11 AT 6 5 166752 CASAVA_Build 3 84622499 1D TCCTCATTTT C/- CCCCCCAACT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 C 7 6 166753 CASAVA_Build 3 84622708 1D TTCTGTGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 T 10 9 166754 CASAVA_Build 3 84624546 1D CTTATATTTG A/- AAAAAAATCC 1078 het 1078 ref 24 16 4 5 A 8 7 166755 CASAVA_Build 3 84624591 1D AAGAAATTAG A/- AAAAAATTAT 1090 het 1090 ref 30 17 3 10 A 7 6 166756 CASAVA_Build 3 84625303 1D TTCTGACAAA G/- GGCTAATATC 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 G 3 2 166757 CASAVA_Build 3 84627551 1D AAAAGGTTCC A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 26 11 15 0 A 8 7 166758 CASAVA_Build 3 84629015 1I TTGGAGGTAC -/A TAGAGCAGGA 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 A 0 1 166759 CASAVA_Build 3 84630514 2I AGAGAGAGAG --/AA AGAGAGAGAG 1172 het 1172 ref 21 11 5 5 A 1 3 166760 CASAVA_Build 3 84636744 1D TCCCTCTTGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 13 19 8 A 9 8 166761 CASAVA_Build 3 84645804 1D AGTATTTTTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 G 10 9 166762 CASAVA_Build 3 84657598 1D AACAAAGGAA C/- AAAACTCTTA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 C 1 0 166763 CASAVA_Build 3 84661635 1D AAAAGAAATG A/- AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 A 7 6 166764 CASAVA_Build 3 84666253 1I CAGTGAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 11 12 166765 CASAVA_Build 3 84674198 1I TCCGGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 2712 het 2712 ref 33 15 9 9 T 12 13 166766 CASAVA_Build 3 84681962 2I CAAGAAAAGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 AT 6 7 166767 CASAVA_Build 3 84688741 1I TGCCAAACAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 A 8 9 166768 CASAVA_Build 3 84689324 1I TTTTGTTGTG -/T TTTTTTTGGG 3021 het 3021 ref 30 15 7 8 T 7 8 166769 CASAVA_Build 3 84701926 8I3M1I GTTTTTACCA --------TGT-/CATACACGTGTA TACACACATG 3070 het 3070 ref 58 27 25 8 N/A 0 0 166770 CASAVA_Build 3 84718003 2D CCAGTATCTG TT/-- TTTTTTTTTT 2991 het 2991 ref 30 12 8 11 T 12 10 166771 CASAVA_Build 3 84738206 1D TTTGCACAGC A/- AAAAAGTTAG 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 6 5 166772 CASAVA_Build 3 84751743 3D AGCGATTCTC CTG/--- CCTCAGCCTC 2083 het 2062 hom 16 7 6 3 CTG 1 0 166773 CASAVA_Build 3 84776744 1D ACTTTGGTAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 9 8 166774 CASAVA_Build 3 84778140 1I TGATTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 11 12 166775 CASAVA_Build 3 84834869 2I TCATGTGGTT --/AG AGAGTGTAAC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 AG 2 3 166776 CASAVA_Build 3 84879851 4I AATAATTAAC ----/AGTT AAAGACCTCA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 AGTT 0 1 166777 CASAVA_Build 3 84908485 1I GTTTCTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 A 15 16 166778 CASAVA_Build 3 84924370 1I GGGAAAAAAT -/A CTATAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 0 1 166779 CASAVA_Build 3 84926415 1D ACCAAAATTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 9 8 166780 CASAVA_Build 3 84926571 1D ACACTGTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 9 6 A 10 9 166781 CASAVA_Build 3 84928800 1D CCAAAAGACA G/- GCAATAACAA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 G 2 1 166782 CASAVA_Build 3 84932275 4D TATGCATGCA GTCC/---- GTCCATGTTA 3070 het 3070 hom 47 21 25 2 GTCC 2 1 166783 CASAVA_Build 3 84937251 1D CTAAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 15 14 166784 CASAVA_Build 3 84939883 2I ATATACACAC --/TT ATATGCCTCT 3070 het 2671 hom 26 10 14 2 T 0 2 166785 CASAVA_Build 3 84940186 1D AGTATAATAG A/- AAAAAATTAT 2360 het 2360 ref 18 9 5 4 A 7 6 166786 CASAVA_Build 3 84949597 2D CCGCTCTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 965 het 965 ref 39 16 4 19 A 13 11 166787 CASAVA_Build 3 84951300 1D CACTTTATTT G/- TTATAGTTTT 2520 het 2520 ref 24 11 6 7 G 1 0 166788 CASAVA_Build 3 84953747 1D GAAGTTAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 10 9 166789 CASAVA_Build 3 84966291 1I AGGAAATATC -/A GGGGTGAACT 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 A 0 1 166790 CASAVA_Build 3 84973574 1D GCATTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1760 het 1760 ref 42 17 6 19 A 19 18 166791 CASAVA_Build 3 84977180 6I GCTTTGTTTC ------/TGTTTT TGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 TGTTTT 2 3 166792 CASAVA_Build 3 85002645 1I TATGGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 10 11 166793 CASAVA_Build 3 85010153 1I GAACCCAGGA -/G GCAGAGGTTG 2752 het 2752 ref 17 8 7 2 G 1 2 166794 CASAVA_Build 3 85010630 3D AAACTGTTTG TGT/--- TGTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 49 23 22 6 TGT 3 2 166795 CASAVA_Build 3 85018008 3D GGTCAGTAAT AAC/--- AAACTTCTCT 3070 het 3070 ref 25 16 8 2 AAC 1 0 166796 CASAVA_Build 3 85027929 1D ATTTTTGGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 T 9 8 166797 CASAVA_Build 3 85029291 4D TATGTATCTG GTTT/---- TTTTTTTGTT 1736 het 1736 ref 45 18 11 18 GTTT 1 0 166798 CASAVA_Build 3 85031124 1I GAACATTTTT -/G CATATGTCTG 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 G 0 1 166799 CASAVA_Build 3 85035248 1D GGGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2749 hom 38 9 20 9 A 11 10 166800 CASAVA_Build 3 85039653 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 1803 het 1803 ref 15 7 5 3 T 7 8 166801 CASAVA_Build 3 85039917 1D TATAAAAGAT A/- ACAATTGTGA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 2 1 166802 CASAVA_Build 3 85047386 1D AACATTCCTT A/- AAAAAAAAAA 2794 het 1662 hom 30 8 12 10 A 17 16 166803 CASAVA_Build 3 85049473 1I CACCCCCAAG -/A AAAAAAACAG 3070 het 1926 hom 27 6 17 4 A 7 8 166804 CASAVA_Build 3 85057015 1D TGTGGAATCT A/- AAAAAAAAAA 1173 het 1173 ref 24 13 5 6 A 17 16 166805 CASAVA_Build 3 85079909 1D AGCAATTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 A 10 9 166806 CASAVA_Build 3 85090264 3I TCCTTTTTTG ---/CAC CACAAGTTCT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 CAC 1 2 166807 CASAVA_Build 3 85094256 4I AGTTTTTGCT ----/CAAA CAAATTGCTC 3070 het 3070 ref 44 21 21 2 CAAA 1 2 166808 CASAVA_Build 3 85101349 1I CTGGTCTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2942 hom 22 7 13 2 T 9 10 166809 CASAVA_Build 3 85102318 3I TTAAAAGTCA ---/TAT AGTTTTTCTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAT 0 1 166810 CASAVA_Build 3 85103437 5D TGGAAGTCAC TAATT/----- TATTTTAAAC 3070 het 3070 ref 41 22 19 1 TAATT 1 0 166811 CASAVA_Build 3 85105572 1D CTGATGCCTC A/- GGGAAAACAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 7 A 1 0 166812 CASAVA_Build 3 85124246 21D CCGAGGCGGG CGGATCACGAGGTCAAGAGAT/--------------------- CGTGACCATC 1926 het 1926 ref 28 17 8 9 CGGATCACGAGGTCAAGAGAT 1 0 166813 CASAVA_Build 3 85136492 4D ATCTTTCAGC CAGA/---- CAAAGTTTGA 3070 het 3070 ref 41 21 17 5 CAGA 1 0 166814 CASAVA_Build 3 85152587 2D TATGTGTACG GT/-- GTGTGTGTGT 3018 het 3018 ref 42 19 11 12 GT 9 8 166815 CASAVA_Build 3 85162788 2D GGGTATTTAC AG/-- AGAGGTGGGG 3070 het 3070 ref 36 21 13 4 AG 3 2 166816 CASAVA_Build 3 85168848 1I GAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 1203 het 426 hom 8 2 5 1 G 0 1 166817 CASAVA_Build 3 85171210 1D AGATAATGTA T/- TTTTTTTTTT 2695 het 2695 ref 30 12 7 11 T 15 14 166818 CASAVA_Build 3 85177491 1D ATGTGTAGCC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 T 9 8 166819 CASAVA_Build 3 85181472 8D ATTACAAGTA TGAGCTAC/-------- TGTGCCTGGC 1493 het 1493 ref 14 4 4 8 TGAGCTAC 1 0 166820 CASAVA_Build 3 85198223 1D ATCAGCATTT A/- AAAAAAAAAA 1438 het 1438 ref 40 27 4 9 A 13 12 166821 CASAVA_Build 3 85202425 1I ACTATATCCT -/G AAGCTATAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 G 0 1 166822 CASAVA_Build 3 85230098 1D ATTATCGTAG A/- AAAAAAAAAA 2811 het 2811 ref 28 10 8 10 A 15 14 166823 CASAVA_Build 3 85242542 1I GCCCTTTCAG -/A AAAATTACAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 4 5 166824 CASAVA_Build 3 85244197 1D GAAACTGTCA T/- TTTTTTTTTT 1943 het 1943 ref 42 28 5 9 T 13 12 166825 CASAVA_Build 3 85249092 1D AATTTTATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 T 10 9 166826 CASAVA_Build 3 85250118 3D ATATTAAAAT ATC/--- ATGTTATTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 ATC 1 0 166827 CASAVA_Build 3 85279530 1I TAGTATTGCA -/C CAATAAAGAA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 C 1 2 166828 CASAVA_Build 3 85324440 2D ATATGAATTC AT/-- ATATATATAT 3068 hom 21 het 13 0 8 6 AT 9 8 166829 CASAVA_Build 3 85325209 1I AAAAAATCTT -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 6 7 166830 CASAVA_Build 3 85352648 1D GGTTGCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 11 10 166831 CASAVA_Build 3 85358091 1I TGGTCCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2457 hom 31 7 13 11 T 13 14 166832 CASAVA_Build 3 85363276 1I AACAAATAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 9 10 166833 CASAVA_Build 3 85391256 1I TTTTCAGAAA -/T ACTTTCATGA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 T 0 1 166834 CASAVA_Build 3 85398981 5I AAGATTAACC -----/GTAAA ATAATTTGAA 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 GTAAA 0 1 166835 CASAVA_Build 3 85452772 1I TTCTGTTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2215 hom 18 6 8 4 T 9 10 166836 CASAVA_Build 3 85469951 1D ATTCCTTATC A/- GACTGAATTA 3070 het 3070 hom 45 19 19 8 A 1 0 166837 CASAVA_Build 3 85474490 3D TTTGACCCTC CTT/--- GTGTTTGGAC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 CTT 1 0 166838 CASAVA_Build 3 85479283 1D GCCAATTTTT G/- GAAGAAAGTA 3070 het 2597 hom 14 7 7 0 G 2 1 166839 CASAVA_Build 3 85489521 1I CCTTCCCAAG -/A GTCGCATTCA 3070 hom 147 het 55 0 49 6 A 0 1 166840 CASAVA_Build 3 85502262 5D ACTCTGTCTC AAAAT/----- AAAATAAAAG 3070 het 1772 hom 20 5 10 6 AAAAT 2 1 166841 CASAVA_Build 3 85502834 1I AGAATAAGAA -/T TTTTTTTAAA 2826 het 2826 ref 24 13 7 4 T 7 8 166842 CASAVA_Build 3 85513431 1D CCATTCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 112 hom 17 1 15 1 T 11 10 166843 CASAVA_Build 3 85524938 2I TTAAAAAAAA --/AC AAAAAAGAAA 3070 het 24 hom 29 2 17 10 AC 0 1 166844 CASAVA_Build 3 85532557 2I TTTCTTCTAG --/AT TTTCTAGTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 0 1 166845 CASAVA_Build 3 85544375 1D ATGTAATTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 28 0 22 6 T 13 12 166846 CASAVA_Build 3 85550063 3I GCTACCTATC ---/ATT ATACATTTGT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 ATT 0 1 166847 CASAVA_Build 3 85551140 1D CTAAAATTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 9 8 166848 CASAVA_Build 3 85551299 1D CTCCGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 15 1 12 2 A 15 14 166849 CASAVA_Build 3 85554016 2D GATTTTAATA AC/-- AGTCGTTAAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 AC 1 0 166850 CASAVA_Build 3 85557972 1D TCAGGCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 11 10 166851 CASAVA_Build 3 85568900 1D GTCTTTATAG T/- TTTGCCTTTT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 T 4 3 166852 CASAVA_Build 3 85570205 1D GTGGTGTTTG A/- AAAAAAAAAA 2068 het 2068 ref 30 17 6 7 A 12 11 166853 CASAVA_Build 3 85572569 1D ACGTCTGTAA T/- CCCAGTACTT 3070 het 2151 hom 32 7 14 11 T 1 0 166854 CASAVA_Build 3 85574315 1I AAGAAAAATA -/G ATAATTCACC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 G 0 1 166855 CASAVA_Build 3 85581400 2I AAATATAAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 11 13 166856 CASAVA_Build 3 85582543 4D CTGACATCTT TAAA/---- TAAGAAAATC 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 TAAA 1 0 166857 CASAVA_Build 3 85586690 2I CACACAAAAC --/AT AGAATCACAA 3070 het 3070 ref 47 28 16 3 AT 0 1 166858 CASAVA_Build 3 85589829 1D TCAGGAATAC T/- TTTATCATCT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 T 4 3 166859 CASAVA_Build 3 85591755 1D TGTTACTGCA T/- TGTTTCATCT 3070 het 3070 hom 48 21 23 6 T 2 1 166860 CASAVA_Build 3 85592120 1I GGAGGTTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 9 10 166861 CASAVA_Build 3 85593500 3D GCTGGGCTTT ATG/--- ATAACCTTTC 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 ATG 1 0 166862 CASAVA_Build 3 85600439 1I TTTTGACCAG -/A AATATGCCAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 2 3 166863 CASAVA_Build 3 85603658 3D GTCAATATTT TTG/--- TTAAAATTCT 3070 het 3070 hom 24 8 15 2 TTG 1 0 166864 CASAVA_Build 3 85608445 1I CAGTGCACTA -/C AAAGATAGCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 0 1 166865 CASAVA_Build 3 85609240 3I TGAAAAAAAA ---/AAT ATGTTAAAAT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 AAT 0 1 166866 CASAVA_Build 3 85611284 1D CTTTAAAGAT G/- GGTATTTCCT 3070 het 3070 ref 45 25 15 6 G 3 2 166867 CASAVA_Build 3 85618149 6D TAGGGGGAAC AATAGA/------ AATAGAAACA 3070 het 3070 hom 34 13 19 4 AATAGA 2 1 166868 CASAVA_Build 3 85618546 1I AGACCAATTG -/A GAATGTGTAT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 0 1 166869 CASAVA_Build 3 85621502 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAATCA 1477 het 1477 ref 20 7 5 8 A 8 7 166870 CASAVA_Build 3 85621537 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAGAA 1543 het 1543 ref 19 8 7 5 A 8 7 166871 CASAVA_Build 3 85621908 5I CAGTGAGTCC -----/ATTAT ATTAATTAGA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 ATTAT 0 1 166872 CASAVA_Build 3 85624625 1D ATGTTAACAC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 17 8 T 7 6 166873 CASAVA_Build 3 85625286 1D TCATCTGCCC T/- GTACATTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 23 3 T 1 0 166874 CASAVA_Build 3 85628872 4D TTAGTAGAGA CACC/---- CAGGGATTTC 2209 het 2209 ref 21 12 6 4 CACC 1 0 166875 CASAVA_Build 3 85634921 2I9M1I CCACACATAC --TTACATATA-/CATTTCATAAAT CTCCTAACAT 3070 het 3070 hom 24 12 13 3 N/A 0 0 166876 CASAVA_Build 3 85639764 1D CCTGAGTTGT A/- AAAAACTATA 3070 het 3070 hom 54 20 29 6 A 6 5 166877 CASAVA_Build 3 85644633 4D GAGGACTATT AATA/---- AATATTATTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 AATA 2 1 166878 CASAVA_Build 3 85657992 1I AGTAAATTGG -/A AAATTTTATA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 3 4 166879 CASAVA_Build 3 85658149 5I CCTTCCAAAA -----/TAAGT TAAGAGGAGA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TAAGT 0 1 166880 CASAVA_Build 3 85659440 1D TTGTAACCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 9 A 10 9 166881 CASAVA_Build 3 85660172 6D TCACGCACAC TCACAT/------ GCACACGTGC 3070 het 3070 hom 58 22 32 8 TCACAT 1 0 166882 CASAVA_Build 3 85666925 1I CAGTAATTTG -/A AGTTCATTTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 A 1 2 166883 CASAVA_Build 3 85667377 1D TGCAAGTATC T/- TTTTTGTGGC 3070 het 3070 ref 62 32 25 5 T 6 5 166884 CASAVA_Build 3 85668233 1D TCCTTTTTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 10 9 166885 CASAVA_Build 3 85668301 1D ATATAGTATT G/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 G 1 0 166886 CASAVA_Build 3 85669448 18D GTAGATTATG CTATTTAACATGTCATGA/------------------ CTATTTAACA 3070 het 3070 ref 30 20 10 6 CTATTTAACATGTCATGA 1 0 166887 CASAVA_Build 3 85669594 1I GGGATTCTGT -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 G 3 4 166888 CASAVA_Build 3 85670294 1D TGAAAGTAGC T/- TGTGCCCTTT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 2 1 166889 CASAVA_Build 3 85670569 1I AAATCACTCC -/A CATTCACGGC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 0 1 166890 CASAVA_Build 3 85670753 2I AGCTATATAT --/AA AACATTGTGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 2 4 166891 CASAVA_Build 3 85670981 3I GATTTACATT ---/AAA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 9 12 166892 CASAVA_Build 3 85671096 4I TGAATAAGAT ----/TAAC TATATGGAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 TAAC 0 1 166893 CASAVA_Build 3 85673120 2I TATATGTCAC --/AT ATATACACAC 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 AT 2 3 166894 CASAVA_Build 3 85673343 1I TAGGAGAACT -/A TATATTAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 0 1 166895 CASAVA_Build 3 85676674 3D AAAAAAAGAA AAG/--- AAAAGGAGAA 3070 het 3070 ref 39 16 14 10 AAG 1 0 166896 CASAVA_Build 3 85678680 1I GTCGGCAGGC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 A 7 8 166897 CASAVA_Build 3 85678935 2I ATTTTGATGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AT 6 7 166898 CASAVA_Build 3 85679337 1D ATATGGTGGG A/- AAAAAAGCTG 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 A 7 6 166899 CASAVA_Build 3 85680390 3I AAATAATCAG ---/AAT AATAATAAGA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AAT 2 3 166900 CASAVA_Build 3 85683851 1D TATATTTGTA G/- GATCCTTCTT 3070 het 3070 ref 32 20 12 1 G 2 1 166901 CASAVA_Build 3 85685125 2D21M1I GTACTCTAGA TCTAGTTTATTGTGTTTTATTTC-/--TAGTTTATTGTGTTTTATTTCT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 6 N/A 0 0 166902 CASAVA_Build 3 85685368 1D AAATTCTACA T/- TCTACTTAAC 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 2 1 166903 CASAVA_Build 3 85686719 4D TTTTTTTATT TTTA/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2593 hom 19 8 9 3 TTTA 1 0 166904 CASAVA_Build 3 85686911 1D GTGATCTAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 A 9 8 166905 CASAVA_Build 3 85693075 4D TATTTAACAG TTTA/---- TTTAATCACT 3070 het 3070 hom 45 23 22 1 TTTA 2 1 166906 CASAVA_Build 3 85697067 1D TAGTCGAGAA G/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 G 1 0 166907 CASAVA_Build 3 85697725 1D TAACTTACAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 T 10 9 166908 CASAVA_Build 3 85700610 2D ACCAAACTAA TT/-- TTTTTTTTGT 1908 het 312 hom 10 1 5 4 T 10 8 166909 CASAVA_Build 3 85703250 1I TGTCCAGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 T 10 11 166910 CASAVA_Build 3 85723259 2I TTACATTAAA --/AC ACAGTTGGGT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 AC 1 2 166911 CASAVA_Build 3 85730173 1I AGAAACCCTG -/A AAATGTATCT 2990 het 2990 ref 25 14 7 4 A 3 4 166912 CASAVA_Build 3 85730692 6D AGTGTGTGTG TGTGTA/------ TATATATATA 3070 het 2958 hom 24 10 15 1 TGTGTA 1 0 166913 CASAVA_Build 3 85731537 1I ATTAAAAAAT -/A TATGTCAAAT 1994 het 1994 ref 19 10 6 3 A 0 1 166914 CASAVA_Build 3 85731756 5I ATGTACATAG -----/TTAAT TTAATATTAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTAAT 1 2 166915 CASAVA_Build 3 85743090 1D ACTGCAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 T 11 10 166916 CASAVA_Build 3 85743549 2D AGAGGAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 36 1 13 23 T 16 14 166917 CASAVA_Build 3 85750885 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2992 het 2992 ref 31 14 9 9 A 11 10 166918 CASAVA_Build 3 85760353 2I TCCCATATAC --/AT ATATATATAT 1183 het 924 hom 16 5 6 5 AT 6 7 166919 CASAVA_Build 3 85766729 1D AGAAAATTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 7 T 8 7 166920 CASAVA_Build 3 85772700 6I GACATTAGGT ------/TAAATA TATATTCTGG 3070 hom 160 het 60 0 54 6 TAAATA 0 1 166921 CASAVA_Build 3 85777647 2I CAGAAATAAA --/AG AGACAACAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AG 1 2 166922 CASAVA_Build 3 85792281 1D CGCTCTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 33 3 21 10 T 14 13 166923 CASAVA_Build 3 85793229 4I CTTTCCAGTT ----/TAAA TAAATTAAGT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TAAA 1 2 166924 CASAVA_Build 3 85798551 1I TTCTTCCTTC -/A GATATGGGAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 166925 CASAVA_Build 3 85801811 4D TTCTTTTCTC AGTT/---- AGGCTACTAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 AGTT 1 0 166926 CASAVA_Build 3 85822176 2D AAGTTTAGAC TT/-- TACTGTTTTG 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 T 3 1 166927 CASAVA_Build 3 85856311 1I TGTTGTTAGC -/A AAAAAAAAAA 1183 het 1183 ref 43 32 3 8 A 10 11 166928 CASAVA_Build 3 85861331 2D GGAAAGGGCT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 38 13 14 12 AG 7 6 166929 CASAVA_Build 3 85864412 2I GAAGACACTG --/CA CTATATAATA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 CA 0 1 166930 CASAVA_Build 3 85872394 1I ATTCTCCCTC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 46 11 24 11 T 7 8 166931 CASAVA_Build 3 85873176 1I CCCTCAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 A 10 11 166932 CASAVA_Build 3 85888002 1I CAAAGACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 35 1 25 9 T 11 12 166933 CASAVA_Build 3 85892180 1I TGGATACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1490 hom 37 4 27 6 T 11 12 166934 CASAVA_Build 3 85904639 1D CTATGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 15 12 T 12 11 166935 CASAVA_Build 3 85904724 2D TCATTTCCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 18 11 T 13 11 166936 CASAVA_Build 3 85916249 1I GCAGTTGAAA -/T TTTTTTAATG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 6 7 166937 CASAVA_Build 3 85933083 1D GAATTACTTT A/- ACAAATTAGT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 2 1 166938 CASAVA_Build 3 85956275 11D AAAACTCAAG GTGAGTGCACA/----------- GTGCACAAAG 3070 het 3070 ref 64 37 24 9 GTGAGTGCACA 1 0 166939 CASAVA_Build 3 85967605 2I ATATAATATA --/AT ATATATATAT 1598 het 1598 ref 13 5 5 3 AT 6 7 166940 CASAVA_Build 3 85971323 1D TTCTTTGCCA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 39 13 21 6 T 8 7 166941 CASAVA_Build 3 85981736 1I ATTACCAAGA -/T AAATGATTTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 0 1 166942 CASAVA_Build 3 85988672 1D AGAGTCACTG C/- TTAGGAAATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 0 166943 CASAVA_Build 3 85990913 1I TTGTATACTA -/T TTTGAGAAGT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 3 4 166944 CASAVA_Build 3 85999507 3I ATAAGAACTT ---/AAG AAGCATTTAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAG 1 2 166945 CASAVA_Build 3 86002597 2D TTCCTTTGGG TA/-- TATAGCCCAT 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 TA 3 2 166946 CASAVA_Build 3 86019036 1D CAGTGATTTT C/- CCGCCTCAGC 3070 het 3070 ref 47 19 19 10 C 3 2 166947 CASAVA_Build 3 86020032 3D TGTATCCTCA AGG/--- AGGTCATACA 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 AGG 2 1 166948 CASAVA_Build 3 86022533 1I AAAGAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 10 11 166949 CASAVA_Build 3 86030414 1D CATATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 13 12 T 13 12 166950 CASAVA_Build 3 86040097 2I TTTTCTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 2420 het 1252 hom 39 8 19 12 TC 0 1 166951 CASAVA_Build 3 86043762 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTATT 2590 het 480 hom 9 1 8 0 T 8 7 166952 CASAVA_Build 3 86054154 1D AAATGTGATT A/- ATCAGTATAT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 2 1 166953 CASAVA_Build 3 86056997 3I ATAATCTATC ---/CTT CTGGCAACTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CTT 0 1 166954 CASAVA_Build 3 86059678 1D TTGTTTTTTA T/- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 T 4 3 166955 CASAVA_Build 3 86061445 4I CAGTCCTGAC ----/AAAT AATCCATTCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAAT 0 1 166956 CASAVA_Build 3 86071864 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 80 het 32 0 26 6 A 10 9 166957 CASAVA_Build 3 86074163 1D TGCCAAATTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 9 8 166958 CASAVA_Build 3 86087420 1D AGAAAAGATT A/- GAAGTACTGT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 1 0 166959 CASAVA_Build 3 86094332 3I TGAGTAAATA ---/TTC TAACAAAATC 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 TTC 0 1 166960 CASAVA_Build 3 86097157 3D TTATGATAAA TAT/--- TATTACAAAT 1053 het 1053 ref 15 9 4 2 TAT 2 1 166961 CASAVA_Build 3 86101823 10D GTATATATAT ATATACACTC/---------- ATACACTCAC 3070 hom 44 het 17 0 11 9 ATATACACTC 1 0 166962 CASAVA_Build 3 86107233 1D AAATTTCTTA T/- TAATGAGAGT 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 T 2 1 166963 CASAVA_Build 3 86110668 1I AAGCATGTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 9 10 166964 CASAVA_Build 3 86118272 5D TATGAGATTC TATTA/----- TGAGTGTTTA 3070 het 3070 ref 39 23 15 3 TATTA 1 0 166965 CASAVA_Build 3 86131408 4D GCAGGAAGGC AGGA/---- AGGAAGGAAG 2254 het 1031 hom 24 5 9 11 AGGA 3 2 166966 CASAVA_Build 3 86133297 1D ATTTTTACAG T/- TCCCAGTAGT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 T 2 1 166967 CASAVA_Build 3 86137395 1I CCGTCTCATA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 569 hom 23 4 10 9 T 1 2 166968 CASAVA_Build 3 86143788 4D TACAATTAAG TAAT/---- TAATTAAGAA 3070 het 2471 hom 20 6 10 4 TAAT 2 1 166969 CASAVA_Build 3 86147915 2I TCACTAAAGG --/AA AAAATAATTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 4 6 166970 CASAVA_Build 3 86153148 1I CCAAAACTGC -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 6 7 166971 CASAVA_Build 3 86154987 4I TCAAAAATGC ----/AATA AATGTGCTAC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 AATA 0 1 166972 CASAVA_Build 3 86171143 16D GGGGTCAGGG AATTCCTAGTCAAAGA/---------------- AATTCCCTTT 2538 het 2538 ref 30 21 7 6 AATTCCTAGTCAAAGA 1 0 166973 CASAVA_Build 3 86171668 1D TTGGGAGGCA C/- CCCCCAGTAG 3070 het 3070 ref 30 18 9 4 C 6 5 166974 CASAVA_Build 3 86183076 1I CCCTAGGGCA -/G GGACTCAATG 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 G 2 3 166975 CASAVA_Build 3 86183808 1I AGTGACTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 A 9 10 166976 CASAVA_Build 3 86193827 1I TGTTGATGGT -/G GGGGGGGGGG 3070 het 975 hom 35 3 26 6 G 10 11 166977 CASAVA_Build 3 86194499 1D CTATGGTAGC G/- GGGCACCTGT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 G 4 3 166978 CASAVA_Build 3 86202475 1I AATACAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 234 hom 42 1 36 5 A 9 10 166979 CASAVA_Build 3 86203858 1I TTAAAAATCA -/C TCCTTATTAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 0 1 166980 CASAVA_Build 3 86222141 1I TAATTTACTG -/T AATGGTTCGT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 0 1 166981 CASAVA_Build 3 86250091 2D ATTTGTTAAA GT/-- GTGTGTTTAC 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 GT 4 3 166982 CASAVA_Build 3 86254012 2D GCTTAATATA TG/-- TTAACATGTC 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 TG 1 0 166983 CASAVA_Build 3 86268404 4D AAATAAATAT ATAA/---- ATATTTGTAT 3070 het 2852 hom 21 7 13 4 ATAA 1 0 166984 CASAVA_Build 3 86281138 2I GGGTGAAAAC --/AT AACCATTGCT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 AT 0 1 166985 CASAVA_Build 3 86282672 4I TATATGTTTT ----/ATTA ATTAACGAAT 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 ATTA 1 2 166986 CASAVA_Build 3 86294575 1I TTTAAAAAAA -/C TTTTAGTTAC 3070 het 2336 hom 27 6 19 2 C 0 1 166987 CASAVA_Build 3 86298263 1D AAAATGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1198 hom 32 5 13 15 T 17 16 166988 CASAVA_Build 3 86300848 3I ATCAGATCAT ---/AAG AAGAAATAGT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 AAG 1 2 166989 CASAVA_Build 3 86305164 1D AAATCATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 11 10 166990 CASAVA_Build 3 86322129 2I CATGCACTCG --/TA TATGTTCATC 3070 het 3070 ref 59 34 20 5 TA 1 2 166991 CASAVA_Build 3 86322249 1D CAAAGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 11 10 166992 CASAVA_Build 3 86329491 2D CATTTTATTC AA/-- AAAAACTATA 3070 het 2874 hom 23 9 13 2 A 7 5 166993 CASAVA_Build 3 86331574 2D AGTACAGCCC CT/-- GTGTGTCCCT 3070 het 3070 hom 41 14 19 9 CT 1 0 166994 CASAVA_Build 3 86336062 2D GAGACAGAGT AA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 27 16 10 4 A 2 0 166995 CASAVA_Build 3 86337969 4D CATTCTTTCC CTAA/---- CTGACTAGAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 CTAA 1 0 166996 CASAVA_Build 3 86338590 25D GCCACTTGAA CTTCTACATCTTAGCTTCAGTTGTT/------------------------- CTTCTACATC 3070 hom 50 het 21 0 17 12 CTTCTACATCTTAGCTTCAGTTGTT 2 1 166997 CASAVA_Build 3 86341992 4I TTGCTTTGCC ----/TTTA TTTGTCTCTA 3070 hom 111 het 39 0 36 3 TTTA 0 1 166998 CASAVA_Build 3 86343406 1I GTTTACAATT -/A AAAAAATACA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 6 7 166999 CASAVA_Build 3 86343881 1I CCAGAGTCTG -/A AAAAAAAAAA 1037 het 1037 ref 34 24 3 7 A 11 12 167000 CASAVA_Build 3 86349039 1D TTGTTGTCTG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 102 het 41 0 35 8 T 8 7 167001 CASAVA_Build 3 86351559 1D TTCTAGAAAA T/- ATACAATAAT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 1 0 167002 CASAVA_Build 3 86356210 1I ATAATTTCAC -/A AAAAAAACCT 2321 hom 12 het 7 0 5 2 A 7 8 167003 CASAVA_Build 3 86359383 5D TTCCATACTT TTAAG/----- TTATTTGTTA 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 TTAAG 1 0 167004 CASAVA_Build 3 86359924 4D AAATTAGTAC ACAA/---- ACAAAATCTC 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 ACAA 2 1 167005 CASAVA_Build 3 86360030 1I TTGAAATTTT -/G TAATAAAAGA 3070 hom 76 het 30 0 26 5 G 0 1 167006 CASAVA_Build 3 86361512 1D ACAGATGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 15 6 T 13 12 167007 CASAVA_Build 3 86362827 11D TCTTTTGGTT TTCTTGTTTGG/----------- TTCTTGTTTA 3070 het 3070 hom 40 19 21 4 TTCTTGTTTGG 1 0 167008 CASAVA_Build 3 86364804 4D CACATATATA TAAT/---- TATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 21 11 10 0 TAAT 1 0 167009 CASAVA_Build 3 86366630 1D ACTATACTAC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 9 8 167010 CASAVA_Build 3 86371425 1D TAAATAGTAG C/- TGGGATAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 C 1 0 167011 CASAVA_Build 3 86378900 1D AAATGACACC A/- AAAAAAAAAA 2456 het 2456 ref 32 14 8 10 A 15 14 167012 CASAVA_Build 3 86382206 1D AGGCTGAAGT G/- GGAGGATTAC 3070 hom 75 het 27 0 24 3 G 3 2 167013 CASAVA_Build 3 86383389 1D GTGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 606 hom 30 2 21 7 T 17 16 167014 CASAVA_Build 3 86385934 35D AGGCTGGTCT CAAACTCCCGACCACAGGTGATCCACCTGCCTCAG/----------------------------------- CAAACTCCCG 2239 hom 24 het 8 0 5 8 CAAACTCCCGACCACAGGTGATCCACCTGCCTCAG 2 1 167015 CASAVA_Build 3 86390651 1D TTTAAAAAAA T/- GATAATTCAT 3070 hom 71 het 28 0 24 4 T 1 0 167016 CASAVA_Build 3 86391787 11I AGTAAATATA -----------/TGTATATACGT TGTATATACG 3070 hom 68 het 29 0 21 8 TGTATATACGT 1 2 167017 CASAVA_Build 3 86397776 4D TCTATAGCTA AAAT/---- AAATAATTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 6 AAAT 2 1 167018 CASAVA_Build 3 86398402 1I TTACACTTAT -/A TTTTTTTCTC 3070 hom 45 het 19 0 16 6 A 0 1 167019 CASAVA_Build 3 86403436 1D CAACCGAGCA G/- GGTGTAGAAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 3 2 167020 CASAVA_Build 3 86412446 4D GGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 474 hom 17 het 17 0 7 11 TA 10 8 167021 CASAVA_Build 3 86416920 4D CATAATAAAA TTTG/---- TTTGTTATCA 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 TTTG 2 1 167022 CASAVA_Build 3 86418781 56D GTTTCAAAAG TGAGAGTCTGGAGAAAGAGAACCAGGAAGAAAGCGTATTTCATATTGTGACTTACC/-------------------------------------------------------- TGAGAGTCTG 3070 hom 36 het 34 0 13 25 TGAGAGTCTGGAGAAAGAGAACCAGGAAGAAAGCGTATTTCATATTGTGACTTACC 1 0 167023 CASAVA_Build 3 86426134 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAT 2534 hom 18 het 10 0 7 3 A 10 9 167024 CASAVA_Build 3 86429781 1D AAACTCCAAC A/- GATGTGCAGC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 1 0 167025 CASAVA_Build 3 86432144 4D GAGAAGAAAC AAAT/---- AGACACAATA 3070 het 470 hom 18 2 15 1 AAAT 1 0 167026 CASAVA_Build 3 86435141 1D TCACTAATAT C/- AGATACTGTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 0 167027 CASAVA_Build 3 86450346 4D TTTTTTAATC AATT/---- AATTAGAATT 3070 hom 123 het 45 0 40 8 AATT 2 1 167028 CASAVA_Build 3 86459283 1I AATTTTGCCC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 76 het 32 0 26 6 T 8 9 167029 CASAVA_Build 3 86461635 1D TCACTGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 16 15 167030 CASAVA_Build 3 86466300 1I AAATGAAATT -/A AAAAGTCATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 4 5 167031 CASAVA_Build 3 86467007 1D TTTATTTTTC T/- TTTAAATAAC 3070 hom 42 het 20 0 15 6 T 4 3 167032 CASAVA_Build 3 86483126 1D GATAATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 877 hom 30 3 17 10 T 14 13 167033 CASAVA_Build 3 86530724 1D TCTTCAGTCT G/- TCACTATATA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 1 0 167034 CASAVA_Build 3 86550447 1I AGTTAGGAGG -/C CCCATATAGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 3 4 167035 CASAVA_Build 3 86550754 2D ACTTTAAAAC TG/-- TGTTTCTCTT 3070 hom 115 het 44 0 39 5 TG 2 1 167036 CASAVA_Build 3 86554695 1I TCTTTGTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 9 10 167037 CASAVA_Build 3 86555928 4D CATGCAACTT ACTC/---- ACTATCATGA 3070 hom 96 het 35 0 32 6 ACTC 1 0 167038 CASAVA_Build 3 86559212 1D ATACATTTTT A/- AAATTGAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 4 3 167039 CASAVA_Build 3 86568691 4D ATTTCGCCTT TAAC/---- TATTCTCTCA 3070 hom 102 het 40 0 35 9 TAAC 1 0 167040 CASAVA_Build 3 86569096 2D AATCATTCAC AT/-- GTCTACTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 5 AT 1 0 167041 CASAVA_Build 3 86569593 4D TTTTTTCTAC TTAT/---- TTATCTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 7 TTAT 2 1 167042 CASAVA_Build 3 86569824 1D CATTTTTCAA C/- ACCAGTCTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 1 0 167043 CASAVA_Build 3 86571287 1D TTTTAAAGTG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 167044 CASAVA_Build 3 86579035 26D CAGGAAGCCT TCTGCATAAGAGAATCAAGTAGCAGA/-------------------------- TCTGCATAAG 3070 hom 78 het 36 0 26 16 TCTGCATAAGAGAATCAAGTAGCAGA 2 1 167045 CASAVA_Build 3 86591487 2D AACAATGAGA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 50 21 25 5 AG 5 4 167046 CASAVA_Build 3 86596361 1I TTTTCATAGA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 6 7 167047 CASAVA_Build 3 86741732 1D CCATGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 1225 het 1225 ref 29 21 3 5 T 13 12 167048 CASAVA_Build 3 86746307 1I GAAATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 13 14 167049 CASAVA_Build 3 86750418 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1449 het 125 hom 23 3 10 10 T 15 14 167050 CASAVA_Build 3 86757671 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 121 hom 33 2 23 8 T 10 11 167051 CASAVA_Build 3 86760920 1I TTAATTAATT -/G GGATGGATTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 2 3 167052 CASAVA_Build 3 86822923 2D AGAAAAACCT AA/-- GACTCCACAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 0 167053 CASAVA_Build 3 86831254 4D TGATTTTCCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 63 het 29 0 22 8 TTTC 5 4 167054 CASAVA_Build 3 86832866 2D TAAATTATAC AT/-- GTTTTATTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AT 1 0 167055 CASAVA_Build 3 86833302 1D AGTATCAAAA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 7 167056 CASAVA_Build 3 86833791 2D ATTCTTATTT TA/-- TATGTTACTG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TA 2 1 167057 CASAVA_Build 3 86834339 1D GTTGAAATTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 8 7 167058 CASAVA_Build 3 86835192 1D ACAACATGCA G/- GTTTGTTACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 2 1 167059 CASAVA_Build 3 86837109 33D CCTCTTTTCC TAATTGAATACACTTTATTTCTTTCTCTTTTTG/--------------------------------- TAATTGAATA 3070 hom 21 het 8 0 8 3 TAATTGAATACACTTTATTTCTTTCTCTTTTTG 1 0 167060 CASAVA_Build 3 86845792 5D TTCTGATAGC TAAGA/----- TAAAATTCCT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TAAGA 1 0 167061 CASAVA_Build 3 86848650 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 115 het 46 0 38 8 A 14 13 167062 CASAVA_Build 3 86850253 11I AAGTACCCAG -----------/TCTCAGATATT TCTTCATAGC 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TCTCAGATATT 0 1 167063 CASAVA_Build 3 86857066 1D TATATTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 958 hom 21 3 15 3 A 15 14 167064 CASAVA_Build 3 86867933 1I AAAATACTAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 8 9 167065 CASAVA_Build 3 86869559 3I ACTAAAACAC ---/CTT CTTCACTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTT 1 2 167066 CASAVA_Build 3 86890993 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 20 0 15 6 T 13 11 167067 CASAVA_Build 3 86906832 1D AGAGAGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 619 hom 40 2 31 7 T 12 11 167068 CASAVA_Build 3 86907033 1I ATGTAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 273 hom 33 2 17 14 T 13 14 167069 CASAVA_Build 3 86913446 1I TTCCTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 10 11 167070 CASAVA_Build 3 86934449 1D CAAAAATGGT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 A 8 7 167071 CASAVA_Build 3 86942429 1D CATGCCATAT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 8 7 167072 CASAVA_Build 3 86948992 1D GTTCTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 24 3 16 5 A 15 14 167073 CASAVA_Build 3 86950496 1I AGAAGGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1192 hom 39 3 31 5 A 12 13 167074 CASAVA_Build 3 86973255 1D GGACCTAGTT G/- TTTTTAGAGT 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 G 1 0 167075 CASAVA_Build 3 87074289 1I AATGGTTGTG -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 6 167076 CASAVA_Build 3 87074852 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 114 het 46 0 39 8 TG 9 8 167077 CASAVA_Build 3 87078530 1I ATGTGTGGTT -/C CATCCTTTCC 3070 hom 39 het 44 1 39 4 C 1 2 167078 CASAVA_Build 3 87080425 4D AATAATAATA AATT/---- AATTAATTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 AATT 3 2 167079 CASAVA_Build 3 87117899 2D ACACACACAC AT/-- ATATACACAC 3070 hom 78 het 29 0 26 4 AT 3 2 167080 CASAVA_Build 3 87142063 3I33M1D TCCAGCTTTG ---TTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTTGTTTTTTGTGGT/TTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTGTTTTTTGTGG- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 29 2 30 9 N/A 0 0 167081 CASAVA_Build 3 87147506 1I TCTTGAGATG -/T AGAAGAACGT 3070 hom 163 het 59 0 55 4 T 0 1 167082 CASAVA_Build 3 87155064 1I ATAATAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 9 10 167083 CASAVA_Build 3 87177659 5D ATGCCTACAG ATAAA/----- ATAAACTATT 3070 hom 105 het 40 0 36 6 ATAAA 2 1 167084 CASAVA_Build 3 87179425 2D TTTGGTCGTA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 96 het 45 0 32 14 TC 10 9 167085 CASAVA_Build 3 87187275 1I TGTTTTGGAC -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 8 167086 CASAVA_Build 3 87192001 3D ATTTAATTTT AAG/--- AAGATGAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAG 2 1 167087 CASAVA_Build 3 87192303 1D TAAGAAAATA T/- TTTTATATTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 5 4 167088 CASAVA_Build 3 87196724 1D CAGAAATCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 9 167089 CASAVA_Build 3 87202279 1D ATGGTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 35 2 18 15 A 15 14 167090 CASAVA_Build 3 87206382 1D TTCCATTTAT A/- AAACATCCCC 3070 hom 126 het 49 0 42 9 A 4 3 167091 CASAVA_Build 3 87211497 1I ACTTCTGGGG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 8 167092 CASAVA_Build 3 87215260 3I CTAGTCAAAC ---/AAA TCACTGACAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 3 167093 CASAVA_Build 3 87216994 2D CAGAAACTGT GA/-- GAGAGAAGGG 3070 hom 123 het 48 0 41 9 GA 4 3 167094 CASAVA_Build 3 87221902 1I CTTCATTATT -/G GCATTTCACT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 G 1 2 167095 CASAVA_Build 3 87294193 1D CCCCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 2168 het 2168 ref 45 33 6 7 A 13 12 167096 CASAVA_Build 3 87321897 3D AGTGAGCTTC CCT/--- CCTCATGTTG 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 CCT 2 1 167097 CASAVA_Build 3 87331398 2I TACTGAAGGA --/CT CTCTCTCCTA 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 CT 3 4 167098 CASAVA_Build 3 87344229 2I AATGCCAAAT --/CA CAGAGTAATC 3070 het 3070 hom 53 25 25 3 CA 1 2 167099 CASAVA_Build 3 87366835 2I TTTTAAAGAC --/AT GTGTTAAATA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 AT 0 1 167100 CASAVA_Build 3 87371128 1D CCAATTTATC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 T 8 7 167101 CASAVA_Build 3 87376250 1I TTTGTACTTC -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 6 7 167102 CASAVA_Build 3 87381413 1D AACAGGTAAA T/- TTTATTTTCC 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 T 4 3 167103 CASAVA_Build 3 87383687 1I ACTTCATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 T 11 12 167104 CASAVA_Build 3 87388764 1I CACCCCCCCC -/T GCCGCCATCC 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 T 0 1 167105 CASAVA_Build 3 87391437 2D ACCCATACTC AT/-- ATGTCTGCGT 3070 het 3070 hom 39 17 19 8 AT 2 1 167106 CASAVA_Build 3 87399433 4D AAATTGTTTA TTTG/---- TTTGTTTGCT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TTTG 3 2 167107 CASAVA_Build 3 87404693 1D TATAATGATG A/- GGGGGGGTGT 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 A 1 0 167108 CASAVA_Build 3 87411937 1I AAAGGATTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 167109 CASAVA_Build 3 87412779 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 627 hom 22 3 16 3 A 14 13 167110 CASAVA_Build 3 87416816 2I CATAATAAAT --/AC AGTTATTATT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AC 0 1 167111 CASAVA_Build 3 87427461 2I GCTCTTTAAA --/AC ACAACTCAGT 3070 hom 78 het 31 0 25 6 AC 1 2 167112 CASAVA_Build 3 87428048 1D GTAGGGTGTC A/- AAGGATGGGC 3070 hom 105 het 43 0 36 8 A 3 2 167113 CASAVA_Build 3 87428534 1I GAGACATCAC -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 7 8 167114 CASAVA_Build 3 87428879 1D ACCAATAATT C/- TTTAAGTTAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 0 167115 CASAVA_Build 3 87430686 1D TTAAAACAAA G/- TTATGCTGTA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 G 1 0 167116 CASAVA_Build 3 87431123 4D AACCTAATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 13 0 9 4 T 18 14 167117 CASAVA_Build 3 87436074 1I GCTAACAAGG -/A CCTTTAGAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 0 1 167118 CASAVA_Build 3 87440296 10D TCTGGCAATG ATTTCCCGTC/---------- ATTTCCTCAC 3070 hom 117 het 44 0 40 6 ATTTCCCGTC 1 0 167119 CASAVA_Build 3 87441989 36I TCATTCAAGC ------------------------------------/CCCCTGTCTTCGGTAGGGAATTTCCCCTGTAGAGAG CATATGCACT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 CCCCTGTCTTCGGTAGGGAATTTCCCCTGTAGAGAG 0 1 167120 CASAVA_Build 3 87442640 1D TTTAAAAATA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 67 het 26 0 23 3 T 8 7 167121 CASAVA_Build 3 87444779 1I AATAAATGGA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 7 8 167122 CASAVA_Build 3 87446930 2D ATACAAATAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 108 het 39 0 37 6 AT 5 4 167123 CASAVA_Build 3 87447091 1D CTTTGAGTCA C/- CCCCACTGAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 5 4 167124 CASAVA_Build 3 87448642 2I TTTTTATTTT --/AA GTGTTTAGTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 2 167125 CASAVA_Build 3 87451259 1I AATTAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 10 11 167126 CASAVA_Build 3 87454260 2D CTCAGCACAG GC/-- AGAGAGAGAG 1623 het 1623 ref 22 8 5 9 GC 1 0 167127 CASAVA_Build 3 87456541 1D GTGTCAAAGT C/- CTCTGATGTC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 2 1 167128 CASAVA_Build 3 87456792 2I ACACACACAC --/AA ACACACACAC 3070 het 281 hom 28 1 22 5 A 1 3 167129 CASAVA_Build 3 87457447 1I AGTAGAAAGA -/C AAAAAGATGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 0 1 167130 CASAVA_Build 3 87461511 1D CAGATGAATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 334 hom 38 4 12 22 T 10 9 167131 CASAVA_Build 3 87462406 1D TTAATATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 13 12 167132 CASAVA_Build 3 87463766 4I GCTAAGCTAT ----/GATG TATGGTAGGG 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 GATG 0 1 167133 CASAVA_Build 3 87463883 4D GGCATTTATA TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 ref 45 24 14 9 TATT 4 3 167134 CASAVA_Build 3 87466026 1D GCCTCTGGGA T/- TTTTGTGAAA 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 T 5 4 167135 CASAVA_Build 3 87466791 4D TTAGCATATA TAAC/---- TAAGATAATT 3070 het 3070 ref 31 16 14 4 TAAC 1 0 167136 CASAVA_Build 3 87467492 1I CAGAAGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 25 6 T 10 11 167137 CASAVA_Build 3 87467963 1I GATGCAAAAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 A 7 8 167138 CASAVA_Build 3 87468516 1D GTCAGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 A 11 10 167139 CASAVA_Build 3 87468655 1I ATCATCCTGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 8 16 8 A 8 9 167140 CASAVA_Build 3 87470179 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 982 hom 11 2 7 2 A 9 10 167141 CASAVA_Build 3 87470698 1D AAGACTTTAA T/- TTTGTCCTGT 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 T 4 3 167142 CASAVA_Build 3 87470925 1D CATCTTTCTG A/- AAAAATAAGC 3070 hom 50 het 30 0 16 15 A 6 5 167143 CASAVA_Build 3 87480653 4D GAAGGAAATT AAAA/---- AGAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 A 5 1 167144 CASAVA_Build 3 87481331 1I CTTAAACAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 T 9 10 167145 CASAVA_Build 3 87481591 1D AGGCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2156 hom 18 9 8 1 A 11 10 167146 CASAVA_Build 3 87488129 2D CAAATGTGGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 59 20 21 18 GT 7 6 167147 CASAVA_Build 3 87490589 1I AAATTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 113 het 44 0 39 5 T 10 11 167148 CASAVA_Build 3 87504948 1I CATAAATAAC -/A ACACTCAATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 167149 CASAVA_Build 3 87505328 1D GGAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 0 167150 CASAVA_Build 3 87508535 3I ATGTAGTTGA ---/GTT GTTATTAGGT 3070 hom 132 het 51 0 43 8 GTT 1 2 167151 CASAVA_Build 3 87510568 3D AATAAATAAT AAC/--- AACAGCACAA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AAC 2 1 167152 CASAVA_Build 3 87511215 4I ACAGTTTAAC ----/CTAA CTGACATTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CTAA 0 1 167153 CASAVA_Build 3 87516662 1D TTTGCTGATT C/- ATTTTTTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 1 0 167154 CASAVA_Build 3 87517894 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2890 hom 39 het 18 0 14 5 A 13 12 167155 CASAVA_Build 3 87518771 1I ATCATAATTC -/T TTAAAGCAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 2 3 167156 CASAVA_Build 3 87520654 1D ATATTTTAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 10 9 167157 CASAVA_Build 3 87525615 2I AAAAATTACC --/AA AAAAAAAAAA 2830 hom 57 het 32 0 20 12 A 12 14 167158 CASAVA_Build 3 87528415 5I TTTATCAGAC -----/ACAGT AGAAAGAGGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACAGT 0 1 167159 CASAVA_Build 3 87544976 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 37 het 20 0 12 8 AT 7 6 167160 CASAVA_Build 3 87551967 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 29 het 15 0 10 5 A 10 9 167161 CASAVA_Build 3 87569205 1I TTTGTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 37 1 29 7 T 13 14 167162 CASAVA_Build 3 87572533 2D AGGAAGGGAC TG/-- GGGCTAGTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TG 1 0 167163 CASAVA_Build 3 87582853 1D ACTTTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 32 1 24 7 A 11 10 167164 CASAVA_Build 3 87587657 1D ATGGGTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 593 hom 27 3 19 5 T 12 11 167165 CASAVA_Build 3 87588068 1I AACAACAATA -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 6 7 167166 CASAVA_Build 3 87594765 1I AAGCATAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 11 12 167167 CASAVA_Build 3 87602855 1I GAGGGTGAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 398 hom 36 1 26 9 A 8 9 167168 CASAVA_Build 3 87602999 1D TGTATTTTAT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 9 8 167169 CASAVA_Build 3 87610531 1I CCAAAGGAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 313 hom 37 1 25 11 A 9 10 167170 CASAVA_Build 3 87613212 5D ACTGTAAAAG TACCA/----- ACATAATGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TACCA 1 0 167171 CASAVA_Build 3 87619298 7D AACTTCTAAA CACAATC/------- CACACTTATT 3070 hom 111 het 37 0 38 1 CACAATC 1 0 167172 CASAVA_Build 3 87620951 1D CAGGGAAAGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 425 hom 34 1 26 7 A 9 8 167173 CASAVA_Build 3 87625385 4D GATACAAGAA AAAT/---- AAATATACAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAAT 2 1 167174 CASAVA_Build 3 87626372 4I TAGAAAGAAG ----/AGAA AGAAAGAGAG 3070 hom 56 het 21 0 18 3 AGAA 1 2 167175 CASAVA_Build 3 87626453 4I AGAAGGAAGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 898 het 271 hom 19 3 9 7 AAGG 3 4 167176 CASAVA_Build 3 87627902 1I AACGCCCACC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 513 hom 45 2 36 7 T 6 7 167177 CASAVA_Build 3 87647147 8D TTGATACTAG CTGGAAAT/-------- CTTAACCTTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 6 CTGGAAAT 1 0 167178 CASAVA_Build 3 87654030 1D CCATTTATCT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 44 19 21 6 A 8 7 167179 CASAVA_Build 3 87655544 1D AGTTTTTTGA G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 120 het 42 0 41 2 G 8 7 167180 CASAVA_Build 3 87656539 1D ATTAAACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2150 hom 29 6 11 12 T 13 12 167181 CASAVA_Build 3 87660203 1I CCTAATCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 10 11 167182 CASAVA_Build 3 87661497 1D CAATTTTTTT A/- AGTTTGTTAA 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 A 2 1 167183 CASAVA_Build 3 87668543 1I GATAAAGAAT -/A AGAGTTAGTT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 1 2 167184 CASAVA_Build 3 87672952 5D TATAGTTCTA ATGAT/----- TTGATTTGAT 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 ATGAT 1 0 167185 CASAVA_Build 3 87674026 35I AGCCTATAGA -----------------------------------/TAGATTATATTAATGAACCAATGTAAATTCTTGGT TTAAAAATCT 3070 hom 52 het 27 0 18 9 TAGATTATATTAATGAACCAATGTAAATTCTTGGT 0 1 167186 CASAVA_Build 3 87674935 1D70M4D AGAGAGTCTG AAAAAAAAAAATAGAGGAAACTTGGCCTACCGCAGAACAAAATTTAAAAATAAATGAAAAGCAATTGCTTGAGAA/-AAAAAAAAAATAGAGGAAACTTGGCCTACCGCAGAACAAAATTTAAAAATAAATGAAAAGCAATTGCTTG---- AGAGTCTTAG 3070 het 147 hom 21 1 18 17 N/A 0 0 167187 CASAVA_Build 3 87679371 1D TTATTACAGC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 7 6 167188 CASAVA_Build 3 87680983 5I TCTAAATAAC -----/TAAAG TAGACACTTC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TAAAG 0 1 167189 CASAVA_Build 3 87681498 1I TGTTTTTTTT -/A TTTCCCCTAA 3070 hom 81 het 42 0 38 4 A 0 1 167190 CASAVA_Build 3 87688576 1D TCTTTTTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 38 het 16 0 13 3 A 10 9 167191 CASAVA_Build 3 87689474 1D GTTGTAGGGG T/- TTTTTTGTGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 6 167192 CASAVA_Build 3 87698649 1D TGAAACCCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 9 167193 CASAVA_Build 3 87698903 3D GCAATTTAGT ATA/--- ATAACAGGAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ATA 2 1 167194 CASAVA_Build 3 87699922 1D ATCTCAAAAA T/- AAAAAAGAAA 3070 het 396 hom 22 1 21 0 T 1 0 167195 CASAVA_Build 3 87711134 1D TACGCATGAA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 8 7 167196 CASAVA_Build 3 87712946 3D TGACATTATT TTG/--- TTGATCAGTG 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 TTG 2 1 167197 CASAVA_Build 3 87739138 1I CCTTGCCTCT -/G TGTCCTGTCC 3070 het 3070 ref 46 26 11 9 G 0 1 167198 CASAVA_Build 3 87752057 3I TTCTGTCAGA ---/CAT CAAGATGATA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 CAT 0 1 167199 CASAVA_Build 3 87801235 1I TCCAAATATA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 6 7 167200 CASAVA_Build 3 87830918 2D AAATAAATAC TG/-- TGTGTGTTCT 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 TG 4 3 167201 CASAVA_Build 3 87866037 1D ACCTTTCACC T/- ATTTGAATGA 1857 het 1857 ref 41 36 4 1 T 1 0 167202 CASAVA_Build 3 87870884 1D ATAATACATG T/- TACACTGTTA 3070 het 2916 hom 20 6 10 4 T 2 1 167203 CASAVA_Build 3 87896257 1D TAGAATGTCG A/- AAAAAAAAAA 2806 het 2806 ref 26 12 9 6 A 12 11 167204 CASAVA_Build 3 87911232 1I TAAATAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 10 11 167205 CASAVA_Build 3 87924365 3D AGACGGAGGA GAG/--- AAGAGGCAGG 3070 het 2575 hom 29 13 10 6 GAG 1 0 167206 CASAVA_Build 3 87929500 1I CATGAATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 9 10 167207 CASAVA_Build 3 87943118 1D TTCTATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1783 hom 20 7 9 5 A 13 12 167208 CASAVA_Build 3 87944282 1D TGCCCTAGGG A/- ATCTGTGGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 167209 CASAVA_Build 3 87972971 1D TGCTTATTAG C/- CGGATTTAAT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 C 2 1 167210 CASAVA_Build 3 87975352 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1647 het 840 hom 10 2 6 2 T 13 14 167211 CASAVA_Build 3 87975525 1I CCCCTCCCCC -/T ACCCCACAAC 1427 het 209 hom 6 2 4 0 T 0 1 167212 CASAVA_Build 3 88006474 2D GCAAAAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 A 12 10 167213 CASAVA_Build 3 88023128 1D AAATTGAGTG T/- TTTTTGTTAA 3070 het 2452 hom 22 5 14 3 T 6 5 167214 CASAVA_Build 3 88024238 1D TCAGTTTAAT A/- TCCAGATTCA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 1 0 167215 CASAVA_Build 3 88030098 1I GTGCAATCTT -/A AGAGTTGTGG 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 A 1 2 167216 CASAVA_Build 3 88039038 1I CCAACATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 T 11 12 167217 CASAVA_Build 3 88058771 1I TTAGTTAGTT -/A AAAATGGCCC 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 A 4 5 167218 CASAVA_Build 3 88078381 1I TATCTACACT -/A AAAAAAAATT 2997 het 1716 hom 14 4 7 3 A 8 9 167219 CASAVA_Build 3 88079210 1D TAGTTCTCTC T/- TAACAAACAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 T 2 1 167220 CASAVA_Build 3 88079639 3I TATTTATTAT ---/ATC ATAACTATTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATC 0 1 167221 CASAVA_Build 3 88082401 1I GTGTCAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 25 1 23 1 A 11 12 167222 CASAVA_Build 3 88085193 2D ATTTAACGGC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 A 11 9 167223 CASAVA_Build 3 88091608 1D CCACCATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 T 15 14 167224 CASAVA_Build 3 88099288 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1981 het 1981 ref 16 9 5 4 A 12 11 167225 CASAVA_Build 3 88099427 1D ATTGAATCAT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 37 het 26 0 14 13 G 9 8 167226 CASAVA_Build 3 88104715 3D CTCAGCTGCT TAA/--- TAATAATACC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TAA 3 2 167227 CASAVA_Build 3 88106401 1I CCTGGCAATC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 101 het 39 0 34 5 T 7 8 167228 CASAVA_Build 3 88107505 4D TCATGGACTT TTTA/---- AACTTTAGAT 3070 het 3070 hom 50 24 24 5 TTTA 1 0 167229 CASAVA_Build 3 88109601 4D TTCCTGAGCT CACA/---- CACACTATTA 3070 het 3070 ref 26 18 8 1 CA 4 2 167230 CASAVA_Build 3 88112518 4I TCAGGCTGTA ----/CATG CTGAGGGGCA 3070 hom 83 het 31 0 26 5 CATG 0 1 167231 CASAVA_Build 3 88113782 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 T 10 11 167232 CASAVA_Build 3 88114811 1I CTTCAAAGAC -/T TGGTGCCATG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 1 2 167233 CASAVA_Build 3 88116294 5D TTTTTGTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTTG 56 het 56 ref 41 21 2 18 TTTGT 2 1 167234 CASAVA_Build 3 88118960 10D AAATAAAATA AAAATAAAAT/---------- AAAATAAAAT 2613 het 1613 hom 11 5 6 0 AAAAT 5 3 167235 CASAVA_Build 3 88125192 1D TAAAATACAG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 8 7 167236 CASAVA_Build 3 88125681 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 41 18 16 9 A 8 7 167237 CASAVA_Build 3 88126205 2D TCCCTGTCAT TC/-- TCTGTTTACT 3070 het 3070 hom 28 10 15 5 TC 2 1 167238 CASAVA_Build 3 88126624 1D TTCCTTCCTG A/- AAAAAATATG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 7 6 167239 CASAVA_Build 3 88139712 1D AGGGTAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 24 2 16 6 T 14 13 167240 CASAVA_Build 3 88141746 7D TAGGGCCCAC AAAGCCT/------- AAAGCCTAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 AAAGCCT 2 1 167241 CASAVA_Build 3 88143443 4D GTTTCTTGGA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 TTGT 3 2 167242 CASAVA_Build 3 88149229 12D GCCGGCTACG GCGCCCGCTACT/------------ GCGCCCTGCT 2075 het 408 hom 8 3 7 0 GCGCCCGCTACT 1 0 167243 CASAVA_Build 3 88152210 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 1 0 167244 CASAVA_Build 3 88157671 1D TCAAAAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 10 hom 29 1 24 6 A 10 9 167245 CASAVA_Build 3 88164611 1I ACAGGATTAG -/T TTTAAGTAGA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 3 4 167246 CASAVA_Build 3 88167597 1I AATATAATAG -/A TAGAGAGGGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 1 167247 CASAVA_Build 3 88167811 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 32 1 27 4 T 12 11 167248 CASAVA_Build 3 88180390 3D GTCTCAAAAA AAT/--- AATAATAATT 2394 het 2394 ref 14 6 6 2 AAT 4 3 167249 CASAVA_Build 3 88182899 1D CATAAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 A 11 10 167250 CASAVA_Build 3 88186757 5D GAAAGATAGT TAAGG/----- TGACTACATC 3070 het 3070 hom 31 12 16 5 TAAGG 1 0 167251 CASAVA_Build 3 88186850 2D TTTTCCACTA TC/-- TCCCTTCCTT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 TC 2 1 167252 CASAVA_Build 3 88187163 1D AGTGAGGTGG T/- TTTTTTTTTG 1149 het 1149 ref 38 31 3 4 T 10 9 167253 CASAVA_Build 3 88188375 1I GAAAAACCAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 9 10 167254 CASAVA_Build 3 88188570 5D GTTAATACTT ACTTC/----- ACTTAACTAG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 ACTTC 1 0 167255 CASAVA_Build 3 88189182 1D TTTTTTCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1646 hom 34 7 13 14 T 15 14 167256 CASAVA_Build 3 88200985 8D TCTCAGGCCA GGCGCCGT/-------- GGCTTACACC 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 GGCGCCGT 1 0 167257 CASAVA_Build 3 88203478 4I TCCATCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 2951 hom 18 het 7 0 7 0 AAAC 3 4 167258 CASAVA_Build 3 88204813 4D TAAAAAAATT GTTA/---- GTTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 GTTA 1 0 167259 CASAVA_Build 3 88209350 1I TTTTTTGTGA -/T TTTTTTTAGT 2467 het 2467 ref 17 9 6 2 T 7 8 167260 CASAVA_Build 3 88209534 1I TGTAATACTT -/A ACTATTTTTA 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 A 1 2 167261 CASAVA_Build 3 88221331 1I AACTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2349 hom 26 10 14 2 A 13 14 167262 CASAVA_Build 3 88225945 1I GATAATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 T 12 13 167263 CASAVA_Build 3 88237127 1D TCCACCCTGC T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 8 7 167264 CASAVA_Build 3 88244131 1I AAAAACTATT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 50 15 26 9 A 7 8 167265 CASAVA_Build 3 88244373 1D GGAGGAACTA C/- AGAATTTGAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 C 1 0 167266 CASAVA_Build 3 88245661 5D ACAGACAACA TATCT/----- TATATTTGTT 3070 het 3070 ref 60 31 25 7 TATCT 1 0 167267 CASAVA_Build 3 88248402 2D ACATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 8 hom 33 1 17 15 AC 8 7 167268 CASAVA_Build 3 88249786 1D ATAGATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 12 11 167269 CASAVA_Build 3 88251915 1I CTACTTATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2258 hom 21 6 11 4 A 9 10 167270 CASAVA_Build 3 88252649 3D AGTCAGTGAC ATT/--- AGTGTGATTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 ATT 1 0 167271 CASAVA_Build 3 88256613 1D CAATACTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 12 11 167272 CASAVA_Build 3 88257351 1D TCTTAAATCT A/- AAGCAAAGTA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 3 2 167273 CASAVA_Build 3 88259287 1I AAAGGGAGTT -/A AAAAAAAAAA 2527 het 2527 ref 25 13 8 4 A 10 11 167274 CASAVA_Build 3 88265430 1D TTCCAAATAT A/- GCAGTCAGCA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 1 0 167275 CASAVA_Build 3 88270291 1I TATGGATAGT -/G GGGCTTGTCA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 G 3 4 167276 CASAVA_Build 3 88273184 1I TATACTTCTT -/C CACTGTATCA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 C 1 2 167277 CASAVA_Build 3 88273861 1D AAGTGTGTGT G/- GGGAGGGGGG 917 het 917 ref 22 13 2 7 G 4 3 167278 CASAVA_Build 3 88274137 2I AAAACAAAAC --/AA AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 8 10 167279 CASAVA_Build 3 88276914 2D TTAAAAAAAC AA/-- AGACTGAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 3 1 167280 CASAVA_Build 3 88291314 1I AGGCCGAGGC -/G GGCGGATCAC 1905 het 1847 hom 10 4 5 1 G 2 3 167281 CASAVA_Build 3 88299835 2D GAATCATGAC TT/-- TTAATGCTGG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 4 2 167282 CASAVA_Build 3 88300567 1I GTATGTAACC -/A AAAAAAAAAA 2435 het 2435 ref 39 14 11 14 A 14 15 167283 CASAVA_Build 3 88310455 3D TTTATAAAAA AAG/--- AAGTACAAAT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 AAG 2 1 167284 CASAVA_Build 3 88310755 1I ATATATTCAC -/A AAAAAGACAT 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 A 5 6 167285 CASAVA_Build 3 88312283 1D TACCCATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 10 9 167286 CASAVA_Build 3 88320606 1I GAATTCGCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 15 28 8 T 9 10 167287 CASAVA_Build 3 88329711 1I GAAAAAAAAA -/T AACATCTCAA 3070 het 3070 hom 30 16 13 1 T 0 1 167288 CASAVA_Build 3 88340040 1I ACTCTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 9 7 T 11 12 167289 CASAVA_Build 3 88346916 4I ATTAAAAAAT ----/ACTA AATAGGCATT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 ACTA 0 1 167290 CASAVA_Build 3 88352614 6D GGGATTACAG GCGTGA/------ GCCACTGTGC 3070 het 2165 hom 20 10 10 1 GCGTGA 1 0 167291 CASAVA_Build 3 88373034 4I CAAATGTCCT ----/TGTA ATCAGCTTAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TGTA 0 1 167292 CASAVA_Build 3 88375680 1I TTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 16 8 T 10 11 167293 CASAVA_Build 3 88377127 20I ACCCTCAAAA --------------------/GGCTGTACTAATTTGCTTTT GGTTTTACAG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 GGCTGTACTAATTTGCTTTT 0 1 167294 CASAVA_Build 3 88379440 1D GGGGGGCGGT G/- GGGGGGGGGA 2659 het 18 hom 21 1 9 11 G 10 9 167295 CASAVA_Build 3 88386760 8D ATGATGGCCA TGCTTGTC/-------- TGCTTGTCTC 3070 hom 58 het 21 0 19 5 TGCTTGTC 2 1 167296 CASAVA_Build 3 88396962 4I CGTGGCAATC ----/TTAG TTGGTTGGCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTAG 0 1 167297 CASAVA_Build 3 88398920 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 1259 het 846 hom 15 4 7 4 A 9 10 167298 CASAVA_Build 3 88400193 31I TGTCCAAGGA -------------------------------/TCTTGAGTCATCTCCCCACAGTAGCAGAATG ACAACAACAA 3070 hom 75 het 41 0 24 17 TCTTGAGTCATCTCCCCACAGTAGCAGAATG 0 1 167299 CASAVA_Build 3 88401288 4D CATGTGTATA TGAG/---- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 82 45 29 9 TGAG 1 0 167300 CASAVA_Build 3 88403830 1D TTGAAAAACA T/- TTATTTTGTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 3 2 167301 CASAVA_Build 3 88404579 1D TTCTCTTTTA T/- TATGAGTTTG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 1 167302 CASAVA_Build 3 88408367 1I GGATAAAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 9 10 167303 CASAVA_Build 3 88411704 1D AAGAAGACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 38 0 29 9 T 13 12 167304 CASAVA_Build 3 88413769 2D AATAGAAAAC AT/-- AAGAGAATGA 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 AT 1 0 167305 CASAVA_Build 3 88415160 4D GCTTATGTTT TATC/---- TATACATATT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 TATC 1 0 167306 CASAVA_Build 3 88417168 1D CAATCTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2309 hom 24 8 13 3 T 16 15 167307 CASAVA_Build 3 88421836 1D GCACAACAAA C/- CCCCTGGACA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 C 5 4 167308 CASAVA_Build 3 88427927 3D TTGTTGTTGC TGT/--- TGTTGTGTCT 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 TGT 3 2 167309 CASAVA_Build 3 88432567 4D TGCTTCTAAC TTAA/---- TTGAGTCCGG 3070 het 3070 ref 46 23 21 5 TTAA 1 0 167310 CASAVA_Build 3 88434659 1I AATTTTTTTT -/C CTTTGCACTC 3070 het 3070 hom 52 21 25 6 C 1 2 167311 CASAVA_Build 3 88436213 1D AAAAAAATCC A/- AAAAAAAAAA 723 het 485 hom 18 8 8 2 A 12 11 167312 CASAVA_Build 3 88440443 4D TAGACTAGGG GTTT/---- GTTTCTCTAT 3070 het 3070 ref 31 17 13 3 GTTT 2 1 167313 CASAVA_Build 3 88440724 1D AATAAAAGTG A/- AAAGCTTCTC 3070 het 3070 hom 23 10 10 4 A 4 3 167314 CASAVA_Build 3 88443755 2I CGCCACTCTC --/TT TGTGGGTGAG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 1 3 167315 CASAVA_Build 3 88448549 15D TTTGGAAGTA GATTCTTCCCCAGTT/--------------- GAGCCTTGGG 3070 het 3070 ref 42 19 20 4 GATTCTTCCCCAGTT 1 0 167316 CASAVA_Build 3 88456599 1I GGAAGAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 A 10 11 167317 CASAVA_Build 3 88461124 1D TACTATCTGA G/- TGTAGAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 G 1 0 167318 CASAVA_Build 3 88461785 1D TTTTAATCTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 7 6 167319 CASAVA_Build 3 88462568 1I GAGGATCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 10 167320 CASAVA_Build 3 88468026 1D CAGAAAATGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 66 hom 26 2 12 12 T 10 9 167321 CASAVA_Build 3 88471108 1I CATGAGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 10 11 167322 CASAVA_Build 3 88473456 1I TTCCCACAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 9 10 167323 CASAVA_Build 3 88476073 2I39M1I CTGGCGAGAC --ATGTGGTCATTTCCATTACCAACAAAATTTTCTTTTTAG-/ATATGTGGTCATTTCCATTACCAACAAAATTTTCTTTTTAGA AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 38 18 28 4 N/A 0 0 167324 CASAVA_Build 3 88477617 1I TTGAAATAAG -/T TCATTTAATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 1 2 167325 CASAVA_Build 3 88477842 9D GACTACACAA ATAATAAAG/--------- ATAATAAAGT 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 ATAATAAAG 2 1 167326 CASAVA_Build 3 88480030 2D GACAGAATGA TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 10 8 167327 CASAVA_Build 3 88482440 2D CAAAGATGAT GA/-- AAAAAAAAAA 2220 het 2091 hom 37 13 6 19 GA 1 0 167328 CASAVA_Build 3 88488833 1I TTTGAGTTTA -/T TTTATATTTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 3 4 167329 CASAVA_Build 3 88489730 1I AAGTAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2704 het 2704 ref 20 12 6 2 T 9 10 167330 CASAVA_Build 3 88490119 4I ATATCATCTG ----/CAAA CAAAGATAAT 3070 het 3070 ref 32 16 16 0 CAAA 1 2 167331 CASAVA_Build 3 88490368 1D TTGTGAGCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 13 3 T 10 9 167332 CASAVA_Build 3 88491189 1I ATCTTTTGTA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 7 8 167333 CASAVA_Build 3 88492658 1D TTAATTTTTT G/- GTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 G 2 1 167334 CASAVA_Build 3 88497933 2I TTGGCAATAT --/TC TCTCTTTCAT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 TC 2 3 167335 CASAVA_Build 3 88505444 2D TAATGAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 104 hom 21 2 8 11 A 14 12 167336 CASAVA_Build 3 88509337 1D TTACAATTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 10 9 167337 CASAVA_Build 3 88514938 1D CCTCTACTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 9 8 167338 CASAVA_Build 3 88516209 1I ACCCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 28 2 24 2 A 10 11 167339 CASAVA_Build 3 88516220 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 417 hom 24 1 19 4 A 7 8 167340 CASAVA_Build 3 88517351 1D ATGAAATAAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 T 9 8 167341 CASAVA_Build 3 88519004 1D AAACACATGC T/- TTTTTTTTTT 2344 het 61 hom 18 1 7 10 T 17 16 167342 CASAVA_Build 3 88520825 1I ACAATGAACC -/A AGCAGACCAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 1 2 167343 CASAVA_Build 3 88521076 1I CATTTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 11 12 167344 CASAVA_Build 3 88529606 1D CTCCTATCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 26 hom 35 1 32 2 T 10 9 167345 CASAVA_Build 3 88534492 5D ATTTGGAAAC ATAAA/----- ATAATATATG 3070 het 3070 ref 43 20 22 2 ATAAA 1 0 167346 CASAVA_Build 3 88548944 1D ATAACATGAA T/- TTTTTTTTTT 2252 het 57 hom 16 1 6 9 T 12 11 167347 CASAVA_Build 3 88561428 2D CTGAACGAGG CT/-- ATGTTCTCTA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 CT 1 0 167348 CASAVA_Build 3 88565110 1I CTTTGTTCTG -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 6 7 167349 CASAVA_Build 3 88566194 1D CCAAATGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 5 A 10 9 167350 CASAVA_Build 3 88569530 13D AAATTTAATT ACTGTCATTAAGG/------------- ACTGATTGTT 3070 het 3070 ref 31 21 14 1 ACTGTCATTAAGG 1 0 167351 CASAVA_Build 3 88569969 1D AATTTACAGA T/- TTCTATCAGA 3070 het 3070 hom 50 16 26 8 T 3 2 167352 CASAVA_Build 3 88570768 1I CAAACTCATG -/T TATCACCGCT 3070 het 3070 hom 60 24 30 6 T 1 2 167353 CASAVA_Build 3 88575732 1D TTAGAGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 11 10 167354 CASAVA_Build 3 88576102 1D TAAAGGGTAC A/- AAAATTACAT 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 5 4 167355 CASAVA_Build 3 88582344 1I TGACCTTTTT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 46 25 12 9 A 7 8 167356 CASAVA_Build 3 88583267 1D AAAATCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 31 2 18 12 T 11 10 167357 CASAVA_Build 3 88583572 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1308 hom 32 4 24 4 T 12 13 167358 CASAVA_Build 3 88584019 1I TCGGTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 14 15 167359 CASAVA_Build 3 88586175 1D GTCTTTATTA G/- ATAATGCTTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 G 1 0 167360 CASAVA_Build 3 88586942 2I CATTGTTTGT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 AC 5 6 167361 CASAVA_Build 3 88587749 1D TATTTAATGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 119 hom 30 2 17 11 T 10 9 167362 CASAVA_Build 3 88588498 2D CTTCCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 21 10 T 14 12 167363 CASAVA_Build 3 88590461 1D TGTGCTCTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 9 8 167364 CASAVA_Build 3 88592928 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 68 het 28 0 23 7 A 10 9 167365 CASAVA_Build 3 88596157 4D GTATAATAAT AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 18 het 9 0 7 4 AATA 4 3 167366 CASAVA_Build 3 88608844 2I TGCATAAGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 10 12 167367 CASAVA_Build 3 88612443 8D GTAATTCTAC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 2055 hom 30 14 12 5 T 22 14 167368 CASAVA_Build 3 88620343 4D GGGCGTGATG TTTT/---- TTTTATCTAA 3070 het 40 hom 39 3 34 3 T 8 4 167369 CASAVA_Build 3 88622719 1I GAGGTTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 48 2 31 15 T 13 14 167370 CASAVA_Build 3 88645811 11D ACAAGAAAGC TGCATCCTGGG/----------- TACACGAAGA 3070 het 3070 hom 34 13 18 7 TGCATCCTGGG 1 0 167371 CASAVA_Build 3 88656216 1D GAATACCTTG T/- TTTTTTTTTC 1363 het 1363 ref 39 32 3 4 T 10 9 167372 CASAVA_Build 3 88659494 2I AAATTACTTG --/CT CTCTCTCCCT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 CT 3 4 167373 CASAVA_Build 3 88661895 2D TGAAATTTAT AA/-- GTTAGTACAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 2 0 167374 CASAVA_Build 3 88664594 1I GTGATTTACC -/T TCTTAGAGTC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 1 2 167375 CASAVA_Build 3 88664935 1I AATGCTACTT -/G TCAATAATAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 0 1 167376 CASAVA_Build 3 88666638 1D GTATAGCTAA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 77 het 31 0 25 6 T 8 7 167377 CASAVA_Build 3 88669918 1I CTATGGATGT -/G GGGGACAGGA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 G 4 5 167378 CASAVA_Build 3 88670695 1D GTACACTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 582 hom 27 2 19 6 T 13 12 167379 CASAVA_Build 3 88671387 5I GTAAAATTAG -----/TTTTA TTTATTTGTT 3070 hom 138 het 51 0 46 5 TTTTA 0 1 167380 CASAVA_Build 3 88672779 1D AAAAGGTCAC T/- TTTTCTAATT 3070 hom 108 het 40 0 36 5 T 5 4 167381 CASAVA_Build 3 88675091 1I ATGGTCATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 9 10 167382 CASAVA_Build 3 88679061 1D ATGATATGAG A/- AAACCTTAGC 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 4 3 167383 CASAVA_Build 3 88693551 4I ATTCAGAATC ----/ATAG ATAGGAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 ATAG 1 2 167384 CASAVA_Build 3 88702119 4I TAGAACTGAT ----/AAAC AAATTCACTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AAAC 0 1 167385 CASAVA_Build 3 88706789 2D TTAAATAGAA TT/-- TGAGATACAT 3070 het 3070 ref 34 19 9 8 T 3 1 167386 CASAVA_Build 3 88708579 1I AATCCAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 584 hom 36 2 31 3 T 10 11 167387 CASAVA_Build 3 88713652 1I TACAGACAGA -/G GGCAAGTAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 2 3 167388 CASAVA_Build 3 88714470 1D AATTTGTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 10 9 167389 CASAVA_Build 3 88716610 4D ATTTGAGGAA ATTG/---- ATTGAGGTCC 3070 hom 102 het 36 0 35 4 ATTG 2 1 167390 CASAVA_Build 3 88720686 2I GGCCTTTCCC --/TT TCTAAGAGAA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 1 3 167391 CASAVA_Build 3 88729169 1I AGTAGAAATA -/T GGACATGAGG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 0 1 167392 CASAVA_Build 3 88734838 1I CAAAAAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1325 hom 23 4 17 2 A 10 11 167393 CASAVA_Build 3 88735357 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 A 10 11 167394 CASAVA_Build 3 88737286 11I CTAGCATCCC -----------/TCTACTAGGTA TCTACCCAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TCTACTAGGTA 0 1 167395 CASAVA_Build 3 88739299 2D TAGAGATATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 34 2 24 10 T 13 11 167396 CASAVA_Build 3 88740948 8D ACTCCGTCTC AAAAAACA/-------- AAAAAACAAA 3019 het 3019 ref 25 14 7 4 AAAAAACA 3 2 167397 CASAVA_Build 3 88741128 1I AAACCAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 667 hom 36 3 19 14 A 11 12 167398 CASAVA_Build 3 88746470 2D GAAAAATGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 580 hom 30 4 17 9 AT 8 7 167399 CASAVA_Build 3 88749854 2I TAAAAAAAAT --/TG TGTTAATAGA 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 TG 1 2 167400 CASAVA_Build 3 88758305 1I CTCAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 1325 het 1325 ref 44 38 3 3 A 10 11 167401 CASAVA_Build 3 88765285 4I AGCAGGAGGA ----/AGAG AGAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 41 11 20 10 AG 3 5 167402 CASAVA_Build 3 88767217 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 T 13 12 167403 CASAVA_Build 3 88776820 1D TGATTTGCCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 30 het 33 1 29 4 T 9 8 167404 CASAVA_Build 3 88777824 8I AACTAGCCTG --------/TTAGTTTT TTAGTTTTTT 2168 het 2168 ref 28 16 6 6 TTAGTTTT 1 2 167405 CASAVA_Build 3 88804658 1D TCTTTCCATA C/- AAAACATCTG 3070 het 3070 hom 48 15 26 8 C 1 0 167406 CASAVA_Build 3 88805370 1I TCCTTGAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 318 hom 23 1 18 4 T 11 12 167407 CASAVA_Build 3 88812527 1D TTAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 974 het 974 ref 31 19 4 8 A 15 14 167408 CASAVA_Build 3 88825393 2I ACTAATAAAG --/AA AAAAAAAGAG 2414 het 2414 ref 27 17 5 5 A 7 9 167409 CASAVA_Build 3 88827541 1D TCTGCACAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 10 9 167410 CASAVA_Build 3 88835080 2I TTACTTAAAC --/TT TTCAAGATTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 2 4 167411 CASAVA_Build 3 88836109 1D TGGGTATTTA C/- TGTGGAATGG 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 C 1 0 167412 CASAVA_Build 3 88841181 1D AGCTTGGCAT G/- GTGGCACGTG 3070 het 3070 hom 48 19 22 8 G 2 1 167413 CASAVA_Build 3 88853226 1D GTGGCAAAGT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 9 8 167414 CASAVA_Build 3 88864437 2I AACAACAAAA --/AC AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 AC 0 1 167415 CASAVA_Build 3 88866121 2I ATGCATGCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 AC 8 9 167416 CASAVA_Build 3 88872942 2D AAGTAATGTG TC/-- TGAACATCTA 3070 het 3070 ref 45 24 20 2 TC 1 0 167417 CASAVA_Build 3 88898056 1D CTTCTATATT A/- AAAAAACTGC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 7 6 167418 CASAVA_Build 3 88915100 1I GTGCATACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 368 hom 36 1 28 7 T 9 10 167419 CASAVA_Build 3 88922585 1D TTTGTAAATC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 48 22 20 7 T 10 9 167420 CASAVA_Build 3 88924819 4D CCGTTTTAAT TTGA/---- TTGAAGATAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 5 TTGA 2 1 167421 CASAVA_Build 3 88935864 4I ATGGGGATTA ----/CTTC CTAGGTTTTA 3070 het 3070 hom 55 24 29 2 CTTC 0 1 167422 CASAVA_Build 3 88936243 2D GTGGGCACAA CT/-- CCTAGAAAGA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 CT 1 0 167423 CASAVA_Build 3 88937091 1I TATGCCTTTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 44 21 18 5 A 8 9 167424 CASAVA_Build 3 88943801 1D GGTACCTGCA T/- TTACAACTAC 3070 het 3070 hom 54 21 29 4 T 3 2 167425 CASAVA_Build 3 88944554 4D AGCATTTGGA AGCT/---- AGCTGTTGGT 3070 hom 125 het 47 0 41 8 AGCT 2 1 167426 CASAVA_Build 3 88947521 4I TTTGACTTCT ----/AACA AACACTTAAA 3070 hom 150 het 53 0 50 3 AACA 1 2 167427 CASAVA_Build 3 88967360 4D GCACATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 8 hom 21 1 11 9 AC 9 7 167428 CASAVA_Build 3 88968799 1I AAGTATTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 38 het 40 1 33 6 T 9 10 167429 CASAVA_Build 3 88972866 3D AATGTTTTGA CTT/--- CTTTATTAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CTT 2 1 167430 CASAVA_Build 3 88973416 1I GACTTTCTTA -/T TCTCTTGACA 3070 hom 157 het 57 0 53 4 T 1 2 167431 CASAVA_Build 3 88974046 1D TTTTCTTTGA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 9 8 167432 CASAVA_Build 3 88988889 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 7 8 167433 CASAVA_Build 3 88995863 1D TATTGTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 39 0 29 10 T 11 10 167434 CASAVA_Build 3 88997730 34D ACAAATTTCC AAAATTGTTTTTATACCCATTTGTAACACAAACA/---------------------------------- ATGGTCAATG 3070 het 3070 ref 31 21 14 3 AAAATTGTTTTTATACCCATTTGTAACACAAACA 1 0 167435 CASAVA_Build 3 89007697 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAATAC 3070 het 1021 hom 13 3 9 1 A 8 7 167436 CASAVA_Build 3 89013953 4D17M2D TGTTATGTTG TTAATTAATTAATTAAAAGGCTA/----TTAATTAATTAAAAGGC-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 38 16 17 8 N/A 0 0 167437 CASAVA_Build 3 89019280 1D AGATATTGCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 9 8 167438 CASAVA_Build 3 89021975 1I AGTGGGGCCA -/T TAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 T 1 2 167439 CASAVA_Build 3 89043152 1D AATTAAGTGG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 42 18 17 8 A 8 7 167440 CASAVA_Build 3 89046370 2D TAAAGACTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2997 hom 40 11 14 16 T 15 13 167441 CASAVA_Build 3 89046548 1D AAAATTATTA C/- CCCCTGACCT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 C 5 4 167442 CASAVA_Build 3 89047708 3I AATACAAACT ---/TAA TGATGGACTG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TAA 0 1 167443 CASAVA_Build 3 89057214 4I GAACAATAAA ----/GTTT GTTTGTGCAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 GTTT 1 2 167444 CASAVA_Build 3 89058553 2I TCTTAGGTTT --/AA AAGTATCCTA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 2 4 167445 CASAVA_Build 3 89084245 1D TGATAAAGAG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 8 7 167446 CASAVA_Build 3 89085560 1D TTCCATGAAA T/- GTGATTAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 T 1 0 167447 CASAVA_Build 3 89097136 5D TAAAATAAGC ACATT/----- ACTTAGAATT 3070 het 3070 ref 27 17 9 4 ACATT 1 0 167448 CASAVA_Build 3 89108252 1D AATGGAGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 A 12 11 167449 CASAVA_Build 3 89110320 1I TATGTATAAG -/A AAAAAAGGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 7 167450 CASAVA_Build 3 89113065 1I GACTAAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 8 9 167451 CASAVA_Build 3 89127681 4I6M2D GAATTCATTC ----GACACCAA/ATTTGACACC-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 29 7 N/A 0 0 167452 CASAVA_Build 3 89133074 2I TTACACCATG --/TT TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 T 8 10 167453 CASAVA_Build 3 89135543 1D CAAGGCATAC A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 5 A 7 6 167454 CASAVA_Build 3 89137353 1D TCTTTCTAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 9 167455 CASAVA_Build 3 89143470 1D ATTCATCGAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 9 8 167456 CASAVA_Build 3 89145752 1I CTCACATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 10 11 167457 CASAVA_Build 3 89147800 1D ATTGTCATCA C/- TACTAGAACC 3070 het 3070 ref 67 34 29 4 C 1 0 167458 CASAVA_Build 3 89163523 1D TAACTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 8 T 11 10 167459 CASAVA_Build 3 89163926 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 615 hom 30 3 19 8 T 15 14 167460 CASAVA_Build 3 89164203 14D TCTCTCTCTC TTTCTTTCTTTCTT/-------------- TTTCTTTCTT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 TTTCTTTCTTTCTT 2 1 167461 CASAVA_Build 3 89178263 1D GTATTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 793 het 114 hom 25 1 6 18 T 14 13 167462 CASAVA_Build 3 89178382 1D ACAGGGGGAT A/- AAGAGAGAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 3 2 167463 CASAVA_Build 3 89183567 1D AAAGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 8 A 11 10 167464 CASAVA_Build 3 89189740 3I CTGGAACTAC ---/AGG AGGAGTATGC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 AGG 1 2 167465 CASAVA_Build 3 89232222 4D AAATTAATTG ATAA/---- ATAAAAGGAC 3070 het 3070 hom 34 14 17 5 ATAA 2 1 167466 CASAVA_Build 3 89232822 2D GTATTCCCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 27 2 14 13 T 14 12 167467 CASAVA_Build 3 89233176 1I AATGGGTTTT -/A AAAAGGACTA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 4 5 167468 CASAVA_Build 3 89239817 1I AAGATGTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 T 10 11 167469 CASAVA_Build 3 89245607 2I TTTGTTTCTC --/CT CTCAAGTTTA 3070 hom 31 het 17 0 11 6 CT 1 2 167470 CASAVA_Build 3 89249924 6D TTTCTCTTGG TTTACT/------ TTTACTATCT 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 TTTACT 2 1 167471 CASAVA_Build 3 89263021 2D TTTGACACTC AT/-- ATAATCTGGC 3070 het 3070 ref 34 17 13 6 AT 2 1 167472 CASAVA_Build 3 89277121 2I TCACAAACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 1390 hom 38 3 29 6 AC 8 9 167473 CASAVA_Build 3 89283444 1I CTATTTCAGT -/A ACTGTTTATA 3070 het 3070 hom 33 8 17 8 A 1 2 167474 CASAVA_Build 3 89288720 1I ACACATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 10 11 167475 CASAVA_Build 3 89295299 1D GCTTTATACT A/- ACCTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 2 1 167476 CASAVA_Build 3 89310087 4D ATATGTAGCC AATA/---- GATAGATAGA 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 AATA 1 0 167477 CASAVA_Build 3 89312146 2I CCAAATCTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 10 12 167478 CASAVA_Build 3 89318219 1I TTTAAAAAAA -/T ATATAAATAA 3070 het 3070 ref 22 10 11 1 T 0 1 167479 CASAVA_Build 3 89328260 14D CCCTGAGGAG AGATTTCAAGTCAT/-------------- AGATTTCAAG 3070 het 3070 ref 39 20 13 13 AGATTTCAAGTCAT 2 1 167480 CASAVA_Build 3 89331360 2D TTAGCATAAC AT/-- ATATCTGTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AT 3 2 167481 CASAVA_Build 3 89339429 1I ATAGAAATAG -/A AAAAAACTGT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 6 7 167482 CASAVA_Build 3 89344434 1D AACATCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 47 0 37 10 T 12 11 167483 CASAVA_Build 3 89385664 1D ATAAGAGGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 10 9 167484 CASAVA_Build 3 89402577 4D TTTTTTCTTC TATT/---- TATTTCTGAT 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 TATT 2 1 167485 CASAVA_Build 3 89404123 1I TGTATTACCA -/T TTTTTTTTTG 1913 het 1913 ref 15 8 4 3 T 9 10 167486 CASAVA_Build 3 89405575 1D TGTATGTTTC T/- GTTTTAAGGC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 1 0 167487 CASAVA_Build 3 89406022 1I CCCCAAGTAA -/T AAGATCAACT 3070 het 3070 hom 44 22 21 1 T 0 1 167488 CASAVA_Build 3 89426356 3D ACACACACAC AGA/--- AGATGACTAC 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 AGA 2 1 167489 CASAVA_Build 3 89426488 1I ATATCAGGCA -/T TTTTAGTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 4 5 167490 CASAVA_Build 3 89427011 1I AGTGCATATG -/A AAGGTTATGT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 2 3 167491 CASAVA_Build 3 89427224 5D TGAAGGGTGG CACCC/----- TTCAGCTGTG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 CACCC 1 0 167492 CASAVA_Build 3 89440443 1D GCCAAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 1750 het 1750 ref 28 13 5 11 T 15 14 167493 CASAVA_Build 3 89444207 1D GCAATTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2039 hom 25 7 11 7 T 12 11 167494 CASAVA_Build 3 89452439 1I TCCCATGGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 9 10 167495 CASAVA_Build 3 89453946 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 1336 het 1336 ref 36 23 5 9 AC 8 7 167496 CASAVA_Build 3 89453974 2D AGGGGGGTTG GA/-- GAGAGAGAGA 2057 het 2057 ref 41 24 7 11 GA 9 8 167497 CASAVA_Build 3 89510702 4D GTGTATAAAC ATCA/---- ATCAGTTAAT 3070 hom 117 het 43 0 40 6 ATCA 2 1 167498 CASAVA_Build 3 89524432 1I AAGTTGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2403 hom 31 8 16 7 T 10 11 167499 CASAVA_Build 3 89525622 1D CAAAAATAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 9 8 167500 CASAVA_Build 3 89532033 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2222 het 165 hom 22 3 9 10 T 19 18 167501 CASAVA_Build 3 89567807 4I ATAATAATAA ----/TAAT TAATTAATTA 1890 het 1890 ref 15 9 4 2 TAAT 3 4 167502 CASAVA_Build 3 89576221 1D TGTAGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 11 10 167503 CASAVA_Build 3 89600096 1I AATTAGGTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 9 10 167504 CASAVA_Build 3 89609447 2D GAATCCCCTC TG/-- TGTGTGTGTG 1383 het 1383 ref 31 24 3 4 TG 8 7 167505 CASAVA_Build 3 89630219 1D ACAGATTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 11 10 167506 CASAVA_Build 3 89701579 1D TACTGGCATT A/- AAAAAAAAAA 1893 het 1893 ref 28 11 7 10 A 19 18 167507 CASAVA_Build 3 89758859 3I TTATTTTGTG ---/ACA ACAAGAACAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ACA 1 2 167508 CASAVA_Build 3 89777201 3D TACACTTTTG ATA/--- ATAAGGAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 ATA 2 1 167509 CASAVA_Build 3 89837039 10I AGTTCCAAAC ----------/TTTCTCACAT TTTCCTCTCT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TTTCTCACAT 0 1 167510 CASAVA_Build 3 89842500 4D GGAGGTTGGA TAGT/---- TAGTTAGTAT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TAGT 3 2 167511 CASAVA_Build 3 89921023 1D TCCAGTAGCA C/- CCCATAAATG 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 C 4 3 167512 CASAVA_Build 3 89947601 1I GAAAATGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 9 10 167513 CASAVA_Build 3 90048412 2D GTGACCTACT TG/-- TGTGTGTGTG 1167 het 1167 ref 48 34 3 13 TG 8 7 167514 CASAVA_Build 3 90062357 1D TGGATACACA C/- CCCCCCCCCC 2927 hom 29 het 20 0 10 10 C 11 10 167515 CASAVA_Build 3 90062686 1D GGGTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 11 10 167516 CASAVA_Build 3 90124871 2I GGAGAAAATA --/TT TGCAAACCAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 3 167517 CASAVA_Build 3 90257260 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 10 9 167518 CASAVA_Build 3 90259580 1I ATATTTGTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 8 167519 CASAVA_Build 3 90267785 1I TCCATATTGC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 8 167520 CASAVA_Build 3 90273057 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 33 1 24 8 A 10 11 167521 CASAVA_Build 3 90294274 1D GTGGAAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 717 hom 35 3 23 9 A 11 10 167522 CASAVA_Build 3 90312943 4I AAAGGGAAAC ----/AGAT AGATAGTCCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AGAT 1 2 167523 CASAVA_Build 3 90327489 1D TGTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 21 0 16 5 T 13 12 167524 CASAVA_Build 3 90342850 4D TCACATTAAT ACTA/---- ACTATTTATA 3070 het 3070 ref 15 7 7 1 ACTA 2 1 167525 CASAVA_Build 3 90355664 4D GAAAAGTTTA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 AAAT 3 2 167526 CASAVA_Build 3 90368555 12D GCTTTCTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 23 4 A 22 10 167527 CASAVA_Build 3 90372728 1I AAGACATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 11 12 167528 CASAVA_Build 3 90387833 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1760 het 31 hom 14 1 7 6 A 17 16 167529 CASAVA_Build 3 90449308 2D TTCTACAAAA AG/-- AGTGTTTCAA 3070 het 2768 hom 58 22 28 8 AG 2 1 167530 CASAVA_Build 3 90455897 1D GATTATTTTT C/- TTTGTGAAGA 3070 het 215 hom 17 2 15 1 C 1 0 167531 CASAVA_Build 3 90482565 1D CTGCTCAATC A/- AAAGAAAGTT 2576 het 2576 ref 48 33 6 10 A 4 3 167532 CASAVA_Build 3 90488838 1I CTGCTCAATC -/A AAAAGAAAGG 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 4 5 167533 CASAVA_Build 3 90528850 1I AAATAGGCTG -/C AAAGGTCTAT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 C 0 1 167534 CASAVA_Build 3 90534716 1D56M2D ATATCCACTT GCAGATTCTATGAAAAGAGTTTTTCAAAACTGCTCTATGAAAAGCTATGTTCAACTCTG/-CAGATTCTACTAAAGGAGTGTTTCAAAACTGATCTATGAAAAGGAAGTTTCAACTC-- TGAATTGAAT 2127 het 2127 ref 79 106 5 14 N/A 0 0 167535 CASAVA_Build 3 90568853 3I TTCTGTCTAG ---/TTT TTATTTGAAG 1254 het 1254 ref 77 69 3 5 T 2 5 167536 CASAVA_Build 3 90578841 1I CAACTCTGTG -/A GTTGAATGCA 3070 hom 53 het 28 0 24 4 A 0 1 167537 CASAVA_Build 3 94988050 1D CACAAAGAAG T/- TTTTTCGGAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 6 5 167538 CASAVA_Build 3 95016287 2I30M1D ATTGGTTTAC --TATATATATATATTATATTCTCCAGAGTTTA/TATATATATATATATTATATTCTCCAGAGTTT- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 6 N/A 0 0 167539 CASAVA_Build 3 95023602 1I GTGGAAGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 38 1 26 11 A 10 11 167540 CASAVA_Build 3 95050700 1D TTTGCCAGTA T/- TTTTATTGAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 5 4 167541 CASAVA_Build 3 95068429 1D AATCTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 13 12 167542 CASAVA_Build 3 95120954 1I ATTTTCCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 12 13 167543 CASAVA_Build 3 95162522 1I AGCTATTGAG -/A AAAAAAAAAA 2639 het 2225 hom 23 7 10 6 A 10 11 167544 CASAVA_Build 3 95165234 3D AGCGCGAGCT AGA/--- AGGAGAGGTC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AGA 1 0 167545 CASAVA_Build 3 95185890 1D ACTCTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 13 12 167546 CASAVA_Build 3 95189773 1D CAATTCTGTG A/- AAAAAAAAAA 1264 het 1264 ref 47 35 4 8 A 15 14 167547 CASAVA_Build 3 95225407 3D TCTAAAATAA TGT/--- TGTTGTTTGA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 TGT 3 2 167548 CASAVA_Build 3 95232816 1D CATGGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 1148 het 1148 ref 49 37 3 9 T 12 11 167549 CASAVA_Build 3 95341465 4D ATTCTTGGTT TAAG/---- TAAGTGTTGA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TAAG 2 1 167550 CASAVA_Build 3 95381835 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 20 0 14 6 T 11 10 167551 CASAVA_Build 3 95415778 1I ACATGCCCAT -/C CTGTCCTCTG 3070 hom 90 het 39 0 30 9 C 1 2 167552 CASAVA_Build 3 95463714 1I AATGCCCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 38 2 26 10 T 10 11 167553 CASAVA_Build 3 95463860 2I CTGACCACAC --/TT TTTTTTTTTT 109 het 109 ref 30 11 3 16 T 14 16 167554 CASAVA_Build 3 95465378 1D ACACTCTGCT A/- AAAAAACCGA 3070 hom 86 het 35 0 28 7 A 7 6 167555 CASAVA_Build 3 95466907 1I TCATCCCCTT -/G GGCATTGCCC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 2 3 167556 CASAVA_Build 3 95468758 1D AATGCAGATT G/- GGGGGGAAAG 3070 hom 124 het 49 0 42 7 G 7 6 167557 CASAVA_Build 3 95478653 1I TTAAAAAAAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 8 9 167558 CASAVA_Build 3 95482649 1D TGAGACTCTG A/- AAAGGTTTTT 3070 hom 98 het 38 0 31 8 A 4 3 167559 CASAVA_Build 3 95490166 1D TTTGCCAAGC T/- TTTTTTTTTG 889 het 889 ref 38 29 3 6 T 10 9 167560 CASAVA_Build 3 95495856 4D CTCAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 147 het 52 0 49 5 AAAC 3 2 167561 CASAVA_Build 3 95502333 1I ACACTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 30 2 21 7 A 14 15 167562 CASAVA_Build 3 95502502 1D AGTTTGATCT A/- ATAGCTGCTG 3070 hom 87 het 32 0 29 4 A 2 1 167563 CASAVA_Build 3 95503004 2I GGGAAGAGGC --/CT CTCTCAGTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CT 2 3 167564 CASAVA_Build 3 95507447 8I AAAGAGCATT --------/TCTACCCA TGTTTTGAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 TCTACCCA 0 1 167565 CASAVA_Build 3 95517379 3D TCCGTCTCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 22 0 17 6 A 17 14 167566 CASAVA_Build 3 95519351 1I CCCAGTGTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 T 9 10 167567 CASAVA_Build 3 95523400 1I ATTAACAATG -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 7 167568 CASAVA_Build 3 95523745 1I CACATTATGG -/T TTTTTTTTTG 296 hom 12 het 17 0 4 13 T 9 10 167569 CASAVA_Build 3 95524723 1D CATTTGAGAC G/- GGAGTCTTGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 3 2 167570 CASAVA_Build 3 95526686 1D CAGAACTAGC A/- GAAATTTGGG 3070 het 3070 hom 48 20 24 6 A 1 0 167571 CASAVA_Build 3 95528550 1I GTCTTCATTT -/A AATTTTTTTT 1079 het 1079 ref 17 8 5 4 A 2 3 167572 CASAVA_Build 3 95530935 1I CATCTCTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 7 A 10 11 167573 CASAVA_Build 3 95543201 8D CTCACTCAGG CTGTTTTA/-------- CTGTTTTATC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 CTGTTTTA 2 1 167574 CASAVA_Build 3 95555196 1D AAGAAAGGTT A/- AAAATTAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 5 4 167575 CASAVA_Build 3 95579488 3I CAGAGAAGTT ---/AAG AAGTAATTTG 3070 het 3070 hom 58 24 30 4 AAG 1 2 167576 CASAVA_Build 3 95584913 16D CTTATCCCAG AGTCTGCCGGGCCACA/---------------- AGAACTTGCA 3070 het 3070 ref 44 26 14 8 AGTCTGCCGGGCCACA 1 0 167577 CASAVA_Build 3 95590538 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 A 8 7 167578 CASAVA_Build 3 95590946 1I TTCTAACACC -/A AAACTTGGCA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 A 3 4 167579 CASAVA_Build 3 95610620 4D AAGGTTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 11 TTTG 5 4 167580 CASAVA_Build 3 95626767 1I TTTCCAACTT -/A AAATCAGAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 3 4 167581 CASAVA_Build 3 95661889 7I GAAAATTCTG -------/TAGTATT TTATTTTATT 2448 het 2448 ref 32 20 7 5 TAGTATT 0 1 167582 CASAVA_Build 3 95663484 1D CAGAAGACCT A/- AAACCAATTT 3070 het 3070 ref 38 23 14 2 A 4 3 167583 CASAVA_Build 3 95664867 1D TCATCTAGCT C/- CAAGTATAAT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 C 2 1 167584 CASAVA_Build 3 95679490 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1299 het 1299 ref 24 19 4 3 A 11 10 167585 CASAVA_Build 3 95681591 1D GGAGGATGTG T/- GTAGGTTACA 3070 het 3070 hom 49 13 22 14 T 1 0 167586 CASAVA_Build 3 95685877 1D CAAGACATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 10 9 167587 CASAVA_Build 3 95712305 1I AAAAATCAGT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 A 7 8 167588 CASAVA_Build 3 95732898 1I GTATTATGAA -/G GGGGGGGGGT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 G 9 10 167589 CASAVA_Build 3 95736478 1D TCACAGTTGG A/- AAAAAATCAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 6 167590 CASAVA_Build 3 95740129 1I TTTGGGACTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 147 hom 27 1 23 3 T 8 9 167591 CASAVA_Build 3 95746680 5I TTTTCATTCA -----/TGCAG TTCACATCTC 3070 hom 111 het 39 0 37 2 TGCAG 0 1 167592 CASAVA_Build 3 95747963 6D GCAGTGTATG TTAAGT/------ TTAAGTGAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTAAGT 2 1 167593 CASAVA_Build 3 95749916 1D AAAAACTGGA G/- GGGGGGTCAA 3070 hom 78 het 40 0 26 15 G 7 6 167594 CASAVA_Build 3 95751440 1I CAGGAGTTGG -/A AGTAAAAATA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 1 2 167595 CASAVA_Build 3 95755668 4D AAAGACACAT ACAC/---- ACGTATGTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AC 3 1 167596 CASAVA_Build 3 95772085 1I TGGTTACTTG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 8 9 167597 CASAVA_Build 3 95776718 1I TATCCAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 10 11 167598 CASAVA_Build 3 95781917 1D TATTTGAATT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 138 het 55 0 47 8 A 9 8 167599 CASAVA_Build 3 95787849 1I TGTCTGCTAT -/A AAAAACCCAT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 A 5 6 167600 CASAVA_Build 3 95788495 1I ATTTTAGCAG -/A AAAAATGAGA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 5 6 167601 CASAVA_Build 3 95791615 2D ACCATCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 35 1 13 21 T 20 18 167602 CASAVA_Build 3 95798200 10I TGTGTATATA ----------/TGTGTATATG TGTGTATATA 3070 het 447 hom 19 4 10 5 TGTGTATATG 0 1 167603 CASAVA_Build 3 95798377 3I ATATGCACAT ---/ATA TTATTATTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ATA 0 1 167604 CASAVA_Build 3 95800354 4D17M8D TAATATAAAG AAATAAATATAAAAAACATAGTAATGAAT/----AAATATAAAAAACATAG-------- TAATGAATAA 3070 hom 42 het 11 0 15 2 N/A 0 0 167605 CASAVA_Build 3 95802245 1I ATACTTGCAC -/A ACACATGTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 1 2 167606 CASAVA_Build 3 95802689 1D CCCAATATGG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 8 7 167607 CASAVA_Build 3 95802947 7D ATTATAATGT TATTTTA/------- TAAAATAAAT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 TATTTTA 1 0 167608 CASAVA_Build 3 95804999 1D TACCAATCTC T/- TTAATCTCTC 3070 hom 132 het 49 0 44 7 T 3 2 167609 CASAVA_Build 3 95807786 11I TTTTGATAGA -----------/CATTATCACTG CATCTTCAGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CATTATCACTG 0 1 167610 CASAVA_Build 3 95807845 3D TTCTTACGGA CTC/--- CTCCTTTTCT 3070 hom 45 het 28 0 16 13 CTC 2 1 167611 CASAVA_Build 3 95808097 1I AGAGTGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 742 hom 45 2 35 8 T 10 11 167612 CASAVA_Build 3 95816823 8D GTATTCATAC ATACATAT/-------- ATATATATAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 ATACATAT 1 0 167613 CASAVA_Build 3 95821782 1I ATATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 34 2 27 5 T 11 12 167614 CASAVA_Build 3 95827095 1D TTTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 11 10 167615 CASAVA_Build 3 95829608 16I ATTCCTTTTT ----------------/TCCTTCCTTCCTTCCC TCCTTCCTTC 2351 hom 25 het 11 0 8 3 TCCTTCCTTCCTTCCC 0 1 167616 CASAVA_Build 3 95848723 1D TGTAGGGAGA C/- CCCCCCCGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 8 7 167617 CASAVA_Build 3 95851881 3I GTTTGCTGTT ---/ATC ATCTCTGCAT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 ATC 1 2 167618 CASAVA_Build 3 95884771 1I ATAAGAAAAT -/A ACAAATAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 1 2 167619 CASAVA_Build 3 95884837 3D ATTCTCAAAC ATT/--- ATTGTTGTTA 3070 het 2899 hom 31 8 17 6 ATT 2 1 167620 CASAVA_Build 3 95893513 4D ACATCACTGA AGAC/---- AGACAGATTT 3070 hom 72 het 30 0 25 8 AGAC 2 1 167621 CASAVA_Build 3 95913638 1D TCCTTTTTGT G/- CCCCAAAACC 3070 hom 99 het 37 0 32 6 G 1 0 167622 CASAVA_Build 3 95918708 1D7M3I GGTAATGGAT AAATAAAT---/-AATAAATCCA TATGTCATAG 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 N/A 0 0 167623 CASAVA_Build 3 95929254 1D TGAAAAAGTA G/- GGCTTTATCA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 3 2 167624 CASAVA_Build 3 95935025 1I AACACTGACA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 9 167625 CASAVA_Build 3 95935681 1I AAAAAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 30 0 18 12 T 13 14 167626 CASAVA_Build 3 95936320 1D AAGGAAGTGT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 8 7 167627 CASAVA_Build 3 95939429 10D ACCAGACATT GAAAAAGTAA/---------- GAAAGGTTGT 3070 hom 123 het 44 0 41 6 GAAAAAGTAA 1 0 167628 CASAVA_Build 3 95940222 4I CACCTGGACC ----/TGAT TGATATAGAG 3070 het 3070 hom 47 17 29 1 TGAT 1 2 167629 CASAVA_Build 3 95942348 2D ACTGATAGAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 68 het 45 0 29 16 TG 10 9 167630 CASAVA_Build 3 95943107 1D AATTCAGTGA G/- GGGGGGAAAA 3070 hom 82 het 32 0 28 5 G 7 6 167631 CASAVA_Build 3 95953026 3I ATAAAAAAAA ---/AAG AAGAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AAG 1 2 167632 CASAVA_Build 3 95954275 1I CCTCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 199 hom 30 1 25 4 A 10 11 167633 CASAVA_Build 3 95954762 1I TCTCTCTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 415 hom 27 1 23 3 T 9 10 167634 CASAVA_Build 3 95955332 14I GCCTTAGGGC --------------/TGGGCACAGAAATG TTTCACCAAT 3070 hom 87 het 32 0 28 5 TGGGCACAGAAATG 0 1 167635 CASAVA_Build 3 95955654 1D AATAAGGACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 10 9 167636 CASAVA_Build 3 95964419 1D TCATGCAAAA G/- CTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 G 1 0 167637 CASAVA_Build 3 95971080 2D CCAGCTACTC GG/-- GGCAGGCTGA 3070 hom 137 het 55 0 43 12 G 4 2 167638 CASAVA_Build 3 95973242 1D TCAGTGGAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 52 28 18 6 A 9 8 167639 CASAVA_Build 3 95976527 1D CATAAATATT A/- AAATACAGTG 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 A 4 3 167640 CASAVA_Build 3 95988640 1D TGGTGAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2814 hom 37 11 19 7 A 15 14 167641 CASAVA_Build 3 95990008 1D ACTACTTCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 8 hom 30 1 9 21 T 9 8 167642 CASAVA_Build 3 95998604 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 457 het 213 hom 22 1 5 16 A 12 11 167643 CASAVA_Build 3 96013207 1I CACTTTTTCT -/A AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 6 7 167644 CASAVA_Build 3 96013276 1I GATAAAACAG -/A AAAAAAGATT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 6 7 167645 CASAVA_Build 3 96017062 1D GTATTTGCCA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 8 7 167646 CASAVA_Build 3 96021815 1I TGTATAATAT -/A AACATTAATA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 2 3 167647 CASAVA_Build 3 96032785 1I AATATATAGG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 7 8 167648 CASAVA_Build 3 96034760 1D AGAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 33 3 20 11 A 11 10 167649 CASAVA_Build 3 96036882 1D GGCTTCTAAG C/- CTTGTAACTC 3070 het 3070 ref 45 26 16 4 C 2 1 167650 CASAVA_Build 3 96043537 1D ACACCAACAT G/- GCACATGTAT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 G 2 1 167651 CASAVA_Build 3 96049605 1I TGGACTAAAC -/G TTCCAATTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 0 1 167652 CASAVA_Build 3 96068838 1I TTGAGTAGCA -/T TAATGCCTTT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 1 2 167653 CASAVA_Build 3 96069962 3D GCTTGTGAAA TTT/--- TTTGAAAAAA 3070 het 1096 hom 16 3 12 1 T 6 3 167654 CASAVA_Build 3 96072904 1I GTGGATTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 T 9 10 167655 CASAVA_Build 3 96086821 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 2332 het 2332 ref 24 12 7 5 A 10 11 167656 CASAVA_Build 3 96087657 1I AAAGGAAGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 30 het 35 1 32 2 T 8 9 167657 CASAVA_Build 3 96097411 1I GAACTAATCC -/T TTTCAAACAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 3 4 167658 CASAVA_Build 3 96098348 1I TTTCTTAGAT -/G TAAAAATTGA 2738 het 2738 ref 15 8 6 1 G 0 1 167659 CASAVA_Build 3 96103459 1I TCATTTCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 10 11 167660 CASAVA_Build 3 96116608 1I AAGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 107 het 38 0 36 2 A 10 11 167661 CASAVA_Build 3 96121965 1D TTTTAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 12 11 167662 CASAVA_Build 3 96123503 1I GCAATTACAG -/T TAGTGGGTAA 3070 het 3070 hom 43 15 27 1 T 1 2 167663 CASAVA_Build 3 96128476 1D CAAAATTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 11 10 167664 CASAVA_Build 3 96131321 4I AACATGCTTA ----/TCTC TCTCTAAGGG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TC 2 4 167665 CASAVA_Build 3 96141341 1I AGAGTTGTAA -/C CCCCCAAAAT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 C 5 6 167666 CASAVA_Build 3 96142480 1I TATTTCTTCT -/A AAAAAAAAAC 2710 het 2710 ref 22 12 8 2 A 9 10 167667 CASAVA_Build 3 96144726 1I TTCTGTTTAT -/G GTGATGGATT 916 het 916 ref 26 19 4 3 G 1 2 167668 CASAVA_Build 3 96146256 1I CAATCTCTGC -/T TTTTTTTTTT 2999 het 2999 ref 21 9 7 5 T 10 11 167669 CASAVA_Build 3 96147133 1D CTTTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 31 2 16 13 T 15 14 167670 CASAVA_Build 3 96154756 1I GCACGGATGA -/T TTTTTATGTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 5 6 167671 CASAVA_Build 3 96160212 1D TAACCCCCCC A/- CACACACACA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 1 0 167672 CASAVA_Build 3 96163730 1D AAAATCTTTT C/- CCTTATTTTC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 C 3 2 167673 CASAVA_Build 3 96163982 1D GTCAATTGAT A/- AAAATGTAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 5 4 167674 CASAVA_Build 3 96168700 3D ATGCTGTCAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1083 hom 27 6 15 7 A 16 13 167675 CASAVA_Build 3 96168767 1D GTAGGTGGAA T/- TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 39 11 16 12 T 7 6 167676 CASAVA_Build 3 96175432 1D TAACCCCCCC T/- CTCCCCACCA 3070 het 3070 hom 33 13 11 11 T 1 0 167677 CASAVA_Build 3 96178420 1I ATAATAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 T 9 10 167678 CASAVA_Build 3 96221383 1D GAATTTCTCA C/- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 C 2 1 167679 CASAVA_Build 3 96221611 1D GCTGTACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2886 hom 33 12 12 9 A 15 14 167680 CASAVA_Build 3 96224597 1D TCTGCGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 11 10 167681 CASAVA_Build 3 96232432 2D GTATTCCATG GT/-- GTGTGTGTGT 1567 het 1567 ref 19 7 4 8 GT 8 7 167682 CASAVA_Build 3 96233474 4D TTTTTAAAAT ACAC/---- ACATACATAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 AC 3 1 167683 CASAVA_Build 3 96247965 4D TTTTTTACAC ATTA/---- ATTAATTATT 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 ATTA 3 2 167684 CASAVA_Build 3 96251720 2I TTGTAGACTC --/TT TACTATTTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 3 167685 CASAVA_Build 3 96253798 2I GGTTAGAAAC --/TG TGTGTTCAAG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 TG 2 3 167686 CASAVA_Build 3 96254051 1D AACAGTAAAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 26 8 11 9 A 7 6 167687 CASAVA_Build 3 96257533 1D TTTAAATGAA T/- TTTTTTGCAG 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 7 6 167688 CASAVA_Build 3 96271393 4D12M2D AGAAAGACTC AAATAAAATCAGAAATAA/----AAAATCAGAAAT-- GAGAGGAAAA 3070 het 3070 ref 33 20 18 5 N/A 0 0 167689 CASAVA_Build 3 96274787 4D TTCAGTGGTT AGAG/---- AGTACACTAG 3070 het 3070 ref 35 19 11 9 AG 3 1 167690 CASAVA_Build 3 96279746 3D TGAAAACCAC AGT/--- AGTAGTCTCT 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 AGT 3 2 167691 CASAVA_Build 3 96288868 5I TCTCACCAAC -----/CATTT ATAAGTCGTT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 CATTT 0 1 167692 CASAVA_Build 3 96291816 1D CCCCTCCGGC A/- AAAAAAAAAA 1546 het 1546 ref 38 20 5 13 A 17 16 167693 CASAVA_Build 3 96292748 1I AAAGTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 11 12 167694 CASAVA_Build 3 96300315 3I CGGCTTTCCA ---/AAG AAGTGCTGGA 3070 het 2585 hom 21 8 11 2 AAG 1 2 167695 CASAVA_Build 3 96301389 1D AGCATGACAC T/- TTTTTTTTTT 2043 het 883 hom 26 6 7 13 T 17 16 167696 CASAVA_Build 3 96308483 1I CCTAAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 11 12 167697 CASAVA_Build 3 96309438 3D ATCGATAGGC ATT/--- ATTTGGGTTG 3070 het 3070 ref 40 21 10 12 ATT 2 1 167698 CASAVA_Build 3 96311964 3D GGTGTTGGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 2372 het 1218 hom 33 7 8 18 T 19 16 167699 CASAVA_Build 3 96316650 2I ATAATAAAAC --/AT GTGACATATA 2653 het 1760 hom 16 5 8 3 AT 0 1 167700 CASAVA_Build 3 96318255 6D TTTTTGTTTG TTTGTT/------ TTTGTTTTTG 2495 het 2495 ref 28 14 6 13 TTTGTT 4 3 167701 CASAVA_Build 3 96323889 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1846 het 360 hom 8 1 6 1 A 11 10 167702 CASAVA_Build 3 96324157 1D GAAGCAAACC A/- AAAAACTTCC 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 6 5 167703 CASAVA_Build 3 96325435 1D CATGGAATAC A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 8 7 167704 CASAVA_Build 3 96325998 2I AAAGTGACTC --/AT ATTTACTGTG 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 AT 1 2 167705 CASAVA_Build 3 96326270 4D TTTTCTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 TTTG 3 2 167706 CASAVA_Build 3 96331082 2D TTAATTACTC AT/-- ATGAAAAGTT 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 AT 2 1 167707 CASAVA_Build 3 96333518 1D AGTGGGAACC A/- AATATTGGTA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 A 3 2 167708 CASAVA_Build 3 96336233 4D TCTGTCATCG ATCT/---- ATCTATCTAT 226 het 226 ref 32 21 5 7 ATCT 4 3 167709 CASAVA_Build 3 96336425 7I GACTGAGCAG -------/AGGGGCC AACCTCTCTT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 AGGGGCC 0 1 167710 CASAVA_Build 3 96340397 4D TTATGTGCTT ATTA/---- ATTAGTCACT 3070 het 3070 ref 44 25 16 5 ATTA 2 1 167711 CASAVA_Build 3 96340878 16I ACAGGCATGC ----------------/ACTACCATGCCCAGCT ACTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 ACTACCATGCCCAGCT 0 1 167712 CASAVA_Build 3 96341114 1D GTCAATGTAC A/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 1 0 167713 CASAVA_Build 3 96341555 4D TATATTTCAG CTTT/---- CTTTAATTTG 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 CTTT 2 1 167714 CASAVA_Build 3 96343755 1I TGATTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 17 20 13 A 10 11 167715 CASAVA_Build 3 96344740 1D CCAATTAGAT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 31 12 17 5 A 7 6 167716 CASAVA_Build 3 96345904 2D CATTAACATT AA/-- GATTAAATTT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 A 2 0 167717 CASAVA_Build 3 96349269 15I AAGAGAGTCT ---------------/TAAACCTCATACATG TGAATGTGAC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 TAAACCTCATACATG 0 1 167718 CASAVA_Build 3 96359911 1I ATTTTCTCTC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 6 7 167719 CASAVA_Build 3 96364870 4I TATGTTATTC ----/TTAA TTGTTTCATT 3070 het 3070 hom 48 15 24 9 TTAA 0 1 167720 CASAVA_Build 3 96372879 1D TTCTTCCCAC T/- TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 37 26 3 8 T 13 12 167721 CASAVA_Build 3 96377476 1D ATTCCAATTG C/- CAAGTGTATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 2 1 167722 CASAVA_Build 3 96377641 4D GTTTTAATTT CTTA/---- CTTATTTTGT 3070 het 3070 hom 34 13 19 6 CTTA 2 1 167723 CASAVA_Build 3 96380509 5D20M1I TCATATTTTC TTTTTTGATTTCTTTTTTTATTATA-/-----TGATTTCTTTTTTTATTATAT TTTAAGTTCT 3070 het 3070 hom 28 12 20 1 N/A 0 0 167724 CASAVA_Build 3 96383870 8D GCTTAAAGTC TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 26 11 11 5 TGTT 4 2 167725 CASAVA_Build 3 96386394 16I TTTACTGCAT ----------------/GAAACACAGGGCCCTG GTGGTGTAGG 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 GAAACACAGGGCCCTG 0 1 167726 CASAVA_Build 3 96388918 1I GAATTTACAT -/A AAAAATACTA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 5 6 167727 CASAVA_Build 3 96390818 1D GTTACATTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 22 8 11 4 A 10 9 167728 CASAVA_Build 3 96393275 1D TGATTTTAAT A/- AAAAATACTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 6 5 167729 CASAVA_Build 3 96395832 4I ATGTATAAGA ----/TAAT TAAAACAGCA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TAAT 0 1 167730 CASAVA_Build 3 96396141 3I TAAGTAAAAC ---/ATA ATAGACAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATA 1 2 167731 CASAVA_Build 3 96398546 1D TTTGCCTTTC T/- TAGACATTTT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 T 2 1 167732 CASAVA_Build 3 96399686 8D AAAAACAAAT ACACAGAC/-------- ACACAGACAC 3070 hom 68 het 50 0 22 29 ACACAGAC 3 2 167733 CASAVA_Build 3 96399714 2D ACAGACACAT AC/-- ACACACACAC 2171 het 2116 hom 49 13 10 28 AC 9 8 167734 CASAVA_Build 3 96401268 1I ATACATAGTG -/A AAAAATGTAT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 5 6 167735 CASAVA_Build 3 96401569 2I AATCTGCATT --/TC TCTTTCACTA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 TC 1 2 167736 CASAVA_Build 3 96402383 1I AAATATGTAG -/T TTTTGATACA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 4 5 167737 CASAVA_Build 3 96402539 1D AAACTAAAAT A/- AAAAATATCT 3070 het 2515 hom 16 6 8 2 A 6 5 167738 CASAVA_Build 3 96403592 1I ATGATGAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 10 7 11 T 9 10 167739 CASAVA_Build 3 96404393 1I TTACACACTA -/G TTGGTGCAGT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 0 1 167740 CASAVA_Build 3 96407330 1D CACTGGCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 11 12 T 12 11 167741 CASAVA_Build 3 96409965 1D ATTTTTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 A 11 10 167742 CASAVA_Build 3 96412687 1I TAATCTTTCT -/A AAGTTTCTGT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 2 3 167743 CASAVA_Build 3 96413486 3I AAAATAAACA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 22 1 9 12 AAC 0 1 167744 CASAVA_Build 3 96414733 1I CAGCAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 9 10 167745 CASAVA_Build 3 96418337 1I TGATCCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 10 11 167746 CASAVA_Build 3 96420640 1D CCAAAAAATG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 8 7 167747 CASAVA_Build 3 96421593 3D GTTCAGCCAT ATC/--- ATCTAAAATT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 ATC 2 1 167748 CASAVA_Build 3 96424166 1D TCCAGCTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 22 13 13 T 10 9 167749 CASAVA_Build 3 96426474 1D AATGCCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 13 12 167750 CASAVA_Build 3 96427009 1I TGGATTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 10 11 167751 CASAVA_Build 3 96427743 1D CCGCCCAGTT C/- TGTGCCTTTG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 C 1 0 167752 CASAVA_Build 3 96437336 32D TAGAATATTT AAAAATTGACGAATCAATCATATCCACCAAAG/-------------------------------- ACATTACAGG 2364 het 2364 ref 21 18 5 4 AAAAATTGACGAATCAATCATATCCACCAAAG 1 0 167753 CASAVA_Build 3 96439687 6D ATTTCCACCA ACAGTG/------ TATAAGAATT 3070 het 3070 ref 34 17 16 4 ACAGTG 1 0 167754 CASAVA_Build 3 96446479 4I ATATGCACTC ----/TCTT TGAGCAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 TCTT 0 1 167755 CASAVA_Build 3 96451645 1D TACTAGAAAC T/- TTTTTCGTTT 3070 het 2455 hom 17 5 10 2 T 6 5 167756 CASAVA_Build 3 96452195 1I TTGAAGGAAA -/T TTGAATTAAT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 2 3 167757 CASAVA_Build 3 96454344 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2336 het 80 hom 17 1 9 8 T 17 16 167758 CASAVA_Build 3 96455259 30D ACCCAGGTTT TATATATATATATATATATATATGTATATA/------------------------------ TATATATATA 1962 het 412 hom 6 1 4 2 TATATATATATATATATATATATGTATATA 1 0 167759 CASAVA_Build 3 96457284 1D CTTTGTACTC T/- TTAGTCATTT 3070 hom 78 het 32 0 27 7 T 3 2 167760 CASAVA_Build 3 96463314 2I TCAAACTAAC --/AG TGAAATCAAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AG 0 1 167761 CASAVA_Build 3 96465232 1I AAGAATACAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 9 10 167762 CASAVA_Build 3 96465975 1D GTTTCTGAAG A/- AAAAAATATC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 7 6 167763 CASAVA_Build 3 96468594 2D TAATTGCTCT AA/-- AAATAGTAAA 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 A 5 3 167764 CASAVA_Build 3 96474005 1I TAATATAACT -/A AAAATAAAAC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 4 5 167765 CASAVA_Build 3 96474427 3D AAAAATTGTT AAG/--- AAAAAGTGTG 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 AAG 1 0 167766 CASAVA_Build 3 96477868 1I CAGGACTGCT -/G GGGGGGGCAG 3030 het 3030 ref 33 21 10 2 G 7 8 167767 CASAVA_Build 3 96480282 4D AATAACTGCT TAAA/---- TAATCAAGAG 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 TAAA 1 0 167768 CASAVA_Build 3 96495468 46I TTAGCCCAAC ----------------------------------------------/ACTTTAGCTGAATAACCACGGAGTTTCATCTTAATCCATGTCATGG ACTTTGAACT 2317 het 2317 ref 32 16 5 13 ACTTTAGCTGAATAACCACGGAGTTTCATCTTAATCCATGTCATGG 0 1 167769 CASAVA_Build 3 96499172 1D GAAAAATAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 10 9 167770 CASAVA_Build 3 96501717 1I ATATGTACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 9 10 167771 CASAVA_Build 3 96503639 1I AGGATTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 18 22 11 T 10 11 167772 CASAVA_Build 3 96517632 1D CATTTTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 T 13 12 167773 CASAVA_Build 3 96520049 2I AAAATGAAAA --/AC AGAGTTCTAC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 AC 0 1 167774 CASAVA_Build 3 96522844 1D GTTAACATCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 9 8 167775 CASAVA_Build 3 96528416 1D CTTTGTTGAC T/- TTCTGCATTC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 T 3 2 167776 CASAVA_Build 3 96529469 1I CCAAATTTTT -/G CTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 G 0 1 167777 CASAVA_Build 3 96532521 1I AAATATATGC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 6 7 167778 CASAVA_Build 3 96533197 1D TTATCTTTAC A/- TTTTATGTGT 3070 het 3070 hom 34 10 21 5 A 1 0 167779 CASAVA_Build 3 96534150 1D TATAGTGTGA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 7 6 167780 CASAVA_Build 3 96537102 2D AAAAATAGAC AA/-- TATATAAACA 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 A 2 0 167781 CASAVA_Build 3 96552568 1D TTCATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 A 11 10 167782 CASAVA_Build 3 96561007 4I CCAATTCCTG ----/TCTA TCTTTCTATT 3070 het 1826 hom 30 7 17 6 TCTA 0 1 167783 CASAVA_Build 3 96566666 1I ATCTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 901 het 300 hom 13 4 3 6 A 13 14 167784 CASAVA_Build 3 96570061 2D AAAACAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 A 14 12 167785 CASAVA_Build 3 96590309 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1672 hom 37 7 19 11 A 12 11 167786 CASAVA_Build 3 96593968 1I AATAAATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 A 10 11 167787 CASAVA_Build 3 96596727 1D TTTCCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 35 1 32 3 A 11 10 167788 CASAVA_Build 3 96600597 1I GGAAACAGAG -/T TTTTCAATGT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 4 5 167789 CASAVA_Build 3 96609959 1D GTTTAAGCTG T/- TTTTTTTTTT 2715 het 2417 hom 33 11 11 11 T 11 10 167790 CASAVA_Build 3 96610023 1I24M1I AAAAGAAGCA -TTTTTTTTTTCTTTTTAAAAGATG-/TTTTTTTTTTTCTTTTTAAAAGATGT TATACTATGC 3070 het 3070 ref 25 9 7 13 N/A 0 0 167791 CASAVA_Build 3 96634999 1I ATGTTGGCCA -/G GCTGGTCTCA 3070 het 3070 ref 19 8 8 3 G 1 2 167792 CASAVA_Build 3 96635354 5I TGTATAATTG -----/TCAGC TCAGCTCAGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 TCAGC 1 2 167793 CASAVA_Build 3 96635500 5I TTTCCTTTGA -----/CTTAT CTTAAGTTTG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 CTTAT 0 1 167794 CASAVA_Build 3 96637189 1D GTTTTCTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 10 9 167795 CASAVA_Build 3 96639604 6D CTTGTGTCTT TTTCTC/------ TTTCACATAA 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 TTTCTC 1 0 167796 CASAVA_Build 3 96640117 1D TACTAGTTAG T/- TTTTTGTTCC 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 T 6 5 167797 CASAVA_Build 3 96640581 1D TCTCTTTTTT G/- CTTTCATATG 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 G 1 0 167798 CASAVA_Build 3 96642530 1D TTGGATCATT C/- TTCATTACCA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 1 0 167799 CASAVA_Build 3 96645109 1I CATGCTTATG -/T TAAATATATC 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 T 1 2 167800 CASAVA_Build 3 96645394 1I GCTTTTAGAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 7 8 167801 CASAVA_Build 3 96647478 1I GCCTAACCAG -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 T 6 7 167802 CASAVA_Build 3 96648320 1D TTGTAATATA G/- GGATACATTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 G 3 2 167803 CASAVA_Build 3 96648594 19D ATTCTGAGTT GGAGATAAATATCTGGAAA/------------------- GGAGATAAAT 3070 het 3070 hom 43 14 16 16 GGAGATAAATATCTGGAAA 2 1 167804 CASAVA_Build 3 96649531 49D GAAATAAGTC TCTCTAAAGAATTGATGTATGAGCAGAGTCCAGAATGATGAAAAGAAAT/------------------------------------------------- TGGTAATTGA 3070 het 3070 ref 45 35 19 4 TCTCTAAAGAATTGATGTATGAGCAGAGTCCAGAATGATGAAAAGAAAT 1 0 167805 CASAVA_Build 3 96649774 5D GTGCTATTGA CTATG/----- CTGTTCCAGG 1133 het 1133 ref 51 43 4 5 CTATG 1 0 167806 CASAVA_Build 3 96652587 1I TCATCTACAT -/C TTCAGCACTA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 C 0 1 167807 CASAVA_Build 3 96653665 1I AAAAATAGTT -/A AAACAGTATG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 3 4 167808 CASAVA_Build 3 96654487 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 7 8 167809 CASAVA_Build 3 96656284 1I GAAATAAAAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 2912 hom 21 7 13 1 A 7 8 167810 CASAVA_Build 3 96656466 1I AGTTTCTATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 8 9 167811 CASAVA_Build 3 96657445 1D CTCATCATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 98 het 40 0 33 7 T 10 9 167812 CASAVA_Build 3 96661617 1I CGGAGACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 11 12 167813 CASAVA_Build 3 96662358 1I TTTTTTTTCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 8 9 167814 CASAVA_Build 3 96667924 4D TCAGTTTTTT TTTA/---- ATCTGCCAAA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 TTTA 1 0 167815 CASAVA_Build 3 96668557 1I TGTGATATCG -/T TGTAAGATGG 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 T 1 2 167816 CASAVA_Build 3 96674206 3D ACAGCCAACT TAA/--- TGACACACAA 3070 het 3070 hom 18 8 10 1 TAA 1 0 167817 CASAVA_Build 3 96676509 1D TTCCTAGTTC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 T 8 7 167818 CASAVA_Build 3 96679211 3D AAACATATTT TGA/--- TGATTAAAAG 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 TGA 2 1 167819 CASAVA_Build 3 96679426 1I16M3D TATGAATCAC -TGTTTTTTTGTATTTTATA/TTTTTTTTTTGTATTTT--- ATGTTTTGAC 3070 het 3070 ref 28 20 10 3 N/A 0 0 167820 CASAVA_Build 3 96680189 4D GCTTCAATAG TATA/---- TATATATATA 1069 het 1069 ref 11 4 3 4 TA 10 8 167821 CASAVA_Build 3 96682047 4I ATGAAATCAT ----/AGTA AGAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 AGTA 0 1 167822 CASAVA_Build 3 96684789 5D TATGAGGGCC TCTTT/----- TCTTTAGTAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 TCTTT 2 1 167823 CASAVA_Build 3 96691389 2I CAATACACTC --/TT TTTTTTTTTT 1763 het 1763 ref 30 9 12 9 T 14 16 167824 CASAVA_Build 3 96695945 2I AATTAAATTC --/AA ACACAGGTAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 1 3 167825 CASAVA_Build 3 96699080 1D ACAACTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 13 12 167826 CASAVA_Build 3 96711766 1D GGGGTTGGAG C/- CCCCCACACA 3070 het 2693 hom 30 8 15 8 C 6 5 167827 CASAVA_Build 3 96713071 1D GCCAATTAAT G/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 1 0 167828 CASAVA_Build 3 96714282 1I ATATAAAGCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 7 8 167829 CASAVA_Build 3 96715352 1I AGGAAAAAAA -/T GTTGTTGTTT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 0 1 167830 CASAVA_Build 3 96718039 1D GTACCTACCA T/- TTCTTATATG 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 T 3 2 167831 CASAVA_Build 3 96727630 4D AAATTATATG GATT/---- GATTAACAAA 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 GATT 2 1 167832 CASAVA_Build 3 96729262 4D GTGGTGAAAT TTTG/---- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 25 12 11 6 TTTG 1 0 167833 CASAVA_Build 3 96731029 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 6 7 167834 CASAVA_Build 3 96734346 4D TCTATCTATC ATCT/---- ATCTATCTAT 2699 het 2699 ref 29 15 9 8 ATCT 4 3 167835 CASAVA_Build 3 96739445 3D GACAATTTCT ATA/--- ATGACACTCT 3070 het 3070 hom 40 17 19 7 ATA 1 0 167836 CASAVA_Build 3 96740250 1D AATGTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3024 het 3024 ref 31 18 8 5 T 11 10 167837 CASAVA_Build 3 96744244 1I CTTTCTTCTG -/T TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 25 16 3 6 T 10 11 167838 CASAVA_Build 3 96745858 1D AATTCATAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 T 10 9 167839 CASAVA_Build 3 96749711 1D GATATCATAG T/- TTTTCACTGC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 5 4 167840 CASAVA_Build 3 96766269 4D TAAATGAAAT AACA/---- AACAAAGTGC 3070 het 3070 ref 28 13 12 5 AACA 2 1 167841 CASAVA_Build 3 96767665 1I GAATCATTGT -/G GGGGACTGAG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 G 4 5 167842 CASAVA_Build 3 96768980 1D AGGAGATTTG C/- CTGGGAGGCG 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 C 2 1 167843 CASAVA_Build 3 96771606 3D ATTCATAATA ATT/--- ATTATTACGT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 ATT 3 2 167844 CASAVA_Build 3 96775391 6D ATATATGGAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 1328 hom 32 8 11 13 AC 11 8 167845 CASAVA_Build 3 96795217 1I CATACTGCAG -/A AAAAAAAAAA 2752 het 1986 hom 25 9 9 7 A 11 12 167846 CASAVA_Build 3 96795281 4D ATGGCTTAAG ATGC/---- ATTTCAAGGG 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 ATGC 1 0 167847 CASAVA_Build 3 96798771 1I AATCCTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 10 11 167848 CASAVA_Build 3 96802785 2I ATAAAATATT --/TA TCAGTGTAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TA 0 1 167849 CASAVA_Build 3 96805338 1I GCAATCCTTT -/C ACCCCTTAAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 C 0 1 167850 CASAVA_Build 3 96810122 2I CCTATAGTAC --/CT CTATATGTGT 3070 het 2609 hom 21 7 13 1 CT 1 2 167851 CASAVA_Build 3 96821107 3D CTATCAAATA TTC/--- TTATGCTTAT 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 TTC 1 0 167852 CASAVA_Build 3 96821261 2D CTCAGAAATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 282 hom 37 1 26 12 AT 8 7 167853 CASAVA_Build 3 96822591 1D AATGAATAAC A/- AGAACCTTGC 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 A 2 1 167854 CASAVA_Build 3 96849774 1D ACAATCCTTC A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 7 6 167855 CASAVA_Build 3 96852756 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 A 8 7 167856 CASAVA_Build 3 96871108 1D CCATTTCTAT A/- GTAATACAGA 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 A 1 0 167857 CASAVA_Build 3 96888146 2D TTTTCTAATT AC/-- GTTATATTTT 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 AC 1 0 167858 CASAVA_Build 3 96897232 1D AGATGTTACC T/- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 51 20 29 2 T 5 4 167859 CASAVA_Build 3 96899869 3D AATAAAGTAG ATA/--- ATAATAGTAA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 ATA 3 2 167860 CASAVA_Build 3 96904038 2D CACTTGTGAT CC/-- CCCCCCCCTC 3070 het 2415 hom 28 13 10 5 C 10 8 167861 CASAVA_Build 3 96908097 1I TATGTCCCCA -/T TTTTTTTTTT 2060 het 1873 hom 21 7 6 8 T 13 14 167862 CASAVA_Build 3 96914485 3D TCATTAAAAA TTG/--- TTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 TTG 1 0 167863 CASAVA_Build 3 96925346 3I AAATTATTAT ---/ATA ATATCAGAGT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 ATA 1 2 167864 CASAVA_Build 3 96929756 1D CTTGAATTGT A/- ACTCCCACAA 3070 het 3070 hom 42 12 23 7 A 2 1 167865 CASAVA_Build 3 96933248 1I CTGCAAAAGT -/A AAAATCTTTG 3070 het 3070 ref 42 25 12 5 A 4 5 167866 CASAVA_Build 3 96944895 1I TCTGTTTCCC -/T TTTAAACATT 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 T 3 4 167867 CASAVA_Build 3 96947096 1D CTTATGATCT A/- ATCACCTCCC 3070 het 3070 ref 30 17 8 6 A 2 1 167868 CASAVA_Build 3 96989927 1D CTTTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 2065 het 1193 hom 39 8 8 23 T 19 18 167869 CASAVA_Build 3 97011319 1I TTCAGTATTT -/C TCATCTTCTC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 C 0 1 167870 CASAVA_Build 3 97015554 1I CACCCAGGTT -/A AAAAAGTCAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 5 6 167871 CASAVA_Build 3 97018060 1D TGTCATTTTG A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 7 6 167872 CASAVA_Build 3 97020154 1D TTTAAATTGA T/- TTGGGGGGGG 3070 het 3070 ref 41 22 13 7 T 3 2 167873 CASAVA_Build 3 97029038 11I AAATTAAAAT -----------/TGGGTAGTTGA TGAAGAAACC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TGGGTAGTTGA 0 1 167874 CASAVA_Build 3 97032984 1I AAAGAATAGG -/A GAATGAATCA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 0 1 167875 CASAVA_Build 3 97034645 1D ATATCTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 T 10 9 167876 CASAVA_Build 3 97040470 3D AGCAAAGCTG ATA/--- ATAAAGGCAG 3070 het 3070 ref 50 23 21 8 ATA 2 1 167877 CASAVA_Build 3 97045215 4D AAATAAAAAA TAAC/---- TAATGCTGGT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 TAAC 1 0 167878 CASAVA_Build 3 97045376 1I GTATATATTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 9 10 167879 CASAVA_Build 3 97046785 1D ATAATAGTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 10 9 167880 CASAVA_Build 3 97052627 4D ATTTCTTTTC AAGT/---- AAGATCTCTG 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 AAGT 1 0 167881 CASAVA_Build 3 97057952 3D GCAAACCAAT CTC/--- CTCCTGGAAC 3070 het 3070 ref 47 24 19 7 CTC 2 1 167882 CASAVA_Build 3 97060289 9I TAAAACTAAC ---------/ATCAGTGAG ATCAGTGAGG 3070 het 2828 hom 22 8 11 3 ATCAGTGAG 1 2 167883 CASAVA_Build 3 97071324 1D TCTTAATGTT G/- TTTTCAACTT 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 G 1 0 167884 CASAVA_Build 3 97074712 1I GTTATTTATA -/T TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 6 7 167885 CASAVA_Build 3 97092841 1D TTATTTAGAC A/- GAGGTATCTC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 A 1 0 167886 CASAVA_Build 3 97097726 1D TATAGGCCAC A/- AGGAATACTA 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 A 2 1 167887 CASAVA_Build 3 97104725 1D GAACGTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 11 10 167888 CASAVA_Build 3 97107266 1D ATGACCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 T 12 11 167889 CASAVA_Build 3 97123328 2D TCTGTGTGTG TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 hom 36 16 18 4 TA 5 4 167890 CASAVA_Build 3 97124460 1D CACCCTATTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 8 7 167891 CASAVA_Build 3 97129346 2D TGATTTGTTG AA/-- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 10 8 167892 CASAVA_Build 3 97132040 1I TATATTTGTA -/G CATATATAAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 G 0 1 167893 CASAVA_Build 3 97135038 4D40M4D GTGCATGCGC GTGTGTGTGCGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGTGT/----GTGTGCGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGC---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 31 28 12 12 N/A 0 0 167894 CASAVA_Build 3 97150039 1I TGAGTCTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 A 8 9 167895 CASAVA_Build 3 97156814 1D TTTTGGTATT A/- ATAGTATTAT 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 A 2 1 167896 CASAVA_Build 3 97158987 1I GCTGTATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 11 12 167897 CASAVA_Build 3 97161221 3I CAAGGTGAAC ---/GTG GTGGTTACCA 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 GTG 1 2 167898 CASAVA_Build 3 97163039 1I AACATTCGGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 A 8 9 167899 CASAVA_Build 3 97180267 2I TGGGAAAAAC --/AT ATTTGTAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AT 1 2 167900 CASAVA_Build 3 97195318 1I AGCTGAACAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 53 22 22 9 A 9 10 167901 CASAVA_Build 3 97197644 4I CTTTTTAATG ----/CTGA CTATTTTGTG 3070 hom 134 het 46 0 45 1 CTGA 0 1 167902 CASAVA_Build 3 97197731 1D GTAGAAATAC T/- TTTTTTGGTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 6 167903 CASAVA_Build 3 97197896 1D GGAGAGTATA T/- TTTTTAGCTT 3070 het 1469 hom 33 5 21 7 T 6 5 167904 CASAVA_Build 3 97198124 1I CATAGTTAAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 8 9 167905 CASAVA_Build 3 97201057 1I AAATTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 30 1 26 3 T 10 11 167906 CASAVA_Build 3 97217232 5D ATCTCAAAGC AGTAA/----- AAGTCTTCCC 3070 het 3070 ref 29 16 8 7 AGTAA 1 0 167907 CASAVA_Build 3 97222972 4D GAAATATTAT AATA/---- AATACAGAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AATA 2 1 167908 CASAVA_Build 3 97231015 1D GATTAGTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 11 10 167909 CASAVA_Build 3 97231544 1D TTTAAAAAAA T/- GTTGATTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 1 0 167910 CASAVA_Build 3 97234335 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTCTTTT 63 het 63 ref 25 11 2 12 T 5 6 167911 CASAVA_Build 3 97245369 1D TGCTATTAAT A/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 1 0 167912 CASAVA_Build 3 97264377 3D CCTTCTCCTT CTC/--- CTCCTCCTCC 2890 het 2181 hom 34 10 9 15 CTC 5 4 167913 CASAVA_Build 3 97265044 25I AGCACACAAC -------------------------/ATAATAATATATATATTAATATTAT GCATATTAAT 1193 het 1193 ref 23 18 3 2 ATAATAATATATATATTAATATTAT 0 1 167914 CASAVA_Build 3 97267986 1D CCTTAATTAC A/- AAAATCTTAC 3070 het 3070 ref 42 25 16 2 A 5 4 167915 CASAVA_Build 3 97269104 1I AGAAAACACA -/T TTTTTGTCCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 5 6 167916 CASAVA_Build 3 97272431 1I TCCCATATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 10 11 167917 CASAVA_Build 3 97284892 2I TATTGAGTTA --/TT TTTTTGTATG 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 T 5 7 167918 CASAVA_Build 3 97293654 1D CAAAAGAAAG A/- AATAGCATCA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 3 2 167919 CASAVA_Build 3 97311918 1I GATTTCATCG -/T GGTGGATAAT 3070 het 3070 hom 35 10 23 2 T 0 1 167920 CASAVA_Build 3 97315198 1I TCCTTAAAAT -/A TAGCTCTCTC 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 A 0 1 167921 CASAVA_Build 3 97315488 3I ATACAGTATT ---/ATA ATATTATTAG 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 ATA 1 2 167922 CASAVA_Build 3 97315738 1D TTCTCAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2805 hom 43 17 17 10 A 15 14 167923 CASAVA_Build 3 97324558 4D ATCCTATCTC AAAT/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 9 AAAT 1 0 167924 CASAVA_Build 3 97325651 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 8 10 A 10 9 167925 CASAVA_Build 3 97339653 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 185 hom 31 2 21 8 A 17 16 167926 CASAVA_Build 3 97347360 1I TATTCTGAAC -/G TATAACATAT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 G 0 1 167927 CASAVA_Build 3 97350106 1D GTTATATATT A/- AAAATAAATT 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 A 5 4 167928 CASAVA_Build 3 97355802 1I CCACCCCCAC -/A CATATTCTTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 0 1 167929 CASAVA_Build 3 97356530 1I CTGTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2578 het 2578 ref 39 20 11 8 A 11 12 167930 CASAVA_Build 3 97357719 1D GACCACCAAT G/- TGTAATGTTC 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 G 1 0 167931 CASAVA_Build 3 97358431 1I ACCTTGGTTC -/A ACCGGTTCTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 1 2 167932 CASAVA_Build 3 97358815 1I TGGAAAACAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 59 het 35 0 18 17 A 8 9 167933 CASAVA_Build 3 97363192 1I GGAGAAGAGA -/C GTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 167934 CASAVA_Build 3 97366040 2D TCAATATAGG AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3 hom 33 1 14 18 A 10 8 167935 CASAVA_Build 3 97369453 1I TATACTCCCT -/A AAAAATTCTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 5 6 167936 CASAVA_Build 3 97373537 4I TCTGTCTGTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 1967 het 1967 ref 25 9 9 7 TG 7 9 167937 CASAVA_Build 3 97375300 1I TGAAGCGGTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 8 9 167938 CASAVA_Build 3 97376561 1I CCAGAGACCC -/A ATAGATAGGT 3070 het 3070 hom 47 14 27 6 A 1 2 167939 CASAVA_Build 3 97382474 1I ATGTAAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 11 12 167940 CASAVA_Build 3 97383133 1D TTCATATATA T/- TTTATCTATA 1473 het 1473 ref 16 7 4 5 T 4 3 167941 CASAVA_Build 3 97384824 2D TTGAAAATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 71 hom 26 1 16 9 AT 7 6 167942 CASAVA_Build 3 97388321 4D AGTTTCAACT CTAA/---- CTGATACTTT 3070 het 3070 ref 37 24 11 4 CTAA 1 0 167943 CASAVA_Build 3 97389171 1I AGGTCTGCGT -/G AATAGTAGGG 3070 hom 50 het 34 0 28 6 G 0 1 167944 CASAVA_Build 3 97390865 1I TGACTATATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 8 9 167945 CASAVA_Build 3 97411840 1I AAGGAAGATT -/A AAAAAAAAAA 2026 het 1984 hom 20 7 7 6 A 11 12 167946 CASAVA_Build 3 97412319 1D AAATGGTTTT A/- ACAGTGTGGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 1 167947 CASAVA_Build 3 97418772 1D TAGGCAGTTG T/- TTTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 62 29 27 6 T 7 6 167948 CASAVA_Build 3 97422073 1D CCTGTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 A 12 11 167949 CASAVA_Build 3 97423323 1D GTTATTTATG T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 6 5 167950 CASAVA_Build 3 97424198 3I TTAGTTTCCA ---/ATC TGTACCATGA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 ATC 0 1 167951 CASAVA_Build 3 97442407 4I ACCAAAAGAA ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 12 13 14 T 14 18 167952 CASAVA_Build 3 97449611 1D AAGAGGCTTT A/- AATTATTTCT 3070 het 3070 hom 38 9 26 3 A 3 2 167953 CASAVA_Build 3 97466113 2D TAAAAAAAAA AG/-- AATATTCTAA 2120 het 2120 ref 20 11 8 3 AG 1 0 167954 CASAVA_Build 3 97468729 2D CACTTAACAT AA/-- GCTAATCATA 3070 het 3070 ref 53 27 23 4 A 2 0 167955 CASAVA_Build 3 97485306 36D GCAACGTCTC ATAGGGATAAAACCCATGAGGTTTATCTAGGCATAA/------------------------------------ ATAAATCCAA 3070 het 3070 ref 33 20 19 4 ATAGGGATAAAACCCATGAGGTTTATCTAGGCATAA 1 0 167956 CASAVA_Build 3 97488477 1I GCTCAATATA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 6 7 167957 CASAVA_Build 3 97494680 8I CACTGCATAG --------/CAACAGAC CAATAAACTG 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 CAACAGAC 0 1 167958 CASAVA_Build 3 97496101 1I TATTCATGCA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 7 8 167959 CASAVA_Build 3 97500491 1I CTCTGGAGAT -/C CCTTCCCTCC 1801 het 1801 ref 26 19 4 3 C 2 3 167960 CASAVA_Build 3 97503470 1D TCTCAGACAG T/- TTGCAAGAAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 3 2 167961 CASAVA_Build 3 97505007 1I CATCAGTCAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 2651 hom 32 10 17 5 T 2 3 167962 CASAVA_Build 3 97505488 1I ATAATATATA -/T TTTTTTATAA 3070 het 2270 hom 21 5 14 2 T 6 7 167963 CASAVA_Build 3 97509343 4D AATATAAATG AATA/---- AATAAATAAT 3070 het 3070 hom 44 18 24 4 AATA 3 2 167964 CASAVA_Build 3 97511060 2D ATGATTATTT AA/-- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 24 11 12 5 A 10 8 167965 CASAVA_Build 3 97517866 1D ATTTCTCAAG A/- AAATTTTTGC 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 4 3 167966 CASAVA_Build 3 97518098 4D ATTGAAGAGA ACAT/---- ACACTGTTCT 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 ACAT 1 0 167967 CASAVA_Build 3 97523788 1D AAAAGTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 A 12 11 167968 CASAVA_Build 3 97525138 11D AGAAGAAGAA AAGAAGAAGAG/----------- GAGAAGAACA 1917 het 1917 ref 27 12 6 13 AAGAAGAAGAG 1 0 167969 CASAVA_Build 3 97525690 1I CAAAATAGGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 A 9 10 167970 CASAVA_Build 3 97526128 1D TTTCATTGGT G/- GGTGATCATT 3070 het 3070 hom 34 14 17 5 G 3 2 167971 CASAVA_Build 3 97530430 1I CTTTTATGAA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 7 8 167972 CASAVA_Build 3 97531454 1I CCATTTTTTT -/C ACATTTCAGA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 C 0 1 167973 CASAVA_Build 3 97535009 1I AAGAATCTGT -/A GTTTGGTAAT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 0 1 167974 CASAVA_Build 3 97535522 2I CCAGGAAATA --/TC TATATCTCTC 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 TC 0 1 167975 CASAVA_Build 3 97547250 1I GACCCCATCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 8 9 A 9 10 167976 CASAVA_Build 3 97552141 2D CAATAGATAC AT/-- GGAGCCCATC 3070 hom 96 het 40 0 33 8 AT 1 0 167977 CASAVA_Build 3 97557198 1I CTCCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 12 5 A 13 14 167978 CASAVA_Build 3 97563334 2I ACTTCCAAAT --/AA AGACAACAAT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 1 3 167979 CASAVA_Build 3 97564032 1I CATTCTTTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 845 hom 43 2 33 8 A 9 10 167980 CASAVA_Build 3 97584279 1I TTATTTCTAA -/T TTTTTGACTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 5 6 167981 CASAVA_Build 3 97598810 1D TTTAGTCTTC A/- GATTTGAATA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 1 0 167982 CASAVA_Build 3 97600421 1D TTAAAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 11 10 167983 CASAVA_Build 3 97615167 3I AGAAAATAAA ---/TAG TAGTATATCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TAG 1 2 167984 CASAVA_Build 3 97632462 1I AAAAAACAAA -/C AAAAAAAAAC 3070 hom 59 het 42 1 35 6 C 0 1 167985 CASAVA_Build 3 97635190 1D ATTTTAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 26 1 20 5 T 13 12 167986 CASAVA_Build 3 97637745 4I ACCAAAAGCA ----/AGTT AGTTAGTTAC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 AGTT 2 3 167987 CASAVA_Build 3 97654095 1I TCCTAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 142 hom 41 1 34 6 A 10 11 167988 CASAVA_Build 3 97655157 1D AAAAAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 11 10 167989 CASAVA_Build 3 97655676 16I TGGTGTGCAC ----------------/CTGTAGTTCCAGCTAT CTGGGGGGCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CTGTAGTTCCAGCTAT 0 1 167990 CASAVA_Build 3 97659834 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 7 6 167991 CASAVA_Build 3 97661064 8I TGGCAAATTG --------/AATACAAT AACACATTAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 AATACAAT 0 1 167992 CASAVA_Build 3 97670071 6D AAGTAAATGG AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 16 10 167993 CASAVA_Build 3 97684110 1I TATTGCATAC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 167994 CASAVA_Build 3 97685693 1D GTTTTTATAT G/- GGGCTAGTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 4 3 167995 CASAVA_Build 3 97686002 1D CTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 10 9 167996 CASAVA_Build 3 97687225 1D GTATTATCCC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 8 167997 CASAVA_Build 3 97694895 1I ACTGTCTGAT -/G GGGGGGTGCC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 6 7 167998 CASAVA_Build 3 97701258 3D AAAAAAGAAA AAG/--- AAAAAAAAAA 1200 hom 31 het 20 0 10 10 AAG 1 0 167999 CASAVA_Build 3 97703895 19D CAAGATATCT CATTATCTTGGAATATTTG/------------------- CATTATGTAT 3070 hom 102 het 34 0 34 8 CATTATCTTGGAATATTTG 1 0 168000 CASAVA_Build 3 97788189 1I AAAGATATTT -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 7 8 168001 CASAVA_Build 3 97794859 11I CTGGTTATTC -----------/CACCTGGTAGT CAGATCACTT 3070 hom 157 het 56 0 53 3 CACCTGGTAGT 0 1 168002 CASAVA_Build 3 97803723 1D GGGTTGTTTC T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 28 het 13 0 9 4 T 7 6 168003 CASAVA_Build 3 97809037 1I TATATTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 435 hom 33 1 23 9 T 9 10 168004 CASAVA_Build 3 97815323 2D TATGTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 303 hom 49 2 36 11 TA 8 7 168005 CASAVA_Build 3 97827209 4D ATACACCAAT AACA/---- AACAAACAGA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AACA 3 2 168006 CASAVA_Build 3 97830635 4D GTTAATATTT CAAA/---- CAAACATGAA 3070 het 3070 hom 37 12 23 3 CAAA 2 1 168007 CASAVA_Build 3 97831184 3I TCTATGTAAT ---/ATA ATGACTATTA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 ATA 0 1 168008 CASAVA_Build 3 97832429 3D AAGATTGTGC AGT/--- AGTCACCTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 AGT 2 1 168009 CASAVA_Build 3 97833442 1D TCCTAGGATT A/- AAAAAAGTAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 7 6 168010 CASAVA_Build 3 97834800 1I ATAAATGATG -/C CCCAGAGGAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 3 4 168011 CASAVA_Build 3 97834942 1D GAGAAATAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 120 het 50 0 40 10 T 9 8 168012 CASAVA_Build 3 97835270 1D ATTAAAAAAA C/- CTTTGCTTCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 2 1 168013 CASAVA_Build 3 97838499 3D TCTCTTCTTT GTG/--- GTGCCCATGT 3070 hom 138 het 51 0 46 8 GTG 2 1 168014 CASAVA_Build 3 97839006 1D GAGATGACAC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 8 7 168015 CASAVA_Build 3 97839517 1D ATTTAAATTT A/- AAAATCTAAA 3070 hom 98 het 35 0 32 4 A 5 4 168016 CASAVA_Build 3 97841256 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCCTCCC 1432 hom 7 het 3 0 3 0 C 6 7 168017 CASAVA_Build 3 97847068 3D TAAAACAACA AAT/--- AATAGAACCT 3070 hom 140 het 49 0 47 4 AAT 2 1 168018 CASAVA_Build 3 97849693 1I ATTCAGAAAT -/A AAAAAGAATT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 5 6 168019 CASAVA_Build 3 97852425 1I AAAGTCAGAG -/A GTGTTAATCC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 0 1 168020 CASAVA_Build 3 97853134 4D TTAAAATCTA CTCT/---- GTCTATTATC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 CT 2 0 168021 CASAVA_Build 3 97855109 4D CCTGCACTAT GTAA/---- GTAACACACC 3070 hom 114 het 41 0 36 5 GTAA 2 1 168022 CASAVA_Build 3 97855916 2I TTTTAGATTA --/AC ATTCAGTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AC 0 1 168023 CASAVA_Build 3 97865497 32I5M1I TGTGGAGACT --------------------------------TACGT-/TAGAATGTGTCTCCACATACCTACTTAGAAGGTATGTG GAGAATGAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 6 N/A 0 0 168024 CASAVA_Build 3 97866075 5I ACTAAACACC -----/TACTT TACTTGCCAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TACTT 1 2 168025 CASAVA_Build 3 97873487 1D CTTTTGCCTT G/- GGGGGAACAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 6 5 168026 CASAVA_Build 3 97882055 3I CAGTTTTTTA ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 TTG 5 6 168027 CASAVA_Build 3 97882134 1I AATTTAAAGA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 6 7 168028 CASAVA_Build 3 97896202 1I AATATTGATT -/C TTCCAATCAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 0 1 168029 CASAVA_Build 3 97899836 1I CAGACATATT -/G GAGCTCCATT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 1 2 168030 CASAVA_Build 3 97901795 1I GTAAACATTC -/A CCCCTAGACA 3070 hom 99 het 36 0 30 6 A 0 1 168031 CASAVA_Build 3 97969478 3D ACCCAGAATA ATT/--- AGACTAGTAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 ATT 1 0 168032 CASAVA_Build 3 98028954 1I TTTTTGAGTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 7 8 168033 CASAVA_Build 3 98060657 4I TTTGATTACC ----/TCAT TCATTCATTC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 TCAT 3 4 168034 CASAVA_Build 3 98109042 1I CCTGTTATTA -/T TTTATAATTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 3 4 168035 CASAVA_Build 3 98203943 1D ATGAGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 2456 het 2456 ref 24 11 9 4 T 11 10 168036 CASAVA_Build 3 98208966 1I CGGTCCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1319 hom 23 4 12 7 T 11 12 168037 CASAVA_Build 3 98278860 1D ACTGCAGATG T/- TTGTGGAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 3 2 168038 CASAVA_Build 3 98306648 1I CCTTTGAATG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 T 8 9 168039 CASAVA_Build 3 98375628 1I ATGAGTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 11 12 168040 CASAVA_Build 3 98396776 16D CTGTTGTAAG TTACTTTTGTGTAACT/---------------- GTTTTTGATT 3070 het 3070 hom 27 13 14 2 TTACTTTTGTGTAACT 1 0 168041 CASAVA_Build 3 98396930 1I TTAACTTCAT -/C CCCAGCCCTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 C 3 4 168042 CASAVA_Build 3 98400060 1I GTGGCATACA -/T AGCACTCTGG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 0 1 168043 CASAVA_Build 3 98430113 2I ATATAAATGT --/TA TATATATATA 2985 het 2985 ref 22 9 7 6 TA 7 8 168044 CASAVA_Build 3 98489593 1D TAGGAGACGT A/- AAAAAAAAAA 1081 het 1081 ref 31 23 3 5 A 12 11 168045 CASAVA_Build 3 98568144 1D ACAATTACTG T/- TTTTTTTTTT 1704 het 1704 ref 61 47 4 10 T 11 10 168046 CASAVA_Build 3 98590918 1I TATTATCTCA -/T TTTTTCAATA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 5 6 168047 CASAVA_Build 3 98653127 1D AAGGATCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 31 3 17 11 A 17 16 168048 CASAVA_Build 3 98654304 2D AACACATATC CA/-- CACACACACA 3070 hom 51 het 26 0 17 9 CA 7 6 168049 CASAVA_Build 3 98672202 1I AGCATTTCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 9 10 168050 CASAVA_Build 3 98674490 5I CTTGAGAAAG -----/TAATA TAACTGTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 TAATA 0 1 168051 CASAVA_Build 3 98674870 1D CCAATTAAAA T/- TTTAATTAAA 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 T 4 3 168052 CASAVA_Build 3 98676678 1D GACAGGTTTA T/- GTTGTGGGTT 3070 het 3070 ref 37 23 11 5 T 1 0 168053 CASAVA_Build 3 98679328 16I ATTATCATGA ----------------/AGTTATATACAATTTC AGGACAATCT 3035 het 3035 ref 44 29 8 7 AGTTATATACAATTTC 0 1 168054 CASAVA_Build 3 98679649 1D TTTACAATAG A/- AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 29 19 10 0 A 7 6 168055 CASAVA_Build 3 98680132 1D GAAAAAAAAA T/- ATTTTGAAGT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 1 0 168056 CASAVA_Build 3 98680437 1I ATAAAACTGC -/T TGAACCATCC 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 1 2 168057 CASAVA_Build 3 98680992 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 A 10 9 168058 CASAVA_Build 3 98693705 1D TTGCTTTGCA C/- CCCCTAATGA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 C 5 4 168059 CASAVA_Build 3 98712760 1D CTGGGGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2820 hom 29 13 11 5 A 12 11 168060 CASAVA_Build 3 98719988 1D GACATACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 15 13 T 11 10 168061 CASAVA_Build 3 98725692 2I GTAGTTATTT --/TG TGTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 TG 1 2 168062 CASAVA_Build 3 98728018 1D CAGTGGCAGT G/- GGGGGGTGAG 3070 hom 133 het 54 0 40 14 G 7 6 168063 CASAVA_Build 3 98731125 4I TCAATCACAT ----/AATA AATCAGTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AATA 0 1 168064 CASAVA_Build 3 98736796 1D TGACCTCTAC T/- TAGCCACATT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 T 2 1 168065 CASAVA_Build 3 98743262 2D CTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1743 het 1743 ref 27 17 8 2 T 13 11 168066 CASAVA_Build 3 98743629 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 11 8 T 13 12 168067 CASAVA_Build 3 98765750 3D TTGTAAAAAC ATT/--- ATTTATTATT 3070 het 3070 ref 28 13 14 4 ATT 2 1 168068 CASAVA_Build 3 98773207 1I CATAATGAAA -/C CTCTTTCCTG 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 C 1 2 168069 CASAVA_Build 3 98777821 1I TGTTTATTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 8 9 168070 CASAVA_Build 3 98778350 1I TGTATAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 9 10 168071 CASAVA_Build 3 98793987 4D AGTTGATTTT ATAA/---- ATTTATGGAG 3070 het 3070 ref 44 21 15 9 ATAA 1 0 168072 CASAVA_Build 3 98816043 1I TAATTTTTTT -/A TTTTTTTTTT 55 het 55 ref 15 7 1 7 A 0 1 168073 CASAVA_Build 3 98820693 3D AACTAAAAAC AAA/--- AACCACATGA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 5 2 168074 CASAVA_Build 3 98824490 1I GGTTGCTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 T 9 10 168075 CASAVA_Build 3 98844423 1D CAGGAGAACT C/- TCCCCAATCT 2421 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 0 168076 CASAVA_Build 3 98849921 1I TACACCCAAC -/A TGGAGATAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 0 1 168077 CASAVA_Build 3 98862840 2D CTTGGAGTTG TC/-- TCAAGTCCCT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 TC 2 1 168078 CASAVA_Build 3 98929605 4I TAGCTTTAGA ----/ACTT ACTTATGATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 ACTT 1 2 168079 CASAVA_Build 3 98929800 1I AGAAATTTCA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 6 7 168080 CASAVA_Build 3 98931245 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 306 hom 34 1 30 3 T 9 10 168081 CASAVA_Build 3 98939693 1D ATAATACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 43 1 35 7 T 11 10 168082 CASAVA_Build 3 98940964 2D CAGAGTAGTA AG/-- AGGGGAAGAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AG 2 1 168083 CASAVA_Build 3 98976994 1I CCTTTTCAGG -/T TTTTTTTTTT 2965 het 2965 ref 36 19 10 7 T 10 11 168084 CASAVA_Build 3 98986858 4I ATTACATAAA ----/TAAT TTGTACCAAA 736 het 736 ref 16 4 3 9 TAAT 0 1 168085 CASAVA_Build 3 98986983 2D TATCTGAGTT TG/-- TGTGTGTTTA 3070 het 1465 hom 16 4 9 3 TG 4 3 168086 CASAVA_Build 3 98991461 1I CTGATAAATT -/A AAAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 3 4 168087 CASAVA_Build 3 99014131 2D ATTTTTTTTT TG/-- TTTGTTTGTT 1028 het 1028 ref 20 10 5 5 TG 1 0 168088 CASAVA_Build 3 99015838 1I TTATTATAAG -/T TTGAATTATT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 2 3 168089 CASAVA_Build 3 99029318 2D GTAGGTAATC AA/-- AAGTCTCACA 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 A 4 2 168090 CASAVA_Build 3 99030363 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2837 het 896 hom 23 6 12 5 A 17 16 168091 CASAVA_Build 3 99055386 2I ATTTTTTCAC --/AT GTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 AT 0 1 168092 CASAVA_Build 3 99063625 1I GAGAAACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 T 10 11 168093 CASAVA_Build 3 99064313 3D GTCTCTAGAA TCT/--- GGCTGGTGAC 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 TCT 1 0 168094 CASAVA_Build 3 99095908 2I TCTGCAAGAG --/AA AAAGATGTGA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 3 5 168095 CASAVA_Build 3 99101688 1D TCGACACCAG C/- CTGAGCAACA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 C 2 1 168096 CASAVA_Build 3 99101941 5I TCAAAAAGAC -----/AACTA AGATTATGTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AACTA 0 1 168097 CASAVA_Build 3 99121249 1D TAAAATGATT A/- AAAAAAAAAA 2551 het 1986 hom 36 15 11 10 A 17 16 168098 CASAVA_Build 3 99123003 1I CATTCATGCC -/T TAAAAATATA 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 1 2 168099 CASAVA_Build 3 99127381 1D TGTATCATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 T 9 8 168100 CASAVA_Build 3 99136235 1D ACACTTGTAT A/- AATAGCTTAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 A 3 2 168101 CASAVA_Build 3 99139714 1D CATTTTCTAG T/- TGGAATAATA 3070 het 3070 hom 43 15 20 9 T 2 1 168102 CASAVA_Build 3 99145297 3I TTTGCAAACA ---/GAT GATGAGTAAT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 GAT 1 2 168103 CASAVA_Build 3 99148874 3D GACAGGAAAT CTC/--- CTCCTCTTGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 6 CTC 3 2 168104 CASAVA_Build 3 99166353 7I ACTTGGTAAA -------/CTCTAGC CTCTAGCCTG 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 CTCTAGC 1 2 168105 CASAVA_Build 3 99170376 4D TGAAAGACTT GTTA/---- TTTATAAATG 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 GTTA 1 0 168106 CASAVA_Build 3 99187394 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTTATT 1731 hom 21 het 9 0 8 1 T 9 7 168107 CASAVA_Build 3 99204257 1D AGTAGCAAGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 8 7 168108 CASAVA_Build 3 99210277 1D ACTTTTCCCC T/- GAACCTTCTC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 1 0 168109 CASAVA_Build 3 99213143 1I TCTGCAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 9 10 168110 CASAVA_Build 3 99214125 1I AAAAGAGACC -/A AAAAAAACCA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 7 8 168111 CASAVA_Build 3 99220644 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 26 0 14 12 A 11 10 168112 CASAVA_Build 3 99225218 1I GTCTCAGAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 7 8 168113 CASAVA_Build 3 99231649 1D ACTGTCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 20 1 14 5 A 15 14 168114 CASAVA_Build 3 99237059 1D TCCCCAAATG C/- CATACAGACT 3070 hom 129 het 45 0 41 4 C 2 1 168115 CASAVA_Build 3 99245874 4I CACTTCCTAT ----/TGAG TATTACTCCT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TGAG 0 1 168116 CASAVA_Build 3 99246273 2I TGTTTGGAAA --/GT GTATATTTTA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 GT 1 2 168117 CASAVA_Build 3 99247122 1I GCTCATAGCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 T 7 8 168118 CASAVA_Build 3 99247489 3D ATTATTCAAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 16 6 T 15 12 168119 CASAVA_Build 3 99248984 1I CCTGCCCTGG -/T TTTATATCCT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 3 4 168120 CASAVA_Build 3 99260488 1D ACTTGAAGAG T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 T 8 7 168121 CASAVA_Build 3 99263058 1D41M1I CTGAGTAAAA TTAAAAACTCTTTAATTCCATGGAATTGTGGGAATATGGGCT-/-TAAAAATTCTTTAATTCCATGGAATTGTGGGAATATGGGCTG AAGTCTCTAG 3070 het 3070 hom 37 17 29 8 N/A 0 0 168122 CASAVA_Build 3 99266257 1D TGCTTATCAA T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 T 7 6 168123 CASAVA_Build 3 99292479 1I GGGTTCTTTG -/T TTTTTTCTTG 2435 het 2435 ref 20 10 5 5 T 6 7 168124 CASAVA_Build 3 99293980 1D GGTGGATAAG C/- TTTTTGATGT 3070 het 1870 hom 11 4 7 0 C 1 0 168125 CASAVA_Build 3 99300936 4I5M11I TTGCAGCTCA ----AGCTG-----------/AGAGAGCTGTAATAAATTCC CATATTTGTC 3070 het 3070 ref 42 22 20 3 N/A 0 0 168126 CASAVA_Build 3 99301302 1I AATAAACTCA -/T TTTTTTTTTC 2395 het 2395 ref 26 18 5 3 T 9 10 168127 CASAVA_Build 3 99301468 14I TTGAATATGA --------------/GGGAGGGGACATGT GGGCCTAAGG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 GGGAGGGGACATGT 0 1 168128 CASAVA_Build 3 99301966 1I CCCATTCTTC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 T 7 8 168129 CASAVA_Build 3 99317774 9I GGTGAATCAA ---------/AGCCCTGAG AGCCCTGAGT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 AGCCCTGAG 1 2 168130 CASAVA_Build 3 99318328 1D TACCATAAGT A/- ATGAACCAAT 3070 het 3070 ref 53 25 23 5 A 2 1 168131 CASAVA_Build 3 99325189 1D GCATACACCT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 44 21 12 12 A 8 7 168132 CASAVA_Build 3 99328642 1I CTGTAGTTCT -/C CCAGGATGCC 3070 het 3070 ref 49 21 22 6 C 2 3 168133 CASAVA_Build 3 99343024 3I AAAAGAAAGA ---/AAG AAGAAGAAAG 2971 het 2795 hom 23 10 7 6 AAG 2 3 168134 CASAVA_Build 3 99344992 6D ACTTATCTTT CCTCTC/------ CCTCTCTTTA 3070 het 3070 hom 44 19 25 0 CCTCTC 2 1 168135 CASAVA_Build 3 99345386 1D TTCGCACTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 57 15 37 5 T 9 8 168136 CASAVA_Build 3 99346295 1I GAAACTGGAT -/G GGGGGCTATC 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 G 5 6 168137 CASAVA_Build 3 99354419 1D CCCATTTTGC T/- GGAGCCACCT 3070 het 3070 ref 46 25 20 1 T 1 0 168138 CASAVA_Build 3 99358838 1I TAAACTTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 T 9 10 168139 CASAVA_Build 3 99364938 2I CATCATCAGA --/AT ATTTTGTATT 1377 het 1377 ref 38 29 3 6 AT 1 2 168140 CASAVA_Build 3 99373150 1D TTATGGACAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 15 13 9 T 10 9 168141 CASAVA_Build 3 99375429 1D TTAAAATATT A/- AATGATTTAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 3 2 168142 CASAVA_Build 3 99375572 2I GAAAACTCAG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 8 10 168143 CASAVA_Build 3 99381897 2D AGAGCAGGCC CA/-- TATACACTGT 3070 het 3070 ref 39 22 12 7 CA 1 0 168144 CASAVA_Build 3 99381994 1I AAATAAATTC -/A ATTCTAGCCG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 1 2 168145 CASAVA_Build 3 99384704 1I ATTGACTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 9 10 168146 CASAVA_Build 3 99387112 1D CAGTGGAATT C/- ATTAAAGAGG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 C 1 0 168147 CASAVA_Build 3 99387638 3D AGGAAAATAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 4 T 13 10 168148 CASAVA_Build 3 99388887 1I TGTTTTAAGG -/A TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 A 0 1 168149 CASAVA_Build 3 99388974 1I AAGGAGTTCC -/A ATTAGGGTTG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 1 2 168150 CASAVA_Build 3 99390699 1I TAATTTTTTT -/C CTCCTTGTTT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 C 1 2 168151 CASAVA_Build 3 99391481 2I ATTTGCACTA --/TT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 8 10 168152 CASAVA_Build 3 99391666 3D TTTTAATATG CTT/--- CTTAAAATGT 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 CTT 2 1 168153 CASAVA_Build 3 99395550 1I ACTTTCCTTA -/C AATTCCTGCA 3070 het 3070 ref 27 17 7 3 C 0 1 168154 CASAVA_Build 3 99396736 1D TGACTGTTTC T/- TCTCTGATCA 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 T 2 1 168155 CASAVA_Build 3 99398689 1D CATAATGCCA T/- TGCAAATTTG 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 2 1 168156 CASAVA_Build 3 99399232 2I GGTTTTTTAT --/AC AGATTAACCT 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 AC 0 1 168157 CASAVA_Build 3 99400814 3I GGCCCTTACC ---/CTA AAAATTACTC 3070 het 3070 ref 54 34 15 5 CTA 0 1 168158 CASAVA_Build 3 99403049 5D GAGTAAGACA TAAAG/----- TATTTTTCAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 TAAAG 1 0 168159 CASAVA_Build 3 99403751 1I AGAGACTTAA -/G GGGGGCCCTG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 G 5 6 168160 CASAVA_Build 3 99408770 1D AAATATATGA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 T 7 6 168161 CASAVA_Build 3 99409387 14I TGCATCCGGC --------------/TATTAATCTTGTCA TATGTAGGTG 3070 het 3070 ref 22 12 10 2 TATTAATCTTGTCA 0 1 168162 CASAVA_Build 3 99410881 1D GAAAAACATG A/- AAAATGAGGA 3070 het 3070 ref 41 27 12 2 A 5 4 168163 CASAVA_Build 3 99411160 1I ATTCTTTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 9 10 168164 CASAVA_Build 3 99417302 1D TTTTTCTTTT C/- TTTTTTTAAA 3070 het 1535 hom 13 4 8 1 C 1 0 168165 CASAVA_Build 3 99417438 1I CTGTGCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 A 10 11 168166 CASAVA_Build 3 99417959 1I CTTTGCACTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 55 24 21 10 T 7 8 168167 CASAVA_Build 3 99420797 1I TTGGCTCCTG -/A AGGGAATCAG 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 A 1 2 168168 CASAVA_Build 3 99421270 12I ATGCCATGAA ------------/TTACTACCTGTG TTGTTGGCAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 TTACTACCTGTG 0 1 168169 CASAVA_Build 3 99422756 1D CATTAACCAC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 T 8 7 168170 CASAVA_Build 3 99424756 1I TATTTTATAG -/T ATTGTATGTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 0 1 168171 CASAVA_Build 3 99438607 1I TGAGTTTCTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 T 8 9 168172 CASAVA_Build 3 99439414 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 8 9 168173 CASAVA_Build 3 99452226 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 11 10 168174 CASAVA_Build 3 99459343 4D AATAAGCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 AAAT 5 4 168175 CASAVA_Build 3 99459465 3D TTTTTTTTTA ATT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 ATT 1 0 168176 CASAVA_Build 3 99460133 4I TTTTAGGATC ----/CTTT CTTTATCCTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CTTT 1 2 168177 CASAVA_Build 3 99461393 1I CTCAAACCAC -/A AGACACAATT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 1 2 168178 CASAVA_Build 3 99462769 1I15M1D TATCCTACCA -TTTTCCAAGAGGAAGT/CCTTTCCAAGAGGAAG- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 24 0 26 2 N/A 0 0 168179 CASAVA_Build 3 99466178 9D TTTTTTCCCT TGTAACCAC/--------- TGTAACCACA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 TGTAACCAC 2 1 168180 CASAVA_Build 3 99467382 2I TGTTATTGTG --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 8 10 168181 CASAVA_Build 3 99468902 30D GATTTATTGG TATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 3070 hom 57 het 17 0 20 5 TA 27 12 168182 CASAVA_Build 3 99469109 1D TTTTAAAAAA C/- CAACTTTTTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 2 1 168183 CASAVA_Build 3 99510285 2D GAATGATATT TC/-- TCTGTCTTTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TC 2 1 168184 CASAVA_Build 3 99534427 1I AGACAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 1776 het 1776 ref 31 19 5 7 A 13 14 168185 CASAVA_Build 3 99547955 1I TATTTAACAT -/A ATACTAAGCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 1 2 168186 CASAVA_Build 3 99556282 1D AAATGTTCTT A/- AAAAAATTAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 7 6 168187 CASAVA_Build 3 99558462 1I ACCTCATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1454 hom 44 5 29 10 T 13 14 168188 CASAVA_Build 3 99560883 1I TTTTTATTAA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 8 9 168189 CASAVA_Build 3 99593097 1I AAATATTATG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 7 8 168190 CASAVA_Build 3 99621946 1I ACACACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 20 1 16 3 A 10 11 168191 CASAVA_Build 3 99627513 1D ACAATAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 903 hom 30 5 16 10 A 17 16 168192 CASAVA_Build 3 99631186 1D CAAATATTGA T/- TTTTCAGAAG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 5 4 168193 CASAVA_Build 3 99634726 2I GCCAACAGAC --/TG TGAGAAAGAA 3070 hom 157 het 57 0 53 4 TG 1 2 168194 CASAVA_Build 3 99636715 2I ATTCAAGAGA --/TT TATATTGATC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 1 3 168195 CASAVA_Build 3 99638640 1D2M1D TAGATAAGTT GTGA/-TG- TAAGTGAAGG 3070 het 3070 ref 37 18 17 6 N/A 0 0 168196 CASAVA_Build 3 99650906 4I ACTAACACAG ----/AACA GAACAGAAAA 2382 het 578 hom 13 3 5 5 AACA 0 1 168197 CASAVA_Build 3 99655484 6I CTAGGTGAGA ------/TAAAAG TAAAGTAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TAAAAG 0 1 168198 CASAVA_Build 3 99667424 1D TAAATTTGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 178 hom 17 1 11 5 T 10 9 168199 CASAVA_Build 3 99673772 2I GGTTGGCTGG --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 51 21 28 2 CT 6 7 168200 CASAVA_Build 3 99677714 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 23 8 3 T 10 9 168201 CASAVA_Build 3 99684584 1D AGATAGTATC T/- TTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 T 6 5 168202 CASAVA_Build 3 99697433 1I ATATTATCAG -/T TTTTTTAATC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 6 7 168203 CASAVA_Build 3 99703183 2D TAACAAAAAA AG/-- AGATAAAATA 3070 het 3070 ref 32 18 13 3 AG 2 1 168204 CASAVA_Build 3 99707988 1I TGTGGCTGCA -/T TAACAAATGA 3070 het 3070 ref 47 30 17 0 T 1 2 168205 CASAVA_Build 3 99716106 1I ACCCCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 9 10 168206 CASAVA_Build 3 99729466 2I TTAGTTGCTT --/CA CATGCTCTTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 CA 1 2 168207 CASAVA_Build 3 99737459 3D CTGTCTCAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 162 hom 18 1 13 5 AAT 7 6 168208 CASAVA_Build 3 99738644 1I TATTTAAAGC -/T TTTTTTTTTT 2743 het 2743 ref 33 14 8 11 T 10 11 168209 CASAVA_Build 3 99749282 5D GATTTAAAGA TAATT/----- TAATTTAATT 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 TAATT 3 2 168210 CASAVA_Build 3 99766485 1D ACCACAACGG A/- AAAAAAAAAA 2243 het 359 hom 34 3 8 23 A 17 16 168211 CASAVA_Build 3 99771613 1D AAGAGTTAAT C/- ATTTTGTAGT 3070 het 3070 hom 17 7 8 3 C 1 0 168212 CASAVA_Build 3 99773232 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAGAAA 803 het 277 hom 12 3 6 5 AG 1 0 168213 CASAVA_Build 3 99775110 1D ACTCCCTGCC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 74 het 28 0 25 4 A 9 8 168214 CASAVA_Build 3 99781639 6I ATGCAGAGAT ------/TAAGAA TATTTCAAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TAAGAA 0 1 168215 CASAVA_Build 3 99789762 4I TCTCCCAACT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTTG 2 3 168216 CASAVA_Build 3 99793501 2D24M4D TATTCCATCC ATATATATATATATATATGTATATGGATAT/--ATATATATATATATATGTATATGG---- ATATATATAT 3070 het 80 hom 26 1 20 10 N/A 0 0 168217 CASAVA_Build 3 99807355 1I ACTCAGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 25 2 16 7 T 15 16 168218 CASAVA_Build 3 99815175 4I AGCTCCAGGT ----/AAGG AAGGTCAAAT 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 AAGG 1 2 168219 CASAVA_Build 3 99852135 1D ACTTCATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 25 2 14 10 A 17 16 168220 CASAVA_Build 3 99854917 2I AAAACATTGC --/AG AGAGACAGCT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 AG 2 3 168221 CASAVA_Build 3 99870476 1I TGACTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 26 1 10 15 T 15 16 168222 CASAVA_Build 3 99914184 1I TTGAGACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 722 hom 35 4 16 15 A 13 14 168223 CASAVA_Build 3 99973687 1I TATTCAGCAA -/G TATGTAAGTC 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 G 0 1 168224 CASAVA_Build 3 99975182 2I TTTCAGAATC --/AT GTGCTATTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AT 0 1 168225 CASAVA_Build 3 99984167 3I AGCTGGCCTC ---/TCT TCTTCTGAAA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 TCT 2 3 168226 CASAVA_Build 3 99984451 3I4M2D9M6D CAGAAGTGTT ---ACTCAGCTCAGTCTATTACTC/AAAACTC--CTGACCCTA------ AGTGGCTGCA 3070 hom 147 het 53 0 49 6 N/A 0 0 168227 CASAVA_Build 3 99990204 1I TTAAGTTGGG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 7 8 168228 CASAVA_Build 3 99991737 1D GTCTGTGTAT A/- TGCTGAAGGG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 1 0 168229 CASAVA_Build 3 99994208 2D GACCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1056 het 326 hom 16 3 4 9 T 18 16 168230 CASAVA_Build 3 99995965 4I AAATGAAGTT ----/TAAC TAACTTTATA 2220 het 2220 ref 15 7 6 2 TAAC 1 2 168231 CASAVA_Build 3 100010869 3D ACCTGCACCA TCT/--- TCTTTATTCC 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 TCT 2 1 168232 CASAVA_Build 3 100013692 4D ACCATTCTTA TAAC/---- TAACTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 TAAC 2 1 168233 CASAVA_Build 3 100017495 1I GGAAATATTT -/G GAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 19 3 15 1 G 1 2 168234 CASAVA_Build 3 100017507 1I AAAAAAAAGA -/G ACTACAATTT 3070 hom 23 het 20 0 15 5 G 0 1 168235 CASAVA_Build 3 100025176 5I TTCTGCTATG -----/AAGAA AAGTCATGCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAGAA 0 1 168236 CASAVA_Build 3 100027699 1I GGCTTTGGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 9 10 168237 CASAVA_Build 3 100037601 4I TGTGTGTGTA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 2295 hom 26 5 12 9 TG 5 7 168238 CASAVA_Build 3 100048410 1I TATGAGAACC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 7 8 168239 CASAVA_Build 3 100048750 14D CTACAAACAG TACACATGTTTTTA/-------------- TTAGATTCAG 3070 het 3070 ref 42 24 19 5 TACACATGTTTTTA 1 0 168240 CASAVA_Build 3 100049935 1D ATTCTAAGTC T/- TTGCTATTGA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 3 2 168241 CASAVA_Build 3 100051423 1I ATGAGGGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 19 7 A 10 11 168242 CASAVA_Build 3 100054865 1D AATCACAAGG A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 7 6 168243 CASAVA_Build 3 100069288 1D AGGGAATCAT G/- GAAAAGCATT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 G 2 1 168244 CASAVA_Build 3 100071657 2D TGTAGACGGT GA/-- GAGATAGGGA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 GA 3 2 168245 CASAVA_Build 3 100072191 2D AGATAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 2963 hom 26 11 10 5 AG 11 10 168246 CASAVA_Build 3 100072559 1I ATTCCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 15 25 10 T 11 12 168247 CASAVA_Build 3 100076786 1I AAATACAATC -/T TCACATAATT 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 1 2 168248 CASAVA_Build 3 100079126 2I AAAAGATATA --/AC ACAGGTACAT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 AC 1 2 168249 CASAVA_Build 3 100080028 1D AACATGATAT A/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 52 26 21 6 A 1 0 168250 CASAVA_Build 3 100086950 1D ACATATACAT A/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 56 22 29 6 A 1 0 168251 CASAVA_Build 3 100088726 1I GTTTTCAAGG -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 96 het 43 0 33 10 T 8 9 168252 CASAVA_Build 3 100107596 1D CCGTCTCATT A/- AAAAAAAAAA 1928 het 1906 hom 16 9 5 2 A 15 14 168253 CASAVA_Build 3 100111306 2I CGGAAGTGAT --/AA GAGGGCTATC 3070 hom 76 het 28 0 26 2 A 0 2 168254 CASAVA_Build 3 100113343 8D TTCTCACTTA TAAGTGGG/-------- AACTGAATGT 1801 het 1801 ref 22 15 4 5 TAAGTGGG 1 0 168255 CASAVA_Build 3 100119468 1I TGTGTTGCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 T 9 10 168256 CASAVA_Build 3 100123841 6D TTAATATCTT AAGATC/------ AGAAACAATC 3070 het 3070 ref 43 19 19 6 AAGATC 1 0 168257 CASAVA_Build 3 100130042 1D GCCAGACTGC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 52 het 21 0 16 5 T 9 8 168258 CASAVA_Build 3 100134727 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 8 7 168259 CASAVA_Build 3 100148997 2I8M3D AAGGGCTAGA --TTATGTAAAGC/TTTTACATAA--- TCTTTCTAAG 3070 het 3070 ref 52 30 22 0 N/A 0 0 168260 CASAVA_Build 3 100155327 1D TATTGACCGT G/- TGCAGAGAAG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 G 1 0 168261 CASAVA_Build 3 100155949 16D TGTTACATGC CAGTATACCCTGTCCT/---------------- CATACTAAAC 3070 het 3070 ref 29 21 11 2 CAGTATACCCTGTCCT 1 0 168262 CASAVA_Build 3 100175237 4D TTTTTACAAT TTAA/---- TTAACTAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 TTAA 2 1 168263 CASAVA_Build 3 100175458 1D TATTTCTCAC A/- GTTTTAGAAG 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 A 1 0 168264 CASAVA_Build 3 100176194 4D GGACTGAACT ACTA/---- ACTATCTGTT 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 ACTA 2 1 168265 CASAVA_Build 3 100184141 1I CTTTTCTCTT -/C CCCCAGCAGT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 C 4 5 168266 CASAVA_Build 3 100187551 1D ACAAGAAGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 9 8 168267 CASAVA_Build 3 100189908 1D ATAATAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 10 9 168268 CASAVA_Build 3 100190211 1D ACACTTTGGA G/- GCAGGGTTAT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 G 2 1 168269 CASAVA_Build 3 100192071 1D GAATTTCTAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 T 9 8 168270 CASAVA_Build 3 100203218 1D GGCAATATAC A/- AAAGAAAGAG 3070 het 2461 hom 18 6 11 1 A 4 3 168271 CASAVA_Build 3 100205747 1D AATTTACTCA T/- TTTCCTCTAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 4 3 168272 CASAVA_Build 3 100206393 1I GCTTAATGGC -/A GAGCATGTGG 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 A 0 1 168273 CASAVA_Build 3 100208195 1I TTTAAAATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 9 10 168274 CASAVA_Build 3 100209229 1D CACAACAGTC T/- TTGTATAGGA 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 T 3 2 168275 CASAVA_Build 3 100213000 2I TTTAAAGATT --/TC CATGGCCCTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 TC 0 1 168276 CASAVA_Build 3 100216761 2D23M4I TAAGCATCAC TTATAAAAGTGGTGCTTTTTGTGTC----/--ATAAAAGTGGTGCTTTTTGTGTCTGAG TAAGAATTTT 3070 het 3070 ref 23 17 12 0 N/A 0 0 168277 CASAVA_Build 3 100219732 4D TTGAAATAAT TTTC/---- TTTCTTTGGA 3070 het 3070 ref 30 15 13 5 TTTC 2 1 168278 CASAVA_Build 3 100221054 1I ATTTCTCCAA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 6 7 168279 CASAVA_Build 3 100228271 7D AGAGCCAAAG ACAAAGA/------- AGGGGAGGTG 3070 het 3070 ref 39 24 13 4 ACAAAGA 1 0 168280 CASAVA_Build 3 100229909 1I AGGTTAAAGA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 39 17 19 3 T 6 7 168281 CASAVA_Build 3 100235260 3D AGGACAGGTA CAG/--- CAGACACTTC 3070 het 3070 ref 46 20 21 6 CAG 2 1 168282 CASAVA_Build 3 100243548 11I TCTCACCTGA -----------/GCACTCCATCT GCTATTTGAA 3070 het 3070 ref 60 28 19 13 GCACTCCATCT 0 1 168283 CASAVA_Build 3 100245003 4I GAGAGAGATA ----/GAGT GAGTGCAATA 3070 het 3070 hom 52 24 25 3 GAGT 1 2 168284 CASAVA_Build 3 100246159 2D AAGAATCCAC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 A 10 8 168285 CASAVA_Build 3 100246682 9D CAACATAGTA CTGGAAGTG/--------- CTAGCCAGAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 5 CTGGAAGTG 1 0 168286 CASAVA_Build 3 100246969 1D AAAATGCCTA G/- AAATAAATTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 G 1 0 168287 CASAVA_Build 3 100247842 1D ACTCAACAAC G/- AAACCCCCCG 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 G 1 0 168288 CASAVA_Build 3 100250889 1D CAGCTTCTTC T/- ACCTCCAGCA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 1 0 168289 CASAVA_Build 3 100252024 2D67M1I ACCAGTTAGA ATATGTTAATACATATTCATAAGAAATTTATACTCAAATATTTCAATATTTAAAAATGATAGCATTAAA-/--ATGTTAATACATATTCATAAGAAATTTATACTCAAATATTTCAATATTTAAAAATGATAGCATTAAAT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 18 19 19 N/A 0 0 168290 CASAVA_Build 3 100269554 1I TTGGAATAGG -/C TAATGCAGTG 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 C 0 1 168291 CASAVA_Build 3 100291982 1I TCAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 12 10 15 A 11 12 168292 CASAVA_Build 3 100301346 1I CGGATATGTC -/T TTTTTTTTTT 3065 het 1269 hom 25 4 11 10 T 13 14 168293 CASAVA_Build 3 100304647 1D GAAAAACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 35 1 28 6 T 11 10 168294 CASAVA_Build 3 100313211 2D TGTGTGTAAC AT/-- ATGTTAATTT 3070 hom 129 het 44 0 44 1 AT 2 1 168295 CASAVA_Build 3 100314654 2D ATTTAAACAG AA/-- AAAAAAATGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 9 7 168296 CASAVA_Build 3 100318676 2I CCCTACTCTC --/AT GTTAGGAAAC 3070 hom 111 het 45 0 36 9 AT 0 1 168297 CASAVA_Build 3 100319956 1D GGTGGAGGAT G/- GACATCTGCA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 G 2 1 168298 CASAVA_Build 3 100323631 2I ACTTTGCTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 37 0 21 16 T 12 14 168299 CASAVA_Build 3 100326373 3I ATTATATTGA ---/TAT TATTTTGAGA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TAT 1 2 168300 CASAVA_Build 3 100329856 1D CTAGTACTAC A/- ACCATAGGAT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 2 1 168301 CASAVA_Build 3 100334544 8D TGAATGGGCA AAAACTGG/-------- AAAACTGGAA 1200 hom 7 het 4 0 3 1 AAAACTGG 2 1 168302 CASAVA_Build 3 100338726 1I TGCAAGCATC -/T TTTTCATATA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 4 5 168303 CASAVA_Build 3 100343999 1I GCACAGACTA -/C CCATAGGACA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 2 3 168304 CASAVA_Build 3 100346180 9D CAGCAACACA CTATAAGCC/--------- CTATAAGCCT 3070 hom 106 het 39 0 34 9 CTATAAGCC 2 1 168305 CASAVA_Build 3 100355773 1D TAAAACAAAT G/- AAAAAGACAG 3070 hom 111 het 38 0 37 1 G 1 0 168306 CASAVA_Build 3 100372553 1I GCCGTGGGCC -/T TTGCAACCCT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 2 3 168307 CASAVA_Build 3 100374801 1D CACAAGAAAT A/- ACTTGGCTGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 2 1 168308 CASAVA_Build 3 100380099 4I TAAATAACTT ----/AAAG AATGTATTTG 2808 hom 18 het 8 0 7 1 AAAG 0 1 168309 CASAVA_Build 3 100385122 1D TCTTTCTGCC T/- TTTTTGCTCA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 6 5 168310 CASAVA_Build 3 100387295 1D GCACCTTCAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 43 het 20 0 15 6 A 9 8 168311 CASAVA_Build 3 100396987 2I ACACTGATAC --/CA AAATCAAACA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CA 0 1 168312 CASAVA_Build 3 100404436 3I GTGGGTGGGG ---/GGA GGGTGGAGGG 3007 hom 18 het 7 0 7 0 GGA 0 1 168313 CASAVA_Build 3 100421584 1D TTTTTGGTAG T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 8 7 168314 CASAVA_Build 3 100433523 1D TCAAATTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 153 het 60 0 50 11 T 10 9 168315 CASAVA_Build 3 100436353 1D GATCTCATTC T/- TTTTTTATGG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 7 6 168316 CASAVA_Build 3 100443773 17D AAGACAAGTT AACAAGATAAAAGCATA/----------------- CCAAATATAT 3070 hom 108 het 39 0 37 4 AACAAGATAAAAGCATA 1 0 168317 CASAVA_Build 3 100460057 1D TGAAACACAC A/- AACAAAGCAA 3070 het 3070 ref 48 26 18 5 A 3 2 168318 CASAVA_Build 3 100462002 4I TTTTTATATT ----/AGTC AGGTTTCTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AGTC 0 1 168319 CASAVA_Build 3 100467000 1D TTTCATGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 27 1 21 5 T 11 10 168320 CASAVA_Build 3 100472990 17I ACTATGAGAA -----------------/ATAAATTTCTGTTGTTT ATAAGCTACC 3070 hom 129 het 46 0 44 4 ATAAATTTCTGTTGTTT 0 1 168321 CASAVA_Build 3 100478646 2D TCTGTTAAGA GT/-- TTTTATCATG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 GT 1 0 168322 CASAVA_Build 3 100479351 2D TATAACAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 29 0 18 12 T 18 16 168323 CASAVA_Build 3 100479475 1I ATCTACACAG -/A AAAAAACACC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 6 7 168324 CASAVA_Build 3 100482088 1I ACTCCCAAAA -/G TCAAGGATGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 0 1 168325 CASAVA_Build 3 100483570 3D GTCACGTTAC CAG/--- CTTCCATATT 3070 hom 60 het 22 0 20 3 CAG 1 0 168326 CASAVA_Build 3 100484004 2D GTCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 23 0 19 6 A 11 9 168327 CASAVA_Build 3 100490114 1D15M1I CTGAAAATCC TTTTTTTTTCTTTTTC-/-TTTTTTTTCTTTTTCT TTTTTTTTTT 1992 hom 45 het 21 0 15 6 N/A 0 0 168328 CASAVA_Build 3 100497181 4I TGAGCTAAAG ----/AATA AATGTTTGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AATA 0 1 168329 CASAVA_Build 3 100498119 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 636 hom 25 2 18 5 A 14 15 168330 CASAVA_Build 3 100499614 3I GAAATTGGAA ---/ATC ATCATTCTCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 ATC 1 2 168331 CASAVA_Build 3 100513332 1I CTCAAAAAAA -/C AAACAAGTGA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 0 1 168332 CASAVA_Build 3 100515408 2I AAATATAACA --/TC TGTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TC 0 1 168333 CASAVA_Build 3 100516295 35I GCTCAATGTG -----------------------------------/ACTTCAACGTTTTCTAAATGAAATTAAACCAACAA AAGGGGCCCC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 ACTTCAACGTTTTCTAAATGAAATTAAACCAACAA 0 1 168334 CASAVA_Build 3 100529171 1D TCTGGTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 15 14 168335 CASAVA_Build 3 100529990 2I TATTTATATA --/TG TATATATTTT 1980 hom 15 het 7 0 6 1 TG 0 1 168336 CASAVA_Build 3 100535937 1I AAAAAGAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 8 9 168337 CASAVA_Build 3 100536025 2D TGAATGGATT AA/-- AAAAAAAACG 3070 hom 28 het 26 0 12 14 A 10 8 168338 CASAVA_Build 3 100536564 1D CTAAATAATC T/- ATTGATTAAA 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 T 1 0 168339 CASAVA_Build 3 100542252 1I ATTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 9 10 168340 CASAVA_Build 3 100543343 1D AAATATTATT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 8 7 168341 CASAVA_Build 3 100549781 1I CAAACAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 9 10 168342 CASAVA_Build 3 100553353 1D TATTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 18 9 T 11 10 168343 CASAVA_Build 3 100566302 1I CTGTTGTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 T 9 10 168344 CASAVA_Build 3 100568126 3D ACACGATGTC TAT/--- TCACACAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 TAT 1 0 168345 CASAVA_Build 3 100569041 5I ACATTTAAAC -----/TTTTA TTTTACTTTC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 TTTTA 1 2 168346 CASAVA_Build 3 100586423 1D TTGCAATATA T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 T 7 6 168347 CASAVA_Build 3 100592376 1D TGTCAGCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 19 8 T 12 11 168348 CASAVA_Build 3 100594887 12D TGAGCTTCCC ATTGACACTGGT/------------ ATCCCTCTCC 3070 het 3070 hom 35 16 20 5 ATTGACACTGGT 1 0 168349 CASAVA_Build 3 100603683 1I TTAATGTCAT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 A 7 8 168350 CASAVA_Build 3 100604513 6I GTTGGTTTTG ------/GTTTTC GTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 GTTTTC 0 1 168351 CASAVA_Build 3 100604716 1I CATGTTTAAG -/A AGTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 1 2 168352 CASAVA_Build 3 100616093 1D TTGAAAGGAA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 8 7 168353 CASAVA_Build 3 100616553 2D AATTAAAAAA AT/-- AAAAAATAAA 2906 het 2906 ref 14 7 6 1 AT 1 0 168354 CASAVA_Build 3 100621415 1D GAGATAGGAG A/- AAACCACCTT 3070 het 3070 hom 39 18 20 3 A 4 3 168355 CASAVA_Build 3 100624174 1D CAGTTATAGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 A 9 8 168356 CASAVA_Build 3 100625516 1I AGTTCTACGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 T 8 9 168357 CASAVA_Build 3 100625575 1D CTTCTGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2933 hom 35 8 15 13 A 13 12 168358 CASAVA_Build 3 100626325 1D TTTCTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 13 12 168359 CASAVA_Build 3 100649501 1D TACATTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 13 12 168360 CASAVA_Build 3 100651270 5I TTGTTTTATT -----/TCATC TTAAGTTCCA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TCATC 0 1 168361 CASAVA_Build 3 100651977 2D ATGTTCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2597 hom 25 7 13 5 T 12 10 168362 CASAVA_Build 3 100658263 1D GCCTGTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 T 11 10 168363 CASAVA_Build 3 100660333 1I TTGAAAAAAA -/T GTCAATTTCT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 0 1 168364 CASAVA_Build 3 100669236 1I ACCGTCTGTT -/G GGAACAAGAT 3070 het 3070 hom 58 26 28 4 G 2 3 168365 CASAVA_Build 3 100719503 1D AGACCAACCT G/- GGCCAACATG 3070 hom 51 het 19 0 18 2 G 3 2 168366 CASAVA_Build 3 100736695 1D ATGAAGTCAG C/- CCAGGAGAGT 3070 hom 157 het 55 0 53 2 C 3 2 168367 CASAVA_Build 3 100749001 1D ACCTTCCCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 10 9 168368 CASAVA_Build 3 100749330 1I AGCATCAGGG -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 168369 CASAVA_Build 3 100749521 9I TAATTTACAA ---------/CATATCATT CATATCATTC 3070 hom 128 het 48 0 42 6 CATATCATT 1 2 168370 CASAVA_Build 3 100755255 2D CAGGATCATA TT/-- AGTGAAGCCA 3070 het 3070 ref 49 21 18 11 T 2 0 168371 CASAVA_Build 3 100761910 2I GGATTGGAAC --/AA AATTAGCCAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 2 4 168372 CASAVA_Build 3 100763390 1I CAAAGGCTTC -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 7 8 168373 CASAVA_Build 3 100776035 1I AACTATCGAC -/A GAGTATACAG 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 0 1 168374 CASAVA_Build 3 100780734 1D AGTCTCTGAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 8 7 168375 CASAVA_Build 3 100782228 5D AAAGCATTCT TTTAA/----- TTTATGTAAC 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 TTTAA 1 0 168376 CASAVA_Build 3 100787954 11I CTGCTTTTTA -----------/AGACAAGAAAT TGACTGCTGG 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 AGACAAGAAAT 0 1 168377 CASAVA_Build 3 100793566 2D TGAAAGAGAT AG/-- AGACACAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 AG 2 1 168378 CASAVA_Build 3 100802774 20D TTTCATCAAG TGTTTGTTTGTTTGTTTGTT/-------------------- TGTTTGTTTG 1942 het 1942 ref 34 14 5 18 TGTT 10 5 168379 CASAVA_Build 3 100805334 1D GCATCTGTTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 8 7 168380 CASAVA_Build 3 100808049 1I AAAGAACGGG -/T TTTTTTTTTT 2745 het 2745 ref 24 12 9 3 T 10 11 168381 CASAVA_Build 3 100809943 1I TCTAAAAAAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 7 8 168382 CASAVA_Build 3 100815301 1D AAAGTAAAAT G/- GGACAATCTC 2604 hom 15 het 6 0 6 0 G 3 2 168383 CASAVA_Build 3 100827102 1D GAATCCTCCC G/- GATCATGCCC 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 G 2 1 168384 CASAVA_Build 3 100827792 1D TCATATGTTA T/- TCCCCAGCCC 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 T 2 1 168385 CASAVA_Build 3 100837275 9I TATGTTGGCT ---------/GGATATTCA GGTTTGAAAG 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 GGATATTCA 0 1 168386 CASAVA_Build 3 100837373 1D CTTTCTGGTA T/- TTTTTTTTTT 1196 het 1196 ref 51 37 3 11 T 12 11 168387 CASAVA_Build 3 100865333 1D TTTTAATCTT A/- AATTTTTGTA 3070 het 3070 hom 46 17 23 7 A 3 2 168388 CASAVA_Build 3 100884400 1D AGCACTCAGT G/- GAGCACGAGC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 G 2 1 168389 CASAVA_Build 3 100923418 1D CAGCACTGGG T/- TTTTTTTTTT 1526 het 1526 ref 27 18 4 5 T 11 10 168390 CASAVA_Build 3 100946560 2D ATAAATGTAA GT/-- GTGAGGAGCA 3070 het 3070 ref 35 18 10 8 GT 2 1 168391 CASAVA_Build 3 100984472 1I TTAGAATTTC -/T TTTTTAGGGG 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 5 6 168392 CASAVA_Build 3 101005164 1D GAGTCAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 A 10 9 168393 CASAVA_Build 3 101018127 1D CGCTGTGGTG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 8 7 168394 CASAVA_Build 3 101018897 14D TCTTTCTGTG GGCGAGCCTTTCCA/-------------- GGCCAATTAC 3070 het 3070 ref 36 21 14 6 GGCGAGCCTTTCCA 1 0 168395 CASAVA_Build 3 101030763 1D GTTCCATTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 34 11 21 3 T 7 6 168396 CASAVA_Build 3 101034268 1I CCAGCTACTT -/G GGAGGCTAAG 2969 het 2969 ref 16 9 7 0 G 2 3 168397 CASAVA_Build 3 101056219 1I AATGTCTCCT -/G GGGGGGCAGT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 G 6 7 168398 CASAVA_Build 3 101061314 1I AAATTTTGGT -/A ATCAGGCCTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 168399 CASAVA_Build 3 101084565 5D TACATGAGAA ATTCT/----- ATTATAATTT 3070 het 3070 ref 38 18 17 6 ATTCT 1 0 168400 CASAVA_Build 3 101092263 1D CAATCCGCTG T/- TTTTTTTTTT 1877 het 1877 ref 35 24 4 7 T 11 10 168401 CASAVA_Build 3 101127114 1D GCAGTAGTTT A/- AAAAAAATTT 2673 het 2673 ref 25 15 7 4 A 8 7 168402 CASAVA_Build 3 101136800 1I TCAGGGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 973 hom 31 3 18 10 A 13 14 168403 CASAVA_Build 3 101163444 1D GAAGCACTGA G/- GGACCAAGTA 3070 het 3070 ref 29 16 10 5 G 3 2 168404 CASAVA_Build 3 101170503 1I AAGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 67 het 29 0 23 6 A 9 10 168405 CASAVA_Build 3 101230958 4D AATAAAAAGC TAAA/---- TAGTCATTCA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 TAAA 1 0 168406 CASAVA_Build 3 101265266 1D AGGTTGCAAG A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 A 7 6 168407 CASAVA_Build 3 101267219 5D CAAATGACAC TTGAT/----- TTGTTTTCCT 3070 het 3070 ref 57 29 23 8 TTGAT 1 0 168408 CASAVA_Build 3 101271974 1D GGACTTGAAT A/- TTAAATAATG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 1 0 168409 CASAVA_Build 3 101276595 1D AATTGCTTAT A/- TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 1 0 168410 CASAVA_Build 3 101281858 1D TAAGAGGGGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 A 9 8 168411 CASAVA_Build 3 101289928 3D AATGAGTAAG TTA/--- TTATTGTCAG 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 TTA 2 1 168412 CASAVA_Build 3 101326437 2I TCAGATCCCC --/CT GTTTTCAGTC 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 CT 0 1 168413 CASAVA_Build 3 101333761 1D CAAAGAAAGA C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 hom 37 13 18 8 C 5 4 168414 CASAVA_Build 3 101381136 5D AAGGAGTGGG CTCCC/----- AAGGCCTTAG 3070 het 3070 ref 40 27 11 3 CTCCC 1 0 168415 CASAVA_Build 3 101384772 1D CTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1119 het 1119 ref 27 18 3 6 T 13 12 168416 CASAVA_Build 3 101390120 2I AAGTAGCATG --/TA TATACTACAA 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 TA 2 3 168417 CASAVA_Build 3 101394693 1I ATAAATTACC -/A AAAAAAAAAA 2583 het 1949 hom 18 5 8 5 A 10 11 168418 CASAVA_Build 3 101394822 1D GATTTGCTGT A/- AAAATCACGT 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 A 5 4 168419 CASAVA_Build 3 101398322 6D AAAAAAAAAA AAATTC/------ AAAAATTAAA 133 het 133 ref 24 18 3 4 AAATTC 1 0 168420 CASAVA_Build 3 101407513 1D TGCTCCCAAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 8 7 168421 CASAVA_Build 3 101424525 1I CAGGATACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 T 10 11 168422 CASAVA_Build 3 101427839 1D TGACTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2782 het 2058 hom 35 14 10 12 A 17 16 168423 CASAVA_Build 3 101463201 1D CGATTTCTGA G/- CTTTGGATGC 3070 het 3070 hom 47 20 26 1 G 1 0 168424 CASAVA_Build 3 101488036 2D ACATATCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 14 12 168425 CASAVA_Build 3 101497940 1D TTTTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 11 10 168426 CASAVA_Build 3 101499230 1I TTAGAATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2556 hom 32 7 19 6 T 10 11 168427 CASAVA_Build 3 101499417 1I GAAAGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 10 11 168428 CASAVA_Build 3 101499838 1D TATCTTTTTT C/- CATATTTCAG 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 C 2 1 168429 CASAVA_Build 3 101501493 2D CTACTAAGTA CT/-- CTCTGGATAT 3070 het 3070 ref 55 31 20 5 CT 3 2 168430 CASAVA_Build 3 101510729 2I AACAAAAAAC --/AA ACAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 A 1 3 168431 CASAVA_Build 3 101513319 1I AGCTGTTGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 8 9 168432 CASAVA_Build 3 101515459 1D ATTTTAACAT A/- AAACCAAATG 3070 het 3070 ref 36 16 18 2 A 4 3 168433 CASAVA_Build 3 101518616 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3010 het 1191 hom 22 8 8 6 A 17 16 168434 CASAVA_Build 3 101519235 4I TTTCTGTTAA ----/CTCT CTCTCTGAAT 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 CT 3 5 168435 CASAVA_Build 3 101520965 1I CTTATGATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 9 10 168436 CASAVA_Build 3 101533981 5I TCTCTCTCTC -----/TCTCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 TCTCT 0 1 168437 CASAVA_Build 3 101542209 5D GAACCTGGTG AATTC/----- AAGTTAAGCA 1954 het 1954 ref 29 20 6 4 AATTC 1 0 168438 CASAVA_Build 3 101575218 4I ATTCAACTAG ----/GTGC TCCAGTTAAG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 GTGC 0 1 168439 CASAVA_Build 3 101580729 1D GTAGAAGTAA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 8 7 168440 CASAVA_Build 3 101583465 1I AAGGTGAAGC -/T TGCCAGTCCC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 1 2 168441 CASAVA_Build 3 101597549 1D TGGTATCAGG T/- TTTTTTTTTT 1891 het 1006 hom 28 5 12 11 T 19 18 168442 CASAVA_Build 3 101599504 8I TCCAGACAAC --------/GTGGAAAA GTGGAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 GTGGAAAA 1 2 168443 CASAVA_Build 3 101604178 1I CAAGTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 1787 het 1787 ref 34 25 5 4 T 13 14 168444 CASAVA_Build 3 101649149 1D AAAAAGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 938 hom 21 6 12 3 A 10 9 168445 CASAVA_Build 3 101649633 4I TGTTTACCTA ----/GATT ATTTATGAAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 GATT 0 1 168446 CASAVA_Build 3 101650783 1D GCACTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 T 13 12 168447 CASAVA_Build 3 101654457 1D AAAATGCTTC T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 T 7 6 168448 CASAVA_Build 3 101657875 1D ACTTTCTTAT C/- CAGAAGTAAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 C 2 1 168449 CASAVA_Build 3 101670273 1I GAGAGGCCGT -/A AGATAACTTC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 1 2 168450 CASAVA_Build 3 101671051 1D CAACCATTCC A/- AATAGGAGAA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 A 3 2 168451 CASAVA_Build 3 101688991 2I TTTTTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 2025 het 142 hom 20 3 12 5 TC 0 1 168452 CASAVA_Build 3 101692178 15D AGAAGGATTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2102 het 2102 ref 24 18 6 7 T 27 12 168453 CASAVA_Build 3 101705784 1D ATATTTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 A 14 13 168454 CASAVA_Build 3 101706948 5D TCAGAAGAAG ATTTC/----- ATTGTCTTTT 3070 het 3070 ref 49 26 21 2 ATTTC 1 0 168455 CASAVA_Build 3 101736495 1D TGCTCAGCTC A/- GCTCTGCACT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 1 0 168456 CASAVA_Build 3 101739380 4D CACTGCATTT TGAC/---- TGTACATTGT 3070 het 3070 hom 51 21 27 4 TGAC 1 0 168457 CASAVA_Build 3 101739904 4D ACACAAAACA AAAC/---- AAACAGAAAG 3070 het 3070 ref 50 26 22 4 AAAC 2 1 168458 CASAVA_Build 3 101743503 1I GTACATGCAT -/G GTTTTATTTC 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 G 1 2 168459 CASAVA_Build 3 101751742 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAAAAAAT 2093 het 2093 ref 19 11 7 1 G 1 0 168460 CASAVA_Build 3 101759091 3D CATTTAATGG TTT/--- TTTTTTTTTC 3070 het 78 hom 35 2 19 14 T 12 9 168461 CASAVA_Build 3 101761796 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1142 het 1142 ref 48 15 4 29 T 13 12 168462 CASAVA_Build 3 101772900 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 23 7 12 4 T 8 9 168463 CASAVA_Build 3 101804598 1I CGAAAAGAAG -/A AAAATCAAAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 4 5 168464 CASAVA_Build 3 101804814 1D AAGAAGTAAA T/- TTGAAACTAA 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 T 3 2 168465 CASAVA_Build 3 101815073 1D CCCCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2136 hom 29 7 11 11 A 13 12 168466 CASAVA_Build 3 101823799 7D TCTATATTCA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 37 5 13 21 T 21 14 168467 CASAVA_Build 3 101827152 2D TTTTCAAAGG AA/-- ATGCTGCCCA 3070 het 3070 ref 25 11 12 4 A 3 1 168468 CASAVA_Build 3 101832658 1D TTATATAATT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 41 15 21 6 A 9 8 168469 CASAVA_Build 3 101836766 2I TTGTGAAATA --/CC ATAAAAATAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 C 0 2 168470 CASAVA_Build 3 101838180 1I TTTGTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 10 11 168471 CASAVA_Build 3 101845722 1I TTCAAAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 10 11 168472 CASAVA_Build 3 101849242 1I CCGGTGAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 89 het 38 0 30 8 A 8 9 168473 CASAVA_Build 3 101849850 3I AAATTGCATG ---/TAA ATTAAGAGCA 1597 hom 10 het 18 0 4 14 TAA 0 1 168474 CASAVA_Build 3 101850330 1D TTAACAACTT A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 A 7 6 168475 CASAVA_Build 3 101900188 1I GCCCAATAGC -/A CTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 0 1 168476 CASAVA_Build 3 101912638 1I CGTGACTCAA -/T TTTTTTTTTT 1836 het 1836 ref 29 16 6 7 T 15 16 168477 CASAVA_Build 3 101919114 1D TTCATCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 40 1 25 14 T 15 14 168478 CASAVA_Build 3 101921815 1D TGTTAAGTAT G/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 46 14 28 4 G 1 0 168479 CASAVA_Build 3 101927946 1D TCTGGCAACA C/- CCTCACAGAC 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 C 3 2 168480 CASAVA_Build 3 101938300 1D GTGTAGAAGT G/- TTTATTACAG 3070 het 3070 ref 48 35 11 3 G 1 0 168481 CASAVA_Build 3 101939620 1D AAACAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 28 10 A 13 12 168482 CASAVA_Build 3 101948877 1D CATTCAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 8 T 11 10 168483 CASAVA_Build 3 101950744 4I50M39I TTTAGGACAT ----AAACAAACAGTAGATATAATGGGGGTTGGTAGAGCCTGAATAAAACTTAG---------------------------------------/AAACAAACAAACAGTAGATATAATGGGGGTTGGTAGAGCCTGAATAAAACTTAGTGAGTGATTTTCCTTCTCAGATAAAAGGTATAGTTGATT TGATTTTCCT 3070 het 3070 ref 39 32 21 8 N/A 0 0 168484 CASAVA_Build 3 101951098 4I TGAATTAAAC ----/AGTT AGTTACAAAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AGTT 1 2 168485 CASAVA_Build 3 101958517 2D CATAGGTCTA AG/-- AGAAATGTCT 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 AG 2 1 168486 CASAVA_Build 3 101959090 2D CTTTTAAAAC AT/-- GTGAGGACTC 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 AT 1 0 168487 CASAVA_Build 3 101987583 1I GATCTCCATT -/C CAGTGCTCTC 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 C 1 2 168488 CASAVA_Build 3 102004290 2D TAAAACATAA CT/-- CTGTCCTGAC 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 CT 2 1 168489 CASAVA_Build 3 102013621 1D TCCATTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 23 23 7 T 10 9 168490 CASAVA_Build 3 102044936 2D AAAATTCTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2910 hom 42 10 16 17 GT 10 9 168491 CASAVA_Build 3 102077017 6D GCTTAATCTC GGCATA/------ GATTTCGAGA 3070 hom 114 het 39 0 39 1 GGCATA 1 0 168492 CASAVA_Build 3 102078360 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 10 0 8 3 A 13 12 168493 CASAVA_Build 3 102083211 1I CTCTAAATGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 9 10 168494 CASAVA_Build 3 102084758 4D AGGAAAGAAA TATT/---- TATCTGCTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 6 TATT 1 0 168495 CASAVA_Build 3 102086273 12I ATATCTAGGG ------------/ACCAAAGACAGC ACCAAATTCC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 ACCAAAGACAGC 0 1 168496 CASAVA_Build 3 102086524 1I AGAGCATGAG -/A AAACCGAGTG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 3 4 168497 CASAVA_Build 3 102092519 1I ACTGGTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 33 1 22 10 T 15 16 168498 CASAVA_Build 3 102098631 3D AAAGCACATT AAG/--- AAGTATGCAA 3070 hom 96 het 40 0 33 9 AAG 2 1 168499 CASAVA_Build 3 102107071 1D CTCTTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 229 hom 30 1 25 5 T 11 10 168500 CASAVA_Build 3 102111954 1D TAAAAAAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 20 0 18 4 A 10 9 168501 CASAVA_Build 3 102126971 3I TTATTTGACA ---/ACT GAGTCTCACT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 ACT 0 1 168502 CASAVA_Build 3 102127401 1D AACTTTAATC T/- TTTTTCTCTG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 6 5 168503 CASAVA_Build 3 102129030 5D CGTAATTTAT AAAGA/----- AAAGAGGTTT 3070 hom 93 het 36 0 31 8 AAAGA 2 1 168504 CASAVA_Build 3 102140919 1D AACCTGCCCC A/- ATAGTCATGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 2 1 168505 CASAVA_Build 3 102155154 1I AGAAATACTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 9 168506 CASAVA_Build 3 102160158 3D AAAGAAAACA AAC/--- AACCACCAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 AAC 2 1 168507 CASAVA_Build 3 102167041 1D TGAATAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 110 hom 30 2 24 4 A 13 12 168508 CASAVA_Build 3 102181099 1D TAACATCTGT G/- GTCCCTTTGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 2 1 168509 CASAVA_Build 3 102182778 1I CTTTTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1090 hom 42 4 35 3 A 11 12 168510 CASAVA_Build 3 102183710 16D AACAGCGTGG GAGAAACCACCCCCAT/---------------- GATCCAATCA 3070 hom 66 het 24 0 21 7 GAGAAACCACCCCCAT 1 0 168511 CASAVA_Build 3 102185680 1D CTGAGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 26 2 20 4 A 13 12 168512 CASAVA_Build 3 102203949 1I TATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 135 het 55 0 45 10 T 9 10 168513 CASAVA_Build 3 102204871 1D CCCCCACCCA C/- CAACAGGCTC 3070 hom 56 het 20 0 17 3 C 2 1 168514 CASAVA_Build 3 102213518 1D ATCATGTATT G/- GGGGGAACCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 6 5 168515 CASAVA_Build 3 102223355 2I AATCAAACCT --/GA GAGTCCTGCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 GA 1 2 168516 CASAVA_Build 3 102223492 1I ATTCTCCAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 8 9 168517 CASAVA_Build 3 102237069 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 11 10 168518 CASAVA_Build 3 102246753 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 9 8 168519 CASAVA_Build 3 102250982 1I TGTTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 10 11 168520 CASAVA_Build 3 102256783 1D ATCATTTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 44 hom 43 1 36 7 T 10 9 168521 CASAVA_Build 3 102264917 1D AATGCAAAGA T/- TTTTTCTCTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 6 5 168522 CASAVA_Build 3 102265269 1I CATTAAAAAA -/C AATATTATTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 168523 CASAVA_Build 3 102274912 5D CTTAGACTGA TAAAG/----- TAATTTTAAA 3070 hom 108 het 42 0 36 8 TAAAG 1 0 168524 CASAVA_Build 3 102277674 1I AAAGAAAAAA -/T CCCCCACAAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 0 1 168525 CASAVA_Build 3 102280629 1I TCATTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 46 2 36 8 A 10 11 168526 CASAVA_Build 3 102292805 3I AAAAATGGTA ---/AAG AAAAAATTAT 559 het 559 ref 27 22 4 1 AAG 0 1 168527 CASAVA_Build 3 102296801 1I GTAACAAAAG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 6 7 168528 CASAVA_Build 3 102300100 1I CCATAATCTC -/T TTTTTTTTTT 2935 hom 33 het 21 0 12 9 T 13 14 168529 CASAVA_Build 3 102303868 2I TAGTGATGGC --/AT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 AT 0 1 168530 CASAVA_Build 3 102308441 1D AAATTGGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 10 9 168531 CASAVA_Build 3 102308795 7D GTGAGTGTTG AGTGTTA/------- CAGTTAAAGA 3070 het 1551 hom 41 7 18 19 AGTGTTA 1 0 168532 CASAVA_Build 3 102309352 1I AGGCAGAGGG -/A GATTTCACAT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 0 1 168533 CASAVA_Build 3 102316095 1I TTTATCACCT -/A AAAGTTTACC 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 3 4 168534 CASAVA_Build 3 102317403 1D CTTAAAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 15 6 A 11 10 168535 CASAVA_Build 3 102318446 1D GTATTGAGTA T/- TAAAAAAACA 310 hom 10 het 27 0 4 23 T 2 1 168536 CASAVA_Build 3 102326769 4D AACCCATATA CTTG/---- CTTGCTGCCA 3070 hom 141 het 52 0 48 5 CTTG 2 1 168537 CASAVA_Build 3 102339534 1I TCCACTTGGC -/A AAAAAAAAAA 1323 het 1323 ref 26 16 4 6 A 15 16 168538 CASAVA_Build 3 102351836 1I CACTTATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 10 11 168539 CASAVA_Build 3 102353873 6D ATCTGAAACT TAAAAA/------ TAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 20 14 7 TAAAAA 2 1 168540 CASAVA_Build 3 102358585 2D GACTCAGATA TT/-- TTTATACACC 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 T 5 3 168541 CASAVA_Build 3 102363954 1D AGTCATATAG C/- CTTTTTTTTT 1130 het 1130 ref 31 17 4 10 C 2 1 168542 CASAVA_Build 3 102374301 1I AGAGTGATAT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 7 8 168543 CASAVA_Build 3 102375506 1I GAAATAAAGG -/A GTATTCAAAT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 0 1 168544 CASAVA_Build 3 102384033 1I CATAGTAAGA -/C CATTTCCTTA 3070 hom 63 het 29 0 18 11 C 1 2 168545 CASAVA_Build 3 102384189 2D ATGATTGCAC CA/-- CTACACTCCA 3070 het 3070 hom 37 10 20 7 CA 1 0 168546 CASAVA_Build 3 102386419 1I CATTTTGGGA -/G GCCAAGGCAG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 G 1 2 168547 CASAVA_Build 3 102388301 1I ACGGACTATA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 168548 CASAVA_Build 3 102389255 11D TCTGTTTCTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2448 het 943 hom 31 7 7 17 T 23 12 168549 CASAVA_Build 3 102390634 16D TGCATGGCCC CTTCCTTTATCTTCAA/---------------- CTTCCTTTAT 3070 hom 102 het 42 0 35 10 CTTCCTTTATCTTCAA 2 1 168550 CASAVA_Build 3 102393616 1D TTCCTTGTAA C/- CTAACTTCCC 3070 het 3070 ref 48 19 15 14 C 2 1 168551 CASAVA_Build 3 102394878 1D CACATCTTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 32 het 26 1 25 0 A 10 9 168552 CASAVA_Build 3 102395095 2I CAGCACCAAG --/GC GCATTGGATT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 GC 1 2 168553 CASAVA_Build 3 102395489 7I CATCAGTGAC -------/ACGTTTT ACGTTTTACG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 ACGTTTT 1 2 168554 CASAVA_Build 3 102398024 1I44M1D TAAATCCTCG -TTTTTTTTTTCTATCAGGCCCAAACATCAGTTTTTCTGACAACTG/TTTTTTTTTTTCTATCAGGCCCAAACATCAGTTTTTCTGACAACT- AAGTTTCCAT 3070 het 3070 ref 35 26 17 12 N/A 0 0 168555 CASAVA_Build 3 102399193 1I TACAAAAAAA -/G GATGTAGAAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 1 2 168556 CASAVA_Build 3 102399316 1I TTTAATGTGG -/T TACTAGAACA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 1 2 168557 CASAVA_Build 3 102401976 2I ACGAACACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 12 12 13 AC 8 9 168558 CASAVA_Build 3 102405541 1I TCTTTCAGAT -/C CCCAGATTTA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 C 3 4 168559 CASAVA_Build 3 102408895 5D TCAGATTAAC AAAGA/----- AGCTTTGGGG 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 AAAGA 1 0 168560 CASAVA_Build 3 102411592 2D TCCTTGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 6 T 13 11 168561 CASAVA_Build 3 102422255 1D GTGGACATAC A/- ATGTATGGAA 3070 het 3070 ref 46 23 17 7 A 2 1 168562 CASAVA_Build 3 102426946 16D CACACACATA CACGCACACACACATT/---------------- CACACATACA 3070 hom 83 het 31 0 27 12 CACGCACACACACATT 1 0 168563 CASAVA_Build 3 102433758 1I AGGATTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2076 het 2076 ref 20 9 6 5 T 10 11 168564 CASAVA_Build 3 102449137 1D GTCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 12 11 168565 CASAVA_Build 3 102464305 1I AAAGGATAAC -/A AAAAAAAAAA 1801 het 1801 ref 31 9 8 14 A 13 14 168566 CASAVA_Build 3 102469393 1I GGGAACCTTC -/T TTTTTTGGGA 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 T 6 7 168567 CASAVA_Build 3 102470155 2I GTAAATATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 AT 7 8 168568 CASAVA_Build 3 102470744 7I TCTCGTCTGC -------/CTTCAGG CTCCTATCAG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 CTTCAGG 0 1 168569 CASAVA_Build 3 102479536 1D TGAGAGGTCC A/- GGCGGGTCAA 2854 het 1581 hom 19 6 9 4 A 1 0 168570 CASAVA_Build 3 102486100 1I TATGAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 9 10 168571 CASAVA_Build 3 102509816 1I GACTCTGTGT -/G GGGGCCCCAA 3070 hom 32 het 13 0 11 2 G 4 5 168572 CASAVA_Build 3 102513560 1D CATCATATAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 A 9 8 168573 CASAVA_Build 3 102518630 13D GTGAGGGAGG TGGGCATTATAAA/------------- TGGTCATGAA 3070 het 3070 ref 40 25 16 1 TGGGCATTATAAA 1 0 168574 CASAVA_Build 3 102521713 3D AGATTAATAA AGT/--- AGTATTTGAT 3070 het 3070 ref 39 21 17 2 AGT 2 1 168575 CASAVA_Build 3 102526843 2I TGAAAAAAAA --/AT AAAGCAGAGT 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 AT 0 1 168576 CASAVA_Build 3 102528446 2I CTCTCTGGGC --/TA TATAGCTGGA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 TA 2 3 168577 CASAVA_Build 3 102532651 1D ACCTAGTGTA T/- TTTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 6 5 168578 CASAVA_Build 3 102537149 1I ACAATATCTG -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 6 7 168579 CASAVA_Build 3 102548440 1I CCATGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2251 hom 21 6 8 7 A 10 11 168580 CASAVA_Build 3 102549701 3I AGAATTATAT ---/AGA AGTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AGA 0 1 168581 CASAVA_Build 3 102560736 1D CTGTGCTTAC A/- CCTTATTTCA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 1 0 168582 CASAVA_Build 3 102562753 1I TCCGCCCCCC -/G CAAAAAAAAA 2630 het 1309 hom 21 9 9 3 G 0 1 168583 CASAVA_Build 3 102568374 5D TTAAATTCCT AAAAA/----- AAAGTAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 8 3 168584 CASAVA_Build 3 102589481 23D CTGACATGCA CTGTCTGGGAGCCTAGGCATAGG/----------------------- CCCACCCAGC 3070 het 3070 ref 56 37 12 17 CTGTCTGGGAGCCTAGGCATAGG 1 0 168585 CASAVA_Build 3 102591877 1D ACATTGACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 A 15 14 168586 CASAVA_Build 3 102592882 1D AACCAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 11 10 168587 CASAVA_Build 3 102595591 4I ACATATTATT ----/TCTA TCTAACTATA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 TCTA 1 2 168588 CASAVA_Build 3 102602268 1I TATGCCAATT -/A CCAGCACTAC 3070 hom 101 het 38 0 33 5 A 0 1 168589 CASAVA_Build 3 102604054 17D TACTTCAGAG GCTGAGGCAGGAGAATC/----------------- GCTTGAACCT 2560 het 2560 ref 17 9 8 0 GCTGAGGCAGGAGAATC 1 0 168590 CASAVA_Build 3 102621902 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1640 hom 22 5 9 8 A 11 12 168591 CASAVA_Build 3 102628018 1D AGAAATAAGA T/- TTTTTTTTTT 2577 het 626 hom 21 2 9 10 T 15 14 168592 CASAVA_Build 3 102629486 1I CAGTGTTTTG -/T TTTTCTCTTC 2907 het 2907 ref 16 10 6 0 T 4 5 168593 CASAVA_Build 3 102633318 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 8 9 168594 CASAVA_Build 3 102633407 1I AATACTAAAG -/A AAGCAGTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 2 3 168595 CASAVA_Build 3 102635514 2I GCTGCAGAAT --/AC ACATTCTTTT 3070 hom 113 het 43 0 38 5 AC 1 2 168596 CASAVA_Build 3 102636766 1D TCTTCATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 10 9 168597 CASAVA_Build 3 102644381 1I CCAGTCAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 A 10 11 168598 CASAVA_Build 3 102649341 1I AGCAAAGTTG -/T TAAGACCCAC 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 1 2 168599 CASAVA_Build 3 102650113 1I TTGTCTCAGA -/G GAGTAAGCGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 1 2 168600 CASAVA_Build 3 102657699 2D TATAAAAGAC AT/-- ATATATGTGT 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 AT 4 3 168601 CASAVA_Build 3 102679034 1I GATTTTAAGT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 8 9 168602 CASAVA_Build 3 102695162 3D TTTATTTTAC AAT/--- AATAAGATTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 2 AAT 2 1 168603 CASAVA_Build 3 102703113 6D GCTGGGCAAC ATGCTT/------ AGGGAACAGC 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 ATGCTT 1 0 168604 CASAVA_Build 3 102704456 1D TCTCAGATTT A/- AAAAAAAAAA 2865 het 2687 hom 20 11 7 2 A 16 15 168605 CASAVA_Build 3 102705975 1D CCTAGGCAAC G/- AGGGCAAAAT 3070 het 2071 hom 20 8 9 3 G 1 0 168606 CASAVA_Build 3 102709201 1D GGGGGAAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 10 9 168607 CASAVA_Build 3 102715990 2D ACAAATTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 680 hom 18 4 9 5 T 14 12 168608 CASAVA_Build 3 102716547 4I CTACAAAGAA ----/AATT AAAAACTAGC 3070 hom 71 het 28 0 18 10 AATT 0 1 168609 CASAVA_Build 3 102717321 1I TACTCGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 21 1 14 6 A 12 13 168610 CASAVA_Build 3 102718551 2D AAAATATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1946 hom 23 7 13 3 T 13 11 168611 CASAVA_Build 3 102727961 1D CTGCCTAGTG A/- AAGCTGTGAG 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 A 3 2 168612 CASAVA_Build 3 102729672 1D AGAGGATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 27 0 15 12 T 12 11 168613 CASAVA_Build 3 102730068 1D TTTAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3001 het 3001 ref 27 12 10 5 A 15 14 168614 CASAVA_Build 3 102746010 1D GGTTGGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 30 0 21 9 T 11 10 168615 CASAVA_Build 3 102748264 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1331 het 1331 ref 22 14 3 5 A 17 16 168616 CASAVA_Build 3 102750804 4D TACCCATGAC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 87 het 36 0 29 11 TA 9 7 168617 CASAVA_Build 3 102769415 1D AGATGGGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 9 168618 CASAVA_Build 3 102781722 3D ATTTTATCTC AAT/--- AAAGCTGTTA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AAT 1 0 168619 CASAVA_Build 3 102788619 9D ACCCCGTCTC TACTAAAAA/--------- TACAATATTA 946 het 946 ref 14 10 4 0 TACTAAAAA 1 0 168620 CASAVA_Build 3 102790945 1I ATGAGCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 28 0 17 11 T 13 14 168621 CASAVA_Build 3 102792246 1I ACCCGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 1388 het 1384 hom 20 5 4 11 T 11 12 168622 CASAVA_Build 3 102792913 6D CTTTTTCCTT TTCTTA/------ TTTAACTACC 3070 het 3070 ref 53 28 21 7 TTCTTA 1 0 168623 CASAVA_Build 3 102797935 1I TCAGACTTAC -/A AAAACATACT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 4 5 168624 CASAVA_Build 3 102800321 4D CGCCTCTGAT AATC/---- AATCTACTCT 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 AATC 2 1 168625 CASAVA_Build 3 102803362 1D TTGTTCAGAC T/- TTTTTTTTTT 2293 het 1921 hom 24 7 6 11 T 17 16 168626 CASAVA_Build 3 102804330 1D GAGGAAACAT G/- GCTGGGGAGG 3070 het 3070 hom 33 17 13 3 G 2 1 168627 CASAVA_Build 3 102808270 1I TTTTTGAGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 8 9 168628 CASAVA_Build 3 102808991 5I TAAATTAGTT -----/AAGAG AAGAAAGGAG 3070 hom 98 het 40 0 34 6 AAGAG 0 1 168629 CASAVA_Build 3 102809056 2I TTACCTGTGC --/TT TTTTTTTAAT 3070 hom 108 het 48 0 37 11 T 7 9 168630 CASAVA_Build 3 102812593 1D ATGTCTTTAA T/- TTTTTACTGG 3070 hom 18 het 10 0 7 3 T 6 5 168631 CASAVA_Build 3 102818246 8I TACAATTTTT --------/ATTTGTCA AGTTCAAGCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATTTGTCA 0 1 168632 CASAVA_Build 3 102820256 1I CTCTTGAACC -/T GGGAGGTGGA 3070 hom 62 het 28 0 20 8 T 0 1 168633 CASAVA_Build 3 102822891 1D CTTTGTCTCA G/- AATCAAAATT 3070 het 3070 hom 33 11 14 9 G 1 0 168634 CASAVA_Build 3 102824449 2D TTTGTCATCC TT/-- TTTTTTTTTT 1386 het 321 hom 21 4 5 12 T 20 18 168635 CASAVA_Build 3 102836439 3I CTCTGAAGAA ---/GAG GAGTTTTCCT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 GAG 1 2 168636 CASAVA_Build 3 102838619 1D CCTTAACTGT A/- ACTCTTCTTC 3070 hom 66 het 26 0 21 6 A 2 1 168637 CASAVA_Build 3 102847279 1I ACACACCAAG -/A AAAAAAGAGA 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 A 6 7 168638 CASAVA_Build 3 102876316 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2929 het 2929 ref 24 11 8 5 A 10 11 168639 CASAVA_Build 3 102882601 1D CTGTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 12 11 168640 CASAVA_Build 3 102885145 2D CAGTATTTAC CT/-- GTTTAATATT 3070 het 3070 ref 26 14 12 1 CT 1 0 168641 CASAVA_Build 3 102897434 2D28M3D GAAAAAGGAC ATATTGAGCCTTCATTTTCGCCTTGGAATTCTC/--ATTGAGCCTTCATTTTCGCCTTGGAATT--- CTGTTTGTAA 1859 het 1859 ref 34 41 5 1 N/A 0 0 168642 CASAVA_Build 3 102904718 3D ATTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 7 A 14 11 168643 CASAVA_Build 3 102907608 1D TTCTATATCC T/- TTTTTTTTTT 1387 het 1387 ref 30 20 3 7 T 12 11 168644 CASAVA_Build 3 102909126 3I TTTTTGGTTT ---/TTG TTGTTGTTTT 2118 het 14 hom 27 1 9 17 TTG 2 3 168645 CASAVA_Build 3 102925836 1D TTATTCACAA T/- TATCAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 2 1 168646 CASAVA_Build 3 102928822 4D TGTTTGAGAG TGTT/---- TGGCTGTCTA 3070 het 3070 ref 46 25 19 4 TGTT 1 0 168647 CASAVA_Build 3 102932109 1D CAAGTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 2773 het 1696 hom 24 8 8 8 T 17 16 168648 CASAVA_Build 3 102932490 1D GATGATTGAA T/- TTTTTTTTTT 2970 het 2970 ref 41 21 7 14 T 17 16 168649 CASAVA_Build 3 102977490 1I ATCAATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 150 hom 37 1 22 15 T 13 14 168650 CASAVA_Build 3 102998959 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2458 het 738 hom 12 2 9 1 T 12 11 168651 CASAVA_Build 3 103039026 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2384 het 86 hom 25 2 10 13 A 17 16 168652 CASAVA_Build 3 103058059 3I GAGAATAAAG ---/GTA GTGCTTTTTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GTA 0 1 168653 CASAVA_Build 3 103058720 23I ATGCAAAGGT -----------------------/ACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC ACACCAGAGT 3070 hom 120 het 41 0 41 4 ACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC 0 1 168654 CASAVA_Build 3 103059516 1I CCTAGAAATA -/T TTTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 4 5 168655 CASAVA_Build 3 103062813 1D TTAGATGCTT A/- AAAAAAAAAA 2409 het 2396 hom 30 13 10 7 A 16 15 168656 CASAVA_Build 3 103066117 1D TTATTTTTGA G/- GGGGAGTGTG 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 G 5 4 168657 CASAVA_Build 3 103066214 12D CATGCACCAC CACACCTGGCTA/------------ CACACCTGGC 3070 hom 27 het 12 0 9 5 CACACCTGGCTA 2 1 168658 CASAVA_Build 3 103082314 1D CCCCCATCTC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 8 7 168659 CASAVA_Build 3 103092148 2D TCAAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 4 A 12 10 168660 CASAVA_Build 3 103097232 1I ATTTTTTTTT -/G AGACAGGGTC 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 G 0 1 168661 CASAVA_Build 3 103097376 1I CATGCCCAGA -/T TAATTTTTGT 2689 het 1334 hom 12 3 6 3 T 1 2 168662 CASAVA_Build 3 103097850 30D CTGGTCTCAA ATTTCTGAGCTCAAATTATCCTGGTCTTGG/------------------------------ ATTCCTGAGC 2620 het 2620 ref 22 18 8 2 ATTTCTGAGCTCAAATTATCCTGGTCTTGG 1 0 168663 CASAVA_Build 3 103101101 5D GCATATAGCA TATAC/----- CTTATTATAT 3070 het 3070 ref 47 26 18 6 TATAC 1 0 168664 CASAVA_Build 3 103109719 1D TGGGAGGGTG T/- TATGTGTCCA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 2 1 168665 CASAVA_Build 3 103110380 1I AGCATTTGCC -/G AGGAGTGTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 0 1 168666 CASAVA_Build 3 103117699 2I TATTCCATTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TA 5 6 168667 CASAVA_Build 3 103127376 1D AAGTGAATGA G/- GGGGGTGGTG 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 G 6 5 168668 CASAVA_Build 3 103131888 1D TTTTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 13 12 168669 CASAVA_Build 3 103132469 3D GCTTTATGAT ATC/--- TTCTTCTTTG 3070 het 3070 hom 38 15 16 9 ATC 1 0 168670 CASAVA_Build 3 103134723 12D CTCACTCCTG TCTGACTGTTTA/------------ TCTGACTGTT 3070 hom 111 het 42 0 37 10 TCTGACTGTTTA 2 1 168671 CASAVA_Build 3 103137531 1I CCTAGCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 T 10 11 168672 CASAVA_Build 3 103139399 1D TTCTGTTTCT A/- ATCCACATGA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 2 1 168673 CASAVA_Build 3 103156814 15D CTGAATCAAT AGTACCCCAAACCTC/--------------- AGCATGACAC 3070 het 3070 ref 41 29 15 5 AGTACCCCAAACCTC 1 0 168674 CASAVA_Build 3 103161111 1D AATAGTCACA T/- TTATCAAATG 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 3 2 168675 CASAVA_Build 3 103163475 1I GCATGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 10 11 168676 CASAVA_Build 3 103169808 1D TATTTGATTC T/- TCTCTCTTTT 2923 hom 15 het 6 0 6 0 T 2 1 168677 CASAVA_Build 3 103179798 1D CTGTACAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 644 hom 38 2 30 6 T 13 12 168678 CASAVA_Build 3 103195849 1D TTATGAAGCC A/- AAAAAAGTAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 7 6 168679 CASAVA_Build 3 103203565 1I TCTGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 639 hom 35 4 20 11 A 13 14 168680 CASAVA_Build 3 103210978 1I TTAAAAAAAA -/T TAGATGAATG 3070 hom 35 het 16 0 12 4 T 1 2 168681 CASAVA_Build 3 103220986 4D TCTTTTCTGC TTGT/---- TTTAGTTTCT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TTGT 1 0 168682 CASAVA_Build 3 103226801 1D ACCTGTAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 46 1 39 9 A 10 9 168683 CASAVA_Build 3 103228890 3I AAGTATCAAG ---/ATA ATAAGTTTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATA 1 2 168684 CASAVA_Build 3 103230456 1D AGATAACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 11 10 168685 CASAVA_Build 3 103230645 1I AAACTTTTAG -/A AAAAACATAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 5 6 168686 CASAVA_Build 3 103239684 2I CCACATTCCC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 37 het 38 1 32 5 T 9 11 168687 CASAVA_Build 3 103240003 9D TTTTTCTTTC TTTGTTTCT/--------- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 4 TTTGTTTCT 1 0 168688 CASAVA_Build 3 103252025 1I CTATTTGGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 638 hom 36 2 28 6 T 9 10 168689 CASAVA_Build 3 103262013 4I TTAGAGAAAT ----/AGAA AGAGTTTATA 3070 hom 65 het 23 0 22 1 AGAA 0 1 168690 CASAVA_Build 3 103265175 1D ACTGCACAGT G/- GGGACACCTG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 G 4 3 168691 CASAVA_Build 3 103265756 2D TATGGATACC TG/-- TAAATACTTC 3070 hom 76 het 29 0 25 4 TG 1 0 168692 CASAVA_Build 3 103266287 18I2M8I TTCTTGTACC ------------------CA--------/ATTTGTACATGAAATGTACAATTCTTGT AACATTTCAT 3070 hom 96 het 29 0 33 2 N/A 0 0 168693 CASAVA_Build 3 103269015 3D CCAAGTAATC GTT/--- GTACAGGCCA 3070 hom 102 het 35 0 35 3 GTT 1 0 168694 CASAVA_Build 3 103282081 5I ATTCTCAGAG -----/AGATA AGAGAAGATA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AGATA 0 1 168695 CASAVA_Build 3 103290046 1D AAAATTTTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 T 9 8 168696 CASAVA_Build 3 103296487 4D ATAGCTTTTT AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 9 AATA 4 3 168697 CASAVA_Build 3 103381257 6D TACTCTGTGC GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 2240 het 670 hom 40 8 7 25 GT 12 9 168698 CASAVA_Build 3 103383744 3D GCAAATAATA AGG/--- AGATCAGTCT 3070 hom 141 het 50 0 48 3 AGG 1 0 168699 CASAVA_Build 3 103387435 1D AAAATTCATT A/- AAAAAATACA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 6 168700 CASAVA_Build 3 103388248 13D AAATAACATT AATTAAGTAGGGA/------------- CCAAATCAAG 3070 het 3070 hom 38 12 27 2 AATTAAGTAGGGA 1 0 168701 CASAVA_Build 3 103511633 3D ACAGAATATT GTA/--- GTAATCTCAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 GTA 2 1 168702 CASAVA_Build 3 103668476 1I TTCCTAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 8 5 A 9 10 168703 CASAVA_Build 3 103680017 29I TGTGAAAAGA -----------------------------/GAACATTATCATCAGCTCATAAGCATACT GTTCCTAGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 6 GAACATTATCATCAGCTCATAAGCATACT 0 1 168704 CASAVA_Build 3 103681703 2D GTGTTGGGAG AC/-- ACATTCTTGA 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 AC 2 1 168705 CASAVA_Build 3 103689285 4I GGGACCTGGT ----/GGGA GGTGATTGGA 3070 hom 109 het 42 0 35 7 GGGA 0 1 168706 CASAVA_Build 3 103696805 5D AAATTCTCAG TAAAC/----- TAAACTAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TAAAC 2 1 168707 CASAVA_Build 3 103697880 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1434 hom 15 4 10 1 A 10 11 168708 CASAVA_Build 3 103708786 3D GATAGTAATT GTA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 35 17 17 2 GTA 1 0 168709 CASAVA_Build 3 103728551 1I ATGCCATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3029 hom 41 12 14 15 T 17 18 168710 CASAVA_Build 3 103736565 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1963 hom 35 6 14 15 T 13 14 168711 CASAVA_Build 3 103749294 4I AAAAAGAAAC ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 2773 hom 25 8 11 6 AT 7 9 168712 CASAVA_Build 3 103752221 2I GTTTACTGTT --/CC CCCCCCCCGC 3070 het 3070 ref 43 17 20 6 C 8 10 168713 CASAVA_Build 3 103762606 1D TGTTGAAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 T 10 9 168714 CASAVA_Build 3 103765861 1D CCCTTTTCAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 9 8 168715 CASAVA_Build 3 103792200 12D ATTTGGAGGC ATAACAAAGAAT/------------ GTTATGCCAT 3070 het 3070 ref 33 22 7 5 ATAACAAAGAAT 1 0 168716 CASAVA_Build 3 103803240 1D CATTTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 T 12 11 168717 CASAVA_Build 3 103833818 1D AATAGGGTCT C/- GGTATGTTGG 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 C 1 0 168718 CASAVA_Build 3 103834279 4D CTTTTGTATT AGTC/---- AGCGTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 AGTC 1 0 168719 CASAVA_Build 3 103834825 1I CTATCTTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 86 het 32 0 29 3 T 9 10 168720 CASAVA_Build 3 103837275 1D AGTAACTTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 9 8 168721 CASAVA_Build 3 103851018 1D CTACTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 46 1 35 10 A 11 10 168722 CASAVA_Build 3 103851979 16D TAATTTCCTT AATCGTATGATGAATA/---------------- TACTATCTGC 3070 het 24 hom 35 1 20 16 AATCGTATGATGAATA 1 0 168723 CASAVA_Build 3 103860897 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2851 het 94 hom 31 3 15 15 T 16 15 168724 CASAVA_Build 3 103884689 1D TTCTTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 10 168725 CASAVA_Build 3 103889130 4I AGCAAGATTG ----/ATAT ATATATTCTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 AT 3 5 168726 CASAVA_Build 3 103894041 2D TTAGTCAGCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 35 0 23 12 T 13 11 168727 CASAVA_Build 3 103898176 4D AAGCTGAGAC ATGA/---- TCATGACACT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 ATGA 1 0 168728 CASAVA_Build 3 103910802 1I GTAATTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 32 1 28 3 T 10 11 168729 CASAVA_Build 3 103910928 1I TATCGCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 43 0 31 12 T 13 14 168730 CASAVA_Build 3 103917498 5D AGTAGCTAAC ATAAT/----- ATGTTAGAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 ATAAT 1 0 168731 CASAVA_Build 3 103920298 1I CTTTCTTTGG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 7 8 168732 CASAVA_Build 3 103928283 1D TAAGGAAGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 53 27 17 11 A 10 9 168733 CASAVA_Build 3 103930131 1D AAAACTTGCA T/- TTTTTTATTA 3070 hom 54 het 24 0 19 6 T 7 6 168734 CASAVA_Build 3 103932028 1I GAACCATCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 9 10 168735 CASAVA_Build 3 103944529 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1605 hom 21 5 11 5 T 14 13 168736 CASAVA_Build 3 103970893 1I CTTTTTAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 42 1 27 14 T 10 11 168737 CASAVA_Build 3 103982795 1D AATGGGATTG T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 7 6 168738 CASAVA_Build 3 104013213 4D TTACAGAATG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 42 het 23 0 15 8 TTTA 5 4 168739 CASAVA_Build 3 104027924 1I CTTTATTTAG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 8 9 168740 CASAVA_Build 3 104029561 1I CATACAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 35 1 30 4 A 11 12 168741 CASAVA_Build 3 104039584 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTGTTCT 3070 hom 51 het 18 0 18 1 TGTT 1 0 168742 CASAVA_Build 3 104041137 4D GTTTCTTAAT ACTG/---- AGTCCTAATT 923 het 923 ref 19 15 3 2 ACTG 1 0 168743 CASAVA_Build 3 104049008 1D CACCTATGAG C/- CTGTAAAATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 1 168744 CASAVA_Build 3 104050274 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 12 11 168745 CASAVA_Build 3 104054962 2I AAGTTCTAAC --/TT TACCCTAGGA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 1 3 168746 CASAVA_Build 3 104055379 1D TGGTTGCAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 168747 CASAVA_Build 3 104055714 4D CATGGCTCGG GGGC/---- GGGGGGGGCT 3070 hom 63 het 22 0 21 1 GGGC 1 0 168748 CASAVA_Build 3 104057941 2I TCATTCAACA --/TT TATTATTTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 3 168749 CASAVA_Build 3 104058544 1I TCTTCAGGTG -/T GTTTTGGTGA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 0 1 168750 CASAVA_Build 3 104058698 8I TCAAAATTTT --------/ATTATTTA ACTTCTTATG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ATTATTTA 0 1 168751 CASAVA_Build 3 104058844 1D GGTCAAGATA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 8 7 168752 CASAVA_Build 3 104059975 3I CTTATTTTTG ---/AAC AACATCTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AAC 1 2 168753 CASAVA_Build 3 104060810 1D GAAAGACTGG A/- ACTCATATTC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 2 1 168754 CASAVA_Build 3 104061897 1I GAAGACCTCT -/G ATATGCCCTG 3070 hom 66 het 23 0 22 1 G 0 1 168755 CASAVA_Build 3 104062573 1D TTAAGTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 11 10 168756 CASAVA_Build 3 104063395 1I CAGACACTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 168757 CASAVA_Build 3 104064204 5D TTTTTATTTC ATTTG/----- TTTTTTTTTT 776 hom 28 het 25 0 9 17 ATTTG 1 0 168758 CASAVA_Build 3 104066802 2I AAGCAGAAAC --/AG AAGTCATGAG 3070 hom 70 het 28 0 23 5 AG 0 1 168759 CASAVA_Build 3 104067310 3I AAAATATATG ---/ATT ATTTCAAATG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ATT 1 2 168760 CASAVA_Build 3 104070454 5I CAAGACTCAC -----/TTTAT TTTTACTTCT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TTTAT 0 1 168761 CASAVA_Build 3 104076170 2I GCAATCTAGG --/TT TTCTGTGCAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 4 168762 CASAVA_Build 3 104076603 1D GATTTTTTAA T/- TTAAAGTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 3 2 168763 CASAVA_Build 3 104078887 1D TTCATGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 9 T 11 10 168764 CASAVA_Build 3 104083249 1D AATCCTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 11 10 168765 CASAVA_Build 3 104083351 1D ATTTAACAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 10 9 168766 CASAVA_Build 3 104087880 1I AAAGTTATAT -/A AGAAGTATAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 2 168767 CASAVA_Build 3 104154971 1D GTATGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 13 12 168768 CASAVA_Build 3 104157386 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 29 4 9 16 T 17 16 168769 CASAVA_Build 3 104222734 1D AGACTATAAC A/- GAGCTGAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 1 0 168770 CASAVA_Build 3 104224447 1D GATATTAATG T/- TAACAGAAAA 3070 hom 102 het 40 0 34 7 T 2 1 168771 CASAVA_Build 3 104239433 1I GACATTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 10 168772 CASAVA_Build 3 104240097 1I AGCAAAAAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 9 168773 CASAVA_Build 3 104246221 1I GAGATTAGGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 73 het 30 0 25 5 T 7 8 168774 CASAVA_Build 3 104262955 1I CCTAAAAATA -/T TTATAAGGAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 2 3 168775 CASAVA_Build 3 104264227 6I AAAATTATTT ------/ATACTA TAAATATTAA 3070 het 2765 hom 23 7 13 3 ATACTA 0 1 168776 CASAVA_Build 3 104264332 2D ATAAAATATT AA/-- GTGTCAATTC 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 A 2 0 168777 CASAVA_Build 3 104267944 4I AACAAATAAT ----/CTAA CTAACAATTA 3070 het 3070 hom 43 13 26 4 CTAA 1 2 168778 CASAVA_Build 3 104274215 12D ACCCTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2581 het 1857 hom 16 7 8 6 A 22 10 168779 CASAVA_Build 3 104277251 1D TTCTGCCTTG A/- AACACAGATC 3070 het 3070 hom 62 28 28 6 A 3 2 168780 CASAVA_Build 3 104278182 1I CGCTTTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 9 10 168781 CASAVA_Build 3 104278529 1D CTCTTCCCCC T/- AATGCTCCCT 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 T 1 0 168782 CASAVA_Build 3 104282330 30D GAATGTGACA TAATTTATTTTACTCCTACTCTTTGGACTT/------------------------------ TAGTTTATTT 3070 het 3070 ref 35 20 15 4 TAATTTATTTTACTCCTACTCTTTGGACTT 1 0 168783 CASAVA_Build 3 104288132 1I TCTATATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 A 11 12 168784 CASAVA_Build 3 104288468 1I TAATGGGTGC -/A AGCACATGCC 3070 het 3070 ref 23 13 10 3 A 1 2 168785 CASAVA_Build 3 104290148 3I AATCCAGTTT ---/TAC TACTGGAATT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 TAC 1 2 168786 CASAVA_Build 3 104290804 2D CAACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 8 het 42 1 32 9 AC 9 8 168787 CASAVA_Build 3 104292286 1D15M14D CATTCTATGA TTTTTTTTTGTCCAAATTAACCATACCCAC/-TTTTTTTTGTCCAAA-------------- TTCTCCATAC 3070 het 2810 hom 34 10 14 25 N/A 0 0 168788 CASAVA_Build 3 104293922 3I TTACAAGAAT ---/ATA ATACTTTCAC 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 ATA 1 2 168789 CASAVA_Build 3 104294598 1D TTTCATTGTA T/- TAGATGTTTC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 2 1 168790 CASAVA_Build 3 104297071 4D ATGTTATTAT TAAG/---- TAAGGACTTA 3070 het 3070 ref 34 15 14 7 TAAG 2 1 168791 CASAVA_Build 3 104301543 1D TTTACTATTG T/- TTTTAATGAT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 5 4 168792 CASAVA_Build 3 104303224 3D TGCAGGTTTA TGT/--- TGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 19 11 6 TGT 2 1 168793 CASAVA_Build 3 104303874 2D CCCCAACACA AT/-- ATAAATATGA 3070 het 3070 ref 31 18 13 1 AT 2 1 168794 CASAVA_Build 3 104320383 16D AACACTGTTG GTGGTAATCTAAATTA/---------------- GTACAAGCAC 3070 het 3070 ref 31 14 14 6 GTGGTAATCTAAATTA 1 0 168795 CASAVA_Build 3 104321281 1D TTAAAATTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2683 hom 27 12 11 4 T 10 9 168796 CASAVA_Build 3 104322441 1I CATAGCAGAG -/T CCAACACTCC 3070 hom 105 het 46 0 33 13 T 0 1 168797 CASAVA_Build 3 104325196 1D AAAGATGAAG C/- AAACATCCCC 3070 het 3070 hom 44 18 19 8 C 1 0 168798 CASAVA_Build 3 104331868 1D AAACATATTG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 8 7 168799 CASAVA_Build 3 104337461 1D GAAAAAAATA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 9 8 168800 CASAVA_Build 3 104339006 1D TGGACACTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 26 4 15 8 T 13 12 168801 CASAVA_Build 3 104347149 2I35M2D CTGTGAATAT --AATAAGTCTGCTGGTAACATTTTACATTAAAAAAAAG/ACAATAAGTCTGCTGGTAACATTTTACATTAAAAAAA-- AGAGAGAATT 3070 het 3070 hom 51 23 29 10 N/A 0 0 168802 CASAVA_Build 3 104355053 2D TATGTGTCTG TA/-- TATATATATA 2490 het 2115 hom 18 8 6 4 TA 7 6 168803 CASAVA_Build 3 104355357 2I CATGCATAAC --/AT ATATATATAT 2305 het 2305 ref 13 6 5 2 AT 5 6 168804 CASAVA_Build 3 104357523 1I TACAATAGAT -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 6 7 168805 CASAVA_Build 3 104357805 1D TCCGTTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 269 hom 41 1 28 12 A 11 10 168806 CASAVA_Build 3 104371473 1I ATATATATAT -/C ATATATATAT 1061 het 861 hom 5 2 3 0 C 0 1 168807 CASAVA_Build 3 104396496 5I ACAGATATAA -----/AAAAC AAAACAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AAAAC 1 2 168808 CASAVA_Build 3 104398775 3I ACTAAAAATA ---/TGT TGTTAGGAGT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TGT 1 2 168809 CASAVA_Build 3 104399387 1I CAGATCTTTT -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 A 7 8 168810 CASAVA_Build 3 104419744 2D AGCTTTAAAT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 het 4 hom 23 1 16 7 G 12 10 168811 CASAVA_Build 3 104420202 4D AAAACGTTTT TTTA/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 TTTA 1 0 168812 CASAVA_Build 3 104420720 1I AACTAGCCTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 79 het 29 0 26 3 T 7 8 168813 CASAVA_Build 3 104421966 1D TTCAGACTGC A/- AAAACTGATG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 5 4 168814 CASAVA_Build 3 104428539 2I ATTCAAACAC --/TG TACTTTATTA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TG 0 1 168815 CASAVA_Build 3 104430218 2D AATTAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 30 0 17 14 A 13 11 168816 CASAVA_Build 3 104439241 18D CATGTCTAGA CTAATTTTTTTCTATTTT/------------------ CTGTACATTG 3070 het 1726 hom 28 8 12 15 CTAATTTTTTTCTATTTT 1 0 168817 CASAVA_Build 3 104442923 2D AATAAATAAC TG/-- AAACTTGAAA 3070 het 3070 ref 36 21 12 5 TG 1 0 168818 CASAVA_Build 3 104448317 1I ATACAATTCT -/A AATATTAATT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 2 3 168819 CASAVA_Build 3 104452495 1D TTATTTTATT A/- TTTTTTTTTT 1455 het 1455 ref 17 9 6 2 A 1 0 168820 CASAVA_Build 3 104462553 1I ATTAAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 10 11 168821 CASAVA_Build 3 104488633 1D CAATGTCTGG T/- TTTTTTTTTT 1482 het 1482 ref 27 14 9 4 T 12 11 168822 CASAVA_Build 3 104500690 1D TTTTGATCAA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 12 22 5 T 8 7 168823 CASAVA_Build 3 104503687 1D GGTTTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 11 12 T 13 12 168824 CASAVA_Build 3 104507654 1D ATAAGAGAGT G/- GCTGGGATGG 3070 het 3070 ref 45 22 17 8 G 2 1 168825 CASAVA_Build 3 104527477 1D GATGTCAATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 5 T 8 7 168826 CASAVA_Build 3 104533581 5D CTTTGGCAAT GACTA/----- GTCAACTTTC 3070 het 3070 ref 45 21 22 4 GACTA 1 0 168827 CASAVA_Build 3 104536553 7I GTCTTTGTTC -------/ATACAAA ATATCCAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 ATACAAA 0 1 168828 CASAVA_Build 3 104561388 4D CGTTTCTCCC TCAA/---- TCAAAGTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 TCAA 2 1 168829 CASAVA_Build 3 104578594 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2053 hom 28 7 13 8 A 12 11 168830 CASAVA_Build 3 104599128 1D ACAAATAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 A 9 8 168831 CASAVA_Build 3 104602052 1D TTAATTGCTC T/- GGCTAAGACT 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 T 1 0 168832 CASAVA_Build 3 104604762 3I AAATAAGATG ---/TGT TGAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 TGT 0 1 168833 CASAVA_Build 3 104624287 1D ATTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3044 hom 31 12 9 10 A 12 11 168834 CASAVA_Build 3 104627602 1I TAGTCCTATC -/T CTCATCCAAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 0 1 168835 CASAVA_Build 3 104631695 1I TCAATTATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 9 10 168836 CASAVA_Build 3 104632671 1I ATGCAGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 11 12 168837 CASAVA_Build 3 104634556 1D AACCTTAGGG T/- TTATCCTAAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 3 2 168838 CASAVA_Build 3 104634848 1D CATCTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2211 het 222 hom 15 3 7 5 A 14 13 168839 CASAVA_Build 3 104636347 1I ATAAAATTTA -/G GTTAACAAAG 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 G 1 2 168840 CASAVA_Build 3 104644341 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 950 het 950 ref 20 11 3 6 T 10 9 168841 CASAVA_Build 3 104653181 1I TAAAAATCAC -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 7 8 168842 CASAVA_Build 3 104653796 1I GGGAAGTCTG -/A AAAAAAAAAA 2549 het 2549 ref 26 11 6 9 A 10 11 168843 CASAVA_Build 3 104655010 4D CTTTGTGTGC TGCA/---- TCATGTGCCT 3070 het 3070 hom 53 24 26 4 TGCA 1 0 168844 CASAVA_Build 3 104673595 2D GTCAGTCCTC TT/-- TTCAATTAGG 3070 het 3070 hom 48 19 27 3 T 4 2 168845 CASAVA_Build 3 104699943 2I AGAAACAAAC --/AT AGAAGAGAAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 AT 0 1 168846 CASAVA_Build 3 104701007 1D GCCCAAACTG A/- AAAAAAAAAA 1431 het 1431 ref 20 15 3 3 A 12 11 168847 CASAVA_Build 3 104710583 2D CTTCTAAAAG AT/-- AGAATTATAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AT 1 0 168848 CASAVA_Build 3 104714170 4I TTATATAGGC ----/AAAG AAAGACAGAG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 AAAG 1 2 168849 CASAVA_Build 3 104715904 1I GGATGGTCTC -/G TTCTCCTGAC 3063 het 1326 hom 11 3 7 1 G 0 1 168850 CASAVA_Build 3 104718016 4I CATTTTAATG ----/TTAA TTATAGTCTT 3070 het 3070 ref 21 8 9 4 TTAA 0 1 168851 CASAVA_Build 3 104720568 1I TTTATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 19 20 9 A 10 11 168852 CASAVA_Build 3 104721860 1I AGCCAACATC -/A TACTCAATAG 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 0 1 168853 CASAVA_Build 3 104723098 1D CACACATATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 10 9 168854 CASAVA_Build 3 104740072 1D TTTACACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2487 hom 29 8 12 9 T 15 14 168855 CASAVA_Build 3 104770069 2I TTATAAACAA --/TT TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 7 9 168856 CASAVA_Build 3 104771279 2D ATAATTGCAC AT/-- AGTCACATAT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 AT 1 0 168857 CASAVA_Build 3 104771702 1I AAATATTCAT -/G AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 G 0 1 168858 CASAVA_Build 3 104778184 1D TAAAAGATGC A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 A 7 6 168859 CASAVA_Build 3 104778968 1D TTAAAAATAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 9 8 168860 CASAVA_Build 3 104779980 2D AACCTGACAG AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 10 8 168861 CASAVA_Build 3 104782326 2D ATGCATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 AT 6 5 168862 CASAVA_Build 3 104787448 5D GGGCTTTCAC TTAAG/----- TTAAGTGGCT 3070 het 3070 ref 28 17 8 5 TTAAG 2 1 168863 CASAVA_Build 3 104789210 1D4M3D GTGTGTGTGT GTGTGTCT/-TGTG--- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 N/A 0 0 168864 CASAVA_Build 3 104789680 4D TTGTGGAAGT TTGA/---- TTGTCTGTGA 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 TTGA 1 0 168865 CASAVA_Build 3 104796623 1D CCAAATGCTA T/- TACATAAAGT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 T 2 1 168866 CASAVA_Build 3 104796940 1D CAAACCTTAA T/- TCCTGAGGGG 1560 het 1560 ref 43 9 5 29 T 2 1 168867 CASAVA_Build 3 104798582 1D GGAGTAGAGA C/- CATGGACATT 3070 het 3070 ref 47 26 16 6 C 2 1 168868 CASAVA_Build 3 104799410 3I TGGACCAGTG ---/TGA TGATATCTTG 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 TGA 1 2 168869 CASAVA_Build 3 104801961 7D AAACAGTTTA TGCCAAG/------- GACTATCAGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 5 TGCCAAG 1 0 168870 CASAVA_Build 3 104803088 1I GTTTTAAATA -/T TTTTTAAGCG 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 5 6 168871 CASAVA_Build 3 104803916 7I TCCTTCAGAG -------/TGTTAAA TGTTAAATAT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 TGTTAAA 1 2 168872 CASAVA_Build 3 104805574 1D CAAACTGCCT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 1002 hom 38 12 21 5 G 11 10 168873 CASAVA_Build 3 104806189 3I TTCTGTAGTT ---/CTC CTTGTCGAGA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 CTC 0 1 168874 CASAVA_Build 3 104811568 2D59M2D GTAAGATAAC ATATATATATATATGACTAATTTACCTAGTCTTTAAAATGGGGATGAAAACATACATACCTCA/--ATATATATATATGACTAATTTACCTAGTCTTTAAAATGGGGATGAAAACATACATACCT-- CAGATTTACA 3070 het 3070 ref 14 14 7 1 N/A 0 0 168875 CASAVA_Build 3 104812198 3I ATTTAAATTT ---/AAA TAAAAAAAAT 2020 het 2020 ref 18 11 5 2 A 0 3 168876 CASAVA_Build 3 104812559 1I CTAAATGTGG -/T TTTTAAGATC 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 4 5 168877 CASAVA_Build 3 104813360 2D GCAAAAATGT GG/-- GGTAAAATCT 3070 het 3070 ref 48 23 24 1 G 4 2 168878 CASAVA_Build 3 104814401 1D CATCAGCATA C/- GATTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 29 11 5 C 1 0 168879 CASAVA_Build 3 104815541 3I GGAGCAGGAA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 AAT 3 4 168880 CASAVA_Build 3 104819225 4D CTGTCTTATG TTTC/---- TTTCAGCTGC 3070 het 3070 ref 43 20 22 3 TTTC 2 1 168881 CASAVA_Build 3 104820237 11I TCTAGCAGAG -----------/CAGTCCAACCT TAAAGCTCTA 3070 het 3070 hom 26 11 14 2 CAGTCCAACCT 0 1 168882 CASAVA_Build 3 104821353 1D TTGCAAGGAC A/- AAAAAACCAA 1407 hom 7 het 3 0 3 0 A 7 6 168883 CASAVA_Build 3 104827455 1I ATTTGCATAT -/G TTGAACCATC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 0 1 168884 CASAVA_Build 3 104828086 1D TCATTTTGTT G/- GGTCTTCTGT 3070 het 3070 hom 44 16 19 10 G 3 2 168885 CASAVA_Build 3 104829245 1I TTTGTTTTTT -/G GGGGTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 G 4 5 168886 CASAVA_Build 3 104830146 3I GAAAGTTTTC ---/TGT TGTTAATTTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 TGT 1 2 168887 CASAVA_Build 3 104831479 1I GAAACAAGTA -/T TTTTTTTTTT 2681 het 2681 ref 27 11 10 6 T 11 12 168888 CASAVA_Build 3 104835428 1I TGTAGTTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 14 21 0 T 8 9 168889 CASAVA_Build 3 104838906 1D TATCCATTGA C/- CCCCACTAGG 3070 het 3070 hom 45 22 18 6 C 5 4 168890 CASAVA_Build 3 104841932 1I TCTCACCCTT -/A ACCAGCTCCT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 1 2 168891 CASAVA_Build 3 104842780 1D TCAAAAAAAA C/- CTGTAGAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 C 2 1 168892 CASAVA_Build 3 104845341 1I TAAACAAATT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 7 8 168893 CASAVA_Build 3 104846037 1I ATGTTCTTAA -/T ATTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 T 0 1 168894 CASAVA_Build 3 104848756 1I AGGTTTGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 9 10 168895 CASAVA_Build 3 104849998 7D TGTTTGAGAA GAGTTCC/------- CAGTGTCTAC 3070 het 3070 ref 36 18 15 7 GAGTTCC 1 0 168896 CASAVA_Build 3 104851415 1D GTTAAAATGA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 8 7 168897 CASAVA_Build 3 104865767 3I GAAAAAAAAA ---/AAG AACAGAAAAG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 AAG 0 1 168898 CASAVA_Build 3 104866520 1I CATCTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 10 11 168899 CASAVA_Build 3 104870728 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 11 10 168900 CASAVA_Build 3 104872554 13I AGGCATTTGG -------------/TTGCACTCCATGC TTCAGCTGAC 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 TTGCACTCCATGC 0 1 168901 CASAVA_Build 3 104875265 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 1076 het 1076 ref 13 6 6 1 AC 9 8 168902 CASAVA_Build 3 104880433 1D TGCCCTTTTC T/- TCCTCTACAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 2 1 168903 CASAVA_Build 3 104903502 1I CCCTAAAAAT -/A AGCATGAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 A 1 2 168904 CASAVA_Build 3 104905483 1I CCAACTGAGA -/C CTCCTTTTGC 3070 het 2714 hom 20 8 9 3 C 1 2 168905 CASAVA_Build 3 104906961 1I ATCCAATGAC -/T TTTACATCTT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 3 4 168906 CASAVA_Build 3 104908122 2D CTCCTCGGTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 14 7 T 11 9 168907 CASAVA_Build 3 104912755 3I CAGAATCTAC ---/AAT GAACCCAAAC 3070 het 2697 hom 19 6 10 3 AAT 0 1 168908 CASAVA_Build 3 104916986 2I GCATAATGTC --/CT CCAGGTTTAT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 CT 0 1 168909 CASAVA_Build 3 104918830 4I CTATTTTATT ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 GA 5 7 168910 CASAVA_Build 3 104936223 1D TAAAAAATAA T/- TTTTTATTAA 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 T 6 5 168911 CASAVA_Build 3 104937370 1I ACCTGAATTG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 8 9 168912 CASAVA_Build 3 104937537 1D AATACTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 11 10 168913 CASAVA_Build 3 104944070 2I ACATACACAC --/AT GTGCACACAC 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 AT 0 1 168914 CASAVA_Build 3 104950105 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 1412 het 1412 ref 23 7 11 5 A 9 10 168915 CASAVA_Build 3 104951269 3D TTTATCTAGA TTG/--- TTTCAATAGT 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 TTG 1 0 168916 CASAVA_Build 3 104954849 3D ACATTGAAAT AAC/--- TATTATAATT 3070 het 2862 hom 18 8 8 3 AAC 1 0 168917 CASAVA_Build 3 104957816 1D GAGAGTGTAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 9 8 168918 CASAVA_Build 3 104962516 1I AATACAAAAC -/A AAAACAAAAA 2357 het 772 hom 12 3 7 2 A 4 5 168919 CASAVA_Build 3 104966893 1I CTTTTGTCTC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 41 16 18 7 T 7 8 168920 CASAVA_Build 3 104967055 1I GGTTCACCTC -/A AAAGCAACTT 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 A 3 4 168921 CASAVA_Build 3 104967896 8D GATATGTGTG TGTATATA/-------- TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 22 9 2 TGTATATA 1 0 168922 CASAVA_Build 3 104968946 1D CTGATTGTAG A/- CATGGGTAAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 1 0 168923 CASAVA_Build 3 104977417 5D ACATGGCAAA ACCCT/----- ACCTTTAATA 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 ACCCT 1 0 168924 CASAVA_Build 3 105001647 1D TATTTCTCTT C/- CGTTTATATT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 C 2 1 168925 CASAVA_Build 3 105046251 1D ACCTTTAACA T/- TTTTTTTTTT 2212 het 2212 ref 46 37 5 4 T 11 10 168926 CASAVA_Build 3 105058563 1I CATCAATAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 6 7 168927 CASAVA_Build 3 105110380 1I TTGTTTATGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 295 hom 28 1 20 7 T 8 9 168928 CASAVA_Build 3 105166747 1I ATTGTTACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 727 hom 23 3 16 4 A 14 15 168929 CASAVA_Build 3 105174767 4D GGATCATTAT TTTA/---- TTTATTAATG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 TTTA 2 1 168930 CASAVA_Build 3 105184329 1D TCTGTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 965 hom 31 3 27 1 A 12 11 168931 CASAVA_Build 3 105191489 1I TCTCTATTGT -/A AAAAAACCAA 3070 het 3070 hom 45 15 20 10 A 6 7 168932 CASAVA_Build 3 105192003 1I CTTTCCAGGA -/G GGTTCAAACA 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 G 2 3 168933 CASAVA_Build 3 105192230 1I CTCAAGGTGG -/A AAAGGGAGGT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 3 4 168934 CASAVA_Build 3 105201373 1I TGCAATTACA -/T TTCTTATTAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 168935 CASAVA_Build 3 105202323 1I GCAAGCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3016 hom 37 8 19 10 T 14 15 168936 CASAVA_Build 3 105207558 10D3M1I TTTAGCTAGT TTCATCACTAGCT-/----------GATG AAACTGGATG 3070 het 3070 ref 29 17 12 1 N/A 0 0 168937 CASAVA_Build 3 105208760 1I ATTTTATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 16 0 10 6 T 10 11 168938 CASAVA_Build 3 105212583 1D GGTAGTTTAT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 8 7 168939 CASAVA_Build 3 105213955 7D TTAGTGATAT CGCTATG/------- CGCTATGCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 CGCTATG 2 1 168940 CASAVA_Build 3 105225287 1I GTCAGAATGG -/A AAAAAAAAAA 2993 het 2993 ref 27 14 8 5 A 10 11 168941 CASAVA_Build 3 105237470 1D GAACAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2476 hom 30 9 13 8 A 13 12 168942 CASAVA_Build 3 105245519 1I CTATTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 10 11 168943 CASAVA_Build 3 105248885 1I CACTAATAGA -/T TTTTCTAGTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 4 5 168944 CASAVA_Build 3 105254102 1D AGCAAGGGAA G/- GGAGAACATC 3070 het 3070 hom 43 16 21 8 G 3 2 168945 CASAVA_Build 3 105261448 11I TCCTGCAGCA -----------/TTAAATTAAAC TTATTTGTTG 2567 het 2567 ref 35 15 6 14 TTAAATTAAAC 0 1 168946 CASAVA_Build 3 105261468 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2532 het 2532 ref 33 15 8 10 T 11 10 168947 CASAVA_Build 3 105263866 1D CAAAGTACAG T/- TTTTCAAGTT 3070 het 3070 hom 62 25 28 9 T 5 4 168948 CASAVA_Build 3 105266452 2I ATGTAAAGAC --/TG TGTCTCTGTC 3070 het 3070 hom 54 17 30 7 TG 1 2 168949 CASAVA_Build 3 105266637 4I TAAAAAAAGG ----/GAGA GAGATTTTGA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 GA 2 4 168950 CASAVA_Build 3 105268797 1I CAACTTCAGA -/C CCAGTTGTCT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 C 2 3 168951 CASAVA_Build 3 105272352 1D TTTCTCTAGA T/- TTTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 T 4 3 168952 CASAVA_Build 3 105273357 1I TTTAAGGCAA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 7 8 168953 CASAVA_Build 3 105277476 1D TATTCAAAAC T/- TTTTTTACAG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 7 6 168954 CASAVA_Build 3 105278400 4D AAAAACACCT CAAA/---- CAACTTCAGG 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 CAAA 1 0 168955 CASAVA_Build 3 105291027 1D TTATTGTGGG C/- CCCAATAATT 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 C 4 3 168956 CASAVA_Build 3 105292275 1D TGTAGGGAGA C/- CCCCCTGAAA 3070 het 2906 hom 25 6 10 9 C 6 5 168957 CASAVA_Build 3 105293539 3I ATATATGCCT ---/TTG TTATTAGTAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTG 0 1 168958 CASAVA_Build 3 105297058 1D CATCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 26 0 20 6 A 12 11 168959 CASAVA_Build 3 105302181 1I GTATGTGGTG -/T TAAGGGGTCC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 1 2 168960 CASAVA_Build 3 105308742 1I AATTAAAGGG -/T TTTTTAATGC 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 T 5 6 168961 CASAVA_Build 3 105314985 8D TCCCAATGTG GGGAGGGC/-------- GGGCCACCAT 3070 het 3070 ref 53 28 18 9 GGGAGGGC 1 0 168962 CASAVA_Build 3 105320167 1D ATGTAACAAA C/- TTGCACACCC 3070 het 3070 ref 39 17 17 8 C 1 0 168963 CASAVA_Build 3 105333943 1I CACTCAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 17 1 13 3 T 14 15 168964 CASAVA_Build 3 105334621 4D AATAACAGAC AGAA/---- AGGAAAGAAA 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 AGAA 1 0 168965 CASAVA_Build 3 105340523 1I AAAAAAAAAA -/T GTTATTATTT 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 T 0 1 168966 CASAVA_Build 3 105355746 4D TGGTGATTAG TTTT/---- TTTTTTGTTG 1329 hom 18 het 37 0 6 32 T 10 6 168967 CASAVA_Build 3 105358313 2D TGGTGGAATA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 41 0 33 12 T 12 10 168968 CASAVA_Build 3 105363048 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3034 het 290 hom 13 2 9 2 T 10 11 168969 CASAVA_Build 3 105366290 1I TGGAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 12 13 168970 CASAVA_Build 3 105386671 12I AGAGAACATC ------------/AAGCCTCATTAA ATTAAAATTT 3070 hom 48 het 18 0 17 2 AAGCCTCATTAA 0 1 168971 CASAVA_Build 3 105386848 6D AATATTATAC TTTTAG/------ TTTAAATACT 3070 het 3070 ref 36 25 10 5 TTTTAG 1 0 168972 CASAVA_Build 3 105387226 2D CATTGTCAGC AA/-- AGTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 3 1 168973 CASAVA_Build 3 105389427 13D CTCAGTATAT ACTGAGGTATATA/------------- CTTTGGTATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ACTGAGGTATATA 1 0 168974 CASAVA_Build 3 105391872 1I TGGGAAGTAA -/T TTTTTTGTCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 6 7 168975 CASAVA_Build 3 105393160 1I ATTGGTATAT -/A AAATATTAAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 3 4 168976 CASAVA_Build 3 105406271 1I AAATGCTATA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 42 24 17 1 T 7 8 168977 CASAVA_Build 3 105409989 1I ACTACTACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 15 12 T 11 12 168978 CASAVA_Build 3 105417449 1D AGCTAAAGCC A/- AAAAAAAAAC 1273 het 1273 ref 45 37 3 5 A 10 9 168979 CASAVA_Build 3 105419542 1I TTTAGTAAAA -/G TGTAAGAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 G 0 1 168980 CASAVA_Build 3 105421369 1I TGATTTTTTC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 7 8 168981 CASAVA_Build 3 105421652 12D GGAGGACTTG ATGTTGCCTCAC/------------ ATATTTCTGA 3070 het 3070 ref 26 13 10 6 ATGTTGCCTCAC 1 0 168982 CASAVA_Build 3 105422118 1D TGCTATTGTG A/- AATAGTGTTG 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 3 2 168983 CASAVA_Build 3 105423791 2I TTTAAAGTAG --/TT TTTTTTTTCT 2554 het 2427 hom 11 5 6 0 T 8 10 168984 CASAVA_Build 3 105424869 1I CCATAACATT -/A AAATGGACCT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 3 4 168985 CASAVA_Build 3 105425110 1I3M1I TATTTTTACA -CTA-/CCTAT TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 20 9 9 3 N/A 0 0 168986 CASAVA_Build 3 105425327 1D45M1I TTTAAAAGTT AAAAAAAAAAACAATAAAAAGAAGCTTTTAGAATAAGAATGTAAAG-/-AAAAAAAAAACAATAAAAAGAAGCTTTTAGAATAAGAATGTAAAGA AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 24 18 9 9 N/A 0 0 168987 CASAVA_Build 3 105427002 1D TCAGATTTCT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 7 6 168988 CASAVA_Build 3 105429486 2D ACTCAATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3057 hom 33 11 11 13 A 16 14 168989 CASAVA_Build 3 105432432 1D TTTTAAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2153 hom 20 6 8 6 A 9 8 168990 CASAVA_Build 3 105435951 1D TTCAGGAATG A/- AAGTTTGTGT 3070 het 3070 ref 58 33 20 5 A 3 2 168991 CASAVA_Build 3 105436304 3D ACTCCTCTTC AGA/--- AGAAGAAGTT 3070 het 3070 hom 50 18 25 8 AGA 3 2 168992 CASAVA_Build 3 105438554 4I ATTTTTTGTC ----/AGAT AGATAGTTTG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 AGAT 1 2 168993 CASAVA_Build 3 105448538 4I AAATCCACTA ----/ACAC AGTTTAAAGT 3070 het 3070 ref 43 23 19 1 AC 0 2 168994 CASAVA_Build 3 105451609 1I CCTCCTCAAA -/T TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 2 3 168995 CASAVA_Build 3 105453401 3D TTGAACAATT CTA/--- CTATTTCTAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 CTA 2 1 168996 CASAVA_Build 3 105454416 1D TCTCTTGCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 10 9 168997 CASAVA_Build 3 105456207 4D TTTTTTCTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 858 hom 34 8 17 11 A 14 10 168998 CASAVA_Build 3 105457298 1D TCCAACTCTA T/- TTGTAACACT 3070 het 3070 ref 37 25 11 1 T 3 2 168999 CASAVA_Build 3 105458698 5D53M1D AAAGCCAGAT AGAAAAGAAAAGGAGACTTCCTGTATTAAGAAGAACCACCTTAGTCTGTGACTGTAGGA/-----AGAAAAGGAGACTTCCTGTATTAAGAAGAACCACCTTAGTCTGTGACTGTAGG- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 21 19 10 6 N/A 0 0 169000 CASAVA_Build 3 105459627 5D TCAACAAAGA TATAT/----- TATAATACAG 3070 het 3070 ref 29 14 13 4 TATAT 1 0 169001 CASAVA_Build 3 105461589 2D TGTTTATACA CT/-- CTCTTTTGGT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 CT 3 2 169002 CASAVA_Build 3 105463206 1D ATTGGAGAAT G/- TTGCATAATT 3070 het 3070 ref 25 14 8 4 G 1 0 169003 CASAVA_Build 3 105464826 13D AGTTGAAGTG GTTATGAGCAGAA/------------- GTTTACCATA 3070 het 3070 hom 37 18 19 6 GTTATGAGCAGAA 1 0 169004 CASAVA_Build 3 105465719 2I ACACAATTTT --/TA TATCTTTATT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 TA 1 2 169005 CASAVA_Build 3 105468594 6I GTGTGTTTTG ------/TTTGTT TTTGTTTTTG 3045 het 2846 hom 19 7 7 5 TTTGTT 2 3 169006 CASAVA_Build 3 105470595 5D AGCCTTGTTT TGTTA/----- TATTACCAGG 3070 het 3070 ref 40 29 10 5 TGTTA 1 0 169007 CASAVA_Build 3 105472647 1D TAAAAGGTAA T/- TTATTTTCCA 3070 het 2264 hom 27 8 18 1 T 3 2 169008 CASAVA_Build 3 105472853 4D CAACATAAAT AACA/---- AACAGAGAAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 AACA 2 1 169009 CASAVA_Build 3 105473431 6D3M27D5M4D GGTTAGAAGG AGTAGCCTCGGGCTAAGACTGCCCAAAGTTTATTAATTTGGTCCA/------CTC---------------------------TTTTG---- TTCTCAGGCT 3070 het 3070 ref 39 29 25 9 N/A 0 0 169010 CASAVA_Build 3 105477000 1I CTATTGCATG -/A AAAATCCTGT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 4 5 169011 CASAVA_Build 3 105484683 3I TCTACCCAAA ---/ATT ATTATTTTAC 2516 het 2516 ref 23 14 6 3 ATT 2 3 169012 CASAVA_Build 3 105490730 1D GTTAAATACA T/- TTTTTTTTTT 2434 het 2434 ref 22 12 7 3 T 11 10 169013 CASAVA_Build 3 105492200 1D ACTCCAGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1658 hom 27 6 13 9 A 12 11 169014 CASAVA_Build 3 105498720 4D GTGAACACTC AATT/---- AATTTTCATA 3070 het 3070 ref 24 13 8 5 AATT 2 1 169015 CASAVA_Build 3 105503009 1D ATTTTTAGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 9 8 169016 CASAVA_Build 3 105505420 4D TTATTTTTAT CTGA/---- CTGTGTTGTT 3070 het 3070 ref 24 14 8 4 CTGA 1 0 169017 CASAVA_Build 3 105507282 1D AAGATTAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 365 hom 38 1 34 3 A 10 9 169018 CASAVA_Build 3 105513132 2D GTAGGGTGAC TT/-- TCTTAGGCCA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 3 1 169019 CASAVA_Build 3 105525582 1D AAAATCCACT C/- TGGTAATATG 3070 hom 78 het 34 0 27 8 C 1 0 169020 CASAVA_Build 3 105530584 1I AATCAGGAAG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 68 het 25 0 23 2 A 8 9 169021 CASAVA_Build 3 105537855 5D GTAGTCCCAG CTACT/----- CTACTCGGCA 1242 hom 12 het 7 0 5 2 CTACT 2 1 169022 CASAVA_Build 3 105539696 1D CTAGTACAGG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 7 169023 CASAVA_Build 3 105543358 1D GAGATATGAA T/- TGACCTAATT 3070 hom 94 het 34 0 32 3 T 2 1 169024 CASAVA_Build 3 105547223 2D AACAGAAATT TA/-- TATATCTGTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TA 3 2 169025 CASAVA_Build 3 105550257 2D ATACACTGTG GA/-- GTCCTGCTCA 3070 hom 75 het 29 0 24 6 GA 1 0 169026 CASAVA_Build 3 105557643 4I AATACAATTG ----/CCTA CCTAATCAGC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CCTA 1 2 169027 CASAVA_Build 3 105559974 1I GAAATAACAA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 8 169028 CASAVA_Build 3 105561645 1D ACAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 12 11 169029 CASAVA_Build 3 105567705 1D AATAAATAAA T/- AAAATAAAAT 269 het 269 ref 19 4 2 13 T 1 0 169030 CASAVA_Build 3 105603787 1D AGAGGATCAG A/- AAAAATAACT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 A 6 5 169031 CASAVA_Build 3 105603909 1D AAAATAAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 52 31 15 7 T 9 8 169032 CASAVA_Build 3 105607158 2D AAGACACATC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 13 15 13 A 11 9 169033 CASAVA_Build 3 105607673 1I ATTGGAAAGG -/A AAAAGTCAAA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 4 5 169034 CASAVA_Build 3 105611109 1D AATATGTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 10 9 169035 CASAVA_Build 3 105617756 1D TTTGAGCATC A/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 42 20 19 5 A 7 6 169036 CASAVA_Build 3 105629791 1D TCCCTAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 A 15 14 169037 CASAVA_Build 3 105639559 1I CCCCTCATTG -/T TAGAAATGTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 1 2 169038 CASAVA_Build 3 105647551 1D ATAAGTTACA T/- TTTTACATAG 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 T 5 4 169039 CASAVA_Build 3 105656370 1D AACCAAAGCA G/- TTCTTAGAAA 3070 het 2411 hom 27 6 13 8 G 1 0 169040 CASAVA_Build 3 105664977 15D TTGAATATAA AATTATTCTATTATT/--------------- AATTATTCTA 2895 het 2514 hom 15 6 6 4 AATTATTCTATTATT 1 0 169041 CASAVA_Build 3 105674603 3D AATTATATTT ATA/--- ATAACATCAA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 ATA 2 1 169042 CASAVA_Build 3 105698949 3I GCAGAGGGTG ---/AAA AAAATGAGGC 3070 het 3070 hom 47 18 28 1 A 4 7 169043 CASAVA_Build 3 105701411 9I CAGCCTCCCA ---------/ACTAGCTGG GCTAACCGGC 3070 hom 36 het 14 0 11 3 ACTAGCTGG 0 1 169044 CASAVA_Build 3 105718935 1D CTTTCCCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 43 het 26 0 15 11 T 10 9 169045 CASAVA_Build 3 105721877 1D AGGAAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 10 9 169046 CASAVA_Build 3 105736757 1D ATAGTCTCAG C/- CCCCAAATCT 3070 het 3070 ref 39 26 11 2 C 5 4 169047 CASAVA_Build 3 105744211 2D GGCCAATATG AC/-- ACACGGCAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 5 AC 3 2 169048 CASAVA_Build 3 105748973 1D GAGACCAGCC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 110 het 43 0 36 7 T 9 8 169049 CASAVA_Build 3 105749570 3I CTTATTATTG ---/TTA TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 TTA 0 1 169050 CASAVA_Build 3 105751726 6D AGAAAACTTG TAAATT/------ AAGTAAAATA 3070 het 3070 hom 40 18 21 4 TAAATT 1 0 169051 CASAVA_Build 3 105752189 1I AACTGTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 T 13 14 169052 CASAVA_Build 3 105752861 1D CCAACTCTAC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 8 7 169053 CASAVA_Build 3 105753941 2D ATATCTAAAC AT/-- ATTGAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 19 20 2 AT 2 1 169054 CASAVA_Build 3 105769686 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 2964 het 654 hom 21 3 9 9 AT 7 6 169055 CASAVA_Build 3 105780725 1D TTTTCCAAAC T/- TTTATGCTGT 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 4 3 169056 CASAVA_Build 3 105789956 1I ATCAAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 10 11 169057 CASAVA_Build 3 105796950 2I TATGTCATAC --/AT ATATATACAC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AT 3 4 169058 CASAVA_Build 3 105797177 1I GTCTATACTG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 A 7 8 169059 CASAVA_Build 3 105797967 1D GCTTAAAACA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 T 9 8 169060 CASAVA_Build 3 105814021 1I TGACTTCACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 9 10 169061 CASAVA_Build 3 105822911 1D AAGTTAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 11 10 169062 CASAVA_Build 3 105838747 1I TCAACAGGAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 8 9 169063 CASAVA_Build 3 105840819 1D AGAAGAAAAG A/- AATAATAAAG 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 3 2 169064 CASAVA_Build 3 105843798 1D TATTCAGCTT C/- AGGCATTAAA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 C 1 0 169065 CASAVA_Build 3 105851696 1D CGTATAAAAC A/- ACATTGCTGT 3070 het 3070 hom 27 9 15 4 A 2 1 169066 CASAVA_Build 3 105852048 1I AGTTCCAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 9 10 169067 CASAVA_Build 3 105853277 2I GGTAGGTTGC --/AT ATGTCTAGGA 3070 hom 114 het 41 0 37 4 AT 1 2 169068 CASAVA_Build 3 105858019 1I TCTTCTTTCT -/C CTTTTTAGTT 3070 hom 83 het 38 0 28 10 C 1 2 169069 CASAVA_Build 3 105859029 5D CAGTTGGATC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 924 hom 31 6 10 16 T 16 11 169070 CASAVA_Build 3 105874184 3I GTGTTAAATA ---/ATC ATCATCCTTC 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 ATC 2 3 169071 CASAVA_Build 3 105881001 2I GCCTGGAATC --/TG TTGGTTTCAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TG 0 1 169072 CASAVA_Build 3 105884945 4I TCCTTCTGAC ----/TTTG TTTAACATTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TTTG 0 1 169073 CASAVA_Build 3 105888438 4D AGTTTATTGA TTGT/---- TTGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 14 4 TTGT 2 1 169074 CASAVA_Build 3 105891301 3D21M1D AATGTTAGAC AATGATGCAGAGAATACCTCAATCG/---GATGCAGAGAATACCTCAATC- AGGCCTACCT 3070 het 3070 ref 53 31 26 7 N/A 0 0 169075 CASAVA_Build 3 105892675 6D GATGTTCCTC GCCCTG/------ GCCCTGTGTC 3070 het 3070 ref 39 27 9 3 GCCCTG 2 1 169076 CASAVA_Build 3 105896258 1D ACCATTATGT A/- ATGTCCTTCT 3070 het 1432 hom 13 3 10 1 A 2 1 169077 CASAVA_Build 3 105897417 9I AGCTAATCCT ---------/TTTTCAAGG TTTTTAGCTT 1386 het 1386 ref 20 13 3 4 TTTTCAAGG 0 1 169078 CASAVA_Build 3 105897583 1D GAAAGAGCAC T/- CTGCTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 1 0 169079 CASAVA_Build 3 105904086 1I TTTTTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 13 14 169080 CASAVA_Build 3 105906677 1D AGCTGCAATG A/- AAAATCTATT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 5 4 169081 CASAVA_Build 3 105907838 3I AATAACATGG ---/ATT AAACACAGAA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 ATT 0 1 169082 CASAVA_Build 3 105908740 1D AATAGAACAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 9 8 169083 CASAVA_Build 3 105909152 1D TATATTATGA G/- GGGGGAAAGG 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 G 6 5 169084 CASAVA_Build 3 105910327 1I TATATTTCTT -/C CTTTTATTGG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 C 1 2 169085 CASAVA_Build 3 105914457 2I AAGAACCTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 14 12 T 10 12 169086 CASAVA_Build 3 105914559 1I CAGATTTTCC -/A AAAACATCTT 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 A 4 5 169087 CASAVA_Build 3 105914752 4D GTCCATGAAA TAAT/---- TAAGATCTAG 3070 het 3070 ref 51 28 19 6 TAAT 1 0 169088 CASAVA_Build 3 105932045 1D CTTCCAAGAT G/- GGGGGAAGCC 3070 hom 123 het 42 0 41 2 G 6 5 169089 CASAVA_Build 3 105933472 1I GTGTTATTTG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 7 8 169090 CASAVA_Build 3 105960638 1D AAATGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 12 11 169091 CASAVA_Build 3 105963905 3D AGGATTTGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 43 3 22 19 A 14 11 169092 CASAVA_Build 3 105964902 1I AAAAAAAAAA -/T GAAAAGGAGT 3070 het 783 hom 32 2 20 10 T 0 1 169093 CASAVA_Build 3 105970657 1D AGCTTTCATG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 77 het 33 0 28 7 T 10 9 169094 CASAVA_Build 3 106001856 2D TTTTTTCCCC CT/-- GTTTGACTTA 3070 het 3070 hom 43 20 21 4 CT 1 0 169095 CASAVA_Build 3 106002016 1I AGAAAATGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 A 9 10 169096 CASAVA_Build 3 106008507 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTAGT 2879 het 677 hom 10 2 7 1 T 8 7 169097 CASAVA_Build 3 106012103 1I TCAACAAATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 A 9 10 169098 CASAVA_Build 3 106015020 1D CACTTACAGC T/- ATCTGATCTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 0 169099 CASAVA_Build 3 106015146 1D TCACTACATA C/- AAAAATTAAC 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 C 1 0 169100 CASAVA_Build 3 106016892 1D GCATACGACT A/- AAAAATATTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 6 5 169101 CASAVA_Build 3 106021588 1I CTAATGTGTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 T 8 9 169102 CASAVA_Build 3 106026726 2D ACAGCAGTGC AG/-- AGTCAGAAGG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 AG 2 1 169103 CASAVA_Build 3 106031418 1D TGGCATTTTT G/- TATGGCAACC 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 G 1 0 169104 CASAVA_Build 3 106034489 5D GAGAAGCTCG GCTGA/----- GCTGAGCTGA 3070 hom 69 het 33 0 24 10 GCTGA 3 2 169105 CASAVA_Build 3 106042993 2I TCAATTAGAT --/AA AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 A 8 10 169106 CASAVA_Build 3 106044573 7D CTTTTATTCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2258 het 25 hom 44 1 17 29 T 19 12 169107 CASAVA_Build 3 106046847 4D ATTAGTTAAT CTGA/---- CTAATTAATT 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 CTGA 1 0 169108 CASAVA_Build 3 106047194 1D AAATGAAATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 120 het 45 0 40 6 A 9 8 169109 CASAVA_Build 3 106058289 1D AATGTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 50 3 34 16 A 12 11 169110 CASAVA_Build 3 106061118 1I AGTAATTTTT -/A AAAAAATTGG 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 A 6 7 169111 CASAVA_Build 3 106061514 1D ATTACAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 948 hom 30 2 19 9 A 11 10 169112 CASAVA_Build 3 106084383 1D TGCCTTGGTC T/- TTTTTTTTTT 2611 het 2611 ref 34 20 8 6 T 15 14 169113 CASAVA_Build 3 106099295 2D TGAAGTCAGC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 1788 hom 33 6 18 10 AG 10 9 169114 CASAVA_Build 3 106124356 9I CCCTTATTTA ---------/TACCCACTG ATATCATCCC 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 TACCCACTG 0 1 169115 CASAVA_Build 3 106128629 2D ACCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 36 0 28 8 A 14 12 169116 CASAVA_Build 3 106132753 1D TCTTTCAGTC T/- TTTTTGATGT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 6 5 169117 CASAVA_Build 3 106142344 1I AAAAATACCG -/A AAAAAAAAAA 1923 het 1923 ref 15 4 5 6 A 10 11 169118 CASAVA_Build 3 106144151 2I AAATATTAAC --/AG AAGTTAAATA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AG 0 1 169119 CASAVA_Build 3 106156165 1I TAGAGATGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 9 10 169120 CASAVA_Build 3 106157658 8D AAAGAGAAAG AGAGAGAA/-------- AGAGAGAAAG 3070 hom 36 het 19 0 13 7 AGAGAGAA 3 2 169121 CASAVA_Build 3 106164901 2I AGATTTATAA --/TG TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 TG 0 1 169122 CASAVA_Build 3 106168283 1I TTTATAGATG -/C CCCGTAACCT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 C 3 4 169123 CASAVA_Build 3 106171894 1D TTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2699 hom 37 13 13 11 T 15 14 169124 CASAVA_Build 3 106185591 1I GATTCCATCC -/T TTTTTTTTTT 2801 het 1506 hom 30 9 8 13 T 15 16 169125 CASAVA_Build 3 106191032 1D CTACACTTTC A/- CAAAATAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 1 0 169126 CASAVA_Build 3 106196874 1D TCTTAAAGGG T/- CATTAATCTC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 1 0 169127 CASAVA_Build 3 106200682 1I CAACTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 8 22 8 A 10 11 169128 CASAVA_Build 3 106204161 1I AGCTAAATTT -/A AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 2 3 169129 CASAVA_Build 3 106210389 1I CAACAAACAT -/G AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 G 0 1 169130 CASAVA_Build 3 106212180 1D TTAATAATTA T/- TTTCACATGC 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 T 4 3 169131 CASAVA_Build 3 106214786 1D GTTCCACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1173 hom 24 5 11 9 T 15 14 169132 CASAVA_Build 3 106234726 1I TCCTAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 A 9 10 169133 CASAVA_Build 3 106286014 4D GCCTACCTGC CTTT/---- CTTTCTTTCT 2006 het 2006 ref 30 11 11 8 CTTT 4 3 169134 CASAVA_Build 3 106288484 1D TCTATCCTTG A/- ATGTTTAGTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 2 1 169135 CASAVA_Build 3 106303733 3I ATAACCTGTA ---/TTT TAAAAGTCCC 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 1 4 169136 CASAVA_Build 3 106359312 1I TTTTGGTCGG -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 7 8 169137 CASAVA_Build 3 106367444 4D CTTTTAGGAC ATTA/---- ATTAAGTAAT 3070 het 3070 hom 56 26 28 3 ATTA 2 1 169138 CASAVA_Build 3 106369316 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1453 het 953 hom 8 3 3 2 T 1 0 169139 CASAVA_Build 3 106380337 1I TCCCCATCTT -/G GTGCTTAGAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 1 2 169140 CASAVA_Build 3 106387395 1D TGCCCTTGCT C/- CCCCTCCCTC 3070 hom 141 het 49 0 47 3 C 5 4 169141 CASAVA_Build 3 106392755 1I GGGGGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 499 hom 25 2 17 6 A 12 13 169142 CASAVA_Build 3 106418284 1I GGTCCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 12 13 169143 CASAVA_Build 3 106422858 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3017 het 3017 ref 19 11 8 0 A 11 10 169144 CASAVA_Build 3 106423060 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1911 hom 16 5 10 1 A 9 10 169145 CASAVA_Build 3 106427212 1I AACGTAACAG -/A AGGATGAAGA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 1 2 169146 CASAVA_Build 3 106442238 1I ATTGGATTTC -/A ACTAGTAACC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 1 2 169147 CASAVA_Build 3 106442404 4D CAAAATTTCC CAAG/---- CTAGTCAATA 3070 het 3070 ref 36 19 16 4 CAAG 1 0 169148 CASAVA_Build 3 106447281 1D CTTATAAGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 10 9 169149 CASAVA_Build 3 106456717 3D CAAGACAAAT AAA/--- AACATGTAAG 3070 het 3070 ref 42 26 12 5 A 5 2 169150 CASAVA_Build 3 106463829 1I ATGTTAGTAC -/A AAGAATGGCT 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 A 2 3 169151 CASAVA_Build 3 106468131 2D TATCAAAAGC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 11 9 169152 CASAVA_Build 3 106473345 10D CATTTTTCAT GTGTGTGTGA/---------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 GTGTGTGTGA 1 0 169153 CASAVA_Build 3 106474221 1I GAGATGTAAT -/G GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 G 1 2 169154 CASAVA_Build 3 106475672 3I TTACATATAG ---/TAC TGGGACTCTA 683 het 683 ref 44 23 4 17 TAC 0 1 169155 CASAVA_Build 3 106479926 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 50 24 16 10 A 7 8 169156 CASAVA_Build 3 106482409 12D CATATATATA CATATGTGTGTG/------------ TATATATATA 420 hom 5 het 3 0 2 2 CATATGTGTGTG 1 0 169157 CASAVA_Build 3 106492930 4D CAACTAATCG TTGT/---- TTAAGTTAGA 3070 het 3070 hom 33 17 14 3 TTGT 1 0 169158 CASAVA_Build 3 106496416 1I CTCTTCTCTC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 405 hom 40 1 33 6 A 7 8 169159 CASAVA_Build 3 106497505 1D AACACACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2654 hom 23 7 10 6 A 13 12 169160 CASAVA_Build 3 106503768 1I TTAATTAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 27 het 12 0 9 3 A 8 9 169161 CASAVA_Build 3 106505783 1D AACATAAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 A 9 8 169162 CASAVA_Build 3 106506756 2D ACTGAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 31 1 12 20 A 14 12 169163 CASAVA_Build 3 106507243 3I TTTAAGACAC ---/ATT ATAATCTAAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 ATT 0 1 169164 CASAVA_Build 3 106509004 1I TTCAGCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 9 8 A 12 13 169165 CASAVA_Build 3 106510489 2D TTGGTCTTTT CA/-- CATAGTCCCA 1941 het 1941 ref 14 8 4 5 CA 2 1 169166 CASAVA_Build 3 106517217 1I ATAATAAAAG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 7 8 169167 CASAVA_Build 3 106522459 1I TTGAATCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 T 9 10 169168 CASAVA_Build 3 106526315 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1888 hom 6 het 23 0 13 10 A 17 16 169169 CASAVA_Build 3 106531422 2D AGATTTTAGA AC/-- AGAGATACTA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 AC 1 0 169170 CASAVA_Build 3 106532071 1D CAGTTTTGTT C/- TTTTTGCTCA 3070 het 3070 hom 39 16 21 3 C 1 0 169171 CASAVA_Build 3 106538229 1I TCTTCTTACA -/G TAAATAGCAG 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 G 0 1 169172 CASAVA_Build 3 106545935 2I GCAGCACAAA --/AG AGAGGCCAAC 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 AG 2 3 169173 CASAVA_Build 3 106626617 3D TTCTACAGAT GAG/--- GAGAATAGGG 3070 hom 120 het 43 0 41 5 GAG 2 1 169174 CASAVA_Build 3 106649939 1D AGTCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 1481 het 1481 ref 38 27 4 7 A 11 10 169175 CASAVA_Build 3 106653635 1D CATTTTTTGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 117 hom 37 1 34 2 T 9 8 169176 CASAVA_Build 3 106695605 1I AATTTAAGAG -/T TTCTTGTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 3 169177 CASAVA_Build 3 106701762 1D ATATTAATAC G/- ACAAAGAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 G 1 0 169178 CASAVA_Build 3 106710360 2I CATTTCTAGT --/TG TGTGTCCTAT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TG 2 3 169179 CASAVA_Build 3 106710446 2D TCACCATCCA CT/-- CTCTGTTTCT 3070 hom 75 het 32 0 25 8 CT 3 2 169180 CASAVA_Build 3 106713892 1I TTTCTGTTGA -/T AATGTTTTTA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 0 1 169181 CASAVA_Build 3 106714991 1D AATTTTAAGA G/- GGGACAATTT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 G 4 3 169182 CASAVA_Build 3 106721581 1D CTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 10 169183 CASAVA_Build 3 106724774 3D TGAATAAGGG GAT/--- GATGAATAAG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 GAT 2 1 169184 CASAVA_Build 3 106733058 1D AGTTATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 37 0 25 12 T 11 10 169185 CASAVA_Build 3 106741838 1D GGACAAAGAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 9 8 169186 CASAVA_Build 3 106747758 1D TTCAGAAAAC A/- ACACATACCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 2 1 169187 CASAVA_Build 3 106753541 1D TTAAGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 45 2 32 11 T 13 12 169188 CASAVA_Build 3 106756311 1I TTTCCTGATA -/T TCAAATCTTA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 1 2 169189 CASAVA_Build 3 106764906 1I AACTTTTTGC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 7 8 169190 CASAVA_Build 3 106765859 4I TGTTATTTAT ----/CTTA CTTCTAAGTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTTA 0 1 169191 CASAVA_Build 3 106785049 1D CCCAGCCATG T/- GGAACTGGAA 3070 hom 54 het 22 0 19 7 T 1 0 169192 CASAVA_Build 3 106786287 2I TACAGCAGTT --/AA AAATAATGTG 3070 hom 122 het 45 0 41 4 A 3 5 169193 CASAVA_Build 3 106787195 4D TTCTATCAGC TTTC/---- TATTGTATTC 3070 het 681 hom 40 3 35 2 TTTC 1 0 169194 CASAVA_Build 3 106796371 7D GAGGCAATAG ATGGCGA/------- ATGTTTCCTA 3070 het 3070 ref 24 15 8 2 ATGGCGA 1 0 169195 CASAVA_Build 3 106797411 1I CGTTGTAAGT -/A AAATCAGTAC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 3 4 169196 CASAVA_Build 3 106799247 2I ATGTGTAGAC --/AT ATATATGTAT 3070 het 3070 hom 102 22 57 23 AT 3 4 169197 CASAVA_Build 3 106811346 1I CCAACTACTC -/A GGGGGCTAAG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 0 1 169198 CASAVA_Build 3 106831576 27I TAATTTAGAA ---------------------------/CCTCAGGGATCCATTGCGACACATATT CCTCATGTTG 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 CCTCAGGGATCCATTGCGACACATATT 0 1 169199 CASAVA_Build 3 106839814 1D TTGTGGGGTC G/- GGGGGGGGAG 2894 hom 21 het 9 0 7 2 G 9 8 169200 CASAVA_Build 3 106840651 1D TTTCATTTGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 T 8 7 169201 CASAVA_Build 3 106848997 1D ATTCAGAGTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 9 8 169202 CASAVA_Build 3 106857820 1D ATGCTGACTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 9 8 169203 CASAVA_Build 3 106865441 1I GCTTATTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1210 hom 41 8 25 8 A 13 14 169204 CASAVA_Build 3 106868841 2I ACAGCCTTTT --/AG AGTTTTCAAA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AG 1 2 169205 CASAVA_Build 3 106881307 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 27 1 21 5 A 13 12 169206 CASAVA_Build 3 106884569 3I TGGAAGAGAC ---/GGT GGATATTTGA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 GGT 0 1 169207 CASAVA_Build 3 106886092 1D CCACACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 31 1 17 13 T 13 12 169208 CASAVA_Build 3 106891186 1D CTTAACTATT C/- AGAGTATCAT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 C 1 0 169209 CASAVA_Build 3 106891570 2I ACACTATGAC --/AG AGCAGCCTCT 3070 hom 104 het 40 0 33 7 AG 1 2 169210 CASAVA_Build 3 106894977 2I AAAACCACTC --/TT TACCATATCT 3070 hom 160 het 65 0 54 11 T 1 3 169211 CASAVA_Build 3 106906580 5I GGGCAGTTTC -----/CTTTT CAAGTCTAAG 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 CTTTT 0 1 169212 CASAVA_Build 3 106914926 1I ACTGATCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 A 13 14 169213 CASAVA_Build 3 106924103 14I TAAAGACCTA --------------/ATTTCAGTGCAATT ATCGTAACTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 ATTTCAGTGCAATT 0 1 169214 CASAVA_Build 3 106933757 3D ATAATACCTC CTA/--- CTGACACATT 3070 het 3070 hom 50 24 25 2 CTA 1 0 169215 CASAVA_Build 3 106934122 1D AATCAACTGT A/- ATTCATTTCC 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 A 2 1 169216 CASAVA_Build 3 106936067 1D TGTCAAATTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 9 8 169217 CASAVA_Build 3 106941642 1I TCTCAAAAAA -/C AAAAAAGAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 0 1 169218 CASAVA_Build 3 106949353 1I AGAGTGTTTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 8 9 169219 CASAVA_Build 3 106950824 1D TCATGTTTTT A/- AAATGATTAG 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 4 3 169220 CASAVA_Build 3 106954911 1D TGTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 10 9 169221 CASAVA_Build 3 106956551 17D GTATCTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTATTATAC 3070 het 1850 hom 25 8 15 2 T 20 3 169222 CASAVA_Build 3 106957040 1I GATTTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 874 hom 42 2 30 10 A 11 12 169223 CASAVA_Build 3 106970694 1D CTAAACATAC A/- AAAAAAACAT 3070 het 1403 hom 18 4 12 3 A 8 7 169224 CASAVA_Build 3 106977789 4D TAAAAATTAC CAAT/---- CAATCAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 CAAT 2 1 169225 CASAVA_Build 3 106977866 1D CATATCCAAC T/- GGAGGGAGGA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 1 0 169226 CASAVA_Build 3 106984113 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1716 het 1662 hom 30 10 7 13 T 25 24 169227 CASAVA_Build 3 106984786 21D ATACATAAGA CATGTAGGTAAGACCCTGATG/--------------------- CATCTAATTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 4 CATGTAGGTAAGACCCTGATG 1 0 169228 CASAVA_Build 3 106995019 1D AATGTTTAAC A/- AAAAAAAAAA 2809 het 605 hom 27 5 12 11 A 17 16 169229 CASAVA_Build 3 106998994 2D AGGGCAGGAG GA/-- GAGAGAGGAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 GA 4 3 169230 CASAVA_Build 3 107004250 3I ACTTCAGGAT ---/ACA ACAACTATTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ACA 1 2 169231 CASAVA_Build 3 107007469 2D AAAGGGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 33 1 24 8 A 14 12 169232 CASAVA_Build 3 107016140 2D GAAATCACTC TT/-- GTGTCCATTC 3070 hom 108 het 41 0 36 6 T 2 0 169233 CASAVA_Build 3 107020421 4D AGAGATTTAG ATTA/---- ATTTGTAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 7 ATTA 1 0 169234 CASAVA_Build 3 107027520 1I AATTAGTAGA -/T TTAAATTCTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 2 3 169235 CASAVA_Build 3 107028769 1D TCCCCAGAGT A/- AATGACGTAA 3070 hom 117 het 45 0 40 6 A 3 2 169236 CASAVA_Build 3 107031759 4D GCCTACTATT AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 43 17 18 10 AATA 3 2 169237 CASAVA_Build 3 107035711 3I TCAAGAGGTT ---/AAC AACAATGTAC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AAC 1 2 169238 CASAVA_Build 3 107036203 5I AAAGAAAAGA -----/AAAAG AAATCAAGTA 3070 hom 95 het 36 0 32 4 AAAAG 0 1 169239 CASAVA_Build 3 107039618 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1101 hom 33 4 17 12 T 15 14 169240 CASAVA_Build 3 107041921 1D ATCGTGTTAG A/- AAAAAAAAAA 1693 het 1693 ref 33 22 5 6 A 12 11 169241 CASAVA_Build 3 107042407 1D ATTACTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 319 hom 31 1 23 7 A 13 12 169242 CASAVA_Build 3 107049148 2I CTCAGTTGAC --/TT TTTTTTTCCA 3070 hom 75 het 36 0 26 10 T 7 9 169243 CASAVA_Build 3 107052909 1D CCATGGGTTC A/- GGGGGGGAAG 3070 het 3070 hom 43 16 23 6 A 1 0 169244 CASAVA_Build 3 107054206 12I TCACTCACTC ------------/ACTTTCAGAGCA ACTTCCAGTC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 ACTTTCAGAGCA 0 1 169245 CASAVA_Build 3 107062675 3I AAAAACAAAA ---/AAC AAAACCTTTA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 AAC 0 1 169246 CASAVA_Build 3 107069413 1I CTCAACTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 14 15 169247 CASAVA_Build 3 107076746 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 20 11 A 12 11 169248 CASAVA_Build 3 107077199 1D CAGAGATTCT G/- TTTTAATTGA 3070 het 3070 hom 35 18 15 2 G 1 0 169249 CASAVA_Build 3 107077688 1D AGATAATCAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 A 10 9 169250 CASAVA_Build 3 107078020 4D TGCTGCCAGT GGAC/---- GGACTCCAGC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 GGAC 2 1 169251 CASAVA_Build 3 107081938 4D ATACACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 AC 10 8 169252 CASAVA_Build 3 107082329 2D ATAATTTAGA TG/-- TGTGTCCTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 TG 3 2 169253 CASAVA_Build 3 107082664 2I CTGACACATT --/AA AAAAAAAAAA 1707 het 551 hom 33 2 9 22 A 12 14 169254 CASAVA_Build 3 107083767 4D ATTTAATAAA TATT/---- TATTAAGCAT 3070 het 3070 hom 35 17 17 3 TATT 2 1 169255 CASAVA_Build 3 107084829 3D CCAGACACCA CTT/--- CTTCTTGTTG 3070 hom 132 het 50 0 43 7 CTT 3 2 169256 CASAVA_Build 3 107113428 5I CAGAGGTAAG -----/AGGTA AGGTAAGGTA 3070 het 3070 hom 38 14 13 11 AGGTA 3 4 169257 CASAVA_Build 3 107114360 3I GAAAGTTTGT ---/GAA GAAGAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GAA 2 3 169258 CASAVA_Build 3 107114532 1I GTGGGAGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 8 9 169259 CASAVA_Build 3 107115054 1I TATTACTAGG -/A ATGGCACTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 2 169260 CASAVA_Build 3 107132651 1D TATTTCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 11 10 169261 CASAVA_Build 3 107141345 2D ATACATGGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 16 11 T 17 15 169262 CASAVA_Build 3 107144960 1D TATTGCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 17 1 11 6 A 16 15 169263 CASAVA_Build 3 107145599 1D ATAGTGGAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 41 0 35 7 T 10 9 169264 CASAVA_Build 3 107155695 1D GTTTGTTGAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 9 169265 CASAVA_Build 3 107163325 1D TATAGAGATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 143 hom 24 1 20 4 T 10 9 169266 CASAVA_Build 3 107165824 3I AGCTGCTAAC ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 TTG 3 4 169267 CASAVA_Build 3 107170823 2D TGATACCCTG TC/-- TCTACTAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 5 TC 2 1 169268 CASAVA_Build 3 107171340 1D AAAATACATA T/- TTTTTCTATT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 6 5 169269 CASAVA_Build 3 107173387 1D TAGGCAGTGC T/- CCAGTGGGGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 1 0 169270 CASAVA_Build 3 107174455 2D TTTTATATCC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 69 het 29 0 23 7 AT 9 8 169271 CASAVA_Build 3 107174530 1I TTTCCATTTG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 8 9 169272 CASAVA_Build 3 107175010 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 13 15 169273 CASAVA_Build 3 107316081 3I CATGTCCTAG ---/AGA AGGATTACTC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AGA 0 1 169274 CASAVA_Build 3 107333560 2I TTTAAATGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 13 6 A 10 12 169275 CASAVA_Build 3 107333959 4I ACTCAATGTA ----/GTTT GTTTGGTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 GTTT 1 2 169276 CASAVA_Build 3 107402399 1I GCATTTGTAC -/A CGTGAAAATG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 0 1 169277 CASAVA_Build 3 107435779 1I TTGGCATGTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 7 8 169278 CASAVA_Build 3 107439435 2I ACCATTTAAC --/TA TATATATATA 3070 het 458 hom 16 1 14 1 TA 8 9 169279 CASAVA_Build 3 107441608 1D CACCTGTGCA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 54 het 26 0 22 5 T 8 7 169280 CASAVA_Build 3 107456631 1D CAATGAAACC A/- AAAAGTTAGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 4 169281 CASAVA_Build 3 107458985 2D3M2I ATGGAACTAA CCATG--/--ATGCA CCCTTAACTA 1624 het 1624 ref 54 49 4 5 N/A 0 0 169282 CASAVA_Build 3 107463036 1D TATAGTAACC A/- AAACAGCATG 3070 hom 105 het 39 0 35 5 A 4 3 169283 CASAVA_Build 3 107476193 1D TTTCCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1125 hom 42 4 26 12 T 13 12 169284 CASAVA_Build 3 107481402 2D ATTTTAAAAT AA/-- AGTTAATAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 3 1 169285 CASAVA_Build 3 107483191 1I AGCTCTACAG -/A AAAAAATATC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 169286 CASAVA_Build 3 107484965 1I CCATGTAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 33 0 24 9 A 9 10 169287 CASAVA_Build 3 107485446 1I TACACAGAGG -/A ACCGTGGGTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 1 2 169288 CASAVA_Build 3 107490275 7D CTGCAGGTTC TGAAGGG/------- GATGACATCA 3070 hom 93 het 33 0 32 5 TGAAGGG 1 0 169289 CASAVA_Build 3 107490869 1D GAAGGCATAG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 69 het 34 0 24 11 T 8 7 169290 CASAVA_Build 3 107492796 2D GTATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 106 het 41 0 36 5 AC 6 5 169291 CASAVA_Build 3 107494014 4I AGTTGAAGAT ----/AGAG AGAATATTGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AG 1 3 169292 CASAVA_Build 3 107494102 1I GGTGTTTGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 222 hom 31 1 28 2 T 8 9 169293 CASAVA_Build 3 107494655 1D TCGTTTTTTT C/- ATATTAGAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 C 1 0 169294 CASAVA_Build 3 107495726 1I GCATTTTTTT -/A ATATCACAAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 1 2 169295 CASAVA_Build 3 107502930 2D TTTTCTTCCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TC 7 6 169296 CASAVA_Build 3 107509425 2D CCTATTCCTG CT/-- CTGCCTTTGC 3070 hom 102 het 39 0 33 7 CT 2 1 169297 CASAVA_Build 3 107514151 1I GCGTGAGCCA -/C CCGCGCCCGG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 2 3 169298 CASAVA_Build 3 107531350 1D CATGTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 2316 het 2316 ref 51 30 7 14 T 14 13 169299 CASAVA_Build 3 107533050 1D TTGGCAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 32 2 15 15 T 17 16 169300 CASAVA_Build 3 107540445 2D CCATAGCTCT TG/-- CTGTGAGACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TG 1 0 169301 CASAVA_Build 3 107551645 1I TAATCTTTAC -/A ATTCCTGCCA 3070 hom 171 het 63 0 56 7 A 1 2 169302 CASAVA_Build 3 107564797 4D AATTTATCTA TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 TTAT 6 5 169303 CASAVA_Build 3 107573099 1I ACAGAAAAGC -/A ACGTGGAATT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 1 2 169304 CASAVA_Build 3 107573411 3I AGAACTTTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 29 0 23 6 T 11 14 169305 CASAVA_Build 3 107576837 1D TTTAGATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 35 1 25 10 T 12 11 169306 CASAVA_Build 3 107581476 2I TTACTTTAAC --/AT ATGTCTCCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 1 2 169307 CASAVA_Build 3 107581976 2D GTGATATCTC TT/-- TGTTACTTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 3 1 169308 CASAVA_Build 3 107582361 2I CTGAAACTGC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 28 0 25 3 T 9 11 169309 CASAVA_Build 3 107582457 1I TGAAAGACAA -/C CTTTGTCAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 2 169310 CASAVA_Build 3 107583904 1D CCATAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 11 10 169311 CASAVA_Build 3 107587211 2I TGGCAAATGC --/AA ACTCTGCAGG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 3 169312 CASAVA_Build 3 107594462 1I TTCCTTTCAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 7 8 169313 CASAVA_Build 3 107594883 3I TGCAAAGAAA ---/AGT AGAGTTTTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AGT 0 1 169314 CASAVA_Build 3 107596901 7I CTGGCAGACA -------/TAGTGTT TAGTGTTTGG 3070 hom 78 het 33 0 25 8 TAGTGTT 1 2 169315 CASAVA_Build 3 107597111 1I TAAATTTTAG -/A GAGATGCAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 0 1 169316 CASAVA_Build 3 107597250 2D CCTCTCACTC TT/-- TGACTTTATT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 3 1 169317 CASAVA_Build 3 107598206 4D TTCCCATGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 hom 85 het 33 0 29 5 AGTG 2 1 169318 CASAVA_Build 3 107601062 1I ATCTCTGGCC -/T TTGTTCCATC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 2 3 169319 CASAVA_Build 3 107604135 18D ATGAGTTATA ATATGAGTTAAAATGGTT/------------------ ATATGAGTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 10 ATATGAGTTAAAATGGTT 1 0 169320 CASAVA_Build 3 107604310 1D GGCACGTGAA C/- TTTTTATATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 1 0 169321 CASAVA_Build 3 107608755 1D CAGAGACAAT A/- CTGGCATTCT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 1 0 169322 CASAVA_Build 3 107621355 14I AGCCCTAAAC --------------/AATATCTCTTTTAA AATATCAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 AATATCTCTTTTAA 0 1 169323 CASAVA_Build 3 107621601 1D GTTAGAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1466 hom 33 6 15 13 A 15 14 169324 CASAVA_Build 3 107625289 2D CGCATTTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 2237 het 870 hom 39 9 5 26 A 16 14 169325 CASAVA_Build 3 107627147 2D TTAGAATTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 35 0 28 8 T 13 11 169326 CASAVA_Build 3 107632104 1I TTTTTGGAGA -/T TTTTTTATAA 3070 hom 92 het 36 0 31 5 T 6 7 169327 CASAVA_Build 3 107637409 4D TGGGAAGGAG AAGA/---- AAGAAAGAAA 2063 het 2063 ref 27 10 9 8 AAGA 4 3 169328 CASAVA_Build 3 107645169 1D AAACACATAA T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 7 6 169329 CASAVA_Build 3 107652505 2D GAGCCCAGGA GG/-- TAGAGGCTGC 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 G 2 0 169330 CASAVA_Build 3 107656717 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 28 1 13 14 T 16 15 169331 CASAVA_Build 3 107658512 1D CAGAGGCAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 86 het 32 0 26 6 T 10 9 169332 CASAVA_Build 3 107671134 3D CTGATATAGT TTG/--- TTATTTGTTC 3070 het 3070 ref 53 26 22 6 TTG 1 0 169333 CASAVA_Build 3 107693917 1I GGGTGTTTGG -/T TTTTTTGTCC 3070 het 1146 hom 18 3 14 1 T 6 7 169334 CASAVA_Build 3 107698994 1I TTAAAAAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 9 169335 CASAVA_Build 3 107700263 2I CAAATAACTT --/AG AGAGTTTCAT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 AG 2 3 169336 CASAVA_Build 3 107701815 1D TGCAACCATT A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 47 18 22 8 A 7 6 169337 CASAVA_Build 3 107704112 6D ATAATAATAC ATATAT/------ ATATATATAT 1128 hom 7 het 6 0 3 4 AT 8 5 169338 CASAVA_Build 3 107704768 1D AGCCACTAGT A/- ACACTTTAAA 3070 het 2405 hom 23 7 13 4 A 2 1 169339 CASAVA_Build 3 107706321 1D TTCAATATAT A/- AAAATCAAAA 3070 het 1554 hom 23 4 15 4 A 5 4 169340 CASAVA_Build 3 107706584 5D TTAATAATGT ATTTA/----- ATTTATTTAA 2676 het 2676 ref 24 16 8 0 ATTTA 2 1 169341 CASAVA_Build 3 107706877 5D TTTGTCTTTG TTAAT/----- TTATCTATTG 3070 het 3070 ref 35 19 14 5 TTAAT 1 0 169342 CASAVA_Build 3 107710052 28I TATATCCTTC ----------------------------/TTAGTGCCTCAAACTAGATCCTGTTCAG ACATGCAATA 3070 hom 63 het 21 0 21 4 TTAGTGCCTCAAACTAGATCCTGTTCAG 0 1 169343 CASAVA_Build 3 107716640 1I TAGCTAGTTC -/A AAAACCTCTC 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 A 4 5 169344 CASAVA_Build 3 107725351 3D AAGCAGAAAG CAA/--- CAACAACAGC 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 CAA 3 2 169345 CASAVA_Build 3 107737082 11I GAAATATGGG -----------/ACTATATGAAA ACACCAAACC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ACTATATGAAA 0 1 169346 CASAVA_Build 3 107741906 1I ATATTACTAT -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 6 7 169347 CASAVA_Build 3 107742061 4D ATATACCTTT CAAA/---- CAAACACTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CAAA 2 1 169348 CASAVA_Build 3 107748415 1D CTACTGCCCT C/- CTCCTCTGTA 3070 het 3070 hom 44 20 19 6 C 2 1 169349 CASAVA_Build 3 107751390 1D TACTATTAGT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 98 het 38 0 32 6 A 9 8 169350 CASAVA_Build 3 107765218 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 2902 het 950 hom 17 3 7 7 A 9 8 169351 CASAVA_Build 3 107769311 1I TTCACAAATA -/T TTTTAACTAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 4 5 169352 CASAVA_Build 3 107771475 2I TAATGAAGAG --/AT ATGTTCTGCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AT 1 2 169353 CASAVA_Build 3 107774600 19I TTTATTAAGT -------------------/TATTTAGAAAATCTTGCTG ATTAACTCAC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TATTTAGAAAATCTTGCTG 0 1 169354 CASAVA_Build 3 107775948 1I CAAAATATGC -/A GTTGCAGAAG 3070 hom 87 het 37 0 28 9 A 0 1 169355 CASAVA_Build 3 107793884 3I AAATGAAACC ---/AAG AAGGAGTAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAG 1 2 169356 CASAVA_Build 3 107794131 1I TGCGATCTCA -/G CTCACTGCAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 169357 CASAVA_Build 3 107802875 2D TCTATCTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 21 0 10 11 T 18 16 169358 CASAVA_Build 3 107806728 1I CTCTATCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 33 1 23 9 A 9 10 169359 CASAVA_Build 3 107807597 3D56M3D ACACAATAAA GATGATCTTAATACAAAACAATTCAAATTCATCTGAACAATGAAAGTAAATAGTTTTGGTTT/---GATATTAATACAAAACAATTCAAATTCATCTGAACAATGAAAGTAAATAGTTTTGG--- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 23 0 21 27 N/A 0 0 169360 CASAVA_Build 3 107813147 4I ACATTGTGAT ----/TAAG TGTGTGTGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAAG 0 1 169361 CASAVA_Build 3 107815769 1D TCTCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 28 1 24 3 T 11 10 169362 CASAVA_Build 3 107816575 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 18 6 A 10 11 169363 CASAVA_Build 3 107818906 1D CTATGTAGGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 44 19 22 5 A 9 8 169364 CASAVA_Build 3 107827474 1I ATACCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 T 11 12 169365 CASAVA_Build 3 107841724 1D CAAAGGTTGC A/- GCGAGCCAAG 1843 het 1843 ref 17 7 6 5 A 1 0 169366 CASAVA_Build 3 107847591 1D AACCCAAAAC A/- GATCATGCTA 3070 het 3070 ref 49 28 20 2 A 1 0 169367 CASAVA_Build 3 107848310 4D ATGGCAAGAG AATT/---- AACTCAGAAG 3070 het 3070 ref 34 18 15 3 AATT 1 0 169368 CASAVA_Build 3 107872853 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAACA 2971 het 480 hom 14 1 8 6 A 9 8 169369 CASAVA_Build 3 107887823 5I CTTCTGATTC -----/TGTTA TAACTCACTG 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 TGTTA 0 1 169370 CASAVA_Build 3 107890123 1I AACAATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 14 14 A 13 14 169371 CASAVA_Build 3 107890514 1I TATCTTCCAA -/T TTTTTTTTTT 2902 het 2902 ref 23 11 8 4 T 11 12 169372 CASAVA_Build 3 107897646 1D GTGTAATTAT C/- CCCATTTACT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 C 4 3 169373 CASAVA_Build 3 107899079 1I CCTAATAGCC -/A AAAACAAAGT 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 A 4 5 169374 CASAVA_Build 3 107902231 7D TGGTTGTAAA ATTGGAG/------- ATTGGAGATC 3070 hom 60 het 24 0 20 5 ATTGGAG 2 1 169375 CASAVA_Build 3 107905807 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 2745 het 2745 ref 13 6 7 0 A 6 7 169376 CASAVA_Build 3 107908412 5D TTGACTTATA AAATT/----- AATTTATTAT 3070 het 1688 hom 17 4 13 1 AAATT 1 0 169377 CASAVA_Build 3 107909708 1I GATAAATAAT -/C ATTTTATAAA 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 C 0 1 169378 CASAVA_Build 3 107915939 1I TCCAATGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 12 13 169379 CASAVA_Build 3 107917664 1I AAAATGGACT -/A ATACAATTTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 1 2 169380 CASAVA_Build 3 107927878 1D TGCATCTCCA G/- TGATCAAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 G 1 0 169381 CASAVA_Build 3 107975411 3D CTGTGCCAGC AGA/--- AGGTCTTTAG 3070 het 3070 ref 49 26 19 5 AGA 1 0 169382 CASAVA_Build 3 107983488 1I GATGACAGAT -/A ACAACATACA 3070 hom 154 het 58 0 52 6 A 1 2 169383 CASAVA_Build 3 107987515 1D GCACAGTTCC A/- AAGCCTTCAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 3 2 169384 CASAVA_Build 3 107991408 1D GAGTGACAAG A/- AAAAAAAAAG 1738 het 1738 ref 37 27 4 8 A 10 9 169385 CASAVA_Build 3 107997467 19D3M4D ACTGGTTACA TACCCAAAGGAAAATAAATTGTTCCA/-------------------TGT---- CCAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 39 32 9 3 N/A 0 0 169386 CASAVA_Build 3 108002526 1D AAGTATTTCA C/- AAAGAAATTA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 C 1 0 169387 CASAVA_Build 3 108003114 1I TAAAAAAAAA -/G AAAAGACATG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 169388 CASAVA_Build 3 108006341 2D GAGGATCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 13 11 169389 CASAVA_Build 3 108009319 10I GGCTCAGCCT ----------/CAAAACAAAA CAAAACAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 CAAAA 2 4 169390 CASAVA_Build 3 108019449 2I ATTACTGTCC --/TT TTTGTTCTTT 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 T 3 5 169391 CASAVA_Build 3 108042721 1D AAATGGAAAG A/- ATTAGTTTTA 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 2 1 169392 CASAVA_Build 3 108045990 1I AAGTGATTAA -/G GCATAAGGAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 1 2 169393 CASAVA_Build 3 108047576 1D CAAAAAAAAA T/- TTGTGAAATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 3 2 169394 CASAVA_Build 3 108051273 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 15 0 11 4 A 17 14 169395 CASAVA_Build 3 108070730 6I CTCTATACCT ------/AAAGGA AAGGGACATT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AAAGGA 0 1 169396 CASAVA_Build 3 108070818 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AC 10 9 169397 CASAVA_Build 3 108071487 1D AAATTAACCC A/- AAAAATGTAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 6 5 169398 CASAVA_Build 3 108076168 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 10 9 169399 CASAVA_Build 3 108099837 4I AAAATGATTA ----/CTTT CTATTTATAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 CTTT 0 1 169400 CASAVA_Build 3 108101336 1D CTGTTATCCA T/- TAACTTCAGT 3070 hom 120 het 47 0 41 7 T 2 1 169401 CASAVA_Build 3 108101414 1I TCCTCACTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 114 hom 39 1 34 4 T 9 10 169402 CASAVA_Build 3 108104347 3I CACCAGAGTA ---/ACT ACTACTATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ACT 2 3 169403 CASAVA_Build 3 108107836 1I AATAAACCAT -/A AAAATGACAA 3070 hom 144 het 51 0 49 2 A 4 5 169404 CASAVA_Build 3 108109676 1D CTGTAATTGC T/- TTTAACTAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 4 3 169405 CASAVA_Build 3 108117738 1D CAACAGTTTG A/- AAAAATACTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 6 5 169406 CASAVA_Build 3 108121959 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 22 0 12 10 A 11 10 169407 CASAVA_Build 3 108132101 1I GATAGTACAT -/A CGTGCTGTTT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 0 1 169408 CASAVA_Build 3 108142678 2I GATGTATGTC --/AT AGACCCATCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AT 0 1 169409 CASAVA_Build 3 108149248 1I AAACAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 10 11 169410 CASAVA_Build 3 108155338 5I ATAAAATAAA -----/TATCT TATGATATCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TATCT 0 1 169411 CASAVA_Build 3 108160112 1I ACAGAATGGG -/A AAAAAATTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 6 7 169412 CASAVA_Build 3 108163019 2I TAATAATTTC --/AA AGTGTTTTAT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 1 3 169413 CASAVA_Build 3 108164261 8D GGAGCACCTC CTAACACT/-------- ATGCAGTTCA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 CTAACACT 1 0 169414 CASAVA_Build 3 108165902 3D TTTCATACAG AGA/--- AGAAGAAGAA 3070 hom 81 het 28 0 28 3 AGA 4 3 169415 CASAVA_Build 3 108174016 1D TCTGGAGGCC G/- GGGTAAAGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 5 G 4 3 169416 CASAVA_Build 3 108196244 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 A 10 9 169417 CASAVA_Build 3 108223671 1D GGGATAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 35 1 22 12 T 12 11 169418 CASAVA_Build 3 108232619 2I AGGGAAAAAA --/AG AGTATAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 AG 1 2 169419 CASAVA_Build 3 108234543 1D ATATATTCTG A/- AAAGCCCTAT 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 A 4 3 169420 CASAVA_Build 3 108235597 1D AGCCCTATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 A 13 12 169421 CASAVA_Build 3 108242521 4D GGATAGGAAG AATC/---- AATATCGCAA 2705 het 2705 ref 15 8 7 0 AATC 1 0 169422 CASAVA_Build 3 108248924 1I ATATACGGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 8 9 169423 CASAVA_Build 3 108255369 1I TATAAGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 41 1 32 8 T 10 11 169424 CASAVA_Build 3 108264172 1I AGTCCTCACT -/G TAACACTATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 169425 CASAVA_Build 3 108289215 2I AACATTTGAT --/TA TATATATATA 3070 het 546 hom 30 2 17 11 TA 7 8 169426 CASAVA_Build 3 108289744 1D CACATGGAAG T/- TTAAAGCAGG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 3 2 169427 CASAVA_Build 3 108303274 8D GGGGTGACCA GCTTCTTC/-------- GCTTCTTCGC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 GCTTCTTC 2 1 169428 CASAVA_Build 3 108307959 1I TAATGTTCCA -/C AAGATCTGTC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 C 0 1 169429 CASAVA_Build 3 108321231 1D TCTCATTTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 10 9 169430 CASAVA_Build 3 108325970 2I CCATTACTAT --/TC TCTCTGAGAA 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 TC 2 3 169431 CASAVA_Build 3 108338424 1I GCAGAAAGCC -/T TTTTCCACAG 3070 het 3070 ref 53 23 22 8 T 4 5 169432 CASAVA_Build 3 108344415 2D AAGAAACAAA AG/-- AGACTATTGA 3070 hom 126 het 44 0 41 3 AG 2 1 169433 CASAVA_Build 3 108372490 1I AGCATAAAGG -/T TTGGAAAATT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 2 3 169434 CASAVA_Build 3 108375670 1D TGAAAAAAAA T/- CAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 1 0 169435 CASAVA_Build 3 108399408 1I GAACTAATTT -/G GGGGGGGTAC 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 G 7 8 169436 CASAVA_Build 3 108400973 3I TATTTTGCAA ---/AAT AATAATACAC 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 AAT 2 3 169437 CASAVA_Build 3 108411817 1I AGCTGGGGGG -/C GGGGGATTAT 3070 het 230 hom 37 7 17 13 C 0 1 169438 CASAVA_Build 3 108428294 1I GTCTTTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 11 14 A 14 15 169439 CASAVA_Build 3 108438522 5D TGTTCTCATA GAGTT/----- ATTAATTTAT 3070 het 3070 hom 54 24 28 4 GAGTT 1 0 169440 CASAVA_Build 3 108439838 1D TAGATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 T 11 10 169441 CASAVA_Build 3 108445428 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 A 9 8 169442 CASAVA_Build 3 108446660 1D CCCCCCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 30 4 13 13 T 13 12 169443 CASAVA_Build 3 108449084 1I AAGTCTCAAG -/A AATTTCAAAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 2 3 169444 CASAVA_Build 3 108474091 4D TAATCTGCTA AAGT/---- AAGCAACCCC 3070 het 3070 hom 46 18 24 5 AAGT 1 0 169445 CASAVA_Build 3 108476240 1I AAATGATCAT -/G CAAATGGGCA 3070 het 3070 ref 61 27 27 7 G 0 1 169446 CASAVA_Build 3 108476698 3D CATTAAAAAA AAC/--- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 AAC 1 0 169447 CASAVA_Build 3 108480565 1D CTTAATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 11 10 169448 CASAVA_Build 3 108523329 9D TGGGATGTTA TAGGAGTTC/--------- TAGGAGTTCT 3070 het 3070 ref 47 22 17 13 TAGGAGTTC 3 2 169449 CASAVA_Build 3 108526624 4I TGAATGAATG ----/AATT AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 AATT 0 1 169450 CASAVA_Build 3 108552731 1D TATTCTAGTA T/- ATCAATATTT 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 T 1 0 169451 CASAVA_Build 3 108556880 1I CATTTTGAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 9 10 169452 CASAVA_Build 3 108557964 1D TCACAGATTA T/- TATTTTGTGT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 2 1 169453 CASAVA_Build 3 108567292 1D CTGTACTCAG T/- TTTAGACTAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 4 3 169454 CASAVA_Build 3 108567527 2D AATTAAAAAT AA/-- AAAGAGATAT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 5 3 169455 CASAVA_Build 3 108574553 4D TGTTGTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 1972 hom 13 het 16 0 6 11 TTTG 4 3 169456 CASAVA_Build 3 108584625 4D GCTAGGTGTG AACA/---- AACAGAGATG 3070 het 3070 hom 50 17 29 4 AACA 2 1 169457 CASAVA_Build 3 108588829 1D TTACTTATTA T/- TTTTCCTGTA 1764 het 1764 ref 33 17 5 13 T 5 4 169458 CASAVA_Build 3 108591207 1I CCTTTGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 722 hom 33 2 27 4 T 10 11 169459 CASAVA_Build 3 108594708 1I TAAATACTAC -/T TTGTGTGATT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 2 3 169460 CASAVA_Build 3 108616224 1D GTCATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 13 12 A 12 11 169461 CASAVA_Build 3 108618874 1D AATAAAATTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 9 8 169462 CASAVA_Build 3 108621580 1D GAATTGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 11 T 11 10 169463 CASAVA_Build 3 108625210 1I TATTTGAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 T 13 14 169464 CASAVA_Build 3 108643065 2D TTTTTTTCTC TT/-- GATTGTTTCT 3070 hom 102 het 38 0 34 7 T 2 0 169465 CASAVA_Build 3 108645044 1D ATTTGGAGTG T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 157 het 55 0 53 3 T 7 6 169466 CASAVA_Build 3 108658797 1I GAAACATCTA -/T TAGATCAGCA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 1 2 169467 CASAVA_Build 3 108669168 1D GTCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 964 het 964 ref 27 10 3 14 A 17 16 169468 CASAVA_Build 3 108674228 1D AATGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 2122 hom 17 het 11 0 6 5 A 11 10 169469 CASAVA_Build 3 108679531 4D AGTCAGACAT AGAA/---- AGAAAAATAT 3070 het 3070 hom 25 7 14 4 AGAA 2 1 169470 CASAVA_Build 3 108681956 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 43 0 33 12 A 10 9 169471 CASAVA_Build 3 108682852 1D TTTCCTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 278 hom 37 1 30 6 A 11 10 169472 CASAVA_Build 3 108694753 1I GCAACTGGCC -/T TTTAAATAGT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 3 4 169473 CASAVA_Build 3 108707699 3D GTCCCTATCC TCT/--- TCTTCTCCTC 3070 het 3070 hom 20 9 11 1 TCT 3 2 169474 CASAVA_Build 3 108707990 3I GAAGCAAGAG ---/AGA AGATGTGTAG 3070 hom 141 het 49 0 48 1 AGA 1 2 169475 CASAVA_Build 3 108712051 1D GACCATACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 12 11 169476 CASAVA_Build 3 108712577 4I ATCATCTTAT ----/TTAA TTCTCATAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTAA 0 1 169477 CASAVA_Build 3 108714235 1I CTCATCTCTA -/C CCCCCCGCCA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 C 6 7 169478 CASAVA_Build 3 108716554 2D55M2D TGCCTTCCTG TCTTACTAGTTCTCTACTTTTACACCGGTAACCAAAAAACCTTCTTTGCATGCAATGTT/--TTACTAGTTCTCTACTTTTACACCGGTAACCAAAAAACCTTCTTTGCATGCAATG-- TTTTTTTTCT 3070 het 2256 hom 23 7 10 21 N/A 0 0 169479 CASAVA_Build 3 108736782 1I TTCTCCCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 T 10 11 169480 CASAVA_Build 3 108768094 1D ACCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2304 hom 28 7 11 10 T 15 14 169481 CASAVA_Build 3 108769803 1I TTTTCTGCTA -/T TTTTTTTTTT 1560 het 86 hom 15 2 9 4 T 17 18 169482 CASAVA_Build 3 108779954 4D CTTGACTGAA AGAT/---- AGAGTGAGGT 3070 het 3070 hom 54 22 27 8 AGAT 1 0 169483 CASAVA_Build 3 108801463 2I AAAGATTAAT --/GA GAGAGACTCC 3070 hom 57 het 26 0 19 7 GA 3 4 169484 CASAVA_Build 3 108812391 2D TTTACATCAC AT/-- GTTATTATTG 2920 het 2920 ref 30 18 7 6 AT 1 0 169485 CASAVA_Build 3 108822471 2D TTTCTGCGGA GT/-- GTGTGTGTGG 2390 het 1836 hom 24 8 8 8 GT 5 4 169486 CASAVA_Build 3 108828192 2D TTCCATAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2120 het 1760 hom 37 15 8 14 T 18 16 169487 CASAVA_Build 3 108830598 4D ATTTCTAAGG TAGT/---- TAGTTAAGCT 3070 het 3070 hom 39 14 19 8 TAGT 2 1 169488 CASAVA_Build 3 108833081 1I AGAATTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 11 12 169489 CASAVA_Build 3 108845741 4D TCCTGAAAGA ACTT/---- ACTTACGTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 ACTT 2 1 169490 CASAVA_Build 3 108851187 2I AAAATGTGTT --/TA TGTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 TA 0 1 169491 CASAVA_Build 3 108853728 4I CTCAAATGAA ----/CTTT CTTTGTTTCT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 CTTT 1 2 169492 CASAVA_Build 3 108853912 9D ATTTGTAAAA TTTACCAGT/--------- TTTTCTGTGT 1819 het 1819 ref 16 5 5 7 TTTACCAGT 1 0 169493 CASAVA_Build 3 108900328 1I TAGAGAGTCA -/T TTTTTTCTCT 2745 het 2745 ref 22 11 7 4 T 6 7 169494 CASAVA_Build 3 108919825 3D ATTGTTAATT ATA/--- ATAGTATTAA 1207 het 1207 ref 7 3 3 1 ATA 2 1 169495 CASAVA_Build 3 108927997 3I TCCACTCAAT ---/TTA TTATACTTGA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 TTA 1 2 169496 CASAVA_Build 3 108933249 1D TTTTTTGCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 T 10 9 169497 CASAVA_Build 3 108946147 1D AAGAAAATAT G/- ATATCTTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 1 0 169498 CASAVA_Build 3 108952626 1I TGTGTTTTTT -/A AAAAAACACC 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 6 7 169499 CASAVA_Build 3 108958735 1I CTTTAAACAG -/T TTTTTTTTTG 535 het 535 ref 49 35 3 11 T 9 10 169500 CASAVA_Build 3 108962255 2I GGGAAAAAAC --/AA TGATGATGGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 2 169501 CASAVA_Build 3 108967534 1D TTTTCATATT A/- GTAGACAAGA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 1 0 169502 CASAVA_Build 3 108970288 1I GTGACCTATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 9 169503 CASAVA_Build 3 108972942 1D CGTGAAATTT G/- GGGAGTTTTG 3070 hom 108 het 39 0 37 3 G 4 3 169504 CASAVA_Build 3 108973631 1D ATTCCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 11 10 169505 CASAVA_Build 3 108987172 1D AATGCCCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 29 13 6 A 10 9 169506 CASAVA_Build 3 109006803 1I GTAACAGCAG -/T TAACTGTTAA 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 T 1 2 169507 CASAVA_Build 3 109035229 1D TCATATTTTC T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 T 7 6 169508 CASAVA_Build 3 109037915 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 A 8 7 169509 CASAVA_Build 3 109038661 1I GATTTCCTTG -/T TTTTTTAAGG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 7 169510 CASAVA_Build 3 109038833 5I TTTTTGCCTT -----/CTCTA CAGCATAGTG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 CTCTA 0 1 169511 CASAVA_Build 3 109055993 2D TGATTAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 70 het 31 0 23 8 AT 9 8 169512 CASAVA_Build 3 109064824 2D GAGTTCCTAT TA/-- TATATATATC 3070 het 3070 hom 38 10 21 9 TA 5 4 169513 CASAVA_Build 3 109067373 4D TATATTAAGG CTCT/---- CTAATTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 CT 3 1 169514 CASAVA_Build 3 109081036 1D GCACCCTTTT A/- AAGTGTACAG 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 3 2 169515 CASAVA_Build 3 109085586 1D TCAAACACCT A/- TTAAGCAAAC 2252 het 2252 ref 22 15 6 3 A 1 0 169516 CASAVA_Build 3 109092637 1I CTCAGTCTCA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 23 2 16 5 C 0 1 169517 CASAVA_Build 3 109103108 1D CAGTCATGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 48 16 22 10 T 10 9 169518 CASAVA_Build 3 109115402 2D TCTTTTCTCT CA/-- AATAGCAAAA 3070 het 3070 hom 46 21 23 5 CA 1 0 169519 CASAVA_Build 3 109116549 1I CTACAACACA -/T TTACGTTCTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 2 3 169520 CASAVA_Build 3 109121259 1D GGCTGCTGCT C/- CCAGCCACAA 2355 het 2355 ref 40 19 11 12 C 3 2 169521 CASAVA_Build 3 109144065 3D4M8D CGTTAGAACT ATGCCTCAAATAAGA/---CCTC-------- GTAGGTATGC 3070 het 3070 hom 39 16 24 3 N/A 0 0 169522 CASAVA_Build 3 109149340 2D GCATTTCAAC AG/-- AGAGAGAGGG 3070 hom 108 het 42 0 37 6 AG 5 4 169523 CASAVA_Build 3 109150218 3D ATCTGGATTC AAT/--- TATCCAGAAA 3070 het 3070 hom 35 15 20 1 AAT 1 0 169524 CASAVA_Build 3 109152399 1D TGGCTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2220 hom 37 6 15 17 A 15 14 169525 CASAVA_Build 3 109159353 1D TGATTTTTAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 45 14 29 2 T 8 7 169526 CASAVA_Build 3 109170450 1D GTGTGGGAGT G/- GGGGGGTATA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 7 6 169527 CASAVA_Build 3 109173458 4I GGGTTTAAAG ----/AGTA AGTAAGTTGA 3070 het 3070 hom 49 23 21 5 AGTA 1 2 169528 CASAVA_Build 3 109174214 2D CTGTCTGAAA AT/-- AAAAAAGAGA 2991 het 2991 ref 20 10 7 5 AT 1 0 169529 CASAVA_Build 3 109175292 1D CTTCTATCTT C/- TTTATAGGGA 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 C 1 0 169530 CASAVA_Build 3 109176405 2I TCTATGTATT --/TA TATATATATA 1584 het 1584 ref 18 9 4 5 TA 8 9 169531 CASAVA_Build 3 109185221 1D TGCCTTCAGA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 7 6 169532 CASAVA_Build 3 109186423 1I CAGTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 11 169533 CASAVA_Build 3 109189134 8D GTTACTGTGA TTTGGGAC/-------- TTTCTACCCC 3070 hom 102 het 38 0 33 10 TTTGGGAC 1 0 169534 CASAVA_Build 3 109204290 1D AGGCACACAC T/- AAAAAGGTGG 3070 hom 90 het 32 0 28 4 T 1 0 169535 CASAVA_Build 3 109208313 1I GATTAAACAG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 7 8 169536 CASAVA_Build 3 109219977 4I CCCATTGCAC ----/TCGA CCGAATGATC 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 TCGA 0 1 169537 CASAVA_Build 3 109220528 1I AGCTCATGCT -/A ACTTCTAAAT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 1 2 169538 CASAVA_Build 3 109223610 3D GAGACAGAGT AGG/--- AACAAGGCTT 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 AGG 1 0 169539 CASAVA_Build 3 109230997 1I TTTTAATGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 4 het 35 1 30 4 T 9 10 169540 CASAVA_Build 3 109247097 1I TGTATACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 10 11 169541 CASAVA_Build 3 109302927 1D GGATAATTCT C/- TTAATTTTGT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 C 1 0 169542 CASAVA_Build 3 109312218 5D TCCCACCAAC CAACT/----- CAACTATTCC 3070 hom 83 het 31 0 25 7 CAACT 2 1 169543 CASAVA_Build 3 109313034 1I ATTTATAAAG -/A ACAGAATTTT 3070 hom 86 het 32 0 28 4 A 1 2 169544 CASAVA_Build 3 109317951 1I TTTTATTTTT -/A TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 0 1 169545 CASAVA_Build 3 109320893 1D GCTGAAAAAG A/- AATATGGAAA 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 3 2 169546 CASAVA_Build 3 109322866 3D CAGGCTGTAC AGA/--- AGATGTCTAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 6 AGA 2 1 169547 CASAVA_Build 3 109328530 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 2442 het 840 hom 10 3 6 1 G 4 5 169548 CASAVA_Build 3 109340701 1D TATTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 9 12 T 11 10 169549 CASAVA_Build 3 109342848 1D GTGGTAGCTT A/- CACCTGTAAT 2870 het 1706 hom 15 6 6 3 A 1 0 169550 CASAVA_Build 3 109349121 1D GTAGGTAAAA G/- GTAGTCCTGG 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 G 2 1 169551 CASAVA_Build 3 109362017 4D TATTAATCTA TACT/---- TACTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 TACT 2 1 169552 CASAVA_Build 3 109362760 1D GTTTTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 2414 het 2414 ref 21 11 7 4 T 11 10 169553 CASAVA_Build 3 109363074 1D GAAAATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 12 11 169554 CASAVA_Build 3 109368007 2D AAGGACTGTC TT/-- TTTCCTTTGA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 5 3 169555 CASAVA_Build 3 109372206 1I ATGTGGAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 11 12 169556 CASAVA_Build 3 109375882 3D GTGTCAAAAT GAA/--- GAAGAAGAAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 GAA 4 3 169557 CASAVA_Build 3 109377340 1D AACCTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 A 13 12 169558 CASAVA_Build 3 109381443 1I ATATTACTTT -/A AAAAAAGTAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 6 7 169559 CASAVA_Build 3 109394446 1D ACAAAATGTC T/- GAATTTTACT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 1 0 169560 CASAVA_Build 3 109396015 1I TCACAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3051 het 3051 ref 23 10 9 4 A 11 12 169561 CASAVA_Build 3 109420654 1I CTTTGTAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 9 10 169562 CASAVA_Build 3 109422252 1I CTGAAACAGA -/C TGCTAGGCCC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 C 0 1 169563 CASAVA_Build 3 109423260 1I67M2D CTGGAGGCGA -ATTTTGGACGGTCTTATAATTTTTCTAGACATTTACTTGTGTTTTTCTGAGTTTTCTTCAATGAGTATT/GATTTTGGACGGTCTTATAATTTTTCTAGACATTTACTTGTGTTTTTCTGAGTTTTCTTCAATGAGTA-- TGTTTCATCT 3070 hom 172 het 37 0 58 4 N/A 0 0 169564 CASAVA_Build 3 109427315 1D CTTATATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 27 1 21 5 T 12 11 169565 CASAVA_Build 3 109428603 5I AGGAGTTCGT -----/AAAAG AAAAGACTTA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AAAAG 1 2 169566 CASAVA_Build 3 109436034 1D GTGAGGCAGA G/- TTCTTCTAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 0 169567 CASAVA_Build 3 109441198 4D ATTAATTGAG AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 hom 53 25 23 6 AATT 3 2 169568 CASAVA_Build 3 109443443 1I TTTGCCCTGT -/G GGGCTGACTA 3070 het 3070 ref 55 26 24 5 G 3 4 169569 CASAVA_Build 3 109444025 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 11 10 169570 CASAVA_Build 3 109450864 5I GGGGAAGTAA -----/TAACT TAAGTTATCC 3070 het 3070 ref 40 20 13 8 TAACT 0 1 169571 CASAVA_Build 3 109454696 1I AATTTGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 27 10 T 10 11 169572 CASAVA_Build 3 109456290 1D CATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1474 het 1474 ref 36 26 5 5 T 13 12 169573 CASAVA_Build 3 109457546 1I TGTGAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 9 10 169574 CASAVA_Build 3 109465225 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATT 2147 het 2147 ref 15 6 5 5 A 9 8 169575 CASAVA_Build 3 109480086 1I ACTCTTTTAG -/C CGTGGCTAGA 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 C 1 2 169576 CASAVA_Build 3 109480368 1I CAGGCTTCTA -/T TTTTTTTTTT 1970 het 1970 ref 21 11 5 5 T 11 12 169577 CASAVA_Build 3 109484881 1I TTACATAAAG -/A AGTAAATAGT 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 A 1 2 169578 CASAVA_Build 3 109489576 2D TCTTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 88 het 62 hom 13 1 2 10 T 18 16 169579 CASAVA_Build 3 109490440 1D TTTATATATA T/- TTATTTAAAT 2052 het 990 hom 8 2 5 1 T 3 2 169580 CASAVA_Build 3 109491050 9D CAGTTGGTTT TTCTTGATC/--------- TTGTGCTCGT 3070 het 3070 ref 37 21 14 5 TTCTTGATC 1 0 169581 CASAVA_Build 3 109491671 1I GATTGGAAAT -/G TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 G 0 1 169582 CASAVA_Build 3 109514049 2I GTATACACTC --/TT TTCCAGAGAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 2 4 169583 CASAVA_Build 3 109543146 1D TTAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 45 19 20 7 A 9 8 169584 CASAVA_Build 3 109545693 2I38M1I TGGGAAAAAC --AGTCAAAGCCTTGTCCTGAGTATGGTGCCACTGTTTGA-/AGAGTCAAAGCCTTGTCCTGAGTATGGTGCCACTGTTTGAT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 19 27 7 N/A 0 0 169585 CASAVA_Build 3 109547659 2I CCCCCAAAAC --/AT GTTAGCACAT 3070 het 3070 ref 48 21 15 12 AT 0 1 169586 CASAVA_Build 3 109550186 1D GACAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2150 hom 18 6 12 0 T 12 11 169587 CASAVA_Build 3 109561645 7D CTGTGTAGCC ATCCTCT/------- ATCCTCTACT 3070 het 3070 ref 35 15 14 10 ATCCTCT 2 1 169588 CASAVA_Build 3 109565510 5D AGTGACTTAC TTCTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 TTCTT 1 0 169589 CASAVA_Build 3 109574971 2I CAGGGATGCC --/CT CTCTCACCAC 3070 het 799 hom 9 2 7 0 CT 2 3 169590 CASAVA_Build 3 109580973 5D AGAACTTACT TAAAG/----- TAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 12 3 TAAAG 1 0 169591 CASAVA_Build 3 109589134 1I CAATAAGAAG -/A AATCAATGGG 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 A 2 3 169592 CASAVA_Build 3 109597878 1I CCAGGTAGCA -/G GGGTTGGGGG 1509 het 1509 ref 28 11 5 12 G 3 4 169593 CASAVA_Build 3 109600047 1I GTATGAACAT -/G GCCTTGCTTC 3070 het 3070 ref 48 27 10 11 G 1 2 169594 CASAVA_Build 3 109602911 8D AGTGAAAATG TGACCGTC/-------- TGCAAGCCAA 3070 het 3070 hom 71 33 37 8 TGACCGTC 1 0 169595 CASAVA_Build 3 109603657 1D AAATAAGAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 T 9 8 169596 CASAVA_Build 3 109604874 1D TTTAACTTAC T/- TACCAGGTCC 3070 het 3070 hom 36 13 17 7 T 2 1 169597 CASAVA_Build 3 109605525 1D TATTTGTTGC T/- TTTTTTTTTT 1238 het 1238 ref 38 24 4 10 T 13 12 169598 CASAVA_Build 3 109611598 15D GATCTGCGAC TTATCAAATGTGAAT/--------------- TTGAACAAGT 3070 het 3070 ref 37 25 9 5 TTATCAAATGTGAAT 1 0 169599 CASAVA_Build 3 109618297 2D ACTATTTTTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 11 9 169600 CASAVA_Build 3 109620175 1D ATCTTGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 21 0 14 7 T 13 12 169601 CASAVA_Build 3 109620295 3I CAGCCTCCCG ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TGT 4 5 169602 CASAVA_Build 3 109633594 4D AATGCATTCA GTTT/---- TGTTTTGTTT 108 het 108 ref 33 22 2 9 GTTT 1 0 169603 CASAVA_Build 3 109635644 22D ATATTAAATA TGTATTTAATATTAAATATTGT/---------------------- TGTATTTAAT 3070 hom 27 het 16 0 10 6 TGTATTTAATATTAAATATTGT 2 1 169604 CASAVA_Build 3 109636109 5I TATTAATTCA -----/ATAAT ATATTTTTCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 ATAAT 0 1 169605 CASAVA_Build 3 109639324 4I CCTTCTGGAA ----/AAAG AAAGAAAGAC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 AAAG 2 3 169606 CASAVA_Build 3 109644310 2D AAAATATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1910 het 549 hom 21 2 5 14 T 14 12 169607 CASAVA_Build 3 109644943 2I CACTAAATTT --/TC TCTGTTTTTA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TC 1 2 169608 CASAVA_Build 3 109645401 1D GGCATCTTTA T/- TTTTTTTTTT 2452 het 2452 ref 26 11 6 10 T 13 12 169609 CASAVA_Build 3 109647388 3D TTTGAAAGAA GAC/--- CAAATAAAAT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 GAC 1 0 169610 CASAVA_Build 3 109648289 1D CCCAGTCAAA G/- CCAGTCCATA 3070 hom 123 het 47 0 39 9 G 1 0 169611 CASAVA_Build 3 109659169 1D CATGAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 12 11 169612 CASAVA_Build 3 109659591 1I TCTCAAATTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2736 hom 39 8 19 12 T 8 9 169613 CASAVA_Build 3 109660291 1D TGAAAACATT A/- AAAAAAAAAA 1210 het 1210 ref 34 29 3 3 A 11 10 169614 CASAVA_Build 3 109661910 1D TATAGCTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 13 12 169615 CASAVA_Build 3 109667471 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 7 8 169616 CASAVA_Build 3 109669506 1D TGATATAAAC T/- TTTTTTTTTT 1422 het 1422 ref 21 12 4 5 T 15 14 169617 CASAVA_Build 3 109680151 1I ATGTGCCTGG -/T CAACCTGAGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 0 1 169618 CASAVA_Build 3 109680218 1D GTCCAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1330 hom 27 7 12 8 A 13 12 169619 CASAVA_Build 3 109684954 1D TGGCTACTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 9 A 12 11 169620 CASAVA_Build 3 109704691 1D TCAAAGAAGG A/- CAAGCAGGAC 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 A 1 0 169621 CASAVA_Build 3 109708992 1D CTCAGTCACC A/- ACCATCACCT 3070 hom 71 het 29 0 22 7 A 2 1 169622 CASAVA_Build 3 109711346 1D GAACTTAGCC T/- TTTTTTTTTA 1741 het 1741 ref 44 32 4 8 T 10 9 169623 CASAVA_Build 3 109745476 6I CAGTTTTAAA ------/AACTAG TTCCCAAGCT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 AACTAG 0 1 169624 CASAVA_Build 3 109747232 8D ATATACACAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 47 22 17 9 AC 11 7 169625 CASAVA_Build 3 109749072 1I TCTTGTAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 9 10 169626 CASAVA_Build 3 109755105 1I AGTAGAAAAT -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 6 7 169627 CASAVA_Build 3 109768722 1D AATGATTTCA G/- GGTTTCACAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 G 3 2 169628 CASAVA_Build 3 109769638 1I GCAATACTAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 A 8 9 169629 CASAVA_Build 3 109771787 4D GATCTCCTTG TCTC/---- TCTATTTCCA 3070 het 3070 ref 27 12 13 3 TC 3 1 169630 CASAVA_Build 3 109774285 1D TATACTCTCA C/- GTCATCTGAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 C 1 0 169631 CASAVA_Build 3 109776954 8D TATGTATACA TATACATG/-------- TATACATACA 3070 het 3070 hom 49 20 27 7 TATACATG 1 0 169632 CASAVA_Build 3 109780039 1D AGCTTTCATT A/- AAATAAAACT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 4 3 169633 CASAVA_Build 3 109783169 1I TTTTACACGC -/A AAAAAAAAAA 1537 het 1537 ref 33 26 5 2 A 11 12 169634 CASAVA_Build 3 109790029 5D ATCATAGGGT TAATA/----- TAATACAATA 3070 het 3070 ref 28 13 13 5 TAATA 2 1 169635 CASAVA_Build 3 109801884 1D TGTAATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 T 12 11 169636 CASAVA_Build 3 109809741 3I AATTGATAAT ---/AAC TAATTATATA 3070 het 3070 ref 34 22 12 0 AAC 0 1 169637 CASAVA_Build 3 109818953 1D ATATTCTGTC T/- TTTTAAACCA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 5 4 169638 CASAVA_Build 3 109825837 3D ATACATTATC GTT/--- ATTATTAGAT 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 GTT 1 0 169639 CASAVA_Build 3 109835602 1D ACAATACTCT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 8 7 169640 CASAVA_Build 3 109838114 1D ACATCAGTGA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 7 6 169641 CASAVA_Build 3 109838266 1D TGTTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 20 1 17 3 T 12 11 169642 CASAVA_Build 3 109839192 11I GCATTAAATT -----------/TTAAGGTAGTA TTAAGGTATG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TTAAGGTAGTA 0 1 169643 CASAVA_Build 3 109841857 1I ATACTATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 10 11 169644 CASAVA_Build 3 109873281 4D ACTAGCTAAC ATTT/---- ATTTATTAGT 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 ATTT 2 1 169645 CASAVA_Build 3 109885585 2D TCCAATATTC AT/-- ATGTTTCATT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AT 2 1 169646 CASAVA_Build 3 109896523 2D AAAATATCCA AG/-- AAGACAGTTA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 AG 1 0 169647 CASAVA_Build 3 109903199 1D TTACTTGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 11 10 169648 CASAVA_Build 3 109938015 2D CTGTTCAGAA TT/-- TGCCTTTGGT 3070 het 3070 ref 57 32 22 4 T 3 1 169649 CASAVA_Build 3 109940496 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 13 12 169650 CASAVA_Build 3 109945035 1I GATTCTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 893 hom 35 2 28 5 A 10 11 169651 CASAVA_Build 3 109950127 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3029 het 717 hom 16 3 8 7 T 7 8 169652 CASAVA_Build 3 109962620 1D AGAGGATAGG C/- ACGCTCAAGA 3070 het 3070 ref 39 19 14 8 C 1 0 169653 CASAVA_Build 3 109965468 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 11 10 169654 CASAVA_Build 3 109967304 1I CAGCTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1407 hom 26 4 15 7 A 11 12 169655 CASAVA_Build 3 109974740 1I TAGGAAACTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 9 10 169656 CASAVA_Build 3 109976439 1I GATAAAAACT -/G GGGGGGCACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 6 7 169657 CASAVA_Build 3 109979505 1D CAACTGAGCT G/- GGTGCTCCAG 3070 hom 141 het 49 0 47 2 G 3 2 169658 CASAVA_Build 3 109981079 1D GGAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 11 10 169659 CASAVA_Build 3 109987590 1D TTGTATGTTG T/- ATTTTGTATT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 0 169660 CASAVA_Build 3 109988153 1I GTTTGTAGAA -/G GAAAAAATAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 1 2 169661 CASAVA_Build 3 109988799 2D ACAGCATATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 13 11 169662 CASAVA_Build 3 109993928 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 31 2 13 17 A 17 15 169663 CASAVA_Build 3 109995595 1D AAAACATCAT C/- CTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 2 1 169664 CASAVA_Build 3 109996034 8D GGTAGACTTA CATTTATG/-------- CATTTATGTA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 CATTTATG 2 1 169665 CASAVA_Build 3 110017114 6D ATATTCTTGC CTTGTA/------ CCTATTTTAG 3070 het 3070 ref 32 20 12 1 CTTGTA 1 0 169666 CASAVA_Build 3 110021897 1D TGAAAAGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 T 10 9 169667 CASAVA_Build 3 110024622 2D ATTTTGAAAC AT/-- GTTAATGAGT 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 AT 1 0 169668 CASAVA_Build 3 110026662 1D AGATGATAGT A/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 1 0 169669 CASAVA_Build 3 110027765 18I TAGTGAGATT ------------------/CAGTGATTTGCACACAAC CAGCCACACA 3070 het 3070 hom 40 18 17 6 CAGTGATTTGCACACAAC 0 1 169670 CASAVA_Build 3 110042075 1I GGGCAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 11 13 15 A 15 16 169671 CASAVA_Build 3 110051844 1I ACTTTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 10 T 14 15 169672 CASAVA_Build 3 110053166 2D CTCCAATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 18 12 A 14 12 169673 CASAVA_Build 3 110053408 11D ACTTGATAAA GTTGACCAAGT/----------- GTTGACCACA 2063 het 2063 ref 22 15 6 3 GTTGACCAAGT 1 0 169674 CASAVA_Build 3 110062364 1D GACTGCGCCA C/- TGCACTCCAA 3070 het 1180 hom 21 4 10 7 C 1 0 169675 CASAVA_Build 3 110067428 2I ACCCCAATTA --/CT TTTGCACCAA 3070 hom 62 het 27 0 20 7 CT 0 1 169676 CASAVA_Build 3 110068057 1D CATCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1905 hom 20 5 11 5 A 12 11 169677 CASAVA_Build 3 110068723 4I ATAGATTAAT ----/AAAC AAATTGATAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAAC 0 1 169678 CASAVA_Build 3 110070515 1D ATGAAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 21 1 15 5 A 13 12 169679 CASAVA_Build 3 110075177 1I CTCTTAGTCC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 63 het 36 1 33 2 T 7 8 169680 CASAVA_Build 3 110075477 3D TATTACAAAT ATA/--- ATGATATTGA 3070 het 3070 hom 35 15 19 2 ATA 1 0 169681 CASAVA_Build 3 110075581 1D GAAACACATA C/- CTAAGTAGTA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 2 1 169682 CASAVA_Build 3 110076770 2D CAGGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 AG 6 5 169683 CASAVA_Build 3 110086483 1I ATTTTTGCCT -/A AAAGGATGAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 3 4 169684 CASAVA_Build 3 110095824 4D ACTGTCAATC TAGA/---- TAGATAGTTA 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 TAGA 2 1 169685 CASAVA_Build 3 110097697 1I CAGGGGCTGT -/G GGGGTCCGGG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 G 4 5 169686 CASAVA_Build 3 110114249 3I TGTTAATTTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 15 18 169687 CASAVA_Build 3 110120759 1D TCCTATGTTC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 T 7 6 169688 CASAVA_Build 3 110134912 1D ATACATCATG T/- TCTGGAGTGG 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 2 1 169689 CASAVA_Build 3 110139788 2D CATAGCATCA CT/-- ATCTGTGAAA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 CT 1 0 169690 CASAVA_Build 3 110142601 1I GGGCTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 A 10 11 169691 CASAVA_Build 3 110157432 1I CTGACTTTTT -/A ATCACCATTA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 1 2 169692 CASAVA_Build 3 110158324 1I ACCCCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 10 11 169693 CASAVA_Build 3 110164327 1D AACCTATCAC A/- TAACTCAATT 3070 het 3070 ref 46 21 20 6 A 1 0 169694 CASAVA_Build 3 110170299 1I ATGCACTAAT -/G ATGGAGCTAG 3070 hom 159 het 60 0 53 7 G 0 1 169695 CASAVA_Build 3 110170493 1I AGTACCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 39 0 29 10 T 11 12 169696 CASAVA_Build 3 110173816 1I ACCACATCTT -/A AAAGTGTATA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 3 4 169697 CASAVA_Build 3 110175132 2D CTTTGTTTTG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 22 1 18 3 GT 1 0 169698 CASAVA_Build 3 110184476 1D14M1D CTAGTTTTGG TTTTTTTTTAAATGCA/-TTTTTTTTAAATGC- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 3 N/A 0 0 169699 CASAVA_Build 3 110184749 1D AGCACTGGGG A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 A 7 6 169700 CASAVA_Build 3 110186082 2I GAAAAGGTTT --/GG GGGGGTAAGG 3070 hom 107 het 48 0 36 12 G 5 7 169701 CASAVA_Build 3 110188406 1I CATGAGCTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 9 10 169702 CASAVA_Build 3 110195739 2D CAGAGGATAC AT/-- GTTTCATAAT 3070 het 3070 ref 46 27 18 4 AT 1 0 169703 CASAVA_Build 3 110201414 1I TTTTAGTGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 8 9 169704 CASAVA_Build 3 110208539 4D ATGACACAAA TTGC/---- TTAATCCTAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TTGC 1 0 169705 CASAVA_Build 3 110210218 1D TTGTATTTTC T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 7 6 169706 CASAVA_Build 3 110217320 7I CTCTGCCACG -------/CCATCCT CATAATCCTC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CCATCCT 0 1 169707 CASAVA_Build 3 110218703 4D CTGAGCTTGG CAAT/---- CAATCGCCTT 3070 hom 111 het 41 0 36 7 CAAT 2 1 169708 CASAVA_Build 3 110229772 1I ACTGCCATTT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 C 8 9 169709 CASAVA_Build 3 110234558 3D CACCAACAAG TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 99 het 45 0 34 11 TTA 5 4 169710 CASAVA_Build 3 110234655 2D TTCTAAAACC AA/-- ATTAATAATT 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 A 3 1 169711 CASAVA_Build 3 110237011 1I ATTATCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 10 11 169712 CASAVA_Build 3 110239825 1D GTTGATGGGG T/- TTTTTTTTTT 2985 het 2985 ref 20 9 7 4 T 12 11 169713 CASAVA_Build 3 110246880 1I AAAGCTAATG -/T TAACAGCCAG 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 T 1 2 169714 CASAVA_Build 3 110251551 1D TCAAATACCT G/- GGGGGGCTGC 3070 het 2448 hom 29 12 12 5 G 7 6 169715 CASAVA_Build 3 110255059 1I ACTAATGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 21 19 2 A 10 11 169716 CASAVA_Build 3 110259226 1I CCAGTCAAAC -/A AAAGGATTTA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 3 4 169717 CASAVA_Build 3 110260363 1D TTCTTCTATT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 8 7 169718 CASAVA_Build 3 110261800 1I TTTTTGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 A 12 13 169719 CASAVA_Build 3 110262535 1D AAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2517 hom 27 8 14 5 A 11 10 169720 CASAVA_Build 3 110266122 1D ATTTAAGTTG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 9 8 169721 CASAVA_Build 3 110266800 3D AATACAGCCA CTT/--- CTTCTTGTCA 3070 het 3070 hom 61 26 31 7 CTT 3 2 169722 CASAVA_Build 3 110267912 8D AACCTCCACC TCCTGGGT/-------- TCAAGTGAGT 3070 het 139 hom 10 1 8 2 TCCTGGGT 1 0 169723 CASAVA_Build 3 110268504 9I TCAAAAATGG ---------/ACACAAAAC ATGCATGGTG 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 ACACAAAAC 0 1 169724 CASAVA_Build 3 110270580 1D GTAATCCCAG C/- TACTGGGGAG 1727 het 1727 ref 11 6 4 1 C 1 0 169725 CASAVA_Build 3 110271392 1I TTATTGTTAC -/T TACAAGAAGC 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 T 1 2 169726 CASAVA_Build 3 110274948 3D GATTCTGCCA CTT/--- TGATTGGACA 3070 het 3070 ref 50 29 17 6 CTT 1 0 169727 CASAVA_Build 3 110288717 3I CCACCTGGCA ---/AAC AACAAGGGAG 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 AAC 1 2 169728 CASAVA_Build 3 110315314 1D ATTAGAGACA G/- TAAAATACGA 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 G 1 0 169729 CASAVA_Build 3 110316992 1I TGTAATTAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 8 9 169730 CASAVA_Build 3 110326680 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1560 het 1343 hom 15 6 6 3 A 15 16 169731 CASAVA_Build 3 110332891 1I CCAGAAACGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 13 12 T 10 11 169732 CASAVA_Build 3 110363299 1I GACTGTGCCC -/T CTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 0 1 169733 CASAVA_Build 3 110370647 5I TTTTTATCCC -----/TAACT TAAGTTGAGT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 TAACT 0 1 169734 CASAVA_Build 3 110376461 4D AAGTGAATAC ATAA/---- ATAAATTTAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 4 ATAA 2 1 169735 CASAVA_Build 3 110380340 3D CTGGTAAAAA AAG/--- AAGGAGTTTC 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 AAG 2 1 169736 CASAVA_Build 3 110389750 1D AAAAAGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2974 hom 23 8 10 5 A 13 12 169737 CASAVA_Build 3 110407428 1D AGAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 959 hom 21 4 9 8 A 17 16 169738 CASAVA_Build 3 110407935 1I GATTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2797 hom 24 8 10 6 A 11 12 169739 CASAVA_Build 3 110413181 5I CTCAATCACA -----/AGTGT CACTAAATGC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 AGTGT 0 1 169740 CASAVA_Build 3 110433139 1D GCTCTACCCT C/- AAGCCTGGAC 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 C 1 0 169741 CASAVA_Build 3 110435738 1I GAGGTACCCA -/G GTTCTGTCAT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 G 1 2 169742 CASAVA_Build 3 110436389 1I CTGGGTGAGA -/C CCCCCCCAAC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 C 7 8 169743 CASAVA_Build 3 110439064 1D AGATAGAGAC A/- AAAAAAAAAT 2008 het 2008 ref 15 7 5 4 A 10 9 169744 CASAVA_Build 3 110452913 1D AGAAAGGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 10 9 169745 CASAVA_Build 3 110456879 1I TGGTCTCAAA -/C TCCTGACCTC 3070 hom 57 het 21 0 18 3 C 0 1 169746 CASAVA_Build 3 110468240 2I GAGACTTGCT --/TA TGAACCGGGG 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 TA 0 1 169747 CASAVA_Build 3 110469125 4D TACAATAGAT TAAC/---- TAAGAAAGCT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 TAAC 1 0 169748 CASAVA_Build 3 110470294 1I TCAGTATGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 384 hom 47 1 39 7 T 9 10 169749 CASAVA_Build 3 110474695 1D CACCCAGCTA T/- TTTTTGTATT 3070 het 3070 hom 33 16 13 6 T 6 5 169750 CASAVA_Build 3 110475830 1I CAGATATTTT -/C AGACATGCAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 0 1 169751 CASAVA_Build 3 110477283 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1868 het 1256 hom 18 5 6 7 A 11 12 169752 CASAVA_Build 3 110486630 1I TTTAGTGGAA -/G GTTTACCTAT 3070 hom 120 het 43 0 38 5 G 1 2 169753 CASAVA_Build 3 110489963 1I AGCTCATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 43 1 31 11 A 11 12 169754 CASAVA_Build 3 110493323 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 96 het 37 0 30 7 T 7 6 169755 CASAVA_Build 3 110497180 4I TTACATATAG ----/ATAT ATAGAGAGAC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AT 1 3 169756 CASAVA_Build 3 110498226 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 10 11 169757 CASAVA_Build 3 110503220 4D AGGAAAAGAG AGAA/---- AGAAAGAAGA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 AGAA 3 2 169758 CASAVA_Build 3 110520578 1I CTAGTCCTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 20 18 1 A 9 10 169759 CASAVA_Build 3 110524270 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1721 het 352 hom 6 1 4 1 A 11 10 169760 CASAVA_Build 3 110532411 7I AAAAATGGCC -------/TAAGGGT TAAGGAGCTC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 TAAGGGT 0 1 169761 CASAVA_Build 3 110539652 1I GAGGGCAAGT -/G GGGGGGGTCT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 G 7 8 169762 CASAVA_Build 3 110541386 1D TTCCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1061 het 1061 ref 21 13 3 6 T 13 12 169763 CASAVA_Build 3 110543404 1I ATCCTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 10 11 169764 CASAVA_Build 3 110556868 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 2808 hom 24 het 9 0 7 2 A 8 7 169765 CASAVA_Build 3 110568939 1D CTGACCTTAA T/- CCCCCAGTTG 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 T 1 0 169766 CASAVA_Build 3 110570293 1D AGCTAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 26 3 12 11 T 13 12 169767 CASAVA_Build 3 110570632 1D GCAGGTAGAA T/- TTTTTTTTTT 2945 het 2945 ref 32 15 9 8 T 12 11 169768 CASAVA_Build 3 110571064 2D ATGCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2872 hom 33 het 23 0 11 13 A 18 16 169769 CASAVA_Build 3 110571580 1D TTTTTTTTTT A/- AGAGATGGGG 3070 het 2030 hom 25 7 16 2 A 2 1 169770 CASAVA_Build 3 110573089 12D CAGGTACTCT TTTATCTATTTA/------------ TTTATTTATT 1384 het 1384 ref 14 7 5 2 TTTATCTATTTA 1 0 169771 CASAVA_Build 3 110573563 1D TCGGGATCCG C/- CCGCCTTGGC 3070 het 3051 hom 23 11 10 2 C 3 2 169772 CASAVA_Build 3 110576196 1D GTGCCCAGTC T/- TTTTTTTTCT 2598 het 2598 ref 22 15 6 2 T 9 8 169773 CASAVA_Build 3 110576810 1I GTGATTCACC -/A TGTTGGCCAG 2854 het 2854 ref 16 8 7 1 A 0 1 169774 CASAVA_Build 3 110577563 1D CAATTCTGCT G/- TATCAGTAGG 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 G 1 0 169775 CASAVA_Build 3 110602079 3I ACATATGAAA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 19 7 T 13 16 169776 CASAVA_Build 3 110631065 1I CCTGTATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 T 11 12 169777 CASAVA_Build 3 110636299 1D TCTTTCTTTG T/- TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 7 6 169778 CASAVA_Build 3 110641006 1D TTCTTATTTT C/- CCCATTAATT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 C 4 3 169779 CASAVA_Build 3 110650422 4I ACTAAGAAAA ----/AAAG AAAGAAGATC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 AAAG 1 2 169780 CASAVA_Build 3 110651064 3D GAGAGAGTAG CTT/--- CTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 18 12 8 CTT 3 2 169781 CASAVA_Build 3 110651790 11D AGAAAAGAAA GAAAGAGGGAG/----------- AGAAAGAAAG 1011 het 1011 ref 36 24 5 9 GAAAGAGGGAG 1 0 169782 CASAVA_Build 3 110656024 4I ACAAAAAAAT ----/AGAA AGAATGAGTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 AGAA 1 2 169783 CASAVA_Build 3 110670009 1D TTTTGAGACA G/- GGTCTCACTC 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 G 3 2 169784 CASAVA_Build 3 110674565 1D TCTTTTTTTT G/- TAAATAGTCA 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 G 1 0 169785 CASAVA_Build 3 110675752 2D TTTTGTACCA GT/-- GTAACATACT 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 GT 2 1 169786 CASAVA_Build 3 110690934 1I CCTAGTCTAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 8 9 169787 CASAVA_Build 3 110694777 4I AATAAAAGAC ----/TAAT TAAAATTAGA 2036 het 1247 hom 10 3 5 2 TAAT 0 1 169788 CASAVA_Build 3 110695001 1D CAAAAATAAA T/- TCCATATACT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 2 1 169789 CASAVA_Build 3 110701017 1D AAAATATCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 35 1 28 6 A 12 11 169790 CASAVA_Build 3 110703856 1I TGTACTTTTC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 T 7 8 169791 CASAVA_Build 3 110706596 3D TCTTACAGGG TGT/--- TGTTCTCTTG 3070 hom 116 het 41 0 36 6 TGT 2 1 169792 CASAVA_Build 3 110707641 1I AATGTGAGTC -/A AAACCACAAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 3 4 169793 CASAVA_Build 3 110717006 3I AGACTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 2686 hom 28 9 10 9 A 12 15 169794 CASAVA_Build 3 110729444 1D CTTTTTTTTT C/- CAACTTCTCT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 C 2 1 169795 CASAVA_Build 3 110742884 2D TGAAGGAGAC AG/-- AGACACAAAA 2931 het 939 hom 11 2 6 3 AG 2 1 169796 CASAVA_Build 3 110748590 1D TCCTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 A 12 11 169797 CASAVA_Build 3 110749227 2D GATTATATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 TG 9 8 169798 CASAVA_Build 3 110754828 5D TATGACTTAT TGAGA/----- GTAATATATG 3070 het 3070 ref 49 25 20 6 TGAGA 1 0 169799 CASAVA_Build 3 110764312 6D TCTTTTTGAA TTCTTT/------ TTAACTGATG 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 TTCTTT 1 0 169800 CASAVA_Build 3 110771267 2I ACAATTCTTC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 9 11 169801 CASAVA_Build 3 110774746 1D GAATAGAAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 9 8 169802 CASAVA_Build 3 110778795 1I TTATAACAGG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 56 22 23 11 T 7 8 169803 CASAVA_Build 3 110779090 3D GTTTCTTTTT TTC/--- TTCTTCTTTT 2834 het 2834 ref 28 13 6 10 TTC 3 2 169804 CASAVA_Build 3 110779768 1D CATTATATCC A/- TAAAGTAATT 3070 het 3070 hom 33 15 16 4 A 1 0 169805 CASAVA_Build 3 110785092 2I TATTATCTTC --/AT ATGCTGAGAA 2727 het 2727 ref 21 10 6 5 AT 1 2 169806 CASAVA_Build 3 110786368 4D GGATATCCAA TTCT/---- TTCTTCTACC 3070 het 3070 hom 34 14 17 7 TTCT 2 1 169807 CASAVA_Build 3 110786524 1I TTTTGTTTTC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 27 2 T 6 7 169808 CASAVA_Build 3 110791283 1I TGCAGGGGAA -/C CCCCCCTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 6 7 169809 CASAVA_Build 3 110821101 1D AAAACAGGCC T/- AGAAGAACTG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 1 0 169810 CASAVA_Build 3 110859361 1I GCAGGTTAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 10 169811 CASAVA_Build 3 110883683 1I GTGCATATCT -/G TGCTTTCTGC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 0 1 169812 CASAVA_Build 3 110887774 12I TCCAGTGGGC ------------/ACATGGAATAGT ACAGTGACAC 3070 hom 132 het 49 0 43 7 ACATGGAATAGT 0 1 169813 CASAVA_Build 3 110896465 1D CCCCTCCTTA G/- GGGGGTGTGA 3070 hom 114 het 44 0 38 8 G 6 5 169814 CASAVA_Build 3 110905233 22D CTTGATGAAT ATATGAATATAATATATTCATA/---------------------- ATATGAATAT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 ATATGAATATAATATATTCATA 2 1 169815 CASAVA_Build 3 110914848 1D CAAGGCGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 821 hom 39 2 32 6 T 11 10 169816 CASAVA_Build 3 110940201 1D ACACAAAGCC A/- AACCATATCA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 3 2 169817 CASAVA_Build 3 110941551 5D CAGAGGGAAA TTACG/----- CCAGTGAGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTACG 1 0 169818 CASAVA_Build 3 110946597 4I2M3D ATCTGCTTTT ----TTTAA/ATACTT--- ACAAATGGAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 9 N/A 0 0 169819 CASAVA_Build 3 110955973 1D AATATAGAAC T/- TTTTTTTTTC 1344 het 1344 ref 45 35 3 7 T 10 9 169820 CASAVA_Build 3 110971790 1I CATAAAGAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 9 10 169821 CASAVA_Build 3 110980362 1D AGGGGCCATA G/- TTCTCTGTTT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 G 1 0 169822 CASAVA_Build 3 110982361 6D AGATTAAGGA TGGGTC/------ TGCTTTCTTC 3070 het 3070 ref 27 20 8 3 TGGGTC 1 0 169823 CASAVA_Build 3 110990567 2I CTCACCTAAC --/TG TGAATTACAC 3070 het 3070 hom 39 15 24 0 TG 1 2 169824 CASAVA_Build 3 111023485 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 6 7 169825 CASAVA_Build 3 111023645 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 446 hom 19 2 13 4 TA 9 8 169826 CASAVA_Build 3 111029088 1I AATAATAACA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 8 9 169827 CASAVA_Build 3 111037274 2D AAGAAGTAAC AT/-- GTGAATTTTT 3070 het 3070 ref 42 28 12 2 AT 1 0 169828 CASAVA_Build 3 111039744 1D TATGTGAAGT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 9 8 169829 CASAVA_Build 3 111042729 1D TGTTCACGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 A 10 9 169830 CASAVA_Build 3 111048256 1D TAGAAAGGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2324 hom 31 8 13 11 T 13 12 169831 CASAVA_Build 3 111052910 1D AGAGGTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 41 3 32 7 A 13 12 169832 CASAVA_Build 3 111053302 1I GAGATATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 10 11 169833 CASAVA_Build 3 111066697 4D GGGCCCAATG CTTT/---- TGTGAGTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 11 1 CTTT 1 0 169834 CASAVA_Build 3 111069990 1D AATATACCAC A/- AAAAGGTGGG 3070 het 3070 hom 40 11 25 7 A 5 4 169835 CASAVA_Build 3 111071460 1I ATGATCTGTG -/T TTTTTTTTTT 1422 het 1422 ref 40 29 4 7 T 10 11 169836 CASAVA_Build 3 111081369 2D TATAAAAAAC AT/-- AAAAAATTAC 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 AT 1 0 169837 CASAVA_Build 3 111087804 2D AGAGCCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3041 het 1883 hom 31 11 9 11 T 18 16 169838 CASAVA_Build 3 111088666 2D TTCCACATTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 11 9 169839 CASAVA_Build 3 111090784 2D ATATTGTGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 TA 6 5 169840 CASAVA_Build 3 111092641 2D ATCTTTTCCC AT/-- AGTATGTTCT 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 AT 1 0 169841 CASAVA_Build 3 111094097 5D TTTTAAAAAA CCTTT/----- CCTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 34 13 14 9 CCTTT 5 4 169842 CASAVA_Build 3 111100112 4I GTCTTTCAAG ----/TTCT TTAAGTTTAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TTCT 0 1 169843 CASAVA_Build 3 111102638 14I CATACACACG --------------/CACACATACACAAA CACACATACA 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 CACACATACACAAA 0 1 169844 CASAVA_Build 3 111110700 2D TTTAATTTTA TG/-- TGAGTCCTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 TG 2 1 169845 CASAVA_Build 3 111113478 1I TTTCATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 10 11 169846 CASAVA_Build 3 111118763 4I ATTTCCATCA ----/TCTT TCTTCTTCTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TCTT 1 2 169847 CASAVA_Build 3 111119865 5D AATTCTGACT TATAG/----- TATAATACTA 3070 het 3070 hom 41 15 24 3 TATAG 1 0 169848 CASAVA_Build 3 111126238 1D CTGGATTGTT C/- CCCCCCCCCG 334 het 202 hom 19 4 3 12 C 10 9 169849 CASAVA_Build 3 111129862 1D TCCCATAGTT A/- ACGGTTCATC 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 2 1 169850 CASAVA_Build 3 111130154 1I CAACATGGTG -/A AAACTCCGTC 2301 het 217 hom 10 1 6 3 A 3 4 169851 CASAVA_Build 3 111135458 1I ATTTATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 11 12 169852 CASAVA_Build 3 111138344 2D AAGACTAGAC TT/-- GTGATAATAT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 2 0 169853 CASAVA_Build 3 111139308 1D ACTCCAAAAC T/- TTATCTGTTT 3070 het 3070 hom 39 13 24 3 T 3 2 169854 CASAVA_Build 3 111140932 1D ATGTTGCAAC A/- AAAAAATAAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 7 6 169855 CASAVA_Build 3 111147338 1I ATTGTTTGTA -/T TTTTTACTAT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 5 6 169856 CASAVA_Build 3 111147830 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 8 7 169857 CASAVA_Build 3 111150793 2D66M1D AAACCTTAAG TTTATACTAAATTATTGTCTTTTCTTGTATTTTTATGTATTCTGTTACAATTTTTTCCCAGCACTAATA/--TATACTAAATTATTGTCTTTTCTTGTATTTTTATGTATTCTGTTACAATTTTTTCCCAGCACTAAT- ACCACACTGT 3070 het 3070 hom 33 27 31 5 N/A 0 0 169858 CASAVA_Build 3 111154225 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2603 het 2603 ref 20 8 7 5 A 11 12 169859 CASAVA_Build 3 111154572 1D TTATATTCCA T/- TTATACAATG 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 T 3 2 169860 CASAVA_Build 3 111156293 3D AATTGTTGCA AAT/--- AATAACTGAA 3070 het 3070 ref 39 25 13 2 AAT 2 1 169861 CASAVA_Build 3 111158883 1I ACACAACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 18 9 T 11 12 169862 CASAVA_Build 3 111167150 1I TACCCCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 599 hom 32 2 25 5 T 11 12 169863 CASAVA_Build 3 111173539 4I AGCTAGTGAC ----/TCTT TCTTTAACTG 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 TCTT 1 2 169864 CASAVA_Build 3 111184567 4I ACCTTTAACA ----/CAGT CAATTAGAAT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 CAGT 0 1 169865 CASAVA_Build 3 111191984 1I GTGCGCTGCA -/C CCACTAACTC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 2 3 169866 CASAVA_Build 3 111196756 1D GGCTGTAAGA T/- TTTTTTGCTG 3070 hom 56 het 38 1 33 5 T 7 6 169867 CASAVA_Build 3 111212640 2I ACACCCTCCC --/AA GACTAAACCA 3070 hom 24 het 10 0 8 2 A 0 2 169868 CASAVA_Build 3 111218935 4D TTCTGTAAAT GAGA/---- GAGAGAGACT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 GA 6 4 169869 CASAVA_Build 3 111220762 1I TCAATTTTAC -/A GATATATAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 0 1 169870 CASAVA_Build 3 111221808 1D AAATTTCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 10 9 169871 CASAVA_Build 3 111223351 5D CCTGACACAT CACAC/----- CACTCCTCTA 3070 het 3070 ref 48 25 19 6 CACAC 1 0 169872 CASAVA_Build 3 111224027 1D CCATCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 12 11 169873 CASAVA_Build 3 111224236 1I TCCAAAGTCA -/T CCTTTTGGTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 0 1 169874 CASAVA_Build 3 111227573 2D35M2D CACATGTTAC ATATATATATATATACACATACATTTATGTATTCATTTA/--ATATATATATATACACATACATTTATGTATTCATT-- TATATATATA 3070 hom 60 het 34 1 34 7 N/A 0 0 169875 CASAVA_Build 3 111236005 4I TTGTATCTCA ----/TTTC TTTCTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 TTTC 1 2 169876 CASAVA_Build 3 111238811 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 862 hom 25 2 10 13 T 12 13 169877 CASAVA_Build 3 111244366 1I TGGCTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 1314 het 1314 ref 38 30 3 5 T 10 11 169878 CASAVA_Build 3 111244662 1I TTGGTCGACA -/G GCACTTATGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 169879 CASAVA_Build 3 111256261 4I30M2D TTGTTATGTT ----ATAATACCTAGCGTTCAACTGATATTAAATAC/ATAAATAATACCTAGCGTTCAACTGATATTAAAT-- AGTTATTATT 3070 hom 120 het 35 0 41 6 N/A 0 0 169880 CASAVA_Build 3 111261081 1D TGAACTGAAT G/- AGAATTTATC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 G 1 0 169881 CASAVA_Build 3 111261554 1I AGCCTCAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 9 10 169882 CASAVA_Build 3 111262647 1I CTGTTAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1942 hom 29 7 10 12 T 12 13 169883 CASAVA_Build 3 111263533 1D GATTTGTTGA C/- CAACACCTTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 2 1 169884 CASAVA_Build 3 111264522 8I8M4D ATCTCTTCCC --------CATTTATATTAG/AATGGGGAAATTTATA---- TGCAACTGAG 3070 hom 123 het 40 0 42 5 N/A 0 0 169885 CASAVA_Build 3 111266523 2D ATGTATATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 60 het 22 0 21 3 AC 6 5 169886 CASAVA_Build 3 111271222 1D ACTATGTATT C/- CCTAATACAT 3070 het 3070 hom 35 15 18 4 C 3 2 169887 CASAVA_Build 3 111284059 1D GTAGTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 332 hom 31 1 26 4 T 13 12 169888 CASAVA_Build 3 111287631 2D AGCATGAGAA AG/-- ATGCTCAGCA 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 AG 1 0 169889 CASAVA_Build 3 111303043 9I TAAAAATAGG ---------/CTGAGAGTC CTGAGAGTCA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 CTGAGAGTC 1 2 169890 CASAVA_Build 3 111313039 1D GAGGCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 34 3 20 11 A 12 11 169891 CASAVA_Build 3 111313558 1I AAGATGCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 11 169892 CASAVA_Build 3 111314649 1D ATTTAACTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 7 A 14 13 169893 CASAVA_Build 3 111322260 4D CAAGACTAAT AAAG/---- AAAAAAAGAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AAAG 1 0 169894 CASAVA_Build 3 111324704 1I GTCAGGGCCA -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 6 7 169895 CASAVA_Build 3 111329404 1I TTTTTCTTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 T 8 9 169896 CASAVA_Build 3 111329485 2D TTCACTTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 93 het 38 0 32 8 TC 6 5 169897 CASAVA_Build 3 111337252 2I GGAAAGTGAC --/AG AGTCTTACCA 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 AG 1 2 169898 CASAVA_Build 3 111338849 1I AAGAAGTAAA -/T GCTAAAACTT 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 T 0 1 169899 CASAVA_Build 3 111340186 1D GTGTAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 10 9 169900 CASAVA_Build 3 111348686 2I GAGGAGGAAG --/TC TCTGTTCTAT 3070 het 3070 ref 62 28 26 8 TC 1 2 169901 CASAVA_Build 3 111352809 1D GGTTGTTTGA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 65 het 28 0 21 7 T 7 6 169902 CASAVA_Build 3 111354826 1D TCGTTGTTTG T/- TTTTATGCTC 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 T 5 4 169903 CASAVA_Build 3 111355146 18D TATGCTGAGA GCAATGTAAGAAACTAAC/------------------ GAATCCTTGT 3070 het 3070 ref 34 20 16 3 GCAATGTAAGAAACTAAC 1 0 169904 CASAVA_Build 3 111363303 1I ATAACTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 10 11 169905 CASAVA_Build 3 111366766 4D CTCCTAGAGA CTCT/---- CTCTATATGT 3070 het 3070 hom 32 15 17 1 CT 4 2 169906 CASAVA_Build 3 111369738 8D ACTTTTTTTT TATTGTAA/-------- TTAATTGTCA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TATTGTAA 1 0 169907 CASAVA_Build 3 111370382 1D GAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 30 12 7 A 11 10 169908 CASAVA_Build 3 111378901 2I TGTGTATGTG --/TA TATATATATA 769 het 769 ref 16 8 4 4 TA 7 8 169909 CASAVA_Build 3 111379883 1I AAAGTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 28 1 21 6 A 10 11 169910 CASAVA_Build 3 111383855 1D ATATATATAA T/- TTTTTTTTTT 2177 het 622 hom 12 3 5 4 T 12 11 169911 CASAVA_Build 3 111384473 1I TCTAAAAAAA -/G AGGGGAATAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 0 1 169912 CASAVA_Build 3 111388643 3D CTTTTTTATA AAG/--- AAGCCTCATT 3070 het 3070 hom 20 8 10 3 AAG 2 1 169913 CASAVA_Build 3 111392009 13I GTGTTGTCTT -------------/TATTTAGTTTTGG TATTAAGATA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TATTTAGTTTTGG 0 1 169914 CASAVA_Build 3 111392442 1I ATTTAATTTC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 7 8 169915 CASAVA_Build 3 111396872 1I TACAGAGTTC -/A AAAAAAAAAA 2021 het 2021 ref 24 9 6 9 A 13 14 169916 CASAVA_Build 3 111398870 2I AGAAAGTAAC --/TT AAGTCAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 0 2 169917 CASAVA_Build 3 111405684 2I GAGAACAAAG --/AC ACAACATACC 1900 het 1192 hom 7 3 4 0 AC 1 2 169918 CASAVA_Build 3 111408513 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 660 hom 30 9 15 6 C 0 1 169919 CASAVA_Build 3 111414592 1D CAAATAAAAT A/- AAAAAACCTA 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 A 7 6 169920 CASAVA_Build 3 111416768 2I AAGGTTTTCT --/TC TCTTTCTTTG 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 TC 1 2 169921 CASAVA_Build 3 111423265 1I AAGTATTCCA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 G 1 2 169922 CASAVA_Build 3 111439035 3I CTTAAATAAG ---/CTT CTTAAGGGAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CTT 1 2 169923 CASAVA_Build 3 111447851 1I ATGAATTGGG -/A AAAAAATCCA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 6 7 169924 CASAVA_Build 3 111455961 1I TTTTCTAAGC -/T TTTTTTGTGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 7 169925 CASAVA_Build 3 111458624 1I AATCCCCATG -/T TTTCAGTCCA 3070 het 115 hom 44 1 36 7 T 3 4 169926 CASAVA_Build 3 111462176 1I TCTACAGCAG -/A AAAAAAAAAA 1369 het 1369 ref 38 31 3 4 A 10 11 169927 CASAVA_Build 3 111466381 2D CAGGTAACTA CT/-- CTCTCTCTCT 1052 het 1052 ref 52 35 3 15 CT 9 8 169928 CASAVA_Build 3 111472910 2I GTGCAAAGGA --/GT GTGTGTGTGG 3070 hom 103 het 41 0 34 7 GT 4 5 169929 CASAVA_Build 3 111474913 1I CTTCAAGGAG -/C AGGTCAAAAG 3070 hom 157 het 60 0 53 7 C 0 1 169930 CASAVA_Build 3 111488014 1I TGGCCTGAAA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 2818 hom 33 9 16 8 T 7 8 169931 CASAVA_Build 3 111499556 23I AATTACAGGT -----------------------/ACAGATGGCTCAGTAGAATATTC AATTAAATAA 3070 hom 55 het 29 0 28 7 ACAGATGGCTCAGTAGAATATTC 0 1 169932 CASAVA_Build 3 111505723 1I TATATCTTTA -/T TTTTTTCACC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 6 7 169933 CASAVA_Build 3 111507940 1I ATATTTTATA -/T TTTTCTCAAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 4 5 169934 CASAVA_Build 3 111510008 4I AGATATAGTC ----/TCTT TATGTATTAA 3070 hom 119 het 44 0 40 4 TCTT 0 1 169935 CASAVA_Build 3 111510133 1I AGCAGGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 10 11 169936 CASAVA_Build 3 111512080 2D TTATTTGGAA AG/-- AGAGAATGAT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AG 3 2 169937 CASAVA_Build 3 111513293 2I ATTAATGCAC --/AA AGAGACTCTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 3 169938 CASAVA_Build 3 111521693 4I CCATGGCCAC ----/AGTT AGCATTTCTA 3070 hom 147 het 53 0 49 4 AGTT 0 1 169939 CASAVA_Build 3 111570714 1I ACCCCCCCCC -/T CAACATCCCT 3070 hom 72 het 30 0 23 7 T 0 1 169940 CASAVA_Build 3 111573418 1I GGGGATGTGT -/G GGGCTTTATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 3 4 169941 CASAVA_Build 3 111575282 1I TAGATGGGCA -/G CCACTACAGG 3070 hom 85 het 30 0 29 1 G 0 1 169942 CASAVA_Build 3 111584872 1D AAACAGAATT C/- TAGTGCCCTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 C 1 0 169943 CASAVA_Build 3 111589025 1D GAACCATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 11 10 169944 CASAVA_Build 3 111596045 1D TTTGTCACCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 55 24 22 9 T 9 8 169945 CASAVA_Build 3 111606705 1I TAATTTCAGA -/G TAACCATTAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 0 1 169946 CASAVA_Build 3 111608342 1I ATCTTTAATT -/A AAAAAATTTT 2588 het 2352 hom 15 6 6 3 A 6 7 169947 CASAVA_Build 3 111609399 1D GGATTTATTC T/- TCTTGACTAA 3070 het 3070 ref 47 26 16 6 T 2 1 169948 CASAVA_Build 3 111611756 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 10 9 169949 CASAVA_Build 3 111615471 1I GAAATCTCTC -/A GAGGAAATGA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 0 1 169950 CASAVA_Build 3 111622542 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAACTAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 6 7 169951 CASAVA_Build 3 111631848 2I CATGAGAGAC --/AA AGATTGTCTA 3070 het 3070 hom 52 19 30 3 A 1 3 169952 CASAVA_Build 3 111635355 4I ACATTTAAAC ----/AATT AATGAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 AATT 0 1 169953 CASAVA_Build 3 111636768 4I TTAAGGAGAT ----/AGAA AGAATCAAGA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AGAA 1 2 169954 CASAVA_Build 3 111647641 2I AAAGTATAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 10 12 169955 CASAVA_Build 3 111650245 2I ATCATTTTTA --/AC ACAGTATAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AC 1 2 169956 CASAVA_Build 3 111654143 1I TCTATACTCA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 7 8 169957 CASAVA_Build 3 111655205 1I TTTTACAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 20 1 15 4 T 10 11 169958 CASAVA_Build 3 111656231 1I GTGAAGTGTG -/T TTCTTCTAGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 3 169959 CASAVA_Build 3 111665311 1I GGCTCAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 T 10 11 169960 CASAVA_Build 3 111665748 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 T 11 12 169961 CASAVA_Build 3 111666515 5D TATCCTATGC TATCT/----- TATCTTATTG 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 TATCT 2 1 169962 CASAVA_Build 3 111674868 1D AGTCACTCAG A/- AAAAAAAAAA 1904 het 1904 ref 31 20 4 8 A 13 12 169963 CASAVA_Build 3 111674986 1D ATGTTCTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 11 10 169964 CASAVA_Build 3 111677597 1I AGAAGTATTG -/T TAAGTGTGAT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 1 2 169965 CASAVA_Build 3 111678091 1D GTTTGCTTCT A/- TTTTCCCCTG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 1 0 169966 CASAVA_Build 3 111683188 1I CATGAATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 14 15 169967 CASAVA_Build 3 111688134 1D CTTCCCACAG A/- AAAGTTCAAC 3070 hom 75 het 41 0 25 20 A 4 3 169968 CASAVA_Build 3 111688170 2D GATTAGAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2717 het 61 hom 29 1 7 21 T 14 12 169969 CASAVA_Build 3 111694106 1D CAGGCCAACA G/- TGCTCTTGGG 3070 het 3070 hom 37 14 16 9 G 1 0 169970 CASAVA_Build 3 111694732 1D ATTAGCTAGA C/- TTTTATGATA 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 C 1 0 169971 CASAVA_Build 3 111694958 1D TAACCTAATT A/- GAGAACCACA 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 A 1 0 169972 CASAVA_Build 3 111695866 1D AAACAAGACT G/- TATTATTCAT 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 G 1 0 169973 CASAVA_Build 3 111703188 2D TATATACGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 191 hom 20 3 12 6 TA 9 8 169974 CASAVA_Build 3 111703375 1D GAAACTCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 88 het 38 0 28 10 T 10 9 169975 CASAVA_Build 3 111703812 4D TATTTATTTA TTTG/---- TTGAGATGGA 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 TTTG 1 0 169976 CASAVA_Build 3 111706975 1I CCAAGCTCCA -/G GGGATATATA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 G 3 4 169977 CASAVA_Build 3 111707167 1D AATAAATAAT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 67 het 27 0 23 4 A 8 7 169978 CASAVA_Build 3 111708610 5I TTCCTGAGTT -----/ACTTC ACTTCACAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ACTTC 1 2 169979 CASAVA_Build 3 111709052 1D GTGGTTTAGA T/- TTGCATTTCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 3 2 169980 CASAVA_Build 3 111721219 1D ATGTGTCCCC A/- AGCATCTATT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 2 1 169981 CASAVA_Build 3 111723749 3D ATCAAGTCAC TCT/--- TCTAGTTGAA 3070 het 3070 ref 43 24 18 3 TCT 2 1 169982 CASAVA_Build 3 111725458 1I CTGCACAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 13 14 169983 CASAVA_Build 3 111728140 1I AGCAAGACTT -/A AGTGTACATG 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 1 2 169984 CASAVA_Build 3 111728935 3I TCATTTGACA ---/GAG TAGTCTTAGG 3070 hom 175 het 65 0 59 6 GAG 0 1 169985 CASAVA_Build 3 111732073 3I ACAAAATTTT ---/AAA GAAGAGAACA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 3 169986 CASAVA_Build 3 111749195 2D TACACAGAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 AT 9 8 169987 CASAVA_Build 3 111749301 1I GGCATATAAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 7 8 169988 CASAVA_Build 3 111756118 5I GGGTAAGGTA -----/TCCCT TCCCTGTGCT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TCCCT 1 2 169989 CASAVA_Build 3 111759826 1D TTTTTTATGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 936 hom 41 5 15 21 T 10 9 169990 CASAVA_Build 3 111761303 1I GCTTTATATG -/C CAGGGTGCCC 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 C 1 2 169991 CASAVA_Build 3 111762469 4I GAATTTCTCC ----/TTAA TTCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 TTAA 0 1 169992 CASAVA_Build 3 111762585 2I TTGATTTCTC --/TA TCTGAAATAT 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 TA 0 1 169993 CASAVA_Build 3 111769941 2D TAATAAAGAC AT/-- GTGTACCAAA 3070 het 3070 ref 41 18 19 5 AT 1 0 169994 CASAVA_Build 3 111771518 1D TATTTATTTA T/- TTTATTTTTT 2949 het 757 hom 16 2 12 2 T 4 3 169995 CASAVA_Build 3 111776012 1I TATTTATGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1405 hom 33 3 26 4 T 9 10 169996 CASAVA_Build 3 111776660 3D AATTTTACTA AAG/--- AAGAAGGTAA 3070 het 2729 hom 22 8 12 3 AAG 3 2 169997 CASAVA_Build 3 111778990 1I AAAAGTAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 9 10 169998 CASAVA_Build 3 111779561 2D AGACTCATCA CT/-- CTCTGCTTTC 3070 het 3070 hom 45 17 26 2 CT 3 2 169999 CASAVA_Build 3 111784560 3I ATCCTACTAC ---/TTT TTTTTTCTTT 2146 het 2146 ref 43 23 11 9 T 6 9 170000 CASAVA_Build 3 111785652 2D ACATGTTTGT TC/-- TCTGTTACCT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 TC 2 1 170001 CASAVA_Build 3 111787629 1I TTCAATAAGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 A 7 8 170002 CASAVA_Build 3 111788866 1D CATGAATAGG T/- TTTTTGATTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 T 6 5 170003 CASAVA_Build 3 111794888 1D ATGCAGTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 12 11 170004 CASAVA_Build 3 111799232 1D AATCAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 14 12 13 A 14 13 170005 CASAVA_Build 3 111801636 1I AGCCTTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 T 12 13 170006 CASAVA_Build 3 111804687 1D AAAAAGAACC T/- TTGTTCTTCA 3070 het 3070 ref 47 23 18 8 T 3 2 170007 CASAVA_Build 3 111805669 3D31M5D CTTGGCATGG AAAAAAAAAAAAAAAGCCTACAACAATAAAAGATAAATA/---AAAAAAAAAAAAGCCTACAACAATAAAAGAT----- AAATAAAATA 3070 het 750 hom 16 5 11 6 N/A 0 0 170008 CASAVA_Build 3 111808567 1D AATGTCTCTT C/- TAGGTACTTA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 C 1 0 170009 CASAVA_Build 3 111809351 1D GCTTACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 A 11 10 170010 CASAVA_Build 3 111813568 1D CCCTGCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1342 hom 37 9 13 15 T 13 12 170011 CASAVA_Build 3 111819395 2D AAATAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 12 10 170012 CASAVA_Build 3 111820906 3D TAGAAATTCT AGG/--- AGAATTCCAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AGG 1 0 170013 CASAVA_Build 3 111827781 6I ATATTCACAT ------/GTTGAA GTTGAAGCCC 3070 hom 157 het 61 0 52 9 GTTGAA 1 2 170014 CASAVA_Build 3 111830299 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 22 11 A 13 12 170015 CASAVA_Build 3 111832090 1I ATGTAGCTGT -/C CCCTCTCTGG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 3 4 170016 CASAVA_Build 3 111848217 1D ACCACAATTC A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 A 8 7 170017 CASAVA_Build 3 111864573 2I TCCTGCTTCG --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 CT 8 9 170018 CASAVA_Build 3 111878917 1D AGAGGTTCAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 8 7 170019 CASAVA_Build 3 111879833 1D ATATCAGTGG A/- AAAAAAAAAA 1395 het 1395 ref 29 22 3 5 A 11 10 170020 CASAVA_Build 3 111885093 1I5M10D AAAAGTGTAG -ATATAATTCAAAAAG/TGTAGA---------- TGTATTTTGA 3070 hom 87 het 28 0 30 0 N/A 0 0 170021 CASAVA_Build 3 111886578 1D AATCTGTGAA C/- CCCCAAAAGG 3070 het 2786 hom 27 9 16 4 C 5 4 170022 CASAVA_Build 3 111894883 1I TTTTTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 13 13 15 T 13 14 170023 CASAVA_Build 3 111895689 2D TGACTTCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2156 het 1910 hom 37 16 11 10 A 16 14 170024 CASAVA_Build 3 111896807 1D CGATGCAGGC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 368 hom 22 2 18 3 T 9 8 170025 CASAVA_Build 3 111900423 10D TATGTTATAT ATATTATATA/---------- CTGTATTCTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 6 ATATTATATA 1 0 170026 CASAVA_Build 3 111902923 1I AATTATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 T 10 11 170027 CASAVA_Build 3 111903189 1D GTGTCCTCAA T/- GTTTCCTTGA 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 T 1 0 170028 CASAVA_Build 3 111903900 1I CATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 10 11 170029 CASAVA_Build 3 111908178 1D TTATTTAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 10 9 170030 CASAVA_Build 3 111908945 1D AGGGTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 2779 het 1454 hom 26 6 8 12 T 17 16 170031 CASAVA_Build 3 111914574 1D TAACAGATAA T/- TTTTTTTTTT 1825 het 1825 ref 17 5 4 8 T 12 11 170032 CASAVA_Build 3 111918440 1D GATAAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 12 11 170033 CASAVA_Build 3 111922681 1D TTAGTTTGTA T/- AAAGTACATA 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 T 1 0 170034 CASAVA_Build 3 111932391 1I AAGGAACGAG -/A AAAAAAAAAA 2692 het 2692 ref 32 20 9 3 A 10 11 170035 CASAVA_Build 3 111933818 1D TTAATCCTGC A/- AAAGTTTGAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 4 3 170036 CASAVA_Build 3 111940527 1D TCCAGTAGTA G/- AAAAGGTAAT 3070 het 3070 ref 48 24 17 8 G 1 0 170037 CASAVA_Build 3 111944446 1D AAATGATACA G/- GAAGTGAACT 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 G 2 1 170038 CASAVA_Build 3 111952010 1D GTTGTTACTT A/- AAAAAAAAAA 2011 het 2011 ref 52 34 6 12 A 13 12 170039 CASAVA_Build 3 111957811 1I CTCAACCAGA -/G TAAGACTGAG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 G 0 1 170040 CASAVA_Build 3 111959762 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 A 12 11 170041 CASAVA_Build 3 111965321 2I AACTTGTCTC --/CA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 CA 0 1 170042 CASAVA_Build 3 111967502 3I TTTGTCTCTC ---/TCT TCTTCTTCTC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TCT 3 4 170043 CASAVA_Build 3 111971807 1D CATTTTATCA T/- CTGTTAAATG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 1 0 170044 CASAVA_Build 3 111985837 1D CAAAATAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 10 9 170045 CASAVA_Build 3 111990051 2I ATACATATAT --/TA TATATATATA 1549 het 281 hom 11 1 8 2 TA 7 8 170046 CASAVA_Build 3 111994191 1I TCAGCTTTTT -/G TTTCACCCAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 0 1 170047 CASAVA_Build 3 111999270 40D TTGTATTTGT GAAGGAAACACACCAAATAGTAAGTGGAGTTTGTATTTGA/---------------------------------------- GAAGGAAACA 3070 hom 56 het 28 0 18 15 GAAGGAAACACACCAAATAGTAAGTGGAGTTTGTATTTGA 1 0 170048 CASAVA_Build 3 112008046 1D AACTTTTTAT G/- AACAAAGAAG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 1 0 170049 CASAVA_Build 3 112015118 1I AATGCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 651 hom 35 2 21 12 T 13 14 170050 CASAVA_Build 3 112024793 1I AATCAGCAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 44 0 29 15 A 9 10 170051 CASAVA_Build 3 112028218 1I TGCTGTGTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 125 hom 27 1 24 2 T 8 9 170052 CASAVA_Build 3 112028754 1I TACTTGGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 33 4 24 5 T 15 16 170053 CASAVA_Build 3 112032402 2I TTGTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 10 12 170054 CASAVA_Build 3 112035278 1I TGCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 2462 hom 27 het 13 0 10 3 T 11 12 170055 CASAVA_Build 3 112039222 2D GGCTGAAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 95 hom 37 2 28 8 TG 8 7 170056 CASAVA_Build 3 112045871 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 6 7 170057 CASAVA_Build 3 112048788 2I TTTTGATGTC --/TA GTGTGTGTGA 3070 hom 163 het 60 0 55 5 TA 0 1 170058 CASAVA_Build 3 112049069 4D CACACACCTG CTAT/---- CTGTTTTTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 CTAT 1 0 170059 CASAVA_Build 3 112050200 1D TATCAAAGTT G/- TTCAGAGCCA 3070 hom 123 het 51 0 42 9 G 1 0 170060 CASAVA_Build 3 112054829 1D GTGAAGTTCC A/- AAGACTCTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 4 A 3 2 170061 CASAVA_Build 3 112056829 1I GGGACAAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1863 hom 52 5 40 7 A 9 10 170062 CASAVA_Build 3 112059476 2D AATCTTCATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 43 1 36 6 A 13 11 170063 CASAVA_Build 3 112073937 1D ACTGCTTTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 9 8 170064 CASAVA_Build 3 112075970 4I TTTGTTTGAG ----/TCTT TCTTTTTTTT 3070 hom 82 het 36 0 27 9 TCTT 1 2 170065 CASAVA_Build 3 112079376 1D TGTACAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 35 1 21 13 T 13 12 170066 CASAVA_Build 3 112082199 1D CCCATCCCAC G/- TGCTCTTCTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 1 0 170067 CASAVA_Build 3 112084077 1D ATAAGTATTT A/- AAAAAAAAAT 1742 het 1742 ref 44 33 4 8 A 10 9 170068 CASAVA_Build 3 112084519 2I TACATAAGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 21 11 T 12 14 170069 CASAVA_Build 3 112096488 1I CTAGAATGAG -/A AAAGAATTTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 3 4 170070 CASAVA_Build 3 112098107 1I TTCTGTCCCT -/A AAAAATACCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 5 6 170071 CASAVA_Build 3 112109686 1D TGGTCAATAC A/- AATTCAGAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 3 2 170072 CASAVA_Build 3 112137771 2D ATTTTATAAA CC/-- TAGGTGGGTC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 2 0 170073 CASAVA_Build 3 112147280 1I AGGCAGGCAG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 170074 CASAVA_Build 3 112154100 1D AAGGTGAAAG C/- CATGTCTCAC 3070 hom 108 het 37 0 36 1 C 2 1 170075 CASAVA_Build 3 112159036 4I ATACCCCACC ----/CAGT CAGTTTGCAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 CAGT 1 2 170076 CASAVA_Build 3 112160030 47D ACAGGAGAGT TCCCAGATCCTCCTCACAGGACATGTGACAGGGGTGTGGCTCATCTG/----------------------------------------------- TTCTCTCATC 3070 hom 105 het 35 0 34 8 TCCCAGATCCTCCTCACAGGACATGTGACAGGGGTGTGGCTCATCTG 1 0 170077 CASAVA_Build 3 112181962 1I CTTAGGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 29 1 25 3 A 10 11 170078 CASAVA_Build 3 112192722 1D CCAGCGCGTT C/- CAAGAACAGT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 C 2 1 170079 CASAVA_Build 3 112206276 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 6 A 11 10 170080 CASAVA_Build 3 112210649 1I GTACTGTGAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 108 het 41 0 38 3 A 8 9 170081 CASAVA_Build 3 112239464 2I GAAAACAACA --/AT ATGACAGAAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AT 1 2 170082 CASAVA_Build 3 112249109 2D TGCTATATTC AA/-- GGTGAAAAGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 2 0 170083 CASAVA_Build 3 112256496 3D AATCTAAGCC AAG/--- GTCATAGCAC 3070 hom 105 het 39 0 34 6 AAG 1 0 170084 CASAVA_Build 3 112261392 1I AAAACTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 11 170085 CASAVA_Build 3 112282216 1D TATGTCATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 32 2 20 11 A 15 14 170086 CASAVA_Build 3 112292238 1D CATCTTAAAG T/- TTTCCATCTG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 4 3 170087 CASAVA_Build 3 112294168 5D GGACTCAGTA CTGTT/----- CTGTTGATTC 3070 hom 141 het 51 0 48 4 CTGTT 2 1 170088 CASAVA_Build 3 112312077 3D ATGAAATTTT TTG/--- TTGATATTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TTG 2 1 170089 CASAVA_Build 3 112317476 1I ACATCTGAAT -/G AAAAACAGGT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 0 1 170090 CASAVA_Build 3 112331800 1D GCCGAGAATG T/- TTTTTTTTTT 1725 het 1725 ref 31 20 5 6 T 13 12 170091 CASAVA_Build 3 112411747 1I CCATCAGACA -/T TGTTGAGCAA 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 1 2 170092 CASAVA_Build 3 112418330 1I AACCAACTCA -/G GGGCTTGATG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 G 3 4 170093 CASAVA_Build 3 112418891 1D GCTTACCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 10 17 11 A 10 9 170094 CASAVA_Build 3 112445364 4D TATCTATCTG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 ref 33 14 11 11 TCTA 5 4 170095 CASAVA_Build 3 112453754 7I CAAACTCCTG -------/ACCTCGA GTGATCTGCC 1630 het 1630 ref 12 5 4 3 ACCTCGA 0 1 170096 CASAVA_Build 3 112457598 5D GGAGTGTTTC TTCTA/----- TTCTGTTTAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 TTCTA 1 0 170097 CASAVA_Build 3 112458122 2I TGTTTCATAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 10 12 170098 CASAVA_Build 3 112463303 1I AAAAAAAAAA -/T ATAAAAATAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 0 1 170099 CASAVA_Build 3 112467238 1D TTACAATGTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 A 9 8 170100 CASAVA_Build 3 112473674 1D AAATTGTGCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 53 18 30 5 T 8 7 170101 CASAVA_Build 3 112475772 1D GTTGACTGAA G/- TACTGATGAA 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 G 1 0 170102 CASAVA_Build 3 112481510 1D AGAGACCCCC A/- AAAACACTTA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 5 4 170103 CASAVA_Build 3 112482590 1D CCATGCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 A 10 9 170104 CASAVA_Build 3 112489702 1I ATGTTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 1152 het 1152 ref 47 31 3 13 T 11 12 170105 CASAVA_Build 3 112503032 2D AACCAAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 32 1 20 11 A 18 16 170106 CASAVA_Build 3 112515913 1I TAGCTCTCAA -/G GTATCTGAGG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 G 1 2 170107 CASAVA_Build 3 112527614 1I TCTTTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 10 11 170108 CASAVA_Build 3 112531351 4I AAAACACTTA ----/GGTG TTAATATCAG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 GGTG 0 1 170109 CASAVA_Build 3 112556384 1D TACTTCTCAA T/- TTTTCTTAAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 5 4 170110 CASAVA_Build 3 112560668 1D GCGAATTAAA C/- CCCTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 6 C 4 3 170111 CASAVA_Build 3 112583097 1I AAATGGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 19 0 13 6 A 15 16 170112 CASAVA_Build 3 112586853 12D GGCACATGTA TACTTATGTAAC/------------ AAACCTGCAC 3070 hom 99 het 34 0 33 3 TACTTATGTAAC 1 0 170113 CASAVA_Build 3 112587136 1D ATATTAAATA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 62 het 27 0 21 7 T 8 7 170114 CASAVA_Build 3 112592311 1I AACCCACAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 0 1 170115 CASAVA_Build 3 112593988 1I AGGAAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 46 1 29 16 T 13 14 170116 CASAVA_Build 3 112595271 1I CTCCTCCACT -/G TTGAAAGGAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 0 1 170117 CASAVA_Build 3 112598694 4I GTATTATTTC ----/TTTT TTCTTATTAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 6 170118 CASAVA_Build 3 112602464 1D GTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 606 hom 31 3 22 6 A 15 14 170119 CASAVA_Build 3 112603993 3I ACCTCAACTC ---/TTT TTTTTAGAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 5 8 170120 CASAVA_Build 3 112607662 1I GTTTGTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 T 12 13 170121 CASAVA_Build 3 112616617 13I5M1I GTAGTACCAG -------------TACTA-/GTAGTTGCTGTCCTACGAC CAGTAGATAA 3070 hom 105 het 34 0 35 4 N/A 0 0 170122 CASAVA_Build 3 112618577 4D GGCTCTAAAC TATT/---- TATTCGATAT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 TATT 2 1 170123 CASAVA_Build 3 112618871 3D CTATAACAAC TTG/--- TCTTCTTAGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TTG 1 0 170124 CASAVA_Build 3 112621904 5D TTCCATTGAA ATTAT/----- ATTATAAGTT 3070 hom 93 het 34 0 32 4 ATTAT 2 1 170125 CASAVA_Build 3 112622185 1I CACAGTATGA -/C ATTCCCATCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 170126 CASAVA_Build 3 112628336 1D GCTTCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 29 2 19 8 A 12 11 170127 CASAVA_Build 3 112640471 1I ACATTAGTTG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 9 170128 CASAVA_Build 3 112650168 1D CAGTCTCCCC T/- GTGCCACTTT 2888 hom 32 het 14 0 10 4 T 1 0 170129 CASAVA_Build 3 112651641 1D TCAGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 52 2 37 14 A 13 12 170130 CASAVA_Build 3 112652055 1D ATTGAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 A 13 12 170131 CASAVA_Build 3 112653099 1D AAACAGAATG T/- TAAAAAATCC 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 2 1 170132 CASAVA_Build 3 112665228 1D TTAACATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 38 0 27 16 T 15 14 170133 CASAVA_Build 3 112670252 1D TTGTTTATGT C/- CTTTGCCCAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 2 1 170134 CASAVA_Build 3 112678482 2D CTTGACAAAC TT/-- TTTTTGGCAG 3070 hom 138 het 58 0 47 11 T 7 5 170135 CASAVA_Build 3 112688903 1D CACCCCCCCC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 39 het 17 0 12 5 A 9 8 170136 CASAVA_Build 3 112694745 9I ATGCAAATGG ---------/AAAACAACA AAAAAAGCAG 3070 hom 67 het 25 0 23 2 AAAACAACA 0 1 170137 CASAVA_Build 3 112700968 1D TCTAACTCAG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 7 170138 CASAVA_Build 3 112701286 1I CATAGAAAAA -/G GAGAAATTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 2 170139 CASAVA_Build 3 112722378 2I TTTCATCCTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 50 het 31 0 25 6 T 9 11 170140 CASAVA_Build 3 112747537 1D TGTGTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 17 21 12 A 11 10 170141 CASAVA_Build 3 112748954 1D TCATACATAG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 8 7 170142 CASAVA_Build 3 112754696 3I CATCAGCCTG ---/ATA ATGTTATATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATA 0 1 170143 CASAVA_Build 3 112754972 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 15 14 170144 CASAVA_Build 3 112757744 1D TAACAACTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2459 hom 32 10 17 5 T 10 9 170145 CASAVA_Build 3 112764073 1I CTCTCTTCTC -/A GATTTTTATA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 0 1 170146 CASAVA_Build 3 112766006 1D AGTGATTTTT A/- AAAATTTATT 2893 het 2893 ref 22 13 6 3 A 5 4 170147 CASAVA_Build 3 112781998 4D GTGGATAGAC AATT/---- AATTATTTTT 3070 hom 108 het 39 0 35 5 AATT 2 1 170148 CASAVA_Build 3 112797699 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 7 8 170149 CASAVA_Build 3 112820800 1D AAAGGGTGGG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 T 9 8 170150 CASAVA_Build 3 112839333 1D ATGGAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 37 0 23 15 T 14 13 170151 CASAVA_Build 3 112865739 2I CCAAAAAGAC --/AT GTGCAAATGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AT 0 1 170152 CASAVA_Build 3 112868080 1I GGTGCAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1363 hom 30 6 15 9 A 16 17 170153 CASAVA_Build 3 112874223 1D GCTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1729 het 1729 ref 33 21 4 8 T 12 11 170154 CASAVA_Build 3 112889222 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2716 het 417 hom 21 4 8 9 T 14 13 170155 CASAVA_Build 3 112891672 1I CTAGAATTGT -/A AAAAATTAGG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 5 6 170156 CASAVA_Build 3 112892610 3D TGTGAGCAGA AAG/--- AAGGTCTCCA 3070 het 3070 ref 40 20 15 8 AAG 2 1 170157 CASAVA_Build 3 112896009 1I TGAAGAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 13 14 170158 CASAVA_Build 3 112899381 4I GTAGTCACTG ----/TATT TATTTATTTC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 TATT 2 3 170159 CASAVA_Build 3 112902148 1D GGAGAAGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 10 9 170160 CASAVA_Build 3 112927596 5I TTAGAACTAT -----/ACCTG ACTGGAGCCC 3070 hom 129 het 51 0 43 8 ACCTG 0 1 170161 CASAVA_Build 3 112930614 1I TTCCAGGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 35 1 24 10 A 11 12 170162 CASAVA_Build 3 112932433 6I CTAGAATCCA ------/GATTCT GATTCCCTTC 3070 hom 92 het 33 0 30 3 GATTCT 0 1 170163 CASAVA_Build 3 112933079 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 T 5 6 170164 CASAVA_Build 3 112947337 4D AAAAGAAAAG AGAA/---- AGAAAGAAGA 3070 hom 66 het 30 0 26 5 AGAA 3 2 170165 CASAVA_Build 3 112967824 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 8 170166 CASAVA_Build 3 112972494 9I TGAGGCAGCT ---------/TGAGTAGGG TGAGGAGAGA 3070 hom 91 het 33 0 26 7 TGAGTAGGG 0 1 170167 CASAVA_Build 3 112972889 1D TGCCTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 27 0 18 9 T 12 11 170168 CASAVA_Build 3 112973603 1I TCTGCTCCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 388 hom 29 1 24 4 A 8 9 170169 CASAVA_Build 3 112979451 1I TTACCCTCCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 296 hom 38 1 33 4 T 8 9 170170 CASAVA_Build 3 112982892 2D TCTAATCCAC AT/-- GTCTCCCATC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AT 1 0 170171 CASAVA_Build 3 113003413 5D TGGATATGGG TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 hom 103 het 48 0 35 19 TGTTT 5 4 170172 CASAVA_Build 3 113005550 1D TCCTGTCCTC T/- AATTCAGTTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 T 1 0 170173 CASAVA_Build 3 113007384 2D AGATGTATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3004 het 1870 hom 24 9 11 4 A 14 12 170174 CASAVA_Build 3 113007572 1D CATAAAAAAA C/- AGGTCAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 C 1 0 170175 CASAVA_Build 3 113009490 1I GGTGTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 30 4 13 13 G 0 1 170176 CASAVA_Build 3 113010030 2D ATATTCTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 T 13 11 170177 CASAVA_Build 3 113015858 2I AAAGACTAAC --/TT AGCCTCCCAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 0 2 170178 CASAVA_Build 3 113024426 1I TAGCCCTCGG -/A AAAAAAAAAT 1222 het 1222 ref 44 35 3 6 A 9 10 170179 CASAVA_Build 3 113049212 2I ATTTCCTTGG --/GA GAGAGCCTTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 GA 2 3 170180 CASAVA_Build 3 113050878 1D TGGATAATTG A/- AAAAAATTTT 2730 het 2345 hom 23 8 7 9 A 7 6 170181 CASAVA_Build 3 113053494 1I CCCCTCAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1819 hom 30 8 13 9 T 10 11 170182 CASAVA_Build 3 113055411 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2867 hom 27 10 10 7 A 13 12 170183 CASAVA_Build 3 113056942 4D CTCTCTCTTT CTTC/---- CTTCCTTCCT 2281 het 1537 hom 25 8 11 7 CTTC 4 3 170184 CASAVA_Build 3 113057049 4I CTTTTCTTTC ----/CTTT CTTTCTTTCT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 CTTT 2 3 170185 CASAVA_Build 3 113068971 4D ATAAAATAAT AAAC/---- AAAGATCAAT 3070 het 2684 hom 20 7 10 4 AAAC 1 0 170186 CASAVA_Build 3 113070159 2D GAGCTGAATT TA/-- TATATATATA 3070 het 2867 hom 24 8 13 3 TA 7 6 170187 CASAVA_Build 3 113070993 11D GTAAAAATTC AAAAAAAAGAA/----------- AAAAAAAAGG 3070 hom 77 het 26 0 26 2 AAAAAAAAGAA 1 0 170188 CASAVA_Build 3 113071251 2I TCTGTGTGTG --/TT TGTGTGTGTG 3070 het 448 hom 56 2 42 12 T 1 3 170189 CASAVA_Build 3 113073202 1I AACAAACAAA -/C AAAAACTCCA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 C 0 1 170190 CASAVA_Build 3 113074866 1I CCTGGGGTAG -/T TAGGGAATCT 3070 het 3070 ref 35 21 8 6 T 1 2 170191 CASAVA_Build 3 113082218 1D CTTTGTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 10 11 T 12 11 170192 CASAVA_Build 3 113089902 1I GGAAATTATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 8 9 170193 CASAVA_Build 3 113090931 1I AAATCAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 T 11 12 170194 CASAVA_Build 3 113114823 11D TTCTCACAAA CCCACTGACCT/----------- CCCCCTCCTC 3070 hom 84 het 29 0 26 4 CCCACTGACCT 1 0 170195 CASAVA_Build 3 113115749 1I ATTTTCAGGG -/T TTTTTTTTTT 2030 het 2030 ref 36 20 6 10 T 13 14 170196 CASAVA_Build 3 113118705 1I AATAACTTAG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 7 8 170197 CASAVA_Build 3 113121480 4I CTCTAGGGAC ----/AAAG AAAGAAAGAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 AAAG 2 3 170198 CASAVA_Build 3 113128128 1D GACTTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 963 hom 34 4 24 6 T 12 11 170199 CASAVA_Build 3 113128778 3I CCTTAAAAAT ---/GAC GACTGGCCAG 3070 hom 81 het 38 0 28 10 GAC 1 2 170200 CASAVA_Build 3 113131946 3I TAATGAGTAG ---/TCT TCTTCTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TCT 2 3 170201 CASAVA_Build 3 113140340 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 6 170202 CASAVA_Build 3 113140756 2D AAGCCACCCA GT/-- GTGGGTTTAA 3070 hom 93 het 33 0 32 3 GT 2 1 170203 CASAVA_Build 3 113142300 1I TTAAGGAAGA -/T TTTTTATATA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 5 6 170204 CASAVA_Build 3 113147616 10I TTGCCCAGGC ----------/TGGAGTGCAG TGGCATGATC 2700 hom 18 het 7 0 7 0 TGGAGTGCAG 0 1 170205 CASAVA_Build 3 113150867 2D13M1I AAATATGTTC TATGTCTTAGCACTC-/--TGTCTTAGCACTCT TAACTCAACT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 N/A 0 0 170206 CASAVA_Build 3 113168505 1I TTTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 10 11 170207 CASAVA_Build 3 113176784 2I ACTATATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 TA 5 6 170208 CASAVA_Build 3 113178607 1I GGGAAGCCAA -/G GGGGGGTGGA 3070 hom 56 het 21 0 18 3 G 6 7 170209 CASAVA_Build 3 113185097 4D CATCACAGTC TAAT/---- TATTGTTAAC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TAAT 1 0 170210 CASAVA_Build 3 113192892 1D AATACTTTTA T/- TTTTCTTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 T 5 4 170211 CASAVA_Build 3 113198359 1D ACTCCGAATC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 18 16 6 A 9 8 170212 CASAVA_Build 3 113217035 1D CAAGATGCAA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 42 het 22 0 18 4 C 11 10 170213 CASAVA_Build 3 113220106 1D TGGTTCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 31 0 23 8 T 13 12 170214 CASAVA_Build 3 113220559 1D AACTAAAGGG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 8 7 170215 CASAVA_Build 3 113241054 1D GGATTGTAAC T/- TTCAAGAGGG 3070 hom 114 het 44 0 37 8 T 3 2 170216 CASAVA_Build 3 113254722 1I TGAATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 871 hom 36 3 25 8 A 11 12 170217 CASAVA_Build 3 113265889 10I GTGTGTTTTC ----------/TTTTCTTTTT TTTTCTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 TTTTCTTTTT 1 2 170218 CASAVA_Build 3 113287087 12D GCGCGTGCAT TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 19 9 19 TG 14 8 170219 CASAVA_Build 3 113288129 1I GGCGGGACAG -/T TAGTAGGACC 1368 het 657 hom 15 6 5 4 T 1 2 170220 CASAVA_Build 3 113295539 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 T 11 12 170221 CASAVA_Build 3 113307802 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 29 6 T 10 9 170222 CASAVA_Build 3 113311075 1I CTTCTGTTTG -/T TTTAGCTCAC 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 T 3 4 170223 CASAVA_Build 3 113328954 4D ATGATCTCCA AAAC/---- AAACAAACAA 2720 het 2720 ref 31 18 8 7 AAAC 3 2 170224 CASAVA_Build 3 113331814 1D TCTCCTGTCC A/- AAGTTTTCAA 3070 het 3070 hom 51 18 29 4 A 3 2 170225 CASAVA_Build 3 113336761 4D GTCACTCATC TGTT/---- TGTTCATTCC 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 TGTT 2 1 170226 CASAVA_Build 3 113337156 1I TCACTTTTCT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 7 8 170227 CASAVA_Build 3 113341673 1I AATTATCACT -/G GGGAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 G 3 4 170228 CASAVA_Build 3 113341897 3D TTTAAATATA TAT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1657 hom 30 10 14 7 TAT 1 0 170229 CASAVA_Build 3 113344773 2D ATAATTTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 TA 8 7 170230 CASAVA_Build 3 113346785 29D GTTTATGTGG TGAACCACAGTTATTGATTTGCTGGATGT/----------------------------- TGAACCAGTC 3070 het 3070 ref 41 21 20 7 TGAACCACAGTTATTGATTTGCTGGATGT 1 0 170231 CASAVA_Build 3 113355640 2I GTCTGTTCTC --/AG AGGTTTATGT 3070 hom 163 het 60 0 54 6 AG 1 2 170232 CASAVA_Build 3 113359301 1D TTCCTAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 11 10 170233 CASAVA_Build 3 113361363 1I TTTTTTGTTC -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 7 8 170234 CASAVA_Build 3 113369708 1D GTAAGTATCA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 T 8 7 170235 CASAVA_Build 3 113373895 3D TTTATTTCCA GTT/--- GTTTGTTACT 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 GTT 2 1 170236 CASAVA_Build 3 113387797 3I GTATCCTATT ---/GAA GAAATCTCTG 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 GAA 1 2 170237 CASAVA_Build 3 113393602 1I TTTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2983 hom 27 9 11 7 T 11 12 170238 CASAVA_Build 3 113398495 1D CTTGTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 12 11 170239 CASAVA_Build 3 113408406 1D GGGGAGGGAT A/- AGCAGTAGGA 2706 het 2579 hom 15 8 7 0 A 2 1 170240 CASAVA_Build 3 113410750 1D ATACCATTTG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 A 9 8 170241 CASAVA_Build 3 113411052 1I TGAATCTAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 8 9 170242 CASAVA_Build 3 113419983 3D TGTATATATA TTT/--- TTTTTTTTAC 3070 hom 19 het 30 1 20 10 T 11 8 170243 CASAVA_Build 3 113420866 1I ATATAAGCAC -/A ATCAATAGAA 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 1 2 170244 CASAVA_Build 3 113422396 1I TGGCAGGGGG -/A GGACAAAGAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 0 1 170245 CASAVA_Build 3 113423591 1D ATGTGGGATG A/- AAAAACTTTT 3070 het 3070 ref 55 26 22 7 A 6 5 170246 CASAVA_Build 3 113425106 2I CTTATCAAAC --/AG AAATAAACAA 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 AG 0 1 170247 CASAVA_Build 3 113425935 1D GCAAGGATAC A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 A 8 7 170248 CASAVA_Build 3 113426146 2D TTATAAAAAA AT/-- AACTGAACAG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 AT 1 0 170249 CASAVA_Build 3 113427088 1I CAAAAAAAAA -/T AACACATGAC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 0 1 170250 CASAVA_Build 3 113428266 2D CCCCCCCCAT CC/-- CCCCACACAC 3070 het 71 hom 33 2 16 15 C 6 4 170251 CASAVA_Build 3 113445231 2D ATATGGATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 24 1 15 8 T 15 13 170252 CASAVA_Build 3 113456052 1I ATGAAATAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 T 8 9 170253 CASAVA_Build 3 113477904 2I ATTTTTCAAG --/TA TATATATATA 2496 het 2496 ref 19 9 6 4 TA 6 7 170254 CASAVA_Build 3 113484203 1D GTTAATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 38 1 26 12 A 11 10 170255 CASAVA_Build 3 113486423 18D CAATGTTTCT AATATTTTAAATTACTAA/------------------ AATATTTTAA 3070 het 2212 hom 20 7 9 9 AATATTTTAAATTACTAA 2 1 170256 CASAVA_Build 3 113492352 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 1561 het 1561 ref 52 22 5 25 T 15 14 170257 CASAVA_Build 3 113495943 1I AATTTAAGAC -/T TTTGGGACAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 3 4 170258 CASAVA_Build 3 113500811 2I TATATCTATC --/TA TATATATATA 3070 het 217 hom 23 3 12 8 TA 7 8 170259 CASAVA_Build 3 113512535 1I ATAATGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 11 12 170260 CASAVA_Build 3 113518958 4I CTTTCTTCTC ----/TCTG TCTTTTTGCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TCTG 0 1 170261 CASAVA_Build 3 113523280 1I CCCAATATAG -/T TTTTTTTTTT 2642 het 2642 ref 29 10 10 9 T 12 13 170262 CASAVA_Build 3 113527255 1D AAATTGCGAT A/- AAAAAATGTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 7 6 170263 CASAVA_Build 3 113534315 2D TTTTTTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 14 12 170264 CASAVA_Build 3 113536286 1D AGACTCGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 10 9 170265 CASAVA_Build 3 113538224 4D ATAAGAACAT ACAA/---- ACAACTTCAG 3070 hom 111 het 39 0 37 10 ACAA 2 1 170266 CASAVA_Build 3 113557893 1D TTTGTTTTTA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 T 7 6 170267 CASAVA_Build 3 113559905 1D AGAAATTTGT G/- GGGACCCACT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 G 4 3 170268 CASAVA_Build 3 113560025 1D TGCTAGTGCA G/- TTGTATCTCT 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 G 1 0 170269 CASAVA_Build 3 113561872 1D CTAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 T 1 0 170270 CASAVA_Build 3 113569060 17D CTTTTTTCTC TTTCTTTCTTTCTTTTT/----------------- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 TTTCTTTCTTTCTTTTT 1 0 170271 CASAVA_Build 3 113571559 13I TATTTTTATA -------------/AATATAGTGTATC CTAGATGTAC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 AATATAGTGTATC 0 1 170272 CASAVA_Build 3 113571619 11D GCCTTCCTAT TCACTCACCAC/----------- TCACTCACAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 8 TCACTCACCAC 1 0 170273 CASAVA_Build 3 113574760 1D ACCCAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 2591 het 369 hom 14 6 6 2 T 16 15 170274 CASAVA_Build 3 113605735 1I TGAATTAGAC -/A AAAATTGTTC 1410 het 1410 ref 20 14 4 2 A 4 5 170275 CASAVA_Build 3 113614168 8D TTGTCTATTT CTGCTGTG/-------- TTGCCTGTGC 3070 het 3070 hom 30 12 18 2 CTGCTGTG 1 0 170276 CASAVA_Build 3 113614622 1D TCACCATTTT G/- GTTAAGTTTA 3070 het 3070 hom 50 20 25 6 G 2 1 170277 CASAVA_Build 3 113616455 1I ATGTTAATGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 23 14 0 T 8 9 170278 CASAVA_Build 3 113629243 1I CCTAGATTGC -/T TGTGAGTGGA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 1 2 170279 CASAVA_Build 3 113633109 1D GCATTATAGA G/- GTGACTTAGG 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 G 2 1 170280 CASAVA_Build 3 113678895 1D ATTTTCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 35 1 26 8 T 12 11 170281 CASAVA_Build 3 113679543 1D AATACTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 25 1 18 6 T 15 14 170282 CASAVA_Build 3 113692278 1D AAAAAAAAAA G/- CAACCATGAA 3070 het 28 hom 34 1 26 7 G 1 0 170283 CASAVA_Build 3 113693387 1D GGATCAGCAG T/- GGTGCATAAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 0 170284 CASAVA_Build 3 113707181 2D TTGTAGCTCA TT/-- TCTTTTTAGT 3070 hom 151 het 58 0 51 7 T 3 1 170285 CASAVA_Build 3 113710788 4D TCAAAATAGA AAAG/---- AAAGAATAGT 3070 hom 96 het 34 0 32 4 AAAG 2 1 170286 CASAVA_Build 3 113713852 1D GAGACTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 13 12 170287 CASAVA_Build 3 113717136 1I AGAACTCATG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 8 170288 CASAVA_Build 3 113731952 1D AAAAAAAAGG C/- GGGGGGGGTG 1999 het 204 hom 24 2 10 12 C 1 0 170289 CASAVA_Build 3 113733138 3D TGACAAATAA AAC/--- AACTGGGAGA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 AAC 2 1 170290 CASAVA_Build 3 113735749 1I TAAATTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 36 1 31 4 A 10 11 170291 CASAVA_Build 3 113736314 1D CAGGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 30 0 18 12 A 17 16 170292 CASAVA_Build 3 113737681 3I CCATATCTAA ---/ATG ATGACTATTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ATG 1 2 170293 CASAVA_Build 3 113778598 5D TACAAAATAA AATAG/----- AATAATTTTT 2713 hom 21 het 11 0 8 4 AATAG 1 0 170294 CASAVA_Build 3 113778630 1I ATTTTTTAAG -/A AAAAAAAAAA 1280 hom 12 het 8 0 5 3 A 11 12 170295 CASAVA_Build 3 113781661 1D TCTCCTGCAT A/- GGGGGAAATT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 1 0 170296 CASAVA_Build 3 113784149 9I AAGGTTTTCC ---------/CTTAGTAAT CTTTAAAAAT 3070 hom 151 het 51 0 51 0 CTTAGTAAT 0 1 170297 CASAVA_Build 3 113787104 1I ATAAAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 11 12 170298 CASAVA_Build 3 113791166 1I GAGTAACAGA -/T TTACAGGCAG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 2 3 170299 CASAVA_Build 3 113791569 1D ATGCCTTGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 T 9 8 170300 CASAVA_Build 3 113797166 1I CTATATATAG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 8 9 170301 CASAVA_Build 3 113806046 4I ACACTTAATA ----/TATT GACTACTAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TATT 0 1 170302 CASAVA_Build 3 113824360 13D GCCCAGCTAA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 1261 hom 20 het 15 0 6 9 T 25 12 170303 CASAVA_Build 3 113827981 2I TCCTGATGAC --/TG TGAGGTTTCT 3070 hom 108 het 46 0 36 10 TG 1 2 170304 CASAVA_Build 3 113830818 1D TACTCTAAGG T/- TTTTTTTTTT 1756 het 1756 ref 27 18 6 3 T 12 11 170305 CASAVA_Build 3 113835677 1I AAATGCTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 235 hom 28 1 22 5 T 9 10 170306 CASAVA_Build 3 113849656 1I CACAGGGTTT -/C CCCGATGCTC 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 C 3 4 170307 CASAVA_Build 3 113850064 2D ATTAAACCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2384 het 2348 hom 32 12 6 15 T 16 14 170308 CASAVA_Build 3 113851907 2D ACACAGATAC AT/-- ATATATATAT 2788 het 2788 ref 22 9 9 4 AT 10 9 170309 CASAVA_Build 3 113853969 1I TGCCTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 1969 het 1429 hom 22 6 7 9 T 15 16 170310 CASAVA_Build 3 113856507 2D AGTCCAAATG CC/-- CCCTAATTGT 3070 het 3070 hom 46 20 17 9 C 5 3 170311 CASAVA_Build 3 113873820 1D CAAGTGTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 13 12 170312 CASAVA_Build 3 113876186 1I ACTGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 10 11 170313 CASAVA_Build 3 113892769 1D ATGGGATTGT G/- GGGTCAAATG 3070 hom 57 het 24 0 20 5 G 4 3 170314 CASAVA_Build 3 113912528 2D TCTCTATTTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 86 het 34 0 30 4 TA 7 6 170315 CASAVA_Build 3 113934367 1I CTAATTTTTG -/T TATTTTTAGT 2812 hom 21 het 9 0 8 1 T 1 2 170316 CASAVA_Build 3 113937203 1I TCCCAAGCCT -/G CTGCACAGGG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 G 0 1 170317 CASAVA_Build 3 113940665 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 87 het 37 0 29 9 AC 6 5 170318 CASAVA_Build 3 113941225 1D AAATATTACA T/- TTTACCTTTG 3070 hom 129 het 47 0 44 4 T 4 3 170319 CASAVA_Build 3 113944374 4D AATCACTGAC TAAT/---- TAGTTTCCCC 3070 hom 69 het 28 0 24 8 TAAT 1 0 170320 CASAVA_Build 3 113952748 1I AAATATATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 10 11 170321 CASAVA_Build 3 113954034 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 550 hom 26 3 15 8 T 13 12 170322 CASAVA_Build 3 113954643 1I AAAAGAGGGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 7 8 170323 CASAVA_Build 3 113954805 1I TAACATACAC -/T TTTCATTCCT 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 T 3 4 170324 CASAVA_Build 3 113964735 1I GATCACATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 12 13 170325 CASAVA_Build 3 113969970 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 32 1 19 12 A 16 14 170326 CASAVA_Build 3 113973539 1D CACATCTCTA T/- TTTGGACTAG 3070 hom 120 het 50 0 41 9 T 4 3 170327 CASAVA_Build 3 113978464 3I ACTCTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 23 1 18 4 A 13 16 170328 CASAVA_Build 3 113978607 2I AGCTGGCTCA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 70 het 28 0 22 6 AG 6 7 170329 CASAVA_Build 3 113980768 1D CAAGTCAAGC T/- GGTTTATTCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 0 170330 CASAVA_Build 3 113981076 2D AAAAAGAAAC TG/-- TGTTCAAAAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TG 2 1 170331 CASAVA_Build 3 114013523 2D CTGCAGTGAG AC/-- ACACACACAA 3070 het 3070 hom 45 17 20 10 AC 5 4 170332 CASAVA_Build 3 114015268 4I ACCAAGAAAG ----/AGAT AGATGGTCAG 3070 het 3070 hom 67 27 31 9 AGAT 1 2 170333 CASAVA_Build 3 114020362 1D CATTTATGAT G/- GCAGGCACGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 G 2 1 170334 CASAVA_Build 3 114021262 1D ACAATGATAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 45 0 36 11 T 10 9 170335 CASAVA_Build 3 114023189 1D TTCTGTGGTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 T 8 7 170336 CASAVA_Build 3 114025459 13I GAAGCGCAAG -------------/GCTAAAGAGAGAA GCAGGTTGTG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 GCTAAAGAGAGAA 0 1 170337 CASAVA_Build 3 114027685 2D TTAATATGAT TA/-- TATTTAATAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 TA 2 1 170338 CASAVA_Build 3 114040023 1I ACAAACAAAC -/A AAACAAAAAA 2832 het 343 hom 27 2 12 13 A 3 4 170339 CASAVA_Build 3 114048911 1I CTAGAAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 10 11 170340 CASAVA_Build 3 114057206 1I CAATCATATG -/T GTCTGATTTG 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 T 0 1 170341 CASAVA_Build 3 114059059 1D ATGATTATTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 55 hom 48 1 40 7 T 9 8 170342 CASAVA_Build 3 114061462 1I GTTTGAATAA -/T ATTCAGTTGT 3070 hom 160 het 59 0 54 5 T 0 1 170343 CASAVA_Build 3 114065202 1D TTCAGCTGTG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 9 8 170344 CASAVA_Build 3 114070688 4I TTGCCTGGAA ----/CATC ATGTTCTATT 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 CATC 0 1 170345 CASAVA_Build 3 114072544 1D TTATTTTTAA T/- TTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 46 21 15 11 T 7 6 170346 CASAVA_Build 3 114076530 2I GAATCATGTT --/TG TGTTTCCCCC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TG 1 2 170347 CASAVA_Build 3 114079938 1D AAAGTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 26 0 25 2 A 11 10 170348 CASAVA_Build 3 114082320 3D AGGCTCTTTA GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 het 3070 hom 47 19 19 12 GTT 5 4 170349 CASAVA_Build 3 114087922 1I TCCTGAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 25 2 15 8 T 11 12 170350 CASAVA_Build 3 114093684 6D GAGAACATTA AAATGT/------ AATCATATTT 3070 het 3070 ref 43 25 17 3 AAATGT 1 0 170351 CASAVA_Build 3 114099318 1D AAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 11 10 170352 CASAVA_Build 3 114100135 1I TGATGCCAAC -/T ATATGATGTT 3070 hom 163 het 57 0 55 2 T 0 1 170353 CASAVA_Build 3 114100550 2I TTAAAAGTTT --/TA TATATATATA 1439 het 1439 ref 17 9 4 4 TA 6 7 170354 CASAVA_Build 3 114110565 1I GTTCAGTTTG -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 96 het 41 0 32 9 T 8 9 170355 CASAVA_Build 3 114113053 1I TATGAAGGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 9 10 170356 CASAVA_Build 3 114113303 3D AGCTAACATC ATA/--- ATGACAGGAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 ATA 1 0 170357 CASAVA_Build 3 114117681 1I CACACGTACC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 8 9 170358 CASAVA_Build 3 114131654 1D ACAGATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 13 12 170359 CASAVA_Build 3 114132908 4D CTGAAAATTA TACT/---- TAAGTAATCA 3070 hom 108 het 41 0 37 6 TACT 1 0 170360 CASAVA_Build 3 114139003 1D CCCATTGCTT G/- TTTCTGTCAG 3070 het 185 hom 22 1 18 3 G 1 0 170361 CASAVA_Build 3 114146018 1I TAAAGAGAAA -/C TTTCTCAACT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 0 1 170362 CASAVA_Build 3 114148488 1I ATTCAGTACT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 10 170363 CASAVA_Build 3 114153582 1D AAAGAATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 36 1 30 6 A 13 12 170364 CASAVA_Build 3 114162409 4I AAGAAAACTA ----/AAGT AAGTACAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAGT 1 2 170365 CASAVA_Build 3 114168889 5D ATGTTTATCC CTCAA/----- CTCTTCTTAC 3070 het 3070 ref 45 23 19 8 CTCAA 1 0 170366 CASAVA_Build 3 114174084 1D CAATAGGGCT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 32 11 14 8 A 8 7 170367 CASAVA_Build 3 114178197 1D ATCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 1173 het 1173 ref 15 8 4 3 A 17 16 170368 CASAVA_Build 3 114182516 4I13M7I TCAATGGCTT ----ATTTTGTCCCCAA-------/AAAAATTTTGTCCCCAAATTACAT ATTTGACCAT 3070 hom 117 het 37 0 40 3 N/A 0 0 170369 CASAVA_Build 3 114185464 1I GCTATCTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 A 8 9 170370 CASAVA_Build 3 114187726 1D CCTTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 497 hom 17 2 7 9 A 11 10 170371 CASAVA_Build 3 114194883 4D CTTCAGAAAG TCTT/---- TCTTTATCCA 3070 het 3070 ref 35 20 12 5 TCTT 2 1 170372 CASAVA_Build 3 114196841 1I ATACATTTAA -/C CCCCAAAGCA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 C 4 5 170373 CASAVA_Build 3 114202812 1D ACTATGGGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 17 14 8 T 10 9 170374 CASAVA_Build 3 114217977 4D AGAGCTACGT AAGA/---- GAGAGAGACT 3070 het 3070 hom 37 18 17 4 AAGA 1 0 170375 CASAVA_Build 3 114246944 1D TTGGTGACTT A/- AGGAGAATAT 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 A 2 1 170376 CASAVA_Build 3 114250172 1I TAAAAATTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2583 hom 22 9 9 4 A 8 9 170377 CASAVA_Build 3 114261821 1I GAATGGAGGA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 T 7 8 170378 CASAVA_Build 3 114271385 1D ACAGATGGAA G/- GGCCTTGAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 G 3 2 170379 CASAVA_Build 3 114275128 1D GAGTCAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 T 12 11 170380 CASAVA_Build 3 114275209 1I ATTTCTGAGA -/T TTTTGGTGCA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 4 5 170381 CASAVA_Build 3 114279977 3D CATAGTTGTT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 21 10 TTC 3 2 170382 CASAVA_Build 3 114280627 4D AAAAATATAT AGAG/---- AGAGTATATA 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 AG 4 2 170383 CASAVA_Build 3 114280947 1D AAGGAAGAAT A/- AGACTCTGTG 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 A 2 1 170384 CASAVA_Build 3 114281653 1I CCGAGGGGAG -/A AAAACCTTAA 3070 hom 89 het 33 0 29 4 A 4 5 170385 CASAVA_Build 3 114282586 1D CAGTGGGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 444 hom 25 1 19 6 T 10 9 170386 CASAVA_Build 3 114293044 4D AAAGAAGGAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 2167 het 2167 ref 24 10 7 7 GAAA 4 3 170387 CASAVA_Build 3 114293143 4D GAGGGAGAGG GAGA/---- GAGAGAGAAA 2363 het 2363 ref 31 17 10 6 GA 6 4 170388 CASAVA_Build 3 114293858 1I GGCATGAGCC -/A CCGCACCCGG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 0 1 170389 CASAVA_Build 3 114300371 1D AAAATTTGCC T/- GAATTGACTG 3070 het 3070 ref 51 29 19 4 T 1 0 170390 CASAVA_Build 3 114308760 1D TGGAGAGCAA T/- TAAGAATCTC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 T 2 1 170391 CASAVA_Build 3 114313704 1I AATTGCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 19 8 T 10 11 170392 CASAVA_Build 3 114316723 1I GAAGTACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2343 hom 25 5 14 6 A 10 11 170393 CASAVA_Build 3 114322982 1I ACCGATGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 10 11 170394 CASAVA_Build 3 114324793 2D CACTCATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1714 het 268 hom 32 4 13 15 T 20 18 170395 CASAVA_Build 3 114325778 1I ATGAGGAGTA -/T TAGAAAGGAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 1 2 170396 CASAVA_Build 3 114326134 8D AAGAAGTGGT GGGCGTGG/-------- GGGCGTGGGC 1580 het 1580 ref 36 13 10 15 GGGCGTGG 2 1 170397 CASAVA_Build 3 114326850 1I AGACAGGCGA -/T TAAGATGCCA 3070 het 3070 ref 65 29 26 10 T 1 2 170398 CASAVA_Build 3 114328393 1D TGGCTTTGCA G/- GGGGTAGTTT 3070 het 3070 ref 41 27 10 4 G 5 4 170399 CASAVA_Build 3 114329350 2I CACACCCCAG --/AC ACATTTTGTT 1956 het 1956 ref 20 10 5 5 AC 1 2 170400 CASAVA_Build 3 114332313 1D TCAGTAAGTC G/- TAACTGTCAT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 G 1 0 170401 CASAVA_Build 3 114337090 1D AATGGTCATA T/- TTTTTCCTTC 3070 hom 141 het 54 0 48 7 T 6 5 170402 CASAVA_Build 3 114338105 1D GTTAGACTTA T/- TTGTGGTCAA 2216 het 2216 ref 21 11 6 4 T 3 2 170403 CASAVA_Build 3 114341770 4D AGCCTTTCAC CCCA/---- CCCACCACTC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 CCCA 2 1 170404 CASAVA_Build 3 114344499 3D CATTCGGGAG ACA/--- CTCGGTTCCA 3070 het 3070 hom 49 20 27 3 ACA 1 0 170405 CASAVA_Build 3 114345149 1I GCCCAGTCTT -/C CCAGTCTAGG 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 C 2 3 170406 CASAVA_Build 3 114353278 1D GTTTAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 862 het 558 hom 15 4 6 5 A 15 14 170407 CASAVA_Build 3 114357174 1I AGCCTGCAGT -/C CCAGCTACTC 3070 hom 59 het 22 0 18 4 C 2 3 170408 CASAVA_Build 3 114357324 1I CCAACTCCAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 7 8 170409 CASAVA_Build 3 114362989 1D TATAGCTTTT A/- AAAAAATCTC 3070 hom 126 het 49 0 43 7 A 7 6 170410 CASAVA_Build 3 114386358 4I CCCTTTCTGA ----/CTCT CTCTCTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 CT 3 5 170411 CASAVA_Build 3 114395800 1I TTGGCTGATA -/C CATCAGCTCT 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 C 1 2 170412 CASAVA_Build 3 114401996 1D CCTCTGCCAC T/- TGGCAGGGTC 2104 het 2104 ref 29 14 9 7 T 2 1 170413 CASAVA_Build 3 114406449 2D ATATATACAC AT/-- ATATATATGT 604 het 604 ref 26 19 4 3 AT 5 4 170414 CASAVA_Build 3 114406943 1D AGACACTGTC A/- AAAAAAAAAA 1527 het 1527 ref 17 10 4 3 A 16 15 170415 CASAVA_Build 3 114407783 1D CGTTTATTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 27 0 20 9 T 10 9 170416 CASAVA_Build 3 114408155 1I TTAGACTCTT -/A ACATTAGTTA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 1 2 170417 CASAVA_Build 3 114410371 1D GTCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 1654 hom 15 het 7 0 6 1 A 12 11 170418 CASAVA_Build 3 114419064 2D ACCCTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 32 1 23 8 A 12 10 170419 CASAVA_Build 3 114421589 1D AGATATTTGG C/- CCAGTAGATA 3070 hom 141 het 52 0 46 7 C 3 2 170420 CASAVA_Build 3 114424247 1D CGCAGGGGGG T/- GCCCAGCTCA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 1 0 170421 CASAVA_Build 3 114426809 1D AGACCTTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1386 hom 22 6 9 7 A 11 10 170422 CASAVA_Build 3 114428232 1I CCAAGATGAA -/C CTGGCTAGGG 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 C 1 2 170423 CASAVA_Build 3 114430493 2I GCATGATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 TG 6 7 170424 CASAVA_Build 3 114434100 14D TGCTGTGCGA GTGTGTGTGTGTGT/-------------- GTGTGTGTGT 3070 het 1134 hom 50 8 20 28 GT 14 7 170425 CASAVA_Build 3 114445831 1D TATAGCAATA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 T 7 6 170426 CASAVA_Build 3 114448230 1I CATAGCCATA -/T TTTTTTGGTC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 6 7 170427 CASAVA_Build 3 114455135 1I TAAAGTACAC -/A AAAGTGTACT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 3 4 170428 CASAVA_Build 3 114460412 1I GCTGAGATCT -/A AAAAGGTGCC 3070 het 3070 hom 55 21 28 6 A 4 5 170429 CASAVA_Build 3 114469503 1D TGTACTTTGA C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 87 het 34 0 27 7 C 9 8 170430 CASAVA_Build 3 114471786 1D TGATGGGAAG C/- TCCAAAATCA 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 C 1 0 170431 CASAVA_Build 3 114484875 1I AATGGGGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 9 10 170432 CASAVA_Build 3 114496539 1I TGATTAAAGA -/T TAAGAATATA 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 T 1 2 170433 CASAVA_Build 3 114501759 9D GAAGGATAGT GGAGGTGGG/--------- GGATGTGGGA 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 GGAGGTGGG 1 0 170434 CASAVA_Build 3 114502014 2I TATCTTATAA --/AT ATATATATAT 2142 het 1122 hom 13 4 5 4 AT 8 9 170435 CASAVA_Build 3 114503553 1D TATAAGTGAT G/- TCATGTGGTA 3070 het 3070 ref 39 25 13 1 G 1 0 170436 CASAVA_Build 3 114518973 2D TCTCTGCAAG CC/-- CTCCTGCCTG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 C 3 1 170437 CASAVA_Build 3 114536203 1I TAAAGGATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 A 9 10 170438 CASAVA_Build 3 114538166 4D AGTAAAGCAG AAGA/---- AAGAAAACAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 AAGA 2 1 170439 CASAVA_Build 3 114540087 1I TCATACCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 10 11 170440 CASAVA_Build 3 114543267 1I GAGTTTAGGT -/A AAAAAAAAAC 2980 het 2980 ref 18 8 7 3 A 9 10 170441 CASAVA_Build 3 114553289 1I TCCCCTTTCT -/A GGTCCCGTGA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 0 1 170442 CASAVA_Build 3 114555622 2D GGCAAGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 11 14 A 16 14 170443 CASAVA_Build 3 114561810 3D CCATGTTATT ATC/--- AAGTGAGATA 3070 het 3070 ref 44 21 20 7 ATC 1 0 170444 CASAVA_Build 3 114562464 1D CTACTAATAT A/- AAAAAAAAAA 1366 het 1366 ref 26 22 3 1 A 12 11 170445 CASAVA_Build 3 114563394 1D CTGACCACAA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3015 hom 23 7 11 5 T 9 8 170446 CASAVA_Build 3 114574929 1D TTTTTAAAGC T/- TTTTGAAATA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 5 4 170447 CASAVA_Build 3 114576692 6I GAAAGAAAGT ------/AGAGTG ATGGTTGCCA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 AGAGTG 0 1 170448 CASAVA_Build 3 114593245 1I TCTATGGGGG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 6 7 170449 CASAVA_Build 3 114594012 1D ACATAGAATG A/- ATAAGATATA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 2 1 170450 CASAVA_Build 3 114594266 1D AATAAAGACC A/- GAATAACTCT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 1 0 170451 CASAVA_Build 3 114594819 2D CCAAAATGAC TT/-- TTAAATTATG 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 T 4 2 170452 CASAVA_Build 3 114604633 1D CTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 10 9 170453 CASAVA_Build 3 114617726 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 73 het 29 0 24 5 T 9 8 170454 CASAVA_Build 3 114631955 11D43M2I CAAGAAGCTG GAAAAATAAATGAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGTAAATTAGCAAAGCCAAAATC--/-----------GAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGTAAATTAGCAAAGCCAAAATCTT AGTCTTTGAA 3070 hom 18 het 24 1 27 13 N/A 0 0 170455 CASAVA_Build 3 114637774 1D TGAGTAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 11 10 170456 CASAVA_Build 3 114638730 1I GGGTCAAGTT -/C CACCTAGTGA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 C 1 2 170457 CASAVA_Build 3 114641898 3D GCGCACAGCC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 TAT 4 3 170458 CASAVA_Build 3 114647555 1I AGCACCACAG -/A AAAAAATGCC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 6 7 170459 CASAVA_Build 3 114650022 1I AAGTTTTCCC -/A AAAAAAAAAG 2418 het 2418 ref 23 12 7 4 A 9 10 170460 CASAVA_Build 3 114653435 4D5M3I ACTCACCTCA CCCTAACCT---/----TAGGTGAG TCCTCACCAA 3070 het 3070 ref 30 19 13 0 N/A 0 0 170461 CASAVA_Build 3 114669341 2D TAGAATGCAG AC/-- ACAGTTAACA 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 AC 2 1 170462 CASAVA_Build 3 114692841 1I AGTTACAATT -/C CATTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 C 1 2 170463 CASAVA_Build 3 114697958 1I CAGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 9 10 170464 CASAVA_Build 3 114705886 2D GCTTCTGATC AA/-- AGACTAAACT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 3 1 170465 CASAVA_Build 3 114706852 1D TTATCACATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 T 10 9 170466 CASAVA_Build 3 114707340 2D CTACTCAGGA GG/-- CTAAGGCAGG 3070 het 3070 ref 46 21 19 7 G 2 0 170467 CASAVA_Build 3 114710971 3D GAAAATACAT AAG/--- AAGTATAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 AAG 2 1 170468 CASAVA_Build 3 114712797 2I ACATTTCTGC --/AT ATATATACCC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 AT 3 4 170469 CASAVA_Build 3 114715876 2D GAAACAAGAA CT/-- CTTTCCAAAC 3070 het 3070 ref 39 21 17 4 CT 2 1 170470 CASAVA_Build 3 114721647 1D ACCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2478 hom 32 11 15 8 A 14 13 170471 CASAVA_Build 3 114723571 1D CAAATATGCT C/- CCCAAAGAAT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 C 4 3 170472 CASAVA_Build 3 114724495 3I TATTGCAAGA ---/TCT TCTTGACCTT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TCT 1 2 170473 CASAVA_Build 3 114726728 1D ACCTTTATAA T/- TTTTCCAGGA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 5 4 170474 CASAVA_Build 3 114735384 12D AACTGCAGCC ATCAGCTGATCA/------------ ATCCAGGTTT 3070 het 3070 ref 45 20 19 7 ATCAGCTGATCA 1 0 170475 CASAVA_Build 3 114736818 1D TTTCAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 28 0 22 6 T 11 10 170476 CASAVA_Build 3 114737980 1D TGGTTTAGGG A/- AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 7 6 170477 CASAVA_Build 3 114743992 1I GAATTTAAAG -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 6 7 170478 CASAVA_Build 3 114760973 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 341 hom 26 1 21 5 T 15 14 170479 CASAVA_Build 3 114764886 1D GTTTAAATAA T/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 45 19 17 10 T 7 6 170480 CASAVA_Build 3 114769726 1I CCCTGTTTTT -/A AAAAAACTAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 6 7 170481 CASAVA_Build 3 114771995 1I CTGTAAGGTT -/A ATTAGAACCT 3070 hom 114 het 45 0 37 8 A 1 2 170482 CASAVA_Build 3 114800348 1I TTTCAAATAA -/G GGACATAGGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 2 3 170483 CASAVA_Build 3 114813448 1D CCCAGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 33 1 26 6 T 12 11 170484 CASAVA_Build 3 114860172 1D TTTCTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 2175 het 2175 ref 47 33 5 10 T 11 10 170485 CASAVA_Build 3 114903743 6D ACTCCGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1817 het 1817 ref 27 16 7 6 A 18 12 170486 CASAVA_Build 3 115002775 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 59 het 22 0 20 2 A 10 9 170487 CASAVA_Build 3 115004203 1I TTGTTTGGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 462 hom 16 1 11 4 T 9 10 170488 CASAVA_Build 3 115032971 1D ACTTTTTTTT A/- ATGTGACAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 A 2 1 170489 CASAVA_Build 3 115033300 2D CCAGAGTTTC TA/-- TGTGGTTCCT 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 TA 1 0 170490 CASAVA_Build 3 115036477 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 142 hom 31 2 15 14 A 17 16 170491 CASAVA_Build 3 115040478 3D CGTCAGGTAA GCC/--- GCGGGCCTCG 3070 hom 50 het 19 0 13 7 GCC 1 0 170492 CASAVA_Build 3 115044984 1D TTTTTAACTG C/- CTGATGAGTG 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 C 2 1 170493 CASAVA_Build 3 115047451 1I GACTAAAACG -/T TTTGATTTCC 3070 het 3070 ref 46 29 16 1 T 3 4 170494 CASAVA_Build 3 115047648 1D TCTGCACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 48 1 34 13 T 13 12 170495 CASAVA_Build 3 115058714 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 7 8 170496 CASAVA_Build 3 115062505 1D ACTCCAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1768 hom 23 7 7 10 A 15 14 170497 CASAVA_Build 3 115065190 2I TTTAAAGTAA --/GT GTGCCATGTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 GT 1 2 170498 CASAVA_Build 3 115076675 2I TAAAGATCAG --/TT TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 T 8 10 170499 CASAVA_Build 3 115077268 2I AAATACAAAC --/AT GTGTTGTATA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 AT 0 1 170500 CASAVA_Build 3 115080742 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 34 0 23 12 A 12 11 170501 CASAVA_Build 3 115089147 4D CTGAGGCAGG AGAA/---- AGGAGAATGG 1402 het 1402 ref 12 8 3 1 AGAA 1 0 170502 CASAVA_Build 3 115090737 1I AACTCCTTCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1260 hom 34 3 23 8 A 9 10 170503 CASAVA_Build 3 115091615 1I TGAACTGAAC -/A GCTGAGGACA 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 A 0 1 170504 CASAVA_Build 3 115100992 2D1M3I TGTCTCTTCA ACT---/--TGGG ATATTAAAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 N/A 0 0 170505 CASAVA_Build 3 115103529 2D ACTGCAAGTG AC/-- TGCAAAGCAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AC 1 0 170506 CASAVA_Build 3 115111447 1D ATGGGATGAG T/- TTTTTGAAAG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 6 5 170507 CASAVA_Build 3 115130507 2D TGCTTCCAGT TC/-- TTTTGGGTAT 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 TC 1 0 170508 CASAVA_Build 3 115134424 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 20 2 15 3 T 14 15 170509 CASAVA_Build 3 115137025 2D CATGCGAGAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 7 AT 7 6 170510 CASAVA_Build 3 115140930 1I TGAATGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1022 hom 49 3 33 13 T 13 14 170511 CASAVA_Build 3 115142187 4D TTTTTATTGA TCTT/---- TCTAAATAAA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 TCTT 1 0 170512 CASAVA_Build 3 115146874 2D CATAAAAAAC AG/-- AAATTTTCAA 3070 het 3070 ref 47 28 12 7 AG 1 0 170513 CASAVA_Build 3 115148935 1I AGAAATCATG -/A AAACGAACAG 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 3 4 170514 CASAVA_Build 3 115158331 1D TCATAGGCTC A/- AAAGTCGCAA 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 A 4 3 170515 CASAVA_Build 3 115165472 1D AAAACACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 14 13 170516 CASAVA_Build 3 115168637 8D CTCTTGTCTC AAAAAAAG/-------- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 AAAAAAAG 3 2 170517 CASAVA_Build 3 115177631 6D CGCTGTCTCT ACTAAA/------ AATACAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 ACTAAA 1 0 170518 CASAVA_Build 3 115179067 2D AAAACATAAC TG/-- TATTTTAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 TG 1 0 170519 CASAVA_Build 3 115185765 1I AACAGTAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 9 10 170520 CASAVA_Build 3 115188667 1D GTGTTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 772 hom 29 3 14 12 A 14 13 170521 CASAVA_Build 3 115202181 2D ACTTTCTTGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 51 24 19 10 TC 7 6 170522 CASAVA_Build 3 115228997 1I CTAAAGATAC -/A AAAAATTAGC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 5 6 170523 CASAVA_Build 3 115261148 1I CAAAATTCCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 T 7 8 170524 CASAVA_Build 3 115280583 2I TATGAAAAAT --/TA TATAGGCAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TA 2 3 170525 CASAVA_Build 3 115289985 1D TCATTGGAAG A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 7 6 170526 CASAVA_Build 3 115293998 1I GTTTTTCGGA -/T TTTTTTTTTT 1232 het 1232 ref 52 42 3 7 T 10 11 170527 CASAVA_Build 3 115296596 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 39 0 30 9 A 11 10 170528 CASAVA_Build 3 115301161 1I CTGCAGTGAG -/C CATGATCACA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 1 2 170529 CASAVA_Build 3 115306358 1D GATAAAAAAA G/- TGTTAACTGT 3070 het 3070 hom 43 16 20 9 G 1 0 170530 CASAVA_Build 3 115327977 4D CCGCCTGGTG CCAC/---- CCATCAGTCC 3070 hom 98 het 36 0 33 4 CCAC 1 0 170531 CASAVA_Build 3 115334533 1I GTCCGTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 922 hom 27 2 16 9 T 12 13 170532 CASAVA_Build 3 115335143 5D TATCTCTGAG CTTCC/----- TTTGTAAAAC 1214 het 1214 ref 31 21 6 5 CTTCC 1 0 170533 CASAVA_Build 3 115351704 4I CTGATCCTGA ----/CACT CACTCACAGC 3070 hom 132 het 54 0 42 12 CACT 1 2 170534 CASAVA_Build 3 115354803 1D TCTGTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 12 11 170535 CASAVA_Build 3 115358373 4D38M2D TCTTTCTTTC CTTTCTTTCTTTTCTTTCTTTCTTCCTTTCTTTCTTTTTCTTTC/----CTTTCTTTTCTTTCTTTCTTCCTTTCTTTTTCTTTCTT-- TCTTTCTTTT 3070 hom 48 het 14 0 17 3 N/A 0 0 170536 CASAVA_Build 3 115362414 3I ATGGTTTCAA ---/CCT CCTCATGCAT 3070 hom 67 het 29 0 23 6 CCT 1 2 170537 CASAVA_Build 3 115364807 1I TTGTAATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 925 hom 33 3 26 4 T 11 12 170538 CASAVA_Build 3 115372195 1I TTCCCAGCCA -/T TCTTTAACAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 2 170539 CASAVA_Build 3 115392248 1I TTCCACTATG -/T TCATGGTACT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 2 170540 CASAVA_Build 3 115396364 1D CTTGCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 1979 het 1979 ref 39 22 6 11 T 15 14 170541 CASAVA_Build 3 115416398 1D AGGTGAATGC A/- AAAAAAAAAA 1780 het 1780 ref 43 29 5 9 A 13 12 170542 CASAVA_Build 3 115506712 4D GAGTTCTAAC ACTA/---- ACTATTTACC 3070 hom 149 het 54 0 49 5 ACTA 2 1 170543 CASAVA_Build 3 115508318 4D GAAATTATGG ATTT/---- TCTTCTTGGG 3070 hom 150 het 54 0 50 5 ATTT 1 0 170544 CASAVA_Build 3 115508695 1I GGGCAGTGAA -/T TATAGGGGCA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 1 2 170545 CASAVA_Build 3 115517265 1I CTGCGGCGGG -/A AAAATCAGGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 4 5 170546 CASAVA_Build 3 115526142 1I ATAGCTCAGT -/G GACACACTCA 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 G 1 2 170547 CASAVA_Build 3 115548221 2D CTCAAACAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2750 het 446 hom 37 4 13 20 T 20 18 170548 CASAVA_Build 3 115556101 1I TCTGAACAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 5 hom 30 1 19 10 T 9 10 170549 CASAVA_Build 3 115558162 1D TTAGTGGGTC T/- TGCACATGAA 3070 hom 90 het 36 0 28 8 T 2 1 170550 CASAVA_Build 3 115558326 1I CCTCATATAT -/G GCCAAGGGAG 3070 hom 135 het 49 0 46 3 G 1 2 170551 CASAVA_Build 3 115560621 1D CTCTGATTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 170552 CASAVA_Build 3 115565603 1I CACTGTAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 54 1 45 8 T 10 11 170553 CASAVA_Build 3 115568467 4I AGTGAAACTC ----/ACTT ACTCTTCTAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 ACTT 0 1 170554 CASAVA_Build 3 115569318 1I CATTTTTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 357 hom 31 1 24 6 A 9 10 170555 CASAVA_Build 3 115588694 1D CAGGTGGTAT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 99 het 36 0 31 6 G 8 7 170556 CASAVA_Build 3 115591270 1D ACTAAAATGC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 33 het 16 0 11 5 A 7 6 170557 CASAVA_Build 3 115607474 1I ACTAGAGGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 9 10 170558 CASAVA_Build 3 115617864 3D AGCAATACTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 35 1 27 8 A 17 14 170559 CASAVA_Build 3 115620123 1I TGAGTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 580 hom 26 2 20 4 A 13 14 170560 CASAVA_Build 3 115631560 4I TTTCCCTTAC ----/AGTT AGTTATATTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AGTT 1 2 170561 CASAVA_Build 3 115633707 1I ATTCCATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 30 1 21 8 A 13 14 170562 CASAVA_Build 3 115654288 1D CAGTTAATAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 9 8 170563 CASAVA_Build 3 115654496 3D AATGCATTAA GAG/--- GAGAACTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 GAG 2 1 170564 CASAVA_Build 3 115657750 2D ATATATATAT GG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 2673 hom 30 9 19 2 G 2 0 170565 CASAVA_Build 3 115666613 1D TCTTGTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2082 hom 25 6 15 4 A 12 11 170566 CASAVA_Build 3 115674251 1D ATCTCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 7 A 12 11 170567 CASAVA_Build 3 115679467 10D TCTTTCTCTG TCTCTCTCTC/---------- TCTCTCTCTC 1484 het 43 hom 9 1 7 2 TC 10 5 170568 CASAVA_Build 3 115680604 1D TTCCTCTATT G/- GGGGGGGGCC 3070 hom 72 het 26 0 24 3 G 9 8 170569 CASAVA_Build 3 115682803 2I AGGATACATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 39 0 26 13 A 14 16 170570 CASAVA_Build 3 115687795 1I TTTGGGATGG -/A AGTGGTAAAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 170571 CASAVA_Build 3 115778332 4I CAAAAAAGAC ----/AGAG AGAGAGTGAG 3070 hom 63 het 29 0 21 8 AG 3 5 170572 CASAVA_Build 3 115799954 2I AAAAAAAAAA --/AG TAGACTTAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AG 0 1 170573 CASAVA_Build 3 115841032 1D CTCCTAGAGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 52 hom 29 1 20 8 T 9 8 170574 CASAVA_Build 3 115877387 3D TTTCAGTCAC CAA/--- CAACAACAGC 3070 hom 135 het 50 0 46 5 CAA 3 2 170575 CASAVA_Build 3 115877499 3I CTAAATCTTC ---/ACA ACAACTCTAC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 ACA 1 2 170576 CASAVA_Build 3 115889928 1I ATAAAAGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1174 hom 40 8 26 6 A 14 15 170577 CASAVA_Build 3 115898599 1I GTACTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 361 het 361 ref 31 10 2 19 A 15 16 170578 CASAVA_Build 3 115898635 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 39 2 30 7 A 12 11 170579 CASAVA_Build 3 115905041 1I GAGGGACTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 9 10 170580 CASAVA_Build 3 115919371 1I TCAACTTCTT -/G GCAACAATTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 1 2 170581 CASAVA_Build 3 115953788 4D CTGACTCTCG TATC/---- TATCTACTCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TATC 2 1 170582 CASAVA_Build 3 115985329 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 1582 het 908 hom 24 5 12 7 A 17 18 170583 CASAVA_Build 3 115993368 1D ACATTTTATT A/- AAAAAGGTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 6 5 170584 CASAVA_Build 3 115994414 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2393 het 127 hom 21 2 8 11 T 17 15 170585 CASAVA_Build 3 116005315 3D TTCAACTTTC TGT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 305 hom 43 7 19 18 TGT 1 0 170586 CASAVA_Build 3 116005381 1I AAATAGATTT -/A CAGAGTATGT 3070 hom 99 het 43 0 33 10 A 0 1 170587 CASAVA_Build 3 116005762 1I TCTAGTCAAT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 112 het 49 0 36 13 A 7 8 170588 CASAVA_Build 3 116007039 5I TGCCCTTCTT -----/ATAAC ATAACATCAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 ATAAC 1 2 170589 CASAVA_Build 3 116010621 1I TGTAACAGTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 132 het 51 0 44 7 T 8 9 170590 CASAVA_Build 3 116023931 1D AATTAGGTCA T/- TAAAAAAACA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 2 1 170591 CASAVA_Build 3 116045381 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1828 het 12 hom 10 1 7 3 T 15 14 170592 CASAVA_Build 3 116048825 1D GGTTCATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 31 1 21 9 A 13 12 170593 CASAVA_Build 3 116060693 2I AGAATTCTTC --/CT CTCTCCCTTC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 CT 2 3 170594 CASAVA_Build 3 116063943 1D ATGGCATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 162 hom 34 1 22 11 T 13 12 170595 CASAVA_Build 3 116066026 2D ATTACAAGGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 506 hom 32 2 18 13 T 11 9 170596 CASAVA_Build 3 116072594 3D GAAGAGAATG AGA/--- AGAAGAAGTC 3070 hom 133 het 51 0 45 7 AGA 3 2 170597 CASAVA_Build 3 116077831 1I TTTCCCCCTG -/A GTCCCTAAAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 0 1 170598 CASAVA_Build 3 116086975 2I TTGTTTAGTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 405 hom 41 1 33 7 TC 5 6 170599 CASAVA_Build 3 116087110 2D TAGTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 112 het 46 0 37 9 T 12 10 170600 CASAVA_Build 3 116094193 1I AGTGAGTTGC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 8 170601 CASAVA_Build 3 116095252 1I GTAAATAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 42 1 30 11 A 10 11 170602 CASAVA_Build 3 116095662 1I CCATTTAAAA -/T GCAGCACGGG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 1 170603 CASAVA_Build 3 116101898 5I TAAAAGAAAT -----/ATATC ATATAAGTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATATC 0 1 170604 CASAVA_Build 3 116102194 1I TTTAAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 37 1 32 4 T 11 12 170605 CASAVA_Build 3 116108754 2I AGCAGAATGT --/AG AGTTAGGCTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AG 1 2 170606 CASAVA_Build 3 116112660 1D TAGTTATCCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 10 9 170607 CASAVA_Build 3 116113668 1D GTGCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1345 hom 39 4 21 15 A 15 14 170608 CASAVA_Build 3 116124361 8D ATCACTCAAT ACATCAAG/-------- ACATCAAGAA 3070 hom 127 het 47 0 43 9 ACATCAAG 2 1 170609 CASAVA_Build 3 116141629 1D AGTGCATTCA T/- TTTTTCAACA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 6 5 170610 CASAVA_Build 3 116141930 1D TCATTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 50 1 36 13 T 13 12 170611 CASAVA_Build 3 116230877 1D TAAAATTGAA G/- GGGGGGGGCA 3070 het 8 hom 28 0 17 12 G 9 8 170612 CASAVA_Build 3 116275370 4I TTAATTCTAG ----/TAAA TAAACTAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TAAA 1 2 170613 CASAVA_Build 3 116362519 5D GGTGACAGAA TTAAT/----- TTATTTAAGC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TTAAT 1 0 170614 CASAVA_Build 3 116393824 17D ACTCAGAAGA ATGAAACCATTTGGTTT/----------------- TTCTTTTATC 3070 het 3070 ref 43 26 18 8 ATGAAACCATTTGGTTT 1 0 170615 CASAVA_Build 3 116393923 1I TGTACATCTT -/A ACGTACATTG 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 A 1 2 170616 CASAVA_Build 3 116422559 6D CAAAATAAAA CATACT/------ CAAAACAGAA 3070 hom 117 het 44 0 40 7 CATACT 1 0 170617 CASAVA_Build 3 116435547 1D GCTCCCACCA T/- TTTTTTGAAG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 7 6 170618 CASAVA_Build 3 116485241 2I GTTTCATGGG --/TT TTTTTTTTTT 1405 het 642 hom 42 3 11 28 T 14 16 170619 CASAVA_Build 3 116538920 2I GGCATCAATT --/AA TGTAGATCAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 2 170620 CASAVA_Build 3 116557125 1I AAAAATCAAA -/T CAAAATGAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 0 1 170621 CASAVA_Build 3 116557429 1I ACTTTATAGG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 7 8 170622 CASAVA_Build 3 116558512 9I TTTTATTGCT ---------/TAAAAATGC TAATAGTCAT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 TAAAAATGC 0 1 170623 CASAVA_Build 3 116580506 1D TAGTTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 1376 het 1376 ref 35 28 3 4 A 11 10 170624 CASAVA_Build 3 116583619 2I CAGAAATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TG 6 7 170625 CASAVA_Build 3 116586626 3D TTTTGCAAGA AAG/--- AAGAAGAAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AAG 3 2 170626 CASAVA_Build 3 116588728 1I TGACTCTCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 112 het 42 0 35 7 T 9 10 170627 CASAVA_Build 3 116590181 1I TTTCAATTAG -/T CAGTCAATTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 0 1 170628 CASAVA_Build 3 116596402 1D TTTCTATGCA T/- TTTTACCATC 3070 hom 108 het 40 0 36 5 T 5 4 170629 CASAVA_Build 3 116610699 1I TGGAAGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 601 hom 40 2 33 5 T 10 11 170630 CASAVA_Build 3 116614349 1I TAATTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 686 het 686 ref 27 5 6 16 T 17 18 170631 CASAVA_Build 3 116627640 1D ATTCCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 1059 het 1059 ref 40 28 4 8 T 12 11 170632 CASAVA_Build 3 116680061 1D ATTTATGGAC A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 98 het 37 0 32 6 A 8 7 170633 CASAVA_Build 3 116724003 1I TAGCCATGAC -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 120 het 41 0 41 0 T 6 7 170634 CASAVA_Build 3 116729169 1D CCACGCAGAA C/- TATGAATCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 0 170635 CASAVA_Build 3 116743367 1D CATTTATAAC T/- TGGCTAACTG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 2 1 170636 CASAVA_Build 3 116768778 1D CCGGGAGTGG T/- GGCTCAAGCC 3070 hom 48 het 20 0 15 5 T 1 0 170637 CASAVA_Build 3 116792525 1I CCTGTACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 31 2 23 6 T 12 13 170638 CASAVA_Build 3 116804882 1I CCTTCAGCTA -/T TGAACACAGT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 1 2 170639 CASAVA_Build 3 116809197 4D TTGTATTTTC CTTG/---- CTGATTTGAC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 CTTG 1 0 170640 CASAVA_Build 3 116820064 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 39 het 14 0 12 2 A 6 5 170641 CASAVA_Build 3 116825636 1D TATTATTTGC A/- AAAAAGCAGG 3070 het 3070 hom 55 20 26 10 A 6 5 170642 CASAVA_Build 3 116828671 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 16 14 170643 CASAVA_Build 3 116834561 1D ATTGGAAAAA G/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 G 1 0 170644 CASAVA_Build 3 116840049 1D CACATCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2094 hom 40 8 19 14 T 14 13 170645 CASAVA_Build 3 116842463 1I TCTTTCCTTC -/T TTTTTTTCCT 1736 het 1736 ref 31 13 7 11 T 7 8 170646 CASAVA_Build 3 116847149 1D ATCTTGGTGG A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 8 7 170647 CASAVA_Build 3 116848718 4D ATAGAGCTTC CTTG/---- CTTGACCCTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 6 CTTG 2 1 170648 CASAVA_Build 3 116865759 1D AAGCATATGA G/- GGTATTTTAT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 G 3 2 170649 CASAVA_Build 3 116885142 1I GCTATCAATA -/G TTTCATTTCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 0 1 170650 CASAVA_Build 3 116888653 1I ATCCCCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 38 1 20 17 T 13 14 170651 CASAVA_Build 3 116898745 5I ATTTATAATA -----/ATAAT ATAAACTTCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 ATAAT 0 1 170652 CASAVA_Build 3 116907935 1D CTACCCAGCT G/- GGGGGTAGGC 3070 het 3070 ref 44 27 13 5 G 6 5 170653 CASAVA_Build 3 116909538 16D ACACACACAC ACACACACACACACAT/---------------- ATATATATAC 3070 het 2920 hom 32 12 15 5 ACACACACACACACAT 1 0 170654 CASAVA_Build 3 116911382 2D ATGAACATAC AT/-- ATATATATAT 2735 het 51 hom 16 2 9 5 AT 10 9 170655 CASAVA_Build 3 116911794 1D TCACCTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 11 10 170656 CASAVA_Build 3 116913345 4D TTTATTTGAC TGTT/---- TGTTATACTA 3070 het 3070 ref 46 22 22 3 TGTT 2 1 170657 CASAVA_Build 3 116913975 1D TGAGACTATT A/- AAACTTGGCA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 4 3 170658 CASAVA_Build 3 116916246 1D TTGTTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 29 0 18 11 T 12 11 170659 CASAVA_Build 3 116920806 1D GGGATTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 10 9 A 11 10 170660 CASAVA_Build 3 116930059 1D TCTCTATCTC T/- TTTTCCCTTC 3070 het 3070 ref 50 20 21 10 T 5 4 170661 CASAVA_Build 3 116937928 5D TCTGTAAAGG ATTTT/----- ATTTCTCCTT 1448 het 1448 ref 9 5 3 3 ATTTT 1 0 170662 CASAVA_Build 3 116945652 3D CTTCTTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2794 het 980 hom 30 6 8 16 T 19 16 170663 CASAVA_Build 3 116968074 1D GTAAAGGACT A/- AGACAACTTT 3070 het 3070 hom 48 19 20 10 A 2 1 170664 CASAVA_Build 3 116975295 1D TGAGGGTTCT A/- GGGGAAGTGG 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 A 1 0 170665 CASAVA_Build 3 116983748 1D ATGAGTTTCA T/- TTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 T 6 5 170666 CASAVA_Build 3 117004064 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 12 11 170667 CASAVA_Build 3 117011500 1I AGTGTGTGTT -/G GGGGGGCTTA 3070 het 3070 ref 43 25 11 7 G 6 7 170668 CASAVA_Build 3 117021639 1I ATAGACAGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 9 10 170669 CASAVA_Build 3 117035317 1I GTCTTTGAGT -/G CTATTTGCAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 G 0 1 170670 CASAVA_Build 3 117038831 1D CCAGTGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 11 10 170671 CASAVA_Build 3 117045224 1I TTGTTTCTGA -/T TATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 1 2 170672 CASAVA_Build 3 117047116 1I GTTCTCCTCT -/G TTTCTCCATG 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 G 0 1 170673 CASAVA_Build 3 117049586 4I TAATAGATTC ----/ATAA ATATTAGGAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 ATAA 0 1 170674 CASAVA_Build 3 117051015 1D AGCCCTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 T 12 11 170675 CASAVA_Build 3 117063060 1I TCCCCCTGGC -/G GGTAGGAGAA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 G 2 3 170676 CASAVA_Build 3 117063391 2I TAATCTACAC --/AT GAGTTGTAAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AT 0 1 170677 CASAVA_Build 3 117065081 3D GTGTTGTATA TGT/--- GTTATTCATA 3070 het 3070 hom 23 9 13 2 TGT 1 0 170678 CASAVA_Build 3 117065797 1I CCATGGCACG -/T TTGCCTGATT 3070 het 3070 hom 57 20 29 8 T 2 3 170679 CASAVA_Build 3 117070508 1D ATAAATCAGG A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 A 8 7 170680 CASAVA_Build 3 117079137 1D ATTTTGTTTC A/- AAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 7 6 170681 CASAVA_Build 3 117079504 3I CTGTTTTGAC ---/CTT CTACTACAGT 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 CTT 0 1 170682 CASAVA_Build 3 117096521 5I AAATGCGGAT -----/GAATA GAATAGAGAA 3070 het 2801 hom 38 8 25 5 GAATA 1 2 170683 CASAVA_Build 3 117104044 5I TGGATCTAAT -----/TAAAC TAAAGAGCTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 TAAAC 0 1 170684 CASAVA_Build 3 117109963 2D TGCAAGGCTC AG/-- AACAAAACTT 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 AG 1 0 170685 CASAVA_Build 3 117134280 1I TAGTCATTTT -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 A 6 7 170686 CASAVA_Build 3 117139307 32D CCCGCAGCAT GCTAAATGATATTGGCTAATCCTGTATGGCCA/-------------------------------- GCTAAATGAT 3070 hom 39 het 21 0 12 12 GCTAAATGATATTGGCTAATCCTGTATGGCCA 2 1 170687 CASAVA_Build 3 117143548 5D ATAAGAATTA TTTTG/----- TTTTAATTAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 TTTTG 1 0 170688 CASAVA_Build 3 117151051 1D ATACAGCCCT C/- CTAGATTAAC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 2 1 170689 CASAVA_Build 3 117156497 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 15 2 9 4 T 13 12 170690 CASAVA_Build 3 117180812 1I CTTCCACCAG -/T TATTTGTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 T 1 2 170691 CASAVA_Build 3 117182930 1I TGAGCTTCTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 7 8 170692 CASAVA_Build 3 117185614 1I ACCAAGTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 85 het 36 0 29 7 A 9 10 170693 CASAVA_Build 3 117199635 2D CCAGCCATTG AC/-- ACACGTCTCC 3070 hom 75 het 32 0 24 9 AC 3 2 170694 CASAVA_Build 3 117208826 1D TGACAAGGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 10 9 170695 CASAVA_Build 3 117209602 1I AAGTTAGTTC -/T TTTCTACTAT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 3 4 170696 CASAVA_Build 3 117213106 1D AAAATTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 11 10 170697 CASAVA_Build 3 117217295 1D ACTGGCCTTA C/- CCAATTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 17 6 C 3 2 170698 CASAVA_Build 3 117217552 1D AAGCTAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 7 T 11 10 170699 CASAVA_Build 3 117220695 1D CATTGTGGGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 66 het 25 0 21 4 G 13 12 170700 CASAVA_Build 3 117223775 2D TATTAACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 35 2 13 20 T 12 10 170701 CASAVA_Build 3 117224727 2I ATATATATAT --/AC ACACACATAT 3031 het 3031 ref 32 17 10 5 AC 3 4 170702 CASAVA_Build 3 117238247 2I AAGATAATAT --/AA AAGAGTATTA 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 2 4 170703 CASAVA_Build 3 117246160 1D AATTGTATCT A/- AAAAAAAAAA 2897 het 1561 hom 22 5 8 10 A 15 14 170704 CASAVA_Build 3 117248912 2D AATCTAGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 35 1 18 16 A 16 14 170705 CASAVA_Build 3 117257500 1D GGATCCCTGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 9 8 170706 CASAVA_Build 3 117260476 1I TGTTTGTTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 889 hom 41 2 32 7 T 11 12 170707 CASAVA_Build 3 117262974 8I CATGGGCATG --------/GTGCTTCT GTGATACAGC 3070 hom 108 het 37 0 35 2 GTGCTTCT 0 1 170708 CASAVA_Build 3 117271097 1D CTTTCCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 170 hom 32 1 27 4 A 11 10 170709 CASAVA_Build 3 117272718 1D TTGCATAAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 8 7 170710 CASAVA_Build 3 117278658 2D ATTAATTTAT AA/-- GTGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 A 2 0 170711 CASAVA_Build 3 117282371 2I AACAAATCTA --/AG ACTTCCAATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AG 0 1 170712 CASAVA_Build 3 117291589 1I AAGTACACAT -/A GAAAAAAAAT 2448 het 2448 ref 14 6 6 2 A 0 1 170713 CASAVA_Build 3 117298738 1D ACCAAAAGCA T/- TGCTAAGTTC 3070 het 3070 ref 38 22 10 8 T 2 1 170714 CASAVA_Build 3 117299273 1D AAAAGAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1076 het 1076 ref 45 33 4 8 T 13 12 170715 CASAVA_Build 3 117316039 1D CCAGAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 11 10 170716 CASAVA_Build 3 117321199 11D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTGAGAAG 3070 het 2967 hom 20 9 11 2 T 15 4 170717 CASAVA_Build 3 117330286 5I AAGCAAACTT -----/AGAGA AAAGACCCAA 3070 hom 166 het 59 0 55 4 AGAGA 0 1 170718 CASAVA_Build 3 117340361 1D GTAAATTGAC T/- TTTTTTTTTT 1331 het 1331 ref 38 27 3 8 T 12 11 170719 CASAVA_Build 3 117344908 4D GCACAAAAAT AGAA/---- AGAATTAATA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AGAA 2 1 170720 CASAVA_Build 3 117351161 1D TTTTCTGATC T/- TTTGGGGGCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 4 3 170721 CASAVA_Build 3 117352448 2I TCATTTCACT --/AC CTTAGCATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AC 0 1 170722 CASAVA_Build 3 117353293 2D AGGTCCTCAA CT/-- CTCTGTCACT 3070 het 3070 ref 43 17 19 8 CT 3 2 170723 CASAVA_Build 3 117356556 2I AATGTTTTGG --/TT TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 10 170724 CASAVA_Build 3 117357283 1D GAGATTTGCA T/- TTTTTTACCT 3070 hom 126 het 55 0 43 13 T 7 6 170725 CASAVA_Build 3 117365559 3I GCTAGAAAAA ---/TGT TGTATGTATT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TGT 1 2 170726 CASAVA_Build 3 117375333 2I TTTTTTTTTT --/TG TTAACAATTG 3070 hom 12 het 24 1 17 6 TG 0 1 170727 CASAVA_Build 3 117381913 2D TTATCCCAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 5 T 13 11 170728 CASAVA_Build 3 117387432 1D AAAAAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 30 6 A 15 14 170729 CASAVA_Build 3 117393335 2D ATTATAATAG TT/-- TTTTTTTGAT 3070 hom 48 het 33 0 17 16 T 9 7 170730 CASAVA_Build 3 117393560 1I TTACTGAGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 9 170731 CASAVA_Build 3 117397259 2I AAAAATGAAA --/AG AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AG 0 1 170732 CASAVA_Build 3 117399500 1D ACCAGTCAAA G/- AAAGGCAGGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 1 0 170733 CASAVA_Build 3 117403681 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 38 3 26 9 T 11 12 170734 CASAVA_Build 3 117404923 4D CAAATTTCTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TTTA 3 2 170735 CASAVA_Build 3 117418098 1D AAAGAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 11 10 170736 CASAVA_Build 3 117423835 1I AATTAGATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 219 hom 36 3 17 16 T 9 10 170737 CASAVA_Build 3 117427291 1D TATATTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 35 1 29 5 T 12 11 170738 CASAVA_Build 3 117436037 4D ATTAATCTAC TTAT/---- TTATTAAAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 3 TTAT 2 1 170739 CASAVA_Build 3 117436569 1I ATTTCCACAG -/A AAAAAATATT 3070 hom 70 het 30 0 22 8 A 6 7 170740 CASAVA_Build 3 117436692 4D ATTAACTTTA TTAT/---- TTATTTATTA 3070 hom 51 het 24 0 18 7 TTAT 3 2 170741 CASAVA_Build 3 117438400 4D GGGCCTTAGA TTCT/---- TTATCTGTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TTCT 1 0 170742 CASAVA_Build 3 117438489 2I22M2D AACATAAGCC --ATATATATATATGCATATATATAC/ATATATATATATATGCATATATAT-- ATATATACAC 3070 hom 60 het 20 0 21 2 N/A 0 0 170743 CASAVA_Build 3 117439211 4I GTTGTTAGCC ----/CTAT TTTGTATATG 3070 hom 172 het 62 0 58 4 CTAT 0 1 170744 CASAVA_Build 3 117440390 1I CATGGTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 39 1 29 9 T 10 11 170745 CASAVA_Build 3 117443550 5D TTCTTTTTAG ACTTA/----- ACTTAATCAG 3070 hom 129 het 46 0 44 5 ACTTA 2 1 170746 CASAVA_Build 3 117444374 4I CCTCATAGAT ----/AGAA AGAAGTGTCC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AGAA 1 2 170747 CASAVA_Build 3 117450928 1D AGATTCTATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 971 hom 38 3 23 12 T 12 11 170748 CASAVA_Build 3 117453296 5D AAATATTTTA ATTTT/----- ATCTTATGAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ATTTT 1 0 170749 CASAVA_Build 3 117454764 1D ATAAATACAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 9 8 170750 CASAVA_Build 3 117458343 4I AGGAGGAGAG ----/AGAT AGGATGAATC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AGAT 0 1 170751 CASAVA_Build 3 117465215 6I GCATTTTATT ------/AGAGTA AAATTTTATG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AGAGTA 0 1 170752 CASAVA_Build 3 117467495 1I AGTTGTGGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 434 hom 31 1 23 7 T 9 10 170753 CASAVA_Build 3 117471970 3I ACTTCATTTG ---/ACA ACAACAATTG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 ACA 2 3 170754 CASAVA_Build 3 117476492 1I AAAAATAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 551 hom 20 2 16 2 A 15 16 170755 CASAVA_Build 3 117477079 1I ACAACAATAG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 7 8 170756 CASAVA_Build 3 117497370 4D CTGTGAGAAA ACAT/---- ACATAATAAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 ACAT 2 1 170757 CASAVA_Build 3 117507471 1D ATTTCAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 31 2 23 6 T 15 14 170758 CASAVA_Build 3 117510143 1D CCAAATTCTC A/- AGATTTCTAT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 A 2 1 170759 CASAVA_Build 3 117574243 1D TGCCCTTATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 87 het 36 0 29 8 A 9 8 170760 CASAVA_Build 3 117614781 2D TTCATGACAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TA 8 7 170761 CASAVA_Build 3 117615440 2I AGAAAATTAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 32 1 26 5 A 11 13 170762 CASAVA_Build 3 117616763 9I AATAGTTATT ---------/ATTATAACC ATTTTACAGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATTATAACC 0 1 170763 CASAVA_Build 3 117627411 1D ATCCTAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 37 2 31 5 A 12 11 170764 CASAVA_Build 3 117628437 1D CCTCAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 25 0 18 7 A 13 12 170765 CASAVA_Build 3 117641076 1D ACACTGGCCT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 8 het 38 1 27 10 A 9 8 170766 CASAVA_Build 3 117653369 7D AGAATGTCAA GTAGGTT/------- GTTATTAATA 3070 hom 117 het 43 0 40 5 GTAGGTT 1 0 170767 CASAVA_Build 3 117655286 1I ATGTTGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 83 hom 29 1 20 8 A 13 14 170768 CASAVA_Build 3 117669859 1I CTCCTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 35 1 22 12 T 12 13 170769 CASAVA_Build 3 117705180 2D CTATAAACAT GG/-- GGGGGGGGAA 3070 hom 88 het 35 0 29 7 G 10 8 170770 CASAVA_Build 3 117710389 1D GGATATTAGT A/- AAAAAAAAAA 1936 het 1936 ref 28 22 5 1 A 11 10 170771 CASAVA_Build 3 117722316 1D ACAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2170 het 25 hom 11 1 7 3 A 12 11 170772 CASAVA_Build 3 117747770 1I TCCCAGCAGA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 7 8 170773 CASAVA_Build 3 117768782 16D ATATAAAATC ATGAGATATTTCTTTT/---------------- ATGACTATGA 3070 hom 132 het 47 0 45 4 ATGAGATATTTCTTTT 1 0 170774 CASAVA_Build 3 117770307 1D AATGATAGCA T/- TTTTAAAACA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 5 4 170775 CASAVA_Build 3 117771672 2I ATTTTTATAC --/CA TATAATCCAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CA 0 1 170776 CASAVA_Build 3 117779495 1I52M1D TATGAAGGAT -GTTGTATTATGTTAGGTGTAATTATGACATTATTTTTGTCTTTATTTGAAGAT/AGCTGTATTATATTAGGTGTAATTATGACCTTATTATTGTCTTTATTTGAAGA- TATGTATGAT 1730 het 1730 ref 65 70 4 5 N/A 0 0 170777 CASAVA_Build 3 117781765 2D AACACAGAAT AA/-- AAGTATGAAT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 A 4 2 170778 CASAVA_Build 3 117782881 1D CATTAAGTCT C/- CTCTGGGCCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 2 1 170779 CASAVA_Build 3 117785701 1D ACACAACCAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 T 9 8 170780 CASAVA_Build 3 117787799 4D ATGAACACAC TGTT/---- TGTAAATTGT 3070 hom 120 het 45 0 41 5 TGTT 1 0 170781 CASAVA_Build 3 117793014 1I GGATGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 687 hom 39 2 28 9 T 10 11 170782 CASAVA_Build 3 117797081 6D TTAAGTGAAA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 hom 90 het 38 0 31 8 AAC 6 4 170783 CASAVA_Build 3 117800151 1D CAGACATATC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 10 9 170784 CASAVA_Build 3 117804497 1D CAGAAGATAC T/- TTCTTCAAGA 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 T 3 2 170785 CASAVA_Build 3 117807068 1I CTTTGTAGCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 2416 hom 17 7 8 2 T 7 8 170786 CASAVA_Build 3 117810025 1I CTTTCTCACT -/C CCTGCCATGT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 C 2 3 170787 CASAVA_Build 3 117814552 1I TCACTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 939 hom 44 3 33 8 A 11 12 170788 CASAVA_Build 3 117814793 5I TTAGAGGAAG -----/GACAT GACATGACAT 3070 het 3070 hom 61 24 32 5 GACAT 2 3 170789 CASAVA_Build 3 117815280 1I AGAATTCCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 170790 CASAVA_Build 3 117815473 1I ATGATACAAT -/A ACATCTCACA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 1 2 170791 CASAVA_Build 3 117818055 3D GATGTGAGAT ATC/--- ATCAGTTTCA 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 ATC 2 1 170792 CASAVA_Build 3 117822303 2D TCTCGATTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 33 2 15 16 A 14 12 170793 CASAVA_Build 3 117822886 1D CCTGGCAGTT A/- AAAAAAAAAC 1037 het 1037 ref 55 41 4 10 A 10 9 170794 CASAVA_Build 3 117832976 1I GGTTCTTTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 10 11 170795 CASAVA_Build 3 117835672 11I TGGAAAATGT -----------/AGTGGGAAGTA AGTGGGAACT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 AGTGGGAAGTA 0 1 170796 CASAVA_Build 3 117839961 1D AAATGGCTTT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 39 26 10 4 A 8 7 170797 CASAVA_Build 3 117849391 2D AATATAGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 10 10 T 16 14 170798 CASAVA_Build 3 117854815 1D TTTTTGTGGG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 8 7 170799 CASAVA_Build 3 117857891 2I GTAGTATATA --/TG TAGTCCTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 TG 0 1 170800 CASAVA_Build 3 117864508 1D23M1I TCTTAGCATC AAAAAAGCAAAAATATATGAAGGC-/-AAAAAGCAAAAATATATGAAGGCA AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 29 0 30 4 N/A 0 0 170801 CASAVA_Build 3 117865750 2D TGATTTTCTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TG 7 6 170802 CASAVA_Build 3 117865902 3D ACACCCAACT AAC/--- TTTTTTTTTT 398 hom 12 het 13 0 4 9 AAC 1 0 170803 CASAVA_Build 3 117867030 1I GTCTTTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 48 1 40 7 A 10 11 170804 CASAVA_Build 3 117867618 1I AAACATTTAA -/T TTTTAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 4 5 170805 CASAVA_Build 3 117871864 1D AATAAAATTA C/- AAAACACAGT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 1 0 170806 CASAVA_Build 3 117877088 5D CCCTTCCTTA ATCTC/----- ATGTACTCTG 3070 hom 90 het 36 0 31 8 ATCTC 1 0 170807 CASAVA_Build 3 117883128 4D TGAAACTGAA AAAC/---- AAATCCAAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAAC 1 0 170808 CASAVA_Build 3 117905177 1D CTCCTACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 21 1 A 11 10 170809 CASAVA_Build 3 117905835 1D AGCTCACCCC T/- GAGATAATGA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 1 0 170810 CASAVA_Build 3 117910475 1D GGAGAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 660 hom 37 3 19 15 T 17 16 170811 CASAVA_Build 3 117920463 2I ACAGAAAAAC --/AT ATAATCAGTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AT 1 2 170812 CASAVA_Build 3 117922858 1D GCATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 38 2 30 7 T 13 12 170813 CASAVA_Build 3 117927383 1I GGAGTAGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 279 hom 42 1 36 5 A 9 10 170814 CASAVA_Build 3 117928581 2I ACAGACAGAC --/TT GATATACAAA 3070 hom 120 het 47 0 39 8 T 0 2 170815 CASAVA_Build 3 117931233 2D GCTATTTTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 23 1 14 8 A 19 17 170816 CASAVA_Build 3 117931846 1I AGAGGAGATC -/A AGGTAGCTTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 1 2 170817 CASAVA_Build 3 117933807 1D ACACTCAATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 88 het 34 0 30 4 A 9 8 170818 CASAVA_Build 3 117935456 1D TTTTTTCTTT C/- TTTTTTTTTT 1347 het 506 hom 17 7 9 2 C 1 0 170819 CASAVA_Build 3 117942117 5D TGAGGAAGAA CTAAT/----- CTATTTTGTA 3070 het 3070 ref 62 32 27 4 CTAAT 1 0 170820 CASAVA_Build 3 117942523 2D GTTCTTGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 183 hom 34 4 14 18 A 16 14 170821 CASAVA_Build 3 117949689 3I GAAAAAATCA ---/AAC AACCCCATCA 3070 hom 20 het 8 0 7 1 AAC 1 2 170822 CASAVA_Build 3 117951335 1I AGTGCTTGAA -/T TTTAACAGAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 3 4 170823 CASAVA_Build 3 117952467 1D GGTCAGGAGA T/- CGAGACCATC 1373 hom 11 het 5 0 3 2 T 1 0 170824 CASAVA_Build 3 117952676 8I CATCTCAAAA --------/AAAAAAAG AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AAAAAAAG 0 1 170825 CASAVA_Build 3 117953041 2D TTGCCAAAAA AT/-- AATAATAATA 1009 het 222 hom 23 2 5 16 AT 1 0 170826 CASAVA_Build 3 117957438 1I AGAGAGCAAA -/G CCAAAGATAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 0 1 170827 CASAVA_Build 3 117963838 1D ATGTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 11 10 170828 CASAVA_Build 3 117966312 1D CTGCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 2808 het 200 hom 15 3 7 5 A 12 11 170829 CASAVA_Build 3 117969350 1D AATGGACTAG A/- AAAAAATATA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 7 6 170830 CASAVA_Build 3 117971057 2I ATGTGTATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AT 6 7 170831 CASAVA_Build 3 117972703 1I GAAGTATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 17 16 11 A 12 13 170832 CASAVA_Build 3 117974839 2D AGAAACAGGT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 11 9 170833 CASAVA_Build 3 117977054 4D CTTGTGTGTG TGTT/---- TGTGCGTGTG 3070 het 3070 ref 63 32 22 11 TGTT 1 0 170834 CASAVA_Build 3 117979081 1I CCCTCATTGG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 7 8 170835 CASAVA_Build 3 117979885 2I27M2I AGTAAATCTG --TATATATATATGTATATGTGTATATAT--/TATATATATATATGTATATGTGTATATATAC ACACACACAC 3070 het 2843 hom 29 8 19 6 N/A 0 0 170836 CASAVA_Build 3 117981010 1I TTTGAATTTT -/C AATTAGTTGG 3070 hom 151 het 55 0 51 4 C 0 1 170837 CASAVA_Build 3 117986677 1D GGTACAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 10 9 170838 CASAVA_Build 3 117988136 1I ATAAGACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 A 11 12 170839 CASAVA_Build 3 117992700 1I TATGTACCAG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 7 8 170840 CASAVA_Build 3 118001047 6D AAAGAGAATA ATAATT/------ ATATTTGTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 ATAATT 1 0 170841 CASAVA_Build 3 118003096 8I ATTCTCAGGC --------/ATTTATAA TGGTTTGCAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ATTTATAA 0 1 170842 CASAVA_Build 3 118003588 1D TGAACTGGGA T/- GCTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 T 1 0 170843 CASAVA_Build 3 118007029 2D AGTTAATCTG AA/-- AAAACTCTCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 4 170844 CASAVA_Build 3 118011279 1D ATGCAAATGT A/- ATGCATATTT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 2 1 170845 CASAVA_Build 3 118019612 3D AATCTGGGAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 34 2 19 14 T 16 13 170846 CASAVA_Build 3 118024757 2I TGCAGACTAT --/GA GAGAGTGAAG 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 GA 2 3 170847 CASAVA_Build 3 118027134 2D TATATATGTA TG/-- TGTGTGTGTA 2756 het 2756 ref 27 19 7 2 TG 5 4 170848 CASAVA_Build 3 118029542 1I GTAAAATGTT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 7 8 170849 CASAVA_Build 3 118031694 3D ATCGAATCGC AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 A 12 9 170850 CASAVA_Build 3 118049424 1D TGCTACAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 10 9 A 11 10 170851 CASAVA_Build 3 118050621 1D AAGTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 A 11 10 170852 CASAVA_Build 3 118053708 8I TTTATGTTTA --------/AAAAGTGT AATTAAAATC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AAAAGTGT 0 1 170853 CASAVA_Build 3 118055612 1D TACAATATAT A/- TTTTATTTAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 0 170854 CASAVA_Build 3 118057650 1I GGAGAAGCTG -/T TTTTTTGCCG 3070 hom 117 het 51 0 40 11 T 6 7 170855 CASAVA_Build 3 118058089 2I TAATAAAAAC --/TT ATATAATACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 2 170856 CASAVA_Build 3 118060099 2I TATTCAGCTC --/TT TTAATTTGCA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 2 4 170857 CASAVA_Build 3 118065781 1D TAAGTTGCCT C/- CCCCCCTTCC 3070 hom 45 het 43 1 31 11 C 7 6 170858 CASAVA_Build 3 118070448 1D GAGACAGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 23 0 19 5 A 15 14 170859 CASAVA_Build 3 118073087 1D CCTATCTCTG A/- GGGAAAAAAA 3070 hom 76 het 36 0 29 7 A 1 0 170860 CASAVA_Build 3 118078390 5D AAGTGCATCT TACAA/----- GATGTATCAA 3070 hom 96 het 42 0 32 14 TACAA 1 0 170861 CASAVA_Build 3 118096628 5I GCAAAATATT -----/TATTA TATTAGGTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TATTA 1 2 170862 CASAVA_Build 3 118098600 1D TATATATGTG T/- TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 5 4 170863 CASAVA_Build 3 118101462 1D AATATGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 T 12 11 170864 CASAVA_Build 3 118111853 1D TAAAATGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 16 12 T 14 13 170865 CASAVA_Build 3 118126621 1I TCTTTAGTTC -/T TTTTTTTTGT 1842 het 1842 ref 21 11 4 6 T 8 9 170866 CASAVA_Build 3 118129002 1I GTGACTTTCA -/C GATGAGGTTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 C 0 1 170867 CASAVA_Build 3 118131508 1D AGGCATGCTT A/- CCTCTCTGTG 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 A 1 0 170868 CASAVA_Build 3 118145753 1I ATTGGGAAAA -/G AAGACCCTAT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 G 0 1 170869 CASAVA_Build 3 118147470 1D TTCTACATCA T/- TTTTTTTTTT 2834 het 2834 ref 22 13 8 1 T 11 10 170870 CASAVA_Build 3 118150449 1D TCCTTATTTG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 20 11 7 A 9 8 170871 CASAVA_Build 3 118159523 4D TAGGCAGTGT TAAG/---- TGTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 36 16 15 8 TAAG 1 0 170872 CASAVA_Build 3 118163693 1I AATGCCATGT -/C AATTTATAGG 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 0 1 170873 CASAVA_Build 3 118174256 1D GATTAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2339 hom 24 8 14 2 A 10 9 170874 CASAVA_Build 3 118182264 1I CAAGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 A 15 16 170875 CASAVA_Build 3 118205408 2D TCAGTGTGTT TC/-- TGTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 TC 1 0 170876 CASAVA_Build 3 118206096 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2639 het 1272 hom 26 6 11 9 A 19 18 170877 CASAVA_Build 3 118210986 1I TTAATTAAAG -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 43 11 26 6 A 6 7 170878 CASAVA_Build 3 118217925 4I ACAACAATGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 96 het 40 0 31 9 AAAC 4 5 170879 CASAVA_Build 3 118228666 3I AACGTGGTCA ---/CTT TCGAGTAGAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CTT 0 1 170880 CASAVA_Build 3 118229257 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 61 het 37 1 32 5 A 9 8 170881 CASAVA_Build 3 118231342 9I TCGCGTTATC ---------/TGATGGCTT TGAGTTTGGG 2776 het 2776 ref 32 20 6 6 TGATGGCTT 0 1 170882 CASAVA_Build 3 118233000 1I GCTCTTTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 10 11 170883 CASAVA_Build 3 118238680 1I CAAAAACAGA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 9 170884 CASAVA_Build 3 118245032 4I GAATGGTGAC ----/TTTG TTTAAGTTAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTTG 0 1 170885 CASAVA_Build 3 118246059 1I GATAGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2718 hom 26 8 10 8 A 15 16 170886 CASAVA_Build 3 118248706 1I ATTTTCTTTG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 8 9 170887 CASAVA_Build 3 118248769 1I TATTATCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 10 11 170888 CASAVA_Build 3 118254142 4I CCTTCCTGAT ----/AGTC GACTAAGCTA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 AGTC 0 1 170889 CASAVA_Build 3 118257556 1D TTTGGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 T 11 10 170890 CASAVA_Build 3 118265030 1D TCCTCCTACT A/- ACTCTGATTC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 2 1 170891 CASAVA_Build 3 118271223 1D AGATAATTTC T/- TTTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 4 3 170892 CASAVA_Build 3 118271254 1D CTTCTGTTCC T/- TTTTTTTTTT 1699 het 1699 ref 39 25 4 10 T 13 12 170893 CASAVA_Build 3 118272326 3D GGCCACAGCC CTG/--- TCATATTTAA 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 CTG 1 0 170894 CASAVA_Build 3 118276124 1D ACTTCTATCC T/- TTTTTTGGCT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 7 6 170895 CASAVA_Build 3 118287857 2D ATCTAAAATA AT/-- AGCATAAAGT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 AT 1 0 170896 CASAVA_Build 3 118296036 1D ATCTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 583 hom 31 2 13 16 T 13 12 170897 CASAVA_Build 3 118296229 4D TTAAATTTAT TTTC/---- TTTTTTTTTT 2191 het 2191 ref 18 9 9 2 TTTC 1 0 170898 CASAVA_Build 3 118303178 1D TTTTACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 13 12 170899 CASAVA_Build 3 118308370 1I TCTTTTCACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 T 9 10 170900 CASAVA_Build 3 118310387 35D ACCTGATGCA TGCCGGGTTTAAAACCTAGATGATGGGTTGATAGG/----------------------------------- TGCAGCAAAC 2732 het 2732 ref 16 15 6 0 TGCCGGGTTTAAAACCTAGATGATGGGTTGATAGG 1 0 170901 CASAVA_Build 3 118310506 4D AAGTAAAATA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 3 AAAT 3 2 170902 CASAVA_Build 3 118321562 1D AATATAGTTT G/- TTTTTTTGGC 3070 hom 129 het 49 0 44 6 G 1 0 170903 CASAVA_Build 3 118331307 1I AGAAAACATC -/A GTGCCTGGGA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 0 1 170904 CASAVA_Build 3 118335324 1D GTAGAATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 38 1 29 8 T 13 12 170905 CASAVA_Build 3 118335975 1D TTAAAATCCG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 8 170906 CASAVA_Build 3 118391470 1I CAAATAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 11 170907 CASAVA_Build 3 118437426 1D CGATAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 26 0 21 5 T 12 11 170908 CASAVA_Build 3 118438896 1D TTTTACTGGG T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 6 170909 CASAVA_Build 3 118443825 1I AGAAATGCTG -/T GCAGGATGGT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 T 0 1 170910 CASAVA_Build 3 118446271 2D AAAAGATAAT AG/-- AGACAGCATT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AG 2 1 170911 CASAVA_Build 3 118447482 1I CTCGCAGCCA -/T GCTAAACTGT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 0 1 170912 CASAVA_Build 3 118448995 1D CTGCTCTCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 25 0 25 1 A 10 9 170913 CASAVA_Build 3 118453415 1I TGAGTAACTC -/T GAAGGCAACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 1 170914 CASAVA_Build 3 118460153 5I TTATTGATAT -----/AACAG AACAGAAAGT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AACAG 1 2 170915 CASAVA_Build 3 118480441 1D TCTTTTCCAG T/- TTTTTTACTT 3070 hom 131 het 50 0 45 6 T 7 6 170916 CASAVA_Build 3 118493148 1D TGTGTTGTGG A/- AAAAGACTGT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 5 4 170917 CASAVA_Build 3 118495139 1I TTATTCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 T 10 11 170918 CASAVA_Build 3 118503833 2D CCCCACTTCA TG/-- TGTCTCACCT 3070 het 3070 hom 55 26 27 3 TG 2 1 170919 CASAVA_Build 3 118513514 1D CCCACTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2970 hom 41 12 15 14 A 15 14 170920 CASAVA_Build 3 118513529 1D AAAAAAAAAA C/- ACATAATAGG 3070 het 3070 hom 41 16 14 11 C 1 0 170921 CASAVA_Build 3 118524058 1D AGTTAATATT A/- CAGTATTCTA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 A 1 0 170922 CASAVA_Build 3 118532953 1D AGTTATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 650 hom 37 2 29 6 A 12 11 170923 CASAVA_Build 3 118533714 1D CAAAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 31 1 22 10 A 11 10 170924 CASAVA_Build 3 118534531 1D TTAGGCTGTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 8 7 170925 CASAVA_Build 3 118535167 1I GCGGTTTGCT -/G GGGGTAAATT 3070 hom 88 het 36 0 30 6 G 4 5 170926 CASAVA_Build 3 118541864 1D AGTATAAACC T/- TTAAGTCCGC 3070 het 3070 hom 37 10 25 2 T 3 2 170927 CASAVA_Build 3 118561716 1D AAGCATAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 8 11 A 10 9 170928 CASAVA_Build 3 118564866 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAAAAC 2734 het 2676 hom 14 7 6 1 A 9 10 170929 CASAVA_Build 3 118567213 4D AATACTTTAT TTAG/---- TTAGTTAGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 6 TTAG 4 3 170930 CASAVA_Build 3 118571320 3D GAATAAGAAT GAA/--- GAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 GAA 3 2 170931 CASAVA_Build 3 118574267 1D CTACAGAGAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 46 19 24 4 A 9 8 170932 CASAVA_Build 3 118576757 2D CATGAGTAAC TT/-- TGATATCTGT 3070 het 3070 ref 53 29 14 10 T 3 1 170933 CASAVA_Build 3 118577386 6D AATTGAAGGA ATCAGT/------ ATCTCCATTG 3070 het 3070 hom 33 14 16 6 ATCAGT 1 0 170934 CASAVA_Build 3 118577547 1I TTATTGTGGC -/A AAAAGAGGTT 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 A 4 5 170935 CASAVA_Build 3 118580353 4D AGTTGCAAAG GTGA/---- GTAAGACAGA 3070 hom 114 het 41 0 39 4 GTGA 1 0 170936 CASAVA_Build 3 118580753 19D ACAGTTCCTG AGTTTTAATGGATATATAC/------------------- AGTTTGGAAG 3070 hom 63 het 22 0 22 3 AGTTTTAATGGATATATAC 1 0 170937 CASAVA_Build 3 118589769 5D GTGTGACAGG GTTGA/----- GTTATTACAA 3070 hom 93 het 40 0 32 9 GTTGA 1 0 170938 CASAVA_Build 3 118590723 2I CAGTTTTCTA --/GT AGGGAAAGCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GT 0 1 170939 CASAVA_Build 3 118591626 2I AGAGGGAGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 38 13 14 11 AG 8 9 170940 CASAVA_Build 3 118593691 2D TGGGTGCGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 13 18 12 CA 8 7 170941 CASAVA_Build 3 118593988 2D CTCTCTGTTG CT/-- CTCTCTCTCT 1417 het 1417 ref 34 16 5 13 CT 10 9 170942 CASAVA_Build 3 118595271 1I CCTTGTAACT -/G AAAAACCAAC 3070 hom 120 het 50 0 41 9 G 0 1 170943 CASAVA_Build 3 118606034 1D CAAAAAAAAA T/- TTAAAACTTA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 T 3 2 170944 CASAVA_Build 3 118607337 1D GTATTGCTTG T/- TTGTTTCTCA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 3 2 170945 CASAVA_Build 3 118609895 4I AATTTTTAAC ----/TCTG TCTATTATAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TCTG 0 1 170946 CASAVA_Build 3 118614122 6D ACTTCCAATC CTCTCT/------ CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 42 22 13 9 CT 9 6 170947 CASAVA_Build 3 118617127 8D CCTTCCTTCT TCCCTTCC/-------- TCCCTTCCTC 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 TCCCTTCC 2 1 170948 CASAVA_Build 3 118621840 1I ACAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 10 11 170949 CASAVA_Build 3 118631857 2I AATGAGTTTA --/AC ATATATATAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 AC 0 1 170950 CASAVA_Build 3 118636854 1D CTTTGGAAAA G/- CCTAGATTAA 3070 het 3070 ref 48 27 13 8 G 1 0 170951 CASAVA_Build 3 118639816 2D CAGAAAAAAA AG/-- ACAGGGATAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 AG 1 0 170952 CASAVA_Build 3 118640450 7D CACAAACTTT TCACAAA/------- CTGTCTTTAT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 TCACAAA 1 0 170953 CASAVA_Build 3 118642135 1I127M1D GAACTGTGAG -AAAAAAAAAATTCAATGGCTTAAGCCACCTAGTCTGAGTGGTATTTTGTTATGGCAGTCCTACCAAATTAATACAGCTATTATCTAGTGTAACTCAATGTAAGTTTCTTCTCTACAGAATATCATAAT/AAAAAAAAAAATTCAATGGCTTAAGCCACCTAGTCTGAGTGGTATTTTGTTATGGCCGTCCTACCAAATTAATACAGCTATTATCTAGTGTAACTCAATGTAAGTTTCTTCTCTACAGAATATCATAA- TTTTTTTTTT 3070 het 1685 hom 37 5 40 49 N/A 0 0 170954 CASAVA_Build 3 118654123 4D TGTGTGTCTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TG 11 9 170955 CASAVA_Build 3 118658172 2D TTCTAATCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 22 11 A 14 12 170956 CASAVA_Build 3 118666786 1D AAAAGTAATA C/- TTCATATAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 0 170957 CASAVA_Build 3 118678221 1D TTGCTTTCAG T/- GGGCCTGAGC 3070 hom 135 het 51 0 44 7 T 1 0 170958 CASAVA_Build 3 118683939 1D AAATGTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 11 10 170959 CASAVA_Build 3 118684847 1I AATGTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 10 11 170960 CASAVA_Build 3 118716671 4I TTTAGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGAG 3070 hom 51 het 22 0 17 5 TTTG 2 3 170961 CASAVA_Build 3 118719088 1D44M3I CTTTAAAAAA TATTTTATCATTTTCTTTATAATATAGCTAATCATCTACTGGAAA---/-ATTTTATCATTTTCTTTATAATATAGCTAATCATCTACTGGAAATTG TTTTTATACT 3070 hom 114 het 27 0 39 3 N/A 0 0 170962 CASAVA_Build 3 118721007 1D AAGGTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 5 T 13 12 170963 CASAVA_Build 3 118728049 2I ATAGAAGCTG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 9 11 170964 CASAVA_Build 3 118729589 2I ATAGTAGGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 TA 6 7 170965 CASAVA_Build 3 118735460 1I GGCTCCATCA -/G TTTTCCTTAT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 G 0 1 170966 CASAVA_Build 3 118739417 1D TTTTACAAAT C/- CCCCCCCCCC 2758 het 2522 hom 24 11 8 5 C 11 10 170967 CASAVA_Build 3 118741952 1D CTTTGAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 11 10 170968 CASAVA_Build 3 118766234 1D AGGGCTCTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 9 8 170969 CASAVA_Build 3 118768734 1I AGAACACATA -/G GTTTGATTTA 3070 het 3070 hom 52 25 24 3 G 1 2 170970 CASAVA_Build 3 118773118 1I GAAGATAGCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 T 8 9 170971 CASAVA_Build 3 118773886 1D AAGATGGGGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 9 8 170972 CASAVA_Build 3 118775170 1I GGATAGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 10 11 170973 CASAVA_Build 3 118775601 5I AAAAGAACAA -----/GTGTT GTGTTAATAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 GTGTT 1 2 170974 CASAVA_Build 3 118776061 5D CTTGTTTTGA TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 2533 hom 22 8 8 8 TTTGT 5 4 170975 CASAVA_Build 3 118777635 1I AATATTTGTA -/T TTTTGTGCCT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 4 5 170976 CASAVA_Build 3 118778091 1D ATCCCTTTCC T/- TACACACAGA 3070 het 3070 ref 49 23 23 3 T 2 1 170977 CASAVA_Build 3 118790739 1D GGGTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 A 11 10 170978 CASAVA_Build 3 118791328 6D TCGTCCTGTG TGGGTC/------ AAGGCTGAAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 5 TGGGTC 1 0 170979 CASAVA_Build 3 118794562 1D TTTTGCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 10 9 170980 CASAVA_Build 3 118795918 3D TCTTAAAATT GTC/--- TGTCTATGAT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 GTC 1 0 170981 CASAVA_Build 3 118797637 1I CAGCCAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 11 12 170982 CASAVA_Build 3 118798149 1D TTTTAATTTA T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 83 het 33 0 27 6 T 8 7 170983 CASAVA_Build 3 118802107 1D AACAGGAGCC A/- AAAACCTAAA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 5 4 170984 CASAVA_Build 3 118808066 1D GAGAAAATAC T/- TTTTTTATAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 7 6 170985 CASAVA_Build 3 118810508 2D TGAAATATTC AG/-- AGTCACGAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AG 2 1 170986 CASAVA_Build 3 118817709 4I GCAAAATTAT ----/TCTC TCTGTGAGTC 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 TC 1 3 170987 CASAVA_Build 3 118820282 3I ATTATTAGAG ---/AAT AATATTTAAT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AAT 1 2 170988 CASAVA_Build 3 118857468 1I CAAATTGTTG -/T TAAGAGTTTG 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 T 1 2 170989 CASAVA_Build 3 118864094 1I ACACTTGTGA -/C AAAAAGCTTA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 C 0 1 170990 CASAVA_Build 3 118867771 1I GTGAGATTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 834 hom 36 2 26 8 A 9 10 170991 CASAVA_Build 3 118871896 1D CTCAACTGAC T/- CTGTAGCTCC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 1 0 170992 CASAVA_Build 3 118879190 1D GCTAATATAT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 16 0 13 3 A 1 0 170993 CASAVA_Build 3 118888869 1I AATGGTATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 144 hom 34 1 31 2 T 9 10 170994 CASAVA_Build 3 118892000 1I TTTTTCTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 9 10 170995 CASAVA_Build 3 118899523 1I TATTCAGGCC -/T TTTTTTATAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 6 7 170996 CASAVA_Build 3 118907280 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 323 hom 45 1 38 6 T 10 11 170997 CASAVA_Build 3 118912337 4I AGTGAGAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 2973 hom 40 12 15 13 AG 6 8 170998 CASAVA_Build 3 118942892 1I AAAAATCTAG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 A 6 7 170999 CASAVA_Build 3 118944797 4D TTTTATTCCC TTAT/---- TTGTCACCTC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 TTAT 1 0 171000 CASAVA_Build 3 118967857 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAC 1507 het 1507 ref 27 13 6 8 A 11 9 171001 CASAVA_Build 3 118976420 1I GAAAAAAAAA -/T GTCCTTGGCT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 0 1 171002 CASAVA_Build 3 118986661 1D TACTACTGAG T/- TGTTGCAGAG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 2 1 171003 CASAVA_Build 3 119013678 11I ATGTCTAAGG -----------/AAGCATTACAT ACACCATAAA 3070 hom 129 het 45 0 44 2 AAGCATTACAT 0 1 171004 CASAVA_Build 3 119024603 12D AAAGGCTAAC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAGG 3070 hom 90 het 35 0 31 7 A 20 8 171005 CASAVA_Build 3 119047677 1I ATCAGTTGAC -/A GAATATGGGA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 0 1 171006 CASAVA_Build 3 119048701 1D AAGACAGAGA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 8 7 171007 CASAVA_Build 3 119052321 1I GATTCTTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 9 10 171008 CASAVA_Build 3 119064515 1I TAAAAAAAAA -/T GTCCTCATTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 0 1 171009 CASAVA_Build 3 119070497 5I AAAGGAAAAA -----/TAAAC TAAAGAAGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TAAAC 0 1 171010 CASAVA_Build 3 119070613 4D TTTAAACCAG TGTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 31 3 25 3 TGTT 1 0 171011 CASAVA_Build 3 119081955 2D AGGTATACTC TT/-- TTCTATATAT 1073 hom 42 het 41 0 14 27 T 4 2 171012 CASAVA_Build 3 119087575 4D TGTGTATATA TATG/---- TATGTATATA 1555 het 1555 ref 11 6 4 1 TATG 2 1 171013 CASAVA_Build 3 119091306 2I ATCCCCAAAC --/AT AGCCTTAATA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AT 0 1 171014 CASAVA_Build 3 119097349 2D GTTTCTTCTC TT/-- TGTCTTTAGT 3070 het 3070 ref 37 17 14 8 T 3 1 171015 CASAVA_Build 3 119100238 5I49M2I CTTAATACAC -----TATAGTATAAATATAATTTTTATATGCACTGAGAAACTAAAAATTTCAC--/TACAGTATAGTATAAATATAATTTTTATATGCACTGAGAAACTAAAAATTTCACAT GAGTCAATTT 3070 het 3070 ref 32 26 12 5 N/A 0 0 171016 CASAVA_Build 3 119109819 16I ATACTAAGAA ----------------/ACACACATGCACACAC ACACACATGC 3070 hom 93 het 35 0 31 8 ACACACATGCACACAC 0 1 171017 CASAVA_Build 3 119114367 1I CTGGAACTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 10 171018 CASAVA_Build 3 119122779 2D CACACACACA TG/-- CACACACACA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TG 1 0 171019 CASAVA_Build 3 119135454 1D CAAATAGATT A/- AAAAAAACGC 3070 hom 90 het 32 0 31 3 A 8 7 171020 CASAVA_Build 3 119135987 1D TCTACAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 9 8 171021 CASAVA_Build 3 119141179 12D AATGATGAAT GTGATCTTAACA/------------ CTGTCCAACT 3070 het 3070 ref 46 29 17 6 GTGATCTTAACA 1 0 171022 CASAVA_Build 3 119157946 1D CATTAATATA G/- ATTTTTATTA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 G 1 0 171023 CASAVA_Build 3 119159348 1I AAAAAAAAAA -/T GGATGCATAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 0 1 171024 CASAVA_Build 3 119159949 2I ATCACTATAC --/AT ATATATATAT 2641 het 2641 ref 30 14 8 8 AT 5 6 171025 CASAVA_Build 3 119168364 5I CCATAATTTC -----/TTCTA TTCTAGTTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTCTA 1 2 171026 CASAVA_Build 3 119170710 2D TAAGATGTAG TC/-- TCTTTTATTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 4 TC 2 1 171027 CASAVA_Build 3 119179339 1D AGCTGAAATA T/- TTTTTTCCAC 3070 hom 107 het 43 0 35 8 T 7 6 171028 CASAVA_Build 3 119188710 1D TGGTATACAA C/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 C 1 0 171029 CASAVA_Build 3 119191316 1D AGGAAGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 10 9 171030 CASAVA_Build 3 119208716 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 10 9 171031 CASAVA_Build 3 119215903 1I TTTTTTTTTT -/C AGACGAAGTT 1908 het 1479 hom 18 8 6 4 C 0 1 171032 CASAVA_Build 3 119223041 5D CTGTAAAGTC TCTTT/----- TCTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 31 14 11 7 TCTTT 2 1 171033 CASAVA_Build 3 119226000 4D AATGGGAATA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 54 25 23 7 TTTG 4 3 171034 CASAVA_Build 3 119230138 9D TCCACTTTTT CTTTGTTAA/--------- CTTTCTGCCT 3070 het 3070 hom 45 19 23 7 CTTTGTTAA 1 0 171035 CASAVA_Build 3 119230418 1D TGTTGCTGTC T/- TTTGGTTTCC 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 T 4 3 171036 CASAVA_Build 3 119234351 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTA 178 het 178 ref 18 9 2 7 A 1 0 171037 CASAVA_Build 3 119234509 1D CCCCTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1534 het 731 hom 8 3 4 1 T 11 10 171038 CASAVA_Build 3 119239348 1I AAAAATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 T 13 14 171039 CASAVA_Build 3 119241249 1D TTATAATAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 A 9 8 171040 CASAVA_Build 3 119241834 1D TAGCCCCCCC T/- GTCACAAAGT 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 T 1 0 171041 CASAVA_Build 3 119245103 6D ATCCCTTGAT TAAGAA/------ TAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 TAAGAA 1 0 171042 CASAVA_Build 3 119248816 2D ACTCCAGCCT GG/-- GTGACAGAGT 3070 het 2268 hom 20 6 13 3 G 3 1 171043 CASAVA_Build 3 119249514 2D AATTAAAAAC AG/-- AAAATTTGCA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 AG 1 0 171044 CASAVA_Build 3 119251958 2D TAGTTTCGCT TC/-- TTTTTATCTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 TC 1 0 171045 CASAVA_Build 3 119258590 4D TAATTATTTA TAGT/---- TAGTTAAGTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 TAGT 2 1 171046 CASAVA_Build 3 119262315 1D GTATTGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 148 hom 26 2 17 7 A 14 13 171047 CASAVA_Build 3 119266398 1I TGTTTTATAG -/T TTTTCAGGGT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 4 5 171048 CASAVA_Build 3 119275768 1D ATGTGCTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 10 9 171049 CASAVA_Build 3 119287860 1I TACTTCATTA -/T TGTAGTCAAA 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 1 2 171050 CASAVA_Build 3 119292132 1D CTTTTGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 26 0 20 6 T 11 10 171051 CASAVA_Build 3 119302359 1I CATCTGATTA -/T TTTATCCTGC 3070 het 3070 hom 37 13 23 1 T 3 4 171052 CASAVA_Build 3 119312550 1I TATGTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 27 1 20 6 A 13 14 171053 CASAVA_Build 3 119312803 1I AAATTAAATT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 7 8 171054 CASAVA_Build 3 119313595 8D GAGTCAAACA TTCATAAT/-------- TTCATAATTT 3070 hom 117 het 42 0 40 5 TTCATAAT 2 1 171055 CASAVA_Build 3 119315519 3I ATATCACCTT ---/TTA TTACCACTGG 3070 hom 90 het 39 0 30 9 TTA 1 2 171056 CASAVA_Build 3 119316136 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 7 8 171057 CASAVA_Build 3 119317498 1I TGAAGAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 25 2 13 10 A 15 16 171058 CASAVA_Build 3 119327301 1D TTGAATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 T 11 10 171059 CASAVA_Build 3 119330020 1D GATGGATGAA C/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 C 1 0 171060 CASAVA_Build 3 119330391 1D GTGTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 11 10 171061 CASAVA_Build 3 119344643 1I CAACACCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 879 hom 25 3 14 8 T 13 14 171062 CASAVA_Build 3 119351854 1I AATTGTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 699 hom 36 3 24 9 A 13 14 171063 CASAVA_Build 3 119366289 1I TTCATATGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 A 9 10 171064 CASAVA_Build 3 119380661 2I CACCCATGAA --/AG AGAGAGAGAG 1656 het 1656 ref 13 5 4 4 AG 5 6 171065 CASAVA_Build 3 119383778 4D TCAACTTGTT ATTA/---- ATTCAGATAC 3070 het 3070 hom 44 21 20 5 ATTA 1 0 171066 CASAVA_Build 3 119385375 4D TTTAGAACAG TTTT/---- TTTTCTAATT 3070 het 3070 hom 37 14 20 7 T 8 4 171067 CASAVA_Build 3 119393165 4I52M1I TTTAAATCAG ----TTTATTTTTTTGCTATTGAGTTGTAGGTGTTCCTTATATTTTGGATAATAAC-/ATTATTTATTTTTTTGCTATTGAGTTGTAGGTGTTCCTTATATTTTGGATAATAACT TTTTTTTAAT 3070 hom 108 het 32 0 37 6 N/A 0 0 171068 CASAVA_Build 3 119397634 1D TGTTGCTGGC T/- TTTTTTTTTT 2896 het 2896 ref 30 14 9 7 T 13 12 171069 CASAVA_Build 3 119398924 3D GCCATGAACA AGG/--- AGGACAGGCC 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 AGG 2 1 171070 CASAVA_Build 3 119403521 1D CAATCATATC A/- GAAGTCACAA 3070 het 3070 hom 47 19 24 5 A 1 0 171071 CASAVA_Build 3 119405945 3I ATTTTTGGCT ---/TAC TACTTTCATG 1783 het 898 hom 8 2 6 0 TAC 1 2 171072 CASAVA_Build 3 119406106 3D TTATGTACTT CTC/--- TATGTCTAGC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 CTC 1 0 171073 CASAVA_Build 3 119407168 3D TTTTGGGATT TTC/--- TTGTTTATAG 3070 het 2378 hom 20 6 13 1 TTC 1 0 171074 CASAVA_Build 3 119412308 5D TTAAAATGTG ATACC/----- ATACCATAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 4 ATACC 2 1 171075 CASAVA_Build 3 119415741 4D ACATTATGAA TGAG/---- TATCTTGGAA 3070 hom 117 het 42 0 40 3 TGAG 1 0 171076 CASAVA_Build 3 119417661 1I AGCAAAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 13 14 171077 CASAVA_Build 3 119439316 2I TCACTGTCCC --/CT GTGTCTCCTT 3070 het 3070 ref 51 31 14 6 CT 0 1 171078 CASAVA_Build 3 119457085 1I TGGGTGGCAG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 7 8 171079 CASAVA_Build 3 119470440 1D GTTTTTCTGA G/- GATGAAATGA 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 G 2 1 171080 CASAVA_Build 3 119475113 3D TGAAAGAATG ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 40 21 11 9 ATA 5 4 171081 CASAVA_Build 3 119478793 1D AGTTGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 1198 het 1198 ref 44 32 4 8 T 14 13 171082 CASAVA_Build 3 119479774 1I AGAATAAACA -/G GGGGGGAGAA 3070 het 2393 hom 28 7 15 6 G 6 7 171083 CASAVA_Build 3 119485133 1D CACCTCTACA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 8 171084 CASAVA_Build 3 119487118 1D AAATGCATAC A/- AAAAAATAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 7 6 171085 CASAVA_Build 3 119490594 1I AGTGAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1051 hom 39 3 30 6 T 13 14 171086 CASAVA_Build 3 119492189 4D GGCTTCAGAT CTTA/---- CATTTAAGTC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 CTTA 1 0 171087 CASAVA_Build 3 119494338 1I TTCATGCCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 8 9 171088 CASAVA_Build 3 119495799 6D ATAGGATTAC AATAAA/------ AATGCACGTG 3070 hom 96 het 34 0 32 5 AATAAA 1 0 171089 CASAVA_Build 3 119500384 9D TTTCTATGTG CATTTCTTC/--------- CATTCTAATC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CATTTCTTC 1 0 171090 CASAVA_Build 3 119501139 1I TATAATAAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 9 171091 CASAVA_Build 3 119504492 2D AATTTATACC CA/-- GTTTATTATC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 CA 1 0 171092 CASAVA_Build 3 119507548 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 30 0 24 7 A 10 9 171093 CASAVA_Build 3 119513660 1D GAGTCCAGTG T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 8 7 171094 CASAVA_Build 3 119514140 1I GGAAGCATGC -/A CATTTGTGCC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 0 1 171095 CASAVA_Build 3 119526054 3I TGGCCCGTGT ---/AAC AAATACCTAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AAC 0 1 171096 CASAVA_Build 3 119532892 1I AATAAACAGC -/A AAAAAAACAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 8 171097 CASAVA_Build 3 119543241 2I GTTGCTAGGT --/AA AAGTGTCAGA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 A 2 4 171098 CASAVA_Build 3 119544607 1D CCTCCATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1839 hom 41 6 20 15 T 17 16 171099 CASAVA_Build 3 119553521 3I CAAATTTACT ---/AGA AGAATTTTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AGA 1 2 171100 CASAVA_Build 3 119557959 3I GTTCTTCTTC ---/TCT TTTTTAATCT 3070 hom 76 het 30 0 26 4 TCT 0 1 171101 CASAVA_Build 3 119560389 1I TATGTTGTGG -/T TTTTTTCCTG 3070 hom 98 het 41 0 33 8 T 6 7 171102 CASAVA_Build 3 119560707 3I TTTAATGGAA ---/TTG TTGTTGTGTC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TTG 2 3 171103 CASAVA_Build 3 119567276 1I TATTTTAAAT -/A AAAAGGCTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 4 5 171104 CASAVA_Build 3 119574508 2I TACATATGTG --/AT ATATATATAT 3070 het 1510 hom 23 5 17 1 AT 7 8 171105 CASAVA_Build 3 119576126 2D GCAATAGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 27 1 21 5 T 14 12 171106 CASAVA_Build 3 119580231 1D ATATTACAAT A/- AAAAAATATG 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 7 6 171107 CASAVA_Build 3 119590779 1I TGTAATTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 10 11 171108 CASAVA_Build 3 119591591 3D TTCTAAACTA AAC/--- AATACGTGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 7 AAC 1 0 171109 CASAVA_Build 3 119592793 4D GACATGCAAA TTTT/---- TTTAAGTATT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 T 7 3 171110 CASAVA_Build 3 119611222 6D TGTGTGTGTG TATATA/------ TATATATATA 1568 hom 38 het 21 0 13 10 TA 10 7 171111 CASAVA_Build 3 119615885 1D AATATAGTCT A/- AACTCTAATC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 3 2 171112 CASAVA_Build 3 119616217 4I TAATAGAGCT ----/AAAG AAAGAGAGAG 3070 hom 108 het 37 0 36 1 AAAG 1 2 171113 CASAVA_Build 3 119622522 1I ACAAGCCTTA -/T TTTGGAGAGA 3070 hom 87 het 40 0 30 10 T 3 4 171114 CASAVA_Build 3 119623261 4I GCTTCTGGGA ----/TACT TACTATGAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TACT 1 2 171115 CASAVA_Build 3 119625420 1I AGGTATATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 899 hom 39 2 30 7 A 11 12 171116 CASAVA_Build 3 119639143 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 A 15 13 171117 CASAVA_Build 3 119642725 1D TAACAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 11 10 171118 CASAVA_Build 3 119655914 2I ACATGCACCT --/AA AAAGGTGGTG 3070 hom 87 het 33 0 26 7 A 3 5 171119 CASAVA_Build 3 119660363 8I CCAGCTAGCA --------/TCATAATG TCATAATGAC 3070 hom 24 het 15 0 9 6 TCATAATG 1 2 171120 CASAVA_Build 3 119662011 1I AAATACTGGC -/A AAACGTAGCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 3 4 171121 CASAVA_Build 3 119669409 13D TAAAAAGGAA CAGCATTAAAGAG/------------- CAGCGTTAAA 3070 hom 114 het 41 0 39 7 CAGCATTAAAGAG 1 0 171122 CASAVA_Build 3 119673908 1I TCAATTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 28 1 17 10 A 10 11 171123 CASAVA_Build 3 119681512 2D TGTACCATTA AT/-- CTGCACATTA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 AT 1 0 171124 CASAVA_Build 3 119684099 5D AGAGAAAAAA TAAAT/----- TAGTCTTTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 6 TAAAT 1 0 171125 CASAVA_Build 3 119684661 1I ATTTAGTGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 371 hom 50 1 44 5 T 9 10 171126 CASAVA_Build 3 119684761 2I TGCATAAGGC --/TG TGTGATGTGC 3070 hom 131 het 50 0 43 7 TG 2 3 171127 CASAVA_Build 3 119694185 3D TTGTTTAGAT TAA/--- TAATATTTAT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 TAA 2 1 171128 CASAVA_Build 3 119698493 1D TTTTTTATAC A/- AAATGCTGAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 4 3 171129 CASAVA_Build 3 119737775 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2687 het 475 hom 20 4 9 7 A 15 16 171130 CASAVA_Build 3 119740187 1D CAATATTTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 86 het 35 0 28 8 T 8 7 171131 CASAVA_Build 3 119743757 2I GCCCTTTAAC --/CA CACACACACA 3070 het 419 hom 38 1 26 11 CA 8 9 171132 CASAVA_Build 3 119743948 2D TCTCTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 98 het 43 0 31 12 TC 10 9 171133 CASAVA_Build 3 119749037 4I ACACACGTGC ----/ACAT ACATATGAGC 3070 hom 91 het 37 0 29 8 ACAT 1 2 171134 CASAVA_Build 3 119750986 7I CCATCTCCTA -------/TGTAGAT TGTAGATGCA 3070 hom 153 het 56 0 51 5 TGTAGAT 1 2 171135 CASAVA_Build 3 119751240 8I CCACAAAAGG --------/TAAATAAA TAAATGAATG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TAAA 1 3 171136 CASAVA_Build 3 119752516 1D TTCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 38 2 35 2 T 11 10 171137 CASAVA_Build 3 119764302 10D3M5D12M15D9M11D9M2I8M2I1M7D4M2D ATCATGGTAG ATGAAACACATTTGATCAACTATAATAAATAACTAGAGCACATCAAATTATTTTGTTTGTTAAGATAAATGTAT--TGGATTCA--CCATTTTACTAAAT/----------TTT-----CCTGCAAAGAAT---------------ATTTATATT-----------TAAATGGATTCTGAAATCAAGC-------CTCA-- CCATGGATTG 3070 hom 24 het 9 0 8 1 N/A 0 0 171138 CASAVA_Build 3 119765624 1I TTCTCCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1341 hom 36 3 28 5 A 11 12 171139 CASAVA_Build 3 119775233 1I TCACTTCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 28 2 19 7 A 11 12 171140 CASAVA_Build 3 119775867 1D GAGAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 0 171141 CASAVA_Build 3 119776980 1D TGAGAATAAT G/- GGGGGGGGGC 3070 hom 57 het 33 0 21 12 G 10 9 171142 CASAVA_Build 3 119801263 1D TCTACCCCCC A/- CCCCACACAC 3070 hom 90 het 36 0 29 8 A 1 0 171143 CASAVA_Build 3 119815947 1D CAAGTAAGCC T/- TAAGCAAATG 3070 hom 99 het 41 0 34 9 T 2 1 171144 CASAVA_Build 3 119817146 41I CTAACTCCTC -----------------------------------------/ACATGGATCCAGATTCAACTAACCTTTACTTAGTAAAGGTT ACATGAGCCA 3070 hom 69 het 24 0 24 3 ACATGGATCCAGATTCAACTAACCTTTACTTAGTAAAGGTT 0 1 171145 CASAVA_Build 3 119821063 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATAGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TA 5 4 171146 CASAVA_Build 3 119843048 4D TTTGGGTGAT TAAC/---- TAAATTTTTA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TAAC 1 0 171147 CASAVA_Build 3 119850562 2D ATAGATAGAT TA/-- TATATATATA 3070 het 204 hom 25 1 18 6 TA 9 8 171148 CASAVA_Build 3 119858077 5I GCTATCATTT -----/TCTTC TGTTGATGTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TCTTC 0 1 171149 CASAVA_Build 3 119861609 2D GTGTGTACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 69 het 35 0 23 12 AC 10 9 171150 CASAVA_Build 3 119864043 1I AGAGAAGGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 9 19 11 A 9 10 171151 CASAVA_Build 3 119870219 4I TAAAAGTAAA ----/TAAG TAAAACAGAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TAAG 0 1 171152 CASAVA_Build 3 119875895 1D GGAGAGGGTA C/- CCCCCCCATC 3070 hom 80 het 32 0 26 6 C 8 7 171153 CASAVA_Build 3 119893335 12D AAGAGTTAAA ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 3070 hom 23 het 11 0 8 4 AT 15 9 171154 CASAVA_Build 3 119912791 4D TTGGATGGTA TGGT/---- TGGTTGTCTG 3070 hom 87 het 34 0 30 7 TGGT 2 1 171155 CASAVA_Build 3 119914422 5D ACAGATTTAC TAGAG/----- TATAGTATTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 7 TAGAG 1 0 171156 CASAVA_Build 3 119925955 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1799 het 1799 ref 15 9 6 0 A 11 12 171157 CASAVA_Build 3 119929795 2I TTTTAATTTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 10 12 171158 CASAVA_Build 3 119939298 1I CTAAAGTCTA -/G GAATTACGAA 3070 het 363 hom 35 2 23 10 G 1 2 171159 CASAVA_Build 3 119944552 1I AACTGACAGG -/A AAAGAAAATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 4 171160 CASAVA_Build 3 119952104 1I AATAGTTAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 8 9 171161 CASAVA_Build 3 119957897 1I CCATCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 2631 het 1309 hom 16 4 8 4 A 15 16 171162 CASAVA_Build 3 119959688 4I AAATATATAT ----/ATAA ATATTTTAAT 1903 het 1903 ref 11 6 4 1 ATAA 0 1 171163 CASAVA_Build 3 119960982 1I GGTTAAATAT -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 6 7 171164 CASAVA_Build 3 119976740 2D AAATAGACAC AT/-- GTGTCATATA 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 AT 1 0 171165 CASAVA_Build 3 119979007 4I AAGAAAATGT ----/GACA GACAAACACC 3070 het 3070 ref 43 29 9 5 GACA 1 2 171166 CASAVA_Build 3 119990685 7D4M6D ACAGTAAGTG AATGTCATAAAATACTT/-------TTAA------ CAGCTTCAAC 3070 het 3070 ref 48 25 26 5 N/A 0 0 171167 CASAVA_Build 3 119996267 1D TTGTACCCAC T/- TTTTTTTTTA 1901 het 1901 ref 20 13 4 3 T 10 9 171168 CASAVA_Build 3 119996741 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 13 15 5 A 9 10 171169 CASAVA_Build 3 119998580 1I CAGTTGGATC -/A CCAGTAGGTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 0 1 171170 CASAVA_Build 3 120004803 1I CACGGGACTG -/T GCTCTTGCAC 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 T 0 1 171171 CASAVA_Build 3 120010023 4I CGGAAAAAAA ----/AAAT ATATATATAT 1591 het 1591 ref 19 9 6 4 AAAT 0 1 171172 CASAVA_Build 3 120012055 3I TGCAACAATG ---/AAT AATAATAATA 3070 het 444 hom 30 1 20 9 AAT 5 6 171173 CASAVA_Build 3 120030906 1I GTGATAAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 A 8 9 171174 CASAVA_Build 3 120035089 1I GGTGGGAACC -/A ATTGTGTAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 2 171175 CASAVA_Build 3 120061993 1I CAAATTACTT -/G TTTTTTTGCT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 G 0 1 171176 CASAVA_Build 3 120062781 1I AATTACACTC -/T TTATTTTTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 3 171177 CASAVA_Build 3 120062989 4D ACCCCACAAA TAAG/---- TAAGACATTT 3070 hom 99 het 38 0 33 7 TAAG 2 1 171178 CASAVA_Build 3 120069072 2I CTCATTAGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 12 14 171179 CASAVA_Build 3 120079533 1I CACACTCAGC -/A CTGGACAGAT 3070 hom 132 het 47 0 44 3 A 0 1 171180 CASAVA_Build 3 120090671 3I TGATTCTTAC ---/AAG AATACACATA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 AAG 0 1 171181 CASAVA_Build 3 120093559 1I TATTAAATAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 7 8 171182 CASAVA_Build 3 120094385 2I ACACACATAC --/AT ATATATATAT 1793 het 1793 ref 34 14 6 14 AT 8 9 171183 CASAVA_Build 3 120095105 3I GCATAACAGA ---/TAT TATTTTCACA 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 TAT 1 2 171184 CASAVA_Build 3 120103287 1D TCATGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2492 hom 30 7 12 11 A 14 13 171185 CASAVA_Build 3 120122175 1I CACAGAGAAA -/T AACGAAATAT 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 T 0 1 171186 CASAVA_Build 3 120136839 2D GTGTATATAC AT/-- ATATATATAT 917 het 620 hom 10 4 4 3 AT 9 8 171187 CASAVA_Build 3 120149618 2D ATATACACAC AT/-- GTTAAATATA 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 AT 1 0 171188 CASAVA_Build 3 120176336 10I ACAATCTTTC ----------/TCTTATCATT TCTTATCATT 3070 het 2750 hom 23 6 11 6 TCTTATCATT 1 2 171189 CASAVA_Build 3 120190895 1D CTTTATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 107 hom 25 1 11 13 T 13 12 171190 CASAVA_Build 3 120192348 1I CCAAGACTCA -/T TTTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 6 7 171191 CASAVA_Build 3 120202065 1I TTGACTATTC -/T TTTTTTTTTT 2385 het 2385 ref 39 19 8 12 T 12 13 171192 CASAVA_Build 3 120209626 1D TTTTACCAAT A/- TTATAGTGAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 1 0 171193 CASAVA_Build 3 120209771 1D AAAGAAAAAG C/- CACATTTGTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 2 1 171194 CASAVA_Build 3 120210812 5D CCATGTTACC AAAAA/----- AAAGAGCAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 8 3 171195 CASAVA_Build 3 120216558 2I TTTAAAATAA --/AC ACAGTTCAAA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 AC 1 2 171196 CASAVA_Build 3 120217239 1D CATAGCCTAA C/- ACAAAGCAGG 3070 het 3070 ref 33 12 13 9 C 1 0 171197 CASAVA_Build 3 120217286 1I AATAAATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 35 1 16 18 A 13 14 171198 CASAVA_Build 3 120227005 1I CTTGCTGTAT -/G GTCAGGCACT 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 G 1 2 171199 CASAVA_Build 3 120230134 1I ATTCCTTAGG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 6 7 171200 CASAVA_Build 3 120230241 1I ATAAAATTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 9 10 171201 CASAVA_Build 3 120232816 4I TAAATAAACA ----/AACT AACTAACTAA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 AACT 2 3 171202 CASAVA_Build 3 120238235 1D AGGTTAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 A 13 12 171203 CASAVA_Build 3 120263316 1I TTAACTATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 908 hom 23 2 17 4 T 11 12 171204 CASAVA_Build 3 120268893 1I GAGCTTCCCA -/T TTCTTCAGTT 3070 het 3070 hom 36 10 22 4 T 2 3 171205 CASAVA_Build 3 120329880 2I GGGTGAGAGT --/GA GAGAAAGAAA 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 GA 2 3 171206 CASAVA_Build 3 120332857 1D AAGGTTAGAT G/- AATGGGTACT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 G 1 0 171207 CASAVA_Build 3 120346101 1D TGTGTCAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 52 24 23 6 A 9 8 171208 CASAVA_Build 3 120351873 1D ACCTGTGAAG A/- AAAAAACTGC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 7 6 171209 CASAVA_Build 3 120352716 1I GACCACATAA -/C TTTTGCTCAG 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 C 0 1 171210 CASAVA_Build 3 120366267 1I ATAAAACATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 532 hom 18 2 10 6 A 11 12 171211 CASAVA_Build 3 120394484 1I49M1I CACTTGTGGT -CCCATTTTCATCCCTCTCATCTGCTTTCATCCAACTACAATTGGCCTCT-/CCCCATTTTCATCCCTCTCATCTGCTTTCATCCAACTACAATTGGCCTCTG GCCTCACCAC 3070 hom 99 het 34 0 33 24 N/A 0 0 171212 CASAVA_Build 3 120394560 1I AAACAACCCT -/G GCCATAATTA 3070 hom 48 het 32 0 17 15 G 1 2 171213 CASAVA_Build 3 120395952 1I CCTCTCTCCT -/C CCCAAGACTT 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 C 3 4 171214 CASAVA_Build 3 120396753 1D GTGAAGACTT G/- TTAATATTCC 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 G 1 0 171215 CASAVA_Build 3 120398073 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 613 het 373 hom 17 5 3 9 T 19 18 171216 CASAVA_Build 3 120398560 3I ATTTTTTGTA ---/GAT GAGATGAGGT 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 GAT 0 1 171217 CASAVA_Build 3 120405341 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 7 8 171218 CASAVA_Build 3 120415606 3D TACAAAAAAT AAA/--- AAAAAATTAG 3070 het 3008 hom 27 7 17 4 A 9 6 171219 CASAVA_Build 3 120417975 8D ATACACACAC ACGCACAT/-------- ACACACACAC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 ACGCACAT 1 0 171220 CASAVA_Build 3 120427435 4D ATAGGTGTGC TATA/---- TAAGCACACT 3070 het 3070 ref 24 11 9 5 TA 3 1 171221 CASAVA_Build 3 120437849 1I ATGGGAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 883 hom 37 3 30 4 A 10 11 171222 CASAVA_Build 3 120449296 1D CCAATCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 30 2 23 5 A 12 11 171223 CASAVA_Build 3 120458158 1I TTTGTTTTTA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 7 8 171224 CASAVA_Build 3 120465168 3D ACAAAGTATA TCC/--- TCTGACCACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TCC 1 0 171225 CASAVA_Build 3 120499051 2I CTGCATTGAG --/AC AGGAAAGATA 3070 het 3070 ref 46 20 22 4 AC 0 1 171226 CASAVA_Build 3 120508581 1I AGTCTGTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 T 10 11 171227 CASAVA_Build 3 120511129 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2872 hom 28 8 14 6 A 11 10 171228 CASAVA_Build 3 120518721 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1216 hom 23 7 12 4 T 13 11 171229 CASAVA_Build 3 120545588 1I TGGCCGGGGG -/C CGCAAAGAGT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 C 1 2 171230 CASAVA_Build 3 120571491 1I ATGAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 10 11 171231 CASAVA_Build 3 120574972 1D TGAGACTGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 656 hom 30 5 15 12 T 10 9 171232 CASAVA_Build 3 120579348 1D TAAATAGCTT A/- AAATACCTTA 3070 het 3070 ref 30 9 10 12 A 4 3 171233 CASAVA_Build 3 120581128 4D ATATTTATCA AATT/---- AATTAAGATA 3070 hom 120 het 45 0 41 7 AATT 2 1 171234 CASAVA_Build 3 120591687 1D TCCATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1801 het 1801 ref 41 27 5 10 A 11 10 171235 CASAVA_Build 3 120593127 1D15M1D TGGGTCTCTA CCCCCCCCTCCCCCCCG/-CCCCCCCTCCCCCCC- CCGTCACTCA 1827 het 44 hom 20 1 11 12 N/A 0 0 171236 CASAVA_Build 3 120611402 1D TGAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 T 9 8 171237 CASAVA_Build 3 120618787 1I GCAGAAAATA -/C TTCTAGCTCA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 C 0 1 171238 CASAVA_Build 3 120624461 10D CTGTAATCCA CTATTCTTCC/---------- CTATGTATTG 3070 het 3070 ref 43 25 19 4 CTATTCTTCC 1 0 171239 CASAVA_Build 3 120629032 14I TTCCTTTGTG --------------/GTTTGTTTTCTATA GTAGTATGCT 3070 hom 75 het 29 0 26 5 GTTTGTTTTCTATA 0 1 171240 CASAVA_Build 3 120629384 14D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 35 0 26 13 T 23 9 171241 CASAVA_Build 3 120637001 4D TGCTTTCATG GTTT/---- ATTTTTATAG 3070 het 3070 ref 31 13 8 11 GTTT 1 0 171242 CASAVA_Build 3 120637214 1D ATATGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2428 hom 33 9 14 11 A 17 16 171243 CASAVA_Build 3 120641075 1I CGAGACTGCA -/C CATTGCACTC 3070 hom 43 het 20 0 14 6 C 1 2 171244 CASAVA_Build 3 120641682 11D AAGTTCAATG CTGCCAAAACA/----------- CAAGCTGCAT 3070 het 3070 ref 30 17 15 4 CTGCCAAAACA 1 0 171245 CASAVA_Build 3 120642029 1D GATAATGCAA T/- AGTAAAAACT 3070 het 3070 ref 44 21 18 7 T 1 0 171246 CASAVA_Build 3 120642930 1I GGTAACAAAG -/C AAAACAGCCT 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 C 0 1 171247 CASAVA_Build 3 120645681 4I AGCCTCTAAG ----/AGTA AGTAAGTTTC 3070 hom 75 het 33 0 25 8 AGTA 1 2 171248 CASAVA_Build 3 120647915 1I ACTAAGCAAC -/T TAATTGACAG 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 T 1 2 171249 CASAVA_Build 3 120665917 1I TAGAAGAAGA -/G TAAGAGTGTC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 G 0 1 171250 CASAVA_Build 3 120674876 5D AACAATTGCC AAATG/----- AAATGAAATG 3070 het 3070 hom 38 13 22 5 AAATG 3 2 171251 CASAVA_Build 3 120704013 1I GCAGTTCACC -/A CCCTCCTTGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 0 1 171252 CASAVA_Build 3 120705276 1D TAATAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 13 12 171253 CASAVA_Build 3 120706617 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1707 hom 27 8 14 6 A 17 16 171254 CASAVA_Build 3 120710725 2D CCTGGGCTAC AG/-- AGTGAGACTC 2984 het 1908 hom 13 4 7 2 AG 2 1 171255 CASAVA_Build 3 120711786 3D AAAATTTTCT TAA/--- TAATAGTACT 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 TAA 2 1 171256 CASAVA_Build 3 120712011 1D ATGCTGATTA T/- TAAGAGCATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 2 1 171257 CASAVA_Build 3 120715669 4D TTGTTAGGAT TTTG/---- TTTGTTTTGC 3070 hom 72 het 30 0 25 6 TTTG 2 1 171258 CASAVA_Build 3 120720417 4D TAAAAGGAAA AAAC/---- AAACAAACAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 AAAC 3 2 171259 CASAVA_Build 3 120720659 13I GAGCAGATAC -------------/ACCAATAAGAACG AGAAAGGAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ACCAATAAGAACG 0 1 171260 CASAVA_Build 3 120721027 1I GGCTTTAAAT -/A AAAAAACTAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 6 7 171261 CASAVA_Build 3 120721444 1D AACATCAAAT A/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 1 0 171262 CASAVA_Build 3 120729076 1D CATGGCAAAA G/- AAGAGGTTAC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 G 1 0 171263 CASAVA_Build 3 120730400 1I GAGGCGGAGG -/C TGCAGTGAGC 3070 hom 25 het 13 0 9 4 C 0 1 171264 CASAVA_Build 3 120734948 1I ACATTTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1542 hom 41 5 28 8 T 13 14 171265 CASAVA_Build 3 120735920 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 80 het 80 ref 16 11 2 4 AAAAG 1 0 171266 CASAVA_Build 3 120749526 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 25 2 13 10 T 11 10 171267 CASAVA_Build 3 120750756 1I TGCAGTCCAT -/G GCCATACAAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 G 1 2 171268 CASAVA_Build 3 120764688 1I CCTGTGACTC -/T TTTTTTTTTA 2205 het 2205 ref 21 7 5 11 T 9 10 171269 CASAVA_Build 3 120774415 3I TAGGCGTGAG ---/CCA CTGCGCCCAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 CCA 0 1 171270 CASAVA_Build 3 120776784 1I ATATAAACAC -/T TTTTTTGGTA 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 T 6 7 171271 CASAVA_Build 3 120792438 3D CAAGTCCCAG GTT/--- GTGGCCTGTG 3070 hom 99 het 38 0 29 9 GTT 1 0 171272 CASAVA_Build 3 120808205 1D TAAACCCCAT G/- CCTGCAGGCC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 G 1 0 171273 CASAVA_Build 3 120810295 1D TCTTTTTTGG C/- CCCCTGTCTA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 C 5 4 171274 CASAVA_Build 3 120811140 7D CCCATCCTCC AGGCTTT/------- AGAGATAGAG 3070 hom 78 het 31 0 25 8 AGGCTTT 1 0 171275 CASAVA_Build 3 120814033 1I CAAGGTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 11 12 171276 CASAVA_Build 3 120824316 1D ACCCCTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 171277 CASAVA_Build 3 120825255 2D TCTCTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2798 het 127 hom 28 3 15 10 T 24 22 171278 CASAVA_Build 3 120829172 1I ACCACCCCTG -/A CCCCCGCCGA 3070 hom 61 het 27 0 14 13 A 0 1 171279 CASAVA_Build 3 120829545 1I AAGGGAATCT -/G GGGGGGGCAA 3070 hom 110 het 42 0 34 8 G 7 8 171280 CASAVA_Build 3 120852901 1I CTACTCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 38 1 31 6 T 11 12 171281 CASAVA_Build 3 120853596 1I AGTATTTAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 9 10 171282 CASAVA_Build 3 120854557 4D CCTTAAAAGG GTGA/---- GTGAGTGTGT 3070 hom 107 het 41 0 34 10 GTGA 2 1 171283 CASAVA_Build 3 120855535 1I AAGCTGGTGA -/G GGCTGTGGGG 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 G 2 3 171284 CASAVA_Build 3 120863100 1I ACAATCCTTC -/A AAAATAAATA 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 A 4 5 171285 CASAVA_Build 3 120865998 4D GCATTCCAGG AAGA/---- AAGAACAGAT 3070 het 3070 ref 46 27 13 8 AAGA 2 1 171286 CASAVA_Build 3 120869677 1D TGTAGCATAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 30 13 16 1 A 8 7 171287 CASAVA_Build 3 120870083 1D CTTCTATACC T/- TTTTTTTTTT 1914 het 1914 ref 44 28 5 11 T 13 12 171288 CASAVA_Build 3 120880785 8I AAAATATTTG --------/AAATCTAC AAATCTACAT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 AAATCTAC 1 2 171289 CASAVA_Build 3 120885664 1D AACCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1160 hom 31 5 13 13 T 12 11 171290 CASAVA_Build 3 120889913 4D CAATTTACTC AGTT/---- AGTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 AGTT 1 0 171291 CASAVA_Build 3 120891766 1I CGTCTTAACT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 7 8 171292 CASAVA_Build 3 120895008 1D TCATAATGGA T/- TTTTTTTTTT 1651 het 79 hom 19 1 7 11 T 17 16 171293 CASAVA_Build 3 120897408 4I ACCCTATTTC ----/TTTG TTTATTCCAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 TTTG 0 1 171294 CASAVA_Build 3 120898327 6I AAATGCTATT ------/CAGTTA CAGTTAGTAG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 CAGTTA 1 2 171295 CASAVA_Build 3 120900760 2D CTGATAAAAC AG/-- ATTGCAGCAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AG 1 0 171296 CASAVA_Build 3 120926615 6D GATTTTTCTG TATAAT/------ TATATTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 12 7 TATAAT 1 0 171297 CASAVA_Build 3 120936006 5I GTTACGGAAG -----/TTCCC TTCTCTTCTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TTCCC 0 1 171298 CASAVA_Build 3 120941136 4D AAACTCACTT CTTC/---- CTTGGAATTG 3070 het 3070 ref 55 27 24 6 CTTC 1 0 171299 CASAVA_Build 3 120963796 4D AAAAATAAAA TACT/---- TACTTAGGAG 3070 het 3070 hom 24 10 12 5 TACT 2 1 171300 CASAVA_Build 3 120972074 1I CTCCTCCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 11 12 171301 CASAVA_Build 3 120975866 1D AAATATCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 311 hom 43 1 29 13 A 12 11 171302 CASAVA_Build 3 120978902 1I TAATTCATAG -/T TAGCCTAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 1 2 171303 CASAVA_Build 3 120984088 6D AAATCACCAC AGGAGA/------ AGCCTTAACT 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 AGGAGA 1 0 171304 CASAVA_Build 3 120984271 1I GTGCTGGCAG -/C CCCCCTGAGG 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 C 5 6 171305 CASAVA_Build 3 120988394 1I AGTGAGGAGG -/C TTTTGTTAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 0 1 171306 CASAVA_Build 3 120989647 3D TTTTTAAAAA ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 ATT 5 4 171307 CASAVA_Build 3 120990871 1D AATTACAAAG A/- AAAAAAGGTT 3070 hom 104 het 38 0 35 3 A 7 6 171308 CASAVA_Build 3 121004714 1D ACTAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 1201 het 1201 ref 26 13 4 9 A 11 10 171309 CASAVA_Build 3 121022869 2D CGAATATAAA TT/-- TGTTTTTATT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 3 1 171310 CASAVA_Build 3 121025867 4D CACATCTCAG CACA/---- CACACACACA 3070 het 22 hom 28 1 12 17 CA 11 9 171311 CASAVA_Build 3 121029407 1I TAATGGGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 11 12 171312 CASAVA_Build 3 121033194 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1221 het 1155 hom 10 6 3 2 A 15 14 171313 CASAVA_Build 3 121041762 1D ATGCCGAGAA T/- TTTTTTTTTT 2009 het 105 hom 21 2 6 13 T 17 16 171314 CASAVA_Build 3 121060479 1I TTGATCAATT -/A AGTTCAATAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 171315 CASAVA_Build 3 121076232 1D ATAAAAATAA C/- ATTATTATTA 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 C 1 0 171316 CASAVA_Build 3 121086225 1I TTCTTAAACT -/A ACAGTGATTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 1 2 171317 CASAVA_Build 3 121090014 5D TATGCCTGTC TTTTT/----- TTTACTTTAA 3070 hom 69 het 28 0 25 3 T 8 3 171318 CASAVA_Build 3 121096970 1D TCAGGATAGA T/- TACCTAGAAG 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 T 2 1 171319 CASAVA_Build 3 121103515 11D GGTTTTCTAG AAAGAAAATGA/----------- AAAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 30 19 11 4 AAAGAAAATGA 1 0 171320 CASAVA_Build 3 121105708 1D TTTGTTACTG A/- AGTACCTATA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 2 1 171321 CASAVA_Build 3 121114041 1D TTGAGAGGTT A/- AAAAAAAAAA 2086 het 2086 ref 51 38 5 8 A 12 11 171322 CASAVA_Build 3 121141648 4D TGTGTGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 TG 11 9 171323 CASAVA_Build 3 121147623 1D ATTTAAACTG A/- AAAAAAAAAA 1354 het 1354 ref 37 26 4 7 A 13 12 171324 CASAVA_Build 3 121155960 1D ATGAAACTTG T/- TAATTATTTT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 2 1 171325 CASAVA_Build 3 121157187 6D GCTTTTGTTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 1582 het 1582 ref 26 15 4 9 TTG 6 4 171326 CASAVA_Build 3 121163913 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 16 1 13 2 A 15 14 171327 CASAVA_Build 3 121172344 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 8 9 171328 CASAVA_Build 3 121202705 1D ACTCATGAAT G/- GGGTTAGCAC 3070 hom 42 het 17 0 15 4 G 4 3 171329 CASAVA_Build 3 121225682 2D AGCCTGGGCA AT/-- ATAGTGAGAT 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 AT 2 1 171330 CASAVA_Build 3 121235646 3D ACTGTAAGAG TTC/--- TTCTTGTATT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TTC 2 1 171331 CASAVA_Build 3 121252665 1D TATCAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2738 hom 27 8 14 5 T 15 14 171332 CASAVA_Build 3 121280083 1D ACTTCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2746 hom 44 14 12 18 T 15 14 171333 CASAVA_Build 3 121288339 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1552 het 1552 ref 20 10 5 6 A 15 14 171334 CASAVA_Build 3 121305850 1I TTGGCTGTGT -/C CCCACCCAAA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 C 3 4 171335 CASAVA_Build 3 121309689 1D AGTTTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 2310 het 24 hom 20 1 8 11 T 15 14 171336 CASAVA_Build 3 121320905 1D CCCTTTTCAG C/- CCCCTCACCA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 C 5 4 171337 CASAVA_Build 3 121328603 1D TCTGCCTCCT G/- GGTTCAAGTG 2000 het 1013 hom 10 4 5 1 G 3 2 171338 CASAVA_Build 3 121332339 1D ACTGTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1497 het 1497 ref 45 35 4 8 A 13 12 171339 CASAVA_Build 3 121348630 5I TTTTTCTCTT -----/TTCTC TTTTAATGTT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 TTCTC 0 1 171340 CASAVA_Build 3 121351808 1D TAATGTAAAA T/- TATCTCTTCT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 2 1 171341 CASAVA_Build 3 121362066 1D GCATAGCAGA T/- TATCTTACAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 171342 CASAVA_Build 3 121363216 5D CCTTCCTTGA TTGAT/----- TTTTCTTTTG 3070 het 3070 ref 50 26 21 5 TTGAT 1 0 171343 CASAVA_Build 3 121365915 4I TTCTCTTTTT ----/TCTC TCTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 TC 2 4 171344 CASAVA_Build 3 121367821 2I TGGGTGAATC --/AA GAGGATGAGC 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 A 0 2 171345 CASAVA_Build 3 121387057 3I TATGTAAAAA ---/CTG CTGCAGCATT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 CTG 1 2 171346 CASAVA_Build 3 121391992 17I ACCATATACC -----------------/AAAATTAACTCAAAATG GATCATAGGC 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 AAAATTAACTCAAAATG 0 1 171347 CASAVA_Build 3 121395340 4I TGGAGCCCTT ----/AGAA AGAGGTTTTT 1173 het 1173 ref 31 14 5 12 AGAA 0 1 171348 CASAVA_Build 3 121403845 1I CCTCCCCTTG -/C CCCCCAACCC 1771 het 1771 ref 14 9 5 0 C 5 6 171349 CASAVA_Build 3 121428110 4I CTGCAGGATG ----/GACA GACAGCATCA 3070 het 3070 ref 56 30 21 5 GACA 1 2 171350 CASAVA_Build 3 121433008 1I GCATGGCTCA -/T TTTTTTTTTG 1495 het 1495 ref 11 7 4 0 T 9 10 171351 CASAVA_Build 3 121434856 10D GCTCTCCCTC CCCCAACCTT/---------- CCCCAACAGG 3070 het 3070 ref 36 20 14 4 CCCCAACCTT 1 0 171352 CASAVA_Build 3 121454915 1I TGGAAGCATT -/C CCCTTGAAAA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 C 3 4 171353 CASAVA_Build 3 121468488 1D TACTAAAAAT A/- CAAAAAATTA 3070 het 1583 hom 25 5 17 4 A 1 0 171354 CASAVA_Build 3 121469490 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAATCG 3070 het 3070 hom 21 10 9 3 A 8 7 171355 CASAVA_Build 3 121470633 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 10 11 171356 CASAVA_Build 3 121473509 2D AGGGCAAAAT TA/-- AAAAATGAAA 3070 hom 108 het 43 0 33 10 TA 1 0 171357 CASAVA_Build 3 121479595 1D CATGGCTGAC A/- AAAAACAAGC 3070 hom 88 het 35 0 28 7 A 6 5 171358 CASAVA_Build 3 121480610 2I AATACCACAT --/AG GTTCTCACTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 AG 0 1 171359 CASAVA_Build 3 121482773 1D TCATTCTTCT C/- CATCCCTAGA 3070 het 3070 hom 45 18 22 7 C 2 1 171360 CASAVA_Build 3 121484698 1D AGTACTGGAG A/- AAAAAAGGTG 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 7 6 171361 CASAVA_Build 3 121484803 1D AAGGCTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 11 10 171362 CASAVA_Build 3 121500051 14I TACTACTGAA --------------/GTTGCTCATGTTTT GTCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 26 17 9 0 GTTGCTCATGTTTT 0 1 171363 CASAVA_Build 3 121502796 1I ATGAAAATAC -/A GTGTTGTGTA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 0 1 171364 CASAVA_Build 3 121503683 3D TGGGGTAGGG AGA/--- AGAAGGGCCG 3070 het 3070 ref 41 22 19 1 AGA 2 1 171365 CASAVA_Build 3 121515184 1I TAGGACATCC -/G GAAGACTGGC 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 G 1 2 171366 CASAVA_Build 3 121523018 4I TTTGGTCCCA ----/TTTC TTTATCTATT 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 TTTC 0 1 171367 CASAVA_Build 3 121523564 1I CTGATTTGAT -/A AGAGCTGGTA 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 A 1 2 171368 CASAVA_Build 3 121531258 1I AGAAAAGGTA -/T CACCTGATGT 3070 het 3070 hom 40 10 27 3 T 0 1 171369 CASAVA_Build 3 121546653 1D AGAAAACGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 11 10 171370 CASAVA_Build 3 121551206 1I GCGTCACGTG -/C CCCCCCCCGT 1231 het 1231 ref 15 5 6 4 C 8 9 171371 CASAVA_Build 3 121551852 1D AATGCTTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 T 13 12 171372 CASAVA_Build 3 121561935 3D CTCGTTTGTC CTT/--- CTTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 47 24 13 11 CTT 2 1 171373 CASAVA_Build 3 121570958 1D ACAGCATATA G/- GGGTGACTAA 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 G 4 3 171374 CASAVA_Build 3 121573923 1I TTATCTTCTG -/T TTTTTTGGAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 6 7 171375 CASAVA_Build 3 121584349 1D TAAAATAGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 46 15 24 7 A 9 8 171376 CASAVA_Build 3 121590209 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTGTGTTT 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 4 5 171377 CASAVA_Build 3 121603123 1D TAAAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 2750 het 2750 ref 34 13 11 10 T 15 14 171378 CASAVA_Build 3 121610354 2I GTGATGTACC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 60 23 26 11 TG 5 6 171379 CASAVA_Build 3 121611532 2D AGCAGCTCTC TT/-- GACTCAAAGA 3070 het 3070 hom 47 23 24 2 T 2 0 171380 CASAVA_Build 3 121613574 22D CGACACACAG ACACACACACACACATACATGC/---------------------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 19 9 22 ACACACACACACACATACATGC 1 0 171381 CASAVA_Build 3 121617411 1I CCGCAAGGTA -/G CCACATTGGC 2794 het 2794 ref 28 13 8 7 G 0 1 171382 CASAVA_Build 3 121620287 2I CAGCTTCCTC --/AT GTGAAAACTG 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 AT 0 1 171383 CASAVA_Build 3 121626593 1D ACAGACAGCA G/- GAAGAGCAGC 3070 het 3070 ref 45 27 12 7 G 2 1 171384 CASAVA_Build 3 121637662 3D ACATGGTTTC TTA/--- TTATCTAGCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTA 2 1 171385 CASAVA_Build 3 121639803 1D TTGTCTTCCC T/- TTTTCCCCCC 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 T 5 4 171386 CASAVA_Build 3 121643933 1I GCCCAGAAAA -/G GGGCACAGCA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 G 3 4 171387 CASAVA_Build 3 121651570 1I AAATTGGTAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 7 8 171388 CASAVA_Build 3 121655655 2D GTAACTCATA AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 AC 5 4 171389 CASAVA_Build 3 121677949 1I TTTAAGCCAT -/C CTCCTGCCTC 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 C 1 2 171390 CASAVA_Build 3 121678129 1I AAGGGATCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 T 9 10 171391 CASAVA_Build 3 121692677 1I TTAAGCAGTT -/C AGAGCTTATA 3070 het 3070 hom 49 17 21 11 C 0 1 171392 CASAVA_Build 3 121697653 4I TGAGAAATTT ----/TCTA TCTAAGTGTG 1257 het 1257 ref 63 55 3 5 TCTA 1 2 171393 CASAVA_Build 3 121699723 1D CTTCAGGATG A/- AAAAAAAAAA 1382 het 1382 ref 32 24 3 6 A 11 10 171394 CASAVA_Build 3 121720562 1D TGTGTCAGTT G/- GGTCCTCCAG 3070 het 3070 ref 58 29 23 6 G 3 2 171395 CASAVA_Build 3 121725000 1I TCCCTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 9 10 171396 CASAVA_Build 3 121734754 1I CTTTAAATAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 8 9 171397 CASAVA_Build 3 121735393 7D GGTTTGTCAT AGGTAGC/------- TCTTATAATT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 AGGTAGC 1 0 171398 CASAVA_Build 3 121756592 1D CACAAAGAAG T/- TTTGCAAATT 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 T 4 3 171399 CASAVA_Build 3 121758487 3I TTTACTTGAT ---/AAC AATCTTTTCC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 AAC 0 1 171400 CASAVA_Build 3 121793093 5D TAGGACTTGA TAACT/----- TAACTCTAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 6 TAACT 2 1 171401 CASAVA_Build 3 121809420 1D GGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 97 hom 21 2 14 5 T 12 11 171402 CASAVA_Build 3 121816604 1D AACAAGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3036 het 60 hom 19 1 11 8 T 14 13 171403 CASAVA_Build 3 121822035 1I TTTTATAACA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 48 het 18 0 17 2 T 7 8 171404 CASAVA_Build 3 121826478 3D GGAAATGAAA TCT/--- TCTTATAATT 3070 hom 58 het 30 0 25 6 TCT 2 1 171405 CASAVA_Build 3 121827515 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2104 het 6 hom 22 1 9 13 A 15 14 171406 CASAVA_Build 3 121865317 2I TATTAGGAAT --/TG TTTTATAAAC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 TG 0 1 171407 CASAVA_Build 3 121865479 1D ATGTAACTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 10 9 171408 CASAVA_Build 3 121865964 1D TTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 31 0 9 22 T 17 16 171409 CASAVA_Build 3 121870506 2D ATCTCATTGC TA/-- TAGTACTGGT 3070 het 3070 hom 45 20 20 6 TA 2 1 171410 CASAVA_Build 3 121876868 1D CATTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 11 10 171411 CASAVA_Build 3 121877979 1D TACACCCAGA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 G 2 1 171412 CASAVA_Build 3 121887055 1D AACAGAACCC A/- GGGGAAAAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 0 171413 CASAVA_Build 3 121910325 2D TTATTAAGAC TG/-- TGACATTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TG 2 1 171414 CASAVA_Build 3 122024424 1I TATTTATTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 7 8 171415 CASAVA_Build 3 122026586 1D AGAATAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 13 12 171416 CASAVA_Build 3 122029600 4I AACAAACAAA ----/AAAC AAACAAATAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 AAAC 1 2 171417 CASAVA_Build 3 122036505 4D TTCTAATGAA TGTT/---- TGTTTACCTA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 TGTT 2 1 171418 CASAVA_Build 3 122046440 1D TGTTTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 T 13 12 171419 CASAVA_Build 3 122048021 1D ACTATAGGTT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 A 8 7 171420 CASAVA_Build 3 122048724 3D AGTCATTCTA GTG/--- GTGTGAAGTG 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 GTG 2 1 171421 CASAVA_Build 3 122049551 1I CAATATGGAT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 G 8 9 171422 CASAVA_Build 3 122049796 1D TAACCACCAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 A 10 9 171423 CASAVA_Build 3 122061868 9D AAGGAAATAT TTGAAAGGA/--------- ACCCAGCTAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 TTGAAAGGA 1 0 171424 CASAVA_Build 3 122068614 4D TGGTAAATGG ATAA/---- ATATTCAGGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 ATAA 1 0 171425 CASAVA_Build 3 122095634 2I ATAATACAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 T 12 14 171426 CASAVA_Build 3 122097740 4D CACTTTATTC TTTT/---- TTTTTAATTA 3070 het 3033 hom 19 9 8 2 T 9 5 171427 CASAVA_Build 3 122103280 1I CTGTCAGACA -/G GGACATTTAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 G 2 3 171428 CASAVA_Build 3 122127894 1I ATGGCAGTTC -/T TTTTTTTTTT 2680 het 984 hom 28 5 11 12 T 15 16 171429 CASAVA_Build 3 122129803 1D TTCTGACTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 9 8 171430 CASAVA_Build 3 122134134 3I TTAACACTGT ---/TGG TGGGACTGTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TGG 1 2 171431 CASAVA_Build 3 122135629 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2043 hom 25 5 15 5 T 13 14 171432 CASAVA_Build 3 122136966 1D ATTTAAAAAG T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 8 7 171433 CASAVA_Build 3 122137939 1I TTTAAAATGG -/A AAAAAAGGAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 6 7 171434 CASAVA_Build 3 122141882 1D CAGGAAGAAA G/- ATGGAGTGGA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 G 1 0 171435 CASAVA_Build 3 122142175 1I CTAGGGGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 22 10 A 11 12 171436 CASAVA_Build 3 122152085 1I AATTTTTTTT -/A ATTATACTTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 1 2 171437 CASAVA_Build 3 122162735 1I TTTTATTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 T 10 11 171438 CASAVA_Build 3 122173318 2D TATGTGTATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 TA 7 6 171439 CASAVA_Build 3 122181998 1D AATGTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 21 10 T 13 12 171440 CASAVA_Build 3 122202538 1D CCGGGGTGGC G/- GGGGGAAGGG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 G 6 5 171441 CASAVA_Build 3 122210469 1D ATATAATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 T 12 11 171442 CASAVA_Build 3 122214567 1D GATTTTATTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 8 171443 CASAVA_Build 3 122222388 1I CAATACAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 11 12 171444 CASAVA_Build 3 122232939 4I CTGTCTATTC ----/ATCA ATCAATCAAT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 ATCA 4 5 171445 CASAVA_Build 3 122233788 1D AGTGATGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 12 11 171446 CASAVA_Build 3 122241586 4D AGTGTAGTAT AATA/---- AATGTTTTAC 3070 het 3070 hom 41 17 21 6 AATA 1 0 171447 CASAVA_Build 3 122266608 1D AAGGTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2152 hom 37 17 15 6 T 12 11 171448 CASAVA_Build 3 122285203 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2712 hom 21 8 9 5 A 12 11 171449 CASAVA_Build 3 122291064 1D GCTTTAAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 10 9 171450 CASAVA_Build 3 122302908 2D GAATCCAACA AC/-- ACAACAAAAA 3070 het 3070 hom 62 28 28 6 AC 2 1 171451 CASAVA_Build 3 122304752 1D ATAGAAAAAT A/- AATTGTTCTA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 3 2 171452 CASAVA_Build 3 122318769 2D TAATATACAC AT/-- GATTCAGCAT 3070 het 3070 hom 30 10 20 1 AT 1 0 171453 CASAVA_Build 3 122338792 1D ATAAAAAAAA T/- GTTGGTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 9 T 1 0 171454 CASAVA_Build 3 122341680 2D TAAATGGCCA AC/-- AAGTATATAG 3070 het 3070 ref 44 27 15 2 AC 1 0 171455 CASAVA_Build 3 122342941 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 11 12 171456 CASAVA_Build 3 122346904 1I ATTATCTTTA -/T TGATGCTGAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 1 2 171457 CASAVA_Build 3 122353367 3D TTATCAGTAT GGC/--- TAGCATTGTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 GGC 1 0 171458 CASAVA_Build 3 122353492 3D ATTTAAAAAT AAA/--- TATTAATCTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 A 3 0 171459 CASAVA_Build 3 122365308 1D ATATATCATG T/- TTTTTTTTTT 1052 het 1052 ref 32 25 4 3 T 11 10 171460 CASAVA_Build 3 122367514 5I TTCCATTCTA -----/TTCTC TTCTCAAATG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTCTC 1 2 171461 CASAVA_Build 3 122368528 1D AACTGTTCAG A/- AAAAAAACGA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 8 7 171462 CASAVA_Build 3 122377395 1D AGTTGACAGT A/- AAAAAAAAAA 1318 het 1318 ref 37 25 3 10 A 12 11 171463 CASAVA_Build 3 122382948 1D GGCCCCACTT A/- AAAGATACAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 4 3 171464 CASAVA_Build 3 122389138 1I CATGAATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 A 10 11 171465 CASAVA_Build 3 122404609 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 10 11 171466 CASAVA_Build 3 122477720 4I CTTTTAGTTT ----/TTTG TTTGTTCTCA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TTTG 1 2 171467 CASAVA_Build 3 122488369 1D TCAAACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 A 11 10 171468 CASAVA_Build 3 122488990 1I CAACAATCTG -/A AATTGAAATT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 2 3 171469 CASAVA_Build 3 122495009 2I TTTTATAAAC --/AT ATTAATTAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 AT 1 2 171470 CASAVA_Build 3 122510003 1I ACAAAGAGCA -/T TGTTAAGGTA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 1 2 171471 CASAVA_Build 3 122517534 2D TGAGACTCTG TC/-- TCAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 8 TC 2 1 171472 CASAVA_Build 3 122525291 1I CTGTACAACC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 8 9 171473 CASAVA_Build 3 122531457 1D ATGAAAAAAA T/- CTACATAAAG 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 1 0 171474 CASAVA_Build 3 122533606 1I TTTAAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 11 12 171475 CASAVA_Build 3 122535977 1I GGGACACAAC -/A AACAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 A 2 3 171476 CASAVA_Build 3 122543406 1I TAGTGAAGGG -/A AAAGTGGGAT 3070 het 3070 hom 52 24 21 7 A 3 4 171477 CASAVA_Build 3 122559830 1I GGTAATTTTC -/T GTATTAGTCC 2412 het 2412 ref 24 12 7 5 T 0 1 171478 CASAVA_Build 3 122566960 1D AATCAGAAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 9 8 171479 CASAVA_Build 3 122570879 1D CCTGTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 12 11 171480 CASAVA_Build 3 122582807 1D ATTTGTGTGG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 9 8 171481 CASAVA_Build 3 122589726 4D CATGATTTGG CTCT/---- CTGTTTGTCT 2745 het 2745 ref 15 9 6 0 CT 3 1 171482 CASAVA_Build 3 122594729 1I ATGTTGAACA -/T TTTTTTTTTT 2891 het 2891 ref 22 12 8 2 T 11 12 171483 CASAVA_Build 3 122595942 1D TTTGAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 11 10 171484 CASAVA_Build 3 122613585 6I CTGTGATTTT ------/TATTTA TATGATTTTA 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 TATTTA 0 1 171485 CASAVA_Build 3 122615695 2D AATTATTGAG TT/-- TTTTTCTATA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 7 5 171486 CASAVA_Build 3 122617688 1I TCCATTTACC -/A AACATGGAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 2 3 171487 CASAVA_Build 3 122619050 5D GCCCAGGCTT TAGAG/----- TAAAGTGGCA 3003 het 3003 ref 21 10 7 4 TAGAG 1 0 171488 CASAVA_Build 3 122620321 5D GGGGATAATT AAAGA/----- AATTATCCAT 3070 het 3070 ref 43 25 18 1 AAAGA 1 0 171489 CASAVA_Build 3 122621914 25D AAGAGTTTAA TGATACAAAATCAATGCTTTTGTCC/------------------------- CTAGGTCAAA 3070 het 3070 hom 37 19 20 4 TGATACAAAATCAATGCTTTTGTCC 1 0 171490 CASAVA_Build 3 122644702 3I CTATTTTTAG ---/TTT TTTGAGAAAC 3070 het 2669 hom 16 6 10 0 T 3 6 171491 CASAVA_Build 3 122645874 1D CTAAGTGTTT A/- ATTTTATTTG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 2 1 171492 CASAVA_Build 3 122663187 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2745 het 10 hom 22 0 9 13 A 15 14 171493 CASAVA_Build 3 122667952 2I CCTTAGCCAG --/GC GCGCAGTGGC 2120 het 1744 hom 15 6 7 2 GC 2 3 171494 CASAVA_Build 3 122684147 1D CCCTCAGAAT G/- GGGGGGGTCT 3070 het 3070 hom 24 10 9 6 G 8 7 171495 CASAVA_Build 3 122684822 2D TCTAAAATAC TT/-- TTAAGCTGCA 3070 hom 66 het 24 0 23 4 T 4 2 171496 CASAVA_Build 3 122694968 1D AAAATTGACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 T 10 9 171497 CASAVA_Build 3 122697226 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2684 het 416 hom 12 1 8 3 A 11 10 171498 CASAVA_Build 3 122700805 1D AACCCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1709 het 1473 hom 26 12 6 8 T 17 16 171499 CASAVA_Build 3 122707962 1D ATTCCCCCAG C/- CCTGGGTAAC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 C 3 2 171500 CASAVA_Build 3 122710511 2I ATAAACAAAC --/TT TTAAAATTCC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 2 4 171501 CASAVA_Build 3 122720297 2I GCCTGTTTTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 9 11 171502 CASAVA_Build 3 122729839 2D TTGTATTTAG GA/-- GAGATGGGGT 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 GA 3 2 171503 CASAVA_Build 3 122730748 1D CATGTCATTC A/- AGGGTCAACT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 2 1 171504 CASAVA_Build 3 122732021 1D CTAAATAAAT A/- AATATAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 3 2 171505 CASAVA_Build 3 122733822 3I AAAAATAATA ---/TTC TTTTCACTCT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TTC 0 1 171506 CASAVA_Build 3 122742434 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1525 hom 16 4 8 4 T 13 14 171507 CASAVA_Build 3 122744034 1I CACAGAAGGT -/A AATTTAGTAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 2 3 171508 CASAVA_Build 3 122751352 15I CTGGGAACAA ---------------/CAGATTCCTATCCCC CAGAGCCCAT 3070 het 3070 hom 34 17 16 2 CAGATTCCTATCCCC 0 1 171509 CASAVA_Build 3 122751567 1I CTCGAAGTGG -/T TTTTTTTTTT 2795 het 2795 ref 21 12 7 2 T 10 11 171510 CASAVA_Build 3 122777457 1I CTCAAACATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 394 hom 29 1 21 7 A 9 10 171511 CASAVA_Build 3 122778797 3D TATATATATA TTT/--- TTTTTTTTTT 754 het 124 hom 6 1 2 3 T 13 10 171512 CASAVA_Build 3 122780994 1D CTTTGTGACT C/- CTCAGCCACA 3070 het 3070 hom 50 19 27 5 C 2 1 171513 CASAVA_Build 3 122789502 2D TGAAAAAATA AT/-- ATATATATAT 1414 het 1414 ref 18 11 4 3 AT 7 6 171514 CASAVA_Build 3 122791011 1I GCCTCCTGGG -/T TCAAATGATT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 1 2 171515 CASAVA_Build 3 122792351 1D AAACTTTTCC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 122 het 46 0 40 7 A 8 7 171516 CASAVA_Build 3 122820713 1I ATTTTTTAAC -/T TGTTTTTTTT 3070 hom 64 het 23 0 19 4 T 1 2 171517 CASAVA_Build 3 122829707 1I TGGATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1886 hom 28 6 14 8 T 13 14 171518 CASAVA_Build 3 122832995 2I AAAGAAGGTT --/CA CAGATATTTC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CA 1 2 171519 CASAVA_Build 3 122871053 1D AAAAGCATAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 114 het 45 0 39 8 T 9 8 171520 CASAVA_Build 3 122873395 1I TGAGATTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 13 14 16 T 12 13 171521 CASAVA_Build 3 122888202 2D TTAAACATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 111 het 51 0 38 13 AC 9 8 171522 CASAVA_Build 3 122912425 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1076 hom 15 3 8 4 A 10 9 171523 CASAVA_Build 3 122917530 1D ACTCTGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 24 1 19 4 A 13 12 171524 CASAVA_Build 3 122943304 1D CCACCAAAAA G/- GCTTAAAAGT 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 G 2 1 171525 CASAVA_Build 3 122949989 1I CAGTGAAAAG -/A AAAAACATTA 3070 het 3070 hom 44 18 25 1 A 5 6 171526 CASAVA_Build 3 122953010 18I ACAGAATTTG ------------------/AAGAGGTTATTCAATGTC AATGCTGCAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AAGAGGTTATTCAATGTC 0 1 171527 CASAVA_Build 3 122954058 1D CCCAATTCCC T/- CTCCCCTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 1 0 171528 CASAVA_Build 3 122957625 1I CAACTTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 27 2 23 2 A 11 12 171529 CASAVA_Build 3 122958536 2I GTAGTTTAAC --/TG TGATTACCTT 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 TG 1 2 171530 CASAVA_Build 3 122969465 5D AGTAGCTGGG ACTAC/----- AGGCATGCGC 2226 het 2226 ref 16 7 6 3 ACTAC 1 0 171531 CASAVA_Build 3 122977582 1I TTCATCCACG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2841 hom 25 7 10 8 T 9 10 171532 CASAVA_Build 3 122980071 1I TGAAAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 1552 het 1482 hom 15 4 4 7 T 11 12 171533 CASAVA_Build 3 122985727 1I TCTATCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 12 13 171534 CASAVA_Build 3 122988817 1I AATTCAGTAA -/G GGATTGTTAA 3070 het 3070 hom 32 16 15 5 G 2 3 171535 CASAVA_Build 3 122990062 6D TCTTGCATTC TTTTTA/------ TTTTTGTCAA 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 TTTTTA 1 0 171536 CASAVA_Build 3 122990240 1D AAAGAACACT A/- AAAAAAAAAA 2167 het 1711 hom 27 9 8 12 A 17 16 171537 CASAVA_Build 3 122992323 1I TACTTACACA -/G AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 G 0 1 171538 CASAVA_Build 3 122998990 2D34M1D GGTATCTGAT AAAAAAAAAAAAATCTGTCTAGACAATCTCTTTAATA/--AAAAAAAAAAATCTGTCTAGACAATCTCTTTAAT- AAAAAAAAAA 2778 het 2778 ref 24 16 9 7 N/A 0 0 171539 CASAVA_Build 3 123002355 1I CTAATCCAAT -/C TTCTGTTGCC 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 C 0 1 171540 CASAVA_Build 3 123005046 3I16M1D ATTGTTCAAA ---TCTGTGGTCATACTAAT/TCTTCTGTGGTCATACTAA- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 40 21 22 5 N/A 0 0 171541 CASAVA_Build 3 123008349 2I GCAATGACAG --/AC ACAGCAGCTG 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 AC 1 2 171542 CASAVA_Build 3 123008843 1D TGCTTCTGAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 A 9 8 171543 CASAVA_Build 3 123017311 1D AAACAAATGG A/- AAAAAAATTC 3070 het 1829 hom 16 6 10 0 A 8 7 171544 CASAVA_Build 3 123018970 4D AATAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 60 het 60 ref 37 19 2 18 AAAG 1 0 171545 CASAVA_Build 3 123020466 1D AGCAACTTTT A/- AAAGCGCCTT 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 4 3 171546 CASAVA_Build 3 123022273 1D TTATCTGTAT A/- AAAGCAGTGT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 4 3 171547 CASAVA_Build 3 123022517 1D TGTTTTTTCC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 8 7 171548 CASAVA_Build 3 123024734 3I AACTGAAGTA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 AAC 3 4 171549 CASAVA_Build 3 123026360 1D TGTAGACAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2791 hom 30 7 16 8 A 10 9 171550 CASAVA_Build 3 123032877 1D GCTCGGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 T 6 5 171551 CASAVA_Build 3 123035406 3I CTGGGCCTTA ---/AAT AATAACCATT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 AAT 1 2 171552 CASAVA_Build 3 123038587 4D GAATGAAAAT AAAC/---- AAAAATAAGC 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 AAAC 1 0 171553 CASAVA_Build 3 123045731 1I GGTTCATCTT -/G GTCTAAACAG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 G 1 2 171554 CASAVA_Build 3 123046243 1I GCAAAAAAAA -/T CTTAAAATAC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 0 1 171555 CASAVA_Build 3 123047327 1D GAGACTGTCA G/- GGGAGGCCCT 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 G 4 3 171556 CASAVA_Build 3 123050122 1I GCAGGATCAC -/T TTTTTTTTTA 2089 het 2089 ref 26 13 5 8 T 9 10 171557 CASAVA_Build 3 123051770 4I ATACTTGATT ----/TTTA TTTATCTTAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTTA 1 2 171558 CASAVA_Build 3 123066190 2D CCATCTCTAC AA/-- AAAAATGCAA 3070 het 2964 hom 23 7 14 2 A 7 5 171559 CASAVA_Build 3 123077382 1D ACTGGATACA G/- TTGATGAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 0 171560 CASAVA_Build 3 123079186 3I TTTATAATTG ---/AAC AACATTAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AAC 1 2 171561 CASAVA_Build 3 123081158 2I TCTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 11 13 171562 CASAVA_Build 3 123084325 1I GAGGTGGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 39 1 30 8 T 12 13 171563 CASAVA_Build 3 123086253 1D TGAGCCACCG C/- GTGCCCGACC 3070 hom 30 het 13 0 10 3 C 1 0 171564 CASAVA_Build 3 123091511 1D GGACATAGCT G/- GTTTTTTACA 3070 hom 63 het 26 0 22 6 G 2 1 171565 CASAVA_Build 3 123099699 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 15 16 171566 CASAVA_Build 3 123147007 2D GAGAGAGAGA GT/-- GAGAGAAATG 3070 het 3070 hom 35 12 18 6 GT 1 0 171567 CASAVA_Build 3 123156801 1D CTGTTTTCCT G/- AAAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 G 1 0 171568 CASAVA_Build 3 123161037 1I GAACTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2004 hom 34 8 12 14 A 13 14 171569 CASAVA_Build 3 123168299 3D CAAAAAAAAA AAT/--- AAATAAAATT 3070 het 3070 ref 21 11 8 4 AAT 1 0 171570 CASAVA_Build 3 123168650 1I TCTGGACACA -/T TACACCCTCC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 1 2 171571 CASAVA_Build 3 123175717 5D CTCTTTTTTT TTTTG/----- TTTTTTGTTT 26 het 26 ref 25 16 2 7 TTTTG 1 0 171572 CASAVA_Build 3 123184085 1D GAGATGTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 T 9 8 171573 CASAVA_Build 3 123185016 1D AATTTTTTTT G/- GGGGGGGAGT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 G 8 7 171574 CASAVA_Build 3 123188387 1I ATGAATAATC -/A AAAAAATCCC 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 6 7 171575 CASAVA_Build 3 123201586 1D AACCTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3032 het 3032 ref 31 16 9 7 A 11 10 171576 CASAVA_Build 3 123203548 9D ATGGTGGCAT GTGCCTATA/--------- GTCCCAGCTT 3070 het 3070 ref 31 19 11 5 GTGCCTATA 1 0 171577 CASAVA_Build 3 123210120 11D CTTTTCTTTT CTTTTCTTTTC/----------- TTTTTTTTTT 436 het 436 ref 17 8 6 3 CTTTTCTTTTC 1 0 171578 CASAVA_Build 3 123210986 1D TCTCTCTCTG A/- GCTAGTTTCT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 1 0 171579 CASAVA_Build 3 123211657 1D TTGTTTCAGT A/- AGCAAGAAAG 3070 het 3070 ref 50 23 19 9 A 2 1 171580 CASAVA_Build 3 123236175 3D CGCAGGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 32 11 13 9 TTG 5 4 171581 CASAVA_Build 3 123252178 1I TATGCTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 8 9 171582 CASAVA_Build 3 123276634 1D TTGACATGTG A/- AAAAAAAAAA 1288 het 1288 ref 27 19 3 5 A 12 11 171583 CASAVA_Build 3 123279080 3D GCTGTCTTCT GAA/--- GCCCCGTGGA 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 GAA 1 0 171584 CASAVA_Build 3 123288454 2D TGCTACACCA GT/-- GTGTGAAAGA 3070 hom 106 het 41 0 34 11 GT 3 2 171585 CASAVA_Build 3 123293118 1D AAGTTTTACC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 109 hom 42 1 32 9 T 9 8 171586 CASAVA_Build 3 123296271 1I TTTCCCTCCC -/T TATATTTTGT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 1 2 171587 CASAVA_Build 3 123296709 2D CACTTTAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2719 het 671 hom 27 4 10 13 T 18 16 171588 CASAVA_Build 3 123302048 1I AAAGAAGGAA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 8 9 171589 CASAVA_Build 3 123319657 2D AGACATTGAT GA/-- GAGAGAGGTA 3070 hom 150 het 54 0 50 4 GA 4 3 171590 CASAVA_Build 3 123321400 1D82M2D ATAGATTGTG TTTTTTTTTTAAATAGACCTCTCAATTTCTGGAAAACTGCCTTTTATCTGCCCAGAATTCTAAGCTGGTGCCCCACTGAATTTTG/-TTTTTTTTTAAATAGACCTCTCAATTTCTGGAAAACTGCCTTTTATCTGCCCAGAATTCTAAGCTGGTGCCCCACTGAATCT-- TGTGTACCTG 3070 het 3070 hom 42 14 23 42 N/A 0 0 171591 CASAVA_Build 3 123323085 2D ATGCATATAT AC/-- ACATACAGCA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 AC 2 1 171592 CASAVA_Build 3 123324864 2D TGGAGACAAA AG/-- AGAGATCATT 3070 hom 44 het 18 0 15 3 AG 3 2 171593 CASAVA_Build 3 123329967 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2481 hom 27 het 13 0 8 6 A 18 16 171594 CASAVA_Build 3 123332370 1I ATTGGAATAC -/A AAGGAATACA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 A 2 3 171595 CASAVA_Build 3 123333293 1I CCATTCCATA -/C AAAAAATAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 C 0 1 171596 CASAVA_Build 3 123333916 4I TAAATTCATT ----/TTTA TTTATTTAAT 3070 hom 52 het 21 0 18 3 TTTA 2 3 171597 CASAVA_Build 3 123343733 2D GGTTTTTCTG CT/-- CTGTTTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 CT 2 1 171598 CASAVA_Build 3 123353385 6D AATATTACTA AAACTT/------ AACTTACTTT 3070 hom 129 het 44 0 44 1 AAACTT 1 0 171599 CASAVA_Build 3 123356670 1I TTTATGAAAT -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 8 9 171600 CASAVA_Build 3 123361971 3D TATGTGTCCG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 22 0 13 9 T 15 12 171601 CASAVA_Build 3 123375562 3D CCTCTCTAAG CTT/--- CATCATTTCT 3070 het 3070 ref 51 28 17 7 CTT 1 0 171602 CASAVA_Build 3 123377489 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 294 hom 21 1 17 3 A 9 10 171603 CASAVA_Build 3 123384301 1D CCAGATTTTG C/- CCCCTTCACT 3070 hom 132 het 50 0 44 7 C 5 4 171604 CASAVA_Build 3 123384666 2I TGTTTTCCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 12 171605 CASAVA_Build 3 123384877 3I TGATCCTGCT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 10 13 171606 CASAVA_Build 3 123385033 4D AAAAAGCCAA AAAC/---- AAACAAACAC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 AAAC 3 2 171607 CASAVA_Build 3 123387528 2I CCTGCCAATA --/AT CAGCACAGTC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AT 0 1 171608 CASAVA_Build 3 123396545 3I CTACTTCCTG ---/CTC CTCCTCCTCC 3070 hom 80 het 34 0 24 10 CTC 4 5 171609 CASAVA_Build 3 123401384 1I AACTAACAAC -/A ATTTATTGTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 1 2 171610 CASAVA_Build 3 123407806 1D TTGATGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 38 2 31 6 T 11 10 171611 CASAVA_Build 3 123413341 1D AATAAACATG A/- AAAAAAGTTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 7 6 171612 CASAVA_Build 3 123416431 1D GATAAATGAC T/- TGCTTTTCTT 3070 hom 166 het 63 0 56 7 T 2 1 171613 CASAVA_Build 3 123416642 2D GGAGAAAGTC TT/-- TGCCTATGCA 3070 hom 147 het 55 0 48 9 T 3 1 171614 CASAVA_Build 3 123418646 1I GAAAGTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1250 hom 31 4 17 10 T 15 16 171615 CASAVA_Build 3 123420152 3D TAAAGGAGGT AGA/--- AGAAGAAGAA 3070 hom 75 het 27 0 26 3 AGA 5 4 171616 CASAVA_Build 3 123424376 1I TCAACAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 11 171617 CASAVA_Build 3 123425404 1I TTATTCCTGG -/A ATGCAAAGTT 3070 hom 132 het 45 0 45 0 A 1 2 171618 CASAVA_Build 3 123429491 2I TCTAAATGAC --/TG TGCTCATGTC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TG 1 2 171619 CASAVA_Build 3 123433296 1D TCCCACTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 40 4 25 12 A 14 13 171620 CASAVA_Build 3 123445987 1I CAATAATGAG -/A AAAAAACAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 6 7 171621 CASAVA_Build 3 123447880 1I AAATGAAAGG -/T TTTAATGTGT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 3 4 171622 CASAVA_Build 3 123454049 4D AGAGAGAGAG AGAA/---- AGAAAGAAGG 2338 hom 22 het 22 0 9 14 AGAA 3 2 171623 CASAVA_Build 3 123457442 4I CCCACAATAT ----/AAAG AAAGAACCTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AAAG 1 2 171624 CASAVA_Build 3 123458015 3D CAATCTTTTA TTC/--- TTCTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 TTC 2 1 171625 CASAVA_Build 3 123461112 1I GACCAACGCC -/T TTTTATGTTT 3070 het 3065 hom 29 8 17 4 T 4 5 171626 CASAVA_Build 3 123465647 1I GACCTGTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 35 1 26 8 A 12 13 171627 CASAVA_Build 3 123478547 1D TGCATTTGCC T/- TTTTTATTAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 6 5 171628 CASAVA_Build 3 123479736 3I AAATGCAAAG ---/TAT TATTAATATG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TAT 1 2 171629 CASAVA_Build 3 123483417 2D GTGCATGCAC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 49 22 16 12 AT 1 0 171630 CASAVA_Build 3 123486909 1I CTTTAAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 49 16 24 9 A 8 9 171631 CASAVA_Build 3 123491458 1D TACAAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 18 0 15 4 A 12 11 171632 CASAVA_Build 3 123495607 1D ACTATTAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 11 10 171633 CASAVA_Build 3 123496877 2D GCAAGCAAAG CT/-- CTTGGGATAG 3070 het 3070 ref 54 26 23 6 CT 2 1 171634 CASAVA_Build 3 123499286 1D ATTCTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 10 9 171635 CASAVA_Build 3 123518875 1D GTTCATTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 37 0 29 8 T 10 9 171636 CASAVA_Build 3 123521638 2I ATACTCTGAA --/AT ATATATATAT 2214 het 2214 ref 18 8 7 3 AT 7 8 171637 CASAVA_Build 3 123529287 1D CCCTGACCCT A/- AAAAAATCCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 7 6 171638 CASAVA_Build 3 123535258 4D AGAAAGAAAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 2523 hom 33 11 18 4 AGAA 3 2 171639 CASAVA_Build 3 123540037 1D TTTTTTCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1214 hom 26 5 20 1 A 16 15 171640 CASAVA_Build 3 123542482 1D TAGTCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 168 hom 31 2 22 7 T 15 14 171641 CASAVA_Build 3 123594892 1D GCATTTATCC A/- AAAAAAAAAG 1261 het 1261 ref 39 28 3 8 A 10 9 171642 CASAVA_Build 3 123635979 2D TGTGCGAAAA CT/-- CTCTAGTCCT 3070 het 3070 hom 45 14 26 7 CT 3 2 171643 CASAVA_Build 3 123645708 1I GAAGAGAAAT -/C ATGATTCTGT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 C 0 1 171644 CASAVA_Build 3 123684895 1I GTTTTGTTTT -/G TTTTAAATTG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 G 0 1 171645 CASAVA_Build 3 123704794 2I GCATGCATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 AT 7 8 171646 CASAVA_Build 3 123737381 1D TAAGTAAGGC A/- AAAAAAAAAA 1889 het 1889 ref 36 16 8 12 A 17 16 171647 CASAVA_Build 3 123777446 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2765 het 1705 hom 21 8 9 4 A 15 14 171648 CASAVA_Build 3 123779588 1I ATTTCTGGTG -/T GTTTTTTTTT 2962 het 2962 ref 29 12 10 7 T 0 1 171649 CASAVA_Build 3 123780133 3D ACCCGTTTAT TCA/--- TCTGCTTTAG 3070 het 3070 ref 29 16 11 4 TCA 1 0 171650 CASAVA_Build 3 123781531 22D CAACAGCAAC TATATGTATATATATATATATA/---------------------- TATATATATA 2109 het 813 hom 15 5 6 6 TATATGTATATATATATATATA 1 0 171651 CASAVA_Build 3 123782353 14D TGAACTTGGG CTAATAATAATGAC/-------------- TGTACAAATA 3070 hom 99 het 32 0 33 1 CTAATAATAATGAC 1 0 171652 CASAVA_Build 3 123783716 1I TGATATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 11 12 171653 CASAVA_Build 3 123784285 17D TCAAATATTT TCTCCTGTACCTTCCTC/----------------- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 33 21 14 1 TCTCCTGTACCTTCCTC 1 0 171654 CASAVA_Build 3 123784473 1I GTTTACAGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 8 9 171655 CASAVA_Build 3 123784824 1D GCCTGGCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 12 11 171656 CASAVA_Build 3 123785547 13D ACCGCTCTCC ATGTGGTAAGCCT/------------- ATGTGGTAAG 3070 het 3070 hom 25 13 13 6 ATGTGGTAAGCCT 2 1 171657 CASAVA_Build 3 123787766 2D GTTAAACGTA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 54 hom 29 1 13 16 T 11 9 171658 CASAVA_Build 3 123788053 1I AACCCATATG -/T TAAACTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 T 1 2 171659 CASAVA_Build 3 123789896 1I GGTTTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 T 11 12 171660 CASAVA_Build 3 123794156 1D AATTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1280 het 1280 ref 39 27 4 8 A 13 12 171661 CASAVA_Build 3 123798885 1D TAGCAAGTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 T 10 9 171662 CASAVA_Build 3 123800053 1I CTGTTCATAA -/T ATGGCAGCTG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 0 1 171663 CASAVA_Build 3 123801065 5I TTTTTCTTTT -----/CTTTC CTTTCCTTTC 3070 het 542 hom 27 4 11 12 CTTTC 3 4 171664 CASAVA_Build 3 123804282 1I CTTTTTCAGG -/A AAAGAATTAC 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 A 3 4 171665 CASAVA_Build 3 123808549 1I TTCTCTAGAG -/T TTTTAGAGTC 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 T 4 5 171666 CASAVA_Build 3 123811249 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2331 het 1095 hom 19 8 10 1 A 12 13 171667 CASAVA_Build 3 123813576 2I TAGTTGAGAT --/TC TCTCTTTCTC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TC 2 3 171668 CASAVA_Build 3 123822359 3I GGGATCCACT ---/CTC CTCCTCCTCC 3070 hom 82 het 30 0 23 7 CTC 3 4 171669 CASAVA_Build 3 123843857 5D ACTGGAATAA TTTTT/----- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 hom 28 14 14 1 T 11 6 171670 CASAVA_Build 3 123845121 1I GTCTCAAACT -/C CCGACCTCAA 3070 het 2695 hom 17 6 9 2 C 2 3 171671 CASAVA_Build 3 123848573 1D ACAGAAATGG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 9 8 171672 CASAVA_Build 3 123861131 1D CTACACTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 A 10 9 171673 CASAVA_Build 3 123862290 2D GGATGACCTG AA/-- GGAGATGTTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 8 A 2 0 171674 CASAVA_Build 3 123870770 1I CTCACTTCAT -/G TTTTTAGAGA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 G 0 1 171675 CASAVA_Build 3 123871933 2I TGTTTATTCC --/CT GTTTATGTTT 3070 het 1981 hom 14 4 9 1 CT 0 1 171676 CASAVA_Build 3 123874103 2D AACTAAAGAC AT/-- AGAAAATTTG 3070 het 3070 hom 34 16 16 4 AT 1 0 171677 CASAVA_Build 3 123878901 1D TTCTTCCAGT A/- TTTGAAAATT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 A 1 0 171678 CASAVA_Build 3 123890103 1D TGGCTCCTTT A/- AAGGAAGCAG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 3 2 171679 CASAVA_Build 3 123894830 24D TGAGATTGGG AAGAGAGCTGTCACCACCCAAAAC/------------------------ AAGTACATTT 3070 het 3070 ref 32 21 13 1 AAGAGAGCTGTCACCACCCAAAAC 1 0 171680 CASAVA_Build 3 123895213 1D GCATCTCTAC A/- AAAAAAATAC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 8 7 171681 CASAVA_Build 3 123904266 3D TTAAAAATAA TGT/--- TGTGTCTCAT 3070 het 3070 ref 39 23 12 5 TGT 2 1 171682 CASAVA_Build 3 123908355 1I ACCAACAGGC -/A AAAAAAAAAA 2139 het 2139 ref 30 10 8 12 A 14 15 171683 CASAVA_Build 3 123923106 2I CCTGGTCGAC --/AG AGAGTGAGAC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 AG 2 3 171684 CASAVA_Build 3 123925840 2D TTATGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 10 12 T 14 12 171685 CASAVA_Build 3 123947826 1I CAAAAAAAAA -/C ATCAAAAGGT 3070 hom 37 het 34 1 30 3 C 0 1 171686 CASAVA_Build 3 123954735 4D CAACATGGAT GGAA/---- GAAGTGTGAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 GGAA 1 0 171687 CASAVA_Build 3 123958668 1I TGTTTGGGTT -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 A 6 7 171688 CASAVA_Build 3 123959648 22D AATCTGCTCA TAATCCTTTTCACATCTAATAG/---------------------- GTCTGAGAAC 3070 het 3070 ref 47 31 21 6 TAATCCTTTTCACATCTAATAG 1 0 171689 CASAVA_Build 3 123962081 1D AGAAAGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 7 T 11 10 171690 CASAVA_Build 3 123962929 4I TCACTGAAGG ----/AAGA TTTTTCTACA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 AAGA 0 1 171691 CASAVA_Build 3 123963809 3D CTCCTTTATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 13 10 171692 CASAVA_Build 3 123970487 1I TTTTTTTTTT -/A AAAATAAAGA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 4 5 171693 CASAVA_Build 3 123971647 1I TATCTTTTCT -/C TACGTTTCTG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 C 0 1 171694 CASAVA_Build 3 123972864 1D TGCAATGAAA T/- TATTCCTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 T 2 1 171695 CASAVA_Build 3 123974196 4I AAAAAAGAAA ----/TAAT TAATCAATTA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 TAAT 1 2 171696 CASAVA_Build 3 123974387 1I TATTTTTTCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 8 9 171697 CASAVA_Build 3 123987658 1D CTTTTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 A 11 10 171698 CASAVA_Build 3 123994415 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1681 hom 17 8 9 1 A 13 12 171699 CASAVA_Build 3 123999861 1D ATTTGCACCC T/- TCTTATTATA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 2 1 171700 CASAVA_Build 3 124007040 1D CAAAAAGAGA G/- GAGAGAGCCC 888 het 888 ref 26 16 4 6 G 2 1 171701 CASAVA_Build 3 124008586 1D AGAAGCGTTT A/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 1 0 171702 CASAVA_Build 3 124008762 2D TATAACATAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2973 hom 22 8 8 6 TA 7 6 171703 CASAVA_Build 3 124024326 2D GTTTCTTCCC CA/-- CCCCAATCCA 3070 het 3070 ref 42 22 16 6 CA 1 0 171704 CASAVA_Build 3 124027253 1I TCATATCATG -/A AAATGTCACA 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 A 3 4 171705 CASAVA_Build 3 124033504 1I TGAAAACACC -/A AAAAAAAAAA 2742 het 2742 ref 23 9 6 8 A 11 12 171706 CASAVA_Build 3 124044819 1I GTATAACCCC -/T ATAAGTCGGT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 T 0 1 171707 CASAVA_Build 3 124046410 2D TTCTTGAAGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1629 hom 21 4 10 7 AT 8 7 171708 CASAVA_Build 3 124058374 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1444 het 1306 hom 23 10 5 8 A 17 16 171709 CASAVA_Build 3 124060147 5D CATGATTAAC CATAT/----- CATGTCAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 19 2 CATAT 1 0 171710 CASAVA_Build 3 124071542 3I TTTCAGTGTG ---/TTC TTATTATATT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TTC 0 1 171711 CASAVA_Build 3 124079326 5I TTATATAGTC -----/AACAT AAAAGCAGAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AACAT 0 1 171712 CASAVA_Build 3 124084523 4I TGTTTGTTTG ----/TTTA TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TTTA 0 1 171713 CASAVA_Build 3 124085936 2D CAAAGGGGAT AC/-- CAGAATATCA 3070 het 3070 ref 38 24 14 0 AC 1 0 171714 CASAVA_Build 3 124089116 1I AAAAATGAAG -/A TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 26 2 20 4 A 0 1 171715 CASAVA_Build 3 124089429 1I AGTCAGAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 9 10 171716 CASAVA_Build 3 124095586 3D ACCCCCAGTG CTT/--- CTTAGCTCAG 3070 hom 129 het 46 0 42 4 CTT 2 1 171717 CASAVA_Build 3 124102263 1D CTTGTCTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 653 hom 18 2 13 4 A 15 14 171718 CASAVA_Build 3 124124415 10I GCTGGAAGCC ----------/AACCACCTTT TTCTGAGCAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AACCACCTTT 0 1 171719 CASAVA_Build 3 124125415 3I GTGTCTGGCA ---/CAC CATGGGGGGA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 CAC 0 1 171720 CASAVA_Build 3 124130385 1D CACAGGGCTG T/- TATCCTCACC 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 T 2 1 171721 CASAVA_Build 3 124132558 1D ACAGAATGGC T/- TTTTTGAGAC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 6 5 171722 CASAVA_Build 3 124146249 1D TGGGGAGTGG T/- CTGGGAGGGC 2434 het 2434 ref 26 12 10 4 T 1 0 171723 CASAVA_Build 3 124161117 3D GAATGAAAAC AAG/--- AAGAATATAA 3070 het 3070 hom 53 23 27 4 AAG 2 1 171724 CASAVA_Build 3 124165039 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAAGAAAA 455 het 455 ref 23 9 4 11 AAAG 1 0 171725 CASAVA_Build 3 124205372 4D CTCTTATCTC AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 AATA 6 5 171726 CASAVA_Build 3 124231025 1D AATGAGCGTG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 87 het 35 0 27 8 C 10 9 171727 CASAVA_Build 3 124231866 1I CGAAACATTG -/T TAATTAAGCA 3070 hom 98 het 41 0 36 5 T 1 2 171728 CASAVA_Build 3 124264415 2D GAAAAAGACT GA/-- GAGATAGTGT 3070 het 3070 ref 40 23 17 0 GA 3 2 171729 CASAVA_Build 3 124279350 1D ATTAATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1911 hom 30 7 12 11 T 15 14 171730 CASAVA_Build 3 124281692 1D TGGGTGTGTG T/- GTGGGGGGGA 745 het 745 ref 42 23 5 15 T 1 0 171731 CASAVA_Build 3 124289008 1D TTCTAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 T 11 10 171732 CASAVA_Build 3 124300240 3D CATTCCTTGG AAC/--- AGTGGTGAGT 3070 het 3070 ref 35 15 14 7 AAC 1 0 171733 CASAVA_Build 3 124330604 4I TCGCTATGAC ----/AAAT AACCTGCAGT 3070 hom 143 het 51 0 47 4 AAAT 0 1 171734 CASAVA_Build 3 124337185 1D ATTCTCAAAG C/- AATATATAAC 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 C 1 0 171735 CASAVA_Build 3 124342132 13I GTGGATGTTG -------------/CCTGTGGAGAGGT CCTATCCATC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 CCTGTGGAGAGGT 0 1 171736 CASAVA_Build 3 124344706 1I GGTGGATCAC -/A AGGTCAGGAG 3070 het 2139 hom 18 6 9 3 A 1 2 171737 CASAVA_Build 3 124358364 1I TGAAGGGGCA -/G GCCCCATTGA 1861 het 1861 ref 27 14 7 6 G 1 2 171738 CASAVA_Build 3 124361986 1I TTACTCATGC -/G GGGGCTCCTC 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 G 4 5 171739 CASAVA_Build 3 124370252 1I GCACTTCTGT -/A AAAAAATCAG 3070 het 2928 hom 30 9 19 2 A 6 7 171740 CASAVA_Build 3 124376967 1I CCTAGAAGGG -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 7 8 171741 CASAVA_Build 3 124380626 2I AACCTCTCTT --/AG GTGCCTTAGC 3070 het 3070 hom 61 25 28 8 AG 0 1 171742 CASAVA_Build 3 124383437 1I CTCTCTGCAC -/T TAAGGTTAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 1 2 171743 CASAVA_Build 3 124396243 1D TTTCCCCTGG T/- TCTGTAGCGC 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 T 2 1 171744 CASAVA_Build 3 124397413 2D CAGATGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3015 het 3015 ref 31 11 9 12 T 12 10 171745 CASAVA_Build 3 124399269 1D TATATATACA T/- TTTTTTTTTT 2686 het 2002 hom 16 7 7 2 T 12 11 171746 CASAVA_Build 3 124399737 1D TATTTTAAAC T/- TTTTTTCGCT 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 T 7 6 171747 CASAVA_Build 3 124406587 1I AGATTAGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 9 10 171748 CASAVA_Build 3 124408133 1D AAAACATGGT A/- AAAAAAAAAT 3033 het 3033 ref 28 18 9 2 A 10 9 171749 CASAVA_Build 3 124418921 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1632 het 1618 hom 8 4 4 0 T 11 10 171750 CASAVA_Build 3 124419076 1I ACTTGGCAAA -/T TTTAACAGTA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 T 3 4 171751 CASAVA_Build 3 124423298 3I ATTTCTGAAT ---/TTG TTATTTAGAA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 TTG 0 1 171752 CASAVA_Build 3 124423663 1D CTTTATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 29 0 18 11 T 13 12 171753 CASAVA_Build 3 124425931 4I TAAGCAATAA ----/AAAG AAAACAGATT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 AAAG 0 1 171754 CASAVA_Build 3 124427468 4D CTCCCACAAA TGAG/---- TGAGAATATG 3070 het 3070 ref 41 25 12 5 TGAG 2 1 171755 CASAVA_Build 3 124428761 2D AGGCTTTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 12 8 A 12 10 171756 CASAVA_Build 3 124436166 3D TCAAAAACTT AAC/--- AACAAAACTA 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 AAC 2 1 171757 CASAVA_Build 3 124436979 2D GTTCAACGTC AT/-- AGTCATTAGG 3070 het 3070 ref 57 36 16 6 AT 1 0 171758 CASAVA_Build 3 124438876 3D ATTAGTACCT ACA/--- ACAGGTCAGA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 ACA 2 1 171759 CASAVA_Build 3 124439405 1D TTAAGGAAGA G/- GGGCAAGATG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 G 4 3 171760 CASAVA_Build 3 124443487 3D ACTTTTCTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 7 A 15 12 171761 CASAVA_Build 3 124443777 1D GTCTGCTTCT C/- CCAGCTATTC 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 C 3 2 171762 CASAVA_Build 3 124445657 2I TTACTGAAGT --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 8 10 171763 CASAVA_Build 3 124447081 1I ACAATTCAAG -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 6 7 171764 CASAVA_Build 3 124451947 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 10 11 171765 CASAVA_Build 3 124452598 1I AATTAGTAGA -/T TTTTAAGCAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 4 5 171766 CASAVA_Build 3 124453135 3D GTGATTCTAA GAG/--- GAGCAAGGAA 3070 het 3070 hom 68 30 35 4 GAG 2 1 171767 CASAVA_Build 3 124453283 1D54M3D CCACTTGACC AAAAGTAGAAACTCCCATTGTTCCAGTTATCGAGGACTTTATATCTGCATTGAGTACA/-AAAGTAGAAACTCCCATTGTTCCAGTTATCGAGGACTTTATATCTGCATTGAGT--- ACAATGTTCT 3070 het 3070 ref 62 42 39 3 N/A 0 0 171768 CASAVA_Build 3 124456275 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTAT 2758 het 2758 ref 27 16 7 4 T 9 8 171769 CASAVA_Build 3 124457987 1D CCTCTGAGTC A/- ATCTTAATCT 3070 het 3070 hom 60 29 30 1 A 2 1 171770 CASAVA_Build 3 124463110 2D TATCTAAAAC TG/-- TGAGGTATTT 3070 het 3070 ref 44 22 21 2 TG 2 1 171771 CASAVA_Build 3 124467138 3D GGTCATGCTT GTG/--- GTGGTCAAGT 3070 het 3070 ref 35 14 16 7 GTG 2 1 171772 CASAVA_Build 3 124468303 4I CTGTTATTGG ----/GTGA GTGTGTTCTG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 GTGA 0 1 171773 CASAVA_Build 3 124468825 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 8 9 171774 CASAVA_Build 3 124471474 1I TGGCCAAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2276 hom 17 5 10 2 T 7 8 171775 CASAVA_Build 3 124471821 4D GAAAATCACT GATA/---- AATACTTCCA 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 GATA 1 0 171776 CASAVA_Build 3 124473425 13I AGCATGGAAG -------------/ACCTGCTAGGAAA AGTCCTCTCA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 ACCTGCTAGGAAA 0 1 171777 CASAVA_Build 3 124475419 4I AGCATTCTGG ----/TTAA TTGAGATTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTAA 0 1 171778 CASAVA_Build 3 124475736 1D ACCTGTATCA T/- TGCTGCCAAA 2830 het 2830 ref 17 10 6 1 T 2 1 171779 CASAVA_Build 3 124475917 1D TAAAAATACC A/- AAAAAAATAA 2499 het 2018 hom 13 5 6 2 A 8 7 171780 CASAVA_Build 3 124476074 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1233 hom 18 3 12 3 A 14 13 171781 CASAVA_Build 3 124476811 3D CTGCCCTATC AGT/--- AGGTGAAAAG 3070 het 3070 ref 47 29 14 5 AGT 1 0 171782 CASAVA_Build 3 124477140 6D CAATTCTGTA TTACAG/------ AATTATAAGA 3070 hom 141 het 50 0 48 4 TTACAG 1 0 171783 CASAVA_Build 3 124480507 1D GGCACCCTCC A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 40 12 17 12 A 7 6 171784 CASAVA_Build 3 124498249 1I AAGATGGTAG -/T TAAGGATTAA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 1 2 171785 CASAVA_Build 3 124505003 1D GACATTCCCT A/- AACTCTTCCT 3070 het 3070 ref 39 21 9 9 A 3 2 171786 CASAVA_Build 3 124510369 11I CTGTCTCAAA -----------/AACAAACAAAC AACAAACAAA 3070 hom 60 het 21 0 20 1 AACAAACAAAC 1 2 171787 CASAVA_Build 3 124518571 2D CGTATATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 40 0 29 12 TG 8 7 171788 CASAVA_Build 3 124518869 1I CTTTTGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 33 3 22 8 T 15 16 171789 CASAVA_Build 3 124520891 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 260 hom 23 3 16 4 A 14 13 171790 CASAVA_Build 3 124528322 11D TAGGATAAGG TGTCCCTCTGA/----------- TGTCCCTCTT 3070 het 3070 ref 44 22 14 14 TGTCCCTCTGA 1 0 171791 CASAVA_Build 3 124544289 1I AGACCAGTCA -/G GTGCAGGGTC 3070 hom 7 het 33 1 29 3 G 1 2 171792 CASAVA_Build 3 124549246 4I GCCCACTTGA ----/AAGG AAGGAAGTGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AAGG 1 2 171793 CASAVA_Build 3 124559693 20D CATGGAACAC GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/-------------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 66 het 29 0 20 13 GT 20 10 171794 CASAVA_Build 3 124564816 4D ACTAGTAAGC AAAG/---- AAATAACAAT 3070 het 3070 hom 44 18 25 3 AAAG 1 0 171795 CASAVA_Build 3 124579167 1D CTGCTCACCA C/- CTGGGGAAGT 3070 het 3070 ref 37 20 8 9 C 2 1 171796 CASAVA_Build 3 124583573 1I TCTCCTGGGG -/A CCCCCCTGTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 0 1 171797 CASAVA_Build 3 124583906 1I GTGGTTTCTC -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 6 7 171798 CASAVA_Build 3 124585242 1I TCAGCTAGGG -/A GGTTTAAACT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 0 1 171799 CASAVA_Build 3 124587827 1D GCCACCATCC T/- TAACGTCAAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 2 1 171800 CASAVA_Build 3 124590117 1I GAGGGTTAAC -/A AAAATCACAG 2854 het 2854 ref 35 16 8 11 A 4 5 171801 CASAVA_Build 3 124591450 1I TTAGCTCTAT -/G GGGGGGCTAC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 G 6 7 171802 CASAVA_Build 3 124592508 2D TAAAGCTGAC TT/-- TGGAAAACCA 3070 het 3070 ref 33 12 14 7 T 3 1 171803 CASAVA_Build 3 124594392 1D GGACAGTCAC T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 8 7 171804 CASAVA_Build 3 124602598 2I GACACACATG --/TA TATGTCCACA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TA 1 2 171805 CASAVA_Build 3 124626662 1I TGGTGCACAC -/A AGGTTATGGA 3070 hom 115 het 43 0 34 9 A 1 2 171806 CASAVA_Build 3 124627245 1I GCCCAGCCCA -/C CCCCCCAGTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 6 7 171807 CASAVA_Build 3 124632985 1D CTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 11 10 171808 CASAVA_Build 3 124640953 1I ATAAGGAAAG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 7 8 171809 CASAVA_Build 3 124641188 4I TCTTGGGCTG ----/TATC TATCCCCCTT 3070 hom 126 het 47 0 40 7 TATC 1 2 171810 CASAVA_Build 3 124669023 1D AGAGACTGTC T/- TTTTTTTTTT 2931 het 412 hom 22 1 10 11 T 16 15 171811 CASAVA_Build 3 124675020 4D CTACTAAAAA AAAT/---- AAATAAATAC 1897 hom 15 het 7 0 6 2 AAAT 3 2 171812 CASAVA_Build 3 124678893 2D TTATTTTAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 101 het 40 0 32 8 AG 10 9 171813 CASAVA_Build 3 124697134 4D TTTGGATGTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 49 1 34 16 A 16 12 171814 CASAVA_Build 3 124706425 5I AAAATGGACA -----/AATGT AATGCATAAC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AATGT 0 1 171815 CASAVA_Build 3 124709544 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 9 8 171816 CASAVA_Build 3 124715967 1I ATTGTTTTCT -/A AAAAATCACC 3070 hom 68 het 28 0 23 5 A 5 6 171817 CASAVA_Build 3 124730544 1D CTTTAAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 39 0 27 14 T 13 12 171818 CASAVA_Build 3 124732855 5D TTAACAGTGT TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 11 9 TTTTC 3 2 171819 CASAVA_Build 3 124764055 3D AATCTTTTAA TAT/--- TATTCTATGA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TAT 2 1 171820 CASAVA_Build 3 124768168 1D CGTGGTGACT G/- CATGCCTGTA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 0 171821 CASAVA_Build 3 124776218 2D AAAAAATTAC AT/-- GTTTCATGTG 3070 het 1972 hom 16 4 10 2 AT 1 0 171822 CASAVA_Build 3 124777787 1D TTTTTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1944 hom 23 5 14 4 T 12 11 171823 CASAVA_Build 3 124784740 1D TAACAGCCTT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 45 20 18 8 A 9 8 171824 CASAVA_Build 3 124806841 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2175 het 1519 hom 12 5 6 1 A 13 12 171825 CASAVA_Build 3 124807109 1D CTAATCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 13 12 171826 CASAVA_Build 3 124807883 4I TTTATATCTC ----/TCTT TATTTTATTT 3070 het 3070 ref 25 15 8 4 TCTT 0 1 171827 CASAVA_Build 3 124808096 4D CTGCTTCTCT TGAG/---- TAATTCATGT 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 TGAG 1 0 171828 CASAVA_Build 3 124814877 1I TTAGCAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 T 10 11 171829 CASAVA_Build 3 124817191 1I ATTTTCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 21 1 14 6 T 13 14 171830 CASAVA_Build 3 124825865 1I CTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2209 het 2209 ref 41 18 9 14 A 17 18 171831 CASAVA_Build 3 124829284 1I TAGGAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 8 11 T 10 11 171832 CASAVA_Build 3 124835367 2D CTACACTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 1246 het 1246 ref 50 37 5 8 TG 7 6 171833 CASAVA_Build 3 124866031 4D AGCAGGGGCA GGAT/---- GGATGGATGA 3070 hom 58 het 23 0 19 4 GGAT 3 2 171834 CASAVA_Build 3 124870961 1D GAGGAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1213 hom 42 4 23 16 T 14 13 171835 CASAVA_Build 3 124874703 1I CTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 507 hom 33 3 24 6 C 0 1 171836 CASAVA_Build 3 124879422 24D AAATAAATGA ATATATATATATATATATATATAT/------------------------ ATATATATAT 3070 het 601 hom 22 2 17 5 AT 17 5 171837 CASAVA_Build 3 124882550 1D CTCCTCCACC A/- AAAAAAAGTA 2271 het 2271 ref 26 18 6 2 A 8 7 171838 CASAVA_Build 3 124886201 12D CTCATGCCTC AGCCTCCTGAGT/------------ AGCCTCCTGA 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 AGCCTCCTGAGT 2 1 171839 CASAVA_Build 3 124887908 1I CTGGGCAGCG -/T TTTTTTTTTT 2733 het 909 hom 25 4 11 10 T 13 14 171840 CASAVA_Build 3 124894969 8I GGTGACTACA --------/GCCAGGGC CCCAGGAGCT 3070 hom 90 het 32 0 24 8 GCCAGGGC 0 1 171841 CASAVA_Build 3 124898286 1D CTTCAGTAGG C/- TCTGTATTTG 3070 hom 118 het 43 0 34 9 C 1 0 171842 CASAVA_Build 3 124919141 1I CTCCAGGGGG -/A AAAAAATTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 6 7 171843 CASAVA_Build 3 124923928 1D GTCATGCTTG C/- TCAGATCCAC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 1 0 171844 CASAVA_Build 3 124925465 4D AATATAAAGG TAAT/---- TAATATATCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TAAT 2 1 171845 CASAVA_Build 3 124926281 4D TCGCTCTTTC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 51 het 29 0 20 11 ATTT 5 4 171846 CASAVA_Build 3 124933321 2I ATGAACTTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 12 171847 CASAVA_Build 3 124941790 5D AGATTCAGAG AAGTT/----- AAGTCATCCA 3070 hom 163 het 57 0 55 2 AAGTT 1 0 171848 CASAVA_Build 3 124945624 1D ACGTATTAAC T/- GATATCCCCA 3070 hom 111 het 45 0 38 10 T 1 0 171849 CASAVA_Build 3 124947855 1D GCACAAAGTT C/- AATAAAATCT 3070 hom 116 het 46 0 37 9 C 1 0 171850 CASAVA_Build 3 124948346 1I CCTAGATTTT -/A AAAAAATAGG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 6 7 171851 CASAVA_Build 3 124955014 1D CTGAGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 31 3 15 13 T 17 16 171852 CASAVA_Build 3 125007030 1D AAATCTAGGG T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 55 23 20 12 T 7 6 171853 CASAVA_Build 3 125007619 5D ATGCTTTTAT TTTTA/----- TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 TTTTA 2 1 171854 CASAVA_Build 3 125009987 1D GATTTGGGTG A/- AGCATTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 2 1 171855 CASAVA_Build 3 125024202 2D TCTGAAGTTA AG/-- AATCTGACAC 3070 het 3070 hom 61 27 31 4 AG 1 0 171856 CASAVA_Build 3 125035063 1D CCCTACCCTG C/- CCCATGCACA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 C 4 3 171857 CASAVA_Build 3 125041908 10D CTACAGACAT TATATATATA/---------- TATATATATA 3070 hom 24 het 13 0 9 5 TA 11 6 171858 CASAVA_Build 3 125042459 2D TTAAAAAGGC AA/-- AAGTTTCTTG 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 A 4 2 171859 CASAVA_Build 3 125044139 1D AAGTCTCAAC A/- AATTCCAAAG 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 A 3 2 171860 CASAVA_Build 3 125046120 1I TAACTCATCT -/G TAAGACAGGA 3070 het 3070 ref 54 26 19 9 G 0 1 171861 CASAVA_Build 3 125049792 1I TCTTATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 11 12 171862 CASAVA_Build 3 125054666 1I CTCTAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 1327 het 1327 ref 36 25 3 8 A 11 12 171863 CASAVA_Build 3 125075091 1D AAGAATCTAG A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 8 7 171864 CASAVA_Build 3 125084277 1D TCAGGTTCCT C/- CCAGACCCAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 C 3 2 171865 CASAVA_Build 3 125089018 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1842 hom 23 6 9 8 A 12 11 171866 CASAVA_Build 3 125107492 1D CTGTATGAAT A/- ATATAACAGT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 2 1 171867 CASAVA_Build 3 125119190 1I TTAAAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 T 10 11 171868 CASAVA_Build 3 125125505 1D CAGAATCATT A/- AAAAAAAAAA 2834 het 2834 ref 24 15 8 1 A 13 12 171869 CASAVA_Build 3 125177976 2I TGAAGAGGCT --/CA CACAGCCTCT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 CA 2 3 171870 CASAVA_Build 3 125180993 1D GCCTGAAAAT G/- GTCCGTGAGG 2738 het 1530 hom 13 5 6 2 G 2 1 171871 CASAVA_Build 3 125196703 1D GCTTAATACA C/- CCCAACTGCA 3070 het 3070 ref 50 23 21 7 C 4 3 171872 CASAVA_Build 3 125197553 1D TAAATTCTCC T/- TTTTTTTCTC 2745 het 2745 ref 27 16 7 4 T 8 7 171873 CASAVA_Build 3 125201119 1D CATAAATGCC T/- TTCTGTCCCA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 T 3 2 171874 CASAVA_Build 3 125202135 1D TGTCCTAGAG T/- TGACATCACC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 1 171875 CASAVA_Build 3 125211941 1I TGAAGTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 10 11 171876 CASAVA_Build 3 125218215 1I GGGCTGCGGT -/G GGTGGGAATG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 G 2 3 171877 CASAVA_Build 3 125247287 3D ACAGCCTAAT GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 het 400 hom 37 6 12 19 G 13 10 171878 CASAVA_Build 3 125248438 1I TGTTGACCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 10 11 171879 CASAVA_Build 3 125256514 4D TAGCTTACTC AGTT/---- AGCCATTAAC 3070 het 3070 ref 44 22 19 5 AGTT 1 0 171880 CASAVA_Build 3 125257391 1I GTGGGTGCCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 7 8 171881 CASAVA_Build 3 125263489 2D TTTACTTTCT AA/-- GACTTGATGC 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 A 2 0 171882 CASAVA_Build 3 125264113 1I ATCTTTAACC -/T CTGCATTAGA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 0 1 171883 CASAVA_Build 3 125308389 1I GTAGTCATTG -/T TATGTGGACA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 1 2 171884 CASAVA_Build 3 125337743 1D GGGTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2919 hom 34 10 18 6 T 11 10 171885 CASAVA_Build 3 125338598 1D GTTTGGGAGA G/- GAGGAAGAGG 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 G 2 1 171886 CASAVA_Build 3 125353201 3D TACACTCCTT ATG/--- ATGCATTTTC 3070 het 3070 ref 24 13 8 5 ATG 2 1 171887 CASAVA_Build 3 125401092 3D AATTTTTATT AAG/--- AAGTTACATA 3070 het 3070 hom 39 14 19 8 AAG 2 1 171888 CASAVA_Build 3 125406137 1D TAGATCAAAG A/- AAAAAATTCC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 7 6 171889 CASAVA_Build 3 125406512 1D CCCTTGTGTC T/- TTGTAACATT 3070 hom 144 het 54 0 49 6 T 3 2 171890 CASAVA_Build 3 125434420 1I TCAGACAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 A 10 11 171891 CASAVA_Build 3 125437039 10I AAGGACATAG ----------/TTTATGTATT TTGAGACGGA 3070 hom 151 het 54 0 49 5 TTTATGTATT 0 1 171892 CASAVA_Build 3 125446581 3D TTATAAATTA TTG/--- TTAACTAGAG 3070 hom 57 het 22 0 20 4 TTG 1 0 171893 CASAVA_Build 3 125447080 1D TTTTATATTT A/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 48 23 15 10 A 1 0 171894 CASAVA_Build 3 125447198 1I TTATTTTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 56 het 35 1 32 2 T 9 10 171895 CASAVA_Build 3 125448991 13I CACCTGCTAT -------------/GTAATAATTGCCA GTTGAAACTG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 GTAATAATTGCCA 0 1 171896 CASAVA_Build 3 125456478 2I CTGTCTGAAG --/TA TATATATATA 2026 het 528 hom 10 2 6 4 TA 6 7 171897 CASAVA_Build 3 125459523 1D ATCACCTAAA G/- GAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 2 1 171898 CASAVA_Build 3 125462384 1D TTGCTTCTCT G/- ACTTTGTGGT 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 G 1 0 171899 CASAVA_Build 3 125464575 2D CTACCCAAAC AT/-- AGACTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 20 18 1 AT 1 0 171900 CASAVA_Build 3 125475287 2D ATCTGTGGAA AC/-- ACAGAGTAAT 3070 het 3070 hom 57 21 31 5 AC 2 1 171901 CASAVA_Build 3 125485351 1D GCAGCTCATC T/- GTCAAGAACA 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 T 1 0 171902 CASAVA_Build 3 125492917 1I AAGCAGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 T 10 11 171903 CASAVA_Build 3 125494185 1I CGGTCACTCT -/G GGGGGTGCAT 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 G 5 6 171904 CASAVA_Build 3 125495287 1I CTTTGTAGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 8 9 171905 CASAVA_Build 3 125504379 1I TGAGCACACA -/C CCCTGGTATC 3070 hom 105 het 45 0 35 10 C 3 4 171906 CASAVA_Build 3 125507243 2I GAGTGGGAAT --/AG ATTTCAATAA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 AG 0 1 171907 CASAVA_Build 3 125507982 4D TATGAAGAAC AGAG/---- AGAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 AG 3 1 171908 CASAVA_Build 3 125509112 5I CTGATTCTGA -----/TAAGT TAAGGTGTAT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 TAAGT 0 1 171909 CASAVA_Build 3 125511778 1D TGAAAACTAT A/- AAGCATTGTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 3 2 171910 CASAVA_Build 3 125516037 1I AAAGTATATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 2869 hom 25 8 13 4 A 0 1 171911 CASAVA_Build 3 125516359 1I TGCTGGCTAA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 6 7 171912 CASAVA_Build 3 125517895 3I CATCTTGCCA ---/CTC CTCTGCTTAA 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 CTC 1 2 171913 CASAVA_Build 3 125533176 5I TTTCTGTCTT -----/ATAAC AGAACTGTGC 3070 hom 95 het 36 0 32 4 ATAAC 0 1 171914 CASAVA_Build 3 125538879 1I TTATTGAGAG -/T TTTTAGCATG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 4 5 171915 CASAVA_Build 3 125550408 1D GCACCTGCCA C/- CACACCCGGC 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 2 1 171916 CASAVA_Build 3 125580222 2D CCAGGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 62 het 38 1 31 9 T 11 9 171917 CASAVA_Build 3 125594149 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 18 1 14 3 T 13 14 171918 CASAVA_Build 3 125597795 1I TTGGAGAGGG -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 94 het 37 0 31 6 T 7 8 171919 CASAVA_Build 3 125609734 1I GCTAAAAAAA -/T ATATGATTAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 0 1 171920 CASAVA_Build 3 125619695 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 9 10 171921 CASAVA_Build 3 125633792 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 A 10 9 171922 CASAVA_Build 3 125651390 11D AGGATTCATC CATGCTATTCG/----------- CATGTATCAA 3070 het 3070 hom 45 21 21 8 CATGCTATTCG 1 0 171923 CASAVA_Build 3 125656209 1I ACTGAAAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 300 hom 51 1 43 7 T 9 10 171924 CASAVA_Build 3 125668032 1I CAGCTTGCTG -/A TTATTAGATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 0 1 171925 CASAVA_Build 3 125672072 1D TAGGTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 37 1 29 7 A 11 10 171926 CASAVA_Build 3 125702421 1D GCAGTCACAC T/- TTAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 6 T 3 2 171927 CASAVA_Build 3 125702522 5I ATCTGCTGAA -----/TCCTT TCCAGCTAAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TCCTT 0 1 171928 CASAVA_Build 3 125712059 1D ATGCTGAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 10 9 171929 CASAVA_Build 3 125736326 1I CCTGAAACAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 7 8 171930 CASAVA_Build 3 125743451 2I GCCCAGATCA --/TT TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 36 10 15 11 T 7 9 171931 CASAVA_Build 3 125746171 6D CTATATATCT ATATAG/------ ATATAGATAT 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 ATATAG 3 2 171932 CASAVA_Build 3 125750739 1I ATGTAGTCTA -/G TAAGCTCCTA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 0 1 171933 CASAVA_Build 3 125769525 3D GGGAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAACA 3070 het 3070 ref 23 12 9 4 AAG 3 2 171934 CASAVA_Build 3 125776055 1I TTTGGAGCCA -/C ATGAACCAGC 3070 hom 132 het 51 0 42 9 C 0 1 171935 CASAVA_Build 3 125778751 1D TACTTCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3033 hom 31 10 10 11 A 12 11 171936 CASAVA_Build 3 125780267 1D GATGTGCCCC T/- GCACTCCAGC 3070 het 543 hom 20 2 10 8 T 1 0 171937 CASAVA_Build 3 125780424 1D ATCAGGGCCT G/- GCCTCTGCAC 3070 hom 94 het 36 0 30 8 G 2 1 171938 CASAVA_Build 3 125784895 10I TGTGAGTAAT ----------/CTCTCCATGA ACAGTGGTTC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 CTCTCCATGA 0 1 171939 CASAVA_Build 3 125789438 1I CACTATGTTG -/C CCAGGCTGGT 3070 hom 60 het 25 0 19 6 C 2 3 171940 CASAVA_Build 3 125789577 3D TTTGATGAAA GAT/--- GATTTTTCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 5 GAT 2 1 171941 CASAVA_Build 3 125790217 3D CTCCCCTCGG CCT/--- CCCAAAGTAC 3070 hom 19 het 26 1 25 7 CCT 1 0 171942 CASAVA_Build 3 125794002 1D AAAAAAAAAA G/- ATAGCCAATT 3070 het 3070 hom 35 9 22 5 G 1 0 171943 CASAVA_Build 3 125794123 3D GCTTTGTTGG TTC/--- TTCTTCAGAC 3070 het 3070 hom 41 17 20 6 TTC 3 2 171944 CASAVA_Build 3 125796727 1I TCCATGTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 T 9 10 171945 CASAVA_Build 3 125798607 4D AAACAAAAAC ACAA/---- ACAAAACAAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 ACAA 2 1 171946 CASAVA_Build 3 125798891 1D AAAAGAAAAG A/- AAAATCAGTT 3070 het 3070 hom 45 18 23 5 A 5 4 171947 CASAVA_Build 3 125799336 2D AAAAAAAAAC TT/-- TTGGAGCTAC 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 4 2 171948 CASAVA_Build 3 125800201 1D4M2D GTTGTTGTTT GTTTGAT/-TTTG-- GTTGTTTTTG 186 het 186 ref 39 20 3 17 N/A 0 0 171949 CASAVA_Build 3 125800511 4I CACGCCTGGC ----/CTCA CTCACACACA 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 CTCA 1 2 171950 CASAVA_Build 3 125803253 1D GTGGTAAATA T/- TCTGCCTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 2 1 171951 CASAVA_Build 3 125803405 2I CATCTCTAGG --/AA AAAAAAAAAA 2619 hom 18 het 13 0 7 6 A 10 12 171952 CASAVA_Build 3 125803563 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 21 0 15 6 A 17 14 171953 CASAVA_Build 3 125805680 3D TGCTTTCACG TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 12 9 171954 CASAVA_Build 3 125806393 1D CTGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 20 2 12 6 A 15 14 171955 CASAVA_Build 3 125807164 5I GTTTCATCCC -----/ACTGT ACTGTGGTCC 3070 hom 65 het 40 0 23 17 ACTGT 1 2 171956 CASAVA_Build 3 125807592 1D CTTTCTCTGA T/- TTATCCCCAT 3070 hom 93 het 39 0 32 9 T 3 2 171957 CASAVA_Build 3 125808852 3I ATAGTATAAA ---/CAT CATTGTGCAA 3070 hom 154 het 58 0 52 6 CAT 1 2 171958 CASAVA_Build 3 125812390 4D CCTACAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 591 het 217 hom 19 2 4 13 AAAG 1 0 171959 CASAVA_Build 3 125814447 4D GATCCCCACT TAAA/---- TAATACAAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 5 TAAA 1 0 171960 CASAVA_Build 3 125814738 1D TGCCTCCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 9 171961 CASAVA_Build 3 125823726 5I GGAGCTAAAG -----/CAAGA CAAAAGAACA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CAAGA 0 1 171962 CASAVA_Build 3 125824468 2I GGGAGTAGCA --/TT TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 8 10 171963 CASAVA_Build 3 125826226 4D GATACCCCTG TAGA/---- TAGATAGAAG 3070 het 3070 ref 54 33 17 5 TAGA 3 2 171964 CASAVA_Build 3 125827291 1D TATTACAAAA T/- TATGATGTAG 243 het 243 ref 30 17 2 11 T 2 1 171965 CASAVA_Build 3 125830420 1D AGCCACCATG C/- CCAGCCATAT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 C 3 2 171966 CASAVA_Build 3 125831337 1D TTCATTTTTT C/- TCTCTCTCTC 3070 het 1154 hom 32 5 16 11 C 1 0 171967 CASAVA_Build 3 125831352 2D TCTCTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 43 het 25 0 15 11 TC 7 6 171968 CASAVA_Build 3 125838258 3D TGCTGGACAC ATA/--- ATAAAGATCT 3070 het 3070 ref 50 26 18 9 ATA 2 1 171969 CASAVA_Build 3 125839873 1D CTTTCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 A 13 12 171970 CASAVA_Build 3 125840295 1D GGTCTCCAAT G/- GGGGGGTGCC 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 G 7 6 171971 CASAVA_Build 3 125840783 1D CAGATCTCCT C/- CTCTACAAGG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 2 1 171972 CASAVA_Build 3 125843842 2D AAAAATTAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 32 16 16 1 AG 9 8 171973 CASAVA_Build 3 125845871 1I TTTTTTAAAA -/T TTTTTTTTTA 3004 het 3004 ref 18 9 7 2 T 9 10 171974 CASAVA_Build 3 125847164 10D GAATAATATT TCTCTCTCTC/---------- TCTCTCTCTC 2560 het 697 hom 20 6 7 9 TC 16 11 171975 CASAVA_Build 3 125847442 2D TCTACATAAG TC/-- TACATTCCCA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 TC 1 0 171976 CASAVA_Build 3 125848367 2D TGAAATTTTG AT/-- ATGTTTTCTT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 AT 2 1 171977 CASAVA_Build 3 125852331 1I AAGCCTGTTT -/A TTCTCTCTTT 3070 hom 75 het 29 0 22 7 A 0 1 171978 CASAVA_Build 3 125856373 1D GGTTTTACAA T/- ACCTACCTTA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 1 0 171979 CASAVA_Build 3 125858178 5D AAAATAAAAC AAAAA/----- AATAAAAATT 3070 het 3070 hom 24 10 12 5 A 7 2 171980 CASAVA_Build 3 125860613 1D AGTGGTGGAG A/- GAATAAGGCC 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 1 0 171981 CASAVA_Build 3 125865660 1I16M1D GTTTTATACA -TTTTCCCTTGGCGTTAC/TTTTTCCCTTGGCGTTA- ATCAGGTCTG 3070 het 3070 hom 47 27 25 5 N/A 0 0 171982 CASAVA_Build 3 125874925 4I CGTGTCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 AAAC 2 3 171983 CASAVA_Build 3 125877056 2D CCTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 30 6 11 14 T 19 17 171984 CASAVA_Build 3 125879940 1D GGATGGGTTA T/- TTTTTTTTTT 2571 het 2571 ref 29 13 9 7 T 12 11 171985 CASAVA_Build 3 125880012 1D46M1I GATCAATTTA TTTTTTATCTTTTATTTCTCCTGGCAACTTCAATTCAAGTAAGTACC-/-TTTTTATCTTTTATTTCTCCTGGCAACTTCAATTCAAGTAAGTACCT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 23 13 10 N/A 0 0 171986 CASAVA_Build 3 125880516 8D GAAAGATCTG CCAATGGA/-------- CCAATGGACA 3070 hom 111 het 43 0 37 7 CCAATGGA 2 1 171987 CASAVA_Build 3 125889423 4D GAAGAAAAAC ACTT/---- AGAACTAAAT 2847 het 2847 ref 33 24 6 4 ACTT 1 0 171988 CASAVA_Build 3 125896787 4D ATTTATTGTT ACTA/---- ACTATGAATT 3070 het 3070 ref 46 21 17 10 ACTA 2 1 171989 CASAVA_Build 3 125906076 4D ATGGAAATTC TTTT/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 T 9 5 171990 CASAVA_Build 3 125912719 1D TTAGTACATT A/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 16 12 6 A 1 0 171991 CASAVA_Build 3 125915611 1D AATCAGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 16 8 A 13 12 171992 CASAVA_Build 3 125927914 1I AAAAGAGTAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 8 171993 CASAVA_Build 3 125929065 1D GGAAGATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 35 0 21 14 T 15 14 171994 CASAVA_Build 3 125929816 4D GTTGTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 74 het 32 0 29 5 TTGT 5 4 171995 CASAVA_Build 3 125932754 4D AAAAACAAAC AAAT/---- AGACCGGGAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 7 AAAT 1 0 171996 CASAVA_Build 3 125933128 3D GCTTAAGAGA TCT/--- TCTTGCCTCG 3070 het 3070 ref 33 20 11 4 TCT 2 1 171997 CASAVA_Build 3 125937958 5D AAAAAGAAAC ATATT/----- AGTTGAGTTT 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 ATATT 1 0 171998 CASAVA_Build 3 125948551 4I TTTGTTTTGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 TTTG 3 4 171999 CASAVA_Build 3 125948804 1I CAGAGCCCAC -/A ACCACTCCAG 2316 het 2316 ref 33 17 10 6 A 1 2 172000 CASAVA_Build 3 125959680 1D TGCAAGTCAC A/- AGGGGATGCG 3070 het 3070 hom 38 18 15 6 A 2 1 172001 CASAVA_Build 3 125964233 14I CCCCTCAGAA --------------/CAAGGGAGGGAGAC CAAGGGGTGG 3070 hom 98 het 37 0 31 6 CAAGGGAGGGAGAC 0 1 172002 CASAVA_Build 3 125964300 4I GGGCCAAAGG ----/TATC TATCTGCTCA 3070 het 2785 hom 34 12 13 9 TATC 1 2 172003 CASAVA_Build 3 125967240 7D CAGCTGCACA TTCATCT/------- TTCTTCTAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 7 TTCATCT 1 0 172004 CASAVA_Build 3 125972625 1D CCCATGTACT G/- GTTGAAACTT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 G 2 1 172005 CASAVA_Build 3 125973617 1D GAGCTGGAGG T/- TGGGGGCACC 3070 het 3070 ref 48 28 11 9 T 2 1 172006 CASAVA_Build 3 125974223 3D CTCATTTGCA CTC/--- TGGTGGAGCA 3070 het 3070 hom 33 10 15 10 CTC 1 0 172007 CASAVA_Build 3 125976841 2I GTGTGCATGA --/GT GTGTGTACAA 3070 het 3070 hom 62 23 32 7 GT 3 4 172008 CASAVA_Build 3 125978408 4D TAGCCTATTC TTTT/---- GCTGAAGGGC 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 T 4 0 172009 CASAVA_Build 3 125978542 1I GGGATGGCTG -/C GGGGGCAGGG 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 C 0 1 172010 CASAVA_Build 3 125980786 1I AGGCAGGATC -/A AGGTCTTTGG 3070 het 3070 hom 54 17 28 9 A 1 2 172011 CASAVA_Build 3 125996335 4I AAAAAGAAAC ----/AAGA AAGAAAGAAA 2917 het 2141 hom 16 7 9 0 AAGA 3 4 172012 CASAVA_Build 3 125996795 3I TTGGGAGGCT ---/GAG GTGGATGGAT 3070 het 1724 hom 18 4 11 3 GAG 0 1 172013 CASAVA_Build 3 126008334 1I AGCATTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 11 12 172014 CASAVA_Build 3 126023428 4D GGTTGGCTGG GCTA/---- GCTAGTCTAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 GCTA 2 1 172015 CASAVA_Build 3 126026060 1D GTTGATGAAC T/- GGGCTTCATC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 1 0 172016 CASAVA_Build 3 126033728 1I TCATGTGGGT -/A AATTGTGATG 3070 het 3070 ref 48 22 22 4 A 2 3 172017 CASAVA_Build 3 126036734 1I AGTTATGACT -/C CAGCCAGTTC 3070 het 3070 hom 46 15 20 11 C 1 2 172018 CASAVA_Build 3 126037751 1I ATGTATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 37 1 29 7 A 13 14 172019 CASAVA_Build 3 126041948 1D31M5D AAAGTATGTG TTATGATAGTGAATTTAAGAGTGTTTTTTTTTTGTTA/-TATGATAGTGAATTTAAGAGTGTTTTTTTTT----- TTGTTATTGG 3007 het 3007 ref 31 19 8 12 N/A 0 0 172020 CASAVA_Build 3 126050329 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 8 7 172021 CASAVA_Build 3 126052249 1D TTAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 A 11 10 172022 CASAVA_Build 3 126069830 12I GCACCATAAG ------------/GGCTGAGAAGCT GGCTGAGAAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 GGCTGAGAAGCT 0 1 172023 CASAVA_Build 3 126074570 1I CTAATATTTA -/T TTCTCAAGTA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 2 3 172024 CASAVA_Build 3 126075601 1D TAGGTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 34 2 24 8 A 15 14 172025 CASAVA_Build 3 126079389 1D AGCCACATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 11 10 172026 CASAVA_Build 3 126080104 1I GCACTGGACT -/G GGGGGGATGC 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 G 6 7 172027 CASAVA_Build 3 126106756 1D CTAACAACAA C/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 0 172028 CASAVA_Build 3 126111913 1D ATCTCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 A 12 11 172029 CASAVA_Build 3 126120963 1D CTGGCCTCAA G/- TGATCCTCCC 3070 het 2269 hom 23 6 13 4 G 1 0 172030 CASAVA_Build 3 126122692 1I CTCTACTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 24 2 19 4 T 10 11 172031 CASAVA_Build 3 126130936 1D ACAATAGGTT A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 A 7 6 172032 CASAVA_Build 3 126131886 1D ATAGCTACGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 9 8 172033 CASAVA_Build 3 126141374 1I GGAGGAGACT -/G GGGGGGAGAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 6 7 172034 CASAVA_Build 3 126145417 1D GCTAAATCAG A/- AAAAAATTTT 3070 het 961 hom 31 4 24 4 A 7 6 172035 CASAVA_Build 3 126160833 1I CTTCACTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 31 2 18 11 T 14 15 172036 CASAVA_Build 3 126161568 1I TATAAGGGAC -/A TTTTTATTAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 0 1 172037 CASAVA_Build 3 126171330 1I AATGGTGATC -/A GAGTCCCAGG 3070 hom 90 het 34 0 29 5 A 0 1 172038 CASAVA_Build 3 126190271 1D GCCAACATGG T/- AAAACCCCGT 2908 het 2908 ref 16 7 7 2 T 1 0 172039 CASAVA_Build 3 126241370 1D GAACAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 819 hom 37 4 20 13 A 14 13 172040 CASAVA_Build 3 126242246 2D GAAAACAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 12 10 172041 CASAVA_Build 3 126249417 1I GAGCTTCACC -/T TTGGCCTCTG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 2 3 172042 CASAVA_Build 3 126266605 3I ATATGAACGG ---/TAA TAATGCCTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TAA 1 2 172043 CASAVA_Build 3 126272849 1I CACTTAACTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 22 0 16 6 T 9 10 172044 CASAVA_Build 3 126274912 1D GATACAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 935 hom 39 3 32 4 A 11 10 172045 CASAVA_Build 3 126275683 1I CAAGAATAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 T 8 9 172046 CASAVA_Build 3 126281335 1D GTTTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3065 het 3065 ref 33 16 9 8 A 13 12 172047 CASAVA_Build 3 126298757 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 28 10 12 7 A 8 7 172048 CASAVA_Build 3 126305538 1D TCCAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 585 hom 22 2 14 6 A 15 14 172049 CASAVA_Build 3 126306609 1I CCAACACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 A 10 11 172050 CASAVA_Build 3 126307887 4I GTTTTTGGGG ----/TTTT TTTTTTGTTG 1322 het 1322 ref 23 15 6 2 T 6 10 172051 CASAVA_Build 3 126331045 1I TCCAGAGGAG -/C CACCAGACCG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 1 2 172052 CASAVA_Build 3 126333055 1D CTGAGTAGCT G/- GGATTACAGG 1741 het 1741 ref 19 10 6 3 G 3 2 172053 CASAVA_Build 3 126334915 1D ACACACACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 10 9 172054 CASAVA_Build 3 126335803 1D GCCAGGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 9 8 172055 CASAVA_Build 3 126340098 4I ACTGGATGCC ----/ATTT ATAGTATAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 ATTT 0 1 172056 CASAVA_Build 3 126347205 1I ATATACTATG -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 6 7 172057 CASAVA_Build 3 126357160 20I AAAAAAGTAG --------------------/CCGGGTGTGGTAGCGGGCAC CTGTAGTCCC 1268 het 1208 hom 6 3 3 0 CCGGGTGTGGTAGCGGGCAC 0 1 172058 CASAVA_Build 3 126362391 4D GCACAGGGCA CAGC/---- CAGAGCACTG 3070 het 3070 hom 32 17 14 3 CAGC 1 0 172059 CASAVA_Build 3 126363215 1D TACTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2198 hom 50 16 16 19 A 17 16 172060 CASAVA_Build 3 126367866 2D ATCTCGTCTC TT/-- TTCCACCCTA 3009 het 1784 hom 23 8 9 8 T 4 2 172061 CASAVA_Build 3 126371548 1I CAATTCAAAG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 8 172062 CASAVA_Build 3 126373809 1I ACTCCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 26 1 21 4 A 14 15 172063 CASAVA_Build 3 126381564 1D TTCCAAACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 321 hom 40 1 31 8 T 10 9 172064 CASAVA_Build 3 126384208 1D GCCTGGTTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 6 5 172065 CASAVA_Build 3 126398833 1I AATTAACCGA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 7 8 172066 CASAVA_Build 3 126404185 6I TTTTTTTTTT ------/AAAAAA AAATCTGTAT 1028 hom 13 het 22 0 5 17 A 3 9 172067 CASAVA_Build 3 126412553 4D CTCACTGTGA CTGT/---- CTGTGGAAGA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 CTGT 2 1 172068 CASAVA_Build 3 126428265 1D ATATTTAAAG A/- AACAAAAAAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 3 2 172069 CASAVA_Build 3 126433862 1D TTATTTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 28 0 13 15 T 15 14 172070 CASAVA_Build 3 126437632 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 9 10 172071 CASAVA_Build 3 126448054 3I AAAATGGAAA ---/TAT TAATAGAATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TAT 0 1 172072 CASAVA_Build 3 126452398 6D GGAACAAATT GTCTGC/------ GTCTGCTTTC 3070 hom 87 het 36 0 30 9 GTCTGC 2 1 172073 CASAVA_Build 3 126453877 23D GTTTTCTAAT AGAAGTTTCATTATTAAAAAAAA/----------------------- AGAAGTTTCA 3070 het 3070 hom 32 16 16 7 AGAAGTTTCATTATTAAAAAAAA 1 0 172074 CASAVA_Build 3 126459649 1I GGTAACTGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 8 9 172075 CASAVA_Build 3 126465349 1I AATGAGGCGA -/C TCTTTCTGGG 3070 hom 63 het 24 0 20 4 C 0 1 172076 CASAVA_Build 3 126468610 1D ACCAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1529 het 1529 ref 26 14 5 7 A 15 14 172077 CASAVA_Build 3 126469116 3D CATACCTCAC AAT/--- AATAAGAGCC 3070 het 3070 ref 41 18 16 9 AAT 2 1 172078 CASAVA_Build 3 126474168 4D TCAATTTATA TATT/---- TAATTACACC 3070 hom 69 het 25 0 24 4 TATT 1 0 172079 CASAVA_Build 3 126475034 2I GAAGAGAATC --/TT TTTTTTTTTT 2846 hom 36 het 14 0 13 1 T 14 16 172080 CASAVA_Build 3 126480789 3I GATCTAGTTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 11 14 172081 CASAVA_Build 3 126481283 1I TTGTTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1337 hom 39 5 27 7 A 12 13 172082 CASAVA_Build 3 126482214 1D AACCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 23 1 15 7 A 15 14 172083 CASAVA_Build 3 126497570 1D TCAATATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 38 1 30 8 A 11 10 172084 CASAVA_Build 3 126498672 1D TTAAAAAAAA T/- ATTATTATCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 0 172085 CASAVA_Build 3 126502330 3D ATGCAGCATA CAT/--- CACTGTGAAT 3070 hom 114 het 39 0 39 3 CAT 1 0 172086 CASAVA_Build 3 126502494 1I AGCCAAATAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 7 8 172087 CASAVA_Build 3 126508589 1I TAGCTATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2475 hom 37 8 19 10 A 13 14 172088 CASAVA_Build 3 126511130 1D AACTACAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 10 9 172089 CASAVA_Build 3 126520037 1I TGATTTGGAA -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 3 4 172090 CASAVA_Build 3 126522938 2I13M2I TAAAAGCTTT --AAAAAAAACTCTA--/AAAAAAAAAACTCTATT TTTTTTCACC 3070 het 3070 ref 25 12 12 3 N/A 0 0 172091 CASAVA_Build 3 126524030 4I GACGTGACAA ----/AGTT AGAGCCAGAG 3070 hom 87 het 37 0 28 9 AGTT 0 1 172092 CASAVA_Build 3 126525719 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 8 9 172093 CASAVA_Build 3 126535070 1I CAACCAAGAA -/T GGGGGGAAGA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 0 1 172094 CASAVA_Build 3 126536622 2I CCCCTTTTAT --/TC TGTTATACAT 3070 hom 135 het 52 0 45 7 TC 0 1 172095 CASAVA_Build 3 126543532 3I CTGTTTCGGG ---/GGA GCGGGGGGGG 2894 hom 33 het 18 0 10 8 GGA 0 1 172096 CASAVA_Build 3 126543665 1I ACAGGGCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 12 13 172097 CASAVA_Build 3 126543872 13D TTCAAAAACT AAAGACAAAAAAA/------------- AAAGACAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 5 AAAGACAAAAAAA 2 1 172098 CASAVA_Build 3 126544839 1D TTTTAAAGAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 9 8 172099 CASAVA_Build 3 126547908 3I TCAAAAGTAA ---/AAT AATAAGTGCT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 AAT 1 2 172100 CASAVA_Build 3 126549627 1I CATTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1670 hom 28 7 10 11 A 10 11 172101 CASAVA_Build 3 126551696 4I TGGGTTTTGG ----/TTTT TTTTGTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 8 172102 CASAVA_Build 3 126553660 1D CACAATGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 15 14 A 13 12 172103 CASAVA_Build 3 126557261 1D GTCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 543 hom 36 2 25 9 A 15 14 172104 CASAVA_Build 3 126559475 1D CTTGCCTTGC T/- TGTTTTATAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 1 172105 CASAVA_Build 3 126564097 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1686 hom 29 5 14 10 T 10 11 172106 CASAVA_Build 3 126566185 3D CAGAATAATA GTT/--- ATTTTTGGTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GTT 1 0 172107 CASAVA_Build 3 126571446 7D GGAGGCGGAG TTTGAAC/------- CCAGCAGTGA 3070 hom 59 het 21 0 19 2 TTTGAAC 1 0 172108 CASAVA_Build 3 126572733 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAGTT 786 het 786 ref 17 11 3 3 A 7 8 172109 CASAVA_Build 3 126590432 6D AATTTAAAGT ATAATA/------ ATAATAATAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 ATA 6 4 172110 CASAVA_Build 3 126609282 2I GGCCTGGCAT --/CA GGTGGCTTAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 CA 0 1 172111 CASAVA_Build 3 126718543 5I GTTATCTCAA -----/TTTAT TTTCACAAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TTTAT 0 1 172112 CASAVA_Build 3 126872775 1I GAACCATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 40 0 27 14 T 11 12 172113 CASAVA_Build 3 126879970 2I GTCAAGGGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 T 10 12 172114 CASAVA_Build 3 126917400 1I CTTATCACCA -/C CCCCTCGCCC 3070 hom 43 het 18 0 12 6 C 4 5 172115 CASAVA_Build 3 126917677 1D GTGTACACCC T/- TTGTGTACAG 3070 het 330 hom 19 1 13 5 T 3 2 172116 CASAVA_Build 3 126930649 1D CTCAAAATGC A/- AAAAAATGAG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 7 6 172117 CASAVA_Build 3 126931667 3I CTCACTTTTC ---/TCT TCTTCTTCTT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TCT 3 4 172118 CASAVA_Build 3 126941134 3D AATATCAGTT ATC/--- ATTATTATCG 2248 het 2248 ref 14 7 7 0 ATC 1 0 172119 CASAVA_Build 3 126946588 1D GGTGTGTACA C/- CCCCCTGCGA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 6 5 172120 CASAVA_Build 3 126947153 3I TTGGGAGTAA ---/CAT CATTCTCTCC 3070 hom 63 het 26 0 20 6 CAT 1 2 172121 CASAVA_Build 3 126960580 1D GCGGGCTGAA G/- GGCTCCTCAA 1109 het 988 hom 17 5 5 7 G 3 2 172122 CASAVA_Build 3 126974328 1I TTTTCAAACA -/T TTTTACTGTA 915 het 915 ref 21 16 2 3 T 4 5 172123 CASAVA_Build 3 126985685 3I GTAAGATCTC ---/AAA AAAATCATTT 266 het 266 ref 47 38 1 8 A 4 7 172124 CASAVA_Build 3 126987296 4I AACTTCAAGT ----/TGGG TGGGCTCTTT 2319 het 2319 ref 30 19 5 6 TGGG 1 2 172125 CASAVA_Build 3 126993316 1I TGTATTTGCA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 T 6 7 172126 CASAVA_Build 3 127001357 2I CAGCACAGAC --/TT TTACGGGTGT 3070 hom 62 het 31 0 15 16 T 2 4 172127 CASAVA_Build 3 127006330 3D TTTGCTGTGC AGG/--- AGCTCTTTCA 3070 het 3070 ref 18 9 8 2 AGG 1 0 172128 CASAVA_Build 3 127022074 3D TGCCAGCTTG GTT/--- GTTGTTACCT 2889 het 2889 ref 29 18 6 6 GTT 3 2 172129 CASAVA_Build 3 127022647 5I AGCCTGCATG -----/ACAGA ACAAGATTCC 3070 hom 28 het 18 0 9 10 ACAGA 0 1 172130 CASAVA_Build 3 127030813 1I TGGCTTTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1256 hom 29 5 15 9 T 9 10 172131 CASAVA_Build 3 127035629 1D GAAGATCTCA G/- GCTGGCTCTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 2 1 172132 CASAVA_Build 3 127039085 4D AAGTTCCAAG AAGA/---- AAGACTCACT 3070 hom 42 het 16 0 14 3 AAGA 2 1 172133 CASAVA_Build 3 127039349 14D CTTCCTACTC CTTTCTCCTCACCT/-------------- CTTTCACAAC 3070 het 2963 hom 24 11 16 3 CTTTCTCCTCACCT 1 0 172134 CASAVA_Build 3 127039827 5D TCAATAGTAT CATGG/----- CATGGCATGT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 CATGG 2 1 172135 CASAVA_Build 3 127048073 3I TGATAATTGC ---/ACA ACATGATTAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 ACA 1 2 172136 CASAVA_Build 3 127062529 7D ACTTTGTCTT AGTGGGA/------- GTTGTCCGGG 3070 het 3070 ref 38 22 16 1 AGTGGGA 1 0 172137 CASAVA_Build 3 127072822 4I TCCAAATGGA ----/CTCT CTCTCTGCAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 CT 3 5 172138 CASAVA_Build 3 127074657 5D TCTCCTTTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 29 het 29 ref 23 11 2 13 TTTTG 1 0 172139 CASAVA_Build 3 127075133 2D GAGGGAGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 1029 hom 23 5 10 11 GA 10 9 172140 CASAVA_Build 3 127080113 1I AATAATGACA -/T TCCTCACGGG 2147 het 2147 ref 47 37 5 5 T 1 2 172141 CASAVA_Build 3 127081261 1I TGTCTCAAAC -/A AAAAAAAAAA 2220 het 2220 ref 27 18 6 3 A 10 11 172142 CASAVA_Build 3 127102557 4I ATATCTATAC ----/ATGT ATATGTGTGT 3070 het 3070 ref 37 23 14 0 ATGT 0 1 172143 CASAVA_Build 3 127106910 4D CTACCCGTGT GATG/---- GATGGAACAT 3070 het 3070 hom 22 10 10 4 GATG 2 1 172144 CASAVA_Build 3 127107449 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 1461 hom 20 3 12 5 T 7 8 172145 CASAVA_Build 3 127108785 4I CTGTTTGCAA ----/TTTT CTTGCTTCAT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 0 4 172146 CASAVA_Build 3 127116870 4D CCTAGTTTTT CTCA/---- CTGTTACACC 2476 het 2476 ref 19 10 6 3 CTCA 1 0 172147 CASAVA_Build 3 127124863 2D AAGGAAAAAC AT/-- AGCATATTGA 3070 het 3070 ref 18 10 7 3 AT 1 0 172148 CASAVA_Build 3 127126284 1I AGTCTGGAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 7 8 172149 CASAVA_Build 3 127132095 3I GCTACCTGCA ---/GCT GAGCTGCCAG 1096 het 1096 ref 19 5 3 11 GCT 0 1 172150 CASAVA_Build 3 127132883 1D ATTTGGGATG C/- TTTTCTTTCA 2012 het 2012 ref 26 17 6 3 C 1 0 172151 CASAVA_Build 3 127133366 2I GAGGCAACAT --/CC CCCGAGGGGA 3070 hom 81 het 32 0 25 7 C 3 5 172152 CASAVA_Build 3 127134293 1I ATAGAATTTC -/T TTTTTTTTTT 2182 het 2182 ref 22 13 5 4 T 11 12 172153 CASAVA_Build 3 127147457 1D CCACAAAAAA T/- ATGTATAAAA 2541 het 2541 ref 23 14 7 3 T 1 0 172154 CASAVA_Build 3 127156665 1D CAATAGTAAG A/- AAAAGTCTCC 2874 het 2874 ref 23 10 6 7 A 5 4 172155 CASAVA_Build 3 127167201 3D TTTCTGAGGG ATA/--- ATAAGATGGC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ATA 2 1 172156 CASAVA_Build 3 127171053 11D CCTTGTTCAC AGGGCAAGGGG/----------- AGGGCAAGGG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AGGGCAAGGGG 2 1 172157 CASAVA_Build 3 127177522 3D TCGACAGTGT CTC/--- CTTACTGATC 3070 het 3070 hom 39 15 21 6 CTC 1 0 172158 CASAVA_Build 3 127179795 1I ACGGGAAGAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 A 7 8 172159 CASAVA_Build 3 127182667 3D CAATTAAAAT TAA/--- TAATTATTAT 3070 het 3070 hom 25 8 14 5 TAA 2 1 172160 CASAVA_Build 3 127190779 1D GGTCTTTTCC T/- TTTTTGCTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 6 5 172161 CASAVA_Build 3 127201219 5D GAAATAACTA AGATC/----- AGAGCAGAAT 3070 het 3070 hom 18 10 8 0 AGATC 1 0 172162 CASAVA_Build 3 127201285 1I CCAAGAGCTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 28 20 8 0 T 8 9 172163 CASAVA_Build 3 127204984 1D AGAGAATCTC T/- TGACTGCAAC 3070 hom 92 het 38 0 31 7 T 2 1 172164 CASAVA_Build 3 127206597 7D CTAGGATCTT GTAACAC/------- GGTGTTGGTC 3070 het 3070 ref 59 29 25 7 GTAACAC 1 0 172165 CASAVA_Build 3 127207959 4D GGTTTTTGCT AACA/---- AACAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 11 19 8 AACA 2 1 172166 CASAVA_Build 3 127213437 1I CAAAACAATG -/T TAACAGGAAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 1 2 172167 CASAVA_Build 3 127215096 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1524 hom 34 7 20 9 A 13 11 172168 CASAVA_Build 3 127222763 4D TTTTCCTGGG CTTT/---- CTGTGTCCTC 2852 het 2852 ref 25 16 7 2 CTTT 1 0 172169 CASAVA_Build 3 127223621 2I TTCAAGTGTA --/CT CTCTCTAATA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 CT 3 4 172170 CASAVA_Build 3 127229861 1D TGTCCCATGT C/- CCAGTCGCTC 2947 het 2947 ref 30 15 7 9 C 3 2 172171 CASAVA_Build 3 127231819 2D AATATATAAT TA/-- TATATATATT 2010 het 1309 hom 10 4 5 2 TA 5 4 172172 CASAVA_Build 3 127234827 35D ATTAGAGGCA AGAGAAGCCTGTTAGCACTGTGCAGTCCATGAGAC/----------------------------------- AGAGAAGGAG 3070 het 3070 ref 53 41 16 8 AGAGAAGCCTGTTAGCACTGTGCAGTCCATGAGAC 1 0 172173 CASAVA_Build 3 127235478 1I ATGACTGCAC -/A CACCTGCACA 3070 hom 123 het 51 0 42 9 A 0 1 172174 CASAVA_Build 3 127238193 2D CCGCTCACTG CC/-- CACCTGTATA 3070 het 3070 ref 39 23 16 0 C 3 1 172175 CASAVA_Build 3 127241544 2I AATGGCTCAT --/TG TAGGGCCAGG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 TG 0 1 172176 CASAVA_Build 3 127243397 1I CAGAAACCAG -/T TTAAGATCTG 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 2 3 172177 CASAVA_Build 3 127246890 1I TTGGTTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 195 hom 23 1 12 10 A 13 14 172178 CASAVA_Build 3 127247346 1I ACACTAGAAG -/A AAAAACTACA 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 A 5 6 172179 CASAVA_Build 3 127247595 1I AAAAAAAAAA -/C ACACCCAACA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 C 0 1 172180 CASAVA_Build 3 127248294 2D CAGGAGTTCA AG/-- ACCAGCCTGG 2114 het 1320 hom 10 3 5 3 AG 1 0 172181 CASAVA_Build 3 127250455 1D AGACTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 A 12 11 172182 CASAVA_Build 3 127252248 1D AAGGAGGAAC A/- GGGGCAAACA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 1 0 172183 CASAVA_Build 3 127253070 1D CCACTGAGCA C/- CCTGTGGGGC 1627 het 1627 ref 19 10 4 5 C 3 2 172184 CASAVA_Build 3 127269353 1I CAATATATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 10 11 172185 CASAVA_Build 3 127281901 1I AACTCAATAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 8 9 172186 CASAVA_Build 3 127287356 1D GGGAGTGTCT G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 63 het 26 0 20 6 G 9 8 172187 CASAVA_Build 3 127289335 2I TTTAAAAAAA --/AG AAAAGATTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AG 0 1 172188 CASAVA_Build 3 127298325 1D GGCTGTGAGA C/- CCCTGATTTC 3070 het 577 hom 17 3 10 4 C 4 3 172189 CASAVA_Build 3 127301741 1D CCCCCTCCCT C/- CCCCTCTTGC 3070 hom 73 het 32 0 24 8 C 5 4 172190 CASAVA_Build 3 127306614 24D GTGTGCCGGG GGACCCCGCCTGCTATGTGCCGGT/------------------------ GGACCCCGCC 3070 hom 76 het 27 0 20 11 GGACCCCGCCTGCTATGTGCCGGT 1 0 172191 CASAVA_Build 3 127314263 2D CTCCAGCCAG GC/-- GCTGCTGTCC 2948 het 2247 hom 23 8 10 6 GC 2 1 172192 CASAVA_Build 3 127319208 1D ACAACAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 A 9 8 172193 CASAVA_Build 3 127321886 1D ATACATATCA C/- TAAGTGAAAG 3070 het 3070 ref 51 24 22 6 C 1 0 172194 CASAVA_Build 3 127324791 4D ACCAAAACTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 25 1 16 10 T 18 14 172195 CASAVA_Build 3 127326091 1I CAAGCTGGGA -/G GAGTAGCTGC 3070 hom 64 het 23 0 18 5 G 1 2 172196 CASAVA_Build 3 127328119 1I CTGCCCCACA -/C CCCCACACAC 3070 hom 69 het 27 0 22 5 C 4 5 172197 CASAVA_Build 3 127341477 1D ACATACTCAC A/- GGAGCTCCAG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 1 0 172198 CASAVA_Build 3 127344078 1D TTCACCTATG A/- AAATCAATCA 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 A 4 3 172199 CASAVA_Build 3 127389431 1D TGTCAAAAAG A/- AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 7 6 172200 CASAVA_Build 3 127398535 1D AACCCTAAAA T/- TCCTATCCCC 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 T 2 1 172201 CASAVA_Build 3 127404345 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 1777 het 658 hom 21 4 7 11 A 10 9 172202 CASAVA_Build 3 127405738 5D TGGGTAACTT ATAAG/----- AAAAGAAGTT 3070 het 3070 ref 37 17 18 4 ATAAG 1 0 172203 CASAVA_Build 3 127408874 4D GCAGTGGATT CTGA/---- CTGTCACCTG 3070 het 3070 ref 34 19 11 6 CTGA 1 0 172204 CASAVA_Build 3 127435030 1D GTTTCTTTGC A/- ATGCCTTGTA 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 A 2 1 172205 CASAVA_Build 3 127435725 1I AGGTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 A 11 12 172206 CASAVA_Build 3 127458674 4D GCTAGACTTC AACT/---- AACTCATGGA 3070 het 3070 ref 48 25 18 7 AACT 2 1 172207 CASAVA_Build 3 127459455 4D TGTGTGTGTG GAGA/---- GAGAGAGAGT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 GA 6 4 172208 CASAVA_Build 3 127476356 1I CTTCTTTTTT -/A CTTCCTCCCT 3070 het 3070 hom 29 13 10 6 A 0 1 172209 CASAVA_Build 3 127481101 1I TTTTAAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 9 10 172210 CASAVA_Build 3 127502793 1D GAGAGCAAAG C/- AGAACATCAC 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 C 1 0 172211 CASAVA_Build 3 127503481 1I CTTTTTTTTT -/C TCCTAGTTTC 3070 het 1316 hom 15 5 9 1 C 0 1 172212 CASAVA_Build 3 127503974 1D GCTGATTTTC T/- GTTTATTTCT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 1 0 172213 CASAVA_Build 3 127505254 1I TTTATATATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 9 10 172214 CASAVA_Build 3 127505488 1I AGAAGTTTGA -/T TTAGGTCTCT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 2 3 172215 CASAVA_Build 3 127505742 4D TCTGGTACTC AGTT/---- AAGTTATTGG 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 AGTT 1 0 172216 CASAVA_Build 3 127507153 6D GGGCTATCTG GTCACA/------ CTTACTGCAA 3070 het 3070 ref 41 24 13 7 GTCACA 1 0 172217 CASAVA_Build 3 127532069 1I CCTTTCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 10 11 172218 CASAVA_Build 3 127539111 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1306 hom 14 4 10 0 A 9 10 172219 CASAVA_Build 3 127542134 4D GTAGATGGTA CTTC/---- CTTCCTCTCT 3070 het 3070 ref 53 33 18 3 CTTC 2 1 172220 CASAVA_Build 3 127542439 1I GCAGCAGGAA -/C CCTGGGGGTG 2643 het 2643 ref 33 16 8 9 C 2 3 172221 CASAVA_Build 3 127552626 6I GAAGGGTGCT ------/GGGTAA CCCTGGTTGG 3070 het 3070 ref 57 33 15 9 GGGTAA 0 1 172222 CASAVA_Build 3 127559464 2I CAGATAAATC --/AG ACTTGCCTAG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 AG 0 1 172223 CASAVA_Build 3 127569354 2I ATTGACAGGG --/AT ATATTCTGGA 3070 het 3070 hom 61 23 33 5 AT 2 3 172224 CASAVA_Build 3 127574997 2I GCCTGGACCT --/CA CACAGTCCCT 3070 het 2920 hom 22 9 11 2 CA 2 3 172225 CASAVA_Build 3 127575231 1I CCTTGAGAGG -/T TGCTGTGTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 1 2 172226 CASAVA_Build 3 127577212 1D GTCTCAAAAA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 1591 hom 34 8 18 10 G 2 1 172227 CASAVA_Build 3 127587676 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 24 0 15 9 T 9 10 172228 CASAVA_Build 3 127589238 1D ATCATTGGGA T/- TTTTTTACAC 3070 hom 69 het 29 0 19 10 T 7 6 172229 CASAVA_Build 3 127591614 1D AGGGCACCGA G/- GGGGCCGCGG 3070 hom 52 het 25 0 15 10 G 5 4 172230 CASAVA_Build 3 127592421 4I TCTCTCTCTG ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 80 het 33 0 26 7 TC 7 9 172231 CASAVA_Build 3 127604917 1D GTATTTTATC T/- TTTTTTTTTT 1386 het 41 hom 23 1 7 15 T 19 18 172232 CASAVA_Build 3 127615493 1D GCTGGATCCA G/- GGGGAACCTT 3070 hom 71 het 26 0 24 2 G 5 4 172233 CASAVA_Build 3 127624022 1D GCCAGCGCAG C/- CCCCCCCACC 3070 hom 50 het 23 0 15 8 C 8 7 172234 CASAVA_Build 3 127629902 4D AGAGAGGGAT AAAG/---- AGAGAGAAAG 3070 hom 135 het 52 0 46 7 AAAG 1 0 172235 CASAVA_Build 3 127630641 16D GTCTCCATCC AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 16 0 18 3 A 27 11 172236 CASAVA_Build 3 127631156 1I CTACTGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 44 1 34 9 T 11 12 172237 CASAVA_Build 3 127631766 4I ATTATTTCTT ----/TAAG TAAGTTCTCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TAAG 1 2 172238 CASAVA_Build 3 127632297 1I AATAATTTCT -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 G 3 4 172239 CASAVA_Build 3 127633274 2I AGGTTTCCTT --/TC TGTTTTCCCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TC 0 1 172240 CASAVA_Build 3 127638588 1I TCTCCTCCCC -/G ATGGAGATGG 3070 hom 77 het 30 0 21 9 G 0 1 172241 CASAVA_Build 3 127640155 1I GTTCTTTGAT -/G GAAAAATGAA 3070 het 134 hom 41 1 36 4 G 1 2 172242 CASAVA_Build 3 127642949 1D AGGGCAGGGT G/- GCCTCAAACA 3070 hom 51 het 19 0 17 3 G 2 1 172243 CASAVA_Build 3 127668852 1I GGCCTTAGAC -/A AAATTATTTA 3070 hom 59 het 21 0 18 3 A 3 4 172244 CASAVA_Build 3 127693615 1I TGCTCCTGCT -/C CCCCCAGGCC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 C 5 6 172245 CASAVA_Build 3 127694170 4I GCCTGAGCGC ----/CTCT CTAACAAGGT 2999 het 2999 ref 30 17 8 5 CT 1 3 172246 CASAVA_Build 3 127699331 5D GGAGGGCAGA GGCTT/----- GGTGTGGGTG 2513 het 2513 ref 26 12 10 4 GGCTT 1 0 172247 CASAVA_Build 3 127702443 12D GCAAGCCACA CACAGCCTGGGC/------------ CCAGAGTCTG 3070 het 3070 ref 32 13 12 10 CACAGCCTGGGC 1 0 172248 CASAVA_Build 3 127703604 2D TGTATGTGTA TG/-- TGTGTGTGTT 3070 het 3070 ref 71 39 22 11 TG 5 4 172249 CASAVA_Build 3 127703836 2D TGTGTGTCTC TG/-- TGCATGTTTA 3070 hom 223 het 82 0 75 8 TG 2 1 172250 CASAVA_Build 3 127704289 4D ATGTGTATGT TGTG/---- TGTGTTTGTG 3070 hom 221 het 81 0 72 12 TG 4 2 172251 CASAVA_Build 3 127741409 1I ACCACACACA -/C CACACAAACA 3070 het 1024 hom 21 4 8 9 C 1 2 172252 CASAVA_Build 3 127750783 1I TCCTCATCCA -/C CGCCCCCCCC 3070 hom 97 het 39 0 32 7 C 1 2 172253 CASAVA_Build 3 127758548 4I CACACAGACC ----/CACA CACACAAACT 3070 hom 130 het 51 0 41 10 CA 3 5 172254 CASAVA_Build 3 127762262 2D CCTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 838 hom 38 7 11 21 T 18 16 172255 CASAVA_Build 3 127766905 1D AAATGCCCTG A/- AAGGTGGTGG 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 A 3 2 172256 CASAVA_Build 3 127767916 8D AAACTAAAAC CTTTCATG/-------- CTTCAAAGGA 3070 het 3070 ref 47 27 18 6 CTTTCATG 1 0 172257 CASAVA_Build 3 127784937 1D ACATATTAAG A/- AAACATTTTG 3070 hom 138 het 49 0 47 3 A 4 3 172258 CASAVA_Build 3 127800550 1I CTTTAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 10 11 172259 CASAVA_Build 3 127800665 1D TCTATTTTAG T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 T 7 6 172260 CASAVA_Build 3 127814795 1I GACTTTCCTA -/T TTTAGGCTTT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 3 4 172261 CASAVA_Build 3 127826690 1I CAGTATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 11 12 172262 CASAVA_Build 3 127832736 1D TACATGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 29 0 22 7 A 11 10 172263 CASAVA_Build 3 127847818 1I TGAGTTAAAC -/T AAAGTGTTAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 0 1 172264 CASAVA_Build 3 127851946 1I GAGGCCAGGC -/G GGTGGATCAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 2 3 172265 CASAVA_Build 3 127869688 1I ACAAAGCAGT -/C TGCGGGGACA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 172266 CASAVA_Build 3 127883086 1D CATAGCTAAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 T 9 8 172267 CASAVA_Build 3 127890549 1D AGTAATTTAA T/- TTTTTTTTCT 1476 het 1476 ref 13 5 6 2 T 9 8 172268 CASAVA_Build 3 127897768 2D ACTACTAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 120 het 48 0 40 9 TG 8 7 172269 CASAVA_Build 3 127917250 18D ACTCAGGGCC TTGCTATCAGTTTTCCCT/------------------ CATCCCTGTT 3070 het 3070 ref 50 40 17 3 TTGCTATCAGTTTTCCCT 1 0 172270 CASAVA_Build 3 127928085 1D TTCAACTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 11 10 172271 CASAVA_Build 3 127945088 1I CCAGGGATGA -/G CTAAAGAGGC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 G 0 1 172272 CASAVA_Build 3 128000148 1I CTCTGTGGCT -/G TGGAGCTGCT 3070 hom 79 het 29 0 23 6 G 0 1 172273 CASAVA_Build 3 128010506 1I TTGAGTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 10 11 172274 CASAVA_Build 3 128013849 1D TCCATGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 585 hom 31 2 11 18 T 15 14 172275 CASAVA_Build 3 128024259 2D GGAATATCAA TT/-- TTTATTAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 T 5 3 172276 CASAVA_Build 3 128091520 2I CGTTGACGGG --/CT CTTTGTCCAG 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 CT 1 2 172277 CASAVA_Build 3 128107074 8D GGGGTGTCTT GGATGTCA/-------- GGATGTCATG 3070 hom 66 het 25 0 21 8 GGATGTCA 2 1 172278 CASAVA_Build 3 128109032 1D CACTTATTTG T/- GGTTTTTACT 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 T 1 0 172279 CASAVA_Build 3 128109621 2I TGTTGGAAAA --/TC TCTGCTTCAG 3070 hom 133 het 51 0 44 7 TC 1 2 172280 CASAVA_Build 3 128114500 6I CTGGGTGGCT ------/CTGCCC CTGTGCACCT 3070 hom 63 het 25 0 18 7 CTGCCC 0 1 172281 CASAVA_Build 3 128117514 1I AGAGATGGGG -/T TTCACCATGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 2 3 172282 CASAVA_Build 3 128120708 1D TTCTGTCAGT A/- AGATGTAGTG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 2 1 172283 CASAVA_Build 3 128120839 7D CTACTATTTC TTTTCTT/------- TTTTCTTTTT 2904 het 2168 hom 25 8 12 6 TTTTCTT 2 1 172284 CASAVA_Build 3 128122620 1D TAAAGGGCCA C/- CCCAGGTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 7 C 4 3 172285 CASAVA_Build 3 128123044 1D CAACCTTCAG T/- CTGCTTCCCG 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 T 1 0 172286 CASAVA_Build 3 128158092 2I CTGGCTGGCA --/GG GGGAGTGCAC 3070 hom 90 het 38 0 26 12 G 3 5 172287 CASAVA_Build 3 128163273 3D TTTGGGGGTT GGG/--- GACGCATCCT 3070 hom 112 het 42 0 36 9 G 4 1 172288 CASAVA_Build 3 128164896 1I TCCCCAACTC -/A TATCAACGAT 3070 hom 126 het 48 0 40 8 A 0 1 172289 CASAVA_Build 3 128172580 1I ATTTCTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 10 11 172290 CASAVA_Build 3 128172625 1I AAAACATCTT -/A AAAAAAAAAA 2734 het 694 hom 18 3 8 7 A 13 14 172291 CASAVA_Build 3 128175421 1D AGCAAAGGTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 8 7 172292 CASAVA_Build 3 128183060 1D GTCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1786 het 1786 ref 39 27 4 8 A 11 10 172293 CASAVA_Build 3 128186192 2I CGTTTTGGGC --/AG AGAGGACAGC 3070 het 1981 hom 26 7 14 5 AG 2 3 172294 CASAVA_Build 3 128263023 1D GCATTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 48 0 29 19 T 13 12 172295 CASAVA_Build 3 128265166 1I AGAGACCAAG -/C CTCCCTATGT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 1 2 172296 CASAVA_Build 3 128265470 3I TATAATAGAT ---/ATC ATGTTGTTAT 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 ATC 0 1 172297 CASAVA_Build 3 128274684 1D GGACACAGGT A/- ACTGGGAGCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 1 172298 CASAVA_Build 3 128281640 1D ATATTTTTAA C/- CCAATTTATC 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 C 3 2 172299 CASAVA_Build 3 128281715 1I GTGTTCTCAC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 7 8 172300 CASAVA_Build 3 128283612 1I CCTGAGAGTT -/G GGGGGGGTCC 2391 het 2391 ref 36 13 8 15 G 7 8 172301 CASAVA_Build 3 128288808 1D TCTTGATAGC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 104 het 44 0 35 9 A 8 7 172302 CASAVA_Build 3 128304330 1D CACAGCCCGG C/- TGCCCCATCG 3070 hom 58 het 22 0 15 7 C 1 0 172303 CASAVA_Build 3 128308201 1I GTACCCTGCA -/C CCCTGCAACC 3070 hom 95 het 37 0 29 8 C 3 4 172304 CASAVA_Build 3 128334850 4I CAGGCAGGTC ----/CTTT CTTGTACTCG 3070 hom 113 het 41 0 35 6 CTTT 0 1 172305 CASAVA_Build 3 128353542 7D TGTAAAAGAT TAAAAAA/------- TAGTATACCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TAAAAAA 1 0 172306 CASAVA_Build 3 128355804 4D GTGTATGAGG GTGT/---- GTGTATGTGA 3070 hom 263 het 91 0 85 8 GT 4 2 172307 CASAVA_Build 3 128355893 2D TGTGTCTGTT TG/-- TGTGTGTCTT 3070 hom 258 het 94 0 85 11 TG 4 3 172308 CASAVA_Build 3 128356313 2I GTGTGTGTCA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 94 hom 100 1 74 25 GT 5 6 172309 CASAVA_Build 3 128356404 2I CGTGTGCATC --/TG TGTGTTTCTG 3070 het 8 hom 98 1 79 18 TG 2 3 172310 CASAVA_Build 3 128356577 2I33M4D TCTGTGTGTC --TGTGTCTGTGCCTGTGTCTGTGTATGTCTGTGTTGTG/TGTGTGTCTGTGCCTGTGTCTGTGTATGTCTGTGT---- TGTCTGTGTG 3070 hom 193 het 88 1 82 31 N/A 0 0 172311 CASAVA_Build 3 128356855 4I AGTGCGTGTG ----/AGTT TTTGTGTGTG 3070 hom 186 het 74 0 61 13 AGTT 0 1 172312 CASAVA_Build 3 128357033 4D18M4D TGAATGTGTG TGTCTGTGCATCTGAGTCTGTGTGTC/----TGTGCATCTGAGTCTGTG---- TGTGTGTGAG 3070 hom 85 het 65 1 58 8 N/A 0 0 172313 CASAVA_Build 3 128357125 4I50M2D AGTGTGTGTG ----TTTGTGTGTGTGTAAGTCTGTGGGTGTTAGAGTGAATGTGAATGTATGTCTG/AGTTTGTGTGTGTGTGTAAGTCTGTGGGTGTTAGAGTGAATGTGAATGTATGTC-- TGTGTCTATG 3070 hom 177 het 54 1 70 25 N/A 0 0 172314 CASAVA_Build 3 128364442 1I TGTAACACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 35 1 28 6 T 10 11 172315 CASAVA_Build 3 128375408 1D TGACAGTCAG C/- CCCAGTGGAC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 4 3 172316 CASAVA_Build 3 128399124 3I TCTCTTTACT ---/TTC TTGTTTTTCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TTC 0 1 172317 CASAVA_Build 3 128407258 1I ATAATCCCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 28 3 14 11 T 16 17 172318 CASAVA_Build 3 128434172 2D ACTACTGTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 31 0 20 11 T 15 13 172319 CASAVA_Build 3 128493153 1I TTTCACTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 28 0 22 6 T 9 10 172320 CASAVA_Build 3 128493636 1I TAACAGTGTC -/T TTGAAATAAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 3 172321 CASAVA_Build 3 128499896 1D GTTTCCCCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 5 hom 37 2 24 11 A 10 9 172322 CASAVA_Build 3 128502715 1I CAACTCATTT -/G GGGGGGGGTT 3070 hom 48 het 29 0 15 14 G 8 9 172323 CASAVA_Build 3 128510301 1D AATCCAGACT A/- AAGGAGGAAA 3070 het 3070 hom 28 8 15 5 A 3 2 172324 CASAVA_Build 3 128513538 11D AATGTCTCAT TATGTCACCCC/----------- AATCAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 26 13 3 TATGTCACCCC 1 0 172325 CASAVA_Build 3 128515103 1D TTAGCTCTGC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 2168 hom 29 7 17 5 T 8 7 172326 CASAVA_Build 3 128515503 2D TTTTAAGTGT CC/-- CCATTTGTTT 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 C 4 2 172327 CASAVA_Build 3 128515626 1I TAGTCAAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 8 9 172328 CASAVA_Build 3 128518887 11D AGGACAAGAC TCAAAAATATA/----------- TCATCTACCA 3070 het 3070 ref 41 25 19 3 TCAAAAATATA 1 0 172329 CASAVA_Build 3 128532323 1D GCTTTAAAAG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 A 8 7 172330 CASAVA_Build 3 128534291 1I ACATATAGCT -/A AGACTAACCT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 1 2 172331 CASAVA_Build 3 128540768 4D ACACACACAT AGAC/---- AGACATACAC 3070 het 3070 hom 92 40 41 17 AGAC 2 1 172332 CASAVA_Build 3 128548147 16D ACACACACAT ATGCACACACATGCAC/---------------- ATGCACACAC 3070 het 3070 hom 48 17 24 16 ATGCACACACATGCAC 2 1 172333 CASAVA_Build 3 128556468 1D CTGCCTCTGG C/- CCTGCACGTG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 C 3 2 172334 CASAVA_Build 3 128588417 1D TGACTGCCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 10 9 172335 CASAVA_Build 3 128589904 1D GAGTTGCAAA T/- AAAAAGGTCA 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 T 1 0 172336 CASAVA_Build 3 128591927 1D TGTATCACTA T/- TGACAGTCCC 3070 hom 78 het 27 0 26 1 T 2 1 172337 CASAVA_Build 3 128608244 1D CAGCCAACCC A/- GAGGGGAGCT 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 A 1 0 172338 CASAVA_Build 3 128616937 1D TGAACAACGC A/- AGGATGTCCA 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 A 2 1 172339 CASAVA_Build 3 128620096 1I GACATTAACA -/C CCCCCCTTTA 3070 hom 93 het 40 0 28 12 C 6 7 172340 CASAVA_Build 3 128622330 1D CTTGAGGTGC T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 7 6 172341 CASAVA_Build 3 128629450 1D CACAACTACA G/- GGGTTTGTCT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 G 4 3 172342 CASAVA_Build 3 128634455 1I ACCACGTATT -/A AAGCACAAGT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 2 3 172343 CASAVA_Build 3 128640721 7D GCCAGGGGTG TGTGCCA/------- GAGCTGGCAG 3070 het 3070 ref 35 18 11 9 TGTGCCA 1 0 172344 CASAVA_Build 3 128641479 2I TCGTTTCCAG --/AA AGCAGAGCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 1 3 172345 CASAVA_Build 3 128642940 1D TTTTGTGGGG A/- TCATTCTGTG 3070 het 3070 hom 56 27 24 5 A 1 0 172346 CASAVA_Build 3 128713067 1I TCTATATATC -/A AAAGACCCCA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 3 4 172347 CASAVA_Build 3 128716084 1I TTTTATATTT -/A AAAAACACAG 2140 het 2140 ref 21 14 5 2 A 5 6 172348 CASAVA_Build 3 128727320 1I GTATGTCCTG -/A TTATTGTTCT 3070 het 3070 hom 57 27 26 4 A 0 1 172349 CASAVA_Build 3 128733067 6D TTCTCCTCTT CCCCCC/------ CCCCCCCCCC 3070 het 308 hom 33 4 20 9 C 18 12 172350 CASAVA_Build 3 128739922 1I TGAATTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 A 10 11 172351 CASAVA_Build 3 128741749 1D CACAAATGTA T/- TTTTTTAGAT 2867 het 2867 ref 25 17 6 4 T 7 6 172352 CASAVA_Build 3 128815874 3D TCCAATATTC TGT/--- TGTTGTTCAC 3070 het 3070 hom 38 14 21 5 TGT 3 2 172353 CASAVA_Build 3 128819752 5D GTTCCCTCGG TCTCT/----- TCTCATGTCC 3070 het 3070 ref 50 24 19 10 TCTCT 1 0 172354 CASAVA_Build 3 128826438 1D GAAAATTAGA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 8 7 172355 CASAVA_Build 3 128842235 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 9 10 172356 CASAVA_Build 3 128843554 1I GGCCGGGCAC -/G GTGGCTCACG 3070 hom 46 het 20 0 14 6 G 1 2 172357 CASAVA_Build 3 128860363 1I GCTCTGAAAC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 7 8 172358 CASAVA_Build 3 128876552 11D TCGGCTCTCC CTGCTTGCTTG/----------- CTGCTTGCTT 3070 het 3070 ref 43 17 16 19 CTGCTTGCTTG 2 1 172359 CASAVA_Build 3 128879851 6I GTGTGTGTGT ------/GCGTGC GCGTGCGCGT 3070 hom 48 het 32 0 11 21 GCGTGC 2 3 172360 CASAVA_Build 3 128885831 1D CTCCCAGGTG A/- AAAAAAAATT 1410 het 1410 ref 25 16 4 5 A 9 8 172361 CASAVA_Build 3 128886222 1D GCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 11 12 A 11 10 172362 CASAVA_Build 3 128887599 16D CTCACTCATT CCCTCATTCATTCATC/---------------- CCCTCATTCA 3070 het 3070 hom 60 19 25 22 CCCTCATTCATTCATC 2 1 172363 CASAVA_Build 3 128887714 4D CATTCATTCT CTCA/---- CTCATTCCCT 3070 het 3070 hom 59 28 25 11 CTCA 2 1 172364 CASAVA_Build 3 128914931 5I TGTAACGGGA -----/TGGTG TGGTGTGCAA 3070 hom 80 het 31 0 25 6 TGGTG 1 2 172365 CASAVA_Build 3 128915626 1I GCTTCGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1229 hom 26 6 12 8 A 13 14 172366 CASAVA_Build 3 128917930 1D CCCTAAGGAG A/- GGCCCAATAA 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 A 1 0 172367 CASAVA_Build 3 128920384 1I AAATTACATT -/A AAAAAATAGA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 6 7 172368 CASAVA_Build 3 128923396 4D CAGCCTGCTT TGTC/---- TGTAGGTAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 8 TGTC 1 0 172369 CASAVA_Build 3 128927826 4D GAAGGAAGGA AGGG/---- AGGGAGGGAG 2176 hom 14 het 14 0 7 7 AGGG 4 3 172370 CASAVA_Build 3 128937722 1D GAAATTATTG T/- TAAGTATCAC 3070 hom 118 het 49 0 40 10 T 2 1 172371 CASAVA_Build 3 128955892 1I AATAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2561 hom 25 8 12 5 A 10 11 172372 CASAVA_Build 3 128968604 1D AGACTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 11 10 172373 CASAVA_Build 3 128968704 8I ACCATCACTC --------/TCACCAAT ATTACCATCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TCACCAAT 0 1 172374 CASAVA_Build 3 128976504 2I TTTGTTCAAC --/AA AGAGGCAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 3 172375 CASAVA_Build 3 129034090 2D AACTGAGAAA TG/-- TGCAATTGAC 3070 het 3070 hom 49 22 21 7 TG 2 1 172376 CASAVA_Build 3 129056240 1D ACAGGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 1409 het 1409 ref 26 18 3 5 T 11 10 172377 CASAVA_Build 3 129056927 1D TAGCTTCTAC T/- GGCCACCAGC 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 1 0 172378 CASAVA_Build 3 129211085 1D TGCCGGGATC T/- TTTTTTTTTT 916 het 695 hom 31 4 5 22 T 19 18 172379 CASAVA_Build 3 129224576 1D GGGAGGCAAA G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 47 het 18 0 13 5 G 9 8 172380 CASAVA_Build 3 129228770 1I TTCTAGAATA -/T TAAGATTGAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 2 172381 CASAVA_Build 3 129250904 4I CTCATTTGGG ----/TACA TACATCTGGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TACA 1 2 172382 CASAVA_Build 3 129256163 4D AAGTGTTTTT AAAG/---- AACACAGTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 6 AAAG 1 0 172383 CASAVA_Build 3 129259111 1D TTAACTGACT G/- GGGGGCGGTG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 G 6 5 172384 CASAVA_Build 3 129259229 1D34M1D CATCTCTACT AAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGACAAG/-AAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGACAA- GTGCCTTAAT 3070 hom 69 het 19 0 24 1 N/A 0 0 172385 CASAVA_Build 3 129259375 1I CATGGGGGAC -/A AGAGCAAGAC 3070 hom 69 het 28 0 25 3 A 1 2 172386 CASAVA_Build 3 129312753 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1994 het 559 hom 25 5 7 13 A 17 16 172387 CASAVA_Build 3 129316384 2I CCAGTTACTC --/CT CTTTCTCTTC 3070 hom 95 het 37 0 30 7 CT 1 2 172388 CASAVA_Build 3 129320139 1D AAGTATCTGG C/- CAGTCCCCTC 3070 hom 102 het 38 0 33 6 C 2 1 172389 CASAVA_Build 3 129335084 4D AGAGAGACTC TGTT/---- TGTTCCTGGG 3070 hom 129 het 44 0 42 3 TGTT 2 1 172390 CASAVA_Build 3 129425420 1D AAAACGGGAT A/- TTTTGTATTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 1 0 172391 CASAVA_Build 3 129425516 1D TGTTCCATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 89 hom 34 1 31 2 A 10 9 172392 CASAVA_Build 3 129431649 1D TTCATTCATT C/- TTTCTCTCCC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 1 0 172393 CASAVA_Build 3 129436773 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 11 3 T 10 11 172394 CASAVA_Build 3 129437015 1I TCTTCCTTTT -/A CCCCCTGCTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 0 1 172395 CASAVA_Build 3 129437399 2I GCCATTTGCC --/AG GTTGTGCTGC 3070 hom 117 het 41 0 39 2 AG 0 1 172396 CASAVA_Build 3 129438116 1D TTAATTTGCA T/- TTTTTTGTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 7 6 172397 CASAVA_Build 3 129459603 3I TAAATGAGCA ---/AAG AATAGCTTAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AAG 0 1 172398 CASAVA_Build 3 129462512 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACATTCA 3070 het 480 hom 39 2 31 6 C 0 1 172399 CASAVA_Build 3 129466687 4I CTTTCTGGAC ----/ACTG GCTGTACGTC 3070 hom 135 het 51 0 44 7 ACTG 0 1 172400 CASAVA_Build 3 129498192 1I GACCTTCCTG -/C CCCTCCACGC 3070 hom 135 het 49 0 44 5 C 3 4 172401 CASAVA_Build 3 129499304 2I TCAACATGTT --/AA GTTATAAAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 0 2 172402 CASAVA_Build 3 129502452 1I TGCTTGGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 368 hom 47 1 36 10 T 9 10 172403 CASAVA_Build 3 129617000 6I GGCAACCCGC ------/TTCCTA CTCAGATGCA 3070 het 2674 hom 44 12 17 15 TTCCTA 0 1 172404 CASAVA_Build 3 129634249 1D CAAATCAAGC A/- GCCCGCCCGG 1667 het 1649 hom 13 7 5 1 A 1 0 172405 CASAVA_Build 3 129647674 3D GTGGTGGTGA TGG/--- TGGTGGTGGT 3070 het 3070 ref 67 21 21 27 TGG 4 3 172406 CASAVA_Build 3 129651434 1I CAGCTTCCAC -/A AAGGTCAACA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 2 3 172407 CASAVA_Build 3 129653540 1D GGGGCCATCC T/- TGACTCCTGT 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 T 2 1 172408 CASAVA_Build 3 129655838 1D GGGGCCAAGC G/- GGTCCTGCAC 1804 het 1804 ref 22 10 6 6 G 3 2 172409 CASAVA_Build 3 129666289 20I TTCCTGCCTG --------------------/CCTTCTTTCCTTCCTTCCTT CCTTCTTTCC 3070 het 3070 hom 39 19 15 5 CCTTCTTTCCTTCCTTCCTT 0 1 172410 CASAVA_Build 3 129666334 5D CCCTCCTTCT TTCCC/----- TTCCCTTCCC 3070 het 3070 ref 39 10 8 22 TTCCC 3 2 172411 CASAVA_Build 3 129672426 1I AGGCTCTGGG -/A GAAGGAGCAG 3070 hom 104 het 38 0 34 4 A 0 1 172412 CASAVA_Build 3 129696219 3I GTGTGTATTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 102 het 46 0 35 11 TTG 5 6 172413 CASAVA_Build 3 129696234 2D GTTGTTGTTG TT/-- TTGTTTTGTT 1522 het 1514 hom 45 6 11 28 T 4 2 172414 CASAVA_Build 3 129704922 1I GTCCAGGCCT -/G GGGCCCTGCC 1517 hom 35 het 19 0 9 10 G 3 4 172415 CASAVA_Build 3 129714413 4D ATATTATGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 24 0 14 12 TA 11 9 172416 CASAVA_Build 3 129770096 1D TGTTTTGGGC T/- TTTTTTTTTT 1758 het 1758 ref 46 32 5 9 T 12 11 172417 CASAVA_Build 3 129789628 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1897 het 1130 hom 22 4 7 11 A 13 14 172418 CASAVA_Build 3 129797042 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1850 het 1080 hom 11 5 5 1 A 13 12 172419 CASAVA_Build 3 129800870 1I GAAAGTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 10 12 A 12 13 172420 CASAVA_Build 3 129804564 1D AGGAAGCAGA G/- GGGGGACCCC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 6 5 172421 CASAVA_Build 3 129808670 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 9 8 172422 CASAVA_Build 3 129813203 2I AGACACACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 68 25 26 17 AC 6 7 172423 CASAVA_Build 3 129825084 1I AAAAAAAACA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 37 10 25 2 T 7 8 172424 CASAVA_Build 3 129831426 1I TAATTGAAAG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 7 8 172425 CASAVA_Build 3 129842632 1D GGAGCAGGTC T/- TTTTTTTTTT 863 het 863 ref 42 27 3 12 T 12 11 172426 CASAVA_Build 3 129856506 1D GCTTGACCCC A/- AGGAGTTTGA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 2 1 172427 CASAVA_Build 3 129859082 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2786 hom 18 het 9 0 7 2 A 8 9 172428 CASAVA_Build 3 129877747 1D TTTGTAACCA T/- TTTTTTTTTA 2566 het 2566 ref 18 8 6 4 T 10 9 172429 CASAVA_Build 3 129879651 2D GGACACCAAA TC/-- TCTCTTTCCT 3070 het 3070 ref 56 27 26 4 TC 3 2 172430 CASAVA_Build 3 129879796 1D GGGATTAATA C/- CTTCTAAGAA 3070 het 3070 ref 64 30 26 8 C 2 1 172431 CASAVA_Build 3 129881590 2I AGAGACAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 1636 hom 21 5 11 5 AG 6 7 172432 CASAVA_Build 3 129884080 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2334 hom 15 het 7 0 6 1 T 13 14 172433 CASAVA_Build 3 129886470 1D CTCAAAAAAA T/- AATAATAAAT 1419 het 1419 ref 11 6 3 2 T 1 0 172434 CASAVA_Build 3 129891013 1D GTCTCTACTG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 A 8 7 172435 CASAVA_Build 3 129899131 3D ATCGCTTTTT TTC/--- TTCTTCTTCT 1793 het 1793 ref 14 6 5 5 TTC 4 3 172436 CASAVA_Build 3 129902517 1D AGGGTTTGGT A/- AAAAGTTTGC 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 A 5 4 172437 CASAVA_Build 3 129912084 1I ATACAATTAC -/T TTTTTTTTTT 1821 het 1821 ref 29 10 8 11 T 15 16 172438 CASAVA_Build 3 129913404 1I CCAGTGTAAC -/A AGGTAATGGG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 1 2 172439 CASAVA_Build 3 129916017 1D TGTTGGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 T 14 13 172440 CASAVA_Build 3 129938580 1I TATTTATTTA -/T TTATTTTTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 3 172441 CASAVA_Build 3 129981128 1I GGGGTGGGGT -/G GGGGGGGTGG 1739 het 1739 ref 26 11 7 8 G 7 8 172442 CASAVA_Build 3 130002984 41I AGTGATGGTT -----------------------------------------/TTCTCTCCAAACTCATGAGTTGTATGCATCAGATCATTAGA TGTGTGCAGC 3070 hom 69 het 24 0 24 3 TTCTCTCCAAACTCATGAGTTGTATGCATCAGATCATTAGA 0 1 172443 CASAVA_Build 3 130053926 1I ATTTTCCTTG -/A AGTATGTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 172444 CASAVA_Build 3 130082082 1D CCTGCCCGGC T/- TTTTTTTTTT 1090 het 214 hom 10 2 3 5 T 13 12 172445 CASAVA_Build 3 130090433 1D GTTTGTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2606 hom 31 12 13 6 T 13 12 172446 CASAVA_Build 3 130097254 3I TGGAAGTGGT ---/CTC CTCTCCTGAG 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 CTC 1 2 172447 CASAVA_Build 3 130139606 1I CAAACAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 9 10 172448 CASAVA_Build 3 130153832 1I CTAGCTAATT -/A AAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 4 5 172449 CASAVA_Build 3 130159366 1D GCCATAAACT G/- GGGGGGGGCT 3070 het 3070 hom 40 10 24 6 G 9 8 172450 CASAVA_Build 3 130169236 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1851 het 379 hom 12 1 8 3 A 14 15 172451 CASAVA_Build 3 130170131 1I CCACTGTGCT -/A AGCAGTTTAC 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 A 1 2 172452 CASAVA_Build 3 130227282 9D AGTAGCACAC CCCAGGGCT/--------- CCCTGAGGAA 3070 het 3070 ref 58 28 24 8 CCCAGGGCT 1 0 172453 CASAVA_Build 3 130275097 1D AATTTTTGGA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 83 het 30 0 28 2 T 7 6 172454 CASAVA_Build 3 130307108 1I AAGGTCAAGA -/G TTCGAGACCA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 G 0 1 172455 CASAVA_Build 3 130314290 1D TTTTTGTTGC T/- TTTTTTTTTT 1366 het 1366 ref 39 24 4 13 T 12 11 172456 CASAVA_Build 3 130341159 1D GGATTCACAC A/- AAAGTAGCTC 3070 hom 80 het 38 0 31 7 A 4 3 172457 CASAVA_Build 3 130341893 4I TGTCACAAAC ----/TTAG TTACTTACGT 3070 hom 150 het 57 0 50 7 TTAG 0 1 172458 CASAVA_Build 3 130347611 1I CTAGCGTAAG -/A AAAAAAAAAA 1389 het 1389 ref 45 37 4 4 A 10 11 172459 CASAVA_Build 3 130366703 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1032 hom 31 5 22 4 A 13 12 172460 CASAVA_Build 3 130366995 1I TCAAGTGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 10 172461 CASAVA_Build 3 130386294 1I TATTCGAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 10 172462 CASAVA_Build 3 130386377 2D TTTTCTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 18 10 T 14 12 172463 CASAVA_Build 3 130390979 13D TCTTTTTCTA TTTCTTTTTTTTT/------------- TTTCTTTTTT 3070 hom 24 het 12 0 9 4 TTTCTTTTTTTTT 2 1 172464 CASAVA_Build 3 130395552 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1435 het 51 hom 8 1 6 1 A 17 18 172465 CASAVA_Build 3 130395718 1I ATATTCAGCA -/T CCAAGTTGTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 0 1 172466 CASAVA_Build 3 130400550 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCCCTAA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 CT 1 2 172467 CASAVA_Build 3 130402442 1D TTCTCTCTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 470 hom 27 1 13 13 T 13 12 172468 CASAVA_Build 3 130409535 12D TAATATTCTA CTCTCTCTCTCT/------------ CTCTATATAT 947 hom 10 het 5 0 4 1 CT 8 2 172469 CASAVA_Build 3 130412704 1D CGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 10 9 172470 CASAVA_Build 3 130424289 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 12 4 T 10 11 172471 CASAVA_Build 3 130424754 1I GCTTGAGACC -/A ACCTGGGCAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 1 2 172472 CASAVA_Build 3 130432665 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 462 hom 17 1 14 2 T 10 9 172473 CASAVA_Build 3 130433543 1D CATTTCAATC A/- ATGATGTTGG 3070 hom 175 het 62 0 59 3 A 2 1 172474 CASAVA_Build 3 130435482 2D ATTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 12 6 T 16 14 172475 CASAVA_Build 3 130436673 3I TTTTTTGTCA ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 40 12 14 14 TTG 5 6 172476 CASAVA_Build 3 130444117 4D CTGTCTCTAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 46 26 19 2 AC 9 7 172477 CASAVA_Build 3 130444648 5D GCTCAGCAAG AAGAA/----- AATTGGTAAG 3070 het 3070 ref 42 19 15 9 AAGAA 1 0 172478 CASAVA_Build 3 130449042 6I CAAGTGCTGG ------/GATTAT AGGCGTGAGC 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 GATTAT 0 1 172479 CASAVA_Build 3 130451507 3D GCGACAAACA CCC/--- CCCCCCCCAG 3070 het 1376 hom 23 8 10 5 C 11 8 172480 CASAVA_Build 3 130463162 1D AACCCTCTCC T/- ACAGTGCCAG 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 1 0 172481 CASAVA_Build 3 130467508 1D TTGTTTTTTG T/- TTTGTTTTTT 3070 het 2907 hom 31 12 15 4 T 4 3 172482 CASAVA_Build 3 130475720 1D AGAGATGAAG A/- AAAAAAAAAA 2037 het 2037 ref 36 27 5 5 A 12 11 172483 CASAVA_Build 3 130490091 1D AGCTGGGTAT G/- GGGGGGCGTG 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 G 7 6 172484 CASAVA_Build 3 130491816 4I TATGTATTTA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 315 hom 16 3 10 3 TTTG 2 3 172485 CASAVA_Build 3 130502969 2I TGTGCCACAC --/TT TGCATTGGCC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 1 3 172486 CASAVA_Build 3 130522619 4I TATATGCACA ----/CACT CACACTCATA 3070 het 3070 ref 86 43 31 12 CACT 0 1 172487 CASAVA_Build 3 130526256 4I AAAACAAACA ----/AACC AACCTCCAAC 3070 het 2234 hom 33 10 11 12 AACC 1 2 172488 CASAVA_Build 3 130533581 1I GTCACACAGT -/A ATTCATCATC 3070 het 3070 ref 50 30 15 5 A 1 2 172489 CASAVA_Build 3 130535283 1I AGCGTTTATT -/C AAGAAAACCT 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 C 0 1 172490 CASAVA_Build 3 130535656 1I CTCATGGGGT -/G GGGGTTCCCT 2047 het 2047 ref 26 9 7 10 G 4 5 172491 CASAVA_Build 3 130544860 2I CATCCCCCCC --/CA CCACCACCTT 3070 het 3070 hom 33 16 12 5 CA 0 1 172492 CASAVA_Build 3 130545120 1I CTCTCGCCCA -/C CTGGGGGCCA 2445 het 2445 ref 21 11 7 3 C 1 2 172493 CASAVA_Build 3 130547220 1I CAGTGGCCAG -/A AGATCTCATT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 1 2 172494 CASAVA_Build 3 130552007 4D CATAGTAGAT ACTC/---- AATAAATATT 3070 het 3070 hom 38 14 17 9 ACTC 1 0 172495 CASAVA_Build 3 130557818 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 1741 het 1741 ref 15 7 4 4 T 9 8 172496 CASAVA_Build 3 130572436 4I GTATGGTGTG ----/TGTA TGTGTGTTTG 3070 het 3070 hom 73 29 28 16 TGTA 0 1 172497 CASAVA_Build 3 130589207 1I AGTGTATCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 9 10 172498 CASAVA_Build 3 130590175 1I CCTCTTCTTG -/A GTCTCAGCGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 0 1 172499 CASAVA_Build 3 130590849 1I TTTCCTACCA -/G GGGAAGCTCC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 G 3 4 172500 CASAVA_Build 3 130596893 1I AGAGTAGAAA -/C CGTCTCTAAA 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 C 1 2 172501 CASAVA_Build 3 130607069 1D CAACAGCCAA C/- TCAGGCTGGG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 C 1 0 172502 CASAVA_Build 3 130608400 1D TTTTGGTGGG T/- TTTTTTTTTT 1949 het 1911 hom 29 11 7 11 T 14 13 172503 CASAVA_Build 3 130628912 1D GTACGTTCTC T/- TATCTCTGTG 3070 het 3070 ref 39 21 10 8 T 2 1 172504 CASAVA_Build 3 130631063 2I GCTTGCAAAC --/TG AGATTGTTGC 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 TG 0 1 172505 CASAVA_Build 3 130631656 2I TATAAAGTGG --/AT GTTTGCCTTG 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 AT 0 1 172506 CASAVA_Build 3 130631827 4D TGAACAACTG ATTT/---- ATTTTTCATT 3070 het 3070 ref 27 18 9 2 ATTT 2 1 172507 CASAVA_Build 3 130643776 1I TAAGAGTTAA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 T 6 7 172508 CASAVA_Build 3 130644115 1I AACTAAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 C 0 1 172509 CASAVA_Build 3 130646062 1D GTTTACACTC T/- TTTTTTTTTT 1343 het 1343 ref 33 20 4 9 T 12 11 172510 CASAVA_Build 3 130647924 9I TGCTTGGCTA ---------/ATTTTTTGT ATTTTTTGTA 3070 het 1481 hom 13 5 7 1 ATTTTTTGT 1 2 172511 CASAVA_Build 3 130654377 2D TCATCCAGAC AG/-- GGGGTGATGG 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 AG 1 0 172512 CASAVA_Build 3 130654548 1D GTTGGAGTTG C/- CCCCCCCACT 3070 het 3070 hom 41 16 23 3 C 8 7 172513 CASAVA_Build 3 130655388 1I GTGGGAAGAA -/C ATGGGCTTTG 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 C 0 1 172514 CASAVA_Build 3 130662314 2I GGACTAAAAC --/TG GGGTTGAGAC 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 TG 0 1 172515 CASAVA_Build 3 130667464 4D CGTGAGCCAC CGCG/---- CACGCCTGGC 1225 het 362 hom 4 1 3 0 CG 2 0 172516 CASAVA_Build 3 130668832 1D AAAGTTCAAC T/- TTTCTGATAA 3070 het 3070 ref 44 23 19 3 T 4 3 172517 CASAVA_Build 3 130673577 2I AGTCTGTGGT --/CC CCACCCTGCT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 C 2 4 172518 CASAVA_Build 3 130675465 1D TTGTTGTTAC T/- TTGTGGGAAG 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 3 2 172519 CASAVA_Build 3 130679799 1D CATTTGTGCT C/- CCCCCCCAGT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 C 8 7 172520 CASAVA_Build 3 130688906 4D CCAGCTATTT GCTG/---- GGACAGGTCA 3070 het 3070 hom 38 13 19 7 GCTG 1 0 172521 CASAVA_Build 3 130689291 1I CACTGCCCAC -/G GGCTGTGCAC 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 G 2 3 172522 CASAVA_Build 3 130695748 1I TTTGTTTGTT -/G TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 21 2 G 0 1 172523 CASAVA_Build 3 130699354 1D TCCTGATTAA C/- GTGGCATATT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 C 1 0 172524 CASAVA_Build 3 130700954 3D CTCACTCTGA AGC/--- ATGTGGTATC 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 AGC 1 0 172525 CASAVA_Build 3 130706443 5I GAGGCATGGT -----/CTCAC CTCTACTGAG 3070 het 3070 hom 56 18 31 7 CTCAC 0 1 172526 CASAVA_Build 3 130710342 1I TGAATATTGC -/G GATGAGGCAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 G 1 2 172527 CASAVA_Build 3 130710857 3D TCGGCAACTT CTC/--- CTGTAGTTGT 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 CTC 1 0 172528 CASAVA_Build 3 130721919 1I TGTGTTTTGT -/G GGGGGGGGCC 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 G 8 9 172529 CASAVA_Build 3 130743958 1D GCTTGGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 30 8 9 T 12 11 172530 CASAVA_Build 3 130759021 1I ACTTCTTTCA -/G GGGGAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 4 5 172531 CASAVA_Build 3 130770790 2I GTTGCTATAA --/AC ACGTGTGTAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AC 1 2 172532 CASAVA_Build 3 130776807 2D CAGGGGAAAC TA/-- TGCACGGAGA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 TA 1 0 172533 CASAVA_Build 3 130781770 1I ACCTCAGGGG -/C CTTGGCAAGA 3070 hom 62 het 26 0 20 6 C 1 2 172534 CASAVA_Build 3 130789505 1I ACTGCCCGCA -/C CCCACCCCTA 3070 het 3022 hom 26 11 11 4 C 3 4 172535 CASAVA_Build 3 130790005 4D GACTCCGAAT GTGA/---- GTATCTGACC 2556 het 2556 ref 29 13 7 9 GTGA 1 0 172536 CASAVA_Build 3 130791841 1D ATGTCCGGGC T/- GTTCCCTGAA 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 T 1 0 172537 CASAVA_Build 3 130792552 2I GTTTTTGCAC --/AA AGGCTCAGCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 3 172538 CASAVA_Build 3 130819315 1I TCCAGCTTTG -/C CCCCTCTGCA 3070 hom 48 het 27 0 17 10 C 4 5 172539 CASAVA_Build 3 130850224 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 861 hom 30 2 21 7 T 10 11 172540 CASAVA_Build 3 130875363 1D CTCTAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 41 3 26 12 A 14 13 172541 CASAVA_Build 3 130909548 1I TAGAGGATGA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 2 172542 CASAVA_Build 3 130923411 4I TCCGTCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAAC 3 4 172543 CASAVA_Build 3 130927218 1I TGAACATTGA -/T TTTTTTTTTT 1386 het 1386 ref 25 21 3 1 T 11 12 172544 CASAVA_Build 3 130927924 4D CATTAAAACA AAAC/---- AAACAAATAA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 AAAC 2 1 172545 CASAVA_Build 3 130966671 1I TCAAATACTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 10 172546 CASAVA_Build 3 130980208 1I AGATCATGGT -/G GGGGGGGGGG 2176 hom 28 het 30 0 13 17 G 10 11 172547 CASAVA_Build 3 130997001 1I TATTTTTTTT -/C CCCTGTTCCA 3070 hom 144 het 56 0 49 7 C 3 4 172548 CASAVA_Build 3 131002197 4D ATATCCATCC ATCT/---- GAGTATTCAT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 ATCT 1 0 172549 CASAVA_Build 3 131012799 8I ATTTTATATA --------/TTTTTTAT TTATTTTTAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TTTTTTAT 0 1 172550 CASAVA_Build 3 131024860 5D ATTCCATCTC AAACA/----- AAACAAAACA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAACA 3 2 172551 CASAVA_Build 3 131041560 1I ACTGGGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 814 hom 35 3 26 6 A 10 11 172552 CASAVA_Build 3 131051416 7D10M1D TTAATTCAAG ATTATAAATTATATTTCT/-------ATTATATTTC- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 4 N/A 0 0 172553 CASAVA_Build 3 131055932 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 11 12 172554 CASAVA_Build 3 131059271 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 7 8 172555 CASAVA_Build 3 131059916 1D ACATTTTTGG T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 105 het 39 0 36 6 T 8 7 172556 CASAVA_Build 3 131069674 1I CAGAGGGGGG -/A AAAAACCATA 3070 hom 120 het 48 0 40 8 A 5 6 172557 CASAVA_Build 3 131123191 1D CGAATATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1448 hom 39 4 27 9 A 13 12 172558 CASAVA_Build 3 131128110 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 8 7 172559 CASAVA_Build 3 131130601 1I TCTCTAAAAA -/G AAAAATTATA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 0 1 172560 CASAVA_Build 3 131141594 1I GTACCTGAAG -/T ATTCTCTGTT 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 T 0 1 172561 CASAVA_Build 3 131144666 1D ACTCCAGACT G/- GGCAGCAGAG 3070 hom 92 het 34 0 28 6 G 3 2 172562 CASAVA_Build 3 131145341 2I CTCACTCTGT --/CG CGCCCAGGCT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 CG 1 2 172563 CASAVA_Build 3 131148368 8I AACTCATAGT --------/CCTTCAGA TGCAACCAGC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 CCTTCAGA 0 1 172564 CASAVA_Build 3 131152514 1D TCAGTGCACC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2986 hom 28 8 15 5 T 9 8 172565 CASAVA_Build 3 131153638 4D CCCCCATTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 22 0 11 13 T 20 16 172566 CASAVA_Build 3 131163437 4D TTTGTTTGTC TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 46 22 19 8 TGTT 3 2 172567 CASAVA_Build 3 131165888 1I CCTGGAAGTC -/A AAAGGTGAAC 3070 hom 97 het 40 0 30 10 A 3 4 172568 CASAVA_Build 3 131171893 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 1840 hom 19 6 12 1 A 9 8 172569 CASAVA_Build 3 131172057 1D GCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 13 12 172570 CASAVA_Build 3 131172357 2D TTCGTGAGAC TG/-- TGTGAGTGTG 3070 het 3070 hom 66 31 30 5 TG 3 2 172571 CASAVA_Build 3 131172428 2I GAGTGTATGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 59 20 25 14 GT 7 8 172572 CASAVA_Build 3 131180081 6I ACTCTAATAA ------/TAATAT TAATAACACA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TAATAT 0 1 172573 CASAVA_Build 3 131195969 1I TGTTACCTGG -/A AAAAATACAT 3070 het 3070 hom 42 11 22 9 A 5 6 172574 CASAVA_Build 3 131198953 6D ATCAATCTAT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 11 5 TTTTTC 3 2 172575 CASAVA_Build 3 131200147 2D CAGCAACTTC CA/-- CACACACACA 3070 hom 117 het 51 0 40 11 CA 7 6 172576 CASAVA_Build 3 131203521 1D CTCCAGCGGG C/- CCTCATCTGC 1702 het 1702 ref 31 22 5 4 C 3 2 172577 CASAVA_Build 3 131211853 2D CTTCATGAAA AG/-- AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 AG 1 0 172578 CASAVA_Build 3 131214274 1D AAACTCTCCT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 31 18 7 6 A 8 7 172579 CASAVA_Build 3 131220569 1D TTTGAACATA T/- AGGTGAGAAG 3070 hom 90 het 38 0 31 8 T 1 0 172580 CASAVA_Build 3 131238577 1I AAGTTGTGGG -/T TTTTTTGGTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 6 7 172581 CASAVA_Build 3 131241599 1D CCGTGTTCAA T/- TTTTTTTTTT 2732 het 336 hom 16 2 7 7 T 17 16 172582 CASAVA_Build 3 131282574 1D8M2I TGGGGTTTTT GTTTGAGAC--/-TTTGAGACAG AGTCTCACTC 3070 hom 45 het 16 0 15 1 N/A 0 0 172583 CASAVA_Build 3 131283176 1D ATTAGAGGGC A/- AAAGTGCTCG 2802 hom 27 het 13 0 9 6 A 4 3 172584 CASAVA_Build 3 131283331 11D ACGGCTACAT CTGACCCACCC/----------- CAGAGATGAG 3070 hom 48 het 19 0 17 4 CTGACCCACCC 1 0 172585 CASAVA_Build 3 131285304 1D TCAGCAGTGC T/- TTTTCCTCTG 2763 hom 15 het 6 0 6 1 T 5 4 172586 CASAVA_Build 3 131285687 1I TGCTGGGGAA -/G GCAGACATTG 3070 hom 45 het 18 0 14 4 G 1 2 172587 CASAVA_Build 3 131285833 4I TCCCCCCCTC ----/CACA AAAAAAAATT 484 hom 8 het 11 0 3 8 CA 0 2 172588 CASAVA_Build 3 131289033 4I GAATGAGGTC ----/CATA CATTAGAAAA 3070 hom 62 het 24 0 21 3 CATA 0 1 172589 CASAVA_Build 3 131289316 2I GAATGAAAAA --/GT GTGCAATGTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 GT 1 2 172590 CASAVA_Build 3 131290279 1D AAGGGGAGCT C/- CCCTGCACAA 3070 het 3070 hom 40 19 18 4 C 4 3 172591 CASAVA_Build 3 131297977 1D ACCCAGTATG A/- AAAAAAAAAA 2948 hom 20 het 8 0 7 1 A 11 10 172592 CASAVA_Build 3 131300457 1D GCGGGCTTGG C/- TTTGTGAGGA 3070 het 237 hom 15 1 10 4 C 1 0 172593 CASAVA_Build 3 131300843 1D ATAGGGAAAC A/- GTTTCTGGTC 3070 hom 53 het 21 0 17 4 A 1 0 172594 CASAVA_Build 3 131302405 1I GAGCTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 A 9 10 172595 CASAVA_Build 3 131310385 2D TGCAAAAAAG AA/-- AGTCTCTGAG 3070 het 963 hom 22 3 17 4 A 3 1 172596 CASAVA_Build 3 131310626 10I GTTTTTAAAG ----------/GGGACAAGCA AACCTGTGGT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 GGGACAAGCA 0 1 172597 CASAVA_Build 3 131311158 3I CTTACAGTGG ---/CCT CAAGTCCAGC 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 CCT 0 1 172598 CASAVA_Build 3 131313415 1D GGCATTAGGG C/- GGGGATAAAC 1428 het 271 hom 6 1 5 1 C 1 0 172599 CASAVA_Build 3 131316891 1D TAACCTGTAG A/- AAAAAAAAAA 2339 hom 20 het 16 0 7 10 A 13 12 172600 CASAVA_Build 3 131317314 1I AGGTGGGGGG -/A ATCACTTGAA 1821 het 1821 ref 37 24 5 8 A 1 2 172601 CASAVA_Build 3 131320331 1D TAGTTACTGA T/- TCTAGGGAAC 2789 het 2789 ref 48 40 6 3 T 2 1 172602 CASAVA_Build 3 131321070 4D CATCAGAGAG AGAA/---- AGAGAGACCG 3070 hom 72 het 28 0 22 6 AGAA 1 0 172603 CASAVA_Build 3 131322930 5D TTATTAACAT TATAA/----- TATATAATGA 3070 hom 81 het 28 0 27 1 TATAA 1 0 172604 CASAVA_Build 3 131326395 5D AAACAAAGAT AAGAA/----- AAAGAAAACT 3070 hom 66 het 23 0 22 3 AAGAA 1 0 172605 CASAVA_Build 3 131327637 1I TGTTTTTTTT -/G TTTTTTTGTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 0 1 172606 CASAVA_Build 3 131329371 3D CAAATCCCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1397 hom 20 5 9 6 T 15 12 172607 CASAVA_Build 3 131330137 1I TCCCATGAGG -/A ATGCCATTAT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 1 2 172608 CASAVA_Build 3 131330222 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 45 het 21 0 16 6 T 9 8 172609 CASAVA_Build 3 131330360 1I TACAGGTGCA -/C TGCACCATGC 2757 het 2757 ref 32 23 7 2 C 0 1 172610 CASAVA_Build 3 131330558 1D TGAATGTGAA T/- TTTTGGAGGA 3070 het 3070 ref 47 32 10 5 T 5 4 172611 CASAVA_Build 3 131331497 1I AACAAAAAAC -/G GATGCTATGT 2768 hom 18 het 16 0 7 9 G 1 2 172612 CASAVA_Build 3 131334454 3D TGGCGTGATA ACC/--- ATAACATATT 3070 het 3070 ref 49 35 10 5 ACC 1 0 172613 CASAVA_Build 3 131344854 3D CCATACATTC ATA/--- ATAACTATAG 2787 het 2787 ref 50 40 6 5 ATA 2 1 172614 CASAVA_Build 3 131358475 1I GAAAAGTCCC -/T TTTGGGGGGA 2688 het 2688 ref 29 18 7 4 T 3 4 172615 CASAVA_Build 3 131359209 1I TGGTGGCGCA -/T TATCTGTAAT 1656 hom 10 het 6 0 4 2 T 1 2 172616 CASAVA_Build 3 131359453 1I GTAGGGAGGG -/C CCTAAGTCAA 3070 het 3070 ref 46 26 11 9 C 2 3 172617 CASAVA_Build 3 131370641 1I CCCTGTATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2529 hom 24 6 15 3 A 9 10 172618 CASAVA_Build 3 131378920 2D TCCAAAAATT AG/-- ACTTAATAGT 3070 het 1051 hom 25 3 19 6 AG 1 0 172619 CASAVA_Build 3 131379848 1I GCAGTTTTAA -/G GGGCCTGACT 3070 het 3070 ref 44 27 10 7 G 3 4 172620 CASAVA_Build 3 131380258 1I TGCCGGGTAA -/G GGGTGCACCT 1391 het 1391 ref 24 20 3 1 G 3 4 172621 CASAVA_Build 3 131382216 1D GAGGCGCTCT A/- AAAACGTTCT 3070 het 922 hom 18 3 15 0 A 5 4 172622 CASAVA_Build 3 131398763 4I TGCTTATGTT ----/TTTC TTTCTTCTCA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 TTTC 1 2 172623 CASAVA_Build 3 131425432 2D AGGATTACTG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 26 5 GT 1 0 172624 CASAVA_Build 3 131428757 1I ATTGTTTCAG -/A AATTTAATCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 2 3 172625 CASAVA_Build 3 131430896 1I TCTGCTCATT -/G GTTTTTTTTT 2727 het 34 hom 33 1 16 16 G 1 2 172626 CASAVA_Build 3 131438484 1D TATACAATGT A/- AGATGATACT 3070 hom 169 het 66 0 57 9 A 2 1 172627 CASAVA_Build 3 131463255 29D TCACAGGTGA TGAACTGCTTTCACATCCATCATCTACTG/----------------------------- TGAACTGCTT 3070 hom 130 het 62 0 42 33 TGAACTGCTTTCACATCCATCATCTACTG 1 0 172628 CASAVA_Build 3 131475211 1D ACTTGGTTTG T/- TTTTTTCACC 3070 het 3070 hom 52 23 26 4 T 7 6 172629 CASAVA_Build 3 131477932 2D GGTCCTCTGA CT/-- CTCAACATAA 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 CT 2 1 172630 CASAVA_Build 3 131481327 1D CAAAAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2855 hom 30 11 12 7 A 13 12 172631 CASAVA_Build 3 131482375 1I TAAAAGCATA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 6 7 172632 CASAVA_Build 3 131489558 1D CTTCAGCAGA T/- TTTTTTGGGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 7 6 172633 CASAVA_Build 3 131492747 1D TACTGTCAAA T/- TTTGTCAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 4 3 172634 CASAVA_Build 3 131499350 1I TATATTCATA -/G AAAAATGGAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 172635 CASAVA_Build 3 131505129 4I ACTTCTCATA ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 102 het 50 0 34 16 TC 6 8 172636 CASAVA_Build 3 131515748 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 1071 hom 10 het 9 0 4 7 TA 10 9 172637 CASAVA_Build 3 131526563 1I ATCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 10 172638 CASAVA_Build 3 131529220 1D GTGGAAGAAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 9 8 172639 CASAVA_Build 3 131534435 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 347 hom 31 1 24 6 A 8 9 172640 CASAVA_Build 3 131540203 1I TTTAATGGAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 42 het 22 0 15 7 T 8 9 172641 CASAVA_Build 3 131540628 2D TCCTCATTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 5 T 12 10 172642 CASAVA_Build 3 131546408 2I GTTCTCTTTG --/TA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 TA 0 1 172643 CASAVA_Build 3 131555257 1I AAAATTTCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 10 172644 CASAVA_Build 3 131580760 1D CATATGGAAA G/- CTTTTGAAGT 3070 het 3070 hom 57 24 25 9 G 1 0 172645 CASAVA_Build 3 131597099 1D ATATTTAGAA C/- CATATATTTA 3070 hom 123 het 42 0 42 0 C 2 1 172646 CASAVA_Build 3 131601281 2D CTGTAATGAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 AT 8 7 172647 CASAVA_Build 3 131605100 1D TGACTTTATT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 101 het 40 0 33 7 G 9 8 172648 CASAVA_Build 3 131611819 3I TTTGGAAAAT ---/GTA GTAGCAGTGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 GTA 1 2 172649 CASAVA_Build 3 131615359 1D AAATATTGTG C/- ATTTGACTGC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 C 1 0 172650 CASAVA_Build 3 131622297 1I CAAATTTGCA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 16 het 38 1 31 6 T 7 8 172651 CASAVA_Build 3 131625278 1D CTTTTTAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 8 7 172652 CASAVA_Build 3 131637417 2I GTCTGCAAAC --/AG AGACAACTTG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AG 1 2 172653 CASAVA_Build 3 131641386 1D TTGGGGACAA T/- TGGGTAGTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 1 172654 CASAVA_Build 3 131648327 1D TTGTTCCAGG T/- TCCCAGGTAT 3070 hom 20 het 26 1 20 5 T 2 1 172655 CASAVA_Build 3 131649366 1I ACCCATATAA -/C CGGCATTGCC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 1 2 172656 CASAVA_Build 3 131651616 19D AAGGAGAGGC TGGGACCCATTTGGTTTGT/------------------- TGGGACCCAT 3070 het 37 hom 33 3 25 8 TGGGACCCATTTGGTTTGT 1 0 172657 CASAVA_Build 3 131653886 1I ACCCCTGATA -/T TTCATGTAGG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 2 3 172658 CASAVA_Build 3 131655783 1I ACCAAAAAAA -/T GGTAGACATT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 0 1 172659 CASAVA_Build 3 131658602 1I TAGTTAAAAC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 7 8 172660 CASAVA_Build 3 131664863 1D TTCAAATTTC A/- AAGCAGGCCA 3070 hom 132 het 47 0 43 4 A 3 2 172661 CASAVA_Build 3 131673411 1D AAAAAGCACA T/- TTAGAAGAAA 3070 hom 163 het 60 0 55 5 T 3 2 172662 CASAVA_Build 3 131677082 1D TGGAATAAAG A/- CAAAATAAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 1 0 172663 CASAVA_Build 3 131686242 1I AATTTTAGCA -/T GCTTTGCTTT 3070 hom 135 het 47 0 45 2 T 0 1 172664 CASAVA_Build 3 131687607 1I TTGAGAGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 9 10 172665 CASAVA_Build 3 131690419 4I GGCCTCTCTC ----/TCTT CTTCTCCACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TCTT 0 1 172666 CASAVA_Build 3 131727531 1D TTATTAAGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 9 8 172667 CASAVA_Build 3 131728545 2I GGCCTTAGGC --/CT CTCAGCTCAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 CT 1 2 172668 CASAVA_Build 3 131736662 1D TCTCTTTTTT C/- CCCCTCACTA 3070 hom 102 het 36 0 34 3 C 5 4 172669 CASAVA_Build 3 131742000 2I TCACTGACCT --/AC ACAGATCCTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AC 1 2 172670 CASAVA_Build 3 131747163 1D AAAGTTTGTA T/- TTTTTTGGTA 3070 hom 36 het 13 0 13 1 T 7 6 172671 CASAVA_Build 3 131748446 2I CTTATGCTAG --/AC ACAGAGTGCT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 AC 1 2 172672 CASAVA_Build 3 131752665 1I TTTTTTTTTT -/C CTGTGTGTGT 3070 het 1700 hom 44 4 33 7 C 1 2 172673 CASAVA_Build 3 131754357 3D TTTTAAGGAC CGT/--- CTCTCTTAAG 3070 hom 96 het 33 0 33 1 CGT 1 0 172674 CASAVA_Build 3 131755386 10D TTGTGTTTTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 hom 81 het 27 0 28 3 TTTTG 4 2 172675 CASAVA_Build 3 131762464 8D CACACCCTTA ACCACCTC/-------- ACCATCTCCT 3070 hom 132 het 47 0 45 5 ACCACCTC 1 0 172676 CASAVA_Build 3 131778200 1I TCATGAATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 9 10 172677 CASAVA_Build 3 131793732 1D AAGGTGAAGG T/- TTATAGGTAA 3070 hom 95 het 57 1 47 9 T 3 2 172678 CASAVA_Build 3 131837740 13D TTAGCTCAAG GAGGTTATCTCTT/------------- GAGCTTTGTG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 GAGGTTATCTCTT 1 0 172679 CASAVA_Build 3 131840240 6D TGGATTGGAT ATTCCA/------ ACAGTTCTGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ATTCCA 1 0 172680 CASAVA_Build 3 131840785 5I GATTAAAATA -----/TCTTC TCTTACCTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TCTTC 0 1 172681 CASAVA_Build 3 131841893 1D CCCACCATTG T/- TTTTTGCCTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 6 5 172682 CASAVA_Build 3 131843291 1D CTTTTCCATT A/- AAAAAAAAAA 1648 het 1648 ref 30 20 5 6 A 12 11 172683 CASAVA_Build 3 131846762 3D TTTTATTAAT AAA/--- AAATCATTAA 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 A 6 3 172684 CASAVA_Build 3 131850551 1I TCTATGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 13 14 172685 CASAVA_Build 3 131851293 3D GGATAATGTC TAT/--- TATTTACCTG 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 TAT 2 1 172686 CASAVA_Build 3 131852288 5I CTGCAAAATC -----/TCTTA ATAGAGAAAC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 TCTTA 0 1 172687 CASAVA_Build 3 131855832 1D TGTTCCATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 T 9 8 172688 CASAVA_Build 3 131866830 1D AACAAATTGC T/- TTTTTTTTTA 1373 het 1373 ref 36 28 3 5 T 10 9 172689 CASAVA_Build 3 131871360 5D AATTAGAAAT AAGTG/----- AAATCAAATG 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 AAGTG 1 0 172690 CASAVA_Build 3 131880210 8D TCTACAGTGT TAAATAAA/-------- TAACTAATAA 3070 het 3070 ref 29 22 8 4 TAAA 2 0 172691 CASAVA_Build 3 131884801 5D GCTATTAGAC ATCTT/----- AAGAGAGATT 3070 het 3070 hom 27 13 12 5 ATCTT 1 0 172692 CASAVA_Build 3 131893264 3I AAAAACATTT ---/ATA ATAATACCAC 3070 het 3000 hom 17 7 8 2 ATA 2 3 172693 CASAVA_Build 3 131907509 1D TACATTTCCA T/- TTTTTATATA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 6 5 172694 CASAVA_Build 3 131907746 3D CAAAAAGCAG ATC/--- ATAAGTTGAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 5 ATC 1 0 172695 CASAVA_Build 3 131912553 1D AAAAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1407 hom 32 5 15 12 A 13 12 172696 CASAVA_Build 3 131918344 2I TAGACCACAC --/AT GTGTGTCTGT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 AT 0 1 172697 CASAVA_Build 3 131919102 2I TCTATGAAAT --/AA AGAATGATAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 1 3 172698 CASAVA_Build 3 131920883 4D TCAGAGGATA TTTC/---- TTTATCTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 TTTC 1 0 172699 CASAVA_Build 3 131923701 1I TTTTACTTTT -/A AAACAGTTTT 3070 het 3070 hom 37 19 16 2 A 3 4 172700 CASAVA_Build 3 131927120 1D ACAAAAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 11 10 172701 CASAVA_Build 3 131929075 1I CTTACAGCTT -/C CTGCTGCCTC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 C 1 2 172702 CASAVA_Build 3 131929518 5I TTTCAGTTAC -----/ACAAA ACAAAGCCTT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 ACAAA 1 2 172703 CASAVA_Build 3 131932936 1I CCTTCATCCT -/G GGGTCCCACT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 G 3 4 172704 CASAVA_Build 3 131933968 1D GCTTGTTTTT A/- AAACTGATAA 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 A 4 3 172705 CASAVA_Build 3 131936273 1D TTTATCCTAT G/- GTTTTCTAGT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 G 2 1 172706 CASAVA_Build 3 131937575 1I GAAAAGAGAT -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 A 6 7 172707 CASAVA_Build 3 131949459 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 1281 het 1094 hom 9 4 3 2 T 10 9 172708 CASAVA_Build 3 131958379 1D AGTCATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 22 23 9 T 11 10 172709 CASAVA_Build 3 131976321 1D AAAATCTAAA T/- TCTATGATTC 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 T 2 1 172710 CASAVA_Build 3 131981241 2I ACACACACAC --/AT GTGCGTGCAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AT 0 1 172711 CASAVA_Build 3 132002887 1I CGTTTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 16 0 12 4 A 13 14 172712 CASAVA_Build 3 132005014 1I GTAATCTCAA -/G GGGGCCAGCT 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 G 4 5 172713 CASAVA_Build 3 132018963 1I AGCTAGACAG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 7 8 172714 CASAVA_Build 3 132040506 25D GACATCTTTA CCTGTAATATATCCAAATAAAATGG/------------------------- CCTGAATTTC 3070 het 3070 ref 46 32 20 3 CCTGTAATATATCCAAATAAAATGG 1 0 172715 CASAVA_Build 3 132054528 1I TCCTTGAGAG -/T ATTTCTAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 0 1 172716 CASAVA_Build 3 132055583 6I ATACAGACAA ------/GAAGAT GAAGATTTGA 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 GAAGAT 1 2 172717 CASAVA_Build 3 132067755 2I ATGAAGACAT --/AA GTTTGTTTCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 0 2 172718 CASAVA_Build 3 132068134 1I AATTGCTAAC -/T TTTGTTCTTA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 3 4 172719 CASAVA_Build 3 132077418 1I ATGTCGAGTG -/T TTTTTTTTTT 2799 het 2799 ref 33 12 8 13 T 12 13 172720 CASAVA_Build 3 132083747 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2310 het 2310 ref 34 19 6 10 T 13 12 172721 CASAVA_Build 3 132085011 2D TTTTTTTTTT TC/-- TCCACAGAGT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 TC 2 1 172722 CASAVA_Build 3 132087150 4D AAAAAAAGAA AACT/---- AATAGAAACT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 AACT 1 0 172723 CASAVA_Build 3 132089762 3D CTTCTTTGCT CTC/--- CTCTTCATAC 3070 het 3070 ref 44 27 11 7 CTC 2 1 172724 CASAVA_Build 3 132116625 1D TCATTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 T 12 11 172725 CASAVA_Build 3 132125682 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 26 14 10 T 11 10 172726 CASAVA_Build 3 132134801 4D CACTGGGTGA TTCT/---- TTATTCCTCT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 TTCT 1 0 172727 CASAVA_Build 3 132135942 1I TGCTATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 10 11 172728 CASAVA_Build 3 132138553 1D TTTCTCACAA T/- TTTTTTGGAA 2404 het 2404 ref 20 12 5 4 T 7 6 172729 CASAVA_Build 3 132142567 1I TCTTGCCTCA -/G GCCTCCTGAG 2751 het 2751 ref 15 8 7 0 G 1 2 172730 CASAVA_Build 3 132147022 1D TACATTAGAT A/- ATATCTCCTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 2 1 172731 CASAVA_Build 3 132151298 4D TTTGAGTGTT AGTA/---- AGTTAAATAC 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 AGTA 1 0 172732 CASAVA_Build 3 132152411 1D ACAACAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 A 11 10 172733 CASAVA_Build 3 132162785 2D AGGATTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 31 5 12 15 T 13 11 172734 CASAVA_Build 3 132164250 1D TGGAAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 34 1 27 6 A 17 16 172735 CASAVA_Build 3 132165696 1I GAATCATCTC -/A AGAGTTTTAC 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 A 1 2 172736 CASAVA_Build 3 132174152 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCTCCCC 1582 het 1453 hom 10 4 5 1 C 5 6 172737 CASAVA_Build 3 132174604 3I TATAAAAGGT ---/AAG AAAAATCAAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 AAG 0 1 172738 CASAVA_Build 3 132181209 1D8M1D TATTTTTAAT CTCATGATCA/-TCATGATC- ACTGTGATGA 3070 het 474 hom 36 2 19 16 N/A 0 0 172739 CASAVA_Build 3 132187719 1I TGAATAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2037 hom 42 8 23 11 T 15 16 172740 CASAVA_Build 3 132217578 1I TTTGTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 16 5 T 11 12 172741 CASAVA_Build 3 132224022 1D TGGCAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1862 het 1862 ref 26 16 5 5 T 17 16 172742 CASAVA_Build 3 132231769 1D CAAGACTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 13 12 172743 CASAVA_Build 3 132238767 9I GAAGCATTTT ---------/TTGGGTCAG TTGTGAGTTA 3070 hom 105 het 36 0 36 1 TTGGGTCAG 0 1 172744 CASAVA_Build 3 132240711 1I ACCTTGTAGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 8 9 172745 CASAVA_Build 3 132241576 1D AGTAGTTTAC T/- TCCACTAATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 2 1 172746 CASAVA_Build 3 132241834 1I TAGTTATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 10 11 172747 CASAVA_Build 3 132243746 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1918 het 1918 ref 24 12 6 6 T 10 11 172748 CASAVA_Build 3 132252413 4I TAGTAATAAA ----/AAAT TAGTGGGCAT 3070 hom 80 het 32 0 25 7 AAAT 0 1 172749 CASAVA_Build 3 132253669 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 36 1 19 17 T 14 13 172750 CASAVA_Build 3 132271512 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2342 hom 23 6 15 2 A 10 9 172751 CASAVA_Build 3 132294965 1D AGATGTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 39 1 32 6 T 11 10 172752 CASAVA_Build 3 132309238 1D TGTTTGGTTG A/- AAAAATATCA 3070 hom 117 het 45 0 40 6 A 6 5 172753 CASAVA_Build 3 132315854 7I ACTATTCACA -------/GTTCACT GAAAGCTACT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 GTTCACT 0 1 172754 CASAVA_Build 3 132335171 3I AGTCTTCCTT ---/CTC CTATAAAACT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CTC 0 1 172755 CASAVA_Build 3 132340598 2D CTGGAGAAAC AG/-- AGAAATGCAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 AG 2 1 172756 CASAVA_Build 3 132350279 2D TTTGTTACAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 45 het 24 0 16 10 AT 9 8 172757 CASAVA_Build 3 132361300 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 284 hom 35 1 32 2 A 9 10 172758 CASAVA_Build 3 132396977 4D TTGAAATGTC TGTT/---- TGTCTTGGAA 3070 het 3070 hom 57 26 24 8 TGTT 1 0 172759 CASAVA_Build 3 132403259 1D CCTCCAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 23 1 19 3 T 11 10 172760 CASAVA_Build 3 132421091 1I TAAAGTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 516 hom 31 2 20 9 A 12 13 172761 CASAVA_Build 3 132421909 1D ATTTGAGCAG T/- TTTTCACACC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 5 4 172762 CASAVA_Build 3 132431694 2I CTACTAATAT --/TA TCACTTAGAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TA 0 1 172763 CASAVA_Build 3 132444872 1D TGGAACCAGA T/- TTTTTTTTCG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 9 8 172764 CASAVA_Build 3 132449374 1D ATTCCTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1171 hom 40 6 24 10 T 13 12 172765 CASAVA_Build 3 132494050 1D AACTAACATC T/- TTTTTTTTTT 1248 het 1248 ref 27 16 6 5 T 17 16 172766 CASAVA_Build 3 132495560 1D AAGAACCAGC T/- TTTGGTCTTC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 4 3 172767 CASAVA_Build 3 132511144 1I ATGCTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 36 1 25 10 T 11 12 172768 CASAVA_Build 3 132530999 1D GGGATCAGTC A/- AAAAAAAAAA 1372 het 1372 ref 39 27 3 11 A 13 12 172769 CASAVA_Build 3 132532461 1D AGAGAAGGAA G/- GGGGGGGGGC 3070 het 3070 hom 34 11 11 12 G 10 9 172770 CASAVA_Build 3 132562611 2D CTCCCAGTCC TG/-- TGCCACAGGA 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 TG 2 1 172771 CASAVA_Build 3 132573275 3I CTTGGCCCTT ---/ATC AGACAGAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATC 0 1 172772 CASAVA_Build 3 132577458 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1371 hom 17 6 9 2 A 11 10 172773 CASAVA_Build 3 132617521 4I CTAGAGAACT ----/CTGA CTAACACAGT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 CTGA 0 1 172774 CASAVA_Build 3 132621204 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 9 8 172775 CASAVA_Build 3 132622162 1D AACTGCAATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 9 8 172776 CASAVA_Build 3 132627792 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 835 het 835 ref 22 15 3 4 A 15 16 172777 CASAVA_Build 3 132629620 1D GTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 33 1 24 8 T 11 10 172778 CASAVA_Build 3 132648700 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2143 het 1947 hom 20 8 8 4 T 17 16 172779 CASAVA_Build 3 132652938 1I TTTCCAACTC -/T TAACACCCCT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 1 2 172780 CASAVA_Build 3 132653256 1D CAAAATTATA C/- CCCCCATGCC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 C 6 5 172781 CASAVA_Build 3 132668225 1D CATTTTTTTT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 2653 hom 30 12 10 8 G 9 8 172782 CASAVA_Build 3 132684428 1I CTCTGTCCTT -/C CAAGTCCTTT 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 C 1 2 172783 CASAVA_Build 3 132685180 1D CCTAACAAAA T/- TTTATTTTAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 4 3 172784 CASAVA_Build 3 132708071 1I AAAAAAATAG -/A AAAAAAGCAG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 6 7 172785 CASAVA_Build 3 132730898 3D TATTTTGCAT TTC/--- TTCTTTTGTG 3070 hom 102 het 38 0 34 5 TTC 2 1 172786 CASAVA_Build 3 132744353 1D CCATGATGAT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 121 het 48 0 38 11 G 9 8 172787 CASAVA_Build 3 132748646 1D TGGGGAAGCC T/- TTGCAGGGCC 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 T 3 2 172788 CASAVA_Build 3 132767353 1D AAGAGTATGT A/- AAAAAAAAAA 2689 het 2689 ref 33 14 9 10 A 17 16 172789 CASAVA_Build 3 132777690 2I TTCTTAGAGA --/CT GACCCAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 CT 0 1 172790 CASAVA_Build 3 132813679 6I AGGCCAAGGC ------/AGGCAG AGGCAGATCA 3070 het 837 hom 15 3 10 2 AGGCAG 1 2 172791 CASAVA_Build 3 132828706 1D CAGCCTGGGT A/- GACAGAGTGA 2440 het 120 hom 9 1 5 5 A 1 0 172792 CASAVA_Build 3 132829054 3D GACTTTCCAG TCT/--- TCTTATTTAA 3070 het 3070 ref 49 24 23 3 TCT 2 1 172793 CASAVA_Build 3 132830926 1I TATGTTCATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 T 9 10 172794 CASAVA_Build 3 132831488 1I CTCTCCCTTA -/C CTCTCAAAAT 3070 het 3070 ref 48 26 14 8 C 1 2 172795 CASAVA_Build 3 132835066 4D AACTGAATCT CTAA/---- CTAAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 12 16 4 CTAA 2 1 172796 CASAVA_Build 3 132851657 9I CATCTTTTAA ---------/AGGCCATAT AGGGCATATC 3070 het 3070 hom 51 12 26 13 AGGCCATAT 0 1 172797 CASAVA_Build 3 132857588 1D ATACTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3045 het 1685 hom 38 10 13 15 T 17 16 172798 CASAVA_Build 3 132861883 4D AGGAGGGGTC CCAT/---- TAGCATCATA 3070 hom 90 het 35 0 29 6 CCAT 1 0 172799 CASAVA_Build 3 132872354 1I TTTTTTGTTT -/G TTTTTTTTTG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 0 1 172800 CASAVA_Build 3 132877296 2D TCGGCAACCC TA/-- TGTCTTTTTA 3070 hom 119 het 42 0 38 4 TA 1 0 172801 CASAVA_Build 3 132879830 1D TATTCTGAGA C/- CTTTACTGAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 2 1 172802 CASAVA_Build 3 132881788 2D CAACCCCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 13 6 T 14 12 172803 CASAVA_Build 3 132886941 1D ATTAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 32 1 25 6 A 13 12 172804 CASAVA_Build 3 132890390 4D CATATACTTT TCTG/---- TCTTTCTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 3 TCTG 1 0 172805 CASAVA_Build 3 132891098 14D AAATAATAAG CCATCTTATGCTTA/-------------- TGCCATCTAT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 CCATCTTATGCTTA 1 0 172806 CASAVA_Build 3 132892266 2I CTGCACAGTT --/AA AAAAAAAAAA 2258 hom 27 het 21 0 9 13 A 10 12 172807 CASAVA_Build 3 132901806 4D TATTAAAATT AGAC/---- AGACAACTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AGAC 2 1 172808 CASAVA_Build 3 132909626 4I TATTGGCTTA ----/GACT GGGGTCCTGG 3070 hom 96 het 33 0 32 1 GACT 0 1 172809 CASAVA_Build 3 132916568 1I TCATAACTGT -/C CTCCAAACCA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 C 1 2 172810 CASAVA_Build 3 132917780 6I CAGCCTTCAG ------/GAGGCA GAGGCAGACT 3070 hom 83 het 35 0 27 9 GAGGCA 1 2 172811 CASAVA_Build 3 132923978 1I CCACCCCATA -/C CCCCCCCACG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 C 7 8 172812 CASAVA_Build 3 132940011 2I AGAAATACCC --/AA AGACACCACT 3070 hom 120 het 43 0 38 5 A 1 3 172813 CASAVA_Build 3 132948653 1D TAAAATCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 41 3 33 5 T 14 13 172814 CASAVA_Build 3 132949077 1I GTTTCCACTT -/A AAAAAAAAAA 3064 het 3064 ref 30 16 9 5 A 10 11 172815 CASAVA_Build 3 132953076 5I TTTTATTTTC -----/ATTTG TTTTAAGTGT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 ATTTG 0 1 172816 CASAVA_Build 3 132961158 1D AAAGTGTAGT G/- GGGGGTGAAA 3070 hom 97 het 35 0 33 3 G 6 5 172817 CASAVA_Build 3 132964447 1D GCTACGACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 10 9 172818 CASAVA_Build 3 132965812 1I GTTTTATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2219 hom 34 8 18 8 A 10 11 172819 CASAVA_Build 3 132967831 19I AAGTGTTTTA -------------------/CATAGTATCGGGCACATAG CAAGTACTCA 3070 hom 138 het 51 0 47 5 CATAGTATCGGGCACATAG 0 1 172820 CASAVA_Build 3 132975874 1D AAACGGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2695 hom 38 8 21 10 A 12 11 172821 CASAVA_Build 3 132982627 1I TGGCTGTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 10 11 172822 CASAVA_Build 3 132984004 2D TTAAAGTAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 45 21 22 3 AC 6 5 172823 CASAVA_Build 3 132989782 1D TAAACAATTG A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 hom 26 8 17 1 A 6 5 172824 CASAVA_Build 3 132991340 1I ATACACAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 56 27 23 6 A 8 9 172825 CASAVA_Build 3 132995778 2I GAAACAACTT --/TA TTTTTTTTTT 3070 het 1965 hom 32 12 12 8 TA 0 1 172826 CASAVA_Build 3 133011080 1I AAATACCCAG -/A AAAAAGTGAG 3070 het 3070 ref 47 26 12 9 A 5 6 172827 CASAVA_Build 3 133040164 1I CAAAAGAAAA -/T TCTGACAGAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 172828 CASAVA_Build 3 133041280 1D TTATAAAAAG A/- AAAAAAGACT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 A 7 6 172829 CASAVA_Build 3 133041834 2D GTCAGCAGCC AA/-- AGAGTGACAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 1 172830 CASAVA_Build 3 133050201 2D ATGTGCATCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 34 2 21 11 A 16 14 172831 CASAVA_Build 3 133067776 1I GAGAGAGTCT -/C CCACAACAGT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 2 3 172832 CASAVA_Build 3 133088098 1D TCTACTGACA G/- TGCACTGTGC 3070 hom 72 het 26 0 19 7 G 1 0 172833 CASAVA_Build 3 133107744 1I TTGTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 G 0 1 172834 CASAVA_Build 3 133110184 1D ATGTGTTAGG A/- AATACATATT 3070 hom 165 het 63 0 54 10 A 3 2 172835 CASAVA_Build 3 133112810 1I CGCTGAAAGG -/A AATGAATTCT 3070 hom 147 het 57 0 48 9 A 2 3 172836 CASAVA_Build 3 133113640 6I CAATACCTTG ------/GTTTTA GGGAGACTAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 GTTTTA 0 1 172837 CASAVA_Build 3 133127088 5I ATTCTCCTTG -----/AAGGA GAGAAAGAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAGGA 0 1 172838 CASAVA_Build 3 133128972 1I52M1I CACTACAAAT -ACTTGTCTTTCACTCACTCATGTGGCTCAATTACTACTGTCATGACATCTCA-/GACTTGTCTTTCACTCACTCATGTGGCTCAATTACTACTGTCATGACATCTCAT TGTCATTGCA 3070 hom 172 het 45 0 58 5 N/A 0 0 172839 CASAVA_Build 3 133129853 1D CTCTTTTCTT A/- AAAAAAATGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 7 172840 CASAVA_Build 3 133131125 2D CCTCCAAGGG AA/-- ATCCCTCACA 3070 hom 56 het 20 0 19 1 A 3 1 172841 CASAVA_Build 3 133135469 2D ATTACAGTTA GT/-- GAGAAGAGAA 3070 het 3070 ref 47 25 16 7 GT 1 0 172842 CASAVA_Build 3 133138185 1I GGAAAAGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 10 11 172843 CASAVA_Build 3 133141074 2I ATATCTGTCT --/CA GTTTGCCTAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CA 0 1 172844 CASAVA_Build 3 133145758 1D CCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 251 hom 55 2 37 16 T 11 10 172845 CASAVA_Build 3 133146738 5I ATACTTTTTA -----/CTTAT CTTATTTAGT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 CTTAT 1 2 172846 CASAVA_Build 3 133149579 4D TTTTTAGGTC TTCT/---- TTAATTTCTT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 TTCT 1 0 172847 CASAVA_Build 3 133157639 1I AAACACTAGA -/T TTTTTTATAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 6 7 172848 CASAVA_Build 3 133158134 1D42M1D TATATGTATG AATTAAAGTTCAATACAGCATTTATTATAATGCAAATAATTTGA/-ATTAAAGTTCAATACAGCATTTATTATAATGCAAATAATTTG- AAAACTATAT 3070 hom 129 het 33 0 44 3 N/A 0 0 172849 CASAVA_Build 3 133159962 2D ATTTGGAAAC TG/-- TGACTATGGA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 TG 2 1 172850 CASAVA_Build 3 133164268 1I AGAAACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 44 1 36 7 A 10 11 172851 CASAVA_Build 3 133173658 1I AGAGAGAGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 602 hom 45 3 34 8 A 9 10 172852 CASAVA_Build 3 133173900 2I CATAGCACTT --/AA ACAAGCAGAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 1 3 172853 CASAVA_Build 3 133178334 1D ATTATCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 12 11 172854 CASAVA_Build 3 133188402 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 A 13 12 172855 CASAVA_Build 3 133198026 1I AGAAAATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 49 het 38 1 30 7 A 8 9 172856 CASAVA_Build 3 133200254 1I TACAGAAATG -/A AAAAGATGGG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 4 5 172857 CASAVA_Build 3 133201588 1D GGAAATAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 45 0 17 29 A 12 11 172858 CASAVA_Build 3 133203050 2D TTGTAATTGT GA/-- GAGAGAGAGA 1182 het 1182 ref 27 20 3 4 GA 8 7 172859 CASAVA_Build 3 133205127 3D GGTGACAGAC CTT/--- CTGCTCACCC 3070 hom 135 het 50 0 44 7 CTT 1 0 172860 CASAVA_Build 3 133205710 1D TGAAAATTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 9 8 172861 CASAVA_Build 3 133207322 1I19M1D CATTTAATTG -AAAAAAAAAATCCACTTCTA/AAAAAAAAAAATCCACTTCT- AAAGCCCTCA 3070 hom 126 het 38 0 43 2 N/A 0 0 172862 CASAVA_Build 3 133208190 3I TTTCTTTCCA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 28 0 20 8 T 9 12 172863 CASAVA_Build 3 133211976 2I CAAGAATGCT --/CA GAGTCGTGGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CA 0 1 172864 CASAVA_Build 3 133217050 2I CATACACACT --/CA CACACACACA 3070 het 460 hom 48 2 38 8 CA 7 8 172865 CASAVA_Build 3 133218573 4D GCAAGCAAAG AAGA/---- AAGAAGGAGC 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 AAGA 2 1 172866 CASAVA_Build 3 133219704 3D ATTTTTAAAA AAG/--- AATTTTGCCA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 AAG 1 0 172867 CASAVA_Build 3 133220632 1I CTTGAAAAGA -/T TTTCCTTTAT 3070 hom 95 het 38 0 32 6 T 3 4 172868 CASAVA_Build 3 133221655 2I AAAAGTGACC --/TG CGTCCTGCAC 3070 hom 168 het 60 0 56 4 TG 0 1 172869 CASAVA_Build 3 133225588 1D TAATACACGT G/- AACAAAAGCT 3070 het 3070 ref 39 15 11 13 G 1 0 172870 CASAVA_Build 3 133226031 4D TTTTAAGGGT TTTA/---- TTTGTCTCCT 3070 hom 114 het 40 0 37 5 TTTA 1 0 172871 CASAVA_Build 3 133228415 3I AGGAAATAGG ---/GCA GACAGGTTTA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 GCA 0 1 172872 CASAVA_Build 3 133229055 1D CCTTTTCTCC A/- ATACAATTCA 3070 hom 129 het 50 0 44 8 A 2 1 172873 CASAVA_Build 3 133229232 7I ACTCCTTGAC -------/TTTTCCA TTTTGCCACT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TTTTCCA 0 1 172874 CASAVA_Build 3 133229359 6D TCTTTGTCTT TAATGA/------ TAATGATAAA 3070 hom 84 het 33 0 27 7 TAATGA 2 1 172875 CASAVA_Build 3 133230366 1I TTAGTACTAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 35 0 29 7 A 8 9 172876 CASAVA_Build 3 133231425 4D TCATAAACTC TCTT/---- TGTTTACTTT 3070 het 3070 ref 36 19 16 4 TCTT 1 0 172877 CASAVA_Build 3 133234268 5I TGGGCAGGTG -----/AATAA AATGAGTTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AATAA 0 1 172878 CASAVA_Build 3 133234940 4D TGTGTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 57 het 27 0 20 8 TG 11 9 172879 CASAVA_Build 3 133238830 2I CGCAGAAAAC --/AT GTGCAGCTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AT 0 1 172880 CASAVA_Build 3 133243829 8D57M1D TCATATTTTC ATGTTAATATTAGTCACTGCATTCTTGTCATTAATTCTCATGAGGCTTTGCCATTTTAAAAAAAAT/--------ATTAGTCACTGCATTCTTGTCATTAATTCTCATGAGGCTTTGCCATTTTAAAAAAAA- ATTCTTACTT 3070 hom 135 het 36 0 46 5 N/A 0 0 172881 CASAVA_Build 3 133250391 3I TGATAATATG ---/TTT TTTATTATTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 3 6 172882 CASAVA_Build 3 133258005 1D AGACTACCAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 9 8 172883 CASAVA_Build 3 133270950 1I TCATAGTATC -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 7 8 172884 CASAVA_Build 3 133272517 9I TCCCACAAAG ---------/CACCATAAA CACAGTGTCT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 CACCATAAA 0 1 172885 CASAVA_Build 3 133272611 2I TGGAAAGTAA --/AT GATGTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 AT 0 1 172886 CASAVA_Build 3 133274877 3I CTGAAAAGTC ---/AAA TAATTTTAGA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 0 3 172887 CASAVA_Build 3 133283843 4D TTTCTCTCTC TCTT/---- TCTCTCCCTG 3070 het 3070 ref 49 20 17 17 TCTT 1 0 172888 CASAVA_Build 3 133293393 1D AAAGGAAGCA T/- TTTTTTCCTG 3070 hom 151 het 54 0 51 3 T 7 6 172889 CASAVA_Build 3 133297731 10I TGAATGACTA ----------/CATCTTCACT ACAGTGTCTA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 CATCTTCACT 0 1 172890 CASAVA_Build 3 133307678 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 10 9 172891 CASAVA_Build 3 133308793 5I TATATCATTG -----/TATTT TAAGTGAATT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TATTT 0 1 172892 CASAVA_Build 3 133309593 1I AAAATATAAT -/A AAAAAATGAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 6 7 172893 CASAVA_Build 3 133310262 1I GGTAGAACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 9 10 172894 CASAVA_Build 3 133312523 2I50M1I TTGAGTCTTC --TCTTTTTTCTTAGTCTGGCTAAAGGTTTGTCAGTTTTATTTATCTTTTCA-/TCTCTCTTTTTTCTTAGTCTACCTAATGGTATGTCAGTTTTGCTTATCTTTTC AAAAAACAAC 2208 het 2208 ref 43 50 5 6 N/A 0 0 172895 CASAVA_Build 3 133315504 17I GAACCGTGCT -----------------/TGCACAGACCTAAAGCC TGCACAGACC 3070 hom 120 het 52 0 37 16 TGCACAGACCTAAAGCC 1 2 172896 CASAVA_Build 3 133319665 1D ATATTTATTT C/- CCCCCAAATG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 6 5 172897 CASAVA_Build 3 133325426 1I CTACAAAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 44 0 31 13 A 9 10 172898 CASAVA_Build 3 133333841 1D ATAATCAGAG A/- AATGCAAGTA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 3 2 172899 CASAVA_Build 3 133335554 1D GAGAAAGTCA T/- TTTTTCAGGC 3070 hom 66 het 26 0 22 5 T 6 5 172900 CASAVA_Build 3 133353104 1D ATACAGCCAT A/- AAAAATGGAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 6 5 172901 CASAVA_Build 3 133363044 1I ATAATTGCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 T 8 9 172902 CASAVA_Build 3 133366758 1I TGTGGCTGGC -/A AGACGGCAGG 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 A 1 2 172903 CASAVA_Build 3 133380550 1D ACCAAGAGAA T/- TAGAGTAGTG 3070 het 3070 ref 48 22 21 7 T 2 1 172904 CASAVA_Build 3 133386665 1D TAGCTGATCC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 9 8 172905 CASAVA_Build 3 133399912 4D CTGAAGGCTC ATGG/---- ATGATCATTC 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 ATGG 1 0 172906 CASAVA_Build 3 133405165 11D CATGCTCATC TCACAAGAACA/----------- TCACAAGTTA 3070 het 3070 hom 32 15 17 4 TCACAAGAACA 1 0 172907 CASAVA_Build 3 133420818 1I TTAGAGGGAA -/G GGGGTCTGCC 3070 het 3070 ref 49 28 19 2 G 4 5 172908 CASAVA_Build 3 133422229 1D GGGTAAAGTC A/- AAGCAAGAAC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 3 2 172909 CASAVA_Build 3 133423546 7D AACATTAAAT AGAAGTC/------- AGGGGAAATT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 AGAAGTC 1 0 172910 CASAVA_Build 3 133429594 1D ATGTGATATG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 29 13 7 9 A 8 7 172911 CASAVA_Build 3 133436662 2I TGTGATATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 AT 5 6 172912 CASAVA_Build 3 133436880 2I ATATACACAC --/AT ATATATACAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AT 3 4 172913 CASAVA_Build 3 133440700 1I AAACATATAG -/T TTTTTCCTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 5 6 172914 CASAVA_Build 3 133443276 5D AGACGTCTGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 52 8 18 33 T 16 11 172915 CASAVA_Build 3 133454502 1D TTCATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 968 hom 34 3 22 9 T 13 12 172916 CASAVA_Build 3 133464847 4D CCCTCACACT CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 61 21 25 17 CA 10 8 172917 CASAVA_Build 3 133466369 2D AATGGTGTCT AA/-- GACTGGAATT 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 A 2 0 172918 CASAVA_Build 3 133486440 20D GGTTGTGAGG CTCCGACCCCATAGCAGTGT/-------------------- CTAGGGGTTA 3070 het 3070 ref 28 16 14 3 CTCCGACCCCATAGCAGTGT 1 0 172919 CASAVA_Build 3 133487306 2I CTCAGAAGAT --/AA GAGATAAAAC 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 A 0 2 172920 CASAVA_Build 3 133491930 1I GACATCCCCC -/T AGCCTCCATA 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 T 0 1 172921 CASAVA_Build 3 133501988 1I AAGAGTTAAA -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 63 het 25 0 19 6 T 7 8 172922 CASAVA_Build 3 133505635 2D AGTCAAAGAG AA/-- AAAGAGATAG 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 A 5 3 172923 CASAVA_Build 3 133506170 1D ATTGAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 18 8 A 12 11 172924 CASAVA_Build 3 133506593 1I TATAAAAAAA -/G AATTTATGCA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 0 1 172925 CASAVA_Build 3 133509590 1D CCAGGACTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 22 2 19 1 A 12 11 172926 CASAVA_Build 3 133515543 3D AGAAAGAAGT ACA/--- ACAAGAGAAC 3070 het 3070 hom 53 20 30 5 ACA 2 1 172927 CASAVA_Build 3 133518660 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 21 1 20 1 A 13 12 172928 CASAVA_Build 3 133519909 1D CTTCCCTACA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 7 6 172929 CASAVA_Build 3 133520036 1D AAGTTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2476 hom 25 8 14 3 T 12 11 172930 CASAVA_Build 3 133520235 1D TTCTGTGCAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 6 A 8 7 172931 CASAVA_Build 3 133524705 1D GAAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2196 het 2196 ref 42 31 5 7 A 11 10 172932 CASAVA_Build 3 133540327 5D TGCTATAGTA CTTTT/----- CTTCTTGTGA 3070 het 3070 ref 51 26 21 6 CTTTT 1 0 172933 CASAVA_Build 3 133540771 1I TTTTGTGTGT -/G GAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 2 172934 CASAVA_Build 3 133551719 3D CTAAACTAAC AAG/--- AAGACAAACA 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 AAG 2 1 172935 CASAVA_Build 3 133557459 1I TGTAAGGTTA -/C CACCAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 1 2 172936 CASAVA_Build 3 133567283 10D GGGAGGTGCA GGTGGTGGTG/---------- GGTGGATCAC 2511 het 2511 ref 29 18 7 4 GGTGGTGGTG 1 0 172937 CASAVA_Build 3 133570286 3I TTTTTATATC ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 T 9 12 172938 CASAVA_Build 3 133571883 18I AATGCCTTTG ------------------/TTTTCCAGATATCGGGAT ATCTGGACAC 2993 het 2993 ref 21 11 7 5 TTTTCCAGATATCGGGAT 0 1 172939 CASAVA_Build 3 133579887 1I TGGAATAATA -/T TATTGTAAAG 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 1 2 172940 CASAVA_Build 3 133585395 2D GAAAATGCGG TA/-- TATATATATA 494 het 494 ref 29 16 3 12 TA 6 5 172941 CASAVA_Build 3 133585739 1I ATGGATATAG -/C ACAGATATCC 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 C 0 1 172942 CASAVA_Build 3 133586625 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 2255 het 1540 hom 13 4 5 4 A 10 9 172943 CASAVA_Build 3 133587692 1D GACCCCATCT C/- AAAAAAAAAA 2578 het 2578 ref 24 11 8 7 C 1 0 172944 CASAVA_Build 3 133594153 3D ATTATTTCAT ATA/--- ATGATTATCA 3070 het 3070 ref 35 24 9 4 ATA 1 0 172945 CASAVA_Build 3 133610527 2D ACTGACAGTA AT/-- ATAATAACCA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AT 2 1 172946 CASAVA_Build 3 133610984 1I TTTTCACAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 9 10 172947 CASAVA_Build 3 133613297 1I TCACAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 A 9 10 172948 CASAVA_Build 3 133620938 3I AAAAATAAAA ---/TAT TATTAATAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TAT 1 2 172949 CASAVA_Build 3 133627623 1D AATTAGAGAA T/- GCAAGAATAT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 1 0 172950 CASAVA_Build 3 133629362 1D TTAGTCCTCA C/- CATAGCCCTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 C 2 1 172951 CASAVA_Build 3 133636688 2D GTTTCCTGTC TG/-- TAAGATGGTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 TG 1 0 172952 CASAVA_Build 3 133643541 1I AACACATTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 11 12 172953 CASAVA_Build 3 133648291 1D CTTATTTCTA G/- GGCTCTCAAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 3 2 172954 CASAVA_Build 3 133661763 1D ATTATCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 12 11 172955 CASAVA_Build 3 133696459 1D GTAACATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 8 10 A 12 11 172956 CASAVA_Build 3 133709008 1I ACTGTGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 12 13 172957 CASAVA_Build 3 133712281 2D TTTATATAAC TT/-- AATTATAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 T 2 0 172958 CASAVA_Build 3 133717079 1D CCTTAGTTGG T/- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 T 5 4 172959 CASAVA_Build 3 133730301 1D AAAGTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 T 11 10 172960 CASAVA_Build 3 133730312 1D TTTTTTTTTT C/- TTTGGTCGTG 3041 het 3041 ref 32 18 10 5 C 1 0 172961 CASAVA_Build 3 133734249 2I GGTATGATTG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 9 11 172962 CASAVA_Build 3 133736180 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 A 8 9 172963 CASAVA_Build 3 133783358 1D GGACACAAAA T/- CTAACACACT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 1 0 172964 CASAVA_Build 3 133784194 2I ATGCACACTC --/TG TCTGACAAAA 3070 het 3070 ref 50 23 23 4 TG 0 1 172965 CASAVA_Build 3 133803493 1I AAAACAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 9 10 172966 CASAVA_Build 3 133814963 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAGAAA 2479 hom 12 het 5 0 5 1 A 7 6 172967 CASAVA_Build 3 133823305 20D TAGCCTGGCC TACCTGTCTTTACCAAATGA/-------------------- AACATAATGA 3070 het 3070 ref 29 14 14 3 TACCTGTCTTTACCAAATGA 1 0 172968 CASAVA_Build 3 133825047 1I TACAGTACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 T 10 11 172969 CASAVA_Build 3 133831425 1I ATGTAATTAG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 7 8 172970 CASAVA_Build 3 133855166 3D CGTAGAAAAA CTC/--- CTCAAGAGAT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 CTC 2 1 172971 CASAVA_Build 3 133885467 1D CCTTCTTACT A/- AAACAACTTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 5 A 4 3 172972 CASAVA_Build 3 133890172 1I TTACTGATCT -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 6 7 172973 CASAVA_Build 3 133895426 1D AAAAAAAAAA T/- GAGGTTGCTA 1527 het 862 hom 16 6 5 5 T 1 0 172974 CASAVA_Build 3 133897848 1D AATAGAACTA T/- TTTTATAATT 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 T 5 4 172975 CASAVA_Build 3 133899061 4I AATATATCTT ----/ACTC ATTCTAATAT 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 ACTC 0 1 172976 CASAVA_Build 3 133931377 1D CATCCTCCAG C/- CCCCCCTCAC 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 C 7 6 172977 CASAVA_Build 3 133931896 2D ATCTTTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 15 9 T 14 12 172978 CASAVA_Build 3 133935523 4D ATGAATAAGT ATTA/---- ATTAACAGTG 3070 het 3070 hom 34 16 14 5 ATTA 2 1 172979 CASAVA_Build 3 133971664 1I TCTCAACATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 9 10 172980 CASAVA_Build 3 133979003 3I GGCATTTATC ---/TGA TGATGATAAT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 TGA 2 3 172981 CASAVA_Build 3 133991842 3I AACAAGGGCA ---/GTT GTTGTACCCA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 GTT 1 2 172982 CASAVA_Build 3 133993960 1D ACGCACACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 13 12 172983 CASAVA_Build 3 134017547 3D CACATGAGGC AAT/--- CACTATTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 17 6 AAT 1 0 172984 CASAVA_Build 3 134036830 1I ATCATATTTA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 T 6 7 172985 CASAVA_Build 3 134050921 1I CAGGAAATCA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 6 7 172986 CASAVA_Build 3 134052228 1D TTCTAGAATC T/- TTATGGTTTC 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 T 3 2 172987 CASAVA_Build 3 134062438 2D ATAGTGAGCC TG/-- TGTGTGTGTG 984 het 984 ref 37 22 4 12 TG 9 8 172988 CASAVA_Build 3 134076034 8I TGGCTACCCT --------/TGTGGCAA TGTGGCAATG 3070 het 2134 hom 22 7 9 6 TGTGGCAA 1 2 172989 CASAVA_Build 3 134089608 1D AATGCACGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 10 9 172990 CASAVA_Build 3 134091114 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 8 CT 2 1 172991 CASAVA_Build 3 134096651 6D AAAAATACCT AATGTA/------ AATAACGAGT 2605 het 2605 ref 14 7 7 2 AATGTA 1 0 172992 CASAVA_Build 3 134096755 1I TTAAAGCATT -/A AAAAAAAAAA 1543 het 1543 ref 17 6 5 6 A 10 11 172993 CASAVA_Build 3 134097239 3D ACAACCCTGA GAG/--- TAGCAATTGC 3070 het 3070 hom 63 30 31 7 GAG 1 0 172994 CASAVA_Build 3 134101000 2I GCCACATGCT --/TA TATATATATA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TA 5 6 172995 CASAVA_Build 3 134101654 5I TATTATATAT -----/TATTA TATTATAATT 1377 het 763 hom 7 3 3 1 TATTA 1 2 172996 CASAVA_Build 3 134110533 5I CTGCAAAAAG -----/AAGAA AAGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AAGAA 0 1 172997 CASAVA_Build 3 134112330 2I AAATACCAAT --/CA CAGTTATCCG 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 CA 1 2 172998 CASAVA_Build 3 134119289 1D TTATTCAGCA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 8 7 172999 CASAVA_Build 3 134124006 12D TTGTTTGTTT TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 25 12 9 8 TG 13 7 173000 CASAVA_Build 3 134127914 24D TGGCAAGATG GCTATAAACCAGTAATCACCGGTT/------------------------ GAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 44 32 15 6 GCTATAAACCAGTAATCACCGGTT 1 0 173001 CASAVA_Build 3 134130166 1D TCATCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2479 hom 30 11 16 3 A 14 13 173002 CASAVA_Build 3 134130340 6D ATAGAAGAGC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 2226 hom 30 8 10 14 A 16 10 173003 CASAVA_Build 3 134134204 1D GTTTTTAAAA C/- CTTGGTCTGA 3070 het 3070 hom 49 22 25 2 C 2 1 173004 CASAVA_Build 3 134134506 1D GCTTGTTATG A/- ACATTGTTGC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 2 1 173005 CASAVA_Build 3 134134843 4D AATTACTACT TATA/---- TATACATGCT 2289 het 2289 ref 25 18 6 2 TA 4 2 173006 CASAVA_Build 3 134139572 3D CTATATTATC CTT/--- CTCCCACAAA 3070 het 3070 hom 36 14 21 2 CTT 1 0 173007 CASAVA_Build 3 134142286 1D23M4I TGTATAGTGG TTTTTTTATGAATACAAGCATAAA----/-TTTTTTATGAATACAAGCATAAATAAT AATATGAAAG 3070 het 3070 ref 23 17 10 3 N/A 0 0 173008 CASAVA_Build 3 134143092 1I CCAAAAGGTT -/G GGTTTTTTTT 2434 het 1548 hom 19 6 9 4 G 2 3 173009 CASAVA_Build 3 134145529 2D TCCATAGGTT AC/-- AGAGCCACAG 3070 het 3070 ref 47 22 21 5 AC 1 0 173010 CASAVA_Build 3 134155469 1D TCTCTATATA T/- TGGATATAGA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 2 1 173011 CASAVA_Build 3 134165726 2D TCCCAAACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 21 8 A 13 11 173012 CASAVA_Build 3 134166240 1D TCATGCTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 A 9 8 173013 CASAVA_Build 3 134173976 14D TTATGGAGGT ACTATGGAGGAGGC/-------------- ACTATGGAGG 3070 het 3070 ref 56 28 24 12 ACTATGGAGGAGGC 2 1 173014 CASAVA_Build 3 134180189 1D TCAGTTCCCC T/- TTGTAGCCAG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 3 2 173015 CASAVA_Build 3 134185480 1I GGCAACCACC -/A ACCACGCCCA 991 het 379 hom 5 1 3 1 A 1 2 173016 CASAVA_Build 3 134186835 1D TTCCAGCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 T 10 9 173017 CASAVA_Build 3 134187406 1D ATGCCACCTC A/- GTGCGACCTT 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 A 1 0 173018 CASAVA_Build 3 134197150 2D AAGTGTTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 2709 het 2065 hom 22 6 10 6 T 16 14 173019 CASAVA_Build 3 134200991 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2476 het 2020 hom 24 9 9 6 T 14 13 173020 CASAVA_Build 3 134201028 1I26M1D CATCCCAATC -TTTTTTTTATATATTTTATTTTTTAAT/TTTTTTTTTTTATATTTTATTTTTTAA- TTTTTTTTAT 1108 het 1108 ref 16 7 3 7 N/A 0 0 173021 CASAVA_Build 3 134217084 1D TATTCATGCA T/- TTTTTTGTGC 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 T 7 6 173022 CASAVA_Build 3 134234745 1I CATGGCAAAA -/C CCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 C 4 5 173023 CASAVA_Build 3 134238795 2D CTGGGTAATA AG/-- AGCTTGGCTA 3070 het 3070 ref 43 25 14 5 AG 2 1 173024 CASAVA_Build 3 134243245 3I GGCATATGTA ---/TTG TTGGTTAATT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 TTG 1 2 173025 CASAVA_Build 3 134248383 3D AATGAGGGAT AGG/--- AGGTTAAAGA 3070 het 3070 ref 45 27 15 6 AGG 2 1 173026 CASAVA_Build 3 134258960 50D ATTAGTTGTG TGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------------------- TATATATATA 3070 het 721 hom 11 2 12 1 TGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 173027 CASAVA_Build 3 134259629 1I ATTGATTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 9 10 173028 CASAVA_Build 3 134260273 1D CTTATTAGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 T 9 8 173029 CASAVA_Build 3 134278807 1D TGCAGAGAGG A/- AAAAGGGCCC 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 5 4 173030 CASAVA_Build 3 134285657 1D TTCTTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 48 2 39 7 A 11 10 173031 CASAVA_Build 3 134286939 2D GGAAAAAGTT TA/-- TATACAAAGC 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 TA 3 2 173032 CASAVA_Build 3 134287299 1I ATTACTTTTA -/T TTTTTTTTTC 2087 het 2087 ref 31 19 7 5 T 9 10 173033 CASAVA_Build 3 134293391 1I AGACTTCTTA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 T 1 2 173034 CASAVA_Build 3 134294473 1I TCTGCCATGT -/C CTGTGGCTTG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 C 1 2 173035 CASAVA_Build 3 134304411 1I TCCATTCAAA -/C CCCCCAATGA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 C 5 6 173036 CASAVA_Build 3 134305684 5D GGGATATTTT CTTAA/----- CTTCTCTTAG 3070 het 3070 hom 39 18 20 3 CTTAA 1 0 173037 CASAVA_Build 3 134312117 3D GACCTGCATC TTG/--- TTGTCACATA 3070 het 3070 ref 57 29 18 12 TTG 2 1 173038 CASAVA_Build 3 134330883 2D CGCACCCACA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 205 hom 32 4 16 12 C 11 9 173039 CASAVA_Build 3 134336692 1D TCTGCTATCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 13 12 173040 CASAVA_Build 3 134355562 1I ATTAGTAGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 9 10 173041 CASAVA_Build 3 134366542 1D ATAAACACTA C/- CTGCCTTTGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 2 1 173042 CASAVA_Build 3 134370867 13I TTCTGTATTT -------------/TCTAAGCTTTGTG CAGTAAGCAT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TCTAAGCTTTGTG 0 1 173043 CASAVA_Build 3 134386992 1I GTCCAGTACC -/A TACAGGCTTC 3070 hom 90 het 37 0 29 8 A 0 1 173044 CASAVA_Build 3 134399876 4I TTTGGGAGAA ----/GGAC GCTTTCTTTA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 GGAC 0 1 173045 CASAVA_Build 3 134403696 1D TATTTCCTTA T/- AAATTTGTTT 3070 hom 42 het 19 0 14 5 T 1 0 173046 CASAVA_Build 3 134408872 2I TCCCAGTGAG --/GT GAGCCAGGTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GT 0 1 173047 CASAVA_Build 3 134416046 2D GAATCTTCTC TT/-- TTCCTAGGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 4 2 173048 CASAVA_Build 3 134425309 2D TAATGGAAAC AG/-- AAATTCTATC 3070 hom 63 het 24 0 21 4 AG 1 0 173049 CASAVA_Build 3 134426385 9I AGACATCTTA ---------/ACATTCATG ACATTCATGG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 ACATTCATG 1 2 173050 CASAVA_Build 3 134427229 1I GGAGGGGGGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 958 hom 22 2 16 4 A 9 10 173051 CASAVA_Build 3 134429724 1I ATATCTCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 41 2 29 10 A 13 14 173052 CASAVA_Build 3 134445317 1D TTGGCCTCCC A/- AAAGTGCTGG 3070 hom 50 het 20 0 13 7 A 4 3 173053 CASAVA_Build 3 134448012 1D GATTTGTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 28 11 A 12 11 173054 CASAVA_Build 3 134449176 1I TAATAATCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 10 11 173055 CASAVA_Build 3 134461822 3D AGACAATAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 17 14 173056 CASAVA_Build 3 134462190 1D TAATGAGGAG C/- CCATTGGAAA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 C 3 2 173057 CASAVA_Build 3 134465839 1I ACTGAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 855 hom 35 2 27 6 A 11 12 173058 CASAVA_Build 3 134469229 1D CAGGAGCTAC A/- GTTATCTGAA 3070 hom 99 het 40 0 34 7 A 1 0 173059 CASAVA_Build 3 134476470 1D TCCACTGCTC T/- TAGATCTGCT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 2 1 173060 CASAVA_Build 3 134491669 2D AGAGGGGGAC AG/-- AGCAGGCTAG 3070 hom 142 het 51 0 44 7 AG 2 1 173061 CASAVA_Build 3 134492155 1D ACTGCATCTG A/- AAAAAAAAAC 1840 het 1840 ref 32 20 5 7 A 10 9 173062 CASAVA_Build 3 134493122 1I TACCAGTGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 T 8 9 173063 CASAVA_Build 3 134493702 3D GAAGAGAATG TTT/--- TTTTTATACA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 T 8 5 173064 CASAVA_Build 3 134505987 3I GTCCAGTCAT ---/ACA ACATTTCTGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 ACA 1 2 173065 CASAVA_Build 3 134519137 1I GAGCATTAAC -/A AATAGTAATT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 3 173066 CASAVA_Build 3 134522014 6I TGAGAAAAAG ------/ACAAAA ACAAAACAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 ACAAAA 1 2 173067 CASAVA_Build 3 134534905 1D CCCCTCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 12 11 173068 CASAVA_Build 3 134541696 1D CAAAAAGTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 T 9 8 173069 CASAVA_Build 3 134551126 1I ACTTAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 895 hom 45 2 36 7 A 10 11 173070 CASAVA_Build 3 134556336 3D CATATAACCA TTT/--- TTTTTTCAAA 3070 hom 87 het 31 0 29 3 T 9 6 173071 CASAVA_Build 3 134557798 8I ATACTTAACC --------/TAGGTATA AAGGAGGTGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAGGTATA 0 1 173072 CASAVA_Build 3 134564951 1D CTTTTCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 13 12 173073 CASAVA_Build 3 134567506 2D AGAGGGAGAC AG/-- AGAAGTGGGG 3070 hom 105 het 38 0 35 4 AG 2 1 173074 CASAVA_Build 3 134579328 14D CCGGTGAGCC AGCATCACCACCGG/-------------- AGCATCACCG 3070 hom 84 het 28 0 27 2 AGCATCACCACCGG 1 0 173075 CASAVA_Build 3 134589915 2I GTTTTTCCTC --/TG TAGAATAAGG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 TG 0 1 173076 CASAVA_Build 3 134592100 1D AAGCACTGTT C/- CTGGGACTTT 3070 hom 125 het 46 0 41 5 C 2 1 173077 CASAVA_Build 3 134592286 1I ACACAAACAC -/A AGACGAGTTA 3070 hom 111 het 40 0 36 4 A 1 2 173078 CASAVA_Build 3 134596362 3D GCAGTAAGTA CTC/--- CTCAGAAAGT 2439 het 2439 ref 35 27 6 2 CTC 2 1 173079 CASAVA_Build 3 134597863 2I TGTTACAGTG --/GT CAAGCGCACG 3070 hom 105 het 43 0 34 9 GT 0 1 173080 CASAVA_Build 3 134605533 1D GGGAGGGGGG A/- ATCTTCCTCA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 2 1 173081 CASAVA_Build 3 134610356 1I TGTTTACATT -/G GAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 G 1 2 173082 CASAVA_Build 3 134612715 3D TATAACACCG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 10 10 A 19 16 173083 CASAVA_Build 3 134613256 1D ATATTTAGAC A/- ACTAGACAGT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 2 1 173084 CASAVA_Build 3 134626046 1D AAATACTTTT G/- CCCAGGTCCC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 1 0 173085 CASAVA_Build 3 134630017 1I AAATAGTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 203 hom 25 1 16 8 A 11 12 173086 CASAVA_Build 3 134630192 1D TTGTCAGAGG A/- AAGTCGGGGA 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 A 3 2 173087 CASAVA_Build 3 134630557 1I GTTATTTGTT -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 6 7 173088 CASAVA_Build 3 134631289 1D AAATGTAAAC T/- TTTTTTTTTT 37 het 37 ref 14 3 1 10 T 13 12 173089 CASAVA_Build 3 134631300 2I TTTTTTTTTT --/TA TTATTATACT 2977 het 813 hom 11 3 8 2 TA 0 1 173090 CASAVA_Build 3 134641761 8D ACCTACCCCC ATGATTCA/-------- ATGATTCAAT 3070 hom 54 het 27 0 18 9 ATGATTCA 2 1 173091 CASAVA_Build 3 134663606 1D AGGCAGGCAT G/- GACCTGGGAG 3070 hom 75 het 31 0 23 8 G 2 1 173092 CASAVA_Build 3 134666196 2I GAAAATATAT --/AC AGTCAGTGTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 AC 0 1 173093 CASAVA_Build 3 134685765 1D AGGTTCCCCT G/- TGTCCACATC 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 G 1 0 173094 CASAVA_Build 3 134698500 3D GTTTAAGCGA TCC/--- ACCCGCCTCG 2309 het 2309 ref 21 10 6 6 TCC 1 0 173095 CASAVA_Build 3 134700340 1I TTTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 1999 het 1999 ref 17 7 7 3 T 11 12 173096 CASAVA_Build 3 134709308 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCATCTC 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 C 5 6 173097 CASAVA_Build 3 134713709 2D TTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 526 het 213 hom 29 3 3 23 T 16 14 173098 CASAVA_Build 3 134721305 1I TGCACTAAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 9 10 173099 CASAVA_Build 3 134741378 1D TACAGAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 12 11 173100 CASAVA_Build 3 134743733 1I TTTAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 77 het 30 0 25 5 A 9 10 173101 CASAVA_Build 3 134745957 4I TTGCAAGGAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 TTTA 3 4 173102 CASAVA_Build 3 134750984 1I AGCTCCTTGA -/G GTTGTCAACT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 1 2 173103 CASAVA_Build 3 134763966 1D AGAGGCAGGT C/- TCACTCTGTG 3070 het 2718 hom 27 8 16 4 C 1 0 173104 CASAVA_Build 3 134771233 2D TTGTGCAGTC CT/-- CTGTTAATGT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 CT 2 1 173105 CASAVA_Build 3 134778092 1I CTTGGCAAAA -/G TAGCACTTTT 3070 hom 126 het 49 0 42 7 G 0 1 173106 CASAVA_Build 3 134792643 1D GATTGAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 24 1 16 8 T 12 11 173107 CASAVA_Build 3 134796276 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 22 2 14 6 A 13 14 173108 CASAVA_Build 3 134799561 2D TCCAAACTCT AG/-- AATTATGAAC 3070 het 3070 ref 39 20 18 2 AG 1 0 173109 CASAVA_Build 3 134800598 8D TTTCAAAGAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2883 het 428 hom 20 2 9 9 T 20 12 173110 CASAVA_Build 3 134807023 4I ACATTTGAAA ----/ATGT ATGTAATTCC 3070 hom 119 het 44 0 40 4 ATGT 1 2 173111 CASAVA_Build 3 134811724 2D GGGGTTGCAG CT/-- CTCTGTTTGC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 CT 3 2 173112 CASAVA_Build 3 134811983 5D ATAATATAAA TAACT/----- AAAGTACTGA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 TAACT 1 0 173113 CASAVA_Build 3 134817348 1I CACTATGTTG -/C CCAGGCTGGT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 C 2 3 173114 CASAVA_Build 3 134817821 1D GTCTCGCAAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 2000 hom 22 7 14 1 T 7 6 173115 CASAVA_Build 3 134820668 2D AACAAAAAAC AA/-- AAAACAAAAC 1163 het 1163 ref 26 14 8 5 A 6 4 173116 CASAVA_Build 3 134827266 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 984 het 984 ref 27 19 3 5 A 12 11 173117 CASAVA_Build 3 134829409 1I TCCAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 15 16 A 13 14 173118 CASAVA_Build 3 134832136 1I CTCGCTGTAA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 T 7 8 173119 CASAVA_Build 3 134837614 1D AAAACTATAG T/- TATTAGAAGT 3070 hom 83 het 31 0 26 6 T 2 1 173120 CASAVA_Build 3 134837931 3I TTTGAAGATG ---/ATA ATAAGATTAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 ATA 1 2 173121 CASAVA_Build 3 134843915 1D GCTTTTTCAA G/- TCTTTTAGCT 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 G 1 0 173122 CASAVA_Build 3 134850333 1D ATCCTGCTTC A/- AAAAAAAAAA 1769 het 1769 ref 28 17 5 6 A 13 12 173123 CASAVA_Build 3 134850475 1I TTATAAAGGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 13 14 0 T 8 9 173124 CASAVA_Build 3 134856585 2D TACTAAAAAT AA/-- AAAGTTATTC 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 A 5 3 173125 CASAVA_Build 3 134861292 1D TTAAAAATAC G/- TATTTATATA 1186 het 1186 ref 20 8 4 9 G 1 0 173126 CASAVA_Build 3 134864213 1I ATGGGCCTGC -/A AAACCTTAGT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 3 4 173127 CASAVA_Build 3 134866674 1D GTAGCAAGAA C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 5 4 173128 CASAVA_Build 3 134875248 4D TTGTGCCAGC TTTG/---- TTTGTTAACG 3070 het 3070 hom 46 17 22 9 TTTG 2 1 173129 CASAVA_Build 3 134891735 1I TAAGCATGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 9 10 173130 CASAVA_Build 3 134897920 1I TAAGTATGTA -/T GTATAGAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 0 1 173131 CASAVA_Build 3 134898328 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 872 het 872 ref 39 8 5 26 T 12 10 173132 CASAVA_Build 3 134905234 1D ATAAGTATAC A/- TTTTTTACTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 0 173133 CASAVA_Build 3 134906809 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 25 0 17 9 A 15 14 173134 CASAVA_Build 3 134910305 1D AATGTATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1478 hom 15 5 9 1 T 13 12 173135 CASAVA_Build 3 134922846 1D TGTCTTAAGG A/- ATTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 2 1 173136 CASAVA_Build 3 134934800 1I ACCTGGGAGA -/G GGGGCCTGTG 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 G 4 5 173137 CASAVA_Build 3 134936338 1D AGAGTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 29 0 16 14 A 15 14 173138 CASAVA_Build 3 134937337 1D52M1I ATATGGGACT ATGTGAAAAGACCAAACCTACATTTGATTTGTGTACCTGAAAGTGACAGGGAG-/-GGTGAAAAGACCAAACCTACGTTTGATTGGTGTACCTGAAAGTGACGGGGAGA AATGGAACCA 2863 het 2863 ref 21 26 6 0 N/A 0 0 173139 CASAVA_Build 3 134951993 10I CTGGGGTTTT ----------/CCTCCTCTAC CCGTGTCTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 CCTCCTCTAC 0 1 173140 CASAVA_Build 3 134970155 5I AATAAACACT -----/GAGTG GAGTGGAGAG 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 GAGTG 1 2 173141 CASAVA_Build 3 134974261 6D ACTAAATTTT GAAATA/------ ATTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 40 24 16 4 GAAATA 1 0 173142 CASAVA_Build 3 134976396 1D AATGGGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 29 0 14 16 T 14 13 173143 CASAVA_Build 3 135005195 1D TCCCAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 12 11 173144 CASAVA_Build 3 135020118 1I CATGTTTTAC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 6 7 173145 CASAVA_Build 3 135031490 4D AACTTTATCT TGTG/---- TGTATGTATA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 TG 3 1 173146 CASAVA_Build 3 135052553 1D AGTGTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 11 11 A 14 13 173147 CASAVA_Build 3 135054219 1D CACCATGTTG C/- CCAGGCTGGT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 C 3 2 173148 CASAVA_Build 3 135063665 1D TGCAATATTG A/- AAAAAAAAAA 2044 het 2044 ref 22 9 6 7 A 13 12 173149 CASAVA_Build 3 135076335 1D TGTCTATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 13 12 173150 CASAVA_Build 3 135076806 2I ACAGTTACAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 813 hom 46 2 36 8 GT 7 8 173151 CASAVA_Build 3 135085113 1I CAGCACTTCT -/A ATGGATCTCT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 A 1 2 173152 CASAVA_Build 3 135085599 4I CCCTGAACTC ----/ACAG ACAACCTGGC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 ACAG 0 1 173153 CASAVA_Build 3 135100798 2D TTTGCTGTGT TA/-- TATATATATA 1647 het 333 hom 12 1 5 6 TA 10 9 173154 CASAVA_Build 3 135101488 1I GCATGTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 10 11 173155 CASAVA_Build 3 135106390 1D TCTATGGTGG T/- TTTTTTTTTT 1863 het 1863 ref 30 26 4 0 T 11 10 173156 CASAVA_Build 3 135113196 1I TAGTCTCCTC -/T TCTTCCTCTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 1 2 173157 CASAVA_Build 3 135120325 1D ATTAAGTACA T/- TTTAATATAT 3070 het 3070 ref 37 24 12 2 T 4 3 173158 CASAVA_Build 3 135146515 2I CTGGTAATGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 84 het 37 0 26 11 GT 5 6 173159 CASAVA_Build 3 135196691 6I AGTCACCACA ------/CACCTC CACCTCCAGG 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 CACCTC 1 2 173160 CASAVA_Build 3 135223363 4D TTGAAGGTAT TCTC/---- TGTAACCTAT 3070 hom 72 het 26 0 24 3 TC 2 0 173161 CASAVA_Build 3 135223519 1D CTTTGCTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 21 0 16 5 A 12 11 173162 CASAVA_Build 3 135225429 3D CAGCCTGGAG TAA/--- TAAGTCATGC 3070 hom 93 het 35 0 29 6 TAA 2 1 173163 CASAVA_Build 3 135230532 1I TGGTGAGTGG -/C ACCTGCTTAG 3070 hom 96 het 36 0 31 5 C 0 1 173164 CASAVA_Build 3 135235605 2D CTGCCAGCCT CA/-- CAATGCTTGG 3070 hom 96 het 35 0 30 5 CA 2 1 173165 CASAVA_Build 3 135242840 1I TTTTAAAATT -/A AAGCTGTAAA 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 A 2 3 173166 CASAVA_Build 3 135253298 3D TTTGTATTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 71 het 31 0 22 9 TTG 4 3 173167 CASAVA_Build 3 135254369 23D TAAAAAAAAA TATATATATATATATATATATAT/----------------------- ATATATATAT 3070 hom 30 het 11 0 11 1 TATATATATATATATATATATAT 1 0 173168 CASAVA_Build 3 135257288 23D CTAGAAACTG TCCTATAAGGCCGTGCAATGACC/----------------------- GCCGGGGGCC 3070 hom 83 het 27 0 26 7 TCCTATAAGGCCGTGCAATGACC 1 0 173169 CASAVA_Build 3 135262057 1I GCTGGAATTC -/A AACCCCTCTC 3070 hom 120 het 47 0 37 10 A 2 3 173170 CASAVA_Build 3 135279133 1I TTTTTTAAAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 T 8 9 173171 CASAVA_Build 3 135281252 1D ACCCTAAAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 T 10 9 173172 CASAVA_Build 3 135314441 1D TTGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1565 het 1565 ref 31 23 4 4 A 11 10 173173 CASAVA_Build 3 135326121 1D ATGAAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 39 0 29 10 A 12 11 173174 CASAVA_Build 3 135336729 2I TTACCCCACT --/AG GTTCTTGGGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AG 0 1 173175 CASAVA_Build 3 135338099 12D AGGAAGGGAA GAAGGAAGGGAG/------------ GAAGGAAGGG 3070 hom 61 het 32 0 23 12 GAAGGAAGGGAG 2 1 173176 CASAVA_Build 3 135349009 3I CCTGGCAGAG ---/CTC CTCAACTGTT 3070 hom 116 het 42 0 33 9 CTC 1 2 173177 CASAVA_Build 3 135370151 1I ACCGGGGCCT -/G TCGTAGGGTA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 G 0 1 173178 CASAVA_Build 3 135378610 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 8 173179 CASAVA_Build 3 135378918 1D AGCTGACAGC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 8 7 173180 CASAVA_Build 3 135380166 1I AGTGACCATC -/T TTCTCTTGGC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 2 3 173181 CASAVA_Build 3 135386679 2D AAATTAATTA AT/-- TAATTAAATA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AT 1 0 173182 CASAVA_Build 3 135408005 1I ACATATATCA -/C CCCAACAGTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 3 4 173183 CASAVA_Build 3 135417570 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 26 2 20 4 A 11 12 173184 CASAVA_Build 3 135425141 1D TGAGAAATGT A/- AAAAAAAAAA 2556 het 2556 ref 47 22 7 18 A 17 16 173185 CASAVA_Build 3 135442947 3D TCACCTTTTT ATA/--- ATATCATATT 3070 hom 96 het 38 0 32 8 ATA 2 1 173186 CASAVA_Build 3 135470915 1I GAGACCCCAT -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 C 8 9 173187 CASAVA_Build 3 135485303 1D TGTTGGTGGC T/- TTTTTTTTTT 2122 het 1812 hom 31 10 6 15 T 17 16 173188 CASAVA_Build 3 135497167 1I TGATTCCACC -/A AAAAAAACTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 7 8 173189 CASAVA_Build 3 135497270 1I TAAACTATCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 9 10 173190 CASAVA_Build 3 135499864 2D AGCTCTACAC AT/-- GTTTGCAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 AT 1 0 173191 CASAVA_Build 3 135499965 1I GAAGATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 10 11 173192 CASAVA_Build 3 135506636 1D TTAATATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 11 10 173193 CASAVA_Build 3 135508552 2I TCCCCCTAGA --/TG GGTGAATATG 2702 het 2702 ref 25 10 7 8 TG 0 1 173194 CASAVA_Build 3 135518310 1I TTTTCTCAAA -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 G 0 1 173195 CASAVA_Build 3 135527869 20I CATTGAGCAG --------------------/CGCCTGAATAAAGTCCAGCT CGCCTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 CGCCTGAATAAAGTCCAGCT 0 1 173196 CASAVA_Build 3 135555114 1D TCTTGTTTGG A/- AAAAAAAAAA 1010 het 1010 ref 40 29 3 8 A 12 11 173197 CASAVA_Build 3 135564829 11D CTGTGGCATG GAGGAAAATAC/----------- GAGGAAGTCC 3070 het 3070 ref 61 31 28 7 GAGGAAAATAC 1 0 173198 CASAVA_Build 3 135566732 1D ATTCTCTCTT G/- AACATCTGCC 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 G 1 0 173199 CASAVA_Build 3 135567761 4D AGAACAAAAG AAGT/---- AAGTCCTCTG 3070 het 3070 hom 34 15 19 1 AAGT 2 1 173200 CASAVA_Build 3 135573408 1D CAGAAGATAA C/- CCACCAGGAA 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 C 3 2 173201 CASAVA_Build 3 135573979 1D TGGGTCAGTC T/- TTTGTGCTGA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 T 4 3 173202 CASAVA_Build 3 135574685 1D CAGTCATGCG C/- CCCCCACACA 3070 het 1790 hom 17 5 10 2 C 6 5 173203 CASAVA_Build 3 135578675 1I AGGAAATGTT -/C CCCCTTACTT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 4 5 173204 CASAVA_Build 3 135579483 1D GACTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1990 hom 30 8 12 10 A 13 12 173205 CASAVA_Build 3 135579762 3D ACATAGATGA ACT/--- ACTGCAGGAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ACT 2 1 173206 CASAVA_Build 3 135620649 5D GACATAGATG AGAAC/----- AGAACATTTG 3070 het 3070 hom 42 19 20 6 AGAAC 2 1 173207 CASAVA_Build 3 135623240 11D TAGTGCCCCT TACCATAGTGC/----------- TACCATGTGT 3070 hom 96 het 41 0 30 13 TACCATAGTGC 1 0 173208 CASAVA_Build 3 135626250 3D CTACAGAAAT ATC/--- ATTGTGAATT 3070 hom 163 het 62 0 55 9 ATC 1 0 173209 CASAVA_Build 3 135627634 3I TGCTCAGGAG ---/GCT GAGGTGGGAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 GCT 0 1 173210 CASAVA_Build 3 135634465 3I CTAGGGTCTC ---/CTT CTCCTACACA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CTT 0 1 173211 CASAVA_Build 3 135636308 16I4M4I GTTTTTTTTG ----------------GTTT----/TTGTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTG TTTTGTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 N/A 0 0 173212 CASAVA_Build 3 135646885 1D GAATATTAAA T/- TTTTATTGTG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 5 4 173213 CASAVA_Build 3 135652660 1D TTCATATAAA T/- AATTACAGGC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 1 0 173214 CASAVA_Build 3 135670777 4D CACCACTGCA CTAT/---- CTATCTAGTA 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 CTAT 2 1 173215 CASAVA_Build 3 135676830 2D TGATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 22 10 11 1 AT 7 6 173216 CASAVA_Build 3 135685921 1D TCCGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 2667 het 2667 ref 25 10 8 7 A 11 10 173217 CASAVA_Build 3 135687524 3D TCCTGCCACG CCC/--- CCCCCCCCTC 1963 hom 5 het 14 0 7 7 C 11 8 173218 CASAVA_Build 3 135688136 4D GGCGGACCCA CCTT/---- CCTTTTCAGC 1969 het 1969 ref 25 13 8 6 CCTT 2 1 173219 CASAVA_Build 3 135694013 4I TGTTTGGCAC ----/TACT CAGGCAGATG 3070 het 3070 hom 46 14 23 9 TACT 0 1 173220 CASAVA_Build 3 135697732 1I ATTGATGCTA -/T TTTCAGTCAT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 3 4 173221 CASAVA_Build 3 135702510 1I TTGAGATCTT -/A ACATTTAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 1 2 173222 CASAVA_Build 3 135703103 1I TATTCTTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 9 10 173223 CASAVA_Build 3 135703816 1I TGGTCTGTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 9 10 173224 CASAVA_Build 3 135705373 22I ATGTTTTTGG ----------------------/TTTCCATTTGTGTAGGATATTT TTTCCCATCT 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 TTTCCATTTGTGTAGGATATTT 0 1 173225 CASAVA_Build 3 135705646 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 24 12 6 T 12 11 173226 CASAVA_Build 3 135705789 1I CCCATATGCA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 38 15 18 9 T 6 7 173227 CASAVA_Build 3 135706239 1I TGTACCTATG -/C CCATCTTTTC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 C 2 3 173228 CASAVA_Build 3 135710504 1I TCTTTCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2909 hom 31 12 12 7 T 13 14 173229 CASAVA_Build 3 135712506 1I CCACCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 2200 het 2200 ref 37 14 11 12 T 12 13 173230 CASAVA_Build 3 135722979 1D CTGGATTGTT C/- CCCCGTTGGG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 C 5 4 173231 CASAVA_Build 3 135728450 1D CTCTAACTCT G/- GGGGGGCTCG 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 G 7 6 173232 CASAVA_Build 3 135743286 1D CTCAAGTGAT C/- CACCCGCCTC 3070 het 2253 hom 29 8 15 6 C 2 1 173233 CASAVA_Build 3 135745378 1D CTCTTTGAAA G/- AAAAGTTTAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 G 1 0 173234 CASAVA_Build 3 135749147 3D TTCTTATTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 289 hom 22 4 11 7 T 15 12 173235 CASAVA_Build 3 135750183 14D TTATCTTTAA GTAATACATTTTTT/-------------- GTTTTTACAT 3070 het 3070 hom 45 21 24 6 GTAATACATTTTTT 1 0 173236 CASAVA_Build 3 135753273 16D ATATATATAT ATATATATATATATAC/---------------- ACACACACAC 1668 het 244 hom 9 2 5 3 ATATATATATATATAC 1 0 173237 CASAVA_Build 3 135755463 2I GAAATAAACT --/AA ATATTTATTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 3 173238 CASAVA_Build 3 135759886 1I TCAAGTAAAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 7 7 T 6 7 173239 CASAVA_Build 3 135767662 1D AATTCACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 9 T 11 10 173240 CASAVA_Build 3 135769000 1I CACTGTTACC -/A AAAAAAAAAA 2631 het 31 hom 32 1 18 13 A 16 17 173241 CASAVA_Build 3 135778392 2D GAACTAAAAC TT/-- GGCTCCCTGT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 2 0 173242 CASAVA_Build 3 135778785 1D AACTTCTAGG A/- AAAAAAAAAT 1655 het 1655 ref 21 13 5 3 A 10 9 173243 CASAVA_Build 3 135780858 1D TTCCCAGGAA T/- TGCTGGGTTT 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 T 2 1 173244 CASAVA_Build 3 135781914 1I TGTACAACTC -/T TAAGAATTTA 3070 het 3070 ref 37 23 8 6 T 1 2 173245 CASAVA_Build 3 135782534 35D GAGTATCAGA GTGATGTGGTATGAGAAGGACTCCACTGGCCATTG/----------------------------------- GTGGTTATGA 3070 het 3070 ref 42 27 23 3 GTGATGTGGTATGAGAAGGACTCCACTGGCCATTG 1 0 173246 CASAVA_Build 3 135783052 1D GCGGAGGTTG C/- CAGTGAGCCG 2686 hom 15 het 6 0 6 0 C 2 1 173247 CASAVA_Build 3 135783753 1D GGGTAGATGT G/- CACAACGTGC 3070 het 1216 hom 14 3 9 2 G 1 0 173248 CASAVA_Build 3 135787559 8D ACTCCTGCTT TTTTTTGC/-------- TTTCTATTTG 1193 het 1193 ref 12 9 3 1 TTTTTTGC 1 0 173249 CASAVA_Build 3 135788753 1I TTCTCTGTCC -/A AGTTTTTTTC 2831 het 2831 ref 33 22 7 4 A 1 2 173250 CASAVA_Build 3 135802795 1D AACGAGAGGG A/- GGGGCTTGCT 2130 het 2130 ref 28 18 6 5 A 1 0 173251 CASAVA_Build 3 135803516 11I ATCTGGTACT -----------/TACCAAGGCAC TCTGTGAGCA 3070 hom 53 het 23 0 17 6 TACCAAGGCAC 0 1 173252 CASAVA_Build 3 135831936 1I ATATTTACTG -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 6 7 173253 CASAVA_Build 3 135833078 7D CTGATAGGTT TTTGATA/------- TATTAGATGT 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 TTTGATA 1 0 173254 CASAVA_Build 3 135840440 2D AGACTGTCAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 1735 hom 41 8 15 19 GT 7 6 173255 CASAVA_Build 3 135844069 2I AGTCAACTGT --/AG AGTCAGTGAT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 AG 1 2 173256 CASAVA_Build 3 135865238 15D GCGGGGCCCC AGAGGGGCCAGGAAG/--------------- GAGGGATATG 3070 het 1802 hom 25 11 12 5 AGAGGGGCCAGGAAG 1 0 173257 CASAVA_Build 3 135866304 1D TCATTTTTTT G/- GGCCCTGGTT 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 G 3 2 173258 CASAVA_Build 3 135870735 1I ATTTTTTAAA -/T TGTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 1 2 173259 CASAVA_Build 3 135894977 1I TTCTGTAAGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 A 8 9 173260 CASAVA_Build 3 135902563 1D CTTTTATATG T/- TTTTTTGTGT 3070 hom 147 het 56 0 49 7 T 7 6 173261 CASAVA_Build 3 135903919 1D ATGTGGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3015 hom 27 11 9 7 A 13 12 173262 CASAVA_Build 3 135913925 1D AGTTTCTGTC T/- TTTAAAACAA 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 T 4 3 173263 CASAVA_Build 3 135917048 1D20M2D CCAGGAAAGG TTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTG/-ATTTTTTTTTTGTTTTTTTT-- TTTTTTCCTC 3070 hom 76 het 31 0 28 9 N/A 0 0 173264 CASAVA_Build 3 135918426 1I GTACAAAAGG -/A ACGGATGCAC 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 A 1 2 173265 CASAVA_Build 3 135926615 1D GTATGCAACC A/- AAACCTGTAA 3070 het 3070 ref 37 21 10 7 A 4 3 173266 CASAVA_Build 3 135934899 2D CTTTAAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 13 11 173267 CASAVA_Build 3 135948629 7D ATTAATTTTT GTATAAG/------- GTATAAGGAA 2276 het 847 hom 8 2 5 2 GTATAAG 2 1 173268 CASAVA_Build 3 135951361 7I GGCTAGGAGA -------/GTTGAGC GTTGAGCAGA 2079 het 2079 ref 22 8 6 8 GTTGAGC 1 2 173269 CASAVA_Build 3 135955425 2I GGACACAAAC --/AT GTGTAAGCCA 3070 hom 137 het 52 0 43 9 AT 0 1 173270 CASAVA_Build 3 135973097 6D GTCGATGTTG CTGTTT/------ CAAGAATCAT 3070 hom 93 het 32 0 32 5 CTGTTT 1 0 173271 CASAVA_Build 3 135973814 1I CGTGCAGCTG -/A TGCAGGGCTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 173272 CASAVA_Build 3 135995371 5I GGGGAGGGGA -----/GGGGC GGAGGAAGGC 2799 hom 35 het 18 0 12 6 GGGGC 0 1 173273 CASAVA_Build 3 136005965 5D GCTACAACTC AAGTT/----- AAGATTTGGG 3070 hom 115 het 42 0 36 10 AAGTT 1 0 173274 CASAVA_Build 3 136017295 1I CTTTCTTTGA -/T TGGGGTCATA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 1 2 173275 CASAVA_Build 3 136040167 1D CCCTTCTCTT A/- AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 7 6 173276 CASAVA_Build 3 136045151 1D CATTGATCTA T/- CTTCAAATTC 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 T 1 0 173277 CASAVA_Build 3 136053927 1D CAGGAGAGAA G/- GGGCAGAGGG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 G 4 3 173278 CASAVA_Build 3 136056448 1D AAGTATAAAG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 A 7 6 173279 CASAVA_Build 3 136057198 1I TTCTGATACA -/T TTTTTTCAGT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 6 7 173280 CASAVA_Build 3 136059462 1D GTTTACACAT A/- AGTCTTTGTG 3070 het 3070 hom 46 20 25 1 A 2 1 173281 CASAVA_Build 3 136064032 1D TTGTAAGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 19 7 A 14 13 173282 CASAVA_Build 3 136071274 3D CAAAAGTGAT AGC/--- AGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 19 17 2 AGC 1 0 173283 CASAVA_Build 3 136087221 1D TTTGGAAAAC T/- TCTGGGTCAA 3070 het 3070 ref 51 24 18 10 T 2 1 173284 CASAVA_Build 3 136090442 3D CTCTGGAAGG GGA/--- GGGGGGCCCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 GGA 1 0 173285 CASAVA_Build 3 136091169 1D CTTACAGCTC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 T 8 7 173286 CASAVA_Build 3 136112906 3I CATCTTCCGG ---/GGA GGAGGAGGGC 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 GGA 2 3 173287 CASAVA_Build 3 136116944 1D TGCAAGCCAA G/- GAACACCAGA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 G 2 1 173288 CASAVA_Build 3 136130375 1I AAGAGTGGGC -/T TGGGAGCAGG 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 T 1 2 173289 CASAVA_Build 3 136131569 13D AACTGGGTTT GCCCCATCCAGAG/------------- GAGGCACACA 3070 het 3070 ref 36 21 11 8 GCCCCATCCAGAG 1 0 173290 CASAVA_Build 3 136134995 1D GTGGAGAGCC T/- ACTGGAAGGC 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 T 1 0 173291 CASAVA_Build 3 136136198 5D AAATATATTG GATAT/----- GACTTTGTGT 2554 het 2554 ref 30 15 7 10 GATAT 1 0 173292 CASAVA_Build 3 136136252 2D GGAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 1434 het 1434 ref 19 11 5 4 AG 7 6 173293 CASAVA_Build 3 136140873 1D CACCTTTCTC A/- AATGGAATAC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 3 2 173294 CASAVA_Build 3 136141657 2I GAGAGGGAGT --/AA TTAGCCTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 0 2 173295 CASAVA_Build 3 136144912 2D TCTTGCCCTG TC/-- TGTTGTCACT 3070 het 3070 hom 46 16 24 7 TC 1 0 173296 CASAVA_Build 3 136146306 2I GATAAAAGTC --/TG AGAAATTATC 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 TG 0 1 173297 CASAVA_Build 3 136148327 3I CCTGCTCCTC ---/CTT CACCTTCCTC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 CTT 0 1 173298 CASAVA_Build 3 136149862 1I GCAGAACAGT -/A AAAAAAAAAA 1989 het 1989 ref 44 19 7 18 A 15 16 173299 CASAVA_Build 3 136150959 6D CCTCTCCACA CTATGC/------ CTGTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 28 18 5 CTATGC 1 0 173300 CASAVA_Build 3 136162457 5D TCTACATCAG CACAC/----- CACACATTCC 3070 het 3070 ref 36 21 10 7 CACAC 2 1 173301 CASAVA_Build 3 136176096 1I TGTGTCCCCA -/C CCCCTGCCCC 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 C 4 5 173302 CASAVA_Build 3 136177312 1D TTAAGAGGGC A/- GGGGGGGAGT 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 A 1 0 173303 CASAVA_Build 3 136179700 1I CACTGAGTTA -/C CAAGTCCTAT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 C 1 2 173304 CASAVA_Build 3 136180775 1D GTGATTAGAT C/- TTTGGAAGCT 3070 het 3070 ref 39 19 15 7 C 1 0 173305 CASAVA_Build 3 136182006 2I AATGGGAAGG --/GT GTGTCAAGAA 3070 het 3070 hom 43 13 21 9 GT 2 3 173306 CASAVA_Build 3 136184350 1D TTTTCAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 12 14 A 12 11 173307 CASAVA_Build 3 136237436 1D GGCTCATGGG A/- TTTGCCGAAG 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 1 0 173308 CASAVA_Build 3 136244366 7D TATGTATTTA TTTATTT/------- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 24 8 10 6 TTTATTT 3 2 173309 CASAVA_Build 3 136254721 1D ATTAACATTT A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 39 het 16 0 14 3 A 8 7 173310 CASAVA_Build 3 136274659 1D AAAATCATTG T/- ATGATTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 1 0 173311 CASAVA_Build 3 136277767 10D CTGAAAAGGG ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 hom 45 het 23 0 16 9 AT 13 8 173312 CASAVA_Build 3 136300642 3D TTTGTTGTTG TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 37 9 23 7 TTA 4 3 173313 CASAVA_Build 3 136308958 1D TTTGCTCCTA C/- TCCTCTGAGC 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 C 1 0 173314 CASAVA_Build 3 136327069 1D GAGAGGAAGA G/- AGCTGAACTT 3070 het 3070 hom 62 30 29 3 G 1 0 173315 CASAVA_Build 3 136327233 1I TGATAATGGT -/A CTACATCCCT 3070 hom 156 het 58 0 52 6 A 0 1 173316 CASAVA_Build 3 136384215 4I CTAGTAGAAA ----/AAGT AAGTAAGTTT 3070 het 3070 hom 51 16 30 5 AAGT 2 3 173317 CASAVA_Build 3 136389735 1D TCTAAAAAAA T/- AAATAAATAA 826 het 826 ref 17 12 4 1 T 1 0 173318 CASAVA_Build 3 136392095 18I ATACATCCAC ------------------/ATATATACACACATACAT ATATACACAC 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 ATATATACACACATACAT 0 1 173319 CASAVA_Build 3 136398207 4D CTACTCAGAG AAGA/---- AAGGAAAAGG 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 AAGA 1 0 173320 CASAVA_Build 3 136405717 4D TTTAGTTATC TTAA/---- TTAATTAAGT 2347 het 2202 hom 12 6 6 0 TTAA 3 2 173321 CASAVA_Build 3 136408980 2I GCCACAAGCT --/GG GGGGACATAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 4 6 173322 CASAVA_Build 3 136430303 4I CTTGGCTGAC ----/AGTT AGGGACTCCA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 AGTT 0 1 173323 CASAVA_Build 3 136434149 1D AATTTGCTGC T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 T 7 6 173324 CASAVA_Build 3 136440819 1I TGTTTGCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 T 10 11 173325 CASAVA_Build 3 136448241 6D CAACAGTTTA GAGGAG/------ GAGGAGAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 21 6 GAG 4 2 173326 CASAVA_Build 3 136461344 1I CAAATTGGGG -/A AAAAAAAAAG 2663 het 2663 ref 28 14 7 7 A 9 10 173327 CASAVA_Build 3 136462431 1D ATAGCCTTTT C/- CCCTAGTCAT 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 C 4 3 173328 CASAVA_Build 3 136463905 1D TTTAGCTCCA G/- GGGGGGCTTT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 G 7 6 173329 CASAVA_Build 3 136465045 1D GCAGGCAGGA G/- CATAGTAGAA 3070 het 3070 hom 58 22 30 6 G 1 0 173330 CASAVA_Build 3 136468853 3I CTTATACAAC ---/TGT TATTATACCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TGT 0 1 173331 CASAVA_Build 3 136481870 1D TTGAGAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 15 12 T 11 10 173332 CASAVA_Build 3 136486318 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 15 1 11 3 A 10 11 173333 CASAVA_Build 3 136490456 1D GCTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2791 het 1192 hom 31 7 13 11 T 19 18 173334 CASAVA_Build 3 136496690 1D ATAGATTTTT A/- ATGTTTTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 A 2 1 173335 CASAVA_Build 3 136501200 2D TGTATGTATC TG/-- TGTGTGTGTG 1343 het 1343 ref 41 34 3 4 TG 7 6 173336 CASAVA_Build 3 136510499 2I31M4D AAGTATACAC --GTGTGTGTGTATATATATGTATGTAAGTATATGTG/GTGTGTGTGTGTATATATATGTATGTAAGTATA---- TGTGTGTGTG 3070 het 167 hom 40 4 36 15 N/A 0 0 173337 CASAVA_Build 3 136519331 1I GAACAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 15 0 12 3 T 11 12 173338 CASAVA_Build 3 136519342 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTTATTA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 2 3 173339 CASAVA_Build 3 136526230 1D AAATTTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3028 hom 25 9 9 7 A 11 10 173340 CASAVA_Build 3 136529667 2D TCCATGCCAA AG/-- AGGGGATGAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AG 2 1 173341 CASAVA_Build 3 136533054 1D TCTAAGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2044 hom 39 10 10 19 T 17 16 173342 CASAVA_Build 3 136534957 1D AAACAATTAC A/- TGTATTTATT 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 A 1 0 173343 CASAVA_Build 3 136540984 3I ATCTGAGACA ---/ATG ATATTTAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 29 1 ATG 0 1 173344 CASAVA_Build 3 136545620 1I AACGTGTAAT -/C CTTAATGGTT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 C 1 2 173345 CASAVA_Build 3 136549291 1D GTTCCCCACC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 9 8 173346 CASAVA_Build 3 136551687 2D TTAAATATTG AA/-- AAGAGATATC 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 4 2 173347 CASAVA_Build 3 136565315 5D TCTGTAGGGC TAGAG/----- TAAAGTGAGT 3070 het 3070 hom 40 17 19 8 TAGAG 1 0 173348 CASAVA_Build 3 136570657 1D CTGCCACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 28 1 20 7 A 12 11 173349 CASAVA_Build 3 136588509 6D AATGTACAAG AAAAAA/------ AACAAACAAC 3070 het 3070 hom 27 11 14 4 A 8 2 173350 CASAVA_Build 3 136591728 3D ATTATTATAA TAT/--- TATTTTAAAA 2626 het 2626 ref 23 11 7 6 TAT 2 1 173351 CASAVA_Build 3 136592836 1D GCTACACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 27 1 21 6 T 13 12 173352 CASAVA_Build 3 136625207 1I CTTATTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 30 1 25 4 A 10 11 173353 CASAVA_Build 3 136627103 1I ACAAATATCC -/A AACCATATCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 3 173354 CASAVA_Build 3 136632246 4D TTGTAAAACA AAAC/---- AAACAAACAG 3070 het 3070 hom 31 10 19 3 AAAC 3 2 173355 CASAVA_Build 3 136645610 4I AACCCTAAGG ----/TCAC TCACTCCCTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TCAC 1 2 173356 CASAVA_Build 3 136648308 1I AGGCTTGCAG -/C CAAGGGCCTT 3070 hom 116 het 45 0 38 7 C 1 2 173357 CASAVA_Build 3 136664748 4I CAAATGTAAA ----/ATTT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 ATTT 0 1 173358 CASAVA_Build 3 136717316 8I ACATCTGCAT --------/CCACAAAA CCAAGAACCA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 CCACAAAA 0 1 173359 CASAVA_Build 3 136723122 2D TGGTTACCAA AT/-- ATATTAATGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 3 2 173360 CASAVA_Build 3 136744626 1D TGTATTCATG T/- TTTTTATGAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 5 173361 CASAVA_Build 3 136748607 1D AAAGATGGAG A/- AAAAAATCCT 3070 hom 116 het 44 0 38 8 A 7 6 173362 CASAVA_Build 3 136756785 4I ATATTAGCCT ----/GATA GATAGGTATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 GATA 1 2 173363 CASAVA_Build 3 136758809 1D ATTATCAAGG C/- CAGTGGTTAC 3070 het 3070 ref 47 26 20 1 C 2 1 173364 CASAVA_Build 3 136762092 5I CAGATCACCC -----/TATAT TATATTTCCA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 TATAT 1 2 173365 CASAVA_Build 3 136767113 2D CAATGGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 38 1 25 13 A 14 12 173366 CASAVA_Build 3 136771714 1D TACAGAGCAC T/- TAGACATTTA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 T 2 1 173367 CASAVA_Build 3 136781246 12I AGATTGAGAC ------------/CATCCTGGCTAA CACGGTGAAA 1451 het 1012 hom 9 3 3 3 CATCCTGGCTAA 0 1 173368 CASAVA_Build 3 136796810 2D CCTCACATGC AG/-- AGAGAGAGAG 1786 het 1786 ref 41 32 4 6 AG 7 6 173369 CASAVA_Build 3 136811691 1D AAAAAAAGAC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 8 7 173370 CASAVA_Build 3 136814461 1I GGGCCACCAT -/C CGCCAGACCC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 1 2 173371 CASAVA_Build 3 136827484 1D AGCAGCCTCT G/- GGGGCCCCCT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 G 5 4 173372 CASAVA_Build 3 136840270 1D GGTTTATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 30 1 25 5 A 13 12 173373 CASAVA_Build 3 136866600 1D CAGACACATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 789 hom 39 3 33 5 A 10 9 173374 CASAVA_Build 3 136868147 1I CAAACAACTC -/A ATAGGAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 173375 CASAVA_Build 3 136872504 4D GTTTGTTTGT TTGA/---- TTTTTAGAGA 3070 hom 122 het 46 0 41 9 TTGA 1 0 173376 CASAVA_Build 3 136877066 1D ACTTGTGAGG T/- TTTTTTCAGG 3070 hom 68 het 27 0 23 4 T 7 6 173377 CASAVA_Build 3 136904484 1D GCTTTACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 11 10 173378 CASAVA_Build 3 136905931 3D GGTTATGTAA ATT/--- ATTATATTTT 3070 het 3070 hom 30 15 15 2 ATT 2 1 173379 CASAVA_Build 3 136913507 1I ACTAAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 173380 CASAVA_Build 3 136926552 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAATCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 8 173381 CASAVA_Build 3 136956206 1D GCAGCCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 T 13 12 173382 CASAVA_Build 3 136959416 1D TTACCTGAAA T/- TTTTTTTTTT 2952 het 320 hom 23 2 12 9 T 19 18 173383 CASAVA_Build 3 136967043 1I GTGGTAACTA -/T TTTTTTTTTT 1070 het 1070 ref 38 31 3 4 T 10 11 173384 CASAVA_Build 3 136983396 2I GTTTATTTTC --/TT TCGGATTCTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 1 3 173385 CASAVA_Build 3 137059198 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 227 hom 21 2 13 8 A 17 16 173386 CASAVA_Build 3 137066308 4I AGATGCCTGT ----/GTTA GTTAGTATAG 3070 hom 105 het 41 0 34 7 GTTA 1 2 173387 CASAVA_Build 3 137081707 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 13 8 3 A 12 11 173388 CASAVA_Build 3 137101004 13I CTATATCTTT -------------/TACTAAATCACTA TGTATTTTAG 3070 hom 114 het 41 0 39 4 TACTAAATCACTA 0 1 173389 CASAVA_Build 3 137107803 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1925 het 482 hom 20 1 9 10 T 15 14 173390 CASAVA_Build 3 137122585 1D TGCAAATGAG A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 7 6 173391 CASAVA_Build 3 137158127 10D ATGCAGTGTT TGGTTTTCTG/---------- TGGTTTTCTA 3070 het 3070 ref 28 14 10 8 TGGTTTTCTG 1 0 173392 CASAVA_Build 3 137170188 5I TCCTCCAAGC -----/CTGTT AAATCAGAGC 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 CTGTT 0 1 173393 CASAVA_Build 3 137177733 2I TAAGTATAAC --/TA TGTAAGTTTC 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 TA 0 1 173394 CASAVA_Build 3 137180015 1I GACAACTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 12 13 173395 CASAVA_Build 3 137181979 1D AAAATGTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 A 13 12 173396 CASAVA_Build 3 137191060 3I CTTTTGGAAA ---/TTC TTCTTCATCC 3070 hom 88 het 38 0 30 8 TTC 2 3 173397 CASAVA_Build 3 137202573 1I TTCCTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3035 hom 29 10 14 5 T 11 12 173398 CASAVA_Build 3 137209539 1D AAATAAAGAA C/- CTTCCTATGT 3070 het 3070 ref 43 22 15 8 C 2 1 173399 CASAVA_Build 3 137215340 17I CTGTGGTTTG -----------------/TTTGTTTACTCTGCTGA TTATTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 TTTGTTTACTCTGCTGA 0 1 173400 CASAVA_Build 3 137222114 1D AAACTTAGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 T 9 8 173401 CASAVA_Build 3 137231847 4I GAGTGTGTCA ----/GTTT GTTTGTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 GTTT 2 3 173402 CASAVA_Build 3 137235572 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1850 het 568 hom 13 3 5 5 T 15 14 173403 CASAVA_Build 3 137242235 4I CTGAATCTAC ----/GTAG CCTAGTTGAT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 GTAG 0 1 173404 CASAVA_Build 3 137242360 1I ATTCCCTGTT -/G GGCTTACCCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 2 3 173405 CASAVA_Build 3 137243206 1I CATTCCCATA -/T GATCCAATTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 0 1 173406 CASAVA_Build 3 137244503 1D AGTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 T 12 11 173407 CASAVA_Build 3 137258014 4D AAACTATTCT AAAA/---- AAAAAAAACC 3070 hom 45 het 19 0 16 6 A 12 8 173408 CASAVA_Build 3 137314741 1I CACTACCCAA -/C TTCAAACTAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 0 1 173409 CASAVA_Build 3 137367398 2I ATTTAAAGTT --/AA AAGAGTATAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 2 4 173410 CASAVA_Build 3 137377411 17D ATATGCCAAA CACTGTGCTAAGCCTGC/----------------- CACTGTGCTA 3070 het 3070 hom 39 16 20 14 CACTGTGCTAAGCCTGC 2 1 173411 CASAVA_Build 3 137380290 3D TGGTCTCGAA CTC/--- CTCCTGACCT 3070 het 176 hom 13 1 10 2 CTC 2 1 173412 CASAVA_Build 3 137407570 2I TTAGGAGGTC --/AG AGTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 AG 1 2 173413 CASAVA_Build 3 137411037 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1977 het 419 hom 13 1 7 5 A 13 14 173414 CASAVA_Build 3 137442998 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1800 het 1800 ref 32 21 4 7 A 11 10 173415 CASAVA_Build 3 137459608 4I AGGAATCACA ----/TTTC TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 TTTC 0 1 173416 CASAVA_Build 3 137463111 1D TGCTTTCATG A/- AAGTACTACT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 3 2 173417 CASAVA_Build 3 137485849 8I AGTTGTTTCT --------/GATGTTTC TCCTTTATTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 GATGTTTC 0 1 173418 CASAVA_Build 3 137496011 1I ACCCAGCAAA -/T TTTTTTTTTT 1449 het 1449 ref 29 20 5 4 T 13 14 173419 CASAVA_Build 3 137501702 6I ATACACATAT ------/GTATAA GTATATGTGT 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 GTATAA 0 1 173420 CASAVA_Build 3 137526923 4D GAGATGGAGT CTCA/---- CTCTGTTGCC 1778 het 1778 ref 15 9 4 4 CTCA 1 0 173421 CASAVA_Build 3 137532316 5I CTAATTATAT -----/AATTA TATTAATATA 2292 het 848 hom 10 4 5 1 AATTA 0 1 173422 CASAVA_Build 3 137538493 4D TCAGAAAGGA AGAG/---- AGAGACTAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 AG 4 2 173423 CASAVA_Build 3 137588586 3I CAAAACTAAA ---/CTT CTGCTTACCC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 CTT 0 1 173424 CASAVA_Build 3 137609598 3D TATATATAAA TCT/--- TCTCATCATC 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 TCT 2 1 173425 CASAVA_Build 3 137613556 4D TTCGTCTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3061 het 3061 ref 22 10 9 4 AAAC 5 4 173426 CASAVA_Build 3 137616858 5I AAAAAAACAA -----/AAAAC AAGACAAACA 3070 het 3070 hom 43 17 14 12 AAAAC 0 1 173427 CASAVA_Build 3 137617546 1D GCCATAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2882 hom 23 8 8 7 T 13 12 173428 CASAVA_Build 3 137620764 4D AAAGTTTGCT TTTC/---- TAGGGAATTC 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 TTTC 1 0 173429 CASAVA_Build 3 137644226 1I GGATGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 11 12 173430 CASAVA_Build 3 137645313 1D AAATTAATAA T/- TTTTCCCTTG 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 5 4 173431 CASAVA_Build 3 137649129 12D AAGCATCACA TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 1253 het 1253 ref 15 7 5 3 T 28 16 173432 CASAVA_Build 3 137652702 1D ACAATATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2572 hom 28 10 12 6 A 13 12 173433 CASAVA_Build 3 137672653 1D AAGTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 11 14 A 13 12 173434 CASAVA_Build 3 137697203 1I CGCCTCTATT -/A AAAAATACAA 3070 het 3034 hom 19 7 11 1 A 5 6 173435 CASAVA_Build 3 137702563 1D TACATGAATG T/- TGACAATAAA 3070 het 3070 ref 38 24 13 1 T 2 1 173436 CASAVA_Build 3 137703851 1I ATGTAGCTTT -/G GCTGGCTCAC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 G 1 2 173437 CASAVA_Build 3 137746291 1I AGCAAGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 13 14 173438 CASAVA_Build 3 137753277 2I CTGGGACTAC --/AG AGGCACACAC 3070 het 3070 hom 32 8 20 4 AG 1 2 173439 CASAVA_Build 3 137758102 1D CTTGACATTC G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 G 1 0 173440 CASAVA_Build 3 137765546 2I CAGAATAAGA --/CT CTGTCTCGAA 3070 het 2274 hom 19 6 11 2 CT 1 2 173441 CASAVA_Build 3 137774727 1D GAAAAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 14 13 173442 CASAVA_Build 3 137780938 4I TTGAATCCTC ----/TATT TAGGGTCTCA 3070 het 3070 ref 62 30 27 5 TATT 0 1 173443 CASAVA_Build 3 137804956 1I TTTTAAAATG -/T TTAAAAATGT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 2 3 173444 CASAVA_Build 3 137821765 1I GATTAAACTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 7 8 173445 CASAVA_Build 3 137836146 1D GCTTTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2428 hom 34 8 16 10 A 15 14 173446 CASAVA_Build 3 137857985 1I TATTTTATCA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 9 173447 CASAVA_Build 3 137884801 1D TTCAACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 33 0 20 15 T 13 12 173448 CASAVA_Build 3 137887457 2I AAGAATAAAG --/AA AAGATTGGGG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 2 4 173449 CASAVA_Build 3 137896842 1I TGGTGGTGCA -/T GCCTGTAGTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 0 1 173450 CASAVA_Build 3 137897167 1I TACTCACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 11 12 173451 CASAVA_Build 3 137897834 1D CAATCCCTGG A/- AGCATGTGCT 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 A 2 1 173452 CASAVA_Build 3 137898230 4D TTTTTAATAA AAGG/---- AATGAAGTAT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 AAGG 1 0 173453 CASAVA_Build 3 137900023 4D TCAAAAAACC AACA/---- AACAGAGGAG 3070 het 3070 ref 32 20 11 3 AACA 2 1 173454 CASAVA_Build 3 137909111 8I GAAAAGAAGT --------/TTATTTCG TTCATGGTTC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TTATTTCG 0 1 173455 CASAVA_Build 3 137913097 1D TGTTTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 18 12 A 11 10 173456 CASAVA_Build 3 137938358 1D TTTTCCTTCC T/- TCTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 T 2 1 173457 CASAVA_Build 3 137950132 6D TTCACCATGT CGGCCA/------ CGGCCAAGCT 3070 hom 38 het 17 0 13 4 CGGCCA 2 1 173458 CASAVA_Build 3 137951450 4D TTAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAACTA 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 AAAG 2 1 173459 CASAVA_Build 3 137962240 1I TCTTTGTAAC -/T TTTTTTTTTT 1411 het 1411 ref 23 5 8 10 T 15 16 173460 CASAVA_Build 3 137990328 1I ATCCTTATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 9 10 173461 CASAVA_Build 3 138003856 3D AACTTCACTC CCT/--- CAACTCTCGC 3070 het 3070 ref 51 26 23 3 CCT 1 0 173462 CASAVA_Build 3 138006044 1I TTTGATTTTC -/T TTTTTTTTTT 1148 het 1148 ref 17 7 5 5 T 10 11 173463 CASAVA_Build 3 138008808 1D TAGCCCCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 11 10 173464 CASAVA_Build 3 138022528 3I TTATAATCTT ---/AAG AACATATGAC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 AAG 0 1 173465 CASAVA_Build 3 138022771 1I ACCAATCCTC -/T TATTGGTTGC 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 T 1 2 173466 CASAVA_Build 3 138031235 1D CTAGGGTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 10 9 173467 CASAVA_Build 3 138033553 1I TCATTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 2568 het 2193 hom 20 5 7 8 T 11 12 173468 CASAVA_Build 3 138036840 2D GGCCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2926 hom 29 11 10 8 T 16 14 173469 CASAVA_Build 3 138037952 1I GCCTGCTTAT -/C CGACCAGTCT 3070 hom 96 het 38 0 31 7 C 1 2 173470 CASAVA_Build 3 138039779 22D TAGCATATAC ATATATATATATATATATATAT/---------------------- ATATATATAT 3070 hom 27 het 11 0 9 4 AT 18 7 173471 CASAVA_Build 3 138047135 1I AAAAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 T 13 14 173472 CASAVA_Build 3 138052124 1I GAGTGTGCAC -/A AATATTTATG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 2 3 173473 CASAVA_Build 3 138053757 3D TGGTGTGCAG GAA/--- GAAGGACTGC 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 GAA 2 1 173474 CASAVA_Build 3 138057269 3I GTTCAGTTAT ---/TAA TATGTATACT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 TAA 0 1 173475 CASAVA_Build 3 138059046 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 36 het 36 ref 40 34 1 6 AAAG 1 0 173476 CASAVA_Build 3 138060992 2I ACTCTGGACA --/AC AGTTTCTTCA 2073 het 2073 ref 28 16 5 7 AC 0 1 173477 CASAVA_Build 3 138064549 4D GTTTTGTAAC CTTT/---- CTTCTGTATT 2486 het 2486 ref 26 16 6 7 CTTT 1 0 173478 CASAVA_Build 3 138064606 2I GGAAGCTGGG --/TT TTTTGTTCAG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 4 6 173479 CASAVA_Build 3 138068465 1D GTCTTTAAAA T/- TTTTTTTTTC 2847 het 2847 ref 27 12 6 10 T 10 9 173480 CASAVA_Build 3 138069454 1D ACATTGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 13 12 173481 CASAVA_Build 3 138070772 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1094 het 1094 ref 31 21 3 7 A 13 12 173482 CASAVA_Build 3 138076342 2D TAATGAAAAC TT/-- TTTTTCATGT 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 T 7 5 173483 CASAVA_Build 3 138080235 1D GTATCTCAAT A/- AAGCTATTTT 3070 het 3070 hom 53 17 28 9 A 3 2 173484 CASAVA_Build 3 138080664 1I TCAGAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 9 10 173485 CASAVA_Build 3 138101401 1D AAAGCCATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 10 9 173486 CASAVA_Build 3 138105306 2D GTTTACATTC AG/-- AGTTATTGAT 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 AG 2 1 173487 CASAVA_Build 3 138119875 1I AATATTCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 9 10 173488 CASAVA_Build 3 138132513 1D TGGAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 T 12 11 173489 CASAVA_Build 3 138133101 1D GATCTTTGCA T/- TTTTCATTTT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 5 4 173490 CASAVA_Build 3 138135243 1D TTAAGTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 9 11 T 11 10 173491 CASAVA_Build 3 138139485 1D AGTGGTGGAA G/- GAGAGCATCC 3070 het 3070 hom 33 10 19 6 G 2 1 173492 CASAVA_Build 3 138143246 1I GAGAATTTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 9 10 173493 CASAVA_Build 3 138148199 16D AAATTGCTAT TGGATGCAATGTGTAA/---------------- GAAGGTAGTC 3070 het 3070 hom 42 18 23 6 TGGATGCAATGTGTAA 1 0 173494 CASAVA_Build 3 138150951 2D TTTCAGCTTT AA/-- GTTTTGTTGA 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 A 2 0 173495 CASAVA_Build 3 138151373 1D AACTTGTGAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 8 7 173496 CASAVA_Build 3 138207777 1D TATGTGTCTT G/- GGGTTGCTCT 2512 hom 29 het 14 0 8 6 G 4 3 173497 CASAVA_Build 3 138234987 1D TGTTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 34 0 24 10 T 11 10 173498 CASAVA_Build 3 138235853 9D CTGTAGTCCC AGCTACTCG/--------- AGCGGCTGAG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AGCTACTCG 1 0 173499 CASAVA_Build 3 138238179 2D TCTTTTTTTT TG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 97 het 39 0 30 9 TG 1 0 173500 CASAVA_Build 3 138238661 1D CAGCAAAGAA T/- TTACCTGCAC 3070 hom 138 het 51 0 44 7 T 3 2 173501 CASAVA_Build 3 138241745 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3025 het 104 hom 20 2 10 8 A 15 14 173502 CASAVA_Build 3 138246194 1D GCAGAGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 247 hom 38 1 26 12 T 13 12 173503 CASAVA_Build 3 138252462 1D TCACCTGGCA T/- GGGCAGGTCT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 1 0 173504 CASAVA_Build 3 138314468 1I AATACTCACC -/A TTGTGTTCCA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 0 1 173505 CASAVA_Build 3 138314858 1D TGCTTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 27 7 9 11 T 17 16 173506 CASAVA_Build 3 138320874 1I TGGCTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 10 11 173507 CASAVA_Build 3 138331000 1I TTTGTTTTTG -/T TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 11 26 9 T 3 4 173508 CASAVA_Build 3 138341207 1D GAAAATGAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2266 hom 29 6 20 3 T 10 9 173509 CASAVA_Build 3 138348428 1I GTCTTTTTTT -/C CTCTTACTGC 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 C 1 2 173510 CASAVA_Build 3 138358145 1I AATTTATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 T 9 10 173511 CASAVA_Build 3 138383597 2D CTTACTCCCC CT/-- GTCTCTGACC 3070 het 3070 hom 49 19 24 8 CT 1 0 173512 CASAVA_Build 3 138410305 1I CTCTGCACTT -/G GCGCAGTAGG 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 G 1 2 173513 CASAVA_Build 3 138427176 1D ACAATTCACC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 42 10 31 1 T 7 6 173514 CASAVA_Build 3 138441398 2I ATAAAAAGAT --/AA AAAATGGGGG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 4 6 173515 CASAVA_Build 3 138446094 1D ACAGGCAGTG T/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 T 7 6 173516 CASAVA_Build 3 138449491 4D ATGTGTATAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 41 17 16 11 AC 11 9 173517 CASAVA_Build 3 138468032 1I GGAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 802 hom 54 3 38 13 A 10 11 173518 CASAVA_Build 3 138471423 1I ACATGATACT -/A AAATAAAAAA 3070 het 716 hom 28 2 20 6 A 3 4 173519 CASAVA_Build 3 138487787 5D CTCTATTTAG TCATA/----- GATAGAAGGG 3070 het 3070 ref 34 20 11 5 TCATA 1 0 173520 CASAVA_Build 3 138488306 7D CCTCTCCTCC AAATGTT/------- TCTTTCTGGC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAATGTT 1 0 173521 CASAVA_Build 3 138494232 4D AAAAAGCCAT ATAC/---- ATACATATTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATAC 2 1 173522 CASAVA_Build 3 138512791 1I TTAGTATTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 9 10 173523 CASAVA_Build 3 138514435 1D ATTTTTCAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 59 het 24 0 20 6 T 10 9 173524 CASAVA_Build 3 138519827 1I AATTTTCATT -/C TTTTTTCTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 0 1 173525 CASAVA_Build 3 138524198 8D CAAACTGCTT TAAGGTCA/-------- CATTTGTACA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TAAGGTCA 1 0 173526 CASAVA_Build 3 138527447 1I CTTTTCTTTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 52 28 20 4 T 7 8 173527 CASAVA_Build 3 138536086 6I CAAGGTATGT ------/TTATGA TTATAAGGAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTATGA 0 1 173528 CASAVA_Build 3 138537500 3D AAATAATAAT AAG/--- GAGAAGATTT 3070 het 3070 ref 32 14 17 5 AAG 1 0 173529 CASAVA_Build 3 138548118 2D TGTATTTTTC AT/-- AGAGATGGGG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AT 1 0 173530 CASAVA_Build 3 138550174 1D ACCATAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 881 hom 30 3 16 11 T 15 14 173531 CASAVA_Build 3 138570010 36D GAGAACAGCT TTTGTATTATTCTAATTTTTAAAAAGTTTGTTGAGG/------------------------------------ TTTGTATTAT 3070 het 3070 ref 28 21 11 3 TTTGTATTATTCTAATTTTTAAAAAGTTTGTTGAGG 1 0 173532 CASAVA_Build 3 138573654 1I AAAGTGTCTG -/T TCATATCCTT 3070 hom 21 het 14 0 8 6 T 1 2 173533 CASAVA_Build 3 138577400 15D TGGGGGAGTT CTGCTGGATAATATC/--------------- CTGAAGAGTG 3070 het 3070 ref 35 20 9 8 CTGCTGGATAATATC 1 0 173534 CASAVA_Build 3 138579665 1D TGAGCATAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 9 8 173535 CASAVA_Build 3 138582315 1I AGATTTAAAT -/G TTAAGCCCAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 G 0 1 173536 CASAVA_Build 3 138582596 4D TACAAAAAAG CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 CAAA 4 3 173537 CASAVA_Build 3 138584332 3D CTGCTACTCT TTC/--- TTCTTCAACT 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 TTC 3 2 173538 CASAVA_Build 3 138589136 1D GCAGGGTTGG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 26 het 47 1 36 10 T 8 7 173539 CASAVA_Build 3 138590045 1D GCATCCATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 9 8 173540 CASAVA_Build 3 138591000 1D TGTGCATGCA T/- AACCTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 12 19 10 T 1 0 173541 CASAVA_Build 3 138595428 1D GATTTGTTGA T/- TTTTTTGAAG 2974 het 2974 ref 19 11 7 1 T 7 6 173542 CASAVA_Build 3 138599347 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAA 1176 het 1176 ref 22 13 5 4 A 10 11 173543 CASAVA_Build 3 138620291 18D AACAACAAAT TACTTATTTATAACAAAA/------------------ AATTCATATA 3070 hom 66 het 20 0 23 4 TACTTATTTATAACAAAA 1 0 173544 CASAVA_Build 3 138621599 2D TGACATCCCC CT/-- GCGTCCACCT 3070 het 3070 hom 41 17 18 8 CT 1 0 173545 CASAVA_Build 3 138626603 1I AAGTGAACTC -/A AAAGTAGGCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 3 4 173546 CASAVA_Build 3 138627748 8D GGCATCTAGA TGAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TGAGAAAG 1 0 173547 CASAVA_Build 3 138628524 8D GGATTTTGGA CAAAGGTG/-------- CAAAGACAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 CAAAGGTG 1 0 173548 CASAVA_Build 3 138629974 2I AAATTTAGCC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 42 0 30 12 T 9 11 173549 CASAVA_Build 3 138630924 2D CTACAGTCCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 28 3 16 9 T 14 12 173550 CASAVA_Build 3 138634706 14I CCAAGCAGAC --------------/CTAATAGACATCTA ATCTCCACCC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 CTAATAGACATCTA 0 1 173551 CASAVA_Build 3 138638207 1D TAAAGAATAA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 35 het 17 0 12 5 T 7 6 173552 CASAVA_Build 3 138640038 3I GAGTCATTCA ---/TGT TGTTGTATGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TGT 2 3 173553 CASAVA_Build 3 138640601 3I AATCTCTTCC ---/TTG CAAAGCATTT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 TTG 0 1 173554 CASAVA_Build 3 138643730 2D TATAGCCTAT AC/-- TATAGCTAGC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AC 1 0 173555 CASAVA_Build 3 138654066 1I TTAGAGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 10 11 173556 CASAVA_Build 3 138667403 1D AGTATATATA T/- GAGTTTGAAA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 1 0 173557 CASAVA_Build 3 138670796 5D TTAAAACTTT AATGA/----- AATATTTTAC 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AATGA 1 0 173558 CASAVA_Build 3 138671171 1I GCTTTTGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 10 11 173559 CASAVA_Build 3 138678448 4I TAATAATTGG ----/GTAA GTGAGTGAGA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 GTAA 0 1 173560 CASAVA_Build 3 138680594 2D ACACAAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 24 0 12 14 T 18 16 173561 CASAVA_Build 3 138688399 4D TGCTCTTCTC TCTT/---- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 36 0 35 4 TCTT 1 0 173562 CASAVA_Build 3 138698646 1D51M1D GATGATCTGA TTTTTTTTTTTTGTACAGAAGCTTGTGAATTTAATTAGGTCCCATTTATTTAT/-TTTTTTTTTTTGTACAGAAGCTTGTGAATTTAATTAGGTCCCATTTATTTA- TTTTTATTTT 3070 hom 7 het 30 1 37 3 N/A 0 0 173563 CASAVA_Build 3 138702696 1D TTATGAATCT G/- GGACTCCAGA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 G 3 2 173564 CASAVA_Build 3 138702920 7D GAATCCTTAT GTGTTAG/------- GTGAAGCTCT 3070 het 3070 hom 36 14 19 5 GTGTTAG 1 0 173565 CASAVA_Build 3 138707505 1I GATATCTTTC -/T TTTTTTAGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 6 7 173566 CASAVA_Build 3 138717487 1D TCATCTAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 9 8 173567 CASAVA_Build 3 138726685 2D GAGCAGAAAG AT/-- AGAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 47 19 24 5 AT 1 0 173568 CASAVA_Build 3 138736648 4D CTTCTATTTC TAAT/---- TAAATAATAC 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 TAAT 1 0 173569 CASAVA_Build 3 138740551 2D TCTCTGAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2588 het 23 hom 17 1 7 10 T 14 12 173570 CASAVA_Build 3 138743801 1I GGTGAGTCCA -/C TGGTGACCAT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 C 0 1 173571 CASAVA_Build 3 138761420 1D CGAACTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3007 hom 37 8 20 9 T 11 10 173572 CASAVA_Build 3 138768499 3D TTTTGTGGCT TGG/--- TGAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 TGG 1 0 173573 CASAVA_Build 3 138771394 1I GAATTGAATA -/T TTAAGGGGGA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 T 2 3 173574 CASAVA_Build 3 138773935 2I GGTTCCTATC --/CT CTCTTCTAAT 3070 het 3070 ref 59 32 24 3 CT 2 3 173575 CASAVA_Build 3 138777047 5D61M1D TATTAACAGC TCAAATAAGAAAAATCACCACCAGAATAAATCATTCCAACTGATTTTAAAGCACAGTAATGTATATG/-----TAAGAAAAATCACCACCAGAATAAATCATTCCAACTGATTTTAAAGCACAGTAATGTATAT- GGTCATTCCT 3070 het 3070 hom 28 21 21 10 N/A 0 0 173576 CASAVA_Build 3 138777256 10I TTATATTGGT ----------/GTTACCAAGA GCAGATGTTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 GTTACCAAGA 0 1 173577 CASAVA_Build 3 138778322 4D TAGTGGAAGG TTAA/---- TTAAACATAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 TTAA 2 1 173578 CASAVA_Build 3 138779546 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 10 11 173579 CASAVA_Build 3 138781167 4D CTCCCACTTA TGAG/---- TGAGAACATG 3070 het 724 hom 11 2 9 1 TGAG 2 1 173580 CASAVA_Build 3 138793737 7D ACAAAAACTT GTTCATG/------- AATGGTCATA 3070 hom 126 het 44 0 43 4 GTTCATG 1 0 173581 CASAVA_Build 3 138796252 1D TCTCGCTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 36 0 31 6 T 10 9 173582 CASAVA_Build 3 138805121 1D TAGAGAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 532 hom 40 2 22 16 A 12 11 173583 CASAVA_Build 3 138812000 4D GTACACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 260 hom 54 5 19 33 AC 11 9 173584 CASAVA_Build 3 138813466 1D GATACACTGT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 120 het 45 0 39 6 A 9 8 173585 CASAVA_Build 3 138817621 3I AGGAAAATCT ---/TTC TTTTTAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTC 0 1 173586 CASAVA_Build 3 138818399 1D GAAGTATAAC G/- GGGGGGGGAG 1360 het 1322 hom 28 12 4 12 G 9 8 173587 CASAVA_Build 3 138821809 1D CTGTCCACTT G/- GGACTAATGG 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 G 3 2 173588 CASAVA_Build 3 138830314 1I ATTATGTCCC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 8 9 173589 CASAVA_Build 3 138833771 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1332 het 575 hom 10 3 4 3 T 13 12 173590 CASAVA_Build 3 138842925 1D TATAATAACC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 9 8 173591 CASAVA_Build 3 138844308 1I AACAAATAAA -/G GGGCATGGGA 3070 hom 39 het 19 0 11 8 G 3 4 173592 CASAVA_Build 3 138846087 1D ATTCATGATT A/- AAAAAAAAAA 2813 het 2813 ref 35 16 8 11 A 12 11 173593 CASAVA_Build 3 138846444 3I ATGGTAGGTT ---/TTG TTGTCAGGCT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 TTG 1 2 173594 CASAVA_Build 3 138850880 1I ACTGTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1918 hom 33 5 19 9 A 14 15 173595 CASAVA_Build 3 138861964 1D AAAGTCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2047 hom 15 6 8 1 A 11 10 173596 CASAVA_Build 3 138869940 2D AGAAAAATTT TC/-- TCTATCAGTT 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 TC 2 1 173597 CASAVA_Build 3 138894268 1I CAGCCTGTTC -/A TTCTAGGAAT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 A 0 1 173598 CASAVA_Build 3 138906879 1D ATTTAGTGTT A/- ATTTCTCTCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 2 1 173599 CASAVA_Build 3 138913278 3D TCACAAAAGA AAG/--- AAGTTTAATG 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 AAG 2 1 173600 CASAVA_Build 3 138913641 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 7 6 173601 CASAVA_Build 3 138915652 2I CCGATTTTGT --/TC TCTTAGCTGG 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 TC 1 2 173602 CASAVA_Build 3 138930119 1I GCTAGTTCTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 52 21 25 6 T 8 9 173603 CASAVA_Build 3 138930864 4D CTGGACTGAA TTGT/---- TTGTTTAAGC 3070 het 3070 ref 31 17 9 7 TTGT 2 1 173604 CASAVA_Build 3 138939071 11D TTTACTTGTG TTCTCTTAAAC/----------- TTCCTGTTTT 3070 hom 93 het 30 0 31 2 TTCTCTTAAAC 1 0 173605 CASAVA_Build 3 138952106 1I TTGAACTCCA -/T TTTTATAGTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 4 5 173606 CASAVA_Build 3 138984879 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 409 hom 43 2 35 6 T 7 8 173607 CASAVA_Build 3 138989821 1D GACGACAAAT A/- AAAAAACACC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 7 6 173608 CASAVA_Build 3 139002391 2I TGTACTGGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 10 12 173609 CASAVA_Build 3 139008467 1D AGCAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 1394 het 1144 hom 12 6 3 3 T 12 11 173610 CASAVA_Build 3 139014137 1I CACTGTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 T 11 12 173611 CASAVA_Build 3 139020871 1I CAGAGAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 A 10 11 173612 CASAVA_Build 3 139021318 2I ACCAAAAAAA --/AG GAAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 9 10 AG 0 1 173613 CASAVA_Build 3 139022623 1I CCAAGAAAAA -/G TTTGCCTTCA 3070 hom 110 het 45 0 37 8 G 0 1 173614 CASAVA_Build 3 139045314 1D AATATCACCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 T 8 7 173615 CASAVA_Build 3 139050947 1D ATAACCAAGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 92 het 37 0 31 6 A 9 8 173616 CASAVA_Build 3 139060239 1D GATGTTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 137 het 54 0 46 8 T 10 9 173617 CASAVA_Build 3 139071568 2I ATTCAAGATA --/AC ACAGAGAAGA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AC 1 2 173618 CASAVA_Build 3 139080323 1I AATAGCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 A 10 11 173619 CASAVA_Build 3 139124403 1I ATAATTTTAG -/A AATGAATGGA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 A 2 3 173620 CASAVA_Build 3 139126889 2D TCACCAATGG AA/-- AACACTCGCT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 4 2 173621 CASAVA_Build 3 139132012 5I CAGGAAGGGA -----/GAAAG GAAAGGAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 GAAAG 2 3 173622 CASAVA_Build 3 139133070 1D ACTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 755 het 755 ref 20 8 2 10 T 16 15 173623 CASAVA_Build 3 139147777 1D TGTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 T 10 9 173624 CASAVA_Build 3 139156618 2D GCTGTAATCT GA/-- GAGACTGTTT 3070 het 3070 ref 38 24 10 4 GA 3 2 173625 CASAVA_Build 3 139196169 2I TCTTAAGGAG --/TT TTTATATATG 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 3 5 173626 CASAVA_Build 3 139202912 1I CCCCCCATTC -/T TTTTTTTTTT 1005 hom 17 het 14 0 6 8 T 15 16 173627 CASAVA_Build 3 139205915 1D AATTCTTATC A/- AAATACCGGC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 4 3 173628 CASAVA_Build 3 139239177 3D CTCAAGTCTC TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 TCT 4 3 173629 CASAVA_Build 3 139252891 3D GGAGGAGGTA GTG/--- GTGGTGATGA 3070 het 38 hom 54 4 26 27 GTG 3 2 173630 CASAVA_Build 3 139254125 4D CACTGATCTC CTCT/---- CTAAGATCCC 3070 hom 126 het 49 0 41 12 CT 3 1 173631 CASAVA_Build 3 139257972 1I AGACGAAAAA -/G TTCTGGAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 0 1 173632 CASAVA_Build 3 139276265 1D ATAATACACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1658 hom 21 5 11 6 A 12 11 173633 CASAVA_Build 3 139293358 4D GAAGATTAAA AGTT/---- AGTATATATA 2663 het 2663 ref 22 11 8 4 AGTT 1 0 173634 CASAVA_Build 3 139293697 4I ATGAGGAGGT ----/TAAC TAACTCATTC 3070 hom 117 het 46 0 39 8 TAAC 1 2 173635 CASAVA_Build 3 139296976 2I TAATAAAAAT --/CA CTGTAGTTTT 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 CA 0 1 173636 CASAVA_Build 3 139302758 1I ACAAACACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 12 13 173637 CASAVA_Build 3 139304647 2D TTCAAGTATT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 63 17 20 28 CA 9 8 173638 CASAVA_Build 3 139304694 4D CACATCATTT ACAA/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 62 14 32 20 ACAA 1 0 173639 CASAVA_Build 3 139308402 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 2135 het 1672 hom 18 10 6 2 G 1 0 173640 CASAVA_Build 3 139335524 1D TCTAACCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 698 hom 37 2 24 11 T 14 13 173641 CASAVA_Build 3 139353117 10D GTCTTGAAAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAG 3070 hom 48 het 24 0 17 8 AAAAG 5 3 173642 CASAVA_Build 3 139355648 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2448 het 400 hom 25 3 13 9 T 21 20 173643 CASAVA_Build 3 139355825 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 11 0 9 2 T 12 11 173644 CASAVA_Build 3 139357398 1I TTACACAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 30 1 24 5 T 10 11 173645 CASAVA_Build 3 139359658 1D ATTATCTAGG T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 7 6 173646 CASAVA_Build 3 139374753 4I GTTTAAGGTC ----/TTTT TTTAATTCAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 3 7 173647 CASAVA_Build 3 139375556 7D CTGTCTCAAG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2204 het 31 hom 18 1 13 5 A 22 15 173648 CASAVA_Build 3 139378783 4D37M8D TCTCAAAAAG AATAAATAAATAAATAAATATCTCGTTTGTGTGTGTGTGTGTATATATA/----AATAAATAAATAAATATCTCGTTTGTGTGTGTGTGTG-------- TATATATATA 3070 het 118 hom 17 1 16 7 N/A 0 0 173649 CASAVA_Build 3 139391599 3D ATTCAGGACT TTG/--- TTGTTTTGTG 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 TTG 2 1 173650 CASAVA_Build 3 139402797 1D TGTTTAAATA T/- TTTCTTGACC 3070 hom 45 het 21 0 14 8 T 4 3 173651 CASAVA_Build 3 139505325 3D AACAGCAGCA ATG/--- ATAATAGCAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 ATG 1 0 173652 CASAVA_Build 3 139534620 1I CATCTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1119 hom 29 3 22 4 T 13 14 173653 CASAVA_Build 3 139556345 2D TGAAGTCTCA CT/-- CTGTTGCTTA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 CT 2 1 173654 CASAVA_Build 3 139559860 2I CAGAACAAGA --/CT CTCTCTCAAA 983 het 983 ref 37 13 6 18 CT 3 4 173655 CASAVA_Build 3 139581852 3I TCTACTTTCT ---/TTC TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 TTC 0 1 173656 CASAVA_Build 3 139582041 2I GATGGGGTTT --/CA CCGTGTTGGC 2988 het 1493 hom 14 5 7 2 CA 0 1 173657 CASAVA_Build 3 139587694 4I CACGTATTGC ----/TGAT TGATTAACAA 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 TGAT 1 2 173658 CASAVA_Build 3 139595224 3I TCTTCTGCTT ---/TTC TTTTCTTTTT 3070 het 2881 hom 18 8 10 0 TTC 0 1 173659 CASAVA_Build 3 139601077 3I ACTCTGTCGC ---/CCT CCTCCATGCA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 CCT 1 2 173660 CASAVA_Build 3 139608343 3D TGCCTTCTTA GTT/--- GTTAGTGATG 3070 het 3070 ref 30 17 10 5 GTT 2 1 173661 CASAVA_Build 3 139618740 1D TGCACAGCCC G/- GGGGGGTACC 3070 hom 57 het 32 0 16 16 G 7 6 173662 CASAVA_Build 3 139643360 1I ACAAAGCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 T 10 11 173663 CASAVA_Build 3 139685447 2I AAGATCTCAT --/TC TCTTTAAGGC 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 TC 1 2 173664 CASAVA_Build 3 139696540 5D AATGATTTGA TTTGT/----- TTTCAGTATG 3070 het 3070 hom 39 19 20 2 TTTGT 1 0 173665 CASAVA_Build 3 139698864 1D GCCATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1109 het 1109 ref 28 17 3 8 A 15 14 173666 CASAVA_Build 3 139700799 1I GGTCAGGTGT -/G GGGGAAAGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 4 5 173667 CASAVA_Build 3 139712559 3I TGCCCAGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TTG 5 6 173668 CASAVA_Build 3 139727912 1D GCCAGGCTGG T/- TCTCAAACTC 3070 hom 79 het 33 0 26 7 T 2 1 173669 CASAVA_Build 3 139728544 1D GACGATAGAC A/- AAAAAAGAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 6 173670 CASAVA_Build 3 139728803 3I GCTCAAGTGA ---/TCT TCTCACCTCA 3070 hom 44 het 19 0 16 3 TCT 1 2 173671 CASAVA_Build 3 139730282 1D CCAGCACTTT G/- GGGAGGCCAA 3070 hom 80 het 30 0 25 5 G 4 3 173672 CASAVA_Build 3 139734138 5D TTCAAAATGC GGTAT/----- GGTATTACAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 GGTAT 2 1 173673 CASAVA_Build 3 139755733 1D ACTCCATATG A/- AAAAAAAAAA 1870 het 1870 ref 30 18 5 7 A 15 14 173674 CASAVA_Build 3 139851980 1D CCACTGATTG A/- AAAAAAAAAA 990 het 990 ref 38 29 3 7 A 12 11 173675 CASAVA_Build 3 139982175 2I TGGGCTAAAT --/AA GTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 30 20 7 3 A 0 2 173676 CASAVA_Build 3 140002109 1D TCAGGCTCTG A/- AAGTGCTGGC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 3 2 173677 CASAVA_Build 3 140004082 1D TTGTGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 11 10 173678 CASAVA_Build 3 140012068 1D TCTAATCATT A/- AAAAAAAAAA 1266 het 1266 ref 50 41 3 6 A 13 12 173679 CASAVA_Build 3 140013772 1I GAATGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 2099 het 256 hom 26 3 11 12 T 13 14 173680 CASAVA_Build 3 140022815 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 17 1 14 2 A 11 12 173681 CASAVA_Build 3 140055718 1D ACATGGCAGC A/- AAAAAAAAAA 2124 het 1082 hom 20 6 8 6 A 17 16 173682 CASAVA_Build 3 140065555 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 22 9 T 12 11 173683 CASAVA_Build 3 140066173 9D ATTTTTAAAG GTTTTTGTA/--------- GAGATGGGAT 3070 hom 46 het 17 0 14 4 GTTTTTGTA 1 0 173684 CASAVA_Build 3 140072316 3I GATATATCAT ---/TTA TTAAGTCAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTA 1 2 173685 CASAVA_Build 3 140074412 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2384 hom 15 het 8 0 6 3 T 12 11 173686 CASAVA_Build 3 140079196 1D ATACTTACTT G/- GCTGAAATAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 G 2 1 173687 CASAVA_Build 3 140085219 4D TATTTCTCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 24 1 15 9 T 17 13 173688 CASAVA_Build 3 140086988 1I TTTTCTTTTT -/C TTTCAGACAG 3070 hom 33 het 15 0 11 4 C 0 1 173689 CASAVA_Build 3 140097448 1D TAAGCTAAGA T/- TTTGAAAATT 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 4 3 173690 CASAVA_Build 3 140106599 1D GTTATGGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 33 0 25 8 T 11 10 173691 CASAVA_Build 3 140108161 22I TTCGGGGACA ----------------------/CATTGAAACCACAGTACCTTTC ACTTAATTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 CATTGAAACCACAGTACCTTTC 0 1 173692 CASAVA_Build 3 140132896 1D TGCCTGGCCA T/- TTTTTTTTTT 777 het 777 ref 24 11 2 11 T 13 12 173693 CASAVA_Build 3 140176656 1I CAGGGAGCCT -/G GGGGATGCTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 4 5 173694 CASAVA_Build 3 140213280 1I ATTATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 13 14 173695 CASAVA_Build 3 140218861 3I AAATCTTGAG ---/AAA AAATCCTGAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 3 6 173696 CASAVA_Build 3 140236532 1D ATTGAAGGAC A/- GCTTGGTTGC 3070 hom 120 het 44 0 41 4 A 1 0 173697 CASAVA_Build 3 140240585 6I GGCAAAGAGG ------/AGGTGA AGGTAGTTCT 3070 hom 111 het 47 0 36 11 AGGTGA 0 1 173698 CASAVA_Build 3 140246318 3D TCGGAGTCGG TGC/--- TGCTGCTGGG 3070 hom 52 het 20 0 14 6 TGC 3 2 173699 CASAVA_Build 3 140258753 4D TATCTATGTA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 99 het 42 0 32 13 TC 11 9 173700 CASAVA_Build 3 140276685 1I ACATATAGAC -/T AACAGTAAAG 3070 hom 96 het 37 0 33 5 T 0 1 173701 CASAVA_Build 3 140289446 1I GGAGCTCCCA -/G GTCTGGGCTC 3070 hom 66 het 27 0 21 6 G 1 2 173702 CASAVA_Build 3 140290368 4I GTGTGCACAC ----/CCAG CTAGGCTGCA 3070 hom 95 het 41 0 28 13 CCAG 0 1 173703 CASAVA_Build 3 140297844 1I TGGACACAGA -/G GGGGCACAGC 3070 hom 61 het 26 0 19 7 G 4 5 173704 CASAVA_Build 3 140303838 1D CTGGGTAGAA C/- CTGCAAGCAA 3070 hom 105 het 41 0 34 8 C 2 1 173705 CASAVA_Build 3 140314374 12D TCTTGACCAC CTTCTGGACACA/------------ CCCTGCCTGT 3070 hom 77 het 30 0 23 9 CTTCTGGACACA 1 0 173706 CASAVA_Build 3 140324128 6I TTCACACACA ------/CACACG CACACGCACA 3070 hom 99 het 45 0 31 14 CACACG 2 3 173707 CASAVA_Build 3 140329634 1I GATGTGTACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 8 9 173708 CASAVA_Build 3 140444569 1I TAGATGACAG -/T TTTTTTTTTT 1713 het 1713 ref 41 22 8 11 T 14 15 173709 CASAVA_Build 3 140468252 3D TCACAGGCAG TTA/--- TTATGACACT 3070 het 3070 hom 51 21 26 8 TTA 2 1 173710 CASAVA_Build 3 140474687 3I AATTAAAAAA ---/ATT ATTAAATTGC 3070 hom 74 het 27 0 23 4 ATT 1 2 173711 CASAVA_Build 3 140480742 1I TCCGTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 1914 het 8 hom 15 1 9 5 A 17 18 173712 CASAVA_Build 3 140481766 1D GAGGTGTGGT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 103 het 40 0 34 8 G 8 7 173713 CASAVA_Build 3 140517549 1I ACTTAATCCT -/C CCAGCAATTC 3070 het 3070 ref 59 23 19 17 C 2 3 173714 CASAVA_Build 3 140524296 4I CATGGTAGCC ----/GCTG GCTGCCAACC 2365 het 2365 ref 31 14 7 10 GCTG 1 2 173715 CASAVA_Build 3 140550427 2D TAAAAGAACA CT/-- CTGGCATTTT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 CT 2 1 173716 CASAVA_Build 3 140552214 1D CCCCCCCCCC G/- CAATCCGACT 1089 hom 7 het 8 0 3 5 G 1 0 173717 CASAVA_Build 3 140558290 4D ATGTGTGTTT ATTA/---- ATTATTGTAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 ATTA 2 1 173718 CASAVA_Build 3 140560218 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 8 A 13 12 173719 CASAVA_Build 3 140561725 1D ATGGGATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 39 0 29 10 A 15 14 173720 CASAVA_Build 3 140563714 5D AATTTTTCTT AAAAC/----- AAATTAGAGT 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 AAAAC 1 0 173721 CASAVA_Build 3 140567782 1D ATTTTAATCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 38 hom 39 1 17 21 T 9 8 173722 CASAVA_Build 3 140585358 2D AATCCAGTAC AT/-- GTTAATTAAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 AT 1 0 173723 CASAVA_Build 3 140590030 8I TAACTTTTTC --------/CTCTGTTT CTAGTTCCAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTCTGTTT 0 1 173724 CASAVA_Build 3 140590941 2I GGAATCAAAC --/TG GACCAAGACC 2975 hom 45 het 21 0 11 10 TG 0 1 173725 CASAVA_Build 3 140607161 1D TGAAAATTCT A/- AAAAATCGAG 1781 het 1781 ref 12 7 4 1 A 6 5 173726 CASAVA_Build 3 140613217 2D ATCTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 853 hom 28 6 9 14 T 16 14 173727 CASAVA_Build 3 140618106 4D TTTTCCTTGT CTTC/---- CTTTAGTGAT 3070 het 3070 ref 33 14 15 6 CTTC 1 0 173728 CASAVA_Build 3 140627546 2I ACACAGTGAC --/AT GTGTGTAAGG 3070 hom 141 het 53 0 47 6 AT 0 1 173729 CASAVA_Build 3 140628681 3D CTAGATATAG TTA/--- TTATTATAGT 3070 hom 45 het 19 0 16 4 TTA 3 2 173730 CASAVA_Build 3 140634675 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2598 hom 24 7 11 7 A 12 11 173731 CASAVA_Build 3 140645299 1D ATAAGGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 41 0 28 14 A 12 11 173732 CASAVA_Build 3 140649115 3I TAATTGCCTA ---/GTT GTTCTAAAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GTT 1 2 173733 CASAVA_Build 3 140659255 1I GGCTCAATTG -/C CTTAAAAGAT 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 C 1 2 173734 CASAVA_Build 3 140663071 1D AACCTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 T 11 10 173735 CASAVA_Build 3 140674765 1D GGCTCACTCA C/- CTTTTGAACT 3070 het 3070 ref 65 33 26 6 C 2 1 173736 CASAVA_Build 3 140679790 1D TACATAGGTT A/- AAAAAAAAAG 1285 het 1285 ref 44 34 3 7 A 10 9 173737 CASAVA_Build 3 140684955 1D AATTTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 1374 het 1374 ref 37 30 3 4 T 11 10 173738 CASAVA_Build 3 140686772 1D AAGTAACTTT A/- AAAAGAACAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 5 4 173739 CASAVA_Build 3 140688574 2D AAGTGAATTA TT/-- TTTTTTTTAT 3027 het 1307 hom 15 4 8 3 T 10 8 173740 CASAVA_Build 3 140692457 4I TTTCGAATTC ----/TCTG TCTGAAAGGT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TCTG 1 2 173741 CASAVA_Build 3 140695308 3D GGACTCTGTT CTC/--- CCACCACTCT 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 CTC 1 0 173742 CASAVA_Build 3 140697923 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 12 11 173743 CASAVA_Build 3 140698372 1D AGGTTGGGCT G/- GAACTCCTGG 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 G 2 1 173744 CASAVA_Build 3 140700696 1D AACAATAGTG A/- CAGAAAAATG 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 1 0 173745 CASAVA_Build 3 140701070 1D TTAAGCTACT A/- AATGTGTTAA 3070 het 3070 hom 38 19 17 4 A 3 2 173746 CASAVA_Build 3 140715204 4D ACTGAGACAG TGTC/---- TGGGGGCTTC 3070 het 2066 hom 23 6 15 3 TGTC 1 0 173747 CASAVA_Build 3 140722728 1D ATTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 636 hom 18 3 12 3 A 16 15 173748 CASAVA_Build 3 140725826 1D TGAAAACAAC T/- TTCCCTAGGA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 3 2 173749 CASAVA_Build 3 140729423 2I TATACATAAA --/AT ATATATATAT 1673 hom 18 het 7 0 7 0 AT 7 8 173750 CASAVA_Build 3 140733433 2D AATGTTGCAT TC/-- TCTCTGTCTC 3070 hom 172 het 62 0 56 6 TC 3 2 173751 CASAVA_Build 3 140746740 1D TAAATTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 451 hom 22 1 16 5 T 10 9 173752 CASAVA_Build 3 140756386 2I AGAGGGAGAA --/AG AGGGGAAGAG 3070 hom 77 het 32 0 22 10 AG 1 2 173753 CASAVA_Build 3 140763019 1I CTTTTCTTGG -/A ATGTATCGAG 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 A 1 2 173754 CASAVA_Build 3 140763675 3I GAGGTGAGTA ---/TTG TTGTGCCCAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 TTG 1 2 173755 CASAVA_Build 3 140765799 1I TCTGTCATGG -/T TACCTCACAG 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 1 2 173756 CASAVA_Build 3 140780255 1D TTGATCTCTC T/- CCTGCTAAGT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 1 0 173757 CASAVA_Build 3 140782836 3I TATTAGATGA ---/TAT TATGTAATTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TAT 1 2 173758 CASAVA_Build 3 140785616 1D TTTCTGTTTC A/- CTAATTTCTG 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 A 1 0 173759 CASAVA_Build 3 140805057 1D CATCACCAAC A/- GTGCCACCAT 3070 het 3070 hom 57 25 28 4 A 1 0 173760 CASAVA_Build 3 140807447 2D CTTCATGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 13 11 173761 CASAVA_Build 3 140809196 1I GTATATTTAG -/T TTTTCTGGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 4 5 173762 CASAVA_Build 3 140809865 4D GGCTTTACCT AACA/---- AACACTTGCA 3070 hom 98 het 37 0 31 8 AACA 2 1 173763 CASAVA_Build 3 140811115 4I TGATTGTGTT ----/TTAA TTGTTAAATT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTAA 0 1 173764 CASAVA_Build 3 140811190 1I AACTTACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 25 2 15 8 T 10 11 173765 CASAVA_Build 3 140812568 3D TGGTGAGGAT GGG/--- GGGGGTGGTG 3070 hom 75 het 33 0 25 9 G 8 5 173766 CASAVA_Build 3 140817258 4D GAATGCTAGC GTGT/---- GTATCAGGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GT 3 1 173767 CASAVA_Build 3 140817400 2D TCTAGCTTCT TG/-- TGTGGGAAAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TG 3 2 173768 CASAVA_Build 3 140820011 4I TGTGAAAGGG ----/GAAA GAAAGAGTGC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 GAAA 1 2 173769 CASAVA_Build 3 140857159 3I TTCTCTAGAT ---/GAA GAAGAAGAAG 3070 het 3070 hom 51 17 17 17 GAA 3 4 173770 CASAVA_Build 3 140860419 1D TAGAACATCT C/- CCTTACCCTG 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 C 3 2 173771 CASAVA_Build 3 140862365 1D AAGGGGAGAT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 A 8 7 173772 CASAVA_Build 3 140883981 1I TGATTCTCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 T 9 10 173773 CASAVA_Build 3 140891399 1I GTTTTATACA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 T 8 9 173774 CASAVA_Build 3 140893085 1I CATGAGGCCT -/C TGTAACCTGG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 C 0 1 173775 CASAVA_Build 3 140897827 10D ATCTTTATAT TTTTGATTTG/---------- TTTTGGCCTT 3070 het 3070 ref 32 19 13 2 TTTTGATTTG 1 0 173776 CASAVA_Build 3 140914177 1I AAGCTTACCA -/T TTTCATTGGG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 3 4 173777 CASAVA_Build 3 140919863 2D GTGTGTAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2307 hom 35 12 13 10 GT 9 8 173778 CASAVA_Build 3 140930030 1I AAGCGGAAAT -/G CAAGTGTAGA 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 G 0 1 173779 CASAVA_Build 3 140949041 2I GACACCAAAT --/CA CAGATCAAGG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 CA 1 2 173780 CASAVA_Build 3 140949727 1D AGAGTTTCTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 37 0 29 10 T 9 8 173781 CASAVA_Build 3 140951305 1D GTTTCATTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 10 9 173782 CASAVA_Build 3 140960060 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 6 7 173783 CASAVA_Build 3 140963201 2D CTTAACCATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 28 0 22 7 TA 7 6 173784 CASAVA_Build 3 140963418 1I CACTTCGGGA -/G GCAGAGGCAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 1 2 173785 CASAVA_Build 3 140965446 4D TAACAACTAG CTCT/---- CTCTCTAAAA 3070 hom 135 het 49 0 44 8 CT 5 3 173786 CASAVA_Build 3 140966332 2D AGTACATGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 132 het 53 0 44 9 CA 9 8 173787 CASAVA_Build 3 140967111 3D GAGAAATGTG TTC/--- TTATTTCAAT 3070 hom 129 het 46 0 44 3 TTC 1 0 173788 CASAVA_Build 3 140975220 2D AGCACCTGGT AC/-- ACAGTGTGAC 3070 het 3070 hom 54 22 28 5 AC 2 1 173789 CASAVA_Build 3 141051537 1I AGTTCATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 15 12 T 11 12 173790 CASAVA_Build 3 141070156 1I GTTTTTAAAG -/T TTTTTAAATT 2917 het 2917 ref 24 12 12 0 T 5 6 173791 CASAVA_Build 3 141070440 4I AGAATAATGT ----/AAAC AAACAAACAA 2684 het 1374 hom 12 4 6 2 AAAC 2 3 173792 CASAVA_Build 3 141071876 1D CACCACAGGG T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 7 6 173793 CASAVA_Build 3 141091845 1D GTGTGTAGTA G/- GTTATACCAT 3070 het 3070 hom 51 19 26 7 G 2 1 173794 CASAVA_Build 3 141099318 2D GCAAACAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 35 0 33 2 A 12 10 173795 CASAVA_Build 3 141100689 2D GAATAAAGAC TG/-- TTTTTATTCT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TG 1 0 173796 CASAVA_Build 3 141103121 2D CACAGCAGGT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 97 hom 64 3 21 40 AG 7 6 173797 CASAVA_Build 3 141108807 1I GACAAACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 697 hom 31 3 14 14 T 15 16 173798 CASAVA_Build 3 141119010 1I TCTTATGTTT -/A ACATCCCCTT 3070 hom 110 het 40 0 35 5 A 1 2 173799 CASAVA_Build 3 141120963 2I55M1I TCATGTAGGG --TTTTTTTTTTTCCTCCACATGGAATTGGTATAGGGTAAGGATTGAATTTCATTTG-/TATTTTTTTTTTTCCTCCACATGGAATTGGTATAGGGTAAGGATTGAATTTCATTTGT GTTTCCTTAT 1903 het 556 hom 32 2 8 40 N/A 0 0 173800 CASAVA_Build 3 141124913 1I ACTGCAGTCT -/G GGCACGAACA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 2 3 173801 CASAVA_Build 3 141127152 1D TAATACATAA G/- TCTAATCCTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 1 0 173802 CASAVA_Build 3 141128360 1I ACTGAGAAAT -/G GAAAGACATA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 G 1 2 173803 CASAVA_Build 3 141129400 1D AATGGTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 39 0 27 12 T 13 12 173804 CASAVA_Build 3 141132617 1D CTGTTCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 25 1 16 8 T 12 11 173805 CASAVA_Build 3 141138395 1I CTTTTCAGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 8 9 173806 CASAVA_Build 3 141142069 1D ATTTGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 41 1 36 4 T 11 10 173807 CASAVA_Build 3 141146608 1I ATTGCCAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 A 9 10 173808 CASAVA_Build 3 141149381 1I TGCACTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 10 11 173809 CASAVA_Build 3 141153995 1I TGGTTTTTTG -/C CCCCTACATT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 C 4 5 173810 CASAVA_Build 3 141159024 1D TAATCTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2304 hom 31 10 13 8 T 13 12 173811 CASAVA_Build 3 141170583 1I TGGTATGTAT -/A ATGCTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 1 2 173812 CASAVA_Build 3 141173796 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2784 het 2784 ref 24 12 9 3 A 12 11 173813 CASAVA_Build 3 141179041 9I ACAGTATCAA ---------/CTAGTACAC CTGTGCTGTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 CTAGTACAC 0 1 173814 CASAVA_Build 3 141184663 1D TAATCTGGTA T/- TTTTTGTCTA 3070 hom 57 het 20 0 20 1 T 6 5 173815 CASAVA_Build 3 141188564 1I TGATGCTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 9 10 173816 CASAVA_Build 3 141189877 1I GCAAACTTCA -/G CAGGTTAAAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 0 1 173817 CASAVA_Build 3 141197761 1I CTTCTGGGAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 388 hom 43 1 36 6 T 8 9 173818 CASAVA_Build 3 141198882 4I TGTCAGAAAG ----/ACAC ACGCAAACAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AC 1 3 173819 CASAVA_Build 3 141200077 1I GGGGTTTCAC -/T CGTGTTTGCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 0 1 173820 CASAVA_Build 3 141200527 1I GGACCTTGTG -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 27 4 A 0 1 173821 CASAVA_Build 3 141214474 2I ACAGAGACAT --/GG GAGTGGCTGT 3070 hom 131 het 51 0 40 11 G 1 3 173822 CASAVA_Build 3 141215436 3D CTGTGTCACA TCT/--- TCCTCCCCAG 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 TCT 1 0 173823 CASAVA_Build 3 141233771 1D ACATGTAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 13 12 173824 CASAVA_Build 3 141259622 1I GCTTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 A 11 12 173825 CASAVA_Build 3 141272141 1D GATGGCCAGA T/- TTGATACTTA 3070 het 3070 ref 41 19 20 2 T 3 2 173826 CASAVA_Build 3 141273730 1I TATATTTCTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 8 9 173827 CASAVA_Build 3 141286288 2D AAGGCATTCC AG/-- CCCCAGCAGA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 AG 1 0 173828 CASAVA_Build 3 141301680 1I TGCATTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2799 hom 33 7 18 8 T 14 15 173829 CASAVA_Build 3 141320112 4D GCAATCTGGA GCCT/---- GCCTAACCTC 3070 het 3070 hom 46 17 24 6 GCCT 2 1 173830 CASAVA_Build 3 141325336 2I47M2D AGATGGAGAC --ATATATATATATATATACACATATATATGTATGTATATGTGTGTGTGTA/ATATATATATATATATATACACATATATATGTATGTATATGTGTGTGTG-- TATATATATA 3070 het 978 hom 27 5 15 21 N/A 0 0 173831 CASAVA_Build 3 141330701 1D TTCCTACCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 T 10 9 173832 CASAVA_Build 3 141332838 1I TTCTTTATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 9 10 173833 CASAVA_Build 3 141338888 14I TTGCCAACCC --------------/CAGCTTTCCAACCT GCATCATTCT 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 CAGCTTTCCAACCT 0 1 173834 CASAVA_Build 3 141350997 1D ATAAATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 38 0 30 8 T 11 10 173835 CASAVA_Build 3 141357489 1D CTTTCTCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 9 173836 CASAVA_Build 3 141382919 5D ACAAGTGTTT GATTC/----- ATTTGGGTTG 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 GATTC 1 0 173837 CASAVA_Build 3 141383846 5D AAAAAAAAAG TAAAC/----- TAATATTTAG 2422 het 2422 ref 24 17 7 2 TAAAC 1 0 173838 CASAVA_Build 3 141394197 1D TTTTTTTCCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 31 8 20 3 T 9 8 173839 CASAVA_Build 3 141415986 2I ACTCTGTCTT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 A 9 11 173840 CASAVA_Build 3 141418791 2I AAGCACAGGT --/TA TTATTTCACT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TA 0 1 173841 CASAVA_Build 3 141439952 2D CACAGAACAG AA/-- AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 23 0 21 4 A 10 8 173842 CASAVA_Build 3 141441468 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TA 6 5 173843 CASAVA_Build 3 141447196 1I GCCCTCCCAC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 126 het 52 0 42 10 A 8 9 173844 CASAVA_Build 3 141460703 1I TAATTGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 19 3 13 3 A 10 11 173845 CASAVA_Build 3 141464032 5D CTCTAACTGG TTGAA/----- AGTGAATGTG 3070 hom 114 het 43 0 39 6 TTGAA 1 0 173846 CASAVA_Build 3 141476810 1I TTGGGAGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 20 0 14 6 T 11 12 173847 CASAVA_Build 3 141479891 1I GCTCAACACT -/G TGAGCGAGCG 3070 hom 71 het 29 0 22 7 G 0 1 173848 CASAVA_Build 3 141484162 1D AAGGATTCCT C/- CCATATTTGT 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 C 3 2 173849 CASAVA_Build 3 141490482 1D CCTCCCTGAT C/- CCCCGTGCCC 3070 hom 98 het 36 0 26 10 C 5 4 173850 CASAVA_Build 3 141503435 1I CATTATAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 T 13 14 173851 CASAVA_Build 3 141540842 2D GCAGACTGAT TC/-- TCTCTCTCTC 1208 het 1208 ref 42 24 3 15 TC 9 8 173852 CASAVA_Build 3 141541657 3D CCCTCCCCTT CTC/--- CTATAGGCTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 CTC 1 0 173853 CASAVA_Build 3 141553325 2I TTTTGTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 9 13 T 12 14 173854 CASAVA_Build 3 141565134 11D AGTCAGAGGG ACCCGGTAGGC/----------- ACTTAGGGTT 3070 het 3070 ref 47 22 22 8 ACCCGGTAGGC 1 0 173855 CASAVA_Build 3 141571110 1I ATAATTTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 26 9 11 A 9 10 173856 CASAVA_Build 3 141590679 5I TTCTTTCTAC -----/TTTAT TTTAAGTTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTTAT 0 1 173857 CASAVA_Build 3 141595754 3I TGATGACCAT ---/AGG AGGACAATGG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 AGG 1 2 173858 CASAVA_Build 3 141596164 1I TGCACTTAAC -/T TTTTTGTCCA 3070 het 3070 hom 57 21 28 8 T 5 6 173859 CASAVA_Build 3 141599512 33I AGACAAGTAT ---------------------------------/TGAAATATTGGTAAATTGTTAAACTCCCTGTGG CAGACACAGG 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 TGAAATATTGGTAAATTGTTAAACTCCCTGTGG 0 1 173860 CASAVA_Build 3 141607094 1I GCCAGTGTCC -/T TTTTGAGAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 4 5 173861 CASAVA_Build 3 141622434 1D AGTCCTATTG C/- GCAGCTAGGT 3070 het 3070 ref 53 29 15 9 C 1 0 173862 CASAVA_Build 3 141623093 1I ATCTCACAGC -/A ATGTAGGAGA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 A 1 2 173863 CASAVA_Build 3 141652495 1I ACAGCTCTTG -/A CAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 0 1 173864 CASAVA_Build 3 141661329 3D CCCTTCCACC CCT/--- CCTACCCCAG 3070 hom 77 het 30 0 22 9 CCT 2 1 173865 CASAVA_Build 3 141675277 1I GTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 10 11 173866 CASAVA_Build 3 141728176 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 1219 het 1219 ref 42 33 3 6 A 10 9 173867 CASAVA_Build 3 141762118 1D CAGACCAGGA G/- GACCCCGAGG 3070 hom 83 het 33 0 27 6 G 2 1 173868 CASAVA_Build 3 141770093 1I CCATTTAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 8 9 173869 CASAVA_Build 3 141772889 1I AAAAAGACAA -/C CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 C 1 2 173870 CASAVA_Build 3 141777257 1D ATGATTTGGT A/- GGGGTATTCG 3070 het 3070 ref 47 22 18 8 A 1 0 173871 CASAVA_Build 3 141783135 2D GGTTATTGAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 AT 7 6 173872 CASAVA_Build 3 141793997 1D ACCATTATTT G/- GGTCTTCACC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 3 2 173873 CASAVA_Build 3 141796255 1D AGAAATAGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 A 10 9 173874 CASAVA_Build 3 141811374 1D TCAAACTATC A/- ATGACGTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 2 1 173875 CASAVA_Build 3 141816770 1D ATAGCTAGAC A/- CATAAATACA 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 A 1 0 173876 CASAVA_Build 3 141835045 2I ATTTTGACTT --/CA GATTCCTGGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CA 0 1 173877 CASAVA_Build 3 141837429 1D ATAGTTATCT G/- GGGGGGCTGA 3070 het 3070 hom 28 13 11 5 G 7 6 173878 CASAVA_Build 3 141837930 1I AATAAGGCAG -/T TAAGCCAGAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 1 2 173879 CASAVA_Build 3 141841582 1D CATCCATGTT C/- CCACAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 C 3 2 173880 CASAVA_Build 3 141842384 1I GTCTTACAGG -/T TTTTTTTTTT 2635 het 2122 hom 21 7 8 6 T 11 12 173881 CASAVA_Build 3 141847283 2I TGGTTTGAAA --/TC TGTTTTGTCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TC 0 1 173882 CASAVA_Build 3 141862383 3I AAAGGAGTCT ---/TTC CTATTCAATA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 TTC 0 1 173883 CASAVA_Build 3 141862887 1I AAAACACATG -/A AAAAAAAGCT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 7 8 173884 CASAVA_Build 3 141868520 5D AAGATTAACC AAGAA/----- AAGAAGAGAG 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 AAGAA 2 1 173885 CASAVA_Build 3 141872622 2I GAAGGAAAAA --/TT TTAAGACATC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 T 2 4 173886 CASAVA_Build 3 141874984 1I AGCGGGGTGA -/G GGGAAAGGGG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 3 4 173887 CASAVA_Build 3 141875921 1D ACCAATTTTT C/- TACAAATTAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 C 1 0 173888 CASAVA_Build 3 141880587 1I GGAGACAATA -/C CCCCCCCCAT 2945 het 2945 ref 34 15 10 9 C 8 9 173889 CASAVA_Build 3 141883180 1I GTCCTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 A 10 11 173890 CASAVA_Build 3 141883400 1I AAAAGTTGTT -/A AAAAAAAAAA 1950 het 1950 ref 26 6 10 10 A 13 14 173891 CASAVA_Build 3 141893510 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 44 0 30 15 A 11 10 173892 CASAVA_Build 3 141900561 6I TAAGGAAAAT ------/TACTTC TACTTCTAGG 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 TACTTC 1 2 173893 CASAVA_Build 3 141904897 1I GCTAGGAAGG -/A AAAGAGGCAT 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 A 3 4 173894 CASAVA_Build 3 141932493 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2723 hom 27 10 11 6 A 13 14 173895 CASAVA_Build 3 141936018 2D GCCACACCTG CC/-- CCCCCAGGTG 3070 het 2995 hom 23 11 8 4 C 7 5 173896 CASAVA_Build 3 141937870 1I AATAATAATA -/T TAATACAAAG 3070 het 3070 hom 19 7 9 3 T 1 2 173897 CASAVA_Build 3 141939904 4I TAAAGTGTGG ----/GACT GACTAATTCA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 GACT 1 2 173898 CASAVA_Build 3 141943060 1D ATCTTTACCC T/- GGCTCTTCTC 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 T 1 0 173899 CASAVA_Build 3 141948657 2D ATTCTGTCTA CT/-- CTATAATGGC 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 CT 2 1 173900 CASAVA_Build 3 141951862 1D CACGTGGGAT A/- GGGGATGGAC 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 A 1 0 173901 CASAVA_Build 3 141958586 1D CCACAGACCA G/- GTCTGATGGG 3070 het 3070 hom 60 18 33 11 G 2 1 173902 CASAVA_Build 3 141993098 1I AAAGTGCTGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 17 11 0 A 8 9 173903 CASAVA_Build 3 142020197 1D TAAATACCTG A/- AAAAAAAAAA 1668 het 1668 ref 29 17 4 8 A 12 11 173904 CASAVA_Build 3 142034512 1D AGAGTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 583 hom 36 3 24 11 A 15 14 173905 CASAVA_Build 3 142036823 1D AAACTGTAGC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 8 7 173906 CASAVA_Build 3 142037640 1I TTCAGGACAT -/A ACAGCATTAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 173907 CASAVA_Build 3 142041639 12I AAAAGTGCAG ------------/GGCTGCTATTCA GGCAGTGCAC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 GGCTGCTATTCA 0 1 173908 CASAVA_Build 3 142052886 1D CCAGTCCATT A/- GAGAAGGTCT 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 A 1 0 173909 CASAVA_Build 3 142054463 1I ATTTAAACAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 92 het 39 0 30 9 A 8 9 173910 CASAVA_Build 3 142060415 2I GTCTACACCC --/CT CTGTCACTTA 3070 het 3070 hom 49 16 25 8 CT 1 2 173911 CASAVA_Build 3 142089301 1I CTCTGGACAC -/T AAACTCAGTT 3070 hom 154 het 55 0 52 3 T 0 1 173912 CASAVA_Build 3 142181952 6I TGTCCAGTCT ------/TGTAGG TGAGGAAACC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TGTAGG 0 1 173913 CASAVA_Build 3 142182243 1I CCCCCTTTTA -/T ATATATATAC 3070 het 221 hom 16 2 10 4 T 0 1 173914 CASAVA_Build 3 142183449 4I GATTTTTAGG ----/GTGA GTTTTTTGTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 GTGA 0 1 173915 CASAVA_Build 3 142185562 1I AATTTGGGGG -/A AAAAAAACTC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 7 8 173916 CASAVA_Build 3 142188629 1I AAGCCAAAGC -/A AAAGGTGAAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 3 4 173917 CASAVA_Build 3 142197743 4D ATTCTATTAT AAGG/---- AAGAATGGTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAGG 1 0 173918 CASAVA_Build 3 142200425 3D ACCCTGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 23 1 15 7 A 16 13 173919 CASAVA_Build 3 142206076 13I AGTAGGGCCC -------------/TGCCTCCCTGTTT TGCCTCCCTG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 TGCCTCCCTGTTT 0 1 173920 CASAVA_Build 3 142218956 25D AAAGGTTTGT AAACGCACCAATCAGCACTCTGTAA/------------------------- AAACGCACCA 3070 hom 73 het 28 0 23 5 AAACGCACCAATCAGCACTCTGTAA 1 0 173921 CASAVA_Build 3 142220551 2D TAGGCAGTGA TG/-- TGTGTTTGGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TG 3 2 173922 CASAVA_Build 3 142224612 2D TATAAAGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 22 0 14 9 T 16 14 173923 CASAVA_Build 3 142228871 1D GACCTGGAAC A/- AAGGTTAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 3 2 173924 CASAVA_Build 3 142230537 1D TAGGTGCAGC A/- AAACCAGCAT 1880 hom 10 het 4 0 4 0 A 4 3 173925 CASAVA_Build 3 142231380 1I GTTATTATTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 41 het 16 0 13 3 T 8 9 173926 CASAVA_Build 3 142244044 1I TACCTGAAAC -/A AAAAATGGAT 3070 hom 114 het 50 0 39 11 A 5 6 173927 CASAVA_Build 3 142248441 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 23 1 20 2 A 10 11 173928 CASAVA_Build 3 142351632 1I GGCCTTGAGG -/C CTCACGGATC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 1 2 173929 CASAVA_Build 3 142371512 1D AGCTGGTGAC T/- TTTAAGTTGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 4 3 173930 CASAVA_Build 3 142386594 5I CAGCTAATTT -----/TTTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 TTTTG 0 1 173931 CASAVA_Build 3 142390899 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTCTTTCTT 3050 het 277 hom 27 5 19 3 T 5 3 173932 CASAVA_Build 3 142397269 4I TGCAGGAGCT ----/GACA AACAAAGTAG 3070 hom 80 het 33 0 25 8 GACA 0 1 173933 CASAVA_Build 3 142412482 2I CCCTTGGGCA --/CT CTCTAATTGG 3070 hom 27 het 12 0 9 3 CT 2 3 173934 CASAVA_Build 3 142414641 1D TTGTTTTTGT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 8 7 173935 CASAVA_Build 3 142420456 1I CATCCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1217 hom 37 4 24 9 A 12 13 173936 CASAVA_Build 3 142427398 1D AAAAGGCAAA C/- CCATAGGCTG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 3 2 173937 CASAVA_Build 3 142441060 3I GATTTTTTTT ---/CTC CTCTTGTGCA 3070 hom 158 het 61 0 51 10 CTC 1 2 173938 CASAVA_Build 3 142455225 2I AAACTTTTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 20 1 12 7 A 13 15 173939 CASAVA_Build 3 142468123 5D CTCAGGTGGG GAGCT/----- GAGGAGGCCC 3070 hom 56 het 21 0 16 6 GAGCT 1 0 173940 CASAVA_Build 3 142469150 1D TCTGCAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 949 hom 39 5 31 3 A 13 12 173941 CASAVA_Build 3 142484674 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1205 hom 15 het 7 0 6 1 T 15 14 173942 CASAVA_Build 3 142485919 1D AAGTGGCATA C/- ATCTTTCCGT 3070 hom 123 het 44 0 40 5 C 1 0 173943 CASAVA_Build 3 142506895 2D AGAGTCTGAG AA/-- AAAAAAAAAA 1653 het 701 hom 19 4 5 10 A 18 16 173944 CASAVA_Build 3 142523782 1I AAGTGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 A 11 12 173945 CASAVA_Build 3 142523964 2D TAAGCCTGCA TT/-- TTTCCCATTA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 T 5 3 173946 CASAVA_Build 3 142535759 1I TATTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1184 hom 31 3 20 8 A 12 13 173947 CASAVA_Build 3 142550467 1D GGAAGCCAAA C/- CTATATTACA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 C 2 1 173948 CASAVA_Build 3 142557561 2I TTCTCTGCCA --/CT CTCTGTTTCA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 CT 2 3 173949 CASAVA_Build 3 142564188 1I AACTGGACAG -/A AGCGGAAGGA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 1 2 173950 CASAVA_Build 3 142579894 4D ACATACAGGT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 49 21 20 10 AC 8 6 173951 CASAVA_Build 3 142600660 1I TTTATATTCC -/T TTTTTTTTTT 2007 het 2007 ref 37 17 9 11 T 13 14 173952 CASAVA_Build 3 142678014 1D GTGGGAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1034 hom 18 6 11 4 A 16 15 173953 CASAVA_Build 3 142684631 1D TCCAATTTTA T/- TTTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 6 5 173954 CASAVA_Build 3 142686081 1I ACATTGATAC -/T TTTATCCATG 3070 het 3070 ref 51 21 18 12 T 3 4 173955 CASAVA_Build 3 142699236 1D TCTACAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 10 9 12 A 15 14 173956 CASAVA_Build 3 142708249 1D GTTCAAGACC A/- GCCTGGGCAA 2087 het 980 hom 22 4 6 12 A 1 0 173957 CASAVA_Build 3 142714730 1I TAGGGATCTG -/T TTTTTTTTTT 2697 het 2697 ref 30 18 7 5 T 11 12 173958 CASAVA_Build 3 142722180 2I TTACATACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 AT 5 6 173959 CASAVA_Build 3 142723474 1D GTTTTCTTAA T/- TTATAATTTG 3070 het 3030 hom 26 8 12 6 T 3 2 173960 CASAVA_Build 3 142736125 1D TTTATAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 T 11 10 173961 CASAVA_Build 3 142745409 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1244 het 1244 ref 22 10 4 8 T 17 16 173962 CASAVA_Build 3 142754960 1I CTTATTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 T 10 11 173963 CASAVA_Build 3 142760223 1I ATTATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 10 11 173964 CASAVA_Build 3 142763956 1I13M1D GAGATCGAGA -CATCCTGGCTAACA/CCATCCTGGCTAAC- ATGGTGAAAC 2306 hom 15 het 6 0 6 0 N/A 0 0 173965 CASAVA_Build 3 142764052 1I13M1D CTACTCAGGA -GCTGGCGCAGGAGA/GGCTGACGCAGGAG- AATTGCGTGC 2909 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 173966 CASAVA_Build 3 142764187 1I AACAACACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2958 hom 20 8 9 3 A 9 10 173967 CASAVA_Build 3 142771620 1D GATAAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 1969 het 1969 ref 29 11 7 11 T 17 16 173968 CASAVA_Build 3 142789417 1D AAGGTTGGTT A/- AAAGTGAGAA 3070 het 3070 hom 44 16 25 4 A 4 3 173969 CASAVA_Build 3 142796406 1I AGAATGCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 10 11 173970 CASAVA_Build 3 142802975 11D CACTGTCTCC AAAAAAAAAGA/----------- AAAAAAAAAG 850 het 850 ref 26 20 3 9 AAAAAAAAAGA 2 1 173971 CASAVA_Build 3 142803040 1D AAAATATCTT C/- GAAACCATGA 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 C 1 0 173972 CASAVA_Build 3 142804527 2I GCCAGTAAAA --/CT CTTGTATTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 CT 1 2 173973 CASAVA_Build 3 142819523 2D TTTTCAACAA AG/-- ACCTGAAGAA 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 AG 1 0 173974 CASAVA_Build 3 142839061 1D CTCCCAAGTA G/- GCTGGGATTA 3070 hom 36 het 15 0 13 6 G 2 1 173975 CASAVA_Build 3 142843381 2I TTTTAAAATT --/AA GTTACTAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 0 2 173976 CASAVA_Build 3 142845921 1I ATTAGCTGAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 7 8 173977 CASAVA_Build 3 142847526 1D ACTCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1373 het 1373 ref 21 11 7 4 A 11 10 173978 CASAVA_Build 3 142855384 1I TTGAGGCCAA -/G TTTGAATGAG 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 G 0 1 173979 CASAVA_Build 3 142855649 21D ACGGGGACTT CAGGAAGAAGGAGTTGGGAGA/--------------------- GGTTTCTTAC 3070 het 3070 ref 28 19 13 6 CAGGAAGAAGGAGTTGGGAGA 1 0 173980 CASAVA_Build 3 142881927 1I GAGGCAGGAG -/A AATCACTTGA 3070 het 3046 hom 24 7 17 0 A 2 3 173981 CASAVA_Build 3 142885554 3D GGTTTGTTTG GTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 GTT 1 0 173982 CASAVA_Build 3 142886095 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 7 6 173983 CASAVA_Build 3 142887042 1I TTAAATCCAA -/T TTTTTTTTTT 1734 het 1084 hom 14 6 5 3 T 13 14 173984 CASAVA_Build 3 142931835 1I CCTAAATGAG -/A GAAACTTTTT 1312 het 1312 ref 13 7 6 0 A 0 1 173985 CASAVA_Build 3 142948289 1I8M3D TAGAATGTTT -AAAAAGATAAC/AAAAAAGAT--- AATTAGAATG 3070 het 3070 ref 48 25 21 6 N/A 0 0 173986 CASAVA_Build 3 142949697 1I TTATTGCCAC -/G GGGTAGTTTG 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 G 3 4 173987 CASAVA_Build 3 142957864 1I AAAAAGGTGG -/C GGGGGTGAAA 2571 hom 18 het 11 0 6 5 C 0 1 173988 CASAVA_Build 3 142967677 4I GACATTTAAC ----/TGGG ATTTACACGC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TGGG 0 1 173989 CASAVA_Build 3 142974668 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 25 0 15 11 A 17 16 173990 CASAVA_Build 3 142977819 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAATAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 4 6 173991 CASAVA_Build 3 142984345 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 34 1 27 7 A 13 12 173992 CASAVA_Build 3 142991188 1D GCCAAATGGG C/- AAAAAAAAAA 3070 het 1057 hom 33 6 17 12 C 1 0 173993 CASAVA_Build 3 142996854 1I TGGGTAGAGG -/C CAGGGATACT 3070 hom 144 het 56 0 48 8 C 1 2 173994 CASAVA_Build 3 143005464 2I GGCTGGTCTC --/TT AACTCCTGAT 3067 hom 39 het 18 0 10 8 T 0 2 173995 CASAVA_Build 3 143008099 2D CATCTCAAAA AT/-- ATATATATAT 1327 het 1327 ref 21 16 4 1 AT 8 7 173996 CASAVA_Build 3 143015758 1I ACATTTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 9 10 173997 CASAVA_Build 3 143033538 1I GGTTGGTCAG -/T TGTGCCTCTG 3070 hom 144 het 54 0 47 7 T 1 2 173998 CASAVA_Build 3 143035504 1I GCCTAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 32 1 23 8 T 10 11 173999 CASAVA_Build 3 143047424 8I GGGCTTCTCA --------/CTAGGGAG CTAAACATGC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 CTAGGGAG 0 1 174000 CASAVA_Build 3 143049935 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 10 9 174001 CASAVA_Build 3 143060484 4D GAAAAAAAAC AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 37 15 12 11 AAAG 5 4 174002 CASAVA_Build 3 143065507 1D AACTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 934 hom 22 5 12 6 T 13 12 174003 CASAVA_Build 3 143074123 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 2652 het 746 hom 16 4 6 6 A 9 10 174004 CASAVA_Build 3 143079190 1I ACAACACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 14 12 T 14 15 174005 CASAVA_Build 3 143091363 2I ATACATATAC --/AT ATATATATAT 2990 hom 21 het 12 0 8 4 AT 7 8 174006 CASAVA_Build 3 143095859 1D CTTTTTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 11 10 174007 CASAVA_Build 3 143107553 4D TGTACATGTA ATAC/---- ATATATAATA 3070 het 3070 hom 44 19 24 2 ATAC 1 0 174008 CASAVA_Build 3 143113734 1D TTGACAGTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 6 174009 CASAVA_Build 3 143116552 2D AAAATGAATT AA/-- GTTTGTTTTA 3070 hom 114 het 42 0 39 5 A 2 0 174010 CASAVA_Build 3 143123262 2D CTCTCATGAA AG/-- AGAGTATAGA 3070 hom 132 het 53 0 43 10 AG 3 2 174011 CASAVA_Build 3 143127827 1D TAAAACATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 41 1 29 11 A 11 10 174012 CASAVA_Build 3 143129759 2D GGAGGGACTC TA/-- TAGATGTAGC 3070 het 3070 ref 56 29 21 7 TA 2 1 174013 CASAVA_Build 3 143129912 2D ATCATTTGAC TT/-- TAGCTGATAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 3 1 174014 CASAVA_Build 3 143135051 3I AGATCAGTTT ---/CAA CAACAACAAC 3070 hom 80 het 30 0 25 5 CAA 5 6 174015 CASAVA_Build 3 143146716 1D GCTGGAGTGC A/- AATGGCACGA 3070 hom 29 het 11 0 10 3 A 3 2 174016 CASAVA_Build 3 143150074 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3016 het 1829 hom 24 6 8 10 A 14 15 174017 CASAVA_Build 3 143156598 1D AATTAAAGCC A/- GAATCTTGTG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 1 0 174018 CASAVA_Build 3 143158473 1I CCCTGCCCCA -/C CCCCCCCCAC 2422 hom 27 het 14 0 10 4 C 8 9 174019 CASAVA_Build 3 143159891 3D TCTAAAGAAC ATA/--- ATATCGAGTG 3070 het 3070 ref 41 19 17 8 ATA 2 1 174020 CASAVA_Build 3 143167546 1I TCTGTCCCTA -/G GTGCCACAAG 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 G 1 2 174021 CASAVA_Build 3 143213123 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 13 1 9 3 A 11 10 174022 CASAVA_Build 3 143215385 1D TGAAAAAAAA T/- ATCCAGTTAC 3070 het 249 hom 25 1 23 2 T 1 0 174023 CASAVA_Build 3 143220586 1D TCTTCGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 20 19 174024 CASAVA_Build 3 143221180 1I ATATTAAACA -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 70 het 30 0 20 10 C 8 9 174025 CASAVA_Build 3 143222517 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 33 0 24 10 A 13 12 174026 CASAVA_Build 3 143226557 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 22 3 16 3 A 13 12 174027 CASAVA_Build 3 143228613 4I CTTTTGCAAC ----/TAAG TGTTTCCTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TAAG 0 1 174028 CASAVA_Build 3 143228823 3D CTGAATATAA AAT/--- AATAAATTTT 3070 hom 79 het 29 0 27 2 AAT 2 1 174029 CASAVA_Build 3 143230997 1D GTTGTCCTGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 8 174030 CASAVA_Build 3 143233473 1D TAAAATATTG A/- ATCTTCCTGA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 2 1 174031 CASAVA_Build 3 143248118 6D GCAACACGGC GTTGGT/------ GTTGGTGGGA 3070 hom 129 het 46 0 42 8 GTTGGT 2 1 174032 CASAVA_Build 3 143252384 4D CATCTCAAAA AATC/---- AATCAATCAA 3070 hom 71 het 31 0 24 9 AATC 4 3 174033 CASAVA_Build 3 143265368 1I GCAGGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 27 1 19 7 A 11 12 174034 CASAVA_Build 3 143266687 1D ATCATTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 23 0 18 5 T 13 12 174035 CASAVA_Build 3 143301232 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 673 het 673 ref 16 11 2 3 A 15 14 174036 CASAVA_Build 3 143307496 1D CAATGTTAGA G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 7 G 6 5 174037 CASAVA_Build 3 143307645 1D GTTTAATTGT G/- GTTAAAAAAA 3070 het 10 hom 31 1 27 3 G 2 1 174038 CASAVA_Build 3 143312487 1D TCTGCCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 30 0 18 13 A 12 11 174039 CASAVA_Build 3 143323383 1D ATACGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 35 0 30 6 A 13 12 174040 CASAVA_Build 3 143330450 2D TGCAACTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 11 9 174041 CASAVA_Build 3 143388836 1I AGGAAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 1672 het 1672 ref 32 21 5 6 A 13 14 174042 CASAVA_Build 3 143411484 1I CAGCTCGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 12 13 174043 CASAVA_Build 3 143427453 1I ACGCCCGGCT -/C ATTTTTGTAT 1367 het 1367 ref 10 4 3 3 C 0 1 174044 CASAVA_Build 3 143442372 4D AAGAACACAG GGTT/---- GGTTCCCTTT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 GGTT 2 1 174045 CASAVA_Build 3 143443295 1D GGGGATGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2952 hom 24 9 9 6 T 11 10 174046 CASAVA_Build 3 143448632 1D CAATAAAAAC A/- AAGAAGAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 A 3 2 174047 CASAVA_Build 3 143451020 4I AGCAACATAC ----/CAAG CAAGACCTTG 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 CAAG 1 2 174048 CASAVA_Build 3 143461820 1D ATTTATAATG A/- AAAAAGATAA 2834 het 2834 ref 23 15 6 2 A 6 5 174049 CASAVA_Build 3 143467082 1D TCTGGTGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 T 14 13 174050 CASAVA_Build 3 143480380 1D TAAACTTAGA T/- TTATCTATTA 3070 het 3070 hom 32 8 23 1 T 3 2 174051 CASAVA_Build 3 143491227 2D ACTCACTGTA CC/-- CAGCCTGTAC 2488 het 2488 ref 18 11 6 1 C 3 1 174052 CASAVA_Build 3 143509595 4D AGCGTGACAG AACT/---- AACTTGAGTG 3070 het 3070 hom 35 15 20 0 AACT 2 1 174053 CASAVA_Build 3 143519465 2I ATATTTCTTC --/TA TGTCTTCATC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TA 0 1 174054 CASAVA_Build 3 143519796 1D44M1I TTTTGGACAT AGTCTACTACCAATAAGAAAATACAGTCCTGAAGAAATTACATGA-/-GTCTACTACCAATAAGAAAATACAGTCCTGAAGAAATTACATGAT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 17 21 2 N/A 0 0 174055 CASAVA_Build 3 143525399 1D TTTTTTACTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 T 10 9 174056 CASAVA_Build 3 143532126 1D AGCCTATGAG T/- TTTTTTTTTT 1720 het 1720 ref 25 13 4 8 T 17 16 174057 CASAVA_Build 3 143536508 3D ACTGGGACTA CAG/--- CAGGCACATG 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 CAG 2 1 174058 CASAVA_Build 3 143556786 1I GAAATTATTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 7 8 174059 CASAVA_Build 3 143566467 2I TAAAAAGATT --/TA GTTTGTTCCT 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 TA 0 1 174060 CASAVA_Build 3 143568920 1D GATTTGTTTG T/- TACCTGAAAG 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 2 1 174061 CASAVA_Build 3 143569478 1D ATCCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 11 10 174062 CASAVA_Build 3 143584578 1D CAAAACTGCT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 9 8 174063 CASAVA_Build 3 143589809 1I AGTAAATATA -/T TTTCTCTTAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 3 4 174064 CASAVA_Build 3 143593858 1D CAGCAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 906 hom 25 3 13 9 T 15 14 174065 CASAVA_Build 3 143605978 1D GAGAGAAGAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 8 7 174066 CASAVA_Build 3 143626398 2I AGTTAATGCC --/AA AAAAAGTCTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 5 7 174067 CASAVA_Build 3 143641283 1I AAACGGGATT -/A AAAAAAAAAA 2438 het 2438 ref 25 14 7 4 A 11 12 174068 CASAVA_Build 3 143646371 1D TATGTTTCAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 A 9 8 174069 CASAVA_Build 3 143651890 1I ATTCAAGACA -/G GTGTTTAAGT 3070 het 2977 hom 30 7 20 3 G 1 2 174070 CASAVA_Build 3 143702824 2I GCCATGACTC --/TT TCCCAAATCC 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 T 1 3 174071 CASAVA_Build 3 143712339 1D CCAAGAATGG A/- AAAAAAAAAA 3067 het 3067 ref 55 37 7 12 A 12 11 174072 CASAVA_Build 3 143738775 1D CTCTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 T 12 11 174073 CASAVA_Build 3 143748748 1D TAAAATAGAG A/- ACATATTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 2 1 174074 CASAVA_Build 3 143753641 1I CTCACGCCAG -/T CAGAATGGCT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 T 0 1 174075 CASAVA_Build 3 143753830 12D GTATATACCC AAAGGAATATAA/------------ AAAGGAATAT 2607 het 2607 ref 20 13 9 3 AAAGGAATATAA 2 1 174076 CASAVA_Build 3 143758653 1I CAGATTCTGA -/T TCAGTAGGTC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 T 1 2 174077 CASAVA_Build 3 143778434 2I AACACTAATA --/TC TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 TC 1 2 174078 CASAVA_Build 3 143791593 3D ACATATGACA TCT/--- TCTCATGTTT 3070 het 3070 hom 30 15 14 2 TCT 2 1 174079 CASAVA_Build 3 143793383 1I TTTGTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 10 11 174080 CASAVA_Build 3 143803640 1I ATCGTTCCGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2750 hom 36 8 17 11 T 14 15 174081 CASAVA_Build 3 143818679 1D ATTAGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 2157 het 2157 ref 33 20 7 6 T 15 14 174082 CASAVA_Build 3 143823670 3D CTCCTGGTAT TTC/--- TTCTGCCAGT 3070 het 3070 ref 53 26 23 5 TTC 2 1 174083 CASAVA_Build 3 143824855 1I TGCCTCTTGA -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 47 19 20 8 T 7 8 174084 CASAVA_Build 3 143829868 31D ATAGTGTGTG TGTGTGCGCGCACATGTGCATGCAGTGTGCA/------------------------------- TGTGTGCGCG 3070 het 3070 ref 30 14 9 16 TGTGTGCGCGCACATGTGCATGCAGTGTGCA 2 1 174085 CASAVA_Build 3 143830732 1D TTGGAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2138 hom 24 7 9 8 T 15 14 174086 CASAVA_Build 3 143837588 1D CACCTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 13 12 174087 CASAVA_Build 3 143867335 1D GATGGAACAA T/- TTTTTTTTTT 2392 het 2392 ref 27 10 8 9 T 13 12 174088 CASAVA_Build 3 143871204 3D CTGCTTTAAA ATG/--- ATGATGATGA 3070 het 3070 hom 46 18 22 7 ATG 6 5 174089 CASAVA_Build 3 143875287 1I GGACAACCAT -/C CCCAATAGAA 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 C 3 4 174090 CASAVA_Build 3 144034286 1D AACAGAATTC A/- ATGGCATTGA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 2 1 174091 CASAVA_Build 3 144035014 1D ACGCTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 2464 het 2060 hom 28 9 8 11 T 17 16 174092 CASAVA_Build 3 144037534 1I TTGCACTGAA -/T TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 50 30 17 3 T 6 7 174093 CASAVA_Build 3 144038986 6I TAAAACATTC ------/TTAATA TTATCAATGT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 TTAATA 0 1 174094 CASAVA_Build 3 144050685 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 719 hom 18 3 13 2 A 13 12 174095 CASAVA_Build 3 144052345 2I ATGGGGGTAA --/CT GGAAGGGGAT 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 CT 0 1 174096 CASAVA_Build 3 144055741 2I TTTGCAGCAC --/AT GTGATTTTTT 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 AT 0 1 174097 CASAVA_Build 3 144055862 25D TCGAGGCACA GTTGATCTACGTAAAGCTCGAGGTG/------------------------- ACCACTCAGT 3070 het 3070 ref 34 23 13 3 GTTGATCTACGTAAAGCTCGAGGTG 1 0 174098 CASAVA_Build 3 144056873 1I TTATAATCTT -/A AAAATAATAG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 4 5 174099 CASAVA_Build 3 144063188 1D TGCTCTGCAC T/- GTTTCTGTTG 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 T 1 0 174100 CASAVA_Build 3 144083732 1I TGGCTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 9 9 A 13 14 174101 CASAVA_Build 3 144085242 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACACATA 3070 het 2243 hom 25 9 16 0 C 0 1 174102 CASAVA_Build 3 144095197 1D ACCAGACTAA T/- TTTTTTTTTC 1869 het 1869 ref 13 6 4 3 T 10 9 174103 CASAVA_Build 3 144095829 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3060 hom 23 10 8 5 A 12 11 174104 CASAVA_Build 3 144099000 2I GTATATTTAC --/AT ATGTTTGTAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AT 1 2 174105 CASAVA_Build 3 144103684 1I GGTGAAACCC -/A CATCTCTACT 1704 hom 10 het 4 0 4 0 A 0 1 174106 CASAVA_Build 3 144105862 2D ACAAACAAAC AT/-- ATATATACAT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 AT 4 3 174107 CASAVA_Build 3 144117165 3D GAGCGCCAGC AGG/--- AGAAATGCCA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 AGG 1 0 174108 CASAVA_Build 3 144120398 2D TACCTAAGTA TT/-- TCATATTTGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 3 1 174109 CASAVA_Build 3 144123105 1I ATTTCTATTC -/T TTTTTTTTTT 2820 het 718 hom 22 2 9 11 T 13 14 174110 CASAVA_Build 3 144127111 4D TTTTCACTGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 29 0 22 7 T 18 14 174111 CASAVA_Build 3 144127833 1I CAATCTAATG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 8 9 174112 CASAVA_Build 3 144130221 1I GATGCATTTC -/T GGGCATCAGT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 0 1 174113 CASAVA_Build 3 144130956 1D TAACACCCCA C/- TACTCCATAC 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 C 1 0 174114 CASAVA_Build 3 144131567 1I AAGCAAGCAC -/A AAATATGAAT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 3 4 174115 CASAVA_Build 3 144144336 1I ATTACTCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 9 10 174116 CASAVA_Build 3 144147313 17I GCCAAAAGGT -----------------/AACTTTTGGGGCATGAA AACAGAAATG 3070 hom 84 het 35 0 25 10 AACTTTTGGGGCATGAA 0 1 174117 CASAVA_Build 3 144148339 2D TGCTAAACGT GG/-- GGGGGGGGGC 2831 het 1306 hom 25 9 9 8 G 11 9 174118 CASAVA_Build 3 144151783 1I AGCCTTGTAA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 6 7 174119 CASAVA_Build 3 144167492 1D TTTATAAAGT A/- AAAAAAAAAT 1399 het 1399 ref 26 21 3 4 A 10 9 174120 CASAVA_Build 3 144177418 1I GTTTTTTTTT -/A AATAAAGTAT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 A 2 3 174121 CASAVA_Build 3 144185840 1I TCATGGTTCA -/T TTTTTTTTTT 2137 het 2137 ref 22 11 8 3 T 10 11 174122 CASAVA_Build 3 144187123 14I CCCAGAAAGC --------------/GGTAGTATGGGCCT GGTCAGGTAG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 GGTAGTATGGGCCT 0 1 174123 CASAVA_Build 3 144189815 1I TAGATGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 A 11 12 174124 CASAVA_Build 3 144202912 9I AGCTGGCCCT ---------/GGACAACGA GATTCTCTGA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 GGACAACGA 0 1 174125 CASAVA_Build 3 144206736 2I TGGATAAAAC --/AG AAAATACTAC 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 AG 0 1 174126 CASAVA_Build 3 144209795 1I TTGATGACTT -/G GGAGTCAGGG 3070 het 3070 hom 35 9 22 4 G 2 3 174127 CASAVA_Build 3 144215591 1D TATTTTTACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2121 hom 25 7 13 5 T 10 9 174128 CASAVA_Build 3 144216968 1I GGTTTTTCAG -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 6 7 174129 CASAVA_Build 3 144237908 4D AGTAGAAAAT AAGC/---- AAGTAATAGA 3070 het 3070 hom 40 19 19 4 AAGC 1 0 174130 CASAVA_Build 3 144245250 2D AGATTATATG TA/-- TATATATATA 2490 het 836 hom 16 3 8 6 TA 9 8 174131 CASAVA_Build 3 144250887 1I AAAGGGGGGT -/A AACAAGCAAA 2882 het 2882 ref 24 15 6 3 A 2 3 174132 CASAVA_Build 3 144253933 3I TGTCTAAAAA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 82 het 33 0 28 5 AAT 3 4 174133 CASAVA_Build 3 144255068 1I AAGGGGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 13 14 174134 CASAVA_Build 3 144264059 2I CAATCCTGTA --/AG AGAATTAAGA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 AG 1 2 174135 CASAVA_Build 3 144265614 1I GCCTATAATG -/C CCATTCATAA 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 C 2 3 174136 CASAVA_Build 3 144266826 1I AAGGTCCTTA -/C TGTCTTGGGA 3070 het 3070 hom 59 20 28 11 C 0 1 174137 CASAVA_Build 3 144274885 16D TAATAAGGCA ATAGATCTAAAAGATC/---------------- ATAGATCTAA 2664 het 2664 ref 23 13 7 10 ATAGATCTAAAAGATC 1 0 174138 CASAVA_Build 3 144278324 1I GCCCAGCTAC -/T TTTTTTTTTT 2275 het 1632 hom 15 5 6 4 T 11 12 174139 CASAVA_Build 3 144279760 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2761 hom 25 8 12 5 A 9 10 174140 CASAVA_Build 3 144280412 1D TTTTTACAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 12 22 9 T 10 9 174141 CASAVA_Build 3 144286049 2D GGGGTTTCAC TG/-- TGTTAGCCAG 3070 het 2945 hom 16 7 9 1 TG 2 1 174142 CASAVA_Build 3 144289834 1I ACAGCTACTC -/T TTTTTTTTTC 2662 het 2662 ref 27 14 10 3 T 9 10 174143 CASAVA_Build 3 144293968 6D ACTCAGAGGA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 71 30 24 19 GT 12 9 174144 CASAVA_Build 3 144315103 1D TCAATTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 T 11 10 174145 CASAVA_Build 3 144316770 2D ATCCCCACTC AG/-- GGCTTCTGCA 3070 het 3070 hom 45 20 22 4 AG 1 0 174146 CASAVA_Build 3 144318230 2I AAAAGGGCCA --/CT CTTGGACTAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 CT 1 2 174147 CASAVA_Build 3 144327701 1D AAGTAATGGT A/- AAAAACTGCA 3070 het 3070 ref 59 33 21 5 A 6 5 174148 CASAVA_Build 3 144331098 1D TGTGCAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 14 9 A 11 10 174149 CASAVA_Build 3 144333224 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3063 het 3063 ref 35 11 10 14 T 11 12 174150 CASAVA_Build 3 144338786 1I TTTTTTTTAG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 7 8 174151 CASAVA_Build 3 144339549 3D TTCTTTTCTT TTC/--- TTTTTTTTTT 306 het 306 ref 28 21 2 5 TTC 1 0 174152 CASAVA_Build 3 144340964 2D GGACACAGAC AT/-- ATAGTCTCTG 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 AT 2 1 174153 CASAVA_Build 3 144344838 5D AATTCATCTA TTTAC/----- TTGTGAGTAC 3070 het 3070 ref 26 16 10 3 TTTAC 1 0 174154 CASAVA_Build 3 144371280 1D CTTCTGGAGT C/- CATGTGCTCT 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 C 2 1 174155 CASAVA_Build 3 144376609 3D AAGAGGCTCC TTA/--- AGGGGTGTGG 3070 het 3070 ref 38 20 13 7 TTA 1 0 174156 CASAVA_Build 3 144379959 4I GGGAAGTAGC ----/TTGT TTGTTTTTTT 1900 het 1900 ref 15 6 5 4 TTGT 1 2 174157 CASAVA_Build 3 144380786 1I AAATTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2696 het 2696 ref 18 8 8 2 A 12 13 174158 CASAVA_Build 3 144380941 1D GCCAGTGAAT A/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 1 0 174159 CASAVA_Build 3 144385303 2D AGTGGGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 1377 het 1377 ref 38 24 6 9 AG 8 7 174160 CASAVA_Build 3 144399057 1D CTGATTACAG C/- CCCCAGATAC 3070 het 3070 hom 25 10 11 5 C 5 4 174161 CASAVA_Build 3 144408825 1I CAACAAAAAT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 C 8 9 174162 CASAVA_Build 3 144411493 1I TAAGAGTCTG -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 7 8 174163 CASAVA_Build 3 144416378 11D CAGAAATGTT GCCTGCTTATG/----------- GCTCATAGAT 3070 het 3070 ref 48 27 25 1 GCCTGCTTATG 1 0 174164 CASAVA_Build 3 144419388 1D CCTTTTTTAG A/- AAAAAAAAAT 1744 het 1744 ref 19 10 7 2 A 10 9 174165 CASAVA_Build 3 144421688 1D ATAAAGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 11 10 174166 CASAVA_Build 3 144423444 1D ACCACATCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 T 9 8 174167 CASAVA_Build 3 144423542 1D GAAATAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 13 12 174168 CASAVA_Build 3 144429687 1I CTGTCCCACA -/G GGCCAGACAC 3070 hom 27 het 13 0 8 5 G 2 3 174169 CASAVA_Build 3 144430022 1I CGGTGTCTGG -/C CCTGTGGGAC 3070 hom 78 het 28 0 25 3 C 2 3 174170 CASAVA_Build 3 144431464 1D ATAATTTTCA C/- CCTGAACAGT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 C 3 2 174171 CASAVA_Build 3 144434490 1I TTTTCTTCCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 T 8 9 174172 CASAVA_Build 3 144438808 7D GATTTCCAGG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1692 het 1127 hom 30 9 9 13 A 23 16 174173 CASAVA_Build 3 144445593 3D CACCGTGTAG AAC/--- AACACAGCTT 3070 het 3070 hom 44 18 25 2 AAC 2 1 174174 CASAVA_Build 3 144446803 1I GTCACCACTT -/C CCCCGACCAC 3070 het 3070 hom 51 19 21 11 C 4 5 174175 CASAVA_Build 3 144449127 1D ATTAGGAGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 10 9 174176 CASAVA_Build 3 144454568 1I AAGGGAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 10 11 174177 CASAVA_Build 3 144455034 1D TGGGAAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 29 1 22 6 A 13 12 174178 CASAVA_Build 3 144456318 1D TCCTGCCACA T/- GAACTCCACG 3070 het 3070 ref 60 26 29 5 T 1 0 174179 CASAVA_Build 3 144464594 4D CCAAATTGAT AGTC/---- AGTTGGCCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AGTC 1 0 174180 CASAVA_Build 3 144466429 4D TCTCCTCTAG TATC/---- TATCTATCTC 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 TATC 3 2 174181 CASAVA_Build 3 144468528 1I AGTCCTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 15 12 17 T 15 16 174182 CASAVA_Build 3 144472637 1I TAGCCATTGT -/G GGTTATCAGA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 G 2 3 174183 CASAVA_Build 3 144480212 1I TTAGGGGCCC -/G GCCCTGTTCC 3070 het 3070 hom 40 11 17 12 G 1 2 174184 CASAVA_Build 3 144497398 1I CAAAGTCTCC -/T TGCTCTCCCC 3070 het 3070 hom 44 13 25 6 T 1 2 174185 CASAVA_Build 3 144497459 1D TCAGAAATGA G/- GGCCCCCATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 3 2 174186 CASAVA_Build 3 144510108 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1783 hom 19 6 10 3 A 13 14 174187 CASAVA_Build 3 144510950 2D ACAGAAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 30 1 13 16 A 16 14 174188 CASAVA_Build 3 144533831 1D TGTAGGGTTC T/- AAAAAACCTC 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 T 1 0 174189 CASAVA_Build 3 144535208 1I GAATGCACAA -/G AGTGAAGAAT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 G 0 1 174190 CASAVA_Build 3 144535453 1D GGGAAACTTC A/- AGTGGATGTC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 2 1 174191 CASAVA_Build 3 144536496 1D AATAGGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 11 10 174192 CASAVA_Build 3 144541059 1D ATGTTACATT C/- CCCCCCTTCT 3070 het 3070 hom 46 17 27 2 C 7 6 174193 CASAVA_Build 3 144547421 4D GTGGAGAAAG GACA/---- GACATTAGTG 3070 het 3070 hom 54 17 26 11 GACA 2 1 174194 CASAVA_Build 3 144558716 2D TGGAGTTATC TT/-- TACATTTTGC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 3 1 174195 CASAVA_Build 3 144574614 6I3M1D ATTTACCATT ------AGTA/TAATCCAGT- AATTCCACTA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 N/A 0 0 174196 CASAVA_Build 3 144582001 1I TAAAAGTTTT -/G CTTGAAGGTA 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 G 0 1 174197 CASAVA_Build 3 144584992 3I CATTTGATCA ---/GAG GAGAAGTATG 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 GAG 1 2 174198 CASAVA_Build 3 144602253 4D GAATTTATGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2106 hom 30 10 12 9 A 18 14 174199 CASAVA_Build 3 144643145 2D GTATCTGCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 17 6 T 12 10 174200 CASAVA_Build 3 144652136 3I TGCCTCCTAT ---/TGG TTAATGAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TGG 0 1 174201 CASAVA_Build 3 144708645 1D ATTTTAGGTT C/- ATAGCAAAAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 0 174202 CASAVA_Build 3 144730335 1I GCTCAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1570 hom 41 5 28 8 A 12 13 174203 CASAVA_Build 3 144773162 1I AGCATGACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 406 hom 40 1 34 5 A 9 10 174204 CASAVA_Build 3 144804983 1I AATCCATTTT -/G GTTGCTCTTT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 G 1 2 174205 CASAVA_Build 3 144807682 5D CTGTAATCCT AGCAC/----- AGCACGTTGG 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 AGCAC 2 1 174206 CASAVA_Build 3 144808528 4I TACAATACAT ----/AGAG AGAAAGTAAA 3070 hom 30 het 23 0 11 12 AG 1 3 174207 CASAVA_Build 3 144811449 1I ACAATGAATA -/T TTTTTGAATA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 5 6 174208 CASAVA_Build 3 144815252 1D CATGCCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 11 10 174209 CASAVA_Build 3 144838802 2D AAAATTTACT AC/-- AGAGATAGAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 AC 1 0 174210 CASAVA_Build 3 144849657 1I TACAACCATA -/T TTACTTTATT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 2 3 174211 CASAVA_Build 3 144853523 1I TTTAGGAACC -/T TAAGTGAATC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 1 2 174212 CASAVA_Build 3 144873720 1I ACATCTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 34 1 23 10 T 10 11 174213 CASAVA_Build 3 144884109 2D TATAACAAAC TT/-- AGTGGCTTAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 3 T 2 0 174214 CASAVA_Build 3 144888440 1I CTAGTCTCTG -/T TTTTTTGCAC 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 T 6 7 174215 CASAVA_Build 3 144889274 1I TTTGTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 10 11 174216 CASAVA_Build 3 144890470 1I TTATAAATAG -/A AAAAAATATA 1700 het 1700 ref 14 8 4 2 A 6 7 174217 CASAVA_Build 3 144891214 1D AGGGTTGGGA T/- TTTAGGTGTG 3070 het 2633 hom 32 7 18 7 T 4 3 174218 CASAVA_Build 3 144899064 1D AATGAGAAAA G/- TAAGACTCAG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 G 1 0 174219 CASAVA_Build 3 144900864 1D CTATCTACAC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 56 21 33 3 A 9 8 174220 CASAVA_Build 3 144904084 1D ACTGCAAATC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 9 8 174221 CASAVA_Build 3 144908011 1D GTTTAATTAG A/- AAGGTTGTGG 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 A 3 2 174222 CASAVA_Build 3 144916731 1I TTCTTTATTC -/T TTTTCTTTCA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 4 5 174223 CASAVA_Build 3 144919625 1I GTTAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 18 14 15 A 12 13 174224 CASAVA_Build 3 144927434 1I TAAAAAAAAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 7 8 174225 CASAVA_Build 3 144928269 1I TCATTGCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 A 10 11 174226 CASAVA_Build 3 144928565 1I TAGTAAATTG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 8 9 174227 CASAVA_Build 3 144951521 1D TACTACTCCA T/- TTTTTGTTAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 T 6 5 174228 CASAVA_Build 3 144955538 4D TCTCAGGATT TCTC/---- TTTCTCCTTC 3070 het 3070 hom 35 16 15 5 TC 2 0 174229 CASAVA_Build 3 144960949 1D TTATTTTTTC T/- TTTTTTGCTG 3070 het 3070 ref 55 27 26 2 T 7 6 174230 CASAVA_Build 3 144969499 4I TAATGTTTGC ----/TTTG TTTGCTGTTA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 TTTG 1 2 174231 CASAVA_Build 3 144976237 1I TTGAACTATA -/T CATTGTAATA 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 0 1 174232 CASAVA_Build 3 144995854 1D TACCTGGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 14 12 T 12 11 174233 CASAVA_Build 3 145019342 18I CTGTTATCTG ------------------/ATAGCTGTTTAATGTTTA ATAGCCTATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATAGCTGTTTAATGTTTA 0 1 174234 CASAVA_Build 3 145020243 2I AGTTTTTTCA --/CT CTTTTCAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 CT 1 2 174235 CASAVA_Build 3 145022355 1I ATATTGGCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 8 9 174236 CASAVA_Build 3 145024540 1D AAATCTGAGG T/- TAGATGCTTG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 2 1 174237 CASAVA_Build 3 145026947 1I GGATGGTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 23 1 16 6 A 10 11 174238 CASAVA_Build 3 145027442 1D CATGCTAAAT C/- AATGATGAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 0 174239 CASAVA_Build 3 145039575 4D TATGGGAGAT AATA/---- AATGTCTTTA 3070 hom 123 het 45 0 41 5 AATA 1 0 174240 CASAVA_Build 3 145041762 11I GCATTGTCAT -----------/ATAAGATAGTA ATAAGATAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATAAGATAGTA 1 2 174241 CASAVA_Build 3 145041876 4I CCAGAAGCAT ----/TATG AGTTAATGGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TATG 0 1 174242 CASAVA_Build 3 145043313 2I TTTTTGATAC --/AG AGTCTTCCCG 3070 hom 30 het 20 0 11 9 AG 1 2 174243 CASAVA_Build 3 145045888 1D TAGACTCAAC A/- TCTATCGAGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 1 0 174244 CASAVA_Build 3 145048264 2D CAAAAAAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 14 12 174245 CASAVA_Build 3 145056365 1I GTAAAAAAAA -/C AAAACAAAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 0 1 174246 CASAVA_Build 3 145066264 1D TCCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1315 het 1315 ref 33 18 3 12 T 17 16 174247 CASAVA_Build 3 145109651 1D GTGTCATCTC T/- TTTTTTTTTT 1260 het 1260 ref 35 23 4 8 T 12 11 174248 CASAVA_Build 3 145158534 1D CCATTTTATT A/- AAAAAAAAAA 1276 het 1276 ref 39 31 4 4 A 11 10 174249 CASAVA_Build 3 145202072 1D TCACTGGAAG A/- AAAAAAAAAA 2633 het 2633 ref 37 26 7 5 A 13 12 174250 CASAVA_Build 3 145209170 1I TTCCAACTTG -/T TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 42 28 3 11 T 11 12 174251 CASAVA_Build 3 145321569 1D CAACCCCCTC A/- AAAAAAATTA 2937 het 2937 ref 30 19 7 4 A 8 7 174252 CASAVA_Build 3 145325962 1D CTGAACTGCA T/- TTTTTTTTTT 1102 het 1102 ref 42 22 5 16 T 16 15 174253 CASAVA_Build 3 145351934 1D CCAAGAAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 10 9 174254 CASAVA_Build 3 145355650 1D TATTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1144 hom 23 10 11 2 T 30 29 174255 CASAVA_Build 3 145362607 1I GAGTCTATCT -/A AGGGAGTCAT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 1 2 174256 CASAVA_Build 3 145363685 1D GACTTTCATA C/- CCTGAATAGT 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 C 3 2 174257 CASAVA_Build 3 145375417 2D GCAAAAGAAC AG/-- AGTGTTTCTG 3070 het 3070 ref 44 25 16 4 AG 2 1 174258 CASAVA_Build 3 145389976 2I TCTGTGGGAT --/AG AGAGTTGATT 3070 het 3070 ref 35 22 9 4 AG 2 3 174259 CASAVA_Build 3 145390819 2I AGAGCTGAAC --/AA AATTGGCTTT 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 A 2 4 174260 CASAVA_Build 3 145398601 1I TGCAGCCTTG -/T CTGCCTTAGG 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 0 1 174261 CASAVA_Build 3 145412853 10D TATGGGAACA TTGAAAACCT/---------- TTGCATACGG 3070 het 3070 ref 40 24 15 5 TTGAAAACCT 1 0 174262 CASAVA_Build 3 145419547 10I CACTCTGAAC ----------/ATTGGTGTAT GTGTGTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 ATTGGTGTAT 0 1 174263 CASAVA_Build 3 145422484 1I ACCTCAGTCT -/C CCCAGCGTGA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 C 3 4 174264 CASAVA_Build 3 145423889 1I TTACTTTTGA -/T TTGATATTTA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 2 3 174265 CASAVA_Build 3 145431308 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 22 1 17 4 T 13 12 174266 CASAVA_Build 3 145442735 2I TTTTGAAAAC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 9 11 174267 CASAVA_Build 3 145445677 1I CGTTTTTTTT -/A AAAAAGCCTT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 5 6 174268 CASAVA_Build 3 145476757 1I ACAGAAAATC -/A AAAACCACAG 3070 het 3070 ref 22 9 11 2 A 4 5 174269 CASAVA_Build 3 145480966 1I AAACCAAAGC -/T TTTTTTTTTT 952 het 952 ref 38 25 4 9 T 11 12 174270 CASAVA_Build 3 145482619 3I ACCTAATGCC ---/TGA TGATCTGAGG 3070 het 3070 ref 61 27 23 11 TGA 1 2 174271 CASAVA_Build 3 145497558 1D CATCATCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 21 18 6 T 11 10 174272 CASAVA_Build 3 145498231 6D GAAGACTCCT TGTGTA/------ TGTGTATGTG 3070 het 3070 hom 28 13 14 3 TGTGTA 3 2 174273 CASAVA_Build 3 145519570 1D ACATATACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2858 hom 21 7 8 6 T 10 9 174274 CASAVA_Build 3 145520611 4D TCCAAAGGTA CTAC/---- CAGCTGAATT 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 CTAC 1 0 174275 CASAVA_Build 3 145522920 1I AGAACTTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3041 hom 29 8 15 6 A 13 14 174276 CASAVA_Build 3 145539628 5I CTTTAAAAAT -----/AAGTC AAGTGCTGGG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 AAGTC 0 1 174277 CASAVA_Build 3 145543872 1I TCAAGTTTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 8 9 174278 CASAVA_Build 3 145546376 1I ACTACCTTGC -/A AGGCATGCTG 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 A 1 2 174279 CASAVA_Build 3 145548787 1I ATTGATAAGG -/A AAAAAAAAAA 1389 het 1389 ref 38 30 4 4 A 11 12 174280 CASAVA_Build 3 145550683 1D ATTCCTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 11 10 174281 CASAVA_Build 3 145556774 1D CAAAATTTAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 8 T 8 7 174282 CASAVA_Build 3 145557181 4D ACTTATTGAC TATT/---- TACTTATATG 1492 het 1492 ref 21 11 4 7 TATT 1 0 174283 CASAVA_Build 3 145559700 1D AAAAGCTATT A/- AAAAAAACAA 2310 het 2310 ref 22 10 7 6 A 8 7 174284 CASAVA_Build 3 145564274 1D GTTTGATTAG A/- AGGAAAAAAG 3070 hom 74 het 29 0 24 5 A 2 1 174285 CASAVA_Build 3 145566023 6I GAAAATGGAG ------/TCTCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 63 het 28 0 21 7 TC 6 9 174286 CASAVA_Build 3 145567061 1D TCAAAAATTT A/- ATTTATCCAA 3070 het 3070 ref 53 26 24 3 A 2 1 174287 CASAVA_Build 3 145578184 4D CAATATCTGA TTGT/---- TTGGCCGCAC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 TTGT 1 0 174288 CASAVA_Build 3 145590894 1D ATATTATATT G/- GCGAATTCAC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 G 2 1 174289 CASAVA_Build 3 145591680 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 2320 hom 48 het 17 0 17 0 AT 6 5 174290 CASAVA_Build 3 145592788 1D AAAGTTAAAC A/- TAACACATAT 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 A 1 0 174291 CASAVA_Build 3 145596680 1D45M2D ACATATGAAG TTTGAGGAGACACAATTCAACCCATAACGAATGACAAGAAAGCACAAC/-TTGAGGAGACACAATTCAACCCATAACGAATGACAAGAAAGCACA-- AGAGTGGGTG 3070 het 3070 hom 60 39 44 5 N/A 0 0 174292 CASAVA_Build 3 145600528 2D TTAATTTTAC AT/-- ATGGCTATTG 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 AT 2 1 174293 CASAVA_Build 3 145602350 1D TACTTTTCCA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 6 5 174294 CASAVA_Build 3 145604232 1I AGGTCATGTT -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 1 2 174295 CASAVA_Build 3 145605730 4I TTTTTAGTTC ----/AAGG AAGAATTTGG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AAGG 0 1 174296 CASAVA_Build 3 145612851 1D TTCTGTTTAG T/- TTTTTTTTTA 2583 het 2583 ref 24 11 7 6 T 10 9 174297 CASAVA_Build 3 145617001 1D TTTTTTTTTT G/- AGACTGACAT 3070 het 553 hom 34 3 21 11 G 1 0 174298 CASAVA_Build 3 145619049 1I ATTAAAAGGC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 8 9 174299 CASAVA_Build 3 145619578 1I GAATCTGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 A 10 11 174300 CASAVA_Build 3 145622685 5D AAATTATATT TTATA/----- TTTATGTGTG 3070 het 3070 hom 42 19 20 4 TTATA 1 0 174301 CASAVA_Build 3 145626247 26I GCACTAGCAT --------------------------/ACAACCTCTCATTCCGCACACCCCCA GTGCAGTTTA 3070 hom 117 het 43 0 39 5 ACAACCTCTCATTCCGCACACCCCCA 0 1 174302 CASAVA_Build 3 145638309 1D CTCTGATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 13 12 174303 CASAVA_Build 3 145647558 1D CTCTGACTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 22 10 3 A 10 9 174304 CASAVA_Build 3 145649423 1I ATGTGGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 T 11 12 174305 CASAVA_Build 3 145680726 5D TCCCAGAACT TAGAG/----- TAAAGTAAAA 1215 het 5 hom 25 1 8 16 TAGAG 1 0 174306 CASAVA_Build 3 145682635 1D ATATTTATCA T/- TATTGTTATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 1 174307 CASAVA_Build 3 145695458 2D AGATATAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 45 het 18 0 16 3 AC 7 6 174308 CASAVA_Build 3 145697134 4D CCGCCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 AAAC 4 3 174309 CASAVA_Build 3 145698958 1I CCTTGTATCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 37 3 25 9 A 12 13 174310 CASAVA_Build 3 145700090 1D GTTGAAAAAT A/- AAAAATCTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 5 174311 CASAVA_Build 3 145709490 2D GCACCCAAGT CA/-- CCTCTTGAAT 3070 hom 66 het 25 0 22 4 CA 1 0 174312 CASAVA_Build 3 145711080 1D TCCCCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 21 2 13 6 T 11 10 174313 CASAVA_Build 3 145712338 1D CCAAATTGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 849 hom 41 2 34 6 A 10 9 174314 CASAVA_Build 3 145712751 1I AACCAGAGAT -/A ATGGTGTTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 174315 CASAVA_Build 3 145713782 1I CTATTCACAT -/A TGTCACTGTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 174316 CASAVA_Build 3 145714753 4D TTTGTCTAAA TTGT/---- TTGTCACTAA 3070 hom 152 het 57 0 51 9 TTGT 2 1 174317 CASAVA_Build 3 145716930 1D CAAAGGAAAG A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 7 174318 CASAVA_Build 3 145723975 1D AGAAAGGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 796 hom 43 3 26 14 A 15 14 174319 CASAVA_Build 3 145725164 1D GCAGTACAGC T/- GATGAGTGCC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 T 1 0 174320 CASAVA_Build 3 145727691 6I GTAGAGTTAT ------/CTTTTA CTTTTACTTT 3070 hom 100 het 46 0 34 12 CTTTTA 2 3 174321 CASAVA_Build 3 145734227 2D AGGGCAAAAC TG/-- TATGAAATAC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TG 1 0 174322 CASAVA_Build 3 145734803 1D TTGCCCAAAA G/- CATAGACAAA 3070 hom 102 het 36 0 34 13 G 1 0 174323 CASAVA_Build 3 145734876 1I AAGAAAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 12 13 174324 CASAVA_Build 3 145736883 1I TCTTAATTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 174325 CASAVA_Build 3 145737136 1D CAGTAAGGGC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 116 het 45 0 39 7 A 8 7 174326 CASAVA_Build 3 145763119 1D GTCTATTTAT A/- TTTTTCTTCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 0 174327 CASAVA_Build 3 145771935 1D TATCTTAAAC A/- GAGAGGGTCG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 1 0 174328 CASAVA_Build 3 145776401 1I CAGCAAAGGC -/A AAAAAAATGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 7 8 174329 CASAVA_Build 3 145777732 2I ATAGAAAAAA --/CC CACAATTATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 1 3 174330 CASAVA_Build 3 145779264 1D ACAGCTTTTC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 8 7 174331 CASAVA_Build 3 145780581 1D GCCAAAAAAA G/- AATGGATAGG 3070 het 320 hom 41 1 35 5 G 1 0 174332 CASAVA_Build 3 145789750 1I TGTAGGCGTG -/T TCCACTTTTT 3070 hom 116 het 44 0 35 9 T 1 2 174333 CASAVA_Build 3 145790566 2I CAGAGCGAGA --/CT CTGTCTCAAA 853 het 727 hom 22 5 8 9 CT 1 2 174334 CASAVA_Build 3 145794392 4D CTACCAAATG TTAC/---- TTACATGAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 TTAC 2 1 174335 CASAVA_Build 3 145803335 2I CATAATCATT --/AC AGTCTATGAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AC 0 1 174336 CASAVA_Build 3 145825417 8I ACCTTAGATT --------/AAAACTTA AAAAACATTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAAACTTA 0 1 174337 CASAVA_Build 3 145827216 1D AAACATGTCA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 8 7 174338 CASAVA_Build 3 145827406 24D ATATATAAAT TATATATATATATATATATATATA/------------------------ TATATATATA 1994 het 489 hom 7 1 5 3 TA 20 8 174339 CASAVA_Build 3 145842726 1D AATTAAGATT A/- AAAAAACACT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 7 6 174340 CASAVA_Build 3 145846286 3I TAATATATAC ---/ATA ATATCTATAC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 ATA 1 2 174341 CASAVA_Build 3 145847882 11D TAGAACTGGG ATTGCTAGATC/----------- ATATGATTTT 3070 het 825 hom 44 6 13 31 ATTGCTAGATC 1 0 174342 CASAVA_Build 3 145848934 2D GGTGTAAGAC AG/-- GGGCCTATTT 3070 hom 90 het 32 0 29 3 AG 1 0 174343 CASAVA_Build 3 145852733 1D TTAAATAGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 43 0 36 8 T 9 8 174344 CASAVA_Build 3 145862704 1I CTCCTAAAGA -/C CCCACCTCTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 3 4 174345 CASAVA_Build 3 145863875 2I TGACTATTGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 54 16 28 10 TG 7 8 174346 CASAVA_Build 3 145875577 1D GCCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 12 11 174347 CASAVA_Build 3 145885499 1D GAGTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 17 1 7 9 A 13 12 174348 CASAVA_Build 3 145887005 4D AATTTATAAT AAAC/---- AAAAACTAAA 3070 het 1777 hom 15 4 9 2 AAAC 1 0 174349 CASAVA_Build 3 145890298 2D TATTAATATC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 66 het 23 0 23 1 AT 5 4 174350 CASAVA_Build 3 145892095 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 8 9 174351 CASAVA_Build 3 145902519 1D ACTTAAAAAT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 33 14 15 7 A 9 8 174352 CASAVA_Build 3 145909816 1D GGACTCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 34 5 13 16 A 15 14 174353 CASAVA_Build 3 145911141 1D AGTTTCCCAC T/- TTTTTTTTTT 1912 het 1912 ref 29 17 5 7 T 13 12 174354 CASAVA_Build 3 145922698 1D CTTGAAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 11 10 174355 CASAVA_Build 3 145945467 1I CAGATTCTAC -/T TTTAATTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 3 4 174356 CASAVA_Build 3 145946407 1D TTTTTGTAGA T/- TTTTTTCAGA 3070 hom 111 het 42 0 38 6 T 7 6 174357 CASAVA_Build 3 145973143 1I TTTTTGTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 8 9 174358 CASAVA_Build 3 145986565 1I TGCGTTTATA -/T TTATGCTGAG 3070 het 3070 hom 53 21 24 8 T 2 3 174359 CASAVA_Build 3 145999717 8D GCAAGAGAGC ATGTGCAG/-------- ATGTGCAGGG 3070 het 3070 ref 53 30 20 5 ATGTGCAG 2 1 174360 CASAVA_Build 3 146006288 1D CTTCTTTGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 T 9 8 174361 CASAVA_Build 3 146043454 1I ACAACATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 10 11 174362 CASAVA_Build 3 146049003 3D TTATCTAAGG ACA/--- ACAAGTTAGT 3070 het 3070 ref 40 20 14 8 ACA 2 1 174363 CASAVA_Build 3 146051561 1D GTGCTTATTT A/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 A 7 6 174364 CASAVA_Build 3 146053365 4I GATCGCATAC ----/CTCA CTAATTCTTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 CTCA 0 1 174365 CASAVA_Build 3 146053965 1I AAACCTCCTT -/C CCTTTAGGCA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 C 2 3 174366 CASAVA_Build 3 146054093 1D TTCTTTGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 A 10 9 174367 CASAVA_Build 3 146064993 4D AGCATAAATA TTTT/---- GAGATTCATT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 T 4 0 174368 CASAVA_Build 3 146071449 1D GAAACGTGAA C/- CCCCCTGGTC 3070 het 3070 hom 46 16 25 7 C 6 5 174369 CASAVA_Build 3 146071921 1D GGAGAGATAC G/- AGGAAATAAG 3070 het 3070 hom 53 21 28 4 G 1 0 174370 CASAVA_Build 3 146075586 1I AAACTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 10 11 174371 CASAVA_Build 3 146085487 2I38M1D TATATATGTG --TATATATATATATATATTTTTCCCACCAATACCACAATC/TATATATATATATATATATTTTTCCCACCAATACCACAAT- CCTTGATTAC 3070 het 3070 hom 17 13 12 4 N/A 0 0 174372 CASAVA_Build 3 146088234 2D TTTATATAGG TA/-- TATATATATA 2253 het 2253 ref 31 11 9 11 TA 8 7 174373 CASAVA_Build 3 146088280 2D CATATATATC TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 TG 5 4 174374 CASAVA_Build 3 146089678 4D ACATTGTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 210 het 210 ref 38 24 2 12 TTTG 1 0 174375 CASAVA_Build 3 146103517 3I3M1I TGTATCTTAC ---ACT-/AGGACTG CATTTGCCTC 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 N/A 0 0 174376 CASAVA_Build 3 146104040 4D TAGGCACATG ATAA/---- ATAGATATTG 3070 het 3070 hom 24 8 12 6 ATAA 1 0 174377 CASAVA_Build 3 146117819 1D ACTTACCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 11 14 T 11 10 174378 CASAVA_Build 3 146125732 2D TGATCATCAT AA/-- AGACTATGAG 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 A 3 1 174379 CASAVA_Build 3 146129566 2I TACTAGGGAT --/GG GGGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 G 7 9 174380 CASAVA_Build 3 146135555 1D CTGAATGAAT A/- AAAAAGACCC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 6 5 174381 CASAVA_Build 3 146146277 1I GCTATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 11 12 174382 CASAVA_Build 3 146146585 1I CCTTTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 25 16 9 T 10 11 174383 CASAVA_Build 3 146150334 1I CATAATGCTG -/T TTTGTTCTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 3 4 174384 CASAVA_Build 3 146154144 3I GCTAAATAAC ---/ATA ATATTTATTA 3070 het 3070 hom 53 25 22 6 ATA 1 2 174385 CASAVA_Build 3 146154892 1D TGGGCAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2415 hom 29 8 12 9 A 13 12 174386 CASAVA_Build 3 146165018 3I ACCAGATATT ---/AAC AAAGAAATAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AAC 0 1 174387 CASAVA_Build 3 146168975 18I CAGATTGTTT ------------------/TCAGGCAAAGCTATTTTC GGGTATAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 TCAGGCAAAGCTATTTTC 0 1 174388 CASAVA_Build 3 146169822 1D GGTATTAGTG T/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 5 4 174389 CASAVA_Build 3 146173398 7D TTTTTCTTTC TTTCTTT/------- TTTTTTTTTT 2507 het 2025 hom 22 8 9 6 TTTCTTT 1 0 174390 CASAVA_Build 3 146176110 1D GGTAACTATT G/- TGACTTCTCT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 G 1 0 174391 CASAVA_Build 3 146196967 2I CCTTTATTTC --/TT TTTCTCTTGC 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 T 3 5 174392 CASAVA_Build 3 146197303 1I TTTGCCAGTA -/C TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 C 0 1 174393 CASAVA_Build 3 146200899 3I GTTGTTGTTA ---/TTG TTGTTGTTTG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TTG 2 3 174394 CASAVA_Build 3 146204224 2I GAGAGAGAGA --/GC GCAAATGGGA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 GC 1 2 174395 CASAVA_Build 3 146204625 3I ACATTTGCAC ---/ACA ACAAGTACAT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 ACA 1 2 174396 CASAVA_Build 3 146206039 1I CGGTTGTGAC -/T TAATGATCCA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 1 2 174397 CASAVA_Build 3 146208996 2D AAGAAAAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 1105 het 1105 ref 32 17 5 10 GT 9 8 174398 CASAVA_Build 3 146224678 3I TCCCTGCATA ---/TTC TTCTATCATA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TTC 1 2 174399 CASAVA_Build 3 146230879 1D TAGATAGAAT A/- AAGATCTAGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 3 2 174400 CASAVA_Build 3 146237070 1D CTGTTTACAA G/- TAAGATATTC 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 G 1 0 174401 CASAVA_Build 3 146239409 4I ATGTTAACTC ----/TCTA TCTAATTTTT 2156 het 1994 hom 10 4 5 1 TCTA 1 2 174402 CASAVA_Build 3 146239953 3I GCCTCACTAA ---/TGT TGTTATTTTT 3070 het 2724 hom 17 7 8 2 TGT 1 2 174403 CASAVA_Build 3 146240916 1I GTCAGATTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 T 8 9 174404 CASAVA_Build 3 146244336 4I TAAAATATAT ----/TAAA TAAAGGGTTT 3070 het 3070 ref 25 18 7 0 TAAA 1 2 174405 CASAVA_Build 3 146247229 1D TATTATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 10 9 T 14 13 174406 CASAVA_Build 3 146250262 4D AATAGGAAAA ATAG/---- ATAAATACAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 5 ATAG 1 0 174407 CASAVA_Build 3 146250904 3D TCAACCATAA AAT/--- AATAATCACT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 AAT 3 2 174408 CASAVA_Build 3 146251082 1I AAAAGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2624 hom 32 9 12 11 T 13 14 174409 CASAVA_Build 3 146251917 2I CTCCTAATAC --/AG AGAAGGTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 AG 1 2 174410 CASAVA_Build 3 146252072 1D TTTTTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 4 T 12 11 174411 CASAVA_Build 3 146256255 1I AAAAGTAAGC -/A AAAACAATAC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 4 5 174412 CASAVA_Build 3 146269262 3D TTTATTTACA TTC/--- TTCTTTAATT 3070 het 3070 ref 20 8 8 5 TTC 2 1 174413 CASAVA_Build 3 146279318 23D CACTGTCAGC ATGGACAAGACATGCACCCTGCA/----------------------- ATGTGACACA 3070 het 3070 ref 27 20 12 0 ATGGACAAGACATGCACCCTGCA 1 0 174414 CASAVA_Build 3 146283076 1D AAGAATTTGT A/- CTGTATTTAG 3070 het 3070 hom 43 19 21 5 A 1 0 174415 CASAVA_Build 3 146284058 3D GTTAGGCTGG AAC/--- AATAGAAATT 3070 het 3070 ref 49 27 20 3 AAC 1 0 174416 CASAVA_Build 3 146285212 2I TATATTACTT --/CA CACAGTGTAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 CA 2 3 174417 CASAVA_Build 3 146291695 7D ATTATGGAGT GACATGA/------- GATCATATTC 3070 het 3070 ref 30 18 12 2 GACATGA 1 0 174418 CASAVA_Build 3 146296574 1I ATCCTTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 10 11 174419 CASAVA_Build 3 146301452 1I CAAACAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 11 12 174420 CASAVA_Build 3 146304954 1I TAATAATAAT -/A AAAAACTCAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 5 6 174421 CASAVA_Build 3 146309698 1D CCATTTTTTT G/- TTTCTACCAT 3070 het 3070 hom 48 21 23 5 G 1 0 174422 CASAVA_Build 3 146318304 1I ACAAAGTATG -/C CTTCATGTGT 3070 het 3070 ref 54 25 20 9 C 1 2 174423 CASAVA_Build 3 146330836 1I TAAGTTTAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 7 8 174424 CASAVA_Build 3 146331919 4I AATTGATTAT ----/TTTA ATTATTCTTG 2183 het 2183 ref 15 7 5 3 TTTA 0 1 174425 CASAVA_Build 3 146334136 2D TAAAGAAAAC AT/-- AAATTTGTGT 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 AT 1 0 174426 CASAVA_Build 3 146347045 2I CAGAATGTGC --/AT TGGTCACTGG 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 AT 0 1 174427 CASAVA_Build 3 146363205 4D TCCATCTCAG ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 ACAA 5 4 174428 CASAVA_Build 3 146365519 11D ATATAATATA ATTTGAATATT/----------- TTGAAACTTT 3070 het 3070 hom 34 11 21 3 ATTTGAATATT 1 0 174429 CASAVA_Build 3 146387198 3I TGTTTTATCA ---/CCT CCTCCTATGC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 CCT 2 3 174430 CASAVA_Build 3 146438065 1D CTACCTGAAC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 T 8 7 174431 CASAVA_Build 3 146445802 1D CTAGCAAATA C/- CCAGGGTACA 3070 het 3070 hom 48 20 22 8 C 3 2 174432 CASAVA_Build 3 146447037 1I TTTAAGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 9 10 174433 CASAVA_Build 3 146462983 4D TGGAAAACTA GTTT/---- GTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 51 23 22 7 GTTT 3 2 174434 CASAVA_Build 3 146465000 2D TTTATACCAA GG/-- TGCTTAGAAC 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 G 2 0 174435 CASAVA_Build 3 146468859 2D GCATACAAAA AC/-- AGTGACATAT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 AC 1 0 174436 CASAVA_Build 3 146470660 1I TATTGTGGGC -/A AAAACAACAT 3070 het 3070 hom 48 15 27 6 A 4 5 174437 CASAVA_Build 3 146474024 2I TCATATATAT --/AC ACACACAATA 793 het 793 ref 8 4 3 1 AC 3 4 174438 CASAVA_Build 3 146486264 1D GGAGTGTAGT G/- GCGTGATCAC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 G 2 1 174439 CASAVA_Build 3 146490496 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2928 het 2928 ref 22 10 9 3 T 12 11 174440 CASAVA_Build 3 146491608 2I ATGGTATTTG --/AA CCTCCCTAAA 3070 het 3070 hom 41 16 25 0 A 0 2 174441 CASAVA_Build 3 146492947 5D CCGTATAGAT TTTAC/----- TTTATTTTAT 2406 het 2406 ref 19 13 6 0 TTTAC 1 0 174442 CASAVA_Build 3 146493818 1D TATTATTATT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 7 6 174443 CASAVA_Build 3 146494496 1D CTGGATGCCC T/- CAGAACTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 T 1 0 174444 CASAVA_Build 3 146498271 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 58 20 28 10 TA 7 6 174445 CASAVA_Build 3 146512962 2D ATTAATTTTT AA/-- AAGTTATTAC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 4 2 174446 CASAVA_Build 3 146516267 4D TTACCTATGT TTGA/---- TTGCCTGTAT 3070 hom 108 het 37 0 37 3 TTGA 1 0 174447 CASAVA_Build 3 146519175 1I ATTGATTCCC -/T TGTAATTTTT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 1 2 174448 CASAVA_Build 3 146519829 6I GTATGTCAGT ------/CTACTC CTCTCTTTAG 3070 hom 132 het 52 0 45 7 CTACTC 0 1 174449 CASAVA_Build 3 146520121 3D TTGAATCATG GTT/--- TTTGTTTGTT 991 het 397 hom 27 2 6 19 GTT 1 0 174450 CASAVA_Build 3 146520630 4I CTAGAATGTC ----/TATT TGTTTTTAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TATT 0 1 174451 CASAVA_Build 3 146521526 2I AGGTGACTGA --/CT CAGCATGAGT 3070 hom 120 het 43 0 37 6 CT 0 1 174452 CASAVA_Build 3 146523660 1D TCAATGTTCC A/- AAATCAAAAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 4 3 174453 CASAVA_Build 3 146526290 3D GAGAGAAAGG AGA/--- AGAAGAAGGA 3070 hom 108 het 42 0 37 7 AGA 3 2 174454 CASAVA_Build 3 146532306 2D GTTAAATAAT AC/-- AAGTTTTAAT 3070 hom 108 het 37 0 37 1 AC 1 0 174455 CASAVA_Build 3 146533016 2D TAGAGATTCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TG 7 6 174456 CASAVA_Build 3 146534558 1D GGGGGGGGGG A/- GGGGGCAGAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 1 0 174457 CASAVA_Build 3 146535318 2D AACATAGGTT TA/-- GTCTCTTAGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TA 1 0 174458 CASAVA_Build 3 146535732 1D AAAATAGTTA T/- CAGATTTTCA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 T 1 0 174459 CASAVA_Build 3 146536889 4I39M2I TAACAGAGAG ----CAAACAAAAAACGCTAGCAAACAAAGACATTCAGAAAAC--/CAAACAAACAAAAAACGCTAGCAAACGAAGACATTCAGAAAACTG TTAAATATTT 3070 hom 120 het 32 0 41 7 N/A 0 0 174460 CASAVA_Build 3 146538492 13I GTTACAGACA -------------/AATTACTTTCTCT CAGTATTTGT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 AATTACTTTCTCT 0 1 174461 CASAVA_Build 3 146540193 4D CCTGCATTCA TCTT/---- TCTTTGTCTA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TCTT 2 1 174462 CASAVA_Build 3 146544331 6D TTGAACCCAG GAGGCA/------ GAGGTTGCAG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 GAGGCA 1 0 174463 CASAVA_Build 3 146549055 1D33M1D TGTGGGGAAG CTAAAACTTAAGGCATTCTCAGTAACAGTGGAGGT/-TAAAACTTAAGGCATTCTCAGTAACAGTGGAGG- TTTGGTAGTA 3070 hom 96 het 26 0 33 2 N/A 0 0 174464 CASAVA_Build 3 146551212 3I TTAAAATAAA ---/AAT AAAATATTAC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAT 0 1 174465 CASAVA_Build 3 146552448 3I ATGATTAGAC ---/ATG ATGAATATGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 ATG 1 2 174466 CASAVA_Build 3 146573227 2D ATAACTTACA TT/-- TTTTTTTAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 9 7 174467 CASAVA_Build 3 146582460 1I TCAAAGTGGA -/G TAGGAAATAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 0 1 174468 CASAVA_Build 3 146586056 1I ATATTTCCTC -/A TTTAAAAAAT 3070 hom 110 het 42 0 37 5 A 0 1 174469 CASAVA_Build 3 146597740 3I GACCAGTTCT ---/CTC CTCCTTTGCA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 CTC 1 2 174470 CASAVA_Build 3 146597839 6D ATATACATTT TATATA/------ TATATATATA 2985 het 44 hom 13 1 10 2 TA 11 8 174471 CASAVA_Build 3 146603132 1I TTTCAGGTAC -/T TTTGGATATC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 3 4 174472 CASAVA_Build 3 146604438 1I CGAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 10 11 174473 CASAVA_Build 3 146605949 1D AAAAGGAAGC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 169 het 62 0 57 7 T 9 8 174474 CASAVA_Build 3 146606363 14D TATGTGACTA CTGCAAGACGACCC/-------------- CTGCCCTGAC 3070 hom 150 het 47 0 49 6 CTGCAAGACGACCC 1 0 174475 CASAVA_Build 3 146610565 5D GTGTTGTGCA TTTAT/----- TTTCTTTTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TTTAT 1 0 174476 CASAVA_Build 3 146612402 46D AAGAAGTAGG CAAAGGACATGAATAGACTATTATCAAAAGAAGATATACAAACAGC/---------------------------------------------- CAACAAACAT 2743 het 2743 ref 30 31 7 7 CAAAGGACATGAATAGACTATTATCAAAAGAAGATATACAAACAGC 1 0 174477 CASAVA_Build 3 146612739 1D AAAAGACACA T/- ACACAAACTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 0 174478 CASAVA_Build 3 146615962 5D GTCTTCTCTT TAGTC/----- TAGCTAGATT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TAGTC 1 0 174479 CASAVA_Build 3 146616892 2I TCTTAGTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 36 1 30 5 T 10 12 174480 CASAVA_Build 3 146618236 1I CACTTTAGCA -/T TTTTTTGTAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 6 7 174481 CASAVA_Build 3 146619740 2I GTATTAGTAT --/TA TATATATATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TA 4 5 174482 CASAVA_Build 3 146623738 1I GCAATTTTTT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 6 7 174483 CASAVA_Build 3 146625686 3D CAGTTTTGTT CAA/--- CAACTTTCCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CAA 2 1 174484 CASAVA_Build 3 146627061 1I TATTTTTAGT -/G AAAAATGTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 G 0 1 174485 CASAVA_Build 3 146627533 9D CAGGATGTAC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 28 1 17 13 T 23 14 174486 CASAVA_Build 3 146630092 1I CAATTTGAGT -/A AAAATGTAGG 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 4 5 174487 CASAVA_Build 3 146653492 1D TTAGTAATAA T/- TATCATTTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 2 1 174488 CASAVA_Build 3 146668331 1D AGAGCACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 31 1 24 6 A 11 10 174489 CASAVA_Build 3 146668465 1I TGAAGAAAGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 300 hom 42 2 35 5 A 8 9 174490 CASAVA_Build 3 146669555 1D CCTGAAAGTG A/- TGGGTTTGTG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 1 0 174491 CASAVA_Build 3 146669906 4I AAAAAACAGA ----/TAGT TAGATAACAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TAGT 0 1 174492 CASAVA_Build 3 146676517 3I GAGAAAAAAA ---/AAG AAAGAAAAGC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AAG 0 1 174493 CASAVA_Build 3 146686093 1D CATACTCCTA T/- TTCAACAGTG 3070 het 3070 ref 56 28 24 4 T 3 2 174494 CASAVA_Build 3 146687563 6I CCTTTTCTTA ------/GATAAT GATATTCGGA 3070 hom 162 het 63 0 53 10 GATAAT 0 1 174495 CASAVA_Build 3 146688071 1I ATGTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 2365 het 2365 ref 29 15 7 7 T 13 14 174496 CASAVA_Build 3 146689575 1D TGATACCCAA T/- TAAAAAAAGC 3070 hom 138 het 52 0 47 6 T 2 1 174497 CASAVA_Build 3 146692809 4D AGCATGCGTG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 CA 12 10 174498 CASAVA_Build 3 146695630 11D AAGTATAATA ATAAAAAAACT/----------- ATAAACAAAC 3070 het 3070 ref 26 17 11 3 ATAAAAAAACT 1 0 174499 CASAVA_Build 3 146697438 2I ATATTAATGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 1941 hom 25 9 9 7 GT 5 6 174500 CASAVA_Build 3 146703059 31I TCACAAAGAA -------------------------------/TAAAAAGAAGTTTTCCATAATAATAATAAAT TAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 21 12 8 3 TAAAAAGAAGTTTTCCATAATAATAATAAAT 0 1 174501 CASAVA_Build 3 146706544 1I TATTTTTCAA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 T 6 7 174502 CASAVA_Build 3 146708268 2I GTCTATATTC --/AT ATCTGTTCAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AT 1 2 174503 CASAVA_Build 3 146712948 1D CAATTTAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 8 7 174504 CASAVA_Build 3 146713304 4I TTGTTTTCTC ----/AGTT AGGATTTGCT 3070 het 3070 ref 32 19 13 0 AGTT 0 1 174505 CASAVA_Build 3 146718691 2I TATATATGTG --/TA TATATATATG 1028 het 683 hom 5 2 3 0 TA 4 5 174506 CASAVA_Build 3 146719347 2D AAAGGCCTCT CA/-- CAAGTGGCCC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 CA 2 1 174507 CASAVA_Build 3 146720510 1I GAGTTTCTGG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 0 1 174508 CASAVA_Build 3 146721082 1D ATATATCCAG T/- TTATATTATT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 3 2 174509 CASAVA_Build 3 146724115 1I TCCTAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 429 hom 26 1 20 5 A 8 9 174510 CASAVA_Build 3 146725645 1I ATTTTTCACT -/G GGTATTTTCC 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 G 2 3 174511 CASAVA_Build 3 146726466 2I TTAGTGTAAT --/GG TTTTTAAATA 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 G 0 2 174512 CASAVA_Build 3 146727561 1D TAAGAACCCT A/- AAAGAACTAG 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 4 3 174513 CASAVA_Build 3 146728088 1I GGAACAGGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 416 hom 21 1 18 2 A 9 10 174514 CASAVA_Build 3 146728900 3I CAAAAATCAA ---/ATC ATAACGGGTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 ATC 0 1 174515 CASAVA_Build 3 146729930 4I TTAAAAAATG ----/TAGT TAAATAGAAT 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 TAGT 0 1 174516 CASAVA_Build 3 146731510 3I AGGAAAATAT ---/GAG GAGTTTTCAC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 GAG 1 2 174517 CASAVA_Build 3 146731988 3D GAATTGTAAG ATA/--- ATAATTATAC 3070 het 3070 ref 27 18 7 4 ATA 2 1 174518 CASAVA_Build 3 146733078 2D TAAAACTTTC GT/-- GTAACTTACA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 GT 2 1 174519 CASAVA_Build 3 146737700 1I GGTTACATGG -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 A 6 7 174520 CASAVA_Build 3 146743975 3I TGAGGGTTTT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 het 2203 hom 34 8 19 7 TTG 0 1 174521 CASAVA_Build 3 146748530 1D ATTAATTACA G/- TGGGATATTG 3070 het 3070 hom 47 24 22 1 G 1 0 174522 CASAVA_Build 3 146749372 1D GAACGTTAGG A/- ATTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 14 14 2 A 2 1 174523 CASAVA_Build 3 146752456 2I ACATCTAATT --/AG AGAGTGCCTA 3070 het 3070 ref 21 14 7 0 AG 2 3 174524 CASAVA_Build 3 146760295 1D GATTTTAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 263 hom 36 1 31 4 T 10 9 174525 CASAVA_Build 3 146771227 1D TAATGCCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 35 0 28 8 A 10 9 174526 CASAVA_Build 3 146773530 1D AACTCTGCCA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 102 het 39 0 32 8 T 7 6 174527 CASAVA_Build 3 146777920 1D ATTTTATTTT C/- TTAGTCCTGG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 C 1 0 174528 CASAVA_Build 3 146782343 2D ATTAGAGAAA AC/-- AGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 25 3 AC 1 0 174529 CASAVA_Build 3 146786037 5I TCACAAGTCT -----/TAAGA CAGGTTATTA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 TAAGA 0 1 174530 CASAVA_Build 3 146790558 1D CACAAAAAAA C/- CAGAAAGATA 3070 het 3070 ref 45 26 14 6 C 2 1 174531 CASAVA_Build 3 146791765 6I TACTCGCAAT ------/GTTTAA GTTTATCAAG 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 GTTTAA 0 1 174532 CASAVA_Build 3 146794077 1I AACTGGTATA -/T CATTTAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 0 1 174533 CASAVA_Build 3 146795884 19D TAAACTCACT GTTATAGTTAGAGATTGCA/------------------- ACAGCTTCCT 3070 het 3070 ref 29 25 9 3 GTTATAGTTAGAGATTGCA 1 0 174534 CASAVA_Build 3 146796775 3D GCCTGTATCA GAT/--- TTTTAAGAAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 GAT 1 0 174535 CASAVA_Build 3 146800476 3D TTAAATATGG GAA/--- GAAGAAGAAG 3070 het 159 hom 23 1 12 10 GAA 6 5 174536 CASAVA_Build 3 146809568 10D GCCTAACTTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTTTG 4 2 174537 CASAVA_Build 3 146809688 5D TGTATTAATA TTTAC/----- TTTATATATT 3070 hom 96 het 36 0 33 5 TTTAC 1 0 174538 CASAVA_Build 3 146809965 3I TATCTGGGTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 35 0 24 11 T 11 14 174539 CASAVA_Build 3 146812832 5D AACAAAAGAG AAAAT/----- AAAACAAAAG 3070 hom 96 het 33 0 33 2 AAAAT 1 0 174540 CASAVA_Build 3 146817995 1D GCCGCTCGCC G/- GCAGTTCAGT 3070 hom 84 het 35 0 27 8 G 2 1 174541 CASAVA_Build 3 146820841 1D AGAGTTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 A 13 12 174542 CASAVA_Build 3 146829742 1D AAGTATATAT A/- TCATACATAT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 1 0 174543 CASAVA_Build 3 146833073 1D ATCTCTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 T 11 10 174544 CASAVA_Build 3 146833362 1D CAGGGACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 754 hom 35 6 19 10 T 13 12 174545 CASAVA_Build 3 146834639 1I GTTCCATTAA -/T TCATTCTTCT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 1 2 174546 CASAVA_Build 3 146837203 4D AGCTTTTTAT TCTA/---- TCTATCTATC 2959 het 2959 ref 21 9 8 4 TCTA 4 3 174547 CASAVA_Build 3 146841134 1D GAAAACTTTC T/- TTATCAAAAG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 3 2 174548 CASAVA_Build 3 146847225 6D GAGGAATATA TCATTT/------ TCATTTTCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TCATTT 2 1 174549 CASAVA_Build 3 146856537 1D ACTACTGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 10 9 174550 CASAVA_Build 3 146856625 2D AAATTCAGTG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 48 20 25 4 T 10 8 174551 CASAVA_Build 3 146857150 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 8 7 174552 CASAVA_Build 3 146861537 1D TCGAAGAACT A/- AAAAAAAAAA 1382 het 1382 ref 38 25 3 10 A 12 11 174553 CASAVA_Build 3 146877315 2I TGCCAATATG --/TA TTCAAGGAGT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TA 0 1 174554 CASAVA_Build 3 146891432 1D GTAAGCCAGC A/- AAAAAAAAAA 1805 het 1805 ref 32 24 4 4 A 15 14 174555 CASAVA_Build 3 146893798 1I AGAATTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 10 5 A 10 11 174556 CASAVA_Build 3 146906282 8D ATTTTAAAAT ATTATAGC/-------- ATTATAGCAT 3070 hom 99 het 45 0 34 11 ATTATAGC 2 1 174557 CASAVA_Build 3 146908073 1D CGTTTTTTTT A/- AAAACCTTTA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 5 4 174558 CASAVA_Build 3 146909481 1D AGGAATACTC T/- TAAGTCGTGG 3070 het 3070 hom 60 27 30 4 T 2 1 174559 CASAVA_Build 3 146927636 1D ACTAATAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1026 hom 39 5 20 14 A 17 16 174560 CASAVA_Build 3 146932984 2I ATTCAGAAAC --/TG TGGGAGTCAG 3070 hom 105 het 44 0 36 8 TG 1 2 174561 CASAVA_Build 3 146943655 1D TTTTAATAAA T/- ATATTGTAAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 1 0 174562 CASAVA_Build 3 146964874 2D AGAGACAGAC AA/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 3 1 174563 CASAVA_Build 3 146965396 1D ATTTAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 23 1 19 3 A 11 10 174564 CASAVA_Build 3 146985971 1D TTTTATACTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 16 21 2 T 8 7 174565 CASAVA_Build 3 146986855 2I TGGAATTTAC --/AG AGTCAGTACT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AG 1 2 174566 CASAVA_Build 3 146987297 1I CACAACTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 43 1 35 7 T 11 12 174567 CASAVA_Build 3 146993836 1D TTTCAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 21 0 11 10 T 11 10 174568 CASAVA_Build 3 146994529 1I GGTTCCTCCC -/A TGACATATGG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 0 1 174569 CASAVA_Build 3 146994595 1I ACAAAACCAT -/A ATCATTCTGC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 1 2 174570 CASAVA_Build 3 146995244 1D TCCATGACAG C/- CCCACCCCTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 4 3 174571 CASAVA_Build 3 146996895 1D GGCTACTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 42 0 29 13 A 12 11 174572 CASAVA_Build 3 146996998 1I CAGTTGGGAG -/A TCTCTCAAAG 3070 hom 83 het 33 0 28 5 A 0 1 174573 CASAVA_Build 3 146997878 3D AAACACTAAG TTA/--- TTATCTTAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 TTA 2 1 174574 CASAVA_Build 3 146999696 4D TAAGCACATC GCTG/---- GCTGAGCATT 3070 hom 99 het 35 0 34 3 GCTG 2 1 174575 CASAVA_Build 3 147001827 1D TCATCTTCTT C/- CCCCCCAGTG 3070 hom 88 het 50 0 45 5 C 7 6 174576 CASAVA_Build 3 147004285 5D ATGCAGCTAT GCAGC/----- AAAGATCTTT 3070 het 3070 hom 45 23 21 2 GCAGC 1 0 174577 CASAVA_Build 3 147004785 10I TCTTTACATG ----------/TGTGCACACA TGTGCACACG 3070 het 3070 ref 34 14 17 3 TGTGCACACA 0 1 174578 CASAVA_Build 3 147005116 1I CTTTGAGAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 8 9 174579 CASAVA_Build 3 147008771 1D GCCCTTCATT C/- AAGGAATTTC 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 C 1 0 174580 CASAVA_Build 3 147010563 4D TTTGCAGACT ATAA/---- ATGTGAACTA 3070 het 3070 ref 48 23 21 5 ATAA 1 0 174581 CASAVA_Build 3 147010985 4I TTTAAAGACC ----/TAAG TGTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 TAAG 0 1 174582 CASAVA_Build 3 147012616 3D CAGCACTTTG GGA/--- GGAGGCCAAG 2208 het 28 hom 7 1 6 1 GGA 2 1 174583 CASAVA_Build 3 147012861 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 6 7 174584 CASAVA_Build 3 147031744 3D TATCCAAAGA GTT/--- GTTTTGAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 6 GTT 2 1 174585 CASAVA_Build 3 147032624 1D AAATAAAAAG A/- AAAAAATATT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 7 6 174586 CASAVA_Build 3 147032713 1D AAGAGGTGAA G/- GGGAGCCTGT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 4 3 174587 CASAVA_Build 3 147032956 9D AGGTTTGTGG AGACCAAAT/--------- AGACCAAATA 3070 hom 123 het 46 0 41 7 AGACCAAAT 2 1 174588 CASAVA_Build 3 147036752 2I ATACTTTAGC --/AT ATATATATAT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 AT 7 8 174589 CASAVA_Build 3 147037029 1I AAGGAGATAA -/T TTTTTTTTTT 2831 het 2831 ref 36 17 8 11 T 13 14 174590 CASAVA_Build 3 147038288 2I CATTTTACTC --/AT AATGGCTGGG 3070 hom 33 het 15 0 11 5 AT 0 1 174591 CASAVA_Build 3 147049463 9I2M10D7M15D TAAAATTATT ---------TTAAAGAAACAATATTTAAAAGAAAGAGAGAGGT/ACCTCTCTCTT----------TCTTTTA--------------- AATATCTCAA 3070 hom 90 het 28 0 31 5 N/A 0 0 174592 CASAVA_Build 3 147053996 1D GGAATTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 21 8 A 12 11 174593 CASAVA_Build 3 147066255 1D TGCTTTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 12 11 174594 CASAVA_Build 3 147070031 1D ATAGGAAAAG A/- AAAAATTATG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 6 5 174595 CASAVA_Build 3 147080215 1D TGGAGTATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 29 4 14 11 A 15 14 174596 CASAVA_Build 3 147084399 1D74M4D AATATATAAT CATATATGATTTCATTAGTTTCATATATATAGAATCATCTGTATATGAATATGCATATTCATGTATGTGTGTGTGTGTA/-ATATATGATTTCATTAGTTTCATATATATAGAATCATCTGTATATGAATATGCATATTCATGTATGTGTGTGTG---- TGTGTGTGTA 3070 het 1611 hom 9 5 10 6 N/A 0 0 174597 CASAVA_Build 3 147091224 2I3M3D CTTAAGTATT --AAAATT/GCAAA--- TAGAAAATTT 3070 het 3070 ref 70 38 23 16 N/A 0 0 174598 CASAVA_Build 3 147091461 8I AATTGCTCTA --------/TGCTCTAT TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 14 29 5 TGCTCTAT 0 1 174599 CASAVA_Build 3 147091874 1I CATTAAGCCA -/T TTTTTGACTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 5 6 174600 CASAVA_Build 3 147092746 1D AGCTGGTCTA C/- CATATGATGG 3070 hom 96 het 37 0 33 5 C 2 1 174601 CASAVA_Build 3 147098840 1I GTGGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 29 1 23 5 T 10 11 174602 CASAVA_Build 3 147101856 2D TCACATATAA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TG 5 4 174603 CASAVA_Build 3 147103840 1D GGAATTACTT C/- ACTTATTAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 1 0 174604 CASAVA_Build 3 147106000 1I TAATGAAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 9 10 174605 CASAVA_Build 3 147107847 4D ATTGTGCGAT ATTA/---- ATTAATACTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 ATTA 2 1 174606 CASAVA_Build 3 147115821 1D GTTTAATTTC T/- TTTTTCAATC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 5 174607 CASAVA_Build 3 147136373 1D AACCAGAGAC T/- TTTTAGAGTC 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 5 4 174608 CASAVA_Build 3 147160456 1D GAGTTCAAAG C/- TTTTGTGCTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 C 1 0 174609 CASAVA_Build 3 147164819 1I TTTGGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 10 11 174610 CASAVA_Build 3 147172107 1D TTAATTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 A 11 10 174611 CASAVA_Build 3 147178098 3I CCCTAGTTAT ---/CTC CTCATCACTG 3070 het 3070 hom 28 12 16 0 CTC 1 2 174612 CASAVA_Build 3 147191641 4D GTTTGTTTGC CTGT/---- CTGTCTTTGT 3070 het 3070 ref 36 20 12 8 CTGT 2 1 174613 CASAVA_Build 3 147192577 1D TTCATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2797 hom 31 11 13 7 T 13 12 174614 CASAVA_Build 3 147197214 1I GTCTTACAAA -/T TAACTCAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 T 1 2 174615 CASAVA_Build 3 147206013 1D ACCAGCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1234 het 1234 ref 39 30 3 6 T 12 11 174616 CASAVA_Build 3 147210134 1I TGATTGGCCC -/T TGGTGGCAGT 3070 het 3070 hom 47 20 19 8 T 1 2 174617 CASAVA_Build 3 147214289 1D GCTAAAGTAA G/- TCACATGGCC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 G 1 0 174618 CASAVA_Build 3 147215472 1D CTGGTGGGCA T/- TTCCATCCTG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 3 2 174619 CASAVA_Build 3 147215869 4D TTCCCTCCTC CTCT/---- CTCTCCTCTC 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 CT 4 2 174620 CASAVA_Build 3 147216367 1I TAAAAATAGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 8 9 174621 CASAVA_Build 3 147219914 6D GTGGAAAAAA GAAGAT/------ GAGAGAGGTT 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 GAAGAT 1 0 174622 CASAVA_Build 3 147220213 1D TGTTTAGTAT C/- ATAACTCAGA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 C 1 0 174623 CASAVA_Build 3 147223522 1I ACATGGGTGG -/T TTTTTATACT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 5 6 174624 CASAVA_Build 3 147224018 1I AATGTTGGTC -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 6 7 174625 CASAVA_Build 3 147226058 13D CTATGGCCAG AATGTGCCTTAGC/------------- AATGTGCCTT 3070 het 3070 ref 46 26 13 10 AATGTGCCTTAGC 2 1 174626 CASAVA_Build 3 147227017 4I AATGAGACAG ----/CAGT CAGTGGTTTG 3070 het 3070 ref 45 19 18 9 CAGT 1 2 174627 CASAVA_Build 3 147227146 5I TGTAATATAT -----/TTAAA TTAGTTAATT 3070 het 3070 hom 30 9 15 7 TTAAA 0 1 174628 CASAVA_Build 3 147227205 1I CGTTCTTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 A 9 10 174629 CASAVA_Build 3 147227614 1D AATTTACAAA G/- CCTGGTAGAT 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 G 1 0 174630 CASAVA_Build 3 147244477 1D CAGCATACAA C/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 C 1 0 174631 CASAVA_Build 3 147245729 2I CCAAAACAAA --/GG GGGGTTACAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 G 4 6 174632 CASAVA_Build 3 147247071 20D TGCAACACAC TATTTATTTATTTATTTATT/-------------------- TATTTATTTA 2136 het 991 hom 16 2 5 9 TATT 10 5 174633 CASAVA_Build 3 147249133 1I CAATAATAAG -/A AAAAAACACC 2843 het 2843 ref 32 17 7 8 A 6 7 174634 CASAVA_Build 3 147249974 3D ATTAAAATAT TTC/--- TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 32 11 18 5 TTC 1 0 174635 CASAVA_Build 3 147250091 1D AATAATGCAG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 9 8 174636 CASAVA_Build 3 147254945 10I TTTGGAAAAA ----------/CCTAAAAACT CTACCAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CCTAAAAACT 0 1 174637 CASAVA_Build 3 147263142 1D TGCTTCAAGG T/- CTCTAAAACG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 1 0 174638 CASAVA_Build 3 147268126 20I TATACACATA --------------------/CACACACATGCACACTTGTG CACACACATG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 CACACACATGCACACTTGTG 0 1 174639 CASAVA_Build 3 147272753 2D CTGTAAAGAC AT/-- GTGTTACCTA 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 AT 1 0 174640 CASAVA_Build 3 147275188 1D AAGTTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 11 10 174641 CASAVA_Build 3 147277016 14I TTTCCAAATT --------------/GCTAAACTAATTTA CATTCCGACC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 GCTAAACTAATTTA 0 1 174642 CASAVA_Build 3 147277467 4D AATTTCTATC TTTA/---- TATTTCATTT 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 TTTA 1 0 174643 CASAVA_Build 3 147280712 1D ATACACTACG T/- TTTTTCCTAC 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 6 5 174644 CASAVA_Build 3 147292585 1I TAGAAATGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 9 10 174645 CASAVA_Build 3 147295839 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 17 0 11 7 A 13 12 174646 CASAVA_Build 3 147298797 1D TACTAACAAT A/- AATGGGTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 3 2 174647 CASAVA_Build 3 147301362 20D TTTCTGCTTT GGCAGAATACTCTAGTTCCA/-------------------- GGCTGCTGGG 3070 het 3070 ref 37 20 19 5 GGCAGAATACTCTAGTTCCA 1 0 174648 CASAVA_Build 3 147310947 1I GGAAAAAATG -/T TGTTTTAAAA 3070 het 2848 hom 34 8 24 2 T 1 2 174649 CASAVA_Build 3 147312199 1I CCTGTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 23 8 4 A 10 11 174650 CASAVA_Build 3 147312323 1D TTGTTGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 11 8 T 11 10 174651 CASAVA_Build 3 147314723 1I4M5I4M1I TTTTATTGCC -TCTG-----TGTG-/TTATGAAGCATGTGA CCTCTGTGAC 3070 het 3070 ref 33 22 11 0 N/A 0 0 174652 CASAVA_Build 3 147318954 2D AAAAATATTA CT/-- CTTATTTTCA 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 CT 2 1 174653 CASAVA_Build 3 147324228 1I ACATATTAAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 T 8 9 174654 CASAVA_Build 3 147325141 1D TGACATACAC A/- AAAAAAACAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 8 7 174655 CASAVA_Build 3 147325564 1I GGCTGGAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 9 10 174656 CASAVA_Build 3 147325872 1I ATAGTCAACC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 A 8 9 174657 CASAVA_Build 3 147326831 1I TTAGTTGGAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 8 9 174658 CASAVA_Build 3 147327298 1D TTTCATTTAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 8 7 174659 CASAVA_Build 3 147332409 1D TTTCAACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 53 21 23 9 A 10 9 174660 CASAVA_Build 3 147340688 1I AAATAAGAAT -/C CCCTTGTTAG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 C 3 4 174661 CASAVA_Build 3 147343782 1I GTGAGAATAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 A 9 10 174662 CASAVA_Build 3 147344967 4D AACAAGAGAC AGAA/---- AGAGTACATA 3070 het 3070 ref 35 19 14 5 AGAA 1 0 174663 CASAVA_Build 3 147345330 2I ATATACAAAC --/AG AAAAAAATGA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AG 0 1 174664 CASAVA_Build 3 147346286 3I TAAGCCCCAC ---/TGG TTTTATCTCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TGG 0 1 174665 CASAVA_Build 3 147346746 1I AATTACTGAA -/G AAAGTCATGA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 0 1 174666 CASAVA_Build 3 147347561 1D AAATCCAACT A/- AGAATGTAAA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 2 1 174667 CASAVA_Build 3 147354307 1D TCCACAGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 13 14 A 15 14 174668 CASAVA_Build 3 147354952 1I AAAGAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2041 hom 34 7 17 10 A 14 15 174669 CASAVA_Build 3 147368612 1I ATTATGTGGC -/T TTTTTTTTTC 1279 het 1279 ref 41 36 3 2 T 9 10 174670 CASAVA_Build 3 147390444 1D ATACACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 44 1 35 9 A 11 10 174671 CASAVA_Build 3 147393529 1D TGACTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 30 0 21 10 A 12 11 174672 CASAVA_Build 3 147407282 1I ATTAACACTA -/T AAGTTAGCAT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 0 1 174673 CASAVA_Build 3 147411325 1D TTTATGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 22 18 10 T 11 10 174674 CASAVA_Build 3 147417216 1D AAGAAGAGCA C/- CCCAGGCGTG 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 C 4 3 174675 CASAVA_Build 3 147422058 1I TGCTTACTAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 46 20 15 11 A 8 9 174676 CASAVA_Build 3 147423577 5I AGACTGGGGC -----/ATGTT ATGTTTAAGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 ATGTT 1 2 174677 CASAVA_Build 3 147429204 2D TATAAATATT GA/-- GTTTTCATAA 3070 het 3070 ref 44 19 20 6 GA 1 0 174678 CASAVA_Build 3 147432427 1I TCCAGAATGG -/T TATGTCCTAG 3070 het 3070 hom 31 12 19 0 T 1 2 174679 CASAVA_Build 3 147433437 1D TCTGGACATA C/- TTTTGTTTCC 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 C 1 0 174680 CASAVA_Build 3 147434447 6I GGTTTTGAAA ------/TATATT TATAGTTCGA 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 TATATT 0 1 174681 CASAVA_Build 3 147441191 1I TCGAAACCTT -/C CATATGTCGC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 C 1 2 174682 CASAVA_Build 3 147446217 4D AATTTTCTAC AATA/---- AATGTATAAT 3070 het 3070 hom 42 19 21 4 AATA 1 0 174683 CASAVA_Build 3 147447874 1D TCTGATATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 6 A 12 11 174684 CASAVA_Build 3 147449022 5I TGTTTTAACT -----/TTAAC TTATGTTTTG 3070 het 3070 hom 50 18 21 11 TTAAC 0 1 174685 CASAVA_Build 3 147466166 1I AGAAGTAAAA -/T TTTGTATAAC 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 3 4 174686 CASAVA_Build 3 147496166 1D TTTTAGTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 T 10 9 174687 CASAVA_Build 3 147662946 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1413 het 1413 ref 27 15 3 9 T 13 12 174688 CASAVA_Build 3 147671525 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 9 174689 CASAVA_Build 3 147678340 1D CAGGCAGGTG C/- CCCTCTGGGA 3070 hom 47 het 22 0 12 10 C 4 3 174690 CASAVA_Build 3 147727282 2I TACTGAATGT --/TC TCTCACTCAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 TC 2 3 174691 CASAVA_Build 3 147746141 1D TCCTGCAATT A/- GAAGGTCCCA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 1 0 174692 CASAVA_Build 3 147769287 1D TTACCATTAC T/- TTTTTTTTTT 2030 het 2030 ref 38 27 5 6 T 11 10 174693 CASAVA_Build 3 147770702 4D CAATTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTTC 2 1 174694 CASAVA_Build 3 147770900 5I TTTTGACTAC -----/TTTTT TTTGTTTTGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 3 8 174695 CASAVA_Build 3 147778556 5I GAATACTGAC -----/ATTTT ATTTTATTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 ATTTT 2 3 174696 CASAVA_Build 3 147778682 1I TTTAATAAAG -/T TTTTTTATTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 6 7 174697 CASAVA_Build 3 147780850 1I TTCTCTCTCT -/C TCTTGTTTAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 0 1 174698 CASAVA_Build 3 147800157 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 32 1 20 11 T 15 14 174699 CASAVA_Build 3 147808480 23I CTAGAAGAAC -----------------------/CAGGGCAACCATTTATTACTCAA GATGGTCATA 3070 hom 117 het 45 0 36 12 CAGGGCAACCATTTATTACTCAA 0 1 174700 CASAVA_Build 3 147808961 3D ATATCACAGG TGT/--- TTCTAAAGAG 3070 hom 132 het 50 0 44 6 TGT 1 0 174701 CASAVA_Build 3 147820358 1I TTGTCTATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 12 13 174702 CASAVA_Build 3 147823278 1D AAAATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3067 hom 28 8 17 3 T 11 10 174703 CASAVA_Build 3 147824140 19D TCCAGAATGC TCATTTGCAAAGGCATTAT/------------------- TTATAAATCT 3070 het 3070 ref 37 27 16 2 TCATTTGCAAAGGCATTAT 1 0 174704 CASAVA_Build 3 147827623 1I TTCTATACCC -/T CCCCCTGAAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 0 1 174705 CASAVA_Build 3 147830131 1D TCTGAGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 18 19 10 T 12 11 174706 CASAVA_Build 3 147830571 1I AGTTGCTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 A 9 10 174707 CASAVA_Build 3 147840211 1I TGTTCAGAGT -/A ACCTGTTACT 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 1 2 174708 CASAVA_Build 3 147845703 1I GGCATTCTTA -/G GCCAGGCATA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 G 1 2 174709 CASAVA_Build 3 147849430 5I AAATAAAATA -----/AAGTT AATATGCTAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 AAGTT 0 1 174710 CASAVA_Build 3 147857048 1D TAATGGGTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 10 9 174711 CASAVA_Build 3 147860239 1D ATTCAGTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 9 174712 CASAVA_Build 3 147862528 1D AAGAAGACAC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 7 174713 CASAVA_Build 3 147865679 1I TAGGGCCTCA -/G AAAGATGAGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 174714 CASAVA_Build 3 147867153 1D ATATAGTTAA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 7 6 174715 CASAVA_Build 3 147867594 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 10 9 174716 CASAVA_Build 3 147867839 2I ACTTGATCTC --/TT GTTTATTTAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 2 174717 CASAVA_Build 3 147873732 4D72M1D AACGTGATTG TTCTTTTTGCCCTTTGACTATGATGAGGAGTTCCTGCTATGAACATTCTTGTACTTTTTTTGTACAAACAAATATAT/----TTTTGCCGTTTGACTATGATGAGGAGTTCCTGCTATGAACATTCTTGTACTTTTTTTGTACAAACAAATATA- TTTTCTCATG 3070 hom 54 het 20 0 19 28 N/A 0 0 174718 CASAVA_Build 3 147874003 1D GATTGTTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 11 8 T 10 9 174719 CASAVA_Build 3 147874256 4I TAGTTATGAT ----/AAAC AAGTTTCAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AAAC 0 1 174720 CASAVA_Build 3 147874436 1I TACATGTATG -/A TGTGAATTAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 0 1 174721 CASAVA_Build 3 147875794 1D ACTATTTGTG T/- TTTTTGTCCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 5 174722 CASAVA_Build 3 147879758 1D ACTTTGCCAG A/- ATAATGACCC 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 2 1 174723 CASAVA_Build 3 147881467 1I GTTGAAGAAA -/C CCACATATTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 2 3 174724 CASAVA_Build 3 147883301 1I TAGTATGAAT -/G GAAGGCAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 1 2 174725 CASAVA_Build 3 147883509 1D GGAGTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 T 12 11 174726 CASAVA_Build 3 147888457 1D ATGAGTTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 10 9 174727 CASAVA_Build 3 147889984 1D GTTTATTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 23 1 10 12 A 11 10 174728 CASAVA_Build 3 147890166 1I TTGTATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 9 10 T 11 12 174729 CASAVA_Build 3 147890780 3I GCATATATAC ---/TTA TTATTATATC 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 TTA 2 3 174730 CASAVA_Build 3 147899797 1D TAAGAAACTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 48 19 26 4 A 9 8 174731 CASAVA_Build 3 147931320 2I GCCAACAAAC --/AT ATGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 AT 1 2 174732 CASAVA_Build 3 147937052 2D TGGAAAATAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 48 17 18 13 GT 9 8 174733 CASAVA_Build 3 147952836 1I GGTTGATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 902 hom 25 2 16 7 T 12 13 174734 CASAVA_Build 3 147953074 2I ATCTTCTCTC --/TT TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 7 9 174735 CASAVA_Build 3 147962669 1I AAAACAGGTA -/T TTTTATATCA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 4 5 174736 CASAVA_Build 3 147979363 1D GCTGATATAT A/- AAAAAACCTT 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 A 7 6 174737 CASAVA_Build 3 147981286 3D TAATGGTAAT ATC/--- ATTAAAAGTT 3070 het 3070 hom 37 14 22 2 ATC 1 0 174738 CASAVA_Build 3 147982152 1D TCTTATCTCC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 8 7 174739 CASAVA_Build 3 147995136 1I AAAAAATCAC -/T TGTGGAAGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 174740 CASAVA_Build 3 147996908 1D AGGGTGGATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 9 8 174741 CASAVA_Build 3 147998328 2D CCCATACCCT TG/-- TGTCAACACT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TG 2 1 174742 CASAVA_Build 3 147999434 2D TCATACAAAT AA/-- AATTATAATC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 4 2 174743 CASAVA_Build 3 148000188 1D GTTTAGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 13 12 174744 CASAVA_Build 3 148004214 1D AATAATACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 T 11 10 174745 CASAVA_Build 3 148014547 2I ACAGAGAAAT --/AC AGAGACATGC 3070 het 3070 hom 47 14 23 10 AC 0 1 174746 CASAVA_Build 3 148019728 2I ACTGTGTGTG --/TT TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 T 1 3 174747 CASAVA_Build 3 148044390 3I GACTATTCTC ---/ATT ATTGCATTAA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 ATT 1 2 174748 CASAVA_Build 3 148046224 1D TCATTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 T 11 10 174749 CASAVA_Build 3 148051577 1I AACTATATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 A 9 10 174750 CASAVA_Build 3 148051877 4D AAAAAGAAAA AGAC/---- AGAAGAGGGA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 AGAC 1 0 174751 CASAVA_Build 3 148052953 1I TAGTTAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 9 10 174752 CASAVA_Build 3 148060474 1I TTTCACATAT -/C CTTTGTACCA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 C 1 2 174753 CASAVA_Build 3 148066403 1D ATCTTTTTTT G/- TTTGGGCAGA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 G 1 0 174754 CASAVA_Build 3 148076117 1D TGTAGCATGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 T 9 8 174755 CASAVA_Build 3 148091962 1D GAATTTCCAC T/- TTTGGGAAGA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 4 3 174756 CASAVA_Build 3 148127649 1D TTGAAAGACA T/- TTTGCAAATA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 4 3 174757 CASAVA_Build 3 148136325 1D GTGGACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 11 10 174758 CASAVA_Build 3 148140853 4I TACACATATA ----/TATG TGTGTACATA 3070 hom 41 het 17 0 12 5 TATG 0 1 174759 CASAVA_Build 3 148153885 1D TAGTTAACTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 9 8 174760 CASAVA_Build 3 148158489 1I TGTACATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 10 11 174761 CASAVA_Build 3 148179285 2I AGGAAATAAG --/CT CACACGAAGG 3070 hom 168 het 64 0 54 10 CT 0 1 174762 CASAVA_Build 3 148181025 1D TCCTAAGCAC A/- AAAAAAAGCG 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 A 8 7 174763 CASAVA_Build 3 148195156 1D TTTGCCTTAA T/- TTCATTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 T 3 2 174764 CASAVA_Build 3 148197795 4I AGGGAGAGAA ----/AGAG AGAGGGAGAG 3070 het 2901 hom 27 9 13 5 AG 2 4 174765 CASAVA_Build 3 148200247 2I GACTCCATCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 22 2 13 8 A 12 14 174766 CASAVA_Build 3 148206028 3I TCACTTTCAT ---/TTA TTATTATCAT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 TTA 2 3 174767 CASAVA_Build 3 148207108 3D CACTGATTGC AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 hom 27 het 21 0 10 11 A 12 9 174768 CASAVA_Build 3 148208042 2D ACTTATTCTT TA/-- TACTGCTTGA 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 TA 2 1 174769 CASAVA_Build 3 148211987 1D TATAGAAATT G/- TACTAACTTA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 1 0 174770 CASAVA_Build 3 148212194 3D TTTCTTGAAC ACT/--- ATCAAGTGTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 ACT 1 0 174771 CASAVA_Build 3 148213211 1D TTTATTCAAC A/- TTTAACTAGG 3070 het 3070 ref 38 17 18 5 A 1 0 174772 CASAVA_Build 3 148213941 1D AAAGCAGGCA T/- TTTTTTTTTT 1500 het 1500 ref 49 29 4 16 T 15 14 174773 CASAVA_Build 3 148214100 4I CTTTTTTTTT ----/TTTC TTTTGAGACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTTC 0 1 174774 CASAVA_Build 3 148217350 2D CCTCTGTCCC CA/-- CTCAAATCTC 3070 het 3070 ref 52 29 21 4 CA 1 0 174775 CASAVA_Build 3 148220620 1D CAGATCTACC T/- AGAGTCTGGA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 T 1 0 174776 CASAVA_Build 3 148232466 3D GAAGAATGTG TTT/--- TTAATATTCT 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 T 5 2 174777 CASAVA_Build 3 148237860 1I CCTTAATACC -/A AAAAAAAAAA 1290 het 1290 ref 38 27 3 8 A 10 11 174778 CASAVA_Build 3 148249806 2D AGCAGAAATT TC/-- TGTTTTATAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 TC 1 0 174779 CASAVA_Build 3 148250249 1I GAAAGGAGGG -/A AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 A 6 7 174780 CASAVA_Build 3 148255805 1I AAAATATAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 9 10 174781 CASAVA_Build 3 148256707 1D TCTCTACACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 T 10 9 174782 CASAVA_Build 3 148272174 1I CAACAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 10 11 174783 CASAVA_Build 3 148272895 2D TCAAGTATCT TC/-- TGAGATCACA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TC 1 0 174784 CASAVA_Build 3 148277280 4I GGCTTGCTGC ----/CTAT CTATTATTGG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 CTAT 1 2 174785 CASAVA_Build 3 148289455 1D AAAATGCTTT A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 7 6 174786 CASAVA_Build 3 148306822 3I TGGGCTTAGT ---/TTG TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTG 0 1 174787 CASAVA_Build 3 148313704 5D ATTTTATAAA TAATG/----- TATTTTCTTG 3070 het 3070 ref 29 17 9 7 TAATG 1 0 174788 CASAVA_Build 3 148332501 1I CTTTTGTAAT -/A ATTTCCTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 2 174789 CASAVA_Build 3 148333154 5I GTCACACACA -----/ATTTT ATTTTAAATC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 ATTTT 1 2 174790 CASAVA_Build 3 148338113 4D TAGAATATAA TTGT/---- TTGCAACTAC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TTGT 1 0 174791 CASAVA_Build 3 148339908 1I TTTATATGAA -/C CACATAAGCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 1 2 174792 CASAVA_Build 3 148340350 3I ATTTCAGGTA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 24 10 T 11 14 174793 CASAVA_Build 3 148351725 2I TGAAAAGTTT --/AA AAAAAAAAAA 1294 het 1015 hom 28 4 3 21 A 12 14 174794 CASAVA_Build 3 148371144 3I AATATTATTA ---/TTC AATTGATTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TTC 0 1 174795 CASAVA_Build 3 148380045 1I TTTTGTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 31 0 28 3 T 11 12 174796 CASAVA_Build 3 148381807 4D TGATACGACT TTGG/---- TTGGAAATAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 6 TTGG 2 1 174797 CASAVA_Build 3 148389144 1D CACAGCCTAG A/- AAAAACGTCC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 6 5 174798 CASAVA_Build 3 148389457 1D TATTTGATTT A/- TTTTCTTTAC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 1 0 174799 CASAVA_Build 3 148398664 2D TAGATCTTCA CT/-- CTGTTTGTGA 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 CT 2 1 174800 CASAVA_Build 3 148399047 5D TAACTTATAG AAAAT/----- AAATCTAATA 2441 het 2441 ref 15 8 6 2 AAAAT 1 0 174801 CASAVA_Build 3 148408963 1D GTTGGTTGTA T/- TTCTGTGGTG 2928 het 2928 ref 21 12 6 3 T 3 2 174802 CASAVA_Build 3 148421877 1I AACAAAAAAA -/T GTAAGCAATT 3070 het 3070 ref 53 27 22 4 T 0 1 174803 CASAVA_Build 3 148423932 14D AAGCCCTGAC TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 het 60 hom 16 2 13 2 TA 20 13 174804 CASAVA_Build 3 148438928 2I TGGAATACTT --/TA TGTCACAAGC 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 TA 0 1 174805 CASAVA_Build 3 148444888 1D TATGAAACTT G/- GAAGTTGTAA 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 G 2 1 174806 CASAVA_Build 3 148447607 2D CGTGGCAGTT TG/-- TGTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 44 18 17 10 TG 2 1 174807 CASAVA_Build 3 148545628 1D GAGGTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 40 1 32 7 T 13 12 174808 CASAVA_Build 3 148550661 1D ACATATCAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 10 9 174809 CASAVA_Build 3 148562938 2D TTTAGACAAC AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 10 8 174810 CASAVA_Build 3 148573274 2I GCTCTTTTGG --/AA AAGACAAGGC 3070 hom 77 het 34 0 23 11 A 2 4 174811 CASAVA_Build 3 148573408 1I CACTCAAGTA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 7 8 174812 CASAVA_Build 3 148578290 1D GCTCCTATCA C/- CCTCAGGCAA 3070 het 3070 ref 45 25 15 7 C 3 2 174813 CASAVA_Build 3 148643930 2D TTTCTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2372 het 1009 hom 27 8 6 15 T 19 17 174814 CASAVA_Build 3 148710765 6D GTTCTGCATG TATGCA/------ TAATAAAATC 3070 het 3070 ref 34 18 14 5 TATGCA 1 0 174815 CASAVA_Build 3 148734030 1D TAACATTTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 107 het 40 0 35 5 T 9 8 174816 CASAVA_Build 3 148759226 1I TTCAGAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 8 9 174817 CASAVA_Build 3 148767340 1D AAGAAAAAAA T/- ATCTTCAAAT 3070 het 3070 ref 46 26 16 5 T 1 0 174818 CASAVA_Build 3 148805237 4I AATTAAATGT ----/GATA GATAGATAAC 3070 het 2709 hom 41 6 30 5 GATA 2 3 174819 CASAVA_Build 3 148827747 1I ACGGAAGTAG -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3038 hom 32 12 13 7 T 3 4 174820 CASAVA_Build 3 148833232 18D TGTGCAATGA TCACCCACTGCACACCAG/------------------ TCTGGGTGTT 264 het 264 ref 31 21 2 12 TCACCCACTGCACACCAG 1 0 174821 CASAVA_Build 3 148833324 2D TCTCTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 2019 het 2019 ref 25 11 8 7 TG 9 8 174822 CASAVA_Build 3 148834478 1D GATTTCTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 9 8 174823 CASAVA_Build 3 148838534 1I AACAAACAAG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 7 8 174824 CASAVA_Build 3 148840371 4D AAAAAAACAA TAAT/---- TATACTTTCT 3070 het 3070 ref 42 23 16 7 TAAT 1 0 174825 CASAVA_Build 3 148859837 2D ATGGTAATTC TA/-- TGTTTAATTT 3070 het 3070 ref 33 18 15 3 TA 1 0 174826 CASAVA_Build 3 148864798 1I ATGCATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2094 hom 41 5 32 4 A 12 13 174827 CASAVA_Build 3 148870832 4I GCTGCCTGGG ----/ATCT ATCTCCCCAT 3070 het 3070 ref 48 18 17 13 ATCT 1 2 174828 CASAVA_Build 3 148881240 1I AAATACAGGC -/T TTAAAGACAA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 2 3 174829 CASAVA_Build 3 148889569 2D GGTGGAGAGA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AG 5 4 174830 CASAVA_Build 3 148893059 1I ACCAAAAAAC -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 A 7 8 174831 CASAVA_Build 3 148897178 1I AGAAAAAGGT -/A AAAAAACACT 3070 hom 66 het 32 0 22 10 A 6 7 174832 CASAVA_Build 3 148897827 2I TTTGGTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 10 12 174833 CASAVA_Build 3 148900806 1D TTCAAATCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 10 9 174834 CASAVA_Build 3 148914285 1I TCTCAGAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 11 174835 CASAVA_Build 3 148920356 2I ATAATAAACT --/TA TATATATATA 2676 het 2676 ref 31 14 7 10 TA 7 8 174836 CASAVA_Build 3 148921070 1D CGGATGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 655 hom 29 2 16 11 T 13 12 174837 CASAVA_Build 3 148923751 2I8M2I CTGAATGTTT --GACTATGG--/CCACCAAAGGCA GTCATCAAGT 3070 het 3070 ref 25 15 8 5 N/A 0 0 174838 CASAVA_Build 3 148959700 1D GTTAAGAATT A/- GTTTAATAAT 3070 het 3070 ref 40 25 14 1 A 1 0 174839 CASAVA_Build 3 148972853 2I ACAGATGTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 12 174840 CASAVA_Build 3 148974666 1D TAACCCACTT G/- GGCATCTTGT 3070 het 3070 hom 37 17 16 6 G 3 2 174841 CASAVA_Build 3 148976222 1I ATTACATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2507 hom 21 6 9 6 T 15 16 174842 CASAVA_Build 3 148979373 1I TTATATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 T 10 11 174843 CASAVA_Build 3 148981864 1I ACGTTGGCTA -/G GGGATTAATG 3070 hom 114 het 41 0 37 4 G 3 4 174844 CASAVA_Build 3 148982068 1D TAAAGACTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 39 2 32 6 A 18 17 174845 CASAVA_Build 3 148995852 1I ACTTCAGATG -/T TTTTTTTTTT 1201 het 1201 ref 40 28 3 9 T 10 11 174846 CASAVA_Build 3 149012074 4I CATCCAAGGT ----/AGGG AGGGGCAATA 3070 het 3070 hom 51 25 23 3 AGGG 1 2 174847 CASAVA_Build 3 149012934 1D TTTCTGAGTG T/- TTTTTTTTGG 1354 het 1354 ref 32 24 3 6 T 9 8 174848 CASAVA_Build 3 149019031 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 1302 het 1302 ref 25 9 6 10 A 17 18 174849 CASAVA_Build 3 149089718 2D CGCCCGGCCC TG/-- TGTGTGTGTG 1150 het 1150 ref 18 15 3 1 TG 9 8 174850 CASAVA_Build 3 149182097 1I GATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1944 het 1944 ref 22 9 6 7 T 11 12 174851 CASAVA_Build 3 149187247 1I GCAGCGCAGT -/G GCATGATCAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 1 2 174852 CASAVA_Build 3 149233611 38I AGTATACTAC --------------------------------------/ATATATTAACAGAATTAATATACATACACACCAATAGA ATATATTAGT 3070 hom 94 het 36 0 32 10 ATATATTAACAGAATTAATATACATACACACCAATAGA 0 1 174853 CASAVA_Build 3 149240066 2D CCTGCTCTTC AG/-- AGAAAGTATT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AG 2 1 174854 CASAVA_Build 3 149240521 4D TGTGAAAGTG TTTC/---- TTTCATTGCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTTC 2 1 174855 CASAVA_Build 3 149248775 1I TGTATTTTAA -/T TTGGTGTGTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 2 3 174856 CASAVA_Build 3 149253996 4D44M2D CAGTAGGTGG ATAAATAAATAAACTGCAGTACATCTAGACAATGAAATATTCACTGCCAA/----ATAAATAAACTGCAGTACATCTAGACAATGAAATATTCACTGCC-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 19 12 21 N/A 0 0 174857 CASAVA_Build 3 149254594 1D ATATAAAGTG T/- TTTTGTTCAT 2722 het 2722 ref 24 14 7 4 T 5 4 174858 CASAVA_Build 3 149258665 1I TTGGTGGAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 93 hom 48 1 46 1 T 9 10 174859 CASAVA_Build 3 149259569 3D TAAAGTTTTA TAT/--- TATTATCAAT 3070 het 3070 ref 28 17 10 2 TAT 3 2 174860 CASAVA_Build 3 149269814 3D CAGCTTCTTC TTA/--- TTATTATTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 TTA 3 2 174861 CASAVA_Build 3 149273516 1I AGATCTGTTT -/A TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 A 0 1 174862 CASAVA_Build 3 149276859 1I GACTTTCGGC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 8 9 174863 CASAVA_Build 3 149282799 3I TATGATGTCC ---/TTG TTGTGATACC 3070 hom 172 het 64 0 58 6 TTG 1 2 174864 CASAVA_Build 3 149392116 1I AACTAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 12 11 T 12 13 174865 CASAVA_Build 3 149406401 2D TTGGTAGAAG CA/-- CACACACACA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 CA 7 6 174866 CASAVA_Build 3 149423281 1D TCCTCCAGTC T/- TTTTTTTTTC 1341 het 1341 ref 40 32 3 5 T 10 9 174867 CASAVA_Build 3 149436585 1D GAATCGTAAA T/- TTTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 38 16 14 10 T 7 6 174868 CASAVA_Build 3 149512829 19I6M2I TGATTATGAA -------------------AGCTTG--/AGTAATCATGAAAGTAATTAGCCTGAT TATAATAAGT 3070 het 3070 hom 31 15 15 3 N/A 0 0 174869 CASAVA_Build 3 149560292 1D ATTTTAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 10 9 174870 CASAVA_Build 3 149563629 1D TTCCCTCTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 T 10 9 174871 CASAVA_Build 3 149591863 1I CCAACTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 21 1 19 1 A 10 11 174872 CASAVA_Build 3 149667144 2I GGGGCACCAT --/GG GGGGGGGCCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 7 9 174873 CASAVA_Build 3 149684873 4I GTAACAATAA ----/GATT ATTTTAAATT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 GATT 0 1 174874 CASAVA_Build 3 149702636 1D TGATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 25 0 20 5 T 11 10 174875 CASAVA_Build 3 149703054 2D TTTTTATATT CA/-- CAGAGTTGTG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 CA 2 1 174876 CASAVA_Build 3 149705108 1I GATGATGAGC -/T TTTTTTCATA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 6 7 174877 CASAVA_Build 3 149706926 1D ACCAGCTCCT C/- CTTTGTACCT 1893 hom 10 het 4 0 4 1 C 2 1 174878 CASAVA_Build 3 149711194 2D GAAAAAACAC AT/-- GTTTGGCACT 3070 hom 88 het 36 0 29 7 AT 1 0 174879 CASAVA_Build 3 149712115 2D TGAAAATGCA CT/-- CTGCAACAAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 CT 2 1 174880 CASAVA_Build 3 149715554 3I AAAATTTAAA ---/TCT TCTCAAAATG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TCT 1 2 174881 CASAVA_Build 3 149728405 4D TCATTGAGAG TTGT/---- TTGTCAGTGA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TTGT 2 1 174882 CASAVA_Build 3 149731684 17D CCCATTTAGT AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 27 1 21 10 A 33 16 174883 CASAVA_Build 3 149733246 1D GGCAATTTTT G/- GCAAATAAAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 2 1 174884 CASAVA_Build 3 149740530 1I AACAGGGCTG -/T TAGGACCTGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 1 2 174885 CASAVA_Build 3 149743129 1I CCTGGACTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 604 hom 34 2 28 4 A 8 9 174886 CASAVA_Build 3 149743221 1I AAGCGTGTTT -/G GGGGTGTATT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 4 5 174887 CASAVA_Build 3 149744488 1D GTTTCCAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 10 9 174888 CASAVA_Build 3 149744781 3D TTTTTTTATT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TTA 5 4 174889 CASAVA_Build 3 149749419 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 8 9 174890 CASAVA_Build 3 149751063 1I CATAAACCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 252 hom 38 1 29 8 A 9 10 174891 CASAVA_Build 3 149773159 1D ACTATGGCTT G/- GCCCCAATAT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 G 2 1 174892 CASAVA_Build 3 149776846 1I ATTAGTAAAG -/A AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 6 7 174893 CASAVA_Build 3 149779982 1D CACCTTATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 27 2 20 5 A 16 15 174894 CASAVA_Build 3 149782171 2D AGCTGGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 32 0 18 14 A 14 12 174895 CASAVA_Build 3 149785230 10D CAGCAGCACA GTGAGGCTTT/---------- CTTTTGGTGT 3070 hom 114 het 40 0 38 5 GTGAGGCTTT 1 0 174896 CASAVA_Build 3 149789632 3I TAAATGAAAG ---/AAA GGTAAAAAAC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 0 3 174897 CASAVA_Build 3 149790854 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 20 0 14 7 A 17 14 174898 CASAVA_Build 3 149795783 4I CATATATGTG ----/TGTT TGTTTGTTAA 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 TGTT 2 3 174899 CASAVA_Build 3 149814255 4D TTGAATGAAT GAAG/---- GAAGTTTGGC 3070 hom 154 het 55 0 51 5 GAAG 2 1 174900 CASAVA_Build 3 149819406 1I AATCATAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 32 1 26 5 A 11 12 174901 CASAVA_Build 3 149819757 1D GGGTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 28 1 19 9 A 13 12 174902 CASAVA_Build 3 149823477 4I AGATATATCT ----/ATCA GATATATCTG 1452 het 318 hom 15 3 6 6 ATCA 0 1 174903 CASAVA_Build 3 149839234 1I TGGAGCCAGT -/C CCCCCCAGAT 2400 het 2400 ref 27 16 6 5 C 6 7 174904 CASAVA_Build 3 149839281 1D GGAAAGACAC A/- ACTCATCTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 2 1 174905 CASAVA_Build 3 149846700 1D ACACAACATC T/- TTTTCATCAC 3070 het 3070 hom 36 11 21 5 T 5 4 174906 CASAVA_Build 3 149860607 1I CAACATAAGA -/C CTTTGGTTCA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 C 1 2 174907 CASAVA_Build 3 149862585 1I TGAAAACATG -/A AATGTCCCTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 2 3 174908 CASAVA_Build 3 149865221 1D AATGCCCATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 436 hom 26 1 13 13 T 10 9 174909 CASAVA_Build 3 149867663 1I GATGACAGCA -/G GGCTTTATTA 3070 het 3070 ref 44 20 21 3 G 2 3 174910 CASAVA_Build 3 149868588 3I AAGCAAAGAT ---/ATC ATTTCACAAG 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 ATC 0 1 174911 CASAVA_Build 3 149871761 1I CAAATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 8 9 A 11 12 174912 CASAVA_Build 3 149878356 1I GGCAGGAGGG -/A AAAAAACCAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 6 7 174913 CASAVA_Build 3 149879087 1I CACGTTTATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 9 10 174914 CASAVA_Build 3 149899472 1D CCGTTTTTTT C/- TTTGGGCAAC 2644 het 2644 ref 25 11 9 5 C 1 0 174915 CASAVA_Build 3 149900059 4D GCTGTGTGAT AGTA/---- AGAGCATTAT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 AGTA 1 0 174916 CASAVA_Build 3 149904303 1I CCCTCATAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 8 9 174917 CASAVA_Build 3 149905917 4I AATCTAACTC ----/TCTT TCCCATTCAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 TCTT 0 1 174918 CASAVA_Build 3 149908089 1I3M9D CTTACATTTA -TAGACATTTCTT/GTAG--------- ACATGTCTAT 3070 het 3070 ref 43 29 18 3 N/A 0 0 174919 CASAVA_Build 3 149909646 2D GAATCTGGAC TG/-- TGCAGATTTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 TG 2 1 174920 CASAVA_Build 3 149917607 1I TATTGCTCAC -/A ACACTTAGAC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 1 2 174921 CASAVA_Build 3 149917779 1I TTAATCCAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 9 10 174922 CASAVA_Build 3 149919771 1I ATTTCATAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 9 10 174923 CASAVA_Build 3 149920829 1I CATACCAAAT -/C TATTAAAATT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 0 1 174924 CASAVA_Build 3 149921193 5D TTTTTTACTC ACGTT/----- ACTACTTTAG 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 ACGTT 1 0 174925 CASAVA_Build 3 149926692 1D AGTCTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1308 hom 20 5 10 5 T 13 12 174926 CASAVA_Build 3 149929491 3I CTTTGAGAAC ---/AAG AAGAGCCTCA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 AAG 1 2 174927 CASAVA_Build 3 149944172 1D GAGCATTCAA G/- TATGTGAATC 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 G 1 0 174928 CASAVA_Build 3 149948949 1I CAGAGATAAG -/C CCTCCTAGAG 3070 hom 141 het 53 0 47 6 C 2 3 174929 CASAVA_Build 3 149949938 1D CCTATGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 49 3 35 12 A 12 11 174930 CASAVA_Build 3 149951699 1D AAGCTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 210 hom 25 4 11 10 A 17 16 174931 CASAVA_Build 3 149971350 2D TATGTCCCCC CT/-- CCCCCGTGCC 3070 hom 71 het 32 0 25 7 CT 1 0 174932 CASAVA_Build 3 149971829 2I ATAAATCTTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 119 het 47 0 39 8 A 13 15 174933 CASAVA_Build 3 149981481 1I TTCCATGGTG -/T TATATGTGCC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 1 2 174934 CASAVA_Build 3 149999496 1D AAACCTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1025 hom 35 3 17 15 A 16 15 174935 CASAVA_Build 3 150002352 1D TCTGCACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 10 12 9 A 12 11 174936 CASAVA_Build 3 150005314 2D GGGGGGGGGG GC/-- TTTATTGGTT 3070 het 22 hom 25 1 14 10 GC 1 0 174937 CASAVA_Build 3 150014406 1I AAGAGATGTT -/G GGGGGTAATT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 5 6 174938 CASAVA_Build 3 150015092 4I AATTTCAGTT ----/AGAC AGAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AGAC 0 1 174939 CASAVA_Build 3 150018838 1I ATTCTCTATT -/A AATAATACTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 2 3 174940 CASAVA_Build 3 150024853 2I CAGCTGTAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 879 hom 37 2 23 12 T 15 17 174941 CASAVA_Build 3 150034436 2I CACAGTGTCA --/AT ATATACCCAT 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 AT 2 3 174942 CASAVA_Build 3 150039470 12I AAAAACTCTA ------------/TATCCTAATCCC CAGAACATGT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 TATCCTAATCCC 0 1 174943 CASAVA_Build 3 150040791 4I GAAAGACCAA ----/AGAT AGATAGGTTT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 AGAT 1 2 174944 CASAVA_Build 3 150042700 1I TCATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 11 12 174945 CASAVA_Build 3 150062010 4I19M1D TCATTTAAAT ----AGACAGAGAACCATATGTGA/AGAGAGACAGAGAACCATATGTG- AAAAAAAAAA 3070 het 1803 hom 42 6 19 24 N/A 0 0 174946 CASAVA_Build 3 150068752 1I AAGAGAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 10 174947 CASAVA_Build 3 150076681 2D AACTGGTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AT 7 6 174948 CASAVA_Build 3 150079506 1D TCTCTGGTAT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 8 7 174949 CASAVA_Build 3 150090993 1I CTGAAAAAGA -/C AAAGTTAAGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 0 1 174950 CASAVA_Build 3 150092524 5I CTGTTAATAA -----/CTCTT CTTCTTGCCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CTCTT 0 1 174951 CASAVA_Build 3 150093334 23I AGGCGCCTGT -----------------------/AGTCCCGGCTACTTGGGAGGCTG AGAGAGGAGA 1564 hom 10 het 9 0 4 6 AGTCCCGGCTACTTGGGAGGCTG 0 1 174952 CASAVA_Build 3 150094945 2D CAGAAAGAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 39 1 32 6 A 13 11 174953 CASAVA_Build 3 150095138 1I TACTATGCCA -/T TAGGAAGAAT 3070 hom 154 het 54 0 52 2 T 1 2 174954 CASAVA_Build 3 150096336 5D TAAATGCAAT TATGA/----- TATGTATATG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TATGA 1 0 174955 CASAVA_Build 3 150096640 1I GTTTTTCCCT -/G GGTGGTTTTC 3070 hom 148 het 58 0 50 8 G 2 3 174956 CASAVA_Build 3 150098647 4D ACTCATTCAC ACTT/---- ACTTACTCAA 3070 hom 138 het 52 0 46 6 ACTT 2 1 174957 CASAVA_Build 3 150099513 2D GATACACAAA AT/-- ATATATGTGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AT 4 3 174958 CASAVA_Build 3 150100487 6D TATAATAGGT TTGAAG/------ CAGGCAGTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 9 TTGAAG 1 0 174959 CASAVA_Build 3 150101113 12D AAAAACAGAA ATATTAAACTGC/------------ ATACTAACTC 3070 hom 48 het 15 0 17 1 ATATTAAACTGC 1 0 174960 CASAVA_Build 3 150103321 1D32M1D AGAACTCTGA TTTTTTTTTCTTATTCAAAAAACCTCTAATTTCT/-TTTTTTTTCTTATTCAAAAAACCTCTAATTTC- TTTTTTTTTA 3070 hom 41 het 22 0 14 13 N/A 0 0 174961 CASAVA_Build 3 150103401 2I ATAATTAAAT --/AA TTTCACAGGG 3070 hom 33 het 19 0 12 7 A 0 2 174962 CASAVA_Build 3 150104110 1I GTTTATTGGC -/A AAAAAAATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 8 174963 CASAVA_Build 3 150105563 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTGTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 4 5 174964 CASAVA_Build 3 150107964 3I TGCCTTCCAA ---/AAG GCACTATGAG 3070 hom 75 het 26 0 25 1 AAG 0 1 174965 CASAVA_Build 3 150113528 1I TTCTAAAAAA -/T ATCCATGTCT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 0 1 174966 CASAVA_Build 3 150133442 1D TTTAGGGGTG A/- TTTCTACGGC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 1 0 174967 CASAVA_Build 3 150134320 24D CAGTTAAATT CACCTTATTTTGATTTAGAACTCC/------------------------ CACCTCATAT 3070 het 3070 ref 39 25 19 4 CACCTTATTTTGATTTAGAACTCC 1 0 174968 CASAVA_Build 3 150148367 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2577 hom 24 8 11 5 A 11 10 174969 CASAVA_Build 3 150149294 2D AAAAGGATTT TA/-- TCAGGTGCTA 3070 het 3070 ref 35 19 15 3 TA 1 0 174970 CASAVA_Build 3 150184652 2I AAGAAATGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 10 12 174971 CASAVA_Build 3 150191097 6I AACAGGTTAG ------/CCAAAA CATTGGCTAA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 CCAAAA 0 1 174972 CASAVA_Build 3 150191359 5I TACAAGAAAA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 2851 het 2851 ref 29 14 8 7 AAAAG 3 4 174973 CASAVA_Build 3 150191567 12D GAGTACACTA AGGAATGATTAT/------------ AGAGGCTGAT 3070 het 3070 ref 39 31 10 4 AGGAATGATTAT 1 0 174974 CASAVA_Build 3 150195002 1D CTAGGAGGGG A/- AAGAAGGAGT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 3 2 174975 CASAVA_Build 3 150230953 3I GAAGCAAGCT ---/GTC GTCCTCCCTT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 GTC 1 2 174976 CASAVA_Build 3 150247689 5I TGAACCACAT -----/TAGTC TACATCTTGC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 TAGTC 0 1 174977 CASAVA_Build 3 150265544 1I GGGTTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2757 hom 31 9 11 11 A 13 14 174978 CASAVA_Build 3 150281743 1D AAAACACACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 12 10 A 13 12 174979 CASAVA_Build 3 150318705 1D TCGATGACCA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 51 25 16 10 T 7 6 174980 CASAVA_Build 3 150331600 1D AGTTTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 775 hom 26 4 14 8 A 18 17 174981 CASAVA_Build 3 150350983 1D GTCACCCCTG C/- CCATTGCCCT 3070 het 3070 ref 43 17 18 9 C 3 2 174982 CASAVA_Build 3 150351490 1D TGATTTTAAC T/- TTTAATTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 T 4 3 174983 CASAVA_Build 3 150361943 4I GAATAATAAT ----/AAAA AAAATCTGTA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 4 8 174984 CASAVA_Build 3 150365962 1I ACTTTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 T 11 12 174985 CASAVA_Build 3 150367919 3D ATGGTATATT ATC/--- ATCATTAAAC 3070 het 3070 hom 56 18 29 11 ATC 2 1 174986 CASAVA_Build 3 150368470 1I GGTAAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 10 11 174987 CASAVA_Build 3 150371904 4I CTTATCCTAT ----/CAAA CAATCTTTAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 CAAA 0 1 174988 CASAVA_Build 3 150392971 1I TACAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 10 11 174989 CASAVA_Build 3 150395092 1I GCGTAATCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 83 het 35 0 26 9 A 9 10 174990 CASAVA_Build 3 150397215 1I32M1I ACTTAAAAGT -AAAAAAAAATTGAGAAGCCTTTGATTAATTTG-/AAAAAAAAAATTGAGAAGCCTTTGATTAATTTGA AAACTTATAA 3070 hom 93 het 31 0 32 6 N/A 0 0 174991 CASAVA_Build 3 150420968 1I AAACCAGGTT -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 6 7 174992 CASAVA_Build 3 150434754 1D ATATGTAGGC T/- TTTGCTTTAA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 4 3 174993 CASAVA_Build 3 150436639 3D ACAAACAGAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 AAC 4 3 174994 CASAVA_Build 3 150445543 2I ACACAATATG --/TA TATATATATA 3070 het 2769 hom 29 7 16 6 TA 5 6 174995 CASAVA_Build 3 150455167 1D GATTAAATGT A/- AAAATTATAT 1711 het 1711 ref 9 4 4 1 A 5 4 174996 CASAVA_Build 3 150469708 1I GTGAGTGGTT -/C TTCTTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 28 15 4 C 0 1 174997 CASAVA_Build 3 150474420 1I AGGCAGTATA -/T TAATAGGCTA 3070 het 3070 ref 47 28 13 6 T 1 2 174998 CASAVA_Build 3 150475463 1I CTTCCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 T 13 14 174999 CASAVA_Build 3 150481364 3D GAAGCTTATT AAG/--- TTCTCTTTTA 3070 het 3070 hom 27 10 15 5 AAG 1 0 175000 CASAVA_Build 3 150481723 3I GGAAGACACT ---/GAA GAACAGTAAG 3070 het 3070 ref 59 31 16 12 GAA 1 2 175001 CASAVA_Build 3 150483909 4D GATTTTTTTC TCTT/---- TCTATTTTAT 3070 het 3070 ref 20 13 7 0 TCTT 1 0 175002 CASAVA_Build 3 150484050 1D CTAAGATAGG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 8 7 175003 CASAVA_Build 3 150487332 2D TTGCTTAGAA AT/-- ATATATATAT 1417 het 1417 ref 28 20 3 5 AT 8 7 175004 CASAVA_Build 3 150489391 1I GGCCAAGGAG -/T TTCAGCTCAG 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 2 3 175005 CASAVA_Build 3 150495152 2D TATAATACAC AT/-- GTTTAATCCA 3070 het 3070 ref 32 18 12 4 AT 1 0 175006 CASAVA_Build 3 150506301 1I AGGGTAAAAG -/T TTTTTCTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 T 5 6 175007 CASAVA_Build 3 150518040 2D TGGAGAAAAC AT/-- ATACTTTTAC 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 AT 2 1 175008 CASAVA_Build 3 150534457 1I GCAAGGGATA -/C AGAAAGGACT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 0 1 175009 CASAVA_Build 3 150547159 1D TTGCTTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 11 10 175010 CASAVA_Build 3 150559513 1D AAAAACTGTC T/- TTTCTCTATT 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 T 4 3 175011 CASAVA_Build 3 150603955 1I AATAGCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 28 5 T 11 12 175012 CASAVA_Build 3 150617691 2D TGTTTTCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2652 hom 34 13 15 9 T 12 10 175013 CASAVA_Build 3 150620961 1D CCTTGGCTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 13 10 3 A 10 9 175014 CASAVA_Build 3 150641895 2D CACAAGTGTT AG/-- AGAGCCAGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 AG 3 2 175015 CASAVA_Build 3 150647655 1D ATTACAGGCG T/- TGAGCCACCG 3070 hom 79 het 31 0 28 4 T 2 1 175016 CASAVA_Build 3 150650072 2I CCTTAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 675 hom 44 7 23 14 A 10 12 175017 CASAVA_Build 3 150656928 1I TCTAGAGAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 8 9 175018 CASAVA_Build 3 150658252 36I TATTCTTTAT ------------------------------------/TACTTCTAGTTCTTTCATTTGTCAGAAAGAAGAAAG GATCTAAATT 3070 hom 42 het 16 0 14 3 TACTTCTAGTTCTTTCATTTGTCAGAAAGAAGAAAG 0 1 175019 CASAVA_Build 3 150658527 1I TGAGATTAAT -/A AAGGAAGGGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 175020 CASAVA_Build 3 150661524 1I GATGCCAAAT -/A CCTGGACTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 175021 CASAVA_Build 3 150675542 1I AGTAGGGAAG -/C CTTAAAATCC 3070 hom 117 het 44 0 38 6 C 1 2 175022 CASAVA_Build 3 150676952 9I CCATCGATCT ---------/TTTAGTAGG TGAACTAGAG 3070 hom 117 het 43 0 36 7 TTTAGTAGG 0 1 175023 CASAVA_Build 3 150678465 1D TGGCTAATAT A/- AAAATAAGGG 3070 hom 75 het 26 0 26 1 A 5 4 175024 CASAVA_Build 3 150679844 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 21 1 16 4 T 14 15 175025 CASAVA_Build 3 150680613 3D CAAAAATAGT AAG/--- AACCCCGGCC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 AAG 1 0 175026 CASAVA_Build 3 150680678 1D GATTCCCAGT G/- GCTTCTTGGC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 G 2 1 175027 CASAVA_Build 3 150681759 10I GGTGTAAGGG ----------/AAGAGGAGGA AAGTACCAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAGAGGAGGA 0 1 175028 CASAVA_Build 3 150683627 4I ACTCAGAACC ----/TATT TATTTCTGAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TATT 1 2 175029 CASAVA_Build 3 150683946 1I CAACTATAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 34 het 17 0 12 5 A 8 9 175030 CASAVA_Build 3 150691773 1D GCCCCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 12 11 175031 CASAVA_Build 3 150711106 18D TTTTCCCTCC CTCTTTCTTTCTTTCCTT/------------------ CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 25 12 8 6 CTCTTTCTTTCTTTCCTT 1 0 175032 CASAVA_Build 3 150720444 1I CAACATCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 25 1 22 2 A 11 12 175033 CASAVA_Build 3 150724805 6D TCTTTTATGG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 17 0 14 4 T 18 12 175034 CASAVA_Build 3 150727631 6D TTTTCTTTTC TTTCTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 31 0 24 8 TTTCTT 1 0 175035 CASAVA_Build 3 150736187 1I GTCTTCACTT -/A AAAAAAAAAA 3023 hom 12 het 21 0 14 7 A 15 16 175036 CASAVA_Build 3 150741661 1D TTTTCTCCCC A/- AAAATGTAGC 3070 hom 89 het 33 0 30 3 A 5 4 175037 CASAVA_Build 3 150767290 1D CCCTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2395 het 2395 ref 45 27 8 11 A 15 14 175038 CASAVA_Build 3 150779988 4I TCCAGAAGAA ----/ATAT ATGTTCCACA 2829 het 2829 ref 28 14 7 7 AT 1 3 175039 CASAVA_Build 3 150783038 1I TCTTATCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3020 hom 21 8 10 3 A 13 14 175040 CASAVA_Build 3 150789342 1D TCTCTGCCTT A/- ACTGTGAGTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 6 A 2 1 175041 CASAVA_Build 3 150790273 4D TGAATTAAAG GAAT/---- GAATGAATGA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 GAAT 5 4 175042 CASAVA_Build 3 150802188 1D AAAAAAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 12 11 175043 CASAVA_Build 3 150823369 3I CTTGTCTCAA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 AAT 5 6 175044 CASAVA_Build 3 150876746 1I GGAAAGAGAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 A 8 9 175045 CASAVA_Build 3 150921741 21D TTGTTATGTT GAGTTAGTTTCCTTCTATTCA/--------------------- GAGTTTACTG 3070 het 3070 ref 32 24 12 6 GAGTTAGTTTCCTTCTATTCA 1 0 175046 CASAVA_Build 3 150968592 1I TGAAACAAGT -/G GGGGAGGGGG 3070 het 3070 hom 40 16 14 10 G 4 5 175047 CASAVA_Build 3 150969065 1D GTTGCTCAGG C/- TGGAGTGCAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 C 1 0 175048 CASAVA_Build 3 150970519 1D AAGATTGAAG A/- CCTTTATAAT 3070 het 3070 ref 38 22 10 7 A 1 0 175049 CASAVA_Build 3 150977282 2D TATAAAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 AC 10 9 175050 CASAVA_Build 3 150977454 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 15 11 A 12 11 175051 CASAVA_Build 3 150983430 1D AGTCTGTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 10 9 175052 CASAVA_Build 3 150989536 3I CAGGTGTGAG ---/CCA CCACCACACC 3070 het 1887 hom 15 5 7 3 CCA 2 3 175053 CASAVA_Build 3 150996838 1I AAATAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 10 11 175054 CASAVA_Build 3 150997254 1I CTAGAGGCCC -/T TTTTTGAGTT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 5 6 175055 CASAVA_Build 3 150998196 1D CAGCACTGAG C/- CCCTAATACG 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 C 4 3 175056 CASAVA_Build 3 151015411 1D GTTTTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 17 15 T 13 12 175057 CASAVA_Build 3 151016996 1D TGCCTTAGCC T/- TTTTTTTTTT 1387 het 1387 ref 24 14 4 6 T 13 12 175058 CASAVA_Build 3 151019913 4I TGGATCATAA ----/TAGT TACTCACTTT 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 TAGT 0 1 175059 CASAVA_Build 3 151022092 1D ATTATGTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 71 het 37 0 30 7 T 10 9 175060 CASAVA_Build 3 151040081 4D CATGAGACTT ACTC/---- ACTCTCATGA 3070 het 3070 ref 30 17 13 2 ACTC 2 1 175061 CASAVA_Build 3 151049848 1D GTAGTGATTA T/- TGAGGGCCAG 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 T 2 1 175062 CASAVA_Build 3 151050460 1I CTACTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 1301 het 1301 ref 31 17 4 10 T 15 16 175063 CASAVA_Build 3 151054166 3D TAGTTAAAAA TTC/--- TTCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 TTC 2 1 175064 CASAVA_Build 3 151056922 1D TGAAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 2675 het 1606 hom 29 7 8 15 T 17 16 175065 CASAVA_Build 3 151060339 1I TCACAGAAAT -/A AGAAAAAACT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 1 2 175066 CASAVA_Build 3 151095923 2D TATAACATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 31 1 17 13 T 18 16 175067 CASAVA_Build 3 151102490 4I TTATGAAGAA ----/AGTT AAGTTGATTA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 AGTT 0 1 175068 CASAVA_Build 3 151106761 3D TGAATAATGC TTT/--- TTTTTTCACT 2140 het 2140 ref 36 23 5 12 T 9 6 175069 CASAVA_Build 3 151109755 1I GCTCAAAACC -/T TTTTTTTTTT 2573 het 2573 ref 41 15 10 16 T 15 16 175070 CASAVA_Build 3 151110430 1I AAAAGAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 11 12 175071 CASAVA_Build 3 151115204 3D CTGAGGTCAG CCT/--- GAGTTCAAGA 1334 het 964 hom 9 3 4 2 CCT 1 0 175072 CASAVA_Build 3 151116564 1D TCTAAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 12 11 175073 CASAVA_Build 3 151132494 1I AATAACAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 14 18 5 T 9 10 175074 CASAVA_Build 3 151133755 1D TTTTTTTTTT A/- AATTGTCTTG 2883 het 556 hom 24 5 12 7 A 3 2 175075 CASAVA_Build 3 151149907 3D ACTGGGTTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2106 hom 26 9 8 10 T 14 11 175076 CASAVA_Build 3 151150763 4D TATCTGAGTC TGTT/---- TGTGATGCCT 3070 het 3070 ref 40 22 13 9 TGTT 1 0 175077 CASAVA_Build 3 151157876 1I AGCAACTAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 T 9 10 175078 CASAVA_Build 3 151159886 3D ATAAATTTCT ATG/--- ATTATAAAAC 3070 het 3070 hom 22 10 12 1 ATG 1 0 175079 CASAVA_Build 3 151161839 1I GCCAAAACAT -/A AAAAAAAAAA 1424 het 1424 ref 24 10 4 10 A 13 14 175080 CASAVA_Build 3 151164045 1D GTAGAAAGCC A/- ATGAATAGTT 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 A 2 1 175081 CASAVA_Build 3 151169058 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAT 3070 het 311 hom 30 2 21 7 C 1 0 175082 CASAVA_Build 3 151173175 3I GTATGTACAT ---/TTA TTATTGTGCT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TTA 1 2 175083 CASAVA_Build 3 151175306 1D TGTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 12 9 T 12 11 175084 CASAVA_Build 3 151180588 1I ATAGAATGGA -/G GTACCAGGCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 1 2 175085 CASAVA_Build 3 151201243 1D GGTTACAAGA G/- GATTTGTGAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 2 1 175086 CASAVA_Build 3 151204125 1I CTCTTTTCAC -/T TTGGGCTCCC 3070 hom 111 het 45 0 36 9 T 2 3 175087 CASAVA_Build 3 151213156 4D AGTTTGTTTG TTTT/---- TTATTAAAAA 3070 het 3070 ref 53 28 20 6 T 6 2 175088 CASAVA_Build 3 151215895 4I TTCACCAGTC ----/GTCT GTCTCACAGA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 GTCT 1 2 175089 CASAVA_Build 3 151223499 1I CTCAGACACA -/C CTATCCCTGT 3070 hom 101 het 39 0 31 8 C 1 2 175090 CASAVA_Build 3 151224102 2D GTATGACAAA AC/-- ACAGTTCTTT 3070 het 3070 ref 37 22 13 4 AC 2 1 175091 CASAVA_Build 3 151231648 4D TTTTTACATC CTAA/---- CTGACTGTGT 3070 het 3070 ref 52 25 23 9 CTAA 1 0 175092 CASAVA_Build 3 151235422 2I CACATTTGTG --/CA CACACACAGG 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 CA 4 5 175093 CASAVA_Build 3 151238479 5D AAGAAAATAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 1910 hom 21 7 11 5 AAAAG 3 2 175094 CASAVA_Build 3 151251727 1D ATATGATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 43 1 36 6 T 11 10 175095 CASAVA_Build 3 151253115 2I GTTTTAACAC --/TT GTTTTAACTG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 0 2 175096 CASAVA_Build 3 151264749 1I TCTTAGTTAG -/A AAAAAATACA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 6 7 175097 CASAVA_Build 3 151265183 1D TGTTCATTGT A/- AAAAAAAAAA 1588 het 1588 ref 14 9 4 1 A 11 10 175098 CASAVA_Build 3 151267284 1D ATTCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 29 1 15 13 T 12 11 175099 CASAVA_Build 3 151276807 1I GGTGACGTGA -/C CCCCGAATGA 3070 het 3070 hom 54 20 25 9 C 4 5 175100 CASAVA_Build 3 151277003 4D GCCACCACAT AGAG/---- AGATTACGTT 3070 het 3070 hom 53 24 24 9 AG 3 1 175101 CASAVA_Build 3 151279865 2D AGATCTGAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 AT 6 5 175102 CASAVA_Build 3 151289934 1I CATGGTTTAT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 7 8 175103 CASAVA_Build 3 151297518 1D ATAATGACTA T/- TTTTTCTTAG 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 T 6 5 175104 CASAVA_Build 3 151310081 4D GGTTGTTATT TTTC/---- TATTGTTGAG 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 TTTC 1 0 175105 CASAVA_Build 3 151319260 2I AAAAGTCAAA --/CT CTTTAAAATA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 CT 1 2 175106 CASAVA_Build 3 151325343 1D TGTTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 854 hom 32 2 26 5 A 11 10 175107 CASAVA_Build 3 151327219 1I TTTAGTGCAC -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 7 8 175108 CASAVA_Build 3 151332017 4I CAGCAAGAGG ----/GTAA GTGTTAGATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GTAA 0 1 175109 CASAVA_Build 3 151334458 1D ACAGGAGGGA C/- CCTGTGGGAG 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 C 3 2 175110 CASAVA_Build 3 151335880 76I ATTCCAGAGA ----------------------------------------------------------------------------/TTCCCAAAAGGCTCATAAACACATCTTAGTTGCTACATGAGGCATGTTGGATATCCAGAAAATAAAGTCTTAATTT GTAAAGTGAG 3070 hom 51 het 14 0 17 6 TTCCCAAAAGGCTCATAAACACATCTTAGTTGCTACATGAGGCATGTTGGATATCCAGAAAATAAAGTCTTAATTT 0 1 175111 CASAVA_Build 3 151340013 4I ATGAAATGAA ----/TATT TATTTACGTA 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 TATT 1 2 175112 CASAVA_Build 3 151343150 1D CTGCAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2610 hom 37 12 14 11 A 15 14 175113 CASAVA_Build 3 151352287 1D TTTGTAGTTC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 9 8 175114 CASAVA_Build 3 151352555 5D GAAGAAAGAT ATAAC/----- ATATTAACAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATAAC 1 0 175115 CASAVA_Build 3 151354601 4D CATATATATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 32 0 23 9 TG 11 9 175116 CASAVA_Build 3 151362352 2D GATATTATTC TG/-- TGTTTCTTCT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 TG 2 1 175117 CASAVA_Build 3 151370078 3D AATAAATTCA AAC/--- AACGAGTCAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 6 AAC 2 1 175118 CASAVA_Build 3 151377848 1I GTTGATCATA -/T TAACCTGGGC 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 T 1 2 175119 CASAVA_Build 3 151392784 3D CACTGTACTA CTT/--- CACAGTTAAT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 CTT 1 0 175120 CASAVA_Build 3 151401406 1D ATTAAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 19 10 T 11 10 175121 CASAVA_Build 3 151403598 4I ACAAGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTTAT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 TTTG 1 2 175122 CASAVA_Build 3 151408564 1D AGTATTTATT A/- AAAAAAAAAA 1551 het 1551 ref 36 24 4 8 A 11 10 175123 CASAVA_Build 3 151409786 1D TGGGGCCCCC G/- TGATGAGATT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 G 1 0 175124 CASAVA_Build 3 151410872 1D AGCTCAGAAG C/- TGCATTATCC 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 C 1 0 175125 CASAVA_Build 3 151433011 1I CTATTTGGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 9 175126 CASAVA_Build 3 151452202 16D CTTTGGTTGG CTTGGTATTTATGTGT/---------------- CCAGTTCAGA 3070 het 3070 ref 44 27 17 2 CTTGGTATTTATGTGT 1 0 175127 CASAVA_Build 3 151487781 2D TAGAGTTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 49 1 40 8 A 12 10 175128 CASAVA_Build 3 151491536 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1372 het 1333 hom 15 6 5 4 T 14 13 175129 CASAVA_Build 3 151496118 1I CTTCCAAACT -/A TTCTTCCTGT 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 A 0 1 175130 CASAVA_Build 3 151498775 1I TTAGGCTTTT -/A AAGAAATTCT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 2 3 175131 CASAVA_Build 3 151501571 1I ATTATCAGTA -/T TGATAAGAAA 3070 hom 154 het 58 0 52 6 T 1 2 175132 CASAVA_Build 3 151503105 1D ATCATCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 23 6 T 13 12 175133 CASAVA_Build 3 151515233 1D TAGCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2143 het 2143 ref 34 12 12 10 T 13 12 175134 CASAVA_Build 3 151516654 1D GTTTTAGAGC T/- GCCAGAAGGA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 1 0 175135 CASAVA_Build 3 151517056 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 11 10 175136 CASAVA_Build 3 151527913 1I CCTGTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1332 hom 20 4 13 3 T 13 14 175137 CASAVA_Build 3 151536812 1D TTTTACTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 25 1 15 9 T 15 14 175138 CASAVA_Build 3 151537950 2I CTATAAGAAT --/TA TCTCTGACAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TA 0 1 175139 CASAVA_Build 3 151542085 1D AGGCTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 12 11 175140 CASAVA_Build 3 151546242 1D AAATTTTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 9 175141 CASAVA_Build 3 151549151 2D ATGTCAAGTT GC/-- GTGCGCCAAG 3070 hom 100 het 41 0 33 8 GC 1 0 175142 CASAVA_Build 3 151550115 2D ATGAGGTGGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 37 0 28 11 T 11 9 175143 CASAVA_Build 3 151553135 7D TAATAGTATT AATAGTA/------- TTAAAAGCAT 3070 hom 66 het 27 0 23 8 AATAGTA 1 0 175144 CASAVA_Build 3 151568158 1I TTGGTTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 422 hom 42 2 33 7 T 9 10 175145 CASAVA_Build 3 151576645 1I ATTTTCCTAC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 8 175146 CASAVA_Build 3 151580802 4D ATAAATATAT ATAA/---- ATATATACTA 3070 hom 57 het 21 0 20 3 ATAA 1 0 175147 CASAVA_Build 3 151595709 1D AGACCAACCT G/- GGACAACAAA 3070 hom 88 het 38 0 28 10 G 3 2 175148 CASAVA_Build 3 151603714 1D ACGGGCTGAT G/- TTTTTTTTCC 3070 het 342 hom 34 1 28 5 G 1 0 175149 CASAVA_Build 3 151616852 1D GTAATTCCTT A/- AATTGGAAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 3 2 175150 CASAVA_Build 3 151640931 1D TATATGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 11 10 175151 CASAVA_Build 3 151641151 3I GCGAATAATT ---/CTA CTGAGAAACC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 CTA 0 1 175152 CASAVA_Build 3 151656658 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 973 hom 27 3 20 4 T 14 13 175153 CASAVA_Build 3 151661325 4D AACACTTCAT AAAC/---- AAAGTAATAG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AAAC 1 0 175154 CASAVA_Build 3 151671388 2D TATTTTTAGT AG/-- AGACGGGGTC 3070 hom 30 het 11 0 11 1 AG 2 1 175155 CASAVA_Build 3 151671643 1D TAGCTGGGAC T/- TACAGGCACA 3070 hom 42 het 19 0 14 5 T 2 1 175156 CASAVA_Build 3 151672634 1I AGTAAATGCT -/G GCTCTTGTTT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 G 1 2 175157 CASAVA_Build 3 151674732 1I AAAGCTAGGA -/T TTTTTTGATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 6 7 175158 CASAVA_Build 3 151678117 4D TGCTTTTATT AGTC/---- AGTCAATCTC 3070 hom 141 het 49 0 47 2 AGTC 2 1 175159 CASAVA_Build 3 151682686 4D TGACAGTTAC TTTT/---- TTTATTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 27 4 T 7 3 175160 CASAVA_Build 3 151693369 1D AATTATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 29 2 20 7 T 15 14 175161 CASAVA_Build 3 151693595 1D CCAAAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 19 1 11 7 T 13 12 175162 CASAVA_Build 3 151693663 1D TTTAATACTC T/- TAAGTTTTAG 2727 hom 15 het 8 0 6 2 T 2 1 175163 CASAVA_Build 3 151695828 2I CTGTGTCTGC --/TT TTTGTTCTTC 3070 hom 82 het 36 0 28 8 T 3 5 175164 CASAVA_Build 3 151703275 1D ATTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 1771 het 259 hom 27 2 6 19 T 17 16 175165 CASAVA_Build 3 151706663 1D AAAAAACTCC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 9 8 175166 CASAVA_Build 3 151717067 11D GCTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 35 0 26 14 A 20 9 175167 CASAVA_Build 3 151728557 4I GAAGAAGACT ----/TAAA AGATCATCAG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TAAA 0 1 175168 CASAVA_Build 3 151729363 1I TTACCCTTTA -/C CCAGATTTAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 2 3 175169 CASAVA_Build 3 151730355 1I CTAGATACTT -/A AAAACGCAAG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 4 5 175170 CASAVA_Build 3 151733837 1D CTGTTGCAAA G/- GCTAAGTTCT 3070 hom 94 het 37 0 30 8 G 2 1 175171 CASAVA_Build 3 151741041 1I CCCACCTCTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 2904 hom 19 7 10 2 T 6 7 175172 CASAVA_Build 3 151744248 1D AACGATCAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 T 10 9 175173 CASAVA_Build 3 151745558 1D AGGAAAGACC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 28 13 10 5 T 8 7 175174 CASAVA_Build 3 151750619 4I TTGTTGTCTT ----/AATG AAAAGAACTG 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 AATG 0 1 175175 CASAVA_Build 3 151757099 4I GGGAATAGAT ----/AAAC AAAATTGGCT 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 AAAC 0 1 175176 CASAVA_Build 3 151767249 6D AAAAAGTAAC ACTGTT/------ ACTGAAAATA 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 ACTGTT 1 0 175177 CASAVA_Build 3 151769898 1D TGCTAACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 T 12 11 175178 CASAVA_Build 3 151782959 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 55 hom 10 1 9 0 T 6 7 175179 CASAVA_Build 3 151783578 4D AAATCTAAGA TAAT/---- TAATCTCCTT 3070 het 3070 ref 48 25 19 6 TAAT 2 1 175180 CASAVA_Build 3 151786004 4D TCACACACAC ACAA/---- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 ACAA 1 0 175181 CASAVA_Build 3 151789000 1D CTGGGGGAAG A/- AAGTCTTTGC 3070 het 3070 hom 45 18 25 2 A 3 2 175182 CASAVA_Build 3 151789325 5D TACTATACTA TACTT/----- GTTATTTTAG 3070 het 3070 ref 42 23 18 5 TACTT 1 0 175183 CASAVA_Build 3 151789570 1D TTTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1717 het 1717 ref 21 12 7 2 A 13 12 175184 CASAVA_Build 3 151794258 8I2M4I AATCACTTCA --------AC----/GGAAAATCACTTCT CTAGGAAGCA 3070 het 3070 ref 29 16 13 1 N/A 0 0 175185 CASAVA_Build 3 151796474 7D ACAACTTGAT TTTGTTG/------- TAATCAATAT 3070 het 3070 ref 35 17 17 6 TTTGTTG 1 0 175186 CASAVA_Build 3 151797645 1D CCAAAAAAAA C/- AAAAAAACAA 3070 het 2987 hom 32 10 16 6 C 1 0 175187 CASAVA_Build 3 151798785 1I ATCTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3043 het 1633 hom 23 8 9 6 A 11 12 175188 CASAVA_Build 3 151799899 1I ACTATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 11 12 175189 CASAVA_Build 3 151800725 4D GGTAATTAAT AAAG/---- ACAGAGATTT 3070 het 3070 ref 30 19 10 3 AAAG 1 0 175190 CASAVA_Build 3 151806116 1I CCGGAGATCA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 6 7 175191 CASAVA_Build 3 151806628 1D TCTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1414 het 1414 ref 32 10 6 16 T 15 14 175192 CASAVA_Build 3 151807037 2D CGTTTAACAC TT/-- AACATAGAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 2 0 175193 CASAVA_Build 3 151814487 1I TTTAGGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 T 11 12 175194 CASAVA_Build 3 151818261 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 9 10 175195 CASAVA_Build 3 151824070 2I ATCAAAACTC --/CT CTCTCTCTTT 3070 hom 69 het 33 0 23 10 CT 4 5 175196 CASAVA_Build 3 151826348 1D AAACAATAAC T/- TTTTTTTTTT 1757 het 683 hom 25 8 6 11 T 17 16 175197 CASAVA_Build 3 151831354 1D AAATATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 12 11 175198 CASAVA_Build 3 151836215 1D AAATGTGACC A/- AAAAAAAAAA 2287 het 2208 hom 41 10 8 23 A 17 16 175199 CASAVA_Build 3 151851312 1I TAAAATTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 10 11 175200 CASAVA_Build 3 151851627 4I AATTTCTAGG ----/TTGT TTGTGTTAAG 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 TTGT 1 2 175201 CASAVA_Build 3 151855706 1I TGTTGCCCAT -/G GCTGGTTTCA 2695 het 2695 ref 22 8 8 6 G 1 2 175202 CASAVA_Build 3 151857322 1I GTTTCAGGGT -/A AAGATTTTGG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 2 3 175203 CASAVA_Build 3 151857825 1I AGGCAAAATG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 6 7 175204 CASAVA_Build 3 151864026 1I GAACCCCCTG -/C CCCCCACCCC 2349 het 2257 hom 28 9 9 10 C 5 6 175205 CASAVA_Build 3 151867805 1D ATACAGAAGA G/- TAGATTAATC 3070 het 3070 ref 43 21 17 7 G 1 0 175206 CASAVA_Build 3 151873131 1D TTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 11 10 175207 CASAVA_Build 3 151876185 3I TTGGCCATTG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 12 15 175208 CASAVA_Build 3 151889715 1I AAGGAAGTCA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 7 8 175209 CASAVA_Build 3 151896732 1I AATTTGGGGG -/A AAAAGGATGG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 4 5 175210 CASAVA_Build 3 151901855 3I TGTCATTTTA ---/AAT AATAATGGAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AAT 2 3 175211 CASAVA_Build 3 151902307 1I CCAATAAAAG -/C CTATATTCAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 1 2 175212 CASAVA_Build 3 151905665 2D TCTTACCCTG TC/-- GCTCAGGCTG 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 TC 1 0 175213 CASAVA_Build 3 151906747 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 12 11 175214 CASAVA_Build 3 151907173 2D CCACTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 19 0 12 7 T 12 10 175215 CASAVA_Build 3 151918885 1D AATTATTATT A/- TTTTTTTTTC 2941 het 1716 hom 18 7 8 3 A 1 0 175216 CASAVA_Build 3 151919568 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 8 175217 CASAVA_Build 3 151925583 1D CAGACAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 8 6 A 13 12 175218 CASAVA_Build 3 151929086 1D CAGGCGTGAG C/- CACCGTGCCT 1672 het 1672 ref 15 7 4 5 C 2 1 175219 CASAVA_Build 3 151959047 1D AGACATTCCA T/- TTTTTTTTTT 1603 het 1192 hom 28 9 6 13 T 19 18 175220 CASAVA_Build 3 151967298 1D AATTCAAATC T/- TTTTTTTTTT 1788 het 1788 ref 34 19 5 10 T 15 14 175221 CASAVA_Build 3 151969511 1I CACTGAAGCC -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 6 7 175222 CASAVA_Build 3 151989960 1D AAGTTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 A 11 10 175223 CASAVA_Build 3 152004812 4I AACCTTTTCA ----/ATTT ATTTAATAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 ATTT 1 2 175224 CASAVA_Build 3 152034087 1D GCAAAGCCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 13 15 6 T 10 9 175225 CASAVA_Build 3 152043341 1D AATGTTTTCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 8 7 175226 CASAVA_Build 3 152048924 1I CAAAGTTTGT -/A AAAATTAAAC 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 4 5 175227 CASAVA_Build 3 152050104 1I CTGCTAATTA -/T TTTTTTTTTT 2487 het 2487 ref 41 18 13 10 T 13 14 175228 CASAVA_Build 3 152052382 2D CTCCAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2839 hom 31 13 9 12 A 14 12 175229 CASAVA_Build 3 152054735 2I AGGGGGGGGG --/GC CTACCCTTTT 1412 het 1412 ref 24 11 6 7 GC 0 1 175230 CASAVA_Build 3 152059310 1D GAGTGGTTTA C/- AGTCCTGGAC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 C 1 0 175231 CASAVA_Build 3 152074308 1D TAGAATATAG A/- AAAAATGATA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 A 6 5 175232 CASAVA_Build 3 152075024 6I AGATAAACAT ------/ATACAC ATATATCTAC 3070 hom 102 het 36 0 34 2 ATACAC 0 1 175233 CASAVA_Build 3 152077527 1D GAATACCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 10 9 175234 CASAVA_Build 3 152085118 1I CATACAGCAT -/A AAAATGTGAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 4 5 175235 CASAVA_Build 3 152085939 1I AAAAGAAAAG -/C CATGTTGGTC 2204 het 9 hom 40 1 9 30 C 1 2 175236 CASAVA_Build 3 152090096 1D ACAGACCTTG T/- TTAACTCATT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 T 3 2 175237 CASAVA_Build 3 152091970 3I CAGGCACCGT ---/GGC GGCTCATGCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GGC 1 2 175238 CASAVA_Build 3 152096761 1I TCTTATATCC -/T TTTTTTGGAT 2651 het 2651 ref 25 12 9 4 T 6 7 175239 CASAVA_Build 3 152117609 1D TTGACACTGT A/- AAAAAAAAAT 1371 het 1371 ref 45 30 3 12 A 10 9 175240 CASAVA_Build 3 152145034 2D GGACTTGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 21 0 14 7 A 14 12 175241 CASAVA_Build 3 152147035 1D ACAAAAATAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 26 5 T 9 8 175242 CASAVA_Build 3 152170995 1I TATGCTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 27 1 20 6 A 12 13 175243 CASAVA_Build 3 152179304 1D TGTGCATTCT A/- AAAAAAGCTT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 7 6 175244 CASAVA_Build 3 152185871 1I AAATTATGAT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 7 8 175245 CASAVA_Build 3 152188933 1D TTTCTGTTTC T/- TTATGGCTAT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 T 3 2 175246 CASAVA_Build 3 152189558 1I ACTATTTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 32 het 25 0 20 5 T 9 10 175247 CASAVA_Build 3 152193175 1D CTTTATTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 26 0 19 7 A 12 11 175248 CASAVA_Build 3 152193412 1I GCATTTTACT -/C CCCCTTCAAA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 C 4 5 175249 CASAVA_Build 3 152200864 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 9 8 175250 CASAVA_Build 3 152201618 1I ACTCAGTGCC -/A ACCTGACGGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 2 175251 CASAVA_Build 3 152203298 1I CGAGTATTCC -/A AAAAAATATC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 6 7 175252 CASAVA_Build 3 152208559 1I CCTAAGTATT -/C CCAACCCATT 3070 hom 144 het 58 0 49 9 C 2 3 175253 CASAVA_Build 3 152212289 2D ATTTTGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 38 2 15 24 A 14 12 175254 CASAVA_Build 3 152213853 2I AATGATTTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 12 175255 CASAVA_Build 3 152216203 4D TGAATTATAG TTAT/---- TTATTTGTCT 3070 het 3070 hom 37 16 19 6 TTAT 2 1 175256 CASAVA_Build 3 152232139 1I ATTTATGACA -/G GGAAAAACTC 297 het 297 ref 44 29 6 9 G 2 3 175257 CASAVA_Build 3 152239505 1I TCCAAGGTAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 8 9 175258 CASAVA_Build 3 152248731 1I TCGAAATAAT -/A ACAAATTCTC 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 A 1 2 175259 CASAVA_Build 3 152261012 7I AGATGAAAGG -------/TGGGCCC TGCTTCAGAC 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 TGGGCCC 0 1 175260 CASAVA_Build 3 152332212 8D TTCCCCTACT AAATGGAG/-------- AAATGGAGGG 3070 hom 132 het 52 0 44 10 AAATGGAG 2 1 175261 CASAVA_Build 3 152338726 3D CCTCTTAGTC CTT/--- CATTGTGTGG 3070 hom 99 het 35 0 31 5 CTT 1 0 175262 CASAVA_Build 3 152365510 1I TTCATCCATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 9 10 175263 CASAVA_Build 3 152381897 1D TTTCCTTCCA T/- TTTTTTTTTT 845 het 845 ref 30 21 3 6 T 13 12 175264 CASAVA_Build 3 152383593 1I CCAATTTACA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 7 8 175265 CASAVA_Build 3 152410609 1D TGGCACACCC A/- TCCAGATAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 1 0 175266 CASAVA_Build 3 152423654 1D TAAAAAGTCC A/- AAAAAAAAAA 1320 het 1320 ref 40 29 3 8 A 15 14 175267 CASAVA_Build 3 152428790 1I GGAGAAGTAG -/T TAGCTACCTC 3070 hom 163 het 63 0 55 8 T 1 2 175268 CASAVA_Build 3 152448095 1I TGTTGTGGGG -/T TCGGGGAGGG 1223 hom 7 het 3 0 3 0 T 1 2 175269 CASAVA_Build 3 152448240 1I AATGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 11 1 9 1 A 11 12 175270 CASAVA_Build 3 152457093 2D AGAAATCACA AC/-- AGACTGCTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 AC 1 0 175271 CASAVA_Build 3 152463243 1I CCTAAGACTT -/A ACTGAGTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 175272 CASAVA_Build 3 152464242 1D TCCCGTACCA C/- CCCCCCCACT 3070 hom 91 het 34 0 30 4 C 8 7 175273 CASAVA_Build 3 152471496 1D CCCAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 516 hom 29 2 18 9 A 13 12 175274 CASAVA_Build 3 152482837 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 10 175275 CASAVA_Build 3 152489302 1D2M1D TTGCATAAAG CTAT/-TA- CAAACTTAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 N/A 0 0 175276 CASAVA_Build 3 152490812 1D TAAGGATGAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 8 7 175277 CASAVA_Build 3 152491113 4D TACAGCCTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 23 0 18 5 T 15 11 175278 CASAVA_Build 3 152491629 3D TTGTTTTCTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 15 12 175279 CASAVA_Build 3 152491790 2D CCTTAGGCAC CA/-- CATTCTCTTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CA 2 1 175280 CASAVA_Build 3 152494441 12D CAGACTTCCA GCCATTAACCCT/------------ GCCATTCACC 3070 hom 117 het 42 0 39 4 GCCATTAACCCT 1 0 175281 CASAVA_Build 3 152512523 3I CCGTCTCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAC 3 4 175282 CASAVA_Build 3 152518840 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 13 12 175283 CASAVA_Build 3 152533217 1D ACTGACGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 10 9 175284 CASAVA_Build 3 152540275 1D TAATGAAAAC T/- TAACAAGTGA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 T 2 1 175285 CASAVA_Build 3 152542045 1I CTGCTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 11 12 175286 CASAVA_Build 3 152544784 2I ACTAATGATT --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 9 11 175287 CASAVA_Build 3 152553125 1D AACCAACTCA T/- TTAGGAGTGT 3070 hom 141 het 52 0 47 5 T 3 2 175288 CASAVA_Build 3 152561909 1I TCCTGGTATG -/A AAAAAAATAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 7 8 175289 CASAVA_Build 3 152567595 1I CCCCTCTGTC -/T CTTTTTCTTC 3070 hom 76 het 32 0 26 6 T 0 1 175290 CASAVA_Build 3 152574701 1I GCGCTTTGTC -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 6 7 175291 CASAVA_Build 3 152586198 3D CTCTGGGGGG GGA/--- AAAAAAAAAA 2706 het 187 hom 28 2 12 17 GGA 1 0 175292 CASAVA_Build 3 152587679 1I AGGGTAACCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 11 12 175293 CASAVA_Build 3 152590761 1D CACAGAAATG T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 20 0 T 6 5 175294 CASAVA_Build 3 152596487 1I ATGACGCAAG -/C CAACAGTCAT 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 C 1 2 175295 CASAVA_Build 3 152596692 1D TTTTTAGCTC T/- TTTTTGGGAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 6 5 175296 CASAVA_Build 3 152599490 2D35M1I TAACTGAAAC TGTGGGAAGTGAAACCGCAGAGAAGTGGCGACTACTG-/--TGGGAAGTGAAACCACAGAGAAGTGGCGACTACTGA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 41 29 18 9 N/A 0 0 175297 CASAVA_Build 3 152600329 1D TCTTGAGACA G/- GGTCTCCCTC 3070 het 3070 hom 27 8 11 8 G 3 2 175298 CASAVA_Build 3 152601760 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 T 11 10 175299 CASAVA_Build 3 152603505 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3020 het 2515 hom 22 9 8 5 T 11 12 175300 CASAVA_Build 3 152615189 1D TAAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 34 1 26 8 A 13 12 175301 CASAVA_Build 3 152621877 2D CTTTACTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 22 0 18 6 T 12 10 175302 CASAVA_Build 3 152633420 1D TACATCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 494 hom 30 2 16 13 A 13 12 175303 CASAVA_Build 3 152635006 3D CAGAAGATGT ATC/--- ATCTATCTGT 3070 hom 135 het 48 0 46 3 ATC 2 1 175304 CASAVA_Build 3 152635730 4D AGCTATACCT ATCA/---- ATCAATCACA 3070 hom 102 het 38 0 35 5 ATCA 3 2 175305 CASAVA_Build 3 152636103 4I CTATAATTCT ----/TAAG TAAGTAAGTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TAAG 2 3 175306 CASAVA_Build 3 152637126 3I TCTTCCAAAA ---/AAT AATAAATTCT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 AAT 1 2 175307 CASAVA_Build 3 152639302 2D40M2I ACATTTTGAG ATATATATATATACACATACATTTTGAGGTATATATATATAT--/--ATATATATATACACATACATTTTGAGGTATATATATATATAG AGAGAGAGAG 3070 hom 69 het 25 0 24 13 N/A 0 0 175308 CASAVA_Build 3 152641193 2I TAATAATGAT --/AG GTCTGAGTCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AG 0 1 175309 CASAVA_Build 3 152654498 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 15 0 10 5 T 16 14 175310 CASAVA_Build 3 152655065 1I TTTTATAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 462 hom 21 1 14 6 T 10 11 175311 CASAVA_Build 3 152655685 1I ATCTCCTGGG -/T TCAAGTGATT 2458 hom 21 het 9 0 7 2 T 1 2 175312 CASAVA_Build 3 152655953 1D TTAGCAGTCA T/- TTTTTCCTAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 6 5 175313 CASAVA_Build 3 152662050 2D ATCATCTCAC AT/-- AGTTACCCCA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AT 1 0 175314 CASAVA_Build 3 152663283 1I AAGCATGTAT -/A ATGAACATGG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 175315 CASAVA_Build 3 152664985 4D CTAATCAGAG TATT/---- TATTTAACAC 3070 hom 129 het 46 0 44 3 TATT 2 1 175316 CASAVA_Build 3 152679873 4D TCTTTTTGGG TAAT/---- TAATTAATTA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 TAAT 4 3 175317 CASAVA_Build 3 152683386 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3018 hom 31 10 18 3 T 11 10 175318 CASAVA_Build 3 152686450 1I AAATGTAAAT -/G GGCTAAGTGT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 G 2 3 175319 CASAVA_Build 3 152687483 2I18M1D TGAAGGAGAT --AGACATGAAATACCTTTCA/AGAGACATGAAATACCTTTC- AAAAAAAATT 2859 het 2859 ref 23 13 8 9 N/A 0 0 175320 CASAVA_Build 3 152688794 5D TCAAGGAAAT AAGAG/----- AGGACACAAA 1311 het 1311 ref 11 6 3 2 AAGAG 1 0 175321 CASAVA_Build 3 152692476 4I ACAAAAGCAA ----/AAAT AAATAAATGA 1687 het 1687 ref 37 23 5 9 AAAT 2 3 175322 CASAVA_Build 3 152694331 4D TTTGTTTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 9 AAAC 4 3 175323 CASAVA_Build 3 152694771 1D GAAACAATGA T/- TTTTCAACAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 5 4 175324 CASAVA_Build 3 152696065 1I TGTTTTTTTT -/A ATCAGACCTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 1 2 175325 CASAVA_Build 3 152696683 1I TGAAGCAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 9 10 175326 CASAVA_Build 3 152700803 4I TCTGATACAT ----/GATA GTTATTAATA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 GATA 0 1 175327 CASAVA_Build 3 152701935 1I CTTGGTATGC -/A GAAGGCATTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 0 1 175328 CASAVA_Build 3 152708404 4D20M4D TAATTTGAAG GTCTGTCAATAAATTTAGATCTAGATCT/----GTCAATAAATTTAGATCTAG---- ATCAATAAAT 3070 het 3070 ref 23 17 10 7 N/A 0 0 175329 CASAVA_Build 3 152728435 1I TGTCTTGAAG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 7 8 175330 CASAVA_Build 3 152729407 2I CACCCCCATG --/CT GAGCCCAGCA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 CT 0 1 175331 CASAVA_Build 3 152733526 2D AATCATAAAT GA/-- ACTCCCATTC 2743 het 2743 ref 20 11 6 4 GA 1 0 175332 CASAVA_Build 3 152734619 1I GGCAATCATT -/A AAAAAGTCAG 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 A 5 6 175333 CASAVA_Build 3 152742353 5I ATGGCCACTT -----/GTAAC TCTCCCTTAA 3070 hom 141 het 55 0 47 8 GTAAC 0 1 175334 CASAVA_Build 3 152743122 16D TAAATGTTTT TAGTAAGAAATGTTTA/---------------- TAGTAAGAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 8 TAGTAAGAAATGTTTA 2 1 175335 CASAVA_Build 3 152746297 2I GAAAATAAAC --/AT GTGGTGAATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 0 1 175336 CASAVA_Build 3 152746685 1D GGCAAGGCTC A/- GGGGGTGATA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 A 1 0 175337 CASAVA_Build 3 152754109 2D TCTCTCTCTC TT/-- TCTATATATA 2553 het 2553 ref 22 11 7 4 T 3 1 175338 CASAVA_Build 3 152754453 2I AACAACAACA --/AC AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 AC 0 1 175339 CASAVA_Build 3 152758998 1D CATGAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 39 3 27 9 T 13 12 175340 CASAVA_Build 3 152764191 1D TTAAAAAAAA T/- ATTAGCCTGC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 1 0 175341 CASAVA_Build 3 152775702 17I GCAGTCTGTC -----------------/CATTCTCAGAGCTCAAA CACCATCCTG 3070 het 2904 hom 26 8 13 5 CATTCTCAGAGCTCAAA 0 1 175342 CASAVA_Build 3 152786461 1I ACATTAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2598 hom 31 11 11 9 T 15 16 175343 CASAVA_Build 3 152792919 18D TGTGCATCAG GTTTGCATCAGTTCCCTT/------------------ GTCCTCCAAG 3070 het 3070 ref 47 29 22 4 GTTTGCATCAGTTCCCTT 1 0 175344 CASAVA_Build 3 152794471 1D GAATGAATAC G/- GCAGATCAGA 3070 het 3070 hom 55 23 27 5 G 2 1 175345 CASAVA_Build 3 152796957 2D ATGGTGTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 72 26 25 21 TG 9 8 175346 CASAVA_Build 3 152805747 1I TACAAATAAA -/T TTTAATGTGT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 3 4 175347 CASAVA_Build 3 152851570 7I AACTTATGAA -------/TCTGTCC TGGGACTTGT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 TCTGTCC 0 1 175348 CASAVA_Build 3 152856463 1I TTATAACAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 9 10 175349 CASAVA_Build 3 152860727 2D CCTCTCTGAC TT/-- TTGAAATACT 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 T 4 2 175350 CASAVA_Build 3 152860993 1I TTTTTTTTTT -/G TGTGTGTGGT 3070 het 2432 hom 27 12 9 6 G 0 1 175351 CASAVA_Build 3 152861719 4I TATATGTTTG ----/TCTA TCTACCCCCA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TCTA 1 2 175352 CASAVA_Build 3 152865921 4D TTGTCTCTTC CTCT/---- CTCTCTTTCT 3070 het 271 hom 31 2 19 11 CT 5 3 175353 CASAVA_Build 3 152865989 6D CTGTTTCTTC CTCTTT/------ CTCTTTCTCT 3070 het 3070 ref 28 14 9 9 CTCTTT 2 1 175354 CASAVA_Build 3 152870294 8I GTCCCCCCTA --------/CAACAGGG CTTTGGGCAA 3070 hom 42 het 14 0 15 1 CAACAGGG 0 1 175355 CASAVA_Build 3 152871543 2I CTTTAGCTAG --/AC ACAGAGTGCT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AC 1 2 175356 CASAVA_Build 3 152871894 1I TTTTTGCTTG -/T TCAATCATTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 1 2 175357 CASAVA_Build 3 152872297 1I CCGTTGCACA -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 6 7 175358 CASAVA_Build 3 152879994 4D CCCCTTGGGC TAAA/---- TAATTAACTC 3070 het 3070 ref 58 28 24 6 TAAA 1 0 175359 CASAVA_Build 3 152880168 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2497 het 8 hom 14 1 12 1 A 13 14 175360 CASAVA_Build 3 152881153 4I ACCAATTCCT ----/GTTA GTTTTAAACT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 GTTA 0 1 175361 CASAVA_Build 3 152882012 2D AATGAAGAAA AG/-- AGAGAAGATC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 AG 3 2 175362 CASAVA_Build 3 152885942 1D ACAATAAACA G/- GTAAACATAA 3070 hom 121 het 48 0 40 8 G 2 1 175363 CASAVA_Build 3 152886158 1D TTGTTGTGGT G/- GTCTGAGAAC 3070 het 3070 ref 49 22 22 6 G 2 1 175364 CASAVA_Build 3 152886396 2D ATATGTATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 42 0 32 12 AC 9 8 175365 CASAVA_Build 3 152892530 2I CTACTTTATG --/TA ATTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TA 0 1 175366 CASAVA_Build 3 152908278 1D AATGGTGTAG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 6 175367 CASAVA_Build 3 152912526 2D TATATATATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 TA 7 6 175368 CASAVA_Build 3 152916497 4I3M3D AAATACCAAT ----TTCTAT/GGCATTC--- TTCACAGAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 N/A 0 0 175369 CASAVA_Build 3 152918216 5D GAACTGCCCG AGACT/----- CGGCAACTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 5 AGACT 1 0 175370 CASAVA_Build 3 152921360 2D TACATGCTAT TC/-- TCTCTCCTTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 TC 4 3 175371 CASAVA_Build 3 152925822 1I GGAAGGCAAA -/G GGGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 G 4 5 175372 CASAVA_Build 3 152932873 4D GTATATATGC ATAT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 45 het 19 0 16 4 AT 2 0 175373 CASAVA_Build 3 152947384 1I TTTTGTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 960 hom 25 2 14 9 T 12 13 175374 CASAVA_Build 3 152949754 2I CCTGGTGTTT --/TA TTTATGTACT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TA 0 1 175375 CASAVA_Build 3 152952612 1I TTATTACCTG -/C TACTGTGTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 0 1 175376 CASAVA_Build 3 152955711 4D TATTAATGAC TTTA/---- TTATCTTAGG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TTTA 1 0 175377 CASAVA_Build 3 152956809 1I TGCACATCGA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 63 25 31 7 T 6 7 175378 CASAVA_Build 3 152957205 4D TTGTACATTC TCTT/---- TCTGTCTCTT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 TCTT 1 0 175379 CASAVA_Build 3 152958995 17I TTTTTAAAAA -----------------/TATTTTCAGTCAAATTT TATTTTTTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TATTTTCAGTCAAATTT 0 1 175380 CASAVA_Build 3 152965813 2D ACCATAGCTG CA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 671 hom 35 4 13 20 CA 1 0 175381 CASAVA_Build 3 152966162 1D GAGCACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 28 1 17 10 A 13 12 175382 CASAVA_Build 3 152966283 6I ACATGAATAG ------/ATTAAA ATTCCTTAAC 3070 hom 120 het 41 0 41 0 ATTAAA 0 1 175383 CASAVA_Build 3 152967535 1I AGTTATTCGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 23 1 17 5 T 11 12 175384 CASAVA_Build 3 152968358 1I TACTGATCCA -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 6 7 175385 CASAVA_Build 3 152969611 2I CACATTAAAC --/TT TTTTTTTTTT 2284 het 1109 hom 38 4 8 26 T 12 14 175386 CASAVA_Build 3 152971812 2I GTTTCCTTGC --/AT ATATATTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 AT 3 4 175387 CASAVA_Build 3 152972227 1D CTCTTTGTGG T/- TTTTTGTTTG 3070 hom 45 het 17 0 15 3 T 6 5 175388 CASAVA_Build 3 152972860 2D TTATTATGTG TA/-- TATATATATA 2676 hom 22 het 12 0 8 4 TA 6 5 175389 CASAVA_Build 3 152973587 1I TGTAATTGCT -/A AATACATCTA 3070 hom 154 het 57 0 52 5 A 2 3 175390 CASAVA_Build 3 152975202 1D ATAAACCTAG A/- AAAAAATAAC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 A 7 6 175391 CASAVA_Build 3 152975834 1D TCCCTACCCC T/- GTCTCCAGTA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 1 0 175392 CASAVA_Build 3 152976122 1D TTTTCTCTTG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 25 het 14 0 11 4 A 8 7 175393 CASAVA_Build 3 152976154 1I TTTGGCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 201 hom 24 2 10 12 T 11 12 175394 CASAVA_Build 3 152978536 1D CACTCCTCCC T/- TTAAGTGATG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 3 2 175395 CASAVA_Build 3 152980761 1D CACACAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 11 10 175396 CASAVA_Build 3 152981532 1D AAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 12 11 175397 CASAVA_Build 3 152982257 4D TTTTCTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 737 het 30 hom 17 1 4 14 T 14 10 175398 CASAVA_Build 3 152985256 2I GTAAAATGCC --/AG AGTTTTAGTC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AG 1 2 175399 CASAVA_Build 3 152988332 3I ACTATATCTA ---/TTG TTGTTTTCTG 3070 hom 96 het 42 0 32 10 TTG 1 2 175400 CASAVA_Build 3 152992482 1D ATGTAAATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 10 9 175401 CASAVA_Build 3 152994292 2D TTTTTAAAAC AG/-- GGGACAGATT 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 AG 1 0 175402 CASAVA_Build 3 152998217 6I TCTCTCTTTC ------/TGTATG TGTATGTGTA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 TGTATG 2 3 175403 CASAVA_Build 3 153003054 3D TTTTCATATT TTC/--- TTATTTGTAT 3070 het 3070 ref 38 23 15 1 TTC 1 0 175404 CASAVA_Build 3 153006961 12I CTCTCCGACT ------------/TGAACCGTAGGA CAGGGGACGC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TGAACCGTAGGA 0 1 175405 CASAVA_Build 3 153014211 2D ACACACACAC AT/-- ATATATGTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AT 4 3 175406 CASAVA_Build 3 153019597 4I TTAAAAAAAT ----/AGAG AGATCTGAAT 3070 hom 99 het 36 0 32 4 AG 1 3 175407 CASAVA_Build 3 153020273 2D TAGACAAGAG AA/-- AAAGAGGCAA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 5 3 175408 CASAVA_Build 3 153025099 4D AGTCTAATCA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 hom 105 het 36 0 36 1 AAAC 2 1 175409 CASAVA_Build 3 153025440 4D TTTTTGAAAC TATT/---- AAAGAGAATA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TATT 1 0 175410 CASAVA_Build 3 153026488 1D GAAGGTTAGA T/- TTTTATTAGT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 5 4 175411 CASAVA_Build 3 153028012 1D TATTTTATTG T/- TTTAAATGAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 4 3 175412 CASAVA_Build 3 153029158 1D AACCAATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 934 hom 36 3 18 16 A 15 14 175413 CASAVA_Build 3 153029376 4I GCAGGGAGAA ----/AAAT AAATAAAATG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAAT 1 2 175414 CASAVA_Build 3 153031618 1I TTTTACACTG -/C TGGTGGAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 0 1 175415 CASAVA_Build 3 153048693 2I GTCGGCAAAC --/AG AGAAAATTTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AG 1 2 175416 CASAVA_Build 3 153055668 1I ATAAAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 35 1 31 3 T 10 11 175417 CASAVA_Build 3 153057768 4D CACACATTGG TAGT/---- TAGTTACAAT 3070 het 3070 ref 39 21 13 8 TAGT 2 1 175418 CASAVA_Build 3 153076864 2D AAGTTTGTTA AT/-- ATGTTAAAGC 3070 het 3070 hom 41 17 23 3 AT 2 1 175419 CASAVA_Build 3 153086693 1D TGAAAATTCC A/- AAAACCAGAG 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 5 4 175420 CASAVA_Build 3 153091036 3I38M4I TTCTGAAAAT ---GTTTTTTTTTCATTTAAGATTTAACTTTTTGACAATAT----/GTAGTTTTTTTTTCATTTAAGATTTAACTTTTTGACAATATAGAG AGTTTAAAAT 3070 hom 111 het 31 0 37 8 N/A 0 0 175421 CASAVA_Build 3 153092896 1D AAACGAGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 11 10 175422 CASAVA_Build 3 153093494 1D GCACATGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 574 hom 39 2 30 7 A 12 11 175423 CASAVA_Build 3 153095426 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 9 8 175424 CASAVA_Build 3 153095910 3I TAACAAATTC ---/ACG ACGAGGTAGG 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 ACG 1 2 175425 CASAVA_Build 3 153096151 2I GCTGTATCTT --/GC AGGGCGAGTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 GC 0 1 175426 CASAVA_Build 3 153107048 1D AAAACCACTC T/- TTTCCACTCT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 4 3 175427 CASAVA_Build 3 153108872 1D GACTTTGGAG A/- AAAAAAAAAA 1273 het 1273 ref 38 30 3 6 A 12 11 175428 CASAVA_Build 3 153114109 4D TCTCTGTCTT ACTC/---- ACTCTCTCTA 3070 het 3070 ref 35 18 13 7 ACTC 2 1 175429 CASAVA_Build 3 153116875 1I26M2D CAGTTTCTAA -CTGTGAACTCCTCAAGAATGTGGAGGCT/CCTGTGAACTCCTCAAGAATGTGGAGG-- CTCTTGCTAA 3070 het 1557 hom 23 5 11 17 N/A 0 0 175430 CASAVA_Build 3 153118336 1D TTTAGGGGGG A/- AAGGTAACTA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 A 3 2 175431 CASAVA_Build 3 153119161 1D GTTTCTCTTC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 123 het 49 0 40 9 T 7 6 175432 CASAVA_Build 3 153125647 4I CTAGCTCCTC ----/ATGG GTGAATTCTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 ATGG 0 1 175433 CASAVA_Build 3 153127954 1D TTGTTTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 15 14 175434 CASAVA_Build 3 153134766 1I ACTCCATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2537 hom 22 7 8 7 A 11 12 175435 CASAVA_Build 3 153140316 31I ATTAGTATTT -------------------------------/TAAATACTATGTTTTAGCATAGTTTATATAG TAATAATAGA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TAAATACTATGTTTTAGCATAGTTTATATAG 0 1 175436 CASAVA_Build 3 153140695 5I TTCAATATAA -----/TTTAC TTAAAACAAA 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 TTTAC 0 1 175437 CASAVA_Build 3 153148367 2D AAATTGATAT AA/-- GATTAGACTT 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 A 2 0 175438 CASAVA_Build 3 153167092 1I ACAAATCCTC -/A AAAATACACC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 4 5 175439 CASAVA_Build 3 153167932 1D CAAGACAAGG T/- ATGTGAACTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 0 175440 CASAVA_Build 3 153171718 2D TATGTGTAAG AT/-- ATATATATAT 1392 het 1392 ref 24 17 3 4 AT 9 8 175441 CASAVA_Build 3 153172746 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 12 13 T 13 12 175442 CASAVA_Build 3 153176686 1D TAGTTCTCAG A/- AAAGATCTAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 4 3 175443 CASAVA_Build 3 153178946 1D TAGTTTTACC T/- TTTTTTTTTT 1710 het 1710 ref 39 28 5 7 T 12 11 175444 CASAVA_Build 3 153179121 1D CAAAATCTTT A/- ATTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 2 1 175445 CASAVA_Build 3 153187756 1I AAGGAAAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2711 hom 27 10 11 6 T 10 11 175446 CASAVA_Build 3 153187887 1I ACTCTAGGGG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 A 7 8 175447 CASAVA_Build 3 153196503 1I TTTTCATTTG -/T TTTTTTCTGT 894 het 894 ref 21 12 3 6 T 6 7 175448 CASAVA_Build 3 153202180 1D AGGTGAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2549 hom 24 7 13 4 T 11 10 175449 CASAVA_Build 3 153202429 1I GTATGACTTA -/G GGCAAGTTAT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 G 2 3 175450 CASAVA_Build 3 153215623 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 26 9 15 3 A 8 7 175451 CASAVA_Build 3 153216031 2D CTTCTCTCAT AC/-- ATCCAGTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 AC 1 0 175452 CASAVA_Build 3 153217313 1D GGTTCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 1623 het 1623 ref 41 29 4 8 T 11 10 175453 CASAVA_Build 3 153219091 1I CTATCAACTT -/A TATAGTAGGA 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 A 0 1 175454 CASAVA_Build 3 153224262 1D GCCAAATAGA T/- TTTTAAAACA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 5 4 175455 CASAVA_Build 3 153224462 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2626 het 1517 hom 12 5 7 0 A 9 10 175456 CASAVA_Build 3 153228698 2D CAAATACCAC AT/-- GTTCTCACTT 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 AT 1 0 175457 CASAVA_Build 3 153232474 2D CCTATATTAC AG/-- AGAGAATGAA 3070 hom 126 het 48 0 43 6 AG 3 2 175458 CASAVA_Build 3 153240161 1I AAAACAGTGG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 7 8 175459 CASAVA_Build 3 153247474 1D CTGAGTAGCT G/- GGACTACAAG 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 G 3 2 175460 CASAVA_Build 3 153250538 1D ATTAATGAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 T 9 8 175461 CASAVA_Build 3 153254610 1D GCCAGGAGTT C/- CCAGAGGCGC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 C 3 2 175462 CASAVA_Build 3 153269738 4D TTTTAAATTT TCTG/---- GGTATAAAAT 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 TCTG 1 0 175463 CASAVA_Build 3 153280112 1D AAATCTTAAA G/- CTCCAAAATG 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 G 1 0 175464 CASAVA_Build 3 153282897 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2410 het 1237 hom 30 9 6 15 A 15 14 175465 CASAVA_Build 3 153293785 1I TTGTCAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 11 12 175466 CASAVA_Build 3 153298652 3D CAACAGAATT TTA/--- TGTAGAACAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 TTA 1 0 175467 CASAVA_Build 3 153311394 4D AGATAGATAC ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 hom 47 15 27 6 ATAG 5 4 175468 CASAVA_Build 3 153321166 1I CTTTGCGTAC -/A AAAAAAAAAA 2758 het 2758 ref 20 12 7 1 A 13 14 175469 CASAVA_Build 3 153331339 5I TTCTTATTCC -----/TTAAA CAACAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 TTAAA 0 1 175470 CASAVA_Build 3 153352520 11D AGTTGCCAAA GTCATTTTTCT/----------- GACACAATCC 3070 het 3070 ref 31 19 10 7 GTCATTTTTCT 1 0 175471 CASAVA_Build 3 153355630 2I GTTGTACTTC --/AG ATGGACTGCG 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 AG 0 1 175472 CASAVA_Build 3 153360103 1I GAATAACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 A 13 14 175473 CASAVA_Build 3 153363454 1D AAGGCTTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 11 10 175474 CASAVA_Build 3 153366626 1D ATGCTGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 19 12 A 12 11 175475 CASAVA_Build 3 153381586 1D TGGTAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 10 175476 CASAVA_Build 3 153382552 2D TTAAATTTTC AA/-- AGTCAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 3 1 175477 CASAVA_Build 3 153385569 1D AAGCTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 43 2 35 7 T 12 11 175478 CASAVA_Build 3 153399450 1I TTTGACTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 11 12 175479 CASAVA_Build 3 153400493 1D GAGAAGTATG C/- CCCTGCCTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 C 4 3 175480 CASAVA_Build 3 153405423 1I CATGTTTAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 9 10 175481 CASAVA_Build 3 153418007 1D TGGGCCTTAG C/- TGCCTCCCTG 2547 hom 27 het 12 0 9 3 C 1 0 175482 CASAVA_Build 3 153425486 2I CAGAATTAAG --/AT ATGCTGTGTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AT 1 2 175483 CASAVA_Build 3 153444908 2D GCAACTATAA CT/-- AAGCATAGAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 CT 1 0 175484 CASAVA_Build 3 153466831 1D CTCAGTTTCC A/- TTTCTCTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 1 0 175485 CASAVA_Build 3 153474709 2I TTATGGGGAC --/AT ATTTAGTTCT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 AT 1 2 175486 CASAVA_Build 3 153476366 4D ACTAAGTTTT TTTG/---- TTTATTTCTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 TTTG 1 0 175487 CASAVA_Build 3 153478071 1I AAACAGTTGC -/T TTTTGGTTAA 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 4 5 175488 CASAVA_Build 3 153480001 1D TATTTTCATC T/- TTTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 T 6 5 175489 CASAVA_Build 3 153497344 1D GCATCATTAT G/- GCTAAGCCAT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 G 2 1 175490 CASAVA_Build 3 153522545 1I GAAAACAGAG -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 T 7 8 175491 CASAVA_Build 3 153526225 1I TAGAAATATT -/A AAAAAAAAAA 1276 het 1276 ref 32 17 4 11 A 15 16 175492 CASAVA_Build 3 153526273 1I GAACTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3025 het 3025 ref 34 16 10 8 T 11 12 175493 CASAVA_Build 3 153538469 1I CACCCTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2536 hom 26 9 10 7 T 10 11 175494 CASAVA_Build 3 153544539 1D TAAAAGATGA C/- CTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 23 13 10 1 C 2 1 175495 CASAVA_Build 3 153550238 4I GTAAATTGTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 48 18 16 14 TG 7 9 175496 CASAVA_Build 3 153556739 3D CCCGAAAAAC TTA/--- TTATTCTATT 2595 het 2595 ref 25 12 8 8 TTA 2 1 175497 CASAVA_Build 3 153568473 1D CTGATGATAG T/- TTTTTTTTTT 1428 het 1428 ref 21 11 3 7 T 11 10 175498 CASAVA_Build 3 153587721 1D AGTCTGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 T 17 16 175499 CASAVA_Build 3 153592559 1I CATTTTGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 11 12 175500 CASAVA_Build 3 153603685 1D CTGGTTTGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 A 10 9 175501 CASAVA_Build 3 153618854 1D GGTTGATTCA T/- TAAGATCTCT 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 T 2 1 175502 CASAVA_Build 3 153629576 5D CAAAAAACAC AAAAG/----- AAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 AAAAG 2 1 175503 CASAVA_Build 3 153631129 1I ATATTCAGTA -/T TACAATCAAT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 T 1 2 175504 CASAVA_Build 3 153643660 4D CCTGTAGAAA CCCC/---- CCCCCCCACA 271 het 271 ref 39 11 5 24 C 11 7 175505 CASAVA_Build 3 153646912 1D CCTTTCACTC T/- TTTTTTTTTC 1266 het 1266 ref 43 29 3 11 T 10 9 175506 CASAVA_Build 3 153659312 1D TTTAATTTGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 2381 hom 24 7 14 4 A 9 8 175507 CASAVA_Build 3 153669344 2I TTTTAAAATC --/TT TGAATTATTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 1 3 175508 CASAVA_Build 3 153725197 2D TATGAATTAC AG/-- AGAGACAACT 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 AG 3 2 175509 CASAVA_Build 3 153727066 3D13M3D TATAGAATAC ATAATACTACATATTTATA/---ATACTACATATTT--- ATATTAATTG 3070 het 3070 hom 16 8 12 2 N/A 0 0 175510 CASAVA_Build 3 153824229 1I AGCATTAAGG -/A AATCTTTTGT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 2 3 175511 CASAVA_Build 3 153831819 18I TTTTGTGGTA ------------------/TTTTATTATTTTTATTAT ATTATGAATG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTTTATTAT 0 2 175512 CASAVA_Build 3 153842361 1D AATTCACACA T/- TTTTATGAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 T 5 4 175513 CASAVA_Build 3 153847735 1D GATGATGCCC G/- GCTCGGCTTT 3070 hom 114 het 42 0 38 5 G 2 1 175514 CASAVA_Build 3 153849827 1I TCACTGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 11 12 175515 CASAVA_Build 3 153852822 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 108 het 43 0 35 8 T 7 8 175516 CASAVA_Build 3 153860778 1I TCAGAAAAAG -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 7 8 175517 CASAVA_Build 3 153860874 2D AAAGTCTTGA AT/-- ATATGAAGTC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 AT 3 2 175518 CASAVA_Build 3 153865688 1D GAAGAGTTTT C/- TGAGGTCTTT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 C 1 0 175519 CASAVA_Build 3 153869417 1I AGAACCACTA -/T TAACACTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 2 175520 CASAVA_Build 3 153871424 4D GTTAAAGAAA AACT/---- AACTGACTAC 3070 hom 102 het 40 0 35 6 AACT 2 1 175521 CASAVA_Build 3 153872662 1I TAATTCTAGG -/A AATCTTTCCC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 3 175522 CASAVA_Build 3 153873208 26D TGACACACAC ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 3070 hom 87 het 29 0 28 9 AT 22 9 175523 CASAVA_Build 3 153881641 1D TTCACTTCCT G/- GTTAAAGTGC 3070 hom 126 het 46 0 42 5 G 2 1 175524 CASAVA_Build 3 153883276 1I AAGTCTTATC -/A TTTTTCCTGT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 0 1 175525 CASAVA_Build 3 153899915 3I TATTTTCACC ---/ACA TTTGCAGTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ACA 0 1 175526 CASAVA_Build 3 153903302 1I TCTTCAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 13 14 175527 CASAVA_Build 3 153935744 1I GTAAAATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 607 hom 36 2 27 7 T 12 13 175528 CASAVA_Build 3 153945258 1D GGCTGAGGCA G/- GAGAATGGCG 3070 het 111 hom 9 1 7 1 G 2 1 175529 CASAVA_Build 3 153945513 1I56M1D ACTCTGTCTC -AAAAAAAAAAAGAGTTTAAAGGTGAGGATGGGGATTTTGTAGGAAAGGAAACTAAGA/AAAAAAAAAAAAGAGTTTAAAGGTGAGGATGGGGATTTTGTAGGAAAGGAAACTAAG- AAAGACACTT 3070 het 620 hom 35 7 23 23 N/A 0 0 175530 CASAVA_Build 3 153949892 1D AATAAAGGGC A/- AAAAAAAATC 1117 het 1117 ref 46 41 3 3 A 9 8 175531 CASAVA_Build 3 153977959 3D GCTGCTGCTT TTC/--- TTGTTTCTCC 3070 hom 123 het 45 0 39 7 TTC 1 0 175532 CASAVA_Build 3 154000808 1D GAAGGTTGTC T/- TTTTTTTTTT 1237 het 1237 ref 40 28 3 10 T 13 12 175533 CASAVA_Build 3 154078278 1I GTGTGTGTAA -/T TATGGGCTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 2 175534 CASAVA_Build 3 154089459 1I GGTCTTGGGC -/T TTTGGGAGAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 4 175535 CASAVA_Build 3 154102823 2I AATGCTTGAA --/AC AATTATACAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AC 0 1 175536 CASAVA_Build 3 154107353 1I GAACTCAAAC -/T ATAAAAATCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 175537 CASAVA_Build 3 154109035 2I CTTATTTTAT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 0 1 175538 CASAVA_Build 3 154116613 2D CCTTTAATAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 11 9 175539 CASAVA_Build 3 154117424 4D43M4I GGGAGAAAGG GAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGGGAGAGAGGAAGAAAGAGAGAA----/----GAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGGGAGAGAGGAAGAAAGAGAGAAAAAG AAAGAAAGAA 3070 het 178 hom 19 1 14 13 N/A 0 0 175540 CASAVA_Build 3 154128393 2I TTTCTTTGTG --/GT GTGTGTGTGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GT 4 5 175541 CASAVA_Build 3 154130529 2I AATAAGTAAT --/AA AAAATGTATA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 4 6 175542 CASAVA_Build 3 154130664 1D AATTATCATG T/- TTTTATTCTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 5 4 175543 CASAVA_Build 3 154137247 1I AACGCTGAGC -/T TATTTCCACT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 1 2 175544 CASAVA_Build 3 154147101 3D CCAAAATAGG TTT/--- TTATTTCAGT 3070 hom 51 het 21 0 18 5 T 5 2 175545 CASAVA_Build 3 154151959 6D GTATCTATTG AAGTTT/------ AAGTTTAAGT 3070 hom 41 het 19 0 14 5 AAGTTT 3 2 175546 CASAVA_Build 3 154152616 1I ATCTTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 2820 het 510 hom 31 3 17 11 A 15 16 175547 CASAVA_Build 3 154165105 7I ATTAAAAGAT -------/TGAACTC GATAGAGATA 3070 het 587 hom 42 3 36 3 TGAACTC 0 1 175548 CASAVA_Build 3 154166008 1I TGTTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 27 1 23 3 A 10 11 175549 CASAVA_Build 3 154168226 3D AGTTTGAGGC TGT/--- TAAGATTTTA 3070 hom 123 het 45 0 41 5 TGT 1 0 175550 CASAVA_Build 3 154169904 1D ACTTACACTG T/- TAAGTCAAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 2 1 175551 CASAVA_Build 3 154170731 1D TCAAGAAAAT G/- GTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 2 1 175552 CASAVA_Build 3 154173474 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 14 0 11 3 A 11 12 175553 CASAVA_Build 3 154175814 1I ATATCCCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 28 1 22 5 A 15 16 175554 CASAVA_Build 3 154177738 1D CAAAATAACT G/- TTTTTTTTGC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 G 1 0 175555 CASAVA_Build 3 154178199 3I TTGGAAGGCC ---/GAG GAGGCTTGAG 3070 hom 72 het 27 0 23 4 GAG 1 2 175556 CASAVA_Build 3 154178886 7I TATACCAGTG -------/ACTTCCA ACTTCATATC 3070 hom 134 het 52 0 45 7 ACTTCCA 0 1 175557 CASAVA_Build 3 154194364 2I TATATGCATG --/TA TATATATATA 3070 het 91 hom 42 1 33 8 TA 6 7 175558 CASAVA_Build 3 154195964 1I CTAGAACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 37 2 23 12 T 14 15 175559 CASAVA_Build 3 154196127 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 9 175560 CASAVA_Build 3 154196393 1D CTGAGGCAGG T/- GGATCATGAG 2373 hom 19 het 8 0 7 1 T 1 0 175561 CASAVA_Build 3 154204756 1I GAATTGAGGT -/G GGATTTCTTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 2 3 175562 CASAVA_Build 3 154215539 1D TTAGAAGTGC T/- TTTTTTTTTT 2983 het 1517 hom 27 5 11 11 T 13 12 175563 CASAVA_Build 3 154220592 1D TGTTTCACAC A/- ACTTATGGTA 3070 het 3070 ref 41 29 10 3 A 2 1 175564 CASAVA_Build 3 154227072 1I TGAAGGACTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 8 9 175565 CASAVA_Build 3 154227906 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 2770 hom 25 9 13 3 A 8 9 175566 CASAVA_Build 3 154233714 1I ATAATTAAAA -/T ATATATATAA 3070 het 1116 hom 21 3 12 6 T 0 1 175567 CASAVA_Build 3 154233747 2D TTAAATATAT AA/-- GTGAATAATG 3070 het 2932 hom 27 8 8 11 A 2 0 175568 CASAVA_Build 3 154238384 1D TTAAATACTT A/- AATTTACATT 2324 het 2324 ref 14 9 5 0 A 3 2 175569 CASAVA_Build 3 154239178 4D AAAAACAAAA GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 hom 51 het 38 0 17 21 GTTT 6 5 175570 CASAVA_Build 3 154239211 2I TGAGACAGAG --/TC TCTCGCTCTG 1672 het 1672 ref 22 7 7 11 TC 2 3 175571 CASAVA_Build 3 154240785 3D GTACTTTTTT AAA/--- ATTCTCTTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 4 1 175572 CASAVA_Build 3 154247636 1D GCGATTGACC T/- TGCCTCAGCC 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 T 2 1 175573 CASAVA_Build 3 154250851 1I ACTAATATAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 A 8 9 175574 CASAVA_Build 3 154253326 4I GCCTGAAAAT ----/CTTA CTGTCATTGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CTTA 0 1 175575 CASAVA_Build 3 154256581 1I CTCTGCCTGG -/T TCCAGCCTCA 3070 hom 99 het 44 0 31 13 T 1 2 175576 CASAVA_Build 3 154262524 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 36 2 24 11 T 13 12 175577 CASAVA_Build 3 154267348 1D ACACACGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 12 11 175578 CASAVA_Build 3 154271196 1I GGAAACAAAG -/T TAAGTGAGAA 3070 hom 54 het 33 0 22 11 T 1 2 175579 CASAVA_Build 3 154272363 1I AGACCAGCCT -/G GGCAATTTAG 3070 hom 83 het 31 0 27 4 G 2 3 175580 CASAVA_Build 3 154274617 1I GAAACCCCGT -/C CTCTACTAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 1 2 175581 CASAVA_Build 3 154277848 1I GCAGTGGCTC -/A TGCCTGTAAT 3070 hom 48 het 19 0 15 4 A 0 1 175582 CASAVA_Build 3 154281043 1D AAATTAAAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 8 7 175583 CASAVA_Build 3 154283906 1I CCAACTTTTT -/A AATTTAGTAT 3070 hom 77 het 28 0 26 2 A 2 3 175584 CASAVA_Build 3 154298354 4I TAAAGAGCTC ----/ACAG ACAAACAATA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 ACAG 0 1 175585 CASAVA_Build 3 154301325 1D AAATAATTTT A/- TTTTTTTTTT 3067 het 1171 hom 16 4 11 1 A 1 0 175586 CASAVA_Build 3 154303057 1I TACTCTCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 40 het 31 0 14 18 A 9 10 175587 CASAVA_Build 3 154307128 1I CATCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 10 11 175588 CASAVA_Build 3 154308823 1D CTCCGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 22 2 A 12 11 175589 CASAVA_Build 3 154310430 1D GACTCTTGAT C/- CACATAGGTT 3070 het 3070 ref 50 31 16 3 C 2 1 175590 CASAVA_Build 3 154359324 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2140 het 1185 hom 10 4 6 0 A 15 14 175591 CASAVA_Build 3 154376917 1I TTTTAATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 19 7 T 10 11 175592 CASAVA_Build 3 154396867 2D TGTGATAGAA AG/-- AGAGTTGTAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 AG 3 2 175593 CASAVA_Build 3 154409397 1I ATTTTTAGTG -/T ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 0 1 175594 CASAVA_Build 3 154429378 3D AAGGAAAGGA GTT/--- GTTGTTTTGT 3070 het 2655 hom 17 7 9 1 GTT 3 2 175595 CASAVA_Build 3 154455847 4D TATTGTTATT GTTA/---- GTTCCATTTT 3070 het 3070 hom 50 23 25 3 GTTA 1 0 175596 CASAVA_Build 3 154458837 1D AGAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 11 10 175597 CASAVA_Build 3 154459260 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1455 het 863 hom 29 9 11 9 T 13 12 175598 CASAVA_Build 3 154463002 4D TATCTCATAT AAAA/---- ACTAATGATT 3070 het 3070 hom 34 12 19 5 A 5 1 175599 CASAVA_Build 3 154469812 2I AAACACAATC --/AT GTGAAATATT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 AT 0 1 175600 CASAVA_Build 3 154474884 1D ATAAAAAAGC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 8 7 175601 CASAVA_Build 3 154483497 1I6M5D8M3I7M1D ATGTAGATAT -AACACATTAACTATATATA---TATGTATG/GCATACA-----TATATATAGTTAATGTGT- CATAACACTA 3070 het 3070 hom 44 22 26 6 N/A 0 0 175602 CASAVA_Build 3 154484228 1I TGACTACAAT -/A AAAGTATAAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 3 4 175603 CASAVA_Build 3 154493030 1I ACAGTAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 9 10 175604 CASAVA_Build 3 154494617 5D7M1I AATATTAAAA TAAATTATAAAC-/-----TATAAACA AAAGGATCAA 3070 het 3070 ref 23 13 11 1 N/A 0 0 175605 CASAVA_Build 3 154503964 4I TATATATCTC ----/TTTG TTTGTGTCCT 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 TTTG 1 2 175606 CASAVA_Build 3 154508901 1I TTTTTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3014 hom 27 het 14 0 10 4 T 13 14 175607 CASAVA_Build 3 154520013 2D TCAATTCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 13 11 175608 CASAVA_Build 3 154527856 1I AACCTATTCT -/A AAATAAAATG 2685 het 2685 ref 19 12 7 0 A 3 4 175609 CASAVA_Build 3 154528297 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 9 10 175610 CASAVA_Build 3 154543571 1I TGGGATCAAT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 6 7 175611 CASAVA_Build 3 154544871 1I CAGTCACATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 9 10 175612 CASAVA_Build 3 154560167 2D AATTATGCCC TT/-- TTGGTCTTCC 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 T 4 2 175613 CASAVA_Build 3 154561304 1I CTCTTTGTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 8 9 175614 CASAVA_Build 3 154562249 2D CTATTTCTGA CT/-- CTCTGCAATG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 CT 3 2 175615 CASAVA_Build 3 154567459 1D CATTTGTCAA T/- TTTTTGCTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 6 5 175616 CASAVA_Build 3 154574109 2D CTATGTTGAC TG/-- TGTGTCTTCC 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 TG 3 2 175617 CASAVA_Build 3 154575661 4D ATAAAAAAGA AAAT/---- AAATACCCTA 3070 het 3070 hom 37 17 20 0 AAAT 2 1 175618 CASAVA_Build 3 154576220 1D TCTAAATATC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 9 8 175619 CASAVA_Build 3 154576727 1D CAATCCTAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 9 8 175620 CASAVA_Build 3 154577236 2I CACTTCAGCC --/CT TTTTCTTTCA 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 CT 0 1 175621 CASAVA_Build 3 154591579 4D ATATGGTAAG AGAT/---- AGGGGTCTAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 2 AGAT 1 0 175622 CASAVA_Build 3 154591899 1D AAAATTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 T 11 10 175623 CASAVA_Build 3 154600076 1D TCTAAAACTG A/- AAAAAAAAAG 1212 het 1212 ref 41 34 3 4 A 10 9 175624 CASAVA_Build 3 154604498 2D TAAGAGATAC AT/-- ATATATATAT 1993 het 604 hom 12 3 7 3 AT 6 5 175625 CASAVA_Build 3 154606726 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 15 0 14 2 A 10 9 175626 CASAVA_Build 3 154606988 4D TCATTACAAA CTTT/---- CTTTCTCACT 3070 het 3070 ref 28 13 12 5 CTTT 2 1 175627 CASAVA_Build 3 154607320 1D TGGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 10 9 175628 CASAVA_Build 3 154609027 1D TAAAAGGGAC T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 7 175629 CASAVA_Build 3 154613612 3D CAGAATACTT AAC/--- AGTCTCTATT 3070 het 3070 ref 44 26 15 5 AAC 1 0 175630 CASAVA_Build 3 154614795 1I ATAATTTTTT -/G CTGTTGTATT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 0 1 175631 CASAVA_Build 3 154618155 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 AC 5 6 175632 CASAVA_Build 3 154619297 10D TATGAAATTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2660 het 2660 ref 25 11 8 9 T 21 11 175633 CASAVA_Build 3 154621831 4D TAGCTTTCCA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 TTTG 4 3 175634 CASAVA_Build 3 154622713 1D TCCTACCCCC T/- CCCACACCCT 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 T 1 0 175635 CASAVA_Build 3 154623162 3I GTTCCCCAGA ---/GTT GTTAAGAGTA 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 GTT 1 2 175636 CASAVA_Build 3 154623369 3I AATTCAAATA ---/CTT CTTTGACAAC 3070 het 234 hom 37 1 18 18 CTT 1 2 175637 CASAVA_Build 3 154623379 2I CTTTGACAAC --/TT TTAAAAAACC 3070 het 308 hom 36 1 17 18 T 2 4 175638 CASAVA_Build 3 154623582 4I AGCTGACAGG ----/CAAA CAAACAAACA 3070 het 2232 hom 32 5 20 7 CAAA 2 3 175639 CASAVA_Build 3 154629326 4D TGATTCCCTT TTTA/---- TTTATTTGTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TTTA 2 1 175640 CASAVA_Build 3 154631173 1D10M1I GCCCGGCCAA TTTTTTTTGTA-/-TTTTTTTGTAT TTTTTTTTAG 1382 hom 24 het 10 0 9 1 N/A 0 0 175641 CASAVA_Build 3 154635390 4D AAAGAACTGC AAAG/---- AAAGAGTGGA 3070 hom 63 het 25 0 22 5 AAAG 2 1 175642 CASAVA_Build 3 154642907 1D TTAGTATCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 28 1 22 6 A 13 12 175643 CASAVA_Build 3 154643800 1D GTAGCACTAC A/- AGAGAGGCCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 2 1 175644 CASAVA_Build 3 154644882 4D ATTTAAAAAA CAAT/---- CAATCAGTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 CAAT 2 1 175645 CASAVA_Build 3 154646350 2D AATTGATTTA TT/-- TTTATCTTCA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 5 3 175646 CASAVA_Build 3 154647600 2D CTATGCAGCC AT/-- AAAAAAGGAT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 AT 1 0 175647 CASAVA_Build 3 154648862 5I GCCAGTACTT -----/ATCTC ATACTGATTA 3070 hom 129 het 54 0 43 11 ATCTC 0 1 175648 CASAVA_Build 3 154649581 1D TTATTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 2694 het 2089 hom 26 14 8 4 T 15 14 175649 CASAVA_Build 3 154659632 1I ATTCAGACAT -/A AAAAATAATG 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 A 5 6 175650 CASAVA_Build 3 154686861 5D TTTTCTTTTC TTTTT/----- TTTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 10 5 175651 CASAVA_Build 3 154688806 1D TAGAGTAGGC T/- TTTTTTTTTT 2117 het 2117 ref 41 27 6 9 T 12 11 175652 CASAVA_Build 3 154712866 6D CTAAAACTTA AAGTAT/------ AATTAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAGTAT 1 0 175653 CASAVA_Build 3 154715735 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2021 hom 25 het 16 0 8 8 A 18 17 175654 CASAVA_Build 3 154735356 1I CTATCCTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 15 16 13 A 10 11 175655 CASAVA_Build 3 154738002 3I GTGATATATT ---/TTA TTATATGTGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TTA 1 2 175656 CASAVA_Build 3 154744738 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTTATA 2376 het 2376 ref 16 9 5 3 T 8 7 175657 CASAVA_Build 3 154753679 2D TATTTCTGGT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 TA 1 0 175658 CASAVA_Build 3 154755046 1I ACAATTACTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 31 13 5 A 9 10 175659 CASAVA_Build 3 154759375 2I TGAAGGAAAT --/AG AGACACAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 AG 1 2 175660 CASAVA_Build 3 154762838 1I ATAGGGATCA -/C GGGGACCCAC 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 C 0 1 175661 CASAVA_Build 3 154763384 3D GGATCTTGCC AGT/--- AGTGATGTTG 3070 het 3070 hom 45 19 23 5 AGT 2 1 175662 CASAVA_Build 3 154765901 2D TTTCTTTTTG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 2959 hom 26 11 15 0 T 10 8 175663 CASAVA_Build 3 154776627 1D GAAATAATAT A/- AAGGCAATTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 3 2 175664 CASAVA_Build 3 154778140 5I AACCTCTAGC -----/CTTTT CTTTGTTCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CTTTT 0 1 175665 CASAVA_Build 3 154778391 13D AAAGGTAGAG GGAGCCTACTTTA/------------- GGAGGGCTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GGAGCCTACTTTA 1 0 175666 CASAVA_Build 3 154778916 2D GCACTTACCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 25 2 20 3 T 13 11 175667 CASAVA_Build 3 154779255 1D ATTCAAAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 9 8 175668 CASAVA_Build 3 154790699 1D GGAATGTTGA G/- GGAAGTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 3 2 175669 CASAVA_Build 3 154798710 1D GATTTTTAAA T/- TTTTTTAATG 2703 het 2703 ref 25 15 9 2 T 7 6 175670 CASAVA_Build 3 154799426 4D CAAATAAGAA AAAT/---- AAATAAACCT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 AAAT 2 1 175671 CASAVA_Build 3 154809348 1I CTCATACCCT -/A CACAGTCAAC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 0 1 175672 CASAVA_Build 3 154809665 18I GTAAAAAGTA ------------------/AATTCAACTTAAAATCAC AATAAGATAT 3070 hom 132 het 44 0 45 1 AATTCAACTTAAAATCAC 0 1 175673 CASAVA_Build 3 154811574 2D TGTCTCAATT AA/-- AAAAAAAAAA 1090 het 28 hom 11 1 3 7 A 14 12 175674 CASAVA_Build 3 154833067 1D TGCAACAGGC T/- TTTTTTTTTT 2191 het 2191 ref 30 14 8 8 T 15 14 175675 CASAVA_Build 3 154848237 1D TTCAGTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 A 11 10 175676 CASAVA_Build 3 154850823 1D TATACTTCCT A/- AATACCCATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 3 2 175677 CASAVA_Build 3 154851910 1D TACTCAGCCA T/- AAAAAGGAAC 3070 het 3070 hom 41 21 17 3 T 1 0 175678 CASAVA_Build 3 154854512 1I CAAACTTATC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 9 175679 CASAVA_Build 3 154858815 1D ACTTAGGGGA T/- TTGCAGTGTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 3 2 175680 CASAVA_Build 3 154880079 1I GCTTTTGTGT -/G GACTTATAAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 G 1 2 175681 CASAVA_Build 3 154880253 1D ATGTTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 688 hom 36 4 15 17 T 11 10 175682 CASAVA_Build 3 154884047 1D TATCAAATAT A/- AAAGTTTTGC 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 A 4 3 175683 CASAVA_Build 3 154885551 1I TTAGTATATG -/A ATAATACCGA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 1 2 175684 CASAVA_Build 3 154894160 4I CTTTTTTTTT ----/TTTC TTTTCTGCTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTTC 0 1 175685 CASAVA_Build 3 154894572 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATACATA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TA 3 4 175686 CASAVA_Build 3 154900348 1D GATCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 29 1 27 3 T 11 10 175687 CASAVA_Build 3 154903178 3D TTTCTTCTCC CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 CTT 4 3 175688 CASAVA_Build 3 154909576 1D CGTGAGTTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 T 9 8 175689 CASAVA_Build 3 154932720 1I TTAATTCAAC -/A AAAAAGTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 A 5 6 175690 CASAVA_Build 3 154953722 5I AGAAAGATTG -----/TAAAA TAAAAGGTAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 TAAAA 1 2 175691 CASAVA_Build 3 154956540 1D ATGTATGGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 T 8 7 175692 CASAVA_Build 3 154956800 1I TGAACCTGGG -/A GGCAGAGCTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 0 1 175693 CASAVA_Build 3 154958125 1I GGGGAAATCT -/C ACCTGCCCTC 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 C 0 1 175694 CASAVA_Build 3 154958270 1I GAGATATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 18 7 A 11 12 175695 CASAVA_Build 3 154960999 1D TACTTAAAAC A/- GCAAAACTCC 3070 het 3070 hom 34 15 15 6 A 1 0 175696 CASAVA_Build 3 154961509 16D AAAAGAAAAC AAAAACAAACAAAAAA/---------------- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 44 30 14 6 AAAAACAAACAAAAAA 1 0 175697 CASAVA_Build 3 154982070 1I AGCATTTTCT -/G GTAATGATGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 175698 CASAVA_Build 3 155009825 4D AAAGGTCCTC ACTT/---- AGTCAACCCC 3070 het 3070 hom 49 21 24 7 ACTT 1 0 175699 CASAVA_Build 3 155031990 4D GGACTGTCTT AGTC/---- AGTGTTTAGA 3070 hom 123 het 46 0 42 6 AGTC 1 0 175700 CASAVA_Build 3 155037415 4D TATGTGAGAA TTCT/---- TTATTAGCTG 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 TTCT 1 0 175701 CASAVA_Build 3 155038707 1I AGGGAGCAAT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 9 175702 CASAVA_Build 3 155043167 1I GGTATGGATG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 9 175703 CASAVA_Build 3 155052614 1I ATTTTTTTTT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 6 7 175704 CASAVA_Build 3 155055126 1I ATAGATGGAC -/T TTTGGTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 3 4 175705 CASAVA_Build 3 155056660 1I TCTGTCTCAC -/T TTCATACACT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 2 3 175706 CASAVA_Build 3 155057204 2I GACCCCCTTT --/TC TCTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 52 26 23 3 TC 2 3 175707 CASAVA_Build 3 155059060 1D TTTTGTAGTA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 8 7 175708 CASAVA_Build 3 155077942 1I GAACTATAAA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3009 hom 15 7 7 1 T 8 9 175709 CASAVA_Build 3 155085820 1I TTTGTAATGA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 7 8 175710 CASAVA_Build 3 155098963 1D ACCATGCATT C/- CCCTTTGATT 3070 het 3070 ref 31 15 8 10 C 4 3 175711 CASAVA_Build 3 155099478 1D TATTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 11 10 175712 CASAVA_Build 3 155101278 1I TACTATATAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 175713 CASAVA_Build 3 155102592 1D TTAAGCAGAG T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 8 7 175714 CASAVA_Build 3 155105932 17I GGGAAGGTGT -----------------/TGTAAAGAATAAAAGGG ATTATACAAA 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 TGTAAAGAATAAAAGGG 0 1 175715 CASAVA_Build 3 155120035 1D GCATAACCTT G/- GCATGACATG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 2 1 175716 CASAVA_Build 3 155134885 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 10 9 175717 CASAVA_Build 3 155135945 4D ATATAAATAC TTAT/---- TTAAACTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 16 4 TTAT 1 0 175718 CASAVA_Build 3 155157595 1I TTCTTCCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 10 11 175719 CASAVA_Build 3 155158017 2D TGAGTCATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2055 hom 28 6 14 8 AT 8 7 175720 CASAVA_Build 3 155162515 1D TTATATGTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 47 24 17 7 A 10 9 175721 CASAVA_Build 3 155169757 3D GTCTCTAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 7 A 14 11 175722 CASAVA_Build 3 155171347 2D ATCATTTATG GT/-- TTTCCTTTTC 3070 het 3070 ref 54 27 20 8 GT 1 0 175723 CASAVA_Build 3 155191878 8I TAGACAATTC --------/TCAGAAGA TCAGAAGAAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TCAGAAGA 1 2 175724 CASAVA_Build 3 155201279 1I GGAAAACATT -/A AAAAAAAAAA 1802 het 1802 ref 14 6 4 4 A 11 12 175725 CASAVA_Build 3 155201620 1I AAAAACAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 9 10 175726 CASAVA_Build 3 155202770 3D TTAATGAATT GGA/--- GGAGAATATA 3070 het 3070 ref 25 15 10 2 GGA 2 1 175727 CASAVA_Build 3 155203518 1D ATCTCTACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 A 13 12 175728 CASAVA_Build 3 155205992 1I TTAATTTGAA -/G GGAAATTAAG 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 G 2 3 175729 CASAVA_Build 3 155207147 1D ATGTGGAAAC A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 A 8 7 175730 CASAVA_Build 3 155211344 4D GATAATACTT TATC/---- TGATCAATTA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TATC 1 0 175731 CASAVA_Build 3 155213817 3I CGCTCCCCCC ---/CCA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 CCA 0 1 175732 CASAVA_Build 3 155214146 4D CAAAAAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 40 13 20 9 AAAG 3 2 175733 CASAVA_Build 3 155214468 1I CAATTCTAAG -/C CTTGGCTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 C 1 2 175734 CASAVA_Build 3 155216140 21D TTGTTGTTGT TATTCAAACCTAATGTTTGGG/--------------------- ATTTCATTAA 3070 het 3070 hom 30 19 19 0 TATTCAAACCTAATGTTTGGG 1 0 175735 CASAVA_Build 3 155216718 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2003 het 2003 ref 34 22 7 6 A 13 12 175736 CASAVA_Build 3 155217719 1I ATCATAAGAC -/A ATTTCTAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 1 2 175737 CASAVA_Build 3 155219515 1I GTTAGGACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 10 11 175738 CASAVA_Build 3 155220290 2I CCAACCAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 AT 7 8 175739 CASAVA_Build 3 155221161 2D AAAATAACAC AT/-- GTTACTAAGT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 AT 1 0 175740 CASAVA_Build 3 155227162 1I TAACAAATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 9 10 175741 CASAVA_Build 3 155227360 4D ATAGAAATAG AGAT/---- AGAGAGAGAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 AGAT 1 0 175742 CASAVA_Build 3 155228745 1I GGTGTGTAAG -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 A 6 7 175743 CASAVA_Build 3 155281577 1D TTTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 25 0 22 3 A 13 12 175744 CASAVA_Build 3 155283866 1I CCTATCTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 9 10 175745 CASAVA_Build 3 155284800 1D TAGTCAAAAT A/- AAAAAAAAAG 1300 het 1300 ref 56 47 4 5 A 10 9 175746 CASAVA_Build 3 155286812 2D TCTTTTCATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 TA 6 5 175747 CASAVA_Build 3 155287388 4D TTTTACTCCA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 58 het 29 0 18 12 TC 8 6 175748 CASAVA_Build 3 155301667 1D CCTAATGAGT A/- AAAACAAGAT 3070 hom 138 het 51 0 46 6 A 5 4 175749 CASAVA_Build 3 155310501 1D TGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 644 hom 21 2 16 3 T 12 11 175750 CASAVA_Build 3 155321447 3D CTGATTTAAG ACC/--- ACCTGAATGC 3070 hom 102 het 38 0 34 5 ACC 2 1 175751 CASAVA_Build 3 155324399 2I GCAATAAGGC --/AG AGATTCTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AG 1 2 175752 CASAVA_Build 3 155325458 1D TAAGGATCTC A/- AAAAAAAAAA 3044 het 2859 hom 23 9 8 6 A 13 12 175753 CASAVA_Build 3 155328009 3I CATGGGGCTG ---/TCA TCATCAATGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TCA 2 3 175754 CASAVA_Build 3 155338722 1I TACATGTAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 7 8 175755 CASAVA_Build 3 155340593 1I GGTCCAAAGT -/C TCTGAATGAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 0 1 175756 CASAVA_Build 3 155349727 4D TTAATTAATA AATT/---- AATATTGATG 3070 hom 102 het 39 0 35 8 AATT 1 0 175757 CASAVA_Build 3 155355053 4D CTCTTCCCAT ATAG/---- ATACTCTTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 ATAG 1 0 175758 CASAVA_Build 3 155356229 5D GAGAAATAAC AAAAG/----- TATAATGTAG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 AAAAG 1 0 175759 CASAVA_Build 3 155357647 6D TTCTTCTTTT AAAACA/------ TTTCTCATTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 AAAACA 1 0 175760 CASAVA_Build 3 155359275 1D TTTCCTTTGA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 102 het 46 0 35 11 T 9 8 175761 CASAVA_Build 3 155361792 16I AAAAAGCCTC ----------------/AAATATAAAAAGCCTT AAGAAATATC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AAATATAAAAAGCCTT 0 1 175762 CASAVA_Build 3 155364936 4I ATAGATACTT ----/TATC TATACAGTGT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TATC 0 1 175763 CASAVA_Build 3 155375913 1D AGCTAGTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 305 hom 26 2 22 2 A 10 9 175764 CASAVA_Build 3 155380011 2I CTAGCCTCTC --/TA TGAGAACTAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TA 0 1 175765 CASAVA_Build 3 155401484 1I AAATATAAGA -/T TTTTTTTTTA 2868 hom 18 het 9 0 7 2 T 9 10 175766 CASAVA_Build 3 155412821 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 34 2 21 11 A 14 13 175767 CASAVA_Build 3 155413935 1I TCCATTGATG -/A CACCATTGCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 0 1 175768 CASAVA_Build 3 155415877 1D CAGTCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 1716 het 1716 ref 34 27 4 4 T 13 12 175769 CASAVA_Build 3 155420393 1I26M10I ACTCCGTCTC -AAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAA----------/AAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAACAAAAAAAAC CAAAAAAGTA 3070 hom 54 het 11 0 19 1 N/A 0 0 175770 CASAVA_Build 3 155424612 2D TTCCTTACTA GG/-- GGAATTCACT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 G 4 2 175771 CASAVA_Build 3 155429221 1D CAAGGAGGCG A/- ACTGCAAATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 2 1 175772 CASAVA_Build 3 155432069 1I TGGTATTGTG -/T TTCTCTCTCT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 2 3 175773 CASAVA_Build 3 155432379 1D GTAGTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 51 2 42 9 T 14 13 175774 CASAVA_Build 3 155440981 4D AGAGCTCTGC CAGT/---- CAGTCACCTC 3070 hom 108 het 42 0 37 7 CAGT 2 1 175775 CASAVA_Build 3 155442884 3D TTCAAGACTT CAG/--- CGGAGGAAGC 3070 het 3070 hom 49 25 23 2 CAG 1 0 175776 CASAVA_Build 3 155458150 1I AATTGTCTTA -/C AGTTTTTTCA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 0 1 175777 CASAVA_Build 3 155458700 1D TTGACATTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 10 9 175778 CASAVA_Build 3 155460550 4D CTAGCATATT TAAC/---- TATATGGCCT 3070 het 3070 hom 45 21 21 4 TAAC 1 0 175779 CASAVA_Build 3 155461133 2I TTTGCAAAAC --/AT AAAGGATTGG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AT 0 1 175780 CASAVA_Build 3 155469201 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 8 175781 CASAVA_Build 3 155475957 1I AAGGAAAAAG -/A GAGAGAAGCC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 0 1 175782 CASAVA_Build 3 155482370 1I CTAATGTATA -/C TACACCAGCT 3070 hom 120 het 52 0 40 12 C 0 1 175783 CASAVA_Build 3 155486663 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AAAAAAAAAA 2613 het 73 hom 29 1 17 11 AAC 0 1 175784 CASAVA_Build 3 155487260 3D ACAAATCACC AAG/--- AAGGACCAAG 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 AAG 2 1 175785 CASAVA_Build 3 155499859 1D AATTTTATAG A/- AAAAAAGGTT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 7 6 175786 CASAVA_Build 3 155515412 1I ATTCCCACAG -/A GGATGTCTTG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 0 1 175787 CASAVA_Build 3 155518320 1D TCAATTGTTT A/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 A 1 0 175788 CASAVA_Build 3 155527227 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 30 1 25 4 A 12 11 175789 CASAVA_Build 3 155543260 2D TCCATAAAAC AT/-- AAACAGAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 8 4 AT 1 0 175790 CASAVA_Build 3 155547866 1D CTGAGCAAAA G/- GGGGAAAAGC 2958 het 2958 ref 22 9 11 2 G 5 4 175791 CASAVA_Build 3 155560502 1I TCATGCAAAA -/G CTTCTAAGAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 0 1 175792 CASAVA_Build 3 155576708 1D TATTTGTTAA T/- GATTTAATTC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 1 0 175793 CASAVA_Build 3 155578571 2D TCCCCCCCCC CT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1460 hom 45 14 12 19 CT 1 0 175794 CASAVA_Build 3 155581113 1I10M1D CAAGGTCAAA -TTTTGTCCTTG/TTTTTGTCCCT- AAATCAATTA 3070 hom 78 het 30 0 24 8 N/A 0 0 175795 CASAVA_Build 3 155581196 1D TCATATAGAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 8 7 175796 CASAVA_Build 3 155582315 1D GTGCACTATT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 8 7 175797 CASAVA_Build 3 155587457 1D ATTTTTCTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 8 175798 CASAVA_Build 3 155592040 1I ACAAGGTAGT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 47 14 26 7 A 7 8 175799 CASAVA_Build 3 155592533 5D AAAGAAATAA ATAAT/----- ATGATAATTG 3070 het 3070 ref 43 21 19 5 ATAAT 1 0 175800 CASAVA_Build 3 155593091 2I TAAATGAAAT --/AG AGAATAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AG 1 2 175801 CASAVA_Build 3 155603227 1I TCCTGTACAC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 7 8 175802 CASAVA_Build 3 155603430 4I GTAATTTCCT ----/AATG AATGGAATCT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 AATG 1 2 175803 CASAVA_Build 3 155604273 1I TAACTCTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 13 6 A 10 11 175804 CASAVA_Build 3 155607873 3I AATTATTATA ---/CTC CTCTTAATAT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 CTC 1 2 175805 CASAVA_Build 3 155614127 1I ATTATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 26 9 A 11 12 175806 CASAVA_Build 3 155615622 2D GAGTTCAAGT AG/-- AGAGTAACCA 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 AG 3 2 175807 CASAVA_Build 3 155620710 1D ACTCATGTAG A/- AAAAAAGACT 3070 het 3070 ref 30 17 11 4 A 7 6 175808 CASAVA_Build 3 155626458 1I GGCACTAGAC -/T CATCCTTCTC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 0 1 175809 CASAVA_Build 3 155632562 4I AGAGAAAGAA ----/AGAG AGAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 AG 3 5 175810 CASAVA_Build 3 155649728 1D CTGCCTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 12 11 175811 CASAVA_Build 3 155652136 1I AATTAAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 8 9 175812 CASAVA_Build 3 155684161 1I ATTTTATGTG -/T TTTTTTTTTT 2515 het 2515 ref 25 12 8 5 T 12 13 175813 CASAVA_Build 3 155784971 1D CTCTCAACTA T/- TTTTTTTTTT 1429 het 1429 ref 43 32 4 7 T 13 12 175814 CASAVA_Build 3 155902974 8D GTCTCACTCT GCCACTCA/-------- GCCTGGCGTC 3070 het 3070 ref 27 15 12 4 GCCACTCA 1 0 175815 CASAVA_Build 3 155943980 4D AAATGTCCTG ACTC/---- ACCTTGATCT 3070 het 3070 ref 52 26 25 2 ACTC 1 0 175816 CASAVA_Build 3 155964771 1D TCTTTGCCCA T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 7 6 175817 CASAVA_Build 3 156087498 1D TTTCTGAAGG A/- AAAACAAAGA 3070 het 3070 hom 40 10 26 4 A 5 4 175818 CASAVA_Build 3 156137456 1D AATAAAAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 10 9 175819 CASAVA_Build 3 156206866 1D CACACTTGTC T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 T 6 5 175820 CASAVA_Build 3 156213559 1D TGGGATTACA G/- GCACATGCCA 1879 het 1879 ref 19 11 5 3 G 2 1 175821 CASAVA_Build 3 156223378 3I TCCGGAGTGA ---/TAT TATACATGCT 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 TAT 1 2 175822 CASAVA_Build 3 156287733 1D TGCCCTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2475 het 1824 hom 28 9 7 13 T 15 14 175823 CASAVA_Build 3 156294338 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1776 het 336 hom 15 4 7 5 A 16 15 175824 CASAVA_Build 3 156309695 1D AGGAGGCCAT G/- GGGGGTGAAA 3070 hom 91 het 37 0 30 7 G 6 5 175825 CASAVA_Build 3 156312519 1I AGGGAATTGC -/T TTTTTCTCTC 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 T 5 6 175826 CASAVA_Build 3 156315903 4D GGTTTGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1285 hom 35 4 20 11 TTTG 5 4 175827 CASAVA_Build 3 156326892 1D CAGTAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 T 11 10 175828 CASAVA_Build 3 156328433 1I TTCTCAGCTT -/A AATTAGGTGC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 2 3 175829 CASAVA_Build 3 156387799 8I TGGCATGAAC --------/CCAGGAGG CCAGGAGGCG 2901 hom 24 het 9 0 8 1 CCAGGAGG 1 2 175830 CASAVA_Build 3 156398813 14I AATAATCATG --------------/GTTTAAGGAGCAAA GTTTATTTTT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 GTTTAAGGAGCAAA 0 1 175831 CASAVA_Build 3 156413472 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1271 hom 30 5 13 12 A 18 17 175832 CASAVA_Build 3 156414441 1D TCTTATAGGA T/- TTTTTTTTTT 919 het 919 ref 46 36 4 7 T 12 11 175833 CASAVA_Build 3 156420491 1I GTCTCTGCTA -/T TGTGAATAGT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 1 2 175834 CASAVA_Build 3 156421620 1D TTCAAAATAG T/- TTTTCCTAAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 5 4 175835 CASAVA_Build 3 156426229 1I CGAGGGGGAT -/C TCCTGATCTG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 0 1 175836 CASAVA_Build 3 156426738 1D TTCTGGTGAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 22 10 8 4 T 9 8 175837 CASAVA_Build 3 156434540 1D ACTGTCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 9 22 8 T 12 11 175838 CASAVA_Build 3 156439660 1D GTCCTTTGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 T 10 9 175839 CASAVA_Build 3 156441027 24D GTGTTCCCAG CCTCCTTGCCCTTCAGCCCAGCAT/------------------------ CTGTGTTCTC 3070 het 3070 ref 40 33 9 5 CCTCCTTGCCCTTCAGCCCAGCAT 1 0 175840 CASAVA_Build 3 156464575 5D GACATATTTA CACAC/----- CACACCACAC 3070 het 3070 ref 46 20 14 16 CACAC 4 3 175841 CASAVA_Build 3 156473781 1D TCAAAAAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 10 9 175842 CASAVA_Build 3 156478429 1D AGCAGGGTAA G/- GGTGATTAGG 3070 het 2793 hom 21 6 13 2 G 3 2 175843 CASAVA_Build 3 156481483 3D AAAAGGACAT AAC/--- AACAACAACA 3070 het 5 hom 31 2 26 3 AAC 7 6 175844 CASAVA_Build 3 156485680 1D ACTCTCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 11 10 175845 CASAVA_Build 3 156486889 1I TAAATAACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 8 9 175846 CASAVA_Build 3 156500229 1I CAATTATATG -/A AAATTAAACA 3070 het 3070 hom 58 22 31 5 A 3 4 175847 CASAVA_Build 3 156501924 1I TGTGAGCCAG -/A AAAAAAACTT 3070 het 107 hom 17 1 8 8 A 7 8 175848 CASAVA_Build 3 156502128 2I GTACTTTTTG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 9 11 175849 CASAVA_Build 3 156504671 2D CCAGGAACCC CA/-- GTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 CA 1 0 175850 CASAVA_Build 3 156505851 1D GGGCCTGTAG T/- GGGGGTGAGG 3070 het 1826 hom 17 5 10 3 T 1 0 175851 CASAVA_Build 3 156508281 1I CCAACACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 T 11 12 175852 CASAVA_Build 3 156510620 1D AAAGAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 2934 het 1894 hom 17 7 8 2 A 11 10 175853 CASAVA_Build 3 156531899 1D ATGAAAGTAA C/- CCTACAGATG 3070 hom 154 het 55 0 52 3 C 3 2 175854 CASAVA_Build 3 156537610 7I TGCCACTGCA -------/CTGAAGC CTGAAGCCTG 2287 het 2287 ref 13 7 5 1 CTGAAGC 1 2 175855 CASAVA_Build 3 156550462 1D ATTAATCGGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 40 het 25 0 16 10 G 11 10 175856 CASAVA_Build 3 156550779 1D TGTCTCTTGG T/- TTTTTATTTG 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 6 5 175857 CASAVA_Build 3 156559418 2D GATAAACAAA TT/-- TTTCCTTTTA 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 5 3 175858 CASAVA_Build 3 156574568 18D TTGCCTTCTG AAGGATCAGCTTCCTGCC/------------------ AAGGCCAGAT 3070 het 3070 ref 31 18 15 5 AAGGATCAGCTTCCTGCC 1 0 175859 CASAVA_Build 3 156577774 1I ATAGAAGTGG -/C AGTCGTCTTT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 C 0 1 175860 CASAVA_Build 3 156579374 4I CTGGTGAAGA ----/CTCT CTCTGTGCCT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 CT 2 4 175861 CASAVA_Build 3 156581359 3I CAAAATAAAC ---/TAA TGATTCATGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TAA 0 1 175862 CASAVA_Build 3 156591252 1I CCATTATGGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2894 hom 29 9 11 9 A 9 10 175863 CASAVA_Build 3 156598634 6I AAGAAAAAAA ------/AAAAAG AAAAAGAAAA 3070 het 1693 hom 32 10 14 8 AAAAAG 2 3 175864 CASAVA_Build 3 156688688 1I ACTGTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 39 0 34 5 T 11 12 175865 CASAVA_Build 3 156695020 1I TTTAATCGAG -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 115 het 44 0 39 5 A 6 7 175866 CASAVA_Build 3 156723194 2D TTTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2970 het 28 hom 24 1 10 14 T 18 16 175867 CASAVA_Build 3 156724004 1I CAGCCTTGAC -/A AGGGAGCATG 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 A 1 2 175868 CASAVA_Build 3 156729873 1D TTACTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 35 0 30 5 T 11 10 175869 CASAVA_Build 3 156731071 6I CAGGCTCCAC ------/TTCTAA TTCTAGTTCT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 TTCTAA 0 1 175870 CASAVA_Build 3 156731577 1I GTGCTGTCAT -/C CAGGCTTTGT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 C 1 2 175871 CASAVA_Build 3 156737670 29D CTAGCACTAC AAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAA/----------------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 134 hom 33 4 27 9 AAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAA 1 0 175872 CASAVA_Build 3 156739429 1I AGGACATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 28 1 24 3 A 10 11 175873 CASAVA_Build 3 156740511 2D ATGGTACTGG TA/-- TATAAAAATA 3070 hom 75 het 28 0 26 5 TA 3 2 175874 CASAVA_Build 3 156744535 1I AACTTTAAAT -/G TAAATGGACT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 G 0 1 175875 CASAVA_Build 3 156761598 1D TCACCTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 10 9 175876 CASAVA_Build 3 156764117 1D CACACATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 41 3 20 18 A 15 14 175877 CASAVA_Build 3 156766183 3D TTTTATTTAT TTA/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTA 1 0 175878 CASAVA_Build 3 156767133 1I AATTGGTTTG -/A AAAAAATGCT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 6 7 175879 CASAVA_Build 3 156768319 1D ATACAGTCAG T/- TGCTACCATT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 2 1 175880 CASAVA_Build 3 156782233 1I TCTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 536 hom 35 3 18 14 T 14 15 175881 CASAVA_Build 3 156783704 1I ATTTCTTTGT -/G GGGAAAATAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 3 4 175882 CASAVA_Build 3 156797636 1I TTTAGAAACA -/T TCCTCTACCA 3070 hom 158 het 58 0 50 8 T 1 2 175883 CASAVA_Build 3 156803870 4D CAGAAGTAAA GGGT/---- ATGTTTGTTT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 GGGT 1 0 175884 CASAVA_Build 3 156857539 1D GGACAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 2450 het 1851 hom 31 11 9 11 A 17 16 175885 CASAVA_Build 3 156968705 1I AGTAGTGAGA -/T TTTAACCAAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 3 4 175886 CASAVA_Build 3 156980135 1I GAAGAAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 10 11 175887 CASAVA_Build 3 156982822 1D AAACTATTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 10 9 175888 CASAVA_Build 3 157005822 1I GACAAGTGCC -/T TGTAGCCCTA 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 T 1 2 175889 CASAVA_Build 3 157006070 4D GATGGGGTAG CGCA/---- CGCAACCTGT 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 CGCA 2 1 175890 CASAVA_Build 3 157012719 1D ACATACATGG T/- TATCTCTCCC 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 2 1 175891 CASAVA_Build 3 157056884 1D TTGATGAAAA T/- TAAAATAGAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 2 1 175892 CASAVA_Build 3 157070394 3D AAGTAACACC TCA/--- TCATCATGAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TCA 3 2 175893 CASAVA_Build 3 157080436 1D GTTTTAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 12 11 175894 CASAVA_Build 3 157088692 1D ACCCAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1180 hom 29 6 10 13 T 17 16 175895 CASAVA_Build 3 157089354 2D AGGTGTGAGC CA/-- CGGCACCTGG 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 CA 1 0 175896 CASAVA_Build 3 157106526 1I CCATTGTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 11 12 175897 CASAVA_Build 3 157117461 1I TTAACTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 T 15 16 175898 CASAVA_Build 3 157132167 4I TTTTTTTTTT ----/TTAA AAAAAAAAAA 2619 het 1234 hom 18 7 9 2 TTAA 0 1 175899 CASAVA_Build 3 157134015 1I ACTTACTGTC -/T TATACGTGGG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 1 2 175900 CASAVA_Build 3 157147164 1D AGACCAGCCT G/- GGCAACATGG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 G 3 2 175901 CASAVA_Build 3 157149275 33D TAAAGAGATC ACTTTAGTGATCACTTAAAGTGATCAACTCCTT/--------------------------------- ATAGATTTGA 3070 hom 48 het 16 0 17 1 ACTTTAGTGATCACTTAAAGTGATCAACTCCTT 1 0 175902 CASAVA_Build 3 157158700 1I TTCATAGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 46 het 22 0 15 7 A 9 10 175903 CASAVA_Build 3 157159208 1I2M4I TTGGCAAGGG -GC----/AGCATAA TTTCTTGAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 N/A 0 0 175904 CASAVA_Build 3 157160616 4D AAGGAGCAAA GATG/---- GTTGATGTCA 3070 het 3070 ref 47 25 20 4 GATG 1 0 175905 CASAVA_Build 3 157161395 3D TAAAATATAC TTA/--- TTATACTTTC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TTA 2 1 175906 CASAVA_Build 3 157165901 3I TGCCATTTTA ---/AAT AGGCAACCTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAT 0 1 175907 CASAVA_Build 3 157180029 1D CTAAATATAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 9 8 175908 CASAVA_Build 3 157194663 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 8 6 175909 CASAVA_Build 3 157210174 5I AATAGTGTTT -----/AACAC AACACAAATA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AACAC 1 2 175910 CASAVA_Build 3 157214624 2I ATGAACAAAC --/TT TGAAAATGCC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 1 3 175911 CASAVA_Build 3 157215285 4D GATGTGGTCA CTTC/---- CTTTCAGTGT 3070 het 3070 hom 37 14 18 7 CTTC 1 0 175912 CASAVA_Build 3 157227769 2I AAGTAATGAA --/AG AATTTGAAAT 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 AG 0 1 175913 CASAVA_Build 3 157235813 12I TTGTCTTTCT ------------/CCTCCTCCTCCC CCTCCTCCTC 3070 het 2149 hom 34 8 12 14 CCTCCTCCTCCC 0 1 175914 CASAVA_Build 3 157240264 1I GTTCTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2670 hom 36 8 16 12 T 15 16 175915 CASAVA_Build 3 157249964 4D ATTAACAATT TATC/---- TAAACAATCT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 TATC 1 0 175916 CASAVA_Build 3 157252166 3D GGCCACACTT GAG/--- GAGCCCTTCA 3041 het 1050 hom 21 8 10 4 GAG 2 1 175917 CASAVA_Build 3 157288838 1D GATTTAAAAT C/- CTGTGCCCCA 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 C 2 1 175918 CASAVA_Build 3 157322670 1D CAAAGGAAAA G/- TAGTCTCGTT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 G 1 0 175919 CASAVA_Build 3 157329527 1I TTCCCGGGGC -/T TTTTATAGTC 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 T 4 5 175920 CASAVA_Build 3 157337706 1D CATACATTGG T/- GGGGGGGGAT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 1 0 175921 CASAVA_Build 3 157349343 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 T 12 11 175922 CASAVA_Build 3 157354701 12D GGTCACCAGA AGTAGTGCAGAT/------------ AGTAGTGCAG 3070 het 3070 ref 49 29 16 8 AGTAGTGCAGAT 2 1 175923 CASAVA_Build 3 157362736 1I TTATACTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 T 11 12 175924 CASAVA_Build 3 157369500 2I CTATGAACAC --/TT TGATGCTATA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 1 3 175925 CASAVA_Build 3 157399230 2I GTCTTGACTC --/TT TATCCAATTT 3070 het 2906 hom 15 6 8 1 T 1 3 175926 CASAVA_Build 3 157403432 6D TTTGCAAAAA TTGTAT/------ TTGTAGTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 5 TTGTAT 1 0 175927 CASAVA_Build 3 157427195 5I AGAAAAAGAA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 AAAAG 2 3 175928 CASAVA_Build 3 157446458 1D CAATATTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2893 hom 29 9 12 8 A 11 10 175929 CASAVA_Build 3 157449511 1D ATCTGGTTGT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 G 1 0 175930 CASAVA_Build 3 157486005 1D TGGGGGGGAT G/- GGGGGGTCTC 3070 het 2065 hom 20 9 8 3 G 7 6 175931 CASAVA_Build 3 157500015 1I TGCCACATGT -/C AACACTGGAC 3070 het 3070 ref 66 30 29 7 C 0 1 175932 CASAVA_Build 3 157507850 1D TCTTTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 13 12 175933 CASAVA_Build 3 157534433 1I CGCTCTTTAT -/A AAAAAAATTA 1860 het 1860 ref 24 15 5 4 A 7 8 175934 CASAVA_Build 3 157534949 1I ATATGGACCT -/A GGGGCAAAAC 3070 het 3070 ref 47 25 21 1 A 0 1 175935 CASAVA_Build 3 157536843 8D AGACTCTGTA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 8 AAAC 5 3 175936 CASAVA_Build 3 157547461 4I TCAAAGAGAT ----/AGAG AAAGAACCTA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AG 0 2 175937 CASAVA_Build 3 157558274 1D TTATTTTATA T/- TTTTATACTA 1754 het 1495 hom 7 3 4 0 T 5 4 175938 CASAVA_Build 3 157559153 1D TCTCTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 11 10 175939 CASAVA_Build 3 157585926 1D TGGATGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 A 12 11 175940 CASAVA_Build 3 157595077 1D GGGATAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 A 10 9 175941 CASAVA_Build 3 157602635 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 11 12 175942 CASAVA_Build 3 157610851 1D TTCCAAAATT A/- TTTGTCAGGT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 1 0 175943 CASAVA_Build 3 157639513 2D AACAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 10 2 A 12 10 175944 CASAVA_Build 3 157722441 1D TTCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 10 9 175945 CASAVA_Build 3 157723311 7D CTGCGATGGC TATTATG/------- TATTATGTCA 3070 hom 111 het 42 0 36 11 TATTATG 2 1 175946 CASAVA_Build 3 157727345 1D GATTCTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 25 11 A 13 12 175947 CASAVA_Build 3 157728658 1D TAATGCAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 559 hom 37 2 25 10 A 14 13 175948 CASAVA_Build 3 157729975 1I AAAGTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1220 hom 33 4 20 9 A 13 14 175949 CASAVA_Build 3 157732497 1I GCTTTTCCAC -/T GGTTTTCCAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 1 175950 CASAVA_Build 3 157736284 2D ATATCTAATA TC/-- TGTGTCCCCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TC 1 0 175951 CASAVA_Build 3 157737724 1D ATCTCACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 12 11 175952 CASAVA_Build 3 157738210 2D TACACATGCT CA/-- GTTTTTTAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CA 1 0 175953 CASAVA_Build 3 157738630 1D AACATGTTTT G/- TTTTTTTTTG 3070 het 495 hom 33 2 25 6 G 1 0 175954 CASAVA_Build 3 157738789 1D TAAAATGCGA T/- TTTTCTGTCA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 5 4 175955 CASAVA_Build 3 157739505 4D TGTATTTCAC AGTT/---- AGTTAGTTAG 3070 hom 69 het 32 0 24 9 AGTT 5 4 175956 CASAVA_Build 3 157745091 1I TCTTCCACTG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 8 9 175957 CASAVA_Build 3 157749258 3I CTATTTCCAT ---/TAC TACTACTACT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 TAC 5 6 175958 CASAVA_Build 3 157768204 1D CAAAGAGATT G/- GGGGCATTTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 G 5 4 175959 CASAVA_Build 3 157820101 1I CTTTCTACCC -/G CCGGCCCTAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 G 0 1 175960 CASAVA_Build 3 157842883 1D AAAAACAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 31 0 25 7 A 10 9 175961 CASAVA_Build 3 157851227 1I CTAAAGTGCT -/G GGGATTATGG 3070 hom 45 het 19 0 14 5 G 3 4 175962 CASAVA_Build 3 157858303 1D ATAATACAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 34 1 26 7 T 12 11 175963 CASAVA_Build 3 157860644 4D TTATCTATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 16 0 9 7 T 18 14 175964 CASAVA_Build 3 157862794 3I TTCCCCATTG ---/ATT ATTAAGATCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ATT 1 2 175965 CASAVA_Build 3 157863206 1I GCCTTTTTTT -/C CCCCTCTCAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 C 4 5 175966 CASAVA_Build 3 157871490 2D TAAAAAGTAT AC/-- ACACACATAC 3070 hom 60 het 25 0 21 6 AC 4 3 175967 CASAVA_Build 3 157879879 3D CACATCTGAA TTC/--- TTCTTTAAAC 3070 hom 105 het 39 0 36 6 TTC 2 1 175968 CASAVA_Build 3 157914337 1I AAATTGTGAG -/A AAAAAATTTG 2029 het 2029 ref 61 48 6 7 A 6 7 175969 CASAVA_Build 3 157919684 1I AGGCAACCAG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 6 7 175970 CASAVA_Build 3 157921860 2I TTATAATATT --/TG TGTCTTTCAT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 TG 1 2 175971 CASAVA_Build 3 157922315 1D GTCTATGTCT G/- CCAGAGTGTC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 G 1 0 175972 CASAVA_Build 3 157925470 1D TCTGTCCACC A/- AAAAAAAAAA 680 het 680 ref 30 16 2 13 A 12 11 175973 CASAVA_Build 3 157925535 1I CTCTTTGTTC -/T ATTTGACTTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 0 1 175974 CASAVA_Build 3 157928249 10D AAATCACAGA TGATCAGATC/---------- TTCTGTGATT 1471 hom 10 het 5 0 4 1 TGATCAGATC 1 0 175975 CASAVA_Build 3 157932989 2D CGAACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 771 hom 47 3 17 27 CA 9 8 175976 CASAVA_Build 3 157937149 1D TCTCTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 11 10 175977 CASAVA_Build 3 157947540 2D CCTAGTACTC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 38 1 33 5 A 11 9 175978 CASAVA_Build 3 157951475 1I TAATTTAGCT -/A AGGCTCTTAG 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 1 2 175979 CASAVA_Build 3 157952493 1D CTCAGCTTTG T/- TTTGCCCTAG 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 4 3 175980 CASAVA_Build 3 157958712 2D TCCCTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 23 8 8 8 TC 8 7 175981 CASAVA_Build 3 157964280 2D GGACTTTTAC AG/-- AGTCATCTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AG 2 1 175982 CASAVA_Build 3 157968218 2D AACTTATAGT AA/-- TTCTTCACAT 3070 hom 120 het 46 0 41 7 A 2 0 175983 CASAVA_Build 3 157985719 1I CCTCTAACTT -/A CCCTTTTGAG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 0 1 175984 CASAVA_Build 3 157986703 1D TTATTCCACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 T 10 9 175985 CASAVA_Build 3 158028953 16I TCTTGTCTAT ----------------/AACTCATGGTCCTCAG GCCTTCTTCC 3070 het 3070 ref 58 25 26 7 AACTCATGGTCCTCAG 0 1 175986 CASAVA_Build 3 158032709 4D CCAACATAAG GAGA/---- GAAAGTCCTC 3070 het 3070 ref 41 21 15 8 GA 3 1 175987 CASAVA_Build 3 158045131 2D TTTTTCAATC TG/-- TAATTTTCTG 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 TG 1 0 175988 CASAVA_Build 3 158051601 1I CATCTGGGCA -/C CCATACTTTG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 C 2 3 175989 CASAVA_Build 3 158053216 1I TTTCAGAATT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 7 8 175990 CASAVA_Build 3 158056485 2D CAATGAAAGC AA/-- AGGTATTCAC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 3 1 175991 CASAVA_Build 3 158066090 5D TCATCTCCCT CTATC/----- ATTGCCCATT 3070 het 3070 ref 54 27 27 5 CTATC 1 0 175992 CASAVA_Build 3 158070243 1D CTTTTGAGGT C/- TTAGCTATAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 C 1 0 175993 CASAVA_Build 3 158083712 1D GGGCCTGTAG C/- CCCCTTTGTT 3070 het 124 hom 21 2 18 1 C 5 4 175994 CASAVA_Build 3 158103193 2I ACTTAAGGTG --/TT AGTTCCTGGT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 0 2 175995 CASAVA_Build 3 158119859 1D TTGTTCCTCC T/- TGATAGTGAC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 2 1 175996 CASAVA_Build 3 158121850 3I AGTGTTTTGA ---/ATG ATAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 ATG 0 1 175997 CASAVA_Build 3 158127891 1I TAAAATCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 12 13 175998 CASAVA_Build 3 158173186 3D GATAAAATAA TAT/--- TATATTTTAA 2478 het 387 hom 8 2 6 0 TAT 2 1 175999 CASAVA_Build 3 158178721 4D TAAGGAACTA ACTC/---- TTTGTAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 ACTC 1 0 176000 CASAVA_Build 3 158179785 5D TAAACAACTT ATAAC/----- AGTGCTCTGT 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 ATAAC 1 0 176001 CASAVA_Build 3 158181052 1D TGGTTGCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 36 0 28 9 A 11 10 176002 CASAVA_Build 3 158182865 1I CAGGAAGGGA -/C TGGTTTTCTA 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 C 0 1 176003 CASAVA_Build 3 158233295 1I GATACTGTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 T 9 10 176004 CASAVA_Build 3 158234534 1I TACTGTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 13 14 176005 CASAVA_Build 3 158264732 4D ATTGCCTGGC TTTG/---- TTTGAGAGGA 3070 het 3070 ref 30 17 8 6 TTTG 2 1 176006 CASAVA_Build 3 158271276 1D CCCTCCCACA C/- CAAAGAAGCC 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 C 2 1 176007 CASAVA_Build 3 158272169 2D CGTGGTGGTG CA/-- CACCTGTAAT 2972 het 2958 hom 17 8 8 2 CA 2 1 176008 CASAVA_Build 3 158283391 1D CTCAGGCAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 71 het 30 0 24 6 A 10 9 176009 CASAVA_Build 3 158294589 1D TTTTAAAAAA G/- GTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 G 2 1 176010 CASAVA_Build 3 158300985 1D AGCGGGGGTT G/- GGGGGGGCGG 1416 hom 28 het 12 0 8 4 G 8 7 176011 CASAVA_Build 3 158301330 8I TATATGGACG --------/CCCTAACC CCTAGTACCT 3066 het 3066 ref 25 12 8 5 CCCTAACC 0 1 176012 CASAVA_Build 3 158309734 2I CTAGATTTCA --/CC CTAGAAGTGA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 C 1 3 176013 CASAVA_Build 3 158334319 1D CCAGGGTCAC A/- ACAGCTGGAC 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 2 1 176014 CASAVA_Build 3 158337927 7I3M3I GAGTTATTGC -------CAA---/CCTTTGGCAATCC AGGTTCAAGT 3070 het 3070 ref 60 30 26 6 N/A 0 0 176015 CASAVA_Build 3 158347114 1D AAAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 703 hom 19 het 18 0 7 11 A 11 10 176016 CASAVA_Build 3 158350471 2I CTGTTGGAGG --/AA AAAAAAAAGT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 8 10 176017 CASAVA_Build 3 158357876 4I CGAAGTAAAC ----/TCTT TAGTCTCACA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TCTT 0 1 176018 CASAVA_Build 3 158359971 2D ACCTGCAGAC AA/-- GAGAGGAGAA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 2 0 176019 CASAVA_Build 3 158365765 1D TCCCCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 27 1 17 10 A 15 14 176020 CASAVA_Build 3 158367327 1D TGAGTACACA C/- ACTCTGAACT 3070 hom 144 het 53 0 49 4 C 1 0 176021 CASAVA_Build 3 158368098 1I AACCCTGCAA -/C ATTCTTACTA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 0 1 176022 CASAVA_Build 3 158369940 5D TCTAAAAAAA AAAAT/----- AAAATAAAAG 3070 hom 80 het 30 0 27 5 AAAAT 2 1 176023 CASAVA_Build 3 158374229 1D CAAAAAACAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 9 8 176024 CASAVA_Build 3 158377510 4D ATTACCAATT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 114 het 48 0 39 10 TC 11 9 176025 CASAVA_Build 3 158380182 3D GGCAGAAGCG CTC/--- CTCATTTCCC 1971 hom 20 het 13 0 7 7 CTC 2 1 176026 CASAVA_Build 3 158382568 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 28 0 24 5 A 12 11 176027 CASAVA_Build 3 158384788 1D AAAAATCAGG C/- CTCTCTTTTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 2 1 176028 CASAVA_Build 3 158385262 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 38 het 22 0 12 10 T 10 9 176029 CASAVA_Build 3 158389957 1I30M4D TAAATCACTC -AAAAAAAAACTATATGATTACATGGAAATTAAAC/AAAAAAAAAACTATATGATTACATGGAAATT---- AATGTGCTCC 3070 hom 54 het 28 0 19 15 N/A 0 0 176030 CASAVA_Build 3 158397750 2D GGGATTACAG GT/-- GCCCACCAGT 3070 hom 68 het 24 0 22 3 GT 1 0 176031 CASAVA_Build 3 158407074 7I TAATGCTATT -------/TAAACAC TAAACACTAA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 TAAACAC 1 2 176032 CASAVA_Build 3 158415274 1D GCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 27 1 22 4 A 15 14 176033 CASAVA_Build 3 158423365 1I ACCTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 910 hom 26 2 20 4 T 13 14 176034 CASAVA_Build 3 158425606 1I ATTTACAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 11 12 176035 CASAVA_Build 3 158436138 1I TGCAGCCTCA -/T TTTTCTGGCT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 4 5 176036 CASAVA_Build 3 158438066 12I TTAGGTATTT ------------/CTGGGCTACATC CTGGGAAGGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CTGGGCTACATC 0 1 176037 CASAVA_Build 3 158451670 12D TTTCTTCCCT TCCCTCCGTCCC/------------ TCCCTCCCTC 1034 hom 13 het 10 0 5 5 TCCCTCCGTCCC 1 0 176038 CASAVA_Build 3 158455336 1I TCAAAACCAC -/T AATGAGATAC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 0 1 176039 CASAVA_Build 3 158461378 5D CTGTAGCTCC TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 hom 108 het 39 0 36 4 TTTTA 3 2 176040 CASAVA_Build 3 158461614 1I GACTTATAAA -/T TCCCTACAGA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 1 2 176041 CASAVA_Build 3 158472724 36D CTCTTTTCTT CTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC/------------------------------------ CTTCCTTCCT 2847 hom 36 het 16 0 10 12 CTTC 14 5 176042 CASAVA_Build 3 158473117 1D GTTTTAAAAA T/- TTTTTATTTT 3070 hom 44 het 21 0 15 6 T 6 5 176043 CASAVA_Build 3 158477378 1D AAGAAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 742 hom 31 3 14 15 T 17 16 176044 CASAVA_Build 3 158485152 1D GGTTTTGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 25 1 18 9 A 14 13 176045 CASAVA_Build 3 158488985 1D CAGAAACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 133 het 55 0 44 11 T 11 10 176046 CASAVA_Build 3 158493467 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 1375 hom 18 het 11 0 6 5 A 16 15 176047 CASAVA_Build 3 158496085 18I AGCAGAGAGC ------------------/TAAGCACTGGTGAAGTAA TGGTGTTGGA 3070 hom 75 het 26 0 26 4 TAAGCACTGGTGAAGTAA 0 1 176048 CASAVA_Build 3 158500178 3D ACATGCAGAC ATT/--- AATGGAAAGA 3070 hom 78 het 32 0 26 8 ATT 1 0 176049 CASAVA_Build 3 158503407 3I AGGAAGAAAA ---/TAT TATAACTTTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TAT 1 2 176050 CASAVA_Build 3 158508674 2I TCTGGTTTAT --/TC TCTTTTAATC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TC 1 2 176051 CASAVA_Build 3 158530105 1D CAGAGTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 37 1 26 10 T 11 10 176052 CASAVA_Build 3 158554741 1I TTTATTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 26 1 20 5 A 10 11 176053 CASAVA_Build 3 158564777 2I CAAACCAAAC --/AA GAGTTATACC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 0 2 176054 CASAVA_Build 3 158592421 4D TAGCACTCTT AAAG/---- AAAAGAAATT 3070 hom 108 het 38 0 34 7 AAAG 1 0 176055 CASAVA_Build 3 158593103 1I CTGATGATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 35 2 27 6 A 10 11 176056 CASAVA_Build 3 158599120 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 24 0 14 10 A 13 12 176057 CASAVA_Build 3 158616114 1I TCACTTGCCC -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 T 6 7 176058 CASAVA_Build 3 158616851 1I TGGAGGAAAT -/A AAAGGGCTAG 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 3 4 176059 CASAVA_Build 3 158619182 1D AAACAAATGG A/- AAAAACATTC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 6 5 176060 CASAVA_Build 3 158631022 2D TAACTGTCTC TT/-- TGTGCAAAAA 3070 het 3070 hom 51 21 28 2 T 3 1 176061 CASAVA_Build 3 158636761 1I ATTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1285 hom 19 3 14 2 A 11 12 176062 CASAVA_Build 3 158643893 1I ACAAAAAAAA -/T GATGAAAACA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 0 1 176063 CASAVA_Build 3 158646131 10D AATTAGCTGG GTGTAGTGGC/---------- GTGCGCCTGT 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 GTGTAGTGGC 1 0 176064 CASAVA_Build 3 158648594 1D CATATTAAAT G/- GGGGGGGGAC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 9 8 176065 CASAVA_Build 3 158653167 2I ATGAGGAAAC --/AG AGGCTGGGAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AG 1 2 176066 CASAVA_Build 3 158655911 1I CTTTGCCGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 539 hom 34 2 25 7 T 9 10 176067 CASAVA_Build 3 158660090 5D AAAATAAAAG AAGAC/----- AAGGAGAATA 3070 het 3070 ref 43 25 15 6 AAGAC 1 0 176068 CASAVA_Build 3 158671152 1D CTAATACAAT A/- AAGGCTTCCT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 A 3 2 176069 CASAVA_Build 3 158672198 1D TGACCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 12 11 176070 CASAVA_Build 3 158675305 1I GCATGGTGTT -/A AAAAAAAAAA 2951 het 2951 ref 20 9 7 4 A 11 12 176071 CASAVA_Build 3 158677002 3D CATACCATAA CTT/--- CTTCTGCCCC 3070 het 3070 hom 48 18 20 11 CTT 2 1 176072 CASAVA_Build 3 158678037 1D TAAGAACTGG A/- GTGGTGGACA 3070 het 3070 ref 58 26 26 8 A 1 0 176073 CASAVA_Build 3 158680568 2I TTTCTTTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TC 7 8 176074 CASAVA_Build 3 158682709 4I TGGTAGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 63 het 33 0 22 11 TTTG 2 3 176075 CASAVA_Build 3 158690196 2D GTCAGAGGGC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 159 hom 36 4 19 13 T 11 9 176076 CASAVA_Build 3 158715974 1I ATTTCCATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 9 10 176077 CASAVA_Build 3 158716603 1D ATTCTCCTTT A/- TTTTCTTCTA 3070 hom 93 het 35 0 32 6 A 1 0 176078 CASAVA_Build 3 158721246 1I ATGAAATTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 8 9 176079 CASAVA_Build 3 158723601 1D TTCTTTCTTT C/- TTTTTTTAGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 1 0 176080 CASAVA_Build 3 158736731 1D ATCCCTTCTA G/- CTTGTATGGT 3070 het 3070 ref 40 23 11 7 G 1 0 176081 CASAVA_Build 3 158745499 1D CAGCTTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 40 1 29 10 T 15 14 176082 CASAVA_Build 3 158747387 1I CCAGCTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 9 10 176083 CASAVA_Build 3 158751736 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 7 6 176084 CASAVA_Build 3 158757759 1D TATAGAAAAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 9 8 176085 CASAVA_Build 3 158760467 8D GCCTCCCAAA GTGCTGGG/-------- ATTACAGGCG 3070 het 2304 hom 23 7 12 5 GTGCTGGG 1 0 176086 CASAVA_Build 3 158761575 2D TCTTTTTTTT TG/-- TGTGTTATTG 3070 het 2761 hom 29 8 12 9 TG 3 2 176087 CASAVA_Build 3 158764333 1D TCTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2457 hom 19 8 7 4 T 12 11 176088 CASAVA_Build 3 158764507 1I CTAATTTTTT -/G TATTTTTAGT 1169 het 1169 ref 9 3 3 3 G 0 1 176089 CASAVA_Build 3 158776817 3D TCAGCTGGAA TTG/--- TTGTCTAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 8 TTG 2 1 176090 CASAVA_Build 3 158777564 2I TAAATATTTA --/AT ATGTCTGTAC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 AT 1 2 176091 CASAVA_Build 3 158778632 1I TACAAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 933 hom 31 2 23 6 T 11 12 176092 CASAVA_Build 3 158791012 1I TAACCTTTGT -/A AGACCTTGCT 3070 hom 151 het 53 0 51 2 A 1 2 176093 CASAVA_Build 3 158800112 4I TTAAAATGGC ----/CTCT CTAAGTGTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CT 1 3 176094 CASAVA_Build 3 158801115 2D CATTATAAAC CA/-- CAGAGGCCCT 3070 hom 111 het 41 0 38 5 CA 2 1 176095 CASAVA_Build 3 158802646 2D GACAAGAGAA TC/-- ATATGTTTCC 3070 hom 114 het 43 0 39 5 TC 1 0 176096 CASAVA_Build 3 158818177 2D AGGACAAAAC TG/-- AAACTGATTC 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 TG 1 0 176097 CASAVA_Build 3 158845269 4D GCTTTGACTT AAAC/---- AAACCACCCA 3070 het 3070 hom 33 13 18 4 AAAC 2 1 176098 CASAVA_Build 3 158908132 3I10M1D3M10D AGGTAAATGC ---TCAACATCACTAATTATTAGGTAA/AAATTAAAATCAC-AAT---------- GGGGTACCAC 3070 het 3070 ref 43 24 24 1 N/A 0 0 176099 CASAVA_Build 3 158913681 4D TGCACACTTA ATAG/---- ATAGACTACA 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 ATAG 2 1 176100 CASAVA_Build 3 158937259 1D TATAAGATGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 8 7 176101 CASAVA_Build 3 158944737 2D TTGTGTCATC TA/-- TGATTTCTTT 3070 het 3070 ref 26 17 9 1 TA 1 0 176102 CASAVA_Build 3 158949293 1I TCATTACTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 32 1 25 6 A 11 12 176103 CASAVA_Build 3 158954791 2I TTCTTCTCCA --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 12 14 8 T 8 10 176104 CASAVA_Build 3 158995074 1D CAGCTCGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 T 13 12 176105 CASAVA_Build 3 159010157 1I AGCCAAAAGG -/T TTAGATACTG 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 T 2 3 176106 CASAVA_Build 3 159019764 1D AGAAGCTCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 8 10 A 12 11 176107 CASAVA_Build 3 159021212 1I GGTTTTCCTC -/A AAAAAAAAAA 1089 het 1089 ref 37 12 6 19 A 17 18 176108 CASAVA_Build 3 159038538 5D ACATCAACTC AAAAT/----- AAGACAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 AAAAT 1 0 176109 CASAVA_Build 3 159050195 1D GGAATTACAA T/- TTGACATAAG 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 T 3 2 176110 CASAVA_Build 3 159050747 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTG 2430 hom 15 het 10 0 6 4 T 9 10 176111 CASAVA_Build 3 159061135 5D TAAGCTGGGC GGGGG/----- GGGGGGGGGC 3070 hom 47 het 21 0 17 4 G 14 9 176112 CASAVA_Build 3 159066835 3D CCTGAGAAAT AAG/--- AAATCATTGG 3070 hom 123 het 46 0 41 6 AAG 1 0 176113 CASAVA_Build 3 159095225 1D GGGTCTTGGC A/- AAAAAAAAAA 2301 het 398 hom 41 9 9 23 A 16 15 176114 CASAVA_Build 3 159105455 8D8M3D TCCTTTGACC TTCAACCTTTCCTTTGGCA/--------TGTCTTTG--- CCTCCAGCAG 3070 hom 108 het 37 0 37 3 N/A 0 0 176115 CASAVA_Build 3 159106105 1I TTTATCTATC -/T TGTTTCCAAT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 1 2 176116 CASAVA_Build 3 159107690 9D ATTCCCTCTA AATAAAAAG/--------- AATAAAAAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 AATAAAAAG 2 1 176117 CASAVA_Build 3 159117565 1D CTGGCACCAG A/- AACCTGTGGC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 A 3 2 176118 CASAVA_Build 3 159119760 1I TTTAAAACTG -/A AAAAAATATG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 6 7 176119 CASAVA_Build 3 159144830 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 226 hom 39 1 32 9 A 10 9 176120 CASAVA_Build 3 159160531 4I TTTACAGCAA ----/AAAG AAAGAATTGC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AAAG 1 2 176121 CASAVA_Build 3 159164459 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGCGGGT 3070 het 742 hom 29 4 12 13 G 6 5 176122 CASAVA_Build 3 159166327 2D TTGCCAATTC CT/-- CTCTCATAAC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 CT 3 2 176123 CASAVA_Build 3 159171706 3I TTTAATTTGT ---/ATA ATATTTTTAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 ATA 1 2 176124 CASAVA_Build 3 159178773 1I ACAAATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 39 2 28 9 A 13 14 176125 CASAVA_Build 3 159188925 1I AATGCATGAT -/G GGGGCTCAAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 4 5 176126 CASAVA_Build 3 159199492 1D GCTAAGTCCC A/- GCCCCACCCA 3070 hom 77 het 29 0 25 6 A 1 0 176127 CASAVA_Build 3 159203140 1I GATTCTTTGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 2533 hom 14 6 7 1 T 8 9 176128 CASAVA_Build 3 159207339 1I GTGATACAGG -/A AAAAAACTGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 6 7 176129 CASAVA_Build 3 159220069 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 7 6 176130 CASAVA_Build 3 159230327 1I ACCACCAGGC -/A AGGTAGCAGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 2 176131 CASAVA_Build 3 159230608 1D GAGATGGGCA T/- ATTGATTTTG 3070 hom 151 het 53 0 51 2 T 1 0 176132 CASAVA_Build 3 159243155 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAACTA 1331 het 1331 ref 44 32 4 9 C 1 0 176133 CASAVA_Build 3 159269691 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 7 8 176134 CASAVA_Build 3 159274211 1I TGTGAGCAGT -/A AAAGACTCCA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 A 3 4 176135 CASAVA_Build 3 159277912 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 885 het 885 ref 21 8 3 10 A 14 15 176136 CASAVA_Build 3 159278282 6D TAAAGTTAAC ATTTAA/------ ATTTAAAATT 3070 hom 135 het 47 0 44 4 ATTTAA 2 1 176137 CASAVA_Build 3 159278991 4D ATATATAGAC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 59 het 27 0 20 7 GT 11 9 176138 CASAVA_Build 3 159295820 3I GATTTCTTCC ---/AGA AGAAGGGGGC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 AGA 1 2 176139 CASAVA_Build 3 159302073 1D GACTGCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 11 10 176140 CASAVA_Build 3 159306941 4I ATACTTCCTA ----/ACGG ACGGCGGCCT 3070 hom 50 het 21 0 15 6 ACGG 1 2 176141 CASAVA_Build 3 159308075 1I TTCGAGTCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 439 hom 20 1 16 3 A 9 10 176142 CASAVA_Build 3 159313855 1I GTTTTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 861 het 67 hom 12 1 5 6 T 15 16 176143 CASAVA_Build 3 159317224 1D GAGTCCCCTG A/- AAAGTGTTGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 4 3 176144 CASAVA_Build 3 159317999 1D GTCTCAAACT C/- CCTGGGTTCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 3 2 176145 CASAVA_Build 3 159318123 4D TTCTCCTGTT TTTA/---- AAGACAGGAT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 TTTA 1 0 176146 CASAVA_Build 3 159318365 12D TCTGTCTCTT TTTCTTTCTTTC/------------ TTTCTTTCTT 3070 hom 75 het 31 0 26 7 TTTC 7 4 176147 CASAVA_Build 3 159320204 2D CACATGTGAA TT/-- TATATGTATG 3070 hom 57 het 21 0 19 3 T 3 1 176148 CASAVA_Build 3 159321409 2I AGAATCTAAA --/GG TTAAAGTAAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 G 0 2 176149 CASAVA_Build 3 159329772 5D TCTTTCTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1980 het 678 hom 30 10 7 13 T 23 18 176150 CASAVA_Build 3 159334591 3D GAATAATAAT ATC/--- AGCCTGAAAA 3070 hom 117 het 45 0 39 7 ATC 1 0 176151 CASAVA_Build 3 159337887 2D ACCCAATTAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 15 0 13 3 AT 8 7 176152 CASAVA_Build 3 159343262 1I CACCAGGGTC -/T CACCTCCAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 1 176153 CASAVA_Build 3 159347999 1I ATAAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 33 1 27 5 T 10 11 176154 CASAVA_Build 3 159350547 1I TTATGTAAAC -/T TTTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 6 7 176155 CASAVA_Build 3 159352566 1D GGGCAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 477 hom 46 2 37 7 T 11 10 176156 CASAVA_Build 3 159354326 1I AAAACTTCTC -/T TTTGTCTGTT 3070 hom 19 het 35 1 29 5 T 3 4 176157 CASAVA_Build 3 159359422 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 574 hom 28 4 12 12 A 17 16 176158 CASAVA_Build 3 159361415 1D GGTCAAATAA T/- TTGCTCTTAC 3070 hom 160 het 59 0 54 5 T 3 2 176159 CASAVA_Build 3 159364243 2I TTTATAGCAA --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 41 0 33 8 TG 0 1 176160 CASAVA_Build 3 159368543 1I AACTGTTTTA -/C TGCCTGTTTT 3070 hom 111 het 48 0 38 10 C 0 1 176161 CASAVA_Build 3 159370791 1I CTGGTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 28 1 24 3 T 12 13 176162 CASAVA_Build 3 159375967 1I TATGGTATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 83 het 33 0 27 6 T 9 10 176163 CASAVA_Build 3 159384766 1D ATGGTTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1151 hom 33 3 23 7 A 12 11 176164 CASAVA_Build 3 159385514 1D GTTTTAAATC T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 7 176165 CASAVA_Build 3 159391397 4D TGAGGTGGAG TTTC/---- TTTCTTTTAT 3070 hom 173 het 63 0 56 8 TTTC 2 1 176166 CASAVA_Build 3 159396663 2D TCGTTGAGCA GT/-- GTGGTTTGTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 GT 2 1 176167 CASAVA_Build 3 159412304 3D CAATAAATGG TCA/--- TCATTTTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 TCA 2 1 176168 CASAVA_Build 3 159413987 1I TTGTGGGTAT -/A AAACCCAAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 3 4 176169 CASAVA_Build 3 159414539 1I AAAATTATAC -/A AAAAAGTACA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 5 6 176170 CASAVA_Build 3 159415524 1D CAGATTTTGC T/- TTGTGTATTT 3070 hom 144 het 51 0 49 3 T 3 2 176171 CASAVA_Build 3 159415782 1D ATATAGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 592 hom 33 3 12 18 T 17 16 176172 CASAVA_Build 3 159418249 2I GTGTGTGTGT --/GG GGGGGGGGAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 8 10 176173 CASAVA_Build 3 159428930 1D AACCATTGAG A/- ACTACATAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 1 176174 CASAVA_Build 3 159430266 1I TTGTTTCTCT -/C TGACTACACA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 0 1 176175 CASAVA_Build 3 159431032 4D TAAGTGAATA AATG/---- AAATAAAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AATG 1 0 176176 CASAVA_Build 3 159432723 2I CTTTAAAAAG --/AT ATATATATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AT 4 5 176177 CASAVA_Build 3 159433507 1D GAATGAATAA T/- TAAAAAACAG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 2 1 176178 CASAVA_Build 3 159435082 1I TTCCTCATAT -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 0 1 176179 CASAVA_Build 3 159444519 1D TGAAGTGGGG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 T 9 8 176180 CASAVA_Build 3 159458822 1D AGGATAAAAG T/- TTTTTTTTTG 1312 het 1312 ref 36 29 3 4 T 10 9 176181 CASAVA_Build 3 159460627 3I TTTCTGAAGG ---/AGA AGGAGTCTCT 3070 hom 117 het 47 0 38 9 AGA 0 1 176182 CASAVA_Build 3 159481581 6D GTGGCAGTTG ATATAA/------ ATATAGATAG 3070 hom 54 het 21 0 19 5 ATATAA 1 0 176183 CASAVA_Build 3 159484365 1D ATTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 13 12 176184 CASAVA_Build 3 159490542 1D TATATGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 43 1 33 10 T 11 10 176185 CASAVA_Build 3 159507471 1D ATCAAAGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 10 9 176186 CASAVA_Build 3 159514888 1D AAAAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 28 0 22 6 T 14 13 176187 CASAVA_Build 3 159515515 2I ACTTTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 19 1 12 6 A 14 16 176188 CASAVA_Build 3 159524440 4D ACACAGAGAG AGAC/---- AGAGAATCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AGAC 1 0 176189 CASAVA_Build 3 159524719 1I ATTGTGCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 18 1 15 2 T 10 11 176190 CASAVA_Build 3 159532918 3I TTCACCTCTT ---/AAC AAAATAAATC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAC 0 1 176191 CASAVA_Build 3 159538694 1I ATAACTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 41 0 31 10 T 11 12 176192 CASAVA_Build 3 159550045 5D AGCATTACAG TTTTC/----- TTTTATACAG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TTTTC 1 0 176193 CASAVA_Build 3 159568526 1D GTTTAGTAGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 119 het 48 0 39 10 A 9 8 176194 CASAVA_Build 3 159575236 7I ATAAAAGGTC -------/ATTTTGA ATTTTGAATT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 ATTTTGA 2 3 176195 CASAVA_Build 3 159577342 1D ATTCTTTTAC A/- TTTTTTTAGA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 1 0 176196 CASAVA_Build 3 159583992 4D CAAGGGAAAA TATC/---- TATCAAATCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TATC 2 1 176197 CASAVA_Build 3 159587556 1I CATTTTCATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 9 10 176198 CASAVA_Build 3 159589096 1D GTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 36 0 34 2 T 16 15 176199 CASAVA_Build 3 159596876 1I ATGGGCAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1001 hom 33 4 19 10 T 14 15 176200 CASAVA_Build 3 159610212 3D TGTGCTTTAG GAT/--- GATAACTTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 GAT 2 1 176201 CASAVA_Build 3 159611994 1I CTACTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 10 11 176202 CASAVA_Build 3 159614129 1I ATTACAAGAG -/A AAAAAAAAAG 2352 hom 12 het 8 0 5 3 A 9 10 176203 CASAVA_Build 3 159620304 3D TAAATCTAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 23 11 A 15 12 176204 CASAVA_Build 3 159627674 1D AGCCAACCAA C/- CAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 7 C 2 1 176205 CASAVA_Build 3 159629920 2I GTGTGTATAC --/AT ATGTCTTGTA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AT 1 2 176206 CASAVA_Build 3 159631755 2I AAATCTCCAC --/AA AAAATTAGAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 4 6 176207 CASAVA_Build 3 159634871 1D ATATCCAGTG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 8 7 176208 CASAVA_Build 3 159637513 2D TAGTAATTCA TT/-- TTATGGCTAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 4 2 176209 CASAVA_Build 3 159640675 4D TTGGAAAAAG TTCT/---- TCGTGTTTGA 3070 hom 120 het 42 0 41 3 TTCT 1 0 176210 CASAVA_Build 3 159641933 1I ATCAGTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1000 hom 50 4 37 9 T 10 11 176211 CASAVA_Build 3 159646768 1I TGTTGCAAGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 8 9 176212 CASAVA_Build 3 159646830 2D AGTACTATAC TG/-- TGTTACTTTT 3070 hom 45 het 24 0 16 9 TG 2 1 176213 CASAVA_Build 3 159650113 1I TATATATATA -/T TTTTTATTAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 5 6 176214 CASAVA_Build 3 159650815 1D TCTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 30 3 16 12 T 15 14 176215 CASAVA_Build 3 159653866 1D GCCCGGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 21 0 13 8 T 15 14 176216 CASAVA_Build 3 159658692 3D ATGCTGACTA AGG/--- AGGAGCAATA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 AGG 2 1 176217 CASAVA_Build 3 159662481 1D AAACCAAGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 972 hom 42 5 20 17 A 16 15 176218 CASAVA_Build 3 159665085 2I TCATCAAATC --/TT TTGCCAGAGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 4 176219 CASAVA_Build 3 159675407 1I GAGGGGAGAC -/A GGGGGTGGTT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 0 1 176220 CASAVA_Build 3 159679432 2D GAGAAAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 42 1 29 12 A 17 15 176221 CASAVA_Build 3 159687779 1I CAATTTATAA -/T TTTGGAAGTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 3 4 176222 CASAVA_Build 3 159704220 1I TCCCACCGTG -/C CCCCCCCAAC 3070 het 353 hom 28 1 20 7 C 7 8 176223 CASAVA_Build 3 159717675 1I TTTACAATTA -/C ATTTTCTGTT 3070 hom 65 het 25 0 21 4 C 0 1 176224 CASAVA_Build 3 159718080 1D TTTGTTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 22 1 14 7 T 13 12 176225 CASAVA_Build 3 159722174 3I TGGAGTTGCC ---/TTA TTATTATATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTA 2 3 176226 CASAVA_Build 3 159732474 3D CATTTCAAAG TTT/--- TTTATTATCT 3070 hom 123 het 45 0 42 5 T 6 3 176227 CASAVA_Build 3 159736005 4I ATTCAGTAAC ----/AATG AATACCCCTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AATG 0 1 176228 CASAVA_Build 3 159739591 1D ATAGCAAGGA T/- TTAACTCTCT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 3 2 176229 CASAVA_Build 3 159748562 1D ATAAGATAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 62 het 40 1 31 8 A 10 9 176230 CASAVA_Build 3 159749627 1I CTCTCCTTAG -/C ATCTTGTATT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 C 0 1 176231 CASAVA_Build 3 159753447 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 13 12 176232 CASAVA_Build 3 159759730 1I ACCATGATTG -/T TAAGTTTCCT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 1 2 176233 CASAVA_Build 3 159762418 2D CAGCTAGTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 11 9 176234 CASAVA_Build 3 159763232 1D CCTAGTACAT A/- GGTTTTAGCT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 1 0 176235 CASAVA_Build 3 159775168 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 15 1 10 4 A 18 17 176236 CASAVA_Build 3 159787295 5I AAAATGTGGA -----/AATAT AATAAGGTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 AATAT 0 1 176237 CASAVA_Build 3 159789106 2I AAAAAAAAAA --/GC AAGCAGAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 GC 0 1 176238 CASAVA_Build 3 159793623 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 10 11 176239 CASAVA_Build 3 159794275 17D GTAGATAGAT AAGCACAACGTTTGGAA/----------------- AAGCACAGAT 3070 hom 120 het 42 0 41 4 AAGCACAACGTTTGGAA 1 0 176240 CASAVA_Build 3 159794957 1I TAGACCGTAG -/T AAGGAGAGTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 0 1 176241 CASAVA_Build 3 159800917 3I21M1D TATTTAGTAA ---TATCATTAGGCAAAATGTGTCT/TATTATCATTAGGCAAAATGTGTC- TTAAATATTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 N/A 0 0 176242 CASAVA_Build 3 159801014 1D41M2I ATCCAAACTC AAAATACTAGTAATATTTTAATGTATTTCTTCCTAATCATTT--/-AAATACTAGTAATATTTTAATGTATTTCTTCCTAATCATTTTA TATATATATA 3070 hom 72 het 27 0 24 10 N/A 0 0 176243 CASAVA_Build 3 159801246 3D TGTACTGTTC AGT/--- AGTACTTAGG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AGT 2 1 176244 CASAVA_Build 3 159808129 1D TGCTAATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 26 0 23 5 A 11 10 176245 CASAVA_Build 3 159813077 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 8 176246 CASAVA_Build 3 159815537 1D GATGTTGAAC A/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 43 0 37 8 A 1 0 176247 CASAVA_Build 3 159815767 1D GTGCAGAAAA T/- TTTTTAGTTA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 6 5 176248 CASAVA_Build 3 159816292 1I AATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 434 hom 22 1 19 2 T 9 10 176249 CASAVA_Build 3 159816748 1I TCCTTTCCAA -/T TTGCATGCCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 2 3 176250 CASAVA_Build 3 159816908 1I TAGCTATGGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 299 hom 28 1 27 0 T 8 9 176251 CASAVA_Build 3 159818049 1I ACTTGAGGGG -/A AAAAAAGTTG 3070 hom 75 het 27 0 26 3 A 6 7 176252 CASAVA_Build 3 159818164 1D ACTTTGGGTT A/- AAAAAATTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 6 176253 CASAVA_Build 3 159818566 2D TGTACAAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 12 10 176254 CASAVA_Build 3 159818763 4I TCTTAAACAA ----/TCAG TCATTTTATT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TCAG 0 1 176255 CASAVA_Build 3 159818853 6I AAAATACCTC ------/TTTATT TTTATAACTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTTATT 0 1 176256 CASAVA_Build 3 159821335 1I CTGGACAAGA -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 18 0 15 3 C 0 1 176257 CASAVA_Build 3 159830198 7I TTATTAAACA -------/TGTGTCT CCTCAAACAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TGTGTCT 0 1 176258 CASAVA_Build 3 159843671 1D CAGGGCCTTC G/- GTTCCCTGTC 3070 hom 103 het 38 0 34 5 G 2 1 176259 CASAVA_Build 3 159845464 2D TTTTCTAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 44 0 25 19 T 18 16 176260 CASAVA_Build 3 159852308 1D AAACCAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 9 176261 CASAVA_Build 3 159856625 1D ATTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 9 8 176262 CASAVA_Build 3 159857086 3I GCCAACACTT ---/AAG GAGGGGGGAA 3070 hom 87 het 37 0 28 9 AAG 0 1 176263 CASAVA_Build 3 159863995 1D TTGGGATTTT C/- CAGACCTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 2 1 176264 CASAVA_Build 3 159874440 1D TCTGATTGAC T/- TTGCCTTTAA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 3 2 176265 CASAVA_Build 3 159876808 1I TCTCTTTGGG -/A AAAGCAAAAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 3 4 176266 CASAVA_Build 3 159879180 3I AAACATTGTT ---/AAA ATTACAACAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 1 4 176267 CASAVA_Build 3 159882452 1I TAATGCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 10 11 176268 CASAVA_Build 3 159885486 3I AACTACAGTC ---/TTG TTATTTCTAG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 TTG 0 1 176269 CASAVA_Build 3 159886881 1I TTTTATATAT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 32 het 12 0 11 1 A 7 8 176270 CASAVA_Build 3 159887135 3D ATAGTATATA TAT/--- TATTAAGTAT 3070 hom 63 het 23 0 20 3 TAT 2 1 176271 CASAVA_Build 3 159891785 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAACCCT 436 het 436 ref 31 10 2 21 AAC 1 0 176272 CASAVA_Build 3 159899161 1I TGACATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 625 hom 33 2 28 3 T 11 12 176273 CASAVA_Build 3 159913134 1D CTCTGTTGTC A/- AAGTCATTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 3 2 176274 CASAVA_Build 3 159936981 5D GTTCCTGCCT ATGAG/----- ATGAGATGGT 3070 hom 133 het 49 0 43 6 ATGAG 2 1 176275 CASAVA_Build 3 159937984 1I CGAATACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 43 1 35 7 T 11 12 176276 CASAVA_Build 3 159943363 1D GGCATTTGGG C/- TAACCAGACT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 1 0 176277 CASAVA_Build 3 159944056 2D GATTTTAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 27 12 T 13 11 176278 CASAVA_Build 3 159962833 1D TGACCAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 321 hom 41 4 22 15 T 17 16 176279 CASAVA_Build 3 159971661 1D TCTTGAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 29 8 A 11 10 176280 CASAVA_Build 3 159985785 1D TATATTTTAC A/- GCGGCAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 1 0 176281 CASAVA_Build 3 160031106 4I GGTGTTGAAT ----/ATTG ACCTCACAAG 3070 het 3070 hom 55 21 29 5 ATTG 0 1 176282 CASAVA_Build 3 160081661 1I TGACAATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 11 12 T 13 14 176283 CASAVA_Build 3 160086928 1I GGATGTTTTT -/C CCCCTCCAGA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 C 4 5 176284 CASAVA_Build 3 160088485 1I CACAGTGGAA -/T AAAACTGTAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 0 1 176285 CASAVA_Build 3 160089028 3D GCCCACTTTT TGA/--- TGATGGGGTT 2190 het 1684 hom 14 6 5 3 TGA 2 1 176286 CASAVA_Build 3 160093786 1D AGAATAATCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 53 18 28 9 T 9 8 176287 CASAVA_Build 3 160097318 4I TAATGAGCAG ----/GTGC GTTGTTCGAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 GTGC 0 1 176288 CASAVA_Build 3 160100880 1D CCTCCAACTC T/- TTTGTTTTCC 3070 hom 115 het 44 0 39 6 T 4 3 176289 CASAVA_Build 3 160104229 1I AATGACATAC -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 8 176290 CASAVA_Build 3 160105520 1D GAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 9 8 176291 CASAVA_Build 3 160108793 1I TTAGCCAGTT -/A AAAAAATACT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 6 7 176292 CASAVA_Build 3 160124261 2I ACACTGGGGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 90 hom 31 1 17 14 GT 7 8 176293 CASAVA_Build 3 160154462 1D GGCCCACCTT A/- AGAGTTAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 2 1 176294 CASAVA_Build 3 160167995 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 27 2 23 2 A 15 13 176295 CASAVA_Build 3 160183836 2I GTGGATCGGG --/GA TTAGTAGTGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GA 0 1 176296 CASAVA_Build 3 160184731 49D ATTTTAGTAC AGATTTAGTACAGATACACTATTTAGTGCAGATACACTATTTAGTATTT/------------------------------------------------- AGTTTGGCCT 3070 hom 62 het 22 0 21 8 AGATTTAGTACAGATACACTATTTAGTGCAGATACACTATTTAGTATTT 1 0 176297 CASAVA_Build 3 160185648 1D GTTGTTTTAC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 111 het 44 0 38 7 T 9 8 176298 CASAVA_Build 3 160196358 2D CTTGGAAGAC TG/-- TGGGCGGGGA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 TG 2 1 176299 CASAVA_Build 3 160201959 1I TTCCTTCCTT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 111 het 45 0 37 8 A 8 9 176300 CASAVA_Build 3 160208258 1D CTTCCCCTTC T/- TTTTTTTTTT 2836 hom 3 het 27 1 9 18 T 15 14 176301 CASAVA_Build 3 160210287 1I TATTCCTAGC -/T TTTTTAGGTC 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 5 6 176302 CASAVA_Build 3 160232190 2D TGTGAAAAAC AT/-- GTGTATTCCT 3070 hom 96 het 36 0 32 5 AT 1 0 176303 CASAVA_Build 3 160239287 1I TTCCCAGGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 134 het 53 0 45 8 T 9 10 176304 CASAVA_Build 3 160239926 2D CAATCTTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 29 0 17 12 T 16 14 176305 CASAVA_Build 3 160244541 1I TATCAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 28 1 21 6 T 10 11 176306 CASAVA_Build 3 160266097 2I AGATAGGGTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 45 1 35 9 T 10 12 176307 CASAVA_Build 3 160284733 2I AAAAATAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 25 0 15 10 A 11 13 176308 CASAVA_Build 3 160285397 1I GCATAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 10 11 176309 CASAVA_Build 3 160293280 1D GAATTAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 12 11 176310 CASAVA_Build 3 160315038 1D CAGTGATCCA C/- CCCCCCTCGG 3070 hom 42 het 17 0 13 4 C 7 6 176311 CASAVA_Build 3 160341640 1I GCTTCCTTGA -/G GAAATTGTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 2 176312 CASAVA_Build 3 160342916 1D TCCCCCCCCC A/- CCAGATGGAG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 1 0 176313 CASAVA_Build 3 160346058 1D TTTAGTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 13 12 176314 CASAVA_Build 3 160398315 1D GCTTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 1203 het 1203 ref 48 35 3 10 T 11 10 176315 CASAVA_Build 3 160470194 3I3M5I GTTTGTAACA ---CAA-----/ATTCAATGCTT GGATAAATGC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 N/A 0 0 176316 CASAVA_Build 3 160473406 1D TTCTCCAGGG A/- AAAGCCCTTC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 4 3 176317 CASAVA_Build 3 160476594 1I ATTTTAACCC -/T TTTTGGCACT 3070 het 3070 ref 49 20 18 11 T 4 5 176318 CASAVA_Build 3 160480169 1I TTTCAGTCTT -/C CAGGTTGCAA 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 C 1 2 176319 CASAVA_Build 3 160481600 1D CACATCAGTC T/- TTTTTGAAAG 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 6 5 176320 CASAVA_Build 3 160482962 1D GAATTTTAAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 9 8 176321 CASAVA_Build 3 160483997 1D GATTATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1020 hom 27 8 12 7 T 13 12 176322 CASAVA_Build 3 160486601 1D TTTGTTGTAA T/- ATAGGTAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 T 1 0 176323 CASAVA_Build 3 160496625 1I CTTGCTGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 11 11 T 13 14 176324 CASAVA_Build 3 160503934 4I AGAGAGAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 39 14 11 14 AG 5 7 176325 CASAVA_Build 3 160509630 1I AGTTAAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 9 10 176326 CASAVA_Build 3 160510084 1I GGTATCTTGT -/A ACCTTCCAGG 3070 het 3070 ref 56 27 22 7 A 1 2 176327 CASAVA_Build 3 160513977 5D TCCTGAAATA AGAAT/----- AGAAGTAAGT 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 AGAAT 1 0 176328 CASAVA_Build 3 160516418 1D GGGAGGGGGT A/- GGGGGCTTAT 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 A 1 0 176329 CASAVA_Build 3 160524727 5D TACTTACTAC AAATA/----- AAATATTTAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AAATA 2 1 176330 CASAVA_Build 3 160535384 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 703 hom 35 2 29 4 T 12 11 176331 CASAVA_Build 3 160547505 1D GCCTCCCTTA T/- TTTTTTTCCG 3070 hom 95 het 42 0 34 8 T 8 7 176332 CASAVA_Build 3 160566800 3D CAAACCCCAC CCA/--- CCACCAGGTG 3070 hom 114 het 41 0 38 4 CCA 3 2 176333 CASAVA_Build 3 160570149 4I GAAGAAGTCA ----/GTTT GTTTGGTACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GTTT 1 2 176334 CASAVA_Build 3 160571546 4D CTGTCTTTCC TGAT/---- TGATTAGAAT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 TGAT 2 1 176335 CASAVA_Build 3 160580674 4I TGACTTTTAA ----/AGAT AGATAGGCAG 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 AGAT 1 2 176336 CASAVA_Build 3 160582717 1I CATTAGGTAT -/A TCTCCTAATG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 0 1 176337 CASAVA_Build 3 160608884 2I TTGCAATGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 22 1 17 4 A 10 12 176338 CASAVA_Build 3 160615706 1I GCAACATGAC -/T TTTGGCAAAT 3070 hom 148 het 57 0 50 7 T 3 4 176339 CASAVA_Build 3 160616517 2I GATGGCAAAC --/AG AGTCAAACTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AG 1 2 176340 CASAVA_Build 3 160619297 1I GATGGCAGAA -/C TCAGTAACCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 0 1 176341 CASAVA_Build 3 160623444 4I TTAGTTACAT ----/ACTC AAGAGTAGAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 ACTC 0 1 176342 CASAVA_Build 3 160629708 1D ATGACATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 20 2 14 4 A 13 12 176343 CASAVA_Build 3 160632476 1I GATTCTAAAA -/T GCAGTAGTAT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 0 1 176344 CASAVA_Build 3 160632823 8D GTGTGTGTGT GAGAGAGA/-------- GAGAGAGAGA 2180 het 117 hom 23 3 15 6 GA 11 7 176345 CASAVA_Build 3 160687613 1I CTAAGATTCA -/G CCTGTCTTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 0 1 176346 CASAVA_Build 3 160829626 2D TTAAACAAAA AC/-- ACACACACAC 1368 het 1368 ref 41 27 3 11 AC 10 9 176347 CASAVA_Build 3 160892864 1D AGATTTGGTC T/- TTTCAAATAG 2667 het 2667 ref 13 7 6 0 T 4 3 176348 CASAVA_Build 3 160893248 2D AGAAGGAAAA AT/-- ACGTCCAATA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AT 1 0 176349 CASAVA_Build 3 160905579 1D CCTGAGTAGC T/- GAGATTACAG 2767 het 2091 hom 12 6 6 0 T 1 0 176350 CASAVA_Build 3 160914338 1D ACAGCAAAGC A/- AACAAATACA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 3 2 176351 CASAVA_Build 3 160922529 1D TATGTCTGCA T/- TCTCATCCCT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 T 2 1 176352 CASAVA_Build 3 160928500 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAGGCAA 3070 het 2602 hom 24 8 11 5 A 5 6 176353 CASAVA_Build 3 160941458 2I AGCCTCTTGC --/AG AGACCAAACC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 AG 1 2 176354 CASAVA_Build 3 160947036 1I TAAAATTTAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 8 9 176355 CASAVA_Build 3 160951385 1D TCCAAACAAA C/- AAAAAAAAAT 3070 het 197 hom 28 1 22 5 C 1 0 176356 CASAVA_Build 3 160954556 1D TTAAATCCCA C/- TTGGAGAAAA 3070 het 3070 ref 48 28 17 4 C 1 0 176357 CASAVA_Build 3 160959008 1D CTGGAAAAAG A/- AAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 7 6 176358 CASAVA_Build 3 160961375 1I TGAGTCTAGT -/A GAGAAGATTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 176359 CASAVA_Build 3 160972176 1D GTCTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 15 14 176360 CASAVA_Build 3 160974683 3D AGGATAGTTG TAA/--- TAATAATCAT 3070 het 3070 hom 49 22 23 6 TAA 3 2 176361 CASAVA_Build 3 160978697 7D AGGATGGTCT CTATCTC/------- CTGACCTCAT 1893 het 402 hom 8 1 4 3 CTATCTC 1 0 176362 CASAVA_Build 3 160997209 2D TTAAATATTT GG/-- GGGTGACAGA 3070 het 3070 ref 48 23 21 6 G 5 3 176363 CASAVA_Build 3 161004393 1D CCCATTTTAC A/- GATTTAGAAG 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 A 1 0 176364 CASAVA_Build 3 161049538 1I GAGAACACTT -/A ACGACAAAAA 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 1 2 176365 CASAVA_Build 3 161052043 8I AAAGGGTAGC --------/TGTTGTTA TGTTAATATA 3070 hom 144 het 54 0 49 7 TGTTGTTA 0 1 176366 CASAVA_Build 3 161096556 1I AATTGGGGGG -/A AAAAACATGC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 5 6 176367 CASAVA_Build 3 161106196 1D TAAGAAAGAG C/- CCCACAAAAC 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 C 4 3 176368 CASAVA_Build 3 161109490 11D ACCTCAAAAT GTTTATCGTAC/----------- GTTTAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 19 16 3 GTTTATCGTAC 1 0 176369 CASAVA_Build 3 161109658 1I TTAAAAAAAA -/T GAATAAATGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 1 176370 CASAVA_Build 3 161110736 4I TTCAAACTTG ----/TACC TACCTCATCA 3070 het 3070 ref 50 28 18 4 TACC 1 2 176371 CASAVA_Build 3 161125072 1I CCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2350 het 2350 ref 28 8 9 11 A 14 15 176372 CASAVA_Build 3 161131373 1I AAATTGACCA -/T TAACTAGGAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 1 2 176373 CASAVA_Build 3 161137358 2I TAATCATTAT --/AA GTTGGAATTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 0 2 176374 CASAVA_Build 3 161163071 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 6 7 176375 CASAVA_Build 3 161166536 2D AATTTTCGTT TC/-- TCTTTGGTAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 TC 2 1 176376 CASAVA_Build 3 161180327 1D ATCTACAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 12 11 176377 CASAVA_Build 3 161180446 1I GTGAGCTATG -/T ATCACACCAT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 T 0 1 176378 CASAVA_Build 3 161188451 1I CTACTCCTGA -/C CCCTGGATCC 3070 hom 124 het 46 0 38 8 C 3 4 176379 CASAVA_Build 3 161195770 12I TTTAGGAGTG ------------/GATAGGGTTTAT GCATAAGGGA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 GATAGGGTTTAT 0 1 176380 CASAVA_Build 3 161206738 4D TGCAGAAAAA TTGC/---- TTGCTTGCTT 3070 het 3070 hom 57 17 23 18 TTGC 5 4 176381 CASAVA_Build 3 161209450 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2465 het 2465 ref 22 11 6 5 A 11 12 176382 CASAVA_Build 3 161250547 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAACT 3070 het 49 hom 32 1 27 4 C 1 0 176383 CASAVA_Build 3 161262165 1I TTATGTGCTG -/T TAACACTCAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 1 2 176384 CASAVA_Build 3 161262663 3I3M2D ACCAGGTGCA ---GCTTG/GTGGCT-- CACGCCTATA 1531 hom 10 het 4 0 4 0 N/A 0 0 176385 CASAVA_Build 3 161263415 12D CTGACAAATT GAGGTAATACGG/------------ GAGGTAATAC 3070 hom 30 het 16 0 10 9 GAGGTAATACGG 2 1 176386 CASAVA_Build 3 161266297 13D GGAGTTCGAG GCCAGGAGTTCAA/------------- ACCAGCCTAG 3070 hom 48 het 19 0 17 3 GCCAGGAGTTCAA 1 0 176387 CASAVA_Build 3 161266565 1I GAAGATTTGG -/A AAATCCTAGG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 3 4 176388 CASAVA_Build 3 161266811 2D TTTTTTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1506 het 580 hom 28 8 6 14 T 18 16 176389 CASAVA_Build 3 161267711 1D TACCTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 10 9 176390 CASAVA_Build 3 161267851 1D GGGATTCCAG C/- CCCCCCACCA 3070 hom 59 het 23 0 18 5 C 7 6 176391 CASAVA_Build 3 161270856 4I GCCTTCTCCT ----/CTTC CTTGGTTACC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 CTTC 0 1 176392 CASAVA_Build 3 161276252 1D TTTTGATGCT C/- ATTATCAAGT 3070 hom 75 het 34 0 26 9 C 1 0 176393 CASAVA_Build 3 161305818 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2789 het 236 hom 20 4 8 8 A 15 14 176394 CASAVA_Build 3 161312442 1D AGAAAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 16 12 A 11 10 176395 CASAVA_Build 3 161322861 4D CACTTAGAAA GAAT/---- GAATAAGACC 3070 het 3070 hom 37 13 16 10 GAAT 2 1 176396 CASAVA_Build 3 161424395 1I TAACAAATGT -/G GCCTTTGAAG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 G 1 2 176397 CASAVA_Build 3 161429830 1D ATATATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3041 hom 33 10 12 11 T 17 16 176398 CASAVA_Build 3 161430511 3I AACTGCAAAT ---/TAA TAATACGTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAA 1 2 176399 CASAVA_Build 3 161456535 1D ATGGGGGTGG T/- TTGCCAGAAA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 3 2 176400 CASAVA_Build 3 161466822 1D TCTTTCTCCT C/- CCCCCCCCTT 3070 het 3070 ref 44 16 11 17 C 9 8 176401 CASAVA_Build 3 161530307 1D AATTGTATGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 9 8 176402 CASAVA_Build 3 161532151 1I ACCCTTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 10 11 176403 CASAVA_Build 3 161532495 1D TATAAAATTT C/- CCAGTCTGGA 2697 het 2697 ref 36 22 9 5 C 3 2 176404 CASAVA_Build 3 161541499 1I TTTTACTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 10 11 176405 CASAVA_Build 3 161541826 2D AACAATGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 19 12 A 14 12 176406 CASAVA_Build 3 161549591 1I TCCTGATAAA -/T TTTGTTTCTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 3 4 176407 CASAVA_Build 3 161565485 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2859 hom 30 10 17 3 A 10 11 176408 CASAVA_Build 3 161569279 2I AAGTAAATTA --/AT ATGTTTTAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AT 1 2 176409 CASAVA_Build 3 161570858 1I AGCCATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 15 11 T 13 14 176410 CASAVA_Build 3 161580519 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1903 het 349 hom 30 6 7 17 T 15 14 176411 CASAVA_Build 3 161596829 2D ACATAAATTC AT/-- ATTAGTTAAT 3070 het 3070 hom 28 8 15 7 AT 2 1 176412 CASAVA_Build 3 161609835 1D TCCTGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 A 11 10 176413 CASAVA_Build 3 161613287 4I TAGGCATATT ----/TATC AATTCATTGA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 TATC 0 1 176414 CASAVA_Build 3 161613931 1D CTTCAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 13 11 T 13 12 176415 CASAVA_Build 3 161620058 1I ATGGCTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 11 12 176416 CASAVA_Build 3 161655299 1D AGTTCAGGAG T/- TTTGAGACCA 3070 het 2360 hom 22 8 9 5 T 4 3 176417 CASAVA_Build 3 161656504 1D7M9D AAACTGCAGA TTAAAGTGTACCTCCAA/-TAAACTG--------- CTGGGACAAG 3070 het 3070 ref 48 24 22 9 N/A 0 0 176418 CASAVA_Build 3 161661887 1I CTGTTGTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 9 10 176419 CASAVA_Build 3 161688494 1D ATGAATCTTA G/- GGGGAATACA 3070 het 3070 hom 34 12 20 3 G 5 4 176420 CASAVA_Build 3 161694957 6D TATGAGTAGG TACTAT/------ TACTATTTTC 3070 het 3070 ref 45 22 21 2 TACTAT 2 1 176421 CASAVA_Build 3 161696006 3I TGGTTAAAAG ---/GAA GAAGATTTTA 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 GAA 1 2 176422 CASAVA_Build 3 161699966 1D CTGGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 2962 het 2962 ref 30 14 10 7 A 15 14 176423 CASAVA_Build 3 161710835 3D CATAAACTTC ATA/--- ATCTCATTTT 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 ATA 1 0 176424 CASAVA_Build 3 161721105 1D TTAATTTTAA G/- GTACAGGGTC 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 G 2 1 176425 CASAVA_Build 3 161725869 2D TAGCACTATT TG/-- TGTGTGCTTT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 TG 4 3 176426 CASAVA_Build 3 161729861 1I TTATGAAACC -/A AAAAATTTTC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 5 6 176427 CASAVA_Build 3 161743579 1D GAATTCCCAG A/- GTTCTCTATA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 1 0 176428 CASAVA_Build 3 161744344 1I ATCCTTGACC -/T TTTTTTTTTT 1269 het 1269 ref 44 26 3 15 T 10 11 176429 CASAVA_Build 3 161744689 2D ATTACCAAAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 23 10 7 TG 6 5 176430 CASAVA_Build 3 161745889 2D AATGACAAAA TC/-- TCTGTCTTCA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 TC 2 1 176431 CASAVA_Build 3 161747234 1I TCTGCTACCA -/T TTATTCCCAT 3070 het 3070 ref 39 18 11 10 T 2 3 176432 CASAVA_Build 3 161751554 3I CTGGCATCAA ---/TTC TTCTTTAAAT 3070 het 3070 hom 46 13 24 9 TTC 1 2 176433 CASAVA_Build 3 161763662 17D GAGGATCATT GGATCATTCGGCCATAA/----------------- GGATCATTCG 3070 het 3070 ref 49 26 20 10 GGATCATTCGGCCATAA 1 0 176434 CASAVA_Build 3 161769956 1I GCTCCACCAC -/A AAAAAAAAAA 1670 het 1525 hom 19 5 6 8 A 17 18 176435 CASAVA_Build 3 161773368 1D AAATAATAAT A/- AAAAAAATAC 2280 het 2280 ref 24 13 6 5 A 8 7 176436 CASAVA_Build 3 161792867 5I TACCTAGGAA -----/TTAAC TTAACCAAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TTAAC 1 2 176437 CASAVA_Build 3 161807222 1D AAAACTTCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 9 8 176438 CASAVA_Build 3 161821536 10D GCAGCCAGGC ATGATGGCTT/---------- ATGCCTACAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 ATGATGGCTT 1 0 176439 CASAVA_Build 3 161823646 13D GAACCATTGC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTC 3070 het 2923 hom 32 12 19 2 T 22 9 176440 CASAVA_Build 3 161830949 2I GCCAAGAAAC --/AT GTGAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AT 0 1 176441 CASAVA_Build 3 161833102 2D CAATAAAATG GT/-- AGTTACCAGA 3070 het 3070 ref 48 24 14 10 GT 1 0 176442 CASAVA_Build 3 161838144 4D TAGATTCAGG GACA/---- GACAGTTAAT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 GACA 2 1 176443 CASAVA_Build 3 161844669 14D GGGCTGTCTT CCACACAGTCTTTC/-------------- AAGGACCAAG 3070 hom 90 het 31 0 30 4 CCACACAGTCTTTC 1 0 176444 CASAVA_Build 3 161845484 1D TTGTAAAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 T 10 9 176445 CASAVA_Build 3 161848151 1D ATCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 11 11 5 A 10 9 176446 CASAVA_Build 3 161857583 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 11 10 176447 CASAVA_Build 3 161857954 25D TTTTTTTTTT AAAAAAAACTTAATCAGATATCCCC/------------------------- TTTTTTTTCC 701 het 701 ref 34 30 5 7 AAAAAAAACTTAATCAGATATCCCC 1 0 176448 CASAVA_Build 3 161858785 4D CTTGTATATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1717 hom 31 8 14 9 T 15 11 176449 CASAVA_Build 3 161859357 1D ACATACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 50 1 44 5 T 11 10 176450 CASAVA_Build 3 161865072 1I TACTCTGGGA -/C CCAGGCTGAT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 C 2 3 176451 CASAVA_Build 3 161872286 2D TAATCACATT AA/-- GTTTTAAATG 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 2 0 176452 CASAVA_Build 3 161912317 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1436 het 1436 ref 27 17 4 6 A 11 12 176453 CASAVA_Build 3 161918852 1I AATCCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 11 12 176454 CASAVA_Build 3 161966730 1D AAGTTGAAGT C/- TATGCTATGA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 C 1 0 176455 CASAVA_Build 3 161973867 1I GAAAAGAGAG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 44 20 22 2 A 7 8 176456 CASAVA_Build 3 161978688 1I ATTATTTAAG -/T TTTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 T 6 7 176457 CASAVA_Build 3 161979589 1I TTTCTGCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 A 10 11 176458 CASAVA_Build 3 161989037 1D GATTTATGGA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 8 7 176459 CASAVA_Build 3 162007412 4D GAAAGAGAGG GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 GAAA 5 4 176460 CASAVA_Build 3 162025664 4D ATGGATAAAC AGAT/---- AGCCATTTGC 3070 het 3070 hom 31 16 14 2 AGAT 1 0 176461 CASAVA_Build 3 162054178 1I TTGAAAATCA -/T TGAAAATAAT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 T 1 2 176462 CASAVA_Build 3 162068019 1D GCTTCCTTCC T/- TTCCCTCCTT 3070 het 3070 ref 36 22 13 2 T 3 2 176463 CASAVA_Build 3 162071849 4D ATACATTATC AAAA/---- AGGTCTTCAT 3070 het 3070 hom 56 26 27 4 A 5 1 176464 CASAVA_Build 3 162078038 1I CCAAGGAAAT -/A AGAGTATGCG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 1 2 176465 CASAVA_Build 3 162081112 1D TTCTGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3022 hom 35 10 15 10 A 13 12 176466 CASAVA_Build 3 162082538 2I GTCTCAAAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 het 2596 hom 34 13 14 7 AC 0 1 176467 CASAVA_Build 3 162085174 1I AGAGCCCACA -/T TACAATGGAA 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 T 1 2 176468 CASAVA_Build 3 162100076 1I GTTTTTGTTG -/T TAATTTCAAG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 2 176469 CASAVA_Build 3 162104313 5D GAAATGATAA TGTAT/----- TAGGAATTAT 3070 het 3070 hom 36 17 19 3 TGTAT 1 0 176470 CASAVA_Build 3 162105210 4D GGGGAAGAGG GAGA/---- GAGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 43 22 11 11 GA 5 3 176471 CASAVA_Build 3 162108850 1I TTGGAACTAT -/A AAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 5 6 176472 CASAVA_Build 3 162118363 3I AATATTCCTT ---/TTG TTCTTTGTTC 3070 het 3070 hom 55 19 32 4 TTG 0 1 176473 CASAVA_Build 3 162122356 1D GGGATTTCAG T/- ATTAAGACCT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 1 0 176474 CASAVA_Build 3 162124726 1I GGCTGTGAGC -/A AAAACCCAGC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 4 5 176475 CASAVA_Build 3 162131324 1I GCCTTGAGGT -/A ACCTCTAACT 3070 hom 78 het 30 0 24 6 A 1 2 176476 CASAVA_Build 3 162132475 1I CATTCTTTTG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 7 8 176477 CASAVA_Build 3 162148810 3I TTCCTCTTGC ---/TAA TAAAATAAGA 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 TAA 1 2 176478 CASAVA_Build 3 162155338 1I TAGGCCAATG -/T CTAGAAGAAT 3070 hom 48 het 25 0 23 2 T 0 1 176479 CASAVA_Build 3 162162743 4D GTGTTAATAT TAGA/---- TATTTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 TAGA 1 0 176480 CASAVA_Build 3 162163457 1I TCTTCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 10 11 176481 CASAVA_Build 3 162164797 7D AATCAACACA TATTTTG/------- TATGTTATGT 3070 het 3070 hom 41 21 21 3 TATTTTG 1 0 176482 CASAVA_Build 3 162168052 5D CACCCCTTTG ATCTA/----- ATCAGCATCC 3070 het 3070 ref 40 23 12 7 ATCTA 1 0 176483 CASAVA_Build 3 162186232 1D CTGAATTGAT A/- ATGCTGTGCA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 2 1 176484 CASAVA_Build 3 162186464 1I CCACCCACCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 20 0 11 9 A 11 12 176485 CASAVA_Build 3 162193558 1D TACAACAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 21 19 12 T 13 12 176486 CASAVA_Build 3 162233175 1D AGAGAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 2791 het 349 hom 24 5 10 9 T 15 14 176487 CASAVA_Build 3 162260734 1D CCAATGTCAA G/- GACAGGAGAA 3070 het 3070 hom 57 24 26 7 G 2 1 176488 CASAVA_Build 3 162302700 1I GATAACAGAC -/A ACAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 1 2 176489 CASAVA_Build 3 162330761 1D GTTAAAAATG T/- TATACTCACT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 2 1 176490 CASAVA_Build 3 162332933 1D AAATACATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 A 9 8 176491 CASAVA_Build 3 162333815 2D TTCAAGTAAC TT/-- TTGAACACAG 3070 het 3070 ref 39 19 14 8 T 4 2 176492 CASAVA_Build 3 162343384 3D CTCCACTTTG TCT/--- TCTTGTCATT 1181 het 1181 ref 17 11 3 3 TCT 2 1 176493 CASAVA_Build 3 162348281 19I CTTAACTTAT -------------------/GGCAATACAGTTATTTGCA CAAGTGCAAT 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 GGCAATACAGTTATTTGCA 0 1 176494 CASAVA_Build 3 162350896 4I TTGCAGCAGT ----/AGAA AGAAAGGCAT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 AGAA 1 2 176495 CASAVA_Build 3 162356855 3I ATAAGCTGTT ---/AGC AGGCAAGAAC 3070 het 3070 hom 41 14 25 2 AGC 0 1 176496 CASAVA_Build 3 162359582 1I CATTTATCTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 8 9 176497 CASAVA_Build 3 162377030 1I AGGGAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 10 11 176498 CASAVA_Build 3 162385644 2D TCCAAAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1606 hom 31 8 13 10 A 15 13 176499 CASAVA_Build 3 162387922 4I AAAGGAAAAC ----/AAAA GAAACAGTTA 3070 het 3070 ref 56 27 22 7 A 0 4 176500 CASAVA_Build 3 162400580 1D AAACAATCCC T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 6 5 176501 CASAVA_Build 3 162422427 8I14M18D AGTGATTTAA --------ATCCCAACATTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT/ATCCCAACATCCCAACATTCTC------------------ TTTTTTTTTT 2075 het 2075 ref 25 11 7 13 N/A 0 0 176502 CASAVA_Build 3 162423979 1I GTCCTTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 11 12 176503 CASAVA_Build 3 162438021 1D AATAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 2327 het 1018 hom 20 9 7 4 T 19 18 176504 CASAVA_Build 3 162439448 3I TTCTAACACA ---/TTT TTCAGCCATG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 2 5 176505 CASAVA_Build 3 162441179 2D GCTAATTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 30 12 10 9 AT 7 6 176506 CASAVA_Build 3 162441320 3D TCAGCCAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 13 10 176507 CASAVA_Build 3 162445122 2D TTTCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 37 3 11 23 T 18 16 176508 CASAVA_Build 3 162447416 1I GAATGAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 10 11 176509 CASAVA_Build 3 162454046 1D TTTCAGCATT C/- CCCCCCCGCT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 C 8 7 176510 CASAVA_Build 3 162467138 5I ACACAAACAC -----/ATCTT ATACATGGCG 3070 het 3070 hom 26 7 14 5 ATCTT 0 1 176511 CASAVA_Build 3 162471295 1D CAGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 11 10 176512 CASAVA_Build 3 162472458 1D CTCCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2597 het 552 hom 26 6 9 11 T 12 11 176513 CASAVA_Build 3 162475763 3I AATGGTGAAT ---/AGG AGGCAGGACT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 AGG 1 2 176514 CASAVA_Build 3 162482180 1D ACAAACAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 A 10 9 176515 CASAVA_Build 3 162493018 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 10 11 176516 CASAVA_Build 3 162498319 5D TTGTCACTTG TTTTC/----- TTTACTTCGT 3070 het 3070 ref 26 17 8 4 TTTTC 1 0 176517 CASAVA_Build 3 162529643 3D TGAAAGATGC TCT/--- TCTTAGTATT 3070 het 3070 hom 47 23 19 5 TCT 2 1 176518 CASAVA_Build 3 162544371 4D CACTACATGC TGAT/---- TGATAGGTTT 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 TGAT 2 1 176519 CASAVA_Build 3 162564446 1I ATGGTACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 10 11 176520 CASAVA_Build 3 162576485 1D CCAGTTTAAC A/- AAAGATTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 4 3 176521 CASAVA_Build 3 162578735 3D AAAGACTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 40 17 13 13 TTG 4 3 176522 CASAVA_Build 3 162587336 1I AATGTTACTC -/T GACAGAAAGA 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 T 0 1 176523 CASAVA_Build 3 162598110 3D AAAACCCTTC AAA/--- AAAATAAATG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 7 4 176524 CASAVA_Build 3 162627220 1I CTTCTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 10 13 A 13 14 176525 CASAVA_Build 3 162629544 1D ATATGCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 11 10 176526 CASAVA_Build 3 162630698 1D CAAAGGAGCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 1206 hom 29 4 17 8 T 8 7 176527 CASAVA_Build 3 162631421 1D CATTTCCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 12 11 176528 CASAVA_Build 3 162634952 1D AAGCATAGTG T/- GAGTAACATC 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 T 1 0 176529 CASAVA_Build 3 162638191 1D TCAGACAAGA G/- GAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 G 2 1 176530 CASAVA_Build 3 162639646 1D CGACAGCAAC A/- AAAAAAAAAA 2937 het 691 hom 17 2 9 6 A 11 10 176531 CASAVA_Build 3 162653557 1I TTTTTGAGAT -/A AGAGTCTTGC 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 1 2 176532 CASAVA_Build 3 162658009 26D CATTACTGTG TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 3070 hom 33 het 17 0 12 5 TA 23 10 176533 CASAVA_Build 3 162681345 3I GCAATTGAGG ---/TGT TGTTCTTTGT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 TGT 1 2 176534 CASAVA_Build 3 162682061 1I ATTTAATGGC -/A ATCTGGCTAA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 1 2 176535 CASAVA_Build 3 162688896 8I GGCTCTTGGG --------/TGTTTCCA TGTTTCCACT 3070 het 3070 hom 50 17 23 10 TGTTTCCA 1 2 176536 CASAVA_Build 3 162689130 4I TGAACTGTCT ----/TGCC TGCCTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 TGCC 1 2 176537 CASAVA_Build 3 162692524 1D CAATAGGTTC T/- TACTGCAGAC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 2 1 176538 CASAVA_Build 3 162695249 1I TTTTCTAGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 T 9 10 176539 CASAVA_Build 3 162698253 1D TGCCCAATGA T/- TTTCTCCATT 3070 het 3070 ref 39 22 17 0 T 4 3 176540 CASAVA_Build 3 162701462 1I AACAAAAGAT -/A GTTAGTTATA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 0 1 176541 CASAVA_Build 3 162701902 4I ATGGGCTGTT ----/AGTC AGGCCCAATA 3070 het 2969 hom 23 6 14 3 AGTC 0 1 176542 CASAVA_Build 3 162702028 1D TAAAGAACAG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 32 13 15 5 T 8 7 176543 CASAVA_Build 3 162708942 1D CAATCCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 A 11 10 176544 CASAVA_Build 3 162711368 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 T 13 12 176545 CASAVA_Build 3 162714416 1I ATGTCTTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 9 10 176546 CASAVA_Build 3 162715364 1D GGGTGGTGTA C/- CCCCCCCCTG 3070 het 2660 hom 31 9 13 9 C 9 8 176547 CASAVA_Build 3 162715437 1D AATGGGGGGG A/- GTACACCCCT 3070 het 3070 ref 33 16 9 9 A 1 0 176548 CASAVA_Build 3 162718680 1D TTTCCGTGAT A/- GGGGGAGTAA 3070 het 2386 hom 28 6 12 11 A 1 0 176549 CASAVA_Build 3 162718701 1D TATCACCTCT C/- CCCCCCCCCG 2702 hom 22 het 35 0 6 29 C 10 9 176550 CASAVA_Build 3 162719902 1I CTCTCCCCCC -/T GATGATTAGG 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 0 1 176551 CASAVA_Build 3 162724682 2I AATGGGACTG --/TC TGATATGTGA 3070 het 3070 hom 55 25 24 6 TC 0 1 176552 CASAVA_Build 3 162735676 1I AAACCGAGTC -/T TTTCAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 19 29 1 T 3 4 176553 CASAVA_Build 3 162738566 1I TGCATTAGGA -/T TTTTTTTTTT 1706 het 1706 ref 20 8 6 6 T 11 12 176554 CASAVA_Build 3 162744176 1D AAGCACTACG A/- AAAAAAAAAA 2185 het 2185 ref 43 30 6 7 A 13 12 176555 CASAVA_Build 3 162747096 1D39M2I ATTTCTAATG TTTTTTTCTAGAAATTATTTTAATTTTTATATAATCAAAA--/-TTTTTTCTAGAAATTATTTTAATTTTTATATAATCAAAAAC ACATTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 17 20 3 N/A 0 0 176556 CASAVA_Build 3 162748278 1I CACTTAACCG -/T TTTTTTTTTT 2699 het 2699 ref 28 12 11 5 T 12 13 176557 CASAVA_Build 3 162755818 1D CCCTGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 1376 het 190 hom 23 2 9 12 A 19 18 176558 CASAVA_Build 3 162768145 1I ATAAAATATT -/A TAAAAAAAAA 2406 het 2406 ref 26 18 6 2 A 0 1 176559 CASAVA_Build 3 162774436 1I AGTGTTAGAT -/A AAAATTGCTT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 A 4 5 176560 CASAVA_Build 3 162783184 1I CAATAGCAAA -/C CTACTTTTGA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 C 1 2 176561 CASAVA_Build 3 162794815 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2457 het 427 hom 25 3 8 14 T 16 14 176562 CASAVA_Build 3 162806585 1D TGAAAATTTT G/- GGGGCTCTTT 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 G 5 4 176563 CASAVA_Build 3 162817166 1I ACTCTAACAA -/T ATTTTTTTTT 2161 het 1289 hom 24 8 9 7 T 0 1 176564 CASAVA_Build 3 162820665 2I TTATAGGTTC --/TA TGTTATACAC 3070 het 3070 ref 49 23 16 10 TA 0 1 176565 CASAVA_Build 3 162821470 2D GAGGCATTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 11 11 15 TG 9 8 176566 CASAVA_Build 3 162833311 1I GGCTCACTAT -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 6 7 176567 CASAVA_Build 3 162837671 6D4M1D23M1I2M6I AATAATTTTT ATACTGATTACTTGCTGAAATATTATTTCAGCAA-TA------/------ATTA-TTGCTGAAATAATATTTCAGCAAGTAATCAGT ATAAAAATTA 3070 het 3070 ref 37 26 17 3 N/A 0 0 176568 CASAVA_Build 3 162846258 2D AAAATCACTA AC/-- ACTCTTCTTG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 AC 2 1 176569 CASAVA_Build 3 162850164 1D AATTTCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 A 13 12 176570 CASAVA_Build 3 162852084 3I TAGAAATAAT ---/AAG AATAGTTGAT 3070 het 3070 hom 33 17 13 3 AAG 0 1 176571 CASAVA_Build 3 162857505 1I TCAGTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 12 10 T 10 11 176572 CASAVA_Build 3 162871930 8I1M3D ATATAGATAT --------TACC/GGAGAGGGT--- TTGGGGCTCC 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 N/A 0 0 176573 CASAVA_Build 3 162874768 1D CTGAATGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2703 hom 43 14 14 16 T 17 16 176574 CASAVA_Build 3 162889337 4D TTCAACTGGC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 38 10 18 11 ATTT 5 4 176575 CASAVA_Build 3 162909868 2D AATGGAAAGC AA/-- AAAAAGGCAG 3053 het 3053 ref 28 10 9 12 A 7 5 176576 CASAVA_Build 3 162911424 1D AACCAATGAC A/- AAAACCACAT 2733 het 2733 ref 21 11 6 4 A 5 4 176577 CASAVA_Build 3 162913797 2D AAATCAACAC TT/-- TTCATTTAGC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 T 4 2 176578 CASAVA_Build 3 162916893 7I ACTCAATACC -------/CACTAAA CATTAAACAA 3070 het 3070 hom 46 22 19 5 CACTAAA 0 1 176579 CASAVA_Build 3 162932967 1D TGAGAGAAGG A/- ATTTGAGTGC 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 A 2 1 176580 CASAVA_Build 3 162943378 1D AGTTGTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1608 hom 27 9 13 5 T 26 25 176581 CASAVA_Build 3 162946980 1I TATCCATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 10 11 176582 CASAVA_Build 3 162947393 1I AAGATACAGT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 7 8 176583 CASAVA_Build 3 162956826 1D AGAATCAGGG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 A 7 6 176584 CASAVA_Build 3 162957685 6D TATAACCAAC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1148 het 1148 ref 29 10 7 12 T 24 18 176585 CASAVA_Build 3 162958238 1D TCACTTTGGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 9 8 176586 CASAVA_Build 3 162959966 3D GCATTTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 14 11 176587 CASAVA_Build 3 162967578 1D CTTGTCTCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 9 8 176588 CASAVA_Build 3 162983767 1D TTAAAGGTTA T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 7 6 176589 CASAVA_Build 3 162984996 1I GAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 1716 het 1716 ref 37 26 5 6 A 10 11 176590 CASAVA_Build 3 162991360 3D TTTAATCTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 30 1 11 18 T 13 10 176591 CASAVA_Build 3 162994062 1D TAAATAAGTG C/- CCCCAGAGTA 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 C 5 4 176592 CASAVA_Build 3 162995599 3D CAATAAATTA TTC/--- TTCTATTGTA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 TTC 2 1 176593 CASAVA_Build 3 163001781 5I AAGTCCCTAG -----/ACTGC ACACAGCACA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 ACTGC 0 1 176594 CASAVA_Build 3 163001993 1D ATTTTCTTTT C/- TATTGCATTG 2112 het 2112 ref 25 16 5 5 C 1 0 176595 CASAVA_Build 3 163003785 2D CTTGAGAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 37 18 12 9 GT 10 9 176596 CASAVA_Build 3 163004231 1I CAAAAAAAAA -/T ATCTAAAAAT 3070 het 257 hom 25 1 22 2 T 0 1 176597 CASAVA_Build 3 163004339 1D TGAATACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 11 11 T 15 14 176598 CASAVA_Build 3 163007199 3D AGAAAATGAT TTG/--- TTATCATTCA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 TTG 1 0 176599 CASAVA_Build 3 163025470 1I AACATGGGTC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 7 8 176600 CASAVA_Build 3 163027681 1I TAAACATTTT -/A TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 0 1 176601 CASAVA_Build 3 163028272 3D GGCTATATTA GAC/--- GACATTGGGG 3070 het 3070 hom 43 17 24 3 GAC 2 1 176602 CASAVA_Build 3 163030896 1I AAGTTTCCTC -/A AATTTAGAGT 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 A 2 3 176603 CASAVA_Build 3 163038770 11D CCATCTAACT CTTGACTTGGG/----------- CTTTTATACA 3070 het 277 hom 28 4 17 11 CTTGACTTGGG 1 0 176604 CASAVA_Build 3 163039547 1D TGGAATTAGA C/- TTTGAAATTG 3070 het 3070 hom 37 16 21 1 C 1 0 176605 CASAVA_Build 3 163047493 2D AGTTCATGTA CG/-- CGTTTTTTAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CG 2 1 176606 CASAVA_Build 3 163057877 1I GAGCTAAAAC -/T TATGTAGACC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 1 2 176607 CASAVA_Build 3 163065540 1I TGAGGCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 843 hom 35 3 25 7 T 11 12 176608 CASAVA_Build 3 163069030 4I TAGTGAAGAC ----/TGAT TGAATTTTAA 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 TGAT 0 1 176609 CASAVA_Build 3 163076356 1I AAGGGAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 9 10 176610 CASAVA_Build 3 163077800 3D AGCAGTAAAA AAG/--- GACAAAGAAG 3070 het 3070 ref 56 30 23 3 AAG 1 0 176611 CASAVA_Build 3 163078924 1D CCTGCCAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2579 hom 32 7 16 10 A 10 9 176612 CASAVA_Build 3 163079386 5D TACAAAAATT AACTC/----- AAGATGGATT 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 AACTC 1 0 176613 CASAVA_Build 3 163079636 1I AAACTAGGAA -/T TATGACAAAG 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 1 2 176614 CASAVA_Build 3 163079962 4I CTCTGTTCTC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 10 14 176615 CASAVA_Build 3 163080302 5I CAAAGAACTT -----/AAAAC AGAACTATCC 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 AAAAC 0 1 176616 CASAVA_Build 3 163083163 1D AGGCTGACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 10 9 176617 CASAVA_Build 3 163086852 1D CCCCATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 22 16 13 T 13 12 176618 CASAVA_Build 3 163088557 1I TTTACCTTTT -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 45 21 18 6 A 6 7 176619 CASAVA_Build 3 163095425 1I GTGTGGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 10 11 176620 CASAVA_Build 3 163095493 1I CTACACAAGC -/A AAAAAAAAAA 2282 het 2282 ref 25 17 5 3 A 10 11 176621 CASAVA_Build 3 163095604 1D GACAAAACTT A/- AAAAAAAGGT 2602 het 2602 ref 21 12 7 4 A 8 7 176622 CASAVA_Build 3 163123659 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 T 8 9 176623 CASAVA_Build 3 163124941 1I TAATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 10 11 176624 CASAVA_Build 3 163125261 1D TTTTCTAGAT G/- AGATGGCAAT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 G 1 0 176625 CASAVA_Build 3 163203640 1D CAACAACATC T/- TTTTTTTTTT 1739 het 1739 ref 32 14 7 11 T 17 16 176626 CASAVA_Build 3 163327652 1D GAATACTTAA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 7 6 176627 CASAVA_Build 3 163331974 1I GGACAAAAAG -/A AAAAAATCCA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 7 176628 CASAVA_Build 3 163340927 3I23M4D AAATATTTCT ---ATCTATTTTCACAATGTTCACTTAATA/ATCATCTATTTTCACAATGTTCACTT---- AATAGAGTAT 3070 hom 132 het 36 0 45 1 N/A 0 0 176629 CASAVA_Build 3 163352997 1I TTTATGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 507 hom 40 2 32 6 T 12 13 176630 CASAVA_Build 3 163353520 1I CAGTTAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 9 18 10 T 14 15 176631 CASAVA_Build 3 163354817 1D GTTCCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 17 1 12 4 T 11 10 176632 CASAVA_Build 3 163359478 1D AAGTGGAAAT G/- GGGTGGGAGG 2518 hom 30 het 14 0 11 3 G 4 3 176633 CASAVA_Build 3 163362303 1D GTTCCAGGAC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 176634 CASAVA_Build 3 163363452 2D TTACTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 TC 8 7 176635 CASAVA_Build 3 163365000 1I CATTCTTAAC -/A TGAATTCAAC 3070 hom 132 het 46 0 44 2 A 0 1 176636 CASAVA_Build 3 163379383 4I TCTTTTATCC ----/TAAT TTATACTGAA 3070 het 3070 hom 25 7 13 5 TAAT 0 1 176637 CASAVA_Build 3 163391810 17D TCCCATTTGG AATGGCTGTATTTACCC/----------------- AATGCCTGTA 3070 het 3070 ref 33 26 10 3 AATGGCTGTATTTACCC 1 0 176638 CASAVA_Build 3 163396845 3D CCTTGATTGA TTG/--- TTTATTCTCA 3070 het 3070 hom 38 16 21 2 TTG 1 0 176639 CASAVA_Build 3 163398289 6D GTAACTACAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 3070 hom 45 12 19 15 AT 10 7 176640 CASAVA_Build 3 163406783 1D TTTCCATGTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 9 8 176641 CASAVA_Build 3 163409522 1I CTTAACAAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 9 10 176642 CASAVA_Build 3 163425302 1I AGAGGAGGGA -/T TTTTATTTTG 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 4 5 176643 CASAVA_Build 3 163437077 1I ATACTTTTTG -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 T 6 7 176644 CASAVA_Build 3 163459083 4I AAGCAATAAC ----/AAAT AAACAGTTAA 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 AAAT 0 1 176645 CASAVA_Build 3 163461964 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAAAAAA 1721 het 1721 ref 17 8 5 4 A 10 12 176646 CASAVA_Build 3 163466309 2D AAAATGACTC TT/-- ATCATTTAGA 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 T 2 0 176647 CASAVA_Build 3 163469952 1D AAATGCCCTA T/- TTAAAGATAA 3070 het 3070 hom 57 23 26 8 T 3 2 176648 CASAVA_Build 3 163486093 1I CTTAAAAAAA -/T CTTTATGTTG 3070 het 3070 ref 62 31 25 6 T 0 1 176649 CASAVA_Build 3 163491410 1D AAGATTGTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 44 12 22 10 T 9 8 176650 CASAVA_Build 3 163492516 2D GCATTTTTTC AT/-- ATGTTTATTG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 AT 2 1 176651 CASAVA_Build 3 163504435 1I AGAACTAAAA -/G AATGAGGGCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 176652 CASAVA_Build 3 163506918 2I TGTGTCAGCA --/AC AGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 AC 0 1 176653 CASAVA_Build 3 163507417 1D GTTTGGCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 T 10 9 176654 CASAVA_Build 3 163510085 1D TAAGTCACCA T/- TTTTTTCTTT 1260 het 582 hom 5 2 3 0 T 7 6 176655 CASAVA_Build 3 163512671 2D CCTTCAACTG TA/-- TATATATATA 2049 het 2049 ref 37 29 5 4 TA 7 6 176656 CASAVA_Build 3 163515875 1I TTTTCCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 12 13 176657 CASAVA_Build 3 163516066 2D TTGTTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 1445 het 1445 ref 53 24 7 23 T 18 16 176658 CASAVA_Build 3 163521086 1D TTCTTTCTAA C/- TTTTTTGTAC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 C 1 0 176659 CASAVA_Build 3 163522873 1D TTGGCTTTTT C/- CTTTCCAATG 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 2 1 176660 CASAVA_Build 3 163525336 1D AAATGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 A 12 11 176661 CASAVA_Build 3 163540308 4I ATATATATAG ----/TTAA TTAATACATT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TTAA 1 2 176662 CASAVA_Build 3 163550896 1D TTTGTGACTG T/- GGGGCAGGCA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 1 0 176663 CASAVA_Build 3 163572943 1D TTTTTATTGG C/- ATTATTTTAT 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 C 1 0 176664 CASAVA_Build 3 163574914 1I ATAAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 11 12 176665 CASAVA_Build 3 163579540 1D CATTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 581 hom 20 4 13 3 T 11 10 176666 CASAVA_Build 3 163585725 1D AAGAAAAAAA G/- AATTATCTAG 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 G 1 0 176667 CASAVA_Build 3 163585974 2I ATATATTTTC --/AT ATATATATAT 3070 het 301 hom 17 1 13 3 AT 7 8 176668 CASAVA_Build 3 163592924 6I CCCCTACCCC ------/TTAAAA TTAAAATTAC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 TTAAAA 1 2 176669 CASAVA_Build 3 163594441 2I CGTGAAAGAA --/AG AATTCAGCAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 AG 0 1 176670 CASAVA_Build 3 163597524 1D CCTCACACAC T/- TTTTTTTTTT 882 hom 23 het 25 0 4 21 T 17 16 176671 CASAVA_Build 3 163597555 6I61M1I GTAAGAACAC ------TTTAAGCAATGTTCACGTACTCAACACATTGTAATTATAGTTACATGTTATCATTATAATG-/TTAAAATTTAAGCAATGTTCACGTACTCAACACATTGTAATTATAGTTACATGTTATCATTATAATGT ATAATAAGTC 3070 hom 134 het 32 0 45 19 N/A 0 0 176672 CASAVA_Build 3 163601823 7D GTGAGCCTAA CATACAG/------- CAGGATGGTA 3070 het 3070 hom 28 14 13 3 CATACAG 1 0 176673 CASAVA_Build 3 163602076 2I TCTCATATCA --/CT CTCTGTGTAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CT 2 3 176674 CASAVA_Build 3 163603209 8D TGTGTGTGTC TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 2971 hom 44 10 23 12 TG 9 5 176675 CASAVA_Build 3 163612392 4D AAACACTTCT TAAC/---- TAATAAGCTA 3070 het 3070 hom 26 10 9 7 TAAC 1 0 176676 CASAVA_Build 3 163614151 4D CTGGATTTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 69 het 34 0 24 10 AAAC 5 4 176677 CASAVA_Build 3 163614572 1I CAAAAGGCGG -/C GGGGGGGAGA 3070 hom 50 het 21 0 16 5 C 0 1 176678 CASAVA_Build 3 163618792 1D CCTGCTACTC G/- GGGGGCTGAG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 6 5 176679 CASAVA_Build 3 163619603 1D TCTCACAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 10 9 176680 CASAVA_Build 3 163623435 2D CGGGGTCTCA CT/-- CTGTTAGCCA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 CT 2 1 176681 CASAVA_Build 3 163624153 3D ATATTGATAC TCT/--- TCTTCTTTTG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TCT 3 2 176682 CASAVA_Build 3 163624492 1D AATCATTTGA C/- CTATGGCAGT 3070 hom 105 het 41 0 35 7 C 2 1 176683 CASAVA_Build 3 163625639 11I GAATTTTCCT -----------/ATCTGCTTTGA ATCTATTGCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATCTGCTTTGA 0 1 176684 CASAVA_Build 3 163625819 1I AACTTAGAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 176685 CASAVA_Build 3 163626060 4I GGCCAGTAAC ----/CTGT CTGTGTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CTGT 1 2 176686 CASAVA_Build 3 163626177 2I ATATATATAT --/AA TAATACTCAC 3070 het 372 hom 17 1 15 1 A 0 2 176687 CASAVA_Build 3 163626530 3I AAATCAGAAA ---/ATC ATCTCATAGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATC 1 2 176688 CASAVA_Build 3 163627295 3D TGAATATTTT TTC/--- TTAAGAAAAG 3070 hom 114 het 41 0 39 3 TTC 1 0 176689 CASAVA_Build 3 163629056 4D GATCAAGCAG AAGA/---- AAGAATTAGT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 AAGA 2 1 176690 CASAVA_Build 3 163629523 1I CTGAAGGGGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 7 8 176691 CASAVA_Build 3 163630286 1I GAATGGATTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 7 8 176692 CASAVA_Build 3 163632045 1D TCCCTTTAAG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 7 176693 CASAVA_Build 3 163633893 9I AAAAAATACA ---------/AAAATTAAC AACGCATGCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AAAATTAAC 0 1 176694 CASAVA_Build 3 163634064 4D AAAAAAAAAA AAAC/---- AACTAAAAAT 3011 het 107 hom 29 3 18 8 AAAC 1 0 176695 CASAVA_Build 3 163635252 4I2M4D GCAAATGGGC ----ATTCCA/TGGAAT---- GTTTATCTGC 3070 het 3070 hom 38 17 13 10 N/A 0 0 176696 CASAVA_Build 3 163635319 2I AGAAGAAAAC --/AT AGAGCTGCCA 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 AT 0 1 176697 CASAVA_Build 3 163642485 3D AGTTTGTAGT AGA/--- AGAAGAATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 4 AGA 3 2 176698 CASAVA_Build 3 163642720 1I TTTCTGACCT -/G ATTTAATCCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 0 1 176699 CASAVA_Build 3 163648106 3D AATGATGTAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 13 10 176700 CASAVA_Build 3 163650604 1I TGAAATTTTC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 7 8 176701 CASAVA_Build 3 163650726 1D GGTACCAGCT C/- CTCTTGGTAC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 C 2 1 176702 CASAVA_Build 3 163655112 1I TTAATTGCTC -/A AATATGTGGC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 2 3 176703 CASAVA_Build 3 163659144 1I AATGGCCAGC -/A AATATTTACC 3070 hom 110 het 39 0 37 2 A 2 3 176704 CASAVA_Build 3 163660369 4D TAAACTGGTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 5 AAAC 5 4 176705 CASAVA_Build 3 163661080 2D AATAAATTGT TA/-- TAACTTTAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TA 2 1 176706 CASAVA_Build 3 163662597 3D ACTCCCTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 95 het 95 ref 19 3 1 15 A 20 17 176707 CASAVA_Build 3 163665203 24D TAAAATTCTA CATCCATTCATGTTAAAAATTCTC/------------------------ CATCCATTCA 3070 hom 71 het 36 0 25 17 CATCCATTCATGTTAAAAATTCTC 2 1 176708 CASAVA_Build 3 163667698 1I TTAAACAATG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 9 176709 CASAVA_Build 3 163670820 1D TTAAACACTG A/- AAAAACAATG 3070 hom 90 het 34 0 31 5 A 6 5 176710 CASAVA_Build 3 163679562 4I AAATTTAAAA ----/AAAG AAAGTATCTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAAG 1 2 176711 CASAVA_Build 3 163679893 1I TTATTGGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 11 12 176712 CASAVA_Build 3 163681493 2D TATTGTAGTC TT/-- TGCAGTCTGG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 3 1 176713 CASAVA_Build 3 163686936 1I TGCAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 9 10 176714 CASAVA_Build 3 163688279 1D TTTAAAAATA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 25 12 9 4 T 8 7 176715 CASAVA_Build 3 163688611 2D CATGCATGGA AC/-- ACTCTAGTCT 3070 hom 89 het 35 0 29 6 AC 2 1 176716 CASAVA_Build 3 163689946 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 9 10 176717 CASAVA_Build 3 163691787 2D TGTTTTTCAC AT/-- GTTTACTTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 AT 1 0 176718 CASAVA_Build 3 163694197 2I ACAATGCGAT --/AG AGTGTTTAGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AG 1 2 176719 CASAVA_Build 3 163696117 1I TGGGGGTATA -/G GCAATGAGTA 3070 hom 138 het 51 0 45 6 G 1 2 176720 CASAVA_Build 3 163701348 5D GAATTGACTC TTCTT/----- TTATTATGAG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TTCTT 1 0 176721 CASAVA_Build 3 163705278 1I ACAAATTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 705 hom 24 2 16 6 A 13 14 176722 CASAVA_Build 3 163706999 1I ATAATTCCAG -/A AAACAATGTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 3 4 176723 CASAVA_Build 3 163712076 2D AGTCACACGT TG/-- AGTTACCCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TG 1 0 176724 CASAVA_Build 3 163712596 1D TATAGAGGCT G/- TAAGTAACAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 0 176725 CASAVA_Build 3 163713400 1I TTGTTATTAA -/T AATTTAACTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 176726 CASAVA_Build 3 163714335 4D ATATATAGAA AAAT/---- AATTTTGTTG 3070 het 3070 ref 36 23 12 3 AAAT 1 0 176727 CASAVA_Build 3 163723961 3I ATTTTCTGAT ---/AGG AGTTTTCACT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 AGG 0 1 176728 CASAVA_Build 3 163727188 4I TTCTTTCTTT ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTTA 1 2 176729 CASAVA_Build 3 163730683 1I CAAGATATAG -/A ACAGTGTCAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 1 2 176730 CASAVA_Build 3 163732310 17D TTTCTTAATG TCTACTGATGTTGAATA/----------------- TCTTTTCATG 3070 hom 69 het 22 0 24 3 TCTACTGATGTTGAATA 1 0 176731 CASAVA_Build 3 163733693 3D AAATTTAGAC ATT/--- ATATTAGCCA 3070 het 3063 hom 25 8 16 1 ATT 1 0 176732 CASAVA_Build 3 163737770 2D CATTTATTTA TG/-- TATATATGTC 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 TG 1 0 176733 CASAVA_Build 3 163740774 3I TAGAATTTCA ---/TCG TCAATTTTTA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 TCG 0 1 176734 CASAVA_Build 3 163742708 3D TCCCTCCCTC CTT/--- ACTTCATTCT 2665 het 2665 ref 31 20 8 3 CTT 1 0 176735 CASAVA_Build 3 163746149 1D AGCCATCTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 106 het 41 0 36 5 A 10 9 176736 CASAVA_Build 3 163749943 1I AACAAAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 28 1 20 7 T 10 11 176737 CASAVA_Build 3 163752201 1I AGAGCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1998 het 1998 ref 28 10 7 11 A 15 16 176738 CASAVA_Build 3 163752418 1I AAGGTAGTTC -/G GGGAAAGGAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 3 4 176739 CASAVA_Build 3 163760087 1I TGAAATGTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 357 hom 30 1 25 4 A 9 10 176740 CASAVA_Build 3 163760897 1D ATTACAGAAC A/- AAAACACAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 5 4 176741 CASAVA_Build 3 163770889 1I TAATTTGCAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 A 8 9 176742 CASAVA_Build 3 163785712 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 17 10 T 10 9 176743 CASAVA_Build 3 163789497 4I TTTCTTCTTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TCTT 3 4 176744 CASAVA_Build 3 163798442 4I TTGCTGTTTT ----/TCTG TCTATCTCTA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 TCTG 0 1 176745 CASAVA_Build 3 163802768 1D GATATAGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 9 176746 CASAVA_Build 3 163807136 2D TTGGGAACTT TG/-- TAAGATTTAA 3070 hom 58 het 24 0 20 5 TG 1 0 176747 CASAVA_Build 3 163809378 3D TTTTCATAAG TGT/--- TGTGATTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TGT 2 1 176748 CASAVA_Build 3 163811315 1D AATTAAACTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 9 8 176749 CASAVA_Build 3 163825636 2I ACTGACAAAA --/AG AAATATGCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AG 0 1 176750 CASAVA_Build 3 163826212 1D TTTCAATGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 5 T 9 8 176751 CASAVA_Build 3 163834504 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 26 2 22 2 A 13 15 176752 CASAVA_Build 3 163839006 1D TAGGGTCCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 585 hom 38 2 28 10 T 10 9 176753 CASAVA_Build 3 163841903 1I AGCCCGTGGT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 8 176754 CASAVA_Build 3 163856002 1D CTGTACAAAC A/- AACTTACCAA 3070 het 3070 ref 55 28 15 13 A 3 2 176755 CASAVA_Build 3 163856101 1D TTATTGCCCC A/- AGCACCTTTG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 A 2 1 176756 CASAVA_Build 3 163857035 1I GTATAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 753 hom 39 2 32 5 T 10 11 176757 CASAVA_Build 3 163857814 2I AATAAGTGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 32 1 14 17 T 15 17 176758 CASAVA_Build 3 163858901 2I GATAGGAGAG --/CA CACTTATGAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 CA 1 2 176759 CASAVA_Build 3 163861699 2I AAGTAGGTTA --/TT TTTGTATCAT 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 3 5 176760 CASAVA_Build 3 163864401 1D CTAAATATCA C/- TGATTATTAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 176761 CASAVA_Build 3 163877611 1D TTTTTTTTTT C/- TCTCTGATGA 3070 het 174 hom 34 2 26 7 C 1 0 176762 CASAVA_Build 3 163878009 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 872 hom 23 2 18 3 A 11 12 176763 CASAVA_Build 3 163879972 2I TTGTTTTGTT --/TA GTTTTGTTTT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 TA 0 1 176764 CASAVA_Build 3 163887500 1I ATTTGGAAAC -/A ATTAATATAC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 1 2 176765 CASAVA_Build 3 163892195 1I ATGTGCAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 29 0 21 8 A 11 12 176766 CASAVA_Build 3 163892594 1I GATTTCATGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 381 hom 40 1 29 10 T 8 9 176767 CASAVA_Build 3 163894497 4I AGCAAGGAGT ----/GTTC GAACATATAC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 GTTC 0 1 176768 CASAVA_Build 3 163894876 1I ATACAAAAAA -/G AAATTACATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 176769 CASAVA_Build 3 163897889 2D TTTCTAACTC CA/-- AGAGAAGTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CA 1 0 176770 CASAVA_Build 3 163902886 2D CCTGAGCTAG AC/-- ACAGAGTGCT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AC 2 1 176771 CASAVA_Build 3 163904307 1D CAGGAAAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 252 hom 47 1 42 4 T 9 8 176772 CASAVA_Build 3 163905413 1I AAAGAAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 767 hom 47 3 32 12 A 14 15 176773 CASAVA_Build 3 163905912 2D TTAAGTAAAC AT/-- ATTCTTATTC 3070 hom 60 het 21 0 21 1 AT 2 1 176774 CASAVA_Build 3 163906577 1I ACATTAAAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 8 9 176775 CASAVA_Build 3 163907017 1I TAGTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 25 1 17 7 A 10 11 176776 CASAVA_Build 3 163908518 2I CATAATTTAA --/TG TGTTTATATT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TG 1 2 176777 CASAVA_Build 3 163909326 1I CAAGCATTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 176778 CASAVA_Build 3 163915407 1D CAGATGCTTT A/- AGGTAATTCT 3070 hom 54 het 22 0 18 5 A 2 1 176779 CASAVA_Build 3 163916174 1I ACCTCTCTTC -/G CTCTCACTTG 3070 hom 48 het 17 0 15 2 G 0 1 176780 CASAVA_Build 3 163917407 3I TCTAAGATGG ---/CCA CCACGGTCAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 CCA 1 2 176781 CASAVA_Build 3 163921531 1I ACTGAGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 927 hom 29 2 21 6 A 13 14 176782 CASAVA_Build 3 163923365 15D TTTTAATCAC CTGGGTGCAGGCAGG/--------------- CTGAGTCCGA 2960 hom 24 het 11 0 9 2 CTGGGTGCAGGCAGG 1 0 176783 CASAVA_Build 3 163926236 1I TGTTGGTCTA -/G GGAGCTTCCG 3070 hom 41 het 15 0 12 3 G 2 3 176784 CASAVA_Build 3 163928698 2D TTTGATAGTC AT/-- ATAAAATGGT 3070 het 3070 hom 38 16 21 3 AT 2 1 176785 CASAVA_Build 3 163928887 1D TACTTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 6 A 11 10 176786 CASAVA_Build 3 163931592 1I TGAGATTTTG -/C GTGCATCCAT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 C 0 1 176787 CASAVA_Build 3 163935431 6D TACAGTTATG TTTATA/------ TTTATTTATG 3070 het 3070 hom 28 12 15 3 TTTATA 1 0 176788 CASAVA_Build 3 163939136 1I TCTATTTCTT -/A AAAGTGGGTA 3070 het 2573 hom 28 7 18 3 A 3 4 176789 CASAVA_Build 3 163945162 4D ACAAGTTCAT AGTA/---- GGTAAATATA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AGTA 1 0 176790 CASAVA_Build 3 163946266 4D GCAATTTAGA AAAG/---- AAAGAAAGAG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 AAAG 3 2 176791 CASAVA_Build 3 163947608 1D ACCTGGCAAA T/- TTTTAAAATT 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 T 5 4 176792 CASAVA_Build 3 163948163 1I GTTTTTTGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 269 hom 34 1 29 4 T 9 10 176793 CASAVA_Build 3 163948948 4I TCATTTCAAC ----/TTTA TTTATTTCTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTTA 1 2 176794 CASAVA_Build 3 163949657 1I GCTGAACTGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 8 9 176795 CASAVA_Build 3 163953475 1I TATTGCAATT -/C CCCCAGTCTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 4 5 176796 CASAVA_Build 3 163953927 9D CCTATTAGCT CAGTGTAAC/--------- CATGAGAAAA 3070 hom 132 het 46 0 45 6 CAGTGTAAC 1 0 176797 CASAVA_Build 3 163954609 1D AAGTGCTGGG A/- TTATAGGCAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 1 0 176798 CASAVA_Build 3 163956626 3I CTAAAAACAA ---/AAC AATAAGAGAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAC 0 1 176799 CASAVA_Build 3 163961747 1I GCAGAACCTC -/T TTATTTTAAT 3070 hom 87 het 32 0 29 4 T 2 3 176800 CASAVA_Build 3 163964372 7I CTTTTAAGGT -------/CCTTTCG GATCTGGGTC 3070 hom 87 het 30 0 29 2 CCTTTCG 0 1 176801 CASAVA_Build 3 163965812 1D GCTTTCTGTT A/- AGATGATTTT 3070 hom 141 het 49 0 48 1 A 2 1 176802 CASAVA_Build 3 163972751 1I CACACCTTTT -/G GGAAAACATC 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 G 2 3 176803 CASAVA_Build 3 163972993 1I GACCTTTAAT -/A AAAGACTTTC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 3 4 176804 CASAVA_Build 3 163973510 4D AGATTACAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AAAT 5 4 176805 CASAVA_Build 3 163976504 5I AGGTTTTATG -----/TTATT TTAATTACTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTATT 0 1 176806 CASAVA_Build 3 163976787 4I TTTAAGTGAA ----/TATT TATTAGTGGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TATT 1 2 176807 CASAVA_Build 3 163978792 1D TTTTAAAGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 8 176808 CASAVA_Build 3 163979101 1I TATAATTTGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 8 9 176809 CASAVA_Build 3 163981878 1D CAACAACGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 82 het 33 0 28 5 A 10 9 176810 CASAVA_Build 3 163982052 4D GGAAAAAAAT AAAG/---- AAAACATAAA 3070 het 3070 hom 40 15 22 5 AAAG 1 0 176811 CASAVA_Build 3 163983148 1D GCAGCTCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 111 hom 28 2 16 10 A 10 9 176812 CASAVA_Build 3 163990378 1D TATTCATTGA T/- TTTTTAATGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 5 176813 CASAVA_Build 3 164003797 2D ATCTATTCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 14 12 176814 CASAVA_Build 3 164012895 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 11 10 176815 CASAVA_Build 3 164018441 5D TAAAAAATTC TCTTT/----- TCTTTATTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TCTTT 2 1 176816 CASAVA_Build 3 164020306 1D AAAAAGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 12 1 11 0 T 14 13 176817 CASAVA_Build 3 164020498 1I TTTAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 1843 het 206 hom 9 1 5 3 T 13 14 176818 CASAVA_Build 3 164033590 1D CAAACACATG A/- AAAAAAAAAG 3065 hom 18 het 7 0 7 0 A 10 9 176819 CASAVA_Build 3 164041124 1D AGAGCATGTG T/- GGATATATAT 3070 hom 34 het 17 0 11 6 T 1 0 176820 CASAVA_Build 3 164041294 1D ACAGTAGCAT G/- TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 16 0 13 4 G 1 0 176821 CASAVA_Build 3 164042821 1I CACTCAGTCT -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 6 7 176822 CASAVA_Build 3 164049295 3I TTTCATACTT ---/AAA AAAAGATTAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 4 7 176823 CASAVA_Build 3 164050502 1D TGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 12 11 176824 CASAVA_Build 3 164052473 1I CGACAATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 10 11 176825 CASAVA_Build 3 164076709 1D CTGTGACCCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 8 7 176826 CASAVA_Build 3 164080335 1I ATTTTGTCAT -/A ACAGAGACAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 1 2 176827 CASAVA_Build 3 164082898 2I ATTTTCTGAC --/TT GAGCAATTGG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 0 2 176828 CASAVA_Build 3 164083169 1I GATTCCTGAG -/A AATTTAACAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 2 3 176829 CASAVA_Build 3 164087591 3I ATCAAGTTTT ---/ATA ATAATAAGCA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 ATA 2 3 176830 CASAVA_Build 3 164088465 3D TTATAAACAG TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 16 0 14 3 T 12 9 176831 CASAVA_Build 3 164088630 2I GAAAAGCAAT --/CA CATAGATATA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 CA 1 2 176832 CASAVA_Build 3 164089228 6I AAGGTATCTG ------/AATTGT AATTGTCAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AATTGT 1 2 176833 CASAVA_Build 3 164091176 1D ATTAAATTTT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 8 7 176834 CASAVA_Build 3 164111109 2D TGCACAATGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 569 hom 47 2 23 24 AT 6 5 176835 CASAVA_Build 3 164111507 1I GTCATGCCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 9 10 176836 CASAVA_Build 3 164115535 1D GGATTTTTAA T/- TTTTATGCAT 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 T 5 4 176837 CASAVA_Build 3 164116144 1D AATATACTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 51 20 21 11 T 9 8 176838 CASAVA_Build 3 164116492 6I AAATCAGATG ------/ATGATT ATTATTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 ATGATT 0 1 176839 CASAVA_Build 3 164128403 1D AAAATAGGGC A/- AAAAAAGTTG 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 A 7 6 176840 CASAVA_Build 3 164128749 4I CAGCCTCCTT ----/TAAA TAAATAATCA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 TAAA 1 2 176841 CASAVA_Build 3 164130321 6D AGCACGCGTA ACTTTT/------ ACTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 22 12 5 ACTTTT 2 1 176842 CASAVA_Build 3 164130452 1D CGCATAAAAA T/- AGAGTTGAAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 T 1 0 176843 CASAVA_Build 3 164134500 1D ATGACTTCTA T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 T 7 6 176844 CASAVA_Build 3 164134746 1D GAAAATTAGA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 8 7 176845 CASAVA_Build 3 164135155 2I ACAGAAATGA --/AG AGTTTGTTCC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AG 1 2 176846 CASAVA_Build 3 164144283 1D TTCTAAAGCC T/- TTTTAAATAA 3070 het 2150 hom 27 8 16 3 T 5 4 176847 CASAVA_Build 3 164145441 2D TGAAGCCTTA AT/-- ATTTACTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 AT 2 1 176848 CASAVA_Build 3 164146895 1I ACATGATATA -/G GGGAGGAAAA 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 G 3 4 176849 CASAVA_Build 3 164147744 1I TCCAACTAGT -/A AAAAAAAAAA 2945 het 2945 ref 33 16 10 7 A 13 14 176850 CASAVA_Build 3 164149498 2D AGACCAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 43 5 20 18 A 13 11 176851 CASAVA_Build 3 164153426 1D CGCAAACAAA T/- CAGCAAGAAA 3070 het 3070 ref 47 21 19 8 T 1 0 176852 CASAVA_Build 3 164159128 4I ATTCAATAGA ----/TTGT TTGAAGTTGT 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 TTGT 0 1 176853 CASAVA_Build 3 164161053 1I ATACAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 A 10 11 176854 CASAVA_Build 3 164167926 1I CCAGAGGTAC -/A AAAGAGGAGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 3 4 176855 CASAVA_Build 3 164169675 1I CACCACCATC -/A AAAATTGGGC 3070 hom 42 het 18 0 14 4 A 4 5 176856 CASAVA_Build 3 164171699 3D TGACAATAAA TAT/--- TATTGTTGCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TAT 2 1 176857 CASAVA_Build 3 164176469 4I TGTCTCTCTC ----/TCTT TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TCTT 0 1 176858 CASAVA_Build 3 164176887 3D CATCAGTTTC TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 12 9 176859 CASAVA_Build 3 164178675 1D TACATTTGAA C/- TTTATTCATC 3070 hom 114 het 40 0 39 2 C 1 0 176860 CASAVA_Build 3 164179512 4D ATATTCTAAT AAAG/---- AAAGTTAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAAG 2 1 176861 CASAVA_Build 3 164180323 2I CCCTTAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 16 7 A 12 14 176862 CASAVA_Build 3 164181960 2D CCAAATCAGC TG/-- TTTTTACATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TG 1 0 176863 CASAVA_Build 3 164182848 2D GCTTTTTTTC AT/-- ATGTTTGTCG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AT 2 1 176864 CASAVA_Build 3 164184335 10I ATAATTTTTC ----------/TTACGTTGTT TTCAAATTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTACGTTGTT 0 1 176865 CASAVA_Build 3 164185321 1I GGAAACAAAC -/A AAACAAAAAA 3070 het 378 hom 32 2 22 8 A 3 4 176866 CASAVA_Build 3 164187420 1I GCAGCAGGCC -/A GGGGTTAGCA 3070 hom 80 het 33 0 26 7 A 0 1 176867 CASAVA_Build 3 164191613 2I AAATTGCAAC --/AT GTGTTTCTGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 0 1 176868 CASAVA_Build 3 164192826 2I AGCTATAGTC --/TT TTTTTTTTAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 8 10 176869 CASAVA_Build 3 164196157 4D TGGGGTGCCT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 54 het 25 0 18 7 AC 9 7 176870 CASAVA_Build 3 164199398 2D GTACTCACAC AT/-- GTTACCATTT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 AT 1 0 176871 CASAVA_Build 3 164208112 5D TACCATATAG ATAAA/----- ATAAAATACA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ATAAA 2 1 176872 CASAVA_Build 3 164213339 1D TTTGTATAAA T/- GGGAATGTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 1 0 176873 CASAVA_Build 3 164214259 2I TCTTTGCACA --/TT GTCTTTAAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 2 176874 CASAVA_Build 3 164220320 2D CCCCACTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2829 hom 36 het 22 0 11 12 T 15 13 176875 CASAVA_Build 3 164223051 1I CTTCCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 30 3 14 13 T 14 15 176876 CASAVA_Build 3 164224399 1I GAAATGAAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 9 176877 CASAVA_Build 3 164227823 1I TTTATGGTTT -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 30 0 25 6 A 0 1 176878 CASAVA_Build 3 164230468 1I ATAACCTGCA -/T GACAATAGAC 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 0 1 176879 CASAVA_Build 3 164232329 2I ATTGAATGTC --/TA TGTTGTTGAG 3070 hom 184 het 67 0 62 5 TA 0 1 176880 CASAVA_Build 3 164233406 4D AAGGACCAAA TAGT/---- TAGGTCATTA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TAGT 1 0 176881 CASAVA_Build 3 164235605 1D50M4I GGATGCCAAG TTTTTTTGTCTTATTTTGTTTTATTTTTTTTAAATCAAACAGAGAAAACAT----/-TTTTTTGTCTTATTTTGTTTTATTTTTTTTAAATCAAACAGAGAAAACATGGCA GGCAATACTT 3070 hom 163 het 38 0 54 3 N/A 0 0 176882 CASAVA_Build 3 164239414 6I TTGCTGAAAC ------/TTAATA TTAATTTTAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TTAATA 0 1 176883 CASAVA_Build 3 164241847 1I ACAAATAGAT -/A AAAAAGGCTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 5 6 176884 CASAVA_Build 3 164242146 2I TGTGAGTCCC --/AA AAGTTGAAAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 2 4 176885 CASAVA_Build 3 164242832 1I GAATGCAAAA -/G AAGGCACCTT 3070 hom 120 het 49 0 41 8 G 0 1 176886 CASAVA_Build 3 164246433 5D GAAATCAGTT TAAAG/----- TATTTTCTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAAAG 1 0 176887 CASAVA_Build 3 164253092 1D GAATTTCAGA T/- TACCATAAGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 1 176888 CASAVA_Build 3 164260317 1D TATATGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 33 1 21 11 A 13 12 176889 CASAVA_Build 3 164260424 1I GAACTTAGAC -/A GAGCCCAATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 176890 CASAVA_Build 3 164266426 1I CAACATACCA -/C AATCTCTGGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 176891 CASAVA_Build 3 164266692 4D ACTTAATTAA TTCT/---- TAATTAATAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 6 TTCT 1 0 176892 CASAVA_Build 3 164270432 1D GCACAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 13 12 176893 CASAVA_Build 3 164280053 1D TATAATTATG A/- GGTTGATTTT 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 A 1 0 176894 CASAVA_Build 3 164284415 1D AATTTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2659 hom 25 7 13 5 T 11 10 176895 CASAVA_Build 3 164285137 1I TCTTTTTGTC -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 T 7 8 176896 CASAVA_Build 3 164297765 3D ATAATTGGCC TAT/--- TATTATAATC 3070 hom 114 het 41 0 39 5 TAT 3 2 176897 CASAVA_Build 3 164300716 1I CTTTGATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2236 hom 23 6 11 6 A 10 11 176898 CASAVA_Build 3 164315988 1D AATTTAGTAC T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 81 het 49 1 40 8 T 8 7 176899 CASAVA_Build 3 164316842 1I GAGGAGGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 9 10 176900 CASAVA_Build 3 164320497 2D TTTAAAAATG AT/-- ATTCTGTGGG 3070 het 3070 ref 47 22 22 4 AT 2 1 176901 CASAVA_Build 3 164324312 1I ATGAACTTTC -/A AAAAAATGAT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 6 7 176902 CASAVA_Build 3 164334098 1D AAAAATCATC A/- AATGAGATGT 3070 het 3070 ref 30 18 7 5 A 3 2 176903 CASAVA_Build 3 164336416 1I AATTGCGTGG -/T TTTTTTTTTC 2201 het 2201 ref 37 18 8 11 T 9 10 176904 CASAVA_Build 3 164339230 4D ATGGAATATC TCTT/---- TCTATCTCTT 3070 het 3070 ref 30 19 10 3 TCTT 1 0 176905 CASAVA_Build 3 164340596 1I CAAGGCCTAT -/G GTAAGTACTG 3070 hom 84 het 38 0 28 10 G 1 2 176906 CASAVA_Build 3 164343305 5D AAAGCAGATA ATAGC/----- ATAGCGAAGG 3070 hom 126 het 45 0 43 3 ATAGC 2 1 176907 CASAVA_Build 3 164344765 1D ATTATTTAGG A/- AAATAGCTGT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 4 3 176908 CASAVA_Build 3 164345434 1I AGGCAAAAAT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 7 8 176909 CASAVA_Build 3 164346355 1I TTGTATCCTG -/A AACTTTACTG 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 2 3 176910 CASAVA_Build 3 164346599 1D TTTAACCTTT C/- CCCATCAGTA 3070 het 3070 ref 52 26 22 7 C 4 3 176911 CASAVA_Build 3 164353082 1I ATTTGTATCA -/T TTTTGAGGGT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 4 5 176912 CASAVA_Build 3 164353371 4D TCTTTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 677 het 677 ref 24 12 5 8 TTTC 1 0 176913 CASAVA_Build 3 164356656 1I GAACTGTGGA -/G GGTCAAGGGA 3070 het 3070 hom 53 21 25 7 G 2 3 176914 CASAVA_Build 3 164357851 2D CATATCTCTC AA/-- AGTTATTATC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 3 1 176915 CASAVA_Build 3 164358110 1D TATAAAAAAA T/- CTTGGCATTT 3070 het 3070 ref 26 18 7 1 T 1 0 176916 CASAVA_Build 3 164365872 1D GCTAGTATTT C/- AATGAGAATT 3070 het 3070 ref 47 29 11 7 C 1 0 176917 CASAVA_Build 3 164366245 2I TTGCAAATAC --/TA TCTTATAACC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TA 0 1 176918 CASAVA_Build 3 164368111 1I CAGGTCCCCT -/A AGGCCCCAGA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 1 2 176919 CASAVA_Build 3 164369782 1I TAAAAGAAAA -/G CAGGTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 G 0 1 176920 CASAVA_Build 3 164378011 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 11 12 176921 CASAVA_Build 3 164382331 1I TTTTTTGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 39 1 33 5 T 10 11 176922 CASAVA_Build 3 164383444 1D TTACATATCA T/- TTTTCCCTCA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 5 4 176923 CASAVA_Build 3 164385892 4D TGTAAGGATC CTGA/---- CTATCATCAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 CTGA 1 0 176924 CASAVA_Build 3 164391163 1D AAAAAATTAG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 A 7 6 176925 CASAVA_Build 3 164399694 1D CTACTCGGGA G/- GGCTGAGGCT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 G 3 2 176926 CASAVA_Build 3 164402219 4D TATCCTATGA AAAT/---- AAATAATGAT 3070 het 3070 ref 46 29 14 5 AAAT 2 1 176927 CASAVA_Build 3 164403399 2D TAGATAGGAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 22 12 12 AC 8 7 176928 CASAVA_Build 3 164404066 5I ACAAAAAAAC -----/AAGTT AAGTAAATAA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 AAGTT 0 1 176929 CASAVA_Build 3 164407343 1D AAAAAGAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 9 8 176930 CASAVA_Build 3 164409364 1D TGTATTGTCA G/- GTGTTGTATA 3070 het 3070 ref 51 26 18 8 G 2 1 176931 CASAVA_Build 3 164411323 1D TTTTTTCAAC T/- TTTAATTACT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 T 4 3 176932 CASAVA_Build 3 164416208 1D ATGTTCGTTA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 41 23 12 7 T 8 7 176933 CASAVA_Build 3 164419881 1I ATAAATATAT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 6 7 176934 CASAVA_Build 3 164422933 1I TTTGTGGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 11 12 176935 CASAVA_Build 3 164424186 1D TTAGTCACAT A/- AAAAACATCA 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 A 6 5 176936 CASAVA_Build 3 164429699 1D TCATGGCCTT C/- TTCCTGTTTG 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 C 1 0 176937 CASAVA_Build 3 164430967 1I GATAATCATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 T 9 10 176938 CASAVA_Build 3 164435793 1I TAAGTGGAAG -/T TGAACAATGA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 1 2 176939 CASAVA_Build 3 164443840 1I GCAATTAAAA -/G TAATGGCAAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 G 0 1 176940 CASAVA_Build 3 164444833 4I TACTTATTAT ----/TTGA TTATTATTTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTGA 0 1 176941 CASAVA_Build 3 164449867 1D CTGGAAACTC A/- AAAAAAAAAA 2735 het 9 hom 16 0 7 10 A 13 12 176942 CASAVA_Build 3 164454947 1D ATGATAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 237 hom 26 4 11 11 A 13 12 176943 CASAVA_Build 3 164456509 3D AGAAGAAAAT AAC/--- AATTTTATTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 AAC 1 0 176944 CASAVA_Build 3 164457956 1D AAAAGTCAAG C/- CCCCCATTTC 3070 het 3070 hom 47 16 25 7 C 6 5 176945 CASAVA_Build 3 164459243 2I TATATAAAGA --/AT ATATATGTGT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AT 3 4 176946 CASAVA_Build 3 164465098 1I AGTAAAATAC -/T TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 4 5 176947 CASAVA_Build 3 164472254 19D CTTTCACTTA AAGCAATACTTATCACTTC/------------------- AAGCAATACT 3070 hom 96 het 36 0 33 15 AAGCAATACTTATCACTTC 2 1 176948 CASAVA_Build 3 164476116 2D TCTGCCTCCT TA/-- TCATATTTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TA 1 0 176949 CASAVA_Build 3 164477348 1D TGATGGCAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 T 8 7 176950 CASAVA_Build 3 164479721 1D TAATGAGGTA T/- AATATTTAAT 2871 het 2871 ref 27 16 7 4 T 1 0 176951 CASAVA_Build 3 164480720 1I TATAGATATT -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 7 8 176952 CASAVA_Build 3 164484556 4D CACACACAGT AAGA/---- AAGAGAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 24 3 AAGA 2 1 176953 CASAVA_Build 3 164486684 16I GAAGGAAGGA ----------------/AGGAAAGAAAGAACCC AGGCATTGAG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 AGGAAAGAAAGAACCC 0 1 176954 CASAVA_Build 3 164489451 1I ATCTTCACAC -/A AAATGTTTAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 3 4 176955 CASAVA_Build 3 164496093 2D ATATATATAT AC/-- ATATATAATA 1404 het 1162 hom 13 6 3 6 AC 1 0 176956 CASAVA_Build 3 164505309 1D GGCGGGGGGG C/- GGGGAGCTCT 2531 het 1242 hom 16 5 8 6 C 1 0 176957 CASAVA_Build 3 164532845 1D CCAAAAAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 34 11 20 4 A 8 7 176958 CASAVA_Build 3 164539058 6D AAATGGAGAT AATAAG/------ AATGAGTATG 3070 het 3070 hom 44 19 23 4 AATAAG 1 0 176959 CASAVA_Build 3 164545728 1D AAAAATATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 13 11 1 A 15 14 176960 CASAVA_Build 3 164545905 3D CCCACTATAT CGA/--- CAGACTGAAT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 CGA 1 0 176961 CASAVA_Build 3 164546707 3D TATGAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 6 A 13 10 176962 CASAVA_Build 3 164546869 2D TGTAAATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 26 1 18 7 A 12 10 176963 CASAVA_Build 3 164558415 1D ACTACACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 28 4 16 9 A 17 16 176964 CASAVA_Build 3 164559255 2D CATAACCAAC AT/-- GTGATTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 AT 1 0 176965 CASAVA_Build 3 164560512 1D TATAATAATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 8 7 176966 CASAVA_Build 3 164571276 1D ATTGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 34 0 19 15 A 11 10 176967 CASAVA_Build 3 164574694 10D ATATATATAT AGAGAGAGAG/---------- AGAGAGAGAG 1508 hom 10 het 5 0 4 2 AG 14 9 176968 CASAVA_Build 3 164576300 4D AAATCCCTTC TCTT/---- TGTCTCTGCT 3070 het 3070 hom 38 17 21 4 TCTT 1 0 176969 CASAVA_Build 3 164586910 1I GGTTTTATAT -/A AATAAGATCT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 2 3 176970 CASAVA_Build 3 164587754 1I CCTGCACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 10 11 176971 CASAVA_Build 3 164595942 1I AAAAAAGCAC -/T TGATAAAATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 1 2 176972 CASAVA_Build 3 164608022 1D CATAGATCTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 9 8 176973 CASAVA_Build 3 164608377 1I TTAAACAGTC -/A AGAGAGATGA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 1 2 176974 CASAVA_Build 3 164619662 1I ATGTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 11 12 176975 CASAVA_Build 3 164622467 4I TCTCTCTTTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 94 het 38 0 32 6 TG 5 7 176976 CASAVA_Build 3 164636616 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 33 1 25 7 A 15 14 176977 CASAVA_Build 3 164637440 1I AATGAAAAGA -/T TATTCTCTTA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 1 2 176978 CASAVA_Build 3 164639798 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 836 het 748 hom 14 6 6 2 A 11 10 176979 CASAVA_Build 3 164648317 1D CCAGAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 1455 het 1455 ref 39 28 5 7 A 12 11 176980 CASAVA_Build 3 164656154 4D CATAGAATGA TTGT/---- TTATTTGACA 3070 het 3070 hom 49 22 26 2 TTGT 1 0 176981 CASAVA_Build 3 164667498 1D TTCAAATATT A/- AAAAAAGATA 1166 het 1166 ref 19 13 5 1 A 7 6 176982 CASAVA_Build 3 164677391 1D GTCAAGAGGG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 36 21 8 8 A 9 8 176983 CASAVA_Build 3 164678036 1D TAAGATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1932 hom 26 7 13 7 T 15 14 176984 CASAVA_Build 3 164678100 1D TAAATGGTAG T/- TTTTTTTTTG 2395 het 2395 ref 31 14 6 11 T 10 9 176985 CASAVA_Build 3 164681732 1D AAAAATTATC A/- AAAAAAGGCA 3070 het 2390 hom 28 7 18 3 A 7 6 176986 CASAVA_Build 3 164683317 4I TTCCTTCCTT ----/CTTC CTTCCTTCTT 2989 hom 54 het 23 0 16 7 CTTC 2 3 176987 CASAVA_Build 3 164687668 1D TTTGTCTAAG A/- AAGAATCTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 3 2 176988 CASAVA_Build 3 164688345 4I ATAAAACAGA ----/TTAT TTATTTATTT 3070 hom 45 het 23 0 15 8 TTAT 2 3 176989 CASAVA_Build 3 164700984 1D TATACTGTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 176990 CASAVA_Build 3 164704754 1I ATAAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 31 1 24 6 A 12 13 176991 CASAVA_Build 3 164707769 1I CGCCTGTAAT -/C ACAGCACTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 0 1 176992 CASAVA_Build 3 164707938 2D GGAGAATAGC TT/-- TTGAACCCGG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 4 2 176993 CASAVA_Build 3 164720530 1D TTTGGGAGGG C/- GAGGTGGGTG 3070 het 1846 hom 21 4 13 4 C 1 0 176994 CASAVA_Build 3 164735345 1I CAGTCCTTTT -/A AAAAAAAAAA 2479 het 2479 ref 27 14 9 4 A 13 14 176995 CASAVA_Build 3 164742933 1D ATAAATTGTA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 7 6 176996 CASAVA_Build 3 164747731 4I TCTACCTATT ----/AACA AACATTTACT 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 AACA 1 2 176997 CASAVA_Build 3 164756807 1I TAAAATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 14 15 176998 CASAVA_Build 3 164770007 1D TTTTATATTA T/- TTATATATCT 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 T 3 2 176999 CASAVA_Build 3 164793132 1D GCTATAGTAT A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 A 7 6 177000 CASAVA_Build 3 164796045 1D AACTGAGATT A/- AAAAAAAAAA 1374 het 1374 ref 44 33 3 9 A 11 10 177001 CASAVA_Build 3 164796612 5D38M2I ATGTAATAAT CTTAACTTTATGACTATTTTAAAACTATTTTCATAAAATGCAC--/-----CTTTATGACTATTTTAAAACTATTTTCATAAAATGCACTT AGGAACAAAT 3070 het 3070 ref 39 30 21 7 N/A 0 0 177002 CASAVA_Build 3 164799332 1I TACATTCCAG -/A AAAAAAAAAA 2106 het 2106 ref 51 20 6 25 A 14 15 177003 CASAVA_Build 3 164811240 1D GAATCTGCTA T/- TTTTTGACTT 3070 het 3070 ref 38 15 11 12 T 6 5 177004 CASAVA_Build 3 164828772 1I TACTTTCAAG -/A GGGTAGGAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 0 1 177005 CASAVA_Build 3 164834856 1I AAATTAATTC -/T TTTTTTTTTT 2155 het 1011 hom 14 4 7 3 T 13 14 177006 CASAVA_Build 3 164839489 2D TATTATTATG AT/-- ATATATATAT 3070 het 2048 hom 21 7 11 3 AT 7 6 177007 CASAVA_Build 3 164840736 1I ATTACATTAG -/T TTTCAAAAAA 2728 het 2728 ref 16 7 7 2 T 3 4 177008 CASAVA_Build 3 164855050 2D ATTTGGGCTA TT/-- TTAGCTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 4 2 177009 CASAVA_Build 3 164855946 1I TATAAACTGC -/A AAAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 3 4 177010 CASAVA_Build 3 164856908 1D AGTTTAAACC A/- AAAAAAAAAA 1320 het 1320 ref 35 21 3 11 A 13 12 177011 CASAVA_Build 3 164859708 4D TTGAAACAGT AGTG/---- AGTGCTTCAT 3070 het 3070 ref 45 20 22 6 AGTG 2 1 177012 CASAVA_Build 3 164860185 5D ATGGAGAGAG ATAAA/----- ATAAATTTGT 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 ATAAA 2 1 177013 CASAVA_Build 3 164867347 2D TGCCTAAACC AA/-- AGTTTAGAAG 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 A 3 1 177014 CASAVA_Build 3 164873559 3D CATGAGATAA TTC/--- TTCTCCCATC 3070 het 3070 ref 40 23 17 1 TTC 2 1 177015 CASAVA_Build 3 164877744 4D TATTCCCTAA ATCT/---- ATCTGTCTAC 3070 het 3070 ref 39 18 16 8 ATCT 2 1 177016 CASAVA_Build 3 164881997 17I CATATTATTA -----------------/ATATAAGATAAATTGAT TGTGAAGCAT 3070 het 3070 ref 39 23 11 6 ATATAAGATAAATTGAT 0 1 177017 CASAVA_Build 3 164889413 1I TTAAACCCTA -/C TTTGATTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 C 0 1 177018 CASAVA_Build 3 164890727 1D AGTATGTGTA G/- TACATGGTAT 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 G 1 0 177019 CASAVA_Build 3 164893552 1I AAATTTTTGG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 7 8 177020 CASAVA_Build 3 164896490 3D CTGTACAGCC AAT/--- AATAATCTCC 3070 het 2411 hom 17 6 9 2 AAT 3 2 177021 CASAVA_Build 3 164906061 4I GTTAAAAAAA ----/AAAG AAAGAGCAGT 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 AAAG 1 2 177022 CASAVA_Build 3 164907831 4I TTCAATGGAG ----/AAAT AAATGCCTAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 AAAT 1 2 177023 CASAVA_Build 3 164912309 1I GTTTTTTAAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 7 8 177024 CASAVA_Build 3 164913437 1D AATAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 A 14 13 177025 CASAVA_Build 3 164913731 4D AACAATAAAA TATT/---- TATTTATTTG 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 TATT 3 2 177026 CASAVA_Build 3 164919269 3D42M2I TTATTCAAAG TAATAATAATAGCAAAATTCACACAAGAAAGACAATCTGCATAGG--/---TAATAATAGCAAAATTCACACAAGAAAGACAATCTGCATAGGTC TCTCTCTATA 3070 het 3070 ref 36 25 15 4 N/A 0 0 177027 CASAVA_Build 3 164920799 4D ACATTACATG CAAA/---- CAAACAAATA 3070 het 3070 ref 36 23 11 3 CAAA 3 2 177028 CASAVA_Build 3 164921245 5D GTGTCATTAG AAAAT/----- AAAATATTAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 2 AAAAT 2 1 177029 CASAVA_Build 3 164923337 1D TTTATTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 11 10 177030 CASAVA_Build 3 164925182 1D28M2I GATTACAGGT GCCAGCCACCATGCCCAGCCAGTTTGTTC--/-CCAGCCACCATGCCCAGCCAGTTTGTTCTT TTTTTTATAA 2715 het 2715 ref 18 14 7 7 N/A 0 0 177031 CASAVA_Build 3 164926508 4I ACATTACCTC ----/TAAT TAACACATTA 2918 het 1547 hom 12 4 6 2 TAAT 0 1 177032 CASAVA_Build 3 164928951 1I AAGAGAAGTG -/A AAAAAACTCT 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 A 6 7 177033 CASAVA_Build 3 164929423 7D6M8D TATATTTATT CAGAAGAAATGAAACCAAGCC/-------AATATA-------- TTCTAATATT 3070 het 3070 ref 17 14 9 4 N/A 0 0 177034 CASAVA_Build 3 164930641 1I AAATATAGGC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 A 7 8 177035 CASAVA_Build 3 164932127 1D AAAAGTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 T 11 10 177036 CASAVA_Build 3 164938643 1D GCAGGGAGGC A/- GGCAAACCTC 3070 het 3070 ref 56 30 20 6 A 1 0 177037 CASAVA_Build 3 164938953 1I AGCCAACTCC -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 A 6 7 177038 CASAVA_Build 3 164943210 2D ATAGGCAGCC TA/-- TATAACAGGT 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 TA 3 2 177039 CASAVA_Build 3 164943761 1D GAAATAAGAT C/- TAGTGTTCAG 3070 het 3070 ref 51 27 22 3 C 1 0 177040 CASAVA_Build 3 164946767 5I ATTTTTTTCT -----/ACTTA ACTTCTAATT 3040 het 3040 ref 16 9 7 0 ACTTA 0 1 177041 CASAVA_Build 3 164958692 4I ATCTTTAGCT ----/AAAC AAACTGTGAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 AAAC 1 2 177042 CASAVA_Build 3 164963859 5I TTCTAAAATT -----/ATATC TTAGAGTCAA 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 ATATC 0 1 177043 CASAVA_Build 3 164965746 1D ACGGAAATAG A/- CACCCAGACT 3070 het 3070 hom 54 23 26 5 A 1 0 177044 CASAVA_Build 3 164982288 3I TGTAAAGAAC ---/GAT GATGATATTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 GAT 2 3 177045 CASAVA_Build 3 164988062 1I TGAGAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 11 12 177046 CASAVA_Build 3 164995240 2D AGAATTAAAT AA/-- AGTTACTAAT 3070 het 3070 hom 39 13 22 5 A 3 1 177047 CASAVA_Build 3 165000931 1I TTCAGCTCAC -/T TGCTGAACTG 3070 het 3070 hom 45 21 18 6 T 1 2 177048 CASAVA_Build 3 165002209 1D GTAAAATGCA C/- CAATCAGCAC 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 C 2 1 177049 CASAVA_Build 3 165007953 1D AAAAGTTGTT A/- AATAACAGGA 3070 het 2923 hom 14 6 7 1 A 3 2 177050 CASAVA_Build 3 165021678 1D ATGAATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 19 11 A 11 10 177051 CASAVA_Build 3 165030872 5D TTAACCTTTA TAAGT/----- TAAGTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 18 8 4 TAAGT 2 1 177052 CASAVA_Build 3 165042136 1D ACAGAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 T 12 11 177053 CASAVA_Build 3 165043287 1I ATTCCCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 516 hom 31 2 24 5 T 13 14 177054 CASAVA_Build 3 165044867 1I TTTGCAAGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 8 9 177055 CASAVA_Build 3 165061093 1I GTAATCAGCT -/A AAAAAAATGC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 8 177056 CASAVA_Build 3 165065519 2D ATTTACTCTC TT/-- GTGTCATGGT 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 T 2 0 177057 CASAVA_Build 3 165068997 1D ATAATCCAAG A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 7 6 177058 CASAVA_Build 3 165069365 1I AATGTTGGAT -/A AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 5 6 177059 CASAVA_Build 3 165069724 1I ATGAATAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 8 9 177060 CASAVA_Build 3 165070101 3D GGGAATTGAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 45 19 20 7 AAC 4 3 177061 CASAVA_Build 3 165071169 2D GAAACTATAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1926 hom 17 5 10 2 AT 7 6 177062 CASAVA_Build 3 165081058 1D CCAAGCTGTG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 2450 hom 23 7 11 5 T 8 7 177063 CASAVA_Build 3 165082150 3D CCCAGAAATG TTC/--- TTATCACTCA 3070 het 3070 ref 47 21 21 6 TTC 1 0 177064 CASAVA_Build 3 165087455 4D TTCTGCTTAC TTAA/---- TTGAGATTTT 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 TTAA 1 0 177065 CASAVA_Build 3 165090147 2D TAATATCAAG TT/-- TTCAATTAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 4 2 177066 CASAVA_Build 3 165093762 1D GTGGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 12 11 177067 CASAVA_Build 3 165094186 4D CAATTTTTCT TTGG/---- TTGGCCACTG 3070 het 3070 hom 46 19 24 5 TTGG 2 1 177068 CASAVA_Build 3 165099181 1I AATCCCCAAG -/C CTTGAAGGGA 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 C 1 2 177069 CASAVA_Build 3 165101755 1I TCAGGGGATT -/A GAGCATATTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 1 177070 CASAVA_Build 3 165108006 2I CCTTACATTA --/AC AGTTATTGTC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AC 0 1 177071 CASAVA_Build 3 165114201 5I GACTTAACTG -----/ATGAC ATTATCTTGT 2924 hom 21 het 10 0 8 2 ATGAC 0 1 177072 CASAVA_Build 3 165115827 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1815 het 237 hom 14 4 8 3 A 20 16 177073 CASAVA_Build 3 165117415 1D TTACCATGTT C/- CCCCATCATT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 C 5 4 177074 CASAVA_Build 3 165119327 1I TTTACATTTA -/T TTATTTATTT 319 het 111 hom 24 1 2 21 T 2 3 177075 CASAVA_Build 3 165126806 1I AACTGTCCTT -/A AAATTCTTGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 3 4 177076 CASAVA_Build 3 165127094 1D AGCTGGAAGT A/- AAAATCCAAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 5 4 177077 CASAVA_Build 3 165130053 1D ATAAGAACTT A/- AAAAAAAAAA 1808 het 1808 ref 50 37 5 8 A 12 11 177078 CASAVA_Build 3 165130756 2I ATATATATAT --/AG ATATAGAGAG 2333 hom 15 het 6 0 6 0 AG 0 1 177079 CASAVA_Build 3 165137572 6D AAATTTTGAG ACAAAT/------ ACAATGAGAC 3070 het 3070 ref 29 15 12 6 ACAAAT 1 0 177080 CASAVA_Build 3 165138940 4I ATAAAATAAA ----/ATTT ATTTGTTTTC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 ATTT 1 2 177081 CASAVA_Build 3 165141536 1I ACTGTTGCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 65 het 24 0 22 2 T 9 10 177082 CASAVA_Build 3 165141947 1D ATGGACATTT G/- GGTTGGTTCC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 3 2 177083 CASAVA_Build 3 165144810 1I ATACTGATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 13 14 177084 CASAVA_Build 3 165152899 2D TTTATTCTCT TC/-- TCTGTTTCAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TC 2 1 177085 CASAVA_Build 3 165153304 18I20M16D ACCTGTGCCA ------------------GCTGGACCAGATGCACGTGGCTGCTGCTTTGGGCAA/GCTCTGTGCAAAGCTATGGCTGGACCAGATGCACGTGG---------------- CTGCTGCTTT 3070 hom 92 het 34 0 27 22 N/A 0 0 177086 CASAVA_Build 3 165159729 1D CTCCCAAGTG T/- GGGAATAAAT 3070 hom 55 het 38 1 32 6 T 1 0 177087 CASAVA_Build 3 165160091 1I GTTAAGTCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 469 hom 43 2 36 5 A 9 10 177088 CASAVA_Build 3 165160299 2I CCCCTCCTAC --/TA TATGGTTGTT 3070 hom 117 het 43 0 38 6 TA 1 2 177089 CASAVA_Build 3 165162210 1I AAATTTTTAG -/C CACTGCCTGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 2 177090 CASAVA_Build 3 165166586 1D ATCATTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 A 11 10 177091 CASAVA_Build 3 165172300 1I CTACAGAAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 9 177092 CASAVA_Build 3 165173972 1I TTTTTTTTTT -/A TAGACAGAGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 0 1 177093 CASAVA_Build 3 165176977 9I AAGATGTACA ---------/TTATAGTAT CATAAGAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 TTATAGTAT 0 1 177094 CASAVA_Build 3 165177745 2D GAGAGTGAAC AA/-- GAGGAATGGC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 2 0 177095 CASAVA_Build 3 165183451 5D CATGCTTCTT AAAAC/----- AAAGCTATGA 3070 hom 135 het 49 0 46 5 AAAAC 1 0 177096 CASAVA_Build 3 165184776 4I AAGAGCAAAA ----/TAAT CAAAGTATAC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TAAT 0 1 177097 CASAVA_Build 3 165187788 4I GGAATAATAT ----/TTAC TTGTTTTCTT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 TTAC 0 1 177098 CASAVA_Build 3 165188097 1D ACTCAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 237 hom 35 1 14 20 T 15 14 177099 CASAVA_Build 3 165189761 3D CTTTTATTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 11 4 T 18 15 177100 CASAVA_Build 3 165192138 1I GTAAATTTTG -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 8 9 177101 CASAVA_Build 3 165193959 1D TCTTCACCAT C/- CCCCCCACTT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 C 7 6 177102 CASAVA_Build 3 165201641 2D AAAGTGGGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 23 0 17 6 T 15 13 177103 CASAVA_Build 3 165204817 2I CGCCAACGCG --/GC GCGGCCTGGG 3070 hom 62 het 26 0 19 7 GC 1 2 177104 CASAVA_Build 3 165205380 1D TATTCACAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 9 177105 CASAVA_Build 3 165207433 3D CTGTCTCAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 24 1 15 8 A 17 14 177106 CASAVA_Build 3 165214488 2D ACTTAATTAA TC/-- TGTCTCAAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TC 1 0 177107 CASAVA_Build 3 165219711 1D TTGGGTCTGA G/- GGGGGTTGGA 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 G 6 5 177108 CASAVA_Build 3 165223025 1D CTTGGGCCCT G/- GGGGGAGAGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 G 6 5 177109 CASAVA_Build 3 165227676 1I ATTTTTTGAA -/T TAACTAGGAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 1 2 177110 CASAVA_Build 3 165227880 11D CCCAGTCACT TCATTTTTTTG/----------- TCATTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 7 TCATTTTTTTG 2 1 177111 CASAVA_Build 3 165228025 4D TGAGTCTCCT TAAA/---- TAAACTTGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TAAA 2 1 177112 CASAVA_Build 3 165229008 1D ACTTGTTTTC T/- TTTTTGTTAT 3070 hom 141 het 50 0 47 4 T 6 5 177113 CASAVA_Build 3 165229875 3D GGATTTAATG ATA/--- ATAAGATGTA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 ATA 2 1 177114 CASAVA_Build 3 165234938 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 21 1 16 4 A 11 10 177115 CASAVA_Build 3 165242910 1I CATAAAACAA -/C GAAAATAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 0 1 177116 CASAVA_Build 3 165247296 5D AGCCAACCTA TATTT/----- TATTATTATT 3070 hom 66 het 24 0 22 3 TATTT 1 0 177117 CASAVA_Build 3 165248059 5D TATTATTTTT ATTTA/----- ATTTAAATTT 161 hom 8 het 14 0 3 11 ATTTA 2 1 177118 CASAVA_Build 3 165249365 1D ATAAAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 42 3 30 9 T 13 12 177119 CASAVA_Build 3 165251077 1D GATGGTAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 432 hom 26 1 24 1 T 10 9 177120 CASAVA_Build 3 165251433 1D CTTTGAATTG A/- AAGTTGCAAC 3070 hom 129 het 46 0 44 3 A 3 2 177121 CASAVA_Build 3 165256804 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 10 9 177122 CASAVA_Build 3 165264660 2D CTTGCTATGC AA/-- AGAGACTGGC 3070 hom 69 het 26 0 24 4 A 3 1 177123 CASAVA_Build 3 165266567 5I AACACAAATA -----/TTATG TTATAACATT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 TTATG 0 1 177124 CASAVA_Build 3 165268545 2I AACTCATGAC --/AG AGACTACAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AG 1 2 177125 CASAVA_Build 3 165268698 1I ATATAAGGTT -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 8 177126 CASAVA_Build 3 165269051 2I GGGAGAATAT --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 114 het 46 0 38 8 A 8 10 177127 CASAVA_Build 3 165272220 1I AACTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 32 2 26 4 T 13 14 177128 CASAVA_Build 3 165272456 1D TCGTGATCCA C/- ATGCCTCGGA 3070 hom 54 het 21 0 17 4 C 1 0 177129 CASAVA_Build 3 165272691 3I TTTGAAAGAT ---/AAA AAAAAGAATA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 5 8 177130 CASAVA_Build 3 165275270 16I TTCTCGGGAA ----------------/GATAATTAAAGATAAT TATGGGTTTG 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 GATAATTAAAGATAAT 0 1 177131 CASAVA_Build 3 165275667 1D ATTCAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 11 10 177132 CASAVA_Build 3 165275960 1D GATTCTCCTG C/- CTCAGCCTCC 3039 het 868 hom 13 4 7 3 C 2 1 177133 CASAVA_Build 3 165292890 2D TGTACAGATA AT/-- AGTCTATCCA 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 AT 1 0 177134 CASAVA_Build 3 165297912 5D TGGAGCAAAA TAACT/----- TAAAGGTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 TAACT 1 0 177135 CASAVA_Build 3 165302366 1I ATATCAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 13 14 177136 CASAVA_Build 3 165303125 1I AAGGATGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 17 het 45 1 33 11 T 9 10 177137 CASAVA_Build 3 165303287 3I TTTAATATGC ---/TAT TATTCAATGC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 TAT 1 2 177138 CASAVA_Build 3 165303706 2I TACCTTTACC --/AT AATGAGCTTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 AT 0 1 177139 CASAVA_Build 3 165304767 1I TTCCGTTCAG -/T TTAGTGTATT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 2 3 177140 CASAVA_Build 3 165305741 3D TTTTCTTCTC AAG/--- GAGGAAGATG 3070 het 3070 hom 44 15 25 6 AAG 1 0 177141 CASAVA_Build 3 165308074 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 T 11 12 177142 CASAVA_Build 3 165309377 1D ATTAAAGCCC T/- AGGGATGACA 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 T 1 0 177143 CASAVA_Build 3 165310009 1D TATATAATTT C/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 34 19 10 7 C 1 0 177144 CASAVA_Build 3 165315821 4D TTTTTGTTAC TTTG/---- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 16 4 TTTG 2 1 177145 CASAVA_Build 3 165318848 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2682 hom 27 8 10 9 A 11 12 177146 CASAVA_Build 3 165319120 12I TTTTTTTCTG ------------/AACTTTTTTCTA ATCTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 AACTTTTTTCTA 0 1 177147 CASAVA_Build 3 165327073 9D AATTGATCGC TGATGGACA/--------- TGATGGACAT 3070 het 3070 hom 57 30 26 2 TGATGGACA 2 1 177148 CASAVA_Build 3 165328943 4D ATTTATTTGA TTGT/---- TTGTTGTTTC 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 TTGT 2 1 177149 CASAVA_Build 3 165329387 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2459 het 45 hom 22 2 8 12 T 19 18 177150 CASAVA_Build 3 165331447 1I AATAATGAAC -/A ATTATATTTC 3070 hom 23 het 34 1 28 5 A 1 2 177151 CASAVA_Build 3 165331983 1D ATAAGTCTAA G/- ATTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 10 20 8 G 1 0 177152 CASAVA_Build 3 165332199 1I ATTGCATTTA -/G GGCATGTGGG 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 G 2 3 177153 CASAVA_Build 3 165333511 1D AGCCATGGAA C/- CAAGGATGAC 3070 hom 129 het 50 0 43 7 C 2 1 177154 CASAVA_Build 3 165334379 3I AATGTTAAAA ---/CTC CTCCAACAAC 2720 het 1848 hom 12 4 7 1 CTC 1 2 177155 CASAVA_Build 3 165338004 13D TGAACACATA AAATTTGTGCATT/------------- TCACTGAAAA 3070 het 3070 hom 36 18 19 3 AAATTTGTGCATT 1 0 177156 CASAVA_Build 3 165339444 1I ATAGTAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 A 9 10 177157 CASAVA_Build 3 165342417 2D GCAAATGCAA AC/-- AGCCCACCCA 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 AC 1 0 177158 CASAVA_Build 3 165342775 3I CCTCTATGCC ---/TCT TCTTCTTCAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TCT 2 3 177159 CASAVA_Build 3 165343526 1D ATCAACTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 11 6 T 13 12 177160 CASAVA_Build 3 165346314 6D ATTCTGATAT GTATTA/------ GTATATGTTG 3070 het 3070 ref 33 18 13 5 GTATTA 1 0 177161 CASAVA_Build 3 165350786 4I CCTAAATCAT ----/GATC CTCTTTCCAG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 GATC 0 1 177162 CASAVA_Build 3 165351656 1I ATGTGTAAGA -/C CCTAAGTCAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 C 2 3 177163 CASAVA_Build 3 165354442 1I AACTTGTCAC -/T ACAATATATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 1 177164 CASAVA_Build 3 165358511 1I TAGATCCTTG -/A GGAATCACCA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 0 1 177165 CASAVA_Build 3 165368104 4I AAATATAGAC ----/AAAG AAAATAAGAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAAG 0 1 177166 CASAVA_Build 3 165373920 5I TTGTTAGTAA -----/AAGAG AAGTATCTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAGAG 0 1 177167 CASAVA_Build 3 165374671 1I TTGCTCATTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 8 9 177168 CASAVA_Build 3 165376563 4D ATGTGGTGGC TTTG/---- TTTATTTAAT 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 TTTG 1 0 177169 CASAVA_Build 3 165387583 10D TATTAAAAAG TTATAGAAAA/---------- TTATAGAAAA 1443 het 1443 ref 11 7 3 1 TTATAGAAAA 2 1 177170 CASAVA_Build 3 165400230 1D CTGAAAATTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 9 8 177171 CASAVA_Build 3 165407355 1D TTCTAATAAC T/- TTTTTTTTTT 2615 het 2355 hom 23 10 6 8 T 15 14 177172 CASAVA_Build 3 165409743 2D CATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 949 het 949 ref 56 42 3 11 TG 7 6 177173 CASAVA_Build 3 165410990 1D TGCCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 25 1 20 4 T 13 12 177174 CASAVA_Build 3 165411240 1I ACATGAAGTG -/T TTTTTTTTTT 1229 het 923 hom 11 5 4 2 T 13 14 177175 CASAVA_Build 3 165411741 2D AGATGCTCTC AA/-- GAGCAGAATG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 2 0 177176 CASAVA_Build 3 165415181 2I TCTATCTATG --/TA TATATATATA 2638 het 2076 hom 20 5 7 8 TA 7 8 177177 CASAVA_Build 3 165415628 1I AACACATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 A 10 11 177178 CASAVA_Build 3 165421834 2D ATTCAAACTC TT/-- TTAATCCACA 3070 het 3070 hom 38 14 21 5 T 4 2 177179 CASAVA_Build 3 165423212 3D CTTTTAATAA TAT/--- TAAGATTTTA 3070 het 3070 hom 32 10 19 5 TAT 1 0 177180 CASAVA_Build 3 165425190 1D AAATGACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 23 1 13 9 T 15 14 177181 CASAVA_Build 3 165433293 1I TTATGTAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 80 het 40 0 35 5 A 9 10 177182 CASAVA_Build 3 165441918 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 2077 het 2077 ref 17 6 8 3 A 9 10 177183 CASAVA_Build 3 165449197 3I CCAGCAATTG ---/TCT TCAGAAATCC 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 TCT 0 1 177184 CASAVA_Build 3 165457462 2D TAAGAAAGAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 A 11 9 177185 CASAVA_Build 3 165460157 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 169 hom 24 1 22 1 A 9 10 177186 CASAVA_Build 3 165461439 4I AAAAACAAAT ----/AATC AATGTTTCAG 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 AATC 0 1 177187 CASAVA_Build 3 165468056 6D TACAAAAAAA TAAAAT/------ AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 7 TAAAAT 1 0 177188 CASAVA_Build 3 165484852 2D GTATGTGTGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 12 13 14 AC 9 8 177189 CASAVA_Build 3 165490921 5D TTTATATGAA TTAAC/----- TTAATCCTGA 3070 het 3070 hom 41 15 24 3 TTAAC 1 0 177190 CASAVA_Build 3 165491113 2I GACTATATAT --/AC ACACACAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 AC 3 4 177191 CASAVA_Build 3 165491629 5I GGTTAAAATT -----/AAAGA AAAAAGATTT 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 AAAGA 0 1 177192 CASAVA_Build 3 165505374 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 2958 het 2958 ref 28 9 11 8 A 13 14 177193 CASAVA_Build 3 165514502 4I TATACATGTG ----/TATA TATATATATA 1469 het 1469 ref 19 13 4 2 TA 5 7 177194 CASAVA_Build 3 165515040 1D TATAATCTTC A/- AAAATGACAA 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 A 5 4 177195 CASAVA_Build 3 165524494 3I AAATATATAT ---/ATA ATATCAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 ATA 1 2 177196 CASAVA_Build 3 165524990 5D AATTAGACTT ATATA/----- GTATTTAGTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 8 ATATA 1 0 177197 CASAVA_Build 3 165525491 1I TTTTCGTATG -/C TTATTTCCCA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 0 1 177198 CASAVA_Build 3 165527963 2I ACAAAAATGG --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 A 8 10 177199 CASAVA_Build 3 165529119 1I AAGTATAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 29 1 16 12 T 11 12 177200 CASAVA_Build 3 165531138 1D ACATGATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3032 hom 30 10 12 8 A 11 10 177201 CASAVA_Build 3 165532521 1D AACCTGTGGG A/- AAAAAAAAAA 2531 het 2531 ref 23 11 7 6 A 12 11 177202 CASAVA_Build 3 165533571 1I GCTTAAGGTC -/A GGGGTAGGGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 0 1 177203 CASAVA_Build 3 165537163 18D AGATAGGCGG TGCCCGTCCATACATGAT/------------------ TTCAAAAGGC 3070 het 3070 ref 35 27 11 5 TGCCCGTCCATACATGAT 1 0 177204 CASAVA_Build 3 165538633 1I AGCTGCCATT -/A AGATTTTTGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 177205 CASAVA_Build 3 165562177 1D GGGGGGTGCG A/- AAAAAAAAAG 1216 het 1216 ref 34 25 3 8 A 10 9 177206 CASAVA_Build 3 165566159 2I TTGATTATAA --/CT CTATTAATTT 3070 het 2044 hom 41 6 21 14 CT 1 2 177207 CASAVA_Build 3 165566179 3D AGAAAAAAAG TAT/--- TATAAAAAGT 3070 het 2650 hom 40 7 16 17 TAT 2 1 177208 CASAVA_Build 3 165575106 2D TTTCAGAAAC TT/-- ATTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 T 2 0 177209 CASAVA_Build 3 165575489 3D ATTTTCCATG AGT/--- TAAATGTTAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 AGT 1 0 177210 CASAVA_Build 3 165575607 1I ATAAACCCCC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 5 6 177211 CASAVA_Build 3 165576450 2D TATTGAAATT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 28 13 9 7 A 10 8 177212 CASAVA_Build 3 165577830 2D GCCTCCCAAA GT/-- GCTGGAATTA 2988 het 2879 hom 15 7 7 3 GT 1 0 177213 CASAVA_Build 3 165587180 3D TGCCTTCTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 A 13 10 177214 CASAVA_Build 3 165587375 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 10 9 177215 CASAVA_Build 3 165591587 3D TGATAATATA ATG/--- ATAATTTTTG 1700 het 1700 ref 16 8 5 3 ATG 1 0 177216 CASAVA_Build 3 165593882 1I TTAGCTTTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 9 10 177217 CASAVA_Build 3 165616148 1D GGGGAGAAGG T/- TTAAATTGGA 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 T 3 2 177218 CASAVA_Build 3 165629329 4I TATTTTAATT ----/TATC TATGGATATG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 TATC 0 1 177219 CASAVA_Build 3 165679590 1D ATTTTGAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 T 10 9 177220 CASAVA_Build 3 165686247 1D CACAAAAATA T/- TTTTATTGCT 3070 het 3070 ref 40 17 19 4 T 5 4 177221 CASAVA_Build 3 165696228 5D GGGAAAAAAA CATCT/----- CATCAATCAT 3070 het 3070 hom 37 13 22 3 CATCT 1 0 177222 CASAVA_Build 3 165696317 1I TGTGTAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 9 10 177223 CASAVA_Build 3 165698411 1D TATTTCTGAG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 7 6 177224 CASAVA_Build 3 165698988 1D51M1D GAAAGAGCTA TTTTTTTTTTCTTTTACCTATACTGCATGTATTTATAGTTTTAGTTTTTTTTA/-TTTTTTTTTCTTTTACCTATACTGCATGTATTTATAGTTTTAGTTTTTTTT- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 33 16 7 N/A 0 0 177225 CASAVA_Build 3 165707034 1I AGAAAAAAAA -/T AAGTCAAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 0 1 177226 CASAVA_Build 3 165711062 2I CAAGGAAAAC --/AG AGCTGTTGGT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 AG 1 2 177227 CASAVA_Build 3 165731988 1D AACATCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1737 hom 15 5 10 0 T 13 12 177228 CASAVA_Build 3 165736399 1I AAAGGTAAAA -/T CCTTTATCTG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 0 1 177229 CASAVA_Build 3 165738228 1D TATTTCTGCA T/- TTTTTTGACT 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 T 7 6 177230 CASAVA_Build 3 165738683 1I ATATAATTTT -/A AAACTCTCTA 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 A 3 4 177231 CASAVA_Build 3 165743843 1D AAGTAGTGAG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 69 28 33 8 A 8 7 177232 CASAVA_Build 3 165746765 2I ATAACAACAA --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 CT 5 6 177233 CASAVA_Build 3 165757169 1I AATTATTTTG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 A 8 9 177234 CASAVA_Build 3 165765458 3D CCATTTTCTT TTC/--- TTAATGGTGT 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 TTC 1 0 177235 CASAVA_Build 3 165792927 1I AAAAGAAGAG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 A 7 8 177236 CASAVA_Build 3 165824588 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2099 het 953 hom 19 7 7 5 A 17 16 177237 CASAVA_Build 3 165861207 2I TCTCAGAGAT --/TC TGTTTACCTC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TC 0 1 177238 CASAVA_Build 3 165871722 1I GCCTGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 25 1 20 4 A 10 11 177239 CASAVA_Build 3 165872686 2I GTGTGTGTTT --/TC GTGTATTTTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 TC 0 1 177240 CASAVA_Build 3 165873784 1D TTTAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 hom 105 het 41 0 36 6 C 1 0 177241 CASAVA_Build 3 165875288 5I TATTAGAAAT -----/ATAAC ATAAGAAAGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATAAC 0 1 177242 CASAVA_Build 3 165877575 1D TAAAATACAT A/- ATAGTGTTGG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 1 177243 CASAVA_Build 3 165878407 1D AAAATCTTCC A/- AAAAAAAATT 3070 het 75 hom 35 1 33 1 A 9 8 177244 CASAVA_Build 3 165883882 4D AATTCATACA CTGT/---- CTGATTTCTC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CTGT 1 0 177245 CASAVA_Build 3 165890419 2I TAGCAGCAAT --/AA AAGTTATTCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 2 4 177246 CASAVA_Build 3 165891634 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 951 hom 18 het 14 0 7 7 A 11 10 177247 CASAVA_Build 3 165891652 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 878 hom 25 het 19 0 7 12 A 10 9 177248 CASAVA_Build 3 165894370 1D CTTTGTTTCT G/- GTCTATTTGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 2 1 177249 CASAVA_Build 3 165898100 1I GACACAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 37 1 30 6 T 10 11 177250 CASAVA_Build 3 165919301 2I TCTCTAATGC --/AT ATATATATAA 2880 hom 18 het 9 0 7 2 AT 4 5 177251 CASAVA_Build 3 165919805 1D TGCTAAACCC T/- GCACTGAAAG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 1 0 177252 CASAVA_Build 3 165921060 1I TTTGGCTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 103 het 44 0 35 9 T 9 10 177253 CASAVA_Build 3 165924306 1D AGAATCACAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 79 het 33 0 26 8 T 10 9 177254 CASAVA_Build 3 165929860 1D AAAAAATCCA G/- TTGCTCCACA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 1 0 177255 CASAVA_Build 3 165930136 1D TTTTGCCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 564 hom 28 2 10 16 T 13 12 177256 CASAVA_Build 3 165945261 14D AAAAGAAAAT ACTAAAAAGAAAAA/-------------- ACTAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 13 20 13 ACTAAAAAGAAAAA 2 1 177257 CASAVA_Build 3 165963044 1I TATATGTATT -/A ATATTTAATC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 1 2 177258 CASAVA_Build 3 165963927 6I ACTGAATAAT ------/TATTAA TATTAATTCT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TATTAA 1 2 177259 CASAVA_Build 3 165964569 1D ATAGTTCATG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 8 7 177260 CASAVA_Build 3 165973190 1I GTCTTTAGGG -/T TTTTTTTTTT 1494 het 1494 ref 29 15 5 9 T 15 16 177261 CASAVA_Build 3 165973968 1D CCAGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1073 het 1073 ref 43 34 3 6 T 11 10 177262 CASAVA_Build 3 165975449 2I TTGTATTAAT --/TA TATATATGTA 3070 het 2389 hom 23 7 13 3 TA 3 4 177263 CASAVA_Build 3 165981796 1I CACATATTGA -/T TTTTCAGCGG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 4 5 177264 CASAVA_Build 3 165985966 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 9 10 177265 CASAVA_Build 3 165986168 1D GACAACCAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 T 10 9 177266 CASAVA_Build 3 166006857 1I AGAGCCACCT -/A AAGGCCAACG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 2 3 177267 CASAVA_Build 3 166010761 1I TCTGAACTTC -/T CAAATCATTA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 0 1 177268 CASAVA_Build 3 166026482 1I CAAAGTCTCC -/T AACACAGTCC 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 0 1 177269 CASAVA_Build 3 166032072 1D TTGACATTGA C/- CCCTGATATG 3070 het 3070 ref 51 27 15 9 C 4 3 177270 CASAVA_Build 3 166045380 1I TTATTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3047 hom 32 8 18 6 A 11 12 177271 CASAVA_Build 3 166047132 4D CCAGCTGACC TAGT/---- TTATTTATAA 3070 het 3070 hom 29 14 15 1 TAGT 1 0 177272 CASAVA_Build 3 166048792 2D AGTAGAACCC CT/-- GTTTTAGTAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 CT 1 0 177273 CASAVA_Build 3 166058804 1D ATATATATAT A/- TATATTTTTT 1178 het 1178 ref 10 3 4 3 A 1 0 177274 CASAVA_Build 3 166073190 7D TTTTCTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2229 het 1161 hom 22 7 7 8 T 18 11 177275 CASAVA_Build 3 166106842 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 7 8 177276 CASAVA_Build 3 166124620 1I TTGTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 2324 het 2324 ref 22 7 8 7 T 15 16 177277 CASAVA_Build 3 166137750 1I CTGGGGCATT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 7 8 177278 CASAVA_Build 3 166200848 3D AGTTAGATAG GAA/--- GAATAAATTT 3070 het 3070 hom 33 8 22 4 GAA 2 1 177279 CASAVA_Build 3 166222918 2D GATTAAAAAC AG/-- ACACTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AG 1 0 177280 CASAVA_Build 3 166246263 2D TCTTAGGTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 26 6 T 11 9 177281 CASAVA_Build 3 166246331 4D TGTTTTTCAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 39 0 25 14 T 20 16 177282 CASAVA_Build 3 166246883 1D AATTTTAAAC G/- TTTTTTTCTG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 G 1 0 177283 CASAVA_Build 3 166248326 1I ATTAAGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 41 1 34 6 T 10 11 177284 CASAVA_Build 3 166249502 1I ATATTATCTT -/A TCTTTTTTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 0 1 177285 CASAVA_Build 3 166258544 2I ATTTTTTTTT --/AA AAAAAATTGA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 6 8 177286 CASAVA_Build 3 166259608 2I TAACTTACAC --/AT GTGTAAACAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AT 0 1 177287 CASAVA_Build 3 166264397 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 35 het 13 0 11 2 A 6 7 177288 CASAVA_Build 3 166268662 1I TAATCTTCTG -/C CATAGCCTGT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 2 177289 CASAVA_Build 3 166269324 1D CTTAAAGAAT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 177290 CASAVA_Build 3 166273327 3I TAAAATCATT ---/TTG TTAAGTTGCA 3070 hom 144 het 50 0 49 1 TTG 0 1 177291 CASAVA_Build 3 166276884 3D CTCAATTCTC ACA/--- ACAATTCTAT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 ACA 2 1 177292 CASAVA_Build 3 166287635 1I CAAAACAAAC -/A AAACAAAAAA 3070 het 356 hom 34 1 31 2 A 3 4 177293 CASAVA_Build 3 166289567 3D TTTTTCTTTT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 6 TTC 1 0 177294 CASAVA_Build 3 166290643 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 3070 het 434 hom 27 2 20 5 G 1 0 177295 CASAVA_Build 3 166294138 1D AGAAAGTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 11 10 177296 CASAVA_Build 3 166296397 1I AGGAGAGAGA -/G GAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 177297 CASAVA_Build 3 166306322 2D ACACACAATC AT/-- ATATATATAT 2209 het 2209 ref 30 19 6 5 AT 9 8 177298 CASAVA_Build 3 166345685 4D TGTTTAAATC TATT/---- TATGTATAAT 3070 hom 144 het 53 0 48 8 TATT 1 0 177299 CASAVA_Build 3 166388343 1D TTTTCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 1818 het 1818 ref 37 27 4 8 A 11 10 177300 CASAVA_Build 3 166392697 1I AATAAATCTT -/A CACATTACAC 3070 het 3070 hom 43 13 25 5 A 0 1 177301 CASAVA_Build 3 166449046 1D AGTTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 11 10 177302 CASAVA_Build 3 166452545 1D TTTCCTTTCC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 8 7 177303 CASAVA_Build 3 166457272 1D TTCTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 1106 het 1106 ref 39 30 4 5 A 12 11 177304 CASAVA_Build 3 166459561 2D AATTTAAATA TG/-- TATCACAATT 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 TG 1 0 177305 CASAVA_Build 3 166481677 1I GTATTAAAAT -/A AAAAAAGTCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 6 7 177306 CASAVA_Build 3 166529933 4I TTTGCGTGAA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TG 5 7 177307 CASAVA_Build 3 166547077 1I TGTTATCTCT -/G GGGGGCTGAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 5 6 177308 CASAVA_Build 3 166550203 22I TTTAAAACAA ----------------------/GTTATAAATTTTACATTGTGAG GTTCACGAAA 3070 hom 63 het 21 0 22 1 GTTATAAATTTTACATTGTGAG 0 1 177309 CASAVA_Build 3 166561434 1D TTGAAGTTTC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 1826 hom 20 6 10 4 T 8 7 177310 CASAVA_Build 3 166563129 1I CTAATACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 11 12 177311 CASAVA_Build 3 166564397 1I ATTAAAGAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 8 9 177312 CASAVA_Build 3 166572208 1D AATTGCTATA C/- ATTTATAATT 1410 het 1410 ref 9 4 3 3 C 1 0 177313 CASAVA_Build 3 166575547 4D TATTGTCCTC TTAA/---- TTAATAGTGC 3070 het 3070 ref 38 20 14 6 TTAA 2 1 177314 CASAVA_Build 3 166579632 1D AGTGCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 39 0 29 10 T 13 12 177315 CASAVA_Build 3 166582611 2D AAATGTGCTA TT/-- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 T 9 7 177316 CASAVA_Build 3 166584804 1D TTTAGCAGCC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 8 7 177317 CASAVA_Build 3 166585659 1D AATTTTGCAA T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 T 8 7 177318 CASAVA_Build 3 166596379 1I TCCATTGTGT -/A AAAAGCAGTA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 4 5 177319 CASAVA_Build 3 166596562 1D CAAACAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 A 11 10 177320 CASAVA_Build 3 166603932 1I GCATTTTAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 T 8 9 177321 CASAVA_Build 3 166605797 1I TACCTAAATC -/T TTTTTTTTTT 2827 het 2827 ref 45 13 12 20 T 15 16 177322 CASAVA_Build 3 166619074 1D CCACAATTAA G/- TAATCTTTAT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 G 1 0 177323 CASAVA_Build 3 166625403 1I AATAAAGATT -/A AAAAAATCAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 6 7 177324 CASAVA_Build 3 166629029 2D AGTGGATAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 34 3 22 9 A 16 14 177325 CASAVA_Build 3 166631387 1D CCAACATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 11 10 177326 CASAVA_Build 3 166631571 1D AAATTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 41 0 36 5 T 11 10 177327 CASAVA_Build 3 166637336 1D ACATACATTG T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 177328 CASAVA_Build 3 166651453 2D TTCAAATGGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 96 het 40 0 32 9 AT 6 5 177329 CASAVA_Build 3 166652959 1D ACAGAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 32 1 24 8 A 12 11 177330 CASAVA_Build 3 166663970 2D GAGTGAAACA CT/-- CTGTATTAAA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 CT 2 1 177331 CASAVA_Build 3 166669993 1I GGGACTCTAT -/C CAATCCATCA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 C 1 2 177332 CASAVA_Build 3 166708779 1I GATAAATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 T 10 11 177333 CASAVA_Build 3 166709983 2D CTCTGCATAA CT/-- CTCTTTTACC 3070 het 3070 ref 57 32 23 2 CT 3 2 177334 CASAVA_Build 3 166724233 1I AAGAAGTGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 9 10 177335 CASAVA_Build 3 166739090 6D TTTTTTTTTG TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 TTTTGT 2 1 177336 CASAVA_Build 3 166752865 1I CAGAATTTCA -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 6 7 177337 CASAVA_Build 3 166763049 2I CTAAACAAAC --/AT AGATTATCTA 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 AT 0 1 177338 CASAVA_Build 3 166770855 1D ACTAAGAAAA T/- GATGTAAGTC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 1 0 177339 CASAVA_Build 3 166780070 1I AAAAAAAAAA -/T AAAGCAGAAA 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 T 0 1 177340 CASAVA_Build 3 166808615 1I AACTTAAAAA -/T AATCATATAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 177341 CASAVA_Build 3 166812536 3I AAAATTAATT ---/TTA TTTTTATATG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TTA 0 1 177342 CASAVA_Build 3 166816688 1D TAAAGTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 12 11 177343 CASAVA_Build 3 166818269 3D TATAAAATGA TAT/--- TATATAACAT 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 TAT 2 1 177344 CASAVA_Build 3 166838868 1I CACAGCTGTC -/A AAAGTCAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 A 3 4 177345 CASAVA_Build 3 166839466 1D TCTAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 12 11 177346 CASAVA_Build 3 166842874 1I GTTTTTTTTT -/A TTTAAAAAAA 3070 het 2758 hom 23 10 9 4 A 0 1 177347 CASAVA_Build 3 166845437 14D11M24D AGCAGGTACA TTATATAATGTACCTTATATAAACTTATATATATACATTATCCAGTATA/--------------TTATATAAACT------------------------ TATATAAACT 3070 hom 54 het 15 0 19 5 N/A 0 0 177348 CASAVA_Build 3 166859286 3I TGAGAATTAT ---/AAA AAAGCTACAG 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 A 3 6 177349 CASAVA_Build 3 166861464 1I GTTGAAATTC -/T TTTTTTTTTT 2011 het 2011 ref 27 12 7 8 T 12 13 177350 CASAVA_Build 3 166862953 1D CTAATAATAC A/- AAAATTAGCT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 5 4 177351 CASAVA_Build 3 166866120 1I CAAATTAGAA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 7 8 177352 CASAVA_Build 3 166871878 1D CTTATGTATT A/- AAAAATAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 6 5 177353 CASAVA_Build 3 166874559 1D TTAAAGTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 152 hom 30 4 13 13 T 10 9 177354 CASAVA_Build 3 166881906 1D AGAAGGCTGG A/- AAAAATAGAC 3070 hom 129 het 50 0 43 7 A 6 5 177355 CASAVA_Build 3 166887090 9I TTTGGAATTG ---------/AGTCTTAGA ACTGGACTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 4 AGTCTTAGA 0 1 177356 CASAVA_Build 3 166896106 1I TGGAAACTTC -/T TTGAGCTGCA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 T 2 3 177357 CASAVA_Build 3 166896731 1I CTTTTTTTTT -/C CTGTGATGTC 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 C 1 2 177358 CASAVA_Build 3 166897748 1D AGCAAGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 31 1 25 5 T 13 12 177359 CASAVA_Build 3 166898774 1D ATAATGACTG A/- AAAAAAGGGC 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 7 6 177360 CASAVA_Build 3 166917422 4D TGTTTTTGTT TTTG/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 14 4 TTTG 1 0 177361 CASAVA_Build 3 166919103 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 14 13 A 13 12 177362 CASAVA_Build 3 166923448 1D AAAATCAGGA T/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 47 23 17 8 T 7 6 177363 CASAVA_Build 3 166940087 1D ATGAAAATGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 T 9 8 177364 CASAVA_Build 3 166949328 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1888 het 1888 ref 24 11 6 7 T 17 16 177365 CASAVA_Build 3 166967029 1D CTCTGGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 19 1 16 2 T 16 15 177366 CASAVA_Build 3 166973571 1I TTTTGGGGGG -/A AAAAACTTAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 5 6 177367 CASAVA_Build 3 166974279 1D ATTACATATA T/- TTTCTTTAGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 4 3 177368 CASAVA_Build 3 166979398 1D CTATTTATAA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 7 177369 CASAVA_Build 3 166982087 1D TGGAGGGTGA G/- GGGAGGGAGA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 G 4 3 177370 CASAVA_Build 3 166982977 1I TCACATTTGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 8 9 177371 CASAVA_Build 3 166988597 5D CCGATCTAAG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 hom 66 het 34 0 23 12 TTTGT 5 4 177372 CASAVA_Build 3 166989777 1I18M1I ACTTAACAAC -AAAAAAAAGCAGAGTATC-/AAAAAAAAAGCAGAGTATCT TTTTTTTTTA 3070 het 2528 hom 32 7 16 10 N/A 0 0 177373 CASAVA_Build 3 166991323 1D GGAAAGCAAA G/- GGGACAGTGT 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 G 4 3 177374 CASAVA_Build 3 166999309 1D CCATCTGAAC A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 7 6 177375 CASAVA_Build 3 167000504 5I ATGGAACTAC -----/TTTAT TTTATTAGCG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTAT 1 2 177376 CASAVA_Build 3 167004539 1I GAAAGGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 12 13 177377 CASAVA_Build 3 167011916 2I AGCAGTGTAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 GT 5 6 177378 CASAVA_Build 3 167012769 1I GAGTCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 44 0 32 12 T 11 12 177379 CASAVA_Build 3 167013543 1D CCTTTTTTTT C/- CTATCAGGAT 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 C 2 1 177380 CASAVA_Build 3 167014701 1I AAATAACACA -/T TTTTCTGGTT 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 T 4 5 177381 CASAVA_Build 3 167015730 2D TTGATTTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 33 1 28 5 A 15 13 177382 CASAVA_Build 3 167019757 1I GATGGGGTTT -/C ACCATATTAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 0 1 177383 CASAVA_Build 3 167020231 4I TTCAATAAAT ----/AGAG AATCATTAGC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 AG 0 2 177384 CASAVA_Build 3 167020685 1I TTGCCCCTTT -/G GGGGGACATC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 G 5 6 177385 CASAVA_Build 3 167021520 1I TTTCTCACTT -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 105 het 46 0 36 10 A 6 7 177386 CASAVA_Build 3 167025824 1D GAATGTAAAT A/- ATATTATGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 2 1 177387 CASAVA_Build 3 167034268 1D GCTAGTATGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 177388 CASAVA_Build 3 167034696 5D TTCCCATGTC ACTTA/----- ACTTGATTTA 3070 hom 105 het 39 0 35 6 ACTTA 1 0 177389 CASAVA_Build 3 167035679 2I GTGACAAATC --/TT TTTTTTTGTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 7 9 177390 CASAVA_Build 3 167045557 1D TATCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 15 9 T 15 14 177391 CASAVA_Build 3 167048939 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 9 177392 CASAVA_Build 3 167049524 1D TCTATTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 7 10 5 T 11 10 177393 CASAVA_Build 3 167059635 1I AACATTTCTT -/A AAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 6 7 177394 CASAVA_Build 3 167063930 1I TCACCAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1071 hom 28 3 17 8 T 14 15 177395 CASAVA_Build 3 167067401 2D CGCTCTTTGT AG/-- AGATTAAAGC 3070 hom 84 het 32 0 29 5 AG 2 1 177396 CASAVA_Build 3 167083579 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAATT 1539 het 994 hom 7 2 4 1 A 9 8 177397 CASAVA_Build 3 167089882 1I TATAAATGTT -/A AATCTTACTT 3070 het 2985 hom 21 8 10 3 A 2 3 177398 CASAVA_Build 3 167099680 1D ATTTTACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 A 11 10 177399 CASAVA_Build 3 167113533 2I AATGTTTTAT --/AA GTGTTAGTTA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 0 2 177400 CASAVA_Build 3 167114316 2D AAAAGGATAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 AT 6 5 177401 CASAVA_Build 3 167114445 1D TGAAGAACTT G/- GGAGTCCAGT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 G 3 2 177402 CASAVA_Build 3 167116056 5D TATATATATA TAAAG/----- TAGATTTTTT 1804 het 1804 ref 23 18 4 2 TAAAG 1 0 177403 CASAVA_Build 3 167120176 5D TAAATTTTAG TGTTT/----- TGTTTATCAG 3070 het 3070 ref 36 19 15 4 TGTTT 2 1 177404 CASAVA_Build 3 167123033 1I GCAGAAATGG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 54 25 19 10 A 7 8 177405 CASAVA_Build 3 167150356 5I ACTAAGGTAC -----/TTCTA TTCTAGAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TTCTA 1 2 177406 CASAVA_Build 3 167151686 1D TCAGCCAACA C/- CCCCTATTTG 3070 het 3070 hom 40 16 20 6 C 5 4 177407 CASAVA_Build 3 167171107 4I GCTGCTGAAT ----/TTTG TTTGTCAGTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TTTG 1 2 177408 CASAVA_Build 3 167171803 2I ACAATGATTG --/TA TGTTTCTTGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 TA 0 1 177409 CASAVA_Build 3 167187524 1I CATTCCCTGA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 49 11 29 9 T 7 8 177410 CASAVA_Build 3 167188602 1D ATGTGCAAGG T/- TTTTTTTTTT 1953 het 1953 ref 39 20 6 13 T 15 14 177411 CASAVA_Build 3 167189666 1D CACAACCCCC T/- AATGGATTTC 2978 het 2978 ref 19 10 8 3 T 1 0 177412 CASAVA_Build 3 167190221 6D AGACAAAGAT ATATAC/------ ATATACATAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 ATATAC 2 1 177413 CASAVA_Build 3 167193734 2D AAATATAAAC AT/-- ATTTCGATTT 3070 het 2790 hom 22 8 14 1 AT 2 1 177414 CASAVA_Build 3 167193819 4I AATCCATTGT ----/ATAA ATAAATAAGA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 ATAA 2 3 177415 CASAVA_Build 3 167208746 1D TTTTGTCAAA G/- GCCTTTTCTG 1840 het 1206 hom 9 3 5 1 G 2 1 177416 CASAVA_Build 3 167210319 2D TTATTATTAT TA/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 TA 1 0 177417 CASAVA_Build 3 167210977 1I TCTGCTTTTT -/G TTTTTCTGAA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 G 0 1 177418 CASAVA_Build 3 167230069 1I TTAGCCCCCC -/T CCCACTTCCT 1535 het 1086 hom 31 7 5 19 T 0 1 177419 CASAVA_Build 3 167231631 1D CTCTATTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 10 9 177420 CASAVA_Build 3 167236931 1I AATTTTGATT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 7 8 177421 CASAVA_Build 3 167241170 1I GAGAGACATT -/A AAAAACTAAA 3070 het 3070 hom 27 7 17 3 A 5 6 177422 CASAVA_Build 3 167242458 1I TCCCCCCGCT -/A AAAAAAAAGA 2747 het 2747 ref 29 16 8 5 A 8 9 177423 CASAVA_Build 3 167244278 3I AGAAGAAGAA ---/AAG AAGAAAGTAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AAG 1 2 177424 CASAVA_Build 3 167246352 1D TGTGCAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2803 hom 24 8 8 8 T 12 11 177425 CASAVA_Build 3 167253357 1I AAGCAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 A 10 11 177426 CASAVA_Build 3 167257710 7I TCTGATACCT -------/TGTGGAC TGCAAAGCAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TGTGGAC 0 1 177427 CASAVA_Build 3 167264499 1I CTCCGTCTCT -/A AAAAAAAAAT 2880 het 1528 hom 12 4 7 1 A 9 10 177428 CASAVA_Build 3 167266052 1I TTTTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 1340 hom 15 het 6 0 6 0 T 12 13 177429 CASAVA_Build 3 167275421 5D CAGCCTTAAG CTGTA/----- ATTTGAAATG 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 CTGTA 1 0 177430 CASAVA_Build 3 167281218 1I ACTGCATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 10 11 177431 CASAVA_Build 3 167282425 1I TTCCTAATTT -/G TTTTTCAGGA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 G 0 1 177432 CASAVA_Build 3 167288089 1D GGTGAGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 11 10 177433 CASAVA_Build 3 167295350 1I ACAAAAAAAA -/T GAAAAGCAAG 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 0 1 177434 CASAVA_Build 3 167301307 11D22M1I AGATCAGTTG TCTAGTGCATATCTCATGGAGTTAGAATTAAGG-/-----------TCTCATGGAGTTAGAATTAAGGT TTTATCAGAA 3070 het 3070 ref 42 24 22 4 N/A 0 0 177435 CASAVA_Build 3 167306895 2I GTCGAGCCTC --/TA TATATCCTTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 TA 2 3 177436 CASAVA_Build 3 167309719 1D CATAAATCTA T/- TTTTTTTTTT 1614 het 1614 ref 16 8 4 4 T 17 16 177437 CASAVA_Build 3 167312836 1D AAAAAGAAAC A/- AAAAAACAAT 3070 het 2771 hom 25 8 14 3 A 7 6 177438 CASAVA_Build 3 167314598 1I ACAAAATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 A 10 11 177439 CASAVA_Build 3 167316569 1I ATAGTAATAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 7 8 177440 CASAVA_Build 3 167330286 1I GTATATATAT -/A TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 0 1 177441 CASAVA_Build 3 167340428 3D TGCTGAGCAG AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 15 17 3 A 12 9 177442 CASAVA_Build 3 167341893 1D TTCTTCCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 10 10 A 12 11 177443 CASAVA_Build 3 167348709 1I TGGAGGCTCC -/A AAAAAAAAAA 2976 het 1472 hom 28 6 11 11 A 15 16 177444 CASAVA_Build 3 167359078 1I TAAAATAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 T 9 10 177445 CASAVA_Build 3 167376863 4D ATTTATGATA TTTG/---- TTTATCAAAT 3070 het 3070 hom 51 23 27 2 TTTG 1 0 177446 CASAVA_Build 3 167378860 2D CTTTTGTTAT AA/-- GATATATTTT 3070 het 3070 ref 28 10 12 7 A 2 0 177447 CASAVA_Build 3 167391686 1D TGGAATGATT A/- AAAAAAAAAA 1021 het 1021 ref 35 23 3 10 A 13 12 177448 CASAVA_Build 3 167401571 1I AAAAAAAAAA -/C ACAACAGAAG 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 C 0 1 177449 CASAVA_Build 3 167419043 1I16M1D CATTGTTTTG -TTTATTTTCTCTCTCAT/TTTTATTTTCTCTCTCA- TTTTTTTTCC 3070 het 2458 hom 20 7 11 5 N/A 0 0 177450 CASAVA_Build 3 167420767 1D CTTCAGACTA T/- TTTAGTCTCT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 4 3 177451 CASAVA_Build 3 167426862 1D CATGAAATTA T/- ATGTATAATC 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 T 1 0 177452 CASAVA_Build 3 167436258 1D AATTTAATTG T/- TAATTATAAG 3070 het 3070 hom 29 9 19 1 T 2 1 177453 CASAVA_Build 3 167445294 3D GATAACTCTC AAG/--- AAATTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 AAG 1 0 177454 CASAVA_Build 3 167445730 1D ACGGAATACA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 8 7 177455 CASAVA_Build 3 167446273 1I AACAACAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 10 11 177456 CASAVA_Build 3 167449333 1D AATGCAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 A 12 11 177457 CASAVA_Build 3 167453454 1I AATATTAGAG -/A AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 6 7 177458 CASAVA_Build 3 167456226 2D TTATAAAAAA AC/-- ACTGTGAAAC 3070 het 3070 ref 31 20 11 0 AC 2 1 177459 CASAVA_Build 3 167460090 2I ATTAAAAAAC --/TT AATTTAAACT 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 T 0 2 177460 CASAVA_Build 3 167466962 2D ATTTACACTT AA/-- AATAGGGGAG 2437 het 2437 ref 18 10 5 3 A 4 2 177461 CASAVA_Build 3 167472214 5D ACTGAAAAAA TGTAT/----- TGTATATGAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 6 TGTAT 2 1 177462 CASAVA_Build 3 167473273 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 428 het 428 ref 13 5 3 5 A 16 14 177463 CASAVA_Build 3 167473322 2D GTACATATGT AC/-- ACATACATAC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 AC 2 1 177464 CASAVA_Build 3 167473450 2D70M4I CAATGTACAC TTTTTGTTGACACAGTATAGGAAATAATATTAGTACTCACACCAATATTTGCATTCTGTTTTTTCTGAAAAC----/--TTTGTTGACACAGTATAGGAAATAATATTAGTACTCACACCAATATTTGCATTCTGTTTTTTCTGAAAACAAGG AAGAACTGCA 3070 het 3070 ref 47 39 23 18 N/A 0 0 177465 CASAVA_Build 3 167474478 1D TCATGAAAAC A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 47 26 15 7 A 6 5 177466 CASAVA_Build 3 167485579 1I TGATCAATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 9 10 177467 CASAVA_Build 3 167493670 9D TATATAATAT TACTAGGTA/--------- TATAATAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 10 6 TACTAGGTA 1 0 177468 CASAVA_Build 3 167497033 2I TGTCTGCCCT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 55 19 29 7 AG 5 6 177469 CASAVA_Build 3 167498955 1D CATTTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 11 10 177470 CASAVA_Build 3 167499751 2D TGAACAAGAT AA/-- AAAAAAAATG 3070 hom 57 het 33 0 20 15 A 10 8 177471 CASAVA_Build 3 167500261 1D AATCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 862 hom 31 4 10 17 A 15 14 177472 CASAVA_Build 3 167501679 1I TTAGCTTTAC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 7 8 177473 CASAVA_Build 3 167503330 1D GTTGGTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 21 2 17 2 A 12 11 177474 CASAVA_Build 3 167503689 3D TTACAATATA CTT/--- CTTCTACTGC 3070 het 3070 ref 38 26 10 4 CTT 2 1 177475 CASAVA_Build 3 167504574 1D ATTTTAAATA T/- TTTTTTAAGC 3070 het 3070 ref 30 18 11 2 T 7 6 177476 CASAVA_Build 3 167508278 1D GCCTCTAAAA T/- ATCTCTAACT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 1 0 177477 CASAVA_Build 3 167510439 6D AAGAAAAGAC AGAGAA/------ AGAGAAAGAG 3070 het 15 hom 23 2 19 3 AGAGAA 3 2 177478 CASAVA_Build 3 167510614 1D ATTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 1301 het 730 hom 10 2 4 4 T 11 10 177479 CASAVA_Build 3 167512300 1D ATTTTATACA T/- TTTTTTCTAA 2508 het 2508 ref 22 13 6 3 T 7 6 177480 CASAVA_Build 3 167516455 1D CATATAGTCC T/- TTGGGGTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 3 2 177481 CASAVA_Build 3 167517008 1I AATTTTGGTT -/A AAATTCATAT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 A 3 4 177482 CASAVA_Build 3 167518476 2I26M1I TGGTAAACCT --CACAGTACCCAGGACAGGCCCACAAC-/ACCACAGTACCCAGGACAGGCCCACAACA AAGAATGATC 3070 het 3070 ref 53 28 30 6 N/A 0 0 177483 CASAVA_Build 3 167520101 1D ATGAGAACTT A/- AAAGTACAAT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 4 3 177484 CASAVA_Build 3 167521621 6D CCAAACCAAA CCAAAC/------ CCAAACAAAT 3070 het 3070 ref 29 18 9 7 CCAAAC 2 1 177485 CASAVA_Build 3 167522153 1I AGCTAGAGAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 8 9 177486 CASAVA_Build 3 167522955 1I TGATTGGGTG -/T TTGTCAGAAA 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 T 2 3 177487 CASAVA_Build 3 167523124 1I ATTGATCTCA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 53 24 18 11 T 6 7 177488 CASAVA_Build 3 167524805 1I16M9I ATGGTAGCTG -TTTAAGTTCTTTGAAA---------/TTTTAAGTTCTTTGAAAAATAACCAG AGTGCTTTCT 3070 het 3070 ref 34 24 15 2 N/A 0 0 177489 CASAVA_Build 3 167535404 3D CAAATATAAA ATG/--- ATGATGACAG 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 ATG 3 2 177490 CASAVA_Build 3 167543348 1I GAGCAAACAC -/A AGGTGAAAGC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 1 2 177491 CASAVA_Build 3 167543542 13I GCCTGGTGAT -------------/CCAGATACTTCTC CCAGATCTTG 3070 het 3070 hom 52 20 22 10 CCAGATACTTCTC 0 1 177492 CASAVA_Build 3 167557428 2I ATCTACAAAA --/CT CTCTGTGTGA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 CT 2 3 177493 CASAVA_Build 3 167563441 3D CTGTATGCAA AGT/--- AGTACAAAGA 3070 het 3070 ref 51 21 24 8 AGT 2 1 177494 CASAVA_Build 3 167563714 2D ATAAAAAGAC AG/-- AGGTGAATTG 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 AG 2 1 177495 CASAVA_Build 3 167570817 6I TACCATCTTG ------/CTCTTC CTCTTCCTCT 3070 hom 93 het 42 0 31 11 CTCTTC 2 3 177496 CASAVA_Build 3 167574845 2D AATGTAGCAT AC/-- AGTTTGAATT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 AC 1 0 177497 CASAVA_Build 3 167586553 1D ACTGTGTGAC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 8 7 177498 CASAVA_Build 3 167587251 1I AATTTTATTT -/A TTTTTTTAAT 1945 het 1945 ref 13 6 7 0 A 0 1 177499 CASAVA_Build 3 167590989 3I AATTTTAAAG ---/AAT GATGACTCAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAT 0 1 177500 CASAVA_Build 3 167593747 5D GTATATATAT ATATA/----- TTTTTTTTAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 ATATA 1 0 177501 CASAVA_Build 3 167599565 1D TTGTATTAAA G/- ATTTTATATC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 G 1 0 177502 CASAVA_Build 3 167606653 1I AGCTTCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 T 11 12 177503 CASAVA_Build 3 167612117 1D TCTCCCTGTT A/- AAACACTCTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 4 3 177504 CASAVA_Build 3 167613088 1I TTGCCTGCAA -/T ATCTTATTGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 1 177505 CASAVA_Build 3 167614867 2D TTATATGCTT AA/-- GTTTATAATG 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 A 2 0 177506 CASAVA_Build 3 167619338 1D CCACATTTTC T/- TTTATCCAGT 3070 hom 64 het 30 0 20 10 T 4 3 177507 CASAVA_Build 3 167620470 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 67 hom 32 1 26 5 T 10 11 177508 CASAVA_Build 3 167635636 4I GGCCGAGGCG ----/GGCA GATCACGAGG 3045 het 2368 hom 17 6 8 4 GGCA 0 1 177509 CASAVA_Build 3 167685197 1I CTATGTACAG -/A AAAAAAAAAA 2208 het 2208 ref 39 22 5 12 A 13 14 177510 CASAVA_Build 3 167721882 1D TTAGCAGTAG T/- TTTTTTTTTA 1198 het 1198 ref 56 48 3 5 T 10 9 177511 CASAVA_Build 3 167740100 1I CCATACACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 14 10 6 A 9 10 177512 CASAVA_Build 3 167743970 6I CTTCAGTTAT ------/TGTCTC TGCAAAAATG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TGTCTC 0 1 177513 CASAVA_Build 3 167747084 1D CTTAAACGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 37 2 19 16 T 15 14 177514 CASAVA_Build 3 167785433 4I GCCAAATGGT ----/AGTC AGAAACAGTT 3070 hom 123 het 42 0 42 0 AGTC 0 1 177515 CASAVA_Build 3 167811257 5D TATGGCATCA TAAAT/----- TAACATAAGA 3070 het 3070 ref 36 17 17 3 TAAAT 1 0 177516 CASAVA_Build 3 167834712 1D TCTAAGTTGA T/- TGGAAGTTGC 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 T 2 1 177517 CASAVA_Build 3 167840969 1I TCACATTATT -/A AATACAGTCT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 A 2 3 177518 CASAVA_Build 3 167842150 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2968 het 1285 hom 20 6 8 6 T 7 8 177519 CASAVA_Build 3 167843346 2I GTTTTTTTTT --/TA ATAGCAGCAA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 TA 0 1 177520 CASAVA_Build 3 167845625 1I GATTGGAAGT -/G GGGGGATGCT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 G 5 6 177521 CASAVA_Build 3 167851320 1D ATATTCGCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 9 8 177522 CASAVA_Build 3 167852957 4I21M1I AAACAAAACA ----AAACAAACAAACAAAAAACAG-/AAACAAACAAACAAACAAAAAACAGA AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 38 13 25 5 N/A 0 0 177523 CASAVA_Build 3 167858771 3I ACAAAAAAAA ---/AAC AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 AAC 0 1 177524 CASAVA_Build 3 167861707 3D ATCCCTATTT CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 het 138 hom 26 3 10 14 C 13 10 177525 CASAVA_Build 3 167867507 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 8 7 177526 CASAVA_Build 3 167870299 4D GATAGGTTAT TTAA/---- TTATTTGTGA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 TTAA 1 0 177527 CASAVA_Build 3 167882267 3I TTGTCAAGGA ---/AAG AAGTAGACAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 AAG 1 2 177528 CASAVA_Build 3 167907871 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1369 het 1369 ref 19 6 4 9 A 15 14 177529 CASAVA_Build 3 167916641 1D ACCATTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1494 hom 29 5 17 7 T 12 11 177530 CASAVA_Build 3 167925328 1D AACCCAGTTT G/- GGATCAGAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 3 2 177531 CASAVA_Build 3 167932146 4D ATTTTACATT GTAA/---- GTGTCATTAT 3070 het 3070 ref 26 16 8 4 GTAA 1 0 177532 CASAVA_Build 3 167935142 1I GCCTGAAGGG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 58 22 30 6 A 7 8 177533 CASAVA_Build 3 167940558 2D AATATACATA TG/-- TGTGTGTGTG 1250 het 1250 ref 54 41 3 10 TG 7 6 177534 CASAVA_Build 3 167955330 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 11 10 177535 CASAVA_Build 3 167960528 1D TGGCTCCATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 12 24 15 T 10 9 177536 CASAVA_Build 3 167997481 1I TCTAAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 10 11 177537 CASAVA_Build 3 168002596 1I GTTTCCCTTA -/T TTTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 T 5 6 177538 CASAVA_Build 3 168010108 1D TCAAAGGGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 10 9 177539 CASAVA_Build 3 168013046 2D AGTGTCTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 33 0 16 17 T 13 11 177540 CASAVA_Build 3 168016792 2I TTAATTACTT --/AA GTCTTATAAA 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 A 0 2 177541 CASAVA_Build 3 168020045 1I AGAAGTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 T 10 11 177542 CASAVA_Build 3 168022643 1I TTCAAAAAAG -/T TAGACAAGGA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 1 2 177543 CASAVA_Build 3 168023154 2D GCTGAGTCTG AA/-- AAGAGAGTCA 1835 het 1835 ref 14 10 4 0 A 4 2 177544 CASAVA_Build 3 168031365 2I TAACGTGAAA --/AT AGTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 AT 0 1 177545 CASAVA_Build 3 168031492 3I GGCTTAAGTC ---/AAT TATAAGAGAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AAT 0 1 177546 CASAVA_Build 3 168033684 1D AGTTGGCAGG A/- AAAAAAATGA 2171 het 1888 hom 14 5 5 4 A 8 7 177547 CASAVA_Build 3 168034956 1D AGACGGTATC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 40 22 18 0 A 7 6 177548 CASAVA_Build 3 168036453 4D7M1I ACTAGAACCC CCCACCCCGTC-/----CCCCGTCA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 14 4 N/A 0 0 177549 CASAVA_Build 3 168037716 1I GAGGATAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 T 13 14 177550 CASAVA_Build 3 168049256 1I CTATTGATAC -/T TGTGGTTGCC 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 T 1 2 177551 CASAVA_Build 3 168053642 1D AATTTGGAAG A/- TAAAAGGCAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 1 0 177552 CASAVA_Build 3 168061122 1I AGTGGACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 A 12 13 177553 CASAVA_Build 3 168061460 4D TATTAATCCA CTCT/---- CTATTCTTGA 3070 het 3070 ref 31 14 14 6 CT 3 1 177554 CASAVA_Build 3 168066946 2D AAACAGTATG TA/-- TATGTATTTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TA 2 1 177555 CASAVA_Build 3 168074982 1I CTCTGATTCC -/A AAGCCAGACA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 2 3 177556 CASAVA_Build 3 168081162 2D TATAATAAAC TG/-- TCTTTAAAAA 2344 het 787 hom 7 2 5 0 TG 1 0 177557 CASAVA_Build 3 168085860 1D29M1D AGGTAAAAAC AAAATAGATGTTTTTGTGGATGTGGTGAAAG/-AAATAGATGTTTTTGTGGATGTGGTGAAA- GAGAATGCTT 3070 het 3070 hom 38 22 25 5 N/A 0 0 177558 CASAVA_Build 3 168086696 1D CCTAAAAATT A/- AAACACTTGA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 4 3 177559 CASAVA_Build 3 168100598 1D TTGAAACTTG A/- AAAAGATATT 3070 het 3070 ref 33 17 16 0 A 5 4 177560 CASAVA_Build 3 168103672 1I CCTGAAATGT -/A AAAATTTTAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 4 5 177561 CASAVA_Build 3 168107312 1I TAATATTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 12 8 8 A 9 10 177562 CASAVA_Build 3 168118717 1D TCTTAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 16 12 4 A 12 11 177563 CASAVA_Build 3 168128929 2I GAAAATCTTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 A 11 13 177564 CASAVA_Build 3 168132364 3D TGGAGACAAC ACA/--- ACAACACAAG 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 ACA 3 2 177565 CASAVA_Build 3 168164182 6D TCCTACTTTC CCCAGT/------ CTCTGATAAC 3070 het 3070 ref 35 21 10 5 CCCAGT 1 0 177566 CASAVA_Build 3 168178401 1I ACCCTTACTG -/C AGCACTGCCC 3070 hom 105 het 36 0 36 0 C 0 1 177567 CASAVA_Build 3 168197478 1D TGTTAGTCCA T/- TTTTCATGCT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 5 4 177568 CASAVA_Build 3 168201730 1D TGTTTTATGG T/- TTTTTTTTTC 1084 het 1084 ref 36 27 3 7 T 10 9 177569 CASAVA_Build 3 168236100 4D TTTAATGGGG TTCT/---- TTGTTTTTTT 3070 hom 75 het 26 0 26 2 TTCT 1 0 177570 CASAVA_Build 3 168236865 3D TATATGTATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 36 1 20 16 T 17 14 177571 CASAVA_Build 3 168238334 1D CTACAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 2988 het 1583 hom 28 9 10 9 A 15 14 177572 CASAVA_Build 3 168241255 1D CTAATTTCCC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 9 8 177573 CASAVA_Build 3 168242662 2D CATAAAGCAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 84 het 30 0 27 6 AT 7 6 177574 CASAVA_Build 3 168248786 1D67M31D AGAGTCTAAG AAAAAAAATCTAATACAAGATAAATATTCAGAAGGTTCTTGCAAGACTGCTTTTATTACCCTCTATGCTTTTATTACCCTCTATGCTTTTATTACCCAT/-AAAAAAATCTAATACAAGATAAATATTCAGAAGGTTCTTGCAAGACTGCTTTTATTACCCTCTATGC------------------------------- ATGCAGTATG 3070 hom 114 het 28 0 39 2 N/A 0 0 177575 CASAVA_Build 3 168254576 12D CAAAAAGGCA GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGTGT 3070 het 1435 hom 37 7 16 15 GT 15 9 177576 CASAVA_Build 3 168258455 1D TTTTAATAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 10 9 177577 CASAVA_Build 3 168264538 45D AAAATTTCAT AAGACAAATTGGAGCTGCCAAAATCTAGAAATTTCATTCACTTCA/--------------------------------------------- TGGATGAATA 3070 het 3070 ref 22 15 16 0 AAGACAAATTGGAGCTGCCAAAATCTAGAAATTTCATTCACTTCA 1 0 177578 CASAVA_Build 3 168264869 1D TTTGCTTATT A/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 A 1 0 177579 CASAVA_Build 3 168274455 1D ATATTATATT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 8 7 177580 CASAVA_Build 3 168278516 1I CAACACTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 8 15 15 A 10 11 177581 CASAVA_Build 3 168280775 4D TTTTTTCACT TAAA/---- TATTTTATTC 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 TAAA 1 0 177582 CASAVA_Build 3 168286384 8D TCACTTTAAG TCATATAT/-------- TCATGTTACA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 TCATATAT 1 0 177583 CASAVA_Build 3 168288011 1D AATTAATAAC A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 7 6 177584 CASAVA_Build 3 168289257 1I GTTCAAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 10 11 177585 CASAVA_Build 3 168293324 1D TAAACATATG A/- ACGTATTCTT 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 A 2 1 177586 CASAVA_Build 3 168294881 1D TTTTTTTTTT A/- AAATAAATGT 1636 het 1636 ref 36 24 8 4 A 4 3 177587 CASAVA_Build 3 168296797 4D AAGTGGTGTC TTAG/---- TTAGGACCAC 3070 het 3070 hom 46 22 22 3 TTAG 2 1 177588 CASAVA_Build 3 168302019 1D CTTACTGCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 150 het 54 0 48 7 T 9 8 177589 CASAVA_Build 3 168320730 1D CATAACTTCC T/- GAAGATAAAC 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 T 1 0 177590 CASAVA_Build 3 168328811 3D AAATTATTTT AAG/--- AAGAAGAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 AAG 3 2 177591 CASAVA_Build 3 168336738 1D GAAAGAGAGC A/- AATAAGGTGA 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 A 3 2 177592 CASAVA_Build 3 168353681 1I TTTCCTCCAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 A 8 9 177593 CASAVA_Build 3 168359563 14D CAGCCCAAAC AGCTGGCTGCTTTG/-------------- AGCAGAAATT 3070 het 3070 hom 42 22 20 2 AGCTGGCTGCTTTG 1 0 177594 CASAVA_Build 3 168373896 4I AAGAGGCATC ----/AAAT AATTTATTTG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 AAAT 0 1 177595 CASAVA_Build 3 168383286 4I1M3D TACAAAAGGA ----CTGT/GAACC--- TGGTCCATAT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 N/A 0 0 177596 CASAVA_Build 3 168402978 1D AGCTATTAGA T/- TTAAAGAATC 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 T 3 2 177597 CASAVA_Build 3 168407006 1D ATAAAAAAAA T/- GTCATAATTT 3070 het 3046 hom 29 8 19 3 T 1 0 177598 CASAVA_Build 3 168415514 4D TCAAAAACTT AGAA/---- AGATCTCAAT 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 AGAA 1 0 177599 CASAVA_Build 3 168419472 1D TACTTGTATC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 10 9 177600 CASAVA_Build 3 168421768 1D CTGTAGTAAC A/- AAAAACAGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 6 5 177601 CASAVA_Build 3 168423332 1D CCAACATATA G/- TTAGAATAAA 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 G 1 0 177602 CASAVA_Build 3 168443403 1I ATAAAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 13 3 A 10 11 177603 CASAVA_Build 3 168446302 1D ATTAAACTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 12 11 3 T 10 9 177604 CASAVA_Build 3 168459591 1D TCATGGACCC T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 102 het 39 0 33 7 T 8 7 177605 CASAVA_Build 3 168462689 1D TTTGTGGGTC G/- GGGGGGGCGT 3070 hom 51 het 20 0 17 4 G 8 7 177606 CASAVA_Build 3 168464695 3D TTCAATGTTG TTA/--- TTGATAAGGA 3070 het 3070 hom 36 17 17 4 TTA 1 0 177607 CASAVA_Build 3 168471688 1D TGGACTAAAC A/- AGGTCTTATT 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 A 2 1 177608 CASAVA_Build 3 168505391 1D TCCTCCAAGC A/- GAAGTAGCAG 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 A 1 0 177609 CASAVA_Build 3 168517005 11D GTCTTCTACA TATGTTCAAGT/----------- TATGTTCAAG 3070 het 3070 hom 42 17 21 7 TATGTTCAAGT 2 1 177610 CASAVA_Build 3 168523719 3D AGAGCTAAAA GAG/--- GGGGGGGGGG 3070 hom 22 het 28 0 16 12 GAG 1 0 177611 CASAVA_Build 3 168527742 1D CAAATATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 12 11 177612 CASAVA_Build 3 168528960 1I TTCTCATATC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 7 8 177613 CASAVA_Build 3 168531674 1D GGCTAATAAA G/- GTAACCAACT 3070 hom 83 het 35 0 25 11 G 2 1 177614 CASAVA_Build 3 168546704 1D TAATTGCCTC T/- CATGCATTTA 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 T 1 0 177615 CASAVA_Build 3 168548919 2D GGAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAAGG 3070 hom 36 het 24 0 12 12 AG 4 3 177616 CASAVA_Build 3 168548952 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAAGG 3070 het 2178 hom 31 7 10 14 AG 4 3 177617 CASAVA_Build 3 168552570 1I CAAGGAACAT -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 7 8 177618 CASAVA_Build 3 168565041 1D AGTTATTTAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 9 8 177619 CASAVA_Build 3 168598338 1D ACTCACTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 13 12 177620 CASAVA_Build 3 168603268 1D TACAATATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 12 11 177621 CASAVA_Build 3 168605011 8I ATCCACTCTT --------/CACTCTCC CACTCTCCCA 3070 het 3070 hom 46 14 20 12 CACTCTCC 2 3 177622 CASAVA_Build 3 168609635 1D AGGTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 11 10 177623 CASAVA_Build 3 168619367 1D AGTCTATCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 10 9 177624 CASAVA_Build 3 168650188 1I GTTGGCCAGG -/C TGGTCCCGAA 1428 het 520 hom 10 1 4 5 C 0 1 177625 CASAVA_Build 3 168651689 6D CACTTAACAG ATTAGA/------ ATGCTTACAC 3070 het 3070 ref 42 25 14 7 ATTAGA 1 0 177626 CASAVA_Build 3 168658669 3I TAATGCTTAC ---/TGA TTATACGATT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 TGA 0 1 177627 CASAVA_Build 3 168660162 1D TCTTATGGGT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 1661 hom 29 12 13 4 G 2 1 177628 CASAVA_Build 3 168662389 3I GGCATAAGCC ---/ACT ACATCTGGCA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 ACT 0 1 177629 CASAVA_Build 3 168681549 1I TATTTCAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 A 14 15 177630 CASAVA_Build 3 168698358 1D ATATTCATTC T/- TTTTTTTTTT 1115 het 1115 ref 39 19 4 17 T 17 16 177631 CASAVA_Build 3 168710422 3D ACTAAGTCAC AGT/--- TATTTTTATA 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 AGT 1 0 177632 CASAVA_Build 3 168726344 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 9 10 177633 CASAVA_Build 3 168727397 1I TGAGGCTTCA -/C CTTAAACTTA 3070 hom 154 het 60 0 49 11 C 1 2 177634 CASAVA_Build 3 168737253 2D ATATATATAT AA/-- AACAACTGAG 1178 het 1059 hom 13 7 4 3 A 4 2 177635 CASAVA_Build 3 168741216 1D CAATTCAGAA G/- GCAGATTATT 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 G 2 1 177636 CASAVA_Build 3 168744548 1I AGACAGCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 A 11 12 177637 CASAVA_Build 3 168746386 4I GTAATATTAA ----/TAGT TATATTATTT 2282 het 2282 ref 12 6 5 1 TAGT 0 1 177638 CASAVA_Build 3 168756249 1I GAGAAACTGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 52 22 21 9 T 7 8 177639 CASAVA_Build 3 168761499 3I GAAAAATAAT ---/AAC TACATAAATG 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 AAC 0 1 177640 CASAVA_Build 3 168770592 1D TAAGCTAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 19 12 A 13 12 177641 CASAVA_Build 3 168778006 1D CTCCAATAAG T/- TTTTTTTTTA 1226 het 1226 ref 42 33 3 6 T 10 9 177642 CASAVA_Build 3 168824111 1D CATTCCCCAT A/- AAGATCAGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 3 2 177643 CASAVA_Build 3 168824828 1I ATGCCATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 15 13 13 A 11 12 177644 CASAVA_Build 3 168890073 1I ACAAAAACAC -/A AGGGGAGAAG 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 A 1 2 177645 CASAVA_Build 3 168910291 1I GAGCTCACAG -/C AATAAGAGAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 0 1 177646 CASAVA_Build 3 168930693 2D TTTTTTGCAT TG/-- TGTGTGTGTG 1513 het 1513 ref 37 26 4 11 TG 8 7 177647 CASAVA_Build 3 168940503 2I TGCCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2798 het 2134 hom 30 8 10 12 T 11 13 177648 CASAVA_Build 3 168998223 1I CTACCAAGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 645 hom 34 2 24 8 T 10 11 177649 CASAVA_Build 3 169002095 1D GATAATGACA C/- TTATCTCATA 3070 het 3070 ref 26 14 8 5 C 1 0 177650 CASAVA_Build 3 169007338 1D TCTCCAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 11 10 177651 CASAVA_Build 3 169011083 1D AGTGAGTCAT A/- AGCTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 2 1 177652 CASAVA_Build 3 169011941 1D TGAAATGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 A 11 10 177653 CASAVA_Build 3 169012167 1D TTTTTTAATT A/- AAATTGTTAC 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 A 4 3 177654 CASAVA_Build 3 169019870 1D AATTTTTCTT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 8 7 177655 CASAVA_Build 3 169023436 1D TCTCTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 23 8 A 11 10 177656 CASAVA_Build 3 169024721 4D AAGGAAGAAA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 33 15 15 6 TTGT 3 2 177657 CASAVA_Build 3 169030754 1D CAACAACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2509 hom 39 10 15 14 A 14 13 177658 CASAVA_Build 3 169037993 1D AGTAATCAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 10 9 177659 CASAVA_Build 3 169039299 4D TTTTTCAAAT AGAA/---- AGGGCTTAGT 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 AGAA 1 0 177660 CASAVA_Build 3 169040403 2I CCCTAACCTC --/AG AGAGTTCTCA 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 AG 2 3 177661 CASAVA_Build 3 169042157 5D AAGTGAGCCT AAGTC/----- AAGTCTCTAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 AAGTC 2 1 177662 CASAVA_Build 3 169048196 6D ACTGCTACTC CAGAGG/------ CAGAGGCAGA 2833 het 1515 hom 23 6 8 10 CAGAGG 4 3 177663 CASAVA_Build 3 169048563 1I TTTTTATATT -/C CACTTGTGAA 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 C 1 2 177664 CASAVA_Build 3 169051258 3I CAACCACCTC ---/TTG TTGTTGTGTC 3070 het 3070 ref 37 13 16 8 TTG 2 3 177665 CASAVA_Build 3 169052679 1I TTGGGAACAT -/C ATAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 C 0 1 177666 CASAVA_Build 3 169061217 9D TTTTCTCATA TTGAAGCAG/--------- TTGAAGCAGA 3070 het 3070 ref 38 20 12 9 TTGAAGCAG 2 1 177667 CASAVA_Build 3 169065952 2D TAGACAGCAC AT/-- GTCTGTATTT 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 AT 1 0 177668 CASAVA_Build 3 169069932 1D CATACTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 19 11 T 11 10 177669 CASAVA_Build 3 169076133 1I TGTTTATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 10 11 177670 CASAVA_Build 3 169080743 1D TGAGTATTTT G/- GATAGTATTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 G 2 1 177671 CASAVA_Build 3 169082670 4D GGAGAGGATG AATC/---- AATCAAATTT 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 AATC 2 1 177672 CASAVA_Build 3 169116928 1D TTCAAAGGGA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 90 het 34 0 30 6 T 8 7 177673 CASAVA_Build 3 169129902 2I GAAAAAGAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 T 12 14 177674 CASAVA_Build 3 169130286 1D CATACTTGAG A/- AAAAAAGCCT 3070 hom 132 het 49 0 43 6 A 7 6 177675 CASAVA_Build 3 169131273 5D TGCTGCTGGT AAGGC/----- AAGAGTGTTG 3070 hom 144 het 50 0 47 3 AAGGC 1 0 177676 CASAVA_Build 3 169131790 1D AATGAATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 11 10 177677 CASAVA_Build 3 169133928 1D TTTATACATT C/- TTTTGTTTAA 3070 hom 151 het 53 0 51 2 C 1 0 177678 CASAVA_Build 3 169137677 2D GGATTTGACT TA/-- TGTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 10 TA 1 0 177679 CASAVA_Build 3 169139721 9D GAATGAATGA ATGTTAACC/--------- ATGTTCTTCT 3070 het 3070 ref 62 29 30 6 ATGTTAACC 1 0 177680 CASAVA_Build 3 169142658 1I CATTTCCAAG -/A GAAAGAGACA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 0 1 177681 CASAVA_Build 3 169145714 1D CATAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 14 13 177682 CASAVA_Build 3 169147445 1I AGAAATAAAT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 68 het 40 0 29 11 A 8 9 177683 CASAVA_Build 3 169147788 2D AAAACTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 632 hom 37 2 17 19 A 12 10 177684 CASAVA_Build 3 169153546 1D ATATATGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2757 hom 24 8 11 7 A 10 9 177685 CASAVA_Build 3 169156727 1I ATGGTACACA -/T TAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 1 2 177686 CASAVA_Build 3 169159882 2D TTCCACCTTC GA/-- AGCATAGGCT 3070 het 3070 ref 66 32 27 8 GA 1 0 177687 CASAVA_Build 3 169162220 7I AATTTATTTC -------/TCATGGT TCTAGAGGGT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TCATGGT 0 1 177688 CASAVA_Build 3 169166703 1D ATATGAGACT G/- TATATAATAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 G 1 0 177689 CASAVA_Build 3 169169647 2D AAATGGAAAC AT/-- ATTTTATGTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AT 2 1 177690 CASAVA_Build 3 169173682 2I CTGAGAAATG --/TC TCTGCATGCC 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 TC 1 2 177691 CASAVA_Build 3 169179012 1I AATTGGGGGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 56 32 17 7 A 8 9 177692 CASAVA_Build 3 169199110 1I TTATTGTTTT -/A AAGCCACCAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 2 3 177693 CASAVA_Build 3 169207228 3D CCTCCAACCC AGA/--- AGGAGATACT 3070 het 3070 ref 55 27 26 3 AGA 1 0 177694 CASAVA_Build 3 169208512 1D CTTTTACTCC T/- AGAACTCTTC 3070 het 3070 hom 25 7 13 5 T 1 0 177695 CASAVA_Build 3 169233924 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAACACA 2753 hom 18 het 7 0 7 0 A 7 6 177696 CASAVA_Build 3 169237541 5D TGGGCATTTG GGTAC/----- ACTGTAAAAC 3070 het 3070 ref 36 22 10 5 GGTAC 1 0 177697 CASAVA_Build 3 169242724 1D TTAGCACCTA T/- TTTTTTTTTT 1515 het 1515 ref 36 19 4 13 T 12 11 177698 CASAVA_Build 3 169245373 1I GCTGTAAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 897 hom 34 4 22 8 A 12 13 177699 CASAVA_Build 3 169249942 3I CACCGAGGGA ---/GAG GAGAACAGAG 3070 hom 160 het 62 0 54 8 GAG 1 2 177700 CASAVA_Build 3 169250744 1I GTCCACTGCT -/A AAAAAGTAAT 3070 het 3070 hom 46 13 26 7 A 5 6 177701 CASAVA_Build 3 169251774 1D GAAGATAATA C/- CCTGACAGCT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 C 3 2 177702 CASAVA_Build 3 169252838 2D ATATATGTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 45 18 21 7 AT 7 6 177703 CASAVA_Build 3 169254388 6D AGAAAGAAAT AAAAAG/------ AAAAAGGAGG 3070 het 3070 ref 32 16 13 6 AAAAAG 2 1 177704 CASAVA_Build 3 169261421 8D GTAAAATTAA CTTTGTAT/-------- GTGTAGAAGA 3070 het 3070 hom 23 10 12 2 CTTTGTAT 1 0 177705 CASAVA_Build 3 169270260 1I AATGCCTGTT -/A AAAAATATCT 3070 hom 135 het 56 0 46 10 A 5 6 177706 CASAVA_Build 3 169279434 2D TTTTTACTTT TG/-- GTCATATTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TG 1 0 177707 CASAVA_Build 3 169285440 1D CATGGAAATT A/- AAAAAAAAAA 1631 het 1631 ref 36 23 5 8 A 13 12 177708 CASAVA_Build 3 169299425 3D GGAAGGAAAA AAT/--- AAAAAGTTGA 2961 het 2961 ref 20 11 8 2 AAT 1 0 177709 CASAVA_Build 3 169319750 1I GTCAACCCTG -/A TAAGGACTAT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 0 1 177710 CASAVA_Build 3 169320667 1D GGCGCGATCT C/- CGGCTCACTG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 2 1 177711 CASAVA_Build 3 169326624 1D ATAAGACAGG A/- AAAAAAAAAA 1341 het 1341 ref 28 23 3 2 A 11 10 177712 CASAVA_Build 3 169378074 1D ATATAGCCCT A/- ATTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 2 1 177713 CASAVA_Build 3 169381333 1D GAAAAATGAT A/- ATTTAGGAAG 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 A 2 1 177714 CASAVA_Build 3 169400299 3I TGAGAGTAAT ---/ATC ATCCTCTCAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 ATC 1 2 177715 CASAVA_Build 3 169411901 4I TTAATAATTT ----/CTTC CTTCATTCTT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 CTTC 1 2 177716 CASAVA_Build 3 169416941 1I CCAGTTTTTT -/A TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 0 1 177717 CASAVA_Build 3 169434061 8I AGTGATTAAG --------/AGGAGGGT AGGGGAAGAG 3070 hom 132 het 50 0 45 6 AGGAGGGT 0 1 177718 CASAVA_Build 3 169441565 1I AAAACAATGG -/T TTTCAAACTT 3070 het 3070 hom 51 23 26 2 T 3 4 177719 CASAVA_Build 3 169483868 1D GATTTGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 T 12 11 177720 CASAVA_Build 3 169521556 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 896 het 896 ref 31 22 2 7 T 12 11 177721 CASAVA_Build 3 169524099 2I GATATTTGGG --/AT ATTAAATATT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AT 1 2 177722 CASAVA_Build 3 169528624 1D AATAAAACTA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 7 6 177723 CASAVA_Build 3 169557563 1D TAGGAAAGGA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 T 8 7 177724 CASAVA_Build 3 169573935 1I TTCTTTATCT -/A AAAAAAAAAT 2262 het 2262 ref 25 10 6 9 A 9 10 177725 CASAVA_Build 3 169576648 4I GAAAACTGAT ----/AAAG GAATAGAATA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 AAAG 0 1 177726 CASAVA_Build 3 169594788 1I CCGTAATTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 A 9 10 177727 CASAVA_Build 3 169603716 3I AAAAAAAAAT ---/AAG GAGACTCCCA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AAG 0 1 177728 CASAVA_Build 3 169604743 1D AAAGATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 11 10 177729 CASAVA_Build 3 169609674 1D TAATAAAACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 10 9 177730 CASAVA_Build 3 169614417 1D ACTAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 T 12 11 177731 CASAVA_Build 3 169636705 12D AAAGAGAGGA AGAGAGAAAAGG/------------ AAGAAAAGAA 3070 het 3070 ref 40 19 18 5 AGAGAGAAAAGG 1 0 177732 CASAVA_Build 3 169643882 1D ATAAGCTTCC T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 44 18 17 10 T 7 6 177733 CASAVA_Build 3 169655554 2I TCGCCTGTAA --/TC TCCTAGCACT 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 TC 1 2 177734 CASAVA_Build 3 169656993 4I TCTGCCTGTC ----/TGTT GGTCTGTTCC 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 TGTT 0 1 177735 CASAVA_Build 3 169660174 1D TTTTTTTAAA C/- TTATTTCAGT 3070 het 3070 hom 33 10 20 4 C 1 0 177736 CASAVA_Build 3 169661641 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 13 17 7 AC 8 7 177737 CASAVA_Build 3 169679934 2D CTGTGATTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 15 9 22 A 16 14 177738 CASAVA_Build 3 169682221 1I GATAAGAATG -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 22 1 T 6 7 177739 CASAVA_Build 3 169692769 1I GGTTGTTTAA -/T TTTTTTCAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 6 7 177740 CASAVA_Build 3 169694403 1D GGGCTCAGAC T/- TTCATCCAAG 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 3 2 177741 CASAVA_Build 3 169701671 1I TTGCCACACT -/A GAACTACAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 0 1 177742 CASAVA_Build 3 169709092 2I TTTTTTCCTC --/CA CAGTTTCTAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 CA 1 2 177743 CASAVA_Build 3 169716739 4D AAGAAATGAA ATGG/---- ATGGTCTCTA 3070 het 3070 ref 44 20 20 6 ATGG 2 1 177744 CASAVA_Build 3 169722118 3D TTATTTTGTG TCA/--- TCATATTGTA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 TCA 2 1 177745 CASAVA_Build 3 169723197 6D AGAGGAAAGG AAAGGA/------ AAAGGAAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 17 3 AAAGGA 3 2 177746 CASAVA_Build 3 169723510 1D GCCCCACTCA T/- TTTTTTTTTC 2812 het 2812 ref 30 17 6 8 T 10 9 177747 CASAVA_Build 3 169724441 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2764 het 473 hom 25 1 14 10 A 17 18 177748 CASAVA_Build 3 169734916 2I GTTAAATCAT --/CA GTTATTTTTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 CA 0 1 177749 CASAVA_Build 3 169752559 1D CAATGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 13 12 177750 CASAVA_Build 3 169765680 3D AGGACATTGT TTA/--- TTAAATACAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 TTA 2 1 177751 CASAVA_Build 3 169782012 1I GAATATACAC -/A AAAACAATTC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 4 5 177752 CASAVA_Build 3 169789008 1D CAAAGGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 15 1 T 12 11 177753 CASAVA_Build 3 169807280 1D TATTTATTTC T/- TTTTTTTTTA 2695 het 2695 ref 19 9 9 1 T 10 9 177754 CASAVA_Build 3 169809864 1D GATAGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 A 11 10 177755 CASAVA_Build 3 169841888 1I TCAAATGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 10 11 177756 CASAVA_Build 3 169845860 4I TGAAGGTAAC ----/AGTT AGGACTGTCT 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 AGTT 0 1 177757 CASAVA_Build 3 169870091 1I TTCTTGTTCA -/T TTTTATTATA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 4 5 177758 CASAVA_Build 3 169872587 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 T 12 11 177759 CASAVA_Build 3 169881442 1D TGAAGACTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 20 0 A 10 9 177760 CASAVA_Build 3 169883358 1I ATACACTGTT -/G GTTGAGAATG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 1 2 177761 CASAVA_Build 3 169916552 1D TCACTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 A 13 12 177762 CASAVA_Build 3 169943782 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1234 het 1234 ref 14 8 4 2 A 12 13 177763 CASAVA_Build 3 169975456 4I ACACAAATCA ----/TCAC TCATAAGAAT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 TCAC 0 1 177764 CASAVA_Build 3 169980046 1D TATTGGGAGG T/- TCATAGTCCA 3070 het 3070 hom 40 19 19 3 T 2 1 177765 CASAVA_Build 3 169980219 1D AATTACTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 12 11 177766 CASAVA_Build 3 169985832 1D CATGAAAAGC A/- GATAAAAAGT 3070 het 3070 hom 45 20 23 3 A 1 0 177767 CASAVA_Build 3 169986482 1D CAATACAATG A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 A 7 6 177768 CASAVA_Build 3 169990120 6D ATATATATTG TTTTTC/------ TTTTTACACC 3070 het 3070 ref 35 17 16 4 TTTTTC 1 0 177769 CASAVA_Build 3 169997803 2I CACCAGACCT --/CA ATATTTACTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CA 0 1 177770 CASAVA_Build 3 170006612 1D AGTGCTGGGA T/- TATAGGCGTG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 2 1 177771 CASAVA_Build 3 170015032 3D TAATAATAAT AAG/--- AAGAAGAATA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 AAG 3 2 177772 CASAVA_Build 3 170029282 1D CACTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 2457 het 1491 hom 31 9 10 12 A 19 18 177773 CASAVA_Build 3 170031155 4I ACTATATAAT ----/AATA TATATAATAT 1633 het 1633 ref 12 7 4 1 AATA 0 1 177774 CASAVA_Build 3 170046020 3D CTCGTCCTTT TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 3070 hom 41 13 16 15 TCC 4 3 177775 CASAVA_Build 3 170050503 3I GATGCCTGAA ---/ACC ACCACAGATA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 ACC 1 2 177776 CASAVA_Build 3 170067093 4I CATGACCTAA ----/AACT AACTATCCCA 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 AACT 1 2 177777 CASAVA_Build 3 170070562 1D TGAATGCAAT A/- AATATGAACA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 3 2 177778 CASAVA_Build 3 170076565 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3063 het 3063 ref 35 11 13 13 AC 10 9 177779 CASAVA_Build 3 170078288 1I GTCAAAACAG -/T CACTATCTAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 0 1 177780 CASAVA_Build 3 170082727 1D AAAAAGAGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 21 hom 46 1 38 7 T 9 8 177781 CASAVA_Build 3 170083149 1D CCAGAAACCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 351 hom 42 1 31 10 T 10 9 177782 CASAVA_Build 3 170083317 2D GCTGCACTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 33 0 29 4 A 12 10 177783 CASAVA_Build 3 170098012 1I GAGCTGGGGG -/A AACTGCCAAA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 A 2 3 177784 CASAVA_Build 3 170098739 1D GAGCATTTGA C/- AAAATTCAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 1 0 177785 CASAVA_Build 3 170101043 5I GAATGGAATA -----/CTTTT TTTTCATAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 CTTTT 0 1 177786 CASAVA_Build 3 170103383 1I AGACTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 23 0 14 9 A 11 12 177787 CASAVA_Build 3 170109894 2D GATCCTGACT CA/-- CAACTCTTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 CA 2 1 177788 CASAVA_Build 3 170181329 1I TGGATTCATA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 7 8 177789 CASAVA_Build 3 170199123 1D AGATTTGGTG A/- AAATTTTTAC 3070 het 3070 hom 34 13 16 7 A 4 3 177790 CASAVA_Build 3 170209100 4D CAACTCAAAA GAGT/---- GTCCAACTTC 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 GAGT 1 0 177791 CASAVA_Build 3 170228463 1D13M1D AAAGTATAAT AAAAAAAAAAATAGA/-AAAAAAAAAATAG- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 N/A 0 0 177792 CASAVA_Build 3 170229211 1I AGAAAAAAAA -/G AAGCAAGATT 3070 het 3070 hom 35 9 19 7 G 0 1 177793 CASAVA_Build 3 170231968 1D TCATGTCACC T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 T 7 6 177794 CASAVA_Build 3 170233338 2D CTATTCTACA TC/-- TCTCTCAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 TC 4 3 177795 CASAVA_Build 3 170237618 1D CCTCAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3017 het 1712 hom 21 7 8 6 T 15 14 177796 CASAVA_Build 3 170242992 4I AAAAAAGATG ----/AACA AAGAGTAGAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AACA 0 1 177797 CASAVA_Build 3 170257203 1I CACAAAAATG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 8 9 177798 CASAVA_Build 3 170260216 4D AATTAGGCAC AGTG/---- AGAGATTAAA 3070 het 3070 hom 19 7 11 2 AGTG 1 0 177799 CASAVA_Build 3 170270915 1I AGGAAGCTCA -/T TTTTTTTTAC 2212 het 2212 ref 30 20 5 5 T 8 9 177800 CASAVA_Build 3 170283908 1I AAGATCTCAG -/C CATCATATCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 1 2 177801 CASAVA_Build 3 170292118 2D GACAGACACG CA/-- CACACACACA 1173 het 1173 ref 56 46 4 7 CA 7 6 177802 CASAVA_Build 3 170292329 4D TTACATAAAA TAAT/---- TAATTTTGAC 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 TAAT 2 1 177803 CASAVA_Build 3 170296519 1D TCCATGTGAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 26 12 12 3 A 8 7 177804 CASAVA_Build 3 170297448 2D TTAGCCCCAG TT/-- TTTTTTTTTT 2370 het 41 hom 20 0 7 14 T 14 12 177805 CASAVA_Build 3 170300093 1D TTTTACCATT A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 7 6 177806 CASAVA_Build 3 170302055 1I TTTATTTAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 181 hom 31 1 27 3 A 9 10 177807 CASAVA_Build 3 170310928 2D ACTTGATGAA AG/-- AGGAAGAGGG 3070 het 3070 hom 37 16 18 7 AG 2 1 177808 CASAVA_Build 3 170313940 2I ATATATATTC --/AG AGAGAGAGAG 2816 het 2346 hom 17 7 8 2 AG 7 8 177809 CASAVA_Build 3 170318388 4D TGAGCCACGT TATG/---- TGTGAGCTTA 3070 het 3070 hom 52 23 27 4 TATG 1 0 177810 CASAVA_Build 3 170319207 1D CAGATGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 35 1 33 1 A 12 11 177811 CASAVA_Build 3 170322379 1D CATTGGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 11 10 177812 CASAVA_Build 3 170325038 3D TATTTGATAA TAT/--- TAAGAAATTA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 TAT 1 0 177813 CASAVA_Build 3 170329100 1I CCATGTTTAA -/G CCTGGTTAAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 0 1 177814 CASAVA_Build 3 170329902 1I GAAGAATTTT -/C CCCAGTTTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 3 4 177815 CASAVA_Build 3 170330556 3D GGATGTAAAC ATG/--- ATATGTTGAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 6 ATG 1 0 177816 CASAVA_Build 3 170332977 2I ATCAGTTTTT --/CA TTTCATTCTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 CA 0 1 177817 CASAVA_Build 3 170339880 12I AGGCCAGGAG ------------/TTTGAATTAAAT TGTGTTCCTT 3070 hom 111 het 43 0 38 6 TTTGAATTAAAT 0 1 177818 CASAVA_Build 3 170340445 1D AGTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 5 A 12 11 177819 CASAVA_Build 3 170341166 1D53M3D ATTCTGTCTG AAAAAAAAAAAATCTGAAATGAAATAACTCACAGAAATCTACTGGAAAATTTAAACT/-AAAAAAAAAAATCTGAAATGAAATAACTCACAGAAATCTACTGGAAAATTTAA--- ACTCAGGAAA 3070 hom 49 het 20 0 16 15 N/A 0 0 177820 CASAVA_Build 3 170341300 1I TTCATTTTTA -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 6 7 177821 CASAVA_Build 3 170344746 1D TCCATCTAAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 9 8 177822 CASAVA_Build 3 170348907 1D AGAAAGAATA C/- AGGGGATACA 3070 hom 138 het 48 0 47 2 C 1 0 177823 CASAVA_Build 3 170354904 1D ATGTTTGTTG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 117 het 48 0 39 9 A 9 8 177824 CASAVA_Build 3 170358549 1I TATTCCTCCA -/C CCCCACATCC 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 C 4 5 177825 CASAVA_Build 3 170370319 2I ACAGTTCTAC --/TT TTTTTTTTTT 2637 het 2329 hom 30 6 12 12 T 14 16 177826 CASAVA_Build 3 170372616 1I AAAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 11 11 A 12 13 177827 CASAVA_Build 3 170375260 1D ACACACAGCA T/- TTTAAAATTA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 4 3 177828 CASAVA_Build 3 170376591 1D AGCTGATGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2135 hom 22 6 12 4 A 10 9 177829 CASAVA_Build 3 170378402 1I ACTTGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 A 11 12 177830 CASAVA_Build 3 170379947 2I CTAAGAAGAA --/AG AGTGCAGTTG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 AG 1 2 177831 CASAVA_Build 3 170385001 1I GCAGAATACA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 8 9 177832 CASAVA_Build 3 170404240 3I GGAAATGGAA ---/CGG CGGCTTCAGT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 CGG 1 2 177833 CASAVA_Build 3 170415740 2I TTTTTTTTTT --/TA AAAAAAGCAG 3070 het 138 hom 27 2 20 5 TA 0 1 177834 CASAVA_Build 3 170423613 1D AAGTCCTATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 11 10 177835 CASAVA_Build 3 170424473 10D AAGAAAAGGA AGAGTGCTTC/---------- AGAATTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 5 AGAGTGCTTC 1 0 177836 CASAVA_Build 3 170432257 1D CCATGACCAG A/- AAAAAAAAAA 2417 het 2417 ref 50 30 7 13 A 13 12 177837 CASAVA_Build 3 170432922 1D CTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 71 het 36 0 32 5 A 10 9 177838 CASAVA_Build 3 170445800 1D CCACAAGATA G/- AAGAAAAATT 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 G 1 0 177839 CASAVA_Build 3 170453874 1I TGTTTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 792 hom 40 4 25 11 T 13 14 177840 CASAVA_Build 3 170468245 1D GCATAGTCCA T/- TTTTTTTTTC 1254 het 1254 ref 57 48 3 6 T 10 9 177841 CASAVA_Build 3 170498011 1D TTACAACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 T 12 11 177842 CASAVA_Build 3 170503304 1D CGAGATTGTA C/- CACTGCACTC 2798 het 2798 ref 17 9 6 2 C 2 1 177843 CASAVA_Build 3 170512166 1D CATTTTACTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 T 10 9 177844 CASAVA_Build 3 170520042 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 A 10 11 177845 CASAVA_Build 3 170523405 1D ACTTGAACCC G/- GGGGGGGCAG 2676 het 1974 hom 17 8 6 3 G 8 7 177846 CASAVA_Build 3 170575881 4D GCTGTTTTTT AAAA/---- AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 21 7 12 2 A 10 6 177847 CASAVA_Build 3 170580003 2I TATATGTGGA --/AG AGACATTTCA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 AG 1 2 177848 CASAVA_Build 3 170580876 2I AAATGGAAAG --/TA TATATATATC 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TA 4 5 177849 CASAVA_Build 3 170583040 2I AATGAATACA --/TG TTTCTTGTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TG 0 1 177850 CASAVA_Build 3 170611712 1I CTATTGCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 9 10 177851 CASAVA_Build 3 170614793 1D ACTGTTAGAA G/- AAAACTAACA 3070 het 3070 ref 38 15 14 10 G 1 0 177852 CASAVA_Build 3 170619263 13D CAAACCCACA GCCAATATCATAC/------------- TGAATTGGCA 3070 het 3070 ref 37 25 15 3 GCCAATATCATAC 1 0 177853 CASAVA_Build 3 170623834 1D AAGGAAGGCA G/- GGGTTTGCCT 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 G 4 3 177854 CASAVA_Build 3 170625582 1I TTTGCAGAAA -/C CCCCCCCCCA 3070 het 27 hom 26 2 16 8 C 9 10 177855 CASAVA_Build 3 170629474 1I AAACAAAGCC -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 5 6 177856 CASAVA_Build 3 170634911 2I AAATGATGTA --/TT TAAAAAGTTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 1 3 177857 CASAVA_Build 3 170639169 4I ATGGATGGGG ----/TACT TACTGGCTGG 3070 het 3070 ref 40 14 14 12 TACT 1 2 177858 CASAVA_Build 3 170640693 2D ATGTTTTATA TG/-- TGTATATATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TG 2 1 177859 CASAVA_Build 3 170651065 1D GGACAAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 348 hom 48 1 32 15 A 12 11 177860 CASAVA_Build 3 170651735 1I TAAGATGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 A 12 13 177861 CASAVA_Build 3 170660251 1I TTCAGGTGTA -/C TAAGGGTCAC 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 C 0 1 177862 CASAVA_Build 3 170675311 1D TCTAGTACTT A/- ACCACCCATT 3070 het 3070 ref 51 29 14 9 A 2 1 177863 CASAVA_Build 3 170680855 1I ACAAAAGGAT -/G TTACAAGGTG 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 G 0 1 177864 CASAVA_Build 3 170685361 4I AGCAAGCACC ----/AACT GAGACTGATT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 AACT 0 1 177865 CASAVA_Build 3 170694418 2I TGACAGTAAC --/AT GTGGTTAAAT 3070 het 3070 ref 56 27 24 5 AT 0 1 177866 CASAVA_Build 3 170698680 4D TTATATCTTA AATT/---- AATAAAGAAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 4 AATT 1 0 177867 CASAVA_Build 3 170699829 13D GATTACCCAC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2189 hom 33 9 18 9 A 26 13 177868 CASAVA_Build 3 170700101 1I GACCAGGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 9 10 177869 CASAVA_Build 3 170705719 1D GTATATCATA C/- CCTGTAATTC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 C 3 2 177870 CASAVA_Build 3 170708687 3I CAAACATGGC ---/AGG AGAACCTGGA 3070 hom 120 het 43 0 36 7 AGG 0 1 177871 CASAVA_Build 3 170708893 1I GTGGGAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 11 12 177872 CASAVA_Build 3 170714783 1I GCACAGAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 44 2 32 10 A 10 11 177873 CASAVA_Build 3 170716382 4I ATTTTTCAAA ----/AATT TACCAATTTT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 AATT 0 1 177874 CASAVA_Build 3 170718105 1D AATCTTATGC A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 8 7 177875 CASAVA_Build 3 170718749 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 314 het 314 ref 18 8 3 9 AAAG 1 0 177876 CASAVA_Build 3 170722933 2D AATAACAGAC TT/-- AGCATCCTTC 3070 het 3070 hom 44 17 22 6 T 2 0 177877 CASAVA_Build 3 170724375 4I ATATACACAT ----/ACAC ATACATACCT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AC 0 2 177878 CASAVA_Build 3 170726516 1I ATCTTGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 27 1 20 6 A 11 12 177879 CASAVA_Build 3 170729586 1I TAAGGCCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 8 9 177880 CASAVA_Build 3 170729738 12I GAACTCCTAC ------------/CAGGCCCCCACA CAGCTGTGCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CAGGCCCCCACA 0 1 177881 CASAVA_Build 3 170730632 4I GAGTACAGAA ----/AGTT AGAAAGGCAA 3070 hom 156 het 61 0 52 9 AGTT 0 1 177882 CASAVA_Build 3 170733661 1D CTTCACGTTT C/- CTCACATTTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 2 1 177883 CASAVA_Build 3 170734778 1I AGAAGTCAAC -/T TTTTCAGACT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 4 5 177884 CASAVA_Build 3 170738201 1D CAGAACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 15 14 177885 CASAVA_Build 3 170742266 1D CTCTGTGCTC T/- TGACAGTAGC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 2 1 177886 CASAVA_Build 3 170751856 1I TCTACACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 15 14 13 A 13 14 177887 CASAVA_Build 3 170752539 1I AGTAACTGCT -/G AACAGGTAAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 G 0 1 177888 CASAVA_Build 3 170765308 1D AACAAATGCT G/- CAAACTAAAC 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 G 1 0 177889 CASAVA_Build 3 170767634 1D AGCCATGTCT G/- GGCCTAGGCC 3070 het 3070 hom 47 16 24 8 G 3 2 177890 CASAVA_Build 3 170777956 1D AAAAGTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2152 hom 29 10 10 10 T 13 12 177891 CASAVA_Build 3 170792164 5I ATAACAATGT -----/GTGGA GTGGATTTGA 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 GTGGA 1 2 177892 CASAVA_Build 3 170796423 1I TCATTCATAT -/A AGTCAATTTC 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 1 2 177893 CASAVA_Build 3 170804920 1D CATGCCCTTG T/- TAATGATGGG 3070 het 3070 hom 31 7 15 9 T 2 1 177894 CASAVA_Build 3 170809940 1D CAGTTAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 13 12 177895 CASAVA_Build 3 170814597 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2734 hom 25 8 10 7 T 10 11 177896 CASAVA_Build 3 170821337 3I TCTGTAAAAT ---/AGA AGGAGATAGA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 AGA 0 1 177897 CASAVA_Build 3 170832701 4D TCAAAACACA TGTT/---- TTTTCAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 TGTT 1 0 177898 CASAVA_Build 3 170832876 1I TACTTCGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 A 9 10 177899 CASAVA_Build 3 170839482 4D TCTCTTTCTC TGTT/---- TGCAGCAATT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 TGTT 1 0 177900 CASAVA_Build 3 170840664 2D AAAAAAATTA AT/-- ATTTTATATG 3070 het 3070 ref 15 8 7 0 AT 2 1 177901 CASAVA_Build 3 170843282 1D CCAACCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 A 12 11 177902 CASAVA_Build 3 170845782 1D GACAGATGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 10 9 177903 CASAVA_Build 3 170885997 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2824 het 937 hom 12 2 7 3 A 10 11 177904 CASAVA_Build 3 170888199 1D CATCCCAGTT A/- ATATTGACTG 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 A 2 1 177905 CASAVA_Build 3 170889306 1D GGACTTCATT C/- CTCCCTTCAT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 C 2 1 177906 CASAVA_Build 3 170891318 7I TGTACATGGG -------/TAATTTT TAATTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 TAATTTT 1 2 177907 CASAVA_Build 3 170892553 1I CTCTTGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 18 25 9 A 10 11 177908 CASAVA_Build 3 170914979 7D TTATGATTTC CTTTCAG/------- CTTGAAGAAT 3070 het 3070 ref 35 20 13 5 CTTTCAG 1 0 177909 CASAVA_Build 3 170921360 1D GAACTTTGTC A/- AAAAAAAAAA 2539 het 2539 ref 21 10 8 3 A 13 12 177910 CASAVA_Build 3 170953007 1D TCAGTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 12 11 177911 CASAVA_Build 3 170954674 2D CCAGAGTGCA GT/-- GTGGTGTAAT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 GT 2 1 177912 CASAVA_Build 3 170974711 1I ATGAGAACTT -/A ACGGTTACTG 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 A 1 2 177913 CASAVA_Build 3 170978642 3D GCGGTGAGTT ATC/--- ATTATACCAG 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 ATC 1 0 177914 CASAVA_Build 3 170996401 2D TCTTACTTTT AA/-- AAGTCTTGAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 A 4 2 177915 CASAVA_Build 3 171005085 2D CCAGAAGAGG AT/-- ATATACCTTA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 AT 3 2 177916 CASAVA_Build 3 171021967 1D TACAAAAAAA T/- TTAGCTGGGC 1821 het 1248 hom 10 3 4 3 T 3 2 177917 CASAVA_Build 3 171036966 4D TATAACAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 47 17 25 7 AG 11 9 177918 CASAVA_Build 3 171037857 2D CACATCCCAT TC/-- TCTCCACGTC 3070 het 3070 ref 39 20 13 8 TC 3 2 177919 CASAVA_Build 3 171043522 1D GCTCCCAGAA T/- TAGCTTAGGC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 2 1 177920 CASAVA_Build 3 171047137 4D CTAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAATG 2128 het 2128 ref 30 18 8 4 AAAG 2 1 177921 CASAVA_Build 3 171065939 1D TCTGAACAAA G/- CTCTCGGTTC 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 G 1 0 177922 CASAVA_Build 3 171076278 1I AAAATAGACA -/C CCCAAAGATC 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 C 3 4 177923 CASAVA_Build 3 171077815 1I CCACCTGTAA -/T TCCAGCTACT 2001 het 2001 ref 15 7 6 2 T 1 2 177924 CASAVA_Build 3 171078265 20D CCAAAACCCG AGTCCTACCACCCCCAAGCC/-------------------- AGCTCACCTC 3070 het 3070 ref 33 23 13 6 AGTCCTACCACCCCCAAGCC 1 0 177925 CASAVA_Build 3 171084722 1I CCTGCCTCGG -/C CCTCCCCAGG 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 2 3 177926 CASAVA_Build 3 171086044 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTATTATTAT 1752 het 1685 hom 14 5 4 5 TTA 7 6 177927 CASAVA_Build 3 171094613 5I TCACAAAAAT -----/AAAAC AAAACATCAT 3070 het 3070 hom 56 22 26 8 AAAAC 1 2 177928 CASAVA_Build 3 171095329 1D AATTCATCCC A/- AAAAATCAAT 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 A 6 5 177929 CASAVA_Build 3 171095689 4I TTCCCTTCTT ----/GACA GACTGGTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 GACA 0 1 177930 CASAVA_Build 3 171109426 1D TGGGTAATCA C/- CTCCAGAACT 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 C 2 1 177931 CASAVA_Build 3 171115249 1D GACTAATGGC A/- AAAAAAAAAA 1316 het 1316 ref 55 35 4 16 A 11 10 177932 CASAVA_Build 3 171116537 4I TCCCTTTGTT ----/TTTG TTTGTTTGAT 3070 het 3070 ref 58 28 19 11 TTTG 2 3 177933 CASAVA_Build 3 171123303 3I TTTTGTGGTC ---/AGA AGATTTACGA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 AGA 1 2 177934 CASAVA_Build 3 171126002 1I AGGTCAGGAG -/T TTCAAGACCA 1453 het 1281 hom 10 3 3 4 T 2 3 177935 CASAVA_Build 3 171129879 1D CATAATTAAC T/- GATACTAGAG 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 1 0 177936 CASAVA_Build 3 171147862 1I TTTCCACACA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 48 16 28 4 T 7 8 177937 CASAVA_Build 3 171168364 1I TTATCCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 18 16 12 T 11 12 177938 CASAVA_Build 3 171169018 1D TATTTACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 A 13 12 177939 CASAVA_Build 3 171176857 1I CTCTTAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2251 hom 27 8 12 7 A 10 11 177940 CASAVA_Build 3 171180838 2D TAAAAATGTC AG/-- AGAGTTTTAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 AG 3 2 177941 CASAVA_Build 3 171194788 3I GGAGTTATAC ---/GTA TAACTAATAA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 GTA 0 1 177942 CASAVA_Build 3 171203288 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1162 hom 23 4 15 5 A 13 12 177943 CASAVA_Build 3 171206206 6D TCTCACCTTC TTAAAA/------ TTATCTCTTC 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 TTAAAA 1 0 177944 CASAVA_Build 3 171219027 9D AGACTCTCTT GCCTCTCTC/--------- GCCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 46 29 15 6 GCCTCTCTC 2 1 177945 CASAVA_Build 3 171221848 1D GCTGGAGGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3057 hom 22 7 10 5 T 9 8 177946 CASAVA_Build 3 171226334 1I TCTAGGAATC -/T TTTTTTTTTT 1495 het 1495 ref 28 14 5 9 T 13 14 177947 CASAVA_Build 3 171253558 1D TCTTGAAATC A/- GGTAGTGTAA 3070 het 3070 hom 47 22 24 2 A 1 0 177948 CASAVA_Build 3 171271578 1I CCATATAATT -/G GAACCACACA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 G 1 2 177949 CASAVA_Build 3 171272120 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2618 het 610 hom 12 2 7 3 A 9 10 177950 CASAVA_Build 3 171279127 4D CTGGTCAGTG CTAA/---- CTAAAACAAC 3070 het 3070 ref 47 29 17 6 CTAA 2 1 177951 CASAVA_Build 3 171285926 3D AATGTAAGAG GAA/--- GAAGAAGATT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 GAA 3 2 177952 CASAVA_Build 3 171286841 4I CCGTCTTAAG ----/TGTT TGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 TGTT 2 3 177953 CASAVA_Build 3 171287698 4I AAAAATCACA ----/TTCT TTCTATAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 TTCT 1 2 177954 CASAVA_Build 3 171296671 1D AATTTGTAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 T 8 7 177955 CASAVA_Build 3 171310449 1D TTGGGAAATT A/- AAACTAGAAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 4 3 177956 CASAVA_Build 3 171315802 3D CCTCAGTGAA AGG/--- AGAACTGTAT 3070 het 3070 ref 45 21 20 6 AGG 1 0 177957 CASAVA_Build 3 171317392 1D GATCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 27 1 19 7 A 11 10 177958 CASAVA_Build 3 171327995 2I ATTCAATCTC --/TT TGTGCCTATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 1 3 177959 CASAVA_Build 3 171335936 1D CCCGCCCAGA T/- TTTTTTTTTT 2565 het 2565 ref 16 8 8 0 T 11 10 177960 CASAVA_Build 3 171347842 1I TTAGAAAATT -/A AAACGACCAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 3 4 177961 CASAVA_Build 3 171363194 2D TGTCACTTCC AT/-- ACCAGAACAG 3070 het 3070 ref 53 26 22 6 AT 1 0 177962 CASAVA_Build 3 171367158 1I TTATTTTGGC -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 T 7 8 177963 CASAVA_Build 3 171368668 6I AAGGCAAAGT ------/CAAAGG CAAAGGGAAA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 CAAAGG 1 2 177964 CASAVA_Build 3 171391614 1D CAAGGTTGTA G/- GGAGCCATGA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 3 2 177965 CASAVA_Build 3 171395211 1D GAGAAGATTC A/- AATAAACTCA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 3 2 177966 CASAVA_Build 3 171398859 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2460 het 2351 hom 15 7 6 2 A 11 12 177967 CASAVA_Build 3 171405200 1D TTGGCTAATG T/- TTTTTTTTGT 2813 het 2813 ref 29 17 7 6 T 9 8 177968 CASAVA_Build 3 171424399 1D ATGTAAGGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 10 9 177969 CASAVA_Build 3 171437454 2D AGATGGACAC AT/-- GTGTAACAAA 3070 het 3070 hom 48 17 29 2 AT 1 0 177970 CASAVA_Build 3 171438780 1I GGGAGACGGA -/G GGTTACAGTG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 G 2 3 177971 CASAVA_Build 3 171452809 1D ATGGGCAGAC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 8 7 177972 CASAVA_Build 3 171455077 1D TTCCCCAGTG T/- TATGTTCTTG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 2 1 177973 CASAVA_Build 3 171491619 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 18 0 15 3 A 12 11 177974 CASAVA_Build 3 171515209 1I AAGGCCTGCC -/A ATCCTTGATA 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 A 1 2 177975 CASAVA_Build 3 171548836 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 A 13 14 177976 CASAVA_Build 3 171550283 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2704 het 2241 hom 30 10 10 10 A 17 16 177977 CASAVA_Build 3 171554930 4I ACTTGCTGCT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 AAAC 2 3 177978 CASAVA_Build 3 171556696 3I GGAAAAAAAA ---/AAT AATAAAAAGT 2364 het 2364 ref 23 12 8 3 AAT 1 2 177979 CASAVA_Build 3 171563027 4D AGGTGGGAGC AATG/---- AATGGCTCAC 2530 het 2530 ref 14 6 7 2 AATG 2 1 177980 CASAVA_Build 3 171573905 1I AGGTGATCCT -/C CCGCCTTGGC 3070 het 3070 hom 21 7 9 5 C 2 3 177981 CASAVA_Build 3 171574748 1D TGACCTAAGA G/- GAAAGAACCT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 G 2 1 177982 CASAVA_Build 3 171576234 1I TTAAAAACAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1963 hom 25 8 13 4 T 8 9 177983 CASAVA_Build 3 171579967 2I CTTGCCCCCC --/CT CTTTTAAGTA 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 CT 1 2 177984 CASAVA_Build 3 171581913 4D GGGAATTTAA TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 2928 hom 29 8 15 8 TTAT 3 2 177985 CASAVA_Build 3 171588831 3I TTAATGCTAG ---/GTT GTTGTTTTAC 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 GTT 2 3 177986 CASAVA_Build 3 171592308 2D CTCTGAATAT TA/-- TATGTTATAT 3070 het 3070 hom 40 17 22 2 TA 2 1 177987 CASAVA_Build 3 171596401 1I AACAGCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 T 10 11 177988 CASAVA_Build 3 171598159 1D AAGGGCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 10 9 177989 CASAVA_Build 3 171599296 1I TGATGATGTT -/G GAGCACCGTG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 G 1 2 177990 CASAVA_Build 3 171601531 7D TGAGCTCAAG TGAACTC/------- CTGAACTCCT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TGAACTC 1 0 177991 CASAVA_Build 3 171622746 4D CGCTGCACTG AGAC/---- AGACAAAGAA 3070 het 3070 hom 49 22 24 4 AGAC 2 1 177992 CASAVA_Build 3 171631026 1D TCTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 T 13 12 177993 CASAVA_Build 3 171638569 10D TGTTCCTTAT TTAAATATAA/---------- ACACCCAGTG 3070 het 3070 ref 41 20 18 6 TTAAATATAA 1 0 177994 CASAVA_Build 3 171643808 29D CAAGGTGTTA CCTTGGATGTGTTCATGTGTTCATGTGTT/----------------------------- CATGTCTATT 3070 hom 63 het 16 0 22 6 CCTTGGATGTGTTCATGTGTTCATGTGTT 1 0 177995 CASAVA_Build 3 171644550 2I AATGATTTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 T 12 14 177996 CASAVA_Build 3 171661950 1D TCTTAAGGAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 41 21 15 6 A 9 8 177997 CASAVA_Build 3 171680482 1D GATTCACTTT A/- AAGTGGACTT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 A 3 2 177998 CASAVA_Build 3 171687107 11D CTGTAATCAC AGCACTTTGAG/----------- AGGCCGATGG 2890 het 2890 ref 26 14 11 2 AGCACTTTGAG 1 0 177999 CASAVA_Build 3 171690839 2D ATACATATAA AC/-- ACAGATAAAC 3070 het 3070 hom 56 24 27 6 AC 2 1 178000 CASAVA_Build 3 171697930 2I CGGAATAAAC --/AG AAGTGATTTT 3070 het 3070 hom 53 24 23 6 AG 0 1 178001 CASAVA_Build 3 171699780 2D AAAGGAACTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 408 hom 22 3 14 5 TG 8 7 178002 CASAVA_Build 3 171701293 8I AGCTACATAG --------/TATTTGTC TATTTGTCTG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 TATTTGTC 1 2 178003 CASAVA_Build 3 171716113 1I GTGTTGGGGT -/G GGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 G 8 9 178004 CASAVA_Build 3 171717042 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 10 11 178005 CASAVA_Build 3 171724998 1I GGGTCAAAAT -/A GGATGAGATC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 0 1 178006 CASAVA_Build 3 171738436 1D TCTAAACATA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 T 8 7 178007 CASAVA_Build 3 171739656 3I TACCACCCTC ---/CTT CTTGGTTCAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 CTT 1 2 178008 CASAVA_Build 3 171749359 4D TTATGTAATA AATT/---- AATTAATTGT 3070 het 3070 ref 46 21 18 8 AATT 3 2 178009 CASAVA_Build 3 171775480 1D AGGGTGGAGG A/- AAAGTGGTTA 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 A 4 3 178010 CASAVA_Build 3 171778865 1D CTCTTCTAGT A/- AAAAATTGAG 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 A 6 5 178011 CASAVA_Build 3 171807683 1D AAAGAAATAC A/- AAAAAATTTG 3070 hom 60 het 21 0 20 3 A 7 6 178012 CASAVA_Build 3 171818763 1I TTTTTTTGTT -/A TTTTTTTGCT 876 het 876 ref 15 10 3 2 A 0 1 178013 CASAVA_Build 3 171823257 8D AAAGACACAG AGGCTTAA/-------- ACACTGTTTG 3070 het 3070 hom 62 26 32 4 AGGCTTAA 1 0 178014 CASAVA_Build 3 171823873 1I TTCTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2519 hom 21 9 9 3 A 13 14 178015 CASAVA_Build 3 171825173 1D AGGTGGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 860 hom 44 2 33 10 T 11 10 178016 CASAVA_Build 3 171827065 2D TGACTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2911 het 2480 hom 21 8 7 6 T 14 12 178017 CASAVA_Build 3 171834722 1I TAGGCTGGTG -/C CCTTGGGCTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 2 3 178018 CASAVA_Build 3 171837467 1I GTAGGTGCTA -/C GGGGGGGATC 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 C 0 1 178019 CASAVA_Build 3 171854943 3I AGATGCCACC ---/CCT CAAGATGTTC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 CCT 0 1 178020 CASAVA_Build 3 171872655 1I TGTCCTGCAG -/T TATTTTCATG 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 1 2 178021 CASAVA_Build 3 171877218 1I GAGAGGGACT -/G ATGTGTAAAA 2388 het 2388 ref 25 18 6 1 G 0 1 178022 CASAVA_Build 3 171881799 2I GAGGCAATAC --/AT ATTCTTAAGA 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 AT 1 2 178023 CASAVA_Build 3 171884220 1I GAGAGTAGAG -/T TAATATAAGG 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 T 1 2 178024 CASAVA_Build 3 171889968 1I CCATCCCTTG -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 7 8 178025 CASAVA_Build 3 171891606 12D AAAGCCAACC ACATGTATTTTG/------------ ACATGTGGAC 3070 het 3070 ref 37 16 15 12 ACATGTATTTTG 1 0 178026 CASAVA_Build 3 171896104 1I ATTAAAAAAA -/C ATCCCAGGAC 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 C 0 1 178027 CASAVA_Build 3 171901971 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2327 het 1587 hom 23 7 7 9 A 17 16 178028 CASAVA_Build 3 171906817 1D GCTCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1782 het 1780 ref 18 9 5 4 T 15 14 178029 CASAVA_Build 3 171959810 1I CGGCTCACCC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 17 0 14 3 T 8 9 178030 CASAVA_Build 3 171959882 2D GACCTCAGTC AT/-- ATTAAATTCT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 2 1 178031 CASAVA_Build 3 172015457 4I ATTTATGACC ----/ACAG ACTATAAAGA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 ACAG 0 1 178032 CASAVA_Build 3 172031068 1D TAACCTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 10 7 T 11 10 178033 CASAVA_Build 3 172031793 1D TCAAGACCAG C/- CTGGGCAACA 2524 het 2524 ref 13 6 6 1 C 2 1 178034 CASAVA_Build 3 172040111 1I AAAGCTAGTT -/A ACATTGTCAG 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 1 2 178035 CASAVA_Build 3 172041580 2I TGATCTAGTT --/TA TAAGTGAGTA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TA 1 2 178036 CASAVA_Build 3 172044773 1D GTGTTCTGCA T/- TCCTTGCATA 3070 het 3070 hom 52 20 30 2 T 2 1 178037 CASAVA_Build 3 172047770 1I TGTGATGTTA -/C CCCCCCCATG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 7 8 178038 CASAVA_Build 3 172048085 1D CCCATTACTG A/- AAACATTAAT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 A 4 3 178039 CASAVA_Build 3 172048596 1I TGAATGTCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 8 9 178040 CASAVA_Build 3 172049379 1I GCCAGGCTAA -/T TTTTGTATCT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 T 4 5 178041 CASAVA_Build 3 172053237 2D CACACAGAGC GA/-- GAGAGAGAGA 864 het 478 hom 29 7 11 11 GA 9 8 178042 CASAVA_Build 3 172067600 2D CTGCAACCAC TT/-- TAGTCCAAGC 3070 het 3070 ref 47 21 18 13 T 3 1 178043 CASAVA_Build 3 172094514 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2000 hom 19 7 9 4 A 15 14 178044 CASAVA_Build 3 172095820 1D AACATTAGTG A/- AAAAAAAAAA 1533 het 1533 ref 47 33 4 11 A 11 10 178045 CASAVA_Build 3 172147416 1D GGGAGGTGAG A/- GGGGGAGAGA 2987 het 2652 hom 23 7 7 9 A 1 0 178046 CASAVA_Build 3 172151689 1D ATTTGATGGT C/- CTAAAGGCAG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 C 2 1 178047 CASAVA_Build 3 172193509 15I CTCGAAAGAA ---------------/GACATACAAGTGGCC GACATACAAG 3070 het 3070 ref 38 18 9 11 GACATACAAGTGGCC 1 2 178048 CASAVA_Build 3 172248057 2I AAAAAATCGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 11 13 178049 CASAVA_Build 3 172248815 1I AAATATGATG -/A AAAAATAATT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 5 6 178050 CASAVA_Build 3 172251435 1I ATAAACAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 11 12 178051 CASAVA_Build 3 172298596 1I TCCTTCCAAA -/G GGTATAGCAT 3070 het 3070 ref 53 21 18 14 G 2 3 178052 CASAVA_Build 3 172299859 1I TACCTCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 19 13 16 T 13 14 178053 CASAVA_Build 3 172304544 3D7M6I7M6D5M3I CATTAGAAAT AACAATTAAA------CTTAAAGGAAATTTTCAA---/---AATTGAAAATTTCCTTTAAG------TTTAATTG TTAACAGTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 6 N/A 0 0 178054 CASAVA_Build 3 172311973 1I AGAATGGCTG -/T TTTTCAAAAG 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 T 4 5 178055 CASAVA_Build 3 172317203 5I TTAATTTGAA -----/TCTTT TCTTATTCAG 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 TCTTT 0 1 178056 CASAVA_Build 3 172346263 1I CAGTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1007 het 1007 ref 43 16 8 19 T 17 18 178057 CASAVA_Build 3 172353260 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 24 1 17 6 T 13 12 178058 CASAVA_Build 3 172354384 4D TGCTGTGATG ATAA/---- ATGATTACTT 3070 het 3070 hom 40 14 21 8 ATAA 1 0 178059 CASAVA_Build 3 172354638 4D CACAATAAAA AGTT/---- AGAGGCTTAG 3070 het 3070 ref 40 21 19 1 AGTT 1 0 178060 CASAVA_Build 3 172359884 4D TTTTGGAGAG TAGT/---- TAGTGTGCTG 3070 het 3070 hom 47 15 22 12 TAGT 2 1 178061 CASAVA_Build 3 172367050 1D CCTTCAGCTC A/- AAAATCTGAT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 5 4 178062 CASAVA_Build 3 172375115 1D TTTTGCCGTA C/- CCTCACACCA 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 C 3 2 178063 CASAVA_Build 3 172378919 1D ACTAGTATGT A/- ACAATAGAGG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 1 178064 CASAVA_Build 3 172397972 1D GGGAAAAGTA T/- TTGCAAATCA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 3 2 178065 CASAVA_Build 3 172403562 1D GAGTGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 1758 het 1758 ref 35 24 5 7 T 12 11 178066 CASAVA_Build 3 172413401 1D TAGGAGAAGT A/- AAAGCATGTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 4 3 178067 CASAVA_Build 3 172427185 4D ATTAGTACTT TATC/---- TAAATGGTAA 3070 het 3070 hom 21 8 12 4 TATC 1 0 178068 CASAVA_Build 3 172436252 1D TTGTTTTGGT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 2059 hom 26 7 11 9 G 10 9 178069 CASAVA_Build 3 172436633 1I GGTAGGTGCC -/A AAATCACACT 3070 het 3070 ref 60 32 24 4 A 3 4 178070 CASAVA_Build 3 172437987 1D ATTCCCACGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2223 hom 36 11 13 12 A 13 12 178071 CASAVA_Build 3 172441030 3D TTCTCTTCTC CTA/--- CTATTCCCCC 3070 hom 93 het 35 0 31 6 CTA 2 1 178072 CASAVA_Build 3 172441519 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2218 hom 22 6 12 4 T 11 12 178073 CASAVA_Build 3 172449360 1D CCAAGTCTTA T/- TGACCTTGTC 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 2 1 178074 CASAVA_Build 3 172452507 5I TGCAATTCTC -----/TACTT TAAGGTAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 TACTT 0 1 178075 CASAVA_Build 3 172462008 15D GTTTGTTGGT TGGATGGATGGATGA/--------------- TGGATGGATG 3070 het 3070 ref 45 24 22 5 TGGATGGATGGATGA 1 0 178076 CASAVA_Build 3 172464819 2I CACGTATAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 AC 8 9 178077 CASAVA_Build 3 172469735 4D ATATTAAACA CTCT/---- CTCTTTCATT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 CT 4 2 178078 CASAVA_Build 3 172486469 3I CTGAAGGATC ---/AGG AGGAGGATAC 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 AGG 2 3 178079 CASAVA_Build 3 172487698 1I CAGAAACAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 8 9 178080 CASAVA_Build 3 172498146 4I AAAAATTAAA ----/CTCT CAATATAATT 3070 het 3070 hom 30 9 21 0 CT 0 2 178081 CASAVA_Build 3 172502825 1I GATTTGTCTG -/T TTTAGTGTAT 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 3 4 178082 CASAVA_Build 3 172505534 1I TGCCACAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1946 hom 20 7 9 4 A 11 12 178083 CASAVA_Build 3 172509359 3I GTTAGAATGG ---/TTA TTATTAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 TTA 2 3 178084 CASAVA_Build 3 172509658 2D GGTAGACTGG AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 10 8 178085 CASAVA_Build 3 172510595 3D TATAACATAC CTA/--- CTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 CTA 1 0 178086 CASAVA_Build 3 172511790 3I GCATACAATT ---/ATC ATTATTCACT 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 ATC 0 1 178087 CASAVA_Build 3 172521101 1I TGATTTATGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 44 24 11 9 A 7 8 178088 CASAVA_Build 3 172523323 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 709 hom 32 3 22 7 T 17 16 178089 CASAVA_Build 3 172523547 13D ACAGCCATTC TCATTCCTTTGTG/------------- TATTGTCTGT 3070 het 3070 ref 32 20 12 4 TCATTCCTTTGTG 1 0 178090 CASAVA_Build 3 172524628 2D AAAATGTGAA AG/-- AGAGGAGGGA 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 AG 3 2 178091 CASAVA_Build 3 172529854 1I AAAATATATA -/T TTTTTAAATC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 5 6 178092 CASAVA_Build 3 172532499 4D ATTTAATGTA AATT/---- AATCTAAAAT 3070 het 3070 hom 19 9 9 3 AATT 1 0 178093 CASAVA_Build 3 172538659 1I CAACCAACAA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 7 8 178094 CASAVA_Build 3 172547212 1I ACATTCCAGG -/A AGCAGGAATG 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 1 2 178095 CASAVA_Build 3 172572436 5D AAATAACAGA AAGAG/----- AAGAGATACA 3070 het 3070 ref 43 19 15 12 AAGAG 2 1 178096 CASAVA_Build 3 172573783 1I GAAAATATAT -/C CCCTCCACCA 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 C 3 4 178097 CASAVA_Build 3 172581189 1I TCCTTCTTTG -/C CCCTTTGCAG 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 C 3 4 178098 CASAVA_Build 3 172604245 1I AACTAGAATA -/G GAGTGAGGTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 1 2 178099 CASAVA_Build 3 172604843 1D AGGAATAAGT A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 7 6 178100 CASAVA_Build 3 172606646 1D GCTAGAAGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 20 15 2 A 10 9 178101 CASAVA_Build 3 172629223 5I CACTGCCCAT -----/CCTCA TATTACCTCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 CCTCA 0 1 178102 CASAVA_Build 3 172633693 1D AACACTAAAG A/- AAGTAGAATA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 3 2 178103 CASAVA_Build 3 172638037 3I TTATGGCTGC ---/ATG ATTTATTCAA 3070 hom 115 het 46 0 35 11 ATG 0 1 178104 CASAVA_Build 3 172638754 4I ATGCAAGCAT ----/TAAG TAAGACCCAC 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 TAAG 1 2 178105 CASAVA_Build 3 172663085 2D GCCTGTACTA TT/-- TTACCACTTA 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 T 4 2 178106 CASAVA_Build 3 172664991 6D CACCTTAACT ACCTTA/------ ACCCCACCAC 2762 het 2762 ref 28 17 7 5 ACCTTA 1 0 178107 CASAVA_Build 3 172685470 8D GTGGCCATCT CTCCACAG/-------- CTCCACAGAC 3070 het 3070 ref 44 20 16 11 CTCCACAG 2 1 178108 CASAVA_Build 3 172686603 1D TTATTTACTT G/- AAATTTTCGG 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 G 1 0 178109 CASAVA_Build 3 172696919 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 8 7 178110 CASAVA_Build 3 172699158 1I CATTTTCATC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 7 8 178111 CASAVA_Build 3 172700046 1I TCCAGACTCA -/T TTCTCTGAAG 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 T 2 3 178112 CASAVA_Build 3 172704726 1D TTTCTTTTTT A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 34 14 15 6 A 7 6 178113 CASAVA_Build 3 172713029 1I CTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTA 2770 het 2770 ref 19 9 7 3 T 9 10 178114 CASAVA_Build 3 172713803 1I CTGGAATCTA -/T TCCCAACACC 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 1 2 178115 CASAVA_Build 3 172721903 1D AACTAATGAA T/- TTTTTTTTTT 2224 het 432 hom 20 1 10 12 T 17 16 178116 CASAVA_Build 3 172749605 1D GATCTCCGTA C/- CAAAGCAACC 3070 hom 81 het 29 0 27 3 C 2 1 178117 CASAVA_Build 3 172758300 1D CTTGAACCTA G/- GGAGGCGGAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 3 2 178118 CASAVA_Build 3 172758375 2I AACTCTGTCC --/AA AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 29 0 25 5 A 8 10 178119 CASAVA_Build 3 172761008 1I AATGACAAGG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 7 8 178120 CASAVA_Build 3 172761630 1I TTTTAGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 25 1 16 8 T 10 11 178121 CASAVA_Build 3 172762721 1D GAACAAGGAA G/- GGAATTGTTA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 G 3 2 178122 CASAVA_Build 3 172769332 4D ATGATAAAAA TGTT/---- TGTGTAAGTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TGTT 1 0 178123 CASAVA_Build 3 172788542 1I GGTCTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 32 1 24 7 T 10 11 178124 CASAVA_Build 3 172789388 1D TTATGTGGAG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 178125 CASAVA_Build 3 172791136 1I TTATAGTTCT -/A TCTGTCCTAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 0 1 178126 CASAVA_Build 3 172796722 3I GTGAGCTCAG ---/TAA TAATGTTGAA 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 TAA 1 2 178127 CASAVA_Build 3 172799655 1D TGGAAAGTAA T/- TTCAGGTTAG 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 T 3 2 178128 CASAVA_Build 3 172808830 1I GTGTCAGTTC -/T TTTTCTTCAT 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 T 4 5 178129 CASAVA_Build 3 172818017 2D GGGTTAGTGA AC/-- ATTAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 AC 1 0 178130 CASAVA_Build 3 172823966 2D GCCTTGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1795 hom 15 het 8 0 7 1 T 14 12 178131 CASAVA_Build 3 172824149 1I CTGTATAATT -/A AAAACAGTGC 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 A 4 5 178132 CASAVA_Build 3 172837909 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 3 4 178133 CASAVA_Build 3 172844230 4I CTTGAAAAGC ----/TTTG TTTATCATTT 3070 het 3070 hom 34 13 21 0 TTTG 0 1 178134 CASAVA_Build 3 172850333 4I AAGGAATGGT ----/TAAC TAAATTATGT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 TAAC 0 1 178135 CASAVA_Build 3 172865108 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTAT 2909 het 1748 hom 18 4 7 7 T 9 8 178136 CASAVA_Build 3 172870670 4I GGTACAAACA ----/TAGT TAGAAGGAAT 3070 hom 85 het 32 0 27 5 TAGT 0 1 178137 CASAVA_Build 3 172872980 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 12 11 178138 CASAVA_Build 3 172873734 10D CCTGGGATGA CTAATATTTG/---------- CTGCCGATAT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 CTAATATTTG 1 0 178139 CASAVA_Build 3 172879472 15I CTATCACCTG ---------------/CCCTAGAGAGACCTC CCATCTCCCC 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 CCCTAGAGAGACCTC 0 1 178140 CASAVA_Build 3 172884023 4I CACCCTCTCT ----/CAGA CAGTTTCTTA 3070 het 3070 hom 43 19 24 0 CAGA 0 1 178141 CASAVA_Build 3 172891905 1I GTTTGGTTGA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 6 7 178142 CASAVA_Build 3 172892332 1I GTTTTAGATA -/T TTGGCAAAAT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 T 2 3 178143 CASAVA_Build 3 172906925 4D TGGAATAGTC TTTG/---- TTTGTGAGTC 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 TTTG 2 1 178144 CASAVA_Build 3 172925445 1D GGGTACCCTA G/- AGGCGAACCC 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 G 1 0 178145 CASAVA_Build 3 172928866 4I AAACAGTGAT ----/TCAC TCAGTATCAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TCAC 0 1 178146 CASAVA_Build 3 172929416 1I TATTATACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 9 10 178147 CASAVA_Build 3 172931509 6I AAACTCCTGA ------/TAAGTT TGATAAGAAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 TAAGTT 0 1 178148 CASAVA_Build 3 172942489 7I6M5I TCTCATTTAA -------TCTTCA-----/ATAAAGTTATTTATTGTG CAATAACTTT 3070 het 3070 ref 47 27 20 2 N/A 0 0 178149 CASAVA_Build 3 172942979 1I CAAAAATTCA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 T 7 8 178150 CASAVA_Build 3 172959584 1I ATTAACACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 940 hom 46 3 35 8 T 10 11 178151 CASAVA_Build 3 172981026 2D AAAGGGGGCC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 639 hom 41 3 12 26 A 11 9 178152 CASAVA_Build 3 172981728 1D AAATGATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 12 11 178153 CASAVA_Build 3 172988735 10D TCTGCACTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1948 het 1948 ref 32 14 6 14 T 21 11 178154 CASAVA_Build 3 172989104 1I TTGAATTGTT -/C TAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 C 0 1 178155 CASAVA_Build 3 172994746 4D TATTTTGTTA TTAG/---- TTATTGTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 TTAG 1 0 178156 CASAVA_Build 3 172995170 1D CTCTAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 641 hom 33 2 26 6 A 11 10 178157 CASAVA_Build 3 172998115 1D GGTTGTCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 A 10 9 178158 CASAVA_Build 3 173000385 1D AAACTATCAA G/- GTCATCAAAA 3070 het 3070 hom 56 18 30 8 G 2 1 178159 CASAVA_Build 3 173007779 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3033 het 3033 ref 25 12 9 4 A 10 11 178160 CASAVA_Build 3 173011161 2I CGTTCCTTGT --/TC TCTCTTTTCC 3070 hom 66 het 29 0 21 8 TC 2 3 178161 CASAVA_Build 3 173019140 1I TATACTTAAG -/A AGTATAACAG 3070 het 2859 hom 23 8 11 4 A 1 2 178162 CASAVA_Build 3 173028856 1I GGAGGTGAGA -/T TTCTGTGTGG 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 T 2 3 178163 CASAVA_Build 3 173030582 1I AGCAGCTGCA -/G GAAGGCATGG 3070 het 2793 hom 35 13 15 7 G 1 2 178164 CASAVA_Build 3 173039968 1I ATCTCTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 A 10 11 178165 CASAVA_Build 3 173041524 1D GAAAATGTCC T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 7 6 178166 CASAVA_Build 3 173042193 1I CAAGGTCTCT -/G GCCCTTGTGA 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 G 1 2 178167 CASAVA_Build 3 173053808 1D TTAAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 1862 het 1862 ref 33 24 4 5 A 13 12 178168 CASAVA_Build 3 173078833 1D GTTTCAAGTG A/- ATTTAATGTG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 2 1 178169 CASAVA_Build 3 173095367 8I AAGTAGGTCG --------/TTGTGGCT TTGAGGACAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TTGTGGCT 0 1 178170 CASAVA_Build 3 173096121 1I GATTGTAAGA -/C CTTTGCCAGG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 C 1 2 178171 CASAVA_Build 3 173099641 1I GGGGTAGGCT -/G AGCATGGTGG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 G 0 1 178172 CASAVA_Build 3 173103251 2I GAGTATACAA --/AC ACACTATAGA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 AC 2 3 178173 CASAVA_Build 3 173104026 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 11 10 178174 CASAVA_Build 3 173107380 1D GCCCCCAGAG C/- TAGACACACA 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 C 1 0 178175 CASAVA_Build 3 173111314 1I TTTTTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 T 10 11 178176 CASAVA_Build 3 173129388 3I GGAAAAAAAA ---/AAG GGGGGGGAGA 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 AAG 0 1 178177 CASAVA_Build 3 173144321 6D CGAGATTACA GGCGTG/------ AGCCTCCGCG 3070 het 3070 ref 34 18 10 9 GGCGTG 1 0 178178 CASAVA_Build 3 173151813 6D CACGATCTAG TGGCAC/------ GATCACTGCA 3070 hom 80 het 28 0 26 4 TGGCAC 1 0 178179 CASAVA_Build 3 173157899 4I CATCTTCTCC ----/CTCT GTGTCCTCAC 3070 hom 163 het 61 0 54 7 CT 0 2 178180 CASAVA_Build 3 173165707 1D GCTGAGTGGA G/- GGGGAAGGGG 3070 hom 77 het 29 0 26 6 G 5 4 178181 CASAVA_Build 3 173169812 1I TGCCTGTTTT -/A AAAAAAACTT 3070 het 2886 hom 31 7 14 10 A 7 8 178182 CASAVA_Build 3 173170771 1I ACTCCGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 A 12 13 178183 CASAVA_Build 3 173173048 3D TAATTTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 585 hom 27 3 12 14 T 17 14 178184 CASAVA_Build 3 173194597 1D ATTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2989 het 2449 hom 17 9 8 0 A 17 16 178185 CASAVA_Build 3 173224888 1D AGTTTGAGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 10 9 178186 CASAVA_Build 3 173228243 2D TTTCACGTAG TT/-- TTTCTCGTCC 3070 het 3070 hom 38 16 16 7 T 5 3 178187 CASAVA_Build 3 173228830 4D CCGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2829 hom 22 7 14 3 AAAC 4 3 178188 CASAVA_Build 3 173236509 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2615 het 2615 ref 19 10 6 3 T 15 14 178189 CASAVA_Build 3 173242105 1I GGAATAACAC -/T TTTTTTTTTG 866 het 866 ref 18 8 4 6 T 9 10 178190 CASAVA_Build 3 173258785 3I TTTCAATAAC ---/AAG AAGAAAATAT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 AAG 1 2 178191 CASAVA_Build 3 173277165 3D GAAATATGAA ATT/--- ATTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 21 12 8 2 ATT 2 1 178192 CASAVA_Build 3 173279001 11I TAGAGGAGCC -----------/AGGGGATCCAT AGGCCTGTGA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 AGGGGATCCAT 0 1 178193 CASAVA_Build 3 173280385 4I AACTGAAACC ----/CTGT CTATGAGGCT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 CTGT 0 1 178194 CASAVA_Build 3 173281831 1I TTTTGTTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 8 9 178195 CASAVA_Build 3 173283029 1I TAGTTCATTC -/T TCCAGCCGTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 1 2 178196 CASAVA_Build 3 173297146 1I TAATCTGTAG -/C CCCCTTACTG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 C 4 5 178197 CASAVA_Build 3 173306365 3I CTGATTTTAC ---/TAA TGTGTCTGTG 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 TAA 0 1 178198 CASAVA_Build 3 173319868 1D GTGGCCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 697 hom 43 3 26 14 A 15 14 178199 CASAVA_Build 3 173322767 1D ATTCTCGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 11 10 178200 CASAVA_Build 3 173328043 1D ATCATTGTAG A/- AAAAAAACCT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 8 7 178201 CASAVA_Build 3 173341630 2D ACTGATTTTT CC/-- CCCCCCTAAA 3070 hom 49 het 51 1 30 20 C 8 6 178202 CASAVA_Build 3 173345192 1D AAAGGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 33 2 24 8 T 13 12 178203 CASAVA_Build 3 173370533 1I TTCCAATCTA -/T TTTTTTTTGT 1848 het 1848 ref 33 25 5 3 T 8 9 178204 CASAVA_Build 3 173372276 1D CTTTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 13 12 178205 CASAVA_Build 3 173373306 4I ATTTAAATAT ----/AAGG AAGGGACCTA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 AAGG 1 2 178206 CASAVA_Build 3 173377665 1I39M2D ATATGGGCCT -AGCGGAAGATACAGAACCCTAACTGAAGTTTGGCTGACCAA/AAGCGGAAGATACAGAACCCTAACTGAAGTTTGGCTGACC-- AAAGAATCTT 3070 het 3070 hom 36 9 15 23 N/A 0 0 178207 CASAVA_Build 3 173379735 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTTCAC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 3 4 178208 CASAVA_Build 3 173381589 11I3M4I AGATATATTC -----------TAA----/ATTTGACATTTTAAAAAG GATGACAGCC 3070 hom 41 het 23 0 16 7 N/A 0 0 178209 CASAVA_Build 3 173385945 3D AGCTTTTTAA AAC/--- ATGCATTGTT 3070 het 3070 ref 45 20 20 6 AAC 1 0 178210 CASAVA_Build 3 173398715 1D TCCTGGCTTC T/- TTTTTAATAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 5 178211 CASAVA_Build 3 173407578 4D CCAGAGAATT GGTA/---- GTCCCAACTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 GGTA 1 0 178212 CASAVA_Build 3 173408589 1I GGACAGCAGA -/T TTTGGTGATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 3 4 178213 CASAVA_Build 3 173409215 2D5M11I CTTGGCCTGG ATCAGGC-----------/--CAGGCTGTGCTCAGCT AGCACCACCG 3070 hom 48 het 21 0 13 9 N/A 0 0 178214 CASAVA_Build 3 173414493 2D TCTATGGTGC CG/-- CGCCATAAAG 3070 hom 127 het 51 0 42 11 CG 2 1 178215 CASAVA_Build 3 173417569 8D TGCCATTCTC TCCATAAT/-------- TAAGAACAGA 3070 hom 166 het 58 0 56 5 TCCATAAT 1 0 178216 CASAVA_Build 3 173418042 3I CAATTCCTTA ---/CAT CATCTTGCAC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 CAT 1 2 178217 CASAVA_Build 3 173418141 1D TTTTTTTTTT A/- AAACCATTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 4 3 178218 CASAVA_Build 3 173420551 2I TACATTTAAC --/TT TTTGAGGAAG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 3 5 178219 CASAVA_Build 3 173420652 2D TGTTATTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 98 het 48 0 34 16 TG 9 8 178220 CASAVA_Build 3 173421412 5D TGGCTCTATT AAAAA/----- AAAATAAATA 464 het 45 hom 35 1 4 31 A 9 4 178221 CASAVA_Build 3 173421662 1I GCTCTAGTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 8 9 178222 CASAVA_Build 3 173421946 1D GACCTTGTTA G/- AAATACTCAT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 G 1 0 178223 CASAVA_Build 3 173475012 1D TAAAATCTCT G/- ATTTGCTGAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 1 0 178224 CASAVA_Build 3 173486526 1D TCAAATGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 13 15 T 13 12 178225 CASAVA_Build 3 173486778 1I CTTTTGGTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 T 9 10 178226 CASAVA_Build 3 173489906 5I CCATATAAGG -----/TAATA TATTCATAGG 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 TAATA 0 1 178227 CASAVA_Build 3 173554447 2I GATCTTGGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 12 14 178228 CASAVA_Build 3 173558221 1I AGTTCCTCAG -/T TTTTTTTTTT 990 het 990 ref 35 26 3 6 T 10 11 178229 CASAVA_Build 3 173562860 1I AACAAACCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 9 178230 CASAVA_Build 3 173567760 2D CAATCATCGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 46 0 37 10 T 12 10 178231 CASAVA_Build 3 173575492 1I TTCATAGTAT -/A AAAAATTGGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 178232 CASAVA_Build 3 173580560 1D TCTTCTTCTT C/- TTTTTTTTTA 3070 hom 50 het 26 0 22 4 C 1 0 178233 CASAVA_Build 3 173584495 1I CATAATTTAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 8 9 178234 CASAVA_Build 3 173586771 6I AAGCAAAACA ------/ATTCAT ATTCATATTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ATTCAT 1 2 178235 CASAVA_Build 3 173592469 1I ATCTTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 10 11 178236 CASAVA_Build 3 173598285 1D AAGCCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1096 hom 35 4 22 9 T 13 12 178237 CASAVA_Build 3 173600150 1D CCCACTATGA C/- CACAGCATCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 2 1 178238 CASAVA_Build 3 173600321 1D ATTGGTTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 30 1 26 3 T 10 9 178239 CASAVA_Build 3 173601245 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 21 1 16 4 T 15 14 178240 CASAVA_Build 3 173613717 2D CAAGTAAAAG CA/-- CACACACACA 1049 het 1049 ref 50 40 3 8 CA 6 5 178241 CASAVA_Build 3 173621194 1I AATCCTACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 83 het 31 0 26 5 T 9 10 178242 CASAVA_Build 3 173622121 5D GATAAATTTC TTCCT/----- TTCCTTTTCA 3070 hom 126 het 44 0 43 4 TTCCT 2 1 178243 CASAVA_Build 3 173623826 1D GTTGTTGTTG T/- TGTTGTCTGA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 2 1 178244 CASAVA_Build 3 173631724 1D TTTCAACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 12 11 178245 CASAVA_Build 3 173637502 1D ATTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 10 9 178246 CASAVA_Build 3 173640558 1D TTCTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 30 1 17 12 T 15 14 178247 CASAVA_Build 3 173641322 1D TTTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 25 2 11 12 T 19 18 178248 CASAVA_Build 3 173643765 1D TGGGTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 34 0 24 10 T 13 12 178249 CASAVA_Build 3 173645077 8D AATTGAGGGT TTCTGTAA/-------- GTGTAAAAAG 3070 hom 66 het 23 0 23 2 TTCTGTAA 1 0 178250 CASAVA_Build 3 173647872 2D AAAGGGGGAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GA 6 5 178251 CASAVA_Build 3 173717972 1D GGAAGCATGG A/- AAAGTAAAGA 3070 hom 83 het 32 0 28 5 A 4 3 178252 CASAVA_Build 3 173719853 5D TGAGTCAGTT GAGTA/----- AAGAACTGGT 3070 hom 129 het 44 0 44 0 GAGTA 1 0 178253 CASAVA_Build 3 173722566 1I TAGAACAAAT -/A CCTAATGCCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 0 1 178254 CASAVA_Build 3 173741151 1D GTATCGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 11 10 178255 CASAVA_Build 3 173741796 1I GTAGAGACAA -/G GTTTCACCGT 2582 hom 38 het 17 0 12 5 G 1 2 178256 CASAVA_Build 3 173757618 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 2300 het 2300 ref 19 11 7 1 A 13 12 178257 CASAVA_Build 3 173759931 1I TCATGGGCCT -/G GACACCTTTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 2 178258 CASAVA_Build 3 173765680 1D TAAATTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 31 het 36 1 28 7 T 10 9 178259 CASAVA_Build 3 173772583 1I AGGTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 846 hom 35 2 28 5 T 10 11 178260 CASAVA_Build 3 173780045 1I GGGCACTGCC -/T TAGGGGAGCT 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 T 1 2 178261 CASAVA_Build 3 173793490 1D ATGTTGTGCT G/- GGGGGTCCAC 3070 hom 51 het 22 0 17 7 G 6 5 178262 CASAVA_Build 3 173794392 4D ATAACTCCTC AGAA/---- AGACCGTTGC 3070 hom 63 het 24 0 22 3 AGAA 1 0 178263 CASAVA_Build 3 173795512 1D CCTGTATCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 107 hom 39 2 34 3 T 10 9 178264 CASAVA_Build 3 173796320 3I TGCTGCTTAC ---/CCT CATTAGCTGT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 CCT 0 1 178265 CASAVA_Build 3 173796876 3D TAAACCAGGA TCT/--- TCTTCAGCCT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TCT 2 1 178266 CASAVA_Build 3 173801212 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1251 het 1251 ref 21 7 6 8 T 12 13 178267 CASAVA_Build 3 173807788 10D ACTCCATCAC AAAAAAAAAG/---------- AAAAAAAAAT 2926 het 2219 hom 14 5 8 4 AAAAAAAAAG 1 0 178268 CASAVA_Build 3 173811592 1D GATCAAACTA C/- CAAGACCCAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 C 2 1 178269 CASAVA_Build 3 173819160 1I GAGACCCTGT -/C CCCCCCCGCA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 C 7 8 178270 CASAVA_Build 3 173823558 1I AAAGCATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 9 10 178271 CASAVA_Build 3 173826345 1I CTGGTAGGCC -/T TAAGGATGGC 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 T 1 2 178272 CASAVA_Build 3 173826580 2I GATTCTCCAC --/AT GTTAGATGGC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 AT 0 1 178273 CASAVA_Build 3 173831502 1D CCACAGTACT A/- AAAAAAAAAA 1691 het 1691 ref 41 33 5 3 A 12 11 178274 CASAVA_Build 3 173831601 4I CAGTGGTTGA ----/CCTC CCTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 CCTC 1 2 178275 CASAVA_Build 3 173841717 7I TGCAAATCTT -------/AGATATA AGATAAACAC 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 AGATATA 0 1 178276 CASAVA_Build 3 173859788 1D AAAAGGCAGA T/- TAACAAGCAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 T 2 1 178277 CASAVA_Build 3 173875065 1D TTTTAACGCA T/- TATTTACAGG 3070 het 3070 ref 29 20 7 2 T 2 1 178278 CASAVA_Build 3 173875928 1D AAAATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 1544 het 1544 ref 14 7 5 2 A 11 10 178279 CASAVA_Build 3 173881152 1D GCGTCACAGG C/- CCCCCCCCCT 2208 hom 34 het 25 0 9 16 C 10 9 178280 CASAVA_Build 3 173882393 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1876 hom 29 5 15 9 A 12 11 178281 CASAVA_Build 3 173884970 3I GATAATTACA ---/AAC AAAAACAACA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 AAC 0 1 178282 CASAVA_Build 3 173886566 1I ACACACTGAC -/A AAGTCCCAGC 3070 hom 123 het 48 0 40 8 A 2 3 178283 CASAVA_Build 3 173890117 1D CCACCTGAGC G/- CCAGGAGGCG 1461 hom 12 het 6 0 4 2 G 1 0 178284 CASAVA_Build 3 173893009 2I ACCTGGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 19 0 15 4 T 12 14 178285 CASAVA_Build 3 173904583 3D TATGAAAGAG ATT/--- ATTAGCACGT 3070 het 3070 ref 59 28 24 12 ATT 2 1 178286 CASAVA_Build 3 173908625 6D CTCACTGCAC AAGATA/------ AAGGACATAA 3070 het 3070 ref 46 29 16 5 AAGATA 1 0 178287 CASAVA_Build 3 173910945 4D CTCCTAAAAA TATT/---- TATCCTCTGC 3070 hom 108 het 39 0 36 6 TATT 1 0 178288 CASAVA_Build 3 173917694 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 981 het 981 ref 22 16 3 4 A 13 12 178289 CASAVA_Build 3 173922433 1D GGGAAATGTT C/- CCCCACAAGG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 C 5 4 178290 CASAVA_Build 3 173923179 1I AAACAGGATT -/A AAAAAAAAAA 1989 het 456 hom 18 1 12 5 A 10 11 178291 CASAVA_Build 3 173924629 1D ATGTGGGAAG C/- ATTCAAACCA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 C 1 0 178292 CASAVA_Build 3 173932800 1I TGACAATTTT -/A AGGTTTCCAC 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 A 1 2 178293 CASAVA_Build 3 173943869 2D ATATTACCCC CT/-- GTTATACTTT 3070 het 3070 hom 43 17 25 1 CT 1 0 178294 CASAVA_Build 3 173948901 1D ATGCAATAAA T/- TTTTCACCGC 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 5 4 178295 CASAVA_Build 3 173962868 1I TTTAAGTTAA -/T ACTGGTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 0 1 178296 CASAVA_Build 3 173967384 2D TTTAGGAGAC AA/-- GAGAACAAAA 3070 het 3070 hom 50 22 25 4 A 2 0 178297 CASAVA_Build 3 173975651 5D AAGTAGTTTA GTTTT/----- ATTTCCTCTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 GTTTT 1 0 178298 CASAVA_Build 3 173983359 1I TGATCTCGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 10 11 178299 CASAVA_Build 3 173987853 4I TCTCATTCTC ----/TTAT TTGAGACAGT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TTAT 0 1 178300 CASAVA_Build 3 173997689 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 13 14 178301 CASAVA_Build 3 174005376 1D AATCTATTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 10 9 178302 CASAVA_Build 3 174008860 1I GTGCCTGGCC -/A AAAAAAAAAA 1893 het 1893 ref 21 9 6 6 A 15 16 178303 CASAVA_Build 3 174014391 1I TGTTATGAAG -/A AACATTTTAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 2 3 178304 CASAVA_Build 3 174025375 4D CAAAACAAAC AAAA/---- AAACTACATG 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 A 7 3 178305 CASAVA_Build 3 174029100 1D AACTGGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 39 3 25 11 T 17 16 178306 CASAVA_Build 3 174033092 4I CTAATTTTTT ----/TGTG TTTGTGTATT 2502 hom 21 het 8 0 7 1 TG 0 2 178307 CASAVA_Build 3 174042942 1I ATTAGATTTT -/C CCCCACCCTT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 C 4 5 178308 CASAVA_Build 3 174043170 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 745 hom 12 2 8 2 T 8 9 178309 CASAVA_Build 3 174044495 4D GCAGTAAGAC TGTT/---- TGATTTGTGC 3070 het 3070 hom 45 19 23 5 TGTT 1 0 178310 CASAVA_Build 3 174050390 12I ATAAATTGGC ------------/TTTTAAAAATCG TTATAAAATA 3070 het 3070 ref 32 23 8 1 TTTTAAAAATCG 0 1 178311 CASAVA_Build 3 174053193 1I CAACGGCGGG -/A AGGGGGGGTG 1632 het 1110 hom 16 6 5 5 A 1 2 178312 CASAVA_Build 3 174059558 1I AAACAAAGGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 8 9 178313 CASAVA_Build 3 174071305 1I GGTTACTCTT -/A AAAACCTTTA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 4 5 178314 CASAVA_Build 3 174073204 8D TCCCTGATTT GCCTCTGG/-------- GCTTCTGAGG 3070 hom 128 het 46 0 43 4 GCCTCTGG 1 0 178315 CASAVA_Build 3 174090844 1I TGTTTGTCAG -/A AAAAAACTAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 6 7 178316 CASAVA_Build 3 174094976 4D CAAAACATGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 233 het 36 hom 22 1 2 19 A 14 10 178317 CASAVA_Build 3 174107061 2I AATGTTCAAC --/TA TACAGACAAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TA 1 2 178318 CASAVA_Build 3 174116721 1I CAGGATTTTT -/G TTTTTTTTTT 1326 het 12 hom 42 1 12 29 G 0 1 178319 CASAVA_Build 3 174122045 1I TAAGCTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 39 1 31 7 A 10 11 178320 CASAVA_Build 3 174199880 8D CCCTATTTCA TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 2864 het 194 hom 35 2 7 26 TTTC 6 4 178321 CASAVA_Build 3 174267472 2I GAAATTAAAC --/AG AAATTCTGGA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AG 0 1 178322 CASAVA_Build 3 174268199 2I GAATAATAAC --/AG AGAACTTTCC 3070 het 3070 ref 31 15 16 0 AG 1 2 178323 CASAVA_Build 3 174269831 1I TTAGAGACTA -/T TATGAGCAAC 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 1 2 178324 CASAVA_Build 3 174270442 1D TAAAAAGACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 11 13 A 11 10 178325 CASAVA_Build 3 174275641 1I TTGAAATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 10 11 178326 CASAVA_Build 3 174276881 1D TAGTATAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 12 11 178327 CASAVA_Build 3 174291531 1I AGCTTCTGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 9 10 178328 CASAVA_Build 3 174291821 1I TTTATTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 T 10 11 178329 CASAVA_Build 3 174297319 1I TGTTTATTAA -/T AGGGAATATG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 0 1 178330 CASAVA_Build 3 174306439 1I TGAACTCTGA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 6 7 178331 CASAVA_Build 3 174307940 1I TCTCTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2895 hom 36 12 14 10 T 15 16 178332 CASAVA_Build 3 174310511 5D AATAATACTT TTATC/----- TTATTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 TTATC 1 0 178333 CASAVA_Build 3 174321413 1D CAGTTTTACA C/- AAGAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 C 1 0 178334 CASAVA_Build 3 174332558 2D TATTTATGAC AA/-- GAGAGTGAGA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 2 0 178335 CASAVA_Build 3 174334477 1I TTTTATATGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 8 9 178336 CASAVA_Build 3 174459694 2D TATTCATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 18 0 10 8 T 14 12 178337 CASAVA_Build 3 174461841 1I AATCCTTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 9 10 178338 CASAVA_Build 3 174464139 1I TCCCCTCTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 73 het 30 0 24 6 T 9 10 178339 CASAVA_Build 3 174467420 1D TAGTTCTTAG T/- TTTTCTCTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 T 5 4 178340 CASAVA_Build 3 174475188 1D AACAAACAAA C/- AAAAACATGT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 C 1 0 178341 CASAVA_Build 3 174483872 2I GTAGATGCAT --/TG TGTTATACGT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TG 1 2 178342 CASAVA_Build 3 174493902 1I AATTTTCTTT -/A AAAAATATTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 6 178343 CASAVA_Build 3 174496574 1I ACTTGCATAT -/G TTAAACCATC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 0 1 178344 CASAVA_Build 3 174497210 1D18M1I CAGCTTTTTG TTTTTATTCATCTTTTGTA-/-TTTTATTCATCTTTTGTAT TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 21 0 25 0 N/A 0 0 178345 CASAVA_Build 3 174524078 1D ATTGTAAATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 85 het 33 0 29 4 T 10 9 178346 CASAVA_Build 3 174613043 2D AGTGAAACTC TA/-- TCTTAATTAC 3070 hom 60 het 24 0 21 5 TA 1 0 178347 CASAVA_Build 3 174614085 5I CTCCATCTCA -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 AAAAT 2 3 178348 CASAVA_Build 3 174616053 4I GCAACCTGGC ----/TGAG TTTCAGTGTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 TGAG 0 1 178349 CASAVA_Build 3 174618119 1D GCAATAATTC A/- ATAACATTGC 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 2 1 178350 CASAVA_Build 3 174618664 6I ATTAGAAGGC ------/ATAATT ATAATTATAA 1938 het 1938 ref 12 8 4 0 ATAATT 1 2 178351 CASAVA_Build 3 174622561 2D ACTTATCATG AT/-- ATATATATGT 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 AT 5 4 178352 CASAVA_Build 3 174622624 2D TATAGTACAC TA/-- TATATACACA 3070 het 3070 hom 49 20 18 12 TA 4 3 178353 CASAVA_Build 3 174624185 2I GTTCCTGTGA --/CT CTGCAGGGTA 3070 het 3070 ref 54 21 21 12 CT 1 2 178354 CASAVA_Build 3 174625838 1D ATGCAGAGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 10 9 178355 CASAVA_Build 3 174643804 2D21M2D ATATATATAC TATATATATATATACACTATGACTA/--TATATATATACACACTATGAC-- TATATATAGT 3070 hom 30 het 11 0 11 3 N/A 0 0 178356 CASAVA_Build 3 174645449 1I GACTTGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 10 11 178357 CASAVA_Build 3 174646720 1I CCACAACAGT -/C CCCGGTGTGT 2309 het 251 hom 6 1 5 0 C 3 4 178358 CASAVA_Build 3 174655064 3D ATGGAGGACA TCT/--- TCTTTCCTTC 3070 het 3070 hom 53 25 27 2 TCT 2 1 178359 CASAVA_Build 3 174665368 1I TTGTGGACTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 8 9 178360 CASAVA_Build 3 174675806 4I TTGTTTTCTG ----/ATTA ATTATCAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATTA 1 2 178361 CASAVA_Build 3 174679781 2D GTAAGAAAAT AA/-- AAGAGTGAGG 3070 hom 120 het 42 0 41 4 A 4 2 178362 CASAVA_Build 3 174713709 1I GAAAATGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 9 10 178363 CASAVA_Build 3 174723082 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 9 10 178364 CASAVA_Build 3 174723626 3I TGTTGTTGTT ---/ATC ATTGAGATGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATC 0 1 178365 CASAVA_Build 3 174737251 2D ACGAGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1521 het 1521 ref 58 43 5 11 GT 7 6 178366 CASAVA_Build 3 174739358 2I ATCTTCATGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 33 1 21 11 T 13 15 178367 CASAVA_Build 3 174752839 1I TTTGAGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 11 10 T 10 11 178368 CASAVA_Build 3 174754285 2I GAAAAGCCGA --/CT CTAACAGAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CT 1 2 178369 CASAVA_Build 3 174757288 1I GACCTGTCTC -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 85 het 34 0 29 5 A 7 8 178370 CASAVA_Build 3 174757519 1D GGCATACTGA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 48 het 26 0 17 11 T 8 7 178371 CASAVA_Build 3 174761009 1D AACAGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 12 11 178372 CASAVA_Build 3 174770072 1D TCATGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 20 1 17 2 T 12 11 178373 CASAVA_Build 3 174770357 2I CACATTCATG --/CT CTTTCTCTAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 CT 1 2 178374 CASAVA_Build 3 174778734 1D AAAAAAAAAA G/- AAGAAGAAGA 234 het 234 ref 19 10 1 8 G 1 0 178375 CASAVA_Build 3 174781404 1D AGTCAACTCT C/- CTATGATATA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 C 2 1 178376 CASAVA_Build 3 174786617 1D TTTAGTTGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 120 het 48 0 41 8 T 10 9 178377 CASAVA_Build 3 174787833 1D TACACAAAAC T/- TTCAGTAAAC 3070 hom 108 het 43 0 37 7 T 3 2 178378 CASAVA_Build 3 174792169 1I CAACAAGGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 8 9 178379 CASAVA_Build 3 174797140 3I TGCTCATGGC ---/ATA AGAGTAAACT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 ATA 0 1 178380 CASAVA_Build 3 174798295 1D TATAAATACT G/- ATGACTTCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 1 0 178381 CASAVA_Build 3 174803938 4D TTGATCTCTA ACAG/---- ACAGTGAGAA 3070 hom 78 het 31 0 27 6 ACAG 2 1 178382 CASAVA_Build 3 174816372 1I GTTCTAGGGC -/T TTTTTCTCAC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 5 6 178383 CASAVA_Build 3 174816604 1I TTTGAAATAG -/A AAGTTACCCC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 2 3 178384 CASAVA_Build 3 174823839 1D TATTTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 16 9 A 11 10 178385 CASAVA_Build 3 174825324 1D TTTATAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 7 T 11 10 178386 CASAVA_Build 3 174825365 1I TTTATTTATA -/T TTTTTTTTCT 2570 het 1821 hom 25 5 6 14 T 8 9 178387 CASAVA_Build 3 174829481 5D TTTATTACTT ATCTC/----- AGTGAGATCA 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 ATCTC 1 0 178388 CASAVA_Build 3 174832386 1D TAAAATGTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 T 9 8 178389 CASAVA_Build 3 174838873 1D TTATAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2862 hom 24 10 12 2 A 11 10 178390 CASAVA_Build 3 174850623 1I TACAGTTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 53 23 26 4 T 8 9 178391 CASAVA_Build 3 174856241 1D AGTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 13 12 178392 CASAVA_Build 3 174860597 1I CTTGCTATTC -/G GTAGAGACAG 3070 hom 114 het 47 0 38 9 G 1 2 178393 CASAVA_Build 3 174860848 1I CCTTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 T 10 11 178394 CASAVA_Build 3 174874870 1I TTATCCCAAC -/T TTTACAGATG 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 3 4 178395 CASAVA_Build 3 174875117 1D ATACCTGTAT A/- AAGAAATCAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 3 2 178396 CASAVA_Build 3 174879611 1D CCCCGATGTG A/- AAAAAAAAAA 1690 het 1690 ref 28 18 5 5 A 13 12 178397 CASAVA_Build 3 174885504 1D CCAGTTGAAT C/- CTCTATGCCC 3070 het 3070 ref 47 23 20 5 C 2 1 178398 CASAVA_Build 3 174898518 2D TTAAAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 14 12 178399 CASAVA_Build 3 174899329 1D AGAAAACAGG A/- ATTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 21 12 0 A 2 1 178400 CASAVA_Build 3 174916372 1D CAGAGTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 10 9 178401 CASAVA_Build 3 174922427 1I ATCTGCTCGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1271 hom 40 3 27 10 A 11 12 178402 CASAVA_Build 3 174927294 4D ACTTTATTGC TTTT/---- TTATTACCTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 2 178403 CASAVA_Build 3 174927425 1D TTTCCTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 26 4 16 6 A 13 12 178404 CASAVA_Build 3 174937719 1D CCTCACTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 53 1 40 12 A 12 11 178405 CASAVA_Build 3 174942909 1I AAAGTGAAAT -/G TTTTTCAAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 178406 CASAVA_Build 3 174945315 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 10 11 178407 CASAVA_Build 3 174947848 2D ATATACTTAA AG/-- ATATATATAT 2263 hom 12 het 5 0 5 0 AG 1 0 178408 CASAVA_Build 3 174956618 6D13M1D TTGGGATTTT ACACAATCACATTTACACAT/------TCACATTTACACA- TTTTTTTGTA 3070 hom 84 het 29 0 29 5 N/A 0 0 178409 CASAVA_Build 3 174957251 1D GGATAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 28 0 20 8 A 12 11 178410 CASAVA_Build 3 174979795 5I TATTTTCCTC -----/TTATA TTAGATGTCT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TTATA 0 1 178411 CASAVA_Build 3 174979968 1I TTTTTACTCT -/C CCCTTATTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 3 4 178412 CASAVA_Build 3 174982583 1I TGGAAGTGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 172 hom 47 1 38 8 T 9 10 178413 CASAVA_Build 3 174983491 4I AAAGAGAGGG ----/AATA AATAAATATA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 AATA 2 3 178414 CASAVA_Build 3 174998181 1I CAACAACAAC -/A AACAAAAAAA 3070 het 497 hom 41 2 36 3 A 2 3 178415 CASAVA_Build 3 175005128 1I AGCCTTTAGA -/T TTGCTATTTA 3070 hom 54 het 29 0 18 11 T 2 3 178416 CASAVA_Build 3 175009588 1I ATGCACTGCG -/T TAAGTGTAGG 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 1 2 178417 CASAVA_Build 3 175016472 3D AAATTATATT ATA/--- ATAATTAATT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 ATA 2 1 178418 CASAVA_Build 3 175016555 8D CTGTAATTAT ATATTTAA/-------- ATTTTTAATA 3070 hom 30 het 10 0 11 1 ATATTTAA 1 0 178419 CASAVA_Build 3 175020809 2D TTTTAAATTG AA/-- AATAGCTATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 4 2 178420 CASAVA_Build 3 175024404 1D TTGTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 33 0 27 7 A 12 11 178421 CASAVA_Build 3 175025867 1I TTCTTAGTGG -/A AAAAAATGAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 6 7 178422 CASAVA_Build 3 175032611 1D CAGCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 506 hom 24 2 20 2 A 16 15 178423 CASAVA_Build 3 175033538 5I TACAATACAA -----/TAAAT TAAAAATCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAAAT 0 1 178424 CASAVA_Build 3 175034475 4I TTTACTTCTC ----/AATT AAACTTAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AATT 0 1 178425 CASAVA_Build 3 175038703 1I AGGGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2426 het 2426 ref 25 11 8 6 A 11 12 178426 CASAVA_Build 3 175040355 6D AATGTGGTAT TATAGA/------ TATAGCTAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TATAGA 1 0 178427 CASAVA_Build 3 175041632 2I TATCTATAGT --/TA TATATATATA 3070 het 697 hom 34 3 24 7 TA 7 8 178428 CASAVA_Build 3 175049983 2I CAGAGGTCAC --/AT GTTACTAGAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AT 0 1 178429 CASAVA_Build 3 175056765 1D TAGTAGCTCG T/- TTTACTATAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 4 3 178430 CASAVA_Build 3 175090270 1D AGATGCATCC A/- AAAAATATGC 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 A 6 5 178431 CASAVA_Build 3 175093060 1I AAGGCAAACT -/A AAAAAAAAAA 2484 het 2484 ref 39 16 12 11 A 16 17 178432 CASAVA_Build 3 175209310 1I GAAAGAGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 9 10 178433 CASAVA_Build 3 175219550 1D TAATAAATCA G/- GTATTCAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 6 G 2 1 178434 CASAVA_Build 3 175227336 1D AATTTCTGTT C/- CTAATTTTAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 C 2 1 178435 CASAVA_Build 3 175227418 5D AGGATATTGT AATTC/----- AATTCAAATA 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 AATTC 2 1 178436 CASAVA_Build 3 175377362 1I CTGAAAGGAA -/C CAAGTAGGGG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 C 1 2 178437 CASAVA_Build 3 175384845 2I AAAAGTACTC --/AT ATTATAAATA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AT 1 2 178438 CASAVA_Build 3 175385533 9D AGAGCTGCAA CTGCACAGC/--------- CTGCACAGTA 3070 hom 132 het 46 0 45 3 CTGCACAGC 1 0 178439 CASAVA_Build 3 175386292 1I GAAATTAACC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 9 10 178440 CASAVA_Build 3 175387463 1I TCCCTTATAT -/A AAATGGCATA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 3 4 178441 CASAVA_Build 3 175390217 5D TCTATATCCC TAATG/----- TAATATATCA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 TAATG 1 0 178442 CASAVA_Build 3 175394577 1D AACTGCAATA T/- TTTTTTATTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 7 6 178443 CASAVA_Build 3 175402033 34I CCTCTCAGCA ----------------------------------/ATGTCAGGTCACTTATAATGTTCTCACTCCATGC ATAGGCAGGT 3070 hom 90 het 25 0 31 2 ATGTCAGGTCACTTATAATGTTCTCACTCCATGC 0 1 178444 CASAVA_Build 3 175403461 4D AGGGAAGCAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TTTA 4 3 178445 CASAVA_Build 3 175405334 2D TTCAAACAGG TT/-- TTTTTTTTAG 3070 hom 83 het 37 0 29 8 T 10 8 178446 CASAVA_Build 3 175409149 3D CATTATAGGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 41 1 31 9 A 16 13 178447 CASAVA_Build 3 175420580 2I CAACACTAAC --/TG GAAAACAGAG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TG 0 1 178448 CASAVA_Build 3 175422088 1I CATACATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 41 1 34 6 T 12 13 178449 CASAVA_Build 3 175422798 2I TTATTTTCCT --/AA GTTTATTTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 2 178450 CASAVA_Build 3 175470610 2D GTTTCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2324 het 619 hom 26 6 6 16 T 16 14 178451 CASAVA_Build 3 175470669 1D TATTTGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 25 0 13 12 T 13 12 178452 CASAVA_Build 3 175471786 1D ACAGTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 11 10 178453 CASAVA_Build 3 175473486 1I TCAGAGGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1535 hom 33 5 21 7 T 13 14 178454 CASAVA_Build 3 175474398 4I TTGGTTATGG ----/ATTT ATTTATTTGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATTT 2 3 178455 CASAVA_Build 3 175495802 5D AGTCCTCTGA TTCTT/----- TTTTTTTTTT 1772 het 380 hom 35 9 7 20 TTCTT 1 0 178456 CASAVA_Build 3 175519537 1D CATTCAAAGG A/- AAAAAAGTAA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 7 6 178457 CASAVA_Build 3 175523689 1I AAGTTGTGTT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 37 het 35 1 25 9 A 8 9 178458 CASAVA_Build 3 175527898 1D CACAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 194 hom 32 3 22 8 T 15 14 178459 CASAVA_Build 3 175528474 1D ATATAAAAAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 41 het 18 0 14 4 T 9 8 178460 CASAVA_Build 3 175531224 2I GATGCCAGAT --/GA AGACAGATAC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 GA 0 1 178461 CASAVA_Build 3 175532623 4D CTACAGCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 96 het 45 0 32 13 AAAC 5 4 178462 CASAVA_Build 3 175533461 1D CATGTGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 27 3 16 8 A 15 14 178463 CASAVA_Build 3 175533830 1I TATAAAAATT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 178464 CASAVA_Build 3 175535920 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 119 het 55 0 39 17 AC 9 8 178465 CASAVA_Build 3 175536219 1I AGGAAAGAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 665 hom 39 2 30 7 A 8 9 178466 CASAVA_Build 3 175539421 2D TCTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TA 1 0 178467 CASAVA_Build 3 175540922 1I GATGGAGCAA -/T ATCTCTCACT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 0 1 178468 CASAVA_Build 3 175543404 8I AACATATTCA --------/CTCACTCT CTCACTCTCT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 CTCACTCT 1 2 178469 CASAVA_Build 3 175548500 2D AGAAGGCATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 266 hom 33 1 24 8 A 14 12 178470 CASAVA_Build 3 175548574 1D AGAGAAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 41 2 28 11 A 13 12 178471 CASAVA_Build 3 175574659 1D AGAAAAAGAA G/- GGGGGGATGA 3070 hom 12 het 35 1 28 7 G 7 6 178472 CASAVA_Build 3 175588245 5I AACCTCACAA -----/TGTAT AGCTTTTACT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 TGTAT 0 1 178473 CASAVA_Build 3 175589831 1I GCCCCTGTGT -/C CTTTGCAGGG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 C 1 2 178474 CASAVA_Build 3 175595648 10D GAATTCCAAA GAATTCCAAT/---------- ATATAAATTT 3070 het 3070 ref 26 14 11 6 GAATTCCAAT 1 0 178475 CASAVA_Build 3 175603790 1D TAAAAAATTA C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 26 0 20 6 C 1 0 178476 CASAVA_Build 3 175609036 7I AGGCCGGAGC -------/GGTGGCT GGTGGCTCAC 2772 het 2772 ref 26 12 9 5 GGTGGCT 1 2 178477 CASAVA_Build 3 175642872 1I TTTTTAGAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 8 9 178478 CASAVA_Build 3 175685903 1I GTACCCATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2993 hom 21 8 10 3 T 10 11 178479 CASAVA_Build 3 175696171 27I GGATACTGAA ---------------------------/TCTTTTAGAAAATCAAGGATTAGGGAT TCCAGCTGTA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 TCTTTTAGAAAATCAAGGATTAGGGAT 0 1 178480 CASAVA_Build 3 175696240 1I GTGTGATAGC -/A AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 5 6 178481 CASAVA_Build 3 175706061 1D ATCTTTTATT G/- GGAGCTATAA 3070 het 3070 hom 38 18 18 4 G 3 2 178482 CASAVA_Build 3 175706668 1D GGTTTATATC T/- TTTTTTTTTT 954 het 954 ref 29 20 2 7 T 15 14 178483 CASAVA_Build 3 175709588 1I ACTGTATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 10 11 178484 CASAVA_Build 3 175734112 2D AATTAGTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 51 5 15 33 A 15 13 178485 CASAVA_Build 3 175742399 3D TGTCCATTGA AGC/--- AGCAGCAGCG 3070 het 3070 ref 49 29 16 6 AGC 4 3 178486 CASAVA_Build 3 175744494 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2790 het 1568 hom 23 6 9 8 A 13 12 178487 CASAVA_Build 3 175758185 1D ACTAGAACTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 8 178488 CASAVA_Build 3 175786152 1I TTTTGTTTTT -/C TTTTTACTTA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 C 0 1 178489 CASAVA_Build 3 175792730 5I ATTTTTCTTT -----/TTTTA TTTTATTTTG 2966 het 2966 ref 29 14 9 6 TTTTA 1 2 178490 CASAVA_Build 3 175820911 17D AGTTTATGTG TGTTTTTTGTTTTGTTT/----------------- TGTTTTTTTC 3070 hom 166 het 58 0 56 5 TGTTTTTTGTTTTGTTT 1 0 178491 CASAVA_Build 3 175824137 1I TGTATTTATT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 9 178492 CASAVA_Build 3 175824671 1D TTATACACTG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 8 7 178493 CASAVA_Build 3 175826573 3D TAACTATAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 15 8 T 18 15 178494 CASAVA_Build 3 175842246 1D TTTTCAGAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 9 8 178495 CASAVA_Build 3 175843234 26D GAAAAAAAAC ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 3070 het 259 hom 15 2 11 4 AT 20 7 178496 CASAVA_Build 3 175847098 2I TTTAGATAAC --/AG AGTGATATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AG 1 2 178497 CASAVA_Build 3 175866938 3D TATAATTTTT AAG/--- AAGTCAATTT 3070 hom 54 het 22 0 19 7 AAG 2 1 178498 CASAVA_Build 3 175868914 1I GAGGTCTTTT -/A TTTTATTATA 3070 hom 93 het 34 0 32 6 A 0 1 178499 CASAVA_Build 3 175869751 1I TGATGGGGTT -/G TTTTTTTCTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 0 1 178500 CASAVA_Build 3 175870613 1D TTTCTAACAG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 8 7 178501 CASAVA_Build 3 175870707 4D TTAGGTACCT TTTA/---- TTTCTTTTTT 3070 hom 105 het 37 0 35 3 TTTA 1 0 178502 CASAVA_Build 3 175872955 1I GATAAAAATT -/C CTGACCTTCT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 1 2 178503 CASAVA_Build 3 175873405 10D TTGTACACAG TGGCTTGTAC/---------- AGTGAAAGGG 3070 hom 96 het 34 0 31 7 TGGCTTGTAC 1 0 178504 CASAVA_Build 3 175874430 1D ATGTATTAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 9 8 178505 CASAVA_Build 3 175876903 1I CTTTATATTA -/T TTAGGTCATA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 2 3 178506 CASAVA_Build 3 175880582 1D TATTTTGTAT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 8 7 178507 CASAVA_Build 3 175886149 11D TTATCCATTT ACTTTTATTTA/----------- ACTTTTATTA 3070 hom 96 het 33 0 33 4 ACTTTTATTTA 1 0 178508 CASAVA_Build 3 175888961 2D AACCTATCTC AT/-- ATAGTTGTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AT 2 1 178509 CASAVA_Build 3 175889203 1I GGAGTTAAAT -/A AAAATAGCAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 4 5 178510 CASAVA_Build 3 175889882 4I CCGCTTCACC ----/TTTT TTTTTTTTAC 3070 hom 48 het 19 0 14 5 T 8 12 178511 CASAVA_Build 3 175890455 1D TTGATCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 11 10 178512 CASAVA_Build 3 175891922 2I TAAAACCCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 10 12 178513 CASAVA_Build 3 175897078 3D GTAGTTATCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 24 21 178514 CASAVA_Build 3 175897604 1D ACTTTGCAGT A/- AAAAAATACG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 7 6 178515 CASAVA_Build 3 175902161 1D TGTCACTATA G/- ATAAGAATTT 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 G 1 0 178516 CASAVA_Build 3 175916818 1I CATTGTATTT -/G TTTGCTTATT 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 G 0 1 178517 CASAVA_Build 3 175916908 3D GGTTCCAAAT ATG/--- ATAATATGCA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 ATG 1 0 178518 CASAVA_Build 3 175921588 5I TAATAATAAA -----/ATAAG ATGAGTACCC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 ATAAG 0 1 178519 CASAVA_Build 3 175927745 5D AATGGAAGCC TGAAT/----- TGAATTCCAC 3070 hom 66 het 26 0 21 5 TGAAT 2 1 178520 CASAVA_Build 3 175949989 1D AGTAGTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 A 12 11 178521 CASAVA_Build 3 175954753 1D TTTTAAAAAT G/- CATATCAGGA 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 G 1 0 178522 CASAVA_Build 3 175957438 5D ATAGACAAAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 10 AAAAC 5 4 178523 CASAVA_Build 3 175964314 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 A 13 12 178524 CASAVA_Build 3 175964649 3I TGGATTAAAC ---/ATG ATTATTCACT 3070 het 3070 hom 53 24 23 6 ATG 0 1 178525 CASAVA_Build 3 175970171 2I18M1D TCTATATTCT --GTTTTCTCCAGTAACATAT/CAGTTTTCTCCAGTAACATA- TTTTTTTCTT 3070 het 2633 hom 18 6 11 4 N/A 0 0 178526 CASAVA_Build 3 175970469 1D TACAATATAT A/- ATATTAGATG 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 2 1 178527 CASAVA_Build 3 175971332 1D TCGGTCTAAC A/- AAAAAAAAAA 2203 het 2203 ref 23 13 6 5 A 12 11 178528 CASAVA_Build 3 175972489 1I ATCAGACACA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 16 7 T 8 9 178529 CASAVA_Build 3 175974357 2D TGAAGTGATG GA/-- GAGTGAGAGA 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 GA 2 1 178530 CASAVA_Build 3 175976087 6I AAACCAATGG ------/TAAACA CTTGTTAAAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 TAAACA 0 1 178531 CASAVA_Build 3 175978934 1I3M3I GGGCTACTCT -GCA---/AGTAAAT CCAGGTTTGG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 N/A 0 0 178532 CASAVA_Build 3 175980410 1I AGCTTTGTTC -/T TTTTGCTTAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 4 5 178533 CASAVA_Build 3 175986972 1I TGAAAAGGAG -/A AAAAAAAAGA 1846 het 1846 ref 15 6 4 5 A 8 9 178534 CASAVA_Build 3 175987087 4D TGAGATTTTT TTTG/---- TTTATCTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 TTTG 1 0 178535 CASAVA_Build 3 175987527 8D AATATAATAA ATTATTAT/-------- ATTATTATAT 3070 het 1867 hom 21 5 15 2 ATTATTAT 2 1 178536 CASAVA_Build 3 175991133 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 27 1 21 6 A 13 12 178537 CASAVA_Build 3 176002268 2D TTTTAATATG AT/-- ATATATATTC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AT 5 4 178538 CASAVA_Build 3 176010135 1I ATGGACTGAC -/T TTTTTTTTTA 3040 het 3040 ref 22 12 8 2 T 9 10 178539 CASAVA_Build 3 176013835 18I AAAGTGGACC ------------------/TGGGCCATGTGTGGCCCA TGGGCCATGG 3070 het 3070 hom 38 17 14 9 TGGGCCATGTGTGGCCCA 0 1 178540 CASAVA_Build 3 176019877 1D ATTTACTTTC T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 7 178541 CASAVA_Build 3 176086807 1I TCTTTTTATA -/T TTTTTTCTGC 1987 het 1824 hom 14 5 5 4 T 6 7 178542 CASAVA_Build 3 176093800 1I TTCAACCCCC -/A CCCCGCAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 A 0 1 178543 CASAVA_Build 3 176142249 1D CTTCTTTATG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 87 hom 32 1 29 2 T 9 8 178544 CASAVA_Build 3 176162473 1I GGCATGTCAC -/T TTCTGATATT 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 T 2 3 178545 CASAVA_Build 3 176164520 2I ATCTTTTGGG --/AA AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 10 178546 CASAVA_Build 3 176181306 5D ATTGATTTAG TATGA/----- TATATGTCTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 TATGA 1 0 178547 CASAVA_Build 3 176227140 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 A 12 11 178548 CASAVA_Build 3 176246497 1D AGACTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 11 10 178549 CASAVA_Build 3 176250840 1I TCTGCCTCCT -/G GGGTTCAAAC 3070 het 934 hom 20 3 12 5 G 3 4 178550 CASAVA_Build 3 176253163 2D TGTTCTTTTA AT/-- ATTTTGCAAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 AT 2 1 178551 CASAVA_Build 3 176262589 5I GAAAGAGATG -----/GTGTT GTGTTAACTT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 GTGTT 1 2 178552 CASAVA_Build 3 176264732 2D GGAAAAGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 13 11 178553 CASAVA_Build 3 176265006 2I AGTCTGAAAG --/GA GAGAGTTAGG 3070 het 3070 hom 48 15 21 12 GA 2 3 178554 CASAVA_Build 3 176270793 4D TCGAACATAG AATT/---- ATTAGACCTT 1859 het 1859 ref 34 18 5 12 AATT 1 0 178555 CASAVA_Build 3 176272270 1I AAAGGATATT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 7 8 178556 CASAVA_Build 3 176272855 3D ATAAATGCTA GTT/--- GTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 38 24 14 1 GTT 2 1 178557 CASAVA_Build 3 176275416 2I AGGAGGAGGA --/AG AGAGTAGAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 AG 2 3 178558 CASAVA_Build 3 176289509 1I ACAGCAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 13 7 A 10 11 178559 CASAVA_Build 3 176291051 2I TCACCAATGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 38 1 28 9 T 14 16 178560 CASAVA_Build 3 176291349 6I ACAAATAATT ------/ATTGTC ATTTCTTTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ATTGTC 0 1 178561 CASAVA_Build 3 176291458 1I CCACAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 35 1 29 5 A 10 11 178562 CASAVA_Build 3 176293018 1I AGAGATTATA -/T TTTTACATAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 4 5 178563 CASAVA_Build 3 176293895 4D GTTCATTTTA TTTT/---- TTTATATATA 247 hom 10 het 8 0 3 5 T 7 3 178564 CASAVA_Build 3 176294609 1I CAATGTTTTT -/C TAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 36 1 32 3 C 0 1 178565 CASAVA_Build 3 176299378 1D CAATTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 T 13 12 178566 CASAVA_Build 3 176303193 1I TATCATTGAT -/A ACAACTAAGC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 178567 CASAVA_Build 3 176305976 2D TATGTATGTA TG/-- TGTGTGTATA 2722 het 956 hom 10 3 7 0 TG 4 3 178568 CASAVA_Build 3 176306058 2I ATATATTCAT --/AC ACACACACAC 1194 het 1194 ref 9 6 3 0 AC 5 6 178569 CASAVA_Build 3 176306244 1I AGATAGAAGA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 7 8 178570 CASAVA_Build 3 176306714 4D ATCAGGACTA AGTT/---- AGAGTGTTAA 3070 het 3070 ref 51 26 25 2 AGTT 1 0 178571 CASAVA_Build 3 176307400 1I TTATGCAAAA -/T GTATCGAATC 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 T 0 1 178572 CASAVA_Build 3 176308443 1D TCTTATCTAT A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 A 8 7 178573 CASAVA_Build 3 176308665 2D TATATACACA AT/-- GTCATAATAT 3070 het 3070 ref 30 12 13 6 AT 1 0 178574 CASAVA_Build 3 176318604 1I TGTCGTAGGG -/T TGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 1 2 178575 CASAVA_Build 3 176319544 1D CATTTATACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 T 11 10 178576 CASAVA_Build 3 176320446 1D CAAGGGTGAG A/- GGGGAAAGGC 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 A 1 0 178577 CASAVA_Build 3 176320552 1D GGATTTTGAT G/- GTATTTAGAT 877 het 877 ref 44 19 5 22 G 2 1 178578 CASAVA_Build 3 176327341 1D TCAAGCTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2132 hom 28 8 10 10 T 17 16 178579 CASAVA_Build 3 176328155 6I CTGACTATAC ------/TTAAAT TTAATAATTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 TTAAAT 0 1 178580 CASAVA_Build 3 176328953 1D TTTTTTTCTC T/- TTTGTGTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 4 3 178581 CASAVA_Build 3 176329590 2D GCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2380 het 2380 ref 26 11 6 10 T 13 11 178582 CASAVA_Build 3 176330685 5D ATAACTTTTG TATAT/----- TATAACTTCT 3070 het 3070 hom 42 20 21 3 TATAT 1 0 178583 CASAVA_Build 3 176335917 2I ACACAAAAAC --/AT ATAAACACAG 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 AT 1 2 178584 CASAVA_Build 3 176337114 1I CAAAATCCAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 114 hom 45 1 38 6 T 9 10 178585 CASAVA_Build 3 176340173 2D CAGTTGAAAC AA/-- AGAGTAGGTG 3070 het 2963 hom 25 7 16 3 A 3 1 178586 CASAVA_Build 3 176346168 1I CTTCTGTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 9 10 178587 CASAVA_Build 3 176346359 4I TGAAATGTAC ----/TCTT TCTTTTGACA 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 TCTT 1 2 178588 CASAVA_Build 3 176348075 1D GTTTATTTTT G/- GGGGGGGTAT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 G 8 7 178589 CASAVA_Build 3 176367052 1I ACACCACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 T 10 11 178590 CASAVA_Build 3 176368527 1I ACTATTACAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 8 9 178591 CASAVA_Build 3 176368647 1I AAGTTACATT -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 6 7 178592 CASAVA_Build 3 176372744 2I ATGTATCTTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 AT 6 7 178593 CASAVA_Build 3 176374451 1D TCAGTTTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 10 9 178594 CASAVA_Build 3 176375272 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATGTG 3070 het 2789 hom 22 9 11 2 TA 4 3 178595 CASAVA_Build 3 176381180 3I TATTATCATA ---/ATC ATCATAAATA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 ATC 1 2 178596 CASAVA_Build 3 176383105 1I AGGTCTCAAA -/C TTTTGACCTC 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 C 0 1 178597 CASAVA_Build 3 176383538 1I AACTTTAAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 T 8 9 178598 CASAVA_Build 3 176383735 1I TTCCTAAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 T 9 10 178599 CASAVA_Build 3 176384477 1D ATTTTTCAAG C/- CCTTCAGCTT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 C 3 2 178600 CASAVA_Build 3 176392486 4D TCCATTCTAA AAAT/---- AAAGCCTGAA 3070 het 3070 hom 43 19 23 3 AAAT 1 0 178601 CASAVA_Build 3 176400240 4D CCAGGAAAAC TGAT/---- TGATTTGCTG 3070 het 2931 hom 23 8 12 3 TGAT 2 1 178602 CASAVA_Build 3 176404102 2D CCTCATGCTG CT/-- CTGTCCTGAA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 CT 2 1 178603 CASAVA_Build 3 176404197 3D TAACCAAGAA AAG/--- AAGAGAGCAA 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 AAG 2 1 178604 CASAVA_Build 3 176405170 1D ATTGTTTACC T/- TGAAAACCCC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 2 1 178605 CASAVA_Build 3 176415093 1I CAGAAAACCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 T 7 8 178606 CASAVA_Build 3 176420624 4D40M4I TATTTTATTT GTAAGTGTTACAAGTATATTTATAAAGGATATTTGATGATAATT----/----GTGTTACAAGTATATTTATAAAGGATATTTGATGATAATTTTTC TTTCTTGTAA 3070 het 3070 ref 12 12 12 1 N/A 0 0 178607 CASAVA_Build 3 176420798 4I TATGTAAAAC ----/AATT AATCTAGAGG 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 AATT 0 1 178608 CASAVA_Build 3 176431773 3D ATATTAGAGA TCT/--- TCTTCTTCAT 3070 het 3070 hom 26 9 15 3 TCT 3 2 178609 CASAVA_Build 3 176433392 1I TTAAAAAAAA -/G ACTTTCTCAG 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 G 0 1 178610 CASAVA_Build 3 176435547 2D ATACACTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 52 hom 27 3 21 4 T 14 12 178611 CASAVA_Build 3 176439685 1I GTAAAAGGGT -/C CTAAGGAGAG 3070 hom 132 het 53 0 45 8 C 1 2 178612 CASAVA_Build 3 176448065 1D GCTAGTCGCT G/- GTAGTTGTGC 3070 hom 69 het 32 0 24 8 G 2 1 178613 CASAVA_Build 3 176455634 4I TGGGCAACAG ----/ATAA ATAAATAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 ATAA 2 3 178614 CASAVA_Build 3 176457855 1I CCTATGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 7 15 3 T 10 11 178615 CASAVA_Build 3 176466456 5I AACACTATTG -----/GGATA GGTTTATAGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 GGATA 0 1 178616 CASAVA_Build 3 176467518 1I TAAAACTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 33 1 26 6 A 12 13 178617 CASAVA_Build 3 176469611 1D CAGTAGAGAC G/- GGATTTCACC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 G 3 2 178618 CASAVA_Build 3 176476675 4D AAACAGAATT AATC/---- AATCCATTTC 3070 het 3070 ref 28 13 14 2 AATC 2 1 178619 CASAVA_Build 3 176480517 1D ACTCCACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 11 10 178620 CASAVA_Build 3 176484285 1D CACCACATTG A/- AAATAGTTCT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 A 4 3 178621 CASAVA_Build 3 176484459 1I TATAAACAGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 178622 CASAVA_Build 3 176489623 1I CAATAATTAG -/C AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 C 0 1 178623 CASAVA_Build 3 176490086 1D CCCTCCCCCC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 7 6 178624 CASAVA_Build 3 176494846 1I CTGTGTATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 10 11 178625 CASAVA_Build 3 176496576 64I TTAGTGAGTC ----------------------------------------------------------------/CTTCCACATTGTCTCATAAAAATCTGAGTCGTATATTCATCAATGCTTTGACTATGATATTAAA TCTGCTACAA 3012 het 3012 ref 32 21 7 4 CTTCCACATTGTCTCATAAAAATCTGAGTCGTATATTCATCAATGCTTTGACTATGATATTAAA 0 1 178626 CASAVA_Build 3 176502528 3I TGATGCAGAA ---/AGC AGCAGTAATC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 AGC 1 2 178627 CASAVA_Build 3 176503309 2I23M4D CTGTCGAAAC --GTGTGTGTATATATGTGTGTGTATGTG/ATGTGTGTGTATATATGTGTGTGTA---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 22 15 6 N/A 0 0 178628 CASAVA_Build 3 176512062 12D ACAGGAAATG CTCCCTTCCCTC/------------ CTCCCTTACC 3070 het 3070 ref 50 30 14 9 CTCCCTTCCCTC 1 0 178629 CASAVA_Build 3 176535119 1I TTTGTTGGAG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 7 8 178630 CASAVA_Build 3 176547479 1I CAAGTATTAC -/T TGTTAACATT 3070 het 3070 hom 50 18 23 9 T 1 2 178631 CASAVA_Build 3 176550539 2I GGCTTGATTG --/AA AAAAAAAAAA 1934 het 1934 ref 31 15 7 9 A 13 15 178632 CASAVA_Build 3 176551951 1I TTCCAAATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 9 10 178633 CASAVA_Build 3 176579675 1D TTCCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1234 het 1234 ref 37 24 5 9 T 15 14 178634 CASAVA_Build 3 176586709 1I ATAGATCATC -/T TTTTTTTTTT 2585 het 2585 ref 28 13 11 4 T 11 12 178635 CASAVA_Build 3 176606205 3I TCTTGAACAC ---/CTT CTATGTTCCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CTT 0 1 178636 CASAVA_Build 3 176611084 1I AGTCTAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 9 10 178637 CASAVA_Build 3 176611972 1I GTTATGGGGG -/A AAAAATGAAG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 5 6 178638 CASAVA_Build 3 176615007 2D TCTTTCAATA AT/-- ATTGAATATT 3070 hom 105 het 37 0 35 3 AT 2 1 178639 CASAVA_Build 3 176618697 1I AAAGATTACA -/T TTGTTTCTGT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 2 3 178640 CASAVA_Build 3 176623151 1I CTGCAGAGAC -/A AAAAAATAAC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 6 7 178641 CASAVA_Build 3 176623651 1D AAGAAAGGGA G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 G 8 7 178642 CASAVA_Build 3 176627201 7D AATAAACATG TATTTAT/------- TATTTTTGCC 3070 hom 108 het 46 0 37 10 TATTTAT 1 0 178643 CASAVA_Build 3 176628289 5D AGTAATTCAA TTTAC/----- TTTCATCCAT 3070 hom 117 het 42 0 40 4 TTTAC 1 0 178644 CASAVA_Build 3 176639987 1D CCAACATCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 9 8 178645 CASAVA_Build 3 176642782 2I ACATATAAAG --/TA TATATATATA 3070 hom 60 het 32 0 28 4 TA 7 8 178646 CASAVA_Build 3 176644337 1D CAAGCATTGC A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 127 het 49 0 43 6 A 8 7 178647 CASAVA_Build 3 176651181 1I CTTGAGTCAA -/C CCAGAATCTA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 2 3 178648 CASAVA_Build 3 176652711 2I TGTCTTCAGA --/TT TTCTCTCTCT 3070 het 367 hom 36 1 31 4 T 2 4 178649 CASAVA_Build 3 176658965 8D TCATGGTTTT ATATATAA/-------- ATATATAAAT 3070 hom 36 het 18 0 13 6 ATATATAA 2 1 178650 CASAVA_Build 3 176671984 2D AGAAAGAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 56 het 24 0 20 6 A 11 9 178651 CASAVA_Build 3 176672101 1D AGATAGATCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 10 9 178652 CASAVA_Build 3 176673877 1I ATAGAAAATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 8 9 178653 CASAVA_Build 3 176675214 1D TTCAGGACTG C/- TTTTCCCTAC 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 C 1 0 178654 CASAVA_Build 3 176677288 2I TATAAAAACA --/AT ACACGTCTGA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 AT 0 1 178655 CASAVA_Build 3 176678282 3D TCAAGGGTTT TTG/--- TTGTTGTTGC 3070 het 3070 ref 48 26 12 11 TTG 4 3 178656 CASAVA_Build 3 176680784 2D ATGTTTACAA CT/-- CTTTTCTGAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 CT 2 1 178657 CASAVA_Build 3 176682547 1D TACTATTGGG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 A 8 7 178658 CASAVA_Build 3 176682888 1D TCATCAAAAG C/- TTTTTAAGTA 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 C 1 0 178659 CASAVA_Build 3 176703156 4D AATTCGTTAT AATA/---- AATGTCTCTC 3070 het 3070 ref 38 19 15 7 AATA 1 0 178660 CASAVA_Build 3 176703409 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 11 10 178661 CASAVA_Build 3 176704186 1D TTTTCACATG C/- TTGTTGGCTA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 C 1 0 178662 CASAVA_Build 3 176710323 8D TTTTTCTTTT TTTTCTTA/-------- TTTTATTTTA 1109 het 1109 ref 14 7 5 2 TTTTCTTA 1 0 178663 CASAVA_Build 3 176716043 1D AATTTTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 21 19 8 A 13 12 178664 CASAVA_Build 3 176735136 1D TATTGTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2626 hom 32 9 12 12 T 12 11 178665 CASAVA_Build 3 176740108 3I AGTTGTTGTC ---/GTT GTTGTTCTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GTT 2 3 178666 CASAVA_Build 3 176748297 1D CAACATCACT G/- ATCATTAGAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 1 0 178667 CASAVA_Build 3 176749638 2I TTTTCCCTTG --/CA CATTGTTTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CA 1 2 178668 CASAVA_Build 3 176752652 4D ACCAAATGTC TAAG/---- TAAGCATCAA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 TAAG 2 1 178669 CASAVA_Build 3 176757991 1D TTTCTAACTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 60 het 26 0 21 6 T 8 7 178670 CASAVA_Build 3 176759912 1I ATGCCCTTTA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 8 178671 CASAVA_Build 3 176763273 1D AAACCCAATT A/- AAAAAAGTCT 3070 hom 104 het 40 0 35 5 A 7 6 178672 CASAVA_Build 3 176766121 1I AAAGTGGCAA -/T TTTCTCTTAT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 T 3 4 178673 CASAVA_Build 3 176767098 1D ATTTCTCACA G/- TCCTTCAAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 0 178674 CASAVA_Build 3 176770397 2I TATATGAATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 32 0 24 8 TG 8 9 178675 CASAVA_Build 3 176788570 1D ACCTTGGGGT A/- AAAAAAAAAA 1672 het 1672 ref 48 25 6 18 A 15 14 178676 CASAVA_Build 3 176789792 15I TTGGTACTGG ---------------/TAATTTAACATTCGT TAAATAAATG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TAATTTAACATTCGT 0 1 178677 CASAVA_Build 3 176790694 40D ACTCCGTCTA ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 33 het 10 0 12 0 AT 28 8 178678 CASAVA_Build 3 176791510 1I ATGATTAACC -/T TGTAAGGCAA 3070 hom 92 het 41 0 30 11 T 1 2 178679 CASAVA_Build 3 176792779 13D TATTCTTTTC TTTTTCTTTTCTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 3 TTTTTCTTTTCTT 1 0 178680 CASAVA_Build 3 176794255 1D GCCCACTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 92 het 35 0 30 5 A 10 9 178681 CASAVA_Build 3 176794464 1D GTTGCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 30 0 25 5 T 13 12 178682 CASAVA_Build 3 176802941 2I TGTGTGTATC --/TA TATATATATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TA 5 6 178683 CASAVA_Build 3 176805862 1D TATTCCCATT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 7 178684 CASAVA_Build 3 176809438 2I ACCATAAAAC --/AT ATACCAAAGA 3070 hom 75 het 37 0 26 11 AT 1 2 178685 CASAVA_Build 3 176820557 1I CTCTTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 19 1 12 6 A 13 14 178686 CASAVA_Build 3 176823772 32D TTTTATTTGT GCCTTACCTAAAGGTTCTTTTATAAATGTAAA/-------------------------------- ATACTTCCAT 3070 hom 87 het 26 0 30 3 GCCTTACCTAAAGGTTCTTTTATAAATGTAAA 1 0 178687 CASAVA_Build 3 176824428 1I GGTGTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 36 1 29 6 A 10 11 178688 CASAVA_Build 3 176828063 8D GACCCATAAC TGTCTGTA/-------- TGATCATTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TGTCTGTA 1 0 178689 CASAVA_Build 3 176828447 1D TTAGTTGCAG A/- AAAAAAAGGC 3070 het 13 hom 47 2 34 11 A 8 7 178690 CASAVA_Build 3 176831933 1D CCTGTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 1409 het 1409 ref 33 23 5 5 T 15 14 178691 CASAVA_Build 3 176837179 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1734 het 849 hom 19 8 5 7 A 18 17 178692 CASAVA_Build 3 176904954 4D ATTTTTTGAC AGAT/---- AGTCTTTTGC 3070 het 3070 ref 32 17 10 7 AGAT 1 0 178693 CASAVA_Build 3 176906037 1D AAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 2988 het 2988 ref 26 11 7 8 A 12 11 178694 CASAVA_Build 3 176909087 1D CTAGGATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 7 A 11 10 178695 CASAVA_Build 3 176909469 1I TGCTGTACTT -/C TACAACAGCT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 C 0 1 178696 CASAVA_Build 3 176910132 1I TATTTGAAAC -/T TATGGCAGTT 3070 het 3070 hom 45 21 18 6 T 1 2 178697 CASAVA_Build 3 176911068 2I ACGTATTCAG --/AT ATATATATAT 3070 het 2976 hom 22 7 8 7 AT 6 7 178698 CASAVA_Build 3 176912319 1I TTCAGTTTTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 7 8 178699 CASAVA_Build 3 176919704 1D TGGGGGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 A 12 11 178700 CASAVA_Build 3 176930261 1I29M1I TTTTTTTTTT -TTTTTTCACATGCCACAGTGACATCCCAG-/GTTTTTTCACATGCCACAGTGACATCCCAGT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 14 8 9 N/A 0 0 178701 CASAVA_Build 3 176934254 1D TGAGGTCTCA G/- GTATTGGGTA 3070 het 3070 hom 28 10 14 5 G 2 1 178702 CASAVA_Build 3 176939707 1I ATGCTAAAAT -/C CAATTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 C 1 2 178703 CASAVA_Build 3 176945438 1I AATTGCAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 11 12 178704 CASAVA_Build 3 176946848 2D ATGTAATATG TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 2657 hom 31 8 14 9 T 10 8 178705 CASAVA_Build 3 176965104 4I AACCAAGAAT ----/AAAC AAAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 AAAC 0 1 178706 CASAVA_Build 3 176970209 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 44 17 16 11 TG 6 7 178707 CASAVA_Build 3 176989761 2D ACTGTAAAAT TC/-- TTTCTAAATT 3070 hom 99 het 35 0 33 3 TC 1 0 178708 CASAVA_Build 3 176998788 3I GTTTTTTTAA ---/ATG ATGATGATGA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 ATG 3 4 178709 CASAVA_Build 3 176999725 3D CAAAACTGTA AAT/--- ATTATGAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 AAT 1 0 178710 CASAVA_Build 3 177002632 1I GTGTATTAAT -/A TTTCTAAAGT 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 A 0 1 178711 CASAVA_Build 3 177003135 5I TGGTATAATT -----/TAAGA TATTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 TAAGA 0 1 178712 CASAVA_Build 3 177004330 3I22M3D AGCTACATAG ---AGCAATTTAAATGCAAATTTTTTTC/GAAAAAAATTTGCATTTAAATTGCT--- CTAACAACTT 3070 het 3070 ref 39 26 19 2 N/A 0 0 178713 CASAVA_Build 3 177011206 5D TGTCCTTGCC TTCCA/----- TTCTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 TTCCA 1 0 178714 CASAVA_Build 3 177014599 1I CTAGACATGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 54 16 26 12 A 8 9 178715 CASAVA_Build 3 177017825 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2458 hom 32 7 17 8 A 11 10 178716 CASAVA_Build 3 177039872 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 A 8 9 178717 CASAVA_Build 3 177066575 1D GTATATTTTA G/- GAAAAGATGC 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 G 2 1 178718 CASAVA_Build 3 177069274 1D GAACTTAAAC A/- AAATCTGGAA 3070 het 3070 ref 48 24 23 1 A 4 3 178719 CASAVA_Build 3 177071585 1I GATGATGAGC -/T TTTTTTCATA 1820 het 476 hom 8 2 6 0 T 6 7 178720 CASAVA_Build 3 177078531 2I TTTGTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 TC 6 7 178721 CASAVA_Build 3 177083602 1D AGTTGTGTGG T/- TTTTGAGTGA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 5 4 178722 CASAVA_Build 3 177103479 1I GAAAACTAAC -/A AACAGAAAGG 2898 hom 15 het 6 0 6 0 A 2 3 178723 CASAVA_Build 3 177116682 1I TACATGGCTT -/G GGGGGGGCCT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 G 7 8 178724 CASAVA_Build 3 177118552 5I TTAAAAATAA -----/TTTAC TTTATTCATG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 TTTAC 0 1 178725 CASAVA_Build 3 177122127 1D CTTAAGTGCT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 29 21 8 0 A 8 7 178726 CASAVA_Build 3 177123979 1I TTATTCTATC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 8 9 178727 CASAVA_Build 3 177127413 1I CTTAAACTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 7 8 178728 CASAVA_Build 3 177128747 3D GCAAAGGCTT GAG/--- GAGGAACATA 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 GAG 2 1 178729 CASAVA_Build 3 177130646 1D TCATCTGAGA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 T 8 7 178730 CASAVA_Build 3 177132385 1I AAAATAGGTC -/T TACATGAACT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 1 2 178731 CASAVA_Build 3 177139479 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAAAGA 3070 het 2986 hom 32 9 18 5 A 0 1 178732 CASAVA_Build 3 177139803 4I GTAAAAAGAT ----/AAAG AAACACACAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AAAG 0 1 178733 CASAVA_Build 3 177143123 1I AACTAGATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 9 10 178734 CASAVA_Build 3 177143486 4I42M40D TAAGACAGTT ----AAACGAGGAAGAGAAAGAAATGAAATGGCAACGTAAAAGAACTTCACCAAACCACAAAGATAAACAGCAAAAAAAAAAAAAA/AAACAAACGAGGAAGAGAAAGAAATGAAATGGCAATGTAAAAGAAC---------------------------------------- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 34 19 6 N/A 0 0 178735 CASAVA_Build 3 177146408 3D CCCTGCCTCC ATA/--- ATAATATAAA 3070 het 3070 ref 25 18 7 0 ATA 3 2 178736 CASAVA_Build 3 177150170 3D TTTTATGTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 11 8 4 T 14 11 178737 CASAVA_Build 3 177164918 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1708 het 1324 hom 21 6 9 6 T 14 13 178738 CASAVA_Build 3 177167456 1I TAGAAAATGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 9 10 178739 CASAVA_Build 3 177172571 1D ACGTTCACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 10 9 178740 CASAVA_Build 3 177175446 17D GTATTTAGTT AGTTCCTTAATGGTGTA/----------------- AGTTCCTTAA 3070 het 3070 ref 28 19 7 7 AGTTCCTTAATGGTGTA 1 0 178741 CASAVA_Build 3 177179416 4I ACATATGAGT ----/CTGA CTAATAATGT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 CTGA 0 1 178742 CASAVA_Build 3 177181123 1D CAAAGTACTT A/- AAAAATCCTT 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 A 6 5 178743 CASAVA_Build 3 177184105 1I TTTTTAATGA -/T AGCCATTCTG 3070 het 3070 ref 48 27 18 3 T 0 1 178744 CASAVA_Build 3 177199154 1I CCAGTATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 T 10 11 178745 CASAVA_Build 3 177201164 4D CTTCTATTAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 31 9 12 12 AC 11 9 178746 CASAVA_Build 3 177211282 1D AAAATAAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 10 9 178747 CASAVA_Build 3 177214254 6I AAATTATAAA ------/ATAAAT ATAAAATATC 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 ATAAAT 0 1 178748 CASAVA_Build 3 177227389 4D CATTGCTAAT TTTA/---- TTTGTTATAT 3070 het 3070 ref 21 12 8 3 TTTA 1 0 178749 CASAVA_Build 3 177235398 1I TTCACATCTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 T 7 8 178750 CASAVA_Build 3 177252954 1D GCAGTAGAAA C/- GTTTGCTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 C 1 0 178751 CASAVA_Build 3 177254852 5D32M4I ATGCATAATC AAAGAAAAGTGTGATTATGCTTAATTTATAACCTATG----/-----AAAGTGTGATTATGCTTAATTTATAACCTATGAATT AATAGATATT 3070 het 3070 ref 34 21 18 5 N/A 0 0 178752 CASAVA_Build 3 177272159 2D TGTATGTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 50 18 16 16 TG 10 9 178753 CASAVA_Build 3 177272911 6D AATTAGACTT TATCTC/------ TATATGATAT 3070 het 3070 ref 41 25 15 5 TATCTC 1 0 178754 CASAVA_Build 3 177277306 4D AAAGGATAAC TTTA/---- TTTATCAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 18 4 TTTA 2 1 178755 CASAVA_Build 3 177292840 1I ATGATTTTGA -/T ACCTTTCATG 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 0 1 178756 CASAVA_Build 3 177294066 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 2884 het 1973 hom 21 7 6 8 A 12 11 178757 CASAVA_Build 3 177296759 10I ATCTATTGGA ----------/CACATTTGAT CTTTATATCA 2361 het 2361 ref 27 16 6 5 CACATTTGAT 0 1 178758 CASAVA_Build 3 177300760 1I CACCAGTTAT -/C ATGTTTGAGC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 0 1 178759 CASAVA_Build 3 177302276 1D TCACACACAT A/- AAAAAATAAA 3070 het 2283 hom 25 7 12 7 A 7 6 178760 CASAVA_Build 3 177305330 1I TAAAAAGGTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 7 8 178761 CASAVA_Build 3 177307525 1I TACAACAGAG -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 T 7 8 178762 CASAVA_Build 3 177328428 1D AATTTTAATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 8 7 178763 CASAVA_Build 3 177331075 1D AGGTTGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 11 10 178764 CASAVA_Build 3 177332304 1I AAATAAAAAC -/A AAAAAATAGA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 6 7 178765 CASAVA_Build 3 177338503 5I GGCCATTTTA -----/ATAAT ATGTCTTCCA 2561 het 2561 ref 22 15 6 1 ATAAT 0 1 178766 CASAVA_Build 3 177340946 1I ATTTTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2442 hom 24 6 11 7 T 10 11 178767 CASAVA_Build 3 177342019 1I GTGTGTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 12 11 T 15 16 178768 CASAVA_Build 3 177351271 1D TAGCCAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1393 hom 29 5 12 12 T 17 16 178769 CASAVA_Build 3 177351642 1I TAGGATATTT -/A ACTCAACTAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 1 2 178770 CASAVA_Build 3 177358704 1I AACTCAGTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 421 hom 26 1 22 3 A 9 10 178771 CASAVA_Build 3 177371017 3D CCATACCTCA TGT/--- TGTTCATTAT 3070 het 3070 hom 40 16 19 7 TGT 2 1 178772 CASAVA_Build 3 177379863 3D GTAAATTAAT ACA/--- ACAACTACTA 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 ACA 2 1 178773 CASAVA_Build 3 177386517 1D GTTTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 25 0 19 7 T 13 12 178774 CASAVA_Build 3 177386839 1D CTAAGAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 12 11 178775 CASAVA_Build 3 177396387 1D GCTATGTCCC A/- AAAAAAAAAA 1575 het 1575 ref 17 8 4 6 A 15 14 178776 CASAVA_Build 3 177396909 1I GTGGAGGGTC -/A GTGTGACAGC 3070 het 3070 hom 53 22 21 10 A 0 1 178777 CASAVA_Build 3 177400767 2D GGATTATTTT TC/-- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 37 14 20 5 TC 1 0 178778 CASAVA_Build 3 177401322 4I CAATAGAGAC ----/TGTT TGTAAGCTCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TGTT 0 1 178779 CASAVA_Build 3 177409924 4I AAAATTAACC ----/TGTT TGACATTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TGTT 0 1 178780 CASAVA_Build 3 177417733 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1414 hom 18 8 10 0 A 15 14 178781 CASAVA_Build 3 177451052 1I CTTAGGTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 T 9 10 178782 CASAVA_Build 3 177483372 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 221 hom 28 5 19 4 T 14 13 178783 CASAVA_Build 3 177501738 2I AATTAATTTT --/AA GTCTTTATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 2 178784 CASAVA_Build 3 177501907 2I ATCTAATATT --/CA CACAGACATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CA 2 3 178785 CASAVA_Build 3 177509918 1I GTCTACATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 83 het 32 0 28 4 T 9 10 178786 CASAVA_Build 3 177528513 1D TTGCAACTTA C/- GACATTTATC 3070 het 3070 ref 37 22 9 6 C 1 0 178787 CASAVA_Build 3 177528735 1D TTTTCAGGGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 8 7 178788 CASAVA_Build 3 177533235 2D CTTAGAGCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2221 hom 23 8 11 4 A 15 13 178789 CASAVA_Build 3 177534789 2D CCATTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1218 hom 28 8 16 4 T 16 14 178790 CASAVA_Build 3 177539041 1D AGTATTCCTT A/- ACAGCAACAC 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 2 1 178791 CASAVA_Build 3 177541014 1I CCTGTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 10 11 178792 CASAVA_Build 3 177541536 3D GAATTCCTTC TTT/--- AATACATGTT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 T 3 0 178793 CASAVA_Build 3 177543227 1I TATATAGTCC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 7 8 178794 CASAVA_Build 3 177553015 5I AATAACTGTT -----/TTAAA TAATTGATCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 TTAAA 0 1 178795 CASAVA_Build 3 177557607 1I AGACTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2651 hom 35 9 14 12 A 13 14 178796 CASAVA_Build 3 177558607 5I TAAACTATTC -----/TAATT TAATTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 TAATT 1 2 178797 CASAVA_Build 3 177559199 1I TATATTTTAA -/T TTTTTTCGTC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 6 7 178798 CASAVA_Build 3 177559879 17I TGAAGCTGCC -----------------/AGAAACTGAGCCTAGTG CATCTAGTGG 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 AGAAACTGAGCCTAGTG 0 1 178799 CASAVA_Build 3 177563769 1I GTGGATAAAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 23 8 11 5 A 7 8 178800 CASAVA_Build 3 177563836 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 TA 6 7 178801 CASAVA_Build 3 177564369 2I AAAAAAAAAA --/AC AAACCTATGT 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 AC 0 1 178802 CASAVA_Build 3 177564459 1D AGAAAAAAAA T/- GTTCCTTGTC 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 T 1 0 178803 CASAVA_Build 3 177566115 4I TTCCCAAAAC ----/AAAG AGATAATAAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 AAAG 0 1 178804 CASAVA_Build 3 177567322 2D GTGATATAAT TA/-- TATATATATC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 TA 5 4 178805 CASAVA_Build 3 177569777 4D TCAAATAAGT GCAA/---- TTGAAAATCA 3070 het 3070 ref 41 23 15 6 GCAA 1 0 178806 CASAVA_Build 3 177570483 1I TGCGAATAAG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 6 7 178807 CASAVA_Build 3 177571859 2I GTAAGACTAC --/AG AGTTATTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 AG 1 2 178808 CASAVA_Build 3 177579068 1D ATATTTGTAC A/- ATTGGTTAAA 3070 het 3070 hom 46 21 20 6 A 2 1 178809 CASAVA_Build 3 177582288 4D GTAGGTAGAT AGAC/---- AGACAGACAG 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 AGAC 3 2 178810 CASAVA_Build 3 177585291 6I CAAAAAAAAA ------/ATAAAT AAAAAAAAAA 2838 het 294 hom 8 2 6 0 ATAAAT 0 1 178811 CASAVA_Build 3 177607503 1D GTTCTGGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 11 10 178812 CASAVA_Build 3 177618333 1D CTTCCCCAAC T/- TCTTGTTTAG 3070 het 3070 ref 52 25 23 5 T 2 1 178813 CASAVA_Build 3 177622571 1I TGTAAGGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 10 11 178814 CASAVA_Build 3 177626515 2I8M4D ATTTTTAAAC --ATGCTGCTTATC/ATATGCTGCT---- TATCTATATA 1411 het 1411 ref 13 10 3 2 N/A 0 0 178815 CASAVA_Build 3 177627889 1D TAGGCAGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 10 9 178816 CASAVA_Build 3 177630681 1D GTATGCATAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 45 21 20 5 T 9 8 178817 CASAVA_Build 3 177632324 4I TACAAATGAC ----/CACT CACTCAGGGA 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 CACT 1 2 178818 CASAVA_Build 3 177632596 1D AAGGAAACAG A/- GCACAAAGAG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 1 0 178819 CASAVA_Build 3 177636175 8D ATAGAGAGAC AATAGAAT/-------- ACTAATTTGC 3070 het 3070 hom 32 16 15 3 AATAGAAT 1 0 178820 CASAVA_Build 3 177637477 4I ATCCATAGAT ----/ATAG ATATAGACAG 2277 het 2277 ref 18 10 6 2 ATAG 0 1 178821 CASAVA_Build 3 177637566 4I GCCTTTCCTC ----/ATAG ATAGATAAAT 1920 het 1920 ref 15 6 5 4 ATAG 1 2 178822 CASAVA_Build 3 177641235 1I CTTGTAAGAC -/A TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 0 1 178823 CASAVA_Build 3 177642124 1I TATATCTGCT -/A AAAAAACTGC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 6 7 178824 CASAVA_Build 3 177671796 1D ATATTTTATC A/- AACAAAAATT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 A 3 2 178825 CASAVA_Build 3 177672823 4D AATTCACTAA TGAC/---- TAATGATGAC 3070 het 3070 ref 42 27 13 7 TGAC 1 0 178826 CASAVA_Build 3 177674148 2D GCTATCCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 13 11 178827 CASAVA_Build 3 177675105 3I TTGTAGGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 51 18 19 14 TTG 5 6 178828 CASAVA_Build 3 177709656 1I AGAAGGGGTA -/T TTCTTATTCA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 2 3 178829 CASAVA_Build 3 177757998 18D TCACCCTGGC TCTGTCACTGATCTGCCG/------------------ TCTATCACTG 3070 het 3070 hom 31 15 18 2 TCTGTCACTGATCTGCCG 1 0 178830 CASAVA_Build 3 177767973 1D TGGGAATTGC T/- TAATATTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 26 4 T 2 1 178831 CASAVA_Build 3 177784129 1I ATCTTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 38 2 26 10 A 13 14 178832 CASAVA_Build 3 177797659 1I TTCTCTTCTT -/C AGTCTACTCA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 C 0 1 178833 CASAVA_Build 3 177801413 4I AAATTAGGTA ----/AAAG AAAGAGTAGT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AAAG 1 2 178834 CASAVA_Build 3 177837775 1I TGAATTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 10 11 178835 CASAVA_Build 3 177850441 2D GTTTAAGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 88 het 45 0 35 11 AC 15 14 178836 CASAVA_Build 3 177858669 1D CAGTGAAGTG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 41 10 26 5 A 8 7 178837 CASAVA_Build 3 177861505 1D TCAGACCATC T/- ATGAAAACTG 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 T 1 0 178838 CASAVA_Build 3 177862524 1I ACTTCATAGT -/A AAAAAAAAAC 2816 het 2816 ref 21 12 6 3 A 9 10 178839 CASAVA_Build 3 177866990 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAGGG 2009 het 469 hom 10 2 6 2 A 8 7 178840 CASAVA_Build 3 177867705 1I TTGCAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 9 10 178841 CASAVA_Build 3 177868691 1I TACGATTTCC -/T TTATTTTGGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 3 178842 CASAVA_Build 3 177870011 1I GCCACAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 C 0 1 178843 CASAVA_Build 3 177870066 1D ATACAGCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 32 0 25 8 A 10 9 178844 CASAVA_Build 3 177872716 5D TAAAACACTA TAGTT/----- TAGCTTATTA 2872 het 2872 ref 25 18 7 3 TAGTT 1 0 178845 CASAVA_Build 3 177874220 4I TTCAGATAGG ----/TAGA TAGATGAACA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TAGA 1 2 178846 CASAVA_Build 3 177877940 1D ACAGAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 11 10 178847 CASAVA_Build 3 177882000 1D TGTCTGCCAT G/- TGAGGACACA 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 G 1 0 178848 CASAVA_Build 3 177883001 1D ATATCCTTTC T/- TTTTTTTTTC 488 het 488 ref 16 5 5 6 T 10 9 178849 CASAVA_Build 3 177885393 7D TAAAATAAGC CCAAGAA/------- CAGGCCAGAC 3070 het 3070 hom 39 17 21 4 CCAAGAA 1 0 178850 CASAVA_Build 3 177887248 2I CTCCCAAGTA --/GG GCTAGGATTA 3070 het 842 hom 13 3 9 3 G 1 3 178851 CASAVA_Build 3 177925588 1I TTCATACGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 9 10 178852 CASAVA_Build 3 177952804 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 2538 het 1763 hom 13 6 6 2 AG 7 6 178853 CASAVA_Build 3 177971912 1D TGTCAACTTG T/- GTGTGTGTGT 3070 het 875 hom 33 6 16 11 T 1 0 178854 CASAVA_Build 3 177974879 3D CATTTCTCAA AAG/--- AAGACATACA 3070 het 3070 ref 32 20 8 5 AAG 2 1 178855 CASAVA_Build 3 177978861 1I TCAACTCCAA -/T TTTTTTCATA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 T 6 7 178856 CASAVA_Build 3 177988402 3I ATTAATCATC ---/ATT GTTATCATTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATT 0 1 178857 CASAVA_Build 3 177994278 4D CAAGACCCTG GAGA/---- GAGAAACCAG 3070 het 3070 ref 46 24 18 7 GA 4 2 178858 CASAVA_Build 3 177995725 1D TGCAAAAAAA G/- TCGTGAGCTT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 G 1 0 178859 CASAVA_Build 3 177995921 2I CAGGTTCTGG --/AA ATACAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 1 3 178860 CASAVA_Build 3 177997752 2D ACACAAACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 14 17 5 AC 7 6 178861 CASAVA_Build 3 177998199 1I TTCTTTGTCC -/A AGAGAATGTG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 1 2 178862 CASAVA_Build 3 178002318 1I AGGCACAGAG -/T TGGCAAGCTG 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 1 2 178863 CASAVA_Build 3 178006080 1D GCCTACTTGA G/- GGGGGAGGAT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 G 6 5 178864 CASAVA_Build 3 178012471 4I ACTTTCTAGG ----/CTCA CTATTTCACT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CTCA 0 1 178865 CASAVA_Build 3 178015940 1D ATTGCAAGTG T/- TTTGGGTATA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 4 3 178866 CASAVA_Build 3 178016709 1I AAATATAAAA -/T AAAAATAAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 0 1 178867 CASAVA_Build 3 178017555 2D TCAGAACGAA AT/-- ATAAGCTTGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AT 2 1 178868 CASAVA_Build 3 178017889 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 16 14 178869 CASAVA_Build 3 178022652 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAATCC 2712 het 2712 ref 22 12 8 5 AAAG 2 1 178870 CASAVA_Build 3 178044601 1I AGGAGGAGGA -/G GGGGGAGGAG 3070 hom 68 het 26 0 19 7 G 5 6 178871 CASAVA_Build 3 178044886 2D GGAAATTGCA TT/-- TTTTTTCTTT 1007 het 279 hom 23 3 7 13 T 8 6 178872 CASAVA_Build 3 178047527 1I CATTGACTAT -/C TTAAAAAAAA 2304 het 2304 ref 22 9 8 5 C 0 1 178873 CASAVA_Build 3 178058491 1D ACAAGCAATC A/- AAAGGAACAA 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 A 4 3 178874 CASAVA_Build 3 178058951 4D CAGTTGTGGG CAGT/---- CACTCTTTTG 3070 hom 93 het 37 0 30 8 CAGT 1 0 178875 CASAVA_Build 3 178069702 11I ATACCCAGTG -----------/CTGTTCTGGCT CTTAGTCTGC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 CTGTTCTGGCT 0 1 178876 CASAVA_Build 3 178074018 1I CTAGCTTCAC -/G TAAGACACAG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 0 1 178877 CASAVA_Build 3 178076531 1D ATATTATTTC T/- TTTTTTTTTT 2954 het 13 hom 20 1 10 9 T 15 14 178878 CASAVA_Build 3 178077114 1I TATTTATATC -/T CTGGGTGCTC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 0 1 178879 CASAVA_Build 3 178080646 1I TAATTTCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 36 0 19 17 A 9 10 178880 CASAVA_Build 3 178081340 3D GTCTCAAATT AAC/--- AACCTAACAT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 AAC 2 1 178881 CASAVA_Build 3 178081545 2I AAAGGAGAAA --/AG AGAGAAGATC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AG 2 3 178882 CASAVA_Build 3 178081961 1D GACACACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 37 2 28 7 A 11 10 178883 CASAVA_Build 3 178083115 7I TGCTCTTCCT -------/ATAAAAC ATAAAACTAC 3070 het 3070 ref 46 28 15 3 ATAAAAC 1 2 178884 CASAVA_Build 3 178084307 3I ATACAAAGAG ---/AAC AACAGACACT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 AAC 1 2 178885 CASAVA_Build 3 178087404 3I ATCAAATGAC ---/CTT CTTCACAGAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 CTT 1 2 178886 CASAVA_Build 3 178090072 1I AAATCGAAGC -/A AAAAAAAAAA 2349 het 1598 hom 23 7 7 9 A 14 15 178887 CASAVA_Build 3 178095523 1D AAGCGTGGGA G/- GGGGTTGAGG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 G 5 4 178888 CASAVA_Build 3 178095828 1I ATACACCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 31 1 19 11 A 11 12 178889 CASAVA_Build 3 178097799 1I TCCAGGCTGT -/G AGTTCCCAGA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 G 0 1 178890 CASAVA_Build 3 178103885 1D AAAAATGTTT G/- GGGGGTATTG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 G 6 5 178891 CASAVA_Build 3 178115084 1D CCCTAACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 44 0 32 13 A 12 11 178892 CASAVA_Build 3 178118381 3I CATGAGGCTC ---/CTT CTCCCCAGCT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 CTT 0 1 178893 CASAVA_Build 3 178118857 4I TCTCGCGCTC ----/TCTA TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 TCTA 0 1 178894 CASAVA_Build 3 178120476 1D CAACAACAAC A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 A 7 6 178895 CASAVA_Build 3 178128997 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 340 hom 26 2 20 4 A 15 14 178896 CASAVA_Build 3 178131530 9D TTCAAAATGT TAAAATATA/--------- TAAAATATAT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TAAAATATA 2 1 178897 CASAVA_Build 3 178131906 2I ATATCCCCAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 54 het 20 0 18 3 AT 6 7 178898 CASAVA_Build 3 178132814 2D TCCCCCCACC TT/-- TTTTTTTTGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 10 8 178899 CASAVA_Build 3 178133583 1I ACAAAACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 55 26 24 5 T 9 10 178900 CASAVA_Build 3 178155608 1D CTATGAGCAA T/- TGGATCTTTT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 T 2 1 178901 CASAVA_Build 3 178161077 4I TAATTTACTA ----/ATGC ATGCCAAATT 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 ATGC 1 2 178902 CASAVA_Build 3 178161322 2D CCCACAGTCT AC/-- ACAGAGTGCT 3070 het 3070 hom 49 23 23 4 AC 2 1 178903 CASAVA_Build 3 178161442 1I TTTTAAGAAG -/C TTTTTGCTTC 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 C 0 1 178904 CASAVA_Build 3 178161616 1I TAGCAGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 31 0 26 5 A 11 12 178905 CASAVA_Build 3 178173321 2I TCGGGAGGCT --/GA GAGGCAGGAG 3070 het 1481 hom 18 5 10 3 GA 1 2 178906 CASAVA_Build 3 178173504 1D ACTTTATAAA T/- TTTTTATTCT 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 T 6 5 178907 CASAVA_Build 3 178190711 1D CTTGGGAGGC A/- GGGGTGGAAG 3070 het 1911 hom 25 6 12 7 A 1 0 178908 CASAVA_Build 3 178210524 1D CATCTCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2304 hom 28 8 10 11 A 11 10 178909 CASAVA_Build 3 178257247 1D CTCTCTCGGT C/- CCTTGGCATT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 3 2 178910 CASAVA_Build 3 178265210 2I ATAATTGCCT --/TG TGTTTGCAAC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 TG 1 2 178911 CASAVA_Build 3 178267968 1D AGTGATGCTT C/- CAGCACCACC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 C 2 1 178912 CASAVA_Build 3 178270648 1I ATGATGAGTC -/A ACTTTGATTT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 1 2 178913 CASAVA_Build 3 178287710 1I TTTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 A 10 11 178914 CASAVA_Build 3 178301652 1D ACAATCGCTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 9 8 178915 CASAVA_Build 3 178319317 4I AATCAAGAGA ----/TACT TACGATTTAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TACT 0 1 178916 CASAVA_Build 3 178322771 1D TAAGACAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 A 15 14 178917 CASAVA_Build 3 178323348 1I ACAGTGTTTT -/A AATAATGTGG 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 A 2 3 178918 CASAVA_Build 3 178323789 2D CTTAAAAAGT TA/-- TATAACATCT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 TA 3 2 178919 CASAVA_Build 3 178324074 4I CAATTCTGCT ----/TTGA TTAATATTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTGA 0 1 178920 CASAVA_Build 3 178324288 3I AACAATCTAC ---/TCT TCAAGTGGAT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 TCT 0 1 178921 CASAVA_Build 3 178324673 1I GCAAGACAAT -/A ACCTCCTGTT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 1 2 178922 CASAVA_Build 3 178326758 3D ACAAGTTAGC AGG/--- AGATGTTGAT 3070 het 3070 ref 52 32 14 9 AGG 1 0 178923 CASAVA_Build 3 178327298 2D ATTTTCAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 2868 het 341 hom 33 3 10 21 A 13 11 178924 CASAVA_Build 3 178331993 2D TCTGAATATC TT/-- TTTTTTTTTT 2351 het 233 hom 22 2 7 13 T 18 16 178925 CASAVA_Build 3 178332389 2D GTGGAAGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3047 het 2772 hom 45 12 15 19 A 18 16 178926 CASAVA_Build 3 178339092 1D AAAAAGGGAG A/- GGGGGAAAGT 3070 het 3070 hom 44 17 18 11 A 1 0 178927 CASAVA_Build 3 178340017 1D ACTCCATCTC G/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 18 10 G 6 5 178928 CASAVA_Build 3 178340152 1I AAATATAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 A 11 12 178929 CASAVA_Build 3 178354884 1D ATTGACAAAC T/- TTTTTTTTTT 3021 het 2179 hom 22 7 9 6 T 12 11 178930 CASAVA_Build 3 178366417 1I TTATCTCCAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 6 7 178931 CASAVA_Build 3 178380855 2D TACGTTCATT CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 372 hom 24 4 12 9 C 12 10 178932 CASAVA_Build 3 178382090 1I AGGAGGTCGG -/A AAGAACCAAT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 2 3 178933 CASAVA_Build 3 178382319 1I AAAAAAAAAA -/C ACACACACAT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 C 0 1 178934 CASAVA_Build 3 178388336 1I TTAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 9 10 178935 CASAVA_Build 3 178389792 1D AAGGCCCAGA G/- GTTCAAGACC 2567 het 2567 ref 22 10 6 7 G 2 1 178936 CASAVA_Build 3 178395449 2I GAAAAATGTC --/TT ATAAACTGAC 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 0 2 178937 CASAVA_Build 3 178397225 1I CCTCCCCCCC -/T CAAACACACA 3070 het 2591 hom 24 10 9 5 T 0 1 178938 CASAVA_Build 3 178399862 1D AGTATCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 13 12 T 13 12 178939 CASAVA_Build 3 178400461 1D CAGGAGTACA T/- TTTTTTTTTT 780 het 780 ref 30 20 3 7 T 12 11 178940 CASAVA_Build 3 178402893 1I GACCACTGTT -/A AAAAAAAAAA 1806 het 1806 ref 36 16 7 13 A 13 14 178941 CASAVA_Build 3 178403299 2I AGAGTCTTTT --/TC TGTCACCCAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TC 0 1 178942 CASAVA_Build 3 178436519 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 18 1 9 8 A 15 16 178943 CASAVA_Build 3 178440102 1D ATTTTGATGT A/- TATACTTCAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 0 178944 CASAVA_Build 3 178443999 6D ATAGCAAAAA GAAACC/------ GAAACCTAGA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 GAAACC 2 1 178945 CASAVA_Build 3 178453358 1D TGGTTAGTGC T/- TTTTTTTTTT 1177 het 1177 ref 23 8 3 12 T 17 16 178946 CASAVA_Build 3 178461766 1I GGGTAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 9 10 178947 CASAVA_Build 3 178468560 1I ACATACCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 T 10 11 178948 CASAVA_Build 3 178486849 1D CACAGCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 829 hom 30 9 10 11 T 17 16 178949 CASAVA_Build 3 178506174 2D GATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 11 22 8 TG 10 9 178950 CASAVA_Build 3 178534041 1D TATTAATTTC A/- ATGGAATAGA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 2 1 178951 CASAVA_Build 3 178535339 2I ATCCAGGGCC --/AA AAAGTTATTT 3070 het 3070 ref 43 15 17 11 A 3 5 178952 CASAVA_Build 3 178541373 13I TTTAACTGAC -------------/ACACAATAATTGT ACATATTTAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 ACACAATAATTGT 0 1 178953 CASAVA_Build 3 178544056 1D GTTTGTGAAG T/- TTTTTTTTTT 1872 het 1872 ref 33 19 4 10 T 11 10 178954 CASAVA_Build 3 178544262 1I TTTAGAGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 10 11 178955 CASAVA_Build 3 178548156 1I CATGCATCTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 8 9 178956 CASAVA_Build 3 178550305 1I AAAAAAAAAA -/G GGGAAAATTC 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 G 3 4 178957 CASAVA_Build 3 178558641 1I GGGTTATAAT -/G GGGGCTGGGG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 G 4 5 178958 CASAVA_Build 3 178632214 1I TGAAGCGGCG -/T GGGGGGAAGA 3070 het 3070 hom 42 21 13 8 T 0 1 178959 CASAVA_Build 3 178639021 1D TAGCTATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1753 hom 31 6 16 10 A 15 14 178960 CASAVA_Build 3 178645195 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 A 9 8 178961 CASAVA_Build 3 178649458 6I TTCAAGCTTT ------/TTCAGC TATAAAGATT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 TTCAGC 0 1 178962 CASAVA_Build 3 178654548 1I CTCAAGTGAT -/A ACACCCGCCT 1353 het 1292 hom 8 3 4 1 A 1 2 178963 CASAVA_Build 3 178698029 1I CTTCGTATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2540 hom 30 8 15 7 A 11 12 178964 CASAVA_Build 3 178705641 2I ATAATTAAAC --/TT ATAACTTTAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 0 2 178965 CASAVA_Build 3 178713913 1I AAAAAAAAAG -/T GGGGGGAGGA 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 T 0 1 178966 CASAVA_Build 3 178728552 1D ATAATACTTC T/- TTTTTTTTTC 1349 het 1349 ref 40 32 3 5 T 10 9 178967 CASAVA_Build 3 178735617 3D GTACAATCTG CTA/--- CTACCTTGAC 3070 het 3070 ref 48 28 19 2 CTA 2 1 178968 CASAVA_Build 3 178738278 2I GAAAGTGCTC --/CA CAGTGTCACT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 CA 1 2 178969 CASAVA_Build 3 178755627 1D AGCTGGTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 497 hom 35 4 17 14 A 15 14 178970 CASAVA_Build 3 178765863 1D TGAGTTCTCC T/- CTAGGATTCT 3070 het 47 hom 19 1 11 7 T 1 0 178971 CASAVA_Build 3 178787142 19D GTATTTTCTT AGTGGTTTAAGGAGTAAAC/------------------- CACTAAGTCT 3070 hom 99 het 32 0 34 2 AGTGGTTTAAGGAGTAAAC 1 0 178972 CASAVA_Build 3 178790762 1D GGCCAAGATT G/- AGGCTGCTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 1 0 178973 CASAVA_Build 3 178791102 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 5 4 178974 CASAVA_Build 3 178801744 1D CTGAAGAGCC T/- AAAGGCATTG 3070 het 3070 ref 49 26 13 10 T 1 0 178975 CASAVA_Build 3 178820607 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 863 het 863 ref 38 29 4 5 A 12 11 178976 CASAVA_Build 3 178824446 1D AATTCTTTGA T/- TTTTGGCATC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 5 4 178977 CASAVA_Build 3 178838030 2I TGGCCTGTTC --/AG AGTTTCTATA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 AG 1 2 178978 CASAVA_Build 3 178852528 1I AGAGAGAAGC -/A AAAGTCTTGC 3070 het 3070 ref 55 24 23 8 A 3 4 178979 CASAVA_Build 3 178853074 1I AATACCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 T 11 12 178980 CASAVA_Build 3 178865934 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 18 1 13 4 T 13 12 178981 CASAVA_Build 3 178872388 1I TTGTGTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 9 10 4 A 11 12 178982 CASAVA_Build 3 178873045 5I TTTATTTTTG -----/AGAGT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 AGAGT 0 1 178983 CASAVA_Build 3 178874889 1D TGTAACCCAA C/- CCCCCCTCTA 3070 het 3070 ref 52 25 17 11 C 7 6 178984 CASAVA_Build 3 178884092 1I ATTCCAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 9 13 T 13 14 178985 CASAVA_Build 3 178886458 1I TCCTCTCCCC -/G CCCCATGATG 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 G 0 1 178986 CASAVA_Build 3 178892790 1D TGGGCAGCTA G/- GTGAGGTGTT 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 G 2 1 178987 CASAVA_Build 3 178894686 1I TATGTTTTTT -/G ATTCCTGAGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 0 1 178988 CASAVA_Build 3 178896052 1I AAGCAACTAC -/T ATACGTAAGT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 0 1 178989 CASAVA_Build 3 178897180 1D AATGGGGTGA T/- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 T 3 2 178990 CASAVA_Build 3 178910164 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2290 het 635 hom 22 3 7 12 T 11 10 178991 CASAVA_Build 3 178912839 1D GAGATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 2699 het 2699 ref 35 12 10 13 T 13 12 178992 CASAVA_Build 3 178922043 5D CATGTTCAGT CTTTC/----- CTTAAGCACC 3070 het 3070 ref 35 18 17 1 CTTTC 1 0 178993 CASAVA_Build 3 178932115 1I GGAGATCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 41 1 32 8 A 10 11 178994 CASAVA_Build 3 178946312 2I TCATTTCATG --/CT CTCTCTATTC 3070 hom 162 het 58 0 54 4 CT 3 4 178995 CASAVA_Build 3 178950603 1D CTCACTGGGG A/- TAAAGGATCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 0 178996 CASAVA_Build 3 178950855 9I39M1D GTTTTTAACA ---------AAAAAGTTAAAAAAATTAATAGAAAAGAGCTTATAGAATA/AAAAAGTTTAAAAAGTTAAAAAAATTAATAGAAAAGAGCTTATAGAAT- AAAATATATA 3070 hom 96 het 30 0 33 2 N/A 0 0 178997 CASAVA_Build 3 178951551 5D TTTTACAATT TTTAC/----- TTTGCTTTAA 3070 hom 81 het 28 0 28 2 TTTAC 1 0 178998 CASAVA_Build 3 178952239 1D CTAGCTGGTG A/- GCGGAGACGA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 1 0 178999 CASAVA_Build 3 178952969 2D CATCTCTACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 17 15 179000 CASAVA_Build 3 178954256 4D CAACCCACAC TGAG/---- TGATAGCTGT 3070 hom 102 het 39 0 34 6 TGAG 1 0 179001 CASAVA_Build 3 178958879 1D CATGCTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 39 1 35 3 T 13 12 179002 CASAVA_Build 3 178969380 10D GATTGCAGGG CACCTAGCTA/---------- GATTGCAGCC 3070 hom 75 het 26 0 20 9 CACCTAGCTA 1 0 179003 CASAVA_Build 3 178980467 1D GTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 2846 hom 23 het 11 0 7 4 T 10 9 179004 CASAVA_Build 3 178980757 14D GACTATGGAC ATAGTCTAGATTAA/-------------- ATAGATTGGA 3070 hom 63 het 20 0 22 2 ATAGTCTAGATTAA 1 0 179005 CASAVA_Build 3 178989416 2D TTATACACTC TG/-- TATTAATTTC 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 TG 1 0 179006 CASAVA_Build 3 178989996 3D GGAGTTTTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 31 10 13 11 TTA 4 3 179007 CASAVA_Build 3 179007368 1D ATTCTCAGTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 8 7 179008 CASAVA_Build 3 179008016 2I TGTTCCAGTT --/TA TCATATTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TA 0 1 179009 CASAVA_Build 3 179013736 1D AGAATAATGG C/- CCCCTCCCCT 1936 het 1936 ref 29 22 5 3 C 5 4 179010 CASAVA_Build 3 179018365 4D AGCCAGGCAG TGCT/---- TGAATGTGGG 3070 het 3070 hom 45 19 22 5 TGCT 1 0 179011 CASAVA_Build 3 179054470 1I TATTGCTTTA -/C CGATACTATC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 C 1 2 179012 CASAVA_Build 3 179062620 1I TGTTTGGCAG -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 T 6 7 179013 CASAVA_Build 3 179073820 5D AGTGCTGAGC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2166 het 1225 hom 28 13 6 16 A 19 14 179014 CASAVA_Build 3 179095506 1I TTAATCTAAG -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 T 5 6 179015 CASAVA_Build 3 179106276 1D TACAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 T 13 12 179016 CASAVA_Build 3 179127792 2I ATAAAGACTT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 TA 0 1 179017 CASAVA_Build 3 179133750 1D TCTGAGACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 A 11 10 179018 CASAVA_Build 3 179142960 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 11 10 179019 CASAVA_Build 3 179150108 4I GGGTGCCTCC ----/TTTT TTTTGCCTGA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 4 8 179020 CASAVA_Build 3 179153123 1D TAGATTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 27 8 13 T 13 12 179021 CASAVA_Build 3 179166795 1D TGTGAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 11 10 179022 CASAVA_Build 3 179166899 1I AAGCAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 9 10 179023 CASAVA_Build 3 179174708 1I ATTTTTTTTT -/C CCGGAAGAGT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 C 2 3 179024 CASAVA_Build 3 179177607 1I TTTATTTTTT -/C CAAAGTCTAG 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 C 1 2 179025 CASAVA_Build 3 179182285 1D TGTCAGTCCT C/- CAGGCCCACT 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 C 2 1 179026 CASAVA_Build 3 179183620 1D GGCGATTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 10 9 179027 CASAVA_Build 3 179227266 1I TGCATGCCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 9 10 179028 CASAVA_Build 3 179254794 1D AATTAATTCC T/- TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 45 35 3 7 T 11 10 179029 CASAVA_Build 3 179257468 12I TGCTGGTCAC ------------/TGTGCAGGTATA TTTGATGGGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TGTGCAGGTATA 0 1 179030 CASAVA_Build 3 179268262 1D AGTAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 11 10 179031 CASAVA_Build 3 179273938 1I CAATACTGCC -/A ATGCCAGGTA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 1 2 179032 CASAVA_Build 3 179283719 1D GAGTAATTTT C/- CCCAAGTTCA 3070 het 3070 hom 43 14 26 4 C 4 3 179033 CASAVA_Build 3 179284995 8D CAAATAAATG ATACTAAA/-------- GGAAAGATAG 3070 het 3070 ref 53 28 24 2 ATACTAAA 1 0 179034 CASAVA_Build 3 179346576 1D TGACTCTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 12 11 179035 CASAVA_Build 3 179347816 5D GGAGGCCAAA TTGAC/----- TTATCCTTGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTGAC 1 0 179036 CASAVA_Build 3 179348061 4D TTGTTTCTCA TTGT/---- TTAAGTGTAC 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TTGT 1 0 179037 CASAVA_Build 3 179360882 2I GGAATCAGAA --/AC AGTCTCAAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AC 0 1 179038 CASAVA_Build 3 179365302 1D CATAGTGAAC T/- GATCTTTAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 1 0 179039 CASAVA_Build 3 179378265 18I AATAAATAGA ------------------/AGGGAAATCATGTTTTGT ATTAGAACGT 3070 hom 57 het 21 0 20 3 AGGGAAATCATGTTTTGT 0 1 179040 CASAVA_Build 3 179379191 58D CTAAGCAAAT TAACACATAACAGAAAAATAAATACTGCATGATCTCACTTGTAAGTGGGAGCTAAACA/---------------------------------------------------------- TTGAGTATAC 1951 hom 17 het 3 0 5 4 TAACACATAACAGAAAAATAAATACTGCATGATCTCACTTGTAAGTGGGAGCTAAACA 1 0 179041 CASAVA_Build 3 179384193 4D TCTTTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2842 hom 33 het 19 0 12 7 TTTC 5 4 179042 CASAVA_Build 3 179389251 3I ATATTAACAT ---/GCA GCATGCTAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 GCA 1 2 179043 CASAVA_Build 3 179394743 1I TCAAAATGCC -/T TTTTTTTTTT 3045 het 33 hom 37 1 13 23 T 11 12 179044 CASAVA_Build 3 179400825 3I GAACTTAGTG ---/GTT TAAAAAAGAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 GTT 0 1 179045 CASAVA_Build 3 179408803 2I CTCCCCAACC --/CT CTCTGTGTCC 3070 hom 45 het 21 0 15 6 CT 2 3 179046 CASAVA_Build 3 179421370 1I ATGTATCTAA -/G AGGACAAAGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 0 1 179047 CASAVA_Build 3 179426719 1I AATAGAAAAT -/A TTTTTTTCTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 179048 CASAVA_Build 3 179427908 1D CTATGCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 40 1 26 13 T 12 11 179049 CASAVA_Build 3 179435920 1D TTAAGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 157 hom 34 1 27 6 A 13 12 179050 CASAVA_Build 3 179440205 4D ATTTCCAAAT AATC/---- AATCAGAGAA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 AATC 2 1 179051 CASAVA_Build 3 179461137 1D TTCAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 1375 het 1375 ref 40 29 3 9 A 11 10 179052 CASAVA_Build 3 179497674 1D TTGAGACAGA G/- GTATGTTATA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 G 2 1 179053 CASAVA_Build 3 179508361 1D TGTGATTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 615 hom 31 3 25 3 T 13 12 179054 CASAVA_Build 3 179512092 4I CCTGTTATAT ----/ACAA ACAAAGACAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 ACAA 1 2 179055 CASAVA_Build 3 179527063 1D TAGATATCCC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 126 het 52 0 43 9 T 8 7 179056 CASAVA_Build 3 179537721 1I CTTCTGCCTG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 8 9 179057 CASAVA_Build 3 179566653 1D CTAAAACCAT A/- AAAAAACCCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 7 6 179058 CASAVA_Build 3 179571535 1D TTCAGTTAGC T/- AGTATTTTGT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 T 1 0 179059 CASAVA_Build 3 179583732 1D TTATAGTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 10 9 179060 CASAVA_Build 3 179595904 1D AACTAAAAGC T/- AATCTGTATA 3070 hom 89 het 33 0 30 4 T 1 0 179061 CASAVA_Build 3 179606043 1I AAAGCTTATT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 A 8 9 179062 CASAVA_Build 3 179607065 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 45 21 21 4 A 10 8 179063 CASAVA_Build 3 179634272 1D CCATGGTTTG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 53 27 21 5 A 8 7 179064 CASAVA_Build 3 179643044 1D AACCAAGATC A/- AAAACACTCA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 5 4 179065 CASAVA_Build 3 179694569 1D TGGTGGATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 10 9 179066 CASAVA_Build 3 179713736 9D TATAGCCTGC AGAACCCTG/--------- AGCCAATTAA 3070 hom 83 het 34 0 26 10 AGAACCCTG 1 0 179067 CASAVA_Build 3 179725621 1D GTGGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 10 6 T 13 12 179068 CASAVA_Build 3 179728423 4I ACTGAATCTT ----/AGAA AGGAAATAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AGAA 0 1 179069 CASAVA_Build 3 179734002 4D TCTCAAGAAA TTCT/---- TTCCTTCCTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 8 TTCT 1 0 179070 CASAVA_Build 3 179746248 4D TGTCTCTGGA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 39 16 17 7 TTGT 3 2 179071 CASAVA_Build 3 179755590 2D GAAGAGTGTC CT/-- CTCACACATG 3070 hom 117 het 45 0 40 7 CT 2 1 179072 CASAVA_Build 3 179758662 2D ATTTTAACCC AA/-- GTCAATTTTA 3070 het 3070 ref 44 22 21 1 A 2 0 179073 CASAVA_Build 3 179767076 2I AAGAAAACCA --/CT GTTTCTCTGT 3070 het 3070 hom 48 24 21 3 CT 0 1 179074 CASAVA_Build 3 179767154 1D AAGCAAACAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 37 19 11 8 A 9 8 179075 CASAVA_Build 3 179769573 1D ATGTTCTCTC T/- TTATTTCTTG 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 T 3 2 179076 CASAVA_Build 3 179770998 14D TAATGATACC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2947 hom 31 11 16 8 T 25 11 179077 CASAVA_Build 3 179785190 1D TAAAGAAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 A 10 9 179078 CASAVA_Build 3 179803943 24D GGGTCATTTG AGAAATGGGCAAAGGAAGGAAGGA/------------------------ AGAAATGGGC 3070 het 3070 ref 40 27 14 6 AGAAATGGGCAAAGGAAGGAAGGA 1 0 179079 CASAVA_Build 3 179820742 1I CTAGAAAAAA -/T ATGCCAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 0 1 179080 CASAVA_Build 3 179825073 4D TTTTTCTTTT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 5 TTTC 2 1 179081 CASAVA_Build 3 179837320 6D ACAGATCATT CCACCA/------ CCCAAGTATT 3070 het 3070 hom 46 20 25 5 CCA 2 0 179082 CASAVA_Build 3 179837520 1I GCTCTCATTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 T 8 9 179083 CASAVA_Build 3 179840550 1I AGAAAAAAAA -/G AATGCCATGA 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 G 0 1 179084 CASAVA_Build 3 179849984 1D AGTCCTGGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 13 18 10 T 10 9 179085 CASAVA_Build 3 179850314 1I ATTCATTGAC -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 6 7 179086 CASAVA_Build 3 179852591 1D CACAGCAAAA G/- AAACTGTCGT 2351 het 2351 ref 17 8 6 3 G 1 0 179087 CASAVA_Build 3 179918373 1D CTTTCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 2254 het 2254 ref 47 31 7 10 A 12 11 179088 CASAVA_Build 3 180051364 1D CATCTCTCCT A/- ATAGTTTTTC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 2 1 179089 CASAVA_Build 3 180057544 2I TTACCAAGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 36 1 26 9 A 10 12 179090 CASAVA_Build 3 180095443 1D CTTCACCTAT A/- TCTAGCACTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 1 0 179091 CASAVA_Build 3 180117576 1I TATCTTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 41 0 31 10 A 10 11 179092 CASAVA_Build 3 180119575 1D TCACAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1005 het 1005 ref 44 34 3 8 A 11 10 179093 CASAVA_Build 3 180132773 1I CAACAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 1347 het 1347 ref 26 19 3 4 A 11 12 179094 CASAVA_Build 3 180136704 1D TTTTCTTCAA T/- TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 7 6 179095 CASAVA_Build 3 180146750 1I AACTTGGGTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 38 26 9 3 T 8 9 179096 CASAVA_Build 3 180159091 4I ATATATATAT ----/ACAC ACACACACAC 1236 het 551 hom 7 3 3 1 AC 7 9 179097 CASAVA_Build 3 180161207 1I CATGTTTCTC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 A 7 8 179098 CASAVA_Build 3 180170047 1D ATGTTTACTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 8 7 179099 CASAVA_Build 3 180174571 2D GGAAGGAGTC TT/-- AGTGAAGAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 2 0 179100 CASAVA_Build 3 180175430 2D TAAAAAAAAA GG/-- AAGGAAGGAA 2310 het 442 hom 16 4 7 5 G 2 0 179101 CASAVA_Build 3 180179144 5I ATCTGAGAGG -----/CCCTC CCAGAACAGG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 CCCTC 0 1 179102 CASAVA_Build 3 180183812 1I ACTGGGAAGT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 A 7 8 179103 CASAVA_Build 3 180189246 3I CAGGCCTTCC ---/AAG AAGGTTTGTG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 AAG 1 2 179104 CASAVA_Build 3 180199671 1D GGCAAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 1187 het 1187 ref 31 23 5 3 A 14 13 179105 CASAVA_Build 3 180209227 2D AAAAAAAAAA AT/-- AAAAAAATCT 2418 het 194 hom 30 1 16 13 AT 1 0 179106 CASAVA_Build 3 180219115 1D ACTTAAAATT C/- TTTAGATTTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 C 1 0 179107 CASAVA_Build 3 180223115 2D TACTGAAAAA AT/-- AATAATAATA 696 het 696 ref 27 16 4 7 AT 1 0 179108 CASAVA_Build 3 180223646 1D TTATAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 24 2 12 11 T 15 14 179109 CASAVA_Build 3 180234039 1D GGATTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 24 0 20 4 A 12 11 179110 CASAVA_Build 3 180236091 1I TGTTGACTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 T 9 10 179111 CASAVA_Build 3 180241075 4I CACTAAACAT ----/AGAA AGAAACAACC 2129 het 2129 ref 28 14 5 9 AGAA 1 2 179112 CASAVA_Build 3 180257855 4D CCTGTACATC CTGA/---- CTGTCAATTC 3070 het 3070 ref 36 23 13 2 CTGA 1 0 179113 CASAVA_Build 3 180260724 1D CAGAGACAAA C/- AATATAAAGT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 C 1 0 179114 CASAVA_Build 3 180269570 1I TATTCATCAG -/T CCCCTGTAAA 3070 het 1540 hom 41 10 28 3 T 0 1 179115 CASAVA_Build 3 180270598 1I GAAAAGGTGG -/A GGGGGGGTGT 3070 het 2368 hom 34 8 18 8 A 0 1 179116 CASAVA_Build 3 180275179 1D GCCCCTAAAC T/- TTTTTTTTTT 2762 het 346 hom 30 3 12 15 T 19 18 179117 CASAVA_Build 3 180278594 1D TATATGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 5 T 11 10 179118 CASAVA_Build 3 180316905 1D AGAATTTGAA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 8 7 179119 CASAVA_Build 3 180354308 1D AACTGTGGAT G/- GGGGAAACTG 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 G 5 4 179120 CASAVA_Build 3 180372974 1D TACCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1150 het 1150 ref 48 37 3 8 A 12 11 179121 CASAVA_Build 3 180426682 5I TCCTCCTCTT -----/ACTTG ACTTAGAATA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 ACTTG 0 1 179122 CASAVA_Build 3 180433900 1D ACTATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 12 11 179123 CASAVA_Build 3 180455647 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAT 1658 het 1658 ref 14 7 4 4 A 9 10 179124 CASAVA_Build 3 180458355 8D AACATTGTTT TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 TG 13 9 179125 CASAVA_Build 3 180467467 2I CGAAGCTGCT --/TC TCTCTCTCTT 3070 het 2903 hom 36 13 10 13 TC 4 5 179126 CASAVA_Build 3 180467578 1D TGAGGCCCAA G/- GGGACCCTCT 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 G 4 3 179127 CASAVA_Build 3 180474559 2D TATACTCCCA TC/-- TCAGTTGGTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 4 TC 2 1 179128 CASAVA_Build 3 180474792 1D TATTTCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 814 hom 17 3 13 3 A 13 12 179129 CASAVA_Build 3 180476475 1D CTTTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2212 het 734 hom 27 5 10 12 A 19 18 179130 CASAVA_Build 3 180482599 14I GGCTGGTGTT --------------/AAACTCCTGGGCTC AAGCGATCCT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 AAACTCCTGGGCTC 0 1 179131 CASAVA_Build 3 180483135 12D CACTGTACTC CAGCCTGGGTGA/------------ CAGAGTGACA 2617 het 2617 ref 20 15 7 3 CAGCCTGGGTGA 1 0 179132 CASAVA_Build 3 180492794 1D AGCATTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2816 hom 31 7 18 6 A 12 11 179133 CASAVA_Build 3 180493980 10D AAAGGTGTAA ACCTCATTAG/---------- TTATCACGCA 3070 het 3070 ref 51 23 23 6 ACCTCATTAG 1 0 179134 CASAVA_Build 3 180494874 1I CTTATAAATA -/T TTGTTAAACT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 2 3 179135 CASAVA_Build 3 180495870 1D CAAAAAATTT G/- GGGGAAAAAA 2716 het 2716 ref 30 18 8 4 G 5 4 179136 CASAVA_Build 3 180507340 1D TTTAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 11 12 T 11 10 179137 CASAVA_Build 3 180509918 2I TGACAATGAA --/TC TTTACAGTAT 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 TC 0 1 179138 CASAVA_Build 3 180513857 2D CCTGGCTAAC TT/-- ACGGTGAAAC 1315 het 1315 ref 10 6 4 0 T 2 0 179139 CASAVA_Build 3 180536814 3I CACTGCTAAC ---/AAT ATTATTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 AAT 0 1 179140 CASAVA_Build 3 180543904 1I CCTTAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 1893 het 1195 hom 24 5 7 12 T 13 14 179141 CASAVA_Build 3 180549995 1I GGAATACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 18 5 T 14 15 179142 CASAVA_Build 3 180553236 1D AAACTCAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 T 10 9 179143 CASAVA_Build 3 180556516 2I ATTTGATCTT --/TG TGTCCCATTC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TG 1 2 179144 CASAVA_Build 3 180561032 1D TCCTTCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2057 hom 30 10 11 10 A 15 14 179145 CASAVA_Build 3 180571838 1I CTCTAGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 A 11 12 179146 CASAVA_Build 3 180579633 2D GCAATATATC TT/-- TTCCACGTAT 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 T 4 2 179147 CASAVA_Build 3 180580915 1D AAGGAATGCA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 T 8 7 179148 CASAVA_Build 3 180586037 1I TTCCTTTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 T 9 10 179149 CASAVA_Build 3 180595677 4D AATTTACAGG TACT/---- TACTTAGTAC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TACT 2 1 179150 CASAVA_Build 3 180597224 4D TCAATGTGTG ATTA/---- ATTAATAAGT 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 ATTA 2 1 179151 CASAVA_Build 3 180608260 2I GCTGCAAAAG --/AA ACACCCAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 27 4 A 1 3 179152 CASAVA_Build 3 180611949 2I ATGTTTTGAC --/AA AAAAAAAAAA 1875 het 1875 ref 29 13 6 10 A 13 15 179153 CASAVA_Build 3 180612799 4I AGATTAAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 AAAC 3 4 179154 CASAVA_Build 3 180617892 1D TTTGTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2368 hom 33 9 13 11 T 16 15 179155 CASAVA_Build 3 180620950 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 1829 het 427 hom 8 1 4 3 A 1 0 179156 CASAVA_Build 3 180622969 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 A 8 9 179157 CASAVA_Build 3 180628788 1I ATTTTCCATC -/T TTTATTTATG 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 3 4 179158 CASAVA_Build 3 180631103 2D GCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1294 het 1294 ref 34 15 5 15 T 18 16 179159 CASAVA_Build 3 180638554 1I ACCTCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 9 10 179160 CASAVA_Build 3 180657308 1I TACAGTATGT -/G ACCTTTCGAG 3070 het 3070 hom 60 26 27 7 G 0 1 179161 CASAVA_Build 3 180661979 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1954 het 1619 hom 18 8 5 7 A 17 16 179162 CASAVA_Build 3 180778299 1D GATCTCATTC T/- TTTTTTTTTT 1920 het 1920 ref 32 14 7 11 T 15 14 179163 CASAVA_Build 3 180838702 1D CTTCAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 1083 het 1083 ref 40 28 3 9 T 12 11 179164 CASAVA_Build 3 180855579 4I GATGATGGTC ----/CTAA CTAACTTAAG 3070 hom 90 het 34 0 29 5 CTAA 1 2 179165 CASAVA_Build 3 180870315 1D ATTTTCTTGA C/- CCCCCCCTCC 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 C 8 7 179166 CASAVA_Build 3 180871174 1I AATCCAGCAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 2015 hom 19 5 8 7 T 7 8 179167 CASAVA_Build 3 180873883 1D AGTTTTCCTG C/- CCCCCCTGCC 3070 hom 126 het 53 0 41 12 C 7 6 179168 CASAVA_Build 3 180875103 1D CACAAATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 11 10 179169 CASAVA_Build 3 180882799 1I69M4D CAAAAATCAT -AAAAAAAAACCATTTGAATGTTCCTGCTTCAGATGTGTTTTGTTTTGTTTTTTAGTATAAGAAATAGAGCTTC/AAAAAAAAAACCATTTGAATGTTCCTGCTTCAGATGTGTTTTGTTTTGTTTTTTAGTATAAGAAATAGAG---- CTTAAAAATT 3070 het 188 hom 29 2 40 13 N/A 0 0 179170 CASAVA_Build 3 180883541 1D TCTATTCTGG T/- TTTTTTTTTT 2102 het 2102 ref 45 31 5 9 T 12 11 179171 CASAVA_Build 3 180885262 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 35 0 24 11 T 11 10 179172 CASAVA_Build 3 180891650 1D TCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 22 0 14 8 A 17 16 179173 CASAVA_Build 3 180908922 7D CCCGAGTAGC TGGGATT/------- TGGGATTACA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TGGGATT 2 1 179174 CASAVA_Build 3 180910464 2D TGAACCGGTG TA/-- GTTTTTCATT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 TA 1 0 179175 CASAVA_Build 3 180918153 1I TTTTCACCTT -/C GAGCTAGTAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 0 1 179176 CASAVA_Build 3 180918439 4I TATTAATAAT ----/AGAA AGACTGAATT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AGAA 0 1 179177 CASAVA_Build 3 180922548 3D AATCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 20 7 A 17 14 179178 CASAVA_Build 3 180927165 1D CCTGGTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 40 2 28 10 T 13 12 179179 CASAVA_Build 3 180930761 1D CAGATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 44 2 30 13 T 11 10 179180 CASAVA_Build 3 180933228 1I CTTTTATGTT -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 7 8 179181 CASAVA_Build 3 180942004 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2997 hom 24 het 9 0 9 0 T 7 6 179182 CASAVA_Build 3 180944313 4D CATCATAAAC TGAT/---- TGGGGACAGG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TGAT 1 0 179183 CASAVA_Build 3 181010154 1I TAAGCACCTG -/A AAAAAAAAAA 2918 het 1618 hom 27 7 10 10 A 11 12 179184 CASAVA_Build 3 181026087 1I GGTATGCTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 9 10 179185 CASAVA_Build 3 181056869 1D TATGATATAA T/- TTTAGTTAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 4 3 179186 CASAVA_Build 3 181062311 1D TTGCAAAAGC A/- AAAGAACTTG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 4 3 179187 CASAVA_Build 3 181074615 2I GTAGATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 AT 8 9 179188 CASAVA_Build 3 181075638 6D AATGCTTATT GACTGA/------ GACTGAGTTG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 GACTGA 2 1 179189 CASAVA_Build 3 181077327 1D TTATTCCTTA T/- GCAAAATGCT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 1 0 179190 CASAVA_Build 3 181085502 1I CTTACGAATT -/A AAAAATATAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 5 6 179191 CASAVA_Build 3 181091450 1D GGTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1857 het 1857 ref 30 10 8 12 T 17 16 179192 CASAVA_Build 3 181106136 1I GTTCTTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 T 11 12 179193 CASAVA_Build 3 181107375 3D TGAGAATCAT TCA/--- TCATCAACAT 3070 het 3070 hom 38 18 19 2 TCA 3 2 179194 CASAVA_Build 3 181117154 1I AAATTAACCA -/C CCCCCCCTTT 3070 het 3040 hom 23 9 8 6 C 7 8 179195 CASAVA_Build 3 181125334 1D TAAGAGAAAA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 8 7 179196 CASAVA_Build 3 181132416 2D TTCTAAATGC AT/-- ATATGGCCTT 3070 het 3070 hom 52 17 29 6 AT 3 2 179197 CASAVA_Build 3 181133928 1I TACAATTCTC -/T TTTTTTTTTT 2641 het 2641 ref 26 16 6 4 T 10 11 179198 CASAVA_Build 3 181135543 1D TATGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 1674 het 1674 ref 51 36 7 8 A 13 12 179199 CASAVA_Build 3 181146500 2D GTACTGAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 17 16 T 14 12 179200 CASAVA_Build 3 181147783 1D TTAATTGAAT A/- AAAATTATAT 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 A 5 4 179201 CASAVA_Build 3 181150107 2D CAAGCAAAAC AA/-- AGACACTGAG 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 A 3 1 179202 CASAVA_Build 3 181150986 6D CTAGAACTTA AAGTAT/------ AATAACAAAA 3070 het 2294 hom 20 6 11 3 AAGTAT 1 0 179203 CASAVA_Build 3 181154686 1D AACCATTAGT C/- GGGGGGGGGG 3070 het 1147 hom 26 9 14 3 C 1 0 179204 CASAVA_Build 3 181154874 1I TTTTCATGTG -/T TTCTTATGTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 3 179205 CASAVA_Build 3 181155268 1D CTTTGTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 12 12 8 T 10 9 179206 CASAVA_Build 3 181157385 1D ATGTACATGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 22 18 1 T 9 8 179207 CASAVA_Build 3 181157640 1I TGCGACTATA -/C AAAAAATTAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 179208 CASAVA_Build 3 181159543 1D AACAAAACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 36 0 31 5 A 12 11 179209 CASAVA_Build 3 181159652 4D GTGGTCCATG AACC/---- AACCACTCTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 4 AACC 2 1 179210 CASAVA_Build 3 181161565 6D CATTCTCTCA CCATTT/------ CCATTTCTTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 4 CCATTT 2 1 179211 CASAVA_Build 3 181161847 1D AATGGAGCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 21 18 13 A 11 10 179212 CASAVA_Build 3 181163729 4D CTCACAGAGA TGGC/---- TAGGCTGGCA 3070 het 3070 hom 32 14 15 5 TGGC 1 0 179213 CASAVA_Build 3 181168174 1D ATCCCTGGGT A/- AATGCCAGGT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 3 2 179214 CASAVA_Build 3 181181506 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 2659 het 2155 hom 30 9 10 12 A 17 16 179215 CASAVA_Build 3 181182288 1D ATGCTATTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 10 9 179216 CASAVA_Build 3 181190883 1D TTCTGATATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 14 15 6 T 10 9 179217 CASAVA_Build 3 181195852 1D GGTTGGTTTT G/- GGGTTTCTGG 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 G 4 3 179218 CASAVA_Build 3 181201976 1I AGAAAACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 10 11 179219 CASAVA_Build 3 181203867 1I ACTGGGCACT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 8 9 179220 CASAVA_Build 3 181206211 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2187 het 2171 hom 22 7 7 8 A 13 14 179221 CASAVA_Build 3 181206849 1I GTTTTCATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 T 9 10 179222 CASAVA_Build 3 181212745 1I TTATGATAAT -/A AGACAGATAT 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 A 1 2 179223 CASAVA_Build 3 181219360 3I TGTCTGTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 TTG 5 6 179224 CASAVA_Build 3 181230220 1I ATAAATCACT -/G GGTTCCTTCA 3070 het 3070 hom 63 26 31 6 G 2 3 179225 CASAVA_Build 3 181231572 5D TATCTAATGG ATATT/----- TATACTAATA 3070 het 3070 ref 26 15 10 3 ATATT 1 0 179226 CASAVA_Build 3 181232417 2D TTTCAAACAC AT/-- GTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 AT 1 0 179227 CASAVA_Build 3 181233885 1I TTCTTTTATT -/A AAAAAACCCA 2823 het 2823 ref 31 17 7 7 A 6 7 179228 CASAVA_Build 3 181242311 2I3M6D4M2D TTTGGAGACA --AACAACAAACTGCCG/GGGTC------TTGC-- TCTATTGTTT 3070 het 3070 hom 23 11 9 5 N/A 0 0 179229 CASAVA_Build 3 181246093 1I GAATGTTAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 8 9 179230 CASAVA_Build 3 181246899 3D CTCTCTCTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 163 het 163 ref 31 16 4 12 CTC 1 0 179231 CASAVA_Build 3 181261249 1D AACTACATGT A/- AAAAAAAAAA 1107 het 1107 ref 49 39 3 7 A 13 12 179232 CASAVA_Build 3 181264699 2D TTTTGTGGGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 39 10 20 9 AT 9 8 179233 CASAVA_Build 3 181280034 4I GAAAAGAGGT ----/TTAA TTGACTCACA 3070 hom 60 het 22 0 19 3 TTAA 0 1 179234 CASAVA_Build 3 181291890 5I CACCAGGCTG -----/GGCAA GAGTGCAATG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 GGCAA 0 1 179235 CASAVA_Build 3 181345922 2D TTAAGGAAAG AC/-- AATTATTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 AC 1 0 179236 CASAVA_Build 3 181345949 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 658 het 658 ref 28 12 2 14 T 13 12 179237 CASAVA_Build 3 181391200 1D TGTCATGTGG A/- AAAAAAAAAA 1224 het 1224 ref 27 14 3 10 A 15 14 179238 CASAVA_Build 3 181418133 3D AATAGAATTG AAT/--- AATAATAAAG 1800 het 1800 ref 24 16 4 8 AAT 3 2 179239 CASAVA_Build 3 181422786 1I CCCATAGAAT -/G GTACAACATC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 G 1 2 179240 CASAVA_Build 3 181425992 1I GACTGCAGAA -/C CTTAGCTTTG 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 C 1 2 179241 CASAVA_Build 3 181430333 5I AACTAATCTG -----/CTCTT TAGCAAAATT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 CTCTT 0 1 179242 CASAVA_Build 3 181432218 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2750 het 2750 ref 20 10 6 4 A 12 11 179243 CASAVA_Build 3 181435669 1I TTGGATTTTT -/G GTCTCCCTCT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 G 1 2 179244 CASAVA_Build 3 181436012 1D AGGAGGCAGA T/- TGGGGGGGGT 2755 het 2755 ref 30 16 10 4 T 2 1 179245 CASAVA_Build 3 181439758 6D TTAATGCATA CTGCAC/------ CTGTCCCTTG 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 CTGCAC 1 0 179246 CASAVA_Build 3 181449334 1I TCACATTCTC -/T TATAATTAAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 1 2 179247 CASAVA_Build 3 181456226 1D GCGAGACACA G/- GCCAAGTGTG 3070 het 3070 ref 42 18 18 7 G 2 1 179248 CASAVA_Build 3 181463852 13D CAAAATTTGT TTTTAAATGTGGA/------------- GGATATGCAT 3070 het 3070 ref 30 16 15 2 TTTTAAATGTGGA 1 0 179249 CASAVA_Build 3 181481130 4I ATATGTACAT ----/AAAG TATGTATACA 3070 het 3070 hom 50 26 21 3 AAAG 0 1 179250 CASAVA_Build 3 181497226 1D TAACAAAGAT G/- GGGAATGTAT 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 G 4 3 179251 CASAVA_Build 3 181529412 1D GGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 11 10 179252 CASAVA_Build 3 181533222 2I CAGTAATGGG --/TT TTTGCACTTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 3 5 179253 CASAVA_Build 3 181539671 1I CCACTTGTTT -/C CCCAAACACC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 C 3 4 179254 CASAVA_Build 3 181542288 3I TGTAACAATT ---/AAG AAGACACTAG 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 AAG 1 2 179255 CASAVA_Build 3 181577419 1I AGTAGGAAGC -/A AATCTGGCTC 3070 het 3070 ref 57 28 24 5 A 2 3 179256 CASAVA_Build 3 181597322 1D AAACAAAACC A/- AAAAAACCCC 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 7 6 179257 CASAVA_Build 3 181597830 3I AAGTATTATT ---/CTA CTATTTTGCA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 CTA 1 2 179258 CASAVA_Build 3 181601683 6D GTGTTTATCT TATCTA/------ TAAGAGCATA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 TATCTA 1 0 179259 CASAVA_Build 3 181607189 1I ATTTGTTGCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3023 hom 22 7 12 3 T 7 8 179260 CASAVA_Build 3 181615720 6I TAGAAACTTA ------/TAACAC GATAAAATTA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 TAACAC 0 1 179261 CASAVA_Build 3 181618826 1D TTAAAGTACA C/- CAAACATAGT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 C 2 1 179262 CASAVA_Build 3 181619696 1I TGTAGGAGGC -/A AAGGAGGACA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 2 3 179263 CASAVA_Build 3 181631636 1I TTTCTTGCTC -/A AAAAAAAAAA 900 het 900 ref 31 19 3 9 A 13 14 179264 CASAVA_Build 3 181679954 1D TTCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2171 het 2171 ref 34 15 5 14 T 11 10 179265 CASAVA_Build 3 181760944 1D CTCCACCTCT G/- GGGTCAGGGC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 G 4 3 179266 CASAVA_Build 3 181762946 1I AGACTTAGAC -/T CCCATATAAT 1369 het 1369 ref 34 28 3 3 T 0 1 179267 CASAVA_Build 3 181816285 1I ACTGCAGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 9 10 179268 CASAVA_Build 3 181820135 1D AACCACTTAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 59 het 27 0 21 6 A 9 8 179269 CASAVA_Build 3 181857210 1D CCAGCTAAAA C/- CCCCCCTGAC 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 C 7 6 179270 CASAVA_Build 3 181865346 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1298 het 209 hom 10 1 6 3 T 15 14 179271 CASAVA_Build 3 181893693 1D AAAGAAAAAA G/- GGGCAGGAAT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 G 4 3 179272 CASAVA_Build 3 181907906 4I GACTATGCCA ----/TCCT CCACAAGTCA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 TCCT 0 1 179273 CASAVA_Build 3 181914369 2D TTTGAGGACA GT/-- GTGTGTGTGT 1786 het 1786 ref 52 31 4 17 GT 9 8 179274 CASAVA_Build 3 181916900 3D GATCTAAAGT ACA/--- ACAACAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 5 ACA 3 2 179275 CASAVA_Build 3 181929714 1D ACAGCATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 T 11 10 179276 CASAVA_Build 3 181945647 3D TGCAACAGAG TGT/--- TGAAGTGTTC 3070 het 3070 ref 31 19 9 5 TGT 1 0 179277 CASAVA_Build 3 181957014 1I TTAAGAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 10 11 179278 CASAVA_Build 3 182007647 6I TGATGGAGAT ------/GAAGAG GAAGTCTCCC 3070 hom 115 het 46 0 37 9 GAAGAG 0 1 179279 CASAVA_Build 3 182025968 1D TCTAAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 2155 het 10 hom 14 1 8 5 T 17 16 179280 CASAVA_Build 3 182040976 2I GGTTTGAGAT --/AA GAGTCTAGTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 0 2 179281 CASAVA_Build 3 182042490 1D CAAATTTGTC T/- TTTTACAAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 5 4 179282 CASAVA_Build 3 182058327 1D GGGGAATGAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 304 hom 41 1 36 4 T 7 6 179283 CASAVA_Build 3 182060313 3D CAAAAAACTG AGA/--- AGGGGAGAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AGA 1 0 179284 CASAVA_Build 3 182064048 6I AAACTGAGAT ------/AATATA AATATAACGT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AATATA 1 2 179285 CASAVA_Build 3 182101729 1D GAAGACTTTG A/- AAAACATACC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 5 4 179286 CASAVA_Build 3 182347103 1D ATGTTATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 11 10 179287 CASAVA_Build 3 182358267 1I TGTATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 11 12 179288 CASAVA_Build 3 182363779 1I ATAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2366 het 281 hom 10 1 9 0 A 11 12 179289 CASAVA_Build 3 182389130 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 9 179290 CASAVA_Build 3 182395164 2D CATTTAGCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 13 11 179291 CASAVA_Build 3 182402231 1D AATTAAGAAT C/- CCATGGTTGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 3 2 179292 CASAVA_Build 3 182411297 1D TTTGTTAACG A/- AAAAACTCTA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 6 5 179293 CASAVA_Build 3 182426154 1I TGTTCCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 34 4 22 8 T 12 13 179294 CASAVA_Build 3 182432089 1D AAAAAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 12 11 179295 CASAVA_Build 3 182465269 1D CAGTTAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 11 10 179296 CASAVA_Build 3 182477466 1D AGGTATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 462 hom 26 4 11 11 A 14 13 179297 CASAVA_Build 3 182504492 1D GTAGAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 46 0 32 14 A 12 11 179298 CASAVA_Build 3 182504864 2D TTACTGGGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 31 1 20 11 A 16 14 179299 CASAVA_Build 3 182522362 1D GGTCCTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 T 13 12 179300 CASAVA_Build 3 182526959 1D AAATGTTCAA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 138 het 54 0 46 9 T 8 7 179301 CASAVA_Build 3 182542383 1D TCCGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 19 0 17 3 A 13 12 179302 CASAVA_Build 3 182550690 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 17 0 13 4 A 11 10 179303 CASAVA_Build 3 182557708 1I TAAGTTCTTC -/T TTATTTCTTT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 T 2 3 179304 CASAVA_Build 3 182560813 1D AACATGTTAG A/- ACAGAGACTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 2 1 179305 CASAVA_Build 3 182578612 1I AATACAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 10 11 179306 CASAVA_Build 3 182591676 4I AATCATCACT ----/CTGA CTGGTGTAAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CTGA 0 1 179307 CASAVA_Build 3 182620206 1I TCTTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 731 hom 31 3 23 5 A 13 14 179308 CASAVA_Build 3 182635679 3I ACCCAAACTA ---/CTT CTTCTTCTCT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 CTT 2 3 179309 CASAVA_Build 3 182638567 1D AGTGGTGATA T/- TTCTTTACAG 3070 het 3070 ref 44 26 17 1 T 3 2 179310 CASAVA_Build 3 182647009 1D CTAGATGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 625 hom 42 3 21 18 T 16 15 179311 CASAVA_Build 3 182655581 1D ACAAATCAGG A/- AAAAAAAAAA 1454 het 1454 ref 45 29 6 10 A 13 12 179312 CASAVA_Build 3 182657548 1D ACAAATGCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 8 179313 CASAVA_Build 3 182667674 1I TCTTATGAAT -/A TACCCTCCTA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 0 1 179314 CASAVA_Build 3 182683975 2I GTGCCTGGCC --/TT TGATAAAACT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 1 3 179315 CASAVA_Build 3 182686735 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 9 10 179316 CASAVA_Build 3 182696143 4D ACAAAACTCA TTGT/---- TTGTTGAATA 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 TTGT 2 1 179317 CASAVA_Build 3 182700376 1D TTAAGTTGGG T/- TTTTGGTAGA 3070 het 967 hom 26 5 13 8 T 5 4 179318 CASAVA_Build 3 182700661 1D AAAAAAAAAA T/- AAAATTGTCT 3070 het 3070 ref 33 21 10 3 T 1 0 179319 CASAVA_Build 3 182749024 1D TCATTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 1414 het 1414 ref 39 28 4 7 A 13 12 179320 CASAVA_Build 3 182758877 1D ACTAAAACGG A/- AAAAAAAAAA 1749 het 1749 ref 38 25 7 6 A 13 12 179321 CASAVA_Build 3 182773342 1D CCAACACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 37 1 20 16 A 15 14 179322 CASAVA_Build 3 182785173 1I ATGTCCCTAC -/A AGCCAGGAGA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 1 2 179323 CASAVA_Build 3 182796019 1I CCTCCAATTA -/T TTTTTCCAGT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 5 6 179324 CASAVA_Build 3 182796644 1I TCACATAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 17 21 14 T 13 14 179325 CASAVA_Build 3 182802045 2D GTTTCTTTCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 208 hom 32 5 16 11 T 13 11 179326 CASAVA_Build 3 182803106 1D ATGAATCAGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 9 8 179327 CASAVA_Build 3 182803422 1D TTGACAAAGC T/- TACAGAAGTG 3070 het 3070 hom 44 18 17 10 T 2 1 179328 CASAVA_Build 3 182806848 2I AATAAATGGC --/TG TGTTACTACA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 TG 1 2 179329 CASAVA_Build 3 182820721 1I TTCTTCAATT -/A AAAAAAAAAA 2692 het 2692 ref 42 14 12 16 A 16 17 179330 CASAVA_Build 3 182828863 4I TCTTCCTTTC ----/TTCT TTCTGTCTCT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TTCT 1 2 179331 CASAVA_Build 3 182839589 1D ATTGCTTATG A/- ACTTGGAATT 3070 hom 102 het 39 0 35 7 A 2 1 179332 CASAVA_Build 3 182847770 2D TAGATAATAG TA/-- TATAGTCAAC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 TA 3 2 179333 CASAVA_Build 3 182850723 1I GTCCTTGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 T 11 12 179334 CASAVA_Build 3 182854951 1D GTAAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 1167 het 1167 ref 22 13 5 4 T 11 10 179335 CASAVA_Build 3 182869485 1D AATAAAAAAC A/- AAAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 6 5 179336 CASAVA_Build 3 182871546 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 737 het 737 ref 13 2 4 7 T 15 14 179337 CASAVA_Build 3 182878030 4D TTATTGGGGG GTGA/---- GTAAGAACAT 3070 het 3070 hom 43 19 22 5 GTGA 1 0 179338 CASAVA_Build 3 182881807 1D ATTTTATTGA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 2906 hom 24 9 15 0 T 8 7 179339 CASAVA_Build 3 182885520 1I TTCTTACTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 8 9 179340 CASAVA_Build 3 182886632 1I AAAGAACTAC -/A AACAAACGAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 3 179341 CASAVA_Build 3 182895191 1D TAAGAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 8 16 8 A 11 10 179342 CASAVA_Build 3 182902475 1D TGCATTTTCG T/- AGTTGGTTAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 1 0 179343 CASAVA_Build 3 182908216 1D AAAAGGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 11 10 179344 CASAVA_Build 3 182918968 1D TCATTCTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 T 10 9 179345 CASAVA_Build 3 182928564 1I AGCTCTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 25 4 T 10 11 179346 CASAVA_Build 3 182941797 1I TGTTTTTTTC -/T TTTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 6 7 179347 CASAVA_Build 3 182961226 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 56 het 38 0 25 13 T 9 10 179348 CASAVA_Build 3 182963934 2D GGAGTCTGAG GA/-- GGGAGAATCA 2916 het 2891 hom 19 8 7 5 GA 1 0 179349 CASAVA_Build 3 182971457 3D TCAAAAACAG CAA/--- CAACAACAAC 3070 het 3070 ref 40 24 10 8 CAA 5 4 179350 CASAVA_Build 3 182971804 1D CATCATAAGG A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 7 6 179351 CASAVA_Build 3 182977752 1D AATTCGCACA T/- GTGAATTATA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 1 0 179352 CASAVA_Build 3 182983385 1I CCAAAATGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 9 10 179353 CASAVA_Build 3 182984092 1D GTTAAAGGCC T/- TTTTTTTTTT 2993 het 2993 ref 25 10 9 6 T 12 11 179354 CASAVA_Build 3 182986073 10D TGGCATCTCC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1691 het 951 hom 21 5 7 9 T 24 14 179355 CASAVA_Build 3 183007325 1I TAAATATTAG -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 A 0 1 179356 CASAVA_Build 3 183023758 1D GGTTGGGAAC G/- GGGGGGTCTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 G 7 6 179357 CASAVA_Build 3 183052614 3I ACGTATTTTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 21 10 11 0 TTG 2 3 179358 CASAVA_Build 3 183054521 1I ATATTGTGTA -/G GTTTATAGTG 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 G 1 2 179359 CASAVA_Build 3 183054887 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1578 het 542 hom 12 3 7 2 A 13 14 179360 CASAVA_Build 3 183055585 5D TCTCTCTCTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 959 het 959 ref 21 10 4 7 T 20 15 179361 CASAVA_Build 3 183057684 1D TCGTCTCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 10 9 179362 CASAVA_Build 3 183076290 1I AAAAAAAAAA -/C AAACACAAAA 3070 hom 50 het 26 0 19 7 C 0 1 179363 CASAVA_Build 3 183082323 1D AATTTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 35 1 27 9 A 12 11 179364 CASAVA_Build 3 183100393 1I TATTTTGAGG -/T TTTTCTTTGC 3070 het 689 hom 44 2 36 6 T 4 5 179365 CASAVA_Build 3 183105833 1D ACCTGTAAAC A/- AGATAGTTAA 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 2 1 179366 CASAVA_Build 3 183118099 1I ATGATATTGG -/A AAAAAATGGG 3070 het 3070 hom 35 16 13 6 A 6 7 179367 CASAVA_Build 3 183119239 4D AGCAAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3021 hom 36 het 17 0 13 5 AAAG 6 5 179368 CASAVA_Build 3 183121233 1D TAAAGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 11 10 179369 CASAVA_Build 3 183123699 1I CAACTGAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 11 179370 CASAVA_Build 3 183137307 1D TATCATATTT C/- ATATAGAACA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 C 1 0 179371 CASAVA_Build 3 183137896 2D TTAAAAAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 13 11 179372 CASAVA_Build 3 183139171 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 18 4 11 3 A 15 14 179373 CASAVA_Build 3 183152403 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAAAAA 2429 het 232 hom 25 2 12 11 AC 0 1 179374 CASAVA_Build 3 183157848 1D GTGACTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 26 0 16 10 T 13 12 179375 CASAVA_Build 3 183162900 2I GTAGAAATTT --/TC TCTCTTCATT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TC 2 3 179376 CASAVA_Build 3 183171818 25I AGGTTTGCTA -------------------------/CATAGATACACATGTGCCATGGTGG TTTGCTGCAC 3070 hom 66 het 22 0 22 5 CATAGATACACATGTGCCATGGTGG 0 1 179377 CASAVA_Build 3 183174007 1D ATTATTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 37 4 23 10 T 14 13 179378 CASAVA_Build 3 183189359 1D AATAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 47 1 42 4 A 11 10 179379 CASAVA_Build 3 183204039 1D AAAGTGGCCA T/- TTGTTTTCCT 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 T 3 2 179380 CASAVA_Build 3 183212295 1D CAATTGAGTG A/- AAAATGTATT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 5 4 179381 CASAVA_Build 3 183214009 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1507 het 1507 ref 22 15 4 3 T 13 12 179382 CASAVA_Build 3 183302008 1D TCATCCAGGC T/- TTGTTGTTTC 3070 het 2922 hom 20 7 12 1 T 3 2 179383 CASAVA_Build 3 183360645 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2704 het 2704 ref 30 12 10 8 T 12 13 179384 CASAVA_Build 3 183382635 2I CAATATAAAC --/TT GAGTAAATAA 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 0 2 179385 CASAVA_Build 3 183394579 1I TAATGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1692 hom 31 8 17 6 A 13 14 179386 CASAVA_Build 3 183395760 1I TTTCACCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 11 12 179387 CASAVA_Build 3 183409199 2I CAATAGGTGG --/CT CTCTGATATC 3070 het 2943 hom 26 8 14 4 CT 2 3 179388 CASAVA_Build 3 183413753 2I ACACAGATTG --/AT AGAGCTCATC 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 AT 0 1 179389 CASAVA_Build 3 183532618 2D CCTTTCTGCA CT/-- CTCTCTTTTG 3070 hom 123 het 44 0 42 3 CT 4 3 179390 CASAVA_Build 3 183552535 1I AAAGAAAAAT -/A AATACCCAGA 2985 het 2985 ref 25 13 8 4 A 2 3 179391 CASAVA_Build 3 183603324 5I CTGTCAAAAG -----/AAAGA AAAGAAAAGA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AAAGA 3 4 179392 CASAVA_Build 3 183641965 4I CAACAGTACA ----/TGGT TGGTTAATTT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 TGGT 1 2 179393 CASAVA_Build 3 183657428 1I ATTTATTTCT -/G GATCCTCTAT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 G 1 2 179394 CASAVA_Build 3 183681936 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1034 het 342 hom 10 2 6 2 T 14 13 179395 CASAVA_Build 3 183696873 2I CCTGATGCAT --/AA GTTAGAGGAG 3070 het 3070 hom 53 19 30 4 A 0 2 179396 CASAVA_Build 3 183703018 4D CTAGGGGATC ATCT/---- ATCTATGCCA 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 ATCT 2 1 179397 CASAVA_Build 3 183741568 1D AAATATGAGC A/- AGCTATCATT 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 A 2 1 179398 CASAVA_Build 3 183745197 2D CAGAACAAAC TG/-- TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 39 17 19 5 TG 1 0 179399 CASAVA_Build 3 183749943 1D GGGTAACAGA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 2 1 179400 CASAVA_Build 3 183750774 1I TGGGATCACT -/A GGAGGTCCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 179401 CASAVA_Build 3 183757731 2D TTTTACTACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 11 T 13 11 179402 CASAVA_Build 3 183759376 1D ATCATAGGGT G/- GGGGCCCTGT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 G 5 4 179403 CASAVA_Build 3 183774620 3D TTTCAGAAAT GAA/--- GGAGAAATAA 3070 het 3070 ref 35 22 13 1 GAA 1 0 179404 CASAVA_Build 3 183775151 1I TAATATCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 10 11 179405 CASAVA_Build 3 183787624 1D AACAAATAAC A/- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 3 2 179406 CASAVA_Build 3 183791304 1I AGGGAGGAAA -/T AAAGAAGAAT 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 0 1 179407 CASAVA_Build 3 183796052 1I ACAACATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 8 25 6 T 11 12 179408 CASAVA_Build 3 183809189 1D CAATGTAAAG C/- CCCCCCCCCT 3070 het 132 hom 30 3 19 8 C 10 9 179409 CASAVA_Build 3 183817213 1D TCCTCTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 17 9 T 11 10 179410 CASAVA_Build 3 183821045 3I TCTTCTGCGG ---/TCT TCTTACAGAA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 TCT 1 2 179411 CASAVA_Build 3 183863168 1D TTAACATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 32 0 24 8 A 12 11 179412 CASAVA_Build 3 183867172 7D AAAAAAAAAG AAAAAGA/------- AAAAAGAAAA 2447 hom 24 het 8 0 8 3 AAAAAGA 2 1 179413 CASAVA_Build 3 183869378 4D CTCATCTGAT ACTC/---- AAGAATGAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 3 ACTC 1 0 179414 CASAVA_Build 3 183899496 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1355 hom 19 5 10 4 A 13 12 179415 CASAVA_Build 3 183901751 1I TTGGATTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 T 11 12 179416 CASAVA_Build 3 183918861 1D TTACCATAAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 8 7 179417 CASAVA_Build 3 183918961 3I TGTTCAAGAG ---/AGA AGGTTAAATT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 AGA 0 1 179418 CASAVA_Build 3 183919181 1I TTAATTTACA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 G 1 2 179419 CASAVA_Build 3 183920508 1I TTCATGCATG -/C CAACAAGAGT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 C 1 2 179420 CASAVA_Build 3 183926190 2I GTTAGGAGTT --/AA AGAGTCTGAG 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 A 1 3 179421 CASAVA_Build 3 183945727 1I CCGTCCCCCC -/A AAAAAAAAAA 988 het 674 hom 15 3 6 6 A 15 16 179422 CASAVA_Build 3 183970834 3I TTCAGGTGCA ---/GTG GTGGCTCATA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 GTG 1 2 179423 CASAVA_Build 3 183971990 1I CCAGATTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 9 10 179424 CASAVA_Build 3 183978616 1D CTCCACGTGA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 T 8 7 179425 CASAVA_Build 3 183982162 5I CATATAGTGA -----/AAAAG AAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AAAAG 1 2 179426 CASAVA_Build 3 183983715 1I TAAACTGCAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 8 9 179427 CASAVA_Build 3 184000873 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1810 hom 22 7 11 4 A 15 14 179428 CASAVA_Build 3 184007524 1D GTATTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 A 12 11 179429 CASAVA_Build 3 184011566 4D CACTGGACAT AATG/---- AATAATCAGA 3070 het 2954 hom 19 6 12 2 AATG 1 0 179430 CASAVA_Build 3 184030805 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1842 het 1842 ref 40 20 5 16 A 17 16 179431 CASAVA_Build 3 184032059 1I TTTCCTACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 12 14 T 11 12 179432 CASAVA_Build 3 184045423 3D AAGCAGGTAT TTG/--- TTGTTACAGT 2548 het 2548 ref 19 9 6 4 TTG 2 1 179433 CASAVA_Build 3 184046781 1I ATATGTCGAG -/A AAAAAAAAAA 1374 het 1374 ref 28 17 4 7 A 13 14 179434 CASAVA_Build 3 184056413 1I TATGTTGTTG -/A GTGGGAATTA 3070 het 3070 hom 35 9 21 5 A 0 1 179435 CASAVA_Build 3 184060431 1D CCTGCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2473 hom 46 15 14 17 T 14 13 179436 CASAVA_Build 3 184066419 5D GAACGTAGTT AAGAA/----- AAGCCCTTAC 3070 het 3070 hom 43 16 25 7 AAGAA 1 0 179437 CASAVA_Build 3 184067415 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTCT 1605 het 1594 hom 8 4 4 0 A 0 1 179438 CASAVA_Build 3 184084466 4I AAGAATGCAG ----/ACTA ACTAAAAACA 2217 het 2103 hom 20 9 7 4 ACTA 1 2 179439 CASAVA_Build 3 184095446 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 13 14 179440 CASAVA_Build 3 184100368 3I TAACTCTATC ---/GTA GTATTGGATA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 GTA 1 2 179441 CASAVA_Build 3 184107260 3D TATCTGTTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 2433 het 1401 hom 16 6 9 2 A 14 11 179442 CASAVA_Build 3 184107575 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1183 hom 25 7 13 6 A 15 14 179443 CASAVA_Build 3 184123119 1I CATGTAACCC -/T TAACCCAATC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 1 2 179444 CASAVA_Build 3 184123335 3I CTCTGTGGGA ---/CTC CTCACTCATC 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 CTC 1 2 179445 CASAVA_Build 3 184124199 2I CCCTGCAACT --/CC CCCCCCCACC 2790 het 2790 ref 31 18 8 5 C 7 9 179446 CASAVA_Build 3 184128692 1D AAACTCTTTC A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 43 16 21 7 A 8 7 179447 CASAVA_Build 3 184129085 2I CCATCACTAT --/AC ACACAATGGT 3070 het 3070 hom 65 24 32 9 AC 2 3 179448 CASAVA_Build 3 184131121 4D TTAAAAATGG TTAA/---- TTAAGATGGT 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 TTAA 2 1 179449 CASAVA_Build 3 184133972 3D CTAAATAAAT GAC/--- GACATCCTGT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 GAC 2 1 179450 CASAVA_Build 3 184141638 5D TTTATGTAAC TATAT/----- TATGAGTTTG 3070 het 3070 hom 40 18 19 5 TATAT 1 0 179451 CASAVA_Build 3 184160763 1D TTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 15 11 16 A 11 10 179452 CASAVA_Build 3 184174955 1I TACTGAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 11 12 179453 CASAVA_Build 3 184194624 3I AAGGGTTTGG ---/GTT TTTTTTCTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 GTT 0 1 179454 CASAVA_Build 3 184195293 1D TTTTCTAGTA T/- TTTTTTTTTT 1833 het 1833 ref 22 11 5 6 T 14 13 179455 CASAVA_Build 3 184196483 2D TTCTCAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 12 10 179456 CASAVA_Build 3 184209850 1D TCTAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 1981 het 1981 ref 33 18 6 9 T 17 16 179457 CASAVA_Build 3 184219145 1D AAATCCTTTC A/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 A 1 0 179458 CASAVA_Build 3 184225101 1I ATTATAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 27 0 22 5 A 10 11 179459 CASAVA_Build 3 184232291 1D TTCTGGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 22 0 13 9 T 15 14 179460 CASAVA_Build 3 184235987 1I GAATTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 1473 het 1473 ref 29 9 7 13 T 17 18 179461 CASAVA_Build 3 184243139 2D GGAACTAAGT TA/-- AATACCTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 TA 1 0 179462 CASAVA_Build 3 184253432 1D CCTTTTACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 9 179463 CASAVA_Build 3 184261312 1D CGGTGTTCCG T/- TTTTTTGTCC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 7 6 179464 CASAVA_Build 3 184262832 5D TGTTTTTTCA GTTTT/----- TTTTTTTTTT 577 het 577 ref 21 11 4 6 GTTTT 1 0 179465 CASAVA_Build 3 184263677 1I GTGTTAGCCA -/G GATGGTCTTG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 1 2 179466 CASAVA_Build 3 184263827 2I AAATCTGATT --/TC TGTTTTTTCT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 TC 0 1 179467 CASAVA_Build 3 184264757 1D AAGATCCCCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 9 179468 CASAVA_Build 3 184270718 2D ATCTCAACTG AC/-- AGAGTTCTAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 AC 1 0 179469 CASAVA_Build 3 184271216 1D GACTCCGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 20 1 12 8 A 15 14 179470 CASAVA_Build 3 184272201 2I TTTTTTTTTT --/AA AGAGACAGGG 3070 hom 48 het 28 0 17 11 A 1 3 179471 CASAVA_Build 3 184273608 3D TGCTGCTGTG AAC/--- AACAAGTATT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 AAC 2 1 179472 CASAVA_Build 3 184276046 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 hom 41 het 23 0 14 9 AG 2 1 179473 CASAVA_Build 3 184278110 1D AATTTTATCA T/- TTTTTTTCGT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 T 8 7 179474 CASAVA_Build 3 184288275 1I ATGGCGTGAA -/C CAGGGAGGCG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 1 2 179475 CASAVA_Build 3 184292207 4D ATCACTCAGC CAGT/---- AAGTAGCAGG 3070 het 3070 hom 37 16 15 7 CAGT 1 0 179476 CASAVA_Build 3 184304947 1D GCTATAATGG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 9 8 179477 CASAVA_Build 3 184334803 2D TGGTTTTAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 60 hom 31 3 12 17 A 11 9 179478 CASAVA_Build 3 184344454 1D CACCAACCAG C/- CCAATTCATC 3070 hom 74 het 27 0 22 6 C 3 2 179479 CASAVA_Build 3 184347734 1D AAAAACAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 A 10 9 179480 CASAVA_Build 3 184347911 2D TGTCCCTCCC TT/-- TTGTCTCCCA 2559 het 2559 ref 41 21 9 13 T 4 2 179481 CASAVA_Build 3 184348098 1D ATGAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 38 1 23 14 T 13 12 179482 CASAVA_Build 3 184366508 1D GAAAAGAAGA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 G 2 1 179483 CASAVA_Build 3 184371823 4I TTTGCCCAAC ----/TGTA TGTAGGCTAA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 TGTA 1 2 179484 CASAVA_Build 3 184378251 2D AAGAAATAAC TG/-- AGAATAAATA 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 TG 1 0 179485 CASAVA_Build 3 184382831 1D TGCCTGGAGC A/- CCACGGGGGG 2043 het 2043 ref 38 24 6 9 A 1 0 179486 CASAVA_Build 3 184385406 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2333 hom 26 7 16 3 T 12 11 179487 CASAVA_Build 3 184390097 6D GAGAGCAGTT ACCATA/------ CTGGAAGGAG 3070 het 3070 hom 60 25 29 9 ACCATA 1 0 179488 CASAVA_Build 3 184391758 4I CATGGCCTCC ----/CTGA CTATCACCAT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 CTGA 0 1 179489 CASAVA_Build 3 184409520 1D AGCCACGAGG C/- CTTCTTTCCT 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 C 2 1 179490 CASAVA_Build 3 184413166 1D ACAAACTTAC T/- GCACAAAGAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 1 0 179491 CASAVA_Build 3 184415853 8D CAAAGAGATC ATACAGTT/-------- ATAGGGGATG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 ATACAGTT 1 0 179492 CASAVA_Build 3 184428973 5I GCCTTCTTGC -----/TCTTA TCTTATCTTC 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 TCTTA 1 2 179493 CASAVA_Build 3 184433835 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 1293 het 1293 ref 15 9 5 2 A 10 9 179494 CASAVA_Build 3 184434695 1I AGCCTCTTAT -/G GCCTTCATGA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 G 1 2 179495 CASAVA_Build 3 184453638 1I AGGGTGGCGG -/C CTGGCGGGCG 1023 hom 7 het 4 0 3 1 C 1 2 179496 CASAVA_Build 3 184469814 7D GTCCTCCTTT AAAAAAA/------- ATAAACAGCC 3070 het 3070 hom 35 14 20 2 A 8 1 179497 CASAVA_Build 3 184525516 4I AAAAACCAAA ----/CACC GCATGTTCTC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CACC 0 1 179498 CASAVA_Build 3 184526618 1D GATCAATGGG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 89 het 33 0 30 4 A 9 8 179499 CASAVA_Build 3 184527197 4D ATAATGTGTG TGTA/---- TGTAGCTCTG 3070 hom 126 het 44 0 43 4 TGTA 2 1 179500 CASAVA_Build 3 184536676 2D CTAAGTAAAC AT/-- AAATATATAA 3070 het 3070 hom 21 9 12 2 AT 1 0 179501 CASAVA_Build 3 184538943 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAGAAAA 2722 het 773 hom 27 7 10 10 G 0 1 179502 CASAVA_Build 3 184542235 1I AACACCCTGC -/T ACAGCACAAC 3070 het 3070 hom 48 12 24 12 T 0 1 179503 CASAVA_Build 3 184544622 1I AAAACCACCA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 C 8 9 179504 CASAVA_Build 3 184549283 1I TAAAAGGGCC -/T TTTTTATCAG 3070 het 3070 ref 37 21 16 0 T 5 6 179505 CASAVA_Build 3 184550352 1D TTGCTGCTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 10 9 179506 CASAVA_Build 3 184550789 1I TGGGGTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 41 3 31 7 T 11 12 179507 CASAVA_Build 3 184559272 1D CCAGTTAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 T 10 9 179508 CASAVA_Build 3 184563089 2D TTACAGGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 21 14 15 A 13 11 179509 CASAVA_Build 3 184563572 3D TTAAAACAAC AAT/--- GAGATACTAC 3070 het 3070 hom 44 19 23 5 AAT 1 0 179510 CASAVA_Build 3 184564038 16D CCAGCGTGGG CAACATAGGGAGACCC/---------------- CAACTCTACA 3070 het 3070 ref 35 19 14 6 CAACATAGGGAGACCC 1 0 179511 CASAVA_Build 3 184571235 14I TTCCTGCCCT --------------/TTACTACAATTTAC TTACTACAAT 3070 het 3070 ref 48 25 11 12 TTACTACAATTTAC 1 2 179512 CASAVA_Build 3 184575553 1D ATATGTTTTC A/- AAAAATTATA 3070 het 3070 ref 47 22 22 4 A 6 5 179513 CASAVA_Build 3 184588835 6I CTGTGGTAGG ------/GCCACA GCAACAGTTT 3070 hom 80 het 35 0 24 11 GCCACA 0 1 179514 CASAVA_Build 3 184598170 1I ATGAGTAAAA -/G TATAAATAGG 3070 het 3070 ref 38 24 7 7 G 0 1 179515 CASAVA_Build 3 184601632 1I CCACTTGGGG -/A AAAGTGAGTT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 3 4 179516 CASAVA_Build 3 184603199 5D TGTTAGCACT AATAA/----- AATAAAAAGA 3070 het 3070 ref 21 8 8 8 AATAA 2 1 179517 CASAVA_Build 3 184610392 1D CCAATCTCTT A/- ACTCCTAGAA 3070 het 3070 hom 50 19 26 6 A 2 1 179518 CASAVA_Build 3 184612771 6D GTTTGTTTGT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 21 9 7 5 TTG 7 5 179519 CASAVA_Build 3 184615281 1I TGAGTTCTTG -/T TTGACTCATT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 2 3 179520 CASAVA_Build 3 184616724 6D CTATGTTATA TAACTT/------ TATGTTTATT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TAACTT 1 0 179521 CASAVA_Build 3 184617959 3I TTAAAAGAAT ---/AAA GAAGAAATAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 3 179522 CASAVA_Build 3 184618274 1D CCACATGGCT A/- AGGGAGGCCT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 A 2 1 179523 CASAVA_Build 3 184621487 15I TTAGCACTTT ---------------/GAATATGTCATACCA TTGCTTTCTG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 GAATATGTCATACCA 0 1 179524 CASAVA_Build 3 184624399 3D CCACTGCGCC CGG/--- CGACATGGCC 3070 hom 66 het 25 0 23 5 CGG 1 0 179525 CASAVA_Build 3 184625563 8D AGAGGCAGAC ACAGAGAG/-------- ACAGGAGGTT 3070 hom 90 het 31 0 27 12 ACAGAGAG 1 0 179526 CASAVA_Build 3 184625924 1D CTCAAACCTT C/- CCCAACTCAT 3070 hom 123 het 45 0 41 5 C 4 3 179527 CASAVA_Build 3 184626438 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 29 1 26 2 A 11 12 179528 CASAVA_Build 3 184633918 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 23 0 19 4 A 12 11 179529 CASAVA_Build 3 184640820 2D TTGTGTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 40 0 27 18 T 12 10 179530 CASAVA_Build 3 184645771 1I ATTGAATGTA -/T TCATTTTCTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 179531 CASAVA_Build 3 184654863 1D TTAATGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 578 hom 31 3 10 18 T 17 16 179532 CASAVA_Build 3 184656955 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 105 het 36 0 35 4 CT 2 1 179533 CASAVA_Build 3 184659458 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 9 10 179534 CASAVA_Build 3 184663167 2D AAAAGCAAAC TT/-- AGTATGAACA 3070 hom 93 het 40 0 32 10 T 2 0 179535 CASAVA_Build 3 184663543 3I GCACTGAATA ---/GAT GATAAGCCCC 3070 hom 159 het 58 0 52 6 GAT 1 2 179536 CASAVA_Build 3 184668442 1I AAACCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 30 0 22 8 A 12 13 179537 CASAVA_Build 3 184669425 1D AACCCAGTCT C/- TACTAAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 1 0 179538 CASAVA_Build 3 184682465 1D CTTTTACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 33 1 28 5 T 11 10 179539 CASAVA_Build 3 184683074 1I GGAATGAGTT -/G GGGATCGTAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 3 4 179540 CASAVA_Build 3 184684351 2D AATCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 32 0 17 15 T 16 14 179541 CASAVA_Build 3 184715156 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 21 0 16 5 T 12 11 179542 CASAVA_Build 3 184724185 1I TTGTTGTTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 32 0 23 9 T 8 9 179543 CASAVA_Build 3 184762523 1I GCCAAGGCTG -/A ACCGTCTACC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 1 2 179544 CASAVA_Build 3 184767818 1D AAGAAAACGT A/- AAAATTCTCC 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 5 4 179545 CASAVA_Build 3 184768558 1I GTTTTTTTTT -/G GTTTTTTTTG 3070 hom 50 het 33 1 28 4 G 1 2 179546 CASAVA_Build 3 184783856 1I ATGGCATGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 840 hom 43 3 34 6 A 9 10 179547 CASAVA_Build 3 184795219 2D ATAGTATATT AA/-- AGACTGCACC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 3 1 179548 CASAVA_Build 3 184818690 3D GATATGGTGA TGG/--- TGGCATGCAC 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 TGG 2 1 179549 CASAVA_Build 3 184822064 1I TGATTGCTAT -/C TCTTAAGAAT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 C 0 1 179550 CASAVA_Build 3 184838930 5I TATTTTTGTC -----/TATTA TATTTGACAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TATTA 0 1 179551 CASAVA_Build 3 184840331 4I CACTAAAAAC ----/CAAA CAAACAAACA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 CAAA 4 5 179552 CASAVA_Build 3 184840592 2D CAAATAAAAC AA/-- TGCATTAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 5 A 2 0 179553 CASAVA_Build 3 184841076 16D TTCTTTTTTC TTTTTTCTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTGA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 TTTTTTCTTTTTTTTT 1 0 179554 CASAVA_Build 3 184842057 1D TCTTGGTTAA C/- CTTTCTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 2 1 179555 CASAVA_Build 3 184843300 4D ATCCAAAGTG TATT/---- CAAATATCAC 3070 hom 60 het 21 0 20 2 TATT 1 0 179556 CASAVA_Build 3 184846534 1I GGTTTTTTGT -/G TTTGTTTTTT 3070 het 339 hom 22 2 20 0 G 0 1 179557 CASAVA_Build 3 184846669 1I CATGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 4 5 179558 CASAVA_Build 3 184848323 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAGTAC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 A 7 6 179559 CASAVA_Build 3 184848987 1D TTCTTTTTGC T/- TGCCAGTCTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 1 179560 CASAVA_Build 3 184849486 2D CCTTGTTTCC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 11 9 179561 CASAVA_Build 3 184849964 2D CATAGATAAA TC/-- TGTCGACATA 3070 hom 62 het 25 0 21 5 TC 1 0 179562 CASAVA_Build 3 184850219 1I TACAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 912 hom 32 2 24 6 A 11 12 179563 CASAVA_Build 3 184852140 1D CTCTACTTAT A/- AAAAAACAAT 3070 het 2532 hom 23 7 12 4 A 7 6 179564 CASAVA_Build 3 184853772 1D TGCTATCACC T/- TCTGTCCCTT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 T 2 1 179565 CASAVA_Build 3 184854284 3I GCAGATAATG ---/TTA TTATAGCTCC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TTA 1 2 179566 CASAVA_Build 3 184857388 1I16M1D CAGAAAAAGG -AAAAAAAAAAAAAGACA/AAAAAAAAAAAAAAGAC- AAAAAAAAAT 2369 het 41 hom 17 1 16 2 N/A 0 0 179567 CASAVA_Build 3 184857589 3I CTGTCCTGAT ---/GCA CCACATCCTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 GCA 0 1 179568 CASAVA_Build 3 184859292 2I CTTCCTCCCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 35 0 24 11 T 11 13 179569 CASAVA_Build 3 184859623 1I GTAGGTTGTT -/G GATTTTTTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 1 2 179570 CASAVA_Build 3 184860202 7D4M3D27M1I TGGCAGAATA ATATATGTGGCAGAAACACATAGGTTTGGGGTTGACATATT-/-------TGGC---CACACATAGGTTTGGGGTTGACATATTA ACAAGTTCAG 3070 hom 84 het 27 0 26 18 N/A 0 0 179571 CASAVA_Build 3 184862891 4I TTCCCCTCTA ----/TATT TAAGTAAGAG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TATT 0 1 179572 CASAVA_Build 3 184866742 1D ATTTTGGATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 56 het 23 0 18 5 T 10 9 179573 CASAVA_Build 3 184873872 1I TGGGCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 49 1 42 6 T 10 11 179574 CASAVA_Build 3 184877393 2D GGTTTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 T 14 12 179575 CASAVA_Build 3 184879409 7D GTCCAGCGCT TACACAG/------- AACACAGAGA 3070 hom 116 het 42 0 38 6 TACACAG 1 0 179576 CASAVA_Build 3 184883413 3I AAACTGTATT ---/TTC TTTTTCGTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 TTC 0 1 179577 CASAVA_Build 3 184884630 1I ATTTACCTTT -/C TTGAAAAAGC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 0 1 179578 CASAVA_Build 3 184885293 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 10 9 179579 CASAVA_Build 3 184889274 1D ACTACAGGCG C/- CCCCCCCACC 1702 hom 10 het 4 0 4 0 C 8 7 179580 CASAVA_Build 3 184903316 2I TCTCTCTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3063 het 2974 hom 31 10 11 10 A 12 14 179581 CASAVA_Build 3 184922667 1I AAGGGAACTA -/G TATTTACTAA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 G 0 1 179582 CASAVA_Build 3 184930159 1D GTTCTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 43 2 36 5 T 12 11 179583 CASAVA_Build 3 184942528 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2474 het 634 hom 22 3 11 8 A 15 16 179584 CASAVA_Build 3 184963556 1I TTAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2475 het 2475 ref 20 11 8 1 A 11 12 179585 CASAVA_Build 3 184969768 2I AAGATTAATT --/TC TGTTTCACCT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 TC 0 1 179586 CASAVA_Build 3 184986897 1D CAACTATTGC T/- TTTTTTTTTA 1769 het 1769 ref 48 32 4 12 T 10 9 179587 CASAVA_Build 3 184993975 6I ATAATGAATA ------/CCCTTC CCTTGTCTGT 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 CCCTTC 0 1 179588 CASAVA_Build 3 185013222 1D ACTTCTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 30 3 20 9 A 13 12 179589 CASAVA_Build 3 185035644 1I TGAGATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1759 hom 26 5 12 9 A 14 15 179590 CASAVA_Build 3 185074031 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2005 het 1600 hom 13 5 5 4 A 13 12 179591 CASAVA_Build 3 185074894 1I AGAAATAATC -/T TTTTTTTTTT 2593 het 1753 hom 29 6 14 9 T 15 16 179592 CASAVA_Build 3 185080166 1I ATAAGGTACA -/T TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 4 5 179593 CASAVA_Build 3 185102866 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2960 het 2728 hom 16 7 7 3 A 12 11 179594 CASAVA_Build 3 185103630 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2081 het 958 hom 13 4 5 4 A 16 14 179595 CASAVA_Build 3 185104215 1D ATATTATACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2858 hom 25 9 11 5 T 10 9 179596 CASAVA_Build 3 185113918 1D GCCAGTTCTC A/- ACTTTCTTTG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 2 1 179597 CASAVA_Build 3 185119205 4D AGGGTGACCA GGAG/---- GGAGGGAGAC 3070 hom 132 het 51 0 43 9 GGAG 3 2 179598 CASAVA_Build 3 185122844 1D AACAAGAGCG A/- AACTCCGTCT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 3 2 179599 CASAVA_Build 3 185123647 1D GTGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 1963 het 1963 ref 46 30 5 11 T 12 11 179600 CASAVA_Build 3 185144967 3D AAGTGTTGGG AAC/--- TCAGAATATA 2293 het 2293 ref 24 18 5 2 AAC 1 0 179601 CASAVA_Build 3 185148811 2I ACCAGAGTTG --/AT ATATTCCGCT 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 AT 2 3 179602 CASAVA_Build 3 185154639 1I TGTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 T 9 10 179603 CASAVA_Build 3 185161273 1I CTCTTATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 35 1 25 9 T 10 11 179604 CASAVA_Build 3 185170922 5D CTCACCCACC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2533 het 2533 ref 26 13 7 6 T 15 10 179605 CASAVA_Build 3 185178797 1D ATATGTGGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 455 hom 38 4 26 8 T 10 9 179606 CASAVA_Build 3 185191789 1I TAAAAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 10 11 179607 CASAVA_Build 3 185194859 1D GGTATTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 35 1 26 8 T 11 10 179608 CASAVA_Build 3 185199585 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3012 hom 4 het 22 1 13 10 A 11 9 179609 CASAVA_Build 3 185204696 1D GGCTTTAGCT A/- AAAAAAAAAA 2531 hom 36 het 24 0 10 14 A 15 14 179610 CASAVA_Build 3 185211983 1I AGTTTCTTAC -/A AAACTAAATA 3070 hom 162 het 62 0 53 9 A 3 4 179611 CASAVA_Build 3 185226545 2I AAATAGTCAC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 T 9 11 179612 CASAVA_Build 3 185230125 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 32 0 24 8 A 10 11 179613 CASAVA_Build 3 185237520 1I TTTGTCACTC -/T TTTTTTTTTT 1231 het 1229 ref 15 5 5 5 T 13 14 179614 CASAVA_Build 3 185239531 13I CAGGCTCTCA -------------/TGTCAGTCCAAAT GTCAGCCTTG 3070 hom 72 het 27 0 23 4 TGTCAGTCCAAAT 0 1 179615 CASAVA_Build 3 185247592 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2799 het 228 hom 12 3 7 3 A 15 14 179616 CASAVA_Build 3 185255493 1D GATTTAACGC A/- AGTTAGATGC 3070 het 3070 hom 51 25 21 5 A 2 1 179617 CASAVA_Build 3 185257567 1I AGATTCAGGG -/A AAGACATTTG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 3 179618 CASAVA_Build 3 185269992 1D CATGGTGAAA C/- CCCATCTCTA 1528 het 1528 ref 8 4 4 0 C 4 3 179619 CASAVA_Build 3 185270170 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAATA 2009 het 1246 hom 8 3 5 1 A 9 8 179620 CASAVA_Build 3 185279586 1I TCTCCTACCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 9 10 179621 CASAVA_Build 3 185290330 1D TGTTAACATT A/- AAAAGAAATT 2473 het 2473 ref 19 8 7 4 A 5 4 179622 CASAVA_Build 3 185293923 1I CGATGGCATC -/A AAAGGAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 3 4 179623 CASAVA_Build 3 185297417 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2991 het 2991 ref 28 11 9 8 A 13 12 179624 CASAVA_Build 3 185299093 1I TAAGAATTTG -/C CTGGAAAGCA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 C 1 2 179625 CASAVA_Build 3 185303802 1D CATCTCTACC A/- AAAATATAAA 1096 het 1096 ref 15 9 4 2 A 5 4 179626 CASAVA_Build 3 185306558 4I ATTGGAAGAG ----/AAGA AAGAAATTCT 3020 het 3020 ref 33 19 8 6 AAGA 1 2 179627 CASAVA_Build 3 185309913 4I TCTTAGGTGT ----/TCTG TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 TCTG 0 1 179628 CASAVA_Build 3 185311375 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1482 het 25 hom 23 1 8 14 T 16 15 179629 CASAVA_Build 3 185315987 1D CATTTCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 12 13 T 11 10 179630 CASAVA_Build 3 185326947 1D GAAATAGTGG A/- AATATTCTAC 2637 het 2454 hom 18 6 7 5 A 3 2 179631 CASAVA_Build 3 185329916 1I TTAAAGGACA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 6 7 179632 CASAVA_Build 3 185391087 1D TGTTATTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 17 24 10 T 12 11 179633 CASAVA_Build 3 185410865 5I TTTTTTAAAT -----/TTAAC TTAATTTATT 3070 het 1853 hom 23 6 14 3 TTAAC 0 1 179634 CASAVA_Build 3 185456568 2I GACCAGCCTG --/AC ACCAACATGA 3070 het 2028 hom 23 6 10 7 AC 1 2 179635 CASAVA_Build 3 185462780 2I ATCTCTGTGC --/CA CAGTGTCTCC 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 CA 1 2 179636 CASAVA_Build 3 185466049 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3029 hom 32 12 15 5 A 13 12 179637 CASAVA_Build 3 185473064 2D AGAAAAATTA AC/-- AGTCAGAGCT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 AC 1 0 179638 CASAVA_Build 3 185479179 8D CCCTCCTTTC TTTCTTCT/-------- TTTCTTCCTC 3070 het 3070 ref 46 22 12 13 TTTCTTCT 1 0 179639 CASAVA_Build 3 185480476 1I AAATGAAAGA -/G GTGGCAGAAG 3070 hom 87 het 31 0 28 3 G 1 2 179640 CASAVA_Build 3 185487811 1D GACTGAATGT G/- GGGGGTTAGG 3070 het 3070 hom 23 9 11 5 G 6 5 179641 CASAVA_Build 3 185492187 12I TGCGGGGCAC ------------/AGGGTGGGGCAA AGGGTGGCGA 3070 hom 88 het 34 0 30 4 AGGGTGGGGCAA 0 1 179642 CASAVA_Build 3 185494210 1I GCTTATTTTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 51 23 23 5 A 8 9 179643 CASAVA_Build 3 185499191 3I TTCTCAAAAG ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 2419 hom 38 9 19 10 CAA 5 6 179644 CASAVA_Build 3 185502795 1I AAGTGAATTC -/A ATGGGGAAAA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 A 1 2 179645 CASAVA_Build 3 185510575 2I CCTCATACTT --/AG TTCTAACTTG 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 AG 0 1 179646 CASAVA_Build 3 185522461 9D AAGAGGAAGA AGGAGAAGC/--------- AGGAGAAGCA 3070 het 3070 hom 37 14 15 12 AGGAGAAGC 3 2 179647 CASAVA_Build 3 185531554 4D GGTGGTTATT TGAC/---- TGACATCTGT 3070 het 3070 ref 46 22 18 8 TGAC 2 1 179648 CASAVA_Build 3 185547655 3D GGAAAATAAT AAC/--- AATCGTAATA 3070 het 3070 ref 36 21 13 4 AAC 1 0 179649 CASAVA_Build 3 185550211 1D GAGGTGTGAT C/- CCCATTTTAC 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 C 4 3 179650 CASAVA_Build 3 185571475 4D CCTCAAAACT CTAA/---- CTGTTACTCC 3070 het 2702 hom 15 6 7 4 CTAA 1 0 179651 CASAVA_Build 3 185592806 1I CATGGTGGTA -/C TGCTGGCAGC 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 C 0 1 179652 CASAVA_Build 3 185595377 1I TCTGACCTTT -/C GCATTGAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 C 0 1 179653 CASAVA_Build 3 185598169 1I AGAGTGAGCA -/T TAAAACAATA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 1 2 179654 CASAVA_Build 3 185599049 3D CCTTCTGACA CCC/--- CCCCCCACCC 3060 het 3060 ref 38 20 13 6 C 9 6 179655 CASAVA_Build 3 185600195 1I TTTTAGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3043 het 3043 ref 38 20 11 7 T 11 12 179656 CASAVA_Build 3 185603164 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 1470 hom 7 het 9 0 3 6 T 11 10 179657 CASAVA_Build 3 185609198 23I TCTTAAGCGT -----------------------/CAAAGTGTACTTATGCATAAGTA CACTTTGCAT 3070 het 3070 hom 32 15 12 7 CAAAGTGTACTTATGCATAAGTA 0 1 179658 CASAVA_Build 3 185615391 2D TATGTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 1230 het 1230 ref 57 34 3 22 TG 10 9 179659 CASAVA_Build 3 185619429 1D CTCCATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 12 11 179660 CASAVA_Build 3 185624924 1I TTATTATTAA -/T TTTTTTTTTG 2754 het 2754 ref 17 7 7 3 T 9 10 179661 CASAVA_Build 3 185632621 1D CGGTCTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 11 10 179662 CASAVA_Build 3 185645610 1D TTATGGACAC T/- TTTCTCTCCT 3070 het 3070 ref 57 27 20 11 T 4 3 179663 CASAVA_Build 3 185648688 4I GGATTACAGG ----/TGTT TGTTAGCCAC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TGTT 1 2 179664 CASAVA_Build 3 185663081 5I CGGGATTATT -----/TAAAG TATTCAGGAG 3070 hom 24 het 12 0 9 3 TAAAG 0 1 179665 CASAVA_Build 3 185668752 1I GTGTGGAGTC -/G GGGGGGGGTC 2747 het 1500 hom 31 7 12 12 G 8 9 179666 CASAVA_Build 3 185685063 7D TGAAAAGTCA CGGATGG/------- CGATCCTGCT 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 CGGATGG 1 0 179667 CASAVA_Build 3 185686520 1I AGTTTTTCAA -/C CCTTGCCCCA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 C 2 3 179668 CASAVA_Build 3 185693100 13D AGAGAGAGGG GAGGACGGAGAGA/------------- GAGAAACCTG 2735 het 2735 ref 22 11 7 7 GAGGACGGAGAGA 1 0 179669 CASAVA_Build 3 185697249 3D TTTTCAAGTT GAA/--- GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 47 20 23 7 GAA 2 1 179670 CASAVA_Build 3 185698687 3I GACCAAAGAT ---/TGG CTGAAAATAT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 TGG 0 1 179671 CASAVA_Build 3 185698861 1I TCTCTGGCTT -/C CCCTCAGAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 3 4 179672 CASAVA_Build 3 185699076 1D CACACCCCCC T/- GCAACTGCCC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 T 1 0 179673 CASAVA_Build 3 185705722 3D TTGGGGGGGG GGC/--- GAAATTCAAG 3070 hom 98 het 39 0 31 8 GGC 1 0 179674 CASAVA_Build 3 185711943 1D GGAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 82 het 30 0 26 4 A 10 9 179675 CASAVA_Build 3 185727267 1I GATTAACGGG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 6 7 179676 CASAVA_Build 3 185730826 1D TGGAAAAATG C/- CCCCCCTTCC 2512 hom 24 het 11 0 9 2 C 7 6 179677 CASAVA_Build 3 185736407 1I TTCCTCAATG -/A AAAAGAAGGG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 4 5 179678 CASAVA_Build 3 185742416 1D GCTGCCATCA T/- TTTTAGTTTG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 5 4 179679 CASAVA_Build 3 185748791 1D TTGTTTCCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 30 5 18 9 T 12 11 179680 CASAVA_Build 3 185758853 1D CACTCTCAGT C/- CCCCCTCCCA 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 C 6 5 179681 CASAVA_Build 3 185774089 3I ACCCTGGGCT ---/CTC CTCTGCCCCT 3070 het 3070 ref 39 15 11 13 CTC 1 2 179682 CASAVA_Build 3 185782736 6D GGATGTGTGA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 63 het 29 0 18 12 GT 12 9 179683 CASAVA_Build 3 185797046 1D GTCCCTACTC T/- TTTTTTTTTT 2952 het 1720 hom 26 8 8 10 T 12 11 179684 CASAVA_Build 3 185801043 3D CCATTTTAGC GAG/--- GAGGCCGTGG 3070 het 3070 hom 52 21 28 3 GAG 2 1 179685 CASAVA_Build 3 185809336 1D TCTCTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 2598 het 2598 ref 20 11 7 2 T 14 13 179686 CASAVA_Build 3 185814827 2D CTTCATCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 29 0 25 5 A 14 12 179687 CASAVA_Build 3 185815864 1I CTCCATCTCG -/A AAAAAACAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 6 7 179688 CASAVA_Build 3 185825077 1I CACACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 23 1 18 4 T 10 11 179689 CASAVA_Build 3 185825489 2D TTATGAACAC TT/-- TTATGGCCCT 3070 het 3070 hom 32 10 16 7 T 4 2 179690 CASAVA_Build 3 185831769 1D AATTAATACC A/- AAAATCCCAC 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 5 4 179691 CASAVA_Build 3 185836033 2I AGGGACAGAG --/AC AGAGACACGG 3070 hom 111 het 39 0 35 4 AC 0 1 179692 CASAVA_Build 3 185839017 2I AGCAGATGGA --/TG TGATCATGGG 3070 hom 96 het 35 0 31 5 TG 1 2 179693 CASAVA_Build 3 185843333 23I TGTGCGTGTG -----------------------/TGCGCACGCGCAGGTGTGTGCGT GAGTGAAGGG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 TGCGCACGCGCAGGTGTGTGCGT 0 1 179694 CASAVA_Build 3 185854465 1I AAAAAAATCC -/A AAAAAAAAAA 2158 het 460 hom 14 2 9 3 A 14 15 179695 CASAVA_Build 3 185854609 1D TTGGAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 12 11 179696 CASAVA_Build 3 185857919 1D TAGGGCAGCC T/- TTTTTTTTTT 1038 het 1038 ref 45 24 4 17 T 15 14 179697 CASAVA_Build 3 185861873 1D AACTCCCATC T/- TTTTTTTTTT 2379 het 507 hom 15 2 6 7 T 15 14 179698 CASAVA_Build 3 185866531 1D CATGGTGAAA C/- CCCCATCTCT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 C 5 4 179699 CASAVA_Build 3 185875552 1I CACTATGCTT -/G GCTGAGGATA 3070 hom 87 het 36 0 28 8 G 1 2 179700 CASAVA_Build 3 185882802 4I ATTCTTTTTC ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 TGTT 4 5 179701 CASAVA_Build 3 185912666 1I GGGTGGGGAC -/G GGGGGTGCGC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 G 5 6 179702 CASAVA_Build 3 185949735 2D AAGGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 2547 hom 22 7 8 7 AG 9 8 179703 CASAVA_Build 3 185949941 4D GAAAGAAAAA AGAC/---- AGAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 9 5 AGAC 1 0 179704 CASAVA_Build 3 185955986 1I TGGCAGGAGG -/A CGTTCTGTTG 3070 het 3070 hom 40 11 18 11 A 0 1 179705 CASAVA_Build 3 185956667 1I TAATCCCCCC -/T TTTCAGGCTG 3070 het 3070 ref 44 16 13 15 T 3 4 179706 CASAVA_Build 3 185963145 1D TCCTCTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 21 3 14 4 T 15 14 179707 CASAVA_Build 3 185973164 3D ACTTTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 110 hom 10 1 8 1 A 16 13 179708 CASAVA_Build 3 185973328 4D36M4D GAGGGAGGGG GAGAGAGAGAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAAAGAAAAGAAAAAG/----GAGAGAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAAAGAAAAGAA---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 18 10 12 5 N/A 0 0 179709 CASAVA_Build 3 185973639 2D TTTATTATCA CC/-- CCCCCCTCCA 3070 het 2349 hom 21 7 11 4 C 8 6 179710 CASAVA_Build 3 185978489 3I ATCAAAGATG ---/TAT TATTGAGCCC 3070 het 3070 ref 37 21 9 7 TAT 1 2 179711 CASAVA_Build 3 185980952 1I TTCCTTTAAT -/C CCTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 C 2 3 179712 CASAVA_Build 3 185992384 1D ATTTGCCAAA G/- GGTTAAGATT 3070 het 3070 hom 60 23 33 4 G 3 2 179713 CASAVA_Build 3 185999710 1I TTGGTGGAAA -/T TTTGTCTACT 861 het 861 ref 27 17 3 7 T 3 4 179714 CASAVA_Build 3 186003258 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2994 het 2994 ref 29 11 8 10 T 12 11 179715 CASAVA_Build 3 186123276 2I GGCTGCAGAC --/AG AGAGGAAACA 3070 hom 84 het 33 0 27 6 AG 2 3 179716 CASAVA_Build 3 186123663 1I GGAACTTTTT -/A ATAGATGTGT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 A 1 2 179717 CASAVA_Build 3 186125282 1I TCTAATTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1399 hom 46 4 26 16 T 13 14 179718 CASAVA_Build 3 186148705 1I ATATAGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 604 hom 29 2 17 10 T 13 14 179719 CASAVA_Build 3 186151929 1I ATTACAGCAC -/T TTCACTCCAG 3070 hom 75 het 36 0 24 12 T 2 3 179720 CASAVA_Build 3 186153018 2I GAAAATAAGC --/CT AGTTCAAGGG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 CT 0 1 179721 CASAVA_Build 3 186156265 4D TACTGAGCAC TATT/---- TATTATGTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 7 TATT 2 1 179722 CASAVA_Build 3 186162204 2D ATAAGTTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 14 12 179723 CASAVA_Build 3 186163339 1D GGCTTTTAAT C/- CATCTGGAGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 1 179724 CASAVA_Build 3 186170071 4I GCCACCACTC ----/TCAG CCAGCTAATC 1332 het 1332 ref 11 5 3 3 TCAG 0 1 179725 CASAVA_Build 3 186182444 1D TAAATGATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 10 9 179726 CASAVA_Build 3 186182871 1D TTGTATTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 272 hom 38 1 26 11 T 13 12 179727 CASAVA_Build 3 186182884 1D TTTTTTTTTT G/- CCCCAAATAT 3070 het 418 hom 35 4 21 10 G 1 0 179728 CASAVA_Build 3 186187899 1D CCCACACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 24 10 T 12 11 179729 CASAVA_Build 3 186191408 2D AATTACACCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 37 0 24 15 T 13 11 179730 CASAVA_Build 3 186202112 2I TCATGCCTGA --/TT AAATTATTGG 3070 hom 96 het 39 0 31 8 T 0 2 179731 CASAVA_Build 3 186203599 12D ATCTAATATT TTTTTATTTTTA/------------ TTTTTATTTT 1471 hom 7 het 11 0 3 8 TTTTTA 5 3 179732 CASAVA_Build 3 186205016 3D GGGAGAGCTC TTT/--- TTTATTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 2 T 6 3 179733 CASAVA_Build 3 186205464 2D AGCCAATGTC TA/-- TACAAGGGTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TA 2 1 179734 CASAVA_Build 3 186207327 2D2M1D TCTGTCAAAT GCAGT/--AG- CCTTTTGTTT 3070 hom 129 het 49 0 43 8 N/A 0 0 179735 CASAVA_Build 3 186209815 5D TAAATCAACT ATACA/----- ATACCATTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 ATACA 1 0 179736 CASAVA_Build 3 186211596 1I CACAGAGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1408 hom 23 4 15 4 A 13 14 179737 CASAVA_Build 3 186293472 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2610 het 42 hom 28 2 12 14 A 17 16 179738 CASAVA_Build 3 186296627 1D TATACTTCTG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 78 het 28 0 25 4 T 7 6 179739 CASAVA_Build 3 186303984 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 38 0 26 12 A 10 9 179740 CASAVA_Build 3 186323767 1D AAAAAAGTCC T/- TTTTTTACAT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 7 6 179741 CASAVA_Build 3 186332907 1D GTAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 A 13 12 179742 CASAVA_Build 3 186337276 1D CGCCTGTAAT C/- CTGGCTACTC 2335 hom 12 het 5 0 5 0 C 2 1 179743 CASAVA_Build 3 186345208 1I CCTGCCTTGG -/C CTCTCAAAGT 3070 hom 71 het 26 0 23 3 C 1 2 179744 CASAVA_Build 3 186345957 4I AATACATTAT ----/TAAA TGTTTTTGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TAAA 0 1 179745 CASAVA_Build 3 186357740 1I CAGTTCCGTA -/G GGAACTGTTG 3070 hom 160 het 61 0 54 7 G 2 3 179746 CASAVA_Build 3 186389989 1D AGCTGGGACT A/- ACAGGCATGC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 2 1 179747 CASAVA_Build 3 186403562 1D AAAGATGGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 36 0 32 5 A 9 8 179748 CASAVA_Build 3 186413156 1I TCAACATGTA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 7 8 179749 CASAVA_Build 3 186417507 1D TGCGGAGACA G/- AAGTTCTCAA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 G 1 0 179750 CASAVA_Build 3 186440884 1D TGGTCTTGGG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 8 7 179751 CASAVA_Build 3 186450978 1D GGAACTGCTT A/- AAAGGAAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 4 3 179752 CASAVA_Build 3 186451187 3D GCCCTTATTT ATA/--- ATGATTCCCT 3070 hom 93 het 36 0 32 8 ATA 1 0 179753 CASAVA_Build 3 186451693 1D AGGTCTTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 74 het 32 0 23 9 T 10 9 179754 CASAVA_Build 3 186454072 3I AAAGAAAAAT ---/AAA AAAAAGTCGG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 5 8 179755 CASAVA_Build 3 186476392 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 842 hom 32 3 25 4 T 12 13 179756 CASAVA_Build 3 186496176 1D AAATCACCCA T/- TTTTTTCTCA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 6 179757 CASAVA_Build 3 186498227 6D AAAAAAAAAA AAAAAG/------ AAAAGAAAAG 3070 hom 71 het 28 0 22 9 AAAAAG 1 0 179758 CASAVA_Build 3 186501590 3I TTACCAACAC ---/TTG TTATTATTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTG 0 1 179759 CASAVA_Build 3 186501809 1I TTTTTTTTTT -/A TTATTATTGA 3070 het 811 hom 32 3 24 5 A 0 1 179760 CASAVA_Build 3 186505414 1D GCACCCGGCC A/- CCCCTGTTCT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 1 0 179761 CASAVA_Build 3 186505913 2D TCACAAATTA TG/-- TCTTTTATAC 3070 het 3070 ref 48 23 20 7 TG 1 0 179762 CASAVA_Build 3 186509005 3D AAAGGCCATG AGT/--- TGGGCATTTT 3070 hom 111 het 43 0 37 9 AGT 1 0 179763 CASAVA_Build 3 186514218 1I AGTAGTGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 496 hom 37 3 32 2 A 11 12 179764 CASAVA_Build 3 186521301 15D TTTGGCAGAG ATTAAACTGCAATTT/--------------- AAATACAGAT 3070 hom 47 het 24 0 23 5 ATTAAACTGCAATTT 1 0 179765 CASAVA_Build 3 186525291 1D CGGCACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 134 hom 27 1 23 3 A 13 12 179766 CASAVA_Build 3 186527995 1I GAAAAGAATT -/G AAGATGATCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 179767 CASAVA_Build 3 186529604 1D AGTAGTTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 8 179768 CASAVA_Build 3 186531993 1D TGTTGTGTTA T/- GTAGGATATA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 T 1 0 179769 CASAVA_Build 3 186532709 2D AATGTGTACT CC/-- CCCCCCCCAT 3070 hom 96 het 39 0 33 7 C 10 8 179770 CASAVA_Build 3 186535086 1D ATGGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 42 0 17 25 T 13 12 179771 CASAVA_Build 3 186535519 1D CAGAAACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 A 13 12 179772 CASAVA_Build 3 186537058 9I AGTTTAAGGA ---------/AGTATCCCT ATAATATTTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AGTATCCCT 0 1 179773 CASAVA_Build 3 186540478 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 31 0 26 6 T 11 10 179774 CASAVA_Build 3 186541520 2D AAATAAAGTT AC/-- ATTCTGAGAT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AC 1 0 179775 CASAVA_Build 3 186555046 1I45M1D CTCAAGTAGA -GCTCATCAAGAGCCTCAAGAACAACACTGGGACTGTTATAAGTATG/GGCTCATCAAGAGCCTCAAGAACAACACTGGGACTGTTATAAGTAT- GGGGGGGGGC 3070 hom 51 het 17 0 18 11 N/A 0 0 179776 CASAVA_Build 3 186559120 2I CTGGACAGAG --/AA AAAAATGGCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 5 7 179777 CASAVA_Build 3 186570950 1I AGTGCTGGGA -/T TTACAGGCGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 2 3 179778 CASAVA_Build 3 186574269 3I TGACATGTTC ---/TCA TCAACCTGGT 3070 hom 42 het 23 0 17 6 TCA 1 2 179779 CASAVA_Build 3 186574626 1I TTTTCACTCC -/T TTTTTGTGGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 5 6 179780 CASAVA_Build 3 186590280 4D AAAAATTTGT TAAG/---- TATTTATTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 TAAG 1 0 179781 CASAVA_Build 3 186591302 1I GATGGGGTTT -/C ACCATGTTGG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 0 1 179782 CASAVA_Build 3 186593673 3I ATAAGAGAAA ---/AAT AATAAGTCAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAT 1 2 179783 CASAVA_Build 3 186597522 1I TTCTTGTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 28 hom 43 1 33 9 T 9 10 179784 CASAVA_Build 3 186601291 1D CTGCTAGGTG T/- TTTTTTTTTT 807 het 807 ref 36 31 3 2 T 13 12 179785 CASAVA_Build 3 186609054 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 37 1 28 8 A 12 11 179786 CASAVA_Build 3 186634470 1D TGGAAAAAAA T/- AATTTATATC 3070 het 263 hom 34 1 31 2 T 1 0 179787 CASAVA_Build 3 186642692 1D AAAAAGTGTA T/- ATTTTCATAT 3070 het 347 hom 21 2 14 5 T 1 0 179788 CASAVA_Build 3 186642804 1I GTCTGACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 11 12 179789 CASAVA_Build 3 186644826 1I TCAAAAAAAA -/T AATAATAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 0 1 179790 CASAVA_Build 3 186645519 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATTT 3070 hom 39 het 27 0 14 13 AT 5 4 179791 CASAVA_Build 3 186645567 1D TCTTAGGGGG A/- ATCCATTATC 3070 hom 48 het 27 0 17 10 A 2 1 179792 CASAVA_Build 3 186650214 1D CCCACATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 29 0 22 8 T 15 14 179793 CASAVA_Build 3 186657615 14D AGCTAAGTTG CCACAGTCGGGTTC/-------------- CTCACCTGAA 1798 het 480 hom 45 4 10 38 CCACAGTCGGGTTC 1 0 179794 CASAVA_Build 3 186661988 4D AGAAAGATAC TCTT/---- TCTATTATTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TCTT 1 0 179795 CASAVA_Build 3 186662367 1I ATTGCTATTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 9 179796 CASAVA_Build 3 186676111 1D AGGCGGGTGG A/- ACACCTGAGG 3070 het 1492 hom 18 7 10 1 A 2 1 179797 CASAVA_Build 3 186683294 1I AATTTCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 11 22 11 A 11 12 179798 CASAVA_Build 3 186693815 1D AAGGAGAAAC T/- TTAGATATCG 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 3 2 179799 CASAVA_Build 3 186707839 1D AGGCAACTCC A/- AAAAAAAAAA 1286 het 1286 ref 28 11 3 14 A 13 12 179800 CASAVA_Build 3 186762830 1I TTTTTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 478 hom 26 3 15 8 T 16 17 179801 CASAVA_Build 3 186768308 1I AGGATACCCT -/A ATTCCTTCTC 1562 het 1562 ref 18 13 4 1 A 1 2 179802 CASAVA_Build 3 186783545 1D GCAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 7 A 11 10 179803 CASAVA_Build 3 186784286 2D AGTTTTCTGA TT/-- TATGTGTGTG 3070 het 2041 hom 24 7 13 5 T 3 1 179804 CASAVA_Build 3 186784527 1D GTCCTGACTC T/- TGATTACATT 3070 het 3070 ref 44 19 14 12 T 2 1 179805 CASAVA_Build 3 186793102 1D CAGGGTCTCC T/- TTTTTTTTTT 2528 het 757 hom 24 5 7 12 T 15 14 179806 CASAVA_Build 3 186807469 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2844 hom 26 10 9 7 T 12 11 179807 CASAVA_Build 3 186812999 3D AGGAATGTCT TGA/--- TGTTGTGGAA 3070 het 3070 ref 42 27 13 6 TGA 1 0 179808 CASAVA_Build 3 186817354 1I TCAAATCTTC -/A TTCTACCTTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 0 1 179809 CASAVA_Build 3 186823706 2D TCACCGCAAC CT/-- CTGTCTCCCG 2931 het 1407 hom 16 5 8 3 CT 2 1 179810 CASAVA_Build 3 186830058 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1682 het 1682 ref 26 11 4 11 A 15 16 179811 CASAVA_Build 3 186833879 1I TGGTACTTAC -/T TAACTCATTT 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 T 1 2 179812 CASAVA_Build 3 186837719 9I TGCCTTAAGC ---------/GGAGCAAAG GGAGGAAATA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 GGAGCAAAG 0 1 179813 CASAVA_Build 3 186841840 1I CCTTCAAATC -/T TTTTTTTTTT 1908 het 1307 hom 20 4 8 8 T 15 16 179814 CASAVA_Build 3 186881315 1D ACAGAAAGAA G/- GGGGGGGAAC 3070 hom 64 het 30 0 25 5 G 8 7 179815 CASAVA_Build 3 186890450 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1112 hom 18 het 10 0 5 6 A 17 16 179816 CASAVA_Build 3 186907682 1I ACTCCAGCCT -/G GGCAACAAGA 1972 hom 24 het 12 0 8 4 G 2 3 179817 CASAVA_Build 3 186913210 1I TGAATTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 58 27 23 8 A 11 12 179818 CASAVA_Build 3 186934954 4I CGTCTCTGTT ----/CATC CATCCATTCT 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 CATC 1 2 179819 CASAVA_Build 3 186942370 3D TGAATGTAGA AAG/--- AAGGCAATGG 3070 het 3070 ref 45 25 17 5 AAG 2 1 179820 CASAVA_Build 3 186943654 1D AATAATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 11 10 179821 CASAVA_Build 3 186971858 1I GGGAGGTGGA -/G GTTGCAGTGG 3070 hom 51 het 22 0 17 5 G 1 2 179822 CASAVA_Build 3 186980247 1I AGCTTCTCCT -/A ATTGCCATTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 2 179823 CASAVA_Build 3 186986566 1D CTAATTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 11 10 179824 CASAVA_Build 3 186988215 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 33 0 23 10 A 12 11 179825 CASAVA_Build 3 186990763 10D CTTCTAAACA AAATGATTGG/---------- GAAGTGAGTC 3070 hom 102 het 35 0 35 7 AAATGATTGG 1 0 179826 CASAVA_Build 3 186997047 4D ATTCCGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2600 het 22 hom 14 1 9 6 A 22 18 179827 CASAVA_Build 3 187002717 2D GCACACAGGT AG/-- AGAGGTTCTG 3070 hom 123 het 47 0 41 7 AG 3 2 179828 CASAVA_Build 3 187004919 1I TGTCTCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 10 11 179829 CASAVA_Build 3 187008803 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 10 9 179830 CASAVA_Build 3 187020331 1I AGATTGGATG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 94 het 36 0 32 4 T 7 8 179831 CASAVA_Build 3 187047928 5D CACTGTGTTA GCCAG/----- GATGGTCTAC 2597 het 819 hom 9 2 7 1 GCCAG 1 0 179832 CASAVA_Build 3 187051638 1I ATATGCTTAG -/A AAAAATAAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 5 6 179833 CASAVA_Build 3 187052033 1D GGCGTAGTGG C/- CTCACACTTG 3070 hom 30 het 13 0 10 3 C 2 1 179834 CASAVA_Build 3 187052472 9D CCCTGTGTGG AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 2105 hom 27 9 12 9 A 20 11 179835 CASAVA_Build 3 187068740 4D TTTATAAATT ATTA/---- ATTATAGATT 3070 het 3070 ref 18 8 9 2 ATTA 2 1 179836 CASAVA_Build 3 187069634 2D AGCTGAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 2710 het 2710 ref 24 15 7 2 A 12 10 179837 CASAVA_Build 3 187087093 1I CACGGTGAAA -/C CCCCTCTCTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 4 5 179838 CASAVA_Build 3 187095525 2I CAGAGTAATG --/CT TAAAATAGAG 3070 het 3070 ref 24 12 7 5 CT 0 1 179839 CASAVA_Build 3 187103268 1D AGAATTCCAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 8 7 179840 CASAVA_Build 3 187104028 1D TCGCCCAGAC T/- TTTTTTTTTT 1861 het 1224 hom 15 5 6 4 T 15 14 179841 CASAVA_Build 3 187112857 1I AAAAGAACAC -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 6 7 179842 CASAVA_Build 3 187113389 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 12 8 A 16 15 179843 CASAVA_Build 3 187114373 6I AAAAAGACTA ------/TTGTTT TTATTTCTGT 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 TTGTTT 0 1 179844 CASAVA_Build 3 187115247 3D GGCGTGTCCA CTG/--- CTAATAAATC 3070 het 3070 ref 41 18 17 7 CTG 1 0 179845 CASAVA_Build 3 187119677 6I TATCAGTGAC ------/TAACTT TAACATCACT 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 TAACTT 0 1 179846 CASAVA_Build 3 187121420 4D TACACATTAA ATTG/---- ATTAAGACAC 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 ATTG 1 0 179847 CASAVA_Build 3 187125294 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 7 6 179848 CASAVA_Build 3 187134285 2D TAGCACAGAC TG/-- TTAAATTTAC 3070 het 3070 hom 37 19 16 2 TG 1 0 179849 CASAVA_Build 3 187145735 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2974 het 883 hom 14 3 8 3 A 11 12 179850 CASAVA_Build 3 187149542 1D CTGAGTTTTT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 30 13 10 8 A 8 7 179851 CASAVA_Build 3 187154204 1D AATACCATTA T/- TACACCCATT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 2 1 179852 CASAVA_Build 3 187155747 2D GTACATGTTC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 49 19 26 6 AT 1 0 179853 CASAVA_Build 3 187158106 1D TGAAGTCATT C/- CCCCGTGACC 3070 hom 57 het 29 0 19 10 C 5 4 179854 CASAVA_Build 3 187174191 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAATTT 1387 het 29 hom 8 1 5 2 A 8 7 179855 CASAVA_Build 3 187175181 1D ATTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2554 het 7 hom 21 1 7 13 T 17 16 179856 CASAVA_Build 3 187175633 1I TCTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 285 hom 44 1 37 6 T 9 10 179857 CASAVA_Build 3 187177558 1I CAAAGAGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2629 hom 43 11 15 17 T 11 12 179858 CASAVA_Build 3 187181512 1D CTCTCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 31 0 21 10 A 11 10 179859 CASAVA_Build 3 187187452 1I AAATACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 9 179860 CASAVA_Build 3 187187916 1I TCATCATTTT -/A TATTTATTTA 2659 hom 30 het 36 0 10 26 A 0 1 179861 CASAVA_Build 3 187188331 4I27M1I TCTTCTTTGG ----TACACAGCTGGACCTCATTTCTCAGCG-/TACATACACAGCTGGACCTCATTTCTCAGCGT TTTTTTGCAA 3070 het 3070 hom 48 27 29 8 N/A 0 0 179862 CASAVA_Build 3 187194570 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 9 8 179863 CASAVA_Build 3 187200895 1I ATGACTCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 11 12 179864 CASAVA_Build 3 187203847 2D GCCCCCAAAC TG/-- TGGTTGACCT 3070 hom 85 het 34 0 28 6 TG 2 1 179865 CASAVA_Build 3 187214086 1D CAGACTCCCT G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 59 het 27 0 19 8 G 8 7 179866 CASAVA_Build 3 187218572 5D CGACTCTTCC TTTCA/----- TTTCAACACT 3070 hom 75 het 29 0 25 5 TTTCA 2 1 179867 CASAVA_Build 3 187234959 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 11 10 179868 CASAVA_Build 3 187248275 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 6 7 179869 CASAVA_Build 3 187271682 1D TGCTCACAGG A/- AAAAAAAAAA 1491 het 1491 ref 36 29 4 3 A 11 10 179870 CASAVA_Build 3 187301945 1I TTTTTTATAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 7 8 179871 CASAVA_Build 3 187314760 1D CCAATCTCTC T/- TTAGAAGTGG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 3 2 179872 CASAVA_Build 3 187317270 1I TATTCATTCA -/T TTTGTAGTAT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 3 4 179873 CASAVA_Build 3 187319067 4D CCAAACAAAC AAAA/---- ACTCAATCAA 3070 het 3070 ref 52 26 25 6 A 5 1 179874 CASAVA_Build 3 187321769 1I TTTTTTTTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1886 hom 16 6 9 1 A 9 10 179875 CASAVA_Build 3 187322560 1I GAACAGGGAA -/G GCTGTCTGGG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 1 2 179876 CASAVA_Build 3 187324956 8D TCAAACGGCA GGTTCAGC/-------- ACTTCTAAGT 3070 het 3070 hom 48 25 22 2 GGTTCAGC 1 0 179877 CASAVA_Build 3 187325331 1D CCAAAGACGG C/- CCCCCAGGCC 1916 het 1916 ref 24 8 8 8 C 6 5 179878 CASAVA_Build 3 187341447 1I CCAGGAAAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 8 9 179879 CASAVA_Build 3 187366719 13D ATTACTGACG ATCACTAATGGAC/------------- ATCACTAATG 3070 het 3070 hom 68 28 28 17 ATCACTAATGGAC 2 1 179880 CASAVA_Build 3 187384995 6D CAATTCTCCT GCCTCA/------ GCCTCCCTTG 3070 het 645 hom 20 3 14 3 GCCTCA 1 0 179881 CASAVA_Build 3 187388941 4D GTGTGCGTGC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 37 15 16 8 GT 7 5 179882 CASAVA_Build 3 187392502 1I CCTTTATTTA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 T 6 7 179883 CASAVA_Build 3 187395587 1I GACTCTGTAT -/A AAAAAAAAAA 2825 het 2825 ref 17 9 7 1 A 10 11 179884 CASAVA_Build 3 187408195 1D CTCCAAGTCA G/- GGCCCTGGCC 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 G 3 2 179885 CASAVA_Build 3 187426979 1I TCAGGGGCAA -/G GGTGGTACAG 3027 het 3027 ref 33 13 10 10 G 2 3 179886 CASAVA_Build 3 187470621 1D AATAAACGTG T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 111 het 44 0 37 8 T 8 7 179887 CASAVA_Build 3 187479900 1D AAGATACCAC T/- AATGGAAGCC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 1 0 179888 CASAVA_Build 3 187487003 4I GCATTCAAAG ----/TACT TACTTAGCAA 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 TACT 1 2 179889 CASAVA_Build 3 187493158 1I GTGCCTGTAA -/T TCCCAGCTAC 1572 het 17 hom 5 0 4 1 T 1 2 179890 CASAVA_Build 3 187494414 1D CAGGAAAAGG T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 6 179891 CASAVA_Build 3 187496596 2D TATCTCAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 30 0 14 16 A 14 12 179892 CASAVA_Build 3 187498330 1D GATCCATAGT G/- GCAGGAATTA 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 G 2 1 179893 CASAVA_Build 3 187511437 2I TTCAAGGAGA --/CT CAGCTCGTAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 CT 0 1 179894 CASAVA_Build 3 187525000 1D CGATCAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 15 11 A 14 13 179895 CASAVA_Build 3 187529059 1I TACACCATTC -/T TTTTTTTTTT 2366 het 1717 hom 26 7 10 9 T 15 16 179896 CASAVA_Build 3 187532499 1I CTGTGTTGTT -/C CAAAGCTCAT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 C 1 2 179897 CASAVA_Build 3 187544878 1I CCATGGAATA -/C TATACAGTGA 3070 het 3070 ref 44 27 15 2 C 0 1 179898 CASAVA_Build 3 187592385 2D AGCTGTAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 34 0 25 9 A 14 12 179899 CASAVA_Build 3 187592951 1I AAACTTGGTC -/A AGACCATAAA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 A 1 2 179900 CASAVA_Build 3 187596628 1I AAAGCATTAG -/A AAAAAGGTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 5 6 179901 CASAVA_Build 3 187601545 1I TAATTTTATT -/A TGTTCACTTT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 0 1 179902 CASAVA_Build 3 187603058 1I ATAATAGGAT -/A AAAAAAGAAG 3070 hom 85 het 35 0 29 6 A 6 7 179903 CASAVA_Build 3 187604087 3I ACCCGACTTC ---/TTT ATTTACTTCT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 0 3 179904 CASAVA_Build 3 187613142 2I CTATTAATAC --/TA TATATATATA 2901 hom 24 het 10 0 9 1 TA 7 8 179905 CASAVA_Build 3 187614285 1I GGAAGCTAGA -/G GGGGGGAAAT 2191 het 2191 ref 29 11 6 12 G 6 7 179906 CASAVA_Build 3 187666423 1I GCATATAGGG -/T GAGCAAGACA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 0 1 179907 CASAVA_Build 3 187692445 3D AGATGAACTT TTA/--- AGTTATTTCC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TTA 1 0 179908 CASAVA_Build 3 187694036 1I ACAAATAAAT -/A AAAACAGCTG 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 A 4 5 179909 CASAVA_Build 3 187778112 1I AGAGTCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 14 22 13 T 13 14 179910 CASAVA_Build 3 187789317 2I TCTGTTATGA --/CT CACTCTTCGT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 CT 0 1 179911 CASAVA_Build 3 187808763 1I TTTTTGCCAC -/G CTGCGGTTGG 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 G 0 1 179912 CASAVA_Build 3 187812405 1I TTTTAACCAG -/T TTTTTTTTTC 2937 het 2937 ref 26 10 9 7 T 9 10 179913 CASAVA_Build 3 187828881 41D GAGGCGGTTG AGGTAAAGAAATAACCAATGACAGGCACCTGGGCGGCAGCA/----------------------------------------- AGGCTCTGAG 3070 het 3070 ref 25 23 11 3 AGGTAAAGAAATAACCAATGACAGGCACCTGGGCGGCAGCA 1 0 179914 CASAVA_Build 3 187829692 4D CTCAGAAATA TAAC/---- TAATATTCCA 3070 het 3070 hom 40 15 23 4 TAAC 1 0 179915 CASAVA_Build 3 187865322 11D GTAGGGGGTC AGCTGTATCAT/----------- AGCCCAGTCC 3070 hom 96 het 30 0 33 2 AGCTGTATCAT 1 0 179916 CASAVA_Build 3 187869359 1I TTTAATACAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 64 het 25 0 22 3 A 9 10 179917 CASAVA_Build 3 187871725 1D AAATATATGA T/- TATATAATAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 2 1 179918 CASAVA_Build 3 187889425 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 34 0 23 11 A 12 13 179919 CASAVA_Build 3 187889937 1D TTCCATGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 30 1 23 7 T 13 12 179920 CASAVA_Build 3 187899951 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 30 2 16 12 T 16 14 179921 CASAVA_Build 3 187904354 1D GGAAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 35 0 28 7 A 12 11 179922 CASAVA_Build 3 187904487 1D GCTTTTATTT A/- TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 30 21 6 3 A 1 0 179923 CASAVA_Build 3 187916450 1D GTCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 28 1 23 4 A 13 12 179924 CASAVA_Build 3 187917112 3I CTGCCTTGAG ---/AGA AGAAGTGGAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGA 1 2 179925 CASAVA_Build 3 187919482 1D ACTTTAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 35 0 21 14 A 11 10 179926 CASAVA_Build 3 187921255 3D ACCATAGCTG GTT/--- GTTGTTTTGC 1976 het 131 hom 22 2 14 6 GTT 3 2 179927 CASAVA_Build 3 187926380 1D TACCCACTAA G/- TTACAGTTCC 3070 hom 57 het 25 0 19 6 G 1 0 179928 CASAVA_Build 3 187930637 1D TGTTATTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 10 9 179929 CASAVA_Build 3 187931290 1D TGATACTTAT G/- AAAGTATCAT 1975 hom 10 het 4 0 4 0 G 1 0 179930 CASAVA_Build 3 187940533 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1230 het 1230 ref 20 12 5 4 A 13 12 179931 CASAVA_Build 3 187945512 1D CCAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 16 8 A 13 12 179932 CASAVA_Build 3 187946074 7I CAGAAAAATA -------/ACGACTC AGGGCTGATA 3070 het 3070 hom 41 18 23 0 ACGACTC 0 1 179933 CASAVA_Build 3 187946907 1D AGCAGCTATA T/- TTTAAAACTC 3070 hom 59 het 23 0 19 4 T 4 3 179934 CASAVA_Build 3 187959223 1D GTCAGGCTGG T/- CTTGAACTCC 1618 het 1618 ref 10 4 4 2 T 1 0 179935 CASAVA_Build 3 187959475 4D GGGAGTTCAG CCAA/---- GGAGCATCTC 3070 hom 69 het 26 0 23 6 CCAA 1 0 179936 CASAVA_Build 3 187959839 1D CTTCAAAAAC A/- AAACAAAACA 2486 het 2486 ref 24 14 7 3 A 4 3 179937 CASAVA_Build 3 187982801 4D AAGAATTTTC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 35 15 16 6 AAAT 3 2 179938 CASAVA_Build 3 187983295 1D AAGTTTATGA T/- TTTTTTCAGG 3070 hom 135 het 50 0 44 6 T 7 6 179939 CASAVA_Build 3 187996687 4D TTCACTGTTA AAGT/---- AAGTTCTTTA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AAGT 2 1 179940 CASAVA_Build 3 188026709 4D GGTGGGAAAT AGAC/---- AGGGGAGGAA 3070 het 3070 ref 44 23 15 8 AGAC 1 0 179941 CASAVA_Build 3 188027628 4D AGGAAGCAAC GTGA/---- GTGTGAGCGA 3070 hom 27 het 10 0 9 1 GTGA 1 0 179942 CASAVA_Build 3 188031706 3D AATAAGTTTC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 hom 97 het 42 0 32 10 TGT 5 4 179943 CASAVA_Build 3 188042374 2I TCTCTCACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 AC 7 8 179944 CASAVA_Build 3 188050396 1I TCAAACAATA -/C GAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 C 0 1 179945 CASAVA_Build 3 188052353 7D GTAAAAAACT ACTTGAG/------- ACTGGGTAAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 ACTTGAG 1 0 179946 CASAVA_Build 3 188055559 1I AAGGTCACAC -/A AGTATTAAGT 3070 het 3070 ref 45 28 15 2 A 1 2 179947 CASAVA_Build 3 188062312 2D CAAATATATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 9 8 179948 CASAVA_Build 3 188063056 1I CCTTTTCTTA -/T ATTTTGCTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 0 1 179949 CASAVA_Build 3 188069625 1D TCTCTACAAA T/- TTTTTTTTTT 2928 het 2567 hom 22 9 7 7 T 13 12 179950 CASAVA_Build 3 188075954 3D GTCCTTCTGG ATA/--- ATGAGACTTA 3070 het 3070 ref 28 17 10 4 ATA 1 0 179951 CASAVA_Build 3 188079723 1D CTGATTTTCT A/- AAGTCATCAC 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 3 2 179952 CASAVA_Build 3 188083553 1D AGTTTCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1566 hom 38 9 14 15 T 17 16 179953 CASAVA_Build 3 188101757 1D AGAGTACCAC A/- AATTGTGTAG 3070 het 3070 ref 48 24 15 10 A 3 2 179954 CASAVA_Build 3 188102187 9D AACACCCATT AGTGTCATC/--------- AGAAAAATGT 3070 het 3070 ref 25 13 11 4 AGTGTCATC 1 0 179955 CASAVA_Build 3 188115308 4D GCTATAAAAT TCTC/---- TCTCTCTTTT 2080 het 2080 ref 30 19 6 6 TC 5 3 179956 CASAVA_Build 3 188117261 3I CTTTCGAAAA ---/TAT TATTAAGTAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TAT 1 2 179957 CASAVA_Build 3 188117750 3I TTTTTTCTTC ---/TCT TCTTCTTTCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TCT 2 3 179958 CASAVA_Build 3 188121315 2D TCTTCCTTCT TC/-- TCCCCAGACT 3070 het 276 hom 29 3 13 13 TC 2 1 179959 CASAVA_Build 3 188133245 1D TTAAAGTTAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 95 het 42 0 32 10 T 9 8 179960 CASAVA_Build 3 188135015 1D ACTGTACTCC A/- GCCTGGGGAC 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 A 1 0 179961 CASAVA_Build 3 188135855 2D TATTCCATAG TA/-- TATATATATA 3056 het 3056 ref 25 12 7 6 TA 6 5 179962 CASAVA_Build 3 188141858 1I TTCCCTGGGT -/C CCCTCCAGAG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 C 3 4 179963 CASAVA_Build 3 188164312 1D CAGCAGTCCA G/- GGAGAAGTGG 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 G 3 2 179964 CASAVA_Build 3 188169683 1D ACAGGCACCT G/- GCCACCATGC 3070 hom 29 het 12 0 10 5 G 2 1 179965 CASAVA_Build 3 188170698 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 952 het 952 ref 21 7 5 9 T 17 16 179966 CASAVA_Build 3 188177078 1I CACCCGGCTA -/T TTTTTTACAT 3070 het 1971 hom 20 5 10 5 T 6 7 179967 CASAVA_Build 3 188185905 1I GTTTAATACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 444 hom 24 1 20 3 T 9 10 179968 CASAVA_Build 3 188187608 4I CTGCATAGGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 3070 het 1970 hom 27 9 13 5 AAGG 2 3 179969 CASAVA_Build 3 188187679 13I GGAGGGAGGG -------------/AAGGAGGGAGGGA AGGGAAGGAA 3063 het 1265 hom 16 4 10 3 AAGGAGGGAGGGA 0 1 179970 CASAVA_Build 3 188195433 2I TCAAAAACAA --/AC AAAAAAAAGA 3070 het 2086 hom 26 7 15 5 AC 0 1 179971 CASAVA_Build 3 188198243 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2934 het 1709 hom 24 6 8 11 A 13 12 179972 CASAVA_Build 3 188200553 1D CAGCATTCTT C/- CTGCCTTGGC 3070 het 3070 ref 34 20 9 6 C 2 1 179973 CASAVA_Build 3 188203985 1D AAATTGAATC T/- TTCAGTTGAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 3 2 179974 CASAVA_Build 3 188205543 1I GGTATTGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 T 10 11 179975 CASAVA_Build 3 188208467 1D ATTATGAAAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 10 22 4 A 9 8 179976 CASAVA_Build 3 188211048 1I CTCTCCCTTT -/C TCCTTTAATC 2567 het 2041 hom 15 6 8 1 C 0 1 179977 CASAVA_Build 3 188233868 1D TCTGCCTGGG C/- CGACAGAGAG 3070 hom 63 het 23 0 22 2 C 2 1 179978 CASAVA_Build 3 188234602 3I CTTTGGAGAC ---/TAT TATTAATACC 3070 hom 106 het 38 0 36 2 TAT 1 2 179979 CASAVA_Build 3 188236308 22D AGGAAACACC ATTCTGGACATCAACCTTGGGA/---------------------- AAGGATTTAT 3070 hom 57 het 19 0 20 1 ATTCTGGACATCAACCTTGGGA 1 0 179980 CASAVA_Build 3 188236421 1I TTTGTGCAGC -/A AAAAGAAACT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 4 5 179981 CASAVA_Build 3 188238342 3I TGAAAACATC ---/TAT TATTATTACC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TAT 2 3 179982 CASAVA_Build 3 188242503 2I TGCACAAAAC --/TA TGTGGTGGAG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TA 0 1 179983 CASAVA_Build 3 188247029 9I AAAAGAACAG ---------/GGATAAGCA GGAAAAGTCA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 GGATAAGCA 0 1 179984 CASAVA_Build 3 188263311 1I TTTAATACAA -/T TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 T 5 6 179985 CASAVA_Build 3 188272830 19D TTGGAACAGA TGTGTTGGACTGTGTTGGC/------------------- TGTGTTGGAC 3070 hom 126 het 55 0 37 21 TGTGTTGGACTGTGTTGGC 2 1 179986 CASAVA_Build 3 188280785 1I CTTTTTATTT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 6 7 179987 CASAVA_Build 3 188281888 4D CTTTTTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3015 het 572 hom 24 7 9 8 T 18 14 179988 CASAVA_Build 3 188284553 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2096 het 2096 ref 30 14 9 7 T 10 11 179989 CASAVA_Build 3 188286403 1D CCACATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 28 3 13 12 T 15 14 179990 CASAVA_Build 3 188288185 1I AATTCTTTGG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 27 het 31 1 25 5 T 6 7 179991 CASAVA_Build 3 188292126 5D TTTTCGTTCC TTTTT/----- TATTTCTTTT 3070 hom 110 het 39 0 37 2 T 6 1 179992 CASAVA_Build 3 188295151 1I ACTTCCCTCA -/T TTTTTGTAAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 5 6 179993 CASAVA_Build 3 188302521 1D AGCTTCACTC T/- CAAGTTCTGG 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 1 0 179994 CASAVA_Build 3 188302752 1D TCTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 15 12 T 12 11 179995 CASAVA_Build 3 188315488 1D ATTCTTTTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 10 9 179996 CASAVA_Build 3 188326315 1I CTAGACTGAG -/C CCCCTAGTGT 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 C 4 5 179997 CASAVA_Build 3 188327775 1I TACATCCCAT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 6 7 179998 CASAVA_Build 3 188330326 3D CCCTCCACCC TTT/--- TTTTTTTTTT 1782 het 1476 hom 23 8 5 12 T 15 12 179999 CASAVA_Build 3 188338304 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2789 het 2376 hom 31 14 9 8 A 15 14 180000 CASAVA_Build 3 188344944 4D AAGACAGGCA AGAG/---- AGAGAGAGCT 3070 het 3070 hom 27 10 16 3 AG 6 4 180001 CASAVA_Build 3 188351918 1I AAAAAACAAT -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 16 8 8 0 A 7 8 180002 CASAVA_Build 3 188356402 2D GAAACTGTGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 TA 8 7 180003 CASAVA_Build 3 188365678 1D TAAAAGTTGA G/- AAAAAAAAAA 1973 het 1501 hom 14 5 6 3 G 1 0 180004 CASAVA_Build 3 188369500 4D TCAAAAAATG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAAC 5 4 180005 CASAVA_Build 3 188373248 1D AAAGAACATT G/- GGGCATAAAT 3070 het 2019 hom 15 5 8 2 G 4 3 180006 CASAVA_Build 3 188381885 5D ATTCCATCTG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 hom 93 het 34 0 29 5 AAACA 4 3 180007 CASAVA_Build 3 188391771 1I GAAAAAAAAA -/C AACACAGAGT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 C 0 1 180008 CASAVA_Build 3 188404576 10D AAGAACTCTG CACCTCCCCT/---------- CAACTCCCAA 3070 het 3070 ref 32 23 10 2 CACCTCCCCT 1 0 180009 CASAVA_Build 3 188407982 1D AATGCCTTTG A/- GGTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 A 1 0 180010 CASAVA_Build 3 188413226 1I TTTGTCTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 9 10 180011 CASAVA_Build 3 188437836 1D TCTAAGTCTT G/- TATCCCACAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 1 0 180012 CASAVA_Build 3 188447515 1D ACCAAGGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 273 hom 37 1 27 11 T 10 9 180013 CASAVA_Build 3 188454490 1I AAGTAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 129 hom 28 1 25 2 A 9 10 180014 CASAVA_Build 3 188455866 1I CCAACAACTT -/A AAATGATCTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 3 4 180015 CASAVA_Build 3 188468394 2I CTATAATTAC --/AT GAGTTCTAAT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AT 0 1 180016 CASAVA_Build 3 188470420 5I TCAAGCCTGA -----/ACGGC ACGGCTAATG 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 ACGGC 1 2 180017 CASAVA_Build 3 188476584 1I GGTTAAAGTG -/C CCCCCCAGGG 3070 hom 51 het 25 0 13 12 C 6 7 180018 CASAVA_Build 3 188479942 1D TAATTCTTTC T/- TTTTTTTACA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 7 180019 CASAVA_Build 3 188482993 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAAGAAGA 2106 het 961 hom 28 11 10 7 AG 0 1 180020 CASAVA_Build 3 188485639 1D ACCCATGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 33 1 24 8 T 11 10 180021 CASAVA_Build 3 188489663 1I GAGGCCCCCC -/T GTAGGAACAG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 0 1 180022 CASAVA_Build 3 188492776 2D CCCAAATAAC TA/-- CAGGTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 TA 1 0 180023 CASAVA_Build 3 188503961 4I TTTTCCTTCC ----/TTCT TTCCTTCCTT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 TTCT 0 1 180024 CASAVA_Build 3 188506109 1I AAATCAGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 9 10 180025 CASAVA_Build 3 188507436 2D TCATAAGGCA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 21 0 19 4 T 11 9 180026 CASAVA_Build 3 188513267 1I CCTGGGCCTT -/G CCATCTATTT 3070 hom 95 het 35 0 30 5 G 0 1 180027 CASAVA_Build 3 188530448 5D TTTTAGTATA GACAG/----- GACAGGGTTT 3070 het 1921 hom 14 5 8 1 GACAG 2 1 180028 CASAVA_Build 3 188531741 1D TGTCTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1156 hom 38 5 27 6 A 14 13 180029 CASAVA_Build 3 188538689 1D ATCTACTCAT G/- GGGGTGGATC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 G 5 4 180030 CASAVA_Build 3 188546411 8D TATTTATTTA TTTATTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 820 hom 25 6 14 8 TTTATTTG 1 0 180031 CASAVA_Build 3 188568776 4D TCTGTGTACT CAGA/---- CAGTCTAAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 6 CAGA 1 0 180032 CASAVA_Build 3 188569506 1I TTTTTTTTTT -/A AAATATCTTA 2361 het 1476 hom 20 8 9 3 A 3 4 180033 CASAVA_Build 3 188575681 1D ATGAACATAT A/- GCGTGTATGT 3070 het 3070 ref 41 27 10 4 A 1 0 180034 CASAVA_Build 3 188580632 1D GTAAGCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 861 hom 25 2 19 4 A 11 10 180035 CASAVA_Build 3 188585817 1I GCTGGCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1930 hom 39 6 26 7 T 13 14 180036 CASAVA_Build 3 188592910 1I AAAATTTAGC -/A ATGTATTCAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 1 2 180037 CASAVA_Build 3 188609026 1D TAAAAAAAAA C/- AAATCAAAAG 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 C 1 0 180038 CASAVA_Build 3 188611655 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 30 0 17 13 A 12 11 180039 CASAVA_Build 3 188619817 1D CGGAACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 271 hom 36 1 28 7 A 15 14 180040 CASAVA_Build 3 188620511 1D GACCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 39 2 31 7 A 11 10 180041 CASAVA_Build 3 188666532 4I TCTTCATGTT ----/TTTG TTTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TTTG 1 2 180042 CASAVA_Build 3 188673980 2I AGAAAGTTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 10 12 180043 CASAVA_Build 3 188685794 1I AAAAGCATTC -/T TTTTTTTTTT 1821 het 1821 ref 36 21 4 11 T 13 14 180044 CASAVA_Build 3 188690645 2I AGCCAAGTGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 12 14 180045 CASAVA_Build 3 188691336 2I TATATCTGAC --/TG TATCTCACAG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TG 0 1 180046 CASAVA_Build 3 188694113 5I TCCACTACCA -----/AGCTT AGTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 AGCTT 0 1 180047 CASAVA_Build 3 188695729 1D TATACCCAAC T/- TGATCATTGA 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 T 2 1 180048 CASAVA_Build 3 188701635 1D CTCTCTGTAC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 57 het 22 0 18 4 A 8 7 180049 CASAVA_Build 3 188702543 2I ACCTTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2197 hom 22 6 11 5 A 12 14 180050 CASAVA_Build 3 188705763 4I GACACAAAAG ----/TGGC TGGCTTGAGA 3070 hom 125 het 44 0 40 4 TGGC 1 2 180051 CASAVA_Build 3 188713108 1D TTCCCAAAGG C/- CCCACCTCTT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 C 4 3 180052 CASAVA_Build 3 188725351 1D GTTTTTACCA T/- GCCACCGCAG 3070 hom 79 het 30 0 26 4 T 1 0 180053 CASAVA_Build 3 188735417 1D TGATTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 25 0 11 14 A 11 10 180054 CASAVA_Build 3 188736856 1I ATTAGTTTTT -/A ATGTGGGAAT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 1 2 180055 CASAVA_Build 3 188739536 3I TGTGCCCTTG ---/AGA AGAAGTAAAA 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 AGA 1 2 180056 CASAVA_Build 3 188742280 1D AATTTTTTTT A/- AAATTATACT 3070 het 2909 hom 15 7 8 4 A 4 3 180057 CASAVA_Build 3 188742642 4I AAATAAATAA ----/ATAT ATAAATAAAT 3070 hom 5 het 18 1 15 2 AT 1 3 180058 CASAVA_Build 3 188746319 1I CCCTTCGTAA -/G GATCCACATC 3070 hom 111 het 39 0 37 3 G 1 2 180059 CASAVA_Build 3 188753566 9I CATAGCTCCT ---------/TTGGGCCTA TTAAACATGT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TTGGGCCTA 0 1 180060 CASAVA_Build 3 188754508 4I TGACTTCTTT ----/CTAA CTTTCACTAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 CTAA 0 1 180061 CASAVA_Build 3 188757079 1I TTCTCAGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 9 10 180062 CASAVA_Build 3 188758003 1I TGTAATGATT -/A AAAGATCAAT 3070 hom 175 het 60 0 59 1 A 3 4 180063 CASAVA_Build 3 188758910 3D CTGTGATAAA CAT/--- CATTGTTCAT 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 CAT 2 1 180064 CASAVA_Build 3 188759905 1I GTTTTTTTTT -/C TTTTCTTACT 3070 het 84 hom 37 1 25 11 C 0 1 180065 CASAVA_Build 3 188766409 1I CCGGGACTGC -/T TTCTACTACA 3070 het 2805 hom 30 7 14 9 T 2 3 180066 CASAVA_Build 3 188769840 1D CGTCTCCGCT A/- AAAAAAAATA 1340 het 1340 ref 21 13 4 4 A 9 8 180067 CASAVA_Build 3 188775247 1D AAAGAAAGAC A/- GGGGTTGGTA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 A 1 0 180068 CASAVA_Build 3 188787215 13D CTAGACCATA AGAAACTTCTTCT/------------- AGAGGTATCT 3070 het 864 hom 40 5 21 21 AGAAACTTCTTCT 1 0 180069 CASAVA_Build 3 188787570 2I CTTCAAACCT --/CC CCAACTGCTT 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 C 2 4 180070 CASAVA_Build 3 188790072 1D GAAAGAAAAG A/- AAAAAAGGAA 1810 het 1570 hom 16 7 6 3 A 7 6 180071 CASAVA_Build 3 188791281 1D TCAGAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 9 14 T 15 14 180072 CASAVA_Build 3 188792170 4I GTTGGCATCT ----/CTTA CTTGCTGTGG 3070 hom 135 het 51 0 45 6 CTTA 0 1 180073 CASAVA_Build 3 188795691 1I CAAGATTGCC -/T AAGTTACGAC 3070 hom 132 het 51 0 44 7 T 0 1 180074 CASAVA_Build 3 188804367 11I GCCATGATCC -----------/TGTATCATGGG CAAAAATATC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 TGTATCATGGG 0 1 180075 CASAVA_Build 3 188808407 1D CCCCAAATAT G/- TTTTCCAAAC 3070 het 1710 hom 16 4 11 1 G 1 0 180076 CASAVA_Build 3 188809331 1D AGCATTAGCT G/- TGGTATTATG 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 G 1 0 180077 CASAVA_Build 3 188812632 1D ACATTGATGT A/- AAAAAAAAAA 1344 het 1344 ref 32 23 3 7 A 12 11 180078 CASAVA_Build 3 188831590 1D CCCTTTTTCC A/- CACAGCTCAA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 1 0 180079 CASAVA_Build 3 188831912 1I AGCCCTCTCT -/G ACCACCCCAG 3070 het 3070 ref 57 26 23 8 G 0 1 180080 CASAVA_Build 3 188845040 1D TATAAGGCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 T 9 8 180081 CASAVA_Build 3 188845737 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 29 1 23 5 T 15 14 180082 CASAVA_Build 3 188863309 1D AATGGTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 22 3 T 11 10 180083 CASAVA_Build 3 188871030 2I TGGCTTACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 16 16 13 A 13 15 180084 CASAVA_Build 3 188876977 7I TCACTTGAAC -------/CCAGGAG CCAGAGGCTG 3070 het 3005 hom 26 9 15 2 CCAGGAG 0 1 180085 CASAVA_Build 3 188879440 2I GTCTTTATCC --/TT TTCTGGCTGT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 2 4 180086 CASAVA_Build 3 188888106 1I GCTCTCTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 10 12 2 A 9 10 180087 CASAVA_Build 3 188891829 9D AATCATTTCC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 2464 hom 36 12 14 11 T 19 10 180088 CASAVA_Build 3 188894012 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAAACC 3070 het 1831 hom 39 13 13 13 AC 0 1 180089 CASAVA_Build 3 188895415 2D TCAGCCAGGA GT/-- GTCTCCCATT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 GT 2 1 180090 CASAVA_Build 3 188898711 1I GCAGGTCCCT -/C CCTGTTGACC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 2 3 180091 CASAVA_Build 3 188902356 6I CCAGAATAAG ------/CCTGCC CCCGCGACTG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 CCTGCC 0 1 180092 CASAVA_Build 3 188910244 1I TTAAAATTTG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 46 15 24 7 A 7 8 180093 CASAVA_Build 3 188914803 22D AGAGCTGGAA ATTCCTGATCCCCAAAGGAATG/---------------------- ATTCAGAGTG 3070 het 3070 hom 38 20 20 1 ATTCCTGATCCCCAAAGGAATG 1 0 180094 CASAVA_Build 3 188915448 1D GTACGTTAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 10 9 180095 CASAVA_Build 3 188934605 1I TCACTGCAAG -/C TCCGCCTTCC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 180096 CASAVA_Build 3 188943505 1I CCGCCCCCTC -/T TTTTTTTTTT 2583 het 593 hom 20 5 6 9 T 11 12 180097 CASAVA_Build 3 188948411 1D TTATATGTGT A/- ATTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 2 1 180098 CASAVA_Build 3 189050298 1D ATTTTGCCCC T/- ATCAACATAT 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 T 1 0 180099 CASAVA_Build 3 189060494 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 23 2 13 9 A 17 16 180100 CASAVA_Build 3 189075117 1I CTAGACTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 10 11 180101 CASAVA_Build 3 189075947 1D GACTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2267 hom 15 het 10 0 6 4 T 13 12 180102 CASAVA_Build 3 189096732 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2343 het 1355 hom 20 6 8 6 A 15 14 180103 CASAVA_Build 3 189110748 6D TTGTTTTTGC TGGTAA/------ TGTGGTGAGT 3070 het 3070 hom 33 12 22 1 TGGTAA 1 0 180104 CASAVA_Build 3 189111167 1D AGGTCACTTT C/- TTCTTTGTGC 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 C 1 0 180105 CASAVA_Build 3 189112787 1D AACGCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1341 het 1341 ref 37 21 4 12 A 19 18 180106 CASAVA_Build 3 189117918 22I TGAATGGTGA ----------------------/CTACCTCTGTGAATACCCGGGC CAGCGACACG 3070 hom 66 het 28 0 19 9 CTACCTCTGTGAATACCCGGGC 0 1 180107 CASAVA_Build 3 189125891 8D CTACAAAGCT ATGGCAGG/-------- ATAAATTAGT 3070 het 3070 ref 42 26 16 5 ATGGCAGG 1 0 180108 CASAVA_Build 3 189130420 4I GAAAAGATTG ----/AGCT GCTCCAGGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AGCT 0 1 180109 CASAVA_Build 3 189140134 1D ATGGATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 18 18 15 T 13 12 180110 CASAVA_Build 3 189145610 1D CTTATTGGGA G/- GCCAAGCAAG 3070 het 3070 ref 41 19 14 10 G 2 1 180111 CASAVA_Build 3 189157128 2I ATGAGCCACT --/AC ACACTTGGCC 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 AC 2 3 180112 CASAVA_Build 3 189163000 1I GAGAGCTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 T 9 10 180113 CASAVA_Build 3 189163289 10I GTGTAGAGCA ----------/TAGTGGATAT TAGTGGATAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 TAGTGGATAT 1 2 180114 CASAVA_Build 3 189167701 1D ACTGGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 21 8 A 11 10 180115 CASAVA_Build 3 189170099 1D GTCCTACCAA G/- GGTAGATGAC 3070 het 3070 hom 49 23 23 5 G 3 2 180116 CASAVA_Build 3 189173760 1D AACCTTAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 23 22 5 A 10 9 180117 CASAVA_Build 3 189185159 16D TTGTTGAATG AATGTCTATAGACAAC/---------------- TTGTATCTTG 3070 het 3070 ref 31 19 14 3 AATGTCTATAGACAAC 1 0 180118 CASAVA_Build 3 189188054 3I GGCATTGTGA ---/CTT CTTGTTTATG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 CTT 1 2 180119 CASAVA_Build 3 189192014 1I TCTGTTTTGA -/G GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 G 5 6 180120 CASAVA_Build 3 189197162 4D GTGAGCAGAT TAAG/---- TGAGAAGCCC 3070 het 3070 ref 49 24 19 8 TAAG 1 0 180121 CASAVA_Build 3 189206410 1D CATACTGGCC A/- TTATAATTGT 3070 het 3070 hom 47 19 20 9 A 1 0 180122 CASAVA_Build 3 189206987 1I AATCCCCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 11 12 180123 CASAVA_Build 3 189216430 4D TATATTCTTT CTTC/---- CTTCCTTATA 3070 het 3070 ref 41 23 17 3 CTTC 2 1 180124 CASAVA_Build 3 189234561 1I TTCCGCTAGC -/T TTTTTGCAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 5 6 180125 CASAVA_Build 3 189246650 3D TCCTGGAATG GGT/--- GGTGCAGGAC 3070 hom 123 het 44 0 41 7 GGT 2 1 180126 CASAVA_Build 3 189289262 1I CGTATCACTG -/T TATACGTGTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 1 2 180127 CASAVA_Build 3 189291975 1D GAAAACCTGC T/- TTTTGAAAAC 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 T 5 4 180128 CASAVA_Build 3 189294943 3D TATATATATA TTT/--- TTTTTTTTTT 524 hom 5 het 7 0 2 6 T 15 12 180129 CASAVA_Build 3 189320632 2D GTTTCCAAAC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 11 9 180130 CASAVA_Build 3 189324439 1D39M2D TTTCTTCCTT CTAAGGAAAAGAGTTCTTTTGATCTTTCAGTTAAAAAAAAAC/-TAAGGAAAAGAGTTCTTTTGATCTTTCAGTTAAAAAAAA-- AAAACACTAA 3070 het 3070 ref 43 32 25 7 N/A 0 0 180131 CASAVA_Build 3 189326389 1I32M1D GATTGGTTCT -AAAAAAAAGATGATTCCTCTATTAGAAAGCTTG/AAAAAAAAAGATGATTCCTCTATTAGAAAGCTT- GCTCATGCCT 3070 het 3070 ref 27 14 14 6 N/A 0 0 180132 CASAVA_Build 3 189326696 1D TCTCGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 28 0 23 7 A 14 13 180133 CASAVA_Build 3 189330499 2D CATGCATAGC TT/-- TTTTTTTTTT 1873 het 22 hom 16 1 5 10 T 18 16 180134 CASAVA_Build 3 189337545 2D TATCTAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 29 10 A 13 11 180135 CASAVA_Build 3 189339784 1D ACTCACTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 582 hom 29 3 19 7 T 13 12 180136 CASAVA_Build 3 189342752 1I TTTAGTAGAT -/C CATTCTTAAT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 C 1 2 180137 CASAVA_Build 3 189342898 1I ATTCCATACA -/T TTGCATGGTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 2 3 180138 CASAVA_Build 3 189345611 1I GTTTATTCTG -/C AAAGTAAAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 0 1 180139 CASAVA_Build 3 189350832 1I AGGAGATCGA -/G ACCATCCTGG 3070 hom 10 het 12 0 8 4 G 0 1 180140 CASAVA_Build 3 189359642 2D AGTGACAGTC TT/-- GAACTCAGTC 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 T 2 0 180141 CASAVA_Build 3 189438858 1D CTTTATGAAC T/- TTTTTTTTTT 2170 het 2170 ref 35 28 5 2 T 12 11 180142 CASAVA_Build 3 189462811 1D GAAAATAGTG T/- TTTTTTTTTT 1384 het 1384 ref 29 25 3 1 T 11 10 180143 CASAVA_Build 3 189489001 1I CAGCATTGCT -/C CCCCTTCACG 3070 het 3070 ref 50 32 12 6 C 4 5 180144 CASAVA_Build 3 189502463 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 10 11 180145 CASAVA_Build 3 189518276 1I AATTGGGGGG -/A AAAAATGAAG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 5 6 180146 CASAVA_Build 3 189553186 4D ATGTTCCAGC TGCA/---- TGCACGGCAC 3070 hom 145 het 52 0 47 5 TGCA 2 1 180147 CASAVA_Build 3 189554444 1D ACTAGACCAC T/- TTTTTTTTTT 1881 het 1881 ref 30 18 7 5 T 12 11 180148 CASAVA_Build 3 189563519 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 12 11 180149 CASAVA_Build 3 189565413 1D GTATTTCAAA G/- GGGGCTTTCT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 G 5 4 180150 CASAVA_Build 3 189566170 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 10 14 T 15 14 180151 CASAVA_Build 3 189568868 1D CCATCATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 25 8 T 11 10 180152 CASAVA_Build 3 189580458 1D AGATTATGAA T/- GCTTGGACTT 3070 het 3070 hom 39 17 21 3 T 1 0 180153 CASAVA_Build 3 189582430 1I CACCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 2177 het 2177 ref 34 10 12 12 T 13 14 180154 CASAVA_Build 3 189596411 3D AATAATAATG ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 ATA 5 4 180155 CASAVA_Build 3 189606362 4D CTCCTCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 41 17 16 10 TCTT 4 3 180156 CASAVA_Build 3 189607687 1D TAATATCTTA C/- CCTCTTCATG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 C 3 2 180157 CASAVA_Build 3 189609237 1I CTACAAAATG -/T TTTTTTTTTT 777 het 777 ref 23 12 3 8 T 13 14 180158 CASAVA_Build 3 189616258 1D TGGGTGGGTC G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 9 8 180159 CASAVA_Build 3 189616586 1I GTCCATATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 10 180160 CASAVA_Build 3 189629063 2I GGATGGGCAC --/TA TATATATATA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 TA 8 9 180161 CASAVA_Build 3 189648865 9I12M2D TATCTATCTA ---------TATTGAGATATCTA/AATAGATATTATTTAGATATC-- TATTTAGATA 3070 het 2425 hom 23 6 15 4 N/A 0 0 180162 CASAVA_Build 3 189659287 1I ATGGCTACTG -/T TTTATGGAAA 3070 hom 126 het 49 0 41 8 T 3 4 180163 CASAVA_Build 3 189663842 1D TGACTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1160 hom 33 6 17 10 A 15 14 180164 CASAVA_Build 3 189669821 9D CTGATTGCCC GGTTGTGGT/--------- GGTTGTGGTG 3070 hom 116 het 40 0 38 4 GGTTGTGGT 2 1 180165 CASAVA_Build 3 189688878 2D CTTGGAAAAC AG/-- GGGAAGGATT 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 AG 1 0 180166 CASAVA_Build 3 189697493 1I TTCTGTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 11 12 180167 CASAVA_Build 3 189712972 2I AGACGGAGGT --/GG TTCAATGAGC 2778 het 2778 ref 15 9 6 0 G 0 2 180168 CASAVA_Build 3 189716417 2I AGTAGAATAC --/AT ATATATATAA 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 AT 4 5 180169 CASAVA_Build 3 189718686 1D TTTGTTACTT A/- AAAAGCACAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 5 4 180170 CASAVA_Build 3 189724384 15I CACTTTATAA ---------------/GTCCTTGTTTTTAAC TCCAGACAGA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 GTCCTTGTTTTTAAC 0 1 180171 CASAVA_Build 3 189726778 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 35 7 T 10 9 180172 CASAVA_Build 3 189730644 4D AAAAACTCAA ACTT/---- ACTTAGCAGT 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 ACTT 2 1 180173 CASAVA_Build 3 189735536 1D TGAAATATAC A/- AAGTGAGCAC 3070 het 3070 ref 54 25 23 7 A 3 2 180174 CASAVA_Build 3 189736485 7D ATTACATGAA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1862 het 1428 hom 18 7 6 7 T 23 16 180175 CASAVA_Build 3 189736802 2D TATTACAAGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 1394 hom 16 4 11 2 T 11 9 180176 CASAVA_Build 3 189737177 1I TATAAGATTT -/A AAGTGGGTTA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 2 3 180177 CASAVA_Build 3 189745753 2D AAAAAACATT AA/-- AAAAAAAAAA 1259 het 707 hom 6 2 3 1 A 12 10 180178 CASAVA_Build 3 189749879 4D CTATTTTGTG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 45 17 18 12 TGTT 5 4 180179 CASAVA_Build 3 189757265 3I TTGAAATCCA ---/AAT GGTTTCTGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAT 0 1 180180 CASAVA_Build 3 189762528 10D TATAATCACG CACACACAGA/---------- CACACACAGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 6 CACACACAGA 3 2 180181 CASAVA_Build 3 189769640 3D AAAACAGCCA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 416 hom 43 1 29 14 AAT 7 6 180182 CASAVA_Build 3 189770506 1I GTTTAATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 345 hom 40 4 19 17 T 13 14 180183 CASAVA_Build 3 189774218 1I AAACTGTGTT -/C CTTGGGGTTG 3070 het 3070 ref 44 19 14 11 C 1 2 180184 CASAVA_Build 3 189779109 1I ATTCCCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 51 0 37 14 T 10 11 180185 CASAVA_Build 3 189782437 1D16M1I TTCGGTAGGC TTTTTTCAGAGTTTCCC-/-TTTTTCAGAGTTTCCCT TTTTGTACTT 3070 het 3070 ref 32 19 14 2 N/A 0 0 180186 CASAVA_Build 3 189790661 3D GTGCTGTGTT CTC/--- CTCATATAGA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 CTC 2 1 180187 CASAVA_Build 3 189802552 2D TCTATCTCAA AT/-- ATATATATAT 1771 het 5 hom 14 0 7 7 AT 10 9 180188 CASAVA_Build 3 189803211 1I ATTATTTATT -/A AAAAAAAAAA 2299 het 2299 ref 23 8 7 8 A 13 14 180189 CASAVA_Build 3 189803833 1D AATTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 37 10 10 17 T 13 12 180190 CASAVA_Build 3 189808991 5I TTCCGGGCTC -----/TCTGT TCTGTTCTGT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TCTGT 2 3 180191 CASAVA_Build 3 189817072 1D TTTCTATGGG T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 108 het 41 0 35 7 T 8 7 180192 CASAVA_Build 3 189823582 6I CCCCATGATT ------/AGATAC GTATGGATGA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AGATAC 0 1 180193 CASAVA_Build 3 189825188 6D CTTCCTTCCT TTTCCC/------ TTTCCCTTTC 3070 het 2837 hom 44 12 12 20 TTTCCC 6 5 180194 CASAVA_Build 3 189830644 4D CAGCAAAACA AACT/---- ATCAACAGAG 3070 het 3070 hom 32 12 17 8 AACT 1 0 180195 CASAVA_Build 3 189842579 1I TGAAGTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 14 10 T 10 11 180196 CASAVA_Build 3 189843423 1I CATCTCAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 11 12 180197 CASAVA_Build 3 189850137 1D GTTGTGAAGG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 80 het 35 0 27 8 T 9 8 180198 CASAVA_Build 3 189858899 1I ACTGAAGTTA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 58 het 25 0 20 5 T 6 7 180199 CASAVA_Build 3 189868258 1D GTTGTTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 T 11 10 180200 CASAVA_Build 3 189873811 1I GGAAACAAAT -/A AACAACAACA 2028 hom 24 het 27 0 8 19 A 2 3 180201 CASAVA_Build 3 189874375 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 15 5 T 13 12 180202 CASAVA_Build 3 189875561 1I AAATTTCTCC -/A CACAGCATTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 0 1 180203 CASAVA_Build 3 189876964 1I AACCCTGTGC -/A AAAAATTATA 3070 het 3070 ref 41 22 11 8 A 5 6 180204 CASAVA_Build 3 189899916 5D TGACTCCAAA TTTGG/----- TTTAAGAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 15 5 TTTGG 1 0 180205 CASAVA_Build 3 189911244 1D ATATTGCCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 14 20 6 A 10 9 180206 CASAVA_Build 3 189913330 1D ACAGAGTAGG T/- TCCTTTGTGG 3070 het 3070 ref 54 27 25 2 T 2 1 180207 CASAVA_Build 3 189917198 1D TAAGAGACAG A/- AGAAAGTCTT 3070 het 3070 hom 47 21 23 5 A 2 1 180208 CASAVA_Build 3 189929358 2D GTGCTTTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3048 het 3048 ref 29 12 9 8 A 13 11 180209 CASAVA_Build 3 189934258 5I GTTTTTGTGG -----/TTGTT TTGTTTTGTT 3070 het 3070 hom 60 24 29 7 TTGTT 3 4 180210 CASAVA_Build 3 189946943 1I GTATTTGTTG -/T TAACTATCTC 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 T 1 2 180211 CASAVA_Build 3 189957703 8D TGAGAGGCAC TGACATCG/-------- TGACATCGTC 3070 het 3070 ref 60 28 24 13 TGACATCG 2 1 180212 CASAVA_Build 3 189962494 1I TACTGCTGTG -/T TTTTTTTATA 3070 hom 68 het 40 0 32 8 T 7 8 180213 CASAVA_Build 3 189963250 1D ATTCTAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2929 hom 33 8 15 10 T 13 12 180214 CASAVA_Build 3 189966190 1I CAGCAACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 10 11 180215 CASAVA_Build 3 189966861 1I CTTAAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 10 11 180216 CASAVA_Build 3 189970827 3D CGCCCAGCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 2334 het 602 hom 9 3 6 0 T 21 18 180217 CASAVA_Build 3 189973844 2D TCTTCAAAGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AT 7 6 180218 CASAVA_Build 3 189974655 1D CAGATAGGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 T 10 9 180219 CASAVA_Build 3 189974915 1D AGCAAACTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 113 het 48 0 41 7 T 10 9 180220 CASAVA_Build 3 189976968 1D TGGGAGAGGT A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 A 7 6 180221 CASAVA_Build 3 189979606 1D AACTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1347 het 1347 ref 44 33 4 7 A 11 10 180222 CASAVA_Build 3 190062371 1I TCTGCTACTC -/T TACGTCCTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 180223 CASAVA_Build 3 190073555 1D ACTAAATTAG T/- GAGAAATGGT 3070 het 3070 hom 58 20 32 6 T 1 0 180224 CASAVA_Build 3 190074068 1I GTTCTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 T 11 12 180225 CASAVA_Build 3 190077547 1I AGATTTAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 T 10 11 180226 CASAVA_Build 3 190080517 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2846 het 1778 hom 28 7 13 8 T 14 15 180227 CASAVA_Build 3 190083572 2I CAAGCTACAC --/AT GACTTTAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 180228 CASAVA_Build 3 190083962 1I TGCCTGTAAT -/C CCAGCACTTT 3070 het 563 hom 17 3 9 5 C 2 3 180229 CASAVA_Build 3 190084775 1D TGCTGTCTCC A/- AAGTAGCCAC 3070 hom 114 het 41 0 35 6 A 3 2 180230 CASAVA_Build 3 190091837 1D TTGCTGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 38 1 29 8 T 11 10 180231 CASAVA_Build 3 190103266 3D CATGTTCATT GAA/--- GAAAAAATAG 3070 het 2585 hom 30 7 20 4 GAA 2 1 180232 CASAVA_Build 3 190104563 1D AGTCCCCACT A/- GGCAAGGTAG 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 1 0 180233 CASAVA_Build 3 190104617 1D AAACCTTCAG A/- AAAAAGTTGA 3070 hom 78 het 35 0 26 10 A 6 5 180234 CASAVA_Build 3 190114207 1D ATACATCTCT A/- ATATAGATAT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 2 1 180235 CASAVA_Build 3 190120742 1D ATGTCCCCCC T/- GAATCTCGTG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 1 0 180236 CASAVA_Build 3 190123255 1I ATTATGTTGG -/T TTTTTCCCCT 3070 het 3070 hom 45 21 18 6 T 5 6 180237 CASAVA_Build 3 190125569 1D AGTCCCTTCT G/- GTAGATAATC 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 G 2 1 180238 CASAVA_Build 3 190141989 2I TTTTTATTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 10 12 180239 CASAVA_Build 3 190147424 1I CTAGGTTTTG -/C CCCCCTGCGT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 5 6 180240 CASAVA_Build 3 190147770 1D ACCTCAGCTA T/- TGCACCGACG 3070 hom 134 het 51 0 35 16 T 2 1 180241 CASAVA_Build 3 190152278 1I AACAGCTTGT -/A CATATTGACG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 0 1 180242 CASAVA_Build 3 190174684 1I ATTGTGAAAA -/C AAAAGGCATG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 C 0 1 180243 CASAVA_Build 3 190187939 2I TGAAGTCTGG --/GT AGAATAGGGT 3070 hom 147 het 52 0 49 3 GT 0 1 180244 CASAVA_Build 3 190191739 19I AATATTGAAT -------------------/TTGTTTTTTTTTGTTGTTG TTGTTTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 2 TTGTTTTTTTTTGTTGTTG 0 1 180245 CASAVA_Build 3 190191898 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 T 8 9 180246 CASAVA_Build 3 190198638 4I AGCAGACCAT ----/TAAC AAACAAACAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAAC 0 1 180247 CASAVA_Build 3 190208569 1D AACGTTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 11 10 180248 CASAVA_Build 3 190212860 3I TTTTCTGCAT ---/TTA TTGAGATAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTA 0 1 180249 CASAVA_Build 3 190213546 1D CTTCTGCTAG C/- TTTGGGGTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 C 1 0 180250 CASAVA_Build 3 190217689 1D TCTGAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3004 hom 18 het 8 0 7 1 T 11 10 180251 CASAVA_Build 3 190231785 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAATTAAA 3070 hom 63 het 25 0 19 6 AG 1 0 180252 CASAVA_Build 3 190236255 2D AAAAAATAAC AG/-- ATGTTGGGGA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 AG 1 0 180253 CASAVA_Build 3 190237515 1I GTGACTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 10 11 180254 CASAVA_Build 3 190239278 1D AGTAATTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 31 3 21 7 A 16 15 180255 CASAVA_Build 3 190240325 1I CTCACTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 44 1 35 8 T 11 12 180256 CASAVA_Build 3 190340151 1D AGCTGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 2700 het 2700 ref 35 19 8 8 T 15 14 180257 CASAVA_Build 3 190351711 7I CCAGTCGTCC -------/TTGGGGT TTCAATAAGC 3070 het 3070 hom 36 19 16 1 TTGGGGT 0 1 180258 CASAVA_Build 3 190352653 1D TTAAGATCTG T/- TTTTTTTTTA 1400 het 1400 ref 49 40 4 6 T 10 9 180259 CASAVA_Build 3 190360512 1D AAGGAAGGCC T/- TGTATGGTGG 3070 het 3036 hom 27 10 15 2 T 2 1 180260 CASAVA_Build 3 190361957 1D CTTTTTTTTT A/- TTATTATTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 1 0 180261 CASAVA_Build 3 190365113 1D AAAGCTTCCC T/- TTTTTTTAAA 1890 het 295 hom 25 2 9 14 T 8 7 180262 CASAVA_Build 3 190372816 1D TAGGCTAGCA T/- TTTTTAGCCT 3070 het 3070 hom 59 18 31 10 T 6 5 180263 CASAVA_Build 3 190375772 1D TCAATAGACG T/- GAGAAGAGTT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 1 0 180264 CASAVA_Build 3 190385020 1D GGAAGATTTC T/- TTTTCCTTCT 3070 het 3070 hom 41 17 18 7 T 5 4 180265 CASAVA_Build 3 190386113 1D AGAAAGTTAT A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 A 7 6 180266 CASAVA_Build 3 190387240 1D AGTACATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 256 hom 26 1 20 5 A 11 10 180267 CASAVA_Build 3 190387962 1D CTGATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 18 1 16 1 T 12 11 180268 CASAVA_Build 3 190394099 2D TTCTTAGTTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 116 hom 29 2 17 10 T 11 9 180269 CASAVA_Build 3 190412493 3I ATTATGATAA ---/TCT TCTTGGTTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TCT 1 2 180270 CASAVA_Build 3 190413051 1D AAAAAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 48 0 42 7 T 11 10 180271 CASAVA_Build 3 190413677 5I TTTATATGTA -----/ATAAT ATAATATATA 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 ATAAT 1 2 180272 CASAVA_Build 3 190420763 2I TTAATTTTTG --/AT ATATATATAT 3070 het 136 hom 23 1 18 4 AT 6 7 180273 CASAVA_Build 3 190422455 1I CCTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 36 2 27 7 T 11 12 180274 CASAVA_Build 3 190427186 1I AAAATTAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 8 9 180275 CASAVA_Build 3 190428852 5I CAAAAATTCT -----/TAAAA TAATAGCAAA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 TAAAA 0 1 180276 CASAVA_Build 3 190430918 1D CATAAATTGC A/- AAAAAAAAAT 1054 het 1054 ref 47 35 3 9 A 10 9 180277 CASAVA_Build 3 190496411 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACATTT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 C 0 1 180278 CASAVA_Build 3 190499548 5D GGTTTTTTTT TTTTC/----- TGAGAATTTT 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 TTTTC 1 0 180279 CASAVA_Build 3 190507327 1I TGACCTACAG -/A ATCAGAAAGG 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 1 2 180280 CASAVA_Build 3 190508676 6I AAAGAGAAAT ------/GATTCA GATTCAGATT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 GATTCA 2 3 180281 CASAVA_Build 3 190509505 20D ATTTTTCTTT ACTCTGTCTTTTTTTTCCTA/-------------------- ACTCTGTCTT 3070 het 3070 hom 24 12 10 8 ACTCTGTCTTTTTTTTCCTA 2 1 180282 CASAVA_Build 3 190510812 1I TTACATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2943 hom 32 11 11 10 T 13 14 180283 CASAVA_Build 3 190513534 1D GCTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 18 7 T 13 12 180284 CASAVA_Build 3 190515179 1I TATGAGACAT -/A AAAAATATCT 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 A 5 6 180285 CASAVA_Build 3 190521760 1I TTATATTCCC -/A ATTCCCAATA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 1 2 180286 CASAVA_Build 3 190526039 1I CTTTTCCTTT -/C TTTAATATTG 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 C 0 1 180287 CASAVA_Build 3 190535831 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 24 5 T 13 12 180288 CASAVA_Build 3 190546931 1D ATTTAGGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 12 11 180289 CASAVA_Build 3 190557226 5D TTCACAGCAT AATGA/----- AAGATGAATA 1947 het 1947 ref 10 6 4 1 AATGA 1 0 180290 CASAVA_Build 3 190559372 1I TATTACCAGA -/G GGAGTAAAGA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 G 2 3 180291 CASAVA_Build 3 190564798 1I TATTATTCTA -/G AGCATGAGGA 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 G 0 1 180292 CASAVA_Build 3 190573055 2I ACTCACACAC --/AT GTTTACACAT 3070 het 3070 ref 46 18 20 8 AT 0 1 180293 CASAVA_Build 3 190595306 3D TAAATGTTCC TCT/--- TCTTCTCGTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 TCT 3 2 180294 CASAVA_Build 3 190598101 4I CTTGTTTCTC ----/AGTT ACTTTAGCTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AGTT 0 1 180295 CASAVA_Build 3 190598445 1I GAAATACATA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 8 9 180296 CASAVA_Build 3 190601190 1D TAACTTATGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 9 8 180297 CASAVA_Build 3 190602495 1D ATGTTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 35 0 29 7 A 11 10 180298 CASAVA_Build 3 190609542 1I TGAAATAATT -/G TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 0 1 180299 CASAVA_Build 3 190617283 3D TTGCTTGAAA TAT/--- TATTATACAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TAT 3 2 180300 CASAVA_Build 3 190624783 1I CCCAAAAGCA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 7 8 180301 CASAVA_Build 3 190640658 4D ACACACACAC ATAT/---- GTACTATTAA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 AT 2 0 180302 CASAVA_Build 3 190641158 1I TACAAAAAAA -/T ATACAAAAAG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 0 1 180303 CASAVA_Build 3 190641802 1I TGGAAACTAG -/A AAATATTTTG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 3 4 180304 CASAVA_Build 3 190643320 12D ATTGGATCGA TCCTTCCTTCCT/------------ TCCTTCCTTC 3070 hom 65 het 26 0 21 8 TCCT 8 5 180305 CASAVA_Build 3 190643691 2I TTTGAATCAA --/CT ATGGATCTCC 3070 hom 132 het 50 0 45 6 CT 0 1 180306 CASAVA_Build 3 190646749 1I AGACTATCTT -/C TTAATTGTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 0 1 180307 CASAVA_Build 3 190648131 1I TAGAAGACAC -/A AGATTATTGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 2 180308 CASAVA_Build 3 190666278 1I ACAAGGGATA -/T TTTTTGAAGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 5 6 180309 CASAVA_Build 3 190670943 1D TGTTCAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 36 0 33 5 A 12 11 180310 CASAVA_Build 3 190691132 1D AACTACAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 399 hom 43 1 35 7 A 10 9 180311 CASAVA_Build 3 190693504 1D ACTAAAGAAC T/- TATTCATGTA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 2 1 180312 CASAVA_Build 3 190694138 2I AATTTCAAAC --/TG TATTTCATAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TG 0 1 180313 CASAVA_Build 3 190696562 3D ATTTAGTTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 31 0 13 19 A 14 11 180314 CASAVA_Build 3 190700152 1I AGAAAATGGA -/G GGGGGGGGAT 2676 hom 45 het 20 0 12 8 G 8 9 180315 CASAVA_Build 3 190700598 1D TTCCATTGTC A/- AGTGTGTTAC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 2 1 180316 CASAVA_Build 3 190724543 5D GAACTCAAAT AACTC/----- AACCAGAGAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AACTC 1 0 180317 CASAVA_Build 3 190725574 1D ATTAGTCCAA C/- CATTGTGGAG 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 C 2 1 180318 CASAVA_Build 3 190741510 1D TTTTGATCTT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 A 8 7 180319 CASAVA_Build 3 190743655 1I TTGCATTTAG -/A CACTAAATAT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 A 0 1 180320 CASAVA_Build 3 190750780 1I ATAACAACAA -/C AAAAACAGTC 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 C 0 1 180321 CASAVA_Build 3 190751823 1D GACTAAAAGG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 35 26 8 2 A 7 6 180322 CASAVA_Build 3 190752715 2I TAATTAAACA --/CT CTGATTTTAA 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 CT 1 2 180323 CASAVA_Build 3 190752935 3D GCCATTCATA ATG/--- ATAACAGAGT 3070 het 3070 hom 40 14 22 6 ATG 1 0 180324 CASAVA_Build 3 190753801 1I AAATCAAAAG -/A AAAAATTACA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 5 6 180325 CASAVA_Build 3 190753921 1D AATGCCTATG A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 7 6 180326 CASAVA_Build 3 190754250 1I TAATAAAATA -/T TACGAACAAC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 1 2 180327 CASAVA_Build 3 190757926 2D AAGAATAGTC TT/-- TTCAAGAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 4 2 180328 CASAVA_Build 3 190766966 2I AAGCCCACGT --/AC AGAGTCCAGG 3070 het 3070 hom 44 19 17 8 AC 0 1 180329 CASAVA_Build 3 190770334 4D AGTCAGAAAT AAAG/---- AAAGTCACCT 3070 het 3070 ref 53 26 21 7 AAAG 2 1 180330 CASAVA_Build 3 190774028 1I CATGGTATAA -/T TTTTTTTTTT 1565 het 504 hom 24 3 10 11 T 17 18 180331 CASAVA_Build 3 190784595 1I TACAAGGGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 33 1 24 8 T 11 12 180332 CASAVA_Build 3 190792129 1D CACTGGCTAC A/- GCAAAAATAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 A 1 0 180333 CASAVA_Build 3 190798412 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 566 hom 29 3 17 10 A 15 14 180334 CASAVA_Build 3 190806256 1I TAATGGCTAG -/A AAAAAAAAAT 1043 het 1043 ref 28 20 3 5 A 9 10 180335 CASAVA_Build 3 190809435 1I AATGCATGGG -/T TACAAGTAGT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 T 1 2 180336 CASAVA_Build 3 190812744 3D AATTCCCACA TGT/--- TGTGGGAAGC 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 TGT 2 1 180337 CASAVA_Build 3 190824344 1I TATTATGTTT -/C CCTTTTATTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 C 2 3 180338 CASAVA_Build 3 190825937 1I AAAAGATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 10 11 180339 CASAVA_Build 3 190827406 4D ATTTTCATGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 122 het 52 0 40 14 TTTG 5 4 180340 CASAVA_Build 3 190834961 1D TCATCCTCTG T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 8 7 180341 CASAVA_Build 3 190837735 1D GGGAACTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 52 19 27 6 T 10 9 180342 CASAVA_Build 3 190843346 2D TAAATAAAAC AT/-- GACAGAAAAC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 AT 1 0 180343 CASAVA_Build 3 190845953 1D CTTTTTTAAA T/- TTTTTTTTAT 2217 het 2217 ref 17 10 6 1 T 9 8 180344 CASAVA_Build 3 190848329 1D ACAAGTGACT A/- AAAAGTATGC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 5 4 180345 CASAVA_Build 3 190848475 4D ATAGAAAGAT TAAA/---- TAAACGAATT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TAAA 2 1 180346 CASAVA_Build 3 190849356 4D TTTTATAGAT AAAG/---- AAACTGAAGG 3070 hom 78 het 29 0 27 4 AAAG 1 0 180347 CASAVA_Build 3 190852029 4D ATTCCATATC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 15 1 14 2 A 16 12 180348 CASAVA_Build 3 190857428 4I CAAGTGAGTG ----/AATA AATAAACTGC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AATA 1 2 180349 CASAVA_Build 3 190857504 2D TGAAGCATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 27 1 24 3 A 13 11 180350 CASAVA_Build 3 190861335 1I TTCTTGATTT -/G GCTCTCAGCT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 G 1 2 180351 CASAVA_Build 3 190863498 1I GTGCTCTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 10 180352 CASAVA_Build 3 190867385 1D TGGATTGGAT A/- TTTTTAAATG 3070 hom 99 het 37 0 34 6 A 1 0 180353 CASAVA_Build 3 190867509 1I ACAGTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 2611 het 828 hom 27 5 12 10 A 16 17 180354 CASAVA_Build 3 190869505 1I GAAAGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 10 11 180355 CASAVA_Build 3 190876429 16I AGCCAGAAAC ----------------/TTTTTGCTGCCATTAT ACACACATTC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TTTTTGCTGCCATTAT 0 1 180356 CASAVA_Build 3 190886728 1I CTTTTACCTG -/T TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 4 5 180357 CASAVA_Build 3 190890606 1D TGGCCTTGGG A/- AAAATCGCTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 A 5 4 180358 CASAVA_Build 3 190898385 1I TGACTTTGTT -/A ATAGTTGCTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 1 2 180359 CASAVA_Build 3 190916906 1I TGCTGAATTT -/C AATTTTAAAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 C 0 1 180360 CASAVA_Build 3 190918799 1I TGAGACTGGG -/T AATTTACAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 1 180361 CASAVA_Build 3 190928656 2D TTTCGTTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 6 A 14 12 180362 CASAVA_Build 3 190931827 1D CCTTCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2991 hom 30 9 16 6 A 9 8 180363 CASAVA_Build 3 190932708 2D ATATCTGGAA AC/-- ACAAGCTGAA 3070 het 3070 ref 45 26 12 8 AC 2 1 180364 CASAVA_Build 3 190935441 1D AATTGTATCC A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 50 22 22 7 A 7 6 180365 CASAVA_Build 3 190937268 3D TTGAAATTTT AAG/--- AAGATGATTG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AAG 2 1 180366 CASAVA_Build 3 190940507 14D AAAGTCAATG GGAGAAAGTCAATT/-------------- GGAGAAAGGC 3070 het 3070 ref 41 25 17 2 GGAGAAAGTCAATT 1 0 180367 CASAVA_Build 3 190941701 1I AAAAAAAAAA -/C CCCTGAGATA 3066 het 3066 ref 43 13 14 16 C 3 4 180368 CASAVA_Build 3 190941926 3I CTGAACTGCT ---/ACA ACAACGGGTG 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 ACA 1 2 180369 CASAVA_Build 3 190942895 1D ACTTTCGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 13 12 180370 CASAVA_Build 3 190948350 4I AGAGAAGACT ----/CAAA CAAAATCAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CAAA 1 2 180371 CASAVA_Build 3 190951059 15D ACAAAATAGC ACATATATCCCATGA/--------------- ACATGTAAAA 3070 het 3070 hom 60 29 28 9 ACATATATCCCATGA 1 0 180372 CASAVA_Build 3 190965730 2D TATAGAGCAG AA/-- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 10 8 180373 CASAVA_Build 3 190971048 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1969 het 1969 ref 29 12 6 11 A 13 14 180374 CASAVA_Build 3 190978239 1I TGTAAACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 12 6 T 12 13 180375 CASAVA_Build 3 190980549 1I AAGAAATTAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 58 24 22 12 A 8 9 180376 CASAVA_Build 3 190987611 1D GCAAAAAATA T/- GGATTTTCCA 3070 het 3070 hom 52 24 24 4 T 1 0 180377 CASAVA_Build 3 190991068 1I GCAAAGGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 A 11 12 180378 CASAVA_Build 3 191014078 1I TCCTCAGGTT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 G 1 2 180379 CASAVA_Build 3 191015486 2D TTCCTACTAC AA/-- AGAGTAACAG 3070 het 3070 ref 39 21 13 8 A 3 1 180380 CASAVA_Build 3 191017485 1I AGATTCATGT -/G GGGGGAAAAA 3070 het 722 hom 34 2 25 7 G 5 6 180381 CASAVA_Build 3 191025318 1D TTGTAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 718 het 718 ref 17 8 4 5 A 17 16 180382 CASAVA_Build 3 191034162 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 39 7 13 19 T 14 12 180383 CASAVA_Build 3 191037702 1D TTTTTTTTTT C/- TCTCTCTCTC 3070 het 540 hom 52 6 15 31 C 1 0 180384 CASAVA_Build 3 191044657 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2456 hom 31 7 18 6 T 12 11 180385 CASAVA_Build 3 191064230 1D ATTCCATCTT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 37 21 13 4 A 8 7 180386 CASAVA_Build 3 191069495 1I CCAGCAAGAT -/A ACGGGCTTTC 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 1 2 180387 CASAVA_Build 3 191072748 1I ATACATTTCA -/T CAACAGAATA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 0 1 180388 CASAVA_Build 3 191076324 1D CTAATAAAAA G/- CAACACCAGC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 G 1 0 180389 CASAVA_Build 3 191083667 1I AAATTTGTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 T 8 9 180390 CASAVA_Build 3 191084421 1I GAGCGTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 12 13 180391 CASAVA_Build 3 191098789 3D CTCGGCGATT TTC/--- TTCTTTTTCA 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 TTC 2 1 180392 CASAVA_Build 3 191099493 11I TGTGTAAGTT -----------/AGATTTTAAAC TGAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 AGATTTTAAAC 0 1 180393 CASAVA_Build 3 191099783 1D TAATCGGAAG A/- AAAATGAGGT 3070 het 3070 hom 50 22 26 2 A 5 4 180394 CASAVA_Build 3 191110635 1D TTAGCACAAT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 A 8 7 180395 CASAVA_Build 3 191116529 1D AAATGTTATA C/- CCTATTCTAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 3 2 180396 CASAVA_Build 3 191118020 1I GCCAACAGAG -/A CAAAACCCCA 1220 het 1220 ref 14 6 3 5 A 0 1 180397 CASAVA_Build 3 191119622 3I TTAGAATAAG ---/TAA TAATAAATTA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TAA 2 3 180398 CASAVA_Build 3 191120194 3I TGGGAGACTT ---/CAA CACCACTCGT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 CAA 0 1 180399 CASAVA_Build 3 191121630 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2053 het 2053 ref 18 8 6 4 A 8 9 180400 CASAVA_Build 3 191125795 1I TGGAGTTTTT -/A ACCTTTTAGA 3070 het 3070 hom 54 25 24 5 A 1 2 180401 CASAVA_Build 3 191145353 1D CTTAGATGTG T/- GTTCTCTTAA 3070 het 3070 ref 59 27 26 6 T 1 0 180402 CASAVA_Build 3 191153458 4D CTACCAAAAT AAAG/---- AGAGGGGGTA 3070 het 3070 ref 45 22 19 6 AAAG 1 0 180403 CASAVA_Build 3 191154681 1D TTTAAAAATA G/- GGCTGAATCA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 G 3 2 180404 CASAVA_Build 3 191156180 1D ACCCATTCAC G/- GCCGGGCACA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 G 2 1 180405 CASAVA_Build 3 191159183 12D TTGCTCCCTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTG 2401 het 1561 hom 16 8 6 2 T 21 9 180406 CASAVA_Build 3 191159707 2I TTTACACCTG --/TC TCTCTTCTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TC 2 3 180407 CASAVA_Build 3 191169423 4D TTTGATGGGG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 20 12 7 2 TTGT 3 2 180408 CASAVA_Build 3 191173521 1I AAAAAAAAAA -/C ACAAAACATG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 C 0 1 180409 CASAVA_Build 3 191175660 3D TCTGCCTCAG TCT/--- TCTTCCTACC 3070 het 3070 ref 57 25 24 9 TCT 2 1 180410 CASAVA_Build 3 191176569 1D TTCTGAAAAT A/- AAAAGCTACC 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 A 5 4 180411 CASAVA_Build 3 191179752 1I ACTAAAACAC -/A AAAAAAAAAA 2538 het 1460 hom 15 5 7 3 A 10 11 180412 CASAVA_Build 3 191184393 1D ACTTTTGTCA T/- TTTTAAATAA 3070 hom 75 het 26 0 26 2 T 5 4 180413 CASAVA_Build 3 191184812 4D TTTTTCCTGG AAAA/---- AAAAAATGAG 3070 hom 114 het 44 0 39 7 A 10 6 180414 CASAVA_Build 3 191185090 1D TGAATCGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 11 10 180415 CASAVA_Build 3 191188869 2I CGTATGTGTG --/TA TATATATATG 3070 het 326 hom 36 1 31 4 TA 4 5 180416 CASAVA_Build 3 191192487 1I CAAGTTTGGT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 6 7 180417 CASAVA_Build 3 191195148 1D GTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 29 1 23 8 T 12 11 180418 CASAVA_Build 3 191197225 2D ATACTTATTA TG/-- TGTCAATTAA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 TG 2 1 180419 CASAVA_Build 3 191198662 5D CCATGAACAC ATAAT/----- ATAAGAGGAT 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 ATAAT 1 0 180420 CASAVA_Build 3 191203979 2D CCTTGATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 34 2 9 23 A 16 14 180421 CASAVA_Build 3 191208293 1D AGCGTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2780 hom 27 7 13 7 T 13 12 180422 CASAVA_Build 3 191211756 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 1684 het 1517 hom 15 6 4 5 A 16 15 180423 CASAVA_Build 3 191216174 1D CTCAGCATCA T/- TGCACTCAGC 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 T 2 1 180424 CASAVA_Build 3 191225663 1I CTAGTAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 10 11 180425 CASAVA_Build 3 191230486 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2142 hom 22 5 16 1 A 11 10 180426 CASAVA_Build 3 191232121 1I CTCCATGTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 A 10 11 180427 CASAVA_Build 3 191234703 2D8M5D ATCACATATG AATAATTGTTCCTCA/--TGATTATT----- TAAACTCTGT 3070 het 3070 hom 40 19 23 3 N/A 0 0 180428 CASAVA_Build 3 191235077 4D GAGGAAGAAA GAAC/---- AAACAAATGG 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 GAAC 1 0 180429 CASAVA_Build 3 191236969 18I TATAGTCGAC ------------------/AAGCTTCATCCCACAGAT ATGATAATTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AAGCTTCATCCCACAGAT 0 1 180430 CASAVA_Build 3 191238278 1D AGACACTCAA T/- ATTTGTTAAG 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 T 1 0 180431 CASAVA_Build 3 191238402 1I TTATTTTTGT -/A ACAAAGCCAC 3070 het 3070 hom 58 22 27 9 A 1 2 180432 CASAVA_Build 3 191239822 1D AATGAAAGCA C/- ATATTCAATT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 C 1 0 180433 CASAVA_Build 3 191243609 1D23M4I TATATTATAA TTATCACAAAATAATAGAAGCGTC----/-TATCACAAAATAATAGAAGCGTCTGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 45 30 23 4 N/A 0 0 180434 CASAVA_Build 3 191246260 1I GTCTTTCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 10 11 180435 CASAVA_Build 3 191247112 4D5M1D TATAATCTCA CAATCAGATA/----CAGGT- TAGATTTAAG 3070 het 3070 ref 32 21 11 3 N/A 0 0 180436 CASAVA_Build 3 191249753 1D AGACACATGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 10 9 180437 CASAVA_Build 3 191251848 3I TGGCATTAAG ---/ATA ATGTCATTTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 ATA 0 1 180438 CASAVA_Build 3 191253013 19D ATTGAGATCT TTCTCCATGCTTAGCACTG/------------------- TTCTCCATGA 3070 het 3070 ref 29 24 10 5 TTCTCCATGCTTAGCACTG 1 0 180439 CASAVA_Build 3 191256008 1D TACAGAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 18 1 7 10 T 13 12 180440 CASAVA_Build 3 191258122 1I GCCATCACAC -/T TTTATCTTAC 3070 het 3070 hom 39 12 23 8 T 3 4 180441 CASAVA_Build 3 191273175 1I ACAGCTATTC -/A AAAAATTTTG 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 A 5 6 180442 CASAVA_Build 3 191275969 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1829 hom 24 6 12 6 A 12 13 180443 CASAVA_Build 3 191276638 1I TTAAGATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 17 15 12 A 11 12 180444 CASAVA_Build 3 191285118 1I TATCAATATT -/A AATGAAGAAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 2 3 180445 CASAVA_Build 3 191294487 4D TGGTGCTATG TAGC/---- TAGCATGAAC 3070 het 3070 hom 32 12 18 5 TAGC 2 1 180446 CASAVA_Build 3 191296451 3I GCATAAAAGG ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 CAA 5 6 180447 CASAVA_Build 3 191296960 3I CTGAGGCCTC ---/CTA CTCACGCTTC 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 CTA 0 1 180448 CASAVA_Build 3 191297728 1D CTGGAACATA T/- CATGCAAGTA 3070 het 3070 ref 51 25 22 6 T 1 0 180449 CASAVA_Build 3 191330063 4D TCTCAAAAAC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 hom 26 9 17 3 ACAA 4 3 180450 CASAVA_Build 3 191333827 2D GATAGAGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 32 1 13 19 T 14 12 180451 CASAVA_Build 3 191334613 1I TTTAACTAGA -/C CCCCCCCACT 3070 hom 52 het 19 0 17 2 C 7 8 180452 CASAVA_Build 3 191337489 1D48M1D GCCAAGGGTT AGGGGGAACTCAGGGTTTTTAAGTCAGTGAAATTACTCTATGATACTATA/-GGGGGAACTCAGGGTTTTTAAGTCAGTGAAATTACTCTATGATACTAT- ATGGTGAACA 3070 het 3070 ref 43 38 21 11 N/A 0 0 180453 CASAVA_Build 3 191338447 3I ATCAAAAATA ---/ATT ATTCTATTGT 3070 het 1285 hom 15 4 9 3 ATT 1 2 180454 CASAVA_Build 3 191338510 2D ATAGATATGA AT/-- ATATGTTATT 1721 het 1721 ref 11 7 4 1 AT 3 2 180455 CASAVA_Build 3 191341332 2D AAGTATTAAA AC/-- ACATATTATA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 AC 2 1 180456 CASAVA_Build 3 191341557 23D CATTCTCATC TGGTCTGGGAAGGAGTATAAATT/----------------------- GGTATGGATT 3070 het 3070 hom 30 14 17 8 TGGTCTGGGAAGGAGTATAAATT 1 0 180457 CASAVA_Build 3 191341625 1I AGTTCAAAGA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 6 7 180458 CASAVA_Build 3 191341930 1I TCCATTCATC -/A ATAAGAGAGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 180459 CASAVA_Build 3 191343752 1D CATTCTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 T 11 10 180460 CASAVA_Build 3 191344081 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1447 hom 28 8 14 6 A 14 15 180461 CASAVA_Build 3 191344156 3I6M5D ACATATATGT ---ATATATGTATA/GTGAGATAT----- CACACGTATA 3070 het 3070 ref 26 16 10 1 N/A 0 0 180462 CASAVA_Build 3 191358454 2D ATATCTAAAG AC/-- ACACACACAC 2764 het 552 hom 33 2 9 22 AC 9 8 180463 CASAVA_Build 3 191359022 5D ATTTCAGAAA TGAAC/----- TGAAGGTCAG 3070 het 3070 hom 51 22 27 6 TGAAC 1 0 180464 CASAVA_Build 3 191359582 1I CCCGTTAGAG -/T TTTAGAAACT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 3 4 180465 CASAVA_Build 3 191359635 1I TGAGAGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 13 14 180466 CASAVA_Build 3 191361920 1I ATATGCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 43 0 19 24 T 11 12 180467 CASAVA_Build 3 191364440 5D TTTTTTGTTT GTTTG/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 14 8 GTTTG 1 0 180468 CASAVA_Build 3 191365347 4I TATATAATGA ----/CTTT CTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 CTTT 1 2 180469 CASAVA_Build 3 191365756 1D GTTTTGTTTT G/- TTTTTTTGAT 1259 het 30 hom 22 1 7 14 G 1 0 180470 CASAVA_Build 3 191366387 3D ATACAATAGT AGA/--- AGACTTCAGT 3070 hom 111 het 41 0 38 5 AGA 2 1 180471 CASAVA_Build 3 191371469 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 954 hom 10 het 7 0 4 3 A 11 12 180472 CASAVA_Build 3 191375094 1I GATTTATGCA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 7 8 180473 CASAVA_Build 3 191376029 2I ATAGACATAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 TA 7 8 180474 CASAVA_Build 3 191382037 1I TTATAACATC -/T TTTATCTTCT 2647 het 2647 ref 20 11 6 3 T 3 4 180475 CASAVA_Build 3 191383265 1I GACTTTGGAA -/T TTATAACTCG 3070 het 3070 hom 43 14 18 11 T 2 3 180476 CASAVA_Build 3 191388704 1I GTTTTGAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 9 10 180477 CASAVA_Build 3 191391036 1D GATATTTGAT C/- AAACATTATT 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 C 1 0 180478 CASAVA_Build 3 191395636 1D CAAGTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 2808 het 217 hom 29 3 10 16 T 15 14 180479 CASAVA_Build 3 191399815 1D CACATATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 13 12 180480 CASAVA_Build 3 191400226 1I GGATGCAATG -/A AACTAAATTG 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 2 3 180481 CASAVA_Build 3 191407524 1I GATTGGCTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 9 10 180482 CASAVA_Build 3 191429275 1D TTTAAAAAAA T/- TAGTTCATGT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 2 1 180483 CASAVA_Build 3 191433661 1I TGTTTTAGAG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 37 24 9 4 T 7 8 180484 CASAVA_Build 3 191442430 1D AAGACTAAGC A/- AAAAGAACAA 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 5 4 180485 CASAVA_Build 3 191444644 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 33 2 23 8 A 13 12 180486 CASAVA_Build 3 191483268 2D AAATTAAGGG TA/-- TATATATATA 2368 het 2368 ref 29 22 5 2 TA 8 7 180487 CASAVA_Build 3 191486688 3I GATTCTTCTC ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 9 12 180488 CASAVA_Build 3 191496244 4D TAGTCAGGAC TCTG/---- TCTGAACTAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 TCTG 2 1 180489 CASAVA_Build 3 191497660 2I TTTGCTTCCA --/GT GTCTTATGAA 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 GT 1 2 180490 CASAVA_Build 3 191497949 2I TCATATTAAT --/TA TGTTATATTA 933 het 933 ref 6 3 3 0 TA 0 1 180491 CASAVA_Build 3 191499279 1D CATCTATTTA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 40 17 17 8 T 7 6 180492 CASAVA_Build 3 191500033 1I TTTTTTCTGA -/T ATTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 0 1 180493 CASAVA_Build 3 191501985 2D TCAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 3070 het 2148 hom 21 8 12 3 AG 1 0 180494 CASAVA_Build 3 191503264 1D CAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 838 hom 15 3 9 3 T 1 0 180495 CASAVA_Build 3 191504381 1I AAAACACAAA -/C AAAAAGCCCC 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 C 0 1 180496 CASAVA_Build 3 191512445 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 34 1 26 7 T 10 11 180497 CASAVA_Build 3 191512787 1D TATTTCTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 10 9 180498 CASAVA_Build 3 191515046 1D CCTGGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2029 hom 24 6 14 5 T 15 14 180499 CASAVA_Build 3 191532475 1D GCCATTTCTC T/- GGTTCACTCT 3070 het 3070 hom 50 23 24 4 T 1 0 180500 CASAVA_Build 3 191552579 1D TGGAATCATG C/- TTTTCTAAAT 3070 hom 75 het 28 0 24 4 C 1 0 180501 CASAVA_Build 3 191553277 1D GTTTTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 11 10 180502 CASAVA_Build 3 191564403 1D TATATTCTTA C/- CAGGAATTAT 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 C 2 1 180503 CASAVA_Build 3 191571572 2I AAATGTATAA --/AT ATATATAGGG 2395 hom 18 het 8 0 7 1 AT 3 4 180504 CASAVA_Build 3 191573725 4I GCAGGGGTTG ----/AAGC CAGGGTTTCT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 AAGC 0 1 180505 CASAVA_Build 3 191574327 2D TGCCCATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 28 0 21 7 A 13 11 180506 CASAVA_Build 3 191576368 1D CTCCCCCCAC A/- AAAAAACACC 3070 hom 129 het 52 0 44 8 A 7 6 180507 CASAVA_Build 3 191584692 1D TTTCAAAGGG A/- GTTAGAAGAC 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 A 1 0 180508 CASAVA_Build 3 191585767 1I TGCATCTGTG -/A CCCTCCATCC 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 A 0 1 180509 CASAVA_Build 3 191586054 1D ATAGTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 40 3 14 24 T 11 10 180510 CASAVA_Build 3 191587846 1I AATATAACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 9 10 180511 CASAVA_Build 3 191588766 1D AGTGGGGCCA G/- GGCTGGTGTC 3070 het 3070 hom 47 20 21 8 G 3 2 180512 CASAVA_Build 3 191590775 4I ATCCCAATAC ----/TTTG TTTGGAAGGC 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 TTTG 1 2 180513 CASAVA_Build 3 191591635 1D ATTTTTTAAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 A 8 7 180514 CASAVA_Build 3 191597352 2I TGAGAGCAAG --/GA GAGTTATTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 GA 1 2 180515 CASAVA_Build 3 191599835 1D AAAAATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 4 A 11 10 180516 CASAVA_Build 3 191600004 1I AAAAAAATTG -/T TTTTTAAACA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 5 6 180517 CASAVA_Build 3 191601724 66D CATGTATTCC TGAATATTATTTTATTTTCCAAAGCAAAGTGTTCTTATGTTTTTTTTTCTCCCCACAGCAATTTAA/------------------------------------------------------------------ CCCCCTCCTT 3070 het 3070 ref 24 21 11 3 TGAATATTATTTTATTTTCCAAAGCAAAGTGTTCTTATGTTTTTTTTTCTCCCCACAGCAATTTAA 1 0 180518 CASAVA_Build 3 191627183 3I CTTACTGTCA ---/TCT TCTTACTTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TCT 1 2 180519 CASAVA_Build 3 191643838 1D AGGCCCTCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 17 9 4 T 9 8 180520 CASAVA_Build 3 191644988 2D ACTGAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 A 14 12 180521 CASAVA_Build 3 191646991 1I TGAGGGTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 9 10 180522 CASAVA_Build 3 191647588 1D GAGAGCATGG C/- TTTGAGTGTA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 C 1 0 180523 CASAVA_Build 3 191678648 1D TGCTCATGGA T/- TGGAAAAGTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 2 1 180524 CASAVA_Build 3 191690970 1D CACAGCTCAT G/- GCAGATCCTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 G 2 1 180525 CASAVA_Build 3 191694533 1I CAAAGTTCAC -/G GGAGGGAAAG 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 G 2 3 180526 CASAVA_Build 3 191695490 1I TAAATATGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 8 9 180527 CASAVA_Build 3 191713547 1D GATGAGCAAG A/- AGATGTGCGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 2 1 180528 CASAVA_Build 3 191717223 5D GAAAAAAAAA ATGCT/----- TACTTTAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 ATGCT 1 0 180529 CASAVA_Build 3 191722222 3I ACAGATCATT ---/CTG CCCCATCTGC 3070 het 3070 ref 34 16 17 1 CTG 0 1 180530 CASAVA_Build 3 191722432 2I ATTCTAGCGT --/TA TGAGTACACA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 TA 0 1 180531 CASAVA_Build 3 191723143 2I AGCTGGTCTA --/AG AGAATGTGCC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 AG 1 2 180532 CASAVA_Build 3 191731442 1I ACTTAGCCCC -/T GATGATTCAA 3070 het 3070 hom 53 25 24 4 T 0 1 180533 CASAVA_Build 3 191732498 2I AGGAATATGT --/AC TGTGTTTATA 3070 het 3070 hom 53 23 25 5 AC 0 1 180534 CASAVA_Build 3 191750199 2D CCCGAGCCCA AT/-- ACTAAGTCAA 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 AT 1 0 180535 CASAVA_Build 3 191764411 2I TCAGTGAAAA --/AG AGAGAGTTGT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 AG 3 4 180536 CASAVA_Build 3 191770068 1D ATCTCTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 12 11 180537 CASAVA_Build 3 191772390 3D CCCAAGACAA TTC/--- TTCTTCTTCC 3070 het 3070 hom 27 13 12 4 TTC 4 3 180538 CASAVA_Build 3 191772928 2I GGAGAGAGGA --/AG AGAGAGAGAG 2964 het 2964 ref 28 14 10 4 AG 6 7 180539 CASAVA_Build 3 191776546 1I TAATTTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 14 11 A 10 11 180540 CASAVA_Build 3 191776867 6D ATATATATAT ACACAC/------ ACACACACGC 701 het 701 ref 49 26 6 18 AC 7 4 180541 CASAVA_Build 3 191800185 1D GTATTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1657 het 1657 ref 37 23 4 10 T 15 14 180542 CASAVA_Build 3 191800332 1D TTTAACATCT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 9 8 180543 CASAVA_Build 3 191805784 2D AGTATTCCTC TT/-- TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 10 8 180544 CASAVA_Build 3 191809312 8I CTGTGATGTC --------/AATTCGTG AATTCGTGTA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 AATTCGTG 1 2 180545 CASAVA_Build 3 191813672 6D CTATGTAATG TCTTAC/------ TCTGCATCTC 3070 het 3070 ref 47 23 22 5 TCTTAC 1 0 180546 CASAVA_Build 3 191815545 1I CTTTCTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 15 11 T 10 11 180547 CASAVA_Build 3 191815857 1D TCCTTTTGTT G/- TTGCTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 G 1 0 180548 CASAVA_Build 3 191816208 16I ATTTTTATTG ----------------/TGAAATTAATCAGAAT TGGTCAAGCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TGAAATTAATCAGAAT 0 1 180549 CASAVA_Build 3 191820734 1I AAAAGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 498 hom 44 2 33 9 T 13 14 180550 CASAVA_Build 3 191825103 1D GCCATTCAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 14 21 10 A 10 9 180551 CASAVA_Build 3 191830880 8D AGTTATCACA CATGAAAT/-------- CATGAAATCA 3070 hom 123 het 47 0 42 7 CATGAAAT 2 1 180552 CASAVA_Build 3 191833566 1D GAACCATATA T/- TTTTTTTCGT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 T 8 7 180553 CASAVA_Build 3 191840410 1D GTGGCCTGTA C/- CCAACTGTCT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 C 3 2 180554 CASAVA_Build 3 191858631 1I CCATTTTTTT -/C CTAAAGAATC 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 C 1 2 180555 CASAVA_Build 3 191906899 2D CTCGAGAAAA AG/-- AGAGACAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 7 AG 3 2 180556 CASAVA_Build 3 191931259 1I AGGCTGTAAA -/C CAATCCCCAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 1 2 180557 CASAVA_Build 3 191941292 2I CTCATCTCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 T 10 12 180558 CASAVA_Build 3 191942451 3D AAAAGGAAAG AAA/--- GAAGGAAAAG 3070 het 3070 hom 24 11 13 1 A 3 0 180559 CASAVA_Build 3 191954097 1D GCCCAAAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2928 hom 22 8 8 6 T 9 8 180560 CASAVA_Build 3 191956395 1D ACAATGGGGG A/- ATTCCAATAT 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 A 2 1 180561 CASAVA_Build 3 191960803 2I AAAAGATCCC --/CT TTTTCCTTTT 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 CT 0 1 180562 CASAVA_Build 3 191980945 1D AGTTTGTTCA T/- TTTTTTACAA 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 T 7 6 180563 CASAVA_Build 3 191981834 1D GGATTATAAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 T 8 7 180564 CASAVA_Build 3 191988027 2I ATAAATTTTA --/TT TTTAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 3 5 180565 CASAVA_Build 3 192002880 1D ATAGGTCTAC A/- TCAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 1 0 180566 CASAVA_Build 3 192039053 1I AATGAAGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 107 het 42 0 35 7 T 9 10 180567 CASAVA_Build 3 192052480 2D AACAAAAAAC AG/-- ATAAAATATG 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 AG 1 0 180568 CASAVA_Build 3 192065943 1I GCTGCTGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 885 hom 38 3 20 15 T 12 13 180569 CASAVA_Build 3 192069975 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATCTTTA 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 TA 2 3 180570 CASAVA_Build 3 192072287 3D TAAGGGAAAA TAT/--- TACACACTTA 3070 het 3070 ref 38 24 12 3 TAT 1 0 180571 CASAVA_Build 3 192074050 2I ACACACACAC --/AG AGACTCACAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AG 1 2 180572 CASAVA_Build 3 192079097 1I TGGATATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 10 11 180573 CASAVA_Build 3 192080115 1I TTATCTGGCC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 T 8 9 180574 CASAVA_Build 3 192081196 1I AAATCTATAT -/G TTTTTTTATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 0 1 180575 CASAVA_Build 3 192090542 1D GACTTCTAAT C/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 C 1 0 180576 CASAVA_Build 3 192092653 5D TTTTCAAGAT ATGAG/----- ATATTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 ATGAG 1 0 180577 CASAVA_Build 3 192100332 1D AATCAGTAAG A/- AAAAAAAACA 3027 het 3027 ref 38 24 8 6 A 9 8 180578 CASAVA_Build 3 192106063 2I TATCCTGTGT --/CC CAGCTGCTCC 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 C 1 3 180579 CASAVA_Build 3 192109159 1I GCCTACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 7 20 1 T 10 11 180580 CASAVA_Build 3 192127065 1I GGCTTTTTCC -/T TTTATAGTCT 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 T 3 4 180581 CASAVA_Build 3 192128817 6D AACCATGCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 2234 hom 29 11 11 8 A 17 11 180582 CASAVA_Build 3 192131560 4I TAAAAAATGT ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 TTTA 1 2 180583 CASAVA_Build 3 192148174 1I AAATTATGTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 7 8 180584 CASAVA_Build 3 192182842 1D TTGTGAATCC A/- AAAAAAAAAG 1613 het 1613 ref 29 20 4 5 A 10 9 180585 CASAVA_Build 3 192204418 4D CGTGGTTTAA GTTT/---- GTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 GTTT 3 2 180586 CASAVA_Build 3 192220822 1I CACCACACTG -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 6 7 180587 CASAVA_Build 3 192227998 4D TTTATGTCAG ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 120 het 48 0 41 10 ATTT 3 2 180588 CASAVA_Build 3 192239568 1I GGTATTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 28 9 3 T 10 11 180589 CASAVA_Build 3 192245102 1I CACTTATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 10 11 180590 CASAVA_Build 3 192249560 1D TGTTTTCAAC A/- GAGCACCAGG 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 A 1 0 180591 CASAVA_Build 3 192251707 1D ATTAGTGTCA T/- TTTATTTATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 4 3 180592 CASAVA_Build 3 192255995 3D ATGGAATCAT ATA/--- ATATGTAATA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 ATA 2 1 180593 CASAVA_Build 3 192258015 1D AGAGAATATA T/- TTTTGTATGA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 5 4 180594 CASAVA_Build 3 192258756 1I TAAAGTGCTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 7 8 180595 CASAVA_Build 3 192259005 1I ACAAACAGAG -/A ATATCATAAC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 1 2 180596 CASAVA_Build 3 192265125 1D TTAATTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 A 11 10 180597 CASAVA_Build 3 192268164 2D GTCTATATGA AG/-- AGCCTTCTCT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 AG 2 1 180598 CASAVA_Build 3 192271473 15D TTCTGAGATA TCAAAGTCACAAGAC/--------------- TTTTTCCTTG 3070 het 3070 ref 42 25 17 6 TCAAAGTCACAAGAC 1 0 180599 CASAVA_Build 3 192272320 1D CAGGAAATGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 9 8 180600 CASAVA_Build 3 192273943 1D CACCAAGCCA G/- GCTAATTTTT 3070 het 3013 hom 26 9 9 8 G 2 1 180601 CASAVA_Build 3 192278333 1I AACAAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 834 hom 35 2 23 10 A 10 11 180602 CASAVA_Build 3 192279699 2D CAGAAAAAAA GC/-- AGGGGTTGCA 1126 het 1126 ref 30 24 3 3 GC 1 0 180603 CASAVA_Build 3 192281070 4D ACCCCCCCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2944 hom 32 11 17 6 AAAC 7 6 180604 CASAVA_Build 3 192281974 1I GGCCATAGTA -/C CCCCCCCCAA 2277 het 2277 ref 22 10 8 4 C 8 9 180605 CASAVA_Build 3 192282941 3D TTTACAGTGT TGG/--- TGGGAGTGTA 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 TGG 2 1 180606 CASAVA_Build 3 192285145 6I GTACTTTATG ------/AAATAC AAATACGGAT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 AAATAC 1 2 180607 CASAVA_Build 3 192309663 4I GTACATGTAA ----/AAAT AAATACCACC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 AAAT 1 2 180608 CASAVA_Build 3 192309815 4I CCCTTTTATT ----/AGTC AGTCAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 AGTC 1 2 180609 CASAVA_Build 3 192310384 1I GTATTTAAAG -/T TTTTTTTCAG 2800 het 2800 ref 28 18 6 4 T 7 8 180610 CASAVA_Build 3 192311069 1D GACAATGTTG A/- AAGTTACTTT 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 A 3 2 180611 CASAVA_Build 3 192311744 1D AATGTACTGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 A 9 8 180612 CASAVA_Build 3 192313318 2I TCCTAGAAAC --/AG AGAGTCAGAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 AG 2 3 180613 CASAVA_Build 3 192315756 1I CAATGATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 T 9 10 180614 CASAVA_Build 3 192326301 1I AGGGGGAGGA -/T TTTTTTTTTT 1915 hom 18 het 7 0 7 0 T 10 11 180615 CASAVA_Build 3 192332272 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 1727 hom 10 het 4 0 4 0 G 4 5 180616 CASAVA_Build 3 192350132 2I TCTACTTTGT --/TC TGTTTTCCAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TC 0 1 180617 CASAVA_Build 3 192362366 10D TCTAAAATTC ATTTGAATTT/---------- ATTTCATTTC 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 ATTTGAATTT 1 0 180618 CASAVA_Build 3 192381059 14D TATCTTAGTA AGCATGATATATTG/-------------- AGCAAAATTT 3070 het 3070 ref 37 24 14 6 AGCATGATATATTG 1 0 180619 CASAVA_Build 3 192414250 1D TTTCTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 11 10 180620 CASAVA_Build 3 192437032 1I ATAATAACGC -/A AAAAAAAAAA 1322 het 1322 ref 32 21 4 7 A 11 12 180621 CASAVA_Build 3 192452544 1I TTTCATATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 9 10 180622 CASAVA_Build 3 192457255 2I TAATTTTAAT --/AA AAGTTTATAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 2 4 180623 CASAVA_Build 3 192459017 1D GAGAAACACC A/- AATGCACGCG 3070 het 3070 hom 30 14 14 4 A 3 2 180624 CASAVA_Build 3 192459983 1I CTTGCCTGGA -/T TTTTTTTTTT 2835 het 1957 hom 25 8 9 8 T 11 12 180625 CASAVA_Build 3 192460816 1I TCCTGTAAAG -/C CCAGAATGTA 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 C 2 3 180626 CASAVA_Build 3 192467505 1I CTGTTTCTGC -/T TTAGTAATGT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 2 3 180627 CASAVA_Build 3 192476185 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 A 10 11 180628 CASAVA_Build 3 192480398 1I GCTTTAAAAG -/A AAAACACATA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 4 5 180629 CASAVA_Build 3 192484260 1I TGTGTCTTAC -/T TTTCTTAAGA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 T 3 4 180630 CASAVA_Build 3 192484686 2D TCTATTTTTT AA/-- AAAGTGTTGA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 5 3 180631 CASAVA_Build 3 192485715 2I AGTGTAGAGT --/TA TATTTTACGT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 TA 1 2 180632 CASAVA_Build 3 192486882 4D AATTTAAGAA GAAT/---- GAAGTCATAT 3070 het 3070 ref 48 20 18 11 GAAT 1 0 180633 CASAVA_Build 3 192487315 1I ATAGGACTTG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 T 7 8 180634 CASAVA_Build 3 192487406 1D AATGTAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 19 24 4 A 10 9 180635 CASAVA_Build 3 192487488 1D GAATAACTTC A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 A 8 7 180636 CASAVA_Build 3 192487614 1D TCCCATCAAA G/- AAAAGCCCAG 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 G 1 0 180637 CASAVA_Build 3 192489407 4I AAAAGCAAAA ----/ACAG ACAAACGAGA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 ACAG 0 1 180638 CASAVA_Build 3 192491549 3D GTGCTTGGAG TTC/--- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 30 10 19 3 TTC 1 0 180639 CASAVA_Build 3 192493699 2D AGTTTTATTT TA/-- TATATGTCAT 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 TA 3 2 180640 CASAVA_Build 3 192496750 10D ACACACTCAC ACACACACAT/---------- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 46 26 20 5 ACACACACAT 2 1 180641 CASAVA_Build 3 192498716 1I ATTGAATTCC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 8 9 180642 CASAVA_Build 3 192503779 1D ATATATCTGC T/- GTCAATTTAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 T 1 0 180643 CASAVA_Build 3 192504014 4D ACATTTCCTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 44 0 35 13 A 16 12 180644 CASAVA_Build 3 192504357 4I ATGTGGTCAG ----/ACAT AGAACAGGAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ACAT 0 1 180645 CASAVA_Build 3 192508321 2D TTTTCTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 885 het 860 hom 23 5 5 14 T 16 14 180646 CASAVA_Build 3 192512478 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAATT 2970 het 2970 ref 20 7 9 4 A 8 9 180647 CASAVA_Build 3 192512774 1D AGAGTATCAG C/- CCTGGAGGCG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 C 3 2 180648 CASAVA_Build 3 192513501 1D GTCAAACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1974 hom 32 9 15 8 T 15 14 180649 CASAVA_Build 3 192516700 1I TATTAGTGTG -/T CCGGAATTGG 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 T 0 1 180650 CASAVA_Build 3 192517948 1I CAGCTGCGGG -/C CGAAGGGCTC 1286 het 1286 ref 17 7 3 7 C 1 2 180651 CASAVA_Build 3 192518926 1I GGTTGCAATG -/T TTTCCAGCTT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 3 4 180652 CASAVA_Build 3 192520370 1I AAAAAGCCAC -/T TTTTTTTTTT 1158 het 1158 ref 18 10 5 3 T 13 14 180653 CASAVA_Build 3 192523634 1I6M2I TTTATTTTAT -TTATTT--/GTTATTTTA ATTTATTTTT 166 het 166 ref 25 19 1 5 N/A 0 0 180654 CASAVA_Build 3 192525543 3D AGGAAAAAAA AAT/--- AATATTAATA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 AAT 2 1 180655 CASAVA_Build 3 192534197 3D GAATGAATAC ATT/--- ATTATTCTCT 3070 het 3070 hom 33 12 19 4 ATT 3 2 180656 CASAVA_Build 3 192553260 3I AGATTAACAT ---/ATC ATTGAAACTC 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 ATC 0 1 180657 CASAVA_Build 3 192553448 1D TCCAGCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 8 T 13 12 180658 CASAVA_Build 3 192554737 4I CTTTTGAAGC ----/AAAA AGAATGGCTC 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 A 1 5 180659 CASAVA_Build 3 192563559 1D TCCTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 1680 het 1680 ref 29 16 8 5 T 12 11 180660 CASAVA_Build 3 192564558 1I TTAGTTCTTA -/T TTTTTTTTTT 1203 het 1203 ref 25 12 8 5 T 14 15 180661 CASAVA_Build 3 192584938 4I TGGAAAAGTT ----/TAGC TAGCTATACA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TAGC 1 2 180662 CASAVA_Build 3 192585194 1I CATGTGTAGG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 8 9 180663 CASAVA_Build 3 192586166 8D GATTTTGTTA TATTTGTT/-------- TATTTGTTTT 3070 hom 51 het 19 0 17 3 TATTTGTT 2 1 180664 CASAVA_Build 3 192586700 15D AGTATGGGCA TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 8 T 26 11 180665 CASAVA_Build 3 192588470 1D TTTGTCTTAA T/- TTTTCTACCA 3070 hom 93 het 36 0 31 6 T 5 4 180666 CASAVA_Build 3 192590519 1D AATTTCTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 7 180667 CASAVA_Build 3 192590825 7I15M5D6M20D7M4D5M1D3M4D TAGGGATACC -------TCAATTGGACGAAACCTTTAAAATTTGTTTCCAGAAAAGGGTCCCGATTCAGACTCCAAGAAGAAGGTTC/CATAGAGTAAAGTGGTAGAAGC-----AAGTTT--------------------ATTAAGA----AAGTA-AAG---- GAATAAAGAA 2560 het 2560 ref 27 20 8 5 N/A 0 0 180668 CASAVA_Build 3 192595636 4D TGTTTACTGA ACTC/---- ACTCTAGAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 ACTC 2 1 180669 CASAVA_Build 3 192609570 1I GGTGTGGGGA -/G GGGGGAGGGA 3070 hom 71 het 31 0 24 7 G 5 6 180670 CASAVA_Build 3 192612339 2D ATGTATCTCC CT/-- CTCTCTCTCT 2868 hom 34 het 26 0 13 13 CT 9 8 180671 CASAVA_Build 3 192612753 1I TTACATGCAT -/A AAGTTCTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 2 3 180672 CASAVA_Build 3 192615042 4D CAATTAATGA GTAT/---- TAGGAGGGGT 3070 het 3070 hom 49 24 21 5 GTAT 1 0 180673 CASAVA_Build 3 192619504 1I AACTGCTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 9 10 180674 CASAVA_Build 3 192631745 1D GACCTCCAAG T/- GGAGATTTGA 3070 het 3070 hom 43 11 25 7 T 1 0 180675 CASAVA_Build 3 192633590 1D CTTCCTGGGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 7 180676 CASAVA_Build 3 192648991 1I AGTTTTAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 T 11 12 180677 CASAVA_Build 3 192655089 2I CATAATTATA --/AC AGTTACTCTG 3070 hom 69 het 32 0 24 8 AC 0 1 180678 CASAVA_Build 3 192655795 2D TTCTATAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 36 3 18 16 A 12 10 180679 CASAVA_Build 3 192656572 2D CAGTGCTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 23 0 11 13 T 13 11 180680 CASAVA_Build 3 192664322 1D CTAGTGTTGA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 6 180681 CASAVA_Build 3 192665128 9I GTACATTTAC ---------/TTATATTAT TTATATTATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTATATTAT 1 2 180682 CASAVA_Build 3 192670623 1D ACATTTTGAC T/- TTTTTTCCTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 7 6 180683 CASAVA_Build 3 192674597 1I ATGGTCATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 180684 CASAVA_Build 3 192674782 1I TTACAGACTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 8 9 180685 CASAVA_Build 3 192678655 20I TTTGTTTTTG --------------------/TTTTTTGTTTTTTGTTTTGC TTTTTTGTTT 3070 hom 50 het 19 0 17 3 TTTTTTGTTTTTTGTTTTGC 0 1 180686 CASAVA_Build 3 192682813 1I TCTGAGGCCT -/C CCCAGCCATG 3070 hom 81 het 31 0 26 5 C 3 4 180687 CASAVA_Build 3 192716020 1I TTTGTATATT -/C TTTAATTTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 0 1 180688 CASAVA_Build 3 192717397 1D AGAAAACAAT A/- AAAATTTCTG 3070 hom 144 het 50 0 49 3 A 5 4 180689 CASAVA_Build 3 192729315 18D CCACAATGCA GGCCATCTGCAAGCTGTG/------------------ GGCCATCTGC 3070 hom 72 het 34 0 22 15 GGCCATCTGCAAGCTGTG 2 1 180690 CASAVA_Build 3 192731277 1I TTACACAATA -/C CCCTTTTTTT 3070 het 332 hom 30 1 23 6 C 3 4 180691 CASAVA_Build 3 192742897 6D GTTCTCTGAC TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 53 25 18 12 TG 12 9 180692 CASAVA_Build 3 192749852 4D TTGGTGGCAG TTTT/---- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 41 20 17 6 T 10 6 180693 CASAVA_Build 3 192750341 5D ATTGGGGACT TTTAA/----- TTTAACAGAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 7 TTTAA 2 1 180694 CASAVA_Build 3 192755450 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 25 1 17 8 A 14 12 180695 CASAVA_Build 3 192756260 4D TAATACAGAG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 7 TGTT 5 4 180696 CASAVA_Build 3 192757082 1D TGAACACTGC A/- TTGGTCATGC 3070 hom 126 het 51 0 43 9 A 1 0 180697 CASAVA_Build 3 192757489 1D CAATAGCAAA T/- CTGGGGCTAC 3070 hom 92 het 33 0 30 3 T 1 0 180698 CASAVA_Build 3 192757734 1D AATGATTTGG T/- TATCCTGCAG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 2 1 180699 CASAVA_Build 3 192758252 1D CATAACAATA G/- CTAAAATTTA 3070 hom 148 het 57 0 50 7 G 1 0 180700 CASAVA_Build 3 192758983 2I ATCAAATTGT --/TC TCTGTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TC 1 2 180701 CASAVA_Build 3 192759818 1I ATACATTTAA -/T TTTTAAGATA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 4 5 180702 CASAVA_Build 3 192763732 7D ATATTCAGAG TATACTT/------- TATGCTTTAT 3070 het 3070 ref 40 23 18 1 TATACTT 1 0 180703 CASAVA_Build 3 192764289 1I CTTAAGAGTT -/C CGTCAATGGC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 1 2 180704 CASAVA_Build 3 192766039 1I ACAAACACAC -/A AAAAAAACTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 7 8 180705 CASAVA_Build 3 192768400 1D TTATAAAGTA G/- AAAAAATTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 G 1 0 180706 CASAVA_Build 3 192770040 1I TTGTTTTGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 94 het 43 0 32 11 A 9 10 180707 CASAVA_Build 3 192771041 9D ACTTCCATAT AAATTGTAG/--------- AATCAGCTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 AAATTGTAG 1 0 180708 CASAVA_Build 3 192772897 4D ATATATTATT TATG/---- TGACTGAAAT 3070 hom 126 het 44 0 43 4 TATG 1 0 180709 CASAVA_Build 3 192777696 1D TTTAAAGACA C/- AGAAAAAAGA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 C 1 0 180710 CASAVA_Build 3 192779676 1I CAGTCACAGC -/T CACTGCAACC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 0 1 180711 CASAVA_Build 3 192781753 2D GAGCATACTC TG/-- TATGTGGTAT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 TG 1 0 180712 CASAVA_Build 3 192782981 2I TAAAAAAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 10 12 180713 CASAVA_Build 3 192784420 3D TCAGAAATAG CCA/--- CCATTCTCAT 3070 het 3070 ref 47 26 20 1 CCA 2 1 180714 CASAVA_Build 3 192787323 1D AGAAAAAAAA C/- AGTAGAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 30 5 C 1 0 180715 CASAVA_Build 3 192789332 4D TGGGTACATA CTTG/---- TGTGTAATAT 3070 hom 102 het 41 0 35 9 CTTG 1 0 180716 CASAVA_Build 3 192802588 2I GCTATCATAC --/CT CTCTTCCTCT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 CT 2 3 180717 CASAVA_Build 3 192810128 4D TTAAATTGGC TGTT/---- TGTAAGAGCT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 TGTT 1 0 180718 CASAVA_Build 3 192819091 1I GTTAGCTGTG -/C TTTTTAAGGA 3070 hom 62 het 24 0 21 3 C 0 1 180719 CASAVA_Build 3 192824496 1D TATGCATCTT A/- AAAAAGACTG 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 6 5 180720 CASAVA_Build 3 192841729 5D TTATATATAT ATATA/----- ATATATGATG 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 ATATA 2 1 180721 CASAVA_Build 3 192842292 2D AAACTAACAC AG/-- AGAGCTGCCT 3070 het 3070 ref 38 20 10 9 AG 3 2 180722 CASAVA_Build 3 192860576 2D AGAAATAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 13 11 180723 CASAVA_Build 3 192860817 1I ATTCCAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 555 hom 27 2 21 4 A 12 13 180724 CASAVA_Build 3 192862131 1I CCTACCCCAG -/C CCCCCATGAC 3070 hom 44 het 20 0 15 5 C 5 6 180725 CASAVA_Build 3 192896609 1I AAGTTCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 10 11 180726 CASAVA_Build 3 192898200 5D TTCATGCTTA TTATG/----- TTATATCTAA 3070 het 3070 ref 32 19 10 7 TTATG 1 0 180727 CASAVA_Build 3 192917086 1I ATTAACTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 T 9 10 180728 CASAVA_Build 3 192917917 1I TATAGCTTAT -/A AAGGCCACAT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 2 3 180729 CASAVA_Build 3 192923653 1I ATCAGTTGAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 T 7 8 180730 CASAVA_Build 3 192924821 1D CGTATATTTT G/- TCTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 G 1 0 180731 CASAVA_Build 3 192928705 2I ATCTATACTC --/TA TATAGATATT 3070 het 3070 ref 54 35 14 5 TA 2 3 180732 CASAVA_Build 3 192952178 2D TTAGTGAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2933 hom 23 8 11 5 T 12 10 180733 CASAVA_Build 3 192953976 1I CTCCACTTTT -/G GGCTGTCTCC 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 G 2 3 180734 CASAVA_Build 3 192958669 1D GTTATATCCC T/- TTGACTCACT 3070 het 3070 hom 41 15 23 4 T 3 2 180735 CASAVA_Build 3 192959079 1I GAACATAAAA -/T TATTTAACAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 1 2 180736 CASAVA_Build 3 192959841 4I ACCCATTTAT ----/GTAA GTAAGCCTTT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 GTAA 1 2 180737 CASAVA_Build 3 192960324 1D ATAAAAGCAG A/- ATATTAAATT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 A 2 1 180738 CASAVA_Build 3 192962219 1D ATTCGGAAGT A/- AAAAATGTGT 3070 het 3070 ref 48 27 19 3 A 6 5 180739 CASAVA_Build 3 192970690 4D GGAGAGGGAC AGAG/---- AGAGAGAGTG 3070 het 3070 ref 43 23 16 6 AG 6 4 180740 CASAVA_Build 3 192971849 1I GTTCCTTGCC -/T TATGGAGTGA 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 T 1 2 180741 CASAVA_Build 3 192977428 1D TCTTACTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 T 9 8 180742 CASAVA_Build 3 192983180 1D GGGAGGGAGT G/- GGATAAGGGC 3070 het 3070 hom 67 28 27 12 G 3 2 180743 CASAVA_Build 3 192983393 4I ATGTTAGAGA ----/TTCT TTATTCTGGT 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 TTCT 0 1 180744 CASAVA_Build 3 192984296 2D ATTATGTCAC AT/-- GTTTTAATCT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 AT 1 0 180745 CASAVA_Build 3 192993830 1I GCAAAGAATA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 7 8 180746 CASAVA_Build 3 193017958 1D ACTCAATAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 9 8 180747 CASAVA_Build 3 193021750 1D GAGGCTCTGA G/- GGTTATTCTA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 G 3 2 180748 CASAVA_Build 3 193058492 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1814 het 1119 hom 17 5 6 6 A 15 16 180749 CASAVA_Build 3 193073778 1I GGAATTCACT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 7 8 180750 CASAVA_Build 3 193081493 1D ATCTTCTAAT G/- TACTCTTATA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 1 0 180751 CASAVA_Build 3 193083761 1D CACTTACATT A/- AGCCTACAGT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 A 2 1 180752 CASAVA_Build 3 193098520 14D GTAACAGGCG AGTGATAACAGGCA/-------------- AGTGATAACA 1876 hom 15 het 5 0 6 0 AGTGATAACAGGCA 1 0 180753 CASAVA_Build 3 193135126 2I TTGCAGTTTT --/TG TAGAGATGTG 3070 hom 96 het 37 0 31 6 TG 0 1 180754 CASAVA_Build 3 193149290 1I TTTTAATTTT -/A AAAAATGTTG 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 5 6 180755 CASAVA_Build 3 193162273 1D TAACTCCAAG T/- TTTTAGACAA 3070 het 3070 ref 43 23 18 3 T 5 4 180756 CASAVA_Build 3 193162684 1I TAGCTCTTTT -/A AAAAAATCGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 6 7 180757 CASAVA_Build 3 193164539 3D TGGCTAATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TTG 5 4 180758 CASAVA_Build 3 193164897 1I AGCTCTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 94 hom 36 2 23 11 A 13 14 180759 CASAVA_Build 3 193166165 1I AAAAAGACAT -/A AAAAAATGAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 6 7 180760 CASAVA_Build 3 193169936 1D CATGGACCAA T/- ATCCTGTGCT 3070 hom 141 het 48 0 48 0 T 1 0 180761 CASAVA_Build 3 193171827 1I TATTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 37 1 31 5 T 10 11 180762 CASAVA_Build 3 193174306 2D GGTCTGCTGC CA/-- CAGTTTAGGC 3070 het 3070 ref 37 17 12 9 CA 2 1 180763 CASAVA_Build 3 193179030 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 74 het 35 0 29 6 A 8 9 180764 CASAVA_Build 3 193180708 2D15M2D GGTAAAATAA AGAAGTAAAAAAGAAGTAA/--AAGTAAAAAAGAAGT-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 N/A 0 0 180765 CASAVA_Build 3 193183612 1D AATATAATGT C/- CAATTTCACT 3070 hom 159 het 61 0 53 9 C 2 1 180766 CASAVA_Build 3 193187085 1I ATTTCAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 885 hom 45 3 36 6 T 10 11 180767 CASAVA_Build 3 193187433 1D AATCATTTTC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 134 het 51 0 45 6 T 9 8 180768 CASAVA_Build 3 193187959 1D TACTATTTTT A/- TTGTTGTATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 0 180769 CASAVA_Build 3 193188160 1D ATCAAGTATC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 9 8 180770 CASAVA_Build 3 193192466 1I ATGAATGGAA -/T TGGTACCTCA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 1 2 180771 CASAVA_Build 3 193195144 1I GTATTAATTT -/G GGGAACTAAT 3070 hom 41 het 17 0 14 3 G 3 4 180772 CASAVA_Build 3 193197468 4I TGTTTGTGGC ----/AGGA AGGAAGGAAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AGGA 2 3 180773 CASAVA_Build 3 193204311 1D TAAAATCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 36 0 29 7 T 11 10 180774 CASAVA_Build 3 193210566 1I AGGGTAAGGG -/C GGTGAGAAAA 3070 het 3070 hom 56 20 28 8 C 0 1 180775 CASAVA_Build 3 193213707 4I TCTCTTTCTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 2845 hom 30 13 11 6 TTTC 3 4 180776 CASAVA_Build 3 193217836 1I GGCAAATACC -/A AAAAAAAACA 3070 het 2401 hom 30 11 12 7 A 8 9 180777 CASAVA_Build 3 193223149 3D GGCAATAGAG CCT/--- CCTCCTCCCT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 CCT 3 2 180778 CASAVA_Build 3 193231648 1D TTGCCTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2978 hom 30 7 17 7 T 10 9 180779 CASAVA_Build 3 193235405 1D ATACAAAACC T/- TGTTAAAATT 3070 het 3070 ref 52 23 25 4 T 2 1 180780 CASAVA_Build 3 193239101 1I TAAATTGTAT -/A AAAAGTAGCA 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 A 4 5 180781 CASAVA_Build 3 193241715 8D TTTACATCTA TAGCTGAG/-------- TAGCTGAGTT 3070 het 3070 ref 38 22 15 2 TAGCTGAG 2 1 180782 CASAVA_Build 3 193242071 4D AAAAAAAAAG AAAA/---- AGAAAGAAAG 1310 het 1310 ref 17 7 5 6 A 5 1 180783 CASAVA_Build 3 193244150 1D CGGGTTTAAA G/- AGTGAAACAC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 G 1 0 180784 CASAVA_Build 3 193247766 1D TTACTAAACA T/- TTTTTAAAGA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 6 5 180785 CASAVA_Build 3 193248457 1I TCACCAAAAA -/C AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 C 0 1 180786 CASAVA_Build 3 193250491 1I TAAATAAAAT -/A AAAAATTACA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 5 6 180787 CASAVA_Build 3 193252674 2I AACAGGCTTC --/TT TATCAGTTAT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 T 1 3 180788 CASAVA_Build 3 193253430 1D GATGAGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 A 10 9 180789 CASAVA_Build 3 193256092 4D GTAGGATATC TTCT/---- TTCTTACTCT 3070 het 3070 hom 48 21 27 1 TTCT 2 1 180790 CASAVA_Build 3 193256776 1I CCACCCCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 9 10 180791 CASAVA_Build 3 193259735 13D AGTTTTTGTG AGCCTCTGGTCAC/------------- AGCATTTTTG 3070 het 3070 ref 42 25 19 2 AGCCTCTGGTCAC 1 0 180792 CASAVA_Build 3 193259894 2I TATCTAACAC --/AT GTTTGTTCTT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 AT 0 1 180793 CASAVA_Build 3 193260679 3D CTAGCTAAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 2700 het 1069 hom 18 4 9 7 T 15 12 180794 CASAVA_Build 3 193271708 1D AAGGGAGATA G/- GGGGTGGGGC 3070 het 2908 hom 21 10 9 2 G 5 4 180795 CASAVA_Build 3 193297562 1D GGACACCAAG A/- AATGGGAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 18 0 A 3 2 180796 CASAVA_Build 3 193309952 1D GGTTAGTTTC T/- TGTTGAATTG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 T 2 1 180797 CASAVA_Build 3 193334804 1I TTAATAATTT -/G GGGGGGCTAC 3070 hom 81 het 30 0 26 4 G 6 7 180798 CASAVA_Build 3 193337832 18D CAAAAAAAAA AAAAAAGAAAAGAAAAAG/------------------ AAAAAAAAAA 2424 het 105 hom 6 1 8 1 AAAAAAGAAAAGAAAAAG 1 0 180799 CASAVA_Build 3 193339411 4I TATTGCATTA ----/TTTG TTTATTTATG 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 TTTG 0 1 180800 CASAVA_Build 3 193342292 4I TGAGTGTGTA ----/TGTG TGTGTATCAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TG 2 4 180801 CASAVA_Build 3 193342957 1D TCTGCATACA T/- TTTTTAACAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 7 T 6 5 180802 CASAVA_Build 3 193346410 1D TTTCTATTAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 8 7 180803 CASAVA_Build 3 193357992 1D ATTTTTTCCA G/- GGCAAGCTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 G 3 2 180804 CASAVA_Build 3 193365795 1I TCCCTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 28 1 13 14 A 11 12 180805 CASAVA_Build 3 193368688 5D CTTGTACTAC TTTTA/----- TAACAAGAAG 3070 het 3070 hom 33 11 21 6 TTTTA 1 0 180806 CASAVA_Build 3 193370319 2D GTTTCCTCAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 532 hom 39 5 20 14 A 11 9 180807 CASAVA_Build 3 193374119 1I CTTTTTATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 9 10 180808 CASAVA_Build 3 193374904 6D CCATTCAGTA TAATTC/------ CAACAGGGCT 3070 het 3070 hom 35 16 17 6 TAATTC 1 0 180809 CASAVA_Build 3 193375184 1D ATTATGCCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 10 9 180810 CASAVA_Build 3 193375871 4I ATCAGAGAAA ----/ACTT ACTTATAGAA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 ACTT 1 2 180811 CASAVA_Build 3 193376435 1D CTTAGGGTCT A/- CCACTGCCCA 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 A 1 0 180812 CASAVA_Build 3 193382733 1D AGAAATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 11 10 180813 CASAVA_Build 3 193390406 2D TTTTAAGGAC TT/-- TTGTGTTTGA 3070 het 3070 hom 37 14 15 10 T 4 2 180814 CASAVA_Build 3 193410447 1I GATTAAAGAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 8 9 180815 CASAVA_Build 3 193410616 1I TCCTTGAGAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 7 8 180816 CASAVA_Build 3 193411217 1I ATATTCTAAC -/A GAGAGTAGAA 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 A 0 1 180817 CASAVA_Build 3 193411984 1D TCTCGGCTCA C/- TGCAAGCTCC 2680 het 2247 hom 16 7 8 2 C 1 0 180818 CASAVA_Build 3 193422764 14D CTTAACAGCC GACTCTATTGAAGA/-------------- GACTCTATTG 3070 het 3070 ref 41 23 16 10 GACTCTATTGAAGA 2 1 180819 CASAVA_Build 3 193427408 1I TGTGTCAATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 A 8 9 180820 CASAVA_Build 3 193430453 1I TGTGAGAAAG -/A ATGTTGTAAA 3070 het 3070 hom 45 13 28 4 A 1 2 180821 CASAVA_Build 3 193431770 1D CAGGCCCCCC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 34 10 15 10 T 9 8 180822 CASAVA_Build 3 193436723 1D TATGATGTCA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 104 het 45 0 35 10 T 9 8 180823 CASAVA_Build 3 193443404 1D GAAAAATAGT A/- AGAAAATTTA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 A 2 1 180824 CASAVA_Build 3 193469649 5D CCACCAGCCT TGTCC/----- TGTCCTCTCA 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 TGTCC 2 1 180825 CASAVA_Build 3 193488550 1I GCTTTAGAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 8 9 180826 CASAVA_Build 3 193492780 1D TACCAAACAA T/- TTTTTTTTTT 1343 het 1343 ref 32 22 3 8 T 13 12 180827 CASAVA_Build 3 193493725 1D ATGTTTACTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 9 8 180828 CASAVA_Build 3 193546524 1I TTTAGAAATT -/A AGGGATAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 1 2 180829 CASAVA_Build 3 193553808 2I CAAATGACTC --/AT GTTTTGCTTT 3066 het 3066 ref 24 12 7 5 AT 0 1 180830 CASAVA_Build 3 193563723 2D AAGTATAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2105 hom 28 6 19 4 A 13 11 180831 CASAVA_Build 3 193564854 4I AATGAAATGA ----/TGAC TGACTATATT 3070 het 3070 hom 59 25 31 3 TGAC 1 2 180832 CASAVA_Build 3 193571057 1I TTTTTTCATA -/T GCCAATGGCT 3070 het 3070 ref 50 19 16 15 T 0 1 180833 CASAVA_Build 3 193572224 1D ATCATTGGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 10 9 180834 CASAVA_Build 3 193578512 1I CTCTTTCTTT -/C TCTTTCTTTC 1690 het 1690 ref 20 12 4 4 C 0 1 180835 CASAVA_Build 3 193584023 1I AAATCTGATT -/A AAAAAAAAAA 1064 het 1064 ref 31 20 6 5 A 12 13 180836 CASAVA_Build 3 193586137 7D CATATAAACC ATAGTTT/------- ATATGTCCAA 3070 het 3070 ref 46 21 22 5 ATAGTTT 1 0 180837 CASAVA_Build 3 193598431 1I AGTGCAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 9 10 180838 CASAVA_Build 3 193599607 1D AAATATAAGC A/- AAAAAAAAAA 2433 het 2433 ref 42 25 7 11 A 13 12 180839 CASAVA_Build 3 193604031 1I GGTCTTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 9 12 T 13 14 180840 CASAVA_Build 3 193606147 1I ATTCGAATAG -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 68 31 30 7 T 5 6 180841 CASAVA_Build 3 193620787 4D GAAAAGGAAA TACT/---- TACTTTAAGT 3070 het 3070 ref 39 23 14 5 TACT 2 1 180842 CASAVA_Build 3 193624570 1I TAAAGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 2697 het 2697 ref 25 12 7 6 A 11 12 180843 CASAVA_Build 3 193627864 1D TCCGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2650 hom 41 11 24 6 A 15 14 180844 CASAVA_Build 3 193630277 1I GCCATTCTGG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 8 9 180845 CASAVA_Build 3 193652878 5D TACATTAATG GATTT/----- GATTTGTCAG 3070 het 3070 hom 45 18 25 4 GATTT 2 1 180846 CASAVA_Build 3 193678899 2I TAATTAGTAG --/AT ATAGTATATA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 AT 1 2 180847 CASAVA_Build 3 193684799 15D CCATTTTCCT AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAGA 3070 het 2599 hom 28 8 20 5 A 23 8 180848 CASAVA_Build 3 193695325 4D GGGCCTATGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 45 het 24 0 16 13 AT 9 7 180849 CASAVA_Build 3 193695934 2I CACAACAATG --/AT ATATATATAA 3070 het 414 hom 38 1 30 7 AT 4 5 180850 CASAVA_Build 3 193698489 2I TAAATGAAAG --/AC AGCAAATTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AC 0 1 180851 CASAVA_Build 3 193704059 2D26M4D TTTGTTTTGG TTTTTTTTTTTTGGTGTGTGTGTGTGTGTTTT/--TTTTTTTTTTGGTGTGTGTGTGTGTG---- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 20 1 19 2 N/A 0 0 180852 CASAVA_Build 3 193707376 1D ATTAACTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 26 2 12 12 T 17 16 180853 CASAVA_Build 3 193728418 2D AATAGCGCAG GA/-- GAAAGACCCA 3070 hom 51 het 18 0 16 2 GA 2 1 180854 CASAVA_Build 3 193742665 3D CCATTCTTTT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 8 TTC 3 2 180855 CASAVA_Build 3 193743625 1D TTTTCAGAAG C/- CAGTCCCTTA 3070 het 3070 ref 44 22 13 10 C 2 1 180856 CASAVA_Build 3 193753019 1I AAAATGTATC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 8 9 180857 CASAVA_Build 3 193755275 1I TGAGCTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 10 11 180858 CASAVA_Build 3 193757749 1I AAATTAAGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 9 10 180859 CASAVA_Build 3 193759084 1D ATATGAAACC A/- AAAAATAAAC 3070 hom 90 het 34 0 29 6 A 6 5 180860 CASAVA_Build 3 193760329 1I TTAATGAATT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 8 180861 CASAVA_Build 3 193770921 2D AGAGAAAAAA AG/-- AGACAGGCTG 3070 het 2913 hom 29 8 15 7 AG 2 1 180862 CASAVA_Build 3 193772033 1D CCGAGAAAGC A/- AAAGCTTTCA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 4 3 180863 CASAVA_Build 3 193773726 1D TGTGGAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 635 hom 43 2 34 8 A 12 11 180864 CASAVA_Build 3 193778358 1I TAATGTGAAG -/T TGTTAGATAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 2 180865 CASAVA_Build 3 193780803 1I AACATTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 12 13 180866 CASAVA_Build 3 193783165 1I CACAGCTAGT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 1061 hom 44 8 23 13 A 8 9 180867 CASAVA_Build 3 193784779 3D TGTATGCCGA TCT/--- TCTTCGGCCT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 TCT 2 1 180868 CASAVA_Build 3 193785509 1D ATTTTCAGAT A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 7 6 180869 CASAVA_Build 3 193820742 2D CGCGCGCACG CA/-- CACACACACA 3070 hom 75 het 27 0 23 5 CA 8 7 180870 CASAVA_Build 3 193823913 1D ATACAGATTT G/- GGGGGTGATG 3070 hom 138 het 51 0 47 5 G 6 5 180871 CASAVA_Build 3 193824680 1D TCTCTTAGAT A/- AAAAAAAAAA 947 het 947 ref 32 27 3 2 A 11 10 180872 CASAVA_Build 3 193828823 1I GGGAATACAC -/T TTTTGTTTTT 2131 het 2131 ref 26 18 5 3 T 4 5 180873 CASAVA_Build 3 193843759 4I CTAATTGATC ----/CTGA CTGACATGGA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 CTGA 1 2 180874 CASAVA_Build 3 193848196 2D GTATATATAC AT/-- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 AT 5 4 180875 CASAVA_Build 3 193848966 2D ACTATTTAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 15 10 T 14 12 180876 CASAVA_Build 3 193854204 4I CATTTGAGGC ----/TTTT TTTTTTTTTT 2632 het 1572 hom 17 5 9 3 T 12 16 180877 CASAVA_Build 3 193854902 1D TCTAAATGAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 8 7 180878 CASAVA_Build 3 193857589 1I TGAGTTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 10 11 180879 CASAVA_Build 3 193858460 1I GAGACTATTT -/G GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 G 3 4 180880 CASAVA_Build 3 193861468 1D CTAGTTCTTT A/- AAAAAAAAAT 518 het 518 ref 22 10 3 9 A 10 9 180881 CASAVA_Build 3 193866272 1I TAAAATTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 A 7 8 180882 CASAVA_Build 3 193899078 4D AAACATAGAC TTCA/---- TTCAATTCCA 3070 het 3070 hom 35 14 15 8 TTCA 2 1 180883 CASAVA_Build 3 193928946 1I ATTTACTACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 T 9 10 180884 CASAVA_Build 3 193929651 4D GTACTCTTCA TATT/---- TATTCTTTTA 3070 het 3070 hom 37 16 20 5 TATT 2 1 180885 CASAVA_Build 3 193932716 1D GTGCCAAGAA T/- TAGGTGAGAC 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 2 1 180886 CASAVA_Build 3 193951253 1D TGTTAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 13 12 180887 CASAVA_Build 3 193951998 1D CACTTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 A 13 12 180888 CASAVA_Build 3 193953135 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1802 het 1090 hom 15 3 6 6 A 13 12 180889 CASAVA_Build 3 193961659 1D AGCAAACAAA T/- TCAAAAGATA 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 T 2 1 180890 CASAVA_Build 3 193961816 1I AATAAAGAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 7 8 180891 CASAVA_Build 3 193964181 4I TATAAGAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 2639 het 817 hom 12 3 6 3 AAAC 1 2 180892 CASAVA_Build 3 193966048 2I GGATTCCCGC --/CA CCCCCCCCCA 1559 het 280 hom 10 1 6 3 CA 0 1 180893 CASAVA_Build 3 193966252 5D CTAACCTAGC TTGAG/----- TTAAGTGTGT 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 TTGAG 1 0 180894 CASAVA_Build 3 193968390 4D TAGAGAAAAT CTAG/---- CTAGCCCACA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 CTAG 2 1 180895 CASAVA_Build 3 193977981 7D ACTTGTGGCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTG 3070 het 950 hom 22 6 11 5 T 16 9 180896 CASAVA_Build 3 193978776 10I TAGTAGCAGT ----------/CCCAGTACTA CTCAGGACTG 1898 het 1415 hom 13 4 5 4 CCCAGTACTA 0 1 180897 CASAVA_Build 3 193978909 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAG 1388 het 1388 ref 19 10 6 3 A 10 9 180898 CASAVA_Build 3 193983722 1D ATTTTGCGGG A/- AAAAAAAAAT 2902 het 2902 ref 27 13 7 7 A 10 9 180899 CASAVA_Build 3 193989057 1I AGCCCTTGGG -/A AAACTGAAGT 3070 het 3070 hom 51 18 30 3 A 3 4 180900 CASAVA_Build 3 194013352 3D TTTTTTCCCT TGA/--- TGCATACGTG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 TGA 1 0 180901 CASAVA_Build 3 194016707 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 9 10 180902 CASAVA_Build 3 194017359 1D TTTCCCCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 10 9 180903 CASAVA_Build 3 194019476 1D AGGAATTGAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 10 9 180904 CASAVA_Build 3 194022960 3I CATAGAAGTT ---/CTC CTAATAGATG 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 CTC 0 1 180905 CASAVA_Build 3 194028206 4I TTCTGTCTAC ----/ACTG ACTTAGTGTC 3070 het 3070 ref 59 30 22 7 ACTG 0 1 180906 CASAVA_Build 3 194082859 8I CGCCCCGCAC --------/ATTCAGTA ATTATTAAAC 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 ATTCAGTA 0 1 180907 CASAVA_Build 3 194085026 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 6 5 180908 CASAVA_Build 3 194096213 1D GTTTTTGGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 9 8 180909 CASAVA_Build 3 194096902 19I TGTTGTGCAG -------------------/TGGCTATTCACAGGTGTGA TCATAGTACA 3070 hom 104 het 40 0 33 8 TGGCTATTCACAGGTGTGA 0 1 180910 CASAVA_Build 3 194098445 1D CTGTCTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 11 10 180911 CASAVA_Build 3 194098643 4D ATTTTATAAC TATT/---- TATTTTTCAA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TATT 2 1 180912 CASAVA_Build 3 194102038 1I ACCCCAACAA -/C CAATTGTATC 3070 hom 141 het 53 0 47 6 C 1 2 180913 CASAVA_Build 3 194107652 5D AACAGTTCTT AAAAG/----- AGATCACTCA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 AAAAG 1 0 180914 CASAVA_Build 3 194112175 1D AGGAATGACA G/- GAAGACCCAG 3070 hom 92 het 35 0 29 6 G 2 1 180915 CASAVA_Build 3 194120629 1D TTTTTAGGCA G/- GGCGTGGTGG 3070 hom 96 het 33 0 33 1 G 3 2 180916 CASAVA_Build 3 194123901 2D TTATTCTCTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 36 14 14 9 CT 6 5 180917 CASAVA_Build 3 194127075 1D AAAATAAGAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 A 8 7 180918 CASAVA_Build 3 194127204 2D TTTGCCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2044 het 2044 ref 26 11 5 10 T 16 14 180919 CASAVA_Build 3 194130426 1D CACATTACTG T/- TAAGAAAACA 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 T 2 1 180920 CASAVA_Build 3 194132168 1D CAATTACTCA G/- GAGGCTGAGG 712 het 712 ref 12 8 3 1 G 2 1 180921 CASAVA_Build 3 194137828 1D ATCCAGTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2334 hom 23 6 13 4 T 10 9 180922 CASAVA_Build 3 194139211 12D GTGAGCAGCA GCAAGTTTTATC/------------ GTGAAGAGCG 2716 het 2716 ref 21 13 6 8 GCAAGTTTTATC 1 0 180923 CASAVA_Build 3 194148254 1D TTTTTGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2527 hom 24 7 11 6 T 11 10 180924 CASAVA_Build 3 194149198 2I GCTAAAGAGG --/AA ATATAGATGG 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 1 3 180925 CASAVA_Build 3 194156014 68D ATTTTCCTGT TAGGGTACAACCTCTCCCTTGAATATTAGTTTTAATTCATTATTAATATGAATTCACTTTTACTTCTA/-------------------------------------------------------------------- TCTCCAAGTT 3070 het 3070 ref 28 30 13 2 TAGGGTACAACCTCTCCCTTGAATATTAGTTTTAATTCATTATTAATATGAATTCACTTTTACTTCTA 1 0 180926 CASAVA_Build 3 194191247 1I GCAGGGCTGT -/G GGGGAGGATC 3070 het 3070 ref 61 29 24 8 G 4 5 180927 CASAVA_Build 3 194229712 1I CCTGAATAAT -/A ACCCCCCACC 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 A 1 2 180928 CASAVA_Build 3 194239467 1D TCATCCCCCC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 8 7 180929 CASAVA_Build 3 194241148 1D CACTCTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 187 hom 33 2 14 17 T 17 16 180930 CASAVA_Build 3 194255205 1I GATGGTTGAA -/G GAAAGTGCAT 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 G 1 2 180931 CASAVA_Build 3 194269159 1D GTCAAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 A 12 11 180932 CASAVA_Build 3 194270260 2I TTCAGAAAAC --/AA AGAGTATACT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 1 3 180933 CASAVA_Build 3 194272918 4I TAAAAAAAAA ----/AAAG AGAAGTAAGC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 AAAG 0 1 180934 CASAVA_Build 3 194274716 2I TATAACTAAC --/TG TATTAATCCA 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 TG 0 1 180935 CASAVA_Build 3 194278790 2D TAAAACAGAC AT/-- ATGTGAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 AT 2 1 180936 CASAVA_Build 3 194293946 2D CCCACAACAC AG/-- GGGAATCTAA 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 AG 1 0 180937 CASAVA_Build 3 194316337 1D ACTTACATAA G/- ACCAGGCTCC 3070 hom 129 het 47 0 43 7 G 1 0 180938 CASAVA_Build 3 194318153 1I TTGTGAAGCA -/G TATATCTGGG 3070 hom 108 het 37 0 36 1 G 0 1 180939 CASAVA_Build 3 194320274 4D TCTAAAATAA TAAT/---- TAATTGGTTG 3070 hom 137 het 52 0 46 7 TAAT 2 1 180940 CASAVA_Build 3 194323169 1D GTTTTGCTGC T/- TGTTAGCCAC 3070 het 3070 ref 30 17 9 5 T 2 1 180941 CASAVA_Build 3 194334831 2I TGACCAAGGC --/CA CATAGCTCGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CA 1 2 180942 CASAVA_Build 3 194342645 1I TTTCCAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 11 12 180943 CASAVA_Build 3 194348255 1I ACTCTATCTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 7 8 180944 CASAVA_Build 3 194354026 1I GTTTCTATTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 133 hom 33 1 27 5 T 8 9 180945 CASAVA_Build 3 194355208 3D TTAAAAACAA TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 13 0 10 3 T 12 9 180946 CASAVA_Build 3 194355615 1D AGTAATGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 11 2 T 11 10 180947 CASAVA_Build 3 194390523 1I AATTTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 56 1 49 6 T 10 11 180948 CASAVA_Build 3 194405267 1I AAACAATAAA -/G GTGAGGAACC 3070 hom 125 het 46 0 39 7 G 1 2 180949 CASAVA_Build 3 194406167 1I TAGGAAAAAT -/A ACCTGGAGCA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 1 2 180950 CASAVA_Build 3 194411816 1D TTGCTTCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 10 9 180951 CASAVA_Build 3 194411965 1D CTATTTACAG A/- ATCATTTTCC 3070 hom 111 het 42 0 38 6 A 2 1 180952 CASAVA_Build 3 194419814 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 40 2 30 8 T 12 11 180953 CASAVA_Build 3 194424281 1I TTGAGGTTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 9 10 180954 CASAVA_Build 3 194426934 1I GAGAGCTTCT -/A GGGGGCTGCA 3070 hom 120 het 48 0 40 8 A 0 1 180955 CASAVA_Build 3 194434238 1D CTTTGCTAAA G/- TTTAGAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 0 180956 CASAVA_Build 3 194435434 2I CAAGTACTGA --/GT GTGAACAACA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 GT 1 2 180957 CASAVA_Build 3 194443826 1I AAACTTACCC -/A AATCAGACAG 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 A 2 3 180958 CASAVA_Build 3 194448831 1I TAGTTGGGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 9 10 180959 CASAVA_Build 3 194451537 1D AAGAAGTCTC A/- GATCTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 1 0 180960 CASAVA_Build 3 194453431 1D CAGGAAGCCT C/- AATAGGAGCA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 C 1 0 180961 CASAVA_Build 3 194458973 2I GAAAGGATAA --/AC ATGATTGATA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 AC 0 1 180962 CASAVA_Build 3 194463976 1D TCTTACTGCC T/- TTTAGTCTTT 3070 hom 144 het 55 0 49 8 T 4 3 180963 CASAVA_Build 3 194467490 1D TGATTTCATC T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 T 7 6 180964 CASAVA_Build 3 194467878 1D CAACCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 11 8 T 11 10 180965 CASAVA_Build 3 194473309 4I TAGCTCACAA ----/AGTT AGCCATCAGT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AGTT 0 1 180966 CASAVA_Build 3 194483903 1D AATCCAACAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 138 het 53 0 47 8 A 8 7 180967 CASAVA_Build 3 194485658 1D CCATTAGGTG A/- AAAAAAAAAT 1349 het 1349 ref 42 38 3 1 A 10 9 180968 CASAVA_Build 3 194486809 3D ACACTTTGCT TTA/--- TTATGTTTCA 3070 het 3070 hom 53 17 32 6 TTA 2 1 180969 CASAVA_Build 3 194489071 2D TAGACTACAG TA/-- TAGTGTAAAC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 TA 2 1 180970 CASAVA_Build 3 194491693 2D TCAACTCTTT TA/-- TTCTAAAGCT 3070 het 3070 hom 59 19 31 11 TA 1 0 180971 CASAVA_Build 3 194494721 1I GTGACCTCCA -/T TTTTTATCCT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 5 6 180972 CASAVA_Build 3 194505500 7D CCCCATGATC CAGTCAA/------- CAGGCTGGGA 3070 het 3070 ref 42 24 13 7 CAGTCAA 1 0 180973 CASAVA_Build 3 194506280 1D GTCTCTGTTT A/- ATGCTGTCCC 3070 het 3070 hom 44 16 21 9 A 2 1 180974 CASAVA_Build 3 194515761 1D ACCTCACCCC T/- CTCCTTCCTA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 1 0 180975 CASAVA_Build 3 194516352 4I CCCTGTTTTA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 33 0 24 9 TG 7 9 180976 CASAVA_Build 3 194520255 1I ATCAGGGGTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 55 21 22 12 A 7 8 180977 CASAVA_Build 3 194521122 13I AAAGGGGCTA -------------/CTTCTAAGGTTTT AAAAAAGACT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 CTTCTAAGGTTTT 0 1 180978 CASAVA_Build 3 194529728 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1777 hom 31 6 13 13 A 13 12 180979 CASAVA_Build 3 194529952 1I CAGCCTCGGG -/A AAAATTAATT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 4 5 180980 CASAVA_Build 3 194547763 9D AATAACAGTA TTTAATTTT/--------- TTTAATTCTC 3070 hom 57 het 22 0 20 12 TTTAATTTT 1 0 180981 CASAVA_Build 3 194549989 2D TATTTGACTC AA/-- TATATAAATG 3070 hom 114 het 41 0 39 3 A 2 0 180982 CASAVA_Build 3 194551899 3D TATGCATTCA GAG/--- CCATGCCCAC 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 GAG 1 0 180983 CASAVA_Build 3 194552975 1D AGTTGTACTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 24 6 G 2 1 180984 CASAVA_Build 3 194553802 1I GGTAAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 22 3 17 2 A 11 12 180985 CASAVA_Build 3 194554583 1D CTATTTTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 10 9 180986 CASAVA_Build 3 194556760 1D ATAAGTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 12 11 180987 CASAVA_Build 3 194557323 2D TTGAGACGGA GT/-- GTCTTGCTCT 3070 het 2770 hom 19 7 9 3 GT 2 1 180988 CASAVA_Build 3 194558457 1D TTCATTCATT C/- ATTCATTCAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 C 1 0 180989 CASAVA_Build 3 194558603 1D ACTACACCTA T/- TTTTTGCTCA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 6 5 180990 CASAVA_Build 3 194559565 2D TAAAGAAAGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 AT 7 6 180991 CASAVA_Build 3 194562611 1I AATAAAAAAA -/G CAACACAAAG 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 G 0 1 180992 CASAVA_Build 3 194570103 1I AGCCAGGAAC -/A ATGTTTGTAC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 1 2 180993 CASAVA_Build 3 194573068 1D TATGGCAGAA C/- TTTTATTTAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 1 0 180994 CASAVA_Build 3 194573936 1D CAATTCTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 10 9 180995 CASAVA_Build 3 194574030 1D AAAAAGAGAA C/- ATATCCTCAA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 C 1 0 180996 CASAVA_Build 3 194590499 3I TGACAGCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 42 het 30 0 15 15 AAC 5 6 180997 CASAVA_Build 3 194590515 2I AACAACAACA --/AC AAAAAAAAAC 3070 het 527 hom 36 4 19 13 AC 0 1 180998 CASAVA_Build 3 194601202 1D TGGGACAATT G/- GTACCATTCA 3070 hom 141 het 54 0 46 9 G 2 1 180999 CASAVA_Build 3 194601877 1D CACAAACTTT A/- AAAAAAAAAT 1068 het 1068 ref 42 30 3 9 A 10 9 181000 CASAVA_Build 3 194603054 1D ATGTTACAAG A/- GTCTCATTTC 3070 hom 151 het 57 0 51 6 A 1 0 181001 CASAVA_Build 3 194610778 1D TATGATAACC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 9 8 181002 CASAVA_Build 3 194613277 4I AGGAGGCCGA ----/GGTG GGTGGTTCAC 3070 hom 102 het 37 0 34 4 GGTG 1 2 181003 CASAVA_Build 3 194617574 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 7 8 181004 CASAVA_Build 3 194620038 1D TACCTCACTT C/- CCCGACCCCC 3070 het 3070 hom 47 19 18 10 C 4 3 181005 CASAVA_Build 3 194622928 1D TAATGCGCAT G/- GAACATTCTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 2 1 181006 CASAVA_Build 3 194624326 1D TAGGCAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 10 9 181007 CASAVA_Build 3 194624805 1I ACAGAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 A 9 10 181008 CASAVA_Build 3 194630070 1D TCATAGAGAC A/- AAAAATAGAT 3070 het 3070 hom 34 13 18 5 A 6 5 181009 CASAVA_Build 3 194631798 3I5M4I TGTTTGAGAA ---TGTGA----/CTGTTTGAGTTC AGTTTAATTC 3070 het 3070 ref 44 22 21 3 N/A 0 0 181010 CASAVA_Build 3 194632603 10D TAGTAAACAA GAGAAAGGTT/---------- GATAATAATG 3070 het 3070 ref 42 21 19 6 GAGAAAGGTT 1 0 181011 CASAVA_Build 3 194635741 1I TAATCAGGTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 8 9 181012 CASAVA_Build 3 194646452 1D AACTGGGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 677 hom 26 2 14 11 A 13 12 181013 CASAVA_Build 3 194653278 3I ATATATATAA ---/TAT TATTATCTTA 1610 hom 10 het 6 0 4 2 TAT 2 3 181014 CASAVA_Build 3 194666078 1I AAATAGCAAT -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 6 7 181015 CASAVA_Build 3 194679318 9D CCACAGACCA ATGTCCCTG/--------- ATGAACATAG 1532 het 1532 ref 25 20 4 1 ATGTCCCTG 1 0 181016 CASAVA_Build 3 194709473 1D ACTGTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 A 13 12 181017 CASAVA_Build 3 194729357 2I TATTCAATGG --/TC TCCATTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 TC 1 2 181018 CASAVA_Build 3 194730103 2D CCAATTTCAC AT/-- GTTACACAAA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 AT 1 0 181019 CASAVA_Build 3 194767543 4I TTATTCAAAT ----/TGTA TGGGTACAAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 TGTA 0 1 181020 CASAVA_Build 3 194790443 1D TTCTTTTGCC A/- AAAAAAAAAA 2668 het 796 hom 33 5 12 16 A 19 18 181021 CASAVA_Build 3 194841940 5D AGGATGTAGG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 hom 111 het 45 0 37 8 GTTTT 3 2 181022 CASAVA_Build 3 194873368 1D AAAAAAAAAA C/- GAAAAACAAA 3070 het 421 hom 23 6 13 4 C 1 0 181023 CASAVA_Build 3 194917526 3I TCTTGAGAAC ---/ATA ATAATTCCCC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 ATA 1 2 181024 CASAVA_Build 3 194918719 4I CTCTATCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 2407 het 2407 ref 33 14 7 12 AAAC 4 5 181025 CASAVA_Build 3 194920669 1D AAAAATGCGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 9 8 181026 CASAVA_Build 3 194924869 2D AGGAAAAAAA CT/-- CTGCATCCTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 CT 2 1 181027 CASAVA_Build 3 194936265 1I AGGTCAAGGG -/C CTTCCATAAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 C 1 2 181028 CASAVA_Build 3 194938340 1I TATGTTTTTT -/C CCCTCCCCCT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 C 3 4 181029 CASAVA_Build 3 194977353 1D TGATGTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 37 0 26 12 T 12 11 181030 CASAVA_Build 3 194987438 1I CATTGAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 517 hom 37 2 27 8 T 10 11 181031 CASAVA_Build 3 194994081 5I TTTTCTTTTC -----/TTTTT TCTTTTCTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 6 181032 CASAVA_Build 3 195005838 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 27 0 23 4 A 12 11 181033 CASAVA_Build 3 195008120 1I GTGAACTTGC -/T TGTGCAGGAT 3070 hom 126 het 52 0 41 11 T 1 2 181034 CASAVA_Build 3 195023708 1I CAAATGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 36 2 31 3 A 11 12 181035 CASAVA_Build 3 195029767 3D CCCAAGACAA TTC/--- TTCTTCTTCC 3070 hom 72 het 27 0 24 4 TTC 4 3 181036 CASAVA_Build 3 195039994 1D ATGAGAAGAA T/- CTATAAACCA 3070 hom 99 het 36 0 33 4 T 1 0 181037 CASAVA_Build 3 195053230 1I ACTTTTTAAT -/G GGGGGGGTTG 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 G 7 8 181038 CASAVA_Build 3 195056209 1I AATATTTCTG -/A AAAATCAAAC 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 A 4 5 181039 CASAVA_Build 3 195057212 4D AACTGGAAGA CACT/---- CAATCACCAG 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 CACT 1 0 181040 CASAVA_Build 3 195058966 1D TGGGTCTGAT A/- AGAGATTGAA 3070 hom 84 het 34 0 28 7 A 2 1 181041 CASAVA_Build 3 195059277 1I TTTAAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 10 11 181042 CASAVA_Build 3 195062123 1I AAAAGAGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 10 12 4 T 9 10 181043 CASAVA_Build 3 195071215 1D TGCAAGGCAC A/- GATATTTAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 0 181044 CASAVA_Build 3 195085495 4D CCAGGCAGAC AAAG/---- AAAGAAAGAG 3070 hom 81 het 33 0 27 8 AAAG 3 2 181045 CASAVA_Build 3 195093394 1D GTTCCCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 30 1 22 8 T 12 11 181046 CASAVA_Build 3 195105752 2D CATTAAAAAC AT/-- AAGCATCGGC 3070 hom 69 het 28 0 24 6 AT 1 0 181047 CASAVA_Build 3 195114983 1D CAAAAAACTG C/- CCACTTCTCC 3070 hom 141 het 58 0 47 12 C 3 2 181048 CASAVA_Build 3 195131287 1D AATTATAAAT C/- CATAAAATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 C 2 1 181049 CASAVA_Build 3 195131612 2I CCTATTGCTA --/CT GTAATAGGTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CT 0 1 181050 CASAVA_Build 3 195168128 1D TTCATGTCTG A/- AAAAAATTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 7 6 181051 CASAVA_Build 3 195170572 3I TTGATTTGGA ---/AGG AGAAGAAACG 3070 hom 96 het 42 0 33 9 AGG 0 1 181052 CASAVA_Build 3 195182336 1D GCCAGGGCTG T/- TAAGACCCAG 3070 hom 117 het 43 0 38 5 T 2 1 181053 CASAVA_Build 3 195220600 1I TCTCTTAAAG -/T TAACTCAAGG 3070 het 3070 ref 52 25 16 11 T 1 2 181054 CASAVA_Build 3 195234517 2I AAAAAAAAAA --/AT AATAATACTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AT 0 1 181055 CASAVA_Build 3 195239357 3D TGATTAAGTA CTT/--- CTTCTGTGAC 3070 hom 147 het 51 0 49 5 CTT 2 1 181056 CASAVA_Build 3 195242148 1I CAAATGCTTT -/G GAAATAGTAA 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 G 1 2 181057 CASAVA_Build 3 195245658 1D GGGAGGATCG T/- TTTTTGAGGT 2293 het 2293 ref 22 10 7 6 T 6 5 181058 CASAVA_Build 3 195248784 2I AGATTTGTCG --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 56 24 23 9 CT 5 6 181059 CASAVA_Build 3 195253463 1I CTCTACAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2594 hom 27 8 13 6 A 11 12 181060 CASAVA_Build 3 195258673 8D TGAAGGACCC ACCCAGGG/-------- AGGAGGCTGA 3070 het 1928 hom 20 8 10 4 ACCCAGGG 1 0 181061 CASAVA_Build 3 195260486 1I GTATTAATCA -/C CCCCTTTCCT 3070 het 3070 hom 37 14 12 11 C 4 5 181062 CASAVA_Build 3 195262925 1D AATTACTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 30 2 15 13 T 15 14 181063 CASAVA_Build 3 195267208 4I CCCTCAAAAA ----/AAAC AAAACTGGGT 3070 het 3070 ref 41 24 16 2 AAAC 0 1 181064 CASAVA_Build 3 195272598 2D AGGAACCGCC AA/-- AGAGATGGGG 3070 hom 81 het 35 0 26 10 A 3 1 181065 CASAVA_Build 3 195272972 2D ATTCCTGTAT TC/-- TGCTTCCCTT 3070 hom 75 het 32 0 26 7 TC 1 0 181066 CASAVA_Build 3 195273902 1I ATGTATAAAC -/T TAAGTGGCAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 1 2 181067 CASAVA_Build 3 195296806 5I AACTGGCGTT -----/TAAAC TGAGACTAAG 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 TAAAC 0 1 181068 CASAVA_Build 3 195299002 1D AGCCAAAATC T/- GGGTGTGCCT 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 T 1 0 181069 CASAVA_Build 3 195311138 1D13M1I TTGAGACAAA TTGCAGTGGTAGGA-/-TGCAGTTACAGGAC TTATGGCTCT 3070 hom 51 het 24 0 16 8 N/A 0 0 181070 CASAVA_Build 3 195325531 2D TTTTTTTGTG GA/-- GAGATGGGAT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 GA 3 2 181071 CASAVA_Build 3 195333153 1D AACATTTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 A 8 7 181072 CASAVA_Build 3 195344426 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2398 het 358 hom 14 2 9 3 T 15 14 181073 CASAVA_Build 3 195362985 1D GGAAGGGCTA G/- GCGGTGAGTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 2 1 181074 CASAVA_Build 3 195366899 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 11 10 181075 CASAVA_Build 3 195371640 2I AAATATCACT --/TA TATATATATA 2947 het 2433 hom 21 7 6 8 TA 7 8 181076 CASAVA_Build 3 195375180 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 8 9 181077 CASAVA_Build 3 195375381 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1458 het 1458 ref 26 14 4 9 T 15 14 181078 CASAVA_Build 3 195377304 1I CCCGTTTGAG -/T TTGCAATGCC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 2 3 181079 CASAVA_Build 3 195386984 10D AGTGGGTAAG AGAATAACCA/---------- AGAATAACCA 3070 het 1606 hom 25 5 14 11 AGAATAACCA 3 2 181080 CASAVA_Build 3 195388750 1D GTATTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2232 hom 20 5 9 6 T 12 11 181081 CASAVA_Build 3 195390477 1D CACTTCTCCC T/- TTTTTTTTTT 930 het 930 ref 16 10 2 4 T 12 11 181082 CASAVA_Build 3 195407358 1D ATTATTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 42 2 18 23 T 16 15 181083 CASAVA_Build 3 195426557 15D AAACCCCTAA CTGTCCTGTTCGCAG/--------------- CTGTCCCCTT 3070 het 3070 ref 32 18 13 8 CTGTCCTGTTCGCAG 1 0 181084 CASAVA_Build 3 195427695 4D AAAATGTAGC ACCA/---- ACATCCACCT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 ACCA 1 0 181085 CASAVA_Build 3 195432166 1I TCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1168 hom 14 3 9 2 T 9 10 181086 CASAVA_Build 3 195448823 1I TGAATCCTTT -/C CGGGGGTTGA 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 C 1 2 181087 CASAVA_Build 3 195451930 1D CACTTTGCAG T/- CGTGCTGCTT 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 T 1 0 181088 CASAVA_Build 3 195461997 1I TTCTTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2356 het 2356 ref 30 14 11 5 A 13 14 181089 CASAVA_Build 3 195462684 1D CTTTTAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 13 12 181090 CASAVA_Build 3 195476850 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2066 het 1003 hom 12 3 6 4 A 13 12 181091 CASAVA_Build 3 195480645 1I GATTCTGCTT -/G GGGGGACCAG 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 G 5 6 181092 CASAVA_Build 3 195483685 1D AAGTTCATAA T/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 1 0 181093 CASAVA_Build 3 195497333 1D ATTTCTTTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 28 het 15 0 10 6 A 10 9 181094 CASAVA_Build 3 195512545 1D TTCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 753 hom 30 4 13 13 T 13 12 181095 CASAVA_Build 3 195547657 1D CAGAGCCGCC A/- CCCCTGGGAT 3070 hom 108 het 41 0 34 8 A 1 0 181096 CASAVA_Build 3 195552331 1I ATTGAAGGGA -/T ATGTTTGTGG 3070 het 179 hom 26 1 14 11 T 0 1 181097 CASAVA_Build 3 195554370 4I TGTAGGGGAG ----/TGTT TGGTGAGTGC 3070 hom 101 het 57 0 34 23 TGTT 0 1 181098 CASAVA_Build 3 195554883 2D TGTGTTGGGG TA/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 63 24 26 13 TA 1 0 181099 CASAVA_Build 3 195563457 1D TTCACTGTGT C/- CCCTGTCTGT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 C 4 3 181100 CASAVA_Build 3 195565675 1I CTCACCCTGC -/A ACTGCCCTGA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 A 1 2 181101 CASAVA_Build 3 195568860 1I CCAGGGAGCA -/G GAGACTTGCC 3070 hom 57 het 23 0 18 5 G 1 2 181102 CASAVA_Build 3 195571543 1I CTGTCCCTGT -/C CCCGAGAGCA 3070 hom 54 het 25 0 17 8 C 3 4 181103 CASAVA_Build 3 195575409 2I TGGTCTCACA --/CT CTGTTGATGG 3070 hom 72 het 28 0 18 10 CT 1 2 181104 CASAVA_Build 3 195579598 1I AGCAAGACTC -/T TGTCTAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 1 2 181105 CASAVA_Build 3 195581881 1I TCGGCGGCTG -/T TAAGAGCAAT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 1 2 181106 CASAVA_Build 3 195589141 1I TCAATGACTT -/A AGCAGAGCAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 1 2 181107 CASAVA_Build 3 195592643 2I71M1D AGACAAGAAT --GAGTCTATTTTTAAAAATTAACAGTGATTGCAGAAGTTAAAAATACAATTGCAGAAATTAACATTTTTGCGT/AAGAGTCTATTTTTAAAAATTAACAGTGATTGCAGAAGTTAAAAATACAATTGCAGAAATTAACATTTTTGCG- TAAGTGTTGG 3070 hom 99 het 22 0 34 6 N/A 0 0 181108 CASAVA_Build 3 195594665 5D TTTAGATCTT ATAAA/----- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 27 14 8 7 ATAAA 1 0 181109 CASAVA_Build 3 195601039 6I CTGACTTAGC ------/CATAAA CATAAAGAGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CATAAA 1 2 181110 CASAVA_Build 3 195616478 1I AACCTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 1091 het 1091 ref 25 12 6 7 A 15 16 181111 CASAVA_Build 3 195646014 1D AAGAAATGAG A/- AGAATGTAAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 2 1 181112 CASAVA_Build 3 195648064 1I AAGAATTACT -/G GTCTAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 G 1 2 181113 CASAVA_Build 3 195648365 1I TCCTCCCACA -/T TCAAAGCTAC 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 T 1 2 181114 CASAVA_Build 3 195658347 2D AGGGATCTTA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 10 8 181115 CASAVA_Build 3 195671162 1D CACACACACC A/- AAAAAAAAAA 1411 het 1411 ref 27 13 4 10 A 12 11 181116 CASAVA_Build 3 195685608 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 7 8 181117 CASAVA_Build 3 195701525 1D GCTCCAAGAG A/- AAAAGTAGAG 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 A 5 4 181118 CASAVA_Build 3 195702205 1I GCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 A 14 15 181119 CASAVA_Build 3 195705922 2D TCTGTTTTTC TG/-- TTTTTCAATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TG 1 0 181120 CASAVA_Build 3 195708469 2I ATGAATATTA --/TT TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 7 9 181121 CASAVA_Build 3 195715895 11D TTCTTTCTTT CTTTCTTTTTC/----------- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 17 9 10 3 CTTTCTTTTTC 1 0 181122 CASAVA_Build 3 195724249 1D CCCCTCCCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 103 het 42 0 33 9 A 10 9 181123 CASAVA_Build 3 195724552 3I TCAGGGAAAC ---/CTT CTTTTTTGGA 3070 hom 115 het 41 0 39 2 CTT 1 2 181124 CASAVA_Build 3 195725511 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 451 hom 20 1 13 6 T 9 10 181125 CASAVA_Build 3 195726790 1I ATTAGTGTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 8 9 181126 CASAVA_Build 3 195727362 1I CCTATATACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 9 10 181127 CASAVA_Build 3 195729471 4D1M3I TTTATCATAC AAAGT---/----TTCC GTGCCTTTGT 3070 het 3070 ref 40 17 15 9 N/A 0 0 181128 CASAVA_Build 3 195729963 3D TTTTCTTTCT TTC/--- TTCTGTTCTT 1672 het 1672 ref 12 8 4 1 TTC 2 1 181129 CASAVA_Build 3 195732437 1D GATTTTGGAC T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 50 22 22 7 T 8 7 181130 CASAVA_Build 3 195746637 1D GGCATATCTG C/- CCCCCAACCC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 C 6 5 181131 CASAVA_Build 3 195748387 2I GAGAGTGCTT --/TC TCTCTCTCTC 2737 het 2737 ref 34 16 8 10 TC 5 6 181132 CASAVA_Build 3 195749410 1I TGTCTTTCAC -/A GAGTAGAAGC 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 0 1 181133 CASAVA_Build 3 195749733 2D TTTGTTTTGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 14 16 10 TG 9 8 181134 CASAVA_Build 3 195750164 3I ATAACCTCCG ---/CCT CCTCCCAGGT 1238 het 1238 ref 14 10 3 1 CCT 1 2 181135 CASAVA_Build 3 195754127 1D AAATAAAAGT A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 7 6 181136 CASAVA_Build 3 195754866 1D TGCTGCTAAA C/- CCCCAGTGCT 3070 het 2471 hom 23 5 14 5 C 5 4 181137 CASAVA_Build 3 195759927 1I TGGTGAGATG -/C CAGGAGGGAA 3070 hom 84 het 29 0 28 2 C 1 2 181138 CASAVA_Build 3 195760040 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2100 het 1711 hom 28 7 8 13 T 10 11 181139 CASAVA_Build 3 195791606 1D AATTCAGAGC G/- GGGGGGCACT 3070 hom 115 het 46 0 36 10 G 7 6 181140 CASAVA_Build 3 195797645 1D TCATTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 780 het 438 hom 23 6 3 14 T 17 16 181141 CASAVA_Build 3 195801605 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1367 het 1367 ref 24 10 4 10 T 16 14 181142 CASAVA_Build 3 195840467 1D TCTCAAGACC A/- AAAAAAAAAA 2241 het 2241 ref 28 14 8 7 A 17 16 181143 CASAVA_Build 3 195849900 2D TGTAATTAGA AT/-- AGTCTTACCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 AT 1 0 181144 CASAVA_Build 3 195853693 2D TCAATAAGTG TC/-- TGCAGAATTT 3070 het 3070 ref 47 21 20 7 TC 1 0 181145 CASAVA_Build 3 195861195 1D TCAAACAAGT A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 7 6 181146 CASAVA_Build 3 195870938 2D GAATGAACCA CT/-- CTGCTATGAG 3070 het 3070 hom 44 20 22 4 CT 2 1 181147 CASAVA_Build 3 195872159 1I TGCAACTATG -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 A 6 7 181148 CASAVA_Build 3 195874840 1D TATTTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 A 10 9 181149 CASAVA_Build 3 195875333 1I AGCGGGAATT -/A ACAGACACGT 2480 het 2480 ref 17 7 6 4 A 1 2 181150 CASAVA_Build 3 195878007 2I GGATTCTCAC --/AT GAGTTTCATA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 AT 0 1 181151 CASAVA_Build 3 195882570 1I GTCTCTACTT -/A AAAAAATACA 1081 het 1081 ref 11 4 4 3 A 6 7 181152 CASAVA_Build 3 195882891 2D AAAAAAAGAC AA/-- TATTATAACA 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 A 2 0 181153 CASAVA_Build 3 195886556 25D GGTAGTCAGA AAAGTAACTTAAATGGAAACTCAGC/------------------------- AAAGTAACTT 2947 het 2947 ref 39 30 14 3 AAAGTAACTTAAATGGAAACTCAGC 2 1 181154 CASAVA_Build 3 195890547 1I ACATCTCATT -/A AAAAAAAAAA 2973 het 2258 hom 31 9 10 12 A 15 16 181155 CASAVA_Build 3 195892519 3I GCCTTAGGAC ---/AAG GTCCAGGCCT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 AAG 0 1 181156 CASAVA_Build 3 195900477 10I TGCTCTTATG ----------/GAGCTTGTAA TCCAGCAGAA 3070 het 3070 ref 40 23 14 5 GAGCTTGTAA 0 1 181157 CASAVA_Build 3 195904922 1D AGAGGGAAAC T/- TGATGCAGAC 3070 hom 123 het 43 0 41 3 T 2 1 181158 CASAVA_Build 3 195920775 1D GTTTTCAGTT G/- TGTGTGTGTG 3070 het 107 hom 24 1 14 9 G 1 0 181159 CASAVA_Build 3 195921581 4D AGGATTAGGG TAGA/---- TAGACCCTAA 3070 hom 118 het 44 0 40 5 TAGA 2 1 181160 CASAVA_Build 3 195923360 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 A 7 6 181161 CASAVA_Build 3 195923555 10D GAGACGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAGAA 3070 hom 57 het 24 0 20 7 A 17 7 181162 CASAVA_Build 3 195927272 1D CTGAAAATCA G/- GGGGGGTGTA 3070 hom 94 het 36 0 31 5 G 7 6 181163 CASAVA_Build 3 195927624 16D TTAGCCAGAG GCAAAGAATGACCTTT/---------------- GCAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 52 24 26 6 GCAAAGAATGACCTTT 1 0 181164 CASAVA_Build 3 195942227 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 11 10 181165 CASAVA_Build 3 195951464 1I AATCCTATTC -/T TTTTTTTTTT 2318 het 2318 ref 32 9 8 15 T 16 17 181166 CASAVA_Build 3 195962269 1I TGAGTGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1344 hom 34 3 24 7 T 13 14 181167 CASAVA_Build 3 195981079 2I TCAAAATAAA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 40 14 22 5 TC 8 9 181168 CASAVA_Build 3 195987492 2D TGAGAAGCAA CT/-- GTTTGTGTTC 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 CT 1 0 181169 CASAVA_Build 3 196007486 1D CACCAGATTT G/- GGGGAAAGAT 3070 het 3070 hom 57 21 27 10 G 5 4 181170 CASAVA_Build 3 196016477 1D GTAAGTCAGG A/- AAGGAGTTGT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 3 2 181171 CASAVA_Build 3 196021295 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 932 hom 17 4 10 3 A 10 11 181172 CASAVA_Build 3 196022202 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 19 19 9 A 10 9 181173 CASAVA_Build 3 196026113 1I TGGAGCCTTT -/C TTACCTTCTC 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 C 0 1 181174 CASAVA_Build 3 196057669 3I AAGCACTGTA ---/GAT GATTTTTAGA 3070 hom 107 het 40 0 36 4 GAT 1 2 181175 CASAVA_Build 3 196076696 4D CTGATATTTT TTGA/---- TTGATTAAGA 3070 hom 75 het 28 0 25 4 TTGA 2 1 181176 CASAVA_Build 3 196083122 1I TGAGGGCATT -/A ATCAGGGCTG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 1 2 181177 CASAVA_Build 3 196085321 1I TTTTTCTCCT -/C TGCCAAAACC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 0 1 181178 CASAVA_Build 3 196091397 2I GTTCTTCCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 11 11 T 12 14 181179 CASAVA_Build 3 196092251 1I TCAAGGGCTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 7 8 181180 CASAVA_Build 3 196099790 4D CTTTGAGTGT CTGA/---- CAGAATTTAG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 CTGA 1 0 181181 CASAVA_Build 3 196104147 1D CACTTCAGAT C/- CCTGCCTGGG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 C 3 2 181182 CASAVA_Build 3 196105544 2D CAATTCCCAC AT/-- GTTATGGGAG 2902 het 2902 ref 28 13 8 7 AT 1 0 181183 CASAVA_Build 3 196109288 2I GTGGGTACCA --/CT GAGTTCTTAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CT 0 1 181184 CASAVA_Build 3 196110043 3I CAAATTTGGC ---/TCT TCTTCTCAAA 3070 hom 129 het 47 0 42 5 TCT 2 3 181185 CASAVA_Build 3 196112109 1I TCTTGAGTAG -/C TGGGGTTACA 1855 hom 15 het 12 0 5 8 C 0 1 181186 CASAVA_Build 3 196118607 2D ATTTGGGTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 25 0 16 9 T 16 14 181187 CASAVA_Build 3 196120456 1I TCCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 A 9 10 181188 CASAVA_Build 3 196129007 1I11M1I TCAGTGTCAT -AAAAAACCAAC-/AAAAAAACCAACA AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 40 22 18 3 N/A 0 0 181189 CASAVA_Build 3 196141437 22D GGGAGGTAGA GGGGAGACGGAGAATGAGTGTT/---------------------- GGGGACAGGA 3070 het 3070 ref 34 27 12 5 GGGGAGACGGAGAATGAGTGTT 1 0 181190 CASAVA_Build 3 196144174 5D ATGACAGGAG TGTCT/----- TCTGTTACCC 3070 het 3070 ref 36 20 16 1 TGTCT 1 0 181191 CASAVA_Build 3 196153638 3D AGATGTGGTG ATA/--- ATAATAACAT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 ATA 3 2 181192 CASAVA_Build 3 196164703 1I TATTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 757 hom 23 2 15 6 A 11 12 181193 CASAVA_Build 3 196166488 1I GCCTGGCTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 62 het 25 0 21 4 T 8 9 181194 CASAVA_Build 3 196189458 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 11 10 181195 CASAVA_Build 3 196210637 1D AAAGTGAAAC A/- AAAAAAAAAA 1480 hom 19 het 16 0 7 9 A 11 10 181196 CASAVA_Build 3 196225591 2I ATTATTAGAG --/TA TATATATAAA 1389 hom 12 het 6 0 5 1 TA 4 5 181197 CASAVA_Build 3 196228509 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 549 het 41 hom 8 0 2 6 A 10 9 181198 CASAVA_Build 3 196236407 1D TTTAGGGAAA C/- CAGAGAGATG 3070 hom 93 het 39 0 29 10 C 2 1 181199 CASAVA_Build 3 196251980 2D TCTCCTTCTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 11 9 181200 CASAVA_Build 3 196252181 12D GATTGCTGGG TCGAATGGGAGT/------------ TCTGCTTTTA 3070 hom 75 het 25 0 26 3 TCGAATGGGAGT 1 0 181201 CASAVA_Build 3 196259173 2I TGTGTGTGTG --/TT TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 T 1 3 181202 CASAVA_Build 3 196278325 1I ACCCGTTCCA -/G GAGAGGAAGA 2330 het 2330 ref 21 9 6 6 G 1 2 181203 CASAVA_Build 3 196283553 1I AAAAAATGTA -/C CAGTGCACAT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 C 1 2 181204 CASAVA_Build 3 196285905 1D TCATCCAGGC G/- CGGTGGCAGG 3042 het 2865 hom 20 9 10 1 G 1 0 181205 CASAVA_Build 3 196298673 1D TTCCTTCTCC T/- CCTCAGGCCT 3070 het 3070 ref 45 29 16 1 T 1 0 181206 CASAVA_Build 3 196299358 1I CATCCTCACT -/A AAACTTTGTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 3 4 181207 CASAVA_Build 3 196308918 1D TGGGGGTGAC G/- GGGGGAGGAG 3070 hom 56 het 21 0 16 6 G 6 5 181208 CASAVA_Build 3 196311412 4I ATAAGTGTGC ----/GTGT ATGTATGTGT 2323 het 2323 ref 76 41 12 23 GT 0 2 181209 CASAVA_Build 3 196311519 2I GTATGTGTAC --/GT GTGTGTGGTG 3070 het 3070 ref 68 37 21 10 GT 3 4 181210 CASAVA_Build 3 196312342 1I3M1I5M1D GTGGGTGAGG -GTG-AGGTGT/TGTGTACGTG- GTGTATGTGT 3070 hom 63 het 22 0 21 4 N/A 0 0 181211 CASAVA_Build 3 196312555 11D GTACGTGTGC GTGTGTGTGGT/----------- GTGTGTGTGG 3070 hom 57 het 68 0 31 39 GTGTGTGTGGT 2 1 181212 CASAVA_Build 3 196312778 11D TGGTGTATAA GTGTGTGTGGT/----------- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 ref 65 33 15 23 GTGTGTGTGGT 2 1 181213 CASAVA_Build 3 196314527 6D CACACCCACA CACACC/------ CACACACACA 3070 het 112 hom 43 3 19 25 CACACC 1 0 181214 CASAVA_Build 3 196314895 2D GCATGCACAC AT/-- GTGCGCACAT 3070 het 3070 ref 66 27 22 18 AT 1 0 181215 CASAVA_Build 3 196317775 3I GGAGGGCGGC ---/AGG AGGTGCAGGC 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 AGG 1 2 181216 CASAVA_Build 3 196319662 1I ACTCCATGCA -/C CCCCCCTCTC 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 C 6 7 181217 CASAVA_Build 3 196321188 2I TGTAATCCCA --/GT GCTACTCGGG 2407 het 1066 hom 9 3 6 0 GT 0 1 181218 CASAVA_Build 3 196321683 3D CCCCAGATGA GAG/--- GAGGCCTCCG 3070 het 3070 hom 46 22 21 5 GAG 2 1 181219 CASAVA_Build 3 196372023 14I AGCTGGGATT --------------/ACAGGCATGCGCCA TCATGCCCGG 3070 hom 51 het 18 0 17 1 ACAGGCATGCGCCA 0 1 181220 CASAVA_Build 3 196387522 1D TAGGGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 2318 het 678 hom 33 6 8 19 T 19 18 181221 CASAVA_Build 3 196394446 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 1747 het 1747 ref 27 17 5 5 A 13 14 181222 CASAVA_Build 3 196412784 9D AAAATAGTTT TCACTGAAA/--------- TCACTGGACA 3070 het 3070 ref 40 27 14 1 TCACTGAAA 1 0 181223 CASAVA_Build 3 196433767 5D GTCATGATGA ATGAT/----- TTTTTTTTTT 2860 het 2860 ref 38 21 9 10 ATGAT 1 0 181224 CASAVA_Build 3 196464519 1D TTTTTGTTGC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 9 8 181225 CASAVA_Build 3 196474957 2D AAGAGCAAAA CC/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 19 het 24 0 12 12 C 3 1 181226 CASAVA_Build 3 196501983 1D AGTGAATTTC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 7 181227 CASAVA_Build 3 196502053 21D TTCTTTTTTC TTTTTTTTTCTTTTTTTTTTT/--------------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 17 0 10 7 TTTTTTTTTCTTTTTTTTTTT 1 0 181228 CASAVA_Build 3 196511028 5I AAAACTACTG -----/AAAGT AAAGAACAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 AAAGT 0 1 181229 CASAVA_Build 3 196512138 8I TAGAAATTGT --------/ATTTAGAC ATTTAGAATT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ATTTAGAC 0 1 181230 CASAVA_Build 3 196523640 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 2132 hom 18 het 11 0 6 5 T 10 9 181231 CASAVA_Build 3 196550349 1D AAAGAAAATA C/- ATTAAAAATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 1 0 181232 CASAVA_Build 3 196551087 1D TGGAACCTGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 33 0 31 4 A 10 9 181233 CASAVA_Build 3 196557300 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 622 hom 46 4 23 19 T 17 16 181234 CASAVA_Build 3 196637183 1I GTGAAGATTA -/G GCTACTATTT 3070 hom 81 het 32 0 26 6 G 1 2 181235 CASAVA_Build 3 196678160 2D AGCCAAAACA CT/-- GTTATTAACT 3070 het 3070 ref 42 23 16 5 CT 1 0 181236 CASAVA_Build 3 196720123 4I CATGTGGCAG ----/GAGA GAGAGAGAAA 3070 hom 98 het 41 0 33 8 GA 4 6 181237 CASAVA_Build 3 196724296 1D AAAAACAAAC A/- AAAAACCCCC 3070 hom 49 het 27 0 23 5 A 6 5 181238 CASAVA_Build 3 196734191 3D TTAAATAAAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2596 het 622 hom 19 3 8 8 T 17 14 181239 CASAVA_Build 3 196745303 3D TGCTTGTGTT TTC/--- TTTTTACCTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 TTC 1 0 181240 CASAVA_Build 3 196745809 5D TTGTTTGCCA TTTAG/----- TTTACTTTCT 3070 het 3070 ref 28 15 13 6 TTTAG 1 0 181241 CASAVA_Build 3 196746638 1D AGAAAACAAA C/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 C 1 0 181242 CASAVA_Build 3 196752955 10I CAAATATCCA ----------/CTGGTGCCGT CTCTCCCTCC 3070 hom 83 het 32 0 26 6 CTGGTGCCGT 0 1 181243 CASAVA_Build 3 196758388 1I GTTGGTTTCT -/C CCCCCAAGGA 2524 het 2524 ref 41 27 10 4 C 5 6 181244 CASAVA_Build 3 196763233 6D ATTATAACTC TAATAA/------ TAATAATAAG 2704 het 2704 ref 25 10 9 7 TAA 5 3 181245 CASAVA_Build 3 196763895 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1933 het 1256 hom 22 7 7 8 T 12 11 181246 CASAVA_Build 3 196764222 1I CAGCTCGTTT -/A TTCCAAACGC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 0 1 181247 CASAVA_Build 3 196767752 1D AAGCAGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 39 0 23 17 T 15 14 181248 CASAVA_Build 3 196774561 1D GCAAATACAC T/- TTTTTAAACA 3070 hom 52 het 24 0 18 6 T 6 5 181249 CASAVA_Build 3 196774947 1I TCATTCACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 9 10 181250 CASAVA_Build 3 196795597 3I GTTTACTAAA ---/TAT TATTCCGTGA 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 TAT 1 2 181251 CASAVA_Build 3 196804301 1D ACCAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 12 11 181252 CASAVA_Build 3 196835534 1I ATCAGCAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 10 11 1 A 9 10 181253 CASAVA_Build 3 196835595 8I TTCTTGACCT --------/CCACTGAA TCTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 CCACTGAA 0 1 181254 CASAVA_Build 3 196880731 2I CGTTCGGCTC --/AT GTGTGTCTTG 3070 het 3070 ref 50 23 14 13 AT 0 1 181255 CASAVA_Build 3 196901429 2D TGTGGAGGAC AG/-- GGGTCAGTGG 1877 het 1877 ref 24 16 4 4 AG 1 0 181256 CASAVA_Build 3 196902683 4I TCAAAGCCAA ----/AACC AACCAAACAA 1987 het 1987 ref 35 17 7 11 AACC 1 2 181257 CASAVA_Build 3 196911829 2D CCACATTTTG TC/-- TCTCTGGAAG 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 TC 3 2 181258 CASAVA_Build 3 196912209 1D GCAACAGGAA T/- TTTTTCAGGC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 6 5 181259 CASAVA_Build 3 196912938 1D AGCTTGGCTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 9 8 181260 CASAVA_Build 3 196913532 1D CTGCTGTCTG C/- CAGTGACTGC 1748 het 1748 ref 24 16 5 3 C 2 1 181261 CASAVA_Build 3 196913859 4D TTCATTAATC AAAT/---- AATTCATGTA 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 AAAT 1 0 181262 CASAVA_Build 3 196915009 1D AAGACCAGCC T/- GGGTAACATG 2023 het 1329 hom 10 3 5 2 T 1 0 181263 CASAVA_Build 3 196915795 4D AGAGAAAAAG AAAA/---- AATAAGATCA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 6 2 181264 CASAVA_Build 3 196917836 4D CCGCACTCTT AAAG/---- AAGATGCATC 3070 het 3070 ref 33 15 15 5 AAAG 1 0 181265 CASAVA_Build 3 196917952 1D TTTGTAAACA G/- GGCTCTGGAA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 G 3 2 181266 CASAVA_Build 3 196918896 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2177 het 2177 ref 26 12 8 6 T 12 13 181267 CASAVA_Build 3 196919224 1I TAGTAGAGAC -/A GGGTTTCACT 3070 het 3070 hom 23 7 12 4 A 0 1 181268 CASAVA_Build 3 196919717 2I TAGTAGAGAC --/AG GGGTTTCACC 1350 het 1350 ref 6 3 3 0 AG 0 1 181269 CASAVA_Build 3 196931002 4I TAAACGAAAA ----/AAAC CAACAAATCA 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 AAAC 0 1 181270 CASAVA_Build 3 196933467 3D GGAGGCTGCC CCT/--- CCTCCCTGGT 2445 het 2445 ref 21 10 7 5 CCT 2 1 181271 CASAVA_Build 3 196933801 4I AAATGACAGT ----/GTGA GTGAGTGTAA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 GTGA 1 2 181272 CASAVA_Build 3 196935089 1I GAGCTACTGA -/G GGGGCTGGGC 2148 het 2148 ref 24 15 8 1 G 4 5 181273 CASAVA_Build 3 196953254 5I TCAATCTCAA -----/AAAAT AAAATAACAT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 AAAAT 1 2 181274 CASAVA_Build 3 197002508 15I TGGAGGAGCT ---------------/GTCTCCTGCGTAACA GTCTCCATCA 3070 het 3070 hom 54 20 27 7 GTCTCCTGCGTAACA 0 1 181275 CASAVA_Build 3 197004778 3D CAAAAAAAAA AAT/--- AAATAAATAA 3070 het 1530 hom 18 6 12 1 AAT 1 0 181276 CASAVA_Build 3 197005642 2D ATATATATAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 1471 hom 29 9 13 8 AG 9 8 181277 CASAVA_Build 3 197017277 10D CCAGCTACTC GGGGGGCTGA/---------- GGCACGAGAA 2370 het 2370 ref 16 11 5 2 GGGGGGCTGA 1 0 181278 CASAVA_Build 3 197055541 3D GCTTGACGTG GAA/--- GAAGAAACAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 GAA 3 2 181279 CASAVA_Build 3 197067501 1I AAGCTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 1674 het 1674 ref 17 9 6 2 A 10 11 181280 CASAVA_Build 3 197070894 3I TACCGCCTAA ---/CAC CACCACCACC 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 CAC 5 6 181281 CASAVA_Build 3 197124980 3D TTTCCATCAA GCT/--- TCCCATGGAC 3070 het 3070 hom 37 15 18 6 GCT 1 0 181282 CASAVA_Build 3 197135662 4D ACAAAGATAG ATAA/---- ATAGATAGAA 3070 het 3070 hom 43 18 22 5 ATAA 1 0 181283 CASAVA_Build 3 197137498 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 632 het 632 ref 20 5 3 12 T 17 16 181284 CASAVA_Build 3 197140949 3D GACTTTGGGA GAT/--- GATAAGGCCA 3070 het 3070 ref 49 24 16 13 GAT 2 1 181285 CASAVA_Build 3 197157681 4D GACACACACC CTCT/---- CTATCGGGGT 3070 het 3070 ref 35 26 8 1 CT 3 1 181286 CASAVA_Build 3 197160915 1D ATCTCTAATT C/- TTTTTTTTAA 2124 het 2124 ref 34 27 5 3 C 1 0 181287 CASAVA_Build 3 197161402 3I GATGAAAGGC ---/AGA AGAAGCTCAG 3070 het 3070 ref 55 40 8 7 AGA 1 2 181288 CASAVA_Build 3 197163448 1D AGATGCAAAT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 61 44 13 4 A 8 7 181289 CASAVA_Build 3 197163809 3I CAACATTTTC ---/ACA ACATCTCAAA 3070 het 3070 ref 40 26 9 5 ACA 1 2 181290 CASAVA_Build 3 197169245 4I CAATTACATG ----/TTTT TGTTTGGTTG 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 T 1 5 181291 CASAVA_Build 3 197206645 3D AGGCACTGCT AAG/--- AACGCTTGTG 1120 het 1120 ref 48 41 3 6 AAG 1 0 181292 CASAVA_Build 3 197208755 1I CAGGTTTGAC -/A AAAAAGGCGA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 A 5 6 181293 CASAVA_Build 3 197208900 3D AGAAGAGGAT GAA/--- GAAGATGAAG 2366 het 2366 ref 40 26 6 9 GAA 2 1 181294 CASAVA_Build 3 197267460 1I CACTGGGCCA -/G CTTAATTTAA 3070 hom 79 het 31 0 24 7 G 0 1 181295 CASAVA_Build 3 197268134 6I CTGTCACCCA ------/AGCTGC AGCTGCAGTG 3070 het 2962 hom 20 8 9 3 AGCTGC 1 2 181296 CASAVA_Build 3 197275169 2D AGCCTGGGCA AC/-- AGAGTGAAAC 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 AC 1 0 181297 CASAVA_Build 3 197277404 2D CTCTAACTAT GC/-- GCCTTTCTGC 3070 hom 72 het 27 0 24 4 GC 2 1 181298 CASAVA_Build 3 197284559 1D TCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1066 het 1066 ref 22 8 8 6 A 19 18 181299 CASAVA_Build 3 197299589 12D AGTACACCCA TGTGTATGCGTG/------------ TGTGTATGCG 3070 hom 81 het 27 0 28 3 TGTGTATGCGTG 2 1 181300 CASAVA_Build 3 197300097 1D CTTTTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 22 2 15 5 T 14 13 181301 CASAVA_Build 3 197302357 1D CACTTTGTGG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 65 het 25 0 21 4 T 8 7 181302 CASAVA_Build 3 197309458 2I TACATGAGAC --/TG TGCATTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TG 1 2 181303 CASAVA_Build 3 197314040 7I ACAGCTAACA -------/TACTTAG AAGTGAAAGA 1833 het 1833 ref 23 16 4 3 TACTTAG 0 1 181304 CASAVA_Build 3 197323610 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 21 7 T 12 13 181305 CASAVA_Build 3 197324863 1D TTTTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 194 hom 34 2 22 10 T 15 14 181306 CASAVA_Build 3 197341154 1I CGCCTGTAGT -/C GCAGTTACTC 2427 het 2427 ref 16 8 6 2 C 0 1 181307 CASAVA_Build 3 197347665 1I AGGCACAGAC -/T TTCCAAGAAG 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 2 3 181308 CASAVA_Build 3 197357147 1D CTGATCAGCT G/- GGGGGGCAAT 3070 hom 61 het 26 0 19 7 G 7 6 181309 CASAVA_Build 3 197369607 1I AGCAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 2186 het 2186 ref 28 16 8 4 T 13 14 181310 CASAVA_Build 3 197370632 1D CACCTGTAAT C/- CCCAGCTACT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 4 3 181311 CASAVA_Build 3 197391024 2I GGCTGGCCCC --/CT GTCCACCCAC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 CT 0 1 181312 CASAVA_Build 3 197395973 1I GTTAGCTCTA -/T TTTTTTCCTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 6 7 181313 CASAVA_Build 3 197397449 1D AAGAAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 31 1 24 6 T 13 12 181314 CASAVA_Build 3 197400819 22D CCGAGATCGC GCCACCGCACTCCAGCCAGGGT/---------------------- GACAGAGCGA 3070 hom 56 het 19 0 16 5 GCCACCGCACTCCAGCCAGGGT 1 0 181315 CASAVA_Build 3 197403759 1D CCCCAAGCAG A/- AAGCTGCTGG 2852 hom 38 het 18 0 9 9 A 3 2 181316 CASAVA_Build 3 197426478 1I TTGTCAGGGT -/G GGGCTGAGGC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 3 4 181317 CASAVA_Build 3 197428833 8D AAGAAAGAAA AAGGAAGG/-------- AAGGAAGGAA 1771 het 1771 ref 21 13 7 5 AAGG 5 3 181318 CASAVA_Build 3 197430118 1I AACAGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 13 14 181319 CASAVA_Build 3 197430509 1I AAAATAAAAG -/A AAAAAAAAGG 2946 het 533 hom 14 2 7 5 A 8 9 181320 CASAVA_Build 3 197433708 1D TTTGAGACCA G/- CCTGCCCAAC 3070 het 892 hom 16 2 11 3 G 1 0 181321 CASAVA_Build 3 197435006 1D AGGTTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 2209 het 655 hom 22 5 7 10 A 13 12 181322 CASAVA_Build 3 197443179 1I ATTAAGTACA -/T TTCCCATAGT 3070 het 3070 hom 56 24 25 7 T 2 3 181323 CASAVA_Build 3 197464180 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 A 7 6 181324 CASAVA_Build 3 197470621 1I TTAAATTGTC -/A AAATTTTTGG 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 A 3 4 181325 CASAVA_Build 3 197473058 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1414 hom 27 6 9 13 A 15 14 181326 CASAVA_Build 3 197477082 1D CTCAGCTCAC T/- TGCAAACTCC 1343 het 1343 ref 15 8 4 3 T 2 1 181327 CASAVA_Build 3 197482459 1I CACCTAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2001 hom 22 6 9 7 T 11 12 181328 CASAVA_Build 3 197483457 1I CCTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 12 1 10 1 T 14 15 181329 CASAVA_Build 3 197485777 1D TGATACTGAT G/- AAATTTTAGG 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 G 1 0 181330 CASAVA_Build 3 197490599 1D ACAGCAATTG T/- TAAGACCTGA 3070 het 3070 hom 35 15 14 8 T 2 1 181331 CASAVA_Build 3 197509522 4D CAAGAGAGAG TTGT/---- TTGTTTTTTG 2852 het 2788 hom 17 7 7 3 TTGT 2 1 181332 CASAVA_Build 3 197517703 1I CTCTTTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 10 11 181333 CASAVA_Build 3 197521537 1I GCTCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1975 het 1737 hom 20 7 8 6 T 15 16 181334 CASAVA_Build 3 197526535 1D TTTATTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1974 het 638 hom 18 4 6 8 T 14 13 181335 CASAVA_Build 3 197534458 4I AGTTCAAGAC ----/CAGA CAGACTGGGC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 CAGA 1 2 181336 CASAVA_Build 3 197555868 2I CGTCTCAAAT --/AA AAAAAAAACA 3070 het 1951 hom 24 6 13 5 A 8 10 181337 CASAVA_Build 3 197556470 7D GTCCCTCAGG CTGGAGT/------- CTGGAGTCCA 3070 het 3070 ref 24 12 10 4 CTGGAGT 2 1 181338 CASAVA_Build 3 197561864 28I TAAGGGTCTG ----------------------------/TCACATTCAATAATCCAGCCATGTAAGT TCACTTCACA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 TCACATTCAATAATCCAGCCATGTAAGT 0 1 181339 CASAVA_Build 3 197562753 1I AACACAGAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 8 9 181340 CASAVA_Build 3 197567307 2D CCAATAACAC AT/-- GTCATGGAAA 3070 het 3070 ref 58 31 22 6 AT 1 0 181341 CASAVA_Build 3 197576518 1D TCCCCACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1477 hom 30 6 14 10 A 17 16 181342 CASAVA_Build 3 197578460 1I CAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2969 hom 27 8 13 6 A 12 13 181343 CASAVA_Build 3 197581546 4D TTTGTTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2597 het 2597 ref 22 11 7 4 TTTG 4 3 181344 CASAVA_Build 3 197585541 1D GAAGAGTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 T 10 9 181345 CASAVA_Build 3 197586629 1D TCACACCTAT A/- ATCCCACTGC 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 A 2 1 181346 CASAVA_Build 3 197607665 2D CCTGTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1801 hom 25 7 10 8 A 18 16 181347 CASAVA_Build 3 197611021 1D GCCTTTTAGA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 T 8 7 181348 CASAVA_Build 3 197615369 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2763 het 2763 ref 38 22 9 7 A 11 12 181349 CASAVA_Build 3 197616738 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2388 hom 29 9 10 10 A 13 12 181350 CASAVA_Build 3 197631799 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3060 het 2273 hom 21 7 9 5 A 15 14 181351 CASAVA_Build 3 197639720 1D GACCGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 264 hom 21 1 16 5 A 13 12 181352 CASAVA_Build 3 197642866 2D GCCATCGTCT CC/-- GTCTTTATGA 1810 het 1810 ref 23 12 4 7 C 2 0 181353 CASAVA_Build 3 197652886 2I GGGTTATCTC --/CA GTTAGGGGCA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 CA 0 1 181354 CASAVA_Build 3 197666957 1D GTCTCTACCA T/- TTTTTTTTTT 1923 het 875 hom 21 6 8 7 T 14 13 181355 CASAVA_Build 3 197669356 1I AATCAATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 10 11 181356 CASAVA_Build 3 197705377 1I TTGAACTCTC -/A AAGTACTGAG 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 2 3 181357 CASAVA_Build 3 197706445 2I ATTGCCTTTC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 141 hom 43 1 33 9 GT 8 9 181358 CASAVA_Build 3 197720322 1I CAAATTAATC -/T TTTTTTTTTT 1617 het 1617 ref 14 6 5 3 T 10 11 181359 CASAVA_Build 3 197725619 2D CTTATATGCA CT/-- GTTTCCTCAG 3070 het 3070 ref 48 31 13 4 CT 1 0 181360 CASAVA_Build 3 197733965 1D TCTTCACCCC T/- AGCTGCAGAT 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 T 1 0 181361 CASAVA_Build 3 197742851 2D TCCTGACCTC AG/-- GTGATCCACC 3070 hom 16 het 31 1 28 2 AG 1 0 181362 CASAVA_Build 3 197745596 1I GAGGGTTGCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 7 8 181363 CASAVA_Build 3 197746289 10D CTGGCTAACA CGGTGAAACC/---------- CCGTCTCTAC 2205 het 2093 hom 14 7 5 2 CGGTGAAACC 1 0 181364 CASAVA_Build 3 197747614 1I CTTTGTAGCC -/T TAGGCTGGTG 2786 het 2786 ref 24 11 7 6 T 1 2 181365 CASAVA_Build 3 197749387 1D TCTACCTTCT C/- CACATTTCCC 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 C 2 1 181366 CASAVA_Build 3 197750042 1D GCACTGTACA C/- CTTCTAAAAG 2411 het 2411 ref 16 9 5 2 C 2 1 181367 CASAVA_Build 3 197768354 1I AGAAAAGAAT -/G AAAGAGTTTG 3070 het 3070 ref 42 15 16 11 G 0 1 181368 CASAVA_Build 3 197772891 1I TCAATTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 12 13 181369 CASAVA_Build 3 197775661 3I TTTTTCTTTT ---/TTC TTCTTTTTTT 2559 hom 34 het 22 0 11 11 TTC 1 2 181370 CASAVA_Build 3 197776468 2D TCTAAATCAC AT/-- AGATAATATT 3070 het 2602 hom 23 6 14 3 AT 1 0 181371 CASAVA_Build 3 197781534 1D CATCCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 1093 het 110 hom 22 2 8 12 T 15 14 181372 CASAVA_Build 3 197782527 2D AACAACAAAA CT/-- CTGTCGCCCA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 CT 2 1 181373 CASAVA_Build 3 197786950 1D TCTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1302 het 1302 ref 22 12 4 6 T 13 12 181374 CASAVA_Build 3 197788535 1D TTGGCATTTA T/- TTTTTAATGT 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 T 6 5 181375 CASAVA_Build 3 197789234 1D TTCAAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 18 1 16 1 T 12 11 181376 CASAVA_Build 3 197789781 1D CTGTCACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 11 10 181377 CASAVA_Build 3 197792090 8D CCTCGGCTGG AGTGGTGC/-------- AGTGGTGCAG 2910 het 2546 hom 22 9 8 7 AGTGGTGC 2 1 181378 CASAVA_Build 3 197796143 1D ATATGTGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 A 12 11 181379 CASAVA_Build 3 197798170 1D TGCAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 8 A 11 10 181380 CASAVA_Build 3 197807030 1D TTTAGTCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 928 hom 27 3 11 13 A 13 12 181381 CASAVA_Build 3 197811216 1D TGCTCTTGAA G/- AGATAAACAT 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 G 1 0 181382 CASAVA_Build 3 197814381 2D GATTCTGTGA CT/-- CTAGTGGCTT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 CT 2 1 181383 CASAVA_Build 3 197822244 1D CTACTTGGGA G/- GCTGAGGCAG 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 G 2 1 181384 CASAVA_Build 3 197825257 1I TCGTCTCCTC -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 A 6 7 181385 CASAVA_Build 3 197827474 2D CATAATTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 2685 hom 15 het 7 0 6 1 T 16 14 181386 CASAVA_Build 3 197829215 1I CAAAAATTAG -/C CCGGGTGTGG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 2 3 181387 CASAVA_Build 3 197829786 2D TTTGTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 28 0 18 10 T 14 12 181388 CASAVA_Build 3 197831709 1D AGGCCTCTTT C/- CCCCTGGTAT 3070 hom 60 het 38 1 32 5 C 5 4 181389 CASAVA_Build 3 197843534 1D GAGAAGAAAG A/- AAAACCTACT 3070 hom 92 het 34 0 31 3 A 5 4 181390 CASAVA_Build 3 197853561 1D GGCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 689 hom 34 8 15 12 A 11 10 181391 CASAVA_Build 3 197854834 2D TTTCTCCCAG GA/-- GAGAGAGCAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 6 GA 4 3 181392 CASAVA_Build 3 197855873 1D TTAAAAATAC A/- AAAATTACCC 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 A 5 4 181393 CASAVA_Build 3 197873293 2I GTTTTTTTTT --/TA ATTGTTCCTT 2367 het 2367 ref 17 8 6 3 TA 0 1 181394 CASAVA_Build 3 197877949 1D GGAGCTGGGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 A 9 8 181395 CASAVA_Build 3 197880013 1D CATGGTGAAA C/- CCCCGTCTCT 3070 het 737 hom 23 4 14 5 C 5 4 181396 CASAVA_Build 3 197903778 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 352 hom 27 1 13 13 T 13 14 181397 CASAVA_Build 3 197904266 1D GTCTTTTCGG C/- TGATGACTGA 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 C 1 0 181398 CASAVA_Build 3 197907421 1I TGACCTCTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 8 9 181399 CASAVA_Build 3 197909823 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 231 hom 20 1 18 1 A 13 14 181400 CASAVA_Build 3 197916704 1D CAAGGATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1579 hom 33 7 11 15 T 17 16 181401 CASAVA_Build 3 197918051 3D TTCCCCTCTC CTT/--- CTTTTCAGTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 CTT 2 1 181402 CASAVA_Build 3 197919729 2D AGTCCCTGAC AG/-- AGTCATGATG 3070 het 3070 ref 41 20 17 7 AG 2 1 181403 CASAVA_Build 3 197922377 2I AATAATGTAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 9 10 T 10 12 181404 CASAVA_Build 3 197924578 1I GCCAAGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 29 0 21 8 T 10 11 181405 CASAVA_Build 3 197927540 1D TTGCTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 60 30 21 9 T 10 9 181406 CASAVA_Build 3 197932017 5D TCATTTCTGA TCTCT/----- TCTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 TCTCT 1 0 181407 CASAVA_Build 3 197950071 1D CTAGGCCCCA G/- CTACACAGGC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 G 1 0 181408 CASAVA_Build 3 197955905 3D GTTAGAAATA AGT/--- AGTACCTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 6 AGT 2 1 181409 CASAVA_Build 3 197956201 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 T 10 9 181410 CASAVA_Build 3 197958440 1D GCTCTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 11 10 181411 CASAVA_Build 3 197960350 1D AGTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 56 27 21 9 T 10 9 181412 CASAVA_Build 3 197961098 1D TTGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 10 9 181413 CASAVA_Build 3 197962022 3I TAAAATAAAG ---/TTT TTTAAAAAAA 815 het 815 ref 34 16 8 10 T 3 6 181414 CASAVA_Build 3 197981998 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGCCTCAGC 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 CTC 1 0 181415 CASAVA_Build 3 198000751 7I TTCTTTTTTC -------/TTTTTTT TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 6 13 181416 CASAVA_Build 3 198036507 1D CCAGCTACTC G/- GGAGGCTGAG 2920 het 2920 ref 20 13 7 0 G 3 2 181417 CASAVA_Build 3 198037282 1D CAGCTAATTG T/- TTTTTTTTTG 1449 het 1449 ref 17 9 4 4 T 10 9 181418 CASAVA_Build 3 198041686 4D CTTTGTAAAC AGTT/---- GGATGGATTA 2062 het 2062 ref 43 33 5 8 AGTT 1 0 181419 CASAVA_Build 3 198078001 1I ACACTCCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 577 hom 19 3 13 3 A 16 17 181420 CASAVA_Build 3 198080149 15I TTCCTACTTA ---------------/TGTTTTTTTTTTGTT TGTTTTTTTT 3070 hom 109 het 46 0 35 11 TGTTTTTTTTTTGTT 0 1 181421 CASAVA_Build 3 198084338 3D GAGATTTAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 1107 het 91 hom 17 2 5 10 T 21 18 181422 CASAVA_Build 3 198092223 1D TCCTTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2331 hom 24 7 9 8 T 10 9 181423 CASAVA_Build 3 198098480 1I ATGGAGTCTT -/A ACTCTGTCGC 3066 het 3066 ref 27 12 8 7 A 1 2 181424 CASAVA_Build 3 198099852 1I ACTCTCTCAC -/A AAAAAAAAAA 2693 het 2693 ref 29 17 10 2 A 10 11 181425 CASAVA_Build 3 198102596 3I GTATAGAGTT ---/AAA TCTTTGTGGG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 0 3 181426 CASAVA_Build 3 198106767 1I CTTTAACTTC -/T TTTTTTTTAA 3039 hom 21 het 8 0 8 0 T 8 9 181427 CASAVA_Build 3 198110673 1I ATTCCTTCTC -/T TAACAATGCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 181428 CASAVA_Build 3 198119162 4D TGGGTTAAGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 9 A 14 10 181429 CASAVA_Build 3 198120083 2D AAGAGTGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 1915 het 450 hom 7 1 4 3 CT 2 1 181430 CASAVA_Build 3 198127796 4D AGAGATTGAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2844 het 267 hom 19 2 10 7 T 16 12 181431 CASAVA_Build 3 198129665 1D TTCTCTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 26 2 17 7 T 13 12 181432 CASAVA_Build 3 198130246 4D TGTATGTGTG TATC/---- TATCTATCTA 3070 hom 66 het 31 0 23 11 TATC 5 4 181433 CASAVA_Build 3 198133746 4D GTTTCAGGGT CTCA/---- CTCCGTCGCC 3070 het 3070 hom 40 15 15 11 CTCA 1 0 181434 CASAVA_Build 3 198135890 1D TATTTTCTGG T/- TAGAGTGTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 1 181435 CASAVA_Build 3 198136436 1I TCATTTTGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 15 12 T 11 12 181436 CASAVA_Build 3 198142068 1D TTCTGGGACC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 117 het 48 0 37 11 T 9 8 181437 CASAVA_Build 3 198147134 1I AGACTCCCCT -/C CCCTGTAGAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 3 4 181438 CASAVA_Build 3 198150274 2D ATTCTTTGGA AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 583 hom 31 6 14 12 AT 1 0 181439 CASAVA_Build 3 198151804 4D TCTCACACAT GTAA/---- GTAAGATCCA 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 GTAA 2 1 181440 CASAVA_Build 3 198154492 2I GTGGAGACAG --/AC CCCTAAGCCT 3070 hom 87 het 33 0 27 6 AC 0 1 181441 CASAVA_Build 3 198154903 1I ACTTTTTGGA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 T 7 8 181442 CASAVA_Build 3 198168650 1I TTTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 2647 het 1035 hom 20 7 11 3 T 13 14 181443 CASAVA_Build 3 198169496 1D ACAACCTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 215 hom 33 1 29 3 T 10 9 181444 CASAVA_Build 3 198187356 4D GCTGGCAGGT GCTA/---- GCTATCTGCC 1858 het 1858 ref 35 12 9 14 GCTA 2 1 181445 CASAVA_Build 3 198205892 1D GGTACAGAGA T/- TTTTCCATCT 3070 hom 108 het 38 0 35 3 T 5 4 181446 CASAVA_Build 3 198206384 2D15M8D CAGACACGTG CACACACAAGCACAGACACACACAG/--CACACAAGCACAGAC-------- ACACACGTAC 3070 het 3070 ref 58 32 23 16 N/A 0 0 181447 CASAVA_Build 3 198206550 2D23M8D CAGACACATG CACACACAGACATGCACACACGCGCACATACAG/--CACACAGACATGCACACACGCGC-------- ACACAGAGAC 3070 het 3070 ref 79 44 30 22 N/A 0 0 181448 CASAVA_Build 3 198206625 2D ACGCAGACAC AG/-- ACACACACAG 3070 het 193 hom 64 2 46 16 AG 1 0 181449 CASAVA_Build 3 198206644 2D CAGACATGCG CA/-- CACACACATG 3070 het 1302 hom 55 8 36 14 CA 5 4 181450 CASAVA_Build 3 198206744 10D GCATGCACAT ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 hom 126 het 51 0 40 19 AC 12 7 181451 CASAVA_Build 3 198206945 3D GGGCAGGAAG AGA/--- AGGAGGGAGC 3070 het 3070 ref 42 19 14 10 AGA 1 0 181452 CASAVA_Build 3 198207361 1I GACCTTGTAC -/T TCTGGAGGGG 3070 hom 54 het 23 0 16 7 T 1 2 181453 CASAVA_Build 3 198212880 1D AGAAGGGCGC G/- GGGGGCCTCA 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 G 6 5 181454 CASAVA_Build 3 198236845 1D TCTGCTCTGT G/- GGGGCAGGAA 3070 het 3070 hom 37 16 15 7 G 5 4 181455 CASAVA_Build 3 198253686 3D TTCTCTCTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CTC 1 0 181456 CASAVA_Build 3 198254160 1I GCAAAATATA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 181457 CASAVA_Build 3 198254753 4D TCACATGATT AAGG/---- AAGATAAGTC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 AAGG 1 0 181458 CASAVA_Build 3 198256483 2D TAGGTGAATT GA/-- GAGATACCTA 3070 hom 144 het 50 0 49 2 GA 3 2 181459 CASAVA_Build 3 198256846 1I CTGTGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 736 hom 31 4 18 9 A 15 16 181460 CASAVA_Build 3 198258228 1I TTTTACTCTT -/A AAAAAATGTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 7 181461 CASAVA_Build 3 198260400 8D CAGCACGGCC AACCCTGT/-------- AACCCTGTCT 3070 hom 45 het 17 0 15 5 AACCCTGT 2 1 181462 CASAVA_Build 3 198260596 1I ACAAAACAAT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 A 6 7 181463 CASAVA_Build 3 198260951 1D ACCCGGGAGG T/- TGTGGTGAGC 2831 hom 21 het 10 0 7 3 T 2 1 181464 CASAVA_Build 3 198261635 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 43 het 18 0 15 3 A 9 10 181465 CASAVA_Build 3 198265601 4I CTCTCTGCCT ----/TTTC TCTCTCTATT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 TTTC 0 1 181466 CASAVA_Build 3 198272860 1D TTCCTCAGTC T/- TTTGTCTTTC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 4 3 181467 CASAVA_Build 3 198274460 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 24 2 15 7 A 13 14 181468 CASAVA_Build 3 198280277 2I ACAAATAATA --/CT TTTTTATTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CT 0 1 181469 CASAVA_Build 3 198283630 18D ACTCCCATAC ATTTACTTGTAATACATT/------------------ ATTTACTTGT 3070 het 3070 ref 38 20 15 6 ATTTACTTGTAATACATT 2 1 181470 CASAVA_Build 3 198292959 5D TTACAGTTAT TGAAG/----- TAAGAGTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 TGAAG 1 0 181471 CASAVA_Build 3 198295190 3D TCAGTGGGCT ATG/--- ATCATGTCAC 3070 het 3070 ref 39 19 9 12 ATG 1 0 181472 CASAVA_Build 3 198301576 1D CAACGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 35 0 29 6 A 13 12 181473 CASAVA_Build 3 198302037 4D GCACACTGTC AGAG/---- AGAATCAATA 3070 het 3070 hom 25 9 14 6 AG 3 1 181474 CASAVA_Build 3 198304832 1I TCATCCACGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 30 1 20 9 T 14 15 181475 CASAVA_Build 3 198319865 4I GACTACATAA ----/TGAT TGATATACTA 3070 hom 126 het 43 0 43 0 TGAT 1 2 181476 CASAVA_Build 3 198332340 2D TAGATGAAAC AA/-- AAAAAACAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 6 A 8 6 181477 CASAVA_Build 3 198339184 1D CTTTATTGCT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 63 het 25 0 21 5 A 9 8 181478 CASAVA_Build 3 198343561 1D CTTTGATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 12 11 181479 CASAVA_Build 3 198349248 1I TCAAAAAAAC -/A AAACAAAAAA 3070 het 486 hom 27 2 23 2 A 3 4 181480 CASAVA_Build 3 198354532 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 67 het 31 0 23 8 T 7 8 181481 CASAVA_Build 3 198359145 1I CTTTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 22 0 13 9 A 12 13 181482 CASAVA_Build 3 198361173 2I GTTATAATCT --/TA TATATGAGCT 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 TA 2 3 181483 CASAVA_Build 3 198363101 3D ACTTGAAACC AGG/--- AGTTCAAAAC 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 AGG 1 0 181484 CASAVA_Build 3 198369958 8I TGCTCTGGAC --------/ATACCTCT ATACCTCTAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 ATACCTCT 1 2 181485 CASAVA_Build 3 198373561 2D AAATGAAAAA AC/-- AACGTAGAGA 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 AC 1 0 181486 CASAVA_Build 3 198376008 8D CGTCTCTACT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAGA 3070 hom 4 het 14 1 11 3 A 16 8 181487 CASAVA_Build 3 198393038 1D AAAATAGAAA G/- GTAATGAAAA 3070 het 3070 hom 41 20 18 4 G 2 1 181488 CASAVA_Build 3 198393974 5I CAACTTGTTT -----/TTAAA TTAGACCATT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTAAA 0 1 181489 CASAVA_Build 3 198394713 1D GGATGGACAG A/- AAACATACAT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 4 3 181490 CASAVA_Build 3 198397886 5I GAATATTTAC -----/TTTAT AATATTAAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTTAT 0 1 181491 CASAVA_Build 3 198407098 1I TCAGTGACAC -/A CAATTTACCC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 0 1 181492 CASAVA_Build 3 198418097 4D GTAAAAAATT AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 4 AATA 4 3 181493 CASAVA_Build 3 198418724 1I TACTTTTATC -/T TTTAACATAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 3 4 181494 CASAVA_Build 3 198419382 1D CAATTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 11 10 181495 CASAVA_Build 3 198422339 2D GGAGAAAAAT TA/-- TATAATTATT 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 TA 3 2 181496 CASAVA_Build 3 198436217 2D TTTAAACCAC AT/-- GTTGTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 AT 1 0 181497 CASAVA_Build 3 198438743 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1955 hom 28 6 16 6 A 9 10 181498 CASAVA_Build 3 198442494 1I AATGCTGTGG -/T TTTGCTTATT 3070 het 3070 hom 50 16 27 7 T 3 4 181499 CASAVA_Build 3 198444206 1I AGAAACAAAG -/A AAGGATTTAC 3070 hom 144 het 50 0 49 1 A 2 3 181500 CASAVA_Build 3 198450864 1I GCAAATCAGA -/T TTGACAGCAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 3 181501 CASAVA_Build 3 198452047 4I TTGCTGAACT ----/GAAA GATTCATTAG 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 GAAA 0 1 181502 CASAVA_Build 3 198452197 1I CTCAAAAAAA -/C AAATGTAAGA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 C 0 1 181503 CASAVA_Build 3 198460003 1I AGGAAGTTTA -/T TTTTTTGTAC 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 T 6 7 181504 CASAVA_Build 3 198460739 1D CCCACCAAAG A/- AAAGCCCAGG 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 4 3 181505 CASAVA_Build 3 198468475 6D AAAGTACCCT AATATA/------ AATATGAATA 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 AATATA 1 0 181506 CASAVA_Build 3 198474318 4D CATAACTCCC TAAA/---- TAAAGTTTAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 5 TAAA 2 1 181507 CASAVA_Build 3 198474617 1D CATTTTCTTC G/- GGGGGGTGGG 3070 hom 78 het 33 0 26 8 G 7 6 181508 CASAVA_Build 3 198478834 9I GTTTGCCTTT ---------/TTTTCTTCC TTTTCTTCCC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 TTTTCTTCC 1 2 181509 CASAVA_Build 3 198498722 3I TTTCCAAACG ---/TGT TATTAAGGGC 3070 hom 78 het 36 0 27 9 TGT 0 1 181510 CASAVA_Build 3 198502495 4I ACTAAAATTC ----/TCCT TCCATTTCAG 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 TCCT 0 1 181511 CASAVA_Build 3 198504896 4I ACCCCTAGAG ----/ACTC ACTCAAACTT 3070 hom 94 het 40 0 31 9 ACTC 1 2 181512 CASAVA_Build 3 198508059 1D ATTACCTGAT A/- ATGCAAAAGC 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 A 2 1 181513 CASAVA_Build 3 198508222 2I GACATCTGTT --/GG GGGGGGGGGC 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 G 9 11 181514 CASAVA_Build 3 198511491 1D GAGGACGTGT C/- CTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 45 22 21 3 C 2 1 181515 CASAVA_Build 3 198512256 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2000 hom 29 9 14 6 A 13 12 181516 CASAVA_Build 3 198514316 1D GTAGTGGAAA T/- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 43 30 4 9 T 15 14 181517 CASAVA_Build 3 198534586 1I CTTCCTAAAT -/G CTTTTACTTA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 G 0 1 181518 CASAVA_Build 3 198538339 2D TTGGCTCACT GC/-- AACCTCCATC 3070 het 1234 hom 17 5 8 4 GC 1 0 181519 CASAVA_Build 3 198542758 3D TAAATCAGAC TCG/--- GAGACCAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 TCG 1 0 181520 CASAVA_Build 3 198573776 4I ATCAAACTCA ----/AACT AACTGTCTGC 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 AACT 1 2 181521 CASAVA_Build 3 198577696 1D GTGACTGCTT C/- CCCCGGTAAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 C 5 4 181522 CASAVA_Build 3 198608764 1I GTGGGTACAG -/C ACAGGCCTTG 3070 het 3070 hom 69 33 32 4 C 0 1 181523 CASAVA_Build 3 198619418 3I TCTAAGAAAT ---/CTC CTTCTTAGCT 3070 het 3070 ref 41 21 20 0 CTC 0 1 181524 CASAVA_Build 3 198627417 1D AGGTGTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 T 12 11 181525 CASAVA_Build 3 198651052 1I TCAGCTTGCA -/G GGCCCCACCA 2556 het 1659 hom 23 5 8 10 G 2 3 181526 CASAVA_Build 3 198659355 1D GACAAAGACA G/- TACAAATTCA 1911 het 1911 ref 17 10 4 3 G 1 0 181527 CASAVA_Build 3 198680533 1I GAGCGACTGA -/C AACCTGCCTG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 C 0 1 181528 CASAVA_Build 3 198684792 1D CAGCCTTTCA T/- TCCTCATGGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 1 181529 CASAVA_Build 3 198695867 6D GCCCTGAAGC TGAAGG/------ TTGTTTAGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 4 TGAAGG 1 0 181530 CASAVA_Build 3 198702016 1I AACACGAGAG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 73 het 31 0 25 6 A 7 8 181531 CASAVA_Build 3 198711093 1D GTCTGTGAGG A/- AAAAAAAAAA 1015 het 1015 ref 47 33 3 12 A 11 10 181532 CASAVA_Build 3 198761244 6I AAATAACTAT ------/TATATA TATATATATA 2896 het 2896 ref 30 19 7 4 TA 5 8 181533 CASAVA_Build 3 198780515 1D TGGAGTACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 500 hom 27 2 15 10 T 10 9 181534 CASAVA_Build 3 198788007 2I AGCATAAGTC --/AG AGGTAGGGGC 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 AG 1 2 181535 CASAVA_Build 3 198791327 1I AAAAATTCAC -/A AAACGTAAAG 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 A 3 4 181536 CASAVA_Build 3 198791436 3D TAATAAACCT AAG/--- AAGACACACT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AAG 2 1 181537 CASAVA_Build 3 198791529 2I AAAAACACTG --/GA GAGACAATGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 GA 2 3 181538 CASAVA_Build 3 198792033 2D AAATAGTAAC AT/-- GTGTCACAAA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 AT 1 0 181539 CASAVA_Build 3 198799152 1I TGTATACATC -/T TTCCTGTTCC 3070 hom 135 het 54 0 46 8 T 2 3 181540 CASAVA_Build 3 198799310 1D CACATTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 37 1 20 16 T 11 10 181541 CASAVA_Build 3 198799521 2D TGAGGTTTAA AT/-- ATATATATAT 3010 het 18 hom 10 1 7 3 AT 8 7 181542 CASAVA_Build 3 198802419 4D GGGAAAGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2785 hom 17 7 10 0 TTTG 3 2 181543 CASAVA_Build 3 198804287 1D GGAAGCAGCT G/- GGGGGCTGGT 1303 het 1303 ref 24 12 6 8 G 6 5 181544 CASAVA_Build 3 198805913 3D TTTGTCCAGT ACA/--- ACATTTAAAG 3070 het 3070 ref 43 27 13 4 ACA 2 1 181545 CASAVA_Build 3 198807478 1D AATTGTCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 12 10 11 A 10 9 181546 CASAVA_Build 3 198810292 1D GAGCATGCCA C/- CCCAGCGTTT 3070 hom 96 het 35 0 32 4 C 4 3 181547 CASAVA_Build 3 198811296 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 2169 het 535 hom 9 2 5 2 T 6 7 181548 CASAVA_Build 3 198812993 1D CTTGAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 14 10 2 T 13 12 181549 CASAVA_Build 3 198834127 1I GACAGCAGCA -/C CAGGGACAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 C 1 2 181550 CASAVA_Build 3 198837048 2I CACCCCCCAC --/CA CACACACACA 2134 het 2134 ref 51 31 8 12 CA 6 7 181551 CASAVA_Build 3 198846333 1I CACGTTTGAC -/A AAAAAGGCGA 1388 het 1388 ref 45 33 5 7 A 5 6 181552 CASAVA_Build 3 198847615 1D TATATATATA T/- TATTCTAAGG 3070 het 3070 hom 20 9 9 3 T 2 1 181553 CASAVA_Build 3 198863365 1D AGTTGAGCAA G/- TTTAACAGAA 2826 het 2826 ref 51 38 6 8 G 1 0 181554 CASAVA_Build 3 198863991 6I AGCACCTCCC ------/CCCCCA CCACCCACAG 2278 het 2278 ref 22 12 7 3 CCCCCA 0 1 181555 CASAVA_Build 3 198864326 1I TCACAACACG -/C CAAGGACCCG 3070 het 3070 ref 49 31 10 8 C 1 2 181556 CASAVA_Build 3 198871632 1I TATATGTCCA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 63 39 15 9 T 6 7 181557 CASAVA_Build 3 198951507 1I CCTTCTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 212 hom 38 1 27 10 T 9 10 181558 CASAVA_Build 3 198958196 1I TCTTGCTCAC -/T TTTTTTTTTT 416 het 416 ref 38 23 3 12 T 13 14 181559 CASAVA_Build 3 198958659 1I AAAGAGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 T 14 15 181560 CASAVA_Build 3 198959725 1I TTGTCATGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 65 het 44 1 36 7 A 9 10 181561 CASAVA_Build 3 198964797 1D TTGTAAGGAA T/- TTTTTTTTTT 1633 het 1633 ref 35 22 4 10 T 15 14 181562 CASAVA_Build 3 198977446 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AGTTTGCTTT 3070 het 18 hom 21 2 18 1 AAG 1 0 181563 CASAVA_Build 3 199018307 1D ACCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 19 2 13 5 A 12 11 181564 CASAVA_Build 3 199020170 1I ACTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 24 0 17 7 A 9 10 181565 CASAVA_Build 3 199032265 1I TGACCTTTGA -/T TTTTATTTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 4 5 181566 CASAVA_Build 3 199039345 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 20 1 14 5 A 16 17 181567 CASAVA_Build 3 199051734 1I CAAAAAAACC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 2262 hom 25 7 16 2 A 7 8 181568 CASAVA_Build 3 199052001 5I AAAAGACAGA -----/CATCT CATCACTGTG 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 CATCT 0 1 181569 CASAVA_Build 3 199152282 2D ATTAATTTAG AA/-- CACTGTCATT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 2 0 181570 CASAVA_Build 3 199236556 4I AAGGAAAAAG ----/AATT AATAAATCAG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AATT 0 1 181571 CASAVA_Build 3 199276243 14I AGGGCAGGAA --------------/AGGTAGCACATGCC AGGTAGCACA 3070 hom 54 het 35 0 19 16 AGGTAGCACATGCC 1 2 181572 CASAVA_Build 3 199286236 1D ATTTCAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 32 1 23 8 A 12 11 181573 CASAVA_Build 3 199295822 1I TAGGATATAT -/A AAAAAACTGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 7 181574 CASAVA_Build 3 199307193 1D TGCAAATAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 9 8 181575 CASAVA_Build 3 199307950 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 6 181576 CASAVA_Build 3 199323328 4I ATGGTAAGCT ----/CTGC TTTTTGTAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 CTGC 0 1 181577 CASAVA_Build 3 199327222 1D CCCACAAAAA T/- AAATTAAAAA 3070 het 1091 hom 72 13 22 38 T 1 0 181578 CASAVA_Build 3 199327429 4I GCCATAGCTC ----/TCAG TCAATCAATC 3070 het 3070 hom 95 29 55 13 TCAG 0 1 181579 CASAVA_Build 3 199327963 1I ACTCCAGCCC -/G GGCAGCAGAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 2 3 181580 CASAVA_Build 3 199328859 7I AATCAATCAG -------/CTGACAC CTGGCAAGTG 3070 het 3070 hom 81 13 57 12 CTGACAC 0 1 181581 CASAVA_Build 3 199329618 21D GTCATAGCAG TTTTGTCATAGCATAGTCCAT/--------------------- TTTGAAAATG 2714 het 2714 ref 34 24 9 9 TTTTGTCATAGCATAGTCCAT 1 0 181582 CASAVA_Build 3 199329707 1D TTGGCCTGAC T/- TCTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 78 18 58 2 T 2 1 181583 CASAVA_Build 3 199335317 4I GTACACACAC ----/ACAT GTTCCCTGGA 3070 het 3070 ref 38 24 10 5 ACAT 0 1 181584 CASAVA_Build 3 199335425 2D ATGGAGTGGG CA/-- TCGGGTACTT 3070 het 3070 ref 59 38 17 5 CA 1 0 181585 CASAVA_Build 3 199335870 1D GTCACTGTGT A/- AAAGGTCATA 3070 het 3070 ref 47 33 10 4 A 4 3 181586 CASAVA_Build 3 199338939 4I TGTTGGAACA ----/TACT TTTATTTCAG 3070 het 3070 hom 103 39 59 5 TACT 0 1 181587 CASAVA_Build 3 199340582 3D GACAAGAAAT GTG/--- GTCCTGAGCA 3070 het 3070 ref 56 35 16 6 GTG 1 0 181588 CASAVA_Build 3 199350500 1D ACTGAAGGCC G/- GCAGCAGAGA 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 G 2 1 181589 CASAVA_Build 3 199351492 2I TGTTGCCAGC --/CT CTTTCCACCT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 CT 1 2 181590 CASAVA_Build 3 199358473 1I GTGTTTTCTA -/G GGGGAAAGAA 3070 het 3070 ref 50 32 7 11 G 4 5 181591 CASAVA_Build 3 199369321 4I TACTGGACTT ----/TGTC TGTTAAAAGG 1396 het 1396 ref 17 10 3 4 TGTC 0 1 181592 CASAVA_Build 3 199382771 1I CAAGTCCGAA -/G GCCCCGCTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 G 1 2 181593 CASAVA_Build 3 199418125 1I TTCACTGACA -/T TTTTTTTTTC 2582 het 663 hom 8 2 6 0 T 9 10 181594 CASAVA_Build 12 18230 1D ACAATGGAAG T/- TTATTTCTCA 3070 het 3070 ref 42 31 8 5 T 3 2 181595 CASAVA_Build 12 19945 1D TAAAGCTTGG A/- AAAAAAAAAA 2925 het 1226 hom 25 6 9 10 A 15 14 181596 CASAVA_Build 12 20835 1D TGAAAAGGGA T/- TTTTTTTTGT 1359 het 1359 ref 43 35 3 5 T 9 8 181597 CASAVA_Build 12 22612 1I CCCCCAAACT -/C TGCTGTCAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 0 1 181598 CASAVA_Build 12 32456 1D AAGTGCTGAA T/- GTCTAAGTGA 3070 het 3070 ref 48 31 13 5 T 1 0 181599 CASAVA_Build 12 35127 20I TCATGATCCA --------------------/CCCGCCTTGGCCTCCCAAAG GGCTGGGATT 3070 het 3070 ref 44 21 22 3 CCCGCCTTGGCCTCCCAAAG 0 1 181600 CASAVA_Build 12 37505 1D AAGAAATCTC T/- GAATTGTCAG 3070 het 3070 hom 85 26 47 18 T 1 0 181601 CASAVA_Build 12 39352 4D CGAGACTAGC CTGA/---- CTAACATGGA 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 CTGA 1 0 181602 CASAVA_Build 12 39558 1D AAAGTAAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 77 35 30 13 T 3 2 181603 CASAVA_Build 12 39764 5I AAGCTAAGGA -----/AAACG AAAAGCTGGC 3070 het 3070 hom 80 24 52 4 AAACG 0 1 181604 CASAVA_Build 12 40252 1D AGGACATAAC A/- AAAAAAGAAA 2910 het 2910 ref 59 46 7 7 A 7 6 181605 CASAVA_Build 12 52620 3D TCAAGATCCA GAT/--- GGTTGAGAAC 3070 het 3070 ref 56 41 8 7 GAT 1 0 181606 CASAVA_Build 12 58658 1I CCCTCCCTCA -/C CCCCCCGCCT 3070 het 2635 hom 39 12 12 15 C 6 7 181607 CASAVA_Build 12 69068 4I GAAACTTACC ----/TCTT TCTGTCAATA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 TCTT 0 1 181608 CASAVA_Build 12 70028 1I TTTTTGAATG -/A CCTTGGTACT 3070 het 3070 ref 48 31 15 2 A 0 1 181609 CASAVA_Build 12 83987 1I CGCCCATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2488 hom 23 7 10 6 A 10 11 181610 CASAVA_Build 12 105388 1I AGGGGCCCTG -/C CTTTGGGGGC 887 het 887 ref 16 7 3 6 C 1 2 181611 CASAVA_Build 12 109033 1I GCCCTTTAGG -/A AATAGAGGGC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 2 3 181612 CASAVA_Build 12 117058 2D ACATGAACTT AA/-- AAAAAAAAAA 2740 het 326 hom 28 5 11 15 A 17 15 181613 CASAVA_Build 12 120351 1D TGTTTGCAGA T/- CTCCCCTGTC 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 1 0 181614 CASAVA_Build 12 133733 3D ACCCTCACCA GCT/--- GCTCCCGCTG 3039 hom 53 het 21 0 13 9 GCT 2 1 181615 CASAVA_Build 12 139604 1D CTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 10 9 181616 CASAVA_Build 12 149511 1D TGAGATTCAC T/- TTCCAAGCAG 3070 het 3070 ref 43 15 15 13 T 3 2 181617 CASAVA_Build 12 149802 1I CAGGGACGTG -/T TCCCTTAGTC 3070 hom 60 het 21 0 19 2 T 1 2 181618 CASAVA_Build 12 157534 4D TGTCCTGGAA GCCT/---- GCCTGCCTGC 3070 hom 51 het 21 0 14 7 GCCT 4 3 181619 CASAVA_Build 12 171020 3I GTCATTATTG ---/TTA TTATTACTAT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 TTA 2 3 181620 CASAVA_Build 12 190457 1D CCCTCTCATA C/- ACACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 C 1 0 181621 CASAVA_Build 12 205086 1D CAAACAGTTT A/- AAAAAAAAAA 734 het 661 hom 15 3 3 9 A 17 16 181622 CASAVA_Build 12 227740 1D GAGGCAGGAG A/- AATGGAGTGA 3070 hom 68 het 27 0 22 5 A 3 2 181623 CASAVA_Build 12 235278 3D CCTGACCTTA CCT/--- TCTATTCACT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 CCT 1 0 181624 CASAVA_Build 12 237147 1D AGCCCTGGGA C/- CCAAACATTG 3070 hom 121 het 46 0 38 9 C 3 2 181625 CASAVA_Build 12 245964 1I TTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 93 hom 30 1 22 7 G 0 1 181626 CASAVA_Build 12 249645 3D TTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 27 1 14 12 T 19 16 181627 CASAVA_Build 12 251595 2D GAACTGCAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 46 24 12 13 AC 6 5 181628 CASAVA_Build 12 257711 1I AACTGACAGA -/G GGGGGGGGGG 1331 het 1331 ref 28 9 8 11 G 10 11 181629 CASAVA_Build 12 283874 2D GAGTATAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 1851 het 1851 ref 43 17 5 21 T 20 18 181630 CASAVA_Build 12 333348 1I ACACCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 22 3 15 4 A 16 17 181631 CASAVA_Build 12 334192 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 21 1 15 5 A 10 11 181632 CASAVA_Build 12 338424 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 9 10 181633 CASAVA_Build 12 350040 1I AACAGAGACT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 32 0 24 8 C 0 1 181634 CASAVA_Build 12 356462 1I TAAAACAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 553 hom 29 2 22 5 A 11 12 181635 CASAVA_Build 12 358902 2I AGGTGTACAC --/AT ATATGAAAAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AT 2 3 181636 CASAVA_Build 12 360425 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 27 0 19 8 T 12 11 181637 CASAVA_Build 12 361244 1I GGTTACTCTG -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 7 8 181638 CASAVA_Build 12 362647 1D AAATTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 39 1 22 16 T 12 11 181639 CASAVA_Build 12 366336 1D TACCAAGATC A/- AAAAAAAAAA 1373 het 1373 ref 30 23 3 4 A 12 11 181640 CASAVA_Build 12 367428 1I AACTTACATG -/A AGAATCATCT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 1 2 181641 CASAVA_Build 12 372448 4I TCTGTTTCTC ----/CATT CAACCCGTTA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 CATT 0 1 181642 CASAVA_Build 12 389695 1I ACTATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 23 0 18 5 T 10 11 181643 CASAVA_Build 12 390608 1D TTTCAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 13 6 T 12 11 181644 CASAVA_Build 12 399033 1D GTGAGAGGGT A/- AAACACACAT 1840 het 1840 ref 47 32 5 11 A 4 3 181645 CASAVA_Build 12 399773 1D GTGAGAGGGT A/- AAACACACAT 3070 het 3070 ref 52 15 11 26 A 4 3 181646 CASAVA_Build 12 400145 3I GAGAGGGTAA ---/AAT ACACACATAG 826 het 826 ref 43 27 3 13 AAT 0 1 181647 CASAVA_Build 12 400883 2I GAGAGGGTAA --/AT ACACACATAG 3070 het 3070 ref 56 36 9 11 AT 0 1 181648 CASAVA_Build 12 408103 1I CAATTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 42 1 36 5 A 10 11 181649 CASAVA_Build 12 421173 1D TCATCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1383 hom 35 6 15 14 T 17 16 181650 CASAVA_Build 12 423501 2D TTGGTTAAAA CT/-- CTGTCACCAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 CT 2 1 181651 CASAVA_Build 12 423901 2I CAGCAACAAC --/TG TGGATAAGGA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 TG 1 2 181652 CASAVA_Build 12 424507 1I TATATATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 975 hom 43 3 27 13 T 13 14 181653 CASAVA_Build 12 425898 2I TACAGGAGAC --/AG AGTTATGTAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AG 1 2 181654 CASAVA_Build 12 433535 6D CCCCTTTCTC TTTTCT/------ TTTTCTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 14 9 TTTTCT 3 2 181655 CASAVA_Build 12 438581 1I GGAATACTGA -/T TTTTTTTTTT 2620 het 2126 hom 23 6 8 9 T 13 14 181656 CASAVA_Build 12 440654 1D AACCCTGAGC A/- AATCTACCAA 3070 hom 63 het 26 0 21 6 A 3 2 181657 CASAVA_Build 12 444058 2I GACTCTACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 19 7 A 12 14 181658 CASAVA_Build 12 444944 1D ACATCAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 118 het 45 0 35 10 T 13 12 181659 CASAVA_Build 12 446573 2I CTTACTCTGT --/AG CTCTCAAGCC 3070 hom 42 het 20 0 15 5 AG 0 1 181660 CASAVA_Build 12 447663 3D TGACCTAGAC ATT/--- GTTGAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 4 ATT 1 0 181661 CASAVA_Build 12 452404 11D GTTCAAACAC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 3070 hom 79 het 31 0 27 7 T 20 9 181662 CASAVA_Build 12 459314 1I CTGACCAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 20 0 13 7 A 9 10 181663 CASAVA_Build 12 464227 1D GAGAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2702 het 1722 hom 38 12 10 17 A 15 14 181664 CASAVA_Build 12 470155 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 15 14 181665 CASAVA_Build 12 476331 5D TAGAGACAGG GTCTT/----- GCTCTGCCGC 3070 het 3070 hom 28 9 16 5 GTCTT 1 0 181666 CASAVA_Build 12 477943 1I TTCCTGTGTG -/T TTGTCCACAC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 2 3 181667 CASAVA_Build 12 481986 2I AGAAACAGGC --/AG GGGTGAAAGA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 AG 0 1 181668 CASAVA_Build 12 483182 5D ACTGATCTCT GAACA/----- GCTGCCTCCC 3070 het 3070 ref 39 19 17 8 GAACA 1 0 181669 CASAVA_Build 12 483707 1D CCCTGTCTAT A/- AAAAAAAAAC 2235 het 692 hom 15 4 5 6 A 10 9 181670 CASAVA_Build 12 485535 1D GCAGTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 12 11 181671 CASAVA_Build 12 489008 2D ACCTAGTTCA AG/-- AGAGTCTTAT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 AG 3 2 181672 CASAVA_Build 12 493730 1D GTTCACGCCA T/- TCTCCTGCCT 1846 hom 12 het 5 0 5 0 T 2 1 181673 CASAVA_Build 12 494602 1D CTCAAAGGGG T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 7 6 181674 CASAVA_Build 12 495710 4D ATACAGAGTT AGAA/---- AGAGAGTGAT 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 AGAA 1 0 181675 CASAVA_Build 12 497177 1D GCATGAAGCA G/- GGCTGTGCCA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 G 3 2 181676 CASAVA_Build 12 501397 1I TCAGAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 34 0 17 17 T 13 14 181677 CASAVA_Build 12 507330 1D AATGAGAGAT A/- ATAAGGAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 2 1 181678 CASAVA_Build 12 510737 11D TGCCATACTG CCACTGCTGGC/----------- CCACTGCTGG 3070 het 3070 hom 28 9 12 8 CCACTGCTGGC 2 1 181679 CASAVA_Build 12 529922 1D8M1I TCAAAAAAAA CAAACAAAC-/-AAACAAACA AAAAAAAACA 3070 hom 40 het 30 1 27 3 N/A 0 0 181680 CASAVA_Build 12 542926 1D AACTTCTTAG A/- AAAAAAAAAA 2333 het 2333 ref 28 15 6 7 A 11 10 181681 CASAVA_Build 12 556752 3I AGGCTAAGTG ---/TAT TATTAAATGC 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 TAT 1 2 181682 CASAVA_Build 12 565563 1I AGGAAAAAAG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 A 7 8 181683 CASAVA_Build 12 582434 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 11 10 181684 CASAVA_Build 12 588158 4I TCAGCAATGT ----/CACC GGTGAGGTGC 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 CACC 0 1 181685 CASAVA_Build 12 589457 1I AGAGCATGAT -/G CCAAGTCGAT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 G 0 1 181686 CASAVA_Build 12 599785 1D TTTGCGGGAA G/- GGGAGAGGGT 3070 het 3070 ref 39 16 15 9 G 4 3 181687 CASAVA_Build 12 604863 1D GGAATCACTG A/- AGGTTTTTGA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 2 1 181688 CASAVA_Build 12 617845 4I CATTTAGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 63 het 31 0 22 9 TTTG 3 4 181689 CASAVA_Build 12 618922 2I TTTTTTTCTA --/CT TTTTGTGTAT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 CT 0 1 181690 CASAVA_Build 12 626354 3D CTCCTGGCGT GGA/--- GCCTGGTCAA 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 GGA 1 0 181691 CASAVA_Build 12 626863 24D TGGTGCCCTG CACTGACAGTGTGGTGGTGCCCCA/------------------------ CACTGAAACA 3066 het 3066 ref 34 27 9 6 CACTGACAGTGTGGTGGTGCCCCA 1 0 181692 CASAVA_Build 12 629508 1I GATTAGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 879 hom 30 4 17 9 T 14 15 181693 CASAVA_Build 12 638505 2D TATAACTGCT TA/-- TATATATATA 2337 het 1233 hom 9 4 5 0 TA 6 5 181694 CASAVA_Build 12 639556 1D CTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 10 9 181695 CASAVA_Build 12 640503 1D TTAACTAAAG A/- GTGTTATTGT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 1 0 181696 CASAVA_Build 12 642393 10I TTCCTGTCTC ----------/CAAAGAACTG CCCGGCAGCT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 CAAAGAACTG 0 1 181697 CASAVA_Build 12 645420 1D ACCATGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 A 15 14 181698 CASAVA_Build 12 649644 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 699 hom 14 het 9 0 3 6 A 11 12 181699 CASAVA_Build 12 651968 2I ACATTTGAGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 39 13 14 12 GT 8 9 181700 CASAVA_Build 12 653259 2I CCATCTCAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1748 hom 23 6 17 1 A 10 12 181701 CASAVA_Build 12 656044 3I CCCGACAGTC ---/AAG AAGATTTCTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAG 1 2 181702 CASAVA_Build 12 664417 1I CTTAGGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 46 2 38 6 A 10 11 181703 CASAVA_Build 12 670381 32D ATCCCAGCTA CTCAGGAGGCTGAGGCAAAAGAATCGCTTGAG/-------------------------------- CTCAGGAGGC 1381 hom 12 het 11 0 5 9 CTCAGGAGGCTGAGGCAAAAGAATCGCTTGAG 2 1 181704 CASAVA_Build 12 674619 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 114 het 49 0 38 12 GT 7 6 181705 CASAVA_Build 12 675060 1I GAGATTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 10 11 181706 CASAVA_Build 12 676376 1D AGCAGTTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 33 0 29 4 T 10 9 181707 CASAVA_Build 12 676893 1D GGAGGGTGAC T/- TAGAGACCCC 3070 hom 69 het 25 0 23 3 T 2 1 181708 CASAVA_Build 12 681810 4D AGGCCGAGGT GGGA/---- GGATCGCTTG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 GGGA 1 0 181709 CASAVA_Build 12 702077 1I GGGGAATGTT -/G GGGGAAAACC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 G 4 5 181710 CASAVA_Build 12 704262 2D TGCACAAGAA TC/-- TCTCCTATGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TC 3 2 181711 CASAVA_Build 12 707287 1I GGTCTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 1261 het 1261 ref 39 27 3 9 A 11 12 181712 CASAVA_Build 12 719313 1D TGACCAACAT G/- GGGGAAACCT 2387 hom 12 het 5 0 5 0 G 5 4 181713 CASAVA_Build 12 727104 1I ATTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2164 hom 26 het 17 0 9 8 T 15 16 181714 CASAVA_Build 12 729091 1D GAAAGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 36 2 25 9 A 13 12 181715 CASAVA_Build 12 743017 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 10 11 181716 CASAVA_Build 12 758825 1D TTCTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 24 0 19 5 T 12 11 181717 CASAVA_Build 12 760528 9D TTATTTCGTT AACAACAAC/--------- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 30 15 14 9 AAC 7 4 181718 CASAVA_Build 12 763485 2D TGTCTCCACC AA/-- AAAAAAAAAA 1636 het 1636 ref 14 6 7 1 A 14 12 181719 CASAVA_Build 12 764833 1I5M1I TCTCCCCCCC -CCCCA-/ACCCCAC CCCCCTCGAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 N/A 0 0 181720 CASAVA_Build 12 770989 1D CTTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 13 12 181721 CASAVA_Build 12 773930 2I GTTGGTTGAA --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 48 1 32 15 TG 0 1 181722 CASAVA_Build 12 775091 4D CAGCATGAAA ACTG/---- ACTAATACAG 3070 het 3070 hom 41 14 24 5 ACTG 1 0 181723 CASAVA_Build 12 776310 10D GATCAATCTT ATGAAGATGC/---------- AAATCTGATC 3070 het 3070 ref 34 21 14 0 ATGAAGATGC 1 0 181724 CASAVA_Build 12 778063 4D TTTTTTTCCT TTAA/---- TTGTGTTCCT 3070 het 2012 hom 15 6 9 1 TTAA 1 0 181725 CASAVA_Build 12 781002 1I TGCCTGACCA -/T TTTTTTTTTT 742 het 742 ref 20 7 6 7 T 15 16 181726 CASAVA_Build 12 790031 4D GCTTCTGGGC GAAT/---- AAAGTGAACA 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 GAAT 1 0 181727 CASAVA_Build 12 795875 1I AAAAAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2780 hom 33 11 13 9 T 13 14 181728 CASAVA_Build 12 800470 14D GTTTCTTGAG TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2581 hom 41 13 21 10 T 25 11 181729 CASAVA_Build 12 804103 4I GTTAAAAAAA ----/AGAG AGAGAGAAGT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AG 3 5 181730 CASAVA_Build 12 812442 1I ACATTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 T 11 12 181731 CASAVA_Build 12 819874 1I TATATTTTTT -/A AATGTTTGGG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 2 3 181732 CASAVA_Build 12 835883 1D TCCATCTCGA G/- GGAAAAAAAA 3070 het 29 hom 24 2 20 2 G 3 2 181733 CASAVA_Build 12 840355 1D TTACAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 28 0 15 13 T 12 11 181734 CASAVA_Build 12 845496 3I TGTGGGTCCT ---/TGC TGCTGCTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TGC 2 3 181735 CASAVA_Build 12 846158 1D CTTAAATCTA G/- AACTGCTTCT 3070 het 3070 ref 22 11 11 0 G 1 0 181736 CASAVA_Build 12 853797 7D ACTTCTCCCC AGATGCT/------- CTAAGATGTA 3070 het 3070 ref 53 29 22 5 AGATGCT 1 0 181737 CASAVA_Build 12 865553 1I ATATGATCAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 T 8 9 181738 CASAVA_Build 12 867368 2I CCATCTCACA --/GT CAGTTCTGCT 3070 hom 90 het 39 0 30 9 GT 0 1 181739 CASAVA_Build 12 878175 1I TAACTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1343 hom 19 5 9 5 T 10 11 181740 CASAVA_Build 12 879286 1I CTAATAGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 A 10 11 181741 CASAVA_Build 12 889715 3I AAGTTAATCT ---/ATC ATCTATCTTT 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 ATC 1 2 181742 CASAVA_Build 12 891299 4I AAAATACAAA ----/AATT AATTAGTCGG 3070 het 2934 hom 21 8 10 3 AATT 1 2 181743 CASAVA_Build 12 891442 1D CAGAGCCAGA C/- CCCCCCTCTC 3070 het 3070 ref 34 14 10 11 C 7 6 181744 CASAVA_Build 12 891955 3I TATATATATA ---/TTC TTCTATTTTG 3070 het 2963 hom 27 8 16 3 TTC 1 2 181745 CASAVA_Build 12 892420 1I GGCAGACGTT -/A ATGCAAAACA 3070 het 3070 ref 37 22 15 0 A 1 2 181746 CASAVA_Build 12 892492 8D4M9I ATTGCTTGAG GGCAAGGAGCCA---------/--------GCTATTATATTGT TTGGTGATTC 3070 het 3070 ref 38 23 12 8 N/A 0 0 181747 CASAVA_Build 12 894259 1D CTCGCTTGTT A/- ACAGCCATAA 3070 hom 87 het 32 0 28 4 A 2 1 181748 CASAVA_Build 12 897273 1D GGCTGAGGCA G/- GGAGAATCAC 2100 hom 24 het 9 0 9 1 G 3 2 181749 CASAVA_Build 12 902650 1I CTCACCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2252 het 2252 ref 13 6 6 1 A 10 11 181750 CASAVA_Build 12 904170 17D TAAATGACAT TGTAATGACATCAGACA/----------------- TGTAATGACA 3070 het 3070 ref 38 23 11 12 TGTAATGACATCAGACA 1 0 181751 CASAVA_Build 12 905257 2D AACAAACTGC AG/-- AGAGTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 8 11 AG 3 2 181752 CASAVA_Build 12 905758 1D CTGTCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2237 het 301 hom 16 1 8 8 A 13 12 181753 CASAVA_Build 12 912521 1D AATAAAAAGC G/- GAAAAAAAAA 2853 het 2853 ref 26 13 8 6 G 2 1 181754 CASAVA_Build 12 913870 2I AGCCTGGGCG --/AC AGAGTGAGAC 1772 hom 17 het 15 0 6 9 AC 0 1 181755 CASAVA_Build 12 914580 1I ACCTCAACTT -/A ACTGCTCACT 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 A 1 2 181756 CASAVA_Build 12 914808 9D CCTGTGAATC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2817 het 1836 hom 24 9 12 3 T 19 10 181757 CASAVA_Build 12 923245 2I TAAGTGACTC --/TA TGGCATCCTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TA 0 1 181758 CASAVA_Build 12 924190 4I TAAAAGCATT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TTTC 2 3 181759 CASAVA_Build 12 924200 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 1649 het 278 hom 31 4 14 13 TC 0 1 181760 CASAVA_Build 12 926757 1D CTGTCCCCCC A/- AAAAAACAAC 3070 het 2954 hom 23 9 9 6 A 7 6 181761 CASAVA_Build 12 928096 1I ACTTTTTTTT -/A AAAAAAGGGA 2161 het 2161 ref 19 9 6 4 A 6 7 181762 CASAVA_Build 12 930547 1D TTTTTTTTTT A/- AAGAGTCAGG 887 het 887 ref 39 33 4 2 A 3 2 181763 CASAVA_Build 12 931153 5D TCTTCATCAC TTCCT/----- TTCTTCTGCT 3070 hom 84 het 42 0 29 17 TTCCT 1 0 181764 CASAVA_Build 12 935375 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTGCATTT 3070 het 153 hom 28 1 24 3 T 5 4 181765 CASAVA_Build 12 941770 4I GCTTTCTTTC ----/TTTT CTTTTTTTTT 2636 hom 45 het 16 0 14 2 T 0 4 181766 CASAVA_Build 12 949507 1I AGGCGGAGGT -/G GGTGGATCAC 3070 hom 43 het 18 0 15 3 G 2 3 181767 CASAVA_Build 12 952423 1I TTTGTGCAAG -/A AAAGTGACAG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 3 4 181768 CASAVA_Build 12 954633 2I TCCACTGGGA --/GG GGGGGGTCCT 3070 hom 71 het 26 0 21 5 G 6 8 181769 CASAVA_Build 12 957323 7I ACATGGGTTT -------/AGGGAAA AAGCCCTTGA 3070 hom 105 het 41 0 34 7 AGGGAAA 0 1 181770 CASAVA_Build 12 961636 1D TCTGTCCTGT G/- TCCCCTTTAG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 G 1 0 181771 CASAVA_Build 12 966796 1D CATGGTTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 25 0 17 8 T 10 9 181772 CASAVA_Build 12 982399 2I TTAAGGAGGC --/CA CAGGCACCGT 2849 het 2832 hom 16 7 7 2 CA 1 2 181773 CASAVA_Build 12 985618 2D TCCTGACCTC AG/-- GTGATCCACC 2052 hom 21 het 13 0 6 7 AG 1 0 181774 CASAVA_Build 12 987220 1D ATTACAGACT C/- TTAAATTCTG 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 C 1 0 181775 CASAVA_Build 12 989038 1I GCATATAATA -/C CGTATTTCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 1 2 181776 CASAVA_Build 12 1002837 1D CTTTTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 12 11 181777 CASAVA_Build 12 1015691 1I TTCTTTGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 9 10 181778 CASAVA_Build 12 1023266 1D CAACATTGCA T/- TGTTGCTAAT 3070 het 3070 hom 56 24 24 8 T 2 1 181779 CASAVA_Build 12 1030957 13D TCTCTACCCC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 2456 het 156 hom 20 2 11 11 A 25 12 181780 CASAVA_Build 12 1040152 1D ACGTGGGAAA T/- TTTTTTTTTT 925 het 180 hom 14 2 4 8 T 19 18 181781 CASAVA_Build 12 1045026 1D TTTTTGGGGC G/- GGGGGGGACG 3070 hom 63 het 24 0 21 6 G 8 7 181782 CASAVA_Build 12 1051931 1D AATGTCTTTA C/- AAACACATGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 1 0 181783 CASAVA_Build 12 1053481 1I TAGTAGAGAC -/G GGCTTTCACC 3070 hom 27 het 13 0 10 3 G 2 3 181784 CASAVA_Build 12 1057864 1I AAATTCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 30 1 21 8 T 13 14 181785 CASAVA_Build 12 1061455 4D TCGGTTTTGC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 38 14 10 16 TTGT 4 3 181786 CASAVA_Build 12 1064098 1I CTTCCAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 616 hom 27 2 23 2 T 10 11 181787 CASAVA_Build 12 1083435 4D AAGTACTGAC TGAT/---- TTATTTAGAG 3070 het 902 hom 37 4 16 20 TGAT 1 0 181788 CASAVA_Build 12 1083454 2D TAGAGACATT CA/-- CAGAGTCTGA 3070 het 954 hom 42 3 21 21 CA 2 1 181789 CASAVA_Build 12 1089898 1D GGAAGAATAC T/- TTTAGCATAG 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 T 4 3 181790 CASAVA_Build 12 1091483 2I CTGTGAACTT --/AG AGAAACTACC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AG 1 2 181791 CASAVA_Build 12 1093911 2I GAATAATCTT --/TA AGTCATAGTT 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 TA 0 1 181792 CASAVA_Build 12 1094114 1D ACTATTTTGC A/- GGATGAATAT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 1 0 181793 CASAVA_Build 12 1104042 2I TAGAAAAAAC --/AG AGTTAATCCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AG 1 2 181794 CASAVA_Build 12 1105798 4D GTGGAGAGAT AGTC/---- AGTCATAAAC 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 AGTC 2 1 181795 CASAVA_Build 12 1108745 12D37M1I AAACAACAAC AACAACAAAACTAACAACAACAACAAAAAACTAACCAGGCAACAACAAG-/------------AACAGCAACAACAAAAAACTAACCAGGCAACAACAAGA AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 10 15 17 N/A 0 0 181796 CASAVA_Build 12 1109264 1I GAGATGCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 104 het 44 0 37 7 A 9 10 181797 CASAVA_Build 12 1110171 1D CAGAGCACAA T/- TGCAGTTTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 1 181798 CASAVA_Build 12 1111066 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 8 7 181799 CASAVA_Build 12 1111739 2I GGGTATGGAC --/TT GGGCAGTTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 0 2 181800 CASAVA_Build 12 1112145 4I TGGAAAGGCT ----/TTTA TTTTTCTGAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TTTA 0 1 181801 CASAVA_Build 12 1131180 2I ACTGCCCAAC --/TT TTGGTGGATC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 T 2 4 181802 CASAVA_Build 12 1133641 24D TGTGTGTGTG TATGTATATGTATATGTATATGTA/------------------------ TATGTATATG 3070 het 2055 hom 40 8 15 20 TATGTA 7 3 181803 CASAVA_Build 12 1135291 1I TGTTCAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2604 hom 23 8 12 3 A 10 11 181804 CASAVA_Build 12 1139522 4I TTTAGTCTGA ----/CAAT CAAGTCTTGA 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 CAAT 0 1 181805 CASAVA_Build 12 1141915 1D CCTAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2298 hom 39 11 16 12 T 12 11 181806 CASAVA_Build 12 1143959 1I TAGTAGAGAA -/G GGGTTTCACC 2602 hom 18 het 7 0 7 0 G 3 4 181807 CASAVA_Build 12 1154893 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 11 12 181808 CASAVA_Build 12 1162661 2D TTTAAACCTC TA/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 21 11 1 TA 1 0 181809 CASAVA_Build 12 1164875 1D CCATTTTTTT A/- AACCGTTAAT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 3 2 181810 CASAVA_Build 12 1170318 1I TTAAGAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 T 13 14 181811 CASAVA_Build 12 1175235 4D TAAGCCAGTT TGAA/---- TGAGGATTCT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 TGAA 1 0 181812 CASAVA_Build 12 1179991 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2207 het 2207 ref 25 9 8 8 T 11 12 181813 CASAVA_Build 12 1187782 1I AGCTTTTTTT -/G CATGTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 G 0 1 181814 CASAVA_Build 12 1188831 1D CTTCATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 11 9 12 T 15 14 181815 CASAVA_Build 12 1191426 1I TGATGCAACA -/G GTAGAGTAAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 G 1 2 181816 CASAVA_Build 12 1194733 1I AGCAGCAAAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 T 7 8 181817 CASAVA_Build 12 1195326 1I GTGTGAATCC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 55 26 25 4 A 7 8 181818 CASAVA_Build 12 1203748 4D AGAGATTGAT TTAA/---- TTGTCTCACA 3070 het 3070 hom 43 19 23 4 TTAA 1 0 181819 CASAVA_Build 12 1204544 4D TCTGTATTCC TTAG/---- TTAGCATTTT 3070 het 3070 hom 44 15 25 5 TTAG 2 1 181820 CASAVA_Build 12 1210573 1D TCTGATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3053 het 3053 ref 27 15 7 5 T 11 10 181821 CASAVA_Build 12 1222635 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1284 het 214 hom 12 3 4 5 A 12 13 181822 CASAVA_Build 12 1224703 3D ATTCTGACTT TTC/--- TTCTTCTTTG 3070 het 3070 hom 29 12 15 4 TTC 3 2 181823 CASAVA_Build 12 1235705 1D TGTTTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 13 12 181824 CASAVA_Build 12 1238528 2I ATATCAGAAC --/AA TATGTATTTT 3070 het 3070 ref 43 21 22 0 A 0 2 181825 CASAVA_Build 12 1270181 10D ATCCTGGGAT CCCTCAGTTA/---------- CCCTCAGTTA 3070 het 3070 ref 39 16 15 9 CCCTCAGTTA 2 1 181826 CASAVA_Build 12 1280457 1I CGAAATAATG -/T TTTTTTGCAG 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 6 7 181827 CASAVA_Build 12 1302598 2D TTTTGGACGT AA/-- GTGTGCAATG 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 A 2 0 181828 CASAVA_Build 12 1326874 1I AATTAACATA -/T TCATTATCTC 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 1 2 181829 CASAVA_Build 12 1339375 1D AGATGCAGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 20 2 T 10 9 181830 CASAVA_Build 12 1350625 3D52M1D CCCATTTCCC CCTCTCTCCTCTGCCTTGCAACCACCATTCTACTCTCTGTTTGCGTGAGTTTGACT/---CTCTCCTCTGCCTTGCAACCACCATTCTACTCTCTGTTTGCGTGAGTTTGAC- GTTTTAGATC 3070 het 3070 ref 46 36 15 18 N/A 0 0 181831 CASAVA_Build 12 1353217 14D AAAGAAAAAG AAGAAAAGAAAGAA/-------------- AAGAAAAGGA 3070 het 3070 hom 28 15 16 2 AAGAAAAGAAAGAA 1 0 181832 CASAVA_Build 12 1354528 2D GCAGACATTC TG/-- TGTGTTAGTC 3070 het 3070 ref 65 34 24 8 TG 3 2 181833 CASAVA_Build 12 1355834 2D GATTTTCCAC AT/-- GTTACCTCCC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AT 1 0 181834 CASAVA_Build 12 1362862 1D CTGCTGCCTC T/- TTTGGTCTCT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 4 3 181835 CASAVA_Build 12 1370899 1I GTGAAGGTCC -/T GACTCCACCA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 0 1 181836 CASAVA_Build 12 1374835 4D AATTTTGTAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 20 7 T 15 11 181837 CASAVA_Build 12 1375091 3I CCCAGCTGGG ---/TTA TTATGTGTCT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TTA 1 2 181838 CASAVA_Build 12 1375212 1I CCAAAAAAAA -/G TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 G 0 1 181839 CASAVA_Build 12 1411610 2D AACTGTGTAC TT/-- CCTGCCAAAA 3070 het 3070 ref 47 29 12 7 T 2 0 181840 CASAVA_Build 12 1453057 2D ACTCTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1030 het 982 hom 29 13 5 11 A 20 18 181841 CASAVA_Build 12 1465166 2D CTTCTGTCTC TA/-- TACAGACATT 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 TA 2 1 181842 CASAVA_Build 12 1467237 6I GAAAAGAAAC ------/AAGAGA GAGAGAGAGA 3070 het 2239 hom 20 6 11 5 AAGAGA 0 1 181843 CASAVA_Build 12 1471023 1I TCATGAGTTT -/G GGGGGTCTCA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 G 5 6 181844 CASAVA_Build 12 1473072 1I TTTACAATCT -/A AAAGATCTAC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 3 4 181845 CASAVA_Build 12 1478810 1I AGAGGAAAGA -/G GAAAATAACA 3070 hom 111 het 46 0 35 11 G 1 2 181846 CASAVA_Build 12 1485979 2I CAGGCAAATT --/CA CAGAGACGCA 3070 het 3070 hom 47 16 19 12 CA 1 2 181847 CASAVA_Build 12 1490007 8I GTCTAAAGCA --------/AGGTCATC AGGTCATCCA 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 AGGTCATC 1 2 181848 CASAVA_Build 12 1491529 1D AAAGATAAAT A/- AAGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 A 3 2 181849 CASAVA_Build 12 1497706 6D TGCATTGTGC TGGAGA/------ TGTTCCCTCC 3070 het 3070 ref 43 24 15 10 TGGAGA 1 0 181850 CASAVA_Build 12 1504182 3D TTTAAGAGAT GGG/--- GGGGGGGGGT 2595 het 201 hom 18 3 7 11 G 12 9 181851 CASAVA_Build 12 1518080 12I TTCGGTTTTT ------------/TCTGCCTGTGTG TCTGCCTGTG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 TCTGCCTGTGTG 1 2 181852 CASAVA_Build 12 1520563 1D TGTTTCACTG C/- CTTGGCACTG 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 C 2 1 181853 CASAVA_Build 12 1536811 2I GGCTGGGAAG --/TT TTCAAAAGAC 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 2 4 181854 CASAVA_Build 12 1537148 12D GCCTTAAGAG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2404 het 1631 hom 18 5 8 8 T 24 12 181855 CASAVA_Build 12 1541756 12D TCAAAAAAAT ATAAATAAATAA/------------ ATAAATAAAT 1660 het 262 hom 16 2 6 9 ATAA 8 5 181856 CASAVA_Build 12 1544347 2D GCTGGGTGAC AA/-- GAGTCAAATT 2033 het 2033 ref 23 14 5 4 A 2 0 181857 CASAVA_Build 12 1544395 4I ATACAAATAA ----/AAAC AAACAAACAA 3028 het 3028 ref 30 17 7 6 AAAC 2 3 181858 CASAVA_Build 12 1545389 1I GAGAGAGAGA -/G GAGAACAAGA 1015 het 1015 ref 44 27 3 14 G 1 2 181859 CASAVA_Build 12 1550630 2D GGGTTTTTTT TG/-- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 TG 1 0 181860 CASAVA_Build 12 1552057 1D GTCGGGGAAG C/- GGGGGGGCAG 3070 hom 60 het 24 0 19 5 C 1 0 181861 CASAVA_Build 12 1552223 9D CTGGGACCTG GGTCAAAAT/--------- GGTCAAAATG 3008 het 3008 ref 27 15 8 6 GGTCAAAAT 2 1 181862 CASAVA_Build 12 1552280 1D TGGCGGTGGA G/- GGGGGATGGA 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 G 6 5 181863 CASAVA_Build 12 1554330 1I AGTTAGGAGC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 7 8 181864 CASAVA_Build 12 1556855 2D ATAAGGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 21 2 8 11 A 12 10 181865 CASAVA_Build 12 1581631 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 48 het 20 0 15 5 A 6 7 181866 CASAVA_Build 12 1584537 2I GAGTGTGTGT --/GA GAGAGTGAGT 3070 hom 68 het 34 0 17 17 GA 2 3 181867 CASAVA_Build 12 1591298 1D GAGGGAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 36 1 21 14 T 13 12 181868 CASAVA_Build 12 1594417 4D TGGCTTTGGT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 94 het 43 0 30 13 TC 9 7 181869 CASAVA_Build 12 1596740 2I AATATATAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 AT 5 6 181870 CASAVA_Build 12 1602751 1D GCCTCCCGAG T/- AGCTGGGACT 1239 het 393 hom 10 1 4 5 T 1 0 181871 CASAVA_Build 12 1603441 2D GCTTTTTGTG AT/-- ATCTCCTGCA 3070 het 3070 hom 45 17 21 8 AT 2 1 181872 CASAVA_Build 12 1616830 2I TAATGTGAAT --/AC AGGCAATAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 AC 0 1 181873 CASAVA_Build 12 1622565 1D TTGCCAGAAG T/- TTCTCTTGGC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 3 2 181874 CASAVA_Build 12 1623197 4D AAAAGGAGCC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 27 het 15 0 10 6 TA 9 7 181875 CASAVA_Build 12 1632016 1D AGGTTGAGGC A/- AGGAGAATCG 3070 het 2915 hom 21 8 10 3 A 2 1 181876 CASAVA_Build 12 1632630 10I CAAGGTGAAA ----------/CCCTATCTCT CCCTATCTCT 1297 het 1297 ref 9 6 3 0 CCCTATCTCT 1 2 181877 CASAVA_Build 12 1637068 1D TGACCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 34 1 26 7 T 15 14 181878 CASAVA_Build 12 1646944 1I CCCAAGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 17 7 A 10 11 181879 CASAVA_Build 12 1649129 1D GGCTTTTTCG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 8 181880 CASAVA_Build 12 1650484 1I AACAAGTCTT -/G ACCAAAGCAG 3070 hom 147 het 56 0 48 8 G 0 1 181881 CASAVA_Build 12 1667214 1D CCCTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 8 T 12 11 181882 CASAVA_Build 12 1672157 1I GCTGGTGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2083 hom 21 6 8 7 T 11 12 181883 CASAVA_Build 12 1672718 10I CTGTAACACC ----------/CACATGGCTG TTATATTTAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 CACATGGCTG 0 1 181884 CASAVA_Build 12 1674458 3D TTTTTTTGTT TTG/--- TTTTTTTAAG 3070 het 983 hom 26 5 13 8 TTG 1 0 181885 CASAVA_Build 12 1678296 1D ATTACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 31 0 28 4 A 11 10 181886 CASAVA_Build 12 1681569 1I GAACAAACAG -/A AAAAAACCCC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 6 7 181887 CASAVA_Build 12 1685628 1I ATCCAGAAAG -/T TTTACCCTCA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 3 4 181888 CASAVA_Build 12 1686840 1D TAATTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 27 10 T 12 11 181889 CASAVA_Build 12 1687465 1I AAATGTTTGG -/T TAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 T 1 2 181890 CASAVA_Build 12 1691041 10D TTGTCTCTTC CTCTCTCTCT/---------- CTCTCTCTCT 3070 het 322 hom 25 4 11 11 CT 14 9 181891 CASAVA_Build 12 1704553 1D GCAAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 485 hom 29 6 8 15 T 15 14 181892 CASAVA_Build 12 1706096 1I TTTGTACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 T 10 11 181893 CASAVA_Build 12 1710314 5D ATGTAAAAGT TTAAG/----- TTATCAGCTC 3070 het 3070 ref 35 20 13 4 TTAAG 1 0 181894 CASAVA_Build 12 1711428 1D AAGTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 21 1 16 5 A 13 12 181895 CASAVA_Build 12 1716773 1I TTTGTTGTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 47 21 19 7 T 8 9 181896 CASAVA_Build 12 1721433 1D CTGAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2829 hom 29 10 14 5 A 13 12 181897 CASAVA_Build 12 1723526 1I TTGAAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 2066 het 2066 ref 23 11 7 5 T 10 11 181898 CASAVA_Build 12 1738523 1I TTTATATTGA -/G CCTAGAGGTT 3070 hom 93 het 40 0 31 9 G 0 1 181899 CASAVA_Build 12 1755289 2I TGATCCCCTT --/TC TCTCTTTCTC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TC 2 3 181900 CASAVA_Build 12 1756645 4D GTCTGTTATA TAGG/---- TAGGATGAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TAGG 2 1 181901 CASAVA_Build 12 1758370 1D GGCATTTAGG A/- AAACGCAAAT 3070 het 3070 ref 45 21 18 8 A 4 3 181902 CASAVA_Build 12 1762827 1D GGCTCATTGC T/- TTTTTTTTTT 1252 het 1252 ref 27 16 3 9 T 17 16 181903 CASAVA_Build 12 1765038 32D TTGTGGCCTG TTAGCAAGAGAGTCTGTGTGTCATTTGCCACT/-------------------------------- TTAGCAAGAG 3070 het 3070 ref 48 23 8 21 TTAGCAAGAGAGTCTGTGTGTCATTTGCCACT 2 1 181904 CASAVA_Build 12 1805268 1I GCAATCCAGT -/C CCCGGACTTA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 3 4 181905 CASAVA_Build 12 1806134 1I TGCCCTTGCC -/G GGGGGCAGAG 1015 het 1015 ref 17 8 3 6 G 5 6 181906 CASAVA_Build 12 1806703 1D GGGAGACACT G/- GGGGGGGCAG 2666 het 2316 hom 21 10 8 3 G 8 7 181907 CASAVA_Build 12 1806855 2D GCATGAACCC CT/-- GAGCTGATGA 2469 het 2469 ref 24 8 9 7 CT 1 0 181908 CASAVA_Build 12 1820273 1I AACCCAGTCA -/C TGGGGAAGAG 3070 het 3070 hom 42 14 16 12 C 0 1 181909 CASAVA_Build 12 1827297 1I AATAACATTT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 7 8 181910 CASAVA_Build 12 1844980 1I AGCCACTCTT -/A AGAGTCGTAG 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 A 1 2 181911 CASAVA_Build 12 1847176 1I ACTCAACAGC -/A AAAAAAACCA 3070 het 118 hom 47 1 40 6 A 7 8 181912 CASAVA_Build 12 1857704 1D CAAATCCCAT A/- CAGTAAGGAT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 A 1 0 181913 CASAVA_Build 12 1871529 14I AATTCAAAAA --------------/GGTCTTCTTCACAG TACATTGTAG 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 GGTCTTCTTCACAG 0 1 181914 CASAVA_Build 12 1874056 4I AAAGAATGAA ----/AGAC AATAACCATA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 AGAC 0 1 181915 CASAVA_Build 12 1876507 1I CTTGTAATCC -/A AGCACTTTGG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 1 2 181916 CASAVA_Build 12 1878006 1D AAAAAAAACT A/- AACAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 22 14 2 A 3 2 181917 CASAVA_Build 12 1883843 1I GAGGCAATGG -/A TATCCCATTT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 0 1 181918 CASAVA_Build 12 1886812 5I AGTGCCCCTA -----/TTGTC TTATTTCCAG 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 TTGTC 0 1 181919 CASAVA_Build 12 1889891 1I TGTTGATAGC -/G GGGGAAGGCT 3070 het 3070 ref 48 22 22 4 G 4 5 181920 CASAVA_Build 12 1892015 1D GGAGAGGGGA G/- GGGGGAGCTT 2734 het 2734 ref 31 15 9 8 G 6 5 181921 CASAVA_Build 12 1898867 3D TTCACAGTGA CTT/--- CTTTGTACAG 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 CTT 2 1 181922 CASAVA_Build 12 1899790 7D TGGCCCAATA TTTATTG/------- TGGCATAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 8 TTTATTG 1 0 181923 CASAVA_Build 12 1900663 1I AGGAGGGGGT -/G ACAGCTGGGC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 0 1 181924 CASAVA_Build 12 1903653 1I CTGGCTAATA -/T TTTTTTTTTT 2217 het 413 hom 10 1 8 1 T 12 13 181925 CASAVA_Build 12 1911078 1D ATCCTGTCCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 10 9 181926 CASAVA_Build 12 1912150 1I TGGGTGCTGT -/G GGGGCCAAAC 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 G 4 5 181927 CASAVA_Build 12 1912315 4D TATTGTGTTA ATGT/---- ATGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 83 39 32 15 ATGT 2 1 181928 CASAVA_Build 12 1912418 2I GTATGTGTAC --/GT GTGTGAATGT 3070 hom 71 het 77 0 23 54 GT 2 3 181929 CASAVA_Build 12 1914819 1D CATTTGCACG T/- TAAGTGATGG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 2 1 181930 CASAVA_Build 12 1937424 1D GGGAAAAGCT C/- CCCAACGTCG 2125 het 2125 ref 34 18 5 13 C 4 3 181931 CASAVA_Build 12 1942065 1D GTCATCATAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 8 7 181932 CASAVA_Build 12 1949839 1I GCCAAAGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 A 9 10 181933 CASAVA_Build 12 1955524 4D TCTTTAGATG GATA/---- GTTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 43 27 14 4 GATA 1 0 181934 CASAVA_Build 12 1960368 2D GTTGAAGGAG AC/-- ATCCATAACA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 AC 1 0 181935 CASAVA_Build 12 1961970 3I TACTATATAT ---/ATC ATAATTTTAT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 ATC 0 1 181936 CASAVA_Build 12 1966431 1I GAATAGAAGT -/G GGGGATAGAA 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 G 4 5 181937 CASAVA_Build 12 1970412 2D TAGAAAGGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 14 15 A 14 12 181938 CASAVA_Build 12 1971543 1D TACAATTGAT A/- AAGTGTACCT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 A 3 2 181939 CASAVA_Build 12 1973450 2I AAACCACTAT --/AA AAGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 2 4 181940 CASAVA_Build 12 1984574 1D GTTACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1744 hom 28 8 13 7 A 13 12 181941 CASAVA_Build 12 1985039 1D GTACTTAATG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 9 8 181942 CASAVA_Build 12 1993702 1D AATAGGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 12 11 181943 CASAVA_Build 12 1998368 1D AGGTTTTAAT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 37 18 11 9 A 8 7 181944 CASAVA_Build 12 2003506 1D TTGACAGATG T/- TGAGCTTGGG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 2 1 181945 CASAVA_Build 12 2008219 1I GATTGTAAAA -/T GGCTGTGATG 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 T 0 1 181946 CASAVA_Build 12 2009816 1I CCCAACATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 36 1 27 8 T 11 12 181947 CASAVA_Build 12 2011421 2D TGAGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 112 het 49 0 37 12 TG 10 9 181948 CASAVA_Build 12 2034094 1D CCAGCGGGGC T/- TTCTGGCAAC 2346 het 2346 ref 33 20 8 5 T 3 2 181949 CASAVA_Build 12 2040967 9D GGAGCCATGT GCACTGCTG/--------- GCACTGCTGC 3070 hom 97 het 39 0 28 12 GCACTGCTG 2 1 181950 CASAVA_Build 12 2041081 4I CTGCCACCAC ----/ACAT ACATGGCTGC 2198 het 2198 ref 32 15 12 5 ACAT 1 2 181951 CASAVA_Build 12 2044950 1I ATCTTCAAGG -/T TACAGCCCTC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 2 181952 CASAVA_Build 12 2053581 9D TATGTGTTAG GATAATGTA/--------- GATAATGTAG 3070 hom 78 het 33 0 27 7 GATAATGTA 2 1 181953 CASAVA_Build 12 2056845 3D AGGAAGATGA AGT/--- AGTAGTATTG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 AGT 3 2 181954 CASAVA_Build 12 2060789 1D TGAGGTCAGG A/- GATCTAGACC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 1 0 181955 CASAVA_Build 12 2069301 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 2195 hom 15 het 7 0 6 1 A 6 7 181956 CASAVA_Build 12 2091870 1I CCGTGAGCCT -/A GATGTTCTGT 3070 het 3070 ref 58 28 24 6 A 0 1 181957 CASAVA_Build 12 2104707 2I TTGGCCTGAC --/TG TGAGAAGAGC 3070 hom 111 het 50 0 37 13 TG 1 2 181958 CASAVA_Build 12 2133448 1D AAAATTCAAG A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 A 7 6 181959 CASAVA_Build 12 2241172 6D TCCTTGTGCA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 ref 55 26 24 6 AC 8 5 181960 CASAVA_Build 12 2245624 2I GCAGCCTCAC --/TT TTTTTCCCTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 5 7 181961 CASAVA_Build 12 2255289 1I GCGAGCCCTC -/A AAAAAACATG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 6 7 181962 CASAVA_Build 12 2255506 1D TTTTTTAATG A/- TTTTTTTTTC 3070 het 2041 hom 29 5 16 8 A 1 0 181963 CASAVA_Build 12 2267402 2D TGATCATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 9 T 15 13 181964 CASAVA_Build 12 2272361 2D GCGTCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 T 13 11 181965 CASAVA_Build 12 2273338 1D TAATTTATCA T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 T 7 6 181966 CASAVA_Build 12 2287111 1D CTGCGCTGCT G/- AACCTGGAGC 3070 het 3070 hom 48 19 20 9 G 1 0 181967 CASAVA_Build 12 2312628 1D CTCATTTAAT C/- CCCCTAGTGG 3070 het 3070 hom 47 17 22 8 C 5 4 181968 CASAVA_Build 12 2314174 4D AAATTAAGAG AATA/---- AATAAACTGT 3070 het 3070 ref 45 24 19 3 AATA 2 1 181969 CASAVA_Build 12 2314866 2D CATATTAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 A 12 10 181970 CASAVA_Build 12 2319386 1I ATATTTTTTT -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 6 7 181971 CASAVA_Build 12 2320228 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2323 het 403 hom 7 2 5 0 A 7 6 181972 CASAVA_Build 12 2320925 1I GAGGCAGTGC -/T TGTGCGGGCC 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 1 2 181973 CASAVA_Build 12 2329847 2D TAACTTGCCC AA/-- GCACACACAA 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 A 2 0 181974 CASAVA_Build 12 2343159 6D ATCTCTTACA GCCTCT/------ GGAGTCTTGA 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 GCCTCT 1 0 181975 CASAVA_Build 12 2347609 2I ATGATAAAGA --/AT ATGTATCTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AT 1 2 181976 CASAVA_Build 12 2351123 4D GGCACACAGG AAGC/---- AAGCACATAC 1220 het 1220 ref 26 12 4 10 AAGC 2 1 181977 CASAVA_Build 12 2370981 4I GCTGGATGAG ----/CAGT CAGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 45 17 17 11 CAGT 1 2 181978 CASAVA_Build 12 2371040 3I GAGAGGAGGA ---/AAC AACAAGGTGT 3070 hom 105 het 46 0 32 14 AAC 1 2 181979 CASAVA_Build 12 2392636 1I CTAAAGACGT -/G GTTTCACCAT 3070 hom 93 het 32 0 29 3 G 1 2 181980 CASAVA_Build 12 2393496 7D GTAAGACTGG CCCAAGT/------- CCTATCCCGT 3070 het 3070 ref 42 22 12 10 CCCAAGT 1 0 181981 CASAVA_Build 12 2393556 2I AGTGGCGTAA --/TC TCTCTGAGTT 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 TC 2 3 181982 CASAVA_Build 12 2406961 1I CGACCCACAC -/A ATCAAGGAGG 3070 hom 33 het 13 0 10 3 A 1 2 181983 CASAVA_Build 12 2407576 3I CTGTTCAAAA ---/CTG CTTACAGAAG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 CTG 0 1 181984 CASAVA_Build 12 2413102 4D TACAGACAGC CCTT/---- CCTTCTTGGG 3070 het 3070 ref 56 27 23 8 CCTT 2 1 181985 CASAVA_Build 12 2417482 3D GTGGTAATGA TGG/--- TGGTGATGAT 3070 het 3070 ref 66 23 22 26 TGG 2 1 181986 CASAVA_Build 12 2417822 3D CATGGTAGTC ATG/--- GTGGTGGTGG 2127 het 2127 ref 54 19 7 29 ATG 1 0 181987 CASAVA_Build 12 2442529 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 3 4 181988 CASAVA_Build 12 2452028 2I GCACTCTCTC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 TA 6 7 181989 CASAVA_Build 12 2453470 1I TATTTGCCAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 8 9 181990 CASAVA_Build 12 2455186 1D TTATGAAATG T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 T 7 6 181991 CASAVA_Build 12 2505073 1I AACTCAGCCT -/C ATTAAATCCT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 C 0 1 181992 CASAVA_Build 12 2509641 3D AGGGAATTGT TGA/--- TGACCAAAAA 3070 het 3070 hom 53 18 29 6 TGA 2 1 181993 CASAVA_Build 12 2514964 1I CATCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 2390 het 2390 ref 17 7 6 4 A 12 13 181994 CASAVA_Build 12 2527537 1D GGAGATAGAT G/- GGTTGGAAGA 3070 het 3012 hom 29 12 16 1 G 3 2 181995 CASAVA_Build 12 2528522 1I TTTCAAGCCA -/C CCAAACTGGG 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 C 2 3 181996 CASAVA_Build 12 2529306 1D GCAAACTACT G/- CTCTTCTGTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 G 1 0 181997 CASAVA_Build 12 2531751 1D GGCAACTATA G/- GATTGGGGTA 3070 het 3070 ref 38 23 10 5 G 2 1 181998 CASAVA_Build 12 2532438 1I AAGAGGAGAA -/T GGGCGACAGC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 181999 CASAVA_Build 12 2546429 1D GAGAAGAGAA T/- AGGGCCTGAG 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 T 1 0 182000 CASAVA_Build 12 2547724 1D TGCTGCTGTC A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 A 8 7 182001 CASAVA_Build 12 2556179 2I TATTTAAGTG --/GT GTTTCACGTC 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 GT 1 2 182002 CASAVA_Build 12 2595028 1I GGGAGCCACA -/C CGTAAATCCT 3070 hom 116 het 44 0 33 11 C 1 2 182003 CASAVA_Build 12 2599685 1D TATGCACCCT A/- ATACTGCTCT 3070 hom 102 het 42 0 35 8 A 2 1 182004 CASAVA_Build 12 2608171 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 9 10 182005 CASAVA_Build 12 2608734 1I TCATCCCATC -/T CCTTTTCCCA 3070 hom 81 het 29 0 26 3 T 0 1 182006 CASAVA_Build 12 2626196 6D AGAGAGAGAA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 3070 het 626 hom 33 5 21 7 AG 11 8 182007 CASAVA_Build 12 2629113 4D TTTGGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 het 3070 hom 42 19 17 7 TTTG 2 1 182008 CASAVA_Build 12 2631227 1D CGGCCCGGGG A/- ATCGCAGGGC 1482 het 1482 ref 24 12 5 8 A 2 1 182009 CASAVA_Build 12 2638054 1D CTTCTACTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 9 8 182010 CASAVA_Build 12 2638273 1I AGCTTTTAAC -/A AAAAAGCTAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 5 6 182011 CASAVA_Build 12 2645622 2D TCTAAAAAAG AA/-- AAAGAAAATA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 5 3 182012 CASAVA_Build 12 2647556 4I TCCTTTCTCT ----/TCTC TCTCTGGGCT 3070 het 3070 hom 37 20 14 3 TC 2 4 182013 CASAVA_Build 12 2648766 1I TGATGAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 10 11 182014 CASAVA_Build 12 2671731 1I GTTGGGTTCC -/T TTTTTATGCT 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 T 5 6 182015 CASAVA_Build 12 2675093 1D CCCAGCCCCA G/- CTCCCTGTCC 1945 het 1945 ref 20 9 6 5 G 1 0 182016 CASAVA_Build 12 2678780 4D GTCACAAGGC AAAG/---- AAAGAAACAG 3070 hom 87 het 31 0 30 3 AAAG 2 1 182017 CASAVA_Build 12 2687352 1D TCTTACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 11 10 182018 CASAVA_Build 12 2689813 6I GAGTTGCATG ------/GGGGGA GGGTGGGGGA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 GGGGGA 0 1 182019 CASAVA_Build 12 2692339 5D TGCAGGCCAA CTAAG/----- CTAAGACATT 3070 hom 150 het 55 0 50 7 CTAAG 2 1 182020 CASAVA_Build 12 2694266 2D GTGTGTGTGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 39 20 9 10 GA 8 7 182021 CASAVA_Build 12 2694332 1I TAATCCCCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1643 hom 27 8 15 4 T 9 10 182022 CASAVA_Build 12 2700989 6D TGTTATCTTA TGTTAG/------ TCAAAAGGTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 7 TGTTAG 1 0 182023 CASAVA_Build 12 2705076 21I AAGTCACAGT ---------------------/TCTCAGTACGGTGAACCCCAG TGGGTTGCTT 3070 hom 101 het 39 0 32 7 TCTCAGTACGGTGAACCCCAG 0 1 182024 CASAVA_Build 12 2722836 3I GAGAGGACTG ---/GGA GGAGAATGGA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 GGA 1 2 182025 CASAVA_Build 12 2730455 2I CAACCAAAAC --/AA AACAAAAATG 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 A 2 4 182026 CASAVA_Build 12 2738943 1I GACTTTGGTG -/C TTGTGCCTCG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 C 0 1 182027 CASAVA_Build 12 2741274 1D AAACCTAGAT C/- CATTAGAAGG 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 C 2 1 182028 CASAVA_Build 12 2756785 1D TCCAAGAATC A/- CCGGATAAAC 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 A 1 0 182029 CASAVA_Build 12 2771365 12D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 het 1899 hom 17 7 11 2 A 22 10 182030 CASAVA_Build 12 2820278 1I GAAAAAAGAG -/A AAAAAAGCAG 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 A 6 7 182031 CASAVA_Build 12 2855155 1I CAGTGTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 31 1 23 7 T 10 11 182032 CASAVA_Build 12 2874243 20D ATTGTTTGAA CCTGGGAGGCGGAGGTTGCG/-------------------- GTGAGCCGAG 3070 hom 42 het 14 0 15 0 CCTGGGAGGCGGAGGTTGCG 1 0 182033 CASAVA_Build 12 2884512 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2786 hom 21 het 11 0 8 3 A 10 12 182034 CASAVA_Build 12 2917227 1D AGATTAATAC A/- AAAAAAAAAA 408 het 408 ref 30 17 2 11 A 15 14 182035 CASAVA_Build 12 2932608 4I CAGCTGTCAG ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 TTGT 2 3 182036 CASAVA_Build 12 2946648 2D TATAATTCGG GT/-- GGGCTGGTAT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 GT 1 0 182037 CASAVA_Build 12 2948425 1D TTAGAACCTG C/- CCAGCATCTG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 C 3 2 182038 CASAVA_Build 12 2955436 3D TCATAGCTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 33 1 21 11 T 15 12 182039 CASAVA_Build 12 2956513 7I AGGCTCTGTG -------/CTCCTGT CTCATGGACA 3070 hom 105 het 40 0 34 6 CTCCTGT 0 1 182040 CASAVA_Build 12 2957804 2D TAAGTGCCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 29 1 23 5 T 12 10 182041 CASAVA_Build 12 2999812 1D CTTGCTCGGC G/- GTTCCATGCA 3070 hom 48 het 20 0 16 5 G 2 1 182042 CASAVA_Build 12 3004341 3I TCTCCTGGCT ---/GCC GCCTCTGTTC 3070 hom 33 het 20 0 12 8 GCC 1 2 182043 CASAVA_Build 12 3005364 1I ATTATGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 45 1 33 11 T 10 11 182044 CASAVA_Build 12 3012160 11D GCCTGGGCAG GTGAAATCAGA/----------- GATGAGGGAG 3070 hom 57 het 19 0 18 3 GTGAAATCAGA 1 0 182045 CASAVA_Build 12 3014541 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 7 8 182046 CASAVA_Build 12 3025380 1I CAACCTTCAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 59 het 26 0 20 6 T 8 9 182047 CASAVA_Build 12 3026803 2I CTAAAAATAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 26 het 13 0 10 3 A 9 11 182048 CASAVA_Build 12 3030617 23D CACACTCTGG CCTCCCTCCCTCCTTCCCTCCTT/----------------------- CCTCCCTCCA 728 hom 15 het 11 0 5 8 CCTCCCTCCCTCCTTCCCTCCTT 1 0 182049 CASAVA_Build 12 3030727 18D CCTTCCTTCC TTCTTTCTTTCTTTTTCT/------------------ TTCTTTCTTT 3070 hom 38 het 18 0 12 7 TTCTTTCTTTCTTTTTCT 1 0 182050 CASAVA_Build 12 3034418 1D TTCGGTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 10 9 182051 CASAVA_Build 12 3034467 6I GGCTAGTAAA ------/ATACTT ATATTTCTAT 3070 hom 27 het 19 0 9 10 ATACTT 0 1 182052 CASAVA_Build 12 3037304 1I TACCTCAACT -/A AAAAGCAGAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 4 5 182053 CASAVA_Build 12 3038123 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 14 1 12 1 A 12 11 182054 CASAVA_Build 12 3050300 1I TCTTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 7 14 7 A 13 14 182055 CASAVA_Build 12 3055013 4D CTAGTATATC TCTT/---- TCCCTGTCTG 3070 hom 102 het 35 0 32 3 TCTT 1 0 182056 CASAVA_Build 12 3056074 5I GAAAAAACAA -----/AAAAC AACAAAACAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AAAAC 0 1 182057 CASAVA_Build 12 3065757 1D CAAATGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 485 hom 36 2 23 11 T 15 14 182058 CASAVA_Build 12 3069653 1D TTCCGTAGTT G/- GCGCAGACTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 5 G 2 1 182059 CASAVA_Build 12 3073454 4D CATGATTGAC TAAT/---- TATTATTTAT 3070 het 3070 hom 26 9 15 3 TAAT 1 0 182060 CASAVA_Build 12 3073966 6D GTTGTTGTTG TTTTTT/------ TTTTTTTTTG 3070 het 2062 hom 27 10 12 9 T 15 9 182061 CASAVA_Build 12 3078633 3I AGGTTGCTGA ---/TGT TGTTATTTTT 3070 het 3070 hom 52 18 26 8 TGT 1 2 182062 CASAVA_Build 12 3085196 6D CACACACGCG CACGCA/------ CACACGCTCA 3070 het 569 hom 40 6 18 20 CACGCA 1 0 182063 CASAVA_Build 12 3112816 1I TATTATATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 9 10 182064 CASAVA_Build 12 3118060 1D TCCGCCATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 13 12 182065 CASAVA_Build 12 3119584 1I GACCTGGGCT -/G ATCTGTAAGG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 G 0 1 182066 CASAVA_Build 12 3129099 5D TGATCTCAAC ACAGG/----- ACAGGATGGG 3070 het 3070 hom 41 16 21 8 ACAGG 2 1 182067 CASAVA_Build 12 3142059 3I GAAAAAAAAA ---/AAG AAGTAATTTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AAG 1 2 182068 CASAVA_Build 12 3155049 1I GGAGGCCTCT -/A AAGTGAGCAG 2846 het 2846 ref 27 8 8 11 A 2 3 182069 CASAVA_Build 12 3159910 1D TATCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1382 hom 27 3 17 7 A 12 11 182070 CASAVA_Build 12 3159977 1D CAGCCTGCAG T/- TTGAAAAGCA 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 T 3 2 182071 CASAVA_Build 12 3164120 1I CCCGGGCATG -/T TGTGACCCGT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 1 2 182072 CASAVA_Build 12 3185154 1I GGCCCCCCCC -/G CCCCAGAGTG 3070 hom 69 het 26 0 20 6 G 0 1 182073 CASAVA_Build 12 3187231 1I CGGCCAAGGA -/G GGAGAGGGAC 1458 het 1458 ref 26 12 5 9 G 2 3 182074 CASAVA_Build 12 3190560 3D AGTGACTGAA GAT/--- GAGTTCCTGG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 GAT 1 0 182075 CASAVA_Build 12 3191944 3I CCTTAAGCAA ---/TCC TCCTGCCTTG 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 TCC 1 2 182076 CASAVA_Build 12 3192866 1I GGAGCTCTTT -/G ATGTCTGAGC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 0 1 182077 CASAVA_Build 12 3203507 1I TCATCCTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 43 0 33 10 A 11 12 182078 CASAVA_Build 12 3209182 15D ACCTGCCAGG CACAGCTGGGGCTGA/--------------- CACAGCTGGG 3070 hom 75 het 34 0 21 20 CACAGCTGGGGCTGA 2 1 182079 CASAVA_Build 12 3217029 3D CTTAGCCCAC TCT/--- TCTTTCTCTG 3070 hom 75 het 31 0 24 8 TCT 2 1 182080 CASAVA_Build 12 3219452 1I TATTACTCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 9 10 182081 CASAVA_Build 12 3225565 1I GGAAGATGAA -/G GGGGAACAGG 3070 hom 53 het 21 0 15 6 G 4 5 182082 CASAVA_Build 12 3228047 8D CAGTGAGCCT GGGAGGTG/-------- GAATAGATCA 3070 hom 117 het 46 0 39 9 GGGAGGTG 1 0 182083 CASAVA_Build 12 3279132 1I TCCATGCTAA -/G GGGGGAGGCC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 G 5 6 182084 CASAVA_Build 12 3279645 3D ACGTGGGACA TTT/--- TTTTTTTAAC 3070 hom 78 het 27 0 25 3 T 10 7 182085 CASAVA_Build 12 3302396 3D GGGGAAAAAA GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 hom 42 het 19 0 15 5 GAG 7 6 182086 CASAVA_Build 12 3307315 1I GGGGTTGGGT -/G GGGGGAGCCC 3070 het 2188 hom 29 10 13 6 G 5 6 182087 CASAVA_Build 12 3309634 1I AAGCATGGAG -/T CTAGAACTCA 3070 het 3070 ref 53 29 17 7 T 0 1 182088 CASAVA_Build 12 3322902 1I CCTACTGCAT -/C CCCCCCGCTC 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 C 6 7 182089 CASAVA_Build 12 3325227 1I ACTTCATTTC -/G GGTTTTAATG 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 G 2 3 182090 CASAVA_Build 12 3331190 2D CTTGGTGGTC AG/-- AGTCTTCTCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 AG 2 1 182091 CASAVA_Build 12 3339931 1D AAATTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 1283 het 1283 ref 39 29 3 8 A 11 10 182092 CASAVA_Build 12 3347591 2D AGGGAAGAAC AG/-- AGGTGGGAAC 3070 hom 96 het 34 0 30 6 AG 2 1 182093 CASAVA_Build 12 3354700 1D TGTTTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 31 4 21 6 T 12 11 182094 CASAVA_Build 12 3358211 1I AAACCCCTCT -/C CCTGGCCCAC 3070 hom 97 het 46 0 31 15 C 2 3 182095 CASAVA_Build 12 3363681 1D CCTCTATTCC T/- TTTTTTTTTT 1482 het 1482 ref 37 23 6 9 T 13 12 182096 CASAVA_Build 12 3365011 4I ATCAACACTT ----/TAAC TATTAGGCTA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 TAAC 0 1 182097 CASAVA_Build 12 3368067 2I AGAAACTGAG --/TC TTAGAGAGAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TC 0 1 182098 CASAVA_Build 12 3414176 2I AAGCCCCATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 32 0 24 8 T 12 14 182099 CASAVA_Build 12 3420667 1I TATTAAGAAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 8 9 182100 CASAVA_Build 12 3427107 2D ATCTCAGTTG TC/-- TCTCTCTCCT 3070 het 3070 hom 44 20 19 6 TC 5 4 182101 CASAVA_Build 12 3459281 1D TACTCTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 39 1 34 4 T 11 10 182102 CASAVA_Build 12 3460079 1I AGTGCTTCCT -/C CCCCCCACCG 3070 hom 85 het 34 0 28 6 C 6 7 182103 CASAVA_Build 12 3466783 1I ATGGTCCGCA -/G GTTAAAATGC 3070 hom 102 het 39 0 30 9 G 1 2 182104 CASAVA_Build 12 3476342 1D AGATACCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 709 hom 33 3 13 17 T 19 18 182105 CASAVA_Build 12 3497469 1D CCTTAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 32 0 22 10 A 12 11 182106 CASAVA_Build 12 3497825 2I TTAGGAATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 19 0 16 3 T 12 14 182107 CASAVA_Build 12 3501359 1D GAGCGACTTT A/- ACCTCAAGAG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 2 1 182108 CASAVA_Build 12 3502435 1D AGCCTGATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 9 182109 CASAVA_Build 12 3521449 1I CTAACCATCA -/T TGCCATACAG 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 T 1 2 182110 CASAVA_Build 12 3528925 1D TTTTCTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 41 0 31 10 T 13 12 182111 CASAVA_Build 12 3543356 1I TAACCCAATG -/C CCCCCCACCT 2956 het 2956 ref 35 14 10 11 C 6 7 182112 CASAVA_Build 12 3547775 1D TGGTGTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 40 1 22 17 A 12 11 182113 CASAVA_Build 12 3557106 1D TTTTGTGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 10 9 182114 CASAVA_Build 12 3589768 2D TTGTTGGTAA CT/-- CTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 CT 2 1 182115 CASAVA_Build 12 3590648 1I ATTGCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 2841 hom 23 7 14 2 A 8 9 182116 CASAVA_Build 12 3599029 1D GTGTCTCCTA G/- TCCCTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 G 1 0 182117 CASAVA_Build 12 3616322 1I AGCCACTGGG -/A AAAAGTTCAA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 4 5 182118 CASAVA_Build 12 3622580 4I TCAAACAAAC ----/ATGT ATGTGTAGGC 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 ATGT 1 2 182119 CASAVA_Build 12 3632500 1D ACCTCTGCCT C/- CCAGGTTCAA 2677 het 1474 hom 15 4 8 3 C 3 2 182120 CASAVA_Build 12 3648953 1D AAATTTCTTC A/- ACCTCTGTGC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 2 1 182121 CASAVA_Build 12 3655960 1I CAGAGCCCTC -/A ACGAATGGCA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 1 2 182122 CASAVA_Build 12 3656177 1I TCTATGGCAG -/T GTATTACAGC 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 0 1 182123 CASAVA_Build 12 3656868 1I GTTCTGCACT -/G GCCTTACTAT 3070 hom 78 het 30 0 23 7 G 1 2 182124 CASAVA_Build 12 3659813 1I TAACACTGAC -/A ACTCACTGGT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 1 2 182125 CASAVA_Build 12 3662222 1D TTATTATTAC T/- TTTTTTTTTT 1782 het 1652 hom 18 5 6 7 T 13 12 182126 CASAVA_Build 12 3669207 1I CCAGCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 14 12 T 11 12 182127 CASAVA_Build 12 3670677 1D ACTGGTCTGC G/- TACTTAAGTG 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 G 1 0 182128 CASAVA_Build 12 3681935 1D CTATACTAAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 9 8 182129 CASAVA_Build 12 3691651 1I AAGTTGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 T 11 12 182130 CASAVA_Build 12 3714511 1I TATAAAAAAA -/T ATTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 0 1 182131 CASAVA_Build 12 3716660 2I GGGAAGCCTG --/TT TTAAGGAGGG 3070 het 3070 hom 57 21 28 8 T 2 4 182132 CASAVA_Build 12 3718463 1D ATTATCTGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 607 hom 29 4 11 15 A 10 9 182133 CASAVA_Build 12 3719783 2D GGAAACAGAT AA/-- AGTCAGAGTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 3 1 182134 CASAVA_Build 12 3733685 2D GGCTTGACCT TC/-- TCTCAGCCTT 3070 het 3070 hom 48 17 23 11 TC 3 2 182135 CASAVA_Build 12 3733748 1I GTGGAAGGGG -/C CCTCAGAGAT 3070 het 1289 hom 29 5 16 8 C 2 3 182136 CASAVA_Build 12 3739394 1D AAGTGCCTTT C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 C 8 7 182137 CASAVA_Build 12 3739913 3D AAAAGAAAAG AAA/--- AGAAGCAAGC 1442 het 978 hom 9 3 6 0 A 4 1 182138 CASAVA_Build 12 3745393 1D TGCAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 11 10 182139 CASAVA_Build 12 3745967 2D43M2D CTTTCTTTTT CACACACACACACATCTCTCTCTCTGTCTCTCATGCATACACACGCA/--CACACACACACATCTCTCTCTCTGTCTCTCATGCATACACACG-- CACACACGTC 3070 het 3070 hom 42 16 18 32 N/A 0 0 182140 CASAVA_Build 12 3751296 1I CTGTGAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 21 23 4 A 9 10 182141 CASAVA_Build 12 3756665 12D GGAAAGGACA GAGGGAAGGAAG/------------ GAGGGAAGGA 3070 het 3070 ref 41 14 12 19 GAGGGAAGGAAG 3 2 182142 CASAVA_Build 12 3762490 3I TTTTCTTTCC ---/CTT TTTTTTTTCT 3070 het 2652 hom 19 9 9 1 CTT 0 1 182143 CASAVA_Build 12 3764217 16D TTTATACGAA TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 2581 het 882 hom 13 4 6 4 T 27 11 182144 CASAVA_Build 12 3768155 2I CTTGGCACCC --/TT GTCAAAGATT 3070 hom 81 het 39 0 27 12 T 0 2 182145 CASAVA_Build 12 3768180 19D ACTGTATATG CTTGGGTTTATGCTGGCCT/------------------- CTCTATTCTG 2582 het 2582 ref 40 10 7 26 CTTGGGTTTATGCTGGCCT 1 0 182146 CASAVA_Build 12 3779803 7I AATGACTGAG -------/AGCTAAA AGCTATATGA 2602 het 2602 ref 31 15 10 6 AGCTAAA 0 1 182147 CASAVA_Build 12 3780846 2D GTCTTCCACA TT/-- GTTAATCTCC 3070 het 3070 hom 46 19 19 9 T 2 0 182148 CASAVA_Build 12 3782770 2D GATACGCCCC CT/-- GTTTCAATTT 3070 het 3070 hom 31 12 19 0 CT 1 0 182149 CASAVA_Build 12 3783061 8D GCAAGGTGAG GGATGGGT/-------- GGATGGGTGA 3070 het 3070 hom 26 9 15 3 GGATGGGT 2 1 182150 CASAVA_Build 12 3785439 2D TGCTTCAAAT AG/-- AGTTTTCAAG 3070 het 3070 hom 25 10 9 7 AG 2 1 182151 CASAVA_Build 12 3788984 1I GATCTGCAAA -/T GTCTAAAAGA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 0 1 182152 CASAVA_Build 12 3794219 2I AGAGAAATGA --/AT ATATAGTCAT 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 AT 2 3 182153 CASAVA_Build 12 3877435 1I CATATTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 17 19 12 A 13 14 182154 CASAVA_Build 12 3879000 1I TTCGGCTACA -/C ATTTAAACAC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 C 0 1 182155 CASAVA_Build 12 3884623 1I CCTGCTATCA -/C CACGGAAGCA 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 C 1 2 182156 CASAVA_Build 12 3916452 1I CAAAATATGC -/A AAAAAAAAAA 2340 het 2340 ref 33 15 10 8 A 16 17 182157 CASAVA_Build 12 3938901 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 526 hom 13 4 8 1 A 18 16 182158 CASAVA_Build 12 3943259 2D21M2I AGAAGTAAAC ATATATATATATATATATTTACT--/--ATATATATATATATATTTACTAC ACACACACAC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 N/A 0 0 182159 CASAVA_Build 12 3944517 2D CATTCTAGAA AT/-- CCTATAATAC 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 AT 1 0 182160 CASAVA_Build 12 3946475 2I TCTTTCCAGA --/TG TGTGTGTGCA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 TG 4 5 182161 CASAVA_Build 12 3946843 2I GTCTCAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 1982 het 1982 ref 21 9 5 7 A 10 12 182162 CASAVA_Build 12 3946982 1I TATTTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 10 11 182163 CASAVA_Build 12 3948894 1D TTGAGACCCA T/- TTCTGGCCAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 3 2 182164 CASAVA_Build 12 3951894 3D AAGCACATTT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 TAA 1 0 182165 CASAVA_Build 12 3953005 1D GAACGTGGGT G/- GGGGGAAGAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 G 6 5 182166 CASAVA_Build 12 3974681 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 12 11 182167 CASAVA_Build 12 3983286 6D GAGGTTTAAC CTTTAA/------ GGAGAGTTAA 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 CTTTAA 1 0 182168 CASAVA_Build 12 3989353 3D CGACAACAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 AAC 4 3 182169 CASAVA_Build 12 3991007 2D AGGAAGGTAT TA/-- TATAACCAGA 3070 het 3070 hom 49 16 23 11 TA 3 2 182170 CASAVA_Build 12 3993286 1I CTCTCTTTCT -/C CCCCCTTACT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 5 6 182171 CASAVA_Build 12 4005938 3I ATTGTAATTT ---/AAA AAACTTAATG 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 3 6 182172 CASAVA_Build 12 4008633 1I CCATGCCTGG -/C TAATTTTGTA 3070 het 1859 hom 15 4 10 1 C 0 1 182173 CASAVA_Build 12 4008799 1D AAGAAATTTA T/- TTTTTTGACC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 7 6 182174 CASAVA_Build 12 4023059 2I ATTGGAACAC --/AG AGCCATGAGG 3070 hom 101 het 39 0 32 7 AG 1 2 182175 CASAVA_Build 12 4032257 1D TGGTTTCTCT G/- GGGGGGGGTA 3070 het 135 hom 22 3 10 10 G 9 8 182176 CASAVA_Build 12 4033477 1I CCTGATTGTT -/G GGGGGCTGTA 3070 hom 54 het 22 0 17 5 G 5 6 182177 CASAVA_Build 12 4067579 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 9 10 182178 CASAVA_Build 12 4074077 1I CATTTATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 10 11 6 A 10 11 182179 CASAVA_Build 12 4084973 1I TTAGTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3005 hom 28 12 13 3 T 10 11 182180 CASAVA_Build 12 4102302 1I CCAGGATGGT -/C TCGATCTCCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 0 1 182181 CASAVA_Build 12 4104825 5D GTAATTTGTA TCTCT/----- TCTCTTGGGA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 TCTCT 2 1 182182 CASAVA_Build 12 4107110 1D AACTGAACCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 18 12 12 A 9 8 182183 CASAVA_Build 12 4109853 2I CTGGCAGTTT --/AA TCAATTGCAT 3070 het 3070 hom 36 9 24 3 A 0 2 182184 CASAVA_Build 12 4110226 1D AAACACAGGA T/- TTTTTTTTTT 2188 het 2188 ref 26 11 8 7 T 11 10 182185 CASAVA_Build 12 4117153 3D TTCTTCACTT CAA/--- CATAGGAAAG 3070 het 3070 ref 35 21 13 3 CAA 1 0 182186 CASAVA_Build 12 4117815 1D ATCCACAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 22 2 11 9 T 13 12 182187 CASAVA_Build 12 4123133 2D TATCAAAGAC AT/-- GTGTAATGAC 3070 het 3070 hom 21 11 8 3 AT 1 0 182188 CASAVA_Build 12 4123511 1I AGAGAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 A 7 8 182189 CASAVA_Build 12 4133595 1D CACCGCCTCT A/- AAAAAAAAAA 1709 het 944 hom 29 6 6 17 A 17 16 182190 CASAVA_Build 12 4137411 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 14 15 182191 CASAVA_Build 12 4148764 2I ATTGCACTCT --/AG AGTCTGGGCA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 AG 1 2 182192 CASAVA_Build 12 4156411 1D GCCTGATCAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 7 6 182193 CASAVA_Build 12 4167962 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 26 1 17 8 A 13 12 182194 CASAVA_Build 12 4170229 1I ATGGCGTTCT -/C CCCCTTGTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 4 5 182195 CASAVA_Build 12 4172455 6D AAATGCACAC TTAAGG/------ TTAAGAACCA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 TTAAGG 1 0 182196 CASAVA_Build 12 4174638 1I ACCCAGGAGG -/T CGAGGTTGTG 3070 hom 32 het 12 0 11 1 T 0 1 182197 CASAVA_Build 12 4184991 10I GGGTGAGGGA ----------/GCTGGAGGGT GCTGGGGCGG 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 GCTGGAGGGT 0 1 182198 CASAVA_Build 12 4198154 1I AAATTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 T 10 11 182199 CASAVA_Build 12 4200330 2D GACTGAATCT TC/-- TCTCTCTCTC 2970 het 2970 ref 23 12 8 5 TC 7 6 182200 CASAVA_Build 12 4200769 1I CTGTTGATGG -/A AATTTGGATT 3070 het 3070 hom 61 23 29 9 A 2 3 182201 CASAVA_Build 12 4207271 4I ATCATAAAAT ----/AAAG AAATAAATAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AAAG 0 1 182202 CASAVA_Build 12 4210986 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 11 12 182203 CASAVA_Build 12 4221575 1I GAATTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2686 het 2106 hom 27 7 10 10 A 9 10 182204 CASAVA_Build 12 4221618 2D AAGTCAGCAT TA/-- TACTATTGTG 3070 hom 84 het 37 0 27 11 TA 2 1 182205 CASAVA_Build 12 4225656 1I AAAGCCCTTC -/A AAAAAAAAAA 2863 het 443 hom 23 4 9 10 A 11 12 182206 CASAVA_Build 12 4231170 4D AGAGAAAGGA AGGG/---- AGGGAGGGAG 1972 het 32 hom 14 1 10 3 AGGG 6 5 182207 CASAVA_Build 12 4231758 1I TAAGCCTCAG -/T TTTCCCTCAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 3 4 182208 CASAVA_Build 12 4234471 1I CCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 12 11 A 11 12 182209 CASAVA_Build 12 4241966 1D CCAAAGTGCT G/- GGATTGCAGG 3070 het 2904 hom 27 9 15 3 G 3 2 182210 CASAVA_Build 12 4257413 2I TGAGAGACCC --/AA AAGAGACAGG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 2 4 182211 CASAVA_Build 12 4267665 2D AGATCAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 2997 het 89 hom 36 2 12 22 T 16 14 182212 CASAVA_Build 12 4268611 1D GGGAAAATAC G/- GAAGAAAACT 3040 het 2287 hom 23 7 7 9 G 2 1 182213 CASAVA_Build 12 4270000 1D CAGGAGTTGG A/- AGCGGCCACC 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 A 2 1 182214 CASAVA_Build 12 4276133 1I CCTCTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 1811 het 833 hom 35 4 12 19 A 15 16 182215 CASAVA_Build 12 4276600 1I ACTTTGTGCC -/T TTAACCCCCA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 2 3 182216 CASAVA_Build 12 4278486 1I AAGTTGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2160 hom 26 8 10 8 T 11 12 182217 CASAVA_Build 12 4280781 1D CCCTTTTCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 36 3 20 14 T 13 12 182218 CASAVA_Build 12 4281112 1D TTCAGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1927 het 1249 hom 21 7 4 11 T 15 14 182219 CASAVA_Build 12 4288235 1I TATCAGATTA -/C CCCCGGGGCT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 C 4 5 182220 CASAVA_Build 12 4289226 2I CCTTTTATAA --/CT CTCTGGTGAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CT 2 3 182221 CASAVA_Build 12 4294119 1D GCCCCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 20 9 A 11 10 182222 CASAVA_Build 12 4295889 1I ATACACATAT -/A TTTTTATATA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 0 1 182223 CASAVA_Build 12 4302586 1I CTAGCTAATA -/G GGGAGGCTGA 3070 het 2026 hom 23 6 9 8 G 3 4 182224 CASAVA_Build 12 4304155 5D TCGCAGGACA CGTCC/----- CGTCCCGCAG 3070 hom 54 het 26 0 15 11 CGTCC 2 1 182225 CASAVA_Build 12 4316719 1I TCAGCCTCCC -/A AATAGCTGGG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 2 3 182226 CASAVA_Build 12 4317575 1D AAAAGTAAAA T/- TAAAAACGAA 3070 hom 102 het 36 0 34 3 T 2 1 182227 CASAVA_Build 12 4320699 2D CAAATGACAA AG/-- AGAGGGGGGG 3070 hom 35 het 13 0 11 2 AG 3 2 182228 CASAVA_Build 12 4338535 1I TCTGACTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 468 hom 40 2 27 11 T 10 11 182229 CASAVA_Build 12 4357155 1D CCACACCTGG C/- CCACATATAG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 3 2 182230 CASAVA_Build 12 4358629 2D AATACACACG CA/-- CACACACACA 3070 hom 81 het 38 0 26 12 CA 9 8 182231 CASAVA_Build 12 4365808 4D TATCTGAGTG TTTA/---- TTTATTTAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TTTA 3 2 182232 CASAVA_Build 12 4373751 2D TTGCCATAAC TT/-- TATGAGAATC 3070 het 3070 hom 49 23 22 5 T 3 1 182233 CASAVA_Build 12 4377012 1I TCCATGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 11 12 182234 CASAVA_Build 12 4378243 1I AGAACAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 15 1 12 2 A 10 11 182235 CASAVA_Build 12 4379091 2I ACAGACACAC --/TT TTATAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 2 4 182236 CASAVA_Build 12 4380930 1I CAGAATCTAT -/A TGGATTTCTA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 0 1 182237 CASAVA_Build 12 4398933 1D GAACTAGAGG C/- CGTTGCTTAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 4 C 2 1 182238 CASAVA_Build 12 4399210 1I TTAATCTCCT -/A AAGAATCCAT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 2 3 182239 CASAVA_Build 12 4407088 1D CCCGGCCTTA T/- TTTTTTATTT 2168 hom 12 het 5 0 5 0 T 7 6 182240 CASAVA_Build 12 4432207 1D CTGGGGTGTT G/- GGTTGAGTCT 3070 het 3070 hom 41 12 20 10 G 3 2 182241 CASAVA_Build 12 4443345 1I AGATGCAAAC -/T TTTTTTTTTT 2218 het 1600 hom 22 8 7 7 T 15 16 182242 CASAVA_Build 12 4445510 2D GGAGAAAGAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2757 hom 32 9 17 6 AT 9 8 182243 CASAVA_Build 12 4445638 4D AACCAGACAT AGAA/---- AGACAAATAC 3070 het 3070 ref 41 20 19 4 AGAA 1 0 182244 CASAVA_Build 12 4523589 1I4M4I3M1I GTTTTGACAG -GACC----CAG-/TCATCTCTTCAGA CACTTATCTC 3070 het 3070 hom 46 18 26 3 N/A 0 0 182245 CASAVA_Build 12 4525577 5D ATTTTAGGAG TCTTA/----- TCTTATCATC 3070 het 3070 ref 55 28 21 9 TCTTA 2 1 182246 CASAVA_Build 12 4526495 4D TACTGCCTCC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 TTAT 4 3 182247 CASAVA_Build 12 4533066 1D TTTAGGGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1707 hom 39 9 16 14 T 13 12 182248 CASAVA_Build 12 4533475 1I AATTAGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 10 11 182249 CASAVA_Build 12 4542281 2I GCTGCCACTC --/TG AGGAAATTCC 3070 het 3034 hom 29 11 14 4 TG 0 1 182250 CASAVA_Build 12 4553853 1D AAAATATATA T/- GGAATCATAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 1 0 182251 CASAVA_Build 12 4559312 2D GGCAGAACAC AA/-- AGAGGTCAGA 3070 het 3070 hom 55 25 25 6 A 3 1 182252 CASAVA_Build 12 4581946 26D GTTGAGTGGT GGGATATAAGCCAACTTATAAGTGGA/-------------------------- GGGATATAAG 3070 het 3070 ref 34 19 10 14 GGGATATAAGCCAACTTATAAGTGGA 1 0 182253 CASAVA_Build 12 4600651 1I CCAAAAAGTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 8 9 182254 CASAVA_Build 12 4603052 1I AGACACTCAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 35 8 19 8 A 7 8 182255 CASAVA_Build 12 4603098 5D CCTGGGTGAC AAAAT/----- AAGCTGTACA 3070 het 3070 ref 37 14 12 14 AAAAT 1 0 182256 CASAVA_Build 12 4604340 1D ATTCCAATAC A/- AAAAAAGTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 7 6 182257 CASAVA_Build 12 4609900 2I GAAAGAAAAG --/AA AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 52 24 25 3 A 4 6 182258 CASAVA_Build 12 4611050 4I AAACACACAC ----/TTAT GTAAATTACA 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 TTAT 0 1 182259 CASAVA_Build 12 4611649 4I TATCACTTAT ----/AAAG AAAGAGGCTA 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 AAAG 1 2 182260 CASAVA_Build 12 4614899 1I22M1I TGCCACGAAC -ATTTCATTTACATTCACTGATG-/AATTTCATTTACATTCACTGATGT TTTAGCTGAT 3070 het 3070 ref 43 28 21 9 N/A 0 0 182261 CASAVA_Build 12 4616052 1I TCTTTATGTC -/T TAATGTCTTA 3070 hom 61 het 28 0 26 2 T 1 2 182262 CASAVA_Build 12 4618819 1I TTTTTCTTTT -/G GGGGGGTGCA 2765 het 2765 ref 21 7 9 5 G 6 7 182263 CASAVA_Build 12 4622878 1D GTTAGGGTAG A/- AAAAAAAAAG 1022 het 1022 ref 37 31 3 4 A 10 9 182264 CASAVA_Build 12 4628079 1D TCTTCTCCAC T/- TTTCCCCTCG 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 4 3 182265 CASAVA_Build 12 4637860 1D TTATCCCCCC T/- AATGATTAAC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 1 0 182266 CASAVA_Build 12 4638783 2D TTGATTGCCT TC/-- TGTTTGCAGG 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 TC 1 0 182267 CASAVA_Build 12 4640430 1I AGTTGGTATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 37 hom 54 1 31 22 T 9 10 182268 CASAVA_Build 12 4647260 1I TAAATGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 10 11 182269 CASAVA_Build 12 4653044 5D GTGAAAAGAC AAGAT/----- AAGAGACAAA 3070 het 3070 hom 40 14 23 10 AAGAT 1 0 182270 CASAVA_Build 12 4661229 1D AAAACATTAT A/- AAAGAAAAAA 3070 het 2618 hom 20 7 11 2 A 4 3 182271 CASAVA_Build 12 4665107 27D CCTAACGTCC TGAAGAAACTGTTGACAGTTTCTTCCT/--------------------------- TCTTTCTTTA 3070 hom 111 het 38 0 37 6 TGAAGAAACTGTTGACAGTTTCTTCCT 1 0 182272 CASAVA_Build 12 4668185 2I TGTACACTAG --/TA TATGTCAGAA 3070 het 2806 hom 31 7 21 3 TA 1 2 182273 CASAVA_Build 12 4671252 1D GGGGGGGGGG T/- CATGGGTCAT 2696 het 306 hom 29 7 9 14 T 1 0 182274 CASAVA_Build 12 4674451 1D TCCATTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 42 0 34 8 T 11 10 182275 CASAVA_Build 12 4677942 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1562 hom 29 10 13 6 A 14 13 182276 CASAVA_Build 12 4682997 13I CTCCCAAAGT -------------/GCTGGGATTACAG GCTGGGATTA 2516 het 2516 ref 26 8 12 6 GCTGGGATTACAG 1 2 182277 CASAVA_Build 12 4687041 1I CACGGACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 10 11 182278 CASAVA_Build 12 4687821 3I GCGAGAAACT ---/AGA AGGTTTTCAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGA 0 1 182279 CASAVA_Build 12 4688325 1D TAAAATAGAA T/- TTAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 T 3 2 182280 CASAVA_Build 12 4688437 2D TAACACCATT TA/-- TGTTATCATA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 TA 1 0 182281 CASAVA_Build 12 4694715 1D GTAGCCACGA T/- TTTTGTGGTG 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 5 4 182282 CASAVA_Build 12 4696365 1D TGAGGTTTAA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 9 8 182283 CASAVA_Build 12 4703452 1I GGCGGGCGCC -/T TGTAGTCCCA 2600 het 58 hom 8 1 7 0 T 1 2 182284 CASAVA_Build 12 4707642 1D AATTGGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 11 10 182285 CASAVA_Build 12 4708560 2D GAAATGTGAC TG/-- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 8 TG 1 0 182286 CASAVA_Build 12 4716022 1I GAAGAGAAAA -/G GAAAAAAAAA 1008 het 1008 ref 48 34 5 9 G 1 2 182287 CASAVA_Build 12 4721007 1I TTTTCTGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 20 10 A 11 12 182288 CASAVA_Build 12 4732688 1D TTTCTACCCC T/- ATCTCTTTCT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 T 1 0 182289 CASAVA_Build 12 4736003 1I GACCTTTTTT -/C CCCCCTCCAA 3070 het 3070 ref 50 33 11 6 C 5 6 182290 CASAVA_Build 12 4737194 6D AGATATAGAG CAGAAT/------ CAGAATAGAC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 CAGAAT 2 1 182291 CASAVA_Build 12 4738204 2D AACGGCAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2945 hom 34 13 11 12 T 13 11 182292 CASAVA_Build 12 4738903 1I CAAAACACTC -/T TAGCTGCCAG 3070 het 2010 hom 39 5 13 21 T 1 2 182293 CASAVA_Build 12 4738979 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 1727 het 1727 ref 51 40 5 6 T 10 9 182294 CASAVA_Build 12 4741045 1I CTTTTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 T 10 11 182295 CASAVA_Build 12 4753961 11D TTTAGGTAAG AAATAAGAGAA/----------- AAATATACCT 3070 het 3070 ref 41 21 19 2 AAATAAGAGAA 1 0 182296 CASAVA_Build 12 4760979 4D CTGTTTACTC TCTT/---- TCAGACACAC 3070 het 3070 hom 37 11 19 8 TCTT 1 0 182297 CASAVA_Build 12 4764732 1I TTCCATCTTT -/A AAGTCAGTAG 3070 hom 111 het 40 0 30 10 A 2 3 182298 CASAVA_Build 12 4777518 1I ATTTCTTCTC -/T TTTTTCAACC 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 5 6 182299 CASAVA_Build 12 4783964 1I TTTAGAACCT -/A AGGGCAGAGG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 1 2 182300 CASAVA_Build 12 4785559 4I CTATAATGTA ----/ATTT ATTTATTACA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 ATTT 1 2 182301 CASAVA_Build 12 4802844 1D GAAAAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 797 hom 37 3 23 12 T 13 12 182302 CASAVA_Build 12 4812355 1D CCTCACCTCA G/- GGGGGTCAAC 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 G 6 5 182303 CASAVA_Build 12 4813307 3D GAGGGACTTG TCT/--- TCTTCTTCTT 2053 het 2053 ref 36 13 8 15 TCT 5 4 182304 CASAVA_Build 12 4814524 6I AATAAATGCA ------/AAATGT AACTGAGTAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AAATGT 0 1 182305 CASAVA_Build 12 4818235 1D CTGTGCACAG A/- GTGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 A 1 0 182306 CASAVA_Build 12 4827678 2I CTGCTTCTGT --/TG CAACTGACAC 3070 hom 87 het 38 0 29 9 TG 0 1 182307 CASAVA_Build 12 4828469 1D ATCATTTGAA C/- CCCGGGAGTC 1571 hom 12 het 5 0 5 0 C 4 3 182308 CASAVA_Build 12 4829727 1D GGGTCCGAGA G/- GGGGACCCCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 5 4 182309 CASAVA_Build 12 4830166 1I CCCTGGCAGG -/A AAAAATGCTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 5 6 182310 CASAVA_Build 12 4841576 4D AGAAATGTGG AATT/---- AGCCAGGTAT 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 AATT 1 0 182311 CASAVA_Build 12 4846632 1D TGGCCTCTAG C/- TACATCTATG 3070 het 3070 hom 33 17 15 2 C 1 0 182312 CASAVA_Build 12 4856452 1D CCAAAAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 T 11 10 182313 CASAVA_Build 12 4858477 1I GGACCAAAGG -/C CCCACGCAAG 3070 hom 66 het 24 0 22 2 C 3 4 182314 CASAVA_Build 12 4873297 5D TGTCTGCAAA TTGGC/----- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 54 24 22 11 TTGGC 1 0 182315 CASAVA_Build 12 4878264 3I ATACATAGTC ---/TGT TGTTGACCAA 3070 het 3070 hom 60 27 29 4 TGT 1 2 182316 CASAVA_Build 12 4878430 16I TGTTTTCCTA ----------------/ATCTACTCTCTCTTTT ATTCTTCTTT 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 ATCTACTCTCTCTTTT 0 1 182317 CASAVA_Build 12 4937089 1D TAACAATTTA T/- TTTTTTTATT 2578 het 2578 ref 19 9 7 3 T 8 7 182318 CASAVA_Build 12 4955689 4I TTGCCCAGGC ----/TGGT TGGTCTCAAA 3070 het 2216 hom 22 5 15 2 TGGT 1 2 182319 CASAVA_Build 12 4962500 1I TTCAAGAAAA -/G CTGCTCTCAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 0 1 182320 CASAVA_Build 12 4965253 1D CCAACTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 24 2 11 12 T 13 12 182321 CASAVA_Build 12 4976661 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 7 6 182322 CASAVA_Build 12 4991835 1D GAACGGACAC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 46 28 14 4 T 8 7 182323 CASAVA_Build 12 4992050 1I TCAGAAAAGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 7 8 182324 CASAVA_Build 12 4997514 5D GGCAACACCG GACCA/----- GACCAGCCGG 1539 het 1539 ref 31 13 7 12 GACCA 2 1 182325 CASAVA_Build 12 5002649 1I GTGTCCGGAT -/C TTGGGCTGAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 0 1 182326 CASAVA_Build 12 5007385 1D GTTCACATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 11 10 182327 CASAVA_Build 12 5007617 1I AATTATGGAT -/G TTTTTTATTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 182328 CASAVA_Build 12 5008937 1I ATACCTAATG -/C TAAATGACGA 1451 het 1327 hom 6 3 3 0 C 0 1 182329 CASAVA_Build 12 5009057 1D ATAAAAAAAA T/- AAACATTATG 2912 het 2912 ref 20 11 8 1 T 1 0 182330 CASAVA_Build 12 5012182 2D TATTGCAACA CT/-- CTGCTCAAGG 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 CT 2 1 182331 CASAVA_Build 12 5013902 3I TGAAAGCTGA ---/GAC GATGATGGGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 GAC 0 1 182332 CASAVA_Build 12 5030132 1D GTGTGTGTAT G/- GTACGCACAG 3070 het 3070 ref 38 20 12 7 G 2 1 182333 CASAVA_Build 12 5032617 1I CTTTGCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 17 13 T 10 11 182334 CASAVA_Build 12 5074541 20I GGAAAGGTGA --------------------/GGGATTGTCTGTCATAATTT GGGAGCACAT 3070 het 3070 hom 38 17 21 2 GGGATTGTCTGTCATAATTT 0 1 182335 CASAVA_Build 12 5084880 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1561 hom 16 4 10 2 T 10 9 182336 CASAVA_Build 12 5102107 3D TTCAATTTGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 30 0 22 9 A 16 13 182337 CASAVA_Build 12 5117233 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 125 het 55 0 42 13 T 11 10 182338 CASAVA_Build 12 5131309 1D GGGAGTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 30 1 21 8 T 12 11 182339 CASAVA_Build 12 5158733 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1407 het 376 hom 37 3 7 27 T 19 18 182340 CASAVA_Build 12 5172696 1D TCTTTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 38 1 31 7 T 12 11 182341 CASAVA_Build 12 5176372 1I CCATAGGATA -/C CCCCGGCACA 3070 hom 103 het 41 0 35 6 C 4 5 182342 CASAVA_Build 12 5178437 5I75M1I ATCTAACAGA -----CTTTTCTGTGCTTACCAAGAAAAGAGGATCTCACTTTACCCCCATCCACACCCTAACTGGTGTAGGTCTCACTGT-/CTTTTCTTTTCTGTGCTTACCAAGAAAAGAGGATCTCACTTTACCCCCATCCACACCCTAACTGGTGTGGGTCTCACTGTC CCACACCAGA 3070 het 48 hom 40 1 40 21 N/A 0 0 182343 CASAVA_Build 12 5181784 1I CTGAAAATAG -/A AAAAAGATGG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 5 6 182344 CASAVA_Build 12 5181891 4I CTGTGTGAAA ----/AACT ACTTTAAAAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AACT 0 1 182345 CASAVA_Build 12 5210284 1D TCTCAAAGGC T/- TTGAGCAACT 3070 het 3070 hom 54 21 28 6 T 3 2 182346 CASAVA_Build 12 5234510 1D ATACATCGTG A/- AATCATCACT 3070 het 3070 ref 47 24 20 5 A 3 2 182347 CASAVA_Build 12 5243265 1D CTTGAGCCCA G/- GAGTTCAAGG 3070 het 2635 hom 24 8 12 4 G 2 1 182348 CASAVA_Build 12 5275318 3D TGTGATAAAC TAT/--- TATTATAAAA 2696 het 2655 hom 16 7 6 4 TAT 3 2 182349 CASAVA_Build 12 5277893 1D GCTTTCCTGC A/- CACGGGGTTA 3070 het 3070 hom 54 22 28 4 A 1 0 182350 CASAVA_Build 12 5285949 1I GTAGGGTCTC -/T TATCACCTGA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 1 2 182351 CASAVA_Build 12 5296891 20I ACTCTTTTGC --------------------/TGTCACTGCTTCAGCAAGCT TGGCCTATTA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 TGTCACTGCTTCAGCAAGCT 0 1 182352 CASAVA_Build 12 5306905 1I TTTTTTTTTT -/C TTCTAACTGA 3070 het 66 hom 43 4 32 7 C 0 1 182353 CASAVA_Build 12 5307243 1I CCTTGCTATG -/A AAAAAAAAAA 2858 het 1190 hom 27 5 10 12 A 14 15 182354 CASAVA_Build 12 5307282 2D GGCAGGTGTC TG/-- TAGTCCCAGC 3070 het 2284 hom 30 11 9 12 TG 1 0 182355 CASAVA_Build 12 5312254 2I AGGGGGCGGT --/AG AGGAAGTCCC 3070 hom 110 het 41 0 34 7 AG 1 2 182356 CASAVA_Build 12 5317425 1I TAGAATACGC -/A AAAAAAAAAA 2468 het 2468 ref 23 8 10 5 A 13 14 182357 CASAVA_Build 12 5319007 3I AGATTGTCAA ---/GAT GATGACCTGA 3070 hom 192 het 71 0 64 7 GAT 1 2 182358 CASAVA_Build 12 5323161 2D ACAAGCAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 40 0 31 10 A 14 12 182359 CASAVA_Build 12 5323925 18D GTTTCAAAGT TCGCTTCCAGTAGTACCA/------------------ TTCTGATGAC 3070 hom 63 het 19 0 22 2 TCGCTTCCAGTAGTACCA 1 0 182360 CASAVA_Build 12 5325495 1I TGTATGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1033 hom 49 3 36 10 A 12 13 182361 CASAVA_Build 12 5333660 1I TCACAGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 27 1 22 4 A 11 12 182362 CASAVA_Build 12 5337674 5D CTTGGCTAAT TTTTA/----- TTTTATGTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 6 TTTTA 2 1 182363 CASAVA_Build 12 5341721 1I TAATTTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 11 12 182364 CASAVA_Build 12 5373419 1I AACGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 1347 hom 7 het 4 0 3 1 C 3 4 182365 CASAVA_Build 12 5386076 3I TACCTTTCTG ---/TCA TCATGAAAAT 3070 hom 157 het 58 0 53 5 TCA 1 2 182366 CASAVA_Build 12 5457904 1D CGGCAGGGAT C/- CCCGCCCCAG 3070 hom 93 het 39 0 31 8 C 4 3 182367 CASAVA_Build 12 5461065 4I CATGCACACA ----/CACT TACAGATATA 3070 hom 171 het 65 0 57 8 CACT 0 1 182368 CASAVA_Build 12 5461288 4I ACACACAAAA ----/ACAT ACATACACAG 3070 hom 221 het 85 0 69 16 ACAT 1 2 182369 CASAVA_Build 12 5481014 2I TGGAGAATCA --/CT GATTCACTAA 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 CT 0 1 182370 CASAVA_Build 12 5482867 1D TATGACAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 A 13 12 182371 CASAVA_Build 12 5499688 4I ACAGTGAGAG ----/GATC GATCAGATGA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 GATC 1 2 182372 CASAVA_Build 12 5507188 1I CTATTACTAG -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 6 7 182373 CASAVA_Build 12 5507933 1I GTCTCAATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 7 8 182374 CASAVA_Build 12 5508071 6D AAAAAAAAAA AAAAAC/------ AACTCTGTTG 1161 het 1131 hom 31 4 6 21 AAAAAC 1 0 182375 CASAVA_Build 12 5508095 1D TGGGTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 27 0 17 10 T 11 10 182376 CASAVA_Build 12 5508287 4D TTCTCATTCC TTCT/---- AAGTTATTTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 TTCT 1 0 182377 CASAVA_Build 12 5515490 1I AAACCTCCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 A 9 10 182378 CASAVA_Build 12 5522859 1D CAGGGCACTT A/- GATATAATTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 1 0 182379 CASAVA_Build 12 5532658 1D GGAAAGGAAA G/- GAAAGAAAGA 163 het 20 hom 19 0 2 17 G 2 1 182380 CASAVA_Build 12 5538435 4I GCAATTTCTT ----/TTTC TTTCTTCAGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTTC 1 2 182381 CASAVA_Build 12 5548786 1I TGCCAGCCGT -/G GCCCCCAAAG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 G 1 2 182382 CASAVA_Build 12 5549887 1I CCTGAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 11 12 182383 CASAVA_Build 12 5553049 1D TGCAGAGGGG C/- CCCCAGGCAG 3066 het 3066 ref 32 18 9 6 C 5 4 182384 CASAVA_Build 12 5575778 4D GGAAATAAAA AAAT/---- AAATGTGAGT 3070 het 3070 hom 31 14 16 3 AAAT 2 1 182385 CASAVA_Build 12 5577838 2I AGGCTGGAGT --/AG AGTGACACAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AG 1 2 182386 CASAVA_Build 12 5578396 1I TAGACCCAAC -/T TTTTGTTAAA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 T 4 5 182387 CASAVA_Build 12 5581684 1D CTAGGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 11 10 182388 CASAVA_Build 12 5581895 1I TGCCCATGCT -/G GGTCTTAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 G 2 3 182389 CASAVA_Build 12 5582215 2I AGAAACAAAC --/AT ATAGATCCTC 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 AT 1 2 182390 CASAVA_Build 12 5584335 1I CTTGCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2316 het 2316 ref 32 11 10 11 T 12 13 182391 CASAVA_Build 12 5589120 1D CTCCACAATC T/- TTCGATAGAT 3070 het 3070 hom 41 12 23 7 T 3 2 182392 CASAVA_Build 12 5590828 1I CTAAAAAGTT -/A AAGCTCTGAG 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 2 3 182393 CASAVA_Build 12 5596359 1D CAGATCACAC A/- GTGCCACACT 3070 het 3070 ref 47 21 12 17 A 1 0 182394 CASAVA_Build 12 5596384 1D AGATCACACC A/- TAACACACTC 1007 het 1007 ref 43 25 5 14 A 1 0 182395 CASAVA_Build 12 5601284 1D AAAAGAAGGA G/- GAAGAGGGAG 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 G 2 1 182396 CASAVA_Build 12 5604795 4D TCCTAGGGGT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 43 18 16 10 GA 9 7 182397 CASAVA_Build 12 5613016 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2039 het 2039 ref 35 15 9 11 A 11 10 182398 CASAVA_Build 12 5616973 1D TTTGCTACTC A/- AAAATGTGGT 3070 het 3070 ref 32 17 9 8 A 5 4 182399 CASAVA_Build 12 5626342 2D GGCCAGAGTC AG/-- AGTTACAACA 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 AG 2 1 182400 CASAVA_Build 12 5635904 1D ATTTGATCAG C/- CCCAGTTGTC 3070 het 3070 hom 55 22 29 4 C 4 3 182401 CASAVA_Build 12 5636920 1I TACTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 820 hom 36 3 27 6 T 12 13 182402 CASAVA_Build 12 5637211 1I41M2I AGATTAATAA -TCTGGCAGCCAATGCTATAAATTTAGCCTCTCACAGAATGG--/TTCTGGCAGCCAATGCTATAAATTTAGCCTCTCACAGAATGGCA CATGTTCAAG 3070 het 3070 hom 39 25 24 3 N/A 0 0 182403 CASAVA_Build 12 5637528 3I CCTTGCTGGA ---/GCT GGGCATCTCA 3070 het 3070 ref 47 25 13 9 GCT 0 1 182404 CASAVA_Build 12 5637797 3D CTTGTTGCCT ATC/--- ATCATCATCA 3070 het 3070 ref 73 35 31 7 ATC 5 4 182405 CASAVA_Build 12 5637879 3D TAATCATCAA CAT/--- CATCATCATA 3070 het 3070 ref 61 29 22 10 CAT 4 3 182406 CASAVA_Build 12 5646078 1D AGTCCACCCC T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 6 5 182407 CASAVA_Build 12 5651673 1I CTCCAATCCA -/G GGAAATGTAA 1363 het 1363 ref 50 41 6 3 G 2 3 182408 CASAVA_Build 12 5652027 8D TGTGTGTGTG CACATGCA/-------- TGTGTGTGTG 1188 het 1188 ref 40 19 7 18 CACATGCA 1 0 182409 CASAVA_Build 12 5652061 6D TGTGTATGTC TCTGTG/------ TGTATGCACA 1365 het 1365 ref 36 24 4 10 TCTGTG 1 0 182410 CASAVA_Build 12 5653856 1D ATGTCAACTC T/- CCCCACGCAC 3004 het 3004 ref 26 15 10 1 T 1 0 182411 CASAVA_Build 12 5654391 1I CTTGAAAGCT -/A AAGGGATGGG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 2 3 182412 CASAVA_Build 12 5658597 1D GTAAAATCCC A/- AACTATAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 A 3 2 182413 CASAVA_Build 12 5661765 4D TCTTTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 2021 het 2021 ref 31 13 8 12 TC 11 9 182414 CASAVA_Build 12 5665229 4D ACAAAACAAA AAAC/---- ACAAAAAACA 311 het 311 ref 29 19 3 8 AAAC 1 0 182415 CASAVA_Build 12 5668755 2D AATGCAAAAG AA/-- AAGAGATCAT 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 A 4 2 182416 CASAVA_Build 12 5674758 1D GAAAAGAATC T/- TTAAGATCAT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 3 2 182417 CASAVA_Build 12 5682001 1D CAAAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1463 hom 40 5 26 10 A 13 12 182418 CASAVA_Build 12 5686631 2D CTCCCCTGCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 CT 6 5 182419 CASAVA_Build 12 5700202 2D TGTCTCTCTC TA/-- TAGCTTTGCT 3070 het 3070 hom 42 18 18 7 TA 2 1 182420 CASAVA_Build 12 5700936 2I GTTTTTTTTT --/TG TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 TG 0 1 182421 CASAVA_Build 12 5719225 2D TTCATCAGCA CT/-- GTCACTTTTT 3070 het 3070 hom 57 26 26 7 CT 1 0 182422 CASAVA_Build 12 5761145 2D ATGAAAGAGG TA/-- TACGGTCTGC 3070 het 3070 ref 54 25 25 4 TA 2 1 182423 CASAVA_Build 12 5763582 1D TCATGCTATT C/- CCCCCTATCT 3070 het 3070 ref 45 28 17 2 C 6 5 182424 CASAVA_Build 12 5768020 2I CGGAGTCTAA --/CT CTGTCACCCA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 CT 1 2 182425 CASAVA_Build 12 5775897 2I TCTTGCACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 63 28 17 18 AC 5 6 182426 CASAVA_Build 12 5792427 4D GCAAACAAGC AAGA/---- AAGAAAGAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAGA 3 2 182427 CASAVA_Build 12 5792493 9D GAAGGAAGGA AGACGAAAG/--------- AGGAAGGAAA 3070 het 368 hom 30 2 12 20 AGACGAAAG 1 0 182428 CASAVA_Build 12 5797601 3I52M1I GTGTTGCCAA ---AGATTAACATTTGAGTCAGTGGGCTGGGAAAGGCAGACCCACCGTTTAATCT-/AGGAGATTAACATTTGAGTCAGTGGGCTGGGAAAGGCAGACCCACCGTTTAATCTG GGTGGGCACC 3070 hom 111 het 36 0 36 15 N/A 0 0 182429 CASAVA_Build 12 5813194 1D ATCTAATGCC T/- GATGATCTGA 3070 hom 56 het 29 0 20 9 T 1 0 182430 CASAVA_Build 12 5814440 15D AGTAGACATG AATACTAATTTGTTT/--------------- AGCCATTTCC 3070 het 3070 ref 38 22 15 8 AATACTAATTTGTTT 1 0 182431 CASAVA_Build 12 5815508 1D ACCAACCAGG A/- CTATTCCTTT 3070 hom 99 het 37 0 31 6 A 1 0 182432 CASAVA_Build 12 5824381 1D AACCATGAAA T/- TTTTTTTTTT 2771 hom 14 het 23 0 12 11 T 19 18 182433 CASAVA_Build 12 5840810 9D2M2D TCCCGCACTC CAGGCCCCTAGCA/---------AG-- GGGACTGGAG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 N/A 0 0 182434 CASAVA_Build 12 5858691 3D TAAATAAGAA GGG/--- ACTGTACTCA 3070 het 3070 ref 41 29 12 0 G 3 0 182435 CASAVA_Build 12 5864337 3D CCCTGCCCAC CCA/--- CCACCATCAG 3070 het 3070 ref 46 22 17 8 CCA 3 2 182436 CASAVA_Build 12 5871270 1I AATAGGATTT -/A AATAAAACCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 3 182437 CASAVA_Build 12 5877165 2D CATACAGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 13 12 A 14 12 182438 CASAVA_Build 12 5885873 3D ACTTGAGGCC AGG/--- AGTTCAAGAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 AGG 1 0 182439 CASAVA_Build 12 5893634 2I CTCAAAAAAG --/AA AAAAAAAGAA 3070 het 2687 hom 35 8 23 4 A 7 9 182440 CASAVA_Build 12 5894891 4D ATCTGCTATT CAAA/---- CAGAGTTCAG 3070 het 3070 hom 45 18 21 7 CAAA 1 0 182441 CASAVA_Build 12 5895448 1D TCACCCCTCT A/- ATCCCAGCAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 2 1 182442 CASAVA_Build 12 5896082 2I TAGATGGAAA --/CT CTCTGTACAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 CT 2 3 182443 CASAVA_Build 12 5896790 1D ACATGCTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 10 9 182444 CASAVA_Build 12 5897540 1I TTCCTGGAGC -/T GAGAATGCAT 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 T 0 1 182445 CASAVA_Build 12 5916538 1I GGTGGTTCCA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 7 8 182446 CASAVA_Build 12 5922056 2D CTTCCCCACA GG/-- GGAAGCTCCA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 4 2 182447 CASAVA_Build 12 5927000 1D AACCTGGCCC T/- GCCACCCAGC 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 1 0 182448 CASAVA_Build 12 5930090 1I AGGATGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 28 16 9 A 12 13 182449 CASAVA_Build 12 5930496 1D CCCAGGGCAG A/- AAAGAAATAC 3070 het 3070 ref 45 26 14 6 A 4 3 182450 CASAVA_Build 12 5934535 1I AATACACAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 9 10 182451 CASAVA_Build 12 5955443 1I TCTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 A 10 11 182452 CASAVA_Build 12 5968319 1D TGAAGGTGAC A/- AAAGATCGGC 3070 het 3070 hom 41 18 17 7 A 4 3 182453 CASAVA_Build 12 5982305 1D CCCCCACCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 47 het 25 0 17 8 A 10 9 182454 CASAVA_Build 12 5987646 1I ACTTTACATT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 9 182455 CASAVA_Build 12 6006451 2I AAGAGAAAAA --/AT ATGTATTCTA 3070 het 3070 ref 53 23 25 5 AT 1 2 182456 CASAVA_Build 12 6010530 2D ATCACTTCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 AC 8 7 182457 CASAVA_Build 12 6012303 2I ATGTACTCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 649 hom 76 8 31 37 AC 6 7 182458 CASAVA_Build 12 6012321 4D ACACGCATAC ACAT/---- ACATACACAC 3070 het 1191 hom 68 11 22 41 ACAT 2 1 182459 CASAVA_Build 12 6022978 1D GCATCCTTCA G/- GATGTATGCG 3070 het 3070 hom 39 18 16 8 G 2 1 182460 CASAVA_Build 12 6030467 9I ATAATGGTAC ---------/TACGGTTAA CTTTACTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 18 9 TACGGTTAA 0 1 182461 CASAVA_Build 12 6032225 3I AAGAGAGAGG ---/AGA AGAAGTAAGG 3070 hom 82 het 34 0 27 7 AGA 1 2 182462 CASAVA_Build 12 6035721 31I TGAGCACAAT -------------------------------/CCAGCCACCCAAGGGACCAGAGAGTGGGAGC AGATACCACC 3070 hom 111 het 41 0 37 8 CCAGCCACCCAAGGGACCAGAGAGTGGGAGC 0 1 182463 CASAVA_Build 12 6040833 8D AAGGGAGGTT GACAAGAG/-------- GATCTCCCAG 3070 het 3070 ref 24 16 7 3 GACAAGAG 1 0 182464 CASAVA_Build 12 6041859 17I TCCAGAGAAA -----------------/CAGTGTTGATGGAGGCC CAGTGAAAAG 3070 het 3070 hom 50 16 27 8 CAGTGTTGATGGAGGCC 0 1 182465 CASAVA_Build 12 6059038 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 2617 het 1665 hom 20 6 9 5 A 15 14 182466 CASAVA_Build 12 6062646 9I GTTTTGCCAT ---------/GTTGGAAGG GTTGGAAGGG 3070 hom 58 het 24 0 19 5 GTTGGAAGG 1 2 182467 CASAVA_Build 12 6075164 1D GCTGGAGTGC A/- GCGGCTATTC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 1 0 182468 CASAVA_Build 12 6082236 1I GACCATACTG -/C CCCAAAGCAA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 C 3 4 182469 CASAVA_Build 12 6092309 1D GCACACACAT A/- AGCATGCACC 3070 hom 66 het 30 0 21 14 A 2 1 182470 CASAVA_Build 12 6107264 1I TATAGAGATG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 A 6 7 182471 CASAVA_Build 12 6116163 3I TCGGTGGGCC ---/CTT CTTCTTCTCC 3070 hom 71 het 29 0 21 8 CTT 2 3 182472 CASAVA_Build 12 6122713 4D CACATCTGAA AGTC/---- AGAAGACACA 3070 hom 72 het 26 0 25 3 AGTC 1 0 182473 CASAVA_Build 12 6125648 4D TCTCAAATAA ATAC/---- ATACAGACAG 3070 hom 91 het 33 0 30 8 ATAC 2 1 182474 CASAVA_Build 12 6130247 1D GCACTTTGGG A/- GGCCAAGGCA 1284 het 1284 ref 12 8 3 1 A 1 0 182475 CASAVA_Build 12 6141750 1I ACCTGTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 14 11 A 13 14 182476 CASAVA_Build 12 6146273 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2780 hom 24 8 10 7 A 11 10 182477 CASAVA_Build 12 6162686 2D TCCCATGTGG CT/-- TCAGAGGGCA 3070 het 3070 hom 34 13 12 10 CT 1 0 182478 CASAVA_Build 12 6163602 3I TATTTATTGC ---/ACT ACACTTCTGG 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 ACT 0 1 182479 CASAVA_Build 12 6164555 4D ACGCAAAAGT AGAG/---- AGAACAGTAT 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 AG 3 1 182480 CASAVA_Build 12 6165016 2D CCTGGGCGAC AG/-- AGCGAGACTC 1072 het 449 hom 6 1 4 3 AG 2 1 182481 CASAVA_Build 12 6166498 2D CTCTATGTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 14 12 182482 CASAVA_Build 12 6168655 4D CCTCATGGTG GAGA/---- AAGAGCAGTA 3070 het 3070 hom 35 16 13 6 GA 2 0 182483 CASAVA_Build 12 6176714 2I TTACAGGCGT --/AA GAGCCACTGC 3070 het 2245 hom 17 8 8 1 A 0 2 182484 CASAVA_Build 12 6177741 6D GCTTCTGCTG CTCTGC/------ CTCTGATCTC 3070 het 3070 ref 45 21 18 11 CTCTGC 1 0 182485 CASAVA_Build 12 6180734 1I GAGAGAACTC -/A AGAGTTCGGG 2162 het 1541 hom 20 6 7 7 A 1 2 182486 CASAVA_Build 12 6189107 7D TGCAAATTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2340 het 836 hom 25 6 11 8 T 21 14 182487 CASAVA_Build 12 6189580 3I TGTCATCTTG ---/TTC TTCTGCCCTT 3070 het 3070 hom 39 11 18 10 TTC 1 2 182488 CASAVA_Build 12 6217773 1D TCCACCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 26 0 14 12 T 15 14 182489 CASAVA_Build 12 6218129 1I TACTAATGAA -/G GAAATCTAGA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 G 1 2 182490 CASAVA_Build 12 6238260 1I TGGAGCCTTG -/T TATGGATTAG 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 T 1 2 182491 CASAVA_Build 12 6240911 1D AATCTGAATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 T 9 8 182492 CASAVA_Build 12 6243994 3I TAAGGACATT ---/GGC GGCAGCAGCA 3070 hom 77 het 35 0 24 11 GGC 1 2 182493 CASAVA_Build 12 6255276 3I CTCAAAAAAA ---/AAT AATAAATGCT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AAT 1 2 182494 CASAVA_Build 12 6256409 4I TCAAACAAAA ----/AAAC AAACAAACCA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AAAC 2 3 182495 CASAVA_Build 12 6257076 1I TCAAACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 10 11 182496 CASAVA_Build 12 6257246 1D TACTGTTGAC T/- TAGAAGCCTT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 2 1 182497 CASAVA_Build 12 6266797 1D GGTGGGCACC T/- TGTAGTCCCA 3070 hom 30 het 13 0 10 3 T 2 1 182498 CASAVA_Build 12 6268120 1D9M1D CACCACCACG CCCTGGCTAAT/-CCTGGCTAA- TTTTTTGTAT 2447 het 80 hom 9 1 6 5 N/A 0 0 182499 CASAVA_Build 12 6268179 1D GTTAGCCAGG A/- ATGGTCTCGT 1734 hom 8 het 7 0 4 4 A 2 1 182500 CASAVA_Build 12 6279073 1I CAGGTGTGGT -/G GCTCACGCCT 2874 hom 26 het 15 0 10 5 G 1 2 182501 CASAVA_Build 12 6279581 1D CTGGAGTGTA G/- GGGGCTGGAT 2491 hom 14 het 7 0 6 3 G 5 4 182502 CASAVA_Build 12 6289117 9D TTTTTCTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1745 het 1255 hom 13 5 4 4 T 21 12 182503 CASAVA_Build 12 6296151 1D AGGAGGACCT G/- GGTGGGTGTA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 G 3 2 182504 CASAVA_Build 12 6302505 1D CTTTCTCCTC T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 8 7 182505 CASAVA_Build 12 6305736 3D AGTCTCAAAA AAT/--- AATAATAATA 1557 het 993 hom 8 2 4 3 AAT 5 4 182506 CASAVA_Build 12 6307433 2I GTATGGTGGT --/GG GGGGTGTAGT 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 G 4 6 182507 CASAVA_Build 12 6307913 1I CTGTCTTTAC -/A AAAAAAAAAT 1366 het 1366 ref 15 9 5 1 A 9 10 182508 CASAVA_Build 12 6323773 1I GTATTAATGA -/T TTAATAACAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 2 3 182509 CASAVA_Build 12 6332659 1D TTGTTCAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 A 10 9 182510 CASAVA_Build 12 6338025 1D GTGGCTTACA C/- CTATAATCCC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 2 1 182511 CASAVA_Build 12 6338287 2D AACCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1943 het 1636 hom 30 13 9 9 A 20 18 182512 CASAVA_Build 12 6342281 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2862 hom 21 8 11 2 T 10 9 182513 CASAVA_Build 12 6342566 3D ACAGTAAAAC AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 AAT 7 6 182514 CASAVA_Build 12 6344189 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 13 1 8 6 A 15 14 182515 CASAVA_Build 12 6345415 1D CCTAGTAGCT G/- GGACTACAGG 1432 het 927 hom 8 3 4 1 G 3 2 182516 CASAVA_Build 12 6357657 1I TATATAGTTC -/T TTTTTTATGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 6 7 182517 CASAVA_Build 12 6357998 2I ACCCAGATGG --/GC ACAAAGACTT 3070 hom 114 het 47 0 38 9 GC 0 1 182518 CASAVA_Build 12 6359202 1I CTAAAATTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 243 hom 13 1 10 2 A 8 9 182519 CASAVA_Build 12 6359641 1D GGCAAAGTCA C/- CCCCGTTGAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 C 5 4 182520 CASAVA_Build 12 6361518 1I GTACCTTACG -/T GTTTCATTGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 1 182521 CASAVA_Build 12 6371058 1D CAAAGACAAA G/- GTCAAGACAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 2 1 182522 CASAVA_Build 12 6374799 1I TTGTTTGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 420 hom 28 1 20 7 T 9 10 182523 CASAVA_Build 12 6377054 6D TCTATTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 36 1 25 10 T 17 11 182524 CASAVA_Build 12 6394454 2D TTTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 21 0 11 10 T 14 12 182525 CASAVA_Build 12 6395103 1D GCTATACTTG T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 7 182526 CASAVA_Build 12 6396316 2I GTTTTTGTCA --/CT CTTTTGTTGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 CT 1 2 182527 CASAVA_Build 12 6404386 2I TTGGCCACAC --/AT AAGTGCAACT 3070 hom 67 het 30 0 15 15 AT 0 1 182528 CASAVA_Build 12 6418638 1I GGTACAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 11 12 182529 CASAVA_Build 12 6431865 2D TAAGCCCAAC AG/-- GGGAAAGGCT 2025 het 2025 ref 27 15 8 4 AG 1 0 182530 CASAVA_Build 12 6435191 7D15M2I CGAGACCCTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAC--/-------TTTTTTTTTTTTAACAG AGTCTCATTC 2871 het 397 hom 9 2 9 0 N/A 0 0 182531 CASAVA_Build 12 6435568 4I TTTTTTACTG ----/CTTT CTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 CTTT 1 2 182532 CASAVA_Build 12 6451254 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2972 hom 21 9 10 3 A 11 10 182533 CASAVA_Build 12 6453242 1D TAAGGTGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 12 11 182534 CASAVA_Build 12 6461235 1I TTATATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 619 hom 25 2 21 2 T 13 14 182535 CASAVA_Build 12 6461614 3D AAAAGGAGAC AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 13 10 3 A 12 9 182536 CASAVA_Build 12 6462266 3I AGGCTGAGAC ---/AGG AGGATTGCTT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 AGG 1 2 182537 CASAVA_Build 12 6462519 1I CAGAGATGCA -/T GCCTGTAATC 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 T 0 1 182538 CASAVA_Build 12 6463093 1I AACAAAGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 9 10 182539 CASAVA_Build 12 6463173 8I GGTAAGGAAA --------/ATGTTCTG ATGTTCTGGA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 ATGTTCTG 1 2 182540 CASAVA_Build 12 6463977 5D ACTTTGTATT AAATC/----- AAATCAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 AAATC 2 1 182541 CASAVA_Build 12 6468175 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 314 hom 31 3 21 7 A 10 9 182542 CASAVA_Build 12 6469267 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTAAA 2605 het 1144 hom 37 7 17 13 T 7 8 182543 CASAVA_Build 12 6470244 1D TGGAGTTTTT G/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 11 3 G 1 0 182544 CASAVA_Build 12 6477077 1I GACTGAGTCT -/C CCTTCTGTCA 3070 hom 34 het 19 0 14 5 C 2 3 182545 CASAVA_Build 12 6478202 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 1669 hom 18 5 11 2 T 6 7 182546 CASAVA_Build 12 6480484 1D ATTACAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1105 hom 31 6 13 12 T 17 16 182547 CASAVA_Build 12 6482702 1I45M1I CTGAGAAAAA -TATGCTGTTATAACTGAATGCCTGAGACTGGATATTTATAATGAA-/TTATGCTGTTATAACTGAATGCCTGAGACTGGATATTTATAATGAAT AGAAATTTAT 3070 hom 57 het 17 0 20 8 N/A 0 0 182548 CASAVA_Build 12 6485274 2I CCTGGGTGAC --/AG AGCAAGAACC 3070 hom 45 het 23 0 15 8 AG 1 2 182549 CASAVA_Build 12 6489343 3D ATTGATATCT CTA/--- CTGATGAGCA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 CTA 1 0 182550 CASAVA_Build 12 6495746 4D2M6D CTGGCCAATA TGGTGAAATCCT/----GA------ GTCTCTACTA 2796 hom 15 het 7 0 6 1 N/A 0 0 182551 CASAVA_Build 12 6501012 1I CTGCTCAGGA -/G GCTGAAGTGA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 G 1 2 182552 CASAVA_Build 12 6511487 11D GAGCCCAGAG TCCTAGGGCCT/----------- GTCCCGGGAT 3070 het 3070 ref 35 26 9 2 TCCTAGGGCCT 1 0 182553 CASAVA_Build 12 6515335 1D TGCTCCCACT C/- CTGATTTCTG 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 C 2 1 182554 CASAVA_Build 12 6518880 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 746 het 746 ref 37 18 3 16 A 13 14 182555 CASAVA_Build 12 6545364 1I CAAACTTGTA -/G GTGCACTGGG 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 G 1 2 182556 CASAVA_Build 12 6546406 1D TACAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 12 11 182557 CASAVA_Build 12 6551159 1I AGGCAGAGGC -/G GGTGGATCAC 1813 hom 5 het 9 0 6 3 G 2 3 182558 CASAVA_Build 12 6553344 2D GCAGCTACTC AA/-- GAGGTTGAGG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 2 0 182559 CASAVA_Build 12 6556369 1D CAGACACGTC T/- TTTTTTTTTT 2532 het 1713 hom 27 10 7 11 T 13 12 182560 CASAVA_Build 12 6569632 1I CCCGAAGAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 8 9 182561 CASAVA_Build 12 6587269 3D CCTTTGCCAA CTT/--- CTTCTTCACT 3070 het 2788 hom 25 8 13 4 CTT 3 2 182562 CASAVA_Build 12 6587479 1I TCACCCCCCC -/A CCATACTACA 3070 het 1674 hom 29 8 10 11 A 0 1 182563 CASAVA_Build 12 6589600 1I AATAACCGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 8 9 182564 CASAVA_Build 12 6598784 5D GAGGAGAAGA GAGAG/----- GAGAGGAGAG 3070 het 3070 ref 40 15 18 8 GAGAG 4 3 182565 CASAVA_Build 12 6614071 1I AAAAAAAAAA -/C AAATTAGCCG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 0 1 182566 CASAVA_Build 12 6640243 5D GCTGAGTAAC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 het 2627 hom 21 7 9 7 TTTCT 3 2 182567 CASAVA_Build 12 6691015 3I AATAAATAAA ---/ATG ATATTATATG 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 ATG 0 1 182568 CASAVA_Build 12 6704585 1D CAGCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1195 het 1195 ref 24 11 3 10 T 17 16 182569 CASAVA_Build 12 6713884 4I TGGTCACAAC ----/AGTT AGTTATCTAT 3070 hom 143 het 57 0 46 11 AGTT 1 2 182570 CASAVA_Build 12 6737612 1I TGTCTCTGCT -/A AAAAAATACA 3070 het 1173 hom 13 3 10 0 A 6 7 182571 CASAVA_Build 12 6738795 1I CTGGCCAACA -/T TGGAGAAACC 2867 het 2867 ref 17 10 7 0 T 1 2 182572 CASAVA_Build 12 6752382 1D CCCCACAGGA G/- GGGACCAGCA 1995 het 1995 ref 28 13 7 8 G 4 3 182573 CASAVA_Build 12 6769640 1D CCAATTTTCC T/- TAACGGGACA 3070 hom 151 het 58 0 51 7 T 2 1 182574 CASAVA_Build 12 6779642 1D GGGTCTCAAT G/- CAGATGACGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 1 0 182575 CASAVA_Build 12 6783774 1D ATAAGGCAAG A/- AAAATGAAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 A 5 4 182576 CASAVA_Build 12 6784533 1D ATTGCTTGAG C/- CCTAGGAGGG 3070 hom 39 het 14 0 12 2 C 3 2 182577 CASAVA_Build 12 6786616 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAACATG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 6 7 182578 CASAVA_Build 12 6789613 1I CACCGCACCT -/G GCCACAGGCC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 1 2 182579 CASAVA_Build 12 6792319 1I TCTCAAGCGA -/T TCTTGTGCCT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 1 2 182580 CASAVA_Build 12 6797224 1D CACACTCTCA C/- CCCATGTACT 3070 het 3070 hom 72 32 33 7 C 4 3 182581 CASAVA_Build 12 6797516 10D TGGACTCACA CGCGCACACG/---------- CGCGCACACA 3070 het 3070 hom 56 24 20 12 CGCGCACACG 1 0 182582 CASAVA_Build 12 6801262 1I GGCAGGCAGC -/G GGGAGCCCGA 2247 het 1600 hom 12 5 7 0 G 3 4 182583 CASAVA_Build 12 6804778 1I CTCCACCTCC -/G GCTTCGCCTC 3070 hom 77 het 30 0 24 6 G 1 2 182584 CASAVA_Build 12 6812600 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 28 0 25 3 A 7 8 182585 CASAVA_Build 12 6854781 1D GACGGAGTCT A/- AGCTCTGATG 3070 hom 42 het 19 0 13 6 A 2 1 182586 CASAVA_Build 12 6864918 1I TGGGATTATA -/G GCGTGCGCCA 3070 hom 65 het 24 0 21 3 G 1 2 182587 CASAVA_Build 12 6868905 1I CGGGATTATA -/G GTGCCCATCA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 1 2 182588 CASAVA_Build 12 6869484 1D CCTGAGCCAC T/- TGCACCTGGC 3070 hom 42 het 19 0 14 6 T 2 1 182589 CASAVA_Build 12 6873353 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1697 het 1697 ref 26 9 6 12 A 15 14 182590 CASAVA_Build 12 6897155 1I CAATAAGCCA -/G GCCTGCGGCT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 1 2 182591 CASAVA_Build 12 6898474 1I GTCTGGATGA -/C CTGTTGGATT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 C 1 2 182592 CASAVA_Build 12 6899437 1I GAAAACTACT -/G GGGTCATGGG 3070 hom 87 het 37 0 29 8 G 3 4 182593 CASAVA_Build 12 6914909 1I ATGCAAGAGA -/G GCCCCAAATC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 1 2 182594 CASAVA_Build 12 6929902 1D TGTCCCCCAG C/- CCCCCAGGAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 6 5 182595 CASAVA_Build 12 6942325 1I CTCTGGCCTG -/C CAGCTCCGCT 3070 hom 60 het 22 0 16 6 C 1 2 182596 CASAVA_Build 12 6950472 1I GGAGGCCGTA -/G GTTTATTGTG 3070 hom 81 het 29 0 26 3 G 1 2 182597 CASAVA_Build 12 6960921 1I ATGAGGGAGA -/G GCTCCGCTCT 3070 hom 99 het 34 0 33 1 G 1 2 182598 CASAVA_Build 12 6964634 1I TAACACGGTG -/A AACCCCGTCT 1520 hom 12 het 5 0 5 0 A 2 3 182599 CASAVA_Build 12 6988887 1I CAGGCGTAAG -/C CACCGTGCCT 3070 hom 47 het 18 0 15 3 C 1 2 182600 CASAVA_Build 12 6989949 10I TCAGTGTGAC ----------/TTTAAGAAAG TTACTCAATC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 TTTAAGAAAG 0 1 182601 CASAVA_Build 12 7051637 1I ACCCCCCCCC -/A CCAGAGCAAA 3070 het 1596 hom 31 10 14 7 A 0 1 182602 CASAVA_Build 12 7051984 1D TCTTGATCTC T/- CTTAGACAGA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 1 0 182603 CASAVA_Build 12 7138308 1D ATATATATAT A/- TTTTTTGCCT 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 A 1 0 182604 CASAVA_Build 12 7160751 1D CAAGGTTGAG A/- CTATGTTGCA 3070 het 3070 ref 45 23 19 4 A 1 0 182605 CASAVA_Build 12 7169940 3D CACCTCTACC AAA/--- AAAAAAAAAA 1959 het 1959 ref 30 13 8 10 A 16 13 182606 CASAVA_Build 12 7172912 30D ACCTTGGCTT TTCCTGAGGAAGGAACCTGGAGCAGGATCC/------------------------------ TTCCTGAGGA 3070 hom 67 het 33 0 23 11 TTCCTGAGGAAGGAACCTGGAGCAGGATCC 1 0 182607 CASAVA_Build 12 7175608 8I CCTCAGCCTC --------/GCCTCCTA GCCTCCTAGC 3070 het 2445 hom 51 7 11 33 GCCTCCTA 1 2 182608 CASAVA_Build 12 7222755 1D CAGTCTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 26 0 22 4 T 13 12 182609 CASAVA_Build 12 7241876 2D TTTGTTTCCT TG/-- TGTTCTTTAG 3070 hom 106 het 39 0 34 5 TG 2 1 182610 CASAVA_Build 12 7245206 4I ACACGTATAT ----/ATAC ATACATATCA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 ATAC 1 2 182611 CASAVA_Build 12 7272804 4D CTCAATTGAT AGTC/---- TATCTAGAGG 3070 hom 117 het 41 0 39 3 AGTC 1 0 182612 CASAVA_Build 12 7274845 3I ATAGGCAATT ---/GTA GTACAGTGGA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 GTA 1 2 182613 CASAVA_Build 12 7275000 1I GGGAGCATTG -/A AGGGTAGAGA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 1 2 182614 CASAVA_Build 12 7275765 2D CTCCAAAATT AC/-- ATTTTATTCA 3070 hom 102 het 42 0 33 9 AC 1 0 182615 CASAVA_Build 12 7279068 1D ATTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 A 13 12 182616 CASAVA_Build 12 7285122 1D TAATAGAAAT A/- TTTTTTTCTG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 1 0 182617 CASAVA_Build 12 7285565 2D TCTGAGACCT GA/-- TTCAGCAAAC 3070 hom 163 het 59 0 55 5 GA 1 0 182618 CASAVA_Build 12 7286377 1D ATTTGTGCCC T/- TACGCAGGTG 3070 hom 60 het 23 0 20 4 T 2 1 182619 CASAVA_Build 12 7291849 1D TCTTCTCTGA G/- GGGGGCTGGG 3070 hom 99 het 38 0 32 6 G 6 5 182620 CASAVA_Build 12 7293040 3I TGTGCTGAAG ---/CTT CTTCATGAGA 3070 het 560 hom 40 7 25 8 CTT 1 2 182621 CASAVA_Build 12 7293933 4D AGCAAGGATA ATAG/---- ATAGAAGCCT 3070 hom 78 het 27 0 27 2 ATAG 2 1 182622 CASAVA_Build 12 7294613 3I AAAATTTAAA ---/AAT AATAAAATAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AAT 1 2 182623 CASAVA_Build 12 7300273 2I AATTTACAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 10 12 182624 CASAVA_Build 12 7301156 1I GGCAATGGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 24 hom 28 1 24 3 A 9 10 182625 CASAVA_Build 12 7307214 1I GAAATACCTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 21 hom 29 1 22 6 A 8 9 182626 CASAVA_Build 12 7314616 4D CAAACAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 123 het 123 ref 30 3 2 25 AAAG 1 0 182627 CASAVA_Build 12 7323250 2I GGGATGTCTG --/CA CAGAGTCCTG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 CA 1 2 182628 CASAVA_Build 12 7335787 8I ACCAGAGGGT --------/ATAATGTA ATAATGTAAA 3070 hom 117 het 49 0 39 11 ATAATGTA 1 2 182629 CASAVA_Build 12 7337682 1I AGGGAGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 122 hom 33 2 20 11 T 13 14 182630 CASAVA_Build 12 7340120 4D TTTTAATCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AAAT 5 4 182631 CASAVA_Build 12 7345383 3I TTTTCTTTGC ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TGT 3 4 182632 CASAVA_Build 12 7345480 1D CGTTCAAGCG A/- AGTCTCCTGC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 2 1 182633 CASAVA_Build 12 7347242 1D ATATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 28 2 14 12 A 19 18 182634 CASAVA_Build 12 7447062 1D ATTATTAAAT A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 7 6 182635 CASAVA_Build 12 7465609 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 1883 hom 18 het 12 0 7 5 TA 12 10 182636 CASAVA_Build 12 7475291 1I GACTCCATCC -/A AAAAAAAAAA 1766 het 1766 ref 15 7 5 3 A 10 11 182637 CASAVA_Build 12 7478953 2D TGTAGTTGAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 AC 6 5 182638 CASAVA_Build 12 7479104 6D TGATAAAATT AAAGAA/------ AACTTGATAA 3070 het 3070 ref 21 11 10 1 AAAGAA 1 0 182639 CASAVA_Build 12 7480580 3D CCACTTTAAT AAC/--- AATAAAATTT 2819 het 2819 ref 19 9 6 5 AAC 1 0 182640 CASAVA_Build 12 7484493 1D ATCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 20 2 13 5 T 15 14 182641 CASAVA_Build 12 7495077 2D AACGTACAAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AG 9 8 182642 CASAVA_Build 12 7495675 1I TAAAATGGGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 8 9 182643 CASAVA_Build 12 7501556 14D GATGCAAAGC AAAACAAAAAACAA/-------------- AAAACAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAAACAA 4 2 182644 CASAVA_Build 12 7504045 1I CACCAGCTGT -/G GTGGCCATGG 3070 hom 125 het 48 0 39 9 G 1 2 182645 CASAVA_Build 12 7508032 2D GGTGCTGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 20 3 10 7 T 17 15 182646 CASAVA_Build 12 7510758 1D ACAACAACTC A/- AAAAATGATA 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 A 6 5 182647 CASAVA_Build 12 7514077 1I GGAGAAAGTT -/C AAGAGATCTA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 C 0 1 182648 CASAVA_Build 12 7515393 1D TTAAATGCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 23 12 6 T 9 8 182649 CASAVA_Build 12 7541161 4I ATGGAAGGAG ----/GAGT GAGTGGATCA 3070 het 3070 ref 47 19 21 8 GAGT 1 2 182650 CASAVA_Build 12 7548388 1D TTTAAGGCAT A/- AAAAATAGCA 3070 hom 157 het 58 0 53 7 A 6 5 182651 CASAVA_Build 12 7552825 4D TCTTGGAGGC TTTG/---- TTTGTTTCTT 2465 hom 12 het 5 0 5 0 TTTG 2 1 182652 CASAVA_Build 12 7555148 14D AGAGAGAGAG TAGGGAGGAGGCAA/-------------- GGAGAGAGAG 301 het 301 ref 37 18 2 21 TAGGGAGGAGGCAA 1 0 182653 CASAVA_Build 12 7572525 4D AGGTTGAAAC TGTT/---- TGGAGTGCTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TGTT 1 0 182654 CASAVA_Build 12 7579859 6D ATGTACGCAC TTATAG/------ TTATAAACTT 3070 hom 93 het 34 0 31 5 TTATAG 1 0 182655 CASAVA_Build 12 7581796 4D TCACTGTTTT TGTC/---- TGTCTGTTTG 3070 hom 45 het 21 0 14 7 TGTC 2 1 182656 CASAVA_Build 12 7591486 1I AGAGATACAC -/A ACAAAAAAAG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 1 2 182657 CASAVA_Build 12 7594393 1D AGTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 20 6 A 12 11 182658 CASAVA_Build 12 7604344 5D CCACGACTAC CACCA/----- CTCTCCTCAC 3070 hom 120 het 44 0 41 5 CACCA 1 0 182659 CASAVA_Build 12 7613153 1I GATGGTTACC -/G GGGCCACAGG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 3 4 182660 CASAVA_Build 12 7613322 1D CTTTAGCCAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 33 0 29 4 A 9 8 182661 CASAVA_Build 12 7613613 1D TTATTTTTCC T/- GGTAATTGGA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 T 1 0 182662 CASAVA_Build 12 7615723 2I ACACAGACAT --/GG GGGATAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 3 5 182663 CASAVA_Build 12 7617915 1D GTCCAAACAG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 7 182664 CASAVA_Build 12 7632992 1I CAAAAGATGA -/T TAAAGTATTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 1 2 182665 CASAVA_Build 12 7636483 1D GATGAAGGTT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 58 het 24 0 20 4 G 11 10 182666 CASAVA_Build 12 7659854 2D TCATTCGTTT TG/-- TGTTATATAT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 TG 2 1 182667 CASAVA_Build 12 7662689 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 595 het 595 ref 27 19 3 7 A 15 14 182668 CASAVA_Build 12 7671890 1I TTTCCATCCT -/G GGGCCCAAGT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 G 3 4 182669 CASAVA_Build 12 7672013 3I CGCGATTTTG ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 hom 73 het 33 0 23 10 TGT 4 5 182670 CASAVA_Build 12 7677363 1I AACACTGCCT -/G TTTATTTGCT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 G 0 1 182671 CASAVA_Build 12 7684572 1I TTTCGCTCTT -/G GGGGTCCATA 3070 hom 51 het 19 0 16 3 G 4 5 182672 CASAVA_Build 12 7691222 1I CCTTGCCCCC -/T GATCTGTGCT 3070 hom 77 het 29 0 25 4 T 0 1 182673 CASAVA_Build 12 7696960 1I GTCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 48 het 18 0 15 3 T 7 8 182674 CASAVA_Build 12 7701441 2I AAACAAAATT --/AA AAAAAACAAA 3070 hom 48 het 32 1 27 4 A 6 8 182675 CASAVA_Build 12 7705960 5D AAACAAAACA AAACC/----- AAACCTTTTT 3070 hom 69 het 24 0 22 2 AAACC 2 1 182676 CASAVA_Build 12 7718541 2D TTTTTATTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 T 13 11 182677 CASAVA_Build 12 7722866 1I ACCCGACTAA -/T TTTTTTTTTT 3008 hom 45 het 23 0 15 8 T 13 14 182678 CASAVA_Build 12 7730175 1I AGAGGTTGTA -/G GTGAACCGAG 2230 het 2230 ref 25 16 6 3 G 1 2 182679 CASAVA_Build 12 7735013 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2258 het 497 hom 13 2 8 3 A 15 14 182680 CASAVA_Build 12 7754236 1D TAAACTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 12 11 182681 CASAVA_Build 12 7754548 1D TGAATAAGAC G/- GGAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 G 3 2 182682 CASAVA_Build 12 7756609 6D GCGCCCGTCC TATTTT/------ TATTTTTATT 1851 het 1851 ref 15 9 5 2 TATTTT 4 3 182683 CASAVA_Build 12 7758139 1D TTACAGTCAT C/- CCTCGGTTAT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 C 3 2 182684 CASAVA_Build 12 7758526 3D TACAGGCATG CAC/--- CACCACCACG 1400 het 1400 ref 16 13 3 0 CAC 4 3 182685 CASAVA_Build 12 7760045 1I AATAAACATA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 7 8 182686 CASAVA_Build 12 7760470 4D GTTGATACTT TCAC/---- GTGCTGTCAC 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 TCAC 1 0 182687 CASAVA_Build 12 7763934 2I CATTTTACAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 45 0 34 11 A 10 12 182688 CASAVA_Build 12 7771509 2I ACTTATTGGG --/GT ATATGAGGAC 3070 hom 52 het 33 0 14 19 GT 0 1 182689 CASAVA_Build 12 7772038 3I TTCAAATATC ---/CTT CTTTTACTTA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 CTT 1 2 182690 CASAVA_Build 12 7773160 4D CTCAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AAAG 1 0 182691 CASAVA_Build 12 7773270 8D TCATTTTATG AATGAATA/-------- AATGAATAAA 3070 het 255 hom 32 8 21 4 AATGAATA 3 2 182692 CASAVA_Build 12 7777854 4D CTCCCAGATT CAAG/---- CAATTCTTCT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 CAAG 1 0 182693 CASAVA_Build 12 7783325 1D ATATTTCCTT C/- CTGCAAAGGA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 C 2 1 182694 CASAVA_Build 12 7795006 2D AGAGGCCAGG CA/-- CAGTGGCTCA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 CA 2 1 182695 CASAVA_Build 12 7796914 3D CCATTCAGGC TAT/--- TATTATTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 TAT 3 2 182696 CASAVA_Build 12 7801226 3D CCTTCCTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 2444 het 936 hom 24 8 6 11 T 25 22 182697 CASAVA_Build 12 7806955 2D CTTTGAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 1533 het 567 hom 35 11 5 19 T 20 18 182698 CASAVA_Build 12 7813190 1D GCCTGGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 580 hom 22 2 13 7 T 15 14 182699 CASAVA_Build 12 7826920 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 92 hom 21 1 18 2 A 10 9 182700 CASAVA_Build 12 7828293 2I CAGTAGTGAG --/GC GGGGGGGGGG 3070 hom 42 het 24 0 14 10 GC 0 1 182701 CASAVA_Build 12 7829800 1D GGCTGTCATG A/- AAAAAAAAAA 2713 het 2713 ref 42 22 7 13 A 15 14 182702 CASAVA_Build 12 7833982 4D GCTGGACACA TGTG/---- AATAAATAGC 3070 hom 141 het 50 0 47 4 TG 2 0 182703 CASAVA_Build 12 7834052 3I ATGAGCATGA ---/TGT TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 TGT 0 1 182704 CASAVA_Build 12 7840219 1I46M3D ATGAATGAAT -AATAAATATGCCAGTTTTAGAAAAAAGGGCACTTACGTGCATTGTACAT/AAATAAATATGCCAGTTTTAGAAAAAAGGGCACTTATGTGCATTGTA--- GTGCATCTAC 3070 hom 48 het 15 0 17 9 N/A 0 0 182705 CASAVA_Build 12 7840565 1D21M4I TCTCTCATTA TTTCCCCAATTGTCCAATGTTA----/-TTCCCCAATTGTCCAATGTTACTCT CTAAGACTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 N/A 0 0 182706 CASAVA_Build 12 7841622 3D ATTCAAGCAA TCC/--- TCCTGCCTGA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TCC 2 1 182707 CASAVA_Build 12 7841784 2D CCGAAGTGCT GA/-- GATTACAGGC 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 GA 2 1 182708 CASAVA_Build 12 7843051 2I GCAGTGGTAG --/CA CACTACCTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 CA 1 2 182709 CASAVA_Build 12 7843245 1D GTCCTCTGAT A/- ACACTGGCGT 3070 hom 63 het 25 0 21 6 A 2 1 182710 CASAVA_Build 12 7844018 1I ACTTGAACCC -/G GTAGGTGGAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 1 2 182711 CASAVA_Build 12 7844130 13D ACAACATAGG AAAATATTTATAA/------------- ACTGTATTAC 3070 het 3070 hom 22 8 11 6 AAAATATTTATAA 1 0 182712 CASAVA_Build 12 7845726 2D CAGATGAAGA CT/-- CTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 16 14 1 CT 2 1 182713 CASAVA_Build 12 7846363 1I ATGGGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 19 0 11 8 A 11 12 182714 CASAVA_Build 12 7846738 1I CCAGGACCAA -/C CCTGGCCTAT 3070 het 3070 hom 29 7 15 7 C 2 3 182715 CASAVA_Build 12 7847712 5D AGCCCATGAT TAAAC/----- TAACAATTTG 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 TAAAC 1 0 182716 CASAVA_Build 12 7847803 4I CCAGTATTTT ----/ATCC GGGGGCCGAG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 ATCC 0 1 182717 CASAVA_Build 12 7848404 1D GCCTGGCCAA C/- ATGGCGAAAC 3070 het 946 hom 10 3 7 0 C 1 0 182718 CASAVA_Build 12 7848803 1I GAAAGTTGAT -/A AGAGTCCTGC 3070 het 3070 ref 23 13 9 2 A 1 2 182719 CASAVA_Build 12 7850855 4D AGATTAGACT GTCC/---- CTCTTTGGGC 3070 het 3070 hom 41 18 15 8 GTCC 1 0 182720 CASAVA_Build 12 7853589 1D TAGTGTACTC T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 7 6 182721 CASAVA_Build 12 7855811 1D AGAAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 897 hom 39 3 27 9 A 13 12 182722 CASAVA_Build 12 7862082 2I GGTCTTACTC --/TG TGTTGCCCAG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TG 1 2 182723 CASAVA_Build 12 7864592 1I TCCCATCCAT -/C CCATATTTGC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 C 2 3 182724 CASAVA_Build 12 7867584 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 68 het 27 0 23 4 A 9 10 182725 CASAVA_Build 12 7871574 1I AGGAAAGGAT -/A AAAGAGAATG 3070 hom 60 het 21 0 19 2 A 3 4 182726 CASAVA_Build 12 7873418 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 28 2 21 6 A 13 12 182727 CASAVA_Build 12 7874021 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 19 1 10 8 T 13 11 182728 CASAVA_Build 12 7875116 2D CCCAGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 29 0 17 12 T 14 12 182729 CASAVA_Build 12 7878585 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 409 hom 31 1 27 3 A 9 10 182730 CASAVA_Build 12 7878964 1D TAGCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 21 1 16 5 A 15 14 182731 CASAVA_Build 12 7887062 1I TTTTTCACCC -/T TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 T 6 7 182732 CASAVA_Build 12 7887820 5D CTTCCTTTAT TGTTG/----- TCTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 27 11 3 TGTTG 1 0 182733 CASAVA_Build 12 7890607 6D CGATTCTCCT GCCTCA/------ GCCTCTGGAG 1484 het 781 hom 9 2 5 3 GCCTCA 1 0 182734 CASAVA_Build 12 7892245 1D TCTTTTTTTT A/- TTATTATTTT 2517 het 2517 ref 29 16 8 6 A 1 0 182735 CASAVA_Build 12 7899491 1I CAAATGCTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 9 10 182736 CASAVA_Build 12 7914742 3D CAAAGCCAAG ACC/--- ACCAAGAAGC 3070 het 3070 hom 32 12 16 6 ACC 2 1 182737 CASAVA_Build 12 7917506 12D CCGTCTCAAA AAACAAACAAAC/------------ AAACAAACAA 3070 hom 49 het 21 0 16 8 AAAC 9 6 182738 CASAVA_Build 12 7920398 1D AGCAGTATGG A/- AGATTCCTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 1 182739 CASAVA_Build 12 7926754 1D ATTCAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 31 0 23 8 A 12 11 182740 CASAVA_Build 12 7927963 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 5 4 182741 CASAVA_Build 12 7929418 1I AATTGGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 25 1 22 2 T 12 13 182742 CASAVA_Build 12 7946161 1D CCCGATTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 T 9 8 182743 CASAVA_Build 12 7946404 1I TATTTTCTGG -/T GTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 1 182744 CASAVA_Build 12 7949541 2D ACAAGGTTAA TT/-- CTACTGTAAA 3070 het 3070 ref 37 27 8 3 T 2 0 182745 CASAVA_Build 12 7951674 1I CCTCTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 1486 hom 10 het 10 0 4 6 T 9 10 182746 CASAVA_Build 12 7952670 4D GCTCTGTAAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 16 12 182747 CASAVA_Build 12 7953512 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 94 hom 26 1 20 5 A 9 10 182748 CASAVA_Build 12 7954852 1D TTCTTTTCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 130 hom 37 1 24 13 T 13 12 182749 CASAVA_Build 12 7957978 2I ATCTTCCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 12 14 182750 CASAVA_Build 12 7960555 6D TGCAGTGGCA CGATCT/------ CGATCTCGGC 1066 hom 7 het 4 0 3 1 CGATCT 2 1 182751 CASAVA_Build 12 7964762 1D AAACTTAAAG T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 2 1 182752 CASAVA_Build 12 7967632 1D CAGGATTGGA T/- TTTTTTTTTT 1885 het 584 hom 25 2 8 15 T 17 16 182753 CASAVA_Build 12 7980708 2I AGGGAAGAAA --/AT ATCTGAATTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 AT 1 2 182754 CASAVA_Build 12 7982505 3I CAATATAAAA ---/ATT ATTAATAGTT 2957 het 2957 ref 22 10 7 5 ATT 1 2 182755 CASAVA_Build 12 7985526 1I ACCCTGAGTC -/A AAAAAAAAAA 1635 het 524 hom 13 2 5 6 A 13 14 182756 CASAVA_Build 12 7987206 1I CTTTCTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 18 5 10 3 C 0 1 182757 CASAVA_Build 12 7988449 1D ATTCAATTAA T/- TTTTTTTTTC 2655 het 2655 ref 36 21 8 7 T 10 9 182758 CASAVA_Build 12 8002395 5D GCAGGATCAC AGACA/----- AGACAAGGGT 3070 het 3070 ref 40 22 12 8 AGACA 2 1 182759 CASAVA_Build 12 8016512 5I TTTATTTTTG -----/TCTTT TCTTTTATTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TCTTT 1 2 182760 CASAVA_Build 12 8022107 2D GACACAACTC TT/-- ATATCTTGAC 2619 het 2002 hom 16 7 6 4 T 2 0 182761 CASAVA_Build 12 8025037 8D GTTTTTGTAT TTTTGGTA/-------- GAAACGGGGT 3070 het 3055 hom 19 9 9 2 TTTTGGTA 1 0 182762 CASAVA_Build 12 8032195 1I AATGATCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 11 12 182763 CASAVA_Build 12 8033467 1I GCTGCACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 A 9 10 182764 CASAVA_Build 12 8035008 1D CAGTTATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1099 hom 40 5 18 17 A 15 14 182765 CASAVA_Build 12 8036486 1I CTAGAAAATT -/A AAAGTTGTGC 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 3 4 182766 CASAVA_Build 12 8037713 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1278 hom 14 3 10 2 A 12 11 182767 CASAVA_Build 12 8038927 4I GTTCCAAGAG ----/TGTA TGTATTTCCG 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 TGTA 1 2 182768 CASAVA_Build 12 8047016 6I GTCTACTACT ------/TCCTTA CCACCACAAT 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 TCCTTA 0 1 182769 CASAVA_Build 12 8057357 5D GTCTCAAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 27 het 18 0 10 9 AAATA 5 4 182770 CASAVA_Build 12 8058636 3D CATTTTATCA AAT/--- AAGGGTTCTG 3070 hom 117 het 43 0 40 5 AAT 1 0 182771 CASAVA_Build 12 8110501 1D TTTAGAAATG A/- AAAAAAAAAG 1012 het 1012 ref 43 39 3 1 A 10 9 182772 CASAVA_Build 12 8123327 5D TAAGTAAGGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 39 0 22 17 T 21 16 182773 CASAVA_Build 12 8126440 1D ATTTCTGCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 33 1 28 4 T 11 10 182774 CASAVA_Build 12 8140656 1D TTGAATTGTG T/- TAACATCTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 T 2 1 182775 CASAVA_Build 12 8147219 1I CTACTAGTTG -/T TTTCTTTGTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 3 4 182776 CASAVA_Build 12 8148031 1D GAAAATCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 40 0 24 16 T 15 14 182777 CASAVA_Build 12 8151635 1D GATCTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 1768 het 1768 ref 27 19 4 4 T 13 12 182778 CASAVA_Build 12 8158114 1I CCTTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 1133 het 1133 ref 18 10 3 5 T 10 11 182779 CASAVA_Build 12 8161096 1D TGGGCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 27 0 20 8 T 11 10 182780 CASAVA_Build 12 8162259 2D GCACTGCTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 39 0 31 10 A 14 12 182781 CASAVA_Build 12 8164540 1D TGTTTTAGTG T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 T 7 6 182782 CASAVA_Build 12 8169069 10D GTAAAGGAAA ATAATAGGTC/---------- AGAAATCAGT 3070 hom 123 het 42 0 42 4 ATAATAGGTC 1 0 182783 CASAVA_Build 12 8175369 1D CAGAGGAGGT C/- CCTCTTTTTG 3070 hom 81 het 30 0 27 4 C 3 2 182784 CASAVA_Build 12 8175688 2I TATATATATC --/TA TATATATATA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TA 7 8 182785 CASAVA_Build 12 8181144 1D TTAATAATGC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 8 182786 CASAVA_Build 12 8196636 1D ACATTGTCAT G/- TGTAAATTTG 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 G 1 0 182787 CASAVA_Build 12 8203526 3I GGATTGTTTG ---/TTC TTTTCTTTTT 1415 het 1415 ref 17 11 4 2 TTC 0 1 182788 CASAVA_Build 12 8205365 1I TCAGGGTATC -/T TAATTCTTCC 3070 het 3070 ref 29 18 11 0 T 1 2 182789 CASAVA_Build 12 8210819 1D TTTGCTTTCC T/- TTTAGTTACC 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 4 3 182790 CASAVA_Build 12 8214404 1I ATGACCAGGT -/A AATGACTTTT 2690 het 2690 ref 21 13 6 2 A 2 3 182791 CASAVA_Build 12 8216359 3I GCTTTTCATC ---/ACA GGTTGATCTG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 ACA 0 1 182792 CASAVA_Build 12 8218737 1D GTAAATCGAA T/- TTTTTTTTGT 2913 het 2913 ref 21 10 7 4 T 9 8 182793 CASAVA_Build 12 8222195 1I TTATGCAATG -/A AAAAATCATG 1340 het 1340 ref 47 41 3 3 A 5 6 182794 CASAVA_Build 12 8229688 1I TATTTAAGAA -/C ATATTCCTGT 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 C 0 1 182795 CASAVA_Build 12 8243818 1D ACATATGCAG T/- TTAAGAAAGG 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 3 2 182796 CASAVA_Build 12 8244917 2D GAATGATATA AC/-- ATTATTTTTT 3070 het 3070 ref 48 16 8 27 AC 1 0 182797 CASAVA_Build 12 8244998 1I TGGGAGTAAT -/G GATGATTCAG 3070 het 3070 ref 59 36 17 6 G 1 2 182798 CASAVA_Build 12 8254788 1D CTTGGCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 75 22 32 21 A 14 13 182799 CASAVA_Build 12 8255156 2D5M1D CATTTATATT AAGTTACA/--GTTAC- ATTAATTAGG 3070 het 3070 ref 77 70 7 3 N/A 0 0 182800 CASAVA_Build 12 8255910 3I ATTATTATCA ---/TCC TCACACATTA 3070 het 3070 ref 68 40 21 7 TCC 0 1 182801 CASAVA_Build 12 8256660 1I TGCTTCTGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 63 15 23 25 T 9 10 182802 CASAVA_Build 12 8256817 4I TCCATTGTGC ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 9 12 13 AT 6 8 182803 CASAVA_Build 12 8268321 3D TGAACCCGAT GTC/--- AACAACACAG 3070 het 1360 hom 22 4 14 6 GTC 1 0 182804 CASAVA_Build 12 8274253 1D TTGATGTGCA C/- CCCCCCCAGG 3070 hom 88 het 32 0 29 3 C 8 7 182805 CASAVA_Build 12 8279971 1I GTTTTATCTT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 25 1 17 7 A 0 1 182806 CASAVA_Build 12 8282587 2D GCGGGTGCTT CA/-- CACACACACA 1371 het 1371 ref 27 15 3 10 CA 6 5 182807 CASAVA_Build 12 8285497 11D TCACGGAAGG CATTTATTAAA/----------- CATTTTGAGA 3070 het 3070 ref 48 36 9 9 CATTTATTAAA 1 0 182808 CASAVA_Build 12 8288709 3D AGATCTGACA AAG/--- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 24 8 4 AAG 1 0 182809 CASAVA_Build 12 8292280 1D CATCAAGAAT A/- AAAGCCCTCT 3070 het 281 hom 16 1 11 5 A 4 3 182810 CASAVA_Build 12 8295865 2I AGCTAGACAC --/AG GGTGCTGATT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AG 0 1 182811 CASAVA_Build 12 8297678 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGTCTCCC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 G 5 4 182812 CASAVA_Build 12 8299426 2I CATATACATG --/TA TATATATATG 3070 hom 3 het 19 1 16 2 TA 4 5 182813 CASAVA_Build 12 8300606 1I TACAGCAACT -/G GGTCAGCTTT 2064 het 2064 ref 40 25 5 10 G 2 3 182814 CASAVA_Build 12 8304321 14I TAGAAGTTGC --------------/TTTTAGGTAGAAGT TGGTCCCATC 1864 het 1864 ref 44 33 4 7 TTTTAGGTAGAAGT 0 1 182815 CASAVA_Build 12 8313818 1I TCCCATGAGG -/A ATGCCATTAT 2106 het 2106 ref 49 34 5 10 A 1 2 182816 CASAVA_Build 12 8314994 1D CCGTCTCTAT A/- AAAAAATTTA 3070 hom 45 het 22 0 15 7 A 7 6 182817 CASAVA_Build 12 8320733 3D TCTTATTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 31 1 15 16 T 16 13 182818 CASAVA_Build 12 8321981 2D TGGAGAAAAC AG/-- AACCTGAAGA 1339 het 1339 ref 32 26 3 4 AG 1 0 182819 CASAVA_Build 12 8331310 1D CCCAGCAAAA G/- GTCATTAACG 3070 het 836 hom 23 3 17 3 G 2 1 182820 CASAVA_Build 12 8342118 1D ATAGTACTGC T/- TTTTTTTTTT 2495 het 458 hom 27 4 7 16 T 15 14 182821 CASAVA_Build 12 8342243 4D CTTTCTATGA GCTG/---- TCGCTCATGG 3070 het 2774 hom 25 6 11 8 GCTG 1 0 182822 CASAVA_Build 12 8352178 6D AGTGAGACAC CCCCTT/------ CCCCAATTTC 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 CCCCTT 1 0 182823 CASAVA_Build 12 8352601 3I AAGCCCTGGA ---/AGG AGATGAGCAG 3070 hom 57 het 21 0 18 3 AGG 0 1 182824 CASAVA_Build 12 8356379 1I GAATAAATCC -/T TTTTTTTTTT 2693 het 541 hom 32 4 12 16 T 15 16 182825 CASAVA_Build 12 8360411 1I ATCTGGAATG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 23 8 3 A 8 9 182826 CASAVA_Build 12 8362005 3D AGAAACTATG TGT/--- TGTTTTACAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 TGT 2 1 182827 CASAVA_Build 12 8362706 1I TGAATCTTGC -/T TGCAAGGTCG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 1 2 182828 CASAVA_Build 12 8367700 1D TTTATAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 17 0 11 7 T 11 10 182829 CASAVA_Build 12 8373008 1D TCTTACAGCC T/- CCCCCCCTTT 3057 het 1901 hom 23 8 9 6 T 1 0 182830 CASAVA_Build 12 8374501 1D TTAAGCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 844 hom 26 4 10 12 T 15 14 182831 CASAVA_Build 12 8375091 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 6 7 182832 CASAVA_Build 12 8379389 6I TGTATTTCTA ------/ATAGAG ATAGAGTTTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 ATAGAG 1 2 182833 CASAVA_Build 12 8381454 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- TCCTGCAAAT 1503 het 1503 ref 52 36 4 16 AAAAG 1 0 182834 CASAVA_Build 12 8382730 1D AGTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 20 1 18 1 A 12 11 182835 CASAVA_Build 12 8385279 2D TGATTTGCTT CC/-- CCTGGGCTCC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 4 2 182836 CASAVA_Build 12 8386506 1D GGTTGCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 21 2 12 7 T 14 13 182837 CASAVA_Build 12 8388271 1D CAAGCAAAAC A/- AAAGAATTTC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 4 3 182838 CASAVA_Build 12 8391024 1I TCCAAAGTTA -/C TTCCACATAT 3070 hom 24 het 11 0 8 3 C 0 1 182839 CASAVA_Build 12 8394318 1I CAGAAACAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 4 het 15 1 11 3 A 9 10 182840 CASAVA_Build 12 8396094 1D AAATCAAAGC G/- GGGGCCATGT 2322 het 2322 ref 46 38 5 3 G 5 4 182841 CASAVA_Build 12 8401924 1D CAACATAGAT G/- AACTTGAAAG 3070 het 2325 hom 27 5 19 3 G 1 0 182842 CASAVA_Build 12 8401991 1D CATGATTTTA C/- TTATATGTGG 2419 het 2419 ref 24 16 5 5 C 1 0 182843 CASAVA_Build 12 8402114 1D CAAAGTTTCC A/- ATAGGAAGAA 3070 het 3070 ref 62 36 16 11 A 2 1 182844 CASAVA_Build 12 8402457 26D TGTGTGTGTG TGTATGTATGTATGCATGTATGTATA/-------------------------- TGTGTGTGTG 1849 het 1849 ref 46 18 12 25 TGTATGTATGTATGCATGTATGTATA 1 0 182845 CASAVA_Build 12 8405640 1I ACACAAAACA -/T TTTCATGAGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 3 4 182846 CASAVA_Build 12 8415886 1D AGTGAGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 30 0 25 5 T 13 12 182847 CASAVA_Build 12 8417612 1I GGTCAGGGAT -/G TTTTTTTGAG 924 het 261 hom 11 2 5 4 G 0 1 182848 CASAVA_Build 12 8430754 1I ACACAGGATG -/C CCCCCACCAC 3070 hom 93 het 34 0 28 6 C 5 6 182849 CASAVA_Build 12 8442333 1D GCAGTTATCA T/- TAAAAGACAG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 2 1 182850 CASAVA_Build 12 8442440 1D AAGAAGCCTG C/- CACATTTTTA 2819 het 2819 ref 26 18 6 2 C 2 1 182851 CASAVA_Build 12 8470593 14I GTGGACACCC --------------/TGTGATATGATTGG TAATATCCTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TGTGATATGATTGG 0 1 182852 CASAVA_Build 12 8482422 1I TTAGCTATAC -/G AGGCTTTCTG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 0 1 182853 CASAVA_Build 12 8482534 1I CTCTTTTCAG -/A AAAAAATACA 2168 het 276 hom 6 1 5 0 A 6 7 182854 CASAVA_Build 12 8483947 1I ATGTATCACT -/C GTGTTATCAC 3070 hom 39 het 19 0 13 6 C 0 1 182855 CASAVA_Build 12 8486628 2I GGGCCTCCTG --/CT CTGAGTCACC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 CT 1 2 182856 CASAVA_Build 12 8487493 1D GCTGCTACCC A/- AAAACACGCC 3070 hom 41 het 16 0 12 4 A 5 4 182857 CASAVA_Build 12 8497603 10I TTGTAACCAA ----------/AGATGCTCTT ATCATTTCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AGATGCTCTT 0 1 182858 CASAVA_Build 12 8497702 1I TTCAATATTC -/A TAGTAGATTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 0 1 182859 CASAVA_Build 12 8499728 2I22M4I ATGGTTTTCA --ATGTTTCTCAATTCCTCTTTTG----/ATATGTTTCTCAATTCCTCTTTTGTTTT TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 27 0 31 4 N/A 0 0 182860 CASAVA_Build 12 8506987 4D TATCCCCTTG AACT/---- AAAATTTACA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AACT 1 0 182861 CASAVA_Build 12 8507194 2I TAAGTAAAAC --/TA TTGGAAGTCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TA 0 1 182862 CASAVA_Build 12 8508199 2I TCTTTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TC 0 1 182863 CASAVA_Build 12 8509107 1I CAATAGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 28 1 20 7 T 13 14 182864 CASAVA_Build 12 8510707 1I TAGTAAAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 3 4 182865 CASAVA_Build 12 8511402 1I ATTCTGTTCC -/A ATTGGTCTCT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 1 2 182866 CASAVA_Build 12 8523414 1D TCAAAAGTGA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 7 6 182867 CASAVA_Build 12 8533042 4D GTAAATGAGA CAAT/---- CAATCACAGA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 CAAT 2 1 182868 CASAVA_Build 12 8539877 1I GCTGCAGGAG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 30 het 12 0 10 2 T 7 8 182869 CASAVA_Build 12 8547182 1D AAGTGGGAAA G/- AAACACACCT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 G 1 0 182870 CASAVA_Build 12 8551237 1D TTGTAAATTC T/- TTTTTCTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 T 6 5 182871 CASAVA_Build 12 8579453 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 A 6 7 182872 CASAVA_Build 12 8584513 1I TGTCCCCCCA -/C CTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 38 0 35 3 C 1 2 182873 CASAVA_Build 12 8584687 4I GTTTTTTGTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TC 6 8 182874 CASAVA_Build 12 8584999 1D AACAGGAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 T 10 9 182875 CASAVA_Build 12 8587431 30D TCCTTTGGGT ATATACCCAGTAATGGGGTGGCTGGGTCAA/------------------------------ ATTGTATTTC 3070 het 3066 hom 11 8 9 2 ATATACCCAGTAATGGGGTGGCTGGGTCAA 1 0 182876 CASAVA_Build 12 8587530 1I ACTAGTTTAC -/A GTCCCACCAA 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 A 0 1 182877 CASAVA_Build 12 8587896 4D TTGAACTGCC ATCT/---- ATCTGTAAGC 3070 het 3070 ref 47 26 17 8 ATCT 2 1 182878 CASAVA_Build 12 8588258 1I TTTTTATTAC -/A AAAAATCCCA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 5 6 182879 CASAVA_Build 12 8588426 1I AACATAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 A 9 10 182880 CASAVA_Build 12 8589834 1I GTATGTATAT -/A ATATACATAC 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 A 1 2 182881 CASAVA_Build 12 8598305 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 12 11 182882 CASAVA_Build 12 8600104 1D AACAAGTTGT G/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 1 0 182883 CASAVA_Build 12 8600471 4I GAGGAATTTA ----/CTCT CTCTCTCTTT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 CT 4 6 182884 CASAVA_Build 12 8601478 4I ATTCCAGACT ----/TAGA TAGTTGTATA 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 TAGA 0 1 182885 CASAVA_Build 12 8609522 1I CCCTCACTGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 A 8 9 182886 CASAVA_Build 12 8614579 3I TACATTATAC ---/AAG AAGAACAATG 3070 het 1840 hom 26 5 16 5 AAG 1 2 182887 CASAVA_Build 12 8620657 1D CATTATTCTT A/- AAACTCCTTG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 A 4 3 182888 CASAVA_Build 12 8624732 1D CATTTTGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 A 11 10 182889 CASAVA_Build 12 8648790 1I AATAATCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 248 hom 30 3 14 13 A 13 14 182890 CASAVA_Build 12 8653605 4I CAAGTAGCTT ----/CTTC CTTTGTACTG 3070 hom 125 het 43 0 42 1 CTTC 0 1 182891 CASAVA_Build 12 8686738 1I GCTTAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 11 12 182892 CASAVA_Build 12 8699923 1D TTCATAATTC T/- TTTTTTTTTT 1476 het 500 hom 18 3 6 9 T 19 18 182893 CASAVA_Build 12 8732564 1I TTATATAATT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 A 7 8 182894 CASAVA_Build 12 8735867 1I CAAGAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 60 21 27 12 T 10 11 182895 CASAVA_Build 12 8736385 1I GTGGTAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 A 9 10 182896 CASAVA_Build 12 8737265 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 13 14 182897 CASAVA_Build 12 8738360 1I CAGGTTCAAA -/C AATTCTCCTG 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 C 0 1 182898 CASAVA_Build 12 8739431 4I TATCATTGGC ----/TTTG TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 TTTG 0 1 182899 CASAVA_Build 12 8742816 1D TTGCCCCTCA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 C 9 8 182900 CASAVA_Build 12 8748727 1D ACATACCTGT C/- ATCCCACCTA 3070 hom 51 het 22 0 17 6 C 1 0 182901 CASAVA_Build 12 8766084 1I TCACAGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1176 hom 35 3 24 8 A 14 15 182902 CASAVA_Build 12 8808010 1I GGCCTTGGGC -/T TTTAGGTCCT 1221 het 1221 ref 30 23 3 4 T 3 4 182903 CASAVA_Build 12 8813882 1D TTGCCCAGGC T/- TGGAGTGCAA 3070 hom 49 het 24 0 15 10 T 2 1 182904 CASAVA_Build 12 8820176 2D CTTAGATTTT AA/-- AAACATGGAT 3070 het 3070 ref 52 31 17 4 A 5 3 182905 CASAVA_Build 12 8823756 4D CTAATTCTTT TATG/---- TATGTATGTA 3070 het 3070 hom 41 16 18 10 TATG 3 2 182906 CASAVA_Build 12 8825999 9D TGAAAGAAAA TGATAAACT/--------- TGAGTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 6 TGATAAACT 1 0 182907 CASAVA_Build 12 8826258 1I AGACATCTTT -/G GTGGTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 G 1 2 182908 CASAVA_Build 12 8832568 26D CCTATCACCA AGCGGTGAGACCATCACCTATAGCTG/-------------------------- AGCGGTGAGA 3070 hom 73 het 20 0 21 12 AGCGGTGAGACCATCACCTATAGCTG 2 1 182909 CASAVA_Build 12 8858707 1D CGAGGTGGAT A/- GATTACCTGA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 1 0 182910 CASAVA_Build 12 8859289 6D1M4I GGAGATTATT AAACCCT----/------TGGTG GGACATTTCC 3070 hom 108 het 38 0 37 2 N/A 0 0 182911 CASAVA_Build 12 8860757 2I TCTGTTGTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 134 hom 35 1 26 8 T 12 14 182912 CASAVA_Build 12 8868604 1D TTTTACCTTA T/- TTTTTTCCAC 2734 het 2734 ref 24 11 7 6 T 7 6 182913 CASAVA_Build 12 8869596 6D GATTGAGGTA TTAGAT/------ TTAAATCTTT 3070 het 3070 ref 21 12 8 4 TTAGAT 1 0 182914 CASAVA_Build 12 8874276 1D GACAAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 11 10 182915 CASAVA_Build 12 8883390 1I8M3D CTGCTGCCCC -AATCCCATAGA/TAATCCCAT--- AGAAGTGCCT 3070 hom 105 het 38 0 36 6 N/A 0 0 182916 CASAVA_Build 12 8886258 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 2128 hom 15 het 6 0 6 0 T 6 5 182917 CASAVA_Build 12 8891851 1D AAAAATCCAG A/- AAAAAAAAAA 1735 het 476 hom 13 3 5 6 A 16 15 182918 CASAVA_Build 12 8901267 2I ACAGATTGAT --/AA GATACAGGGA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 0 2 182919 CASAVA_Build 12 8906587 1D91M2I CATGAAATGT GTGTCCGAGACAATGGGTTAAATACACCTGTTCCACCGTGTATTGGTTTATTGTGATGATCTCTTTTCCATTATCTTGTATTGCAAGCTCAC--/-TGTCCGAGACAATGGGTTAAATACACCTGTTCCACCGTATATTGGTTTATTGTGATGATCTCTTTTCCATTATCTTGTATTGCAAGCTCACAT GTTTCCTGTT 3070 het 359 hom 37 2 41 26 N/A 0 0 182920 CASAVA_Build 12 8908064 1D TTTAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 11 10 182921 CASAVA_Build 12 8912584 2I TGGCGTGTAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 AC 7 8 182922 CASAVA_Build 12 8919645 1D AAAAGCTAAT G/- CTTGGTATTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 1 0 182923 CASAVA_Build 12 8919957 1D CTCTGTGACA T/- TTACTGGAGG 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 3 2 182924 CASAVA_Build 12 8921991 1I CATGGCAAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 3 4 182925 CASAVA_Build 12 8924073 1D GTAAAAATAC A/- AAAAAATCAG 3070 het 2781 hom 22 8 13 1 A 7 6 182926 CASAVA_Build 12 8955213 1D AGAGGTATCC T/- TTATATCTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 3 2 182927 CASAVA_Build 12 8959557 1I GTTGTCTCCA -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 6 7 182928 CASAVA_Build 12 8970786 1I CTTAAAAAAA -/G AAAATGTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 G 0 1 182929 CASAVA_Build 12 8976055 11D ACATGGATTC AGCCTTTGAGA/----------- AACTCCAAGT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 AGCCTTTGAGA 1 0 182930 CASAVA_Build 12 8986738 1I GCAGTAGGGG -/A AAAAAAGCAC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 6 7 182931 CASAVA_Build 12 8987173 2I AGCATAATGT --/AC ACACATACAA 3070 het 3070 ref 55 30 18 7 AC 2 3 182932 CASAVA_Build 12 8988824 12D AGATCAAGAC CATCATGGCCAA/------------ CATTGTGAAA 2224 het 2224 ref 20 13 5 5 CATCATGGCCAA 1 0 182933 CASAVA_Build 12 8995172 1I CCCTTCTTTC -/A AAAAAAAAAA 2875 het 2047 hom 15 6 7 2 A 11 12 182934 CASAVA_Build 12 8996911 1D GCTAGTGACA C/- CCCCCCCCCG 3070 hom 55 het 31 0 17 15 C 10 9 182935 CASAVA_Build 12 9012105 1D45M2D TATCTAAAAC AAAAAAAAAACCACACTGAAATAATAGAAAAATCTATACCATACAAAG/-AAAAAAAAACCACACTGAAATAATAGAAAAATCTATACCATACAA-- AGAGTTGGAG 3070 het 3070 hom 36 25 26 3 N/A 0 0 182936 CASAVA_Build 12 9022659 1I CTCACTGCAA -/C CCTCTGCCTC 2347 het 2347 ref 18 8 5 5 C 2 3 182937 CASAVA_Build 12 9029035 1D TTTCTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 40 0 26 14 T 12 11 182938 CASAVA_Build 12 9062555 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 1935 het 887 hom 17 6 9 2 AAG 1 0 182939 CASAVA_Build 12 9097071 1D TGCCTGCGAC G/- GGGTGTCCTG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 G 4 3 182940 CASAVA_Build 12 9098426 2D ATTATTTATT TG/-- TGTTAGGAGC 3070 het 3070 hom 35 11 18 7 TG 2 1 182941 CASAVA_Build 12 9113065 1D TCAAAGAGGC A/- TCTAAAAGGT 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 A 1 0 182942 CASAVA_Build 12 9117190 1I CTTTGCAGCC -/A ATGAGCAGAG 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 1 2 182943 CASAVA_Build 12 9122146 1I TGAGTGAGAA -/C ATGTGGTGTT 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 C 0 1 182944 CASAVA_Build 12 9131002 1D CAAATAAATG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 A 8 7 182945 CASAVA_Build 12 9131106 4I AAATTACTGA ----/TGTC TGTCTAGTTA 3070 het 3070 hom 49 23 21 5 TGTC 1 2 182946 CASAVA_Build 12 9132119 1I TGATGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 T 11 12 182947 CASAVA_Build 12 9143092 3D AGTGATTCTG CTT/--- CTTAGTGTGA 3070 het 3070 ref 54 30 21 4 CTT 2 1 182948 CASAVA_Build 12 9148393 1I CACAGCAGTG -/A AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 A 8 9 182949 CASAVA_Build 12 9150599 1I AGGACACAAT -/A AAATATTCTC 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 A 3 4 182950 CASAVA_Build 12 9152639 1I CAGTCTCTTC -/A GTAAAAATGT 3070 het 3070 hom 62 24 30 8 A 0 1 182951 CASAVA_Build 12 9156969 1D TCACATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 652 hom 28 4 12 12 T 13 12 182952 CASAVA_Build 12 9158598 4D ATATACATAA ATAC/---- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 33 17 15 4 ATAC 1 0 182953 CASAVA_Build 12 9158976 3D CAATTGCATC ATT/--- GTTACCACTT 3070 het 3070 hom 51 20 26 7 ATT 1 0 182954 CASAVA_Build 12 9166798 1I GGTTTTTGAC -/T TTTGGCAGTA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 3 4 182955 CASAVA_Build 12 9173088 4D GGTGCTAAAT ATAA/---- ATAAATTTTT 3070 hom 63 het 22 0 22 1 ATAA 2 1 182956 CASAVA_Build 12 9176543 1D GAAGAGTGAG A/- AAAAATATGG 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 A 6 5 182957 CASAVA_Build 12 9182326 1I TGGCCTGTCA -/T TTTTTTTTTT 986 het 986 ref 32 21 3 8 T 10 11 182958 CASAVA_Build 12 9183714 1I TTCTGACCAA -/T TTTTTGGTCA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 5 6 182959 CASAVA_Build 12 9190508 1D GTCTTGTATA G/- GAGAAGGTTC 3070 het 3070 hom 34 19 15 1 G 2 1 182960 CASAVA_Build 12 9190782 4I AAAGATCAAC ----/TCTT TCTTTTCCCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TCTT 1 2 182961 CASAVA_Build 12 9204437 2D CTTTATATTC AG/-- AGTCTATCAT 3070 het 3070 ref 49 33 10 8 AG 2 1 182962 CASAVA_Build 12 9213044 1D GGTTTGCAAA T/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 1 0 182963 CASAVA_Build 12 9220336 4D TTGAAGAAAG AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 AAAT 3 2 182964 CASAVA_Build 12 9226283 2I AATTTTCTGC --/AT ATATATATGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 4 5 182965 CASAVA_Build 12 9227272 1I ATAAATGTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 9 10 182966 CASAVA_Build 12 9229522 2D GAAATGAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 6 A 12 10 182967 CASAVA_Build 12 9239731 3D ATATAAAAAT ATA/--- ATAATAATAA 3051 het 3051 ref 21 10 9 3 ATA 4 3 182968 CASAVA_Build 12 9240638 1I ACAAGAAAAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 9 10 182969 CASAVA_Build 12 9252918 1I TTATCTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 49 0 37 12 T 10 11 182970 CASAVA_Build 12 9256602 1I ATTGAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 10 11 182971 CASAVA_Build 12 9262425 1I ACCAAAATCT -/C ACAAATCACC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 0 1 182972 CASAVA_Build 12 9262844 1D TACCACTCCT A/- ATTCAACATA 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 A 2 1 182973 CASAVA_Build 12 9266924 3D GACATTTTCA TTG/--- TTAAGTTAAA 3070 het 3070 ref 47 24 20 5 TTG 1 0 182974 CASAVA_Build 12 9271167 1I AGAAAGGAGG -/T TTAGTTGGCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 3 182975 CASAVA_Build 12 9275445 1D GGCTTTGCTA T/- TTTGTAAGGG 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 T 4 3 182976 CASAVA_Build 12 9282693 2D GTTTTTAATG AT/-- AATTTAAATA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 AT 1 0 182977 CASAVA_Build 12 9287042 2I AGAATCAAAC --/AA GAGGAATGGA 3070 het 3070 hom 58 26 29 3 A 0 2 182978 CASAVA_Build 12 9288170 1I GGAATCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 776 hom 49 2 35 12 T 12 13 182979 CASAVA_Build 12 9288370 2D CTATACAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 135 het 52 0 44 10 T 14 12 182980 CASAVA_Build 12 9296108 1D TTGAAACTAT A/- AAAACCCTAG 2599 het 2599 ref 25 14 6 5 A 5 4 182981 CASAVA_Build 12 9297206 2D AATAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 13 11 182982 CASAVA_Build 12 9297507 1D TCATTAGCAG C/- ACACTCTGGT 3070 het 3070 ref 46 23 16 9 C 1 0 182983 CASAVA_Build 12 9297647 1I AAAGCAGCCA -/C TTTTATAATT 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 C 0 1 182984 CASAVA_Build 12 9298121 2D TTTAAAAAAA AT/-- AAATATCTAA 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 AT 1 0 182985 CASAVA_Build 12 9299511 1D CTTGGCCATT C/- CCAAGATTTA 3070 het 3070 ref 46 26 16 5 C 3 2 182986 CASAVA_Build 12 9300782 5I AAGAAAAGAC -----/TTGCA TTTATACCAC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 TTGCA 0 1 182987 CASAVA_Build 12 9302973 1I AAAAAAAACA -/G AGAAAAATCA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 G 0 1 182988 CASAVA_Build 12 9305047 1D CCAAATTGCT A/- AATTGTTCAG 3070 het 3070 ref 58 29 22 7 A 3 2 182989 CASAVA_Build 12 9309493 1D GTTAAAAACA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 9 8 182990 CASAVA_Build 12 9311502 4I CTTCTGAGAT ----/CAAA CATAGTTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 CAAA 0 1 182991 CASAVA_Build 12 9312427 2D TGTTTTGTTT TG/-- TTTTTTTTTC 3070 het 200 hom 35 3 18 14 TG 1 0 182992 CASAVA_Build 12 9323038 1D ACTGCAGTGA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 32 14 12 7 T 8 7 182993 CASAVA_Build 12 9327319 8D49M1D ATAGATGAAT ACACACACACACACACACACACACACACACACATATATTCTGTATAATCATTAAAAAT/--------ATATACACACACACACACACATATATATATTCTGTATAATCATTAAAAA- GTCACTTAAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 25 N/A 0 0 182994 CASAVA_Build 12 9330606 2D TTCTGTGAGT TC/-- TCTCTTCTTG 3070 het 3070 ref 35 24 7 4 TC 3 2 182995 CASAVA_Build 12 9335234 3I AACCTGGAAT ---/GCA GCATGCTTTG 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 GCA 1 2 182996 CASAVA_Build 12 9336918 3D GTGTGAGCCC AGG/--- AGGAGTTCCA 2963 hom 30 het 13 0 7 6 AGG 2 1 182997 CASAVA_Build 12 9342970 2I GTAAAACCTT --/AC AGTGTTCCGA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 AC 0 1 182998 CASAVA_Build 12 9347605 1I AAACATGAAC -/T TTACAGGGCT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 2 3 182999 CASAVA_Build 12 9349032 3I TTCCTTCTCC ---/CCT CTTCTTCCCA 3070 hom 74 het 27 0 25 2 CCT 0 1 183000 CASAVA_Build 12 9353524 1I TGGCCACGTG -/T TATTTTTGAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 1 2 183001 CASAVA_Build 12 9358845 1D CTATTAAAAA G/- AAATAAGGGA 2856 hom 15 het 7 0 6 1 G 1 0 183002 CASAVA_Build 12 9359203 2I GTGCCAGGGC --/AG AGTGGGTGAT 2338 hom 20 het 9 0 6 3 AG 1 2 183003 CASAVA_Build 12 9359825 1D TGCCCTGGGA C/- CCCCATTAAG 3070 het 3070 hom 36 12 22 3 C 5 4 183004 CASAVA_Build 12 9360606 4D GAATGGGAGA GAAG/---- GAAGGATGGA 1266 het 1266 ref 15 12 3 1 GAAG 2 1 183005 CASAVA_Build 12 9367601 1D CTTTGGTACT A/- GGGGGTGTTA 2519 het 2519 ref 45 39 6 1 A 1 0 183006 CASAVA_Build 12 9368454 15I CCTGGGCACA ---------------/AGCCGTACACCGGAG AGCTGCTTGG 3070 hom 66 het 26 0 21 5 AGCCGTACACCGGAG 0 1 183007 CASAVA_Build 12 9372309 2D GTGCTGGGGA GT/-- GTTGAAATTT 2609 het 2609 ref 29 18 7 4 GT 2 1 183008 CASAVA_Build 12 9375233 9D GGAGCTTTGC TGGAGCAGG/--------- TGGAGCTCCG 3070 het 3070 ref 40 18 16 11 TGGAGCAGG 1 0 183009 CASAVA_Build 12 9380198 2I AACGGGGGAC --/CA CCCCCCCACA 1899 het 1899 ref 22 11 6 5 CA 0 1 183010 CASAVA_Build 12 9380658 1I GAGGGTACTT -/A ACAGGAGACC 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 1 2 183011 CASAVA_Build 12 9385345 2D AAGTTTAAAG AA/-- AAAAAAGACT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 8 6 183012 CASAVA_Build 12 9385507 1D CAGAGTGCAC T/- TTTTTTTTTT 1428 het 1428 ref 18 11 3 4 T 13 12 183013 CASAVA_Build 12 9396237 44D ACTTCCAGCC TTCTCAACTGAGACAGAATACATTTCTATTGTTATAAGCCAGGG/-------------------------------------------- AGCCCTAGGA 3070 hom 122 het 38 0 37 8 TTCTCAACTGAGACAGAATACATTTCTATTGTTATAAGCCAGGG 1 0 183014 CASAVA_Build 12 9409246 6D TTAATTTTAG TTTAGT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TTTAGT 1 0 183015 CASAVA_Build 12 9413332 3D AAATACTACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 22 10 A 13 10 183016 CASAVA_Build 12 9416405 6D TGATGAATGA ACATTC/------ ATCATCTCTG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 ACATTC 1 0 183017 CASAVA_Build 12 9416697 4D CTTTCCTTTT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 het 12 hom 37 2 23 13 TTTC 2 1 183018 CASAVA_Build 12 9417030 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTCTTTTT 3070 het 437 hom 22 2 20 0 T 4 5 183019 CASAVA_Build 12 9419045 1D ATAAACACTT A/- AGGGGAAGGA 3070 hom 128 het 47 0 41 6 A 2 1 183020 CASAVA_Build 12 9420546 2I TTCTCCAAAC --/TG GTGCTGGCTT 3070 hom 118 het 47 0 39 8 TG 0 1 183021 CASAVA_Build 12 9426146 4D GGACTAATTT TTTG/---- TTGTTTTTGA 3070 hom 102 het 38 0 35 6 TTTG 1 0 183022 CASAVA_Build 12 9428001 1I ATCTTTGGTC -/A AGAAGGAGTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 1 2 183023 CASAVA_Build 12 9428632 1I TTTTTTTTTT -/A AAATCTCTTC 3070 het 272 hom 35 1 28 6 A 3 4 183024 CASAVA_Build 12 9431166 1I AGTTCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 10 11 183025 CASAVA_Build 12 9431464 1I TTGTTGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 49 1 44 4 T 10 11 183026 CASAVA_Build 12 9434920 1I CAAATCTTTC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 6 7 183027 CASAVA_Build 12 9436654 1I AAAGATTGGC -/T TTTTTTCACC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 T 6 7 183028 CASAVA_Build 12 9440273 1D GCCTGGGACA C/- ACCAACTTGC 3070 het 1656 hom 51 4 39 8 C 1 0 183029 CASAVA_Build 12 9440846 1D AGTTGCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 30 0 12 18 A 12 11 183030 CASAVA_Build 12 9441721 4I TATTAGTAAA ----/TGAT TGATAGAGAC 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 TGAT 1 2 183031 CASAVA_Build 12 9442172 1I ATTTTGGAAA -/G TTTAGTAGCT 3070 het 3070 ref 67 40 23 4 G 0 1 183032 CASAVA_Build 12 9446463 1I AGCCCCTCTT -/C CCCCCCCTGG 3070 het 2354 hom 25 8 13 4 C 7 8 183033 CASAVA_Build 12 9452832 3I TGGGAGAAGC ---/AAG AAGAAGTCAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AAG 2 3 183034 CASAVA_Build 12 9452989 1I GCTGGTTCCC -/G GGGGGCCCAC 1047 het 1047 ref 23 14 3 6 G 5 6 183035 CASAVA_Build 12 9464056 10I CATGACGCCC ----------/GCACCTGGAT GCACCTGGAA 3070 hom 63 het 28 0 20 8 GCACCTGGAT 0 1 183036 CASAVA_Build 12 9470190 3D CAACGCAGTG TCC/--- TCCTCAGGGG 3070 hom 35 het 23 0 14 9 TCC 2 1 183037 CASAVA_Build 12 9484409 3I CCGCAAAGCA ---/TGC TGCATTCCAG 1738 het 1375 hom 10 3 5 2 TGC 1 2 183038 CASAVA_Build 12 9488994 2I TTGCACAAGA --/AG AGAGAACTCA 2359 het 2359 ref 38 26 5 7 AG 2 3 183039 CASAVA_Build 12 9495496 3D TTTTTTAATT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 66 het 28 0 22 7 TTG 4 3 183040 CASAVA_Build 12 9497254 1D ATATTTCTCC A/- AAAAAAGATG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 7 6 183041 CASAVA_Build 12 9504851 2D TTTGCATAAC AG/-- AAATTGTTCT 3070 hom 63 het 25 0 21 6 AG 1 0 183042 CASAVA_Build 12 9507414 4D ATTCCCAGAG TTGT/---- TTGTCAGTGT 3070 hom 51 het 20 0 18 4 TTGT 2 1 183043 CASAVA_Build 12 9510122 1I GGGCTTTGGA -/G GAGAGGGGGG 2892 hom 27 het 10 0 10 0 G 1 2 183044 CASAVA_Build 12 9511062 1D CCTCACAGGT G/- GGCCTCCTCA 3070 hom 80 het 34 0 23 11 G 3 2 183045 CASAVA_Build 12 9511450 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TACACAAGTT 3070 het 3070 ref 79 50 24 5 TA 3 1 183046 CASAVA_Build 12 9513763 4D AAACAGCAAC CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 30 het 18 0 11 7 CAAA 5 4 183047 CASAVA_Build 12 9517990 2I CAGCCATAAA --/AT AAAAAAACAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 0 1 183048 CASAVA_Build 12 9525087 3D AGCCTCCTCT CTC/--- CTCCTGGGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CTC 2 1 183049 CASAVA_Build 12 9534262 3D ATGGTGGAGT ATA/--- GGAATGGCCA 3070 hom 87 het 31 0 28 3 ATA 1 0 183050 CASAVA_Build 12 9541282 1I TAATGACTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 27 het 19 0 10 9 T 8 9 183051 CASAVA_Build 12 9543933 1D CTGAGAGAAA T/- GTAAAGGAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 0 183052 CASAVA_Build 12 9544981 4D ATCATTCCAC AGAT/---- AGATATAATT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AGAT 2 1 183053 CASAVA_Build 12 9555221 1D AGAGAAAGAG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 A 8 7 183054 CASAVA_Build 12 9573432 1D AGGATCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 17 1 10 6 T 13 12 183055 CASAVA_Build 12 9578136 1D TTCAGCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 14 13 183056 CASAVA_Build 12 9578150 1D TTTTTTTTTT C/- AGTAGCATTT 3070 het 31 hom 20 2 16 2 C 1 0 183057 CASAVA_Build 12 9581727 1D CCTCCAAGCA T/- TTTTTTTTTA 2383 het 2383 ref 32 26 5 1 T 10 9 183058 CASAVA_Build 12 9589442 1I CTCTCATCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 8 9 183059 CASAVA_Build 12 9592664 4I TTAGCTTTTA ----/TGTT TGTTTGTTTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TGTT 2 3 183060 CASAVA_Build 12 9594425 1D GCCCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 19 8 T 12 11 183061 CASAVA_Build 12 9620581 3I GATGTAGCCG ---/GTC GTCGTCACCC 3047 hom 36 het 14 0 11 3 GTC 2 3 183062 CASAVA_Build 12 9628077 4I ATTCAGGAGA ----/TTAT TTGTTTGTAG 3070 hom 105 het 44 0 36 8 TTAT 0 1 183063 CASAVA_Build 12 9628532 4D TTAATATAAA TGAT/---- TGAACAGTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TGAT 1 0 183064 CASAVA_Build 12 9628926 1D TTTGCTCTTG A/- TGTATTTTAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 1 0 183065 CASAVA_Build 12 9632309 1D ACAGAATTTC A/- AGCCATGTAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 2 1 183066 CASAVA_Build 12 9633050 6I AGCAAACTAC ------/AATTAT AATTATATGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AATTAT 1 2 183067 CASAVA_Build 12 9633699 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 6 5 183068 CASAVA_Build 12 9634209 1D TTTTAACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 36 1 31 4 A 12 11 183069 CASAVA_Build 12 9637047 9D2M3D GCCTGAAATA ACATGAACCTGCAT/---------TG--- GTTAGACATG 3070 hom 120 het 41 0 41 4 N/A 0 0 183070 CASAVA_Build 12 9638780 5D GGCTTGCCGC GTGCG/----- GGAAGAGACA 3070 hom 87 het 32 0 30 4 GTGCG 1 0 183071 CASAVA_Build 12 9639012 1I TAACAGTTGT -/A CAATTCTCAG 3070 hom 112 het 42 0 36 6 A 0 1 183072 CASAVA_Build 12 9641286 1I CTGTGTCGCA -/T AATGCCTCAT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 0 1 183073 CASAVA_Build 12 9642303 2I ATGCACAGAC --/AT ATTAATATGG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AT 1 2 183074 CASAVA_Build 12 9647882 1D CTAAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 2007 het 2007 ref 52 37 6 9 T 12 11 183075 CASAVA_Build 12 9648267 4I CTCACATCTC ----/TCTT TCTGGTTTTG 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 TCTT 0 1 183076 CASAVA_Build 12 9660804 14D AAAAAATTAT TTTTTATTTAATTA/-------------- TTTTTATTTA 3070 het 3070 hom 21 9 13 4 TTTTTATTTAATTA 1 0 183077 CASAVA_Build 12 9661597 5I TATGCTTCTC -----/TTCTT TTATTTGTCA 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 TTCTT 0 1 183078 CASAVA_Build 12 9668098 1I GCACTGTCAA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 7 8 183079 CASAVA_Build 12 9671135 2D ACGTAAGCTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 11 9 183080 CASAVA_Build 12 9690523 2D CATAACTGAC AA/-- AAAGTCATCT 2381 het 2381 ref 22 15 5 2 A 5 3 183081 CASAVA_Build 12 9697999 1I CAAGTAGACC -/A AAAGCCTGAA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 3 4 183082 CASAVA_Build 12 9702751 1I CTGTGTCTCA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 G 1 2 183083 CASAVA_Build 12 9705248 1D CTGGTTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 13 12 183084 CASAVA_Build 12 9716041 4D TGCATAAGAA AGAG/---- AGAGAGCAAG 3070 hom 132 het 48 0 44 8 AG 5 3 183085 CASAVA_Build 12 9720907 1D GCCTTATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2663 hom 36 7 17 12 T 13 12 183086 CASAVA_Build 12 9725477 1I GCATCTAATA -/T TAGACCAAGC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 1 2 183087 CASAVA_Build 12 9735083 2I CAAATAATTA --/TC TGTTATAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 TC 0 1 183088 CASAVA_Build 12 9740410 2D TTTTAATAAA GT/-- AAAAAAAAAA 303 het 262 hom 31 3 5 23 GT 1 0 183089 CASAVA_Build 12 9740900 2D ACATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 24 0 15 9 AT 8 7 183090 CASAVA_Build 12 9741405 2D TCTATATTTC TG/-- TGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 TG 5 4 183091 CASAVA_Build 12 9741583 1D AGTGAAACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 A 10 9 183092 CASAVA_Build 12 9755376 3D TAAGTTATTT AAA/--- AAAAAAAAAA 2453 het 110 hom 28 1 5 24 A 15 12 183093 CASAVA_Build 12 9762114 1I CACATGAACA -/T TTCATGTGCA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 2 3 183094 CASAVA_Build 12 9762224 1D TTCCTTACTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 10 9 183095 CASAVA_Build 12 9765082 1I CTAATAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 10 11 183096 CASAVA_Build 12 9766331 1I TCCTAGCCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1252 hom 36 3 25 8 A 12 13 183097 CASAVA_Build 12 9768048 1D CAACTCCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 3 A 13 12 183098 CASAVA_Build 12 9768605 5D CCCAAAACTT AAGAG/----- AAGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 AAGAG 2 1 183099 CASAVA_Build 12 9769412 1D CATAGAATAT A/- AAAAAATAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 5 A 7 6 183100 CASAVA_Build 12 9770117 1D GAAATAAAAG A/- AGAAATAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 2 1 183101 CASAVA_Build 12 9772812 1I ACTGCATTGA -/C CTTTTCTAGG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 1 2 183102 CASAVA_Build 12 9773440 3D TAAATAATAT TAC/--- TAATTACTTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 4 TAC 1 0 183103 CASAVA_Build 12 9776975 5I AAACTTCTGA -----/TAAGT TAAGTAAATT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TAAGT 1 2 183104 CASAVA_Build 12 9779552 4D CTTGCTGAAC TTGT/---- TTATTACCTC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TTGT 1 0 183105 CASAVA_Build 12 9788091 3I7M11D AGTGTGGATA ---GCTTTTTTATTACAAAAA/ATCCCTTGCT----------- GGGTATTACC 1284 het 1284 ref 28 31 3 2 N/A 0 0 183106 CASAVA_Build 12 9790545 2D TGGATATGAT TC/-- TGTTTATAGA 3070 het 3070 hom 43 19 19 7 TC 1 0 183107 CASAVA_Build 12 9794931 1D GAATTGTATA T/- TTTTTATCTA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 T 6 5 183108 CASAVA_Build 12 9796278 2I GTTATAGTAA --/CT CTGTTTTCTG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CT 1 2 183109 CASAVA_Build 12 9797216 6D AAGAAAATTC CCAAGA/------ CACTATAAAA 3070 het 3070 ref 19 12 7 3 CCAAGA 1 0 183110 CASAVA_Build 12 9797618 1D ACAAGAATTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 9 8 183111 CASAVA_Build 12 9808406 1I TAGTTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2973 het 2973 ref 37 18 8 11 A 10 11 183112 CASAVA_Build 12 9812426 1I TACTGGATTG -/T TTGCCAAATG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 2 3 183113 CASAVA_Build 12 9813964 1D CATTCACTCC A/- AAACTGTTAT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 4 3 183114 CASAVA_Build 12 9825939 6D GGCACTGGGG GGGGGT/------ GGGCACTGGT 2134 het 23 hom 7 1 6 0 GGGGGT 1 0 183115 CASAVA_Build 12 9831617 11I AACTTACTTG -----------/TTTTTTTTTGT TTTGTTTTTT 3070 het 558 hom 23 5 11 8 TTTTTTTTTGT 0 1 183116 CASAVA_Build 12 9831633 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCCCATG 2754 het 8 hom 20 1 9 10 C 8 7 183117 CASAVA_Build 12 9832100 2I AATATCTGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 T 12 14 183118 CASAVA_Build 12 9833398 3I ATTATTTGTT ---/TTC TTCTTGCTGA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 TTC 1 2 183119 CASAVA_Build 12 9833504 3I CTGTTTACTC ---/TGA TGATTATGTC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 TGA 1 2 183120 CASAVA_Build 12 9842822 1I TACCAGGGTG -/T TTTTTTTTTT 2876 het 2876 ref 30 12 8 10 T 11 12 183121 CASAVA_Build 12 9848032 4D TTCATTTGTG TTTC/---- TTTAATAACT 3070 het 3070 ref 36 23 10 5 TTTC 1 0 183122 CASAVA_Build 12 9851053 2I AAAATCACTC --/AT ATGATTTTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AT 1 2 183123 CASAVA_Build 12 9885713 3D CCAAGGGAAG TGT/--- TGTTATTGGT 3070 hom 93 het 36 0 32 7 TGT 2 1 183124 CASAVA_Build 12 9908713 3I CTTACTTAAC ---/AAT AATAACATGG 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 AAT 1 2 183125 CASAVA_Build 12 9910330 1D ACCACTTCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 9 8 183126 CASAVA_Build 12 9917142 3I TACTTTAGAT ---/AAC AATTTTTAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAC 0 1 183127 CASAVA_Build 12 9918467 1D AAAAGAATTA T/- TTTTTTATCT 3070 hom 129 het 46 0 44 3 T 7 6 183128 CASAVA_Build 12 9921985 1I ACCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 46 2 36 8 A 10 11 183129 CASAVA_Build 12 9923022 4D AATGAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 625 het 625 ref 41 17 7 19 AAAG 1 0 183130 CASAVA_Build 12 9926656 1D ATAAAAAAAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 84 het 29 0 28 1 A 8 7 183131 CASAVA_Build 12 9929200 2D ATTATTTAAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TA 8 7 183132 CASAVA_Build 12 9936770 1I TTTATTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 966 hom 22 4 13 5 A 13 14 183133 CASAVA_Build 12 9937573 1D CTTCCTCCCT C/- CCTTTTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 18 5 C 3 2 183134 CASAVA_Build 12 9941427 1I CGCTCAGTAT -/A AAAAAAAAAA 1173 het 1173 ref 31 22 4 5 A 13 14 183135 CASAVA_Build 12 9942987 1D CCCTACTAGT A/- AAAAAAAAAA 1547 het 1547 ref 37 26 4 7 A 15 14 183136 CASAVA_Build 12 9986093 1I AGAAATACCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 12 25 4 T 8 9 183137 CASAVA_Build 12 9992148 1D GCTCCTGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 11 10 183138 CASAVA_Build 12 10000852 1I ACTAATTTTT -/A AAAAAAGCAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 6 7 183139 CASAVA_Build 12 10005589 1I GTTATTTAAT -/A AAAAAATTAT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 6 7 183140 CASAVA_Build 12 10007173 3D TTTAGGTAGA AAC/--- AACACTCTTC 3070 hom 24 het 12 0 9 3 AAC 2 1 183141 CASAVA_Build 12 10010281 1I AGTGGCTGCC -/G GGTGAGATGG 3070 hom 33 het 16 0 12 4 G 2 3 183142 CASAVA_Build 12 10012251 1I GAAGGGAGAT -/A GGGGTGGGGC 3070 het 6 hom 13 1 10 2 A 0 1 183143 CASAVA_Build 12 10014085 1D TGTTTTTCTA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 7 6 183144 CASAVA_Build 12 10014552 1I GAGATCAAAT -/G GGTTGAGTCA 3070 hom 90 het 37 0 29 8 G 2 3 183145 CASAVA_Build 12 10015923 6D TGTGTGTGTG TGTGTT/------ TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TGTGTT 1 0 183146 CASAVA_Build 12 10022145 1D ATAATTCCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 10 9 183147 CASAVA_Build 12 10022281 4D AGATCTGGAC TGAT/---- TAAGATCAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TGAT 1 0 183148 CASAVA_Build 12 10030211 1D GTCTCCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1142 hom 25 4 15 7 A 17 16 183149 CASAVA_Build 12 10030292 1D CCCCCCCCCC T/- TTTTTTCTAT 3070 het 50 hom 23 1 15 7 T 7 6 183150 CASAVA_Build 12 10033233 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 18 0 14 4 A 9 10 183151 CASAVA_Build 12 10040471 1D TGACCCACTA T/- GTACCTGAGC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 1 0 183152 CASAVA_Build 12 10041840 1I GTTCTTAGGA -/T ATGCAAGATA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 0 1 183153 CASAVA_Build 12 10043030 1I GTTTCCAACT -/C TTACAATTTC 3070 hom 105 het 39 0 33 6 C 0 1 183154 CASAVA_Build 12 10092233 1D TGAGATTCCG A/- AAAAAAAAAA 2361 het 645 hom 33 5 13 15 A 17 16 183155 CASAVA_Build 12 10108594 2I TTTTTGTCTC --/TT ATAGGATTTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 0 2 183156 CASAVA_Build 12 10112310 1D TGCTATACAC T/- TTTTTCTGTT 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 T 6 5 183157 CASAVA_Build 12 10126609 1I TGGAGGCCAA -/C CAACTCAAAC 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 C 1 2 183158 CASAVA_Build 12 10127870 1D AAGATAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 11 10 183159 CASAVA_Build 12 10132294 48D TTCTTTGAAT AACTGTTCAAAGAACAGTTAAAAGAACTGTTCAAAGAACAGTTAAAAG/------------------------------------------------ AACTGTTCAA 3070 het 3070 ref 31 23 11 5 AACTGTTCAAAGAACAGTTAAAAG 2 0 183160 CASAVA_Build 12 10132809 1I TGGCAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 T 10 11 183161 CASAVA_Build 12 10134690 1I TCCTTTTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 A 8 9 183162 CASAVA_Build 12 10135886 1D TAGGTCCATT A/- TATACAAATA 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 A 1 0 183163 CASAVA_Build 12 10136426 1D AGTAGTAATG A/- AATGAAATGA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 3 2 183164 CASAVA_Build 12 10136505 1I GGAGTTGTTG -/T TTTTCTGCCC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 4 5 183165 CASAVA_Build 12 10138827 12D CTAAACTCAA TCAGTAACTCAT/------------ TCATTCCTAT 3070 het 3070 ref 52 27 25 5 TCAGTAACTCAT 1 0 183166 CASAVA_Build 12 10141925 2D AACAGGATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 12 10 183167 CASAVA_Build 12 10142524 1D AATATAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 11 10 183168 CASAVA_Build 12 10153331 1D TCTGTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 18 12 A 15 14 183169 CASAVA_Build 12 10156865 3D TAACCCCCCC CCG/--- CCACAAAAAA 3070 het 441 hom 30 4 14 12 CCG 1 0 183170 CASAVA_Build 12 10167634 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 A 14 12 183171 CASAVA_Build 12 10167912 3D TACTTTCGTT AAG/--- AAGTACTTCT 3070 hom 99 het 36 0 33 4 AAG 2 1 183172 CASAVA_Build 12 10170781 1I GAGGTATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1190 hom 27 4 18 5 A 13 14 183173 CASAVA_Build 12 10183400 1I AAAAGCAAAC -/A AACAAAAAAA 3070 hom 49 het 21 0 16 5 A 2 3 183174 CASAVA_Build 12 10190677 2D CTCAAAAAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 41 het 18 0 14 4 TA 7 6 183175 CASAVA_Build 12 10192109 4I GTTTTATGAC ----/TATT TAATAATAGC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TATT 0 1 183176 CASAVA_Build 12 10199881 1D AATACTAGAT A/- TTTTTAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 1 0 183177 CASAVA_Build 12 10202663 1I CACAGCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1542 hom 35 4 26 5 A 13 14 183178 CASAVA_Build 12 10205807 6D ATATATATAT ATATAA/------ AAAACACATA 3070 hom 45 het 18 0 16 4 ATATAA 1 0 183179 CASAVA_Build 12 10206822 2D TGTATTTCTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TG 10 9 183180 CASAVA_Build 12 10206894 1I ATTATATAAC -/A AATACAAATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 2 3 183181 CASAVA_Build 12 10207450 2D AAAACTTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 15 0 12 3 T 13 11 183182 CASAVA_Build 12 10241950 1D GCTGTGATGA C/- CTAGTTGTCG 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 C 2 1 183183 CASAVA_Build 12 10243148 1I ACCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 A 11 12 183184 CASAVA_Build 12 10246936 3D TCTGAGACTC CTA/--- CTGTTTGAAT 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 CTA 1 0 183185 CASAVA_Build 12 10247397 1I TAAAAGTGAG -/A TGCTACAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 1 183186 CASAVA_Build 12 10248250 4D CATGTAGTGA GGTT/---- GGTTGTTTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GGTT 2 1 183187 CASAVA_Build 12 10248594 2I ACAGTCTATC --/TT TATTTCCTAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 1 3 183188 CASAVA_Build 12 10249435 1D AGCTTTCATT G/- GGGTTGCCAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 G 4 3 183189 CASAVA_Build 12 10259765 1D GTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 16 10 T 11 10 183190 CASAVA_Build 12 10266282 1D CACAGTACCA C/- CCCAGGGGTG 3070 het 3070 ref 28 10 8 10 C 4 3 183191 CASAVA_Build 12 10270519 2D TGTCACATGA CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 62 het 34 0 16 19 C 13 11 183192 CASAVA_Build 12 10278572 1I AGGGCACAAT -/G TCCCAAGGGT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 0 1 183193 CASAVA_Build 12 10280566 1D TATTGTCTTA G/- GGGGAAAACA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 G 5 4 183194 CASAVA_Build 12 10281949 4D CTTTTTTCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 25 0 11 14 T 20 16 183195 CASAVA_Build 12 10288672 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAACCA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 C 0 1 183196 CASAVA_Build 12 10296821 2D GGGCAGTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 18 16 183197 CASAVA_Build 12 10297278 1D TCACAGTGTC T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 7 183198 CASAVA_Build 12 10297440 1I TCTCTCACCC -/T TATCCCCTTG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 1 2 183199 CASAVA_Build 12 10300292 4D37M3D TGATTAGCTG TTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGACACATTTTCATTATCTTCTC/----TTTTTTTTTTTTCGTAGAGACACATTTTCATTATCTT--- CTTTCCTTTT 3070 hom 4 het 21 1 28 5 N/A 0 0 183200 CASAVA_Build 12 10300890 2D GATATACCAC CT/-- CTCTGCCTTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CT 3 2 183201 CASAVA_Build 12 10301530 1D TAACTTTTTG A/- GCATATTTAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 0 183202 CASAVA_Build 12 10301923 3I ATTTTCTTGA ---/CTT CTTTACTTAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 CTT 1 2 183203 CASAVA_Build 12 10302120 3I AGCTCAAGCT ---/CTC CTCCTTCTGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CTC 1 2 183204 CASAVA_Build 12 10304513 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2271 hom 15 het 6 0 6 0 A 9 8 183205 CASAVA_Build 12 10304844 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTGAGG 3070 hom 30 het 27 1 22 4 T 7 6 183206 CASAVA_Build 12 10308371 2D AAAATAGTCT TC/-- TATATGGAGT 3070 hom 138 het 55 0 46 10 TC 1 0 183207 CASAVA_Build 12 10317986 2I TCGTCTCTAC --/TA AAAACACAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 0 1 183208 CASAVA_Build 12 10331022 1D CAAAACCCTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 9 8 183209 CASAVA_Build 12 10335482 2D CAGCCACATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 34 1 22 11 T 16 14 183210 CASAVA_Build 12 10338423 3D60M1D TGCCACCATG CCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCCAGGCTAGTCTCA/---GGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCACATTGGCCAGGCTAGTCTC- AAACTCCTGA 3070 hom 60 het 23 0 21 5 N/A 0 0 183211 CASAVA_Build 12 10339368 1I AGGTATCCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 434 hom 27 1 23 3 T 9 10 183212 CASAVA_Build 12 10350016 4I CTGGGTGACA ----/GAGC GAGACTCCAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 GAGC 0 1 183213 CASAVA_Build 12 10367301 1D TATCCCTCAT C/- TTTTTTTTTC 3070 het 525 hom 42 2 33 7 C 1 0 183214 CASAVA_Build 12 10387860 1I CACCTACTTA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 T 6 7 183215 CASAVA_Build 12 10393214 1D TTCTTCTAAA T/- TTTTTTTCAA 2938 het 1765 hom 11 5 6 0 T 8 7 183216 CASAVA_Build 12 10393838 2D CTGTATATAT AC/-- ACCATATTTT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 AC 2 1 183217 CASAVA_Build 12 10395231 1D GTTTTTTTTT C/- TTTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 1 0 183218 CASAVA_Build 12 10396648 1D AGCTTTGTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 10 9 183219 CASAVA_Build 12 10397386 1D9M1D GTTTGAGAGT GTTTTTTTTCT/-TTTTTTTTC- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 17 4 N/A 0 0 183220 CASAVA_Build 12 10406444 1D TGCAGGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 10 13 A 12 11 183221 CASAVA_Build 12 10409273 1D CCTCTTAAGA G/- GACAAGCAGA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 G 2 1 183222 CASAVA_Build 12 10414403 3D TAACCCTGTC CTT/--- CTCTTTATCA 3070 het 3070 ref 28 16 9 7 CTT 1 0 183223 CASAVA_Build 12 10416428 4D GTCCTAAGAT CTTA/---- CTTAAGGCTG 3070 het 3070 ref 51 29 19 5 CTTA 2 1 183224 CASAVA_Build 12 10417562 6D GTGTGTATAA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 338 hom 38 4 10 25 GT 10 7 183225 CASAVA_Build 12 10418911 1I TTTTTCTGTT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 A 7 8 183226 CASAVA_Build 12 10420164 4I TCTAGTCCAT ----/AACA AACACTGATG 2955 het 2955 ref 29 19 7 3 AACA 1 2 183227 CASAVA_Build 12 10421444 5D GAATTGCAAA CTAAT/----- CTAAAGTGAC 3070 het 3070 hom 34 13 19 6 CTAAT 1 0 183228 CASAVA_Build 12 10431442 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1101 het 1101 ref 32 22 4 6 T 13 12 183229 CASAVA_Build 12 10439020 4I GACTAGAAAT ----/ACCC ACAGGTGTGG 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 ACCC 0 1 183230 CASAVA_Build 12 10444622 3I TATGACACAG ---/ATT ATTGTGGTGG 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 ATT 1 2 183231 CASAVA_Build 12 10453950 2D AAAATACATT AA/-- GTTAGTGACT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 2 0 183232 CASAVA_Build 12 10461523 1I AGGAAAGGGA -/C CCCACGACTA 3070 het 3070 ref 46 30 12 4 C 3 4 183233 CASAVA_Build 12 10462804 1I TATGGCTGAA -/T TTTATGGCTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 3 4 183234 CASAVA_Build 12 10463195 4I TCAAAAATTA ----/ATTT GTTTTTCTAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 ATTT 0 1 183235 CASAVA_Build 12 10464723 5D AAAAATTGGT ATTAA/----- ATTAAGGTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATTAA 2 1 183236 CASAVA_Build 12 10465061 5D TACTATTGAA AACAT/----- AATATATTTT 1837 hom 15 het 9 0 5 5 AACAT 1 0 183237 CASAVA_Build 12 10468477 1D TATATAAACC A/- AAAAAACAGT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 7 6 183238 CASAVA_Build 12 10468832 11I26M1I TTCTTTTTAT -----------GAGCTTTTTTCTATATTTCATTTTAA-/TCTTTTTCTACGAGCTTTTTTCTATATTTCATTTTAAT TTTTTTTCTT 1963 het 296 hom 6 1 4 1 N/A 0 0 183239 CASAVA_Build 12 10469600 2D TGACGTAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 22 het 31 1 22 8 AC 9 8 183240 CASAVA_Build 12 10472991 1D AATAAAACTA T/- TTTTCATTAC 3070 hom 18 het 7 0 7 1 T 5 4 183241 CASAVA_Build 12 10473450 1D CAACCTCCGA C/- CCCTGGTTTA 2550 het 294 hom 12 1 9 2 C 4 3 183242 CASAVA_Build 12 10478246 1I TATGGCTGAA -/T TTTATGGCTT 2107 het 2107 ref 26 15 5 6 T 3 4 183243 CASAVA_Build 12 10478587 1I ACTTTAGCAC -/A AAACTTCACC 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 A 3 4 183244 CASAVA_Build 12 10478810 1D AACCATATTA C/- TTTTGGTTCC 2143 het 2143 ref 13 5 5 3 C 1 0 183245 CASAVA_Build 12 10483797 1D CCAAGGATAC A/- AACCTGTACA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 3 2 183246 CASAVA_Build 12 10483855 4D AATGGTAATT TTTG/---- TTTATCTAAT 2438 het 2438 ref 16 9 5 2 TTTG 1 0 183247 CASAVA_Build 12 10483914 1D AAAAAAGGTT A/- AAAATGGCAT 3070 het 3036 hom 23 9 7 7 A 5 4 183248 CASAVA_Build 12 10484222 9I12M1I29M1I TCTTAACAAC ---------TATATTCTTTTT-TATGAGCTTTTTTCTATATTTCATTTTAA-/TATTTTCTTTATATTCTTTTTCTACGAGCTTTTTTCTATATTTCATTTTAAT TTTTTTTCTT 1963 het 311 hom 5 1 4 1 N/A 0 0 183249 CASAVA_Build 12 10487357 1D GTAATATACA T/- TTTTTATCAT 3061 hom 18 het 9 0 7 3 T 6 5 183250 CASAVA_Build 12 10489250 2D TACAATTGAT AA/-- AATCTATTAG 3070 het 3070 ref 22 12 10 2 A 4 2 183251 CASAVA_Build 12 10489969 5D AAATGATTAA AAATC/----- AATGATGTTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 6 AAATC 1 0 183252 CASAVA_Build 12 10491190 11I GATTGGACAC -----------/CCCTGGTCCAT CTGATAATCA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 CCCTGGTCCAT 0 1 183253 CASAVA_Build 12 10493892 6D TCATAATAAT TTTAAG/------ TTTTTGTTTG 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TTTAAG 1 0 183254 CASAVA_Build 12 10497431 1D CCTATGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 44 3 31 11 T 12 11 183255 CASAVA_Build 12 10502551 1I TTATCTTTGA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 T 7 8 183256 CASAVA_Build 12 10509974 1D GATGCTATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 51 26 19 8 T 10 9 183257 CASAVA_Build 12 10511292 1D CCGTTCTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 T 10 9 183258 CASAVA_Build 12 10527867 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAAGG 2852 het 2852 ref 22 10 7 5 A 9 8 183259 CASAVA_Build 12 10531745 1I ACTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 10 10 A 10 11 183260 CASAVA_Build 12 10534060 1I TTTTTCTACA -/T TTTTTCATGA 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 5 6 183261 CASAVA_Build 12 10534725 1D AGTGAAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 22 1 14 7 A 16 15 183262 CASAVA_Build 12 10537033 5D TTGTTTGTTT GTTTG/----- TTTTGAGGCG 1931 hom 33 het 21 0 12 9 GTTTG 1 0 183263 CASAVA_Build 12 10538931 1I AGAAGAGAGT -/G GGGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 G 7 8 183264 CASAVA_Build 12 10558115 1I CAAAATATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 444 hom 23 1 20 2 T 9 10 183265 CASAVA_Build 12 10564372 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 1217 hom 17 3 14 4 ATA 4 3 183266 CASAVA_Build 12 10569119 3D GAAAACTTAC AGA/--- AGAAGAAATA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AGA 3 2 183267 CASAVA_Build 12 10575057 2D AATGACTCTC TT/-- ATGTTTTCTA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 T 2 0 183268 CASAVA_Build 12 10580005 5D AAAAAGAGAA CAAAC/----- CAATTCCAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CAAAC 1 0 183269 CASAVA_Build 12 10583981 1D TATGTAGAGC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 9 8 183270 CASAVA_Build 12 10593463 1D TGACCAAATC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 8 7 183271 CASAVA_Build 12 10594340 1I AAGCAAATAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 A 8 9 183272 CASAVA_Build 12 10603045 4D ATAATGGAAA TAAT/---- TATAGTAAAT 3032 het 1548 hom 13 4 7 2 TAAT 1 0 183273 CASAVA_Build 12 10603690 4I TTTTGAAAAG ----/TATT TATTTTGTTG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 TATT 1 2 183274 CASAVA_Build 12 10608125 2I CATCTTTCAC --/AT ATGTTTTTGG 3070 hom 53 het 25 0 18 7 AT 1 2 183275 CASAVA_Build 12 10609326 1D TAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 10 9 183276 CASAVA_Build 12 10612694 1D TTTTCTTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 10 9 183277 CASAVA_Build 12 10614933 2I GAAATCTATA --/AC AGTCACGGGT 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 AC 0 1 183278 CASAVA_Build 12 10616533 1I AATTATCAGT -/A AAAAAAAAAA 1866 het 1866 ref 12 6 5 1 A 10 11 183279 CASAVA_Build 12 10620299 3D AAAATCAAAG AAA/--- AAAAAAAACG 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 11 8 183280 CASAVA_Build 12 10621534 1I GGAGATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 14 13 18 A 11 12 183281 CASAVA_Build 12 10621897 1D TAATCTATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 A 9 8 183282 CASAVA_Build 12 10622246 2I TAGGTAAATG --/GT TAATCAAACT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 GT 0 1 183283 CASAVA_Build 12 10622961 1I CATCATTAGA -/T TTAAGGACCC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 2 3 183284 CASAVA_Build 12 10623193 1I TGAATCCGAT -/A CTTGATTCAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 0 1 183285 CASAVA_Build 12 10623345 2I AAAATAAAAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 9 11 183286 CASAVA_Build 12 10626158 1I ATATAAAGAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 8 9 183287 CASAVA_Build 12 10627612 1I AACAAAGCTA -/C CAATCACCTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 1 2 183288 CASAVA_Build 12 10632707 4I GAAGATAGAA ----/AGAG AGAGAGAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 AG 3 5 183289 CASAVA_Build 12 10632922 87D GAAGATGCTG GAATGATTTATCCTATTGATAAGAAAAAAGACCCAGGATATAATATCAGAGTTCTCTAACTGGTTGTATAGGTAGTTCTGAGAATTA/--------------------------------------------------------------------------------------- GAAAGAATGA 3070 het 3070 ref 22 24 9 1 GAATGATTTATCCTATTGATAAGAAAAAAGACCCAGGATATAATATCAGAGTTCTCTAACTGGTTGTATAGGTAGTTCTGAGAATTA 1 0 183290 CASAVA_Build 12 10635489 1D CAAGGTAATT C/- CCTCTGTGTG 3070 het 3070 hom 42 20 21 2 C 3 2 183291 CASAVA_Build 12 10636882 2I TAAATGTAAC --/TG TTTTACTGTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 TG 0 1 183292 CASAVA_Build 12 10640932 2D CATTTGAAAC AA/-- AGAGACAATA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 3 1 183293 CASAVA_Build 12 10645154 4I CATTGACAAG ----/TATT TATTTTCGTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TATT 1 2 183294 CASAVA_Build 12 10654687 8D AGATCATTGC TAGACATG/-------- TAGACAATAA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TAGACATG 1 0 183295 CASAVA_Build 12 10657684 2D TATGATAGTC TT/-- TTTTATGGAC 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 T 6 4 183296 CASAVA_Build 12 10661291 1I TTAAAATGCT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 9 10 183297 CASAVA_Build 12 10667954 1I ATCTTTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 35 1 27 7 T 11 12 183298 CASAVA_Build 12 10676068 1I CCATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 38 1 29 8 A 10 11 183299 CASAVA_Build 12 10678025 3I AGAAGAGAAT ---/GAA GAAGAAGCCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 GAA 2 3 183300 CASAVA_Build 12 10681203 1D GAGTCTAGGA T/- TTTTTTTTTT 1564 het 633 hom 21 4 6 11 T 19 18 183301 CASAVA_Build 12 10687838 1I TGTATTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 39 1 30 8 A 10 11 183302 CASAVA_Build 12 10695736 1D TGTTCTATTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 9 8 183303 CASAVA_Build 12 10696604 1I42M1I GAAAGAAAAA -GGTTAACGAGTCTAAGGAGAGGTAATATGAGATGCACTCTGG-/TGGTTAACGAGTCTAAGGAGAGGTAATATGAGATGCACTCTGGA AAAAAATCTA 3070 hom 141 het 33 0 48 7 N/A 0 0 183304 CASAVA_Build 12 10697106 2I GCCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 9 11 183305 CASAVA_Build 12 10700934 1D TGGAAGATAC T/- GGAAGTGTCC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 1 0 183306 CASAVA_Build 12 10703450 2I GGCCCAGGAG --/CC GCAAGTTATC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 0 2 183307 CASAVA_Build 12 10705711 2D TAATATTACT TG/-- TGTTTTATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TG 2 1 183308 CASAVA_Build 12 10706110 2I GGATATACAC --/AG AGATTCTGTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AG 1 2 183309 CASAVA_Build 12 10707608 1I ACCATTTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 132 hom 31 1 24 6 A 11 12 183310 CASAVA_Build 12 10713305 1I GAATAAAAAT -/A AGATAATATA 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 1 2 183311 CASAVA_Build 12 10715324 3I GCGTCAGCAT ---/GAG AAGACATGAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 GAG 0 1 183312 CASAVA_Build 12 10739719 11I TGAAAATATA -----------/TTCAACGTCAT TAGCTATTAG 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 TTCAACGTCAT 0 1 183313 CASAVA_Build 12 10744104 4D AATGCTTACC TAAT/---- TAATGGCTGA 3070 het 3070 hom 29 12 16 3 TAAT 2 1 183314 CASAVA_Build 12 10745475 1D AACAGCTTAC A/- AAACGGCAAC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 4 3 183315 CASAVA_Build 12 10748113 1D AGTAAAAAAC A/- AAATGCTTCA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 A 4 3 183316 CASAVA_Build 12 10752185 1D TATATTCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 10 9 183317 CASAVA_Build 12 10762168 1D CCACAGGCCA C/- CCACCTTCCT 3070 het 3070 ref 56 29 24 3 C 3 2 183318 CASAVA_Build 12 10767936 1I AGCCTCGAGG -/A ATGAGAGGTA 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 A 1 2 183319 CASAVA_Build 12 10770740 1D TACATTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1584 hom 33 8 19 6 T 15 14 183320 CASAVA_Build 12 10771343 1I AAGCAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 A 11 12 183321 CASAVA_Build 12 10771496 4I GTTCTTAGTG ----/TTTA TTTAAAGACT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTTA 1 2 183322 CASAVA_Build 12 10774077 2D AGTGATGATT TA/-- TATATATATA 3070 het 274 hom 22 2 9 12 TA 8 7 183323 CASAVA_Build 12 10774091 3D TATATATATA TAT/--- TATTATTATT 1849 het 613 hom 23 2 5 16 TAT 4 3 183324 CASAVA_Build 12 10776281 2D AAGACCCCCC CA/-- CCCAACCGCC 3070 hom 58 het 24 0 19 5 CA 1 0 183325 CASAVA_Build 12 10777034 1D ACCGTCTGGC G/- GCCCCGTCTA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 G 2 1 183326 CASAVA_Build 12 10781108 1I TTTCAAAGCC -/T TTTCTCCAAA 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 T 3 4 183327 CASAVA_Build 12 10781824 2D GTAAATTGGA CC/-- TGTGAGCTGG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 2 0 183328 CASAVA_Build 12 10812601 1I AGAACCAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 47 2 36 9 T 13 14 183329 CASAVA_Build 12 10841243 5I TTATTTAAGA -----/TAACT TAAATAATTA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TAACT 0 1 183330 CASAVA_Build 12 10842825 1I TTCTTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 1383 het 1383 ref 26 16 4 6 T 11 12 183331 CASAVA_Build 12 10852778 1D TTTAGATGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 T 10 9 183332 CASAVA_Build 12 10873104 8D ATACATATAT ATATATAC/-------- ATATACATAT 1240 hom 10 het 4 0 4 0 ATATATAC 1 0 183333 CASAVA_Build 12 10883363 5I CCAAGAAAAA -----/TAAAT TAAAAAAGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TAAAT 0 1 183334 CASAVA_Build 12 10884747 4I TGTACAAAAT ----/ATTA ATTAAAATAT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 ATTA 1 2 183335 CASAVA_Build 12 10886161 11D CTGATACAGT AGCCTAAAATG/----------- GCTAAGAGAT 3070 het 3070 ref 35 22 10 6 AGCCTAAAATG 1 0 183336 CASAVA_Build 12 10907475 2I TATTAAAAAG --/CA AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CA 0 1 183337 CASAVA_Build 12 10908957 1I AGACTTCAAC -/A AAAAAACTGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 6 7 183338 CASAVA_Build 12 10913210 1D TGAATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 561 hom 38 2 31 6 A 13 12 183339 CASAVA_Build 12 10923967 1I AGAAAATGCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 8 9 183340 CASAVA_Build 12 10931790 1I AGGCGCTTAT -/C TTTAGAACAA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 C 0 1 183341 CASAVA_Build 12 10935520 3D AGCTTGTCAC TTG/--- TTGTACTTGC 3070 het 3070 ref 52 25 23 5 TTG 2 1 183342 CASAVA_Build 12 10936378 5I AGAAAGGATT -----/GAAAG GAAAGTGAAT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 GAAAG 1 2 183343 CASAVA_Build 12 10941263 1D ACTTGAATTG C/- CCCCAGTTGT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 C 5 4 183344 CASAVA_Build 12 10943147 1D AAAGATTACA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 16 17 6 T 9 8 183345 CASAVA_Build 12 10945688 1I AAAGGGAAAG -/A AAAAAAGAAC 3070 hom 71 het 29 0 24 5 A 6 7 183346 CASAVA_Build 12 10949536 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 9 10 183347 CASAVA_Build 12 10951380 2D TATAACTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 46 15 19 12 TG 9 8 183348 CASAVA_Build 12 10957321 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 A 12 13 183349 CASAVA_Build 12 10960148 2D ATGGGAATTA CT/-- CGGGAGCCAC 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 CT 1 0 183350 CASAVA_Build 12 10961207 1D TTAAGGGATT A/- AATATTTAAT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 3 2 183351 CASAVA_Build 12 10976307 1I TCTTTCCTCC -/T TTATCCTTAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 2 3 183352 CASAVA_Build 12 10978487 1D TTCTTCCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 10 9 183353 CASAVA_Build 12 11000950 1D ACTGGGAATG A/- AAAAAAAAAA 1399 het 1399 ref 43 34 4 6 A 11 10 183354 CASAVA_Build 12 11003211 1I AGAAAGGATT -/C CGGAGACCAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 1 2 183355 CASAVA_Build 12 11006997 4D AACAAACAAA TAAC/---- TAAATCAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 15 5 TAAC 1 0 183356 CASAVA_Build 12 11007853 2D AATCACGTTT AA/-- GCACACTATG 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 2 0 183357 CASAVA_Build 12 11008131 1D ATATAGATAC T/- TTTTAGACTA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 5 4 183358 CASAVA_Build 12 11010560 4D GCAGAAAAAC CTAA/---- CTGATATAGG 3070 het 3070 ref 31 15 14 4 CTAA 1 0 183359 CASAVA_Build 12 11011982 4I AATAATAAAC ----/AAAT AAAAATAATA 2547 het 1891 hom 14 8 6 0 AAAT 0 1 183360 CASAVA_Build 12 11014681 1I GATCCACCCG -/C CTCAGCCACC 2971 het 1637 hom 16 5 9 2 C 1 2 183361 CASAVA_Build 12 11015229 4D TCTTACACTT GTGA/---- GTATTATCTA 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 GTGA 1 0 183362 CASAVA_Build 12 11020500 1D GGCTGAGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 22 8 T 12 11 183363 CASAVA_Build 12 11027955 1I ACTAACTCAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 8 9 183364 CASAVA_Build 12 11035629 2D31M1I ACAGACAAGA GGAAGAACTAGCAAAGGAGACTAAGAAATTGTG-/--AAGAACTAGCAAAGGAGACTGAGAAGTGCTGC CCAGTGAACA 2964 het 2964 ref 56 59 7 6 N/A 0 0 183365 CASAVA_Build 12 11060611 6I TTGAATGTGT ------/AATTGA AATGGACACA 3002 het 3002 ref 47 32 7 9 AATTGA 0 1 183366 CASAVA_Build 12 11061089 1D TTTTATGTCA G/- GGCTTTGTCA 2432 het 2432 ref 44 33 6 6 G 3 2 183367 CASAVA_Build 12 11062651 1D TGAGGTCTAA G/- GGGAACCCCT 3070 het 3070 ref 47 28 12 7 G 4 3 183368 CASAVA_Build 12 11062830 1D AGTAGAAAGC G/- GGGAAACATA 3070 het 3070 ref 63 34 24 5 G 4 3 183369 CASAVA_Build 12 11063158 1I GTCTGTCTCA -/C CTAATTGTGA 3070 het 3070 ref 71 49 12 11 C 1 2 183370 CASAVA_Build 12 11063410 4I69M1I AAAGGATACT ----AAAAAAATATACAAATAATGTGTAAGAAAGGTGACTGGTTACAAACTCAATTTTTAAAAATGAAATGCC-/AAACAAAATAATATACAAATAATTTGTAAGTAAGGTGAGTGGTTACTAACTCAATTTTTAAAAATGAAATACCT TTTTTGTGTA 3070 het 3070 ref 43 59 9 2 N/A 0 0 183371 CASAVA_Build 12 11065423 1D ACAAACACTA T/- GGAAAAACTG 2762 het 2762 ref 34 24 6 4 T 1 0 183372 CASAVA_Build 12 11066735 1I AAGTGGAAAA -/T TGAATTCTCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 1 2 183373 CASAVA_Build 12 11073955 4D ATGAAATATA AAAT/---- ACATGAATGA 3070 het 1055 hom 22 6 15 2 AAAT 1 0 183374 CASAVA_Build 12 11074093 4I ACACACATAA ----/ACAC ACACACACAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AC 4 6 183375 CASAVA_Build 12 11078400 5I TTATTATTTT -----/TTGCA CTAAACATTC 2454 hom 12 het 5 0 5 0 TTGCA 0 1 183376 CASAVA_Build 12 11085047 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 10 183377 CASAVA_Build 12 11085888 3D TACATCAGAA AAG/--- AAGAAAAATT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 AAG 2 1 183378 CASAVA_Build 12 11087483 1I CAATTAACAT -/A AAAAATTAGT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 5 6 183379 CASAVA_Build 12 11089184 1I AATGGTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 799 hom 36 2 20 14 A 15 16 183380 CASAVA_Build 12 11089528 1D TTAAAATACC A/- AAAAATGTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 6 5 183381 CASAVA_Build 12 11091381 1D ATGTCAATTT C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 C 1 0 183382 CASAVA_Build 12 11095268 1D GTAATAATAA T/- TTTCATGGAA 893 het 893 ref 26 23 2 2 T 4 3 183383 CASAVA_Build 12 11096796 2D TTTGATTTTT TG/-- TTTTTTGTTT 3070 hom 72 het 39 1 35 4 TG 1 0 183384 CASAVA_Build 12 11098453 3I ACATGCATGG ---/TAT TATAATCTTT 1721 het 1721 ref 36 29 4 3 TAT 1 2 183385 CASAVA_Build 12 11098588 3I TTGAAATGTT ---/GTG ATCATAAATA 1352 het 1352 ref 31 23 3 5 GTG 0 1 183386 CASAVA_Build 12 11100376 1D TACAACTACT C/- CCTGCCTCAG 867 het 867 ref 42 34 3 6 C 3 2 183387 CASAVA_Build 12 11100872 2D GAACTTTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 251 hom 49 6 28 15 T 14 12 183388 CASAVA_Build 12 11101540 2D GATGGATTAT AG/-- AATGAGTGCA 2620 het 2620 ref 50 41 6 7 AG 1 0 183389 CASAVA_Build 12 11101793 2D TACATTTTTT TA/-- AAAACATCAT 3070 het 3070 ref 49 33 11 6 TA 1 0 183390 CASAVA_Build 12 11103823 11D5M9D3M41D AAAGAGATGA GATCATCTTGCTCTCTGATCTTACATTCAACAGAAAGCAAGACAGAGATGAGATCATCTCTGATCTGAT/-----------TCTCT---------TTC----------------------------------------- TTTACAGTTC 360 het 360 ref 44 68 2 4 N/A 0 0 183391 CASAVA_Build 12 11109528 1D CTATAAATCA T/- TTTTTAATGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 5 183392 CASAVA_Build 12 11109994 1I ATTGAAGAAC -/T TTTAAGTCTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 3 4 183393 CASAVA_Build 12 11110063 1D CCCTATCCGT G/- AGTATAGTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 G 1 0 183394 CASAVA_Build 12 11110495 4D TCATTTAATG AGAT/---- AGATGTATAT 3070 hom 21 het 8 0 8 1 AGAT 2 1 183395 CASAVA_Build 12 11110744 1I ATTTCTTTGC -/T TTCTTTTTCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 3 183396 CASAVA_Build 12 11110966 3D CTAAATCTGG ATC/--- ATTTTACTAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 ATC 1 0 183397 CASAVA_Build 12 11111047 3D TTTATACCTT AAC/--- AAATTTGCCT 3070 hom 39 het 17 0 14 7 AAC 1 0 183398 CASAVA_Build 12 11111311 1D AAATTGGAAA T/- AAGAAAAAAG 3070 hom 33 het 12 0 12 2 T 1 0 183399 CASAVA_Build 12 11111895 1I CTTTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 21 1 15 5 T 11 12 183400 CASAVA_Build 12 11112774 4I GTATTATTAC ----/TTCT TTCTATTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TTCT 1 2 183401 CASAVA_Build 12 11113299 1I TGAGATCTTG -/T GGCAATCTCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 0 1 183402 CASAVA_Build 12 11113355 5D GAGAATGAGA AGTGG/----- AGTGGTGCCC 3070 hom 30 het 11 0 11 1 AGTGG 2 1 183403 CASAVA_Build 12 11113822 1D TTTCCTAGAT A/- AACAGTACCC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 3 2 183404 CASAVA_Build 12 11114033 1D AGGGAGAGGC A/- ATTTCACAAT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 2 1 183405 CASAVA_Build 12 11114616 1D CTAACACTAA T/- TATCTAGGTA 3070 hom 66 het 29 0 20 11 T 2 1 183406 CASAVA_Build 12 11114970 1D28M1D GCAGGGCACA TTTTTCTAACTATGTGCTCCGAGACCAATC/-TTTTCAAACTTAGTGCTCCAAGACAGAT- TCTCCTGAGA 3070 hom 17 het 11 0 8 5 N/A 0 0 183407 CASAVA_Build 12 11115588 1D TTAGAGTCTG T/- TAAGTGGCCC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 T 2 1 183408 CASAVA_Build 12 11117808 1D CAAGCAAAAA G/- CCCCTCAAGC 3070 hom 60 het 22 0 20 4 G 1 0 183409 CASAVA_Build 12 11118831 1I AAGTGACAAC -/T GGCAAAGTCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 0 1 183410 CASAVA_Build 12 11120285 5I14M3I TATACTCTCT -----TTGGGACTTTTTTT---/TTATGTTGGGCTTTTTTTTTTA AAGATAGAGA 2767 hom 15 het 6 0 6 0 N/A 0 0 183411 CASAVA_Build 12 11121928 1D AATAATATGA C/- CCAGAGTAAA 1855 hom 10 het 4 0 4 1 C 3 2 183412 CASAVA_Build 12 11123942 1D CCACTTTCCA T/- TTCCCCTATA 3070 hom 33 het 12 0 12 1 T 3 2 183413 CASAVA_Build 12 11124003 1D TATGATCATC T/- TTTTTTAAAT 2197 hom 12 het 9 0 5 4 T 7 6 183414 CASAVA_Build 12 11127395 11D ATTGTGAAAC ATAACATACAT/----------- ATATATATAA 1449 hom 7 het 17 0 3 14 ATAACATACAT 1 0 183415 CASAVA_Build 12 11128582 3D AAATTGTTAC TCT/--- TTTTAAATTC 1947 het 488 hom 11 6 4 1 TCT 1 0 183416 CASAVA_Build 12 11130036 4I TAAAATGAAA ----/AAGT AATTAATTTT 2258 hom 12 het 7 0 5 3 AAGT 0 1 183417 CASAVA_Build 12 11145874 3I GAAATCTTCA ---/AGG AGAACTACAA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 AGG 0 1 183418 CASAVA_Build 12 11147106 2I ACACATGCAC --/AT ATATGTTTAT 1804 hom 15 het 7 0 6 1 AT 2 3 183419 CASAVA_Build 12 11147717 1D TATTTTAACA C/- CTAAAGAAAT 3070 hom 57 het 20 0 20 1 C 2 1 183420 CASAVA_Build 12 11148320 4I TCTCACATCT ----/GTGA GTATTATTAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GTGA 0 1 183421 CASAVA_Build 12 11155818 1I TAGACACAAT -/A AAAAAATAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 6 7 183422 CASAVA_Build 12 11159283 1D CTATTAGACC A/- AAGCAAAGAG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 3 2 183423 CASAVA_Build 12 11163183 1D AATGGCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 39 0 28 11 A 12 11 183424 CASAVA_Build 12 11165072 4D AAATAAAAAT AGAA/---- AGAGATGCCT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 AGAA 1 0 183425 CASAVA_Build 12 11168221 4D TGGGGGAGGG CTTA/---- CTTATTTGAT 3070 hom 99 het 52 0 34 18 CTTA 2 1 183426 CASAVA_Build 12 11168338 1I AATCAAAATC -/T TTTTTATAGT 1750 het 1750 ref 31 24 4 4 T 5 6 183427 CASAVA_Build 12 11169577 5I TCGATATTAC -----/TATAA TATATTGGAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TATAA 0 1 183428 CASAVA_Build 12 11171552 5I CTAAAATGAA -----/AAAGT AATTAATTTT 2694 het 2694 ref 44 34 8 3 AAAGT 0 1 183429 CASAVA_Build 12 11172236 1I GGAGTCAGAC -/T GCCAGGTCAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 183430 CASAVA_Build 12 11173449 2D GATGGGTTAT CG/-- AATGAATGCA 3070 het 3070 ref 51 37 11 4 CG 1 0 183431 CASAVA_Build 12 11175194 2I GGCTGCCAGC --/AG AGTCATACCA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 AG 1 2 183432 CASAVA_Build 12 11179371 53D AGAGCTATCC AACAAACCCATTTAGAAAAACAAAATCCAAAGCCATGTGATATATAAATATCT/----------------------------------------------------- AATGTAGTTT 3070 hom 40 het 15 0 14 5 AACAAACCCATTTAGAAAAACAAAATCCAAAGCCATGTGATATATAAATATCT 1 0 183433 CASAVA_Build 12 11181089 2I TTAAATTTTA --/CT CTGTTTTTAT 3070 hom 50 het 19 0 16 3 CT 1 2 183434 CASAVA_Build 12 11181853 1I TATATTATTC -/T CAGCATCAGG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 0 1 183435 CASAVA_Build 12 11182676 1D AGGCTGAGGC A/- GGTGGATTGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 1 0 183436 CASAVA_Build 12 11184875 2I TAAGTAATAC --/TT TTGTATAACT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 2 4 183437 CASAVA_Build 12 11186983 1D ATGAACTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 66 hom 38 1 35 2 A 10 9 183438 CASAVA_Build 12 11187615 16D AGGTCAACAT ATAAAGGGGTCAACTC/---------------- ATCGAAAGGA 3070 hom 93 het 31 0 32 5 ATAAAGGGGTCAACTC 1 0 183439 CASAVA_Build 12 11188112 3D TCAGACTCTC CTT/--- CTGTGGGTCT 2883 hom 27 het 11 0 10 3 CTT 1 0 183440 CASAVA_Build 12 11189629 1D AATTAAGAAC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 9 8 183441 CASAVA_Build 12 11190137 1I TTCTAGGTAG -/T TTTTTTTACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 8 183442 CASAVA_Build 12 11195140 1D TCATCCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 506 hom 49 2 33 14 T 13 12 183443 CASAVA_Build 12 11195806 1D GTATGTCATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 10 9 183444 CASAVA_Build 12 11196200 3D GTGAGATAGT ATA/--- ATAATACAAG 3070 hom 24 het 9 0 9 1 ATA 3 2 183445 CASAVA_Build 12 11198780 9I TTCCTGTTTA ---------/GTCCAGCAT GTCAAAGAGC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 GTCCAGCAT 0 1 183446 CASAVA_Build 12 11202258 1D CATTTTATAA T/- TTTTTCCCTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 5 183447 CASAVA_Build 12 11202601 5D AGGTCTTCTA TTAAG/----- TTATTTCTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTAAG 1 0 183448 CASAVA_Build 12 11203204 1I TCAGCCAGGC -/A AAAAAATAAG 3070 hom 132 het 51 0 43 8 A 6 7 183449 CASAVA_Build 12 11205043 2D TCTTGGAAGC TA/-- TGTGTTAAAG 3070 hom 120 het 48 0 41 9 TA 1 0 183450 CASAVA_Build 12 11208610 1D GAGGCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 24 1 17 6 A 11 10 183451 CASAVA_Build 12 11209519 12I ATATTTACAG ------------/TAAATCCTGAGA TAAATCCTGA 3070 hom 72 het 32 0 25 8 TAAATCCTGAGA 1 2 183452 CASAVA_Build 12 11211279 1I ACAGATGAAA -/T CAATTCATGT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 0 1 183453 CASAVA_Build 12 11211796 1D TGCATGGTTT A/- AAAAATGTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 6 5 183454 CASAVA_Build 12 11213498 1I AAAATCCAGG -/A ACGTAATGAC 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 1 2 183455 CASAVA_Build 12 11218550 1D GGAAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 25 4 T 13 12 183456 CASAVA_Build 12 11221344 2I GGGTTGGGGG --/GT GAGGGCAGGG 3070 hom 32 het 13 0 11 2 GT 0 1 183457 CASAVA_Build 12 11223050 1I AATATTACTG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 94 het 35 0 31 5 T 7 8 183458 CASAVA_Build 12 11224321 3I TCCAATTCCA ---/GGT GGTGGCATTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 GGT 1 2 183459 CASAVA_Build 12 11226716 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACACCCC 3070 het 339 hom 45 3 36 6 C 0 1 183460 CASAVA_Build 12 11227450 1I CATGGTGAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 3 4 183461 CASAVA_Build 12 11231755 2I ATATGTTCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 26 1 20 5 T 10 12 183462 CASAVA_Build 12 11233212 1I GAAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1017 hom 28 4 21 3 A 10 11 183463 CASAVA_Build 12 11236616 3I AAACAATAGT ---/AAC AACAACAATA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAC 2 3 183464 CASAVA_Build 12 11237474 1I AAACAAATCT -/G TGTTTGTACC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 0 1 183465 CASAVA_Build 12 11239514 1D TCCAGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 1429 het 1429 ref 35 26 4 5 A 12 11 183466 CASAVA_Build 12 11248693 2D CCATTTTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 37 1 27 9 A 15 13 183467 CASAVA_Build 12 11252649 1D TATTGTTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 9 8 183468 CASAVA_Build 12 11253132 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 23 0 21 2 A 13 14 183469 CASAVA_Build 12 11261290 1I ACACATATAC -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 7 8 183470 CASAVA_Build 12 11266344 1D ACAGAACTAG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 7 183471 CASAVA_Build 12 11268299 9I38M1I TAAGCAATAA ---------AAAGTAATAGAAGAAAAATTTTCAAACGTGAAAGTGAC-/ATCATCAATAAAATAATAGAAGAAAAATTTTCAAACGTGAAAGTGACT TAAGAGAGAA 3070 hom 51 het 21 0 18 8 N/A 0 0 183472 CASAVA_Build 12 11274619 5D GTAGTCATCC TACAA/----- TACACAGAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TACAA 1 0 183473 CASAVA_Build 12 11276263 5D CAGATAAAGA AAAGT/----- AAAGAAAGTG 3070 hom 111 het 40 0 37 8 AAAGT 1 0 183474 CASAVA_Build 12 11287820 5D AAGGAAAGGA AAGGG/----- AGAGACCTCA 3070 hom 85 het 31 0 26 9 AAGGG 1 0 183475 CASAVA_Build 12 11291331 1D CATTTCATGC T/- TTTTTTGTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 6 183476 CASAVA_Build 12 11292734 4D TAACATTGAC TGAA/---- TATTCACTCC 3070 hom 126 het 47 0 42 8 TGAA 1 0 183477 CASAVA_Build 12 11294393 2D CATATTCTCG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 94 het 34 0 32 3 CT 6 5 183478 CASAVA_Build 12 11298073 2D AATATTTTGT TA/-- TACTTACCTA 3070 hom 154 het 54 0 52 2 TA 2 1 183479 CASAVA_Build 12 11301130 15D TTCCTGCCTG GCAGCTCTGAAGAGA/--------------- GCAGCCGATC 3070 hom 66 het 25 0 18 11 GCAGCTCTGAAGAGA 1 0 183480 CASAVA_Build 12 11304039 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 10 9 183481 CASAVA_Build 12 11311601 1D TCCTGGATGA G/- GGTGGGGGAC 3070 hom 57 het 22 0 17 5 G 3 2 183482 CASAVA_Build 12 11312361 3I TGGAGGAGGT ---/GGG GGACACACGG 3070 hom 57 het 23 0 18 5 G 2 5 183483 CASAVA_Build 12 11319559 10I TTTCCACAGT ----------/TTTGTTTACA TTTGTTGTTT 3070 hom 73 het 28 0 25 3 TTTGTTTACA 0 1 183484 CASAVA_Build 12 11321359 1I CTTTCTTTTA -/T GTTGAGAAAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 0 1 183485 CASAVA_Build 12 11326656 2D TCCTGTGCTC AG/-- GGGATTCCCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AG 1 0 183486 CASAVA_Build 12 11331081 1D AGAATTAAAT A/- GACACAATAA 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 A 1 0 183487 CASAVA_Build 12 11331484 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 8 7 183488 CASAVA_Build 12 11348481 1D ATTTCTCAAA G/- AACTAAAACT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 G 1 0 183489 CASAVA_Build 12 11353257 1D GAGAAGTTGA G/- GGGCTCTCAG 3070 het 102 hom 26 1 22 3 G 4 3 183490 CASAVA_Build 12 11371011 1I AAATCTAATC -/T TCTAAGTGAG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 1 2 183491 CASAVA_Build 12 11377530 4D TTTTCTTTTT TTTC/---- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 TTTC 1 0 183492 CASAVA_Build 12 11385535 2I GGTGAAAGAA --/AG AGACTCTGCC 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 AG 1 2 183493 CASAVA_Build 12 11387448 1D AGGTGAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 30 0 24 6 A 11 10 183494 CASAVA_Build 12 11405639 2D TCACAAACTC TA/-- TTATTTTTCT 3070 het 3070 ref 74 56 9 11 TA 1 0 183495 CASAVA_Build 12 11406213 2D TCCATATTAT AA/-- AAAAAAAACT 3070 hom 6 het 34 1 20 14 A 10 8 183496 CASAVA_Build 12 11409794 1D GAAATGCATG A/- AAAGAGATTA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 4 3 183497 CASAVA_Build 12 11414454 2D CAAAACACAC TG/-- TGTAATTTGA 3070 het 3070 hom 60 19 33 10 TG 2 1 183498 CASAVA_Build 12 11415153 1I AATTAAAAAC -/A ACAGAAAAGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 1 2 183499 CASAVA_Build 12 11424577 1D TGGTTTTTCG A/- AAAAAATCAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 7 6 183500 CASAVA_Build 12 11431742 1I CAGAATTGGT -/A AAAAAATAAT 3070 hom 164 het 68 0 59 9 A 6 7 183501 CASAVA_Build 12 11435792 1I ATGATGACCT -/A TTTTCCAATG 3070 hom 123 het 49 0 41 8 A 0 1 183502 CASAVA_Build 12 11467793 1D TGTGGCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 518 hom 33 3 19 11 T 16 15 183503 CASAVA_Build 12 11484065 1I AGAGGGTGAC -/A AAAAAGAGGG 3070 hom 130 het 50 0 42 8 A 5 6 183504 CASAVA_Build 12 11490547 1I TTTTGTTTTG -/C CCCCCCAGGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 6 7 183505 CASAVA_Build 12 11497016 1D TCTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 23 0 15 8 A 11 10 183506 CASAVA_Build 12 11500843 1I CGATATTCTG -/T TCAAAAAAAA 3070 het 58 hom 25 1 21 3 T 1 2 183507 CASAVA_Build 12 11505586 1D ATTTTTCAGC A/- TGGGAGGAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 0 183508 CASAVA_Build 12 11506071 1D TTTCTTTTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 92 het 33 0 30 3 T 8 7 183509 CASAVA_Build 12 11506170 13D CTCCTGAGTA GCTAGGACTGCAG/------------- GCACGCACCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 GCTAGGACTGCAG 1 0 183510 CASAVA_Build 12 11513981 1I TTTACAAGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 18 0 12 6 A 9 10 183511 CASAVA_Build 12 11516510 1I CAATAAACAT -/G GGCATGCAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 G 2 3 183512 CASAVA_Build 12 11521053 1I CAAAAAACCA -/C CCCTCCCCAT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 3 4 183513 CASAVA_Build 12 11524324 3I TAGAAAAAAA ---/AAG AAGCTATGCC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 AAG 1 2 183514 CASAVA_Build 12 11526815 1I TTTCTTTTTT -/C CTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 24 3 18 3 C 1 2 183515 CASAVA_Build 12 11541456 1D ACCTCCCAGC T/- TTCAAGCAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 3 2 183516 CASAVA_Build 12 11560212 3D TTGGCAGTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 1682 het 784 hom 21 5 5 11 T 19 16 183517 CASAVA_Build 12 11567627 2D TTACGTGTGA TT/-- TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 9 7 183518 CASAVA_Build 12 11569104 1I CTAAACTCTC -/A AAAAAAAAAA 2082 het 2082 ref 35 20 6 9 A 14 15 183519 CASAVA_Build 12 11582336 1I ATAGTAGAAT -/G GGGGGGGATT 3070 hom 59 het 25 0 18 7 G 7 8 183520 CASAVA_Build 12 11582811 1I CTCCCCTCTG -/C CAGTGCCTGT 3070 hom 116 het 42 0 35 7 C 1 2 183521 CASAVA_Build 12 11584957 2D GTGTGTGTGT GA/-- GAGAGAGTGT 3070 hom 152 het 63 0 46 20 GA 4 3 183522 CASAVA_Build 12 11592530 1I GTAACACTCA -/C CGCGAGGGTC 3070 hom 75 het 26 0 25 1 C 1 2 183523 CASAVA_Build 12 11598458 3D AGTCTGTAGG AAC/--- AACAACAAGA 3070 hom 100 het 42 0 33 11 AAC 3 2 183524 CASAVA_Build 12 11669093 1I TTCACAGATA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 8 9 183525 CASAVA_Build 12 11669179 2D AGCACAAAGC TG/-- GAGGCATTAC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 TG 1 0 183526 CASAVA_Build 12 11669517 1I AGAAAACATA -/G GGGAAACACT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 3 4 183527 CASAVA_Build 12 11671179 11D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAGAGAAA 3070 hom 46 het 16 0 15 4 A 15 4 183528 CASAVA_Build 12 11672989 1D GCAAATGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 10 9 183529 CASAVA_Build 12 11675217 5I TGCTAAAAAT -----/AATAA AATAAAATAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AATAA 1 2 183530 CASAVA_Build 12 11691220 4D TTTGGCGGTA TCTG/---- TCTGGGTAGA 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 TCTG 2 1 183531 CASAVA_Build 12 11698806 1I GTGGGGGTAG -/A AAATGGGCCA 3070 het 3070 hom 41 16 13 12 A 3 4 183532 CASAVA_Build 12 11707450 1D TACAGCTACC A/- AAGGCTCAAG 3070 het 3070 ref 59 26 24 10 A 3 2 183533 CASAVA_Build 12 11707959 2D GTTGGTAGGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 37 0 28 10 TG 7 6 183534 CASAVA_Build 12 11711735 4I GGTGGTTTAT ----/TTTC TTTCTTTTTT 3070 hom 11 het 27 1 19 7 TTTC 1 2 183535 CASAVA_Build 12 11716141 1D AGGTCATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 A 11 10 183536 CASAVA_Build 12 11725692 3I CATTTTCACC ---/ACT GTTTAAGGTC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 ACT 0 1 183537 CASAVA_Build 12 11732308 2D GCTGCCTGTT AG/-- AGTCTTGGCT 3070 het 3070 ref 41 18 19 5 AG 2 1 183538 CASAVA_Build 12 11733812 1I ACTCCCTAGC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 7 8 183539 CASAVA_Build 12 11742806 1D CTCCTTCAAC A/- ACTAGCAAGG 3070 hom 110 het 40 0 36 4 A 2 1 183540 CASAVA_Build 12 11754835 6I TTAGTATCAC ------/AATGCT AATGCTAGTA 3070 hom 135 het 52 0 45 7 AATGCT 1 2 183541 CASAVA_Build 12 11784782 1I TCTATCACTG -/T TTTAGAATTG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 3 4 183542 CASAVA_Build 12 11801629 1I GTTTGTTCCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 10 183543 CASAVA_Build 12 11803363 1I TATAGATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 266 hom 29 1 23 5 T 11 12 183544 CASAVA_Build 12 11803985 1I TTGGCTTGAA -/C TGTGCTTCTC 3070 hom 147 het 57 0 48 9 C 0 1 183545 CASAVA_Build 12 11804910 1I GCAAATGAGC -/T TTTAGTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 3 4 183546 CASAVA_Build 12 11805134 8D TGTGTGTGTG TGTATATA/-------- TGTATATATG 3070 hom 60 het 27 0 21 10 TGTATATA 2 1 183547 CASAVA_Build 12 11808456 1I AGCACTATAA -/T TTTGCTTAGG 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 T 3 4 183548 CASAVA_Build 12 11815103 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 25 19 10 A 11 12 183549 CASAVA_Build 12 11820507 1I CTCAATCATT -/A AAATTAAATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 3 4 183550 CASAVA_Build 12 11828660 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2372 het 50 hom 16 1 10 5 A 17 16 183551 CASAVA_Build 12 11830538 1I ACTTAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1416 hom 31 3 23 5 T 10 11 183552 CASAVA_Build 12 11834302 1I TCAGCACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 10 11 183553 CASAVA_Build 12 11835958 3I TGTTCATTGA ---/TGT TATTGTTATA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 TGT 0 1 183554 CASAVA_Build 12 11840387 4D AAAGTACATT GTGA/---- GTGAGTCTTA 3070 het 3070 ref 45 30 12 4 GTGA 2 1 183555 CASAVA_Build 12 11840981 1I TTTTTTTTTT -/G TGTGTGTGTG 1596 het 1596 ref 21 12 7 2 G 0 1 183556 CASAVA_Build 12 11841493 1D TCCAAAACCT C/- GGCTGTACCC 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 C 1 0 183557 CASAVA_Build 12 11848706 1I AGTTTATGTT -/C CTACCTCAGG 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 C 1 2 183558 CASAVA_Build 12 11853367 1I ACCCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2875 hom 35 9 15 11 A 12 13 183559 CASAVA_Build 12 11860007 1D GACGGGCAGA G/- GGACAGTATG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 G 3 2 183560 CASAVA_Build 12 11881574 1I CCAGTAGTTC -/T TTTTTTTGGT 2645 het 2645 ref 28 14 7 7 T 7 8 183561 CASAVA_Build 12 11885536 1D GCGTTGATCT A/- AAAGGCCAAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 4 3 183562 CASAVA_Build 12 11886609 16D TGACACAGAT ACACACACACACACAC/---------------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 15 18 11 AC 16 8 183563 CASAVA_Build 12 11887115 1D GTTCATTTTT A/- AAGCAAGCAA 3070 het 3070 ref 46 18 17 11 A 3 2 183564 CASAVA_Build 12 11890432 1I CTCTTACTTT -/A AAAAAAAAAA 2946 het 2689 hom 29 9 9 11 A 13 14 183565 CASAVA_Build 12 11894751 12D AGTGTTTGTG GTGGTGGTGGTA/------------ GTGGTGGTGG 3070 het 3070 hom 34 15 14 7 GTGGTGGTGGTA 2 1 183566 CASAVA_Build 12 11904894 1I TTGGTTGTTT -/C CCCCCCCTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 7 8 183567 CASAVA_Build 12 11916696 11D ATTATATTAC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 15 5 T 21 10 183568 CASAVA_Build 12 11918578 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2363 het 328 hom 11 2 6 3 A 14 13 183569 CASAVA_Build 12 11918640 2D CACATATATG TA/-- TATATATATG 2640 hom 18 het 8 0 7 1 TA 5 4 183570 CASAVA_Build 12 11930667 1D CCATCAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 11 10 183571 CASAVA_Build 12 11936224 5D TTAGCTTGGG AGCGC/----- AGCGCTGCAA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 AGCGC 2 1 183572 CASAVA_Build 12 11937557 4I CTTACTGTTC ----/AAAG AAAGAATCTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AAAG 1 2 183573 CASAVA_Build 12 11939591 1I AATTTTTTAT -/A AAAAAAAAAA 2897 het 2897 ref 39 21 10 8 A 13 14 183574 CASAVA_Build 12 11961209 1D TTTTGCTCAG T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 114 het 44 0 37 7 T 7 6 183575 CASAVA_Build 12 11969724 5D AAAAAAAAAC TAATA/----- TAAGATCTTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 4 TAATA 1 0 183576 CASAVA_Build 12 11980038 1D AAATAAGTTC T/- TTTTTTTTAT 2986 het 2131 hom 18 8 8 3 T 9 8 183577 CASAVA_Build 12 11992787 1D CTCCTAAAGA C/- CCCCTCTCCA 2495 het 2495 ref 22 13 6 5 C 5 4 183578 CASAVA_Build 12 12011636 1D CTAAGGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 826 hom 34 4 16 14 T 15 14 183579 CASAVA_Build 12 12020076 1D TTAAGTGGGT G/- AATTGTATGG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 1 0 183580 CASAVA_Build 12 12022509 1D CATGGCGAAA C/- CCCGTCTATA 3070 hom 41 het 16 0 14 2 C 4 3 183581 CASAVA_Build 12 12026714 2I CTAGACAACC --/TA GCAGGTAAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TA 0 1 183582 CASAVA_Build 12 12027135 1I AAAAGGGAGG -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 5 6 183583 CASAVA_Build 12 12028592 1D TCTACAATAC T/- TTTTTTTTTG 1705 het 1705 ref 33 23 4 7 T 10 9 183584 CASAVA_Build 12 12044257 1I CTTGCCTGGT -/C CTCCCCAGGC 3070 hom 99 het 41 0 33 8 C 1 2 183585 CASAVA_Build 12 12045890 2I CAAAAAAAAA --/AG GAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AG 0 1 183586 CASAVA_Build 12 12046648 3I TTCATATAGA ---/AGG AGTTGTTTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AGG 0 1 183587 CASAVA_Build 12 12049589 1D CTGTCACCCA C/- CCCCCCCCGC 3070 hom 38 het 18 0 13 5 C 9 8 183588 CASAVA_Build 12 12049917 1I GACAACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 32 3 14 15 A 13 14 183589 CASAVA_Build 12 12074937 2D TGTCTCCAAT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 2655 hom 30 9 13 8 A 11 9 183590 CASAVA_Build 12 12081973 1I TTTCTGTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 9 10 183591 CASAVA_Build 12 12092157 2D TATCTGTGTG TC/-- TGTGTATCTG 1194 het 1194 ref 96 73 7 18 TC 1 0 183592 CASAVA_Build 12 12095776 1D TTTCAGCCCC T/- GGTCCCCATT 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 T 1 0 183593 CASAVA_Build 12 12100411 4D TATTGCAGTG GTCC/---- GTCCCTACAC 3070 het 3070 ref 41 22 16 6 GTCC 2 1 183594 CASAVA_Build 12 12105710 4D CAAGCCTTAC AAGT/---- TAGTTCAGGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AAGT 1 0 183595 CASAVA_Build 12 12108511 1I TTGATTTTTT -/G TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 G 0 1 183596 CASAVA_Build 12 12108600 6I3M4D CCAAAAGCAC ------ACCCAAA/TGAGATTCC---- AGGTGTGAGC 3070 het 3070 hom 37 16 18 6 N/A 0 0 183597 CASAVA_Build 12 12109737 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2095 hom 22 het 12 0 8 6 A 15 14 183598 CASAVA_Build 12 12112319 1I TAACTTTTTA -/G TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 G 0 1 183599 CASAVA_Build 12 12118762 1I GCCTCAGCCT -/C CCCAAGTAGC 3070 hom 70 het 26 0 24 2 C 3 4 183600 CASAVA_Build 12 12119182 5D TAAAACATAC ACTGT/----- ACTGTGTTTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ACTGT 2 1 183601 CASAVA_Build 12 12120533 15D GCAAACGATT TGCATGTAAGTGAAA/--------------- TGCATGTAAG 3070 hom 72 het 28 0 22 8 TGCATGTAAGTGAAA 1 0 183602 CASAVA_Build 12 12142256 1I CAAAGGGTAG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 8 183603 CASAVA_Build 12 12149160 4I GTTTGGAAAC ----/AAAT AAAACCTGTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAAT 0 1 183604 CASAVA_Build 12 12151185 1I AGACAAGCAA -/C CTTAAAAGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 1 2 183605 CASAVA_Build 12 12156109 1I CTCAAAGGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 27 7 2 A 9 10 183606 CASAVA_Build 12 12156386 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAACCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 183607 CASAVA_Build 12 12198469 1I CTTCTCCCAG -/A TATCCGCATA 3070 hom 175 het 63 0 58 5 A 0 1 183608 CASAVA_Build 12 12203568 2D TGCTTCAAAC TT/-- ATATTCCTGC 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 2 0 183609 CASAVA_Build 12 12206154 4I TCAGTAACAT ----/TTGA TTATTAACCC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TTGA 0 1 183610 CASAVA_Build 12 12220228 1D ACCTGATCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 13 12 183611 CASAVA_Build 12 12226640 1D TCATTTTAAA T/- TGTTCAAGTA 3070 het 3070 hom 43 13 27 4 T 2 1 183612 CASAVA_Build 12 12230028 2I GAGGCGTTTT --/TG TGTGTGTGTG 988 het 988 ref 44 17 9 18 TG 7 8 183613 CASAVA_Build 12 12230043 1I GTGTGTGTGT -/G TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 G 0 1 183614 CASAVA_Build 12 12237702 1I AGACTGACCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 A 9 10 183615 CASAVA_Build 12 12251565 1D TTAAAAACAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 55 het 22 0 18 4 A 6 5 183616 CASAVA_Build 12 12283869 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1585 het 1585 ref 39 25 5 9 T 12 11 183617 CASAVA_Build 12 12304579 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1427 hom 19 6 12 1 A 14 13 183618 CASAVA_Build 12 12321371 9D TTTTGCCTCT AGGAGTTTA/--------- AGAAAATCTT 1897 het 1897 ref 18 13 4 5 AGGAGTTTA 1 0 183619 CASAVA_Build 12 12322766 8I AAATGAACAT --------/CTAAGAAG CTCAACAGAT 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 CTAAGAAG 0 1 183620 CASAVA_Build 12 12334024 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 9 8 183621 CASAVA_Build 12 12346036 2I CTATCTCTAC --/AA AAAAAAAAAA 2327 het 558 hom 22 4 13 5 A 15 17 183622 CASAVA_Build 12 12356300 1I GGGGCGTGGT -/G GCTCACGCCT 1621 hom 18 het 9 0 6 3 G 1 2 183623 CASAVA_Build 12 12358840 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 2033 het 985 hom 7 2 5 0 A 6 5 183624 CASAVA_Build 12 12361746 1I CTGAGTCTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2786 hom 23 7 12 4 T 9 10 183625 CASAVA_Build 12 12362273 7I GAGACTGAAA -------/ACAGAGG ACAGAGGAGC 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 ACAGAGG 1 2 183626 CASAVA_Build 12 12363999 4D TCCACACCAC TGAA/---- TGAATAATGA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 TGAA 2 1 183627 CASAVA_Build 12 12366094 1I29M12D TAAACTCCCC -TTATGTCTGTCTGTCTATCTGTCTGTCTGTCTATCTATCTA/TTTATGTCTGTCTGTCTATCTGTCTGTCTG------------ TCTATCTATC 3070 het 3070 ref 24 12 9 9 N/A 0 0 183628 CASAVA_Build 12 12366766 1I CTAGATGAGG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 7 8 183629 CASAVA_Build 12 12369684 3D AATTGTCTCA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 41 17 21 5 AAC 4 3 183630 CASAVA_Build 12 12370805 1D AGTTTTTTAG T/- TTTTTTTTTG 1093 het 893 hom 17 5 5 7 T 10 9 183631 CASAVA_Build 12 12378275 1I CATACTGAGA -/C CCCCCCCATT 1897 het 1897 ref 16 10 4 2 C 7 8 183632 CASAVA_Build 12 12381317 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 15 0 9 6 A 13 12 183633 CASAVA_Build 12 12386160 4D GCCACTGCGC TCCG/---- TCCGGCCTGG 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 TCCG 2 1 183634 CASAVA_Build 12 12390399 2I GCATGAACCC --/TG CAGGCGGAGC 1041 het 1041 ref 8 4 3 1 TG 0 1 183635 CASAVA_Build 12 12390472 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2574 het 2574 ref 24 9 7 8 A 11 12 183636 CASAVA_Build 12 12408586 6I CAAAGAAAAA ------/TAAAAT TATAAGGAAG 3070 hom 57 het 20 0 19 1 TAAAAT 0 1 183637 CASAVA_Build 12 12408809 1D CGTTTTATGA T/- TAATCACTAG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 2 1 183638 CASAVA_Build 12 12433072 14I AGCATAACTC --------------/CCTTTGGTTAGACA CCTAAGCCAT 3070 het 3070 hom 53 21 28 4 CCTTTGGTTAGACA 0 1 183639 CASAVA_Build 12 12435289 11D GTATTGATAG ACTACTATTGT/----------- GCATCCAGTC 3070 het 3070 ref 41 27 15 3 ACTACTATTGT 1 0 183640 CASAVA_Build 12 12435596 1I CAAAATGACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 9 10 183641 CASAVA_Build 12 12437959 1D GACTTCAGGT A/- GATCTGCCCG 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 1 0 183642 CASAVA_Build 12 12450847 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 10 9 183643 CASAVA_Build 12 12453608 1D GTGTGTGATG T/- TTCCCTTCCT 2887 het 362 hom 9 1 7 1 T 3 2 183644 CASAVA_Build 12 12461388 1I ACCTTTAGGT -/A TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 0 1 183645 CASAVA_Build 12 12466594 1D GCAGGCAGAT C/- ACCTGAGGTC 2063 het 2063 ref 20 6 7 7 C 1 0 183646 CASAVA_Build 12 12467189 1I GGGCTTTTTT -/A TTTTTTATTT 1593 het 1593 ref 15 7 6 2 A 0 1 183647 CASAVA_Build 12 12467743 1D GGTTGACAGG T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 6 5 183648 CASAVA_Build 12 12469592 13D CCAAATTCCC TTTTTAGTTACTT/------------- TTTTTAGGAA 3070 het 3070 ref 49 30 19 6 TTTTTAGTTACTT 1 0 183649 CASAVA_Build 12 12472772 3D TATTAAACTA AAG/--- AAGAAGTAGA 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 AAG 3 2 183650 CASAVA_Build 12 12473798 1I ATTCCTTTGA -/T TTTTGAAGTT 3070 het 2944 hom 33 8 23 2 T 4 5 183651 CASAVA_Build 12 12480841 3I CTCTGGTGAG ---/AGA AGAAGATGGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AGA 2 3 183652 CASAVA_Build 12 12482024 1D GTTTAGTGAT A/- ACATTCATAG 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 2 1 183653 CASAVA_Build 12 12485746 1D GTGTTAGCTC T/- TTGTTATTGC 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 T 3 2 183654 CASAVA_Build 12 12485922 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2986 het 1859 hom 23 9 9 5 T 13 12 183655 CASAVA_Build 12 12506862 8I TTTATTTTAT --------/TTTATTTA TTTATTTATT 3070 het 791 hom 28 3 15 11 TTTA 2 4 183656 CASAVA_Build 12 12507124 9I TCCCAAAGTT ---------/CTGGGATTA CTGGTATGAG 3070 het 1966 hom 21 5 10 6 CTGGGATTA 0 1 183657 CASAVA_Build 12 12510269 1D TTTTATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 912 hom 26 4 16 6 T 15 14 183658 CASAVA_Build 12 12514878 2I TTCATGTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 30 0 19 11 T 12 14 183659 CASAVA_Build 12 12518871 1D CCAGAAGGAA G/- GGGGACCATG 3070 hom 95 het 37 0 30 7 G 5 4 183660 CASAVA_Build 12 12525327 2D AGCAGGTCAC TT/-- TAATGAGATC 3070 het 3070 ref 45 23 14 9 T 3 1 183661 CASAVA_Build 12 12527851 1I GAGAGCTGGA -/G GGAAGAGCCC 3070 het 3070 hom 49 23 20 6 G 2 3 183662 CASAVA_Build 12 12535365 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 716 hom 32 3 18 11 T 15 16 183663 CASAVA_Build 12 12546903 1D CAGGTATGCA C/- CACCACCCTC 2773 het 2519 hom 17 7 8 2 C 2 1 183664 CASAVA_Build 12 12547279 1D GTTACTTAAG C/- CCCTCCTACT 3070 hom 117 het 44 0 40 6 C 4 3 183665 CASAVA_Build 12 12551809 3D GGTTAAATTC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 2679 hom 28 7 13 8 TTG 4 3 183666 CASAVA_Build 12 12560311 1I TCCAAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 10 11 183667 CASAVA_Build 12 12562478 1I CACTTTGGGA -/G GGCCGAGGCA 2237 het 1184 hom 15 4 8 3 G 2 3 183668 CASAVA_Build 12 12569010 2D CATATGGTTC AA/-- AAAAAGTCTA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 7 5 183669 CASAVA_Build 12 12570503 2I CAATTTTGTC --/TG TGTTTTTATA 3070 het 2973 hom 25 9 14 2 TG 1 2 183670 CASAVA_Build 12 12573043 4I AAAATAGAGC ----/AAGG AAGAGCAAAG 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 AAGG 0 1 183671 CASAVA_Build 12 12586030 4I ATCTAAAATA ----/AACT ATTTAAGAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 AACT 0 1 183672 CASAVA_Build 12 12615865 1I GGCAGAGGTT -/G CAGTGAGCCG 3070 hom 21 het 11 0 8 3 G 0 1 183673 CASAVA_Build 12 12618310 1D TAGTGAGACC T/- TTGTCTCTAC 2693 het 2693 ref 30 20 7 3 T 3 2 183674 CASAVA_Build 12 12619332 1D TTAAAATTGC T/- GTTTTTGAAG 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 1 0 183675 CASAVA_Build 12 12640833 2D AGTGGAGCTA CT/-- CTCTCTTCCC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 CT 4 3 183676 CASAVA_Build 12 12648752 1D ACTCTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 6 A 12 11 183677 CASAVA_Build 12 12651563 1D GCAGCAATAA T/- TACTCTTTTG 3070 hom 132 het 51 0 44 7 T 2 1 183678 CASAVA_Build 12 12653804 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 29 1 16 12 A 16 15 183679 CASAVA_Build 12 12663812 7I ACTCTGTCTC -------/AAAGAAA AAAGGAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 AAAGAAA 0 1 183680 CASAVA_Build 12 12664444 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 39 2 27 11 T 11 10 183681 CASAVA_Build 12 12670406 9I AGTTAACTCC ---------/TAAAGAGCA TAAAGAGCAT 3070 hom 75 het 46 1 38 7 TAAAGAGCA 1 2 183682 CASAVA_Build 12 12677868 1D GATGTGACAG A/- AGTTTGGTAA 3070 hom 78 het 33 0 26 8 A 2 1 183683 CASAVA_Build 12 12679571 1D CCCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2023 hom 30 9 10 12 A 18 17 183684 CASAVA_Build 12 12681435 1I GACAATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 31 1 23 7 A 11 12 183685 CASAVA_Build 12 12690786 2D TTGCAGTAAG AT/-- AAATATTTGG 3070 hom 133 het 48 0 43 7 AT 1 0 183686 CASAVA_Build 12 12698415 1D TTAAGCTGCC A/- AAAAAAAAAA 2506 het 2506 ref 43 13 13 17 A 14 13 183687 CASAVA_Build 12 12723761 1I GGGTATGTTA -/G GCCCTAGGAG 3070 hom 87 het 37 0 29 8 G 1 2 183688 CASAVA_Build 12 12723858 1I TTGTCTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 36 1 19 16 A 13 14 183689 CASAVA_Build 12 12728157 1I TCCCCAAGCC -/A CTGCCAATAA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 0 1 183690 CASAVA_Build 12 12732549 1D TAATGTCGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 10 9 T 11 10 183691 CASAVA_Build 12 12741577 1D GTTTGAAAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 9 8 183692 CASAVA_Build 12 12742819 1I ACTTAAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 941 hom 34 2 20 12 T 10 11 183693 CASAVA_Build 12 12743661 1I CTTAAGTATT -/G GGGGGTAATT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 G 5 6 183694 CASAVA_Build 12 12744363 4I TCTCTTTCTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TC 6 8 183695 CASAVA_Build 12 12752853 2D AACACTCAGT TC/-- TCTATTTCAG 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 TC 2 1 183696 CASAVA_Build 12 12769630 1D TTGCAGATGA T/- TTTTTTTTTC 1745 het 659 hom 11 3 4 4 T 10 9 183697 CASAVA_Build 12 12771962 2D CTCTGAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 2242 het 129 hom 24 1 12 12 T 18 16 183698 CASAVA_Build 12 12780568 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAACTA 532 het 532 ref 10 3 3 5 AAAC 1 0 183699 CASAVA_Build 12 12781425 1I AACCCAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 22 0 16 6 T 10 11 183700 CASAVA_Build 12 12784991 1I ATTTGGAATC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 7 8 183701 CASAVA_Build 12 12792851 1D TAATTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 T 11 10 183702 CASAVA_Build 12 12795823 3I AAGTGCTAGG ---/ACT ACTATAGGCG 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 ACT 1 2 183703 CASAVA_Build 12 12807716 1D TATTGTGTGT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 149 hom 29 1 25 3 G 10 9 183704 CASAVA_Build 12 12814982 1I AATACATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 884 hom 18 2 13 3 A 14 15 183705 CASAVA_Build 12 12822091 21D AGGAAAGGTG TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/--------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 33 1 32 4 T 36 15 183706 CASAVA_Build 12 12824451 1D TTTAATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 33 0 25 8 T 13 12 183707 CASAVA_Build 12 12833091 2D AAGCCAAAAT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 4 hom 36 1 28 8 GA 9 8 183708 CASAVA_Build 12 12833224 4I ACAGAAAGGA ----/TCCT ATATGAAGTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TCCT 0 1 183709 CASAVA_Build 12 12839255 4I TAGCAAACAC ----/AGTT AGTTATTTAA 3070 hom 79 het 31 0 25 7 AGTT 1 2 183710 CASAVA_Build 12 12839330 3D TTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2867 het 4 hom 18 1 10 7 T 17 14 183711 CASAVA_Build 12 12850517 1I CATCATTTGA -/T TTTTTTCCAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 7 183712 CASAVA_Build 12 12850956 1I AACAAACATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 8 9 183713 CASAVA_Build 12 12851275 4D GTCATAAGTG AGCT/---- AGCTTCCTCC 3070 hom 117 het 47 0 40 8 AGCT 2 1 183714 CASAVA_Build 12 12852128 1I TTTTTAATAC -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 6 7 183715 CASAVA_Build 12 12853160 2I GAGACTTGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 25 0 18 7 T 13 15 183716 CASAVA_Build 12 12855969 3I ATCTCAGCTC ---/ACT ACTGCAACCT 3070 hom 51 het 19 0 18 3 ACT 1 2 183717 CASAVA_Build 12 12874512 1D ACAAAAAAAA C/- ATTAGCCTGG 1086 het 748 hom 7 2 3 2 C 1 0 183718 CASAVA_Build 12 12876328 2I TGAAACCCTG --/TC TCTACTAAAA 1503 hom 12 het 5 0 5 0 TC 1 2 183719 CASAVA_Build 12 12881214 6D CTGTTTGTTA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 509 hom 62 7 28 29 TG 8 5 183720 CASAVA_Build 12 12897183 4D TCAAAAAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 125 hom 20 1 11 9 AAAT 3 2 183721 CASAVA_Build 12 12899150 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGCGCCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 1 2 183722 CASAVA_Build 12 12901286 3D AAAAATAATA ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 ATT 4 3 183723 CASAVA_Build 12 12906368 1D GTGAGGCACC G/- GTGCCCTGTC 3070 hom 33 het 14 0 11 3 G 2 1 183724 CASAVA_Build 12 12920896 3I CTTAAAACAT ---/CTC CTCTGGGCCG 3070 hom 21 het 11 0 8 3 CTC 1 2 183725 CASAVA_Build 12 12923596 1I GAGATGGGGG -/T TTCACCATGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 2 3 183726 CASAVA_Build 12 12925595 2D CTGCATACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 108 het 44 0 37 8 AC 7 6 183727 CASAVA_Build 12 12936041 1D ACAACTCAGA T/- TTTTTTTTTT 2035 hom 7 het 17 0 7 10 T 17 16 183728 CASAVA_Build 12 12958960 4D GGGATTACAG GCGT/---- GCGTGCGCCA 1463 het 1463 ref 24 12 5 8 GCGT 2 1 183729 CASAVA_Build 12 12962873 1D ATTTTTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2607 hom 26 9 10 8 T 11 10 183730 CASAVA_Build 12 12972740 10I TATATACATA ----------/TATGTATATG TATGTATATG 2615 het 2615 ref 16 9 6 1 TATGTATATG 1 2 183731 CASAVA_Build 12 12988710 9I AAAAAAATGT ---------/TGAGAATTG TCAAAAAGGG 3070 hom 144 het 55 0 48 7 TGAGAATTG 0 1 183732 CASAVA_Build 12 12997111 1I CAGGTAATGA -/G GGTTTCACTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 2 3 183733 CASAVA_Build 12 12998795 1D CCTCCTGGTG A/- TGTTTTAGCT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 1 0 183734 CASAVA_Build 12 13000259 4I TCTTTCCTTT ----/TTTC TTTCTTTCTC 3070 hom 27 het 16 0 9 7 TTTC 2 3 183735 CASAVA_Build 12 13001313 1D GTTATTCTAC T/- TTTTTTTTTT 2830 het 2830 ref 40 25 6 10 T 12 11 183736 CASAVA_Build 12 13019934 2D ACGTGAAAAA CT/-- CTAATGCGGG 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 CT 2 1 183737 CASAVA_Build 12 13027532 1D GATAGTGCTA T/- TTTTTTTCAC 1294 het 1294 ref 51 40 3 8 T 8 7 183738 CASAVA_Build 12 13033970 4I AGATAAAGTT ----/AAAC AAACAGGAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAAC 1 2 183739 CASAVA_Build 12 13036687 2D TTACAGGTAT GA/-- GCCACTGTGC 3070 hom 84 het 31 0 28 7 GA 1 0 183740 CASAVA_Build 12 13040852 1D TTGTATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 34 0 27 8 A 11 10 183741 CASAVA_Build 12 13042341 5I TTCCTCACTC -----/CCCTT CCCTGCTTGC 3070 hom 111 het 41 0 36 5 CCCTT 0 1 183742 CASAVA_Build 12 13049110 1D CAGCGTCCAT A/- ATGCTTTGTA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 2 1 183743 CASAVA_Build 12 13057213 1I TGATCGACCT -/G GCCTGAGCCT 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 G 1 2 183744 CASAVA_Build 12 13066875 1D CTGACATCAG C/- CTTTTGCTCA 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 C 2 1 183745 CASAVA_Build 12 13067225 5I ACTGTTATTA -----/CTTTC TGTACCGGTT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 CTTTC 0 1 183746 CASAVA_Build 12 13068334 4D ACATATTTAA GTCT/---- GTCTGTTGTA 3070 het 3070 ref 51 32 17 4 GTCT 2 1 183747 CASAVA_Build 12 13069572 4I ACCCTATTCC ----/CTCT AACTTGTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 CT 0 2 183748 CASAVA_Build 12 13070269 1D TACCCGGGGA G/- TTTGGTGAAG 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 G 1 0 183749 CASAVA_Build 12 13070969 2D TTGGGTAAAC AT/-- GTATAGTATT 3070 het 3070 ref 40 23 14 4 AT 1 0 183750 CASAVA_Build 12 13081387 5D CCATTCCTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 54 24 23 11 TTTTG 4 3 183751 CASAVA_Build 12 13087384 1I GTTCTAAGAT -/A AACACAGTAT 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 A 2 3 183752 CASAVA_Build 12 13117872 3D CTGCAGCTAA TAT/--- GGGCCAACAG 3070 hom 141 het 52 0 47 7 TAT 1 0 183753 CASAVA_Build 12 13136991 2D AAACTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 56 hom 22 1 14 8 T 16 14 183754 CASAVA_Build 12 13154696 1I TAAATGAGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 8 9 183755 CASAVA_Build 12 13165571 1I TACAGGTTTG -/C ACCCCTATGC 3070 hom 69 het 26 0 22 4 C 0 1 183756 CASAVA_Build 12 13166751 1I GGGAGCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1313 het 1313 ref 40 19 5 16 T 15 16 183757 CASAVA_Build 12 13174412 2D CAAAATTTAC AT/-- AGTCAATCTG 3070 het 3070 ref 48 25 19 5 AT 1 0 183758 CASAVA_Build 12 13174562 1I ATTAAATTAT -/A TTTTTGTGTA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 0 1 183759 CASAVA_Build 12 13236719 3D GCCGGGCGTT GTG/--- GTGCATGCCT 3070 het 1660 hom 22 5 14 4 GTG 2 1 183760 CASAVA_Build 12 13266813 2D TACCTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 37 1 16 20 T 14 12 183761 CASAVA_Build 12 13268772 2I CTTGCTCCTT --/AA AGTCTAAAGA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 1 3 183762 CASAVA_Build 12 13274066 1D ATCAAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 2864 het 37 hom 27 1 12 14 T 15 14 183763 CASAVA_Build 12 13278018 1I TGCTTCATGA -/T GGCAGGGTTG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 0 1 183764 CASAVA_Build 12 13283466 1D TTTTACTCAG T/- TTTTTTACCT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 7 6 183765 CASAVA_Build 12 13285426 1D TCTAAGCCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 9 8 183766 CASAVA_Build 12 13297267 3D TGAGCTTCTT CTC/--- CTCTCCACCC 3070 het 3070 ref 46 26 17 6 CTC 2 1 183767 CASAVA_Build 12 13299427 1I102M2D AAGAGAAAAA -TTTCACTAGAAATGTCTTTTCAGAAAAAAAGCACTTCCCTTAGGTGATTTACTCTTCAGTAGGGATTTTAAGTTAACAGGGTAGCTGGGATACCAGTCTTGATT/CTGCCACTAGAAATGTCTTTTCAGAAAAAAAGCACTTCCCTTAGGTGATTTACTCTTCAATAGGGATTTTAAGTTAACAGGGTAGCTGGGATACCAGTCTTGA-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 43 12 13 N/A 0 0 183768 CASAVA_Build 12 13305737 4I ACAGCTGAAG ----/GAGC GAGCCGGAGA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 GAGC 1 2 183769 CASAVA_Build 12 13323725 1I AAGATACTAT -/G GGGGGGGGGA 1607 het 1607 ref 25 13 4 8 G 9 10 183770 CASAVA_Build 12 13334416 1D CCAGGGCATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 16 17 14 T 10 9 183771 CASAVA_Build 12 13334832 2D TTCTTCTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 1779 het 1779 ref 19 9 6 4 T 15 13 183772 CASAVA_Build 12 13349518 1D GGGGTGAGGC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 45 15 17 13 T 8 7 183773 CASAVA_Build 12 13349889 1I GTTTCAGACA -/T TTTTCTGGGT 3070 het 3070 hom 52 20 30 2 T 4 5 183774 CASAVA_Build 12 13367449 1D TTCATAATCA G/- GAAGTGCTAA 3070 hom 117 het 41 0 40 2 G 2 1 183775 CASAVA_Build 12 13401425 2D GCCCCCCCTT AA/-- AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 27 11 15 3 A 8 6 183776 CASAVA_Build 12 13404491 1I GAAATTTTAG -/A AAAAAGCTGT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 5 6 183777 CASAVA_Build 12 13405840 2D TTCGGAAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 T 14 12 183778 CASAVA_Build 12 13406568 2I CAGGTAGAAC --/AT GTTGAAGGCG 3070 hom 107 het 39 0 34 5 AT 0 1 183779 CASAVA_Build 12 13412846 1I TTAATAGCCT -/G GGGTGAGAGG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 3 4 183780 CASAVA_Build 12 13415278 1I GATTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 14 10 T 12 13 183781 CASAVA_Build 12 13424633 1I GAATCCCATC -/T TTTTAAACAT 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 T 4 5 183782 CASAVA_Build 12 13433713 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 8 9 183783 CASAVA_Build 12 13450106 14I GCATAGGCCC --------------/CTCCCTCTGAGATT CTAATTCAGC 3070 hom 68 het 26 0 23 4 CTCCCTCTGAGATT 0 1 183784 CASAVA_Build 12 13452137 3I GCGAAGAAGG ---/AAC AACAAAGTCA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 AAC 1 2 183785 CASAVA_Build 12 13455824 6D CACTAACATG AAAACA/------ AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 AAAACA 3 2 183786 CASAVA_Build 12 13458954 1I AAGCATAGTA -/G GGGCATAAAA 3070 hom 72 het 30 0 28 2 G 3 4 183787 CASAVA_Build 12 13459338 3D AAGCTAAAAG TCT/--- TCTGCACAAC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 TCT 2 1 183788 CASAVA_Build 12 13465514 1D CCTGGTACAT A/- ACAGGTATAT 3070 het 3070 hom 45 15 20 10 A 2 1 183789 CASAVA_Build 12 13466099 10D GACGTGATTA GGTCACTAAT/---------- GGGATTAGTG 3070 het 3070 ref 56 34 21 9 GGTCACTAAT 1 0 183790 CASAVA_Build 12 13476589 22D CCAGTATCAC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 9 12 T 34 12 183791 CASAVA_Build 12 13485510 2D CCTTTGGTGA GT/-- GGAGTTCTTC 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 GT 1 0 183792 CASAVA_Build 12 13488203 5D TAAATACATT TAATC/----- TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 TAATC 1 0 183793 CASAVA_Build 12 13489223 1I TACTTATTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 T 9 10 183794 CASAVA_Build 12 13491553 2D ATATAGACTC TT/-- TTATTCTTTA 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 T 4 2 183795 CASAVA_Build 12 13493069 1D TTTTATGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 11 11 10 T 12 11 183796 CASAVA_Build 12 13496634 1D TAATTTCTGC T/- TGCAACCTTG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 2 1 183797 CASAVA_Build 12 13506080 1D ACACAAACCC A/- AACAAAACTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 3 2 183798 CASAVA_Build 12 13507937 1D TGGAGTGCTC T/- TTAGCATATG 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 T 3 2 183799 CASAVA_Build 12 13514107 1D TGGTTCCAAG T/- TCGTAGTCAG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 2 1 183800 CASAVA_Build 12 13526217 1D CTCCAAAGAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 43 19 17 8 A 9 8 183801 CASAVA_Build 12 13526790 11D GGCTTGAGGC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1127 het 374 hom 30 5 5 21 T 25 14 183802 CASAVA_Build 12 13528135 1I GTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 36 1 27 8 T 10 11 183803 CASAVA_Build 12 13530654 2I TACAATCCCA --/TT TAGCAGCATC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 3 183804 CASAVA_Build 12 13539048 2D GTTACTATAG CT/-- CTGTAGCATA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 CT 2 1 183805 CASAVA_Build 12 13540438 12D AGTGCCAGGC ACTGTGCCAGGT/------------ AAAGTACATA 3070 het 3070 ref 35 19 13 7 ACTGTGCCAGGT 1 0 183806 CASAVA_Build 12 13547928 1I ATTTTATACA -/C CTAAAGTGCT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 C 1 2 183807 CASAVA_Build 12 13552529 1D ATCTCCCTAT C/- CCCCCCCCCC 2672 hom 34 het 27 0 9 18 C 12 11 183808 CASAVA_Build 12 13559113 2I TATATAATGT --/TC TTTGTCTCTT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 TC 0 1 183809 CASAVA_Build 12 13566043 3D TTTAATTTTC ATA/--- ATAATCCTAT 3070 het 3070 ref 42 24 15 4 ATA 2 1 183810 CASAVA_Build 12 13572682 1D TCTAACCTAT A/- AAATGGGAGT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 4 3 183811 CASAVA_Build 12 13583044 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 7 6 183812 CASAVA_Build 12 13584006 1D ATTGTATGGA C/- CTTATGACTT 3070 het 3070 ref 42 28 12 3 C 2 1 183813 CASAVA_Build 12 13587374 1D AGTTCCTTGA C/- CCCTGCTCCT 3070 het 3070 ref 44 24 11 10 C 4 3 183814 CASAVA_Build 12 13588117 2D CCAGTCCCTC TA/-- TGTTTGTATT 3070 het 3070 ref 46 21 17 9 TA 1 0 183815 CASAVA_Build 12 13593206 3I AAGGACTGAT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 11 14 183816 CASAVA_Build 12 13595249 6D CAGTAAGAGT TCCACC/------ TCCACCTAGA 3070 hom 144 het 54 0 48 9 TCCACC 2 1 183817 CASAVA_Build 12 13614873 1I ATTTTATGTA -/T TTGTGCTTTG 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 2 3 183818 CASAVA_Build 12 13615685 3I CAACAGGTCT ---/TTA TTACATACAC 3070 hom 148 het 55 0 50 5 TTA 1 2 183819 CASAVA_Build 12 13620363 1I AAAACAGAGA -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 6 7 183820 CASAVA_Build 12 13623050 18D ATCTGAACCG AGACCTGAATAATAAGAA/------------------ AGAACCAGAC 3070 het 3070 hom 41 17 23 5 AGACCTGAATAATAAGAA 1 0 183821 CASAVA_Build 12 13625692 3D GCCCAGTGGG AGA/--- AGAAGAAGGT 3070 het 3070 ref 44 22 14 10 AGA 3 2 183822 CASAVA_Build 12 13638873 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 2126 het 1616 hom 18 7 8 3 A 13 14 183823 CASAVA_Build 12 13650424 4D TTATAAAGAA AAAG/---- AAAGATTCAG 3070 het 3070 ref 35 19 16 2 AAAG 2 1 183824 CASAVA_Build 12 13652231 1I TAGGCCCGCA -/G GAGGCCTGCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 183825 CASAVA_Build 12 13663188 2I CCCAAAAAGG --/AA AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 10 183826 CASAVA_Build 12 13665068 1D AAAGTCGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 11 10 183827 CASAVA_Build 12 13665155 1I AACTTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1268 hom 23 3 16 4 A 10 11 183828 CASAVA_Build 12 13665931 1D CCTCAGAAGG A/- AAGTCTACCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 3 2 183829 CASAVA_Build 12 13694551 3I ATGTAAATTC ---/TCT TCTTCTTTCA 3070 hom 140 het 58 0 46 12 TCT 2 3 183830 CASAVA_Build 12 13702744 1D TTACACTTAA G/- AAGAGTCTTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 G 1 0 183831 CASAVA_Build 12 13741916 1I AAATCTGTGC -/A GTGAAAACAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 0 1 183832 CASAVA_Build 12 13752214 3I GTAGAGTTTG ---/TTC TTCAAGGAAC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TTC 1 2 183833 CASAVA_Build 12 13763621 1I AGGATCACTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 9 10 183834 CASAVA_Build 12 13767682 1D AGAATTACTT A/- AAAAAAAAAA 1346 het 1346 ref 35 24 5 6 A 13 12 183835 CASAVA_Build 12 13768078 4D CTGAAAATCA GATC/---- GATCCAGAGG 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 GATC 2 1 183836 CASAVA_Build 12 13774185 1D TATACACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 803 hom 20 4 11 5 T 17 16 183837 CASAVA_Build 12 13777498 1D TGGTTTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 31 0 12 19 T 15 14 183838 CASAVA_Build 12 13780099 1I GAAGACAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 11 12 183839 CASAVA_Build 12 13780350 3D GGGGGGGGGG GGT/--- TGGCGGGAAT 1334 hom 5 het 11 0 8 3 GGT 1 0 183840 CASAVA_Build 12 13782350 2D GCACTTACCC TG/-- TGTGTCTTAT 3070 hom 120 het 46 0 40 7 TG 3 2 183841 CASAVA_Build 12 13823134 1I CCCCTTCAAA -/G TGACCCAGAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 G 0 1 183842 CASAVA_Build 12 13831160 1D TTCAAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 994 het 994 ref 42 32 3 7 A 11 10 183843 CASAVA_Build 12 13833277 1I CTGGTTGTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 8 9 183844 CASAVA_Build 12 13836975 3I CTGCAATTAG ---/AAC AACAGGAAAC 3070 hom 153 het 59 0 50 9 AAC 1 2 183845 CASAVA_Build 12 13839577 1I TGCAGTGGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2066 hom 37 5 23 9 A 11 12 183846 CASAVA_Build 12 13848359 2I TGCAGCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 25 0 17 8 T 12 14 183847 CASAVA_Build 12 13886675 2D TCATCTAATT TC/-- TGTGCCATTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 TC 1 0 183848 CASAVA_Build 12 13887119 12D TTGGTTTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 1 T 22 10 183849 CASAVA_Build 12 13890151 1I CTTTGTTTAC -/T TTTAATCTAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 3 4 183850 CASAVA_Build 12 13898858 5I GAACACTGAC -----/ACTTA ACCCTTTCAG 3070 hom 132 het 50 0 44 6 ACTTA 0 1 183851 CASAVA_Build 12 13932994 1D TATAAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 20 1 15 4 A 13 12 183852 CASAVA_Build 12 13935824 1D CTTTCTAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 10 9 183853 CASAVA_Build 12 13951993 1D CAATTTTTTT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 7 183854 CASAVA_Build 12 13973552 1D CTGTTGCTTT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 90 het 42 0 37 5 A 8 7 183855 CASAVA_Build 12 13981704 1D CCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 8 183856 CASAVA_Build 12 13985269 12D CACATATGTT CACACACACACA/------------ CACACACACA 3070 hom 123 het 44 0 41 4 CA 11 5 183857 CASAVA_Build 12 13986532 1I TGGGTCTGAG -/A AAAAAACCCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 6 7 183858 CASAVA_Build 12 14016720 1I CATTACATAT -/A AAGAGAGAAC 3070 hom 87 het 31 0 27 4 A 2 3 183859 CASAVA_Build 12 14025363 2D CCTCCCCCAC AA/-- AAAAAAAAAA 2972 hom 26 het 12 0 9 3 A 12 10 183860 CASAVA_Build 12 14037783 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2331 het 595 hom 11 4 6 1 A 12 11 183861 CASAVA_Build 12 14039792 1I AAAAAATACA -/T TTTTTTAGAA 2424 het 2424 ref 25 13 7 5 T 6 7 183862 CASAVA_Build 12 14042977 1D TTCTGGATTC T/- TCTGTCCCTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 2 1 183863 CASAVA_Build 12 14045948 1I GGGCATAAGT -/C CAAGGGAAGA 3070 het 3070 ref 62 29 23 10 C 1 2 183864 CASAVA_Build 12 14060123 1D TGTATTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 13 12 183865 CASAVA_Build 12 14066836 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 809 het 809 ref 30 11 6 13 T 10 9 183866 CASAVA_Build 12 14074744 1I GATCAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 18 24 12 T 11 12 183867 CASAVA_Build 12 14076158 9D AACTGCAAGG GGGCCATGA/--------- GCCAAGGAAT 3070 het 3070 ref 41 22 16 7 GGGCCATGA 1 0 183868 CASAVA_Build 12 14079207 2D ATTATTTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2622 hom 30 9 15 6 A 14 12 183869 CASAVA_Build 12 14083308 1I TTGATCCCAC -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 A 5 6 183870 CASAVA_Build 12 14087058 1D TGTATGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 T 15 14 183871 CASAVA_Build 12 14095020 4I AGGAAGGACT ----/CTAA CTGACTATTT 3070 het 3070 hom 52 19 25 8 CTAA 0 1 183872 CASAVA_Build 12 14109442 2D TTAAGTCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 34 5 12 18 T 16 14 183873 CASAVA_Build 12 14124851 1D AAGGAGGATG T/- TCGAACCCAA 3070 het 3070 ref 23 14 8 2 T 2 1 183874 CASAVA_Build 12 14139908 1D TACTGTGAGG T/- TGAGTGAGGC 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 2 1 183875 CASAVA_Build 12 14144145 2I GAGAGGAGTT --/AA AAATGTATTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 3 5 183876 CASAVA_Build 12 14153489 4I TGCAGTGCTT ----/AAGG GAGGGAACTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAGG 0 1 183877 CASAVA_Build 12 14162962 16D CATATCTGCC AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAACC 3070 het 3067 hom 35 15 17 7 A 24 8 183878 CASAVA_Build 12 14163523 1D ACAGGAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1033 hom 35 4 18 14 A 15 14 183879 CASAVA_Build 12 14163582 3D AGAAAACAAA AAT/--- AATAAACAAA 3070 het 3070 hom 36 11 15 11 AAT 2 1 183880 CASAVA_Build 12 14181688 12D AAGTTTTGGG TTATTTCATTTA/------------ TTATTACTAG 2878 het 2878 ref 17 9 6 5 TTATTTCATTTA 1 0 183881 CASAVA_Build 12 14182586 4D AAAAGAGAGC AGAG/---- AGTCAACACT 3070 het 3070 hom 38 13 23 5 AG 3 1 183882 CASAVA_Build 12 14183780 1I TAGGGGGGTC -/A GGGGGACATC 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 A 0 1 183883 CASAVA_Build 12 14184115 4I TTTTCAAACA ----/TCAG TAAGTATAGA 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 TCAG 0 1 183884 CASAVA_Build 12 14185240 2D GCATGGTGAC TT/-- GCGCCTGTAG 2950 het 2572 hom 16 7 7 2 T 2 0 183885 CASAVA_Build 12 14186413 2D AGAAAATCCA CT/-- GTTTTCCGGA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 CT 1 0 183886 CASAVA_Build 12 14207260 4D TACTAAACAT ACAA/---- ACAATTAGCC 2045 het 1668 hom 15 6 8 1 ACAA 2 1 183887 CASAVA_Build 12 14207862 1D GCCAGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1494 hom 12 het 6 0 5 1 T 7 6 183888 CASAVA_Build 12 14218892 40D TGGAAAGAAG TATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------------- TATATATATG 3070 hom 93 het 27 0 31 2 TATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 183889 CASAVA_Build 12 14220615 1I AGACCAGGAG -/T TTTGAGACCA 3070 hom 49 het 19 0 17 2 T 3 4 183890 CASAVA_Build 12 14224506 1I GAGAAACAGG -/A AAACCTAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 3 4 183891 CASAVA_Build 12 14227483 1I AACAAGTCAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 9 10 183892 CASAVA_Build 12 14229295 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 10 9 183893 CASAVA_Build 12 14229379 5D AATATAAGTA ATAAG/----- ATAAGGCTTA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 ATAAG 2 1 183894 CASAVA_Build 12 14234774 1I CACTTTGGGA -/G GACCAAAAGG 3070 hom 68 het 26 0 23 3 G 1 2 183895 CASAVA_Build 12 14235006 11D TCTTGTCTCC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 25 0 19 11 A 22 11 183896 CASAVA_Build 12 14238276 1D AAAGAAAGAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 9 8 183897 CASAVA_Build 12 14247047 1D ATATCTTTCA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 T 7 6 183898 CASAVA_Build 12 14267487 1I GTCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 9 10 183899 CASAVA_Build 12 14270834 6D TAGTGTAAAA TGTAGT/------ TTCATTGCTG 3070 hom 87 het 30 0 30 3 TGTAGT 1 0 183900 CASAVA_Build 12 14271992 1D GATTTTATTT A/- TTAGGGTCTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 1 0 183901 CASAVA_Build 12 14278879 1I TATCTCCTGG -/T TTTTACCTCA 3070 het 67 hom 34 1 27 6 T 4 5 183902 CASAVA_Build 12 14287724 3D AATTTATAAA AAT/--- AATGACAGAG 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 AAT 2 1 183903 CASAVA_Build 12 14287835 1D ACACCTGTAA T/- TCTAGCACTT 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 T 2 1 183904 CASAVA_Build 12 14300974 4I CAGATTAGGG ----/TTGC TTATTATCTG 3070 hom 123 het 47 0 40 7 TTGC 0 1 183905 CASAVA_Build 12 14350851 1D GTAGCCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1529 hom 18 5 8 5 T 14 13 183906 CASAVA_Build 12 14352198 2I TGTGAAGATA --/AG AGAGAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 AG 2 3 183907 CASAVA_Build 12 14372700 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 8 7 183908 CASAVA_Build 12 14386421 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 A 7 8 183909 CASAVA_Build 12 14393418 1I TCTGTCTAAC -/A AAAAAAAAAA 1654 het 1654 ref 15 6 5 4 A 13 14 183910 CASAVA_Build 12 14407917 3D AATTATAATA AAT/--- AAATTATAAT 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 AAT 1 0 183911 CASAVA_Build 12 14408178 10I TGATATTTCT ----------/TTTTTTTTTC TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 6 TTTTTTTTTC 1 2 183912 CASAVA_Build 12 14413158 1D ACTGCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 1757 het 1757 ref 30 21 4 5 T 11 10 183913 CASAVA_Build 12 14439520 1I TCTCACCATT -/G GGAAGTTTTT 3070 hom 109 het 42 0 34 8 G 2 3 183914 CASAVA_Build 12 14442676 1D AGCCTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 20 9 T 12 11 183915 CASAVA_Build 12 14444668 1D AACCAGGAAA T/- TAATAGGATT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 1 183916 CASAVA_Build 12 14445490 1D TCCGCCTCCT G/- GGGTTCAAGT 3070 hom 57 het 20 0 17 3 G 4 3 183917 CASAVA_Build 12 14448221 1I ATTTGAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 18 19 13 T 11 12 183918 CASAVA_Build 12 14448334 1I ATTTGTAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1231 hom 49 5 29 15 T 14 15 183919 CASAVA_Build 12 14451977 4D TTATTTTAAC TTAA/---- TTGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 37 21 15 4 TTAA 1 0 183920 CASAVA_Build 12 14455764 1I ACAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 10 11 183921 CASAVA_Build 12 14459896 1I CTTACTGTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 41 4 18 19 G 0 1 183922 CASAVA_Build 12 14464836 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 10 9 183923 CASAVA_Build 12 14471308 2I TCTGTATAAC --/AT AGAGGTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 AT 0 1 183924 CASAVA_Build 12 14480984 1D TGGCTACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 22 0 17 5 T 13 12 183925 CASAVA_Build 12 14489595 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 10 11 183926 CASAVA_Build 12 14491172 1I CATTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1197 hom 29 4 15 10 T 14 15 183927 CASAVA_Build 12 14492262 1D TCCTCCTGAA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 7 183928 CASAVA_Build 12 14493260 2D ATATTGACTC TT/-- ATATAAATTA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 2 0 183929 CASAVA_Build 12 14503534 1I TCTTATATGT -/A ACTGCCTATT 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 A 1 2 183930 CASAVA_Build 12 14512046 3I CTTCAGTCAA ---/AAT AACCCCATTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AAT 0 1 183931 CASAVA_Build 12 14512695 1D GAAGAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 23 0 13 10 A 15 14 183932 CASAVA_Build 12 14525660 4I TGCATATGTC ----/AGTT AGCTAGATTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AGTT 0 1 183933 CASAVA_Build 12 14526123 2D TTAGTTACAT AC/-- ATATGTTACA 1294 het 1294 ref 44 7 7 31 AC 1 0 183934 CASAVA_Build 12 14531327 1I TATTAGAACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 934 hom 25 2 19 4 T 9 10 183935 CASAVA_Build 12 14550912 1D TTACAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 12 11 183936 CASAVA_Build 12 14567672 1I ATAGAAAGAG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 7 8 183937 CASAVA_Build 12 14570210 4I AAAGCCAACT ----/TGAG TATTAAAATA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TGAG 0 1 183938 CASAVA_Build 12 14572018 1I ATGAAATGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 46 0 35 11 A 10 11 183939 CASAVA_Build 12 14572638 1D AAACAGTGAC A/- AAGATCTGAA 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 3 2 183940 CASAVA_Build 12 14582090 1D AGTCTCCTCC T/- TTACCTGTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 3 2 183941 CASAVA_Build 12 14582547 1I GGTGCCCGCC -/A CCATGTCCAG 3070 hom 30 het 14 0 11 6 A 0 1 183942 CASAVA_Build 12 14587281 1I TCCACTTATA -/T TTACTGGGAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 2 3 183943 CASAVA_Build 12 14595905 2D TTCTGCAAAT CA/-- CAGTTTCCAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 CA 2 1 183944 CASAVA_Build 12 14607730 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 31 3 A 10 9 183945 CASAVA_Build 12 14607985 1I GTGTTGGAGT -/C CAGGCTTCAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 1 2 183946 CASAVA_Build 12 14614340 3I CACTGAATTA ---/GAT GATGATAAAT 3070 hom 78 het 31 0 25 6 GAT 2 3 183947 CASAVA_Build 12 14616012 1D CTGATGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 29 0 22 7 T 15 14 183948 CASAVA_Build 12 14623781 7I TTTTTTTTGG -------/CTAAAGT CTCAGTCACC 2420 hom 19 het 11 0 9 2 CTAAAGT 0 1 183949 CASAVA_Build 12 14629581 2I TAATACATAA --/CT CATAACTGTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CT 0 1 183950 CASAVA_Build 12 14637631 2D CCAGCATCTG TT/-- TTTTTTTTTG 2695 hom 38 het 42 0 12 31 T 11 9 183951 CASAVA_Build 12 14639660 4D CCTGCCTGGT TAGC/---- TGTATTCCTA 3070 het 2915 hom 27 11 13 4 TAGC 1 0 183952 CASAVA_Build 12 14642208 1I ATGAAATCCT -/G GGTTGGATTT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 G 2 3 183953 CASAVA_Build 12 14649723 3D TATAAAATTC TTT/--- TTTTTTCTCT 3070 hom 93 het 32 0 30 2 T 9 6 183954 CASAVA_Build 12 14669529 2D AGTACATGCA TT/-- TTTTTTTTTT 2307 het 100 hom 23 2 10 11 T 18 16 183955 CASAVA_Build 12 14672946 1I CACCTGGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2926 hom 24 8 11 5 A 9 10 183956 CASAVA_Build 12 14677867 1I ACAAAGAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 9 183957 CASAVA_Build 12 14682547 1D TACCATATGA T/- CCACCAATCC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 1 0 183958 CASAVA_Build 12 14688404 3D GGGGAAGCCT GGC/--- CCCCGTGATG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 GGC 1 0 183959 CASAVA_Build 12 14713412 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2227 het 2227 ref 28 14 7 7 T 13 14 183960 CASAVA_Build 12 14716284 1I TTGGAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 9 10 183961 CASAVA_Build 12 14718731 3D TAGCTGTGGA ATC/--- ATCTATTGCT 3070 het 3070 hom 44 20 22 5 ATC 2 1 183962 CASAVA_Build 12 14724098 1D TCCTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 31 0 26 6 T 11 10 183963 CASAVA_Build 12 14724320 1D AATATATTGT C/- ATAGATAAGT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 C 1 0 183964 CASAVA_Build 12 14725689 1D CTGGAATAGG A/- AAAAGAGAAA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 5 4 183965 CASAVA_Build 12 14728734 4I TCTCCCTTCC ----/TCTT TCTTTTTCTC 3070 hom 53 het 23 0 16 7 TCTT 1 2 183966 CASAVA_Build 12 14746303 1D ATTTTATAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 51 17 26 8 T 10 9 183967 CASAVA_Build 12 14748088 1I TTTTAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 T 10 11 183968 CASAVA_Build 12 14753795 3I CTAAGGGTGA ---/AGG AGAAGGGGTT 3070 het 253 hom 12 1 11 0 AGG 0 1 183969 CASAVA_Build 12 14756087 1D AAAGGCCTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 98 het 40 0 31 10 A 10 9 183970 CASAVA_Build 12 14757775 1I ATTTGTGGGG -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 A 6 7 183971 CASAVA_Build 12 14760316 1D TAGCTTTCTT G/- GGGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 G 5 4 183972 CASAVA_Build 12 14761617 3D TGACTATGAC CTT/--- CTGCTGATTA 3070 het 3070 ref 44 21 20 5 CTT 1 0 183973 CASAVA_Build 12 14763015 3I TTTGGCTTGC ---/TAT TATTATTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 TAT 2 3 183974 CASAVA_Build 12 14771633 1D GATTTAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 A 10 9 183975 CASAVA_Build 12 14776016 1D TGGCTTCCCC T/- GATGCTGTGG 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 T 1 0 183976 CASAVA_Build 12 14778351 1I AACAATGTTA -/T AAAAAACTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 1 183977 CASAVA_Build 12 14783107 2I TCACTAGAGA --/GC GCCATCACTT 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 GC 1 2 183978 CASAVA_Build 12 14785007 1I ACCTCAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1585 hom 24 5 10 9 T 15 16 183979 CASAVA_Build 12 14786950 4I AGATCTGTGG ----/GTGA GTATCTTAGA 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 GTGA 0 1 183980 CASAVA_Build 12 14787552 4D TCTTACAGAC TAAG/---- TAAGAGTTTT 3070 hom 75 het 26 0 25 2 TAAG 2 1 183981 CASAVA_Build 12 14788547 1I TTCTGAGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 T 9 10 183982 CASAVA_Build 12 14788807 1D ACAAGAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 A 12 11 183983 CASAVA_Build 12 14794813 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1373 het 1373 ref 17 6 7 4 A 13 12 183984 CASAVA_Build 12 14795092 2D GGTTCTCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 1579 het 234 hom 21 1 5 15 T 16 14 183985 CASAVA_Build 12 14797404 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAACAAA 56 het 56 ref 15 4 2 9 A 7 6 183986 CASAVA_Build 12 14799035 3I CTTGAGATGC ---/TGA TAAGTTAAAA 3070 het 2639 hom 27 6 18 3 TGA 0 1 183987 CASAVA_Build 12 14801263 2D TTTGAAGTTG AT/-- ACAGGGGATA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AT 1 0 183988 CASAVA_Build 12 14805976 1D GGCAGTGAAT A/- AGTCTCATGA 3070 het 3070 hom 33 11 17 6 A 2 1 183989 CASAVA_Build 12 14810774 1I TAAAAATAAT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 6 7 183990 CASAVA_Build 12 14817061 1D GGAATAAAAG A/- AAAAAAATCG 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 A 8 7 183991 CASAVA_Build 12 14827023 1I CAAATACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 769 hom 25 2 14 9 T 13 14 183992 CASAVA_Build 12 14829141 5I GTATTGTCAC -----/ATCTT ACCACTAATT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 ATCTT 0 1 183993 CASAVA_Build 12 14830154 3I ACATTAAACT ---/TAG TACTAAGAGT 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 TAG 0 1 183994 CASAVA_Build 12 14838943 1D GAGGTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 11 10 183995 CASAVA_Build 12 14847525 1D AGGTGAGGAA G/- AGTAGTAAAT 2442 het 2442 ref 34 17 7 10 G 1 0 183996 CASAVA_Build 12 14849319 1I AGCTGCCTCC -/T TTTTTGCTAG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 5 6 183997 CASAVA_Build 12 14872824 1I TAACTAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 38 0 28 10 A 8 9 183998 CASAVA_Build 12 14875628 1I TGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2855 hom 28 9 13 6 T 10 11 183999 CASAVA_Build 12 14895299 1D CATGTGCCCT G/- GGGGGAGGGT 3070 het 3070 hom 43 12 18 13 G 6 5 184000 CASAVA_Build 12 14899120 1D AGTAGGGGCA G/- AAGAGCTGGG 3070 het 3070 hom 42 9 25 8 G 1 0 184001 CASAVA_Build 12 14900494 1I CTTCTTCCAT -/C CCCTGCCCTT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 C 3 4 184002 CASAVA_Build 12 14903028 1I TTGTTCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 25 13 11 T 13 14 184003 CASAVA_Build 12 14916717 2D CTTTAGTAGC AA/-- AGAGTGTGTT 3070 het 3070 ref 50 26 18 7 A 3 1 184004 CASAVA_Build 12 14924127 2I GTGCACACAC --/AG TGGACTGATC 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 AG 0 1 184005 CASAVA_Build 12 14928455 1I TTCTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 10 11 184006 CASAVA_Build 12 14944362 1I AGGGGGTTAG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 7 8 184007 CASAVA_Build 12 14955351 4I GGCTGTTTTA ----/CTGT CTATGTATTT 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 CTGT 0 1 184008 CASAVA_Build 12 14956916 3D GACTGCCTAT GAA/--- GAAGACCGGC 2067 het 2067 ref 25 19 5 3 GAA 2 1 184009 CASAVA_Build 12 14958236 1D GATGCCAGCC T/- TTCTCCTATA 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 T 3 2 184010 CASAVA_Build 12 14959194 1D AGTTTGAGTC T/- CACGATATAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 1 0 184011 CASAVA_Build 12 14966684 2I TCTATCTTTT --/TC TCTCTGATTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TC 2 3 184012 CASAVA_Build 12 14971701 3D ATGTGAAAGG TGT/--- TGTACTAGAT 3070 het 3070 hom 45 17 17 11 TGT 2 1 184013 CASAVA_Build 12 14974828 3I TATATGCAAC ---/TTA TTATGGTTTC 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 TTA 1 2 184014 CASAVA_Build 12 14982489 1I GCAAAATGCA -/T CTTATCCAGG 3070 hom 156 het 56 0 52 4 T 0 1 184015 CASAVA_Build 12 14987606 2D GTTGTTGTTG TT/-- TTTTTTATGG 1952 het 1025 hom 25 12 8 6 T 8 6 184016 CASAVA_Build 12 14997836 1D TATCTCAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 10 9 184017 CASAVA_Build 12 15002058 9I AAGAGGGAGA ---------/GAGAAAGAG GAGAAAGAGG 2167 het 2167 ref 33 20 7 6 GAGAAAGAG 1 2 184018 CASAVA_Build 12 15014915 1D TCATGTCATG T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 97 het 38 0 32 6 T 8 7 184019 CASAVA_Build 12 15019570 1D TGTCTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 13 12 184020 CASAVA_Build 12 15029808 2I TAGCCTGTGT --/CA CACTCCCTGG 3070 hom 116 het 48 0 35 13 CA 1 2 184021 CASAVA_Build 12 15031070 2I AAGATAAGTC --/TT GTTTCCACCC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 T 0 2 184022 CASAVA_Build 12 15031181 2I ATGTATACAC --/TT TTTTTTTGCA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 7 9 184023 CASAVA_Build 12 15041106 3D TTTATAAAAG AAA/--- AAAACACTTG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 7 4 184024 CASAVA_Build 12 15041921 3I GTATGCATTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 15 7 T 12 15 184025 CASAVA_Build 12 15051204 1I AATGAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 11 184026 CASAVA_Build 12 15055974 1I TAACAATAAA -/T TTTTTCCTTG 3070 hom 129 het 54 0 44 10 T 5 6 184027 CASAVA_Build 12 15061459 2I TTTCAGTGTC --/TT TTGGATTTTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 4 184028 CASAVA_Build 12 15064833 7D TAGACTGGTA CTTTACC/------- CATTACTTGT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 CTTTACC 1 0 184029 CASAVA_Build 12 15072204 30D TTAGGATAGT TAGGTTTTCTTTTTGAATTGAGCCCTATAA/------------------------------ TAGGTTTTCT 3070 hom 45 het 20 0 16 7 TAGGTTTTCTTTTTGAATTGAGCCCTATAA 1 0 184030 CASAVA_Build 12 15086763 2D TGCCAAAAAT AA/-- AAGTTATAAT 3070 hom 129 het 44 0 44 0 A 4 2 184031 CASAVA_Build 12 15090086 2D TCAATGAGGC AA/-- AAAAGTTTAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 6 4 184032 CASAVA_Build 12 15090786 1D CAAGACATCA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 8 7 184033 CASAVA_Build 12 15091340 1D ACACACCCCC A/- CCAACTCCCA 3070 hom 68 het 32 0 23 10 A 1 0 184034 CASAVA_Build 12 15105842 1I TATTTTTAGA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 184035 CASAVA_Build 12 15121285 1I AAGTATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 11 12 184036 CASAVA_Build 12 15123137 2D AAAAAAAAAA AC/-- ACAAAATTAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AC 2 1 184037 CASAVA_Build 12 15123219 1D69M1D GCTTGAACCC GGGGGGGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGAGATGGCACCGTTGCACTCTAGCCTGGCAAGGAGAGCAAAACTC/-GGGGGAGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGAGATGGCACCATTGCACTCTAGCCTGGCAAGGAGAGCAAAACT- CGTCTCAAAA 3070 het 232 hom 14 3 14 10 N/A 0 0 184038 CASAVA_Build 12 15129636 1I GCTTATCTTT -/C GAGTTCAATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 0 1 184039 CASAVA_Build 12 15135721 1I GTGGTTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 11 12 184040 CASAVA_Build 12 15142948 1I ACTTTTTTTT -/C TCCAAATTCG 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 C 0 1 184041 CASAVA_Build 12 15150462 4I TCTTTCTTTC ----/TTCT TTCTTTTTTT 3070 hom 34 het 27 0 21 6 TTCT 1 2 184042 CASAVA_Build 12 15162247 1I AAGGAACTGA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 8 9 184043 CASAVA_Build 12 15164697 1I CAAAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 33 1 25 7 A 10 11 184044 CASAVA_Build 12 15168490 3D CATCATTATC AAG/--- AAGAAGCAGG 3070 het 3070 hom 39 15 14 12 AAG 3 2 184045 CASAVA_Build 12 15169128 1I GCCTTTTGAA -/T TTTTGTCTAT 3070 het 3070 ref 45 22 13 10 T 4 5 184046 CASAVA_Build 12 15172641 1D CCAGGAACCA T/- TTTTAGGCAG 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 T 5 4 184047 CASAVA_Build 12 15179600 1I TGTATTTTCC -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 T 6 7 184048 CASAVA_Build 12 15179902 5I GATTTGATAA -----/ATTTC ATTAGTTAAT 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 ATTTC 0 1 184049 CASAVA_Build 12 15184765 1I CCATGAATAA -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 T 6 7 184050 CASAVA_Build 12 15200072 1D ATAATAATAC T/- TTTTAAATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 5 4 184051 CASAVA_Build 12 15200197 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAATATA 3070 hom 21 het 14 0 8 6 A 7 6 184052 CASAVA_Build 12 15204058 4I AATGGAAACA ----/AAAC AAACAACAAC 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 AAAC 1 2 184053 CASAVA_Build 12 15218767 2D TCATTCTGCT TC/-- TTTCTTTCCT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 TC 1 0 184054 CASAVA_Build 12 15218911 1I AAGTTCACCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 8 9 184055 CASAVA_Build 12 15228635 1D TTACAGAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 9 8 184056 CASAVA_Build 12 15238711 1I CGATCTCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 782 hom 37 3 25 9 A 11 12 184057 CASAVA_Build 12 15307506 1D TAAGACAGTG T/- TTTTTTTTTT 1102 het 1102 ref 40 31 3 6 T 11 10 184058 CASAVA_Build 12 15337151 1I TTTATTGTGA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 184059 CASAVA_Build 12 15351217 3D TACTTTCCCC TCT/--- TCTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 48 13 20 19 TCT 2 1 184060 CASAVA_Build 12 15491958 1D TCTTATAGTC T/- TTGAACAAAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 3 2 184061 CASAVA_Build 12 15493325 1I ATTTACAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 22 0 15 7 A 13 14 184062 CASAVA_Build 12 15508610 6D GGCTGGTGTG CAGTGA/------ CACAATCTCG 3070 het 3070 ref 19 8 10 1 CAGTGA 1 0 184063 CASAVA_Build 12 15536141 8D TTCCTGTTTG ACAAACAA/-------- ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 51 22 17 17 ACAA 7 5 184064 CASAVA_Build 12 15542880 2I CAATGAAAAC --/AG ATAATCTGCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AG 0 1 184065 CASAVA_Build 12 15543904 2D AAGAAAGAAA AT/-- ATATATGTTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 AT 4 3 184066 CASAVA_Build 12 15545484 1D CAGAGATACA T/- TTTTTTGTAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 7 6 184067 CASAVA_Build 12 15553846 10I TGCAGTGAGC ----------/CGAGATCGCA CCACTGTACT 1681 hom 12 het 7 0 5 2 CGAGATCGCA 0 1 184068 CASAVA_Build 12 15572077 15I GGAACTGTGA ---------------/CCCGCCCACCACCCC CCCGCCCACG 3070 hom 45 het 22 0 16 6 CCCGCCCACCACCCC 0 1 184069 CASAVA_Build 12 15582441 1I TTAGTGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 31 3 19 9 T 11 12 184070 CASAVA_Build 12 15599283 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 7 6 184071 CASAVA_Build 12 15606943 1I GTGTTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1457 hom 31 7 19 5 T 15 16 184072 CASAVA_Build 12 15616949 6D4M5D ATCACCTTAG TTTCTTTATGTATAA/------TATG----- AATGGGTGAG 3070 hom 108 het 40 0 37 4 N/A 0 0 184073 CASAVA_Build 12 15622992 1I ATAAACCAGT -/G TGAACAATAA 3070 hom 157 het 57 0 52 5 G 0 1 184074 CASAVA_Build 12 15633581 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1808 het 559 hom 17 7 4 6 A 13 12 184075 CASAVA_Build 12 15642868 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 31 1 22 8 T 11 10 184076 CASAVA_Build 12 15665395 1I TTTGCATGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 10 184077 CASAVA_Build 12 15685575 2I TTAAAAAAAG --/AA AATGTTGTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 4 184078 CASAVA_Build 12 15689623 5D CATCTTCCCT CTTAA/----- CTTCTTAATT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 CTTAA 1 0 184079 CASAVA_Build 12 15700435 1D CATCAAAAAT G/- TTAAAAACTA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 G 1 0 184080 CASAVA_Build 12 15706922 1D ACAGCATGAT G/- TTAATCATGA 3070 hom 108 het 41 0 37 6 G 1 0 184081 CASAVA_Build 12 15707201 1D ACTTGCCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 842 hom 34 6 13 15 A 17 16 184082 CASAVA_Build 12 15719054 1I TTGTTCTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 353 hom 34 1 28 5 A 9 10 184083 CASAVA_Build 12 15733556 1D TCCTTTTTCC A/- TAACAGCACC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 1 0 184084 CASAVA_Build 12 15735183 1D GGCTGAATAT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 8 7 184085 CASAVA_Build 12 15738770 1D TTTATCCATT C/- TTTATTAATT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 C 1 0 184086 CASAVA_Build 12 15750670 1I TCCCTGACTC -/A CCAATCTATC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 0 1 184087 CASAVA_Build 12 15754298 1I GGTTGGGGGA -/C CCCCTGGCTT 3070 hom 83 het 34 0 28 6 C 4 5 184088 CASAVA_Build 12 15763030 1D CTACTTCAGC T/- TATTAAAATC 3070 hom 102 het 40 0 34 7 T 2 1 184089 CASAVA_Build 12 15789760 1I CTATGTATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1750 hom 28 6 14 8 A 15 16 184090 CASAVA_Build 12 15823171 4D TAACAGACTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 36 het 21 0 13 10 TTTC 5 4 184091 CASAVA_Build 12 15838102 3D TATAATTTGA AAT/--- AATAATGTAG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 AAT 3 2 184092 CASAVA_Build 12 15842303 1D GATTTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 45 1 37 7 A 11 10 184093 CASAVA_Build 12 15859573 1D AAATAAGCAA T/- TATGTTTGCA 3070 hom 132 het 54 0 45 11 T 2 1 184094 CASAVA_Build 12 15917481 1D ATTAATTGGA T/- TTTTTTTTTT 1489 het 1489 ref 26 12 5 9 T 17 16 184095 CASAVA_Build 12 15947194 1I CAATCATATG -/T TGCAGTTAGT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 1 2 184096 CASAVA_Build 12 15964312 4D TGCTGAAGGT ATAG/---- ATAGAGACTC 3070 hom 85 het 33 0 29 5 ATAG 2 1 184097 CASAVA_Build 12 15966128 3D TCCATCTCAG ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ATA 6 5 184098 CASAVA_Build 12 15967903 1I ATAGTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2017 hom 33 7 20 6 T 13 14 184099 CASAVA_Build 12 16026074 1I GTGCTTTATA -/T TCCAACCAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 2 184100 CASAVA_Build 12 16029783 10D TTTTCATTAC TTTTCAGTGA/---------- AAGTTATTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 TTTTCAGTGA 1 0 184101 CASAVA_Build 12 16074291 2D GCCCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1526 hom 12 het 6 0 5 2 T 16 14 184102 CASAVA_Build 12 16076731 2D GTTTTTCCTC TT/-- TTTGTTTTAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 5 3 184103 CASAVA_Build 12 16079166 8I ACTACCTTAC --------/AGAGTCAT AGCTTGGGCT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 AGAGTCAT 0 1 184104 CASAVA_Build 12 16090439 1D TTTGATAGAT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 7 184105 CASAVA_Build 12 16093723 5I CATCTTCCTT -----/TTTTG TTACTACATG 3070 hom 93 het 32 0 30 3 TTTTG 0 1 184106 CASAVA_Build 12 16105559 4I GTACAAACTC ----/CATT CAAAGTTGTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CATT 0 1 184107 CASAVA_Build 12 16108334 5I TTTTTTTCTT -----/TAATC TAATAATGGG 3070 hom 65 het 24 0 22 2 TAATC 0 1 184108 CASAVA_Build 12 16113958 3I GAAGCTGTGT ---/TTG TTGTTATGGT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 TTG 1 2 184109 CASAVA_Build 12 16134020 5D ACATATTGGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2122 het 762 hom 34 8 7 20 T 21 16 184110 CASAVA_Build 12 16137125 8D TATATATATA TTCATATT/-------- TATATTCATA 335 het 335 ref 14 6 3 5 TTCATATT 1 0 184111 CASAVA_Build 12 16149275 2D CCTTTTTTTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 GT 7 6 184112 CASAVA_Build 12 16165275 4D AGAAGGTAGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 T 16 12 184113 CASAVA_Build 12 16171707 1I AAATATTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 589 hom 49 3 41 5 T 10 11 184114 CASAVA_Build 12 16204652 4I AACATAGAAG ----/TACC TACCACCCAA 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 TACC 1 2 184115 CASAVA_Build 12 16209514 2I TATGATCAGA --/TT TTTTTTTGAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 7 9 184116 CASAVA_Build 12 16215506 4D AGTGTTGGGA TTAC/---- TTACAGGCAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTAC 2 1 184117 CASAVA_Build 12 16229875 3I GGGGTTACTG ---/TGA TGATTAAATG 3070 het 3070 ref 31 15 8 8 TGA 1 2 184118 CASAVA_Build 12 16230017 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2738 het 2100 hom 21 9 9 3 T 13 11 184119 CASAVA_Build 12 16233213 4D CCTAATTTCC TTCT/---- TTCTTTTAAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TTCT 2 1 184120 CASAVA_Build 12 16233616 1I AAAACTGTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 8 9 184121 CASAVA_Build 12 16238126 1D GATTTTGTAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 1088 hom 39 6 29 4 T 8 7 184122 CASAVA_Build 12 16238146 1D ATTGACCTTG A/- AATGGTCACT 3070 het 695 hom 40 3 35 2 A 3 2 184123 CASAVA_Build 12 16241651 2I CATGGGCTTT --/GG AGTCAGGTAG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 0 2 184124 CASAVA_Build 12 16248637 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1563 hom 20 5 10 6 A 13 14 184125 CASAVA_Build 12 16248709 1D TGGAGAATAT G/- GTTTTCATAA 3070 het 3070 ref 27 13 7 7 G 2 1 184126 CASAVA_Build 12 16251651 5D CCCAAATTAC TTTAA/----- TTTAAGAGTA 3070 het 1860 hom 25 6 17 3 TTTAA 2 1 184127 CASAVA_Build 12 16252311 1I GGGGGGTGCC -/A ACAGGAAGGC 3070 het 3070 hom 29 15 13 1 A 1 2 184128 CASAVA_Build 12 16254553 3D ACTTTCTAAT TTC/--- TTCTTCTCCC 3070 het 3070 ref 48 28 17 5 TTC 3 2 184129 CASAVA_Build 12 16255701 1D CAATTATCCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 107 het 40 0 36 4 T 9 8 184130 CASAVA_Build 12 16256729 2I CCAGAAAAAC --/AT GTGAAAAGTC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 AT 0 1 184131 CASAVA_Build 12 16260274 3D GAGAATAGAA ACT/--- AACACTTTCT 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 ACT 1 0 184132 CASAVA_Build 12 16263958 1I ATCAATTTGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 53 25 18 10 T 8 9 184133 CASAVA_Build 12 16266559 1D CCAGAAAGGT A/- ATACTTGATT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 2 1 184134 CASAVA_Build 12 16266668 3D CTGTGATATA AAG/--- AAGAATACAA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 AAG 2 1 184135 CASAVA_Build 12 16267358 1I AAATATTTAT -/C TTTAAGGAGT 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 C 0 1 184136 CASAVA_Build 12 16267923 1D ATAAATGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 T 13 12 184137 CASAVA_Build 12 16268041 1D CTCAGCCTCC T/- TGAGTAGCTG 1968 het 1016 hom 10 3 5 2 T 2 1 184138 CASAVA_Build 12 16273037 4D TAAAATGTAT ATTG/---- ATTGTTTATG 3070 het 3070 hom 43 17 25 3 ATTG 2 1 184139 CASAVA_Build 12 16275124 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2535 het 1777 hom 18 5 10 3 A 12 13 184140 CASAVA_Build 12 16283194 1I TAAGCAAACT -/A AAAACAAGGA 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 A 4 5 184141 CASAVA_Build 12 16283443 4I CCTAAATTGC ----/ACTT ACTATTTGAT 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 ACTT 0 1 184142 CASAVA_Build 12 16286031 5D CAGAAATATG TTAAC/----- TTAATAATGT 3070 het 3070 hom 24 11 12 2 TTAAC 1 0 184143 CASAVA_Build 12 16295999 1I CTAAAAAGAG -/A AAACATTCCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 3 4 184144 CASAVA_Build 12 16297243 1D AAGGGGGAAA G/- GACAGTCTCT 3070 het 3070 ref 52 25 23 4 G 2 1 184145 CASAVA_Build 12 16299991 1I TATACTAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 12 7 6 A 9 10 184146 CASAVA_Build 12 16303401 1D TACCTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 2390 het 2390 ref 27 14 8 5 T 11 10 184147 CASAVA_Build 12 16304960 1D TATTTTCCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 11 10 184148 CASAVA_Build 12 16307131 5D TGTAACTGTA AGTCC/----- AGTTAAACCT 3070 het 2850 hom 18 7 8 3 AGTCC 1 0 184149 CASAVA_Build 12 16310496 1D TAGGAAACTC T/- TTTTAAAAAG 3070 het 3070 hom 53 19 28 7 T 5 4 184150 CASAVA_Build 12 16312109 1I CTGGGTAATT -/A AAAAAAAAAT 2208 hom 15 het 8 0 6 2 A 9 10 184151 CASAVA_Build 12 16313113 15D AATGGTATTA GGGAGTGGTGTATTT/--------------- GGGAGGTGGG 3070 het 3070 hom 30 9 16 7 GGGAGTGGTGTATTT 1 0 184152 CASAVA_Build 12 16315801 4I AAAGAAAGAA ----/AGAG AGAGAAAAGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AG 2 4 184153 CASAVA_Build 12 16323784 3I7M1I GTACCCAAAA ---GGGACTG-/GGGGGGACTGC CCCATGAGGC 3070 het 3070 ref 49 30 14 7 N/A 0 0 184154 CASAVA_Build 12 16324345 1D AAACTAGTTC A/- ACCATTGTGG 3070 het 985 hom 10 2 7 1 A 2 1 184155 CASAVA_Build 12 16326162 1D CAGTTGAGAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 2966 hom 20 7 11 2 A 8 7 184156 CASAVA_Build 12 16328298 3D ATCATCCCTA TTG/--- TTCATTCTGT 3070 het 3070 ref 51 30 15 6 TTG 1 0 184157 CASAVA_Build 12 16331370 1D CTTTATATAA C/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 C 1 0 184158 CASAVA_Build 12 16338633 1I AGATACCTCC -/T TTTTTGGGGC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 5 6 184159 CASAVA_Build 12 16344135 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 10 9 184160 CASAVA_Build 12 16347692 1D ACTGTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 1564 het 1564 ref 36 26 5 5 A 11 10 184161 CASAVA_Build 12 16348097 1I GGTTAAAACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 59 32 22 5 A 9 10 184162 CASAVA_Build 12 16349076 3D GAGCACCTAC TAT/--- GTGTCATCTA 3070 het 3070 hom 38 18 20 0 TAT 1 0 184163 CASAVA_Build 12 16355922 1D TTGACTCCCA C/- CCACAATATG 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 C 3 2 184164 CASAVA_Build 12 16370073 1I CTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 9 10 184165 CASAVA_Build 12 16371802 1D AAATAAATAG A/- AAAAAAAAAA 2564 het 436 hom 11 1 8 2 A 12 11 184166 CASAVA_Build 12 16390262 2I AACACTTTGG --/GA GAGGCTGAGG 2335 het 1248 hom 12 3 6 3 GA 1 2 184167 CASAVA_Build 12 16395531 2I ATACTAGAAC --/AA AAGCAGACAC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 2 4 184168 CASAVA_Build 12 16404467 1I TTTTTAAGTT -/A AGACTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 A 1 2 184169 CASAVA_Build 12 16405182 1I TTATAGTGTT -/C CCCCCCCTCC 2466 het 2466 ref 24 13 8 3 C 7 8 184170 CASAVA_Build 12 16406582 19I TGTCTCTATG -------------------/TGAGATGTTGTGGCTCACA TAGTCATCCT 3070 het 3070 ref 50 26 20 5 TGAGATGTTGTGGCTCACA 0 1 184171 CASAVA_Build 12 16416241 1D AAACCAAAAT G/- GATTAAAAGC 3070 het 3070 ref 57 26 18 13 G 2 1 184172 CASAVA_Build 12 16437312 1D CCTGTTTTTA G/- TTTTGTAAAT 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 G 1 0 184173 CASAVA_Build 12 16449913 1D AGCTAATCCA C/- CACAATGAAA 3070 het 3070 hom 40 19 18 6 C 2 1 184174 CASAVA_Build 12 16456510 4D CCAAACATGG TAGA/---- TAGTCTAACT 3070 het 3070 ref 40 23 14 4 TAGA 1 0 184175 CASAVA_Build 12 16459586 1I TACAGTTGAC -/T TTTGAACAAC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 3 4 184176 CASAVA_Build 12 16467756 1I ACCTATGTAC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 9 184177 CASAVA_Build 12 16473700 1I CTAGTCATCC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 9 184178 CASAVA_Build 12 16474815 1I TTGAAAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 32 1 29 2 T 10 11 184179 CASAVA_Build 12 16482073 1I TAAAAAGTAG -/A AAAAAAACCC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 7 8 184180 CASAVA_Build 12 16486454 2D ATTTTCTCAC AG/-- AGTGTGGCTT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 AG 2 1 184181 CASAVA_Build 12 16505382 1I TGCCCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 40 3 16 21 A 13 14 184182 CASAVA_Build 12 16506750 1I ATGCACTTTA -/T CCCCCCCAAA 3070 hom 56 het 30 0 21 9 T 0 1 184183 CASAVA_Build 12 16507812 1D GAAAAGGAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 45 het 21 0 16 6 A 9 8 184184 CASAVA_Build 12 16512599 3I ATCGGGTCTC ---/ATT GTTGTTGGAT 3070 hom 102 het 40 0 33 7 ATT 0 1 184185 CASAVA_Build 12 16531088 6D CTTGATTATA CTCCTG/------ TAATTGCAGG 3070 hom 120 het 42 0 39 4 CTCCTG 1 0 184186 CASAVA_Build 12 16535817 1D TTTTAAACTG A/- ATAAATGTAA 3070 hom 138 het 49 0 47 4 A 2 1 184187 CASAVA_Build 12 16548410 1D ACTGGCCCAG C/- CTAAATGTTG 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 C 2 1 184188 CASAVA_Build 12 16563848 1I ATAGACTACA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 7 8 184189 CASAVA_Build 12 16566153 1D AGAAAGGTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 10 9 184190 CASAVA_Build 12 16569238 1D ATGGAACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 11 10 184191 CASAVA_Build 12 16591055 1I TGCCAAAAGC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 A 7 8 184192 CASAVA_Build 12 16595795 1D GATGACTTGC T/- TTTTTTTTTT 1119 het 1119 ref 40 27 4 10 T 13 12 184193 CASAVA_Build 12 16620025 2I TAAATTCTTC --/AG ACTTTCTACT 3070 hom 141 het 55 0 46 9 AG 0 1 184194 CASAVA_Build 12 16635748 1I ATTTAGTGCT -/G TATGTCAAGG 3070 hom 148 het 57 0 50 7 G 0 1 184195 CASAVA_Build 12 16646532 1D ACAACCTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 42 0 38 4 A 10 9 184196 CASAVA_Build 12 16647194 1I TGAAAAATCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 13 14 184197 CASAVA_Build 12 16651363 8D CACACACTCT CCTTCCTC/-------- CCTTCCTCCC 3070 het 3070 hom 35 16 16 6 CCTTCCTC 3 2 184198 CASAVA_Build 12 16651904 1D GTTGAACTAC A/- AAAAACTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 6 5 184199 CASAVA_Build 12 16658675 2D GATTTTGTCA TC/-- TGTCTTCATG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TC 1 0 184200 CASAVA_Build 12 16661986 4D ATGAGGACCC TTAG/---- TTAGCTACAG 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 TTAG 2 1 184201 CASAVA_Build 12 16677407 1I TATGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 10 11 184202 CASAVA_Build 12 16681647 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2315 het 2315 ref 21 10 5 7 A 13 12 184203 CASAVA_Build 12 16704273 1D ACCTTTCATC A/- AAATTAATTC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 4 3 184204 CASAVA_Build 12 16707693 1I AATTCATGGG -/C CCCCAAAACT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 4 5 184205 CASAVA_Build 12 16721740 1I TACCCTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 8 18 2 T 10 11 184206 CASAVA_Build 12 16733847 4D ATTTCCTCTC TCTT/---- CCTTCCTTGT 3070 het 3070 ref 46 25 20 2 TCTT 1 0 184207 CASAVA_Build 12 16739811 2I GGAAACAGAA --/AG AGGAGGAAAT 3070 hom 132 het 45 0 44 1 AG 1 2 184208 CASAVA_Build 12 16754835 1D TAGGGGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 11 10 184209 CASAVA_Build 12 16768338 1D CAGTTTACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 10 9 184210 CASAVA_Build 12 16784050 1I CAACACTATG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 8 9 184211 CASAVA_Build 12 16787354 1D ACCACACACA T/- TAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 1 184212 CASAVA_Build 12 16802696 1D TTTTGCTTTT G/- AGCCAAGCCC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 G 1 0 184213 CASAVA_Build 12 16841366 4D TACACTAAAT AGAG/---- AGCACAGCAT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 AG 3 1 184214 CASAVA_Build 12 16856583 2D ACTTTACCTT TA/-- TTTGTGTCTT 3070 het 3070 ref 48 24 20 7 TA 1 0 184215 CASAVA_Build 12 16865535 1I ATAGTATTCC -/A TGGTGTATAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 0 1 184216 CASAVA_Build 12 16880060 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 13 14 184217 CASAVA_Build 12 16888272 1D GATCAAAGCG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 54 28 22 4 T 7 6 184218 CASAVA_Build 12 16889158 1I AAAAAAAAAA -/C AACTAATGTC 3070 het 2708 hom 37 11 20 6 C 0 1 184219 CASAVA_Build 12 16893418 3I TAGCAAATAT ---/ATA ATATTAACTC 3070 het 3070 ref 43 26 17 0 ATA 1 2 184220 CASAVA_Build 12 16929529 1I TCTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 1271 het 1271 ref 49 33 4 12 T 11 12 184221 CASAVA_Build 12 16935257 5D TGATCACTAC ATATT/----- ATAAGTATTG 3070 het 3070 hom 48 24 24 2 ATATT 1 0 184222 CASAVA_Build 12 16935969 2D AATAATTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 TA 7 6 184223 CASAVA_Build 12 16945574 4D AAACTGACCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 52 23 19 11 AAAC 5 4 184224 CASAVA_Build 12 16950174 1D GTTTTCACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 14 12 8 A 10 9 184225 CASAVA_Build 12 16953010 2I TGCGTCAAAC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 9 11 184226 CASAVA_Build 12 16977084 1I TGCCAATTTT -/A AAAAAAACAT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 7 8 184227 CASAVA_Build 12 16985594 1I TCTTTTTTTT -/G TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 G 0 1 184228 CASAVA_Build 12 17000601 1D AGTACAATGT A/- AAAAAAAAAA 1637 het 1637 ref 43 30 4 9 A 13 12 184229 CASAVA_Build 12 17005586 2D AACAGTTTAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 25 10 7 9 TA 9 8 184230 CASAVA_Build 12 17013013 1I AACACTAAGG -/A ATCTACATAA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 1 2 184231 CASAVA_Build 12 17016169 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1685 het 1685 ref 41 31 4 6 T 12 11 184232 CASAVA_Build 12 17020985 1I TTTATTTCTG -/C AATATCTAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 0 1 184233 CASAVA_Build 12 17030335 1D ATATAATTCT A/- AAAAAACATC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 7 6 184234 CASAVA_Build 12 17037348 1I GGGTCCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 13 14 10 A 12 13 184235 CASAVA_Build 12 17053967 4I TAAATTTCCC ----/GAAA GAAAGATTCT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 GAAA 1 2 184236 CASAVA_Build 12 17055667 1D TGGTTCTTTT G/- CTCTTTGCAG 3070 het 3070 ref 28 19 9 0 G 1 0 184237 CASAVA_Build 12 17057801 1I GATTTAGGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 G 0 1 184238 CASAVA_Build 12 17083594 1D AGTAGAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 721 hom 45 2 34 9 A 13 12 184239 CASAVA_Build 12 17087306 1I TAGAACAAAT -/A AAAGTATTAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 3 4 184240 CASAVA_Build 12 17107157 4D GTGTGTCCCT GGTA/---- GGTAGGATTT 3070 hom 78 het 34 0 27 8 GGTA 2 1 184241 CASAVA_Build 12 17111971 1I TCAAAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 T 10 11 184242 CASAVA_Build 12 17112130 1I GACAGCAAAA -/G GGGGGGGGGA 2865 het 2865 ref 47 21 13 13 G 9 10 184243 CASAVA_Build 12 17113345 2D TAAAAATGCT AA/-- GAGTAATATC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 2 0 184244 CASAVA_Build 12 17121522 7D TGAAATGTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 963 hom 28 4 15 10 T 19 12 184245 CASAVA_Build 12 17124585 1I ATTTTATTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 8 9 184246 CASAVA_Build 12 17131635 1I TAGTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 2539 het 987 hom 29 9 12 8 G 0 1 184247 CASAVA_Build 12 17135870 4D GCAAGTCAGG AAGA/---- AAGAATTTGC 3070 het 3070 ref 51 25 19 8 AAGA 2 1 184248 CASAVA_Build 12 17146801 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 474 hom 12 1 10 2 A 9 8 184249 CASAVA_Build 12 17152575 1I TTTTTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 2710 het 1082 hom 20 5 8 7 T 15 16 184250 CASAVA_Build 12 17160344 1I TTTGTACACC -/A AACACCAACA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 3 184251 CASAVA_Build 12 17165474 2D TAATAATAAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 11 9 184252 CASAVA_Build 12 17169557 1I AGTTTTCACC -/A AAAAATATTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 5 6 184253 CASAVA_Build 12 17181485 1D ACATCTAAGA T/- TTTTTTTTTT 1230 het 1230 ref 53 33 4 16 T 12 11 184254 CASAVA_Build 12 17193782 1I TAATGAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 8 9 184255 CASAVA_Build 12 17246222 1I ATTCCATGTT -/A AAAAAAAAAA 2433 het 2284 hom 29 7 9 13 A 13 14 184256 CASAVA_Build 12 17267282 1I AAAGTGAACA -/T TAGTAGTTAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 1 2 184257 CASAVA_Build 12 17270168 1I AAACTAAGTG -/A ATTTCCTGTC 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 A 1 2 184258 CASAVA_Build 12 17286312 1I CTTTGACCAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 T 8 9 184259 CASAVA_Build 12 17306895 4D ATATAGCCAG CTAT/---- CTATCTATCT 2322 het 2322 ref 17 8 7 2 CTAT 6 5 184260 CASAVA_Build 12 17309999 9D AACAGTCATT GTTACATGA/--------- CATACAATGT 3070 het 3070 ref 53 30 23 4 GTTACATGA 1 0 184261 CASAVA_Build 12 17316410 5I ATCCTTGCTA -----/AGCAT TAGAGAATCT 3070 hom 157 het 53 0 53 0 AGCAT 0 1 184262 CASAVA_Build 12 17319846 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1046 hom 7 het 4 0 3 1 A 6 7 184263 CASAVA_Build 12 17326375 2D TATCATATGG AT/-- ATATATATAT 1652 het 1652 ref 43 27 4 13 AT 8 7 184264 CASAVA_Build 12 17349297 4D CTTGAATTCC CTTT/---- CTTTGTCTAT 3070 het 3070 ref 62 34 25 5 CTTT 2 1 184265 CASAVA_Build 12 17351085 1D GTAAGATTTT G/- TTCCCATCAT 3070 het 3070 ref 53 30 19 4 G 1 0 184266 CASAVA_Build 12 17356482 1D TTGTTTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 19 6 A 11 10 184267 CASAVA_Build 12 17358323 1D TTGAAAAAAA T/- AATGGATAAA 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 1 0 184268 CASAVA_Build 12 17359736 1D AAGCTTTTTA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 T 7 6 184269 CASAVA_Build 12 17365277 2D TTTGTTGCCT AA/-- ATACCTCTTT 3070 het 3070 ref 46 28 15 4 A 3 1 184270 CASAVA_Build 12 17368190 1D ATTATGCTTC A/- AAATTATATT 3070 het 1480 hom 14 3 9 2 A 4 3 184271 CASAVA_Build 12 17372076 4I ATACTAGCAC ----/CTAT CTACTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 CTAT 0 1 184272 CASAVA_Build 12 17377262 9D ATTTTTTATT AACCTCATA/--------- AACCTCATAA 3070 hom 93 het 31 0 32 7 AACCTCATA 2 1 184273 CASAVA_Build 12 17378589 1I AAGGCTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 726 hom 34 2 25 7 A 11 12 184274 CASAVA_Build 12 17378876 1D TCAATGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 819 hom 29 2 18 9 T 13 12 184275 CASAVA_Build 12 17380557 1I AAAATAGGCT -/A TTTTTTTTAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 184276 CASAVA_Build 12 17382589 1D TTACTGATAT A/- AAAAAACTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 7 6 184277 CASAVA_Build 12 17393430 1D TCTTACTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 844 hom 32 2 27 3 A 11 10 184278 CASAVA_Build 12 17402426 1I TCTTTTTTCA -/T CCTTTTTTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 0 1 184279 CASAVA_Build 12 17404946 1I CATAAAGTCC -/T TTTTTTGAAC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 6 7 184280 CASAVA_Build 12 17408396 1D ACATCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 13 12 184281 CASAVA_Build 12 17413846 6D TAAATATGAG TATCTA/------ TATCTATATA 3070 hom 93 het 42 0 32 11 TATCTA 2 1 184282 CASAVA_Build 12 17421273 1D AAGAGGGAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 97 het 39 0 37 2 T 10 9 184283 CASAVA_Build 12 17425018 3I ATAAATAAAC ---/ATT ATTAAAAATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATT 1 2 184284 CASAVA_Build 12 17442348 2I GCTCCATTGG --/AA AAAAAAAAAA 783 het 615 hom 30 2 6 22 A 12 14 184285 CASAVA_Build 12 17464969 1I TTGCTGAAGA -/T TTTTTGCATC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 5 6 184286 CASAVA_Build 12 17465302 1D AAATCTAGAA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 8 7 184287 CASAVA_Build 12 17468616 1I ATTTCTGCTC -/T AATTTTTTAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 0 1 184288 CASAVA_Build 12 17470082 4D TTGTTTTGCT TAAG/---- TGTTTATAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TAAG 1 0 184289 CASAVA_Build 12 17474976 1I GATATTTACC -/A AAGAAAGCTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 2 3 184290 CASAVA_Build 12 17501497 6D ACTAATAGTA GAATTT/------ ACTGTCTTAT 3070 hom 129 het 45 0 44 3 GAATTT 1 0 184291 CASAVA_Build 12 17504185 1I TAAAGGCAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 9 10 184292 CASAVA_Build 12 17515036 1I GGGCAAACTT -/C CACCCTCCAT 3070 hom 66 het 23 0 20 3 C 1 2 184293 CASAVA_Build 12 17515231 1I GACCTGGATA -/T TTTTTTGTCA 3070 hom 73 het 27 0 25 2 T 6 7 184294 CASAVA_Build 12 17526983 1I ACAACAAAAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 61 24 29 8 A 8 9 184295 CASAVA_Build 12 17529533 4I TTAAAAAACA ----/AAAC AAACAAACTG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AAAC 2 3 184296 CASAVA_Build 12 17531474 1I GTGCAATATC -/T TGGCTGAACC 3070 het 3070 ref 51 26 17 8 T 1 2 184297 CASAVA_Build 12 17536280 4D TTCTCTATCT CTTA/---- CTTACTTTAC 3070 het 3070 ref 32 18 13 3 CTTA 2 1 184298 CASAVA_Build 12 17549098 1I AATAGAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3000 hom 34 8 19 7 T 10 11 184299 CASAVA_Build 12 17554929 1D ACAATGGCAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 56 28 21 8 A 8 7 184300 CASAVA_Build 12 17561156 1I CTTCTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 38 1 27 10 T 10 11 184301 CASAVA_Build 12 17574475 4I ATGTGACTTT ----/TTAG TTAGTTAATG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 TTAG 1 2 184302 CASAVA_Build 12 17576504 3I CTATGCCCAT ---/AGA AGATGGCAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AGA 1 2 184303 CASAVA_Build 12 17577504 1I TACTGCTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 A 9 10 184304 CASAVA_Build 12 17579333 4I TAGTTTTCTG ----/TCTC TCTCTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 TC 2 4 184305 CASAVA_Build 12 17588399 1D AATTCCCCTT C/- CCCTGAATGG 3070 het 3070 ref 72 32 32 10 C 4 3 184306 CASAVA_Build 12 17588614 1I GCAGGCTAGG -/T GAGTTGATTC 3070 het 3070 ref 55 23 20 12 T 0 1 184307 CASAVA_Build 12 17593163 5D ATACAATATG TTATA/----- TTATATTACT 2508 het 605 hom 9 2 6 2 TTATA 2 1 184308 CASAVA_Build 12 17600937 4I AAGGCCTAGT ----/CACA CACACACAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 CA 4 6 184309 CASAVA_Build 12 17607145 1D TTCCATTTGC T/- TGGTAGATCT 1471 hom 7 het 3 0 3 0 T 2 1 184310 CASAVA_Build 12 17615831 1D AAAAACAGTG C/- AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 34 15 19 2 C 1 0 184311 CASAVA_Build 12 17618507 1I ACTACTGGGG -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 7 8 184312 CASAVA_Build 12 17620248 1D AGTAAACCTA T/- TTTTACACAC 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 T 5 4 184313 CASAVA_Build 12 17624203 1D ACACCAGCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 290 hom 33 1 29 4 T 10 9 184314 CASAVA_Build 12 17632078 3I AACATGGACG ---/ATA ATAACGATGT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 ATA 1 2 184315 CASAVA_Build 12 17635224 6I ACATTGAAAC ------/TTTTAT TTTTAATTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TTTTAT 0 1 184316 CASAVA_Build 12 17635810 2D AAAAATTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 36 2 26 8 A 16 14 184317 CASAVA_Build 12 17637051 1D CAAATCTAGG T/- TTTTTTTTTT 1952 het 1952 ref 33 16 7 10 T 19 18 184318 CASAVA_Build 12 17638058 5D TAAAGTTCTC TTAGT/----- TTAGTTTTGT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 TTAGT 2 1 184319 CASAVA_Build 12 17638370 3I ATGATAATAT ---/TAA TTTTAACACT 3070 het 3070 hom 31 16 15 0 TAA 0 1 184320 CASAVA_Build 12 17638963 1D TCTCTTATTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 9 8 184321 CASAVA_Build 12 17641431 1I ACTATTACTT -/C CCCCATTGAA 3070 het 3070 hom 46 18 27 1 C 4 5 184322 CASAVA_Build 12 17643640 10I GACTCTGTCT ----------/CAAAACAAAA CAAAACAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CAAAA 2 4 184323 CASAVA_Build 12 17644213 4D TCTATACCTT TGTA/---- TGTATGTATG 3070 het 3070 hom 45 14 22 9 TGTA 8 7 184324 CASAVA_Build 12 17644946 3D CTCTATTAGA TAT/--- TATTATCTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAT 3 2 184325 CASAVA_Build 12 17645700 1I CAAAATGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 40 1 32 7 T 10 11 184326 CASAVA_Build 12 17652756 1D GTTTAGCAAG T/- TTTAAATGAC 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 T 4 3 184327 CASAVA_Build 12 17653797 1I TTCTTTCTTG -/T TTTTTCTCCC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 5 6 184328 CASAVA_Build 12 17653919 1I CTGGTTGGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 131 het 50 0 43 7 A 8 9 184329 CASAVA_Build 12 17655406 4I AATATTAGTA ----/ATTT ATTAATAAGA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 ATTT 0 1 184330 CASAVA_Build 12 17679370 1I41M1I TTATGTAAAT -TTTTTTTTTCAGAAACTAGTCTAAAATGTCCGTATTTGTAT-/ATTTTTTTTTCAGAAACTAGTCTAAAATGTCCGTATTTGTATA ACTAAACAAA 3070 het 3070 hom 33 14 29 5 N/A 0 0 184331 CASAVA_Build 12 17681789 2D ACCAACAATC TA/-- TAGGGGAAAG 3070 het 3070 hom 42 21 18 4 TA 2 1 184332 CASAVA_Build 12 17683876 1D AAAGCCCACC T/- TTCTCACAAT 3070 het 3070 ref 57 28 23 7 T 3 2 184333 CASAVA_Build 12 17685738 1I GTAATGGTTC -/T TTTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 6 7 184334 CASAVA_Build 12 17685820 1I TTATATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 10 11 184335 CASAVA_Build 12 17697963 1D TGAAGATAAA T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 T 7 6 184336 CASAVA_Build 12 17699895 1I GTAGCTTTTA -/C CCCCCCAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 6 7 184337 CASAVA_Build 12 17720849 1D AAAGTCTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 33 1 21 11 T 13 12 184338 CASAVA_Build 12 17738134 4D25M4D TACATGTATT TTTATTTATTTATTTGTCTATATATATATATAC/----TTTATTTATTTGTCTATATATATAT---- ATGATGCATA 3070 het 3070 ref 27 18 15 5 N/A 0 0 184339 CASAVA_Build 12 17748422 2D2M6D GTTTTCAGCT TGCCTTGGTT/--CC------ ATCAGGTCCT 1875 het 1875 ref 18 12 5 2 N/A 0 0 184340 CASAVA_Build 12 17748610 1D ATCCAGCTTT G/- TTCCGTTGCT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 G 1 0 184341 CASAVA_Build 12 17750167 5D AGATTACCCA AAAGG/----- AAAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 27 14 10 5 AAAGG 1 0 184342 CASAVA_Build 12 17754146 2D AGAAAAGAAT TA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 21 20 7 TA 1 0 184343 CASAVA_Build 12 17754548 3D GTAAGAAAAC ATT/--- ATTTTCTGTA 3070 het 3070 ref 43 23 18 3 ATT 2 1 184344 CASAVA_Build 12 17754961 1I ATCATCTGAC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 7 8 184345 CASAVA_Build 12 17755115 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 11 10 184346 CASAVA_Build 12 17755532 5I TATTGAAATT -----/AAATC AAAAGAATAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AAATC 0 1 184347 CASAVA_Build 12 17756628 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 T 12 11 184348 CASAVA_Build 12 17757038 1I ATTACTGATG -/A AATATTTGCC 3070 hom 54 het 22 0 19 4 A 2 3 184349 CASAVA_Build 12 17757503 1I TCTATTTTTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 2637 hom 22 7 11 4 A 7 8 184350 CASAVA_Build 12 17759537 1I GTTGAAGTCT -/C CCAACTGTTA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 C 2 3 184351 CASAVA_Build 12 17762632 1D CTGGGTCTTG C/- CCAAGGCCCA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 C 3 2 184352 CASAVA_Build 12 17763417 6D CCCTATTCAG TGTCTT/------ TTTCCTTGAT 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 TGTCTT 1 0 184353 CASAVA_Build 12 17763738 1I TATCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2397 het 2397 ref 22 10 8 6 T 10 11 184354 CASAVA_Build 12 17765327 2D GGAGAAACAC TG/-- TAAACCGGCA 2375 het 2375 ref 20 10 5 6 TG 1 0 184355 CASAVA_Build 12 17766680 1I AGCACATGTG -/T TTTTTATGAG 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 5 6 184356 CASAVA_Build 12 17768902 1D GTTAAAGAGG T/- TTTTAGGTTT 1880 het 1880 ref 14 7 6 1 T 5 4 184357 CASAVA_Build 12 17769195 8D GGGGCACGGA AATAAGGG/-------- ATCAGGGGGT 3070 het 3070 ref 21 12 10 5 AATAAGGG 1 0 184358 CASAVA_Build 12 17769420 2I AAATTATTTA --/AT ATATGTTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 AT 2 3 184359 CASAVA_Build 12 17769593 1D ATTGGCATAC T/- GGGTACTCCC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 1 0 184360 CASAVA_Build 12 17770101 4D AGATTGTTGA TTTC/---- TTTATGAATT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 TTTC 1 0 184361 CASAVA_Build 12 17770381 1I CTGATTTTAC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 A 7 8 184362 CASAVA_Build 12 17770983 6I TCTTAACACT ------/TCTCTC TCTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 TC 3 6 184363 CASAVA_Build 12 17771902 3D AAGTAAGGTA GTC/--- TGATGCCTCT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 GTC 1 0 184364 CASAVA_Build 12 17772374 4D AGGTATTTTA TCTT/---- TCTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 TCTT 2 1 184365 CASAVA_Build 12 17773039 19D CACACTAGAA GCAGAAAATAAAAGGTAAG/------------------- GCAGAGTTAT 3070 het 3070 ref 28 17 11 5 GCAGAAAATAAAAGGTAAG 1 0 184366 CASAVA_Build 12 17773174 5D TTTTTCTCTC TTTCT/----- TTTATTTTCC 3070 het 643 hom 30 3 19 11 TTTCT 1 0 184367 CASAVA_Build 12 17773206 1I TTTCTTCTTT -/C CCCCCCCACC 2938 het 1853 hom 29 6 9 14 C 7 8 184368 CASAVA_Build 12 17774231 1I AAAGCTTTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 12 17 9 T 8 9 184369 CASAVA_Build 12 17774504 1I43M1I ATCCACATGC -AAAAAAAAAATAATAAATTAGGGCATCTATCTTAAACCATATC-/AAAAAAAAAAATAATAAATTAGGGCATCTATCTTAAACCATATCA AAAAAACTCA 3070 het 112 hom 22 1 21 15 N/A 0 0 184370 CASAVA_Build 12 17774687 1I GATGAATAGC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 7 8 184371 CASAVA_Build 12 17775463 2D GTCATCTATC AT/-- ATATTATTCT 3070 hom 81 het 35 0 28 8 AT 3 2 184372 CASAVA_Build 12 17776805 5D TCTTGAATTT TTATC/----- TTATCTTTGA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 TTATC 2 1 184373 CASAVA_Build 12 17779363 2I AAAGAAAGAA --/AG AATAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 AG 0 1 184374 CASAVA_Build 12 17780197 3I TAATAATAAT ---/AAA TTTAAAAAAA 1180 het 1074 hom 11 5 4 2 A 0 3 184375 CASAVA_Build 12 17788930 3D ATCACTGTAC TGA/--- TGATTAGGAA 3070 hom 103 het 38 0 34 4 TGA 2 1 184376 CASAVA_Build 12 17792663 1D AGAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2500 het 591 hom 21 3 7 12 T 15 14 184377 CASAVA_Build 12 17792979 4D TTGCTACTTG TTTA/---- CTTACAAGAA 3070 het 3070 hom 29 12 16 3 TTTA 1 0 184378 CASAVA_Build 12 17799051 1I ACCCTTTATC -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 A 0 1 184379 CASAVA_Build 12 17799147 3D AAAAACCGAG CTC/--- CTGGATTCAC 3070 het 2968 hom 18 8 10 2 CTC 1 0 184380 CASAVA_Build 12 17801910 4I TTCCTCTGAT ----/TTTA TTTATTTGCA 2400 het 2400 ref 22 14 6 2 TTTA 1 2 184381 CASAVA_Build 12 17804064 17I AGTCTGGAGG -----------------/ACAGGGGCCATCTTCTC ACAGCTCCAC 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 ACAGGGGCCATCTTCTC 0 1 184382 CASAVA_Build 12 17805860 3I TTTTCCTCTC ---/ATT GTTTCTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ATT 0 1 184383 CASAVA_Build 12 17812483 1I AAATGTATGT -/G GAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 G 1 2 184384 CASAVA_Build 12 17830548 1I AGCAGCAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 9 10 184385 CASAVA_Build 12 17843089 1D AGAGATTATC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 25 11 9 A 9 8 184386 CASAVA_Build 12 17843477 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 23 11 7 C 1 0 184387 CASAVA_Build 12 17865602 12I GGCCTGGGAT ------------/TTCACTTGAGTA TTCATTGCAG 3070 hom 117 het 40 0 39 1 TTCACTTGAGTA 0 1 184388 CASAVA_Build 12 17871157 6D GTTCTCTATT CTATTA/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 CTATTA 1 0 184389 CASAVA_Build 12 17873211 1I CAATTAAGAC -/T TTTTTATTAT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 5 6 184390 CASAVA_Build 12 17874889 5I AAAAGAAAGT -----/TAAAG TAAAGAATTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TAAAG 1 2 184391 CASAVA_Build 12 17876495 4I ACAGTCTATT ----/AGAC AGATAAACAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AGAC 0 1 184392 CASAVA_Build 12 17878800 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1081 hom 21 4 15 2 A 10 11 184393 CASAVA_Build 12 17883024 1D GGTTCTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 T 12 11 184394 CASAVA_Build 12 17885010 1D TCCTTAAATG T/- TTTTTAATAC 3070 het 3070 hom 45 14 28 3 T 6 5 184395 CASAVA_Build 12 17887632 1D ACTTTGAGTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 9 8 184396 CASAVA_Build 12 17888376 1D ATTTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 19 0 14 5 A 12 11 184397 CASAVA_Build 12 17889279 6I TTATCAATAT ------/TATATA TATATATATA 1411 hom 7 het 6 0 3 3 TA 6 9 184398 CASAVA_Build 12 17892710 1D TTCAAAAGAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 34 0 31 5 T 9 8 184399 CASAVA_Build 12 17893109 5I GTTAAAAAAA -----/TACTT AATTGCTAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TACTT 0 1 184400 CASAVA_Build 12 17895744 3D TGTGACTCTC TTT/--- TTTTTACTTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 8 5 184401 CASAVA_Build 12 17896847 6I ACCACAACAG ------/ATAATA ATAATAATAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ATA 4 6 184402 CASAVA_Build 12 17910607 3D GGACTACAGG CGC/--- CCGCCACCAC 3070 hom 38 het 18 0 11 11 CGC 1 0 184403 CASAVA_Build 12 17926112 5D GATTAGAAAA TAATT/----- TAATTTAATA 3070 het 3070 ref 31 14 11 8 TAATT 2 1 184404 CASAVA_Build 12 17933189 1D TATGGGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 12 11 184405 CASAVA_Build 12 17945058 1D CAAAAATGTC T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 7 184406 CASAVA_Build 12 17967006 1D TTTGTCTTCA C/- TAGACCAGCC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 C 1 0 184407 CASAVA_Build 12 17974623 3D CTATGATATC TTA/--- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 TTA 1 0 184408 CASAVA_Build 12 17977967 2D CTTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 T 10 8 184409 CASAVA_Build 12 17978106 1D ATATATGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1347 hom 27 3 17 7 T 13 12 184410 CASAVA_Build 12 17982342 4D CTGTTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 484 het 323 hom 16 3 4 9 TTTG 1 0 184411 CASAVA_Build 12 17985626 13I ATAAATCAAT -------------/AAATAAAATAATA AAATAAAATA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 AAATAAAATAATA 0 1 184412 CASAVA_Build 12 17987853 1D TACTGCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 45 0 37 9 T 12 11 184413 CASAVA_Build 12 17988222 4D TGTTGTTGTG GTTT/---- GTTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 18 7 GTTT 3 2 184414 CASAVA_Build 12 17992606 18D TGTGTGTGTG TGTGTGTGTGTGTGTGTC/------------------ TGTGTGTATA 2629 het 2334 hom 14 7 7 2 TGTGTGTGTGTGTGTGTC 1 0 184415 CASAVA_Build 12 18007773 1I ATACACTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 11 12 184416 CASAVA_Build 12 18011057 1D CATGGAGTTG T/- TGGTTTGCTG 3070 hom 43 het 41 0 14 29 T 2 1 184417 CASAVA_Build 12 18013309 1D CACTGTCATT A/- AAAAAAAAAA 1274 het 1274 ref 39 31 3 5 A 11 10 184418 CASAVA_Build 12 18016536 3I TCAGAAAAAT ---/ATA ATGTCATAAA 3070 hom 138 het 49 0 46 3 ATA 0 1 184419 CASAVA_Build 12 18031062 1D TAAATATGTG C/- CCAAATACTC 3070 het 3070 hom 45 21 19 6 C 3 2 184420 CASAVA_Build 12 18033611 5D ACAATAACTT TAGAC/----- TAATGCTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 14 6 TAGAC 1 0 184421 CASAVA_Build 12 18035259 1D AGATATCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 23 1 T 11 10 184422 CASAVA_Build 12 18036467 1I ATATTCCTCA -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 6 7 184423 CASAVA_Build 12 18052306 3D TTATACAAAA TAG/--- TAGCAAATTT 3070 het 3070 hom 43 16 23 5 TAG 2 1 184424 CASAVA_Build 12 18059515 2D GTTTTTTTTT CA/-- AATAGCAATT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 CA 1 0 184425 CASAVA_Build 12 18065504 1D ATCAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 11 9 A 11 10 184426 CASAVA_Build 12 18086275 1D GTTTAAAAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 A 9 8 184427 CASAVA_Build 12 18088608 1D GCCCTATTTC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 7 6 184428 CASAVA_Build 12 18089009 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 9 8 184429 CASAVA_Build 12 18091014 6D TCAAATGATA AAAATG/------ AAAGAGTAAT 3070 het 3070 hom 27 14 13 0 AAAATG 1 0 184430 CASAVA_Build 12 18092870 1D ACATTTCTAA G/- GATATAATAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 G 2 1 184431 CASAVA_Build 12 18120119 6I TGCAAACAAA ------/TGTGTT TAACTGTAAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 TGTGTT 0 1 184432 CASAVA_Build 12 18125742 4D AAAAAAAAAA AAAC/---- AGATTTATAA 2932 het 2932 ref 28 16 9 4 AAAC 1 0 184433 CASAVA_Build 12 18129195 4I AAAATATATC ----/ATTT ATTTATCTGT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 ATTT 1 2 184434 CASAVA_Build 12 18130362 1D GCGTGAGCCA C/- CGCGCCCAGC 1687 het 1687 ref 18 5 6 7 C 2 1 184435 CASAVA_Build 12 18134791 1I TTCTTCTGTG -/A AAAAAAAAGG 2326 het 2326 ref 30 15 8 7 A 8 9 184436 CASAVA_Build 12 18141324 12D GCATGTATGT ATGTGTGTATGC/------------ ATGTGTGTAT 3070 het 3070 hom 47 18 22 8 ATGTGTGTATGC 2 1 184437 CASAVA_Build 12 18142778 9D11M5D AAATATATAT ACATATATGGTATATATATATGGCG/---------GTAAATATATA----- TATATATATG 212 het 212 ref 7 5 2 3 N/A 0 0 184438 CASAVA_Build 12 18143923 6I ATCTTCTTTC ------/CCTTTT CCTTTCGTCA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 CCTTTT 0 1 184439 CASAVA_Build 12 18148511 2D ACATGGTGGT GA/-- GAGAGAGAGA 1295 het 1295 ref 45 31 3 12 GA 7 6 184440 CASAVA_Build 12 18148968 4I TCTAAAGAGA ----/TTTC TTTATCACTA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 TTTC 0 1 184441 CASAVA_Build 12 18158072 1I TATGTACCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 23 16 14 T 10 11 184442 CASAVA_Build 12 18161381 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 1028 het 1028 ref 30 6 11 13 A 17 18 184443 CASAVA_Build 12 18167856 1D AAGATTTAGA T/- TTTTTATCTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 6 5 184444 CASAVA_Build 12 18175444 4I CATATTCCTG ----/ATTT ATTTGAGTTT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 ATTT 1 2 184445 CASAVA_Build 12 18178330 16D ATGATAGAGA TGTGTGTGTGTGTGTG/---------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 28 13 16 6 TG 19 11 184446 CASAVA_Build 12 18194058 1I CAAGAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 10 184447 CASAVA_Build 12 18197661 3I GTGGGAGAAA ---/AAG AAGAAGAGGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAG 2 3 184448 CASAVA_Build 12 18203344 1I TAGAGCCAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 103 het 40 0 34 6 A 9 10 184449 CASAVA_Build 12 18207242 2I CTTTATGTGC --/TT TTTTTTTTTT 2186 het 616 hom 44 3 9 32 T 14 16 184450 CASAVA_Build 12 18207982 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 473 hom 27 2 14 11 TA 8 9 184451 CASAVA_Build 12 18220709 3I TCCTATACAA ---/GTT GTTATCTTGA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 GTT 1 2 184452 CASAVA_Build 12 18272658 1D CATAAATGAA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 7 6 184453 CASAVA_Build 12 18280096 3D TTGCAATTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 15 0 10 6 T 19 16 184454 CASAVA_Build 12 18288861 1I TAATCAGGTA -/T TGTCTTAGGC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 1 2 184455 CASAVA_Build 12 18289699 1I TTTGGGAGGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 7 8 184456 CASAVA_Build 12 18291211 2D AAGGAAAATC AT/-- ATGTTATATA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 AT 2 1 184457 CASAVA_Build 12 18292778 12D TCTCAAACAA AACAACAACAAC/------------ AACAACAACA 2938 het 2938 ref 22 11 7 11 AAC 10 6 184458 CASAVA_Build 12 18293975 4D AAATCTTCTG CTAA/---- CTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 CTAA 1 0 184459 CASAVA_Build 12 18294131 1D GTTCCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 8 A 11 10 184460 CASAVA_Build 12 18297475 4D TCGATAAATT AAAA/---- AAACTTATTT 3070 het 3070 ref 44 24 15 10 A 7 3 184461 CASAVA_Build 12 18298053 1I GCTTCAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 16 20 12 T 13 14 184462 CASAVA_Build 12 18298225 1D GAAAAAAAAA G/- ATGCATCCTA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 G 1 0 184463 CASAVA_Build 12 18300160 4D TTGTCCCTTA TTAC/---- TTATGGTTCC 3070 het 3070 hom 49 22 23 6 TTAC 1 0 184464 CASAVA_Build 12 18301922 4I ACAGGAAGGT ----/GGAA GGAAGGAAGG 3070 het 2221 hom 33 8 16 9 GGAA 2 3 184465 CASAVA_Build 12 18302480 1D TCCCATACCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 12 24 1 T 10 9 184466 CASAVA_Build 12 18303951 1I AAACTTGCAC -/T GTAAACATTG 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 0 1 184467 CASAVA_Build 12 18304364 1D TCTCATAAGT C/- CTCCTGAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 C 2 1 184468 CASAVA_Build 12 18316908 1I AACATATTTG -/A TATTAGCTAG 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 0 1 184469 CASAVA_Build 12 18317190 2I AAATGACACT --/CA CACACACACA 3070 het 2668 hom 29 9 14 6 CA 7 8 184470 CASAVA_Build 12 18323998 3D AATAGCTTTA AAT/--- AATATTTTGA 3070 het 3070 ref 42 27 12 5 AAT 2 1 184471 CASAVA_Build 12 18325064 1D TAGACAGAGA G/- GGGAAGATAG 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 G 4 3 184472 CASAVA_Build 12 18325522 2I CACAGAAAGA --/CT CAGAAATTCC 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 CT 0 1 184473 CASAVA_Build 12 18326666 3D CCTGGGGAAG CCC/--- CATAGGAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 C 4 1 184474 CASAVA_Build 12 18327158 1I TAAAAAAAAA -/T ATCATCTATA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 0 1 184475 CASAVA_Build 12 18334089 1I TAGTTAACAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 212 hom 45 1 38 6 A 8 9 184476 CASAVA_Build 12 18339208 4I GCCTTAAGAC ----/TAAT TATTTTCCTT 3070 het 2470 hom 22 5 13 4 TAAT 0 1 184477 CASAVA_Build 12 18349545 1D CAAGTTTTTT A/- AAAAGCTGAA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 5 4 184478 CASAVA_Build 12 18349827 4D AATAAAGTGA TTAG/---- TTAGAGAATT 3070 het 3070 hom 45 20 23 6 TTAG 2 1 184479 CASAVA_Build 12 18350640 1I ACTTGAAGAC -/A AAAATAACAA 3070 het 3070 ref 49 30 16 3 A 4 5 184480 CASAVA_Build 12 18351422 1D GGGTAATTAT G/- GTGCTAGAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 G 2 1 184481 CASAVA_Build 12 18352703 2I AAAATATAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 25 1 18 6 A 10 12 184482 CASAVA_Build 12 18353336 1D TGTGGAATAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 69 het 28 0 23 6 A 9 8 184483 CASAVA_Build 12 18353642 1D TGTTTTCCTT A/- AAAGTGACAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 4 3 184484 CASAVA_Build 12 18405735 1I CTTCCCACTG -/A AAAAAAAAAA 1082 het 1082 ref 44 33 4 7 A 11 12 184485 CASAVA_Build 12 18436047 4I TGAGAAAGTG ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 42 19 16 14 TC 6 8 184486 CASAVA_Build 12 18436811 1D TTCTTTGGCC A/- CTCTATGTGA 3070 het 3070 ref 57 33 14 10 A 1 0 184487 CASAVA_Build 12 18439218 11D TTTCTTCTTT TTCTTTCTTTC/----------- TTTCTTTGTT 3070 het 2956 hom 22 8 13 3 TTCTTTCTTTC 1 0 184488 CASAVA_Build 12 18439527 1D GCCTCTCATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 A 10 9 184489 CASAVA_Build 12 18441420 1I AATACTTCAG -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 A 6 7 184490 CASAVA_Build 12 18443735 1I GGTAAAAGAT -/A GTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 0 1 184491 CASAVA_Build 12 18445861 1I CTTAAAACTC -/A AACAATAGAA 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 A 2 3 184492 CASAVA_Build 12 18448295 1D TATTTAACAG A/- ACAGTGCCTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 2 1 184493 CASAVA_Build 12 18449774 1I AAATAAACTG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 8 9 184494 CASAVA_Build 12 18455690 1D CAATCATCTT A/- AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 A 7 6 184495 CASAVA_Build 12 18466527 1I AATTTAAAAA -/G AAAAACACTG 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 G 0 1 184496 CASAVA_Build 12 18473127 1D GTAGTGCCCC T/- TTCCATTTGG 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 T 3 2 184497 CASAVA_Build 12 18477183 1I AAGATGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 11 12 184498 CASAVA_Build 12 18483783 2D TGAGCCACTC AT/-- GTATGTATCT 3070 het 3070 ref 46 25 18 5 AT 1 0 184499 CASAVA_Build 12 18486407 4D TAGCTTTTCT CTAA/---- CTGACAGTAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 CTAA 1 0 184500 CASAVA_Build 12 18486609 3D CAAATCTGAA AAG/--- AACATTTATA 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 AAG 1 0 184501 CASAVA_Build 12 18487657 1D GGCTTTAAAG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 9 8 184502 CASAVA_Build 12 18488194 2I TCATGCTCTC --/AT GTGTATTGAG 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 AT 0 1 184503 CASAVA_Build 12 18489623 1I GGCAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3069 het 3069 ref 27 11 9 7 A 11 12 184504 CASAVA_Build 12 18496706 1D ATCTTTTTTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 25 13 11 1 A 9 8 184505 CASAVA_Build 12 18497941 4D TTCAATTAAA AGAG/---- AGAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 29 14 15 3 AG 5 3 184506 CASAVA_Build 12 18511688 1D TATTTACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 26 0 20 6 T 12 11 184507 CASAVA_Build 12 18513980 2D GTCTCTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 36 4 17 15 A 14 12 184508 CASAVA_Build 12 18518101 16I TTTTTGGCAA ----------------/ACTGAGCATGTGGGCT AAACAGTATA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 ACTGAGCATGTGGGCT 0 1 184509 CASAVA_Build 12 18525301 1D ATCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 2681 het 1611 hom 10 4 6 0 T 8 7 184510 CASAVA_Build 12 18532075 4D TCAGCCTAAT TAAG/---- TAATTTGTAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 6 TAAG 1 0 184511 CASAVA_Build 12 18551237 1I TTTCTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 T 12 13 184512 CASAVA_Build 12 18555284 1I GATCATGTGA -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 6 7 184513 CASAVA_Build 12 18557578 1I ATTGGTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 10 11 184514 CASAVA_Build 12 18571881 1D AACTTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 11 10 184515 CASAVA_Build 12 18578902 1D TAAAAAAAAA G/- AAAGGCTTCT 3070 hom 75 het 29 0 26 5 G 1 0 184516 CASAVA_Build 12 18580174 1D TGGGGGAAGA G/- GGGTAGGGAT 3070 het 1082 hom 19 3 12 4 G 4 3 184517 CASAVA_Build 12 18587354 1D GACATTGAGC T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 7 6 184518 CASAVA_Build 12 18655010 3I TATTAAGAAA ---/TAT TATTAATCAA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 TAT 1 2 184519 CASAVA_Build 12 18674924 2I ATATAAAATT --/CA CAGTTGGTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CA 1 2 184520 CASAVA_Build 12 18689367 1D ACCAGAACCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 T 9 8 184521 CASAVA_Build 12 18689505 3D CTTACTATTT AAC/--- AACATCATGG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 AAC 2 1 184522 CASAVA_Build 12 18691282 1I CTTTTTGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 9 10 184523 CASAVA_Build 12 18691869 1D GGATTCTTAC A/- AAAATAGCCT 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 A 5 4 184524 CASAVA_Build 12 18692379 4D GTCTTTTGTG TTGT/---- TTATTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 TTGT 1 0 184525 CASAVA_Build 12 18698616 1D AAAGTATCAG C/- ATTATTGTAA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 C 1 0 184526 CASAVA_Build 12 18699256 1I AAACAATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 66 hom 29 1 15 13 A 9 10 184527 CASAVA_Build 12 18700956 3D AACAACAACG ACA/--- ACAACAACAA 3070 hom 108 het 43 0 36 8 ACA 4 3 184528 CASAVA_Build 12 18701660 1D TTACAAGCTG A/- AGTGTTGAAG 3070 het 3070 hom 43 18 24 3 A 2 1 184529 CASAVA_Build 12 18705545 2I33M4D CCGTACCAAG --ACATTATAATCCTACTGCCAAAAATAAAAAAAAAGAG/ACACATTATAATCCTACTGCCAAAAATAAAAAAAA---- AGAGAGAGAA 3070 het 1096 hom 30 3 20 14 N/A 0 0 184530 CASAVA_Build 12 18706510 5I CCTCTAAACA -----/TAAAG TAAAGGTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TAAAG 1 2 184531 CASAVA_Build 12 18710478 2D GTAGATTAAA CT/-- CTTCAATTAA 3070 het 3070 hom 21 9 9 4 CT 2 1 184532 CASAVA_Build 12 18718603 1I TTATGACAGT -/G GGAAGCGTGT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 G 2 3 184533 CASAVA_Build 12 18720212 1I GAATCTATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 9 10 184534 CASAVA_Build 12 18724278 3D TTCCAGTGTG TTA/--- TTACTTGGAA 3070 het 3070 ref 53 29 23 3 TTA 2 1 184535 CASAVA_Build 12 18745186 3D ATTATAGAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 T 16 13 184536 CASAVA_Build 12 18753733 1I ATTTTAGGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 9 10 184537 CASAVA_Build 12 18766419 1I CCATCACCTT -/C CTTGCTCTAT 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 C 1 2 184538 CASAVA_Build 12 18781740 1D CACACAGTGG T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 8 7 184539 CASAVA_Build 12 18789811 3I AAAATTCAAT ---/TCA TCATTGGGTC 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 TCA 1 2 184540 CASAVA_Build 12 18815624 1I TTAAAAAAAA -/T CTAATTCTTG 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 T 0 1 184541 CASAVA_Build 12 18845045 1I GTAGAGACGG -/T GGTTTCACCA 2200 hom 12 het 5 0 5 0 T 0 1 184542 CASAVA_Build 12 18847883 5D AGAATTTAAT ATATA/----- ATATAATAAT 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 ATATA 2 1 184543 CASAVA_Build 12 18853716 1D TTTTTTGTGG T/- TTTTTTTTAG 1886 hom 12 het 5 0 4 1 T 9 8 184544 CASAVA_Build 12 18864649 1I AAATACTGTA -/C CCCCTTCTGT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 C 4 5 184545 CASAVA_Build 12 18865513 1I CTTGCTAGAA -/C AGGGATAATC 3070 het 3070 hom 51 18 27 6 C 0 1 184546 CASAVA_Build 12 18868629 1D CTTTCTGTGC T/- ATAGATAAAC 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 1 0 184547 CASAVA_Build 12 18869250 1D CTCTGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 32 0 24 8 A 11 10 184548 CASAVA_Build 12 18870068 3I ATACCAACAA ---/TAG TAGTAATAGT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 TAG 1 2 184549 CASAVA_Build 12 18882637 1D GGATCATCTG T/- AAGTCAGGAG 3070 hom 46 het 19 0 13 6 T 1 0 184550 CASAVA_Build 12 18897464 2I AGGCCCTAGG --/AT ATGTTAGGTC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 AT 1 2 184551 CASAVA_Build 12 18909407 4D TTTGTTTTCT TCTC/---- TGTTTCTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 7 TC 2 0 184552 CASAVA_Build 12 18927993 1I AATTTCCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 11 12 184553 CASAVA_Build 12 18933592 2D TCGAGAAGAA TC/-- TCTGTTGCCC 3070 het 3070 ref 61 28 29 5 TC 2 1 184554 CASAVA_Build 12 18934472 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2986 hom 23 9 8 6 T 10 11 184555 CASAVA_Build 12 18945650 1I ACAGCCCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 9 10 184556 CASAVA_Build 12 18951095 1D TCCAGATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 31 0 24 7 T 11 10 184557 CASAVA_Build 12 18960798 1I AAAAATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 31 3 24 4 T 11 12 184558 CASAVA_Build 12 18964698 3D ATACAAAGAG CTT/--- CTTCTTGCTT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 CTT 3 2 184559 CASAVA_Build 12 18969858 2D TCCAATTATA CT/-- CTTTTAGTTA 3070 het 3070 ref 38 23 15 1 CT 2 1 184560 CASAVA_Build 12 18988739 1I GATCACACAA -/T TTTTTTTTTT 2663 het 2663 ref 27 11 8 8 T 13 14 184561 CASAVA_Build 12 18991753 1D GTTTGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 T 11 10 184562 CASAVA_Build 12 18997456 1D GTGTGCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 T 13 12 184563 CASAVA_Build 12 19002172 1I TCTCACTCAA -/C CCCCCCCACT 3070 het 3062 hom 24 8 11 5 C 7 8 184564 CASAVA_Build 12 19002963 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 2327 het 2327 ref 20 11 8 1 A 14 13 184565 CASAVA_Build 12 19003883 1I AATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 9 10 184566 CASAVA_Build 12 19007098 2I AGCACTTTAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AT 5 6 184567 CASAVA_Build 12 19019007 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2864 hom 22 het 11 0 7 4 A 13 14 184568 CASAVA_Build 12 19025374 1I TGCAGCTCGA -/T TTTTACAGGC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 4 5 184569 CASAVA_Build 12 19047165 1I TGCCTCATTT -/A AAAAAATATT 3070 hom 15 het 26 1 22 3 A 6 7 184570 CASAVA_Build 12 19093431 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 24 0 20 5 A 14 13 184571 CASAVA_Build 12 19118647 1I TGAAATTTTC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 8 9 184572 CASAVA_Build 12 19128380 1I CAGGTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 74 het 30 0 25 5 A 9 10 184573 CASAVA_Build 12 19130114 1D TTTCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 A 11 10 184574 CASAVA_Build 12 19132385 3D TGTAATGAAC AGA/--- AAGCAGTTGT 3070 hom 112 het 46 0 37 10 AGA 1 0 184575 CASAVA_Build 12 19136095 1I TCCAGCCTGG -/A TAACAGATCA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 0 1 184576 CASAVA_Build 12 19145419 1D ACTAAAAGTA C/- AAAAATTAGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 1 0 184577 CASAVA_Build 12 19152716 4D AGCATCATGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 65 het 26 0 22 4 TTTG 4 3 184578 CASAVA_Build 12 19154707 1D AAAGCGAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 112 het 42 0 36 6 A 10 9 184579 CASAVA_Build 12 19169255 1I AAAGGAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 42 1 29 12 T 12 13 184580 CASAVA_Build 12 19173108 16D ACACACACAC ACACATATATATATAT/---------------- ACACACATAT 3070 hom 41 het 21 0 22 3 ACACATATATATATAT 1 0 184581 CASAVA_Build 12 19183309 2I TGGAAAGGAA --/AG AGGCCATTGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 AG 1 2 184582 CASAVA_Build 12 19185967 9D2M9D ACAAGTGGCA GTAGAACTTCACTGTGGTGG/---------CA--------- AAACCTCACC 3070 hom 114 het 36 0 36 5 N/A 0 0 184583 CASAVA_Build 12 19191798 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 27 0 15 12 T 15 14 184584 CASAVA_Build 12 19192219 1D ATTATAGGCA T/- TGAGCAGCTG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 2 1 184585 CASAVA_Build 12 19195669 4I CCTGGGACTT ----/ACAG ACAGAGGCCG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 ACAG 1 2 184586 CASAVA_Build 12 19210297 9D GGATCTGGCT CCCAAGTCC/--------- CTGTTCTTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 CCCAAGTCC 1 0 184587 CASAVA_Build 12 19212715 4D63M1I AACAAAAAAC AAAAAAACTCAGTAGGAGAAATAAAATTTGATACGATTAGTAGTATTTTTGCCTGTGTTTGAATATT-/----AAACTCAGTAGGAGAAATAAAATTTGATACGATTAGTAGTATTTTTGCCTGTGTTTGAATATTA AAATTCACTT 3070 hom 87 het 30 0 30 19 N/A 0 0 184588 CASAVA_Build 12 19214630 1D TTCAGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1491 het 465 hom 25 3 7 15 T 15 14 184589 CASAVA_Build 12 19217662 1D AGGATTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2689 het 2689 ref 26 13 7 6 A 11 10 184590 CASAVA_Build 12 19222606 1D AATTTTGTAG A/- AAATAAAAGA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 4 3 184591 CASAVA_Build 12 19224996 1D AAATATAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 13 12 184592 CASAVA_Build 12 19225241 1D TTGAAATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 968 hom 36 4 23 10 A 15 14 184593 CASAVA_Build 12 19239589 7I ATATAAAGTA -------/AAGAGAC CGGGTGAGTG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 AAGAGAC 0 1 184594 CASAVA_Build 12 19242957 1I GCAGAGTGGG -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 7 8 184595 CASAVA_Build 12 19248049 1I CACAGTTAGA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 6 7 184596 CASAVA_Build 12 19252467 1I AAAATTAGCT -/G GGCATGGTGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 2 3 184597 CASAVA_Build 12 19257507 1D GGTTTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 11 10 184598 CASAVA_Build 12 19263108 1D24M1D ATTATTATTA TTTTTTTTTTTACTTTTTAATTTTCT/-TTATTTTTTTACTTTTTAATTTTC- TTTTTTTTTT 2077 hom 18 het 7 0 7 1 N/A 0 0 184599 CASAVA_Build 12 19271153 1I AATTTTTAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 365 hom 45 1 40 4 T 9 10 184600 CASAVA_Build 12 19272634 2D TTTATATTTT TC/-- TCTGTTTTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TC 2 1 184601 CASAVA_Build 12 19281705 1D CATTATGTAA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 7 184602 CASAVA_Build 12 19285961 1D GATTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 19 0 12 7 A 13 12 184603 CASAVA_Build 12 19295608 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 25 0 16 9 A 15 14 184604 CASAVA_Build 12 19298860 1I TGACTGTACT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 8 184605 CASAVA_Build 12 19301742 1I TAAACAGGTA -/T TTTTTTTTTT 1812 het 1812 ref 36 21 6 9 T 13 14 184606 CASAVA_Build 12 19308994 3I AAAAACAAAA ---/AAG AAGTCACACA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAG 1 2 184607 CASAVA_Build 12 19313588 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 114 hom 21 1 18 2 A 8 9 184608 CASAVA_Build 12 19313710 1D CCATGCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 8 T 12 11 184609 CASAVA_Build 12 19317266 1I CTCCACCAAG -/C CCAGCTAATT 3070 hom 92 het 36 0 30 6 C 2 3 184610 CASAVA_Build 12 19353946 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 5 A 11 10 184611 CASAVA_Build 12 19371831 7D GTTGCTATTA CTTTTTT/------- CTTTTTTCTT 3004 het 63 hom 28 1 12 17 CTTTTTT 3 2 184612 CASAVA_Build 12 19374806 4D ACTCCTTAAA TAAT/---- TAAGCACATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAT 1 0 184613 CASAVA_Build 12 19379127 1D GATGGCACAC A/- TCTGTTTTCC 2399 hom 15 het 6 0 5 1 A 1 0 184614 CASAVA_Build 12 19397519 9D CATGCCTGGC TAATTTTTG/--------- TATTTTTTAT 3070 het 2716 hom 20 6 10 6 TAATTTTTG 1 0 184615 CASAVA_Build 12 19401233 4I AGAAAGAAAA ----/TATC TAGAGGTGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TATC 0 1 184616 CASAVA_Build 12 19404504 1D ATCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 24 1 17 8 A 11 10 184617 CASAVA_Build 12 19404967 1I GCACCATCTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 T 8 9 184618 CASAVA_Build 12 19407324 1I TCTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2431 hom 28 het 13 0 10 3 T 10 11 184619 CASAVA_Build 12 19413157 1D GCATAGAACT A/- AAAAAAGTTC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 7 6 184620 CASAVA_Build 12 19413752 4I TTAAAAAGAA ----/AAAG AAAATCACAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AAAG 0 1 184621 CASAVA_Build 12 19418149 1I TGTTTTCTTC -/T TTATTCCAAG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 2 3 184622 CASAVA_Build 12 19418835 1D ACTCCAGCCT G/- GGCGACAGAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 3 2 184623 CASAVA_Build 12 19420136 1D GCTTGTTTTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 8 7 184624 CASAVA_Build 12 19429018 1D GTTTCCAAAA G/- GCTGCATGGC 3070 hom 84 het 30 0 28 3 G 2 1 184625 CASAVA_Build 12 19443000 1I CAGGAGCTTA -/C CCCCCCCCGG 3070 het 334 hom 36 1 27 8 C 8 9 184626 CASAVA_Build 12 19445060 6D GACTTTTATT TATTTA/------ TTATTTATTT 378 het 345 hom 14 3 2 12 TATTTA 1 0 184627 CASAVA_Build 12 19450873 2I CAAGAGCGAA --/CG ACTCTGTCTC 3060 hom 29 het 15 0 8 7 CG 0 1 184628 CASAVA_Build 12 19453552 1D CATTTGTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 27 10 A 15 14 184629 CASAVA_Build 12 19460629 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AG 2 1 184630 CASAVA_Build 12 19461079 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 14 0 9 5 T 12 11 184631 CASAVA_Build 12 19466702 1D TAGAAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 30 1 16 13 T 13 12 184632 CASAVA_Build 12 19487305 1D TATCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 23 2 18 3 T 12 11 184633 CASAVA_Build 12 19490302 10I TTTTCTAGTA ----------/ATGGCTATGC ATGGCAGTGG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 ATGGCTATGC 0 1 184634 CASAVA_Build 12 19491889 2D TAGAGTCATT TA/-- TATATCCCCA 3070 hom 135 het 53 0 46 7 TA 3 2 184635 CASAVA_Build 12 19495044 1I ACATTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 27 1 19 7 A 11 12 184636 CASAVA_Build 12 19495189 1D AGTATGACAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 10 9 184637 CASAVA_Build 12 19495888 2D CATCTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 72 hom 28 1 13 14 T 16 14 184638 CASAVA_Build 12 19500146 1I CAAAGAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 11 12 184639 CASAVA_Build 12 19511416 1I CCAATACACC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 9 10 184640 CASAVA_Build 12 19518995 1I ATTTGAATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 9 10 184641 CASAVA_Build 12 19519381 7D ACCTGAGCTG TGTACAC/------- TGTACACTGT 3070 hom 51 het 23 0 17 7 TGTACAC 2 1 184642 CASAVA_Build 12 19520732 2D TAGTAGAGAC AG/-- AGCTTCACCC 3070 hom 48 het 17 0 16 1 AG 2 1 184643 CASAVA_Build 12 19532328 1I ACAGATTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 27 1 23 3 T 15 16 184644 CASAVA_Build 12 19538211 12D TGAGAAAATC TGGTGTATTTCA/------------ TGGTTTTAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TGGTGTATTTCA 1 0 184645 CASAVA_Build 12 19545850 2D AAAAAAAAAA TT/-- ATATATACAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 0 184646 CASAVA_Build 12 19548582 1D AATACAGGCG C/- CCCCCCCACC 3070 hom 30 het 12 0 9 4 C 8 7 184647 CASAVA_Build 12 19557524 1I ATTTCATGTA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 7 8 184648 CASAVA_Build 12 19567604 4I GTTCCTTTTT ----/GTCA GTCCTGTTTT 3070 hom 46 het 24 0 15 9 GTCA 0 1 184649 CASAVA_Build 12 19571154 2I TGAGTGAAAC --/AT GTATGGTGTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AT 0 1 184650 CASAVA_Build 12 19571762 1D AAACTGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 37 0 34 5 A 11 10 184651 CASAVA_Build 12 19572336 4D AATTAGAAAC AGAA/---- AGAAAACTGC 3070 hom 68 het 26 0 22 5 AGAA 2 1 184652 CASAVA_Build 12 19574232 1D AAATAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 620 hom 34 3 25 7 T 14 13 184653 CASAVA_Build 12 19575356 1I TGGTGGGGGG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 7 8 184654 CASAVA_Build 12 19576393 1D TTGCAGTGAG C/- CGAGATCCCG 3070 hom 68 het 28 0 24 5 C 2 1 184655 CASAVA_Build 12 19579279 4D ACCCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 27 0 18 9 A 16 12 184656 CASAVA_Build 12 19587235 3I ATTACCAAAT ---/ATC ATGAAGCAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATC 0 1 184657 CASAVA_Build 12 19588164 4I TCAGCATGCT ----/CTTC CTTCTGCCGC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CTTC 1 2 184658 CASAVA_Build 12 19588809 1I GAGCTCAACT -/C CCTGATCACT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 2 3 184659 CASAVA_Build 12 19589063 1D GACTTATTGA C/- CCCAGAATAT 3070 hom 123 het 43 0 42 2 C 4 3 184660 CASAVA_Build 12 19589832 2I TCATTTTTGG --/TA TATATATATA 3070 het 1006 hom 22 4 12 6 TA 7 8 184661 CASAVA_Build 12 19589882 2D TGTATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TA 10 9 184662 CASAVA_Build 12 19592727 4I TGTACAAAAA ----/TCCC ATACTAATTT 1460 het 1460 ref 18 9 4 5 TCCC 0 1 184663 CASAVA_Build 12 19593054 4D TGTGATGCTG TGAT/---- TGATTTGAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 4 TGAT 2 1 184664 CASAVA_Build 12 19597396 1D ATCTCACTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 A 10 9 184665 CASAVA_Build 12 19606753 16I CCCTTGCAAA ----------------/GAATGTGTATTAAATG GAATGTTCTG 3070 het 3070 ref 30 16 7 7 GAATGTGTATTAAATG 0 1 184666 CASAVA_Build 12 19607500 1D ACACTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 13 12 184667 CASAVA_Build 12 19615723 1D TCTTTTCATC T/- TTTTTTGATC 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 7 6 184668 CASAVA_Build 12 19622968 2D AATGTGAAAC AT/-- GTGCATGGTG 3070 het 3070 hom 45 19 24 4 AT 1 0 184669 CASAVA_Build 12 19636641 1D TATAGTGGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 10 9 184670 CASAVA_Build 12 19638735 4D TAATGTACAC AGAG/---- AGCTCAGAAC 3070 het 3070 ref 49 29 16 5 AG 3 1 184671 CASAVA_Build 12 19638818 4D TTGAAGGACA AATT/---- AATTAACACC 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 AATT 2 1 184672 CASAVA_Build 12 19661455 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1224 het 1224 ref 19 14 4 1 A 13 12 184673 CASAVA_Build 12 19669338 1D AATATGAAAT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 A 8 7 184674 CASAVA_Build 12 19674737 1I AGATCCTATC -/A AAAAAAAAAA 1972 het 1021 hom 26 5 11 10 A 17 18 184675 CASAVA_Build 12 19685506 2I TCACTTCTGG --/GA GACCCCTAAC 3070 hom 104 het 40 0 34 6 GA 1 2 184676 CASAVA_Build 12 19686934 1I CTGGCTAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 79 hom 20 1 13 6 A 8 9 184677 CASAVA_Build 12 19688648 1D GCTCCGCTTG A/- AAAAAAAAAA 2980 het 2980 ref 22 8 10 4 A 11 10 184678 CASAVA_Build 12 19689476 1D CAACATTGAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 51 23 23 6 A 9 8 184679 CASAVA_Build 12 19695956 2I GGTAGAGGTA --/GT GTCCTCCTCT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 GT 1 2 184680 CASAVA_Build 12 19702202 1I ATTTGGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 39 0 24 15 T 11 12 184681 CASAVA_Build 12 19705418 3I GGCTAGTTTG ---/AAT AATGTCAATG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAT 1 2 184682 CASAVA_Build 12 19709113 1I GTGGTGGCTC -/A ACGCCTATAA 2009 het 2009 ref 23 16 5 2 A 1 2 184683 CASAVA_Build 12 19709938 1I TGGAACTCTG -/C CTCCCAAATT 3070 hom 123 het 43 0 39 4 C 1 2 184684 CASAVA_Build 12 19712176 1D TTTTTTGTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 A 10 9 184685 CASAVA_Build 12 19715008 1D AAATTAATGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 9 8 184686 CASAVA_Build 12 19718087 1D GAGGATATAC T/- TTTTGGGTCT 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 T 5 4 184687 CASAVA_Build 12 19723628 1I TGCTTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 11 12 184688 CASAVA_Build 12 19725773 3D AGCAGGGCTT AAG/--- AACTTTCCCC 2372 het 2372 ref 29 14 11 5 AAG 1 0 184689 CASAVA_Build 12 19728570 1D GCTGAGGCAC A/- AGAGAATTGC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 2 1 184690 CASAVA_Build 12 19729901 1I ATTCCTTTTT -/G AAAAGAATCC 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 G 0 1 184691 CASAVA_Build 12 19734678 4I AACTATTGAT ----/TGAG TATTTTTCAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TGAG 0 1 184692 CASAVA_Build 12 19737091 2I AGCAAAAGAA --/AC AATCAGCAGA 3070 het 75 hom 35 1 31 3 AC 0 1 184693 CASAVA_Build 12 19738130 9D TAAAAAATCT AAATAGATG/--------- AGAAACCATG 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 AAATAGATG 1 0 184694 CASAVA_Build 12 19741111 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1295 hom 21 5 14 2 A 13 14 184695 CASAVA_Build 12 19742455 1D TATCCATTCT A/- AGTGAAGTAC 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 A 2 1 184696 CASAVA_Build 12 19743248 1I GTGTCCTGAT -/C CCTTCATCTT 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 C 2 3 184697 CASAVA_Build 12 19746923 1I CAAGCAAATG -/C CTAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 C 1 2 184698 CASAVA_Build 12 19748231 3D AGAAAAAGAT CCC/--- CCCCCCCCCC 2962 het 12 hom 24 1 10 13 C 13 10 184699 CASAVA_Build 12 19751114 1I CTTTATGTGC -/T GCCAAGGAGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 0 1 184700 CASAVA_Build 12 19753448 1D TATTTTTCAA T/- TTTTTGTATA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 T 6 5 184701 CASAVA_Build 12 19754631 3D CAGAAGGCTG TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 53 25 24 4 TAT 4 3 184702 CASAVA_Build 12 19760975 1D TCTACCTAAT A/- AAAAAAGGGG 3070 het 3070 hom 27 10 17 0 A 7 6 184703 CASAVA_Build 12 19781121 6D TTTAAGAATA TATATC/------ TATATCTATG 3070 hom 111 het 42 0 38 6 TATATC 2 1 184704 CASAVA_Build 12 19782386 1D TTTAGAATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 9 8 184705 CASAVA_Build 12 19785818 1I CCCTTCCCCC -/T GCCTAACCAT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 0 1 184706 CASAVA_Build 12 19787374 17D GAGATGGCCT GATACGGAGTCTGGCTA/----------------- GAGTACTGAA 3070 het 3070 ref 49 26 17 9 GATACGGAGTCTGGCTA 1 0 184707 CASAVA_Build 12 19790627 1I TATTCCTATC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 T 8 9 184708 CASAVA_Build 12 19796726 5D TAAAAATACA TATCT/----- TATAGAAGTA 3070 het 2323 hom 24 6 17 1 TATCT 1 0 184709 CASAVA_Build 12 19805396 1D TAATACTGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 17 9 T 12 11 184710 CASAVA_Build 12 19810785 3I GTTGAGATGT ---/AAA AAACCATATA 3070 hom 35 het 13 0 12 1 A 3 6 184711 CASAVA_Build 12 19810997 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 2464 het 109 hom 11 1 5 8 A 12 11 184712 CASAVA_Build 12 19811411 3I TCCCTAACTC ---/ATT TTATGAGGCC 3070 hom 113 het 40 0 37 3 ATT 0 1 184713 CASAVA_Build 12 19822662 1D TATGCAATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 18 15 8 T 10 9 184714 CASAVA_Build 12 19829768 1I CCATTGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 41 2 33 6 T 13 14 184715 CASAVA_Build 12 19830738 1I ATTTGTCCTG -/T TTGTATGCCT 3070 hom 129 het 44 0 44 0 T 2 3 184716 CASAVA_Build 12 19830913 3I46M1I GTCAGAAATA ---CTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTAAATGCCTGGTTTCTTGTGGG-/CTTCTTATTATTTTGAGGTATGTTCCTTAAATGCCTGGTTTCTTGTGGGT TTTTTTTTTT 3070 het 510 hom 38 2 32 13 N/A 0 0 184717 CASAVA_Build 12 19833295 2D TGTCTTTTTT TA/-- TTTTTATATT 3070 hom 14 het 30 0 13 17 TA 1 0 184718 CASAVA_Build 12 19836031 34D TATATATGTG TATATATGTGTGTGTGTATATATGTGTGTATATA/---------------------------------- TGTGTGTATA 3070 het 1081 hom 30 4 18 16 TATATATGTGTGTGTGTATATATGTGTGTATATA 1 0 184719 CASAVA_Build 12 19837506 2D TGAGAAAGAT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 11 9 184720 CASAVA_Build 12 19849496 1I TGGTCTACCA -/G GGTGCGAAAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 2 3 184721 CASAVA_Build 12 19851213 1D TAATCAACCC T/- GAGATGGTGT 3070 het 3070 ref 44 20 21 6 T 1 0 184722 CASAVA_Build 12 19854546 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 A 6 7 184723 CASAVA_Build 12 19855859 1D GTATTTTTTT A/- AAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 41 14 24 4 A 6 5 184724 CASAVA_Build 12 19856356 1I CTGTATGTGT -/G GGTCCTGGGC 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 G 2 3 184725 CASAVA_Build 12 19867450 1I TAATCTTTTT -/G GGGAAGGCTA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 G 3 4 184726 CASAVA_Build 12 19869359 5D CAAAGCTGAC AAAAA/----- AAAAAAAAAG 3070 het 390 hom 37 5 17 15 A 14 9 184727 CASAVA_Build 12 19879655 1D TAATGTGCTA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 7 6 184728 CASAVA_Build 12 19885258 2D TCTTTCTTGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 54 het 28 0 20 10 TC 7 6 184729 CASAVA_Build 12 19890372 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 7 6 184730 CASAVA_Build 12 19892461 1I TGAATATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 32 1 24 7 A 11 12 184731 CASAVA_Build 12 19897764 1I8M5D TGTTTTTTTT -TTTGTTTGTTTTT/GTTTGTTTG----- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 19 1 19 0 N/A 0 0 184732 CASAVA_Build 12 19898420 1I AAAAAGATTG -/A AAAAATCACT 3070 hom 83 het 42 0 36 6 A 5 6 184733 CASAVA_Build 12 19899724 1I TATTTTACTC -/T TTATGTCCTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 3 184734 CASAVA_Build 12 19900536 1I ATATAACTTC -/A AATCCAAATG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 2 3 184735 CASAVA_Build 12 19900698 1I GAGGTTACAG -/T TATTTTTTTG 3070 hom 120 het 47 0 40 7 T 1 2 184736 CASAVA_Build 12 19902424 1D AGACTTCGAG T/- TTAATCTTTC 3070 hom 99 het 38 0 33 7 T 3 2 184737 CASAVA_Build 12 19907386 1D CATGCTATTG A/- AACTTCTTTC 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 3 2 184738 CASAVA_Build 12 19908187 2I AAATGGATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 AT 5 6 184739 CASAVA_Build 12 19910001 1D AAAACAATCT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 42 18 18 7 A 9 8 184740 CASAVA_Build 12 19915666 1I TAAGGCAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2288 hom 18 6 9 3 T 9 10 184741 CASAVA_Build 12 19916597 1D CTATGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 2445 het 54 hom 15 1 6 8 A 11 10 184742 CASAVA_Build 12 19928127 1D TGAAATGGTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 9 8 184743 CASAVA_Build 12 19934489 4D GTATTTAAAC TATT/---- TATGATATAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 4 TATT 1 0 184744 CASAVA_Build 12 19940950 10D CTTTCTCCTC CTTCCTCCTT/---------- CTTCCTCCTT 2265 het 1034 hom 25 8 6 12 CTTCCTCCTT 2 1 184745 CASAVA_Build 12 19944071 1D CAGTTACCAG T/- TTTTTGTTTG 3070 hom 29 het 19 0 9 10 T 6 5 184746 CASAVA_Build 12 19946892 1D GTTTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1674 het 816 hom 14 5 5 4 T 15 14 184747 CASAVA_Build 12 19949684 4D TTAGCGTGAT AGAG/---- AGGTAAAAGC 3070 het 3070 ref 41 21 13 9 AG 3 1 184748 CASAVA_Build 12 19950286 1I TGGTAAATAT -/A AAAGCAGGCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 3 4 184749 CASAVA_Build 12 19954543 1D TGCCCACCTC G/- GGCCTCCCAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 3 2 184750 CASAVA_Build 12 19957103 1I ACACTTACCA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 7 8 184751 CASAVA_Build 12 19967380 1I ATAAACCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 25 1 22 4 T 15 16 184752 CASAVA_Build 12 19968482 6D GTGAGTAGAA GCACTT/------ GGTATAATCC 3070 het 3070 hom 31 15 15 3 GCACTT 1 0 184753 CASAVA_Build 12 19973541 1I GCCCTTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1258 hom 41 3 29 9 T 11 12 184754 CASAVA_Build 12 19988901 3I TGCTGAGGAA ---/GTG GTGGTAGTAG 3070 het 3070 hom 53 17 23 13 GTG 1 2 184755 CASAVA_Build 12 20008473 36D AAAACCTGGC TCCCAGCTCCTTTCTTGCACCTTCCCTGCAGCATCT/------------------------------------ CCAAATCCTC 3070 hom 138 het 43 0 46 4 TCCCAGCTCCTTTCTTGCACCTTCCCTGCAGCATCT 1 0 184756 CASAVA_Build 12 20011060 1D AATCTAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 T 13 12 184757 CASAVA_Build 12 20014345 1I AAAACGAGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 9 10 184758 CASAVA_Build 12 20014826 1D GTTTCATGGC A/- AAAAAAAAAA 1567 het 1567 ref 36 21 6 10 A 13 12 184759 CASAVA_Build 12 20029602 1D GCTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 36 1 25 10 T 14 13 184760 CASAVA_Build 12 20034417 1D TTGATGGTAA G/- TCTCTCTCAT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 G 1 0 184761 CASAVA_Build 12 20045820 1I TGCTGTTGGT -/G GGGATGTAAA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 G 3 4 184762 CASAVA_Build 12 20050725 1I TGAGCTAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 9 10 184763 CASAVA_Build 12 20053693 5I ATTTTGACAT -----/ATGAA ATGAAAAGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATGAA 1 2 184764 CASAVA_Build 12 20053996 2I GATGAGTGTT --/AC ACAGCTCTTA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AC 1 2 184765 CASAVA_Build 12 20058359 1D CCCAATTCTT G/- GGGGGGGCGG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 8 7 184766 CASAVA_Build 12 20059516 1D AAGTGTTTCA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 8 7 184767 CASAVA_Build 12 20061389 1D TTGAGGAGGT A/- AAAAAATAAC 3070 hom 98 het 36 0 33 4 A 7 6 184768 CASAVA_Build 12 20063326 3I54M1D ATTTCAAATT ---AAAAAAAATTGTTAACTTGTTTCCAAAGACACTGATCTGTGTTTGACTACAGCCA/AAAAAAAAAAATTGTTAACTTGTTTCCAAAGACACTGATCTGTGTTTGACTACAGCC- AAAATGCCAG 3070 hom 48 het 19 0 17 15 N/A 0 0 184769 CASAVA_Build 12 20063438 2D AAAAACATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 66 het 31 0 23 10 AC 6 5 184770 CASAVA_Build 12 20066163 1I TATTTTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 31 1 29 1 T 11 12 184771 CASAVA_Build 12 20067044 1I ACATATCTTT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 6 7 184772 CASAVA_Build 12 20069081 1I GTAAAATGTC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 8 9 184773 CASAVA_Build 12 20069794 1D AAAAAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 26 0 12 14 A 15 14 184774 CASAVA_Build 12 20070713 5D GTCTAGCTGT CTTAA/----- CTTTAAAACC 3070 hom 175 het 63 0 59 8 CTTAA 1 0 184775 CASAVA_Build 12 20073169 4D CTCAGAATCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 43 het 21 0 15 8 TTTA 5 4 184776 CASAVA_Build 12 20073737 6D ATTCACCAAA CCCAAC/------ TGGAAATCAG 3070 hom 108 het 41 0 37 8 CCCAAC 1 0 184777 CASAVA_Build 12 20074339 1D TGAGATTGCC T/- TTTAAATACC 3070 hom 105 het 37 0 36 3 T 4 3 184778 CASAVA_Build 12 20076231 1D AAACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 35 2 31 2 A 13 12 184779 CASAVA_Build 12 20080437 1D ATTTTTATCC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 7 6 184780 CASAVA_Build 12 20081344 1I TCTTCCAGAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 86 het 36 0 29 7 T 7 8 184781 CASAVA_Build 12 20090415 3D ATAATAATAA TAT/--- TAAAATAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TAT 1 0 184782 CASAVA_Build 12 20109847 3D ACCCATCTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 24 0 18 7 A 22 19 184783 CASAVA_Build 12 20121457 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 10 8 184784 CASAVA_Build 12 20122794 4I CACACATTAT ----/CTTA CTTAATTTTT 3070 hom 105 het 43 0 34 9 CTTA 1 2 184785 CASAVA_Build 12 20124907 5D CTTCTCTGCC TTTTA/----- TTTTAAACAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TTTTA 2 1 184786 CASAVA_Build 12 20125054 5D CTTTTGAGAT AAAGA/----- AGTCTTAACC 3070 het 3070 ref 34 17 15 5 AAAGA 1 0 184787 CASAVA_Build 12 20131455 4D GAGAAATGAG TCAC/---- TGAAGAAAAC 3070 hom 72 het 30 0 25 6 TCAC 1 0 184788 CASAVA_Build 12 20133720 1D TTGCAGTGAT C/- CGAGATCGCA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 C 2 1 184789 CASAVA_Build 12 20145225 1D AATCATAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 11 10 184790 CASAVA_Build 12 20154342 1D AGGAAATTTT A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 49 19 26 5 A 8 7 184791 CASAVA_Build 12 20171036 1D TTCTCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 11 10 184792 CASAVA_Build 12 20176197 1I TGGATTTAAA -/T TTATGAAATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 184793 CASAVA_Build 12 20211374 20I CAGTTACATT --------------------/TTCCCTTTAAGGAGAAAGTA ATCCCATTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TTCCCTTTAAGGAGAAAGTA 0 1 184794 CASAVA_Build 12 20306526 16I TGGTGGAATA ----------------/TGAGCTGGGTTTGTTG TGAGCTGGAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 TGAGCTGGGTTTGTTG 0 1 184795 CASAVA_Build 12 20318715 2D ATATGATATT TA/-- TATATATATA 2900 hom 18 het 10 0 7 3 TA 6 5 184796 CASAVA_Build 12 20333727 1I ATCATTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 10 11 184797 CASAVA_Build 12 20354621 1D GGGAGGCTGA G/- GCAAGAGGGA 3070 hom 36 het 15 0 13 3 G 2 1 184798 CASAVA_Build 12 20367956 2D TTTATTGCTT GA/-- GTGTTACATG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GA 1 0 184799 CASAVA_Build 12 20375598 3I TAATGACCAG ---/TGA TGATGAGCTT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TGA 2 3 184800 CASAVA_Build 12 20395281 11I ACATATTCCA -----------/AAAAACCAATG GTCACTGGCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AAAAACCAATG 0 1 184801 CASAVA_Build 12 20407332 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 24 0 22 3 A 11 10 184802 CASAVA_Build 12 20411272 29I CCTTTATAGT -----------------------------/TTCTCATATCTACTTATGTCATAATATTA ATATCTGCCT 3070 hom 102 het 37 0 35 6 TTCTCATATCTACTTATGTCATAATATTA 0 1 184803 CASAVA_Build 12 20434791 1D GGTCACTGAG A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 126 het 49 0 42 7 A 8 7 184804 CASAVA_Build 12 20439890 2I ATAGAATCAT --/TA TATATATATA 3070 het 483 hom 9 1 7 1 TA 8 9 184805 CASAVA_Build 12 20441220 1D ATATAGAAAA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 7 184806 CASAVA_Build 12 20455720 1D CTACTTACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 368 hom 48 1 43 4 T 10 9 184807 CASAVA_Build 12 20455874 4I TAGTCTTTAT ----/ATAC ATACATGGCT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 ATAC 1 2 184808 CASAVA_Build 12 20456150 2D TTAATTTTCT CA/-- GTGTTTATAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CA 1 0 184809 CASAVA_Build 12 20459220 1I TAATAGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 31 0 25 6 T 10 11 184810 CASAVA_Build 12 20485127 1I AGTAAAAGGA -/G GGAGAAAACT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 2 3 184811 CASAVA_Build 12 20487292 1I ATATAAATGT -/A TATATAAATA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 184812 CASAVA_Build 12 20492954 1I TATTTTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2849 hom 35 9 13 13 T 15 16 184813 CASAVA_Build 12 20498297 2I CCGTCATCTG --/TC TCTCTGTGAT 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 TC 2 3 184814 CASAVA_Build 12 20501284 8D AAACCACATA AAACAAAC/-------- AAAACCTGAC 3070 het 3070 ref 35 19 15 4 AAAC 2 0 184815 CASAVA_Build 12 20501996 1I GCTGTAAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 7 8 184816 CASAVA_Build 12 20502328 1D GATGCATTTA T/- TATTTATAAA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 2 1 184817 CASAVA_Build 12 20511516 2D GCTTTTTTTT TG/-- TTTGTATATC 3070 het 95 hom 34 1 28 5 TG 1 0 184818 CASAVA_Build 12 20516787 3I AATCTAAATG ---/ACC ACCACATTAT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 ACC 1 2 184819 CASAVA_Build 12 20529536 1D CACAGACATA T/- TGGATTGGAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 2 1 184820 CASAVA_Build 12 20531358 4I TGGCGTAGTG ----/TCTA TCTGTGAGTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TCTA 0 1 184821 CASAVA_Build 12 20533081 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1489 hom 33 6 14 13 A 16 17 184822 CASAVA_Build 12 20536615 1D TGTCTGCTAT A/- TGTATGAGTC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 0 184823 CASAVA_Build 12 20539074 1D ACAATTCCGC A/- AAAAAAAAAA 2810 het 1802 hom 31 9 10 12 A 15 14 184824 CASAVA_Build 12 20553015 1I AGTTGATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 807 hom 28 2 19 7 A 11 12 184825 CASAVA_Build 12 20554019 2I AAACCATTAC --/TA TATAATGCTG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TA 2 3 184826 CASAVA_Build 12 20558526 2D GAAAGGAAAA AT/-- GTCTTCTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 AT 1 0 184827 CASAVA_Build 12 20562768 1D TTCTGTCATT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 9 8 184828 CASAVA_Build 12 20563246 1D TCATAACTTT A/- GGGGTAGCAG 3070 het 3070 hom 46 15 27 6 A 1 0 184829 CASAVA_Build 12 20565337 1D TCCTGGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 35 4 24 7 T 14 13 184830 CASAVA_Build 12 20570923 1I CTTAAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 23 1 17 5 T 13 14 184831 CASAVA_Build 12 20576146 1D GAAATAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2917 hom 22 7 10 5 T 12 11 184832 CASAVA_Build 12 20576560 4I AAATCATGTA ----/ATTT ATTTATGCAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATTT 1 2 184833 CASAVA_Build 12 20580543 2D TTACTGTGAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 54 18 21 16 GT 9 8 184834 CASAVA_Build 12 20582051 2D CTTTGTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 28 2 18 10 A 18 16 184835 CASAVA_Build 12 20584106 1I AGTCTTATTA -/T TTCCATTTTG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 2 3 184836 CASAVA_Build 12 20598183 1D TACAAGAGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 T 10 9 184837 CASAVA_Build 12 20598232 1I TCTAAATGAA -/T TTTTTTTGTA 2238 het 2238 ref 29 14 6 9 T 7 8 184838 CASAVA_Build 12 20598302 1D TGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 2419 hom 33 het 16 0 10 6 T 10 9 184839 CASAVA_Build 12 20598575 1I43M1I AAAAAAAAAT -AAAAAAAATAAAAAAAGATTTAGATTTATTTAATTTTTTTTTT-/AAAAAAAAATAAAAAAAGATTTAGATTTATTTAATTTTTTTTTTA ATTTCCCAAG 3070 hom 47 het 22 0 25 3 N/A 0 0 184840 CASAVA_Build 12 20606721 1D GCCCAGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 19 1 12 6 T 11 10 184841 CASAVA_Build 12 20607646 1I CTCATTATTA -/C GTCTCTCAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 0 1 184842 CASAVA_Build 12 20610718 1D TAAAAGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 21 4 T 11 10 184843 CASAVA_Build 12 20623600 1D TTCTGTTCCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 367 hom 36 1 31 4 T 10 9 184844 CASAVA_Build 12 20626401 3D TATTATTATC GTT/--- GTTATTATTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 GTT 2 1 184845 CASAVA_Build 12 20629847 5D TCATTATTAA ATGAG/----- ATAATTTGTG 3070 hom 166 het 57 0 56 2 ATGAG 1 0 184846 CASAVA_Build 12 20631115 1D CAGATATGTA T/- TTTTTTTACC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 8 7 184847 CASAVA_Build 12 20631641 1D TTGGGATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 11 10 184848 CASAVA_Build 12 20632834 4D TGAGCATACT ACAA/---- ACAAACAGCT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 ACAA 2 1 184849 CASAVA_Build 12 20637749 1D CTTTTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 27 8 A 13 12 184850 CASAVA_Build 12 20638403 1D TAGTAGAGGA T/- AATGCTAACA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 0 184851 CASAVA_Build 12 20647466 12D ATGCTGTGTT TGCCTCCCAGGG/------------ TGCCTCCCAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 TGCCTCCCAGGG 1 0 184852 CASAVA_Build 12 20652583 1D ACTAAGGATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 10 9 184853 CASAVA_Build 12 20654141 4I AAACCGTGAA ----/ACTT ACTTATAGAA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 ACTT 1 2 184854 CASAVA_Build 12 20654325 1D ACAGACTGGG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 8 7 184855 CASAVA_Build 12 20655443 1I CCCTATAGAT -/A ACAAATATGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 1 2 184856 CASAVA_Build 12 20655620 4D ATTTTCTGTT TTTG/---- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 TTTG 1 0 184857 CASAVA_Build 12 20656100 1I AATGAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 11 12 184858 CASAVA_Build 12 20656451 2I TAAGTGGCTT --/TA TATATATATA 3070 het 382 hom 32 1 27 4 TA 6 7 184859 CASAVA_Build 12 20658361 4I TTCCAATACA ----/CAAT CAGTTTTGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CAAT 0 1 184860 CASAVA_Build 12 20660294 4D ACTCAAATTT TAGA/---- TAGATAGGTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TAGA 2 1 184861 CASAVA_Build 12 20662622 6D TGATCAAAAG AAGAAT/------ AAGAATGAGA 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 AAGAAT 2 1 184862 CASAVA_Build 12 20663367 5I ATGCATTTAT -----/ATATA ATATAATACA 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 ATATA 1 2 184863 CASAVA_Build 12 20665018 1D GAAATAATGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 54 20 24 10 A 10 9 184864 CASAVA_Build 12 20667489 1D GATAGAAGAC A/- AAAAATACTT 3070 het 3070 hom 37 8 29 1 A 6 5 184865 CASAVA_Build 12 20670585 1I TTGGCTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 A 11 12 184866 CASAVA_Build 12 20671616 2D CCTGCCCCTC TT/-- TTTGCTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 T 5 3 184867 CASAVA_Build 12 20676148 1D GTTGTGGTTT C/- CCCCTGCTGA 3070 hom 80 het 33 0 24 10 C 5 4 184868 CASAVA_Build 12 20677151 3D ATAATGAGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 2575 het 209 hom 22 3 9 11 T 19 16 184869 CASAVA_Build 12 20687826 1D TGGTTAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 40 0 32 9 T 10 9 184870 CASAVA_Build 12 20688201 1I TGTGATACTG -/C CCCCCCATCC 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 C 6 7 184871 CASAVA_Build 12 20689374 6D ACAGGCATGA GCCACT/------ GCACCTGGCC 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 GCCACT 1 0 184872 CASAVA_Build 12 20691633 1D GGATTTTTTA T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 57 het 38 0 19 20 T 8 7 184873 CASAVA_Build 12 20693302 2D AATTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1715 hom 19 6 10 3 T 12 10 184874 CASAVA_Build 12 20694155 9D GTAATTGATT ATATATGCC/--------- AATTTAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 ATATATGCC 1 0 184875 CASAVA_Build 12 20695025 1I GCAAGCATTT -/G GGGGGAAGAA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 G 5 6 184876 CASAVA_Build 12 20695969 4I GAATGAAAGA ----/TTTG TTTTTTTTAT 3070 het 2431 hom 27 6 13 8 TTTG 0 1 184877 CASAVA_Build 12 20706083 15D TACTGGGGCA GTGCCTAATGGAACT/--------------- GTGAGAAGAG 3070 het 3070 ref 29 19 9 2 GTGCCTAATGGAACT 1 0 184878 CASAVA_Build 12 20710743 1I TTTGTCTTTA -/T TTGCTAGACT 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 T 2 3 184879 CASAVA_Build 12 20722020 1D GTTCCTTGGC T/- TTTGATTTTG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 T 4 3 184880 CASAVA_Build 12 20731705 1D TTAACTGGTG T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 29 13 10 7 T 7 6 184881 CASAVA_Build 12 20733608 18D TTTAAATTAC ATGGTGTGAGGGATAATA/------------------ ATGGGTAAGT 3070 het 3070 ref 40 21 18 5 ATGGTGTGAGGGATAATA 1 0 184882 CASAVA_Build 12 20734760 1D AATGATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 12 11 184883 CASAVA_Build 12 20744290 1D GAAGAGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2138 hom 33 12 16 5 T 14 13 184884 CASAVA_Build 12 20747620 3D TTGTTGTTGT TGA/--- TATTACCTTA 3070 het 3070 hom 43 16 23 6 TGA 1 0 184885 CASAVA_Build 12 20748541 1I AAACAGAAGT -/C GTTTATTGTG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 C 0 1 184886 CASAVA_Build 12 20748930 4I GATTGCTTAC ----/AGAT AGATGTAGGG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 AGAT 1 2 184887 CASAVA_Build 12 20751252 1D TACAGTCAGA T/- TTTTGACCTC 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 T 5 4 184888 CASAVA_Build 12 20761301 4D AAATGACAGC TTTT/---- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 T 11 7 184889 CASAVA_Build 12 20765867 1D AGATCCAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 12 A 11 10 184890 CASAVA_Build 12 20770453 1D CTTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 T 12 11 184891 CASAVA_Build 12 20772457 1D CACAGTACCA T/- TTATTGAATA 2517 het 2517 ref 33 22 7 5 T 3 2 184892 CASAVA_Build 12 20775593 4D ACTTAAAAAG AACA/---- AACAAAGGGA 3070 het 3070 ref 33 19 13 4 AACA 2 1 184893 CASAVA_Build 12 20776069 1D TTGCATGACA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 T 9 8 184894 CASAVA_Build 12 20780468 1I GGCAGAGAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 9 10 184895 CASAVA_Build 12 20785939 3D AGTCTCAGTT ATA/--- ATATTTTCAT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 ATA 2 1 184896 CASAVA_Build 12 20786535 1I AAAAGTCATG -/T TTTTTTTTTT 2673 het 2673 ref 28 14 9 5 T 13 14 184897 CASAVA_Build 12 20787927 6D TGAAGCCTAA ATATAT/------ TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 26 15 11 1 AT 3 0 184898 CASAVA_Build 12 20788077 1I AATTGAAATG -/T TTTTTTCTGA 1935 het 1935 ref 24 14 7 3 T 6 7 184899 CASAVA_Build 12 20790558 1I AATAAAGGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 A 7 8 184900 CASAVA_Build 12 20790679 1I AGCATAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 A 11 12 184901 CASAVA_Build 12 20791015 2I TGGTATTGTC --/TT TTTTTTTTTT 869 het 869 ref 37 20 4 13 T 10 12 184902 CASAVA_Build 12 20791025 3I TTTTTTTTTT ---/TTC CAAAAACCAT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 TTC 0 1 184903 CASAVA_Build 12 20791216 3D AAAATGTGTT AGG/--- AGTAAGAATG 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 AGG 1 0 184904 CASAVA_Build 12 20791636 1I TCTCAAAAAA -/C AAATAGAGTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 C 0 1 184905 CASAVA_Build 12 20791812 1D AACATTTGAA T/- TTTTTTGGCT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 7 6 184906 CASAVA_Build 12 20795621 8I AGCATTGAAG --------/CAATGCTT CAATGGCTTA 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 CAATGCTT 0 1 184907 CASAVA_Build 12 20797759 1D GTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2237 hom 20 5 11 4 T 10 9 184908 CASAVA_Build 12 20803126 1D TAGAGGAAAA T/- AATGGAAATA 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 T 1 0 184909 CASAVA_Build 12 20819305 2D AATAAAAAAA AT/-- AAAAGACATT 3070 het 3070 hom 20 8 12 0 AT 1 0 184910 CASAVA_Build 12 20822997 1I TTTTGACTTC -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 T 6 7 184911 CASAVA_Build 12 20831549 2I CATTAAACCC --/TT TTTCCTGTAT 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 T 3 5 184912 CASAVA_Build 12 20832827 1D GTACCAGTGA T/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 7 6 184913 CASAVA_Build 12 20836860 1I AATCTCCTGA -/C CTTGTGATCC 3070 het 2523 hom 20 7 9 4 C 1 2 184914 CASAVA_Build 12 20839046 1D AGACAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 13 5 A 12 11 184915 CASAVA_Build 12 20839602 4D TGATCACTTG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 GA 11 9 184916 CASAVA_Build 12 20842036 1D CTTTTTTTAG A/- CAGAGTCTTG 3070 het 3070 ref 25 12 11 4 A 1 0 184917 CASAVA_Build 12 20843471 1D AAAAGAACTA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 8 7 184918 CASAVA_Build 12 20845029 1D ATTAAGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 12 11 184919 CASAVA_Build 12 20848991 1D TAAGAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 15 15 A 16 15 184920 CASAVA_Build 12 20856588 8D GTGGTACAGA AGGATGAG/-------- AGGATGAGAG 3070 het 3070 ref 38 26 12 3 AGGATGAG 2 1 184921 CASAVA_Build 12 20857066 1D GCCTTGCAAG T/- CGTTCAAAAA 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 T 1 0 184922 CASAVA_Build 12 20859098 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 956 hom 20 2 16 2 A 12 11 184923 CASAVA_Build 12 20859912 18D3M4D ACAATTAAAA ATATTCACTTGGTATCTGTAGTTTA/------------------TAG---- ATAATGGACC 3070 het 3070 hom 28 15 16 4 N/A 0 0 184924 CASAVA_Build 12 20861956 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1368 het 1368 ref 10 4 5 1 T 11 12 184925 CASAVA_Build 12 20862964 4D AACTGCCATC AATA/---- AATCAAGCGT 1420 het 1420 ref 12 7 4 3 AATA 1 0 184926 CASAVA_Build 12 20870432 1I AAGGTAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 9 10 184927 CASAVA_Build 12 20870756 1D ACTTGATCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 10 9 184928 CASAVA_Build 12 20870883 1I GTCATTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 A 10 11 184929 CASAVA_Build 12 20871775 1D TTCCAATTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 9 184930 CASAVA_Build 12 20872504 2D CTATTTTAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 33 0 21 13 A 17 15 184931 CASAVA_Build 12 20873165 9I GCCCCTCAGG ---------/TAATCAATA TAATTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 14 21 11 TAATCAATA 0 1 184932 CASAVA_Build 12 20877152 3I AACAAAAAAA ---/ATT ATTATCTTAG 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 ATT 1 2 184933 CASAVA_Build 12 20877937 4D TACATATGTA ATTT/---- ATTTATGTAA 2718 het 2718 ref 26 19 7 1 ATTT 2 1 184934 CASAVA_Build 12 20878187 2D CATAGTAAAC AT/-- ATATGTCTAT 2278 het 2278 ref 17 8 6 3 AT 3 2 184935 CASAVA_Build 12 20878369 4I TATATCAAAC ----/TATA TATGTATGTA 1895 hom 15 het 6 0 6 0 TA 1 3 184936 CASAVA_Build 12 20881401 1D ATTCACTCTC T/- TTTTTTTTCC 1627 het 1627 ref 40 30 4 6 T 9 8 184937 CASAVA_Build 12 20884592 5D TGCTTCTCAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 79 hom 21 2 9 12 T 19 14 184938 CASAVA_Build 12 20885710 6D CCTGCCATAA TTGCAC/------ TGTGGCAGAT 1489 het 1243 hom 29 7 6 18 TTGCAC 1 0 184939 CASAVA_Build 12 20886704 1I CAGCTACAAG -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 0 1 184940 CASAVA_Build 12 20888096 6I ATATTCTTAT ------/GTTTTA CTAAACTTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GTTTTA 0 1 184941 CASAVA_Build 12 20889510 2I10M4D CCCTGATCAA --CAATGAGTAGAAAC/ACCTTTTGTTTG---- ATCATCAGTC 3070 hom 102 het 34 0 35 4 N/A 0 0 184942 CASAVA_Build 12 20889828 5I AAAATTGAGA -----/TTTGT TTTGTGATGT 3070 hom 129 het 53 0 43 10 TTTGT 1 2 184943 CASAVA_Build 12 20890177 1D CTTCCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 30 2 26 2 T 13 12 184944 CASAVA_Build 12 20891024 1D CTTCTGACTG T/- TAAGTCCAGA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 2 1 184945 CASAVA_Build 12 20891421 1D TGGAAGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 A 10 9 184946 CASAVA_Build 12 20891743 2D GAATTATGAA AT/-- ATACATGTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 AT 2 1 184947 CASAVA_Build 12 20892332 1I CAAAGAACAC -/T TAAAACTCAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 1 2 184948 CASAVA_Build 12 20894234 1D CCCAACAGCC T/- TTTTTTTTTT 2793 het 1301 hom 33 9 10 14 T 17 16 184949 CASAVA_Build 12 20896011 1D102M1D GGCATTTAAT CCCATTTTGAGTTAGTTTTCACATATGGTGTAAGACAATGGGTCAACTTCATTCCTTTGTATGTGGATACCCAGTTTTCTCAACATCAATTGTTGAAGAGACTG/-CCATTTTGAGTTAGTTTTCACATATGGTGTAAGACAATGGGTCAACTTCATTCCTTTGTATGTGGATATCCAGTTTTCTCAACATCAATTGTTAAAGAGACT- GTTCTCTCCC 3070 hom 135 het 37 0 46 28 N/A 0 0 184950 CASAVA_Build 12 20899663 2D TGTTGAAAAA CT/-- CTGGTCCTAC 3070 het 3070 hom 49 13 30 7 CT 2 1 184951 CASAVA_Build 12 20899860 1D GTTTAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 T 13 12 184952 CASAVA_Build 12 20901166 1D ACTGTAATTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 9 8 184953 CASAVA_Build 12 20905549 1I TATATGCAGC -/T TTTTGTCCAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 4 5 184954 CASAVA_Build 12 20905948 1D GAAGTGGAGG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 A 8 7 184955 CASAVA_Build 12 20906152 1D TAAAAAAAAA T/- ATTTTGTAAC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 1 0 184956 CASAVA_Build 12 20910665 3D GACTCGAAAC ATG/--- ATTCAAGAAA 3070 hom 144 het 52 0 48 4 ATG 1 0 184957 CASAVA_Build 12 20910933 1I CCTATTCTGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 A 8 9 184958 CASAVA_Build 12 20912870 5D ACAAAGAGAT AAAAG/----- AAAAGACCCC 1884 hom 12 het 9 0 6 4 AAAAG 2 1 184959 CASAVA_Build 12 20913614 3D ATTATTATAA TAT/--- TGGAATAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 2 TAT 1 0 184960 CASAVA_Build 12 20921451 1I TTATGAACTG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 7 8 184961 CASAVA_Build 12 20922337 23D TAGGTGAATT TAATTCCATAGGTGAAATTCACC/----------------------- TAATTCTATA 3070 hom 84 het 27 0 29 3 TAATTCCATAGGTGAAATTCACC 1 0 184962 CASAVA_Build 12 20923108 1I AATTCTAAAG -/C CCTGGGCAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 2 3 184963 CASAVA_Build 12 20924308 3D26M6D CTTAATAATT ATCATATCTTTACAAAACAAATAAAATCTTTAAGC/---ATATCTTTACAAAACAAATAAAATCT------ TTAAACATTA 3070 hom 60 het 19 0 21 2 N/A 0 0 184964 CASAVA_Build 12 20924473 1I TATGCAGAGA -/T TTTTTTATCC 3070 het 1825 hom 17 5 9 3 T 6 7 184965 CASAVA_Build 12 20926772 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 9 10 184966 CASAVA_Build 12 20928050 4D AGGCACACAC TGAT/---- TGACAGTTGC 3070 hom 117 het 44 0 40 5 TGAT 1 0 184967 CASAVA_Build 12 20929717 6D CACTAGAAAG AAAAAT/------ AAATCAGAGT 3070 het 3070 hom 45 19 27 1 AAAAAT 1 0 184968 CASAVA_Build 12 20934117 2D ATTTTCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 654 hom 34 4 17 13 T 13 11 184969 CASAVA_Build 12 20934431 1D CATTTCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 10 9 184970 CASAVA_Build 12 20935515 1D TTGGCTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 T 11 10 184971 CASAVA_Build 12 20940413 2I3M5D ACATTCAGCT --TTCAAATT/CCTCC----- TCAGGTATTC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 N/A 0 0 184972 CASAVA_Build 12 20957086 1D CCATGTTGAT C/- AGTCTTGTGT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 1 0 184973 CASAVA_Build 12 20960796 1I TGATGCCTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 8 9 184974 CASAVA_Build 12 20966859 4D CAGATATATG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 hom 40 15 20 6 TCTA 3 2 184975 CASAVA_Build 12 20971216 5D TTAATCTATC TTGAG/----- TTAATTTTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTGAG 1 0 184976 CASAVA_Build 12 20996223 4I GTAGAGGGGC ----/CTGA CTGTTAGAAG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 CTGA 0 1 184977 CASAVA_Build 12 21001960 1I TCAAAAAGAC -/A AAAAAATGGG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 6 7 184978 CASAVA_Build 12 21002780 4D GATAGGTTGT TAGA/---- TAGACTAATA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TAGA 2 1 184979 CASAVA_Build 12 21004694 1D GTTTCATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 12 11 184980 CASAVA_Build 12 21008424 1D AGGAAGAGAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 8 7 184981 CASAVA_Build 12 21013812 2D CATATATAAC TA/-- TATATATATA 2655 hom 15 het 8 0 6 2 TA 8 7 184982 CASAVA_Build 12 21015264 4D CTTAGATTGT TTAA/---- TTGTTTTAGC 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 TTAA 1 0 184983 CASAVA_Build 12 21015822 1D AGATTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 28 0 22 6 T 13 12 184984 CASAVA_Build 12 21028522 1I TATCTAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 10 11 184985 CASAVA_Build 12 21033513 2D ATATTTTAAG TT/-- TTAGGGTACA 2216 het 731 hom 7 2 5 0 T 4 2 184986 CASAVA_Build 12 21042461 1D CTTTTTGTGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 8 7 184987 CASAVA_Build 12 21048111 4I ATTTGATCCT ----/AATA AATCAAATTA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AATA 0 1 184988 CASAVA_Build 12 21048239 1D GCTAATACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 26 1 23 3 A 11 10 184989 CASAVA_Build 12 21055710 1I CATTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 15 15 T 13 14 184990 CASAVA_Build 12 21060026 1I TGCATATGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 9 10 184991 CASAVA_Build 12 21060715 1D ATGCTTAACT A/- AATAATATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 2 184992 CASAVA_Build 12 21064312 1I TACTGGGGGG -/A GAAAGGCTTT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 A 0 1 184993 CASAVA_Build 12 21070467 2D AGAAAAACTC TT/-- ATAGGTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 0 184994 CASAVA_Build 12 21075375 1I CATTTTATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 9 10 184995 CASAVA_Build 12 21081310 1D TTTCAAAAAA C/- AGATTGTATT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 C 1 0 184996 CASAVA_Build 12 21099581 11D AAATTTGGGA GTGAAATGAGG/----------- GTATATGAGG 3070 hom 120 het 39 0 40 3 GTGAAATGAGG 1 0 184997 CASAVA_Build 12 21103469 10I CCAGGAGAGT ----------/TTTTCCTAGG TTTTCCCCTA 3070 hom 91 het 36 0 31 6 TTTTCCTAGG 0 1 184998 CASAVA_Build 12 21107244 1I AAAATCTATA -/T TTTTCTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 4 5 184999 CASAVA_Build 12 21123605 1D TCACTACGAG A/- ACAGTGTGGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 1 185000 CASAVA_Build 12 21132991 1I ATAAGGTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 9 185001 CASAVA_Build 12 21139848 1D TCTTGTAGGG A/- AAATATAGTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 3 185002 CASAVA_Build 12 21143026 2D CCTGCCATCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 36 1 21 14 T 14 12 185003 CASAVA_Build 12 21145325 1I TGTGGTTGGA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 8 185004 CASAVA_Build 12 21169714 4I TTTAATACAT ----/TAAG TATCTTAATT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TAAG 0 1 185005 CASAVA_Build 12 21172496 11D AGAAGGCTAA AAAATAAAAAG/----------- AAAATAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 7 AAAATAAAAAG 2 1 185006 CASAVA_Build 12 21175889 1I TGGCAAACAT -/A AAAAAACAGG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 6 7 185007 CASAVA_Build 12 21179416 1D GTTATAATTT C/- TGTTCTTTTC 3070 het 2329 hom 13 5 8 0 C 1 0 185008 CASAVA_Build 12 21182975 1I ACAACCAAGA -/G ATGGAGAATG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 0 1 185009 CASAVA_Build 12 21185463 4D27M4D TGATTCTATA TTACTTACTTGTTTCAAATTTCTCTCCACAAATTT/----TTACTTGTTTCAAATTTCTCTCCACAA---- ATTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 31 18 13 4 N/A 0 0 185010 CASAVA_Build 12 21186272 1I AAATTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 27 2 19 6 A 11 12 185011 CASAVA_Build 12 21188226 1D GAATTCTTTT C/- TACCCCTTCT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 C 1 0 185012 CASAVA_Build 12 21199301 1I TCAACCTGCA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 86 het 32 0 29 3 T 6 7 185013 CASAVA_Build 12 21208144 1D CAAATCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 21 22 10 A 12 11 185014 CASAVA_Build 12 21212185 1I GCGCAGGTAA -/T TTTTTTTTTT 2427 het 898 hom 9 3 5 1 T 11 12 185015 CASAVA_Build 12 21212414 5D AGGTTCATCC ATATT/----- GTAGCACATG 3070 het 3070 ref 38 21 15 4 ATATT 1 0 185016 CASAVA_Build 12 21217828 1I TTTATAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 10 11 185017 CASAVA_Build 12 21218920 1I AGTAAGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1683 hom 34 9 10 15 A 14 15 185018 CASAVA_Build 12 21222657 6D GAATATAAAT TACTTG/------ TACTTGTAAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 5 TACTTG 2 1 185019 CASAVA_Build 12 21233657 1D TTCAAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 T 12 11 185020 CASAVA_Build 12 21235463 1I TCCTTCAATT -/A ATTAACACAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 2 185021 CASAVA_Build 12 21235581 1D ATTCTTTATG A/- TTTTAGTGTA 2229 het 2229 ref 26 16 5 5 A 1 0 185022 CASAVA_Build 12 21249939 1D23M3I TTCTTCATAT AAAGAAAAATTCTTTATCTACTTT---/-AAGAAAAATTCTTTATCTACTTTTTC TTTTCCCTCT 3070 het 3070 ref 43 26 20 6 N/A 0 0 185023 CASAVA_Build 12 21259867 3D TTGTTTTTGA TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 TGT 4 3 185024 CASAVA_Build 12 21264043 1D ATTGCTGCAA C/- CCTCCGCCTC 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 C 3 2 185025 CASAVA_Build 12 21275764 6D CTCAAGTGAG AAAAAT/------ AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 AAAAAT 1 0 185026 CASAVA_Build 12 21280038 3I CTTGGCTGTC ---/ATT ATTATTATTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 ATT 3 4 185027 CASAVA_Build 12 21288813 3I CACCCAAAAT ---/TAG TAGAAGAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TAG 1 2 185028 CASAVA_Build 12 21302853 1I AGCATGGAAT -/A GCTTTTCATT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 0 1 185029 CASAVA_Build 12 21302962 1I20M1I TATTTTATTG -TTTTTGTGGCAATTGTGAAT-/TTTTTTGTGGCAATTGTGAATG GGGAGTTCAT 3070 hom 69 het 25 0 23 3 N/A 0 0 185030 CASAVA_Build 12 21314222 4D ATTGTTGTTA TAAC/---- TAACTAGTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TAAC 2 1 185031 CASAVA_Build 12 21314920 4D TGGTAATATA TAAT/---- TAATTGTCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TAAT 2 1 185032 CASAVA_Build 12 21315660 4I TTCTTATTTG ----/AGAT AGATAGGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AGAT 1 2 185033 CASAVA_Build 12 21321696 2I TGAGAGACTC --/TT TCTGTTTGAG 3070 hom 116 het 45 0 37 8 T 1 3 185034 CASAVA_Build 12 21324169 1D AAATGTAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 10 9 185035 CASAVA_Build 12 21333955 4D AGCCCAGGGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 34 0 29 7 A 14 10 185036 CASAVA_Build 12 21360754 1I CTGCTGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 519 hom 35 2 25 8 T 13 14 185037 CASAVA_Build 12 21362210 1I CTGTACTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 9 10 185038 CASAVA_Build 12 21366874 1I TGTCAGACTT -/A AAAGTCTGTG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 3 4 185039 CASAVA_Build 12 21373957 1D TAACTCTTAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 9 8 185040 CASAVA_Build 12 21375464 1I CTTCTCTAGA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 8 9 185041 CASAVA_Build 12 21375824 1D TCGCTGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 108 hom 39 2 27 10 A 11 10 185042 CASAVA_Build 12 21379037 1I CCTGGAACGC -/T TTTAATACAG 3070 hom 116 het 42 0 39 3 T 3 4 185043 CASAVA_Build 12 21385659 1D AATAAGAATA T/- AGAACACTTT 3070 het 3070 ref 42 27 14 1 T 1 0 185044 CASAVA_Build 12 21400744 3D AGTCATGATC ATA/--- ATATTTGAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 ATA 2 1 185045 CASAVA_Build 12 21402958 1D TTGGAGATAC T/- TTTAAAATAT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 T 4 3 185046 CASAVA_Build 12 21412672 1D ACCAGTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 11 10 185047 CASAVA_Build 12 21432410 1D GTTAATGCTG A/- AATGAGTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 A 3 2 185048 CASAVA_Build 12 21437234 1I TCCTATTATC -/A AATAATTCAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 3 185049 CASAVA_Build 12 21449280 1I TTTTAATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 24 1 18 5 T 12 13 185050 CASAVA_Build 12 21450549 3I TAAGTAGTTT ---/GAA GAAGGACAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GAA 1 2 185051 CASAVA_Build 12 21452022 2D AAAAATAAAT GA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1030 hom 28 7 15 6 GA 1 0 185052 CASAVA_Build 12 21455889 2D ATCAGTATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 32 2 14 18 T 13 11 185053 CASAVA_Build 12 21458291 2I CTAAGAAAAC --/TG TAACACTTTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 TG 0 1 185054 CASAVA_Build 12 21460686 1D ATTAGGAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 T 10 9 185055 CASAVA_Build 12 21469423 2D AAAGTTTAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 18 1 10 9 A 16 14 185056 CASAVA_Build 12 21506662 1D TGAAGCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 30 2 20 8 A 13 12 185057 CASAVA_Build 12 21507894 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 23 1 13 9 A 17 16 185058 CASAVA_Build 12 21508926 1I AAGGTCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 670 hom 38 2 27 9 T 12 13 185059 CASAVA_Build 12 21529532 1D CCCAGAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 212 hom 27 2 22 3 A 13 12 185060 CASAVA_Build 12 21531308 4I GAAGCCAAAT ----/AAAC AAACATACAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AAAC 1 2 185061 CASAVA_Build 12 21533595 1I CAATCAGTAA -/T TATCAGTAGC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 1 2 185062 CASAVA_Build 12 21548077 1I TCACCGCCCC -/A AAAAAAGACA 3070 hom 129 het 49 0 38 11 A 6 7 185063 CASAVA_Build 12 21548858 1D AGTTACTGAA T/- TACCTCTAGG 3070 het 3070 hom 58 17 32 9 T 2 1 185064 CASAVA_Build 12 21550239 4I2M1I CTTTAAAGCT ----TA-/CGTCTAC CACCTCGTCT 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 N/A 0 0 185065 CASAVA_Build 12 21559194 1D CTGGAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 24 1 14 9 A 15 14 185066 CASAVA_Build 12 21565467 3I TTTTCTCCTC ---/CTT CTCCCTATCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CTT 0 1 185067 CASAVA_Build 12 21566068 3D TGTTCAACAT CTA/--- CTGCTTGCTC 3070 hom 141 het 53 0 48 6 CTA 1 0 185068 CASAVA_Build 12 21570129 3I GTGTGTCTCA ---/TAG TAGGCACTCA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TAG 1 2 185069 CASAVA_Build 12 21579468 2I GTTACCAATC --/AA GAGTATCATT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 0 2 185070 CASAVA_Build 12 21580202 4I TCTATTTTTT ----/CTAA CTATTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 CTAA 0 1 185071 CASAVA_Build 12 21583434 1D TATAGCTTTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 A 9 8 185072 CASAVA_Build 12 21587805 1I TTACTTTAAG -/T TCTGGGACAC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 1 2 185073 CASAVA_Build 12 21592302 1D TTCCTTTGTT A/- ATGAGTAGAA 3070 het 3070 hom 46 21 20 6 A 2 1 185074 CASAVA_Build 12 21595720 1I GGATTAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 10 11 185075 CASAVA_Build 12 21596627 2D CAATGCACTC TG/-- AGAGTTTAGA 3070 het 3070 ref 35 22 13 0 TG 1 0 185076 CASAVA_Build 12 21598769 1I TAACATTTTT -/A AAAACACAAT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 4 5 185077 CASAVA_Build 12 21600933 10D TTAAATACTA AAGCCAAGAG/---------- GCTATTATTC 3070 het 3070 ref 32 18 13 5 AAGCCAAGAG 1 0 185078 CASAVA_Build 12 21603996 15D TGTTTTGTTG ACATTCTTTGAAATT/--------------- ACATTCTTTG 3070 het 3070 ref 38 19 15 10 ACATTCTTTGAAATT 2 1 185079 CASAVA_Build 12 21605716 1D AAAATAAATG T/- ACTATGTGGA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 1 0 185080 CASAVA_Build 12 21606845 8D AACATAGAAG GGGAGAAT/-------- GGGATAAGCT 3070 het 3070 ref 25 14 7 9 GGGAGAAT 1 0 185081 CASAVA_Build 12 21608637 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 11 10 185082 CASAVA_Build 12 21610015 6I AAGTAGAAGA ------/CAATGT CAATGTTACC 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 CAATGT 1 2 185083 CASAVA_Build 12 21611733 1D TTCTATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 21 11 22 T 17 16 185084 CASAVA_Build 12 21626278 1I ACAGAATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 9 10 185085 CASAVA_Build 12 21628573 34D CATCCCATGT GAGTGCTCACCAATGGGTGACCTCAGCAGAAGAG/---------------------------------- GATTTTAATA 3070 het 3070 ref 26 21 13 3 GAGTGCTCACCAATGGGTGACCTCAGCAGAAGAG 1 0 185086 CASAVA_Build 12 21637503 3I AATAGAGAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AAC 3 4 185087 CASAVA_Build 12 21639845 1D AATGGCCACC A/- AAAGTGAGTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 4 3 185088 CASAVA_Build 12 21643272 2I CTCTCTCTCG --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 60 het 33 0 21 12 CT 8 9 185089 CASAVA_Build 12 21661335 4I ATTTCTTGGC ----/TCCT TCCTTCCTTC 3070 hom 39 het 16 0 12 4 TCCT 3 4 185090 CASAVA_Build 12 21664788 1D AAGTAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 36 10 A 11 10 185091 CASAVA_Build 12 21670446 1I CACATTTCTT -/G GGAGGCTTTG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 2 3 185092 CASAVA_Build 12 21672561 17D TAGGCTTTTC TACATTTATTAGAATGT/----------------- TGCTTTTACC 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TACATTTATTAGAATGT 1 0 185093 CASAVA_Build 12 21672972 4D TGGGAAACAG AATT/---- ATTTACTACA 3070 hom 108 het 38 0 37 6 AATT 1 0 185094 CASAVA_Build 12 21673191 1D CAGGAACTTT G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 5 4 185095 CASAVA_Build 12 21673990 4I ATTACCCCAC ----/AATG AATGGAGTGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AATG 1 2 185096 CASAVA_Build 12 21674176 2D ATCTCTCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 22 1 15 6 T 13 11 185097 CASAVA_Build 12 21676368 2D CTGTTGGAAG AC/-- ACTGATGCCA 3070 hom 138 het 51 0 47 5 AC 2 1 185098 CASAVA_Build 12 21682103 1I CAAATTCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 10 185099 CASAVA_Build 12 21682678 1D GCCACTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 572 hom 24 4 16 4 A 15 14 185100 CASAVA_Build 12 21684358 1I TTTTATTATT -/A TTTTTTTGCC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 0 1 185101 CASAVA_Build 12 21684550 2D ACGAAGCACT AA/-- AAAAAAGTGT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 8 6 185102 CASAVA_Build 12 21691992 6D CCACCTCCCG GGTTCA/------ AGTGATTTTC 3070 hom 51 het 19 0 17 3 GGTTCA 1 0 185103 CASAVA_Build 12 21692240 1D GAAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 71 het 29 0 23 6 A 10 9 185104 CASAVA_Build 12 21692737 1I GGGTATTAAT -/G GGGGGGGAGG 3070 hom 44 het 19 0 14 5 G 7 8 185105 CASAVA_Build 12 21693834 1D41M1I AAATGGCTTT AAAAAAACCTATTTATTTTTACTCTACTCCTGTGACAGACTT-/-AAAAAACCTATTTATTTTTACTCTACTCCTGTGACAGACTTA AAAAAAAGGC 3070 hom 72 het 27 0 24 12 N/A 0 0 185106 CASAVA_Build 12 21696310 3I ATTTATGATT ---/ACA ACATCATAGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ACA 1 2 185107 CASAVA_Build 12 21701217 1D CGGTGCGCAC A/- AACCATCTTT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 A 3 2 185108 CASAVA_Build 12 21749810 7I TCAACCCCTG -------/CACAACA CACACACTCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CACAACA 0 1 185109 CASAVA_Build 12 21781613 4D AGAATGATAG TGTT/---- TGTTTGAGAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 TGTT 2 1 185110 CASAVA_Build 12 21836731 1I TTTTGAAGGG -/T TTTTTTGTGT 1471 hom 7 het 3 0 3 0 T 6 7 185111 CASAVA_Build 12 21866992 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1007 het 346 hom 13 3 3 8 A 19 18 185112 CASAVA_Build 12 21881981 1D GCAAAATTGA T/- TTTCTCCATT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 4 3 185113 CASAVA_Build 12 21889339 1I CAAGGCTTGC -/T TTAAAAGCAG 3070 hom 74 het 33 0 25 8 T 2 3 185114 CASAVA_Build 12 21891889 8D ACAAATGGCA TTCTAATT/-------- TTCTTATCCT 3070 hom 135 het 45 0 46 3 TTCTAATT 1 0 185115 CASAVA_Build 12 21896104 1D CCAAAGATGG C/- ATTAGAATTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 C 1 0 185116 CASAVA_Build 12 21900715 1I AAAAATAATA -/T TTTTTGATAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 5 6 185117 CASAVA_Build 12 21904293 1I CTTACACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 10 11 185118 CASAVA_Build 12 21905428 1I ACTACTTCCC -/A CCCCCTTTTT 3070 het 1183 hom 31 6 20 5 A 0 1 185119 CASAVA_Build 12 21907484 46D ACATGTATAA AGTTTGGTTTTCTACACTGAAGAAGTGTTTTATGGTCTAAACAACT/---------------------------------------------- AATTGAAATT 3070 hom 72 het 24 0 25 1 AGTTTGGTTTTCTACACTGAAGAAGTGTTTTATGGTCTAAACAACT 1 0 185120 CASAVA_Build 12 21910260 1D GTGCTAGATG A/- AAAAAAAAAA 2678 het 2678 ref 47 37 6 5 A 12 11 185121 CASAVA_Build 12 21910426 2D GAAGGGGCTC AT/-- AATCCATTTT 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 AT 1 0 185122 CASAVA_Build 12 21914981 3D CTTTCAAACT CTA/--- CTATGTTATT 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 CTA 2 1 185123 CASAVA_Build 12 21918339 1I TATAAAATAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 8 9 185124 CASAVA_Build 12 21922213 1D CAATGGTGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 10 9 185125 CASAVA_Build 12 21922967 1D TCTGATTTGG T/- GCTACATTGA 3070 het 3070 ref 57 28 19 10 T 1 0 185126 CASAVA_Build 12 21927927 2I AAGATCTAGA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 11 185127 CASAVA_Build 12 21932312 12D AATTGCTGAG GACAGAGGGGTT/------------ TCCAGGACAT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 GACAGAGGGGTT 1 0 185128 CASAVA_Build 12 21933123 1D GGGAAAACTT A/- ACTTGGCACA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 2 1 185129 CASAVA_Build 12 21933543 3D GTTATGAAAC ATT/--- ATTTTATTCC 3070 het 3070 ref 43 22 17 7 ATT 2 1 185130 CASAVA_Build 12 21937396 3I AAATGGTCTT ---/ATC ATATCACATC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATC 0 1 185131 CASAVA_Build 12 21938741 102D AAAGAATGTT CTGTTGTTTTGGGGTCCTCACTGTGGATCTTTACTAAAACTGTCAGCATTAATATCCAAAGAAGACTTACTTCCATTTTTTTTTTTTTGAGACACGGTATCA/------------------------------------------------------------------------------------------------------ CTTCATTGCC 2056 het 2056 ref 28 22 5 21 CTGTTGTTTTGGGGTCCTCACTGTGGATCTTTACTAAAACTGTCAGCATTAATATCCAAAGAAGACTTACTTCCATTTTTTTTTTTTTGAGACACGGTATCA 1 0 185132 CASAVA_Build 12 21942065 1I TATTTGACTC -/A AATACCAACA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 2 3 185133 CASAVA_Build 12 21956097 13I ATCTGGTTCA -------------/TTTCCATTATAAT TGAACACTAA 3070 hom 172 het 58 0 58 2 TTTCCATTATAAT 0 1 185134 CASAVA_Build 12 21962232 1D TGGATTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 35 2 29 4 A 11 10 185135 CASAVA_Build 12 21967285 2D ATCCACTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 2612 het 2612 ref 37 18 8 11 A 14 12 185136 CASAVA_Build 12 21982291 2I AGGAAAAAAC --/AG AGTGTTATAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AG 1 2 185137 CASAVA_Build 12 21994062 1I AAGCTGCACC -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 A 7 8 185138 CASAVA_Build 12 21999261 1D AATTTGTACA T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 7 6 185139 CASAVA_Build 12 22000402 15D AGACTCTCTA TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 20 0 12 9 T 27 12 185140 CASAVA_Build 12 22001348 16D TGCAAGAACT TCTAATGAACGTACAG/---------------- TGCAGTGGTG 3070 hom 87 het 29 0 30 2 TCTAATGAACGTACAG 1 0 185141 CASAVA_Build 12 22007977 28D ACCAAGTTAG AAAACACTCTTCAGGATGTTATTCAGGA/---------------------------- GAACTTCCCC 3070 het 96 hom 10 1 9 3 AAAACACTCTTCAGGATGTTATTCAGGA 1 0 185142 CASAVA_Build 12 22019277 1I AAAAAGCATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 9 10 185143 CASAVA_Build 12 22019360 1D TGTTTCCCTG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 7 185144 CASAVA_Build 12 22031207 1D TTGTTTGTCA C/- CTTTACTCTG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 C 2 1 185145 CASAVA_Build 12 22034052 16I CTTTCCCTAA ----------------/CTTCATTTAAAACATG CTTTACTGAC 3070 hom 132 het 50 0 44 7 CTTCATTTAAAACATG 0 1 185146 CASAVA_Build 12 22050486 1I TGCTCTTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 9 10 185147 CASAVA_Build 12 22053905 1I CTGTGCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 631 hom 30 2 15 13 A 15 16 185148 CASAVA_Build 12 22056309 1I CAACAACAAC -/A AAAAACATCC 3070 hom 78 het 31 0 25 6 A 5 6 185149 CASAVA_Build 12 22056436 2D TGTATGTATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 90 het 38 0 31 8 TA 6 5 185150 CASAVA_Build 12 22064600 1I AAACTAGCAG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 7 8 185151 CASAVA_Build 12 22069149 1I CATCATCTAA -/T TTTTTTAGGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 7 185152 CASAVA_Build 12 22071323 1D ATTTTCTGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 37 0 31 7 A 10 9 185153 CASAVA_Build 12 22079770 3I AGGATTAAAT ---/AAA AATTCTTGGC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 2 5 185154 CASAVA_Build 12 22086619 8D GGCTTCTGTT TTGCATTC/-------- TGTCTCAGTC 3070 het 3070 ref 47 21 19 10 TTGCATTC 1 0 185155 CASAVA_Build 12 22089097 1D TTAAAGTCTC T/- TTTTTTTTTT 1382 het 1382 ref 33 24 3 6 T 13 12 185156 CASAVA_Build 12 22096075 4I AATAGCTAAC ----/ATTT ATTAAATGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATTT 0 1 185157 CASAVA_Build 12 22115870 1D GCTTCTGAGC A/- CATAGTTAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 1 0 185158 CASAVA_Build 12 22117535 1I AGTTTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1324 hom 27 4 19 4 A 10 11 185159 CASAVA_Build 12 22137473 1I ATTTATGTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 109 het 45 0 37 8 T 8 9 185160 CASAVA_Build 12 22141609 4I TTTGCTGAAG ----/TTGT TTATCAGCTG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TTGT 0 1 185161 CASAVA_Build 12 22142103 1D TTTGGTGTGC T/- GCTAGAATCG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 0 185162 CASAVA_Build 12 22148185 1D TTTTGCACTG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 A 8 7 185163 CASAVA_Build 12 22151637 1D TAGGTCACTG C/- TGCAGCATCC 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 C 1 0 185164 CASAVA_Build 12 22152622 1I CAATAACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 11 12 185165 CASAVA_Build 12 22154308 3D ACCAAATACC GTA/--- ACCTGTTCCC 3070 het 3070 hom 46 19 21 7 GTA 1 0 185166 CASAVA_Build 12 22155241 4D ATTTGTAAAA AAAT/---- AAAATAAAAT 394 het 394 ref 33 16 4 14 AAAT 1 0 185167 CASAVA_Build 12 22155448 1D CGCCTTGCCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 8 7 185168 CASAVA_Build 12 22156893 1I GCTTTCTTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 A 8 9 185169 CASAVA_Build 12 22159586 1D CATTCATACT C/- CCTCAGCTCC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 C 3 2 185170 CASAVA_Build 12 22161417 1D CCTATTAGTG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 8 7 185171 CASAVA_Build 12 22166342 1I TTCCCTAACG -/C CCCCCCCCAT 2600 het 2600 ref 28 14 8 6 C 8 9 185172 CASAVA_Build 12 22167322 2I ATTGTTAAGA --/TT TTTTTTTTTT 2285 hom 35 het 16 0 12 4 T 12 14 185173 CASAVA_Build 12 22199266 2D ATATATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 42 0 31 11 AC 8 7 185174 CASAVA_Build 12 22202412 1D AACAAATAAT A/- ACTTCCTTAC 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 A 2 1 185175 CASAVA_Build 12 22207869 2I TGTCAAAAAC --/AA AAAACAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 4 6 185176 CASAVA_Build 12 22217144 2D ACAAACAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AC 9 8 185177 CASAVA_Build 12 22222030 1D AAATGGTTAG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 7 6 185178 CASAVA_Build 12 22223755 3D TTGTATACAG ATT/--- ATATTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 13 3 ATT 1 0 185179 CASAVA_Build 12 22248382 1I TCTCCTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 A 10 11 185180 CASAVA_Build 12 22258727 1D AGTTAAAAAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 39 17 16 7 A 8 7 185181 CASAVA_Build 12 22278131 1I ATTGGCAGAT -/A TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 0 1 185182 CASAVA_Build 12 22281327 1D AGAGATGGGG C/- CTCACTCTGT 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 C 2 1 185183 CASAVA_Build 12 22282365 1D CTTGAGAACT C/- CCCCCCCAAC 3070 het 3070 ref 44 23 12 9 C 8 7 185184 CASAVA_Build 12 22287624 4I TACATACTGC ----/CTTT CTCACTTCAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 CTTT 0 1 185185 CASAVA_Build 12 22287791 2I GTATTTAACC --/AA AAGTTTCCAG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 2 4 185186 CASAVA_Build 12 22298044 1I ACCAAGTGAG -/A AAAAAAAAAT 949 het 949 ref 49 40 3 6 A 9 10 185187 CASAVA_Build 12 22311538 1D ATTTTCATTT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 37 23 13 2 A 8 7 185188 CASAVA_Build 12 22321568 2D AATAGTGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 1171 het 682 hom 17 8 3 6 T 20 18 185189 CASAVA_Build 12 22336326 1D ATTTTCAAGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 29 15 11 6 A 9 8 185190 CASAVA_Build 12 22394044 58D GCAGAAGACA TGATCAATGGTGTATAAAGAAAGAATATATTTCCTTCCATATGGTCCATTTTTTTAGG/---------------------------------------------------------- TGATCCAAGG 3070 het 3070 ref 53 33 23 6 TGATCAATGGTGTATAAAGAAAGAATATATTTCCTTCCATATGGTCCATTTTTTTAGG 1 0 185191 CASAVA_Build 12 22401980 1D GTATTTGACA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 T 7 6 185192 CASAVA_Build 12 22429635 14I TCCATGCTCC --------------/TAACCAGCAGGCTA TATTACATAT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 TAACCAGCAGGCTA 0 1 185193 CASAVA_Build 12 22430323 1D TTCCAAAAAT A/- AATGTAAACT 3070 het 3070 hom 35 9 22 4 A 3 2 185194 CASAVA_Build 12 22477554 1I TACACACACA -/C CATGGGATAC 2760 hom 17 het 7 0 6 1 C 1 2 185195 CASAVA_Build 12 22498771 2D AGACTTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 1358 het 1030 hom 36 9 3 25 T 16 14 185196 CASAVA_Build 12 22503559 1D TTCTACCTAC A/- AAAAAAAAAA 2534 het 2534 ref 23 14 6 3 A 12 11 185197 CASAVA_Build 12 22523066 1I AAAAAAAGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2833 hom 34 9 13 12 A 9 10 185198 CASAVA_Build 12 22530115 1I ATTCTCCAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 T 9 10 185199 CASAVA_Build 12 22620079 1D TATAAAATCA T/- TTTTTTTTTT 1327 het 1327 ref 26 13 3 10 T 13 12 185200 CASAVA_Build 12 22632235 1D GAACATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 14 13 185201 CASAVA_Build 12 22641350 1I GTTAATGTTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 8 9 185202 CASAVA_Build 12 22641894 1I AGGCGATCAG -/C CCCCCCTTAG 3070 het 920 hom 15 2 9 4 C 6 7 185203 CASAVA_Build 12 22642479 4D GCTTAGTAAG ACAA/---- ACAGTTAATG 3070 het 3070 ref 57 29 26 2 ACAA 1 0 185204 CASAVA_Build 12 22653718 8D CTGTTTTTAT AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 1281 hom 43 8 13 28 AAAC 6 4 185205 CASAVA_Build 12 22654904 1D GTAGAGTCTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 9 8 185206 CASAVA_Build 12 22666370 1I CTACACTGTC -/T TTTTTTTTTT 2624 het 2624 ref 35 16 10 9 T 10 11 185207 CASAVA_Build 12 22668681 1D TGAGACGCAA G/- ATTTCAAGGC 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 G 1 0 185208 CASAVA_Build 12 22670628 1D CCTTGCAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 9 8 185209 CASAVA_Build 12 22671352 1I AGTTAAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 10 11 185210 CASAVA_Build 12 22682064 2I GTGACAGAGC --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 GA 6 7 185211 CASAVA_Build 12 22684598 1D ATTGAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 2437 het 2437 ref 33 14 6 13 T 17 16 185212 CASAVA_Build 12 22688262 1I TTGAAAAATA -/T GGGCATTTAA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 0 1 185213 CASAVA_Build 12 22694649 4D ATTGAAGATA CTCT/---- CTCTTTATTC 2236 het 2236 ref 18 10 7 2 CT 4 2 185214 CASAVA_Build 12 22701809 1I ATTTTCCTAA -/T TTTTCTAATA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 4 5 185215 CASAVA_Build 12 22713541 1I AAAATAAAAG -/A AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 A 6 7 185216 CASAVA_Build 12 22714023 1D ACAAAAAGAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 22 12 8 3 A 8 7 185217 CASAVA_Build 12 22714571 2D CCCACATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 18 12 T 14 12 185218 CASAVA_Build 12 22719424 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 29 12 10 7 T 7 6 185219 CASAVA_Build 12 22721058 1D TTTTGATGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2599 hom 27 11 9 7 T 10 9 185220 CASAVA_Build 12 22724214 4D GGGTGGAGGA ATAC/---- ATACATCATT 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 ATAC 2 1 185221 CASAVA_Build 12 22725407 1D CTATAAAAAT G/- GTTGCCTACA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 G 2 1 185222 CASAVA_Build 12 22729953 4D ATTTTATAGT ATCA/---- AATTGTTTCT 3070 het 3070 ref 29 14 13 5 ATCA 1 0 185223 CASAVA_Build 12 22735702 1D TTTCCTCCCC T/- GATTTAGCAA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 1 0 185224 CASAVA_Build 12 22742574 10I TTTTCTCTTG ----------/TTTCCAAGTT TTTATCCTTG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TTTCCAAGTT 0 1 185225 CASAVA_Build 12 22747355 2D ACTAAATAAC AG/-- AGCTGGTCTC 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 AG 2 1 185226 CASAVA_Build 12 22752439 2I1M14D AGAAAGCAGC --AGGAGTTGTATTATT/CAA-------------- AAGAAGTTGG 3070 het 3070 ref 40 28 12 7 N/A 0 0 185227 CASAVA_Build 12 22756150 1I GGCCTAACCT -/A AACCTTTTCC 3070 hom 123 het 50 0 38 12 A 2 3 185228 CASAVA_Build 12 22760898 4I46M2I CTATTAAAAA ----CTATTTTATAAAGATATTTAAAAGACATTCCCTTACCGTTTTCTTT--/CTTTCTATTTTATAAAGATATTTAAAAGACATTCTCTTACCGTTTTCTTTAA AGTTTTAAAG 3070 hom 108 het 30 0 37 10 N/A 0 0 185229 CASAVA_Build 12 22761415 1I CTACATGAGA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 185230 CASAVA_Build 12 22769564 1D GTTATATAGG A/- AAGGTACTAC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 3 2 185231 CASAVA_Build 12 22775024 4I AAATATAAAT ----/TAAG TGTCTCTTAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TAAG 0 1 185232 CASAVA_Build 12 22782359 1D CATAGTAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 40 2 27 11 T 13 12 185233 CASAVA_Build 12 22801979 4I AAAATGTGAG ----/TAAC TATATGCCAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TAAC 0 1 185234 CASAVA_Build 12 22810294 1I GACAGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 20 9 A 14 15 185235 CASAVA_Build 12 22811802 3I CTGACTTGAT ---/AAG AAGATCAATT 3070 hom 135 het 52 0 45 7 AAG 1 2 185236 CASAVA_Build 12 22818548 1D TTGGCTGCCA T/- TTTTGAGCAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 5 4 185237 CASAVA_Build 12 22818751 1D CTTCAAAATG A/- AAAAAAAAAG 506 het 506 ref 39 28 2 10 A 10 9 185238 CASAVA_Build 12 22818843 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 32 3 20 10 T 18 17 185239 CASAVA_Build 12 22821661 1I CATGTCTTTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 A 7 8 185240 CASAVA_Build 12 22839865 1I CTGAAAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 T 11 12 185241 CASAVA_Build 12 22842027 1I CACCAGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 628 hom 34 2 25 7 A 11 12 185242 CASAVA_Build 12 22854055 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAGAATC 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 6 5 185243 CASAVA_Build 12 22854896 5I TGAGTTTCTA -----/AAGAT AAGATATCAG 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 AAGAT 1 2 185244 CASAVA_Build 12 22868590 1I GTGTTGTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 9 10 185245 CASAVA_Build 12 22877202 1D GTGCCCTTAT A/- AAAAAAGGCT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 7 6 185246 CASAVA_Build 12 22878924 3I TTGGAAATCC ---/ATT ATTGTCTCCA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 ATT 1 2 185247 CASAVA_Build 12 22881282 17D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1822 hom 18 6 11 7 A 28 11 185248 CASAVA_Build 12 22888589 1D TTTTCAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 11 10 185249 CASAVA_Build 12 22889826 3D TTCTTTCCTT CTC/--- CTCCTCCTCC 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 CTC 5 4 185250 CASAVA_Build 12 22897944 1D TTTCTGAGGC T/- TTTTTTTTTT 1083 het 1083 ref 31 19 5 7 T 12 11 185251 CASAVA_Build 12 22902819 19D GCAACAGGCC GGGTACTATTTCTTGCACT/------------------- GGGAATATAG 3070 het 3070 ref 29 17 12 3 GGGTACTATTTCTTGCACT 1 0 185252 CASAVA_Build 12 22908769 1I GATCAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 A 10 11 185253 CASAVA_Build 12 22921245 1D TTGAACATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 637 hom 28 3 13 12 T 17 16 185254 CASAVA_Build 12 22928449 1D AGAAAAAAAG A/- GAAAGCAGTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 1 0 185255 CASAVA_Build 12 22930015 1D AAAAGATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 12 11 185256 CASAVA_Build 12 22941928 1I AAATGGGGAG -/T GGAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 0 1 185257 CASAVA_Build 12 22942527 2D GGGGGTGAGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 1531 hom 20 6 12 4 AG 9 8 185258 CASAVA_Build 12 22952438 1I AAAACAACAA -/C AAAAAAAAAC 3070 het 2461 hom 32 12 13 7 C 0 1 185259 CASAVA_Build 12 22968250 1D TGTTGCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 17 13 A 12 11 185260 CASAVA_Build 12 22969717 1D GGTGTGGGGT G/- GGTTGGGTGG 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 G 3 2 185261 CASAVA_Build 12 22971814 1D TGCATTTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 10 9 185262 CASAVA_Build 12 22980722 1I TTCAGTTTAG -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 7 8 185263 CASAVA_Build 12 23005648 2D ACCATATAGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 AC 8 7 185264 CASAVA_Build 12 23019479 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1664 het 1664 ref 25 11 8 6 T 13 12 185265 CASAVA_Build 12 23039257 1D TTTTCCCCAG A/- AAAGCTCTAT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 4 3 185266 CASAVA_Build 12 23052303 1I CATTTATTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 9 10 185267 CASAVA_Build 12 23055575 5D ATTTATTTCA TTTAT/----- TTTATTCTTG 2525 het 2525 ref 24 16 7 3 TTTAT 2 1 185268 CASAVA_Build 12 23076733 5D TTTCTTTTAT ATCTA/----- ATCTACTAGA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 ATCTA 2 1 185269 CASAVA_Build 12 23079097 5I TCTCCTTTCC -----/TTTCT TTTCCTTTCC 3070 het 11 hom 18 1 13 4 TTTCT 0 1 185270 CASAVA_Build 12 23087676 4I CTAATATAGA ----/TAGT TAGTCAGCCC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 TAGT 1 2 185271 CASAVA_Build 12 23094585 8I CCCACTCCCA --------/TCATATCT TCATATCTTC 3070 het 3070 ref 49 20 20 9 TCATATCT 1 2 185272 CASAVA_Build 12 23094889 4I ATTGATGTTC ----/AAAG AAAGAGTCCC 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 AAAG 1 2 185273 CASAVA_Build 12 23105088 4I TTTAAGGACA ----/AGAT AGATAGATTC 3070 hom 65 het 29 0 21 8 AGAT 2 3 185274 CASAVA_Build 12 23106326 1I CCTTATGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 39 1 29 9 A 12 13 185275 CASAVA_Build 12 23109776 3I ACTTTGAAAA ---/AAC AAAAACAACA 3070 het 39 hom 42 4 37 1 AAC 0 1 185276 CASAVA_Build 12 23110270 2D AAAGAGAAAC AG/-- TACCAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 AG 1 0 185277 CASAVA_Build 12 23111989 3D CACACATAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 2391 het 1264 hom 53 15 9 30 T 19 16 185278 CASAVA_Build 12 23112997 1D TTGATGGGAG A/- TTTGGGGGTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 A 1 0 185279 CASAVA_Build 12 23114146 1I AAAAGAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 36 0 33 3 A 10 11 185280 CASAVA_Build 12 23143169 5D TGTGTGTGTG TCTGT/----- GGTTTTTTTG 3070 hom 58 het 38 0 25 13 TCTGT 1 0 185281 CASAVA_Build 12 23144152 3I ATAAGCAAGT ---/GAA GAAGAGAGGT 3070 hom 134 het 50 0 45 5 GAA 1 2 185282 CASAVA_Build 12 23146559 1I GCTTTTAGAT -/A ATAGTTTCAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 2 185283 CASAVA_Build 12 23146938 3I TCCATCTGAA ---/CTC CTCTTTTAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTC 1 2 185284 CASAVA_Build 12 23154674 6D TGTGCCCTTT GCTGTG/------ GCTGTTAATA 3070 het 3070 hom 40 11 21 10 GCTGTG 1 0 185285 CASAVA_Build 12 23156080 26D CTTCCCTCTC TCCCTCCCTCCCTCTCTCCCTCTCCT/-------------------------- TCCCTCCCTC 2854 het 2078 hom 23 8 9 9 TCCCTCCCTCCCTCTCTCCCTCTCCT 1 0 185286 CASAVA_Build 12 23163250 2D GTTCAGCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 20 10 T 13 11 185287 CASAVA_Build 12 23165351 24D TATATATATA TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/------------------------ TGTGTGTGTG 2671 het 77 hom 18 1 10 10 TG 20 8 185288 CASAVA_Build 12 23167107 1D CAAATATACA T/- TTTTTTTTTT 2589 het 2589 ref 31 15 6 10 T 15 14 185289 CASAVA_Build 12 23172703 1D ACAAATGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2179 hom 29 7 15 7 A 11 10 185290 CASAVA_Build 12 23173309 1D TTTCCTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 19 2 9 8 T 17 16 185291 CASAVA_Build 12 23175144 2I ACCTGTATAC --/TT TTACATTTTG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 2 4 185292 CASAVA_Build 12 23186422 1I ATCTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 19 19 12 A 11 12 185293 CASAVA_Build 12 23196451 5D ATAAATAAAT AAATA/----- AAATAAAGTA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 AAATA 2 1 185294 CASAVA_Build 12 23197774 1I ACCCGGCTAA -/T TGTTAGTATT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 1 2 185295 CASAVA_Build 12 23199992 1D GAATGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 1359 het 571 hom 25 10 3 12 T 19 18 185296 CASAVA_Build 12 23204738 1D CAGATTTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 T 9 8 185297 CASAVA_Build 12 23209695 7I TGAAGTCACA -------/CCTGGAG CCTGGAGCTA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 CCTGGAG 1 2 185298 CASAVA_Build 12 23220276 1D ATGCTATGAA G/- GGAAAGGACA 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 G 3 2 185299 CASAVA_Build 12 23225449 14D29M2I TGCAAATAAT ACATGTTCATTATAGAATAATATAAAATTTATTGATAATAAGC--/--------------GAATAATATAAAATTTATTGATAATAAGCAA AGAGAAGACA 3070 het 3070 ref 29 19 17 4 N/A 0 0 185300 CASAVA_Build 12 23259908 1D AAGATAAAGC T/- TTTTTTGGGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 6 185301 CASAVA_Build 12 23312196 1I TAAAAGTAAC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 7 8 185302 CASAVA_Build 12 23313503 1D TAGATAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 T 13 12 185303 CASAVA_Build 12 23322330 1I ACCTCTTTTT -/A TTTTTTAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 0 1 185304 CASAVA_Build 12 23326500 1D ATCTAATATG T/- TTTTTGACTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 6 5 185305 CASAVA_Build 12 23329852 1I TTAGTGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 29 1 19 9 T 10 11 185306 CASAVA_Build 12 23352843 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 764 hom 26 2 15 9 A 15 16 185307 CASAVA_Build 12 23362620 1D TAAAAATCAA T/- TGACGTTAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 T 2 1 185308 CASAVA_Build 12 23364528 1I TAAGACCTAC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 7 8 185309 CASAVA_Build 12 23365182 1I GGTAACTATA -/G TTAACAATAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 0 1 185310 CASAVA_Build 12 23370865 1D AAAGAGATGC A/- AAAAAAAAAC 2859 het 2859 ref 27 15 6 6 A 10 9 185311 CASAVA_Build 12 23372678 3D TCCATAACCT CTG/--- CTGCTCTACG 3070 het 3070 hom 45 20 21 5 CTG 2 1 185312 CASAVA_Build 12 23382963 1I TTATATTGAT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 7 8 185313 CASAVA_Build 12 23385933 1I ACCTTGAACA -/G ATTATCTGAA 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 G 0 1 185314 CASAVA_Build 12 23393505 2I CTTAAGACTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 12 20 15 T 12 14 185315 CASAVA_Build 12 23409834 4D TGTATAAGGG AAGT/---- AAGAGGGAAG 3070 het 3070 ref 41 19 17 7 AAGT 1 0 185316 CASAVA_Build 12 23413039 3D TATTATTTAC ATA/--- ATAATATAGT 1403 het 531 hom 7 2 4 2 ATA 3 2 185317 CASAVA_Build 12 23415353 1I GAACCTAAGT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 A 7 8 185318 CASAVA_Build 12 23423916 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1735 hom 22 6 9 7 A 11 12 185319 CASAVA_Build 12 23424077 10D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 1295 het 1295 ref 22 6 7 11 A 23 13 185320 CASAVA_Build 12 23429239 1I AGGAATAAAT -/A AACTCCTATC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 2 3 185321 CASAVA_Build 12 23429348 1I TAGTTTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 11 12 185322 CASAVA_Build 12 23430669 2D TGTAAACCAG AC/-- ACCACTTGGA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 AC 2 1 185323 CASAVA_Build 12 23439323 1I CTTAGAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2082 hom 22 6 11 5 A 12 13 185324 CASAVA_Build 12 23443355 1I CTCACAAAGT -/A AAAAATTGTA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 5 6 185325 CASAVA_Build 12 23449843 1D AAGATGGTAC T/- TGGTCTTGTC 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 T 2 1 185326 CASAVA_Build 12 23450399 1D AGATTTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 11 10 185327 CASAVA_Build 12 23450579 1D AAATTTAACC A/- AGGAGGTAAA 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 A 2 1 185328 CASAVA_Build 12 23469567 1D TTGATGGCAT G/- GGGGGTTGGC 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 G 6 5 185329 CASAVA_Build 12 23473886 2D TATTTCATGC AT/-- ATATATGTTA 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 AT 4 3 185330 CASAVA_Build 12 23473982 1I GAATGTTATA -/T TGATATAATC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 1 2 185331 CASAVA_Build 12 23485162 1D GAGCTGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 13 12 185332 CASAVA_Build 12 23491582 1I TCGTTTTTCT -/G TTTTGTTAAC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 G 0 1 185333 CASAVA_Build 12 23500328 10D CTGTTTCAAA AAAATAAAAT/---------- AAAATAAAAT 3070 het 1948 hom 22 4 12 10 AAAAT 5 3 185334 CASAVA_Build 12 23507366 4D GGTTCTAGTT TTTG/---- TTTGTTTAAT 3070 het 3070 hom 45 17 24 6 TTTG 2 1 185335 CASAVA_Build 12 23523212 1D ACTCTACAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 10 9 185336 CASAVA_Build 12 23526280 1I ACACAATTGT -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 6 7 185337 CASAVA_Build 12 23540275 1D CACCTTTAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 A 10 9 185338 CASAVA_Build 12 23541531 1D AAACACTGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 10 9 185339 CASAVA_Build 12 23545905 1D TCTGAATTTA T/- TTTTGTCAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 5 4 185340 CASAVA_Build 12 23546078 1D TCCTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 217 hom 24 1 13 10 T 11 10 185341 CASAVA_Build 12 23549843 1I ATTTGAGAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 10 185342 CASAVA_Build 12 23565566 1I TTATTATTGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 8 9 185343 CASAVA_Build 12 23575724 1I AACATGGTGT -/A AAAGTAAGTA 3070 het 3070 ref 47 23 23 1 A 3 4 185344 CASAVA_Build 12 23582146 1D AGTAATAGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 43 2 25 16 T 13 12 185345 CASAVA_Build 12 23585200 1I TAAATATTGA -/G GCCCAAAATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 1 2 185346 CASAVA_Build 12 23602678 1I TAGGTGCAGC -/A AACCATTTTG 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 2 3 185347 CASAVA_Build 12 23602825 1D TTTTTTGAGA C/- GGAGTTCCGC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 C 1 0 185348 CASAVA_Build 12 23616658 1D GACTTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 40 3 32 6 A 12 11 185349 CASAVA_Build 12 23620391 1I TGTAGGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 T 10 11 185350 CASAVA_Build 12 23623143 5D AGAAACAAAA CAAAG/----- CAAAGCAAAG 3070 het 3070 hom 36 13 19 7 CAAAG 5 4 185351 CASAVA_Build 12 23630845 1D CTTAGACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 12 11 185352 CASAVA_Build 12 23637284 2D TGTCTCAAAA AT/-- AAATAAATAA 3070 hom 57 het 20 0 20 1 AT 1 0 185353 CASAVA_Build 12 23644004 1D TACTCTTCCT C/- CTAAAATAAC 3070 het 3070 ref 35 20 15 1 C 2 1 185354 CASAVA_Build 12 23649236 1I AGGCAACGGG -/A AAAAAAGTAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 7 185355 CASAVA_Build 12 23649694 2D AATAAATTTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 936 hom 14 2 11 2 AC 8 7 185356 CASAVA_Build 12 23651722 3D AAAAATTATG CTC/--- CTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 36 17 15 8 CTC 1 0 185357 CASAVA_Build 12 23651857 6D TCTGCCCTAA TAACAG/------ GTGATGTCTA 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 TAACAG 1 0 185358 CASAVA_Build 12 23657537 1D ATCAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 20 21 5 A 12 11 185359 CASAVA_Build 12 23659887 1D GATCTCATTC T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 T 7 6 185360 CASAVA_Build 12 23666517 1I ATAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 10 10 A 10 11 185361 CASAVA_Build 12 23666730 1I AAAAGGGTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 7 8 185362 CASAVA_Build 12 23682273 1D CACCCCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 A 11 10 185363 CASAVA_Build 12 23701336 2I TGTTGGAATG --/AA TGGAAATGGA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 0 2 185364 CASAVA_Build 12 23708524 4I ATTCATTAAC ----/ATAT ATATATATAT 2162 het 2162 ref 24 12 6 6 AT 7 9 185365 CASAVA_Build 12 23709483 1I ATCTAAGTCC -/T TTTAAGTACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 3 4 185366 CASAVA_Build 12 23713249 4I TACATGTCCC ----/TATT TATTTATTCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TATT 2 3 185367 CASAVA_Build 12 23713847 1I TGGATGAGGA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 G 1 2 185368 CASAVA_Build 12 23715010 3I AGCAAGCAAA ---/ACC ACCACAGACA 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 ACC 1 2 185369 CASAVA_Build 12 23720778 1I GCTGTGAAAC -/A AGCGAAGCTA 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 A 1 2 185370 CASAVA_Build 12 23722060 1D AAACAAAAAC A/- AAGATAATAT 3070 het 3070 ref 49 23 21 6 A 3 2 185371 CASAVA_Build 12 23722947 1D ATAAAGAAAC A/- GGGAAGCCTA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 1 0 185372 CASAVA_Build 12 23724166 1I AGTAACAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 9 10 185373 CASAVA_Build 12 23725106 1I AGGCCAGTGA -/T TTTTCCATAA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 4 5 185374 CASAVA_Build 12 23734788 1I ATTTATAACT -/G TTTTTCACTC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 G 0 1 185375 CASAVA_Build 12 23737319 1I TTTAATTATT -/A TTATTATTGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 0 1 185376 CASAVA_Build 12 23746953 2D GAAACAGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 1252 het 1252 ref 41 30 4 9 GT 10 9 185377 CASAVA_Build 12 23748889 8D ATATGCATGC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 hom 27 het 16 0 10 6 AT 14 10 185378 CASAVA_Build 12 23776678 1I GGAAGCTGTG -/A AAAATGAATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 5 185379 CASAVA_Build 12 23787153 1D TACACTGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 29 1 19 9 A 13 12 185380 CASAVA_Build 12 23804815 1D CAGTGAATGG C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 92 het 43 0 30 13 C 8 7 185381 CASAVA_Build 12 23812024 4D ATCTTCACTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AT 10 8 185382 CASAVA_Build 12 23814430 1I CACTTTCTAG -/C CCCCCAAATT 3070 het 3070 hom 22 7 13 2 C 5 6 185383 CASAVA_Build 12 23814750 1I TTTTTTCAGA -/T TTTTTTTTTC 2257 het 2257 ref 25 18 5 2 T 9 10 185384 CASAVA_Build 12 23832153 2D AGGATCTGAG CA/-- AAGAGTCTTA 3070 het 3070 hom 45 20 19 8 CA 1 0 185385 CASAVA_Build 12 23833435 1D TCTTTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 A 12 11 185386 CASAVA_Build 12 23839129 1D TAGATTAGAA T/- TTTTTTTAAC 1838 het 1838 ref 16 8 5 4 T 8 7 185387 CASAVA_Build 12 23842126 1D CAGGTCCTTT G/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 G 1 0 185388 CASAVA_Build 12 23860409 1D ACAAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 28 7 10 12 T 18 17 185389 CASAVA_Build 12 23867145 1D CTAGGACTGC T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 7 185390 CASAVA_Build 12 23870901 1D ATTAGGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 9 A 11 10 185391 CASAVA_Build 12 23884030 1I TCAACTTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 255 hom 33 3 23 7 A 15 16 185392 CASAVA_Build 12 23886174 1D TAACATAAGC A/- AAATTTTAAA 3070 hom 160 het 54 0 54 1 A 4 3 185393 CASAVA_Build 12 23887409 1D TGTCACAGCC A/- AAAAAAGCCT 3070 hom 117 het 44 0 40 7 A 7 6 185394 CASAVA_Build 12 23902271 2D TATGCCTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 TG 10 9 185395 CASAVA_Build 12 23904506 1D AAATAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 22 10 A 11 10 185396 CASAVA_Build 12 23905158 4I TTTTGTAAAA ----/AAAC AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 AAAC 0 1 185397 CASAVA_Build 12 23917507 1D CTGTCTCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 88 het 35 0 29 6 A 10 9 185398 CASAVA_Build 12 23919488 1I TAAACTTGCT -/A AAAAAAATTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 185399 CASAVA_Build 12 23923532 1D TAATCTGATG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 73 het 36 0 24 12 A 9 8 185400 CASAVA_Build 12 23930042 1D AATACAGGGG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 51 het 31 0 16 16 A 8 7 185401 CASAVA_Build 12 23930085 1D AGAAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 573 hom 31 3 12 16 A 14 13 185402 CASAVA_Build 12 23932615 1D CCCATAGCAC T/- TTTTTTTTTT 2151 het 2151 ref 38 29 5 4 T 11 10 185403 CASAVA_Build 12 23935809 1D AGCTGCCTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 34 0 30 4 T 9 8 185404 CASAVA_Build 12 23946788 1D AAATTAAACA T/- TTTTTATTAG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 T 6 5 185405 CASAVA_Build 12 23948954 1I ACATGTTTAG -/T TTTCTGAGAT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 T 3 4 185406 CASAVA_Build 12 23951948 1D GTGCATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 49 0 40 10 A 13 12 185407 CASAVA_Build 12 23954036 1I TGCTAGAACA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 8 9 185408 CASAVA_Build 12 23973222 1I GCTCTGGTAG -/T TGTTTTTTTA 3070 het 335 hom 30 1 27 2 T 1 2 185409 CASAVA_Build 12 23986140 1D ACTAGCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 31 0 24 7 A 13 12 185410 CASAVA_Build 12 23986860 2D GCTCTGAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 44 0 33 13 T 15 13 185411 CASAVA_Build 12 23992423 1D TTTAATTATT A/- AAAAAAAAAA 1341 het 1341 ref 29 22 3 4 A 11 10 185412 CASAVA_Build 12 23994464 2D GAAATACACG CA/-- CACACACACA 2111 het 2111 ref 43 24 5 15 CA 9 8 185413 CASAVA_Build 12 23995855 4I ATATATATAT ----/ACTC ACACACACAC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 ACTC 0 1 185414 CASAVA_Build 12 24000886 1I TGCCTAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 30 1 18 11 T 10 11 185415 CASAVA_Build 12 24002930 1I GATTTTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 11 12 185416 CASAVA_Build 12 24006481 2I CAGTGGTGAC --/AG AGACTCTTAA 3070 hom 114 het 41 0 37 4 AG 1 2 185417 CASAVA_Build 12 24010674 1I TGCAATGAAG -/A AAAAATATAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 5 6 185418 CASAVA_Build 12 24011673 1D TACAGACAAT A/- ATGCAATATA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 1 185419 CASAVA_Build 12 24013527 2I CTTCAATCCA --/TT TTTTTTTTCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 10 185420 CASAVA_Build 12 24014432 1I AGCTGACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 31 0 24 7 T 10 11 185421 CASAVA_Build 12 24029864 1D GCTTCCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 11 10 185422 CASAVA_Build 12 24031051 1D AATTAGCCAA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 8 7 185423 CASAVA_Build 12 24035246 1I CGTAATACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 304 hom 31 1 28 2 A 9 10 185424 CASAVA_Build 12 24035392 2D CCGTCTCTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 17 1 13 4 A 14 12 185425 CASAVA_Build 12 24047088 1D40M5D GAAAACTACA TTACAAATATTCATCATGTATATAGACACAAAAATTTGAGCAATAT/-TACAAATATTCATCATGTATATAGACACAAAAATTTGAGC----- ATTAACAAAC 3070 hom 132 het 40 0 45 7 N/A 0 0 185426 CASAVA_Build 12 24048510 1D TTTGTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 29 1 24 5 A 11 10 185427 CASAVA_Build 12 24056331 1I ACTTCAGCAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 8 9 185428 CASAVA_Build 12 24060124 1D ATGGGGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1290 hom 48 4 33 12 A 14 13 185429 CASAVA_Build 12 24067123 1D GACCATGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 270 hom 31 1 20 11 A 12 11 185430 CASAVA_Build 12 24073771 8I CCACTGAGCC --------/CAGCCCAT CAGCCCATTT 3070 het 3070 hom 40 14 21 6 CAGCCCAT 1 2 185431 CASAVA_Build 12 24088490 3I GCAGGTAAGT ---/ATA ATAACACTGT 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 ATA 1 2 185432 CASAVA_Build 12 24090099 6I TTGGTTTATT ------/CCATAG CCATAGCTCT 3070 hom 90 het 52 1 44 7 CCATAG 1 2 185433 CASAVA_Build 12 24090474 1D AAAAGCGAAA C/- TTGGGGCGGG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 C 1 0 185434 CASAVA_Build 12 24091256 1D TTCCTTCTTA T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 6 5 185435 CASAVA_Build 12 24130158 1I CGGATATGCT -/A AAAAAAAAAA 2946 het 2946 ref 34 12 13 9 A 15 16 185436 CASAVA_Build 12 24136512 1D TGCTGCGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 11 10 185437 CASAVA_Build 12 24141695 1I ATTTTACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 10 11 185438 CASAVA_Build 12 24147556 1D TCTCAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 34 1 30 3 T 12 11 185439 CASAVA_Build 12 24159141 4I TGTCTCTAAC ----/TAAA TAAATAAAGT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TAAA 2 3 185440 CASAVA_Build 12 24161661 2D CCACTTCTGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 AT 6 5 185441 CASAVA_Build 12 24168764 1I GGAATGGGAC -/A AAAAAAAAAA 1931 het 1744 hom 26 7 8 11 A 13 14 185442 CASAVA_Build 12 24185255 2D GGTCAGAAAT AG/-- AGAAGAACAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 AG 2 1 185443 CASAVA_Build 12 24185915 6D TTATTATTTA TACAAG/------ TACATCAATG 3070 het 3070 ref 45 21 21 5 TACAAG 1 0 185444 CASAVA_Build 12 24189030 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 A 8 9 185445 CASAVA_Build 12 24193073 6D CCTGGGTGAC AGAGGG/------ AGAGGGAGAC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 AGAGGG 2 1 185446 CASAVA_Build 12 24197049 2D CTGGCACAGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 20 0 A 11 9 185447 CASAVA_Build 12 24203383 4D TCACTCATCT ATCC/---- ATCCATCCAT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 ATCC 6 5 185448 CASAVA_Build 12 24207707 1I TTTTAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 T 14 15 185449 CASAVA_Build 12 24218713 1D CAGAATGAGT G/- GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 G 9 8 185450 CASAVA_Build 12 24224145 1D TTTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3036 het 3036 ref 28 11 11 6 A 12 11 185451 CASAVA_Build 12 24231140 1I AAAACACATT -/G AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 G 0 1 185452 CASAVA_Build 12 24257803 2D ATTATAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 12 10 185453 CASAVA_Build 12 24289575 1D ATTAATGAAT A/- AAACTAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 4 3 185454 CASAVA_Build 12 24290484 1I CAGACACAGA -/T TTTTTTTTTT 221 het 221 ref 40 30 2 8 T 13 14 185455 CASAVA_Build 12 24291452 1D TCGACCAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 153 hom 40 1 26 14 A 10 9 185456 CASAVA_Build 12 24301679 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 7 8 185457 CASAVA_Build 12 24307260 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 22 0 19 4 A 10 9 185458 CASAVA_Build 12 24318874 1I TTTTGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1791 hom 43 6 22 15 A 13 14 185459 CASAVA_Build 12 24319248 1I CGACTTTGGG -/A AAAAAGTAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 5 6 185460 CASAVA_Build 12 24320134 3D TGCATTCCTT TTA/--- TTACCTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 TTA 2 1 185461 CASAVA_Build 12 24325210 2D GAGAGGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 5 A 13 11 185462 CASAVA_Build 12 24326733 1D AACTAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 24 1 19 4 A 12 11 185463 CASAVA_Build 12 24332943 4D GCAACAATGC ATGT/---- CCAACCTTTA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 ATGT 1 0 185464 CASAVA_Build 12 24333138 7I TGTCTCATGA -------/TGTCTTC TGGGAGGTAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TGTCTTC 0 1 185465 CASAVA_Build 12 24338482 1D AACTCATGGG T/- TTTTTTTTTT 1728 het 1728 ref 46 36 4 6 T 12 11 185466 CASAVA_Build 12 24339943 1I ATTTTTGTAG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 86 het 32 0 29 3 T 7 8 185467 CASAVA_Build 12 24358174 3D GATTCTTCTC CTT/--- CTCACACACT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 CTT 1 0 185468 CASAVA_Build 12 24358764 1D GCTTATACAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 14 0 11 4 A 9 8 185469 CASAVA_Build 12 24366600 3I ATAAAAACTA ---/AAG AAGATAACAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AAG 1 2 185470 CASAVA_Build 12 24367035 3D TATCAAATAA TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 50 26 21 6 TGT 4 3 185471 CASAVA_Build 12 24370660 2I CGCACTTGTG --/TA TATGTTTATC 3070 hom 135 het 53 0 46 7 TA 1 2 185472 CASAVA_Build 12 24379115 1I CCAATTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 36 2 27 7 A 12 13 185473 CASAVA_Build 12 24379471 1I AGAGGGGCCC -/A AAAAAAACAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 7 8 185474 CASAVA_Build 12 24387481 1I TCCCCTCTAC -/T TTTACAATCT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 3 4 185475 CASAVA_Build 12 24402665 1I CTTAACTGCC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 8 9 185476 CASAVA_Build 12 24402813 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 198 het 198 ref 24 5 5 14 A 14 16 185477 CASAVA_Build 12 24417326 1I TGTCAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 38 0 31 7 A 10 11 185478 CASAVA_Build 12 24437370 1D AGAAGCTGGC A/- AAAAAACAAA 3070 het 2149 hom 18 7 7 4 A 7 6 185479 CASAVA_Build 12 24444589 1D TTATAATAAA T/- TATTTCAAGA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 2 1 185480 CASAVA_Build 12 24505464 4I AGCTGGTCAT ----/TTAA TTAAGTCAGA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TTAA 1 2 185481 CASAVA_Build 12 24552030 7D GTATGTCAAA ATCTAAC/------- ATTGAATATA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 ATCTAAC 1 0 185482 CASAVA_Build 12 24564705 1I GATAAACAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 33 1 27 5 A 9 10 185483 CASAVA_Build 12 24595549 4I TTGGTGACAG ----/ACAA ACAATCAGAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 ACAA 1 2 185484 CASAVA_Build 12 24597150 2D GGAGGATCAC TT/-- GAGCTCGGGC 3070 het 3070 ref 22 12 8 4 T 2 0 185485 CASAVA_Build 12 24620259 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 41 0 35 6 A 10 11 185486 CASAVA_Build 12 24623713 1D TGCAAAGAGG A/- AAAAAAAAAG 1414 het 1414 ref 46 35 4 7 A 10 9 185487 CASAVA_Build 12 24645259 1D GAATAATGGC T/- TTTTTTTTTC 831 het 831 ref 41 34 3 4 T 10 9 185488 CASAVA_Build 12 24655586 12D CTACAAACAT TTATATAAGTAG/------------ TTATGTGGTT 3070 het 3070 hom 31 14 17 6 TTATATAAGTAG 1 0 185489 CASAVA_Build 12 24661082 1D TCTCCCTTGA G/- GTATACTGAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 G 2 1 185490 CASAVA_Build 12 24663554 33D GAATAAAGGA GAGGTTTAGCAAGCAGTTGTGAAAGTGAGTCTG/--------------------------------- GAGCCTGGGG 3070 het 3070 ref 40 21 18 13 GAGGTTTAGCAAGCAGTTGTGAAAGTGAGTCTG 1 0 185491 CASAVA_Build 12 24679232 1D AACCAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 29 1 19 9 A 15 14 185492 CASAVA_Build 12 24689316 1D CCAATATAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 8 185493 CASAVA_Build 12 24691879 1D TCTATAAGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 9 8 185494 CASAVA_Build 12 24707137 1D GGTGCTTGCA T/- TCAGTAGCTG 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 T 2 1 185495 CASAVA_Build 12 24711538 1I TAGCTCTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 A 11 12 185496 CASAVA_Build 12 24718422 1D GATTTTCATA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 8 7 185497 CASAVA_Build 12 24725783 1D CACTTGCTCC A/- GCCAGCTTTC 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 A 1 0 185498 CASAVA_Build 12 24742283 1D AACAGCTACC A/- AAAAAAAAAA 2009 het 1311 hom 22 8 10 4 A 15 14 185499 CASAVA_Build 12 24746546 1I TCTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 12 0 10 2 A 10 11 185500 CASAVA_Build 12 24753503 1I AAGAACACAC -/A AAAAAACCCC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 6 7 185501 CASAVA_Build 12 24758201 1D TGTCCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 27 1 21 5 T 13 12 185502 CASAVA_Build 12 24765519 3D AACTGGTTAA CTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 609 hom 35 6 17 12 CTT 1 0 185503 CASAVA_Build 12 24767568 1I TATACTCATT -/A AAAAAATATG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 6 7 185504 CASAVA_Build 12 24769703 2D ACACATATGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 AT 9 8 185505 CASAVA_Build 12 24775535 1D AGCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 14 9 T 13 12 185506 CASAVA_Build 12 24784358 4I TTAACTCCCT ----/AGAG AAATATTAAT 3070 hom 52 het 27 0 18 9 AG 0 2 185507 CASAVA_Build 12 24826532 2I14M1I TGAAATACTC --TGTGATTATTCCTA-/TTTGTGATTATTCCTAT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 62 30 36 2 N/A 0 0 185508 CASAVA_Build 12 24828513 3D20M1D TTGACACTAT AGGAAGAGGTAGGAAACAAGGAGA/---AAGAGGTAGGAAACAAGGAG- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 42 27 19 8 N/A 0 0 185509 CASAVA_Build 12 24830154 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 25 0 14 11 A 9 10 185510 CASAVA_Build 12 24831044 1D ATTTGGCGCT A/- AAAAAAATAT 3070 het 641 hom 31 3 13 15 A 8 7 185511 CASAVA_Build 12 24831126 1D CCGTCACTAC A/- AAAAAATGCC 3070 het 3070 ref 34 17 16 3 A 7 6 185512 CASAVA_Build 12 24836417 15I CATACAGTTG ---------------/TACTCCTAAATTACA GCTGTAAATC 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 TACTCCTAAATTACA 0 1 185513 CASAVA_Build 12 24841067 1I TATTAATTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 8 9 185514 CASAVA_Build 12 24846815 2I TGGCCTCAAG --/CC TTTCAAAGTG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 C 0 2 185515 CASAVA_Build 12 24848563 1I ACTGCAACCT -/C CCACCTCCTG 1356 het 996 hom 6 2 3 1 C 2 3 185516 CASAVA_Build 12 24853446 4D GTCTTATTCA TTCT/---- TTCTATTTTT 3070 het 3070 hom 39 18 15 8 TTCT 2 1 185517 CASAVA_Build 12 24856521 1I TCTCTAAGGG -/A AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 50 16 30 4 A 6 7 185518 CASAVA_Build 12 24858618 1I ATGCAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 31 2 25 4 A 11 12 185519 CASAVA_Build 12 24865029 1I TTTCATACGG -/C CTTTGCTAAA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 C 1 2 185520 CASAVA_Build 12 24869665 3D TTATTGCCTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 27 0 23 4 T 17 14 185521 CASAVA_Build 12 24871522 2D CATGCAGAAA TT/-- TTTATTAGCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 5 3 185522 CASAVA_Build 12 24876573 1I GTCCCAGTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 T 8 9 185523 CASAVA_Build 12 24898590 1D AGCAAGACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 9 185524 CASAVA_Build 12 24900737 1I TAAGAAGAGG -/A AAAAGACACC 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 4 5 185525 CASAVA_Build 12 24909809 4D TTATATTGGC TGTG/---- TGTGTGTATG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TG 5 3 185526 CASAVA_Build 12 24914217 4I GTGTGTGTGT ----/GTGC GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 GTGC 0 1 185527 CASAVA_Build 12 24915340 7I ACAGATCAAA -------/TGCCAAT TGCCAATTTC 3070 het 3070 ref 52 24 17 11 TGCCAAT 1 2 185528 CASAVA_Build 12 24929177 3I AATAAGCTCG ---/CAA CAAACGTTAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 CAA 1 2 185529 CASAVA_Build 12 24937056 4I TCTGTCTGAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 2186 hom 28 5 13 10 AAAT 3 4 185530 CASAVA_Build 12 24938748 1D TACAGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 A 11 10 185531 CASAVA_Build 12 24940968 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 9 10 185532 CASAVA_Build 12 24942530 1I TGTGGAAGAA -/T TTGGAATGCC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 2 3 185533 CASAVA_Build 12 24942624 1D GTTTGCAGTT G/- GGTAATCATT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 3 2 185534 CASAVA_Build 12 24943681 1I GAAGCTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 A 10 11 185535 CASAVA_Build 12 24943979 2D CCAAACACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 740 hom 33 6 17 10 A 13 11 185536 CASAVA_Build 12 24960204 1D ACCAAAAATA C/- AAAAAATTAG 1586 het 1586 ref 11 4 6 1 C 1 0 185537 CASAVA_Build 12 24960715 1I AAATAAGCTC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 8 185538 CASAVA_Build 12 24968296 1I GTTTCCTCCC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 T 7 8 185539 CASAVA_Build 12 24981718 1I TGTTTGTTTG -/T TTTGTTTGCT 2537 het 2537 ref 30 16 7 7 T 3 4 185540 CASAVA_Build 12 25001326 2D CTTTTGAGAC AG/-- AGTTTTGCTC 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 AG 2 1 185541 CASAVA_Build 12 25002613 2D20M1I TGGTAGACTC TTTTTGAATTTTCTTTGTTTTG-/--TTTGAATTTTCTTTGTTTTGT TTGTTTTTTT 3070 hom 44 het 16 0 15 7 N/A 0 0 185542 CASAVA_Build 12 25006471 2D AAGAGCCATA GT/-- GTTATTGGGC 3070 het 3070 ref 56 28 19 10 GT 2 1 185543 CASAVA_Build 12 25006665 1I ATCAATAAGC -/A TCCACAAGCA 3070 hom 132 het 46 0 42 5 A 0 1 185544 CASAVA_Build 12 25008544 2I CAGTTAAATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 28 0 12 16 T 12 14 185545 CASAVA_Build 12 25010027 1I TCTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 1480 het 505 hom 34 4 12 18 C 0 1 185546 CASAVA_Build 12 25028389 1D ATCTTCTGAG C/- CCTCACCAGA 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 C 3 2 185547 CASAVA_Build 12 25042512 3D TTGCATTTAT TAA/--- TAATCAGAAA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 TAA 2 1 185548 CASAVA_Build 12 25043112 5I ATTACATTGT -----/TAACA TAATCTGTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 TAACA 0 1 185549 CASAVA_Build 12 25054007 1D TAGAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 30 7 A 13 12 185550 CASAVA_Build 12 25054678 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 37 1 29 10 A 12 11 185551 CASAVA_Build 12 25060397 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 31 2 22 7 A 12 13 185552 CASAVA_Build 12 25061919 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 10 11 185553 CASAVA_Build 12 25071233 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1084 hom 25 3 20 3 T 12 11 185554 CASAVA_Build 12 25073869 1D TTACAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 13 8 T 12 11 185555 CASAVA_Build 12 25077160 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 33 1 18 14 T 15 12 185556 CASAVA_Build 12 25086079 1I GTGACCCATT -/A TAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 185557 CASAVA_Build 12 25086478 6D ATTTAGACAG CAAAGT/------ CTGAGAAAGA 3070 hom 120 het 43 0 40 4 CAAAGT 1 0 185558 CASAVA_Build 12 25088692 1D ACATATTAAA T/- TTTAAAAAGC 3070 het 3070 hom 41 21 17 3 T 4 3 185559 CASAVA_Build 12 25091644 2I TTTTTGTTGT --/TG TTTTTTGTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TG 0 1 185560 CASAVA_Build 12 25095105 1D ACGATCCCAC T/- TCTCTGAGGT 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 T 2 1 185561 CASAVA_Build 12 25103471 1I TAAGACAGAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 6 7 185562 CASAVA_Build 12 25117964 2D AGAAGGAAAC AA/-- ATTATTTCCA 3070 het 3070 ref 60 32 25 4 A 3 1 185563 CASAVA_Build 12 25124265 1D GGAATTTACT G/- GGTTTCAACT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 G 3 2 185564 CASAVA_Build 12 25126811 1I AAAAAAAAAA -/C CAAAAAACAA 2484 het 2484 ref 19 8 7 4 C 1 2 185565 CASAVA_Build 12 25128238 1I AAAGCTCTAT -/A AAACATAAGG 3070 het 3070 hom 45 13 25 7 A 3 4 185566 CASAVA_Build 12 25130479 1D ATGACATGTC A/- CGGGTATGGG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 1 0 185567 CASAVA_Build 12 25135852 8I GGTCATATAG --------/TAATTATA TAATTATATT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 TAATTATA 1 2 185568 CASAVA_Build 12 25138291 3D TAAGTCTGAT GTA/--- GTTCCATTTG 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 GTA 1 0 185569 CASAVA_Build 12 25138933 4I TATTTGTGTC ----/TTCT TTGTCTTCTT 3070 het 1785 hom 25 8 13 4 TTCT 0 1 185570 CASAVA_Build 12 25140335 1I ACAGATAAGG -/A AACAGCAAAT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 2 3 185571 CASAVA_Build 12 25141440 3I AAAATATAAT ---/AAC ACGATCCAGT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 AAC 0 1 185572 CASAVA_Build 12 25149842 1I AGCTGGTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 9 10 185573 CASAVA_Build 12 25158372 4I AACTGCTGAC ----/CTCA CTCAGGTGAT 3070 het 1106 hom 21 3 14 4 CTCA 1 2 185574 CASAVA_Build 12 25162577 1D CTATTCTCCT G/- CCTCAGCCTG 2891 het 2891 ref 24 13 8 3 G 1 0 185575 CASAVA_Build 12 25168482 1D GTCTTCCCCC T/- GACCAGCTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 1 0 185576 CASAVA_Build 12 25168561 1I TTATTCATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 10 11 185577 CASAVA_Build 12 25184440 3D CAAATCAGTA AAG/--- AAGAAGTCAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AAG 3 2 185578 CASAVA_Build 12 25209108 2I GGTCCGGCTT --/AC AGTTTCGTTC 3070 het 509 hom 14 2 12 0 AC 0 1 185579 CASAVA_Build 12 25209854 1D GGAAGCCTAC G/- GGACCATCAC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 G 3 2 185580 CASAVA_Build 12 25220299 1I GGATATATCC -/A AATAGAATCT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 2 3 185581 CASAVA_Build 12 25222532 1I AACAGTTTAA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 7 8 185582 CASAVA_Build 12 25225886 1I ACTTAATAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 9 10 185583 CASAVA_Build 12 25227386 2D TACAATGGGT AC/-- ACATGGTCAT 3070 het 3070 ref 37 15 15 9 AC 2 1 185584 CASAVA_Build 12 25232104 1D AATGCAGAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 10 9 185585 CASAVA_Build 12 25237885 3D AGAAGGATCT AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 30 14 12 7 AAG 4 3 185586 CASAVA_Build 12 25238031 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 25 0 21 4 T 10 9 185587 CASAVA_Build 12 25241355 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1632 het 1632 ref 20 10 4 7 A 13 12 185588 CASAVA_Build 12 25244413 1D CTCCATGCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 10 9 185589 CASAVA_Build 12 25246591 3D CAAATGCAGT GAG/--- GAGGGCCTCT 3070 het 3070 ref 33 14 13 9 GAG 2 1 185590 CASAVA_Build 12 25248842 2D52M1D TTTTACTGAC AAGAGAATGCCATTTACCGAACATTTAATAAGCAAAATAATTTCTTACACACTTA/--GAGAATGCCATTTACCGAACATTTAATAAGCAAAATAATTTCTTACACACTT- CTTCTCTTAA 3070 het 3070 hom 41 29 30 5 N/A 0 0 185591 CASAVA_Build 12 25249930 2D TGCAGATAAC TT/-- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 T 8 6 185592 CASAVA_Build 12 25250732 1D AAAGGTAATT A/- ACCACTACCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 7 A 2 1 185593 CASAVA_Build 12 25251717 1I CTCTGACACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 11 12 185594 CASAVA_Build 12 25252369 1I ACATAGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 29 1 21 7 A 12 13 185595 CASAVA_Build 12 25255086 5I TCAAACTGGT -----/AGTAG AGTAGATTTT 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 AGTAG 1 2 185596 CASAVA_Build 12 25261678 6D TATCCAGTGA TATATT/------ TATATTTAAC 3070 het 3070 hom 46 19 22 7 TATATT 2 1 185597 CASAVA_Build 12 25263123 1I GTTTTTTGTT -/G TTTTTTTAAC 2372 het 1720 hom 19 7 9 3 G 0 1 185598 CASAVA_Build 12 25263538 1D ACTTTAAATA T/- GTAAATTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 1 0 185599 CASAVA_Build 12 25274997 4D CTGTAATAAA AATT/---- AATTATCTCA 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 AATT 2 1 185600 CASAVA_Build 12 25306415 1I ACTCCAGCCT -/G GGTGACAGAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 G 2 3 185601 CASAVA_Build 12 25312289 1D TTCTTTCCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 775 hom 45 2 35 8 T 10 9 185602 CASAVA_Build 12 25327533 1I ATTTACCGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 10 11 185603 CASAVA_Build 12 25339184 1I CACAATTAGG -/A GGACCAGGTT 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 A 0 1 185604 CASAVA_Build 12 25339804 1D TTCAGCAGAG T/- TTTTAGGCTG 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 T 5 4 185605 CASAVA_Build 12 25340434 1D ATATTGTTTT C/- AGCTATAGTT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 C 1 0 185606 CASAVA_Build 12 25341182 1D TAACAGCTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 17 6 T 10 9 185607 CASAVA_Build 12 25342075 1D TCTAATATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 10 9 185608 CASAVA_Build 12 25344244 1D ATTTTCACAT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 34 12 16 10 A 8 7 185609 CASAVA_Build 12 25344546 2I TCTCTCTAAT --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 A 8 10 185610 CASAVA_Build 12 25346258 1I ATGAGGCACC -/A GTCACAATAA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 0 1 185611 CASAVA_Build 12 25349937 3D ATATACATTC TAT/--- TATTCATCAG 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 TAT 2 1 185612 CASAVA_Build 12 25351876 2D CTGTTCTTCT AG/-- AGAGAACCCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AG 3 2 185613 CASAVA_Build 12 25353530 1I GCATTCTCAC -/T TATAGTAATT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 1 2 185614 CASAVA_Build 12 25360249 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 11 9 A 13 12 185615 CASAVA_Build 12 25360350 4D AAAAACAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 35 15 11 13 AAAC 3 2 185616 CASAVA_Build 12 25361232 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2648 hom 18 het 7 0 7 0 A 8 9 185617 CASAVA_Build 12 25361389 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 14 13 185618 CASAVA_Build 12 25361484 7I GTGTGTGTCT -------/AGAAAGG AAAGTCTATT 3070 hom 27 het 20 0 9 11 AGAAAGG 0 1 185619 CASAVA_Build 12 25363564 3D TCAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 213 het 213 ref 16 5 1 10 AAG 1 0 185620 CASAVA_Build 12 25363681 1I CTCAGGGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 31 2 24 5 T 10 11 185621 CASAVA_Build 12 25370371 1I AACTAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 10 185622 CASAVA_Build 12 25371012 3I TTATATATAT ---/TTA TTATCTTTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TTA 1 2 185623 CASAVA_Build 12 25375699 1I TTAATTTACC -/A ACCTTGGGGC 3070 hom 125 het 47 0 38 9 A 1 2 185624 CASAVA_Build 12 25387569 1I CATCTTCCTG -/C CCTCGGCCTC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 2 3 185625 CASAVA_Build 12 25396387 1D CAACAAGCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 10 9 185626 CASAVA_Build 12 25402445 3I AAATGATCCT ---/CCC CCCGTCTTGG 3070 hom 53 het 19 0 17 2 C 3 6 185627 CASAVA_Build 12 25403827 1I TTGGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 23 2 17 4 A 13 14 185628 CASAVA_Build 12 25406236 1D CCTTCCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 11 10 185629 CASAVA_Build 12 25409364 1D TACAGGGCTT A/- AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 28 23 3 2 A 11 10 185630 CASAVA_Build 12 25409692 2I AGCAATGTGC --/AA AAAGTCACCA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 A 3 5 185631 CASAVA_Build 12 25412197 2D TGCTCATCAC AG/-- AGAGCTGTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AG 3 2 185632 CASAVA_Build 12 25420657 1D ATGGGTTCTG T/- TTTCCTGAGC 3070 hom 66 het 23 0 22 1 T 4 3 185633 CASAVA_Build 12 25423873 3D TTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 938 het 73 hom 13 1 8 4 T 21 18 185634 CASAVA_Build 12 25424300 3I GAACTTTCCC ---/GAA CCCACTTGCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 GAA 0 1 185635 CASAVA_Build 12 25440865 5D CTCCCATATT CATGC/----- CATATGGGTA 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 CATGC 1 0 185636 CASAVA_Build 12 25446395 7D TTAGTTTTAT ATCATTA/------- ATCCTAAACC 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 ATCATTA 1 0 185637 CASAVA_Build 12 25447704 2I ATGTGGAAAG --/AT ATATTCTTTA 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 AT 2 3 185638 CASAVA_Build 12 25448461 2I GCTATATGTA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 AT 5 6 185639 CASAVA_Build 12 25453293 1D AATTTCACTT A/- AATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 4 A 3 2 185640 CASAVA_Build 12 25457815 2I AGGGCTACGT --/GC CAGGACAGAG 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 GC 0 1 185641 CASAVA_Build 12 25463966 4I CCTTCCTTCT ----/TTCC TTCCTTCCTT 3070 hom 77 het 34 0 24 10 TTCC 3 4 185642 CASAVA_Build 12 25465761 1I TGCTTCAGGA -/G CCACTCCAGA 3070 hom 87 het 37 0 28 9 G 0 1 185643 CASAVA_Build 12 25466188 2D CCTATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 99 het 38 0 33 8 TG 10 9 185644 CASAVA_Build 12 25470070 1D TCTTGAAGAT A/- TTTTTTAAAC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 1 0 185645 CASAVA_Build 12 25471483 2D8M2D ATCTACCTAC CTACCTACCTAC/--ATCTACCT-- ATCTACCTAT 3070 het 3070 ref 48 19 14 22 N/A 0 0 185646 CASAVA_Build 12 25473167 1D GTTGAGATAC T/- TTTTTTTTTT 1707 het 1707 ref 51 37 4 10 T 13 12 185647 CASAVA_Build 12 25490961 14I AGAAACCCTC --------------/TTCTTACGACACAA TCGTTTACCC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TTCTTACGACACAA 0 1 185648 CASAVA_Build 12 25491864 2I CCATGACTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 10 12 185649 CASAVA_Build 12 25494972 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAACA 1855 het 1855 ref 26 18 5 3 A 8 9 185650 CASAVA_Build 12 25501960 2D ATAAAAAGGC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 11 9 185651 CASAVA_Build 12 25503567 3D GTGGGAGGTG TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 TTA 4 3 185652 CASAVA_Build 12 25506108 1I ATGAATAATA -/T TTCCCTTGTT 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 T 2 3 185653 CASAVA_Build 12 25508975 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 21 4 T 12 11 185654 CASAVA_Build 12 25518943 4I TCCGTGTCTC ----/AGTT AGGGTTAAGC 3070 het 3070 hom 58 24 28 6 AGTT 0 1 185655 CASAVA_Build 12 25527974 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 18 11 A 15 14 185656 CASAVA_Build 12 25534518 1D TGACCATAAT A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 A 1 0 185657 CASAVA_Build 12 25545183 4D TGTTTTTGTC TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 17 9 TGTT 3 2 185658 CASAVA_Build 12 25548743 1D CGAAATAATA T/- CCTAGGTGTA 3070 het 3070 ref 48 24 17 8 T 1 0 185659 CASAVA_Build 12 25552313 4I GTTTTTATTG ----/TTCA TTAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 TTCA 0 1 185660 CASAVA_Build 12 25559390 1I ACTTGGTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 9 10 185661 CASAVA_Build 12 25560141 1D23M2I TGTTTTGTCT GGTTTTTTTTCTTTGCCAGCTATT--/-GTTTTTTTTCTTTGCCAGCTATTAA GTGTGTGCTA 3070 het 3070 hom 40 24 24 3 N/A 0 0 185662 CASAVA_Build 12 25561969 7I AAGCAGGAAA -------/AAAAAAG AAAGAAAAAG 2479 het 1989 hom 14 4 6 4 AAAAAAG 0 1 185663 CASAVA_Build 12 25562698 1D ACAAAAAGTG T/- TTTTTCATTG 3070 het 3070 hom 44 22 19 3 T 6 5 185664 CASAVA_Build 12 25565340 1D GTTTGCAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 T 10 9 185665 CASAVA_Build 12 25566394 1I AGATTATGGC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 A 7 8 185666 CASAVA_Build 12 25577703 1D TGCTTTTAGG T/- TTTTTGATAT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 6 5 185667 CASAVA_Build 12 25579231 1I AAATAAATTG -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 A 5 6 185668 CASAVA_Build 12 25579615 1I AAATAATGGT -/A AAAAATTTTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 5 6 185669 CASAVA_Build 12 25580197 2I GTCATTTCAT --/AA AATGATACAA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 A 2 4 185670 CASAVA_Build 12 25588569 5I CTATTTTATC -----/TGATA TAAGTATAGC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TGATA 0 1 185671 CASAVA_Build 12 25594412 1I AAAGATTTCC -/T TTTTTATATC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 5 6 185672 CASAVA_Build 12 25619891 1I CTCTATTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 10 185673 CASAVA_Build 12 25627546 1I TTTTAAAAAA -/C TTTTAGTAGA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 0 1 185674 CASAVA_Build 12 25632855 2I TTAGCAAAAC --/AT GTGGGGTTTC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 AT 0 1 185675 CASAVA_Build 12 25641134 2I GCACAGAGTC --/TT TATTAGTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 3 185676 CASAVA_Build 12 25642891 1I CTGCAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 11 185677 CASAVA_Build 12 25657978 19D CATTGGAAAG AGAGAAAGTATTTGGAAAT/------------------- ACTTTCACTT 3070 hom 69 het 22 0 21 6 AGAGAAAGTATTTGGAAAT 1 0 185678 CASAVA_Build 12 25668395 11I CAATAGGGAT -----------/GCAAGATGAAC TGTTCTCAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 GCAAGATGAAC 0 1 185679 CASAVA_Build 12 25668787 16I ATAGGACTTT ----------------/TAGGAGTCATTGCCTA TAGGAGTCAT 3070 hom 87 het 39 0 28 11 TAGGAGTCATTGCCTA 1 2 185680 CASAVA_Build 12 25669231 1D ATATATACAC A/- TGCACACATT 3070 hom 132 het 47 0 44 5 A 1 0 185681 CASAVA_Build 12 25677245 1D AAAAAAAAAA C/- AAACTTTAAA 3070 het 1599 hom 39 5 23 11 C 1 0 185682 CASAVA_Build 12 25680065 1D AGCAAAGCAA G/- CAAAAACATA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 1 0 185683 CASAVA_Build 12 25703814 1D TCTAATTCAC T/- TTCTTAACAT 3070 hom 116 het 45 0 37 9 T 3 2 185684 CASAVA_Build 12 25713492 1D AATACTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 37 0 29 8 A 12 11 185685 CASAVA_Build 12 25742867 1I TCAGAACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 10 11 185686 CASAVA_Build 12 25760623 1D GAAGGAAGTT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 8 7 185687 CASAVA_Build 12 25815906 1I ACCTTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 849 het 849 ref 34 16 3 15 A 15 16 185688 CASAVA_Build 12 25822562 1I ATATGGCTGC -/A AATGATATCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 3 185689 CASAVA_Build 12 25829917 1D AGTCAGGGCT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 31 hom 20 1 15 4 G 9 8 185690 CASAVA_Build 12 25833979 1D AGGCAGTTCC A/- AATTCCAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 2 185691 CASAVA_Build 12 25838128 1D CTTCTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 30 1 18 11 T 12 11 185692 CASAVA_Build 12 25841286 1I CTGAAAAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 342 hom 37 1 28 8 T 9 10 185693 CASAVA_Build 12 25847785 2I GAAAAGCAAG --/AA AAAAATTACA 3070 het 3070 ref 47 31 13 3 A 5 7 185694 CASAVA_Build 12 25863466 1D AATATGTGTC T/- TTTTTTTTTT 1214 het 1214 ref 40 26 4 10 T 12 11 185695 CASAVA_Build 12 25875898 1D TGTTCATGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 26 0 20 7 A 10 9 185696 CASAVA_Build 12 25876060 5I GTATTGTTAG -----/ACTCT ACTCTATAAC 3070 hom 135 het 50 0 44 6 ACTCT 1 2 185697 CASAVA_Build 12 25881972 1I AATAGGTTTC -/T TTTGATATGC 3070 hom 141 het 49 0 47 2 T 3 4 185698 CASAVA_Build 12 25891624 1I AAGTATAGAA -/T ACATTTTGTG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 0 1 185699 CASAVA_Build 12 25893392 2I GCGTGAATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 42 het 21 0 15 6 AT 5 6 185700 CASAVA_Build 12 25894892 1D GTTTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 A 13 12 185701 CASAVA_Build 12 25936250 1I46M1D AATCTCTTTA -TTTAGTAATTTGGTAGGATTTTCTCTAGAACAGATCATTTTCTTTAT/TTTTAGTAATTTGGTAGGATTTTCTCTAGAACAGATCATTTTCTTTA- TTTTTCCCTC 3070 hom 111 het 32 0 38 11 N/A 0 0 185702 CASAVA_Build 12 25937424 1D AATTTTAAAC A/- CGTAGGATCA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 A 1 0 185703 CASAVA_Build 12 25938896 1I AAAAAAAAAA -/T GTTTTCCAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 0 1 185704 CASAVA_Build 12 25943441 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAATCC 3070 hom 164 het 62 0 55 7 A 8 7 185705 CASAVA_Build 12 25946641 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 839 hom 25 3 14 8 T 17 16 185706 CASAVA_Build 12 25948172 1D GAGAGTGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 121 het 50 0 41 9 A 13 12 185707 CASAVA_Build 12 25951549 1I TTTTTTTTTT -/G AGATGGAGTC 3070 het 339 hom 22 1 18 3 G 0 1 185708 CASAVA_Build 12 25953316 2D TTTTTTGTAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 AC 8 7 185709 CASAVA_Build 12 25968250 1D TCCTTCTGTC A/- AAAGCCTCCC 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 A 4 3 185710 CASAVA_Build 12 25970190 5I TAAATAAAAC -----/AATAA AATAAAATAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AATAA 3 4 185711 CASAVA_Build 12 25974377 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 43 0 32 11 T 11 12 185712 CASAVA_Build 12 25980564 4D CCCTAGGAAC CTGA/---- CTGACTCCTC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 CTGA 2 1 185713 CASAVA_Build 12 25981053 1D AGAAGGCTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 9 8 185714 CASAVA_Build 12 25982810 1D AAAAAAAAAA G/- AAGAAGAACT 3070 hom 74 het 33 0 27 7 G 1 0 185715 CASAVA_Build 12 25989129 1D AAGATAGGCT A/- AAAAAACTCT 3070 hom 96 het 37 0 32 7 A 7 6 185716 CASAVA_Build 12 25992659 1D CTTCACAAAG T/- TTTTTCAACA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 6 5 185717 CASAVA_Build 12 25998008 4D TCAGATCCCC TTGA/---- TTAACTTGAC 3070 hom 63 het 26 0 22 5 TTGA 1 0 185718 CASAVA_Build 12 26001884 1D AAGGCGGGGT G/- GGGGGGGGCA 2875 het 2875 ref 30 11 12 7 G 9 8 185719 CASAVA_Build 12 26006255 1D CAGCAGCCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 39 0 34 5 A 10 9 185720 CASAVA_Build 12 26027443 1I12M4I TAAAAATGAC -AAAAAAAATCTG----/AAAAAAAAATCTGAAAA AAACTAAATA 3070 hom 105 het 33 0 36 2 N/A 0 0 185721 CASAVA_Build 12 26038036 1I TTTTTATTAG -/A AAAAAAAAAA 1202 het 1202 ref 32 24 3 5 A 10 11 185722 CASAVA_Build 12 26038479 2D ATAGATTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 32 0 28 4 A 14 12 185723 CASAVA_Build 12 26047644 4I GCAGTGGGAG ----/AAGT AAGTAAGGTA 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 AAGT 1 2 185724 CASAVA_Build 12 26054405 4D TAGGAGAGTT AGTC/---- AGGCACCAGC 3070 het 3070 ref 40 24 12 6 AGTC 1 0 185725 CASAVA_Build 12 26055485 3D CCATTGAAAA TAG/--- TAGGTACTGA 3070 het 3070 hom 50 23 21 7 TAG 2 1 185726 CASAVA_Build 12 26057832 1D AAAACTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 11 10 185727 CASAVA_Build 12 26059870 1I ACTTATTTTT -/A TAGTGATGTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 0 1 185728 CASAVA_Build 12 26060051 1D TTTTTCTTTA T/- TGATAAGAAT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 T 2 1 185729 CASAVA_Build 12 26060422 1D TTTTTTTTTT A/- TTTGTTTGTT 2695 het 2139 hom 30 13 10 7 A 1 0 185730 CASAVA_Build 12 26061569 4I TAGAGATTGA ----/TAAG TAAGAGGTGA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 TAAG 1 2 185731 CASAVA_Build 12 26062322 1D ATTCTTGAGA T/- GAATCTTTGA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 1 0 185732 CASAVA_Build 12 26066902 1D GTATAATAAC A/- AAAAAAATTT 1777 het 1777 ref 20 12 5 3 A 8 7 185733 CASAVA_Build 12 26072395 6D CAGAACTTCA TTTTCT/------ TTCCCTGTAC 2560 het 2560 ref 21 15 6 3 TTTTCT 1 0 185734 CASAVA_Build 12 26085255 1D GCCTGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1591 hom 18 5 11 2 T 11 10 185735 CASAVA_Build 12 26090873 1D CCATCTCTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 9 8 185736 CASAVA_Build 12 26097388 1D TCCACAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 12 11 185737 CASAVA_Build 12 26097816 1D TGGCTTTCTT A/- ACATTTCTTT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 2 1 185738 CASAVA_Build 12 26101309 10I TTTGTGTGTG ----------/TGTGTGTGTA TGTGTGTGTG 3070 hom 26 het 36 1 19 17 TGTGTGTGTA 0 1 185739 CASAVA_Build 12 26115610 1I GTGTTTTTTT -/A TAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 0 1 185740 CASAVA_Build 12 26116015 1D TAAATACAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 A 10 9 185741 CASAVA_Build 12 26120460 1D CACAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 2876 het 2126 hom 20 8 8 4 T 13 12 185742 CASAVA_Build 12 26130119 1I AAGTTTTTCA -/T TTTTTTGTAG 2725 het 2725 ref 24 16 7 1 T 6 7 185743 CASAVA_Build 12 26135836 1I AATAAACACA -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 135 het 50 0 45 5 T 7 8 185744 CASAVA_Build 12 26136734 1I8M1I ACTGCAGCAG -AAATTAGG-/AAAATTAGGC CTACAACCTG 3070 hom 56 het 24 0 17 9 N/A 0 0 185745 CASAVA_Build 12 26138603 1I ATGGATTGAT -/C CATTCAGAGA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 C 1 2 185746 CASAVA_Build 12 26142317 1D AGGGTGGTGG T/- TCTCAATTGA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 2 1 185747 CASAVA_Build 12 26144198 3I TTTAATAATA ---/TTG TTATTGATAT 2397 het 2397 ref 16 9 5 2 TTG 0 1 185748 CASAVA_Build 12 26153052 1D CATCAAACAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 9 8 185749 CASAVA_Build 12 26162050 4I AACCACTGAC ----/TGTT TGTCCCTCCT 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 TGTT 0 1 185750 CASAVA_Build 12 26177815 4I AAAATCTTGA ----/CAAT CAATTGGTTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CAAT 1 2 185751 CASAVA_Build 12 26195396 1D GTTTTCTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 10 9 185752 CASAVA_Build 12 26213232 1I CCTCATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 A 10 11 185753 CASAVA_Build 12 26215825 1D GTTTTCCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1194 hom 21 6 14 1 T 11 10 185754 CASAVA_Build 12 26220040 1D TTATTTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 22 1 14 7 T 15 14 185755 CASAVA_Build 12 26230405 1I CAGGAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 A 10 11 185756 CASAVA_Build 12 26235878 24D AATTTGTTCT ACACACACACACACACACACACAC/------------------------ ACACACACAC 3070 hom 105 het 37 0 36 5 AC 20 8 185757 CASAVA_Build 12 26257329 1D TTGAAAAGCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 T 9 8 185758 CASAVA_Build 12 26257470 1D TAACAGAAAT A/- AAAAGAGTCA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 5 4 185759 CASAVA_Build 12 26259101 1I TTTAAAAAAA -/T AACACATTGG 3070 hom 71 het 27 0 24 3 T 0 1 185760 CASAVA_Build 12 26263682 1D GCACATCCAC A/- AAAAATGGAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 6 5 185761 CASAVA_Build 12 26269460 1I TACTAAGGTG -/A AAAAAAATAA 3070 het 411 hom 35 1 30 4 A 7 8 185762 CASAVA_Build 12 26272574 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1782 het 1782 ref 26 12 6 8 A 15 16 185763 CASAVA_Build 12 26276208 1D CACCACAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 20 het 41 2 28 12 A 10 9 185764 CASAVA_Build 12 26276569 1I GACTTCTCTC -/T TGTGATTATT 3070 het 3070 ref 56 29 22 5 T 1 2 185765 CASAVA_Build 12 26277532 2D CCGTCAGGAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 1469 hom 24 5 11 8 AT 9 8 185766 CASAVA_Build 12 26285385 1D CTTTAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 50 1 42 7 A 12 11 185767 CASAVA_Build 12 26288060 5D TCTTCTGCTC TTTAG/----- TTTAGGTCTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 TTTAG 2 1 185768 CASAVA_Build 12 26328527 2D ACACACATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 62 het 30 0 21 10 TA 8 7 185769 CASAVA_Build 12 26329884 4D CCAGACAAAC TGTT/---- TGCTTCCTGA 3070 hom 138 het 51 0 46 6 TGTT 1 0 185770 CASAVA_Build 12 26334920 7I CTAGACTTTA -------/GACTTTT AACTCAACAT 3070 hom 96 het 40 0 29 11 GACTTTT 0 1 185771 CASAVA_Build 12 26341917 3I3M11I3M3D TTGATTTGAG ---TTA-----------GGACAT/AACTTAAAAGAGTTGTTGGA--- GCTCCATGTT 3070 hom 120 het 40 0 40 3 N/A 0 0 185772 CASAVA_Build 12 26345918 1I ATGTATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 556 hom 24 2 17 5 T 15 16 185773 CASAVA_Build 12 26349305 6D TTATAATTGC TAAAAG/------ TAAAAGGACT 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 TAAAAG 2 1 185774 CASAVA_Build 12 26353240 1D GATTAATGGA T/- TTTTAACAAT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 5 4 185775 CASAVA_Build 12 26354080 1I TTTTCCCCTA -/G GGATAATCAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 2 3 185776 CASAVA_Build 12 26357152 1D GATCCTGGGC T/- TTTTTTTTTG 2903 het 2903 ref 25 17 6 2 T 10 9 185777 CASAVA_Build 12 26364178 8I TGGTAAGTAG --------/CCCTAACA CCCTAACACC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 CCCTAACA 1 2 185778 CASAVA_Build 12 26365365 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAGAAAA 3070 hom 60 het 22 0 19 3 A 5 6 185779 CASAVA_Build 12 26370666 23D TTGCAGGCTG ATGACTTCTCACTGTATCATCAC/----------------------- AGGATGGAAA 3070 het 3070 ref 38 25 17 5 ATGACTTCTCACTGTATCATCAC 1 0 185780 CASAVA_Build 12 26374308 1D CATCCAGGAC A/- AATTTCTCTA 3070 het 3070 ref 46 21 22 3 A 3 2 185781 CASAVA_Build 12 26376143 1I AGCCTCAGAT -/G TGTCAGCTGG 3070 het 3070 hom 42 13 14 15 G 0 1 185782 CASAVA_Build 12 26398469 2I GCCAGACTCC --/CT CTCAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 CT 1 2 185783 CASAVA_Build 12 26399618 4I CTGGACCAAC ----/TAAG TAAGAATGAA 3070 hom 113 het 43 0 37 6 TAAG 1 2 185784 CASAVA_Build 12 26401828 1I GCTGTAGCCT -/G GGGGACTCCC 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 G 4 5 185785 CASAVA_Build 12 26403803 1D TCTTGTGGGG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 117 het 43 0 38 6 A 9 8 185786 CASAVA_Build 12 26411425 1D TGTAAAAAAA T/- ATATCAATGT 3070 het 3070 ref 37 21 11 6 T 1 0 185787 CASAVA_Build 12 26411682 1D ATCACTGAGG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 9 8 185788 CASAVA_Build 12 26414857 3D GAATTTATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 2943 het 2943 ref 27 15 9 4 TTG 5 4 185789 CASAVA_Build 12 26418015 1D AAAGCTGATT A/- CATGTGTGAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 6 A 1 0 185790 CASAVA_Build 12 26428128 1D TGAGGAAGGA C/- TTTTCACATT 3070 het 3070 ref 44 24 19 1 C 1 0 185791 CASAVA_Build 12 26433689 2D GCCTCTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2846 het 1673 hom 28 11 9 8 T 14 12 185792 CASAVA_Build 12 26439793 1I TATGACCGTG -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 62 27 20 15 A 7 8 185793 CASAVA_Build 12 26445268 1D TATCTCTACT A/- AAAATCAAAA 1941 het 1941 ref 14 8 4 2 A 5 4 185794 CASAVA_Build 12 26449335 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 33 3 22 8 A 13 12 185795 CASAVA_Build 12 26459724 9D AAACACTAAT AAGAAAAGA/--------- AGGCATTGGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 AAGAAAAGA 1 0 185796 CASAVA_Build 12 26461989 4I AACAAGAAAG ----/TTGA TTGAGCACAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 TTGA 1 2 185797 CASAVA_Build 12 26466218 1I TGTTTGTTTG -/T TTAATTAGTG 3070 het 2545 hom 24 7 11 6 T 2 3 185798 CASAVA_Build 12 26466545 4D TAATTAGATA ATTT/---- ATTAGTTAAA 1938 het 1938 ref 14 8 6 1 ATTT 1 0 185799 CASAVA_Build 12 26476231 1D ACATTTATTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 185800 CASAVA_Build 12 26476447 1I TATCTTTTAA -/T TTTGGATAGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 3 4 185801 CASAVA_Build 12 26480975 1I TAAAAAAACT -/C CAAACCCATA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 C 1 2 185802 CASAVA_Build 12 26481870 1D TTGAAAATTA T/- TTTAAGATTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 T 4 3 185803 CASAVA_Build 12 26484137 1I ACTTTAGACT -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 7 8 185804 CASAVA_Build 12 26488949 3I ATGAATTTTA ---/AAT AATAATTCAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAT 2 3 185805 CASAVA_Build 12 26491229 4I TCTCATATTG ----/TATC TATCTGAGTA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TATC 1 2 185806 CASAVA_Build 12 26491742 1I AATCAAGAAA -/C TATGCTTTGA 3070 het 359 hom 36 2 28 6 C 0 1 185807 CASAVA_Build 12 26492202 2I GACTTTTTTT --/AA TAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 34 2 24 8 A 0 2 185808 CASAVA_Build 12 26494650 1I GGTCCTTCAT -/A AAGAACACAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 2 3 185809 CASAVA_Build 12 26496582 1I ACACATTTTC -/A AAAAAAATGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 8 185810 CASAVA_Build 12 26497359 4I CAGAAGATAC ----/TTAT TTAAGATTTT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 TTAT 0 1 185811 CASAVA_Build 12 26511572 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 49 22 19 10 TCTT 1 0 185812 CASAVA_Build 12 26512425 3D TTGTAACAAC AGA/--- AGGAGATATT 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 AGA 1 0 185813 CASAVA_Build 12 26521580 2D TATCAGTAAC AT/-- ATTTTACAGA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 AT 2 1 185814 CASAVA_Build 12 26523345 1D ATTCACTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 16 2 11 3 A 15 14 185815 CASAVA_Build 12 26525053 12D AAGTAAAGTT AAAAATAAAATA/------------ AAAAATAAAA 3070 het 1777 hom 15 5 11 2 AAAAATAAAATA 2 1 185816 CASAVA_Build 12 26530614 1I TTTACTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 14 13 A 13 14 185817 CASAVA_Build 12 26538231 1D GATACATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 36 1 29 6 T 13 12 185818 CASAVA_Build 12 26544581 1I ACCACAGTTG -/A AGAAGTTTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 1 2 185819 CASAVA_Build 12 26550412 1D CTACCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 13 12 185820 CASAVA_Build 12 26553745 2I GCTGCTATTT --/AC CATAAAGTTC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AC 0 1 185821 CASAVA_Build 12 26558148 1D TGTCATTTGT C/- CGTTTGTCCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 2 1 185822 CASAVA_Build 12 26566453 2I TCCTGTTTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 AC 6 7 185823 CASAVA_Build 12 26568388 4D ACGAATAAGG CTAT/---- CTAATAGTAT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 CTAT 1 0 185824 CASAVA_Build 12 26582762 8D GCCTGTGATT TTTTTTTC/-------- TTTTTTTCTT 2265 het 2265 ref 27 7 17 4 TTTTTTTC 3 2 185825 CASAVA_Build 12 26588768 4D34M2D TCACACATAG ACACACACACACACAGACAAACACACAGAGACACACAGAC/----ACACACACACAGACAAACACACAGAGACACACAG-- ACACACACAC 3070 het 1945 hom 32 9 19 16 N/A 0 0 185826 CASAVA_Build 12 26594891 5D ATACAAATAT TTATA/----- TTATATTACA 2668 het 2022 hom 15 6 7 4 TTATA 2 1 185827 CASAVA_Build 12 26602061 1I ACATTAGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 9 10 185828 CASAVA_Build 12 26603750 12D ACATCACCTC CTAATACTAATA/------------ CTAATACTAT 3070 hom 60 het 23 0 21 7 CTAATA 3 1 185829 CASAVA_Build 12 26618416 1D GGAACCTGTT A/- AAAAAAAAAA 2533 het 2482 hom 29 11 11 7 A 15 14 185830 CASAVA_Build 12 26633856 1I GCGTGGTGGC -/G GGGGGCCTAT 2089 hom 22 het 10 0 8 2 G 5 6 185831 CASAVA_Build 12 26637939 1I ATTTTTTTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 32 0 27 5 G 0 1 185832 CASAVA_Build 12 26644914 4D TCCTCTTTTC CTAT/---- CTATTATTTC 3070 hom 95 het 35 0 32 6 CTAT 2 1 185833 CASAVA_Build 12 26649589 1I GGCCATTTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 T 8 9 185834 CASAVA_Build 12 26650745 1I AGTTCCTCCC -/T TTTTTTTTTT 2796 het 422 hom 28 2 14 12 T 14 15 185835 CASAVA_Build 12 26653830 1I TGGAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 10 11 185836 CASAVA_Build 12 26656444 1D ATTGGAGATA T/- TTTTTATTCT 3070 het 3070 hom 43 16 19 9 T 6 5 185837 CASAVA_Build 12 26663013 12D GTAATAATAT ATGTTAGAGAAA/------------ ATGAATGAGT 3070 het 3070 ref 25 17 13 4 ATGTTAGAGAAA 1 0 185838 CASAVA_Build 12 26665634 1D CACATTATAA T/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 7 6 185839 CASAVA_Build 12 26674647 1D GATGGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 2523 het 2523 ref 41 17 10 14 A 11 10 185840 CASAVA_Build 12 26677343 1D GATTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 13 12 185841 CASAVA_Build 12 26685647 1I28M5D AAGCTGTAGG -TTTTTTTTTTAAAGAAGAGAGAAAAAGAAAAAG/TTTTTTTTTTTAAAGAAGAGAGAAAAAGA----- AAAAGAAACC 3070 het 3070 ref 23 16 11 4 N/A 0 0 185842 CASAVA_Build 12 26686140 4D TAGAAGGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 53 22 22 12 AAAC 4 3 185843 CASAVA_Build 12 26692385 1I GATTTCCCAG -/A AAAAAACAAA 3070 hom 103 het 42 0 35 7 A 6 7 185844 CASAVA_Build 12 26694282 1D TTGCTGAAAG A/- ATAATTAAGG 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 2 1 185845 CASAVA_Build 12 26708541 1I ATTTACTGTT -/G TTTGTATACA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 0 1 185846 CASAVA_Build 12 26710360 3D ATAGATAGAT AGA/--- TTTTTTTTTA 944 het 517 hom 35 4 2 29 AGA 1 0 185847 CASAVA_Build 12 26712120 3I ATTGCAAATC ---/ACG ACATGTCAAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 ACG 0 1 185848 CASAVA_Build 12 26713008 1D TGGATATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 11 10 185849 CASAVA_Build 12 26721294 1I TTCAAGGGTA -/C ATTGCTAATG 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 C 0 1 185850 CASAVA_Build 12 26722613 2I AAGGGAAGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 2383 hom 29 6 16 7 AG 8 9 185851 CASAVA_Build 12 26726072 4I TTAAAGAGTT ----/ACTC ACCTCCTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 ACTC 0 1 185852 CASAVA_Build 12 26726695 2D ATAAGGAACA TG/-- TGTCACACAG 3070 het 3070 hom 56 23 29 4 TG 2 1 185853 CASAVA_Build 12 26734560 2D AATAAATGGC AA/-- GCGCCAGTCT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 2 0 185854 CASAVA_Build 12 26739931 1I ATTCAATTAA -/T TATTCTATCC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 1 2 185855 CASAVA_Build 12 26740204 1I CAAATTAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 A 8 9 185856 CASAVA_Build 12 26746632 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1485 het 15 hom 10 1 6 3 T 12 11 185857 CASAVA_Build 12 26747102 1D GCAATTCACC A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 50 13 31 7 A 8 7 185858 CASAVA_Build 12 26748373 1I TATAGACCAT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 7 8 185859 CASAVA_Build 12 26748833 4D CTCTGCATTT TCTC/---- TCTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 48 29 18 3 TC 3 1 185860 CASAVA_Build 12 26752098 1D CTCAACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 7 A 11 10 185861 CASAVA_Build 12 26765406 1I AAAAGTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 10 11 185862 CASAVA_Build 12 26804689 19I CTAAGTACAA -------------------/ATCAGTTTGACTCTATTAT ACCCCAAGGC 3070 het 3070 hom 40 15 18 8 ATCAGTTTGACTCTATTAT 0 1 185863 CASAVA_Build 12 26808918 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAACTG 2281 het 2281 ref 28 12 6 10 A 7 8 185864 CASAVA_Build 12 26818000 3D GCAAAGCAAT GTG/--- GTGTTCTCAT 3070 het 3070 ref 44 30 12 3 GTG 2 1 185865 CASAVA_Build 12 26824253 1D ACTCAGCCTC T/- TTCCCCAGCC 2817 het 1840 hom 19 7 8 6 T 3 2 185866 CASAVA_Build 12 26826864 1I GCATAACTTC -/T TTATACTTAC 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 2 3 185867 CASAVA_Build 12 26827607 6D CCACCCTCCA GGAAAT/------ GGTCCCTGGG 3070 het 3070 ref 48 26 19 10 GGAAAT 1 0 185868 CASAVA_Build 12 26828039 1I CATATTCTAT -/A AAAATACCTA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 4 5 185869 CASAVA_Build 12 26834697 3D GCTGTTTAAA ACT/--- ACATTAAACA 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 ACT 1 0 185870 CASAVA_Build 12 26844426 1D CTTTCCATTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2991 hom 27 11 11 5 A 10 9 185871 CASAVA_Build 12 26859150 4D CCTAAACAAA TTTG/---- TTTATCTGTA 3070 het 3070 hom 38 14 20 6 TTTG 1 0 185872 CASAVA_Build 12 26871467 21D TGCACTTACA CGGAGAAAAGAACAATAAACT/--------------------- CGGAGAAAAG 3070 hom 102 het 42 0 35 10 CGGAGAAAAGAACAATAAACT 1 0 185873 CASAVA_Build 12 26872453 3D TAATGACCCC ACA/--- ACAAGACAAT 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 ACA 2 1 185874 CASAVA_Build 12 26891616 1D TTTATCTAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 10 9 185875 CASAVA_Build 12 26898638 1D TCTAGCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 12 11 185876 CASAVA_Build 12 26907298 1D TTGTTCCCAA C/- CTGCCTGATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 2 1 185877 CASAVA_Build 12 26912967 1I TTTAAATGTA -/T TATAATCAGG 3070 hom 163 het 58 0 55 4 T 1 2 185878 CASAVA_Build 12 26927026 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2444 het 2444 ref 26 15 6 5 A 11 12 185879 CASAVA_Build 12 26928879 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1604 hom 17 7 9 2 A 12 11 185880 CASAVA_Build 12 26930640 4I CAAGAAGTGC ----/TAAT TAATTGAGCT 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 TAAT 1 2 185881 CASAVA_Build 12 26931235 2I46M1D CATTTTTAAG --ACAGACCTTAATCGTCAGTTATATTAGGTAGTTGTTAGGTTTTGGTA/ACACAGACCTTAATCATCAGTTATATTAGGTAGTTGTTAGGTTTTGGT- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 19 21 3 N/A 0 0 185882 CASAVA_Build 12 26938413 1I AGGAGGCTGA -/G GGGGGAGGAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 5 6 185883 CASAVA_Build 12 26939697 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2826 het 1989 hom 33 13 11 9 TA 6 7 185884 CASAVA_Build 12 26948938 2D CCCAAGAAAC AT/-- ATAACATGTA 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 AT 2 1 185885 CASAVA_Build 12 26951504 1I CAGAAGCAGA -/C TCCCACATAC 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 C 0 1 185886 CASAVA_Build 12 26975653 6I CAAAATAAAT ------/AAAAGA AAAAGAAAAA 2710 het 1700 hom 12 4 6 2 AAAAGA 2 3 185887 CASAVA_Build 12 26980714 1D AAATTCATAT A/- AAAATTCATT 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 A 5 4 185888 CASAVA_Build 12 26987671 1D CAATTTCTCT A/- AAAAAATCTT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 7 6 185889 CASAVA_Build 12 26995349 1D AGGTATACGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 12 11 185890 CASAVA_Build 12 27012862 4I AACTGATGGA ----/TATT TAGTTTGCAA 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 TATT 0 1 185891 CASAVA_Build 12 27014566 1I GCTTGCAGAT -/G GCTCCCCTCT 3070 het 3070 ref 53 30 19 4 G 1 2 185892 CASAVA_Build 12 27016621 1D CAATACAGAC T/- TTTTTTTTTT 1416 het 1416 ref 17 6 5 6 T 13 12 185893 CASAVA_Build 12 27019862 1I TGTTCAGCTG -/T TGGAAGAGTG 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 T 1 2 185894 CASAVA_Build 12 27022945 2D ACCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2241 het 736 hom 24 8 7 9 T 18 16 185895 CASAVA_Build 12 27042374 3D TTCTTCCTAC CTT/--- CTTGACTACT 3070 het 3070 ref 32 19 9 6 CTT 2 1 185896 CASAVA_Build 12 27223792 2I CCTTTTGAAA --/TT AAAGGAATCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 2 185897 CASAVA_Build 12 27224964 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 12 11 185898 CASAVA_Build 12 27254320 3D CTGATAACAT ATA/--- ATGATCTCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 ATA 1 0 185899 CASAVA_Build 12 27254911 2D TACCCTCCCA CT/-- CTCTCTCTTG 3070 hom 78 het 31 0 26 6 CT 5 4 185900 CASAVA_Build 12 27256656 3I AGATTTTGAA ---/GAG GAGATATAGC 3070 hom 95 het 39 0 30 9 GAG 1 2 185901 CASAVA_Build 12 27263773 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 10 11 185902 CASAVA_Build 12 27268324 1D AGTGTGGCAG T/- TTTTTTTACA 3070 hom 81 het 32 0 26 6 T 8 7 185903 CASAVA_Build 12 27269005 2D72M1D GGGAACTCTC TGTACTTTCCATTCAATTTTGCTGTGAACCTAAAACTGCTCTAAAAAATGAAGCCTATTAAAGATGTATTAGCTA/--TACTTTCCATTCAATTTTGCTGTGAACCTAAAACTGCTCTAAAAAATGAAGCCTATTAAAGATGTATTAGCT- AAAAAAAGGG 3070 het 252 hom 27 1 22 27 N/A 0 0 185904 CASAVA_Build 12 27277091 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTGTAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 6 7 185905 CASAVA_Build 12 27281235 2D CTTGCTGTCT TC/-- TCTCTCTCAC 3070 hom 114 het 43 0 36 10 TC 5 4 185906 CASAVA_Build 12 27283713 1D ATTTCAGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 10 9 185907 CASAVA_Build 12 27290951 4I TACTTAAGTG ----/CACT CACTGGTTGC 3070 hom 99 het 40 0 32 8 CACT 1 2 185908 CASAVA_Build 12 27292838 1D GTACTCATAG T/- TTAAGTACAG 3070 hom 120 het 46 0 40 7 T 3 2 185909 CASAVA_Build 12 27297645 5I GATGGGTCTC -----/TCCTT TCTAGTGAAA 3070 hom 111 het 40 0 36 4 TCCTT 0 1 185910 CASAVA_Build 12 27303170 2I CCCATCTCTC --/TT TTCCTCTCAG 3070 hom 138 het 48 0 47 1 T 2 4 185911 CASAVA_Build 12 27306373 6I AAACCACAGA ------/AATCTC AATCTCACAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AATCTC 1 2 185912 CASAVA_Build 12 27308419 5I CAAGTTCTAT -----/ATAAA GAGCAATGAT 3070 het 3070 ref 39 27 9 3 ATAAA 0 1 185913 CASAVA_Build 12 27308475 2D TTGAATGCTG GT/-- AAGTAATGTT 2635 het 2635 ref 55 39 6 11 GT 1 0 185914 CASAVA_Build 12 27308586 1I5M1I GAGATTTTGA -AAGAG-/CAAGAGT GTTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 56 42 8 7 N/A 0 0 185915 CASAVA_Build 12 27311939 1D CTTCCTCATT C/- GAAACTAGAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 1 0 185916 CASAVA_Build 12 27326731 1D AAAACTAAAG T/- TTTTTTTTTA 1311 het 1311 ref 37 31 3 3 T 10 9 185917 CASAVA_Build 12 27346219 1D AACTTGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 13 12 185918 CASAVA_Build 12 27371567 1D TTTAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1707 het 33 hom 13 1 10 2 T 13 12 185919 CASAVA_Build 12 27381811 1D CAGATGTCAC T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 7 6 185920 CASAVA_Build 12 27396142 2D AAATTTAATA TT/-- TTTAGACCAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 6 T 5 3 185921 CASAVA_Build 12 27396774 10D TAGTCCTGGG CAGTCAGAGC/---------- AGTCCTAGCC 3070 het 3070 ref 35 20 14 5 CAGTCAGAGC 1 0 185922 CASAVA_Build 12 27422163 2I CTCCCTACTC --/TT TTATCTGGAA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 T 2 4 185923 CASAVA_Build 12 27463167 2I11M2I CAGCAGAACA --AGACTCCATCT--/AGAGACTCCATCTAA AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 26 0 23 3 N/A 0 0 185924 CASAVA_Build 12 27473679 1D ATAAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 25 1 19 6 A 13 12 185925 CASAVA_Build 12 27485876 1I ATCCAGACAG -/A AAAATCAACA 3070 hom 117 het 49 0 40 9 A 4 5 185926 CASAVA_Build 12 27499111 1I GAGCTCATCC -/T TTTTTTATGG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 6 7 185927 CASAVA_Build 12 27514701 1I GAACAGCCAG -/T TTGAAAGGGG 3070 hom 169 het 58 0 57 1 T 2 3 185928 CASAVA_Build 12 27521777 1I TATCCAAATA -/T TTGGTTTCCT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 2 3 185929 CASAVA_Build 12 27541779 1D TTGTATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1860 hom 34 4 21 9 A 11 10 185930 CASAVA_Build 12 27568965 1D CGTTGAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 2863 hom 23 9 9 5 A 9 8 185931 CASAVA_Build 12 27579771 1D TGCCTGGCAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2815 hom 31 10 13 8 T 9 8 185932 CASAVA_Build 12 27584265 1I CTATTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 2164 het 2164 ref 34 15 8 11 T 15 16 185933 CASAVA_Build 12 27585612 4D AACATCTGAG TGAC/---- TGAAACCAGC 3070 het 3070 hom 33 16 15 5 TGAC 1 0 185934 CASAVA_Build 12 27588746 1D AATTTACAAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 1841 hom 22 5 17 0 A 7 6 185935 CASAVA_Build 12 27595779 1D TTGATGTTCC A/- TTGTGTAATG 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 A 1 0 185936 CASAVA_Build 12 27598185 1D GAATTGAGCA G/- GGCAGAAAAA 3070 het 3070 hom 49 16 23 12 G 3 2 185937 CASAVA_Build 12 27601156 1D CCCACCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 10 A 11 10 185938 CASAVA_Build 12 27603379 1D TTAATAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 12 11 185939 CASAVA_Build 12 27605138 2I GAAGAGATGA --/TT TTTTTGCTAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 5 7 185940 CASAVA_Build 12 27610206 8I TGTGACAGCC --------/ATACCATA TTATGTTAGA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 ATACCATA 0 1 185941 CASAVA_Build 12 27615137 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAATAAA 2341 het 2341 ref 20 8 11 1 A 7 6 185942 CASAVA_Build 12 27630900 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 A 10 11 185943 CASAVA_Build 12 27631047 4I AGAAAATGTC ----/CAAA CAATTTGAAG 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 CAAA 0 1 185944 CASAVA_Build 12 27645885 3D CCTCAGCTGA GTT/--- GTTTATGCAT 3070 het 3070 ref 38 20 12 7 GTT 2 1 185945 CASAVA_Build 12 27650539 1D GGAGGATGAG T/- TCTCATGTAC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 2 1 185946 CASAVA_Build 12 27652140 1D CTAATTGAGG T/- TTTTATTGGT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 5 4 185947 CASAVA_Build 12 27678018 7I TTCACTTTCC -------/ACCAATG ACCAATGACT 2968 hom 21 het 8 0 8 0 ACCAATG 1 2 185948 CASAVA_Build 12 27679914 1D GGTCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 32 0 25 8 A 12 11 185949 CASAVA_Build 12 27680457 8I CTACACAAAC --------/TTGATAAT TGGAGTTATT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TTGATAAT 0 1 185950 CASAVA_Build 12 27680956 2I AAACCACAGT --/GG GCTTACTGTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 3 185951 CASAVA_Build 12 27682706 1D TTGGTTTTCT G/- GTCTGTAAAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 2 1 185952 CASAVA_Build 12 27683106 5D GCCAACTTGA GAGGC/----- CCTGTACTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 GAGGC 1 0 185953 CASAVA_Build 12 27689116 1I TCAAGCCCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 8 9 185954 CASAVA_Build 12 27691844 1I GGATCATTCC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 7 8 185955 CASAVA_Build 12 27697298 1D CTGGGAAGTG T/- TATTTTATTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 1 185956 CASAVA_Build 12 27703648 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 9 10 185957 CASAVA_Build 12 27705679 1D CAGGTTTCCT C/- CCCCCCCAGT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 8 7 185958 CASAVA_Build 12 27708676 1D GTTTTTCTAC T/- TTGGTTGACT 3070 het 3070 hom 56 23 28 5 T 3 2 185959 CASAVA_Build 12 27710312 4D GAAAATAAAG AAAA/---- GAGATAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 A 4 0 185960 CASAVA_Build 12 27711210 3I CTAGGTCCTA ---/TGT TGTTGTTTTT 3070 hom 79 het 34 0 27 7 TGT 2 3 185961 CASAVA_Build 12 27714319 1D ACTTTGTTCA T/- TTTTTTTTTT 1048 het 1048 ref 33 23 3 7 T 11 10 185962 CASAVA_Build 12 27717175 1I AGATCTTTTC -/T TTTCTCACTA 3070 hom 132 het 51 0 44 7 T 3 4 185963 CASAVA_Build 12 27718622 10D TAGAATGCAG ATCGGTGGTT/---------- ACCAGTGGTA 3070 het 3070 ref 45 23 19 5 ATCGGTGGTT 1 0 185964 CASAVA_Build 12 27719179 2D TACTCGGCTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 2156 hom 28 9 10 10 T 11 9 185965 CASAVA_Build 12 27725204 1D AAAAAAACCA T/- TCATCTTCCC 3070 het 3070 hom 41 19 18 5 T 2 1 185966 CASAVA_Build 12 27726192 1D43M1I CATTGGCCTG TTTTTCTCAGTGTAAGATATGCAATTAACTTCACTTTGCAAAAG-/-TTTTCTCAGTGTAAGATATGCAATTAACTTCACTTTGCAAAAGA AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 36 0 36 14 N/A 0 0 185967 CASAVA_Build 12 27728942 3D ATATTACTAA TAT/--- TATTATAGTG 2917 het 2585 hom 17 6 8 3 TAT 3 2 185968 CASAVA_Build 12 27747186 1I CCTTTTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 221 hom 33 1 28 4 A 9 10 185969 CASAVA_Build 12 27766714 1D CTTATTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 15 4 T 11 10 185970 CASAVA_Build 12 27767475 1D TTCCTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 955 het 955 ref 42 29 4 11 T 13 12 185971 CASAVA_Build 12 27793339 1I TTATGGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 10 11 185972 CASAVA_Build 12 27826966 1D TCATCCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 16 10 A 13 12 185973 CASAVA_Build 12 27836338 1D GAGAGCTGTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 A 9 8 185974 CASAVA_Build 12 27837724 2D GCTGGGTGAC AG/-- AGTGAGACCC 2543 het 1734 hom 22 4 8 11 AG 2 1 185975 CASAVA_Build 12 27839113 1D CATATAATTG A/- AAAAAAAAAA 1364 het 1364 ref 29 19 3 7 A 13 12 185976 CASAVA_Build 12 27839837 5I AAAAAAAGAA -----/AAAAG AAAGTTAGTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 AAAAG 0 1 185977 CASAVA_Build 12 27840734 1I AGGAGAAAAG -/A AAAAGAGAAC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 4 5 185978 CASAVA_Build 12 27845404 1I AACCCTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 13 14 185979 CASAVA_Build 12 27846339 1I TTTTTTGCTC -/T TATGATTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 1 2 185980 CASAVA_Build 12 27848560 3D CCCTATTTCC TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 44 16 17 12 TCT 4 3 185981 CASAVA_Build 12 27853164 3I TCTGGGCAGG ---/TTC TCATGGGAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 TTC 0 1 185982 CASAVA_Build 12 27854595 1D TGCTATTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2870 hom 20 11 8 1 A 10 9 185983 CASAVA_Build 12 27854915 3I CAAACAAACA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 AAC 4 5 185984 CASAVA_Build 12 27857104 2I TGCTCCAAGC --/AG AGAGAACTCA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 AG 2 3 185985 CASAVA_Build 12 27859105 1I TTGGCTGTCA -/T TTTTTCTGTC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 5 6 185986 CASAVA_Build 12 27871025 6D CTTACTGCAG CCTTGA/------ CCTTGACCTC 3070 hom 30 het 10 0 10 1 CCTTGA 2 1 185987 CASAVA_Build 12 27874534 2I CCATCATGAA --/GT GTGGCTTAAC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GT 1 2 185988 CASAVA_Build 12 27876887 14I CTCGATGCAT --------------/ACTTGATAATTTCC AGGAAGGAGA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 ACTTGATAATTTCC 0 1 185989 CASAVA_Build 12 27879695 1I GGTGTAAACA -/T AACTTTTATA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 T 0 1 185990 CASAVA_Build 12 27880239 1D GACAGCACTC A/- AAAAAATTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 7 6 185991 CASAVA_Build 12 27881174 1D TAGATTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 24 0 18 6 T 13 12 185992 CASAVA_Build 12 27898098 1D TTTCTGGTGG T/- TTTTTTTTTT 1343 het 299 hom 27 4 6 17 T 17 16 185993 CASAVA_Build 12 27903924 1D TGTCTGTGGG A/- GCAGCCCTTG 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 A 1 0 185994 CASAVA_Build 12 27906058 1I TCAAAACCAC -/A GATTCACTTC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 0 1 185995 CASAVA_Build 12 27921163 1I ATATGAAGTT -/A GATGAGAGAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 0 1 185996 CASAVA_Build 12 27933888 1I CTCTTCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1492 hom 30 4 13 13 T 15 16 185997 CASAVA_Build 12 27935149 1D GGCTATTTTT A/- AATACAAAAT 3070 het 3070 ref 33 20 12 2 A 3 2 185998 CASAVA_Build 12 27940742 1D CAAGACTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1121 hom 29 3 21 7 A 13 12 185999 CASAVA_Build 12 27941955 1D ATCCCAGCTA C/- CTGGGGAGGC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 2 1 186000 CASAVA_Build 12 27943995 1D ATTAAAAATA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 8 7 186001 CASAVA_Build 12 27952622 2D GGGACAATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 10 6 A 15 13 186002 CASAVA_Build 12 27954252 1I TTCTTTTAAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 9 10 186003 CASAVA_Build 12 27954597 1I AAAACTGCTG -/T TCCTACCACT 3070 hom 77 het 29 0 23 6 T 1 2 186004 CASAVA_Build 12 27957574 4D TCAGCCAGTA GCAC/---- AGCCAGCCAG 3070 het 3070 ref 40 18 12 11 GCAC 1 0 186005 CASAVA_Build 12 27958016 1I TTAAAAATGT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 8 9 186006 CASAVA_Build 12 27963347 1I GTGAAACCCC -/G TCTCTACTAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 0 1 186007 CASAVA_Build 12 27975989 1I TGAGACCAGT -/C CCCGAGGCAG 3070 hom 126 het 46 0 41 5 C 3 4 186008 CASAVA_Build 12 27976211 1D TGGAAAGAAG A/- GGGGCAGCTG 3070 het 3070 ref 55 22 21 12 A 1 0 186009 CASAVA_Build 12 27985400 1I TATGTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 11 12 186010 CASAVA_Build 12 28002587 1I TAGCCTTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 A 10 11 186011 CASAVA_Build 12 28005488 16D TATATATACG TATATATATATACGTA/---------------- TATATATATA 2343 het 364 hom 9 3 6 0 TATATATATATACGTA 1 0 186012 CASAVA_Build 12 28031494 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 95 het 37 0 33 6 A 9 8 186013 CASAVA_Build 12 28031667 1I TCAAACAAAA -/C AAAAAAAACC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 186014 CASAVA_Build 12 28034659 2D GATGATGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 22 0 14 11 A 13 11 186015 CASAVA_Build 12 28035958 1D TATACATCTG A/- TAAGGGGTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 0 186016 CASAVA_Build 12 28036397 1D TTATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 12 11 186017 CASAVA_Build 12 28037415 1I GACATTTTTG -/A AAAACAGTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 4 5 186018 CASAVA_Build 12 28076436 1I AATATCATTC -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 6 7 186019 CASAVA_Build 12 28082200 1I TTTTGGTTTT -/A AAAGTGGAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 3 4 186020 CASAVA_Build 12 28094906 1D TTTCTACCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 25 20 9 A 10 9 186021 CASAVA_Build 12 28101947 2D AGCAATTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1873 hom 34 10 9 15 A 18 16 186022 CASAVA_Build 12 28112157 1D CACCATCGCC A/- AAAAAAAAAA 2800 het 546 hom 32 4 8 20 A 17 16 186023 CASAVA_Build 12 28115222 1I CTGAATTCTA -/C CAAAAATTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 2 186024 CASAVA_Build 12 28125158 3I ATCATTTCTT ---/CTC CTCATAATCC 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 CTC 1 2 186025 CASAVA_Build 12 28126864 1I TTACCTCAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 T 8 9 186026 CASAVA_Build 12 28127032 1D CATACGTACA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 43 23 16 5 T 8 7 186027 CASAVA_Build 12 28127771 14I TCCCACCAGG --------------/TCCCTCCCTTGACA TGTGGGAATT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 TCCCTCCCTTGACA 0 1 186028 CASAVA_Build 12 28130645 4D TCCCACTGAA GGCG/---- GGCGCCTTCC 3070 het 3070 ref 37 22 13 3 GGCG 2 1 186029 CASAVA_Build 12 28131300 1I GAATAACTGC -/G GGGGGGGCGG 1187 het 546 hom 13 2 5 6 G 7 8 186030 CASAVA_Build 12 28138179 4D TCTTTCTCTT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 het 2669 hom 20 10 8 2 TTTC 2 1 186031 CASAVA_Build 12 28139714 1I GAAGCAACTC -/T TTTTTTTTTT 723 het 723 ref 23 6 3 14 T 17 18 186032 CASAVA_Build 12 28140731 2D TTTTTTATTG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1365 hom 37 9 17 11 GT 1 0 186033 CASAVA_Build 12 28142275 27D AATAGAGTGC ATACAGTAATGACAGTATATACAGTAT/--------------------------- ATACAGTAAT 3070 het 3070 ref 36 20 10 13 ATACAGTAATGACAGTATATACAGTAT 2 1 186034 CASAVA_Build 12 28143012 1D AGACTTTTTG T/- TTCTCTAATC 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 3 2 186035 CASAVA_Build 12 28143357 1D TTTAGTAAGT G/- GGGTGTATTA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 G 4 3 186036 CASAVA_Build 12 28172247 1D TACCTGCACA C/- CCTTGCTTAT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 C 3 2 186037 CASAVA_Build 12 28279795 1I GCATAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 498 hom 28 2 17 9 A 13 14 186038 CASAVA_Build 12 28302131 1D AATGCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 1449 het 1449 ref 30 17 4 10 T 17 16 186039 CASAVA_Build 12 28302512 3D TGTTTCAGAT ATC/--- ATCTGGCTTA 3070 hom 84 het 30 0 28 4 ATC 2 1 186040 CASAVA_Build 12 28309833 1D ACTAACCCTG T/- TTTTCCAGTA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 5 4 186041 CASAVA_Build 12 28323439 6D TATAAAAGTT TGTCTC/------ TGTATCTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TGTCTC 1 0 186042 CASAVA_Build 12 28332698 1D TGATGAATCA T/- ATTTATTAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 0 186043 CASAVA_Build 12 28335022 2I TACCCAACTC --/AT ATGTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 1 2 186044 CASAVA_Build 12 28342319 4D CACAGATGCT ATTC/---- ATTTGTTTTC 3070 hom 81 het 33 0 28 6 ATTC 1 0 186045 CASAVA_Build 12 28358385 1D AAATTTAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 41 het 30 1 25 5 A 10 9 186046 CASAVA_Build 12 28358832 1I CATTTACATA -/T TTTTTTGGCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 6 7 186047 CASAVA_Build 12 28370592 1I GTTAGAATTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 9 10 186048 CASAVA_Build 12 28380259 1I TTTGAACTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 938 hom 30 2 25 3 T 11 12 186049 CASAVA_Build 12 28382459 1I CTTATGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 491 hom 29 2 20 7 T 12 13 186050 CASAVA_Build 12 28396995 1D GAACACAGGC A/- AGAGCAGCAT 3070 hom 160 het 56 0 54 5 A 2 1 186051 CASAVA_Build 12 28406481 2I AGCAAAGCTT --/TA TATATATATA 3070 het 48 hom 29 1 25 3 TA 7 8 186052 CASAVA_Build 12 28408932 1D TAAAATAATT A/- TCACATGAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 1 0 186053 CASAVA_Build 12 28417815 1D TTTCTATACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 10 9 186054 CASAVA_Build 12 28438912 4D CTGTTTCTTG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 40 19 12 12 CT 10 8 186055 CASAVA_Build 12 28446788 1I TGTCATCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2978 hom 17 8 8 1 A 15 16 186056 CASAVA_Build 12 28459428 1D GTAAAGCGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 13 12 186057 CASAVA_Build 12 28460170 1D GAGGAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 11 10 186058 CASAVA_Build 12 28463955 1D TAAATTATCA T/- TTTTTTTTTT 1601 het 1601 ref 36 22 5 10 T 13 12 186059 CASAVA_Build 12 28464958 1D CATTTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 19 8 T 12 11 186060 CASAVA_Build 12 28487340 3I TTGAATTTTT ---/TTC TTCCCAGGTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTC 1 2 186061 CASAVA_Build 12 28489050 1D TTCTTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 11 10 186062 CASAVA_Build 12 28499361 1I CAGTAAATAT -/C CCTGAAGAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 2 3 186063 CASAVA_Build 12 28535134 2I CCATTTCAAC --/AG TGTGGTAATT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AG 0 1 186064 CASAVA_Build 12 28537948 1D AAATACTGAA G/- GTATCTCTTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 G 2 1 186065 CASAVA_Build 12 28543229 4D AATCTAACTC TGTT/---- TGTTCAAATT 3070 het 3070 ref 41 23 14 5 TGTT 2 1 186066 CASAVA_Build 12 28580244 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATTGTG 1655 het 1655 ref 29 8 12 9 T 1 0 186067 CASAVA_Build 12 28585527 3I GTGCAAAGAA ---/CTC AAGAATAAGA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 CTC 0 1 186068 CASAVA_Build 12 28588279 2I TATTTTTCAA --/AC ACAAAGCATG 3070 hom 111 het 43 0 36 7 AC 1 2 186069 CASAVA_Build 12 28588553 2D TTCTTGTCTC TT/-- TTCAAGTCTC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 4 2 186070 CASAVA_Build 12 28595040 1D TCTTCCACTT A/- ACTTTTTTCC 3070 hom 86 het 31 0 29 2 A 2 1 186071 CASAVA_Build 12 28600474 2D TACACCACCG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 45 het 18 0 15 5 C 12 10 186072 CASAVA_Build 12 28600905 1D CCAAAGCTGC A/- CTAAGCCCTC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 1 0 186073 CASAVA_Build 12 28604962 3I GTATGTTATA ---/TTG TTGTTATACA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 TTG 1 2 186074 CASAVA_Build 12 28605214 1I GTAACTGGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 45 0 35 10 T 8 9 186075 CASAVA_Build 12 28606090 3D CTGTCTAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 34 0 26 8 A 13 10 186076 CASAVA_Build 12 28606404 1I GAAATATCTC -/T TAAGTCACCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 2 186077 CASAVA_Build 12 28608397 3I GAAATGGCTC ---/CTT CTATGATGTT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 CTT 0 1 186078 CASAVA_Build 12 28608747 1D TCTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 31 1 21 9 T 15 14 186079 CASAVA_Build 12 28611754 4D CATGTTCCGT CTCA/---- CTCTTTGCAC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 CTCA 1 0 186080 CASAVA_Build 12 28620750 1D AATTTAGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 123 het 47 0 42 7 A 10 9 186081 CASAVA_Build 12 28621443 1I TGGAAGATAC -/A AAAGATCTAT 3070 hom 100 het 39 0 34 5 A 3 4 186082 CASAVA_Build 12 28642577 2D ACACAGAAAG AA/-- AGAAAATTAG 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 A 3 1 186083 CASAVA_Build 12 28645613 1I CCTGGGCTAA -/G GAAACAGGTG 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 G 1 2 186084 CASAVA_Build 12 28652406 1D TGAGTTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 11 10 T 15 14 186085 CASAVA_Build 12 28655627 7I CATGGTGATG -------/AGTACTC AGTCTCTGCC 3070 het 3070 hom 47 20 18 9 AGTACTC 0 1 186086 CASAVA_Build 12 28657549 2I TATATATTTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AT 5 6 186087 CASAVA_Build 12 28667729 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 7 A 12 11 186088 CASAVA_Build 12 28671301 1I CAAAAGAAAA -/C CTGCTTCTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 2 186089 CASAVA_Build 12 28680199 1D TGGAGGGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 12 9 T 10 9 186090 CASAVA_Build 12 28681716 5D ACTCTTTTAA AATGC/----- ACAATGCTGT 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 AATGC 1 0 186091 CASAVA_Build 12 28685827 1I GGGATTTTTA -/T TGGGATTAAA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 1 2 186092 CASAVA_Build 12 28687793 1I GCCTGAACTT -/C CAATACTATG 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 C 1 2 186093 CASAVA_Build 12 28688232 1D TGAAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1814 hom 27 9 13 5 T 13 12 186094 CASAVA_Build 12 28706082 1I ATGTGTTAGG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 A 6 7 186095 CASAVA_Build 12 28706275 4I TTAATAAGCC ----/TAAG TAAGCCAGGT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 TAAG 1 2 186096 CASAVA_Build 12 28707990 1D TCCAGATGTT A/- AAAAAAAAAT 910 het 910 ref 45 29 3 13 A 10 9 186097 CASAVA_Build 12 28708024 1D TTACATCTTC A/- AAAAATCAAC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 6 5 186098 CASAVA_Build 12 28711464 2D GAAAATAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 19 1 14 4 A 17 15 186099 CASAVA_Build 12 28723943 1D ATTTTTGCTC T/- GATTTTGGTG 3070 het 3070 ref 38 21 9 10 T 1 0 186100 CASAVA_Build 12 28738734 1I GAATGGGGTT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 52 18 28 6 A 7 8 186101 CASAVA_Build 12 28740792 1D AAATAGAATC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 8 7 186102 CASAVA_Build 12 28744188 2I CCATGGCAAG --/AC ATGCAAAAAT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 AC 0 1 186103 CASAVA_Build 12 28744337 1I GCCCCCCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 11 12 186104 CASAVA_Build 12 28748626 1I GATTTCCTTA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 8 9 186105 CASAVA_Build 12 28755782 1I CTGAAATGCA -/C TATGACTTTT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 C 0 1 186106 CASAVA_Build 12 28772733 1I TTTCATTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 9 10 186107 CASAVA_Build 12 28792985 2D TTCTGTGGGT AA/-- AAAACTGCAA 3070 hom 129 het 49 0 44 7 A 6 4 186108 CASAVA_Build 12 28802779 26I10M25I CTCCAGTGTA --------------------------AGTTGCACTG-------------------------/AACTTTTGATAATTTTTAAGTATTTTAATTGAAATGTAATATACATGTAGAAAAGTGCAAA AACTGTGAGC 3070 hom 27 het 5 0 10 1 N/A 0 0 186109 CASAVA_Build 12 28802970 1D TTATTTTTTG T/- TTTTTTATAC 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 T 7 6 186110 CASAVA_Build 12 28810287 1I TAAGTTGAAT -/G GGCCTGCAGA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 G 2 3 186111 CASAVA_Build 12 28818073 2D GGTGTGTGTG TT/-- TGTGTGTCTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 3 1 186112 CASAVA_Build 12 28835764 38D ATCAATCTAC ATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 15 het 10 0 10 3 AT 25 6 186113 CASAVA_Build 12 28838243 1I AAAGGAGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 9 10 186114 CASAVA_Build 12 28843895 1D AACTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 11 10 186115 CASAVA_Build 12 28873631 1D AAACAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 9 8 186116 CASAVA_Build 12 28874035 1I TTTTCAGACT -/A AAAAAAAGTT 2942 het 2942 ref 29 18 9 2 A 7 8 186117 CASAVA_Build 12 28874657 5D CTTCTTATTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 29 0 16 15 A 19 14 186118 CASAVA_Build 12 28874932 1I TGACACACCT -/G GTCAAACCAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 1 2 186119 CASAVA_Build 12 28877217 1I GGTTAAAAAA -/G GGAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 22 10 G 2 3 186120 CASAVA_Build 12 28880266 1D CAGTGTTTGG T/- TTTTTTGTCC 1982 hom 12 het 6 0 5 1 T 7 6 186121 CASAVA_Build 12 28884932 1D GACACTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 34 1 28 5 A 17 16 186122 CASAVA_Build 12 28886934 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 15 9 T 16 14 186123 CASAVA_Build 12 28887584 1I TGATTCCCCC -/T GCCTTAGCCT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 T 0 1 186124 CASAVA_Build 12 28888343 1D TTCAATTACA T/- TTTATTATTT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 T 4 3 186125 CASAVA_Build 12 28888471 1D TGGCTATTCT G/- GGTCCCTTAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 3 2 186126 CASAVA_Build 12 28889185 1I CCTGTTGTCA -/G CTTGAAGACT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 0 1 186127 CASAVA_Build 12 28890203 2I CTAAACTTGC --/TA TGTTTGTGTT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 TA 0 1 186128 CASAVA_Build 12 28892584 1D GGATTTTTTT A/- AAAATAAAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 5 4 186129 CASAVA_Build 12 28900550 1I GACCTGCAAG -/A AAATGGGGAA 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 A 3 4 186130 CASAVA_Build 12 28901295 2I TGTGTGGTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 45 0 31 14 T 11 13 186131 CASAVA_Build 12 28911029 1I AGGAATAGGA -/T TTTTTTTTTT 2935 het 2935 ref 31 20 8 3 T 10 11 186132 CASAVA_Build 12 28912246 1D CATGGCAAGC T/- TTTGAATAGA 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 T 4 3 186133 CASAVA_Build 12 28927901 2D TCCAAGTATC TT/-- TGCTTTTAAG 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 T 3 1 186134 CASAVA_Build 12 28954653 1I GTTTTTGAGG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 A 6 7 186135 CASAVA_Build 12 28962127 1D TGGGATGCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 21 20 0 A 10 9 186136 CASAVA_Build 12 28968437 1I TGCCAACAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 A 9 10 186137 CASAVA_Build 12 28976463 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAAG 2195 het 2195 ref 39 20 10 10 AAG 3 2 186138 CASAVA_Build 12 29026013 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 26 1 21 5 A 11 12 186139 CASAVA_Build 12 29026331 1D ATCCACAAAA T/- AACACTGTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 1 0 186140 CASAVA_Build 12 29032225 16I AATGGGCAAA ----------------/CACAAATATGTATTAG CCTATTAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 7 CACAAATATGTATTAG 0 1 186141 CASAVA_Build 12 29035412 1D CAAGCAGACC A/- ACTCTTCCTT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 2 1 186142 CASAVA_Build 12 29037340 1D CATTCTCAGT C/- TTTCATTTCC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 C 1 0 186143 CASAVA_Build 12 29040179 1I TCAACGGTCT -/C CCCTTTCAGC 3070 hom 77 het 30 0 25 5 C 3 4 186144 CASAVA_Build 12 29048358 1I ACGTTAGTTC -/A AAACTCGCTA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 3 4 186145 CASAVA_Build 12 29054859 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1304 het 1304 ref 26 17 3 6 A 13 12 186146 CASAVA_Build 12 29058094 4D TCTCCCAGGC TGGA/---- TGGAGTGCAG 1389 hom 10 het 4 0 4 0 TGGA 2 1 186147 CASAVA_Build 12 29061214 1D ATGAAACGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 10 9 186148 CASAVA_Build 12 29062776 1D ACAAAAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 10 9 186149 CASAVA_Build 12 29064615 21D CAGTCTGAAA CTCCCTTTCTACCACCTATTG/--------------------- CCCCTTGCAA 3070 hom 117 het 40 0 38 4 CTCCCTTTCTACCACCTATTG 1 0 186150 CASAVA_Build 12 29072363 1I GGATTCTGAA -/G GGGGGAAAAT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 5 6 186151 CASAVA_Build 12 29083120 1D CATTTTAATG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 7 6 186152 CASAVA_Build 12 29086289 1D GGAAGAAAGG A/- AAAGACTATT 3070 hom 113 het 44 0 36 8 A 4 3 186153 CASAVA_Build 12 29090405 2I TGCTTAGGAA --/TC TAAATAATCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TC 0 1 186154 CASAVA_Build 12 29091352 1I AAATTTGTAT -/G AAAGAAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 0 1 186155 CASAVA_Build 12 29094642 1I AACACATGTA -/C CCCCAAAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 4 5 186156 CASAVA_Build 12 29095669 3D GTTCTATCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 39 0 29 12 T 14 11 186157 CASAVA_Build 12 29102692 1D CTACCAAAGG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 9 8 186158 CASAVA_Build 12 29103279 1I AGATTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 39 2 25 12 A 12 13 186159 CASAVA_Build 12 29103673 1I TGACCTTGAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 8 9 186160 CASAVA_Build 12 29107734 3I TACTTATTCA ---/TTG TTGGTACAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TTG 1 2 186161 CASAVA_Build 12 29108058 1I TTTCTTCTAT -/A AATTTAATGG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 2 3 186162 CASAVA_Build 12 29113944 2I ATAAATGTTA --/AT CTCATCTAAA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 AT 0 1 186163 CASAVA_Build 12 29117823 1I TTAAGTTAAG -/C CACCTTAAGT 3070 hom 141 het 56 0 48 8 C 1 2 186164 CASAVA_Build 12 29119882 2D TAATAACTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 41 0 32 10 A 12 10 186165 CASAVA_Build 12 29120722 1D TTTAGATTAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 8 186166 CASAVA_Build 12 29121446 1I AGGGGAGGGG -/A AGGGATAACA 3070 hom 32 het 21 0 19 2 A 1 2 186167 CASAVA_Build 12 29121740 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 75 het 26 0 25 3 ATA 7 6 186168 CASAVA_Build 12 29127681 4I TCAGTTTAAT ----/TTAA TTAGTTCATT 3070 hom 63 het 32 0 22 10 TTAA 0 1 186169 CASAVA_Build 12 29130534 1D GCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 42 0 41 2 A 10 9 186170 CASAVA_Build 12 29134367 1D ACAAATAAAT A/- AAAAGATGTA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 5 4 186171 CASAVA_Build 12 29137579 1I CCAAAGGTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 10 186172 CASAVA_Build 12 29143548 2I TAAAAATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 11 13 186173 CASAVA_Build 12 29147017 1I TAAATACGTT -/A AAAAATAGGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 5 6 186174 CASAVA_Build 12 29150411 1D GATTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 30 1 26 3 A 13 12 186175 CASAVA_Build 12 29151801 1I GACCATTGTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 8 9 186176 CASAVA_Build 12 29161749 3D TATTCCCATC ATT/--- AAGTGACACA 3070 hom 81 het 31 0 28 7 ATT 1 0 186177 CASAVA_Build 12 29165298 2D CCATCTGTAC AA/-- AAAAAAATAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 9 7 186178 CASAVA_Build 12 29166614 1D AAATAATTCA C/- CCTGGAATGG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 3 2 186179 CASAVA_Build 12 29198987 3I CATGTTAATA ---/ATT ATCAAGAAAA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 ATT 0 1 186180 CASAVA_Build 12 29206137 1D CTTGTGATGT C/- CCCCAAGTCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 5 4 186181 CASAVA_Build 12 29214950 8D CTGTCTCTTC CTCTCTCT/-------- CTCTCTCTCT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 CT 11 7 186182 CASAVA_Build 12 29221042 4D GAGAAAAGGG AAAA/---- AAAGGAAACT 3070 hom 147 het 54 0 49 7 A 7 3 186183 CASAVA_Build 12 29222035 1I GTATAAGCAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 8 9 186184 CASAVA_Build 12 29222384 1D TTATAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 855 hom 33 2 22 10 A 13 12 186185 CASAVA_Build 12 29232979 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1545 het 1545 ref 43 31 6 6 T 12 11 186186 CASAVA_Build 12 29234523 1I GTGATGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 671 hom 25 2 16 7 A 11 12 186187 CASAVA_Build 12 29234992 1D ATCTGAGATG T/- CCGCATCACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 0 186188 CASAVA_Build 12 29242835 1D CATGTTTTGA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 63 het 25 0 22 5 T 8 7 186189 CASAVA_Build 12 29243903 1I CATAAAAGAT -/A GGCAGGCAGA 3070 hom 81 het 28 0 27 1 A 0 1 186190 CASAVA_Build 12 29246334 3I TGCTAATTTA ---/TAT TTATTATTAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TAT 0 1 186191 CASAVA_Build 12 29250041 1D TTGTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 37 0 29 8 T 11 10 186192 CASAVA_Build 12 29255147 1D TCTTAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 98 het 41 0 33 8 A 10 9 186193 CASAVA_Build 12 29256116 2D GGACACAGAG AC/-- ACACACACAC 923 het 923 ref 49 41 3 6 AC 7 6 186194 CASAVA_Build 12 29262559 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 15 1 13 1 A 12 13 186195 CASAVA_Build 12 29272079 1I TTGCTAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 823 hom 26 2 16 8 A 13 14 186196 CASAVA_Build 12 29272559 2I GAAAATGGCA --/CT CTCTTTCTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CT 2 3 186197 CASAVA_Build 12 29272791 2I GTCTTTTTTG --/TT TGTTTGTTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 3 186198 CASAVA_Build 12 29282417 1I TAAGGCCAGA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 7 8 186199 CASAVA_Build 12 29284722 1I AAATGGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 655 hom 46 2 36 8 T 10 11 186200 CASAVA_Build 12 29299151 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2452 het 424 hom 18 2 8 8 A 16 17 186201 CASAVA_Build 12 29302383 1I GTCTTTACTT -/A AAAAAAAAAA 2404 hom 21 het 9 0 7 2 A 15 16 186202 CASAVA_Build 12 29310178 1D TTATCTCACT C/- CAGTTAAAAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 C 2 1 186203 CASAVA_Build 12 29325943 1D AACATCACCT A/- AAAAAAAAAA 2200 het 2200 ref 39 21 6 12 A 15 14 186204 CASAVA_Build 12 29340387 4D ATTTTTGTGG CTGT/---- CTTTTTAGTA 3070 hom 75 het 29 0 26 6 CTGT 1 0 186205 CASAVA_Build 12 29375411 1I AAAGATAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 41 4 29 8 T 14 15 186206 CASAVA_Build 12 29385626 4D GAGTGCAGTG GTAC/---- GTACGATCAT 3070 hom 70 het 26 0 22 4 GTAC 2 1 186207 CASAVA_Build 12 29397038 1I CTGTTCTTTT -/A AGCACCTTTA 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 A 1 2 186208 CASAVA_Build 12 29397926 3I ATAATATTTC ---/CTT CTTCTTTTTT 3070 hom 80 het 29 0 27 2 CTT 2 3 186209 CASAVA_Build 12 29401251 1I CACTGTAACC -/T CCGCCTCCTG 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 0 1 186210 CASAVA_Build 12 29408036 1D CATAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1536 hom 28 7 11 10 A 15 14 186211 CASAVA_Build 12 29409874 1D GCAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 28 1 24 4 A 13 12 186212 CASAVA_Build 12 29411399 1I CTTACCCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 11 12 186213 CASAVA_Build 12 29421128 2I TATTCCATTT --/TG TGTCAAAACA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 TG 1 2 186214 CASAVA_Build 12 29424258 3D ACCATCATTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 254 hom 25 3 14 9 A 16 13 186215 CASAVA_Build 12 29425620 2I CGACTAACAC --/TT TGAGACTGCA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 1 3 186216 CASAVA_Build 12 29431149 4D TAGATAAACT AATA/---- AATGAATAAT 3070 hom 45 het 19 0 16 5 AATA 1 0 186217 CASAVA_Build 12 29431651 2D CAGGTTAGAA TT/-- TTTGTGTCTC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 5 3 186218 CASAVA_Build 12 29431845 1D TTTCAAATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 10 9 186219 CASAVA_Build 12 29433358 1D TTTTTATGTA C/- ATGATGAACT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 0 186220 CASAVA_Build 12 29445615 2D TGGGTCAAAC AG/-- GGGGTGCTAA 3070 het 3070 hom 35 11 17 9 AG 1 0 186221 CASAVA_Build 12 29449222 3D ACTCCACCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1720 hom 24 8 13 4 A 35 32 186222 CASAVA_Build 12 29449519 4I AAACTCCCAG ----/ACTC ACTCATCAAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 ACTC 1 2 186223 CASAVA_Build 12 29450400 5D AATATTAGGT AATAA/----- AATCACTAGA 3070 het 3070 hom 38 15 20 5 AATAA 1 0 186224 CASAVA_Build 12 29458083 2D CATCCAAATC TT/-- TTACGTTATG 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 T 4 2 186225 CASAVA_Build 12 29460279 1I CAAAAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 10 11 186226 CASAVA_Build 12 29478917 1I CCCCAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 9 10 186227 CASAVA_Build 12 29480494 3I GACACCCAGT ---/ACA ACTTTATGAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 ACA 0 1 186228 CASAVA_Build 12 29482667 1D ATCCCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 11 10 186229 CASAVA_Build 12 29485036 1D TAGCAATTGG A/- TTTTTTACCC 3070 het 3070 hom 44 15 18 12 A 1 0 186230 CASAVA_Build 12 29496656 1I TACAAGAACC -/T AATCAGATAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 0 1 186231 CASAVA_Build 12 29524936 1I CCAGAATACA -/G GAGAGGCTTG 3070 het 2834 hom 34 9 18 7 G 1 2 186232 CASAVA_Build 12 29533200 2I TTCAAGCTGC --/TT TTTTTGGCCA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 5 7 186233 CASAVA_Build 12 29536529 1D TTAGTTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 12 11 186234 CASAVA_Build 12 29545768 4D GACCAGCAAG ATAA/---- ATAACCCCCA 3070 het 3070 hom 45 15 25 6 ATAA 2 1 186235 CASAVA_Build 12 29557522 2D ATCAATGGCC AT/-- ATATATATAT 1616 het 1616 ref 41 29 4 10 AT 8 7 186236 CASAVA_Build 12 29557740 3D TGTGTTTTCC AAT/--- AATATTTAAA 3070 het 3070 ref 38 21 16 3 AAT 2 1 186237 CASAVA_Build 12 29566192 2D ACAAGTTAAC AA/-- AATGTCATCT 3070 het 3070 ref 49 25 22 3 A 4 2 186238 CASAVA_Build 12 29576861 3I AAAGAGATGC ---/ATA ATATTAAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATA 1 2 186239 CASAVA_Build 12 29580987 5I GCCAAACTGC -----/CAATG TTAATCTTTG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CAATG 0 1 186240 CASAVA_Build 12 29582735 1I ATCAGGAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 742 hom 47 3 34 10 A 9 10 186241 CASAVA_Build 12 29584884 1D GCATTCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 29 7 A 12 11 186242 CASAVA_Build 12 29588150 1I AAAGAATTTT -/A AAAAAATATT 3070 het 2350 hom 24 8 14 2 A 6 7 186243 CASAVA_Build 12 29589346 1D CACAGATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 11 10 186244 CASAVA_Build 12 29591103 1D CTTTTCTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 227 hom 33 1 31 4 A 10 9 186245 CASAVA_Build 12 29593023 6D GTTATATATT GCTTGA/------ TTATATCACT 968 hom 5 het 2 0 2 1 GCTTGA 1 0 186246 CASAVA_Build 12 29600138 1D TACACTCCCA C/- CAACAGCAAC 3070 hom 135 het 47 0 46 1 C 2 1 186247 CASAVA_Build 12 29655378 1D TCTGAACTTC T/- TTTTTTTTTT 1498 het 1498 ref 26 11 6 9 T 17 16 186248 CASAVA_Build 12 29662756 1D GAATTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 13 12 186249 CASAVA_Build 12 29671889 3D TTAGTAGTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 52 1 28 23 A 17 14 186250 CASAVA_Build 12 29676474 1I GCAGTAGCAG -/T TTTTTCATAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 5 6 186251 CASAVA_Build 12 29701791 2I ATACAAACAC --/AT GTTGGAAGTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 0 1 186252 CASAVA_Build 12 29713321 1D TCCAAGTGAC A/- AATGTAGCTG 3070 hom 120 het 43 0 41 4 A 3 2 186253 CASAVA_Build 12 29715764 3D TTAAGTGCAT ACA/--- ACAACGACAA 3070 hom 69 het 32 0 24 9 ACA 2 1 186254 CASAVA_Build 12 29719481 5D TCCTAAACTT AACTC/----- AAGTCCAACT 3070 hom 138 het 49 0 46 4 AACTC 1 0 186255 CASAVA_Build 12 29725864 1I CAAGGCCCCT -/C CCCCCTCCCA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 C 5 6 186256 CASAVA_Build 12 29728052 1I ATCATTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 het 52 hom 39 1 32 6 C 0 1 186257 CASAVA_Build 12 29729568 1D TTTCCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 13 12 186258 CASAVA_Build 12 29731186 1I ATTTTTTATT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 7 8 186259 CASAVA_Build 12 29731765 1I AGTCTGAATT -/A GATCTGTAGT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 0 1 186260 CASAVA_Build 12 29754281 4D GTAATGGGTC TCTA/---- TCTGTCTCTA 3070 het 3070 hom 51 22 27 4 TCTA 1 0 186261 CASAVA_Build 12 29764840 1D AAAAAGATAG A/- AATATGAAAC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 3 2 186262 CASAVA_Build 12 29765537 1I ACCTGAAAGA -/G TAAAAGTTTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 0 1 186263 CASAVA_Build 12 29767149 4D AGAAAGAAAG AAAA/---- AAGAAAAGAA 3070 hom 51 het 21 0 16 6 A 6 2 186264 CASAVA_Build 12 29769396 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2032 het 1537 hom 17 6 7 4 T 10 11 186265 CASAVA_Build 12 29775850 1I AAGCAAGTAG -/T ATCAATATAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 0 1 186266 CASAVA_Build 12 29799848 5I TTGGAAACTA -----/TTGTT TTAAGTAATT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 TTGTT 0 1 186267 CASAVA_Build 12 29803543 1D AAAAATATAC A/- AAAATTAGCC 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 5 4 186268 CASAVA_Build 12 29811907 4D TAAACACTTT AATA/---- GAGTGAACTC 3070 het 3070 hom 25 11 13 3 AATA 1 0 186269 CASAVA_Build 12 29812013 2I45M4I TATTTACATG --TATATATATGTGTGTGTATACACGTATACACGTATACATACACAC----/TATATATATATGTGTGTGTATACACGTATACACGTATACATACACACACAT ATTCATATTC 3070 het 3070 hom 47 32 27 12 N/A 0 0 186270 CASAVA_Build 12 29817621 5D TGATTTAGGA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 123 het 52 0 42 11 AAAAC 4 3 186271 CASAVA_Build 12 29818226 2D GGAGACATGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 GT 9 8 186272 CASAVA_Build 12 29820926 3D AAATAAGGGT AAA/--- AAAACACAGA 3070 het 3070 ref 32 15 16 2 A 7 4 186273 CASAVA_Build 12 29821308 1I TCTCTTTTTA -/T TTTTTTTTAA 2677 het 2020 hom 23 8 11 4 T 8 9 186274 CASAVA_Build 12 29821816 2D GACTGTAGTC TA/-- TAAAGTATAT 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 TA 2 1 186275 CASAVA_Build 12 29824033 1D CTCAACATTT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 120 het 48 0 40 10 A 8 7 186276 CASAVA_Build 12 29824866 1D ATAAAAAAAA T/- AGAAGTACAT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 1 0 186277 CASAVA_Build 12 29825324 21I TTCATGCTAT ---------------------/CGCACTAGAAGATGCAGTTTC ACCTCAGGTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 CGCACTAGAAGATGCAGTTTC 0 1 186278 CASAVA_Build 12 29826662 1I TACACCCGTT -/G GCAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 1 2 186279 CASAVA_Build 12 29829769 4D TGTGTGCGTC TGTA/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3017 hom 34 10 18 8 TGTA 1 0 186280 CASAVA_Build 12 29831660 1D AAAACATAAA T/- TTTTGTTGTC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 5 4 186281 CASAVA_Build 12 29832181 3I AAAGACAGAT ---/TAA CAAGAGAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TAA 0 1 186282 CASAVA_Build 12 29833516 29D GAAAGAGATA TATAGTAGAACGTTATTCTACAGCATTTT/----------------------------- TACCAAACAG 3070 het 3070 ref 17 15 9 3 TATAGTAGAACGTTATTCTACAGCATTTT 1 0 186283 CASAVA_Build 12 29835979 2I TGCGCACAAC --/AT ATATTCAACA 3070 hom 244 het 92 0 82 10 AT 2 3 186284 CASAVA_Build 12 29839406 48D TTACAATCTC CCATCTTTCCTAGCTGTGCTGCTAAGTCTTATTTCTTGGACTATTTTT/------------------------------------------------ CCATGTGTGA 3070 het 3070 ref 27 20 14 1 CCATCTTTCCTAGCTGTGCTGCTAAGTCTTATTTCTTGGACTATTTTT 1 0 186285 CASAVA_Build 12 29839817 1D ATCTGACAAC T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 T 8 7 186286 CASAVA_Build 12 29849197 1D GGCCGAGGCA G/- GGTGGATCAC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 3 2 186287 CASAVA_Build 12 29851274 1D GGCATTTAAA T/- TTTTTTTTGA 2991 het 2991 ref 21 12 7 2 T 9 8 186288 CASAVA_Build 12 29936556 1I ATGGGACTGG -/T TATTAATTGA 3070 het 3070 ref 44 17 17 10 T 1 2 186289 CASAVA_Build 12 29937409 1I ATGTCAGCAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 9 10 186290 CASAVA_Build 12 29977683 2D AATTAATAGG AT/-- ATATATATAT 1571 het 1571 ref 27 21 4 2 AT 7 6 186291 CASAVA_Build 12 30015850 1D AAGAGCACAG A/- AGGCCTTTCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 2 1 186292 CASAVA_Build 12 30022386 1I TCTTTCACGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2025 hom 32 10 12 10 A 11 12 186293 CASAVA_Build 12 30032346 1I GTTCCAGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2497 hom 37 9 18 10 T 15 16 186294 CASAVA_Build 12 30034537 17D CACGGCAGGG CCCAATTATAGATCTGA/----------------- CCCAATTATA 3070 hom 88 het 32 0 27 12 CCCAATTATAGATCTGA 2 1 186295 CASAVA_Build 12 30036619 11D TCCCGGCTGC TTCCAGGCTGT/----------- AGAGGCTGCT 3070 het 3070 ref 48 26 19 9 TTCCAGGCTGT 1 0 186296 CASAVA_Build 12 30036988 1D AAACTTAGTG A/- TAGATGATTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 A 1 0 186297 CASAVA_Build 12 30038958 1I GCAAGAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 9 10 T 10 11 186298 CASAVA_Build 12 30043846 2I TATCTTTATA --/AT ACTCTGTGAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AT 0 1 186299 CASAVA_Build 12 30056658 1I ATTTTCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 35 3 23 9 T 15 16 186300 CASAVA_Build 12 30062658 1D ATTTTGTTTT A/- AATCAGTAGG 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 3 2 186301 CASAVA_Build 12 30063935 1D CGTGGATATT A/- GTCATTTGTT 3070 het 3070 hom 62 24 34 4 A 1 0 186302 CASAVA_Build 12 30069654 1D TTTCCCCCCA G/- ATACCTTAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 G 1 0 186303 CASAVA_Build 12 30070629 3I ATATATAAAA ---/AAG AAGAAGTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAG 2 3 186304 CASAVA_Build 12 30070757 1I AGTTTCAGAC -/A GCAGGAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 0 1 186305 CASAVA_Build 12 30076836 2I TATGAAGGCA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 AT 6 7 186306 CASAVA_Build 12 30078006 1I AGGTAAGACC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 37 hom 39 1 31 7 T 8 9 186307 CASAVA_Build 12 30079690 2I ATTAGAAACA --/AT ATCCCTATAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AT 1 2 186308 CASAVA_Build 12 30088164 4D GGAAGATAGA ATTT/---- ATTTATTAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 5 ATTT 2 1 186309 CASAVA_Build 12 30090551 1D CCCAAAAATT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 G 1 0 186310 CASAVA_Build 12 30096345 5D AGCAAGTGAC ATATG/----- ATAAGAAAGT 3070 het 3070 hom 36 18 17 2 ATATG 1 0 186311 CASAVA_Build 12 30098353 5I CTGAATACTT -----/AAAAG AAAAGATTAC 3070 het 3070 ref 36 24 9 3 AAAAG 1 2 186312 CASAVA_Build 12 30100568 1I TATAAAACCG -/C CCCCATCCCT 984 het 984 ref 18 11 4 3 C 4 5 186313 CASAVA_Build 12 30101598 1D GCACTTTCAA T/- TTTTTCCATC 3070 het 3070 hom 27 12 11 5 T 6 5 186314 CASAVA_Build 12 30106243 3D TTATTTATAT AAG/--- AAGACAGGAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AAG 2 1 186315 CASAVA_Build 12 30107067 2D AGAATAAATG GA/-- GAGTTTAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 GA 2 1 186316 CASAVA_Build 12 30111004 6D TCCATCACAT ACTTTA/------ ACCATGTTGT 3070 het 3070 hom 51 21 24 7 ACTTTA 1 0 186317 CASAVA_Build 12 30114229 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1394 het 1394 ref 14 8 4 2 A 16 14 186318 CASAVA_Build 12 30115306 2D ATACACTCAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 AT 6 5 186319 CASAVA_Build 12 30123701 4D CCAACCAGTC AAAG/---- AAAGCACTCA 3070 het 3070 ref 50 22 20 11 AAAG 2 1 186320 CASAVA_Build 12 30126705 1I AATCCAGATG -/T CAATATTCAA 3070 hom 157 het 58 0 53 5 T 0 1 186321 CASAVA_Build 12 30127113 4D TAGCTCTATT TCTC/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TC 3 1 186322 CASAVA_Build 12 30129449 1D ACAAAGTAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 9 8 186323 CASAVA_Build 12 30134517 4I ATAAAACAAC ----/TATT TATTTATGGT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TATT 1 2 186324 CASAVA_Build 12 30139261 7D ATTGTATTTT TTTTCTA/------- TTTTCTATTT 3070 hom 73 het 29 0 24 7 TTTTCTA 3 2 186325 CASAVA_Build 12 30140369 1I AATAAGTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 10 11 186326 CASAVA_Build 12 30152919 1I TATCTAGGAT -/A AGAGGAATAT 3070 het 14 hom 13 1 10 2 A 1 2 186327 CASAVA_Build 12 30159032 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCTCCCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 6 5 186328 CASAVA_Build 12 30176674 2I TAGCAAAGAC --/AT AGAATCAGCT 3070 hom 95 het 38 0 32 6 AT 0 1 186329 CASAVA_Build 12 30183614 1I ATTAGCACAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 9 186330 CASAVA_Build 12 30183678 1I AATTGAAGGG -/A AAAAAATCTG 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 6 7 186331 CASAVA_Build 12 30187248 1D AATTTCACCC T/- TAGCGTTTTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 2 1 186332 CASAVA_Build 12 30188121 1I TCCTGATACC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 9 186333 CASAVA_Build 12 30190551 1D CTGAAACCAA T/- TTTGCAGTGA 3070 hom 117 het 44 0 40 6 T 4 3 186334 CASAVA_Build 12 30194019 1D ACGCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 23 0 19 5 A 15 14 186335 CASAVA_Build 12 30194542 1D TCGGAATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 38 0 21 17 T 15 14 186336 CASAVA_Build 12 30195985 2I ACAAAAAAAA --/AC CAAAAAAACT 3070 hom 57 het 22 0 19 4 AC 0 1 186337 CASAVA_Build 12 30197912 5I CAAGTATGTT -----/GTGTA GTGTACCAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GTGTA 1 2 186338 CASAVA_Build 12 30203186 3D ACACTTAACA AAG/--- AAGAGATACT 3070 hom 117 het 44 0 40 9 AAG 2 1 186339 CASAVA_Build 12 30210664 1D CATAGATCTT C/- TTTTCCTGTA 3070 hom 132 het 49 0 45 5 C 1 0 186340 CASAVA_Build 12 30211063 2I AAAATAGGAC --/CA TTAAACTAGG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 CA 0 1 186341 CASAVA_Build 12 30214309 1D ACCTCCTCCT C/- CCCACTGCGA 1786 hom 30 het 14 0 6 8 C 4 3 186342 CASAVA_Build 12 30219967 2I TCCATATAAC --/AT AGCATCCAGA 3070 hom 132 het 54 0 44 10 AT 0 1 186343 CASAVA_Build 12 30222405 1D TGTGACAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 28 1 23 4 T 11 10 186344 CASAVA_Build 12 30223187 1D CCTAGCAGTG T/- CTCACTTCCC 3070 hom 111 het 40 0 38 3 T 1 0 186345 CASAVA_Build 12 30224307 1D ACAAAACAGG A/- AACGAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 3 2 186346 CASAVA_Build 12 30225626 2D GATTCAAAAC TT/-- ATTATTCTAA 3070 hom 120 het 42 0 41 3 T 2 0 186347 CASAVA_Build 12 30226961 1D AGGGCAGCAG A/- AGTGGCAGAG 3070 hom 104 het 40 0 34 7 A 2 1 186348 CASAVA_Build 12 30228018 2D TAGGTGAAAC TG/-- TATTTTAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TG 1 0 186349 CASAVA_Build 12 30228247 3D TTAGTCTGAT AGG/--- AGTGTCATAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AGG 1 0 186350 CASAVA_Build 12 30229346 1I AACATAAGAG -/A AAAAAAACCC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 7 8 186351 CASAVA_Build 12 30230246 1I ACAGAAATTC -/T TTTTTCTTCT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 5 6 186352 CASAVA_Build 12 30233186 4I CTCACTCATC ----/TATT TATTTAGACT 3070 hom 138 het 54 0 45 9 TATT 1 2 186353 CASAVA_Build 12 30234873 26D CTGGCTCACT CTATTACCCAGGATGGAGGTGCAGTG/-------------------------- GCGACCTCCA 3070 hom 36 het 12 0 12 6 CTATTACCCAGGATGGAGGTGCAGTG 1 0 186354 CASAVA_Build 12 30240769 1I AAGAAAGAAG -/A GTTTAGCATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 0 1 186355 CASAVA_Build 12 30242600 1I GATATTTGAC -/T TTTTTTTATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 8 186356 CASAVA_Build 12 30245782 4D CGTGCGGCCC GGCG/---- GGCGCCCCGC 2256 hom 36 het 13 0 13 1 GGCG 2 1 186357 CASAVA_Build 12 30255921 1D CCTCTGATTT G/- AGCCTTCTTG 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 G 1 0 186358 CASAVA_Build 12 30261165 1D AAAGCAAAAG A/- ATATAAAATA 3070 het 3001 hom 23 7 12 4 A 2 1 186359 CASAVA_Build 12 30262906 1I TCTAGTTATT -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 49 het 21 0 16 5 A 7 8 186360 CASAVA_Build 12 30263818 1D CAGTGAACAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 T 8 7 186361 CASAVA_Build 12 30265047 1D TATTTAAAAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 T 9 8 186362 CASAVA_Build 12 30270194 3D CTTAAAAATA AAC/--- AACAACTGTA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 AAC 3 2 186363 CASAVA_Build 12 30270693 1I TTTGACCCTA -/T TTATGAGCTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 2 3 186364 CASAVA_Build 12 30274905 1D ACAGGGAGAC T/- TGCCTGATAC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 2 1 186365 CASAVA_Build 12 30291616 1D TGAACTGCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 384 hom 32 1 24 7 T 10 9 186366 CASAVA_Build 12 30293785 1D AAAATAAAAA C/- CCGACAAATA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 C 3 2 186367 CASAVA_Build 12 30295810 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 397 hom 32 1 25 6 A 9 10 186368 CASAVA_Build 12 30296484 1I ATAAGAAACA -/T TTACCATATC 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 2 3 186369 CASAVA_Build 12 30307568 1D TGCTGTTAAA G/- GTATTCGGTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 2 1 186370 CASAVA_Build 12 30308932 6I CTGTAAGTCC ------/AATTTA AACCTCTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 AATTTA 0 1 186371 CASAVA_Build 12 30309435 3D ACTAATAAAT TCC/--- TCAGTAAAGG 3070 het 3070 ref 28 14 9 8 TCC 1 0 186372 CASAVA_Build 12 30309975 5D4M1D ACTAGGAGGC AGAGTCATGA/-----CATG- GAATTGCTTG 1808 het 1766 hom 9 5 4 0 N/A 0 0 186373 CASAVA_Build 12 30311064 1I GGATGTGGAG -/A AAAGGGAAGC 207 het 207 ref 42 37 2 3 A 3 4 186374 CASAVA_Build 12 30314801 1D ATGTGAAGAT A/- GGGGAGGCAG 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 1 0 186375 CASAVA_Build 12 30329211 1I AAAAAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 11 12 186376 CASAVA_Build 12 30331005 1D TCAATCTAGT G/- GGTGTGAAGT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 G 3 2 186377 CASAVA_Build 12 30332386 1I TTTTCACAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 8 9 186378 CASAVA_Build 12 30338537 2D ACACCAATGT AA/-- AAAAAAACAA 3070 het 158 hom 28 2 16 10 A 9 7 186379 CASAVA_Build 12 30340484 1D GCTCCCTATT C/- CCCCCATCCC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 C 6 5 186380 CASAVA_Build 12 30345235 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2043 het 1375 hom 13 4 6 3 T 12 11 186381 CASAVA_Build 12 30345708 1D AACACTGGGA G/- CAGCATGAGC 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 G 1 0 186382 CASAVA_Build 12 30347862 1I ACTCAATGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 A 9 10 186383 CASAVA_Build 12 30348293 1D ACATTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 32 4 13 15 A 13 12 186384 CASAVA_Build 12 30348617 9I AGGGACAGAC ---------/ACAAAGGCA ACCATATCTG 3070 hom 122 het 45 0 37 8 ACAAAGGCA 0 1 186385 CASAVA_Build 12 30349301 2D ATGCAGCACC CA/-- CAGTGTTAGA 3070 het 3070 ref 39 17 14 10 CA 2 1 186386 CASAVA_Build 12 30357442 1I TTTTTTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 10 11 186387 CASAVA_Build 12 30359230 1I TTGTCAACTC -/A GTTGGGAATG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 0 1 186388 CASAVA_Build 12 30361712 1D TGTTTTCACA T/- TTTTTTACCA 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 T 7 6 186389 CASAVA_Build 12 30363883 1I TGTTTTCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 T 9 10 186390 CASAVA_Build 12 30370686 2D AGCTTGTAAG AC/-- AGACAACATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AC 1 0 186391 CASAVA_Build 12 30373616 6D6M4I ACTAAGCTGG TATTTATGTGGT----/------TGGGCTTCCG ATTTATGTGG 3070 het 3070 ref 41 26 18 2 N/A 0 0 186392 CASAVA_Build 12 30374493 10D ATTAGCATCA ATTCAGAACC/---------- ATTCAGAACC 3070 hom 56 het 40 1 33 8 ATTCAGAACC 2 1 186393 CASAVA_Build 12 30375109 2I CTTTCCAAAC --/TG TGTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 TG 1 2 186394 CASAVA_Build 12 30382893 1I GTCCAATGCT -/G GGGGGGCCAA 2160 het 2160 ref 20 11 5 4 G 6 7 186395 CASAVA_Build 12 30384749 1I CATTCTCCCC -/T AACCCACCTC 3070 het 3070 ref 39 23 10 6 T 0 1 186396 CASAVA_Build 12 30385519 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2258 hom 17 7 10 0 T 12 11 186397 CASAVA_Build 12 30387807 2I CTCATCCTTT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 9 11 186398 CASAVA_Build 12 30390419 1I AAAAAAAAAA -/T GTTTGTTTCT 2316 het 2316 ref 32 21 8 3 T 0 1 186399 CASAVA_Build 12 30391604 89D AAAAGTATTT AATGGCTACTAGCCTTAATACCTGGGTGACAAAATAGTCTATACAACAAACCCACATGGCATAAAACTGCACTTGGACCCCTGAACTTA/----------------------------------------------------------------------------------------- AATTAGAAGT 3070 het 3070 ref 31 42 11 1 AATGGCTACTAGCCTTAATACCTGGGTGACAAAATAGTCTATACAACAAACCCACATGGCATAAAACTGCACTTGGACCCCTGAACTTA 1 0 186400 CASAVA_Build 12 30392017 3I GCTCTATTGT ---/TTA TTGTTTATCC 3070 het 3070 ref 63 30 25 8 TTA 0 1 186401 CASAVA_Build 12 30396237 4D TCCTCCACTT AGTG/---- AGCAACTATC 3070 het 3070 hom 50 20 28 4 AGTG 1 0 186402 CASAVA_Build 12 30397110 1I ATCTCCATTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 8 9 186403 CASAVA_Build 12 30397838 2D CTAGATTCTC AT/-- ATCTGTTTCT 3070 het 3070 hom 22 9 8 7 AT 2 1 186404 CASAVA_Build 12 30401639 1I TCCTGACTCC -/A AAAAAAAATC 3070 het 2961 hom 30 8 14 8 A 8 9 186405 CASAVA_Build 12 30405820 18I28M1I CCTTTTGTCA ------------------GCTATTTTATTTTCCTTTCACATTTCCC-/TAGCAAGTTTGGGATCCTGCTATTTTATTTTCCTTTCACATTTCCCT TTTCTTCTTA 3070 het 3070 ref 33 22 10 12 N/A 0 0 186406 CASAVA_Build 12 30406307 1I GAAAAAGGAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 8 9 186407 CASAVA_Build 12 30417680 1D AAGCAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 12 11 186408 CASAVA_Build 12 30417962 3D ACTTGCAAAA GTT/--- GTTAACTCCT 3070 het 3070 ref 31 17 13 3 GTT 2 1 186409 CASAVA_Build 12 30426339 3D ACCCTGCATT TGA/--- TGATGATATT 3070 het 3070 ref 48 23 21 5 TGA 3 2 186410 CASAVA_Build 12 30469822 1D ACATCCTGCT G/- GGGGGGGGGT 1303 het 1303 ref 34 11 4 19 G 10 9 186411 CASAVA_Build 12 30504191 1D CCTTTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 1090 het 1090 ref 23 18 3 2 T 13 12 186412 CASAVA_Build 12 30511965 1I TCAAGCTCCT -/A AGTTAGTGTA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 1 2 186413 CASAVA_Build 12 30556836 1I TCTTTTACAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 T 8 9 186414 CASAVA_Build 12 30577727 4I TAAGGCTGAC ----/AGAA CAGACTCTTT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 AGAA 0 1 186415 CASAVA_Build 12 30580552 1I TTGTTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 T 12 13 186416 CASAVA_Build 12 30596631 5I TATAGGAGCA -----/TTATT TTATTAGGAC 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 TTATT 1 2 186417 CASAVA_Build 12 30597948 1D ATAAGGACTT A/- AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 A 8 7 186418 CASAVA_Build 12 30598328 3I AATAGCACAG ---/GTT TTTTTTTATT 3070 het 2960 hom 31 10 16 5 GTT 0 1 186419 CASAVA_Build 12 30607972 4D AATCAAAAAT CAAA/---- AATCAAAGAA 3070 het 3070 ref 46 21 20 6 CAAA 1 0 186420 CASAVA_Build 12 30614025 1D AGGGTCTCCA T/- CCCCTCAAGC 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 T 1 0 186421 CASAVA_Build 12 30617293 2I TGTCTCTACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 33 0 23 10 A 13 15 186422 CASAVA_Build 12 30618100 1D TCAGCCATTT A/- AAAAATGTTA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 A 6 5 186423 CASAVA_Build 12 30619473 1D TCCATCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3005 het 72 hom 19 2 11 7 A 17 16 186424 CASAVA_Build 12 30620215 1D CTTATTAAAA G/- GGTAGATTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 3 2 186425 CASAVA_Build 12 30621746 1I ATTCATAACC -/T TTTTATCTTC 3070 hom 66 het 27 0 21 6 T 4 5 186426 CASAVA_Build 12 30623297 1I AATGGCTATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 879 hom 47 2 34 11 A 9 10 186427 CASAVA_Build 12 30653693 1D CAAGAAAAAA G/- AAAACAATCT 3070 het 3070 ref 24 11 8 7 G 1 0 186428 CASAVA_Build 12 30663730 1I TGCCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 10 11 186429 CASAVA_Build 12 30664592 6D TGTTTTTTGT TTTTTG/------ TTTTTTTTTG 196 het 196 ref 28 17 3 9 TTTTTG 1 0 186430 CASAVA_Build 12 30670507 1I AAAACAAAAG -/A AAAAATCGAC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 A 5 6 186431 CASAVA_Build 12 30671847 5I TAAAAAAAAT -----/AAATA AAATAACTGT 2431 het 2358 hom 15 7 6 2 AAATA 1 2 186432 CASAVA_Build 12 30684613 2I GTAGAAAGTT --/AA GAGTTATATT 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 A 0 2 186433 CASAVA_Build 12 30688574 1I AATCTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 A 11 12 186434 CASAVA_Build 12 30688637 2I AAGGTCATAA --/TT TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 T 7 9 186435 CASAVA_Build 12 30688850 1I TGTTTTTTTT -/G TTTTGTTTTT 3070 het 307 hom 13 3 9 1 G 0 1 186436 CASAVA_Build 12 30689868 1D AACCCAGGAA C/- AAAACAGGGT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 C 1 0 186437 CASAVA_Build 12 30693098 1I TCCTTCATTA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 7 8 186438 CASAVA_Build 12 30703706 1I ACAAATAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 13 5 A 13 14 186439 CASAVA_Build 12 30705311 5D TAAATGCTAC TATTA/----- TATCATAAAC 2542 het 2542 ref 28 21 6 3 TATTA 1 0 186440 CASAVA_Build 12 30707232 2I GATCAGAACA --/CT CTGAACAAAT 3070 het 3070 hom 50 21 27 2 CT 1 2 186441 CASAVA_Build 12 30708952 1I AATATTTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 T 9 10 186442 CASAVA_Build 12 30712261 2D AACAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 28 13 10 7 AG 10 9 186443 CASAVA_Build 12 30713968 2I CTCCAGCTCC --/AA AAAAAAAAAA 2430 het 2430 ref 20 7 9 4 A 12 14 186444 CASAVA_Build 12 30723788 1D GCTCTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 2878 het 2878 ref 23 12 9 2 A 11 10 186445 CASAVA_Build 12 30748606 1I TTTTTTCCTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 7 8 186446 CASAVA_Build 12 30758783 3D AAATTCTATA TTC/--- TTCTTTGTGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 5 TTC 2 1 186447 CASAVA_Build 12 30778961 1D CCTTCCAGAC A/- ATCTGTCAAC 3070 het 3070 ref 23 12 9 3 A 2 1 186448 CASAVA_Build 12 30790333 3D CGATATTAAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 19 8 AAC 3 2 186449 CASAVA_Build 12 30795992 5D TTTCTATCAT TATCA/----- TAGAGTAGGC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 TATCA 1 0 186450 CASAVA_Build 12 30796975 1D GTTTCACAGG C/- TACATGACTC 3070 het 3070 ref 56 30 20 6 C 1 0 186451 CASAVA_Build 12 30800291 5D TGCTGAACAT GAGGA/----- GAGGAAGGCT 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 GAGGA 2 1 186452 CASAVA_Build 12 30809233 1D TCTGTGCCAG A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 7 6 186453 CASAVA_Build 12 30816361 1I TGCTTTTATA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 8 9 186454 CASAVA_Build 12 30819180 1D AATAAATTAT A/- AAAAATTTTA 2961 het 2961 ref 20 10 10 0 A 6 5 186455 CASAVA_Build 12 30819520 1D AGATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 11 10 186456 CASAVA_Build 12 30842327 1I CCGTCACTAA -/T TTTTTTTTTT 781 het 781 ref 33 9 2 22 T 17 18 186457 CASAVA_Build 12 30867771 14D GCCAGTGCAT GTGTGTGTGCGTGC/-------------- GTGTGTGTGC 3070 hom 75 het 29 0 24 6 GTGTGTGTGCGTGC 1 0 186458 CASAVA_Build 12 30882596 1D TCTCTACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 31 0 27 5 T 11 10 186459 CASAVA_Build 12 30892513 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1349 hom 14 het 9 0 5 4 T 11 10 186460 CASAVA_Build 12 30897458 1I CATATACATA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 8 9 186461 CASAVA_Build 12 30900553 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 729 hom 23 3 10 10 A 17 16 186462 CASAVA_Build 12 30911709 1D GTTTAAAAAA G/- AAAACTGTTG 3070 het 3070 ref 30 20 9 2 G 1 0 186463 CASAVA_Build 12 30915863 1I TTTTTAAGCC -/T CTCCAGGCCC 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 T 0 1 186464 CASAVA_Build 12 30922289 5D ATGGTCACTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 461 hom 46 6 24 18 A 15 10 186465 CASAVA_Build 12 30924783 1I CCGAGGAGAC -/T TTTTTTTTTT 2940 het 25 hom 29 1 12 16 T 13 14 186466 CASAVA_Build 12 30929379 4I GAGAATTTTG ----/GGCA GGCAGTTTTA 3070 het 3070 ref 32 21 11 0 GGCA 1 2 186467 CASAVA_Build 12 30940064 4D AATTGCTGAC TCTT/---- TATTTAAACT 3070 het 3070 ref 42 20 15 8 TCTT 1 0 186468 CASAVA_Build 12 30956799 1I GAGAAAGTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 69 hom 45 1 38 6 T 9 10 186469 CASAVA_Build 12 30967195 1I GCACCCCGCC -/G GGGACAGAAG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 G 3 4 186470 CASAVA_Build 12 30975700 2I GAAATGCGGT --/AA AGAGATTTCT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 1 3 186471 CASAVA_Build 12 31000918 1D TCTTTCCCCT A/- CCATTTTCTT 2439 het 2439 ref 22 9 8 5 A 1 0 186472 CASAVA_Build 12 31002368 1D ACCCCTCAGT A/- AAGACTCATG 3070 het 101 hom 38 1 32 5 A 3 2 186473 CASAVA_Build 12 31008309 18D CAGCCCTGGA GTGGGAGGGGCTGAGGCT/------------------ GTGGGAGTGC 3070 het 1856 hom 22 7 12 6 GTGGGAGGGGCTGAGGCT 1 0 186474 CASAVA_Build 12 31011881 38D CATTCGTGCA CACACATGCATATGCATGCACACACATGCATATGCACG/-------------------------------------- CACACATGCA 3070 het 3070 ref 53 36 20 15 CACACATGCATATGCATGCACACACATGCATATGCACG 1 0 186475 CASAVA_Build 12 31036278 3I ACCATAGCTT ---/CTA CTGTGCCCAC 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 CTA 0 1 186476 CASAVA_Build 12 31037316 1I CCCATAGGGA -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 C 7 8 186477 CASAVA_Build 12 31039987 4D AAGGGCTTTT ACAA/---- ACAGATTGCT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 ACAA 1 0 186478 CASAVA_Build 12 31042352 1D AGAAGGGACA G/- GTGCCCTCCA 3070 het 3070 ref 55 25 19 13 G 2 1 186479 CASAVA_Build 12 31052314 6D TTCTTTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 1462 hom 27 6 10 12 T 17 11 186480 CASAVA_Build 12 31052497 1I TCTGCTGAAA -/G CTTCCTGTCC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 0 1 186481 CASAVA_Build 12 31053270 1D CCCAATGACT A/- ACACTATAAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 A 2 1 186482 CASAVA_Build 12 31059040 6D AATCCAGGCA CAAAGG/------ TTAATTGGCA 3070 het 3070 hom 31 15 17 1 CAAAGG 1 0 186483 CASAVA_Build 12 31059285 4I ACATAAACGC ----/ATAA ATATTCTTTA 2154 het 2154 ref 46 37 5 4 ATAA 0 1 186484 CASAVA_Build 12 31072432 1I TTACAATTTA -/T TTTTTTTTTT 1947 het 1527 hom 14 6 4 4 T 11 12 186485 CASAVA_Build 12 31072875 1I CCAAAACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 10 11 186486 CASAVA_Build 12 31087901 4D CTTGCAGTTT TTTG/---- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 28 16 10 4 TTTG 1 0 186487 CASAVA_Build 12 31097854 2I CTTGTGTATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 15 10 13 TG 8 9 186488 CASAVA_Build 12 31103485 2D GTGTCTAAAA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 25 9 12 7 AG 5 4 186489 CASAVA_Build 12 31113147 1D TCATCACCAA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 8 7 186490 CASAVA_Build 12 31113747 4I CAGAACAATC ----/TAGT TAGTCTCTGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 TAGT 1 2 186491 CASAVA_Build 12 31118443 3D TGGGCATTAA CAG/--- CAGCCGCGTG 3020 het 2393 hom 21 6 10 6 CAG 2 1 186492 CASAVA_Build 12 31119503 1I AATAATACTT -/A ACGTTTCTTC 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 1 2 186493 CASAVA_Build 12 31120683 1D TATGCTGGAT A/- TCTCTTGCAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 1 0 186494 CASAVA_Build 12 31121234 4D CTTTCCCCTC GTAA/---- ATAGAGTGAC 3070 het 3070 ref 42 27 12 3 GTAA 1 0 186495 CASAVA_Build 12 31124805 1D GTCTCTGCCG A/- AATCACTTCC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 3 2 186496 CASAVA_Build 12 31132798 1I TTCTTTTTTT -/C CTCCCTTCAC 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 C 1 2 186497 CASAVA_Build 12 31134691 1D ATTCAGTTTT C/- CAGTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 C 2 1 186498 CASAVA_Build 12 31136770 1D CGGTGGAAAC T/- TAGCAGGGAG 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 T 2 1 186499 CASAVA_Build 12 31140220 3D TAGAAGTTCC TTT/--- TTTTTTTTTA 1952 het 1952 ref 15 6 4 5 T 12 9 186500 CASAVA_Build 12 31146323 1D CAGAGGATTT C/- CCCCAAAGTC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 C 5 4 186501 CASAVA_Build 12 31147040 1I CAGTCGGAGA -/G GGCTGAGGGA 2931 het 2931 ref 26 15 8 3 G 2 3 186502 CASAVA_Build 12 31150295 4I CAGGCAGGTC ----/AGGT AGGTAGGATG 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 AGGT 1 2 186503 CASAVA_Build 12 31150512 12I CCCCAGCCCT ------------/TGCACCTGCCCC TGCACCTGCC 3070 hom 60 het 28 0 15 13 TGCACCTGCCCC 1 2 186504 CASAVA_Build 12 31151616 4D CACCAGATGC CAAT/---- CAATCAGTAG 2944 het 2944 ref 28 15 7 6 CAAT 2 1 186505 CASAVA_Build 12 31153609 4I CTTTTTCTTC ----/TTCT TTTTTTTTTT 1158 het 1158 ref 38 15 7 16 TTCT 0 1 186506 CASAVA_Build 12 31160457 5I ATGAGAACTC -----/ATCAT ATTACCATGA 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 ATCAT 0 1 186507 CASAVA_Build 12 31161073 3I AATATTCCTC ---/AAG AAACTTCTCT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 AAG 0 1 186508 CASAVA_Build 12 31161348 3I GTTAAACTGG ---/AAA ATCTCACTGG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 1 4 186509 CASAVA_Build 12 31171328 1I GGCCTAAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 26 11 8 T 10 11 186510 CASAVA_Build 12 31174430 5D CAGAGTAAGA CGTGC/----- CGTGCCCTCT 2676 het 2676 ref 45 36 7 5 CGTGC 2 1 186511 CASAVA_Build 12 31183806 3D TCTTACATAA TCT/--- TCTGAAGAAA 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 TCT 2 1 186512 CASAVA_Build 12 31185027 1D TATAAAGGGG A/- AAAAAACATT 2862 het 2862 ref 22 13 6 3 A 7 6 186513 CASAVA_Build 12 31187553 1I AAGCTTACAT -/A AGATAATACA 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 A 1 2 186514 CASAVA_Build 12 31190371 4I AGTGCTCGTT ----/CTAA CTTCTTTTCA 1038 het 1038 ref 20 13 4 3 CTAA 0 1 186515 CASAVA_Build 12 31190413 2D ATATACACAC AT/-- ATATATATAC 2637 het 184 hom 13 1 6 7 AT 5 4 186516 CASAVA_Build 12 31197020 1I CAGTACTTAC -/A CTGAAAGTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 0 1 186517 CASAVA_Build 12 31198168 1I TGTTTCCACT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 8 9 186518 CASAVA_Build 12 31198503 1D GAGTGAGAAC T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 45 31 9 5 T 8 7 186519 CASAVA_Build 12 31199225 1I CACAAGATTT -/G TAAAGGTTCA 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 G 0 1 186520 CASAVA_Build 12 31213571 4I GGTTGACATT ----/TAAA TGTAAAATGC 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 TAAA 0 1 186521 CASAVA_Build 12 31230198 2I CACTAGTCAC --/AA GTATTCACAC 3070 het 3070 ref 42 29 8 5 A 0 2 186522 CASAVA_Build 12 31243537 1I TTTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTC 2369 het 2369 ref 24 14 5 5 T 9 10 186523 CASAVA_Build 12 31245998 1D TTATTATTTA T/- TTTTTTTTTT 1817 het 1246 hom 13 3 6 4 T 12 11 186524 CASAVA_Build 12 31248526 12I TCAGGCATGT ------------/ACTTACATATAG ACTTACATAT 3070 het 3070 hom 42 12 21 11 ACTTACATATAG 1 2 186525 CASAVA_Build 12 31252825 13I TAGGCCAAAG -------------/TAGTGAACGCTGT AGTGTACCCT 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 TAGTGAACGCTGT 0 1 186526 CASAVA_Build 12 31262600 12D TAAGGACAAG GGGAAAGGGGAA/------------ GGGAGAAAGG 3070 het 3070 ref 32 14 14 6 GGGAAAGGGGAA 1 0 186527 CASAVA_Build 12 31278224 1D CCCCTCTCCA G/- GCTGAGAAGA 3070 het 3070 hom 35 14 13 9 G 2 1 186528 CASAVA_Build 12 31282428 1I AAGGGAGTCA -/C AAAAGAATAG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 C 0 1 186529 CASAVA_Build 12 31284576 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3045 hom 18 7 10 1 A 11 12 186530 CASAVA_Build 12 31287345 17D ACAACATGCC GAAAAGAAGAAAAAAAA/----------------- GAAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 37 21 20 2 GAAAAGAAGAAAAAAAA 1 0 186531 CASAVA_Build 12 31290666 1D CTACAACTAC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 8 7 186532 CASAVA_Build 12 31301438 1D AAGAAACATG A/- AAAAAAAATT 2914 het 2914 ref 24 13 10 1 A 9 8 186533 CASAVA_Build 12 31305262 1D AATCCTCCCG C/- CCCCACCTAT 3070 hom 86 het 34 0 27 10 C 5 4 186534 CASAVA_Build 12 31326405 1D GAAGGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2684 hom 23 8 12 3 A 12 11 186535 CASAVA_Build 12 31332832 4D ACACCTGGCG GTAA/---- GTAATAGGGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 GTAA 2 1 186536 CASAVA_Build 12 31351291 3D GAGAGGTCTT ATC/--- AGAAGACTGG 3070 het 3070 hom 51 22 23 7 ATC 1 0 186537 CASAVA_Build 12 31390417 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1909 het 1909 ref 18 10 5 3 A 15 14 186538 CASAVA_Build 12 31402138 1D TAACAATTTC T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 7 186539 CASAVA_Build 12 31412188 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 21 1 15 5 A 13 14 186540 CASAVA_Build 12 31420643 1I GCGCCCAGCC -/T TTTTTGTTAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 5 6 186541 CASAVA_Build 12 31420997 4D ACTCCGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1997 het 16 hom 14 1 8 5 A 20 16 186542 CASAVA_Build 12 31432335 1I TTTCTATGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 9 10 186543 CASAVA_Build 12 31438501 2I AGAAAATACC --/CT GTTATCCATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CT 0 1 186544 CASAVA_Build 12 31440031 13D TATATTCATG TTCTGTGGCTGCC/------------- TTCTGTGGCT 3070 hom 81 het 31 0 25 10 TTCTGTGGCTGCC 1 0 186545 CASAVA_Build 12 31442018 1D CCAGCTACTT G/- GAAAGCTGAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 2 1 186546 CASAVA_Build 12 31442270 1D AACTTTCTTC T/- TTTTAAAATC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 5 4 186547 CASAVA_Build 12 31445052 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 18 1 16 1 T 10 11 186548 CASAVA_Build 12 31447582 1D TCCTCCCTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 29 0 23 7 T 9 8 186549 CASAVA_Build 12 31463744 2I GCACGTTTGT --/AG AGAGGGCAGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AG 2 3 186550 CASAVA_Build 12 31464647 2D CTCCCAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 122 hom 15 2 9 4 T 16 14 186551 CASAVA_Build 12 31465750 4D TCATATTCCT ATAA/---- ATATACATCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ATAA 1 0 186552 CASAVA_Build 12 31471628 1D CAACATGGTT A/- AAACCCCATC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 4 3 186553 CASAVA_Build 12 31478045 2I CATAGTGAGA --/CT CTGTCTCTAC 3070 hom 78 het 30 0 27 6 CT 1 2 186554 CASAVA_Build 12 31479863 1D ATTTTGTTTT A/- GTTTGTTTGT 2889 hom 42 het 35 0 14 21 A 1 0 186555 CASAVA_Build 12 31481348 2D TGCCCCCCCC TT/-- TTTTTTTTTT 2695 het 99 hom 17 2 10 5 T 14 12 186556 CASAVA_Build 12 31483688 1D ATTAGGTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 349 hom 33 1 30 2 T 10 9 186557 CASAVA_Build 12 31483840 1I CATCAAAAGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 8 9 186558 CASAVA_Build 12 31489904 1I ATTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2766 hom 34 het 16 0 12 4 A 11 12 186559 CASAVA_Build 12 31494568 4I AAAATTATCT ----/TTTA TTTGTTTTTT 3070 hom 89 het 36 0 30 6 TTTA 0 1 186560 CASAVA_Build 12 31507492 3D ACAAAAAACC CAA/--- CAACAACAAC 3070 hom 54 het 24 0 18 7 CAA 5 4 186561 CASAVA_Build 12 31510902 6D TCAAAAACAA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 hom 91 het 32 0 31 2 AAC 5 3 186562 CASAVA_Build 12 31513020 4D CTCAAAAAAC CAAA/---- CAAACAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 6 CAAA 3 2 186563 CASAVA_Build 12 31519555 5I ACAAAAAAAT -----/ACTCA AGAGTATAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ACTCA 0 1 186564 CASAVA_Build 12 31522901 1I GAACTTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 37 1 28 8 A 10 11 186565 CASAVA_Build 12 31524526 1I ATAAATGTTG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 7 8 186566 CASAVA_Build 12 31533956 2D TACAAAAAGG TA/-- TACAAGGTAC 3070 hom 159 het 55 0 52 4 TA 2 1 186567 CASAVA_Build 12 31534345 1D ATTCACTGAC A/- AAAGACTGGT 3070 hom 110 het 40 0 37 3 A 4 3 186568 CASAVA_Build 12 31539996 1D AAATGAGGGG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 8 7 186569 CASAVA_Build 12 31558040 1I TCAGATAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1032 hom 28 5 16 7 T 15 16 186570 CASAVA_Build 12 31561216 1D TAGATACCTT C/- CCTCCTGAAT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 C 3 2 186571 CASAVA_Build 12 31562779 1D CAAATATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 13 12 186572 CASAVA_Build 12 31568921 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 351 hom 36 1 30 5 A 9 10 186573 CASAVA_Build 12 31572155 2D TAAATTAAAA AC/-- AGTCAGTGTC 3070 hom 111 het 44 0 38 7 AC 1 0 186574 CASAVA_Build 12 31580189 1D CGGTACTGTT C/- CTCCTGATAG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 C 2 1 186575 CASAVA_Build 12 31585243 1I CTTACCATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 38 1 31 6 A 10 11 186576 CASAVA_Build 12 31588867 1D ATTCAACTAC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 8 7 186577 CASAVA_Build 12 31592611 2I AAGAAGAAGA --/AG AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 40 0 37 3 AG 0 1 186578 CASAVA_Build 12 31603678 4D GAGTTATCTC CAGA/---- CAAAGAGTAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 CAGA 1 0 186579 CASAVA_Build 12 31607128 1D TCCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 22 11 T 15 14 186580 CASAVA_Build 12 31611519 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 745 hom 23 3 15 5 A 13 14 186581 CASAVA_Build 12 31615694 1D ATTTGGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 11 10 186582 CASAVA_Build 12 31615819 1D AAAGCCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 11 10 186583 CASAVA_Build 12 31621101 1D CCTTATTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 11 10 186584 CASAVA_Build 12 31638632 1I AGGCACGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 296 hom 28 1 23 4 T 10 11 186585 CASAVA_Build 12 31644380 1D AAAAAAAGGT A/- AAGCTGATCT 732 het 4 hom 16 0 8 8 A 3 2 186586 CASAVA_Build 12 31645280 1I CCGTCCAGTT -/A AAAAAAAAAA 2693 het 336 hom 22 3 14 5 A 15 16 186587 CASAVA_Build 12 31657193 4D AGAAAGAAAG GAAA/---- GAAAGAGAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 GAAA 2 1 186588 CASAVA_Build 12 31664532 1D ACTTTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 22 1 18 4 A 12 11 186589 CASAVA_Build 12 31670314 2I CCTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2852 het 3 hom 23 1 13 9 A 12 14 186590 CASAVA_Build 12 31672206 1D ATATGGGTTG A/- AACGAAGTCT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 3 2 186591 CASAVA_Build 12 31676263 1I TCTTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 19 0 15 4 C 0 1 186592 CASAVA_Build 12 31676556 3I CACACCCAGC ---/CTT CTTCTTTCTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 CTT 2 3 186593 CASAVA_Build 12 31676905 1I CCAGACAGCT -/A AATTATTTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 2 3 186594 CASAVA_Build 12 31678188 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 260 hom 9 1 8 0 A 7 8 186595 CASAVA_Build 12 31679125 4I GATCCTCTTG ----/CCTC TGCCTCCCGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CCTC 0 1 186596 CASAVA_Build 12 31680798 2I GAGGTGTGTT --/AA AAAAAAAAAA 1776 hom 33 het 25 0 12 13 A 13 15 186597 CASAVA_Build 12 31683083 1D TGTAAGAAAT A/- ACACACCTTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 2 1 186598 CASAVA_Build 12 31687622 1D CTAATTTTTG T/- TTTTCGTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 5 4 186599 CASAVA_Build 12 31690249 3D TGACATGAAA GTT/--- GTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 14 5 GTT 3 2 186600 CASAVA_Build 12 31693188 1I46M1I AATAGTTGTA -TTTTTTTTGGAGACGGAGTCTCGCTTTGTCACCTAGGCTGGAGTGC-/TTTTTTTTTGGAGACGGAGTCTCGCTTTGTCACCTAGGCTGGAGTGCA AGTGGCGTGC 3070 hom 36 het 17 0 13 9 N/A 0 0 186601 CASAVA_Build 12 31694829 1I TGACCTGACC -/T TTTTTTTTTT 1012 het 1012 ref 37 19 3 15 T 15 16 186602 CASAVA_Build 12 31695509 1I ATGCCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2109 hom 20 het 20 0 9 12 T 13 14 186603 CASAVA_Build 12 31711571 1I GTAAAAAAAC -/A AAAATCTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 4 5 186604 CASAVA_Build 12 31727782 4D CTTATGATAG TAAA/---- TAAGTCTCAT 3070 het 3070 ref 29 12 13 5 TAAA 1 0 186605 CASAVA_Build 12 31730057 1D TTTGTTATTA T/- TTTTTTTTTT 1998 het 1184 hom 13 4 5 4 T 13 12 186606 CASAVA_Build 12 31732806 1I CTCAGGAGTT -/A AGAGACCAGC 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 A 1 2 186607 CASAVA_Build 12 31736653 1D25M1D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAACAAACGAAAAAAAAC/-AAAAAAAAAAACAAACGAAAAAAAA- ATATTAAATT 3070 het 3070 hom 16 10 11 2 N/A 0 0 186608 CASAVA_Build 12 31748698 1D ACTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 41 2 30 10 T 12 11 186609 CASAVA_Build 12 31751191 5D TAAAAGAAAT AAGAA/----- AAGATTAATA 3070 het 532 hom 22 3 9 12 AAGAA 1 0 186610 CASAVA_Build 12 31751215 2I AAGATAAAAC --/AA GAAACCATAA 3070 het 1242 hom 31 5 17 9 A 0 2 186611 CASAVA_Build 12 31774282 6I AAGCACCCAT ------/GGTTGG GGGGGTGGGA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 GGTTGG 0 1 186612 CASAVA_Build 12 31775982 1I AACTTCAGGA -/T TTCCCCCCCC 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 T 2 3 186613 CASAVA_Build 12 31778834 1I CCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 10 11 186614 CASAVA_Build 12 31778991 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 1581 het 1581 ref 10 5 4 1 T 8 9 186615 CASAVA_Build 12 31789633 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 271 hom 49 7 18 24 AC 10 9 186616 CASAVA_Build 12 31791772 2I AAGAAAAAAA --/AC AAATCAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AC 0 1 186617 CASAVA_Build 12 31797081 1I GAAAGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 31 1 24 6 A 10 11 186618 CASAVA_Build 12 31800718 1D AAAAAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 10 7 A 15 14 186619 CASAVA_Build 12 31809939 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2844 hom 21 8 8 5 A 10 11 186620 CASAVA_Build 12 31812329 1D TCCTAGACCA G/- GGGTCCCCAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 G 4 3 186621 CASAVA_Build 12 31831920 6I AACATAGTAC ------/AAGTAT AAGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AAGTAT 0 1 186622 CASAVA_Build 12 31846643 1D AGGCAAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 177 hom 26 1 20 6 A 12 11 186623 CASAVA_Build 12 31850903 3D TACCTGAAGG CCT/--- CCTCTGCACA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 CCT 2 1 186624 CASAVA_Build 12 31853788 3I CCATTGTTTC ---/ATT ATTCATAATA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 ATT 1 2 186625 CASAVA_Build 12 31853931 1I TCTTTCTGAA -/T TTTTTTTTTT 2648 het 2648 ref 26 11 8 7 T 13 14 186626 CASAVA_Build 12 31858511 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2359 hom 22 7 11 4 T 9 10 186627 CASAVA_Build 12 31859414 4I CAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 1118 hom 30 6 13 11 AAAG 2 3 186628 CASAVA_Build 12 31863800 2D AGATCTTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 11 7 A 13 11 186629 CASAVA_Build 12 31866123 3D ATAATAATAA CAG/--- ATGTTTTTGT 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 CAG 1 0 186630 CASAVA_Build 12 31875998 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1868 het 657 hom 22 5 8 9 A 17 16 186631 CASAVA_Build 12 31883319 2D TTGAGCCCAG GA/-- GTTCAAGACC 3070 het 3070 hom 39 14 19 8 GA 1 0 186632 CASAVA_Build 12 31912472 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2469 het 750 hom 29 4 11 14 T 17 16 186633 CASAVA_Build 12 31918258 1D GCTAATTTTG T/- TTTTTGTATT 1725 het 1725 ref 15 10 4 1 T 6 5 186634 CASAVA_Build 12 31922913 1I GGAATTGCAA -/T TTGGGAGACA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 3 186635 CASAVA_Build 12 31923777 1D GTTGAGATAA G/- GGGGGGTGGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 7 6 186636 CASAVA_Build 12 31924105 1D AAAGAGTCTG T/- TTTTGTCAGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 5 4 186637 CASAVA_Build 12 31924972 3I AGTTTAGGTT ---/TTG TTTGTTTGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTG 0 1 186638 CASAVA_Build 12 31926673 5D TCTTTAAAAT TTTTA/----- TTTTATTTAT 3070 hom 69 het 26 0 23 5 TTTTA 2 1 186639 CASAVA_Build 12 31928000 2D CCTATGTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 23 6 T 13 11 186640 CASAVA_Build 12 31929659 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 29 1 26 2 A 12 11 186641 CASAVA_Build 12 31932500 1D TTGCAGTAAA G/- GCTTGCCTCC 3070 hom 113 het 40 0 35 5 G 2 1 186642 CASAVA_Build 12 31933110 1D TTTTTGGTGG A/- GGGGGGGGCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 0 186643 CASAVA_Build 12 31934373 2I CCACACAAAA --/CT CTAAAAATAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CT 1 2 186644 CASAVA_Build 12 31934674 4D CTCTTGAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAAT 4 3 186645 CASAVA_Build 12 31934734 5I ATGTATTCAA -----/TCTGT TTTGTTTTAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TCTGT 0 1 186646 CASAVA_Build 12 31937229 1I TCTCAGCTAC -/T TTGGGAGGTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 2 3 186647 CASAVA_Build 12 31938797 6D TCATACTACT CTCATA/------ CTAAGAACAC 3070 het 3070 ref 34 18 10 8 CTCATA 1 0 186648 CASAVA_Build 12 31943120 16D AGAAGAAAGG AAGAAAAGAAAGAAGA/---------------- AAGAAAAGAA 3070 het 2085 hom 27 7 14 11 AAGAAAAGAAAGAAGA 2 1 186649 CASAVA_Build 12 31944085 11D AGCATAATGC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 12 15 8 T 20 9 186650 CASAVA_Build 12 31949151 1I AATAAAATTG -/T TTTCAGACAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 3 4 186651 CASAVA_Build 12 31949566 1D AAAAAGAGTC A/- AAAAAAAAAA 2893 het 2671 hom 25 8 8 10 A 12 11 186652 CASAVA_Build 12 31950261 1D TTTGTTACTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 10 9 186653 CASAVA_Build 12 31960665 1D GATTGGCAGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 9 8 186654 CASAVA_Build 12 31961731 1I GCATTCCAGC -/T GAGATTGGAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 0 1 186655 CASAVA_Build 12 31964957 2D CTGACTGCAA GC/-- GCTCCGCCTC 1017 het 1017 ref 11 6 3 3 GC 2 1 186656 CASAVA_Build 12 31969068 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 322 hom 5 het 4 0 2 3 T 1 0 186657 CASAVA_Build 12 31978014 8I TTTCGCTCTG --------/TCGCCATC TCGCCATCTC 2101 hom 14 het 16 0 6 10 TCGCCATC 1 2 186658 CASAVA_Build 12 31980030 5D GCATGAGCCA CTGTG/----- CTGTGCCCAG 3070 het 1520 hom 16 4 11 1 CTGTG 2 1 186659 CASAVA_Build 12 31982286 1D GGATTATTTC T/- TTTTAAGAGA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 5 4 186660 CASAVA_Build 12 31996484 1D AATCCCAGAA C/- TTTGGGAGGC 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 C 1 0 186661 CASAVA_Build 12 32000049 1D CAATAGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 A 13 12 186662 CASAVA_Build 12 32003173 2D TGTTGATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 10 T 12 10 186663 CASAVA_Build 12 32008424 2I44M1I TTTGTGGAAC --ATTATTTAATCACCCAGGTATTAAGCCTAGTACCCAATTAGTTG-/AGATTATTTAATCACCCAGGTATTAAGCCTAGTACCCAATTAGTTGT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 29 12 11 N/A 0 0 186664 CASAVA_Build 12 32017879 1D GGGATGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 12 11 186665 CASAVA_Build 12 32030242 1D TCATGCTGTC T/- TGGGCTGCTG 3070 het 3070 ref 40 26 14 0 T 2 1 186666 CASAVA_Build 12 32032900 1D GAGTATTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 T 10 9 186667 CASAVA_Build 12 32042174 1I TCTCCACCCC -/G CCCCCCCAAC 1115 het 570 hom 19 3 11 5 G 0 1 186668 CASAVA_Build 12 32043603 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 12 11 186669 CASAVA_Build 12 32044453 1I TAAAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 2717 het 440 hom 14 2 11 2 A 14 15 186670 CASAVA_Build 12 32045579 1D CTCTAATTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 10 9 186671 CASAVA_Build 12 32048198 1I TTCAGTGATA -/T TTTTTTAGTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 186672 CASAVA_Build 12 32050052 2I TAAAAAAAAC --/AA GAGTTTCACT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 A 0 2 186673 CASAVA_Build 12 32065058 4D GTGTGCCTAT AATC/---- AATCCCAGCT 3070 hom 51 het 19 0 16 3 AATC 2 1 186674 CASAVA_Build 12 32078158 1I TAAATTGACA -/T AAGGCAGATT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 0 1 186675 CASAVA_Build 12 32078670 13D CTTAGTGGTT TTATCATTATATA/------------- TTGTATAAAT 3070 het 3017 hom 17 9 10 2 TTATCATTATATA 1 0 186676 CASAVA_Build 12 32079971 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 21 1 A 14 12 186677 CASAVA_Build 12 32080061 4D TTGCACAAAA TATT/---- TATCAACATT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TATT 1 0 186678 CASAVA_Build 12 32085022 2D GGAATCTAAA AC/-- AATCAAGCTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 8 AC 1 0 186679 CASAVA_Build 12 32085549 1I CTAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2903 het 2903 ref 28 12 9 7 A 13 14 186680 CASAVA_Build 12 32087793 1D TCCAGGGAAG A/- AATCTGTTCC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 3 2 186681 CASAVA_Build 12 32089755 1I AGACTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2400 het 2400 ref 30 15 9 6 A 15 16 186682 CASAVA_Build 12 32092865 1I GCTTCAACCT -/G GGAGGCAGGG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 2 3 186683 CASAVA_Build 12 32093707 1D CCAGAGGAGA C/- TACCATATGA 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 C 1 0 186684 CASAVA_Build 12 32094073 2I CCTCCATAAT --/TG TGAGAGCCAA 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 TG 1 2 186685 CASAVA_Build 12 32094559 1D CTACTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 A 11 10 186686 CASAVA_Build 12 32099585 4D GTCTTCAGTT CCAA/---- TTGTCTTTTG 3070 het 3070 ref 47 25 18 5 CCAA 1 0 186687 CASAVA_Build 12 32100134 2D GAAATAAGAC AT/-- GTTAATAGTT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 AT 1 0 186688 CASAVA_Build 12 32105179 12I ACACGAATCG ------------/CTATGGTGACAC CTGACACCTT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 CTATGGTGACAC 0 1 186689 CASAVA_Build 12 32112213 1I ATGCCTGTAA -/T TCCCAGCACT 3070 het 2570 hom 20 8 9 3 T 1 2 186690 CASAVA_Build 12 32118265 1D GGGATTGAGG T/- TTTTTTTTTT 1381 het 1381 ref 33 22 3 8 T 12 11 186691 CASAVA_Build 12 32118672 1D CTGGAATGTT G/- ATTTTAATAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 G 1 0 186692 CASAVA_Build 12 32120098 1I GGAAAAGTTC -/A GAGGTACTTT 3070 hom 165 het 59 0 53 6 A 0 1 186693 CASAVA_Build 12 32127614 2D CTAAAAATAC CA/-- AAAAAATTAG 851 het 851 ref 16 13 2 3 CA 1 0 186694 CASAVA_Build 12 32132808 1I GACTCCCCCT -/A AAAAAAAAAA 2965 hom 41 het 18 0 13 5 A 13 14 186695 CASAVA_Build 12 32133095 4D TGCCCACCTC CCTT/---- GTTTTCTGTG 3070 het 3070 ref 45 26 17 8 CCTT 1 0 186696 CASAVA_Build 12 32133665 1I TAGAAACATG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 11 22 9 A 8 9 186697 CASAVA_Build 12 32136555 4D GCAAAAGATG GAAA/---- GAAAGAGAAG 3070 het 3070 ref 30 18 10 5 GAAA 2 1 186698 CASAVA_Build 12 32136702 1I GCAAAGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3063 het 3063 ref 21 10 9 2 T 11 12 186699 CASAVA_Build 12 32142848 1I ACGTCCACAA -/C GAAAGTTGTA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 C 0 1 186700 CASAVA_Build 12 32164957 1D CGCATGACCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 T 10 9 186701 CASAVA_Build 12 32165069 8D ATCAACCATT AGAGAGAG/-------- AGAGAGAGAG 1888 het 1888 ref 24 10 6 9 AG 14 10 186702 CASAVA_Build 12 32165489 1D AATTCATACC A/- GATCTTAATT 3070 het 3070 ref 27 16 7 5 A 1 0 186703 CASAVA_Build 12 32169348 1I CCCACTGTCC -/T TCTGCGTGGT 3070 het 3070 ref 61 33 19 9 T 1 2 186704 CASAVA_Build 12 32171922 1D AGTGTGAACG A/- AGGCAGATCA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 2 1 186705 CASAVA_Build 12 32172812 1D TCCTTTTCTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 A 9 8 186706 CASAVA_Build 12 32172954 1D TACTTTAGAA T/- CTTTTAAAAC 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 T 1 0 186707 CASAVA_Build 12 32173141 1D GTCCAACTAA T/- TTTTTTTTTC 1576 het 1576 ref 24 15 4 6 T 10 9 186708 CASAVA_Build 12 32179708 1D TTTAAGTGAT C/- CTTACATCTC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 C 2 1 186709 CASAVA_Build 12 32184997 17D TTACATACTT CGTGTGTGTAGTTTTGG/----------------- CATTTAAGGA 2734 het 2734 ref 51 24 8 27 CGTGTGTGTAGTTTTGG 1 0 186710 CASAVA_Build 12 32185527 2D ATATTTCTGA TT/-- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 9 7 186711 CASAVA_Build 12 32189393 1I GAAGAAAGAA -/G TAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 G 0 1 186712 CASAVA_Build 12 32190790 1D GTCACAGGAG T/- GAATGAGATT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 1 0 186713 CASAVA_Build 12 32191687 3D ACGATTTACT AAG/--- AAGAATTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 AAG 2 1 186714 CASAVA_Build 12 32192165 1I TATAGGGAGA -/C CCCCCCATCT 3070 het 1830 hom 18 6 10 4 C 6 7 186715 CASAVA_Build 12 32193465 5I GGTCATCAAT -----/GAAAA GATTTTCTCT 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 GAAAA 0 1 186716 CASAVA_Build 12 32194695 1D AAGATAGGGA T/- TAAAAGAATT 3070 het 3070 ref 60 27 27 7 T 2 1 186717 CASAVA_Build 12 32196458 1I TTTTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 14 15 186718 CASAVA_Build 12 32199236 1D GAAGTGCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 70 het 39 1 36 2 T 10 9 186719 CASAVA_Build 12 32205017 2D GATACACACA TG/-- TGTGTTTTGT 3070 hom 135 het 52 0 46 7 TG 3 2 186720 CASAVA_Build 12 32207245 1D GTTTTAACAT A/- TTTAGTTGAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 1 0 186721 CASAVA_Build 12 32212209 2D AGGAGATGGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 202 hom 33 5 16 12 GT 15 14 186722 CASAVA_Build 12 32213163 4D AACTTCATCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 CAAA 5 4 186723 CASAVA_Build 12 32217266 2I TTGTTTTTTT --/TG TGGAGACAGC 2009 het 2009 ref 22 9 8 5 TG 1 2 186724 CASAVA_Build 12 32221943 1D TATATTTATA T/- AAAATATATA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 T 1 0 186725 CASAVA_Build 12 32230142 2D AGGAGACTAA AC/-- ACCGCCAGTT 3070 het 3070 ref 47 22 17 9 AC 2 1 186726 CASAVA_Build 12 32242111 1D TGCATATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 26 6 A 13 12 186727 CASAVA_Build 12 32247974 14D CAGCTCTCGG TCTCTTCTTTGGCC/-------------- TCTCTTCTTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TCTCTTCTTTGGCC 2 1 186728 CASAVA_Build 12 32248387 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAATGCA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 7 6 186729 CASAVA_Build 12 32248548 1I AGACCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2633 het 2607 hom 29 11 10 8 A 15 16 186730 CASAVA_Build 12 32251453 2I AAAAACTCTC --/TA AACAGTTGAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TA 0 1 186731 CASAVA_Build 12 32253939 4D GGCCAGGTTC TAGG/---- TCACTCCCTC 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 TAGG 1 0 186732 CASAVA_Build 12 32259995 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1176 het 450 hom 4 1 3 0 A 11 10 186733 CASAVA_Build 12 32262366 4D GAGCATCCTC ACTT/---- ACACAGCCAC 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 ACTT 1 0 186734 CASAVA_Build 12 32271213 1D CGGGGAAGAT A/- ACACAGCTCA 3070 het 3070 ref 32 18 9 6 A 2 1 186735 CASAVA_Build 12 32271335 1D AATAGAACAA G/- GGGGGACACC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 G 6 5 186736 CASAVA_Build 12 32272166 3D CTTCATGGAG TTC/--- TTCTTCTTGG 3070 het 3070 ref 67 32 29 6 TTC 3 2 186737 CASAVA_Build 12 32275080 3I TGAAATTATC ---/ATG ATGACTGCTG 3070 het 3070 ref 61 32 23 6 ATG 1 2 186738 CASAVA_Build 12 32279672 1I TTTATGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 9 10 186739 CASAVA_Build 12 32279760 1D ATATTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 30 1 21 8 T 11 10 186740 CASAVA_Build 12 32280816 3I ACTTTAAATC ---/AAA AAAACATAGA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 4 7 186741 CASAVA_Build 12 32282446 1I CTAAAAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 10 186742 CASAVA_Build 12 32292132 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCC 2777 het 1205 hom 13 4 6 3 A 5 4 186743 CASAVA_Build 12 32295694 1I AGGGAAGAAT -/C CTTTTCCTTG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 C 1 2 186744 CASAVA_Build 12 32297692 1D CCGTGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 T 11 10 186745 CASAVA_Build 12 32304292 8D CGCCCAGCTA ATTTTTGT/-------- ATTTTTAGTA 1216 het 1216 ref 9 5 4 1 ATTTTTGT 1 0 186746 CASAVA_Build 12 32305439 1I TCCAAAACTT -/A ACAAAAATTT 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 1 2 186747 CASAVA_Build 12 32306197 9I TACAGTACCT ---------/GACAGGGGC GACAGGGGCA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 GACAGGGGC 1 2 186748 CASAVA_Build 12 32311835 4D TTTTTGTTTC TTAT/---- TTAAGAAATT 2018 het 2018 ref 21 15 5 1 TTAT 1 0 186749 CASAVA_Build 12 32319220 2I TGCTTATTAA --/AC AAATAAATTC 3070 het 3070 hom 49 15 28 6 AC 0 1 186750 CASAVA_Build 12 32320879 1D TGCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 A 10 9 186751 CASAVA_Build 12 32325264 1D ATTTCCCAAA C/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 34 12 17 7 C 1 0 186752 CASAVA_Build 12 32327346 6D GACTGACTGT AGGAAG/------ AGGAAGAGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AGGAAG 2 1 186753 CASAVA_Build 12 32334323 105D ACAGCCTAGA AGCATTCTGAATAACAAGGAGCTCCAACCCCTTATATATAAATGAGGTTACATATAGTAGGTTGAAAGCAGGTTTCCAAAACAACCAATTAGTTTGTATAGCTTC/--------------------------------------------------------------------------------------------------------- AGCTTCAGGA 3070 het 3070 ref 38 55 9 12 AGCATTCTGAATAACAAGGAGCTCCAACCCCTTATATATAAATGAGGTTACATATAGTAGGTTGAAAGCAGGTTTCCAAAACAACCAATTAGTTTGTATAGCTTC 1 0 186754 CASAVA_Build 12 32339296 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAAGAAAA 3070 het 320 hom 26 1 22 3 AG 0 1 186755 CASAVA_Build 12 32340338 1D TCCAGAGGCT C/- CCCAGGTCTT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 C 4 3 186756 CASAVA_Build 12 32341707 2D CTAATTAATG AA/-- GTGTTAAGTA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 A 2 0 186757 CASAVA_Build 12 32342007 12I AAAGAGTCTA ------------/TTTATTCATTTG TTTACATTCC 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 TTTATTCATTTG 0 1 186758 CASAVA_Build 12 32345821 1I CTACAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2297 het 2297 ref 36 21 8 7 A 9 10 186759 CASAVA_Build 12 32354637 1D TGTGCAGGAG A/- ATGAAATCCC 3070 het 3070 hom 51 19 24 8 A 2 1 186760 CASAVA_Build 12 32358576 1D GAGTGTACCA T/- TTTTTTATCC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 7 6 186761 CASAVA_Build 12 32358963 1D TACAAAGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2443 hom 24 8 10 6 T 13 12 186762 CASAVA_Build 12 32360337 7D ACCCTGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 12 2 9 1 A 18 11 186763 CASAVA_Build 12 32360488 1D TGATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3018 hom 24 10 10 4 T 11 10 186764 CASAVA_Build 12 32368768 6D TGTACTGTAC TTTTCT/------ TTTTCTTTTT 2704 het 2704 ref 30 14 9 9 TTTTCT 3 2 186765 CASAVA_Build 12 32369349 2D TCCATTTATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 8 T 12 10 186766 CASAVA_Build 12 32388606 1I TGAGAGCAGA -/C CTTACCACGG 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 C 1 2 186767 CASAVA_Build 12 32391155 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1471 hom 26 5 10 11 T 15 16 186768 CASAVA_Build 12 32392925 40D TCACACAAAA ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------------- ATATATATAT 3070 het 6 hom 13 1 13 5 AT 28 8 186769 CASAVA_Build 12 32395070 2D TTCATTGTCC TT/-- TGTCACCTCT 3070 het 3070 hom 60 20 33 7 T 3 1 186770 CASAVA_Build 12 32395160 5D AATAGCCAAG TTTAT/----- TTTAACTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 18 6 TTTAT 1 0 186771 CASAVA_Build 12 32403709 16D ACTCCCATCA TAACCCATGAATCCAT/---------------- TAACCCATGA 3070 het 3070 ref 39 24 8 13 TAACCCATGAATCCAT 2 1 186772 CASAVA_Build 12 32407029 2D TGGCAAATTC TG/-- TGTTTGTTTC 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 TG 2 1 186773 CASAVA_Build 12 32407811 2D GCCTAGATAT CA/-- CAACCTCCAG 3070 het 3070 ref 51 29 16 7 CA 2 1 186774 CASAVA_Build 12 32411684 1D TGTATTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 12 11 186775 CASAVA_Build 12 32430163 4I TGAGTTTCTT ----/AAAC AATTTATGAA 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 AAAC 0 1 186776 CASAVA_Build 12 32432165 3D TAAATAAAAA AAG/--- AAATTATTTA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 AAG 1 0 186777 CASAVA_Build 12 32432633 1I AAATAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 985 hom 17 3 7 7 A 7 8 186778 CASAVA_Build 12 32434839 1I TGCTACTAGC -/G GGTGGCCTGC 2503 het 2503 ref 26 13 9 4 G 2 3 186779 CASAVA_Build 12 32439345 1D TCTTAAAGAT C/- CCCTAGATCA 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 C 4 3 186780 CASAVA_Build 12 32442471 3I AATAAATAAA ---/TAC TACTACTAAT 1267 hom 9 het 18 0 3 15 TAC 2 3 186781 CASAVA_Build 12 32445088 2I AGCTTTTAAA --/TG TTCCCTTTTA 3070 het 3070 hom 41 9 30 2 TG 0 1 186782 CASAVA_Build 12 32446803 2D GCACACACCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2330 hom 32 10 15 9 T 14 12 186783 CASAVA_Build 12 32448288 1D TTTTGGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 11 17 T 12 11 186784 CASAVA_Build 12 32458131 3I CAGAAAGATA ---/ACT ACTGAGAGAT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 ACT 1 2 186785 CASAVA_Build 12 32462122 1D CATATCTCTG T/- TTTTTTCCAG 3070 het 2625 hom 18 8 8 2 T 7 6 186786 CASAVA_Build 12 32474836 4D GTGTGTGTAA AAGT/---- AATATTAATA 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 AAGT 1 0 186787 CASAVA_Build 12 32479151 1D CCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1846 het 1846 ref 28 18 8 3 T 10 9 186788 CASAVA_Build 12 32479496 8I ATCTAGCTCA --------/GGAGTTAG GGAGTTAGAC 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 GGAGTTAG 1 2 186789 CASAVA_Build 12 32482796 4I AAACATGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 2038 het 2038 ref 30 8 9 13 TTTG 4 5 186790 CASAVA_Build 12 32484252 2D ATTCCTTCTC TA/-- TGTTATTTTG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 TA 1 0 186791 CASAVA_Build 12 32506770 1I TACATTCTGA -/T TTTTTTTTTA 2112 het 2112 ref 27 15 5 7 T 9 10 186792 CASAVA_Build 12 32508598 1I CAGCAATCCG -/C CCCACCTCGG 2951 het 2490 hom 18 8 7 3 C 3 4 186793 CASAVA_Build 12 32509431 1I CCTTACTGAT -/A AACATAAACA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 2 3 186794 CASAVA_Build 12 32532750 1D GTGTTCCCCC T/- GTTAGCTTAG 1251 het 1251 ref 22 14 5 3 T 1 0 186795 CASAVA_Build 12 32579841 1D ATATGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 A 13 12 186796 CASAVA_Build 12 32687661 4D TTTTAAATAA CTAT/---- CAAGAACATT 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 CTAT 1 0 186797 CASAVA_Build 12 32778491 1D GATCTCAGAT G/- GAGCCAAGGC 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 G 2 1 186798 CASAVA_Build 12 32828650 1D AGTGTGTGAT A/- GGACTTTATT 3070 hom 84 het 32 0 29 8 A 1 0 186799 CASAVA_Build 12 32828860 1I TAGGTACTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 990 hom 42 3 23 16 T 12 13 186800 CASAVA_Build 12 32829153 1D TAAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 32 1 23 8 T 13 12 186801 CASAVA_Build 12 32830127 1D GTTATCTTCC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 8 186802 CASAVA_Build 12 32834107 2D49M2D ATACACACAC ATATATATATATATGTAGGTGTCTATATATAAACGTATGTGTGTGTGTGTGTA/--ATATATATATATGTAGGTGTCTATATATAAACGTATGTGTGTGTGTGTG-- TATATATATA 3070 het 402 hom 33 1 32 18 N/A 0 0 186803 CASAVA_Build 12 32834424 10I GCCCTTTGGA ----------/ACAAATAAAC ACAAATAAAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ACAAATAAAC 1 2 186804 CASAVA_Build 12 32834725 5D TCATTTTTAT GGTCA/----- GGTCACCATC 3070 hom 115 het 42 0 38 7 GGTCA 2 1 186805 CASAVA_Build 12 32835426 1D GGATGATGTC A/- ACCATTTAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 2 1 186806 CASAVA_Build 12 32840237 1D CCGCACATTC A/- CAACCGGATT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 1 0 186807 CASAVA_Build 12 32846382 1I TTTGTAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 783 hom 38 2 33 3 T 10 11 186808 CASAVA_Build 12 32849399 1D AGACTCTGGA T/- ATTAGACCTT 3070 hom 41 het 23 0 19 4 T 1 0 186809 CASAVA_Build 12 32853961 1D GATCTGTGGG A/- GAAGCATGGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 1 0 186810 CASAVA_Build 12 32854560 1D TCAGCCATCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 53 0 42 12 T 9 8 186811 CASAVA_Build 12 32861019 1D GTAGTTTTGA T/- TTGATAATTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 3 2 186812 CASAVA_Build 12 32864087 3D GCACACACAA CCC/--- CCCCCCCCCC 3070 hom 64 het 44 1 33 10 C 13 10 186813 CASAVA_Build 12 32879761 1D GAAAAAGAGG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 A 8 7 186814 CASAVA_Build 12 32924990 5I TCTCAGCTTT -----/TTTTG TTTTGAGTTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TTTTG 1 2 186815 CASAVA_Build 12 32932858 1I GCCCAGCTTA -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 22 het 11 0 8 3 T 6 7 186816 CASAVA_Build 12 32944858 4D GCTTTCAATC ATTA/---- TGTTGGTAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 5 ATTA 1 0 186817 CASAVA_Build 12 32947580 1I TCATTTTTTT -/C CCATACACAC 3070 het 27 hom 38 1 34 3 C 2 3 186818 CASAVA_Build 12 32953518 2I TGGTGTAATC --/AG GGAGGATTTG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 AG 0 1 186819 CASAVA_Build 12 32965252 5D AAATGAAATG TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TTTTA 3 2 186820 CASAVA_Build 12 32968257 1D CTGTATTTTA T/- TTTTTTCAGG 3070 hom 84 het 35 0 28 8 T 7 6 186821 CASAVA_Build 12 32972597 1D ACAAAAATTA G/- CCAGGCGTGG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 1 0 186822 CASAVA_Build 12 32977862 6D GACTCCATCT CAAAAA/------ CAAAAACAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CAAAAA 4 3 186823 CASAVA_Build 12 32992533 12D AGTCTGGCAT GGTGCCTAGCAC/------------ GGTGCCTAGC 3070 het 3070 ref 42 21 15 8 GGTGCCTAGCAC 2 1 186824 CASAVA_Build 12 32997580 1I GTTATATTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 2233 hom 30 9 14 7 A 0 1 186825 CASAVA_Build 12 32997947 13I CAGTTTAGAC -------------/AAAGGTATGTGAA AATGAGAATT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AAAGGTATGTGAA 0 1 186826 CASAVA_Build 12 33011718 1I TTATATTAAA -/G AAAAGAGTAA 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 G 0 1 186827 CASAVA_Build 12 33011929 1D TGAAACCTCA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 8 7 186828 CASAVA_Build 12 33012791 1D GAAACTTTGA C/- TGTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 44 16 20 9 C 1 0 186829 CASAVA_Build 12 33014121 1D CACATTCTCC T/- GTATACTTTA 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 1 0 186830 CASAVA_Build 12 33014264 1I CAACCATCCA -/T TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 8 9 186831 CASAVA_Build 12 33014401 4D AATGTGAAAC AAAT/---- AACGACAAAT 3070 het 3070 ref 43 21 16 8 AAAT 1 0 186832 CASAVA_Build 12 33016632 1D GCTTACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 14 19 T 15 14 186833 CASAVA_Build 12 33021257 6I TGAAAATTAA ------/TATACT TATATTGGTA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TATACT 0 1 186834 CASAVA_Build 12 33023107 1D GTCCTAACAA T/- TTTTTTTTTT 2740 het 125 hom 20 2 9 9 T 12 11 186835 CASAVA_Build 12 33041412 1I CTTTATGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 19 9 T 13 14 186836 CASAVA_Build 12 33043454 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 9 8 186837 CASAVA_Build 12 33048166 2D TTGTTTTTTC TA/-- TTTCTGTGAA 3015 het 3015 ref 21 12 8 1 TA 1 0 186838 CASAVA_Build 12 33051066 1D TTTGGGAGAT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 G 10 9 186839 CASAVA_Build 12 33056132 8D GCACAGCACC CTGTGTGA/-------- CTGTACAGAT 3070 het 3070 ref 36 22 14 2 CTGTGTGA 1 0 186840 CASAVA_Build 12 33065296 10D GCATGCCCAG GGAAGCCGTT/---------- GGTAGTATCA 3070 het 3070 ref 33 20 14 4 GGAAGCCGTT 1 0 186841 CASAVA_Build 12 33074461 3I CTCTGACAAC ---/CTT CTTCTGTGCC 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 CTT 1 2 186842 CASAVA_Build 12 33075671 1I TCATAGAATG -/A AAAGATCACG 3070 het 3070 hom 63 28 28 7 A 3 4 186843 CASAVA_Build 12 33079622 1D TCAGGATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 11 10 186844 CASAVA_Build 12 33080929 5I TTCAAACCCA -----/GGTCT TTGACATTCC 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 GGTCT 0 1 186845 CASAVA_Build 12 33081810 1I TAAAGATGGC -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 7 8 186846 CASAVA_Build 12 33102463 1D ATTTAAAAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2014 hom 22 6 12 4 T 9 8 186847 CASAVA_Build 12 33105885 4D AATGATTGAG TAAA/---- TAAATAAGGG 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 TAAA 2 1 186848 CASAVA_Build 12 33109210 1I AATCCAAACA -/C GAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 0 1 186849 CASAVA_Build 12 33125903 5D ATGACAGTAC CATAT/----- CATATTAGTC 3070 het 3070 hom 33 15 14 8 CATAT 2 1 186850 CASAVA_Build 12 33130379 1I GAGTTTGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 9 10 186851 CASAVA_Build 12 33131712 1I TTACGAATTG -/T TTTTTATAAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 5 6 186852 CASAVA_Build 12 33138146 1I CCAAGCTACA -/T TTTTTATTCC 3070 het 3070 hom 53 21 22 10 T 5 6 186853 CASAVA_Build 12 33139022 1D GTGTTAGGAG A/- AAACTAATTC 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 A 4 3 186854 CASAVA_Build 12 33140164 1D CTGAAACTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 51 22 21 8 T 10 9 186855 CASAVA_Build 12 33177545 3I GGTTTCACCA ---/TAT TATTGGTCAG 1294 het 421 hom 6 1 5 0 TAT 1 2 186856 CASAVA_Build 12 33185701 1I CCTCTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 T 10 11 186857 CASAVA_Build 12 33218157 1I TGTTGAATAG -/A AATGTTGGGA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 2 3 186858 CASAVA_Build 12 33224591 1D TACTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2929 het 2929 ref 30 12 8 11 T 11 10 186859 CASAVA_Build 12 33229242 3D GGCTCTGTAG TTC/--- TTCTTGACAT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 TTC 2 1 186860 CASAVA_Build 12 33231209 1D ATAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 7 22 8 A 11 10 186861 CASAVA_Build 12 33234597 1D AATTTACAAG A/- AAAACGTAAC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 5 4 186862 CASAVA_Build 12 33237118 1I TGTACTTTTT -/G CTCAGGATTG 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 G 0 1 186863 CASAVA_Build 12 33239258 1I CTTGAGTTAA -/T TTTTGTATAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 4 5 186864 CASAVA_Build 12 33239574 1I ATATGAGCTC -/T ATTTTGGTTC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 0 1 186865 CASAVA_Build 12 33239895 1I TTGTCTATTA -/T TGGCGCATAG 2817 het 2817 ref 22 15 6 1 T 1 2 186866 CASAVA_Build 12 33240524 2D GTTCATCAGG GA/-- GAGATTGGCC 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 GA 3 2 186867 CASAVA_Build 12 33244587 1D ATTGCTGTGC T/- TTGGAGACCC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 3 2 186868 CASAVA_Build 12 33245795 1D ACTTGAAACA T/- TTTTTTTTTT 1179 het 1179 ref 29 17 3 9 T 12 11 186869 CASAVA_Build 12 33248811 1D CAAATTTTTA T/- TTATATTTAT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 T 3 2 186870 CASAVA_Build 12 33248982 1D TAAAATTTTA T/- GTGATTTAAA 3070 hom 123 het 43 0 42 2 T 1 0 186871 CASAVA_Build 12 33259911 2D ATCCAGTAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1367 hom 21 4 11 6 AT 7 6 186872 CASAVA_Build 12 33264181 12D CTTTTTTATG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 9 12 T 23 11 186873 CASAVA_Build 12 33266415 1D ATTTCTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 11 10 186874 CASAVA_Build 12 33277923 1D AAAAATAATG T/- TTTGGCTCAC 3070 het 3070 ref 19 11 7 1 T 4 3 186875 CASAVA_Build 12 33284063 2I TGCATATGTT --/AG AGAGAGAGAT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 AG 4 5 186876 CASAVA_Build 12 33290372 1I TCAGATCTCA -/T TGACAGATTC 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 T 1 2 186877 CASAVA_Build 12 33296354 1D CTGCCTCTCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 8 7 186878 CASAVA_Build 12 33298102 1D TAGGGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1277 het 1277 ref 28 14 4 10 T 15 14 186879 CASAVA_Build 12 33328329 1D14M1D TTATTTAAAT CGAAGGTACCTTCCAC/-GAAGGTACCTTCCA- TAGAGTACAA 3070 hom 87 het 29 0 30 3 N/A 0 0 186880 CASAVA_Build 12 33328466 1I TGCCAAAAAT -/A TCAAGGACAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 0 1 186881 CASAVA_Build 12 33344944 1D AAGGCAATGC T/- TTGGGCTAAT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 3 2 186882 CASAVA_Build 12 33352286 2I AGGAGGGACA --/CT CTCTGTAATT 3070 het 3070 hom 53 22 23 8 CT 2 3 186883 CASAVA_Build 12 33355159 1I GATTAATAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 9 10 186884 CASAVA_Build 12 33371189 1D GAAATTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1109 hom 39 7 15 17 T 17 16 186885 CASAVA_Build 12 33371734 1I AGACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 1860 het 1860 ref 17 9 4 4 A 13 14 186886 CASAVA_Build 12 33397509 1D TGAATTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 12 11 186887 CASAVA_Build 12 33402532 4D TCCTCACTCT GTGC/---- GTGCATCTTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 GTGC 2 1 186888 CASAVA_Build 12 33411080 1D CCATTAAAAC A/- AAAAACAAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 6 5 186889 CASAVA_Build 12 33413782 1D TATCTGCATT A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 46 22 17 8 A 7 6 186890 CASAVA_Build 12 33414818 1D GAATTTTTTT G/- GGGGGGGGTA 3070 hom 62 het 28 0 22 6 G 9 8 186891 CASAVA_Build 12 33416208 1I TAGGACAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 9 10 186892 CASAVA_Build 12 33427496 1D TTGCTATCAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 48 28 14 9 T 9 8 186893 CASAVA_Build 12 33431956 1I CATGTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1209 hom 43 7 18 18 G 0 1 186894 CASAVA_Build 12 33432324 1D CAAAACTGCT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 8 7 186895 CASAVA_Build 12 33437847 1D ACTTCTCAAC A/- AAAGCCATCA 3070 het 3070 hom 41 16 19 9 A 4 3 186896 CASAVA_Build 12 33440071 3I AAGAAAATTC ---/ATT ATTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 ATT 1 2 186897 CASAVA_Build 12 33442926 1D TAAACAATAA C/- AAAAACCTAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 0 186898 CASAVA_Build 12 33444792 2I AAAAAAAAAA --/AT TTTCATTGAA 3070 het 389 hom 31 1 26 4 AT 0 1 186899 CASAVA_Build 12 33450062 1I AATAATCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 753 hom 36 2 28 6 A 10 11 186900 CASAVA_Build 12 33454059 3I AGAAAGGAGA ---/AGC AGTTGAAGAA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 AGC 0 1 186901 CASAVA_Build 12 33456438 1D GTAAAGTCCC T/- TTATAAGAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 3 2 186902 CASAVA_Build 12 33489340 1D GGGGAAACCA C/- CCCCCATGAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 6 5 186903 CASAVA_Build 12 33489431 1I GAACAGAGCC -/A AACCATATCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 2 3 186904 CASAVA_Build 12 33489641 3D AATCATAATC ATA/--- ATCATTATTT 1104 het 684 hom 26 6 7 15 ATA 1 0 186905 CASAVA_Build 12 33495081 1I GAAATTAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 11 12 186906 CASAVA_Build 12 33502186 14I AGTCCTGCAA --------------/GATAAAATGAAAGG ACACTGGTCA 3070 hom 102 het 34 0 35 2 GATAAAATGAAAGG 0 1 186907 CASAVA_Build 12 33509676 13D AATTGACCAC ATAATTGGAAGTA/------------- AAACACTCCT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 ATAATTGGAAGTA 1 0 186908 CASAVA_Build 12 33522933 1D TGCTTAATAG A/- AAAATGTATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 5 4 186909 CASAVA_Build 12 33524143 1I AACCCCCCCC -/T AAAACTAATA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 0 1 186910 CASAVA_Build 12 33545019 1I ATATGTCTTC -/A AAAATACTGA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 4 5 186911 CASAVA_Build 12 33545531 4D TAATTACTTC CTTT/---- GTTTCACAGT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 CTTT 1 0 186912 CASAVA_Build 12 33545706 4D ATTTAGGTCT TTAA/---- TCCATGTTGA 3070 hom 117 het 42 0 40 4 TTAA 1 0 186913 CASAVA_Build 12 33546083 1D TTAGTCCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 26 0 23 4 A 11 10 186914 CASAVA_Build 12 33556688 2D ATGTTTCTGC AA/-- AAAAAAAAGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 10 8 186915 CASAVA_Build 12 33570571 1I GTATGTACCC -/A AAGGATTATA 2817 hom 15 het 7 0 6 1 A 2 3 186916 CASAVA_Build 12 33572717 1D TATTTATGTA T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 6 186917 CASAVA_Build 12 33574774 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 7 8 186918 CASAVA_Build 12 33581344 1I ATCTTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 34 1 28 5 T 11 12 186919 CASAVA_Build 12 33591690 4D ACCTTAATAT ATAG/---- ATAGACTCTG 3070 hom 91 het 35 0 30 8 ATAG 2 1 186920 CASAVA_Build 12 33594097 1D ATTCCCAAAA G/- TTTCTTTATA 3070 het 3070 hom 39 15 19 7 G 1 0 186921 CASAVA_Build 12 33673742 1D TAATACAAAT A/- AAAAAAATGC 2294 het 2294 ref 15 8 5 2 A 8 7 186922 CASAVA_Build 12 33679965 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2217 het 942 hom 12 4 5 3 A 15 16 186923 CASAVA_Build 12 33697025 8D GACAGGCCTC GGTGTGTG/-------- GGTGTGTGAT 1916 het 1916 ref 15 12 4 2 GGTGTGTG 2 1 186924 CASAVA_Build 12 33701834 6D AAACTAACTT TCCAGC/------ TCCAGCTCAT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 TCCAGC 2 1 186925 CASAVA_Build 12 33843492 1D TGAAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 14 0 10 4 T 11 10 186926 CASAVA_Build 12 33888331 1I AATGCAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 17 0 11 6 A 10 11 186927 CASAVA_Build 12 33901693 1D GAGTTTCCAC T/- TTTTTTTTTT 2525 het 2460 hom 34 13 11 10 T 15 14 186928 CASAVA_Build 12 33905648 4I GGTCTTGGGA ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 11 15 186929 CASAVA_Build 12 33922544 2D TTGAAAATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 TA 7 6 186930 CASAVA_Build 12 33923560 1I TATGTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 10 11 186931 CASAVA_Build 12 33939743 1D AAATAGAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 8 186932 CASAVA_Build 12 33940054 1I TTGAAATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 770 hom 41 2 35 4 A 9 10 186933 CASAVA_Build 12 33940958 1D CAATAGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 618 hom 46 3 34 10 A 13 12 186934 CASAVA_Build 12 33945145 1D CCTGATACAG T/- TTTTCATTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 5 4 186935 CASAVA_Build 12 33956469 2I AAATTTGTTT --/AA GTTAGACTTT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 0 2 186936 CASAVA_Build 12 33965327 1I CTTTTGAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 58 24 21 13 T 9 10 186937 CASAVA_Build 12 33982237 5D TTCCAACTAT AAGAC/----- AAGACAATAT 3070 hom 57 het 25 0 20 7 AAGAC 2 1 186938 CASAVA_Build 12 33985987 4D TAGTGAGATT TTTA/---- TTTGACTTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 TTTA 1 0 186939 CASAVA_Build 12 33987573 3D GCCATTGCTT AGC/--- AGTTTGATGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AGC 1 0 186940 CASAVA_Build 12 34076920 1D TAATTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1480 hom 25 6 9 10 T 13 12 186941 CASAVA_Build 12 34143000 1D TGTTATTTTT A/- GTTTTATATT 1837 het 1837 ref 44 36 4 6 A 1 0 186942 CASAVA_Build 12 34187543 1I AGCACACCTG -/C TCTGCCAAGG 3070 het 3070 ref 61 36 20 5 C 0 1 186943 CASAVA_Build 12 34191784 1I TGAGATAAGG -/C CCCCAAGGAG 3070 het 3070 hom 89 37 52 0 C 4 5 186944 CASAVA_Build 12 34200363 1I TGAAGCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 20 17 16 T 16 17 186945 CASAVA_Build 12 34212268 1D CATCATTCAG C/- CAGCCACAGG 1298 het 1298 ref 65 57 4 4 C 2 1 186946 CASAVA_Build 12 34214333 20I TCTTCTTTAG --------------------/TTGGGTTTAGTCTTCTTTAA TTGGGCTAGC 2163 het 2163 ref 65 45 8 12 TTGGGTTTAGTCTTCTTTAA 0 1 186947 CASAVA_Build 12 34216222 1I TTTATCACAC -/T TTTTTTTTAT 2153 het 2153 ref 77 42 8 27 T 8 9 186948 CASAVA_Build 12 34216849 1D CTGGCAGGGG A/- GAGTTCAGCC 3070 het 3070 ref 57 27 24 7 A 1 0 186949 CASAVA_Build 12 34218258 1D TCACTAAAGT C/- AGGGGCTATT 2569 het 2569 ref 46 34 7 6 C 1 0 186950 CASAVA_Build 12 34219184 3I GCCTAAAGTA ---/GGG GAAGACTGAG 2178 het 2178 ref 44 36 5 3 G 1 4 186951 CASAVA_Build 12 34219547 3D22M12I CATTATACTC TCGTCCTCTCTTTGGTTTTAATTTT------------/---TCCTCCCTTTGGTTTTAATTTTAATTTCAATTTC AATTTTTAAT 1719 het 1719 ref 26 23 7 11 N/A 0 0 186952 CASAVA_Build 12 34219734 2D AATTATACTC TT/-- TTAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 76 33 7 36 T 4 2 186953 CASAVA_Build 12 34219750 1I6M2I TTTTTATAAA -ATGTAA--/TGTGGAATT ATATTATTTT 3070 het 3070 ref 66 22 23 21 N/A 0 0 186954 CASAVA_Build 12 34232899 1I CTACTCTCCC -/A ATTTCTTGAA 3070 het 3070 ref 78 64 7 7 A 1 2 186955 CASAVA_Build 12 34233371 1D GCACAATACT A/- AATAAGTGTA 1770 het 1770 ref 82 69 6 8 A 3 2 186956 CASAVA_Build 12 34234847 1D AGGCAACTAT A/- ACACCTGTTA 3070 het 3070 ref 67 26 35 7 A 2 1 186957 CASAVA_Build 12 34238547 3D TCTAAATAGA TCT/--- TCATTAATGT 3070 het 3070 ref 71 50 11 11 TCT 1 0 186958 CASAVA_Build 12 34239199 1I ACACATACAC -/T CCCTCAAGAC 1937 het 1937 ref 41 30 7 5 T 0 1 186959 CASAVA_Build 12 34259268 1D ATTTAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 14 9 27 A 10 9 186960 CASAVA_Build 12 34273987 1D AGACCCTATC A/- AAAAAAAAAA 2649 het 2649 ref 39 18 8 13 A 15 14 186961 CASAVA_Build 12 34291356 1D TTGAAGTACG T/- TTTTTCCCAG 2041 het 2041 ref 22 11 6 6 T 6 5 186962 CASAVA_Build 12 34296886 1D AAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 2400 het 503 hom 15 3 7 5 A 13 12 186963 CASAVA_Build 12 34299169 2D GTGTGAGAAT TA/-- TATATATATA 2334 het 2008 hom 16 5 6 5 TA 7 6 186964 CASAVA_Build 12 34302304 1D CAAACATTCC T/- TTTTTTTTTT 860 het 860 ref 43 30 4 10 T 15 14 186965 CASAVA_Build 12 34308632 3D8M7D27M7D5M7D3M2D CTGGCGGGGG GGCCCCCATTGTTTTTTTTTTTTTTATCAGCACTTTATTTTTCTTTTCTTCCTGTGTTAGTTTCTTTAA/---CCCTATTG-------TTCTTTGATCGGCGCTTTACTTTTCTT-------TGTGT-------TTT-- TGCAAATAGG 3070 het 3070 ref 42 26 9 22 N/A 0 0 186966 CASAVA_Build 12 34325065 1D CCCTTAGTGC T/- TTTTTTTTTT 2627 het 1114 hom 24 8 9 8 T 15 14 186967 CASAVA_Build 12 34484257 1D TTCCTTCTAG T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 7 186968 CASAVA_Build 12 34495351 1I AATATCCCTT -/C TCAGATTCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 0 1 186969 CASAVA_Build 12 34499175 12D CCTCAATGTG CTCCCCAATATC/------------ CTTTTGAATT 3070 hom 77 het 28 0 26 7 CTCCCCAATATC 1 0 186970 CASAVA_Build 12 34501822 4D CTGAATCAAT AGAA/---- AGTTTTACCT 3070 hom 81 het 32 0 27 7 AGAA 1 0 186971 CASAVA_Build 12 34511620 4D TCTGAGAGAC TGTT/---- TGTTTTAATT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TGTT 2 1 186972 CASAVA_Build 12 34544884 2D GCATTTTCTC AG/-- AGAGCTTCTT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 AG 3 2 186973 CASAVA_Build 12 34557670 1D GAATGCACAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 9 8 186974 CASAVA_Build 12 34560989 1D ATATATTTAC T/- TCCTCAACAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 2 1 186975 CASAVA_Build 12 34579260 1I TGCACACATC -/A CAAAGAAGTT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 0 1 186976 CASAVA_Build 12 34579713 1I CTACAAAGAC -/A GTGTTTCCGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 0 1 186977 CASAVA_Build 12 34584755 1I TGAAAAAAAA -/G GTTTTACTCT 3070 hom 91 het 33 0 28 5 G 1 2 186978 CASAVA_Build 12 34588581 1D AGATCCGAAA T/- GCCCATTCGC 3070 hom 72 het 31 0 26 5 T 1 0 186979 CASAVA_Build 12 34589893 1I TCTGAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1453 hom 32 4 22 6 T 11 12 186980 CASAVA_Build 12 34602790 1D ACACAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2010 het 2010 ref 35 20 5 10 A 13 12 186981 CASAVA_Build 12 34613844 1I TCACCATAGG -/C CTCAATGTTC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 C 1 2 186982 CASAVA_Build 12 34667026 1D TTCTCTAGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 62 hom 31 1 21 9 T 10 9 186983 CASAVA_Build 12 34670692 1I CTGAGGGTGG -/C CCCCTCTTCT 3070 het 2676 hom 24 8 13 3 C 4 5 186984 CASAVA_Build 12 34732634 1I36M1D GTAGAATTTG -AAGTGGATTTGTAAAGCACTTTGAGGCATATGGTAGA/CAAGTGGAGAATTCTAGCGCTTTGACGCCAATGGTAG- AAAGGAAATA 3070 het 3070 ref 87 50 42 32 N/A 0 0 186985 CASAVA_Build 12 34732694 3I TCATATAAAA ---/ACT AGACAGAATC 1922 het 1922 ref 89 29 17 46 ACT 0 1 186986 CASAVA_Build 12 34733019 1D AACAAAATAT C/- CTTCATATAA 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 C 2 1 186987 CASAVA_Build 12 34739520 1D11M1D AGAAAAGGAA GTATCTTCACATA/-TTTCTTCATAT- AAAGCTAGAC 3070 het 3070 ref 98 68 21 17 N/A 0 0 186988 CASAVA_Build 12 36143169 2D TCTTATAATC TT/-- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 52 21 28 3 T 8 6 186989 CASAVA_Build 12 36143364 1D48M1D CTTTATTTGC ATTAATCTTTATTATTTCCTTCCTTTTGCTGGGTTTGGGCTTAGTTCTTC/-TTAATTTTTATTATTTCCTTCCTTTTGCTGGGTTTGGGCTTGGTTCTT- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 58 52 24 23 N/A 0 0 186990 CASAVA_Build 12 36143557 1I TGTTTTTTTA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 62 33 20 9 T 7 8 186991 CASAVA_Build 12 36143935 1D41M1I CTAGGATTTG AAAAAAAATAACCACTTCTCCCTGTCTTTACAGACTGGTTTT-/-AAAAAAATAACCACTTCTCCTTGTCTTTACAGACTGGTTTTG CACTGGGAAA 3070 het 3070 ref 68 52 17 30 N/A 0 0 186992 CASAVA_Build 12 36145499 1I CTGAATTACA -/T TTTTTGAAAC 3070 het 3070 hom 76 24 35 17 T 5 6 186993 CASAVA_Build 12 36147001 4I TGTTATTTTA ----/ATTG TTTAAGGGTT 3070 het 3070 ref 49 32 13 4 ATTG 0 1 186994 CASAVA_Build 12 36147220 1I AAGACTAAAA -/G TTTAAGTTAA 3070 het 3070 hom 63 19 42 2 G 0 1 186995 CASAVA_Build 12 36147407 3I AATCTGAAAC ---/ATG GTGGAGAAGT 3070 het 3070 hom 90 21 62 16 ATG 0 1 186996 CASAVA_Build 12 36147897 4D CTTCTCTCCT CTTC/---- CTTTGTATTC 3070 het 3070 ref 87 58 17 17 CTTC 1 0 186997 CASAVA_Build 12 36149094 1I104M3D TGTTTTATTA -AAAAACCCAAACACTCCAGGAGTGAATTAAATGTAAATTGAAATCTCCCTCTCTCTACAATCCCACTTGCCTCATCATTTCCTCTATTCCTTAGAAATCCACCGACA/CAAAAACTCAAACACTCCAGGAGTGAATTAAATGTAAATTGAAATCTTCCTCTCTCTACAATTCCACTTGCCTCATCATTTCCTCTATTCCTTAGAAATCCACCG--- ACAATTTAAT 3070 het 3070 ref 54 71 31 34 N/A 0 0 186998 CASAVA_Build 12 36149252 1D GTATGTGTAC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 20 9 T 7 6 186999 CASAVA_Build 12 36149421 1I CATCTTTGCA -/T TTTTTTATAA 3070 het 3070 ref 94 38 12 44 T 6 7 187000 CASAVA_Build 12 36149867 8I TTGTTTTGTT --------/TTTGTTTG TTTGTTTGTT 2139 het 2139 ref 51 15 9 27 TTTG 2 4 187001 CASAVA_Build 12 36150465 1I ACCAACAACA -/G GAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 79 17 55 7 G 1 2 187002 CASAVA_Build 12 36150674 1I GTGTACAAAG -/A AAAAGAAACT 1864 het 1864 ref 36 26 4 6 A 4 5 187003 CASAVA_Build 12 36151558 4D TACAGCCAAT AACA/---- AACAAACACA 3070 het 3070 ref 87 34 45 10 AACA 3 2 187004 CASAVA_Build 12 36152210 2D CCAACCAAAC TG/-- TAAATCAGAT 3070 het 3070 hom 63 31 26 8 TG 1 0 187005 CASAVA_Build 12 36152588 1I GTCAGTTTAA -/C GGAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 101 55 39 9 C 0 1 187006 CASAVA_Build 12 36153658 2I TTCCTGGGAT --/AA AAAAAAATCA 1873 het 1873 ref 60 28 4 28 A 7 9 187007 CASAVA_Build 12 36153802 4D AGGGTAATTG TTTA/---- TTTTTCCCTC 2658 het 2658 ref 37 28 7 6 TTTA 1 0 187008 CASAVA_Build 12 36154618 1D ATAGATGAAG A/- GACACTTAGA 2631 het 2631 ref 50 28 11 12 A 1 0 187009 CASAVA_Build 12 36160249 10I GTTCATTTTA ----------/TTTAATTTTG TTTTAATTAG 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 TTTAATTTTG 0 1 187010 CASAVA_Build 12 36162575 1D CAGAATAACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1538 hom 32 5 18 9 T 10 9 187011 CASAVA_Build 12 36163944 1D TTTATCAAAC A/- AAAAGTGTAA 3070 het 3070 ref 64 47 11 8 A 5 4 187012 CASAVA_Build 12 36164730 1D AACTTTTTTT A/- TTGTTGATTT 3070 het 3070 ref 73 33 18 22 A 1 0 187013 CASAVA_Build 12 36165113 1D TACCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 31 1 15 15 T 13 12 187014 CASAVA_Build 12 36165434 3I ATCATCCTCA ---/TCT TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 100 65 27 8 TCT 0 1 187015 CASAVA_Build 12 36165517 1I ATTATATATG -/A AAAACTGAAA 3070 het 3070 hom 99 34 49 17 A 4 5 187016 CASAVA_Build 12 36167927 1D AGCTAATCCA T/- TAGTTAGTAT 2370 het 2370 ref 40 32 5 3 T 2 1 187017 CASAVA_Build 12 36168712 1I GAGAGAACAG -/T TTTTTTTTCA 1274 het 1274 ref 40 28 4 8 T 8 9 187018 CASAVA_Build 12 36170005 1I TCAACCAGCT -/C CCCTGTTCAA 2742 het 2742 ref 45 34 6 5 C 3 4 187019 CASAVA_Build 12 36171021 1I ACTTTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 10 11 187020 CASAVA_Build 12 36175524 2I TCAAGCACTC --/TG TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 25 8 5 TG 0 1 187021 CASAVA_Build 12 36183714 1D AATTACCCCC T/- CTTTTTAAAT 873 het 873 ref 26 24 2 2 T 1 0 187022 CASAVA_Build 12 36185243 5D GATTCTATAC TCTTA/----- TATTGGTCTA 3070 het 3070 ref 45 36 9 5 TCTTA 1 0 187023 CASAVA_Build 12 36188596 1I GATCTTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 27 2 18 7 T 13 14 187024 CASAVA_Build 12 36190950 3I CCACTGATAA ---/TCT TCTTTCTAGA 3070 het 3070 ref 53 36 9 8 TCT 1 2 187025 CASAVA_Build 12 36194592 1I ATCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2885 het 910 hom 13 3 8 2 A 11 12 187026 CASAVA_Build 12 36200147 2I CATACACACG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 18 7 8 AT 5 6 187027 CASAVA_Build 12 36207020 2D CCTTCATAGA CT/-- CTACAAAGAG 3070 het 3070 ref 50 38 8 5 CT 2 1 187028 CASAVA_Build 12 36215904 1D ACGGTGAGTT G/- GGGGGGGATA 1835 het 1835 ref 24 14 6 4 G 8 7 187029 CASAVA_Build 12 36231397 3I TTAGGCAGGT ---/GTG GTGACACATG 3070 hom 74 het 29 0 24 5 GTG 1 2 187030 CASAVA_Build 12 36235008 1I AAATGAAGGG -/A AAAAAAACAC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 7 8 187031 CASAVA_Build 12 36235137 16I ATTGGTGGGG ----------------/TGTGATGGCTCACACC TGTAATCCCA 3070 hom 20 het 15 0 10 5 TGTGATGGCTCACACC 0 1 187032 CASAVA_Build 12 36235636 1I ACATATTTTT -/G CCTGTGTTTA 1818 het 1818 ref 36 26 4 6 G 0 1 187033 CASAVA_Build 12 36246024 1I ATTTAAAATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 44 het 22 0 15 7 T 9 10 187034 CASAVA_Build 12 36252508 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 2 A 10 9 187035 CASAVA_Build 12 36253538 1D TACTCTTTGG A/- AAAATGCCTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 5 4 187036 CASAVA_Build 12 36266064 1D TCTCAATATA T/- CAACTTGATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 1 0 187037 CASAVA_Build 12 36273937 1I CTTAGCATTT -/C CCTTCAGTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 2 3 187038 CASAVA_Build 12 36282938 1I TGGAAGAGCA -/G TTTTGAAACA 1757 het 1757 ref 45 31 7 7 G 0 1 187039 CASAVA_Build 12 36293252 1D TCTCAGAAAC T/- ATTTTGTGAT 1383 het 1383 ref 70 52 4 14 T 1 0 187040 CASAVA_Build 12 36295071 1D TGCTTTGAGG C/- CAATGGTGGA 489 het 489 ref 48 34 5 9 C 2 1 187041 CASAVA_Build 12 36319868 4D TCAGAATGTT ACTG/---- TCTAGTTTTT 2308 het 2308 ref 66 52 5 11 ACTG 1 0 187042 CASAVA_Build 12 36335769 1D GGATCTGTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 46 het 21 0 16 6 T 10 9 187043 CASAVA_Build 12 36377123 1I ACATCACAAA -/G AAGTTTCTCA 2359 het 2359 ref 56 35 7 14 G 0 1 187044 CASAVA_Build 12 36383405 9I AGAGAAAGGT ---------/TCAAGTCTG TGAGATGAAA 905 het 905 ref 43 36 3 4 TCAAGTCTG 0 1 187045 CASAVA_Build 12 36419527 1I GGCCTATTGT -/G TAAAAAGAAA 1363 het 1363 ref 47 36 3 8 G 0 1 187046 CASAVA_Build 12 36468211 1I AGTTAAAAAC -/T TTGGAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 2 3 187047 CASAVA_Build 12 36483428 1I TAGACAGAAA -/C TTTCTGAGAA 3070 het 157 hom 27 3 20 4 C 0 1 187048 CASAVA_Build 12 36514921 2D CAAACTAAAA AG/-- AAAGTTTCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AG 1 0 187049 CASAVA_Build 12 36516440 1I TTGAAAAAGG -/A AAATATCTTC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 3 4 187050 CASAVA_Build 12 36524128 1D CACCATAGGC T/- TTTTTTGCAC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 7 6 187051 CASAVA_Build 12 36530705 1I AGCAGTTTCT -/C AAAAAGCTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 1 187052 CASAVA_Build 12 36541377 1I AAGAAGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 26 0 19 7 T 12 13 187053 CASAVA_Build 12 36550891 1D CAAAGATTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 9 187054 CASAVA_Build 12 36555053 1I TTCTCAAAAA -/G CTCCTTTCCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 187055 CASAVA_Build 12 36557811 1I TCTGAAGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 9 10 187056 CASAVA_Build 12 36561112 1I CAGATTCTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 8 9 187057 CASAVA_Build 12 36590536 2I AAATGTTAAA --/CT CTCTGAGATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CT 2 3 187058 CASAVA_Build 12 36595392 1D GCTTGTTTCC A/- GTTTTTATCT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 1 0 187059 CASAVA_Build 12 36597345 1D CACAGATTAC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 8 7 187060 CASAVA_Build 12 36609301 1D GATAAATACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 10 9 187061 CASAVA_Build 12 36610503 1D GGCTTCTTTC T/- TGGTTTTCAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 1 187062 CASAVA_Build 12 36617605 1D CCACCAAAAG A/- AAGGTTTATC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 3 2 187063 CASAVA_Build 12 36634353 1D CAAACTGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 A 11 10 187064 CASAVA_Build 12 36672433 1I ATATTTCCAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 9 187065 CASAVA_Build 12 36674455 2D GGAGTAAAAC TT/-- AATATTCCTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 2 0 187066 CASAVA_Build 12 36677452 2D AGAGTTAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 41 0 34 7 T 13 11 187067 CASAVA_Build 12 36677655 1I GGTTGGAAAC -/A CTCTTTTTGG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 0 1 187068 CASAVA_Build 12 36678141 1I AGAGTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 50 2 39 9 T 10 11 187069 CASAVA_Build 12 36686891 1D ACTTTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 11 10 187070 CASAVA_Build 12 36687069 4D TAAATCTTTC TTTT/---- GATTCAGTAG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 4 0 187071 CASAVA_Build 12 36691405 2I AAAAAAAAAA --/AT ATCCTGTGAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AT 1 2 187072 CASAVA_Build 12 36694671 3D GGTTAAACCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 13 10 187073 CASAVA_Build 12 36698386 3I TCAGATCACA ---/GAG TTATATCTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GAG 0 1 187074 CASAVA_Build 12 36718175 1I ATATCCCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 9 10 187075 CASAVA_Build 12 36724560 1I AATATCCTGC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 8 9 187076 CASAVA_Build 12 36730831 29D5M1I32M22I7M1D GGTGTGGTGG TGTGTGCCTGTAATCTTAGCTACTCAGGAGGCTG-GGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAAAAGCGGA----------------------GCCACTGT/-----------------------------CGCTGAGACAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTCCAGTGAGCTGAGATCACGCCACTG- AAATCCAGCC 1767 het 1767 ref 26 48 4 1 N/A 0 0 187077 CASAVA_Build 12 36730983 1I TGTTTAACTC -/G AAAGTGTCAC 3070 het 3070 ref 48 33 13 2 G 0 1 187078 CASAVA_Build 12 36732095 21D TCAAGACAGT AATTCTGGGTCACAGCTGAAG/--------------------- CGAGGGAGAA 3070 het 3070 ref 44 43 48 3 AATTCTGGGTCACAGCTGAAG 1 0 187079 CASAVA_Build 12 36740382 1I TTTTTGGGGT -/G GGGGGCTTGG 3070 hom 66 het 30 0 22 8 G 5 6 187080 CASAVA_Build 12 36746904 3D AAAAAAAAAA AAC/--- GTTAAGTTGT 3070 hom 9 het 13 0 12 3 AAC 1 0 187081 CASAVA_Build 12 36750450 2D AGTATTGGAA CT/-- CTTAGAAACA 3070 het 3070 ref 50 25 14 14 CT 2 1 187082 CASAVA_Build 12 36750497 1D GCCAGGTGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 35 het 39 1 27 11 A 10 9 187083 CASAVA_Build 12 36750956 1I ACTCTCTCTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 9 187084 CASAVA_Build 12 36751141 1D AGCCAAGAAG A/- AAAATATAAA 1881 het 1881 ref 37 28 4 5 A 5 4 187085 CASAVA_Build 12 36755696 1D AAAAAAACTT A/- AAAAAAAAAC 1538 hom 4 het 12 0 5 8 A 10 9 187086 CASAVA_Build 12 36757892 3I AGAAAGAAAA ---/AAG AATACTCTGA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AAG 0 1 187087 CASAVA_Build 12 36759967 1I TCCACCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 29 1 16 12 T 14 15 187088 CASAVA_Build 12 36762573 1I TGATGCCTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 368 hom 44 1 32 11 A 9 10 187089 CASAVA_Build 12 36764438 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 29 3 17 9 A 17 16 187090 CASAVA_Build 12 36766960 2D ACAAAATTTT AG/-- AAGGTCTTAA 2992 het 2992 ref 63 35 18 11 AG 1 0 187091 CASAVA_Build 12 36769817 1D CGTGCTTGAA T/- TTTTTTAACA 2871 het 1781 hom 39 12 10 17 T 7 6 187092 CASAVA_Build 12 36769869 2I27M2I ATATATGAAC --ATATATATATATAACTATATATATGAA--/ATATATATATATATAACTATATATATGAAAT ATATATATAT 2901 hom 15 het 8 0 6 2 N/A 0 0 187093 CASAVA_Build 12 36770477 1D AGCTGAAAAT G/- AGGTATTCAA 3070 het 3070 ref 71 41 26 5 G 1 0 187094 CASAVA_Build 12 36778163 2D ATATCCAAAC AT/-- AAACAAATTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AT 1 0 187095 CASAVA_Build 12 36782372 1I CAGCATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 40 0 34 6 T 10 11 187096 CASAVA_Build 12 36783638 1I GCTTTTTGTA -/T CAAATTTTAG 142 het 142 ref 54 33 3 19 T 0 1 187097 CASAVA_Build 12 36784656 1I GGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 284 hom 37 1 27 9 T 9 10 187098 CASAVA_Build 12 36786052 1I TGTTGCTATC -/A TTGGTGTAGA 3070 het 3070 ref 51 33 12 6 A 0 1 187099 CASAVA_Build 12 36787466 3I CACTACTTTG ---/GGT GCTAATACTG 2918 het 2918 ref 49 21 9 19 GGT 0 1 187100 CASAVA_Build 12 36788345 3I6M2D CTTCAATGGA ---TCTTTTAC/TTGTCTTTT-- ATCAGAGGAT 3070 het 3070 ref 67 51 9 8 N/A 0 0 187101 CASAVA_Build 12 36796762 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 12 13 8 T 10 9 187102 CASAVA_Build 12 36801939 1I TTTTATTATT -/A TTTTTTTAGA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 0 1 187103 CASAVA_Build 12 36807212 2D TCCAACTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 32 1 25 6 A 16 14 187104 CASAVA_Build 12 36808202 1D CCACACAGCC A/- AAAAATATCA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 6 5 187105 CASAVA_Build 12 36813685 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 9 8 187106 CASAVA_Build 12 36822120 2I CTCTTGCTGA --/CT CTCTCTTGAC 3070 het 3070 ref 92 33 49 11 CT 3 4 187107 CASAVA_Build 12 36822878 38I GATGAGTCCC --------------------------------------/CTGGTCTGTCTATCACAGGACCGTACACGTAAGGAGGA AAAAACTCAT 3070 het 3070 ref 46 30 10 6 CTGGTCTGTCTATCACAGGACCGTACACGTAAGGAGGA 0 1 187108 CASAVA_Build 12 36823220 2D CAGGCTGAAA CT/-- CTCATTGGCA 3070 hom 56 het 38 0 24 14 CT 2 1 187109 CASAVA_Build 12 36839335 1D CCTGTCTTGC A/- ACAGAGTGCG 3070 hom 51 het 20 0 15 5 A 2 1 187110 CASAVA_Build 12 36844089 3I ACATAGAATG ---/AGT AGTTTACACA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 AGT 1 2 187111 CASAVA_Build 12 36844573 1I TAACATTTTT -/G TAGTTGGATT 3070 het 3070 ref 63 45 12 6 G 0 1 187112 CASAVA_Build 12 36845177 1D TTTTTTTTTT A/- AAAGGTGAGT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 A 4 3 187113 CASAVA_Build 12 36847377 1I GGGTTAGCAG -/T TTTATAAACC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 3 4 187114 CASAVA_Build 12 36853489 1D CCTATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 29 0 16 13 T 11 10 187115 CASAVA_Build 12 36856289 4D AAAAAGTTAC AATA/---- ATAAACATAG 1669 het 1669 ref 40 32 7 2 AATA 1 0 187116 CASAVA_Build 12 36859734 4I8M1I GAATTATTTA ----TTAATATT-/TTGTTTAATATTG TTTATTGTTA 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 N/A 0 0 187117 CASAVA_Build 12 36864633 3I TCTGGCTCCC ---/AGG TAGCACCTAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AGG 0 1 187118 CASAVA_Build 12 36867064 1D AAGAGATTAA G/- AAGGTCATTA 3070 het 3070 ref 96 45 50 1 G 1 0 187119 CASAVA_Build 12 36873393 11I TTGGAATGTC -----------/CTTATCCAAGA AGAGAGGTCC 3070 hom 232 het 81 0 78 3 CTTATCCAAGA 0 1 187120 CASAVA_Build 12 36875809 1D TGACTCCTTT C/- TTTGCAGCTT 3070 het 3070 ref 48 31 16 1 C 1 0 187121 CASAVA_Build 12 36876883 1D CTTCCAGACT C/- CCATGGATCA 442 het 442 ref 76 70 3 3 C 3 2 187122 CASAVA_Build 12 36878692 1D ACATCCCTAG A/- AGATAGAAAA 3070 het 3070 ref 80 43 18 23 A 2 1 187123 CASAVA_Build 12 36880847 1I AAATCTGTCC -/A AACATTGAGG 2152 het 2152 ref 80 61 8 17 A 2 3 187124 CASAVA_Build 12 36881360 12I CAATCTAGGA ------------/CAGGTGCAAAGG CACTCTGTGA 3070 het 3070 ref 76 38 24 15 CAGGTGCAAAGG 0 1 187125 CASAVA_Build 12 36883809 24I CACAGCTGAC ------------------------/GAGGAGGAGTTTGAGGAGTATGCT GAGGAGGAGG 3070 hom 93 het 38 0 34 11 GAGGAGGAGTTTGAGGAGTATGCT 0 1 187126 CASAVA_Build 12 36884234 5I GAAGGCAACA -----/CTTGG CTTGGCTTAT 3070 hom 132 het 50 0 43 7 CTTGG 1 2 187127 CASAVA_Build 12 36888723 1D AAGTTTAGAG A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 7 6 187128 CASAVA_Build 12 36889083 1D CTCTCAGCAG A/- AAAATCTACA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 5 4 187129 CASAVA_Build 12 36894888 1D ACAAGTAAGA C/- TATGCTACAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 1 0 187130 CASAVA_Build 12 36898409 1D AAACACTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 11 10 187131 CASAVA_Build 12 36903633 1D ATTTTGGTTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 9 8 187132 CASAVA_Build 12 36904953 1I CTATTACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1990 hom 31 7 21 3 T 10 11 187133 CASAVA_Build 12 36914846 1I GAAATTTTTT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 7 8 187134 CASAVA_Build 12 36915010 3D GTATCGAGTT TCA/--- TACTATAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 TCA 1 0 187135 CASAVA_Build 12 36920156 20D TGCCTACATG TTAACATCATTCTCAAACAT/-------------------- TTGTTGGCTG 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TTAACATCATTCTCAAACAT 1 0 187136 CASAVA_Build 12 36924454 3D AAGAGCAAGT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 hom 72 het 35 0 25 11 TTC 5 4 187137 CASAVA_Build 12 36928283 1I ACATTAAAAA -/G TTGCTCAGAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 0 1 187138 CASAVA_Build 12 36928947 1I TGGTGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1056 hom 43 5 26 12 T 11 12 187139 CASAVA_Build 12 36930290 1D AATGTAGCGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 9 187140 CASAVA_Build 12 36937745 1I ATCTCTCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 947 hom 27 2 19 6 A 11 12 187141 CASAVA_Build 12 36941530 1D CTCCCCAGAG C/- CTGAAGACAG 3070 hom 169 het 62 0 57 5 C 2 1 187142 CASAVA_Build 12 36962882 4I ATAATTTGTC ----/ATTA ATTATAGTTA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 ATTA 1 2 187143 CASAVA_Build 12 36993722 15I TGTATTCTCA ---------------/CTGTAATGCTCAAAC CCAAATAAAT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 CTGTAATGCTCAAAC 0 1 187144 CASAVA_Build 12 37018325 1D TTTCTTATTT C/- TTTTTTTTAT 3070 hom 56 het 24 0 19 5 C 1 0 187145 CASAVA_Build 12 37030690 1D AGAAATGCTG T/- TATATATTAC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 T 2 1 187146 CASAVA_Build 12 37041981 2D GGAAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 11 9 187147 CASAVA_Build 12 37044498 1I AATGAAACTT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 7 8 187148 CASAVA_Build 12 37045233 6I AAGATGATAC ------/TGATAG ATAATACCCT 3070 hom 92 het 37 0 31 6 TGATAG 0 1 187149 CASAVA_Build 12 37049673 9D CCTTTCCCCC AAGTCCCCA/--------- AAGTCCCCAA 3070 hom 99 het 36 0 30 7 AAGTCCCCA 2 1 187150 CASAVA_Build 12 37051384 1I TATTTTCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 693 hom 32 2 24 6 A 9 10 187151 CASAVA_Build 12 37063376 2D TCGAGCAGTG GT/-- GTTTATAGTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 GT 2 1 187152 CASAVA_Build 12 37068644 1I TTGCTTATGA -/G TATTGAGGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 187153 CASAVA_Build 12 37071832 6I ATAGAGACAC ------/AAACTT AAATCTTTTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AAACTT 0 1 187154 CASAVA_Build 12 37072502 1I AAAAACTTTA -/C TAATAGCCTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 0 1 187155 CASAVA_Build 12 37079972 2D AACTTTGCAT AA/-- TATAATGGAA 3070 hom 112 het 42 0 38 4 A 2 0 187156 CASAVA_Build 12 37089361 1D AAACTTCTGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 8 7 187157 CASAVA_Build 12 37091458 3D AAAAAAAAAA ATT/--- AATTAATTAA 308 het 308 ref 21 9 2 11 ATT 1 0 187158 CASAVA_Build 12 37094121 1I AAAAACAATG -/T TTTTTTTTTT 1448 het 1448 ref 20 8 6 6 T 13 14 187159 CASAVA_Build 12 37116345 1D GTAATTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 42 1 36 5 A 11 10 187160 CASAVA_Build 12 37137539 1I CACCATAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 10 11 187161 CASAVA_Build 12 37141625 2D TCAAAGAGAC AT/-- GTGCACTTGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AT 1 0 187162 CASAVA_Build 12 37150378 4D AACATCAAGT GACC/---- GACCACAACC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GACC 2 1 187163 CASAVA_Build 12 37167243 7D ATGGAAGTAG TATATAT/------- TATATATATG 3070 hom 126 het 45 0 43 6 TATATAT 2 1 187164 CASAVA_Build 12 37172931 1I AGGGGGAGTG -/C CATAGGCAGT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 1 2 187165 CASAVA_Build 12 37175468 1I ATGTTATTTA -/G GGATACATTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 2 3 187166 CASAVA_Build 12 37177703 1D TCCAAACTGC T/- TTCTGTACTG 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 3 2 187167 CASAVA_Build 12 37179085 2D TCTGTGTATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 91 het 37 0 31 9 TG 7 6 187168 CASAVA_Build 12 37180109 1D ACTATACCAT A/- AGGCTACAGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 2 1 187169 CASAVA_Build 12 37182823 1I AAGGAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 631 hom 32 5 23 4 T 13 14 187170 CASAVA_Build 12 37203119 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 14 0 13 1 A 12 11 187171 CASAVA_Build 12 37205037 5D ATAATTCAGC TTTGT/----- TTTATTTTGT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TTTGT 1 0 187172 CASAVA_Build 12 37210428 1I TTGGGTCCTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 13 hom 29 2 23 4 T 8 9 187173 CASAVA_Build 12 37231659 1I TTTCAATTTT -/G GTCTACTCCA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 1 2 187174 CASAVA_Build 12 37233061 1I GCAAACAAAA -/G GTCCTCTACC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 G 1 2 187175 CASAVA_Build 12 37268165 1D GATACCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 36 1 28 8 A 13 12 187176 CASAVA_Build 12 37268178 1D AAAAAAAAAA C/- AAAGATCTCA 3070 het 484 hom 31 2 23 6 C 1 0 187177 CASAVA_Build 12 37268604 1D GATAAACACC A/- AAACAGTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 4 3 187178 CASAVA_Build 12 37277566 1D AAGTTTATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 9 8 187179 CASAVA_Build 12 37284769 2D AAGATCGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 32 1 25 6 A 13 11 187180 CASAVA_Build 12 37316136 1I GATCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 20 1 13 6 T 13 14 187181 CASAVA_Build 12 37321620 1I TTGCAACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 17 0 9 8 A 10 11 187182 CASAVA_Build 12 37324611 4D GATAAATCTC ACAA/---- ACAAAATATT 3070 hom 93 het 35 0 31 6 ACAA 2 1 187183 CASAVA_Build 12 37336043 1I TAAGGATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 817 hom 31 3 23 5 A 12 13 187184 CASAVA_Build 12 37349121 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 18 6 A 11 10 187185 CASAVA_Build 12 37356184 1I GAGCCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 2305 het 397 hom 11 1 6 4 A 15 16 187186 CASAVA_Build 12 37357072 1I CCTAAAAAAA -/C AAACATACAA 3070 hom 124 het 46 0 41 5 C 0 1 187187 CASAVA_Build 12 37357430 1I GGTGATTTTA -/T TTTTATTGTT 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 T 4 5 187188 CASAVA_Build 12 37377814 1D GTAATGAGGG A/- AGTTCTCACT 3070 hom 96 het 38 0 27 12 A 2 1 187189 CASAVA_Build 12 37388446 1I GTGTCAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 536 hom 33 3 27 3 A 10 11 187190 CASAVA_Build 12 37400673 1D TATCAAGTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 9 8 187191 CASAVA_Build 12 37404434 2D GATGATATTG AT/-- TTTTTTTATA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 AT 1 0 187192 CASAVA_Build 12 37405908 1D TTTGGGTGTT A/- ATTTAGTTGA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 2 1 187193 CASAVA_Build 12 37410026 3D AAAATGCTAA TCT/--- TCTTCTTTAT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 TCT 3 2 187194 CASAVA_Build 12 37410441 1I AAATTAAAGG -/A AAAAAAGTAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 6 7 187195 CASAVA_Build 12 37410922 1I GTCACTACAC -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 7 8 187196 CASAVA_Build 12 37414090 3I GCTTCATTCC ---/CTT CTTTTTTGCT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 CTT 1 2 187197 CASAVA_Build 12 37415324 7D AGCAGTCACG AAAATGA/------- AAGACCCCTT 3070 hom 81 het 29 0 26 5 AAAATGA 1 0 187198 CASAVA_Build 12 37415520 2I CCATGAGACT --/TG TGTTTTCCTA 3070 hom 96 het 44 0 31 13 TG 1 2 187199 CASAVA_Build 12 37416587 1I CGCCAAATTA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 6 7 187200 CASAVA_Build 12 37418266 3I GTAAGTCACA ---/AAG AAGAGGAGAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAG 1 2 187201 CASAVA_Build 12 37423886 1D TGGAGAAGCG T/- TGTGTCAGTA 3070 hom 135 het 47 0 46 2 T 2 1 187202 CASAVA_Build 12 37424830 1I CCTATCAGGA -/T TTTTGCAAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 4 5 187203 CASAVA_Build 12 37438419 2D TTTCCAGACA AT/-- ATACAATTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 3 AT 2 1 187204 CASAVA_Build 12 37454682 1I GACTGGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 11 187205 CASAVA_Build 12 37472367 1I AAACTAAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 32 1 29 2 T 11 12 187206 CASAVA_Build 12 37489059 1D CAAGTTTCAA C/- AAAAAGTAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 0 187207 CASAVA_Build 12 37504241 3D TCAAATTATT TCA/--- TCATTATGCA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TCA 2 1 187208 CASAVA_Build 12 37517343 4D TCCAAATTTT CTAA/---- CTGAGTAAAC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 CTAA 1 0 187209 CASAVA_Build 12 37532749 2D GGACACAGAC AT/-- GTGTTTGATT 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 AT 1 0 187210 CASAVA_Build 12 37540632 1D AGTATATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 29 2 21 7 A 13 12 187211 CASAVA_Build 12 37589604 1I GAACACCTTG -/A ATTTTAGACT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 1 2 187212 CASAVA_Build 12 37707317 1I TAATTCTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 A 9 10 187213 CASAVA_Build 12 37710245 1I TCATTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 A 11 12 187214 CASAVA_Build 12 37730585 2D AATATATAAC AT/-- AAAATATGAT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 AT 1 0 187215 CASAVA_Build 12 37746600 2I TTCTAAATTC --/TT TTTTTTTCAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 9 187216 CASAVA_Build 12 37760203 1I TCCTGTGTCT -/A TCTAAAGTCC 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 A 0 1 187217 CASAVA_Build 12 37761328 1D CTGAATGCAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 2589 hom 21 7 12 2 T 9 8 187218 CASAVA_Build 12 37763017 1I TCCCATATAA -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 29 het 28 1 21 6 C 9 10 187219 CASAVA_Build 12 37782628 1D CGCTGATTAC A/- AAAAAAAAAA 2319 het 2319 ref 41 23 8 10 A 15 14 187220 CASAVA_Build 12 37784456 3D TCGTGTGACG AGA/--- AGAAGAATAC 3070 het 3070 hom 43 17 20 8 AGA 3 2 187221 CASAVA_Build 12 37801334 1I GTAAATTCTC -/T CAGCATTTGC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 0 1 187222 CASAVA_Build 12 37815130 1I TTGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 11 12 187223 CASAVA_Build 12 37823994 3D TGATGCAAAG TTA/--- TTGTTGTTTG 3070 het 3070 hom 55 22 29 6 TTA 1 0 187224 CASAVA_Build 12 37837050 1I GAATGGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 T 11 12 187225 CASAVA_Build 12 37861262 1D TCAAGTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 13 12 187226 CASAVA_Build 12 37863117 1D AGAAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 13 12 187227 CASAVA_Build 12 37880304 1I CAAGCCTCTA -/T ATCACCCTCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 187228 CASAVA_Build 12 37882889 1I ATTTACGATA -/C CCCCCCCCCA 3070 het 57 hom 30 2 12 16 C 9 10 187229 CASAVA_Build 12 37888907 11D CAAAGGATCG CAGCTCGTTGC/----------- CAGCAATGAA 3061 het 3061 ref 24 20 7 2 CAGCTCGTTGC 1 0 187230 CASAVA_Build 12 37895854 1I TCCAGAATGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 8 9 187231 CASAVA_Build 12 37898316 1D TTGTTTTTAT G/- GTTTTTGCAC 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 G 2 1 187232 CASAVA_Build 12 37899380 1I GTTGGGGGGG -/A GGGGATAGAT 3070 het 1866 hom 28 11 13 4 A 0 1 187233 CASAVA_Build 12 37919567 1I ATTTTGAGGA -/C CTACTAGAGC 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 C 1 2 187234 CASAVA_Build 12 37953494 19I GATCAAAATC -------------------/TTCAGAATGTTCCTCAGTT TATACAGAAA 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 TTCAGAATGTTCCTCAGTT 0 1 187235 CASAVA_Build 12 37968514 3I CTCTTCAGAT ---/AAG AAGTGAAGTA 3070 het 3070 ref 56 23 22 11 AAG 1 2 187236 CASAVA_Build 12 37973803 1D ACAGCACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 A 15 14 187237 CASAVA_Build 12 38021797 7D ATAAAAAAAT TCACTTG/------- TCATCAGTAT 3070 het 3070 ref 40 23 11 9 TCACTTG 1 0 187238 CASAVA_Build 12 38146227 1D AAGTCCATAA T/- TTACATTAGT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 3 2 187239 CASAVA_Build 12 38247714 5I AGGTTAATAT -----/TGTTA TGTGTGAATT 2407 het 2407 ref 29 20 5 4 TGTTA 0 1 187240 CASAVA_Build 12 38305515 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 24 5 10 9 T 17 16 187241 CASAVA_Build 12 38334824 2D TACTGGCCTC AT/-- AGAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 7 AT 1 0 187242 CASAVA_Build 12 38338157 1I ATCAAAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 11 12 187243 CASAVA_Build 12 38339760 2I TTATGATAAC --/TG TTTTAATGTA 3070 het 3070 hom 45 15 27 3 TG 0 1 187244 CASAVA_Build 12 38342590 1D ATCTAAGAGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 10 9 187245 CASAVA_Build 12 38357097 1D TAACACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 13 12 187246 CASAVA_Build 12 38362072 3I TTAACCTAGA ---/ATT ATTATTTCTG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 ATT 2 3 187247 CASAVA_Build 12 38367559 1I TGAGGTGGGA -/G GTGCCACACA 3070 het 3070 hom 41 21 19 1 G 1 2 187248 CASAVA_Build 12 38368287 2D CTAGTCAGAA AG/-- AGACAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 AG 2 1 187249 CASAVA_Build 12 38372607 1D TGCAACTTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 T 10 9 187250 CASAVA_Build 12 38374822 4D GTGTTCTATT GAGA/---- CACCAGCTGG 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 GA 2 0 187251 CASAVA_Build 12 38378488 1D AACATTCCTC T/- TTTCAGCATT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 4 3 187252 CASAVA_Build 12 38389394 3D ATCTATGGGA ATT/--- ATTATTAATT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 ATT 3 2 187253 CASAVA_Build 12 38391522 2I GTACATATAT --/AC ACACATATAC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AC 2 3 187254 CASAVA_Build 12 38392393 2D24M4D GTATATATAC ATATGTTTATATACCTGTATTTATATATAC/--ATGTTTATATACCTGTATTTATAT---- ATACATACAT 2548 het 2548 ref 30 30 6 4 N/A 0 0 187255 CASAVA_Build 12 38393960 2D GTATATACAC TT/-- ATACGTATAT 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 T 2 0 187256 CASAVA_Build 12 38394467 2I TGTATATATG --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 TA 4 5 187257 CASAVA_Build 12 38423144 1I AAAAATCCCC -/T TGTGCCTCTG 3070 hom 94 het 36 0 29 7 T 1 2 187258 CASAVA_Build 12 38436498 1I GCAATATGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 A 9 10 187259 CASAVA_Build 12 38441701 1D GAATTTTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 95 het 50 1 45 4 A 10 9 187260 CASAVA_Build 12 38442484 34I ACACAAATTG ----------------------------------/AGGACTCAAAGGCCATGTTTGACTGAATTTCAGT ACTACCTCAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 AGGACTCAAAGGCCATGTTTGACTGAATTTCAGT 0 1 187261 CASAVA_Build 12 38442997 1I CATTTTTCTC -/A TGGTTTTCTG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 0 1 187262 CASAVA_Build 12 38449614 1D AAACATTGTA G/- GGTGTAGGCT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 G 3 2 187263 CASAVA_Build 12 38452941 3D AAGTAGCTCC TCA/--- TCATCCTCAT 3070 het 3070 hom 56 27 26 4 TCA 2 1 187264 CASAVA_Build 12 38456340 9I TTTATACTAC ---------/ACAGTCACT ACACTGCTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 ACAGTCACT 0 1 187265 CASAVA_Build 12 38456806 1I GACATTTTTC -/T TTTCTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 3 4 187266 CASAVA_Build 12 38460274 2D TTTTGCATAT AA/-- GTCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 26 21 9 A 2 0 187267 CASAVA_Build 12 38461465 1I GGCCTGCCCC -/T CTCCAGCCTT 3070 hom 111 het 44 0 28 16 T 0 1 187268 CASAVA_Build 12 38467065 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 A 7 6 187269 CASAVA_Build 12 38470197 1D TTTTGTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 12 11 187270 CASAVA_Build 12 38472873 1I GTATTTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 A 11 12 187271 CASAVA_Build 12 38479524 1D TACACGGCGC A/- CTTTTACAGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 1 0 187272 CASAVA_Build 12 38481317 2D GAGTATAATT AA/-- AAAAAAAATC 2138 het 138 hom 7 1 5 1 A 10 8 187273 CASAVA_Build 12 38485202 5I GAAGACAGCA -----/AGGGC AGGGCAGGCC 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 AGGGC 1 2 187274 CASAVA_Build 12 38485584 2D CCTCTGTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 38 0 17 21 T 12 10 187275 CASAVA_Build 12 38498392 1D TTAAATACTG A/- TCGGTACCTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 A 1 0 187276 CASAVA_Build 12 38503688 3I ATGATGATGA ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 TAT 5 6 187277 CASAVA_Build 12 38508782 2D AGTAACTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1068 hom 24 5 14 5 T 12 10 187278 CASAVA_Build 12 38509581 7D GTTCAAGTGA TTCTCCT/------- TTCTCCTGCC 3070 het 3070 ref 23 11 7 7 TTCTCCT 2 1 187279 CASAVA_Build 12 38512785 4I CCTCTACTTG ----/CTCT CTATTATCAG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 CT 1 3 187280 CASAVA_Build 12 38527363 1I TACATTCATT -/C CTTCCCTCCT 3070 het 3070 ref 51 21 22 8 C 1 2 187281 CASAVA_Build 12 38551452 1I AAGAGCTTTG -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 6 7 187282 CASAVA_Build 12 38551555 1D14M1D AAAAGGATAG AAAAAAAAAACAATTA/-AAAAAAAAACAATT- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 18 12 5 N/A 0 0 187283 CASAVA_Build 12 38571190 1D CAAATATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 11 10 187284 CASAVA_Build 12 38576101 2D ACATACATGC AT/-- ATGTTTATAT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 AT 2 1 187285 CASAVA_Build 12 38586198 7D TGCAGATACA GAACTTT/------- GAACTTTGTT 3070 hom 102 het 53 1 47 8 GAACTTT 2 1 187286 CASAVA_Build 12 38596896 4I TCATTTAAAT ----/AATC AAAGTATAAA 3070 hom 128 het 48 0 44 4 AATC 0 1 187287 CASAVA_Build 12 38597313 1D TGATGAAATA G/- TGTTCTTACA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 1 0 187288 CASAVA_Build 12 38618473 1I AAGAAACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 29 2 22 5 A 11 12 187289 CASAVA_Build 12 38618578 4D GAAGGCATAA ATAC/---- ATACATACAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATAC 3 2 187290 CASAVA_Build 12 38619699 1I GTCTTTCTTC -/A AAAGACATGA 3070 het 3070 hom 57 19 33 5 A 3 4 187291 CASAVA_Build 12 38620716 1I ATGGCTGTGA -/T TTTTTTTTTA 2692 het 2692 ref 31 14 8 9 T 9 10 187292 CASAVA_Build 12 38620947 3D CACTCTTCCC CCT/--- CAAGTCCCCA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 CCT 1 0 187293 CASAVA_Build 12 38631453 1I AGAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 10 11 187294 CASAVA_Build 12 38633059 1D TATATCATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 10 9 187295 CASAVA_Build 12 38634438 1I AGGAGGAGAA -/C TCTGGAGATC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 187296 CASAVA_Build 12 38635545 5D TCCATGAAGT AGAAA/----- AGAAGAGAGT 3070 het 3070 hom 23 9 14 1 AGAAA 1 0 187297 CASAVA_Build 12 38648804 6I15M2I11M32D TGCCCTTTCT ------TTTTTATTTTTGTTG--TTTTTTTTTGGTATATATATATATATATATATATATATATATA/TTTTTGTTTTTATTTTTGTTGTTTTTTTTTTTGG-------------------------------- TATATATATA 3070 hom 51 het 18 0 17 5 N/A 0 0 187298 CASAVA_Build 12 38654212 4I CTTTATATAC ----/TTTG TTTAATTCTC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TTTG 0 1 187299 CASAVA_Build 12 38671876 2I CTATCTTTTT --/TA AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TA 0 1 187300 CASAVA_Build 12 38680401 1D ACCCAAAAAC T/- TACAGGCTGT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 2 1 187301 CASAVA_Build 12 38682918 1I ATATTCCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 525 hom 33 4 23 6 A 12 13 187302 CASAVA_Build 12 38687575 1D ACTTTTTTTT A/- AAAAAAGGTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 6 187303 CASAVA_Build 12 38699429 1D CAATGCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 13 12 187304 CASAVA_Build 12 38719000 1D TATCGTTGTT A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 A 8 7 187305 CASAVA_Build 12 38726831 1D CATTAGCTTC A/- AAGAGTTTTC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 3 2 187306 CASAVA_Build 12 38734546 5D TATTAGAGTA AACAT/----- AACCACAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 10 8 AACAT 1 0 187307 CASAVA_Build 12 38742455 1I GCTTCAGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 424 hom 34 1 31 2 A 9 10 187308 CASAVA_Build 12 38743550 1D AAAACTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 A 11 10 187309 CASAVA_Build 12 38744598 1D TGCAAGGAAA T/- TCTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 13 21 6 T 2 1 187310 CASAVA_Build 12 38746524 4D GACTCTGCCT AATA/---- AATATTCACT 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 AATA 2 1 187311 CASAVA_Build 12 38747589 2D AACATGGTTA AT/-- ATTGTTTCCA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 AT 2 1 187312 CASAVA_Build 12 38753288 8D ATAAACATAT ACACACAC/-------- ACATGCACAT 3070 het 3070 ref 48 31 16 2 AC 5 1 187313 CASAVA_Build 12 38760268 1D TTAAAGTCTA T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 6 187314 CASAVA_Build 12 38764252 1I AAGATATTGT -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 A 6 7 187315 CASAVA_Build 12 38779970 1D GGAGTAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 12 11 187316 CASAVA_Build 12 38782021 1I GTAAAGTACT -/A CCACCAGGTC 3070 hom 104 het 44 0 35 9 A 0 1 187317 CASAVA_Build 12 38788589 1D TGTGCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 11 8 T 13 12 187318 CASAVA_Build 12 38788966 2D TATATATATA TT/-- GTTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 2 0 187319 CASAVA_Build 12 38798156 1I TGTTGAAAAA -/G ATGAGTAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 18 10 G 0 1 187320 CASAVA_Build 12 38799333 1I CACAATCCCT -/A AAAGGAAAAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 3 4 187321 CASAVA_Build 12 38802700 1D AAGCTGTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 G 1 0 187322 CASAVA_Build 12 38803070 1I TACATAAGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 35 0 20 15 T 8 9 187323 CASAVA_Build 12 38807916 3D AAGCAAAATC TTG/--- TTGTTAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 TTG 2 1 187324 CASAVA_Build 12 38816379 1I CTCTGGGGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 A 8 9 187325 CASAVA_Build 12 38816549 1D TGTTTTGATA C/- AGGCGTGCAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 C 1 0 187326 CASAVA_Build 12 38838143 1D GTAATTACAT G/- AAGTTAGATT 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 G 1 0 187327 CASAVA_Build 12 38839591 4I AAGAGATGAC ----/TGTT TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 TGTT 0 1 187328 CASAVA_Build 12 38842208 1I TAAAAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 22 8 T 11 12 187329 CASAVA_Build 12 38842513 1I TGACTCTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 10 11 187330 CASAVA_Build 12 38844268 1D TTATTTTTTT A/- AAAAAAATCC 3051 het 3051 ref 25 14 9 2 A 8 7 187331 CASAVA_Build 12 38846303 11D TTTTATTTGA TTTCACTGTAT/----------- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 36 15 20 4 TTTCACTGTAT 1 0 187332 CASAVA_Build 12 38848599 1D TGGCCAACAT G/- GTGAACCATG 3070 het 2613 hom 21 6 11 10 G 2 1 187333 CASAVA_Build 12 38851781 1I GGACTTGTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 T 9 10 187334 CASAVA_Build 12 38857909 1D GCACAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1432 hom 26 4 11 11 A 15 14 187335 CASAVA_Build 12 38859584 1I TTTTAATCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 9 10 187336 CASAVA_Build 12 38861335 7I ACCCGGGAGG -------/TGGAGCT TGGAGCTTGC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 TGGAGCT 1 2 187337 CASAVA_Build 12 38866549 1D AGATATTAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 123 het 45 0 42 4 T 10 9 187338 CASAVA_Build 12 38869096 2I TATAAATGAA --/AG AGATTCTTAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AG 1 2 187339 CASAVA_Build 12 38885882 1I TTGCTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2818 hom 30 10 12 8 T 13 14 187340 CASAVA_Build 12 38892499 3D CTATGGACAA TTG/--- TTGTCTTATT 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 TTG 2 1 187341 CASAVA_Build 12 38898430 1I AGAAAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 709 hom 36 2 27 7 T 10 11 187342 CASAVA_Build 12 38917893 4D GTAGTTTATC AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 46 18 15 15 AACA 6 5 187343 CASAVA_Build 12 38943471 1I TTCATTTCTG -/A CCTTTTTATG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 1 187344 CASAVA_Build 12 38964545 2D ATTTTATCTC TT/-- ATAAGTAATT 3070 het 3070 hom 24 9 13 4 T 2 0 187345 CASAVA_Build 12 38967410 1I GGTGTATCTC -/T TTATTTTCAG 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 T 2 3 187346 CASAVA_Build 12 38973963 2D TTTTTTGGGG CA/-- CATATATATA 3070 het 2370 hom 26 10 12 4 CA 2 1 187347 CASAVA_Build 12 38991416 1D GAGAGAACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 10 9 187348 CASAVA_Build 12 38992034 1I AATCCAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 10 11 187349 CASAVA_Build 12 38993060 1D GTAAATATGG A/- AGTAATGGTT 3070 het 3070 hom 36 9 22 5 A 2 1 187350 CASAVA_Build 12 38993757 1I ATTTATCTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 11 12 10 T 9 10 187351 CASAVA_Build 12 38995876 1D TGGAAAATGA T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 30 8 17 6 T 7 6 187352 CASAVA_Build 12 38999854 1D TTAATTTAAC A/- ATTTTTTTTT 3070 het 2707 hom 32 11 16 6 A 2 1 187353 CASAVA_Build 12 39001578 1I AGACATTTAC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 A 7 8 187354 CASAVA_Build 12 39003868 2D ACTCAAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 20 11 T 16 14 187355 CASAVA_Build 12 39011667 1I AAAAAATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 A 10 11 187356 CASAVA_Build 12 39023327 4I CAACATTAAC ----/TCAG TCAGTCAGAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TCAG 2 3 187357 CASAVA_Build 12 39026257 1D GAGAGAAGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 57 hom 34 1 27 6 T 10 9 187358 CASAVA_Build 12 39027096 1D CAGATGATCA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 8 7 187359 CASAVA_Build 12 39028026 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 11 12 187360 CASAVA_Build 12 39029579 3D TGTATTCTTT TTC/--- TTATTTATTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TTC 1 0 187361 CASAVA_Build 12 39029628 8D TGTCACCCAG GCTGGAGT/-------- GCTGGAGTGC 3070 hom 36 het 15 0 10 8 GCTGGAGT 2 1 187362 CASAVA_Build 12 39029760 1I TTTCCTTTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 7 8 187363 CASAVA_Build 12 39034905 14D TTCTTTGAAA AAAAAAAAATATAT/-------------- ATATATATAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 AAAAAAAAATATAT 1 0 187364 CASAVA_Build 12 39036563 1D TATATTGTGG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 7 187365 CASAVA_Build 12 39037433 2D TTGATTCCAC TT/-- TTTTTTTTAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 10 8 187366 CASAVA_Build 12 39038805 1D GTTTTAGAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 9 8 187367 CASAVA_Build 12 39039088 3D TTCAGCTACT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 TTG 5 4 187368 CASAVA_Build 12 39039312 1I GTGTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 541 hom 35 2 30 3 T 10 11 187369 CASAVA_Build 12 39040947 7D TTATGCCCCC TGCCTAT/------- TTCAGTCCAA 3070 hom 90 het 31 0 31 2 TGCCTAT 1 0 187370 CASAVA_Build 12 39041312 4D TTTCTGTCTT TACA/---- TATTTATTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 TACA 1 0 187371 CASAVA_Build 12 39043382 4I AGTGTTTTTA ----/CATG CATTAAGAAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CATG 0 1 187372 CASAVA_Build 12 39052990 4I CCACTCTGTC ----/TGAG TAACATTACT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 TGAG 0 1 187373 CASAVA_Build 12 39056215 1I GAATCTAAGG -/A AAAAATATTT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 5 6 187374 CASAVA_Build 12 39060691 3I ATTTTAAAAC ---/AAG AAGGAGACAT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 AAG 1 2 187375 CASAVA_Build 12 39069283 1I ACTGTTGACT -/C CCACCCCTCC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 2 3 187376 CASAVA_Build 12 39089666 1D TGGTCTCACC T/- TGGAAAAGAA 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 T 2 1 187377 CASAVA_Build 12 39093076 14D CACTTGTTTA CATTAGGTGTTAGT/-------------- CATTTTCTCA 3070 het 3070 ref 49 25 24 8 CATTAGGTGTTAGT 1 0 187378 CASAVA_Build 12 39106713 1D ATTGTAGTTA C/- AGCTCTGTAA 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 C 1 0 187379 CASAVA_Build 12 39118648 1I GTTTTGTTTT -/A AACACCAGTA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 2 3 187380 CASAVA_Build 12 39123768 2I ATTTGGTTAC --/TT TTGAGATTAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 2 4 187381 CASAVA_Build 12 39134249 1I TAGCAAAGGG -/T TTTTTTTTTG 1241 het 1241 ref 57 45 3 9 T 9 10 187382 CASAVA_Build 12 39134452 4D ATTTTGGATA ATAT/---- ATTAGTGCTT 3070 het 3070 ref 39 23 15 2 AT 3 1 187383 CASAVA_Build 12 39135833 4D AAGGAATAAT TAAC/---- TAGGTGAATG 3070 het 3070 hom 47 21 21 7 TAAC 1 0 187384 CASAVA_Build 12 39139138 1D ATATCTTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 9 8 187385 CASAVA_Build 12 39140136 1D TGTAAAAAAG A/- AAAAAAGGCA 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 A 7 6 187386 CASAVA_Build 12 39142437 1D GCACAGGTAG A/- AGTATTAACT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 187387 CASAVA_Build 12 39147854 12D CCCACAAAAC AATAATAATAAT/------------ AATAATAATA 3070 het 764 hom 28 5 13 15 AAT 10 6 187388 CASAVA_Build 12 39151064 1I GCAGCCTAGG -/C AACACAGTGA 3070 hom 26 het 19 0 9 10 C 0 1 187389 CASAVA_Build 12 39151237 122D CCAATTTGGG AGAAGGAGTGAGATCCTATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAATCAAATAAAGTAAATTTCTTCTGTAATGTTCCATTTGAGTGAGAAATATATATATAAACTT/-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ATATATACCA 2687 hom 15 het 7 0 6 4 AGAAGGAGTGAGATCCTATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAATCAAATAAAGTAAATTTCTTCTGTAATGTTCCATTTGAGTGAGAAATATATATATAAACTT 1 0 187390 CASAVA_Build 12 39155147 1I AGCCTGAACC -/A ATTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 A 1 2 187391 CASAVA_Build 12 39165474 2I CTGAAGTGAC --/AG GGACAATTGG 3070 hom 123 het 49 0 41 8 AG 0 1 187392 CASAVA_Build 12 39168655 1D TGACAGGGAT A/- AGTGGACTAT 3070 het 3070 ref 44 20 12 14 A 2 1 187393 CASAVA_Build 12 39170931 9I GTAACATGGA ---------/CAACTGGAC CACCTGGACC 3070 het 3070 hom 64 21 26 17 CAACTGGAC 0 1 187394 CASAVA_Build 12 39179374 1D TCAAGTGATC T/- GCCAGCCTTG 3070 het 3070 hom 37 14 17 8 T 1 0 187395 CASAVA_Build 12 39181013 10I GTCCTCCTGA ----------/CTGAGAATAC CAGGAAGATT 3070 hom 172 het 65 0 57 9 CTGAGAATAC 0 1 187396 CASAVA_Build 12 39181760 1D AGAACACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 12 11 187397 CASAVA_Build 12 39185519 1I TTGTCCCCAC -/T TTGCTCATGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 2 3 187398 CASAVA_Build 12 39185721 25I TTCTTATGTA -------------------------/CAATGGTACTTCAATGGGTACCAAC GAAGTTGCCC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 CAATGGTACTTCAATGGGTACCAAC 0 1 187399 CASAVA_Build 12 39193495 3D3M10D CTTTGACATC CAGTTACTACTGGCCT/---TTA---------- TTGATGTAAA 2634 het 2634 ref 47 31 13 12 N/A 0 0 187400 CASAVA_Build 12 39194078 1I5M2D6M1I AAATTCCAAT -TTCCCTGCCAAAA-/CTTCCC--CCAAAAG AGAAGGACAT 1619 het 1619 ref 56 55 4 7 N/A 0 0 187401 CASAVA_Build 12 39201461 1I AAAAAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 37 1 32 4 T 10 11 187402 CASAVA_Build 12 39206114 1I AAGAAAAAAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 7 8 187403 CASAVA_Build 12 39228986 2D AAAATAACAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 14 0 11 4 AT 7 6 187404 CASAVA_Build 12 39242662 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 28 0 19 10 TA 7 6 187405 CASAVA_Build 12 39305478 1I CCACCCCGCC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 8 9 187406 CASAVA_Build 12 39305616 4I ATTTGCTATT ----/AAAA AAAATTCCTG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 4 8 187407 CASAVA_Build 12 39318979 4D TTTCCTGAGA TTTG/---- TTTAAGTTCT 3070 hom 63 het 22 0 21 1 TTTG 1 0 187408 CASAVA_Build 12 39344474 1I GATATTGCAA -/T TTTTTTTTTT 1260 het 1260 ref 57 42 3 12 T 10 11 187409 CASAVA_Build 12 39350221 5I CAGGAAAAAT -----/AAAAC AAAAGCCCCC 2600 het 2600 ref 28 17 8 3 AAAAC 0 1 187410 CASAVA_Build 12 39357577 2D AAAGTGTGCT TA/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 TA 1 0 187411 CASAVA_Build 12 39369107 1D AAGTGGCATG C/- TTTCACATAT 3070 het 3070 hom 50 18 21 11 C 1 0 187412 CASAVA_Build 12 39379149 9I ATTTTGACTC ---------/CCATGGTAA CCTGTGGATA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 CCATGGTAA 0 1 187413 CASAVA_Build 12 39383095 2I TATATATATA --/TT TTTTTTACAG 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 T 6 8 187414 CASAVA_Build 12 39394099 4D TATTCTTTGA CTAT/---- CTATGTGGTG 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 CTAT 2 1 187415 CASAVA_Build 12 39397147 1D AAAAGTGTTA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 T 8 7 187416 CASAVA_Build 12 39400198 6D GGGATTACAG GCATGA/------ GCCACCGCGC 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 GCATGA 1 0 187417 CASAVA_Build 12 39421984 1D TGCTATTATG T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 7 6 187418 CASAVA_Build 12 39424374 1I TAAATTAAAT -/A AAAAAAAAAA 2276 het 96 hom 23 2 8 13 A 10 11 187419 CASAVA_Build 12 39424388 2D AAAAAATAAA AG/-- AACAAAACAA 3070 het 358 hom 24 3 14 8 AG 1 0 187420 CASAVA_Build 12 39435502 1I AAGAAAAAGA -/G GCTGGGCAAG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 G 1 2 187421 CASAVA_Build 12 39437363 1I TGGGAAGGAC -/A AAAACTTTCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 4 5 187422 CASAVA_Build 12 39438058 4D GTTGTCGAGG ATTA/---- ATTAAGATAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 ATTA 2 1 187423 CASAVA_Build 12 39438954 2D ATTCAGGTTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 29 0 26 3 TA 8 7 187424 CASAVA_Build 12 39442466 1D GTCCATGGAC A/- AATAGAAGTC 3070 hom 120 het 46 0 41 6 A 3 2 187425 CASAVA_Build 12 39448063 24D AAGACTGATC ATTTCTATACTGATATACTTCTAA/------------------------ AGCTTATACA 3070 hom 102 het 33 0 35 4 ATTTCTATACTGATATACTTCTAA 1 0 187426 CASAVA_Build 12 39449335 1I ACAATATATC -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 T 7 8 187427 CASAVA_Build 12 39455242 1D AGGAAAGTGG T/- TATTTATCTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 2 1 187428 CASAVA_Build 12 39460989 1D GATGGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 12 11 187429 CASAVA_Build 12 39467764 2D ATAAAATAAC TG/-- TGAATTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TG 2 1 187430 CASAVA_Build 12 39472573 1D GGAGGTAATG A/- AAAACATTCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 5 4 187431 CASAVA_Build 12 39473535 1D ACTTGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 19 15 20 A 15 14 187432 CASAVA_Build 12 39474041 1I GGTAAGGGGG -/A AACTCATTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 2 3 187433 CASAVA_Build 12 39484943 4D CTGAAAACTG TCTT/---- TATTTTGCCT 3070 het 3070 hom 40 17 22 2 TCTT 1 0 187434 CASAVA_Build 12 39491897 1D TTATCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 27 1 8 18 A 13 12 187435 CASAVA_Build 12 39504420 20D AAATGCCTTC AAGCCTTTTCTTCCAACACT/-------------------- AAGCCTTGAG 3070 het 3070 ref 38 21 16 6 AAGCCTTTTCTTCCAACACT 1 0 187436 CASAVA_Build 12 39505931 4I CTGATGATGA ----/TGTG TGTGTGTATG 3070 het 3070 hom 53 21 24 8 TG 3 5 187437 CASAVA_Build 12 39507495 1I GAGTCCTGGT -/A AAAAATCTCC 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 5 6 187438 CASAVA_Build 12 39510490 1D AATATATTAC A/- AAAATATATA 3070 het 3070 ref 27 13 12 4 A 5 4 187439 CASAVA_Build 12 39513642 3D CTTTTTTCTT AAA/--- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 A 11 8 187440 CASAVA_Build 12 39521757 1I ATATGATATT -/A CCAATAGATG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 0 1 187441 CASAVA_Build 12 39525660 1I AGCCTCAAGA -/C TGGGGCTAGT 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 C 0 1 187442 CASAVA_Build 12 39526772 3D TTGTTGTTGT TGC/--- TGCTGAGGCA 3070 het 3070 hom 36 14 22 3 TGC 2 1 187443 CASAVA_Build 12 39526927 1D TGCCCAGTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3027 hom 18 8 8 2 T 9 8 187444 CASAVA_Build 12 39539607 3D TGGAAAAAAA AAC/--- AACGACAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 AAC 2 1 187445 CASAVA_Build 12 39543835 3I CTGATGATCT ---/GTG GTGGAACAGT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 GTG 1 2 187446 CASAVA_Build 12 39545029 1I TTCCACCAGC -/A ATGAATAAAG 3070 het 3070 ref 51 26 16 9 A 1 2 187447 CASAVA_Build 12 39546193 1I TTGTTCATTG -/C CAAGTATATA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 C 1 2 187448 CASAVA_Build 12 39550283 1D GTCTTTATCA G/- CAGCATAAAA 3070 het 2453 hom 29 6 16 8 G 1 0 187449 CASAVA_Build 12 39551120 4I CATAAACCAC ----/TGTG TGTCTCACAA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 TG 1 3 187450 CASAVA_Build 12 39551256 18D TGTTACAGAG AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 8 A 28 10 187451 CASAVA_Build 12 39592293 1D TTCTTCTTAA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 T 9 8 187452 CASAVA_Build 12 39592472 1D TTTCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 A 11 10 187453 CASAVA_Build 12 39600406 5D AAAAAGCAAA GCTTT/----- GCTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 29 14 10 11 GCTTT 2 1 187454 CASAVA_Build 12 39600568 1D ATTTGACAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 A 10 9 187455 CASAVA_Build 12 39601354 1D GGCCAGGAAA T/- GAGCGATGTG 3070 het 3070 ref 32 11 9 12 T 1 0 187456 CASAVA_Build 12 39605599 2D CACATGAAAT TG/-- TGTGTGTGTG 2456 het 2302 hom 17 6 7 4 TG 9 8 187457 CASAVA_Build 12 39624757 2I CAAGTCCTAT --/AA AGTTAAACAT 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 A 1 3 187458 CASAVA_Build 12 39628422 1D GACTGAGACC A/- AAAAAAAAAA 1580 het 1580 ref 27 17 4 6 A 15 14 187459 CASAVA_Build 12 39632197 6I TTACCAAACA ------/CTGAAC CTAAATCCAG 3070 het 3070 hom 58 23 26 9 CTGAAC 0 1 187460 CASAVA_Build 12 39657656 1I AGATCCCTGG -/C AATGACTGAC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 C 0 1 187461 CASAVA_Build 12 39680702 1I TATAGTTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 T 8 9 187462 CASAVA_Build 12 39695277 1I CAAAAAAAAA -/T CTAATCTGAA 3070 hom 99 het 34 0 33 1 T 0 1 187463 CASAVA_Build 12 39698766 2I TTTTAATATA --/TG TGTGTGTGTG 1697 het 1697 ref 16 10 5 1 TG 8 9 187464 CASAVA_Build 12 39701705 1D AACAGGAAGC T/- TTTTTTTTTT 2040 het 2040 ref 44 17 6 21 T 17 16 187465 CASAVA_Build 12 39702102 7I AATGCCAAAT -------/ATATGAC ATATGACATA 3070 het 2790 hom 22 7 9 6 ATATGAC 1 2 187466 CASAVA_Build 12 39712460 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAGAA 1812 het 1469 hom 16 7 8 1 A 8 7 187467 CASAVA_Build 12 39759239 9I AAAAATTAAG ---------/TCATACCAA TTTGAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 TCATACCAA 0 1 187468 CASAVA_Build 12 39799850 1I CAAGAAATAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 8 9 187469 CASAVA_Build 12 39800115 1D CTCTACTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 13 8 A 12 11 187470 CASAVA_Build 12 39800553 1D AATCGTTAAA C/- CCCTTAAAAG 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 C 4 3 187471 CASAVA_Build 12 39807790 1I AATAGAATTT -/C CAAGTAAAGC 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 C 1 2 187472 CASAVA_Build 12 39827689 1I GCCCCACAAA -/G TTTTAACTCA 3070 het 3070 ref 39 26 11 2 G 0 1 187473 CASAVA_Build 12 39833177 1I ATACATATCC -/T ATTTTTAGTT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 0 1 187474 CASAVA_Build 12 39833920 1D TTCATAATTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 10 9 187475 CASAVA_Build 12 39835945 1I AGCCTAATTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 187476 CASAVA_Build 12 39838273 1I TTTCCATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 9 10 187477 CASAVA_Build 12 39846725 1I TAAAGTATAA -/T TTTTAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 4 5 187478 CASAVA_Build 12 39852726 3D TAAAAAAAAG TTC/--- TTCTATGCTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TTC 2 1 187479 CASAVA_Build 12 39866556 1I TCATATGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1311 hom 48 3 37 8 T 11 12 187480 CASAVA_Build 12 39881237 1I TTGTGCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1387 hom 37 4 29 4 A 11 12 187481 CASAVA_Build 12 39888023 1I TACAGTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 11 12 187482 CASAVA_Build 12 39889409 5I CTTTTTATTT -----/TTTTA TTTTATTTAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TTTTA 1 2 187483 CASAVA_Build 12 39890268 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 29 het 12 0 10 3 T 7 6 187484 CASAVA_Build 12 39890943 1D ACATTTTACC A/- AAAGACACTA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 4 3 187485 CASAVA_Build 12 39895921 1I GCCTCCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 11 12 187486 CASAVA_Build 12 39905505 1I TTACACTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 30 1 25 4 T 10 11 187487 CASAVA_Build 12 39912171 2D TTGCAAAGAC AT/-- GTTGTAGAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 1 AT 1 0 187488 CASAVA_Build 12 39912713 1I CTGATGGTAG -/T ATTTTTGCTG 3070 hom 27 het 11 0 10 3 T 0 1 187489 CASAVA_Build 12 39920211 1I GTCCTTGTAA -/G TATTACTATT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 G 0 1 187490 CASAVA_Build 12 39924940 6D TTTTTAGTAG AGACGA/------ AGACGGGGTT 2365 hom 15 het 6 0 6 0 AGACGA 1 0 187491 CASAVA_Build 12 39928035 5D AAGGCTCACA GACGT/----- GAAAGTTATT 3070 hom 132 het 46 0 43 7 GACGT 1 0 187492 CASAVA_Build 12 39928587 1D GCAGTAATAG C/- CAAGATTTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 C 2 1 187493 CASAVA_Build 12 39932198 4I TAAATAAATA ----/AATG AATAAATAAT 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 AATG 0 1 187494 CASAVA_Build 12 39947744 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3065 het 528 hom 22 3 13 6 A 17 16 187495 CASAVA_Build 12 39951308 1D CAAAATAGAG A/- CAGGATACAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 0 187496 CASAVA_Build 12 39952129 1D AAATAGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 11 10 187497 CASAVA_Build 12 39971942 2I CCATTACCTC --/AA AAACCTGGTA 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 3 5 187498 CASAVA_Build 12 39979789 1D TATAAAATTG A/- GTTAGTTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 0 187499 CASAVA_Build 12 39991341 1D GCAATGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 11 10 187500 CASAVA_Build 12 39997310 11D GACTCACATG GTTGTGGGGCT/----------- GTCAAATTCA 3070 hom 60 het 19 0 20 1 GTTGTGGGGCT 1 0 187501 CASAVA_Build 12 40000813 1D CAATACAGAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 7 187502 CASAVA_Build 12 40006220 9I ACTCGGCTAA ---------/TTTTTGCAT TTTTTTTTTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TTTTTGCAT 0 1 187503 CASAVA_Build 12 40019704 4D CAACAAAGTG AACA/---- GACAACCCAT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 AACA 1 0 187504 CASAVA_Build 12 40022647 8D GACAAACAAA TGACCAAC/-------- TGACCAACAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 4 TGACCAAC 2 1 187505 CASAVA_Build 12 40023800 1D AGGAGAGAGG C/- TTTTGAATGG 3070 het 3070 hom 46 20 24 3 C 1 0 187506 CASAVA_Build 12 40030915 4D GACTGGAGTT TGTC/---- TGACCCAGAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 7 TGTC 1 0 187507 CASAVA_Build 12 40042526 1I GAATTTTTGT -/C CTAATTGCAG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 C 1 2 187508 CASAVA_Build 12 40053275 1D CCACAGGACC G/- GGGTGAAATT 3070 het 1481 hom 16 3 10 4 G 4 3 187509 CASAVA_Build 12 40054231 8I AAAATGCCTG --------/AACATTTC AGGTACATGA 3070 het 3070 ref 55 24 23 8 AACATTTC 0 1 187510 CASAVA_Build 12 40059335 1D TTTTTTTTTT G/- GTTGGTCTAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 G 2 1 187511 CASAVA_Build 12 40068458 1D ATAAAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 12 11 187512 CASAVA_Build 12 40073577 1D CTTCTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2792 hom 27 9 17 1 A 12 11 187513 CASAVA_Build 12 40075313 1D CTGTGAAACT A/- AAAAAGCAAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 2 A 6 5 187514 CASAVA_Build 12 40077072 1D AGTGTAATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 10 9 187515 CASAVA_Build 12 40084925 1I CAACAAGACC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 7 8 187516 CASAVA_Build 12 40087793 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAATGGCATA 3070 het 3070 ref 33 18 13 5 AC 1 0 187517 CASAVA_Build 12 40087993 1D TAGAAGCTGT G/- TTACCTGGAT 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 G 1 0 187518 CASAVA_Build 12 40092528 1D TTTGGGTAAT C/- ATGTGCCAGG 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 C 1 0 187519 CASAVA_Build 12 40097493 2I TTAGGAGATT --/TA TATATGATGA 3070 het 3070 hom 55 26 25 4 TA 2 3 187520 CASAVA_Build 12 40104722 4I ATGCTGGGGC ----/AACA AACAGTCTTC 3070 het 3070 hom 51 18 32 1 AACA 1 2 187521 CASAVA_Build 12 40126596 2D ATTTAGATGG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 11 18 9 T 11 9 187522 CASAVA_Build 12 40128582 1D GTGTGTATTT C/- AGTTCTGCTG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 C 1 0 187523 CASAVA_Build 12 40130754 1I ACTTTTGGGA -/G GCTGAGGCGG 3032 het 3032 ref 21 12 8 1 G 1 2 187524 CASAVA_Build 12 40131244 1I ATTTAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3052 het 389 hom 21 1 9 11 A 12 13 187525 CASAVA_Build 12 40132186 1D AATAAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2436 hom 27 9 14 5 A 13 12 187526 CASAVA_Build 12 40132344 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1416 het 397 hom 7 2 5 0 A 15 14 187527 CASAVA_Build 12 40134110 1D TCGTGTCAGG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 43 21 13 9 T 8 7 187528 CASAVA_Build 12 40141276 1I ATTACTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 10 11 187529 CASAVA_Build 12 40142853 2I AATTCTGTGA --/TT TTTTTTTTTC 2190 het 2190 ref 27 13 7 7 T 9 11 187530 CASAVA_Build 12 40144367 1D AGCTTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 25 12 A 12 11 187531 CASAVA_Build 12 40150560 1D GGCTTCACTT C/- CTTTTTTTTT 2305 het 2305 ref 19 10 6 3 C 2 1 187532 CASAVA_Build 12 40151791 3D AATAATAATC ATT/--- ATAATAATTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 ATT 1 0 187533 CASAVA_Build 12 40151989 3I AACTTCAAAG ---/TAA TTGATAGGTG 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 TAA 0 1 187534 CASAVA_Build 12 40167321 1D TGCCCAATAA T/- TTTTTTTTTT 2425 het 2425 ref 29 10 11 8 T 13 12 187535 CASAVA_Build 12 40170130 1I TGACCTTAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 14 16 6 A 9 10 187536 CASAVA_Build 12 40174115 1I CACAGAAACA -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 5 6 187537 CASAVA_Build 12 40196840 1D GAATAGCAGC T/- TTTTTTTTTT 2640 het 2640 ref 31 11 8 12 T 13 12 187538 CASAVA_Build 12 40214355 1I TCTTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 10 11 187539 CASAVA_Build 12 40227238 1I GAGAAGGGGG -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 A 6 7 187540 CASAVA_Build 12 40232583 1D TAATATTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 33 0 20 13 A 12 11 187541 CASAVA_Build 12 40233597 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2833 hom 28 9 12 7 A 14 13 187542 CASAVA_Build 12 40233950 1D AACGTTACCT A/- AATATACTGA 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 A 3 2 187543 CASAVA_Build 12 40238656 1D TGACACTTCC A/- AAATCCTTAG 3070 het 3070 hom 41 15 26 0 A 4 3 187544 CASAVA_Build 12 40245518 1D AAAAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 1722 het 1722 ref 22 16 4 2 A 12 11 187545 CASAVA_Build 12 40245589 1D TTGTTGTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 10 9 187546 CASAVA_Build 12 40247674 3I ATAAGAGTCC ---/TTT TTTTTTTTTT 1591 het 1591 ref 31 10 10 11 T 15 18 187547 CASAVA_Build 12 40274322 1I TTCTTGTGGA -/T TTTTTATGTA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 5 6 187548 CASAVA_Build 12 40274453 1D GAACAGAAAT A/- AAAAGTCATC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 5 4 187549 CASAVA_Build 12 40275625 14D ATAGCATTCC ACCCCGGCCCAAAA/-------------- ACTCATATCC 3070 het 3070 ref 33 21 15 4 ACCCCGGCCCAAAA 1 0 187550 CASAVA_Build 12 40276333 1D CTGGGTCAGG A/- ATTCAGAGAG 3070 het 3070 ref 46 21 18 9 A 2 1 187551 CASAVA_Build 12 40277843 6D GATTTTTTTC ACTAAT/------ ACTAATTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 ACTAAT 2 1 187552 CASAVA_Build 12 40278839 1D CAGTCGCTTC A/- CATGAAAGAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 5 A 1 0 187553 CASAVA_Build 12 40281502 21I CGGAGCTCAG ---------------------/GTGGTAATGCGGTGATGGAGA GTGGCTGTAA 2926 het 2926 ref 34 15 9 10 GTGGTAATGCGGTGATGGAGA 0 1 187554 CASAVA_Build 12 40281774 15D AGTTGGGGTA ATTGCAGTGCTTACC/--------------- ATTGCAGTGC 3070 het 3070 hom 43 19 19 11 ATTGCAGTGCTTACC 2 1 187555 CASAVA_Build 12 40283755 1I AATGATAGTC -/T TAATAACCTG 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 1 2 187556 CASAVA_Build 12 40291148 1I ATTTAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2529 hom 35 11 12 12 A 13 14 187557 CASAVA_Build 12 40297963 1I ACACTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2314 hom 27 7 11 9 T 11 12 187558 CASAVA_Build 12 40298685 1I TTATCCTTAT -/G CATGTGTGTT 3070 het 3070 hom 63 28 28 7 G 0 1 187559 CASAVA_Build 12 40305976 3I CCAATCTTTG ---/ATT ATCATTATCT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 ATT 0 1 187560 CASAVA_Build 12 40310024 2D TTTTATTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 10 10 T 13 11 187561 CASAVA_Build 12 40311107 1I TGAGTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 11 12 187562 CASAVA_Build 12 40313711 1D AAAAGAGAAA G/- GTATCTCAAT 3070 het 3070 ref 35 17 11 9 G 2 1 187563 CASAVA_Build 12 40325930 4D AAGAAAGAAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 1647 het 1647 ref 19 10 4 5 GAAA 6 5 187564 CASAVA_Build 12 40343177 1D TTGCTAAAGT G/- TAACATGGAA 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 G 1 0 187565 CASAVA_Build 12 40346373 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2019 het 19 hom 8 1 5 2 T 14 13 187566 CASAVA_Build 12 40358659 1D CTGGCCTCAT C/- CATCACTTGA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 C 2 1 187567 CASAVA_Build 12 40359661 5I TTCATCATTT -----/AAGTA AAGAGTATGT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 AAGTA 0 1 187568 CASAVA_Build 12 40363709 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 8 9 187569 CASAVA_Build 12 40364148 2I ATTCAGCAAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 TG 5 6 187570 CASAVA_Build 12 40369277 1D TTAAATATGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 T 10 9 187571 CASAVA_Build 12 40370863 6I TATATATATA ------/TATAAT GGATATACTG 2329 het 2329 ref 32 20 6 6 TATAAT 0 1 187572 CASAVA_Build 12 40423777 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 2943 hom 18 het 7 0 7 0 T 5 4 187573 CASAVA_Build 12 40433000 1D GTCTGTCTTG T/- TTTTATAATG 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 T 5 4 187574 CASAVA_Build 12 40436499 5D CATAAAATCA AAAAC/----- AAGTTAGTTA 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 AAAAC 1 0 187575 CASAVA_Build 12 40442086 1I ATCGGAAAGG -/A AAAAATTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 5 6 187576 CASAVA_Build 12 40443507 1I AACTAAAGAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 A 8 9 187577 CASAVA_Build 12 40448991 3I CTTTGACCAG ---/ATA ATAAGTTAAA 3070 hom 116 het 41 0 36 5 ATA 1 2 187578 CASAVA_Build 12 40459758 2D GTTTGGAAAC TG/-- TAGGTTTAAG 3070 het 3070 ref 45 23 17 6 TG 1 0 187579 CASAVA_Build 12 40462023 1I GTCTCCTATT -/A AAATTTCAAG 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 3 4 187580 CASAVA_Build 12 40463583 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 9 10 187581 CASAVA_Build 12 40465186 1D TTATTTAGTG A/- TTAATATAGA 3070 hom 171 het 64 0 56 8 A 1 0 187582 CASAVA_Build 12 40465560 1I AATGCTGCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 35 1 28 6 T 9 10 187583 CASAVA_Build 12 40466638 4I TACTTTGCTG ----/TGTT TGTTTGTCTG 2699 het 1102 hom 19 3 9 7 TGTT 1 2 187584 CASAVA_Build 12 40468233 2D GCATAAAAAT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 A 10 8 187585 CASAVA_Build 12 40478522 1I TTGTGATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 10 11 187586 CASAVA_Build 12 40480642 3D ATTCAATCTA TTC/--- TTCTTTTTGC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 TTC 2 1 187587 CASAVA_Build 12 40481759 4D ATTTCCATCC CTAT/---- CTGTCAGGCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 CTAT 1 0 187588 CASAVA_Build 12 40506439 1D GCTTCTGGTA C/- CACCAAAATG 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 C 2 1 187589 CASAVA_Build 12 40507831 1I TCTCCCCATA -/G GGTAATACTG 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 G 2 3 187590 CASAVA_Build 12 40512163 1I CTCCACACTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 8 9 187591 CASAVA_Build 12 40514607 1D CCTCCTAAAG A/- AAAAAAACGC 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 A 8 7 187592 CASAVA_Build 12 40521322 1D GTGTGGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 129 het 51 0 43 9 T 11 10 187593 CASAVA_Build 12 40525814 1D CTGTATTTTT C/- CCCCACAGAA 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 C 5 4 187594 CASAVA_Build 12 40533623 1I GAGCTTGTTT -/C CCCTCTAGTG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 C 3 4 187595 CASAVA_Build 12 40539796 1D TACAGGGTTG T/- TGTGACAAAT 3070 het 3070 ref 39 26 13 0 T 2 1 187596 CASAVA_Build 12 40548504 1D CTATCATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 A 10 9 187597 CASAVA_Build 12 40549947 1D AATGGACAAA G/- GGGCTGGGTG 3070 het 3070 ref 27 10 11 6 G 4 3 187598 CASAVA_Build 12 40550698 1D CTGCAGGAGG T/- TTTTTTTTTT 2599 het 27 hom 17 1 8 8 T 15 14 187599 CASAVA_Build 12 40553582 1I ACATCTCTAT -/G TACATAAACT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 0 1 187600 CASAVA_Build 12 40559476 1D GGGGGAACTG C/- CCCCATGATC 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 C 5 4 187601 CASAVA_Build 12 40576040 11I AACTTCCTAA -----------/AATCAAACGAG AAGAAATACA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 AATCAAACGAG 0 1 187602 CASAVA_Build 12 40577711 1D ATAAAAGGAC A/- AAAAACCTAA 3070 het 3070 hom 27 7 19 1 A 6 5 187603 CASAVA_Build 12 40585609 2I CCGTATGACA --/AT AGGAAATCTG 3070 het 3070 hom 54 21 29 4 AT 0 1 187604 CASAVA_Build 12 40586452 2D CTCAAAATCC AA/-- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 31 18 10 6 A 9 7 187605 CASAVA_Build 12 40597953 1D CAACATAGTC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 T 8 7 187606 CASAVA_Build 12 40600014 1I32M3D AAAGAAACGG -AATCTGTTTCTATGGCCAGGACTGCCTGTATCTCT/AAATCTGTTTCTATGGCCAGGACTGCCTGTATC--- TCTTCCTGGT 3070 het 3070 ref 34 20 14 9 N/A 0 0 187607 CASAVA_Build 12 40602865 4I AGTTAAGAGA ----/CTGT CTGTCCATAA 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 CTGT 1 2 187608 CASAVA_Build 12 40606488 1D TGAAATCAAT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 A 8 7 187609 CASAVA_Build 12 40607271 13I AACAGAACAA -------------/TTATGTACACATT TTATGTAGCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTATGTACACATT 0 1 187610 CASAVA_Build 12 40607899 3I AGACAAATAT ---/AAC AACAATAAAA 3070 het 3070 ref 49 22 22 5 AAC 1 2 187611 CASAVA_Build 12 40611498 2I CCAAAAATAC --/AT GTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 47 18 27 2 AT 0 1 187612 CASAVA_Build 12 40613287 1I TTTATTTTTG -/T TTTTTTGTAA 3070 het 1282 hom 12 3 9 0 T 6 7 187613 CASAVA_Build 12 40615435 1D AGCTTCTATA C/- AGGGAAATTT 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 C 1 0 187614 CASAVA_Build 12 40616404 3I GTGTTGCTTG ---/TGA TGATGATGAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TGA 3 4 187615 CASAVA_Build 12 40634048 1I AAAGCATTTT -/A AAAATCATTT 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 A 4 5 187616 CASAVA_Build 12 40636644 1I AAAGTGTTCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 A 8 9 187617 CASAVA_Build 12 40640205 7D TAATAATAAT AAAAATA/------- AAAAATAAAA 3070 het 2921 hom 18 7 8 3 AAAAATA 3 2 187618 CASAVA_Build 12 40647669 2D GAGACTTTCC TG/-- TGTATAAGTT 3070 hom 120 het 45 0 40 6 TG 2 1 187619 CASAVA_Build 12 40679504 5I GGAATAACTC -----/AAAAT AAATTAGGCA 3070 het 3070 hom 35 9 16 10 AAAAT 0 1 187620 CASAVA_Build 12 40679800 1I CACAGAAAAC -/A AAGGAACTTC 3070 hom 105 het 45 0 35 10 A 2 3 187621 CASAVA_Build 12 40680969 14D TATAACTAAT ATATACTAATATAA/-------------- CAGAGGTTCT 3070 hom 108 het 38 0 36 3 ATATACTAATATAA 1 0 187622 CASAVA_Build 12 40690675 1D ATGAGAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 4 A 11 10 187623 CASAVA_Build 12 40694774 1D TAACAGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1961 hom 34 5 24 5 A 12 11 187624 CASAVA_Build 12 40705170 1D TTATGACCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 104 het 42 0 35 7 A 10 9 187625 CASAVA_Build 12 40708591 2D ATGCCCTCCC CT/-- GACATGTGGG 3070 het 3070 ref 40 23 14 5 CT 1 0 187626 CASAVA_Build 12 40721161 1D TGGACTCAGA T/- TTTGCCTCCA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 4 3 187627 CASAVA_Build 12 40723247 3I TAATAAATTT ---/TAA TAATAATATG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TAA 2 3 187628 CASAVA_Build 12 40732614 1I CTTCCCCCCT -/G CTCGCTCTCT 3070 hom 95 het 39 0 31 8 G 0 1 187629 CASAVA_Build 12 40739913 1I TGGCCATGAT -/C CAATCCATTA 3070 hom 71 het 34 0 27 7 C 1 2 187630 CASAVA_Build 12 40741508 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 23 8 11 4 A 11 12 187631 CASAVA_Build 12 40755873 3D AAAATAAAAG TCT/--- TCTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 12 10 4 TCT 2 1 187632 CASAVA_Build 12 40760657 2I TTTAGTACAC --/AT GATTCTCATC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AT 0 1 187633 CASAVA_Build 12 40764532 1I AGAAAACAAC -/A GAACAAAACA 3070 het 3070 hom 49 23 21 5 A 0 1 187634 CASAVA_Build 12 40770184 1I TCTTCACTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 578 hom 35 3 26 6 A 9 10 187635 CASAVA_Build 12 40775079 1I AGAAAATTCA -/C CCCCCAAAAA 3070 het 2207 hom 21 8 12 1 C 5 6 187636 CASAVA_Build 12 40775788 1D AATATCCCCC T/- ATCAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 1 0 187637 CASAVA_Build 12 40778526 2I CTATTAGTCT --/CA GATTTATTTG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CA 0 1 187638 CASAVA_Build 12 40784324 1I GAGAAGTCAC -/T ATTTTTTTTT 3070 het 929 hom 29 4 21 4 T 0 1 187639 CASAVA_Build 12 40789772 1I TAAAACAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 0 1 187640 CASAVA_Build 12 40801726 1D TTTCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 A 13 12 187641 CASAVA_Build 12 40807429 1I TGCTTTTTTT -/A AAATGTAATA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 3 4 187642 CASAVA_Build 12 40814175 3D AGGCTGAGTT AGG/--- AGGATAGTTT 3070 het 1867 hom 21 5 11 6 AGG 2 1 187643 CASAVA_Build 12 40818616 1I AAGGGAGGGG -/A AAAAAAACTG 3070 hom 54 het 29 0 18 11 A 7 8 187644 CASAVA_Build 12 40820639 4I AAGGTCAACA ----/CAGT CAGTAAGTGG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 CAGT 1 2 187645 CASAVA_Build 12 40837132 1D CTCAATCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 44 0 33 11 T 12 11 187646 CASAVA_Build 12 40841111 2D ACCAAAAAAC TG/-- TGACAGCCTA 3070 hom 113 het 52 0 39 13 TG 2 1 187647 CASAVA_Build 12 40855604 1D ATTATACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1187 hom 32 3 23 6 A 12 11 187648 CASAVA_Build 12 40887539 3D GATAAATTAT TAA/--- TAATATTATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TAA 2 1 187649 CASAVA_Build 12 40893132 1I GTCATTAAGA -/G GCCAGGCACG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 1 2 187650 CASAVA_Build 12 40916637 2I AATTCTGTAA --/AC AGTGTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AC 0 1 187651 CASAVA_Build 12 40921432 1I TGTTTCTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 426 hom 34 1 26 7 A 9 10 187652 CASAVA_Build 12 40924267 3D TCTCAAGTAG TCT/--- TCTCTCTGTG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 TCT 2 1 187653 CASAVA_Build 12 40940241 4I AGAAAGGAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 76 het 31 0 25 6 AAAG 3 4 187654 CASAVA_Build 12 40949106 3I ACCTCATCCC ---/TTT TTACCATGCC 3070 hom 93 het 38 0 30 8 T 2 5 187655 CASAVA_Build 12 40949299 1D CTAATACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 A 11 10 187656 CASAVA_Build 12 40949977 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 9 10 187657 CASAVA_Build 12 40958896 1I AATGTGGCAC -/A TATACACCAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 0 1 187658 CASAVA_Build 12 40960747 1I ATAAAAAAAA -/T AATTTATGTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 0 1 187659 CASAVA_Build 12 40962963 4D ATTAATTAAA AGAT/---- AGAAATTCAA 3070 hom 81 het 28 0 27 2 AGAT 1 0 187660 CASAVA_Build 12 40969826 1D TTCTTTCTTT A/- AAAAAAAAAT 1343 het 1343 ref 34 29 3 3 A 10 9 187661 CASAVA_Build 12 40970349 1D GTTCTGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 25 0 16 9 A 14 13 187662 CASAVA_Build 12 40982734 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 8 7 187663 CASAVA_Build 12 40983366 1I TGTCTGACCA -/C CCCCAGCAGA 3070 hom 71 het 30 0 23 7 C 4 5 187664 CASAVA_Build 12 41003512 1D GTCTTTATTC A/- AAAGTCACCT 3070 hom 135 het 47 0 46 1 A 4 3 187665 CASAVA_Build 12 41015484 4D TATTTAACAT AGAG/---- AGAGTAGATA 3070 het 3070 hom 36 13 21 3 AG 4 2 187666 CASAVA_Build 12 41019440 1I CTCAGGTGCA -/T TTTTTTTTTT 1361 het 1361 ref 34 26 3 5 T 10 11 187667 CASAVA_Build 12 41019935 3I ACAGATACAT ---/CTA CTGCTGTTGT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 CTA 0 1 187668 CASAVA_Build 12 41029462 5I TATTTTGTAA -----/GTTTT GTTTTGTTTT 3070 hom 65 het 27 0 21 6 GTTTT 3 4 187669 CASAVA_Build 12 41054510 1I AGAGTACAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 29 0 21 8 T 9 10 187670 CASAVA_Build 12 41057866 1D ATTAGTCTTA T/- TTTTTATCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 6 5 187671 CASAVA_Build 12 41097781 1D GATTTTATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 85 het 38 0 34 4 A 10 9 187672 CASAVA_Build 12 41099468 8I CCACCACCAC --------/ACCTGGCT ACCTTTTATA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ACCTGGCT 0 1 187673 CASAVA_Build 12 41128428 2D ATCTATTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2599 het 1141 hom 45 8 8 29 T 18 16 187674 CASAVA_Build 12 41139326 1D ATGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 46 3 36 7 T 11 10 187675 CASAVA_Build 12 41153901 1D GAAGGATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 801 hom 30 2 14 14 A 15 14 187676 CASAVA_Build 12 41178195 1I TGGGATTATA -/G GTGTGAGCCT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 G 1 2 187677 CASAVA_Build 12 41190654 1I AAAGCATAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 9 10 187678 CASAVA_Build 12 41206313 1D ATCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 10 9 187679 CASAVA_Build 12 41210024 3I CTTCCTTCCT ---/TCC TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 25 0 21 4 TCC 0 1 187680 CASAVA_Build 12 41211206 1I AGCTCCGCCT -/C CCCAGGTTCA 1818 hom 17 het 8 0 6 2 C 3 4 187681 CASAVA_Build 12 41222074 1D AGAACTCACT C/- CGAACATAGT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 C 2 1 187682 CASAVA_Build 12 41224137 3D AAGAAGGAAG AGA/--- AGAAGGGGCT 3070 hom 95 het 37 0 30 9 AGA 2 1 187683 CASAVA_Build 12 41225057 1D CCACGCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 22 2 14 6 T 15 14 187684 CASAVA_Build 12 41229047 2I AAAATTAGCT --/GA GTGTGATAGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 GA 0 1 187685 CASAVA_Build 12 41232129 14D AGAAAGTTAC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 2520 het 1226 hom 21 7 6 8 T 24 10 187686 CASAVA_Build 12 41240277 14D GAGATCTTGG CTCACTGCAACCTC/-------------- CATCTCTCAG 1625 het 1286 hom 5 4 4 1 CTCACTGCAACCTC 1 0 187687 CASAVA_Build 12 41258708 1I AGCTGGGGGG -/A AAAAACCCAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 5 6 187688 CASAVA_Build 12 41264610 1D ATTAGACTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 50 9 30 11 T 10 9 187689 CASAVA_Build 12 41284568 1D AGAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 34 1 31 3 A 11 10 187690 CASAVA_Build 12 41288607 3I AGGCAGAGAG ---/GGA GGAGTTCTGC 3070 hom 109 het 44 0 34 10 GGA 1 2 187691 CASAVA_Build 12 41291486 4I CAATTAGAAC ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 33 0 22 11 T 11 15 187692 CASAVA_Build 12 41293231 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 12 11 187693 CASAVA_Build 12 41294169 1D ATCACTCCAC A/- AAAGGCAGGC 3070 het 3070 hom 47 17 23 8 A 4 3 187694 CASAVA_Build 12 41296041 4I CCTGTTAGAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 AAAC 4 5 187695 CASAVA_Build 12 41296261 1D ACAAAACGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 10 9 187696 CASAVA_Build 12 41299623 12D TATTATCAGA TTATTTATTTAT/------------ TTATTTATTT 3070 hom 57 het 20 0 20 2 TTAT 9 6 187697 CASAVA_Build 12 41304469 3I AGAACAGAGA ---/GTT GTGGAAAACC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 GTT 0 1 187698 CASAVA_Build 12 41308722 1I49M1D TAGATAAAGC -AAAATGTATCTGGTATTTACTATATATCATGCACTCCAAAGCCAAACTCT/AAAAATGTATCTGGTATTTACTATATATCATGCACTCCAAAGCCAAACTC- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 34 16 18 N/A 0 0 187699 CASAVA_Build 12 41309851 3D ATTGGCTGAC CTA/--- CTACGTTTGA 3070 hom 138 het 48 0 46 4 CTA 2 1 187700 CASAVA_Build 12 41311682 1D GTCTACAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 16 9 A 13 12 187701 CASAVA_Build 12 41318186 1D CTGGTTGCCA T/- TTGACAGTAG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 3 2 187702 CASAVA_Build 12 41319469 1D GTTTGTGTAA T/- TAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 46 23 16 8 T 2 1 187703 CASAVA_Build 12 41328131 1D CTAGAAAATG T/- TTTCTGCTTT 3070 het 3070 ref 33 14 11 10 T 4 3 187704 CASAVA_Build 12 41328539 1I AATGAACAAT -/A AACAAGTTCA 3070 het 3070 hom 53 23 25 5 A 2 3 187705 CASAVA_Build 12 41333069 1I TCTGGTGATT -/A AAAAAAAAAA 2176 het 2098 hom 20 7 6 7 A 11 12 187706 CASAVA_Build 12 41342436 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1452 het 1452 ref 23 8 7 8 T 15 16 187707 CASAVA_Build 12 41351098 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AC 7 8 187708 CASAVA_Build 12 41353447 1D TGGGAAGTCC T/- TGGAATGTGA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 2 1 187709 CASAVA_Build 12 41377420 1D GAGACATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 42 0 34 8 A 11 10 187710 CASAVA_Build 12 41399337 1I TGCAGAAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 436 hom 40 2 35 3 T 9 10 187711 CASAVA_Build 12 41407074 2D CATATAATTT TC/-- TGTTTGCCTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TC 1 0 187712 CASAVA_Build 12 41421169 1D GCAATGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 35 1 31 3 A 13 12 187713 CASAVA_Build 12 41423110 1I ATGAATAAAA -/T TGCACAATGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 2 187714 CASAVA_Build 12 41427964 2D CCCCATTAAA TG/-- TGTGTGTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 TG 4 3 187715 CASAVA_Build 12 41432024 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2890 het 217 hom 15 1 10 4 A 12 14 187716 CASAVA_Build 12 41438202 1I GTAAAAGGTA -/T TAGTGTCCTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 1 2 187717 CASAVA_Build 12 41439403 1I GATACAAGGC -/A GGCAAGGTTT 3070 het 3070 ref 55 25 25 5 A 0 1 187718 CASAVA_Build 12 41441430 2D GGAAAAGAGA AG/-- AGAGGGAAGC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AG 3 2 187719 CASAVA_Build 12 41453323 1I GACATGGGGA -/T TTTTTTTTTT 1303 het 1303 ref 37 27 3 7 T 10 11 187720 CASAVA_Build 12 41455056 1I ATTTGTTTGC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 7 8 187721 CASAVA_Build 12 41463381 3I GGGCATGGAT ---/AGG AAGAAGTCAG 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 AGG 0 1 187722 CASAVA_Build 12 41493211 1D AGTGTGTGTT C/- CCAGGATAAG 3070 hom 138 het 54 0 47 7 C 3 2 187723 CASAVA_Build 12 41496105 2I TGTTTGCTGC --/TG TGTGTTGCTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 TG 2 3 187724 CASAVA_Build 12 41498336 1I AGCCTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 14 20 17 T 13 14 187725 CASAVA_Build 12 41498811 2D AATGGACCGT CC/-- CCCCCCCCCC 2265 hom 6 het 17 0 8 9 C 13 11 187726 CASAVA_Build 12 41498874 1D GACATCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 18 0 13 6 T 12 11 187727 CASAVA_Build 12 41500632 1D AGGTTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 41 1 22 18 A 13 12 187728 CASAVA_Build 12 41504496 1I TGATTAACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 9 10 187729 CASAVA_Build 12 41510198 1D TAACAGTGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 10 9 187730 CASAVA_Build 12 41522152 2I ATATTAAGTC --/TT ATTTCTTTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 0 2 187731 CASAVA_Build 12 41529446 1D CTAATTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 958 hom 34 4 19 11 T 14 13 187732 CASAVA_Build 12 41539236 1I AAGGGAGCCA -/T TTTTTCCAGG 3070 het 3070 hom 56 23 29 4 T 5 6 187733 CASAVA_Build 12 41539693 1D TTTTGTGGTG C/- CTCGGATAGT 3070 het 3070 hom 26 10 12 6 C 2 1 187734 CASAVA_Build 12 41542691 3D ACAGTATTGC CTT/--- CTTCTTTTGC 3070 hom 102 het 36 0 35 2 CTT 3 2 187735 CASAVA_Build 12 41549946 1I GAATTTTTTT -/A AAAAAATAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 6 7 187736 CASAVA_Build 12 41550245 1I TTATTGGTGT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 A 7 8 187737 CASAVA_Build 12 41551420 2D CTAGATCTGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 11 9 187738 CASAVA_Build 12 41551734 1D GTTGGGATAG T/- TTTAATTTTA 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 T 4 3 187739 CASAVA_Build 12 41554396 3I GAAAAATGTA ---/TCT TCTTGTTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TCT 1 2 187740 CASAVA_Build 12 41554840 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTGA 1377 het 486 hom 10 3 3 4 T 9 8 187741 CASAVA_Build 12 41556000 8D ACATGTGCCA TGCTGGTG/-------- TGCTGCACCC 1711 het 68 hom 6 1 4 1 TGCTGGTG 1 0 187742 CASAVA_Build 12 41558726 1I GAGAATACCT -/A AATACAATAC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 2 3 187743 CASAVA_Build 12 41580991 1D TCATGACATC T/- TTTAAAAAGC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 4 3 187744 CASAVA_Build 12 41591758 1I CCATGGGACA -/G GGGGTTTGTG 2684 het 2684 ref 31 17 8 6 G 4 5 187745 CASAVA_Build 12 41606846 1D GGAGAGAAAC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 A 8 7 187746 CASAVA_Build 12 41612762 1D ATATATATAT A/- ATGTATATAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 2 1 187747 CASAVA_Build 12 41612999 1D TTCTACGTGG A/- AAAAAAGTTG 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 7 6 187748 CASAVA_Build 12 41618405 3D CCACAACAAC AAA/--- AAAAGAGCTA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 7 4 187749 CASAVA_Build 12 41625790 1I AAATGGGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 10 11 187750 CASAVA_Build 12 41627715 1D TGTAAGTTCT G/- GTAAAGGAAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 G 2 1 187751 CASAVA_Build 12 41643442 1D AACATTATAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 8 187752 CASAVA_Build 12 41646636 1I GGAATACAAC -/A AGCAGAGCAG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 1 2 187753 CASAVA_Build 12 41656994 1I TTTTCCCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 T 11 12 187754 CASAVA_Build 12 41665486 3D TCTATTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 30 1 19 10 T 18 15 187755 CASAVA_Build 12 41666062 1I AAAATTTTCA -/T TTTAGAAAGA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 3 4 187756 CASAVA_Build 12 41677842 1D TTTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 32 4 17 11 T 15 14 187757 CASAVA_Build 12 41704425 4I TTCTTTATTT ----/ATTC ATTCATTCAA 3070 het 3070 hom 48 13 28 7 ATTC 2 3 187758 CASAVA_Build 12 41708093 1D AGTCAATGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 10 9 187759 CASAVA_Build 12 41725945 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 8 9 187760 CASAVA_Build 12 41748382 1D TTGTTTTACT A/- AAACAGCTGG 3070 hom 135 het 51 0 45 7 A 4 3 187761 CASAVA_Build 12 41792039 1I TTTGAATGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 8 9 187762 CASAVA_Build 12 41832448 1D ATATTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 2017 het 1628 hom 29 10 6 13 T 17 16 187763 CASAVA_Build 12 41864013 1D CACACAAAGT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 42 0 35 9 A 9 8 187764 CASAVA_Build 12 41874097 3D TTCCTAAGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 498 hom 31 5 19 7 T 15 12 187765 CASAVA_Build 12 41875028 4D GGGTTCATAT ATAA/---- ATATTTCATA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ATAA 1 0 187766 CASAVA_Build 12 41879377 1D TATCCATATA T/- TTTTTAGTAG 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 6 5 187767 CASAVA_Build 12 41879929 1D TTGTGGAAGA T/- TAACAAATAC 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 2 1 187768 CASAVA_Build 12 41884991 1D TAGAGAAGAT A/- AAATGGAATA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 4 3 187769 CASAVA_Build 12 41888445 1D TGAGTTCACA C/- ATGGTACTCA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 C 1 0 187770 CASAVA_Build 12 41897295 1I TCTGCTATCC -/A AGAATAAGCT 3070 hom 99 het 44 0 34 10 A 1 2 187771 CASAVA_Build 12 41898619 1D GTATTTATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 T 10 9 187772 CASAVA_Build 12 41905904 2I ACATCAGATT --/CA CAGTCTTCTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 CA 1 2 187773 CASAVA_Build 12 41907065 1D TCCTAGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 9 187774 CASAVA_Build 12 41916171 1D10M4I TAACTGTTGC TTCTTCTTTGC----/-TCTTCTTTGCCTCT CTCTCCTTTT 3070 hom 105 het 36 0 36 6 N/A 0 0 187775 CASAVA_Build 12 41918279 1I AAAGTGGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 45 0 36 9 A 9 10 187776 CASAVA_Build 12 41920330 1I TGGTGTTCTT -/C CTGCAACAAT 3070 hom 132 het 46 0 43 3 C 1 2 187777 CASAVA_Build 12 41924185 1D CTTTGCTTTC T/- TTTTTACTTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 6 5 187778 CASAVA_Build 12 41932851 1I TGCTATTTAA -/G CAAAAAAAAA 3070 het 571 hom 26 4 18 4 G 0 1 187779 CASAVA_Build 12 41940673 1I GCTTAATGTT -/A TTCATCCCAT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 A 0 1 187780 CASAVA_Build 12 41942721 1I ACTAAAAAAA -/T AATTGATCAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 0 1 187781 CASAVA_Build 12 41944672 1I TTCAGAAATC -/A ATCTTAAAGG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 1 2 187782 CASAVA_Build 12 41945505 1I AAACAATTGT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 57 hom 45 1 39 5 A 7 8 187783 CASAVA_Build 12 41946688 2D CTTGGGTGAC AG/-- AAGCAGATGA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 AG 1 0 187784 CASAVA_Build 12 41969858 1I AAAGGGAAGG -/A AGCACAACTG 3070 hom 120 het 49 0 39 10 A 1 2 187785 CASAVA_Build 12 41996588 1I TAGAGGTAGA -/T TTTTTTCTGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 187786 CASAVA_Build 12 42012531 1D CAAGTATTTA T/- TCATTTACTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 1 187787 CASAVA_Build 12 42015153 2D ATGCAATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 A 12 10 187788 CASAVA_Build 12 42015706 4I TACAAGCTAT ----/GTTA GTTAGTTATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GTTA 2 3 187789 CASAVA_Build 12 42016184 1I GTTCAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 36 2 28 6 A 10 11 187790 CASAVA_Build 12 42020029 4D AAGATGAGAA AATT/---- AATACAGTCT 3070 hom 120 het 44 0 41 7 AATT 1 0 187791 CASAVA_Build 12 42023342 1I CCTTTCAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 9 187792 CASAVA_Build 12 42029741 1D ATAGCTGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 10 9 187793 CASAVA_Build 12 42032732 1D ACTCCGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 233 hom 19 3 11 6 A 17 16 187794 CASAVA_Build 12 42034609 17I AATATTATAT -----------------/ACCATACTATAATTTAG ACAATTTAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 ACCATACTATAATTTAG 0 1 187795 CASAVA_Build 12 42034794 1I GTACAAATGA -/T TTTTAAAGGC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 4 5 187796 CASAVA_Build 12 42039024 4I AATAAGTGTG ----/TTAA TTAATTCCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTAA 1 2 187797 CASAVA_Build 12 42040158 1I CAGAACATAT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 7 8 187798 CASAVA_Build 12 42054816 2D TTACTTTAAA CT/-- CTGCAAAAAG 3070 hom 81 het 33 0 27 7 CT 2 1 187799 CASAVA_Build 12 42060057 1I CAGACATCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 35 0 25 10 A 11 12 187800 CASAVA_Build 12 42062898 1D TGGCTTAGAT A/- AAAAAACAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 7 6 187801 CASAVA_Build 12 42081812 2I ATTTTTATGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 26 1 21 4 T 10 12 187802 CASAVA_Build 12 42114606 1I GAGGAATGAC -/T TTTTATAATA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 4 5 187803 CASAVA_Build 12 42115118 1I AGATGAAGCA -/C AAGAGATTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 0 1 187804 CASAVA_Build 12 42116567 3I TTAAAATATG ---/ATC ATTTGAACAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 ATC 0 1 187805 CASAVA_Build 12 42121149 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2984 hom 58 het 23 0 18 5 A 10 11 187806 CASAVA_Build 12 42157140 1D AAAAAAAAAA C/- AATTACCTTA 3070 het 836 hom 26 5 16 5 C 1 0 187807 CASAVA_Build 12 42180105 1D TCCTTATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 12 11 187808 CASAVA_Build 12 42181126 4D TATGTAATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 18 9 T 20 16 187809 CASAVA_Build 12 42181546 10D CGCGCGCGCG CGCGCGCACA/---------- CACACACACA 3070 hom 94 het 35 0 32 6 CGCGCGCACA 1 0 187810 CASAVA_Build 12 42183215 1D GCCCTAATGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 187811 CASAVA_Build 12 42188678 6D TAAAATTTTT TTATTA/------ TTAAAAAATA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 TTA 3 1 187812 CASAVA_Build 12 42204633 3I TTAGTTACTC ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 AAG 3 4 187813 CASAVA_Build 12 42220710 1D TAGCAGACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 103 het 37 0 35 2 A 10 9 187814 CASAVA_Build 12 42222586 1D CAATCTATTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 8 187815 CASAVA_Build 12 42227772 1D TGATGCAGCA G/- GACTTTGTAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 2 1 187816 CASAVA_Build 12 42229269 5I TGTATAATAC -----/ATTAA ATTATCCACA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATTAA 0 1 187817 CASAVA_Build 12 42240244 1D GTTACACCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 10 9 187818 CASAVA_Build 12 42250880 1I TACTATTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 28 1 24 3 A 10 11 187819 CASAVA_Build 12 42258809 1D GCCCACAATA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 63 het 25 0 21 5 T 9 8 187820 CASAVA_Build 12 42259487 1I GGTAAGAAAA -/C AAAACATTCT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 C 0 1 187821 CASAVA_Build 12 42263099 17I GACACAGGGA -----------------/GGGGATCATCACATGCC GGGGCCTGTT 1598 hom 13 het 8 0 4 4 GGGGATCATCACATGCC 0 1 187822 CASAVA_Build 12 42273570 9I TGGTATGGAA ---------/TTGTTATTT TTGTTATTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TTGTTATTT 1 2 187823 CASAVA_Build 12 42276172 1I TGTTGATACA -/T TTATTCACAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 2 3 187824 CASAVA_Build 12 42277245 1D TTGCCCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 32 0 18 15 T 14 13 187825 CASAVA_Build 12 42293173 2I ATCATTTACT --/TG TAAGAGTTCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TG 0 1 187826 CASAVA_Build 12 42296510 1D CTGCTCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 34 0 20 15 T 13 12 187827 CASAVA_Build 12 42298975 1I TTCTAAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 4 T 10 11 187828 CASAVA_Build 12 42306269 1I AATGCCTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 T 9 10 187829 CASAVA_Build 12 42313559 1D AAACAAGACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 T 10 9 187830 CASAVA_Build 12 42319880 1I TTAAGTCCTA -/T TTAGGGTATT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 2 3 187831 CASAVA_Build 12 42339022 2I CTGGGAAAAC --/TG TTAAACACAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TG 0 1 187832 CASAVA_Build 12 42349074 8I GATATCTGTG --------/TGTGTATA TGTGTATATG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TGTGTATA 1 2 187833 CASAVA_Build 12 42356430 6D TCTGACATTA GTGTAC/------ GTGTACGACA 3070 het 3070 ref 42 18 15 11 GTGTAC 2 1 187834 CASAVA_Build 12 42412530 1I AATAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 12 13 187835 CASAVA_Build 12 42447706 1D TTTCAGTACG T/- TTTTTTTTTT 1669 het 1669 ref 41 26 5 12 T 12 11 187836 CASAVA_Build 12 42532501 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAACAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 9 5 187837 CASAVA_Build 12 42537569 2I CATATACATG --/GT GTGCAGAGGG 3070 hom 101 het 37 0 33 4 GT 1 2 187838 CASAVA_Build 12 42539579 1D76M1D CTATTGTGGG AAAAAAAACAGAATATATGAAGTCAAAGAAGAAAAATTTTTTGATCAAAAAGATGACGAGATCAAAACAGTATCATAG/-AAAAAAACAGAATATATGAAGTCAAAGAAGAAAAATTTTTTGATCAAAAAGATGACGAGATCAAAACAGTATCGTA- GAAAATGCAT 3070 het 3070 hom 25 14 29 9 N/A 0 0 187839 CASAVA_Build 12 42543056 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 A 7 8 187840 CASAVA_Build 12 42548176 4I ATACACACAC ----/ACAG ACACACAGAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 ACAG 0 1 187841 CASAVA_Build 12 42548962 4D CAATAGAGAA AATT/---- AATAAATCCA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AATT 1 0 187842 CASAVA_Build 12 42552441 2D AAAAGGCGTC TG/-- TACCTCTAAC 3070 hom 96 het 34 0 32 4 TG 1 0 187843 CASAVA_Build 12 42553360 3I AGGCAAACTT ---/AAC AAGTGTTGTG 3070 hom 103 het 38 0 35 3 AAC 0 1 187844 CASAVA_Build 12 42554497 1I CTAAAAGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 20 1 15 4 A 14 15 187845 CASAVA_Build 12 42558134 2D TTTTACAATG AA/-- AAAAAGTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 7 5 187846 CASAVA_Build 12 42574923 1D TTCAATGCCC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 9 8 187847 CASAVA_Build 12 42575944 22D GAATATTGTT ATTTTCTAAACAGGCTCAAAAC/---------------------- ATTCTCATAA 3070 hom 132 het 46 0 44 6 ATTTTCTAAACAGGCTCAAAAC 1 0 187848 CASAVA_Build 12 42576695 1D AATAAACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 44 0 30 14 T 11 10 187849 CASAVA_Build 12 42577383 1D GTAACCATTC T/- TTTTTTTTTT 2746 het 203 hom 30 1 11 18 T 17 16 187850 CASAVA_Build 12 42577852 2D AATTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTGC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 10 8 187851 CASAVA_Build 12 42579708 1I TAAATTTTTA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 7 8 187852 CASAVA_Build 12 42579944 7I TGTGACCTTG -------/TGCAAAC TGCTTTTCTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TGCAAAC 0 1 187853 CASAVA_Build 12 42592578 14D AATAATAATT TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 2630 hom 27 het 10 0 9 5 TA 14 7 187854 CASAVA_Build 12 42597218 1D ATTCCAACAC T/- TTTGGAGGCC 3070 hom 88 het 40 0 29 11 T 4 3 187855 CASAVA_Build 12 42605372 1D CCAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 41 1 28 12 T 13 12 187856 CASAVA_Build 12 42606841 4D TTTATCTCTG CTAT/---- CTATGTTTGT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 CTAT 2 1 187857 CASAVA_Build 12 42641352 3D AATTAAAAAC AAT/--- AAATAATTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AAT 1 0 187858 CASAVA_Build 12 42648301 8I AGAACACCTT --------/CAGTGACA CAGTGACATT 3070 hom 105 het 37 0 35 3 CAGTGACA 1 2 187859 CASAVA_Build 12 42650368 1I TTATTATTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 9 10 187860 CASAVA_Build 12 42675327 1D GCTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2776 het 2776 ref 28 16 6 6 A 15 14 187861 CASAVA_Build 12 42682468 1D TGCTACCAAA C/- TCAGAGTCCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 1 0 187862 CASAVA_Build 12 42786812 4I ACATAATCTA ----/AATT AATAATTGAT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 AATT 0 1 187863 CASAVA_Build 12 42839469 1D CTTTAAAGAC T/- TTTTTTTTTA 1321 het 1321 ref 36 29 3 5 T 10 9 187864 CASAVA_Build 12 42871033 2I TAATATATAT --/TA TATATATATA 1712 het 1712 ref 13 6 4 3 TA 6 7 187865 CASAVA_Build 12 42879249 1I TGTGAAGATG -/T TCTCATTCTG 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 T 1 2 187866 CASAVA_Build 12 42887854 1D TGCCCTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2207 hom 28 8 14 6 A 12 11 187867 CASAVA_Build 12 42915423 1D TCTGAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 T 12 11 187868 CASAVA_Build 12 42985311 1D AATTTATGAC T/- TAAGTCCCCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 1 187869 CASAVA_Build 12 43028319 1D TTTAAGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 8 20 10 A 12 11 187870 CASAVA_Build 12 43080117 1D AAGAACAAAT A/- AATGTATTGG 3070 het 3070 ref 54 26 24 4 A 3 2 187871 CASAVA_Build 12 43144551 1D TTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 A 12 11 187872 CASAVA_Build 12 43189187 1I CATGACTCTA -/C CTATTGCAGA 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 C 1 2 187873 CASAVA_Build 12 43205986 1I GTCTAGAGTG -/T TTTTTGAGGC 3070 het 3070 hom 55 25 26 4 T 5 6 187874 CASAVA_Build 12 43230465 1D GCCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 26 17 3 6 T 13 12 187875 CASAVA_Build 12 43233337 2D ATAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 1700 het 65 hom 6 1 5 0 A 13 11 187876 CASAVA_Build 12 43258482 1D GATCAAGATA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 G 2 1 187877 CASAVA_Build 12 43258680 1D AAATATAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 13 12 187878 CASAVA_Build 12 43261724 2D GTTTGTTTTG AA/-- AAGTGAAAAG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 4 2 187879 CASAVA_Build 12 43271535 7I CAACATGGAT -------/GATCCTG GAGAACATTA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 GATCCTG 0 1 187880 CASAVA_Build 12 43384402 1D TGTGTTAAAG A/- TGAATATTAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 1 0 187881 CASAVA_Build 12 43385721 3D ATAGCTCAGC ACA/--- ACATCAAACT 3070 hom 88 het 35 0 30 6 ACA 2 1 187882 CASAVA_Build 12 43400081 1D CTGCCTACAA C/- CTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 29 0 29 1 C 2 1 187883 CASAVA_Build 12 43409625 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAC AAAACCAAGA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 AAAAC 1 2 187884 CASAVA_Build 12 43433909 1I GTAAGGAATG -/T TTTTGTTAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 4 5 187885 CASAVA_Build 12 43440700 4D TAAGTGAACA AAAT/---- AATCATTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 AAAT 1 0 187886 CASAVA_Build 12 43453953 4I CTACTGTCTT ----/TCTC TCTCTCCACC 2854 het 2854 ref 20 10 8 2 TC 3 5 187887 CASAVA_Build 12 43472009 1D TATTACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 16 7 A 11 10 187888 CASAVA_Build 12 43479563 1I GTAGGTTGAG -/A AAGGGTCAAC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 2 3 187889 CASAVA_Build 12 43481993 5I AAGGAACTTC -----/TCATT TCATCACTTT 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 TCATT 0 1 187890 CASAVA_Build 12 43483286 3I TCCAGATTGA ---/AGG AGATGCTGGT 3070 het 3070 ref 60 29 24 7 AGG 0 1 187891 CASAVA_Build 12 43486165 1D TTTAGTACAT A/- AAAAAACCAT 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 7 6 187892 CASAVA_Build 12 43500670 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAAAG 3070 hom 17 het 20 0 15 5 G 0 1 187893 CASAVA_Build 12 43519183 2I ATATGATCTT --/TC TAAAATTCTA 3070 hom 129 het 45 0 43 2 TC 0 1 187894 CASAVA_Build 12 43522824 2D ATTCAATGAC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 11 9 187895 CASAVA_Build 12 43540757 3I CCACAATAAT ---/CTC CTTATTTTTA 3070 hom 98 het 39 0 33 6 CTC 0 1 187896 CASAVA_Build 12 43543571 1I TAGAAGTAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 19 het 33 1 29 3 A 9 10 187897 CASAVA_Build 12 43558779 1D CTACCACATC A/- AATCCCTTTA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 3 2 187898 CASAVA_Build 12 43563424 2I TCACACTACA --/CT CTCTCTCTGG 3070 hom 77 het 34 0 24 10 CT 4 5 187899 CASAVA_Build 12 43630678 1D GTCATCAAAG A/- AAAAAACCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 7 6 187900 CASAVA_Build 12 43679640 13I ATAAATATGC -------------/AACTGAATTGTGA ACCCCATGGC 3070 hom 87 het 30 0 30 1 AACTGAATTGTGA 0 1 187901 CASAVA_Build 12 43691720 1D TTATGGTGGC T/- TTTTGGAAGA 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 5 4 187902 CASAVA_Build 12 43701899 22D4M14D AACCTATCAC ATGATACTGTCTATATTATTATATAGTTTTATCAAACTTT/----------------------ATAG-------------- TTATGAGCTT 3070 hom 114 het 32 0 38 4 N/A 0 0 187903 CASAVA_Build 12 43714179 2I CACCCACACC --/CA CACACACACA 3070 hom 53 het 36 0 26 10 CA 7 8 187904 CASAVA_Build 12 43719206 1I AATTAAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 T 11 12 187905 CASAVA_Build 12 43729713 1I GGACGCAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1495 hom 30 7 14 9 A 15 16 187906 CASAVA_Build 12 43752260 1I TTACTTTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 737 hom 20 3 13 4 A 14 15 187907 CASAVA_Build 12 43754951 4I ATTCTGAATC ----/GATT AGTCCTGTGT 3070 hom 120 het 46 0 40 7 GATT 0 1 187908 CASAVA_Build 12 43766489 1I GTGTATGTTG -/A ATCAGCCTTG 3070 hom 33 het 14 0 12 3 A 1 2 187909 CASAVA_Build 12 43781643 1I AAGACTTCAC -/A ACTCACAAGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 187910 CASAVA_Build 12 43784445 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1975 het 328 hom 17 1 9 7 A 15 16 187911 CASAVA_Build 12 43786074 1I TGTTCAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 11 9 16 T 12 13 187912 CASAVA_Build 12 43790440 1I AATATATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 10 11 187913 CASAVA_Build 12 43793401 3I AATCAAAACT ---/AAA AAATGTAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 3 6 187914 CASAVA_Build 12 43797524 1D ACATAATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 34 1 32 2 A 14 13 187915 CASAVA_Build 12 43805876 3I GCTTGAGCCC ---/AGG AGGAGTTGAA 3070 hom 71 het 31 0 20 11 AGG 1 2 187916 CASAVA_Build 12 43812753 1D CCCCTGCAAA G/- GGGGGCTGAA 3070 hom 82 het 33 0 24 11 G 6 5 187917 CASAVA_Build 12 43826050 1D33M2D AAAAAAAAAG AAAAAAAAAAGCAAGGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAA/-AAAAAAAAAGCAAGGAAAGAAAGAGAGAGAGAG-- AGAAAGAAAG 3070 het 551 hom 23 9 14 13 N/A 0 0 187918 CASAVA_Build 12 43827831 13I CCAACGAGAG -------------/GCAGTGTTGGGGA GCAGTACCCC 3070 hom 102 het 44 0 34 10 GCAGTGTTGGGGA 0 1 187919 CASAVA_Build 12 43829747 20D AGAAAAACAA AGCAGGGAAAGCAGATAAGG/-------------------- AGTGCTGGAC 3070 hom 105 het 35 0 35 6 AGCAGGGAAAGCAGATAAGG 1 0 187920 CASAVA_Build 12 43842877 1D CTCGCCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 31 1 24 6 T 11 10 187921 CASAVA_Build 12 43886307 1D GCGTATGTTG A/- AGAAAAGTGT 3070 hom 105 het 42 0 35 8 A 2 1 187922 CASAVA_Build 12 43906477 2I CTTGAAATTG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 11 187923 CASAVA_Build 12 43938517 1I CTTTCAGTGA -/T TTTTCACCTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 4 5 187924 CASAVA_Build 12 43941004 1I CAACCGGCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1914 hom 30 8 15 7 T 8 9 187925 CASAVA_Build 12 43952237 1I CCTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 9 10 187926 CASAVA_Build 12 43981299 1D CTTTTTTTTT A/- AAAACGTCTC 3070 hom 14 het 28 1 23 6 A 5 4 187927 CASAVA_Build 12 43989753 1D ATCCCAGAAA C/- CCAACTAAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 3 2 187928 CASAVA_Build 12 43994496 1I TTATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2852 hom 24 het 10 0 8 2 A 10 11 187929 CASAVA_Build 12 44002344 14I AAGATTTGGA --------------/TAGGTGGTAAGGAG TAGGTGGTTA 3070 hom 135 het 53 0 45 9 TAGGTGGTAAGGAG 0 1 187930 CASAVA_Build 12 44003910 1D TTTTGTAAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 10 9 187931 CASAVA_Build 12 44023961 3I CTTGGCCTGG ---/CTT CTTTGCATCA 3070 hom 97 het 38 0 32 6 CTT 1 2 187932 CASAVA_Build 12 44031934 2I CACGTTTTGC --/AA AGATAATGTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 3 187933 CASAVA_Build 12 44046166 1D GTTACTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1009 hom 34 5 16 13 T 17 16 187934 CASAVA_Build 12 44078030 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 9 10 187935 CASAVA_Build 12 44105206 5D TTCTAGAAAT TAAAA/----- TAAAATCATT 3070 het 3070 ref 25 14 10 3 TAAAA 2 1 187936 CASAVA_Build 12 44115764 1D AAACTCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 33 2 26 5 A 11 10 187937 CASAVA_Build 12 44134170 1D TTAAAAATCC A/- AAAAAAAATT 2517 het 2517 ref 23 9 7 7 A 9 8 187938 CASAVA_Build 12 44139180 3D AGAACTGTGA AAC/--- AATAAAATTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 AAC 1 0 187939 CASAVA_Build 12 44148845 2D TCAAAACAAA AC/-- AGATATGATC 3070 het 3070 hom 51 22 25 5 AC 1 0 187940 CASAVA_Build 12 44152184 1I AAATTCTTTG -/A AAAAAAGGCT 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 A 6 7 187941 CASAVA_Build 12 44152325 2I TATAGATTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1562 hom 26 6 13 7 T 10 12 187942 CASAVA_Build 12 44152484 3D TCCTGGCTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2015 het 1475 hom 18 6 6 6 T 15 12 187943 CASAVA_Build 12 44166260 1D CCAAAAAAAA T/- CAAAACCAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 1 0 187944 CASAVA_Build 12 44183957 1I TTCACATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 13 14 187945 CASAVA_Build 12 44194877 1I CAATCCCCCC -/T CCCACTCACA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 0 1 187946 CASAVA_Build 12 44205566 4I CTGAAAGAGC ----/ACAA ACAGACAATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ACAA 0 1 187947 CASAVA_Build 12 44207574 18I TGATCTAGCA ------------------/ATCCCACTACTGGGTATC ATCCCAGAGA 2496 het 2496 ref 29 20 6 4 ATCCCACTACTGGGTATC 0 1 187948 CASAVA_Build 12 44213873 3I GTTATCCTAT ---/TTA TTAAGTATTC 3070 hom 62 het 30 0 21 9 TTA 1 2 187949 CASAVA_Build 12 44221114 15D ATCACTCAAT GCCAGCTTATAACCA/--------------- GCCCAGGCTA 3070 het 3070 ref 50 31 18 9 GCCAGCTTATAACCA 1 0 187950 CASAVA_Build 12 44226121 3D CTATCTGACA TGT/--- TGTACAAAGT 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 TGT 2 1 187951 CASAVA_Build 12 44232914 3I GCCACTGGCT ---/TGC TGCAGGAGGA 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 TGC 1 2 187952 CASAVA_Build 12 44235467 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 A 15 14 187953 CASAVA_Build 12 44240026 3D TTTGGGAGTT GAA/--- GGAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 18 5 GAA 1 0 187954 CASAVA_Build 12 44243008 1I TTTCCAAACA -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 6 7 187955 CASAVA_Build 12 44245252 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 651 hom 32 3 22 8 A 13 12 187956 CASAVA_Build 12 44264324 2D ATCATGAACA GG/-- GTGTTATGTG 2310 het 2310 ref 35 24 6 5 G 3 1 187957 CASAVA_Build 12 44274554 1I TGTCTGGGCA -/C CCCATGGCCC 3070 hom 102 het 41 0 32 9 C 3 4 187958 CASAVA_Build 12 44275978 1I CATTCCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 11 12 187959 CASAVA_Build 12 44284261 1I AACTTCCAGG -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 6 7 187960 CASAVA_Build 12 44317602 1D ACAAACGAAC A/- AAAAACCCAG 3070 het 3070 ref 37 21 13 6 A 6 5 187961 CASAVA_Build 12 44318292 1D TTACCATAAG A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 7 6 187962 CASAVA_Build 12 44327890 1D AAACTGTATG A/- AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 A 9 8 187963 CASAVA_Build 12 44342110 2D AAAAAAAATA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 2752 hom 29 13 13 3 AG 10 9 187964 CASAVA_Build 12 44345712 3D AAAAAAAAAA AAC/--- AGAGCAAGTT 1951 het 1951 ref 30 11 10 9 AAC 1 0 187965 CASAVA_Build 12 44345922 1D AAGAAAGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 13 12 187966 CASAVA_Build 12 44348266 2I AAGGTTAGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 12 14 187967 CASAVA_Build 12 44349262 1D CTTATCCCCC T/- GTCTACTGTA 3070 hom 95 het 36 0 32 4 T 1 0 187968 CASAVA_Build 12 44367332 1D TAATCAACCC A/- AGCTGTTTTG 3070 hom 135 het 54 0 43 13 A 2 1 187969 CASAVA_Build 12 44367646 1I TTAAACCTTT -/G TGCTGGGGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 187970 CASAVA_Build 12 44377623 1I GCTGCTATCA -/G ATTTGTTGTG 3070 hom 78 het 27 0 20 7 G 0 1 187971 CASAVA_Build 12 44379886 1I TTTCTCTCTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 264 hom 33 1 25 7 A 8 9 187972 CASAVA_Build 12 44382885 5I CCCCTGAACT -----/TAAAA TAAAAGTTGG 3070 hom 66 het 31 0 23 8 TAAAA 1 2 187973 CASAVA_Build 12 44383009 3I AGATAACAAC ---/AAT AATTTACTGA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AAT 1 2 187974 CASAVA_Build 12 44384045 1I TTCCTTTTTT -/G TTTGTATGAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 G 0 1 187975 CASAVA_Build 12 44392352 1I ATTAAAAAAC -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 39 het 17 0 13 4 T 6 7 187976 CASAVA_Build 12 44394032 1D TCACATCCAT G/- GGTAGTTTGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 3 2 187977 CASAVA_Build 12 44396887 1D TTCTTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 12 11 187978 CASAVA_Build 12 44406738 2D TTGTGTATGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 53 18 17 19 AC 7 6 187979 CASAVA_Build 12 44542218 1D TTTTAGTAGG T/- TTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 5 4 187980 CASAVA_Build 12 44543908 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 62 het 27 0 23 4 T 10 9 187981 CASAVA_Build 12 44597508 1I AATATAATTC -/A TATGCTGGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 187982 CASAVA_Build 12 44624837 1D TTAGAGGTGC T/- TTTATTTCTA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 4 3 187983 CASAVA_Build 12 44634990 1I ATTCCCCCCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 438 hom 27 1 21 5 T 8 9 187984 CASAVA_Build 12 44659158 1I TAGGCTGTGA -/G GGCTATGCCC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 2 3 187985 CASAVA_Build 12 44675628 2D TGTACCATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 38 2 27 11 T 15 13 187986 CASAVA_Build 12 44679511 1I CAGTCTGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 370 hom 26 1 21 4 T 9 10 187987 CASAVA_Build 12 44702376 1D TCATATCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 30 2 20 8 T 13 12 187988 CASAVA_Build 12 44705369 2D CTTTTCCTGT TA/-- AGTTCCTGTA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 TA 1 0 187989 CASAVA_Build 12 44727623 1I61M4I AATATAAATT -AAAAAAAAAGGTAACTAACAGGTAAATATAAAGTCAGTTTTAATGTATTTTTGATTTGTAA----/AAAAAAAAAAGGTAACTAACAGGTAAATATAAAGTCAGTTTTAATGTATTTTTGATTTGTAACTTT CTTTCCTATA 3070 hom 39 het 18 0 14 15 N/A 0 0 187990 CASAVA_Build 12 44739182 8D GCTAAACCCA AAGCAAGC/-------- AAGCAAGCAG 3070 hom 24 het 11 0 9 3 AAGC 4 2 187991 CASAVA_Build 12 44746613 3I CATCTCTCTC ---/CTT CTTCTGAGAC 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 CTT 1 2 187992 CASAVA_Build 12 44759673 1D TTCTGGAAAA C/- TTTGTATATT 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 C 1 0 187993 CASAVA_Build 12 44763158 1I AGTAGAGCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 9 10 187994 CASAVA_Build 12 44763971 1I GGAGAGGAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 8 9 187995 CASAVA_Build 12 44766529 7D TGAGAGTTTG AGGGTCA/------- AATTTATCCC 3070 het 3070 ref 35 19 10 8 AGGGTCA 1 0 187996 CASAVA_Build 12 44769068 2D TTTCTTTCTT TC/-- TTTCTTTCTT 2678 hom 33 het 17 0 11 6 TC 1 0 187997 CASAVA_Build 12 44775402 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 73 het 32 0 26 6 A 9 8 187998 CASAVA_Build 12 44780273 2I TTGGGGACTC --/AG GGGGAAGTGT 3070 hom 102 het 41 0 35 13 AG 0 1 187999 CASAVA_Build 12 44781738 2I AGAGGGGGCA --/AT ATGACTCAGG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 AT 1 2 188000 CASAVA_Build 12 44784019 2D TAAATAAATA GT/-- GTTTTTAGTC 3070 hom 93 het 36 0 31 7 GT 2 1 188001 CASAVA_Build 12 44785723 1D ATTAGAGAGA C/- CTTTGACCAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 2 1 188002 CASAVA_Build 12 44790280 1I GGAGCTTTAT -/G GCCCTGCCCA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 1 2 188003 CASAVA_Build 12 44791839 4D AACTTAAAAA TAAT/---- TAGAAGAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 6 TAAT 1 0 188004 CASAVA_Build 12 44792056 1D AACATAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 33 1 29 3 A 11 10 188005 CASAVA_Build 12 44794811 1D GGACATAACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 10 9 188006 CASAVA_Build 12 44797492 1D TAAAAAACTA C/- CAGGAATCAG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 C 2 1 188007 CASAVA_Build 12 44801041 13D AAAACAAAAG AAAACAAAAACAA/------------- AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 18 3 AAAACAAAAACAA 2 1 188008 CASAVA_Build 12 44802210 1I ATGGACTTAC -/T GACTTACATT 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 T 0 1 188009 CASAVA_Build 12 44808462 10I TGGCTGCATA ----------/GTATTCTATG GTGTGTATGT 3070 het 3049 hom 17 9 7 1 GTATTCTATG 0 1 188010 CASAVA_Build 12 44813363 2I TCTCTCTCTC --/TG TCTCAAGATA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 TG 0 1 188011 CASAVA_Build 12 44813611 1D AATTTGCTAA G/- GGCATTGGAT 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 G 3 2 188012 CASAVA_Build 12 44826672 1D CATCATCAAT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 A 7 6 188013 CASAVA_Build 12 44828261 3D CCACAAATAC TTG/--- TTGGGGCCCT 3070 het 3070 ref 46 21 21 6 TTG 2 1 188014 CASAVA_Build 12 44833192 2I TTTTTTTTTT --/TA AGTTGTGGAG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 TA 0 1 188015 CASAVA_Build 12 44849964 5I AAGGAAGTAT -----/AATAA AATAAGATAC 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 AATAA 1 2 188016 CASAVA_Build 12 44903711 1D TCAACCAAAT A/- AAATTTAAAC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 4 3 188017 CASAVA_Build 12 44911169 1I CTATGTCACC -/A ATAACAAATA 3070 het 3070 ref 48 26 21 1 A 1 2 188018 CASAVA_Build 12 44923115 4D CTAAAAAATA TTAG/---- TTATTTATTA 1455 het 1455 ref 14 8 4 2 TTAG 1 0 188019 CASAVA_Build 12 44933047 1D TCTTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 2012 het 2012 ref 32 15 8 9 A 17 16 188020 CASAVA_Build 12 44960969 1I TTAACAACAG -/A GTGAGACTTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 0 1 188021 CASAVA_Build 12 44961609 1I GCCTGTCATA -/T CTGACACATG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 0 1 188022 CASAVA_Build 12 44962761 1D ATGTAAGTAC A/- AAAATGAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 26 5 A 5 4 188023 CASAVA_Build 12 44972743 14D AGCAGGGCAG TCAAATCTTACAGC/-------------- TCCAAAATGA 3070 het 3070 ref 27 13 9 8 TCAAATCTTACAGC 1 0 188024 CASAVA_Build 12 44974737 1I TTTAACAGTG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 49 17 30 3 A 7 8 188025 CASAVA_Build 12 44975409 2I GAATCAACCT --/AA GTGTCCATCA 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 A 0 2 188026 CASAVA_Build 12 44977373 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 15 8 A 12 11 188027 CASAVA_Build 12 44982346 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 2420 het 1229 hom 20 5 6 9 A 10 11 188028 CASAVA_Build 12 44987080 2D TTTATTATTT TA/-- TATATATATA 1248 het 879 hom 9 2 5 2 TA 7 6 188029 CASAVA_Build 12 44987826 1D TTGATTTGCA T/- TTCTATGATG 1938 het 1938 ref 16 9 4 3 T 3 2 188030 CASAVA_Build 12 45001983 1I ATGGCCTGGA -/T ATGGTTTTGG 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 T 0 1 188031 CASAVA_Build 12 45010966 1D AGAGCTGAAC A/- AAGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 3 2 188032 CASAVA_Build 12 45013125 1D CTAAGGTTGG C/- CCAAGAGGGC 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 C 3 2 188033 CASAVA_Build 12 45018131 1I AGACTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2798 hom 19 8 9 2 A 11 12 188034 CASAVA_Build 12 45042801 1D TATCCAAAAT A/- GTAACTATTT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 A 1 0 188035 CASAVA_Build 12 45046825 3I GATAATTAAC ---/TAA TAATCATTTT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 TAA 1 2 188036 CASAVA_Build 12 45073207 1D CATTTTCACC T/- TTTCTAACTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 6 T 4 3 188037 CASAVA_Build 12 45088085 1I TGGGGCTCTT -/A AAAGTGGGAA 3070 hom 98 het 43 0 32 11 A 3 4 188038 CASAVA_Build 12 45093303 4I AGAATAAAAA ----/AACT AACTAACAGG 3070 hom 101 het 41 0 33 8 AACT 1 2 188039 CASAVA_Build 12 45098855 1D AAATTGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 38 1 31 7 A 12 11 188040 CASAVA_Build 12 45100593 1I TTATTTTTTT -/C ATGTTCTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 0 1 188041 CASAVA_Build 12 45110762 4D TATTAACTAG TTGT/---- TTGTATTAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 6 TTGT 2 1 188042 CASAVA_Build 12 45112947 3I CTTCATCCTT ---/CTC CTCCTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CTC 1 2 188043 CASAVA_Build 12 45117741 1D CTATGAGTTA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 90 het 35 0 31 6 T 8 7 188044 CASAVA_Build 12 45118249 4D CTTGTTGAGG CTTT/---- CTGAGTTTCA 3070 het 3070 hom 46 20 23 4 CTTT 1 0 188045 CASAVA_Build 12 45125176 2I TTGGAAGGAA --/GT GTGTGAAGAT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 GT 2 3 188046 CASAVA_Build 12 45129753 1I CTGTCCCCAC -/T TTTTTTTTTT 2775 het 2775 ref 30 13 9 8 T 11 12 188047 CASAVA_Build 12 45131884 1I TCAAGGTTTC -/T TGAAAGGGAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 2 188048 CASAVA_Build 12 45134511 2D TAGATTTCAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AT 8 7 188049 CASAVA_Build 12 45138877 1I TTTACCTCAT -/G TAGCATTTTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 0 1 188050 CASAVA_Build 12 45144135 6D TTCTTATTGC CAAGAT/------ CAAGATTTTT 3070 hom 87 het 30 0 30 2 CAAGAT 2 1 188051 CASAVA_Build 12 45148261 1I CCTCTTACGG -/T TTTCTTTTAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 4 188052 CASAVA_Build 12 45151859 1I TTTTTCCCCA -/G TGCTTGGTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 188053 CASAVA_Build 12 45157532 1I ACCTTGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 10 11 188054 CASAVA_Build 12 45158914 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 25 1 17 7 A 13 12 188055 CASAVA_Build 12 45181500 2I TTTTTTTTTT --/TA AAAATTGAGT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 TA 0 1 188056 CASAVA_Build 12 45195296 1D TACAGTCAAA T/- AGACTTCTTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 1 0 188057 CASAVA_Build 12 45208558 1D TTGGCAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 T 11 10 188058 CASAVA_Build 12 45226916 2D TGTTTCTCTC CT/-- GCCCCCTCCA 3070 het 3070 hom 46 20 22 6 CT 1 0 188059 CASAVA_Build 12 45229535 1D CTCTATCTCG A/- AAAAAAAAAA 1884 het 1840 hom 16 5 7 5 A 12 11 188060 CASAVA_Build 12 45231330 1I CACTACTGTT -/A AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 6 7 188061 CASAVA_Build 12 45234283 1D ACCAAATGAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 38 14 16 9 T 8 7 188062 CASAVA_Build 12 45239866 1D CATTATAACA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 9 8 188063 CASAVA_Build 12 45241649 2D AAAAACAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2676 hom 26 8 12 6 A 14 12 188064 CASAVA_Build 12 45248060 1D GACTTGACAC T/- TTTCTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 T 4 3 188065 CASAVA_Build 12 45256505 1I TGGAAAAAAA -/T ATCATTTAAC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 0 1 188066 CASAVA_Build 12 45260300 1I TTGAAATGTT -/A ACGAATACAT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 1 2 188067 CASAVA_Build 12 45263042 2D CGGTCTATTC AG/-- AGAGTCCACT 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 AG 3 2 188068 CASAVA_Build 12 45280599 3D TCAGAGGAGT TTG/--- TTATTACTCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 TTG 1 0 188069 CASAVA_Build 12 45285352 1I GAACGTTGGA -/T TACCCTTTGC 3070 het 3070 hom 60 26 31 3 T 1 2 188070 CASAVA_Build 12 45289975 1D TTTGCCATTC T/- TTTTGGTTGT 3070 het 3070 ref 54 24 19 11 T 5 4 188071 CASAVA_Build 12 45293743 3D GAACAATTAT AGG/--- AGTTTTCATC 3070 het 3070 ref 38 24 11 5 AGG 1 0 188072 CASAVA_Build 12 45321139 5D AAAAAATCTC AAATT/----- AACAACCTCA 3070 het 3070 ref 31 22 8 3 AAATT 1 0 188073 CASAVA_Build 12 45322717 2D GAAACAACTC TT/-- TTAAAATTCT 3070 het 3070 hom 41 17 20 6 T 4 2 188074 CASAVA_Build 12 45333123 1D CTGTGTAATC T/- ACAGGAGGGC 3070 hom 123 het 46 0 40 6 T 1 0 188075 CASAVA_Build 12 45333954 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 329 het 329 ref 22 7 4 11 T 11 10 188076 CASAVA_Build 12 45335896 1I TGATGATGCC -/T TTGGCCTCAG 3070 het 3070 hom 50 19 28 3 T 2 3 188077 CASAVA_Build 12 45337878 1D TCGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 33 3 18 12 T 13 12 188078 CASAVA_Build 12 45339461 2I TATAATAAAC --/AT ATATGTGGAT 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 AT 2 3 188079 CASAVA_Build 12 45345926 1D AGTTCGTTTA G/- TACCTGAATA 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 G 1 0 188080 CASAVA_Build 12 45351796 1D TGGTATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 A 11 10 188081 CASAVA_Build 12 45354654 2D TTCTGTGACA TT/-- TTAAATACTA 3070 het 3070 hom 34 14 20 1 T 4 2 188082 CASAVA_Build 12 45354788 1I GAGACTGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 9 10 188083 CASAVA_Build 12 45363640 5I ATCAAAACTT -----/TGACC ATGATGTGGA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TGACC 0 1 188084 CASAVA_Build 12 45367649 1I AGGTTGTCAC -/A AGTGTTTGGT 3070 het 3070 ref 48 19 17 12 A 1 2 188085 CASAVA_Build 12 45367820 1I CTTCCTTTTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 7 8 188086 CASAVA_Build 12 45367999 1I CCCCCCCCCC -/T CAAAAAACAA 3070 het 52 hom 25 2 12 11 T 0 1 188087 CASAVA_Build 12 45375162 1I CTGTAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1440 hom 27 3 22 2 T 10 11 188088 CASAVA_Build 12 45387440 1D CTCAAAAAAA T/- CATCTTGTTC 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 T 1 0 188089 CASAVA_Build 12 45388074 1D AAAGCTACTG T/- TAACTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 T 2 1 188090 CASAVA_Build 12 45388196 1I CCAAGTAATG -/A AAAAATCCCT 3070 het 3070 ref 39 23 16 0 A 5 6 188091 CASAVA_Build 12 45389740 3D CTTATGGCTT TTG/--- TTGTTTGTGT 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 TTG 2 1 188092 CASAVA_Build 12 45396723 1D CAGCAACAAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 8 188093 CASAVA_Build 12 45400718 1D CAGGTATATC A/- GTTTGGTCCA 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 A 1 0 188094 CASAVA_Build 12 45401232 1D CCCTCATTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 10 9 188095 CASAVA_Build 12 45402214 1D TAATTGAAAG A/- AAAAGTGCAC 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 5 4 188096 CASAVA_Build 12 45404201 1D TCATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 926 hom 40 9 14 17 T 15 14 188097 CASAVA_Build 12 45405936 4I ATAATTAAAT ----/CAAA CTAATTTACA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 CAAA 0 1 188098 CASAVA_Build 12 45406206 1I TAGATTCCAC -/A AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 54 24 26 4 A 6 7 188099 CASAVA_Build 12 45407844 1D TAACATTAAC A/- ATACTTAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 2 1 188100 CASAVA_Build 12 45415747 1D TACCACCAAA G/- GATCACACTA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 G 2 1 188101 CASAVA_Build 12 45416182 2D ACATGGAAAC AT/-- ATTTGAAGGA 3070 het 3070 ref 34 21 9 6 AT 2 1 188102 CASAVA_Build 12 45419198 4I ATATAAATGG ----/GCTA AAAGCCCTAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 GCTA 0 1 188103 CASAVA_Build 12 45423655 1I AGAATACACA -/T TTTTTCTCAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 5 6 188104 CASAVA_Build 12 45428459 1D AATCCTAAGC A/- AAAAAGAACA 3070 het 3070 ref 36 24 9 3 A 6 5 188105 CASAVA_Build 12 45430962 1D AAATATATAT A/- AAAATTGTGT 1592 het 1592 ref 9 5 4 0 A 5 4 188106 CASAVA_Build 12 45436615 1I TGGCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 A 10 11 188107 CASAVA_Build 12 45440304 2D TTTCAGGGAG TT/-- TTTTTTTTTT 2537 het 2537 ref 39 17 9 14 T 16 14 188108 CASAVA_Build 12 45440867 11D TTCTTCTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 3070 het 1530 hom 15 7 10 2 T 20 9 188109 CASAVA_Build 12 45460654 2D GTCAAAGAAG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 258 hom 40 6 17 17 T 11 9 188110 CASAVA_Build 12 45465450 2I AGTCCCTAAC --/TT TTTTTTAATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 6 8 188111 CASAVA_Build 12 45475970 4I GCAGACGGCC ----/CATT CAATCAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 CATT 0 1 188112 CASAVA_Build 12 45476803 10D AGCATCCTCC CTTGAGGTTT/---------- CTTTACAGAT 3070 het 3070 hom 47 21 21 8 CTTGAGGTTT 1 0 188113 CASAVA_Build 12 45488574 1I AAATTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 41 0 32 9 A 10 11 188114 CASAVA_Build 12 45497098 1I AGGGGAAGAT -/A ATGGTTTATG 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 1 2 188115 CASAVA_Build 12 45497447 1I CAGGACTCAC -/T TAGATGCTTG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 1 2 188116 CASAVA_Build 12 45509496 3D TGTAAAAAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 28 1 17 10 A 14 11 188117 CASAVA_Build 12 45510125 2D AGCAGCCTCC AA/-- AAAAAGTTAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 A 7 5 188118 CASAVA_Build 12 45535075 2D AATCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2729 hom 5 het 28 0 8 21 A 14 12 188119 CASAVA_Build 12 45540565 2D GTAAAACTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 A 13 11 188120 CASAVA_Build 12 45540852 1D AGGACATGCA C/- CCCTGACACA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 C 4 3 188121 CASAVA_Build 12 45540994 4D TCTGTCCCTA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 22 11 9 3 AT 8 6 188122 CASAVA_Build 12 45545846 1I GCCATCTTTT -/A ATCCAGATTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 1 2 188123 CASAVA_Build 12 45546418 1D CCTCTCACAC G/- CCCCCATTCC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 G 1 0 188124 CASAVA_Build 12 45547064 2D TATATGATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 175 hom 13 1 10 3 TA 8 7 188125 CASAVA_Build 12 45549122 1I AGCCAGCCAG -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 6 7 188126 CASAVA_Build 12 45581188 1D CTGTCCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 661 hom 34 2 24 8 A 12 11 188127 CASAVA_Build 12 45582143 1I ACACCTATCT -/A CCTACCCTAG 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 A 0 1 188128 CASAVA_Build 12 45587370 1D TTTTGTGGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 10 9 188129 CASAVA_Build 12 45589924 5D CAGAGGAAAC AAAAT/----- AAAAAAGAAT 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AAAAT 1 0 188130 CASAVA_Build 12 45592054 4D AAATTAAAAC AAAG/---- AAAACAATAC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AAAG 1 0 188131 CASAVA_Build 12 45596100 14D CACACACACA CGCGCGCGCGCGTG/-------------- CGCACGCGCG 1211 het 165 hom 28 3 6 22 CGCGCGCGCGCGTG 1 0 188132 CASAVA_Build 12 45601079 1D ATTCTTTGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 49 20 26 4 T 9 8 188133 CASAVA_Build 12 45617594 1D AAATAAATGT A/- AATATTATCT 2970 het 2102 hom 12 5 7 0 A 3 2 188134 CASAVA_Build 12 45621438 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 255 het 62 hom 9 1 3 5 A 9 10 188135 CASAVA_Build 12 45629260 1I GTTTGATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 984 hom 32 3 17 12 A 14 15 188136 CASAVA_Build 12 45633239 1D CTAAAAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 9 11 A 17 16 188137 CASAVA_Build 12 45642664 5I TCAGGAAACA -----/AAAAG AAAAGAAATA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 AAAAG 1 2 188138 CASAVA_Build 12 45646540 1D TATCCTGGGG A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 8 7 188139 CASAVA_Build 12 45663539 1D AGTCTCAGTC A/- CCCCACCCTT 3070 het 3070 ref 51 24 16 11 A 1 0 188140 CASAVA_Build 12 45667178 1D TGATTGTATA T/- TTAGAAAACG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 3 2 188141 CASAVA_Build 12 45669171 1D CAGTTATTTT A/- AAAAAAAAAA 2048 het 2048 ref 28 15 8 5 A 13 12 188142 CASAVA_Build 12 45678879 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 229 hom 34 1 23 10 T 17 16 188143 CASAVA_Build 12 45685581 1I AGCTATAGTT -/C CATGTTCAAT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 C 1 2 188144 CASAVA_Build 12 45696304 1D AAAAAAATGT A/- AAAAAACATG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 7 6 188145 CASAVA_Build 12 45703140 5D CAATCTTTTT TAAAA/----- GTTGTAAACA 3070 het 3070 hom 32 16 15 2 TAAAA 1 0 188146 CASAVA_Build 12 45706220 1I AGACCTTGCC -/T TGGATTTACT 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 T 1 2 188147 CASAVA_Build 12 45708517 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1728 hom 22 5 9 8 A 14 15 188148 CASAVA_Build 12 45709486 2I CAATTTATTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 A 10 12 188149 CASAVA_Build 12 45710165 1I CATGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 131 het 48 0 41 7 C 2 3 188150 CASAVA_Build 12 45718549 1I CTCCCTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 685 hom 30 4 19 7 A 12 13 188151 CASAVA_Build 12 45718570 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 2888 het 2763 hom 40 16 9 15 A 10 9 188152 CASAVA_Build 12 45723101 2I ATATTGCTGT --/AA AGTTTTTTGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 1 3 188153 CASAVA_Build 12 45724893 1D AACTAAATAA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 T 7 6 188154 CASAVA_Build 12 45729523 1I CAAACTTAAC -/A AAGGAACAAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 2 3 188155 CASAVA_Build 12 45731244 6D GGGTCCTGGG CCTGGC/------ CCTGGCCCAC 3070 hom 12 het 29 1 24 6 CCTGGC 2 1 188156 CASAVA_Build 12 45744493 4D GAATCATCTT TAAC/---- TAGCTAAGAG 3070 hom 54 het 21 0 19 3 TAAC 1 0 188157 CASAVA_Build 12 45747815 2D AAAATTCCTC TT/-- GACAGAACTG 3070 hom 129 het 47 0 43 5 T 2 0 188158 CASAVA_Build 12 45756491 5I AAATCAACTT -----/TACTA TAAGAATTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 TACTA 0 1 188159 CASAVA_Build 12 45772347 1D TTTGATGCTA T/- TGTAAATATG 3070 het 3070 ref 38 15 13 11 T 2 1 188160 CASAVA_Build 12 45775925 1D TAACTCCAAC T/- TTTGGCTCAT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 4 3 188161 CASAVA_Build 12 45781127 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 2771 het 2771 ref 20 12 6 2 A 10 9 188162 CASAVA_Build 12 45783660 9D TAATGAAAAA TGAACCGGT/--------- TGTTCTTGAG 3070 het 3070 ref 55 30 18 14 TGAACCGGT 1 0 188163 CASAVA_Build 12 45784227 2D GTGTTGAAGA CT/-- CTGCCTCCTA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 CT 2 1 188164 CASAVA_Build 12 45789406 2D CTTGAAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 38 1 28 9 T 16 14 188165 CASAVA_Build 12 45790440 1I CAATCCATAG -/T GATTCAGCCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 1 188166 CASAVA_Build 12 45794017 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 het 626 hom 28 3 11 14 C 1 0 188167 CASAVA_Build 12 45804561 1D ATACATGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 39 1 27 11 T 13 12 188168 CASAVA_Build 12 45809641 1D CTAGCCAATT A/- AAAAAAAAAT 1523 het 1523 ref 17 8 6 3 A 10 9 188169 CASAVA_Build 12 45816000 1I ATGGTTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 812 hom 37 4 25 8 A 13 14 188170 CASAVA_Build 12 45819450 1I GGAAAGGATC -/T TCTAAGGAAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 1 2 188171 CASAVA_Build 12 45822924 4I TAACAGAAGA ----/AGAG AGAGAGAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AG 3 5 188172 CASAVA_Build 12 45823848 16I AACAAAGCTA ----------------/GAGGATCATACTTCTT GACTTCAAAT 3070 hom 84 het 29 0 28 2 GAGGATCATACTTCTT 0 1 188173 CASAVA_Build 12 45831185 2I TATATAATAT --/AC ATACACACAC 3070 het 921 hom 27 3 23 1 AC 0 1 188174 CASAVA_Build 12 45839131 1D GATTTTATTA T/- TTTTTTACAG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 7 6 188175 CASAVA_Build 12 45840793 1I TTGAATATGG -/C TTTTTCCCCA 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 C 0 1 188176 CASAVA_Build 12 45851840 3D AGTCTAACGT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 47 22 16 11 TTC 6 5 188177 CASAVA_Build 12 45859920 1D ATGTATATAT C/- AATATGTCAG 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 C 1 0 188178 CASAVA_Build 12 45861051 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 31 2 20 9 T 13 11 188179 CASAVA_Build 12 45861424 2D TCTTTCATTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2799 hom 21 7 9 5 T 13 11 188180 CASAVA_Build 12 45862641 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2551 hom 23 8 14 1 A 11 10 188181 CASAVA_Build 12 45863065 1D GGGGTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 13 11 T 11 10 188182 CASAVA_Build 12 45865843 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 31 1 25 5 A 13 12 188183 CASAVA_Build 12 45866361 2D GGAAAATGAC TT/-- TGAGCTTCTA 3070 hom 87 het 31 0 28 3 T 3 1 188184 CASAVA_Build 12 45880245 1I ATCTTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 7 10 8 A 13 14 188185 CASAVA_Build 12 45886808 1I CCCCCGCAAC -/A AAAAAAAAAA 3024 het 3024 ref 22 9 9 4 A 10 11 188186 CASAVA_Build 12 45888287 1D GCCATTTTGG T/- TTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 5 4 188187 CASAVA_Build 12 45893417 1D ACAACCAAAG A/- AAAAAACATA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 7 6 188188 CASAVA_Build 12 45898379 1D TCACCAGCAC A/- AGATTCTTGT 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 A 2 1 188189 CASAVA_Build 12 45902827 1I GAGCAGGATC -/T AAACCCAGGG 3070 hom 98 het 37 0 33 4 T 0 1 188190 CASAVA_Build 12 45911458 1D GGAGAGGGTG C/- TAAAGCTAGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 0 188191 CASAVA_Build 12 45920070 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1346 het 440 hom 13 5 4 4 A 19 18 188192 CASAVA_Build 12 45939799 1I CCACTGCCTT -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 6 7 188193 CASAVA_Build 12 45941688 1I CAACCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 10 11 188194 CASAVA_Build 12 45956268 1I CGCAGGAGAC -/T TTTTTTTTTT 2572 het 2444 hom 28 9 8 11 T 14 15 188195 CASAVA_Build 12 45962118 12D TATTGACTAA GATAAGGCTTCT/------------ GAGACTCTCG 3070 het 3070 ref 32 22 13 1 GATAAGGCTTCT 1 0 188196 CASAVA_Build 12 45966249 1D TTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2478 het 2478 ref 23 12 7 4 A 15 14 188197 CASAVA_Build 12 45979764 3D GAAAAACAAA AAG/--- AAAGAGAGAA 2301 het 2301 ref 37 19 8 11 AAG 1 0 188198 CASAVA_Build 12 45980609 1D CATTGTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 762 hom 25 2 13 10 T 15 14 188199 CASAVA_Build 12 45981280 3I AGTTTCACTC ---/TTG TTGTCCAGGC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 TTG 1 2 188200 CASAVA_Build 12 45991706 5D ACCCACACTC AAGGG/----- GAGGGGATTT 3070 hom 124 het 47 0 42 7 AAGGG 1 0 188201 CASAVA_Build 12 45992395 2D AATGAACAAT AA/-- AAGTTTATTA 1076 het 1076 ref 7 3 3 1 A 4 2 188202 CASAVA_Build 12 45993777 1I TCTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 23 1 15 7 T 11 12 188203 CASAVA_Build 12 45999409 2D ATCATGAGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 32 1 22 10 A 14 12 188204 CASAVA_Build 12 46001366 1D ATATTTTTTA G/- CTTTCTGACT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 G 1 0 188205 CASAVA_Build 12 46024562 2D CAACAGAAAT GA/-- GTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 GA 1 0 188206 CASAVA_Build 12 46025911 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 758 hom 23 3 13 7 A 13 12 188207 CASAVA_Build 12 46026199 1I CATTATTTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 8 9 188208 CASAVA_Build 12 46029798 1D AACCACATTG T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 35 11 17 8 T 7 6 188209 CASAVA_Build 12 46030179 1I TGATGCTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 11 12 188210 CASAVA_Build 12 46032497 4D AAAGAAAGAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 hom 63 het 29 0 20 9 GGAA 6 5 188211 CASAVA_Build 12 46032627 1I CCAATCTGTT -/A AAAAAATTAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 6 7 188212 CASAVA_Build 12 46038581 1I AATACACACA -/C AAAAAAAATT 2122 hom 12 het 7 0 5 2 C 0 1 188213 CASAVA_Build 12 46044657 1I TTGTAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1386 hom 26 4 11 11 A 17 18 188214 CASAVA_Build 12 46047581 1I TCGCTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 38 1 28 9 T 11 12 188215 CASAVA_Build 12 46050289 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 8 7 188216 CASAVA_Build 12 46065462 1I CTACCCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 T 11 12 188217 CASAVA_Build 12 46078564 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1199 het 1199 ref 17 8 4 5 A 19 18 188218 CASAVA_Build 12 46133202 1D AGAATTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 8 T 12 11 188219 CASAVA_Build 12 46157322 1D CAAGTTGGAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 48 21 25 2 A 9 8 188220 CASAVA_Build 12 46176102 1D CAAATTTCCA G/- GTGTGAGTGC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 2 1 188221 CASAVA_Build 12 46192904 3D CATGGAATAC TAT/--- TATGCAGCCA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TAT 2 1 188222 CASAVA_Build 12 46197619 7D TTTGACTACT GAAAGCA/------- GAGCACCTCA 3070 het 3070 hom 56 26 27 6 GAAAGCA 1 0 188223 CASAVA_Build 12 46199640 2D TTGTCCATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 39 hom 35 2 17 16 T 13 11 188224 CASAVA_Build 12 46201469 2D TTTTTCTTGT AA/-- GTTTGTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 2 0 188225 CASAVA_Build 12 46201854 1I ACCATTTATT -/A AATAGGGAGT 3070 hom 6 het 21 1 19 1 A 2 3 188226 CASAVA_Build 12 46202018 7D CTTATAGTAT ACTTTGA/------- AGTCAGGTAG 1790 het 1790 ref 25 13 5 7 ACTTTGA 1 0 188227 CASAVA_Build 12 46208759 5D CTTTCCTGAT TTTTA/----- TTTCCTGTCT 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 TTTTA 1 0 188228 CASAVA_Build 12 46209337 1I TCTTCTTTGA -/T TTTTTTTTTG 2691 het 2691 ref 28 14 8 6 T 9 10 188229 CASAVA_Build 12 46212667 1D TATTGGGCTC T/- GTGCTCAGTC 3070 het 3070 hom 50 24 22 6 T 1 0 188230 CASAVA_Build 12 46215786 1I TTTCCTGAAA -/G GGGCAAAGCC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 3 4 188231 CASAVA_Build 12 46220816 6I ATTCTCATGA ------/CCACAT CCACATCCCA 3070 hom 66 het 30 0 22 8 CCACAT 1 2 188232 CASAVA_Build 12 46230933 1D TTCTAATGTG T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 8 7 188233 CASAVA_Build 12 46231516 1I TCACTTGTCA -/T AATTGTGGGG 3070 hom 120 het 51 0 41 10 T 0 1 188234 CASAVA_Build 12 46246209 1D TTTCTTTTTA T/- TTTTGTCTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 5 4 188235 CASAVA_Build 12 46246886 1D AGTTCTCCAA G/- GGGTGTTGGA 3070 hom 126 het 45 0 39 6 G 4 3 188236 CASAVA_Build 12 46261410 1D GGAACACCCA C/- CACAATAATT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 C 2 1 188237 CASAVA_Build 12 46266120 3I AGAAAGGAGT ---/TGG TGGTGGTGGC 3070 hom 103 het 41 0 32 9 TGG 3 4 188238 CASAVA_Build 12 46275649 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2664 het 420 hom 19 2 9 8 A 16 15 188239 CASAVA_Build 12 46277240 1D TCTGTTACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 21 4 A 12 11 188240 CASAVA_Build 12 46278887 1I GTATCTGCAT -/G GGGAAGAGGG 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 3 4 188241 CASAVA_Build 12 46279337 1D ATCTTGTACC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 101 het 39 0 34 5 A 8 7 188242 CASAVA_Build 12 46279462 1D ACGATAGTGT G/- ATTTGGCCGT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 1 0 188243 CASAVA_Build 12 46282328 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2921 het 50 hom 14 1 8 5 A 17 16 188244 CASAVA_Build 12 46283920 3D TAACAGCATC CAA/--- CAACAACAAT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 CAA 4 3 188245 CASAVA_Build 12 46313377 2I14M4D GTGTTTATAC --ATATATATTTACACATAT/ATATATATATTTACAC---- GTGTGTATAT 3070 hom 52 het 17 0 18 4 N/A 0 0 188246 CASAVA_Build 12 46314268 2D GTGTATACAC GT/-- GTGTATACAT 2300 het 2300 ref 30 11 8 11 GT 3 2 188247 CASAVA_Build 12 46323548 1D CTATAGAATT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 8 188248 CASAVA_Build 12 46327334 1D CCACTCCTAC A/- ATTCAGATTC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 2 1 188249 CASAVA_Build 12 46330755 3I TTAGAAACTG ---/AGA AGAAGGGGAA 3070 hom 141 het 53 0 48 6 AGA 1 2 188250 CASAVA_Build 12 46336270 1I ACTGCCTACA -/C CCCCAAGGTC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 4 5 188251 CASAVA_Build 12 46336902 1I CTGCAGTGAG -/C CAAGATCGCA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 C 1 2 188252 CASAVA_Build 12 46341430 3I TAATAATAGT ---/AAC AACAGTAGCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AAC 1 2 188253 CASAVA_Build 12 46352680 1I AATGCCGACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 42 0 33 9 T 9 10 188254 CASAVA_Build 12 46354762 4D AGAGTAAAAG AAAC/---- AAACAAAGCC 3070 het 84 hom 21 1 18 4 AAAC 2 1 188255 CASAVA_Build 12 46361158 1D CACCTGCAAT C/- CCATTAGTTA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 3 2 188256 CASAVA_Build 12 46387469 2I ACCCTGCTTT --/TC TCTCTCTCTT 3070 hom 96 het 38 0 29 9 TC 4 5 188257 CASAVA_Build 12 46390058 1I GAACTCTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 263 hom 35 1 31 3 A 9 10 188258 CASAVA_Build 12 46393791 2D ATAAGTTGGC GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 75 het 29 0 25 6 G 12 10 188259 CASAVA_Build 12 46396690 2D CTCTTGAAAG TC/-- ACACATCAGG 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 TC 1 0 188260 CASAVA_Build 12 46410032 2D ATACACTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 34 3 13 18 T 14 12 188261 CASAVA_Build 12 46420649 1D AAAGGTAGCC G/- GGGGGACTCT 3013 hom 46 het 23 0 13 10 G 6 5 188262 CASAVA_Build 12 46422256 3D TATCTTTATT ATG/--- ATATTAATGT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 ATG 1 0 188263 CASAVA_Build 12 46451983 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1430 hom 20 6 11 4 A 15 14 188264 CASAVA_Build 12 46452726 1D GACTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1439 het 1439 ref 17 9 4 4 A 12 11 188265 CASAVA_Build 12 46456532 1I GGACCAGTGA -/G GGGGCTCCAT 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 G 4 5 188266 CASAVA_Build 12 46467296 2I CAGGCCCCCC --/CG CCCAGCTGCC 3070 hom 52 het 23 0 13 10 CG 0 1 188267 CASAVA_Build 12 46490867 32D TCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTA/-------------------------------- TCTCTATCTC 2869 het 2869 ref 25 13 14 11 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTA 1 0 188268 CASAVA_Build 12 46518064 2I TGGCCAACAC --/TT ATGATTGATA 3070 het 3070 hom 62 24 30 8 T 0 2 188269 CASAVA_Build 12 46518755 1I CTTTGGGGGC -/G GGGGGGCCAG 1403 het 740 hom 11 3 3 5 G 6 7 188270 CASAVA_Build 12 46524003 1D AGGCACTGGC A/- GGGGGAGGAC 2841 het 1654 hom 28 7 8 13 A 1 0 188271 CASAVA_Build 12 46529911 1D TTTATTTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1244 hom 21 5 11 8 T 10 9 188272 CASAVA_Build 12 46548849 1D CAACCGGGCA T/- TTCGCTCTGG 2091 het 1340 hom 30 6 11 13 T 3 2 188273 CASAVA_Build 12 46561851 1D TTTAGAACAT A/- GCACACATTC 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 A 1 0 188274 CASAVA_Build 12 46566741 1I TTCAGCTCTG -/A AAAATCTCAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 4 5 188275 CASAVA_Build 12 46603126 1I GTATCGGAAC -/T CTTCAAGCAA 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 T 0 1 188276 CASAVA_Build 12 46613581 1D CTGACAAACT A/- AAAAAAAAAA 2348 het 2348 ref 21 9 6 6 A 13 12 188277 CASAVA_Build 12 46620723 1D ACCTGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 2748 het 2748 ref 26 11 7 8 T 13 12 188278 CASAVA_Build 12 46624989 10I CCCACATCCA ----------/CACACACATG CACACACATG 3070 het 3070 hom 66 19 23 24 CACACACATG 1 2 188279 CASAVA_Build 12 46631487 9D CAGCTCTTAA CACAGGTAC/--------- CACAGGTACC 2486 het 2486 ref 30 13 10 13 CACAGGTAC 2 1 188280 CASAVA_Build 12 46649794 2D GTTTTGAAAC AT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 AT 1 0 188281 CASAVA_Build 12 46659986 1I TCCCAGAACA -/C CCCCCGCCAT 3070 hom 45 het 18 0 13 5 C 5 6 188282 CASAVA_Build 12 46662711 1I TCTCCCTGAA -/C CCCATGTTCA 3070 hom 65 het 28 0 20 8 C 3 4 188283 CASAVA_Build 12 46670057 1D TCTTCTAATC T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 84 het 32 0 25 9 T 7 6 188284 CASAVA_Build 12 46692001 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 587 hom 25 2 19 4 A 11 12 188285 CASAVA_Build 12 46692575 1D TATTACCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 12 11 188286 CASAVA_Build 12 46698713 2D TTCTTTTTGT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 117 het 42 0 39 7 TC 7 6 188287 CASAVA_Build 12 46700057 6I ATTTGACAGA ------/TATTGT TAAATTCCCT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TATTGT 0 1 188288 CASAVA_Build 12 46704214 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 20 6 T 10 11 188289 CASAVA_Build 12 46718185 1I AGAAAGTGAA -/C CCAATGACAG 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 C 2 3 188290 CASAVA_Build 12 46728188 1I GGTTTATCAG -/T TTTTTCCCTT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 5 6 188291 CASAVA_Build 12 46738595 2D GCTTTAACGT AC/-- AGTCTTCCTT 3070 het 3070 ref 50 27 20 4 AC 1 0 188292 CASAVA_Build 12 46739772 5D GTTGGCTTTT CTCTG/----- GGATATAGGT 3070 het 3070 hom 45 20 23 4 CTCTG 1 0 188293 CASAVA_Build 12 46751395 13D GCCAGGCATG GTGGCTCACGCCT/------------- GTAATCCCAG 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 GTGGCTCACGCCT 1 0 188294 CASAVA_Build 12 46755106 1I AAGAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 2680 het 2680 ref 44 17 9 18 A 11 12 188295 CASAVA_Build 12 46759799 4D AAACTTTAAT AGAG/---- AGCACAAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 12 3 AG 3 1 188296 CASAVA_Build 12 46780553 2D TGGCGGCGCA CG/-- CATGTTTGTA 1903 het 1903 ref 21 15 6 1 CG 1 0 188297 CASAVA_Build 12 46783723 1D TTTTCTTTTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 188298 CASAVA_Build 12 46797225 3I GCTTGATAAT ---/TTC TTTTTATTGA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TTC 0 1 188299 CASAVA_Build 12 46798940 1D ACTATATTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 14 15 5 T 8 7 188300 CASAVA_Build 12 46803575 1I AAGAGGGTAT -/G TGATTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 G 0 1 188301 CASAVA_Build 12 46821082 1I AGTAGGAACA -/G GCAGGAATTA 3070 het 3070 ref 63 31 23 9 G 1 2 188302 CASAVA_Build 12 46823440 2D GAGAGAGATA CT/-- CTCTCAAAAC 3070 het 3070 ref 48 22 21 9 CT 3 2 188303 CASAVA_Build 12 46839254 1D TCAAACTAAC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 7 6 188304 CASAVA_Build 12 46848250 1I TGGAAGAAAT -/A AACAAGAATA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 3 188305 CASAVA_Build 12 46852717 1D GATGGAATTC T/- TTTTTTTTTT 2373 hom 27 het 13 0 10 3 T 11 10 188306 CASAVA_Build 12 46860099 1I TTTATAGTGC -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 6 7 188307 CASAVA_Build 12 46868788 1I GAATTAAGTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 A 8 9 188308 CASAVA_Build 12 46874131 3I TTTTTTTTTT ---/TTA AAAGGGAAGT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 TTA 0 1 188309 CASAVA_Build 12 46876689 1I AAAACATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1118 hom 21 5 9 7 A 11 12 188310 CASAVA_Build 12 46876726 7I ACCTGAAAGA -------/TGAAGGC TGGAATGAGG 3070 het 269 hom 19 1 9 9 TGAAGGC 0 1 188311 CASAVA_Build 12 46881482 2I GGTGCTGATC --/TT TTTTTTTTTT 2506 het 2506 ref 35 18 9 9 T 10 12 188312 CASAVA_Build 12 46882125 13D AGAGGAAAAG AAACTGAGGAAAA/------------- AAACTAAGGA 3070 het 3070 ref 33 16 16 4 AAACTGAGGAAAA 1 0 188313 CASAVA_Build 12 46885034 5I GGGGCCCAGA -----/AAGGG AAGGGAAGGG 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 AAGGG 3 4 188314 CASAVA_Build 12 46885145 1I AGTGAGCTAC -/A CTCCAGAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 0 1 188315 CASAVA_Build 12 46887771 1I CAATCCAATT -/A AAAAAAAAAA 2795 het 2795 ref 17 8 6 3 A 10 11 188316 CASAVA_Build 12 46891647 1I GTTTTTTCTT -/A CTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 0 1 188317 CASAVA_Build 12 46892192 4D ACAGATCTTT TGTC/---- TGTCTGTTTA 3070 het 3070 ref 37 21 13 4 TGTC 2 1 188318 CASAVA_Build 12 46892311 1D ATATTTAATT A/- GGGGCACAAG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 1 0 188319 CASAVA_Build 12 46892796 2I GCACTCAAGT --/GA GAGGAATGGG 2969 hom 49 het 20 0 12 8 GA 1 2 188320 CASAVA_Build 12 46893762 1I TCTTGTTCCC -/G GGGGGAAAGG 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 G 5 6 188321 CASAVA_Build 12 46893813 2I TCTTAGAGAC --/TG TGATACAGAG 3070 het 3070 ref 48 21 14 13 TG 1 2 188322 CASAVA_Build 12 46894068 1D AGGGAGACAG A/- CAAGAAACAG 3070 het 3070 ref 51 22 24 5 A 1 0 188323 CASAVA_Build 12 46894394 1D TCTGCAAAGG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 33 21 10 3 A 7 6 188324 CASAVA_Build 12 46897025 5I GAAATGGACA -----/GGCCT GGCCTGTAGA 3070 het 3070 hom 49 17 27 5 GGCCT 1 2 188325 CASAVA_Build 12 46898779 2D TTTATGGCTA CT/-- CTCTGCCTCT 3070 het 3070 ref 33 12 14 8 CT 3 2 188326 CASAVA_Build 12 46902121 3D GTAATCTGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 1502 het 1022 hom 21 5 6 10 T 15 12 188327 CASAVA_Build 12 46909973 6D ACACATATAC ATATAT/------ ATATATATAT 2444 hom 12 het 6 0 5 1 AT 10 7 188328 CASAVA_Build 12 46913201 3D AATTAGGAAG TGA/--- TGATGAATTT 3070 hom 109 het 41 0 36 5 TGA 3 2 188329 CASAVA_Build 12 46918632 11D TTGTATCGGG CCCACATCAGC/----------- CCCACATCAG 3070 het 3070 ref 38 12 12 19 CCCACATCAGC 3 2 188330 CASAVA_Build 12 46931231 6D AAGAAAAAAG AAAAAA/------ AAAAAAAGAT 2830 het 2830 ref 22 11 11 1 A 13 7 188331 CASAVA_Build 12 46941114 3I ATGTTAATTT ---/TGA TGATATCTAA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 TGA 1 2 188332 CASAVA_Build 12 46941215 8I TCTATATATA --------/TATTAAAT CCTAAAAATT 2923 het 2923 ref 22 15 6 1 TATTAAAT 0 1 188333 CASAVA_Build 12 46948674 1D CTGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 11 10 188334 CASAVA_Build 12 46950913 1I TGCTGTGTTC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 7 8 188335 CASAVA_Build 12 46953989 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 T 9 10 188336 CASAVA_Build 12 46969391 17I CAAAGTACTG -----------------/AAATTGGTTTAAGTTAA TCACACTTTA 3070 hom 123 het 42 0 41 5 AAATTGGTTTAAGTTAA 0 1 188337 CASAVA_Build 12 46970003 1I CAAAAAACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 30 1 25 4 A 10 11 188338 CASAVA_Build 12 46989278 1D TCCCCATTGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 9 8 188339 CASAVA_Build 12 46991848 1D TTAAACTTGC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 8 7 188340 CASAVA_Build 12 46996443 2D GTTTTCCACA CT/-- CTGTTCTAGG 3070 hom 39 het 15 0 13 3 CT 2 1 188341 CASAVA_Build 12 46997382 6D AATGGAGAAT TTAGTG/------ TCTTTTGAAT 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 TTAGTG 1 0 188342 CASAVA_Build 12 47011747 1I ATTAAGTTTA -/T TTTTTTTTTT 2160 het 56 hom 7 1 5 1 T 11 12 188343 CASAVA_Build 12 47014745 6I ACAATTAGAA ------/TAAAGT TAATCAAGTG 3070 hom 71 het 28 0 23 5 TAAAGT 0 1 188344 CASAVA_Build 12 47020572 1D CATCCTTATA C/- CACTGATGCC 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 C 2 1 188345 CASAVA_Build 12 47021047 11D ACTGCATTCC AGGAAGAATGA/----------- AGGAAGAAGG 3070 het 3070 hom 38 15 20 8 AGGAAGAATGA 1 0 188346 CASAVA_Build 12 47024823 1D TATATTTCTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 9 8 188347 CASAVA_Build 12 47028591 3D GTAATCACAC AGA/--- AGATTTTCTG 3070 het 3070 ref 58 31 23 5 AGA 2 1 188348 CASAVA_Build 12 47038368 3D ATTTCTCTGA TGT/--- TGTAAAATTA 3070 het 3070 hom 35 13 17 7 TGT 2 1 188349 CASAVA_Build 12 47042733 1D TCCATATGAA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 7 6 188350 CASAVA_Build 12 47043248 1I CAACAACTCC -/T TCACTCCTTC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 1 2 188351 CASAVA_Build 12 47043594 1D TTACAGTCTT A/- AAATGTAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 4 3 188352 CASAVA_Build 12 47048330 1I CTAACAGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 9 10 188353 CASAVA_Build 12 47056183 1I CTTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 1054 het 1054 ref 47 38 3 6 T 10 11 188354 CASAVA_Build 12 47057184 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 13 12 188355 CASAVA_Build 12 47061278 4I CTTTCTCTCT ----/TCTG TTTTTTTATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TCTG 0 1 188356 CASAVA_Build 12 47090273 1I AAGGCTCTGT -/G GGCATGGGAC 3070 hom 73 het 28 0 21 7 G 2 3 188357 CASAVA_Build 12 47096913 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 A 10 11 188358 CASAVA_Build 12 47100132 1I CCACAGTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2701 hom 25 9 9 7 T 10 11 188359 CASAVA_Build 12 47101401 1I CAACAATAAA -/G GTAGCAATGA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 1 2 188360 CASAVA_Build 12 47112566 4D TGATCCTAAC AGAA/---- AGATATCTAT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 AGAA 1 0 188361 CASAVA_Build 12 47113506 2D GCTTTTTTTT GG/-- GGGGGGGGGG 158 het 141 hom 24 2 2 21 G 14 12 188362 CASAVA_Build 12 47123786 3D TAAAGTGTGG TCT/--- TCTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 67 38 27 4 TCT 2 1 188363 CASAVA_Build 12 47128073 1D GGCAGCTAGC A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 8 7 188364 CASAVA_Build 12 47132612 4D CAGAGTAAAT AGAC/---- AGCCTACAGA 3070 het 3070 ref 39 24 15 2 AGAC 1 0 188365 CASAVA_Build 12 47138784 1D TTGATTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 19 18 15 T 13 12 188366 CASAVA_Build 12 47139051 8I TTTTTTGAAC --------/CTCACTTT CTCCTGTAAG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 CTCACTTT 0 1 188367 CASAVA_Build 12 47139460 2I TTTTAAAACA --/GT GTGTGATTCA 3070 het 3070 ref 56 28 17 11 GT 2 3 188368 CASAVA_Build 12 47142242 3D AAAGCTCACT CAA/--- GAAGAAATAG 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 CAA 1 0 188369 CASAVA_Build 12 47146595 1D ACTTTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 2871 het 2871 ref 33 19 8 8 A 13 12 188370 CASAVA_Build 12 47150734 1I CACTGGTCCA -/T TTTTTTTTTG 2849 het 2849 ref 26 11 9 6 T 9 10 188371 CASAVA_Build 12 47160990 1D ATGGAGGTCA T/- TATCCCAGGC 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 T 2 1 188372 CASAVA_Build 12 47161121 1I AGGGGGCAAA -/G GATGAAAAGC 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 G 1 2 188373 CASAVA_Build 12 47161261 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 8 7 188374 CASAVA_Build 12 47167783 2D ATATGTACTC TT/-- ATATACAAAT 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 T 2 0 188375 CASAVA_Build 12 47173974 1I AATAATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2422 hom 20 8 8 4 A 10 11 188376 CASAVA_Build 12 47174115 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCT 2386 hom 12 het 5 0 5 0 A 5 4 188377 CASAVA_Build 12 47179288 1I TATTTCAACA -/T AGTTCTGAAT 3070 het 3070 hom 50 11 30 9 T 0 1 188378 CASAVA_Build 12 47179664 2I GCTTTGTGTG --/AT ATGTCTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 AT 1 2 188379 CASAVA_Build 12 47179793 2I TTTTTTTTTT --/TC TTAATTGATC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 TC 0 1 188380 CASAVA_Build 12 47181511 2D TGGCAGCAGT AC/-- AGTCCAGCTT 2704 het 486 hom 7 1 6 0 AC 1 0 188381 CASAVA_Build 12 47202557 2D TGCCTACAGT CG/-- CCCAGCTACT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 CG 1 0 188382 CASAVA_Build 12 47204443 1D CTTATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1493 hom 25 7 13 6 A 15 14 188383 CASAVA_Build 12 47213719 11D CATCTCAATG GATTCAGAAAA/----------- GGCTTTTAAT 3070 het 3070 ref 42 26 10 11 GATTCAGAAAA 1 0 188384 CASAVA_Build 12 47221484 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 13 12 A 10 11 188385 CASAVA_Build 12 47222798 2D CCTCAGCCAT TA/-- TATATATATA 3070 het 1803 hom 21 5 11 6 TA 8 7 188386 CASAVA_Build 12 47226890 2D ACAATGATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2808 het 2808 ref 26 11 10 5 T 12 10 188387 CASAVA_Build 12 47231263 6D GAATGTTGAG CTCCCT/------ CTCCCTCTCC 1256 het 1256 ref 26 10 3 13 CTCCCT 3 2 188388 CASAVA_Build 12 47238021 1I CGTAAAAAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 19 11 2 T 8 9 188389 CASAVA_Build 12 47241168 1D AAAAAAAAAA C/- AGAATCTATT 3070 het 641 hom 27 9 12 7 C 1 0 188390 CASAVA_Build 12 47242002 1I AAAATGACTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 8 9 188391 CASAVA_Build 12 47244030 1D ATAAGTAAAG T/- AGTACCTAGC 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 T 1 0 188392 CASAVA_Build 12 47276556 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2246 het 2246 ref 15 5 7 3 A 10 11 188393 CASAVA_Build 12 47276665 5D AAAATAAAAA TAAAT/----- TAATCACATT 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 TAAAT 1 0 188394 CASAVA_Build 12 47305831 1D GCACCAGGCT A/- AAAAAGCGTT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 A 6 5 188395 CASAVA_Build 12 47307626 1I CTCAAAAAAA -/G AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 21 15 5 G 0 1 188396 CASAVA_Build 12 47333754 2D TATCTCAAAG AC/-- ACCACTCACA 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 AC 2 1 188397 CASAVA_Build 12 47341333 1D AGGCCCATTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 A 10 9 188398 CASAVA_Build 12 47367084 1I GCACTTAGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 0 1 188399 CASAVA_Build 12 47408099 1D AAACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 9 12 A 13 12 188400 CASAVA_Build 12 47409584 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1905 hom 14 5 9 0 A 10 11 188401 CASAVA_Build 12 47422254 7D CACCTCACCT AGCCCCC/------- AGCTTTTAAG 1704 het 1704 ref 21 13 5 3 AGCCCCC 1 0 188402 CASAVA_Build 12 47505078 1I GGGGACAGTG -/T TTCTAGGCAG 2169 het 2169 ref 37 23 9 5 T 2 3 188403 CASAVA_Build 12 47526190 1I AGCTAATTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2731 hom 22 8 11 3 T 8 9 188404 CASAVA_Build 12 47528636 9D CAGGTTTGTT TTGTTGTTG/--------- TTGTTGTTGA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 TTG 6 3 188405 CASAVA_Build 12 47532575 3I CAACCGCAGT ---/AAC AACAATAAAT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 AAC 1 2 188406 CASAVA_Build 12 47533881 1D CCCTGACTGG A/- AAAAAAAAAA 1980 het 1980 ref 36 18 5 13 A 14 13 188407 CASAVA_Build 12 47540755 1I ACCTGGCCTC -/T TTTTTTTTGT 1940 het 1940 ref 18 6 5 7 T 8 9 188408 CASAVA_Build 12 47545173 2D GCGATCAGGG AC/-- ACACACACAC 1276 het 1276 ref 44 26 5 16 AC 7 6 188409 CASAVA_Build 12 47577400 1I AAAAGACTGA -/T ACACTTGACT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 0 1 188410 CASAVA_Build 12 47579569 2D AGACTCCGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 27 2 16 9 A 16 14 188411 CASAVA_Build 12 47581797 2D TTTTTTTTTT TA/-- AATACGGAGT 1822 het 41 hom 15 1 10 4 TA 1 0 188412 CASAVA_Build 12 47583400 3I AAAAAGGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 TTG 5 6 188413 CASAVA_Build 12 47591661 1D ATCCGGTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 10 9 188414 CASAVA_Build 12 47595102 1I TTTAAATAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 T 8 9 188415 CASAVA_Build 12 47597326 1I CATAGGGAGT -/C CCCCCCCATC 1739 hom 5 het 20 0 9 11 C 7 8 188416 CASAVA_Build 12 47603472 1I AGGAAGGGGT -/G GGGGGGTGGC 1682 het 1682 ref 28 13 7 8 G 6 7 188417 CASAVA_Build 12 47618719 2I CCCAGAGGGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 GA 5 6 188418 CASAVA_Build 12 47620164 1I AACCCTTTGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 42 18 12 12 A 8 9 188419 CASAVA_Build 12 47625046 1D TTAAAAATAT A/- AAAATTAGCT 1941 het 1941 ref 17 6 5 6 A 5 4 188420 CASAVA_Build 12 47628027 3D AGGCTGATGC AAG/--- AAGATTGCCT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 AAG 2 1 188421 CASAVA_Build 12 47628257 1I AATATGTCTC -/A AAAAAAAAGA 2942 het 2942 ref 24 15 7 2 A 8 9 188422 CASAVA_Build 12 47636954 1D AGGTGGGGGA G/- GGAGAGGGAG 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 G 3 2 188423 CASAVA_Build 12 47727644 1D ATTTTTGTTA T/- TTTTTAGAAG 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 6 5 188424 CASAVA_Build 12 47781130 1I CCCTCCTTTC -/A AAATTAAGTC 3070 het 2841 hom 29 6 18 5 A 3 4 188425 CASAVA_Build 12 47809791 2D AGGAAAAAAG AT/-- ATCACAATTT 3070 het 3070 hom 40 19 18 4 AT 2 1 188426 CASAVA_Build 12 47812704 2D TATCTATATA TG/-- TGTGTCTCCA 3070 het 3070 hom 37 9 20 8 TG 3 2 188427 CASAVA_Build 12 47821681 4I TTCCCCTCTA ----/TCTT AGTTTATCAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TCTT 0 1 188428 CASAVA_Build 12 47833581 2I ACTCAGGTCT --/TC TCTATACAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TC 1 2 188429 CASAVA_Build 12 47842381 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1828 hom 30 9 12 10 A 13 12 188430 CASAVA_Build 12 47857354 2D TGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1989 hom 25 6 13 7 TA 7 6 188431 CASAVA_Build 12 47861539 1D ATGAATGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 A 15 14 188432 CASAVA_Build 12 47867020 1D CAGCACGATA C/- AAAGATTAAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 1 0 188433 CASAVA_Build 12 47867647 1I ATTTCATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 10 11 188434 CASAVA_Build 12 47867774 4I GAAAAGGTAC ----/CAAA CAAAGAATAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 CAAA 1 2 188435 CASAVA_Build 12 47885201 1I ACATATTTTT -/A TTTTTCCATT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 0 1 188436 CASAVA_Build 12 47958468 1D GCGCCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 2754 het 974 hom 13 3 7 3 T 12 11 188437 CASAVA_Build 12 47961848 1I ATATTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 1480 het 1480 ref 22 7 6 9 T 14 15 188438 CASAVA_Build 12 47966135 1I TAACCTCTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 7 12 7 A 8 9 188439 CASAVA_Build 12 47987791 1D TTCCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 11 10 188440 CASAVA_Build 12 47994040 1D GCCCAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 2968 het 2589 hom 17 7 8 3 T 11 10 188441 CASAVA_Build 12 47995884 3I TACTCTTTGG ---/AGA AGAAGCTTCA 3070 het 3070 ref 45 23 13 9 AGA 1 2 188442 CASAVA_Build 12 48012523 1I AGTCCGGATA -/G GGGGGGAATG 2096 het 2096 ref 24 10 6 8 G 6 7 188443 CASAVA_Build 12 48021175 1D CCCACCCTGA C/- ACTGTTAAGC 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 C 1 0 188444 CASAVA_Build 12 48053658 2I CTTGGGCAAC --/AT AGCGAGACCC 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 AT 0 1 188445 CASAVA_Build 12 48071128 1I TTAAAATTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2634 hom 22 6 12 4 A 9 10 188446 CASAVA_Build 12 48086824 1I AGATTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 11 12 188447 CASAVA_Build 12 48093832 4D CCTGTGAACT AAAC/---- AGACAGGGCA 3070 het 3070 ref 58 26 20 13 AAAC 1 0 188448 CASAVA_Build 12 48099937 4I TGAAAACATA ----/CTGT CTGTTTTATT 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 CTGT 1 2 188449 CASAVA_Build 12 48145417 1I ATGGTCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 10 11 188450 CASAVA_Build 12 48157153 1D AACTCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1947 het 1947 ref 31 16 6 9 A 17 16 188451 CASAVA_Build 12 48160846 1D TTGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 12 11 188452 CASAVA_Build 12 48180083 1I ATAATTATTC -/T TTTTTTTTTT 2164 het 2164 ref 29 15 7 7 T 13 14 188453 CASAVA_Build 12 48184785 1D TATTGGCGCG T/- TTTTTTTTTT 2139 het 113 hom 20 3 9 9 T 11 10 188454 CASAVA_Build 12 48186374 1I CAAGGAAAGA -/G GTTTAATTGA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 G 1 2 188455 CASAVA_Build 12 48194288 1I ACAGCTTACT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 6 7 188456 CASAVA_Build 12 48196761 1D TCTCAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1998 hom 19 6 11 2 A 13 12 188457 CASAVA_Build 12 48202079 1I TTTTCATCTG -/A AAAAAAAAAA 1873 het 1873 ref 22 11 6 5 A 13 14 188458 CASAVA_Build 12 48202279 5I ATTTGCAAAG -----/TTGAT TTGACTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 TTGAT 0 1 188459 CASAVA_Build 12 48223922 1D AGAGTGGCTG C/- CCCCCCAGCC 2291 het 1399 hom 20 5 5 10 C 7 6 188460 CASAVA_Build 12 48233195 1D TGGAAATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2997 hom 37 11 21 6 T 11 10 188461 CASAVA_Build 12 48243239 2D TCACACATGC CT/-- CTCTGCCTTA 3070 het 3070 ref 41 18 16 9 CT 3 2 188462 CASAVA_Build 12 48245858 2I CAGCCTGGTT --/CA GTGGCCATGG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 CA 0 1 188463 CASAVA_Build 12 48276536 1I TGATGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 11 12 188464 CASAVA_Build 12 48474663 1D TGACCCCCCC A/- CCAGCTGCTT 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 A 1 0 188465 CASAVA_Build 12 48498466 4D TGCAGTGGTG CAAT/---- CAATCATGGC 2117 het 2117 ref 25 12 5 9 CAAT 2 1 188466 CASAVA_Build 12 48503698 1I TCTATACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 11 12 188467 CASAVA_Build 12 48522436 1I GCCTACTCAC -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 T 7 8 188468 CASAVA_Build 12 48535138 1D TGTTTTCCTT C/- CTCTGTCTAC 3070 hom 154 het 61 0 51 10 C 2 1 188469 CASAVA_Build 12 48536958 1I GATTACTAGA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 7 8 188470 CASAVA_Build 12 48539145 15I TCTCCTAGGT ---------------/ATATACCCGAAAGAA GTGAAAACAC 3070 hom 141 het 50 0 48 3 ATATACCCGAAAGAA 0 1 188471 CASAVA_Build 12 48539419 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 30 2 17 11 A 12 13 188472 CASAVA_Build 12 48558112 2I GTATATGTGC --/GT GTGTATGTGT 3070 hom 161 het 66 0 53 14 GT 2 3 188473 CASAVA_Build 12 48558235 2D CATGTGTATA TG/-- TGTGTGCATA 3070 hom 182 het 69 0 61 9 TG 4 3 188474 CASAVA_Build 12 48558437 6D CATGTGTGTA TATGTG/------ TGTGTCTGTG 2931 het 2931 ref 51 24 8 24 TATGTG 1 0 188475 CASAVA_Build 12 48558615 2I21M2D11M2D10M2I TGTGAGTGTA --TATGTTCATGTGTATATGTACATGTGTATGTGTATGTGTGCATGTG--/TGTATGTTCATGTGTATATGTAC--GTGTATGTGTA--TGTGCATGTGTA TATGTGTGCA 3070 het 3070 hom 51 23 19 50 N/A 0 0 188476 CASAVA_Build 12 48559273 4D TGTATGTGCA TGTG/---- TGTATGTATG 3070 hom 133 het 55 0 45 23 TG 3 1 188477 CASAVA_Build 12 48559520 24D GTATATGTGC ATGTGTATGTGCATGTGAGTGTAT/------------------------ GTGTGTATAT 3070 hom 180 het 54 0 59 9 ATGTGTATGTGCATGTGAGTGTAT 1 0 188478 CASAVA_Build 12 48559752 4I CTGTGTGCAT ----/GTGA GTGTGTGTGT 3070 hom 178 het 91 1 85 5 GTGA 0 1 188479 CASAVA_Build 12 48560002 6D ATATATGTGC GCTTGT/------ ATGTGCATGT 2219 het 2219 ref 78 24 11 45 GCTTGT 1 0 188480 CASAVA_Build 12 48560095 2I TGTATATGCA --/TG TGTGTATATA 3070 hom 177 het 79 0 59 20 TG 2 3 188481 CASAVA_Build 12 48560105 2D TGTGTATATA TG/-- TATTTATTTG 1868 het 1868 ref 78 15 12 56 TG 1 0 188482 CASAVA_Build 12 48560345 2D24M2D TGAGTGTATC TGTGTATGTGCATGTGTGTATGTGTATG/--TGTATGTGCATGTGTGTATGTGTA-- TGTGTCTGTG 3070 het 3070 hom 69 34 30 22 N/A 0 0 188483 CASAVA_Build 12 48560425 2D TGCATGTGTA TG/-- TGTGTCTATG 3070 hom 178 het 64 0 60 5 TG 3 2 188484 CASAVA_Build 12 48560499 10D36M14I TTTGTGTATG TGCATGTGTATGTGTGTGTGCATGAGTGCATGTGTATGCATGTGTA--------------/----------TGTGTGTGTGCATGAGTGCATGTGTATGCATGTGTATGTGTGTGTATATG TGTGTGTGTA 3070 het 3037 hom 72 16 10 58 N/A 0 0 188485 CASAVA_Build 12 48560605 18D58M2D TGCATGCGTG TGTGTGCATGTGTGTATCTGTGCATGTGTATATGTGCATGTGTATGTGTGTGCATGTGAGTGTATGTGCATGTGTGTA/------------------TGTGCATGTGTATATGTGCATGTGTATGTGTGTGCATGTGAGTGTATGTGCATGTGTG-- TATATATGCA 3070 het 271 hom 49 3 48 72 N/A 0 0 188486 CASAVA_Build 12 48560775 6D12M2D TGCGTGTATA TGTGTGTGTGTATGTGTGCA/------TGTGTATGTGTG-- TGTGTGTGTG 3070 het 2647 hom 72 19 27 38 N/A 0 0 188487 CASAVA_Build 12 48564286 1I AAAAAAAAAA -/C AAACAAAAAA 3070 hom 4 het 31 2 24 5 C 0 1 188488 CASAVA_Build 12 48575111 5I GGTGTGGAGC -----/GGGCA GGGCAGGGCA 3070 hom 57 het 26 0 19 7 GGGCA 3 4 188489 CASAVA_Build 12 48621230 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAACCC 2967 het 401 hom 22 7 12 3 AC 0 1 188490 CASAVA_Build 12 48642442 3D TGAGTGCCCT GGG/--- GGGGGGGTGG 3070 hom 26 het 12 0 8 4 G 10 7 188491 CASAVA_Build 12 48645834 1D ACAGGGTACC A/- GGGGACCCCA 3070 hom 93 het 38 0 30 8 A 1 0 188492 CASAVA_Build 12 48651968 1D CATGGGGGTT G/- GGGGGGGTAC 3070 het 186 hom 37 5 14 18 G 8 7 188493 CASAVA_Build 12 48661875 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2805 het 1362 hom 19 5 10 4 A 15 14 188494 CASAVA_Build 12 48689517 1I GAAATCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 20 1 14 5 T 10 11 188495 CASAVA_Build 12 48690986 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 14 1 12 1 A 10 11 188496 CASAVA_Build 12 48693108 2D AGTGAAACTC TT/-- GTTTCAAAAA 2468 het 1671 hom 17 5 6 7 T 2 0 188497 CASAVA_Build 12 48700314 1I CGCAACTTCC -/A ATTTTCAGGG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 1 2 188498 CASAVA_Build 12 48700395 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 11 12 188499 CASAVA_Build 12 48714952 1D CTCTCTCATC A/- AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 26 15 5 6 A 17 16 188500 CASAVA_Build 12 48722884 5D ATCAGGCTGA CTCAT/----- CTCATGTCTT 3070 het 3070 ref 41 25 11 6 CTCAT 2 1 188501 CASAVA_Build 12 48728300 1I CCAAACCATC -/T CCAATCAACT 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 T 0 1 188502 CASAVA_Build 12 48742660 1D ATGCTTTTGC A/- AAGTATAGCG 3070 het 3070 hom 31 10 16 6 A 3 2 188503 CASAVA_Build 12 48747168 2I AAACTAAAAC --/AT ATGTGTCTCT 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 AT 1 2 188504 CASAVA_Build 12 48771817 19D TTAGTAGAGA CGGGGCTTCACCATGTTTG/------------------- CCAGGCTGAT 2046 het 2046 ref 13 5 5 3 CGGGGCTTCACCATGTTTG 1 0 188505 CASAVA_Build 12 48806212 1D GAATACTGGA T/- TTTTTTTTTT 1495 het 787 hom 28 7 5 17 T 17 16 188506 CASAVA_Build 12 48806891 1I TTTAGGATTA -/G GATGGACAAT 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 G 1 2 188507 CASAVA_Build 12 48808733 2D TATCTCTAAT AA/-- AAAAGAATAA 3070 het 2539 hom 23 6 12 5 A 6 4 188508 CASAVA_Build 12 48809869 4D ACTTTTAATC ACAA/---- ACAAACAATA 2066 het 2066 ref 32 23 6 3 ACAA 3 2 188509 CASAVA_Build 12 48812474 2D AATAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2597 hom 22 8 12 2 A 12 10 188510 CASAVA_Build 12 48814345 3I GGGAGAATCC ---/CTT AAGCCCAGGT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 CTT 0 1 188511 CASAVA_Build 12 48820032 2I ACCTTAGCCT --/CC CAAAGTGAGG 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 C 1 3 188512 CASAVA_Build 12 48823455 3I ATACATATCC ---/TTG TTTTGTCTCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TTG 0 1 188513 CASAVA_Build 12 48825721 1D GGTGGGGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 10 9 188514 CASAVA_Build 12 48845050 1I GCCTTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 2938 het 2938 ref 32 11 11 10 T 11 12 188515 CASAVA_Build 12 48849929 1I TGTTTGCATG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 T 7 8 188516 CASAVA_Build 12 48855644 1I TCCAGAAAAA -/T TTTGTCTTCC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 3 4 188517 CASAVA_Build 12 48855734 2D CTATTCAACT AA/-- AACTTAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 4 2 188518 CASAVA_Build 12 48885292 1D CACGCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 2255 het 1637 hom 29 9 10 10 T 15 14 188519 CASAVA_Build 12 48913351 58D TGCCAGGAAG ATTAAATGTAATCATGTGTAAAAACATTTTGAAATTAGTTAAGTCCATACAGCAATGC/---------------------------------------------------------- ATTAATTCCA 3070 het 3070 ref 39 49 12 5 ATTAAATGTAATCATGTGTAAAAACATTTTGAAATTAGTTAAGTCCATACAGCAATGC 1 0 188520 CASAVA_Build 12 48928199 1D AATTTTAATT A/- ACTTAAACTG 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 A 2 1 188521 CASAVA_Build 12 48935098 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAC 2310 het 2310 ref 26 13 7 6 A 9 10 188522 CASAVA_Build 12 49045701 4D GAGTGGCCAA AATG/---- AAGTTCAGTC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AATG 1 0 188523 CASAVA_Build 12 49047740 6D CATGTGCGTG CACACA/------ CACACACACA 3070 hom 78 het 27 0 26 3 CA 12 9 188524 CASAVA_Build 12 49052467 1D CATAGTGAAA C/- CCCCGTCTCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 5 4 188525 CASAVA_Build 12 49056797 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 27 0 17 10 T 13 12 188526 CASAVA_Build 12 49057409 1D CAAACCAGAA G/- TGAAAAACAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 G 1 0 188527 CASAVA_Build 12 49057529 4I TGGGAGAAAA ----/TACT TACGAACTTG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TACT 0 1 188528 CASAVA_Build 12 49058275 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 12 3 A 12 11 188529 CASAVA_Build 12 49060015 4D GGAAAAGGTG GAAA/---- GAAAGAAGGA 3070 hom 147 het 54 0 48 9 GAAA 2 1 188530 CASAVA_Build 12 49061038 1I CACAGGCACA -/G GTGCCGACTC 3070 hom 102 het 38 0 31 7 G 1 2 188531 CASAVA_Build 12 49064719 1D TTGATTTTCA G/- CAAAGATGCC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 G 1 0 188532 CASAVA_Build 12 49079454 4I TTATTTCATT ----/TTTA TTTATTTATT 2643 het 2513 hom 17 7 6 4 TTTA 2 3 188533 CASAVA_Build 12 49080524 1I AGTATCATAG -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 57 het 24 0 18 6 T 6 7 188534 CASAVA_Build 12 49083986 5I TAGTGATAAG -----/GAAAC TAAGGCAGCT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 GAAAC 0 1 188535 CASAVA_Build 12 49085502 1D TTATTTACAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 10 9 188536 CASAVA_Build 12 49097397 1D TGCGCTCCAG C/- CTGGGTGACA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 C 2 1 188537 CASAVA_Build 12 49101190 2I TAGTAGAGAC --/AG GGTTTCGCTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AG 0 1 188538 CASAVA_Build 12 49102023 1I ATTGGTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 15 16 188539 CASAVA_Build 12 49110202 1D GAGCCCAGGA G/- TTTGAGAACA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 1 0 188540 CASAVA_Build 12 49112116 1I AACCCAGGAT -/G GTGGAGTATG 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 G 1 2 188541 CASAVA_Build 12 49115531 5I CTATTTTGTT -----/TATTC TTTTCAGAGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TATTC 0 1 188542 CASAVA_Build 12 49118543 2I TCTTTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 A 12 14 188543 CASAVA_Build 12 49124306 1D GTCTTACTGA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 8 7 188544 CASAVA_Build 12 49136971 2D GTAATATAAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 11 9 188545 CASAVA_Build 12 49147908 1I TCTAATTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 79 hom 32 1 28 3 T 10 11 188546 CASAVA_Build 12 49147918 1I TTTTTTTTTT -/A AATTATAACA 3070 het 133 hom 37 3 31 3 A 2 3 188547 CASAVA_Build 12 49149988 4D AAAAATAAAT AGGC/---- AGGCACATTG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 AGGC 2 1 188548 CASAVA_Build 12 49150271 1D AACCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 233 hom 21 1 17 3 A 12 11 188549 CASAVA_Build 12 49152551 1I ATTTCATTAA -/T TTTTTTTTTA 2339 het 2339 ref 31 13 8 10 T 9 10 188550 CASAVA_Build 12 49156741 1I TGATTCCCCC -/T GAATACCCCC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 0 1 188551 CASAVA_Build 12 49160817 1D AGACCCCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2298 hom 40 11 19 10 A 12 11 188552 CASAVA_Build 12 49160927 1D TCAAGCCCAG C/- CTAGAGTATT 1744 het 1744 ref 38 25 5 8 C 2 1 188553 CASAVA_Build 12 49164495 1D48M1D CAGCCCTGGG TTTTTTTTTTCATTTGTTTGTTTTGTGGAGACACGCTCTTGTTTTGTTGC/-TTTTTTCTTCATTTGTTTGTTTTGTGGAGACACGCTCTTGTTTTGTTG- CCAGGCTGGT 3070 het 3070 ref 25 13 10 9 N/A 0 0 188554 CASAVA_Build 12 49168513 1I GTGTAATCAA -/T TTTTTTTTTT 2195 het 2098 hom 40 9 10 21 T 17 18 188555 CASAVA_Build 12 49171691 1I CTTTTCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 935 hom 27 3 16 8 T 13 14 188556 CASAVA_Build 12 49185912 1I TCATAAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 T 11 12 188557 CASAVA_Build 12 49187965 1D TCTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 21 11 T 11 10 188558 CASAVA_Build 12 49189190 2D TTTTAAGAAG CT/-- CTGAGTCTGC 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 CT 2 1 188559 CASAVA_Build 12 49189739 2I GAGGAAAAAG --/AA GAGATGTTGG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 0 2 188560 CASAVA_Build 12 49199859 1I TTCTTGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 45 1 31 13 T 11 12 188561 CASAVA_Build 12 49206794 1I TCAAGCGATT -/C TCCTGCCTCA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 0 1 188562 CASAVA_Build 12 49208486 1D CCTGCTTTCC A/- AAAAAAAAAA 1015 het 1015 ref 33 24 3 6 A 12 11 188563 CASAVA_Build 12 49216918 1I AATAATTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2867 hom 23 7 13 3 T 12 13 188564 CASAVA_Build 12 49218674 1I TCTTCCTGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 T 9 10 188565 CASAVA_Build 12 49238150 3D CGCGGTAGCG TCC/--- TAAGCCTGTA 3070 hom 87 het 33 0 29 5 TCC 1 0 188566 CASAVA_Build 12 49241667 4D TTGTTGTATT ATTG/---- ATTGATTGAG 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 ATTG 3 2 188567 CASAVA_Build 12 49245999 1D CCATTTCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 9 11 4 T 10 9 188568 CASAVA_Build 12 49263352 1I CATCTACACG -/T TTTTTTTTTT 2120 het 2120 ref 43 26 9 8 T 10 11 188569 CASAVA_Build 12 49281383 1D ATATCTATAT A/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 1 0 188570 CASAVA_Build 12 49297210 1D ATCTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 22 3 10 9 T 14 13 188571 CASAVA_Build 12 49301503 1I TAGTTTTCCA -/C CCAAGTACAC 3070 hom 137 het 51 0 44 7 C 2 3 188572 CASAVA_Build 12 49305901 1D ACCATACATT C/- CCCCCCCCAA 3070 het 2466 hom 33 10 19 4 C 9 8 188573 CASAVA_Build 12 49306825 1D AACTAATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2247 hom 29 9 14 6 T 17 16 188574 CASAVA_Build 12 49318915 1I GTGTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1933 hom 43 5 31 7 T 12 13 188575 CASAVA_Build 12 49331715 2D CCGGGCTCTC TA/-- TTGTTCCGTT 3070 het 3070 hom 38 13 22 5 TA 1 0 188576 CASAVA_Build 12 49371807 4D CTTAAATAAG GATT/---- GATTAAGTTA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 GATT 2 1 188577 CASAVA_Build 12 49379915 6D CCTGTCTCAA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 2837 hom 37 11 14 15 AC 12 9 188578 CASAVA_Build 12 49410867 7I AAATTCATAC -------/TCATTCT TCATTCTTCA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 TCATTCT 1 2 188579 CASAVA_Build 12 49433416 1D TATCTCTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 107 het 42 0 33 9 A 10 9 188580 CASAVA_Build 12 49442938 2I AAATATTCTG --/AA AAGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 2 4 188581 CASAVA_Build 12 49452369 2D GCTCCATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1138 het 1138 ref 20 9 3 8 T 18 16 188582 CASAVA_Build 12 49452727 2D AATATATTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 TC 9 8 188583 CASAVA_Build 12 49462292 2D12M4D CTGTTTTTTT TGTTTGTTTGTTTATTTG/--TTTGTTTGTTTA---- TTTGTTTGTT 2074 het 2074 ref 12 6 6 0 N/A 0 0 188584 CASAVA_Build 12 49463111 2D CCATTTCTCT CA/-- CTAATTTTTT 3070 het 2914 hom 35 9 19 7 CA 1 0 188585 CASAVA_Build 12 49472661 1I ACCTATAATA -/T TATAAACCAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 1 2 188586 CASAVA_Build 12 49473742 4I10M3I AGATTTTTCT ----TAATTATTGG---/TAAATAATTATTGGTTA TTATTTCTTA 3070 het 3070 hom 17 8 8 2 N/A 0 0 188587 CASAVA_Build 12 49476751 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2263 het 746 hom 17 4 6 9 A 15 14 188588 CASAVA_Build 12 49486746 1D TGTACTTGTG A/- AAAAAAAAAA 1588 het 1588 ref 40 25 6 9 A 13 12 188589 CASAVA_Build 12 49493871 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 A 12 11 188590 CASAVA_Build 12 49500225 2I GTTATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 TG 8 9 188591 CASAVA_Build 12 49501508 3D TTTTTCAACA GAT/--- GATAATATAT 3070 het 3070 hom 56 25 26 7 GAT 2 1 188592 CASAVA_Build 12 49509061 1I CTCAGGCCTA -/G AATGGAGGCC 1716 het 1716 ref 40 34 5 1 G 0 1 188593 CASAVA_Build 12 49511368 1I TGAACTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 541 hom 35 2 22 11 T 15 16 188594 CASAVA_Build 12 49522009 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 340 hom 46 1 38 7 A 9 10 188595 CASAVA_Build 12 49528236 1D GGTTGTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 33 3 20 10 A 13 12 188596 CASAVA_Build 12 49529560 8I ATAACCTTAA --------/ATCCTCTC ATCCTCTCAT 3070 hom 132 het 50 0 43 7 ATCCTCTC 1 2 188597 CASAVA_Build 12 49536691 1I GTTTTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 38 2 32 4 A 10 11 188598 CASAVA_Build 12 49536911 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 79 het 31 0 26 5 T 10 9 188599 CASAVA_Build 12 49537497 2I CCTCTAACTC --/TT GTCTGCACTG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 0 2 188600 CASAVA_Build 12 49541440 2D ATTATTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 29 7 T 12 10 188601 CASAVA_Build 12 49547897 1I AACAATTATC -/A GCCAAGAATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 0 1 188602 CASAVA_Build 12 49549227 1D AAATTGAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 10 9 188603 CASAVA_Build 12 49550389 1I ACACAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 22 1 15 6 A 11 12 188604 CASAVA_Build 12 49554908 1I TACAAAAAAA -/T TCCCTAGGAA 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 T 1 2 188605 CASAVA_Build 12 49558251 1I TATTTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 2072 het 2040 hom 31 9 10 12 A 15 16 188606 CASAVA_Build 12 49558475 1I CTGCAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 9 10 188607 CASAVA_Build 12 49560700 9D CTGGATATCT ACCAAAGAC/--------- AAATGAAAAC 3070 het 3070 ref 53 29 25 3 ACCAAAGAC 1 0 188608 CASAVA_Build 12 49571307 2I ACATTTTGCC --/CT GTTTACACTC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 CT 0 1 188609 CASAVA_Build 12 49600474 1I TGATTGGCTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 8 9 188610 CASAVA_Build 12 49620064 1I ACACCACTGC -/A ACTCAAACCA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 1 2 188611 CASAVA_Build 12 49658657 1D AAACCTGCAC G/- CTGTGCACAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 G 1 0 188612 CASAVA_Build 12 49665969 1D TGTTTCAGTA T/- TTTTTGTATC 3070 hom 135 het 52 0 45 7 T 6 5 188613 CASAVA_Build 12 49670100 3D CTAGCTTCCT ACA/--- ACAACTATAT 3070 het 2712 hom 28 10 16 2 ACA 2 1 188614 CASAVA_Build 12 49670236 2D ACTCTAGAAT GA/-- GAGAGTCAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 GA 3 2 188615 CASAVA_Build 12 49674868 1D TCCTTCTACA C/- CCACAGGTCA 3070 hom 126 het 44 0 42 2 C 3 2 188616 CASAVA_Build 12 49681716 1D AAATTATAGG A/- AAAAAAAAAA 1664 het 1664 ref 34 23 4 7 A 11 10 188617 CASAVA_Build 12 49707226 1D AACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 1839 het 32 hom 8 1 5 2 A 15 14 188618 CASAVA_Build 12 49711256 4D TAAAACAGAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2466 het 1659 hom 24 8 9 7 T 18 14 188619 CASAVA_Build 12 49722187 3D TTGAGGACAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 40 0 31 10 T 14 11 188620 CASAVA_Build 12 49733163 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 25 0 18 8 A 12 11 188621 CASAVA_Build 12 49752692 2I AGCCTCTCTC --/GA TCTCGAAGAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 GA 0 1 188622 CASAVA_Build 12 49758448 1D GCCAGGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 32 1 27 4 A 11 10 188623 CASAVA_Build 12 49764080 1I TGTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2674 hom 27 het 11 0 10 1 A 13 14 188624 CASAVA_Build 12 49773491 1I CATTTCTATA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 2 3 188625 CASAVA_Build 12 49777003 1I CCTGTAATAA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 73 hom 28 1 24 3 T 6 7 188626 CASAVA_Build 12 49778527 1D AATACAAAAA T/- TAGCCAGGCG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 2 1 188627 CASAVA_Build 12 49779528 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 42 1 25 17 A 15 14 188628 CASAVA_Build 12 49791162 1D AATTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 T 12 11 188629 CASAVA_Build 12 49796671 1D AGATATAATC T/- TTTTTTTTTT 1562 het 1562 ref 30 17 4 9 T 15 14 188630 CASAVA_Build 12 49798905 1D ACTGCAATGC T/- TTGGAAAGCC 3070 hom 138 het 52 0 47 6 T 3 2 188631 CASAVA_Build 12 49804149 1I GCTACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 36 0 25 11 T 10 11 188632 CASAVA_Build 12 49809565 6D ACCCCGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3059 het 3 hom 16 0 11 5 A 22 16 188633 CASAVA_Build 12 49809887 1I AAAACTGGGG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 25 2 20 3 A 0 1 188634 CASAVA_Build 12 49810035 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 188635 CASAVA_Build 12 49813194 1D ACTAAAAAAA G/- AAAGGTACAT 1565 het 1565 ref 41 29 7 6 G 1 0 188636 CASAVA_Build 12 49815164 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2906 het 390 hom 14 2 9 3 A 12 11 188637 CASAVA_Build 12 49815486 1D CACACACACA C/- AAAAAAAACA 1763 het 1168 hom 30 6 6 18 C 1 0 188638 CASAVA_Build 12 49816353 1D GACTCTAAAT A/- AAAAAAAAAA 2749 het 142 hom 12 2 8 2 A 15 14 188639 CASAVA_Build 12 49816700 1I AAAAACTACA -/C CATAGGCTGG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 C 1 2 188640 CASAVA_Build 12 49819814 5D TCTCTTCTAC CTCAA/----- CTCAATTGCT 3070 hom 123 het 45 0 40 8 CTCAA 2 1 188641 CASAVA_Build 12 49821154 2I ATTTTTTACA --/TT TTTTTTTTGG 1823 hom 12 het 6 0 5 1 T 8 10 188642 CASAVA_Build 12 49833449 2D TCATTTAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 27 5 T 12 10 188643 CASAVA_Build 12 49833617 2I GAACTACTCA --/CT CTCCCCTCTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 CT 1 2 188644 CASAVA_Build 12 49834097 1D GTTACTTTGA T/- TTTTTTACTA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 6 188645 CASAVA_Build 12 49836096 14D TTTTTGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 26 1 22 5 A 26 12 188646 CASAVA_Build 12 49837068 1D TCTTTTTTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 328 hom 18 1 16 1 C 1 0 188647 CASAVA_Build 12 49837515 1D ACAGGAATGT G/- TTATTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 1 0 188648 CASAVA_Build 12 49841737 2D CTCAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 215 hom 3 het 7 0 1 7 AT 1 0 188649 CASAVA_Build 12 49847450 1D CTGATTGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 27 1 21 5 T 12 11 188650 CASAVA_Build 12 49848145 1D AATTAAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 143 hom 35 1 30 4 A 9 8 188651 CASAVA_Build 12 49870960 1D AATGAAGTCC T/- TTTGAGGAGT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 4 3 188652 CASAVA_Build 12 49875561 1D CACTTGGAAT A/- ATAGTAGGCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 1 188653 CASAVA_Build 12 49881595 3I AAAAAAAAAA ---/AAC CAAAAAAATT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AAC 0 1 188654 CASAVA_Build 12 49885517 1D CTCAGAACAC T/- TAAGTCTCCC 3070 hom 108 het 37 0 34 3 T 2 1 188655 CASAVA_Build 12 49898328 1I CCCCTCCGAG -/C GTGCCGCGGA 3070 hom 41 het 18 0 13 5 C 0 1 188656 CASAVA_Build 12 49927303 1D ATATTTTTAC A/- ATAAGTGAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 2 1 188657 CASAVA_Build 12 49932147 1I CTACATCAGA -/T TTTTTTTTTT 2659 het 1354 hom 27 4 10 13 T 15 16 188658 CASAVA_Build 12 49932887 1I AAGAGAATCA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 7 8 188659 CASAVA_Build 12 49939668 1D AAGTACTTAT G/- GGGGGGTCCC 3070 hom 92 het 35 0 31 4 G 7 6 188660 CASAVA_Build 12 49946520 1I TTGACTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 35 1 25 9 A 13 14 188661 CASAVA_Build 12 49947548 1D CCCCTAACTC T/- TTTTTTTTTT 981 het 19 hom 11 0 3 8 T 15 14 188662 CASAVA_Build 12 49968803 1D ATCCTAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 24 0 11 13 T 15 14 188663 CASAVA_Build 12 49969273 3D AATGTATCTT AAA/--- AAAAAGTCTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 8 5 188664 CASAVA_Build 12 49974710 12D53M14D TGTGTGCATG TTACATTTAGTATTACATTTAGTATTTATTTCCATGCGTATTATTTTATGTGTGAAACATACATGCACACATAAAACAA/------------TTACATTTAGTATTTATTTCCATGCGTATTATTTTATGTGTGAAACATACATG-------------- CACACATAGA 3070 hom 84 het 30 0 28 13 N/A 0 0 188665 CASAVA_Build 12 49989606 1D TTTTTCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 31 0 26 5 T 11 10 188666 CASAVA_Build 12 50002659 1D TCTTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 1661 het 1661 ref 42 30 8 4 T 13 12 188667 CASAVA_Build 12 50036216 16D TATATATGTG TGTGTGTATATATATA/---------------- TGTGTGTATA 2005 het 2005 ref 21 11 5 6 TGTGTGTATATATATA 2 1 188668 CASAVA_Build 12 50048285 1I GCAGTCACCC -/A AAGGCCTTGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 3 188669 CASAVA_Build 12 50065812 1D GGACCAGAGA G/- GCCATGCCAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 G 2 1 188670 CASAVA_Build 12 50070776 2D GAGCTCAGAG CA/-- CAGAGTTAAC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 CA 2 1 188671 CASAVA_Build 12 50072623 1I ATTCCGTATC -/A AAAAAAAAAA 1279 het 248 hom 14 1 7 6 A 15 16 188672 CASAVA_Build 12 50073105 4D TTCTTTCTTA CTCT/---- CTCTGTCTCT 3070 hom 37 het 19 0 11 10 CT 4 2 188673 CASAVA_Build 12 50076551 1I TTTTAAAAAA -/T ATCAAAATTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 0 1 188674 CASAVA_Build 12 50084899 1I CTTTTGTCTC -/T TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 5 6 188675 CASAVA_Build 12 50089084 1D ATATATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 11 10 188676 CASAVA_Build 12 50093025 1D CTATTTTTAG T/- TTTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 6 5 188677 CASAVA_Build 12 50113921 11D TTTTTTTTTT TTTTTTTTTGG/----------- TTGGTTTTTT 3070 het 1491 hom 29 6 19 5 TTTTTTTTTGG 1 0 188678 CASAVA_Build 12 50120462 1D TCTCTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2255 hom 42 10 14 18 T 15 14 188679 CASAVA_Build 12 50124516 4D ATGTTCGTGA TAAT/---- TGATTGTACT 3070 het 3070 hom 47 21 21 6 TAAT 1 0 188680 CASAVA_Build 12 50125905 1D TCATTTCTGA C/- CCCCCCCAAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 C 8 7 188681 CASAVA_Build 12 50136241 4D GACAGGAGGT GATA/---- GATAGAGGGA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 GATA 2 1 188682 CASAVA_Build 12 50140443 1D AGACCCTGTC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 6 5 188683 CASAVA_Build 12 50142042 1I AAAGCTGATT -/A AAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 4 5 188684 CASAVA_Build 12 50144169 1D TGAGCTCTGA C/- CCTCCCTTCC 3070 het 3070 hom 47 16 28 3 C 3 2 188685 CASAVA_Build 12 50146587 5D TGCATCAAAC TTAAA/----- TTAAACTCAT 3070 het 3070 ref 39 18 19 6 TTAAA 2 1 188686 CASAVA_Build 12 50156958 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1351 het 1351 ref 22 6 7 9 T 17 16 188687 CASAVA_Build 12 50158991 5I CTTCCCTGTG -----/CCTCA CCTCATCTGC 3070 hom 149 het 56 0 48 8 CCTCA 1 2 188688 CASAVA_Build 12 50174465 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2847 hom 35 12 14 9 T 15 14 188689 CASAVA_Build 12 50182589 1I GCCTGACCTC -/T TTTTTTTTTT 2647 het 1590 hom 22 4 8 10 T 11 12 188690 CASAVA_Build 12 50188492 1D TGTCTCTTGA G/- GATACATTCC 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 G 2 1 188691 CASAVA_Build 12 50199545 1I GATATGCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 43 2 29 12 T 11 12 188692 CASAVA_Build 12 50219214 4I CTTGGGTACA ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 TTTC 3 4 188693 CASAVA_Build 12 50231410 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2106 hom 20 7 10 3 A 11 12 188694 CASAVA_Build 12 50238812 2D AAAATTTCAC TT/-- TGTTATGAGA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 3 1 188695 CASAVA_Build 12 50253291 1I TAGAGGGTTT -/C GAGTAGAGTA 3070 hom 132 het 51 0 44 7 C 0 1 188696 CASAVA_Build 12 50258325 1D GAGTATTGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 9 8 188697 CASAVA_Build 12 50294836 1I CTGTATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1971 hom 35 7 15 13 T 15 16 188698 CASAVA_Build 12 50295192 1D TAATATTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 10 9 188699 CASAVA_Build 12 50328097 2D TGCTGCAAAC TG/-- GCCTCTGGGG 3070 hom 93 het 34 0 25 10 TG 1 0 188700 CASAVA_Build 12 50335423 1D TTTTAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 27 0 20 7 T 12 11 188701 CASAVA_Build 12 50359145 3I ATAAAAAAAT ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 hom 4 het 17 1 14 2 A 9 12 188702 CASAVA_Build 12 50380222 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 228 het 228 ref 23 11 4 8 A 11 12 188703 CASAVA_Build 12 50391056 2D AATGCAAGAC TT/-- TTAGAAATTT 3070 hom 111 het 40 0 38 4 T 4 2 188704 CASAVA_Build 12 50394415 6I CATTTGAGAA ------/ATTTTC ATTTCCTGAG 3070 hom 81 het 33 0 28 6 ATTTTC 0 1 188705 CASAVA_Build 12 50396222 1I CTGTATCTAC -/A AAAAAATATA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 6 7 188706 CASAVA_Build 12 50403899 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 24 1 17 6 A 13 12 188707 CASAVA_Build 12 50408783 8D CCTGTTTCCC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 20 0 15 6 A 22 14 188708 CASAVA_Build 12 50422639 1I CCATTGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1083 hom 44 6 26 12 T 11 12 188709 CASAVA_Build 12 50427915 1I CACACACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 31 0 23 8 A 11 12 188710 CASAVA_Build 12 50437364 1I CATGGTCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 813 hom 52 2 37 13 T 10 11 188711 CASAVA_Build 12 50445706 1I TTTGTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 32 1 24 7 T 10 11 188712 CASAVA_Build 12 50448416 5D AATTTGTTCT TAAAA/----- TATGATGACA 3070 hom 96 het 35 0 32 6 TAAAA 1 0 188713 CASAVA_Build 12 50460049 3I GGAGCCACAG ---/TTC TTCTTGGGAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TTC 1 2 188714 CASAVA_Build 12 50461778 3D GGTGGTAATA GTT/--- GTCCTGTGGT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 GTT 1 0 188715 CASAVA_Build 12 50476147 2I TTTATTAGAC --/CA CAGTTTCCTT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 CA 1 2 188716 CASAVA_Build 12 50477461 3I TTAACAAAAT ---/AAG GAGGAAATAC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 AAG 0 1 188717 CASAVA_Build 12 50485007 2D TGCTAGCATT AG/-- AGAATAAGTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AG 2 1 188718 CASAVA_Build 12 50485886 1I AAAATGTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 28 1 21 6 T 11 12 188719 CASAVA_Build 12 50506223 1D GCTGGGCCCG C/- CCCCCCCACA 3070 hom 43 het 21 0 13 8 C 8 7 188720 CASAVA_Build 12 50521290 1D AAAAGATACT G/- GGGGGAGGGT 3070 het 3070 ref 37 15 15 8 G 6 5 188721 CASAVA_Build 12 50523596 1D AGACAATCTC A/- AAAAAAAAAA 1919 het 1919 ref 42 26 7 9 A 15 14 188722 CASAVA_Build 12 50525512 1D TGGCTCACCG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 33 het 28 0 16 12 C 10 9 188723 CASAVA_Build 12 50525825 1D CAGTCGGAGC T/- TGGGGGGAGA 3070 hom 38 het 23 0 15 8 T 2 1 188724 CASAVA_Build 12 50567835 2D GTTCAGGTGA CC/-- CCCCTGGAGA 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 C 6 4 188725 CASAVA_Build 12 50571477 2I GCTCTCAACC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 TA 5 6 188726 CASAVA_Build 12 50571836 2D AGGATAGATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 34 2 13 19 A 14 12 188727 CASAVA_Build 12 50574545 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2150 het 1029 hom 12 5 6 2 T 11 10 188728 CASAVA_Build 12 50658751 1I GCGTGGTGGC -/G GGCGCCTGTA 821 hom 12 het 5 0 3 2 G 2 3 188729 CASAVA_Build 12 50691657 1D AATTAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 35 0 25 10 T 13 12 188730 CASAVA_Build 12 50696532 3D ACCCAGCTAA TTG/--- TTGTATTTTT 3070 hom 47 het 23 0 16 7 TTG 2 1 188731 CASAVA_Build 12 50765732 8I TAACCCTGAA --------/ACAGTACT ACAGTACTAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 ACAGTACT 1 2 188732 CASAVA_Build 12 50809846 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 23 2 18 3 A 15 14 188733 CASAVA_Build 12 50814887 1D AGGCAAGACA C/- CGTGTGCTTC 3070 hom 81 het 30 0 24 6 C 2 1 188734 CASAVA_Build 12 50814960 2D CTGTAATCCC CA/-- AACATTTTGG 3070 hom 39 het 16 0 13 4 CA 1 0 188735 CASAVA_Build 12 50830183 1D TGAAAGCCCT G/- GGGCTCAGGG 3070 hom 87 het 33 0 27 6 G 4 3 188736 CASAVA_Build 12 50853384 1I TGGGTGGCCT -/C CTCCTGGCTG 3070 hom 63 het 25 0 20 5 C 1 2 188737 CASAVA_Build 12 50864080 2D TCAGATGCCC TG/-- TGTGTGTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 TG 4 3 188738 CASAVA_Build 12 50875864 6I AAGCCTTCCC ------/TCCAAG ACATGAGCCT 3070 het 3070 ref 38 24 13 1 TCCAAG 0 1 188739 CASAVA_Build 12 50876359 2I TCTTGATCTC --/TT GACCTCATGA 2336 het 2336 ref 19 11 5 3 T 0 2 188740 CASAVA_Build 12 50877655 2D ACTACAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 18 10 T 13 11 188741 CASAVA_Build 12 50896633 10I GAGGGAAGTG ----------/GTGTGGTGAT GGGACTTATC 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 GTGTGGTGAT 0 1 188742 CASAVA_Build 12 50896682 4I CAGTGCGGGA ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 8 10 17 AC 7 9 188743 CASAVA_Build 12 50897729 1D TACAAAGGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 12 23 5 T 10 9 188744 CASAVA_Build 12 50898474 8I GAAAAAGAAA --------/AAAACTCT CTCTCTTCTC 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 AAAACTCT 0 1 188745 CASAVA_Build 12 50901548 1I GGCGTAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 27 19 8 T 11 12 188746 CASAVA_Build 12 50904227 2D AAGAGAAAAC AG/-- AAAGAATGTA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 AG 1 0 188747 CASAVA_Build 12 50905662 1D GAAGGGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 33 1 15 17 T 15 14 188748 CASAVA_Build 12 50917662 2I GTCTGAAAAC --/AT ATGGGACAAA 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 AT 1 2 188749 CASAVA_Build 12 50927887 1D ACAGCTACCA T/- TCACCGAATC 3070 het 3070 ref 45 28 11 6 T 2 1 188750 CASAVA_Build 12 50927928 6D ACAGATTATG TCATTT/------ AACCCTCACA 2123 het 2123 ref 37 24 7 8 TCATTT 1 0 188751 CASAVA_Build 12 50950139 1D GTCATCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 39 2 23 15 T 13 12 188752 CASAVA_Build 12 50953529 1D GATCAGATTG C/- CTTACACATA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 C 2 1 188753 CASAVA_Build 12 50954012 1D TGGATACACG T/- TATGACATAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 1 188754 CASAVA_Build 12 50955488 1D ATTTCATTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 8 7 188755 CASAVA_Build 12 50962154 3I TGCAAAATAG ---/AAT AGTAACTATC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 AAT 0 1 188756 CASAVA_Build 12 50963311 1I CCGGTGTGGT -/G GCAGGCACCT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 1 2 188757 CASAVA_Build 12 50972718 6D TTCTTTATTA TTTATT/------ TTTATTTTAT 3070 hom 72 het 25 0 25 2 TTTATT 2 1 188758 CASAVA_Build 12 50976715 1I CTGACTTGGG -/C CTCTCCCCAA 3070 hom 84 het 34 0 26 8 C 1 2 188759 CASAVA_Build 12 50987099 1I TCGAAGCTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 31 0 25 6 T 9 10 188760 CASAVA_Build 12 50990147 1I TCATGCCTCA -/G GATTCTGTGG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 1 2 188761 CASAVA_Build 12 50993128 1D GAAGGCGAGA G/- GCTGATATGA 3070 hom 77 het 31 0 25 7 G 2 1 188762 CASAVA_Build 12 50994358 1D CAAAGCAGGT C/- CCCAAGTTTA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 C 4 3 188763 CASAVA_Build 12 50994998 5I CTATTCTGAA -----/GGTGT GGAGGGAACC 3070 hom 78 het 30 0 24 6 GGTGT 0 1 188764 CASAVA_Build 12 50999467 1D ATCAGAGGAC A/- AAGAGGGGTT 3070 hom 74 het 27 0 24 3 A 3 2 188765 CASAVA_Build 12 51000218 1D AAATTCCACA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 135 het 56 0 42 14 T 9 8 188766 CASAVA_Build 12 51006129 3I AATAAAAAAC ---/AAG AAAATCTGAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAG 0 1 188767 CASAVA_Build 12 51014714 1D TGAACCCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 T 13 12 188768 CASAVA_Build 12 51027429 1D CCCCATCTCT G/- GAAGAGCAAG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 G 2 1 188769 CASAVA_Build 12 51029207 2D CTGAACTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 T 12 10 188770 CASAVA_Build 12 51035871 1I TATTTGGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3069 hom 35 12 14 9 T 12 13 188771 CASAVA_Build 12 51035959 1I CTTTAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 7 17 8 T 10 11 188772 CASAVA_Build 12 51038982 1I GGCAGCAGGC -/A AAGAGACCTG 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 2 3 188773 CASAVA_Build 12 51041898 1D AATGCATATA G/- AAGTGCATCA 3070 het 3070 ref 51 23 22 7 G 1 0 188774 CASAVA_Build 12 51046728 2D ACACACATGT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 hom 57 28 25 5 AC 5 4 188775 CASAVA_Build 12 51064312 3I TCCATTGGCT ---/GAG ATGTGTAGAG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 GAG 0 1 188776 CASAVA_Build 12 51072157 2D GCTATTACTG TA/-- TATAATTCAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TA 3 2 188777 CASAVA_Build 12 51072271 1I TATTTTTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 26 0 21 5 A 10 11 188778 CASAVA_Build 12 51075961 1D TCAATGAATG T/- GGGTAGGGGA 3070 hom 71 het 26 0 21 5 T 1 0 188779 CASAVA_Build 12 51097358 1D ATATCACCCT G/- GTTGTCAGCA 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 G 2 1 188780 CASAVA_Build 12 51104010 1D GGGGCAAGGG C/- TGATGCCTCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 C 1 0 188781 CASAVA_Build 12 51111246 1D ACAGCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2560 hom 38 12 14 12 T 13 12 188782 CASAVA_Build 12 51120801 1I TCTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 10 188783 CASAVA_Build 12 51130745 1I AGTTTCCTGG -/C AGGTCTGGGA 3070 het 3070 ref 53 30 18 5 C 0 1 188784 CASAVA_Build 12 51132959 4D TTTGGTGTCC CAAT/---- CAGAGTCAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 CAAT 1 0 188785 CASAVA_Build 12 51139350 1D GATTTATTGA T/- TTTTTTTTTT 2501 het 2501 ref 18 7 6 5 T 11 10 188786 CASAVA_Build 12 51144118 1I CATATTCAAT -/A AAGGACTATT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 2 3 188787 CASAVA_Build 12 51145936 1D AGCATTTAAT C/- CTTTTGGTGT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 2 1 188788 CASAVA_Build 12 51151646 3I CCTGCCAATT ---/CTC CTCTCCCAGG 3070 het 2956 hom 27 9 12 6 CTC 1 2 188789 CASAVA_Build 12 51154312 3I AGAGGAGCAG ---/AAC AACACAATGG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 AAC 1 2 188790 CASAVA_Build 12 51155342 1D ATCCCAGCAC T/- TTTTGGAGGC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 5 4 188791 CASAVA_Build 12 51160587 1D AAAAATTTGC T/- GTAGGGGTGG 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 T 1 0 188792 CASAVA_Build 12 51162896 1I CCCTTCCCCC -/T ACCCTTCCTG 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 0 1 188793 CASAVA_Build 12 51166350 11I ACAGGACAGG -----------/TCAATAGACCA ACCTTGAACC 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 TCAATAGACCA 0 1 188794 CASAVA_Build 12 51168678 3I ATTTCCTAGT ---/GAA GAAGGGGCCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GAA 1 2 188795 CASAVA_Build 12 51168736 1I CTATCTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 T 11 12 188796 CASAVA_Build 12 51169325 6D TTATGAGGGT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 het 2062 hom 30 6 19 6 TTTTTC 3 2 188797 CASAVA_Build 12 51180968 3D CTGCAACAAC CCA/--- CCATTATAGT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 CCA 2 1 188798 CASAVA_Build 12 51182155 3I TGCCTTCTCA ---/TTC TTTTGGCAGT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 TTC 0 1 188799 CASAVA_Build 12 51183414 1D TAATCATGTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 9 8 188800 CASAVA_Build 12 51184205 1D AATTTCCTTC T/- TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 7 6 188801 CASAVA_Build 12 51185045 3D TCTCTACCCC ATT/--- ATTCCATTGG 3070 het 3070 hom 33 16 15 5 ATT 2 1 188802 CASAVA_Build 12 51189340 1I TAAGGTAAGC -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 T 6 7 188803 CASAVA_Build 12 51190319 1I GGTTCTAGAT -/C TTTGAAGACT 2658 het 2658 ref 29 19 6 4 C 0 1 188804 CASAVA_Build 12 51216856 2I AAAAAAAGAC --/TA TTGTAGATTT 1052 het 359 hom 12 1 7 4 TA 0 1 188805 CASAVA_Build 12 51218945 1I GCTCAAAGGT -/G GTGGCCCTGC 3070 hom 141 het 53 0 46 7 G 1 2 188806 CASAVA_Build 12 51221304 1D GCCTTCTTCA C/- CCCGGCCCCA 3070 hom 70 het 27 0 21 6 C 4 3 188807 CASAVA_Build 12 51225675 3D AATAAAATAA GAG/--- GAGAAGAGAA 3070 hom 96 het 34 0 33 6 GAG 2 1 188808 CASAVA_Build 12 51228052 2D CCCAAAGCAC AG/-- AGTCATGAGT 3070 hom 108 het 39 0 36 5 AG 2 1 188809 CASAVA_Build 12 51238987 1D CCCCCAGAAG C/- CCCCCTCCTG 3070 hom 66 het 26 0 21 5 C 6 5 188810 CASAVA_Build 12 51239743 1I TCAACCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 28 1 24 3 T 11 12 188811 CASAVA_Build 12 51242820 2D GTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 11 T 14 12 188812 CASAVA_Build 12 51242937 1D CTGGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 12 12 T 15 14 188813 CASAVA_Build 12 51259645 3D TATGCCAATC ATG/--- AGAAAAAGGC 3070 hom 92 het 36 0 27 9 ATG 1 0 188814 CASAVA_Build 12 51306051 2I GGGGTTAAAC --/AG AGTGTCACAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 AG 1 2 188815 CASAVA_Build 12 51332691 1I TGTAGTTCTC -/T TTGTAGTTTC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 2 3 188816 CASAVA_Build 12 51341226 1D GCAATTCAGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 14 21 8 T 10 9 188817 CASAVA_Build 12 51341733 1I CATGCCTAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 8 9 188818 CASAVA_Build 12 51349938 1I TTGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 10 11 188819 CASAVA_Build 12 51359739 1I TCAAACCTAC -/A TGTGTTTTGA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 0 1 188820 CASAVA_Build 12 51365448 1I TAATAACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 34 1 26 7 A 11 12 188821 CASAVA_Build 12 51366989 1I CAAGAGAGGA -/T GGGAAAGGAG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 0 1 188822 CASAVA_Build 12 51374267 4D TCACACACTA CTAT/---- CTATTATAAA 3070 het 3070 ref 27 17 9 3 CTAT 2 1 188823 CASAVA_Build 12 51375728 4D CCCTAGTGGG ACCC/---- TAGTGTTGGG 3070 hom 60 het 24 0 21 5 ACCC 1 0 188824 CASAVA_Build 12 51391096 1D GTTAATTCAG A/- AAAAGCTCAG 3070 het 3070 ref 42 20 19 5 A 5 4 188825 CASAVA_Build 12 51401130 1I GAGAAGAGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 A 8 9 188826 CASAVA_Build 12 51406367 1D AGAAAAATAT C/- CTTACTTCTC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 C 2 1 188827 CASAVA_Build 12 51408021 1I ATATACATTT -/A AAAAAAAAAA 2575 het 922 hom 10 2 6 2 A 11 12 188828 CASAVA_Build 12 51411298 1I TTGTTTTTGA -/G GGGGGATGCA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 G 5 6 188829 CASAVA_Build 12 51413535 3I TGACTGTGTC ---/CTT CTTTGTCACT 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 CTT 1 2 188830 CASAVA_Build 12 51422398 1D CCGGGAAGGG C/- CCCCCCTCCA 3070 hom 65 het 26 0 20 7 C 7 6 188831 CASAVA_Build 12 51423823 1I TTTGATGGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 420 hom 35 1 28 6 A 9 10 188832 CASAVA_Build 12 51423979 1I GCCTGGCCAA -/C ATAGTGAAAC 3070 hom 33 het 17 0 12 5 C 0 1 188833 CASAVA_Build 12 51425144 2I AAAAAAGACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 29 0 19 10 A 14 16 188834 CASAVA_Build 12 51437644 2I CATAGAAGGA --/AC AGACTGGACT 3070 hom 141 het 53 0 46 7 AC 0 1 188835 CASAVA_Build 12 51442637 1D GACCTACCAC T/- AGGCTGATCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 0 188836 CASAVA_Build 12 51474477 1I ATCTCCTGGG -/C CCCCCAGCAC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 5 6 188837 CASAVA_Build 12 51479409 1I GTGTAAAATC -/A GAGACTCATA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 0 1 188838 CASAVA_Build 12 51481492 1D GTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2219 hom 25 het 22 0 8 14 A 17 16 188839 CASAVA_Build 12 51485843 3I TGTCCCCAAA ---/GGC TCTACCCAGA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 GGC 0 1 188840 CASAVA_Build 12 51495389 5I CATCTTGAAT -----/CCATC TGTACTCCCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CCATC 0 1 188841 CASAVA_Build 12 51496595 4D TTCCATATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 5 T 15 11 188842 CASAVA_Build 12 51507287 1I GCCATGGCGT -/C CCCATGTGCC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 3 4 188843 CASAVA_Build 12 51541655 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 18 9 A 14 12 188844 CASAVA_Build 12 51543175 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 2141 het 971 hom 26 4 13 9 A 17 18 188845 CASAVA_Build 12 51555647 14D TAGGACACAC ACACACACTCACAT/-------------- ACACATGCAC 3070 hom 53 het 30 0 15 22 ACACACACTCACAT 1 0 188846 CASAVA_Build 12 51555988 2D AAACCCACTC AA/-- GCCCCGACCC 3070 hom 90 het 34 0 29 7 A 2 0 188847 CASAVA_Build 12 51558463 1D CCCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 36 1 17 18 A 13 12 188848 CASAVA_Build 12 51558695 10I TGGTGTGCAC ----------/ATGTCTGTCT ATGTCTGTCT 3070 hom 107 het 41 0 36 5 ATGTCTGTCT 1 2 188849 CASAVA_Build 12 51561977 1D CAGGTGGCTA T/- GATTGGCAGA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 T 1 0 188850 CASAVA_Build 12 51567648 1I GAGGCCGAAG -/C CGGGCGGCTC 1182 hom 10 het 5 0 4 1 C 1 2 188851 CASAVA_Build 12 51568992 1I GAAAGCCGTA -/T GCCCAAATAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 0 1 188852 CASAVA_Build 12 51576586 1I AAGTCCCACA -/C ATTTCTAGCT 3070 hom 144 het 51 0 48 3 C 0 1 188853 CASAVA_Build 12 51583315 5D TTAGGGGCTC TCATA/----- TTCATTTTAT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 TCATA 1 0 188854 CASAVA_Build 12 51591403 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 308 hom 23 1 18 4 A 10 11 188855 CASAVA_Build 12 51609240 2D CCTTCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 33 3 12 18 T 18 16 188856 CASAVA_Build 12 51619759 2D AGTGACAGAC GG/-- GGAGACTCCC 3070 hom 57 het 24 0 20 5 G 4 2 188857 CASAVA_Build 12 51620677 2D ACACAGTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2589 hom 25 het 15 0 7 8 T 18 16 188858 CASAVA_Build 12 51629729 1I TCCATAACCA -/C CCCAACCCCT 3070 hom 83 het 35 0 18 17 C 3 4 188859 CASAVA_Build 12 51657679 1I CCTTTCCCCT -/C CCCCCCCACA 1452 het 1452 ref 38 22 6 10 C 7 8 188860 CASAVA_Build 12 51660710 3D TCTGATGGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 26 2 17 7 T 14 11 188861 CASAVA_Build 12 51661642 1I TATGTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 2510 hom 15 het 10 0 6 4 T 11 12 188862 CASAVA_Build 12 51673053 1I CTATTTCACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 10 188863 CASAVA_Build 12 51674907 6I GTGCCCGCCA ------/CCATGC CCATGCCCGG 2004 hom 15 het 9 0 5 4 CCATGC 1 2 188864 CASAVA_Build 12 51681242 1I GACCTTTTTA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 8 9 188865 CASAVA_Build 12 51681609 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2078 het 17 hom 16 1 9 6 T 18 16 188866 CASAVA_Build 12 51682300 1I GCAACAACCA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 7 188867 CASAVA_Build 12 51690616 4I CTAGGCACTC ----/TGTT TGGGTGGATC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TGTT 0 1 188868 CASAVA_Build 12 51692371 2D TTTGGGATAC AG/-- AGGCGGGCAG 3070 hom 62 het 23 0 17 7 AG 2 1 188869 CASAVA_Build 12 51696318 2D GTACGTAAAC AT/-- GTGTTTACAC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 AT 1 0 188870 CASAVA_Build 12 51708014 1D TAACTTTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 10 9 188871 CASAVA_Build 12 51709979 1I TGTTTTTTTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 188872 CASAVA_Build 12 51710117 2D TGCAAAAAAT AC/-- AAAAGTTAGC 3070 hom 48 het 18 0 15 3 AC 1 0 188873 CASAVA_Build 12 51712104 4D AGAAATCAGA CTGC/---- CTGCCTTAAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CTGC 2 1 188874 CASAVA_Build 12 51716039 25I CGACTAATTT -------------------------/TTTGTATTTTTAATAGAGACGCAGA TTTGAACGGG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TTTGTATTTTTAATAGAGACGCAGA 0 1 188875 CASAVA_Build 12 51716134 3D CATGCCTGGC CTT/--- CTATTTTTTT 2342 hom 12 het 6 0 5 1 CTT 1 0 188876 CASAVA_Build 12 51718868 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 16 0 14 3 A 10 9 188877 CASAVA_Build 12 51719917 1I TTGGTCTTTA -/T CTGAAATAGC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 0 1 188878 CASAVA_Build 12 51721561 3I TTTGTTGTTG ---/TTT TTTTTTTAAG 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 7 10 188879 CASAVA_Build 12 51722477 12D CCCCTCTGGC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 23 0 12 14 T 28 16 188880 CASAVA_Build 12 51725624 1D ATTTCTGGGT G/- GGGGGGGACA 3070 hom 79 het 33 0 25 8 G 8 7 188881 CASAVA_Build 12 51793056 1D AACTCCTGAA C/- CTCATGATCC 3051 hom 26 het 12 0 8 5 C 2 1 188882 CASAVA_Build 12 51903393 1D GGCAATGGGA G/- GGGGGTCTCT 3070 hom 25 het 12 0 8 4 G 6 5 188883 CASAVA_Build 12 51923604 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 15 14 188884 CASAVA_Build 12 51924291 1D TCCTGGATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 77 het 27 0 25 2 T 10 9 188885 CASAVA_Build 12 51925177 1D CAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 27 1 18 9 A 15 14 188886 CASAVA_Build 12 51925444 1I CACAACCTAA -/C CCCACGGATG 3070 hom 129 het 44 0 44 0 C 3 4 188887 CASAVA_Build 12 51926298 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2069 hom 13 het 6 0 5 1 A 12 11 188888 CASAVA_Build 12 51943809 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 27 0 18 9 T 9 10 188889 CASAVA_Build 12 51951153 1I TTTTTTAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 9 10 188890 CASAVA_Build 12 51958540 2I CTATTTCATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 12 14 188891 CASAVA_Build 12 51968535 2D AAGGAAGAAC AA/-- AGAGAATGGC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 3 1 188892 CASAVA_Build 12 51968883 4D ACCCCAGCAC TCTG/---- TCTATGAGCT 3070 hom 96 het 38 0 32 8 TCTG 1 0 188893 CASAVA_Build 12 51974551 1D TGGTAAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1032 hom 47 3 30 14 T 11 10 188894 CASAVA_Build 12 51975096 1D TGACAAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 24 0 18 7 T 13 12 188895 CASAVA_Build 12 51976456 1D GAGGATACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 253 hom 21 1 15 5 T 11 10 188896 CASAVA_Build 12 51977599 3I GTAGGAAAAC ---/ATT ATGTCTAGTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATT 0 1 188897 CASAVA_Build 12 51978645 2D AAAAGCTCCC CT/-- CTGTTATAAT 3070 hom 113 het 44 0 38 6 CT 2 1 188898 CASAVA_Build 12 51979545 1D GTGATGAGAT G/- GGGGGTGTGG 3070 hom 99 het 36 0 31 6 G 6 5 188899 CASAVA_Build 12 51984865 2D GGCTGGACTC AA/-- AAACTCCTGG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 5 3 188900 CASAVA_Build 12 51985171 1D CGCCCGCCTC G/- GCCTCCCAAA 1266 hom 10 het 4 0 4 0 G 2 1 188901 CASAVA_Build 12 51992617 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 17 0 11 7 A 12 13 188902 CASAVA_Build 12 51992914 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 12 11 188903 CASAVA_Build 12 51999637 7I CCAAGGCAGG -------/CAGATTA CCTGAGGTCA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 CAGATTA 0 1 188904 CASAVA_Build 12 52003420 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3061 hom 10 het 14 0 8 6 A 15 13 188905 CASAVA_Build 12 52006986 5I CAATACATAC -----/TTGAT TTATTTGAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTGAT 0 1 188906 CASAVA_Build 12 52013779 23I GCAGCAGCTG -----------------------/CTTCCCTCTCTGAACCCCACGTT CTTCCCACTG 3070 hom 88 het 33 0 26 7 CTTCCCTCTCTGAACCCCACGTT 0 1 188907 CASAVA_Build 12 52022109 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1398 hom 13 het 9 0 5 4 A 11 12 188908 CASAVA_Build 12 52031354 1D TTTTATTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 53 het 22 0 18 4 T 10 9 188909 CASAVA_Build 12 52040088 1I CCATCTCTAG -/A AAAAAATTTT 3070 hom 50 het 19 0 17 2 A 6 7 188910 CASAVA_Build 12 52044248 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 26 0 17 9 T 14 15 188911 CASAVA_Build 12 52083571 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 21 1 14 6 T 15 14 188912 CASAVA_Build 12 52086051 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 9 10 188913 CASAVA_Build 12 52130082 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2498 het 2280 hom 17 6 9 2 A 10 11 188914 CASAVA_Build 12 52136984 1D CCAAGATTAG A/- AATGTTACCT 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 A 3 2 188915 CASAVA_Build 12 52152056 1I AGGGGTTGGT -/A GGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 0 1 188916 CASAVA_Build 12 52159720 17I AGCTTCTCCC -----------------/TGGTTTTTTTTTTTTTT TGGTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 15 6 TGGTTTTTTTTTTTTTT 0 1 188917 CASAVA_Build 12 52181869 1I ATGCATTCTT -/C CCCCCCTTGC 2545 het 2545 ref 34 10 12 12 C 6 7 188918 CASAVA_Build 12 52188610 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 699 hom 30 2 26 2 A 12 13 188919 CASAVA_Build 12 52214394 3D TTAAAAAGGT AAA/--- GAAGATTCTG 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 3 0 188920 CASAVA_Build 12 52226525 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTT 2687 hom 29 het 15 0 9 6 AG 1 2 188921 CASAVA_Build 12 52228089 1D TGCCTAGCTA T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 8 7 188922 CASAVA_Build 12 52234179 4D ATGTTTTATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTTA 4 3 188923 CASAVA_Build 12 52239289 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 66 het 26 0 21 5 T 8 9 188924 CASAVA_Build 12 52241381 1D CTGTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 708 hom 31 2 16 13 A 19 18 188925 CASAVA_Build 12 52243511 1D TACCGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 27 2 22 4 A 12 11 188926 CASAVA_Build 12 52266462 1D GCCACCATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 466 hom 42 2 34 6 A 13 12 188927 CASAVA_Build 12 52276448 3D AACTCTCCAT GAG/--- TAGTATCTCC 3070 het 3070 hom 44 19 23 4 GAG 1 0 188928 CASAVA_Build 12 52279509 2I ATAAATGGAG --/AT ATATATATAT 2014 het 2014 ref 20 8 6 6 AT 6 7 188929 CASAVA_Build 12 52289209 1I TCTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2072 het 1899 hom 24 8 8 8 T 14 15 188930 CASAVA_Build 12 52293307 5I TCAAATACTT -----/AAAAC AAAATGACAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAAAC 0 1 188931 CASAVA_Build 12 52297941 4D ACAGAAGACC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2991 hom 36 10 12 16 A 15 11 188932 CASAVA_Build 12 52298754 2I TAAATGGCAA --/TT TTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 2 4 188933 CASAVA_Build 12 52300915 1I TTTGAAAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 9 10 188934 CASAVA_Build 12 52302704 1D ATTGCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1286 hom 22 8 9 5 A 17 16 188935 CASAVA_Build 12 52314120 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2064 het 936 hom 24 6 8 10 T 15 16 188936 CASAVA_Build 12 52315979 1D CTATCTTGAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 A 9 8 188937 CASAVA_Build 12 52320570 1D CATGTGGAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 10 9 188938 CASAVA_Build 12 52327702 1I TCCCCCTGGC -/A AAAAAAAAAA 2719 het 408 hom 26 2 21 3 A 12 13 188939 CASAVA_Build 12 52329044 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAC 2163 het 1374 hom 15 5 6 5 A 10 9 188940 CASAVA_Build 12 52330407 1I CCAAACCCAA -/G GTTACTAAAA 1527 het 1527 ref 12 7 4 1 G 1 2 188941 CASAVA_Build 12 52330635 1I ATATGTAAGG -/T TTTTTTTTTT 2577 het 2577 ref 29 8 9 12 T 13 14 188942 CASAVA_Build 12 52334058 1I ACCTTGACAC -/T TTTTAAAGAT 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 T 4 5 188943 CASAVA_Build 12 52337388 1D GGTTTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2539 het 2539 ref 25 11 7 7 A 11 10 188944 CASAVA_Build 12 52340906 3I ATCTCAAAAT ---/CAA CAACAACAAC 3070 hom 66 het 33 0 23 10 CAA 5 6 188945 CASAVA_Build 12 52341742 1I GCCTCATTCA -/T TTTTTTTTTT 2214 het 2214 ref 15 7 7 1 T 10 11 188946 CASAVA_Build 12 52342368 3I ACCTTAGCAC ---/TTA TTCAAAAGAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTA 0 1 188947 CASAVA_Build 12 52342798 1I TGGCCAGGAT -/G GTCTCCATCT 3070 hom 39 het 14 0 12 2 G 1 2 188948 CASAVA_Build 12 52343015 2D ATGCTATTTT GA/-- GATACGGCCC 2808 het 2808 ref 22 12 7 4 GA 2 1 188949 CASAVA_Build 12 52343335 3I AAACAACAAA ---/AAC AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 AAC 2 3 188950 CASAVA_Build 12 52345803 18I CCAAATAGGA ------------------/TGGAAGAGGCATCCAGAG TGGAAGGGTC 3070 hom 111 het 47 0 37 12 TGGAAGAGGCATCCAGAG 0 1 188951 CASAVA_Build 12 52347555 1I TGCGAAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1558 hom 29 4 14 11 T 11 12 188952 CASAVA_Build 12 52351025 1D16M9I TCATAAAGTT AAAAAAAAAAAATCTTA---------/-AAAAAAAAAAATCTTAAGTCAAATC ATCTAAAGTT 2084 het 267 hom 23 2 5 18 N/A 0 0 188953 CASAVA_Build 12 52353871 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2277 het 2277 ref 24 10 9 5 A 16 17 188954 CASAVA_Build 12 52356330 2I GAGCGCCGAC --/TG TGCAGAAATG 3070 hom 60 het 23 0 19 4 TG 1 2 188955 CASAVA_Build 12 52360750 1D GAAAAAAAAA T/- TATGAAATAT 2524 het 2524 ref 24 18 6 0 T 2 1 188956 CASAVA_Build 12 52362513 7D TCGCCCAGGC CGGACTG/------- CGGACTGCAG 649 hom 5 het 2 0 2 2 CGGACTG 2 1 188957 CASAVA_Build 12 52363209 1D TATCAAAAAA G/- AAAAAAAAAA 1991 het 1865 hom 20 7 11 4 G 1 0 188958 CASAVA_Build 12 52367624 1I ACCATTCCTT -/G GTGACTAGAA 3070 hom 86 het 34 0 29 5 G 1 2 188959 CASAVA_Build 12 52370585 1I15M3D TTTCTTTTAC -TTTTTTCTTTCTTTCTTT/TTTTTTTCTTTCTTTC--- TTTTTTTTTT 2046 het 2046 ref 25 9 6 13 N/A 0 0 188960 CASAVA_Build 12 52370714 10D GGTGTCCTTT TTCTTTGAGA/---------- TGGAGTCTTG 3066 het 3066 ref 22 13 8 2 TTCTTTGAGA 1 0 188961 CASAVA_Build 12 52375493 1I TTAACATCAC -/A ATCGGCGGCT 1881 het 1520 hom 16 5 5 6 A 1 2 188962 CASAVA_Build 12 52384475 1D CCAAGCCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 A 10 9 188963 CASAVA_Build 12 52387364 1D CTTAAAAAAA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 8 7 188964 CASAVA_Build 12 52390060 1D GAGAGGGAGA G/- GGGGGAAGGT 3070 hom 80 het 31 0 25 6 G 6 5 188965 CASAVA_Build 12 52412131 1I TGACCGGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 639 hom 31 2 22 7 A 12 13 188966 CASAVA_Build 12 52429601 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 9 10 188967 CASAVA_Build 12 52435654 1I TTTAATTACA -/C GTAAGCCCTG 3070 hom 99 het 39 0 31 8 C 0 1 188968 CASAVA_Build 12 52437086 1I AGGTGGGGGA -/G GGGGCATGGC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 G 4 5 188969 CASAVA_Build 12 52454994 1I AGTGGAGGGA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 7 8 188970 CASAVA_Build 12 52455446 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 39 1 27 11 T 11 12 188971 CASAVA_Build 12 52457074 4D GTCAGTCTGG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 111 het 45 0 38 8 TTGT 5 4 188972 CASAVA_Build 12 52458664 2D TGTGGCCTCC CT/-- CTCAATCTGT 3070 hom 123 het 46 0 40 7 CT 2 1 188973 CASAVA_Build 12 52459025 1D TTCTTTCTTT C/- TTTTTTTTTT 2670 het 314 hom 26 7 10 9 C 1 0 188974 CASAVA_Build 12 52461790 1D AGTTACTGAG C/- CAGGTGACTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 2 1 188975 CASAVA_Build 12 52487491 3D TGCAGCTTCT GTC/--- GTCACTTCTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 GTC 2 1 188976 CASAVA_Build 12 52492337 2D CTTTTCTTTC TT/-- TCTTTCTTTC 834 het 333 hom 17 2 5 10 T 3 1 188977 CASAVA_Build 12 52495830 4D CTTCTACTTC TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 TATT 6 5 188978 CASAVA_Build 12 52500187 1I AAAAAAACCC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 8 188979 CASAVA_Build 12 52504597 2D TTTTGAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 21 1 15 5 T 16 14 188980 CASAVA_Build 12 52510996 4I CACAATTGAG ----/TCTT TCATTATTAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TCTT 0 1 188981 CASAVA_Build 12 52513036 3D CATTGAAGTT AAA/--- AAAAGCAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 4 188982 CASAVA_Build 12 52517494 6D CAACATTTAC TGAGAT/------ CTTAGTATGT 3070 hom 142 het 50 0 47 4 TGAGAT 1 0 188983 CASAVA_Build 12 52517677 1I GATTAAATTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 40 1 35 4 C 0 1 188984 CASAVA_Build 12 52522635 2D CTGTCTCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 8 A 14 12 188985 CASAVA_Build 12 52524642 6D GTGCATGTGC GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 36 het 50 1 27 28 GT 12 9 188986 CASAVA_Build 12 52546373 1D GCAAAGAAAC T/- TTTACACCTG 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 T 4 3 188987 CASAVA_Build 12 52552369 1I TTTGATGGGA -/T TTTCTTTTTT 2408 het 2408 ref 32 17 7 8 T 3 4 188988 CASAVA_Build 12 52562303 1I ATATTACAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 9 10 188989 CASAVA_Build 12 52562881 5I TTGTATTTTT -----/AGTAG AGGCAGGGTT 1732 het 1732 ref 13 8 5 0 AGTAG 0 1 188990 CASAVA_Build 12 52563226 4I CCTTCCAATC ----/TAAG TAAGGTCTTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TAAG 1 2 188991 CASAVA_Build 12 52571413 1I GTAAGAGAGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 7 8 188992 CASAVA_Build 12 52585324 4I ACTATATACT ----/TAAA TAAAGTTAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAAA 1 2 188993 CASAVA_Build 12 52595406 4I GAACATGCTG ----/ATTA ATTGTGTTAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 ATTA 0 1 188994 CASAVA_Build 12 52602539 5I ACTAATAATC -----/CTTAT CTTTTGACTC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 CTTAT 0 1 188995 CASAVA_Build 12 52606194 1D TCCTATCGCG T/- GTCTGAACTA 3070 het 3070 ref 58 29 19 11 T 1 0 188996 CASAVA_Build 12 52612945 2D CTGTGATGAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 AT 7 6 188997 CASAVA_Build 12 52623639 2I ATTGGACCCC --/CT GTCTCCCATT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 CT 0 1 188998 CASAVA_Build 12 52628179 1D GGGAATAATG A/- AAAAAAAGAA 2305 het 2305 ref 22 10 6 7 A 8 7 188999 CASAVA_Build 12 52637644 1D ACTGCCTCAC G/- GGCCGGCCAG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 G 3 2 189000 CASAVA_Build 12 52642719 1D GCAGGAGGAA G/- TTCAGGCATT 3070 hom 78 het 37 0 27 10 G 1 0 189001 CASAVA_Build 12 52644264 1D50M4I AAATAAAGTT AAAAAAAAAACAACAAACCTTGGGTGTAATTGCTGGTTTAGGTTGCAGCAC----/-AAAAAAAAACAACAAACCTTGGGTGTAATTGCTGGTTTAGGTTGCAGCACTTAA TTCTCTCGCC 3070 het 122 hom 29 1 38 4 N/A 0 0 189002 CASAVA_Build 12 52646880 1D CCGCAGCCGG C/- CCGGCGAGAC 3070 hom 47 het 21 0 14 7 C 3 2 189003 CASAVA_Build 12 52648853 1I GGCAAAAGAT -/C TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 189004 CASAVA_Build 12 52650632 1D AAACTTTATG C/- CTTACTTTTA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 C 2 1 189005 CASAVA_Build 12 52657790 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 132 het 56 0 45 11 TG 5 6 189006 CASAVA_Build 12 52667991 1D GGACATTCAG A/- TTTTTTTAGA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 1 0 189007 CASAVA_Build 12 52670192 2D AGACAGAATG CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 909 hom 22 5 12 5 C 11 9 189008 CASAVA_Build 12 52674724 1I GAAGGTCTTT -/C CTGTCTTTTC 3002 het 3002 ref 19 9 9 1 C 1 2 189009 CASAVA_Build 12 52696275 6I AGGTCTAGTC ------/CCCTAG CCCTAGGTTC 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 CCCTAG 1 2 189010 CASAVA_Build 12 52707692 1D TTCTATTGCA T/- TTTTTATACA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 T 6 5 189011 CASAVA_Build 12 52729596 1I CCATGATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 808 hom 22 2 17 3 T 11 12 189012 CASAVA_Build 12 52762199 1I GCCCTCTTAT -/A AAAAAAAAGA 2353 het 2353 ref 24 13 6 5 A 8 9 189013 CASAVA_Build 12 52767601 1I GACATCCCCT -/C ACCAGTGGCA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 C 0 1 189014 CASAVA_Build 12 52774826 4D AAGTTCTTAG AATA/---- AATACATTGG 2837 het 2837 ref 26 17 8 1 AATA 2 1 189015 CASAVA_Build 12 52776855 1I TTCTTGGGGC -/T TTTTCTCAAA 3070 het 3070 ref 51 27 17 7 T 4 5 189016 CASAVA_Build 12 52777905 1I TTGGCCACTC -/A GGAAGCCACC 2988 het 2988 ref 55 40 9 6 A 0 1 189017 CASAVA_Build 12 52778901 2I TATATGTAAA --/CT CTGTTCCAGG 3070 het 3070 ref 41 31 8 2 CT 1 2 189018 CASAVA_Build 12 52781478 3D ACAAAAACAG AGA/--- AGGACAGAAC 3070 het 3070 ref 39 17 16 8 AGA 1 0 189019 CASAVA_Build 12 52782925 1I GTTTATTTTG -/A AAACTCAAGA 1824 het 1824 ref 17 8 4 5 A 3 4 189020 CASAVA_Build 12 52783154 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2216 het 2207 hom 17 7 5 5 A 11 12 189021 CASAVA_Build 12 52783813 1I TGTTCTCTTC -/T TGAATGCCCT 3070 het 3070 ref 58 35 13 10 T 1 2 189022 CASAVA_Build 12 52788231 3D TGGGTTGGGG GTC/--- ATGTCTGTCT 2023 het 2023 ref 50 36 5 11 GTC 1 0 189023 CASAVA_Build 12 52793515 3I31M3D TCTCACACAC ---TCATCATACAGATTAGGAAACTGAGATGCAGAGA/TCATCATCATACAGATGAGGAAACTGAGATGCAG--- AGTTCACCCA 1833 het 1833 ref 37 43 4 5 N/A 0 0 189024 CASAVA_Build 12 52798822 2D CCTCGACCCT GG/-- GGAGTCTTCA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 G 4 2 189025 CASAVA_Build 12 52800880 1D CTTCGCATAC T/- TATCTGGCCC 2341 het 2341 ref 45 32 6 7 T 2 1 189026 CASAVA_Build 12 52802042 1I GACCTGAAAC -/A TTCATGGAAA 3070 het 3070 ref 49 35 8 6 A 0 1 189027 CASAVA_Build 12 52817238 1I TTTTGTGGGG -/C GGGGGGGCGC 3070 het 1486 hom 22 6 13 3 C 0 1 189028 CASAVA_Build 12 52833100 1D AAACTCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 13 12 189029 CASAVA_Build 12 52833772 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1088 hom 23 4 14 5 A 11 10 189030 CASAVA_Build 12 52847648 1D ATGCATTCAG A/- AAAAAACTGC 3070 het 3070 ref 58 29 20 9 A 7 6 189031 CASAVA_Build 12 52853116 2D AAGGCCAGAG AC/-- AAGAAGACGG 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 AC 1 0 189032 CASAVA_Build 12 53039521 1D AGCTTAGGAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 439 hom 19 1 13 5 A 9 8 189033 CASAVA_Build 12 53040410 2D CGTGTTAAGA GT/-- GTACCCCGCA 3070 hom 102 het 37 0 34 4 GT 2 1 189034 CASAVA_Build 12 53045947 2I TCTTTACAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 A 11 13 189035 CASAVA_Build 12 53047048 5D TCTTTCTCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAAC 5 4 189036 CASAVA_Build 12 53051273 4D TGGGTTCTTT CTAA/---- CTAAGCTCCT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 CTAA 2 1 189037 CASAVA_Build 12 53053534 2D TATTTCCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 32 0 21 12 A 16 14 189038 CASAVA_Build 12 53054249 2I ATCTCCCCAC --/AG AGAGCTCCCT 3070 hom 123 het 47 0 40 7 AG 2 3 189039 CASAVA_Build 12 53054456 1I CTGACTCAGA -/C CCCCCACCTA 3070 het 98 hom 43 1 36 6 C 5 6 189040 CASAVA_Build 12 53062296 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 2271 hom 20 het 11 0 7 4 T 11 10 189041 CASAVA_Build 12 53090399 1I TTCCACCTCC -/T TTTTTTTTTT 2850 het 265 hom 31 2 16 13 T 16 17 189042 CASAVA_Build 12 53112218 1D TTAGTGGAGA G/- GGGGGATGGT 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 G 6 5 189043 CASAVA_Build 12 53156468 1I TTTGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 501 hom 34 2 24 8 A 10 11 189044 CASAVA_Build 12 53158011 1I TCAGTTCTAG -/A AAGCTAAAGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 3 189045 CASAVA_Build 12 53159855 1D GAAATTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 29 4 T 12 11 189046 CASAVA_Build 12 53165370 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1084 het 1084 ref 42 32 4 6 A 12 11 189047 CASAVA_Build 12 53178965 12D TTTATTTTTA TATTTATTTATT/------------ TATTTATTTA 3070 het 474 hom 15 1 10 4 TATT 8 5 189048 CASAVA_Build 12 53180178 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 15 14 189049 CASAVA_Build 12 53213629 1D TGTGGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 11 10 189050 CASAVA_Build 12 53230662 1I GGAATCTGGA -/G GGGGGGGTTG 3070 hom 80 het 30 0 22 8 G 7 8 189051 CASAVA_Build 12 53233226 1D GCTACACCCA C/- CCAAGTGATG 3070 hom 57 het 27 0 18 9 C 3 2 189052 CASAVA_Build 12 53241813 2D TGTTTTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1057 het 1057 ref 40 28 4 8 GT 10 9 189053 CASAVA_Build 12 53247556 4D CCCTGTCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAAT 6 5 189054 CASAVA_Build 12 53273737 1I TTGATTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 30 1 21 8 A 11 12 189055 CASAVA_Build 12 53347033 1D AATTAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 11 10 189056 CASAVA_Build 12 53353496 3I GTGAGGAAGC ---/TGA TATCAGTCAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TGA 0 1 189057 CASAVA_Build 12 53356187 1D AAATTAGCCA G/- GTGTGGTGGT 1018 hom 17 het 11 0 4 7 G 2 1 189058 CASAVA_Build 12 53357127 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 13 1 12 0 A 13 12 189059 CASAVA_Build 12 53363923 1D TATTTGTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 22 0 19 5 A 10 9 189060 CASAVA_Build 12 53366991 1D AGGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 24 2 17 6 A 15 14 189061 CASAVA_Build 12 53367716 1D AATGTTTGTG C/- CCCCCTAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 6 5 189062 CASAVA_Build 12 53369551 1I CCTTCTTTCT -/A ACCTCTTCCT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 1 2 189063 CASAVA_Build 12 53388734 1I ATGTGTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 886 hom 28 2 21 5 T 12 13 189064 CASAVA_Build 12 53391018 1I TACTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 10 11 189065 CASAVA_Build 12 53391781 1I CTTACTTATC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 9 10 189066 CASAVA_Build 12 53404344 1I AAAAACTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 556 hom 29 2 20 7 T 13 14 189067 CASAVA_Build 12 53422103 1I TGGTTTTTTT -/G TTTTTGCTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 G 0 1 189068 CASAVA_Build 12 53446032 1D CAGAAAGGGA T/- TTTTTTTTTT 1593 het 1593 ref 30 20 4 7 T 16 15 189069 CASAVA_Build 12 53475603 1D ATTCCTTTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 7 T 10 9 189070 CASAVA_Build 12 53480540 1I AATGCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 11 12 189071 CASAVA_Build 12 53481925 1D TAGATACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 23 2 19 2 T 12 11 189072 CASAVA_Build 12 53482586 1I CCCAACTCTG -/C CCACTGAAAA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 2 3 189073 CASAVA_Build 12 53486682 1I ATTAATTTAG -/T TTTTAAATTA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 4 5 189074 CASAVA_Build 12 53489024 4I CAGAACTTCC ----/AATA AATACTATGT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AATA 1 2 189075 CASAVA_Build 12 53492624 1I GGCTGCTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 8 9 189076 CASAVA_Build 12 53502142 1I GGGCTGCCAT -/G AGCTCTCTCC 3070 hom 58 het 21 0 19 2 G 0 1 189077 CASAVA_Build 12 53504246 6D AAATCTGTCA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 T 22 16 189078 CASAVA_Build 12 53507245 1D TATTATAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 29 2 23 4 T 13 12 189079 CASAVA_Build 12 53509743 1D TATATCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 12 11 189080 CASAVA_Build 12 53509882 1D CAAGTGCCAT A/- AATATTTTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 3 2 189081 CASAVA_Build 12 53525259 4I TCATCTTCTT ----/AGTC AGATACTTTC 3070 hom 150 het 55 0 49 6 AGTC 0 1 189082 CASAVA_Build 12 53528078 2D ATCTCAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1951 het 716 hom 41 8 8 25 T 18 16 189083 CASAVA_Build 12 53551547 1D GATCACTCAC T/- AACAAAACTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 1 0 189084 CASAVA_Build 12 53558864 8D TTGATTTTTG TAAAAGTA/-------- TCCACATACT 3070 het 3070 ref 55 28 27 7 TAAAAGTA 1 0 189085 CASAVA_Build 12 53605405 1I TTACCAGCTT -/G GATTTTCCCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 2 189086 CASAVA_Build 12 53608553 1D GAAATAAAAA C/- CCTTAGAAGC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 3 2 189087 CASAVA_Build 12 53611261 11D GAGTAAAAGA AGGAAAAAAAT/----------- AGGTATTAAA 3070 hom 95 het 34 0 32 6 AGGAAAAAAAT 1 0 189088 CASAVA_Build 12 53625530 1D AGAGTATATG A/- GGTTTCACAC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 1 0 189089 CASAVA_Build 12 53627538 1D GAGAAGGGGT G/- GGGGGGTGTT 3070 hom 49 het 20 0 15 6 G 7 6 189090 CASAVA_Build 12 53629140 1D AACTTGGAGT G/- GGGGGGCTTT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 G 7 6 189091 CASAVA_Build 12 53629431 4D TCTCTTCCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 29 0 21 9 T 16 12 189092 CASAVA_Build 12 53631901 1D TTCTAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 1344 het 1344 ref 31 15 3 13 T 13 12 189093 CASAVA_Build 12 53695310 1I ATACTTGTGT -/A AAAAAAAAAA 2269 het 2269 ref 44 34 5 5 A 11 12 189094 CASAVA_Build 12 53700049 1D GCCCAGAGGC T/- TGTGGTCCTG 3070 hom 100 het 40 0 29 11 T 2 1 189095 CASAVA_Build 12 53700267 4I TGAAAGCGTC ----/TTTT TCTTCTACCA 3070 hom 157 het 58 0 52 6 T 1 5 189096 CASAVA_Build 12 53709234 1D GTATAAGTTA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 8 7 189097 CASAVA_Build 12 53716353 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 8 189098 CASAVA_Build 12 53717265 1D ATACATGTGG C/- ATGAGGCCTG 3070 hom 151 het 53 0 51 3 C 1 0 189099 CASAVA_Build 12 53785506 1I TTACACAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 236 hom 28 1 22 5 T 10 11 189100 CASAVA_Build 12 53794922 1D TTTTTAAGGG T/- TTTTTTTTTT 1392 het 1392 ref 31 17 4 10 T 15 14 189101 CASAVA_Build 12 53815377 1I GGACACGTGA -/C CCCCCCCACC 3070 hom 84 het 33 0 27 6 C 7 8 189102 CASAVA_Build 12 53825718 1D TCTTGTTAGG A/- AAAAAAAAAA 1347 het 1347 ref 39 31 3 6 A 11 10 189103 CASAVA_Build 12 53829486 2D TGTGAGAAAA TG/-- CAGCAATTTT 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 TG 1 0 189104 CASAVA_Build 12 53840930 3D GATTTGAACA ATT/--- ATTACCATGT 3070 het 1602 hom 17 5 8 5 ATT 2 1 189105 CASAVA_Build 12 53880468 1I CAGGAATGTG -/C CACTCTCACA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 1 2 189106 CASAVA_Build 12 53881159 1I GTTGAATTGG -/C CAAAACCTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 2 189107 CASAVA_Build 12 53950553 2D GTGTGCACTG AC/-- ACACACACAC 763 het 763 ref 32 28 2 2 AC 7 6 189108 CASAVA_Build 12 54020400 1D CCAGTATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 17 9 T 11 10 189109 CASAVA_Build 12 54031025 1D TTCTAGTGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 10 9 189110 CASAVA_Build 12 54037668 1I CAACAAAGAT -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 7 8 189111 CASAVA_Build 12 54040458 1I TTCTGCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 18 1 10 7 A 11 12 189112 CASAVA_Build 12 54050819 11D TATTGTGTAT AACATGTTTTG/----------- AAGTATACAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AACATGTTTTG 1 0 189113 CASAVA_Build 12 54051285 13D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 14 0 9 7 A 27 14 189114 CASAVA_Build 12 54053636 2D TCTCAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 11 9 189115 CASAVA_Build 12 54055579 1D GATTTGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 27 1 19 7 T 14 13 189116 CASAVA_Build 12 54059201 2I CAAAATAGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 10 12 189117 CASAVA_Build 12 54062820 1I CATCCTCGCA -/C ACACACAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 0 1 189118 CASAVA_Build 12 54107226 1D GATTTCCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 40 1 33 6 A 12 11 189119 CASAVA_Build 12 54107880 4D AAAAAATATA TATT/---- TATAATACAC 1650 hom 12 het 5 0 5 3 TATT 1 0 189120 CASAVA_Build 12 54111564 1I CTGTGCACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 10 11 189121 CASAVA_Build 12 54115295 1D TCTCATGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 34 3 15 16 A 17 16 189122 CASAVA_Build 12 54116676 1I GATACTGTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 A 9 10 189123 CASAVA_Build 12 54119552 1D TCAAAAAAAA T/- ATCCCAAATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 0 189124 CASAVA_Build 12 54119643 4D AACAAATGAT TAGA/---- TAAAGAAAAC 3070 hom 114 het 41 0 39 6 TAGA 1 0 189125 CASAVA_Build 12 54120996 1I ATTGGGGGAA -/C CCCCCCCTCC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 C 7 8 189126 CASAVA_Build 12 54261111 1D TTCAAGATTC T/- TTTAAAAAAA 1919 het 1919 ref 34 23 5 6 T 4 3 189127 CASAVA_Build 12 54262693 5I AATAAAGAAT -----/CTTTA CTTGGTGACC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 CTTTA 0 1 189128 CASAVA_Build 12 54264657 1D2M2D GTATAGATGT ATGCC/-TG-- ATTTTATGAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 N/A 0 0 189129 CASAVA_Build 12 54271588 4I ATGTTAAGGG ----/CAGA CAGAGAGAAA 3070 het 3062 hom 22 8 11 3 CAGA 1 2 189130 CASAVA_Build 12 54276838 1D AAACAAATGG A/- AAAGATATCA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 4 3 189131 CASAVA_Build 12 54284252 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 A 9 8 189132 CASAVA_Build 12 54303074 1I CAAGTTTAAG -/A AAAAGACTGT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 4 5 189133 CASAVA_Build 12 54309479 3D ACATAGGCTG TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 111 het 48 0 36 12 TAT 5 4 189134 CASAVA_Build 12 54313654 1D GGCTGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 1337 het 1337 ref 45 22 5 18 A 15 14 189135 CASAVA_Build 12 54314790 1I TTAAGGCCAC -/A AAAAAAAAAA 1879 het 1879 ref 40 30 6 4 A 11 12 189136 CASAVA_Build 12 54319099 7D TTCTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1283 hom 35 11 12 12 T 19 12 189137 CASAVA_Build 12 54320991 5D ATGTATCAAT TAAAA/----- TAATAGGCCA 2048 hom 18 het 10 0 6 6 TAAAA 1 0 189138 CASAVA_Build 12 54322140 1I CTGAAAAGAT -/A AGAGAGATAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 2 189139 CASAVA_Build 12 54327636 1D ATATATATAA T/- TTTTTTTATG 2725 het 2725 ref 16 8 6 3 T 8 7 189140 CASAVA_Build 12 54327799 1I TGGAAAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 10 11 189141 CASAVA_Build 12 54330922 4D TTCTCATGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 hom 25 12 11 3 AGTG 2 1 189142 CASAVA_Build 12 54333719 2D CCCGGGAGGC AG/-- AGTTTTCAGT 1073 het 1073 ref 6 3 3 0 AG 2 1 189143 CASAVA_Build 12 54343854 1D TTCTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 13 12 189144 CASAVA_Build 12 54349806 3D ACTCTATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1067 het 70 hom 19 2 5 13 A 16 13 189145 CASAVA_Build 12 54349834 4D AAAGAAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGCA 3070 het 77 hom 26 2 13 12 AAAG 3 2 189146 CASAVA_Build 12 54362860 2D ATAAATAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 67 het 28 0 23 5 AG 9 8 189147 CASAVA_Build 12 54372392 2I CGCTTGAACC --/AG AGAGGCAGAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AG 2 3 189148 CASAVA_Build 12 54391529 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 21 1 13 7 A 15 16 189149 CASAVA_Build 12 54435992 5I ATAAAGAGAC -----/AAAGT GAAGAAAACT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAAGT 0 1 189150 CASAVA_Build 12 54438957 1D CCTAATATAC T/- TTTTTTTTTT 866 het 866 ref 25 11 3 11 T 19 18 189151 CASAVA_Build 12 54446930 14D GCCTCTGCCG CCTAGTCTCTGCCT/-------------- CCTAGTCTCT 3070 hom 45 het 15 0 15 5 CCTAGTCTCTGCCT 2 1 189152 CASAVA_Build 12 54455429 1D TGGCCAACAT G/- GGTGAAACCC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 3 2 189153 CASAVA_Build 12 54489663 10I AACTAGCCAG ----------/GCATGGTAGT GCACACTTGT 3070 hom 66 het 25 0 22 4 GCATGGTAGT 0 1 189154 CASAVA_Build 12 54491133 1D ACTCCATCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 23 0 14 9 A 13 12 189155 CASAVA_Build 12 54501357 2I TTTCTTGTTC --/TG TCTTTTAAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TG 0 1 189156 CASAVA_Build 12 54526196 1I GAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 408 hom 35 1 32 2 T 9 10 189157 CASAVA_Build 12 54536802 1D TTTTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 34 2 26 6 T 11 10 189158 CASAVA_Build 12 54581812 4D CAGGAGGTGG AAGT/---- AAGCCAGTAT 3070 hom 84 het 32 0 27 5 AAGT 1 0 189159 CASAVA_Build 12 54587149 4D GAAAGTTAAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 10 8 189160 CASAVA_Build 12 54599950 5D TCTCAAAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 30 het 30 ref 24 8 2 16 AAAAG 1 0 189161 CASAVA_Build 12 54610827 3I CAGTTTGGAT ---/ACA ACAACAATAC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 ACA 2 3 189162 CASAVA_Build 12 54642341 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCC 2010 hom 12 het 5 0 5 0 A 4 5 189163 CASAVA_Build 12 54652713 1I TGACAGTGCT -/A AAAAAAAAAA 2494 het 671 hom 27 2 6 19 A 11 12 189164 CASAVA_Build 12 54652727 1D AAAAAAAGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1109 hom 31 5 17 9 T 10 9 189165 CASAVA_Build 12 54653108 24D ACACACACAC CACACCACACACACATCACATACA/------------------------ CACACCACAC 3070 het 3070 ref 41 19 14 14 CACACCACACACACATCACATACA 1 0 189166 CASAVA_Build 12 54654976 1D ATCAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 11 10 189167 CASAVA_Build 12 54657334 4D CCGTGTGTGC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 GT 8 6 189168 CASAVA_Build 12 54674012 1D TTTAAGTTCC T/- TGTTCCAGCC 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 2 1 189169 CASAVA_Build 12 54677401 2D GTAAGGAGAC TG/-- GGGGTGGTAA 2613 het 2613 ref 24 12 6 8 TG 1 0 189170 CASAVA_Build 12 54691231 1I TCCACCCCTG -/C CCAAACATAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 2 3 189171 CASAVA_Build 12 54708907 3D GATTACAGGC GTG/--- GTGTCAGCCA 1914 het 1914 ref 28 14 7 8 GTG 2 1 189172 CASAVA_Build 12 54727936 1D TGTAAGTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 11 11 9 A 10 9 189173 CASAVA_Build 12 54732682 5I ACTCCATCTC -----/AAAAA AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 9 14 189174 CASAVA_Build 12 54736375 1D GGAGGCGGAG A/- TTGCAGTGAG 3070 het 2164 hom 18 5 10 3 A 1 0 189175 CASAVA_Build 12 54737389 1D GCCTCGGCCT C/- CCAAAGTGCT 1494 het 905 hom 10 2 4 4 C 3 2 189176 CASAVA_Build 12 54739576 1D ATATTTAAAC T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 7 6 189177 CASAVA_Build 12 54740366 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 14 1 10 3 A 12 11 189178 CASAVA_Build 12 54741788 3D TTTGTCCAAA CCT/--- CCTCTTTCTT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 CCT 2 1 189179 CASAVA_Build 12 54746495 2D GATTTTTTTG TA/-- TATTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TA 2 1 189180 CASAVA_Build 12 54751933 2I CATCTTTATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 14 16 189181 CASAVA_Build 12 54757981 1D GGCGCACGCC T/- TGTAGCCCCA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 2 1 189182 CASAVA_Build 12 54769959 1D TGACCACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 11 10 189183 CASAVA_Build 12 54775003 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 35 1 28 6 A 13 14 189184 CASAVA_Build 12 54778300 2D CTAAATATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 14 12 189185 CASAVA_Build 12 54790411 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 1601 het 1601 ref 24 8 6 10 A 15 16 189186 CASAVA_Build 12 54796605 1I CCCCGCCCTT -/G GGGGGGGGCA 1976 het 1976 ref 37 11 10 16 G 8 9 189187 CASAVA_Build 12 54809970 1D AAAAGGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1925 hom 30 11 11 8 T 12 11 189188 CASAVA_Build 12 54819647 1I AGGGTAGATT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1810 hom 38 11 15 12 G 0 1 189189 CASAVA_Build 12 54850324 4D TGTCTAACAC TTTT/---- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 4 0 189190 CASAVA_Build 12 54878762 1D ACTATGCCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 26 6 T 10 9 189191 CASAVA_Build 12 54878923 1D TATACATCTT A/- AATGCTTGGT 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 A 3 2 189192 CASAVA_Build 12 54883237 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTCTTTTTTT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 4 2 189193 CASAVA_Build 12 54885537 1D TTCCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 20 1 17 2 A 13 12 189194 CASAVA_Build 12 54890684 2D CCTGGATATG AT/-- ATAACTCTAC 3070 hom 103 het 43 0 33 12 AT 2 1 189195 CASAVA_Build 12 54900424 1D TGCAGCCATG C/- CCCGGCTAAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 4 3 189196 CASAVA_Build 12 54910104 3D GCCTGCCTGC CTG/--- CCCCCCCAGC 628 het 129 hom 16 1 3 12 CTG 1 0 189197 CASAVA_Build 12 54944614 1D CTAGTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 116 hom 38 1 26 11 T 10 9 189198 CASAVA_Build 12 54964753 1I GATATCGAGA -/C CATCCTGGCC 2160 hom 17 het 9 0 5 4 C 1 2 189199 CASAVA_Build 12 54968869 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 25 1 17 9 A 13 12 189200 CASAVA_Build 12 54970764 5D ATTTGGAGTT AGGAA/----- AGGAAGTCTG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 AGGAA 2 1 189201 CASAVA_Build 12 54992446 1D CTTTTTTATA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 45 het 18 0 14 4 T 8 7 189202 CASAVA_Build 12 55049370 1D AAATAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 10 9 189203 CASAVA_Build 12 55085182 2D TAGTAAACGC AT/-- ATATATATAT 1894 het 1894 ref 32 24 4 4 AT 7 6 189204 CASAVA_Build 12 55092600 2I GAGCTTGGAG --/AC ACACCAGGAA 1745 het 1745 ref 19 8 7 4 AC 2 3 189205 CASAVA_Build 12 55092848 2D AGAATGAGGT AC/-- ACAGACAACT 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 AC 2 1 189206 CASAVA_Build 12 55100524 3I TGACGATAAG ---/GAT GATAAGGAGG 3070 hom 131 het 53 0 38 15 GAT 1 2 189207 CASAVA_Build 12 55105251 1I TAAAGAGGGC -/T TTTCCCCATC 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 3 4 189208 CASAVA_Build 12 55111940 1D TTATAGAATG T/- ATATATGTGC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 1 0 189209 CASAVA_Build 12 55112840 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 10 0 7 3 A 11 10 189210 CASAVA_Build 12 55118096 1D TTGATAAACA T/- TTTTTTTTTT 2235 het 2235 ref 35 20 6 9 T 13 12 189211 CASAVA_Build 12 55121042 2D CTAATTTTTT TG/-- TGTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 TG 2 1 189212 CASAVA_Build 12 55130093 1I ACCCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 541 hom 38 3 30 5 A 11 12 189213 CASAVA_Build 12 55142376 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAATAA 2983 hom 15 het 6 0 6 0 A 8 7 189214 CASAVA_Build 12 55149832 2I CCACCCACCA --/AC ACTACTGCCA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 AC 1 2 189215 CASAVA_Build 12 55155845 1I CTTTCCTCTC -/T TGAGGCCAGC 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 1 2 189216 CASAVA_Build 12 55156217 1I TTTCTCTTTC -/T TTTTTTTTGA 2030 het 2030 ref 26 6 9 11 T 8 9 189217 CASAVA_Build 12 55156239 9D CAGTCTTGCT TTGTCACCC/--------- TTGTCACCCA 3070 hom 64 het 35 0 22 15 TTGTCACCC 2 1 189218 CASAVA_Build 12 55166982 34D TCCCTTACGA CAGAGACTCGAGTAGTGGTGAGGTAGTGTTGTGT/---------------------------------- CAGAGACTCG 2342 het 2342 ref 27 14 7 12 CAGAGACTCGAGTAGTGGTGAGGTAGTGTTGTGT 2 1 189219 CASAVA_Build 12 55175349 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 864 het 864 ref 13 8 2 3 T 11 10 189220 CASAVA_Build 12 55178289 1I ATCTAAGCAA -/C CATTTTCGCA 2767 het 2767 ref 46 31 6 9 C 1 2 189221 CASAVA_Build 12 55181624 4I TTGGAATAAA ----/AAGT AATTGCTACA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AAGT 0 1 189222 CASAVA_Build 12 55199883 1D CTTAAAAAAA T/- ATATATATAT 2223 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 0 189223 CASAVA_Build 12 55222111 1I AGTAGATTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 40 0 29 11 T 8 9 189224 CASAVA_Build 12 55222288 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 9 10 189225 CASAVA_Build 12 55222465 1I AAATCCCTTT -/A ACCTGTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 1 2 189226 CASAVA_Build 12 55228489 2D CAGAGTAAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 2574 hom 23 6 16 2 CT 2 1 189227 CASAVA_Build 12 55231185 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 2828 het 2256 hom 31 11 12 8 A 10 9 189228 CASAVA_Build 12 55231698 5D GCAGTCAGAC AAGTT/----- AAGAGATATT 3070 het 3070 ref 42 19 14 10 AAGTT 1 0 189229 CASAVA_Build 12 55235124 1I TATACACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 36 0 29 7 A 10 11 189230 CASAVA_Build 12 55238822 1D AATTTTTGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2332 hom 20 7 10 4 T 10 9 189231 CASAVA_Build 12 55240038 6D CTCCGCCTCC CAGGTT/------ CAAGCATTTC 1946 het 1862 hom 11 5 5 3 CAGGTT 1 0 189232 CASAVA_Build 12 55255331 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 8 7 189233 CASAVA_Build 12 55263706 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 26 1 22 3 A 11 10 189234 CASAVA_Build 12 55275997 1D TCAAATGTGG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 8 7 189235 CASAVA_Build 12 55276085 3D TTCGCTAGAC TTT/--- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 53 34 16 5 T 9 6 189236 CASAVA_Build 12 55317822 1I AATAGAGGCC -/A AAAAAAAAAA 2649 het 2649 ref 41 20 10 11 A 15 16 189237 CASAVA_Build 12 55358157 1D ATGAACTCCA G/- GAACTACTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 G 2 1 189238 CASAVA_Build 12 55360833 1D TTTTTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 752 hom 43 4 23 17 T 15 14 189239 CASAVA_Build 12 55365156 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 8 9 189240 CASAVA_Build 12 55365451 5D TTTTCTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2292 hom 28 het 17 0 9 8 T 21 16 189241 CASAVA_Build 12 55366162 5I AAATCTACTT -----/TCCTA TCCTAGTAAT 3070 hom 84 het 34 0 27 7 TCCTA 1 2 189242 CASAVA_Build 12 55366425 4D ATACATTCAA ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATTT 4 3 189243 CASAVA_Build 12 55366932 2D TTCCAAAGAC AT/-- AAAGTCACTC 3070 hom 72 het 27 0 23 8 AT 1 0 189244 CASAVA_Build 12 55369924 25D TGGGTCTCAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAG/------------------------- TTAACTTGGC 3070 hom 21 het 6 0 8 6 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAG 1 0 189245 CASAVA_Build 12 55370441 1D TCAGGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 15 14 189246 CASAVA_Build 12 55376259 8D CAAAAAGAAT ATACATAC/-------- ATACATACAC 3070 hom 105 het 42 0 36 11 ATAC 4 2 189247 CASAVA_Build 12 55381399 2D TAGTAGAGAC AG/-- GGGTTTCACC 3000 het 1191 hom 14 3 8 4 AG 1 0 189248 CASAVA_Build 12 55390921 3D GCCCTTTTTT TTG/--- TTGTTATTTT 2305 het 599 hom 9 2 7 1 TTG 2 1 189249 CASAVA_Build 12 55402748 14I GTCTCAAAAC --------------/AAAACAAAACAAAA AAAACAAACC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAAACAAAACAAAA 0 1 189250 CASAVA_Build 12 55405999 1I CCCCCCCCCC -/A AAAAAAAACA 2702 het 366 hom 23 1 12 10 A 8 9 189251 CASAVA_Build 12 55412832 1D CTCCATACCC T/- TTATCTTATC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 3 2 189252 CASAVA_Build 12 55418454 1D AAACCCTGTA T/- TTAAAGTGAA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 3 2 189253 CASAVA_Build 12 55420433 2D AGATACCCAC AT/-- GTCAGACACC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 1 0 189254 CASAVA_Build 12 55427440 1D AGAAGTATTT A/- AAAATTTTTC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 5 4 189255 CASAVA_Build 12 55449934 1I GCAGGTCTTC -/T TTGCTGCTAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 3 189256 CASAVA_Build 12 55465807 1I TCATTGTTTA -/C CCTTTTGATA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 C 2 3 189257 CASAVA_Build 12 55466394 1D TCTGCCTCCC G/- GGTTCAAGCA 3070 het 1888 hom 14 4 8 3 G 3 2 189258 CASAVA_Build 12 55489730 3D ACAAGACAAA GAG/--- GAGCTTTATT 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 GAG 2 1 189259 CASAVA_Build 12 55495021 1I ACCCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 7 13 2 A 11 12 189260 CASAVA_Build 12 55503974 1D TAAATGACAT G/- GGGGGGGGCT 3070 hom 79 het 37 0 27 10 G 9 8 189261 CASAVA_Build 12 55510106 10D TCGCTTTCTA TCTTTCTCTT/---------- TCTTTCTTTC 2652 hom 31 het 28 0 11 20 TCTTTCTCTT 1 0 189262 CASAVA_Build 12 55515586 1I GTTTTTGTTT -/G TTTGTTTTTT 3070 het 219 hom 26 1 22 3 G 0 1 189263 CASAVA_Build 12 55521034 1I CCCCCATGCA -/C TCCTTCACTC 3070 hom 85 het 32 0 26 6 C 0 1 189264 CASAVA_Build 12 55522433 2D TTTTGGCCAC AT/-- GTTATGTCTT 3049 het 3049 ref 30 19 7 7 AT 1 0 189265 CASAVA_Build 12 55524463 4D TGATCCTCCC GTGT/---- ACACTGGCCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 5 GT 2 0 189266 CASAVA_Build 12 55527398 1I CTAGGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2612 het 2401 hom 24 7 7 10 T 10 11 189267 CASAVA_Build 12 55534499 1D TGGAAATTTC A/- GTGCCAGCAC 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 1 0 189268 CASAVA_Build 12 55539775 4D AAATAGTGTA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 33 het 19 0 12 8 AT 9 7 189269 CASAVA_Build 12 55550819 2I ATCTCATCTG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 9 11 189270 CASAVA_Build 12 55556890 1D TTTTTAGAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 T 10 9 189271 CASAVA_Build 12 55567102 2D GCCTGGTCTC AT/-- ATGAGACTTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 7 AT 2 1 189272 CASAVA_Build 12 55570895 6D AGATGGTCTT TGAAAC/------ TGATGAGAAC 2362 het 2362 ref 18 12 5 2 TGAAAC 1 0 189273 CASAVA_Build 12 55574305 4I TAAAATAGAT ----/TAAG TAAACAAATT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 TAAG 0 1 189274 CASAVA_Build 12 55601809 1D AAGGGGAAAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 9 8 189275 CASAVA_Build 12 55612260 1I AAGCTAACAC -/A GGGAAATTAT 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 0 1 189276 CASAVA_Build 12 55625557 2D TTCATTGACC CA/-- CACTGGTCTC 3070 hom 48 het 19 0 17 3 CA 2 1 189277 CASAVA_Build 12 55732642 1I AGACATTTGG -/T GGTAGAGGGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 0 1 189278 CASAVA_Build 12 55735357 1D TTTATGCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 13 12 189279 CASAVA_Build 12 55738228 1I TAGTTGTCAC -/T TTAGGACAGT 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 T 2 3 189280 CASAVA_Build 12 55743930 1D CGCCTTAACA G/- CACCATTCTA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 G 1 0 189281 CASAVA_Build 12 55745572 2D TTGGTTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 1210 het 1162 hom 32 14 3 16 T 18 16 189282 CASAVA_Build 12 55760636 1I CTCAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 2446 hom 26 het 11 0 6 5 A 13 14 189283 CASAVA_Build 12 55766578 1D TGTCACCACT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 68 het 26 0 23 3 C 11 10 189284 CASAVA_Build 12 55801255 1D TAATAATGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 19 17 9 T 10 9 189285 CASAVA_Build 12 55804479 2D CCTTCCTACG CA/-- CACTTCCTTA 3070 het 3070 hom 56 21 26 9 CA 2 1 189286 CASAVA_Build 12 55806523 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2719 hom 28 8 14 6 T 10 9 189287 CASAVA_Build 12 55826272 1D CAGCAACCTT A/- AAAGTCAACA 3070 hom 168 het 60 0 53 7 A 4 3 189288 CASAVA_Build 12 55833962 1D AAGCAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1231 het 1231 ref 32 21 3 8 A 15 14 189289 CASAVA_Build 12 55842049 2D ACGCATATGA GT/-- GTGTGTGTGT 1336 het 1336 ref 42 32 3 7 GT 9 8 189290 CASAVA_Build 12 55867628 1I CTCCACCCTT -/C CCCTGCTGTG 3070 het 3070 ref 48 16 15 17 C 3 4 189291 CASAVA_Build 12 55872149 2D ACAAACATGC CA/-- CACACACACA 3070 het 38 hom 45 1 27 17 CA 9 8 189292 CASAVA_Build 12 55875245 1D TGCAGACGAC G/- GCGAACCATC 1799 het 1799 ref 26 15 5 6 G 2 1 189293 CASAVA_Build 12 55887581 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 29 1 17 11 A 14 13 189294 CASAVA_Build 12 55899034 2D TCTGTGTGCT TG/-- TGATTGTGAG 3070 het 3070 hom 48 19 26 6 TG 2 1 189295 CASAVA_Build 12 55909359 1D AATTCAGGTC T/- TCCGACCCTT 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 T 2 1 189296 CASAVA_Build 12 55911271 4D TCATCTGATC CCTT/---- CCTTCCTTCC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 CCTT 3 2 189297 CASAVA_Build 12 55922354 1D CGCGATTAAA G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 57 het 21 0 17 4 G 8 7 189298 CASAVA_Build 12 55929586 1I GGCTTCCCAG -/C CCCCCCACAC 3070 het 2906 hom 36 9 13 14 C 6 7 189299 CASAVA_Build 12 55936874 3I TTATCTCTCT ---/CTC TTTTTTTTTT 787 het 787 ref 27 13 4 10 CTC 0 1 189300 CASAVA_Build 12 55960981 2I TCCTTTTGCT --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 22 het 31 1 25 5 AG 6 7 189301 CASAVA_Build 12 55962350 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2513 hom 22 8 10 4 A 13 14 189302 CASAVA_Build 12 55963349 1D CAATCAATTC T/- TTTTTTTTTT 1403 het 1403 ref 39 29 3 7 T 11 10 189303 CASAVA_Build 12 55978258 1D ATACATGAAA C/- TGCTTTGCAT 3070 het 3070 hom 51 24 22 5 C 1 0 189304 CASAVA_Build 12 55990273 1D TCTCTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 32 0 25 7 A 11 10 189305 CASAVA_Build 12 55999582 2D CCACCGGCCC CT/-- GTTTAGCCTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 CT 1 0 189306 CASAVA_Build 12 56007038 1I TATGTTGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 11 12 189307 CASAVA_Build 12 56009800 6I CGTCTCAAAA ------/AAAAAG AAAAAGAAAA 2866 het 2866 ref 25 12 8 5 AAAAAG 2 3 189308 CASAVA_Build 12 56038196 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 17 8 T 13 12 189309 CASAVA_Build 12 56039816 4D CATCTTTTAG ATTA/---- ATTAAGCATT 3070 het 3070 ref 34 16 17 3 ATTA 2 1 189310 CASAVA_Build 12 56045986 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 11 12 189311 CASAVA_Build 12 56054368 1I AGACCATCTC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 47 23 14 10 A 8 9 189312 CASAVA_Build 12 56061763 1I ATGTGACATG -/T TTTATTGATG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 3 4 189313 CASAVA_Build 12 56070232 4D TAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 2565 hom 32 11 16 5 AAAG 3 2 189314 CASAVA_Build 12 56087305 1D TTCTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2402 hom 21 7 9 5 A 13 12 189315 CASAVA_Build 12 56088916 1I GTTTGGCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 984 hom 35 3 30 2 A 10 11 189316 CASAVA_Build 12 56089758 5D TAAAAAGTGT TAAGA/----- TAATTGGTTT 3070 het 3070 hom 31 15 14 5 TAAGA 1 0 189317 CASAVA_Build 12 56092360 1I GGGAGGCCAA -/G GGGGGGCGAA 3070 het 2066 hom 19 6 8 5 G 6 7 189318 CASAVA_Build 12 56095631 2D CCAGGGGTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 34 1 18 16 A 15 13 189319 CASAVA_Build 12 56111249 3D CCCTCTCCTC CTT/--- CCGCGTTACC 2748 het 1504 hom 16 5 9 4 CTT 1 0 189320 CASAVA_Build 12 56138352 1I GATGGGGTTT -/A CACCATGTTG 3070 het 1344 hom 11 3 7 1 A 0 1 189321 CASAVA_Build 12 56156731 1D GGATCTGTAA G/- TCACCCTCGC 3070 hom 63 het 24 0 17 7 G 1 0 189322 CASAVA_Build 12 56160237 1I TCATTCATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 105 hom 35 2 19 14 T 12 13 189323 CASAVA_Build 12 56191193 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 17 5 A 13 14 189324 CASAVA_Build 12 56193665 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 658 het 658 ref 35 17 3 15 A 19 18 189325 CASAVA_Build 12 56197883 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1314 het 1314 ref 25 16 3 6 T 13 12 189326 CASAVA_Build 12 56224446 1D TTAAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 11 10 189327 CASAVA_Build 12 56234187 1D TAAGGCTCTG A/- CACAGTGTTG 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 A 1 0 189328 CASAVA_Build 12 56263350 1I CTGCTGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3026 het 3026 ref 34 19 11 4 T 11 12 189329 CASAVA_Build 12 56273513 1D ACCTTACACC T/- TAGACAGGTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 1 189330 CASAVA_Build 12 56283487 1D CAGAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 2791 het 1351 hom 26 7 7 12 T 17 16 189331 CASAVA_Build 12 56316358 1D AGAACCTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 9 8 T 10 9 189332 CASAVA_Build 12 56325515 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 2999 hom 16 7 8 1 A 9 8 189333 CASAVA_Build 12 56333598 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAT 2350 het 1863 hom 16 6 5 5 A 10 9 189334 CASAVA_Build 12 56336699 1I GGATGTGGGT -/G GGGTCAGCTA 2583 het 2583 ref 26 15 7 4 G 3 4 189335 CASAVA_Build 12 56338992 1I GGACTGTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 A 9 10 189336 CASAVA_Build 12 56343710 1I ATATTTGAAT -/A TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 A 0 1 189337 CASAVA_Build 12 56348893 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 17 12 1 A 12 11 189338 CASAVA_Build 12 56349197 1D CCAGGCTGGA C/- CCGCAGTGGC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 3 2 189339 CASAVA_Build 12 56360342 1D TTTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 15 5 T 13 12 189340 CASAVA_Build 12 56362809 10D TCAGTGTATT CACTTGGTGA/---------- CACTTGGTGT 3070 het 34 hom 21 2 14 8 CACTTGGTGA 1 0 189341 CASAVA_Build 12 56364374 2I ATTAGGTCTC --/TT TGTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 1 3 189342 CASAVA_Build 12 56366419 8D TCTCTTTTGT GCTGGATC/-------- GCTGGATCCC 3070 het 3070 hom 35 17 16 3 GCTGGATC 2 1 189343 CASAVA_Build 12 56378356 4I CCGTTATAGC ----/ACTT ACTTCATTGT 3070 het 3070 ref 58 25 26 7 ACTT 1 2 189344 CASAVA_Build 12 56381132 1I CTCTCCCTCC -/T CGCCAGAAAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 0 1 189345 CASAVA_Build 12 56383813 1D AATTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 T 11 10 189346 CASAVA_Build 12 56388327 1I TACTCTGAGA -/T TTTTTTTAAA 2761 het 2761 ref 25 14 8 3 T 7 8 189347 CASAVA_Build 12 56392546 1D GACTTAAATT C/- TTAATTCTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 1 0 189348 CASAVA_Build 12 56410173 1I TATATATATA -/T TATTTTTTTT 3070 hom 39 het 31 1 26 4 T 1 2 189349 CASAVA_Build 12 56425521 1I TGTGAACCTC -/A AGTTTCTTCC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 1 2 189350 CASAVA_Build 12 56434989 1I CCCCGCCCCT -/G GGGACACCTG 3070 hom 33 het 13 0 11 2 G 3 4 189351 CASAVA_Build 12 56437257 2D CGCCAGTTAC CA/-- CAGTCTCCCG 3070 hom 69 het 27 0 24 6 CA 2 1 189352 CASAVA_Build 12 56449572 1D GAAGGGCCCC T/- GAGTAGGCCA 3070 het 3070 ref 45 20 14 11 T 1 0 189353 CASAVA_Build 12 56459716 2I ATCTTCACCC --/CT GTTTCTGCCC 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 CT 0 1 189354 CASAVA_Build 12 56461617 1I TTGGACTGTA -/G TTTCTTCATG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 0 1 189355 CASAVA_Build 12 56468318 1I CAGTGTACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3059 hom 32 11 11 10 T 11 12 189356 CASAVA_Build 12 56489059 1D TTCTGAGTGC T/- TTTTTTTTTT 1505 het 1505 ref 38 19 4 15 T 13 12 189357 CASAVA_Build 12 56490698 1I CACAGGAGTT -/A ACTTGGATGC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 1 2 189358 CASAVA_Build 12 56529530 2D TGAAGTCTCA CT/-- CTGTTGCCCC 3070 het 270 hom 45 2 39 6 CT 2 1 189359 CASAVA_Build 12 56538710 1D TAAGAAATAG T/- TTTCACGTCC 3070 hom 22 het 21 0 13 8 T 4 3 189360 CASAVA_Build 12 56544913 1I TCTTATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 521 hom 21 2 11 8 A 12 13 189361 CASAVA_Build 12 56553468 14D CTTGGGGATC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 13 0 11 4 T 24 10 189362 CASAVA_Build 12 56557189 2D AAACTCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 1666 het 174 hom 15 2 6 7 A 18 16 189363 CASAVA_Build 12 56578173 1D CTTAGGTGGA G/- GGGGGGGTGC 3070 hom 90 het 33 0 29 4 G 8 7 189364 CASAVA_Build 12 56581538 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1420 hom 43 het 24 0 15 9 A 12 13 189365 CASAVA_Build 12 56583962 1D TATAGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 17 1 12 4 T 13 12 189366 CASAVA_Build 12 56584258 2I CTGAGGAGAA --/AC AGCACCAGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AC 0 1 189367 CASAVA_Build 12 56592168 4I AAGTAAAAAT ----/AAGC AAGAGAAATT 2752 het 2019 hom 14 5 7 2 AAGC 0 1 189368 CASAVA_Build 12 56592912 2D ACATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 AT 6 5 189369 CASAVA_Build 12 56596190 1D GTCTCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 26 11 6 T 11 10 189370 CASAVA_Build 12 56610321 7D GCCTTTTAGA CTTTTTT/------- CTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 9 CTTTTTT 3 2 189371 CASAVA_Build 12 56610701 2D TATGTGCTTT AC/-- ACACATATCT 3070 hom 110 het 41 0 37 5 AC 3 2 189372 CASAVA_Build 12 56616479 4D ACATGTTAGC TTTA/---- TTTAACCATT 3070 het 3070 ref 24 11 12 2 TTTA 2 1 189373 CASAVA_Build 12 56620110 1I AGAAAGCATG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 7 8 189374 CASAVA_Build 12 56634877 1D ACTCTGGAGT G/- GGGGGTGGAA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 G 6 5 189375 CASAVA_Build 12 56641020 5D TACAAAAGAT AAATG/----- AAACAAAAAG 3002 het 3002 ref 24 17 7 0 AAATG 1 0 189376 CASAVA_Build 12 56643106 4D TACAATGAAC ACAA/---- ACAAATCAGT 3070 het 3070 ref 24 11 9 5 ACAA 2 1 189377 CASAVA_Build 12 56644034 1D ATAATACAAT C/- CAATTTAATT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 C 2 1 189378 CASAVA_Build 12 56657115 1I CACTTAAAAG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 7 8 189379 CASAVA_Build 12 56661088 1D TTTTGAGGGC A/- TTGGAAGATT 3070 het 3070 hom 36 17 15 6 A 1 0 189380 CASAVA_Build 12 56671220 2I TGTGTGTGCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2842 hom 43 11 15 17 TG 8 9 189381 CASAVA_Build 12 56673248 3I TATATTTTGG ---/AGA AACAGTAGGA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 AGA 0 1 189382 CASAVA_Build 12 56677338 2I GCCACTGCAT --/AC AGTCAGACAT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 AC 0 1 189383 CASAVA_Build 12 56677766 1I GAAATCTTCA -/G GGGGCAGCTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 4 5 189384 CASAVA_Build 12 56681772 4D CGGTTATGTG TGGT/---- TACTTGCCAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 TGGT 1 0 189385 CASAVA_Build 12 56688810 23D CTAATTTATT CATTTATGCCTGTCTAACCGCTA/----------------------- AAGACATGGA 3070 het 3070 ref 38 30 11 3 CATTTATGCCTGTCTAACCGCTA 1 0 189386 CASAVA_Build 12 56696497 1I ATGGCGGGCA -/T TTTTCCTTCG 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 4 5 189387 CASAVA_Build 12 56698691 1D CTTTTTTGGT C/- CCATATGAAA 3070 het 2188 hom 15 7 7 1 C 3 2 189388 CASAVA_Build 12 56706064 2I AAGCAGAAAC --/AG GGAACAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 AG 0 1 189389 CASAVA_Build 12 56713165 1D TTGTCTTTGT C/- AAATTGGGTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 C 1 0 189390 CASAVA_Build 12 56722795 1I AAAGTTGCTG -/T TTTTTTTTGG 2625 het 2625 ref 26 15 7 4 T 8 9 189391 CASAVA_Build 12 56724445 1D CAGGACAGAC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 9 8 189392 CASAVA_Build 12 56726818 1D GTGATTCTAG A/- ACATGGGGCT 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 A 2 1 189393 CASAVA_Build 12 56727591 1I ACCACCACTA -/T TTTTTTTTTA 2936 het 2082 hom 27 8 10 9 T 9 10 189394 CASAVA_Build 12 56744058 1I AAAATATAAT -/A AAAAAAAAAA 2615 het 2615 ref 20 10 8 2 A 10 11 189395 CASAVA_Build 12 56754852 2D GTTTCCCTCC CT/-- GTGTCCATGT 2415 het 2415 ref 12 6 6 0 CT 1 0 189396 CASAVA_Build 12 56755858 1D ATGCTCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 12 11 189397 CASAVA_Build 12 56766647 4D AAAAAAATAA TAAT/---- TGATTGAAGT 3070 hom 144 het 49 0 48 3 TAAT 1 0 189398 CASAVA_Build 12 56767587 3I TTGGCTGGAT ---/TGG TGAGGGGGGG 3070 hom 76 het 30 0 20 10 TGG 0 1 189399 CASAVA_Build 12 56768188 2I AGAGAGAAAC --/TG TGCAAATCTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TG 1 2 189400 CASAVA_Build 12 56768386 2I ATGCAATTGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 205 hom 29 1 22 6 A 11 13 189401 CASAVA_Build 12 56768684 8D CAGTGTTTAT AAAGGACC/-------- AAACATTCAC 3070 hom 123 het 43 0 42 6 AAAGGACC 1 0 189402 CASAVA_Build 12 56772155 22D TCGATGACTA AATGAATGTGCAGTTTACACAC/---------------------- AAATGTAACC 3070 het 3070 ref 35 19 19 4 AATGAATGTGCAGTTTACACAC 1 0 189403 CASAVA_Build 12 56803082 1D ATTAGCTGGG C/- CGTGGCGGTG 2272 hom 21 het 8 0 8 0 C 2 1 189404 CASAVA_Build 12 56803859 1I AGTTTTCTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 8 9 189405 CASAVA_Build 12 56808722 1D TTATATAAAT G/- GAATCATACT 3070 het 3070 hom 53 22 23 8 G 2 1 189406 CASAVA_Build 12 56815075 1D CAAAGTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 T 13 12 189407 CASAVA_Build 12 56829001 4D ACCACATAAC ATTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 105 het 45 0 33 14 ATTT 1 0 189408 CASAVA_Build 12 56829148 8D TTCCTTTCTT CCTCCCTC/-------- CCTCCCTCCC 3070 hom 38 het 26 0 16 12 CCTC 6 4 189409 CASAVA_Build 12 56839608 1D TTCCTCTTTC A/- CTTGGCTCTC 3070 hom 90 het 35 0 29 7 A 1 0 189410 CASAVA_Build 12 56839790 1I ACTAACACAG -/A AAAGATATGG 3070 hom 81 het 34 0 26 8 A 3 4 189411 CASAVA_Build 12 56841227 21D CACGCAGTGG GAGAAATGCATGGGCAAACAT/--------------------- GAGAAATGCA 3070 hom 96 het 39 0 32 13 GAGAAATGCATGGGCAAACAT 2 1 189412 CASAVA_Build 12 56842724 4I GATAACTGCC ----/TAGA TTGGGGTACA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TAGA 0 1 189413 CASAVA_Build 12 56844384 1I AGATATATAT -/A AAAAAAGTGT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 6 7 189414 CASAVA_Build 12 56855873 1I AAACTGACAG -/T TTTCAACTTT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 3 4 189415 CASAVA_Build 12 56867738 1I AAAGAAAGGG -/A AAAAAATCCC 3070 het 3070 ref 52 23 20 9 A 6 7 189416 CASAVA_Build 12 56872040 4D TTGCATTTCT CTAA/---- CTATTAGTGA 3070 het 3070 ref 41 26 15 3 CTAA 1 0 189417 CASAVA_Build 12 56877031 1D TTCTCTGTAG T/- TTTTATTCCA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 5 4 189418 CASAVA_Build 12 56888121 1D AGATTTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1035 hom 26 4 13 9 T 15 14 189419 CASAVA_Build 12 56889441 1D GTTAGCACTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 A 9 8 189420 CASAVA_Build 12 56890352 2D CTCTTAAAAA CT/-- CTCTCAATTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 CT 3 2 189421 CASAVA_Build 12 56936327 1I CATCTGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2693 hom 23 6 11 6 T 9 10 189422 CASAVA_Build 12 56953488 1I AACAACCATG -/A GGCATATCTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 0 1 189423 CASAVA_Build 12 56959256 2D CACAAAAAAT AA/-- AGTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 A 3 1 189424 CASAVA_Build 12 56990853 1D TTTAGTTTTT A/- ATAGAAGAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 2 1 189425 CASAVA_Build 12 56991664 1I GAGATTACAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 7 8 189426 CASAVA_Build 12 57023123 4I GAAAAAAGAT ----/AAAC AGAAAGAACA 3070 het 3070 hom 53 20 27 6 AAAC 0 1 189427 CASAVA_Build 12 57035575 1I TTTTTTGTTC -/T TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 5 6 189428 CASAVA_Build 12 57044626 1D AGAACCTGCA T/- TTCAGGCAGA 3070 het 3070 ref 51 24 22 6 T 3 2 189429 CASAVA_Build 12 57077782 1D GAGCTTTTTT C/- CCCCCCATGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 7 6 189430 CASAVA_Build 12 57087852 3D GCTCTTTTGC CTT/--- CTTGATATGT 3070 het 3070 ref 40 22 17 2 CTT 2 1 189431 CASAVA_Build 12 57112774 2I3M4D7M2D TTAATTTAAA --TGTAAAATAAATTTCA/GCTTT----TACATTT-- AAAATTATAT 3070 het 3070 ref 24 14 10 3 N/A 0 0 189432 CASAVA_Build 12 57112903 2D AAATTATCAC TG/-- TCCTTTGATT 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 TG 1 0 189433 CASAVA_Build 12 57113395 2D ATATATATAT AG/-- GACTATATAT 2774 het 2774 ref 23 11 7 5 AG 1 0 189434 CASAVA_Build 12 57132445 1D GCCTTAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 6 T 12 11 189435 CASAVA_Build 12 57133061 1D GATTGAGTGA G/- CCCAAATCAA 3070 het 3070 hom 52 23 22 7 G 1 0 189436 CASAVA_Build 12 57133658 1I TAGAATTTAA -/T GCTCCCCTTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 0 1 189437 CASAVA_Build 12 57133811 1D AAGTCTCATT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 7 6 189438 CASAVA_Build 12 57137218 1D GAGTTTGAGA C/- CAGCCTAGGC 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 C 2 1 189439 CASAVA_Build 12 57137713 1I GCTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 22 8 T 10 11 189440 CASAVA_Build 12 57150353 1D CCAAGCCAGA T/- TTAATAAGTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 3 2 189441 CASAVA_Build 12 57151414 1D TTGCTATGAC T/- TTTTTTTTTT 2891 het 94 hom 15 1 7 7 T 12 11 189442 CASAVA_Build 12 57158854 11I GGCCTTAAAC -----------/TGGTTGGATAA TGTCTCAGAG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 TGGTTGGATAA 0 1 189443 CASAVA_Build 12 57160000 1D TAAATGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 60 27 22 11 T 11 10 189444 CASAVA_Build 12 57160608 2D GCACTTTGTG TA/-- TCTGACTCAT 3070 het 3070 ref 45 22 20 5 TA 1 0 189445 CASAVA_Build 12 57163982 1D TATCAAAATA T/- TTTTTTACAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 6 189446 CASAVA_Build 12 57164661 1I TCACTGATTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 8 9 189447 CASAVA_Build 12 57166034 2I TCACAGAGAC --/TG TGAGATTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 TG 1 2 189448 CASAVA_Build 12 57166483 1I ATTATATCCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 43 21 21 1 T 7 8 189449 CASAVA_Build 12 57169499 1D GACTTGAATT A/- AAAAAAAAAA 1440 het 1440 ref 50 36 4 10 A 12 11 189450 CASAVA_Build 12 57172209 1I TATAGATTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 50 28 14 8 T 8 9 189451 CASAVA_Build 12 57190630 2I ACACAACGAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 TA 5 6 189452 CASAVA_Build 12 57193790 1I TCTTGGTGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 9 10 189453 CASAVA_Build 12 57196591 1I ATTTCAGGAG -/A ATTGTTTAGT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 A 1 2 189454 CASAVA_Build 12 57210591 1D GCTATGCAGG T/- TTTTTATTAC 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 T 6 5 189455 CASAVA_Build 12 57217064 3D CACCTGGCTT CTC/--- CTTACCACCT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 CTC 1 0 189456 CASAVA_Build 12 57220335 1I TTTGTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 10 11 189457 CASAVA_Build 12 57227704 3D TAAAAAAAAT AAC/--- AAAACATTGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 6 AAC 1 0 189458 CASAVA_Build 12 57232044 1I TTCAATTTGA -/T TACTGTGTAC 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 1 2 189459 CASAVA_Build 12 57238276 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 800 hom 10 2 8 0 T 7 6 189460 CASAVA_Build 12 57238977 1D CAAAAAAAAA C/- AAACAAACAA 2328 hom 38 het 19 0 11 8 C 1 0 189461 CASAVA_Build 12 57243500 1I GTCATTTTTT -/A AGACTGCCTG 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 1 2 189462 CASAVA_Build 12 57250331 2D AAAAGAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 30 8 13 9 A 14 12 189463 CASAVA_Build 12 57251510 2D AGTCTGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 1838 het 830 hom 24 6 7 11 A 20 18 189464 CASAVA_Build 12 57252862 1I AGGCCTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1079 hom 34 3 19 12 A 11 12 189465 CASAVA_Build 12 57254444 1D ATTTTTTTTT A/- TCCTGGAGGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 A 1 0 189466 CASAVA_Build 12 57256039 5D CTTGATTTGC TGAGT/----- TATTTCAGGT 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 TGAGT 1 0 189467 CASAVA_Build 12 57257518 1I TTAGGTGTGG -/C CCACGTAAGA 3070 hom 81 het 37 0 27 10 C 2 3 189468 CASAVA_Build 12 57272867 1D CTAGGAATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 T 10 9 189469 CASAVA_Build 12 57275603 2I TCCGTGGCTA --/AT ATGTGTTGAA 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 AT 1 2 189470 CASAVA_Build 12 57275711 2I TGGTGGGGAC --/CA GAGTCCTCTC 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 CA 0 1 189471 CASAVA_Build 12 57280616 1I TCTCCAGTGA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 T 7 8 189472 CASAVA_Build 12 57282693 1I GGGAGGCGGA -/G CTTGCAGTGA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 G 0 1 189473 CASAVA_Build 12 57285848 3I TCCTTTATTC ---/CTT CTTTTCTTCT 3070 hom 38 het 19 0 13 6 CTT 1 2 189474 CASAVA_Build 12 57294326 4I TGGAAGAGAA ----/AGTC AGCCTATTAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AGTC 0 1 189475 CASAVA_Build 12 57298228 1D CTTGGGATTC A/- AATAAAGTCT 3070 hom 169 het 62 0 57 6 A 3 2 189476 CASAVA_Build 12 57301496 1I ATGGGCGGGG -/C CTTGCGGCAT 2791 hom 21 het 8 0 8 0 C 1 2 189477 CASAVA_Build 12 57310002 1I GGTAAGTGGC -/A GGGGAAAGAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 0 1 189478 CASAVA_Build 12 57314402 1I TGAGTGGATT -/A AAAAAATGCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 6 7 189479 CASAVA_Build 12 57318667 4I TAATCCTTAG ----/AAGT AAGAGGATAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAGT 0 1 189480 CASAVA_Build 12 57321244 1D TTTCAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 22 1 17 6 A 14 13 189481 CASAVA_Build 12 57322990 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAACTT 3070 hom 66 het 33 0 23 10 A 7 8 189482 CASAVA_Build 12 57337298 2I CTCTTGAAAT --/CC AACACCTGCA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 0 2 189483 CASAVA_Build 12 57345329 5D CAGGTTGAAA GCCCT/----- GCTTAATTAC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 GCCCT 1 0 189484 CASAVA_Build 12 57406724 1D ATTTTGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 12 11 189485 CASAVA_Build 12 57431260 1I AAATATTCTC -/T TTACCATGAT 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 2 3 189486 CASAVA_Build 12 57439866 4I GTATGTCTTC ----/TTTT GAGAAGTGTC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 4 189487 CASAVA_Build 12 57440312 1I CACTGGGCAT -/C AGATCAACTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 189488 CASAVA_Build 12 57445898 3I CATTATTTGT ---/AGA AGAAGTACTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AGA 1 2 189489 CASAVA_Build 12 57449642 2D CAGGAGCTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 16 9 T 13 11 189490 CASAVA_Build 12 57455606 1I TCAGTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 11 9 T 13 14 189491 CASAVA_Build 12 57456860 1I CAAATATAGG -/T TTTTTTCTGC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 6 7 189492 CASAVA_Build 12 57471576 1I CTCTAACACG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 9 10 189493 CASAVA_Build 12 57478921 1I TTTCATATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1404 hom 32 4 15 13 T 11 12 189494 CASAVA_Build 12 57481105 2D GATATATATA TT/-- ACATATAATA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 2 0 189495 CASAVA_Build 12 57490633 1D CACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1433 het 1433 ref 24 15 4 5 A 15 14 189496 CASAVA_Build 12 57491810 1D TTATAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 46 1 34 13 A 11 10 189497 CASAVA_Build 12 57499659 5I GCTGCCGCAG -----/GGCCT GGCCTGCACG 3070 hom 107 het 45 0 31 14 GGCCT 1 2 189498 CASAVA_Build 12 57499999 1I TGTGTTTGAG -/C CATTAAATTA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 1 2 189499 CASAVA_Build 12 57501926 1D AAACTATTTC T/- TTTTTTTCTT 1487 het 1484 ref 22 8 9 6 T 8 7 189500 CASAVA_Build 12 57507792 1D ACCAGTCATC A/- GGGGAATGCA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 0 189501 CASAVA_Build 12 57508143 1I TATGAATAGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 8 189502 CASAVA_Build 12 57572984 1I ACCTCCCTTG -/A AAAGGCCGCT 3070 hom 110 het 40 0 36 4 A 3 4 189503 CASAVA_Build 12 57577485 2D GTCATAACAC AT/-- GTTAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 19 14 6 AT 1 0 189504 CASAVA_Build 12 57595600 1D TTTTTCACCT A/- AAAAAAAAAA 1247 het 1247 ref 37 23 4 13 A 11 10 189505 CASAVA_Build 12 57692189 1D CTTTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 29 0 14 15 T 17 16 189506 CASAVA_Build 12 57703602 1D GTGTTAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 28 1 20 8 A 12 11 189507 CASAVA_Build 12 57716124 1D AGTGTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 110 het 43 0 37 6 A 11 10 189508 CASAVA_Build 12 57716334 1I ATAGATCTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 59 het 27 0 20 7 A 9 10 189509 CASAVA_Build 12 57721734 1D GAAAACATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 38 0 30 8 T 12 11 189510 CASAVA_Build 12 57728526 2I TATTATACAC --/AT GTTTTATCCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 0 1 189511 CASAVA_Build 12 57729093 4I TTCAATTAAC ----/TAAT TAAATATTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAT 0 1 189512 CASAVA_Build 12 57746902 1D AAACACCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 28 1 24 3 T 12 11 189513 CASAVA_Build 12 57763579 3D TTAATTCACT TGA/--- TGATGACCTT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 TGA 3 2 189514 CASAVA_Build 12 57774908 1D TCACAGGCTG A/- AAAGTCTGTG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 4 3 189515 CASAVA_Build 12 57788991 3D TTTACCTGCT GAC/--- GACCTTCTCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 GAC 2 1 189516 CASAVA_Build 12 57807826 4D TGAATCTAAG AGAT/---- AGATACTTTA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 AGAT 2 1 189517 CASAVA_Build 12 57808825 6D TATTACTATA ACCTCT/------ ACCCATGTGC 3070 het 3070 ref 27 15 10 4 ACCTCT 1 0 189518 CASAVA_Build 12 57811357 1D ACGGAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3045 het 1518 hom 21 6 10 5 T 13 12 189519 CASAVA_Build 12 57819751 1I GATGGGGTTG -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 T 6 7 189520 CASAVA_Build 12 57822978 1I GTGATATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2747 hom 25 7 12 6 T 13 14 189521 CASAVA_Build 12 57828498 1I CTATTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 40 1 33 6 A 10 11 189522 CASAVA_Build 12 57832541 1I ACACTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 10 11 189523 CASAVA_Build 12 57836578 1D AATGTATAAT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 2789 hom 33 10 21 3 A 1 0 189524 CASAVA_Build 12 57837628 1I TAATTTCCTC -/T TGGTCCAGTC 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 1 2 189525 CASAVA_Build 12 57845951 3I TTAAGAAATA ---/TTC ATTAGCCCCT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 TTC 0 1 189526 CASAVA_Build 12 57857341 1I CAGAAAATGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 9 10 189527 CASAVA_Build 12 57881909 4D TGCCATAGTC AGTT/---- AGAGTGATCA 2897 het 2897 ref 33 19 9 6 AGTT 1 0 189528 CASAVA_Build 12 57890766 1I TTTTTTAAAG -/T TTTTTTTTAA 2427 het 2427 ref 16 9 6 1 T 8 9 189529 CASAVA_Build 12 57897399 9I CACAAAGCTT ---------/TTTTGAATA TTTCAAAATG 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 TTTTGAATA 0 1 189530 CASAVA_Build 12 57901289 5I GTAAAAATAG -----/TTTAT TTTATGTAAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 TTTAT 1 2 189531 CASAVA_Build 12 57913288 1I GATGATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 13 9 A 10 11 189532 CASAVA_Build 12 57918520 1I GCAATCTTGA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 8 9 189533 CASAVA_Build 12 57923669 2D TCAGCAGAAA CT/-- CTACAAGCCA 1834 het 1834 ref 17 11 5 1 CT 2 1 189534 CASAVA_Build 12 57942685 1I CTAAGTCCCA -/T TTTTTCTGAT 3070 het 3070 hom 50 18 26 6 T 5 6 189535 CASAVA_Build 12 57947549 1I ATCCTGTTTA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 6 7 189536 CASAVA_Build 12 57949519 1D CTTTAGGATA T/- TATCCAGGAG 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 2 1 189537 CASAVA_Build 12 57950710 1D CACTCCCCAG A/- AAAATGCAAA 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 A 5 4 189538 CASAVA_Build 12 57964194 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1082 het 777 hom 10 4 3 4 A 18 16 189539 CASAVA_Build 12 57969125 2D ACCTAATGTT AC/-- AGTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 AC 1 0 189540 CASAVA_Build 12 57972312 3I AAAACAAACA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 AAC 5 6 189541 CASAVA_Build 12 57985488 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 39 1 31 7 A 13 12 189542 CASAVA_Build 12 57988399 5I CATAGGGCTT -----/AAGAG AAGTTACCTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAGAG 0 1 189543 CASAVA_Build 12 57997320 2D TGTGATTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 2571 het 95 hom 24 1 10 13 T 18 16 189544 CASAVA_Build 12 58012036 1I GTATGCTTAC -/T TAAAGGCAAC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 1 2 189545 CASAVA_Build 12 58013985 1I TTTTATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 12 13 189546 CASAVA_Build 12 58015866 2D TAAAATTGAT TG/-- TGTGATGGTC 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 TG 3 2 189547 CASAVA_Build 12 58022826 2D TTTTTATAAG AT/-- ATGTAGTAAT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 AT 2 1 189548 CASAVA_Build 12 58033067 4D AAAAGGAAAT AGAA/---- AGAACACATA 3070 het 3070 hom 41 20 19 5 AGAA 2 1 189549 CASAVA_Build 12 58040067 1I GAAGGCCTAA -/T TGCAGGAATT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 1 2 189550 CASAVA_Build 12 58045127 1I TATATTAAGA -/G GAGGGTTATG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 G 1 2 189551 CASAVA_Build 12 58051022 1D AGACTGAAGC T/- TTATTTGTAT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 T 3 2 189552 CASAVA_Build 12 58051689 2D ATGCAGGCAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 72 het 33 0 25 10 GT 8 7 189553 CASAVA_Build 12 58053275 1I TTTTTATTGT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 6 7 189554 CASAVA_Build 12 58053920 4I CAATAATCAC ----/ACAA ACAAATGTAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 ACAA 1 2 189555 CASAVA_Build 12 58058071 4I TTTTAATAGG ----/AATT AATTGTTAGT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AATT 1 2 189556 CASAVA_Build 12 58059574 5I ATTCTGAAAA -----/TTTGT TTTGTACCCC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 TTTGT 1 2 189557 CASAVA_Build 12 58060050 1D TCTTTTCTAA C/- CTAATGGAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 2 1 189558 CASAVA_Build 12 58060668 2D ACTTGTCATT GG/-- GGAGGTGGTG 3070 hom 51 het 23 0 17 6 G 4 2 189559 CASAVA_Build 12 58061121 1I ACTTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2854 het 473 hom 14 1 9 4 A 15 16 189560 CASAVA_Build 12 58062103 2D CCCCCATCCC CT/-- GACAGGCCTT 3070 het 1846 hom 21 6 13 2 CT 1 0 189561 CASAVA_Build 12 58064253 4D GTTTGATAAC ATTG/---- ATTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 ATTG 1 0 189562 CASAVA_Build 12 58066352 1D CCCTTTTTAT A/- GTCCCCTTTT 3070 hom 160 het 58 0 54 5 A 1 0 189563 CASAVA_Build 12 58067652 5I TTTTACACAC -----/TGATA TAAGATAAAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TGATA 0 1 189564 CASAVA_Build 12 58084056 13D ATTGGAAACA CTTGAGACTAATG/------------- CTTGAGACTA 3070 het 3070 ref 39 16 14 14 CTTGAGACTAATG 2 1 189565 CASAVA_Build 12 58106616 1D TTTTTCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 11 10 189566 CASAVA_Build 12 58109246 1I TGTCCCACTC -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 6 7 189567 CASAVA_Build 12 58117346 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 T 11 10 189568 CASAVA_Build 12 58121178 2D ATTAAAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 T 12 10 189569 CASAVA_Build 12 58127391 1I ACATTACAAT -/A AAAAATACCT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 5 6 189570 CASAVA_Build 12 58133531 1I TGCTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 7 9 A 10 11 189571 CASAVA_Build 12 58135051 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 13 12 189572 CASAVA_Build 12 58150729 1D TCTTCATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 11 10 189573 CASAVA_Build 12 58156739 1I CTCTTCATGA -/C CTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 50 24 24 2 C 1 2 189574 CASAVA_Build 12 58157806 1D TTTATAGTAT G/- TAAATTATAT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 G 1 0 189575 CASAVA_Build 12 58165232 1I TTATTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 T 11 12 189576 CASAVA_Build 12 58166960 1I CTCCAGCTGC -/A AAGGTCTCCT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 A 2 3 189577 CASAVA_Build 12 58193588 1I TACCACACAG -/A AAAAAATGTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 6 7 189578 CASAVA_Build 12 58204981 1I CTTATATCTT -/A AAGTAAACTG 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 A 2 3 189579 CASAVA_Build 12 58206057 1I CAGGCCAACC -/T TTTTTTTTTT 2093 het 1187 hom 22 6 9 7 T 17 18 189580 CASAVA_Build 12 58209464 1I CCTAATATCC -/A GGGGGGGAGG 3070 het 1492 hom 28 10 14 4 A 0 1 189581 CASAVA_Build 12 58219618 2D GATCTTACTC TT/-- AGTATCACAG 3070 het 3070 ref 47 27 19 2 T 2 0 189582 CASAVA_Build 12 58219787 2I TACAGAAGGT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 13 25 12 AC 6 7 189583 CASAVA_Build 12 58221543 1D AACCCCCCTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 34 0 27 7 T 9 8 189584 CASAVA_Build 12 58246232 1D TGGACCACAA C/- CTCCACATAA 3070 het 3070 hom 42 16 24 3 C 2 1 189585 CASAVA_Build 12 58253670 1D GAAGTACACT A/- AATTTTTATG 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 3 2 189586 CASAVA_Build 12 58254305 1I CTCTGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 2039 het 102 hom 12 2 8 2 A 12 13 189587 CASAVA_Build 12 58254921 4I AAAATTAAAA ----/AAAT AAATAAACAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAT 1 2 189588 CASAVA_Build 12 58255864 1I TAGCCTGGCG -/T TGGTGGCACG 3070 het 60 hom 23 1 19 3 T 1 2 189589 CASAVA_Build 12 58256947 2I15M1D9M9I AGTACACTTT --CCTCACCCATCACAAGGGTAATGGC---------/TACCTCACCCATCACAA-GGTATAGGCACATCTTTT TGATGTGCCT 3070 hom 17 het 20 1 16 9 N/A 0 0 189590 CASAVA_Build 12 58257786 4I GCACCAAATA ----/AAAT AAATAGGGGT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 AAAT 1 2 189591 CASAVA_Build 12 58264289 3I ATGACCAGTA ---/GAT GATAACATGG 3070 het 3070 hom 47 16 31 0 GAT 1 2 189592 CASAVA_Build 12 58264686 1D ATTTTTTTTT C/- CCTCATAGCT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 C 3 2 189593 CASAVA_Build 12 58272606 2D GGCTTAAAAC AA/-- TGGTCTCTTG 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 A 2 0 189594 CASAVA_Build 12 58274446 3D AAGACTTAAA AAG/--- AAGGTTACGA 3070 het 3070 hom 47 19 28 2 AAG 2 1 189595 CASAVA_Build 12 58275525 1D AAATGATTTG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 8 7 189596 CASAVA_Build 12 58279146 1D GCATGAAGCT A/- AATAAGAGCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 3 2 189597 CASAVA_Build 12 58309791 1D TTTAGTATAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 9 8 189598 CASAVA_Build 12 58320570 1I TGACATTCTG -/A AAAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 5 6 189599 CASAVA_Build 12 58321606 1D TCTAGGGCTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 38 11 13 15 T 9 8 189600 CASAVA_Build 12 58324222 1I CAAAATAAAT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 7 8 189601 CASAVA_Build 12 58327667 1I TGGTGACCAG -/A AAGGGGCCCA 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 A 2 3 189602 CASAVA_Build 12 58343414 1D TTATCAATAT A/- AAAAAAGTAG 3070 het 3070 ref 34 21 10 4 A 7 6 189603 CASAVA_Build 12 58356479 1D TAGCTCCTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 T 9 8 189604 CASAVA_Build 12 58356886 1D AACGTTACTT A/- AAAATCTTTC 2923 het 2903 hom 24 8 7 10 A 5 4 189605 CASAVA_Build 12 58358489 12D GTTCAGCTCT TAGCAGAGAGGA/------------ TACCCTGAAA 3070 het 3070 ref 43 25 21 3 TAGCAGAGAGGA 1 0 189606 CASAVA_Build 12 58362000 2D CGAGAATCTC AT/-- AACACAGCTT 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 AT 1 0 189607 CASAVA_Build 12 58363116 1D CTCTGTCTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 A 10 9 189608 CASAVA_Build 12 58394614 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1554 het 1463 hom 25 4 12 9 T 11 12 189609 CASAVA_Build 12 58399712 3D AACATGTTAA TCT/--- TCTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 13 7 TCT 2 1 189610 CASAVA_Build 12 58400204 2I TAAAGAACAC --/AG AATTGGAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AG 0 1 189611 CASAVA_Build 12 58407854 1D TAATTGTGTT G/- GGGGGGAGGT 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 G 7 6 189612 CASAVA_Build 12 58410261 2D AATACAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 12 10 189613 CASAVA_Build 12 58412113 2I GCATATATAT --/TA TATATATATA 3070 het 1482 hom 15 3 8 4 TA 5 6 189614 CASAVA_Build 12 58418881 1I CTCAAAGATT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 2112 hom 23 7 13 3 C 0 1 189615 CASAVA_Build 12 58439061 1D CTGTATGGAC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 8 7 189616 CASAVA_Build 12 58442200 2D ATGTGAATTT TC/-- TCTGTTTCTG 3070 het 3070 ref 29 14 11 6 TC 2 1 189617 CASAVA_Build 12 58447110 1D AGTCTTGCGA G/- GGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 19 11 7 2 G 3 2 189618 CASAVA_Build 12 58461333 3I GAAGTTTAAC ---/ATT ATGATTAATT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 ATT 0 1 189619 CASAVA_Build 12 58461954 2I AAAGACTACA --/TT TTATATATAT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 2 4 189620 CASAVA_Build 12 58474340 2D ATGATTTCAC AT/-- GTTTTTTCTT 2454 het 2454 ref 18 10 7 3 AT 1 0 189621 CASAVA_Build 12 58475140 3D TTAAAGTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 17 14 189622 CASAVA_Build 12 58478978 7D ATCAGAAAGC TAGAAGA/------- TCTCAAACCA 1839 het 1839 ref 38 31 4 5 TAGAAGA 1 0 189623 CASAVA_Build 12 58491221 1D CACAATAACC A/- AAGAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 3 2 189624 CASAVA_Build 12 58492941 1D AATCTCCATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 9 8 189625 CASAVA_Build 12 58499054 7D TATCTAAGCC CTAAGTA/------- CTGTGTCTAG 3070 het 3070 ref 41 22 17 5 CTAAGTA 1 0 189626 CASAVA_Build 12 58506765 3I TTTAAAAAAA ---/TCT TCTAGGAACA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 TCT 1 2 189627 CASAVA_Build 12 58510547 2D TAATTAAATA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 414 hom 44 8 17 19 C 11 9 189628 CASAVA_Build 12 58512583 1I CTAAAAACAC -/A AAAAAATAGC 2832 het 1286 hom 12 3 7 2 A 6 7 189629 CASAVA_Build 12 58515250 1I TGAGGGTGTT -/A ACATCTACAT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 1 2 189630 CASAVA_Build 12 58515711 6I ATACATACAT ------/ATACAC ATACACATGT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 ATACAC 1 2 189631 CASAVA_Build 12 58515927 1D AGTGCAGAAG A/- AGATGAAAGT 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 A 2 1 189632 CASAVA_Build 12 58525759 4D TTTTCATGGT TAAA/---- TAAATAAGAA 3070 het 3070 ref 48 21 18 12 TAAA 2 1 189633 CASAVA_Build 12 58529104 2D CCCTTCCCCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 CT 7 6 189634 CASAVA_Build 12 58532274 1D GAAAAGCTGA T/- TTTTCCCTTC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 5 4 189635 CASAVA_Build 12 58532723 3D GGCTTTTTTT TGG/--- GGGGGGGGTG 3070 het 2208 hom 29 10 14 6 TGG 1 0 189636 CASAVA_Build 12 58542710 1D TGCTATGTCC A/- AGTTATATCT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 2 1 189637 CASAVA_Build 12 58558103 1I ATATTTACAC -/A AACTTAGATG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 2 3 189638 CASAVA_Build 12 58600522 1I AGCAATAACA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 60 het 30 0 21 9 T 7 8 189639 CASAVA_Build 12 58601475 1I CGCTTGCTGG -/A AGTCATCACT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 189640 CASAVA_Build 12 58606329 1D AAAAAACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 592 hom 28 3 16 10 A 16 15 189641 CASAVA_Build 12 58611905 1I CAAGAGGAAC -/T TTGGAAACTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 3 189642 CASAVA_Build 12 58618437 4I AGGGGAAAGA ----/AAGG AAGGAAAGGA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 AAGG 1 2 189643 CASAVA_Build 12 58622299 1D TTTTGAAAGA T/- TTATCTCTAA 3070 hom 85 het 39 0 27 13 T 3 2 189644 CASAVA_Build 12 58635514 1D AAAAATAATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 9 8 189645 CASAVA_Build 12 58638434 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 38 1 30 7 A 11 10 189646 CASAVA_Build 12 58652402 1D TGTAAGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1221 hom 27 8 12 7 A 17 16 189647 CASAVA_Build 12 58657927 1I ATGGTGTAGC -/A GACCAAACCC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 0 1 189648 CASAVA_Build 12 58682070 1I TTTGCTAAAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 9 189649 CASAVA_Build 12 58688722 15D TCCAACTTTA TTTTTTATTTTTTAT/--------------- TTTTTTTATT 3070 het 2235 hom 17 5 12 0 TTTTTTATTTTTTAT 1 0 189650 CASAVA_Build 12 58693845 1I AAATTTAGGT -/A AAAAACTCAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 5 6 189651 CASAVA_Build 12 58694634 2I TACAGATAAG --/AT GTGAATATGC 3070 hom 144 het 52 0 48 4 AT 0 1 189652 CASAVA_Build 12 58694968 1I GTGGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 30 0 25 5 A 10 11 189653 CASAVA_Build 12 58711944 1D TAGTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 46 0 36 10 T 11 10 189654 CASAVA_Build 12 58719626 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 214 hom 31 4 18 9 A 15 14 189655 CASAVA_Build 12 58783522 4D GACAGCAAAA AGAT/---- AGGAATATTC 3070 hom 111 het 43 0 38 6 AGAT 1 0 189656 CASAVA_Build 12 58784744 1I AATTCACTCC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 7 8 189657 CASAVA_Build 12 58785798 4D GCCTTTAACA GATG/---- AAGGGCAAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 GATG 1 0 189658 CASAVA_Build 12 58788300 2I AAAAATGGGA --/TT TTTTTTAAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 8 189659 CASAVA_Build 12 58795959 3I TCATAGAAGA ---/AAG AAGATTTGTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AAG 1 2 189660 CASAVA_Build 12 58797726 1D TAAGCATATG A/- AAAAATGCTC 3070 het 3070 ref 28 14 9 6 A 6 5 189661 CASAVA_Build 12 58821180 4I CTCTTGCAAC ----/TCTT TCTTTCAGCT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 TCTT 1 2 189662 CASAVA_Build 12 58822821 1D ATCAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 29 1 17 11 T 13 12 189663 CASAVA_Build 12 58843908 4D GACAATAATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 91 het 44 0 31 13 TTTG 4 3 189664 CASAVA_Build 12 58844438 1I TGTAGATGAG -/A AAAAAGAACT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 5 6 189665 CASAVA_Build 12 58850037 2D ACAGAAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 40 2 28 10 A 16 14 189666 CASAVA_Build 12 58859183 3I TCTGCTAGTT ---/TGG TGAATGATAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TGG 0 1 189667 CASAVA_Build 12 58861505 5D GATACTATAG AAATA/----- ATAACAGATA 3070 hom 99 het 35 0 34 3 AAATA 1 0 189668 CASAVA_Build 12 58870540 4D AAGAAAACTT AAAA/---- GAGATATTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 A 4 0 189669 CASAVA_Build 12 58872948 1D GCTAATTTAT C/- TACAGGCATC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 1 0 189670 CASAVA_Build 12 58879497 2I AGATTAGCCA --/AC ACACACAAGA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 AC 3 4 189671 CASAVA_Build 12 58880238 1D CATAATGCCT A/- CTTCTGGGGT 3070 hom 66 het 27 0 22 7 A 1 0 189672 CASAVA_Build 12 58885011 1I GTCATCCAAA -/C AAAAATGAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 189673 CASAVA_Build 12 58906704 2I GCAGAAAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 30 4 A 10 12 189674 CASAVA_Build 12 58911258 11D AAAGGGCATG TTATCACTCAA/----------- ATTAACTAGG 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TTATCACTCAA 1 0 189675 CASAVA_Build 12 58914826 1D GCTGCAGGAG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 72 het 30 0 22 9 T 9 8 189676 CASAVA_Build 12 58917926 1I AAGATTAAAA -/C CCACCAGCCA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 C 2 3 189677 CASAVA_Build 12 58927101 3D AAAATAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 48 het 20 0 16 5 AAG 5 4 189678 CASAVA_Build 12 58928048 4I ACAGAATATC ----/CAGA CAGAGAGAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CAGA 1 2 189679 CASAVA_Build 12 58929227 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2925 het 13 hom 12 1 9 2 A 15 14 189680 CASAVA_Build 12 58930731 5D GATTTTCACT GAAAA/----- GAAAAGCATA 3070 hom 135 het 48 0 46 4 GAAAA 2 1 189681 CASAVA_Build 12 58932005 4D ACTAGACTTT AGAA/---- AGACTTTATT 3070 hom 63 het 27 0 22 6 AGAA 1 0 189682 CASAVA_Build 12 58934215 1I AGACAGAGTG -/T GTCAACAGGC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 0 1 189683 CASAVA_Build 12 58939209 1I TTCTCTTGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 9 10 189684 CASAVA_Build 12 58941653 2I TTTGAATGAC --/AT GACTTGTTCA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 AT 0 1 189685 CASAVA_Build 12 58951790 1D TGAAGGTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 22 1 17 4 T 12 11 189686 CASAVA_Build 12 58956342 1D TGGGGTTTCA C/- CGTGGTGCCC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 2 1 189687 CASAVA_Build 12 58957559 1D CTTCACTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 11 10 189688 CASAVA_Build 12 58960563 4I ATTCAATCTC ----/TAAT TAGCTTTATG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TAAT 0 1 189689 CASAVA_Build 12 58969122 1D AGTTTTCATA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 9 8 189690 CASAVA_Build 12 58970503 1I GGCCTACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 11 12 189691 CASAVA_Build 12 58973060 4D CTATATATCT TTAA/---- TTAATTGCAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTAA 2 1 189692 CASAVA_Build 12 59014684 3D TTGTGACAAC AAT/--- GTCAGAGAAT 3070 hom 84 het 30 0 27 3 AAT 1 0 189693 CASAVA_Build 12 59017148 2D TATTTCATCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 138 het 53 0 47 9 TG 6 5 189694 CASAVA_Build 12 59036870 1D AGAAACACAG A/- AAAAAAGTTC 3070 hom 99 het 37 0 33 5 A 7 6 189695 CASAVA_Build 12 59038649 1D CAGTGTCTGG A/- AAAAAACACC 3070 hom 105 het 40 0 35 6 A 7 6 189696 CASAVA_Build 12 59102720 2I TATGGTTGAA --/AT ATATATATAT 2497 het 819 hom 14 2 7 5 AT 8 9 189697 CASAVA_Build 12 59107255 1D ATGATACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 12 17 A 17 16 189698 CASAVA_Build 12 59159227 2D AAATTCAAGT TA/-- TATATATATA 3070 het 1333 hom 17 4 8 5 TA 10 9 189699 CASAVA_Build 12 59164171 20I ATAAGTTCAG --------------------/CAGGCAAGGAAGATTTTATT CAGTACTATT 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 CAGGCAAGGAAGATTTTATT 0 1 189700 CASAVA_Build 12 59179521 2I TTGTGCACTC --/AT GTGCACAGTC 3070 het 3070 hom 60 24 30 6 AT 0 1 189701 CASAVA_Build 12 59191025 1D GTGCCTACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 A 11 10 189702 CASAVA_Build 12 59192451 3D GAAGCAAAAA AAG/--- AAAAGTTATT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AAG 1 0 189703 CASAVA_Build 12 59197992 1D CCTTGCTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2560 hom 28 8 13 7 A 13 12 189704 CASAVA_Build 12 59207238 4I TCAATCATTC ----/ATTT GTTGATGGAC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 ATTT 0 1 189705 CASAVA_Build 12 59214397 1I TTTTCTGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 22 22 6 A 10 11 189706 CASAVA_Build 12 59218273 1I TTTTAGGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 9 10 189707 CASAVA_Build 12 59228255 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 1381 het 1381 ref 26 20 3 4 A 11 10 189708 CASAVA_Build 12 59239202 13I TTGTGAATAG -------------/TGATGTGCTGTGA TGCTGTGATG 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 TGATGTGCTGTGA 0 1 189709 CASAVA_Build 12 59241513 1I TCTGAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 1020 het 1020 ref 35 13 7 15 T 11 12 189710 CASAVA_Build 12 59241887 1I AGTGTGTGGG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 7 8 189711 CASAVA_Build 12 59255546 1D CTTTTTTTTT A/- ATCTTCTTAC 3070 het 3070 ref 36 16 18 3 A 2 1 189712 CASAVA_Build 12 59255969 4D ACACTAATGA TAAC/---- TAACTAATGA 3070 hom 106 het 38 0 36 3 TAAC 2 1 189713 CASAVA_Build 12 59280945 1I TCTATTCATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 A 8 9 189714 CASAVA_Build 12 59289728 2D GAATTGACAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 AT 7 6 189715 CASAVA_Build 12 59296264 21I ATACAGGTTA ---------------------/GGCCCCAAGAGCTTAGATTCC AGCCCCAACC 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 GGCCCCAAGAGCTTAGATTCC 0 1 189716 CASAVA_Build 12 59304117 1D CCACAAAAAA G/- GATGAGTTCA 3070 het 3070 hom 38 18 15 6 G 2 1 189717 CASAVA_Build 12 59316891 2I TGTGGAAACT --/TG TGTGATCATG 3070 het 3070 hom 40 12 14 14 TG 2 3 189718 CASAVA_Build 12 59317333 1I GTTTGTTGCT -/C CCTAAGTTCA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 C 2 3 189719 CASAVA_Build 12 59328407 1D AACAGAAGTG A/- AAAAAAAAAG 1096 het 1096 ref 41 37 3 1 A 10 9 189720 CASAVA_Build 12 59330010 1D GGTTGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 5 A 12 11 189721 CASAVA_Build 12 59331842 1I ATGAAAAGTT -/A AGTGTTTTAT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 A 1 2 189722 CASAVA_Build 12 59360483 1I TTGTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2534 het 2341 hom 23 7 7 9 A 12 13 189723 CASAVA_Build 12 59361249 1D AATGAAATCA T/- TTTTTTTTTT 2537 het 2537 ref 33 12 7 15 T 11 10 189724 CASAVA_Build 12 59363163 1D AGTGAATAAT A/- AAAACTGTTT 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 A 5 4 189725 CASAVA_Build 12 59363438 1I AGGTATCTTA -/T TTTTTTTTTT 2311 het 2311 ref 28 21 5 2 T 11 12 189726 CASAVA_Build 12 59372649 1I TCAAATGAGA -/T TTTGTCTTAC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 3 4 189727 CASAVA_Build 12 59379764 2I AAATATTTGC --/AT ATATATATGT 3037 het 3037 ref 20 12 7 1 AT 4 5 189728 CASAVA_Build 12 59388127 1D GATGGGGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 7 6 T 10 9 189729 CASAVA_Build 12 59391261 1I TTACCTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 T 9 10 189730 CASAVA_Build 12 59399980 1I ATGGAGAATA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 7 8 189731 CASAVA_Build 12 59403779 6I CTGTGCAAAA ------/ACTTTT GAGTTTGATG 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 ACTTTT 0 1 189732 CASAVA_Build 12 59410425 1D TAGAGTCAAC A/- AAATATGAAT 3070 het 3070 hom 32 14 18 2 A 4 3 189733 CASAVA_Build 12 59425597 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTGCCC 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 T 6 7 189734 CASAVA_Build 12 59433220 1D GACATCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 14 15 A 12 11 189735 CASAVA_Build 12 59437714 1I TAAATTTGAG -/A AAAAAAAACA 2401 het 2401 ref 30 17 7 6 A 8 9 189736 CASAVA_Build 12 59441440 4I TTGTAACCTG ----/AAAT AAATTAGTTT 2201 het 2201 ref 10 5 5 0 AAAT 1 2 189737 CASAVA_Build 12 59451001 1D AAAAAAAAAA C/- CCAACAACGC 2719 het 2719 ref 27 17 8 2 C 3 2 189738 CASAVA_Build 12 59455548 1I CTATTTTATA -/T TTTTTTTCAA 3042 het 3042 ref 26 15 9 2 T 7 8 189739 CASAVA_Build 12 59456472 1D GTAAATATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 T 10 9 189740 CASAVA_Build 12 59468335 4I TGGACCAAAA ----/TAAT TAATATTGTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 TAAT 1 2 189741 CASAVA_Build 12 59494087 6I TCTAATACTT ------/TCTCTC TAATCATATT 3070 het 3070 hom 35 16 19 0 TC 0 3 189742 CASAVA_Build 12 59494354 1D ATTCAGCATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 A 9 8 189743 CASAVA_Build 12 59496223 4I TTCTTTTCTC ----/TCTT TCTTTCTCTA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 TCTT 1 2 189744 CASAVA_Build 12 59505518 2D ATACTGAATT TA/-- TATGTTTATA 3070 het 3070 ref 30 18 11 4 TA 2 1 189745 CASAVA_Build 12 59512201 1D GATCTTCACA T/- TACAAAATTC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 2 1 189746 CASAVA_Build 12 59545986 1D GTATGAAAAG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 8 7 189747 CASAVA_Build 12 59547016 4D TAGAGCACAG AAGA/---- AAGACTGCTT 3070 het 3070 hom 39 12 24 4 AAGA 2 1 189748 CASAVA_Build 12 59557770 1I TGTAGGTATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 9 10 189749 CASAVA_Build 12 59562903 1I ATCCTTAGTC -/T TATAGCCATA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 1 2 189750 CASAVA_Build 12 59564067 1I ATGGGATTGA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 T 6 7 189751 CASAVA_Build 12 59564220 4I TTAGTTTAAT ----/TAAG TCTCATCTAT 3070 het 2751 hom 21 6 13 2 TAAG 0 1 189752 CASAVA_Build 12 59567404 1I ATGGATTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 T 11 12 189753 CASAVA_Build 12 59567620 1D TTGGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 10 16 T 11 10 189754 CASAVA_Build 12 59570036 1I TAAGTGTGGG -/A AAAAATGGTT 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 A 5 6 189755 CASAVA_Build 12 59571957 1D GTTATTACTC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 9 8 189756 CASAVA_Build 12 59573286 1I TGTATGATAA -/T TTTTTAATAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 5 6 189757 CASAVA_Build 12 59575119 1D TCAACGTGTG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 8 7 189758 CASAVA_Build 12 59584548 1I ACTTCTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 36 1 25 10 T 10 11 189759 CASAVA_Build 12 59589130 1I AAAACAACTA -/T TTTTTTTTTT 1236 het 1236 ref 39 32 3 4 T 10 11 189760 CASAVA_Build 12 59599421 1D ACAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 126 hom 30 1 26 3 A 12 11 189761 CASAVA_Build 12 59617390 5I AAAAAAAAAG -----/AAAGA AAAGAAAAGG 3070 hom 51 het 30 0 15 15 AAAGA 1 2 189762 CASAVA_Build 12 59618710 1D TTTACTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 788 hom 37 4 16 17 A 17 16 189763 CASAVA_Build 12 59648957 1D ATGGAAATAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 7 6 189764 CASAVA_Build 12 59651192 1D TAACAGATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 441 hom 29 1 20 8 A 10 9 189765 CASAVA_Build 12 59657471 1I GTCATTGCAC -/T TTATTTGAAA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 2 3 189766 CASAVA_Build 12 59664082 2I GCATTTTTTC --/AT ATGTTTGTTG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AT 1 2 189767 CASAVA_Build 12 59669766 1D TAATATTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 28 1 17 10 T 15 14 189768 CASAVA_Build 12 59673705 1D11M1D ATTCTGAGAA CCCCCAGACCGGT/-CCCCAGACCGG- TAGGATTCTA 3070 hom 132 het 42 0 44 3 N/A 0 0 189769 CASAVA_Build 12 59674422 4I TTAAAGACAA ----/TAGT TAGCCTCTCT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 TAGT 0 1 189770 CASAVA_Build 12 59693099 1I AAAGGAAAAG -/A AAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 6 7 189771 CASAVA_Build 12 59698509 1I ATTATGATCC -/A AAAAAAAAAA 2886 het 2886 ref 32 11 11 10 A 13 14 189772 CASAVA_Build 12 59699663 2I TCCACCATAC --/AT ATATATATAT 2534 het 143 hom 13 1 7 5 AT 7 8 189773 CASAVA_Build 12 59702653 1I TTTATTTATC -/T TTTCAAAGAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 3 4 189774 CASAVA_Build 12 59709943 1D CCTCCTCTTC T/- TTTTTCTTTC 2450 het 2450 ref 17 8 6 3 T 6 5 189775 CASAVA_Build 12 59721053 6I GTTTTATATG ------/TATATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 TA 6 9 189776 CASAVA_Build 12 59721249 1I GTTTGTATGG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 6 7 189777 CASAVA_Build 12 59723798 2I GAGCCATGCC --/CT GTTTCAAAAA 3070 het 3070 hom 57 23 27 7 CT 0 1 189778 CASAVA_Build 12 59725671 1D TCAGCACCAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 T 9 8 189779 CASAVA_Build 12 59730585 4D TAAAGATTCT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 343 hom 51 8 21 22 AC 10 8 189780 CASAVA_Build 12 59730857 6D TCATCATATC TAAATT/------ CATTTTAAGG 3070 het 3070 ref 39 25 14 2 TAAATT 1 0 189781 CASAVA_Build 12 59732050 1D TTTAAGAACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 T 10 9 189782 CASAVA_Build 12 59783657 1D AACTTTCTAC T/- TCATAATTTT 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 T 2 1 189783 CASAVA_Build 12 59823558 4I TTGCAGGAAA ----/TAGT TACTCTTCTC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 TAGT 0 1 189784 CASAVA_Build 12 59882684 20D TCCATGGTTC TGTTGTAAACTTTTCAACTG/-------------------- TGTTATAAAA 3070 hom 69 het 24 0 23 3 TGTTGTAAACTTTTCAACTG 1 0 189785 CASAVA_Build 12 59882982 1D CTCGTAACAA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 189786 CASAVA_Build 12 59883922 1D TATTCTTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 9 8 189787 CASAVA_Build 12 59888646 2I TCAACTCGTC --/AA AGTCATTCTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 1 3 189788 CASAVA_Build 12 59889408 5I TCCCAACTGC -----/CTTGT CTTGTTGTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CTTGT 1 2 189789 CASAVA_Build 12 59890322 1D AACACTGAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 43 0 34 11 T 10 9 189790 CASAVA_Build 12 59890901 1I TAAATGTCAC -/A TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 0 1 189791 CASAVA_Build 12 59891525 1I AATCTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 22 1 17 4 T 15 16 189792 CASAVA_Build 12 59892003 1D CAGCTGGAGG A/- AAAAGGTACG 3070 hom 180 het 63 0 60 4 A 5 4 189793 CASAVA_Build 12 59893689 3D TTTTATGTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 26 0 16 10 T 15 12 189794 CASAVA_Build 12 59896065 4D TATAAAATTA TTAT/---- TTGTCAATTA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TTAT 1 0 189795 CASAVA_Build 12 59900140 1I AATTTGTATT -/A AAAATAAAAA 3070 het 341 hom 32 1 26 5 A 4 5 189796 CASAVA_Build 12 59904507 4D GTCTTGTTGA TCTG/---- TCTAATGTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TCTG 1 0 189797 CASAVA_Build 12 59922679 2D CATGAGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 18 0 12 6 TA 9 8 189798 CASAVA_Build 12 59926377 1D TCCACCAACC T/- TTTTTTTTTT 851 het 851 ref 32 20 3 9 T 13 12 189799 CASAVA_Build 12 59927529 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 36 2 27 7 T 11 12 189800 CASAVA_Build 12 59929333 3D TATTGCATTT ATA/--- ATAATAAAGT 3070 hom 81 het 36 0 28 10 ATA 3 2 189801 CASAVA_Build 12 60027621 1D TTATGGAGAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 10 9 189802 CASAVA_Build 12 60028241 3D TCAACAACAA AAG/--- AATAATCCAA 3070 het 3070 hom 47 20 19 9 AAG 1 0 189803 CASAVA_Build 12 60031475 1D ACTGGTACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 10 9 189804 CASAVA_Build 12 60033686 9D ATTTCAATCC CAATAGAAT/--------- CTGTAATATT 3070 het 3070 ref 41 19 18 7 CAATAGAAT 1 0 189805 CASAVA_Build 12 60036314 1D AGCACTCCCT C/- CAGCTTCCCC 3070 hom 58 het 23 0 18 5 C 2 1 189806 CASAVA_Build 12 60043014 1D GATCATCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 22 1 T 10 9 189807 CASAVA_Build 12 60052434 2I CATCTCTCTC --/TT GTTTGTACCT 3070 hom 113 het 43 0 38 5 T 0 2 189808 CASAVA_Build 12 60057298 1I TCATCGTTTA -/G CATTAGGTAT 3070 het 1045 hom 11 3 8 0 G 0 1 189809 CASAVA_Build 12 60058426 4I AATTACCACA ----/AATT AATAACTGAA 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 AATT 0 1 189810 CASAVA_Build 12 60058588 2D AGTCAGAAAC AT/-- AGTGGAATGG 3070 het 3070 ref 51 18 17 16 AT 1 0 189811 CASAVA_Build 12 60063108 2I AAATTAACCA --/TT TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 8 10 189812 CASAVA_Build 12 60063809 2I TAACTTGCCC --/CT GTTCTCTGTT 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 CT 0 1 189813 CASAVA_Build 12 60069839 3D CATTTTCTAG TCT/--- TCTTCTGAGC 3070 het 3070 ref 34 18 13 7 TCT 3 2 189814 CASAVA_Build 12 60071865 1D AAAATGGGGA T/- TAAAAATAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 2 1 189815 CASAVA_Build 12 60073377 1D AGAAAGGGGA G/- GAGTTGGTGA 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 G 2 1 189816 CASAVA_Build 12 60078541 1I AAGAAGGAGG -/A AAACATACTG 3070 het 3070 ref 27 19 8 0 A 3 4 189817 CASAVA_Build 12 60079703 2I GGCATCAAAA --/AT AGAGTGAAAA 3070 het 3070 hom 52 18 26 8 AT 0 1 189818 CASAVA_Build 12 60080317 6D GTATATTCTT TAAGAA/------ TATTTAAATA 560 het 560 ref 22 18 2 3 TAAGAA 1 0 189819 CASAVA_Build 12 60082577 1I ACTAAGTGGG -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 6 7 189820 CASAVA_Build 12 60113604 2I CAACAAGCGA --/TT ATGTGATCAG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 0 2 189821 CASAVA_Build 12 60118328 2D TGTATTTAGA GT/-- GTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 GT 2 1 189822 CASAVA_Build 12 60121762 4I GACTACATAA ----/GAGT GAGTTGATGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GAGT 1 2 189823 CASAVA_Build 12 60126200 1I CTGTATCAAG -/A AAAATCATAG 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 A 4 5 189824 CASAVA_Build 12 60140144 1I GAAAAAAGGG -/A AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 6 7 189825 CASAVA_Build 12 60143441 1D TTGAATCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 25 0 19 6 A 12 11 189826 CASAVA_Build 12 60164683 1I GAGATACAAC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 6 7 189827 CASAVA_Build 12 60167768 10I GACTCATCTA ----------/CTTCTGATTC CTTCTGGCAA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 CTTCTGATTC 0 1 189828 CASAVA_Build 12 60168182 1I ATCTTGAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 9 10 189829 CASAVA_Build 12 60173632 1I TTCCACTTTG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 8 9 189830 CASAVA_Build 12 60186684 1D CTAAATTCTG A/- AAAAAAAAAA 1625 het 1625 ref 32 19 6 8 A 15 14 189831 CASAVA_Build 12 60187196 4I AAAAAAAATA ----/AATT AATTAATAAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 AATT 1 2 189832 CASAVA_Build 12 60195856 1I GAGGTTCAGC -/A GCAAGCATTT 3070 hom 157 het 56 0 52 4 A 0 1 189833 CASAVA_Build 12 60201666 1D CCATGACATT A/- AAAAAAAAAA 2382 het 2382 ref 39 20 6 14 A 15 14 189834 CASAVA_Build 12 60212588 1I GGCCCAAAAA -/G GTGCTCCATA 3070 hom 89 het 47 1 40 6 G 1 2 189835 CASAVA_Build 12 60215377 1D ATTATGTGTG T/- TACTTAGCCC 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 T 2 1 189836 CASAVA_Build 12 60216449 1D CGCAAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 1129 het 1129 ref 38 28 3 8 T 11 10 189837 CASAVA_Build 12 60223763 2I GAAAAAAGAA --/CT GTTTGTGAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CT 0 1 189838 CASAVA_Build 12 60229770 1D TCAAGACTAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 8 7 189839 CASAVA_Build 12 60241079 1I TTTTGACCTA -/T CAGATACTGT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 0 1 189840 CASAVA_Build 12 60242350 4D TCCCTTCCTT CCTC/---- CCTCCCTCCC 1387 het 1387 ref 25 8 10 7 CCTC 5 4 189841 CASAVA_Build 12 60246048 6D TCCTTGTCTG TTTAAC/------ TTTATCTACT 3070 het 3070 ref 46 23 15 13 TTTAAC 1 0 189842 CASAVA_Build 12 60251528 2D GAGGTTGCAG AT/-- CACGCCACTG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 AT 1 0 189843 CASAVA_Build 12 60263646 4D ACCAATTTTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 46 0 35 13 TG 10 8 189844 CASAVA_Build 12 60269254 1I AGACCCTGAA -/G GGTCAGAAGG 3070 hom 58 het 21 0 17 4 G 2 3 189845 CASAVA_Build 12 60272230 1I AAGCCCCCTC -/G GGCACTCTCT 3070 hom 30 het 14 0 9 5 G 2 3 189846 CASAVA_Build 12 60295498 1I GCAGCTCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 10 11 189847 CASAVA_Build 12 60307519 6D CAGCCATGAG GCCTCA/------ CTCCTGTAAT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 GCCTCA 1 0 189848 CASAVA_Build 12 60325302 1I GTTTTAAACC -/T TTTTGAATTA 3070 het 98 hom 36 1 31 4 T 4 5 189849 CASAVA_Build 12 60329921 1D CCCTTTGCTT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 9 8 189850 CASAVA_Build 12 60334685 1D TAGTGTATTT G/- GGGGAAAACT 3070 hom 95 het 40 0 31 9 G 5 4 189851 CASAVA_Build 12 60345064 1I CTTCCTTATT -/A AAAAAACATT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 6 7 189852 CASAVA_Build 12 60346909 1I GGGGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 11 189853 CASAVA_Build 12 60347102 4D TTTAGCCGGG ATAA/---- ATAGTTGATA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 ATAA 1 0 189854 CASAVA_Build 12 60351017 1D CCTCCAAGGC T/- TAAGGCTTGC 3070 hom 93 het 34 0 31 4 T 2 1 189855 CASAVA_Build 12 60378312 1D GTAGACTATC T/- TTGAGTATTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 3 2 189856 CASAVA_Build 12 60382230 2D ATATATACAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 50 het 25 0 21 4 AT 5 4 189857 CASAVA_Build 12 60392858 2D TAATACTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 12 10 189858 CASAVA_Build 12 60402004 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 18 1 14 3 A 13 12 189859 CASAVA_Build 12 60408851 1I AATACCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 9 10 189860 CASAVA_Build 12 60427928 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 1903 het 1580 hom 10 4 4 2 A 10 9 189861 CASAVA_Build 12 60440859 1I CAAGACCCCC -/T GGAGAAGATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 0 1 189862 CASAVA_Build 12 60451958 1D AAATTGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 28 1 22 5 A 11 10 189863 CASAVA_Build 12 60464751 1I CCCATTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 32 1 27 4 A 11 12 189864 CASAVA_Build 12 60470226 1I CCTTCATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 454 hom 45 2 33 10 A 11 12 189865 CASAVA_Build 12 60522325 1I ACATGACAGA -/T ACTTGCCCTT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 0 1 189866 CASAVA_Build 12 60552121 1I TTTAATTGTT -/A AAAAGCAAGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 4 5 189867 CASAVA_Build 12 60577633 1I CAACACTTAT -/A AAAATCATCA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 A 4 5 189868 CASAVA_Build 12 60582956 2D AAAAATTTAT AA/-- GTCACCTGTG 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 A 2 0 189869 CASAVA_Build 12 60583328 1D CCTATCCTTC T/- CCCCCTCCCT 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 T 1 0 189870 CASAVA_Build 12 60585246 1D AAAAAAGCTA T/- TTTATGACTA 3070 het 3070 hom 66 31 31 4 T 4 3 189871 CASAVA_Build 12 60602159 3I TGTGTAGAAG ---/AGA AGGAGAGCAA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 AGA 0 1 189872 CASAVA_Build 12 60620943 1D ATTTATTTAA G/- GGGAAAATAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 G 4 3 189873 CASAVA_Build 12 60631940 1I TCACTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 A 10 11 189874 CASAVA_Build 12 60633637 2D TAACCTATAC AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 27 hom 35 2 16 17 A 10 8 189875 CASAVA_Build 12 60641271 1D AAGAACACAA G/- GGGGGAAATC 3070 het 3070 hom 35 14 13 9 G 6 5 189876 CASAVA_Build 12 60641590 1D ATATAAATTT A/- ATGTCTATAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 2 1 189877 CASAVA_Build 12 60650578 6I CAAAAGAATT ------/TTTTTC TTCAGAAGTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TTTTTC 0 1 189878 CASAVA_Build 12 60652354 1D GTTGAACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 15 14 189879 CASAVA_Build 12 60657965 1D AAATAAAGAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 96 het 39 0 30 9 A 9 8 189880 CASAVA_Build 12 60670671 6I ACAGGCATGA ------/GCCACC GCGCCCGGCC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 GCCACC 0 1 189881 CASAVA_Build 12 60675920 4I ATTCTGTAAC ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AAAT 2 3 189882 CASAVA_Build 12 60696840 9D AGGGTACCAG TAAGTACCT/--------- GGTACCCTGA 3070 hom 117 het 42 0 39 5 TAAGTACCT 1 0 189883 CASAVA_Build 12 60697278 1D GTTAATGCGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 56 het 42 1 33 8 A 10 9 189884 CASAVA_Build 12 60699868 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAATTTA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 7 6 189885 CASAVA_Build 12 60701523 2D TGCATCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 16 7 T 12 10 189886 CASAVA_Build 12 60707618 1I AGTCTAATGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 7 8 189887 CASAVA_Build 12 60709670 3D6M4I TAAAAAAGCC AAAACATGG----/---TTTTGGCTTT ATTACTTGGA 1740 het 1740 ref 37 23 5 16 N/A 0 0 189888 CASAVA_Build 12 60712724 1I TGCATTAATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 8 9 189889 CASAVA_Build 12 60713943 1I TACTTTTATG -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 A 6 7 189890 CASAVA_Build 12 60732222 24D CTTCTTTTGT GTGTGTGCATGTGTGCATGCGTGC/------------------------ GTGTGTGCAT 3070 hom 100 het 33 0 31 11 GTGTGTGCATGTGTGCATGCGTGC 1 0 189891 CASAVA_Build 12 60738674 2D CACCTCCCCC CT/-- TTTTTTTCTG 3070 hom 30 het 36 1 27 10 CT 1 0 189892 CASAVA_Build 12 60741067 1D AGTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 A 11 10 189893 CASAVA_Build 12 60758872 1D AGAGCCAATA T/- TTATCTGAAC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 3 2 189894 CASAVA_Build 12 60759712 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 840 hom 24 3 10 11 A 15 16 189895 CASAVA_Build 12 60760910 1D AAAGTAGCCT C/- CTAAACCTTT 3070 het 1897 hom 21 5 13 3 C 2 1 189896 CASAVA_Build 12 60761447 1I AAGAATAAAT -/A ATTTTTCCAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 1 2 189897 CASAVA_Build 12 60768359 1D ACTTCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 A 11 10 189898 CASAVA_Build 12 60781138 3I CTAGGTTAGT ---/AGG AGATTACCCA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 AGG 0 1 189899 CASAVA_Build 12 60781448 1D ACTTAGCTGG A/- AATATACACT 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 A 3 2 189900 CASAVA_Build 12 60783796 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 974 hom 32 5 20 7 A 14 15 189901 CASAVA_Build 12 60784325 1D CTTCTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 28 3 11 14 A 13 12 189902 CASAVA_Build 12 60786932 1I AGGATCACCG -/C TACCTTTTTT 3070 hom 70 het 35 0 22 13 C 0 1 189903 CASAVA_Build 12 60787974 1D TAAAGAATTT A/- ATTGTTTCAT 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 A 2 1 189904 CASAVA_Build 12 60798740 1D TATTATGTTT C/- TTTGTGTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 C 1 0 189905 CASAVA_Build 12 60799415 3D GAAGAGAAAC AAG/--- AAGATGATTT 3070 het 3070 hom 34 13 18 5 AAG 2 1 189906 CASAVA_Build 12 60803736 2D CCCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CA 8 7 189907 CASAVA_Build 12 60804350 1I TGAGGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 A 10 11 189908 CASAVA_Build 12 60805722 1D CCCGCAGATA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 T 8 7 189909 CASAVA_Build 12 60812348 3D CAGTTAGCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 29 0 23 7 A 13 10 189910 CASAVA_Build 12 60815624 3D AAAATTAAAC ATT/--- AGAAAAAAAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 ATT 1 0 189911 CASAVA_Build 12 60823918 2D TGGCAAAACC CT/-- CTCTCTACAA 3070 het 3070 hom 27 13 10 4 CT 4 3 189912 CASAVA_Build 12 60833717 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1827 het 1827 ref 36 25 4 7 A 11 12 189913 CASAVA_Build 12 60834729 1I CCGGTATCAT -/G GAAAAAGACC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 1 2 189914 CASAVA_Build 12 60852997 2D GACTCTCAAC TA/-- TCTAACCATA 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 TA 1 0 189915 CASAVA_Build 12 60855928 3D ATATATATAT ATA/--- TTAAATTACA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 ATA 1 0 189916 CASAVA_Build 12 60868332 1D CTTATTTTTA C/- TTGAATCTTC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 C 1 0 189917 CASAVA_Build 12 60869240 1D ATTTTCACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 11 10 189918 CASAVA_Build 12 60878649 3D ACTTGTCTCC TCT/--- TATTTTATTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 6 TCT 1 0 189919 CASAVA_Build 12 60879093 1D GTGGATTGGC A/- ATTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 A 2 1 189920 CASAVA_Build 12 60879497 2D TATAAATGAG AA/-- CATGCGGTGT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 2 0 189921 CASAVA_Build 12 60880492 1D AGGTGTAAGG A/- AAGGGTCCAG 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 A 3 2 189922 CASAVA_Build 12 60886925 1I TACATCCTGG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 T 8 9 189923 CASAVA_Build 12 60888527 2D ACTTCTAGTT AA/-- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 10 17 9 A 10 8 189924 CASAVA_Build 12 60888672 1D TCCAAATTTA T/- CAGGAAATTA 3070 hom 108 het 44 0 37 8 T 1 0 189925 CASAVA_Build 12 60891628 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2218 het 32 hom 16 1 7 8 A 15 14 189926 CASAVA_Build 12 60893690 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 36 1 23 12 A 14 15 189927 CASAVA_Build 12 60902243 2I GGTATAATAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 47 18 15 14 AC 8 9 189928 CASAVA_Build 12 60910211 1I20M2I TATCTTTTTT -AAAAACTAACTTTTAATTGA--/AAAAAACTAACTTTTAATTGATC TTTTTTTTGG 3070 het 2297 hom 24 7 11 11 N/A 0 0 189929 CASAVA_Build 12 60916310 1D GTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 144 het 144 ref 27 13 2 12 T 10 9 189930 CASAVA_Build 12 60917806 1D CATTAGATGG T/- GCATTAAGCC 3070 het 3070 ref 46 28 16 2 T 1 0 189931 CASAVA_Build 12 60920471 1D TGTCTCAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 9 10 A 12 11 189932 CASAVA_Build 12 60922489 4D TAGAGATTTA TTTG/---- TTTATTAATT 3070 het 3070 ref 40 23 17 0 TTTG 1 0 189933 CASAVA_Build 12 60945998 17D ATTTTATATT TAGTAGCAGAATTCTAC/----------------- CATTTGCCTC 3070 het 3070 ref 29 21 12 1 TAGTAGCAGAATTCTAC 1 0 189934 CASAVA_Build 12 60957755 1I ATGATAAGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 A 10 11 189935 CASAVA_Build 12 60976771 3D CAAAACTGAG AAC/--- AACAACATTG 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 AAC 3 2 189936 CASAVA_Build 12 60977608 1D TGGGTTTCTG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 A 8 7 189937 CASAVA_Build 12 60980214 1D CCAATTTGCC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 8 7 189938 CASAVA_Build 12 60990843 1I GATTTTTGAG -/A AATCTCCACA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 3 189939 CASAVA_Build 12 61001680 5D TTAAGCATAC TGTAT/----- TATACATGAA 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 TGTAT 1 0 189940 CASAVA_Build 12 61004051 1D CTCCTGGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 11 10 189941 CASAVA_Build 12 61006601 3D CAAAAGGACA CTT/--- CTTTATAATC 3070 het 3070 ref 44 25 16 5 CTT 2 1 189942 CASAVA_Build 12 61007265 1D TTACGTGAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 9 8 189943 CASAVA_Build 12 61007995 7D CCAAATAATA ATTTACT/------- GTAATACAGA 3070 het 3070 hom 32 13 16 5 ATTTACT 1 0 189944 CASAVA_Build 12 61012862 30D TGATTAAGGG AATTCCAAATTGATGACTGAAACACTATAA/------------------------------ ACTTAATTTC 3070 het 3070 ref 26 16 14 1 AATTCCAAATTGATGACTGAAACACTATAA 1 0 189945 CASAVA_Build 12 61018345 2I TTGTCTGTTC --/AT ATATCCTTTG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 AT 2 3 189946 CASAVA_Build 12 61021251 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 2460 het 2460 ref 23 10 7 6 T 11 10 189947 CASAVA_Build 12 61027069 5D GTTATCATAC TTGTA/----- TTGTATTATA 3070 het 3070 ref 43 25 16 3 TTGTA 2 1 189948 CASAVA_Build 12 61032880 2D TCAATTTCAC AA/-- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 9 7 189949 CASAVA_Build 12 61047783 4D GTCTGTCTAT TTTG/---- TTTATCTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 3 TTTG 1 0 189950 CASAVA_Build 12 61056225 4I2M1D CAGTTTTGTG ----TGC/ACTATG- TAATAACTTA 3070 het 3070 hom 18 8 10 1 N/A 0 0 189951 CASAVA_Build 12 61064693 1D TTAATTGTAA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 9 8 189952 CASAVA_Build 12 61066145 1I CATTTGGTGA -/C CAATAATATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 2 189953 CASAVA_Build 12 61069155 4D CTGGGCAACA GAGT/---- GAGTGAGAGC 3070 het 3070 hom 38 17 16 6 GAGT 2 1 189954 CASAVA_Build 12 61081906 2I AGTATGGGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2355 hom 30 9 16 5 TG 7 8 189955 CASAVA_Build 12 61081967 2D GTATATATAC AT/-- ATATATATAT 1948 het 1948 ref 14 5 4 5 AT 8 7 189956 CASAVA_Build 12 61088375 1I CTTCCAACTC -/T TCCCTATGTA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 T 1 2 189957 CASAVA_Build 12 61090902 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1016 hom 24 8 10 6 G 0 1 189958 CASAVA_Build 12 61103678 1D TCGAGACCAT C/- CTGGCTAACA 1841 het 933 hom 9 2 4 3 C 2 1 189959 CASAVA_Build 12 61107178 4I CAAAAAAGGT ----/GAAA GAAAGAATCA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 GAAA 1 2 189960 CASAVA_Build 12 61113080 1I TATGTAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 10 11 189961 CASAVA_Build 12 61117277 1I AGAGAATTTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 7 8 189962 CASAVA_Build 12 61118316 3I AAAGTGTTGT ---/TGC TCCTACAGTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 TGC 0 1 189963 CASAVA_Build 12 61153364 9D TAAAGCTGGA AAATGGTGG/--------- AAATGGTGGA 3070 het 3070 hom 39 14 15 13 AAATGGTGG 2 1 189964 CASAVA_Build 12 61156060 5D CTCCGTCTCA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 21 10 11 0 AAAAG 3 2 189965 CASAVA_Build 12 61156485 1D TGAATTTCAC T/- TTTTTTTTTT 1900 het 1786 hom 28 11 6 11 T 15 14 189966 CASAVA_Build 12 61157636 1I TAATTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 2332 het 1658 hom 35 15 13 7 C 0 1 189967 CASAVA_Build 12 61165627 2D GTTTTATAAC AT/-- TATGCACAGA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AT 1 0 189968 CASAVA_Build 12 61170258 1I AGAGTTACAC -/T TATTGAGGGA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 1 2 189969 CASAVA_Build 12 61173086 4D ATACACACAT ACAC/---- ACACACAAAC 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 AC 5 3 189970 CASAVA_Build 12 61184293 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 807 het 807 ref 24 14 2 8 T 17 16 189971 CASAVA_Build 12 61186773 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2569 het 2569 ref 21 11 7 3 A 13 14 189972 CASAVA_Build 12 61187205 1D TTATTAAATC T/- TCTGCATGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 2 1 189973 CASAVA_Build 12 61195866 1D CCGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1059 het 1059 ref 30 19 3 10 A 12 11 189974 CASAVA_Build 12 61200481 4I ACAGGCGTAC ----/TTTG TTTATTTTTG 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 TTTG 0 1 189975 CASAVA_Build 12 61205623 3D GTTAACATGG TCA/--- TTGGAGTTTG 3070 het 3070 ref 43 22 20 4 TCA 1 0 189976 CASAVA_Build 12 61215015 1D TGTGTCAGTT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 8 7 189977 CASAVA_Build 12 61216272 1I GTGATTGTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 9 10 189978 CASAVA_Build 12 61218876 1D GTAATTACAA T/- TTATGATTGG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 3 2 189979 CASAVA_Build 12 61239822 1D ACCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 A 13 12 189980 CASAVA_Build 12 61240161 1I GGGTTTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 9 189981 CASAVA_Build 12 61244089 1I TATTTCTGAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 7 8 189982 CASAVA_Build 12 61267427 1I TAATTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 2669 het 2669 ref 22 9 6 7 A 13 14 189983 CASAVA_Build 12 61282056 2D TCCTTACTTT TG/-- TCATAAGCAG 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 TG 1 0 189984 CASAVA_Build 12 61289678 3D TGATCTAAGG AAA/--- AAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 16 3 A 8 5 189985 CASAVA_Build 12 61290332 2D GACTAATATA GT/-- GCAAGTTCAC 3070 het 3070 ref 37 22 11 5 GT 1 0 189986 CASAVA_Build 12 61290912 2I TTTTAAATGG --/TC AACTCTAATA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 TC 0 1 189987 CASAVA_Build 12 61293528 4D ACAATTATTA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 GT 8 6 189988 CASAVA_Build 12 61294748 4I AACAGGGGTC ----/AACA AACTTCTCTG 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 AACA 0 1 189989 CASAVA_Build 12 61296908 1D TTCTTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 12 11 189990 CASAVA_Build 12 61301869 1I TGAAACTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2753 hom 37 8 19 10 A 12 13 189991 CASAVA_Build 12 61306117 1D ACTATAGCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 12 19 7 A 10 9 189992 CASAVA_Build 12 61306917 9D TCATCTAGAC AATCCCCCA/--------- AATCCCCCAA 3070 het 3070 ref 56 27 18 11 AATCCCCCA 2 1 189993 CASAVA_Build 12 61310423 1D TGGCCCAAAC A/- ACCCCCAAAT 2809 het 2809 ref 36 19 9 9 A 2 1 189994 CASAVA_Build 12 61314434 4I CAGATGATAG ----/TAAA TAGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 TAAA 0 1 189995 CASAVA_Build 12 61329248 1D AGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3067 hom 27 10 16 1 T 11 10 189996 CASAVA_Build 12 61341765 1D GTTAAAACAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 9 8 189997 CASAVA_Build 12 61344040 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2424 het 1740 hom 20 9 9 2 A 17 16 189998 CASAVA_Build 12 61344134 2I GGCCTCACTC --/TG AGAAATATCT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TG 0 1 189999 CASAVA_Build 12 61355523 8D TTCACAAAAA TGCCCATT/-------- TGCAAAGATA 3070 het 3070 ref 42 24 16 6 TGCCCATT 1 0 190000 CASAVA_Build 12 61364512 2D TGTGAGTTTC TT/-- TTTTTTTAAC 2656 het 2656 ref 28 17 9 2 T 9 7 190001 CASAVA_Build 12 61368056 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1806 het 1806 ref 29 14 6 9 A 17 16 190002 CASAVA_Build 12 61416243 1D TGCAGCTCAG A/- GGCCCTTGGT 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 1 0 190003 CASAVA_Build 12 61425878 4D GAGGGATTAA ATGC/---- ATGCATGACT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 ATGC 2 1 190004 CASAVA_Build 12 61427189 1D GTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 67 hom 14 2 10 2 T 12 11 190005 CASAVA_Build 12 61430115 3D ATCATTTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 37 0 24 14 A 16 13 190006 CASAVA_Build 12 61476479 1D GTTCCCAAGA C/- CCCCCTCTCC 3070 hom 85 het 36 0 27 10 C 6 5 190007 CASAVA_Build 12 61480373 2D AATCTCCAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 26 1 23 2 T 12 10 190008 CASAVA_Build 12 61482731 16D ATGCCTCAGT CTTCTCATGCCTCAGC/---------------- CTCTGGAGTA 3070 hom 57 het 21 0 20 3 CTTCTCATGCCTCAGC 1 0 190009 CASAVA_Build 12 61483043 1I AGTAGACCCA -/T TTTTCCCCTT 3070 hom 110 het 44 0 34 10 T 4 5 190010 CASAVA_Build 12 61487659 3I ATGCCATGGT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 hom 136 het 53 0 45 8 TTG 2 3 190011 CASAVA_Build 12 61488440 1I CACCAGAGGG -/A AAGGTTGCCT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 2 3 190012 CASAVA_Build 12 61492377 1I GACATAATAC -/A CTTCAAAATT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 0 1 190013 CASAVA_Build 12 61493399 11I AGGGGGAATT -----------/GAAAAACAATC GGTCGGCGTG 3070 hom 125 het 48 0 38 10 GAAAAACAATC 0 1 190014 CASAVA_Build 12 61495235 4I ACCATACCTC ----/TTTT TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 9 13 190015 CASAVA_Build 12 61497515 4D TCTCAAAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 48 het 20 0 17 4 AAAC 4 3 190016 CASAVA_Build 12 61498869 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1998 het 1998 ref 30 15 6 9 T 17 16 190017 CASAVA_Build 12 61499807 5D TTGTATTTTA TTTCT/----- TTTAAGTCAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TTTCT 1 0 190018 CASAVA_Build 12 61505930 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 10 9 190019 CASAVA_Build 12 61511853 4I CACACACACA ----/TGTG TATATATGTG 3070 hom 66 het 24 0 22 4 TG 0 2 190020 CASAVA_Build 12 61513280 2I AGAAAAGGTG --/TT TGTTTTTTCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 1 3 190021 CASAVA_Build 12 61534767 2D CTTTTATTTA AC/-- AGACATTGAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AC 1 0 190022 CASAVA_Build 12 61537270 4D CAAATATTTT AACA/---- AACAAACAAA 3070 hom 99 het 43 0 34 10 AACA 3 2 190023 CASAVA_Build 12 61538510 4I GTTGTTGTTG ----/TTCA TTGTTTTTTT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 TTCA 0 1 190024 CASAVA_Build 12 61547791 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 13 0 10 3 T 12 11 190025 CASAVA_Build 12 61551333 1I GAAGCTAGAC -/A AAAAAAAACG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 8 9 190026 CASAVA_Build 12 61600536 1I AATGAGGTTT -/G TTTTTTTTTT 581 het 581 ref 28 9 8 11 G 0 1 190027 CASAVA_Build 12 61603131 1D TCTGAGGTGG C/- CCCTTCCATG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 4 3 190028 CASAVA_Build 12 61603997 6I TTCATAAAAC ------/TAAAAG TATTTGATTT 3070 hom 89 het 35 0 29 6 TAAAAG 0 1 190029 CASAVA_Build 12 61622479 1I AAATGTATGT -/A CAACAACAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 190030 CASAVA_Build 12 61625765 49D GTCCTCAGCA TACAAGTTAGGTGTTTCTGTATGTTGAAAAGTGCTCAATTTGACATATC/------------------------------------------------- TACAAGTTAG 3070 hom 36 het 21 0 13 13 TACAAGTTAGGTGTTTCTGTATGTTGAAAAGTGCTCAATTTGACATATC 1 0 190031 CASAVA_Build 12 61636279 4D GTAGGCTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 TTTG 5 4 190032 CASAVA_Build 12 61646987 1D AGAATTCATC T/- CTCAGAATTG 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 1 0 190033 CASAVA_Build 12 61649732 1I AAAGAGACCA -/G GGAAAGTAGG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 2 3 190034 CASAVA_Build 12 61666024 1D TTTGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 35 1 25 10 T 11 10 190035 CASAVA_Build 12 61666302 6D TATATTAGAG AAAAAT/------ AAAATTCCAT 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 AAAAAT 1 0 190036 CASAVA_Build 12 61672883 1D AGGCATAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1228 hom 35 4 21 10 T 13 12 190037 CASAVA_Build 12 61677687 1D TAAAAAAAAA C/- AAAACTAATT 3070 het 3070 ref 29 13 15 1 C 1 0 190038 CASAVA_Build 12 61678898 1I GGGGAGACTA -/G GGATGGAAGC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 G 2 3 190039 CASAVA_Build 12 61681134 1I TTGGAGAGAT -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 6 7 190040 CASAVA_Build 12 61696299 1I AGAACTTATA -/T AATTATCAGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 0 1 190041 CASAVA_Build 12 61725459 1D AATGGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 37 1 25 11 T 12 11 190042 CASAVA_Build 12 61764995 1D TAAACTGTGA G/- GCATTGGAGA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 G 2 1 190043 CASAVA_Build 12 61765693 1I ACCAAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 13 14 190044 CASAVA_Build 12 61766191 3I GTTTAGAGAG ---/ATA ATCCAAGCCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATA 0 1 190045 CASAVA_Build 12 61771180 1I AAACTGGCCA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 7 8 190046 CASAVA_Build 12 61775392 1D TTCACATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 32 0 24 8 T 12 11 190047 CASAVA_Build 12 61791740 4D GAACAACCAT GTTA/---- GTTATTTATT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 GTTA 2 1 190048 CASAVA_Build 12 61793998 1D AAATTGAGGC A/- AAAAATATTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 6 5 190049 CASAVA_Build 12 61797102 2D ATTTGCAAAC TA/-- TGAATCTGAC 3070 hom 72 het 26 0 23 4 TA 1 0 190050 CASAVA_Build 12 61797245 1D AATAAACATG A/- AAAAAATGCT 3070 hom 89 het 37 0 30 7 A 7 6 190051 CASAVA_Build 12 61872154 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 11 10 190052 CASAVA_Build 12 61884308 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2257 het 1080 hom 16 6 7 3 T 13 12 190053 CASAVA_Build 12 61887273 1I TACAAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 18 10 T 10 11 190054 CASAVA_Build 12 61891749 4I GTGAGAACTT ----/ACTC ACTATCACCA 2158 het 2158 ref 21 12 5 4 ACTC 0 1 190055 CASAVA_Build 12 61893148 4D TTTTTTGTGA TTGT/---- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 TTGT 1 0 190056 CASAVA_Build 12 61893518 7I ACATGTGTGT -------/TGCTGGG GCTTGGTATA 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 TGCTGGG 0 1 190057 CASAVA_Build 12 61894870 1D TACTTAGCAT G/- GAGGTGGTCG 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 G 2 1 190058 CASAVA_Build 12 61896437 9D AACACAGATA TTTGGAATT/--------- CTAAGACACA 3070 het 3070 hom 40 21 22 1 TTTGGAATT 1 0 190059 CASAVA_Build 12 61897364 3I TGCAGTATAA ---/ATT ATTTAGCTTG 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 ATT 1 2 190060 CASAVA_Build 12 61898783 9D CTTAGGAGCC ATTTCTTGG/--------- ATACATGTTT 3070 het 3070 ref 27 20 7 5 ATTTCTTGG 1 0 190061 CASAVA_Build 12 61898856 4D GTTCACACAT ACCA/---- ACCAGCCTTT 3070 het 3070 ref 45 26 17 6 ACCA 2 1 190062 CASAVA_Build 12 61899823 2D TAGTGTTTTG AT/-- ATATATATTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 AT 5 4 190063 CASAVA_Build 12 61905795 1I CTTTTATCTA -/T ATACCTGTCC 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 0 1 190064 CASAVA_Build 12 61907660 1I AGGTTTTAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 8 9 190065 CASAVA_Build 12 61909023 1D AAAACTGGAA C/- TTTCATATAC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 C 1 0 190066 CASAVA_Build 12 61911533 1I CGTACCCCTG -/A ACCTAAAATA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 1 2 190067 CASAVA_Build 12 61915676 1I GTTTATCTTG -/T TTTTTCCCTT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 5 6 190068 CASAVA_Build 12 61919435 8D ATTCTTGTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 6 TTTG 6 4 190069 CASAVA_Build 12 61936348 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 10 9 190070 CASAVA_Build 12 61940504 1I AGATGATAAA -/G GGCCACAAAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 2 3 190071 CASAVA_Build 12 61942186 1D ACATTATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 28 9 T 13 12 190072 CASAVA_Build 12 61945926 4I TCTTAGTAGG ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 TTGT 2 3 190073 CASAVA_Build 12 61963307 2I ACTTAGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2937 hom 22 9 8 5 A 11 13 190074 CASAVA_Build 12 61972492 3I TACCAGTTGG ---/TTC TTACTAAAAC 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 TTC 0 1 190075 CASAVA_Build 12 61973506 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1457 hom 23 4 16 3 T 11 10 190076 CASAVA_Build 12 61974098 3D AGTGGCAGGT TTG/--- GATGGAATGT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 TTG 1 0 190077 CASAVA_Build 12 61985437 1D GACCCAGACA T/- TTTTCTTATT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 T 5 4 190078 CASAVA_Build 12 62007185 1I TTTGTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 13 10 T 10 11 190079 CASAVA_Build 12 62021469 2D CAATATCATG AA/-- AATGGCCATA 2344 het 978 hom 7 2 5 0 A 4 2 190080 CASAVA_Build 12 62025929 1D GATGGCTTCA G/- GAAGCTTGCA 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 G 2 1 190081 CASAVA_Build 12 62031620 1I AATTTAGTGT -/G GACTCATAAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 G 1 2 190082 CASAVA_Build 12 62038938 1D GATAGTTGAG A/- TGGCAGTTAT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 1 0 190083 CASAVA_Build 12 62044288 1I GATAGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 T 11 12 190084 CASAVA_Build 12 62050027 4D GTCTCATTGA TCTG/---- TCTAATATTG 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 TCTG 1 0 190085 CASAVA_Build 12 62054715 1I ATTTTCTAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 T 6 7 190086 CASAVA_Build 12 62058231 1D GCAGGAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 25 1 17 7 T 12 11 190087 CASAVA_Build 12 62060187 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAATCAA 3070 het 2422 hom 17 6 9 3 A 6 7 190088 CASAVA_Build 12 62060646 1D AACTCGTTTT A/- TGAGGCCAGC 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 1 0 190089 CASAVA_Build 12 62068890 1D TGTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2145 het 2145 ref 36 23 5 9 A 13 12 190090 CASAVA_Build 12 62073527 1D TAAACACATC T/- AAAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 1 0 190091 CASAVA_Build 12 62075411 1I TTCTTGTCTC -/T TTTTTTTTTT 2432 het 2432 ref 44 14 13 17 T 13 14 190092 CASAVA_Build 12 62077337 2D TCCCACTTAT AA/-- GTGAGAACAT 2595 het 2595 ref 16 8 7 1 A 2 0 190093 CASAVA_Build 12 62085563 1D ATGTCTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 279 hom 27 1 19 9 T 12 11 190094 CASAVA_Build 12 62088854 1D CACATCCAAA T/- CAAAATTAGG 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 T 1 0 190095 CASAVA_Build 12 62089533 4D GAAACAAAAC TTGT/---- TTAACAAAAT 3070 het 3070 ref 43 26 13 5 TTGT 1 0 190096 CASAVA_Build 12 62090334 1D TGAAGAGTTA G/- GGGAAAAAAC 3070 hom 116 het 44 0 38 6 G 4 3 190097 CASAVA_Build 12 62090966 3D CTTTGGGGGG TCT/--- TGAGTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 TCT 1 0 190098 CASAVA_Build 12 62097317 1D CTATTGCTCA C/- CACTGCAGAT 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 C 2 1 190099 CASAVA_Build 12 62097952 1D AGACAAACAA G/- AACTTCGAAA 3070 het 3070 ref 39 23 11 6 G 1 0 190100 CASAVA_Build 12 62102068 2I CTTTTCACTC --/TT TGGGATATTC 3070 hom 135 het 51 0 44 7 T 1 3 190101 CASAVA_Build 12 62112755 11I CTTCAACACG -----------/AAAAGATTGCA AAAACTTATC 3070 hom 114 het 40 0 39 2 AAAAGATTGCA 0 1 190102 CASAVA_Build 12 62133481 1I GACTCCAACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1442 hom 21 5 12 4 A 9 10 190103 CASAVA_Build 12 62134175 2D CCACCAAAAA AT/-- AGTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 AT 1 0 190104 CASAVA_Build 12 62144022 2D CCATTTCCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 20 1 11 9 T 12 10 190105 CASAVA_Build 12 62150052 8D AGAGAGAGAG AGAGAGAA/-------- AAAAAAAAAG 3070 het 1517 hom 28 7 13 9 AGAGAGAA 1 0 190106 CASAVA_Build 12 62158541 1I22M1I GTTTTGAGGG -AAAAAAATCACGGGGTTTTGAC-/AAAAAAAATCACGGGGTTTTGACT TTTTTTCTCT 3070 hom 75 het 21 0 26 1 N/A 0 0 190107 CASAVA_Build 12 62166628 1D TTAAAAGTGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 8 7 190108 CASAVA_Build 12 62167207 1I GTGTTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 40 0 30 10 A 10 11 190109 CASAVA_Build 12 62179526 1I AAATATATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 590 hom 39 2 25 12 T 12 13 190110 CASAVA_Build 12 62186522 1D AGTCAAAGTT A/- AGTTGTTATT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 2 1 190111 CASAVA_Build 12 62193815 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 10 9 190112 CASAVA_Build 12 62195768 1D TAATAAATTT G/- TTGCAATAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 1 0 190113 CASAVA_Build 12 62200598 1D TTAAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 13 12 190114 CASAVA_Build 12 62202546 1I AGAGGAATAA -/T TTTTTCCCGA 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 T 5 6 190115 CASAVA_Build 12 62204558 1D TGCACATGTA C/- CCCGTGAATC 1947 het 639 hom 10 2 4 4 C 4 3 190116 CASAVA_Build 12 62209014 2D ACACACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 44 20 13 12 AT 7 6 190117 CASAVA_Build 12 62209781 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2325 hom 28 8 7 13 T 15 14 190118 CASAVA_Build 12 62217925 28I ATGTAGCTAT ----------------------------/TTTAACTTAGTTAACTAATGTAACTAAG TTTAACTTAG 1291 het 1291 ref 21 16 3 3 TTTAACTTAGTTAACTAATGTAACTAAG 0 1 190119 CASAVA_Build 12 62218303 1D TCCCTGGAGT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 9 8 190120 CASAVA_Build 12 62221166 1D ATAATAACCC A/- AAATCCTCTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 9 A 4 3 190121 CASAVA_Build 12 62221995 1I10M2I AAGTCAGAAA -ATTGCATCTC--/CATTGCATCTCTA AAAGATTGCT 2888 het 2888 ref 21 18 6 2 N/A 0 0 190122 CASAVA_Build 12 62224001 12I ATGACCTTTA ------------/CTTTCCAAACTG CTTTCCAAAC 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 CTTTCCAAACTG 0 1 190123 CASAVA_Build 12 62228895 1D CTAGGATGAA G/- GAAGAAAGAT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 G 2 1 190124 CASAVA_Build 12 62229507 4D AATACTAAAA TCTT/---- TCTGTTATCT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 TCTT 1 0 190125 CASAVA_Build 12 62229644 1I CTGTATTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 14 8 T 8 9 190126 CASAVA_Build 12 62237764 1D AAACTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 19 12 7 A 12 11 190127 CASAVA_Build 12 62240865 1I TTAGAAATTT -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 6 7 190128 CASAVA_Build 12 62243140 5I CAACCACTGC -----/GCCCG GCCTATTTTG 1868 het 1868 ref 21 14 4 3 GCCCG 0 1 190129 CASAVA_Build 12 62244904 1I GATTTGTCTA -/T TTTTTCCTAA 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 T 5 6 190130 CASAVA_Build 12 62249154 3D AGGTACCAGG ATA/--- ATATTTTAAT 3070 het 3070 hom 21 7 10 4 ATA 2 1 190131 CASAVA_Build 12 62274629 2D GATGTTTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TG 7 6 190132 CASAVA_Build 12 62282316 4I GAATACTATC ----/AAAA AAAAAAAATA 1833 het 1833 ref 34 25 4 5 A 8 12 190133 CASAVA_Build 12 62290359 2D TGAGTATAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 TA 7 6 190134 CASAVA_Build 12 62299193 1I CAGAAGTCAT -/A AAAAAAAAAA 2964 het 2964 ref 23 11 9 3 A 10 11 190135 CASAVA_Build 12 62305984 2D ATATATATGT TA/-- TATATATATA 2945 het 818 hom 17 3 7 7 TA 6 5 190136 CASAVA_Build 12 62306137 5D TGTGGATAAG TAACT/----- TAACTTTCTC 3070 het 3070 ref 19 9 8 3 TAACT 2 1 190137 CASAVA_Build 12 62321322 1D GAATCCTTTT C/- CCTCAAAATA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 C 3 2 190138 CASAVA_Build 12 62339525 1I TCACAGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 573 hom 26 2 21 3 T 11 12 190139 CASAVA_Build 12 62341615 1I TTTTTTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 462 hom 19 1 14 4 A 12 13 190140 CASAVA_Build 12 62343360 1D ATTGAAAAAC A/- GAAAATTATT 2935 het 2935 ref 19 10 6 3 A 1 0 190141 CASAVA_Build 12 62343971 1D22M3I AGAAAGCCAT AAAAAAGAAAACAATAAATTGTT---/-AAAAAGAAAACAATAAATTGTTATA ATATTAATTT 3070 het 3070 hom 17 11 10 1 N/A 0 0 190142 CASAVA_Build 12 62360648 1D GAAAGGATTT G/- ATGGTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 27 13 6 G 1 0 190143 CASAVA_Build 12 62360961 1D CATAACTGGA T/- TTTTTTGAAC 1857 het 1857 ref 44 36 4 4 T 7 6 190144 CASAVA_Build 12 62371853 1I GTACTCTATC -/T TTTTTTTCAA 2686 het 2686 ref 41 29 6 6 T 7 8 190145 CASAVA_Build 12 62371931 1D CAATCTCTAC A/- AAAAAAGACT 3070 het 3070 ref 35 22 7 6 A 7 6 190146 CASAVA_Build 12 62379907 1I ACCTGCACTC -/T TATCAGTACT 946 het 946 ref 61 51 3 7 T 1 2 190147 CASAVA_Build 12 62381625 1D CTATAATTTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 9 8 190148 CASAVA_Build 12 62387065 3I CCTCTGGACT ---/AGA AGGATTAGTT 3070 het 3070 ref 52 42 8 2 AGA 0 1 190149 CASAVA_Build 12 62387245 1D GCCAGGTATA G/- GGTGTGTGAA 1480 het 1480 ref 34 26 4 4 G 3 2 190150 CASAVA_Build 12 62392050 1D ATACTATGAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 9 8 190151 CASAVA_Build 12 62402906 2I TCATAACCAC --/AT GTCTTATTTA 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 AT 0 1 190152 CASAVA_Build 12 62427482 2D AAATATTTTT TG/-- TTCTCTTAAA 3070 het 3070 ref 92 58 25 14 TG 1 0 190153 CASAVA_Build 12 62427602 1D ATTTAGGGGG A/- AAAAACTTCA 3070 het 3070 hom 100 35 59 7 A 6 5 190154 CASAVA_Build 12 62438480 4I GCCAGCAACA ----/GAGC TTCAATTCCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GAGC 0 1 190155 CASAVA_Build 12 62442770 1I TTCCTCAAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 94 het 36 0 32 4 T 9 10 190156 CASAVA_Build 12 62463508 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 12 13 190157 CASAVA_Build 12 62496664 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1155 hom 28 6 15 7 T 12 11 190158 CASAVA_Build 12 62498227 3I TAGCTCCTGG ---/ACA ACATTTCTAG 3070 hom 95 het 38 0 30 8 ACA 1 2 190159 CASAVA_Build 12 62502417 1D GTATGATACA T/- TTTTCTGCTT 2833 het 2833 ref 68 52 8 8 T 5 4 190160 CASAVA_Build 12 62502531 1I GAGCTATGGA -/G AAAAATGAAT 2684 het 2684 ref 46 35 6 5 G 0 1 190161 CASAVA_Build 12 62530478 1D AATTGGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 683 hom 27 3 17 7 T 15 14 190162 CASAVA_Build 12 62540692 3D TCTTTTCTGT TAA/--- TAACAAATGT 3070 het 3070 ref 44 22 21 5 TAA 2 1 190163 CASAVA_Build 12 62587790 4I AAGTTCAACT ----/TAAC TATTTTTTAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TAAC 0 1 190164 CASAVA_Build 12 62596691 11D AGGGGCTGGA GGGAAATGACG/----------- GGGAACATTT 3070 hom 105 het 38 0 36 6 GGGAAATGACG 1 0 190165 CASAVA_Build 12 62597667 1I AAGAGCTTGC -/T TTTCTGTTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 3 4 190166 CASAVA_Build 12 62599045 4D GAAGAGGTAT GTTA/---- GTTATTTCGT 3070 het 3070 ref 40 22 13 7 GTTA 2 1 190167 CASAVA_Build 12 62617143 4I GAAAAGCAGC ----/AGAG AGAGAGTGAA 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 AG 3 5 190168 CASAVA_Build 12 62619074 1I GTGATGGCTT -/G TGCCTGTAGT 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 G 0 1 190169 CASAVA_Build 12 62621724 1D TGCCAGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 12 11 13 A 15 14 190170 CASAVA_Build 12 62638117 8D TGGCTCCAAA GAGATACT/-------- GAGATACTGG 3070 het 3070 ref 50 29 18 11 GAGATACT 2 1 190171 CASAVA_Build 12 62640104 1I CCACATCCTT -/A AACTCCTGAT 3070 het 3070 ref 50 28 16 6 A 2 3 190172 CASAVA_Build 12 62643835 1I TTTTAGAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 9 10 190173 CASAVA_Build 12 62657688 4I GGCAAGTATT ----/AGTC AGCAGATTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AGTC 0 1 190174 CASAVA_Build 12 62658729 1D GCAAGTTTTT G/- TATGGAAATA 3070 hom 148 het 52 0 50 3 G 1 0 190175 CASAVA_Build 12 62669591 3D CTGTCTGGAC AGT/--- AGTAGTCAGT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 AGT 3 2 190176 CASAVA_Build 12 62688412 6D CATAAGAATG TTTTTC/------ TTTTTCTATT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 TTTTTC 2 1 190177 CASAVA_Build 12 62689798 1I AGTTTTGTCT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 101 het 39 0 34 5 A 7 8 190178 CASAVA_Build 12 62691239 1I TGGATGAGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 8 9 190179 CASAVA_Build 12 62694696 1D ATCTTGTCCT A/- AAGATATTTG 3070 hom 99 het 39 0 33 9 A 3 2 190180 CASAVA_Build 12 62694806 3D ATAAGGGAAT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 81 het 42 0 27 15 TTG 7 6 190181 CASAVA_Build 12 62695018 2I5M3D TGTGTGCCAC --CACACCTG/AACACAC--- GCTAATTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 N/A 0 0 190182 CASAVA_Build 12 62702204 2D AACAGAATGG GT/-- GTGTGTGTGT 1884 het 1884 ref 38 26 4 8 GT 8 7 190183 CASAVA_Build 12 62705200 1D ACGTTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 15 14 190184 CASAVA_Build 12 62706913 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2627 het 2627 ref 25 12 9 4 A 13 14 190185 CASAVA_Build 12 62715093 6D TGGGAACAAG AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 279 het 279 ref 31 12 4 16 A 16 10 190186 CASAVA_Build 12 62715185 2D ACTGAGAAAC AG/-- AGACATCCAT 3070 hom 87 het 35 0 30 7 AG 2 1 190187 CASAVA_Build 12 62715384 1D CAACTGCCCC T/- CTCCCACCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 0 190188 CASAVA_Build 12 62719996 4I TTCCAATTAC ----/GTAA ACACGGCTCA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 GTAA 0 1 190189 CASAVA_Build 12 62730504 2D TCTATGTCCC TA/-- TATATACACA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TA 4 3 190190 CASAVA_Build 12 62736106 2D CTCCACACAC AT/-- AACAACATTC 3070 het 3070 hom 60 27 28 5 AT 1 0 190191 CASAVA_Build 12 62738863 1D TCTAGTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 12 11 190192 CASAVA_Build 12 62742081 4I TCATTTCTCT ----/TAGA TATATATCTA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 TAGA 0 1 190193 CASAVA_Build 12 62746082 1D ACCACAAATG T/- TTCTTGCATT 3070 hom 135 het 51 0 45 7 T 3 2 190194 CASAVA_Build 12 62747082 1D TTTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 339 hom 17 1 15 2 A 10 9 190195 CASAVA_Build 12 62749057 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2433 het 53 hom 11 1 8 2 A 13 14 190196 CASAVA_Build 12 62771861 2I AATTGTAAGA --/CC CTATGATCTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 3 190197 CASAVA_Build 12 62794075 1D CTGAAAGTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 10 9 190198 CASAVA_Build 12 62801882 2I GTTCACCTGA --/TT TTTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 6 8 190199 CASAVA_Build 12 62823757 11D GGGTGGTTTA CACAGGAGGAT/----------- GGCTTTGGGC 3070 het 3070 ref 39 23 10 7 CACAGGAGGAT 1 0 190200 CASAVA_Build 12 62830764 45I GCAGGAGGAT ---------------------------------------------/CAATTGAGGCCAGGAGTTCAACCAGCCTGGACAATGAACTGAACA CAAAAAATGC 2208 het 2208 ref 23 10 5 8 CAATTGAGGCCAGGAGTTCAACCAGCCTGGACAATGAACTGAACA 0 1 190201 CASAVA_Build 12 62851821 1D AAAAGAGAAC A/- ACTATTGATG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 2 1 190202 CASAVA_Build 12 62854642 4I TATATATGTA ----/TGTG TGTGTGTGTG 1491 het 1491 ref 15 6 6 3 TG 7 9 190203 CASAVA_Build 12 62874984 1D CTACAATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 34 2 15 17 T 13 12 190204 CASAVA_Build 12 62892185 1D TGTACAGTCA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 9 8 190205 CASAVA_Build 12 62897002 1D AAAAAAACTC A/- AGAGATGGAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 1 190206 CASAVA_Build 12 62903440 3I GTTTTTTCCT ---/TTC TTCTTCTTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTC 2 3 190207 CASAVA_Build 12 62905012 1D TATAATAATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 9 8 190208 CASAVA_Build 12 62905251 2D CAAAAGAAAC TG/-- TTTAATTTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TG 1 0 190209 CASAVA_Build 12 62912484 2D AGTGAGGGAA AT/-- ATTGCCTCAC 3070 hom 126 het 46 0 41 6 AT 2 1 190210 CASAVA_Build 12 62918715 1I TTCCACCCCA -/C CCCCCCCATC 3070 hom 78 het 31 0 22 9 C 7 8 190211 CASAVA_Build 12 62918979 1D CTACATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 34 0 27 7 A 13 12 190212 CASAVA_Build 12 62920586 1I ATTGCCCTGC -/A TTTCAGTTAT 3070 hom 112 het 45 0 38 7 A 0 1 190213 CASAVA_Build 12 62927258 2D TATTCCATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 23 0 20 5 TA 8 7 190214 CASAVA_Build 12 62930241 1I TTGTGGAGAT -/G GGGGGTCTCA 3070 hom 61 het 23 0 20 3 G 5 6 190215 CASAVA_Build 12 62939176 1I AATTTTTGTA -/T TTTTGGTAGA 3070 hom 59 het 25 0 18 7 T 4 5 190216 CASAVA_Build 12 62948488 4I TAAGCTCAGT ----/GAAA GAAGTCAGAC 3070 hom 162 het 58 0 54 4 GAAA 0 1 190217 CASAVA_Build 12 62949642 1D TTATTTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 42 1 36 5 T 12 11 190218 CASAVA_Build 12 62952628 4D AAATAAAAAT AAAA/---- AAATAAATAA 3070 hom 42 het 17 0 15 4 A 7 3 190219 CASAVA_Build 12 62952732 1D CACCACACAG A/- AAACAAAGGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 4 3 190220 CASAVA_Build 12 62953345 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 23 0 23 1 A 22 9 190221 CASAVA_Build 12 62954230 1I AAAGGGAGGG -/A AAAGCATTTC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 3 4 190222 CASAVA_Build 12 62955286 1D TAATATATAA T/- AGTCATGTAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 1 0 190223 CASAVA_Build 12 62956049 1I GAAATACACA -/C CCCCCCCCCG 2025 hom 32 het 19 0 11 8 C 9 10 190224 CASAVA_Build 12 62962590 1I GGGGGTAAGA -/G GGGGGCAGAT 3070 hom 68 het 26 0 21 5 G 5 6 190225 CASAVA_Build 12 62977444 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 8 9 190226 CASAVA_Build 12 62990771 1I TCTTTCTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 7 14 1 T 9 10 190227 CASAVA_Build 12 62998108 1I ACCCCAGGTG -/T ATTTTTGTTT 3070 hom 96 het 40 0 31 9 T 0 1 190228 CASAVA_Build 12 62998814 3I CACTTATGGA ---/GTT GTTGTGATCT 3070 het 3070 hom 56 23 25 8 GTT 1 2 190229 CASAVA_Build 12 63002490 1I TTCTATTTCT -/G TGCTGAGACT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 G 0 1 190230 CASAVA_Build 12 63006787 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 499 hom 26 3 14 9 A 13 12 190231 CASAVA_Build 12 63007238 1I AAGAAATACA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 T 7 8 190232 CASAVA_Build 12 63011083 1I TCCTTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 10 11 190233 CASAVA_Build 12 63011240 1D CAAAAAGAAC T/- TTGACTTTGA 3070 het 3070 hom 52 18 28 7 T 3 2 190234 CASAVA_Build 12 63012666 1D GTTATTTCAA G/- GGGGGGCTCT 2988 het 2988 ref 22 11 9 2 G 7 6 190235 CASAVA_Build 12 63027028 1D TCTAGTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 23 1 15 7 T 11 10 190236 CASAVA_Build 12 63030991 1D AACTTATACA T/- TTGTCATGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 3 2 190237 CASAVA_Build 12 63031918 3I ACTCCTTTGG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 11 14 190238 CASAVA_Build 12 63055826 1I TTTAAAAAAT -/C ATTGTTCTAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 C 0 1 190239 CASAVA_Build 12 63056117 1I GAGATGCACC -/A AAAACTGCAA 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 4 5 190240 CASAVA_Build 12 63059975 15D CTAAAAATAC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAG 1842 het 40 hom 10 2 8 1 A 24 9 190241 CASAVA_Build 12 63063354 1D ACAAAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 27 2 19 6 A 13 12 190242 CASAVA_Build 12 63079703 5D AAAAACACAA AAAAC/----- AAAAAAAACT 3070 hom 51 het 19 0 18 4 AAAAC 1 0 190243 CASAVA_Build 12 63088712 1I CATTTGTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 9 10 190244 CASAVA_Build 12 63090890 1D CTATAATTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 5 T 8 7 190245 CASAVA_Build 12 63097577 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2177 het 2177 ref 31 12 6 13 A 17 16 190246 CASAVA_Build 12 63125020 1D ACCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 23 0 15 8 A 16 15 190247 CASAVA_Build 12 63144368 1I CAATCAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 11 190248 CASAVA_Build 12 63145175 2I GCACTTGTAG --/TC ACAGCTACTC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TC 0 1 190249 CASAVA_Build 12 63145548 1I TCATAATAGC -/A AAAAAAAAAA 1218 het 1218 ref 39 24 4 11 A 13 14 190250 CASAVA_Build 12 63152707 1D GACTATGGTA T/- TAGTGCAGAG 3070 hom 123 het 45 0 42 4 T 2 1 190251 CASAVA_Build 12 63170951 2D CCTGGGTGAC AA/-- GAGTGAAACT 3070 hom 27 het 14 0 9 5 A 2 0 190252 CASAVA_Build 12 63182098 2D TTTTAAGCTG TA/-- TATTTCTTTA 3070 hom 54 het 21 0 18 4 TA 2 1 190253 CASAVA_Build 12 63197356 2D ATTAATTCCT CC/-- CCCCCCCCAC 3070 het 1870 hom 25 7 15 3 C 10 8 190254 CASAVA_Build 12 63197669 1D ACACACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 15 14 190255 CASAVA_Build 12 63200597 4D ATACACACAT ACAC/---- ACATATATAT 273 het 181 hom 13 2 4 7 AC 3 1 190256 CASAVA_Build 12 63205972 2D CAAAGGCTGC AA/-- AGAGTCTCAA 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 A 3 1 190257 CASAVA_Build 12 63206589 1D AAATGAGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 10 9 190258 CASAVA_Build 12 63215364 1I CTCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 2486 het 2486 ref 35 18 7 10 A 11 12 190259 CASAVA_Build 12 63224665 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 8 A 12 11 190260 CASAVA_Build 12 63228387 1D GCCCAGCTAG T/- TTTTTTTATT 2243 het 2243 ref 25 13 6 6 T 8 7 190261 CASAVA_Build 12 63234024 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2108 het 882 hom 14 6 7 1 A 17 16 190262 CASAVA_Build 12 63261041 2I AACCTGTAAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 6 7 190263 CASAVA_Build 12 63267194 1D TCCGCCTCCT A/- GGGTTCAAGC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 1 0 190264 CASAVA_Build 12 63270113 3D CTCTTATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 35 1 24 10 A 17 14 190265 CASAVA_Build 12 63271523 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 24 1 18 5 A 11 12 190266 CASAVA_Build 12 63285414 1D TATGGGTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 10 9 190267 CASAVA_Build 12 63316168 1D TAACTTACGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 28 0 20 8 T 12 11 190268 CASAVA_Build 12 63343574 1D GTTATTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 29 1 22 7 T 13 12 190269 CASAVA_Build 12 63346413 1I TTTCTTTTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 435 hom 39 1 32 6 T 9 10 190270 CASAVA_Build 12 63350418 1D GATTTTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 26 1 18 7 T 13 12 190271 CASAVA_Build 12 63350592 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2775 het 113 hom 28 2 13 15 T 17 16 190272 CASAVA_Build 12 63355963 1D CCTGCCATTT A/- AAAAAAAAAA 1474 het 1474 ref 47 30 4 13 A 13 12 190273 CASAVA_Build 12 63378804 1D AAAAAAAACC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 39 het 19 0 13 6 T 9 8 190274 CASAVA_Build 12 63380927 1I GGATAAAGGT -/G GGGGGGGCAG 3070 hom 58 het 27 0 19 8 G 7 8 190275 CASAVA_Build 12 63392638 1D ATAACAGACC T/- ACTTAATTAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 0 190276 CASAVA_Build 12 63406976 1D ATAACACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 34 0 28 7 A 12 11 190277 CASAVA_Build 12 63407415 1I2M10D CGTAGGAGAC -TGAGGCTGCAGT/GTG---------- GAGCTGTGAT 3070 hom 105 het 36 0 34 3 N/A 0 0 190278 CASAVA_Build 12 63418873 1I ACCAGCCCCC -/A CAAAAAAATC 3070 hom 83 het 35 0 25 10 A 0 1 190279 CASAVA_Build 12 63424590 1D ACAAAGTAAT C/- TCTGTAGTCG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 1 0 190280 CASAVA_Build 12 63432150 4D CCAGAGAGGT TAAA/---- TAGTTTGTCC 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TAAA 1 0 190281 CASAVA_Build 12 63440877 1I GGGCTTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 991 hom 35 4 18 13 A 13 14 190282 CASAVA_Build 12 63464918 1D AAAATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 20 1 17 4 A 13 12 190283 CASAVA_Build 12 63465195 1D CTTTAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 32 6 11 15 T 17 16 190284 CASAVA_Build 12 63475857 1I AGTTAGATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 686 hom 34 2 27 5 T 10 11 190285 CASAVA_Build 12 63482065 5D CATTTTTCTT TTCTG/----- GTACTGGCAC 3070 hom 111 het 40 0 38 7 TTCTG 1 0 190286 CASAVA_Build 12 63498108 2D AGACTCTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 28 0 15 15 A 18 16 190287 CASAVA_Build 12 63513915 1I CTTTCATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 37 1 28 8 T 10 11 190288 CASAVA_Build 12 63568544 1D TTTAATTCTC A/- TAACCACCCC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 1 0 190289 CASAVA_Build 12 63568906 1I AAAAGCCTGT -/C CCCCCCAACC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 6 7 190290 CASAVA_Build 12 63578520 1I4M3I CAAATCCCAG -TTGA---/CCTGATCT ATCTTAGATT 3070 hom 123 het 47 0 41 8 N/A 0 0 190291 CASAVA_Build 12 63591064 2D ACATTGCCCC AA/-- AATTTCTAGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 4 2 190292 CASAVA_Build 12 63599610 1I TACAAGGTAG -/C TTTTTGCTGT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 0 1 190293 CASAVA_Build 12 63604857 1I ATGTTAAATA -/T TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 6 7 190294 CASAVA_Build 12 63605053 1I GGAAGAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 65 het 27 0 20 7 T 9 10 190295 CASAVA_Build 12 63606853 1D TCTAGTGCCG A/- AAAGGTTGGG 3070 het 3070 ref 59 33 17 10 A 4 3 190296 CASAVA_Build 12 63610070 1D TGTGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2865 het 2865 ref 32 15 7 10 T 12 11 190297 CASAVA_Build 12 63612444 1D TGGGAGCTTC T/- TTCACCCTGT 3070 het 3070 hom 52 17 28 7 T 3 2 190298 CASAVA_Build 12 63618159 1D ATACTGGACA T/- TTTTTTTTTT 2893 het 1980 hom 30 10 9 11 T 13 12 190299 CASAVA_Build 12 63693872 2I GCTAAAAATT --/AA GTTTCCTTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 0 2 190300 CASAVA_Build 12 63717752 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 26 6 T 12 11 190301 CASAVA_Build 12 63719506 1I AACCCGGGGT -/G GGGGGGGGTT 2805 hom 26 het 14 0 10 4 G 8 9 190302 CASAVA_Build 12 63720919 1I ATCACGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 19 0 10 9 T 12 13 190303 CASAVA_Build 12 63735911 5I ACATGCACAG -----/ATTTC ATTTCATACC 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 ATTTC 1 2 190304 CASAVA_Build 12 63737645 3D TTTTGGTAGT GGA/--- GGAGTTTGGA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 GGA 2 1 190305 CASAVA_Build 12 63738139 1D AAGAAGGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 36 1 30 6 T 11 10 190306 CASAVA_Build 12 63740071 1I CATTTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 31 1 26 4 A 10 11 190307 CASAVA_Build 12 63743300 1D AATCACACTT C/- GTGATTCATC 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 C 1 0 190308 CASAVA_Build 12 63744636 1D GAGGTAGAAA T/- TTTTTTTTTT 932 het 932 ref 26 20 3 3 T 12 11 190309 CASAVA_Build 12 63757423 1I ATCCCATTTG -/C CCCCCAATCA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 5 6 190310 CASAVA_Build 12 63766198 1I CTAAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 884 hom 37 2 30 5 A 10 11 190311 CASAVA_Build 12 63766751 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2073 het 2073 ref 53 15 10 28 T 15 14 190312 CASAVA_Build 12 63769990 1I GACTAATCTA -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 6 7 190313 CASAVA_Build 12 63790727 4I TACCTCACTT ----/ATTC ATTCATTCAA 3070 hom 94 het 38 0 31 7 ATTC 2 3 190314 CASAVA_Build 12 63808826 1D36M1D ACTATGTCTC AAAAAAAAAAAGAAAAAAGATAAATAAATTTGACCTGA/-AAAAAAAAAAGAAAAAAGATAAATAAATTTGACCTG- AAAAAGTTTT 3070 het 86 hom 27 1 22 12 N/A 0 0 190315 CASAVA_Build 12 63817977 5I TTTTCATAAT -----/ATAAC AATAAAATTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ATAAC 0 1 190316 CASAVA_Build 12 63822542 1I CTCTGGAAAC -/T GGAAAGGGCA 3070 hom 120 het 50 0 41 9 T 0 1 190317 CASAVA_Build 12 63831992 1D TACGGTGACA T/- TTTTTGCTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 5 190318 CASAVA_Build 12 63907783 1D ATTTTTGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 23 1 13 9 T 17 16 190319 CASAVA_Build 12 63916598 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 14 13 190320 CASAVA_Build 12 63920148 4D TTATGTCAAG TGAT/---- TGATTCATTT 3070 hom 111 het 39 0 37 5 TGAT 2 1 190321 CASAVA_Build 12 64045123 2I TCTGACATGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 38 0 31 7 T 11 13 190322 CASAVA_Build 12 64047966 2I ATATACATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AC 6 7 190323 CASAVA_Build 12 64055978 1I CTTATTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 10 11 190324 CASAVA_Build 12 64062404 4I GAGTTTTATT ----/CTAA CTTAGATTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CTAA 0 1 190325 CASAVA_Build 12 64067889 1I GGTTGCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 9 10 190326 CASAVA_Build 12 64087386 1D TCCTGGTATG T/- TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 26 18 3 5 T 12 11 190327 CASAVA_Build 12 64089213 2I ATCTATATAC --/AT GTGTGTGTGT 2262 het 2262 ref 18 11 6 1 AT 0 1 190328 CASAVA_Build 12 64093612 1I CATAGATTAA -/T TTTCATCCCT 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 T 3 4 190329 CASAVA_Build 12 64100385 1D CCTTCAGCTA T/- TTTTTTTTTC 2169 het 2169 ref 23 12 8 4 T 10 9 190330 CASAVA_Build 12 64100452 1I AGTTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3060 hom 22 8 10 4 T 10 11 190331 CASAVA_Build 12 64102436 30D GAGTACATAG TATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 1975 hom 10 het 7 0 4 3 TA 21 6 190332 CASAVA_Build 12 64112246 1D TTGAGAGTAG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 41 19 20 4 A 7 6 190333 CASAVA_Build 12 64113062 5I TGGAATCTTA -----/TACAT TACTAGTGGG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TACAT 0 1 190334 CASAVA_Build 12 64117775 4D ATTCCCCAGG TGAA/---- TGAATAATAA 3070 het 3070 ref 50 22 23 6 TGAA 2 1 190335 CASAVA_Build 12 64126779 1D TTTTCCCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 10 9 190336 CASAVA_Build 12 64130165 1D GCTGCAATCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1201 hom 41 7 16 18 A 10 9 190337 CASAVA_Build 12 64134228 1D TAGCTACTCA G/- GGGGGCTGAA 3070 hom 53 het 22 0 17 5 G 6 5 190338 CASAVA_Build 12 64139161 1D TTTTTGTAAT A/- TTTTTTTAAG 3070 hom 135 het 52 0 46 7 A 1 0 190339 CASAVA_Build 12 64143879 1I GCTAAGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1277 hom 41 4 30 7 T 11 12 190340 CASAVA_Build 12 64151627 1I CCCCCTCTCC -/T TTTTAAGACA 3070 het 45 hom 29 1 13 16 T 4 5 190341 CASAVA_Build 12 64154882 1I CTTCCTCACT -/G GAAGACTCTT 3070 het 3070 ref 45 18 18 9 G 1 2 190342 CASAVA_Build 12 64157454 1I GATTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 34 1 21 12 A 13 14 190343 CASAVA_Build 12 64166302 1I AGTTCCGTTA -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 6 190344 CASAVA_Build 12 64167198 15I TATGTATCTC ---------------/TATATTATATATTTG TATATTATAT 2597 hom 15 het 12 0 6 6 TATATTATATATTTG 0 1 190345 CASAVA_Build 12 64176044 16D CAGAGCCACT CCGTGCTCATGTGAAG/---------------- CAGAGTCTCA 3070 hom 132 het 46 0 45 3 CCGTGCTCATGTGAAG 1 0 190346 CASAVA_Build 12 64183875 1D GTTCTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 40 0 35 6 T 11 10 190347 CASAVA_Build 12 64216545 1I TTTTCTAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 A 9 10 190348 CASAVA_Build 12 64258555 16I ACATCTGACC ----------------/TCATGTGATGCATGCA TGAAATTTAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 TCATGTGATGCATGCA 0 1 190349 CASAVA_Build 12 64259301 1I GTAGGAAGAA -/T TAGGAAGGAG 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 1 2 190350 CASAVA_Build 12 64269682 1I AAACCTGATT -/A AAAAAAAAAA 1243 het 1243 ref 32 20 4 8 A 15 16 190351 CASAVA_Build 12 64282816 11I CTGATCCCGA -----------/GACGAGGGAGG GAGCTTCCCG 3070 het 3048 hom 24 9 11 4 GACGAGGGAGG 0 1 190352 CASAVA_Build 12 64303126 1I GGGTGGTGGA -/G GGGGCCCTAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 G 4 5 190353 CASAVA_Build 12 64311332 1D ACTTAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 31 1 25 5 A 13 12 190354 CASAVA_Build 12 64325742 1D AGTTGTGTCT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 9 8 190355 CASAVA_Build 12 64326851 4I ATAAAACATA ----/TCTT TCTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TCTT 1 2 190356 CASAVA_Build 12 64327191 1D CAATTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 11 10 190357 CASAVA_Build 12 64347690 2I ATTAAGGAGA --/CT CTGCCACCCC 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 CT 1 2 190358 CASAVA_Build 12 64358772 1D AAAAGTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 40 0 29 11 A 11 10 190359 CASAVA_Build 12 64359650 1D AGGATTGTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 9 8 190360 CASAVA_Build 12 64417636 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 24 1 21 2 A 11 10 190361 CASAVA_Build 12 64418222 1I ATACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 507 hom 25 2 17 6 A 10 11 190362 CASAVA_Build 12 64426765 1D TAAACAAACA T/- TTTTTTTTTT 1399 het 1399 ref 37 25 4 8 T 12 11 190363 CASAVA_Build 12 64447638 4D AAAGCAAAGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2476 het 1194 hom 23 10 6 10 A 19 15 190364 CASAVA_Build 12 64462318 1I CATCATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 21 18 10 T 10 11 190365 CASAVA_Build 12 64522039 1I TCCCTTCATC -/T TTTTTTTTTT 1286 het 1286 ref 37 20 4 13 T 13 14 190366 CASAVA_Build 12 64543623 1D GATTTCAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 54 22 29 4 A 9 8 190367 CASAVA_Build 12 64553443 1D TTTTCTCAAT A/- TTTTTTTCGT 3070 het 3070 ref 38 25 13 0 A 1 0 190368 CASAVA_Build 12 64668320 1I AGCTTTAGCA -/T TTTTTTTTTT 2178 het 2178 ref 30 10 6 14 T 16 17 190369 CASAVA_Build 12 64671850 3D TGCCAATGAA ATC/--- AGCAATGCAT 3070 hom 123 het 46 0 42 6 ATC 1 0 190370 CASAVA_Build 12 64673409 1I CTTTGTGGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 T 9 10 190371 CASAVA_Build 12 64682924 1I TTTGAAAAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 7 8 190372 CASAVA_Build 12 64690772 5D GCAGTCTTCA AGAGC/----- ATTGAAAGAG 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 AGAGC 1 0 190373 CASAVA_Build 12 64691698 3I CTGAGGGAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 67 het 34 0 22 12 AAC 5 6 190374 CASAVA_Build 12 64702120 1D ATTAATCGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 11 10 190375 CASAVA_Build 12 64717771 2D ATAGGTGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2904 het 91 hom 18 1 10 9 A 16 14 190376 CASAVA_Build 12 64718983 1I CTTAGTGTGA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 7 8 190377 CASAVA_Build 12 64733661 1I GGTAACAAAA -/G GGGGAGTTGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 4 5 190378 CASAVA_Build 12 64741879 1D GAGATGCCTT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 7 6 190379 CASAVA_Build 12 64758259 1I AGAAAGGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 300 hom 33 1 27 5 T 10 11 190380 CASAVA_Build 12 64762657 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 26 1 19 6 A 14 15 190381 CASAVA_Build 12 64765113 4D GACCCTGTCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 99 het 39 0 34 6 CAAA 6 5 190382 CASAVA_Build 12 64785293 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 T 9 8 190383 CASAVA_Build 12 64785399 2D ATTAGCCATG AA/-- AAGACTCTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 A 4 2 190384 CASAVA_Build 12 64792629 2I TAAAAGATGT --/TA TATACTACCT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 TA 2 3 190385 CASAVA_Build 12 64793369 1I AGCTTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 2152 het 2152 ref 22 9 7 6 T 14 15 190386 CASAVA_Build 12 64794417 1D ATGCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2538 hom 32 14 13 5 A 13 12 190387 CASAVA_Build 12 64802840 1I TATTTTTTTT -/A AACCAAGCAT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 2 3 190388 CASAVA_Build 12 64805878 4D CTTCTAATAT GAAA/---- GAAAGAGACA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 GAAA 2 1 190389 CASAVA_Build 12 64807274 1D GAATGTTCAC A/- GCAGCACTAT 3070 het 3070 ref 57 30 19 8 A 1 0 190390 CASAVA_Build 12 64807556 3D GAGGCTGGGG GTA/--- GGAGGAGGAG 3070 het 3070 ref 41 23 15 7 GTA 1 0 190391 CASAVA_Build 12 64810995 8D AGAATGCTGA CGGGTGTC/-------- CGGTCAAGGT 3070 het 3070 ref 43 19 17 9 CGGGTGTC 1 0 190392 CASAVA_Build 12 64811602 4D AACGATATGG GTGA/---- GTAATTAATG 3070 het 3070 ref 54 27 22 7 GTGA 1 0 190393 CASAVA_Build 12 64811970 1I CATTTGATAT -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 A 7 8 190394 CASAVA_Build 12 64822818 2I TCAGAAACAC --/AA GAGACCCATG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 0 2 190395 CASAVA_Build 12 64825648 1I GGAAAGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 T 11 12 190396 CASAVA_Build 12 64826786 1D TAATTTTTCA G/- GGGAGTAATT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 G 4 3 190397 CASAVA_Build 12 64830470 2I TCCCACCCCC --/CT CTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 39 12 14 13 CT 1 2 190398 CASAVA_Build 12 64831218 1I ATTCATAAAC -/G TTTTTAGTTT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 G 0 1 190399 CASAVA_Build 12 64842125 1I CAACATCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 A 10 11 190400 CASAVA_Build 12 64851941 1D TACCAGTTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 A 9 8 190401 CASAVA_Build 12 64870435 1D GGCCCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2602 hom 27 9 9 9 A 12 11 190402 CASAVA_Build 12 64873674 19I GACTTTCCTC -------------------/GTTTTTGATGACTTTGACA GTTTTGAGGA 3070 hom 153 het 55 0 49 7 GTTTTTGATGACTTTGACA 0 1 190403 CASAVA_Build 12 64879824 1I AAGTGTTTAT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 A 6 7 190404 CASAVA_Build 12 64886148 1D ATTTTCAATC T/- TCCATTTTAT 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 T 2 1 190405 CASAVA_Build 12 64887520 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 12 4 A 11 10 190406 CASAVA_Build 12 64888386 6D ACACACACAC ACACAA/------ ACACACACAC 2599 het 2599 ref 20 9 9 3 ACACAA 1 0 190407 CASAVA_Build 12 64890487 1I CTCTTCACAC -/A GGGGGATATT 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 A 0 1 190408 CASAVA_Build 12 64899415 5I AAGTCTCACA -----/AGATC AGATCTGATG 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 AGATC 1 2 190409 CASAVA_Build 12 64922772 1D AATTCCCTTG C/- CACCCTTAGC 3070 het 3070 hom 30 12 14 6 C 2 1 190410 CASAVA_Build 12 64923642 1I CTAGCTGCCA -/T TTTTTTGAGC 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 T 6 7 190411 CASAVA_Build 12 64925719 1D GCTGGGATTA T/- TAGGCACGAG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 2 1 190412 CASAVA_Build 12 64926120 3D CAAGAGAAAC ATG/--- ATGATAGACA 3070 het 3070 ref 52 29 15 9 ATG 2 1 190413 CASAVA_Build 12 64927317 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 91 het 33 0 30 3 A 9 8 190414 CASAVA_Build 12 64929798 2D TCTCACCGCA TC/-- TCTTCACTAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TC 2 1 190415 CASAVA_Build 12 64943009 1I31M4D GATGTCCTCC -TTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTCTCTT/TTTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTC---- TCTTTCTTTC 3070 hom 48 het 19 0 16 5 N/A 0 0 190416 CASAVA_Build 12 64943054 1I9M1D11M4I TCTTTCTTTC -TTTCTTTTCTTTTCTTTCTTC----/TTTTCTTTTC-TTTCTTTCTTCTCTT TCTTTCTTCC 3070 hom 36 het 17 0 13 11 N/A 0 0 190417 CASAVA_Build 12 64948239 6I GGATCTGCGT ------/TTTCTG TTTCTGTTTC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 TTTCTG 2 3 190418 CASAVA_Build 12 64952119 1I CTATTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 19 0 11 8 T 11 12 190419 CASAVA_Build 12 64957908 3I TATAATTTTT ---/ATC ATCATCATTC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 ATC 2 3 190420 CASAVA_Build 12 64960126 1D ATTTTTAAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 113 het 44 0 37 7 T 10 9 190421 CASAVA_Build 12 64964695 2D CCTGACATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 39 0 29 12 A 13 11 190422 CASAVA_Build 12 64966058 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1909 het 86 hom 21 2 7 12 A 19 18 190423 CASAVA_Build 12 64973156 1I TCAACATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 10 11 190424 CASAVA_Build 12 64975216 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 20 1 16 3 A 15 12 190425 CASAVA_Build 12 64978542 1D ATAATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 17 9 T 12 11 190426 CASAVA_Build 12 64978701 2I GACAGGGTTT --/CA CCATGTTAGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 CA 0 1 190427 CASAVA_Build 12 64978996 2I ACAAACAAAC --/AA AGAAAATTGA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 1 3 190428 CASAVA_Build 12 64979954 2D TTTCATGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 129 het 46 0 40 8 T 13 11 190429 CASAVA_Build 12 64980931 1D CCCACCCCCC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 104 het 42 0 33 10 A 9 8 190430 CASAVA_Build 12 64984344 2D TAAGTAAGTG AT/-- AGTTAAGCTG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AT 1 0 190431 CASAVA_Build 12 64985794 1D CGTCTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1182 hom 27 3 17 7 A 15 14 190432 CASAVA_Build 12 64991205 1I AGTCTTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 828 hom 32 4 22 6 A 14 15 190433 CASAVA_Build 12 64993248 10I TAGTTTTAGT ----------/AGAAAAAAAA AGAAAAATTA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 AGAAAAAAAA 0 1 190434 CASAVA_Build 12 64999928 1I TGCTTTTTTG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 334 hom 47 2 42 3 T 0 1 190435 CASAVA_Build 12 65000776 1I TATTCCTTAG -/A GAAGCATATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 0 1 190436 CASAVA_Build 12 65002613 3D ACGCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 89 hom 22 2 20 1 A 17 14 190437 CASAVA_Build 12 65020657 1D ATATATATGT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 27 hom 21 1 14 6 G 10 9 190438 CASAVA_Build 12 65080982 1D AAACAATAGA T/- TTTTTTCAAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 7 6 190439 CASAVA_Build 12 65102626 1I TTCCTTTGGC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 123 het 46 0 40 6 T 6 7 190440 CASAVA_Build 12 65104977 1D AAACCCTGGG A/- AACCCAGAGG 3070 hom 153 het 55 0 48 7 A 3 2 190441 CASAVA_Build 12 65112795 4D GTAGGAACTG AAGT/---- AAGATGAAGG 3070 hom 129 het 48 0 44 6 AAGT 1 0 190442 CASAVA_Build 12 65113340 1I GTTATCAATC -/A AAAAAGACTA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 5 6 190443 CASAVA_Build 12 65117422 2D GGCTCAGCGG GA/-- GAATATCGGT 3070 hom 141 het 53 0 47 7 GA 2 1 190444 CASAVA_Build 12 65118562 1D TGAGACGGAG T/- TTTTTTTTTT 3061 hom 32 het 21 0 10 11 T 12 11 190445 CASAVA_Build 12 65130595 1I TTGAGATGAT -/A AAAAATTATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 5 6 190446 CASAVA_Build 12 65138263 2D TGGATTCCCC CT/-- CTCTCTCCAC 3070 het 3070 ref 52 25 17 10 CT 4 3 190447 CASAVA_Build 12 65138435 1D AATAGGTTAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 9 8 190448 CASAVA_Build 12 65141243 4D AAAACACTTG AATT/---- ATTTATGAAT 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 AATT 1 0 190449 CASAVA_Build 12 65143243 4D CATTTACTTA AAAT/---- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 42 18 20 5 AAAT 1 0 190450 CASAVA_Build 12 65143382 1D GTCTTTCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 10 9 190451 CASAVA_Build 12 65144866 2D GCAAGAGAAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 20 12 12 TG 9 8 190452 CASAVA_Build 12 65146643 4D TAAAATTGAC AATT/---- AACAATACTA 3070 hom 93 het 35 0 32 6 AATT 1 0 190453 CASAVA_Build 12 65150952 1D AGAAAAGCCT A/- AAGTGATGAG 3070 hom 117 het 47 0 39 9 A 3 2 190454 CASAVA_Build 12 65158747 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAAGAT 2151 hom 12 het 5 0 5 0 A 8 7 190455 CASAVA_Build 12 65159153 1I GATAAAACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 9 10 190456 CASAVA_Build 12 65163912 1D TCCTAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 20 0 11 9 T 13 12 190457 CASAVA_Build 12 65166840 1D CAGGTCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 16 15 190458 CASAVA_Build 12 65168758 4I AATTAATAAA ----/ATAG ATAGACCACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ATAG 1 2 190459 CASAVA_Build 12 65186925 1I AAAATAAACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 9 10 190460 CASAVA_Build 12 65210779 1I CATTTCTGCA -/T TAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 53 21 28 4 T 1 2 190461 CASAVA_Build 12 65222231 4I CCAGGTTGAC ----/AATA AATAGTCCAA 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 AATA 1 2 190462 CASAVA_Build 12 65227344 1I AGGATGCAGA -/G AAATTAGATC 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 G 0 1 190463 CASAVA_Build 12 65233638 1D GCACCTTCGT A/- GGAACCAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 1 0 190464 CASAVA_Build 12 65236689 1D ATAAAACATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 10 9 190465 CASAVA_Build 12 65237238 1I TCTATCAGAC -/A AAAATAGATT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 4 5 190466 CASAVA_Build 12 65238847 3I CCAAAAAATA ---/AAG AAGGAGAGAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 AAG 1 2 190467 CASAVA_Build 12 65242937 4I TTCTTATAAT ----/AAAG AAAAGAGAAT 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 AAAG 0 1 190468 CASAVA_Build 12 65244127 2I GTTTCTTCTC --/TT TGTCTTTTTC 2762 het 2762 ref 33 22 6 5 T 1 3 190469 CASAVA_Build 12 65279025 3D CTTTAGAAAT GTA/--- CCCAGTTTGC 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 GTA 1 0 190470 CASAVA_Build 12 65283230 1D TGAACTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 11 10 190471 CASAVA_Build 12 65285114 4I ATATATATAC ----/ATAT ATATATATAT 2084 het 2084 ref 19 10 6 3 AT 6 8 190472 CASAVA_Build 12 65291857 1I ACGGTTTATA -/C CAACAGAGTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 2 190473 CASAVA_Build 12 65301541 1I TGTTTATTCA -/G TCTGTTGATG 3070 het 3070 ref 52 26 17 9 G 0 1 190474 CASAVA_Build 12 65305049 1I TTTCAGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 13 14 190475 CASAVA_Build 12 65306388 1I CCCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 1998 het 1844 hom 20 6 6 8 A 12 13 190476 CASAVA_Build 12 65308451 1I GATTTCCCGT -/A ACTAACATGT 3070 het 3070 hom 48 14 23 11 A 1 2 190477 CASAVA_Build 12 65310104 1D AAGAGAATAT A/- AAAAAATTCA 1117 het 1117 ref 13 8 4 1 A 7 6 190478 CASAVA_Build 12 65317430 5D ATGTCTTCTT TTGTC/----- TTCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 TTGTC 1 0 190479 CASAVA_Build 12 65328250 1D CGCTCCTGGC T/- TGTGGCTCAT 3070 hom 98 het 37 0 32 5 T 2 1 190480 CASAVA_Build 12 65338641 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATC 1726 het 1726 ref 15 7 6 3 A 9 8 190481 CASAVA_Build 12 65340333 5I ATATCATAAT -----/ATAAC ATATCTCCTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 ATAAC 0 1 190482 CASAVA_Build 12 65346926 1D CATTGAAACC T/- TTTTTTTTTT 1134 het 1134 ref 39 27 3 10 T 12 11 190483 CASAVA_Build 12 65348822 1D TATCAAAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 A 9 8 190484 CASAVA_Build 12 65361012 1I AATATGCTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 8 9 190485 CASAVA_Build 12 65376852 16D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 2292 het 169 hom 13 2 7 8 A 28 12 190486 CASAVA_Build 12 65387025 1D CATGTATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 19 8 T 11 10 190487 CASAVA_Build 12 65388831 1I CCCATCACTT -/A ACATTTTAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 1 2 190488 CASAVA_Build 12 65393598 1D ATCTCTTGAA C/- CCCCCATTCT 3070 hom 164 het 62 0 53 9 C 6 5 190489 CASAVA_Build 12 65397431 1I TGCTCACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1646 hom 32 4 23 5 A 13 14 190490 CASAVA_Build 12 65423636 1D GTAAATAGGC T/- TTTTTTTTGT 612 het 612 ref 37 22 4 11 T 9 8 190491 CASAVA_Build 12 65425161 1I AGATTTCTAT -/G GGCTCCCTGG 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 G 2 3 190492 CASAVA_Build 12 65433381 1D TGGAAGGAAT G/- GGGCCACTTT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 G 4 3 190493 CASAVA_Build 12 65445192 3I TCACATTTGG ---/AAA TCTTCCTCAA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 A 0 3 190494 CASAVA_Build 12 65447620 1I TCTCTGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 15 16 10 A 13 14 190495 CASAVA_Build 12 65449273 1D CAAATGGAAA T/- TTTTTTTTTT 1366 het 1366 ref 40 18 5 17 T 17 16 190496 CASAVA_Build 12 65469635 3I ACAAATAGAT ---/AAG AATGGTCCAT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 AAG 0 1 190497 CASAVA_Build 12 65488007 1D CCAACCTAAA G/- CCCTTTGTCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 0 190498 CASAVA_Build 12 65488903 1I GGCATAAATG -/C TTGTGAACAA 3070 hom 114 het 44 0 35 9 C 0 1 190499 CASAVA_Build 12 65490646 2I TTATGTGAGG --/GT TAGATAGGAT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 GT 0 1 190500 CASAVA_Build 12 65494883 9I CAAAAGGCAA ---------/AGGAGAAGC AGGGACCTTC 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 AGGAGAAGC 0 1 190501 CASAVA_Build 12 65503798 7I TACACCACTC -------/ACAGAGT ACAGAATTCA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 ACAGAGT 0 1 190502 CASAVA_Build 12 65505506 1I ATGCCTTCAT -/C CTTATCCTTA 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 C 1 2 190503 CASAVA_Build 12 65510879 1D GGTATCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 12 11 T 17 16 190504 CASAVA_Build 12 65511904 1D AGACTGCAGT A/- AAAACTAATT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 A 5 4 190505 CASAVA_Build 12 65512567 1I TGTTTATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 9 10 190506 CASAVA_Build 12 65516620 1I GTGTGATACA -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 T 6 7 190507 CASAVA_Build 12 65523855 1D TAACTTGAAA T/- GGATATAATA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 1 0 190508 CASAVA_Build 12 65534373 7I CTGATTACAA -------/AGCACAG AGATGAGAAT 3070 hom 78 het 39 0 27 12 AGCACAG 0 1 190509 CASAVA_Build 12 65534531 1D AATGGTGTGG A/- GGGGGGCTTT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 1 0 190510 CASAVA_Build 12 65536018 1D GAGTTTTTCT A/- AATAATAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 A 3 2 190511 CASAVA_Build 12 65538125 1I ATTCACCATG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 53 27 16 10 T 7 8 190512 CASAVA_Build 12 65544607 1I TATTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 1197 het 1197 ref 10 4 5 1 A 10 11 190513 CASAVA_Build 12 65561240 1D AAAAAGAGAG A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 7 6 190514 CASAVA_Build 12 65564373 1I AGAAATTGCC -/T CTCTCCAGCC 3070 hom 125 het 46 0 41 5 T 0 1 190515 CASAVA_Build 12 65579522 1I GTGATCCCCC -/A ACCTCAGCCT 3070 het 3070 hom 46 17 18 11 A 1 2 190516 CASAVA_Build 12 65610153 1D CTTTATACTC T/- TTTTTTTTTA 1163 het 1074 hom 15 3 5 7 T 10 9 190517 CASAVA_Build 12 65653311 1I TAATACAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 A 8 9 190518 CASAVA_Build 12 65661357 1I TTGTGTTCAT -/G TGTTACTTCT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 G 0 1 190519 CASAVA_Build 12 65672431 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 9 8 190520 CASAVA_Build 12 65674245 1D GACAAGTGGG A/- AAAAAAAAAA 1630 het 1630 ref 30 20 4 6 A 12 11 190521 CASAVA_Build 12 65675229 1D CATGCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1057 het 1057 ref 35 25 3 7 A 13 12 190522 CASAVA_Build 12 65678477 1I ATAAAAAAAA -/T ATATATATTT 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 T 0 1 190523 CASAVA_Build 12 65685071 1D CATTAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 12 11 190524 CASAVA_Build 12 65688971 1D TTTCTCCAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 A 9 8 190525 CASAVA_Build 12 65704181 1I CAAATAGTTA -/C AAATTATCAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 C 0 1 190526 CASAVA_Build 12 65704823 1I GTACAATGAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 8 9 190527 CASAVA_Build 12 65705484 2D AACAGGAAAC TT/-- ATTAAAAACT 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 T 2 0 190528 CASAVA_Build 12 65720277 2D CCCCCCCAGC AA/-- AGTGTCATGG 3070 het 3070 ref 31 16 11 6 A 3 1 190529 CASAVA_Build 12 65733885 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 14 2 10 2 A 13 12 190530 CASAVA_Build 12 65740091 1I CTGTGACAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 A 8 9 190531 CASAVA_Build 12 65745254 1D CCATGGTGGT A/- ACATGTCTGC 2482 het 2482 ref 25 16 6 4 A 2 1 190532 CASAVA_Build 12 65754999 1D ATCCCCCCAA T/- TACACACACA 3070 hom 78 het 28 0 27 5 T 2 1 190533 CASAVA_Build 12 65763854 1I TCCCTGGACA -/G GGAGCAGGAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 G 2 3 190534 CASAVA_Build 12 65772620 1D TTGCCAGCGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 11 10 190535 CASAVA_Build 12 65782498 1D GGTAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2495 hom 39 12 18 9 A 11 10 190536 CASAVA_Build 12 65784064 2I TGATAATAGC --/AG AGTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 AG 1 2 190537 CASAVA_Build 12 65786606 8D TTTCTAAGTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 2250 hom 26 5 11 14 TTTG 5 3 190538 CASAVA_Build 12 65788583 1I ATATTGGGAT -/A GCAAATTACT 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 0 1 190539 CASAVA_Build 12 65796287 1I CATTACAAGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 8 9 190540 CASAVA_Build 12 65799499 1D AAACACTGTT C/- CAGATTGAAG 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 C 2 1 190541 CASAVA_Build 12 65803084 16I TCAGGCTGCT ----------------/TTAACAAAATAACATA GAATGTGTGG 3070 het 3070 ref 45 18 16 12 TTAACAAAATAACATA 0 1 190542 CASAVA_Build 12 65804846 1D TTTTTTTTCC A/- AAATGAATTC 3070 het 2778 hom 20 8 9 4 A 4 3 190543 CASAVA_Build 12 65806792 24D CTGCTGGGCT AGGAGTATATCTCACCTGAATTCA/------------------------ AGTTACTGAA 3070 het 3070 ref 34 22 13 5 AGGAGTATATCTCACCTGAATTCA 1 0 190544 CASAVA_Build 12 65807716 2D TGTTTTGTGT AA/-- TGAGATTTCA 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 A 2 0 190545 CASAVA_Build 12 65811745 13D ATATCCCTGA AAGGATTTCCTGT/------------- AAAGCAGCTC 3070 het 3070 hom 38 20 19 3 AAGGATTTCCTGT 1 0 190546 CASAVA_Build 12 65814543 1D TAGAGTATAA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 6 5 190547 CASAVA_Build 12 65816540 2D AATAAAAAAA AT/-- AAAATTTTTT 2828 hom 18 het 7 0 7 1 AT 1 0 190548 CASAVA_Build 12 65817309 3I ACAAGAGACT ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 AAC 3 4 190549 CASAVA_Build 12 65822811 1D GGGTATGGGA T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 T 7 6 190550 CASAVA_Build 12 65835260 1I GGAGACTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 10 11 190551 CASAVA_Build 12 65837932 1D TGAATGTAAG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 8 7 190552 CASAVA_Build 12 65847196 2I GTTCGTTTAA --/AT ATATGTTTGA 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 AT 2 3 190553 CASAVA_Build 12 65860035 4I TATATAAATA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 AAAC 3 4 190554 CASAVA_Build 12 65862126 1D CTCTTTGTTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 9 8 190555 CASAVA_Build 12 65883310 1D TATGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1653 het 167 hom 17 1 8 8 T 17 16 190556 CASAVA_Build 12 65887034 1D CAAAAATGTA T/- TGAATTTTCA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 2 1 190557 CASAVA_Build 12 65893653 2I TTCATGCTGG --/AA AAAAAAACCC 3070 hom 105 het 48 0 36 12 A 7 9 190558 CASAVA_Build 12 65918470 4I ATTATAAAAA ----/AGAC AGACAACTAA 3070 hom 141 het 55 0 47 8 AGAC 1 2 190559 CASAVA_Build 12 65925670 1D AGAAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1995 het 1995 ref 23 7 8 8 T 13 12 190560 CASAVA_Build 12 65933211 3I GGAGGAAACT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 10 13 190561 CASAVA_Build 12 65934743 2D ACATATCAGC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 2438 hom 25 8 12 5 T 11 9 190562 CASAVA_Build 12 65934948 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 169 hom 14 3 10 1 A 7 8 190563 CASAVA_Build 12 65935803 2I TAAACTACAC --/AT GTGTTTTATA 3070 het 3070 ref 53 21 17 15 AT 0 1 190564 CASAVA_Build 12 65936630 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2847 hom 30 11 13 7 A 12 11 190565 CASAVA_Build 12 65938106 1D AGGTTTTGTT A/- AACCAAACTG 3070 het 3070 ref 45 26 12 7 A 3 2 190566 CASAVA_Build 12 65938551 2D CCTGTCTCTT AA/-- AAAAATATAA 15 het 15 ref 22 13 1 9 A 7 5 190567 CASAVA_Build 12 65940582 11D AAAAAAGAGA CATGCTGGCTT/----------- CATGCTGTTT 3070 het 3070 ref 22 15 9 1 CATGCTGGCTT 1 0 190568 CASAVA_Build 12 65941315 1I TCTGTTTCAA -/T TATATATCGA 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 T 1 2 190569 CASAVA_Build 12 65941562 1I CATATCAAAC -/A AAAACAGAAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 4 5 190570 CASAVA_Build 12 65966610 1I TTTTTGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 T 13 14 190571 CASAVA_Build 12 65967785 4D TCCTAATGGG TTTC/---- TTTCTAATTT 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 TTTC 2 1 190572 CASAVA_Build 12 65976195 1D TGAGGAATTT A/- TGTTTAATTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 1 0 190573 CASAVA_Build 12 65980328 1D CCTTGAACTT A/- ACCTGTTATA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 2 1 190574 CASAVA_Build 12 65991278 9I AAGAGAAAAA ---------/GGTTTATGG GGTTTATGGG 3070 het 3070 hom 49 24 20 5 GGTTTATGG 1 2 190575 CASAVA_Build 12 65992215 1D AAAATCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2230 hom 29 8 18 3 T 13 12 190576 CASAVA_Build 12 66003350 1D GGGCAGGTTA C/- CCATCTTTGA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 C 3 2 190577 CASAVA_Build 12 66003495 1I CCATATCTCT -/G TGAGGTAGGT 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 G 0 1 190578 CASAVA_Build 12 66012427 1D ATTTGTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 1908 hom 14 4 8 2 T 9 8 190579 CASAVA_Build 12 66015758 1I AGTGCTAAAT -/G GTAGGCATCC 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 G 1 2 190580 CASAVA_Build 12 66022381 3D GAATTTATCC ATT/--- TCTTCTAGTT 3070 het 3070 hom 44 21 22 2 ATT 1 0 190581 CASAVA_Build 12 66027705 1I AGATTTGGGT -/G GGGACACAGC 3070 hom 8 het 26 1 24 1 G 3 4 190582 CASAVA_Build 12 66035338 1D GTTGTATGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 10 9 190583 CASAVA_Build 12 66037289 1I TAATATGAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 9 10 190584 CASAVA_Build 12 66039484 3I GACATTAATG ---/TGA TGATCACTCT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 TGA 1 2 190585 CASAVA_Build 12 66052025 1I TAGATTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 10 11 190586 CASAVA_Build 12 66057005 3D TTGTAATAAT AAC/--- AACAGTTGAC 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 AAC 2 1 190587 CASAVA_Build 12 66067470 2I TGACTATATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 13 17 13 T 13 15 190588 CASAVA_Build 12 66073977 1D TGTTTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2316 hom 27 6 8 13 A 15 14 190589 CASAVA_Build 12 66074400 1I GGAATGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 10 11 190590 CASAVA_Build 12 66076399 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 12 11 190591 CASAVA_Build 12 66097512 5D GACTCCATCT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 27 9 11 8 AAAAC 5 4 190592 CASAVA_Build 12 66119318 5D TTTATCACAT AATTA/----- AATTAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 5 AATTA 2 1 190593 CASAVA_Build 12 66122082 1I AACGGATATA -/T TTTTTCCCCA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 5 6 190594 CASAVA_Build 12 66122204 3I AAAGGTGGCA ---/TTT TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 T 7 10 190595 CASAVA_Build 12 66122881 5I TTTATCCCTT -----/TTCCA TTCCCATGCA 3070 hom 99 het 44 0 33 11 TTCCA 0 1 190596 CASAVA_Build 12 66123558 3D TCATGTTAAT CTC/--- CTAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 35 16 15 6 CTC 1 0 190597 CASAVA_Build 12 66130883 1D ATTAAACCTC T/- TTTTTTTTTT 2724 het 2724 ref 34 19 10 5 T 17 16 190598 CASAVA_Build 12 66132609 1D AGAGGTTTAA T/- GGACTCACAG 3070 het 1479 hom 16 4 11 1 T 1 0 190599 CASAVA_Build 12 66136946 1I TACAGAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 A 11 12 190600 CASAVA_Build 12 66139218 1I AAATGCTGTT -/A ACTAGATGAA 3070 het 3070 ref 34 23 10 1 A 1 2 190601 CASAVA_Build 12 66144014 1D TTATTCCTGT G/- GAGAGCGTGC 3070 het 3070 hom 47 16 28 3 G 2 1 190602 CASAVA_Build 12 66195069 1D CCTCTCTCTT C/- ACACACACAC 3070 hom 65 het 30 0 21 10 C 1 0 190603 CASAVA_Build 12 66197919 1D TTAAAATAGC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 8 190604 CASAVA_Build 12 66211679 1I GATTTTAGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 49 30 15 4 A 8 9 190605 CASAVA_Build 12 66228547 1D AAAGAAGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2162 hom 22 8 8 6 A 11 10 190606 CASAVA_Build 12 66232732 1D TTTTGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 11 10 190607 CASAVA_Build 12 66247206 5D ACATGAACAA AAAAC/----- AAAACAACAA 3070 het 3070 ref 41 20 20 3 AAAAC 2 1 190608 CASAVA_Build 12 66248465 1D ACAACCCCCC T/- TCCCATGGAT 3070 hom 79 het 35 0 29 6 T 2 1 190609 CASAVA_Build 12 66249192 2D CCAATATAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 32 1 14 18 T 12 10 190610 CASAVA_Build 12 66270533 1I AAAAAAAAAA -/T AAAAAAAAAA 3070 het 856 hom 37 12 20 5 T 0 1 190611 CASAVA_Build 12 66274436 2I ATGAGTAAGG --/GA GACAGTCAAC 3070 het 3070 ref 54 26 18 10 GA 1 2 190612 CASAVA_Build 12 66276735 2I TCTTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 9 11 190613 CASAVA_Build 12 66280286 2D AAAATTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 1231 het 517 hom 20 5 5 10 A 18 16 190614 CASAVA_Build 12 66281214 1I ACAAAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 A 11 12 190615 CASAVA_Build 12 66283829 1D GAGGGCTTAC A/- AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 A 7 6 190616 CASAVA_Build 12 66284743 2D CTAGAAAAGA CT/-- CTGAGACTCC 3070 het 3070 hom 47 21 22 6 CT 2 1 190617 CASAVA_Build 12 66287106 2I CTGTTCATGG --/AC ACACAGCTAG 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 AC 2 3 190618 CASAVA_Build 12 66290854 1I TTTTGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 13 14 12 T 12 13 190619 CASAVA_Build 12 66299522 1D AACTCTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 32 1 25 7 A 12 11 190620 CASAVA_Build 12 66304417 2D TCTCCATCCA CC/-- CCCCCCCCGT 3070 het 7 hom 36 1 28 7 C 10 8 190621 CASAVA_Build 12 66304462 1D AAAATAACCA T/- GGTGGCACGA 3070 het 3070 ref 53 20 9 26 T 1 0 190622 CASAVA_Build 12 66314852 1D ATCCTCCATG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 65 het 33 0 26 7 C 10 9 190623 CASAVA_Build 12 66323145 2D ACCACAGAAC TT/-- TTTCCCTTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 5 3 190624 CASAVA_Build 12 66344067 3D TGTGGCTTTC TTT/--- TTTTTTCTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 6 190625 CASAVA_Build 12 66344616 1D TGCTCCAAAG T/- TGACTACAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 1 190626 CASAVA_Build 12 66348153 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 68 het 33 0 21 12 A 10 9 190627 CASAVA_Build 12 66365700 13D GTTTTGGCTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 24 0 19 5 T 25 12 190628 CASAVA_Build 12 66367905 1I GGTAGTGGGG -/A GGCTGTGGAG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 0 1 190629 CASAVA_Build 12 66371143 1D CAACTTTAGC G/- GGGGGGGATG 3070 hom 61 het 28 0 24 4 G 8 7 190630 CASAVA_Build 12 66381237 1I ATTAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 37 1 29 7 T 10 11 190631 CASAVA_Build 12 66383716 1D TCCTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 13 12 190632 CASAVA_Build 12 66392939 12D CTAAAAATAA ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 51 het 22 0 18 5 AC 15 9 190633 CASAVA_Build 12 66405988 3D CTAGAAGAGA AAG/--- AAGGACTTAA 3070 hom 114 het 43 0 39 6 AAG 2 1 190634 CASAVA_Build 12 66410986 9I TAACATCTCT ---------/TCCCTCCCC TCCCTCATGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TCCCTCCCC 0 1 190635 CASAVA_Build 12 66423031 2D CAGATTACCA AG/-- AGAGTCTAAG 3070 hom 111 het 43 0 37 7 AG 3 2 190636 CASAVA_Build 12 66428764 1I TTCCAGAGGG -/A AAAATCAACA 3070 hom 144 het 56 0 49 7 A 4 5 190637 CASAVA_Build 12 66435678 1D TTAAGATTAC A/- TGTTCTGGAA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 A 1 0 190638 CASAVA_Build 12 66438495 1D AAGAAGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 39 0 30 10 T 12 11 190639 CASAVA_Build 12 66462211 4D ATCCTGGGTT TGTC/---- TGTGAGGGTG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TGTC 1 0 190640 CASAVA_Build 12 66462626 4D TATGTGTAAA TATG/---- TATATATATA 2257 hom 18 het 8 0 7 3 TATG 1 0 190641 CASAVA_Build 12 66478979 1I ATGAAATTTG -/A AAAAAAAAAA 1772 het 1772 ref 28 17 5 6 A 13 14 190642 CASAVA_Build 12 66479349 7D TCCTCCCCTT TCCACAC/------- TGGAAAAAAA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 TCCACAC 1 0 190643 CASAVA_Build 12 66480219 4D TGTAACAGTC ACAT/---- ACAAGCTCAT 3070 hom 135 het 50 0 45 7 ACAT 1 0 190644 CASAVA_Build 12 66489139 1D AGTATTTGTG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 T 7 6 190645 CASAVA_Build 12 66493497 1D TTTGACTGCA C/- TAGATACCTC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 1 0 190646 CASAVA_Build 12 66496358 3I AAGCAAAGCC ---/AGA TTCTTTATGT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 AGA 0 1 190647 CASAVA_Build 12 66496717 1I AGACTTCTGT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 7 8 190648 CASAVA_Build 12 66497226 1I TTCAGTTATA -/T TTTTCAATTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 4 5 190649 CASAVA_Build 12 66500058 4D AGTTGAGGAA ACAG/---- ACAGAGTAGA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 ACAG 2 1 190650 CASAVA_Build 12 66505561 1D GATTTAAAAG C/- CTTGCCCAAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 C 2 1 190651 CASAVA_Build 12 66530287 1I ATTTTACCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 A 9 10 190652 CASAVA_Build 12 66555159 3D TCACGCCATT CTC/--- CTGCCTCAGC 2449 het 963 hom 12 3 8 2 CTC 1 0 190653 CASAVA_Build 12 66565547 2I GTAGTTACAA --/AC ACACCTTGGT 3070 het 3070 hom 59 27 27 5 AC 2 3 190654 CASAVA_Build 12 66569643 1I TTTGTAACAT -/G GGAAGAACAA 1219 het 7 hom 5 0 3 3 G 2 3 190655 CASAVA_Build 12 66569930 1I ACAGAGCCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 A 8 9 190656 CASAVA_Build 12 66574740 1D GGAGAGTAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 50 23 20 7 A 9 8 190657 CASAVA_Build 12 66593090 4D CCCAAAACTG TTAA/---- TTATCAATTA 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 TTAA 1 0 190658 CASAVA_Build 12 66603087 2I TCTTTTGTTC --/TT TTTCTTTAGC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 T 3 5 190659 CASAVA_Build 12 66603875 1D GTGCTGTAGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 10 9 190660 CASAVA_Build 12 66611184 1I CCCCTGGACA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 8 9 190661 CASAVA_Build 12 66615678 1I GAACCTGGGA -/G GTGAAGGTCG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 G 1 2 190662 CASAVA_Build 12 66619764 1D TCACTAAGTT A/- ATGGTCAGAA 3070 het 3070 hom 57 18 31 8 A 2 1 190663 CASAVA_Build 12 66620950 2D TGGTGCTCTC TT/-- AATTCTTTGG 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 T 2 0 190664 CASAVA_Build 12 66622929 1D CATGTAAGGC A/- AAAAAAATGG 3070 hom 129 het 51 0 42 9 A 8 7 190665 CASAVA_Build 12 66647712 4I GCCAAGGGAC ----/AGAG AGAGATTCGT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 AG 2 4 190666 CASAVA_Build 12 66663755 1D TTATTTGCTC A/- ACCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 2 1 190667 CASAVA_Build 12 66669775 3D TGTGAGGGAG GAA/--- GAAGAAGGAG 3070 het 3070 hom 44 16 24 5 GAA 3 2 190668 CASAVA_Build 12 66670942 1D ACATAAATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2025 hom 21 5 12 4 T 9 8 190669 CASAVA_Build 12 66694843 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 14 het 22 1 15 7 AC 10 9 190670 CASAVA_Build 12 66695991 1D AACTAGAGAC G/- GGGGGGGGAA 3070 het 33 hom 32 1 20 11 G 9 8 190671 CASAVA_Build 12 66698835 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 0 1 190672 CASAVA_Build 12 66717761 1I CCCTGTGGTC -/T TAGAGAAATG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 1 2 190673 CASAVA_Build 12 66726564 1D CTTGAATTAA T/- TTTTTTATAA 2985 het 2781 hom 19 8 7 5 T 7 6 190674 CASAVA_Build 12 66730055 2I ATAGAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 A 10 12 190675 CASAVA_Build 12 66731900 2D TAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 335 het 335 ref 31 20 3 8 AG 1 0 190676 CASAVA_Build 12 66733149 1I AGACCACGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 9 10 190677 CASAVA_Build 12 66745682 1D TCTTTCTTCC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 8 7 190678 CASAVA_Build 12 66751015 2I GTTAAATGAC --/TT GAGTTTATTG 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 0 2 190679 CASAVA_Build 12 66755088 1I AATTTATATC -/A CCTTTTCAGC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 0 1 190680 CASAVA_Build 12 66761459 1D AAATTAATGT A/- AAAAAAAAAC 1387 het 1387 ref 31 25 3 3 A 10 9 190681 CASAVA_Build 12 66762689 1I AATACAGAGT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 8 9 190682 CASAVA_Build 12 66763731 1D CTACCATTCT G/- GGGTCTGGAG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 G 4 3 190683 CASAVA_Build 12 66785032 1I GACTATCCAA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 6 7 190684 CASAVA_Build 12 66787987 1I ATCTTTGCAG -/T TACAGGGACA 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 1 2 190685 CASAVA_Build 12 66791449 4D CTGTCTCTAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 14 3 9 3 A 20 16 190686 CASAVA_Build 12 66802622 1D TTAAGTTTCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 9 8 190687 CASAVA_Build 12 66802678 1I GCCTAGGTTT -/A AAAAAAAAAA 2841 het 2841 ref 29 12 8 9 A 15 16 190688 CASAVA_Build 12 66826146 2D TTGTCTAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 29 2 11 18 T 14 12 190689 CASAVA_Build 12 66827960 1I TGAAATTGCC -/A AAAAAAAAAA 1904 het 1904 ref 42 8 11 23 A 15 16 190690 CASAVA_Build 12 66836499 1I ACTATGGCTA -/C CTCACCACAT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 C 1 2 190691 CASAVA_Build 12 66838309 1D CCTGCATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 13 11 A 13 12 190692 CASAVA_Build 12 66841079 1I TTTCAGATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 13 13 11 A 9 10 190693 CASAVA_Build 12 66845796 1I TTTGAATTGG -/A ATTGAATTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 1 2 190694 CASAVA_Build 12 66852055 1I TTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 A 10 11 190695 CASAVA_Build 12 66852114 1I GAGGGCAGAT -/G TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 40 26 7 7 G 0 1 190696 CASAVA_Build 12 66865686 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1649 het 1649 ref 19 8 8 3 A 15 14 190697 CASAVA_Build 12 66870555 1I TCTAGGTAAC -/A AAGGCATTTG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 2 3 190698 CASAVA_Build 12 66875885 4I TTTATCCATC ----/TTTA TTTATGAAGA 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 TTTA 1 2 190699 CASAVA_Build 12 66898285 1D ATAACGAGGG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 A 7 6 190700 CASAVA_Build 12 66902033 2D AAATCCAACC AG/-- AGTCATACCC 3070 het 3070 ref 44 18 19 8 AG 2 1 190701 CASAVA_Build 12 66904087 1D AAAATAAACA C/- CCCCCCCCTC 3070 het 3070 hom 41 18 15 9 C 9 8 190702 CASAVA_Build 12 66909323 4D TGAAACACAC CTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 17 14 CTTT 1 0 190703 CASAVA_Build 12 66925717 1I GCACCCCAGA -/C CTTCACAGTG 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 C 1 2 190704 CASAVA_Build 12 66934583 2D ACACACACAC AT/-- GGATGTCTGA 3070 het 152 hom 28 3 17 8 AT 1 0 190705 CASAVA_Build 12 66945471 1I AACATGGTGA -/G ACCCTGTCTG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 0 1 190706 CASAVA_Build 12 66946613 1I AGGAAACAAG -/A ACAGGTCAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 2 190707 CASAVA_Build 12 66959222 1D GAAAGGAATT G/- TCAAAATATG 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 G 1 0 190708 CASAVA_Build 12 66967823 1D TCAAATTATT A/- AAATAAATCT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 4 3 190709 CASAVA_Build 12 66984299 1I CTATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2539 het 1949 hom 22 6 7 9 A 10 11 190710 CASAVA_Build 12 67000449 2D GAAAGAAAGC AA/-- AAGAGTGGCC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 A 4 2 190711 CASAVA_Build 12 67001220 1I CAGTGGCATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 190712 CASAVA_Build 12 67019726 1D6M1D ATGTGTGCAT GCTTGATG/-CTTGAT- TCCCTCTTAA 3070 hom 84 het 29 0 29 3 N/A 0 0 190713 CASAVA_Build 12 67023759 3D AACTAAAAAC ATT/--- ATAGGAGAAT 3070 het 3070 ref 33 20 9 5 ATT 1 0 190714 CASAVA_Build 12 67035522 1I ACTACACTAC -/T TGGTAACATG 3070 het 3070 hom 53 25 25 3 T 1 2 190715 CASAVA_Build 12 67037150 1I TTCTTCCCCC -/T CTCTTCCCCC 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 T 0 1 190716 CASAVA_Build 12 67049798 1D AACCCAATAA T/- AATTAGATGC 3070 het 3070 hom 50 14 32 4 T 1 0 190717 CASAVA_Build 12 67061542 1I TTAACAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 13 12 A 10 11 190718 CASAVA_Build 12 67073811 1D GCCGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 A 12 11 190719 CASAVA_Build 12 67075187 1I TTTACATGCA -/C CCGTTGTCAT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 C 2 3 190720 CASAVA_Build 12 67098308 3I TCTTTCTGTG ---/GGT GGTGGTGGTG 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 GGT 3 4 190721 CASAVA_Build 12 67105404 1I TTGCGGGGGC -/G GGGGGGGGAA 3070 het 2216 hom 30 8 15 7 G 8 9 190722 CASAVA_Build 12 67144768 2D ACTAAAACAA AT/-- AGAGGAACGC 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 AT 1 0 190723 CASAVA_Build 12 67153764 1I ATCTATCATT -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 7 8 190724 CASAVA_Build 12 67166602 1D CTGGCCAACA T/- GGTGAGACCC 2913 het 1377 hom 18 5 9 6 T 1 0 190725 CASAVA_Build 12 67166783 1I CTCTGCCTCG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 9 10 190726 CASAVA_Build 12 67232176 1I TGTAATTACC -/T TTTTAAGCAA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 4 5 190727 CASAVA_Build 12 67270889 3D GGTAACTAAC TTG/--- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 49 21 23 7 TTG 1 0 190728 CASAVA_Build 12 67279344 1D AAGAATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 12 11 190729 CASAVA_Build 12 67281477 5D GAATGCATAC TGAAT/----- TATTTATAAG 1419 het 1419 ref 23 15 3 9 TGAAT 1 0 190730 CASAVA_Build 12 67290012 3I CCCTCAATCC ---/CCA CTTTTCCCTG 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 CCA 0 1 190731 CASAVA_Build 12 67304072 1D TATCTCAGGG A/- AAAAAAAAAA 1739 het 1739 ref 25 17 6 2 A 15 14 190732 CASAVA_Build 12 67357301 1I TTTTTAAAAG -/A ATAAAACATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 1 2 190733 CASAVA_Build 12 67363023 1I TTCTTTTCCC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 25 1 19 5 A 0 1 190734 CASAVA_Build 12 67368234 1D TATCTGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 11 10 190735 CASAVA_Build 12 67376841 1I TCTTTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 50 4 34 12 T 13 14 190736 CASAVA_Build 12 67387355 1D GTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 2435 het 2214 hom 23 8 8 7 A 10 9 190737 CASAVA_Build 12 67396952 1I ATGTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 1139 het 1139 ref 22 12 3 7 T 11 12 190738 CASAVA_Build 12 67398749 1I GGCTGAGGTA -/G GGGGGGATCC 3070 het 2434 hom 19 6 11 2 G 6 7 190739 CASAVA_Build 12 67404182 1D CAAGACAACG T/- TTTTTTTTTA 1522 het 1522 ref 33 24 4 5 T 10 9 190740 CASAVA_Build 12 67436488 1D TCAACTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 32 4 18 11 T 15 14 190741 CASAVA_Build 12 67454627 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 A 13 14 190742 CASAVA_Build 12 67454869 1I CCTATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3011 het 689 hom 21 2 13 6 A 17 18 190743 CASAVA_Build 12 67459545 5I ACAGTGCTAG -----/GACTA GACTGTCTGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 GACTA 0 1 190744 CASAVA_Build 12 67467175 10D GACTGTGTCA TTTTCTGGTC/---------- TTTAGGTGGA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 TTTTCTGGTC 1 0 190745 CASAVA_Build 12 67471014 5D AGGACTGCTT GAGCC/----- GAGCCCAGTA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 GAGCC 2 1 190746 CASAVA_Build 12 67471462 1I CTTAATTTGG -/A AAGGTGGATC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 2 3 190747 CASAVA_Build 12 67473853 1I TCATTTAAAG -/A CACCCATCTC 3070 hom 135 het 49 0 45 4 A 0 1 190748 CASAVA_Build 12 67549939 1I AAAAAAAAAG -/T TGAGTTGTTC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 1 2 190749 CASAVA_Build 12 67552786 1D ACATTGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 13 12 190750 CASAVA_Build 12 67555410 3D TCAAAAAAAA AAG/--- AAGTTGAGGG 3070 het 3070 hom 24 11 13 1 AAG 2 1 190751 CASAVA_Build 12 67560153 1I CCTTCCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 10 11 190752 CASAVA_Build 12 67561625 1I AAATAGCATA -/G TCTCTTTTGG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 190753 CASAVA_Build 12 67561775 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 13 12 190754 CASAVA_Build 12 67597273 3I GGCTGATCTC ---/TCT TTATCCTTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TCT 0 1 190755 CASAVA_Build 12 67608959 1D GTTAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 24 2 17 5 T 17 16 190756 CASAVA_Build 12 67635552 1D GTGTGGGGGT G/- GGGGGGGCAT 3070 hom 46 het 22 0 16 6 G 8 7 190757 CASAVA_Build 12 67641813 4I AAACAAACAG ----/ACAA ACAAACAACA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 ACAA 2 3 190758 CASAVA_Build 12 67642258 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAACC 3070 het 9 hom 30 2 28 0 C 0 1 190759 CASAVA_Build 12 67650117 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 18 1 13 4 T 15 14 190760 CASAVA_Build 12 67657402 1I TTTAATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 34 0 26 8 T 10 11 190761 CASAVA_Build 12 67664635 5D TGTTTTTCTC CCTTT/----- CCTTTCCTTT 3070 hom 108 het 42 0 33 16 CCTTT 3 2 190762 CASAVA_Build 12 67680618 2D GGTAGCCTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 41 3 18 20 A 15 13 190763 CASAVA_Build 12 67691082 1I GGACCTGATG -/T TTTTAGCTGT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 T 4 5 190764 CASAVA_Build 12 67702858 1D TGTCTCATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2346 hom 35 11 12 15 A 15 14 190765 CASAVA_Build 12 67704345 1I AAATGTAATT -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 7 8 190766 CASAVA_Build 12 67708201 1D GGTGCTGGGG A/- CACTGTCTGC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 1 0 190767 CASAVA_Build 12 67714618 4D AATGCCCACT TAAC/---- TAACTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 14 13 12 TAAC 2 1 190768 CASAVA_Build 12 67720854 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 11 10 190769 CASAVA_Build 12 67729171 1D AGGGCGAAAC T/- TTTTTTTTTT 2854 het 2854 ref 30 12 10 8 T 12 11 190770 CASAVA_Build 12 67748014 1I GTTTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 20 6 A 10 11 190771 CASAVA_Build 12 67765990 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 18 13 23 A 15 14 190772 CASAVA_Build 12 67775820 1I CAAAGGTGGA -/T GCCCTTTAAG 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 0 1 190773 CASAVA_Build 12 67776913 5I AACAATAGAG -----/AGAGA AGAGAAGAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AGAGA 1 2 190774 CASAVA_Build 12 67795553 4I GCGTAGAGCC ----/ATCT AGATAGGAGA 3070 het 3070 ref 37 21 8 9 ATCT 0 1 190775 CASAVA_Build 12 67796052 13I CATGTCACCT -------------/ATGTCACCGGGGC ATGCAGCCCC 2171 het 2171 ref 28 16 9 3 ATGTCACCGGGGC 0 1 190776 CASAVA_Build 12 67807198 2D TTTTCTCTTC CT/-- CTCTCCCTCC 3070 hom 79 het 33 0 27 6 CT 3 2 190777 CASAVA_Build 12 67808746 1D GCGTGGTGGT G/- CGTGCCTGTA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 G 1 0 190778 CASAVA_Build 12 67810221 3D GAGTCAGGTG CTA/--- CTACTTATCT 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 CTA 2 1 190779 CASAVA_Build 12 67817629 2I ATATGAAACA --/GG GTGAGTGACT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 G 1 3 190780 CASAVA_Build 12 67817912 2D AACACAATAT AA/-- AGTTATTATT 3070 hom 59 het 23 0 19 4 A 3 1 190781 CASAVA_Build 12 67831437 2D CCGTTGAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 13 11 190782 CASAVA_Build 12 67836054 1D CCTGAAAATC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 29 18 11 0 A 8 7 190783 CASAVA_Build 12 67837875 1I TCAAGTGATC -/T GCCTGCCCTG 1584 hom 10 het 5 0 4 1 T 0 1 190784 CASAVA_Build 12 67842781 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 10 9 190785 CASAVA_Build 12 67850241 10D CGGCTACTCA GGAGGCTGAG/---------- GCAGGAGGAT 3070 het 3070 hom 37 17 19 3 GGAGGCTGAG 1 0 190786 CASAVA_Build 12 67852366 1I TAACAGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 10 11 190787 CASAVA_Build 12 67859811 5I AAATTTGGTT -----/TTTAA TTTGTGTTCA 3070 het 3070 hom 48 20 27 1 TTTAA 0 1 190788 CASAVA_Build 12 67860972 1I TCATTCACAC -/A AGCACTATCA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 A 1 2 190789 CASAVA_Build 12 67864028 1D AAGAGGAAAG A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 hom 69 28 37 5 A 7 6 190790 CASAVA_Build 12 67891367 1D AGAAGCCATA C/- GTCATTAGAG 3070 het 3070 ref 26 17 8 2 C 1 0 190791 CASAVA_Build 12 67892675 4D ATTGTGGGGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 TTTG 3 2 190792 CASAVA_Build 12 67896683 1I TTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 1612 hom 27 8 11 8 G 0 1 190793 CASAVA_Build 12 67898727 1I CCTTGTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 11 12 190794 CASAVA_Build 12 67899871 1D TTATTAATAA T/- TACTCCTTAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 T 2 1 190795 CASAVA_Build 12 67912513 1D AAGCAGCCAC A/- GGGGCAGAGC 3070 het 3070 ref 42 20 13 10 A 1 0 190796 CASAVA_Build 12 67913091 1I TGTGGCACTT -/C CCCCCTCACT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 5 6 190797 CASAVA_Build 12 67914628 1D AAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1066 het 1066 ref 24 14 4 6 T 13 12 190798 CASAVA_Build 12 67918469 1D TTTGTGCATG A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 A 7 6 190799 CASAVA_Build 12 67924743 1D GAACCTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 13 13 13 T 11 10 190800 CASAVA_Build 12 67927170 1I GTAATTAGGG -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 6 7 190801 CASAVA_Build 12 67929474 2I TCTGGGTCAT --/TC TCTATCCATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TC 1 2 190802 CASAVA_Build 12 67932301 4I AAAACAAAAC ----/AAAA AAACACTTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 3 7 190803 CASAVA_Build 12 67934231 1D CAGAAGTTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 A 10 9 190804 CASAVA_Build 12 67938604 1I TAGTGAAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 989 hom 35 3 27 5 T 9 10 190805 CASAVA_Build 12 67940367 1I GCTGGAGTGG -/T TTTTTTTTTT 1720 het 1720 ref 38 20 6 12 T 11 12 190806 CASAVA_Build 12 67942170 1I CTACTAGTTT -/A AATAGATGAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 2 3 190807 CASAVA_Build 12 67943144 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 11 10 190808 CASAVA_Build 12 67946075 4D GTTAATTTTG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 15 3 A 15 11 190809 CASAVA_Build 12 67958082 1I CTCTTATCTC -/T TATTATGTGT 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 T 1 2 190810 CASAVA_Build 12 67965934 1I AAAGAAAATT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 8 9 190811 CASAVA_Build 12 67966285 5D AAACTGGAAA CATCT/----- CAAATAGCCA 3070 het 3070 hom 34 13 19 4 CATCT 1 0 190812 CASAVA_Build 12 67968777 1D AAAACCATTC T/- TTTTTTTTTT 2284 het 1655 hom 25 5 8 12 T 15 14 190813 CASAVA_Build 12 67981764 1I AAACTGGATA -/C CAGATGAAGA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 C 1 2 190814 CASAVA_Build 12 67987101 4I TAGGATCTAT ----/TTAG TTAGATTTGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTAG 1 2 190815 CASAVA_Build 12 68002634 3D AGATATCAAT CCC/--- CCCCCAACAA 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 C 8 5 190816 CASAVA_Build 12 68003427 6D TTCAATGACA TTAGCC/------ TCTCTCTGCA 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 TTAGCC 1 0 190817 CASAVA_Build 12 68004594 1D AGGTTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 27 2 23 3 A 11 10 190818 CASAVA_Build 12 68005537 1I ATCCATATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 11 12 190819 CASAVA_Build 12 68006117 1D CCACTGCACT C/- CAGCCTGGGT 1816 het 203 hom 8 1 5 2 C 2 1 190820 CASAVA_Build 12 68015712 4D CAATAAGACC CTGT/---- CTGTCTCGAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 6 CTGT 2 1 190821 CASAVA_Build 12 68016611 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 13 14 190822 CASAVA_Build 12 68021140 18I AGAAAACAAA ------------------/AAAGAACATGCTGGGATC ACTAATCCTT 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 AAAGAACATGCTGGGATC 0 1 190823 CASAVA_Build 12 68031782 3D ACAAATCTGT ATC/--- ATCATTTTAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 ATC 2 1 190824 CASAVA_Build 12 68034934 1I CAGTCTGCCC -/T TAGTAACCTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 1 2 190825 CASAVA_Build 12 68041671 4D TTGGTTACAT TCAC/---- TCAGCACTTT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 TCAC 1 0 190826 CASAVA_Build 12 68045819 1D TAATTTACTA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 8 7 190827 CASAVA_Build 12 68052933 1D ATATATAATG T/- TTTATCTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 3 190828 CASAVA_Build 12 68054188 1I TTAGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 11 12 190829 CASAVA_Build 12 68057500 1I GGAGCTGGGG -/A ATCTCGCTGT 2920 het 2891 hom 17 6 6 5 A 1 2 190830 CASAVA_Build 12 68058970 2I GATTGAAGAA --/CT CTTCAGCATT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 CT 1 2 190831 CASAVA_Build 12 68059894 1I CAAGCCCACT -/A AATTCTTTGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 2 3 190832 CASAVA_Build 12 68062124 1D ATGATAAATT A/- TCTTCCCTAC 3070 het 3070 ref 34 17 15 4 A 1 0 190833 CASAVA_Build 12 68064356 3I TGACAAAACT ---/ATC ATCATTTATT 3070 het 3070 hom 31 8 15 8 ATC 1 2 190834 CASAVA_Build 12 68065044 5D TATTTGTCCT ATTAA/----- ATTAGCAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 4 ATTAA 1 0 190835 CASAVA_Build 12 68065339 5I GTACCGATTA -----/AGAGT AGAGTAAACT 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 AGAGT 1 2 190836 CASAVA_Build 12 68068111 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 14 0 11 3 T 12 11 190837 CASAVA_Build 12 68069658 11D CCTCCCAAGT TCAAGTGATTC/----------- TCATGCCTCA 3070 het 3011 hom 17 7 10 1 TCAAGTGATTC 1 0 190838 CASAVA_Build 12 68073633 2D AAAAAAAAAA AG/-- GTAAATATTA 3070 het 3070 hom 36 16 15 7 AG 1 0 190839 CASAVA_Build 12 68075511 2D TTTGAAAAAC AG/-- TGTTTATGAT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 AG 1 0 190840 CASAVA_Build 12 68075614 2I TTTTAGGGAC --/TG TAACTATCTT 3070 hom 66 het 31 0 22 9 TG 0 1 190841 CASAVA_Build 12 68082385 1D GGGCCATTCG T/- TGTGGGCCTA 3070 hom 81 het 32 0 27 6 T 2 1 190842 CASAVA_Build 12 68093558 1I GTCTTCAACG -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 42 het 19 0 11 8 C 8 9 190843 CASAVA_Build 12 68100803 2D ACAATAAAAA AC/-- ACACTGGGGG 3070 het 3070 ref 45 18 18 10 AC 3 2 190844 CASAVA_Build 12 68102755 1I CAAGGCCACA -/C CACAGCCTGT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 C 1 2 190845 CASAVA_Build 12 68121417 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1643 het 1065 hom 20 6 5 9 T 16 15 190846 CASAVA_Build 12 68127257 1I CCAATGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 11 11 T 13 14 190847 CASAVA_Build 12 68133853 1D TACAGCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 13 12 A 12 11 190848 CASAVA_Build 12 68138485 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 8 7 190849 CASAVA_Build 12 68139508 1I AGAGGGAATG -/A AAAAAAAAAG 940 het 940 ref 40 27 3 10 A 9 10 190850 CASAVA_Build 12 68145496 3I GTCAATATGA ---/CTT GGGGTGGGAG 3070 het 3070 ref 37 19 18 0 CTT 0 1 190851 CASAVA_Build 12 68145775 2D AATTAAAAAA AT/-- ATATATATAC 2879 het 2879 ref 24 15 7 3 AT 5 4 190852 CASAVA_Build 12 68154474 1I GAGGGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 A 10 11 190853 CASAVA_Build 12 68169864 1I GTTTTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 T 11 12 190854 CASAVA_Build 12 68178066 1D TTTTTTCAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 10 9 190855 CASAVA_Build 12 68181220 1D TGCCATCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 12 9 A 13 12 190856 CASAVA_Build 12 68194879 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2602 hom 23 9 9 5 A 13 12 190857 CASAVA_Build 12 68198450 1D TAAAGGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 23 1 17 7 T 12 11 190858 CASAVA_Build 12 68205240 1D TGTAATATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 7 T 14 13 190859 CASAVA_Build 12 68208048 1D GTGAAAATAG A/- TTGTTCAGAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 1 0 190860 CASAVA_Build 12 68218282 2D CATTGCAGAT TA/-- TATATATATA 453 het 453 ref 10 3 1 6 TA 7 6 190861 CASAVA_Build 12 68229484 1D ATTTCAATTG A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 A 8 7 190862 CASAVA_Build 12 68231431 2D CCAACTACCA GT/-- AATTATATGT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 GT 1 0 190863 CASAVA_Build 12 68245869 1I TTACAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 16 32 7 T 10 11 190864 CASAVA_Build 12 68246664 1D TGGGGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 18 7 A 11 10 190865 CASAVA_Build 12 68247210 2D TCTATTTACA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 31 12 14 7 TC 7 6 190866 CASAVA_Build 12 68248772 1D CTTAAGTTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 10 9 190867 CASAVA_Build 12 68253560 1D CCAGGCTGAT A/- ATGTAATGGT 2711 het 2711 ref 23 13 7 3 A 2 1 190868 CASAVA_Build 12 68269330 2D CCCACCCCTC TT/-- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 37 16 13 9 T 10 8 190869 CASAVA_Build 12 68271583 3D TAATAAAAAT ATA/--- GGACTTAACC 3070 het 3070 hom 33 16 17 2 ATA 1 0 190870 CASAVA_Build 12 68272540 1D CAAAAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2715 het 2715 ref 22 8 7 8 A 13 12 190871 CASAVA_Build 12 68275117 8I TGAGAATTAA --------/GGAGACCT GGAGACCTGG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 GGAGACCT 1 2 190872 CASAVA_Build 12 68278498 1I TTTGTGGCCG -/T TTGTTAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 2 3 190873 CASAVA_Build 12 68280639 1D TCCAGAAGAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 9 8 190874 CASAVA_Build 12 68282982 1D TTTGTGGGAA G/- GGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 35 14 11 10 G 10 9 190875 CASAVA_Build 12 68283846 2D TACCACATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2661 het 348 hom 14 4 7 3 T 13 11 190876 CASAVA_Build 12 68284687 5I GATAAAATGA -----/TTTCT TTTCCGTGGG 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 TTTCT 0 1 190877 CASAVA_Build 12 68285304 2I AATGATTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1884 hom 35 7 17 11 T 13 15 190878 CASAVA_Build 12 68288082 4D GTCAAAAGAA AGTC/---- AGAAATCTAT 3070 het 3070 ref 42 22 19 3 AGTC 1 0 190879 CASAVA_Build 12 68294029 1D AAAATCAAGA C/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 C 1 0 190880 CASAVA_Build 12 68307226 1D CAGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 13 11 A 10 9 190881 CASAVA_Build 12 68325845 1I CCAATAGTTG -/T TAACCCTCCC 3070 het 3070 ref 57 30 24 3 T 1 2 190882 CASAVA_Build 12 68336417 4I TATGAATCTA ----/TCTG TCTGTCTGTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCTG 3 4 190883 CASAVA_Build 12 68339765 1I TTTCTTTTAT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 0 1 190884 CASAVA_Build 12 68345656 12D AAAACAAAAC ACAAAAAAACAA/------------ ACAAAAAAAA 3070 hom 45 het 13 0 16 3 ACAAAAAAACAA 1 0 190885 CASAVA_Build 12 68351394 1D ATTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 25 1 20 4 T 13 12 190886 CASAVA_Build 12 68353878 1D GCTTACCTAG T/- TTTTACCCTA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 5 4 190887 CASAVA_Build 12 68358280 1I AGCCCTTATA -/T TAAAAAAAAT 3070 hom 137 het 47 0 46 1 T 1 2 190888 CASAVA_Build 12 68360989 4D AACATTAATT AATA/---- GTTAATAGTA 3070 het 712 hom 18 2 13 4 AATA 1 0 190889 CASAVA_Build 12 68361228 1I AATTTTTGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 9 10 190890 CASAVA_Build 12 68367520 9D TATCAAAAAA GAAAAAAAG/--------- GAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 12 17 4 GAAAAAAAG 2 1 190891 CASAVA_Build 12 68373292 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 1207 het 477 hom 19 5 5 9 C 1 0 190892 CASAVA_Build 12 68374353 2D CCCATGCAGA GT/-- CATCGGTGTC 3070 het 3070 ref 44 23 15 7 GT 1 0 190893 CASAVA_Build 12 68374487 1D CAAAGTAACG T/- TTTTGGACTC 3070 het 3070 hom 45 15 27 4 T 5 4 190894 CASAVA_Build 12 68380621 1D AAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 11 10 190895 CASAVA_Build 12 68383412 3I GAGGAGGCAA ---/GAG GAGGAGGAGG 3070 het 3055 hom 29 11 12 6 GAG 5 6 190896 CASAVA_Build 12 68384150 1D ACAGTCCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 10 9 190897 CASAVA_Build 12 68385791 3I CCATCTCTGT ---/TGA TGAACATTCC 3070 hom 143 het 51 0 46 5 TGA 1 2 190898 CASAVA_Build 12 68396431 1D CACTATGTCA T/- GTGTTTTACG 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 T 1 0 190899 CASAVA_Build 12 68398027 4D TGGGAATAGT TAAG/---- TAAACAAGGT 3070 het 3070 hom 40 17 20 5 TAAG 1 0 190900 CASAVA_Build 12 68398156 4D GTACGATCAC AATT/---- AAGTCAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 6 AATT 1 0 190901 CASAVA_Build 12 68409525 1D ATTTATCTGC T/- TTTTTTTTTT 2209 het 2209 ref 29 19 5 5 T 11 10 190902 CASAVA_Build 12 68413870 4D CTGTGTGTGA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 48 22 17 12 GT 9 7 190903 CASAVA_Build 12 68416599 1I GCACAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 1353 het 1000 hom 15 4 6 5 T 17 18 190904 CASAVA_Build 12 68419739 1D ACTTGTGTTC G/- GGGGAGTTGA 3070 het 2921 hom 22 9 12 2 G 5 4 190905 CASAVA_Build 12 68425348 3D TTTCCTGCTT TTA/--- TTATTACAAA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 TTA 3 2 190906 CASAVA_Build 12 68425478 1D TTATGTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 11 10 190907 CASAVA_Build 12 68425999 1I TCTCAGCCTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 8 9 190908 CASAVA_Build 12 68428119 1D ACAGCTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1268 hom 36 7 13 17 T 15 14 190909 CASAVA_Build 12 68437758 1I AGTATATTCA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 7 8 190910 CASAVA_Build 12 68440631 3D TTTTACATTT TTG/--- TTGTGCATGT 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 TTG 2 1 190911 CASAVA_Build 12 68459732 1D AGCTAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 41 1 24 17 T 15 14 190912 CASAVA_Build 12 68461748 4D TTCATGGCTT GTTA/---- GTTCATTTTC 2554 het 2554 ref 38 27 7 4 GTTA 1 0 190913 CASAVA_Build 12 68466841 7D AAATGCAGCT TAGGCAA/------- TAGGCAATAA 3070 hom 81 het 35 0 28 11 TAGGCAA 2 1 190914 CASAVA_Build 12 68467838 3D TACCTCCATT ATG/--- ATGAAGATAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 4 ATG 2 1 190915 CASAVA_Build 12 68486994 1D TTCTTAGTCC A/- GAACAAAATG 2212 het 1882 hom 10 5 5 0 A 1 0 190916 CASAVA_Build 12 68498111 3I GAAGAAACAC ---/AAT AAAGTCAAGT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 AAT 0 1 190917 CASAVA_Build 12 68498705 3D CTTGCAGCAC AAT/--- AACTCAGAAT 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 AAT 1 0 190918 CASAVA_Build 12 68499407 2D TGTGCATAAC AG/-- AGACAGAAAT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 AG 2 1 190919 CASAVA_Build 12 68504032 2D AAGGGTATGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 135 hom 34 2 21 12 AT 10 9 190920 CASAVA_Build 12 68504274 7D TGTTCCCAAC ATAAATG/------- ATAAATGATA 3070 hom 57 het 26 0 20 7 ATAAATG 3 2 190921 CASAVA_Build 12 68523233 5D CTCCTCTATC TTCTT/----- TTCTTCCTCT 3070 het 3070 hom 44 18 25 4 TTCTT 2 1 190922 CASAVA_Build 12 68553891 1D TTTGTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 11 10 190923 CASAVA_Build 12 68559187 1I GTTGCTCTTC -/A CTCCTCGACT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 0 1 190924 CASAVA_Build 12 68601261 1I CTTTAAAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2317 hom 29 7 14 8 T 9 10 190925 CASAVA_Build 12 68605607 2D ACTTGCAAAC AG/-- AGAGAAAGAT 3070 het 3070 hom 50 24 22 4 AG 3 2 190926 CASAVA_Build 12 68605829 1I TATGTGCTTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 A 7 8 190927 CASAVA_Build 12 68606124 3D GACAATTCAA CAT/--- CATTCAGAAG 2257 het 2257 ref 23 12 6 5 CAT 2 1 190928 CASAVA_Build 12 68607462 1I CTTTCTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 10 11 190929 CASAVA_Build 12 68611702 1D CTATCCCAAA T/- TCCCCGGAAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 1 190930 CASAVA_Build 12 68613921 3D TGCTTATTAG GTC/--- GTCTTATTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 5 GTC 2 1 190931 CASAVA_Build 12 68615238 1I TATGGCACAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 56 27 14 15 T 9 10 190932 CASAVA_Build 12 68615301 5I AAATAATGAG -----/GAGTC GAGTCAAGTT 3070 het 3070 hom 47 11 25 11 GAGTC 1 2 190933 CASAVA_Build 12 68630159 1I GCATGCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 11 12 190934 CASAVA_Build 12 68634246 3D AGTCCTAGAA CTT/--- CTTTGACAAG 3070 hom 114 het 43 0 38 6 CTT 2 1 190935 CASAVA_Build 12 68635894 1D CAAAAGACAG A/- AAAAAAAAAA 3031 het 1972 hom 38 11 13 14 A 15 14 190936 CASAVA_Build 12 68636236 1D CAGGACACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2563 hom 28 10 13 5 A 15 14 190937 CASAVA_Build 12 68637096 3I AACATACATA ---/CTC CTCAACTGAG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 CTC 1 2 190938 CASAVA_Build 12 68639625 2D AGAAATTTGA TT/-- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 42 19 20 4 T 10 8 190939 CASAVA_Build 12 68640003 3D GTAAAGCACA GAT/--- GATGATAGGT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 GAT 3 2 190940 CASAVA_Build 12 68642098 1I CAACAACAAC -/A AACAACAACA 3070 het 3070 hom 27 9 10 8 A 2 3 190941 CASAVA_Build 12 68648745 1D GTTAAGACAG C/- TGGAGATTCA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 C 1 0 190942 CASAVA_Build 12 68648934 5D TCACTAGACT TAGAG/----- TAGACAGAGG 3070 het 3070 hom 47 22 24 4 TAGAG 1 0 190943 CASAVA_Build 12 68651542 1I CCCCCACCAG -/C TCCCTCTCAC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 C 0 1 190944 CASAVA_Build 12 68655067 3I CATAGTTCTA ---/AAT AATATGCATA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 AAT 1 2 190945 CASAVA_Build 12 68657484 1I AAGACCCTAG -/A AAGGACCAAG 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 A 2 3 190946 CASAVA_Build 12 68660174 2D TCCATAGTGA AC/-- AGTTATTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 AC 1 0 190947 CASAVA_Build 12 68660463 1I CCTTGCACAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 8 9 190948 CASAVA_Build 12 68661272 14I TATTCCCTCC --------------/CTGCAAAATGATTT CTGCCTGTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 CTGCAAAATGATTT 0 1 190949 CASAVA_Build 12 68667503 1I GTGCTGTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 A 10 11 190950 CASAVA_Build 12 68670079 1I CCCAGTTTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 2650 hom 31 8 14 9 A 8 9 190951 CASAVA_Build 12 68674970 1I TATGAAATTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 8 9 190952 CASAVA_Build 12 68703048 1D CAACGTCACT G/- ATTTTCAGAG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 G 1 0 190953 CASAVA_Build 12 68710493 1I TTTTATAGAT -/A AAAAATGATG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 5 6 190954 CASAVA_Build 12 68713196 1D74M1D AATAGGACAT AAAAAAAAAATCAGAGAACTTGAAGTTAGAAAAATAGAAATCACCCAATCTAAACAATGGAAAGAAAATTGAATGA/-AAAAAAAAATCAGAGAACTTGAAGTTAGAAAAATAGAAATCACCCAATCTAAACAATGGAAAGAAAATTGAATG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 13 18 14 N/A 0 0 190955 CASAVA_Build 12 68719084 1D AAAATGCAGC A/- AAAAAGCAAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 5 190956 CASAVA_Build 12 68719421 1D GAGAACACTT C/- CAAAGCAGAT 3070 hom 75 het 28 0 25 4 C 2 1 190957 CASAVA_Build 12 68720961 2I TCTGGTACTC --/AG CACTAAGTCC 3070 het 3070 hom 45 17 26 2 AG 0 1 190958 CASAVA_Build 12 68721620 2I GGGTTATTCA --/AG AGAGAAGCGG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AG 2 3 190959 CASAVA_Build 12 68721922 1D CGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 2110 het 1730 hom 16 5 5 6 T 13 12 190960 CASAVA_Build 12 68722304 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 2104 hom 15 het 7 0 6 1 A 5 6 190961 CASAVA_Build 12 68728880 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 13 14 190962 CASAVA_Build 12 68730913 3D TCATTAAATG TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 TTA 5 4 190963 CASAVA_Build 12 68747117 2I ATCCCCAATG --/CA ACAATATTGA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 CA 0 1 190964 CASAVA_Build 12 68747399 2D TTTCCCTGTC TG/-- TGGTTCTGTT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 TG 2 1 190965 CASAVA_Build 12 68747756 3I TTTTATTTAG ---/CTT CTTATTTATC 3070 hom 113 het 48 0 37 11 CTT 1 2 190966 CASAVA_Build 12 68750139 4D ACCAAACATC ATAA/---- ATATTTATGT 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 ATAA 1 0 190967 CASAVA_Build 12 68751061 2I GCTGAGGTAT --/AA AAGTGACTTT 3070 het 3070 hom 55 23 25 7 A 2 4 190968 CASAVA_Build 12 68751482 2D ATCTCTCAAG TA/-- TTTGCAAGGG 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 TA 1 0 190969 CASAVA_Build 12 68752703 3D GAAATGTTTC AAT/--- AATATTTGCT 3070 het 3070 ref 38 16 13 12 AAT 2 1 190970 CASAVA_Build 12 68753892 1D ATCATTCTAA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 9 8 190971 CASAVA_Build 12 68762824 1I CCTTCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 11 12 190972 CASAVA_Build 12 68768748 1I CCAGCCTCTC -/T TTGCCTTCAC 3070 het 2008 hom 15 5 8 2 T 2 3 190973 CASAVA_Build 12 68773001 1D GAAGAATATG A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 8 7 190974 CASAVA_Build 12 68778827 11I GATACTGCAG -----------/AGAGTACCCTT AGACCCTTCA 3070 hom 105 het 40 0 35 7 AGAGTACCCTT 0 1 190975 CASAVA_Build 12 68780697 1I AAGTGGGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 9 10 190976 CASAVA_Build 12 68782003 1I TTGATTAACA -/T TTAAACATTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 2 3 190977 CASAVA_Build 12 68788853 1I AGGACTGAGA -/C AGGGATGTGA 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 C 0 1 190978 CASAVA_Build 12 68798347 1D ACAAATTATA G/- GTGTCCAGCA 3070 het 3070 hom 32 8 18 6 G 2 1 190979 CASAVA_Build 12 68801885 2D TTTATTCAAG TT/-- TTCTCACCAA 3070 het 3070 ref 43 17 16 11 T 4 2 190980 CASAVA_Build 12 68812909 2D GTATTCCATC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 49 23 17 10 GT 6 5 190981 CASAVA_Build 12 68818429 1D CCTAGGGCCC T/- TTTTTTTTGT 2316 het 2316 ref 27 17 6 4 T 9 8 190982 CASAVA_Build 12 68820435 1D TACCCAAGGC T/- TGTTCACAGA 3070 het 3070 hom 42 20 17 6 T 2 1 190983 CASAVA_Build 12 68827161 4I TCTCTCTCTA ----/TCTC TCTCTCTCAC 3070 het 3070 ref 41 16 18 7 TC 4 6 190984 CASAVA_Build 12 68833552 1D GTCAATTAAA C/- CCCTTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 C 4 3 190985 CASAVA_Build 12 68845770 1I AGGAGGAAGT -/G GGGAAACTGA 3070 het 3070 hom 56 19 30 7 G 3 4 190986 CASAVA_Build 12 68852375 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 10 9 190987 CASAVA_Build 12 68861264 1D TTAGCTGAAA G/- GGGGAATGGG 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 G 5 4 190988 CASAVA_Build 12 68872554 3D28M1D TTGTTTTTGT TTCTTCTTCTATTAACATTAGGTTGTTATTCT/---TTCTTCTATTAACATTAGGTTGTTATTC- TTTTTTTTTT 3070 het 1587 hom 27 7 15 15 N/A 0 0 190989 CASAVA_Build 12 68875375 1I AAAAAATCGC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 7 8 190990 CASAVA_Build 12 68877996 2I ACATTGTACT --/CA CAGTCATTTT 3070 het 3070 ref 50 23 25 2 CA 1 2 190991 CASAVA_Build 12 68879262 17I GGGTTTTTAT -----------------/CCTTATACTGTTTTTAA CTAGTTATAA 3070 hom 114 het 48 0 39 9 CCTTATACTGTTTTTAA 0 1 190992 CASAVA_Build 12 68900223 1I CACAAATTGA -/T TTTTTTTTTC 2218 het 2218 ref 21 10 6 5 T 9 10 190993 CASAVA_Build 12 68909127 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 12 11 190994 CASAVA_Build 12 68919556 1D CAGTGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 263 hom 37 1 27 9 T 11 10 190995 CASAVA_Build 12 68935255 1I AGGGTAAAAT -/A ATCATGATAA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 1 2 190996 CASAVA_Build 12 68937081 1D GAACATTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 10 9 190997 CASAVA_Build 12 68953361 1I AATTCTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 10 11 190998 CASAVA_Build 12 68965740 2D ACTTCTTGAC AA/-- AGTGTCCCCA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 3 1 190999 CASAVA_Build 12 68966407 3I TATTGAGATA ---/TTC TTCTTCATAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TTC 2 3 191000 CASAVA_Build 12 68967261 1D ACCTTATATA T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 7 6 191001 CASAVA_Build 12 68970705 2I CTACTCTCTC --/TT GGTTGGAAGT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 0 2 191002 CASAVA_Build 12 68976702 1D ACATGAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2480 hom 21 7 9 5 T 13 12 191003 CASAVA_Build 12 68976805 1D TTTATTTAAG C/- CCCCCCCCCT 1970 het 1970 ref 23 9 5 9 C 10 9 191004 CASAVA_Build 12 68978743 1I AGAAAGGGCA -/T TTTTAAGTAG 3070 het 3070 hom 42 9 27 6 T 4 5 191005 CASAVA_Build 12 68981533 1D AATCATGCCG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 8 7 191006 CASAVA_Build 12 69006092 3D TTAGATCATA TTC/--- TTTAAGGGTT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 TTC 1 0 191007 CASAVA_Build 12 69008766 1D AGCAGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1402 het 1402 ref 27 20 3 4 A 13 12 191008 CASAVA_Build 12 69011192 1I GATTGCCTAC -/A ATGTATATAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 1 2 191009 CASAVA_Build 12 69027107 6D TCTGATTTCA CAACTC/------ CATGATTTTT 1328 het 1328 ref 27 21 3 4 CAACTC 1 0 191010 CASAVA_Build 12 69032303 1I CCGCTTACTG -/T ATGACTTGTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 1 191011 CASAVA_Build 12 69038792 5I TGTAGAGTTG -----/TTTTC TTTTGATGTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 TTTTC 0 1 191012 CASAVA_Build 12 69056919 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2577 het 771 hom 14 4 7 3 A 13 12 191013 CASAVA_Build 12 69064398 2D ATAAATGCTC TG/-- TGAAACACAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 4 TG 2 1 191014 CASAVA_Build 12 69067273 1D GAAAGAGCCT A/- TTTTTTGCAG 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 1 0 191015 CASAVA_Build 12 69073887 1D CTTGTCCTCC A/- AGGCACATTA 3070 het 3070 hom 61 27 25 10 A 2 1 191016 CASAVA_Build 12 69074306 4I TCCTAGTCTT ----/AATG AATCACACTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 AATG 0 1 191017 CASAVA_Build 12 69078676 2I TTATAATGTC --/TA TATATTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TA 2 3 191018 CASAVA_Build 12 69081684 1I GCAATGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 43 4 19 20 T 17 18 191019 CASAVA_Build 12 69086187 3D GGGGGTAACG GAA/--- GTTACTAATC 3070 het 3070 ref 42 19 16 10 GAA 1 0 191020 CASAVA_Build 12 69097877 1I TTAGCAGGGT -/G GTGATGCTCT 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 G 1 2 191021 CASAVA_Build 12 69098436 1I TGTGGTTGTT -/A AAAGTGATCT 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 A 3 4 191022 CASAVA_Build 12 69100992 5I GTAGTCCCAG -----/CTACT CGGGAGGCTG 2519 het 678 hom 10 2 7 1 CTACT 0 1 191023 CASAVA_Build 12 69101099 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3047 het 448 hom 29 4 13 12 A 17 16 191024 CASAVA_Build 12 69145192 1I GGAAGGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 A 11 12 191025 CASAVA_Build 12 69148812 1I ACCTTTACAG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 6 7 191026 CASAVA_Build 12 69156146 1I CATTCTCTAG -/C CCCCCGCCGC 3070 het 3070 ref 36 14 16 6 C 5 6 191027 CASAVA_Build 12 69159699 3I TCTGGTTGTT ---/TAA TAAAAGTGTG 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 TAA 1 2 191028 CASAVA_Build 12 69160088 1D TAAGTTACAC A/- AGAGCTGATG 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 A 2 1 191029 CASAVA_Build 12 69169026 1I TTTGAAACAA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 7 8 191030 CASAVA_Build 12 69169132 1I GCAAGAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 11 12 191031 CASAVA_Build 12 69174157 2I TGATCTTTTC --/AA AATACCAGCT 2478 hom 12 het 5 0 5 0 A 2 4 191032 CASAVA_Build 12 69175587 1I TAAATATTGG -/C CCCCCACTGT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 C 5 6 191033 CASAVA_Build 12 69180804 6D TGTGGAAATG TACATA/------ TACATATACA 3070 hom 79 het 34 0 24 10 TACATA 2 1 191034 CASAVA_Build 12 69182290 1D GATGCGGGGC T/- TTTTTTTTTT 2005 het 572 hom 13 2 6 5 T 13 12 191035 CASAVA_Build 12 69186657 3D GGAGAAGAAA AAG/--- AAGAAGAACA 3070 het 1627 hom 26 8 10 9 AAG 3 2 191036 CASAVA_Build 12 69195977 1I GCTATATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 T 10 11 191037 CASAVA_Build 12 69198477 1D ACTTCATTTC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 8 7 191038 CASAVA_Build 12 69202759 1D TACAAAAAAA T/- AGAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 8 T 1 0 191039 CASAVA_Build 12 69204321 4D TGTCTGGCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3036 hom 36 12 19 5 T 14 10 191040 CASAVA_Build 12 69205988 4I GATGTCAGAC ----/AGAT AGATAGATAT 3070 het 3070 hom 43 15 27 1 AGAT 2 3 191041 CASAVA_Build 12 69207570 3D AAGCAAATGA GAT/--- GATTGAGACT 3070 hom 138 het 50 0 45 6 GAT 2 1 191042 CASAVA_Build 12 69208536 11I GAGAGTTGAT -----------/AAAGGGCTGTG CAAGGGCAGT 3070 het 3070 hom 46 15 16 15 AAAGGGCTGTG 0 1 191043 CASAVA_Build 12 69208958 4I TTTCTGTTTT ----/GAAA GAAAGAGAAT 3070 het 3070 ref 55 24 26 5 GAAA 1 2 191044 CASAVA_Build 12 69209700 4D AGAAGGATAA TAAT/---- TAATAATTAT 3070 het 3070 hom 35 13 20 4 TAAT 2 1 191045 CASAVA_Build 12 69210537 4D GACATGTATT ACAC/---- ACATACATAT 3070 het 3070 hom 59 23 34 6 AC 3 1 191046 CASAVA_Build 12 69211804 1D GAGTGGGGCT G/- GGGGAGAGAA 3070 het 3070 hom 25 11 10 5 G 5 4 191047 CASAVA_Build 12 69218055 1I GGATACCCCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 46 18 18 10 T 8 9 191048 CASAVA_Build 12 69221708 1D AATCTACTTT C/- TGTGTCTGTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 C 1 0 191049 CASAVA_Build 12 69221950 3D TTATGAATAA TGC/--- TGCTATGAAC 3070 het 3070 ref 37 26 10 1 TGC 2 1 191050 CASAVA_Build 12 69222049 2I CGTATGGTAA --/CT CTCTAGGTTT 3070 het 3070 hom 46 14 27 5 CT 2 3 191051 CASAVA_Build 12 69227056 1I GAAGTACTCC -/T TTTTTTTTTT 1522 het 1522 ref 31 13 7 11 T 11 12 191052 CASAVA_Build 12 69236241 1I TCAGGGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 11 13 T 11 12 191053 CASAVA_Build 12 69237367 3D TCTATTTAAA CTT/--- CTGCTATTTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 CTT 1 0 191054 CASAVA_Build 12 69258488 1I CCCATTTTCC -/T CCTTTATCGT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 0 1 191055 CASAVA_Build 12 69276402 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 13 13 A 12 13 191056 CASAVA_Build 12 69369078 1I CTAGGTGGGT -/G GGGTGAATGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 3 4 191057 CASAVA_Build 12 69385557 4I GAATGGAAAT ----/GGAA GGAAGAGGAC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 GGAA 1 2 191058 CASAVA_Build 12 69386083 1D ATGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 21 13 3 A 10 9 191059 CASAVA_Build 12 69387045 4D CTTCACTCTC TATT/---- TACACAGCTA 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 TATT 1 0 191060 CASAVA_Build 12 69387482 4D AAACTATATC ATGA/---- ATGTCTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 ATGA 1 0 191061 CASAVA_Build 12 69395072 1I GCCAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 T 10 11 191062 CASAVA_Build 12 69396384 1D TCTTCTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 17 14 A 15 14 191063 CASAVA_Build 12 69406629 3D CTGCATTTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 51 2 36 13 T 17 14 191064 CASAVA_Build 12 69407270 1D CTAGTCCCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 11 10 191065 CASAVA_Build 12 69409973 22D TTTGACGTTC TAATGTCATTTGATATTTTTCA/---------------------- TAATGTCATT 3070 hom 45 het 23 0 16 11 TAATGTCATTTGATATTTTTCA 1 0 191066 CASAVA_Build 12 69412783 3D AATTTTTGTA TTT/--- TTAGTAGAGA 3070 het 2706 hom 17 7 10 0 T 5 2 191067 CASAVA_Build 12 69412921 1I TCTATTTTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 1874 hom 24 7 13 4 T 7 8 191068 CASAVA_Build 12 69414256 1D TAGCAAAAAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 44 0 40 5 A 9 8 191069 CASAVA_Build 12 69420420 1D TATGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 12 11 191070 CASAVA_Build 12 69431742 1D TAATATACTA T/- TTTTTAGAGT 3070 het 3070 hom 45 16 25 5 T 6 5 191071 CASAVA_Build 12 69438441 1D AGGGAGCTTC T/- TTTGGTTTGC 3070 het 3070 hom 34 13 13 9 T 4 3 191072 CASAVA_Build 12 69454678 4I AGAAAAGCTG ----/GATT GATTTTGTAG 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 GATT 1 2 191073 CASAVA_Build 12 69455246 1I AAACATACAG -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 6 7 191074 CASAVA_Build 12 69455836 1I CCCCCAACCC -/T TTTTTTTTTT 2440 het 2440 ref 34 17 8 9 T 10 11 191075 CASAVA_Build 12 69459214 1D TTTTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 2535 het 2535 ref 29 10 11 8 T 15 14 191076 CASAVA_Build 12 69465376 5I TAGTTTTTCC -----/TTCAT TTCATTAGTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 TTCAT 1 2 191077 CASAVA_Build 12 69467670 1I TAAATCCTGC -/T TGGAAATTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 191078 CASAVA_Build 12 69476754 1D TATGTATATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 69 het 25 0 22 3 A 9 8 191079 CASAVA_Build 12 69495169 5D TTCTAAGGAG AGATA/----- AGATATCAAA 2288 hom 36 het 20 0 12 8 AGATA 2 1 191080 CASAVA_Build 12 69509467 1D GCTCAGGCTA T/- TGCAAACCAC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 2 1 191081 CASAVA_Build 12 69519467 1I AAATTAAGGG -/A AAAAATCTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 5 6 191082 CASAVA_Build 12 69521770 3D AAAGTAAAGA CAT/--- CATTTTCCTA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 CAT 2 1 191083 CASAVA_Build 12 69525267 1D GTGGAGGGAG A/- AAAGAAGCTT 3070 hom 150 het 56 0 50 6 A 4 3 191084 CASAVA_Build 12 69539002 1I CATTTCGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 976 hom 36 3 22 11 T 13 14 191085 CASAVA_Build 12 69545349 7D ATCTTTATCA GCAGCAT/------- GCAAACAGAC 1366 het 199 hom 15 1 5 11 GCAGCAT 1 0 191086 CASAVA_Build 12 69564760 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2659 hom 23 het 9 0 8 1 A 10 11 191087 CASAVA_Build 12 69565783 2I GGGTTTCACC --/CT GTTAGCCAGG 3070 hom 62 het 23 0 21 2 CT 0 1 191088 CASAVA_Build 12 69567497 1I AGACTCTTTC -/T CAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 0 1 191089 CASAVA_Build 12 69568066 14I AATGTGTGTA --------------/TGTGTGTGTGTGTC TGTGTGTGTG 3070 hom 156 het 56 0 52 4 TGTGTGTGTGTGTC 0 1 191090 CASAVA_Build 12 69578276 1D GAGAAACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 654 hom 35 2 32 1 A 12 11 191091 CASAVA_Build 12 69584268 1D TCTTACCCCA G/- AGAAATAAAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 G 1 0 191092 CASAVA_Build 12 69627012 3D ACTAAGTGTG ATT/--- ATTATTATTG 3070 het 3070 ref 44 23 20 1 ATT 4 3 191093 CASAVA_Build 12 69650477 3D AGAGCCAAGT AGA/--- AGAAGATGAC 3070 hom 154 het 59 0 52 8 AGA 3 2 191094 CASAVA_Build 12 69668393 2I TGCGCACACA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 47 20 11 16 TG 7 8 191095 CASAVA_Build 12 69672378 1D AATGAGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 12 11 191096 CASAVA_Build 12 69673657 1D GAGTGATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 13 12 191097 CASAVA_Build 12 69695742 2D TCCCTGAAAA AT/-- ATGTTTCATT 3070 het 3070 ref 19 12 7 0 AT 2 1 191098 CASAVA_Build 12 69700113 2I GATTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 12 14 191099 CASAVA_Build 12 69704659 4I CACTAGAGGT ----/TAAA TAGAGGCTCA 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 TAAA 0 1 191100 CASAVA_Build 12 69717933 1I TGAAAACTTA -/T TTTTTAGGTC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 5 6 191101 CASAVA_Build 12 69745503 2D AGAACTTTAC AT/-- ATAAACATTG 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 AT 2 1 191102 CASAVA_Build 12 69746513 2I TCCAAAATTT --/TA TATATATATA 1708 het 1708 ref 11 5 4 2 TA 6 7 191103 CASAVA_Build 12 69748089 1D ATTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 12 15 T 11 10 191104 CASAVA_Build 12 69767054 2I CCACCGGGCT --/TA CTCACATTTC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 TA 0 1 191105 CASAVA_Build 12 69769354 2D TTTCACTTAT AA/-- TGTGAGTCTG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 2 0 191106 CASAVA_Build 12 69788152 1I TAGCGAGGAT -/A TAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 0 1 191107 CASAVA_Build 12 69789332 4I CCATTGTAAT ----/AGAG AGAGAAGATT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 AG 2 4 191108 CASAVA_Build 12 69793775 1I ATAAAGAAGG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 53 23 21 9 A 7 8 191109 CASAVA_Build 12 69795875 4D AGAGTGTACA CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 45 18 15 13 CT 8 6 191110 CASAVA_Build 12 69796082 16I AATATAGGAG ----------------/TTCCCTGTATAATTTT TTCATTGTTT 3070 het 3070 ref 31 18 14 2 TTCCCTGTATAATTTT 0 1 191111 CASAVA_Build 12 69805918 1I17M1I CAAGAGGAAT -AAAAAATGAAGTAACTC-/AAAAAAATGAAGTAACTCT TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 15 18 4 N/A 0 0 191112 CASAVA_Build 12 69807332 1I TATAAAATGC -/T TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 3 4 191113 CASAVA_Build 12 69809467 2D CAGGTCTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 7 6 A 12 10 191114 CASAVA_Build 12 69809999 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1914 het 1914 ref 25 9 7 9 T 15 13 191115 CASAVA_Build 12 69810687 1I CTAAGTCATC -/T TTTCCCCTTC 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 3 4 191116 CASAVA_Build 12 69816141 2I TCTGAGGGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 10 12 191117 CASAVA_Build 12 69817652 1D GTCCCCCCCC A/- AAAAAAAGGG 3070 het 1710 hom 28 9 15 4 A 8 7 191118 CASAVA_Build 12 69863935 1I TCCCAGAAAG -/C TGGTATCCAG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 0 1 191119 CASAVA_Build 12 69868336 1D TTAAGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 A 11 10 191120 CASAVA_Build 12 69871456 5I ATTATTGTAT -----/ATATG ATATAATTGC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 ATATG 0 1 191121 CASAVA_Build 12 69879192 1D AAACCAAAAA G/- CCACTCTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 G 1 0 191122 CASAVA_Build 12 69882367 28D TGTTAAGGTT TATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATA 3070 het 584 hom 26 2 22 5 TA 21 7 191123 CASAVA_Build 12 69884143 1D CAATAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 A 11 10 191124 CASAVA_Build 12 69887755 4D GTAGTAATCT TCTG/---- TCTGTCTAGG 3070 het 3064 hom 26 8 15 3 TCTG 2 1 191125 CASAVA_Build 12 69898164 1D CTGTTTGTGA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 9 8 191126 CASAVA_Build 12 69928070 1D AGAAACTGAG A/- AAACCCATTC 2287 het 2287 ref 38 21 9 9 A 4 3 191127 CASAVA_Build 12 69943507 1I TAAAACAAAT -/A AAAAAAAAAA 2072 het 2072 ref 31 16 10 5 A 12 13 191128 CASAVA_Build 12 69958296 9I ATTATCTATA ---------/TTCTTGTAT TTCTTGTATT 3070 het 3070 ref 43 23 11 9 TTCTTGTAT 1 2 191129 CASAVA_Build 12 69961765 1D AAGAGTCAGG C/- CATGCCACCC 3070 het 3070 ref 45 28 12 6 C 2 1 191130 CASAVA_Build 12 69968027 4D GTAATATCTC CTCT/---- CTAATTTCTG 3070 het 3070 ref 23 13 10 4 CT 3 1 191131 CASAVA_Build 12 69976719 1I TCAATTTCAC -/A GCTCTCAAGA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 A 0 1 191132 CASAVA_Build 12 69979853 1D TAGAGAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 17 9 T 11 10 191133 CASAVA_Build 12 69983158 1D GTTAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 184 hom 30 1 22 7 A 13 12 191134 CASAVA_Build 12 69999235 1D ACATCTTCCT C/- CAAACAATAC 3070 het 3070 ref 52 25 21 7 C 2 1 191135 CASAVA_Build 12 70001204 1D TGACAAAGAA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 T 4 3 191136 CASAVA_Build 12 70002447 1I CTACCGCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 10 11 191137 CASAVA_Build 12 70005528 2D ATCCACATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 27 12 A 14 12 191138 CASAVA_Build 12 70005665 1I TTAACAATGA -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 6 7 191139 CASAVA_Build 12 70013532 3I TCTTCTGACT ---/ATA ATATTAGCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATA 1 2 191140 CASAVA_Build 12 70019109 1I TTAAACAAAT -/C AACAAGCAAA 3070 hom 78 het 28 0 25 3 C 0 1 191141 CASAVA_Build 12 70022413 1I TGAAAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 T 13 14 191142 CASAVA_Build 12 70027718 1D AAATAGTATC A/- AAAAAAAATG 2915 het 1618 hom 12 4 6 4 A 9 8 191143 CASAVA_Build 12 70029427 1I GATACGGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 9 10 191144 CASAVA_Build 12 70034754 1I AACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 10 11 191145 CASAVA_Build 12 70035864 1I AAAATTATAT -/A AATGGATTTA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 A 2 3 191146 CASAVA_Build 12 70036290 4I AGAAAATGGT ----/TAAA TAAATTCTGG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TAAA 1 2 191147 CASAVA_Build 12 70040757 3I TTAAAAAAAA ---/AAC CTCAACTATA 3070 het 3070 ref 38 24 10 4 AAC 0 1 191148 CASAVA_Build 12 70045012 2D CTATGATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 53 21 20 12 TG 7 6 191149 CASAVA_Build 12 70045601 2D TATATATATC AT/-- ATATATATCA 2022 het 188 hom 11 2 7 2 AT 5 4 191150 CASAVA_Build 12 70046065 1D AATTGATGGG T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 25 9 10 7 T 8 7 191151 CASAVA_Build 12 70048814 1D GCCAACAAAC G/- TAAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 G 1 0 191152 CASAVA_Build 12 70049733 2D TGCCTGTTAC TG/-- TCTCTGAAGA 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 TG 1 0 191153 CASAVA_Build 12 70049877 1I AGAAAATTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 8 9 191154 CASAVA_Build 12 70051404 1I CCAACGGGAA -/C GTGATATATT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 C 0 1 191155 CASAVA_Build 12 70056646 1I ATATGGTGAG -/A GATGGGGTCC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 0 1 191156 CASAVA_Build 12 70069567 4D TGTGCTGTGA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2960 hom 27 7 17 5 TTTG 4 3 191157 CASAVA_Build 12 70069990 1D TATTTCTCTA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 8 7 191158 CASAVA_Build 12 70074997 1D AAACTGTCTC T/- CAGCTATTTA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 1 0 191159 CASAVA_Build 12 70075506 1D ACTCCAGCCT G/- GGGGACAGAG 2925 het 1509 hom 12 4 7 4 G 5 4 191160 CASAVA_Build 12 70084209 1D AAGTTAAAAG A/- TAAAATATTA 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 A 1 0 191161 CASAVA_Build 12 70084539 4I ACTACAAAAT ----/AGTC AGACAACAAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 AGTC 0 1 191162 CASAVA_Build 12 70085870 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 A 10 11 191163 CASAVA_Build 12 70091237 16D ATGCTGTAAA ACAATTCTCAATAGTG/---------------- AAATGAAACT 3070 het 3070 ref 32 24 11 3 ACAATTCTCAATAGTG 1 0 191164 CASAVA_Build 12 70092454 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 0 1 191165 CASAVA_Build 12 70104480 1I CATTTCTGCC -/T TCAAAATGCA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 1 2 191166 CASAVA_Build 12 70107784 1I CAAAAAAACC -/T TTCCCTTTTC 3070 hom 80 het 32 0 26 6 T 2 3 191167 CASAVA_Build 12 70107902 3D22M1I TGTTAGCACT TCATCATTTTGGAGCACAGCCCAAG-/---TCATTTTGGAGCACAGCCCAAGC TTTGTCTGTG 3070 hom 114 het 36 0 38 3 N/A 0 0 191168 CASAVA_Build 12 70108136 1D TATTTTGTTA T/- TTTTTTCTCA 3070 hom 76 het 41 1 39 2 T 7 6 191169 CASAVA_Build 12 70111166 1D TTGGGGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 27 8 T 12 11 191170 CASAVA_Build 12 70113436 1I CAATAGATGC -/A AAAAAAAAAA 2269 het 2269 ref 37 17 8 12 A 11 12 191171 CASAVA_Build 12 70123962 1I AGAGAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 11 12 191172 CASAVA_Build 12 70134255 1I GCAGGTCTGG -/A AAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 43 10 23 10 A 6 7 191173 CASAVA_Build 12 70148407 1I GCTTTGTGGC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 A 7 8 191174 CASAVA_Build 12 70154194 1D AACTAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 11 10 191175 CASAVA_Build 12 70162580 1D CACTATCTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 10 9 191176 CASAVA_Build 12 70173818 1I GTAAATAAGC -/T TTTTTTTTTT 2320 het 393 hom 25 2 13 10 T 15 16 191177 CASAVA_Build 12 70178368 1D CCATTTGTCC A/- GGCTGCTACA 3070 het 3070 ref 54 32 16 8 A 1 0 191178 CASAVA_Build 12 70193689 1D TCATGCCCAT A/- AAGTACTGAA 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 A 3 2 191179 CASAVA_Build 12 70196645 1D TGCTCTCATA C/- CTCCATTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 2 1 191180 CASAVA_Build 12 70197050 1D AAACAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 15 14 191181 CASAVA_Build 12 70206485 1D TTTCCATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 16 20 12 A 11 10 191182 CASAVA_Build 12 70210004 1D TTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1452 het 1452 ref 30 14 6 10 A 17 16 191183 CASAVA_Build 12 70210300 1D ATATAGTTGA G/- AACCACAGTG 3070 het 3070 ref 25 16 7 2 G 1 0 191184 CASAVA_Build 12 70214218 1I ATACTGGGAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 9 191185 CASAVA_Build 12 70215559 1D CCTTTTACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 616 hom 48 2 36 10 A 12 11 191186 CASAVA_Build 12 70217239 1I TCAAAAAAAA -/C AAAAAAAAGC 3070 het 1488 hom 22 8 10 4 C 0 1 191187 CASAVA_Build 12 70222918 1D GGATGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 11 10 191188 CASAVA_Build 12 70223079 1I TTCAGCACCA -/G GTAGAGTAGC 3070 hom 154 het 58 0 52 6 G 1 2 191189 CASAVA_Build 12 70242512 1D ATTCTAACAC T/- TTGGGAGGCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 3 2 191190 CASAVA_Build 12 70245075 1I TATATGCATA -/C AAGTACATGG 3070 hom 151 het 52 0 51 1 C 0 1 191191 CASAVA_Build 12 70249563 1D GACACTTCTC A/- AAAAAAAAGA 2438 hom 12 het 5 0 5 0 A 9 8 191192 CASAVA_Build 12 70284956 1I CAAAATACTT -/C TTTTTTTTTT 148 hom 13 het 25 0 3 22 C 0 1 191193 CASAVA_Build 12 70291502 2I CTACAACAGG --/GT TGACACACCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 GT 0 1 191194 CASAVA_Build 12 70294334 1I ATATCCCTTC -/A ATTTTGCTTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 2 191195 CASAVA_Build 12 70298742 3D ATAAAGAGAT GAG/--- GAGGACAAAG 3070 hom 78 het 28 0 26 4 GAG 2 1 191196 CASAVA_Build 12 70301356 1D CTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 19 12 T 13 12 191197 CASAVA_Build 12 70307174 1D AGAAACGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 36 2 29 6 A 12 11 191198 CASAVA_Build 12 70314875 1D GAAGCTTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 13 12 191199 CASAVA_Build 12 70314888 1D AAAAAAAAAA C/- ATTTGAAGTC 3070 het 93 hom 36 4 28 4 C 1 0 191200 CASAVA_Build 12 70319520 4D AATGTTTAAT AGTC/---- AGACACTTGA 3070 hom 126 het 49 0 43 7 AGTC 1 0 191201 CASAVA_Build 12 70363855 4D TGTCTATTGC ATGG/---- ATGGATATGC 3070 hom 90 het 32 0 30 3 ATGG 2 1 191202 CASAVA_Build 12 70396299 1D AAATTTTATG T/- TTTTTTACCA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 T 7 6 191203 CASAVA_Build 12 70396665 2D AGTAATGAAG CA/-- CAGACTCTGG 3070 hom 112 het 41 0 34 8 CA 2 1 191204 CASAVA_Build 12 70405936 28I TGTATCTTTC ----------------------------/TTAGTGCCTCAAATTAGATCCTGTTCAG ACATGTTATA 3070 hom 81 het 31 0 27 7 TTAGTGCCTCAAATTAGATCCTGTTCAG 0 1 191205 CASAVA_Build 12 70409104 1D ATAACAGAAT A/- AAAATGGCAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 5 4 191206 CASAVA_Build 12 70415209 26D AGTCAGTTAA AGGAATTTTAAAATTCCTGTCTTTAC/-------------------------- AGGAATTTTA 3070 hom 54 het 24 0 19 9 AGGAATTTTAAAATTCCTGTCTTTAC 2 1 191207 CASAVA_Build 12 70422019 1I TTGTTGTTGG -/T TTTTTTTTTT 1132 het 1132 ref 20 12 4 4 T 13 14 191208 CASAVA_Build 12 70427444 1D CTCTATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 22 1 11 10 A 14 13 191209 CASAVA_Build 12 70427826 3D TTTGAGTAAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 34 1 13 22 T 21 18 191210 CASAVA_Build 12 70431320 1D AGCTCTAGTG T/- TTTTTTTTTT 830 het 830 ref 35 25 3 8 T 13 12 191211 CASAVA_Build 12 70454804 1D ACTGTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 829 het 829 ref 17 11 3 3 A 17 16 191212 CASAVA_Build 12 70508615 1D ACCTTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 2598 het 2598 ref 50 27 9 14 T 13 12 191213 CASAVA_Build 12 70568892 1D TACATGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2282 het 2282 ref 43 24 8 11 T 17 16 191214 CASAVA_Build 12 70648985 1I TTGTAGGATG -/T TTGGAATATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 3 191215 CASAVA_Build 12 70654583 2D ATAAGGACTC TT/-- ATGATTATAT 3070 het 3070 ref 49 21 20 10 T 2 0 191216 CASAVA_Build 12 70663116 1D CTATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 12 11 191217 CASAVA_Build 12 70675016 3D TTAGCCTGTG TGC/--- TGTGGTTTGC 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 TGC 1 0 191218 CASAVA_Build 12 70677028 1D TCTTTAAAGA T/- GAGAAAAGAT 3070 het 3070 ref 53 31 21 1 T 1 0 191219 CASAVA_Build 12 70677813 1D GGACAGGGGG A/- AAAAAAGAGG 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 A 7 6 191220 CASAVA_Build 12 70685438 2D AAAAGATAAC AT/-- ATATTTATTG 3070 het 3070 hom 43 12 23 8 AT 3 2 191221 CASAVA_Build 12 70694443 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1441 het 1441 ref 25 6 9 10 T 13 14 191222 CASAVA_Build 12 70701072 3D36M1I GCTGGAAATA ATTATTATTTTCTGCCCCTTTTCAGGAGTGTTTAAATTC-/---ATTATTTTCTGCCCCTTTTCAGGAGTGTTTAAATTCT CTTTCTTAAC 3070 het 3070 ref 43 25 19 12 N/A 0 0 191223 CASAVA_Build 12 70727258 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 803 het 803 ref 27 11 3 13 T 15 14 191224 CASAVA_Build 12 70755077 1I TTAAATCACG -/A AACAGTTGAA 3070 het 3070 hom 50 19 28 3 A 2 3 191225 CASAVA_Build 12 70758323 1I GAGTACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2889 hom 20 8 11 1 T 10 11 191226 CASAVA_Build 12 70794225 1I AAAAAAAAAA -/G GCATGCTGGG 837 het 837 ref 26 15 4 7 G 1 2 191227 CASAVA_Build 12 70829635 1D ACACTCATTC T/- TTTTTTTTTC 2310 het 2310 ref 51 40 5 7 T 10 9 191228 CASAVA_Build 12 70866678 1I AAGGTAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2844 hom 25 7 11 7 T 13 14 191229 CASAVA_Build 12 70896365 1D GCATTGTCAA C/- CCATTATTTC 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 C 3 2 191230 CASAVA_Build 12 70902580 1I ATTTGTTATG -/T TCTGGGGATA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 1 2 191231 CASAVA_Build 12 70903974 1D TTTTTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 1801 het 1801 ref 41 31 4 6 T 11 10 191232 CASAVA_Build 12 70928554 4I AATGCTTTTC ----/CTAA CTGATTGTGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 CTAA 0 1 191233 CASAVA_Build 12 70936580 4D CCTTATTAGA ATGC/---- AAGTTCCACA 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 ATGC 1 0 191234 CASAVA_Build 12 70940403 1I AAAATGATAC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 8 9 191235 CASAVA_Build 12 70943408 1D34M10D TCCCCAGGTT AAAAAAAAAAAAGCCGTTTCTCTAGTGTGTGTGCATGTTTTGTTT/-AAAAAAAAAAAGCCGTTTCTCTAGTGTGTGTGCA---------- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 36 18 21 17 N/A 0 0 191236 CASAVA_Build 12 70948004 3D ATGAAACCCC ACA/--- ACAACATCAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 ACA 3 2 191237 CASAVA_Build 12 70959400 1D CTTCACCCCC A/- ATGCTCATCC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 2 1 191238 CASAVA_Build 12 70964027 1D GTTATATCTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 A 9 8 191239 CASAVA_Build 12 70975839 1I ATGTATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 10 11 191240 CASAVA_Build 12 70989730 1D AAAGGGTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 26 0 21 7 T 10 9 191241 CASAVA_Build 12 70991251 1I CAACCACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 10 11 191242 CASAVA_Build 12 70998764 1I TCAAAAGTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 9 10 191243 CASAVA_Build 12 71000037 1D AATTATGGTA C/- TGATAATACT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 C 1 0 191244 CASAVA_Build 12 71005206 1I ATTTGCTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 9 10 191245 CASAVA_Build 12 71017864 10D TATTATTATT TTTATTTTTA/---------- TTGTCAGCCC 3070 het 3070 ref 38 23 19 0 TTTATTTTTA 1 0 191246 CASAVA_Build 12 71018041 1D CAGAACTCGG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 44 17 19 9 A 8 7 191247 CASAVA_Build 12 71024049 1D TATATATATA T/- TATTTTTCAC 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 T 2 1 191248 CASAVA_Build 12 71025923 2D GAGTGCCTTT TA/-- GTTTGCCTTC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 TA 1 0 191249 CASAVA_Build 12 71026070 53D AAGAATGTAT CATGGAATGATATGAAAAATTTGCATTTGCTTTTCAAAGGTAGTGACACAGAA/----------------------------------------------------- CATAAATTTC 3070 het 3070 ref 32 23 14 6 CATGGAATGATATGAAAAATTTGCATTTGCTTTTCAAAGGTAGTGACACAGAA 1 0 191250 CASAVA_Build 12 71026538 2I AACTGTTCCC --/CT GAGGAGCATC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 CT 0 1 191251 CASAVA_Build 12 71033951 4D TATGCTAATC CTGA/---- TGTCATGGCA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 CTGA 1 0 191252 CASAVA_Build 12 71043370 2I CAACCAAAAA --/AG AGAATTTTAG 1686 hom 12 het 5 0 5 0 AG 1 2 191253 CASAVA_Build 12 71059159 1D AAAGTTTTTG T/- GTTTGAACCA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 1 0 191254 CASAVA_Build 12 71076791 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 AAAC 5 4 191255 CASAVA_Build 12 71082316 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2496 hom 29 9 16 4 A 10 11 191256 CASAVA_Build 12 71093512 5D ATTATATATG TAAAA/----- TAAAATGATA 2787 het 2787 ref 15 9 6 2 TAAAA 2 1 191257 CASAVA_Build 12 71105975 2I GCCAAAACTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 AT 6 7 191258 CASAVA_Build 12 71106763 1D CAAAAATAGA T/- TTAAAAAAAA 2835 het 2835 ref 27 15 10 2 T 3 2 191259 CASAVA_Build 12 71158566 1I ACGTCTTTTT -/A AAGAATAGAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 2 3 191260 CASAVA_Build 12 71159695 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 1963 hom 21 het 8 0 8 0 T 9 10 191261 CASAVA_Build 12 71160886 1D TGATAATGCC A/- AAAATTATAC 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 A 5 4 191262 CASAVA_Build 12 71162301 1D ATTTAGGAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 12 14 2 T 9 8 191263 CASAVA_Build 12 71163007 1I ATATAACTTA -/C CAGGCCTAAA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 C 1 2 191264 CASAVA_Build 12 71172281 4D GCTTTTACTT TCTC/---- TATCAGTATG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TC 2 0 191265 CASAVA_Build 12 71227199 1D TTTTTACTTG T/- TTTTTTTTTT 1198 het 1198 ref 56 46 3 7 T 12 11 191266 CASAVA_Build 12 71240165 1D TTTCTCTTTT A/- AAAAAGGGAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 6 5 191267 CASAVA_Build 12 71246670 4I GGAAATTATG ----/TTTA TTTATATTAG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TTTA 1 2 191268 CASAVA_Build 12 71320019 1D CTGTGCCCTG C/- CCCCCAGAGG 1310 hom 9 het 5 0 3 2 C 6 5 191269 CASAVA_Build 12 71352539 9I TCTTTTGTTG ---------/TTGTTGTTA TTGTTGTTGT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 TTGTTGTTA 0 1 191270 CASAVA_Build 12 71411739 1D AGGGTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 2037 het 2037 ref 42 29 6 10 A 12 11 191271 CASAVA_Build 12 71430046 2I TCTCTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 TC 6 7 191272 CASAVA_Build 12 71438044 1I AATAACCTCA -/C ACTCCCCCTC 3070 hom 59 het 25 0 19 6 C 0 1 191273 CASAVA_Build 12 71462501 4D AGAGTGAAAC AATT/---- AAACTTCTTC 3070 het 3070 ref 31 19 11 3 AATT 1 0 191274 CASAVA_Build 12 71473284 1D TAGGAGAGTC T/- TTCCTGACCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 3 2 191275 CASAVA_Build 12 71496431 1D GAGCCAGGAT G/- AGCCAGGAAA 3070 het 3070 hom 28 7 17 4 G 1 0 191276 CASAVA_Build 12 71590923 1I ATTTATATCG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 43 1 33 9 A 11 12 191277 CASAVA_Build 12 71630462 4D TTTAAATTCA ATTT/---- TTTGAGATTA 3070 het 3070 ref 35 19 14 6 ATTT 1 0 191278 CASAVA_Build 12 71666493 1I TAGCATGATG -/A AATTTTGTGC 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 2 3 191279 CASAVA_Build 12 71667330 1I GCATTTTCTA -/T TTTTTTGTGC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 6 7 191280 CASAVA_Build 12 71669086 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 T 10 9 191281 CASAVA_Build 12 71675709 4D GGAGGGAGGG AGGA/---- AGGAAGGAAG 1632 het 1632 ref 32 9 8 15 AGGA 6 5 191282 CASAVA_Build 12 71691372 2D CTTTTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 T 13 11 191283 CASAVA_Build 12 71692779 1D GTGGGATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 11 10 191284 CASAVA_Build 12 71695837 1I TCTCTAATGA -/C CAGTGATGAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 1 2 191285 CASAVA_Build 12 71698437 3D AAAGATAATC AAG/--- AAGGCACTTA 3070 het 3070 ref 45 29 15 3 AAG 2 1 191286 CASAVA_Build 12 71704027 1I ATGTCTAGAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 16 26 9 C 0 1 191287 CASAVA_Build 12 71710052 5D CAATTTTTCC TACAT/----- TAAAGAACAG 3070 het 3070 hom 44 17 25 5 TACAT 1 0 191288 CASAVA_Build 12 71713181 1I AAGTCTCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 11 12 191289 CASAVA_Build 12 71713482 3D TTTAATTTTT TTA/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 8 11 4 TTA 1 0 191290 CASAVA_Build 12 71717536 1D TTTGTTCAGC T/- TTTTACTTAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 5 4 191291 CASAVA_Build 12 71722419 1D TGCTATAGGA T/- TTCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 3 2 191292 CASAVA_Build 12 71725373 3D AGAAGGTTTT AGA/--- AGAAGAGGTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 5 AGA 3 2 191293 CASAVA_Build 12 71730176 3D TAGCAAGATG TAA/--- TAAAGACACT 3070 het 3070 hom 31 9 18 5 TAA 2 1 191294 CASAVA_Build 12 71730436 1I CACTGGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 959 hom 36 3 21 12 T 13 14 191295 CASAVA_Build 12 71730716 1D CACCAGAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 38 1 29 9 A 10 9 191296 CASAVA_Build 12 71742725 4I AAGATGTGTT ----/AGTG AGGAAATGGA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 AGTG 0 1 191297 CASAVA_Build 12 71754584 1I TGCTAGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 10 11 191298 CASAVA_Build 12 71762493 2D TTAACCGTCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 2984 hom 30 10 14 6 TC 8 7 191299 CASAVA_Build 12 71770579 1D CTCAATAGCC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 8 7 191300 CASAVA_Build 12 71785634 5I TAGTGATGAC -----/ATAAA ATAAAATCTA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 ATAAA 1 2 191301 CASAVA_Build 12 71793092 5D AGTGTAGACA TATAT/----- TATGTGCCTT 3070 het 3070 ref 38 20 17 5 TATAT 1 0 191302 CASAVA_Build 12 71795383 3I CCAGCTCTAT ---/GAG GAGAAGGAGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 GAG 1 2 191303 CASAVA_Build 12 71796612 1D GTGAACGTTG T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 6 191304 CASAVA_Build 12 71797659 1I ATACAACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 10 11 191305 CASAVA_Build 12 71798912 1I CCACTAGCTA -/T TTTTTTTTCT 2812 het 2812 ref 35 19 8 8 T 8 9 191306 CASAVA_Build 12 71805945 1D CTAAGGGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 T 10 9 191307 CASAVA_Build 12 71806750 1I GTAAACTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 10 11 191308 CASAVA_Build 12 71827287 2D GTAAAATCAA AT/-- ATGTTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 7 AT 2 1 191309 CASAVA_Build 12 71827618 1D TATCTTTTTA T/- TTTTTTATTT 2541 het 383 hom 18 3 6 9 T 7 6 191310 CASAVA_Build 12 71836441 1I AAACTCTGTG -/A AAATTCATCT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 3 4 191311 CASAVA_Build 12 71838330 1D TGCTGGTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 10 9 191312 CASAVA_Build 12 71840446 9D5M3I GGAGAAAAAG AGCTAAAAAAATTT---/---------TATTTACG TCTTGAGAAA 3070 het 3070 hom 31 15 16 2 N/A 0 0 191313 CASAVA_Build 12 71850530 1D TGTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 13 12 191314 CASAVA_Build 12 71861481 1I CTGCTGTGAC -/A GGGCAGCACT 3070 het 3070 ref 42 27 11 4 A 0 1 191315 CASAVA_Build 12 71864195 14D AGTTATTTTG CTTATATATATATA/-------------- TATATATATA 2906 het 442 hom 16 5 7 4 CTTATATATATATA 1 0 191316 CASAVA_Build 12 71872920 2I TCAAAAAATT --/TA TGTGATGAAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 TA 0 1 191317 CASAVA_Build 12 71873678 3D TTCTTTTTTT TTA/--- TTATTATACT 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 TTA 3 2 191318 CASAVA_Build 12 71884464 4I AATAATTACT ----/TAAA TGAATGAAAC 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 TAAA 0 1 191319 CASAVA_Build 12 71886521 1I CTTTTTTCTC -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 A 6 7 191320 CASAVA_Build 12 71896929 3I GTTTTGAAAA ---/TAT TATTAGAGTT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 TAT 1 2 191321 CASAVA_Build 12 71904117 1I TTACTGAGAT -/A ATAATTTACA 3070 het 3070 ref 34 15 17 2 A 1 2 191322 CASAVA_Build 12 71904215 4D TGTCATCACA GTTT/---- ATTTAGAAGT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 GTTT 1 0 191323 CASAVA_Build 12 71910394 26D GCCCTAGACT GAGCAATACTTTAGACCTACTAGACA/-------------------------- GAGCAATACT 3070 het 3070 ref 29 17 8 11 GAGCAATACTTTAGACCTACTAGACA 1 0 191324 CASAVA_Build 12 71913718 1I GCACTGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 10 11 191325 CASAVA_Build 12 71916464 1I AGAAGGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 9 10 191326 CASAVA_Build 12 71917457 1D TGTACATGAT A/- AAAAAGCTCA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 6 5 191327 CASAVA_Build 12 71920063 1I TGTGGAAAGT -/A AATGCTGTTG 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 A 2 3 191328 CASAVA_Build 12 71923918 1I TAGTAACATT -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 A 7 8 191329 CASAVA_Build 12 71924115 2D TGTGTACAGT CC/-- CCCCAGAATT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 C 6 4 191330 CASAVA_Build 12 71932985 1I CTGAGCTGAC -/T TGATTCCCAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 2 191331 CASAVA_Build 12 71937034 1D TCCTTAATGA C/- CCCCCTTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 C 6 5 191332 CASAVA_Build 12 71937604 1I TTAGTTAAAT -/A AGAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 1 2 191333 CASAVA_Build 12 71940100 1I AAAAAGGAAC -/A AAAACCCTGT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 4 5 191334 CASAVA_Build 12 71947211 1D CAGTAACAAC A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 A 7 6 191335 CASAVA_Build 12 71947557 2I TCGACCTGAC --/AG AGTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 AG 1 2 191336 CASAVA_Build 12 71950074 1D GTTTTTTTTT A/- AAAAAAACTA 3070 het 2828 hom 25 11 10 4 A 8 7 191337 CASAVA_Build 12 71952238 42D ATCAGTGAGC TTTTTAATGATCAGTGGATCATTTTTAATGATCAGTGGATCA/------------------------------------------ TTTTTAATGA 3070 het 3070 ref 47 32 14 7 TTTTTAATGATCAGTGGATCA 3 1 191338 CASAVA_Build 12 71960259 1D TGCTAATCTA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 8 7 191339 CASAVA_Build 12 71975598 3I GAGAAATAAA ---/TTG TTGTTTAAGC 3070 het 3070 ref 52 24 25 3 TTG 1 2 191340 CASAVA_Build 12 71994851 2I GAATTATTTA --/TC TGTTATTTCT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 TC 0 1 191341 CASAVA_Build 12 71999258 1I TCTTTTTCTT -/C TTTTTTTTTT 235 het 235 ref 17 4 6 7 C 0 1 191342 CASAVA_Build 12 72005632 1D ATTTTTAATC A/- AACTTGGTAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 3 A 3 2 191343 CASAVA_Build 12 72023570 5D TAATAATCTC TTATT/----- TTATTTTATT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 TTATT 3 2 191344 CASAVA_Build 12 72023801 1I CTATTTTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 8 9 191345 CASAVA_Build 12 72025175 1I AGCTTTTTTT -/C CATATATTTG 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 C 1 2 191346 CASAVA_Build 12 72032403 1D ATTACTCTGA T/- TTTTTTTTTT 2871 het 2871 ref 32 13 13 6 T 11 10 191347 CASAVA_Build 12 72032436 1I GTTTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 1392 het 1392 ref 25 10 4 11 T 13 14 191348 CASAVA_Build 12 72034944 2I TTCTAAAAAT --/AC ACACACACAC 1589 het 1496 hom 16 6 4 6 AC 7 8 191349 CASAVA_Build 12 72039785 2D AACATGATTA TC/-- TCTATAGAAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 TC 2 1 191350 CASAVA_Build 12 72045992 1D TAGGATACTG T/- TAAGAGTGGC 3070 het 3070 hom 20 9 10 2 T 2 1 191351 CASAVA_Build 12 72046227 4D GACCTAAATA AATG/---- AAGACATGTA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 AATG 1 0 191352 CASAVA_Build 12 72046417 1D ATGTTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 10 23 10 A 13 12 191353 CASAVA_Build 12 72046952 1D CCTAACATGG T/- TAAAACCCCA 3070 hom 42 het 19 0 15 5 T 2 1 191354 CASAVA_Build 12 72054400 2D ACTTTTTGTT TC/-- TGAGTTTTGA 3070 het 3070 ref 44 25 18 3 TC 1 0 191355 CASAVA_Build 12 72055270 2D TAGGTAGGTG TA/-- TACATCTAAC 3070 het 3070 ref 43 22 20 2 TA 2 1 191356 CASAVA_Build 12 72062920 2I TACCCGCCCC --/CT CCCCATGCCG 1234 het 1234 ref 22 11 5 6 CT 0 1 191357 CASAVA_Build 12 72070151 1I AATTATTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 11 12 191358 CASAVA_Build 12 72071913 4I AAAATAAGAT ----/AATC AATTTTAATA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 AATC 0 1 191359 CASAVA_Build 12 72073200 1I TCTTCTTTTG -/C TTAATATTTA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 C 0 1 191360 CASAVA_Build 12 72074456 4D AATATATGTG TATA/---- TATATATATA 2322 het 988 hom 11 2 6 3 TA 9 7 191361 CASAVA_Build 12 72081287 1I ATAGTGTAAT -/G TTTTTAGTGC 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 G 0 1 191362 CASAVA_Build 12 72082572 3I TATTTTGTAC ---/AAT AATAATGTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AAT 2 3 191363 CASAVA_Build 12 72087581 7D ATACTCTATT TATTAAG/------- TAAATAGTGC 3070 het 3070 ref 35 20 13 5 TATTAAG 1 0 191364 CASAVA_Build 12 72089255 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1755 hom 28 6 12 10 T 15 14 191365 CASAVA_Build 12 72093859 1I TTGTTTTTCC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 7 8 191366 CASAVA_Build 12 72108177 3D ACTGGAGAAA ATT/--- ATTATATTTT 3070 het 3070 hom 29 10 19 1 ATT 2 1 191367 CASAVA_Build 12 72109356 3I GATGAAATCA ---/TTG TTGTCACTTG 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 TTG 1 2 191368 CASAVA_Build 12 72119603 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 2543 het 2543 ref 27 12 9 6 AT 7 6 191369 CASAVA_Build 12 72124212 1D ACCACCCCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2242 hom 26 7 12 7 A 13 12 191370 CASAVA_Build 12 72127348 1I TTCTACAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 10 11 191371 CASAVA_Build 12 72135654 1I TTTGCAAATA -/T TTTTGTCCAG 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 4 5 191372 CASAVA_Build 12 72139889 20D GAGTGATGTG ATTAGTCTAATACTTAGAGT/-------------------- ATTAGTCTAA 3070 het 3070 ref 42 24 18 6 ATTAGTCTAATACTTAGAGT 1 0 191373 CASAVA_Build 12 72142483 1D CTTTTTCATG T/- TTTTTTTTTC 2851 het 2851 ref 26 16 6 4 T 10 9 191374 CASAVA_Build 12 72142606 1D22M2D GTGATGATAG TTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTATT/-TTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTA-- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 30 20 12 4 N/A 0 0 191375 CASAVA_Build 12 72172236 1D CAAATCTTTC A/- GGCAGACTGT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 1 0 191376 CASAVA_Build 12 72172382 1D ATAAAATTGG A/- AATCAATAGC 3070 het 3070 ref 55 30 21 4 A 3 2 191377 CASAVA_Build 12 72176463 1I AATAAAACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2955 hom 24 8 13 3 A 12 13 191378 CASAVA_Build 12 72194079 4D ATATCAAATG ACAA/---- ACAAACACAT 3070 het 3070 ref 53 30 17 6 ACAA 2 1 191379 CASAVA_Build 12 72196427 4D TCTTATTTAT TAAA/---- TAAATATTTT 1708 het 231 hom 7 1 5 1 TAAA 2 1 191380 CASAVA_Build 12 72197159 1I CTGTTTATTG -/T TTTTTCTTCT 3070 hom 79 het 32 0 27 5 T 5 6 191381 CASAVA_Build 12 72197380 4D TTGCCCTTAG TTCT/---- TTGTCTATTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 TTCT 1 0 191382 CASAVA_Build 12 72197672 47D TATTATAAAC ATATATATATATATAAATATATATAAATATATATAAACATATATTAT/----------------------------------------------- AAATGTTCAT 3070 hom 96 het 30 0 33 0 ATATATATATATATAAATATATATAAATATATATAAACATATATTAT 1 0 191383 CASAVA_Build 12 72203514 1I ATAGGCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 526 hom 30 2 25 3 T 10 11 191384 CASAVA_Build 12 72207744 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 11 2 T 12 11 191385 CASAVA_Build 12 72214925 1I CTCAGACTCT -/C CTTTTTTCCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 1 2 191386 CASAVA_Build 12 72216523 1D TTTACAAGTT C/- ACACTCATTG 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 C 1 0 191387 CASAVA_Build 12 72226311 3I ATAGAGTAGT ---/GGA GGAGAGGAAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 GGA 1 2 191388 CASAVA_Build 12 72250751 1D AGTGTGAATG A/- AAAAACTCAT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 A 6 5 191389 CASAVA_Build 12 72251988 2I AAAAGTGTAT --/AA GAGACAATGA 3070 het 3070 ref 39 17 19 3 A 0 2 191390 CASAVA_Build 12 72256165 2D AGAAAATAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1668 hom 24 6 11 8 A 13 11 191391 CASAVA_Build 12 72260771 3D12M1D TTTAAGCTAT TAGTAGTAATTATGAT/---TAGTAATTATGA- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 11 13 5 N/A 0 0 191392 CASAVA_Build 12 72261079 1D GGTACTATTG A/- TACAGTAGGG 2505 het 2505 ref 30 9 10 11 A 1 0 191393 CASAVA_Build 12 72262288 1D ATAATAATTA T/- TTTTAACAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 5 4 191394 CASAVA_Build 12 72263130 1D ACAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 11 10 191395 CASAVA_Build 12 72270439 2D CATTATAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 9 A 13 11 191396 CASAVA_Build 12 72272014 1I ATGAAAGGTT -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 6 7 191397 CASAVA_Build 12 72277294 2D TATTTGCTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2171 hom 30 9 15 6 A 16 14 191398 CASAVA_Build 12 72281753 2D CCACCCACAC AT/-- ATGTTATCTC 3070 het 3070 hom 43 16 20 8 AT 2 1 191399 CASAVA_Build 12 72301279 2I AAGACAAATA --/TT TTAGAAAGGT 3070 het 3070 ref 49 21 25 3 T 2 4 191400 CASAVA_Build 12 72311469 5D TAGAACTTAA GGTAT/----- AATAATACAA 3070 het 3070 hom 27 8 18 1 GGTAT 1 0 191401 CASAVA_Build 12 72317014 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 9 10 191402 CASAVA_Build 12 72326387 1I TTCAAAATTA -/C CCCCCCCCAC 2773 het 2773 ref 36 19 11 6 C 8 9 191403 CASAVA_Build 12 72334956 1D AGAAAATGTT A/- AAAAAGAACA 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 A 6 5 191404 CASAVA_Build 12 72338480 3D GTCCTCCTTC CTT/--- CTTCTAAACT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 CTT 2 1 191405 CASAVA_Build 12 72343015 4D TGAATATGCT CAGA/---- CAGAGGCATT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 CAGA 2 1 191406 CASAVA_Build 12 72345981 8I AGAGAGAGGG --------/AGAGAGAC AGAGAGACAG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 AGAGAGAC 1 2 191407 CASAVA_Build 12 72347452 1D TTTTTTTGCC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 T 8 7 191408 CASAVA_Build 12 72349439 1D TTAATGAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 18 15 2 A 12 11 191409 CASAVA_Build 12 72357321 1I GTGGAAAGGA -/G GGGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 G 4 5 191410 CASAVA_Build 12 72361174 1D TTTTCTCTCT C/- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 C 1 0 191411 CASAVA_Build 12 72361460 2D GTTTCCTTTT TC/-- TTTCTCACTA 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 TC 1 0 191412 CASAVA_Build 12 72364309 2D AATTAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 13 11 191413 CASAVA_Build 12 72367300 1D CATTATTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 11 10 191414 CASAVA_Build 12 72379897 6D CTAGGAGTGA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3003 het 3003 ref 30 15 11 6 GT 10 7 191415 CASAVA_Build 12 72383839 1D AGGAACAAAC A/- AAGCCTCCAA 3070 het 2589 hom 18 7 11 0 A 3 2 191416 CASAVA_Build 12 72384689 2I AATGGAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 1792 het 1792 ref 22 11 6 5 A 10 12 191417 CASAVA_Build 12 72386672 1D TTGGAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 2658 het 2658 ref 19 8 8 3 T 13 12 191418 CASAVA_Build 12 72389275 2D TCAATTGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 28 3 13 12 T 15 13 191419 CASAVA_Build 12 72392762 5D GCAAGACTGA GAAAT/----- GAGTCATTGA 3070 het 3070 ref 23 14 9 3 GAAAT 1 0 191420 CASAVA_Build 12 72396028 4D TGGGGACATC TTTG/---- TTTGTTAGTT 3070 het 3070 ref 41 21 18 5 TTTG 2 1 191421 CASAVA_Build 12 72397270 1D ATTTTCACTA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 T 7 6 191422 CASAVA_Build 12 72398533 3D GTATAGGAGC AGA/--- AGAAGCTCCT 3070 het 3070 hom 26 12 12 5 AGA 2 1 191423 CASAVA_Build 12 72408902 2I ACTATATATA --/TG TATTTATTAT 2280 hom 21 het 10 0 8 2 TG 0 1 191424 CASAVA_Build 12 72409206 1D AGAATAAAAA T/- ATCTCTGAAT 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 T 1 0 191425 CASAVA_Build 12 72411674 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 6 191426 CASAVA_Build 12 72465836 1D AAGGTTGAAA C/- CGACTTCCTT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 2 1 191427 CASAVA_Build 12 72483960 1D CAATCTTTGC T/- TTTTTTGCCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 6 191428 CASAVA_Build 12 72500951 1I TAAAAAAAAA -/C AAATTAGTTA 3070 hom 86 het 35 0 29 6 C 0 1 191429 CASAVA_Build 12 72504416 1D TTAAAATGTT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 8 7 191430 CASAVA_Build 12 72527930 3D TAAATTGCAA ATT/--- ATTATATATA 3070 hom 45 het 17 0 16 4 ATT 2 1 191431 CASAVA_Build 12 72535694 1I AATTTAATTC -/T TTTTTTATGG 3070 hom 141 het 54 0 48 6 T 6 7 191432 CASAVA_Build 12 72559456 1I TAATGGAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 9 10 191433 CASAVA_Build 12 72565704 1I CAGTTTATCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 9 191434 CASAVA_Build 12 72574298 5D TTGTTTTCCT GAAGA/----- GTAGAGGATA 3070 hom 63 het 25 0 22 6 GAAGA 1 0 191435 CASAVA_Build 12 72578829 1I TCTCCTTTTT -/C TTTTTTAACC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 0 1 191436 CASAVA_Build 12 72601819 1D ATGCACATGC T/- TAACGATGCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 2 1 191437 CASAVA_Build 12 72609798 1D GCTTTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 14 13 191438 CASAVA_Build 12 72610990 1I TTGTTCTTTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 8 9 191439 CASAVA_Build 12 72620724 2D AGCAACTGAC TT/-- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 10 8 191440 CASAVA_Build 12 72639950 1D AATGCAAGTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 8 191441 CASAVA_Build 12 72669797 7D ACTCCGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 13 0 9 5 A 17 10 191442 CASAVA_Build 12 72675290 1D TAACACATAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 8 7 191443 CASAVA_Build 12 72725490 1D AAAAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 16 6 A 14 13 191444 CASAVA_Build 12 72741744 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 2778 hom 16 6 9 1 A 7 8 191445 CASAVA_Build 12 72760174 2D AAAAGATAAG AA/-- AAATACTAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 5 3 191446 CASAVA_Build 12 72775033 1D TTTTTAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 26 3 16 7 T 17 16 191447 CASAVA_Build 12 72821118 1I CTCTCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 946 hom 31 2 23 6 T 11 12 191448 CASAVA_Build 12 72834897 1D CAAACTGTAA T/- TTTTTTTTTT 1027 het 1027 ref 19 10 4 5 T 17 16 191449 CASAVA_Build 12 72851935 1D GTGCTCATTG A/- AAAAAAAAAA 2230 het 2230 ref 32 18 6 8 A 17 16 191450 CASAVA_Build 12 72922966 1I CTGTGGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 T 13 14 191451 CASAVA_Build 12 72926648 2D CTTCCTCCCT TC/-- TCTGCCTTTT 3070 het 3070 hom 47 24 23 0 TC 2 1 191452 CASAVA_Build 12 72929377 4D TTTCTTATTG TGTA/---- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 TGTA 1 0 191453 CASAVA_Build 12 72929741 2I TCAACACAAG --/TA TATAATTAAG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 TA 2 3 191454 CASAVA_Build 12 72955387 1D TTTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 11 10 191455 CASAVA_Build 12 72966686 2D TCTGTCACAC AT/-- GATTTTCCTC 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 AT 1 0 191456 CASAVA_Build 12 73002555 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 492 hom 20 2 13 5 A 14 13 191457 CASAVA_Build 12 73006417 1D TAGAACAGGG A/- AAAAATAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 6 5 191458 CASAVA_Build 12 73030230 1D ATTTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1452 het 1452 ref 49 35 5 10 A 13 12 191459 CASAVA_Build 12 73037156 1I ACAACTATGA -/T TTTTTTTTCT 1707 het 1495 hom 10 4 5 1 T 8 9 191460 CASAVA_Build 12 73056271 1D GTAGGATGGA T/- TTTTTACTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 6 5 191461 CASAVA_Build 12 73058273 1D AAAGTAAAGG A/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 53 24 23 6 A 7 6 191462 CASAVA_Build 12 73059762 1D GATAATATGT A/- AAAAAAACCA 3070 hom 79 het 30 0 27 4 A 8 7 191463 CASAVA_Build 12 73068328 1D GACAAAGATT A/- ACAGAAATAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 2 1 191464 CASAVA_Build 12 73076991 1D TTTTAGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 11 10 191465 CASAVA_Build 12 73081156 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3000 hom 41 15 17 11 A 9 8 191466 CASAVA_Build 12 73088626 1D GTCAGGAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2049 hom 30 7 16 8 T 10 9 191467 CASAVA_Build 12 73102851 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1697 hom 33 9 17 7 T 17 16 191468 CASAVA_Build 12 73103826 1D GTCCCTACTA C/- CCCCTGCAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 5 4 191469 CASAVA_Build 12 73109406 16I GTCTCAAAAA ----------------/AGAAAAAAACCAAAAC AGAAAAAAAC 2028 het 1546 hom 16 5 5 6 AGAAAAAAACCAAAAC 1 2 191470 CASAVA_Build 12 73120073 1I AAATTATTAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 7 191471 CASAVA_Build 12 73126093 1I AGAGAAAAAA -/G CATGGCTCTA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 0 1 191472 CASAVA_Build 12 73126520 2I TATATAACGT --/TA TATATATATA 1536 het 1536 ref 10 4 5 1 TA 7 8 191473 CASAVA_Build 12 73126903 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2709 het 186 hom 14 2 9 3 T 15 14 191474 CASAVA_Build 12 73128313 1D TCAATAATTG T/- TCATTGATCA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 2 1 191475 CASAVA_Build 12 73143379 2D TGAATTTGAG TT/-- TATTATTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 T 3 1 191476 CASAVA_Build 12 73166813 1I TCAAGGGAGG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 8 9 191477 CASAVA_Build 12 73170205 1I TATTGCTAGG -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 6 7 191478 CASAVA_Build 12 73190420 1D CTAAAGAATT A/- AAAACTTCCT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 5 4 191479 CASAVA_Build 12 73196234 4D CTCTATTAAT AGAC/---- AGAACAATGG 3070 het 3070 ref 45 28 15 4 AGAC 1 0 191480 CASAVA_Build 12 73199385 2D AAGGCAAAGT AA/-- AAATCCCAGC 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 A 5 3 191481 CASAVA_Build 12 73202109 10D TGTGTGTGTA TGTGTGTGTG/---------- CGTGTGTGGG 3070 het 3070 hom 53 21 25 8 TG 5 0 191482 CASAVA_Build 12 73205418 1D GTCCCTTATT C/- CACCTATATT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 C 2 1 191483 CASAVA_Build 12 73205827 1D CAATTTACAC T/- TTATTTTATT 3070 het 3070 ref 40 18 16 7 T 3 2 191484 CASAVA_Build 12 73206146 2I CTCTTTTCTC --/TT GTCTTCTTCC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 0 2 191485 CASAVA_Build 12 73220121 1D TTGGCCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 29 0 21 8 T 12 11 191486 CASAVA_Build 12 73222615 1D ATCTTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 59 26 20 13 A 11 10 191487 CASAVA_Build 12 73224365 1D TTGCTCCAAA T/- TATGTGAATC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 2 1 191488 CASAVA_Build 12 73225895 4D AACAGATGAA AAAG/---- AAAGACTCTG 3070 het 3070 hom 37 13 19 10 AAAG 2 1 191489 CASAVA_Build 12 73226532 3I GTGTTGCCTC ---/CTT GTCTCCCAGT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 CTT 0 1 191490 CASAVA_Build 12 73227324 2I GGAAGAAGAC --/AG AGATTTTAAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AG 1 2 191491 CASAVA_Build 12 73229155 1I AGGAAAAGGA -/T TTAAAGCTAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 3 191492 CASAVA_Build 12 73230986 1D TAAATTTACC A/- AAAGGAAATT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 4 3 191493 CASAVA_Build 12 73232156 1I GATTCTCAGG -/C CTTTATCCTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 1 2 191494 CASAVA_Build 12 73235110 10I TGTAATTAGA ----------/CCCCCTGAGT CTATCTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 CCCCCTGAGT 0 1 191495 CASAVA_Build 12 73240228 2I AAACCATCTC --/TT TGTGAATACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 3 191496 CASAVA_Build 12 73242233 4I TTGGTGAAAC ----/AGAA AGAATATTAT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 AGAA 1 2 191497 CASAVA_Build 12 73248965 2I TTCTTTTTTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 9 11 191498 CASAVA_Build 12 73249627 1D19M2I CCTGAATGGA TTTTTTTTTTTAACAATCAC--/-TTTTTTTTTTAACAATCACTT TTCAAAATAC 3070 het 1255 hom 34 6 18 18 N/A 0 0 191499 CASAVA_Build 12 73252559 1D28M1D GCATCACAGT AGAAAGTGATCTTTGGAAGTTCTTACGTGT/-GAAAGTGATCTTTGGAAGTTCTTACGTG- TTTTTTACTG 3070 het 3070 hom 56 26 26 9 N/A 0 0 191500 CASAVA_Build 12 73263535 2I AACTTTGTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2719 hom 23 7 10 6 T 14 16 191501 CASAVA_Build 12 73273046 1D TATGTTTAAC T/- TTATAAGAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 3 2 191502 CASAVA_Build 12 73275795 25D TAATAATTCA TCACTAACTAACATTCATCACTAAC/------------------------- CTCTCTGGCT 3070 het 3070 ref 48 34 21 5 TCACTAACTAACATTCATCACTAAC 1 0 191503 CASAVA_Build 12 73277437 1D TTTTTAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 25 1 22 2 A 11 10 191504 CASAVA_Build 12 73279280 1D TTATTTAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 8 191505 CASAVA_Build 12 73283064 2D AAAGACAAAG GC/-- TCAATTCAAC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 GC 1 0 191506 CASAVA_Build 12 73284083 14D ATTAAATTCC AGGGCACTGAAAAA/-------------- AGAATTTAAT 3070 hom 105 het 37 0 36 4 AGGGCACTGAAAAA 1 0 191507 CASAVA_Build 12 73285292 1D AACACTTGTC T/- TTTGAATATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 4 3 191508 CASAVA_Build 12 73291581 1I ATTCATTAGA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 7 8 191509 CASAVA_Build 12 73294219 1D TGAAACTAGA C/- TAAAGGTCAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 C 1 0 191510 CASAVA_Build 12 73296396 1I GTTACAAGAA -/T TTTTTTCTTG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 6 7 191511 CASAVA_Build 12 73297202 1D TGGACAATAT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 A 7 6 191512 CASAVA_Build 12 73298163 1D CTAAAGGCAA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 T 8 7 191513 CASAVA_Build 12 73298580 7D TTAACCATAT TAAAGCA/------- TAAAGCATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 5 TAAAGCA 2 1 191514 CASAVA_Build 12 73300573 4I TTGCTTTCTC ----/TCTA TCTCTCTCTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 TCTA 0 1 191515 CASAVA_Build 12 73301854 1D GTATTTTTAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 8 191516 CASAVA_Build 12 73306889 1I GATGGGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 494 hom 40 2 29 9 T 12 13 191517 CASAVA_Build 12 73308986 2I CTTCTTCCAG --/TT TTCTTAAAGT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 2 4 191518 CASAVA_Build 12 73315496 3I ACTCCTTTAA ---/TTC TCCTCTTCTC 2307 het 2307 ref 21 13 6 2 TTC 0 1 191519 CASAVA_Build 12 73318253 1D CAATAGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 18 9 A 12 11 191520 CASAVA_Build 12 73320105 1D AGCTTTCTTC A/- TTGATTTCAA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 1 0 191521 CASAVA_Build 12 73322993 1I TATATTGGTG -/T CCTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 0 1 191522 CASAVA_Build 12 73323331 4D TCCTTTTCCC TAGT/---- TAATCTGGCT 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 TAGT 1 0 191523 CASAVA_Build 12 73326059 3I CTCTAAATAA ---/AAT AATAATAATA 2308 hom 12 het 13 0 5 8 AAT 5 6 191524 CASAVA_Build 12 73329353 1D CTTAATCAAG A/- ATGTGGGATG 3070 hom 81 het 32 0 27 6 A 2 1 191525 CASAVA_Build 12 73480686 4I ATTAGCAATG ----/TAGT TAGTAACAAC 3070 hom 144 het 53 0 47 6 TAGT 1 2 191526 CASAVA_Build 12 73483508 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1573 het 1573 ref 26 10 5 11 A 15 14 191527 CASAVA_Build 12 73534458 1I ATATTTCCCC -/T ATCAGAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 0 1 191528 CASAVA_Build 12 73547991 5I GTCCTCAGTG -----/TTTAT TTTATTTTAT 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 TTTAT 2 3 191529 CASAVA_Build 12 73575329 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 13 12 191530 CASAVA_Build 12 73588867 30D GCTTTTATCC GAGGTTGAGACAGCTCCTGGTGAGACCTCA/------------------------------ GAGGTTGAGA 3070 het 3070 ref 34 18 19 5 GAGGTTGAGACAGCTCCTGGTGAGACCTCA 2 1 191531 CASAVA_Build 12 73595551 1I AGTACAAATG -/A ATGTTCTTTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 2 191532 CASAVA_Build 12 73601043 3D AACCATCACA CAT/--- CATGACTGAA 3070 het 3070 ref 76 38 30 8 CAT 2 1 191533 CASAVA_Build 12 73604324 1I TAAAATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 10 191534 CASAVA_Build 12 73605942 1D AAGAAATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 31 2 12 17 A 13 12 191535 CASAVA_Build 12 73613870 7D GCAATGACCA TTTTCAC/------- TTTGACTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 16 6 TTTTCAC 1 0 191536 CASAVA_Build 12 73615505 1I CTTACTATGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 9 10 191537 CASAVA_Build 12 73623769 1I GTGTGAGAAC -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 6 7 191538 CASAVA_Build 12 73626084 1D TCTGGAAATG A/- TTAATGAATA 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 A 1 0 191539 CASAVA_Build 12 73628417 4D TGTGTGAGTC AGTG/---- AGTGAGTGAT 3070 het 3070 ref 53 25 22 7 AGTG 3 2 191540 CASAVA_Build 12 73628494 5D AACTGTACAC TTACA/----- TTACATTAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 5 TTACA 2 1 191541 CASAVA_Build 12 73635561 1D ATGTGAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 32 2 27 3 T 11 10 191542 CASAVA_Build 12 73639801 1D TGCTCACTAA T/- CAAAACTGCT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 1 0 191543 CASAVA_Build 12 73648256 1D TCTATCAAGG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 A 8 7 191544 CASAVA_Build 12 73654013 1I GTGCAAATTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 10 191545 CASAVA_Build 12 73670498 1D TGCATGCTGG C/- CATTCTTAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 C 2 1 191546 CASAVA_Build 12 73689304 1D TGTTACTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 14 12 T 12 11 191547 CASAVA_Build 12 73691708 1D TTTGAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 47 1 37 10 T 12 11 191548 CASAVA_Build 12 73693323 1D TGAACACAAG C/- TTTTATCACA 3070 het 3070 hom 47 23 21 3 C 1 0 191549 CASAVA_Build 12 73709125 1D TAAAGAAAGG T/- TTCAGGAACC 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 3 2 191550 CASAVA_Build 12 73710536 2D AAATACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 2784 hom 31 9 13 10 AC 10 9 191551 CASAVA_Build 12 73718054 1D AACCAATCTG A/- AAAAAAAATA 1867 het 1867 ref 13 8 4 2 A 9 8 191552 CASAVA_Build 12 73718131 1I GTAAAAAGAT -/C CCCCCCCCAC 2800 het 2800 ref 22 9 8 5 C 8 9 191553 CASAVA_Build 12 73733319 2I ACTCCCACCC --/CT CAACTACACT 3070 hom 129 het 52 0 44 8 CT 0 1 191554 CASAVA_Build 12 73735374 1D ATATTGAAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 9 191555 CASAVA_Build 12 73760340 3D AGCATTTTTA CAT/--- CAAGTTTGAG 3070 hom 99 het 34 0 34 2 CAT 1 0 191556 CASAVA_Build 12 73761143 2D CCTTCCTGTA AC/-- GCTATACACT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 AC 1 0 191557 CASAVA_Build 12 73762199 6D AACTTTTAGA AGTGCT/------ AGTGCTATAG 3070 hom 75 het 27 0 26 5 AGTGCT 2 1 191558 CASAVA_Build 12 73763156 15D ATTTTCTTTT ATCTGTTATTTCCAA/--------------- ATTTTCTAAA 3070 het 3070 ref 20 13 11 0 ATCTGTTATTTCCAA 1 0 191559 CASAVA_Build 12 73765082 1I AGGAATTCAC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 8 9 191560 CASAVA_Build 12 73768044 1I TCAGTTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 10 11 191561 CASAVA_Build 12 73780056 4I AAAATGTTTT ----/AGAG AGAGAAGGCT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AG 2 4 191562 CASAVA_Build 12 73799418 2I GGATATTTTC --/TG TCTCTAGTAG 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 TG 0 1 191563 CASAVA_Build 12 73801995 9D CTTGAACACT GACTCAGTG/--------- GACTCAGTGT 3070 hom 111 het 44 0 37 10 GACTCAGTG 2 1 191564 CASAVA_Build 12 73805370 1I ACAGATTTTG -/A AAAATAATCT 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 A 4 5 191565 CASAVA_Build 12 73848155 1I CCTAAAACTG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 6 7 191566 CASAVA_Build 12 73854183 1I CAGTTCTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 10 11 191567 CASAVA_Build 12 73862387 1D CTGGTTAACA C/- GGTGAAACCC 3070 het 804 hom 10 2 7 1 C 1 0 191568 CASAVA_Build 12 73876845 1I ACATGCAATT -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 A 6 7 191569 CASAVA_Build 12 73882843 1I CCTATGTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 16 9 T 12 13 191570 CASAVA_Build 12 73885418 1D TTTGACCTTG T/- TTTAATCTCA 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 T 4 3 191571 CASAVA_Build 12 73924105 5D AATAAGTTGA TTAAT/----- TTAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TTAAT 1 0 191572 CASAVA_Build 12 73927563 1I GTAAAAAAAA -/C AAAAGACTAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 C 0 1 191573 CASAVA_Build 12 73932476 1I TATCCTGTTT -/G GGGGGTCTCC 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 G 5 6 191574 CASAVA_Build 12 73932931 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 8 9 191575 CASAVA_Build 12 73937275 2D CATTTGCACA CT/-- CTCAGTCTGT 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 CT 2 1 191576 CASAVA_Build 12 73939115 1I TTTGTCCAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 9 10 191577 CASAVA_Build 12 73948899 4D TTTAATGTTA TATT/---- TTAAAAAATA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 TATT 1 0 191578 CASAVA_Build 12 73952738 1I CTACATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 842 hom 40 3 32 5 T 12 13 191579 CASAVA_Build 12 73957258 1D GTAGCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 31 2 16 13 T 15 14 191580 CASAVA_Build 12 73976257 2I GTAACAGTGT --/TA TGTGTGTATA 3070 hom 97 het 43 0 33 10 TA 0 1 191581 CASAVA_Build 12 74009533 1I ATTTCCCTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 126 het 53 0 43 10 T 9 10 191582 CASAVA_Build 12 74013307 2I ACACACACAC --/AT ATATATGTGT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 AT 3 4 191583 CASAVA_Build 12 74018880 4D CTCCCACTTA TAAG/---- TGAGAACATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TAAG 1 0 191584 CASAVA_Build 12 74023011 1I ATATAATAGA -/T TTTTGCATAT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 4 5 191585 CASAVA_Build 12 74032638 1D TTAGCCAGAT G/- ACAGAGACAG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 G 1 0 191586 CASAVA_Build 12 74034214 1D AGAAAAAAAA G/- GGGGGGGGGT 3070 het 43 hom 19 1 10 8 G 10 9 191587 CASAVA_Build 12 74061662 3D TTCTTAAGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 1352 het 324 hom 18 4 5 9 T 19 16 191588 CASAVA_Build 12 74064898 1I CTAAATATTT -/G TCCCCTCCAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 0 1 191589 CASAVA_Build 12 74080965 2I AGCATAATTT --/TA TATATATATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 6 7 191590 CASAVA_Build 12 74085692 8D CGCAGTTTGT CAGTTTGC/-------- CAGTTTGCCA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 CAGTTTGC 2 1 191591 CASAVA_Build 12 74086198 1I GTCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 9 10 191592 CASAVA_Build 12 74096444 1D ATCAGCATGT G/- GGAGAGTGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 3 2 191593 CASAVA_Build 12 74097834 1I TGAAACTATA -/T TTACATATAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 3 191594 CASAVA_Build 12 74102029 8D ATTTTTAAAT TTTATTTC/-------- TTTATTTCTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TTTATTTC 2 1 191595 CASAVA_Build 12 74103082 3I AATGGATTGG ---/ACA ACAAGAAAAA 3070 hom 151 het 53 0 51 2 ACA 1 2 191596 CASAVA_Build 12 74104658 1D ATGCCCAGCT A/- ATTTTTTTTT 2001 het 217 hom 12 1 7 4 A 2 1 191597 CASAVA_Build 12 74107269 1I TATGTAACTA -/T TTTAATGAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 4 191598 CASAVA_Build 12 74108565 2D GGTAGAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AT 6 5 191599 CASAVA_Build 12 74111276 1D AAAAAGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 330 hom 29 1 22 7 A 13 12 191600 CASAVA_Build 12 74112576 1D TGAGGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 37 0 34 3 A 13 12 191601 CASAVA_Build 12 74112773 1D CTTTGCTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 10 9 191602 CASAVA_Build 12 74113454 1D ATGGGAGTTC T/- TTTTCAAAGA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 5 4 191603 CASAVA_Build 12 74127173 1I ATGCTGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 568 hom 37 2 22 13 A 13 14 191604 CASAVA_Build 12 74127419 1D TATAAACACA T/- TATCTGAGCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 191605 CASAVA_Build 12 74135149 1I CCAGCTTCTT -/G TAGCCCCAGG 3070 hom 129 het 53 0 44 9 G 0 1 191606 CASAVA_Build 12 74144137 1I GGATTTACTG -/A CTTTTTGATG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 191607 CASAVA_Build 12 74144926 1D ATCCCTTGTC T/- TTTTTTTATC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 8 7 191608 CASAVA_Build 12 74155871 13I ACTTTGGGAG -------------/GCAGGCGGATCAC GCAGTCAAGA 3070 hom 27 het 11 0 10 2 GCAGGCGGATCAC 0 1 191609 CASAVA_Build 12 74160070 3D ACCACTGTAA GCT/--- CCTTGGGGCC 3070 hom 141 het 53 0 47 7 GCT 1 0 191610 CASAVA_Build 12 74163143 1D TCGTGGTGCT A/- CAGATGAACC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 1 0 191611 CASAVA_Build 12 74166364 1D CCTGCCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 11 10 191612 CASAVA_Build 12 74166855 3I GCTGGGGTCT ---/GGG GGTGGGGGTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 2 5 191613 CASAVA_Build 12 74170629 2D AAAAACAACA AC/-- AAAAAAAAAC 889 het 212 hom 6 1 3 3 AC 1 0 191614 CASAVA_Build 12 74171223 4D AAAAATGATA GATT/---- GTTTATATAA 3070 hom 84 het 31 0 29 6 GATT 1 0 191615 CASAVA_Build 12 74176619 1D TCCCAGTATG T/- TTTTTTACCA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 7 6 191616 CASAVA_Build 12 74177943 1D AAATATATAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 8 191617 CASAVA_Build 12 74178432 4I CTCACATTCT ----/AATA AATATTTAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AATA 1 2 191618 CASAVA_Build 12 74180538 4D ATATTCAATG AATT/---- AATTCATTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AATT 2 1 191619 CASAVA_Build 12 74186664 1D TGCCTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 45 4 25 16 A 17 16 191620 CASAVA_Build 12 74210649 1I GTCTCTACAG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 7 8 191621 CASAVA_Build 12 74242404 1I TAACATAGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 8 9 191622 CASAVA_Build 12 74252802 1D GTAACACAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 9 8 191623 CASAVA_Build 12 74256580 3I ACTCCATCTC ---/AAA AAAAATAATA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 5 8 191624 CASAVA_Build 12 74263251 1D GTGCCATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 A 12 11 191625 CASAVA_Build 12 74265552 1D GTGAATCATC T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 122 het 43 0 41 2 T 7 6 191626 CASAVA_Build 12 74276827 3I TGTAGGATTC ---/ACA ACAACAGCTT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 ACA 2 3 191627 CASAVA_Build 12 74283930 1D ATTCCTAGGC A/- AAAAAAATGG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 A 8 7 191628 CASAVA_Build 12 74305969 4I AAGTAAAATA ----/AAAC AAACAATCAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AAAC 1 2 191629 CASAVA_Build 12 74306317 5D AATTCACAGG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 22 0 14 10 A 16 11 191630 CASAVA_Build 12 74307598 1D TTTCTTAAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 9 8 191631 CASAVA_Build 12 74313255 2D TTGTGATCCG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 24 het 23 0 14 9 C 12 10 191632 CASAVA_Build 12 74316460 4D CCTGATTGGC CTTT/---- CTGCTTCCAG 3070 hom 117 het 42 0 38 5 CTTT 1 0 191633 CASAVA_Build 12 74318742 5I TTCGGGTTCC -----/TGCTG TGCTGTTTCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TGCTG 1 2 191634 CASAVA_Build 12 74318903 1I TAGAGTAGCT -/G GGGATTACAG 3070 hom 99 het 35 0 31 4 G 3 4 191635 CASAVA_Build 12 74320817 1I AAAACTTATA -/G GTACATTATA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 1 2 191636 CASAVA_Build 12 74345321 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1358 het 1358 ref 14 9 4 2 A 15 14 191637 CASAVA_Build 12 74374149 1I GAAATGGCAG -/A AATCAATGAG 3070 hom 112 het 42 0 32 10 A 2 3 191638 CASAVA_Build 12 74380557 1I ATTTTCTGGG -/A ATAGGTTAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 191639 CASAVA_Build 12 74390774 2D TCTTTAAACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 36 4 15 18 A 12 10 191640 CASAVA_Build 12 74392732 1D AATGGCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 A 11 10 191641 CASAVA_Build 12 74397177 1I GCTTAATATA -/T TTTTTTACAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 6 7 191642 CASAVA_Build 12 74404102 2D CTACTCTGTA AT/-- ATATATATTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 AT 5 4 191643 CASAVA_Build 12 74413468 1I TTTTGCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 38 1 35 2 T 10 11 191644 CASAVA_Build 12 74422512 1D TCTGTGAAGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 40 0 34 7 A 9 8 191645 CASAVA_Build 12 74427300 1I ATGGATTTTT -/A TAAAAAAAAC 3070 hom 11 het 15 1 14 0 A 0 1 191646 CASAVA_Build 12 74429612 30D CCCAAATGCT TGGGGAGACTGATTTGAGTAACAATAAAAC/------------------------------ TCTGGTCTCC 1798 het 1798 ref 8 6 4 2 TGGGGAGACTGATTTGAGTAACAATAAAAC 1 0 191647 CASAVA_Build 12 74433398 4D GGCATACAAC TAAG/---- TAAGACAGCC 3070 het 3070 hom 43 15 22 7 TAAG 2 1 191648 CASAVA_Build 12 74441969 1I GGAAAGGCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 9 10 191649 CASAVA_Build 12 74454861 1I GAGTGATTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 8 9 191650 CASAVA_Build 12 74457223 1D TTGGATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2945 hom 35 9 17 9 A 15 14 191651 CASAVA_Build 12 74464387 1I CTCCAGCCCC -/A CTCCAGGACA 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 A 0 1 191652 CASAVA_Build 12 74475192 1I GACTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2758 het 2758 ref 25 11 7 7 A 10 11 191653 CASAVA_Build 12 74476534 1I ATTTGGACAA -/C TACTCCATCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 0 1 191654 CASAVA_Build 12 74479991 4D TGAATGGTCT GTAA/---- GTGTTTGTGT 3070 het 3070 ref 36 19 15 4 GTAA 1 0 191655 CASAVA_Build 12 74484576 19I AAATATTTTT -------------------/GACTAAATAAATAAATGAA GAGTAAATAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 GACTAAATAAATAAATGAA 0 1 191656 CASAVA_Build 12 74484682 3I GATAACAACC ---/CAA AACAAGGTTG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CAA 0 1 191657 CASAVA_Build 12 74486365 1D AAAATAGAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 14 13 8 A 10 9 191658 CASAVA_Build 12 74490354 1D CCTTATAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 10 9 191659 CASAVA_Build 12 74519455 5D TGTGATTACT TAACC/----- TAACAAAGTA 3070 het 3070 hom 49 23 24 6 TAACC 1 0 191660 CASAVA_Build 12 74519914 1I TTTTTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 T 13 14 191661 CASAVA_Build 12 74522083 1I CTTACACAAG -/A AAATGCATTT 3070 het 3070 hom 54 23 28 3 A 3 4 191662 CASAVA_Build 12 74522759 1D TAACAAATAG T/- TACTGAGCAC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 2 1 191663 CASAVA_Build 12 74530327 6I TTGTTGTTGT ------/TTTTGG TTTTGGTTTC 1066 het 1066 ref 31 12 6 13 TTTTGG 1 2 191664 CASAVA_Build 12 74530342 2D GTTTCTTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 551 het 551 ref 26 13 2 11 T 14 12 191665 CASAVA_Build 12 74537582 1D11M1I AAGGCCTTTG TTTTTTCTTTTC-/-TTTTTCTTTTCT TTTTTTTTTT 1836 het 1681 hom 40 13 15 12 N/A 0 0 191666 CASAVA_Build 12 74553706 1I TAACTGTGGC -/A AAGGGGAGTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 2 3 191667 CASAVA_Build 12 74554158 1D TCTTATTCAA T/- TTTTTTTTTT 1339 het 1339 ref 22 12 4 6 T 17 16 191668 CASAVA_Build 12 74565378 1D TGTCTAAGGT A/- AAAAAAAAAA 1332 het 1332 ref 38 24 3 11 A 15 14 191669 CASAVA_Build 12 74575009 6D AATAAAATTA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 2469 hom 28 6 19 3 AAT 5 3 191670 CASAVA_Build 12 74579516 1D ATTATAGTAT A/- AAACATAAAC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 4 3 191671 CASAVA_Build 12 74583202 2I CATGTGTACA --/TG TGTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 TG 4 5 191672 CASAVA_Build 12 74602629 1D GGATTAAAAG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 7 6 191673 CASAVA_Build 12 74614201 1D CCAACATGGA G/- TAACCCCATC 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 G 1 0 191674 CASAVA_Build 12 74636476 1I CCCTGTATAC -/T TTTTTTTTAT 2319 het 2319 ref 18 8 7 3 T 8 9 191675 CASAVA_Build 12 74638269 3D CATGAGCCAT TAA/--- TAATACCCAA 3070 het 3070 ref 39 18 19 3 TAA 2 1 191676 CASAVA_Build 12 74653739 1D TACATATGAC T/- TTTTTTTTTT 2915 het 2915 ref 37 20 7 10 T 12 11 191677 CASAVA_Build 12 74657285 1D TCTGTCACCC A/- AGGCTGGAGG 1715 het 4 hom 17 0 6 11 A 2 1 191678 CASAVA_Build 12 74662990 1D ATCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 T 10 9 191679 CASAVA_Build 12 74676994 10D TTGGAGATCC AAGGATGATG/---------- AAGCACATGG 3070 het 3070 ref 36 21 16 2 AAGGATGATG 1 0 191680 CASAVA_Build 12 74682924 1I TTAAACCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 12 13 191681 CASAVA_Build 12 74691510 1I CAAATGGCAC -/G CTGGTCCAGG 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 G 0 1 191682 CASAVA_Build 12 74701840 1D TCTTGATACC T/- TTTTTTTTTA 2027 het 2027 ref 18 8 5 5 T 10 9 191683 CASAVA_Build 12 74705395 1D AAAAATGGTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 9 8 191684 CASAVA_Build 12 74709833 1D ACAAGCATTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 9 8 191685 CASAVA_Build 12 74713815 5I AACTTTGCTC -----/TTAAT TTGTTATTTC 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 TTAAT 0 1 191686 CASAVA_Build 12 74715062 2I GTGTAGTCTA --/AG AGAAATCAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 AG 1 2 191687 CASAVA_Build 12 74731378 1I ATAGAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2312 het 2312 ref 25 14 8 3 A 11 12 191688 CASAVA_Build 12 74734060 1D TAAATGATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 T 9 8 191689 CASAVA_Build 12 74745580 1D AGAGCAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 189 hom 28 1 14 13 A 14 13 191690 CASAVA_Build 12 74747525 1I GACGTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 10 10 A 10 11 191691 CASAVA_Build 12 74752008 1D ACTAGCCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 11 A 13 12 191692 CASAVA_Build 12 74753549 1D ACAATAAGTC T/- TTTATAAAGC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 4 3 191693 CASAVA_Build 12 74761126 1I AAATAAATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 7 15 4 T 9 10 191694 CASAVA_Build 12 74766178 1I ATTATTTGCC -/T TTCCCACTCT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 2 3 191695 CASAVA_Build 12 74770481 1I ACTCCATCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2860 hom 18 7 9 2 A 10 11 191696 CASAVA_Build 12 74770834 1I GGCAGTGTTA -/T TGTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 1 2 191697 CASAVA_Build 12 74781095 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2670 het 1270 hom 21 8 8 5 T 14 13 191698 CASAVA_Build 12 75045842 1D TATAAATCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 737 hom 36 3 27 6 A 10 9 191699 CASAVA_Build 12 75049718 1I ACACATAGGG -/C CAGGTAGGCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 1 2 191700 CASAVA_Build 12 75053870 1D TTCTTGGGCC A/- AAAAAAAAAA 1817 het 1817 ref 35 24 5 6 A 15 14 191701 CASAVA_Build 12 75054205 1I AATAGACAGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 8 9 191702 CASAVA_Build 12 75057040 1I TCATAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 T 10 11 191703 CASAVA_Build 12 75061534 1I TAATGCACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 98 het 39 0 32 7 T 9 10 191704 CASAVA_Build 12 75063159 4I ATAAAAAAAT ----/AATC AATTCCTTTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AATC 0 1 191705 CASAVA_Build 12 75068477 1D CCAGAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 7 6 191706 CASAVA_Build 12 75069503 1I TATTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 18 0 15 3 A 12 13 191707 CASAVA_Build 12 75075626 8I CCATCTCTAC --------/AAAAAATT AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 AAAAAATT 1 2 191708 CASAVA_Build 12 75089997 2I AAATTTTTTT --/AA AAAAAGAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 5 7 191709 CASAVA_Build 12 75090046 1I AAAGAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 18 0 12 6 A 12 13 191710 CASAVA_Build 12 75092092 2D ACACCTTCAC TA/-- GTTGTATAAA 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 TA 1 0 191711 CASAVA_Build 12 75117273 5D GTAAGAGAGC AGAGA/----- AAAGACAGTT 3070 hom 113 het 40 0 38 4 AGAGA 1 0 191712 CASAVA_Build 12 75142559 1I AACAGAACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 36 2 29 5 A 10 11 191713 CASAVA_Build 12 75150593 1D ACTTAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 10 9 191714 CASAVA_Build 12 75159134 3I GGGCCATGTC ---/CTT CTGCTGATCA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 CTT 0 1 191715 CASAVA_Build 12 75160128 1D AGGGTATATA T/- TTTTTATATA 2221 het 489 hom 6 1 5 0 T 6 5 191716 CASAVA_Build 12 75161123 19D TTTTTTTCTG TTGCTTTAGGCAAAGATTT/------------------- TTGCTTAAGG 3070 het 3070 hom 39 17 24 1 TTGCTTTAGGCAAAGATTT 1 0 191717 CASAVA_Build 12 75167627 2D ATGAAATGAC AT/-- AAAATAATCA 3070 het 3070 hom 60 27 28 7 AT 1 0 191718 CASAVA_Build 12 75168851 1I TTCCCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 16 9 T 11 12 191719 CASAVA_Build 12 75171965 2D GGGATGAAAC TG/-- TTCCACCTCA 3070 het 3070 hom 32 13 15 6 TG 1 0 191720 CASAVA_Build 12 75176390 2I CTGCTGCTTC --/TT TTTTTTTTTC 2971 het 2790 hom 24 9 12 3 T 9 11 191721 CASAVA_Build 12 75178557 1I ATCTCCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 613 hom 28 2 21 5 T 10 11 191722 CASAVA_Build 12 75180102 2I TGCTTCCAGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 12 14 191723 CASAVA_Build 12 75198193 10D GATTGCATTT TATAAAACTA/---------- ATAAAGGATT 3070 het 3070 hom 44 21 20 6 TATAAAACTA 1 0 191724 CASAVA_Build 12 75203679 1D CTATGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 11 10 191725 CASAVA_Build 12 75206158 1D AGATTGCTGG A/- TATATGGTAT 3070 het 3070 hom 38 10 23 6 A 1 0 191726 CASAVA_Build 12 75211154 1D CCTCCCCCCC T/- GCCCAACAAT 3070 het 2700 hom 22 9 9 4 T 1 0 191727 CASAVA_Build 12 75213580 1I TTGTTCCTGG -/C CCGGACTTCA 1935 het 1935 ref 16 7 4 5 C 2 3 191728 CASAVA_Build 12 75213877 4D ACTCTTGCAA AGGG/---- ACTACACGTC 3070 het 3070 ref 32 19 12 3 AGGG 1 0 191729 CASAVA_Build 12 75216457 1D GTAATAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2702 hom 28 7 12 9 T 13 12 191730 CASAVA_Build 12 75229703 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 8 9 191731 CASAVA_Build 12 75245136 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 19 1 14 6 A 18 16 191732 CASAVA_Build 12 75250661 2D TCCCACCAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 2598 hom 29 8 9 13 AC 10 9 191733 CASAVA_Build 12 75250867 1D TAAAAGTGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 10 9 191734 CASAVA_Build 12 75267364 1D TCTTATAACA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 8 7 191735 CASAVA_Build 12 75280220 3I AAACCGAATC ---/CAG CAGCACATCA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 CAG 1 2 191736 CASAVA_Build 12 75284721 1I GTTTTGTTTG -/T TTTCTGAGAC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 3 4 191737 CASAVA_Build 12 75286365 1I TTTGGGGATT -/G GGGGGGTCTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 G 6 7 191738 CASAVA_Build 12 75287055 3I CCAAATTTTA ---/AAT GTTGGTTGCT 2710 het 2710 ref 21 13 7 1 AAT 0 1 191739 CASAVA_Build 12 75291197 1I TTAAATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 T 10 11 191740 CASAVA_Build 12 75291647 4I GTGTCCTCCC ----/CTAA CTGTCAAGAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CTAA 0 1 191741 CASAVA_Build 12 75299642 1D ATTTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 2354 het 2354 ref 33 18 5 10 T 13 12 191742 CASAVA_Build 12 75301304 1D AAACAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3063 het 3063 ref 34 12 8 14 A 13 12 191743 CASAVA_Build 12 75313479 1I CTGCATTTTC -/A AAATAGCTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 3 4 191744 CASAVA_Build 12 75315114 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 18 1 9 8 T 11 12 191745 CASAVA_Build 12 75327962 1I TTTCTTCAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 8 9 191746 CASAVA_Build 12 75339792 5I GTCAAATGCC -----/TAATT TAATAAATAT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 TAATT 0 1 191747 CASAVA_Build 12 75347388 1D ATGTTATACG A/- AATGCTTAGG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 3 2 191748 CASAVA_Build 12 75347799 1D CAAGGGTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 38 0 31 8 A 12 11 191749 CASAVA_Build 12 75349207 1I CCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 9 10 191750 CASAVA_Build 12 75357501 1I CTTTTTTTTT -/C CCCTAAAGGC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 C 3 4 191751 CASAVA_Build 12 75369251 1D GTCATTTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 8 A 11 10 191752 CASAVA_Build 12 75370912 1I CAATTTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 13 14 191753 CASAVA_Build 12 75393168 2D GTCTTAAAAC TT/-- GGGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 2 0 191754 CASAVA_Build 12 75396112 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 2196 het 2196 ref 24 15 7 2 A 10 11 191755 CASAVA_Build 12 75398982 1I GCCATGAGCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 8 9 191756 CASAVA_Build 12 75400525 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1586 hom 18 5 12 3 A 12 11 191757 CASAVA_Build 12 75413936 1D CCAGATCACC T/- TACTTGCACA 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 2 1 191758 CASAVA_Build 12 75414081 1I GTCTGTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 11 12 191759 CASAVA_Build 12 75417764 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1892 hom 24 6 11 7 A 13 12 191760 CASAVA_Build 12 75419278 3D AAGGGCTATA AAG/--- AAGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AAG 3 2 191761 CASAVA_Build 12 75420128 1D GTGCATGGCT C/- TGAGAATGAG 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 C 1 0 191762 CASAVA_Build 12 75432343 3I ATTACAAGCA ---/CTT TGAGCCGGCT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 CTT 0 1 191763 CASAVA_Build 12 75443454 3I ATATGCTCTT ---/AAC AACTGATAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAC 1 2 191764 CASAVA_Build 12 75444836 11D GCTGGGATTA CAGGTGTGAGC/----------- CACCATGCCT 3070 het 3070 ref 26 15 11 3 CAGGTGTGAGC 1 0 191765 CASAVA_Build 12 75446794 5I TAAGTAAAGT -----/ATAGC ATAGCAACTT 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 ATAGC 1 2 191766 CASAVA_Build 12 75447011 3D CTAAAATATC ATT/--- ATGAATTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 17 4 ATT 1 0 191767 CASAVA_Build 12 75452986 1D ATTTGTAGAC A/- AAAAAATTCT 3070 het 1794 hom 18 4 11 3 A 7 6 191768 CASAVA_Build 12 75454728 1D TAGGAGTATC A/- AAAAAAAAAA 2439 het 493 hom 33 4 7 23 A 19 18 191769 CASAVA_Build 12 75455926 5D CAGGGTTAAA TTAAT/----- TTAAGTCTCT 3070 het 3070 ref 31 14 12 8 TTAAT 1 0 191770 CASAVA_Build 12 75462752 1D CACTGAGTCT A/- AAAAAAAAAA 1318 het 1318 ref 40 32 3 5 A 12 11 191771 CASAVA_Build 12 75467833 14D AAGCAGATGC AAAAAAAAAAAAGG/-------------- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 6 AAAAAAAAAAAAGG 1 0 191772 CASAVA_Build 12 75471109 4I ATATACCAAC ----/ATAG ATAGATTCCA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 ATAG 1 2 191773 CASAVA_Build 12 75474381 4I GTGGGAAGAA ----/AGAT AGATCTAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 AGAT 1 2 191774 CASAVA_Build 12 75476038 1I CGGTTAATAT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 0 1 191775 CASAVA_Build 12 75478221 1D TCATTAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2715 hom 38 8 21 9 T 13 12 191776 CASAVA_Build 12 75484109 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 1184 het 332 hom 31 5 11 16 AG 1 0 191777 CASAVA_Build 12 75484525 1D AATGACATTC T/- TATTTCAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 T 2 1 191778 CASAVA_Build 12 75490843 1D CGAGACTGTC A/- AAAAAAAAAC 2610 het 2610 ref 20 13 6 1 A 10 9 191779 CASAVA_Build 12 75493402 1D AACATTTGTA T/- TAGTCAGGGT 1948 het 819 hom 10 3 4 3 T 2 1 191780 CASAVA_Build 12 75493457 24D TATATATATA TATATATATATGTACATATATATG/------------------------ GACATATAAT 695 het 695 ref 7 5 6 3 TATATATATATGTACATATATATG 1 0 191781 CASAVA_Build 12 75494524 1D AGACTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 582 hom 24 3 12 10 A 16 15 191782 CASAVA_Build 12 75494992 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 18 0 11 8 A 14 12 191783 CASAVA_Build 12 75497034 3I AATACAGAAT ---/CAA CAACAAGGAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CAA 2 3 191784 CASAVA_Build 12 75497522 11D AAACCAATGG GACAGGATAGA/----------- GAGCCTCAAA 3070 hom 54 het 19 0 18 5 GACAGGATAGA 1 0 191785 CASAVA_Build 12 75499347 1I AGAAGAAAAC -/G GTTAAAAGCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 G 1 2 191786 CASAVA_Build 12 75518788 1D AGGCTGCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 A 12 11 191787 CASAVA_Build 12 75544984 1D TTCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 A 12 11 191788 CASAVA_Build 12 75546189 1I CAAAAAGGAG -/A AAAAGCTTGA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 4 5 191789 CASAVA_Build 12 75552115 1I ATATACCCCT -/C TTTGTGTATT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 C 0 1 191790 CASAVA_Build 12 75578424 1D CTATAAGAAA G/- GTGATATTGT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 G 2 1 191791 CASAVA_Build 12 75585417 1D TTTTTTTCCC T/- TGACTTTGTC 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 2 1 191792 CASAVA_Build 12 75590539 3I ATTTTTTTGT ---/TCA TCATTTTGTC 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 TCA 1 2 191793 CASAVA_Build 12 75600383 1I ACAAAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 11 12 191794 CASAVA_Build 12 75604751 9I CTGGGAATGC ---------/AGCCCAGCA AGTCCTAGCT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AGCCCAGCA 0 1 191795 CASAVA_Build 12 75607912 1I CTCTCGAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 10 11 191796 CASAVA_Build 12 75608231 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCACC 1730 het 1206 hom 7 3 4 0 G 4 3 191797 CASAVA_Build 12 75609403 4I TAAAATGTCA ----/GTTT CTTTGTCCAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 GTTT 0 1 191798 CASAVA_Build 12 75617318 4D TTTTTCTCCC TTCT/---- TTCTGTTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 TTCT 2 1 191799 CASAVA_Build 12 75620575 14D ACCCTCCGGT CTCAGAGGAATTAA/-------------- CTCACTTATT 3070 het 3070 ref 26 16 8 4 CTCAGAGGAATTAA 1 0 191800 CASAVA_Build 12 75620773 1I TTTTATATAT -/A TTTTTTTTTA 1179 het 1179 ref 16 9 4 3 A 0 1 191801 CASAVA_Build 12 75624556 1I TGTCTTCCAG -/A AAAACCTAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 4 5 191802 CASAVA_Build 12 75635752 1D AGGAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 13 27 10 A 11 10 191803 CASAVA_Build 12 75643537 3D GAAATTTTAC TGA/--- TGATTTCAAA 3070 het 2639 hom 24 6 15 4 TGA 2 1 191804 CASAVA_Build 12 75654272 1I TACCTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 10 11 191805 CASAVA_Build 12 75681721 1I TGGGCGTGGG -/C CTCCTCGGCT 2899 hom 35 het 15 0 8 7 C 1 2 191806 CASAVA_Build 12 75752922 1D TCCATTTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 33 0 27 6 T 10 9 191807 CASAVA_Build 12 75762957 1D TTATATGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 T 11 10 191808 CASAVA_Build 12 75763512 1D AATCTTGTTT A/- AAAAATATAG 3070 het 3070 hom 24 11 10 4 A 6 5 191809 CASAVA_Build 12 75775261 4D TTGTTTCTGC TTAT/---- TTATTTTTTT 3070 hom 34 het 32 1 27 5 TTAT 2 1 191810 CASAVA_Build 12 75775679 3D TCAATTTTAC TAA/--- TAATACACAT 3070 hom 86 het 31 0 29 3 TAA 2 1 191811 CASAVA_Build 12 75811312 1D TGTGGCATAA T/- TTTTTTTTTT 1323 het 1323 ref 24 10 4 10 T 17 16 191812 CASAVA_Build 12 75823109 1D ATAGGATTTA T/- TATTTCTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 2 1 191813 CASAVA_Build 12 75824777 2D24M1D TATGTGTGAG TTTTTTTTTTTTTTCTATCTTCTTTGT/--TTTTTTTTTTTTCTATCTTCTTTG- TTTTTTCTAA 3070 hom 78 het 26 0 26 8 N/A 0 0 191814 CASAVA_Build 12 75832604 1D22M2D CCTGGCCAAC AATAGTGAAACCCTGTCTCTACTAA/-ATAGTGAAACCCTGTCTCTACT-- AAAAAAAAAC 3070 hom 144 het 41 0 48 6 N/A 0 0 191815 CASAVA_Build 12 75834152 4D AGGAAAACCA TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 het 116 hom 30 3 9 19 T 13 9 191816 CASAVA_Build 12 75869621 2D AAACCCACAC AG/-- AGATGTTAGT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 AG 2 1 191817 CASAVA_Build 12 75869734 1I TTAACACAAC -/A AGGCAGAATA 3070 hom 148 het 58 0 50 8 A 1 2 191818 CASAVA_Build 12 75877387 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2068 het 2068 ref 30 19 8 3 T 11 10 191819 CASAVA_Build 12 75895316 1D ATTCACTGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 8 191820 CASAVA_Build 12 75912066 1D CTTTGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 11 10 191821 CASAVA_Build 12 75914735 1D TACAGCTGGG A/- AAAAAAAAAA 1349 het 1349 ref 47 37 3 8 A 11 10 191822 CASAVA_Build 12 75920304 1D GAACCACGCT C/- CCCCTGAAGT 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 C 5 4 191823 CASAVA_Build 12 75921056 1I GAAATTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 14 11 A 11 12 191824 CASAVA_Build 12 75923410 8D GTCACACGTT TAGTACAG/-------- TAGTACAGTG 3070 het 3070 hom 49 20 27 5 TAGTACAG 2 1 191825 CASAVA_Build 12 75941662 1I CTACTTCCAG -/C AATAAGACGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 191826 CASAVA_Build 12 75942107 1D CTGAAAAAAG A/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 A 6 5 191827 CASAVA_Build 12 75952136 1I TTCAATGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 10 11 191828 CASAVA_Build 12 75953813 1D TCTAGAGATT A/- AAAAAAATAC 3070 het 836 hom 28 4 15 9 A 8 7 191829 CASAVA_Build 12 75953827 2I AAAATACAGT --/GG GGGGGGATGA 3070 hom 36 het 32 0 12 20 G 6 8 191830 CASAVA_Build 12 75953891 1I4M2I4M11I4M4I ATAAAGAATA -TGAA--TAAA-----------TGAA----/GAGAACTTAAAGACACAGCAATAGAAACTG TAAATAAATG 3070 het 3070 ref 33 22 20 1 N/A 0 0 191831 CASAVA_Build 12 75954446 1I CTTTGTCTCC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 8 9 191832 CASAVA_Build 12 75989173 1D AAAGTATGAG A/- ATGATGAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 2 1 191833 CASAVA_Build 12 75989875 1D TTTAATAGCA T/- TTTTTTTTTT 2902 het 985 hom 24 6 9 9 T 17 16 191834 CASAVA_Build 12 76036860 1D GGATTTTGTT A/- TCTAGTAAGA 3070 het 3070 ref 37 19 18 0 A 1 0 191835 CASAVA_Build 12 76040071 4I ACAGTTTGAC ----/AAAT AGATTTGTTC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 AAAT 0 1 191836 CASAVA_Build 12 76069765 1D TAATAAAATT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 7 6 191837 CASAVA_Build 12 76070552 1I TTTAGAGTGA -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 5 6 191838 CASAVA_Build 12 76070747 1I TTCTAAACTT -/A ACATCTTCCC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 1 2 191839 CASAVA_Build 12 76074400 2I AGTGAAAAAC --/TT ATATTTCAAA 3070 hom 117 het 49 0 40 9 T 0 2 191840 CASAVA_Build 12 76077147 1I CACAAAAAAA -/T CTCATAATGT 3070 hom 55 het 21 0 19 2 T 0 1 191841 CASAVA_Build 12 76077585 1I TGGTTAAATA -/T ATCTTGATTT 3070 hom 116 het 42 0 38 4 T 0 1 191842 CASAVA_Build 12 76087793 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 23 1 16 6 A 13 12 191843 CASAVA_Build 12 76087955 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 11 12 191844 CASAVA_Build 12 76091111 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 10 11 191845 CASAVA_Build 12 76099215 3I GTGGAATTAA ---/TCC CTCCTCCAAC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TCC 0 1 191846 CASAVA_Build 12 76100435 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1050 hom 16 6 8 2 A 15 14 191847 CASAVA_Build 12 76105765 9I9M1I AGAGGAAGCC ---------AGGCTTCCT-/CTCTAGAGTAGGCTTCCTA CTGCTCCCAT 3070 het 3070 ref 50 30 18 7 N/A 0 0 191848 CASAVA_Build 12 76111773 5I TTTGTCAACC -----/AATTA TAAGTTCTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AATTA 0 1 191849 CASAVA_Build 12 76114768 1D TTCTAGTAGC T/- TTTTTTTTTC 1228 het 1228 ref 53 41 3 9 T 10 9 191850 CASAVA_Build 12 76115669 1D ATGGTTGGAT A/- AAAATATCTA 3070 het 3070 ref 29 17 12 1 A 5 4 191851 CASAVA_Build 12 76123013 8D GGGAAATTGT AGGTGCAA/-------- AGCTGCAATT 3070 het 3070 ref 54 30 23 7 AGGTGCAA 1 0 191852 CASAVA_Build 12 76138852 1I GGCTTAAACA -/T TAGAGGTACC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 T 1 2 191853 CASAVA_Build 12 76164052 1D TTTCATTCAA C/- CATTTGTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 C 2 1 191854 CASAVA_Build 12 76164172 1I ATCTTTTTTT -/A AATCCCTGTG 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 A 2 3 191855 CASAVA_Build 12 76166009 1I CTTTTTTGGG -/C GGGGGGGGAC 3070 het 2565 hom 27 12 10 5 C 0 1 191856 CASAVA_Build 12 76169822 9I ATGCAAAATA ---------/ACAACCCAT ACAACCCATA 3070 het 3070 ref 44 17 15 12 ACAACCCAT 1 2 191857 CASAVA_Build 12 76176715 1I AAGAAATACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 19 20 7 T 9 10 191858 CASAVA_Build 12 76185572 2I TATATGTATA --/TG TGTGTGTGTG 1839 het 1839 ref 25 16 5 4 TG 5 6 191859 CASAVA_Build 12 76189582 2D AAATTCTTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 13 13 6 AT 9 8 191860 CASAVA_Build 12 76196528 2I TCTGTGAAAA --/AG AGAAAATTAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 AG 1 2 191861 CASAVA_Build 12 76211924 6D TCAAATTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 2443 hom 34 10 17 8 T 17 11 191862 CASAVA_Build 12 76215189 1I AGGAGGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 882 hom 39 2 30 7 A 10 11 191863 CASAVA_Build 12 76224034 2I TGTAACAAAG --/GT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 GT 0 1 191864 CASAVA_Build 12 76232436 7I AAAGGATATA -------/ATTATTT ATCTTTACCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 ATTATTT 0 1 191865 CASAVA_Build 12 76236627 5D TCACCTAAAC AACTT/----- AATTACATTT 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 AACTT 1 0 191866 CASAVA_Build 12 76256005 1I48M1D TTTTCCTTCA -TTTTTTTTTAAGAAAACTGATAGGTTTTGAGCTATAGTTTACAATCAAT/TTTTTTTTTTAAGAAAACTGATAGGTTTTGAGCTATAGTTTACAATCAA- ATAAGTCCAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 28 N/A 0 0 191867 CASAVA_Build 12 76287121 1I CTTTCAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 10 11 191868 CASAVA_Build 12 76288417 1I AGATGGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 121 hom 30 2 17 11 T 16 17 191869 CASAVA_Build 12 76309709 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2695 het 2695 ref 36 18 10 9 T 14 13 191870 CASAVA_Build 12 76311922 1D TTTTACACTC A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 A 7 6 191871 CASAVA_Build 12 76319569 8D GTTGGTAGAA GCATTAAT/-------- CAGAACAAGT 3070 het 3070 ref 38 22 15 3 GCATTAAT 1 0 191872 CASAVA_Build 12 76320336 1I ATGCAGCCTT -/A AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 6 7 191873 CASAVA_Build 12 76339895 1I14M1D6M1D TGGGAGAAGT -AAACATTTCAGGACAAAAGTCG/AAAACATTTCAGGAC-AAAGTC- GCTTTCTTTC 3070 hom 57 het 22 0 20 5 N/A 0 0 191874 CASAVA_Build 12 76340687 1I GATTATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 41 2 31 8 T 11 12 191875 CASAVA_Build 12 76343121 4I TTCTTGTAAA ----/TTTG TTTAAGTTCT 3070 hom 31 het 13 0 10 3 TTTG 0 1 191876 CASAVA_Build 12 76348056 1I TTGTTTTTGA -/T TTTTTGAGAT 3070 hom 60 het 26 0 19 7 T 5 6 191877 CASAVA_Build 12 76355764 2D TTTTAATATT TA/-- AACCAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 TA 1 0 191878 CASAVA_Build 12 76357688 1D GCTAAACTAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 9 8 191879 CASAVA_Build 12 76358191 4I TTTCAAAGCC ----/AACT AACTGCATCA 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 AACT 1 2 191880 CASAVA_Build 12 76360786 1D ATACAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 11 10 191881 CASAVA_Build 12 76362954 102D TAAGCAACTA TTTTAAGATAAAGCTAAGTTTGTATGTACTGGCTGTACCACTTGTGAGCTATATGACCTTAGGAAGTTATTTAACCTCCTTGTCTCTCAATGTTTTGTCTCC/------------------------------------------------------------------------------------------------------ TCATCTGGAA 1754 het 1754 ref 28 40 4 6 TTTTAAGATAAAGCTAAGTTTGTATGTACTGGCTGTACCACTTGTGAGCTATATGACCTTAGGAAGTTATTTAACCTCCTTGTCTCTCAATGTTTTGTCTCC 1 0 191882 CASAVA_Build 12 76363237 1I CGTTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 10 11 191883 CASAVA_Build 12 76371296 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAACAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 7 6 191884 CASAVA_Build 12 76376355 1I TTCATGGGAA -/T TTTTGGCATC 3070 het 3070 hom 60 27 24 9 T 4 5 191885 CASAVA_Build 12 76393977 1I AAAAAAAAAA -/C CCCCACCGAA 3070 het 388 hom 24 1 17 6 C 4 5 191886 CASAVA_Build 12 76395439 4I CTACACATAG ----/AATT AATTCTCATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AATT 1 2 191887 CASAVA_Build 12 76401826 1I AAAGGAATAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 8 9 191888 CASAVA_Build 12 76405116 1I AGATTCTTTT -/G CAGTGCTGTC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 G 0 1 191889 CASAVA_Build 12 76408022 8I AACTTTACAT --------/CCTACAAC CCTCCTATAT 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 CCTACAAC 0 1 191890 CASAVA_Build 12 76425261 1D ATACATCTCA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 6 191891 CASAVA_Build 12 76433299 1I TCATGGTGGA -/G TCCCTATCCC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 G 0 1 191892 CASAVA_Build 12 76440754 7I AAAAATCATT -------/ATTTCAA ATCTTTGAAA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 ATTTCAA 0 1 191893 CASAVA_Build 12 76454721 1D GATTAGTGAT C/- AACAGAGAGC 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 C 1 0 191894 CASAVA_Build 12 76458553 7D GTGTCTTTGG TTTTTGT/------- TTTTTATTAC 3070 het 3070 ref 31 15 14 5 TTTTTGT 1 0 191895 CASAVA_Build 12 76468206 4I AATGAGGGGC ----/CTCT CTGACAGTCT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 CT 1 3 191896 CASAVA_Build 12 76484901 4I ACACCATTGG ----/GTTA GTTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 GTTA 0 1 191897 CASAVA_Build 12 76488344 1D GCCAGATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 53 2 43 8 A 12 11 191898 CASAVA_Build 12 76490814 1I TTCACCTTCA -/T TTTTTCTAGC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 5 6 191899 CASAVA_Build 12 76502334 1I ATAGTATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 10 11 191900 CASAVA_Build 12 76503404 1D GGAAAAAGAC A/- AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 36 20 11 7 A 6 5 191901 CASAVA_Build 12 76504091 1I AAAAAAAAAA -/T TTGCTGTAAG 1645 het 1130 hom 17 5 7 5 T 2 3 191902 CASAVA_Build 12 76507283 1I AGCAGCCCCC -/T CTCTGTGGTA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 0 1 191903 CASAVA_Build 12 76511192 4D TATGTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 45 het 36 1 26 10 TG 11 9 191904 CASAVA_Build 12 76523754 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1173 het 1173 ref 35 25 3 8 A 12 11 191905 CASAVA_Build 12 76549990 3D TTGAGGTGGG TTC/--- ATATTCAGAA 3070 het 3070 ref 41 24 16 3 TTC 1 0 191906 CASAVA_Build 12 76552038 1I AAATCTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 28 1 21 6 T 11 12 191907 CASAVA_Build 12 76594471 2I CTTTAAAGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 25 1 18 7 T 13 15 191908 CASAVA_Build 12 76602182 3I CATTTTTAAC ---/TAT TATTATTATT 3070 het 216 hom 21 1 15 5 TAT 4 5 191909 CASAVA_Build 12 76605214 19D TATTAGGAGT ATTATTTCATTATTTGGAC/------------------- ACACTATGTG 3070 hom 120 het 39 0 41 3 ATTATTTCATTATTTGGAC 1 0 191910 CASAVA_Build 12 76613732 1I GAGAACTTTT -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 6 7 191911 CASAVA_Build 12 76617701 1I CTGCATGACC -/T TTTTTTTTTT 2681 het 67 hom 33 3 18 12 T 15 16 191912 CASAVA_Build 12 76618850 2D ATATTATAAA CT/-- CTTTTATATT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 CT 2 1 191913 CASAVA_Build 12 76620753 17I TTTTGTATTT -----------------/AGGCTGTATTTCATATA GCCTCTATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 AGGCTGTATTTCATATA 0 1 191914 CASAVA_Build 12 76638067 2D TACTTGAGTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 87 het 31 0 30 3 TC 12 11 191915 CASAVA_Build 12 76641272 1D TATTGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 26 6 T 11 10 191916 CASAVA_Build 12 76643398 1D TTTCCCCAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 9 8 191917 CASAVA_Build 12 76643983 1D ATTAGCAATC T/- TAATTTTCCC 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 2 1 191918 CASAVA_Build 12 76644089 1I CCTTCTGTGC -/A ATTTTTCCAG 3070 hom 138 het 48 0 46 2 A 1 2 191919 CASAVA_Build 12 76646773 3I ACCCGCTTCA ---/CTT CTTCTGCCTC 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 CTT 1 2 191920 CASAVA_Build 12 76676026 1I AGTGTCTGAG -/T TTTGGTTTAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 3 4 191921 CASAVA_Build 12 76677675 1I CTGATTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 T 9 10 191922 CASAVA_Build 12 76689839 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 9 8 191923 CASAVA_Build 12 76707228 1I GCCCTTCCTT -/C CCCTTACCAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 3 4 191924 CASAVA_Build 12 76709266 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2580 het 106 hom 12 2 9 1 A 19 18 191925 CASAVA_Build 12 76714757 1I TTAATTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 11 12 191926 CASAVA_Build 12 76716473 2D GAATAATAGT AA/-- AACTTCTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 4 2 191927 CASAVA_Build 12 76734697 1D GCAGAAATGC A/- AAAGTTACTT 3070 het 3070 ref 52 28 22 2 A 4 3 191928 CASAVA_Build 12 76736961 4D CTATGCAAAC TTCT/---- TTCTTTAATA 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 TTCT 2 1 191929 CASAVA_Build 12 76737433 2D AAAGTAAAAT AA/-- GAGTTAAGTT 3070 het 3070 ref 55 30 22 3 A 2 0 191930 CASAVA_Build 12 76738001 2D ATAAATTGAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 242 hom 53 2 9 45 GT 10 9 191931 CASAVA_Build 12 76739004 2D GTTCGCACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 257 hom 43 5 24 14 AC 10 9 191932 CASAVA_Build 12 76751239 4D TACAGCAATT AATG/---- AATCAATGAA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 AATG 1 0 191933 CASAVA_Build 12 76752794 2D AGCTTTTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 13 11 191934 CASAVA_Build 12 76752995 1D TCAGGAAGTT G/- TCAGGGAACC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 G 1 0 191935 CASAVA_Build 12 76761745 1D TGTCTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 15 1 13 1 A 12 11 191936 CASAVA_Build 12 76763417 1I TTGTTGAATG -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 6 7 191937 CASAVA_Build 12 76769460 1D CAATAATATT A/- AGCAATCAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 1 191938 CASAVA_Build 12 76777549 1D AATCAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 12 11 191939 CASAVA_Build 12 76783294 1D GCCCTCTTCT A/- AACACACATA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 3 2 191940 CASAVA_Build 12 76783710 2I GTATATATGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 921 hom 46 4 28 14 GT 8 9 191941 CASAVA_Build 12 76808193 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 6 7 191942 CASAVA_Build 12 76812490 2I CCCTCACTAG --/CT GCCACCAGCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CT 0 1 191943 CASAVA_Build 12 76843450 1D GATGAAAAGG C/- GGGGGGAGGT 2856 het 2856 ref 34 14 10 11 C 1 0 191944 CASAVA_Build 12 76848981 3I ATTCTTTCCT ---/ATA ATAATTTTTT 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 ATA 1 2 191945 CASAVA_Build 12 76849314 5I TCTCATTTCT -----/AGCCC AGGGTATTAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AGCCC 0 1 191946 CASAVA_Build 12 76852363 1I AATGTTGTCC -/T TTTGTGATTC 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 3 4 191947 CASAVA_Build 12 76863042 1I GAAAAAAAAA -/T AAATAAATAG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 0 1 191948 CASAVA_Build 12 76878362 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 2801 het 2418 hom 24 7 9 9 AC 10 9 191949 CASAVA_Build 12 76878782 3I ACACATATAA ---/TAT TAATATATTG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TAT 0 1 191950 CASAVA_Build 12 76880926 4D TTTGAATTTT GTTA/---- GTTTGTTTGA 3070 het 3070 ref 38 23 14 2 GTTA 1 0 191951 CASAVA_Build 12 76887745 4D TGTCTAAAGT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 78 het 33 0 26 8 AAAC 4 3 191952 CASAVA_Build 12 76892934 2I CCATTCCACT --/AA GTTTAATTAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 0 2 191953 CASAVA_Build 12 76895401 1D TGTAAAACCT G/- GATATTAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 8 G 2 1 191954 CASAVA_Build 12 76895847 12D TGTATGCCAG TTACGTAAAAAA/------------ TGCCTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 TTACGTAAAAAA 1 0 191955 CASAVA_Build 12 76897136 1D AATACAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 255 hom 32 3 12 19 A 17 16 191956 CASAVA_Build 12 76902391 1I CAAGTATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 38 2 22 14 T 15 16 191957 CASAVA_Build 12 76903482 1D CTTTCTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 T 11 10 191958 CASAVA_Build 12 76908361 1D TGGTAAGTTT C/- AGTTCATTGA 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 C 1 0 191959 CASAVA_Build 12 76909382 1D TTCATTACAT A/- AAAAGGGTAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 5 4 191960 CASAVA_Build 12 76926573 1D TTATTTTTTT G/- CTCAATGAGG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 G 1 0 191961 CASAVA_Build 12 76933093 1D TTATGTTTTT G/- GAAACCATTT 3070 het 3070 ref 44 26 15 4 G 2 1 191962 CASAVA_Build 12 76933406 1I ATTAAATGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 43 12 21 10 T 8 9 191963 CASAVA_Build 12 76942899 1I AAAAAGGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 9 10 191964 CASAVA_Build 12 76955452 1D CTTGAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 11 10 191965 CASAVA_Build 12 76960846 1D ATGATCATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2561 hom 23 7 12 4 T 11 10 191966 CASAVA_Build 12 76964117 21D GATTTTTTGA AGGGTTTTTGTGTCTCTATCT/--------------------- CCTTCAGTTC 1956 het 1446 hom 7 3 4 0 AGGGTTTTTGTGTCTCTATCT 1 0 191967 CASAVA_Build 12 76973129 30D ATTAATTGTA ATATGCACACATATGTGTATATATACATAT/------------------------------ ATATGCACAC 3070 hom 60 het 32 0 21 17 ATATGCACACATATGTGTATATATACATAT 2 1 191968 CASAVA_Build 12 76995981 6I TGTAGTTAGC ------/TGACTT TTCTGTGTCT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 TGACTT 0 1 191969 CASAVA_Build 12 77006193 1I TGACATAGAC -/A AAATATAACA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 3 4 191970 CASAVA_Build 12 77008101 2D43M5D11M2D TATATGTGTG TATATATATATATATGGTTGAATTATACATATATAAAGTTGAATTATATATATATATCAAATT/--TATATATATATATGGTTGAATTATACATATATAAAGTTGAATT-----TATATATCAAA-- TTATATATAT 3070 het 3070 ref 25 18 14 7 N/A 0 0 191971 CASAVA_Build 12 77010838 1D CAATGTATGT A/- ACTTGGCTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 2 1 191972 CASAVA_Build 12 77016630 1I TTTGAAACTG -/T GTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 0 1 191973 CASAVA_Build 12 77016867 1I GTATCCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 29 2 21 6 T 14 15 191974 CASAVA_Build 12 77037965 5I TGTATAAGGT -----/ATATA ATATATATAT 3070 het 3042 hom 21 7 12 2 ATATA 1 2 191975 CASAVA_Build 12 77038034 1I AACAGCTAGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 8 9 191976 CASAVA_Build 12 77038107 3D TAGCAACACA AAC/--- AACATCTAAG 3070 het 3070 ref 24 11 11 4 AAC 2 1 191977 CASAVA_Build 12 77039431 1D ATTTAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 58 het 34 0 20 14 A 10 9 191978 CASAVA_Build 12 77039523 2D TAACAGCAAG TA/-- TATGGTCAAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 4 TA 2 1 191979 CASAVA_Build 12 77041452 1I CTTTGTAAAA -/T ACAAAACCCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 1 191980 CASAVA_Build 12 77043295 1D TAAATAAAAT A/- ATAAAATACA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 2 1 191981 CASAVA_Build 12 77044549 4D TACTAGAATC AATT/---- AAGTTTTAAG 3070 het 3070 ref 24 15 9 2 AATT 1 0 191982 CASAVA_Build 12 77045759 3I ATTAATCTAA ---/CAT TATTTAATAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 CAT 0 1 191983 CASAVA_Build 12 77056321 1I TTCTGACTGA -/G GGGGTTAGGC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 G 4 5 191984 CASAVA_Build 12 77057008 1I ATAGAAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 9 10 191985 CASAVA_Build 12 77058733 3D GAACCAGAGA TGT/--- TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TGT 1 0 191986 CASAVA_Build 12 77059185 1I TTTTTGACAA -/T GGAGAGTTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 0 1 191987 CASAVA_Build 12 77060493 1D AAAATGATGA G/- GATAATTAGA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 G 2 1 191988 CASAVA_Build 12 77061270 3I GGCCAAGCGC ---/GGT GGTGGCTCAT 3070 hom 62 het 24 0 20 4 GGT 1 2 191989 CASAVA_Build 12 77062846 14D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAG/-------------- AAAGAAAGAA 2158 het 888 hom 18 8 11 10 AAAAAAAAAAAAAG 1 0 191990 CASAVA_Build 12 77064306 1D ATTCAGAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 10 9 191991 CASAVA_Build 12 77066734 1I ATTCCATTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 7 8 191992 CASAVA_Build 12 77068403 17D TTTCACATTT TTTTGTTTTTGTTTTTG/----------------- TTTTTTTTTC 3070 hom 59 het 23 0 23 4 TTTTGTTTTTGTTTTTG 1 0 191993 CASAVA_Build 12 77068975 1I ACAATCATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 9 10 191994 CASAVA_Build 12 77083331 1D CATTTTTCAG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 8 7 191995 CASAVA_Build 12 77084343 3I TTTTTAATCA ---/AAG AAGACTATGG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 AAG 1 2 191996 CASAVA_Build 12 77085428 1D TAGCATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2900 hom 32 7 18 8 T 13 12 191997 CASAVA_Build 12 77085895 2I TTATTGGGAC --/AT ATCTTAAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 AT 1 2 191998 CASAVA_Build 12 77087341 3D AACAATGAAA GGG/--- GTATTTCTGC 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 G 4 1 191999 CASAVA_Build 12 77091457 1D CCTACACATA T/- TCTTCTATTG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 2 1 192000 CASAVA_Build 12 77093796 12D33M3I AGTGAAAAAA TGATGATGATGGTGATGATGATGGTGATAGTGGTCTTGGAGGAAA---/------------TGATGATGATGGTGATAGTGGTCTTGGAGGAAAAGG AGGAGAATGG 3070 het 3070 ref 34 24 12 11 N/A 0 0 192001 CASAVA_Build 12 77094144 3I TTTTAATACC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 10 13 192002 CASAVA_Build 12 77095840 1D GTAGCCCCCC G/- TTATCCACCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 0 192003 CASAVA_Build 12 77095920 1I GTATATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 34 3 13 18 T 10 11 192004 CASAVA_Build 12 77104583 1D ACAGACAATG C/- CTTTGAACAC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 C 2 1 192005 CASAVA_Build 12 77107473 2I ACACACACCC --/AT ATATATATAT 3070 het 302 hom 30 1 21 8 AT 7 8 192006 CASAVA_Build 12 77116830 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1197 hom 37 4 29 4 A 15 16 192007 CASAVA_Build 12 77134998 2D ACATATATAT AC/-- ACATATATAC 2198 hom 24 het 9 0 9 0 AC 2 1 192008 CASAVA_Build 12 77138624 1I TAGCTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 28 1 19 8 T 10 11 192009 CASAVA_Build 12 77163354 1D AGGCTAAACG T/- TTTTTACAAG 3070 hom 114 het 46 0 39 8 T 6 5 192010 CASAVA_Build 12 77189208 2I TTATTTTATT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 TA 0 1 192011 CASAVA_Build 12 77194578 3I TTTTAAAATA ---/CTT CTTAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CTT 1 2 192012 CASAVA_Build 12 77195566 10I GAAGAAAACA ----------/GGAAAATATG GGAAAATATG 3070 hom 75 het 32 0 25 7 GGAAAATATG 1 2 192013 CASAVA_Build 12 77205563 1D GAACATGAGG T/- GATGAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 T 1 0 192014 CASAVA_Build 12 77207437 1I ACTTTCATGG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 A 7 8 192015 CASAVA_Build 12 77211056 3I TATCACAGTG ---/TAA TAATAATAGA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 TAA 2 3 192016 CASAVA_Build 12 77215808 1D GAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2105 hom 18 het 8 0 7 1 T 15 14 192017 CASAVA_Build 12 77224486 1I GGCCCTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1869 hom 20 5 12 3 T 11 12 192018 CASAVA_Build 12 77226959 1D TTACAATAAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 8 7 192019 CASAVA_Build 12 77243160 1I CTTCAACCTA -/C CTCTCTCAAA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 C 1 2 192020 CASAVA_Build 12 77243821 5I GGCTCATGCC -----/TGTAA TCCCAGCACT 2216 het 1834 hom 17 7 6 4 TGTAA 0 1 192021 CASAVA_Build 12 77243898 1D CATGGTGAAA C/- CCCCATCTCT 3035 het 1972 hom 13 5 7 1 C 5 4 192022 CASAVA_Build 12 77251487 5D ATGATCATAC GATAT/----- GATATGATAT 3070 het 3070 ref 43 18 14 14 GATAT 3 2 192023 CASAVA_Build 12 77252291 1D AACGGGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 13 12 192024 CASAVA_Build 12 77255486 1D TAATAATAAG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 T 8 7 192025 CASAVA_Build 12 77255869 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 13 8 A 11 12 192026 CASAVA_Build 12 77256412 1D TATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 16 1 14 1 A 14 13 192027 CASAVA_Build 12 77256675 1D CAAGGCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 A 12 11 192028 CASAVA_Build 12 77263939 4D CATAAAAATT AAAC/---- AATATACTGC 3070 het 3070 hom 43 19 21 5 AAAC 1 0 192029 CASAVA_Build 12 77264252 2D TAACAAAAAG TT/-- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 8 6 192030 CASAVA_Build 12 77274168 1D CTTATTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 17 2 11 4 T 15 14 192031 CASAVA_Build 12 77278272 1D GGGACATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 13 11 T 11 10 192032 CASAVA_Build 12 77284529 2I ACACCATGGA --/CC CAAGCACTTT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 C 1 3 192033 CASAVA_Build 12 77284928 3D TCTGCACAAG TTC/--- TTCTTAGCCC 3070 het 3070 hom 39 15 21 5 TTC 2 1 192034 CASAVA_Build 12 77292339 4D TTTTAACAAC ACTT/---- ACAACATTTA 3070 het 3070 ref 33 17 15 4 ACTT 1 0 192035 CASAVA_Build 12 77303758 1I TCCTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 10 11 192036 CASAVA_Build 12 77313800 1I TGAGGCCTGC -/T TTTAAGAACT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 3 4 192037 CASAVA_Build 12 77320086 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 25 1 11 14 A 13 12 192038 CASAVA_Build 12 77321991 1D TATTATAAAA T/- TAGTTAAATA 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 T 2 1 192039 CASAVA_Build 12 77324160 1I TCTGAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 12 13 192040 CASAVA_Build 12 77325198 1D TTGTTGTTAG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 7 6 192041 CASAVA_Build 12 77359209 8I TCATGGACAT --------/GGTGATGA AATTAGAGTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 GGTGATGA 0 1 192042 CASAVA_Build 12 77360123 1I CATGTCCACA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 7 8 192043 CASAVA_Build 12 77361288 1I CAAGGTTTAT -/A AGTCTAGTGG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 1 2 192044 CASAVA_Build 12 77389164 1D ATATAGTAAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 A 8 7 192045 CASAVA_Build 12 77391048 4I GCTACTGTGC ----/TCCA TCCAACTTGG 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 TCCA 1 2 192046 CASAVA_Build 12 77392660 1D TACTTAAGCA T/- AAAATTATCT 3070 het 3070 hom 38 11 19 9 T 1 0 192047 CASAVA_Build 12 77392776 4I ACCCAGAGAA ----/TTTG TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTTG 0 1 192048 CASAVA_Build 12 77393893 2D TCTGATTATT TA/-- TGTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 TA 1 0 192049 CASAVA_Build 12 77395052 29I CAGCCAGTGG -----------------------------/AGGGAAGACACAGAGGGACAAGCTGCATT AGGGATAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 18 5 AGGGAAGACACAGAGGGACAAGCTGCATT 0 1 192050 CASAVA_Build 12 77408584 1I TTTGGCTAAC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 7 8 192051 CASAVA_Build 12 77409280 1D ATATCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 12 11 192052 CASAVA_Build 12 77414520 1D TATACAAGCC A/- TTTTGCACAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 1 0 192053 CASAVA_Build 12 77418633 1I GAAGATGATC -/A AAAAATTCAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 5 6 192054 CASAVA_Build 12 77419338 1D CTATGTTAGT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 8 7 192055 CASAVA_Build 12 77419872 1I CTCCTCCCCC -/T ATCTCCTCCT 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 T 0 1 192056 CASAVA_Build 12 77420738 1I CTAGAAGATT -/A AAAACTGCTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 4 5 192057 CASAVA_Build 12 77421544 3D AGAGTCCACA TAC/--- TTAACCCCTG 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 TAC 1 0 192058 CASAVA_Build 12 77424193 11D TGTCCAAATT CATGTAAATAA/----------- CACATCTTAG 3070 het 3070 ref 32 19 13 3 CATGTAAATAA 1 0 192059 CASAVA_Build 12 77436191 1I TATCCTTGCC -/T TTAGGAATCT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 2 3 192060 CASAVA_Build 12 77436849 8D GAAATTCCCT TATGTGCC/-------- TATACCACTG 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 TATGTGCC 1 0 192061 CASAVA_Build 12 77451210 1D ACTGTGCAGC T/- AACTATATTC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 1 0 192062 CASAVA_Build 12 77451676 1D GTGTCTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 21 16 12 A 11 10 192063 CASAVA_Build 12 77453317 3I AAGCACAAGA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 AAT 5 6 192064 CASAVA_Build 12 77472573 1I ACTTTGCTCA -/G CTGTTCTAAG 3070 het 3070 hom 51 24 26 1 G 0 1 192065 CASAVA_Build 12 77487639 10I AATCCCAGCA ----------/CTTTCGGAGG CTGAGGCAGG 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 CTTTCGGAGG 0 1 192066 CASAVA_Build 12 77491125 1D AAGGACTCTT C/- CTCTGAAGGT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 C 2 1 192067 CASAVA_Build 12 77500438 1D CTGTATTTTT A/- GTAGAGATGG 3070 het 2060 hom 22 6 14 2 A 1 0 192068 CASAVA_Build 12 77502072 5D TATTTATGTC TTAAT/----- TTATTCAATT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 TTAAT 1 0 192069 CASAVA_Build 12 77506536 6D TACACATGTG TATATA/------ TGTATGTGTA 3070 het 3070 ref 34 13 12 11 TA 3 0 192070 CASAVA_Build 12 77517894 2D TACTTTTCAC AT/-- GTTTGTATAT 3070 het 3070 hom 27 13 11 4 AT 1 0 192071 CASAVA_Build 12 77522947 1D AAGGAACATA G/- ACTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 G 1 0 192072 CASAVA_Build 12 77523190 5I AACAACAAAA -----/ACATG ACATGATTCT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 ACATG 1 2 192073 CASAVA_Build 12 77523390 1D TGACCACAAG A/- TATGTCTCCT 3070 het 3070 ref 60 26 23 11 A 1 0 192074 CASAVA_Build 12 77525850 1I TATGGAAAAC -/A GTATGGAGAT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 A 0 1 192075 CASAVA_Build 12 77529172 2I GTTTTGGAGG --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 A 8 10 192076 CASAVA_Build 12 77531629 4D AACAGAAAAT AAAC/---- AAACAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 18 20 3 AAAC 2 1 192077 CASAVA_Build 12 77537856 2D ACACATTTAC CT/-- CTCTCTGGCA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 CT 4 3 192078 CASAVA_Build 12 77543777 2I TAGAGAGAAC --/AT ATATATATGT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AT 4 5 192079 CASAVA_Build 12 77550163 1D GGATTTGTTG A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 32 14 17 1 A 7 6 192080 CASAVA_Build 12 77564465 1I TTCAAATCCC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 T 8 9 192081 CASAVA_Build 12 77576051 2I TTGTAAATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 1039 hom 39 6 32 1 AT 6 7 192082 CASAVA_Build 12 77589679 1D TTCCTGATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 14 4 T 10 9 192083 CASAVA_Build 12 77619186 1D ATTTGGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 33 1 29 3 T 13 12 192084 CASAVA_Build 12 77652339 1I ACAGTTTGCA -/T TTTTTTAATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 6 7 192085 CASAVA_Build 12 77707766 1D GGATGTAAAA G/- TTTCTTCCAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 G 1 0 192086 CASAVA_Build 12 77757601 1D GTTATAATGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 10 9 192087 CASAVA_Build 12 77770040 1D ATGCTGAGAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 27 het 18 0 11 7 A 9 8 192088 CASAVA_Build 12 77775322 1I AACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2789 het 1603 hom 18 5 12 1 A 13 14 192089 CASAVA_Build 12 77778572 1D AGAAATCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 7 A 10 9 192090 CASAVA_Build 12 77783830 1D CTTGAGTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 13 12 192091 CASAVA_Build 12 77784970 1D CATTTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 129 hom 32 3 21 9 A 15 14 192092 CASAVA_Build 12 77795583 1I ACAGCCTGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 8 9 192093 CASAVA_Build 12 77799891 1D GCACCCTGTA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 82 het 31 0 25 6 T 8 7 192094 CASAVA_Build 12 77801941 4I TAAAATACTC ----/AAAT AATCTAATAA 1856 het 1856 ref 15 9 5 1 AAAT 0 1 192095 CASAVA_Build 12 77802386 1D TACTAAAGGA T/- TTTATAGATT 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 T 4 3 192096 CASAVA_Build 12 77807579 4D ATTGATTTAT AAAG/---- AAAGAAAGGT 3070 het 3070 hom 31 14 16 3 AAAG 3 2 192097 CASAVA_Build 12 77817532 1D AGAGTTTTTT C/- TTTTTTCTTA 3070 het 2279 hom 24 6 14 5 C 1 0 192098 CASAVA_Build 12 77832016 4D ATTAATGTTC AATT/---- AATTATTCTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 AATT 2 1 192099 CASAVA_Build 12 77832391 5I35M4I CAACAAATTA -----TAATTTGTTTGTATTGATGCACATGTTAGATAGAT----/TAAAGTAATTTGTTTGTATTGATGCACATGTTAGATAGATAGAC AGATGATAGA 3070 het 3070 hom 51 30 38 4 N/A 0 0 192100 CASAVA_Build 12 77832548 2D TTAAATAGAC AT/-- ATGAATTACA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 AT 2 1 192101 CASAVA_Build 12 77833015 2D TGATGTCATC AG/-- AGAGATGCTT 3070 het 3070 ref 50 26 14 14 AG 3 2 192102 CASAVA_Build 12 77835533 2D AAAAAATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2134 hom 19 7 10 7 A 13 11 192103 CASAVA_Build 12 77837935 1I CATTGGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 9 10 192104 CASAVA_Build 12 77838484 2I TTTTATAACC --/AA AAGTTCTCTA 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 A 2 4 192105 CASAVA_Build 12 77839905 1D TTTAAAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 11 10 192106 CASAVA_Build 12 77879772 3D AAGTAGCTGA TAT/--- TATACTTTAG 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TAT 2 1 192107 CASAVA_Build 12 77890451 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1934 het 1934 ref 18 10 4 4 T 1 0 192108 CASAVA_Build 12 77919172 1D CATTTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 824 het 824 ref 43 33 3 7 A 12 11 192109 CASAVA_Build 12 78049029 1D GTGTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 712 het 712 ref 28 20 3 5 T 13 12 192110 CASAVA_Build 12 78053681 2D CACAGGAAAC AG/-- GGGTCAATGA 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 AG 1 0 192111 CASAVA_Build 12 78092325 1D GTCCTTATAG A/- AAAAATAGGC 3070 hom 102 het 37 0 33 5 A 6 5 192112 CASAVA_Build 12 78093045 1I TTTAGCCTGT -/C CCTCTATCAA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 C 2 3 192113 CASAVA_Build 12 78095810 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTCTTG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 6 7 192114 CASAVA_Build 12 78096162 1I ATTTTGAGAT -/C TTTTTTATTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 0 1 192115 CASAVA_Build 12 78098118 2I AACCATTATT --/TC TCTTTGAAAA 3070 hom 86 het 32 0 29 3 TC 1 2 192116 CASAVA_Build 12 78098392 9D ATTTTCTTTT TTTTTTTTA/--------- AAAAAAGGAG 3070 hom 57 het 19 0 19 3 TTTTTTTTA 1 0 192117 CASAVA_Build 12 78103788 9I TTTTTAAATC ---------/TTCAACATT TTCAACATTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 TTCAACATT 1 2 192118 CASAVA_Build 12 78106870 1I CACTAACCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 9 10 192119 CASAVA_Build 12 78120998 1I AAGCCTATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 41 0 30 11 A 9 10 192120 CASAVA_Build 12 78130410 1I AAGTAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 26 1 19 6 A 13 14 192121 CASAVA_Build 12 78135811 2D TCCAGTTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 12 10 192122 CASAVA_Build 12 78144080 10D CATCTTACTA AATCATACAT/---------- TTTAAATTTC 3070 hom 96 het 33 0 33 5 AATCATACAT 1 0 192123 CASAVA_Build 12 78161030 1D ACAGCAGGGG A/- AAAACCAGCC 3070 hom 51 het 18 0 18 2 A 5 4 192124 CASAVA_Build 12 78176027 1D AATAAACAAG A/- ATATCTCATT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 2 1 192125 CASAVA_Build 12 78176299 1D TCACTTTTGT A/- AACTGAGAGT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 3 2 192126 CASAVA_Build 12 78178717 1I AAATCTCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 29 1 24 4 T 11 12 192127 CASAVA_Build 12 78180372 3I TTACAAGAAA ---/TAT TATACAATTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAT 1 2 192128 CASAVA_Build 12 78207802 1D AACTCAGTAG T/- TTTTTTTTTT 1579 het 1096 hom 23 3 7 13 T 17 16 192129 CASAVA_Build 12 78278106 1D CAAGTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 2059 het 2059 ref 34 18 5 11 T 13 12 192130 CASAVA_Build 12 78303376 1D TATTCATTGA T/- TTTTTTCAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 6 192131 CASAVA_Build 12 78309882 4I CAATTCATAT ----/ATAC TGTAAACCTT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 ATAC 0 1 192132 CASAVA_Build 12 78310671 1I CCTGAAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 13 1 9 3 T 11 12 192133 CASAVA_Build 12 78310710 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1258 het 1258 ref 19 8 5 6 T 18 17 192134 CASAVA_Build 12 78408590 1I CTAATGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 34 1 27 6 T 14 15 192135 CASAVA_Build 12 78417218 1D TTCTTCTGGC A/- AAAAAAAAAA 1972 het 1972 ref 48 36 6 6 A 13 12 192136 CASAVA_Build 12 78477309 1I TTCAAATCTT -/A AAGACTATCT 3070 het 3070 ref 47 26 12 9 A 2 3 192137 CASAVA_Build 12 78505820 4D ATGATCAAAG CTGT/---- CTAACACAAT 3070 het 3070 ref 37 21 15 4 CTGT 1 0 192138 CASAVA_Build 12 78539445 1D CAAGGCATTC T/- GCAGAAGGTA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 T 1 0 192139 CASAVA_Build 12 78540038 1D GGAATTGGAC A/- AAAAAAAAAA 1305 het 1305 ref 49 43 3 5 A 11 10 192140 CASAVA_Build 12 78556050 1D TTTGGGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1486 het 1486 ref 46 32 4 10 A 13 12 192141 CASAVA_Build 12 78582570 1I ACTCTTTGGC -/G GGGGGGGGGA 999 het 145 hom 13 1 5 7 G 9 10 192142 CASAVA_Build 12 78635549 1D ATGCATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 T 17 16 192143 CASAVA_Build 12 78664229 1D AAAAATAAGT A/- AATATGAATG 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 A 3 2 192144 CASAVA_Build 12 78673708 1D ATATAATGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 10 9 192145 CASAVA_Build 12 78675224 2I AACAAACTCA --/TT GCCTTTAGCA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 0 2 192146 CASAVA_Build 12 78676083 1D ACTTAAAATT A/- AAAAAATTTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 7 6 192147 CASAVA_Build 12 78678979 1D8M1D12M1D CATGTTGGCC AAGCTGGTCATGAACTCACGACT/-AGATGGTC-TCATCTCTTGAC- CAGGTGATCC 3070 het 3070 ref 28 17 16 8 N/A 0 0 192148 CASAVA_Build 12 78686773 2D CTGCTTCAGC CT/-- CTTGAGTAGA 3070 het 10 hom 69 1 64 7 CT 2 1 192149 CASAVA_Build 12 78690335 2D ATATTCAGAT AC/-- AGAGACCACA 3070 het 3070 hom 45 22 23 0 AC 1 0 192150 CASAVA_Build 12 78692546 1D TTTTTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 34 1 19 14 A 13 12 192151 CASAVA_Build 12 78693629 1D GGTCTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 33 1 25 7 A 12 11 192152 CASAVA_Build 12 78707690 1D TAGGTGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 662 hom 29 5 14 10 T 17 16 192153 CASAVA_Build 12 78712676 4D TCAGTGAAAG AATA/---- GTTAGAAATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AATA 1 0 192154 CASAVA_Build 12 78725403 2D GTACTAAGAT TA/-- TATACCCTAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TA 3 2 192155 CASAVA_Build 12 78733893 1D ACAGCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 11 10 192156 CASAVA_Build 12 78750992 1I AAAAGCACTT -/A ACTCTAAGCA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 1 2 192157 CASAVA_Build 12 78751582 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2684 hom 17 het 12 0 7 5 A 17 16 192158 CASAVA_Build 12 78767307 1D CAAAGGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 61 hom 33 1 26 7 A 10 9 192159 CASAVA_Build 12 78785442 1D CTTAAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 11 10 192160 CASAVA_Build 12 78813914 1D GTTAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 8 T 11 10 192161 CASAVA_Build 12 78834297 1D ATTCATTCTT A/- AGACAGATAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 1 192162 CASAVA_Build 12 78844656 1D AGATTTAAAG A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 6 192163 CASAVA_Build 12 78844944 1D TCTGTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 11 10 192164 CASAVA_Build 12 78851933 3D2M5D CCGGAGGTGG GCAAGCCCTT/---AG----- TAGAGGGCTT 3070 hom 104 het 37 0 33 7 N/A 0 0 192165 CASAVA_Build 12 78860084 1I TATGATGTTG -/A CAACTTCCTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 1 192166 CASAVA_Build 12 78878837 1D CATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 T 11 10 192167 CASAVA_Build 12 78878962 9D TCCCAAGTAG CTGGGATTA/--------- CTGGGATTAC 3070 hom 63 het 22 0 21 2 CTGGGATTA 2 1 192168 CASAVA_Build 12 78891129 4D CGGGGCGGGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 50 het 21 0 18 4 GA 9 7 192169 CASAVA_Build 12 78891270 1I GTGAAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 31 2 22 7 T 10 11 192170 CASAVA_Build 12 78898014 2I AATGATAAAC --/AT ATGTTGTAAC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AT 1 2 192171 CASAVA_Build 12 78900823 2D TCTATTTCTC TT/-- TCTCTCTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 3 1 192172 CASAVA_Build 12 78917820 20D GTCGCCCAGG CTGGAGTGCAGTGGCATGAT/-------------------- CTGGAGTGCA 2836 hom 16 het 11 0 6 5 CTGGAGTGCAGTGGCATGAT 2 1 192173 CASAVA_Build 12 78933658 1D GTGCTATCAA T/- TTTTTTTTTT 792 het 792 ref 34 25 3 6 T 15 14 192174 CASAVA_Build 12 78955901 1I GAAAAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 10 11 192175 CASAVA_Build 12 79010010 1D TCTCCTCCCC A/- CTGACTTTTG 3070 het 3070 ref 50 21 20 10 A 1 0 192176 CASAVA_Build 12 79084106 2I TCCCTTCTTC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 531 hom 29 2 18 9 CT 8 9 192177 CASAVA_Build 12 79092850 1I GTAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 41 0 35 6 A 9 10 192178 CASAVA_Build 12 79103965 2I TAGGGCTTCT --/TC TTTCCAAGGG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TC 0 1 192179 CASAVA_Build 12 79110666 1I GGGAAATACC -/T GTCAAATTAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 0 1 192180 CASAVA_Build 12 79124598 1D TTGTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1193 het 1193 ref 18 10 3 6 T 15 14 192181 CASAVA_Build 12 79130820 1I AGTAGAGACC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 797 hom 40 2 32 6 T 8 9 192182 CASAVA_Build 12 79138451 9D GCCAGTCATT CTTTTGGAC/--------- CTTTAATTAA 3070 het 3070 ref 27 17 10 3 CTTTTGGAC 1 0 192183 CASAVA_Build 12 79139592 1D TAAAAAGACG T/- TTTTGAAAGA 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 T 5 4 192184 CASAVA_Build 12 79151877 4I TTTATAACAA ----/TAGT TAGTTTGAGC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TAGT 1 2 192185 CASAVA_Build 12 79169866 1I AAGTATGCAA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 7 8 192186 CASAVA_Build 12 79172280 5D ATTGATTTTA TTTAT/----- TTTATTTTAT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 TTTAT 3 2 192187 CASAVA_Build 12 79175219 1I TAAGGTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 782 hom 35 3 22 10 T 13 14 192188 CASAVA_Build 12 79182704 1I CAATACACTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 8 9 192189 CASAVA_Build 12 79187957 1D AAATTCAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 635 hom 44 2 35 7 A 13 12 192190 CASAVA_Build 12 79187970 1D AAAAAAAAAA C/- AACAGATTTG 3070 het 876 hom 46 9 32 6 C 1 0 192191 CASAVA_Build 12 79193877 4D AAAAAATCTG CTTT/---- ATTGACTTGC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 CTTT 1 0 192192 CASAVA_Build 12 79195388 4I CTTAATTATA ----/TATT TATATTTAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TATT 0 1 192193 CASAVA_Build 12 79214618 5D ATTTTAGAGG TAAGT/----- TGTTTTTCAG 3070 hom 66 het 25 0 23 5 TAAGT 1 0 192194 CASAVA_Build 12 79242943 1D TATAAACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 42 0 32 11 T 11 10 192195 CASAVA_Build 12 79246517 1I AATGTAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 48 1 43 4 T 10 11 192196 CASAVA_Build 12 79262743 1D GAACATCTTG C/- TTTTATATTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 1 0 192197 CASAVA_Build 12 79267008 1I GAAGGGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 37 1 30 6 T 10 11 192198 CASAVA_Build 12 79270366 3I CTGTTAACTG ---/AAT AATATTTTTC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AAT 1 2 192199 CASAVA_Build 12 79274873 1I AGGATCTAGG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 7 8 192200 CASAVA_Build 12 79281454 2D GGGAGTGGGA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 AG 5 4 192201 CASAVA_Build 12 79284602 1D TTAGTATCTG T/- TTTTTCACTA 3070 hom 57 het 23 0 19 5 T 6 5 192202 CASAVA_Build 12 79285052 2D CATACCCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 29 3 14 12 T 17 15 192203 CASAVA_Build 12 79286295 2I TGGAAAATGT --/CC CCCCCCCCAC 3070 hom 118 het 48 0 36 12 C 8 10 192204 CASAVA_Build 12 79286731 4D ACAACTACTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 8 T 16 12 192205 CASAVA_Build 12 79288336 2D TTAGATAAAC TT/-- AGGGTCATTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 0 192206 CASAVA_Build 12 79289815 3D ATTTTTCTAT GAA/--- GGCTTTGTGG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 GAA 1 0 192207 CASAVA_Build 12 79297381 1D AACATTGCAT C/- TGCAAATCCC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 C 1 0 192208 CASAVA_Build 12 79297488 2I TCCTATTAAC --/AT ATATAGATAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AT 2 3 192209 CASAVA_Build 12 79298510 1I CCAGACTGGT -/A AAAAAACCAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 6 7 192210 CASAVA_Build 12 79299126 2I TTAAATTTTA --/TG TATATATATA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TG 0 1 192211 CASAVA_Build 12 79301054 2I ACAGACTCTC --/AT GTGTTGATTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 192212 CASAVA_Build 12 79301304 1D TTTATTGCTA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 7 192213 CASAVA_Build 12 79303821 1I TTGCGGAGGG -/A AAAAAAACTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 192214 CASAVA_Build 12 79310347 6D ACATATATAT AATATA/------ ATATAATATA 3070 hom 18 het 7 0 7 1 AATATA 1 0 192215 CASAVA_Build 12 79315404 1I AGAAACCAAA -/T ATGGATGAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 0 1 192216 CASAVA_Build 12 79317385 2D ATATAGTATC AT/-- GTGTGTATTT 3070 hom 164 het 58 0 54 5 AT 1 0 192217 CASAVA_Build 12 79318254 2D GCCGCAGAGA AC/-- ACACACACAC 1220 het 1220 ref 57 40 7 11 AC 8 7 192218 CASAVA_Build 12 79325009 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATATATA 3070 hom 44 het 20 0 15 8 TGTA 1 0 192219 CASAVA_Build 12 79333435 1I GGGATTTTAC -/T TAGCTGTTTC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 T 1 2 192220 CASAVA_Build 12 79336449 1I TCTTTTATTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 32 het 30 1 26 3 T 8 9 192221 CASAVA_Build 12 79345523 1I ATTTCACTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 9 10 192222 CASAVA_Build 12 79346580 2I CAACAGGAAA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 9 11 192223 CASAVA_Build 12 79354454 1D GTTCTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 26 1 19 6 T 15 14 192224 CASAVA_Build 12 79359357 1I ATATGAAATG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 192225 CASAVA_Build 12 79402313 1I AATTTCCCCC -/T TTTTCTTTTC 2681 hom 21 het 11 0 8 3 T 4 5 192226 CASAVA_Build 12 79407283 1D CTATCTCTTT G/- GGGGGACAAT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 G 6 5 192227 CASAVA_Build 12 79407898 9I3M8I TGAATGTAAG ---------AAG--------/TCTTGTGCTAAGTCTTGTGC AAAGTCTTGT 3070 hom 129 het 44 0 44 8 N/A 0 0 192228 CASAVA_Build 12 79414457 1I CTTTTGTTTT -/G CTTTGTTTGT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 G 0 1 192229 CASAVA_Build 12 79417030 1I GAGAAGTAAA -/G TTGGGGCTTG 3070 hom 120 het 46 0 40 7 G 0 1 192230 CASAVA_Build 12 79446391 1I AAAAGTCTTG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 6 7 192231 CASAVA_Build 12 79453137 4D CTCTTTACAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AC 10 8 192232 CASAVA_Build 12 79461248 1I TATATCCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 51 1 40 10 T 10 11 192233 CASAVA_Build 12 79554501 1I TGCACAAGGG -/A AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 6 7 192234 CASAVA_Build 12 79555109 1D AAAGAGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 17 7 T 12 11 192235 CASAVA_Build 12 79563211 1D TTAGACTCAC A/- TGCTTTTTGT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 1 0 192236 CASAVA_Build 12 79596770 13D TTTTCTTTAA CTTTTCTCTAATC/------------- CAAGTTGGGC 3070 het 3070 ref 31 16 16 5 CTTTTCTCTAATC 1 0 192237 CASAVA_Build 12 79663491 1I AAATTATGGA -/T TTTTTCTCTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 5 6 192238 CASAVA_Build 12 79667044 1I AATTAGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 31 2 14 15 T 13 14 192239 CASAVA_Build 12 79668941 1D CCTCAAAAAA T/- CTAAAAATTG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 1 0 192240 CASAVA_Build 12 79669955 8I ATTACAGTTC --------/ACAAAAAA ACCAACAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 ACAAAAAA 0 1 192241 CASAVA_Build 12 79670393 1I ACAGCCTGTA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 2740 hom 28 7 18 3 T 7 8 192242 CASAVA_Build 12 79677901 5D GTATTGTAAT TAATC/----- TATTCTATTG 3070 het 3070 hom 41 21 20 1 TAATC 1 0 192243 CASAVA_Build 12 79697368 1I TTCTATGGGT -/C CCCTTCTTTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 C 3 4 192244 CASAVA_Build 12 79700091 1I ACTTTTGCTT -/A AAGGCAAATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 2 3 192245 CASAVA_Build 12 79702459 2D ACCTAGACTA AG/-- AGGTATTTTA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 AG 2 1 192246 CASAVA_Build 12 79713386 1D7M8D TAGAAAACAC AAATGTAAACTATCTT/-AATGTAA-------- ACCATTTGAT 3070 het 3070 ref 52 34 20 7 N/A 0 0 192247 CASAVA_Build 12 79718974 2D GAAAATAAGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 26 0 15 13 AT 8 7 192248 CASAVA_Build 12 79732330 3I GTTTATGTTT ---/TAA TAATAATGGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TAA 2 3 192249 CASAVA_Build 12 79733006 7I CAGAAGCATA -------/TCTTAAT TCTTGTCTTA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 TCTTAAT 0 1 192250 CASAVA_Build 12 79734321 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2250 hom 20 7 8 5 A 11 10 192251 CASAVA_Build 12 79734394 2I ATACAATAGT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 TA 6 7 192252 CASAVA_Build 12 79743650 1I TCAGAATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 13 12 T 11 12 192253 CASAVA_Build 12 79744015 3D GCTTTCTTGC AGG/--- AGAAGTCAAA 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 AGG 1 0 192254 CASAVA_Build 12 79746683 4D TTGTATTTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 5 AAAT 3 2 192255 CASAVA_Build 12 79752735 1D AAAATTATAT A/- AACCCTTAGA 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 A 3 2 192256 CASAVA_Build 12 79754497 2D TCTGGGAGGC AG/-- AGTTTGCAGT 1418 het 1418 ref 12 7 5 0 AG 2 1 192257 CASAVA_Build 12 79758522 2I TAAATAAAAC --/AT ATATTGTGTT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 AT 2 3 192258 CASAVA_Build 12 79760540 1I CCATTACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 10 192259 CASAVA_Build 12 79760890 1D GCATTAGATT G/- GAAAGATAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 2 1 192260 CASAVA_Build 12 79762685 2I CAGAGAATAT --/AA GTTATGAGAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 0 2 192261 CASAVA_Build 12 79769680 1I CATTTGTAAG -/C ACATTTCATT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 C 0 1 192262 CASAVA_Build 12 79771550 1D TGTGTAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 22 8 A 12 11 192263 CASAVA_Build 12 79781813 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 11 24 4 T 9 8 192264 CASAVA_Build 12 79783277 1D34M1D GCTGTTGGAT AAAGAATAAGGATGCCTGCTTATATAATATCTACCA/-AAGAATAAGGATGCCTGCTTATATAATATCTACC- CAGTTTTTAT 3070 hom 135 het 36 0 46 7 N/A 0 0 192265 CASAVA_Build 12 79787659 1D ACGCCAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 17 10 6 T 13 12 192266 CASAVA_Build 12 79791456 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2516 het 2516 ref 28 12 11 6 A 11 10 192267 CASAVA_Build 12 79799071 1I TCTCCAGGGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 7 8 192268 CASAVA_Build 12 79799540 2D AAAGCTAAGT TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 33 0 24 9 TA 8 7 192269 CASAVA_Build 12 79804115 1D AACTTCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 12 11 192270 CASAVA_Build 12 79804405 1I AATAATAAAG -/A AAATTCCAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 3 4 192271 CASAVA_Build 12 79808873 1D TCAGAGCTCA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 49 23 22 5 T 8 7 192272 CASAVA_Build 12 79816534 1D GCAGAGTATG T/- TTTTTCCATT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 T 6 5 192273 CASAVA_Build 12 79819451 1I AATTGAGAGA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 T 6 7 192274 CASAVA_Build 12 79820380 3I GGCTATTTTT ---/ATG ATATTGATTC 3070 het 3070 hom 37 11 14 12 ATG 0 1 192275 CASAVA_Build 12 79823101 2D TTTCCAAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 72 hom 22 3 11 9 T 12 10 192276 CASAVA_Build 12 79827769 1I AATTTTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 11 13 A 11 12 192277 CASAVA_Build 12 79829923 4I TTTATTTCTC ----/TATT TATTAACAGA 3070 het 3070 hom 48 21 18 9 TATT 1 2 192278 CASAVA_Build 12 79830624 6D GACTTGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1717 het 578 hom 9 3 5 1 A 16 10 192279 CASAVA_Build 12 79854647 1I CCCTGAGCTT -/G GTGAGGGCGT 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 G 1 2 192280 CASAVA_Build 12 79859326 4I CTTGAGACAT ----/ACTC AGAGAGAGGA 3070 het 2982 hom 19 7 9 3 ACTC 0 1 192281 CASAVA_Build 12 79863306 1D TTAAGAAGGA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 8 7 192282 CASAVA_Build 12 79864903 2D TCCTTTAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 GT 6 5 192283 CASAVA_Build 12 79866858 2D ATATAATGTG TA/-- TATATATGTT 1171 het 1171 ref 14 10 4 0 TA 4 3 192284 CASAVA_Build 12 79872807 4I GGGCAAATGG ----/ATGA ATAATACAAA 3070 het 3070 ref 47 28 18 1 ATGA 0 1 192285 CASAVA_Build 12 79880695 1D TTAACTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 8 T 11 10 192286 CASAVA_Build 12 79899758 1D GTTTTATCCA C/- CCCCCACAAC 3070 het 3070 ref 52 23 18 11 C 6 5 192287 CASAVA_Build 12 79903034 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1780 het 1499 hom 22 6 4 12 A 12 11 192288 CASAVA_Build 12 79919874 1I TTTGATGTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 7 8 192289 CASAVA_Build 12 79926804 2D GGTCAACAAC AT/-- AAATAATTAG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AT 1 0 192290 CASAVA_Build 12 79935452 2I CTAAATTGTA --/TC TCTCTATGCT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TC 2 3 192291 CASAVA_Build 12 79955477 1I GCTTCTAGGC -/T TTTTTTTTTT 2778 het 2778 ref 26 8 7 11 T 12 13 192292 CASAVA_Build 12 79959474 5I TGAAAATCTT -----/CCTCA CCTCACCCAT 3070 hom 96 het 38 0 31 7 CCTCA 1 2 192293 CASAVA_Build 12 79961701 19I GATAAAAAAC -------------------/AAACAAACAAAGTAATGTT AGATAATCAT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AAACAAACAAAGTAATGTT 0 1 192294 CASAVA_Build 12 79963084 1I ACCTCCCGGG -/T TCAAGTGATT 1699 hom 15 het 6 0 6 0 T 1 2 192295 CASAVA_Build 12 79964693 3I TCTCTTTTAT ---/TCC TTTTAAAGTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TCC 0 1 192296 CASAVA_Build 12 79965672 1D CAAATTGTTC T/- TTTTCTATGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 5 4 192297 CASAVA_Build 12 79970109 3I CTGAAACTGA ---/AAT AATAATGAGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAT 2 3 192298 CASAVA_Build 12 79971138 1I TGCAATACAT -/A AAAAAATTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 192299 CASAVA_Build 12 79976839 1D CCAGCTTCTC T/- TTGTACCTCT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 T 3 2 192300 CASAVA_Build 12 79980153 1D GTGTACTGCA C/- CCACTGTCCT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 3 2 192301 CASAVA_Build 12 79991215 4I CACCTCCCTG ----/GTTC AGGCAATTCT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 GTTC 0 1 192302 CASAVA_Build 12 79992085 2D TAGTAGAGAC AG/-- GGTTTCACCA 2944 het 2944 ref 23 11 8 4 AG 1 0 192303 CASAVA_Build 12 79992334 2D TCTTTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 76 het 36 0 26 10 TC 10 9 192304 CASAVA_Build 12 79993053 1D TTAACCATTG A/- AAAGATTGTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 4 3 192305 CASAVA_Build 12 79993981 1I AGCTCCTCCT -/C CCCACTTTTA 3070 hom 95 het 36 0 32 4 C 3 4 192306 CASAVA_Build 12 80004173 1I TTTAAAATAT -/A AAAATCATCA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 4 5 192307 CASAVA_Build 12 80010925 1D GTGTTTAAGG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 39 12 19 9 T 9 8 192308 CASAVA_Build 12 80011375 1D CACCGCCACC A/- AAAAAAAAAA 2760 het 2760 ref 39 19 9 11 A 13 12 192309 CASAVA_Build 12 80021604 1D ACTCTTGTTT A/- AAAAAAAAAT 2993 het 2993 ref 23 12 7 4 A 10 9 192310 CASAVA_Build 12 80037987 2D AAAAATAGAA GT/-- GTGTGCCCCA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 GT 3 2 192311 CASAVA_Build 12 80040973 1I CATTTGCAGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 43 20 21 2 A 8 9 192312 CASAVA_Build 12 80044499 1D TCAAGGAAAT G/- GAAGACAATA 3070 het 3070 ref 53 30 17 6 G 2 1 192313 CASAVA_Build 12 80047244 1D ACTCAGAATG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 A 8 7 192314 CASAVA_Build 12 80047508 1D TGACCTGCGA T/- TTTGAGATCT 3070 het 3070 hom 19 7 11 1 T 4 3 192315 CASAVA_Build 12 80051028 1D TAAAATCGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 27 1 8 18 T 11 10 192316 CASAVA_Build 12 80051895 1I TATCATGTGT -/G GGCTTATAAT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 G 2 3 192317 CASAVA_Build 12 80055047 1D CTTTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 2433 het 2433 ref 28 14 6 9 T 11 10 192318 CASAVA_Build 12 80058304 1D GCAGATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 11 10 192319 CASAVA_Build 12 80062509 1I AAGTATCAAC -/A TGAGAGAAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 0 1 192320 CASAVA_Build 12 80066070 1D AAAGACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 11 10 192321 CASAVA_Build 12 80068795 1I TAAAAAACAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 2066 hom 32 7 17 8 T 8 9 192322 CASAVA_Build 12 80069468 1I ATTAGAAAAG -/T TTTGTATTGC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 3 4 192323 CASAVA_Build 12 80070261 2I TATCCCTAAC --/AG ATTTCTAGAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AG 0 1 192324 CASAVA_Build 12 80074411 1I AAAATTAATG -/A AAAAAGAACT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 5 6 192325 CASAVA_Build 12 80081043 1D TTCTTTATAG A/- ATGATCGGTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 A 2 1 192326 CASAVA_Build 12 80095377 1I GTAAAGTTTC -/A AAGATCCAAA 3044 het 3044 ref 24 13 7 4 A 2 3 192327 CASAVA_Build 12 80096386 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 9 10 192328 CASAVA_Build 12 80097676 4I GTGACAGAGC ----/GAGA GAGACTCCGT 1733 hom 22 het 9 0 4 5 GA 2 4 192329 CASAVA_Build 12 80101762 1I ATGGTACTTC -/A AAAATCCCAC 3070 het 3070 ref 51 26 17 8 A 4 5 192330 CASAVA_Build 12 80105064 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 8 192331 CASAVA_Build 12 80110300 4D AGGAAAAAAG CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 27 10 11 8 CAAA 4 3 192332 CASAVA_Build 12 80112771 1D GGGGATAGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 12 20 14 A 10 9 192333 CASAVA_Build 12 80127299 1D ATTGCTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1570 hom 21 5 13 3 A 17 16 192334 CASAVA_Build 12 80128444 4I AATAAGAAGG ----/CTTT CTATGAACCT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 CTTT 0 1 192335 CASAVA_Build 12 80147800 1D TGCCCAAAGA G/- GCATCGGCAG 3070 het 3070 ref 45 26 16 4 G 2 1 192336 CASAVA_Build 12 80164974 5I AAGGAACTTT -----/ATAAA ATATTTTAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATAAA 0 1 192337 CASAVA_Build 12 80173429 4D AGGTCTTTTG TTAC/---- TTAGGCAAGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTAC 1 0 192338 CASAVA_Build 12 80178916 4D TAAAGTAGCT TTCA/---- TTAATTGGTA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TTCA 1 0 192339 CASAVA_Build 12 80211949 1D ACTTGGAAAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 177 hom 49 1 44 4 A 9 8 192340 CASAVA_Build 12 80225543 2D GCTCCTAGAA TC/-- TCTCTATCTC 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 TC 3 2 192341 CASAVA_Build 12 80225876 1D TCATGCTTTA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 7 6 192342 CASAVA_Build 12 80232782 1D TAAATAAATA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 8 7 192343 CASAVA_Build 12 80235421 1I ATTTGAGAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 8 9 192344 CASAVA_Build 12 80237950 4D TTCTGGAATA CAGT/---- TCATTTAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 22 2 CAGT 1 0 192345 CASAVA_Build 12 80251508 5I TTAATCAATA -----/ATCAT TTGACTTTAG 674 het 674 ref 34 14 4 19 ATCAT 0 1 192346 CASAVA_Build 12 80256515 2I AGTTTTAAGC --/AA AAAAAAAAAT 2934 het 2934 ref 18 7 7 4 A 9 11 192347 CASAVA_Build 12 80259367 2I TTTGATTAAT --/AA AAACACCATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 5 192348 CASAVA_Build 12 80262841 5I TGGGGCCATG -----/TGTAC TGTACAGGCA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TGTAC 1 2 192349 CASAVA_Build 12 80265037 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 34 18 12 5 T 9 8 192350 CASAVA_Build 12 80268718 1I TATTGTCATA -/C AGGTAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 C 0 1 192351 CASAVA_Build 12 80278698 4I TATAATAAGT ----/TCTA TCTGTTTAGC 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 TCTA 0 1 192352 CASAVA_Build 12 80284976 1D GAATAGAAAA T/- AAAAATAGAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 1 0 192353 CASAVA_Build 12 80289179 1D8M3I12M29D AATATTATTT AAAAATATA---TTTTATTAAAAATAAAAATTTAAATAATATTATTTAAATTT/-AAATTTTAGAGTTCTATTAAGAA----------------------------- TAGAGTAAGT 3070 hom 45 het 13 0 16 2 N/A 0 0 192354 CASAVA_Build 12 80298448 1D CTGCTTATTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 A 9 8 192355 CASAVA_Build 12 80298918 1I GTGTGTATAC -/A AAAAAAAAAA 2444 het 1213 hom 30 5 9 16 A 12 13 192356 CASAVA_Build 12 80313461 2D CTCCTCCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 TC 8 7 192357 CASAVA_Build 12 80350023 1I AAATAATTAG -/T TTTTTTAATC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 6 7 192358 CASAVA_Build 12 80350936 1I AACAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 10 11 192359 CASAVA_Build 12 80353665 5D ACAATCTAAA TCTCT/----- TCTCTTAATT 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 TCTCT 2 1 192360 CASAVA_Build 12 80361441 1I ACAACAACCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 7 8 192361 CASAVA_Build 12 80370909 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 1048 hom 10 het 7 0 4 3 T 9 10 192362 CASAVA_Build 12 80376262 10D TTTTTTTTTT TTACAAAATA/---------- ACAAAATAAC 3070 het 458 hom 29 4 14 12 TTACAAAATA 1 0 192363 CASAVA_Build 12 80382867 1I TTTAATTGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 8 9 192364 CASAVA_Build 12 80385305 1I AAGCTTTCTT -/A AAACATGTCT 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 A 3 4 192365 CASAVA_Build 12 80390655 1D CTTCCCCAGC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 6 192366 CASAVA_Build 12 80402142 1D ATGGACAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 9 8 192367 CASAVA_Build 12 80403723 4D TTTGACACCC TTTA/---- TTTAAGGAAC 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 TTTA 2 1 192368 CASAVA_Build 12 80417568 4I ATGAGAAGAG ----/TGGA TGGACTTCAG 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 TGGA 1 2 192369 CASAVA_Build 12 80425327 3D CCAGAACATA ATT/--- ATTATTAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 22 3 ATT 3 2 192370 CASAVA_Build 12 80433882 1I GCATGCCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 11 12 192371 CASAVA_Build 12 80445279 1I GGGGAGCTCC -/A ATTTTATGCT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 1 2 192372 CASAVA_Build 12 80446058 1D ATATTCAGTA T/- TTTTTTGAAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 7 6 192373 CASAVA_Build 12 80448663 1I20M1I TAAAAAAGAG -AAAAAAAAAAACACATTATA-/AAAAAAAAAAAACACATTATAT TAATATATGT 3070 het 3070 ref 38 21 18 7 N/A 0 0 192374 CASAVA_Build 12 80450878 2I TATCATTTAA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 9 11 192375 CASAVA_Build 12 80453553 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 15 15 17 AC 7 8 192376 CASAVA_Build 12 80459582 1I TTAAAGCAAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 8 9 192377 CASAVA_Build 12 80477715 1D TGCTTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 18 12 T 11 10 192378 CASAVA_Build 12 80482197 4D CAAGCTGAAG GAAA/---- GAAACTTAGA 3070 het 3070 ref 47 21 22 6 GAAA 2 1 192379 CASAVA_Build 12 80499638 8D AAACAAAACA AAACGAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 41 24 16 3 AAACGAAC 1 0 192380 CASAVA_Build 12 80510726 25D AATTCACTGG TGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTC/------------------------- TGCATCCCAG 3070 het 3070 ref 36 27 12 3 TGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTC 1 0 192381 CASAVA_Build 12 80515655 1D GTGTTCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 20 8 T 11 10 192382 CASAVA_Build 12 80519508 1D CATTTGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2217 hom 27 9 10 8 T 11 10 192383 CASAVA_Build 12 80522508 2I AATCGAAAAT --/TA TATATATATA 1896 het 1896 ref 23 10 4 9 TA 6 7 192384 CASAVA_Build 12 80527004 1I ATACTATAGA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 T 8 9 192385 CASAVA_Build 12 80564976 1D TAAAAAAAAA G/- GGGGGGGGAG 2759 het 2759 ref 27 13 6 8 G 9 8 192386 CASAVA_Build 12 80565673 2D TCTGTCTCAA AT/-- ATATATATAT 1725 hom 10 het 6 0 4 2 AT 8 7 192387 CASAVA_Build 12 80576206 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3021 het 1028 hom 19 6 10 3 A 11 10 192388 CASAVA_Build 12 80599626 1D TGTGCAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 A 11 10 192389 CASAVA_Build 12 80601260 2D GAAAAAAATA AT/-- ATATATATAT 3070 het 343 hom 18 1 12 6 AT 8 7 192390 CASAVA_Build 12 80607035 1I TCTTAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 A 9 10 192391 CASAVA_Build 12 80616678 4I CTTTATACAC ----/ACAA ACACACACAC 3070 het 3070 ref 51 30 18 3 ACAA 0 1 192392 CASAVA_Build 12 80617464 1D TCTCTAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 12 11 1 A 10 9 192393 CASAVA_Build 12 80626365 3D GCAAAAAGTT TTC/--- TTAAGTTATT 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 TTC 1 0 192394 CASAVA_Build 12 80628217 2D CACTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 CA 7 6 192395 CASAVA_Build 12 80635192 3D TGAAACAGTG TTC/--- TTCTTTTGTT 3070 het 3070 ref 50 22 23 7 TTC 2 1 192396 CASAVA_Build 12 80658897 1D ATTCATACAC T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 8 7 192397 CASAVA_Build 12 80659546 1D TTTTTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 648 hom 29 2 17 10 T 15 14 192398 CASAVA_Build 12 80661687 4D ATACATGTGA CAGC/---- CAGCAGAATT 3070 het 3070 hom 38 17 19 4 CAGC 2 1 192399 CASAVA_Build 12 80669324 1D ATTTACAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 13 12 192400 CASAVA_Build 12 80671228 1D TATCTTAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2806 hom 22 8 11 4 T 10 9 192401 CASAVA_Build 12 80684092 1D TCCCCAGTCA C/- CCCTGTCATT 3070 hom 147 het 51 0 45 6 C 4 3 192402 CASAVA_Build 12 80685221 1I CTCCACCAGG -/A AAAAAGCCAT 3070 het 86 hom 36 1 31 4 A 5 6 192403 CASAVA_Build 12 80689950 1I TTGACCCAAG -/A TGTCTTCTGC 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 A 0 1 192404 CASAVA_Build 12 80693404 1D AAATTAAAAG A/- AAAAATCAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 6 5 192405 CASAVA_Build 12 80698389 1I TGAAAAAAAA -/T CATCATCAGT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 0 1 192406 CASAVA_Build 12 80702169 1D GTTCAATCTT G/- TTATATTAAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 G 1 0 192407 CASAVA_Build 12 80704871 3D ACAAAGAGCT TGC/--- TGCGCACATG 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 TGC 2 1 192408 CASAVA_Build 12 80712543 2D TTTAAAATTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 13 11 192409 CASAVA_Build 12 80721954 1D AATTCTATGC A/- ATATTTTAAT 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 A 2 1 192410 CASAVA_Build 12 80727368 17D GTTATTATTA CTTTACTTTTAGAATGT/----------------- CTTTACTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 11 CTTTACTTTTAGAATGT 1 0 192411 CASAVA_Build 12 80728746 2D TACTTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 585 het 585 ref 18 6 6 6 TC 7 6 192412 CASAVA_Build 12 80740731 1D TTTGGACTTC A/- AAAAAAGGGC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 A 7 6 192413 CASAVA_Build 12 80740861 3D TTAATTAATA TAC/--- AAGAATATAT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 TAC 1 0 192414 CASAVA_Build 12 80745278 2D TATATAATAG AT/-- ATATATATAT 2829 hom 27 het 11 0 10 2 AT 6 5 192415 CASAVA_Build 12 80748419 1D TGCCTCACTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 9 8 192416 CASAVA_Build 12 80763871 1D TCTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 11 10 192417 CASAVA_Build 12 80769358 1D TTTTCAACTT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 8 7 192418 CASAVA_Build 12 80786755 1D ATCGTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 11 10 192419 CASAVA_Build 12 80791633 1I CATTCTTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 12 13 192420 CASAVA_Build 12 80804246 1I TATGGAACTG -/T TAAGTCCAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 1 2 192421 CASAVA_Build 12 80807304 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2826 hom 24 het 17 0 8 9 T 13 12 192422 CASAVA_Build 12 80820150 1I CTCGGGGAAC -/A AATAATAGAG 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 2 3 192423 CASAVA_Build 12 80829236 2D CATATATCAC TA/-- TATATATATA 2155 hom 15 het 8 0 6 2 TA 9 8 192424 CASAVA_Build 12 80830591 2D ATATTTCTGA TT/-- TTTTTACTGA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 7 5 192425 CASAVA_Build 12 80837038 2D TATGTATGTA TG/-- TATATATATA 3070 het 47 hom 19 2 15 2 TG 1 0 192426 CASAVA_Build 12 80842088 1D TCAAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 40 0 25 16 T 12 11 192427 CASAVA_Build 12 80844637 16I CCTACCAGTT ----------------/GCTGGCTCAAGCAGTA GCTTCTAATC 3070 hom 96 het 34 0 31 3 GCTGGCTCAAGCAGTA 0 1 192428 CASAVA_Build 12 80844988 2D TGTATATATA TG/-- TAAAAATATA 2577 het 90 hom 12 1 8 3 TG 1 0 192429 CASAVA_Build 12 80848802 1D AAGAATATAG A/- AATGAAAGCC 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 3 2 192430 CASAVA_Build 12 80856990 1I TTTTTCTCCT -/A AGGCCTTTGG 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 1 2 192431 CASAVA_Build 12 80861442 1D GGAGTTTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 988 hom 43 8 21 15 T 9 8 192432 CASAVA_Build 12 80865716 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGA 1492 het 1492 ref 20 13 5 2 T 9 8 192433 CASAVA_Build 12 80866033 4D AAATAAATAA ACAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 19 9 9 2 ACAT 1 0 192434 CASAVA_Build 12 80875988 6D TATGACCATT TTAACA/------ TTGAGTTACT 3070 het 3070 ref 32 19 11 5 TTAACA 1 0 192435 CASAVA_Build 12 80877932 1D AATTTTGTCA T/- TTTTTTTTTT 1137 het 1137 ref 33 25 4 4 T 11 10 192436 CASAVA_Build 12 80884758 1D TAAATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 146 hom 47 4 21 23 T 11 10 192437 CASAVA_Build 12 80885094 1D CCTTCATAGT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 34 13 12 10 A 8 7 192438 CASAVA_Build 12 80886519 1D ATGCCATTTG C/- ATAGTGTGCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 C 1 0 192439 CASAVA_Build 12 80889461 1I TTAAGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 11 11 A 10 11 192440 CASAVA_Build 12 80904356 2I ATGTCAACAC --/TT ATTAAATTTT 3070 het 3070 ref 52 28 21 3 T 0 2 192441 CASAVA_Build 12 80910623 1D AAACCATTTC T/- GCTTCATTCA 3070 het 3070 ref 50 22 23 5 T 1 0 192442 CASAVA_Build 12 80920474 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1548 het 1548 ref 16 9 5 2 A 13 12 192443 CASAVA_Build 12 80923755 1D CACAGAGGCA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 8 7 192444 CASAVA_Build 12 80930859 2D CTTTGGGACA CC/-- GAGGCAGGAG 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 C 2 0 192445 CASAVA_Build 12 80931267 1I AGCATTTAAC -/T TTTAAGTCAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 3 4 192446 CASAVA_Build 12 80937795 1D TTATAGCAGT G/- TGAGAATGAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 G 1 0 192447 CASAVA_Build 12 80938071 8D GTGTGTATAC ATATATAT/-------- ATATATATAT 694 het 85 hom 15 1 4 11 AT 11 7 192448 CASAVA_Build 12 80946675 2I AATAAGACTC --/TT ATTAATTTTA 3070 het 1965 hom 13 4 8 1 T 0 2 192449 CASAVA_Build 12 80958022 4I ATGTAATTTT ----/TAAC TAGCCTTTAG 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 TAAC 0 1 192450 CASAVA_Build 12 80958217 4I ATGACTTAAT ----/TAAA TGTTATATAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 TAAA 0 1 192451 CASAVA_Build 12 80959896 1I TATAACAGGA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 T 6 7 192452 CASAVA_Build 12 80962423 1I TTTGTAAAAT -/G GCAGTATCCA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 G 1 2 192453 CASAVA_Build 12 80964474 2D TCATTATATG GA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 GA 1 0 192454 CASAVA_Build 12 80971749 4D TAAGTGTCTT AGTC/---- AGTTTGTGCT 3070 het 3070 ref 41 21 16 9 AGTC 1 0 192455 CASAVA_Build 12 80972501 1I TATCTCTACA -/T TACGGACTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 1 2 192456 CASAVA_Build 12 80974380 1D AAAATGAAAG T/- TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 7 6 192457 CASAVA_Build 12 80974474 2I CAGTGAAAGT --/TA TGTTAGGACT 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 TA 0 1 192458 CASAVA_Build 12 80974795 1D TGGTTAACTG A/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 1 0 192459 CASAVA_Build 12 80975100 1D ACAATCACCA C/- CCCTTAACCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 C 4 3 192460 CASAVA_Build 12 80977294 3I GAAGAAAAGG ---/GAA GAAGAAGAAG 3070 het 3035 hom 40 11 15 14 GAA 3 4 192461 CASAVA_Build 12 80979041 2I CATGGCAACA --/AC AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AC 0 1 192462 CASAVA_Build 12 80982694 1D TTTTAAATAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 8 7 192463 CASAVA_Build 12 80982914 1I TATAAAAAAA -/T AATCTTACCC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 0 1 192464 CASAVA_Build 12 80983318 6I ATTAGGGTAC ------/TGCCAA TGCCAATAAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 TGCCAA 1 2 192465 CASAVA_Build 12 80984169 1D TGAAAAGTCC A/- AAAATTGTAC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 5 4 192466 CASAVA_Build 12 80985331 6D TATATACCAG ACTTAA/------ ACTTAAAGAG 3070 het 3070 hom 39 15 23 3 ACTTAA 2 1 192467 CASAVA_Build 12 80985729 11I ACCCACTTGT -----------/ACTAAGGTTTG ACAATAATGA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 ACTAAGGTTTG 0 1 192468 CASAVA_Build 12 80986949 1I TGGGGAAAAG -/C CCCCATAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 11 C 4 5 192469 CASAVA_Build 12 80991734 1D CCTGCCTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 10 9 192470 CASAVA_Build 12 80999377 1D GCTGAATGGA T/- TTTTTTTTTT 1055 het 1055 ref 39 27 3 9 T 12 11 192471 CASAVA_Build 12 81001637 1D ATTATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 12 11 T 12 11 192472 CASAVA_Build 12 81035222 30D GCTGCTGCTT CAAGTGACCCTCCCCCAGTCTATTCCAATG/------------------------------ CTCTGAAATG 3070 het 3070 hom 46 22 24 9 CAAGTGACCCTCCCCCAGTCTATTCCAATG 1 0 192473 CASAVA_Build 12 81039469 7I ACACAAAGTC -------/CTCCACT CACTAGTGCC 3070 het 3070 ref 54 34 14 6 CTCCACT 0 1 192474 CASAVA_Build 12 81048738 2D TAAAGCTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 20 17 6 A 13 11 192475 CASAVA_Build 12 81051838 2I ATGAAATAAT --/GA GTTATGTTTT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 GA 0 1 192476 CASAVA_Build 12 81074731 2D TATTTTTTAG AC/-- ACAGAGTTTC 3070 het 1259 hom 17 4 12 1 AC 2 1 192477 CASAVA_Build 12 81079819 2I TAATCTTCTC --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 CA 7 8 192478 CASAVA_Build 12 81081119 1I GCATGAACAT -/G GGGGGGGGTA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 G 8 9 192479 CASAVA_Build 12 81085542 1I CATAAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 47 17 24 7 A 8 9 192480 CASAVA_Build 12 81087425 1I GTTTCCTGAC -/T TTTTAATGAT 2621 het 2621 ref 19 13 6 0 T 4 5 192481 CASAVA_Build 12 81089023 4D CCATTTCTTT AAAG/---- AAAGAACTAG 3070 het 3070 ref 22 11 11 0 AAAG 2 1 192482 CASAVA_Build 12 81129640 2D GGCTTCTGTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 66 het 33 0 22 12 CT 7 6 192483 CASAVA_Build 12 81131420 2D TTTACAAAAC TT/-- AATCTTGTAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 2 0 192484 CASAVA_Build 12 81134384 1D CTGGGGTTTT G/- GGGTCATGGA 3070 hom 118 het 47 0 38 9 G 4 3 192485 CASAVA_Build 12 81136215 1D TGCCTGTTTG C/- TATATGTTGC 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 C 1 0 192486 CASAVA_Build 12 81137944 1I CTCTCAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 13 14 192487 CASAVA_Build 12 81139400 1D GCCAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 T 12 11 192488 CASAVA_Build 12 81142984 1D CACGTACCCT A/- AAACTTAAAG 568 het 568 ref 16 6 4 10 A 4 3 192489 CASAVA_Build 12 81149431 4D AATTAATTCA AAAT/---- AATAATTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 AAAT 1 0 192490 CASAVA_Build 12 81155278 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 19 0 11 8 A 14 13 192491 CASAVA_Build 12 81155572 2D AGCCATAAAC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 389 hom 38 5 16 18 T 11 9 192492 CASAVA_Build 12 81156683 1D TTCAATTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 13 12 192493 CASAVA_Build 12 81157329 4I AAATTATGAC ----/AATT AAGGAGAATA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 AATT 0 1 192494 CASAVA_Build 12 81162789 10D TTTTTCTTGT AAATCTGTTA/---------- AAGTTCCTTG 2277 het 2277 ref 22 16 6 2 AAATCTGTTA 1 0 192495 CASAVA_Build 12 81170997 4I TATTAAATAG ----/ATAA ATAAATAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 ATAA 2 3 192496 CASAVA_Build 12 81171804 1D AAAGGTAGTC T/- ACAGATTGAG 3070 het 3070 ref 28 12 9 8 T 1 0 192497 CASAVA_Build 12 81180986 2D GAAGTAAGAC TT/-- AAAATCTGAG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 2 0 192498 CASAVA_Build 12 81182184 5D ACTACACATT TAAAA/----- TAAAATAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TAAAA 2 1 192499 CASAVA_Build 12 81182302 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 110 hom 22 1 18 4 A 10 11 192500 CASAVA_Build 12 81182615 3D54M1D GAAAAAGAAA GAGGAGAAGGAGAAAGAGGAATAAGAGCAGCAAGGAGAAGGAGGATGATAAAATTGAG/---GAGAAGGAGAAAGAGGAATAAGAGCAGCAAGGAGAAGGAGGATGATAAAATTGA- GAAGAAAAAG 3070 hom 35 het 27 0 22 28 N/A 0 0 192501 CASAVA_Build 12 81183617 1D ATTCTTCCAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 8 192502 CASAVA_Build 12 81185859 1I ACTCAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 A 10 11 192503 CASAVA_Build 12 81188695 1D GATGATTCTG A/- AAAAATTACC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 6 5 192504 CASAVA_Build 12 81190430 1D ACTCTGTCCC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 43 het 30 1 26 4 A 9 8 192505 CASAVA_Build 12 81196963 1D GAATGTTAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 43 0 37 7 A 9 8 192506 CASAVA_Build 12 81197076 10I TTCTGTGTTC ----------/TGATATCTCA TGATATCTCA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TGATATCTCA 1 2 192507 CASAVA_Build 12 81198795 1D AAAGAGACCC A/- AAAAATGTGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 5 192508 CASAVA_Build 12 81204711 1I TCAATGTGAA -/T TCACCAGAGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 1 2 192509 CASAVA_Build 12 81204910 1D ACTTATAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 22 3 12 7 A 15 14 192510 CASAVA_Build 12 81211808 1D AGAATAAGAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 9 8 192511 CASAVA_Build 12 81214078 1I TTGTGCTTTA -/T TTTTTGTTGG 3070 hom 117 het 49 0 40 9 T 5 6 192512 CASAVA_Build 12 81219806 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTTTGAG 3070 het 1422 hom 27 7 12 8 G 0 1 192513 CASAVA_Build 12 81225053 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 6 7 192514 CASAVA_Build 12 81227747 1D CTTTAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 A 13 12 192515 CASAVA_Build 12 81231026 2I GGTTCTGGAC --/TT TTTTTGGCTA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 5 7 192516 CASAVA_Build 12 81235567 1I CTTTGTCTAT -/A TATCCTCTGA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 0 1 192517 CASAVA_Build 12 81236205 1D AAAAAAATGT A/- TCAAGAACTT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 A 1 0 192518 CASAVA_Build 12 81240388 1I TTAAATCAGC -/T TTGTAATAGA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 2 3 192519 CASAVA_Build 12 81241159 1I AAAAAAAAAA -/G GAAAAAAAAA 1549 het 1549 ref 18 10 5 3 G 1 2 192520 CASAVA_Build 12 81241537 2D AGAGACAAAA TC/-- TCTCTGTTAC 1627 het 1627 ref 31 18 6 8 TC 3 2 192521 CASAVA_Build 12 81246421 1I AAATATATAA -/T TATATACATA 3070 het 1275 hom 13 3 10 0 T 1 2 192522 CASAVA_Build 12 81263509 1I GCTCATTTAG -/C ATGTAACCTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 C 0 1 192523 CASAVA_Build 12 81268689 4D TAAGCCTCTC TCTT/---- TCTATGTTGT 3070 het 3070 ref 38 22 13 6 TCTT 1 0 192524 CASAVA_Build 12 81271931 1D ATAATAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 T 12 11 192525 CASAVA_Build 12 81272298 2D ACAAATATTT AC/-- AGAGAGAATA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 AC 1 0 192526 CASAVA_Build 12 81275194 3D ATTGAGGAAT ATC/--- ATCCAAAATT 3070 het 3070 ref 47 27 13 7 ATC 2 1 192527 CASAVA_Build 12 81277213 1I AAGGCACTAG -/C CTGCAGAGCC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 C 1 2 192528 CASAVA_Build 12 81288611 4D CTTTACTATT TCTA/---- TCTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 TCTA 1 0 192529 CASAVA_Build 12 81293353 1D AGCTGTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 36 0 16 21 A 11 10 192530 CASAVA_Build 12 81297430 2D ATTTAGTATC TG/-- TTGTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 TG 1 0 192531 CASAVA_Build 12 81298344 2D TGTATGTGTA TG/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 TG 1 0 192532 CASAVA_Build 12 81301258 4D CTTGATTTTC TTTG/---- TTTGTCCACT 3070 het 3070 ref 41 20 19 4 TTTG 2 1 192533 CASAVA_Build 12 81302526 1I ACCCTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 9 10 192534 CASAVA_Build 12 81316164 1I TTTATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2226 het 2226 ref 18 9 5 4 T 11 12 192535 CASAVA_Build 12 81320166 5I TTGTTGTTAA -----/AGTAG AGTAGAAATA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 AGTAG 1 2 192536 CASAVA_Build 12 81332668 5D TAATCTACTC ATTTT/----- ATATATAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 ATTTT 1 0 192537 CASAVA_Build 12 81342453 2D AATATAAAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TA 8 7 192538 CASAVA_Build 12 81345716 1D GATATACAGA T/- TTTGCTATAT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 4 3 192539 CASAVA_Build 12 81346687 1D CTGTGCTCAG T/- TTCCCTATCT 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 T 3 2 192540 CASAVA_Build 12 81347287 3D AAATGTAGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 889 hom 34 7 14 14 T 15 12 192541 CASAVA_Build 12 81348237 2I GTTGTAAAAC --/AT AGGTGCAATT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 AT 0 1 192542 CASAVA_Build 12 81352558 5I TATAAATCTT -----/ATAAG ATAAGACTCA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 ATAAG 1 2 192543 CASAVA_Build 12 81357778 3I GTTCATGTGT ---/TTA TTATTTCCTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTA 1 2 192544 CASAVA_Build 12 81360866 4D GCTAAAGAAA TAAT/---- TAATGAACTG 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 TAAT 2 1 192545 CASAVA_Build 12 81361730 4D TAGAGCAAGA ACTC/---- ACTCACTGTC 3070 het 3070 ref 37 20 10 8 ACTC 2 1 192546 CASAVA_Build 12 81364419 2D AATCAATAAC AA/-- GAGAACCTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 2 0 192547 CASAVA_Build 12 81365508 1D GTAAGGTAAA C/- ACAAGATTCA 3070 het 3070 hom 45 17 23 6 C 1 0 192548 CASAVA_Build 12 81366730 3I CAAAATTTTA ---/TGC TGTTGATCTT 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 TGC 0 1 192549 CASAVA_Build 12 81367741 1D CCTCTAACCA C/- TGTCCTATGT 3070 het 3070 hom 50 21 19 10 C 1 0 192550 CASAVA_Build 12 81373072 1D CTTTTGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 20 10 A 13 12 192551 CASAVA_Build 12 81375242 1I CCACTGAGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 933 hom 30 2 24 4 A 9 10 192552 CASAVA_Build 12 81379621 1I AAATAAAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 9 10 192553 CASAVA_Build 12 81382805 1D GACTTCTTGA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 8 7 192554 CASAVA_Build 12 81384243 1D TCATTCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 T 12 11 192555 CASAVA_Build 12 81388456 20D ACTAATTTTT ACAGGGCAGAAATGAAGAAG/-------------------- ACAGGGCAGA 3070 het 3070 hom 31 9 16 14 ACAGGGCAGAAATGAAGAAG 1 0 192556 CASAVA_Build 12 81396708 1D AATTTTGTTT A/- ACAAAGCATA 1595 het 1595 ref 23 18 4 2 A 2 1 192557 CASAVA_Build 12 81398920 4I TTTCCTCATA ----/TTGT TTGTTGACTA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 TTGT 1 2 192558 CASAVA_Build 12 81400627 1I AAAGTTTTCC -/T GTTAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 0 1 192559 CASAVA_Build 12 81404224 3I CTGAGCTAAA ---/ATC ATGCTATAAT 3070 het 3070 hom 54 21 25 8 ATC 0 1 192560 CASAVA_Build 12 81408789 2D AAATCCACAA AT/-- ATGTGAAAAT 3070 het 2798 hom 21 8 10 3 AT 2 1 192561 CASAVA_Build 12 81413600 1D TTCGGCCATG A/- AAAATGGTGA 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 A 5 4 192562 CASAVA_Build 12 81416656 8D CGTTATTCTC ATCTGATT/-------- AACATCCTCT 3070 het 3070 hom 31 13 17 3 ATCTGATT 1 0 192563 CASAVA_Build 12 81416754 3D CTCCCAGACT AAA/--- AAAAAAAAAA 2745 het 1832 hom 30 12 11 8 A 17 14 192564 CASAVA_Build 12 81417511 1I GTTTGTGATA -/T TAAGTATCAA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 1 2 192565 CASAVA_Build 12 81443181 1I AACTATAAGG -/A AAAAAAAAAA 3057 het 3057 ref 23 11 8 4 A 10 11 192566 CASAVA_Build 12 81475520 1I TATCCACTGT -/A AAAAAAAAAA 2831 het 2831 ref 29 15 7 7 A 10 11 192567 CASAVA_Build 12 81476556 1D TTTTTTGGGG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 T 8 7 192568 CASAVA_Build 12 81479796 2I CATATATAGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 TG 6 7 192569 CASAVA_Build 12 81484271 1I TTGTTAAATA -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 7 8 192570 CASAVA_Build 12 81484818 2I AGTAGATCTA --/AG AACAGAAGGC 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 AG 0 1 192571 CASAVA_Build 12 81486746 1D CTGTTTTCTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 9 8 192572 CASAVA_Build 12 81492405 11D ACTAGACATT GCTCAGACATC/----------- GCTCAGACAT 3070 het 3070 hom 40 19 18 4 GCTCAGACATC 2 1 192573 CASAVA_Build 12 81497971 4D CATGCAATGT TTGA/---- TTTTCTGTCC 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 TTGA 1 0 192574 CASAVA_Build 12 81498747 4D TATAATAGAT ACAC/---- AAAATATAAT 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 AC 2 0 192575 CASAVA_Build 12 81501115 1D ATTTAAAAAA C/- AATATAATTC 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 C 1 0 192576 CASAVA_Build 12 81514924 1D GAAGCTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3062 het 3062 ref 32 14 10 11 A 15 14 192577 CASAVA_Build 12 81523258 1I CCATTTCCTC -/T TTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 6 7 192578 CASAVA_Build 12 81527155 11I TGTTAGAACC -----------/CAGAAAATATT CATGGGCTCT 3070 het 3070 ref 42 22 20 0 CAGAAAATATT 0 1 192579 CASAVA_Build 12 81528779 1I TAATAACCAC -/A AATTCTTAAC 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 A 2 3 192580 CASAVA_Build 12 81532658 1I CAGTGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 A 10 11 192581 CASAVA_Build 12 81536243 1I CCCCCAATGA -/G GACACCAACT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 G 1 2 192582 CASAVA_Build 12 81564870 1D CTTACCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1449 hom 19 5 11 3 T 11 10 192583 CASAVA_Build 12 81580022 1D GGAGAATGGT A/- AAAGGTACTA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 4 3 192584 CASAVA_Build 12 81612696 1I GATTTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1324 hom 47 3 37 7 A 11 12 192585 CASAVA_Build 12 81624234 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 977 het 492 hom 18 5 5 8 A 19 18 192586 CASAVA_Build 12 81629348 1D ATATGTTGTT A/- AAAAAAAAAA 1582 het 1582 ref 25 14 4 8 A 11 10 192587 CASAVA_Build 12 81645755 13D AAGAAAGGCC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAGA 3070 hom 17 het 32 1 29 9 A 21 8 192588 CASAVA_Build 12 81667238 4D AGAAACTAAT ACTC/---- ACACATTTGT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 ACTC 1 0 192589 CASAVA_Build 12 81668152 1I AAGTTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 19 9 T 11 12 192590 CASAVA_Build 12 81672657 4D AAAAAAATAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 AAAT 3 2 192591 CASAVA_Build 12 81678094 1D AATTGGGGTT A/- TTTTTTTGTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 1 0 192592 CASAVA_Build 12 81681102 1D79M1D TAGAAGCTAG AAAAAAAAAACAAGAAAAAAATAATTAAGATATAAAATCTGAGCCACAAACTGAATAGAAGACAGAAAGACAGAAAGTAAC/-AAAAAAAAACAAGAAAAAAATAATTAAGATATAAAATCTGAGCCACAAACTGAATAGAAGACAGAAAGACAGAAAGTAA- ATGGTAGAAC 3070 hom 172 het 29 0 58 5 N/A 0 0 192593 CASAVA_Build 12 81682698 1D TCATGTAAGA G/- GGGGGTAGGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 6 5 192594 CASAVA_Build 12 81682748 2D TGAATCTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 26 0 14 12 T 15 13 192595 CASAVA_Build 12 81687417 1I AAAGATGTAA -/G GGGTAACTGC 3070 hom 42 het 18 0 13 5 G 3 4 192596 CASAVA_Build 12 81711279 1D GTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1212 het 1212 ref 42 33 3 6 T 13 12 192597 CASAVA_Build 12 81730660 1D TTTGCTCTTA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 T 8 7 192598 CASAVA_Build 12 81738936 1D GCCTGGATAA T/- TTTTTTTTTT 2339 het 2339 ref 36 22 6 9 T 13 12 192599 CASAVA_Build 12 81803447 1D GTCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2863 het 2505 hom 19 8 9 2 T 12 11 192600 CASAVA_Build 12 81819797 3I TGTAATCAAC ---/TAT TATTATTATA 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 TAT 3 4 192601 CASAVA_Build 12 81820152 6D AGGAAAACCC CCAAAA/------ GTTTGGGAGT 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 CCAAAA 1 0 192602 CASAVA_Build 12 81830668 5I GGCAACATGG -----/TGAAA TGAAACCCTG 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 TGAAA 1 2 192603 CASAVA_Build 12 81832208 1I TTTATTTGCA -/T TTTTTTACTC 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 T 6 7 192604 CASAVA_Build 12 81834657 1I AAGTACTAAA -/T TTTTATGTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 4 5 192605 CASAVA_Build 12 81836625 8D TTTCTTTTCT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 2169 het 225 hom 24 5 8 11 TC 12 8 192606 CASAVA_Build 12 81855421 1D ATAGTGGAGG T/- TTAGGACTTC 3070 hom 114 het 39 0 38 2 T 3 2 192607 CASAVA_Build 12 81858519 1D TATGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1349 het 1349 ref 28 21 3 4 T 11 10 192608 CASAVA_Build 12 81858669 1I CTATACATCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 273 hom 39 1 34 4 T 8 9 192609 CASAVA_Build 12 81864653 3D CACTTTTCTT TTC/--- TTTTTTTTTT 169 het 169 ref 22 14 2 9 TTC 1 0 192610 CASAVA_Build 12 81866281 3I CCTTAATTTA ---/AAC AACAAAAAAA 3070 hom 14 het 25 1 18 6 AAC 1 2 192611 CASAVA_Build 12 81866764 1D TCAAAAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 11 10 192612 CASAVA_Build 12 81869210 1I GGAATTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 32 1 24 7 T 10 11 192613 CASAVA_Build 12 81871751 1D TATCTCTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1112 hom 40 4 30 6 A 12 11 192614 CASAVA_Build 12 81878740 1D TTTTTAATTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 8 7 192615 CASAVA_Build 12 81887796 1I TAAAAAACAT -/A AAACAGATAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 3 4 192616 CASAVA_Build 12 81893657 1D CCATTACACT C/- TTTTGACTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 0 192617 CASAVA_Build 12 81893808 2D ACTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAATA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 10 8 192618 CASAVA_Build 12 81898519 1D TAGAGACTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 10 9 192619 CASAVA_Build 12 81900350 1I ATCCATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1016 hom 38 3 28 7 T 13 14 192620 CASAVA_Build 12 81902923 4I AACTGGTAAA ----/TTTT ATTTATTTAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 0 4 192621 CASAVA_Build 12 81909149 1I AAGTGTGGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 9 10 192622 CASAVA_Build 12 81911282 1D TTATACACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 20 1 18 1 T 11 10 192623 CASAVA_Build 12 81912350 1I GTCTCACACA -/T TTTATTGTTG 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 3 4 192624 CASAVA_Build 12 81918052 1D GGGCAGTCAA T/- TTTTTTTTTT 2750 hom 29 het 15 0 10 5 T 11 10 192625 CASAVA_Build 12 81919386 1I CGTCTCTACT -/A AAAAACAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 5 6 192626 CASAVA_Build 12 81919667 2I CATCAGTCTC --/TT TGCTGAAACA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 1 3 192627 CASAVA_Build 12 81922959 1D ACTAAAAATA C/- AAAAATTAGC 3070 het 3070 hom 17 8 8 1 C 1 0 192628 CASAVA_Build 12 81928739 4D TGATGTTTTA TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTAT 5 4 192629 CASAVA_Build 12 81932641 1D AGAAGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 11 10 192630 CASAVA_Build 12 81935724 1D TTTATAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 30 2 22 6 A 15 14 192631 CASAVA_Build 12 81935855 2D GTAAATCATC AG/-- AGAATTTAGT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AG 2 1 192632 CASAVA_Build 12 81936574 1I AATTTGCGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 24 1 15 8 T 12 13 192633 CASAVA_Build 12 81937069 1D AAACTAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 12 11 192634 CASAVA_Build 12 81938576 1D TGTCAGGATA C/- CAATATAGCA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 C 2 1 192635 CASAVA_Build 12 81939514 1D ATAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 2412 het 2412 ref 27 18 7 3 T 9 8 192636 CASAVA_Build 12 81940014 3D CCAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 AAG 3 2 192637 CASAVA_Build 12 81940273 1I CACATAACCC -/T TCCCCCCTCC 2047 het 2047 ref 27 9 6 12 T 1 2 192638 CASAVA_Build 12 81945428 1I GCTGATGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 53 23 20 10 A 9 10 192639 CASAVA_Build 12 81958521 1I CCTTGCTGCA -/G GGGTTCCAGC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 3 4 192640 CASAVA_Build 12 81968239 1D ATAGCATTAT A/- TAATAATTTT 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 A 1 0 192641 CASAVA_Build 12 81970856 2D GCAGCCTGAC TT/-- TCTCCTACTC 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 T 3 1 192642 CASAVA_Build 12 81981208 1D TGCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 408 hom 39 1 32 6 T 10 9 192643 CASAVA_Build 12 81990960 1I TGTACTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 10 11 192644 CASAVA_Build 12 82017832 1I AGTTGTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 33 1 26 6 T 12 13 192645 CASAVA_Build 12 82025682 1I ATCCTTATGA -/C CCCCCCGTGC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 C 6 7 192646 CASAVA_Build 12 82033558 2D TTTTTTATTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 26 0 17 9 T 11 9 192647 CASAVA_Build 12 82042496 1D TTTAATGAGC A/- GAAGTTTGTC 3070 hom 67 het 38 1 29 8 A 1 0 192648 CASAVA_Build 12 82052201 1D TGGCAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 33 1 28 4 A 12 11 192649 CASAVA_Build 12 82070130 2D AGCTGACTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 7 A 13 11 192650 CASAVA_Build 12 82074281 1I TTAATAATAA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 7 8 192651 CASAVA_Build 12 82074417 6I CACCCATTCA ------/TCCACT AAACATTTGT 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 TCCACT 0 1 192652 CASAVA_Build 12 82075563 12I9M8D5M4D AGTTCGTAGG ------------TTTAAAAAACTGCCTCTTCAAACTGC/TTTAAATTTTTATTTAAAAAA--------TAAAA---- TTATATTTTT 1730 het 896 hom 17 6 5 11 N/A 0 0 192653 CASAVA_Build 12 82090604 1D GTCAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 37 1 27 9 A 11 10 192654 CASAVA_Build 12 82092856 1I TTGTGTTTTG -/T TTTTTTGAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 192655 CASAVA_Build 12 82121961 15D GAAATTTACT TTTAAACTGCATTCC/--------------- TTACTTATGC 3070 hom 69 het 23 0 24 2 TTTAAACTGCATTCC 1 0 192656 CASAVA_Build 12 82123786 4I TTTATCTAAC ----/TGTT TGTTTGTACC 3070 hom 98 het 38 0 33 5 TGTT 1 2 192657 CASAVA_Build 12 82124907 1D ATGCACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 12 11 192658 CASAVA_Build 12 82125563 1D ATGAATATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 9 8 192659 CASAVA_Build 12 82126403 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAGCTGC 739 het 739 ref 15 9 4 2 G 0 1 192660 CASAVA_Build 12 82128090 1I TTAATTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 693 hom 46 2 36 8 T 10 11 192661 CASAVA_Build 12 82129799 1D TTTGCTTACC G/- GTAAGTTTCC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 G 2 1 192662 CASAVA_Build 12 82140416 2D CCAGCTCAAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 45 24 13 10 GA 6 5 192663 CASAVA_Build 12 82144749 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2901 het 2480 hom 25 9 10 6 T 11 12 192664 CASAVA_Build 12 82152603 1I GTTTTTTTTT -/C AGATGTAGTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 0 1 192665 CASAVA_Build 12 82181804 1D TAAACCAAAA G/- TAGCCTCTTT 3070 hom 105 het 44 0 35 11 G 1 0 192666 CASAVA_Build 12 82184378 1I GTGTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 797 hom 26 3 22 1 G 0 1 192667 CASAVA_Build 12 82185035 1I CCAACTTGGG -/T TAAAAAAAAA 2860 het 2860 ref 35 23 8 4 T 1 2 192668 CASAVA_Build 12 82194266 1D GACGTTCTGG T/- TTTTTGGAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 6 5 192669 CASAVA_Build 12 82209388 2D GTATATTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AT 8 7 192670 CASAVA_Build 12 82215856 1I ACTATAAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 10 192671 CASAVA_Build 12 82227362 1I CCATTCTCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 8 9 192672 CASAVA_Build 12 82228861 2I CAGCTGCAAG --/AT ATACAGCCAA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 AT 1 2 192673 CASAVA_Build 12 82241484 2D GAAAATTCCA TT/-- TTTTTTTTGC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 T 10 8 192674 CASAVA_Build 12 82243143 2I TGTGTGTATG --/TA TATATATATA 3070 het 449 hom 25 1 16 8 TA 6 7 192675 CASAVA_Build 12 82245925 3D AGCTCCTAGA TCT/--- TCTTGAGCAT 3070 het 3070 ref 55 28 24 5 TCT 2 1 192676 CASAVA_Build 12 82246147 2D TGAAAAAAAA AT/-- ATATTCAACC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 AT 3 2 192677 CASAVA_Build 12 82266794 3D TCAAGGAGTT ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 ATA 7 6 192678 CASAVA_Build 12 82287710 1I AATGTTTTTT -/A AAATAATTGT 3070 hom 123 het 51 0 42 9 A 3 4 192679 CASAVA_Build 12 82296413 1I TCTAGACCAG -/C CCCTCATCCC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 3 4 192680 CASAVA_Build 12 82298561 1I TCTCAAAAAA -/T AAAAATAAAA 3070 het 315 hom 25 1 21 3 T 0 1 192681 CASAVA_Build 12 82304740 1I TCAAAATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 10 192682 CASAVA_Build 12 82319066 1I TTTGTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 745 hom 35 2 22 11 A 12 13 192683 CASAVA_Build 12 82319596 1D CTTCAACTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 9 8 192684 CASAVA_Build 12 82319837 2D ACCTATGAGT GA/-- GAGAACATGG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 GA 3 2 192685 CASAVA_Build 12 82343201 1D CAAAAATAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 29 0 23 7 T 10 9 192686 CASAVA_Build 12 82343914 4D TTGAGTTTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 22 1 10 11 T 22 18 192687 CASAVA_Build 12 82362522 1D TTATAGAATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 82 hom 34 1 30 4 T 9 8 192688 CASAVA_Build 12 82377192 1I GCTTGATGCA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 192689 CASAVA_Build 12 82378879 4D CTAGATTAAC ATAT/---- ATATAGGTAG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 AT 4 2 192690 CASAVA_Build 12 82412902 1I CCATCACTTC -/T GTAATTATTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 0 1 192691 CASAVA_Build 12 82448612 1I TAAAAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1485 hom 30 7 12 11 T 16 17 192692 CASAVA_Build 12 82457638 1I ATAAACTTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 7 8 192693 CASAVA_Build 12 82481935 1D CACTTTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 307 hom 20 2 15 4 T 10 9 192694 CASAVA_Build 12 82496935 19D TGTGAGTGTT AAATATAAAATAATTAAAA/------------------- TAAGAATAAA 3070 hom 99 het 33 0 33 6 AAATATAAAATAATTAAAA 1 0 192695 CASAVA_Build 12 82497697 4D TTGTTCTCAT TCTC/---- TCTCTATTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 5 TC 4 2 192696 CASAVA_Build 12 82515438 1D CCTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 42 0 30 12 A 13 12 192697 CASAVA_Build 12 82517595 1D CCAACATATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 9 192698 CASAVA_Build 12 82523333 1D AATGAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 9 5 A 12 11 192699 CASAVA_Build 12 82528928 1I GATATATGCA -/T TTTAGGCTTT 3070 hom 166 het 60 0 55 5 T 3 4 192700 CASAVA_Build 12 82540460 1I CATGTATAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 24 hom 19 1 17 1 A 9 10 192701 CASAVA_Build 12 82543681 2I ACAACAAAAC --/AT GTATTTTAGA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AT 0 1 192702 CASAVA_Build 12 82545514 1I TGACAGGTTT -/A TTGGGATGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 192703 CASAVA_Build 12 82577195 1I GAATTTAGTG -/A AGGACAAGGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 1 2 192704 CASAVA_Build 12 82579838 2D TTCATTCATT TC/-- TGTGTCCTTC 3070 het 3070 ref 47 20 19 10 TC 1 0 192705 CASAVA_Build 12 82668637 1D CTTCTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 1603 het 1603 ref 40 25 4 11 T 15 14 192706 CASAVA_Build 12 82708030 1I TTGTCTATTC -/G GGGGTTCTTT 2082 hom 18 het 10 0 7 3 G 4 5 192707 CASAVA_Build 12 82730385 4D TTCTTCCCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 3070 hom 78 het 34 0 27 9 CCTT 4 3 192708 CASAVA_Build 12 82764126 2D TTGTGTACTT TC/-- TTTCTTCCAT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 TC 1 0 192709 CASAVA_Build 12 82765964 1D AGCCTTCCTA T/- TAATACACAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 1 192710 CASAVA_Build 12 82779269 1I TGTGCTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 10 11 192711 CASAVA_Build 12 82786727 3I TGGGGCTTCA ---/GTC GTCTTTCACT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 GTC 1 2 192712 CASAVA_Build 12 82792553 1I AGACACAACC -/A AAAAAGAGAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 5 6 192713 CASAVA_Build 12 82798406 1D CGACAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 12 11 192714 CASAVA_Build 12 82801680 1D ATCTTTACCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 405 hom 39 1 32 6 A 10 9 192715 CASAVA_Build 12 82808443 1I ATGTATATAA -/T TTTTTCTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 6 192716 CASAVA_Build 12 82811005 1D CAAAATGTCA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 7 6 192717 CASAVA_Build 12 82811900 3D ATTTACTGAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 23 1 17 5 A 16 13 192718 CASAVA_Build 12 82811914 3D AAAAAAAAAA AAC/--- AATATTTTTA 3070 het 32 hom 24 2 15 7 AAC 1 0 192719 CASAVA_Build 12 82814286 4I17M4I TAAAGAACAC ----AAAGAAACTATGATAGA----/AATTAAAGAAACTATGATAGATAAT TAAGAAAGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 5 N/A 0 0 192720 CASAVA_Build 12 82816083 1I TTCCAAGTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 284 hom 44 1 36 7 A 8 9 192721 CASAVA_Build 12 82816458 1I TGCTATTCCT -/C CCCTAGCACC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 C 3 4 192722 CASAVA_Build 12 82821659 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 0 1 192723 CASAVA_Build 12 82827020 3D CAACAACAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AAC 4 3 192724 CASAVA_Build 12 82828341 2I TGTCATCTGT --/TC TCTGTCGGTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TC 1 2 192725 CASAVA_Build 12 82831811 1I TTTTTTTTTT -/A AATTATTTTT 3070 het 179 hom 15 1 14 0 A 2 3 192726 CASAVA_Build 12 82840446 1D AACCTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 377 hom 33 2 24 7 A 11 10 192727 CASAVA_Build 12 82846410 1I TCTAGCACTA -/T TTTAGGACAG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 3 4 192728 CASAVA_Build 12 82871296 2D AAAAAAACTC AA/-- AGAAATGAAT 3070 hom 65 het 29 0 24 6 A 3 1 192729 CASAVA_Build 12 82881321 1I AAACAAAATC -/T TTTCCTCATC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 3 4 192730 CASAVA_Build 12 82887497 2D CAGGAATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 41 1 22 18 T 13 11 192731 CASAVA_Build 12 82904843 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 87 het 40 0 29 13 TA 11 9 192732 CASAVA_Build 12 82907648 1D ATATTTGAAT A/- AAAACACCTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 5 4 192733 CASAVA_Build 12 82912620 1D AATAGACATA T/- TTTTTTCAGT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 7 6 192734 CASAVA_Build 12 82920464 20I GAAGAAAGGA --------------------/TTTAACTTGTTGTTACTCCG TTGTTTATTT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 TTTAACTTGTTGTTACTCCG 0 1 192735 CASAVA_Build 12 82923761 1D TCTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 19 0 9 10 T 14 13 192736 CASAVA_Build 12 82944941 1I AGAAATGAAG -/A AAAAAACTTC 3070 hom 92 het 36 0 31 5 A 6 7 192737 CASAVA_Build 12 82966452 1D ATTTTAAAGA T/- TTTTTTCATA 3070 hom 45 het 17 0 16 2 T 7 6 192738 CASAVA_Build 12 82987007 1D TCTAATTTTT A/- AAAAAAGTTT 3070 het 351 hom 40 1 38 1 A 7 6 192739 CASAVA_Build 12 82989774 1I GAAAACTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 A 12 13 192740 CASAVA_Build 12 82992132 1D AAAGTAGGCA G/- TTTGAAAGAG 3070 hom 81 het 31 0 26 6 G 1 0 192741 CASAVA_Build 12 82994797 1D ATTGCTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 7 A 11 10 192742 CASAVA_Build 12 83000700 1I TTGCAGAAGG -/A AAAATCAACG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 4 5 192743 CASAVA_Build 12 83039112 5I AATTGCCTAC -----/TATTT TATTTTAATA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 TATTT 1 2 192744 CASAVA_Build 12 83044604 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 30 2 19 9 A 14 13 192745 CASAVA_Build 12 83058768 2D TGTAGACCTC AG/-- GGTGAAAACG 3070 hom 99 het 40 0 34 7 AG 1 0 192746 CASAVA_Build 12 83065690 1I CAATTAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 876 hom 32 2 14 16 T 13 14 192747 CASAVA_Build 12 83067660 1I TACAAAAATA -/C AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 192748 CASAVA_Build 12 83085190 1D GATTGACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 12 11 192749 CASAVA_Build 12 83096297 1I TGTTTAGACA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 7 8 192750 CASAVA_Build 12 83110378 1D GGACTGCAAT A/- AAAAACCTTA 3070 hom 77 het 32 0 25 7 A 6 5 192751 CASAVA_Build 12 83122597 1I TACTGTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 46 0 37 9 T 10 11 192752 CASAVA_Build 12 83123844 1D TAGAAAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 17 1 13 3 A 15 14 192753 CASAVA_Build 12 83128665 2I TTGTAGTAAC --/AA AAGTTTCAGG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 2 4 192754 CASAVA_Build 12 83139297 2I TATGTGCATG --/TA TATATATATA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TA 5 6 192755 CASAVA_Build 12 83153881 1D TCTGGGTAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 9 8 192756 CASAVA_Build 12 83179472 4I AATTTTTCTG ----/TTAC TTTATTTATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTAC 0 1 192757 CASAVA_Build 12 83182871 1I AACAAAAATT -/A AAATAGATGG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 3 4 192758 CASAVA_Build 12 83199425 2D GTGTCAAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 40 0 25 15 T 14 12 192759 CASAVA_Build 12 83217261 4I GTGTAGATAC ----/ATAG ATAGATACAA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 ATAG 1 2 192760 CASAVA_Build 12 83227575 1D GGTATTGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 38 2 28 8 T 13 12 192761 CASAVA_Build 12 83227973 16D GCATGATCTT GGCTCACTACGATCTC/---------------- GGCTCACTAC 3070 hom 75 het 27 0 23 7 GGCTCACTACGATCTC 2 1 192762 CASAVA_Build 12 83231289 21D12M78D AGGGATTGAG AGAATCTGTAGTCTCTTCTATAGAACCATTCAGGGATCCAGCTTCTTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCATCCTCTCTTGTTGTCACTTATGTGGTCATTGCTCTTA/---------------------AGACCCCTTGAG------------------------------------------------------------------------------ CAACACCATG 2518 hom 15 het 8 0 6 2 N/A 0 0 192763 CASAVA_Build 12 83240761 1D TTCTGCCCTT A/- ACCACATTCA 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 2 1 192764 CASAVA_Build 12 83255323 3I AAGTGGATAA ---/AAC AACAACAAAA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 AAC 2 3 192765 CASAVA_Build 12 83258921 1D AGAACAAGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 10 9 192766 CASAVA_Build 12 83259287 1D CATGTGTGTG C/- ATACTCAGGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 0 192767 CASAVA_Build 12 83270348 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2511 het 1203 hom 19 6 8 5 T 17 18 192768 CASAVA_Build 12 83281721 1I TTCCAGTCAG -/A AAAACGACAC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 4 5 192769 CASAVA_Build 12 83308981 1D GCCAAAGAGG C/- TATTTGGGAT 2706 het 2706 ref 30 18 6 6 C 1 0 192770 CASAVA_Build 12 83344542 1D GTAAACTTGG A/- AAATATAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 4 3 192771 CASAVA_Build 12 83361207 2D ATAGTGCATG TA/-- TATATATAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 6 TA 5 4 192772 CASAVA_Build 12 83366075 1I TACTATGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 38 het 42 1 33 8 A 9 10 192773 CASAVA_Build 12 83378161 1I TATATAGGAA -/T TTTCAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 3 4 192774 CASAVA_Build 12 83382776 1I CAATAGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 746 hom 31 4 19 8 T 15 16 192775 CASAVA_Build 12 83389313 3I ATTATGCATT ---/TAA TAATATGTTT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 TAA 1 2 192776 CASAVA_Build 12 83393770 1D ACAAAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 24 0 20 4 A 13 12 192777 CASAVA_Build 12 83394006 1D ATAAAATCAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 7 192778 CASAVA_Build 12 83396958 1I ACTCAACACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 944 hom 35 3 23 9 A 12 13 192779 CASAVA_Build 12 83399177 1D CAAATAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 39 3 28 9 A 13 12 192780 CASAVA_Build 12 83400055 3D TCCAGGAAAT CTA/--- CTCTGTCAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 7 CTA 1 0 192781 CASAVA_Build 12 83404662 1I CAAATGTGAC -/A ATTTTAAAGA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 1 2 192782 CASAVA_Build 12 83412211 1D CACATTCCAA T/- TTTTTTCTAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 7 6 192783 CASAVA_Build 12 83418391 1D TTTTCTCATT A/- AAAAAAAAAG 1366 het 1366 ref 43 29 3 11 A 10 9 192784 CASAVA_Build 12 83434620 1I GAGTCAAAGA -/T TAAAGAGAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 2 192785 CASAVA_Build 12 83435713 4D AGACTCTGAT ATAC/---- TAAGGATCCA 3070 hom 72 het 27 0 23 4 ATAC 1 0 192786 CASAVA_Build 12 83436191 3I AACCCTATAG ---/ACA ACAACTTTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ACA 1 2 192787 CASAVA_Build 12 83436325 2D ACAACTTGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 19 0 13 6 AT 10 9 192788 CASAVA_Build 12 83438518 5D TGTTCTTAAC TTAAT/----- TTGAAATAAC 3070 hom 135 het 47 0 46 5 TTAAT 1 0 192789 CASAVA_Build 12 83439182 1D CTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 8 192790 CASAVA_Build 12 83440353 6I GATCTCCCTG ------/AGATGC AGAAGACCAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AGATGC 0 1 192791 CASAVA_Build 12 83443202 2I CGCACACACG --/CA CACACACACA 3070 hom 58 het 31 0 18 13 CA 7 8 192792 CASAVA_Build 12 83443724 1D40M1I GTAGGGGACC AAAAAAAAAAACACCACCACCACCAACAACAACAACAACAA-/-AAAAAAAAAACACCACCACCACCACCAACAACAACAACAAC AAAACAAACA 3070 hom 64 het 27 0 20 12 N/A 0 0 192793 CASAVA_Build 12 83445895 1I TTTAAGGTTT -/A GATTAATATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 1 192794 CASAVA_Build 12 83446831 1I ACTTCTCTAC -/T TTTTTCTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 5 6 192795 CASAVA_Build 12 83451165 1D GGAGAACCTC T/- ACTAGGGCAG 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 1 0 192796 CASAVA_Build 12 83454600 1D CTTTTTATAA T/- TAATTATATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 1 192797 CASAVA_Build 12 83456445 1D ACCTTTGCTC T/- ATTTTTTGAT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 1 0 192798 CASAVA_Build 12 83459650 3I CAGTACCATG ---/TTA AATACAAGTA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 TTA 0 1 192799 CASAVA_Build 12 83459807 1D TTTTGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 874 hom 38 2 30 6 T 11 10 192800 CASAVA_Build 12 83460140 1D AGAGTAACCC T/- GGTCTCACAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 1 0 192801 CASAVA_Build 12 83462253 1I GACTGGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 34 0 21 13 T 13 14 192802 CASAVA_Build 12 83467645 2I TTTACTGAGA --/AT ATATCCTCAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AT 2 3 192803 CASAVA_Build 12 83477991 2D AACTCAAATT TG/-- TGTGTTTATG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TG 3 2 192804 CASAVA_Build 12 83490139 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 4 A 10 9 192805 CASAVA_Build 12 83497709 4I TTTATGTGGT ----/AAAC AAACATGAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAAC 1 2 192806 CASAVA_Build 12 83514512 1I GTAGAATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 518 hom 49 2 41 6 T 9 10 192807 CASAVA_Build 12 83523724 1I TGTTCAAGAA -/C AAATCTTGAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 0 1 192808 CASAVA_Build 12 83528479 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 25 het 11 0 9 2 A 7 6 192809 CASAVA_Build 12 83536326 4D ATTTTTGTCA TCTT/---- TCTGATTGCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TCTT 1 0 192810 CASAVA_Build 12 83552069 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 9 8 192811 CASAVA_Build 12 83554156 1I CTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 34 1 23 10 T 11 12 192812 CASAVA_Build 12 83560512 1I CAATACTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 405 hom 32 1 25 6 A 9 10 192813 CASAVA_Build 12 83566582 1I AACAAATCTG -/T TTAAGGAGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 3 192814 CASAVA_Build 12 83571858 4I TCTCCTTACC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTAT 2 3 192815 CASAVA_Build 12 83597696 1I GAAGAAATGC -/A AGATGAGAGA 3070 hom 82 het 35 0 30 5 A 1 2 192816 CASAVA_Build 12 83599677 3I CCACGGAGGC ---/AGA AGAAGGAACT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 AGA 1 2 192817 CASAVA_Build 12 83603237 2D TCTGTTTTTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 34 het 16 0 12 4 AT 10 9 192818 CASAVA_Build 12 83607089 4I TAATGGTGAC ----/TAAA TAAAATCGGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAAA 1 2 192819 CASAVA_Build 12 83613467 3I AACAGACAAC ---/AAT GAGTGAACAC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AAT 0 1 192820 CASAVA_Build 12 83620711 1I TTAATTACGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 9 hom 56 1 54 1 A 8 9 192821 CASAVA_Build 12 83629891 6D ATATATACAC ACATAT/------ ATATGTGTGT 1726 het 309 hom 15 2 9 4 ACATAT 1 0 192822 CASAVA_Build 12 83636363 1I ATTAATAGTG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 8 192823 CASAVA_Build 12 83641554 1I TCAGAAAGAT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 8 192824 CASAVA_Build 12 83646584 3I ATTTTATGCA ---/TCT TATTATATCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TCT 0 1 192825 CASAVA_Build 12 83655153 1D TTTACCTTCT A/- AAATTCTATC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 4 3 192826 CASAVA_Build 12 83661306 1I GATGTGTCAT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 7 8 192827 CASAVA_Build 12 83664372 3I CTGATGCCTT ---/TTC TTGTCAACTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TTC 0 1 192828 CASAVA_Build 12 83670840 2I ATTCATAAAC --/AT ATGTGGATGC 3070 hom 99 het 37 0 32 5 AT 1 2 192829 CASAVA_Build 12 83679447 20I TGTAAAATAA --------------------/TCACATATATAACCCCTTGT TCAGGAGTAT 3070 hom 48 het 14 0 17 3 TCACATATATAACCCCTTGT 0 1 192830 CASAVA_Build 12 83685406 2I GGCCTGCCTG --/CA CACACACACA 3070 het 409 hom 46 1 30 16 CA 8 9 192831 CASAVA_Build 12 83690120 1I CCTTCAATTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 9 10 192832 CASAVA_Build 12 83696509 1D TTTTACATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 173 hom 47 1 36 10 T 10 9 192833 CASAVA_Build 12 83699190 2D GAGCGTGCAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 120 het 57 0 40 18 GT 7 6 192834 CASAVA_Build 12 83722313 2D TGTCTTTCTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 84 het 34 0 29 8 TA 6 5 192835 CASAVA_Build 12 83724396 1D AGAAGGTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 28 1 22 5 A 13 12 192836 CASAVA_Build 12 83725951 2I TGCCAAAATT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 9 11 192837 CASAVA_Build 12 83737975 2D TCCTCTCTAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 AT 6 5 192838 CASAVA_Build 12 83741461 1I CTTTAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 27 0 17 10 T 11 12 192839 CASAVA_Build 12 83742345 1D CATCCATATT G/- TTGCATATTT 3070 hom 111 het 43 0 38 6 G 1 0 192840 CASAVA_Build 12 83742759 4D AAACATTTGT TTAA/---- TTAACAGCAT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 TTAA 2 1 192841 CASAVA_Build 12 83750598 1D TACTCACTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 129 het 45 0 43 3 T 10 9 192842 CASAVA_Build 12 83766385 1I AGAAAGAAAG -/A CAAAGAAAGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 0 1 192843 CASAVA_Build 12 83903288 2I TAATAGCCCA --/AC ACATATTTAT 2077 het 1019 hom 9 3 5 1 AC 1 2 192844 CASAVA_Build 12 83914241 3I CCCTGCTGTC ---/TCA TCAGTGTATT 3070 het 3070 ref 48 30 14 4 TCA 1 2 192845 CASAVA_Build 12 83915387 1D CAGGACTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 12 11 192846 CASAVA_Build 12 83919211 1I ACTAAAAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 13 24 2 T 9 10 192847 CASAVA_Build 12 83925907 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 9 10 192848 CASAVA_Build 12 83926800 2D CATGGAGAAA CT/-- CTGTCTCTAC 3070 het 1355 hom 14 4 9 1 CT 2 1 192849 CASAVA_Build 12 83939407 1I GTTGGGGGTG -/A AACATATGGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 3 192850 CASAVA_Build 12 83943719 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGCACCT 3070 het 187 hom 25 1 20 4 C 1 2 192851 CASAVA_Build 12 83951377 1I AATGGAAACA -/G GTATCACAAT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 G 1 2 192852 CASAVA_Build 12 83961555 15D AACATCTTTG TTTCTATAGTAGATA/--------------- GAGACTATCT 3070 het 3070 hom 41 18 22 4 TTTCTATAGTAGATA 1 0 192853 CASAVA_Build 12 83965064 9D GTAAAATTAA AAAAAAATT/--------- AAAAAAATTA 3070 het 2298 hom 17 6 12 2 AAAAAAATT 2 1 192854 CASAVA_Build 12 83990145 1I AGAAAGGTCA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 8 9 192855 CASAVA_Build 12 83999358 1D TTGGATTGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 10 9 192856 CASAVA_Build 12 84000401 1I TTCCTTTTCA -/T TTTGTTTTCT 3070 het 3070 hom 50 18 27 5 T 3 4 192857 CASAVA_Build 12 84004524 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3027 hom 25 10 9 7 T 12 11 192858 CASAVA_Build 12 84032469 2D ATAAATTGAC AT/-- ATTTTATTAC 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 AT 2 1 192859 CASAVA_Build 12 84054100 2I TGTGGGTGTG --/CA CACACACATA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 CA 4 5 192860 CASAVA_Build 12 84059847 1D TTCTTTCCTG C/- CATTAACATG 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 C 2 1 192861 CASAVA_Build 12 84064046 3D AGCTGGACTC CTT/--- CTTTTCCCTC 3070 het 3070 hom 51 13 27 13 CTT 2 1 192862 CASAVA_Build 12 84065619 1D ATAGCTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 18 12 T 14 13 192863 CASAVA_Build 12 84067648 1I ACATATTTTT -/G GTTGCGATTA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 G 1 2 192864 CASAVA_Build 12 84068693 2D CAATAACGCA TT/-- TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 8 6 192865 CASAVA_Build 12 84076772 1I ATCCCTTGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 9 10 192866 CASAVA_Build 12 84077659 4D GTTCTTTGAC ATGT/---- CATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 ATGT 1 0 192867 CASAVA_Build 12 84081255 1D GGGCATCTGA T/- GCCCCCCAGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 1 0 192868 CASAVA_Build 12 84092450 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1719 het 1719 ref 22 15 4 3 A 13 12 192869 CASAVA_Build 12 84095370 1D AGTTTGAAGG C/- TGAGTAAAAG 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 C 1 0 192870 CASAVA_Build 12 84099023 33I TATACTATCC ---------------------------------/CATGTCATTTCTTTTCTTCACCCTGTATAAGGT CTTGAACTTA 3070 het 3070 ref 43 22 19 5 CATGTCATTTCTTTTCTTCACCCTGTATAAGGT 0 1 192871 CASAVA_Build 12 84106055 1I AGCACTCAGT -/A AAAAAAAAAA 961 het 961 ref 53 45 3 5 A 13 14 192872 CASAVA_Build 12 84165760 1I AGGCAATATT -/G TCTTTTGTTA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 G 0 1 192873 CASAVA_Build 12 84200807 1D GTTTTTAGGT A/- AAAAAAAAAA 1454 het 1454 ref 31 24 4 4 A 12 11 192874 CASAVA_Build 12 84214830 1D AAAATTAATA T/- TTTTTTACTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 6 192875 CASAVA_Build 12 84227539 1I TAACAGAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1282 hom 35 3 16 16 T 15 16 192876 CASAVA_Build 12 84244185 3D9M1I CTTTCTTTTC TATTTTTCTTTT-/---TTTTCTTTTC TCGTTTTCTT 1481 hom 10 het 14 0 5 11 N/A 0 0 192877 CASAVA_Build 12 84276417 1D ATACTGGCAA C/- ATTTTGGTGA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 C 1 0 192878 CASAVA_Build 12 84280763 2I AGAAAGAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AG 7 8 192879 CASAVA_Build 12 84296346 1I TTATTGTTGG -/A CAGATTATAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 0 1 192880 CASAVA_Build 12 84308343 4D AACCCTGAAA TATT/---- TATTCTCTGG 3070 het 3070 hom 41 17 18 7 TATT 2 1 192881 CASAVA_Build 12 84309448 2D TTGAGAGCAC AT/-- GTTTTATCTC 3070 het 3070 hom 41 15 17 11 AT 1 0 192882 CASAVA_Build 12 84310042 2I GGGTATAAGG --/AC ACACTAATTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 AC 2 3 192883 CASAVA_Build 12 84335342 2I ACTTTAATTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 AT 5 6 192884 CASAVA_Build 12 84346592 1I GGGTGCTTGC -/T TGTTGTGCTC 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 T 1 2 192885 CASAVA_Build 12 84348636 3I GGGATTTTTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 TTG 2 3 192886 CASAVA_Build 12 84354468 1I AGAATTTAGC -/A GAATTTTCAG 3070 het 3070 hom 53 23 27 3 A 0 1 192887 CASAVA_Build 12 84380490 1I TGGCTTAACT -/A AAGTTTTGTT 3070 het 2413 hom 17 6 9 2 A 2 3 192888 CASAVA_Build 12 84381985 1I TATTTTGTGG -/T TTTTTTTTTT 2759 het 2759 ref 44 18 6 20 T 15 16 192889 CASAVA_Build 12 84390958 3I TAAAGCATAT ---/TAA TAAGCATTCA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TAA 1 2 192890 CASAVA_Build 12 84402425 1D CTATACAAGC T/- TTTTCAGAAT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 5 4 192891 CASAVA_Build 12 84413637 1D TGCTTTTTTC T/- GCTTATATTA 3070 het 3070 ref 54 24 24 7 T 1 0 192892 CASAVA_Build 12 84433098 1D AAAATGTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 10 13 A 15 14 192893 CASAVA_Build 12 84438289 1I TCTGCCTCCA -/G GGTTCAAAAG 1813 het 1813 ref 18 11 5 2 G 2 3 192894 CASAVA_Build 12 84444182 2I GCATCAATTC --/TA TGAGTTTCTC 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 TA 0 1 192895 CASAVA_Build 12 84444980 1I GTAAAAAAAA -/C GTGGCTGCAT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 C 0 1 192896 CASAVA_Build 12 84453329 1D ATATTTTAGG T/- TTTTTGTTAT 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 T 6 5 192897 CASAVA_Build 12 84457670 1D CATGAGCCTT A/- AAAAATAGCT 3070 het 3070 ref 56 25 25 6 A 6 5 192898 CASAVA_Build 12 84457982 1I TTTAAAAATT -/A AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 5 6 192899 CASAVA_Build 12 84464514 1I ATCAGACAGG -/A AAACATGTCT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 3 4 192900 CASAVA_Build 12 84466874 16D CATTTTTGTT AATCAGCAAATCAGCA/---------------- AATCAGCAAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 6 AATCAGCA 3 1 192901 CASAVA_Build 12 84473267 1I ATTTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 11 12 192902 CASAVA_Build 12 84473404 5I TCCATAAAAT -----/ATAAA ATAAAATTGT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 ATAAA 1 2 192903 CASAVA_Build 12 84485185 4I AAATTATTGA ----/TTTT TTAAATGAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 2 6 192904 CASAVA_Build 12 84487408 1D AGGCTGGGAT A/- AACCTTACCC 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 A 3 2 192905 CASAVA_Build 12 84488960 1I ACTAACTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 T 10 11 192906 CASAVA_Build 12 84505643 3I GCACTGTGTA ---/CCT CCTTTTGCAA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 CCT 1 2 192907 CASAVA_Build 12 84508160 1I TGAGTACATT -/G GAATATACAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 G 1 2 192908 CASAVA_Build 12 84511685 2D GCTTTTTTCC TA/-- TGTTTCTTGG 3023 het 3023 ref 28 18 7 4 TA 1 0 192909 CASAVA_Build 12 84517748 3D AAAAACTAAT AAC/--- AAGTGATACA 3070 het 3070 hom 28 15 12 3 AAC 1 0 192910 CASAVA_Build 12 84521213 1I ATATTAAATT -/A AAAAATACAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 5 6 192911 CASAVA_Build 12 84524693 1D TGGGTGTATA T/- TTGGCTTTCC 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 T 3 2 192912 CASAVA_Build 12 84528978 1D TTTTAGGTTC A/- GGGGTACACG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 1 0 192913 CASAVA_Build 12 84539786 1D GTGGTTCATG T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 7 6 192914 CASAVA_Build 12 84542543 2I AGTTATAGCC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 9 11 192915 CASAVA_Build 12 84556206 1D TGCCACTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 T 11 10 192916 CASAVA_Build 12 84565715 1I TTATGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 10 11 192917 CASAVA_Build 12 84566393 1D GATATTGAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 T 10 9 192918 CASAVA_Build 12 84572338 1I GTTGCAGCTA -/C TTTTGCAAGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 192919 CASAVA_Build 12 84574165 1I CGTCTCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3015 hom 29 11 11 7 A 11 12 192920 CASAVA_Build 12 84580063 1D ATCCTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 A 11 10 192921 CASAVA_Build 12 84588170 1D AGGGAGTGGT G/- GGGTTGGGGG 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 G 4 3 192922 CASAVA_Build 12 84598561 2D CCACTCTCTC TT/-- GATTGGTTCC 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 T 2 0 192923 CASAVA_Build 12 84602566 1I TGTATTCATT -/G TGGTGCTTGT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 G 0 1 192924 CASAVA_Build 12 84606482 2D TGATTATGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 28 1 13 14 A 13 11 192925 CASAVA_Build 12 84611090 1D GGTAATCTCT G/- ATCCGGCATC 3070 het 3070 hom 40 17 23 0 G 1 0 192926 CASAVA_Build 12 84612092 3D TTTGAGTATT TTA/--- TTATTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 TTA 2 1 192927 CASAVA_Build 12 84613772 1I GGTTTTCTGT -/C CCTTAAATAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 2 3 192928 CASAVA_Build 12 84614502 2I ATATATATAC --/AT ACATATATAT 2169 het 2169 ref 28 20 6 2 AT 0 1 192929 CASAVA_Build 12 84616872 4I CAATTTTAAT ----/AGTC AGCCTTAATT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 AGTC 0 1 192930 CASAVA_Build 12 84620707 8D GACCAGGTGG AGGTAACT/-------- GAATCATAGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 6 AGGTAACT 1 0 192931 CASAVA_Build 12 84621759 1I55M4I ACTTAAGGGT -AAATTTTAATACAAATAAAATTATTATGTTTCAATCAGGGATATTTTTTATTGAA----/AAAAGTTTAATACAAATAAAATTATTATGTTTCAATCAGGGATATTTTTTATTGAAACTG GCCACCGTGT 3070 het 3070 ref 39 31 22 6 N/A 0 0 192932 CASAVA_Build 12 84629319 1D ATGTAAGCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 10 9 192933 CASAVA_Build 12 84638426 3D CAGCAGTTTT AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 12 9 192934 CASAVA_Build 12 84647174 1D AAATTCTGAG T/- TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 T 7 6 192935 CASAVA_Build 12 84649311 1D ACAGAGACAC A/- GGGAATAGTT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 A 1 0 192936 CASAVA_Build 12 84652541 4I TTAAAAAAAG ----/AAAT AAAAGGATTC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AAAT 0 1 192937 CASAVA_Build 12 84653590 2I AAAGCAGTCT --/TT GCTGCACTGC 3070 het 1985 hom 43 7 31 5 T 1 3 192938 CASAVA_Build 12 84657413 7D3M27D CTAACATAAG TTATGTTATGTACCTAAACCATTACATAACATAACAT/-------AGG--------------------------- AAATTAAGAA 3070 hom 84 het 26 0 29 0 N/A 0 0 192939 CASAVA_Build 12 84658394 1I ATGTTCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1221 hom 40 3 30 7 T 13 14 192940 CASAVA_Build 12 84678015 4D ACTCAAGAAT TCTA/---- TCTAAGAACA 3070 hom 111 het 40 0 36 5 TCTA 2 1 192941 CASAVA_Build 12 84679140 3I TCTGCCCCAG ---/AGA AGAAGAATTG 3070 hom 177 het 66 0 59 7 AGA 2 3 192942 CASAVA_Build 12 84679714 2D CTTTTTTCAC AG/-- AGTCTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 AG 2 1 192943 CASAVA_Build 12 84680439 3D ATGATGGTTT CTA/--- CTATTTTGGT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 CTA 2 1 192944 CASAVA_Build 12 84683176 2I TTTTAAAAAC --/AT ATTTTCTCTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AT 1 2 192945 CASAVA_Build 12 84685367 1D TATTCCAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 9 192946 CASAVA_Build 12 84688056 4D AAAATGACTC AATT/---- AAAAAATAAC 3070 hom 117 het 40 0 40 3 AATT 1 0 192947 CASAVA_Build 12 84692522 15I9M2I CTTGTTCTTT ---------------TTTAATGAT--/AAAAACATTCATTTGTTTATTTTTGG AAATGTAGAA 3070 hom 48 het 12 0 16 1 N/A 0 0 192948 CASAVA_Build 12 84694508 1I ACTGAACTCC -/T CTTCTCAGTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 1 192949 CASAVA_Build 12 84699794 1D ACATAATCAC A/- AGCTAAATGT 3070 het 3070 hom 47 16 28 4 A 2 1 192950 CASAVA_Build 12 84702665 2D TCTTCATTCT CA/-- GTCATTGCAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 6 CA 1 0 192951 CASAVA_Build 12 84704559 1I AAAAACCATG -/A AAAAAGATTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 5 6 192952 CASAVA_Build 12 84711127 1I ATAAAGCAGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 8 9 192953 CASAVA_Build 12 84712339 8I ACAATTAACT --------/AATATACA AGCCCTGTTA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 AATATACA 0 1 192954 CASAVA_Build 12 84724123 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1105 hom 7 het 3 0 3 0 T 10 11 192955 CASAVA_Build 12 84726622 2D TTTGTACCAC AT/-- AGAGTTAATT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 AT 1 0 192956 CASAVA_Build 12 84728828 5I TTCTGTTTTA -----/CTTTG CTTTGTGTGT 3070 hom 55 het 33 0 19 14 CTTTG 1 2 192957 CASAVA_Build 12 84733629 1D TCATATGACG C/- ATTGGTCGCA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 C 1 0 192958 CASAVA_Build 12 84737120 1D GCTTTAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 11 10 192959 CASAVA_Build 12 84738498 1D AAAAATGTCA T/- TTTTTCCTCA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 6 5 192960 CASAVA_Build 12 84751008 1D TTAAATTTAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 7 192961 CASAVA_Build 12 84763019 1I ATCTGGCTTG -/C CCTTAGCAGG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 C 2 3 192962 CASAVA_Build 12 84764615 3D TGAAATAACT TGC/--- TTGGGGTTAC 3070 hom 102 het 37 0 34 4 TGC 1 0 192963 CASAVA_Build 12 84767271 1D TGGGAGAGGG A/- ACCCCGTGGA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 2 1 192964 CASAVA_Build 12 84771539 2I CAAATAATTT --/TA TGAGGCCAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TA 0 1 192965 CASAVA_Build 12 84773408 4I GTGAGCAAGC ----/ACAG ACAGAGTCTG 3070 het 3070 hom 44 12 22 10 ACAG 1 2 192966 CASAVA_Build 12 84775541 2D CCAAGAAATA AC/-- ACATTACAAC 3070 het 3070 hom 54 23 27 5 AC 2 1 192967 CASAVA_Build 12 84789695 1I CCAGCTACTC -/G GGGGGGCTGA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 G 6 7 192968 CASAVA_Build 12 84794016 1I CTTAAAGTAC -/A AATACAATTC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 2 3 192969 CASAVA_Build 12 84794741 1I20M1D TTCCTTTTTG -AAAAAAAAAATTTCTTTTAGT/AAAAAAAAAAATTTCTTTTAG- TAAAAGAAGT 3070 hom 87 het 35 0 30 10 N/A 0 0 192970 CASAVA_Build 12 84801631 2D ATATGAGCTG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 29 0 16 13 AT 10 9 192971 CASAVA_Build 12 84802441 2D CATATAAGTT TC/-- TCAAAACATT 3070 hom 96 het 43 0 33 10 TC 2 1 192972 CASAVA_Build 12 84803670 1D GTACGCTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 25 1 16 8 T 13 12 192973 CASAVA_Build 12 84809822 1D CTGGCTCATT A/- AACATTATCA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 3 2 192974 CASAVA_Build 12 84817910 1D TTTCAGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 11 10 192975 CASAVA_Build 12 84821232 2D ATTAATCCAT AA/-- GTCAATAGAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 2 0 192976 CASAVA_Build 12 84821528 1D CCACCAGGAC T/- TTTTTTTTTT 1757 het 1613 hom 25 8 5 12 T 15 14 192977 CASAVA_Build 12 84821812 1D GCTGGTGAAA T/- TTTTTTGTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 6 192978 CASAVA_Build 12 84830741 1I TTGTAAATGA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 7 8 192979 CASAVA_Build 12 84836468 1D AATAACTTAA T/- TTGTTATCAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 3 2 192980 CASAVA_Build 12 84839757 1I AGCCTCCCCC -/T ATGCCCCCCA 2376 het 2376 ref 15 10 5 0 T 0 1 192981 CASAVA_Build 12 84841328 2D TAGGATGTGA AT/-- ATATTTGAGA 3070 het 3070 ref 38 20 13 8 AT 3 2 192982 CASAVA_Build 12 84844803 1D CTGACCATAT G/- GGCCATAACT 3070 hom 177 het 64 0 57 7 G 3 2 192983 CASAVA_Build 12 84850208 1I AATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 33 2 23 8 T 11 12 192984 CASAVA_Build 12 84851370 4I GAATACTAGC ----/TTTA TTTATTAACC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTTA 1 2 192985 CASAVA_Build 12 84852793 1I CAATTTCCTC -/A AAAAAGCTTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 5 6 192986 CASAVA_Build 12 84859758 3D11M1I10M13D AATTTTTGTG AAATTAATTAATTA-ATTAATGAAAATAATTAATTATT/---TTTATTATGTATATAGATGTAA------------- ATTTTGCAAC 3070 hom 72 het 19 0 24 5 N/A 0 0 192987 CASAVA_Build 12 84860155 1I AAACTCCATC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 30 het 16 0 11 6 A 8 9 192988 CASAVA_Build 12 84871499 1I AGTTCATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 823 hom 32 2 22 8 T 10 11 192989 CASAVA_Build 12 84872349 6I TGTTAAAATA ------/AAATTG GTGGTTCAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AAATTG 0 1 192990 CASAVA_Build 12 84873004 4D AACGAGAATG AAAC/---- AAAATTAAAA 3070 het 3070 ref 30 19 11 1 AAAC 1 0 192991 CASAVA_Build 12 84874808 4I TTGAATTGAC ----/ACAA ACAAGCACAG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 ACAA 1 2 192992 CASAVA_Build 12 84875741 4D ATTAAATAAT TAAA/---- TAGGTAATGG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TAAA 1 0 192993 CASAVA_Build 12 84886782 1D AATAATGTTG A/- GATGAACTGG 3070 hom 163 het 60 0 55 5 A 1 0 192994 CASAVA_Build 12 84891042 2D CACATATCTC TG/-- TGCCATACTT 3070 hom 126 het 49 0 40 10 TG 2 1 192995 CASAVA_Build 12 84893345 1I TGCTACCTTT -/A AAAAACATAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 6 192996 CASAVA_Build 12 84896772 1I TTATCATTCC -/A CCCAACTGTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 0 1 192997 CASAVA_Build 12 84925932 4D TATATGTCTC TATT/---- TATTTTTCTT 3070 hom 117 het 45 0 40 8 TATT 2 1 192998 CASAVA_Build 12 84934865 3I CCGTATTACT ---/GAA GATGCCTCTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 GAA 0 1 192999 CASAVA_Build 12 84941521 2I TTACGTAATC --/AT ATATGTTTAT 2166 hom 15 het 6 0 6 0 AT 2 3 193000 CASAVA_Build 12 84949020 1D TTATAAATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 10 9 193001 CASAVA_Build 12 84951081 1D CTATCCCTAT A/- AGTATAGTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 1 193002 CASAVA_Build 12 84952481 1D TTTTGTTGTT G/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 20 0 18 3 G 1 0 193003 CASAVA_Build 12 84955598 1D TTGCATTTGC T/- GAGGAGTGTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 1 0 193004 CASAVA_Build 12 84956877 1I CTGCAAAAGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 8 9 193005 CASAVA_Build 12 85013708 1I ATATTCATCT -/C CTGTGATTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 1 2 193006 CASAVA_Build 12 85017997 2D TTATTATCTT TA/-- TGTTTAATCT 3070 het 3070 hom 31 13 15 5 TA 1 0 193007 CASAVA_Build 12 85022170 1D GTCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 2018 het 2018 ref 27 13 8 6 A 15 14 193008 CASAVA_Build 12 85022772 1I GCAAACCTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 T 9 10 193009 CASAVA_Build 12 85031962 1D TGTGTCTACC T/- TTTGCACCTG 3070 het 3070 hom 39 11 23 5 T 4 3 193010 CASAVA_Build 12 85038126 4I TTTTATTATT ----/TTTA TTTATTTTAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TTTA 1 2 193011 CASAVA_Build 12 85040697 2I GTATATGTTC --/AT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 AT 0 1 193012 CASAVA_Build 12 85043867 1D AAAATAAAAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 8 7 193013 CASAVA_Build 12 85048196 3I TCACAAAAAT ---/AAA GAAAATACCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 3 193014 CASAVA_Build 12 85049653 1I TAAAAACTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 9 10 193015 CASAVA_Build 12 85064743 2D AATTCTCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 32 0 22 10 T 12 10 193016 CASAVA_Build 12 85065156 1I ATTTATTAAA -/T TTTTTTTTTT 2119 het 2058 hom 21 5 5 11 T 13 14 193017 CASAVA_Build 12 85075041 1I GCAAAATATG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 8 9 193018 CASAVA_Build 12 85077335 1D AATTTGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 29 1 26 4 T 12 11 193019 CASAVA_Build 12 85085578 1I ACTTTTATAA -/C AAGTCCACTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 0 1 193020 CASAVA_Build 12 85102546 1I CTTTTTTTTT -/C CTCTTCCTTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 C 1 2 193021 CASAVA_Build 12 85105660 1D TTCCAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 563 hom 28 2 23 4 A 13 12 193022 CASAVA_Build 12 85117296 1I AGGGGAAAAA -/G GTAGAATTTT 3070 het 31 hom 32 1 28 3 G 1 2 193023 CASAVA_Build 12 85119372 1D TTACATATAT A/- AAACATTTCA 1856 hom 12 het 6 0 5 1 A 4 3 193024 CASAVA_Build 12 85119926 1D TGAAAAAAAA G/- TTATTACATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 1 0 193025 CASAVA_Build 12 85123236 4D TTGAAAATTA TAGT/---- TAGTTTTAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 TAGT 2 1 193026 CASAVA_Build 12 85123860 4D TGCTTCCACC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 10 A 15 11 193027 CASAVA_Build 12 85125021 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 13 12 193028 CASAVA_Build 12 85125490 1D AGGAGAAAGG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 8 7 193029 CASAVA_Build 12 85131161 1D GAAACATGCA C/- TTGTCAAGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 C 1 0 193030 CASAVA_Build 12 85133041 1I CTTACAATGC -/T TTCTGGAGCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 2 3 193031 CASAVA_Build 12 85137282 3I CTGTTCTAAA ---/ATT TCTAAAATTG 3070 hom 117 het 41 0 39 2 ATT 0 1 193032 CASAVA_Build 12 85145135 1D TTTAGTCTAC T/- TTTTTTACTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 6 193033 CASAVA_Build 12 85148779 1I AAACACTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 33 3 20 10 T 13 14 193034 CASAVA_Build 12 85168422 2D GTTGAAAAGC AG/-- AGACTGTTGG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AG 2 1 193035 CASAVA_Build 12 85175929 2I TAAATATAAG --/AT ATAATTAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 1 2 193036 CASAVA_Build 12 85186574 2I TATTAACTAC --/AT ATATATATAT 1887 het 110 hom 12 1 9 2 AT 7 8 193037 CASAVA_Build 12 85193251 1I TGCAGTCTCA -/T TTATCCTTCT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 2 3 193038 CASAVA_Build 12 85196882 26I TGATGTCTCA --------------------------/CATTGATTGATTTATGTATGCTGAAC CATCCTTATA 3070 hom 84 het 28 0 29 2 CATTGATTGATTTATGTATGCTGAAC 0 1 193039 CASAVA_Build 12 85197567 1I TGCTCTGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 217 hom 28 2 22 4 T 10 11 193040 CASAVA_Build 12 85203601 1D TATAAATATA C/- CCCTGATGTC 3070 hom 120 het 43 0 41 3 C 4 3 193041 CASAVA_Build 12 85205301 1I GTTCTGGGAT -/A TATGTGCAGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 0 1 193042 CASAVA_Build 12 85208381 1D ACAGACTAAT A/- AAAAAACTGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 7 6 193043 CASAVA_Build 12 85209733 4I CTGAATACTG ----/TGTT TGAATAGGAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TGTT 0 1 193044 CASAVA_Build 12 85210351 1I ACCCTACTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 698 hom 17 2 13 2 T 10 11 193045 CASAVA_Build 12 85212040 1I AAACAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 24 0 16 8 A 10 11 193046 CASAVA_Build 12 85212273 1D CTAAAACTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 11 10 193047 CASAVA_Build 12 85221469 1I GAAGACACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 10 11 193048 CASAVA_Build 12 85223353 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 16 1 11 5 A 15 14 193049 CASAVA_Build 12 85224761 4D GATACGTGAT AAAG/---- AAAGTATAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 4 AAAG 2 1 193050 CASAVA_Build 12 85225126 2D TTATAATAAC TG/-- TATTAGATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TG 1 0 193051 CASAVA_Build 12 85229390 1I TCTAAACTAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 117 het 50 0 39 11 T 7 8 193052 CASAVA_Build 12 85232927 1I TATAGAACTG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 8 9 193053 CASAVA_Build 12 85243793 1D CTCCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 35 1 32 2 A 11 10 193054 CASAVA_Build 12 85262949 5I TTTTAATGTG -----/TTCCT TTCCTTTTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TTCCT 1 2 193055 CASAVA_Build 12 85272365 1D AGTAGACTTT A/- AAGCAGATAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 3 2 193056 CASAVA_Build 12 85274686 1I CTGGGGGAGA -/G GGGGTTGGCC 3070 hom 75 het 27 0 24 3 G 4 5 193057 CASAVA_Build 12 85278956 1D AAGCCAAAAG A/- ACAAAGCTGG 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 2 1 193058 CASAVA_Build 12 85280396 1D AAGGTATAAT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 8 7 193059 CASAVA_Build 12 85281882 2D CTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 2995 hom 39 het 18 0 14 5 CA 10 9 193060 CASAVA_Build 12 85311697 2I AGCCATAGGC --/AT ATTTAATGCC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AT 1 2 193061 CASAVA_Build 12 85324622 1I CAGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 18 23 11 A 11 12 193062 CASAVA_Build 12 85328945 1I CCAGCCATGC -/T TTCTGTGTAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 2 3 193063 CASAVA_Build 12 85332513 1D TTACTTTTTT A/- GAGCCAAAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 1 0 193064 CASAVA_Build 12 85337920 1D AAGACCATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 9 193065 CASAVA_Build 12 85342219 1I AGATTTTTGT -/C CCCCACTCTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 4 5 193066 CASAVA_Build 12 85351266 2I GTGTGTGTGC --/AT ATATATATAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AT 5 6 193067 CASAVA_Build 12 85368692 2D TATATAAATA TG/-- TGACTATACA 3070 hom 119 het 47 0 40 10 TG 2 1 193068 CASAVA_Build 12 85376843 1D AGTGACTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 10 9 193069 CASAVA_Build 12 85380886 5I TTCCATCCTT -----/CAATC CAATCAAGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CAATC 1 2 193070 CASAVA_Build 12 85382383 1I7M1D TGTAACCTTA -TATTTGAT/GTCTTTCA- TATAACCATC 3070 hom 129 het 45 0 44 2 N/A 0 0 193071 CASAVA_Build 12 85384122 5D CCGTCAAAAA AAAAC/----- AAAAACAAAA 56 het 56 ref 20 2 2 18 AAAAC 1 0 193072 CASAVA_Build 12 85403409 3D TGAACATTAG TTC/--- TTCAAGTCAA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 TTC 2 1 193073 CASAVA_Build 12 85460274 1I CAATTCCTAG -/T TTCAGAAATA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 2 3 193074 CASAVA_Build 12 85461742 2I TAGTCTATGC --/TG GTTTAGCTGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TG 0 1 193075 CASAVA_Build 12 85471376 1D CCATAACTAA G/- TAAATCCAGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 0 193076 CASAVA_Build 12 85484657 2I ACAATGTATC --/TG TGTGTGTGTG 2176 het 18 hom 10 1 7 2 TG 6 7 193077 CASAVA_Build 12 85488218 4I ATATATAATA ----/TTTG TTTGTCAATT 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 TTTG 1 2 193078 CASAVA_Build 12 85493162 4I TAAAATACAC ----/AATT AAGTTATTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AATT 0 1 193079 CASAVA_Build 12 85497917 1I TTATTAAATG -/C CTTGAGGTAG 3070 hom 84 het 37 0 29 8 C 1 2 193080 CASAVA_Build 12 85499637 2D TTTCTGGGAT AA/-- GTTTTCTTGG 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 2 0 193081 CASAVA_Build 12 85502819 2I TAACATATAT --/AA GTTTTTATGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 0 2 193082 CASAVA_Build 12 85508155 26D TACCAAGGAT GAAATTGAAGCTCAGAGAAATTTTAA/-------------------------- GAATTTCCCT 3070 hom 127 het 44 0 43 4 GAAATTGAAGCTCAGAGAAATTTTAA 1 0 193083 CASAVA_Build 12 85511174 1D AATTTAAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 T 10 9 193084 CASAVA_Build 12 85521709 1I TAGTATATAT -/A ATTATATAGT 2443 hom 12 het 5 0 5 0 A 1 2 193085 CASAVA_Build 12 85527700 1D GCACTACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 12 8 A 12 11 193086 CASAVA_Build 12 85528470 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 18 0 16 4 T 9 10 193087 CASAVA_Build 12 85545072 1I AAGCCTGGCT -/G GGGGAGGGGC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 G 4 5 193088 CASAVA_Build 12 85545402 1I TCATACAGCT -/G GGTGCCCCTC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 2 3 193089 CASAVA_Build 12 85546382 2I ATGAAGGAAA --/AC AAATGTTAAG 3070 hom 18 het 9 0 7 2 AC 0 1 193090 CASAVA_Build 12 85556038 1I AAAAATCAAA -/T TGTTGGACTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 1 2 193091 CASAVA_Build 12 85572251 1D GTTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 33 1 25 7 T 11 10 193092 CASAVA_Build 12 85609536 1I CTAGCCATCA -/C CCAGATGCAA 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 C 2 3 193093 CASAVA_Build 12 85610957 1I TGATTGGATC -/A GCCATTAGAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 0 1 193094 CASAVA_Build 12 85615999 1I TGTTATATCA -/T TTTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 6 7 193095 CASAVA_Build 12 85624377 1I ATTTTGCCCA -/G GCTGGTTGCA 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 G 1 2 193096 CASAVA_Build 12 85630815 1D AGCCATCCTT C/- CCCTATAAGA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 C 4 3 193097 CASAVA_Build 12 85635092 1I TAATTATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1699 hom 18 5 9 4 A 10 11 193098 CASAVA_Build 12 85638210 1D CTGCATGACC T/- TTTATAATCT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 4 3 193099 CASAVA_Build 12 85639335 1D GCACCATAAG A/- AAAAAAAAAG 640 het 640 ref 39 34 2 4 A 10 9 193100 CASAVA_Build 12 85641613 1I ACATGAGTTT -/G GGGGGGGACA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 G 7 8 193101 CASAVA_Build 12 85642843 1D AGGTAATGCA T/- TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 48 32 15 1 T 7 6 193102 CASAVA_Build 12 85647562 1I ATATAAAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 8 9 193103 CASAVA_Build 12 85648307 1I GGCACAGAAG -/A AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 6 7 193104 CASAVA_Build 12 85657221 4I ATTTTATTCA ----/TAAT TAAAGAGTAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TAAT 0 1 193105 CASAVA_Build 12 85666855 1D TCTTTTAACC T/- TTTTTTTTTT 1761 het 1761 ref 38 22 7 9 T 12 11 193106 CASAVA_Build 12 85702577 1I TAGGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 989 het 989 ref 35 27 3 5 A 11 12 193107 CASAVA_Build 12 85719717 15D9M10D16M4D CCAGAAATGT CCATCATACCTAACCCTAATTCTTCCAGAAATAGGTAATACAAAATGTTAAGGG/---------------CTTTTTATT----------TTAATATTTTATTTTA---- AAATATTTTT 3070 het 3070 ref 31 32 11 3 N/A 0 0 193108 CASAVA_Build 12 85722369 1I AAGAAAGAAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 2815 hom 13 6 7 0 A 7 8 193109 CASAVA_Build 12 85722771 3D ACCTATACTT GAC/--- GAACTTTGGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 GAC 1 0 193110 CASAVA_Build 12 85727462 1I TGGTATCCTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 T 6 7 193111 CASAVA_Build 12 85739895 3D ATTAAAAATA ATG/--- ATAACTGAAA 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 ATG 1 0 193112 CASAVA_Build 12 85740477 3I AATAGACTTC ---/TTT AAGTCAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 T 0 3 193113 CASAVA_Build 12 85742757 1D TTGTAGAGCC T/- TTACTGCTAG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 3 2 193114 CASAVA_Build 12 85753022 2D AAAGACAGAC AT/-- GTGTTATGTT 3070 het 3070 hom 36 12 18 7 AT 1 0 193115 CASAVA_Build 12 85753440 1I TGAAAAGGGC -/A AAAGGGCACG 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 A 3 4 193116 CASAVA_Build 12 85758721 1D CTAATGTGCA T/- TGAGTACCTC 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 T 2 1 193117 CASAVA_Build 12 85766428 1D TAATCAATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 A 10 9 193118 CASAVA_Build 12 85775081 3I GGATTACTCT ---/ATA ATAATATATA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 ATA 2 3 193119 CASAVA_Build 12 85786859 1I TATTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 11 12 193120 CASAVA_Build 12 85788383 1I AGAACAGTAT -/G GGGGAAAGCA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 G 4 5 193121 CASAVA_Build 12 85789063 1D AGCATTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 13 12 193122 CASAVA_Build 12 85789278 1D GCTGTTGTGA T/- TCATTATTCA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 2 1 193123 CASAVA_Build 12 85792176 3D TTGCCAAAAT TTG/--- TTATTACCTG 3070 het 3070 ref 44 24 17 5 TTG 1 0 193124 CASAVA_Build 12 85793526 4I GATGTATCAT ----/TGGA TAGTTTATTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 TGGA 0 1 193125 CASAVA_Build 12 85798524 3D ATATTAATAG TAA/--- TAATAATAAT 1917 het 1917 ref 16 9 4 4 TAA 7 6 193126 CASAVA_Build 12 85806219 2D TAAATTTAAA AC/-- AGTTATAGTT 2007 het 2007 ref 17 9 6 2 AC 1 0 193127 CASAVA_Build 12 85806696 1I ATTTTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 2903 het 2903 ref 33 13 11 9 T 13 14 193128 CASAVA_Build 12 85815090 5D AATTGCATGG AAATA/----- AAATAACTTA 3070 het 3070 hom 33 12 19 6 AAATA 2 1 193129 CASAVA_Build 12 85821297 1D AGAAAGTGTG T/- TAGTGAGCTT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 T 2 1 193130 CASAVA_Build 12 85826809 1D CTAAAATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2134 hom 24 9 9 6 A 15 14 193131 CASAVA_Build 12 85847937 1D CATAAATGCC A/- AAAAAAAAAA 914 het 914 ref 37 25 3 9 A 12 11 193132 CASAVA_Build 12 85876557 1D ATCTATTGTA T/- TTTTTTCAAT 3070 hom 26 het 12 0 9 4 T 7 6 193133 CASAVA_Build 12 85921719 10I GACATCATTG ----------/ATGTACAGAA ATGCTTTTGA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 ATGTACAGAA 0 1 193134 CASAVA_Build 12 85939434 1D CAACAAAGAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 93 het 41 0 31 11 T 9 8 193135 CASAVA_Build 12 85971227 1I CTTTCTTCAG -/T TTTGCTTTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 3 4 193136 CASAVA_Build 12 86004890 3D TTGTTGTCAA TCT/--- TCTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 TCT 2 1 193137 CASAVA_Build 12 86073656 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2777 het 1643 hom 26 9 9 9 A 17 16 193138 CASAVA_Build 12 86075037 3D44M3D CATTTGTTTC ATTGAGTCAGACAATGGAGGTGAAGCTGTTAAGAAAAAATAAACTCCATA/---GAGTCAGACAATGGAGGTGAAGCTGTTAAGAAAAAATAAACTCC--- CAAGGTAAGT 3070 het 3070 ref 31 24 12 9 N/A 0 0 193139 CASAVA_Build 12 86140571 1D CCATATCAAT C/- TTCTCAGTTA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 C 1 0 193140 CASAVA_Build 12 86163155 1D AGAAACAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 11 10 193141 CASAVA_Build 12 86163224 1I TGTTGGTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 10 11 193142 CASAVA_Build 12 86165831 4I CTACTGTCTT ----/TTTA TTTGTTTCTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTTA 0 1 193143 CASAVA_Build 12 86168993 4I TGTACTTGTC ----/AAGT AAGTGTTTGT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 AAGT 1 2 193144 CASAVA_Build 12 86219597 1D ATTTCAAAGG A/- ATAAGTATAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 1 193145 CASAVA_Build 12 86254903 1D AGTCTTTCTG C/- CCCCCATTTC 3070 hom 72 het 31 0 24 7 C 6 5 193146 CASAVA_Build 12 86259200 1D AACATCTAAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 8 7 193147 CASAVA_Build 12 86265621 2D ACACAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 11 9 193148 CASAVA_Build 12 86270441 1I GAGCCCTTGA -/C TGCTCCTCTG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 0 1 193149 CASAVA_Build 12 86276140 14I TAGAATGATT --------------/TATACTCCTTTGGG TATATACCCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TATACTCCTTTGGG 0 1 193150 CASAVA_Build 12 86283005 1I AATCAAAAAT -/A AAAACACAGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 4 5 193151 CASAVA_Build 12 86285359 4I AAATTAGAAG ----/AACT AACAAAACAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AACT 0 1 193152 CASAVA_Build 12 86289177 1I GTGTATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 44 3 33 8 T 11 12 193153 CASAVA_Build 12 86306595 5D ACATTTTTAT ATTGA/----- ATTGATGGGA 3070 hom 78 het 29 0 27 5 ATTGA 2 1 193154 CASAVA_Build 12 86309639 2D GTCTTCAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2944 het 21 hom 12 1 9 4 A 14 12 193155 CASAVA_Build 12 86320783 1D CACTCTAGCC T/- TCTCCCCTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 1 193156 CASAVA_Build 12 86324920 1D AAAACTATAT A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 1 0 193157 CASAVA_Build 12 86331540 1I TATGATAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 10 193158 CASAVA_Build 12 86335322 2D TGAGATAATC AT/-- GTGGTTTTTG 3070 het 22 hom 15 1 13 1 AT 1 0 193159 CASAVA_Build 12 86340614 2D CTGGGGTATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 18 1 13 5 A 13 11 193160 CASAVA_Build 12 86347609 2D GCCATAACAA AC/-- ACAGACCAGA 3070 hom 64 het 26 0 17 9 AC 2 1 193161 CASAVA_Build 12 86356093 5D ATGCTTGTCA CAATG/----- CAATGGAGAG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 CAATG 2 1 193162 CASAVA_Build 12 86359094 3D CCCTATTCAG AGA/--- AGGTTTGCAA 3070 het 3070 ref 50 30 14 6 AGA 1 0 193163 CASAVA_Build 12 86365773 1D TGGGTGGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 499 hom 17 2 10 6 T 12 11 193164 CASAVA_Build 12 86365900 1D GCTTATGAGC T/- TTTTGAATTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 5 4 193165 CASAVA_Build 12 86379794 1D AAAACATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 45 0 35 10 T 12 11 193166 CASAVA_Build 12 86387248 1D TAATGATGAG A/- AGGGGACAAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 2 1 193167 CASAVA_Build 12 86390727 1D AATAACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 688 hom 34 2 25 7 T 12 11 193168 CASAVA_Build 12 86393658 1I ACAATTCAAG -/T TTTTTTACCC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 6 7 193169 CASAVA_Build 12 86394504 1I AAATAACTTG -/A AAATCACATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 3 4 193170 CASAVA_Build 12 86400728 1D GCCTATTTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 10 9 193171 CASAVA_Build 12 86401059 1I AAATCATTTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 8 9 193172 CASAVA_Build 12 86404112 12D CGTGTATACG TGTATACATATA/------------ TGTATACATG 3070 het 122 hom 12 2 9 2 TGTATACATATA 1 0 193173 CASAVA_Build 12 86427720 2D GAATTGTCTC TT/-- GATGAAAATT 3070 hom 75 het 28 0 26 4 T 2 0 193174 CASAVA_Build 12 86490679 8D CCATACATTA TTTAATAT/-------- TTTAACCTTA 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 TTTAATAT 1 0 193175 CASAVA_Build 12 86582542 1I TTGAGATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 10 12 T 16 17 193176 CASAVA_Build 12 86597611 1D AAAATTAATG T/- TTTTTTACTG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 7 6 193177 CASAVA_Build 12 86602828 4D ACTGTCATAA CCAT/---- TAGCATACTT 3070 het 3070 hom 40 18 20 4 CCAT 1 0 193178 CASAVA_Build 12 86604072 1I TTCTTCTTCT -/A AAAAAAAAAA 1117 het 1117 ref 31 22 4 5 A 11 12 193179 CASAVA_Build 12 86626323 1I AAATAAAAAG -/A AAATATAATA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 3 4 193180 CASAVA_Build 12 86646861 1I CTGGAAGTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 9 10 193181 CASAVA_Build 12 86680130 2D ACTGCAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 2547 het 743 hom 41 9 9 23 T 18 16 193182 CASAVA_Build 12 86693697 3D CTTAATTTGT TTC/--- TTGTTATTAG 3070 het 3070 ref 37 18 18 3 TTC 1 0 193183 CASAVA_Build 12 86694684 1D GCTGCATGAC T/- TAGAAGGAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 2 1 193184 CASAVA_Build 12 86696884 4I GTCTTATTTA ----/TTCT TTCTATTTTA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 TTCT 1 2 193185 CASAVA_Build 12 86698677 1I TGTGCAGATA -/G TTGTTAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 G 0 1 193186 CASAVA_Build 12 86700569 8I TCTTCAAATA --------/GGCATGTT GTTATTGTTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 GGCATGTT 0 1 193187 CASAVA_Build 12 86710789 1I ATCTCCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 18 22 11 A 10 11 193188 CASAVA_Build 12 86710944 2D ATTCTCTGAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 54 27 20 8 A 11 9 193189 CASAVA_Build 12 86711613 1D CCCCAAAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 13 16 3 T 8 7 193190 CASAVA_Build 12 86715462 1D GTGAAATATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 20 17 7 A 10 9 193191 CASAVA_Build 12 86716076 1D TTAATTTCAC T/- TTCATATAAA 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 T 3 2 193192 CASAVA_Build 12 86716876 1D AACACTTTCG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 10 9 T 10 9 193193 CASAVA_Build 12 86733972 1D CCTTGACATT C/- CTGCCTCGTG 3070 het 3070 ref 44 20 19 6 C 2 1 193194 CASAVA_Build 12 86743108 4D CATGTCTCCC AAGG/---- AAGGTAGCTT 3070 het 3070 ref 42 21 20 2 AAGG 2 1 193195 CASAVA_Build 12 86743378 1D AAATAAATTT A/- AAAAAAAACT 991 het 991 ref 21 8 3 12 A 9 8 193196 CASAVA_Build 12 86752929 1D GTTAGGACAC A/- AAAATGAATT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 5 4 193197 CASAVA_Build 12 86755773 1I CAGAATTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 15 6 A 10 11 193198 CASAVA_Build 12 86767955 1I GAAGAACACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 34 5 22 7 A 10 11 193199 CASAVA_Build 12 86770967 7D GTAGAACTAA TCTTTTT/------- TCTTTTTTCT 3070 het 1208 hom 23 5 8 10 TCTTTTT 3 2 193200 CASAVA_Build 12 86771672 1I AAGAAACTCA -/C CTGGGGCAGA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 C 1 2 193201 CASAVA_Build 12 86776197 3D CGTGAGTAAA TAT/--- TATCTCCTCA 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 TAT 2 1 193202 CASAVA_Build 12 86787763 1I TATAGAAGAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 8 9 193203 CASAVA_Build 12 86794479 1I AACACAGTTC -/A ACAATAGCAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 1 2 193204 CASAVA_Build 12 86797532 4D TTTACTTTAG AATA/---- AATAAATTTA 3070 hom 120 het 45 0 40 8 AATA 2 1 193205 CASAVA_Build 12 86797686 1D TCTCAGGCTC T/- AAGACCACCA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 1 0 193206 CASAVA_Build 12 86799443 1I CAATATCTCT -/C CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 C 1 2 193207 CASAVA_Build 12 86801772 2I GCTCCCTATT --/AC AGAGTAAAGG 3070 hom 140 het 52 0 45 7 AC 0 1 193208 CASAVA_Build 12 86802122 4D ACAGAACATG AATT/---- AATTATGACT 3070 hom 90 het 34 0 30 9 AATT 2 1 193209 CASAVA_Build 12 86809219 1I GAGACAGATT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 7 8 193210 CASAVA_Build 12 86809891 1D TTTGCACTAT A/- AAAAAATACC 3070 hom 117 het 49 0 40 9 A 7 6 193211 CASAVA_Build 12 86816394 1D GATTTTCTTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 9 8 193212 CASAVA_Build 12 86818286 3I AACCCTATTT ---/CCC AACTATATAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 0 3 193213 CASAVA_Build 12 86821176 4I TGAAAATCTG ----/AAAT AAATGAATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAT 1 2 193214 CASAVA_Build 12 86822160 1D CAATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 18 9 T 12 11 193215 CASAVA_Build 12 86826505 3I AAGAAATGAC ---/CGT GGTGGCCTTC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 CGT 0 1 193216 CASAVA_Build 12 86837709 1D CTACAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 12 11 193217 CASAVA_Build 12 86838342 1D AAAGCCATTG C/- CCTTTGCAAT 3070 hom 83 het 33 0 27 6 C 3 2 193218 CASAVA_Build 12 86845557 6I CTCTCATGAC ------/ACATGG GAATTGTGGA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 ACATGG 0 1 193219 CASAVA_Build 12 86847249 1I CATAATGAGA -/T TTTTTGTTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 5 6 193220 CASAVA_Build 12 86851380 1I TTCTGATGTA -/T TTCCTGATTT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 2 3 193221 CASAVA_Build 12 86852178 1D CTTCTGTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 9 193222 CASAVA_Build 12 86866916 1I CTCTGCAGCC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 666 hom 17 2 13 2 A 8 9 193223 CASAVA_Build 12 86867260 4I TAAAATAAAA ----/TACT TAAACAATTT 3070 hom 27 het 11 0 9 2 TACT 0 1 193224 CASAVA_Build 12 86875181 10D TTTGTTGTTC TTGTTTTGTT/---------- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 46 25 18 6 TTGTT 5 3 193225 CASAVA_Build 12 86900707 1D GCAGCACAGC A/- AAAAAAAAAA 1437 het 1437 ref 46 29 4 13 A 15 14 193226 CASAVA_Build 12 86919440 1D TTGCATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 12 14 T 13 12 193227 CASAVA_Build 12 86958705 1D GGAAAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 T 11 10 193228 CASAVA_Build 12 86964469 1I TACAAAAAAA -/G GTATCTGTCC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 G 1 2 193229 CASAVA_Build 12 86978726 1I TGATCACATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 8 9 193230 CASAVA_Build 12 86981051 1D AAGCAGTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 46 1 30 15 A 14 13 193231 CASAVA_Build 12 86982203 1I CTTGCAGAAC -/A AAAGGTAGTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 3 4 193232 CASAVA_Build 12 86983248 4D CCATCTGATT TTTG/---- TTTGAGGAGA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TTTG 2 1 193233 CASAVA_Build 12 86985123 1D CACCAATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 13 12 193234 CASAVA_Build 12 86990197 11D ATGAAACAAA GTTTTGACTGT/----------- GTTTTGACTG 3070 hom 81 het 31 0 27 7 GTTTTGACTGT 2 1 193235 CASAVA_Build 12 86993199 1D CCAAAACAGG T/- TATGTTCTAG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 2 1 193236 CASAVA_Build 12 86994530 4I TTTTTTGGGG ----/TTGA TTATTTCAAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TTGA 0 1 193237 CASAVA_Build 12 87000531 1D GAGCCTGGAA G/- GTCAAGGTTG 3070 het 3070 ref 30 21 9 0 G 2 1 193238 CASAVA_Build 12 87002230 1D CCTCACCTAT A/- AACTCAATTA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 3 2 193239 CASAVA_Build 12 87002448 1D GCATTTGCTT A/- AAAAAACTAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 7 6 193240 CASAVA_Build 12 87007404 1D GCCTGATATT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 8 7 193241 CASAVA_Build 12 87009311 1D ATAAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 288 hom 26 3 16 7 A 15 14 193242 CASAVA_Build 12 87012581 1D CATTTTTTGA G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 92 het 38 0 31 7 G 9 8 193243 CASAVA_Build 12 87013959 4D ATAAAACAAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 44 3 20 23 T 15 11 193244 CASAVA_Build 12 87020550 2D GATAATATAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 62 het 38 1 33 5 TG 9 8 193245 CASAVA_Build 12 87025520 1D TTCTTAGTGC A/- AAAAAAAAAA 2332 het 2332 ref 21 13 6 2 A 15 14 193246 CASAVA_Build 12 87039522 1D TGTGAATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 737 hom 35 6 15 16 A 17 16 193247 CASAVA_Build 12 87046955 1I TAAAAGACAA -/C AGTTATTTCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 0 1 193248 CASAVA_Build 12 87047068 3I GTATTCATAC ---/TTA TTATATACAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTA 1 2 193249 CASAVA_Build 12 87059430 1I ACAAACTGTC -/A AGAGTGTCCC 3070 het 3070 ref 43 27 11 5 A 1 2 193250 CASAVA_Build 12 87069586 2D GCAATTCAAA AT/-- ACATATTCCC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 AT 1 0 193251 CASAVA_Build 12 87074605 1I AACAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 181 hom 38 1 32 5 A 11 12 193252 CASAVA_Build 12 87076586 5I AAGAAAATGT -----/ATTCA ATTCATGAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATTCA 1 2 193253 CASAVA_Build 12 87080828 1I TTCTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 168 hom 28 1 17 10 T 11 12 193254 CASAVA_Build 12 87081589 1D ACATTGCCTT C/- TTTTCCAGTG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 C 1 0 193255 CASAVA_Build 12 87086289 1I ATAAACTTGA -/T TTAATTCCTC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 2 3 193256 CASAVA_Build 12 87087846 1D ACCCTGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 33 1 22 10 A 13 12 193257 CASAVA_Build 12 87105076 1D TTTATCTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 15 14 193258 CASAVA_Build 12 87116962 1I28M3I TTTTAGTGTT -AAAAAAATACAACATTGTATATAGAGAT---/AAAAAAAATACAACATTGTATATAGAGATTTC TTCTTTTATG 3070 hom 123 het 36 0 42 5 N/A 0 0 193259 CASAVA_Build 12 87119243 3I AGAGAAGTTA ---/AAG AATAAAAGCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAG 0 1 193260 CASAVA_Build 12 87131182 1D GTGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 33 1 20 12 A 12 11 193261 CASAVA_Build 12 87134557 1D TTTTCCCACC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 9 8 193262 CASAVA_Build 12 87135138 1D AGACTGTGAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 51 het 30 0 17 13 A 9 8 193263 CASAVA_Build 12 87135900 6D GGGAACTCAC ACTTCT/------ ACCATGGAAA 3070 hom 120 het 45 0 39 8 ACTTCT 1 0 193264 CASAVA_Build 12 87147816 1I ATCTCATTGG -/C CTTGCCACTG 3070 hom 102 het 42 0 33 9 C 1 2 193265 CASAVA_Build 12 87161119 4D TCTTCCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 35 het 13 0 12 1 TCTT 3 2 193266 CASAVA_Build 12 87167149 31D CCACTGTATC TACATTATGGTGAGTTATATAATTATTTCAT/------------------------------- TACATATTAC 3070 hom 68 het 23 0 22 5 TACATTATGGTGAGTTATATAATTATTTCAT 1 0 193267 CASAVA_Build 12 87172106 3D7M2I TCCATTCTTT TTGTTTGTTT--/---TTTGTTTTG GTTTGTTTGT 3070 hom 87 het 28 0 28 4 N/A 0 0 193268 CASAVA_Build 12 87174292 1I TTAGTTTTTA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 7 193269 CASAVA_Build 12 87185917 1D TTGACCAAAG A/- GGTGGTATTT 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 A 1 0 193270 CASAVA_Build 12 87189459 1D AAAGCAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 28 9 11 9 A 9 8 193271 CASAVA_Build 12 87195420 4I TTTTAATGTT ----/CCCA TATAAAGGGT 2310 het 2310 ref 16 9 6 1 CCCA 0 1 193272 CASAVA_Build 12 87198180 1D CATTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 15 14 193273 CASAVA_Build 12 87203725 2D CTACAAAGTC TG/-- TGTTTCCTTT 2582 het 2582 ref 17 10 6 1 TG 2 1 193274 CASAVA_Build 12 87212844 4I AAATACCACC ----/ATCA TTCATTGCAG 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 ATCA 0 1 193275 CASAVA_Build 12 87214223 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1746 hom 26 7 9 11 A 15 14 193276 CASAVA_Build 12 87215046 1D ACATACTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 10 9 193277 CASAVA_Build 12 87218703 1D CATCAGAAAA G/- TTATTCTGAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 G 1 0 193278 CASAVA_Build 12 87219220 3D TAACAAAAAC ATT/--- ATGGTTCCTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 8 ATT 1 0 193279 CASAVA_Build 12 87222762 1D ATTGATTCTA C/- TTCTCTAGAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 C 1 0 193280 CASAVA_Build 12 87223567 3I AAAAAGGTCA ---/CAC CACATAGCTA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 CAC 1 2 193281 CASAVA_Build 12 87225407 6I AGAGAGAGAA ------/AGAGAG AGAGAAAGAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 AG 2 5 193282 CASAVA_Build 12 87228034 1I ATTATACTTT -/A AAAATTAGAG 3070 het 3070 hom 55 23 28 4 A 4 5 193283 CASAVA_Build 12 87228370 3D GGAATACCAA AAG/--- AAGAGTTAGA 3070 het 3070 hom 47 20 25 5 AAG 2 1 193284 CASAVA_Build 12 87230687 3I ATTATTAAAG ---/AAT AATAATAATG 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 AAT 3 4 193285 CASAVA_Build 12 87231974 3I TTGAGATCTC ---/ATT GTTGTCTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 ATT 0 1 193286 CASAVA_Build 12 87246726 5D TAAAAATATT TATCA/----- TATCATTTAT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TATCA 2 1 193287 CASAVA_Build 12 87255972 1D TTTTAACTTG A/- ACTGTTTTGA 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 2 1 193288 CASAVA_Build 12 87257957 1D GTTTTGCTTT C/- CATGGTTTCA 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 C 2 1 193289 CASAVA_Build 12 87261087 4D TTGTTTTATT CATA/---- CAAACATTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 3 CATA 1 0 193290 CASAVA_Build 12 87278028 1D AACACTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 T 11 10 193291 CASAVA_Build 12 87281383 1D TCACTGCAGC T/- TTTTTTTTTT 2115 het 2115 ref 43 29 7 7 T 15 14 193292 CASAVA_Build 12 87291352 4D ATATATATAT ATAC/---- ACACACACAC 3070 hom 36 het 14 0 13 3 ATAC 1 0 193293 CASAVA_Build 12 87293440 2D TTAGGGGAGA CT/-- CTATTATGCA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 CT 2 1 193294 CASAVA_Build 12 87295221 4D AGAGGGCAAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 39 het 22 0 12 10 AG 7 5 193295 CASAVA_Build 12 87305777 1D CTTACTTGTC A/- AAAAAATCAC 3070 hom 72 het 28 0 25 5 A 7 6 193296 CASAVA_Build 12 87311528 1I CTGCATAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 25 1 18 6 A 13 14 193297 CASAVA_Build 12 87312951 1I GGAATTACAC -/A ATTGAGATTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 193298 CASAVA_Build 12 87317848 1D AATTGACTTA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 7 193299 CASAVA_Build 12 87319030 1I AGATATTCTT -/A AATTACACGT 3070 hom 111 het 53 0 38 15 A 2 3 193300 CASAVA_Build 12 87327614 12D GAGTAAAGAA GGTGTGAAAAGC/------------ TAATGTGTAC 3070 het 3070 ref 45 22 22 3 GGTGTGAAAAGC 1 0 193301 CASAVA_Build 12 87337592 4I TCCACCTGCC ----/TAGT TAGTCAGGTG 3070 hom 98 het 38 0 31 7 TAGT 1 2 193302 CASAVA_Build 12 87339814 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 8 7 193303 CASAVA_Build 12 87342017 1I CATTACCTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 9 10 193304 CASAVA_Build 12 87342696 1D ATTTGCTGGG C/- TTTTTGAATG 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 C 1 0 193305 CASAVA_Build 12 87347769 1D AGACTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 157 hom 21 2 9 10 A 15 14 193306 CASAVA_Build 12 87361444 1I GATTCCATAG -/T CAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 0 1 193307 CASAVA_Build 12 87362821 1I AAATTGTCCA -/G ATCAGTCAGA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 G 0 1 193308 CASAVA_Build 12 87364169 1D TTGTGCCAGG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 8 7 193309 CASAVA_Build 12 87367554 4D ATAAATGTTT CTAA/---- CTATCTCTTT 3070 het 3070 ref 47 27 16 5 CTAA 1 0 193310 CASAVA_Build 12 87395243 1I CTAAAATGCC -/A AAAGCAATTG 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 3 4 193311 CASAVA_Build 12 87405464 2D ATTTAAACAT TC/-- TCTCAGTTCT 3070 het 2328 hom 16 7 7 2 TC 3 2 193312 CASAVA_Build 12 87420816 1I AAAAGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 41 1 30 10 A 10 11 193313 CASAVA_Build 12 87434952 1D CCTACTGAAA C/- TATTGCACAT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 C 1 0 193314 CASAVA_Build 12 87443481 3D GTATCTGATG TTA/--- TTATATGCAC 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 TTA 2 1 193315 CASAVA_Build 12 87449627 1D ACTGAAGTCC T/- TTTTTAGGGG 3070 het 3070 hom 42 15 25 3 T 6 5 193316 CASAVA_Build 12 87450422 1I CTACAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 12 9 A 11 12 193317 CASAVA_Build 12 87459725 1I AGAAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 A 10 11 193318 CASAVA_Build 12 87466363 2D CTACATCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 13 11 193319 CASAVA_Build 12 87468335 3D GGCTTTAAAT AGG/--- AGTATAGGTA 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 AGG 1 0 193320 CASAVA_Build 12 87479861 5D AGCACCTCTT ATCAC/----- ATCACATCAC 3070 hom 114 het 50 0 39 11 ATCAC 4 3 193321 CASAVA_Build 12 87481871 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1919 hom 25 6 15 4 A 9 10 193322 CASAVA_Build 12 87482299 4I ACAGGGAAAC ----/TGTT TGGATAGCAA 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 TGTT 0 1 193323 CASAVA_Build 12 87486011 1D TCAGTTAATT A/- ACTCTCTTGA 3070 hom 114 het 42 0 37 5 A 2 1 193324 CASAVA_Build 12 87495550 2D AAAATCAAAC AG/-- AAATCTGAAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 AG 1 0 193325 CASAVA_Build 12 87506829 1I GACTAGGGAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 7 8 193326 CASAVA_Build 12 87511474 1I GGGTCAGTTA -/C CCCCCATGCT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 C 5 6 193327 CASAVA_Build 12 87519576 1D TTTCAAAATA T/- TTTTTATTGT 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 T 6 5 193328 CASAVA_Build 12 87520710 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 2474 het 1507 hom 16 4 6 6 T 13 12 193329 CASAVA_Build 12 87558337 2I TGGAAAATAG --/AC ACAGAGAAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AC 1 2 193330 CASAVA_Build 12 87564386 1I TCTCTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2995 het 236 hom 22 3 12 7 A 15 16 193331 CASAVA_Build 12 87576054 1D AGCTTAATGC T/- TTTTTTTTTT 1635 het 1635 ref 47 29 6 13 T 13 12 193332 CASAVA_Build 12 87580885 1I CTTCACGCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 35 1 28 6 A 10 11 193333 CASAVA_Build 12 87667136 3D TGTGTTATAC AAT/--- AATAATTATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAT 3 2 193334 CASAVA_Build 12 87683631 1I TACAGAGAAA -/C CTTTTTAAAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 C 1 2 193335 CASAVA_Build 12 87724330 1D AATATTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1331 hom 27 5 12 10 T 17 16 193336 CASAVA_Build 12 87730208 2D GGCTCATAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 149 hom 44 4 19 21 T 13 11 193337 CASAVA_Build 12 87741305 1I GAAAAACAAC -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 7 8 193338 CASAVA_Build 12 87750083 2D CACATTTTCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 27 14 9 7 TG 9 8 193339 CASAVA_Build 12 87759160 2I TATGCATCTA --/TC TCTGTGAGCA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TC 1 2 193340 CASAVA_Build 12 87760774 1I CAAAGGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 10 11 193341 CASAVA_Build 12 87771840 1I GTTTTCAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 9 10 193342 CASAVA_Build 12 87777449 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 18 4 8 6 T 16 15 193343 CASAVA_Build 12 87779058 1D CGATTTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 10 9 193344 CASAVA_Build 12 87780989 1I TTTTTGTCAT -/C TCCCCAAGAG 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 C 0 1 193345 CASAVA_Build 12 87781437 2I TCACGTCCTT --/CC CCCCTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 C 4 6 193346 CASAVA_Build 12 87782479 1D GACAAATGTA T/- TTTCATATGA 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 T 4 3 193347 CASAVA_Build 12 87791561 4D TACAGGACCT TTAA/---- TTAGTATTTT 3070 het 3070 ref 26 18 8 1 TTAA 1 0 193348 CASAVA_Build 12 87806380 1I TAGGTAATTT -/G GCTATGCCAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 1 2 193349 CASAVA_Build 12 87863780 1D CAGATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 22 23 13 T 11 10 193350 CASAVA_Build 12 87876591 1D TTGTAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2837 hom 24 6 14 5 A 11 10 193351 CASAVA_Build 12 87891906 1D GTAAGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 34 2 23 9 T 12 11 193352 CASAVA_Build 12 87894434 2I ATATATACAC --/AT ATATAAATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 2 3 193353 CASAVA_Build 12 87896227 1I TGTAAAAGTT -/A AAAAATTAAA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 5 6 193354 CASAVA_Build 12 87905787 1I AAATCATTTG -/T TATCTACACT 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 T 1 2 193355 CASAVA_Build 12 87907638 2I TATGTATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 TA 7 8 193356 CASAVA_Build 12 87910786 4I ACTCCGTCTC ----/TCTA TCTATCTCTC 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 TCTA 1 2 193357 CASAVA_Build 12 87941127 1I TTCAGGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 35 2 23 10 T 13 14 193358 CASAVA_Build 12 87962785 1D ATGATATGTG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 8 7 193359 CASAVA_Build 12 87988062 1I TTCTTCCTCA -/C CCGTTCCTCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 2 3 193360 CASAVA_Build 12 87996496 1D TTAAAATACA T/- TTTTTTGCAT 3070 hom 63 het 29 0 22 8 T 7 6 193361 CASAVA_Build 12 88000043 4I TAGAATCTTG ----/AAAT AAAAGACTCT 3070 het 3070 ref 46 21 22 3 AAAT 0 1 193362 CASAVA_Build 12 88008770 1D TTTGCTCCTG C/- CCTAGAGATC 2897 het 2897 ref 22 13 7 2 C 3 2 193363 CASAVA_Build 12 88030408 1I TAGACTGCCT -/A AGGTTTGAAT 3070 het 3070 ref 51 29 15 7 A 1 2 193364 CASAVA_Build 12 88033175 4I GTAAGGAATT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 2818 hom 26 8 13 5 TTTG 3 4 193365 CASAVA_Build 12 88055156 2D GATGTTTCTG TA/-- TCTCACTTCC 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 TA 1 0 193366 CASAVA_Build 12 88068386 9I ATCACTAATC ---------/ATCAGGGAA ATCAGGGAAA 3070 het 3070 hom 47 22 24 2 ATCAGGGAA 1 2 193367 CASAVA_Build 12 88080267 1I TAGAGAAGAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 8 9 193368 CASAVA_Build 12 88117281 1I ATCTTCAGGA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 6 7 193369 CASAVA_Build 12 88125551 16D3M2D GTGTGTATAT GCATATATATGTACACTTATG/----------------TTA-- TATGTGTGTA 1020 het 1020 ref 30 17 4 16 N/A 0 0 193370 CASAVA_Build 12 88128592 1D ATGTGTCAGG C/- AGTGTGAGAA 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 C 1 0 193371 CASAVA_Build 12 88155687 1D CTATTCCCCT A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 51 26 21 5 A 8 7 193372 CASAVA_Build 12 88160133 1I CTATTCAGTA -/T GATACTAGCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 1 193373 CASAVA_Build 12 88164332 1D GTTATTGGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 10 9 193374 CASAVA_Build 12 88165906 1D AGTAAAGGCA G/- GCTTCAGTAG 3070 het 3070 hom 45 10 29 7 G 2 1 193375 CASAVA_Build 12 88173304 1D TCATCACCAA G/- GGGACGGTGC 3070 het 3070 ref 37 21 10 7 G 4 3 193376 CASAVA_Build 12 88184158 1D TAAAATAATC T/- TTTTTTTTTT 2689 het 621 hom 19 3 9 7 T 17 16 193377 CASAVA_Build 12 88187160 1I CTAAGCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 10 11 193378 CASAVA_Build 12 88191961 1D TGGGGGTAGC G/- GGGGGGTGAG 3070 hom 48 het 19 0 15 4 G 7 6 193379 CASAVA_Build 12 88192249 1D TTTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 2125 het 2125 ref 25 10 6 9 A 13 12 193380 CASAVA_Build 12 88246429 6D CTCACTCTCA CTCTCT/------ CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 41 17 12 13 CT 10 7 193381 CASAVA_Build 12 88247820 1D AGTTTGTGGG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 3 A 8 7 193382 CASAVA_Build 12 88264204 5D TCTCTCTCTC CTTTA/----- TTCAGACTGG 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 CTTTA 1 0 193383 CASAVA_Build 12 88264905 2D ACTGACTTGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 54 21 24 10 TA 6 5 193384 CASAVA_Build 12 88265952 9D TATAACTGAG TTTTTAAAA/--------- ACACACATTC 3070 het 3070 ref 37 20 18 3 TTTTTAAAA 1 0 193385 CASAVA_Build 12 88266360 4D GGTAAGGCAT AGTC/---- AAACTACATA 3070 het 3070 ref 62 38 22 7 AGTC 1 0 193386 CASAVA_Build 12 88275609 10D AGACCTTAGC CAATTTGGCT/---------- AAGCTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 16 26 3 CAATTTGGCT 1 0 193387 CASAVA_Build 12 88275730 1I TTATCTAGAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 7 8 193388 CASAVA_Build 12 88277056 2D TTTTATTGTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 49 22 22 6 AC 8 7 193389 CASAVA_Build 12 88279775 1D TTAGCTGGCA T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 31 10 14 8 T 7 6 193390 CASAVA_Build 12 88289834 1D TCCCATCAGG A/- GGGGAAAGGC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 A 1 0 193391 CASAVA_Build 12 88290845 1I CTGGGTTCTG -/T TTCTGAGCTC 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 2 3 193392 CASAVA_Build 12 88300977 1I TCTTTTCTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 7 8 193393 CASAVA_Build 12 88312384 1I CATGGTGAAA -/C CCCGTCCTGA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 C 3 4 193394 CASAVA_Build 12 88324879 1D CATGCCGAAA C/- CCCCGTCTCT 3070 hom 74 het 26 0 24 2 C 5 4 193395 CASAVA_Build 12 88330266 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 25 0 19 6 T 14 13 193396 CASAVA_Build 12 88333778 4D GCTTATAAGA CTGT/---- CTACGTAACT 3070 het 3070 ref 35 20 14 3 CTGT 1 0 193397 CASAVA_Build 12 88339949 1D CTTTTGTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 26 0 21 5 T 10 9 193398 CASAVA_Build 12 88369417 5D AAGCAACATA ATTTT/----- ATTTATGTTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 ATTTT 1 0 193399 CASAVA_Build 12 88377012 1I GAAGGACAAA -/T TAACACAATA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 1 2 193400 CASAVA_Build 12 88379041 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 A 13 12 193401 CASAVA_Build 12 88386584 2D TTTTATTTGT TA/-- TGTTTATTCA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 TA 1 0 193402 CASAVA_Build 12 88386796 1D GAAGTACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 11 10 193403 CASAVA_Build 12 88390186 10D GTGAAAATCT AGAAAGAAGA/---------- AGAAAGAAGA 3070 het 3070 hom 27 12 13 5 AGAAAGAAGA 2 1 193404 CASAVA_Build 12 88392120 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1511 het 1511 ref 23 18 4 2 A 12 11 193405 CASAVA_Build 12 88405855 1I ATTTAGTATC -/T ATGTTTCCCC 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 T 0 1 193406 CASAVA_Build 12 88406067 3D ATGATTCAAT ACA/--- ACGACAACGA 3070 het 3070 hom 32 11 19 3 ACA 1 0 193407 CASAVA_Build 12 88408819 22D ACCACCTTGA TCCAAGCCAGGACCTGGACTGC/---------------------- TCAGCCTCCT 3070 het 3070 ref 52 34 21 10 TCCAAGCCAGGACCTGGACTGC 1 0 193408 CASAVA_Build 12 88412116 4I CCCAGCTAAT ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 het 1466 hom 18 5 11 2 TTTA 1 2 193409 CASAVA_Build 12 88422509 1I GAATGATCAA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 1 2 193410 CASAVA_Build 12 88427921 1I ACTCAGTTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2700 hom 16 6 9 1 T 8 9 193411 CASAVA_Build 12 88436483 3D GTGTTTTGCC CAA/--- CATTTGCACA 3070 het 3070 hom 36 18 16 4 CAA 1 0 193412 CASAVA_Build 12 88437712 1I GGTGACTAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 11 22 2 T 8 9 193413 CASAVA_Build 12 88451694 2D AGCATCACTC AG/-- ACCTTCCAAG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AG 1 0 193414 CASAVA_Build 12 88456794 4D TGTTCTGCTG CTGA/---- CTAATACTGC 3070 het 3070 hom 47 21 25 2 CTGA 1 0 193415 CASAVA_Build 12 88460144 1I GTGAAATGGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 59 25 24 10 A 8 9 193416 CASAVA_Build 12 88462415 2I TGACAATACC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 A 9 11 193417 CASAVA_Build 12 88487671 3I TGGTCAAGAG ---/AGA AGGAGCATGA 3070 hom 144 het 57 0 48 9 AGA 0 1 193418 CASAVA_Build 12 88494051 4I AGTTTCCAAA ----/ACTC TTAGTATCAA 3070 hom 138 het 48 0 47 1 ACTC 0 1 193419 CASAVA_Build 12 88500448 12D ACAGTAAATG AAAACAAAAACA/------------ AAAACAAAAA 3070 hom 24 het 13 0 9 5 AAAACA 4 2 193420 CASAVA_Build 12 88512503 1I TTCAACAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 949 hom 37 3 23 11 A 11 12 193421 CASAVA_Build 12 88518557 1D TGACAATGTA T/- TTTTTTTTTT 2815 het 736 hom 22 2 11 9 T 17 16 193422 CASAVA_Build 12 88524004 10D CAGCATTTAC AGTCACAGTA/---------- AGTCACAGTA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AGTCACAGTA 2 1 193423 CASAVA_Build 12 88533855 1D GTAGACATTT A/- AAAAAATTAC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 7 6 193424 CASAVA_Build 12 88539711 1I TACAGTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 12 13 193425 CASAVA_Build 12 88540208 1I AGTTGCTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 428 hom 42 2 36 4 T 9 10 193426 CASAVA_Build 12 88540982 3I TGATACATTT ---/ACC ACTTTATTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ACC 0 1 193427 CASAVA_Build 12 88550050 1D TTAAAGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 35 1 23 11 T 12 11 193428 CASAVA_Build 12 88551389 1D CATCTCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 29 1 22 6 T 15 14 193429 CASAVA_Build 12 88555968 4I TAAATCCTTT ----/CCTA CCTACTGACA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CCTA 1 2 193430 CASAVA_Build 12 88560742 1I TGAACTCCTG -/A ACCTAAGGTG 3070 hom 80 het 29 0 25 4 A 1 2 193431 CASAVA_Build 12 88570229 1D CAACTGCCTT C/- CCAGTAACTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 3 2 193432 CASAVA_Build 12 88581431 3I AAAGTTGGCA ---/AGT AGGTCTAAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AGT 0 1 193433 CASAVA_Build 12 88581793 4I CACTTTCCAC ----/TGTT TGTCCTTTTT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 TGTT 0 1 193434 CASAVA_Build 12 88588280 1I TAAAACCGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 883 hom 30 3 21 6 T 13 14 193435 CASAVA_Build 12 88603116 1I TAAGTTCCTT -/A ATAATAAAGC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 1 2 193436 CASAVA_Build 12 88606831 6I CTAATCGTAT ------/CTTTTG CTTTTGCTTA 3070 het 3070 hom 52 19 23 10 CTTTTG 1 2 193437 CASAVA_Build 12 88611522 1D TAAAAACCTT C/- CTTTTCCATC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 2 1 193438 CASAVA_Build 12 88614418 2D AAAATAATAC AA/-- AGTTTCTAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 3 1 193439 CASAVA_Build 12 88616572 1D TGTTTATGAG A/- AAAAAAGGAC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 7 6 193440 CASAVA_Build 12 88620842 1I AAAATATGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 9 10 193441 CASAVA_Build 12 88624928 1D GTTCCCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 88 het 39 0 30 10 A 10 9 193442 CASAVA_Build 12 88628385 1D TTGCAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 41 3 21 18 A 15 14 193443 CASAVA_Build 12 88631519 2D ATTTAAAAAG AA/-- AAGAGATTTA 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 A 4 2 193444 CASAVA_Build 12 88635382 2D AAGGCAAAAA AT/-- AAAAAAATGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 0 193445 CASAVA_Build 12 88640102 1D TTTATAGGAC T/- TCAAGAACAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 1 193446 CASAVA_Build 12 88640948 1D TGTATGTGTG T/- TTTTTTTATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 8 7 193447 CASAVA_Build 12 88642908 1D AGAGCAACAC T/- TATCTTACAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 2 1 193448 CASAVA_Build 12 88647284 1D ACTTTAAACC A/- AAAAAAAAAA 2443 het 21 hom 16 1 7 8 A 13 12 193449 CASAVA_Build 12 88650249 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 95 het 41 0 30 11 AG 8 7 193450 CASAVA_Build 12 88667970 1I TTCTGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 835 hom 37 2 24 11 A 13 14 193451 CASAVA_Build 12 88680563 15I AGTGGCAATT ---------------/ATGTCACCCCTACTC ACAAAGCCAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATGTCACCCCTACTC 0 1 193452 CASAVA_Build 12 88681524 1I CATCTTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1372 hom 37 3 21 13 A 11 12 193453 CASAVA_Build 12 88684662 1I TCTATTTGGG -/A AAAATTTTTT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 4 5 193454 CASAVA_Build 12 88693727 2I AATTATTTGC --/AG AGTCTTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AG 1 2 193455 CASAVA_Build 12 88714623 1I TGACCCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1746 hom 46 5 24 17 T 15 16 193456 CASAVA_Build 12 88716982 1I TAGGGCTTAA -/T TTTGCTAATA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 3 4 193457 CASAVA_Build 12 88735270 1I GTAATTTTAA -/T TAATTATTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 1 2 193458 CASAVA_Build 12 88737024 1D TTCAGGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 34 1 27 6 T 11 10 193459 CASAVA_Build 12 88774823 1D GAAAGACTCC T/- AAAGTTTATT 3070 hom 77 het 27 0 26 2 T 1 0 193460 CASAVA_Build 12 88810515 1I ATCATCCTAA -/C CATCACCACC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 C 1 2 193461 CASAVA_Build 12 88811762 1I TCATGCTGAA -/C CTGTGAGTCA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 C 1 2 193462 CASAVA_Build 12 88841044 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 9 10 193463 CASAVA_Build 12 88875466 1D AAAGGCTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 83 het 40 0 37 3 T 10 9 193464 CASAVA_Build 12 88914736 1D TGTGTGTGTC A/- GGGGGTATTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 1 0 193465 CASAVA_Build 12 88917537 3I TATGACAGAA ---/TTC TTCTTTGTCA 3070 hom 85 het 34 0 28 6 TTC 1 2 193466 CASAVA_Build 12 88924703 1D TTATATGACT A/- ATCTTTCAGA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 2 1 193467 CASAVA_Build 12 88925063 1I TGCATGGGAC -/A ATATATTTTA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 1 2 193468 CASAVA_Build 12 88925691 5I TCGCACACAT -----/ATAAA GTAATTCACT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 ATAAA 0 1 193469 CASAVA_Build 12 88929437 5I ATAAGAAGAT -----/CTGTC CTGTCCTAGC 3070 hom 99 het 42 0 32 10 CTGTC 1 2 193470 CASAVA_Build 12 88939557 2I TTGAAGCCCC --/CA CCCCGCCCCC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 CA 0 1 193471 CASAVA_Build 12 88944025 1D CATAGCATTG T/- TATCAGTTCA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 T 2 1 193472 CASAVA_Build 12 88953751 1I AGTTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 9 10 193473 CASAVA_Build 12 89005556 4I GTTTCTGGAG ----/AAAT AAATACTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAAT 1 2 193474 CASAVA_Build 12 89016740 1I TGGTTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 37 1 24 12 T 13 14 193475 CASAVA_Build 12 89022429 1D TTACTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 39 2 25 12 T 15 14 193476 CASAVA_Build 12 89024226 2I GTACCAAACC --/AT ATATATATAT 3070 hom 45 het 24 0 16 8 AT 5 6 193477 CASAVA_Build 12 89028235 5D ATCGTGAATG GAAAA/----- GAAAAGATAG 3070 hom 90 het 32 0 31 6 GAAAA 2 1 193478 CASAVA_Build 12 89035890 1D ATATGTTACC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 9 193479 CASAVA_Build 12 89038020 4I TTATGTCCTT ----/TCTC TTCTTCTTTT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TC 0 2 193480 CASAVA_Build 12 89048266 3D TCTATTCCAG CTC/--- CTTGATTCTA 3070 hom 123 het 49 0 42 8 CTC 1 0 193481 CASAVA_Build 12 89051107 1I CTAATAGGAA -/G GGGACTTTAA 3070 hom 144 het 55 0 49 6 G 3 4 193482 CASAVA_Build 12 89054877 1I AGTGTTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1003 hom 42 3 30 9 T 11 12 193483 CASAVA_Build 12 89073789 6D TATATGGAAT TATACA/------ TATATAGACT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TATACA 1 0 193484 CASAVA_Build 12 89074313 4D61M4I TATTATATAG TTATTTAATTATATTACATGTATATATCTCTAAATATATAACATAACTTTTATGTATTAAATATA----/----TTAATTATATTACATGTATATATCTCTAAATATATAACATAACTTTTATGTATTAAATATAATAC ATATATAATT 3070 hom 30 het 11 0 11 10 N/A 0 0 193485 CASAVA_Build 12 89075039 1D TAATCAAAGA T/- TTTGATTGCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 4 3 193486 CASAVA_Build 12 89076274 1D48M3I AGCACAATGT AAAAAAAAAATGACTATGGTATGTTATTTTTATGTAAGATGGTGAGAAG---/-AAAAAAAAATGACTATGGTATGTTATTTTTATGTAAGATGGTGAGAAGTCT TCTTTGAGAA 3070 hom 45 het 18 0 16 10 N/A 0 0 193487 CASAVA_Build 12 89083173 2D TTATGTTAAC TT/-- TTATATGCTC 3070 hom 129 het 46 0 43 4 T 4 2 193488 CASAVA_Build 12 89087005 1D TGTTCTTTGG T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 129 het 52 0 42 13 T 8 7 193489 CASAVA_Build 12 89088874 4D CTTTCTTCTT TCTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TC 2 0 193490 CASAVA_Build 12 89092884 2D TGCAATTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 35 1 26 9 A 15 13 193491 CASAVA_Build 12 89097936 1D GCTCTGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 26 1 20 6 T 12 11 193492 CASAVA_Build 12 89120391 1I GCCACGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 32 0 27 5 T 12 13 193493 CASAVA_Build 12 89121031 1I TCTTATCACC -/T TTTTGCAAAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 4 5 193494 CASAVA_Build 12 89123372 1D TAGTAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 12 11 193495 CASAVA_Build 12 89124870 1I ACATTTATTT -/G TTCTCCTTAA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 G 0 1 193496 CASAVA_Build 12 89126518 1I TTTGTTATGC -/T TTATCAAAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 2 3 193497 CASAVA_Build 12 89128901 1D GAAAGTGTAG A/- AGTTAAAAGA 3070 hom 93 het 37 0 31 7 A 2 1 193498 CASAVA_Build 12 89130240 4D AATCTTACTA TTAC/---- TTATTTATGG 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TTAC 1 0 193499 CASAVA_Build 12 89150328 1D AGAATATTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 9 8 193500 CASAVA_Build 12 89156401 46D3M5D AATAATTAAT ATTATTATTAGAATTATTAGAATTATTAGAATTATAGAATTATTAATATTAGAA/----------------------------------------------TAT----- TAATTTTCAA 3070 hom 63 het 19 0 22 0 N/A 0 0 193501 CASAVA_Build 12 89164724 2D TTAAAGTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 44 1 22 22 T 18 16 193502 CASAVA_Build 12 89166551 1I TACCGCTGCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 8 9 193503 CASAVA_Build 12 89174097 1D TGCTTGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 43 1 37 5 A 11 10 193504 CASAVA_Build 12 89180684 1D TTCAAACTAC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 7 6 193505 CASAVA_Build 12 89181685 1I AAAGAATAAC -/T TTTTTTTTTT 1460 het 1460 ref 47 29 5 13 T 13 14 193506 CASAVA_Build 12 89183744 1I CTTCACTGGC -/A ATGATCTATT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 1 2 193507 CASAVA_Build 12 89186001 3D ATACCCATTG AAC/--- AACAACTCCA 3070 het 3070 ref 62 27 27 8 AAC 3 2 193508 CASAVA_Build 12 89193396 2D CAAAGCCAAC AA/-- GAGATATAAA 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 A 2 0 193509 CASAVA_Build 12 89204672 2I TTAAATTTGT --/TC TTTGTTTCTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TC 0 1 193510 CASAVA_Build 12 89205987 1D TGTGGCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 37 0 28 10 T 12 11 193511 CASAVA_Build 12 89206458 1D TATTGTTTTT G/- TTTGGTCTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 0 193512 CASAVA_Build 12 89207400 1I CTTACTGAGA -/T TTAGTAGATT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 2 3 193513 CASAVA_Build 12 89213147 5D CGCAAATTTA TTTAT/----- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 29 8 17 6 TTTAT 1 0 193514 CASAVA_Build 12 89218934 4I CATATGACTG ----/TCTT TCTTTTTAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TCTT 1 2 193515 CASAVA_Build 12 89219647 1I ATTGTTGCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 T 9 10 193516 CASAVA_Build 12 89221287 1D TATTTATTTA T/- TTTTTATCTT 3070 het 2917 hom 21 7 11 3 T 6 5 193517 CASAVA_Build 12 89222705 1I GCAATAATTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 A 8 9 193518 CASAVA_Build 12 89228276 1D ATTCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 11 10 193519 CASAVA_Build 12 89232022 1D CTCATAGAAG T/- ACATGGGTTT 3070 het 3070 ref 56 27 25 5 T 1 0 193520 CASAVA_Build 12 89232322 4I CATTTCCAGG ----/TAGA TAGCCAAGTG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TAGA 0 1 193521 CASAVA_Build 12 89232711 1D CAGCAGACAG C/- CTTTAGAGAG 3070 hom 98 het 36 0 32 4 C 2 1 193522 CASAVA_Build 12 89233509 3D CTGCTCCACA AAG/--- AAGAATAAAC 3070 hom 135 het 49 0 45 6 AAG 2 1 193523 CASAVA_Build 12 89238024 2I CTTTGTGCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 41 0 27 14 T 12 14 193524 CASAVA_Build 12 89260383 1D TTGCCAGTGA C/- TTGCCAGCCA 3070 het 3070 ref 63 31 24 9 C 1 0 193525 CASAVA_Build 12 89261730 1D TTTTAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 43 1 35 9 T 11 10 193526 CASAVA_Build 12 89268520 1I TCTGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 A 11 12 193527 CASAVA_Build 12 89272632 4I CAAATTATTC ----/ACTG ACTATATGTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ACTG 0 1 193528 CASAVA_Build 12 89272804 1D AAGTATCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2959 hom 37 11 12 15 A 17 16 193529 CASAVA_Build 12 89273351 1D CACATTCACT A/- AAAAACAACA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 6 5 193530 CASAVA_Build 12 89281001 2D ATATACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 502 hom 34 4 14 17 AC 9 8 193531 CASAVA_Build 12 89283473 1D CGCCCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2653 hom 21 8 11 2 T 12 11 193532 CASAVA_Build 12 89284779 1D CGGTGGCTCA C/- GCCTGTAATC 3070 het 2375 hom 25 9 10 6 C 1 0 193533 CASAVA_Build 12 89287007 6D AGACTTAAAC ATGAAT/------ ATGGAAATGA 3070 het 3070 ref 46 26 16 5 ATGAAT 1 0 193534 CASAVA_Build 12 89296986 1I AAAAGAGGTT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 7 8 193535 CASAVA_Build 12 89300646 1I CTCTGAGGTC -/A ATTGTATCAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 1 2 193536 CASAVA_Build 12 89301954 1D TATCAAATGC T/- TTTAAAAAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 4 3 193537 CASAVA_Build 12 89302236 1I ACCAAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 8 9 193538 CASAVA_Build 12 89302398 2D GAGAATACTT GC/-- GCTGGTGGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 GC 2 1 193539 CASAVA_Build 12 89307586 1I GGCTATTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 31 0 25 6 A 10 11 193540 CASAVA_Build 12 89309594 5D TTGATACTAT TTATC/----- TTTTTTTCCC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TTATC 1 0 193541 CASAVA_Build 12 89313063 1I AGTGAGACTC -/A AAAAAAAAAA 2228 het 1068 hom 22 4 8 10 A 11 12 193542 CASAVA_Build 12 89313102 1I TGGGCAAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 12 13 193543 CASAVA_Build 12 89322138 1D ATAGAAACAG A/- AAAGTAGAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 4 3 193544 CASAVA_Build 12 89342469 1D ATATTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 1615 het 1615 ref 37 28 4 5 T 12 11 193545 CASAVA_Build 12 89366634 1I AAATATACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 26 1 14 11 T 12 13 193546 CASAVA_Build 12 89367176 1D TTATATTAAA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 8 7 193547 CASAVA_Build 12 89392340 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 11 10 193548 CASAVA_Build 12 89415888 1I CTCCCTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2929 hom 25 8 9 8 T 11 12 193549 CASAVA_Build 12 89442335 1D GCTTTGAGGT C/- TCCCTATCTC 3070 het 3070 ref 50 28 21 1 C 1 0 193550 CASAVA_Build 12 89462887 1D GACAGAGGCA C/- TTGAAGTCCA 3070 het 3070 hom 43 18 18 8 C 1 0 193551 CASAVA_Build 12 89463044 6I ACCATGTTTA ------/CTTCAC CCGCTTAGTC 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 CTTCAC 0 1 193552 CASAVA_Build 12 89473616 1I TCTTAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 10 11 193553 CASAVA_Build 12 89500386 3D TTGAATTGAT GTA/--- GTAGCATATC 3070 het 3070 ref 18 7 8 5 GTA 2 1 193554 CASAVA_Build 12 89502001 1D TATATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2398 hom 31 8 17 6 T 12 11 193555 CASAVA_Build 12 89503029 1D GCTCTACTTG A/- ATTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 2 1 193556 CASAVA_Build 12 89511421 1I ATTGACTTCC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 52 33 14 5 A 8 9 193557 CASAVA_Build 12 89514543 2D GATAACTGAC AA/-- TATGGATAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 A 2 0 193558 CASAVA_Build 12 89519102 2I ATAATACTTG --/TT TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 8 10 193559 CASAVA_Build 12 89523332 1I TATCTCTTCA -/T TTTTATCCTA 1944 het 1944 ref 14 7 4 3 T 4 5 193560 CASAVA_Build 12 89524251 1I AGGAAATCTG -/T TTTTTTTTGT 2065 het 2065 ref 20 13 6 1 T 8 9 193561 CASAVA_Build 12 89528589 1D GTTTGTAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 A 10 9 193562 CASAVA_Build 12 89532029 6D CACAGCTCAG TCTCTC/------ TCTATGTCTC 3070 het 3070 ref 50 24 22 6 TC 4 1 193563 CASAVA_Build 12 89536249 1D CCAAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 2468 het 1362 hom 20 5 7 8 T 13 12 193564 CASAVA_Build 12 89537829 1D ACCCTGCTGT A/- AAAAAAAAAA 1831 het 1831 ref 40 27 5 8 A 13 12 193565 CASAVA_Build 12 89542672 1I AAAAGAGAGA -/T TTTTTTTAAA 2884 het 1635 hom 15 4 7 4 T 7 8 193566 CASAVA_Build 12 89548579 2D ACTAAGCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2984 hom 26 10 12 4 A 13 11 193567 CASAVA_Build 12 89552622 1D AAGTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 12 11 193568 CASAVA_Build 12 89558003 1I ACATTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 11 12 193569 CASAVA_Build 12 89640796 5I ATTAACTTTG -----/AATAT AATATATTTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 AATAT 1 2 193570 CASAVA_Build 12 89652655 1I GTGCCTGTGG -/C TTTTCTAGAT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 C 0 1 193571 CASAVA_Build 12 89658123 1I CTATCAAAAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 8 9 193572 CASAVA_Build 12 89659132 1I GAGGGATTAT -/G TAAGAATTCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 0 1 193573 CASAVA_Build 12 89682526 1I GCTATTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 10 11 193574 CASAVA_Build 12 89685106 1D CAAGTTACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 T 10 9 193575 CASAVA_Build 12 89698135 1D AATCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1206 het 1206 ref 45 32 3 12 A 12 11 193576 CASAVA_Build 12 89708449 1D TAAAGACCTA T/- GGCCAATGTT 3070 het 3070 hom 24 8 12 5 T 1 0 193577 CASAVA_Build 12 89714295 1I TCTCAAACGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 9 10 193578 CASAVA_Build 12 89722526 1D ATATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1917 hom 32 5 20 7 T 12 11 193579 CASAVA_Build 12 89729459 2D CTGAGAAAAA AT/-- GTTTCATTTT 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 AT 1 0 193580 CASAVA_Build 12 89739649 1D TCAGCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1916 hom 25 6 11 9 A 11 10 193581 CASAVA_Build 12 89747248 1D ATACAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 797 het 797 ref 28 17 2 10 T 12 11 193582 CASAVA_Build 12 89763477 3I AAGCAAAGAC ---/AAG AAAAGACATT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 AAG 0 1 193583 CASAVA_Build 12 89786367 2D CTAAATTCAC AA/-- AATCACTATT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 4 2 193584 CASAVA_Build 12 89787804 7I CTGCCAGAAG -------/AAAAAAT AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AAAAAAT 1 2 193585 CASAVA_Build 12 89788913 1D GATGCTTTCC T/- TACAGCCAGT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 2 1 193586 CASAVA_Build 12 89797768 1I ACCTGGACAC -/T TTGGGCTCCT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 2 3 193587 CASAVA_Build 12 89801278 1D ATAGTGACTT C/- CTTCCAAATA 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 C 2 1 193588 CASAVA_Build 12 89807330 1I TCTAGTTAAC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 7 8 193589 CASAVA_Build 12 89815322 2D GTAAATATAC AA/-- AAAAAACACC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 8 6 193590 CASAVA_Build 12 89817455 1D GGAATGGGAG A/- AAATCACTGT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 4 3 193591 CASAVA_Build 12 89818399 2I TAAAAAAAAA --/AT AAATATATAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 AT 0 1 193592 CASAVA_Build 12 89822948 1I ATGGTGGTTG -/T TTTGGGGGGA 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 T 3 4 193593 CASAVA_Build 12 89826745 2I CCTTTGATAG --/TA TATATATATG 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 TA 4 5 193594 CASAVA_Build 12 89827140 1I AGCAATTTTC -/T TTTAGGAAGA 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 T 3 4 193595 CASAVA_Build 12 89861993 1I ATAAGTAATT -/A ATGCTTCTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 1 2 193596 CASAVA_Build 12 89877218 1I TTATTCTTGT -/G CGTAGAATTG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 0 1 193597 CASAVA_Build 12 89877488 1I GCAGTGCTCA -/T TTTTTTCTTG 3070 hom 82 het 38 0 28 10 T 6 7 193598 CASAVA_Build 12 89877822 1I ACCATTGTGG -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 157 het 58 0 53 5 T 6 7 193599 CASAVA_Build 12 89881918 5I CTACATTTTC -----/ATTAT ATTATAACAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 ATTAT 1 2 193600 CASAVA_Build 12 89885229 1I TTATCTCTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 8 9 193601 CASAVA_Build 12 89887432 1I TATGGTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 33 1 24 8 A 13 14 193602 CASAVA_Build 12 89891123 4I AGTACTTTTC ----/TATT TATTAGAAAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TATT 1 2 193603 CASAVA_Build 12 89892175 1D TGAGATGTCA G/- GTAAGTTAAG 3070 hom 117 het 44 0 40 5 G 2 1 193604 CASAVA_Build 12 89910925 2D CAAGGGACAT AA/-- AAACTGACTA 3070 hom 111 het 40 0 37 4 A 5 3 193605 CASAVA_Build 12 89915264 1D AAAATTTTAC T/- GGATGAGTGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 0 193606 CASAVA_Build 12 89918707 1I ACTTTTTTTT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 193607 CASAVA_Build 12 89920776 1I TCACAAAAGC -/T TTTTCATCAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 4 5 193608 CASAVA_Build 12 89924592 1I TGAAAATACC -/T AACTTTCTTC 3070 hom 160 het 58 0 54 4 T 0 1 193609 CASAVA_Build 12 89925498 4I AAAACAAAAA ----/CAAC AAAAACAACA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CAAC 0 1 193610 CASAVA_Build 12 89925925 2I TCTGAAACTC --/AT AACATGTGGC 3070 hom 116 het 45 0 39 6 AT 0 1 193611 CASAVA_Build 12 89926349 1I TATCATAATT -/A ACTCCCTTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 2 193612 CASAVA_Build 12 89927105 2D GCAATTATGC TT/-- TTTTTTTAAC 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 9 7 193613 CASAVA_Build 12 89932299 1D AATTCAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 972 hom 33 3 20 10 T 13 12 193614 CASAVA_Build 12 89932396 1D TTATTTCTAA T/- TTTTTTGATG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 7 6 193615 CASAVA_Build 12 89933002 1I AACCAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 30 1 23 6 A 10 11 193616 CASAVA_Build 12 89933370 2I ATGCACCACG --/AC ACTAATTATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AC 1 2 193617 CASAVA_Build 12 89937252 1D AACTGGAAAC A/- ATAAAGATAT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 2 1 193618 CASAVA_Build 12 89940912 1D TATTTATACT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 9 8 193619 CASAVA_Build 12 89943237 1D TATAGTCTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 10 9 193620 CASAVA_Build 12 89952717 1D GGGATCTCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 10 9 193621 CASAVA_Build 12 89960019 1D CTCAAAAGTG A/- AATTAATATC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 3 2 193622 CASAVA_Build 12 89965532 2I CACTTCTTAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AC 8 9 193623 CASAVA_Build 12 89970755 14D CATCAAGCTC ATGTCCCATAATCA/-------------- ATGTATGTCT 3070 het 3070 ref 40 24 18 3 ATGTCCCATAATCA 1 0 193624 CASAVA_Build 12 89975283 2D CATATATATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TA 9 8 193625 CASAVA_Build 12 89975529 1D AGAAACATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 11 10 193626 CASAVA_Build 12 89975694 2D TGTCTCAGTC TG/-- AGGTTTGCTA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 TG 1 0 193627 CASAVA_Build 12 89982411 1I CAGAATGCTG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 9 193628 CASAVA_Build 12 89993568 1D GTTCGTCTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 10 9 193629 CASAVA_Build 12 89994098 1D GGAGAATAAA T/- GCACAGAAGT 3070 het 3070 ref 37 20 16 4 T 1 0 193630 CASAVA_Build 12 90001517 22D GCCATAATAC TTAATACATACTTAATACATAA/---------------------- TAATTAAATC 3070 hom 87 het 28 0 30 6 TTAATACATACTTAATACATAA 1 0 193631 CASAVA_Build 12 90002181 1I CCAGTGTGTG -/T ATGTTCCCTG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 0 1 193632 CASAVA_Build 12 90007479 1I GTGGTATGAG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 T 7 8 193633 CASAVA_Build 12 90011941 1I ATCACTTCAT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 8 9 193634 CASAVA_Build 12 90014278 1I GTTCATAGGG -/A AAAAATGTAG 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 A 5 6 193635 CASAVA_Build 12 90018902 1D GATCACAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 10 9 193636 CASAVA_Build 12 90019632 1D TAGAATATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 10 9 193637 CASAVA_Build 12 90025628 1D TTTGTGGACA T/- TTTTTTTTTT 2655 het 2655 ref 29 13 7 9 T 12 11 193638 CASAVA_Build 12 90027178 2I AGTCAATCTC --/TT CAGGCTCTTC 3070 hom 90 het 32 0 29 3 T 0 2 193639 CASAVA_Build 12 90029436 2I AAGAGCTGAA --/GG GGGGGGTGGG 3070 het 3070 ref 56 23 19 14 G 6 8 193640 CASAVA_Build 12 90029996 1D CTTCTAATGC T/- AAGGAGACTC 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 T 1 0 193641 CASAVA_Build 12 90031841 1D AATTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 14 9 A 13 12 193642 CASAVA_Build 12 90058280 1D ACAGGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 997 hom 42 6 15 21 A 19 18 193643 CASAVA_Build 12 90074531 1D CTTAAAAAGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 A 9 8 193644 CASAVA_Build 12 90075542 1I TTTAGAGAAA -/T TTTTTTTTTT 2737 het 2737 ref 26 10 10 6 T 13 14 193645 CASAVA_Build 12 90086931 4D AAAAACAAAC AATT/---- AATCCTGAAT 3070 het 3070 hom 27 8 15 6 AATT 1 0 193646 CASAVA_Build 12 90090015 1D AGATATTACC A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 29 9 17 4 A 7 6 193647 CASAVA_Build 12 90098208 3I AGAAGAAAGA ---/AAG AAGAAGGAAG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AAG 2 3 193648 CASAVA_Build 12 90114968 1I CTCTTTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 38 2 27 9 T 12 13 193649 CASAVA_Build 12 90118125 1I TCCTACTCTT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 A 7 8 193650 CASAVA_Build 12 90121723 9I GCACTTATTG ---------/CTTTATTTA GGGGTTTACT 3070 het 3070 hom 34 12 16 8 CTTTATTTA 0 1 193651 CASAVA_Build 12 90122110 1D CTTGAATTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 10 9 193652 CASAVA_Build 12 90126167 1D TTTGAAGTCG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 T 8 7 193653 CASAVA_Build 12 90126854 1D TTCAACTGTG C/- CCTGTATCTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 C 3 2 193654 CASAVA_Build 12 90131449 4I ACATTTTCTT ----/TATC TAAGCAGCCA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 TATC 0 1 193655 CASAVA_Build 12 90136290 1D TGCTTCCTGG T/- TTTTTTCTGA 3070 het 2968 hom 26 8 13 5 T 7 6 193656 CASAVA_Build 12 90136336 3I ATTTTATTTT ---/ATG ATTATTATTA 3070 het 942 hom 13 2 8 3 ATG 0 1 193657 CASAVA_Build 12 90136730 2I GATAGCTTCT --/TA TATTCAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TA 1 2 193658 CASAVA_Build 12 90138820 1D AGAGATAGGT G/- TAATATAATC 3070 het 3070 ref 53 31 15 7 G 1 0 193659 CASAVA_Build 12 90139521 10I AGATTATACC ----------/CAAGTGTCTA TGCACCAAGA 3070 het 3070 ref 38 21 16 3 CAAGTGTCTA 0 1 193660 CASAVA_Build 12 90142386 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 6 T 13 11 193661 CASAVA_Build 12 90142980 1D CAAATCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 9 24 10 T 12 11 193662 CASAVA_Build 12 90143062 4I TTTTGGAGGG ----/ACAC ACATTGCTTA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 AC 1 3 193663 CASAVA_Build 12 90154681 4I ATTTACTAAT ----/TCTC TATTAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 TC 0 2 193664 CASAVA_Build 12 90154869 14D AGAAGAACCT AATGTATTCAGAAC/-------------- AATGTATGCT 3070 het 3070 ref 37 24 12 6 AATGTATTCAGAAC 1 0 193665 CASAVA_Build 12 90159446 3D GGCAAAAAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 165 het 165 ref 40 21 3 17 A 16 13 193666 CASAVA_Build 12 90162322 1I CAATATTATT -/A AAAAAAAAAA 1587 het 1587 ref 23 12 6 5 A 10 11 193667 CASAVA_Build 12 90163610 1D CATAACACCT G/- GGCATCTACT 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 G 3 2 193668 CASAVA_Build 12 90165534 2D ATTAATTAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2138 hom 15 6 7 2 TA 6 5 193669 CASAVA_Build 12 90167306 2I CCATTGGCCT --/TA TATATATATA 2458 het 481 hom 15 1 7 7 TA 8 9 193670 CASAVA_Build 12 90173945 3D TTGAGCAGAA GAT/--- GATACTTTAT 3070 het 3070 ref 53 23 22 10 GAT 2 1 193671 CASAVA_Build 12 90174908 3I CCCCAGATTC ---/AAT TTTTTCACAG 3070 het 3070 hom 40 11 24 5 AAT 0 1 193672 CASAVA_Build 12 90175159 1D TTTTTCTACT C/- CCTACCCAAG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 C 3 2 193673 CASAVA_Build 12 90176689 2D ACTTTTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 29 1 11 17 T 18 16 193674 CASAVA_Build 12 90188034 1I TATGTTACAA -/T TTGGGGGATA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 2 3 193675 CASAVA_Build 12 90188242 7D TATGGTAATT ATAACTG/------- AAACTACTTT 3070 het 154 hom 30 2 15 16 ATAACTG 1 0 193676 CASAVA_Build 12 90189387 5D AGTCCAAGGT AGTGG/----- AGTGGCGTTG 3070 hom 127 het 49 0 41 10 AGTGG 2 1 193677 CASAVA_Build 12 90193108 1D AGTGTTAGAA T/- CTTCTCCTTG 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 T 1 0 193678 CASAVA_Build 12 90199505 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1834 hom 15 het 9 0 6 3 T 11 10 193679 CASAVA_Build 12 90200374 1I AAATAAAAAA -/T TATCAACAGG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 2 193680 CASAVA_Build 12 90201680 4I ACACATATAC ----/AGAT AGATACATAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AGAT 1 2 193681 CASAVA_Build 12 90210513 1I GACTATGGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 8 9 193682 CASAVA_Build 12 90213571 1D AAGATGAGAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 9 8 193683 CASAVA_Build 12 90214947 6D GTTCTCATTG TTCAAC/------ TCCCGCTTAT 3070 hom 87 het 32 0 26 7 TTCAAC 1 0 193684 CASAVA_Build 12 90216041 4D TTTGATGGGG TTGT/---- TTGTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 3 TTGT 2 1 193685 CASAVA_Build 12 90226133 1D AGTTCCCCAC A/- AAAAAAAAAA 1669 het 1669 ref 34 19 4 11 A 13 12 193686 CASAVA_Build 12 90228204 1I GGCAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 619 hom 40 2 35 3 A 10 11 193687 CASAVA_Build 12 90233792 1D CTTTTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 11 10 193688 CASAVA_Build 12 90234052 1D CATTTGGATA T/- TCTACTTGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 1 193689 CASAVA_Build 12 90235856 1I CAAAATCATG -/T GGTCAAAATT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 0 1 193690 CASAVA_Build 12 90237987 6D ATTTGTCAAT TAAAAA/------ TAAAAAGAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TAAAAA 2 1 193691 CASAVA_Build 12 90260802 1D29M1D AAATCGTTTA TTTTTTTTAACAGTGACTCAAACATTGATGA/-TTTTTTTAACAGTGACTCAAACATTGATG- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 38 17 26 4 N/A 0 0 193692 CASAVA_Build 12 90280089 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1565 het 1163 hom 29 17 5 7 T 17 16 193693 CASAVA_Build 12 90286199 3I GACAATGGTC ---/AGA AGAAGAGTGA 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 AGA 2 3 193694 CASAVA_Build 12 90291948 1D TCTGATTAGC G/- ATTTCAAGTT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 G 1 0 193695 CASAVA_Build 12 90301683 4D CCACAGCTGG GTTC/---- GTTCCAAACA 3070 hom 105 het 38 0 35 5 GTTC 2 1 193696 CASAVA_Build 12 90305194 2I GAATTTCCTC --/TT TCTTACCTCA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 1 3 193697 CASAVA_Build 12 90317671 1D TGTTATCTAA T/- TTGTCTTCCT 3070 hom 144 het 50 0 48 3 T 3 2 193698 CASAVA_Build 12 90330631 1D ATATTATATA T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 24 9 11 5 T 7 6 193699 CASAVA_Build 12 90341058 7I ACAAAACAAC -------/TTTTACG TTTTTCGTTT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 TTTTACG 0 1 193700 CASAVA_Build 12 90348282 2D AAAACACCCC AT/-- GTTAATTAGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AT 1 0 193701 CASAVA_Build 12 90484701 5D AAATTGGGTT CTTTC/----- CTTTATTTCC 3070 het 3070 hom 38 12 21 8 CTTTC 1 0 193702 CASAVA_Build 12 90488780 2I ATGAATGAAT --/AA AAATGAATAA 3070 het 3070 hom 65 30 29 6 A 3 5 193703 CASAVA_Build 12 90546875 1D AAGACACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2729 hom 44 14 16 14 A 17 16 193704 CASAVA_Build 12 90555328 1I TTCCAAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 10 11 193705 CASAVA_Build 12 90556201 5D CTTATGCTTG TTATT/----- TTATTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 14 5 TTATT 2 1 193706 CASAVA_Build 12 90556911 1D TAGTCCGAAA T/- TTTTTCAGGA 3070 hom 87 het 35 0 29 8 T 6 5 193707 CASAVA_Build 12 90586442 2D TCCAATCACA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 GT 7 6 193708 CASAVA_Build 12 90587505 1I TGTTAGGTGT -/A GGGTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 0 1 193709 CASAVA_Build 12 90589787 1I TAAATACCAG -/A ATTCCTAAAC 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 1 2 193710 CASAVA_Build 12 90591056 1I AGCAATGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 A 10 11 193711 CASAVA_Build 12 90603963 2D TCTCTCTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 2855 het 2855 ref 42 22 13 9 TG 8 7 193712 CASAVA_Build 12 90607900 1D GAGAGATGAC A/- AGTGTTTGAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 A 2 1 193713 CASAVA_Build 12 90610007 1D AAAAAAGAAC T/- TTTTTTTTTT 2880 het 2880 ref 34 13 11 10 T 17 16 193714 CASAVA_Build 12 90611769 1I TTTCAAGACA -/G GGTCTTGCTC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 2 3 193715 CASAVA_Build 12 90622628 1D ATTCTAATTG A/- AAAAAAAAAA 1731 het 1731 ref 31 14 6 12 A 12 11 193716 CASAVA_Build 12 90623746 2I CTCTTAATAA --/GT GTTAGCCATT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 GT 1 2 193717 CASAVA_Build 12 90623874 13D27M12D TCTGGGTCAT AGAAGGTGACCCAGAAGTTGAGCTGAGAGTGAAATCTAATTCTTTATTTGAG/-------------TCTGTTGAGCTGAGAGTGAAATCTAAT------------ TCTTTATTTG 3070 het 3070 ref 31 24 14 5 N/A 0 0 193718 CASAVA_Build 12 90632891 1D TTTCTTGGGG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 9 8 193719 CASAVA_Build 12 90635461 1D AAAGTCTTCC A/- CCTAACCCCT 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 A 1 0 193720 CASAVA_Build 12 90638155 3I GTTTTTAGAT ---/AAG AACATTAATG 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 AAG 0 1 193721 CASAVA_Build 12 90640402 4I TCATTCATTC ----/ATTT ATCTATTTAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 ATTT 0 1 193722 CASAVA_Build 12 90647553 1D CAGAATGGAT G/- GTGGTATAAG 3070 het 3070 hom 45 13 26 7 G 2 1 193723 CASAVA_Build 12 90658935 2I TATTGATAGA --/AT ATATATATAT 2941 het 545 hom 8 2 6 0 AT 6 7 193724 CASAVA_Build 12 90664666 1I AAGCAACAAC -/A AAAAAAAAAA 1171 het 1171 ref 37 29 3 5 A 10 11 193725 CASAVA_Build 12 90667698 1I TCTCATATTC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 18 7 9 2 T 7 8 193726 CASAVA_Build 12 90677804 1I GAAAAAAAGG -/A AGAGCAATGA 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 A 1 2 193727 CASAVA_Build 12 90678079 3I ATTATGAACA ---/TGT TGTTGAAAAC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 TGT 1 2 193728 CASAVA_Build 12 90691665 1I GCCTTCATCA -/G TTGCATATGA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 G 0 1 193729 CASAVA_Build 12 90716595 1D AATCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2911 hom 21 8 10 4 A 11 10 193730 CASAVA_Build 12 90719570 1I AAAACTTTAT -/G CTGATCCCAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 193731 CASAVA_Build 12 90720963 1D ATAATTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 A 12 11 193732 CASAVA_Build 12 90724368 1D CCTGAAGGAA G/- CACTAAATAT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 G 1 0 193733 CASAVA_Build 12 90725540 1D ATGTAGACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2773 hom 30 10 13 7 A 15 14 193734 CASAVA_Build 12 90734384 3D TTATTTGTCC TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 TTA 8 7 193735 CASAVA_Build 12 90737866 1D AGTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 11 10 193736 CASAVA_Build 12 90739131 1I GAGCCACCGT -/G CCAAGCGACA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 G 0 1 193737 CASAVA_Build 12 90739260 1D GATTCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 2391 het 2391 ref 34 18 7 9 T 15 14 193738 CASAVA_Build 12 90759539 1D CAATCATATG A/- AAAAAGCTCA 3070 het 3070 ref 31 13 14 5 A 6 5 193739 CASAVA_Build 12 90763193 1D TGCTTCTTGT A/- AAGAGACTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 3 2 193740 CASAVA_Build 12 90782889 1I GTCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2670 het 2670 ref 33 14 10 9 T 13 14 193741 CASAVA_Build 12 90822323 1I GTAATTTTTT -/C CATATCTTGT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 C 1 2 193742 CASAVA_Build 12 90853661 1I GTAAATAATA -/T AACAACTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 1 193743 CASAVA_Build 12 90853935 2I TATTTATTTG --/TT TTATTTATAT 659 het 659 ref 23 15 2 6 T 2 4 193744 CASAVA_Build 12 90858003 1D CCCCCACCTT G/- TATTTCTCAG 3070 het 3070 ref 51 27 19 6 G 1 0 193745 CASAVA_Build 12 90861372 1D ATCTCAACTT A/- AAAAAAAAAA 979 het 979 ref 43 33 3 7 A 11 10 193746 CASAVA_Build 12 90862037 3I AATGTTGGTT ---/ATC ATCTTCCAAC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 ATC 1 2 193747 CASAVA_Build 12 90863581 1I TTTTAATCTT -/A ACCACACTCG 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 A 1 2 193748 CASAVA_Build 12 90866379 1D ATATTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 11 10 193749 CASAVA_Build 12 90867508 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 21 1 15 5 A 10 11 193750 CASAVA_Build 12 90876024 1I AGAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 A 9 10 193751 CASAVA_Build 12 90877441 1I GTTATTTGAC -/A TTTGTTAACC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 A 0 1 193752 CASAVA_Build 12 90880560 4D TTTATTTTAC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 1441 hom 19 4 9 6 TTAT 4 3 193753 CASAVA_Build 12 90883056 5I AACACAAGTG -----/ACAAA ACAAAACAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 ACAAA 2 3 193754 CASAVA_Build 12 90894869 2D TACAAATGAA TC/-- TCCATCACCC 3070 hom 65 het 27 0 21 7 TC 2 1 193755 CASAVA_Build 12 90902144 1I AGAATCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 T 10 11 193756 CASAVA_Build 12 90902849 1D GACGAAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 41 0 32 10 T 10 9 193757 CASAVA_Build 12 90918223 1I ATAATTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 34 1 22 11 T 10 11 193758 CASAVA_Build 12 90939596 1D AATTCTTCAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 9 8 193759 CASAVA_Build 12 90942670 8D ATATATGTTT TATATATA/-------- TATATATATA 3070 het 2840 hom 16 7 7 2 TA 11 7 193760 CASAVA_Build 12 90951366 1D TTCTTGATGT C/- AAGCTAAAGT 3070 het 3070 ref 57 29 26 2 C 1 0 193761 CASAVA_Build 12 90962894 3D TTTATTTGTT TTG/--- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 23 5 TTG 1 0 193762 CASAVA_Build 12 90967663 1I AGGAATGAAA -/C CTTAAAGTTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 C 1 2 193763 CASAVA_Build 12 90974543 1I TTTATTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 10 11 193764 CASAVA_Build 12 90979383 1I TGATATTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 10 11 193765 CASAVA_Build 12 90980755 1I ATGGTTTTGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 A 8 9 193766 CASAVA_Build 12 91002473 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 960 het 960 ref 33 19 3 11 T 15 16 193767 CASAVA_Build 12 91022056 1I AAAAAGTAGA -/T TTTTTTTTAT 2015 het 1918 hom 15 7 7 1 T 8 9 193768 CASAVA_Build 12 91026471 1I TTCTGTAGTG -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 7 8 193769 CASAVA_Build 12 91027565 4D ATTTATTTAT TTAG/---- TTAGTTAGTT 3070 het 3070 hom 43 16 19 9 TTAG 4 3 193770 CASAVA_Build 12 91031401 1D CTCTATTCTG C/- CCCCCCCTCC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 C 8 7 193771 CASAVA_Build 12 91031857 1D TAGCTATACA T/- TATTTTATTT 3070 het 2955 hom 24 8 11 7 T 2 1 193772 CASAVA_Build 12 91036487 6I TTTATCTAAA ------/TATTCT TAATCTTATT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TATTCT 0 1 193773 CASAVA_Build 12 91036649 29I TCTAAGATGT -----------------------------/CTGAACAGGATCTAGTTTGAGGCACTAAA AAGGACAACA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CTGAACAGGATCTAGTTTGAGGCACTAAA 0 1 193774 CASAVA_Build 12 91042113 1I GAGAAAGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 17 12 A 13 14 193775 CASAVA_Build 12 91044472 2D TTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 13 11 193776 CASAVA_Build 12 91048952 1D CAACGACATG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 85 het 35 0 29 8 A 9 8 193777 CASAVA_Build 12 91052094 2I2M4D TTAATGAGTG --ATGGGA/AAAT---- TTCCTTTTTA 3070 hom 144 het 55 0 49 8 N/A 0 0 193778 CASAVA_Build 12 91052421 1I CCCTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 11 12 193779 CASAVA_Build 12 91056996 1D CCTAAGATTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 9 8 193780 CASAVA_Build 12 91069351 1I CCTACCCCGC -/A AGCCTTGCCC 2443 het 1926 hom 21 8 8 5 A 1 2 193781 CASAVA_Build 12 91070778 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 33 0 28 5 A 11 10 193782 CASAVA_Build 12 91078159 1D GCCTTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1412 hom 31 7 19 5 A 14 13 193783 CASAVA_Build 12 91082937 1I ATTTAAAAGG -/T GGGGGGCAAA 3070 het 3070 hom 40 22 15 3 T 0 1 193784 CASAVA_Build 12 91083219 1I TTGTTCAATG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 T 8 9 193785 CASAVA_Build 12 91085483 2I TATCTGTGTA --/TG TGTGTATATA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TG 2 3 193786 CASAVA_Build 12 91094387 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 9 10 193787 CASAVA_Build 12 91097453 2I AGATAATGCA --/CT CTTTTTCCCC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 CT 1 2 193788 CASAVA_Build 12 91112194 2D TACTCTCCAC CA/-- CACAAAATCT 3070 het 2890 hom 38 11 21 6 CA 3 2 193789 CASAVA_Build 12 91130247 1D TTTATTCATT A/- AAAAAAAAAA 2071 het 1850 hom 23 9 7 7 A 13 12 193790 CASAVA_Build 12 91133383 1D TGGCACTTGA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 9 8 193791 CASAVA_Build 12 91135709 1D AAACAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 19 8 A 15 14 193792 CASAVA_Build 12 91150882 1I AGTGTAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 10 11 193793 CASAVA_Build 12 91152049 1D ATGAGGAGAA T/- TTTCAGCTTC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 4 3 193794 CASAVA_Build 12 91157694 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 8 7 193795 CASAVA_Build 12 91158457 4I TAATTAATTA ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 ATTT 2 3 193796 CASAVA_Build 12 91160100 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 T 12 11 193797 CASAVA_Build 12 91168847 1I ACAAATAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 144 hom 25 1 20 4 A 9 10 193798 CASAVA_Build 12 91171018 3I ATTCCCATGT ---/CGA CATTACACAT 3070 hom 117 het 50 0 40 10 CGA 0 1 193799 CASAVA_Build 12 91175110 1D GCCTTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 32 0 18 14 T 15 14 193800 CASAVA_Build 12 91187360 12D TAATTTTTGA TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 26 14 193801 CASAVA_Build 12 91192512 15I CATGATTCTG ---------------/GTTCACTGCAACCTT TGCCTCCTGG 3070 hom 83 het 33 0 24 9 GTTCACTGCAACCTT 0 1 193802 CASAVA_Build 12 91193614 2D AATGGTAAGT TA/-- TATATATATA 3070 hom 99 het 45 0 34 11 TA 7 6 193803 CASAVA_Build 12 91217804 3D AAGAGGAAGA AGG/--- AGGAGGAGGA 2289 hom 19 het 27 0 12 17 AGG 7 6 193804 CASAVA_Build 12 91221065 3D TCTAATAATT ATA/--- ATGATATATT 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 ATA 1 0 193805 CASAVA_Build 12 91224660 5I TTGGCTGTGT -----/CCCCA CCCCACCCAA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 CCCCA 1 2 193806 CASAVA_Build 12 91242786 2D TTTGGGTAGG CT/-- CTGTCAGAGG 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 CT 2 1 193807 CASAVA_Build 12 91247878 2I CATAAAAAAT --/TA GGCGACAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 14 2 TA 0 1 193808 CASAVA_Build 12 91265453 1D TAAAAAAAAA T/- ATTATCTAAC 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 1 0 193809 CASAVA_Build 12 91270631 1I TATAGAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 14 14 T 11 12 193810 CASAVA_Build 12 91285097 8D GTTGGGTGAG TGGTTGGT/-------- TGGTTGGTTG 1819 het 982 hom 16 8 6 5 TGGT 6 4 193811 CASAVA_Build 12 91297697 1D CTACACCAGT A/- AAGACTATCT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 3 2 193812 CASAVA_Build 12 91302349 1D TTAAAATGTA T/- AACCCTCGTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 1 0 193813 CASAVA_Build 12 91302909 1I ACTTATTTAA -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 7 8 193814 CASAVA_Build 12 91313752 1D AGTTCTGAGT G/- GGCATGAATT 3070 het 3070 hom 57 24 28 5 G 3 2 193815 CASAVA_Build 12 91317581 1D GTTTGTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 11 10 193816 CASAVA_Build 12 91319027 2D TGAATACAGG AC/-- ACACACACAC 726 het 726 ref 45 38 2 6 AC 6 5 193817 CASAVA_Build 12 91345992 1D AATTAACCCC T/- GTTACTTACC 3070 het 3070 ref 57 29 23 5 T 1 0 193818 CASAVA_Build 12 91352818 9D CTCCCCTTTT CTCCTCCTC/--------- CTCCTCCTCC 1879 het 1510 hom 32 7 6 19 CTC 7 4 193819 CASAVA_Build 12 91361449 1I GCTGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 536 hom 35 2 25 8 A 10 11 193820 CASAVA_Build 12 91370346 1D CACTGAGAGT A/- AAAAAAAAAA 1268 het 1268 ref 38 33 3 3 A 12 11 193821 CASAVA_Build 12 91378757 1D TAACCCAAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 8 193822 CASAVA_Build 12 91389866 1I TGTATATGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 82 hom 30 1 24 5 T 9 10 193823 CASAVA_Build 12 91424698 2D AACTTAGGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 12 8 A 13 11 193824 CASAVA_Build 12 91433225 1I GAAAAAGCAC -/A ATGAACATTG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 1 2 193825 CASAVA_Build 12 91452972 1D CTCTTATCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 T 10 9 193826 CASAVA_Build 12 91453800 3D41M1I ATGAGGAGAC CTTCTCTTTTCCAGTGGCTCTTTGGGAGACACTGTCTCCATCTT-/---CTCTTTTCCAGTGGCTCTTTGGGAGACACTGTCTCCATCTTC TCCATTACCT 3070 het 3070 hom 29 8 11 20 N/A 0 0 193827 CASAVA_Build 12 91454542 1I ATTAAATTGA -/T TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 T 6 7 193828 CASAVA_Build 12 91454991 66D TATACTTTTG TTTCTATTAGATAAGACATGCAACTGTTTCATAAGAATTCTTATTGTTAAATAATTTAGATAATAT/------------------------------------------------------------------ TATATTATTC 3070 het 3070 ref 20 21 10 0 TTTCTATTAGATAAGACATGCAACTGTTTCATAAGAATTCTTATTGTTAAATAATTTAGATAATAT 1 0 193829 CASAVA_Build 12 91455906 1D TAAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 2494 het 3 hom 18 1 11 6 A 15 14 193830 CASAVA_Build 12 91461496 2I GTTCTGCAGG --/TT TTTTTCTTGT 3070 het 3070 ref 57 30 22 5 T 5 7 193831 CASAVA_Build 12 91461743 1I TCTTACAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 14 13 T 15 16 193832 CASAVA_Build 12 91463452 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3043 het 3043 ref 21 10 8 3 A 11 12 193833 CASAVA_Build 12 91467152 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2073 hom 22 7 9 6 T 11 12 193834 CASAVA_Build 12 91478059 1I AGTTTGATAG -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 A 0 1 193835 CASAVA_Build 12 91516229 2D CTTTCTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 14 12 193836 CASAVA_Build 12 91519323 5D AGCAAAGGGG GAGAA/----- GAGAAGTGCA 3070 hom 45 het 16 0 15 3 GAGAA 2 1 193837 CASAVA_Build 12 91525710 1I ATGTATAAAA -/G TATTTTTTTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 G 0 1 193838 CASAVA_Build 12 91528848 1D GGAGAAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 9 8 193839 CASAVA_Build 12 91530364 1D AAAGTTTATC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 49 0 42 8 A 9 8 193840 CASAVA_Build 12 91530835 3D TGTGTGCTGC TGA/--- TGTCATGTCA 3070 hom 129 het 48 0 41 8 TGA 1 0 193841 CASAVA_Build 12 91539714 3D GCAGCCAGGG GAA/--- GAAGAAGAGG 3070 hom 66 het 26 0 20 7 GAA 3 2 193842 CASAVA_Build 12 91541835 2D TATATATTGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 TA 6 5 193843 CASAVA_Build 12 91544969 6D GTGAAACAAC TGTCCT/------ TGTCCTTTAT 3070 hom 129 het 50 0 42 8 TGTCCT 2 1 193844 CASAVA_Build 12 91547160 2D ATGTGGTCTC TT/-- TCTCTTCTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 3 1 193845 CASAVA_Build 12 91553467 3D CAAGACATTA ATC/--- ACAGGGAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 ATC 1 0 193846 CASAVA_Build 12 91553879 1I ATAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 28 1 21 6 A 10 11 193847 CASAVA_Build 12 91561977 1D TATTCTACAG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 96 het 40 0 33 9 A 8 7 193848 CASAVA_Build 12 91562350 1I AGAACACACC -/T ATTATAAAGC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 0 1 193849 CASAVA_Build 12 91570095 2I TAAGCTCACC --/TT AGCCATTAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 0 2 193850 CASAVA_Build 12 91570443 9I ATATTCTTAG ---------/CCATAATAA CCTGAATTCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CCATAATAA 0 1 193851 CASAVA_Build 12 91573182 1I GTCAGAAGGG -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 A 7 8 193852 CASAVA_Build 12 91575354 1I TAGCCCAAAC -/A GGCAGAATGG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 193853 CASAVA_Build 12 91581960 2D ACCAAAGTCA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 33 0 28 8 AC 8 7 193854 CASAVA_Build 12 91585303 5I GAAGAAAAAG -----/AAAGA AAAGAAAAGA 3070 hom 77 het 35 0 25 10 AAAGA 2 3 193855 CASAVA_Build 12 91587806 1I TTGTCTTAAG -/C CACCCTAAAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 1 2 193856 CASAVA_Build 12 91593720 1D ATTAAGTAAC T/- TTTGTGTGTG 3070 hom 160 het 58 0 54 4 T 4 3 193857 CASAVA_Build 12 91607068 4I TAGCACTATC ----/TTGG CTCACTGCAA 3070 hom 51 het 19 0 16 3 TTGG 0 1 193858 CASAVA_Build 12 91665226 34D AACCACAATG AGATATCATCTTACCCCAGTTAAAATGACTACTA/---------------------------------- AGATATCATC 3070 hom 45 het 16 0 16 5 AGATATCATCTTACCCCAGTTAAAATGACTACTA 1 0 193859 CASAVA_Build 12 91669440 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 19 0 15 4 T 13 14 193860 CASAVA_Build 12 91699636 3I TGTAAAACTA ---/AAG AAGAGCAGTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AAG 1 2 193861 CASAVA_Build 12 91707195 1I ACGCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 24 2 11 11 A 12 13 193862 CASAVA_Build 12 91714371 2I ACTTTTTATT --/TA TATATATATA 2724 het 2724 ref 27 16 7 4 TA 6 7 193863 CASAVA_Build 12 91755032 2D TGTCTCATTT AA/-- AAAAAAAAAA 2924 hom 24 het 21 0 10 12 A 18 16 193864 CASAVA_Build 12 91771907 3I AAAGGAAAAG ---/ATA ATAATACTGT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 ATA 2 3 193865 CASAVA_Build 12 91780141 2I ATGCAGTAAC --/TA TTCCGTAAGC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TA 0 1 193866 CASAVA_Build 12 91786913 1I TGGGTAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 41 1 35 5 A 10 11 193867 CASAVA_Build 12 91801551 3D ATGATTTTCT TAA/--- TAATATTTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 3 TAA 2 1 193868 CASAVA_Build 12 91805253 1D AACTTAAAAA T/- TTAAAAAATA 3070 hom 66 het 29 0 24 5 T 3 2 193869 CASAVA_Build 12 91810465 1D TTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 37 0 29 8 T 11 10 193870 CASAVA_Build 12 91813416 1D CTGCCACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 601 hom 23 3 15 5 A 15 14 193871 CASAVA_Build 12 91823349 2D TACTAAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 73 het 29 0 24 6 AC 10 9 193872 CASAVA_Build 12 91826525 1I AAAAATTGCT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 8 193873 CASAVA_Build 12 91829717 2I AAAAGTAACT --/TC TGTTTTTCAA 3070 hom 129 het 46 0 43 3 TC 0 1 193874 CASAVA_Build 12 91853092 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 11 10 193875 CASAVA_Build 12 91855517 2D TCTTGAATGC CA/-- GTGTCTCCTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 CA 1 0 193876 CASAVA_Build 12 91863467 1I AAAGCTAAAA -/G CCATGGCTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 193877 CASAVA_Build 12 91865136 1D CCCCTCGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2462 hom 36 12 14 10 T 12 11 193878 CASAVA_Build 12 91869366 3D AACAAGAGGA ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 48 het 27 0 16 12 ATT 7 6 193879 CASAVA_Build 12 91903748 6D AAAAAAAACA AAAACC/------ AAAAACCAAA 2019 het 2019 ref 23 12 9 5 AAAACC 1 0 193880 CASAVA_Build 12 91912912 1I TAACAAAGGA -/T TTTTTTTTGG 2414 het 1910 hom 32 8 15 9 T 8 9 193881 CASAVA_Build 12 91913190 1D TATTCTCTGG A/- AGCTTATATA 3070 het 3070 ref 41 21 18 4 A 2 1 193882 CASAVA_Build 12 91914163 1I GCCATGTCGG -/C CCAGGCTGGT 3070 het 1755 hom 21 6 13 2 C 2 3 193883 CASAVA_Build 12 91936543 1I AGGTTGGGTT -/C CCTTCTGAGA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 C 2 3 193884 CASAVA_Build 12 91951104 2D ATATACAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 AT 7 6 193885 CASAVA_Build 12 91952165 1D TTTAGTGAAT A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 129 het 46 0 43 3 A 8 7 193886 CASAVA_Build 12 91958694 1D ACTCTTCGTA C/- CACTATGTTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 C 2 1 193887 CASAVA_Build 12 91981083 2D TAATTATGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 27 1 12 14 T 14 12 193888 CASAVA_Build 12 91985640 1I ATCTTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 618 hom 31 5 14 12 A 10 11 193889 CASAVA_Build 12 91990236 3I ATTAGGGGTG ---/AAA CTGTGAGAGG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 0 3 193890 CASAVA_Build 12 91996086 3D TACCAGAGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 18 6 T 15 12 193891 CASAVA_Build 12 92000875 1D TTAAACTCCA T/- TTTTTTTTTT 1757 het 1757 ref 18 9 4 5 T 12 11 193892 CASAVA_Build 12 92032134 1D GCCAGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 2606 het 16 hom 14 1 7 6 T 15 14 193893 CASAVA_Build 12 92059451 1D TCCATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1473 hom 20 4 9 8 A 11 10 193894 CASAVA_Build 12 92133981 4D CCTCTCTCTC TATT/---- TAATTTTGGC 3070 het 3070 hom 45 18 21 8 TATT 1 0 193895 CASAVA_Build 12 92166998 1D AGCCTCCAAC T/- GCATAACTCC 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 T 1 0 193896 CASAVA_Build 12 92167706 6D CTTTTGTTTT GTTTTG/------ GTTTTGGTTT 2586 het 2586 ref 26 10 7 10 GTTTTG 4 3 193897 CASAVA_Build 12 92168466 1I TCAACTTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2552 hom 25 7 10 8 T 9 10 193898 CASAVA_Build 12 92169700 1I ATTTAAGTGC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 7 8 193899 CASAVA_Build 12 92179100 12D AACAATTTTC TTTTTTATTTAT/------------ TTATTTATTT 1531 het 844 hom 12 3 5 4 TTTTTTATTTAT 1 0 193900 CASAVA_Build 12 92180958 3D TTTTGTTTTG TTT/--- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 T 11 8 193901 CASAVA_Build 12 92185705 1I GAAAAAAAAA -/G AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 G 0 1 193902 CASAVA_Build 12 92194600 1I CAAAAAATGT -/A AAATAATTTT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 3 4 193903 CASAVA_Build 12 92205163 1I TTGCCTTAAG -/A AAAAAAAAAA 1450 het 1450 ref 38 27 4 7 A 13 14 193904 CASAVA_Build 12 92205532 2D TCTCAAACCC CT/-- GTTTGCTTTG 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 CT 1 0 193905 CASAVA_Build 12 92208431 9I GCTGATGCAC ---------/GCTGCTGGT GCAAGTGGCC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 GCTGCTGGT 0 1 193906 CASAVA_Build 12 92209898 4I TTTTTTTCTT ----/TTTC TTTCTGAGAT 2525 het 2525 ref 23 12 7 4 TTTC 1 2 193907 CASAVA_Build 12 92211649 1D CGTCTTTACT A/- AAAATATAAA 2882 het 678 hom 12 2 9 1 A 5 4 193908 CASAVA_Build 12 92213278 1D GCCATAAACA T/- TTTTTTTAAT 2412 het 2412 ref 16 7 5 4 T 8 7 193909 CASAVA_Build 12 92213573 1D CTGCCAAATA C/- AAAGGCAAGA 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 C 1 0 193910 CASAVA_Build 12 92214464 8I AAGATTTGGA --------/AATGACTG AAGCTTGAGA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 AATGACTG 0 1 193911 CASAVA_Build 12 92219914 1D TTTTGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2426 het 2426 ref 23 15 6 2 T 12 11 193912 CASAVA_Build 12 92226811 4I TCAGGAATAC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 48 19 19 10 TTTG 2 3 193913 CASAVA_Build 12 92234159 3D CCCAGATAAT TTG/--- TTCTGAGCAG 3070 het 3070 hom 46 18 24 6 TTG 1 0 193914 CASAVA_Build 12 92245269 8D GGAGATATTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 2113 hom 25 5 13 7 TTTG 6 4 193915 CASAVA_Build 12 92246081 1I GAAGTCCTAA -/C CCCCAGTACT 3070 hom 167 het 65 0 55 10 C 4 5 193916 CASAVA_Build 12 92247209 1D CAAATTTAAC A/- GGCAAAATTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 1 0 193917 CASAVA_Build 12 92249805 1I GCAATTCTCC -/T TCCTCAACTT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 1 2 193918 CASAVA_Build 12 92258465 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 13 12 193919 CASAVA_Build 12 92260597 1I AATTTTGTAC -/T TTTTTTTTTT 1517 het 1517 ref 27 17 6 4 T 15 16 193920 CASAVA_Build 12 92267354 1D CTCTAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 2632 het 633 hom 17 3 9 5 T 11 10 193921 CASAVA_Build 12 92275030 1I ATGCCCAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 T 10 11 193922 CASAVA_Build 12 92286781 1D CCCTCACCCT C/- CCTCCCTTTC 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 C 3 2 193923 CASAVA_Build 12 92287010 1I TGAATAAGAG -/T TAAGTAAATA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 1 2 193924 CASAVA_Build 12 92289229 1D TAATCTAGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 9 8 193925 CASAVA_Build 12 92290374 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2118 het 1685 hom 13 4 6 4 A 11 10 193926 CASAVA_Build 12 92291995 1D AACACTCAAT A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 47 24 16 8 A 7 6 193927 CASAVA_Build 12 92293743 1I TTTGTCATTT -/A AAAAGGCCAC 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 4 5 193928 CASAVA_Build 12 92293914 1D CACCTCTACT A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 A 7 6 193929 CASAVA_Build 12 92301377 2I TTAGGTTAAC --/AT GTAGTTTCAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 AT 0 1 193930 CASAVA_Build 12 92314128 3I CCTTAGCAAA ---/TAT TATTATATGA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 TAT 2 3 193931 CASAVA_Build 12 92315190 4D GAATGATGTG TTAA/---- TTGACAGTTG 3070 het 3070 ref 48 22 22 5 TTAA 1 0 193932 CASAVA_Build 12 92316895 1I CCATCCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 13 14 193933 CASAVA_Build 12 92318528 2I GTAAAAGATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 692 hom 33 7 15 11 T 13 15 193934 CASAVA_Build 12 92320940 1D GACTCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2745 het 1066 hom 26 5 11 10 T 15 14 193935 CASAVA_Build 12 92323487 4I ATGGCAAGTT ----/ACTC AGTACCATAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 ACTC 0 1 193936 CASAVA_Build 12 92329539 1I AACTTGCTCT -/A AAACTCAACC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 3 4 193937 CASAVA_Build 12 92334359 1I CTTATCTATC -/T TTTTTTTTTT 1675 het 1675 ref 19 7 7 5 T 15 16 193938 CASAVA_Build 12 92355086 1I GCCCTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 1023 het 1023 ref 29 20 3 6 A 10 11 193939 CASAVA_Build 12 92356243 1D AAGGGAAACT G/- GTTTATACGG 3070 het 3070 hom 49 19 26 5 G 2 1 193940 CASAVA_Build 12 92357797 3I CAGTATGAGT ---/TAC TACTGTCTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TAC 1 2 193941 CASAVA_Build 12 92366549 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 15 14 193942 CASAVA_Build 12 92370022 1D CTATAGGAAC T/- TTTTTTTTTT 2686 het 454 hom 23 3 11 9 T 19 18 193943 CASAVA_Build 12 92372778 14I GCCTGCTCTA --------------/ATTTTTATATTTTT ATTTTTATAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 ATTTTTATATTTTT 1 2 193944 CASAVA_Build 12 92386215 1D TATCACTATT G/- GGGGGAAGGG 3070 hom 97 het 41 0 33 9 G 6 5 193945 CASAVA_Build 12 92387540 1I CCCCACCTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 104 hom 34 1 25 8 A 9 10 193946 CASAVA_Build 12 92387887 1D TATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 29 0 20 9 T 14 13 193947 CASAVA_Build 12 92392062 2D TACTGTTGTC TT/-- GAGTTTTCTT 3070 het 3070 ref 35 27 7 1 T 2 0 193948 CASAVA_Build 12 92392769 5D AGGCCAAGGC GGGCT/----- GGGCTGATCA 3070 hom 36 het 13 0 11 3 GGGCT 2 1 193949 CASAVA_Build 12 92397221 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 20 0 14 6 A 15 16 193950 CASAVA_Build 12 92397781 1D GTTCTGACAG T/- TTTTTTTTTT 2417 het 1551 hom 22 4 10 8 T 15 14 193951 CASAVA_Build 12 92400804 1D AATCTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 13 8 T 13 12 193952 CASAVA_Build 12 92402433 1D GTGACAGGAA T/- TTTTTTAGCT 3070 het 3070 hom 60 23 25 12 T 7 6 193953 CASAVA_Build 12 92403471 2I AAAGAAAATA --/TC TGTTTGAATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TC 0 1 193954 CASAVA_Build 12 92405253 1I TGAATAATGC -/A ACTAAGTGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 193955 CASAVA_Build 12 92405706 1I TATGTTGTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 9 10 193956 CASAVA_Build 12 92405879 1D AATTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 2640 het 58 hom 17 1 9 7 T 15 14 193957 CASAVA_Build 12 92407435 1D9M1I TTCCTTCTTA TTTTATTTTA-/-TTTATTTTAT TTTATTTATT 1004 hom 25 het 23 0 8 15 N/A 0 0 193958 CASAVA_Build 12 92412840 2I TCAGGAACTC --/TA TAGAGATATA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TA 1 2 193959 CASAVA_Build 12 92415954 1I TTTCTCACAG -/T TATCAGTAAA 2429 hom 12 het 5 0 5 0 T 1 2 193960 CASAVA_Build 12 92420897 3D CACATAGTCC GTG/--- ATCACCAGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 7 GTG 1 0 193961 CASAVA_Build 12 92421290 1D CAAAAACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 38 1 25 13 T 15 14 193962 CASAVA_Build 12 92421911 1I TTATTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 16 3 T 10 11 193963 CASAVA_Build 12 92423398 1D CTTCTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 34 1 24 9 T 11 10 193964 CASAVA_Build 12 92426198 3I GGGAGGGTGG ---/GGT GGTGGTGCTG 3070 hom 27 het 11 0 9 2 GGT 2 3 193965 CASAVA_Build 12 92434392 4D GTCATCCATG TACC/---- TACCTACCTA 3070 het 3070 hom 48 19 22 8 TACC 4 3 193966 CASAVA_Build 12 92439566 2D GGCCAGCCCT GG/-- GGGGGGGGAC 3070 hom 87 het 34 0 27 9 G 10 8 193967 CASAVA_Build 12 92465342 2D ACTAAATCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TC 7 6 193968 CASAVA_Build 12 92466668 1D TCATTTTTAC A/- ACCTGTGCAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 A 2 1 193969 CASAVA_Build 12 92470318 1D CCTCCCACCT C/- GGCCTCCCAA 3070 het 1944 hom 26 7 14 5 C 1 0 193970 CASAVA_Build 12 92472438 46D GTGCTTCTGG AAAAAAACAAGATGATATATAACAAAAAAACAAGATGATATATAAC/---------------------------------------------- AAAAAAACAA 3070 hom 108 het 38 0 37 6 AAAAAAACAAGATGATATATAAC 2 0 193971 CASAVA_Build 12 92492485 1I GTGGTGGCCC -/T GGTAAACTTT 2555 het 2555 ref 25 11 6 8 T 0 1 193972 CASAVA_Build 12 92531993 1D TAACCAGCCA T/- TTTTTTTTTT 1915 het 1915 ref 47 38 6 3 T 12 11 193973 CASAVA_Build 12 92538330 1I TTTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 T 10 11 193974 CASAVA_Build 12 92539237 2D AAGGGAAATT AC/-- ACAGACTGTC 3070 het 3070 ref 54 29 22 3 AC 2 1 193975 CASAVA_Build 12 92542652 2D6M2I TGCTGGAACC CATTAAGT--/--TTTAGTAG TGCTCCCATT 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 N/A 0 0 193976 CASAVA_Build 12 92543162 4D ACACACACAA TCTC/---- TCTCTGTCAT 3070 het 3070 hom 45 14 29 5 TC 4 2 193977 CASAVA_Build 12 92548964 5I ACAGCATGTA -----/ATTAG ATCCTGTTTT 3070 het 3070 hom 40 19 17 5 ATTAG 0 1 193978 CASAVA_Build 12 92560216 1I TGGTCCATGG -/T GACTAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 T 0 1 193979 CASAVA_Build 12 92566988 2D ATACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2033 hom 20 7 9 4 AT 6 5 193980 CASAVA_Build 12 92570582 4D AAGAAGAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 26 9 10 10 AAAG 3 2 193981 CASAVA_Build 12 92574148 1D AGTCACAGGG T/- TTTTAAGTGG 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 5 4 193982 CASAVA_Build 12 92598184 1I GGTTTCTGAT -/A AAGAGTGATA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 2 3 193983 CASAVA_Build 12 92650194 6D GTGTGCATTT TCAGTG/------ TCTCTAAAGA 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 TCAGTG 1 0 193984 CASAVA_Build 12 92653704 2D TACTAGATCT AG/-- AACCAGAGAC 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 AG 1 0 193985 CASAVA_Build 12 92656745 2D AAAGAAGGAA AG/-- AGAGGGAGAG 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 AG 3 2 193986 CASAVA_Build 12 92666318 1I GTTCAGGCGA -/T TTCCCCCCTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 3 193987 CASAVA_Build 12 92666570 2I AGTGATCTGC --/AA AAAAGCATGA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 4 6 193988 CASAVA_Build 12 92668135 1D CGAGTTCTTC A/- AGGGAGAGGG 3070 hom 117 het 46 0 40 7 A 2 1 193989 CASAVA_Build 12 92677332 1D TCGAGAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 10 9 193990 CASAVA_Build 12 92681280 1I CCTCTCTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 9 10 193991 CASAVA_Build 12 92682641 2D ATATTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 12 10 193992 CASAVA_Build 12 92683756 1I TTTTATTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 30 1 29 0 T 11 12 193993 CASAVA_Build 12 92693484 1I TTTTGGAGAA -/G GGGGGATCGA 3070 hom 113 het 43 0 37 6 G 5 6 193994 CASAVA_Build 12 92708400 4I AACTCAACTA ----/TAAC AAGCATGGTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TAAC 0 1 193995 CASAVA_Build 12 92716100 1I CTTTTTCTTT -/G TTTCCCAGGA 3070 hom 134 het 48 0 44 4 G 0 1 193996 CASAVA_Build 12 92720403 7D GAGAATTTCT GGGCCAG/------- GGGCCAGGCC 3070 hom 144 het 52 0 48 5 GGGCCAG 2 1 193997 CASAVA_Build 12 92728958 1D TTTCCCTTAG C/- CCCCCCTCCT 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 C 7 6 193998 CASAVA_Build 12 92740025 2I ACTCAGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 24 0 19 5 A 12 14 193999 CASAVA_Build 12 92749968 1I TTATGATTGA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 40 18 20 2 T 7 8 194000 CASAVA_Build 12 92750460 2D CTCTATACTC TT/-- TATTACTTAG 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 T 3 1 194001 CASAVA_Build 12 92751651 1I TGAACAAACA -/T TTTTTTCACA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 6 7 194002 CASAVA_Build 12 92751730 1I TCATTTTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 378 hom 42 1 33 8 T 9 10 194003 CASAVA_Build 12 92755471 2I CACCGGGCGG --/TT TTTCCATGTG 2294 het 2294 ref 16 6 6 4 T 3 5 194004 CASAVA_Build 12 92756464 2D CTTCTCTCTT TC/-- TCTCTCTTTT 3070 hom 35 het 40 0 24 16 TC 4 3 194005 CASAVA_Build 12 92758468 2D AACTAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 28 0 22 8 T 12 10 194006 CASAVA_Build 12 92760034 1I GCACCTCTTC -/T TTAGCCGTTG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 2 3 194007 CASAVA_Build 12 92764852 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 7 20 0 A 9 8 194008 CASAVA_Build 12 92766678 1I TAGGAGCTCC -/T TCTGTATAAC 3070 hom 144 het 55 0 47 8 T 1 2 194009 CASAVA_Build 12 92771350 1I TATAATTTTT -/G GTGGCATGTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 G 1 2 194010 CASAVA_Build 12 92772130 1I TGTGGTCAGC -/T TGGTGGGTTG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 1 2 194011 CASAVA_Build 12 92783732 1I TGTATTGTTA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 8 194012 CASAVA_Build 12 92791147 1I AACACTACTG -/A TTTTTGTATG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 1 194013 CASAVA_Build 12 92793159 1I CTGATTTTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 8 9 194014 CASAVA_Build 12 92794949 8D CCCAAGCCCA GTAACACT/-------- GTGGTTCTTG 3070 hom 79 het 32 0 24 10 GTAACACT 1 0 194015 CASAVA_Build 12 92799347 1D AAAAAAGTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 832 hom 24 4 11 10 G 10 9 194016 CASAVA_Build 12 92842082 5D TATCTTATTA TATCT/----- TATCACCTAA 3070 het 3070 ref 50 26 17 8 TATCT 1 0 194017 CASAVA_Build 12 92857538 2D GCATTTAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 2824 het 323 hom 23 4 7 12 T 14 12 194018 CASAVA_Build 12 92864209 1I ACAAGTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 10 11 194019 CASAVA_Build 12 92873124 2D GTCTCATAAC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 152 het 57 0 51 8 CT 8 7 194020 CASAVA_Build 12 92873719 1D GAGTGAAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 426 hom 35 1 24 10 A 10 9 194021 CASAVA_Build 12 92874071 9D TGGGTGAGTA TGAAAGTTC/--------- TTTTCCTAGT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TGAAAGTTC 1 0 194022 CASAVA_Build 12 92882476 9I AGGAGCTGGG ---------/TCAGGCTCT GGCCGGGCGC 1854 hom 18 het 9 0 7 2 TCAGGCTCT 0 1 194023 CASAVA_Build 12 92883621 4I TGTTTGATTG ----/TTTA TTTGTTTTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTTA 0 1 194024 CASAVA_Build 12 92896072 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 17 3 12 2 G 0 1 194025 CASAVA_Build 12 92896461 5D CACAAGAGGA AAGAG/----- AAGAGGAGAC 3070 het 3070 hom 42 13 24 6 AAGAG 2 1 194026 CASAVA_Build 12 92905429 1D ATTCTGGCTC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 96 het 49 1 46 2 T 9 8 194027 CASAVA_Build 12 92908041 1D GTTGGTGTTT A/- ATGAGTATAG 3070 het 3070 hom 42 20 20 4 A 2 1 194028 CASAVA_Build 12 92910313 1I TCAATAGATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 9 10 194029 CASAVA_Build 12 92910465 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 het 2190 hom 24 8 11 5 G 4 5 194030 CASAVA_Build 12 92939442 3I TTGCAAAATT ---/TTC TTCTCTCATG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTC 1 2 194031 CASAVA_Build 12 92942821 2I GTTTTCAGCT --/TC TAAGTTTTGG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 TC 0 1 194032 CASAVA_Build 12 92951460 4D AAATACATTC AGAG/---- AGAGAGTCAC 3070 hom 123 het 48 0 40 8 AG 5 3 194033 CASAVA_Build 12 92954677 1I TGAAAGGGAG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 7 8 194034 CASAVA_Build 12 92955527 3D CCAGCCAGCC ACT/--- ACCCAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 27 11 ACT 1 0 194035 CASAVA_Build 12 92969380 1D TAAGAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 11 10 194036 CASAVA_Build 12 92975110 24I ATTCCCACAT ------------------------/AATTAATTCACATATTTAATTATG GCATAATGCA 3070 hom 65 het 19 0 22 2 AATTAATTCACATATTTAATTATG 0 1 194037 CASAVA_Build 12 92999243 1D GCTTTGTCAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 114 het 41 0 39 4 A 8 7 194038 CASAVA_Build 12 93014703 5I TTTGCTGAGA -----/TTGTT TTGAAACCAA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 TTGTT 0 1 194039 CASAVA_Build 12 93025290 2I TGCTATAAGG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 58 21 23 14 AC 7 8 194040 CASAVA_Build 12 93026551 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 10 9 194041 CASAVA_Build 12 93039594 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 17 1 11 5 A 11 10 194042 CASAVA_Build 12 93041685 1I GCCAGAGCTA -/T TTTTTTTTTC 2605 het 2147 hom 16 6 6 4 T 9 10 194043 CASAVA_Build 12 93043545 1D TTAGACTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 T 14 13 194044 CASAVA_Build 12 93044048 1D CATTTGTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 A 11 10 194045 CASAVA_Build 12 93051722 1I CATCCCCCCC -/T ATCTAGTATC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 0 1 194046 CASAVA_Build 12 93052261 1D CAGGTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 11 10 194047 CASAVA_Build 12 93054283 1D CTCACTACAA C/- CTCCACATCC 3070 het 1426 hom 18 3 12 3 C 2 1 194048 CASAVA_Build 12 93082355 6I GAGCACCCTG ------/CCCGAA CCTCGATGAG 3070 hom 105 het 38 0 29 9 CCCGAA 0 1 194049 CASAVA_Build 12 93087266 1I TAAAAAAACA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 106 het 39 0 36 3 T 7 8 194050 CASAVA_Build 12 93091936 1D GTCTCCCCGA C/- CTCCCAGGGA 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 C 2 1 194051 CASAVA_Build 12 93095439 10I AGAGGGAGAA ----------/AGAAAGAAAG AGAAAGAAAG 3070 hom 51 het 27 0 18 9 AGAAAGAAAG 1 2 194052 CASAVA_Build 12 93102659 1I TTGTGTGTTT -/A AAATAGACTG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 3 4 194053 CASAVA_Build 12 93104077 8I GCCTGGGAAT --------/ACGCACTG ACGCACTGTC 3070 hom 103 het 38 0 33 6 ACGCACTG 1 2 194054 CASAVA_Build 12 93106883 2D TGAGGAGAAA AG/-- AGAGAGAAGG 3070 het 3070 ref 32 12 14 6 AG 4 3 194055 CASAVA_Build 12 93109677 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 11 12 194056 CASAVA_Build 12 93118514 1I AGGAATGTGG -/C CCCCCAGTTA 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 C 5 6 194057 CASAVA_Build 12 93127292 1I GACATGATGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 A 7 8 194058 CASAVA_Build 12 93129448 1I TATTAGCTCT -/A ATTCAAAGGC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 A 1 2 194059 CASAVA_Build 12 93137896 1D AAAATCATCA T/- TTTTTCCCCA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 6 5 194060 CASAVA_Build 12 93144396 1I TGTCCAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 15 16 194061 CASAVA_Build 12 93146297 4D TTGTTCCAGG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 35 11 19 7 GTTT 4 3 194062 CASAVA_Build 12 93152047 1D TATATTCAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 T 9 8 194063 CASAVA_Build 12 93156396 1I TCCCCCTTCG -/A AAAAAAAAAA 2257 het 2257 ref 32 17 8 7 A 11 12 194064 CASAVA_Build 12 93159885 3I AAGCTTTGTT ---/AAA AAAAAAAAAA 2842 het 1963 hom 31 8 13 10 A 12 15 194065 CASAVA_Build 12 93163413 1D CATAGTGAGA C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 C 5 4 194066 CASAVA_Build 12 93168995 4D24M3D TAGAATAAAG GGCAGGCAGGGGCTTCTTGCCTACAGGTTAC/----GGCAGGGGCTTCTTGCCTACAGGT--- TACTGCCTCT 3070 het 3070 ref 29 21 13 5 N/A 0 0 194067 CASAVA_Build 12 93171588 2I ATGTAATTTC --/TT TTTTTTTTTT 2173 het 2173 ref 31 15 8 8 T 12 14 194068 CASAVA_Build 12 93175816 3I ACTCTGTCTC ---/AAA AAAAAAAATA 1705 het 1435 hom 7 3 4 0 A 8 11 194069 CASAVA_Build 12 93179071 2I TTCAAACACC --/AA AGAGAACAAA 3070 het 3070 hom 52 17 27 8 A 1 3 194070 CASAVA_Build 12 93181875 1D AGCAGGTGAG A/- CCCAGTGGAA 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 1 0 194071 CASAVA_Build 12 93182409 22D CTGGGAACTG CCCGGGCCGGGCCTGGCCTGGC/---------------------- CCATGGAGAG 2697 het 2697 ref 23 15 8 3 CCCGGGCCGGGCCTGGCCTGGC 1 0 194072 CASAVA_Build 12 93194971 2I CTCTTTATAA --/AC ACACCATAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 AC 2 3 194073 CASAVA_Build 12 93196054 1D CCTTAAAACC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 8 7 194074 CASAVA_Build 12 93196905 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 2586 hom 24 het 19 0 9 11 A 10 12 194075 CASAVA_Build 12 93197641 1D CCCCTCCCTG C/- CCCCACCAGC 3070 hom 31 het 12 0 11 1 C 5 4 194076 CASAVA_Build 12 93199518 1D TTATAGAGAC A/- AGTCTCACTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 1 194077 CASAVA_Build 12 93200037 5D ACAAACAAAC AAAGT/----- AAAACAGAAC 3070 het 3070 hom 43 15 24 9 AAAGT 1 0 194078 CASAVA_Build 12 93201068 1I GTGCAAAAAA -/G GGACGGAGAG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 2 3 194079 CASAVA_Build 12 93217475 1D TTCTAGCCTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 T 9 8 194080 CASAVA_Build 12 93225151 3I CAATTTCTGT ---/ATA ATAATATTTC 3070 het 3070 ref 57 26 24 7 ATA 2 3 194081 CASAVA_Build 12 93225590 1D GTGGACTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 12 11 194082 CASAVA_Build 12 93228302 1I CTCCTACTCA -/C CCCCCATTCA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 C 5 6 194083 CASAVA_Build 12 93244936 1I CCTCAGGATG -/A AATCACAGGT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 2 3 194084 CASAVA_Build 12 93248184 2D ATATAACACG CA/-- CACACACACA 1297 het 1297 ref 42 29 3 10 CA 9 8 194085 CASAVA_Build 12 93266892 4I GCAGAAAATG ----/CTTT CTAAGTGTTT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 CTTT 0 1 194086 CASAVA_Build 12 93271640 1D GAAGTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 A 13 12 194087 CASAVA_Build 12 93271765 1D AAAGAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 11 10 194088 CASAVA_Build 12 93272921 1I AACACAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2980 hom 23 12 8 3 A 9 10 194089 CASAVA_Build 12 93294363 1I CAATGATTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 7 8 194090 CASAVA_Build 12 93295904 1I CTGGCTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 A 10 11 194091 CASAVA_Build 12 93319153 1I TCATTATGAT -/A AAAGTGTATA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 3 4 194092 CASAVA_Build 12 93333600 1I CCACTAAATA -/T GTAAGGCAGA 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 T 0 1 194093 CASAVA_Build 12 93354663 1I ACTTGAACCC -/G GGAGGAGGTT 3070 het 2150 hom 20 9 10 1 G 2 3 194094 CASAVA_Build 12 93406247 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTGTTTT 2862 het 2862 ref 29 14 9 7 T 6 5 194095 CASAVA_Build 12 93406857 3I AGCAATAGAC ---/TAA TAATAGCTAC 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 TAA 1 2 194096 CASAVA_Build 12 93407791 1D GAGAGAGAGT A/- AAAGAGGGTC 3070 het 3070 hom 52 26 24 3 A 4 3 194097 CASAVA_Build 12 93418266 1D AGACCCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 26 0 15 12 A 12 11 194098 CASAVA_Build 12 93423126 1D CATCCTCTTC A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 8 7 194099 CASAVA_Build 12 93424113 4D CCTTAATTTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 95 hom 28 3 19 6 AT 8 6 194100 CASAVA_Build 12 93431923 1D TAGAATCTTG C/- AAAAATACTA 3070 hom 123 het 47 0 42 6 C 1 0 194101 CASAVA_Build 12 93433982 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 758 het 758 ref 10 4 4 2 AAAG 1 0 194102 CASAVA_Build 12 93440794 1D TGGGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1687 het 48 hom 20 0 8 12 T 17 16 194103 CASAVA_Build 12 93445686 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2537 hom 4 het 14 0 7 7 T 15 14 194104 CASAVA_Build 12 93464931 8D TCTCTCTCTG CTCTGGAT/-------- CTCTGGATCT 3070 hom 81 het 38 0 24 14 CTCTGGAT 2 1 194105 CASAVA_Build 12 93475950 1I AGGTGTGCTC -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 8 194106 CASAVA_Build 12 93476476 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 10 11 194107 CASAVA_Build 12 93483635 1D GAGTTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 20 0 16 4 A 10 9 194108 CASAVA_Build 12 93500902 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAGAAAGA 370 hom 18 het 18 0 6 12 A 6 4 194109 CASAVA_Build 12 93507044 1D TGAGGTTGTT G/- TTTTTTTTTA 3070 hom 47 het 21 0 15 6 G 1 0 194110 CASAVA_Build 12 93507967 13I GTCCACAGCT -------------/CTGGTGTGGCTTC CTGGAGCCAC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 CTGGTGTGGCTTC 0 1 194111 CASAVA_Build 12 93509312 1D41M1D CAATTTCTGA TTTTTTTTTTTCTTTAAATTAAAATTGGTGTTTCCTCGTAGGA/-TTTTTTTTTTCTTTAAATTAAAATTGGTGTTTCCTCGTAGG- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 24 0 15 17 N/A 0 0 194112 CASAVA_Build 12 93512106 6D TTAAATTTAA ATATAT/------ ATATATATAT 1424 het 37 hom 27 1 10 17 AT 9 6 194113 CASAVA_Build 12 93513771 1D CCACTTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 10 9 194114 CASAVA_Build 12 93516291 1I CCATTAAATA -/C TGCAAATGTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 0 1 194115 CASAVA_Build 12 93521824 1I TTCTAGCAAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 8 9 194116 CASAVA_Build 12 93525193 2D TATTGTTCAA AC/-- ACACGTTTTA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 AC 3 2 194117 CASAVA_Build 12 93548164 2D ACTCTGTCCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 23 1 17 5 A 15 13 194118 CASAVA_Build 12 93556909 1I TTTACTTTAG -/A AAAAACATGT 3070 hom 109 het 41 0 37 4 A 5 6 194119 CASAVA_Build 12 93561097 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 10 11 194120 CASAVA_Build 12 93570514 1D TAAAAATATA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 T 7 6 194121 CASAVA_Build 12 93582777 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 19 1 13 6 A 17 16 194122 CASAVA_Build 12 93587066 1I ACATTCTTGG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 7 8 194123 CASAVA_Build 12 93587522 3I CTTGATCAAT ---/AGA AAATAGGAAT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 AGA 0 1 194124 CASAVA_Build 12 93597478 1I GGCTTGGCCT -/A AAGTGGTCAC 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 2 3 194125 CASAVA_Build 12 93607427 1I GGCTTAGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 189 hom 50 1 44 5 A 8 9 194126 CASAVA_Build 12 93609790 1I CTGAGACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 A 11 12 194127 CASAVA_Build 12 93611996 1I AGGGATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 35 3 17 15 T 15 16 194128 CASAVA_Build 12 93617328 1D TGTCAACCGG T/- TTTTTTTTCA 2751 het 2751 ref 30 16 6 8 T 9 8 194129 CASAVA_Build 12 93620215 3I AGAAACGCTC ---/AGA AGAGACAAAC 3070 het 3070 hom 45 15 20 10 AGA 1 2 194130 CASAVA_Build 12 93620527 1D AGGCAGATAC A/- AAATGAGGAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 4 3 194131 CASAVA_Build 12 93631531 3I TCGTTCTCCG ---/CTT CTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 CTT 1 2 194132 CASAVA_Build 12 93633229 2I ATTAAACATC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 11 194133 CASAVA_Build 12 93633552 12D CTCCGTCTCA AAAAACAAAAAC/------------ AAAAACAAAA 3070 het 1822 hom 22 5 15 8 AAAAAC 4 2 194134 CASAVA_Build 12 93635400 1I AAGCCGAGGA -/T TTTTTTTTTT 2527 het 2527 ref 30 9 10 11 T 12 13 194135 CASAVA_Build 12 93635890 1I AAGGAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 11 12 194136 CASAVA_Build 12 93637906 1D CAGTCTCTAT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 A 8 7 194137 CASAVA_Build 12 93652621 1D GGAAAAGGAC T/- GTGGACTTGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 0 194138 CASAVA_Build 12 93659821 1D CCAGACCTGA G/- GCACTGCATC 3070 hom 147 het 50 0 48 2 G 2 1 194139 CASAVA_Build 12 93659947 5I ATAGGAGACT -----/GAGAA GAGGGTTTGG 3070 hom 116 het 43 0 37 6 GAGAA 0 1 194140 CASAVA_Build 12 93662148 1I TTCTTTGCAC -/G TAAGTGTAAC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 0 1 194141 CASAVA_Build 12 93663262 2D AAAAAAACAA AC/-- AGAGCCCCAA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 AC 1 0 194142 CASAVA_Build 12 93663798 1D TCACTCAGGT G/- GAACAAACTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 2 1 194143 CASAVA_Build 12 93677847 3D ATATCATATC ATT/--- ATTAGATTAT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 ATT 2 1 194144 CASAVA_Build 12 93692752 1I TCAAAGTTCT -/G GCATTACAGG 3070 hom 102 het 38 0 32 6 G 1 2 194145 CASAVA_Build 12 93697123 4I CTTAGGTCTC ----/CTGA CTTTCAAAGA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 CTGA 0 1 194146 CASAVA_Build 12 93709919 2I ATGTACACAC --/AT ATATACATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 2 3 194147 CASAVA_Build 12 93714320 2I ACCTAGTCTC --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 45 0 38 7 A 9 11 194148 CASAVA_Build 12 93714900 1D ATTTATACCC A/- AATAATTATC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 3 2 194149 CASAVA_Build 12 93721882 1I TTTATCTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 A 10 11 194150 CASAVA_Build 12 93737998 18D GCACCAGAAG CTTACATAAAATTAGGCA/------------------ CTTGGGGAAG 3070 het 3070 ref 35 28 10 3 CTTACATAAAATTAGGCA 1 0 194151 CASAVA_Build 12 93739228 10I GGTGAATGGT ----------/AAACACTTAA AAATATTCTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AAACACTTAA 0 1 194152 CASAVA_Build 12 93739355 2I CCTTGTCTCT --/AA AAAAAAAAAT 1778 hom 12 het 5 0 5 2 A 9 11 194153 CASAVA_Build 12 93741446 1D CCTTCCAGTA G/- GGGGCCGACT 3070 hom 27 het 10 0 9 2 G 5 4 194154 CASAVA_Build 12 93746919 2I GTATAATAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AT 5 6 194155 CASAVA_Build 12 93755686 3D7M14D TGTGTATATA CATTATATATACACACACACACAC/---TATATAT-------------- ACACACACTA 270 het 270 ref 21 5 2 16 N/A 0 0 194156 CASAVA_Build 12 93757272 1D TGCGTGCCTT A/- AGTCACAGCT 3070 hom 60 het 23 0 20 4 A 2 1 194157 CASAVA_Build 12 93772795 5D3M1D ATGGCTCACT TGATGGCAT/-----GCA- GCCTTGACTT 3070 hom 57 het 21 0 18 3 N/A 0 0 194158 CASAVA_Build 12 93773650 7D CTGTCTCAAG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 15 3 A 26 19 194159 CASAVA_Build 12 93776562 2D ACTCCATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 30 0 25 5 A 13 11 194160 CASAVA_Build 12 93781273 1I GTTAATTACC -/T TTTTTTCTAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 6 7 194161 CASAVA_Build 12 93782370 1I CATCTCTACT -/A AAAAATACAA 2747 hom 21 het 8 0 7 1 A 5 6 194162 CASAVA_Build 12 93798322 2I ATATAGACAC --/TG TGTCTCCCTT 3070 hom 114 het 48 0 39 9 TG 1 2 194163 CASAVA_Build 12 93800067 1D CTTCTTGGGG A/- AAAAAAAATC 1963 het 1963 ref 23 8 7 8 A 9 8 194164 CASAVA_Build 12 93800105 1I GAGATGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 32 0 22 10 A 11 12 194165 CASAVA_Build 12 93804992 1D GCTTCAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 8 T 11 10 194166 CASAVA_Build 12 93809327 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 8 9 194167 CASAVA_Build 12 93820813 1I AAGATAGAAA -/G GGTGATATTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 2 3 194168 CASAVA_Build 12 93825947 1D TTTGTTTTGG T/- TACAGACCTG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 2 1 194169 CASAVA_Build 12 93828995 1I AGGCTGAGGC -/G GGTGGATCGC 3070 hom 48 het 21 0 16 5 G 2 3 194170 CASAVA_Build 12 93831374 4D AGACAATAGA ATTC/---- ATTCACCATG 3070 hom 102 het 37 0 34 4 ATTC 2 1 194171 CASAVA_Build 12 93832456 2I TATCTTTGCC --/AT CTTGCAGAAG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AT 0 1 194172 CASAVA_Build 12 93833094 13D TTTTTTATTT TTTAATTTTTTTA/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 18 1 14 5 TTTAATTTTTTTA 1 0 194173 CASAVA_Build 12 93833247 1D TTACAGGCTT A/- ATGCCACCAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 2 1 194174 CASAVA_Build 12 93842047 1D TGCCACTTTG C/- TTTTTTTTCT 1476 het 1476 ref 19 11 6 2 C 1 0 194175 CASAVA_Build 12 93844333 1I ATTTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 10 11 194176 CASAVA_Build 12 93854722 1I CAGAAGCACA -/G GGGGGATTAA 3070 hom 89 het 33 0 28 5 G 5 6 194177 CASAVA_Build 12 93861429 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 1323 het 1323 ref 19 13 3 3 A 10 9 194178 CASAVA_Build 12 93874959 1D CTTTTGCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 55 2 39 15 A 12 11 194179 CASAVA_Build 12 93876228 4D TCACCATGTT AGTC/---- AGGCTGGTCT 3070 hom 18 het 7 0 7 2 AGTC 1 0 194180 CASAVA_Build 12 93876530 6D ATTTTCTATG ATGTAC/------ ATGTATTGCT 3070 hom 42 het 17 0 15 4 ATGTAC 1 0 194181 CASAVA_Build 12 93877818 2I TTTTGTTTTT --/TC TTTTTTAAAT 3070 hom 79 het 31 0 27 4 TC 0 1 194182 CASAVA_Build 12 93880103 2D TCAAAGGAAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 TC 8 7 194183 CASAVA_Build 12 93882435 1I CCATGAGTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 194184 CASAVA_Build 12 93885670 3D ACATTCTGTT GAG/--- GAGGTGATAC 3070 hom 138 het 50 0 47 5 GAG 2 1 194185 CASAVA_Build 12 93887245 2D TCAGCCAGAT AG/-- ACTTTGAGAG 3070 hom 96 het 33 0 33 1 AG 1 0 194186 CASAVA_Build 12 93890787 8I GGGACAGAGT --------/GCGATCAA GCAGGAAGCT 3070 hom 94 het 35 0 30 5 GCGATCAA 0 1 194187 CASAVA_Build 12 93897575 1D CCACCCCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 11 10 194188 CASAVA_Build 12 93898494 1D ATTTTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 11 10 194189 CASAVA_Build 12 93900183 4D TTTTCTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 21 1 13 7 T 18 14 194190 CASAVA_Build 12 93901675 3D CTTACAACAG CTT/--- CTTAAGTGAG 3070 hom 211 het 73 0 71 6 CTT 2 1 194191 CASAVA_Build 12 93901803 7I GAGGAATGTA -------/GACATCT GCACTTGGTA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 GACATCT 0 1 194192 CASAVA_Build 12 93902839 8D GAGTCAAGAT CGCACCAC/-------- TGCACTCCAG 2650 hom 15 het 6 0 6 0 CGCACCAC 1 0 194193 CASAVA_Build 12 93904550 1D TAAAAAAAAA C/- CAGCAGGTTG 3070 hom 78 het 33 0 26 8 C 2 1 194194 CASAVA_Build 12 93904784 1D GTTCCAACTA G/- TCAAATTGAG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 1 0 194195 CASAVA_Build 12 93908179 1D TAGAATGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 546 hom 35 2 22 11 A 12 11 194196 CASAVA_Build 12 93914727 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 20 2 16 2 A 16 18 194197 CASAVA_Build 12 93944859 1D TCAACATAGC A/- AATAGTCATC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 3 2 194198 CASAVA_Build 12 93958073 4D AGTCTTACAG TCTC/---- TCTATCTTTG 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TC 3 1 194199 CASAVA_Build 12 93992350 4D AATGAGTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TC 6 4 194200 CASAVA_Build 12 93993279 1D AGAGTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 1758 het 1758 ref 33 19 4 10 T 12 11 194201 CASAVA_Build 12 93994732 4I TTATAAAGTA ----/TCTT TATATGGACA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 TCTT 0 1 194202 CASAVA_Build 12 93998375 1D GGATTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 40 0 32 8 T 11 10 194203 CASAVA_Build 12 94013281 1I GACAAGGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 29 0 25 4 T 10 11 194204 CASAVA_Build 12 94017963 4D CTTTTCTGAT CCCC/---- CCCCCCCCCA 3070 hom 42 het 22 0 15 7 C 13 9 194205 CASAVA_Build 12 94018473 1I CTGTTGGCTG -/T TATCTGTTCC 3070 hom 72 het 30 0 22 8 T 1 2 194206 CASAVA_Build 12 94019982 1D GGAGGCTGAG T/- GGGGGTGGAT 3070 hom 29 het 17 0 10 7 T 1 0 194207 CASAVA_Build 12 94022879 1D TCAGAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 739 hom 30 4 18 8 A 17 16 194208 CASAVA_Build 12 94024020 3I2M1I TTTCTCTAAA ---AT-/TATATC ATATATTTGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 N/A 0 0 194209 CASAVA_Build 12 94024345 4D GCCTGGCTAA TTTT/---- TGTTTGTTTT 2680 hom 30 het 13 0 11 2 T 5 1 194210 CASAVA_Build 12 94025106 1I ACCCAGAATG -/T TTTATTAGAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 3 4 194211 CASAVA_Build 12 94027476 1I AAGGACTATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 46 het 22 0 16 7 A 8 9 194212 CASAVA_Build 12 94028269 1D TATATCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 20 1 12 7 T 15 14 194213 CASAVA_Build 12 94030149 1D TCAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 12 11 194214 CASAVA_Build 12 94033116 1D TTTGCACAAA G/- GGGACAATAA 3070 hom 123 het 48 0 41 8 G 4 3 194215 CASAVA_Build 12 94044638 2D ACTCAGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2453 hom 24 het 11 0 7 5 A 15 13 194216 CASAVA_Build 12 94050282 1D ACACTTTCTC A/- ATAAAAAACA 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 A 2 1 194217 CASAVA_Build 12 94056887 1D CTGCATACTT A/- AGAGCACAGA 3070 hom 117 het 43 0 40 5 A 2 1 194218 CASAVA_Build 12 94061201 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 496 hom 31 2 17 12 T 14 13 194219 CASAVA_Build 12 94062322 2I TTTTTGAGAC --/AA AGAGTTTCAC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 1 3 194220 CASAVA_Build 12 94064782 1D AGACCTAAGC A/- AAAAATCAAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 6 5 194221 CASAVA_Build 12 94067564 2I CCCTTTTTTC --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 9 11 194222 CASAVA_Build 12 94068321 1I ATCAGAGAGC -/A AATAAGACAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 3 194223 CASAVA_Build 12 94085975 1I ATTACACACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 8 9 194224 CASAVA_Build 12 94087152 2D CAACAATTTA TT/-- GTATATTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 T 2 0 194225 CASAVA_Build 12 94098902 1D TTGCCGTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 10 9 194226 CASAVA_Build 12 94099593 2I GGGCACAGTG --/GC GCTCACGCCT 3070 het 1181 hom 13 4 8 1 GC 1 2 194227 CASAVA_Build 12 94100094 10D TCACAGTTGC ATACACATAT/---------- TTACACATAT 2764 hom 41 het 21 0 12 11 ATACACATAT 1 0 194228 CASAVA_Build 12 94106069 1D TAAAGCAAAG A/- GTCCTATTTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 0 194229 CASAVA_Build 12 94110895 7D AAAACAGTGA CAACTAC/------- CAACTACCAA 3070 hom 111 het 40 0 37 6 CAACTAC 2 1 194230 CASAVA_Build 12 94118085 1D AAATGTTATC A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 8 7 194231 CASAVA_Build 12 94118930 1D TCTAGTCTGC T/- TTTTTTTTTT 986 het 986 ref 35 25 3 7 T 12 11 194232 CASAVA_Build 12 94121578 4D TTGACATATG GTCA/---- GTATCTGTGA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 GTCA 1 0 194233 CASAVA_Build 12 94123175 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 A 13 14 194234 CASAVA_Build 12 94124607 1I TCTCCAAAGA -/G AAAAAAAAAA 1815 het 1815 ref 32 13 6 13 G 0 1 194235 CASAVA_Build 12 94132769 1D TCCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 847 het 488 hom 23 6 4 13 T 19 18 194236 CASAVA_Build 12 94144306 1I TTAACTGTGA -/T TTTTTTTTTT 2608 het 2608 ref 39 17 8 14 T 13 14 194237 CASAVA_Build 12 94161988 4D GACTAAAAAC TCTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 15 8 TCTT 1 0 194238 CASAVA_Build 12 94168655 1I GTTGGGGTGA -/T TTTTTTTTTT 2189 het 2189 ref 30 11 8 11 T 15 16 194239 CASAVA_Build 12 94204693 1I CTTTTTTACT -/C TTTCCATTCT 3070 het 3070 ref 38 26 10 2 C 0 1 194240 CASAVA_Build 12 94230965 4D ACAATAAAAA ATAC/---- ATACGTGAAT 3070 het 3070 ref 44 25 16 5 ATAC 2 1 194241 CASAVA_Build 12 94231930 1D AAAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 35 2 30 3 A 11 10 194242 CASAVA_Build 12 94235003 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2381 het 1326 hom 36 11 12 13 T 19 18 194243 CASAVA_Build 12 94237892 2I TACCAATAAC --/TT TGACCCCTAA 3070 hom 79 het 34 0 27 7 T 1 3 194244 CASAVA_Build 12 94238228 20D GATTAATTCT TTTTGTTTTGTTTTGTTTTG/-------------------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 TTTTG 7 3 194245 CASAVA_Build 12 94260197 9D ACCATTCTTC CAAAATAAA/--------- CAAAATAAAC 3070 hom 74 het 29 0 25 5 CAAAATAAA 2 1 194246 CASAVA_Build 12 94266868 1D GATAATATAA C/- ACCCCCATGC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 1 0 194247 CASAVA_Build 12 94267798 2I CAGAGGGAGG --/CT CTGTCTCAGG 1024 het 1024 ref 31 15 5 11 CT 1 2 194248 CASAVA_Build 12 94279399 1I ACTTAAAAAT -/G GTTAAGAAGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 1 2 194249 CASAVA_Build 12 94284681 1I TGTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 38 1 30 7 T 10 11 194250 CASAVA_Build 12 94290161 1D TACCTCAGCT C/- CCCCAAGTAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 C 5 4 194251 CASAVA_Build 12 94292917 4D GAAATATCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 48 19 21 8 AAAC 5 4 194252 CASAVA_Build 12 94294900 1I TAGGTATTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 9 194253 CASAVA_Build 12 94295859 1D AGCATCTTAA T/- TAAGTCAGCT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 2 1 194254 CASAVA_Build 12 94296954 1D GAATAACTTT G/- TTTTATAACC 3070 hom 60 het 22 0 21 2 G 1 0 194255 CASAVA_Build 12 94297266 6D TGCGCACGTG CGCACA/------ CACACACAAA 3070 hom 57 het 26 0 18 9 CGCACA 1 0 194256 CASAVA_Build 12 94301486 1I ATTAGTTTCA -/G GATCAGTAGC 3070 het 3070 hom 48 23 24 1 G 1 2 194257 CASAVA_Build 12 94302433 9D CTTCTCTTCT TTCTTTCTC/--------- TTTCTTTCTT 3070 hom 57 het 25 0 17 8 TTCTTTCTC 1 0 194258 CASAVA_Build 12 94303259 1I TAGCCAGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 12 194259 CASAVA_Build 12 94309226 2D TACCTGCCAA AG/-- ATTATGTAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 AG 1 0 194260 CASAVA_Build 12 94317242 1D CTTCTGAAAA G/- GGAGATAGGA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 G 3 2 194261 CASAVA_Build 12 94317866 1I AAGACCTTAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 8 9 194262 CASAVA_Build 12 94318973 6D CTACTACCTA TGTATC/------ TGTATCTGTG 3070 hom 60 het 38 0 21 20 TGTATC 2 1 194263 CASAVA_Build 12 94319388 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 327 het 327 ref 16 10 3 3 AT 6 5 194264 CASAVA_Build 12 94319946 4D AGGCCAAGTT GTAG/---- GTAGGATGGG 3070 hom 98 het 35 0 30 5 GTAG 2 1 194265 CASAVA_Build 12 94320608 2I TGTCTCAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 40 0 23 17 A 12 14 194266 CASAVA_Build 12 94321316 4D ATTTTTTCTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 TTTA 5 4 194267 CASAVA_Build 12 94326017 2I TGACGCCCTC --/TT TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 8 10 194268 CASAVA_Build 12 94326512 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAAATT 2496 het 2496 ref 26 9 8 10 A 9 8 194269 CASAVA_Build 12 94331105 3D CTCCTCCTCT ATC/--- ATCATCTCTG 3070 hom 133 het 50 0 43 7 ATC 3 2 194270 CASAVA_Build 12 94340737 1I GCATAGTGCT -/A AATCTCAGAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 2 3 194271 CASAVA_Build 12 94341092 2I CATCACTACT --/AA AAAAAAAAAT 2515 het 2152 hom 15 7 7 1 A 9 11 194272 CASAVA_Build 12 94355592 1I GCCGATGGTT -/C CCTGGGGGTC 3070 het 3070 hom 50 23 20 7 C 2 3 194273 CASAVA_Build 12 94358733 2D TCAACTGTGC TA/-- TATAGTCTGA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 TA 3 2 194274 CASAVA_Build 12 94362134 1I TTTTTATAAC -/A TTTTTCATGA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 A 0 1 194275 CASAVA_Build 12 94362690 1I TGTGACAAAA -/T TTGTTGAAAT 601 het 601 ref 49 34 3 12 T 2 3 194276 CASAVA_Build 12 94364174 1D ATTACGAAAC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 8 7 194277 CASAVA_Build 12 94364298 1I GAAAATCACG -/T TTAAGGGTAG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 2 3 194278 CASAVA_Build 12 94364880 1D GTATCCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 27 10 T 11 10 194279 CASAVA_Build 12 94370153 1I AATGGACCAA -/G GGATTATTCC 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 G 2 3 194280 CASAVA_Build 12 94379757 3I GCTTTTTATT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 TTA 5 6 194281 CASAVA_Build 12 94380549 10D TGGTCTTGAA CTCCTGGACT/---------- CTCCTGGACT 3070 hom 72 het 32 0 22 13 CTCCTGGACT 2 1 194282 CASAVA_Build 12 94381646 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1441 het 1441 ref 14 7 5 2 A 14 13 194283 CASAVA_Build 12 94382114 1D TTCAAAAAAT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 9 8 194284 CASAVA_Build 12 94383723 2D CATCTCAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2094 hom 24 8 13 3 A 16 14 194285 CASAVA_Build 12 94386244 1I ACCCAACATG -/T TTAGAGATAA 3070 het 2933 hom 31 8 15 8 T 2 3 194286 CASAVA_Build 12 94390029 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 24 0 17 7 A 13 14 194287 CASAVA_Build 12 94390941 4I ATTTAAAGAG ----/ATAA ATAAAGATCT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 ATAA 1 2 194288 CASAVA_Build 12 94393736 3I CAGTTCACGC ---/TTT TGTTTATCTT 3070 het 3070 ref 51 28 21 2 T 1 4 194289 CASAVA_Build 12 94395012 1D TTACTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2732 hom 31 11 10 11 T 11 10 194290 CASAVA_Build 12 94403085 1D CATTTTGTAG A/- TGAGGAAACT 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 A 1 0 194291 CASAVA_Build 12 94432798 1I GGTTTGGATT -/A CTTAACATTA 2551 het 2551 ref 22 14 6 2 A 0 1 194292 CASAVA_Build 12 94434756 4I CTACAGGATA ----/CTAT CTATCTTTCA 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 CTAT 1 2 194293 CASAVA_Build 12 94435397 1D CCAGCCATCA T/- TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 7 6 194294 CASAVA_Build 12 94436843 1I GGACTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 11 12 194295 CASAVA_Build 12 94437118 2I TGCTCAATGT --/AC ACAAACTTTG 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AC 1 2 194296 CASAVA_Build 12 94445005 1I TGGATCATTC -/T TTTTTTTTTT 1317 het 175 hom 15 3 7 5 T 15 16 194297 CASAVA_Build 12 94456451 1I CATTTTAAAA -/G GGGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 22 8 12 2 G 8 9 194298 CASAVA_Build 12 94471530 6I AGACTGTTCT ------/AATGGA ACCTCCTGTA 3070 hom 54 het 21 0 17 4 AATGGA 0 1 194299 CASAVA_Build 12 94471668 10D ACAGCAGAAT ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 het 968 hom 29 5 16 9 AC 11 6 194300 CASAVA_Build 12 94475476 1I CTCCAGACTC -/T TTTTTTTTTT 2787 het 2787 ref 40 17 11 12 T 10 11 194301 CASAVA_Build 12 94479877 5D CCTTTTTTTT TTTTG/----- TTTTGTTTAA 3070 het 3070 hom 33 15 12 8 TTTTG 2 1 194302 CASAVA_Build 12 94481168 1D CACATACCTG A/- ATATATCTTG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 2 1 194303 CASAVA_Build 12 94481302 1I TCCGCTTTTC -/T TTTCTTTTTC 3070 het 390 hom 32 6 14 12 T 3 4 194304 CASAVA_Build 12 94486050 2D AACATACATT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TC 9 8 194305 CASAVA_Build 12 94489391 7D CTCTAAAAAA AAAATGT/------- AAAAAAGAGA 75 het 75 ref 34 21 3 13 AAAATGT 1 0 194306 CASAVA_Build 12 94490404 2D TTTTGTAGGA AC/-- AGAGTTTCTC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 AC 1 0 194307 CASAVA_Build 12 94495743 1I TCTAGATTGG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 194308 CASAVA_Build 12 94496472 1D TGGTTCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 25 1 12 12 T 15 14 194309 CASAVA_Build 12 94515327 4I ACACACACAC ----/ATGT GTGTATATAT 1500 het 1500 ref 19 9 8 2 ATGT 0 1 194310 CASAVA_Build 12 94520381 2I ATTGGTTCAG --/GT GTTGGCAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GT 1 2 194311 CASAVA_Build 12 94525581 1I TCTTATAAAA -/G CTCTTTTGAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 0 1 194312 CASAVA_Build 12 94526506 3I TGGAGAAAAA ---/TAT TATTATTATC 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 TAT 3 4 194313 CASAVA_Build 12 94526796 1I TGGTGCTTTT -/C TTCTGTGATT 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 C 0 1 194314 CASAVA_Build 12 94526997 2I CTAAAAATCC --/AA AAAATAGCCA 2751 het 2751 ref 17 10 7 0 A 4 6 194315 CASAVA_Build 12 94528510 1D GAAAATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 11 10 194316 CASAVA_Build 12 94528592 2I ATAAACTCAC --/AT GTTTTACTAT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 AT 0 1 194317 CASAVA_Build 12 94534485 2I CTTTTTTGAG --/AC AGAGTCTCAC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 AC 0 1 194318 CASAVA_Build 12 94537338 1D GCCCAGCTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1432 hom 31 6 18 7 T 10 9 194319 CASAVA_Build 12 94545153 1I TGGCTTTTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 8 9 194320 CASAVA_Build 12 94554164 2I TAAGAAGTAA --/CT CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 CT 1 2 194321 CASAVA_Build 12 94559374 1I TGCAGCTGCT -/G GGAGGGCCAG 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 G 2 3 194322 CASAVA_Build 12 94566607 2D AGGTGCGTGG CA/-- CCATGCCCGG 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 CA 1 0 194323 CASAVA_Build 12 94569917 12D CGAAAAAATT AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2140 het 2140 ref 23 16 8 1 A 26 14 194324 CASAVA_Build 12 94573660 4I TAATAGTAAC ----/CTAT CTATCTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 CTAT 1 2 194325 CASAVA_Build 12 94579753 1D GTGCTAGAAT A/- AAAAAAGAGT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 A 7 6 194326 CASAVA_Build 12 94581036 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 9 10 194327 CASAVA_Build 12 94582503 4D CAAATTTATT AATC/---- AATCAAAGAC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AATC 2 1 194328 CASAVA_Build 12 94584851 1D GAAACAAAAA G/- TCTGTGCATA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 G 1 0 194329 CASAVA_Build 12 94586379 2I TGTACATTTC --/AA AAGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 2 4 194330 CASAVA_Build 12 94587511 1I AAGTCTCCCA -/C CCAATAAGCC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 2 3 194331 CASAVA_Build 12 94588079 4D TAAAAATGGT GTTA/---- GTTATTAGAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 GTTA 2 1 194332 CASAVA_Build 12 94588735 27D ATTTAAAAGG GACTTTGAAGAATAAGTAGAATATTTT/--------------------------- CTCCCAATAG 3070 hom 114 het 38 0 39 2 GACTTTGAAGAATAAGTAGAATATTTT 1 0 194333 CASAVA_Build 12 94589983 2D ATCCCAGCAC TT/-- TGGGAGGTCG 3070 het 3070 hom 23 8 12 4 T 3 1 194334 CASAVA_Build 12 94590488 1I GCGGCACTAT -/G GGGGGTCTGA 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 G 5 6 194335 CASAVA_Build 12 94591536 2D TTACTTTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 24 0 13 11 A 12 10 194336 CASAVA_Build 12 94592070 1I AGACTCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 10 11 194337 CASAVA_Build 12 94593388 3I CATAATAAAA ---/TGT TGTTGGGAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 TGT 1 2 194338 CASAVA_Build 12 94594320 1D AGCCCCGGGT A/- AAAAAAAAAA 1938 het 1938 ref 16 9 4 3 A 12 11 194339 CASAVA_Build 12 94595276 4D CAATGGTTTT ATAG/---- ATAAATTCTA 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 ATAG 1 0 194340 CASAVA_Build 12 94609232 1D CAAGAACTTA T/- TTTTTCACAA 3070 hom 117 het 42 0 40 3 T 6 5 194341 CASAVA_Build 12 94611643 1D GTCTCAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 19 1 8 10 A 16 15 194342 CASAVA_Build 12 94613818 4I TCTCTCCCTT ----/CCTC CCTCCCTCCC 1420 het 1420 ref 37 13 5 19 CCTC 4 5 194343 CASAVA_Build 12 94624201 4I AGTAACAAAA ----/AAAC AAAACTAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 AAAC 0 1 194344 CASAVA_Build 12 94626679 2D TATCTTATAT AC/-- ACACACTTTG 3070 hom 65 het 28 0 21 7 AC 4 3 194345 CASAVA_Build 12 94628264 3D CAATGACCTC CTT/--- CTTTTGGGTT 3070 het 3070 hom 56 23 29 8 CTT 2 1 194346 CASAVA_Build 12 94641200 3D CTCCCTGTGC CCA/--- CCACCAAGAG 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 CCA 3 2 194347 CASAVA_Build 12 94644879 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3059 het 2202 hom 19 9 9 2 A 12 11 194348 CASAVA_Build 12 94650395 2D TCACTGCAAA CT/-- CTGCCTCCTG 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 CT 2 1 194349 CASAVA_Build 12 94664296 1D TTTAACTAGA C/- CCCCCCCTCC 1114 het 1114 ref 14 8 5 1 C 8 7 194350 CASAVA_Build 12 94665092 5D AAAAATTTGA AAAAG/----- AAAATATAAG 3070 het 3070 hom 29 12 16 2 AAAAG 1 0 194351 CASAVA_Build 12 94675598 1D AAAATAATAC A/- AAAAAAAAAA 2154 het 2154 ref 29 13 6 11 A 13 12 194352 CASAVA_Build 12 94675644 6I TAGTGAAAAT ------/TCATTA TCATTATCAT 2639 het 2639 ref 28 13 7 8 TCATTA 1 2 194353 CASAVA_Build 12 94681230 1I AATGGCTGAT -/G GCCCATTCAT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 G 1 2 194354 CASAVA_Build 12 94683330 3D CCAAGACTGA TGT/--- TGTCCTCTAA 3070 het 3070 hom 54 17 33 5 TGT 2 1 194355 CASAVA_Build 12 94687632 1D TGTTGTTACA G/- GTGCATACTC 2969 het 2969 ref 36 21 9 7 G 2 1 194356 CASAVA_Build 12 94690900 7D AATGGCTTTT TTTTTTC/------- TTTTTTCTTT 3070 hom 46 het 24 0 16 10 TTTTTTC 3 2 194357 CASAVA_Build 12 94692095 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 21 1 14 6 A 0 1 194358 CASAVA_Build 12 94711398 2D AGCCTGGGCA AC/-- AGAGTGAGAC 3070 het 2820 hom 17 6 10 2 AC 1 0 194359 CASAVA_Build 12 94711945 3D TTTTTGGCAC TGT/--- TGTTCTATTT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TGT 2 1 194360 CASAVA_Build 12 94712846 1D GTTTTCAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2621 hom 37 7 18 12 A 13 12 194361 CASAVA_Build 12 94713243 1D GGGCAAGAAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 T 7 6 194362 CASAVA_Build 12 94717833 1D GGTGCTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 12 11 194363 CASAVA_Build 12 94723673 1D AACTTAACTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 A 8 7 194364 CASAVA_Build 12 94727844 2D GGAAAGTTGC AG/-- AGACATAATA 3070 het 3070 ref 31 13 13 6 AG 2 1 194365 CASAVA_Build 12 94743114 5I AACCCAGGAC -----/TACTA CTACTCTGTG 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 TACTA 0 1 194366 CASAVA_Build 12 94766316 1I TCCACCCCCC -/T TTTTTTTTGG 1623 het 1623 ref 15 4 9 2 T 8 9 194367 CASAVA_Build 12 94774455 1I GATATCTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 10 8 A 10 11 194368 CASAVA_Build 12 94777135 1I TCTGCTTTTA -/G GGTTTCTGAG 3070 hom 30 het 14 0 10 4 G 2 3 194369 CASAVA_Build 12 94779648 4D ACTGACTGTA TGTC/---- TGTCAAACGA 3070 het 3070 ref 44 27 15 2 TGTC 2 1 194370 CASAVA_Build 12 94793349 2I ATCATTAAGA --/GT GTGGAAGTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GT 1 2 194371 CASAVA_Build 12 94795204 4D GTGCACACTT ACAC/---- ACAGACATAT 3070 het 3070 ref 24 14 10 2 AC 3 1 194372 CASAVA_Build 12 94798563 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 2700 het 2700 ref 21 9 8 4 A 13 14 194373 CASAVA_Build 12 94803702 3D TCACTGCATC AAT/--- AATGCCTATG 3070 het 3070 ref 49 28 16 11 AAT 2 1 194374 CASAVA_Build 12 94805116 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 9 10 194375 CASAVA_Build 12 94806873 1D AAAGAAGGGG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 7 194376 CASAVA_Build 12 94813319 1I TTGTTTATTA -/T TTCTGTAGGA 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 2 3 194377 CASAVA_Build 12 94814735 1I CACCTTTCTA -/G GATGATGTGA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 G 1 2 194378 CASAVA_Build 12 94839657 8D CTTAAATCAG AGATAGGA/-------- AGATAGGAAG 3070 het 3070 ref 49 21 21 13 AGATAGGA 2 1 194379 CASAVA_Build 12 94848882 4D CATTACTAAT TAAC/---- AACCTTGAGA 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 TAAC 1 0 194380 CASAVA_Build 12 94854443 1D CTGTTGAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 9 8 194381 CASAVA_Build 12 94858797 5D ACAAACAAAC AAACA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 10 11 8 AAACA 1 0 194382 CASAVA_Build 12 94863693 1D ACAGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 19 9 T 11 10 194383 CASAVA_Build 12 94868785 1I CTACTAGTGT -/A AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 31 16 14 1 A 6 7 194384 CASAVA_Build 12 94876975 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 11 24 7 A 10 9 194385 CASAVA_Build 12 94877869 9I CATGCCCCGA ---------/TAATTTTTG TACTTTTAGT 1454 het 1454 ref 17 12 4 1 TAATTTTTG 0 1 194386 CASAVA_Build 12 94880180 2I CTCAAAAATA --/AC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 AC 0 1 194387 CASAVA_Build 12 94880412 1I TCACCCCAGA -/C CCAAGAGCTG 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 C 2 3 194388 CASAVA_Build 12 94891733 1D AAGCAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 28 1 19 10 A 15 14 194389 CASAVA_Build 12 94898153 2D GTCTTCAAAT GG/-- AGATTTGGAA 3070 hom 111 het 43 0 38 7 G 2 0 194390 CASAVA_Build 12 94909156 1D GAACTAGCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 9 8 194391 CASAVA_Build 12 94918445 2D TCCTGACCTC AG/-- GTGATTCACC 3070 het 2552 hom 16 6 9 1 AG 1 0 194392 CASAVA_Build 12 94921982 1I ATTGCACACT -/A AAGTAAATTC 3070 het 3070 hom 33 17 15 1 A 2 3 194393 CASAVA_Build 12 94923667 1D TTTAAAAAAA T/- TTTTTTATGA 2432 het 2432 ref 27 15 6 6 T 7 6 194394 CASAVA_Build 12 94941232 2I GGTGATACGT --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 TA 4 5 194395 CASAVA_Build 12 94953569 1D AGGAAGTTTC T/- TAAAGTCAGA 3070 het 3070 hom 44 12 20 13 T 2 1 194396 CASAVA_Build 12 94954021 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTAGCTGT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 5 4 194397 CASAVA_Build 12 94955671 3I GGCGCAATCT ---/CGG CGGCTCACAC 3070 het 3070 ref 24 12 7 5 CGG 1 2 194398 CASAVA_Build 12 94962879 1D CCTCCAGTCT G/- GGCTAGAGTC 3070 hom 99 het 38 0 30 8 G 3 2 194399 CASAVA_Build 12 94966067 1I TCCAAGCTGC -/T TCCCCTTGGC 3070 het 2844 hom 26 9 13 4 T 1 2 194400 CASAVA_Build 12 94987125 2D TTGTTGCCAC AG/-- AGGTAAGCAT 3070 hom 96 het 36 0 31 6 AG 2 1 194401 CASAVA_Build 12 94987533 1D GGGATGTGAG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 141 het 51 0 46 5 A 7 6 194402 CASAVA_Build 12 94989603 1D CATGGTGAAA C/- CCTGTCTCTA 3070 het 428 hom 11 1 8 2 C 3 2 194403 CASAVA_Build 12 94997338 1D CCTGTTACGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 296 hom 27 1 20 6 T 11 10 194404 CASAVA_Build 12 95000485 1I CTGTCTCAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 25 hom 44 1 34 9 A 8 9 194405 CASAVA_Build 12 95014387 2D TTGCACAGTG TA/-- TATATAGTAG 3070 hom 117 het 47 0 39 13 TA 4 3 194406 CASAVA_Build 12 95019807 7D ACAAACACAC TTAACTA/------- TTATACTAGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 TTAACTA 1 0 194407 CASAVA_Build 12 95029319 1I TAGGCTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3022 hom 42 16 19 7 T 10 11 194408 CASAVA_Build 12 95034418 1D ACCCGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 2741 het 1274 hom 20 6 9 5 T 13 12 194409 CASAVA_Build 12 95036470 25D GCATGATCTC GGCTCACTGCAACCTCCACCTCCAG/------------------------- GGCTCAAGCA 2139 het 2139 ref 30 18 11 6 GGCTCACTGCAACCTCCACCTCCAG 1 0 194410 CASAVA_Build 12 95056138 2D TATATATCAA AG/-- AGATTTATAT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 AG 2 1 194411 CASAVA_Build 12 95061425 4I GAGAAATTGA ----/TTGT TTGGGGGATA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 TTGT 0 1 194412 CASAVA_Build 12 95071960 8I AGGAGGTAGC --------/AAGGGAGG AAGGGAGGAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 AAGGGAGG 1 2 194413 CASAVA_Build 12 95079069 1I AAAGCCTCTC -/T ATTTTAATAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 0 1 194414 CASAVA_Build 12 95103245 3I TTTTCTAATA ---/ATT ATTATTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ATT 2 3 194415 CASAVA_Build 12 95110430 1D ACTGTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 32 1 22 9 T 12 11 194416 CASAVA_Build 12 95113191 1D GTGTGGGGCT G/- GGGGCTGCGT 2912 het 1589 hom 21 8 8 5 G 5 4 194417 CASAVA_Build 12 95114331 1D CTTTGGGGGT G/- GGGGGGGTGT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 8 7 194418 CASAVA_Build 12 95122079 1D CAATGTAAAG T/- TTTTTTTTTT 1339 het 1339 ref 43 32 3 8 T 11 10 194419 CASAVA_Build 12 95131831 3I GATGGGGGTC ---/TCA TCGTGTTGCC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TCA 0 1 194420 CASAVA_Build 12 95131878 3D AACTGTCCTC CCT/--- CCTCGGTCTC 3070 het 3070 hom 35 10 11 15 CCT 2 1 194421 CASAVA_Build 12 95132365 3D ACAAACAAAC AAA/--- AAAAAAAACA 3070 het 2826 hom 20 8 10 2 A 11 8 194422 CASAVA_Build 12 95144425 12D ACACCCATGC CCACACAGATGT/------------ CCACATGTCC 3070 het 2234 hom 56 17 33 20 CCACACAGATGT 1 0 194423 CASAVA_Build 12 95150667 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 8 7 194424 CASAVA_Build 12 95160583 1D TGGGCACCGC T/- GTGGGGGGCT 2489 het 2489 ref 33 13 11 9 T 1 0 194425 CASAVA_Build 12 95162549 1I TCGCTGAGGG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 7 8 194426 CASAVA_Build 12 95173918 1D AACCTCAAAT C/- TGGGGCTAAG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 C 1 0 194427 CASAVA_Build 12 95179927 1D TGATAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 1395 het 120 hom 17 1 7 9 T 19 18 194428 CASAVA_Build 12 95184467 5D AGCTCCAAAA TAATC/----- TATTCTAAAT 3070 het 3070 hom 24 10 14 2 TAATC 1 0 194429 CASAVA_Build 12 95185742 5D AAACATTGAT AAAAG/----- AAAATGTTCT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 AAAAG 1 0 194430 CASAVA_Build 12 95189698 2I GGATAAAGAA --/GT GAGCAAAATG 3070 hom 141 het 48 0 48 0 GT 0 1 194431 CASAVA_Build 12 95190125 1D CCTGAGGAGT A/- AATGACACAG 3070 hom 166 het 62 0 56 7 A 3 2 194432 CASAVA_Build 12 95194172 1D ATGGTGCTGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 9 8 194433 CASAVA_Build 12 95209032 1D CTATGCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 34 1 19 14 A 17 16 194434 CASAVA_Build 12 95210753 1I CAGATTAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 A 10 11 194435 CASAVA_Build 12 95215487 1I CCAATTTACT -/A ATGTTTTTCT 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 A 1 2 194436 CASAVA_Build 12 95218834 1D ATTCTGTCAT G/- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 8 G 1 0 194437 CASAVA_Build 12 95222449 3I TGTCTCAAAA ---/AAC AACAACAAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AAC 2 3 194438 CASAVA_Build 12 95222755 1I CTGAGAGATG -/T TAAGGACTTG 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 T 1 2 194439 CASAVA_Build 12 95224934 1I GCCAGGCGCA -/G GGGGCTCACG 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 G 4 5 194440 CASAVA_Build 12 95227210 1D TTTTGACTGA C/- AAATTTCTGC 3070 het 3070 hom 36 11 21 5 C 1 0 194441 CASAVA_Build 12 95229090 1D TTAAATCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 13 12 194442 CASAVA_Build 12 95241186 1I CTAAAAAAAA -/C AAAAAAAACA 1848 het 498 hom 12 3 8 1 C 0 1 194443 CASAVA_Build 12 95241534 1I AATAGGCTTT -/A ATATGGTGAT 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 A 1 2 194444 CASAVA_Build 12 95248204 1D CAGTGACAGC A/- AAAAAAAAAA 1689 het 1689 ref 32 18 5 9 A 12 11 194445 CASAVA_Build 12 95260873 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 9 12 8 A 11 12 194446 CASAVA_Build 12 95264364 4D CTATCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AAAT 5 4 194447 CASAVA_Build 12 95269228 2D GGGATATACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 582 hom 42 5 22 16 A 13 11 194448 CASAVA_Build 12 95270302 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 1129 het 1129 ref 44 29 5 10 A 12 11 194449 CASAVA_Build 12 95275164 1I AGGCCAGGAG -/T TTTGAGACTA 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 T 3 4 194450 CASAVA_Build 12 95286015 1D GTTCAATAGG A/- AAAAAAAAAG 2367 het 2367 ref 49 38 6 6 A 10 9 194451 CASAVA_Build 12 95286716 7D ACTCTAAGAC GGGGGGG/------- GGGGGGGGGG 3070 hom 14 het 13 0 11 3 G 18 11 194452 CASAVA_Build 12 95287394 1I ATTTCTTTTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 7 8 194453 CASAVA_Build 12 95295605 2D TTTTTTTTCG TT/-- TTTTTTTTTT 1255 het 736 hom 20 5 4 11 T 16 14 194454 CASAVA_Build 12 95298084 1D TCCCCCGACC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 22 4 A 10 9 194455 CASAVA_Build 12 95300873 3D TGAATAGAGA AAG/--- AAGACATCAA 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 AAG 2 1 194456 CASAVA_Build 12 95301969 1D AATCCACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 A 10 9 194457 CASAVA_Build 12 95306936 6D TCACTTTTTT TTATTA/------ TTATTATTAT 2363 het 1918 hom 15 6 5 5 TTA 6 4 194458 CASAVA_Build 12 95309195 1D TTGTTTTTGA T/- TTTTTTTTTC 2748 het 632 hom 21 6 10 5 T 10 9 194459 CASAVA_Build 12 95316047 1I AAGACTCCCG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 9 10 194460 CASAVA_Build 12 95319975 1D CACCAAAAAA G/- GGAGTCTATG 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 G 3 2 194461 CASAVA_Build 12 95320316 1D TTGTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 32 3 13 16 T 12 11 194462 CASAVA_Build 12 95321505 1I TAATATAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 10 11 194463 CASAVA_Build 12 95323541 1D TGTCTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 A 13 12 194464 CASAVA_Build 12 95331404 1I AATTGGGGAT -/C GGGGGGGTGT 3070 het 3070 hom 34 16 12 6 C 0 1 194465 CASAVA_Build 12 95336221 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1837 hom 19 6 11 2 A 11 12 194466 CASAVA_Build 12 95344200 1I AGGTACTTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 44 het 18 0 15 3 T 8 9 194467 CASAVA_Build 12 95351270 3I AGGCTGAAGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 30 het 11 0 8 3 AGG 0 1 194468 CASAVA_Build 12 95357316 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 31 0 26 5 A 9 8 194469 CASAVA_Build 12 95377831 1I TTTTTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 1844 het 1219 hom 14 5 8 1 T 10 11 194470 CASAVA_Build 12 95378564 2I TCACAGAAAA --/CT CTGAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 CT 1 2 194471 CASAVA_Build 12 95378671 1I TTGGGTCCAT -/A ATATTTGGGT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 1 2 194472 CASAVA_Build 12 95388725 1D CCTTGCCTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 20 14 10 T 9 8 194473 CASAVA_Build 12 95390837 2I AAAAAAGAAG --/AA AAAAAAAAAT 1986 het 1986 ref 18 8 7 3 A 9 11 194474 CASAVA_Build 12 95392545 1D TAATTTAAAA T/- TGTCTAGTAG 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 2 1 194475 CASAVA_Build 12 95396446 3I CCTCAAACAA ---/TCC TCCTGCCTTG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 TCC 1 2 194476 CASAVA_Build 12 95408693 1D35M2D ATCAAGTGCT GTTCAAGGAACTAGGAAAACATCAAGTTAACAAAACAT/-TTCAAGGAACTAGGAAAACATCAAGTTAACAAAAC-- ATAAGAATCC 3070 het 3070 ref 15 11 9 2 N/A 0 0 194477 CASAVA_Build 12 95413050 4D GAAATATCTT TAAA/---- TAAGAGTATG 3070 het 3070 ref 44 27 14 4 TAAA 1 0 194478 CASAVA_Build 12 95426213 1D TTTTTTTTTT G/- AGATGGAGTC 1226 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 0 194479 CASAVA_Build 12 95430209 38D GGGAACCAAT TTTATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------- TATATATATA 1660 het 106 hom 9 3 5 1 TTTATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 194480 CASAVA_Build 12 95434911 1D CTTTTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2615 hom 33 9 13 11 T 15 14 194481 CASAVA_Build 12 95443071 1I TTTGTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 T 10 11 194482 CASAVA_Build 12 95445459 1D ATTTATATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 34 1 25 8 T 13 12 194483 CASAVA_Build 12 95446140 1I TTGCTAAGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 23 12 9 T 9 10 194484 CASAVA_Build 12 95451910 1D ATCCTCCTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 T 10 9 194485 CASAVA_Build 12 95453332 1I ATTTGTGTCA -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 T 7 8 194486 CASAVA_Build 12 95456002 1D GCCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 18 15 4 A 10 9 194487 CASAVA_Build 12 95461511 3I TGTAATGGAC ---/ATT ATTATTGCTA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 ATT 2 3 194488 CASAVA_Build 12 95462140 1I CATGACTCCC -/A TAGTTCTTAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 0 1 194489 CASAVA_Build 12 95462397 1I TTCTCTCCAA -/G GGATGGCCAT 3024 het 3024 ref 28 16 7 5 G 2 3 194490 CASAVA_Build 12 95464713 6I CCTCTAGCCT ------/GGTCAA GGTCAACAGT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 GGTCAA 1 2 194491 CASAVA_Build 12 95475045 1I TTTCCTTGTC -/T TTTTCCAGCT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 4 5 194492 CASAVA_Build 12 95486988 1I AAATATAGTA -/T TCATTATGTG 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 T 1 2 194493 CASAVA_Build 12 95492491 1D AATGAATGTT A/- AAAAATGTTT 3070 het 3070 ref 42 24 13 6 A 6 5 194494 CASAVA_Build 12 95499583 2D TATCTAATTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 AT 8 7 194495 CASAVA_Build 12 95502548 1I TTGAAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 22 20 9 T 12 13 194496 CASAVA_Build 12 95502949 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 495 hom 32 2 20 11 T 13 12 194497 CASAVA_Build 12 95506590 3D ATACCTTAGC TGT/--- TTCCATAAAG 3070 het 3070 ref 40 22 18 0 TGT 1 0 194498 CASAVA_Build 12 95508877 4D AGATCTTGAA AATG/---- AATGGTATCT 3070 het 3070 ref 47 24 22 3 AATG 2 1 194499 CASAVA_Build 12 95511597 2I ATAATCTTGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 AT 6 7 194500 CASAVA_Build 12 95516016 6I TTTGAAAAGC ------/TAAACT TATTCGTCTA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 TAAACT 0 1 194501 CASAVA_Build 12 95520075 1I GTCTTTGTTC -/T CATTGCTTTC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 194502 CASAVA_Build 12 95523958 1I GTGATTTAGT -/G GGGGGGGTGA 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 G 7 8 194503 CASAVA_Build 12 95530213 1D CATAAGTGAA G/- GAAAAATAAA 2538 het 988 hom 8 2 6 0 G 2 1 194504 CASAVA_Build 12 95536535 1I GGTTTGGGCC -/A GCCACTGAAG 3070 hom 88 het 34 0 27 7 A 0 1 194505 CASAVA_Build 12 95537387 1D AGCATCAGTA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 8 7 194506 CASAVA_Build 12 95539359 1D GGAGGTAAAC T/- TACGGTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 2 1 194507 CASAVA_Build 12 95546838 1D ATATAAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 13 22 11 A 12 11 194508 CASAVA_Build 12 95547584 1I GGCATTTAAA -/T TCTTCCTAAT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 1 2 194509 CASAVA_Build 12 95548148 1D TTTAGGTAAT G/- AAATTAAGAG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 1 0 194510 CASAVA_Build 12 95548293 1D TATAATCAGA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 8 7 194511 CASAVA_Build 12 95549384 1D AATTTGCTTT G/- GAAATTTGCC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 G 2 1 194512 CASAVA_Build 12 95561307 8D TATGTGTGTA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 34 0 31 5 TG 10 6 194513 CASAVA_Build 12 95569804 1D GTAGAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 11 10 194514 CASAVA_Build 12 95571749 3I TAAATTAAAA ---/ATT ATTAAATCTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ATT 1 2 194515 CASAVA_Build 12 95572120 1I TTTTTATTTG -/T GAAAATTTAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 194516 CASAVA_Build 12 95572941 1I GTGAATGGCC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 7 8 194517 CASAVA_Build 12 95574294 1I GCTTTGTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 10 11 194518 CASAVA_Build 12 95575764 1D AAATTACACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 42 0 33 9 T 10 9 194519 CASAVA_Build 12 95576526 1D CCCAGAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 11 10 194520 CASAVA_Build 12 95578979 1I GTCCTTTGGG -/T GTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 0 1 194521 CASAVA_Build 12 95581405 1I GAAAAATCTG -/C CATTGGGAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 1 2 194522 CASAVA_Build 12 95583021 1D CACATGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 13 1 11 1 T 11 10 194523 CASAVA_Build 12 95594922 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 444 hom 22 1 20 1 T 8 9 194524 CASAVA_Build 12 95596087 1D TTTCTACTCC T/- GACCATTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 17 6 T 1 0 194525 CASAVA_Build 12 95603468 1D GTTGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2721 hom 28 9 13 7 T 11 10 194526 CASAVA_Build 12 95610311 1D AGAAATGAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 10 9 194527 CASAVA_Build 12 95620133 10D6M1D TCCAGATAGG AGCATGTTAAGTATGAG/----------GGTTGA- ACATGTTAAG 3070 het 3070 ref 43 24 19 4 N/A 0 0 194528 CASAVA_Build 12 95620473 2D TGAAATAAAT AA/-- AAACAAAAGT 3070 het 3070 ref 42 16 19 8 A 5 3 194529 CASAVA_Build 12 95623856 1D AACAATGGAA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 47 14 27 6 T 8 7 194530 CASAVA_Build 12 95624993 3I GAGGTATAGG ---/AGA AGAAGAAGAA 3070 het 3070 ref 44 17 11 16 AGA 3 4 194531 CASAVA_Build 12 95625173 1I TTAACTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 25 22 7 T 10 11 194532 CASAVA_Build 12 95626832 4D TCTCTATGCT TATA/---- TAATGACACA 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 TA 3 1 194533 CASAVA_Build 12 95628573 1D ACATACAGAA T/- TTTTTTTTTT 1300 het 1300 ref 31 19 3 9 T 13 12 194534 CASAVA_Build 12 95633185 1D GTGAGAAGAG T/- TAGCATCGTT 3070 het 3070 hom 44 17 18 10 T 2 1 194535 CASAVA_Build 12 95673852 6D TGGGATTACA AGCGTG/------ AGCCACCACG 3070 het 2266 hom 25 8 11 8 AGCGTG 1 0 194536 CASAVA_Build 12 95679434 1I GATTGTGGGG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 8 9 194537 CASAVA_Build 12 95680681 1D ATGATTAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 T 10 9 194538 CASAVA_Build 12 95687088 1D GTATATACTC T/- TATCATTTTG 3070 het 3070 hom 47 15 26 8 T 2 1 194539 CASAVA_Build 12 95697017 2D TCTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1387 het 815 hom 22 9 7 6 A 18 16 194540 CASAVA_Build 12 95711812 1D TTTGATGGGA T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 T 7 6 194541 CASAVA_Build 12 95741032 2D TGTGTTTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 TG 7 6 194542 CASAVA_Build 12 95768615 1D AAGGAGGTTT A/- ATTGACTCAC 3070 het 3070 ref 42 25 15 3 A 2 1 194543 CASAVA_Build 12 95775353 1D CTAGCTTCAT C/- CATGTTCCAC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 C 2 1 194544 CASAVA_Build 12 95777302 1D TGCACTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 G 1 0 194545 CASAVA_Build 12 95797744 1I CTAATCCAGA -/T TTTTTTTTTT 1334 het 1334 ref 29 11 5 13 T 15 16 194546 CASAVA_Build 12 95801890 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATG 1856 hom 20 het 13 0 8 5 TA 4 5 194547 CASAVA_Build 12 95809581 1D AATAAAAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 10 9 194548 CASAVA_Build 12 95810111 24D TTGTTCTCCC TTTCAGCCCAATAAACTGAACTCT/------------------------ TTTCAGCCCA 3070 het 3070 ref 40 23 13 13 TTTCAGCCCAATAAACTGAACTCT 1 0 194549 CASAVA_Build 12 95815929 3D AGGGCCTGGG GGC/--- GGGGGGGGGG 3070 hom 4 het 19 0 9 10 GGC 1 0 194550 CASAVA_Build 12 95827814 1D AGTATCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2405 hom 38 8 20 10 A 12 11 194551 CASAVA_Build 12 95841259 2D TTTAAGATAC AT/-- GTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 62 23 33 6 AT 1 0 194552 CASAVA_Build 12 95844898 2D AAAAAAAAAT TG/-- TGTGTGTGTG 1984 het 1984 ref 25 9 6 10 TG 10 9 194553 CASAVA_Build 12 95850476 1I TTTTGTTTAT -/C CCAGGATTCT 2422 het 1868 hom 11 6 5 0 C 2 3 194554 CASAVA_Build 12 95860815 1I GGCTGGAGAT -/A ATCAGTTCCA 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 A 1 2 194555 CASAVA_Build 12 95873022 1I AATTAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 22 0 19 3 T 13 14 194556 CASAVA_Build 12 95875183 1D TCTAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 44 2 34 9 A 13 12 194557 CASAVA_Build 12 95879793 4D TCAAAGAACT CCAA/---- CTAAGATAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 4 CCAA 1 0 194558 CASAVA_Build 12 95895075 2D TTTTTCCTCC CT/-- GTGTCGGTTG 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 CT 1 0 194559 CASAVA_Build 12 95896019 1D TGCCTTCATC T/- TTGTGGTTCA 3070 het 3070 hom 38 15 22 1 T 3 2 194560 CASAVA_Build 12 95899325 1D CTGAACTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 17 12 A 15 14 194561 CASAVA_Build 12 95908310 1D AATTGTTTTT C/- TCTCTTGCAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 C 1 0 194562 CASAVA_Build 12 95913014 1I CTTCTGTCCT -/C CCCCCCCGAA 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 C 7 8 194563 CASAVA_Build 12 95930618 2D GCTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3028 hom 26 10 12 6 TA 1 0 194564 CASAVA_Build 12 95942010 1I AAAATACCAA -/C ATTATAAAGA 3070 hom 135 het 54 0 46 8 C 0 1 194565 CASAVA_Build 12 95945125 1I TCATCAGAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 8 9 194566 CASAVA_Build 12 95949100 7D GACTGGGGAG AAGGCCT/------- CTTTCCTGTG 3070 het 3070 ref 36 23 10 6 AAGGCCT 1 0 194567 CASAVA_Build 12 95951898 5I ATAATGCTAG -----/CTTTA CTTTATTAGG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 CTTTA 1 2 194568 CASAVA_Build 12 95952974 1D TTAAAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 11 10 194569 CASAVA_Build 12 95953993 1I TATTTCTAAG -/C CCATCTTCTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 2 3 194570 CASAVA_Build 12 95957013 1D AAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 784 hom 36 2 28 7 A 11 10 194571 CASAVA_Build 12 95959770 5D ACTCTGCCTC AAATA/----- AAATAAAATA 119 het 119 ref 17 12 3 2 AAATA 4 3 194572 CASAVA_Build 12 95969004 1D TTGGATTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2713 hom 28 10 12 6 A 11 10 194573 CASAVA_Build 12 95991847 2I CTGCAGACTC --/AT GTTTCTTCAG 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 AT 0 1 194574 CASAVA_Build 12 95996041 1D CCATTTCTTC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 8 7 194575 CASAVA_Build 12 95998988 1I TCCCCTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 23 21 11 T 10 11 194576 CASAVA_Build 12 96000764 1I CAGTAAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 T 10 11 194577 CASAVA_Build 12 96003097 12D ACTGCCTGTA TCACAGTCACAG/------------ TCACAGTCAC 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 TCACAG 3 1 194578 CASAVA_Build 12 96005678 1D TAGTCATAGC T/- TTTTCTATTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 5 4 194579 CASAVA_Build 12 96010245 4D ACACTTGTTT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 74 het 34 0 26 9 AC 15 13 194580 CASAVA_Build 12 96011459 1D TTAGGGGAAG A/- GGCTTTCTGT 3070 het 3070 ref 49 29 19 1 A 1 0 194581 CASAVA_Build 12 96014249 1I ATTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 10 11 194582 CASAVA_Build 12 96018332 1I TTGATGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 10 11 194583 CASAVA_Build 12 96018586 7I TCTGACCTCT -------/TTAATGA TTGGAGGGCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TTAATGA 0 1 194584 CASAVA_Build 12 96019142 1I TTTCTCACAG -/T TGTGGAGGCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 1 2 194585 CASAVA_Build 12 96021690 1I GAATTTTAGA -/T ATTTTTTTTT 2925 het 2409 hom 13 7 6 0 T 0 1 194586 CASAVA_Build 12 96022862 1D TTTTTGGTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 9 8 194587 CASAVA_Build 12 96027701 1D CCAAAAGTTA G/- TTACCTTTAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 G 1 0 194588 CASAVA_Build 12 96039704 1D ATCTCAATAA T/- TTTAGTGTTC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 4 3 194589 CASAVA_Build 12 96048290 1D ACCCAAGATG T/- TTCGTAAAGA 3070 het 3070 hom 44 16 17 13 T 3 2 194590 CASAVA_Build 12 96063332 2D GGTCCTGAGA CT/-- CTTCTGCTCA 3070 het 3070 ref 51 31 13 8 CT 2 1 194591 CASAVA_Build 12 96066424 1D ATAGGAAAAT G/- ATTCATATTC 3070 het 3070 hom 39 13 21 6 G 1 0 194592 CASAVA_Build 12 96080865 1D GTCTGGATGG T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 T 7 6 194593 CASAVA_Build 12 96084636 1I TGTTTATTTC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 41 22 15 6 T 6 7 194594 CASAVA_Build 12 96085564 1I TTTAAAAGAT -/A ACCATGTACC 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 A 1 2 194595 CASAVA_Build 12 96098522 1D TATAGATCAA G/- GGTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 G 3 2 194596 CASAVA_Build 12 96100912 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAGAAGAAGG 3070 het 2115 hom 28 12 9 9 AAAAG 1 0 194597 CASAVA_Build 12 96109146 1D AAAGGCACAT A/- AAAACCTTTA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 5 4 194598 CASAVA_Build 12 96112791 8I GTTGATGTTA --------/ATGAGGTG ACACTTGGAG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 ATGAGGTG 0 1 194599 CASAVA_Build 12 96112885 1I AGGGAGGGGG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 6 7 194600 CASAVA_Build 12 96128760 1I TTGCTGATGA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 63 26 28 9 T 7 8 194601 CASAVA_Build 12 96129610 2D TTTTGAATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3028 het 547 hom 36 4 10 22 T 17 15 194602 CASAVA_Build 12 96133468 1D AGGTAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 9 8 194603 CASAVA_Build 12 96147810 1D ACAAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 599 hom 32 3 22 7 A 16 15 194604 CASAVA_Build 12 96148369 1D GGCAGTAAAC A/- ATAAATTAAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 2 1 194605 CASAVA_Build 12 96148978 3D GACAGATAAT GTG/--- GTGCTCTGAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 GTG 2 1 194606 CASAVA_Build 12 96157792 8D ATATAGATTA TTATGCGT/-------- TTATTAAAGT 3070 het 3070 ref 28 21 7 4 TTATGCGT 1 0 194607 CASAVA_Build 12 96162136 1D TATGGGAATT A/- ACAATTTGAG 3070 hom 99 het 40 0 33 8 A 2 1 194608 CASAVA_Build 12 96225390 16D CTGCATCTCA AAACAAACAAACAAGC/---------------- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 16 8 8 3 AAACAAACAAACAAGC 2 1 194609 CASAVA_Build 12 96225931 68D TTTAAATGTT TTGTTACCAGCAATTGGTCAAACCAAAGGTGGAGAACCTCAAATACCAGTGTTCTTTTGGTTGTACTA/-------------------------------------------------------------------- TCAGGCAAAT 3070 het 3070 ref 38 41 14 5 TTGTTACCAGCAATTGGTCAAACCAAAGGTGGAGAACCTCAAATACCAGTGTTCTTTTGGTTGTACTA 1 0 194610 CASAVA_Build 12 96232089 1I CCCCTTGGCC -/A TGAGAACTGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 1 194611 CASAVA_Build 12 96232309 1I CCCTTTCCCA -/C CTTAATTATC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 1 2 194612 CASAVA_Build 12 96238724 13D TCTCTTTCTC TCTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 1743 het 1015 hom 16 4 10 2 TCTTTTTTTTTTT 1 0 194613 CASAVA_Build 12 96249514 1I TTGTGATCTT -/A AATTGTTTCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 3 194614 CASAVA_Build 12 96250554 1I ACAGTTTAAT -/A AAAAAATGGA 3070 het 375 hom 38 1 33 4 A 6 7 194615 CASAVA_Build 12 96250739 1D TTGCCAGATT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 8 7 194616 CASAVA_Build 12 96251463 1D TTACTTACAC T/- TTTTTTGGTG 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 7 6 194617 CASAVA_Build 12 96274156 1D CTAGAACACC T/- GTCCTGAGCC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 1 0 194618 CASAVA_Build 12 96278797 1I GCAAAATGTA -/G GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 12 9 G 5 6 194619 CASAVA_Build 12 96288412 1D TTAAAAATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 T 10 9 194620 CASAVA_Build 12 96292381 3D CTTCCTTCGT TTC/--- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 12 9 TTC 1 0 194621 CASAVA_Build 12 96292493 2D CCTTTCCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 2836 het 2836 ref 27 8 10 9 TC 7 6 194622 CASAVA_Build 12 96299312 2D GATGCATTCT GA/-- AAGGTCAGAA 3070 het 3070 ref 52 28 22 2 GA 1 0 194623 CASAVA_Build 12 96308590 1D TTTCTAAAAA G/- GGTTGTCCTT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 G 3 2 194624 CASAVA_Build 12 96309386 2D CACTTTGAAA CT/-- CTGAAAATTA 3070 het 3070 ref 56 28 22 6 CT 2 1 194625 CASAVA_Build 12 96316011 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 32 het 14 0 11 3 A 8 7 194626 CASAVA_Build 12 96316212 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAAGT 1151 het 184 hom 25 1 4 21 AAC 1 0 194627 CASAVA_Build 12 96316299 1I AGTTTAAAAG -/A AAAAAAAGCG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 7 8 194628 CASAVA_Build 12 96316500 1I ACTATTTTGT -/G GGAGGATTTC 3070 het 3070 hom 29 8 19 2 G 2 3 194629 CASAVA_Build 12 96317265 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 12 11 194630 CASAVA_Build 12 96325737 2D GATGAGCCAA CT/-- CTCTTACTTT 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 CT 3 2 194631 CASAVA_Build 12 96331889 1D ATGCAGAACT A/- AAAAAGATTT 3070 het 3070 ref 34 18 16 0 A 6 5 194632 CASAVA_Build 12 96332129 2I TGGTGAAACC --/CT GTCTCTACTA 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 CT 0 1 194633 CASAVA_Build 12 96374867 1D GTGACTATTC A/- ACAGGAGGAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 6 A 2 1 194634 CASAVA_Build 12 96387556 1D CTGAGATGAC T/- TAAAATCTAG 3070 het 3070 ref 47 27 12 8 T 2 1 194635 CASAVA_Build 12 96392642 1D AAATATGTGG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 8 7 194636 CASAVA_Build 12 96404262 8I GTGACATGGC --------/AAAGTCAT TACCTTGAAC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 AAAGTCAT 0 1 194637 CASAVA_Build 12 96416510 1D CATTATGATT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 8 7 194638 CASAVA_Build 12 96447503 2I CTGCGCAAAC --/TT TTTATTTTGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 5 194639 CASAVA_Build 12 96448918 2D CTCTGAAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 14 12 194640 CASAVA_Build 12 96466426 4I TGAACATGGG ----/CTAT CTATTTTAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CTAT 1 2 194641 CASAVA_Build 12 96509462 1D TAGTGCATAC T/- TTTTTTTTTT 2709 het 2709 ref 37 17 8 12 T 15 14 194642 CASAVA_Build 12 96518310 2I AGTTCTTATC --/CT CTGTTTCGCT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 CT 1 2 194643 CASAVA_Build 12 96556732 1I TGGGGATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 658 hom 25 3 16 6 T 15 16 194644 CASAVA_Build 12 96561303 2I AGTCTCTGAC --/CA TTTTCTCACT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 CA 0 1 194645 CASAVA_Build 12 96576914 2I TTTTTTTTTT --/AA TAATGAAGGA 1489 het 633 hom 24 3 4 17 A 0 2 194646 CASAVA_Build 12 96582481 1D CTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1014 hom 37 4 21 13 T 11 10 194647 CASAVA_Build 12 96617099 28D TGCTGTGTTC CCTTTGGAGGCTCTAGGGGAGAATCCAT/---------------------------- CCTTGCCTCT 3070 hom 120 het 34 0 41 3 CCTTTGGAGGCTCTAGGGGAGAATCCAT 1 0 194648 CASAVA_Build 12 96617789 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 26 1 23 2 A 11 10 194649 CASAVA_Build 12 96619029 1D TTTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 10 9 194650 CASAVA_Build 12 96628042 2I CGAGCTACCT --/GG GGGGGGCAGA 3070 het 3070 ref 33 14 16 3 G 6 8 194651 CASAVA_Build 12 96637482 5D TGCATTTTCA AAGTC/----- AAGTCAAGTC 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 AAGTC 3 2 194652 CASAVA_Build 12 96639408 2D TATCCTGCCC TT/-- TTTCTACCAA 3070 het 3070 ref 51 30 15 8 T 5 3 194653 CASAVA_Build 12 96655781 1D AGATTGCAGA G/- GGGATGCAGG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 G 4 3 194654 CASAVA_Build 12 96656089 6I TTTATTATTA ------/TATTTT AAGTTTTAAG 1333 het 1333 ref 17 6 3 8 TATTTT 0 1 194655 CASAVA_Build 12 96657865 3D AGAGCAAGAA AGG/--- AGGAGAGCTA 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 AGG 2 1 194656 CASAVA_Build 12 96661032 5D AAAATAAAAC AAGTT/----- AATACATATT 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 AAGTT 1 0 194657 CASAVA_Build 12 96665465 2I TGCCCCTTCT --/TA TATTTTATTA 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 TA 1 2 194658 CASAVA_Build 12 96666604 1I ATTCCTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 9 10 194659 CASAVA_Build 12 96669985 2D TTAAAATAAC AT/-- AGAACTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 AT 1 0 194660 CASAVA_Build 12 96676602 1I CATATCTTGA -/T TGCTTCCACT 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 T 1 2 194661 CASAVA_Build 12 96678532 1D TTGCAAGAGA C/- CCCCCAAAAG 3070 hom 108 het 40 0 35 5 C 6 5 194662 CASAVA_Build 12 96683930 1D AGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 12 11 194663 CASAVA_Build 12 96687604 1I CTGTAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 T 10 11 194664 CASAVA_Build 12 96691930 2D TTTCCAAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1424 hom 36 7 16 15 A 16 14 194665 CASAVA_Build 12 96693439 5D CTTAGCTGAT AAGAC/----- AAGGCAAGAA 2421 het 2421 ref 30 20 8 4 AAGAC 1 0 194666 CASAVA_Build 12 96697497 3D AAGAATATGA TAT/--- TATTGCGTGG 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 TAT 2 1 194667 CASAVA_Build 12 96703721 1I AAACAACAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 T 9 10 194668 CASAVA_Build 12 96703988 1I TAATATTGTT -/G AATTGGGGAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 0 1 194669 CASAVA_Build 12 96705513 4D CCATTTTATT ATTA/---- ATTAATAGTA 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 ATTA 2 1 194670 CASAVA_Build 12 96712014 2D TCTGAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 30 1 19 11 A 14 12 194671 CASAVA_Build 12 96714306 1I AGGACATCTG -/T TTTTTTAAAA 2654 het 2654 ref 27 12 7 8 T 6 7 194672 CASAVA_Build 12 96731424 3I GGACTCACTT ---/GAA GTCCCTAGGC 3070 hom 123 het 47 0 40 7 GAA 0 1 194673 CASAVA_Build 12 96735516 1D CTACTTTCTG A/- ACTTTACACC 2833 het 2833 ref 31 18 7 6 A 2 1 194674 CASAVA_Build 12 96736750 1I TTCTTCTTGT -/C TTCCTCTTAC 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 C 0 1 194675 CASAVA_Build 12 96757523 2I TAAAGTAACA --/CT CTTTTTATTA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 CT 1 2 194676 CASAVA_Build 12 96758186 1I TAAATAAAGC -/T TTTTTTTTTT 2793 het 102 hom 43 1 17 25 T 11 12 194677 CASAVA_Build 12 96762809 1I TGAACTGTTT -/C TATAAAAAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 0 1 194678 CASAVA_Build 12 96770693 1D AGGAATAGAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 9 8 194679 CASAVA_Build 12 96793887 2D GGGTAATAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 13 11 194680 CASAVA_Build 12 96794121 1D ACTTTCTGTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 9 8 194681 CASAVA_Build 12 96796438 3D ATGATGATGA TGG/--- TGGTGGTGGT 3070 hom 112 het 42 0 38 4 TGG 4 3 194682 CASAVA_Build 12 96798386 1D GTATAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 11 10 194683 CASAVA_Build 12 96803977 1I CAGGATAATG -/A AAAATCTAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 4 5 194684 CASAVA_Build 12 96804548 1D AACCCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 876 hom 32 2 24 7 A 13 12 194685 CASAVA_Build 12 96809182 1I ATACTTAGTG -/T TTGTTTTTTT 3070 het 100 hom 28 3 22 3 T 2 3 194686 CASAVA_Build 12 96819986 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 2299 hom 17 6 10 1 T 7 6 194687 CASAVA_Build 12 96830468 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 14 3 A 11 10 194688 CASAVA_Build 12 96835156 1D CCCTTTTTAG A/- ACATTCTCTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 1 194689 CASAVA_Build 12 96838146 1D AAATGATCAC G/- TTTAGGCTTA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 G 1 0 194690 CASAVA_Build 12 96838489 1I CTTATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1838 het 1838 ref 16 6 5 5 T 13 14 194691 CASAVA_Build 12 96844243 1D GTTGTTGTTG T/- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 4 3 194692 CASAVA_Build 12 96857036 2D TTCTTAGCCT CA/-- GTTTTCTCAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 CA 1 0 194693 CASAVA_Build 12 96858353 1D CAGTATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 35 1 25 9 A 13 12 194694 CASAVA_Build 12 96862350 1I TGTTTAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 61 27 18 16 T 10 11 194695 CASAVA_Build 12 96871866 16D CAGGTGAGAT TGGAGCCATGTGAGAA/---------------- TGGAGCCATG 2578 het 2578 ref 31 19 12 7 TGGAGCCATGTGAGAA 1 0 194696 CASAVA_Build 12 96873851 1I CTGTAAATTT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 A 7 8 194697 CASAVA_Build 12 96887332 2I TGTATATATA --/TG TGTGTGTGTA 2557 het 2557 ref 32 16 10 6 TG 4 5 194698 CASAVA_Build 12 96889580 1D TGAATCATGT C/- CCCTAAAACC 3070 het 3070 hom 47 16 22 10 C 4 3 194699 CASAVA_Build 12 96917930 1D ATACAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 19 8 A 11 10 194700 CASAVA_Build 12 96926083 6D GGAAGAAGAA GAAGAG/------ GAAGAGGAAG 3027 het 985 hom 42 13 14 17 GAAGAG 2 1 194701 CASAVA_Build 12 96930182 3I CATTTCTTCC ---/AAG AAGTCTATAA 3070 hom 138 het 48 0 46 2 AAG 1 2 194702 CASAVA_Build 12 96944948 1D TGGATGATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 10 9 194703 CASAVA_Build 12 96947081 1D ACTTTCTGGG A/- AAAAAAGGGT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 7 6 194704 CASAVA_Build 12 96958298 1I TTTCATGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 101 hom 38 1 30 7 A 9 10 194705 CASAVA_Build 12 96958719 1I TTTAAAAACA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 7 8 194706 CASAVA_Build 12 96962846 1D AAGCCTATCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 31 1 22 8 A 11 10 194707 CASAVA_Build 12 96965299 2D CACACATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 38 0 29 9 TG 8 7 194708 CASAVA_Build 12 96971631 1I AATTTCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 34 1 29 4 A 12 13 194709 CASAVA_Build 12 96973671 7D CTAAAAATAC AAAAATT/------- AGCTGGGCTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAAAATT 1 0 194710 CASAVA_Build 12 96974686 1D AAAACACTAG T/- TTTAATTAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 3 194711 CASAVA_Build 12 96997137 1D ATTTTGTCAT C/- CTTGCTATTA 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 C 2 1 194712 CASAVA_Build 12 97010733 5D TTGTAAAATG TATAT/----- TATAAGAATA 3070 het 3070 ref 39 22 15 5 TATAT 1 0 194713 CASAVA_Build 12 97012229 1D GTAATTTTAC T/- TTTAGTTCTT 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 T 4 3 194714 CASAVA_Build 12 97020116 2D ACTGTGAGAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 50 13 28 9 AT 7 6 194715 CASAVA_Build 12 97025406 1I CCCCAGCTTA -/G GCAGTGTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 G 1 2 194716 CASAVA_Build 12 97029215 1D TACAGTGTAT A/- TATACACACA 3070 het 3070 hom 59 25 25 9 A 1 0 194717 CASAVA_Build 12 97030280 1I TTTTCTTAGA -/G TTGCCATTTG 3070 het 3070 hom 49 18 19 12 G 0 1 194718 CASAVA_Build 12 97043493 6D TTTTACAGAT GAGAAA/------ CCTGAGAAGT 3070 het 3070 hom 52 20 29 3 GAGAAA 1 0 194719 CASAVA_Build 12 97051808 1D TGACATGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 737 hom 37 6 17 14 T 17 16 194720 CASAVA_Build 12 97053610 1D CCATTTGGTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 8 7 194721 CASAVA_Build 12 97054500 1I GTCCTCCTGC -/T CCAAAAGAGA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 T 0 1 194722 CASAVA_Build 12 97062916 1D TCTCATTTCT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 588 hom 25 2 13 11 A 9 8 194723 CASAVA_Build 12 97066210 2I GAACTATTTG --/GA GAGTTAGTGT 2024 het 2024 ref 35 15 9 11 GA 1 2 194724 CASAVA_Build 12 97067510 4D TTTAATATTT AAAG/---- AAAGAGAATA 2798 het 2798 ref 31 19 7 6 AAAG 2 1 194725 CASAVA_Build 12 97068132 3I CCGATAATGG ---/CCC CCCTTTTGAT 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 C 3 6 194726 CASAVA_Build 12 97068438 5D14M3D AAAAAAAAAC AAAAAAAAACAAAAAAAAAAAC/-----AAAACAAAAAAAAA--- CAGTCAACAC 3070 het 3070 hom 35 18 23 1 N/A 0 0 194727 CASAVA_Build 12 97070033 16D GAAGGAAGGA AGGAAGGGAGGGAGGG/---------------- AGGGAGGGAG 3070 hom 38 het 12 0 10 6 AGGAAGGGAGGGAGGG 1 0 194728 CASAVA_Build 12 97097609 12I TGGCAATCCT ------------/TAGTGTTCCTTG TAGTGTTCCT 3070 hom 99 het 39 0 32 10 TAGTGTTCCTTG 1 2 194729 CASAVA_Build 12 97100139 1I ATTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 A 10 11 194730 CASAVA_Build 12 97143250 1I GGTTGATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 T 11 12 194731 CASAVA_Build 12 97147838 1D TGATCTGGTG A/- AAACAGTATA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 4 3 194732 CASAVA_Build 12 97149617 1I TGGAAAGGCA -/C ACCACATTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 0 1 194733 CASAVA_Build 12 97155198 1I TGGAGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3060 het 1948 hom 31 9 12 10 A 16 17 194734 CASAVA_Build 12 97156025 2D CGTGTATGCA TG/-- TGTGTGTGTT 3070 het 3070 ref 53 31 14 9 TG 5 4 194735 CASAVA_Build 12 97163263 4I CTGAACTCAC ----/CAAT CAATCACAAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CAAT 1 2 194736 CASAVA_Build 12 97166975 1I TTTCATTTGG -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 6 7 194737 CASAVA_Build 12 97176191 4D GTTTAGAAAA TGTT/---- TGGGGGAACA 3070 het 3070 hom 49 20 26 5 TGTT 1 0 194738 CASAVA_Build 12 97183360 1D CTTTCTTCTC T/- TTTTTTTATT 2098 het 2098 ref 17 8 5 4 T 8 7 194739 CASAVA_Build 12 97196013 1I TTCCAGTATG -/A AGACATCTTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 1 2 194740 CASAVA_Build 12 97198041 4D CCAATTGATG CTTA/---- CTTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 39 22 16 4 CTTA 1 0 194741 CASAVA_Build 12 97209301 1D CTGAATCCCC T/- TTTTTTTTTT 2094 het 1825 hom 34 11 10 13 T 17 16 194742 CASAVA_Build 12 97226031 1D GCTTGAATTA C/- AAGTAGCCAA 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 C 1 0 194743 CASAVA_Build 12 97229595 2D ACTAACAAAC AG/-- AAAGAAACAG 3070 het 3070 ref 46 29 12 7 AG 1 0 194744 CASAVA_Build 12 97237309 2D GAGCCAAGAC TG/-- TACCACTGCA 3070 het 2874 hom 23 8 12 4 TG 1 0 194745 CASAVA_Build 12 97239251 1D CCTAACTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 A 13 12 194746 CASAVA_Build 12 97240540 1D ATCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1663 het 1663 ref 46 37 4 5 T 11 10 194747 CASAVA_Build 12 97243547 2D CCAGGATGAG CT/-- CTGTCTCTAG 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 CT 2 1 194748 CASAVA_Build 12 97247762 1I GAGTGCAGGG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 8 9 194749 CASAVA_Build 12 97250196 1D TGATACTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2155 hom 28 8 13 7 A 15 14 194750 CASAVA_Build 12 97253664 1I TAAAGGGAAA -/G CAGAAGGCAT 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 G 0 1 194751 CASAVA_Build 12 97255446 3I TTATAAAATA ---/AAG AAGAATTCTA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AAG 1 2 194752 CASAVA_Build 12 97257565 6I GGCTGGCAAT ------/GGCAAC GGCAACGTCT 2691 het 2691 ref 28 11 10 7 GGCAAC 1 2 194753 CASAVA_Build 12 97264354 1D GTTTCCTCAG T/- TGTCCTCCTT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 T 2 1 194754 CASAVA_Build 12 97265032 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2764 het 987 hom 20 3 11 6 A 14 15 194755 CASAVA_Build 12 97278200 1I ATTCCCACCA -/T TTTTTTTACT 1556 het 1556 ref 37 21 6 10 T 7 8 194756 CASAVA_Build 12 97278245 2I CCTTCTGTGC --/GT ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 49 20 16 13 GT 0 1 194757 CASAVA_Build 12 97303938 10I TGGATCCCTA ----------/GTAGACCCTG GTTAAAAGGT 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 GTAGACCCTG 0 1 194758 CASAVA_Build 12 97323140 31D GCATCCCTTT GTTGACACATCCAGAAAACTGTGACTCGGAA/------------------------------- GTGGGATTGA 3070 het 3070 ref 44 28 20 10 GTTGACACATCCAGAAAACTGTGACTCGGAA 1 0 194759 CASAVA_Build 12 97343719 2D CCAGTATATC AT/-- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 AT 1 0 194760 CASAVA_Build 12 97352126 1D TAACAGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 11 10 194761 CASAVA_Build 12 97357058 1I CAGAAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 2716 het 1385 hom 21 6 10 5 T 11 12 194762 CASAVA_Build 12 97368139 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1140 hom 17 4 8 5 T 12 11 194763 CASAVA_Build 12 97392731 1D AACAGAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 A 10 9 194764 CASAVA_Build 12 97403769 1D TAATTCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 12 11 194765 CASAVA_Build 12 97405033 1D ATATCTGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 486 hom 32 2 18 12 A 15 14 194766 CASAVA_Build 12 97405614 1I AGTTGGGCAT -/G GTGTTTCATG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 2 194767 CASAVA_Build 12 97405883 1D AGCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 33 5 17 11 A 17 16 194768 CASAVA_Build 12 97412818 1D CAGACTTTTG C/- CTCTCAGTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 C 2 1 194769 CASAVA_Build 12 97422236 1I GGGGTCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2967 hom 34 10 14 10 T 11 12 194770 CASAVA_Build 12 97422440 1I TTAAAGTGAG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 51 29 16 6 T 7 8 194771 CASAVA_Build 12 97423363 3D TTTTAGATTT TGA/--- TGATATGTTT 3070 het 3070 ref 34 23 11 4 TGA 2 1 194772 CASAVA_Build 12 97428799 8I CTGGCCCCTC --------/TTATTTAT TTATTATTTT 2255 hom 17 het 8 0 6 2 TTAT 1 3 194773 CASAVA_Build 12 97430225 1D TCTGACCACA G/- TCAGAATATT 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 G 1 0 194774 CASAVA_Build 12 97439222 2D GGAGTTTCAC TG/-- TGTTAGCCAG 2695 het 418 hom 10 1 7 2 TG 2 1 194775 CASAVA_Build 12 97442492 1D CTTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2791 het 2037 hom 16 7 7 2 A 12 11 194776 CASAVA_Build 12 97444867 1I CTCCACCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2003 hom 19 5 10 4 A 10 11 194777 CASAVA_Build 12 97448418 1D GCTCATCTTA C/- CAGGAGTTAA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 C 2 1 194778 CASAVA_Build 12 97491508 1D AAATTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3032 hom 33 9 13 11 T 15 14 194779 CASAVA_Build 12 97505578 2D CTTAACCCCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 42 1 30 12 A 15 13 194780 CASAVA_Build 12 97513319 1D ACTTACTTGA T/- TTTTTTTTTT 1414 het 1414 ref 34 28 4 2 T 11 10 194781 CASAVA_Build 12 97537292 2I CTTATTCTTA --/AG GAAGGATCAG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 AG 0 1 194782 CASAVA_Build 12 97544820 4D GAATCAGACT GACA/---- AAGATATTTA 3070 het 3070 hom 36 13 17 8 GACA 1 0 194783 CASAVA_Build 12 97559707 1I TGGGACTACA -/G GCGAATGCCA 3070 hom 72 het 29 0 23 6 G 1 2 194784 CASAVA_Build 12 97632753 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1842 het 1842 ref 27 16 4 8 T 13 12 194785 CASAVA_Build 12 97638720 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 2356 het 489 hom 6 1 5 0 A 7 8 194786 CASAVA_Build 12 97671344 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 10 9 194787 CASAVA_Build 12 97676690 1D TTTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 949 het 949 ref 28 10 3 15 T 18 17 194788 CASAVA_Build 12 97678181 1I TTATTCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 10 16 17 T 11 12 194789 CASAVA_Build 12 97686792 1I AGCTTCTGTA -/G GGGGGGGCTC 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 G 7 8 194790 CASAVA_Build 12 97707329 1I AGATGTATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 573 hom 37 2 21 14 T 13 14 194791 CASAVA_Build 12 97709464 1I CAACAGAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 9 10 194792 CASAVA_Build 12 97728983 1I CTGGCAGCCG -/C CACTGCTTTT 3070 hom 71 het 29 0 21 8 C 1 2 194793 CASAVA_Build 12 97731980 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 3070 hom 59 het 21 0 19 2 G 2 3 194794 CASAVA_Build 12 97751493 1I ATACCTTGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 9 194795 CASAVA_Build 12 97753007 12D CATTTGCTTA ATTATTATTATT/------------ ATTATTATTA 3070 het 2989 hom 25 7 15 5 ATT 10 6 194796 CASAVA_Build 12 97757305 4I TGTATGTATG ----/TATC TATCTATCTT 3070 het 3070 hom 56 25 24 7 TATC 2 3 194797 CASAVA_Build 12 97766469 1D TAATTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 1007 het 1007 ref 25 11 6 8 T 17 16 194798 CASAVA_Build 12 97768006 2I CAAATAACAC --/AG AGAGACAGAC 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 AG 2 3 194799 CASAVA_Build 12 97782039 1D TCTGTGATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 25 17 10 T 13 12 194800 CASAVA_Build 12 97791821 1D TATGGTGGGT G/- GGGGGAAAGG 3070 het 3070 hom 45 14 20 11 G 6 5 194801 CASAVA_Build 12 97793824 1I TGGGGTGTGC -/A ACCTGTTGGC 3070 hom 159 het 59 0 53 6 A 1 2 194802 CASAVA_Build 12 97800664 1I GCCATACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 A 15 16 194803 CASAVA_Build 12 97809663 1D ATATGCATAC T/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 hom 44 22 21 1 T 7 6 194804 CASAVA_Build 12 97813703 4D GTTTTGTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2950 hom 26 8 17 1 TTTG 3 2 194805 CASAVA_Build 12 97822770 1D TCAGTATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2755 hom 32 8 17 7 T 11 10 194806 CASAVA_Build 12 97833271 1I TGAGACAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 9 10 194807 CASAVA_Build 12 97865476 1I ATACCATGGA -/G GAAGTCCAAC 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 G 1 2 194808 CASAVA_Build 12 97868545 1D TTTAGTCCTG C/- CCCCCAAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 C 6 5 194809 CASAVA_Build 12 97897577 1I TGCTTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 22 1 15 6 T 12 13 194810 CASAVA_Build 12 97900213 1I CTGTAGTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 303 hom 28 2 20 6 A 12 13 194811 CASAVA_Build 12 97908476 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1371 hom 46 4 31 12 A 13 12 194812 CASAVA_Build 12 97908823 2D TTATGGTGTC TT/-- TAGTTGGCTT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 T 3 1 194813 CASAVA_Build 12 97913963 1I ATCTGGGGCT -/G GGAATAGTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 2 3 194814 CASAVA_Build 12 97917146 1I GCAGAGTCAA -/C CTTTCGGTGA 3070 hom 172 het 64 0 57 7 C 1 2 194815 CASAVA_Build 12 97919487 5D ATGTGATAAT TTAAG/----- TTGTGAAATG 3070 hom 108 het 43 0 37 8 TTAAG 1 0 194816 CASAVA_Build 12 97920398 1I TACTTATCTC -/T TCTTTTTTTT 3070 het 693 hom 58 3 39 16 T 1 2 194817 CASAVA_Build 12 97922692 1D TAAATAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 22 9 T 12 11 194818 CASAVA_Build 12 97924969 1I AATAAAGCAT -/A AAAAAATCAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 194819 CASAVA_Build 12 97927751 3D TCATCTATGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 38 0 29 10 A 13 10 194820 CASAVA_Build 12 97928666 1D TATTATTATT A/- TTATTTTTTT 3070 het 365 hom 18 2 13 3 A 1 0 194821 CASAVA_Build 12 97933900 1D AGAATTAAAT A/- GGAGAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 0 194822 CASAVA_Build 12 97937981 1D TCCATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 11 10 194823 CASAVA_Build 12 97944531 1D ATTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 32 1 27 4 A 12 11 194824 CASAVA_Build 12 97968600 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1035 het 142 hom 13 3 4 6 T 19 18 194825 CASAVA_Build 12 98083614 1D ACATATAGTG A/- AAGAAATAAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 2 194826 CASAVA_Build 12 98167171 2D AATCTCAGCC AA/-- AAGAGTTTCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 4 2 194827 CASAVA_Build 12 98168609 11I TATGAAAATA -----------/GATAATTCATT TAAACTATAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GATAATTCATT 0 1 194828 CASAVA_Build 12 98177690 2D CACGTCTTTC CT/-- CTGTTACCCT 3070 hom 78 het 29 0 25 6 CT 2 1 194829 CASAVA_Build 12 98187414 2D AATAAGCAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 14 12 194830 CASAVA_Build 12 98250599 1I CTGAGCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 42 1 35 6 A 12 13 194831 CASAVA_Build 12 98360422 1I TATACTAAAG -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 T 1 2 194832 CASAVA_Build 12 98395383 1D TCAGCCTACT C/- TAGAGCCAGA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 C 1 0 194833 CASAVA_Build 12 98398905 1I TTTTCACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 11 12 194834 CASAVA_Build 12 98402079 1D TGTTGCTGTA T/- CCCAGAGAAT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 1 0 194835 CASAVA_Build 12 98402680 4I TGTGTTTTTT ----/TTTG TTTTTTTTTT 3070 het 256 hom 33 6 16 11 TTTG 0 1 194836 CASAVA_Build 12 98414633 1D CATCTGATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 10 9 194837 CASAVA_Build 12 98418999 1I TTTCTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 10 11 194838 CASAVA_Build 12 98432918 1I TCTATCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2016 hom 32 5 20 7 A 13 14 194839 CASAVA_Build 12 98435281 2I ATCCTGACAC --/TT TACTAAATTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 1 3 194840 CASAVA_Build 12 98460428 1D AAATCCCTAT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 8 7 194841 CASAVA_Build 12 98468533 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2169 het 2169 ref 18 8 7 3 A 15 16 194842 CASAVA_Build 12 98489341 1D TCACAACAAG A/- AAAAAAAAAG 1476 het 1476 ref 39 33 4 3 A 10 9 194843 CASAVA_Build 12 98508944 1I GTAAAGAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 10 11 194844 CASAVA_Build 12 98532802 2I CTTCCTCAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 A 11 13 194845 CASAVA_Build 12 98535717 1D AGTAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 14 10 A 11 10 194846 CASAVA_Build 12 98539769 4I TGAGGCAGAA ----/AACT AACAAAGAAA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 AACT 0 1 194847 CASAVA_Build 12 98560269 1I GTAGCTATTG -/T TATCTGTTTC 2239 het 2239 ref 26 12 6 8 T 1 2 194848 CASAVA_Build 12 98566071 1D ACTGTCTTGA T/- TTAAAGGAAG 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 T 3 2 194849 CASAVA_Build 12 98568218 2D TCTCTCTCTC CT/-- CTCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 40 14 19 8 CT 5 4 194850 CASAVA_Build 12 98568812 7I ACATGGTTTG -------/ATAACCC AGAACCAGAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 ATAACCC 0 1 194851 CASAVA_Build 12 98574971 10D GTTGCTGTCT ATAAAATACA/---------- ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 30 13 18 3 ATAAAATACA 1 0 194852 CASAVA_Build 12 98577313 1D ATTCTACTAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 9 17 3 A 9 8 194853 CASAVA_Build 12 98577574 4D TGTGTGTGCA TGTG/---- TGTATGTGTA 3070 het 3070 hom 27 11 15 4 TG 3 1 194854 CASAVA_Build 12 98581612 1D TTTTAAACTT G/- AGGATTTGCC 3070 het 3070 ref 58 32 22 4 G 1 0 194855 CASAVA_Build 12 98586162 2I CTAGGTTGTC --/AA AGTTATTGCT 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 A 1 3 194856 CASAVA_Build 12 98586629 1D GTTTTTGTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 T 9 8 194857 CASAVA_Build 12 98587997 1I CCTTTAAAGG -/C TTTGACAAAA 3070 het 3070 hom 55 23 29 3 C 0 1 194858 CASAVA_Build 12 98598343 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 1722 het 1722 ref 19 7 5 7 A 11 12 194859 CASAVA_Build 12 98601733 1D GTTCAACATA C/- ACAAATAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 10 10 C 1 0 194860 CASAVA_Build 12 98603657 2I GTGTGTATAC --/AT ATATATATAT 2484 het 2484 ref 28 17 8 3 AT 6 7 194861 CASAVA_Build 12 98606790 1D TGCTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2821 hom 27 11 14 3 A 13 12 194862 CASAVA_Build 12 98610169 1I ACAATAATCC -/A GGTGAGAATT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 0 1 194863 CASAVA_Build 12 98613108 2I AGAAGTTGAC --/AT GTTTTAACAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 AT 0 1 194864 CASAVA_Build 12 98614618 1I TATATAAAAT -/A AAAAATTGAT 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 A 5 6 194865 CASAVA_Build 12 98622481 4D ACATACATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 15 20 6 AC 8 6 194866 CASAVA_Build 12 98628511 1D CTTCAGTAGC A/- AAAATTCCTT 3070 het 3070 ref 51 29 21 2 A 5 4 194867 CASAVA_Build 12 98632166 5D CATGCCTTCT TCTCA/----- TAAGAACCCT 3070 hom 111 het 41 0 37 7 TCTCA 1 0 194868 CASAVA_Build 12 98641873 1I CAGCATCAGC -/A AAAAAGTGTC 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 A 5 6 194869 CASAVA_Build 12 98650930 1D CTTGCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 20 6 A 11 10 194870 CASAVA_Build 12 98654283 2I CAAAAAAAAA --/AC CTCTTCAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 AC 0 1 194871 CASAVA_Build 12 98654626 3D AACTAAAAAG CTT/--- CTGCACAGCA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 CTT 1 0 194872 CASAVA_Build 12 98657292 1I AAAGCTAAAA -/C AAAAACTCCA 2658 het 2658 ref 26 13 7 6 C 0 1 194873 CASAVA_Build 12 98663094 3I AAACAAAGAG ---/AAC AATAAGGAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 AAC 0 1 194874 CASAVA_Build 12 98665887 1I TTCTATATTG -/A AAGCACTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 A 2 3 194875 CASAVA_Build 12 98669052 3I TGCTTAATCC ---/CAG CAGATTCTAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 CAG 1 2 194876 CASAVA_Build 12 98672981 2D GCTGCTTTTT AA/-- AAAAAAAAAT 2809 het 2809 ref 29 21 6 3 A 11 9 194877 CASAVA_Build 12 98673086 1I ATATTACCCC -/T GACCCCATAG 2797 het 2797 ref 22 13 7 2 T 0 1 194878 CASAVA_Build 12 98674089 1I GACATGATCC -/T ATATCTAGAA 3070 het 3070 hom 42 21 19 2 T 0 1 194879 CASAVA_Build 12 98674896 1I CCAAAACTAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 A 8 9 194880 CASAVA_Build 12 98676451 1I TTTTTCATAT -/A TAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 0 1 194881 CASAVA_Build 12 98677862 1D TTAGAAAGAA C/- AAAAGTATCA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 C 1 0 194882 CASAVA_Build 12 98680256 2D AAACAGAAAC AT/-- AGAACAAAGG 3070 het 3070 ref 46 28 15 4 AT 1 0 194883 CASAVA_Build 12 98686922 1D AAATAAATGC T/- TTTTTTTTTT 2853 het 2853 ref 32 11 9 12 T 12 11 194884 CASAVA_Build 12 98692738 3I AGCCTTAAAA ---/AAG AAGGAGATCC 3070 het 3070 hom 52 25 22 5 AAG 1 2 194885 CASAVA_Build 12 98694604 4I TGTTTGTTTG ----/TTTT TTTGAGATGG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 3 7 194886 CASAVA_Build 12 98698352 1D GCCCAACTAA T/- TTTTTTTTTT 2226 het 532 hom 10 2 5 3 T 13 12 194887 CASAVA_Build 12 98709730 24D3M11D TAAAATAAAT AATCTAATGATGCATCTTAAAGAATTTAAAAAGCAAGA/------------------------TTT----------- GCAAGCTGAA 3070 hom 54 het 16 0 19 2 N/A 0 0 194888 CASAVA_Build 12 98716343 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAC 0 1 194889 CASAVA_Build 12 98724786 1D TCATTGAATC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 9 8 194890 CASAVA_Build 12 98735075 2I TCTTCTCCCC --/CA CCCCCCTTTC 3070 hom 70 het 34 0 24 10 CA 0 1 194891 CASAVA_Build 12 98735416 1D CCTGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 46 1 30 15 T 11 10 194892 CASAVA_Build 12 98738008 1I TAATACTTGC -/T AGTAAATTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 0 1 194893 CASAVA_Build 12 98743929 1D AAAGAGTCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 41 0 35 7 T 10 9 194894 CASAVA_Build 12 98748549 2D TGAAAGAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 26 0 17 9 A 15 13 194895 CASAVA_Build 12 98749369 4D TATTTTAAGA AATT/---- AATTAATAGT 3070 het 3070 hom 37 15 19 6 AATT 2 1 194896 CASAVA_Build 12 98753351 1D AAATAAAAAG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 7 6 194897 CASAVA_Build 12 98756821 1D CCTGTATTTC A/- AATCTGTATT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 3 2 194898 CASAVA_Build 12 98770221 2D CCTATTTTAT TG/-- TGTCACTTTG 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 TG 2 1 194899 CASAVA_Build 12 98786457 1I AGAAAACCCC -/A AAAATAATCT 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 A 4 5 194900 CASAVA_Build 12 98794641 1D TGCTTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 27 3 23 1 A 13 12 194901 CASAVA_Build 12 98800162 1D AAAAATAAAT A/- AGAGCCTCAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 2 1 194902 CASAVA_Build 12 98822105 1D CTAATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 14 7 T 15 14 194903 CASAVA_Build 12 98822208 3D TCAAGATAAT CTC/--- CTGCCTCAGC 3008 het 2133 hom 19 7 9 7 CTC 1 0 194904 CASAVA_Build 12 98828712 2D ACTCATTTAC AG/-- AGAGTTCTGA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 AG 3 2 194905 CASAVA_Build 12 98840710 1D ATGACATTAA G/- GTAGGAATGG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 G 2 1 194906 CASAVA_Build 12 98842239 1I CATGTATAAT -/A GGAAATATTA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 0 1 194907 CASAVA_Build 12 98843875 1D CCTCACACCT A/- AATGGATAGC 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 A 3 2 194908 CASAVA_Build 12 98852951 4D TTCTATTCCG ATAA/---- ATAAATTAAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 3 ATAA 2 1 194909 CASAVA_Build 12 98853798 8I AATACCTGAC --------/ACTGGATA ACTGGATAAT 3070 hom 123 het 49 0 41 8 ACTGGATA 1 2 194910 CASAVA_Build 12 98859374 1D ATAGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 42 1 33 8 A 11 10 194911 CASAVA_Build 12 98863263 1D GTAAAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 42 2 24 16 A 15 14 194912 CASAVA_Build 12 98869623 1D GCCTCTACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 35 6 20 9 A 15 14 194913 CASAVA_Build 12 98893063 1I ACTTGTCTCC -/A AAAAAAATGG 3070 hom 97 het 37 0 33 4 A 7 8 194914 CASAVA_Build 12 98900243 1D TCTATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 40 1 21 19 A 17 16 194915 CASAVA_Build 12 98907288 1I CTTCAAACTA -/T TTTTCCCACC 3070 hom 134 het 53 0 44 9 T 4 5 194916 CASAVA_Build 12 98919304 1D TTTTGGGGGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 22 11 8 4 T 8 7 194917 CASAVA_Build 12 98943184 1I TATAAAAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 9 10 194918 CASAVA_Build 12 98957072 1I TTATAATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 12 13 194919 CASAVA_Build 12 98988200 1I AATTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1056 hom 21 3 14 4 T 13 14 194920 CASAVA_Build 12 99000673 1D CTGTTTTTGT A/- ATGAGAACAT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 A 2 1 194921 CASAVA_Build 12 99003256 1I GCCTTGGATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 12 13 194922 CASAVA_Build 12 99003771 23D CTCTTATTCT TAGCTTCATACTCTTTTCATTCC/----------------------- TAGCTTCATA 3070 het 3070 ref 21 15 10 7 TAGCTTCATACTCTTTTCATTCC 1 0 194923 CASAVA_Build 12 99008939 1I TGAATAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2092 hom 32 8 11 13 T 15 16 194924 CASAVA_Build 12 99018637 1D TCACATTCTA T/- TTTTTTTTTT 2790 het 2790 ref 25 13 8 5 T 15 14 194925 CASAVA_Build 12 99020610 1D AGGTTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1013 hom 26 7 4 15 T 19 18 194926 CASAVA_Build 12 99024189 1D TGACTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 23 0 17 6 A 13 12 194927 CASAVA_Build 12 99027677 1D CCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1918 hom 28 11 9 9 A 17 16 194928 CASAVA_Build 12 99035914 1I ATCCTGGACT -/G TATGTGTATC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 G 0 1 194929 CASAVA_Build 12 99036298 10D GAGACCGTCT CAAAACAAAA/---------- CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 4 CAAAA 6 4 194930 CASAVA_Build 12 99052526 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 27 0 18 9 A 15 14 194931 CASAVA_Build 12 99054120 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2939 het 2939 ref 29 16 8 5 A 15 14 194932 CASAVA_Build 12 99066736 1I ACTCCGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2434 het 1035 hom 33 7 8 18 A 17 18 194933 CASAVA_Build 12 99086147 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 9 8 194934 CASAVA_Build 12 99098941 1I TTCATATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 22 13 16 A 13 14 194935 CASAVA_Build 12 99141093 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 2761 hom 22 9 11 3 A 8 7 194936 CASAVA_Build 12 99152019 4I CTGTCTCCAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 AAAC 3 4 194937 CASAVA_Build 12 99152494 3D AGATGGGACT AGA/--- AGAAGATTCA 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 AGA 3 2 194938 CASAVA_Build 12 99152975 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TA 6 7 194939 CASAVA_Build 12 99155867 1I GATGACTAGC -/A AAATCCCTAC 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 A 3 4 194940 CASAVA_Build 12 99170266 1D AAAAAATAGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 9 8 194941 CASAVA_Build 12 99170749 11D TCATTTTGCT AAAAGGTCATC/----------- AAATTAATAA 3070 het 3070 ref 36 19 16 3 AAAAGGTCATC 1 0 194942 CASAVA_Build 12 99217612 1D TAGTTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 12 9 T 12 11 194943 CASAVA_Build 12 99226507 4I TAAAAAAAAC ----/TGCA TGCACATTCT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 TGCA 1 2 194944 CASAVA_Build 12 99287758 1D ACAAAACATA T/- TTTTCTAATG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 5 4 194945 CASAVA_Build 12 99288874 1I CAAATATTAA -/T TTTAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 3 4 194946 CASAVA_Build 12 99291290 1I TTTCTGGGCA -/G GGATGAATAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 2 3 194947 CASAVA_Build 12 99297677 12I TCTATAGAGG ------------/TCAGTGAAAAAT TCTACCATTT 3070 het 1958 hom 20 6 11 3 TCAGTGAAAAAT 0 1 194948 CASAVA_Build 12 99301751 1I AGCTGGGTCC -/A ACAGGCTCAT 3070 hom 90 het 33 0 28 5 A 1 2 194949 CASAVA_Build 12 99308263 1I GTTTGTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 23 2 18 3 T 11 12 194950 CASAVA_Build 12 99321191 4I CAGCCTGACC ----/AACA AACATGGCAA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 AACA 1 2 194951 CASAVA_Build 12 99329500 4D CTGGAATCAG CAGA/---- CAGTCTCCAA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 CAGA 1 0 194952 CASAVA_Build 12 99329756 2D GTATTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 9 T 14 12 194953 CASAVA_Build 12 99344346 1D CATTCAACAA T/- TTTTTTTTTT 2264 het 2206 hom 28 9 6 13 T 17 16 194954 CASAVA_Build 12 99347803 2I GGTAATAGTA --/TC TCTCTATTTC 3070 hom 107 het 41 0 36 5 TC 2 3 194955 CASAVA_Build 12 99355314 1D AAATTCCAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 10 9 194956 CASAVA_Build 12 99357361 1D GATTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 9 12 A 13 12 194957 CASAVA_Build 12 99372857 2D CTTTAAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 43 1 37 5 A 14 12 194958 CASAVA_Build 12 99373207 1D AGTGACTGTT A/- AAACATTTAC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 4 3 194959 CASAVA_Build 12 99377735 14D GTGACAGAGC AAAACCCTGTCTCT/-------------- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 19 7 12 2 AAAACCCTGTCTCT 1 0 194960 CASAVA_Build 12 99383591 1I ACTATTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 13 14 194961 CASAVA_Build 12 99413569 3I TGAACCAGGG ---/AGT CAGAGGTTGC 3070 hom 78 het 27 0 26 1 AGT 0 1 194962 CASAVA_Build 12 99444103 2I ATTTTAAGTA --/TT TTTTTTTTTT 1445 het 15 hom 24 0 5 19 T 12 14 194963 CASAVA_Build 12 99454312 1D TATTTATGCC T/- TTTTTTTTTT 1304 het 1304 ref 31 22 3 6 T 11 10 194964 CASAVA_Build 12 99475179 1D GCATGTCACA T/- GGTGAGACAG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 T 1 0 194965 CASAVA_Build 12 99477071 5D GAGAGAAAGT ATGTG/----- ATGTGATCTG 3070 hom 51 het 23 0 17 7 ATGTG 2 1 194966 CASAVA_Build 12 99486334 3D AGTTCGAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 14 11 194967 CASAVA_Build 12 99534529 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAACTG 3070 hom 61 het 23 0 21 2 C 1 0 194968 CASAVA_Build 12 99540486 2I AAACACTCAT --/CA CACAGCAAAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CA 2 3 194969 CASAVA_Build 12 99595136 1D TCCTACCTCC T/- TGGTGAGGGC 3070 hom 97 het 38 0 31 7 T 2 1 194970 CASAVA_Build 12 99600751 8D CCATTCCCCA CTTCATCC/-------- CTTCATCCCC 3070 hom 122 het 49 0 40 10 CTTCATCC 2 1 194971 CASAVA_Build 12 99605994 4D GAACACCTAG TGCA/---- CCCACATGAT 3070 hom 75 het 33 0 25 9 TGCA 1 0 194972 CASAVA_Build 12 99622709 1I CTGATTCTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 9 10 194973 CASAVA_Build 12 99626349 4D TCCCTTCCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 3070 hom 62 het 32 0 22 12 CCTT 4 3 194974 CASAVA_Build 12 99631030 1I GAGAGAGGGA -/G GGGGAGAATT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 4 5 194975 CASAVA_Build 12 99639762 1D TAACTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2068 het 2068 ref 39 23 7 9 T 19 18 194976 CASAVA_Build 12 99644870 1I TGCCCCGGGA -/C CCCCCCCCGC 2244 hom 25 het 13 0 11 2 C 8 9 194977 CASAVA_Build 12 99645996 3D AGACATTAAA ATT/--- ATTATTTTAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATT 3 2 194978 CASAVA_Build 12 99692093 1D TGTGGTTTTA C/- CCTCTCAGTA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 C 3 2 194979 CASAVA_Build 12 99695025 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTT 2803 hom 51 het 22 0 16 6 AG 2 1 194980 CASAVA_Build 12 99695829 2D ATGCTTACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 18 16 194981 CASAVA_Build 12 99701910 1I CACTCCATGG -/C CTCCATCTAG 3070 hom 129 het 48 0 39 9 C 1 2 194982 CASAVA_Build 12 99702838 1D CCTCTCACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 47 0 39 10 T 10 9 194983 CASAVA_Build 12 99705138 1I CAGATGGACT -/G GTCAAGGAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 1 2 194984 CASAVA_Build 12 99714273 1I TCCCTAACTG -/T CTTGCTCATT 3070 hom 108 het 44 0 35 9 T 0 1 194985 CASAVA_Build 12 99719410 1I GAATGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 530 hom 35 2 26 7 T 15 16 194986 CASAVA_Build 12 99729949 2D ATATATGTGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AC 7 6 194987 CASAVA_Build 12 99735176 5D AACAGGCATG CATGT/----- ATTTTATATT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CATGT 1 0 194988 CASAVA_Build 12 99738265 1D TCGGTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 123 hom 29 2 14 14 A 16 15 194989 CASAVA_Build 12 99744210 2I AGAAAAAAAG --/AT ATGGAAAATG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AT 1 2 194990 CASAVA_Build 12 99744520 1D CAACCGCAAT G/- GCCCTGTTCC 3070 hom 114 het 47 0 38 9 G 2 1 194991 CASAVA_Build 12 99755174 10D17M1I TTAATCCTAC AACAACCATATGAGATAAATAGTACTG-/----------TGTTATAAATAGTACTGT TTATAATATC 3070 hom 96 het 31 0 33 6 N/A 0 0 194992 CASAVA_Build 12 99759971 2D TAAATATCCA CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 91 het 39 0 30 10 C 16 14 194993 CASAVA_Build 12 99764855 1D TCCTTCCACA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 76 het 37 0 30 7 C 9 8 194994 CASAVA_Build 12 99771538 1D TTCTTCCCCA T/- TTTTTTCCTG 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 7 6 194995 CASAVA_Build 12 99776716 1I TGCCCTGCTT -/C CTTTTTCTGC 3070 hom 90 het 35 0 29 6 C 1 2 194996 CASAVA_Build 12 99813058 1I CTTCTACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 11 12 194997 CASAVA_Build 12 99823318 1D AAAGATGGAG A/- AAACCCAGAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 4 3 194998 CASAVA_Build 12 99833963 2D GTAATGTAAC TT/-- TTACATTGTT 3070 het 3070 ref 37 24 13 0 T 4 2 194999 CASAVA_Build 12 99834295 3D AATCAGAGCG TCT/--- TCTTAGTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 TCT 2 1 195000 CASAVA_Build 12 99837059 1I GTCAAAAGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 8 9 195001 CASAVA_Build 12 99838410 33D TGAGATTGAA AAGCATCAGAACTTTTCTTTACCCATTAGAAGT/--------------------------------- AACTGGCCAT 3070 het 3070 ref 32 27 12 8 AAGCATCAGAACTTTTCTTTACCCATTAGAAGT 1 0 195002 CASAVA_Build 12 99843675 2D TTATATATAG TA/-- TATATATATA 3070 het 2233 hom 21 8 10 3 TA 7 6 195003 CASAVA_Build 12 99849899 1D GGAGGTGTTC T/- TTTTTTTTTT 1404 het 1404 ref 42 24 6 12 T 15 14 195004 CASAVA_Build 12 99850271 1I ACACTTGCTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 18 12 2 T 0 1 195005 CASAVA_Build 12 99853260 2D TGAGATAATC AT/-- GTGTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 AT 1 0 195006 CASAVA_Build 12 99857973 1I ATATTCCTAA -/T GGTTTTTATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 195007 CASAVA_Build 12 99861252 12D TTCTGATTCT GTTCCTCAAGGC/------------ TGAGGGGATA 3070 het 3070 ref 30 16 14 3 GTTCCTCAAGGC 1 0 195008 CASAVA_Build 12 99861631 3D GAATTAAAAA TGT/--- TGTTTCTTCC 3070 het 3070 ref 42 20 16 7 TGT 2 1 195009 CASAVA_Build 12 99862284 1I GTTGGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 10 11 195010 CASAVA_Build 12 99865214 5D TTGAAGCAAT AAGAA/----- AAGAATGACC 3070 het 3070 hom 42 15 24 4 AAGAA 2 1 195011 CASAVA_Build 12 99899347 8D AGAAAAGGAG GGAAGGAA/-------- GGAAGGAAGG 1671 het 1671 ref 31 15 8 11 GGAA 6 4 195012 CASAVA_Build 12 99902823 1D TTATGCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 T 12 11 195013 CASAVA_Build 12 99922059 1D AGGATACTGT G/- GGGGAAGTGA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 G 5 4 195014 CASAVA_Build 12 99940005 1I AAATTAAAAT -/A ATAACATGGA 3070 het 3070 hom 42 12 16 14 A 1 2 195015 CASAVA_Build 12 99942505 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2738 hom 22 7 12 3 A 13 12 195016 CASAVA_Build 12 99952527 5I ATACATAAAT -----/AAAAG AGAATGATAA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 AAAAG 0 1 195017 CASAVA_Build 12 99955924 1I CAAAACATAC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 8 9 195018 CASAVA_Build 12 99962905 1D ATCAGAAGCC A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 A 2 1 195019 CASAVA_Build 12 99980977 1I5M1D ATGGGAAAAG -ATACTA/CATAGT- ATCTGGGCCA 3070 hom 63 het 22 0 20 6 N/A 0 0 195020 CASAVA_Build 12 99997241 1D AACCACACGA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 81 het 35 0 28 8 C 9 8 195021 CASAVA_Build 12 99998792 2D TATATATATA TT/-- ATATATATAT 1355 het 444 hom 7 2 5 1 T 2 0 195022 CASAVA_Build 12 99998941 2I AGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TG 8 9 195023 CASAVA_Build 12 100006802 1I GTAAAAAATT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 195024 CASAVA_Build 12 100007378 1I CCCCTTTTGA -/C CCCCCCACCA 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 C 6 7 195025 CASAVA_Build 12 100051853 7I4M1D ACACAGGTGT -------CTAAC/TCAATCCCTAA- TTGAAGGGAA 3070 het 3070 ref 37 21 14 9 N/A 0 0 195026 CASAVA_Build 12 100079098 1I GATTAAATAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 411 hom 38 1 31 6 T 8 9 195027 CASAVA_Build 12 100095186 1I TTTTGAAACT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 9 195028 CASAVA_Build 12 100104136 2I GGGATGTAAC --/AG AAGTGTGCCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AG 0 1 195029 CASAVA_Build 12 100105449 2D ACAAACCAGC AA/-- AAGACAACTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 4 2 195030 CASAVA_Build 12 100110320 1D GCAAAATGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 31 0 22 9 T 9 8 195031 CASAVA_Build 12 100110881 2D ACCTTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 1484 het 100 hom 18 2 5 11 T 18 16 195032 CASAVA_Build 12 100121862 1I TCCAGAGTTT -/A TGATTCTGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 1 195033 CASAVA_Build 12 100134589 1I TAATTTATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 9 10 195034 CASAVA_Build 12 100135015 3I CCTATTTCTA ---/AAG AAGAAGGAGA 3070 het 3070 ref 57 28 25 4 AAG 2 3 195035 CASAVA_Build 12 100135497 1I CCCCCCCCTC -/T TTTTTTTTGA 2437 het 2437 ref 31 11 8 12 T 8 9 195036 CASAVA_Build 12 100138971 1D TCTTATCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 12 11 195037 CASAVA_Build 12 100140835 1D AAAACAAAAC A/- AAAACTGGCA 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 A 5 4 195038 CASAVA_Build 12 100147726 2D CTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 37 3 14 21 A 13 11 195039 CASAVA_Build 12 100150711 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 686 het 287 hom 7 2 4 1 TA 6 7 195040 CASAVA_Build 12 100152960 1D TCTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 11 10 195041 CASAVA_Build 12 100154555 3D GTTGGTTGGT TGG/--- TTTTTTTTTT 2207 het 708 hom 31 4 8 20 TGG 1 0 195042 CASAVA_Build 12 100154736 4I TATAAAGTAA ----/ACAG ACAGGTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ACAG 1 2 195043 CASAVA_Build 12 100159914 1I CTAAAACCTT -/A AGAAATCAAA 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 A 1 2 195044 CASAVA_Build 12 100160593 1I TTATAAATTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 T 8 9 195045 CASAVA_Build 12 100163484 1I TCTCAAGCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 83 het 35 0 27 8 T 9 10 195046 CASAVA_Build 12 100168047 3I CGCTGTCTCA ---/CCC AAGCTAGAAG 1946 het 1946 ref 30 7 7 16 C 0 3 195047 CASAVA_Build 12 100178993 1I GTCATCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 627 hom 17 2 9 6 T 12 13 195048 CASAVA_Build 12 100192803 1D TGCAGTTTTC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 9 8 195049 CASAVA_Build 12 100200373 1D GTATAGGGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 55 22 27 7 T 10 9 195050 CASAVA_Build 12 100201954 4D GTTTATTCTC TCTT/---- TTTTCTCTCT 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 TCTT 1 0 195051 CASAVA_Build 12 100213368 1I ATAAGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 10 11 195052 CASAVA_Build 12 100213762 2D AAAGCAAAAA GT/-- GTGTATGAAC 3070 het 3070 hom 40 12 24 6 GT 3 2 195053 CASAVA_Build 12 100219255 1D ATAGTGAGAG C/- CCCCCCCGCC 2153 het 1211 hom 11 5 5 1 C 8 7 195054 CASAVA_Build 12 100229186 1I TCTGAAAAGT -/G TGTTTCATGT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 G 0 1 195055 CASAVA_Build 12 100229565 1I TTTTTTTTTT -/C CTATGAGCAA 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 C 1 2 195056 CASAVA_Build 12 100231317 4D GACTTTGGCT CTTA/---- CTTTTGGTGA 3070 het 3070 ref 42 22 12 13 CTTA 1 0 195057 CASAVA_Build 12 100244443 2I TATTTATGTG --/TT TTTTCCTGAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 4 6 195058 CASAVA_Build 12 100256617 1D AATTTAACTT A/- AATGTTCATA 3070 het 3070 ref 28 17 9 4 A 3 2 195059 CASAVA_Build 12 100259231 1I AAAACAGAAT -/A AAAATCAGAC 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 4 5 195060 CASAVA_Build 12 100298296 4D AAAAAAACAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 534 het 534 ref 46 21 6 22 AAAG 3 2 195061 CASAVA_Build 12 100301742 2D TGTTTATATT TA/-- TATATATACA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TA 5 4 195062 CASAVA_Build 12 100306350 4D CAAAAAAGAC AAAG/---- AAGGCCATTA 2836 het 1911 hom 10 4 6 0 AAAG 1 0 195063 CASAVA_Build 12 100313234 1I CAAAAATAGG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 7 8 195064 CASAVA_Build 12 100333491 1D AACATTTTCA G/- CACCCTGAAT 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 G 1 0 195065 CASAVA_Build 12 100336894 1D CTGAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2399 het 1846 hom 18 7 7 4 T 15 14 195066 CASAVA_Build 12 100343718 1D CTCAGATAAA T/- TTTTTTGGCC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 T 7 6 195067 CASAVA_Build 12 100343930 1D CCTTCATTTT G/- GGGGTATTGT 3070 het 3070 ref 27 12 14 1 G 5 4 195068 CASAVA_Build 12 100383205 1I TAGGTTTTCC -/T TTTTTCACTG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 5 6 195069 CASAVA_Build 12 100392582 5I GAAGCCAAGT -----/AAGAG AAGAGAACGG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AAGAG 1 2 195070 CASAVA_Build 12 100393853 2I TTGATATTTA --/AT ATATGTTATG 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 AT 2 3 195071 CASAVA_Build 12 100408127 4D CTATACAATT ATAA/---- ATAGTCAATT 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 ATAA 1 0 195072 CASAVA_Build 12 100417896 8D CATGACTGAA TTTGCTCT/-------- TCCAGCAGCA 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 TTTGCTCT 1 0 195073 CASAVA_Build 12 100418067 1I ATGCAGCCAC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 6 7 195074 CASAVA_Build 12 100422095 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1772 hom 31 8 9 14 T 14 13 195075 CASAVA_Build 12 100426299 1D TGTTTATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 760 hom 25 3 17 6 T 15 14 195076 CASAVA_Build 12 100426856 1I TTAATTATAC -/T TTAAGTTTTA 2186 het 1110 hom 16 4 9 3 T 2 3 195077 CASAVA_Build 12 100448410 1I CAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 32 1 27 4 A 11 12 195078 CASAVA_Build 12 100471500 1D GCCCATGGAC A/- GGGGTGAGCC 3070 het 3070 hom 44 18 20 10 A 1 0 195079 CASAVA_Build 12 100476054 1D TTCTTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 899 het 899 ref 35 28 3 4 A 11 10 195080 CASAVA_Build 12 100476945 1D TCATAGATGC G/- AATTGAACAA 2435 het 2435 ref 17 8 6 3 G 1 0 195081 CASAVA_Build 12 100479265 3D TTTTTATTTA AAC/--- AAGACAGGGT 3070 het 3070 hom 18 9 7 3 AAC 1 0 195082 CASAVA_Build 12 100482703 1D AGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1585 het 1585 ref 21 10 5 6 T 13 12 195083 CASAVA_Build 12 100483990 1D AAGAAATTTC A/- AAAAAAAAAA 1759 het 1759 ref 27 19 4 6 A 11 10 195084 CASAVA_Build 12 100491015 1D CAGACACAGG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 A 8 7 195085 CASAVA_Build 12 100491216 1I GTATTTAGGA -/T TTTTTGCTAA 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 T 5 6 195086 CASAVA_Build 12 100495953 1D TGTCTGGCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 10 9 195087 CASAVA_Build 12 100497462 2I CATAGTGAGA --/CC CCCCCCCCAT 1720 het 954 hom 11 3 4 4 C 8 10 195088 CASAVA_Build 12 100524376 1D CAATTTAGTA T/- TTTTTTTTTT 1947 het 1947 ref 32 19 6 7 T 15 14 195089 CASAVA_Build 12 100547523 17D GCCTCACGCC TGTAATCCCAGCACTCT/----------------- GGGAGGTCCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 TGTAATCCCAGCACTCT 1 0 195090 CASAVA_Build 12 100553385 1D AATTACTTTG A/- AAAGTTATTT 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 A 4 3 195091 CASAVA_Build 12 100554959 76I GCACATATGA ----------------------------------------------------------------------------/TTCCGTCTCATGACTGAATAAATGAAGCCTTCATTCTCTTACCTTTGATATTTAGTCAAAAAATCAGTTTTACGAT TTTGGTAGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 3 TTCCGTCTCATGACTGAATAAATGAAGCCTTCATTCTCTTACCTTTGATATTTAGTCAAAAAATCAGTTTTACGAT 0 1 195092 CASAVA_Build 12 100555267 2D CAATAAAATT TA/-- TAGGATTTCA 3070 het 3070 ref 47 22 17 9 TA 2 1 195093 CASAVA_Build 12 100566099 1I TTTAATAGAC -/A AAAAAAATTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 7 8 195094 CASAVA_Build 12 100573802 1D AACTTTTTCA T/- TTTTTCCTAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 6 5 195095 CASAVA_Build 12 100576298 1D TCAATCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 8 A 13 12 195096 CASAVA_Build 12 100594674 1I AGAAAAAAAA -/T AATAATAATG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 0 1 195097 CASAVA_Build 12 100597067 1I CAAAAAAAAA -/G AAAAAAAGGA 3070 het 381 hom 26 6 10 10 G 0 1 195098 CASAVA_Build 12 100599894 1D AAAGATTTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 19 9 7 T 9 8 195099 CASAVA_Build 12 100610578 5I CTACTATGTT -----/AATTC AAGATAAGGG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 AATTC 0 1 195100 CASAVA_Build 12 100618228 2D GATCAGCCTC AT/-- GTGAAAAAAA 1906 het 875 hom 30 7 9 15 AT 1 0 195101 CASAVA_Build 12 100624719 5D TAAATTAGAT CTTTA/----- CTTTCATTAA 3070 het 3070 ref 40 21 19 2 CTTTA 1 0 195102 CASAVA_Build 12 100634824 1D TTGTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 12 11 195103 CASAVA_Build 12 100637864 4I AAAAAAAAGT ----/TAAA TAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 TAAA 1 2 195104 CASAVA_Build 12 100643533 1D TGTGGATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2354 hom 36 16 16 4 A 17 16 195105 CASAVA_Build 12 100644328 4D ACAAGCATAT TGAC/---- TGACTAATAG 3070 het 976 hom 43 7 16 20 TGAC 2 1 195106 CASAVA_Build 12 100644793 2D CAAGTTATGT TC/-- TAAGAAATTT 3070 het 3070 ref 32 17 14 2 TC 1 0 195107 CASAVA_Build 12 100645106 4D ACTTAGAAAA ACTT/---- ACTTGGTAAA 3070 het 3070 ref 33 17 15 3 ACTT 2 1 195108 CASAVA_Build 12 100645406 4D TGAAGTAATC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 14 10 195109 CASAVA_Build 12 100650992 1D GATCCAAACT C/- CCATCAGTCA 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 C 3 2 195110 CASAVA_Build 12 100652044 1I TTAAGTCAGC -/T TAAAACATAC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 1 2 195111 CASAVA_Build 12 100653945 2I ATTTTTTACT --/AA AAGAGACAAA 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 A 2 4 195112 CASAVA_Build 12 100658761 1D GCTAATTAAG A/- AAAAAAAAAA 865 het 865 ref 25 16 3 6 A 17 16 195113 CASAVA_Build 12 100664654 1D ATGGGAAATG A/- AAAAAAAAAA 1516 het 1516 ref 34 24 4 6 A 11 10 195114 CASAVA_Build 12 100690342 1D CCAGAGGTGA G/- AGTTAGAAAT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 G 1 0 195115 CASAVA_Build 12 100700146 1I AAACCTTTAT -/A ATATGGTACC 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 A 1 2 195116 CASAVA_Build 12 100717637 1I4M1I CTTGCCAGTA -AGTA-/GGGTAC CTTCTATTAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 7 N/A 0 0 195117 CASAVA_Build 12 100718106 3I TTCAAAAATT ---/ATG ATCTTTGGCC 2256 het 2256 ref 27 16 6 5 ATG 0 1 195118 CASAVA_Build 12 100724176 2D CCCCATGTAA AC/-- ACAGACAAAC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 AC 2 1 195119 CASAVA_Build 12 100729293 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2619 hom 34 13 15 6 T 13 12 195120 CASAVA_Build 12 100743609 5I AATCCATTAC -----/GTTAT AAGTCATGCT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 GTTAT 0 1 195121 CASAVA_Build 12 100744416 1D TGATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1602 het 1602 ref 23 11 6 6 T 14 13 195122 CASAVA_Build 12 100750462 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1162 het 1162 ref 27 15 6 6 T 16 15 195123 CASAVA_Build 12 100757502 3D GGAAAAAAAA AAC/--- AAACAAACAA 2580 het 2580 ref 29 18 7 5 AAC 1 0 195124 CASAVA_Build 12 100802843 1D AGAGAAAATG T/- TTTTTTTTTT 706 het 706 ref 25 11 4 10 T 17 16 195125 CASAVA_Build 12 100843159 1D CAAGTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 11 10 195126 CASAVA_Build 12 100850062 3D CTTGTTGAAA TGT/--- TGTAGGCAGG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TGT 2 1 195127 CASAVA_Build 12 100862427 5D ATTTTTGTTC TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 9 TGTTT 3 2 195128 CASAVA_Build 12 100864468 1I AATGATGTGA -/C TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 195129 CASAVA_Build 12 100870343 3D TCACGAGGTC AGG/--- AGATCAAGAC 3070 het 2279 hom 27 5 16 6 AGG 1 0 195130 CASAVA_Build 12 100870690 1I TTAATAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2636 hom 21 7 11 3 T 8 9 195131 CASAVA_Build 12 100872152 2D TTCTGGTCTC TT/-- TATGTTTCTC 3070 het 3070 ref 32 18 11 5 T 3 1 195132 CASAVA_Build 12 100874675 1I CAAGGCTGCA -/T AAATTGTTCA 3070 hom 78 het 37 0 27 10 T 0 1 195133 CASAVA_Build 12 100877570 4D TACAAATCTT AGTG/---- AGTTTAAATA 3070 het 3070 ref 43 21 19 4 AGTG 1 0 195134 CASAVA_Build 12 100879176 1I ACCCTGATGG -/C CAGGTCTAGG 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 C 1 2 195135 CASAVA_Build 12 100879481 1D ACTGTTGTAA T/- TTTTTTCACG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 7 6 195136 CASAVA_Build 12 100884836 6D TATTATACAT TATATA/------ TATATATATA 1996 hom 12 het 7 0 5 2 TA 12 9 195137 CASAVA_Build 12 100886862 10I GCTAAGTGAC ----------/TGGTTCAAGA TCACATAAGT 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 TGGTTCAAGA 0 1 195138 CASAVA_Build 12 100890664 2D GATATCTGTA CT/-- CTCAGCAATA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 CT 2 1 195139 CASAVA_Build 12 100890883 2I TTCCTCACTC --/AT ATGTGGGAGC 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 AT 1 2 195140 CASAVA_Build 12 100900771 1I AGTTCCTAAA -/G GTTGAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 G 1 2 195141 CASAVA_Build 12 100907893 1D GGCCTATATA T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 8 7 195142 CASAVA_Build 12 100914821 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 26 het 13 0 9 5 T 8 7 195143 CASAVA_Build 12 100916027 1I ATTGTTGTGC -/A ACCATTGCCA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 1 2 195144 CASAVA_Build 12 100932265 1I TAGATGCGAG -/C CCCGTGCCTG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 3 4 195145 CASAVA_Build 12 100939756 1I AAAAAGTTTT -/A TTGCTTTCCA 3070 het 3070 ref 56 31 21 4 A 0 1 195146 CASAVA_Build 12 100943940 1I TGCCATCACT -/G GTACACCCTA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 1 2 195147 CASAVA_Build 12 100966548 1D GAAATCATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 10 9 195148 CASAVA_Build 12 101002379 2I CATGGTGAAA --/CT CTGTTTCTAC 3070 het 1931 hom 27 8 17 2 CT 1 2 195149 CASAVA_Build 12 101026214 1D TTTCTCCTGT A/- GTTGGATGCT 3070 hom 117 het 42 0 37 5 A 1 0 195150 CASAVA_Build 12 101029704 2I AGTTATTTTA --/AG AGTTATACTT 3070 het 3070 hom 48 16 27 5 AG 1 2 195151 CASAVA_Build 12 101035350 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1494 het 1494 ref 27 20 4 3 A 11 10 195152 CASAVA_Build 12 101051285 1I TTGTCAGATG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 T 7 8 195153 CASAVA_Build 12 101055425 1D CTGCTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 8 9 4 T 12 11 195154 CASAVA_Build 12 101069023 1I GAGTTAGCTG -/A CAACACACGT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 0 1 195155 CASAVA_Build 12 101075360 1D TCCCCTAATC T/- TTTTTTTTTT 1162 het 1162 ref 31 23 3 5 T 12 11 195156 CASAVA_Build 12 101100438 1I AATTTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 14 13 T 12 13 195157 CASAVA_Build 12 101123850 1I CATCTCAATT -/A AAAAAAAAAA 1197 het 1197 ref 35 22 3 10 A 13 14 195158 CASAVA_Build 12 101129013 1D TATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 724 het 724 ref 22 10 3 9 A 15 14 195159 CASAVA_Build 12 101158821 1I AAAGGATTAT -/A AATCATGCTA 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 A 2 3 195160 CASAVA_Build 12 101175701 1D GAGTATTCTG T/- TTTTTTTTTT 1043 het 1043 ref 42 33 3 6 T 12 11 195161 CASAVA_Build 12 101185084 1I ACTCCCCCTG -/T TTTTTCCTCA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 5 6 195162 CASAVA_Build 12 101186467 1I GGCATATTGA -/G GCCGGGCGCA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 G 1 2 195163 CASAVA_Build 12 101213445 1D TAAGGGCCCA T/- TTTTTTTTTT 1694 het 1694 ref 34 17 5 12 T 17 16 195164 CASAVA_Build 12 101241014 4I TTATTTCTTA ----/CTTT ATTTTATTTA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 CTTT 0 1 195165 CASAVA_Build 12 101251643 1I CAAACGTGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 9 10 195166 CASAVA_Build 12 101256198 1D GATTTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 2549 het 2426 hom 30 8 8 14 T 17 16 195167 CASAVA_Build 12 101263637 4D GCCATCTGTA TATC/---- TTCTTTGGTG 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 TATC 1 0 195168 CASAVA_Build 12 101268434 1D AAGGAGAGAG A/- AGCAAAGAAG 3070 het 3070 hom 55 22 29 4 A 2 1 195169 CASAVA_Build 12 101275006 1D AAATATCCTC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 8 7 195170 CASAVA_Build 12 101298745 1D TGTATACATA T/- TTGTTCTTAG 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 T 3 2 195171 CASAVA_Build 12 101299390 1I CTCTCAAAGT -/G CTGGAATTCC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 0 1 195172 CASAVA_Build 12 101335128 3I CAAAAAAGAT ---/GAA GAAGAGTGCA 3070 hom 101 het 45 0 30 15 GAA 1 2 195173 CASAVA_Build 12 101340610 2D CCTATTTGAG AT/-- AGTTATTTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AT 1 0 195174 CASAVA_Build 12 101395906 1D TCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2745 het 2745 ref 29 12 8 9 T 15 14 195175 CASAVA_Build 12 101396286 1I TTAAAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 16 9 T 10 11 195176 CASAVA_Build 12 101397885 1I CCTGCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1673 hom 46 4 33 9 A 10 11 195177 CASAVA_Build 12 101409336 1I TTTGTTAATC -/T TTTCAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 3 4 195178 CASAVA_Build 12 101437891 1D AATATGGATC A/- AATGACCAGG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 3 2 195179 CASAVA_Build 12 101444047 4I GGTATCTCAC ----/GCCT GCCTGTAATC 3070 het 482 hom 22 2 15 5 GCCT 1 2 195180 CASAVA_Build 12 101465870 3D GGCAGCAGTA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 10 het 23 1 16 6 AAT 7 6 195181 CASAVA_Build 12 101468426 1I ATTTACCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 10 11 195182 CASAVA_Build 12 101469473 1D GGCTTGGGCA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 77 het 27 0 24 3 T 7 6 195183 CASAVA_Build 12 101470392 1D CTACTGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 21 10 T 13 12 195184 CASAVA_Build 12 101471524 1I AATCCAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 652 hom 35 2 23 10 T 11 12 195185 CASAVA_Build 12 101474401 2D GAAGAGAAAC AG/-- GGAACAATGA 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 AG 1 0 195186 CASAVA_Build 12 101475495 4I AGATGTTTGA ----/TATG TAACTGACTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TATG 0 1 195187 CASAVA_Build 12 101477500 1D ACAAAGCCCT G/- GCAACCTGCT 3070 het 3070 hom 50 15 29 6 G 2 1 195188 CASAVA_Build 12 101486714 1I TTCTAACTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 8 9 195189 CASAVA_Build 12 101495149 1I ACATTCTAAT -/A GTTTTCATTC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 0 1 195190 CASAVA_Build 12 101496265 1I AAAAATTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 635 hom 24 3 17 4 A 13 14 195191 CASAVA_Build 12 101496593 2D ATGTATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 2130 hom 27 11 12 4 AC 6 5 195192 CASAVA_Build 12 101505817 1I GTACTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 T 10 11 195193 CASAVA_Build 12 101511532 1D TATAGAACAG A/- AAAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 A 7 6 195194 CASAVA_Build 12 101511685 2D ATGGCGATAA CT/-- CTGTCAACTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 8 CT 2 1 195195 CASAVA_Build 12 101511721 1D TGGGTATAAT A/- AATTTAAGAA 3070 het 2811 hom 34 7 16 11 A 3 2 195196 CASAVA_Build 12 101517059 1I AGAATCCATT -/C CCCTTTCCTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 3 4 195197 CASAVA_Build 12 101525043 1I TTTCTGTGGG -/A TTGGTGGTGA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 0 1 195198 CASAVA_Build 12 101530214 1I57M1D4M1D GCACTGAAAG -AAAAAAAAACTATCAACCCAGAATTTAGTATCCATCAAAAATATCCTTCAGGAATGAGAAACA/AAAAAAAAAACTATCAACCCAGAATTTAGTATCCATCAAAAATATCCTTCAGGAATGA-AAAC- AAAATGAAAC 3070 het 219 hom 28 2 20 22 N/A 0 0 195199 CASAVA_Build 12 101531877 1D CAAAGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 7 6 A 11 10 195200 CASAVA_Build 12 101533586 1D TGTAAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 36 1 20 15 T 17 16 195201 CASAVA_Build 12 101539307 1D CATACAGCCA C/- CTATGCAAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 6 C 2 1 195202 CASAVA_Build 12 101541313 1D TAGCTGCTCA T/- TCTCACATGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 195203 CASAVA_Build 12 101547227 14D TTCAGGCTGG GTCCATATTCTTAA/-------------- GTAGAGCTGA 3070 het 3070 ref 32 16 15 7 GTCCATATTCTTAA 1 0 195204 CASAVA_Build 12 101554170 1D5M1D8M1D5M1D9M1D TGGTCAATTT GCATGGTTTTAGTGGTAAAGGCCATTGTGCTG/-CATGG-TTTAGTGG-AAAGG-CATTGTGCT- AGAAATTGAG 3070 hom 60 het 19 0 21 1 N/A 0 0 195205 CASAVA_Build 12 101554341 1D CTTTGATTTC A/- AACAACTGTC 3070 hom 103 het 38 0 35 4 A 3 2 195206 CASAVA_Build 12 101559011 1I ATTGCAGCAC -/T TTTCACAATG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 3 4 195207 CASAVA_Build 12 101561281 2I6M3D14M1D5M1D TACTGTAAAC --TCTAATAAGCCCGTACACTTCACATAAAGC/TTTCTTTT---CCTGTACACTTGAC-TAGAG- GTGGCCACAC 3070 hom 57 het 21 0 20 2 N/A 0 0 195208 CASAVA_Build 12 101561390 1D TACAGCTATT G/- CCACCCTGTT 3070 hom 123 het 45 0 42 4 G 1 0 195209 CASAVA_Build 12 101577478 1D CAAATTAAAC A/- AAAAAAATGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 8 7 195210 CASAVA_Build 12 101584672 1I CTTGAAGTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 7 8 195211 CASAVA_Build 12 101589893 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 24 0 9 15 T 15 14 195212 CASAVA_Build 12 101597800 1I ATGTGAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 195213 CASAVA_Build 12 101599066 1D TCTAGAACAG T/- TGGTTCTCGG 3070 hom 108 het 40 0 34 7 T 2 1 195214 CASAVA_Build 12 101599859 10D CTCCCTTCAT TCTTTCTTTC/---------- TCTTTCTTTC 3070 hom 34 het 17 0 11 8 TCTTTCTTTC 2 1 195215 CASAVA_Build 12 101605269 3I TGGAAAATAT ---/AGG AGAAGGGGCA 3070 hom 108 het 38 0 35 3 AGG 0 1 195216 CASAVA_Build 12 101607539 1I GGTGGGGAGT -/G GTGGAAAAGG 3070 hom 120 het 46 0 40 6 G 1 2 195217 CASAVA_Build 12 101614911 1D AAAAAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 37 1 32 4 A 11 10 195218 CASAVA_Build 12 101624992 4I GTGGGGCTCC ----/ATCA ATCAGGGTAC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 ATCA 1 2 195219 CASAVA_Build 12 101660484 1D TGGGTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 33 2 24 7 T 13 12 195220 CASAVA_Build 12 101689223 9D GCAATACTCA GTGATTGCT/--------- GTGATTGCTG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 GTGATTGCT 2 1 195221 CASAVA_Build 12 101702375 26D TTAACAAATT TCCACTATGTTCTCTTCATTACAATC/-------------------------- TCCACTATGT 3070 het 3070 ref 40 24 15 14 TCCACTATGTTCTCTTCATTACAATC 1 0 195222 CASAVA_Build 12 101703701 1I TGAATGTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 11 12 195223 CASAVA_Build 12 101706164 1I CTCTTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 1114 het 1114 ref 35 20 4 11 A 13 14 195224 CASAVA_Build 12 101773987 4I ATTAGAAAAC ----/TAAA TAAATAAATA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TAAA 2 3 195225 CASAVA_Build 12 101778413 1I ATATGGAACC -/A AAAAATAGCC 1915 hom 18 het 8 0 6 2 A 5 6 195226 CASAVA_Build 12 101780855 1I AATGATGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 703 hom 45 4 29 12 A 12 13 195227 CASAVA_Build 12 101786085 10D CATATATGTG TATATATATA/---------- TATATATATA 2458 hom 27 het 10 0 10 2 TA 14 9 195228 CASAVA_Build 12 101786572 1D TGATGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 30 6 A 12 11 195229 CASAVA_Build 12 101793863 4I ATATATAGAC ----/AGAG AGAGCGAGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AG 2 4 195230 CASAVA_Build 12 101812338 1I CTTATAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 944 hom 19 2 13 4 A 12 13 195231 CASAVA_Build 12 101852345 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 8 9 195232 CASAVA_Build 12 101868859 1I AAACGGATAG -/T TGTGTGTGTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 1 2 195233 CASAVA_Build 12 101868967 1D GTTTGTGCGT G/- GGGGGGGAAG 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 G 8 7 195234 CASAVA_Build 12 101877339 1D AAAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 5 hom 37 2 31 5 A 10 9 195235 CASAVA_Build 12 101878317 1D TATTACTGCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 9 8 195236 CASAVA_Build 12 101882582 1I GCAACTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 33 1 25 7 A 13 14 195237 CASAVA_Build 12 101883176 3I CATAGAGAGA ---/GAG GAGGAGAGAA 3070 hom 81 het 31 0 26 5 GAG 2 3 195238 CASAVA_Build 12 101890322 3D ATGATGATGG TGA/--- TAACTAGGTG 3070 het 3070 ref 49 26 21 2 TGA 1 0 195239 CASAVA_Build 12 101891355 14D CCCTTCCTTC CTCCCTCCCCCTCT/-------------- CTGCCTCCCT 874 het 874 ref 22 10 4 15 CTCCCTCCCCCTCT 1 0 195240 CASAVA_Build 12 101904496 1D TTTTTTTTTT C/- TCAAAGTCTA 3070 het 1672 hom 24 8 13 3 C 1 0 195241 CASAVA_Build 12 101905575 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 30 1 17 12 T 15 14 195242 CASAVA_Build 12 101911529 1D GAAATTACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 43 0 33 10 T 11 10 195243 CASAVA_Build 12 101914087 1I ATTGTCCAAC -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 7 8 195244 CASAVA_Build 12 101915124 1I CAACTGGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 23 1 19 3 T 12 13 195245 CASAVA_Build 12 101917843 1D TTTCTGAGAG T/- TTTTCTTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 5 4 195246 CASAVA_Build 12 101920543 1D TTCAGAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 11 10 195247 CASAVA_Build 12 101932360 4D TTCCTCCCTC TTCT/---- TTGTTTCTTC 3070 hom 102 het 40 0 31 9 TTCT 1 0 195248 CASAVA_Build 12 101935205 1D TACATTTACC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 9 8 195249 CASAVA_Build 12 101936960 12D AGATCACATG GCAAGAGAGAGA/------------ GCAAGAGAGA 3070 hom 64 het 27 0 18 12 GCAAGAGAGAGA 2 1 195250 CASAVA_Build 12 101938382 1I ACATGTAAGC -/A AAGCCAAGAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 2 3 195251 CASAVA_Build 12 101948805 1D AATAATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 30 1 21 9 A 11 10 195252 CASAVA_Build 12 101957378 21D34M2I AGTGGTCTCT CCTGGCTTTGGCTTTAATGTCCCTGCCTATCCCCCACCCTCATACCCCTGCTGAA--/---------------------CCTGCCTATCCCCCACCCTCATACCCCTGCTGAAAT ATATGTTCTC 3070 hom 90 het 34 0 30 21 N/A 0 0 195253 CASAVA_Build 12 101965940 1I AAGGAGCCTT -/A TTACCAGGAG 3070 hom 122 het 47 0 41 6 A 0 1 195254 CASAVA_Build 12 101975089 1D ACAGCACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 768 hom 32 2 24 6 T 15 14 195255 CASAVA_Build 12 102050232 25D CAGGGCTTGG CTGGGGTCCTGAAATGGCTCCCTAA/------------------------- CATGGGAAAA 3070 hom 149 het 49 0 45 13 CTGGGGTCCTGAAATGGCTCCCTAA 1 0 195256 CASAVA_Build 12 102050705 7I AGCAGCCACC -------/ACCATGG GCTACCGCAG 3070 hom 107 het 44 0 30 14 ACCATGG 0 1 195257 CASAVA_Build 12 102059445 2I CACTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 30 0 25 5 TG 0 1 195258 CASAVA_Build 12 102066542 3I1M2D GAGTAAAATG ---TAA/AGTT-- TATCTTAGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 N/A 0 0 195259 CASAVA_Build 12 102079286 1I GCAAAATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 48 1 35 12 A 10 11 195260 CASAVA_Build 12 102083718 1I GGGAGGCCGA -/G GGGGGTAGAT 1119 het 869 hom 16 4 5 7 G 5 6 195261 CASAVA_Build 12 102088489 1D ATGATCCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 10 9 195262 CASAVA_Build 12 102095031 1D AGGCAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 A 11 10 195263 CASAVA_Build 12 102099172 4D CCATCTAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 2855 het 2855 ref 24 16 7 4 AAAT 3 2 195264 CASAVA_Build 12 102122777 1I ATATTGACCT -/A ATTTACAATA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 1 2 195265 CASAVA_Build 12 102132467 1D CAACAAGCTG T/- GATTTTAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 1 0 195266 CASAVA_Build 12 102133232 2I ACCAAAACTC --/AT ATATATATAT 2156 het 2156 ref 19 10 5 4 AT 5 6 195267 CASAVA_Build 12 102136188 1I ACTCCGCTTC -/A AAAAAAAAAA 2945 het 2945 ref 33 13 12 8 A 16 17 195268 CASAVA_Build 12 102138610 1I GGCCTCCCCC -/T GCTCCCTCCC 3070 het 3070 hom 35 17 13 5 T 0 1 195269 CASAVA_Build 12 102147397 1I ATATTTATAA -/T TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 2 3 195270 CASAVA_Build 12 102162461 1D GCATTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 2292 het 2292 ref 32 14 8 10 A 15 14 195271 CASAVA_Build 12 102164703 1I AAAATGACCA -/T TGGACTATGT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 1 2 195272 CASAVA_Build 12 102175530 1I TACAGTGTGG -/A AAAACACATA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 4 5 195273 CASAVA_Build 12 102186408 1I ATTTTTCATT -/A AAAAAAAAAA 2138 het 1131 hom 21 6 8 7 A 10 11 195274 CASAVA_Build 12 102213323 1I GCATACATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 60 25 26 9 T 11 12 195275 CASAVA_Build 12 102235606 1I TTCTGAGTAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 8 9 195276 CASAVA_Build 12 102299825 2D38M3D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAATTTGCTTTCTCTTTCTCTGCCTCAGTCTC/--AAAAAAAAAAAATTTGCTTTCTCTTTCTCTGCCTCAGT--- CTCATCTGTA 3070 hom 36 het 14 0 13 14 N/A 0 0 195277 CASAVA_Build 12 102301031 2D TGACTCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 41 0 26 16 T 13 11 195278 CASAVA_Build 12 102303485 4I TCCATATAAT ----/ACTC AATAATGTTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 ACTC 0 1 195279 CASAVA_Build 12 102310527 1D CTTAATTTCC T/- TTTCAGGTTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 4 3 195280 CASAVA_Build 12 102333943 2I GTTTAGTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 31 0 26 5 T 11 13 195281 CASAVA_Build 12 102334141 1I ATGTAGGTTA -/A AAAAAAAAGG 3070 het 570 hom 33 3 21 9 A 9 10 195282 CASAVA_Build 12 102334537 1I CAAGACAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 9 10 195283 CASAVA_Build 12 102346816 5D GCCTTTAATA AAATT/----- CAACACCCCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AAATT 1 0 195284 CASAVA_Build 12 102349007 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 396 hom 31 1 27 3 A 8 9 195285 CASAVA_Build 12 102367332 1I CCAAAATCTC -/A AGAAATCACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 195286 CASAVA_Build 12 102369281 10I ACCACAAGTG ----------/TGCACCACCA TGCCCACCTA 3070 hom 78 het 29 0 25 5 TGCACCACCA 0 1 195287 CASAVA_Build 12 102370934 1D ATAGTATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 5 A 11 10 195288 CASAVA_Build 12 102382325 1I TTTAATGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 17 2 12 3 T 11 12 195289 CASAVA_Build 12 102384479 2I CTCTCCCTGA --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 1104 hom 49 3 33 13 CT 7 8 195290 CASAVA_Build 12 102399565 1D GAGTTACTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 9 195291 CASAVA_Build 12 102409868 3I TTGTTTTTTT ---/TTG TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TTG 0 1 195292 CASAVA_Build 12 102478262 9D TGCAAGATCA GGCTCTGAT/--------- GCTTACTAGC 3070 het 3070 ref 47 19 18 15 GGCTCTGAT 1 0 195293 CASAVA_Build 12 102487948 1D AATCAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 38 0 26 13 A 12 11 195294 CASAVA_Build 12 102495163 1D ACAAAAAAAA T/- ACCAAAGTAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 1 0 195295 CASAVA_Build 12 102525307 1D GTTTTTTTTT A/- ATTATACTTT 3070 het 2038 hom 21 6 12 3 A 2 1 195296 CASAVA_Build 12 102549350 1I TGTTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 41 1 25 15 A 13 14 195297 CASAVA_Build 12 102569386 3I CATGCCCAGC ---/TAT TAATGTTGAT 3070 hom 102 het 36 0 35 2 TAT 0 1 195298 CASAVA_Build 12 102581319 1I TCTGGGGGCT -/C CCAACAATTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 2 3 195299 CASAVA_Build 12 102595289 4D GTCTGGAAAT TCTC/---- TCTTATTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TC 3 1 195300 CASAVA_Build 12 102600058 8D AAAACATCCT GATGGGAA/-------- GATGGGAAGA 3070 het 3070 hom 34 16 15 6 GATGGGAA 3 2 195301 CASAVA_Build 12 102600514 1D ATGCTTTTTA G/- GGCCCAAGTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 G 3 2 195302 CASAVA_Build 12 102600856 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 7 6 195303 CASAVA_Build 12 102606919 1D AGTCTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 T 11 10 195304 CASAVA_Build 12 102607403 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1314 hom 25 8 15 2 A 11 10 195305 CASAVA_Build 12 102610305 1I TGTGGGGGCA -/G GGGGGGGACA 3070 het 3070 hom 38 11 13 14 G 7 8 195306 CASAVA_Build 12 102611431 1D AAGAACTGGA G/- GGAGAGGCAT 3070 het 3070 ref 54 26 25 5 G 3 2 195307 CASAVA_Build 12 102619727 1D TAAATCATAA G/- GGACTTTAAC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 G 3 2 195308 CASAVA_Build 12 102620047 3D GTTCTTCCCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 511 hom 23 3 15 6 A 17 14 195309 CASAVA_Build 12 102622197 5D GGTTTTTAAT AAATA/----- AAAGTTATTG 3070 het 3070 hom 31 9 20 3 AAATA 1 0 195310 CASAVA_Build 12 102657053 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 39 2 19 18 T 15 14 195311 CASAVA_Build 12 102659989 3I ACACTGTATC ---/ATA ATCATTATTA 3070 het 3070 ref 46 28 16 2 ATA 0 1 195312 CASAVA_Build 12 102662059 1D TTAATGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 11 10 195313 CASAVA_Build 12 102665478 1D AGGAATTGTT A/- AAAATCACAT 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 A 5 4 195314 CASAVA_Build 12 102669845 12D CTTTCCCTAT AGGCACAGTTAC/------------ AGAACCATCC 3070 het 3070 hom 33 12 20 4 AGGCACAGTTAC 1 0 195315 CASAVA_Build 12 102674380 1I ACATGACAGG -/T TGCTCCATAA 3070 het 3070 ref 56 28 21 7 T 1 2 195316 CASAVA_Build 12 102678917 4I TTTGCTACTT ----/ACTC CCTGGGTGAT 3070 het 3070 ref 53 22 22 9 ACTC 0 1 195317 CASAVA_Build 12 102704438 2I GCTTTTACTC --/AG AGAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 51 21 18 12 AG 3 4 195318 CASAVA_Build 12 102717713 1D TCCACATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2131 hom 32 8 15 11 A 13 12 195319 CASAVA_Build 12 102721768 1I TTCATTACCA -/C CCCCCCCCCC 1123 het 1123 ref 29 12 5 12 C 10 11 195320 CASAVA_Build 12 102727960 10D GGCAAGTCAG GGCAGTGCCT/---------- GGCACATGGG 3070 het 3070 ref 34 20 12 7 GGCAGTGCCT 1 0 195321 CASAVA_Build 12 102735514 1I CATTCTCTCA -/T TTAATCCTTC 3070 hom 148 het 56 0 50 6 T 2 3 195322 CASAVA_Build 12 102750420 3D ATTATTTAAT CTC/--- CTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 CTC 1 0 195323 CASAVA_Build 12 102754580 1I TCCTTTTTCC -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 T 6 7 195324 CASAVA_Build 12 102787402 12D TATGAGTTAT GTTATGTTATGA/------------ GTTATGTTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 7 GTTATGTTATGA 2 1 195325 CASAVA_Build 12 102787528 1D ATCTCTCTCT C/- TCTTTTTTTT 1431 hom 7 het 13 0 8 6 C 1 0 195326 CASAVA_Build 12 102791348 4I CAGGAGCAGA ----/TTTT TTTTTTTAAA 3070 hom 71 het 27 0 22 5 T 7 11 195327 CASAVA_Build 12 102792558 1I ACCACAAACA -/G GGTGGCTTAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 G 2 3 195328 CASAVA_Build 12 102793514 3I CAACATATAG ---/AAT AAGAGAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAT 0 1 195329 CASAVA_Build 12 102797938 1D GAATTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 32 0 28 4 A 11 10 195330 CASAVA_Build 12 102802525 1I CCCCTGCAGG -/A AAAAAAACTC 3070 hom 105 het 42 0 34 8 A 7 8 195331 CASAVA_Build 12 102805717 1I AACAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 54 1 44 9 A 10 11 195332 CASAVA_Build 12 102807686 1I TCAAATGAGG -/A AAACGGAGCA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 3 4 195333 CASAVA_Build 12 102808210 2D TGTGCAACCC CA/-- GTCAGCCAAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CA 1 0 195334 CASAVA_Build 12 102808246 10I GCCTTAGCAT ----------/TTTTTTTTTA TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 7 TTTTTTTTTA 0 1 195335 CASAVA_Build 12 102809270 10D ACTGTTATAG CAGAGAAAAA/---------- CAGAGAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 9 CAGAGAAAAA 2 1 195336 CASAVA_Build 12 102812334 1I ATGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 27 10 A 11 12 195337 CASAVA_Build 12 102812784 4D CTTCAGGTAA CTGT/---- CTGGCCATCC 3070 hom 96 het 38 0 29 11 CTGT 1 0 195338 CASAVA_Build 12 102813223 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 15 1 9 5 T 11 10 195339 CASAVA_Build 12 102814794 1D AATAATGAAG T/- TTTTATTCTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 5 4 195340 CASAVA_Build 12 102815662 3I TAAAGTGACC ---/TAG TAGCAGCAAC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TAG 1 2 195341 CASAVA_Build 12 102817891 2D CAAGCAGCCC CT/-- GTCAGAGCCC 3070 hom 30 het 12 0 10 4 CT 1 0 195342 CASAVA_Build 12 102820154 3I AATAAATAAT ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 111 het 44 0 36 8 AAC 3 4 195343 CASAVA_Build 12 102820232 1I GTTTTTTGGG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 7 8 195344 CASAVA_Build 12 102834557 1D AAGAGCTCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 10 9 195345 CASAVA_Build 12 102835076 1D CACACTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 11 10 195346 CASAVA_Build 12 102835614 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 22 4 A 11 10 195347 CASAVA_Build 12 102835802 1D AAAACGTGAA G/- ATGGGACAAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 0 195348 CASAVA_Build 12 102836062 2D GCATAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 27 1 19 7 A 14 12 195349 CASAVA_Build 12 102837848 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 13 12 195350 CASAVA_Build 12 102838538 1I GTCTTTAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 9 195351 CASAVA_Build 12 102842675 1D GAAATATCAC T/- TTTTGTCTTA 3070 hom 60 het 26 0 19 7 T 5 4 195352 CASAVA_Build 12 102857147 17I AGCTAGGACC -----------------/ACAGACACACGCCACCA ACAGACACAC 3070 hom 54 het 31 0 18 13 ACAGACACACGCCACCA 1 2 195353 CASAVA_Build 12 102859881 2D TTTGTGGAGT AA/-- AACCAGATTT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 4 2 195354 CASAVA_Build 12 102865883 1D CTTGGCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 34 2 20 12 T 14 13 195355 CASAVA_Build 12 102872238 5I TTATAAAGAA -----/AAGAG GTTTATTTGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AAGAG 0 1 195356 CASAVA_Build 12 102876815 3I CAAAAACCTC ---/CTG CTTTCTTAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CTG 0 1 195357 CASAVA_Build 12 102879063 1D25M1D TTTGTGTCTT AAGTTTTTCACAAAATTTTTAAAAGTA/-AGTTTTTCACAAAATTTTTAAAAGT- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 19 0 25 2 N/A 0 0 195358 CASAVA_Build 12 102884574 2D TGGGGGAGTC AA/-- GAGAAAAATT 3070 hom 96 het 35 0 32 4 A 2 0 195359 CASAVA_Build 12 102885740 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 15 14 195360 CASAVA_Build 12 102888657 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 18 4 A 10 9 195361 CASAVA_Build 12 102893968 1D TAGCAGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 17 0 13 4 A 11 10 195362 CASAVA_Build 12 102904460 5I ACAAAAATTA -----/GCTGG GCATGGTGGC 3070 hom 42 het 19 0 13 6 GCTGG 0 1 195363 CASAVA_Build 12 102905336 2I GATTCTTAAC --/TG TGCATAAACC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TG 1 2 195364 CASAVA_Build 12 102927933 1I TAAACAAACC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 46 0 37 9 A 9 10 195365 CASAVA_Build 12 103003645 2I AGTTAAACTT --/TG TGCATTTGAT 3070 hom 92 het 42 0 29 13 TG 1 2 195366 CASAVA_Build 12 103005261 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 12 0 10 2 A 17 16 195367 CASAVA_Build 12 103017526 1I CTCTAAATTT -/A AAAAAAAAAA 1545 het 1545 ref 31 21 4 6 A 15 16 195368 CASAVA_Build 12 103050313 1D AAATCACATT A/- AAAAAAAAAA 2665 het 2665 ref 47 28 7 12 A 11 10 195369 CASAVA_Build 12 103130501 1D TCCATCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 24 1 21 2 A 14 13 195370 CASAVA_Build 12 103151224 1D AAAGGGAAAC T/- TTTGAAGAGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 3 195371 CASAVA_Build 12 103158280 4I CAACTGGGAA ----/GATT GATTGAGGTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 GATT 1 2 195372 CASAVA_Build 12 103171302 1I CAGAAGACAC -/A AGTCCCATCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 1 2 195373 CASAVA_Build 12 103174685 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2161 het 5 hom 18 1 8 9 A 15 16 195374 CASAVA_Build 12 103178387 2D CAAAACAAAC AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 10 8 195375 CASAVA_Build 12 103190699 1I GACTCCACCT -/A AAAAAAAAAA 1572 het 78 hom 6 1 4 1 A 13 14 195376 CASAVA_Build 12 103195788 1I GGCAAGATTC -/T TTTTTTTTTT 2861 het 791 hom 21 4 9 8 T 15 16 195377 CASAVA_Build 12 103207648 1D TTATGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 17 9 A 12 11 195378 CASAVA_Build 12 103216717 1I TTGTATACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 11 12 195379 CASAVA_Build 12 103223269 1D AACAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 44 0 35 10 A 11 10 195380 CASAVA_Build 12 103228096 8D CTCTGTGAGA CTCCCAGG/-------- CTGGAGTGCA 3070 hom 29 het 12 0 10 3 CTCCCAGG 1 0 195381 CASAVA_Build 12 103243780 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2146 het 397 hom 14 3 8 4 A 17 16 195382 CASAVA_Build 12 103263557 20I CATAGTTATG --------------------/AGTAGTAATTTCAACTAATC AAGTTCACTT 3070 hom 102 het 34 0 35 5 AGTAGTAATTTCAACTAATC 0 1 195383 CASAVA_Build 12 103272969 1D CATTGCTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 27 2 17 8 A 12 11 195384 CASAVA_Build 12 103278042 1D CCTCCCCCCG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 12 het 17 0 10 7 C 10 9 195385 CASAVA_Build 12 103282897 1I CCGTCTCCAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 A 7 8 195386 CASAVA_Build 12 103288777 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 7 8 195387 CASAVA_Build 12 103289879 6I AGACAGCAGT ------/CCTCAA CCTTTTTGGC 3070 hom 118 het 46 0 34 12 CCTCAA 0 1 195388 CASAVA_Build 12 103292534 1D CAGAGCTGGC A/- AAATTATTCT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 A 4 3 195389 CASAVA_Build 12 103295490 3I CGAATGGGGA ---/GAG GAGGACCCCT 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 GAG 1 2 195390 CASAVA_Build 12 103297266 1I TCTTTCTTTC -/T TTTCTTTTTT 2026 het 2026 ref 20 7 10 3 T 3 4 195391 CASAVA_Build 12 103298437 1I GTTTTGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2910 hom 23 9 13 1 T 11 12 195392 CASAVA_Build 12 103303624 6D ACATCACCAT CACCAC/------ CACCATCATC 268 het 268 ref 40 17 3 23 CAC 3 1 195393 CASAVA_Build 12 103315874 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 2 3 195394 CASAVA_Build 12 103322516 1I CTGTCTCTAT -/A AAAAAATTAA 3070 hom 70 het 26 0 24 2 A 6 7 195395 CASAVA_Build 12 103322680 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAACTTTT 3070 hom 65 het 24 0 22 2 A 6 5 195396 CASAVA_Build 12 103351756 5I AAGGTAATTG -----/CTGTC CTGACTTGGT 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 CTGTC 0 1 195397 CASAVA_Build 12 103352424 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2089 het 1285 hom 17 5 8 5 T 16 15 195398 CASAVA_Build 12 103352740 4I TTGGGAAAAC ----/TATT TAGCCTTTCT 3070 het 3070 ref 57 27 19 11 TATT 0 1 195399 CASAVA_Build 12 103360233 1D CCCAGCTAAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 2900 hom 16 7 8 1 T 8 7 195400 CASAVA_Build 12 103404213 1D GTCAGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 15 14 195401 CASAVA_Build 12 103414639 1D TCCTCAAAAC T/- TTTTTTTTTT 935 het 935 ref 43 31 3 9 T 13 12 195402 CASAVA_Build 12 103415484 1I CTCACGTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 A 9 10 195403 CASAVA_Build 12 103417324 1I AAATCCAGGT -/A CCTGGGCTGT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 0 1 195404 CASAVA_Build 12 103418287 1D TGGCACAGAG A/- ATTTTAAATG 3070 het 3070 ref 36 24 10 3 A 2 1 195405 CASAVA_Build 12 103436883 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2691 het 2691 ref 23 10 8 5 T 15 14 195406 CASAVA_Build 12 103458278 1D CAGATTTAGG A/- AAAGTCATTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 4 3 195407 CASAVA_Build 12 103462053 18D AAAAAAAGAA AGAAAGAAAGAAAGAAAG/------------------ AAAGAAAGAA 3070 hom 41 het 18 0 14 7 AGAAAGAAAGAAAGAAAG 1 0 195408 CASAVA_Build 12 103463092 1D AATCCATTCA T/- TGCCTTCTTA 3070 hom 126 het 47 0 42 7 T 2 1 195409 CASAVA_Build 12 103464265 2D AGTCCCAGCT AC/-- ATGGGAGGCT 3070 hom 38 het 33 1 25 7 AC 1 0 195410 CASAVA_Build 12 103464385 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- ATTTAAATTT 3070 hom 61 het 29 0 24 6 AAAG 1 0 195411 CASAVA_Build 12 103479702 2D ATTAGGTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 2794 het 2665 hom 28 9 10 9 T 16 14 195412 CASAVA_Build 12 103482921 1D TTGTGACATG T/- GGGGATTATG 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 1 0 195413 CASAVA_Build 12 103501640 1D TTTTTTTTGA G/- GATGGAGTCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 2 1 195414 CASAVA_Build 12 103502587 5I AGTGGTTAAT -----/TTAAC TTAAACTCCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTAAC 0 1 195415 CASAVA_Build 12 103503300 1I AACAGTGAGA -/T TTTGGGTTGG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 3 4 195416 CASAVA_Build 12 103514493 7I GCTACTTGCC -------/CTTGCTG CTTGCTGACT 3070 hom 166 het 63 0 56 7 CTTGCTG 1 2 195417 CASAVA_Build 12 103516799 26D GCCTAGCTGA GTTGGGAGGTGACCCTCACCTCACAG/-------------------------- GTTGGGCAGC 3070 hom 85 het 25 0 25 7 GTTGGGAGGTGACCCTCACCTCACAG 1 0 195418 CASAVA_Build 12 103522945 2D AGTAATAAAC AG/-- AGTGAAATTC 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 AG 2 1 195419 CASAVA_Build 12 103529137 1D TTTAGTCAAT A/- AAAAATGTAT 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 A 6 5 195420 CASAVA_Build 12 103531113 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 10 9 195421 CASAVA_Build 12 103531181 4D AATGTGAGTG AGAT/---- AGATAGATAG 3070 het 3070 ref 29 13 12 5 AGAT 5 4 195422 CASAVA_Build 12 103542436 3I AATGAATGAA ---/GGT GGGAAAAATG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 GGT 0 1 195423 CASAVA_Build 12 103550715 1D GTCCTCCTCC G/- GGAGGAGCCC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 G 3 2 195424 CASAVA_Build 12 103552993 7D GGAGTCCTGT CCTGCCC/------- CCGTACCCAG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 CCTGCCC 1 0 195425 CASAVA_Build 12 103560712 1D GGGATTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 11 10 195426 CASAVA_Build 12 103572832 1I AGCATCCTCA -/T TTATAATGAC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 2 3 195427 CASAVA_Build 12 103588378 2I TATGTTCAGA --/CC CCCACACACA 3070 het 3070 ref 59 28 25 6 C 3 5 195428 CASAVA_Build 12 103623827 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 11 10 195429 CASAVA_Build 12 103628112 1I TGTCTCAAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 7 8 195430 CASAVA_Build 12 103632460 12D GTGGAGGTGG TGATGATGATGA/------------ TGATGATGAT 3070 het 3070 hom 53 15 26 16 TGA 8 4 195431 CASAVA_Build 12 103661849 2I ACATGATCTC --/TT TCTTTTTTTA 3070 hom 71 het 27 0 24 3 T 1 3 195432 CASAVA_Build 12 103678166 1I CCCTTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 121 het 47 0 41 6 A 10 11 195433 CASAVA_Build 12 103686712 1I TTTCAGATAA -/G AATTGTGAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 195434 CASAVA_Build 12 103697068 1D AATCTCATAG A/- AAAAATGTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 6 5 195435 CASAVA_Build 12 103716505 1D AAAAAGTTGC T/- TTTTTTTTTT 1289 het 1289 ref 31 27 4 0 T 11 10 195436 CASAVA_Build 12 103727282 4I TTTTAGCTCT ----/AACA AACACCTTTA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AACA 1 2 195437 CASAVA_Build 12 103742941 1I ACTTTGTCTC -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 82 het 30 0 27 3 T 6 7 195438 CASAVA_Build 12 103747746 1I TTACTTTGTG -/A CATATGAACA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 0 1 195439 CASAVA_Build 12 103753760 1I CAAAGCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 26 1 18 7 T 10 11 195440 CASAVA_Build 12 103759231 1I AAAATCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 873 hom 33 2 25 6 T 11 12 195441 CASAVA_Build 12 103762882 1I AGGGTAGCCA -/C TTCTGATCTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 0 1 195442 CASAVA_Build 12 103773900 1I CCATGAAATG -/A AGCCGTATGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 1 2 195443 CASAVA_Build 12 103784496 1D CTCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 890 hom 26 3 14 9 A 17 16 195444 CASAVA_Build 12 103811889 1D ATTGTACATT A/- AAAAATAACT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 6 5 195445 CASAVA_Build 12 103820095 1I AGTTAAAAAG -/A AGACCATACT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 1 2 195446 CASAVA_Build 12 103824976 1I CTGCCTTGTT -/A ATTCATGTAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 195447 CASAVA_Build 12 103829729 1D AGCACTGGGT G/- GGGGGGGTTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 8 7 195448 CASAVA_Build 12 103843474 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 11 12 195449 CASAVA_Build 12 103848113 11I TGTGGACTTG -----------/CACTGAGACTC CAATGAGTAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CACTGAGACTC 0 1 195450 CASAVA_Build 12 103853302 1I GGTGATGTAT -/A ATGTTAGTTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 1 2 195451 CASAVA_Build 12 103858260 1D AGGCTCACCT G/- GGGGGGAGGG 555 het 3 hom 8 0 2 6 G 7 6 195452 CASAVA_Build 12 103873665 1D TTTTTAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1300 hom 50 3 34 13 T 13 12 195453 CASAVA_Build 12 103883751 3I TCTCACTAAC ---/ATT ATTCTGAAAG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 ATT 1 2 195454 CASAVA_Build 12 103886180 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1859 het 769 hom 11 3 6 2 T 11 10 195455 CASAVA_Build 12 103891242 2D TGCCCAGCAA TT/-- TTTTTTTCTT 3070 het 1270 hom 20 6 12 2 T 9 7 195456 CASAVA_Build 12 103917586 1I TAGAATTCTG -/C CCCTACCACT 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 C 3 4 195457 CASAVA_Build 12 103927936 1D GGAATAGTTT C/- AGAAGGAATG 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 C 1 0 195458 CASAVA_Build 12 103930933 3I GCTGGGAGAT ---/CTG CTGCTCTCTT 1934 het 1934 ref 27 13 5 9 CTG 1 2 195459 CASAVA_Build 12 103936285 1I AAAAGGAATC -/A TGGCACATGA 3070 het 3070 hom 61 26 29 6 A 0 1 195460 CASAVA_Build 12 103949384 5D CCCTTCTTTG TTTTA/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 45 21 18 9 TTTTA 1 0 195461 CASAVA_Build 12 103957226 1D CTTACAGCTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 A 9 8 195462 CASAVA_Build 12 103959781 2I GCCCCTATTA --/CT CTTTGAGCAT 3070 het 3070 ref 58 26 27 5 CT 1 2 195463 CASAVA_Build 12 103959989 2I TGTATACACA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 54 19 24 11 AC 7 8 195464 CASAVA_Build 12 103960316 3I TTGGGTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 TTG 4 5 195465 CASAVA_Build 12 103960789 1D CAAAATGAAA G/- CAATACCTTC 3070 het 3070 hom 51 24 21 7 G 1 0 195466 CASAVA_Build 12 103962295 1D CCAACTCAGA C/- CAATTAAATC 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 C 2 1 195467 CASAVA_Build 12 103963397 1D ACATATACAT A/- ATGAAACTAC 3070 het 1978 hom 28 6 17 6 A 2 1 195468 CASAVA_Build 12 103963707 2I27M2I AAGAAGAAAT --AAGAGTTGAGAGGTAACAAATTATAAA--/AAAAGAGTTGAGAGGTAACAAATTATAAACT CTTCTAGAAT 3070 het 3070 ref 31 25 8 8 N/A 0 0 195469 CASAVA_Build 12 103966956 2I GAAAAAAAAA --/TT TTTTTTTTTA 2936 het 2374 hom 20 9 7 4 T 9 11 195470 CASAVA_Build 12 103970223 1D GTATTACTGA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 4 3 195471 CASAVA_Build 12 103971761 5I TTATTATATA -----/ATATG TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 ATATG 0 1 195472 CASAVA_Build 12 103972692 1D TCCTGGACTC A/- AAGTGATCCT 3070 het 3070 hom 32 10 16 10 A 3 2 195473 CASAVA_Build 12 103973602 4I AATTAAAGGA ----/AAGT AAGAGAATAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 AAGT 0 1 195474 CASAVA_Build 12 103980247 10I GGAACTAGCG ----------/GGACTCTTAA GCCTACAGTC 3070 het 3070 ref 42 17 20 7 GGACTCTTAA 0 1 195475 CASAVA_Build 12 103981876 1I GTATTAATTC -/T TTTTTTTTTT 1609 het 1609 ref 29 10 5 14 T 16 17 195476 CASAVA_Build 12 103989346 1I CTGAGAAGAG -/C CGCTGTCCCC 3070 het 3070 ref 28 10 9 9 C 1 2 195477 CASAVA_Build 12 103991317 20D GACAAATGGA AAGGGGGTCCTGACCCTGGG/-------------------- ACCAGGCACT 3070 het 3070 ref 38 23 19 7 AAGGGGGTCCTGACCCTGGG 1 0 195478 CASAVA_Build 12 103997642 5D AGCTCCTTAC GAAAA/----- GAAAAGATCA 2683 het 2683 ref 23 14 7 2 GAAAA 2 1 195479 CASAVA_Build 12 104005596 2I CACAAAACTC --/TG TATGAAAGTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 TG 0 1 195480 CASAVA_Build 12 104012774 1D TGGGTACATA G/- GTAGGTGTAT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 G 2 1 195481 CASAVA_Build 12 104014453 2I TGTTTGGCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 T 11 13 195482 CASAVA_Build 12 104029993 4D AGGCAACCAC CAGT/---- CAATCTACTT 3070 het 3070 hom 55 19 28 10 CAGT 1 0 195483 CASAVA_Build 12 104043297 4D GATACTAATC TATT/---- TATGTGTTAA 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 TATT 1 0 195484 CASAVA_Build 12 104048618 1I AGTATTCCTG -/C CCCCCATACT 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 C 5 6 195485 CASAVA_Build 12 104053604 8I GTCTCTAATC --------/TGCTGTTA AATTCATCTA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 TGCTGTTA 0 1 195486 CASAVA_Build 12 104055094 6I CTTTTTTCCT ------/GTTTTC TTATTCCACT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 GTTTTC 0 1 195487 CASAVA_Build 12 104059927 1D GGGGTCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 12 11 195488 CASAVA_Build 12 104060561 2I TTTAATAAAC --/TA TTTTAAAATT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 TA 0 1 195489 CASAVA_Build 12 104062548 3D TCAAGGACAA GTT/--- GTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 12 9 GTT 3 2 195490 CASAVA_Build 12 104068785 3I GGAAGCCCTT ---/ATA ACAACCATCA 2809 het 2809 ref 20 13 6 1 ATA 0 1 195491 CASAVA_Build 12 104072960 4I TTTCCGTCTG ----/TTCT TTCTTTCAAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTCT 1 2 195492 CASAVA_Build 12 104073304 1I CCCTGATTCG -/T TTCACATTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 3 195493 CASAVA_Build 12 104073383 1D4M2D8M1D3M1D9M1D3M1D4M1D AACAGTAGCA GAGGGGTGCAAGATCGATGTCAGGATTTTGATTACTGAG/-AGGG--GCAAGATC-ATG-CAGGATTTT-ATT-CTGA- GGTGGAAAGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 N/A 0 0 195494 CASAVA_Build 12 104073476 1D11M1D GCCGGGCATG TGTGGCTCACACA/-GTGGCTCACAC- CTGTAATCCC 1848 hom 10 het 5 0 4 1 N/A 0 0 195495 CASAVA_Build 12 104073625 1D GGCGGACGCC A/- TGTGATCACA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 1 0 195496 CASAVA_Build 12 104075803 1D GTCAGTTGTG C/- ATTTGTCCCA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 C 1 0 195497 CASAVA_Build 12 104077540 1D TGAGTTCTTG A/- AAAAAAGAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 6 195498 CASAVA_Build 12 104089681 4I ATTTAAAAAT ----/AGTC AGTGCATGCA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 AGTC 0 1 195499 CASAVA_Build 12 104092785 2D TTTTTTTGGT GG/-- GGGGGGGGGT 1061 het 582 hom 27 8 4 15 G 11 9 195500 CASAVA_Build 12 104093683 2I AATCTGAAAG --/AA AGGAAATCTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 3 195501 CASAVA_Build 12 104102828 1D GCCCCTGACT G/- GGGGCTGCTA 3070 het 2993 hom 19 8 8 3 G 5 4 195502 CASAVA_Build 12 104109992 1D TGTCCAAAAC A/- TGAACTCTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 A 1 0 195503 CASAVA_Build 12 104128708 1I CTTTCTCCAA -/G ACCCCGCTTT 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 G 0 1 195504 CASAVA_Build 12 104136035 1I ATTATAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 9 10 195505 CASAVA_Build 12 104145043 1I AATTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2084 hom 30 8 15 7 A 10 11 195506 CASAVA_Build 12 104146576 1I TTTGTTCCAC -/A AAACAAAGAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 3 4 195507 CASAVA_Build 12 104147681 4D CTTGTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 1807 hom 22 5 12 5 TTTC 4 3 195508 CASAVA_Build 12 104152702 1D ATATAAAAAA G/- GGAGGCCTTG 3070 hom 114 het 44 0 39 6 G 3 2 195509 CASAVA_Build 12 104155178 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1328 hom 27 7 10 10 A 17 16 195510 CASAVA_Build 12 104158992 1I GAGACTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 9 10 195511 CASAVA_Build 12 104159614 1D TCTGCCACCT A/- GGGTTCAAGC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 1 0 195512 CASAVA_Build 12 104160921 2D GTGTCCTGAC AG/-- GGGACGATGC 3070 het 3070 ref 52 26 21 6 AG 1 0 195513 CASAVA_Build 12 104173847 2I AAAAAAAAAA --/AT TCACTGAATT 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 AT 0 1 195514 CASAVA_Build 12 104189903 1D AGAAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 1049 het 1049 ref 38 22 3 15 T 15 14 195515 CASAVA_Build 12 104197936 1D CTGTGCATCT C/- CGCCATACTA 3070 het 41 hom 39 2 21 16 C 2 1 195516 CASAVA_Build 12 104234946 8D AGGGAAAGAA AAGAAAGG/-------- AAGAAAGGAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 AAGAAAGG 3 2 195517 CASAVA_Build 12 104246399 1D GAAGCAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 59 25 22 12 T 12 11 195518 CASAVA_Build 12 104250644 1D CGCTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2420 het 360 hom 19 4 9 6 A 15 14 195519 CASAVA_Build 12 104256933 1D TTGACCTGAA T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 7 6 195520 CASAVA_Build 12 104262873 1I AAATTCTAAG -/C CCCCCCCCCA 2710 het 2710 ref 28 13 9 6 C 9 10 195521 CASAVA_Build 12 104273771 1D GAGAATAACT G/- GGGGGAGGAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 G 6 5 195522 CASAVA_Build 12 104291270 2I TTTTGGACTC --/TT TTAAAGGCAC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 2 4 195523 CASAVA_Build 12 104295974 2D CTGTTGGCTT AG/-- GTATATTTTT 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 AG 1 0 195524 CASAVA_Build 12 104317103 1D CTGAACTTTC T/- TTTTTTTTTG 1295 het 1295 ref 33 26 3 4 T 10 9 195525 CASAVA_Build 12 104334834 3D AACTTCATCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2254 hom 19 9 10 0 A 15 12 195526 CASAVA_Build 12 104353604 3I TTCTCTTCTT ---/CTG AGCCCTCACT 3070 het 3070 hom 44 20 18 6 CTG 0 1 195527 CASAVA_Build 12 104353975 2D AGAGAGGGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 1593 hom 25 7 12 6 AG 6 5 195528 CASAVA_Build 12 104354257 1I CCCAAATTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 9 10 195529 CASAVA_Build 12 104384739 2D TTCCATGGCG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 38 15 11 12 TC 7 6 195530 CASAVA_Build 12 104401092 1I ATAAACCTTG -/T TTAATTTTAC 3070 het 3070 ref 47 28 16 3 T 2 3 195531 CASAVA_Build 12 104403026 3I TGATTGGGTT ---/TGG GTCATATCAG 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 TGG 0 1 195532 CASAVA_Build 12 104415891 1I ATTTTGAAAA -/G GGAAACTGTC 3070 het 3070 hom 36 12 13 11 G 2 3 195533 CASAVA_Build 12 104419703 1I ATAGAAAGAC -/A ACTACAACAT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 1 2 195534 CASAVA_Build 12 104421816 1I AAAAGCAAGT -/C TGCTCTCTAT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 C 0 1 195535 CASAVA_Build 12 104463807 1I AAGGTGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 10 11 195536 CASAVA_Build 12 104467034 2D TCCCTAACAC TG/-- TTATCTACGG 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 TG 1 0 195537 CASAVA_Build 12 104474289 1D TTACTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 1496 het 851 hom 23 5 6 12 T 19 18 195538 CASAVA_Build 12 104494943 2D ATTCTCCTGA CT/-- CAGCCTCCCA 3070 het 2995 hom 17 7 10 1 CT 1 0 195539 CASAVA_Build 12 104507090 1D TATTTACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 32 1 26 5 T 12 11 195540 CASAVA_Build 12 104510256 3I TCTTGTGCCC ---/ATA ATATTTAAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 ATA 1 2 195541 CASAVA_Build 12 104512681 1D CAGTCCCTTA C/- CCCCCTGGGT 3070 hom 110 het 45 0 34 11 C 6 5 195542 CASAVA_Build 12 104519947 9I CCTTCCTCTC ---------/GTACTGCTA GTACTGCTAA 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 GTACTGCTA 1 2 195543 CASAVA_Build 12 104520490 1D AGAAGTGCCA T/- TCACCTTCCA 3070 het 2758 hom 22 7 8 7 T 2 1 195544 CASAVA_Build 12 104520845 1D GTAATAGTTA G/- GGTTCTCTAG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 G 3 2 195545 CASAVA_Build 12 104536323 2I GTTTTTAATG --/TT TTTTTTTTTT 2424 het 216 hom 52 3 20 29 T 12 14 195546 CASAVA_Build 12 104545174 1I CATGTAAGAT -/G GTATATTGGT 3070 het 3013 hom 24 8 16 0 G 1 2 195547 CASAVA_Build 12 104552184 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2669 hom 25 7 18 1 A 11 10 195548 CASAVA_Build 12 104553246 1I AGAAGAGAGC -/A AAAAAAAAAA 2771 het 2771 ref 37 17 10 10 A 12 13 195549 CASAVA_Build 12 104554035 1I TGACCATCTT -/A ACGTATTTTC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 1 2 195550 CASAVA_Build 12 104563548 8I TAGTTTTCTT --------/AATTGTAA AATTGTAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 AATTGTAA 1 2 195551 CASAVA_Build 12 104576168 1D TTTTTGTCTA T/- TTTTTTTTTC 1251 het 1251 ref 47 36 3 8 T 10 9 195552 CASAVA_Build 12 104603620 2D GAAAAGATCT CA/-- CTTTCTTTTG 3070 het 3070 hom 47 18 25 5 CA 1 0 195553 CASAVA_Build 12 104604993 1D GCCATTCCTG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 T 8 7 195554 CASAVA_Build 12 104605661 2D TCAAGAGAAA AT/-- ATATAATATT 3070 hom 102 het 40 0 35 7 AT 3 2 195555 CASAVA_Build 12 104608437 2I TCTTTTTGCT --/AA AAAAAAAAAA 2840 het 2840 ref 34 15 11 8 A 12 14 195556 CASAVA_Build 12 104615307 1I TTTTAAATTT -/C CCATCTTGAT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 C 2 3 195557 CASAVA_Build 12 104616244 1I CCCACCAATT -/G CACCAAGTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 G 0 1 195558 CASAVA_Build 12 104618818 1D AGTCACTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1863 hom 25 5 15 5 A 11 10 195559 CASAVA_Build 12 104620143 1D AAGCATGCTT A/- AAAACAACCT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 5 4 195560 CASAVA_Build 12 104622994 8D CACCCACACC CACACCCA/-------- CACACACACA 3070 het 597 hom 34 5 16 14 CACACCCA 1 0 195561 CASAVA_Build 12 104625964 1I TTGTACTGGG -/A AAAAAAAAAA 2559 het 367 hom 29 2 12 15 A 10 11 195562 CASAVA_Build 12 104630248 4I TTTCAGGTGT ----/TTTG TTTGTTTGTC 3070 het 3070 ref 48 22 22 4 TTTG 2 3 195563 CASAVA_Build 12 104633405 5D AAAAATAAAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 16 17 9 AAAGA 3 2 195564 CASAVA_Build 12 104636026 2D GTGAGGGCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 21 0 10 12 A 18 16 195565 CASAVA_Build 12 104636590 1D CCTTTTTTTT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 8 7 195566 CASAVA_Build 12 104647932 9D CACATATTAA ATATGTTAT/--------- ATGGTCAGCC 3070 het 3070 ref 45 24 22 5 ATATGTTAT 1 0 195567 CASAVA_Build 12 104651587 1D CCTGAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 40 4 22 16 A 16 15 195568 CASAVA_Build 12 104665595 2D GAATTGTGAC AG/-- GTGGCTGACC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 AG 1 0 195569 CASAVA_Build 12 104666339 2D ATAGGCTGAA GG/-- CTCTGTACTG 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 G 2 0 195570 CASAVA_Build 12 104667656 3D TCTCTCTCTC CTT/--- CTGTCTTTCT 3070 het 3070 hom 54 23 24 9 CTT 1 0 195571 CASAVA_Build 12 104671506 10I CATAGCTGCT ----------/CTTCCCATTG CTGTCTGATG 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 CTTCCCATTG 0 1 195572 CASAVA_Build 12 104674028 2D AATATAATAT TA/-- TATATATTAT 2658 hom 18 het 7 0 7 0 TA 4 3 195573 CASAVA_Build 12 104687384 3D TCTACCTCTC CTT/--- CTTCTGCTAC 3070 het 3070 hom 36 15 16 8 CTT 2 1 195574 CASAVA_Build 12 104689586 1D ATCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 15 0 11 5 A 13 12 195575 CASAVA_Build 12 104700323 1I ATGCTGTCTC -/T TAACTTATTT 2385 hom 15 het 6 0 6 0 T 1 2 195576 CASAVA_Build 12 104704701 1I CTGCTTCTGG -/C CCTGCGTGTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 2 3 195577 CASAVA_Build 12 104704967 1D TTTATAGGTA G/- GGATTCCAAT 3070 hom 126 het 48 0 43 6 G 3 2 195578 CASAVA_Build 12 104715111 2D TGATAGGTTA TC/-- TGGCAGCCAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TC 1 0 195579 CASAVA_Build 12 104715657 1D CAAAATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 130 hom 33 2 20 12 T 15 14 195580 CASAVA_Build 12 104727725 2I AAAACTACTA --/AG AGTGACTATG 3070 hom 123 het 45 0 40 5 AG 1 2 195581 CASAVA_Build 12 104740678 1I GAGGGCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1151 hom 43 4 27 12 T 15 16 195582 CASAVA_Build 12 104741174 8D TTGGTAGTCG GTTTTTTT/-------- GTTTTTTTGT 3070 hom 68 het 31 0 21 12 GTTTTTTT 3 2 195583 CASAVA_Build 12 104741301 1D CTCCTGATTT C/- AAGCAATTGT 3070 hom 45 het 16 0 16 2 C 1 0 195584 CASAVA_Build 12 104741765 5I GGAAACAGAA -----/TAAAG TAGAGTGTGT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 TAAAG 0 1 195585 CASAVA_Build 12 104741953 1D TTACACCCCA T/- TCACCACCAG 3070 hom 116 het 45 0 38 7 T 2 1 195586 CASAVA_Build 12 104745826 4D AAGTATAATT TAAA/---- AAAATAAATA 150 het 150 ref 26 21 3 4 TAAA 1 0 195587 CASAVA_Build 12 104767314 3I CCAGCCTCTT ---/CCC CCCATCCCTA 3070 het 3070 hom 54 22 22 10 C 3 6 195588 CASAVA_Build 12 104781585 1I CTAGAAAGGA -/G GGGGGTCCCA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 5 6 195589 CASAVA_Build 12 104792165 1I AAATTACTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 9 10 195590 CASAVA_Build 12 104797127 1I TGCTATGGAG -/A AAAAAACTAA 3070 hom 190 het 72 0 64 8 A 6 7 195591 CASAVA_Build 12 104814872 23D CCTTCCCTGA TGTCCTTTCCTTTCTCCTCTACT/----------------------- GTTTCTCCTG 3070 het 3070 ref 33 24 13 6 TGTCCTTTCCTTTCTCCTCTACT 1 0 195592 CASAVA_Build 12 104817186 1D GCCGATGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 30 1 24 5 A 11 10 195593 CASAVA_Build 12 104827203 2I ACAGTAGCAA --/AT ATGTCCTAGC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 AT 1 2 195594 CASAVA_Build 12 104838571 1D TCAGTGGGGA C/- CGTTTGCATA 3070 het 3070 ref 44 23 13 9 C 2 1 195595 CASAVA_Build 12 104860821 1D TTAGGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 9 13 T 12 11 195596 CASAVA_Build 12 104863103 1D CCTCTGTCCC T/- TTTTTTTTTT 1980 het 1980 ref 40 13 9 19 T 15 14 195597 CASAVA_Build 12 104864410 1I ACTTTTCCCA -/C ACCCCCCACT 1665 hom 12 het 7 0 5 2 C 0 1 195598 CASAVA_Build 12 104870553 1I TAAAACAAAT -/A AAAAACAATA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 5 6 195599 CASAVA_Build 12 104871164 1D TTAATTTGGA G/- GCCAATGGAA 3070 het 3070 ref 56 26 24 6 G 2 1 195600 CASAVA_Build 12 104898347 4D TCCACAAGTC TGTG/---- TGAGAAGCCA 3070 het 3070 ref 42 26 16 3 TG 3 1 195601 CASAVA_Build 12 104904564 1D TTTTCTATTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 30 12 14 4 A 9 8 195602 CASAVA_Build 12 104905308 2D GGGAGGAGAC CA/-- CACACAAGGG 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 CA 4 3 195603 CASAVA_Build 12 104906282 1I TCTATACTGC -/T TTTTTTTTCT 2966 het 2966 ref 40 23 10 7 T 8 9 195604 CASAVA_Build 12 104914869 4I GATCAAACAG ----/AAGA AAGAATCAGT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 AAGA 1 2 195605 CASAVA_Build 12 104923332 1D ATGGTTTTAC A/- AAAAAAAAAA 1367 het 1367 ref 40 28 3 9 A 11 10 195606 CASAVA_Build 12 104926601 1D TGACAGCCTG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 8 7 195607 CASAVA_Build 12 104927879 16D TCATTATTGT AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 7 A 25 9 195608 CASAVA_Build 12 104929637 2I CATCTCCCCC --/CT CTCTCTCTTC 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 CT 4 5 195609 CASAVA_Build 12 104972297 2D ATATTAACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 35 4 16 15 A 16 14 195610 CASAVA_Build 12 104972815 2I TAATGAAAGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 AT 5 6 195611 CASAVA_Build 12 104972895 2D AGTGTATATA GT/-- GTGTGTGTGT 2972 het 2972 ref 30 14 12 4 GT 6 5 195612 CASAVA_Build 12 104973955 2D AAGACATTAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 32 11 16 7 AG 7 6 195613 CASAVA_Build 12 104980278 1D TTTGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 14 16 T 16 15 195614 CASAVA_Build 12 104983452 1D GATTTGGGGG A/- AAAAAAGCAC 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 A 7 6 195615 CASAVA_Build 12 104984375 8I CATCTGGATG --------/AATGAAGC ACTTCTAAGG 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 AATGAAGC 0 1 195616 CASAVA_Build 12 104999163 1I ATTATCCTCT -/A AGACTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 1 2 195617 CASAVA_Build 12 105021326 6D TAACGAAACT CACTTC/------ CACTTCCACA 3070 het 3070 ref 41 18 16 11 CACTTC 2 1 195618 CASAVA_Build 12 105024289 1D GATATGGGGG T/- TAAAAAAAAA 3070 het 1596 hom 33 11 14 8 T 2 1 195619 CASAVA_Build 12 105026413 1I ACTTCCCTTC -/G ACTTACGTCA 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 G 0 1 195620 CASAVA_Build 12 105054970 1D TGATAACAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 9 8 195621 CASAVA_Build 12 105058772 1D AAGATATGGA T/- TTAGCAGATC 3070 hom 134 het 49 0 40 9 T 3 2 195622 CASAVA_Build 12 105060404 1I ATTTGGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 11 12 195623 CASAVA_Build 12 105087511 1D ACTTAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 28 2 19 8 A 12 11 195624 CASAVA_Build 12 105098908 1D TTTTACGAGA T/- TTTTTTTTTT 1095 het 1095 ref 24 16 3 5 T 13 12 195625 CASAVA_Build 12 105112055 1I ATACTGCAAT -/G TTTTTAGATT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 0 1 195626 CASAVA_Build 12 105115894 1I AAGGCTGAGT -/C CCTAGGATGA 3070 hom 83 het 34 0 26 8 C 2 3 195627 CASAVA_Build 12 105124722 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 7 195628 CASAVA_Build 12 105125575 3I ATTTATTTAA ---/CTT CTTTGTAGAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 CTT 1 2 195629 CASAVA_Build 12 105128217 1I CGACTCCTGC -/T TTTTTTTTTC 1766 hom 10 het 7 0 4 3 T 9 10 195630 CASAVA_Build 12 105129533 1D ACCTTTGGTC T/- TTGATGTTGG 3070 hom 111 het 42 0 36 6 T 3 2 195631 CASAVA_Build 12 105131345 3D CTGCCTTTCA AAG/--- AAGCCAATAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AAG 2 1 195632 CASAVA_Build 12 105135950 1D TCACTAATGC T/- GTTCGTTCTG 3070 hom 143 het 55 0 45 10 T 1 0 195633 CASAVA_Build 12 105144262 17I GCATCCAACA -----------------/TTTGACTTGCCTTATTT TTTGACTTGC 3070 hom 53 het 33 0 18 15 TTTGACTTGCCTTATTT 1 2 195634 CASAVA_Build 12 105153236 2I CCCACACACA --/CC AATTATTGAG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 C 0 2 195635 CASAVA_Build 12 105153391 1I GTAAAGAGGT -/A ATAGTGGTCC 3070 het 3070 ref 53 32 17 4 A 1 2 195636 CASAVA_Build 12 105173551 3I AGGAGGATGA ---/TGG TGGTGATTAT 3070 het 3070 hom 64 25 29 10 TGG 1 2 195637 CASAVA_Build 12 105208988 1D AGAAGGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 11 21 12 T 10 9 195638 CASAVA_Build 12 105209979 2D GCAAAATAAC AT/-- AGATTAATTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 AT 1 0 195639 CASAVA_Build 12 105213651 1D ACACCGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1714 hom 24 5 13 6 T 13 12 195640 CASAVA_Build 12 105214941 1D AGTTTGGGGC A/- AAAAACATGT 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 A 6 5 195641 CASAVA_Build 12 105234021 1D CTTTGGTAAC T/- TGCATTTTGC 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 T 2 1 195642 CASAVA_Build 12 105234163 4I CTTCCATATC ----/CACA CAGTAGCCTT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 CA 1 3 195643 CASAVA_Build 12 105236101 3D ATAATGCATT CAA/--- CAAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 CAA 2 1 195644 CASAVA_Build 12 105250652 2D GAGGAAGCTC TT/-- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 48 28 18 3 T 8 6 195645 CASAVA_Build 12 105254985 1I TCTAAGTCAG -/A AAATTCTTAG 3070 hom 104 het 39 0 35 4 A 3 4 195646 CASAVA_Build 12 105256255 11D GAGCCAGTAT CTGTTGTTCCC/----------- CTTTATGTCC 3070 het 3070 ref 47 27 18 5 CTGTTGTTCCC 1 0 195647 CASAVA_Build 12 105263570 1I TTTTTTTTTT -/A ATCAGTCAGC 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 A 1 2 195648 CASAVA_Build 12 105266878 12I TGATGCTCTT ------------/TTATATATTTGA TTATACTACA 3070 hom 114 het 40 0 37 3 TTATATATTTGA 0 1 195649 CASAVA_Build 12 105271238 1D ACCCTATCTG A/- AAAAAAAAAA 1702 het 1702 ref 36 27 5 5 A 12 11 195650 CASAVA_Build 12 105273934 1D CCCGCCCCCC A/- CCAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 1 0 195651 CASAVA_Build 12 105276041 5D CGCGTGCGCG AGTGA/----- AGGCTGATCC 1765 het 1765 ref 15 7 6 2 AGTGA 1 0 195652 CASAVA_Build 12 105286803 1D CAAATGAGCG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 17 hom 38 2 22 14 T 10 9 195653 CASAVA_Build 12 105289079 1D TTATGCAGCC A/- AAAAACACAT 3070 het 1398 hom 16 4 11 1 A 6 5 195654 CASAVA_Build 12 105301371 1I CATGCAACCC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 47 19 14 14 T 8 9 195655 CASAVA_Build 12 105304815 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1607 hom 28 6 14 8 A 11 10 195656 CASAVA_Build 12 105306233 1I GAAATTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 T 12 13 195657 CASAVA_Build 12 105308612 1I ACTTGTTTGC -/A AAAAAAAAAA 2550 het 2550 ref 29 11 10 8 A 14 15 195658 CASAVA_Build 12 105309366 1D TCTATGAAGG T/- TTTTAAAACC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 5 4 195659 CASAVA_Build 12 105314695 1I GCTGAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 11 12 195660 CASAVA_Build 12 105332013 4D ATCTAATATG CCAT/---- TAATTATCAG 3070 het 3070 ref 44 25 17 4 CCAT 1 0 195661 CASAVA_Build 12 105337666 1I AAGTCTACTT -/G TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 G 0 1 195662 CASAVA_Build 12 105353041 1D CATTAAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2738 hom 32 7 16 9 T 13 12 195663 CASAVA_Build 12 105356749 1I TCAAAAACTC -/T TAAGTTTATG 3070 het 3070 hom 52 17 29 6 T 1 2 195664 CASAVA_Build 12 105359245 4D TAGTGTACTT AAAC/---- AAACCTAGAT 3070 het 3070 ref 36 26 10 3 AAAC 2 1 195665 CASAVA_Build 12 105383378 1I TCCACTAAAC -/T TTTTTTTTTG 1506 het 1506 ref 22 13 4 5 T 9 10 195666 CASAVA_Build 12 105397909 2I TGTTTTTGGG --/TT TTTTTTTTTT 2108 het 2108 ref 17 7 6 4 T 10 12 195667 CASAVA_Build 12 105402502 1I CCATTTCAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 8 9 195668 CASAVA_Build 12 105428685 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3014 het 1171 hom 21 5 10 6 T 10 11 195669 CASAVA_Build 12 105434611 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2408 hom 24 8 11 5 A 15 14 195670 CASAVA_Build 12 105441489 2D TCATTTTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1804 hom 37 11 16 10 A 16 14 195671 CASAVA_Build 12 105445690 1I GAGAGTAGAC -/A AAAACAAGAA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 4 5 195672 CASAVA_Build 12 105445858 1D CTACAAGCAA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 G 1 0 195673 CASAVA_Build 12 105446485 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 21 0 15 6 A 12 11 195674 CASAVA_Build 12 105450312 1D GGTCCTGGAC T/- TTTTTTTTTT 2650 het 2650 ref 27 15 6 6 T 12 11 195675 CASAVA_Build 12 105451766 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1243 hom 30 10 15 5 T 21 20 195676 CASAVA_Build 12 105465189 1D TCTCTGTTTT G/- GGTACCAGTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 3 2 195677 CASAVA_Build 12 105491172 1I AGACAATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 32 1 27 4 A 11 12 195678 CASAVA_Build 12 105491922 1I CATGGTGAAA -/C CCGCATCTCT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 C 2 3 195679 CASAVA_Build 12 105498181 2D GAGAGCAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2800 het 5 hom 37 1 14 23 T 19 17 195680 CASAVA_Build 12 105502028 1I CTGGGCGTCA -/G GTTTTGGGGG 3070 hom 78 het 33 0 24 9 G 1 2 195681 CASAVA_Build 12 105510115 1D AAGAATACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 112 het 45 0 37 9 A 10 9 195682 CASAVA_Build 12 105540763 1D TCTTGACCTC G/- GTGATCTGCC 3070 hom 48 het 17 0 16 1 G 2 1 195683 CASAVA_Build 12 105597373 1D AGAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 A 11 10 195684 CASAVA_Build 12 105602693 3I GCTCAGCACA ---/AAG AAGAATTTTC 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 AAG 1 2 195685 CASAVA_Build 12 105604757 5D CTTTTTTTTT TTTTC/----- TCTCTCTCCC 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 TTTTC 1 0 195686 CASAVA_Build 12 105608490 1I GCTGGTTGCT -/G GGGGGGTGAT 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 G 6 7 195687 CASAVA_Build 12 105613154 2I ATAAAAATTC --/AG AGTTATGTGT 3070 het 3070 hom 57 20 32 5 AG 1 2 195688 CASAVA_Build 12 105642921 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2559 het 2559 ref 36 18 8 11 A 15 14 195689 CASAVA_Build 12 105652504 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1784 het 1784 ref 16 6 6 4 A 13 14 195690 CASAVA_Build 12 105653605 1D CACACATGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 9 8 195691 CASAVA_Build 12 105658724 1I GTGGTCAGAG -/A ATGCCTCCCT 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 A 1 2 195692 CASAVA_Build 12 105677245 2I GGGACCAGAA --/GG GGGAGGCCTC 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 G 3 5 195693 CASAVA_Build 12 105680951 3I ATTAAGTAAA ---/AAT AATAGTACCT 3070 het 2672 hom 25 6 16 3 AAT 1 2 195694 CASAVA_Build 12 105683018 4I AAGACAGCAA ----/AAAC AAACAGTTAT 3070 het 2819 hom 22 7 12 3 AAAC 1 2 195695 CASAVA_Build 12 105707838 1I AGTGCCCTTC -/A AAAAAAAAAA 2260 het 2260 ref 29 16 7 6 A 13 14 195696 CASAVA_Build 12 105718263 2D GAGCAGGAGG AA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 A 2 0 195697 CASAVA_Build 12 105730354 1D CTATAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1682 het 1682 ref 26 13 5 8 T 13 12 195698 CASAVA_Build 12 105734088 1D AAGAAAGAGA T/- TTTTGGTTCC 3070 het 3070 ref 46 23 18 6 T 5 4 195699 CASAVA_Build 12 105750475 1I ACTCTGTATG -/A AAAAAAAAAA 2996 het 2996 ref 30 10 8 12 A 15 16 195700 CASAVA_Build 12 105755835 1I CAGGCGTGAG -/C CACCACACCT 3070 hom 47 het 20 0 15 5 C 1 2 195701 CASAVA_Build 12 105763237 4I ATTTCACAGC ----/TTCT TTTTCTTCAC 3070 het 3070 ref 55 25 22 8 TTCT 0 1 195702 CASAVA_Build 12 105773345 1I CTTGAAAAAC -/T TAGTCCTCAA 3070 hom 175 het 66 0 59 7 T 1 2 195703 CASAVA_Build 12 105796733 1I GCCTCATGTT -/C CCCCCCCCCT 2949 het 2682 hom 29 9 7 13 C 9 10 195704 CASAVA_Build 12 105801618 1I ACACACTATT -/A ATGATGACCC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 1 2 195705 CASAVA_Build 12 105813644 1I CGGCCTGGAG -/T TTTTTCTAAG 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 5 6 195706 CASAVA_Build 12 105814750 6D AAGTTCTCAG GAATAA/------ GAATAACAAA 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 GAATAA 2 1 195707 CASAVA_Build 12 105847535 1D GGTTTGAAGG T/- TTTTTTTTTT 1164 het 1164 ref 42 30 3 9 T 11 10 195708 CASAVA_Build 12 105860596 1D TGGGATGAGT C/- CTTTGACTTC 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 C 2 1 195709 CASAVA_Build 12 105901986 20D TAGCTCCCCT TCACAGCTTTCATTATCCAG/-------------------- TCACAGCTTT 1965 het 1965 ref 40 25 6 17 TCACAGCTTTCATTATCCAG 2 1 195710 CASAVA_Build 12 105905322 1D AAAATATAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 8 7 195711 CASAVA_Build 12 105909259 3I GAAAAAAAAA ---/CAC CACGTACACA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 CAC 1 2 195712 CASAVA_Build 12 105914275 3D TATCTAGTCT ATC/--- ATCGACTGGC 3070 het 3070 ref 44 25 13 7 ATC 2 1 195713 CASAVA_Build 12 105928043 5I CAAGAAATTT -----/TTTCA TTTCATCTCA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 TTTCA 1 2 195714 CASAVA_Build 12 105929269 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2925 hom 28 12 12 4 A 12 11 195715 CASAVA_Build 12 105932497 4D TTTTCTTTCT ACTA/---- ACTATTAGTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 ACTA 2 1 195716 CASAVA_Build 12 105938434 1D GCAAGATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2344 hom 25 7 11 7 T 11 10 195717 CASAVA_Build 12 105958245 1D CCAGGCTGGA G/- GTGCAGTGGC 1690 het 1690 ref 19 11 4 5 G 2 1 195718 CASAVA_Build 12 105960516 1D CTGTATCTGA G/- TAAGATGGCC 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 G 1 0 195719 CASAVA_Build 12 105965996 1I TCCATTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 11 12 195720 CASAVA_Build 12 105990086 5D TACAACCACC TTTCT/----- ATGCAAAGAT 3070 het 3070 hom 50 18 29 5 TTTCT 1 0 195721 CASAVA_Build 12 105992924 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2366 hom 25 7 15 3 A 10 11 195722 CASAVA_Build 12 106007282 1I CTCTCTGTGT -/C ACCCAGGCTG 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 C 0 1 195723 CASAVA_Build 12 106016771 4I TTTTTTTAAA ----/CAGG CAGCTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 CAGG 0 1 195724 CASAVA_Build 12 106018672 3D AAAAGGGTCC CTT/--- CTTATTCTTT 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 CTT 2 1 195725 CASAVA_Build 12 106022088 1I TTTTTTGTTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 A 8 9 195726 CASAVA_Build 12 106032443 1D CTATTAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 8 10 A 14 13 195727 CASAVA_Build 12 106035545 6D GCTAAAACAA ATAATT/------ ATATAAAAAT 3070 het 3070 ref 21 12 9 2 ATAATT 1 0 195728 CASAVA_Build 12 106036221 1I AAAATAAAAT -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 51 18 29 4 A 7 8 195729 CASAVA_Build 12 106036713 15D GCCTGAACAG TGTTTGCCAAGGGTT/--------------- TGTTTGCCAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 12 TGTTTGCCAAGGGTT 2 1 195730 CASAVA_Build 12 106054593 1D AGTGATTCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 T 9 8 195731 CASAVA_Build 12 106063955 1I TCTCCAGGTA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 6 7 195732 CASAVA_Build 12 106185533 1I TACCCTGGAA -/G GCCAGGTTTG 3070 hom 93 het 39 0 31 8 G 1 2 195733 CASAVA_Build 12 106195747 1D TAGACACTTG A/- AAAAAAAAAG 1377 het 1377 ref 37 29 3 5 A 10 9 195734 CASAVA_Build 12 106213433 1I TGAGATGGAG -/T TTCACTCTGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 3 195735 CASAVA_Build 12 106254378 2D CTCTGAGCCT CA/-- GTTTCCTCCC 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 CA 1 0 195736 CASAVA_Build 12 106263375 1I TGCAAGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 11 12 195737 CASAVA_Build 12 106265386 2D GCATGTGGCT CC/-- CAAGATGGCT 3070 het 3070 hom 53 24 26 3 C 3 1 195738 CASAVA_Build 12 106276507 1D CATCTATTTG T/- TTTTTTTTTC 2332 het 2332 ref 26 11 8 7 T 10 9 195739 CASAVA_Build 12 106296248 1I CTGCACCACT -/G GCCACCACAA 3070 hom 126 het 49 0 42 7 G 1 2 195740 CASAVA_Build 12 106334446 2I ACCCCCATCA --/CC CCTCCCTGTC 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 C 2 4 195741 CASAVA_Build 12 106351375 13D GAGCTTGCAG AGCTTGACAAGCA/------------- AGGTGGCCCT 3070 het 3070 ref 34 24 11 4 AGCTTGACAAGCA 1 0 195742 CASAVA_Build 12 106409906 1I TAGTCCATCT -/C CCCCAGGAGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 C 4 5 195743 CASAVA_Build 12 106567987 19I CCTGGCTGAT -------------------/GTCCAGGTGCCTGGCTGAC GAGAGATGTC 3070 het 3070 ref 54 29 23 2 GTCCAGGTGCCTGGCTGAC 0 1 195744 CASAVA_Build 12 106569837 1D TGCCAAGGTC T/- TGCTTCCTGC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 2 1 195745 CASAVA_Build 12 106574959 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 8 9 195746 CASAVA_Build 12 106592231 1D ATCCCTTTTA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 11 10 195747 CASAVA_Build 12 106599088 1D TAAAAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 2752 het 2752 ref 28 14 10 4 T 11 10 195748 CASAVA_Build 12 106603245 1I12M1I GTGCTAAATG -TTTTTTTCTCAC-/TTTTTTTTCTCACT TTTTTTTTTT 3070 het 1460 hom 38 8 30 3 N/A 0 0 195749 CASAVA_Build 12 106606197 1D TCTATAAAAT C/- TATATTTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 C 1 0 195750 CASAVA_Build 12 106623754 18D ATGTATGTGC ACATATGCACATACGTGT/------------------ GCATGTGTCT 2165 het 2165 ref 23 16 7 0 ACATATGCACATACGTGT 1 0 195751 CASAVA_Build 12 106646857 2D ATGCTAATAA CT/-- CTATGCCACA 3070 het 3070 hom 54 23 28 4 CT 2 1 195752 CASAVA_Build 12 106653668 1I ATTTTTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2749 hom 32 14 11 7 T 15 16 195753 CASAVA_Build 12 106661024 4D GATTCTTAAC TCTT/---- TCTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 51 23 24 6 TCTT 2 1 195754 CASAVA_Build 12 106663039 1D TGGGTCCTAG C/- CCTGTAAATA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 3 2 195755 CASAVA_Build 12 106685732 1I ACAGAGAGAG -/A TTCTGTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 A 0 1 195756 CASAVA_Build 12 106739304 1D TTGTGTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 614 hom 35 3 17 15 T 17 16 195757 CASAVA_Build 12 106752526 2D GCCATGACAC AT/-- AGCTGCTTTG 3070 hom 104 het 38 0 35 3 AT 1 0 195758 CASAVA_Build 12 106760428 1I TTCGCTCCTC -/T TTTACTTTAA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 3 4 195759 CASAVA_Build 12 106765648 1D GGAACTTTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 9 8 195760 CASAVA_Build 12 106765936 6I CAAGGGAAGC ------/TCCATT TCCTTCCCTA 3070 hom 116 het 43 0 37 6 TCCATT 0 1 195761 CASAVA_Build 12 106772093 1D AGGACTGTAT A/- AAGCATATCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 3 2 195762 CASAVA_Build 12 106774907 3D CTTCAAAATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 30 1 23 7 T 15 12 195763 CASAVA_Build 12 106778465 1D TAATACTTTC T/- TTTTTTACTA 3070 hom 111 het 43 0 38 7 T 7 6 195764 CASAVA_Build 12 106780856 3D TGCAAAAGCT AGC/--- AGAAGACAAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AGC 1 0 195765 CASAVA_Build 12 106788430 1D ACCCACCACC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 118 het 52 0 44 9 A 10 9 195766 CASAVA_Build 12 106792353 1I GACATTTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 401 hom 24 1 19 4 T 9 10 195767 CASAVA_Build 12 106799908 1I GTTCTATAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 103 het 41 0 34 7 T 9 10 195768 CASAVA_Build 12 106802290 1I TAATTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 478 hom 25 2 16 7 T 13 14 195769 CASAVA_Build 12 106809488 3I TCATAAGGGT ---/TGA CATCTTATGA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 TGA 0 1 195770 CASAVA_Build 12 106811569 1D TGCCCGGCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 8 7 195771 CASAVA_Build 12 106811998 1D ATTCGCTCAA G/- TCTTTACTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 1 0 195772 CASAVA_Build 12 106830697 1D TGCCGGTGGA G/- GGTGTTTGGT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 3 2 195773 CASAVA_Build 12 106842753 1D TTGTATCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1087 hom 46 3 34 10 A 12 11 195774 CASAVA_Build 12 106848830 1D TTCAGCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 23 0 14 9 T 15 14 195775 CASAVA_Build 12 106850932 1D AATAGAATAC A/- AAGTAGGAAG 3070 hom 107 het 49 0 41 9 A 3 2 195776 CASAVA_Build 12 106854327 1D ATTTGTTATG T/- GGCAATAGAT 3070 hom 63 het 28 0 22 7 T 1 0 195777 CASAVA_Build 12 106887215 1D GAGTTGACTA T/- ATGCAATTCA 3070 hom 135 het 53 0 43 10 T 1 0 195778 CASAVA_Build 12 106887794 2I TGATTTTACA --/CC ACACAGATCC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 0 2 195779 CASAVA_Build 12 106891409 1I TCAAGTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 92 het 43 0 32 11 T 9 10 195780 CASAVA_Build 12 106893408 1D GGAGAGGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 37 1 19 18 T 15 14 195781 CASAVA_Build 12 106901359 1D GCCACCCTAG A/- AGTCTATCTG 3070 hom 117 het 45 0 38 7 A 2 1 195782 CASAVA_Build 12 106903514 2D AAAAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 2682 het 234 hom 22 4 9 10 AG 8 7 195783 CASAVA_Build 12 106912765 2D TATTTTGAGC AA/-- ACTTTTTGTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 3 1 195784 CASAVA_Build 12 106921717 2D TTGATTGGCC CA/-- CACAGACTAA 3070 hom 99 het 39 0 33 7 CA 3 2 195785 CASAVA_Build 12 106925201 4I GCCCAGCAGA ----/TCTG TCTTATTTTA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 TCTG 0 1 195786 CASAVA_Build 12 106925562 1D ACGGTACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 539 hom 46 2 37 8 A 12 11 195787 CASAVA_Build 12 106942051 1I CTTTTAGTGG -/T TTTCTGGTAT 3070 hom 138 het 54 0 47 7 T 3 4 195788 CASAVA_Build 12 106985519 3D CAGCCTCAAA CTC/--- CTGGGCTCAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 CTC 1 0 195789 CASAVA_Build 12 106985621 2I TCCTTTTTTT --/TG TTTTTGATGG 1527 hom 27 het 19 0 10 9 TG 0 1 195790 CASAVA_Build 12 106988038 2I AAGCACCCCC --/CG CCCACACACA 2673 het 237 hom 14 2 6 6 CG 0 1 195791 CASAVA_Build 12 106993340 1D AGAGGGAGCC T/- TTTTTTTTTT 2164 het 1073 hom 24 7 7 11 T 15 14 195792 CASAVA_Build 12 106998129 1D TTAAAGTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 118 hom 29 2 18 9 A 13 12 195793 CASAVA_Build 12 107003024 1I TGTATGGTGT -/G GGGGGGGCGC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 G 7 8 195794 CASAVA_Build 12 107021183 3I ACCTTCTCTC ---/CTT CTTCACCTGG 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 CTT 1 2 195795 CASAVA_Build 12 107050043 1I GTCAGTGTGA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 142 het 52 0 46 6 T 7 8 195796 CASAVA_Build 12 107053772 1I CCATTCATTG -/A GCTATTGTCT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 0 1 195797 CASAVA_Build 12 107054242 26I CTTTAGCAAG --------------------------/TCCCTTCCCCTCTTTGGGCCTCAGTT TCCCATCTAT 3070 hom 121 het 48 0 40 11 TCCCTTCCCCTCTTTGGGCCTCAGTT 0 1 195798 CASAVA_Build 12 107086441 4D TAGTTATTCC ACTT/---- ACTTACTGAA 3070 hom 124 het 47 0 41 8 ACTT 2 1 195799 CASAVA_Build 12 107088079 1D TCCAAACAAG A/- ACCACCTTTC 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 2 1 195800 CASAVA_Build 12 107089243 1D CGAAGAAGTC A/- AGAGAGAGGC 3070 hom 146 het 51 0 46 5 A 2 1 195801 CASAVA_Build 12 107094722 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 9 8 195802 CASAVA_Build 12 107100921 8D GATTCAGATG GGTCCACA/-------- GGCAGTGTTC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 GGTCCACA 1 0 195803 CASAVA_Build 12 107115311 1D AATGCTCACA G/- GGAGGCAAAG 3070 hom 89 het 34 0 28 7 G 3 2 195804 CASAVA_Build 12 107119427 1I GGGTGTGGGT -/G GGGGGGCGGG 1611 het 1611 ref 30 18 4 8 G 6 7 195805 CASAVA_Build 12 107135844 15I CTCTGCAGAG ---------------/CTGGATCTACAAAGA CTTCCTTCCT 3070 hom 98 het 39 0 31 8 CTGGATCTACAAAGA 0 1 195806 CASAVA_Build 12 107142148 21D AGGCCCAGGA CTTTTCCCGTAAAGCCCAGGG/--------------------- CAATGAGAGG 3070 het 3070 ref 28 20 13 7 CTTTTCCCGTAAAGCCCAGGG 1 0 195807 CASAVA_Build 12 107142983 1I AGGAAGTGAG -/T TTTAATACTG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 3 4 195808 CASAVA_Build 12 107143526 1I TCAGAGCTTT -/G GGCACTGGAT 3070 hom 75 het 28 0 24 4 G 2 3 195809 CASAVA_Build 12 107151558 1I AGTCACACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 10 11 195810 CASAVA_Build 12 107154490 2D TCTCTCTCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 43 13 22 10 TC 8 7 195811 CASAVA_Build 12 107171297 2D CTCCCCCTTT TC/-- TCTCTCTGTT 2307 het 2307 ref 24 11 7 7 TC 4 3 195812 CASAVA_Build 12 107176043 1I TACACAGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 A 9 10 195813 CASAVA_Build 12 107181509 1D CCCCACAAAA G/- CATCCAGTCC 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 G 1 0 195814 CASAVA_Build 12 107197796 1D CGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1573 het 1573 ref 50 36 5 10 T 15 14 195815 CASAVA_Build 12 107198376 1D ATTTTAGAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 22 9 8 5 T 10 9 195816 CASAVA_Build 12 107198685 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 1358 het 396 hom 9 1 6 2 A 9 8 195817 CASAVA_Build 12 107206864 1I TTTCTGCACC -/G CCCCCCCCAC 3070 het 1102 hom 33 7 18 8 G 0 1 195818 CASAVA_Build 12 107220450 1D GTCCTACAGA G/- GGTGGCCTTG 3070 het 3070 hom 40 15 19 8 G 3 2 195819 CASAVA_Build 12 107224295 5D TTCTCGTTAA TCACC/----- TCATTTGAGT 3070 het 3070 hom 46 19 21 8 TCACC 1 0 195820 CASAVA_Build 12 107296760 1D GGATGAATCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 10 9 195821 CASAVA_Build 12 107300644 1D AAACAGGTTT A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 8 7 195822 CASAVA_Build 12 107314315 1I ACAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 10 11 195823 CASAVA_Build 12 107321833 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 26 0 21 5 A 11 12 195824 CASAVA_Build 12 107330339 2D GGCTACCCAA AT/-- ATTTGATAAT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 AT 2 1 195825 CASAVA_Build 12 107330638 2I GAGAAAATAA --/CT CAGTTCTTCC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CT 0 1 195826 CASAVA_Build 12 107331678 5I CCCCTGAACT -----/TAAAA TAAGAGTTGT 3070 hom 78 het 27 0 26 1 TAAAA 0 1 195827 CASAVA_Build 12 107332362 3I AAATTTTGAC ---/AAG AAGAAGATTA 3070 hom 111 het 44 0 35 9 AAG 2 3 195828 CASAVA_Build 12 107344011 1D TCTTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 27 0 21 6 A 14 13 195829 CASAVA_Build 12 107353475 1I GCAGTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 285 hom 32 1 29 2 T 9 10 195830 CASAVA_Build 12 107360773 1I GGTCTTGGGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 195831 CASAVA_Build 12 107384020 2D GTTTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 T 13 11 195832 CASAVA_Build 12 107392420 2D CGCCTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2421 hom 15 het 23 0 10 14 T 15 13 195833 CASAVA_Build 12 107395491 4I TTAGGCAGAT ----/AGAG AGGGTACAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AG 1 3 195834 CASAVA_Build 12 107400635 1D TCACTCTTTA C/- ATAAATTACT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 1 0 195835 CASAVA_Build 12 107401323 2I CTATGGGCTG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 43 hom 35 1 26 8 GA 5 6 195836 CASAVA_Build 12 107402044 2I CTCTTCAATT --/AG AGTCATATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AG 1 2 195837 CASAVA_Build 12 107407965 1I CAACATGGTG -/A AACCCCGTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 2 3 195838 CASAVA_Build 12 107413957 2I TAAGGGAGAC --/AG AGTTTTCACC 3070 hom 154 het 52 0 52 0 AG 1 2 195839 CASAVA_Build 12 107418270 1D TCCAAAGCCA C/- CCCTTGCAGC 3070 hom 122 het 43 0 40 3 C 4 3 195840 CASAVA_Build 12 107420570 1I TCATCCCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 26 1 19 6 A 11 12 195841 CASAVA_Build 12 107425840 1I GTCATTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 715 hom 33 3 27 3 A 11 12 195842 CASAVA_Build 12 107428408 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 16 1 11 5 A 12 11 195843 CASAVA_Build 12 107441651 1I TTAAAAGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 9 14 A 11 12 195844 CASAVA_Build 12 107449431 1I TCTAAATGGC -/A AAGAATATGA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 2 3 195845 CASAVA_Build 12 107458062 1I ATGAGATCTT -/A AAAAGCAGTC 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 A 4 5 195846 CASAVA_Build 12 107458480 1D AATTCCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 A 11 10 195847 CASAVA_Build 12 107460445 4D ATCGCAGTAC ACAG/---- ACAACTTTAC 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 ACAG 1 0 195848 CASAVA_Build 12 107472171 1I TATGTCTTAT -/G CCTTGACTTG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 G 0 1 195849 CASAVA_Build 12 107474007 1D AGAAACTCTC T/- TTTTTTTTTT 2294 het 2294 ref 29 14 8 7 T 13 12 195850 CASAVA_Build 12 107479237 1I TTTTATACCC -/T TGTAAAAGCT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 1 2 195851 CASAVA_Build 12 107480268 1D ACTGCAGAAG C/- CCTGAGGTCC 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 C 3 2 195852 CASAVA_Build 12 107480656 1I GGACAAAAGA -/G GGGACGCGCG 1860 hom 18 het 12 0 6 6 G 3 4 195853 CASAVA_Build 12 107487226 1I TAAAACAGAT -/C TGCGCATATA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 0 1 195854 CASAVA_Build 12 107490188 1D TGGCACACAG A/- GTTCACTGTT 3070 het 3070 hom 61 19 33 9 A 1 0 195855 CASAVA_Build 12 107491628 1D CATTATATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 12 11 195856 CASAVA_Build 12 107492684 1I GTGTTGACCA -/G GCTGGTCTCA 2103 het 2103 ref 18 9 6 3 G 1 2 195857 CASAVA_Build 12 107496518 3D27M9D TCACCACCAC CATCACCATCACCATCACCACCACCACCATCACAACCAC/---CACAACCACCATCACCACTACCACCAT--------- CACCACCATC 2911 het 2911 ref 35 20 11 15 N/A 0 0 195858 CASAVA_Build 12 107498083 1D TCACTTATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2091 hom 30 6 10 14 T 10 9 195859 CASAVA_Build 12 107498746 1I CGGCCTTTGG -/C CCACCCTGCG 3070 hom 81 het 32 0 24 8 C 2 3 195860 CASAVA_Build 12 107503158 18D TTTTTGGTTC TTGTTGTTGTTGTTGTTG/------------------ TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 31 14 15 4 TTG 10 4 195861 CASAVA_Build 12 107513218 2D GCACACACGC CA/-- CACACACACA 491 het 491 ref 74 43 2 31 CA 7 6 195862 CASAVA_Build 12 107519868 1I TATTTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 2652 het 2392 hom 23 8 9 6 T 13 14 195863 CASAVA_Build 12 107565858 4I TGCCATCTGT ----/GAGG GAGGCTCCTT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 GAGG 1 2 195864 CASAVA_Build 12 107570751 19I7M7I CAATGCTGTT -------------------ATGCCAG-------/CACAGACCTAAGGGCACCAATACCAGGCACTGA TATGATGATA 3070 het 3070 ref 53 28 24 4 N/A 0 0 195865 CASAVA_Build 12 107573003 4I ATCATTCCAT ----/ATTC CAAAATCCTA 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 ATTC 0 1 195866 CASAVA_Build 12 107594677 1I ACTCCATCCC -/A AAAAAAAAAA 2126 het 2126 ref 31 20 7 4 A 17 18 195867 CASAVA_Build 12 107612698 1D TCTACGTAGA T/- TTTTTTCTTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 7 6 195868 CASAVA_Build 12 107621684 6I GACTATGGGC ------/CCTGGA CTGGATGACA 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 CCTGGA 0 1 195869 CASAVA_Build 12 107650715 3I TAAAATGGGG ---/ATA ATAACAGCCC 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 ATA 1 2 195870 CASAVA_Build 12 107654565 4D ACCTTCCGTT CATC/---- CATCCCCTCC 3070 het 3070 ref 50 26 17 10 CATC 2 1 195871 CASAVA_Build 12 107670363 1I GCTCAATCCT -/G GAATACAGAT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 G 1 2 195872 CASAVA_Build 12 107673511 1D TGACAGATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 13 10 T 13 12 195873 CASAVA_Build 12 107691353 2D TGCATGTGTA TG/-- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 65 30 23 14 TG 4 3 195874 CASAVA_Build 12 107691609 10D14M6D TGTGTGTATG CGCACGTGCATGTGTGTATATGTGTGTATA/----------TGTGTGTATATGTG------ TGTATGCACA 1973 het 1973 ref 61 51 8 19 N/A 0 0 195875 CASAVA_Build 12 107692570 1D CGGGCTGGAG T/- GCAGAGGCGT 3070 het 3070 ref 33 17 10 7 T 1 0 195876 CASAVA_Build 12 107695685 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2660 het 1487 hom 33 11 9 13 T 17 16 195877 CASAVA_Build 12 107697005 4I CCACCGTGCC ----/CAGA CAAATTTGTC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 CAGA 0 1 195878 CASAVA_Build 12 107707274 1I GGGGAGGCTC -/T TCATTTCACT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 1 2 195879 CASAVA_Build 12 107718579 1D CCGTTAGGAT C/- CCCCCTCCCA 3070 hom 106 het 41 0 30 11 C 6 5 195880 CASAVA_Build 12 107720969 2I AAAAAATTTT --/AA AAGAGAGGAG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 2 4 195881 CASAVA_Build 12 107721394 1D GTTCCCAAGA G/- GGCAGACCCC 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 G 3 2 195882 CASAVA_Build 12 107723600 1I CAAGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1659 hom 23 6 13 4 A 14 15 195883 CASAVA_Build 12 107734729 2I TCTCAATTGA --/CT CTGAGTTCTG 3070 hom 137 het 53 0 39 14 CT 1 2 195884 CASAVA_Build 12 107741137 1I AGCTCCAATG -/T TAAGAGTATC 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 T 1 2 195885 CASAVA_Build 12 107747322 13D ATATACTCTG ATTAACCCCTAGA/------------- ATTAACCCCT 3070 het 3070 ref 33 17 14 6 ATTAACCCCTAGA 2 1 195886 CASAVA_Build 12 107798539 3I CTCTGCAAAT ---/AAC AACTTCATGA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 AAC 1 2 195887 CASAVA_Build 12 107817239 1I TGGCAGCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 9 10 195888 CASAVA_Build 12 107835472 3I ATATCATACA ---/TAT TATTCTGCAA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 TAT 1 2 195889 CASAVA_Build 12 107836947 1D CAATACCCGC A/- ACCTGGGCCG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 2 1 195890 CASAVA_Build 12 107847896 1D TTCCCACCCA G/- GTATAAGAGA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 G 2 1 195891 CASAVA_Build 12 107848341 3D AGTTGATTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 1621 het 141 hom 34 3 8 24 T 21 18 195892 CASAVA_Build 12 107854728 1I TCTGCAAACC -/A TCCGTCTAGT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 0 1 195893 CASAVA_Build 12 107930223 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 21 5 A 12 11 195894 CASAVA_Build 12 107969358 1D GGTGGATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 44 0 32 12 T 12 11 195895 CASAVA_Build 12 107976723 5D GTCTCAAAAA AAAAT/----- AAAAATAAAA 784 het 784 ref 31 5 7 22 AAAAT 1 0 195896 CASAVA_Build 12 107978015 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAA 183 het 183 ref 37 16 4 20 AAAG 1 0 195897 CASAVA_Build 12 107985295 1D ATTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 9 T 11 10 195898 CASAVA_Build 12 107989469 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1245 hom 15 4 11 0 T 12 11 195899 CASAVA_Build 12 107998030 1D TTACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2779 het 44 hom 26 2 10 14 T 17 16 195900 CASAVA_Build 12 108013897 3D AGCTCATTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 TTG 5 4 195901 CASAVA_Build 12 108021807 2I TGCAGCTTGT --/TA TATAGTCAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TA 2 3 195902 CASAVA_Build 12 108025819 4D GTTTTCTTTC TTTT/---- TTTTCTTTTT 3070 het 2513 hom 28 7 19 3 T 8 4 195903 CASAVA_Build 12 108026244 15I TGTTTCTGGG ---------------/TTTTTTGTTTTTTGT TTTTTTGTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TTTTTTGTTTTTTGT 0 1 195904 CASAVA_Build 12 108031952 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1624 het 1371 hom 14 5 5 4 A 18 17 195905 CASAVA_Build 12 108034217 1D ATAATTGTGC T/- TACACCAGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 1 195906 CASAVA_Build 12 108035838 2I AATACATCTC --/TT TGTTCAAATT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 1 3 195907 CASAVA_Build 12 108037778 1I CATTCCTTCA -/C CCCCGGTTCC 3070 hom 90 het 34 0 27 7 C 4 5 195908 CASAVA_Build 12 108045952 1D CTCGGCTCAC T/- TGCAGCCTCT 2802 hom 21 het 9 0 8 1 T 2 1 195909 CASAVA_Build 12 108049137 5I GTACACCCGT -----/ACTCA ACTCTAGGAT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 ACTCA 0 1 195910 CASAVA_Build 12 108057997 1D GAGGTAATAC T/- TTTTTTTTTT 1341 het 99 hom 22 2 7 13 T 19 18 195911 CASAVA_Build 12 108060088 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1888 het 1888 ref 18 7 4 7 T 11 12 195912 CASAVA_Build 12 108060759 1I AAGAGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 33 0 20 13 A 12 13 195913 CASAVA_Build 12 108081164 4I CTCCCTTTCG ----/AAAC AAACAAACGA 3070 hom 101 het 37 0 32 5 AAAC 2 3 195914 CASAVA_Build 12 108084141 1D GTTGCATCTA C/- CTTTTTTTGT 2482 het 1715 hom 18 6 8 4 C 2 1 195915 CASAVA_Build 12 108092974 2D TGGTAAATTT TG/-- TGTGTGTTTT 3070 hom 60 het 27 0 19 8 TG 4 3 195916 CASAVA_Build 12 108112815 1I TTTCCCTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 68 het 26 0 22 4 T 9 10 195917 CASAVA_Build 12 108115406 2D AGATTTAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 1752 het 233 hom 24 6 7 11 T 18 16 195918 CASAVA_Build 12 108124415 1D GAACAGTTAT G/- TAAGTAGTGC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 G 1 0 195919 CASAVA_Build 12 108128787 1I TCAGACCTCA -/G TCCTCACTTG 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 G 0 1 195920 CASAVA_Build 12 108147020 15I TAAGAAAATA ---------------/TGAGATGACGTCTTG TGTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 TGAGATGACGTCTTG 0 1 195921 CASAVA_Build 12 108152600 8I CTGAGAAGGA --------/ATTCTTTT CTCTTTTGAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 ATTCTTTT 0 1 195922 CASAVA_Build 12 108174629 1D GGAACCCCCC A/- AAAAAGTAAT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 A 6 5 195923 CASAVA_Build 12 108205364 1D AATCCATTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 327 hom 40 1 35 4 T 10 9 195924 CASAVA_Build 12 108216955 1D CATCCCCCAA C/- CCCCTGCCCA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 C 5 4 195925 CASAVA_Build 12 108246202 1D CTGACTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2854 het 1256 hom 27 7 9 11 A 15 14 195926 CASAVA_Build 12 108250882 1I TCTAATGTCG -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 6 7 195927 CASAVA_Build 12 108251222 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1839 het 1839 ref 33 21 5 8 T 15 14 195928 CASAVA_Build 12 108257767 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 A 10 11 195929 CASAVA_Build 12 108258278 1D AAGCAATCCC A/- ATCCTCTTAA 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 A 2 1 195930 CASAVA_Build 12 108260214 1D GAAAGCTAAG A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 61 26 28 7 A 8 7 195931 CASAVA_Build 12 108262916 1I AGAAGGTTAT -/A TCTACATATT 3070 het 3070 hom 54 22 27 5 A 0 1 195932 CASAVA_Build 12 108263809 1I GGCTGTTTGC -/A GGGAGAAAGC 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 A 0 1 195933 CASAVA_Build 12 108264637 1I CCAGTCCTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 8 9 195934 CASAVA_Build 12 108269773 7D TTTTCTTTTC TTTTTTT/------- TTTCTTTTTT 2882 het 2882 ref 35 17 11 9 T 10 3 195935 CASAVA_Build 12 108273185 3I AACCACCATC ---/AGT AGTAATTATT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 AGT 1 2 195936 CASAVA_Build 12 108275132 2I ATTGAGACAC --/AG AGCCCCACTA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 AG 1 2 195937 CASAVA_Build 12 108276232 3D AAAGGTGTAA TTC/--- TTCTGTAATC 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 TTC 2 1 195938 CASAVA_Build 12 108276628 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 663 hom 15 2 8 5 A 10 9 195939 CASAVA_Build 12 108278063 2I GCCCAGCAAA --/TT TTTTTTTTTT 1529 het 1529 ref 21 12 4 5 T 12 14 195940 CASAVA_Build 12 108278578 3D TTTGTTTTTG TTT/--- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 10 7 195941 CASAVA_Build 12 108279310 1I TTCTATGAGG -/A AAACTACTAC 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 A 3 4 195942 CASAVA_Build 12 108282866 1D AATCTATAGT C/- TTGCTCTTTC 3070 het 3070 hom 52 18 26 8 C 1 0 195943 CASAVA_Build 12 108284250 1I GATTGCCTTC -/T TGTTTAAGTT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 1 2 195944 CASAVA_Build 12 108304014 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 9 10 195945 CASAVA_Build 12 108307603 3I CCCACTTCAG ---/CCT CATGAGCAGC 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 CCT 0 1 195946 CASAVA_Build 12 108317793 1D GTGGTAGTGC T/- GCACTTATAA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 1 0 195947 CASAVA_Build 12 108318073 4D TTTTGTTTTG TTTT/---- TTGTTGGTTT 2392 het 2392 ref 33 19 9 6 T 6 2 195948 CASAVA_Build 12 108320427 3I AGAGCACTGC ---/TCA TCATCATGAG 3070 het 3070 ref 51 24 24 3 TCA 2 3 195949 CASAVA_Build 12 108330162 3I TATAATCATC ---/ATT GTTTCTTTAA 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 ATT 0 1 195950 CASAVA_Build 12 108330531 1I TGCTAATTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 9 10 195951 CASAVA_Build 12 108333794 11I AAAACGAGGT -----------/TGGCATTAAGC TGGTCATAGT 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 TGGCATTAAGC 0 1 195952 CASAVA_Build 12 108333936 2I GATTAAGCCC --/CT TTCTTCCCCC 3070 het 3070 ref 49 23 17 10 CT 0 1 195953 CASAVA_Build 12 108340885 5I TACAGGCACC -----/CACCA CCACGCCCGG 3070 hom 24 het 9 0 9 1 CACCA 0 1 195954 CASAVA_Build 12 108342062 1D CCCCCAACTT A/- AAAAAAAAAA 1410 het 1410 ref 25 7 4 14 A 17 16 195955 CASAVA_Build 12 108343416 1I GTGTATGATG -/C CCCCCTGGGC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 C 5 6 195956 CASAVA_Build 12 108345275 1D CCCTGTCTTG A/- AAAAAACAGA 2424 het 2424 ref 21 10 6 6 A 7 6 195957 CASAVA_Build 12 108348105 2D TCTGGCTCGT TC/-- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 10 TC 5 4 195958 CASAVA_Build 12 108350994 1D CTCACCCCCC T/- CCAAACATAT 2684 het 2684 ref 36 22 8 7 T 1 0 195959 CASAVA_Build 12 108351396 4I CTCTGTATCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AAAC 2 3 195960 CASAVA_Build 12 108353117 2I15M1I TGTATCAAAA --ATATATATACATGTA-/ATATATATATACATGTAT TTTTTTTTAA 2793 het 2793 ref 19 10 8 1 N/A 0 0 195961 CASAVA_Build 12 108357529 8I TCCGCCGTTT --------/CAGTTCTC CAGTTCTCGT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 CAGTTCTC 1 2 195962 CASAVA_Build 12 108361269 1D TTGTTGTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 59 het 28 0 20 8 T 8 7 195963 CASAVA_Build 12 108361687 20I GGGCAGATTT --------------------/GGCCTGTGGCCTACATTCCA GGCCTCTGGC 3070 hom 75 het 31 0 24 7 GGCCTGTGGCCTACATTCCA 0 1 195964 CASAVA_Build 12 108364073 2D CATCTCAACT AA/-- AATACAAAAT 2227 het 2227 ref 18 6 6 8 A 4 2 195965 CASAVA_Build 12 108364984 13D GTGTCTGCTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 1287 het 1287 ref 24 12 4 9 T 23 10 195966 CASAVA_Build 12 108366090 1I ACTCTGGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 A 11 12 195967 CASAVA_Build 12 108367553 4D CATTCTTCCT TTCC/---- TCAAATATGC 3070 het 3070 ref 62 30 28 5 TTCC 1 0 195968 CASAVA_Build 12 108368512 1I AGTTTTGCTG -/A AAAACGACAT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 4 5 195969 CASAVA_Build 12 108372145 1D CAATACACGA T/- TTTGACATTC 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 T 4 3 195970 CASAVA_Build 12 108372542 3D TCCAGCAGGG GCC/--- GCCACCTGTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GCC 2 1 195971 CASAVA_Build 12 108377582 1D ATAATAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2275 het 2194 hom 19 7 7 5 A 12 11 195972 CASAVA_Build 12 108381372 1I AAAGGCTCCT -/G GAAGTTAGAA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 1 2 195973 CASAVA_Build 12 108388776 3D AACATCCAAG TTC/--- TTCTTGGTTT 3070 hom 135 het 48 0 46 3 TTC 2 1 195974 CASAVA_Build 12 108398076 2I CAATTGCAAC --/TG TTCCATCAAA 3070 hom 163 het 60 0 54 6 TG 0 1 195975 CASAVA_Build 12 108402839 2D ACCCTGCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 25 9 A 14 12 195976 CASAVA_Build 12 108437548 1D ATTATTACTG T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 7 6 195977 CASAVA_Build 12 108442077 7I ACCCCTGAAT -------/AAGATTC CGGGGCACCA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 AAGATTC 0 1 195978 CASAVA_Build 12 108442932 1D GTAGGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 32 2 19 11 T 14 13 195979 CASAVA_Build 12 108449072 2I AAAAAAAAAA --/AT AATTGATTTG 3070 hom 18 het 17 0 14 3 AT 0 1 195980 CASAVA_Build 12 108449923 2D AGCCAGGGCC AG/-- AGAGAGAGCA 3070 hom 106 het 39 0 33 6 AG 5 4 195981 CASAVA_Build 12 108458679 3D GATTTTTGAC AAG/--- GAGGGGTAGT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AAG 1 0 195982 CASAVA_Build 12 108465568 1I CGGGGTCAGC -/G GGCTGGTAAC 3070 hom 70 het 31 0 22 9 G 2 3 195983 CASAVA_Build 12 108467246 4D GGAAGGTGAC CTCA/---- CTCACTCACT 3070 hom 156 het 60 0 51 13 CTCA 3 2 195984 CASAVA_Build 12 108471862 2D CAAAAAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 44 1 19 25 A 18 16 195985 CASAVA_Build 12 108474139 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 9 8 195986 CASAVA_Build 12 108474584 2I GGGTGACAGG --/GT GTGAGACTCC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 GT 1 2 195987 CASAVA_Build 12 108499871 1D GGAGTTTTTT G/- TGATGGTGGT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 1 0 195988 CASAVA_Build 12 108500627 4D TGCCAGGCAC TAAG/---- TGTGTTCACA 3070 hom 123 het 48 0 41 8 TAAG 1 0 195989 CASAVA_Build 12 108532115 1I GATAAATGGA -/G GGGGCAGGGG 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 G 4 5 195990 CASAVA_Build 12 108541302 8D TAATGCTGCC TGAGTGAA/-------- TGACGTCAGA 3070 het 3070 ref 47 23 19 11 TGAGTGAA 1 0 195991 CASAVA_Build 12 108545193 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1672 hom 21 8 7 6 T 13 12 195992 CASAVA_Build 12 108565595 1I ATCTCCATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 9 10 195993 CASAVA_Build 12 108582559 1I CTGCCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 A 10 11 195994 CASAVA_Build 12 108582602 1I GATTAGAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 18 11 20 A 11 12 195995 CASAVA_Build 12 108582864 1I CGTCTCCACT -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 5 6 195996 CASAVA_Build 12 108585264 1I GGACGCACAT -/G GGAGTGGTGA 3070 het 3070 hom 54 19 20 15 G 2 3 195997 CASAVA_Build 12 108587962 3D CATCTCTACA AAT/--- AATAATAATA 2661 het 2661 ref 17 7 7 3 AAT 7 6 195998 CASAVA_Build 12 108595388 2I GTGCATGCAA --/AC ACTCATGTGT 3070 hom 178 het 68 0 59 9 AC 1 2 195999 CASAVA_Build 12 108600006 1I GGGGGGTGAA -/G GGGGGTGGTG 3070 het 3070 hom 36 19 14 3 G 5 6 196000 CASAVA_Build 12 108602665 1I ACTCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 11 11 13 A 12 13 196001 CASAVA_Build 12 108608504 5D AGATGAGGTA ACTTT/----- ACGCATGTGA 3070 het 3070 ref 50 25 21 6 ACTTT 1 0 196002 CASAVA_Build 12 108611495 1I CCCAGGCTGG -/T CTTGAACTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 0 1 196003 CASAVA_Build 12 108634173 3D GAACTGCTGC CTT/--- CTTCTCCTCT 3070 het 3070 ref 55 27 24 5 CTT 2 1 196004 CASAVA_Build 12 108651162 2I GGTTACAGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 29 0 19 10 A 12 14 196005 CASAVA_Build 12 108651422 6I AGAATTCTAG ------/TTTTTA TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 TTTTTA 0 1 196006 CASAVA_Build 12 108664800 1I TCTCTCGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 26 0 18 8 T 13 14 196007 CASAVA_Build 12 108669879 6I ATTGTGTTGG ------/TTAAGT TTATTTCTGG 3070 hom 123 het 48 0 41 7 TTAAGT 0 1 196008 CASAVA_Build 12 108673072 1D TGAGGACTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 7 6 196009 CASAVA_Build 12 108675736 2D ACCTCACCTG CC/-- CCCCCATCCC 3070 hom 61 het 24 0 17 7 C 7 5 196010 CASAVA_Build 12 108682802 1D ACCCTCCCTG C/- CCACCTCAGT 3070 hom 99 het 36 0 31 5 C 3 2 196011 CASAVA_Build 12 108702256 1I TGGGGGAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 682 hom 27 3 21 3 T 13 14 196012 CASAVA_Build 12 108718118 1I ATTTTTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 344 hom 19 1 17 3 T 9 10 196013 CASAVA_Build 12 108722600 6I TCCATGGTAC ------/CAAGTT TCCCCATGGC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 CAAGTT 0 1 196014 CASAVA_Build 12 108728888 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 20 5 A 11 10 196015 CASAVA_Build 12 108742591 13I CGGTGGGGCA -------------/CAGAGTGAGAGAG CATTTTGACG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 CAGAGTGAGAGAG 0 1 196016 CASAVA_Build 12 108753324 2D TTCCAGTCAC GT/-- CACAAACTCC 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 GT 1 0 196017 CASAVA_Build 12 108760274 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1792 het 1792 ref 22 9 7 6 A 16 17 196018 CASAVA_Build 12 108776186 1I TACCTGCCTT -/G GCCTCCCAAA 3070 hom 29 het 12 0 9 3 G 1 2 196019 CASAVA_Build 12 108781716 1I CAAAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 10 11 196020 CASAVA_Build 12 108781793 1D ACAAAAAAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 7 196021 CASAVA_Build 12 108782192 3I TCCCCGAGAC ---/GGA TTTTTGCTCC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 GGA 0 1 196022 CASAVA_Build 12 108783935 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 86 het 34 0 28 6 A 9 8 196023 CASAVA_Build 12 108785409 2D GCTTCGCCAC AT/-- GTTTGAATTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AT 1 0 196024 CASAVA_Build 12 108840468 1D AGTTTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 11 10 196025 CASAVA_Build 12 108917182 2D TTTGAGTTAT CA/-- CAGTTCTATT 3070 het 3070 hom 64 27 31 6 CA 2 1 196026 CASAVA_Build 12 108966055 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 hom 44 het 21 0 16 5 AAAC 1 2 196027 CASAVA_Build 12 108984812 1I AAAAAAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 920 hom 31 2 16 13 T 14 15 196028 CASAVA_Build 12 109058055 1D ACTTTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 2558 het 429 hom 23 3 11 9 A 19 18 196029 CASAVA_Build 12 109107540 1I TGCCCAACTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 1830 hom 21 7 13 1 T 7 8 196030 CASAVA_Build 12 109124892 1I CCGCCCACCT -/G GGCCTCCCAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 2 3 196031 CASAVA_Build 12 109160940 1D CCGCGCCCAG C/- CCCTTGCATT 3070 hom 54 het 20 0 18 3 C 4 3 196032 CASAVA_Build 12 109198941 2D ATATACCGAC TG/-- TAGTTTATAT 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 TG 1 0 196033 CASAVA_Build 12 109199239 1I GGTCCACCCG -/C CTTGGCCCCC 3070 hom 53 het 20 0 18 2 C 1 2 196034 CASAVA_Build 12 109223650 1D GTCATCTTGA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 T 6 5 196035 CASAVA_Build 12 109226291 2D TGGCTTTCTC TT/-- AGCATAGTGT 3070 het 3070 ref 59 26 26 11 T 2 0 196036 CASAVA_Build 12 109229981 1D CAATTCTGTA G/- GTTGTCAGTT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 G 2 1 196037 CASAVA_Build 12 109239609 1I TTTGTTTGGG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 8 9 196038 CASAVA_Build 12 109301048 1D ACTCTAACTA T/- TTTTTTTTTT 1087 het 1087 ref 28 15 4 9 T 17 16 196039 CASAVA_Build 12 109311270 12D ACTCCATCTT AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAG 3070 het 1697 hom 18 8 11 1 A 21 9 196040 CASAVA_Build 12 109318872 1I CTAATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 15 4 T 11 12 196041 CASAVA_Build 12 109320609 1D CCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 47 0 36 11 A 12 11 196042 CASAVA_Build 12 109322776 3I AACTAAGAGT ---/TAC AACTAGGGCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TAC 0 1 196043 CASAVA_Build 12 109348515 1I ACAAAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 1628 het 1628 ref 20 11 8 1 T 12 13 196044 CASAVA_Build 12 109372194 2I GGAGTAGACG --/GA GAGAGAGAAA 1617 hom 22 het 12 0 5 7 GA 4 5 196045 CASAVA_Build 12 109386780 1D GTCCATTTAC T/- TTTTTTTTTT 956 het 348 hom 20 3 5 12 T 19 18 196046 CASAVA_Build 12 109388696 1D ACACTGTATC T/- TTTTTTTTTT 1353 het 1353 ref 35 27 3 5 T 12 11 196047 CASAVA_Build 12 109434982 5D AAAAGAACTC ATAAT/----- ATATGTTTTC 3070 het 3070 ref 26 14 11 4 ATAAT 1 0 196048 CASAVA_Build 12 109488353 1I GCATTTAGGA -/G GTCCCTGGAA 3070 hom 151 het 55 0 51 4 G 1 2 196049 CASAVA_Build 12 109606490 1D TGAAATGTAC T/- TAAATGCCAC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 2 1 196050 CASAVA_Build 12 109623338 1D GGACATGTTA G/- TTGTACAAGC 3070 hom 116 het 47 0 36 11 G 1 0 196051 CASAVA_Build 12 109655665 1I TTGCTAACAA -/T TTTTTTTTTT 657 het 657 ref 38 23 3 12 T 11 12 196052 CASAVA_Build 12 109672958 1D ATTTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 2696 het 48 hom 21 1 10 10 T 15 14 196053 CASAVA_Build 12 109678793 1D AAGAAGAAGG A/- AAAAAAAAAG 1308 het 1308 ref 43 38 3 3 A 10 9 196054 CASAVA_Build 12 109713311 1I AACCTTCTTG -/C TGCGCCTCAT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 0 1 196055 CASAVA_Build 12 109714771 1I CTGGTGCAGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 G 1 2 196056 CASAVA_Build 12 109743626 1D AAGGAGTCTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 8 7 196057 CASAVA_Build 12 109743991 3I TAAAAAAAAA ---/TAG TAGTGCTGAG 3070 hom 92 het 39 0 29 10 TAG 1 2 196058 CASAVA_Build 12 109746851 4D AGGGAGGGAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 hom 84 het 32 0 27 5 GGAA 5 4 196059 CASAVA_Build 12 109748974 4I AGGGAGGCAG ----/TGTT TGTTGTCAGC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TGTT 1 2 196060 CASAVA_Build 12 109752535 1I TAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 20 0 17 3 G 0 1 196061 CASAVA_Build 12 109755253 12D TCTTTTTTTC TTTTTCTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 23 1 19 3 TTTTTCTTTTTT 1 0 196062 CASAVA_Build 12 109760936 1I TGGCTCTTTG -/C TTTGCTGACA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 0 1 196063 CASAVA_Build 12 109761388 1D CTGTCTCTAC T/- TAAAAATACA 3070 hom 33 het 12 0 12 1 T 2 1 196064 CASAVA_Build 12 109765710 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 7 196065 CASAVA_Build 12 109773441 4D TAAATGCTGG TGCT/---- TGCTTGGATG 3070 hom 194 het 74 0 65 9 TGCT 2 1 196066 CASAVA_Build 12 109778854 4I TGGGCCCCTC ----/AGAT AGAGAACATT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 AGAT 0 1 196067 CASAVA_Build 12 109788168 1D AACTTTTTTC T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 7 6 196068 CASAVA_Build 12 109794685 1I ACCAACTCTC -/A GTAAAGTTCC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 0 1 196069 CASAVA_Build 12 109798454 1I AGATAGTATG -/C CTACGGTCCT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 1 2 196070 CASAVA_Build 12 109802967 3I ATAATGATGA ---/TGG TGGTGGTGAT 3070 hom 83 het 59 1 39 19 TGG 2 3 196071 CASAVA_Build 12 109803905 1I TAAGACTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 11 196072 CASAVA_Build 12 109804501 1D GAGTTTGAGA C/- TGGCCTGGGC 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 C 1 0 196073 CASAVA_Build 12 109807378 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAA 3070 het 2743 hom 23 8 12 8 AG 6 4 196074 CASAVA_Build 12 109812834 2I ACACACACAC --/AT GCCCATTTAC 3070 het 3070 ref 49 21 15 13 AT 0 1 196075 CASAVA_Build 12 109814588 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCCATCT 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 C 6 7 196076 CASAVA_Build 12 109815006 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2521 het 2521 ref 19 9 8 2 A 10 11 196077 CASAVA_Build 12 109816391 3I GTGGGAGCTG ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 CAA 5 6 196078 CASAVA_Build 12 109819466 1I TAATTTTATT -/A AAAAAAAAAA 1705 het 1705 ref 22 14 5 3 A 15 16 196079 CASAVA_Build 12 109826526 1I AGACCTTGTC -/A AAAAAAAAAA 2940 het 1471 hom 25 7 11 7 A 14 15 196080 CASAVA_Build 12 109835387 1I26M1D AGGGGGGACA -GGGGGCAAGCAGGGAACCCCCTTCCTC/GGGGGGCAAGCAGGGAACCCCCTTCCT- CCCCACAGAC 3070 het 3070 ref 32 19 14 7 N/A 0 0 196081 CASAVA_Build 12 109837704 1D ATTTCAAGAG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 44 17 19 9 A 8 7 196082 CASAVA_Build 12 109842496 1D AACTCTCTTA T/- TTTGTGTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 4 3 196083 CASAVA_Build 12 109852667 2I32M2I GTGTTTGTGA --GTGTGTGTGACAGGTGTGTATGTGACTGTGTG--/GTGTGTGTGTGACAGGTGTGTATGTGACTGTGTGAA AGTGTGTGAG 3070 hom 208 het 60 0 69 10 N/A 0 0 196084 CASAVA_Build 12 109852854 2D GATTGTGAGA GT/-- GTGTGTGTGA 3070 hom 158 het 59 0 52 9 GT 5 4 196085 CASAVA_Build 12 109858220 1I ATTCTTCTCT -/G GGGGGATACT 3070 hom 104 het 37 0 35 2 G 5 6 196086 CASAVA_Build 12 109860269 1I TTTTTTTTTT -/C TTTAATATAC 3070 hom 16 het 9 0 8 1 C 0 1 196087 CASAVA_Build 12 109869114 1D AGGCCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 522 hom 20 3 9 8 T 15 14 196088 CASAVA_Build 12 109875505 4I TTGAAAAAGA ----/CTAT CTTTTTTCTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CTAT 0 1 196089 CASAVA_Build 12 109877635 1D TCCTTTAAAT C/- AGTAAAATTC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 1 0 196090 CASAVA_Build 12 109878531 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 819 hom 28 4 16 8 A 15 16 196091 CASAVA_Build 12 109879398 4D GAAAGAACTC CCTT/---- CCCGGATTCC 3070 hom 101 het 36 0 31 6 CCTT 1 0 196092 CASAVA_Build 12 109884320 3D20M1I TGATTGGGTT TTGTTGTTGTTGTTTTCTTGTTG-/---TTGTTGTTGTTTTCTTGTTGT TTTTGAGAGA 3070 hom 138 het 47 0 47 10 N/A 0 0 196093 CASAVA_Build 12 109885270 1I CTTCTCTAGG -/A AAAGACCATA 3070 hom 169 het 62 0 57 5 A 3 4 196094 CASAVA_Build 12 109887593 2D CCCCTCCACA CC/-- CCCCCCCCTT 3070 het 76 hom 24 1 11 12 C 10 8 196095 CASAVA_Build 12 109912167 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 22 0 16 7 T 15 14 196096 CASAVA_Build 12 110068826 2I GGTTAGTAAC --/AT GTGTATTTGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AT 0 1 196097 CASAVA_Build 12 110116133 5I2M1I CTGGATGCCA -----AG-/CTCTCAGC GTTGGGCTCC 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 N/A 0 0 196098 CASAVA_Build 12 110132999 3D AAAAAAAAAG ACA/--- ACATTTATTG 2144 het 2144 ref 31 17 9 7 ACA 2 1 196099 CASAVA_Build 12 110137219 2D AGCCCTCTGA CT/-- CTATATAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 CT 2 1 196100 CASAVA_Build 12 110138973 4D ACATCAGTCT ATCA/---- ATCAGTGGCT 3070 het 3070 hom 38 15 18 7 ATCA 2 1 196101 CASAVA_Build 12 110154400 2D TGAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 1359 het 1359 ref 13 6 5 2 AT 7 6 196102 CASAVA_Build 12 110175992 1I TAAAATACTG -/T TTTTTTTAGA 2028 het 2028 ref 28 9 7 12 T 7 8 196103 CASAVA_Build 12 110187081 1D AGCCGTAGAT A/- AGAGTCGATT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 2 1 196104 CASAVA_Build 12 110197139 1D TCCATGATTC A/- AAAAAAAAAA 2874 het 2564 hom 28 11 9 8 A 12 11 196105 CASAVA_Build 12 110214540 1D GCACTTTGGG A/- GGCCAAGGCG 3070 het 1746 hom 20 7 11 2 A 1 0 196106 CASAVA_Build 12 110215316 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1104 hom 18 5 13 0 A 10 11 196107 CASAVA_Build 12 110228514 1D GTTTGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1700 hom 22 8 9 5 T 15 14 196108 CASAVA_Build 12 110234731 8D CTACTAAAAA TACAAAAT/-------- TACCTGGGCA 3070 het 1639 hom 14 4 9 2 TACAAAAT 1 0 196109 CASAVA_Build 12 110235416 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1272 hom 12 het 9 0 4 5 T 14 15 196110 CASAVA_Build 12 110236514 1I CCTGCCTCGG -/C CTCCCAAAGT 2958 het 1161 hom 20 3 8 9 C 1 2 196111 CASAVA_Build 12 110254818 1D GTTTTGAGGT A/- ACTTCTAATT 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 A 2 1 196112 CASAVA_Build 12 110281152 1D AATGAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1377 het 1377 ref 32 13 5 14 T 17 16 196113 CASAVA_Build 12 110315905 1D TAAAGACTGG A/- ATTGAGGCTC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 2 1 196114 CASAVA_Build 12 110316599 14D TATGTGTGTG TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 1117 hom 10 het 12 0 4 10 TA 14 7 196115 CASAVA_Build 12 110317271 1D TAACAAAATG A/- ATTAATTAAT 3070 het 2850 hom 16 6 8 2 A 2 1 196116 CASAVA_Build 12 110338669 1D TTGTTGCTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 9 8 9 T 10 9 196117 CASAVA_Build 12 110378615 1D CCATCTGGAC A/- ACTCCTTTCT 3070 het 3070 hom 55 23 25 7 A 2 1 196118 CASAVA_Build 12 110391815 1I TATTCAACCA -/C TTAAAATACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 196119 CASAVA_Build 12 110396585 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 9 10 196120 CASAVA_Build 12 110403694 1I AACCAAAGAC -/A ATATCGGTTA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 1 2 196121 CASAVA_Build 12 110412234 1I TACTAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2863 hom 22 7 11 4 A 12 13 196122 CASAVA_Build 12 110433433 1D CATTTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 2245 het 2245 ref 37 21 7 9 T 13 12 196123 CASAVA_Build 12 110451541 2D CGTGACTATT AG/-- AAAAGTGTTA 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 AG 1 0 196124 CASAVA_Build 12 110453772 3D TACGAGCATA TAC/--- TACTACACCA 3070 het 3070 ref 33 20 10 6 TAC 3 2 196125 CASAVA_Build 12 110481140 1I AATTTCCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 27 2 23 2 A 14 15 196126 CASAVA_Build 12 110489216 3D AAGCAAGAGA ACT/--- AAAATTAGAA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 ACT 1 0 196127 CASAVA_Build 12 110504539 3I AGGCTGAGGC ---/AGA AGAACTGCTT 3070 hom 108 het 41 0 35 7 AGA 1 2 196128 CASAVA_Build 12 110542158 1D CAAGGAGCTG T/- TTTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 T 4 3 196129 CASAVA_Build 12 110564130 1D TTTTTTTTTT G/- TATTTTTAGT 2498 het 1705 hom 14 7 7 0 G 1 0 196130 CASAVA_Build 12 110577522 1D ACTGAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1924 hom 39 10 16 13 A 17 16 196131 CASAVA_Build 12 110593289 1I TCATGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3007 hom 23 8 12 3 A 10 11 196132 CASAVA_Build 12 110613782 1D AGGAATGAGA T/- TTTTTTTTTT 1181 het 1181 ref 34 13 4 17 T 19 18 196133 CASAVA_Build 12 110623590 4D CACCTGTAAT CACA/---- CACAGTACCT 1350 het 1350 ref 21 11 5 7 CA 4 2 196134 CASAVA_Build 12 110629600 2I GATACTTTAA --/TT AAATGTTTGT 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 T 0 2 196135 CASAVA_Build 12 110630659 1D CCTCTTAGAC T/- TTTTTTTTTT 986 het 986 ref 45 33 3 9 T 11 10 196136 CASAVA_Build 12 110643302 1D TCTATTCATC T/- TTTGAGTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 4 3 196137 CASAVA_Build 12 110671780 1I TAGCAGCAGA -/G GGCAAGGTTC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 G 2 3 196138 CASAVA_Build 12 110676810 6D GGGACCAACC CATGCT/------ CATGCTCACA 3070 het 3070 ref 30 15 12 9 CATGCT 2 1 196139 CASAVA_Build 12 110682755 6D ACTATCTGTA TATTAT/------ TATTATTATT 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 TAT 5 3 196140 CASAVA_Build 12 110704025 1D CTTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 36 25 4 7 T 11 10 196141 CASAVA_Build 12 110715773 1I TATATTCGGG -/T TTTTTTTTTT 2553 het 2553 ref 26 11 7 8 T 11 12 196142 CASAVA_Build 12 110719122 1D AGGAGTATAT A/- AGTGCATATT 3070 hom 36 het 24 0 15 9 A 2 1 196143 CASAVA_Build 12 110728524 4D AAAAAAGAAA AAAC/---- AAACAAACAG 1846 het 1846 ref 23 9 8 7 AAAC 3 2 196144 CASAVA_Build 12 110732596 2D GTAAACAGCT TC/-- TGTTTCATGC 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 TC 1 0 196145 CASAVA_Build 12 110737970 3I ATATATATAT ---/ATA TTTTTTTTTT 1703 het 1066 hom 14 6 7 1 ATA 0 1 196146 CASAVA_Build 12 110762822 1I GGGACCGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 A 11 12 196147 CASAVA_Build 12 110772081 1D TTAAAATAAC T/- TTTTTTTTTG 2533 het 2533 ref 28 13 8 7 T 10 9 196148 CASAVA_Build 12 110772137 2D TCTCCAGCTC TT/-- GAGCTCAAGC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 2 0 196149 CASAVA_Build 12 110772222 1I TGAAATATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 T 10 11 196150 CASAVA_Build 12 110777136 1I ATTAATTCAG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 8 9 196151 CASAVA_Build 12 110785794 1D TGGATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1760 het 1491 hom 27 11 5 11 T 17 16 196152 CASAVA_Build 12 110790879 1I TGTTTCAGGG -/T TTTTTTGTTT 2681 het 2681 ref 26 13 9 5 T 6 7 196153 CASAVA_Build 12 110791303 1D AACTCTGGAA G/- GAAGGCATCT 3070 het 3070 ref 51 27 22 2 G 2 1 196154 CASAVA_Build 12 110796130 2I TTAACAATAT --/AA AAGTCTCCCA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 A 2 4 196155 CASAVA_Build 12 110799089 4I ACACATTCTT ----/ACAA ACAGTGTACA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 ACAA 0 1 196156 CASAVA_Build 12 110801575 1D TTAGAGTAGG T/- TTTTTTTTTT 1534 het 1366 hom 27 8 8 11 T 19 18 196157 CASAVA_Build 12 110804571 3D GTCTCAAAAA AAG/--- AAAATACAGG 3070 het 3070 hom 23 9 13 2 AAG 1 0 196158 CASAVA_Build 12 110809856 2I AGCAAGACTC --/TG TCTCAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TG 0 1 196159 CASAVA_Build 12 110823118 1I CAAGAGTGTT -/A ACAATTCAAT 3070 het 3070 hom 65 26 26 13 A 1 2 196160 CASAVA_Build 12 110824860 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCTCC 2257 het 2257 ref 23 13 6 4 G 4 3 196161 CASAVA_Build 12 110828009 5I AGAGTCTCTG -----/GCTAT GCTGGCAATC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 GCTAT 0 1 196162 CASAVA_Build 12 110829612 1D ACCTCAAGCC A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 8 7 196163 CASAVA_Build 12 110837488 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 13 4 A 15 14 196164 CASAVA_Build 12 110849744 10D AAATGTGGAA TAATATAATG/---------- TGACCAACAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 TAATATAATG 1 0 196165 CASAVA_Build 12 110854262 1I AGCTTCAGTG -/C CCCCCCCTTA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 C 7 8 196166 CASAVA_Build 12 110861086 3I ATAGAAAACA ---/TAT TATATTTGGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TAT 1 2 196167 CASAVA_Build 12 110876260 1I AATAAAGCTG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 6 7 196168 CASAVA_Build 12 110887052 1I TTTAAAAAAA -/T ATTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 0 1 196169 CASAVA_Build 12 110891578 1D AATGGATGAG T/- TTTTTTGTTT 2872 het 2872 ref 21 9 8 4 T 7 6 196170 CASAVA_Build 12 110891972 1D TCTCCATGTT G/- GCTAGGCTGG 1419 het 1419 ref 10 4 5 1 G 2 1 196171 CASAVA_Build 12 110893686 1D CCAGTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 13 12 196172 CASAVA_Build 12 110897515 1I TATACAAACA -/T TTTTTTTTTG 2194 het 2194 ref 21 11 6 4 T 9 10 196173 CASAVA_Build 12 110897981 1I GGGATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 10 11 196174 CASAVA_Build 12 110900593 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 9 10 196175 CASAVA_Build 12 110902628 1I ATATATGAAT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 A 6 7 196176 CASAVA_Build 12 110903252 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 15 14 196177 CASAVA_Build 12 110913713 1I CTGTCTCAGA -/G AAAAAAAAAA 3049 het 3003 hom 23 7 7 9 G 0 1 196178 CASAVA_Build 12 110955786 1D ATACTTAAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 16 23 5 A 9 8 196179 CASAVA_Build 12 110977982 1D TTTAAGTAAA C/- TACTTTCCAA 3070 het 3070 ref 31 12 9 10 C 1 0 196180 CASAVA_Build 12 110980344 1D AAAACAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 16 19 9 A 13 12 196181 CASAVA_Build 12 110988689 2D CTGCTGGTCC CT/-- GTTTTCCTCC 3070 het 3070 ref 42 20 19 7 CT 1 0 196182 CASAVA_Build 12 111009104 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATAGCTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AGG 0 1 196183 CASAVA_Build 12 111012233 1I TGGCCGGGCT -/G GTCTCTAACT 3070 hom 57 het 20 0 17 3 G 1 2 196184 CASAVA_Build 12 111013891 1D CCTTATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2192 hom 32 10 12 12 A 13 12 196185 CASAVA_Build 12 111021475 1I GCACTCGGCC -/T TTTTTTTTTT 1873 het 1873 ref 18 7 5 6 T 11 12 196186 CASAVA_Build 12 111039841 1I CATGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 2890 het 1303 hom 10 3 7 0 C 4 5 196187 CASAVA_Build 12 111065106 1D ATTCTGAACA T/- TTTTTTTTTT 777 het 777 ref 18 6 3 9 T 15 14 196188 CASAVA_Build 12 111078252 1I CCCTTTATCA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 T 6 7 196189 CASAVA_Build 12 111083445 8I GGGCAAAGAT --------/GCACTGGG GCAGTGGGTG 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 GCACTGGG 0 1 196190 CASAVA_Build 12 111084319 2D ATCAAATTAG AC/-- ACAAACTGTC 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 AC 2 1 196191 CASAVA_Build 12 111092696 3D CCTTCCCAGT CCC/--- CCCAAGACTC 3070 het 1730 hom 27 7 13 7 C 6 3 196192 CASAVA_Build 12 111104572 1D AAGAGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2091 hom 21 8 9 4 A 14 13 196193 CASAVA_Build 12 111129615 1I CAGGCGTGAG -/C CACCATGGCC 3070 hom 85 het 37 0 33 4 C 1 2 196194 CASAVA_Build 12 111156033 1D ATTTTGTTTG T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 7 6 196195 CASAVA_Build 12 111213748 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCCCATC 980 het 980 ref 11 5 4 2 C 7 8 196196 CASAVA_Build 12 111223988 1D CAGCTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 15 7 T 11 10 196197 CASAVA_Build 12 111252464 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1792 het 1669 hom 17 10 6 1 A 15 14 196198 CASAVA_Build 12 111262609 2I CTTGTCTGGG --/GA AGACTAAAGC 3070 het 3070 hom 57 22 26 9 GA 0 1 196199 CASAVA_Build 12 111271827 1I AACAGATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 11 12 196200 CASAVA_Build 12 111276550 1I CAATAGTGTC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 7 8 196201 CASAVA_Build 12 111300582 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1839 hom 17 het 7 0 5 2 T 11 10 196202 CASAVA_Build 12 111314003 1D ACGCCTGGCT A/- AATATTTTGA 3070 hom 35 het 16 0 10 6 A 3 2 196203 CASAVA_Build 12 111318694 1I AATGGAAAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 9 10 196204 CASAVA_Build 12 111337438 2I GTGGGGAGAC --/AG GGGGTGGTGA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 AG 0 1 196205 CASAVA_Build 12 111361120 1I GCTTGTTTTG -/T TTTTTAATTC 3070 het 3070 ref 53 27 16 10 T 5 6 196206 CASAVA_Build 12 111381224 1I TGTCCCAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 0 1 196207 CASAVA_Build 12 111402743 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 3038 het 2018 hom 17 6 8 3 G 2 3 196208 CASAVA_Build 12 111408198 6I ATGATACTAT ------/AATAAA AGTCTGTGTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 AATAAA 0 1 196209 CASAVA_Build 12 111423139 7D TTGCCCAGGC CAGAGTG/------- CAGTGGTGCG 3070 het 3070 ref 23 12 11 1 CAGAGTG 1 0 196210 CASAVA_Build 12 111430223 5D TTGGTTTTGT CTTGA/----- CTTGACTTGA 2113 het 2113 ref 52 46 5 3 CTTGA 3 2 196211 CASAVA_Build 12 111430378 1D TAGTTTTGTT A/- TAAGATATTG 1330 het 1330 ref 54 41 3 10 A 1 0 196212 CASAVA_Build 12 111440007 1I ATTAAAAAAA -/T AAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 0 1 196213 CASAVA_Build 12 111449141 1D GTGAGCGCCT G/- TAGTCCCGCC 3070 het 3016 hom 24 10 11 3 G 1 0 196214 CASAVA_Build 12 111449264 1D ACTGTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2848 hom 31 9 19 4 A 12 11 196215 CASAVA_Build 12 111453953 1I TAACTTCTAA -/T TTTTTTTGTT 2652 het 2652 ref 23 14 7 2 T 7 8 196216 CASAVA_Build 12 111460619 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1597 het 217 hom 22 2 8 12 T 17 16 196217 CASAVA_Build 12 111460965 2I TGTCTGTGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2906 hom 31 10 15 6 A 12 14 196218 CASAVA_Build 12 111461350 3I AAAAAAAACA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 het 2591 hom 30 11 14 5 AAC 0 1 196219 CASAVA_Build 12 111461695 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAG AAAGAAAAAA 3070 het 2666 hom 39 13 17 9 AAAAG 0 1 196220 CASAVA_Build 12 111465438 6I TCTTTCTTTT ------/TCTTTC TTCTTCCTTC 2849 het 1164 hom 10 4 6 0 TCTTTC 0 1 196221 CASAVA_Build 12 111469981 1I TGTTTTTTTT -/G TTTGTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 G 0 1 196222 CASAVA_Build 12 111479749 1I CTTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 1965 het 1965 ref 26 7 6 13 A 15 16 196223 CASAVA_Build 12 111487592 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2110 het 2110 ref 21 8 7 6 A 15 16 196224 CASAVA_Build 12 111506441 3I TAAACACAAA ---/AGG AGAATAGAGT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 AGG 0 1 196225 CASAVA_Build 12 111517353 1D AATAACTGCT A/- AATTCAGTGA 3070 hom 163 het 62 0 55 8 A 3 2 196226 CASAVA_Build 12 111569793 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 2783 het 2783 ref 32 12 10 11 TG 10 9 196227 CASAVA_Build 12 111570215 1D AAAAAATCAA T/- TTTGGTTTTC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 4 3 196228 CASAVA_Build 12 111572921 1D TGTTTACACA T/- TTTTTTTTTT 1126 het 1126 ref 29 14 3 12 T 15 14 196229 CASAVA_Build 12 111576592 1D TTCTCTTGCC T/- TTTTTTTTCA 1673 het 1673 ref 40 30 5 5 T 9 8 196230 CASAVA_Build 12 111660387 1D AATTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 11 10 196231 CASAVA_Build 12 111662132 1D CTCCCTTCAT C/- CCCCCCCAGC 3070 hom 52 het 23 0 17 6 C 8 7 196232 CASAVA_Build 12 111674783 1D CAGGCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 730 hom 38 6 15 17 T 17 16 196233 CASAVA_Build 12 111676552 1I CCAAGCAAAT -/A AAACAGAAGG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 3 4 196234 CASAVA_Build 12 111694466 3I TCAGGGATGA ---/GTT GTTGCTGATG 3070 hom 89 het 34 0 29 5 GTT 1 2 196235 CASAVA_Build 12 111703381 3D AAAAAACCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 70 het 25 0 24 1 AAC 7 6 196236 CASAVA_Build 12 111733151 2D TTGTGTGTAC AT/-- ATATGTGTGT 3070 het 3070 hom 28 13 14 2 AT 3 2 196237 CASAVA_Build 12 111750098 1D AAAAAAAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1938 hom 30 7 15 8 A 10 9 196238 CASAVA_Build 12 111753389 3I TTCTACTCTC ---/TTG TTGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TTG 1 2 196239 CASAVA_Build 12 111757076 5I AAGTCTGTTA -----/CTTAC CTTTCCTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 CTTAC 0 1 196240 CASAVA_Build 12 111758061 1I TGGTTCAGTT -/C TTCATGTTAA 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 C 0 1 196241 CASAVA_Build 12 111776015 1D GACTGTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 A 12 11 196242 CASAVA_Build 12 111846090 1D CAGCATACAC A/- AAAATCAACT 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 A 5 4 196243 CASAVA_Build 12 111848750 1I AATCTTCAAA -/G GGGAGGAAAT 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 G 3 4 196244 CASAVA_Build 12 111849607 1D TAGGATCTTC G/- GTGGATTTAA 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 G 2 1 196245 CASAVA_Build 12 111854099 1D AAGGAACTAT A/- CCAATAATTA 3070 het 3070 ref 39 21 12 7 A 1 0 196246 CASAVA_Build 12 111856717 15D GAAAGAAAGA AAGAAAGAAAGAGAG/--------------- AAAGAAAAGA 836 het 836 ref 9 4 3 5 AAGAAAGAAAGAGAG 1 0 196247 CASAVA_Build 12 111860927 7I TTTATGTGTC -------/CAAAGGG CAAAGGGGAG 2698 het 2698 ref 23 11 8 4 CAAAGGG 1 2 196248 CASAVA_Build 12 111871418 1I TGGAGACACA -/G GGGGGGACCC 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 G 6 7 196249 CASAVA_Build 12 111874731 1D TTTTGTTTTT G/- TTTTTACAAT 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 G 1 0 196250 CASAVA_Build 12 111885208 1D CCCACTCCTC A/- CTCTGCTTCC 3070 het 3070 ref 46 20 23 4 A 1 0 196251 CASAVA_Build 12 111890946 1I TCAAGTGATC -/T GCCTGCCTAG 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 T 0 1 196252 CASAVA_Build 12 111904772 1D CTAGCATTTT G/- TTGAAGGTAT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 G 1 0 196253 CASAVA_Build 12 111915295 1D AGAAAAGCAA C/- CTACAGGGGA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 C 2 1 196254 CASAVA_Build 12 111916151 2D GTTTTTTTGT GG/-- GGGGGGGAGG 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 G 9 7 196255 CASAVA_Build 12 111922141 1D GCTACATTGG C/- CAGGCTGGTC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 C 2 1 196256 CASAVA_Build 12 111922670 2D ATGCACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 66 23 30 18 AC 9 8 196257 CASAVA_Build 12 111931583 1D GCCCCCTAAG C/- CCCCACTACA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 C 5 4 196258 CASAVA_Build 12 111933241 1D39M1D CTGCCTTTCT CCCCCCCACCCAGGAGTATCCTCTTGCCAAATCAAAAGACT/-CCCCCCACCCAGGAGTATCCTCTTGCCAAATCAAAAGAC- TTTTCCTTGG 3070 het 3070 ref 34 21 23 3 N/A 0 0 196259 CASAVA_Build 12 111939920 1I TCACTTGAAC -/T TCAGGAGGCG 2842 het 1476 hom 12 3 7 4 T 1 2 196260 CASAVA_Build 12 111950308 1I AATACACATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 9 10 196261 CASAVA_Build 12 111951903 3D CCAATCTTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 709 hom 29 7 10 12 T 17 14 196262 CASAVA_Build 12 111953776 1D AATGGAACAA T/- GTTGTTCACA 3070 het 3070 hom 41 17 17 9 T 1 0 196263 CASAVA_Build 12 111953936 3D AACAATCTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 8 A 15 12 196264 CASAVA_Build 12 111956777 1D AAAATAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 A 13 12 196265 CASAVA_Build 12 111963532 2D CCACCCCCCC CG/-- GGCTCAAGCA 1760 het 1760 ref 18 7 7 4 CG 1 0 196266 CASAVA_Build 12 111988906 2D TGTGTGCCAG GC/-- ACTGTCCGGG 3070 hom 117 het 44 0 39 7 GC 1 0 196267 CASAVA_Build 12 111990068 1D AAATAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 30 1 22 7 A 11 10 196268 CASAVA_Build 12 112002279 1D TTCCAGGGAT G/- CATCACAGCC 3070 het 3070 ref 41 14 11 16 G 1 0 196269 CASAVA_Build 12 112007184 2D AACACAGGCC CA/-- CATAGTCCAT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 CA 2 1 196270 CASAVA_Build 12 112014515 1I ACAGCAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 15 11 A 13 14 196271 CASAVA_Build 12 112019733 1D TTCTACAAAA G/- AATGGCCAGC 3070 hom 80 het 29 0 25 5 G 1 0 196272 CASAVA_Build 12 112033283 2D CCCCACGCGC TG/-- CTTGCTTTGT 3070 het 3070 hom 28 10 14 6 TG 1 0 196273 CASAVA_Build 12 112045737 1D GTCTCCTTGC T/- TTTTGTTTAC 3070 hom 116 het 50 0 39 11 T 5 4 196274 CASAVA_Build 12 112117193 1I TTTTTACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 951 hom 15 3 9 3 A 11 12 196275 CASAVA_Build 12 112216815 5D ACTCTGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 788 hom 18 4 10 7 A 16 11 196276 CASAVA_Build 12 112220972 1I AAATTTTGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 9 10 196277 CASAVA_Build 12 112221065 1I TTCGGCAACA -/T TAAGGCGGGG 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 T 1 2 196278 CASAVA_Build 12 112225982 1I GGCCCTTCCG -/C CTGCGTGCTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 C 1 2 196279 CASAVA_Build 12 112230271 1D CGGTGGCTCA C/- CGCCTGTAAT 3070 het 3070 ref 24 14 8 3 C 2 1 196280 CASAVA_Build 12 112232235 1D AGCTATTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 11 10 196281 CASAVA_Build 12 112247943 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 1192 hom 7 het 3 0 3 0 G 3 4 196282 CASAVA_Build 12 112255471 1I GCTTCTGGGG -/C CAGGTGGGTG 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 C 1 2 196283 CASAVA_Build 12 112266094 1D AGTGAGCCAC G/- CACGCCTGGC 2541 hom 26 het 12 0 8 5 G 1 0 196284 CASAVA_Build 12 112266481 1D TTAAAAAACA T/- TTTTTTAATA 2772 het 2772 ref 23 12 7 4 T 7 6 196285 CASAVA_Build 12 112271658 1I ACTGCCTCCG -/A AAACAACTTT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 3 4 196286 CASAVA_Build 12 112318675 9I CTTTCTCTCT ---------/CTTTCTTTC CTTTCTTTCC 3070 hom 30 het 17 0 11 6 CTTTCTTTC 1 2 196287 CASAVA_Build 12 112351109 1D CCTGGAATTG T/- TTTTTTTTTT 772 het 772 ref 45 25 4 16 T 12 11 196288 CASAVA_Build 12 112379820 1D CCCTGGGATG T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 56 het 20 0 15 5 T 8 7 196289 CASAVA_Build 12 112410180 1D CTTTTTCTCA G/- GCTTTGGCCT 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 G 2 1 196290 CASAVA_Build 12 112419268 2D CGGAGTCTCA CT/-- CTGTTGCCCT 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 CT 2 1 196291 CASAVA_Build 12 112420562 3D TCATGAAAGA AGC/--- AGCTTTCCTG 3070 het 3070 hom 48 20 22 8 AGC 2 1 196292 CASAVA_Build 12 112421019 1D GGAGAATTAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 8 7 196293 CASAVA_Build 12 112421734 1D AGAGATGGGG T/- TTTTTTTTTT 1689 het 764 hom 11 4 5 2 T 12 11 196294 CASAVA_Build 12 112423541 2D ACACTCTACT AC/-- ACACACACAC 1279 het 1279 ref 54 41 3 14 AC 7 6 196295 CASAVA_Build 12 112424514 3D AATGTTTATG AAA/--- AAAACCTCAA 3070 het 3070 hom 47 17 24 7 A 7 4 196296 CASAVA_Build 12 112426932 1D GGAAACCCCA C/- CTTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 C 2 1 196297 CASAVA_Build 12 112430447 2D AGCAGAGGTC GA/-- GAGAGAGAGA 1802 het 1802 ref 38 25 4 10 GA 8 7 196298 CASAVA_Build 12 112435279 3I GGCTTCTTTC ---/CAT CATCATTATG 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 CAT 2 3 196299 CASAVA_Build 12 112436325 31D TGGAAATTAC CCACCCCTTTCCCGGAAAATTTACGAATAAT/------------------------------- CCACCCCTTT 3070 hom 38 het 29 0 13 18 CCACCCCTTTCCCGGAAAATTTACGAATAAT 2 1 196300 CASAVA_Build 12 112449422 1D ACTGAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 T 12 11 196301 CASAVA_Build 12 112467254 1I AGAGTGCACC -/A AGGGGAGACC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 1 2 196302 CASAVA_Build 12 112478416 1D CATGGTTGGC T/- TTGGGCTTCC 3070 het 3070 ref 59 29 25 5 T 3 2 196303 CASAVA_Build 12 112482754 2I ACACTTGCAT --/AC ACACACACGT 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 AC 4 5 196304 CASAVA_Build 12 112487200 1I TGTACGAAAA -/C CCCCACCCCC 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 C 4 5 196305 CASAVA_Build 12 112493489 2D CTTTGTATCA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 87 het 37 0 29 9 AC 7 6 196306 CASAVA_Build 12 112497700 38D CGTATGTGAC TGTGTGCGGGGCTGGACTGTGTGTGCGGGGCTGGACTG/-------------------------------------- TGTGTGCGGG 3070 het 3070 ref 40 13 20 20 TGTGTGCGGGGCTGGACTG 2 0 196307 CASAVA_Build 12 112503671 1D TATTTTTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 60 22 26 12 T 10 9 196308 CASAVA_Build 12 112524953 3I AAAGCCTAGT ---/AGA AGAAGATTTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 AGA 2 3 196309 CASAVA_Build 12 112527196 5D CAACTATTTA TATTT/----- TATTTTATTA 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 TATTT 2 1 196310 CASAVA_Build 12 112528288 5I CAGCAAGAAA -----/CTGAG CTGAGGTTGT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 CTGAG 1 2 196311 CASAVA_Build 12 112534361 1D CTGCGAGGCA T/- TTTTTCGGGC 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 T 6 5 196312 CASAVA_Build 12 112538233 1I CTATGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2837 hom 26 10 13 3 A 10 11 196313 CASAVA_Build 12 112542733 11I TAAAGTGTAA -----------/ATGCAATTTAC ATAACATAAA 3070 hom 177 het 65 0 58 7 ATGCAATTTAC 0 1 196314 CASAVA_Build 12 112542962 3I GTCATACAAA ---/GAG TGCAATCTGT 3070 hom 120 het 44 0 39 5 GAG 0 1 196315 CASAVA_Build 12 112543140 1D GTCATCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 30 1 22 7 T 11 10 196316 CASAVA_Build 12 112545212 1I AATCATACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 10 20 8 T 11 12 196317 CASAVA_Build 12 112545630 1I GCATAAGTCA -/C CCATGTCCGG 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 C 2 3 196318 CASAVA_Build 12 112546523 1I CTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 64 het 24 0 22 2 T 9 10 196319 CASAVA_Build 12 112546765 1I TTGTTTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 35 1 29 5 T 11 12 196320 CASAVA_Build 12 112547285 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 40 3 12 25 T 15 14 196321 CASAVA_Build 12 112555429 1D GTGTTGCTAG A/- TATAGTGGTT 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 A 1 0 196322 CASAVA_Build 12 112559874 3I GCTGTTGTAC ---/TTG TTGTACATAA 3070 hom 56 het 22 0 17 5 TTG 1 2 196323 CASAVA_Build 12 112561756 2I TTTGCGCACG --/CA CACACACGCA 3070 hom 130 het 49 0 41 8 CA 3 4 196324 CASAVA_Build 12 112562991 2D CGTCCAGAGA TG/-- TGTGTGTGGT 3070 het 3070 hom 52 20 24 9 TG 5 4 196325 CASAVA_Build 12 112564969 3I TTTCCCTTCT ---/TCC TCCTTCCCTC 2221 het 2221 ref 26 12 8 6 TCC 1 2 196326 CASAVA_Build 12 112566849 1D TATTATTGTA T/- TTTTTTTGTA 2153 het 2153 ref 13 6 5 2 T 8 7 196327 CASAVA_Build 12 112570928 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2916 hom 36 10 19 8 A 12 11 196328 CASAVA_Build 12 112594957 2I TTTTTGTTTT --/TG TTTTTTTGCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TG 0 1 196329 CASAVA_Build 12 112596649 1D GGCCCTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 515 hom 40 3 18 20 T 15 14 196330 CASAVA_Build 12 112601931 1I CCTTGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 677 hom 38 2 29 7 A 13 14 196331 CASAVA_Build 12 112621089 1I GTTAATGGAT -/A AAAAAAAAAA 2039 hom 12 het 5 0 5 0 A 11 12 196332 CASAVA_Build 12 112645186 1D GCAAGACCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 18 0 13 6 A 16 15 196333 CASAVA_Build 12 112655540 3I CAGAGCAGAA ---/AAG AAGGAGATGA 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 AAG 1 2 196334 CASAVA_Build 12 112656983 1I ACATGCATTT -/C CCCCCATATT 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 C 5 6 196335 CASAVA_Build 12 112660713 1I TTTTTTATTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 A 7 8 196336 CASAVA_Build 12 112660875 4D AAACCTTGTG GATT/---- TCCCATTCAT 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 GATT 1 0 196337 CASAVA_Build 12 112667015 1D CAAGAGAAAA G/- GGGGGTCCAC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 G 6 5 196338 CASAVA_Build 12 112696467 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 1063 het 1063 ref 19 11 6 2 A 15 16 196339 CASAVA_Build 12 112706131 2D CACGCACGTG CA/-- CACACACACA 1271 het 1271 ref 63 40 4 20 CA 10 9 196340 CASAVA_Build 12 112711131 1I TCCAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 37 1 28 8 T 10 11 196341 CASAVA_Build 12 112714237 2D TTAAAGAAAG AC/-- AGAAAGAAGG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 AC 1 0 196342 CASAVA_Build 12 112717002 1D AGAGTCACCA C/- CCCCCCCCTC 3070 hom 73 het 33 0 22 11 C 9 8 196343 CASAVA_Build 12 112722677 8D CAAGACTTGA CGTCATGT/-------- TCAAGATGTC 3070 hom 66 het 25 0 22 5 CGTCATGT 1 0 196344 CASAVA_Build 12 112733505 2D GCTGTGATAC AT/-- GAGTCTTTAA 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 AT 1 0 196345 CASAVA_Build 12 112739865 1D TTCTTTAAAC T/- GTGTAAGTCT 3070 het 2499 hom 30 7 15 8 T 1 0 196346 CASAVA_Build 12 112740754 3D TTATGTTCAC AAT/--- AATGATGGCA 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 AAT 2 1 196347 CASAVA_Build 12 112753419 2I CTAATTTCAG --/TT CCGACAACTT 3070 het 3070 hom 48 17 28 3 T 0 2 196348 CASAVA_Build 12 112773923 1D TGTGGTAAAG T/- TTTTTTTTTT 1721 het 630 hom 20 4 5 11 T 17 16 196349 CASAVA_Build 12 112774237 1D AGATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 19 5 A 13 12 196350 CASAVA_Build 12 112776353 1I GCCTTGGTTT -/C CCCAGCTGTC 3070 het 3070 ref 58 32 19 7 C 3 4 196351 CASAVA_Build 12 112777470 1D ACACTGTTCT G/- GGAGTTGAGA 3070 het 3070 ref 58 27 21 10 G 3 2 196352 CASAVA_Build 12 112782032 2I GGCTGCCTGG --/GC GCACACACAC 3070 het 2441 hom 27 7 14 6 GC 1 2 196353 CASAVA_Build 12 112790569 1D AGAGAATTTC A/- TAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 A 1 0 196354 CASAVA_Build 12 112793655 4D TATAAAGGGT CAGA/---- CAGTCAATAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 CAGA 1 0 196355 CASAVA_Build 12 112796175 3D TAGAAACCCA GTC/--- ACCGCCCTGC 3070 het 3070 ref 42 17 13 15 GTC 1 0 196356 CASAVA_Build 12 112798978 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 9 10 196357 CASAVA_Build 12 112805895 1D AGGTCTGTCT G/- GTTTCTGAGT 3070 het 3070 hom 50 21 22 9 G 2 1 196358 CASAVA_Build 12 112807107 1D CCACACTGAT A/- AAAAAATAAG 3070 hom 91 het 33 0 30 4 A 7 6 196359 CASAVA_Build 12 112811860 2D CAAACAAACA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2946 hom 37 12 22 3 AC 1 0 196360 CASAVA_Build 12 112816367 1I GCACACACTT -/C CAGAGGCTCA 3070 hom 144 het 54 0 46 8 C 1 2 196361 CASAVA_Build 12 112833243 1D GGGTGGCGGT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 70 het 42 1 31 10 G 8 7 196362 CASAVA_Build 12 112840331 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 10 9 196363 CASAVA_Build 12 112858971 1D TTTTTTCCCC T/- AAAAGCTTTA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 1 0 196364 CASAVA_Build 12 112859756 1D CACGGGCAAC A/- CCTGTATACG 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 1 0 196365 CASAVA_Build 12 112867056 2D TATAAAAATG TA/-- TATATATATA 3070 het 1865 hom 21 8 12 2 TA 6 5 196366 CASAVA_Build 12 112887709 1I ATTTAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 A 7 8 196367 CASAVA_Build 12 112889971 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 12 11 196368 CASAVA_Build 12 112890458 1D TCATAGCCAC T/- CTAGTGGGTG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 1 0 196369 CASAVA_Build 12 112939584 5D TGACTGGAAT ATTTC/----- ATTCTCCCTT 3070 het 3070 hom 42 16 24 4 ATTTC 1 0 196370 CASAVA_Build 12 112945943 1I AGATATTCAG -/T TGCAAGTCTA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 1 2 196371 CASAVA_Build 12 112973229 35D GTTCTTCTGC CCAGCTTGCTGCCATTAGGCTATATATAAGGCAGT/----------------------------------- CCAGCTTGCT 3070 het 3070 ref 43 21 21 10 CCAGCTTGCTGCCATTAGGCTATATATAAGGCAGT 1 0 196372 CASAVA_Build 12 112984254 1D ATGTACACAA G/- GTCTCTTCTT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 G 2 1 196373 CASAVA_Build 12 112985665 3D CCCATACCTC ATT/--- GTTGGGATTT 3070 het 3070 ref 31 19 11 3 ATT 1 0 196374 CASAVA_Build 12 112986993 1I AGAACCCCTT -/C CCCCTTCCTT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 C 4 5 196375 CASAVA_Build 12 112991972 1I AATAAACTAT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 A 7 8 196376 CASAVA_Build 12 113006001 1D CAACTTTTTA T/- TTTTTTTTAT 2975 het 2329 hom 22 6 6 11 T 9 8 196377 CASAVA_Build 12 113011844 1D GCTGAGTCCA T/- ACATGAGTTG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 1 0 196378 CASAVA_Build 12 113070824 2I CATGTAACTA --/TG TGAATCTCAC 3070 het 3070 ref 59 27 23 9 TG 1 2 196379 CASAVA_Build 12 113072666 6D ACGTCCAGGA AGTAGG/------ AGTAGGAGAC 3070 het 3070 ref 59 31 25 7 AGTAGG 2 1 196380 CASAVA_Build 12 113073739 1I AAAATTTGGT -/A AAAAAAAAAA 1626 het 1614 hom 22 8 7 7 A 13 14 196381 CASAVA_Build 12 113088576 1D AGAACATAAA G/- GGGGGGGGAA 3070 het 3070 hom 52 21 18 14 G 9 8 196382 CASAVA_Build 12 113092478 2I GGTTCAGCCC --/CA CAGCAGCATC 3070 het 3070 ref 65 30 27 8 CA 1 2 196383 CASAVA_Build 12 113101500 1D CAGGATTAGG C/- AGCATACAGG 3070 het 3070 ref 53 30 21 2 C 1 0 196384 CASAVA_Build 12 113105914 2I AGGCTGAGAC --/AG AAGATTCCTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 AG 0 1 196385 CASAVA_Build 12 113116360 6D GGAGGTGAAT ACACAC/------ ACACACCCCT 3070 het 2461 hom 31 10 15 7 AC 6 3 196386 CASAVA_Build 12 113123201 1I23M1D GAAGGAAGGG -AGCATAGAGCAACCCATAGTTCCT/AAGCATAGAGCAACCCATAGTTCC- TTTTTCTCTC 3070 hom 105 het 33 0 36 5 N/A 0 0 196387 CASAVA_Build 12 113124212 2D GCATGGAAAA CT/-- CTGGAAGGAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 7 CT 2 1 196388 CASAVA_Build 12 113126499 1I GTTGCGGGGG -/C GGGTGGGGGG 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 C 0 1 196389 CASAVA_Build 12 113129615 1D GGAGTCTGGG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 8 7 196390 CASAVA_Build 12 113135998 1I CTGAGCAGCC -/A AAAAAAAAAA 2029 het 2029 ref 42 15 13 14 A 14 15 196391 CASAVA_Build 12 113150068 15D GGAGAGCACC CTCAGATAGGAACTG/--------------- CAGCTGCTGG 3070 hom 107 het 38 0 33 7 CTCAGATAGGAACTG 1 0 196392 CASAVA_Build 12 113151168 1D GTTCTCAGTA C/- CCAGCAGAAG 3070 hom 111 het 44 0 37 7 C 3 2 196393 CASAVA_Build 12 113155884 4D GATAGATGGG TAGA/---- TAGATAGATA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TAGA 4 3 196394 CASAVA_Build 12 113160497 1I CAAGCTGGTA -/C AAACCAGCTC 3070 hom 141 het 55 0 48 7 C 0 1 196395 CASAVA_Build 12 113163339 3D CTTGTACTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 30 0 20 11 A 17 14 196396 CASAVA_Build 12 113164213 1D CCCCAGCTAC T/- AATGGGCATG 3070 hom 129 het 52 0 40 12 T 1 0 196397 CASAVA_Build 12 113169193 13D CACTTCAATT CCATGCTCTACAG/------------- CCAACTGGGT 3070 hom 99 het 34 0 31 8 CCATGCTCTACAG 1 0 196398 CASAVA_Build 12 113170041 1D TTTTTTTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 8 196399 CASAVA_Build 12 113170628 1D ATAATACAGG C/- AATACCTGCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 1 0 196400 CASAVA_Build 12 113192734 1D CCTGGGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 40 0 32 8 A 11 10 196401 CASAVA_Build 12 113201861 1D CCTGTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 40 1 32 7 A 12 11 196402 CASAVA_Build 12 113205066 1D CATCATGTCA G/- GGGGGATCCC 3070 hom 114 het 41 0 36 5 G 6 5 196403 CASAVA_Build 12 113212716 66D TGGGAGCCAT TGCACCCAGCAGAAAGGTAAATTCTTTCTTGCAGGGAGCTCCAAGTGGTACACTCCCATGGCTGCC/------------------------------------------------------------------ ATGCTTAGGG 3070 hom 51 het 13 0 14 8 TGCACCCAGCAGAAAGGTAAATTCTTTCTTGCAGGGAGCTCCAAGTGGTACACTCCCATGGCTGCC 1 0 196404 CASAVA_Build 12 113223913 1D49M1I AAAGCACTTA GAAAATGCCTGGACAAGAAACAGCATTCATAAGTGTTAAATTCCCAGGTT-/-AAAATGCCTGGACAAGAAACAGCATTCATAAGTGTTAAATTCCCAGGTTA AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 33 1 49 8 N/A 0 0 196405 CASAVA_Build 12 113236577 1D TCCCCCTTTT C/- CCCCTAGGAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 C 5 4 196406 CASAVA_Build 12 113254705 2D CTTGGAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 38 17 13 10 AG 10 9 196407 CASAVA_Build 12 113261517 1D CCACCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 11 10 196408 CASAVA_Build 12 113263654 2D AAACAGCCTC TT/-- ATCAATATTT 3070 het 3070 hom 47 18 22 8 T 2 0 196409 CASAVA_Build 12 113267685 1I TCAGTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 10 11 196410 CASAVA_Build 12 113272335 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 A 11 10 196411 CASAVA_Build 12 113274185 1I GTGTAATCTG -/A GGGGGGGAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 196412 CASAVA_Build 12 113275922 8D GGATATAAAC CAGTGGAT/-------- CATATATTCA 3070 hom 102 het 36 0 35 5 CAGTGGAT 1 0 196413 CASAVA_Build 12 113276335 1D ATAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 9 196414 CASAVA_Build 12 113287254 1D GATGACTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2120 hom 26 5 14 8 A 12 11 196415 CASAVA_Build 12 113292039 1I TGTTCTTCAA -/G TGCCTCCTAA 3070 hom 99 het 39 0 32 7 G 0 1 196416 CASAVA_Build 12 113292930 1D TCATTTAACC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 16 9 T 9 8 196417 CASAVA_Build 12 113303039 2I AGTTTTTATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 A 10 12 196418 CASAVA_Build 12 113306462 1D CATTCTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 36 1 25 10 T 12 11 196419 CASAVA_Build 12 113309132 1D AAATACAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 3 2 196420 CASAVA_Build 12 113309312 4D AACAAAAAAC AAAA/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 5 A 7 3 196421 CASAVA_Build 12 113314911 1D CTTATTGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 127 hom 40 1 33 6 T 10 9 196422 CASAVA_Build 12 113315454 14D GACTGTAGCT AAGAAAAGGGAGGG/-------------- GCACACCATC 2751 het 2751 ref 24 13 11 2 AAGAAAAGGGAGGG 1 0 196423 CASAVA_Build 12 113325005 1D TCCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 11 10 196424 CASAVA_Build 12 113341191 9I CCCCGGAACT ---------/TAAAAAAAA TAATAATTTT 3070 het 3070 ref 26 14 7 5 TAAAAAAAA 0 1 196425 CASAVA_Build 12 113352504 1I ATTTTTCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 10 11 196426 CASAVA_Build 12 113354919 1I GAAAAAAAAA -/G GGGGGGACTC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 G 6 7 196427 CASAVA_Build 12 113355294 1D TATCACAGTA T/- AATGCAACAG 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 T 1 0 196428 CASAVA_Build 12 113355645 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 2928 het 2928 ref 21 13 7 2 T 11 10 196429 CASAVA_Build 12 113356510 1I TTCTGTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 10 11 196430 CASAVA_Build 12 113356780 1D CCAAAAAAAT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 A 9 8 196431 CASAVA_Build 12 113368101 3D TGAGAAGGCC GGG/--- GGGGGGGTGT 3070 het 633 hom 16 3 9 5 G 10 7 196432 CASAVA_Build 12 113368264 1D GAGGATCCCA T/- TATATTCCCT 3070 hom 122 het 43 0 38 5 T 2 1 196433 CASAVA_Build 12 113415822 1D GCCAACTCAG T/- TTTTTTTTTT 1544 het 1544 ref 48 35 5 8 T 12 11 196434 CASAVA_Build 12 113461018 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2632 hom 23 8 12 3 A 15 14 196435 CASAVA_Build 12 113467795 1I GTGATTGTGG -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 6 7 196436 CASAVA_Build 12 113480569 1D CCTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 134 hom 37 3 19 16 T 12 11 196437 CASAVA_Build 12 113484234 2D TGAATTGATA TG/-- TGTAGCCTTT 3070 hom 71 het 30 0 23 7 TG 2 1 196438 CASAVA_Build 12 113484356 1I ACTGATAATA -/G TGTGTGGCGA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 G 0 1 196439 CASAVA_Build 12 113487010 1D AAAACTAAAC A/- AAAAAACACC 3070 het 3070 hom 43 15 19 10 A 7 6 196440 CASAVA_Build 12 113488080 1D TTTAATACTT A/- AAAAAAAATA 2816 het 2816 ref 23 13 7 3 A 9 8 196441 CASAVA_Build 12 113488511 4I TTGGCTTTGC ----/TGCT TGCTCCCTGG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 TGCT 1 2 196442 CASAVA_Build 12 113501239 1D AAAGCCCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 C 1 0 196443 CASAVA_Build 12 113503025 1D AGTGGGGGTG C/- CCCCCCATGT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 C 7 6 196444 CASAVA_Build 12 113507279 1I GCATTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 2424 het 2424 ref 20 9 6 5 T 10 11 196445 CASAVA_Build 12 113511516 1D AATGACTGGG T/- TTTTTACTGT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 6 5 196446 CASAVA_Build 12 113514287 1D TCTGCTGGGG A/- TAGGCCCCCA 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 A 1 0 196447 CASAVA_Build 12 113522500 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 17 16 7 T 9 8 196448 CASAVA_Build 12 113525322 4D TAAGTGAATG AATT/---- ATCAAATAAA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 AATT 1 0 196449 CASAVA_Build 12 113573803 1I CTATCTCTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 A 9 10 196450 CASAVA_Build 12 113582118 1I AAAATAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3001 hom 37 10 14 13 A 13 14 196451 CASAVA_Build 12 113588761 1D TCCATAATTT C/- CCCCAGAGGA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 C 5 4 196452 CASAVA_Build 12 113606676 4D CAGCCCCTGA GCTC/---- GCTCGCTCGC 2156 het 957 hom 10 3 5 3 GCTC 4 3 196453 CASAVA_Build 12 113611591 21D CTGCAAGTTA ACCTAGGAACCTAGGGTGGGG/--------------------- AGCTCTATAG 3070 hom 78 het 27 0 27 3 ACCTAGGAACCTAGGGTGGGG 1 0 196454 CASAVA_Build 12 113630352 8D24M1D AATGGAGAGC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGA/--------AAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAG- AAAAAAAAAA 2657 het 2657 ref 32 17 11 14 N/A 0 0 196455 CASAVA_Build 12 113635929 2I CAGAAATGAC --/TG TGGGCCAGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TG 1 2 196456 CASAVA_Build 12 113636431 1D TGTCTGGCTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 8 7 196457 CASAVA_Build 12 113638400 4D ATTCTGCTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 1185 hom 15 3 7 7 AAAT 4 3 196458 CASAVA_Build 12 113640989 2D CTCTGGGCTT CA/-- GTTTGATCTA 3070 het 3070 hom 45 22 23 2 CA 1 0 196459 CASAVA_Build 12 113646475 8D TCTGTCCAAG TGTGCCCC/-------- TGTGCCCCGG 3070 het 3070 hom 34 11 16 8 TGTGCCCC 2 1 196460 CASAVA_Build 12 113648980 1D TTTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 2993 het 2463 hom 28 8 9 11 T 15 14 196461 CASAVA_Build 12 113660094 1D CCCGTCTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 T 10 9 196462 CASAVA_Build 12 113660645 1I TGAAAACAAA -/C AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 C 0 1 196463 CASAVA_Build 12 113665265 1I TTTATTTTTA -/T TTTTATTTTT 3070 het 2990 hom 17 6 7 4 T 4 5 196464 CASAVA_Build 12 113680204 1D CCAGCAGAGA G/- GCCTTCACAA 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 G 2 1 196465 CASAVA_Build 12 113686688 1D AGACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 A 12 11 196466 CASAVA_Build 12 113705744 2D CAGCAGAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 33 2 17 14 A 18 16 196467 CASAVA_Build 12 113707606 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 21 1 17 3 A 14 13 196468 CASAVA_Build 12 113732442 1I CTAAGGACGG -/C GGGGGGGGGG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 C 0 1 196469 CASAVA_Build 12 113759347 1D CAGCTGAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 21 16 6 A 13 12 196470 CASAVA_Build 12 113760243 1I AAATTCAGTC -/T TCCAAGAAAC 3070 het 3070 ref 57 30 20 7 T 1 2 196471 CASAVA_Build 12 113763737 1I TGACCCCGTC -/T TTACCCCCAG 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 T 2 3 196472 CASAVA_Build 12 113772932 3I GTAAGACGGG ---/GCT AATAATGAAA 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 GCT 0 1 196473 CASAVA_Build 12 113774505 6I AGTTATCCTG ------/GAGTCT TCATTCACTA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 GAGTCT 0 1 196474 CASAVA_Build 12 113775512 2D TTACGCACTT AA/-- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 47 23 19 7 A 9 7 196475 CASAVA_Build 12 113810314 2D TTTCTAGGTA TT/-- TTTTTTTTTT 1455 het 309 hom 13 3 5 6 T 18 16 196476 CASAVA_Build 12 113826892 2D AAAGTGTGTG TA/-- TGTGTGAGGA 3070 het 3070 hom 87 38 39 11 TA 1 0 196477 CASAVA_Build 12 113828742 1I TCAATTATAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 8 9 196478 CASAVA_Build 12 113828954 1I GTGTGTCCTC -/A GTGTCCTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 0 1 196479 CASAVA_Build 12 113831301 1I TACATCCACT -/A CCAGATTATA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 0 1 196480 CASAVA_Build 12 113834428 3I CAAAAACAAC ---/AAA AACAACAACA 3070 hom 69 het 28 0 23 6 A 2 5 196481 CASAVA_Build 12 113838612 1I TTTGTTGTTA -/C CCGGGTCCCA 3070 hom 111 het 47 0 38 9 C 2 3 196482 CASAVA_Build 12 113842690 4D TCTAAAAATC AATG/---- ATTCTCATTA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 AATG 1 0 196483 CASAVA_Build 12 113842786 4D CTCAAAATAG TTTC/---- TTTAGTAATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTTC 1 0 196484 CASAVA_Build 12 113843874 15D TATATTTTGT GATTTAGCCAGCTGA/--------------- GAGCCTTTGT 3070 hom 69 het 24 0 24 3 GATTTAGCCAGCTGA 1 0 196485 CASAVA_Build 12 113850409 4D TGATAATAAT AAAG/---- AAACTAGAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAG 1 0 196486 CASAVA_Build 12 113852854 8D32M1D GTCTCAAAAA AAACAAACAAACAAACAAAAAAAAACATGCCATTTGTGGGT/--------AAACAAACAAAAAAAAACATGCCATTTGTGGG- TTTTTTTTTC 3070 het 227 hom 11 1 7 8 N/A 0 0 196487 CASAVA_Build 12 113852953 1D AATCCCTTAC T/- AGATATATGG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 1 0 196488 CASAVA_Build 12 113853486 1I CGCTTTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1042 hom 40 5 28 7 T 11 12 196489 CASAVA_Build 12 113854334 1D CCAAATAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 11 10 196490 CASAVA_Build 12 113854898 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCC 3070 hom 56 het 21 0 19 4 A 5 4 196491 CASAVA_Build 12 113855412 2I ATAAGACAGA --/AT ATAATGTTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AT 1 2 196492 CASAVA_Build 12 113869111 4D AATGCATATG TGTT/---- TGTGTGTGGT 3070 het 3070 hom 70 27 34 12 TGTT 1 0 196493 CASAVA_Build 12 113877132 3I CCTTGCAGTG ---/TTA TTATGAGGAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 TTA 1 2 196494 CASAVA_Build 12 113880075 3I TGCATTTATG ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 9 12 196495 CASAVA_Build 12 113885140 1D AATAGCTTGC T/- TATGATCATG 3070 het 3070 hom 38 15 22 1 T 2 1 196496 CASAVA_Build 12 113895363 2D GGCATTAATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 13 11 196497 CASAVA_Build 12 113897568 1I AAAGCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 11 12 196498 CASAVA_Build 12 113903258 1D CAAAAGCTCT G/- GGGGGTTATA 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 G 6 5 196499 CASAVA_Build 12 113904792 2D TCAAAAAAAA AG/-- AAAAGTTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 AG 1 0 196500 CASAVA_Build 12 113924245 1I AAGCCTTTGC -/A AAGACAGGAC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 2 3 196501 CASAVA_Build 12 113959705 1D GAGCAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 1403 het 1403 ref 38 26 4 8 T 13 12 196502 CASAVA_Build 12 114001104 3D GCTGTTGTTA TTG/--- TTGTTGTTGA 3070 het 3070 hom 59 21 30 10 TTG 4 3 196503 CASAVA_Build 12 114005790 1D GGAGAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 40 2 31 7 A 13 12 196504 CASAVA_Build 12 114010014 4D ATTTGGTCCT CAAA/---- CAAACAACAC 3070 hom 120 het 44 0 41 5 CAAA 2 1 196505 CASAVA_Build 12 114020831 8D CCTCCCTCCT TTCCTTCC/-------- TTCCTGCCTT 3070 hom 29 het 13 0 11 2 TTCC 3 1 196506 CASAVA_Build 12 114030258 1D GTTGTTGTGC T/- AATTAAATAA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 T 1 0 196507 CASAVA_Build 12 114031506 1I TATTTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 10 11 196508 CASAVA_Build 12 114031924 16I CCCAAGTTCT ----------------/CGTAGCTGGGAAGAGG CGTAGCTGGG 3070 het 3070 hom 54 20 22 13 CGTAGCTGGGAAGAGG 1 2 196509 CASAVA_Build 12 114036015 1I AGGTGATGAG -/T TTGATAGGTG 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 2 3 196510 CASAVA_Build 12 114038048 5I TTATGTTGTA -----/TATAT TATATTAAAT 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 TATAT 1 2 196511 CASAVA_Build 12 114057502 3I ACTTGATTTA ---/ATG ATCATTAAAT 686 het 686 ref 25 15 3 7 ATG 0 1 196512 CASAVA_Build 12 114078714 1D GCCTGGGAAA T/- TTTTTTTTTT 1090 het 1090 ref 30 15 4 11 T 17 16 196513 CASAVA_Build 12 114080453 1D CAACGTTTGT A/- AAAACATCCT 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 A 5 4 196514 CASAVA_Build 12 114089731 1I TGGTTTGGAC -/T TTTCAAAATG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 3 4 196515 CASAVA_Build 12 114095379 1D GAAGCTTGAC G/- GGGGGTCCTC 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 G 6 5 196516 CASAVA_Build 12 114115624 1I TTGAGTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 10 11 196517 CASAVA_Build 12 114152090 1I TCATAAGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 9 10 196518 CASAVA_Build 12 114170861 6D TTGGATGCAA TTATTT/------ TTATTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 21 15 8 TTATTT 2 1 196519 CASAVA_Build 12 114185525 2I CATCTGACAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 54 25 24 5 A 9 11 196520 CASAVA_Build 12 114201319 1D ATCTCTCTCT C/- CAGCCTCACG 3070 hom 149 het 56 0 50 6 C 2 1 196521 CASAVA_Build 12 114202931 5D CCCCATCATA ATGGC/----- AGAAGAGGCA 3070 hom 120 het 42 0 39 7 ATGGC 1 0 196522 CASAVA_Build 12 114207166 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 32 1 21 10 T 12 10 196523 CASAVA_Build 12 114244995 1D TATGGTTTTT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1133 hom 20 4 12 5 C 12 11 196524 CASAVA_Build 12 114248536 1I ATTAGTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1063 hom 32 4 19 9 T 14 15 196525 CASAVA_Build 12 114250861 1D CTGATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1824 het 1824 ref 30 15 5 10 T 15 14 196526 CASAVA_Build 12 114250949 3I GTAGCTTCGA ---/CCT CCTAGGATCA 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 CCT 1 2 196527 CASAVA_Build 12 114252136 1I TTATCTGATA -/G GGGGTTAATA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 4 5 196528 CASAVA_Build 12 114254294 6D ACACACACAA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 2778 hom 30 7 14 13 AC 11 8 196529 CASAVA_Build 12 114256126 1D CTGCCTTGGG A/- AAAAAAAAAA 1550 het 1550 ref 45 31 8 6 A 15 14 196530 CASAVA_Build 12 114262835 1D TTGGAGTGCA G/- TGGTACAACC 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 G 1 0 196531 CASAVA_Build 12 114264382 9I GCACAAAATA ---------/AAAGGTTCC AATGCATGTT 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 AAAGGTTCC 0 1 196532 CASAVA_Build 12 114265007 1D GTATCCTTTA T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 T 7 6 196533 CASAVA_Build 12 114300557 1D TTCTTATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 29 0 15 14 A 16 15 196534 CASAVA_Build 12 114301757 2I AAACCACTCC --/TA TATGAGGAAG 3070 hom 116 het 44 0 38 6 TA 1 2 196535 CASAVA_Build 12 114302334 1I GTTTTTAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 10 11 196536 CASAVA_Build 12 114305143 2D TCTGGGGGTA AG/-- AGAGAGAGAG 1412 het 1412 ref 31 20 4 7 AG 8 7 196537 CASAVA_Build 12 114305514 5I GGACAATAAT -----/AACAC AACCTCATGG 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 AACAC 0 1 196538 CASAVA_Build 12 114309157 1D GCCTGCCACG T/- TTTTCCTCCT 3070 het 2612 hom 27 7 16 5 T 5 4 196539 CASAVA_Build 12 114312591 1I TCCTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 26 16 7 A 11 12 196540 CASAVA_Build 12 114313995 2I TGAAAACAGC --/AA AAGAGGCTCA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 2 4 196541 CASAVA_Build 12 114318311 1D ATTTTTTTTT A/- AATTTTATTT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 A 3 2 196542 CASAVA_Build 12 114323270 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 872 hom 27 4 13 10 A 15 14 196543 CASAVA_Build 12 114323979 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1065 hom 31 5 20 6 A 15 16 196544 CASAVA_Build 12 114324826 4I GTGACGCAAT ----/AATA AAGATCTCTA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 AATA 0 1 196545 CASAVA_Build 12 114331221 1D GATTTATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1337 hom 37 5 17 15 T 17 16 196546 CASAVA_Build 12 114331238 1D TTTTTTTTTT G/- TAAATGACCA 2934 het 1561 hom 36 9 11 16 G 1 0 196547 CASAVA_Build 12 114334888 1D CAACCACTTA C/- CCAGCTGAGT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 3 2 196548 CASAVA_Build 12 114347409 2I TATATAAAGT --/TA TATATATATA 2597 hom 18 het 8 0 7 1 TA 5 6 196549 CASAVA_Build 12 114348301 6D ATGGATAGAT ACTTAA/------ ACATATGGAG 3070 hom 82 het 33 0 27 8 ACTTAA 1 0 196550 CASAVA_Build 12 114360043 1D AATTCACCAT A/- AGCTTCTACA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 2 1 196551 CASAVA_Build 12 114364645 1I CTCAGGCACC -/A GAGGAAGGTC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 1 196552 CASAVA_Build 12 114375219 4D GGCGCACTTC ACAA/---- ACAGTCATTA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 ACAA 1 0 196553 CASAVA_Build 12 114375915 1D GGGATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 27 2 13 12 T 13 12 196554 CASAVA_Build 12 114379322 1D40M4D GAAGGAAGGG AAAAGAAAGAAAGGAAGGGAAGGAAGAAGGAAGGAAGGAAGAAGA/-AAAGAAAGAAAGGAAGGGAAGGAAGAAGGAAGGAAGGAAG---- AAGAAAGAAG 3070 hom 39 het 15 0 13 13 N/A 0 0 196555 CASAVA_Build 12 114381778 10I CTATCTGCCA ----------/AGAATATGGC AATTATAAGG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 AGAATATGGC 0 1 196556 CASAVA_Build 12 114383882 1I TATTTTTCAC -/A AAAAAACTTT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 6 7 196557 CASAVA_Build 12 114386053 1D AGGGATGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 797 hom 39 7 23 9 A 15 14 196558 CASAVA_Build 12 114419681 3I AGATGAAAGG ---/GAA GAAGGAGGAG 3070 hom 107 het 43 0 36 7 GAA 1 2 196559 CASAVA_Build 12 114443629 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 12 1 9 2 AC 0 1 196560 CASAVA_Build 12 114461089 1D AATCATGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 17 9 T 11 10 196561 CASAVA_Build 12 114471974 2D CATATTCTCG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 CT 7 6 196562 CASAVA_Build 12 114473059 1D GGAAGTTATG A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 A 7 6 196563 CASAVA_Build 12 114474619 10D TATTCTGTGC CCAGCCTGTA/---------- CCAGGCATTT 2072 het 2072 ref 30 19 6 5 CCAGCCTGTA 1 0 196564 CASAVA_Build 12 114487872 1D TTGCTATACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 818 hom 30 3 18 9 A 13 12 196565 CASAVA_Build 12 114507539 3I TTCCCGTGGG ---/AAC ATGAAGTGTC 3070 hom 87 het 35 0 28 7 AAC 0 1 196566 CASAVA_Build 12 114509655 2I ACATGACTTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 49 21 20 8 AT 5 6 196567 CASAVA_Build 12 114513810 1I GCATGCTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 T 9 10 196568 CASAVA_Build 12 114514601 5D TGGCAGGGAG GATCT/----- GTTCCCTGCT 3070 het 3070 ref 57 28 27 5 GATCT 1 0 196569 CASAVA_Build 12 114528779 6D GATTCACCCG ATTAGA/------ ATTAGATGCC 3070 het 3070 ref 38 19 18 5 ATTAGA 2 1 196570 CASAVA_Build 12 114529851 1I CAAGGTTTCA -/C AATATTGGCT 3070 hom 39 het 17 0 13 4 C 0 1 196571 CASAVA_Build 12 114530138 1D GGTAAAAGTG C/- CCCCCCCTTC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 C 8 7 196572 CASAVA_Build 12 114543520 1I ATGAGCTCAT -/G GCCTTCAGCA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 G 1 2 196573 CASAVA_Build 12 114543739 4D AGTTTGGGTG TTTC/---- TTTGTTACAG 3070 het 3070 ref 29 16 13 3 TTTC 1 0 196574 CASAVA_Build 12 114544739 2I CCAAGCCACT --/AC ACAGTCTGGC 3070 hom 90 het 37 0 29 8 AC 1 2 196575 CASAVA_Build 12 114548371 1D CAGTACAATT A/- AAAAAATGGG 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 7 6 196576 CASAVA_Build 12 114550190 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 21 0 17 4 A 12 11 196577 CASAVA_Build 12 114567905 1I GCATTGTGGA -/T TTTTTTTTTT 2596 het 2596 ref 29 10 11 8 T 15 16 196578 CASAVA_Build 12 114570951 7D GGGCACAGGG CAAGATA/------- CAAGATACAA 3070 het 3070 hom 44 18 22 7 CAAGATA 2 1 196579 CASAVA_Build 12 114571838 1I TGATTTATGC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 8 9 196580 CASAVA_Build 12 114573602 12I3M1D TGGTAATAAA ------------AGTC/ATAGTAGGACAGAGT- AGGACAATAG 3070 het 3070 ref 42 21 21 3 N/A 0 0 196581 CASAVA_Build 12 114580176 2I GTGTTTATTC --/TA TATATATTTC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 TA 3 4 196582 CASAVA_Build 12 114591763 1D TGGAGATCAG A/- GAGGATGTTC 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 1 0 196583 CASAVA_Build 12 114602817 1D TTGCTAAATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 A 9 8 196584 CASAVA_Build 12 114604951 1D GACTGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 T 15 14 196585 CASAVA_Build 12 114609651 1D GCTCCCCTTG C/- CCCCTCCCAG 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 C 5 4 196586 CASAVA_Build 12 114616510 1D GAATTGCAGC T/- TTTTTTTTTT 1287 het 1287 ref 59 46 3 11 T 11 10 196587 CASAVA_Build 12 114617841 1D ATGGACAGAT A/- ATCTGCTGAT 3070 hom 84 het 29 0 29 1 A 2 1 196588 CASAVA_Build 12 114628591 1I CATTCTAGCT -/A CTGGAAATAA 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 A 0 1 196589 CASAVA_Build 12 114632279 1I GCAAGTACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 9 10 196590 CASAVA_Build 12 114648012 1D TTTGGATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2732 hom 39 11 19 10 T 12 11 196591 CASAVA_Build 12 114652201 5D AGGGTAAGCC TTACT/----- TTACATTTTT 3070 het 3070 ref 59 34 21 7 TTACT 1 0 196592 CASAVA_Build 12 114664376 1I CCATCTCTAT -/A AAAAAAAAAT 2431 het 2424 hom 19 6 6 7 A 9 10 196593 CASAVA_Build 12 114668257 1I GCTTAATTTG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 6 7 196594 CASAVA_Build 12 114672240 1D TGAAAGATCC T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 42 22 16 6 T 6 5 196595 CASAVA_Build 12 114675701 1I TTCTTTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2076 hom 38 10 23 5 T 10 11 196596 CASAVA_Build 12 114677082 5D TCTCAGCCTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 27 4 11 12 T 19 14 196597 CASAVA_Build 12 114680921 1D TAGGGGAGGC T/- TTTATTTTCT 3070 het 3070 hom 32 9 16 12 T 4 3 196598 CASAVA_Build 12 114681845 2D AGGATTTGAG GT/-- ACCTTATTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GT 1 0 196599 CASAVA_Build 12 114684298 7D ACAAACAAAC AAAAAAA/------- AAAAAACAAT 769 het 769 ref 35 18 5 15 A 13 6 196600 CASAVA_Build 12 114684519 1I CCTTGGTCAT -/C CATTTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 C 1 2 196601 CASAVA_Build 12 114686444 3D TTTTTGTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2358 hom 32 11 17 5 T 16 13 196602 CASAVA_Build 12 114717138 3I AGGGCTAACA ---/CTT CTTCTGCTTA 3070 hom 151 het 54 0 51 3 CTT 1 2 196603 CASAVA_Build 12 114717867 3I CCCACGTGTC ---/CTT CAACTTACCC 3070 hom 137 het 47 0 42 5 CTT 0 1 196604 CASAVA_Build 12 114721659 2I ATCTCTACAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 63 het 25 0 20 5 AT 5 6 196605 CASAVA_Build 12 114721958 4I GGAGATCCAC ----/CTCT CTCTCTCTAC 2211 het 1971 hom 10 4 5 1 CT 4 6 196606 CASAVA_Build 12 114726579 5I TTATGAATCT -----/GACAG GACAGGCAAG 3070 het 3070 hom 49 21 27 1 GACAG 1 2 196607 CASAVA_Build 12 114751395 1D GGCTCAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 T 15 14 196608 CASAVA_Build 12 114783939 1D GAGATTATAC T/- TGGATTGAGG 3070 het 3070 ref 57 31 19 7 T 2 1 196609 CASAVA_Build 12 114798910 1D TTGTAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 7 A 12 11 196610 CASAVA_Build 12 114804778 1I AGAGCATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 8 8 T 10 11 196611 CASAVA_Build 12 114811382 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2167 het 2167 ref 18 6 6 6 A 11 12 196612 CASAVA_Build 12 114812217 1D TTTGTCAATT A/- AAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 A 6 5 196613 CASAVA_Build 12 114818355 1D AACATGAGAG A/- AAAAAAAATG 859 het 859 ref 40 28 2 10 A 9 8 196614 CASAVA_Build 12 114823080 4D TAGGGTGACT TAGA/---- TAGTCTCCAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 TAGA 1 0 196615 CASAVA_Build 12 114823376 2D TTTTTCCCTG TC/-- TTATCCTGTC 3070 het 3070 ref 59 26 26 10 TC 1 0 196616 CASAVA_Build 12 114830601 2I GCCAGCCCCC --/TT CTCATGAGAG 3070 het 939 hom 20 4 13 3 T 0 2 196617 CASAVA_Build 12 114837839 1I CAAGTCCTCT -/C CCCACCCTGG 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 C 3 4 196618 CASAVA_Build 12 114850313 3I TACAGGGAGA ---/AGG AGGCTTAGAG 3070 het 3070 hom 49 16 24 9 AGG 1 2 196619 CASAVA_Build 12 114852898 1I CTATTTTGTC -/T TTTTTCCTGC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 5 6 196620 CASAVA_Build 12 114855262 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2227 het 630 hom 20 3 7 10 A 18 17 196621 CASAVA_Build 12 114859481 1I AAAATAGAAT -/C CTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 16 9 C 1 2 196622 CASAVA_Build 12 114865680 2D GGATTGTCAG CC/-- CCCATTTTAC 2416 het 2416 ref 19 9 7 6 C 5 3 196623 CASAVA_Build 12 114876005 1I AAAACACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 A 11 12 196624 CASAVA_Build 12 114914588 1I ATTTTTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 14 4 T 10 11 196625 CASAVA_Build 12 114941101 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 2596 het 2303 hom 30 13 10 7 A 9 10 196626 CASAVA_Build 12 114942491 5D TTTTTAAACG AAATA/----- AAATATGGAT 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 AAATA 2 1 196627 CASAVA_Build 12 114949281 1I TACAATTTGC -/A ATGTGGCATA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 1 2 196628 CASAVA_Build 12 114978279 1D GCAGCCCAAA G/- GTAAGTTTGT 3070 het 3070 hom 44 17 15 13 G 2 1 196629 CASAVA_Build 12 114978474 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 2740 het 2740 ref 29 15 12 2 T 10 11 196630 CASAVA_Build 12 115053041 1D TAAGCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2702 hom 34 8 17 9 A 12 11 196631 CASAVA_Build 12 115061353 1D AAAGACCCCC T/- GAGTCAAGAA 3070 het 3070 hom 62 25 31 7 T 1 0 196632 CASAVA_Build 12 115101879 1I GTGAATAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2931 hom 35 13 12 10 T 11 12 196633 CASAVA_Build 12 115103120 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2133 het 427 hom 26 2 9 15 T 17 16 196634 CASAVA_Build 12 115115805 1I AATCTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 10 11 196635 CASAVA_Build 12 115120937 6I TTCCTCTTAC ------/AGTTAA AGATCTTATG 3070 hom 150 het 57 0 50 7 AGTTAA 0 1 196636 CASAVA_Build 12 115122268 1D GATGCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 24 2 14 8 A 16 15 196637 CASAVA_Build 12 115209944 1D TTATTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1240 het 1240 ref 26 17 4 5 A 12 11 196638 CASAVA_Build 12 115220277 34D GCAGACAGAT GGGAGTGGCCTTTTAAGGTGAACAAGAGAAGAAA/---------------------------------- GGGGACCCAG 3070 het 3070 ref 26 21 10 4 GGGAGTGGCCTTTTAAGGTGAACAAGAGAAGAAA 1 0 196639 CASAVA_Build 12 115258486 1I ATGCAGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 11 12 196640 CASAVA_Build 12 115261029 1I TTTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1854 hom 33 het 19 0 11 8 T 13 14 196641 CASAVA_Build 12 115268635 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 41 1 25 17 T 11 10 196642 CASAVA_Build 12 115272039 1D CAGCAAATTT A/- AAAAAAAAAA 2234 het 1156 hom 15 6 7 3 A 14 13 196643 CASAVA_Build 12 115294133 1D AATAGTTAAG T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 37 het 27 1 26 0 T 6 5 196644 CASAVA_Build 12 115297950 2D GTGTGTATGC AT/-- GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 87 45 35 8 AT 1 0 196645 CASAVA_Build 12 115302028 1D TCTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 817 het 817 ref 40 23 3 14 T 13 12 196646 CASAVA_Build 12 115305896 10D AGGTGAGCCT TTTTCTTTTC/---------- TTTTCTTTTC 2397 het 299 hom 24 5 7 12 TTTTC 5 3 196647 CASAVA_Build 12 115349062 3I ATGGCTTGAA ---/CCC AGGAGTTCAA 3070 het 2846 hom 23 8 11 4 C 0 3 196648 CASAVA_Build 12 115365809 1D AAAATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2459 het 1391 hom 19 7 9 3 A 11 10 196649 CASAVA_Build 12 115366836 1D GTTAAACCTC T/- TTTTTTTTTT 2792 het 1189 hom 22 7 10 5 T 17 16 196650 CASAVA_Build 12 115370084 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 691 het 691 ref 25 11 5 9 T 16 15 196651 CASAVA_Build 12 115400161 6D TTTATTTTTA TTTTTT/------ TTTTTTTTAT 3070 hom 54 het 22 0 18 6 T 14 8 196652 CASAVA_Build 12 115404101 1D TCCCACCCCC T/- GACCCCCACC 3070 hom 55 het 22 0 13 9 T 1 0 196653 CASAVA_Build 12 115405367 2I2M3D TTAAAAAAAA --TTAAA/ATTT--- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 N/A 0 0 196654 CASAVA_Build 12 115406945 1I GCTTTCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 33 0 25 8 T 10 11 196655 CASAVA_Build 12 115418508 1D TTTTTTTTTT A/- TTTTAAAGAG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 1 0 196656 CASAVA_Build 12 115421583 12D TCATTGCTCT ACAAATATATTC/------------ TGGTCATTCC 3070 hom 114 het 43 0 39 8 ACAAATATATTC 1 0 196657 CASAVA_Build 12 115437433 1I ACATTACATG -/C TTTTATAGCA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 C 0 1 196658 CASAVA_Build 12 115445690 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2409 het 351 hom 19 2 12 5 T 13 14 196659 CASAVA_Build 12 115496437 1I TGTAATAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 11 12 196660 CASAVA_Build 12 115498515 1I GTAAAACCAG -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 6 7 196661 CASAVA_Build 12 115498558 1D CTTACCAAGG A/- AAAAAAAAGG 2116 het 2116 ref 26 16 6 5 A 9 8 196662 CASAVA_Build 12 115499933 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 19 17 12 T 9 10 196663 CASAVA_Build 12 115504362 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 36 0 31 6 T 11 10 196664 CASAVA_Build 12 115507931 1D TCCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 33 2 28 3 T 12 11 196665 CASAVA_Build 12 115508382 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAACCT 2986 het 1922 hom 24 7 10 7 A 8 7 196666 CASAVA_Build 12 115513850 1D AGAGCAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 260 hom 25 6 9 12 A 11 10 196667 CASAVA_Build 12 115545747 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 9 8 196668 CASAVA_Build 12 115557696 1D CCCGTCCCCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 11 14 12 T 8 7 196669 CASAVA_Build 12 115559608 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 813 het 733 hom 19 9 3 8 T 19 18 196670 CASAVA_Build 12 115561286 1I CCTCAGGTGA -/T TTCGCCTGCC 2837 het 1400 hom 23 6 9 8 T 2 3 196671 CASAVA_Build 12 115564528 1D GGGAGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 789 hom 44 6 16 22 T 15 14 196672 CASAVA_Build 12 115566189 1I TGATGAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 10 11 196673 CASAVA_Build 12 115573001 1D CCACATAATG T/- TTTTAAATTT 3070 het 3070 ref 29 19 9 2 T 5 4 196674 CASAVA_Build 12 115586826 4I TTTTTTTTTC ----/TTTT TCTTTTCTTT 3070 het 2486 hom 36 16 13 7 T 1 5 196675 CASAVA_Build 12 115591401 1D CTAGGAAAAG T/- GTGTCAATCC 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 1 0 196676 CASAVA_Build 12 115599667 1D CCCCCCTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1802 hom 27 14 11 2 A 13 12 196677 CASAVA_Build 12 115604278 3I GGCCAATATA ---/TTG TTTTAAAATT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TTG 0 1 196678 CASAVA_Build 12 115633399 4D CAGGACAACA CTCT/---- CTCTCGCTCT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 CT 4 2 196679 CASAVA_Build 12 115642840 2D AGGCACTCCC CT/-- GTTATCGCCA 3070 het 3070 hom 49 23 19 9 CT 1 0 196680 CASAVA_Build 12 115648867 1D TTAACTGCAT C/- CATCAAGCTA 3070 hom 111 het 40 0 36 4 C 2 1 196681 CASAVA_Build 12 115651425 1D AATACACCAA G/- AAAATCTATT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 1 0 196682 CASAVA_Build 12 115652921 1D ATACAATACT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 8 7 196683 CASAVA_Build 12 115658301 1D AAAAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 12 11 196684 CASAVA_Build 12 115662372 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2407 het 1379 hom 30 6 11 13 A 12 13 196685 CASAVA_Build 12 115674385 2D TGAAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 AG 6 5 196686 CASAVA_Build 12 115694283 1D GTATCTCAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 9 8 196687 CASAVA_Build 12 115697509 10D TGTCCTTACT GAAGTCACCA/---------- GAAGTCACCA 3070 hom 39 het 23 0 16 10 GAAGTCACCA 2 1 196688 CASAVA_Build 12 115709907 1D TCTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 905 hom 26 3 18 5 A 15 14 196689 CASAVA_Build 12 115711015 4D TGGATGGATA GATG/---- GATGGATGGA 3070 hom 105 het 56 0 31 30 GATG 5 4 196690 CASAVA_Build 12 115719924 3D ACCGTGACTA CTC/--- CTGCAGAGCA 3070 het 3070 ref 51 25 18 9 CTC 1 0 196691 CASAVA_Build 12 115721768 1I GTTAGCTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 18 16 12 T 9 10 196692 CASAVA_Build 12 115722822 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 17 0 13 4 A 12 11 196693 CASAVA_Build 12 115725121 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1367 het 1367 ref 31 20 4 7 A 13 12 196694 CASAVA_Build 12 115725283 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 11 10 196695 CASAVA_Build 12 115733562 1I AATGGGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 24 1 17 6 T 11 12 196696 CASAVA_Build 12 115757489 3I AACCACACTT ---/CTC CTACTGAATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTC 0 1 196697 CASAVA_Build 12 115765894 1D GCTGGGCCCT G/- GGGTAAACCT 3070 hom 104 het 41 0 33 8 G 4 3 196698 CASAVA_Build 12 115769721 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2047 het 2047 ref 26 15 8 3 T 12 13 196699 CASAVA_Build 12 115772510 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2791 hom 28 het 14 0 10 4 T 15 14 196700 CASAVA_Build 12 115774566 6I AACCAGGACT ------/TTCCCC TTCCCCTTGG 3070 het 3070 hom 51 21 19 11 TTCCCC 1 2 196701 CASAVA_Build 12 115777944 1D AAGGTATGTG T/- ACTCAAACTC 3070 het 3070 hom 42 20 17 6 T 1 0 196702 CASAVA_Build 12 115781016 1D AATATTTTTT A/- AAAAACAAGA 3070 het 3070 hom 32 17 14 1 A 6 5 196703 CASAVA_Build 12 115781827 2I ATTATTCTTC --/TT TTTTTTTTTT 2811 het 2811 ref 30 11 12 7 T 13 15 196704 CASAVA_Build 12 115790318 1D AAATGACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 25 2 14 9 T 13 12 196705 CASAVA_Build 12 115790442 13I CCACGCCTGG -------------/CTAAAATGCCTGA CTAAAATGCC 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 CTAAAATGCCTGA 1 2 196706 CASAVA_Build 12 115795139 4I CAGAAAGAAG ----/GAAA GAAAGAAAAT 2653 hom 21 het 12 0 8 4 GAAA 2 3 196707 CASAVA_Build 12 115795681 1D CCTCACTCAG C/- CTCCCGAGTA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 C 2 1 196708 CASAVA_Build 12 115825503 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 14 0 12 2 A 10 11 196709 CASAVA_Build 12 115831921 2D AAGGGAAGGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 6 5 196710 CASAVA_Build 12 115832268 1I TCAGATTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2839 hom 24 9 13 2 A 9 10 196711 CASAVA_Build 12 115834360 1D TTTTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 619 hom 26 3 14 9 T 15 14 196712 CASAVA_Build 12 115846335 29D GAAATGACAG GTTGTCCATTTTCATGTTTTTAAGTCAGT/----------------------------- GTTGTCCATT 3070 hom 72 het 22 0 24 3 GTTGTCCATTTTCATGTTTTTAAGTCAGT 2 1 196713 CASAVA_Build 12 115851732 1D CTGATTTTTC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 6 196714 CASAVA_Build 12 115858220 2D GCTTCCATTG TA/-- TATACAATAA 3070 hom 96 het 37 0 32 7 TA 3 2 196715 CASAVA_Build 12 115862682 1I GATGGTGGGC -/T TTTTTTTTTT 2170 het 2170 ref 33 13 10 10 T 13 14 196716 CASAVA_Build 12 115898575 1D CCTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1964 het 993 hom 26 8 6 13 A 15 14 196717 CASAVA_Build 12 115918701 1I TCCAGAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 10 11 196718 CASAVA_Build 12 115920569 1I CTTGAGACTC -/T TAAGTTTACA 3070 hom 166 het 58 0 56 2 T 1 2 196719 CASAVA_Build 12 115920910 1D TGCCTTTGTT C/- CAGAGGTGAA 3070 hom 94 het 39 0 28 13 C 2 1 196720 CASAVA_Build 12 115931795 5D TTGAATTAAG TTGAA/----- TTGAATTAAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 4 TTGAA 2 1 196721 CASAVA_Build 12 115940795 4I GTCGACGAGA ----/GCTT AGCCAGAGTG 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 GCTT 0 1 196722 CASAVA_Build 12 115948797 13I GCACCCCTCC -------------/CAACAGACCCTTT CAGCCCACAG 3070 het 2824 hom 31 11 11 9 CAACAGACCCTTT 0 1 196723 CASAVA_Build 12 115956871 1D AGGGATGAGA G/- GGGGCTTGCT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 G 5 4 196724 CASAVA_Build 12 115963151 3D TTCCTTGTCT TCC/--- TCAAGTACCC 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 TCC 1 0 196725 CASAVA_Build 12 115964763 1D CCACTGGGGA G/- GGCAGGGCCA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 G 3 2 196726 CASAVA_Build 12 115967103 2D AAGAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAC 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 AG 5 4 196727 CASAVA_Build 12 115975138 3D CTCCCCAGTT CTC/--- CTGGTAATCC 3070 het 3070 hom 33 11 18 5 CTC 1 0 196728 CASAVA_Build 12 115978101 1D TTCCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1203 het 655 hom 29 9 7 13 T 19 18 196729 CASAVA_Build 12 115991719 1D AGCCACTGCG C/- CCGGCCAACA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 C 3 2 196730 CASAVA_Build 12 115993164 1D GTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 9 8 196731 CASAVA_Build 12 115993630 1I GCTGTGGGCC -/T TTCACGGGGC 2692 het 2692 ref 32 17 9 6 T 2 3 196732 CASAVA_Build 12 116004249 1I CCATCTATAC -/A AAAAAAAAAA 2083 het 34 hom 15 0 6 9 A 15 16 196733 CASAVA_Build 12 116008457 1D TACACTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 13 12 196734 CASAVA_Build 12 116017426 4D CCGCGCACAG CTAA/---- TTTTTGTAGT 1502 het 1502 ref 13 5 4 4 CTAA 1 0 196735 CASAVA_Build 12 116018177 4D GCTGGTTTAC CTCT/---- CTAAGCCTCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 CT 3 1 196736 CASAVA_Build 12 116018782 1D CAATAACAAA C/- CATGTACATG 3070 het 3070 ref 58 29 24 5 C 2 1 196737 CASAVA_Build 12 116041192 2I GGTCACCCAT --/CC CCCTGTCCCA 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 C 3 5 196738 CASAVA_Build 12 116048260 3D CAACAAACAT ATC/--- ATGTCATTGG 3070 het 3070 hom 68 25 36 10 ATC 1 0 196739 CASAVA_Build 12 116051492 4D69M2I TTAATGTGAC TATATATGTAATGTGTGATGTTACATGCACATTTTATGTATGTATAATGTTATAGATACATGCTATGCATAAC--/----TATGTAATGTGTGATGTTACATGCACATTTTATATATGTACAATGTTATAGATACATGCTATGCATAACAT ATAATGCTAT 3070 het 3070 ref 71 70 26 20 N/A 0 0 196740 CASAVA_Build 12 116057652 1D TGAGGCAGGT G/- GATCACATGA 3070 het 2215 hom 20 6 11 4 G 2 1 196741 CASAVA_Build 12 116061567 3D AAACTTAATG ATA/--- ATAATAATAA 921 het 921 ref 30 20 3 8 ATA 6 5 196742 CASAVA_Build 12 116116616 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2047 het 1868 hom 21 7 5 9 T 14 13 196743 CASAVA_Build 12 116134264 1D AAAAAAAAAT A/- GATTCTAACC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 1 0 196744 CASAVA_Build 12 116159564 1I AGATGATCCA -/C CCGCCTCAAC 2887 het 2887 ref 33 19 10 4 C 2 3 196745 CASAVA_Build 12 116159866 1D CATTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 20 20 14 A 11 10 196746 CASAVA_Build 12 116173785 1D ATTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1256 hom 28 5 12 11 T 15 14 196747 CASAVA_Build 12 116183015 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 6 7 196748 CASAVA_Build 12 116184955 1D TGGGGTTCTC T/- TTTTTTTGGG 3070 hom 80 het 36 0 27 9 T 8 7 196749 CASAVA_Build 12 116185402 20D ACACCCAACT AATGAATGAATGAATGAGTA/-------------------- AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 10 AATGAATGAATGAATGAGTA 1 0 196750 CASAVA_Build 12 116189776 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2921 het 570 hom 19 3 10 6 A 15 14 196751 CASAVA_Build 12 116200108 1D ACTGGGCAAA C/- CCACTCACCC 3070 hom 92 het 38 0 25 15 C 3 2 196752 CASAVA_Build 12 116202857 7I AAAGTCTGTG -------/GGTAAAA GTCTGGGGAC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 GGTAAAA 0 1 196753 CASAVA_Build 12 116209556 1D TTTACAGTTG T/- TATAGTATTC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 2 1 196754 CASAVA_Build 12 116218844 3I TTAATAAACT ---/CCC CTTTATATAT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 1 4 196755 CASAVA_Build 12 116227652 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 629 het 7 hom 16 0 5 11 A 15 16 196756 CASAVA_Build 12 116228607 2I CTGAGTTTGT --/GC AGGGAGAATG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 GC 0 1 196757 CASAVA_Build 12 116229431 1I AGGTGGTAGG -/T GGGTAAGCTA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 0 1 196758 CASAVA_Build 12 116244870 4D TGCTTCCTTT CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 hom 58 het 28 0 22 8 CTTC 4 3 196759 CASAVA_Build 12 116248579 12D GTCTCAAAAA AAAAAAAAAAAC/------------ AAAAAAACAA 3070 hom 42 het 16 0 14 5 AAAAAAAAAAAC 1 0 196760 CASAVA_Build 12 116250743 1I CCTTCCCTGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2181 hom 23 7 14 2 T 8 9 196761 CASAVA_Build 12 116267220 4D GCTTTCTTGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1774 het 17 hom 19 0 8 12 T 20 16 196762 CASAVA_Build 12 116269486 1D CAAAACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 27 1 22 4 A 13 12 196763 CASAVA_Build 12 116272085 1D TAATTTTTTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 75 het 34 0 24 10 T 8 7 196764 CASAVA_Build 12 116275964 1I CACCATATTG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 108 het 39 0 35 4 T 7 8 196765 CASAVA_Build 12 116280520 1D CAATACCCCC G/- CCCTCTCACT 2581 hom 32 het 18 0 12 7 G 1 0 196766 CASAVA_Build 12 116281567 1I ATAACGGGGG -/A AAAAAATCTA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 6 7 196767 CASAVA_Build 12 116356265 6D CCCTCCCACG CACACA/------ CACACACACC 3070 hom 183 het 80 0 61 22 CA 7 4 196768 CASAVA_Build 12 116358658 1D TCCTCTCCTT A/- ACCTGCCAGG 3070 hom 146 het 52 0 47 5 A 2 1 196769 CASAVA_Build 12 116380593 1D GCCAAGCTGG T/- TTTTTTTTTT 1722 het 1722 ref 26 15 5 7 T 12 11 196770 CASAVA_Build 12 116387942 56D GGCTTCCTGT TCACTGCCCAGATAATCCTGCTATTGCTCTGCTTGGGGACAGATTTCCCTTTTGTA/-------------------------------------------------------- TCAGGTCACA 2955 het 2955 ref 20 22 9 3 TCACTGCCCAGATAATCCTGCTATTGCTCTGCTTGGGGACAGATTTCCCTTTTGTA 1 0 196771 CASAVA_Build 12 116390020 1I TAGGCTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 26 0 18 8 A 12 13 196772 CASAVA_Build 12 116420348 2D CCTTCACCTC TT/-- TTCAGGATTT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 T 4 2 196773 CASAVA_Build 12 116427646 2I1M6D TCAAACAGAA --GCTCAAA/TTG------ TGCTTCTGTT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 N/A 0 0 196774 CASAVA_Build 12 116433610 4D AAAGAATAAC CAAA/---- CAAAGATTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 7 CAAA 2 1 196775 CASAVA_Build 12 116434132 1I GGAAAGGATC -/T TTCCAGTTCT 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 2 3 196776 CASAVA_Build 12 116434916 6I CACCTCTTAA ------/TAGACT TAGACTTAGA 3070 hom 107 het 46 0 35 11 TAGACT 1 2 196777 CASAVA_Build 12 116437059 2D TTCATATCTC TT/-- GCTACTCCCC 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 2 0 196778 CASAVA_Build 12 116452021 2D TGAATCCCTG TC/-- TCTACAAAAA 2614 het 2614 ref 17 8 7 2 TC 2 1 196779 CASAVA_Build 12 116460292 1D TCTAACGGTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 1706 hom 23 7 9 7 T 9 8 196780 CASAVA_Build 12 116464625 1D AGTTTTCTCT A/- CTGATAACAT 3070 het 3070 ref 43 26 13 5 A 1 0 196781 CASAVA_Build 12 116473030 1I GCCTATGGGC -/T TGCTTTGGGT 3070 het 3070 ref 63 28 29 6 T 1 2 196782 CASAVA_Build 12 116486656 19I ACACAGAAAA -------------------/TGCCCTGCCACCCTCATAG AGCCTGCAAA 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 TGCCCTGCCACCCTCATAG 0 1 196783 CASAVA_Build 12 116488282 2D CCAGTAGTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 23 2 9 12 T 12 10 196784 CASAVA_Build 12 116504085 12I GTGCCAGGCC ------------/CTGTGCTAAGCA CTTTACAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CTGTGCTAAGCA 0 1 196785 CASAVA_Build 12 116517170 2D GCCCAGAAAG AC/-- AGGGAAGGAC 3070 hom 190 het 70 0 63 8 AC 1 0 196786 CASAVA_Build 12 116523484 1D CCAAGATCTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 36 hom 41 2 21 18 G 11 10 196787 CASAVA_Build 12 116537579 1D TGTTAAATGC T/- TTGTTTTCTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 3 2 196788 CASAVA_Build 12 116538360 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAGATT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 0 1 196789 CASAVA_Build 12 116541399 1D GTCAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 522 hom 35 2 26 7 T 13 12 196790 CASAVA_Build 12 116552548 2D AGGAAGAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 1507 het 1507 ref 73 49 4 20 TG 8 7 196791 CASAVA_Build 12 116560352 5I TTAAAATCTT -----/TTTGA TTTATTTAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTTGA 0 1 196792 CASAVA_Build 12 116562431 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 64 het 31 0 22 11 T 8 9 196793 CASAVA_Build 12 116583456 1I CCTGTACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1784 hom 40 5 28 7 A 11 12 196794 CASAVA_Build 12 116591760 1I TGCTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 18 13 14 A 11 12 196795 CASAVA_Build 12 116592143 1I TTGCTGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 9 10 196796 CASAVA_Build 12 116595870 1D AGGCATGGTC A/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 56 24 25 11 A 1 0 196797 CASAVA_Build 12 116608238 1D ATTTTATTCC T/- TTTTTTTTCT 2742 het 2742 ref 27 14 11 2 T 9 8 196798 CASAVA_Build 12 116628963 1I ACCTGTTAAG -/C AAATAAATAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 0 1 196799 CASAVA_Build 12 116649033 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 8 9 196800 CASAVA_Build 12 116652642 16D TCCACAGTCT CCCTCTCCCTCGTCTC/---------------- CCCTCTCCCT 2413 het 2413 ref 25 9 9 10 CCCTCTCCCTCGTCTC 2 1 196801 CASAVA_Build 12 116659550 1D GCACACTGCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 8 196802 CASAVA_Build 12 116660042 4I TCTGATGAAT ----/ACTG CATCCAATGT 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 ACTG 0 1 196803 CASAVA_Build 12 116662080 2I GTGTTACTGT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 TG 0 1 196804 CASAVA_Build 12 116662843 9D ATTATATATG TAATATATA/--------- ATATATATAA 2299 het 1762 hom 11 4 5 3 TAATATATA 1 0 196805 CASAVA_Build 12 116671662 1I ACTCGATATA -/C CCATAGGAAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 C 2 3 196806 CASAVA_Build 12 116672908 1D ATGTGTACAC A/- AATGTGTAGC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 3 2 196807 CASAVA_Build 12 116742208 1I GACTCACCGG -/A AAAATGCGAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 4 5 196808 CASAVA_Build 12 116748681 1I GACTAAGGGG -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 A 6 7 196809 CASAVA_Build 12 116756154 1I CTGTCTGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1507 hom 20 6 10 4 A 11 12 196810 CASAVA_Build 12 116756338 1I CAAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2569 het 2569 ref 27 14 8 5 A 12 13 196811 CASAVA_Build 12 116758298 1D TATGTTAAAA G/- AAGATTGCGA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 G 1 0 196812 CASAVA_Build 12 116766665 4D CCTCCTCTTC TGAG/---- TATTTTTTTT 1027 het 29 hom 18 1 7 11 TGAG 1 0 196813 CASAVA_Build 12 116779831 2D GGATGGAACA CT/-- GTTTTAAGGT 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 CT 1 0 196814 CASAVA_Build 12 116789028 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 10 9 196815 CASAVA_Build 12 116850371 1D CCTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2624 het 1609 hom 33 9 9 15 T 15 14 196816 CASAVA_Build 12 116851056 13I CAGAGATTGG -------------/GCAGGTAATTTGC CTACGACATC 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 GCAGGTAATTTGC 0 1 196817 CASAVA_Build 12 116871496 1I TGTTAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 11 12 196818 CASAVA_Build 12 116888203 1I GAAAGTGGTT -/G GCATGCTCTG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 G 1 2 196819 CASAVA_Build 12 117002010 4D CACCTTTGCA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 2702 hom 32 9 14 9 TTTC 5 4 196820 CASAVA_Build 12 117025514 5D CCCCCGCACG TCGGC/----- TCGGCTCGGC 2858 het 910 hom 25 5 9 11 TCGGC 3 2 196821 CASAVA_Build 12 117026442 1D AGGACCCCCC T/- GGCAGTCCCC 2805 het 2805 ref 19 10 8 3 T 1 0 196822 CASAVA_Build 12 117045700 3D ACACACTACA TGT/--- TGTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 TGT 3 2 196823 CASAVA_Build 12 117092362 1I TCTCAAGCAG -/T TTTTTTTTTT 2350 het 2350 ref 23 9 5 9 T 10 11 196824 CASAVA_Build 12 117122308 1I TAATACATTA -/T TTTTTAACAG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 5 6 196825 CASAVA_Build 12 117130613 1D GAGAAATAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 10 9 196826 CASAVA_Build 12 117157867 1I TCCCTATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 11 12 196827 CASAVA_Build 12 117233808 1D AGTTGAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 T 12 11 196828 CASAVA_Build 12 117239791 1I CAGCCAGAAA -/T TTTTTAAAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 5 6 196829 CASAVA_Build 12 117251830 2D ATTCTATGAC TT/-- TGGTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 T 3 1 196830 CASAVA_Build 12 117293720 1I GCTCCGGAGT -/C CCCCCGGAGT 3070 hom 44 het 17 0 13 4 C 5 6 196831 CASAVA_Build 12 117320803 1D TGCAGAAGCC T/- TTTTTTTTTT 1156 het 1156 ref 33 16 3 14 T 19 18 196832 CASAVA_Build 12 117324819 2D GAAGAAAACA AG/-- AGTCTTCTTT 3070 het 3070 hom 35 11 22 2 AG 2 1 196833 CASAVA_Build 12 117328896 1I TAATTGGCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 18 6 A 10 11 196834 CASAVA_Build 12 117339866 1I AAGGTATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2702 hom 34 10 10 14 T 15 16 196835 CASAVA_Build 12 117349345 1I ACAAACAACC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2935 hom 19 7 8 4 T 8 9 196836 CASAVA_Build 12 117353995 1D TTCTATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 15 13 14 T 13 12 196837 CASAVA_Build 12 117354437 1D ATGTTAACTC T/- TATTAGGCTA 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 T 2 1 196838 CASAVA_Build 12 117362994 7I GTTTGTCTTC -------/CACCATG ATTGTGAGGC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 CACCATG 0 1 196839 CASAVA_Build 12 117376517 1I ACAAGACATC -/A ATGAATCTTA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 1 2 196840 CASAVA_Build 12 117382678 1D ACCTTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2712 hom 26 12 10 4 A 12 11 196841 CASAVA_Build 12 117388894 1I ATTTGATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 9 8 A 11 12 196842 CASAVA_Build 12 117397598 4D TACCCAAAGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 10 AAAC 4 3 196843 CASAVA_Build 12 117406441 1D ACCTGTGGGG T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 T 8 7 196844 CASAVA_Build 12 117413296 1I CATGGGCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 T 9 10 196845 CASAVA_Build 12 117442168 1D TTTCTCCATA T/- TTTTTTTTTT 2073 het 2073 ref 29 16 5 8 T 15 14 196846 CASAVA_Build 12 117474692 1I GCTAGTTGCA -/C CCCCATGCCC 3070 hom 140 het 49 0 46 3 C 4 5 196847 CASAVA_Build 12 117487244 1D CGTCTCTACT A/- AAAATGGTTC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 5 4 196848 CASAVA_Build 12 117488869 1D GGCTCTAGTG T/- TTTTTTTTTG 1372 het 1372 ref 28 18 3 7 T 10 9 196849 CASAVA_Build 12 117489576 1I CTGACTTCAG -/A AAAAAAAAAA 2429 het 2429 ref 23 11 7 5 A 11 12 196850 CASAVA_Build 12 117491287 1I TATCTACCAT -/G TTACTATTAC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 0 1 196851 CASAVA_Build 12 117493134 1D GACTGGCCAT A/- AAAAAAAAAA 1384 het 1384 ref 44 23 4 17 A 11 10 196852 CASAVA_Build 12 117498081 2I GTGTGTGTGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 91 30 36 25 TG 6 7 196853 CASAVA_Build 12 117498641 2I GTGTGGTGTA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 58 28 20 10 TG 4 5 196854 CASAVA_Build 12 117503125 1I CTCTGTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 11 12 196855 CASAVA_Build 12 117504652 9D GTTCCTATTC CTTTTTTTT/--------- CTTTTTTTTC 3070 het 2726 hom 25 7 11 7 CTTTTTTTT 3 2 196856 CASAVA_Build 12 117506628 1I ACAGTTGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2883 hom 34 8 18 8 A 9 10 196857 CASAVA_Build 12 117506736 1I CCCTTTAATA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2899 hom 27 7 15 5 T 8 9 196858 CASAVA_Build 12 117515322 2D TTCTTTTTTC AA/-- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 A 10 8 196859 CASAVA_Build 12 117515529 1I GTGAAAACAA -/C CCAAATATCC 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 C 2 3 196860 CASAVA_Build 12 117516441 1D GAAATTAAAA T/- TTTTTTTTTC 2471 het 2471 ref 26 16 6 4 T 10 9 196861 CASAVA_Build 12 117520585 1D TGGCTGGGGT G/- GGGGAGCTGG 3070 het 3070 hom 37 18 14 5 G 5 4 196862 CASAVA_Build 12 117520708 1I TGGTTTGTGG -/T GACAGCCTTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 0 1 196863 CASAVA_Build 12 117520887 1I TCTATCACCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 9 10 196864 CASAVA_Build 12 117521471 1I TTCAGAGTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 9 10 196865 CASAVA_Build 12 117522513 1D TCACAGATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2878 hom 35 13 12 10 T 13 12 196866 CASAVA_Build 12 117528563 2D ACAGATGCAC AG/-- ACACACATGT 3070 het 3070 ref 69 33 14 23 AG 1 0 196867 CASAVA_Build 12 117539672 1I TCATCTTTCT -/C CCCATGCTGG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 3 4 196868 CASAVA_Build 12 117547484 2I CCTCCTGAGG --/TT TTTTAATACA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 4 6 196869 CASAVA_Build 12 117548080 17D TTTTATTTCA TTCATTGTTTCATTCAT/----------------- TTCATTGTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 5 TTCATTGTTTCATTCAT 1 0 196870 CASAVA_Build 12 117559254 1D ATAAGGTAGG A/- AAACAAAGTG 3070 het 3070 ref 50 29 17 5 A 4 3 196871 CASAVA_Build 12 117567509 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 6 196872 CASAVA_Build 12 117574535 1D ACCATGTTGG C/- CAGGATGGTC 2068 het 2068 ref 20 10 8 2 C 2 1 196873 CASAVA_Build 12 117587768 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1931 het 501 hom 23 2 10 11 A 19 18 196874 CASAVA_Build 12 117588279 4D AAATTAAAGT TGTA/---- TGTATTTATG 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 TGTA 2 1 196875 CASAVA_Build 12 117599079 1I ACTTTGTCTT -/A AAAATCAGCC 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 A 4 5 196876 CASAVA_Build 12 117600783 6I TCATTACTGA ------/CAAGAG CAATGGAATT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 CAAGAG 0 1 196877 CASAVA_Build 12 117607033 2I6M2D18M1I ACGTGGTGCA --TGGGAGCATGGGAGCATGGGCATGGT-/CTAGGTAG--AGGGAGCATGGGCATGGTG GGTGGTATGG 3070 hom 78 het 23 0 26 2 N/A 0 0 196878 CASAVA_Build 12 117609061 1I TACATATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 319 hom 29 1 24 4 A 11 12 196879 CASAVA_Build 12 117609929 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 196880 CASAVA_Build 12 117633157 1D ATAAATATGT A/- ATGAGTGAAA 3070 het 3070 ref 60 30 27 3 A 2 1 196881 CASAVA_Build 12 117639569 1D ATCCTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 11 10 196882 CASAVA_Build 12 117642781 16D TCCCTCCCTC TCTCTCTTTCTTTCTT/---------------- TCTTTCTTTC 2354 het 1951 hom 11 5 5 1 TCTCTCTTTCTTTCTT 1 0 196883 CASAVA_Build 12 117644431 1D GCTGTAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 A 11 10 196884 CASAVA_Build 12 117648319 1I CTCCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 29 1 18 11 A 10 11 196885 CASAVA_Build 12 117649648 9D ACAATTCCTC CAAATAACT/--------- CAAATAACTG 3070 hom 81 het 34 0 25 11 CAAATAACT 2 1 196886 CASAVA_Build 12 117650854 1I CACCTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 30 1 20 9 T 10 11 196887 CASAVA_Build 12 117663134 1I CTCTATCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 9 9 A 11 12 196888 CASAVA_Build 12 117665208 1D ATAATTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 27 2 16 9 T 13 12 196889 CASAVA_Build 12 117667222 1D ATAGTGAAAC A/- AAGTGAATTT 3070 het 3070 ref 49 21 20 10 A 3 2 196890 CASAVA_Build 12 117675333 4D AAATAAATAA AAAT/---- AAATAAATAA 1021 het 600 hom 7 3 3 3 AAAT 4 3 196891 CASAVA_Build 12 117686985 1D TCAGCCCTGT G/- GTCAGCTCAC 3070 het 3070 ref 55 24 21 10 G 2 1 196892 CASAVA_Build 12 117689402 1D CTGACCCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 31 het 29 0 15 14 A 10 9 196893 CASAVA_Build 12 117690941 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 22 11 T 13 12 196894 CASAVA_Build 12 117696481 1I TGACCCCCCC -/A ACACTGCCTA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 1 2 196895 CASAVA_Build 12 117700605 1D TGGTAATGTG T/- TTACAGCAGT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 3 2 196896 CASAVA_Build 12 117705472 1I CTATACTAAT -/G GGCTGAAGCC 3070 hom 111 het 39 0 37 2 G 2 3 196897 CASAVA_Build 12 117707683 1D CAGGTTGATG A/- AGGATGAAGA 3070 hom 141 het 50 0 48 3 A 2 1 196898 CASAVA_Build 12 117711777 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTCCTT 1856 hom 38 het 32 0 12 20 T 7 6 196899 CASAVA_Build 12 117726488 2D CAGGGGTTAC AT/-- ATATGTAGGT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AT 3 2 196900 CASAVA_Build 12 117728632 1I ATTGCTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 9 10 196901 CASAVA_Build 12 117754227 1I ATGATAACTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 10 196902 CASAVA_Build 12 117773081 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTAGTAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 5 6 196903 CASAVA_Build 12 117778567 1D GCATTATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 T 11 10 196904 CASAVA_Build 12 117783166 4I TTTCTTTCTT ----/CTTC CTTCCTTCCT 2081 het 1964 hom 33 13 10 10 CTTC 3 4 196905 CASAVA_Build 12 117801441 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 het 453 hom 21 2 15 4 G 0 1 196906 CASAVA_Build 12 117803544 1D GCAGGGCTCT C/- CTATTAGATT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 C 2 1 196907 CASAVA_Build 12 117804510 1I TGCCTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 458 hom 40 3 18 19 T 16 17 196908 CASAVA_Build 12 117806739 4I AAAAAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 52 26 22 4 AAAC 2 3 196909 CASAVA_Build 12 117809391 3I TTGCTGCAAC ---/TTT TTTATTTTGT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 3 6 196910 CASAVA_Build 12 117816105 1I CAAACCTATG -/A AAAAAAGCTC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 6 7 196911 CASAVA_Build 12 117820301 1D CAGCATCTCA G/- GGGGGTGGGG 3070 hom 134 het 48 0 44 4 G 6 5 196912 CASAVA_Build 12 117821697 1D TACTTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 11 10 196913 CASAVA_Build 12 117849963 4I ACAATGAATA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 AAAC 2 3 196914 CASAVA_Build 12 117867680 19D CAAAGTGTGG CCTCAGACAAGTGTCTTAA/------------------- CCTCAGACAA 3070 het 3070 ref 44 20 20 11 CCTCAGACAAGTGTCTTAA 2 1 196915 CASAVA_Build 12 117874149 1I TATTACTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 10 11 196916 CASAVA_Build 12 117881484 2D TGTTATCTCA TG/-- TAACCCTCAC 3070 het 3070 hom 45 21 23 2 TG 1 0 196917 CASAVA_Build 12 117893385 1D TTCCTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 21 8 T 11 10 196918 CASAVA_Build 12 117898365 5D AGCCTAGACT TTAGA/----- TTAAGACATA 3070 het 3070 ref 47 24 20 6 TTAGA 1 0 196919 CASAVA_Build 12 117901643 4D TTGAAATAAG ATAA/---- ATAAATAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 ATAA 3 2 196920 CASAVA_Build 12 117904863 2I TTTTGTTTTT --/TG TTTTGTTTTT 650 het 304 hom 27 5 9 13 TG 0 1 196921 CASAVA_Build 12 117910316 1I AGAGGAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 10 11 196922 CASAVA_Build 12 117911386 1D TCTGCTTCTG T/- TTGACTCCTC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 T 3 2 196923 CASAVA_Build 12 117922958 3I TTTGCCAGAG ---/CCT CCTAACCTAA 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 CCT 1 2 196924 CASAVA_Build 12 117923223 4D GAGGGTGGCA TAGT/---- TAGGGTAGGC 3070 hom 170 het 62 0 56 8 TAGT 1 0 196925 CASAVA_Build 12 117928529 3D GCGACTACTC CTT/--- CTTTTCCTGG 3070 het 3070 ref 46 21 19 8 CTT 2 1 196926 CASAVA_Build 12 117931261 4D ACACATACTC ACAT/---- ACACACACTC 2272 het 1941 hom 20 8 10 4 ACAT 1 0 196927 CASAVA_Build 12 117935456 1D CAGAGATGAG A/- AAAATCAGGC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 5 4 196928 CASAVA_Build 12 117936117 1D ATGCTACCCT C/- CCCTTCTTCC 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 C 4 3 196929 CASAVA_Build 12 117946192 1I CATTGTACTC -/T TTGGCTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 2 3 196930 CASAVA_Build 12 117947626 3D GTTTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTGTT 623 het 537 hom 20 4 4 12 TTG 1 0 196931 CASAVA_Build 12 117952690 1I TTTTGATTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 9 196932 CASAVA_Build 12 117963113 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 10 196933 CASAVA_Build 12 117965777 1D TGCATACAGC A/- AAAAGAAGTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 5 4 196934 CASAVA_Build 12 117966717 6D GAGCCCCCAC AGCAAG/------ AGCAAGCTGT 3070 hom 125 het 44 0 35 9 AGCAAG 2 1 196935 CASAVA_Build 12 117968718 1D TCATAAATAA T/- TTTTTATACA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 6 5 196936 CASAVA_Build 12 117975936 1I CCAACAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 11 12 196937 CASAVA_Build 12 117989339 1I CTTTCCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 T 11 12 196938 CASAVA_Build 12 117994246 2D CTCCAAGGCT CA/-- GTTTCTTCAT 3070 het 3070 hom 47 23 20 4 CA 1 0 196939 CASAVA_Build 12 117994813 9I TTACCCGCAG ---------/ATGGAGGTA ATTGAACAGA 3070 hom 109 het 41 0 32 9 ATGGAGGTA 0 1 196940 CASAVA_Build 12 117995282 1I CATGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 43 1 28 14 A 11 12 196941 CASAVA_Build 12 117996290 1I TGGCAAGGGG -/A TGGCAGTTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 0 1 196942 CASAVA_Build 12 117996395 1D GGAAACGGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 76 het 31 0 26 5 A 10 9 196943 CASAVA_Build 12 117998104 9I TGGTGATGAT ---------/GGTGATGAA GATGATGATG 3070 het 380 hom 55 5 35 15 GGTGATGAA 0 1 196944 CASAVA_Build 12 117998518 1D TTACAGATGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 94 het 41 0 30 11 A 9 8 196945 CASAVA_Build 12 117999138 1D TAAATTTAAA G/- GGGGTATTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 4 G 5 4 196946 CASAVA_Build 12 117999278 1I ACTGATTTTC -/T TCCCTTCAGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 1 2 196947 CASAVA_Build 12 118000230 1D CTTATTCACT G/- GGTCTGCCTG 3070 hom 123 het 48 0 41 8 G 3 2 196948 CASAVA_Build 12 118002413 3D GCTTTGCTGT GTC/--- GTGACCTCAG 3070 hom 72 het 27 0 24 4 GTC 1 0 196949 CASAVA_Build 12 118002545 2D TATAATTAAC AT/-- ATATATATTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AT 5 4 196950 CASAVA_Build 12 118011935 3D CATCCTCAAT ATC/--- ATCATCATCA 3070 hom 120 het 55 0 39 18 ATC 7 6 196951 CASAVA_Build 12 118014652 1I TTCCCCATCT -/G CAGTTGTTCC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 G 0 1 196952 CASAVA_Build 12 118021645 1D ATATGTTAAC A/- ATTTTTGAAC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 2 1 196953 CASAVA_Build 12 118042247 1D TCATACCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 A 11 10 196954 CASAVA_Build 12 118042720 3D AATGTCTCAT TAC/--- TACCCCTGCC 3070 hom 103 het 38 0 33 5 TAC 2 1 196955 CASAVA_Build 12 118045686 3I CAACAGCGCT ---/AGG AGGAAGGACC 3070 het 3070 hom 50 18 21 11 AGG 1 2 196956 CASAVA_Build 12 118051621 1D TTGTCAGCCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 55 26 18 12 T 9 8 196957 CASAVA_Build 12 118058216 1I GCTCTGTGTG -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 62 30 28 4 A 7 8 196958 CASAVA_Build 12 118059291 1D AAACAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 12 11 196959 CASAVA_Build 12 118075560 1I TTATTAACCA -/C CCGGTGGGGA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 C 2 3 196960 CASAVA_Build 12 118086954 1I AAGTCCCCCC -/A AACACACTGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 3 196961 CASAVA_Build 12 118119259 1D CTTTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 26 1 16 9 T 12 11 196962 CASAVA_Build 12 118133313 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2120 het 1155 hom 20 4 10 6 T 15 16 196963 CASAVA_Build 12 118138173 1D GCCATTCTCC T/- TAACTCAGCC 3070 hom 66 het 24 0 20 4 T 2 1 196964 CASAVA_Build 12 118140515 2D TGGGTTCATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 32 1 18 13 T 16 14 196965 CASAVA_Build 12 118145747 1I TAAGATGATC -/A GGGGTTGCAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 196966 CASAVA_Build 12 118151894 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 18 8 T 16 14 196967 CASAVA_Build 12 118158167 1I TTCCTGGATC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 103 het 39 0 35 4 T 8 9 196968 CASAVA_Build 12 118159677 1I CTTTCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 42 0 31 11 T 14 15 196969 CASAVA_Build 12 118159847 1D TGTCTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 32 2 28 2 A 11 10 196970 CASAVA_Build 12 118165198 4D GGATATATCA GTTT/---- GTTTATCCAT 3070 hom 90 het 31 0 31 1 GTTT 2 1 196971 CASAVA_Build 12 118165375 2I ATAGTTTACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 T 13 15 196972 CASAVA_Build 12 118176380 1I TACTCATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 9 10 196973 CASAVA_Build 12 118182244 2I ACTACTCACC --/AT ATCTTCAGCT 3070 hom 134 het 54 0 44 10 AT 1 2 196974 CASAVA_Build 12 118187829 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 8 7 196975 CASAVA_Build 12 118190937 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTATAG 1102 het 1102 ref 14 8 3 3 T 6 7 196976 CASAVA_Build 12 118191248 1D TTCTCTCCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 10 9 196977 CASAVA_Build 12 118206517 1D ATGCATATAA C/- AGGATGCTAA 3070 het 3070 ref 74 37 29 8 C 1 0 196978 CASAVA_Build 12 118210183 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 8 9 196979 CASAVA_Build 12 118220259 1D TCTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2110 hom 20 6 10 4 T 15 14 196980 CASAVA_Build 12 118232225 1D GCTCAGAGAG T/- CTACATAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 1 0 196981 CASAVA_Build 12 118233010 22D TATATCAAAT TATGTATAGATCTATAGATCTA/---------------------- TATATATAGA 3070 het 3070 ref 21 13 8 3 TATGTATAGATCTATAGATCTA 1 0 196982 CASAVA_Build 12 118234792 1D TTGTCAAACT A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 7 6 196983 CASAVA_Build 12 118239389 2D TTTTTCACTC TT/-- GTAATAACAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 T 2 0 196984 CASAVA_Build 12 118241337 1I ATTGAAAAAT -/G GCACCACCCC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 1 2 196985 CASAVA_Build 12 118242489 1D TATTTATATC T/- TTTTTTTTTT 1654 het 319 hom 24 3 6 15 T 13 12 196986 CASAVA_Build 12 118248542 2I GCTGAACAAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 55 26 15 14 AC 8 9 196987 CASAVA_Build 12 118258436 1I GTATAATAAT -/A ACAAAAAAAG 3070 het 499 hom 12 2 8 2 A 1 2 196988 CASAVA_Build 12 118261731 1D TGAACACTTT G/- GGGGGGGCCG 3070 hom 68 het 28 0 22 6 G 8 7 196989 CASAVA_Build 12 118275681 2I TCTGTCTCTG --/TC TCTCTCTGTC 3070 hom 64 het 27 0 22 5 TC 3 4 196990 CASAVA_Build 12 118279647 1D TGAGATCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 30 1 16 14 T 13 12 196991 CASAVA_Build 12 118295852 4D CTCCGGGGTG GGGT/---- GGGGGGGGGT 1466 het 914 hom 16 5 5 7 GGGT 1 0 196992 CASAVA_Build 12 118296176 1D GAACTTTATC T/- TTTTTTTTTT 2021 het 2021 ref 31 18 5 9 T 13 12 196993 CASAVA_Build 12 118296876 1I CAGAGCAGTG -/T GCATGGGCTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 0 1 196994 CASAVA_Build 12 118304683 1I AAAGTATTCG -/T TAACAGGGGG 3070 het 3070 hom 55 24 26 5 T 1 2 196995 CASAVA_Build 12 118307126 1I AACATTGAGT -/G GGGGGGGCTG 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 G 7 8 196996 CASAVA_Build 12 118323029 2D GGCCATCCCG GA/-- GAGCCCATTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 GA 2 1 196997 CASAVA_Build 12 118325097 1I GCAAATGATA -/G GAAAACCCCA 3070 het 3070 hom 52 19 25 8 G 1 2 196998 CASAVA_Build 12 118328381 4D ATATATATAG ATAT/---- ATATATATAG 30 het 12 hom 13 0 2 11 AT 6 4 196999 CASAVA_Build 12 118333106 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 9 8 197000 CASAVA_Build 12 118340318 3I ACATGTTTCC ---/ATG ATATTTTTCA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 ATG 0 1 197001 CASAVA_Build 12 118347205 1D GTGACATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 16 21 12 A 10 9 197002 CASAVA_Build 12 118348545 1D ATTTATTTTT G/- TTTTGTTTTG 3070 het 2160 hom 26 9 12 5 G 1 0 197003 CASAVA_Build 12 118349321 1D CTTTCATTAT G/- TAACTAATTA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 G 1 0 197004 CASAVA_Build 12 118351168 4I GCCTCCAGCC ----/ACCT GCCTAGAATT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 ACCT 0 1 197005 CASAVA_Build 12 118355351 4I CCGACAGAGA ----/GTCG GTTGTTAAAC 3070 hom 108 het 41 0 34 7 GTCG 0 1 197006 CASAVA_Build 12 118356467 2I GAAGCTATTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 9 11 197007 CASAVA_Build 12 118357027 5D GTAAGAGCTG GCTCA/----- GCCCACACGC 3070 het 3070 hom 43 21 18 10 GCTCA 1 0 197008 CASAVA_Build 12 118360127 1I CAAGTGGCCA -/T TTAACGAGTC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 2 3 197009 CASAVA_Build 12 118368890 8D TTAAAAGCTG TGTGTGCC/-------- TGTGTGGATG 3070 het 3070 ref 45 21 19 8 TGTGTGCC 1 0 197010 CASAVA_Build 12 118377308 3D GTTTGTGGTG GTT/--- GTTGTTTGAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 8 GTT 3 2 197011 CASAVA_Build 12 118382287 7D TAGGAGTGGT TAGTTAA/------- TAGTTAATAG 3070 hom 79 het 37 0 27 12 TAGTTAA 3 2 197012 CASAVA_Build 12 118387946 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1156 hom 20 3 10 7 A 13 14 197013 CASAVA_Build 12 118389090 1D AAACAGGGAC A/- GGGAAGAAGC 3070 het 3070 ref 55 24 21 11 A 1 0 197014 CASAVA_Build 12 118390878 2I ATGAAAAGAA --/TT TTTTATTTAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 4 6 197015 CASAVA_Build 12 118400549 1D ACAACAACCA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 1000 hom 22 5 16 2 C 9 8 197016 CASAVA_Build 12 118419939 1D CTCCAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 30 2 22 6 A 12 11 197017 CASAVA_Build 12 118428153 2I CTTTTATACT --/AA GTCTTTGAAA 3070 hom 39 het 25 0 14 11 A 0 2 197018 CASAVA_Build 12 118442585 1D CAATTATATA C/- CATCAAGTTA 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 C 2 1 197019 CASAVA_Build 12 118467781 1I CTAGAGAAGC -/T TTTTTTCTGT 2770 het 2770 ref 23 13 6 4 T 6 7 197020 CASAVA_Build 12 118471666 1I CCAGAGGTAT -/A AAAGAGAGCC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 3 4 197021 CASAVA_Build 12 118471727 1I GTTAAAACAG -/A AATGTTCAGG 3070 hom 36 het 27 0 13 14 A 2 3 197022 CASAVA_Build 12 118472149 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2064 het 1269 hom 21 5 8 8 A 13 14 197023 CASAVA_Build 12 118475334 1D TTTCTCCCCA C/- CCTGACCCCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 C 3 2 197024 CASAVA_Build 12 118478633 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 11 10 197025 CASAVA_Build 12 118479260 1I TGAGTCACCT -/G GGGGAGTGTT 3070 het 3070 ref 54 31 22 1 G 4 5 197026 CASAVA_Build 12 118479537 1D TGCCACTGCA G/- GGACGGAATA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 3 2 197027 CASAVA_Build 12 118481316 5I ACTAAAATAT -----/ACATA ACATAAAATT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 ACATA 1 2 197028 CASAVA_Build 12 118485534 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1893 het 1893 ref 20 11 5 4 A 15 14 197029 CASAVA_Build 12 118492155 2I TAGCTGGGCT --/TG TGGTGGTGTG 3070 het 1700 hom 20 4 12 5 TG 1 2 197030 CASAVA_Build 12 118496933 1D GAACAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 1136 het 1136 ref 45 29 3 14 A 17 16 197031 CASAVA_Build 12 118510272 1D CCCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1092 het 379 hom 22 2 6 15 T 19 18 197032 CASAVA_Build 12 118521623 1I CCAGAATTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 8 9 197033 CASAVA_Build 12 118527187 4I CCTCACTATC ----/TCTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 TCTT 0 1 197034 CASAVA_Build 12 118528503 6D AAAGAAAGAA ACAGAG/------ ACAGAGACAG 3070 hom 67 het 28 0 22 9 ACAGAG 4 3 197035 CASAVA_Build 12 118543697 1D ACAAAGAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 39 het 39 1 34 4 A 10 9 197036 CASAVA_Build 12 118548004 1I TCTTCTGTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 9 10 197037 CASAVA_Build 12 118550168 1D TAACAACCTG C/- CCCTTAATTT 3070 het 3070 ref 28 17 9 5 C 4 3 197038 CASAVA_Build 12 118551586 15D TGACAGAGTG AGACTCTGTCTCAAA/--------------- AAAAAAAAGA 3070 hom 57 het 19 0 20 3 AGACTCTGTCTCAAA 1 0 197039 CASAVA_Build 12 118556124 1D AATCAGAAGT G/- GGGTTCAAGA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 G 4 3 197040 CASAVA_Build 12 118561650 1I CTAAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 11 12 197041 CASAVA_Build 12 118562342 5I TTTGTTGTTG -----/TTGTT TTGTTTTGTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TTGTT 3 4 197042 CASAVA_Build 12 118563682 1D TAGAATGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 40 0 30 10 T 11 10 197043 CASAVA_Build 12 118568261 1I TTTTTTTTTT -/C TTTGAGATGG 3070 het 159 hom 37 1 29 7 C 0 1 197044 CASAVA_Build 12 118574299 1D CACTTTTGGA G/- AGAAATTTGG 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 G 1 0 197045 CASAVA_Build 12 118576160 2D CCAAGAAGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 31 3 12 18 A 14 12 197046 CASAVA_Build 12 118577210 1D TTTTGTTTTG T/- TTTGTTTGTT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 4 3 197047 CASAVA_Build 12 118624297 1D GCCATTCATC T/- TTTTTTTTTT 1736 het 1736 ref 37 21 4 12 T 13 12 197048 CASAVA_Build 12 118629238 4I GTTCTCATGA ----/ACTG ACTTTGTTAT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 ACTG 0 1 197049 CASAVA_Build 12 118630237 1D CTTTTCTTTC A/- AGAGAGCCCC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 2 1 197050 CASAVA_Build 12 118631212 4D AGGAACCGTT CAGA/---- TTAAAGGAGA 3070 het 3070 ref 42 26 11 8 CAGA 1 0 197051 CASAVA_Build 12 118634330 1I AGCCCCCTTT -/A ACAAAGACAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 1 2 197052 CASAVA_Build 12 118645266 1D ACGAAAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 11 11 7 A 10 9 197053 CASAVA_Build 12 118665419 1D GGACCAGTTT A/- AAAAAAAAAA 1046 het 1046 ref 41 36 3 2 A 12 11 197054 CASAVA_Build 12 118668015 1I ATAAAATACC -/A AAAAATAGAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 5 6 197055 CASAVA_Build 12 118669229 4D TGCTACAGAG AATA/---- AATATCTACA 3070 het 3070 hom 40 14 23 5 AATA 2 1 197056 CASAVA_Build 12 118673569 1D ATGGCCCCAC A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 25 13 10 2 A 7 6 197057 CASAVA_Build 12 118675521 1I CATCCCGAAG -/C CCATAGGGGT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 C 2 3 197058 CASAVA_Build 12 118680679 1D GAAGTCATTC A/- ATCCACTCCA 3070 het 3070 hom 48 14 27 7 A 2 1 197059 CASAVA_Build 12 118688430 1D AGTTGAAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 10 9 197060 CASAVA_Build 12 118692717 1D ACGTTCCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2017 hom 46 10 19 17 A 15 14 197061 CASAVA_Build 12 118694328 15D AGGGTGAAAT CAACTACGGCACGCC/--------------- CCTTCTGTGG 3070 het 3070 ref 22 13 11 0 CAACTACGGCACGCC 1 0 197062 CASAVA_Build 12 118696746 8D ACAATGTATA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 10 23 10 TG 13 9 197063 CASAVA_Build 12 118699865 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 9 10 197064 CASAVA_Build 12 118703857 2I GTTTAGAAAG --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 8 10 197065 CASAVA_Build 12 118705035 1I GGTGACCTTA -/G GGGATCCAGC 3070 het 3070 hom 55 23 24 8 G 3 4 197066 CASAVA_Build 12 118707753 1D CATCCCGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1178 hom 21 4 10 7 T 12 11 197067 CASAVA_Build 12 118722029 2I ACTTTATGAG --/TT TTTTTTTTTT 2735 het 2735 ref 29 13 10 6 T 13 15 197068 CASAVA_Build 12 118727264 1I TTTTAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 48 1 42 5 A 10 11 197069 CASAVA_Build 12 118731625 2I TTATTATGAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 AT 5 6 197070 CASAVA_Build 12 118743310 2D TGGAAAAACC CT/-- GTTTCTACGA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CT 1 0 197071 CASAVA_Build 12 118747728 1D TTACTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 680 hom 41 3 27 11 A 15 14 197072 CASAVA_Build 12 118752794 1D GGTTCTCAAA C/- CCCACTTCCC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 C 4 3 197073 CASAVA_Build 12 118779952 1D TTTATGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1583 het 1583 ref 53 36 4 13 A 12 11 197074 CASAVA_Build 12 118805202 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1400 hom 19 5 9 5 A 13 14 197075 CASAVA_Build 12 118811543 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 T 7 8 197076 CASAVA_Build 12 118820955 1D CCTCCACCCA C/- CCCCACAACA 1474 het 1474 ref 15 9 6 0 C 5 4 197077 CASAVA_Build 12 118823205 4D CTGTTTTTTT GTTG/---- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 GTTG 1 0 197078 CASAVA_Build 12 118832853 1I GACTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1475 het 1475 ref 12 6 4 2 A 11 12 197079 CASAVA_Build 12 118869734 4D GGTTTGTTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 35 14 20 2 TTGT 3 2 197080 CASAVA_Build 12 118873505 1D ACAGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 36 0 22 15 A 14 13 197081 CASAVA_Build 12 118891720 1I GACTTCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 10 10 13 A 13 14 197082 CASAVA_Build 12 118904562 3I GTAAGTATTA ---/CTT CTTCTTCTTC 3070 het 1634 hom 29 9 10 10 CTT 5 6 197083 CASAVA_Build 12 118913231 13D TTCTGCCAGT TCTCTAGGCAGTC/------------- TTTCAGAGTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 6 TCTCTAGGCAGTC 1 0 197084 CASAVA_Build 12 118918794 4I TTAGTTCATT ----/CAGA CAGTCTCAGT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 CAGA 0 1 197085 CASAVA_Build 12 118933972 2I CCATAAAGTC --/AT CAACAGCATT 3070 het 3070 hom 30 7 19 4 AT 0 1 197086 CASAVA_Build 12 118940882 1I GAATTGTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 25 1 19 5 A 10 11 197087 CASAVA_Build 12 118942376 5D GCGAGCCTGA CACAT/----- TATCTTGTGC 3070 het 3070 ref 40 19 14 10 CACAT 1 0 197088 CASAVA_Build 12 118946869 4D ATTTAAATCC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TCTT 5 4 197089 CASAVA_Build 12 118950560 1D ATTGGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1212 hom 27 7 13 7 A 12 11 197090 CASAVA_Build 12 118968106 13I TAAAGTATTA -------------/TAATAATAATAAT TAATAATAAT 2429 het 1831 hom 10 4 5 1 TAATAATAATAAT 1 2 197091 CASAVA_Build 12 118983830 1I ATAAATGAAA -/G GCAGAAACCT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 G 1 2 197092 CASAVA_Build 12 118985720 1I CTCGTAGGAC -/T TGAAACAAGC 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 T 1 2 197093 CASAVA_Build 12 118994555 1D CAAATGAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 10 9 197094 CASAVA_Build 12 118996418 3D TTCTTGACCC CTT/--- CTTCCTTCCA 3070 het 2145 hom 22 6 11 5 CTT 2 1 197095 CASAVA_Build 12 118999674 1D ATCGGTGAGG C/- CCTCAGCCAG 2671 het 2671 ref 35 19 10 6 C 3 2 197096 CASAVA_Build 12 119004448 1I AAACTAGGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 T 9 10 197097 CASAVA_Build 12 119012775 1D CAGCATGGCT C/- CCCCACTGGA 3070 het 1524 hom 19 6 9 4 C 5 4 197098 CASAVA_Build 12 119013711 2D AGGAGGGACC GT/-- GTGTTGGCAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 GT 3 2 197099 CASAVA_Build 12 119022070 3I GGAGGAGGAG ---/GAC GGGGACCACA 2661 het 2661 ref 28 8 11 9 GAC 0 1 197100 CASAVA_Build 12 119041643 1D CAGCCTCATC A/- AGAGTTAAGA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 2 1 197101 CASAVA_Build 12 119044372 4D TATGCCTGGC TTTT/---- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 11 7 197102 CASAVA_Build 12 119054493 2D CAGTAATAAC TG/-- TATTTACATA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 TG 1 0 197103 CASAVA_Build 12 119096660 1I GAAGGCTTCG -/C CTTACCTAAG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 C 1 2 197104 CASAVA_Build 12 119156291 2D TAAGATAAAA AG/-- AGAGGCTTCA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 AG 3 2 197105 CASAVA_Build 12 119173044 3I CACTAAGTGC ---/CCA CCACCAAGGC 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 CCA 2 3 197106 CASAVA_Build 12 119196653 4D CTGATAAAAT TTAG/---- TTAGTTACAA 3070 het 3070 ref 56 30 22 5 TTAG 2 1 197107 CASAVA_Build 12 119215273 1D TCAACTGCAA G/- AAAATTCAGT 2861 het 2861 ref 30 16 9 5 G 1 0 197108 CASAVA_Build 12 119216039 2D GTGAGTACTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TA 6 5 197109 CASAVA_Build 12 119216496 1D TTCTTGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2793 hom 22 8 12 2 T 11 10 197110 CASAVA_Build 12 119235537 1I CTAAAACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 662 hom 33 2 17 14 T 15 16 197111 CASAVA_Build 12 119235840 1D CGGCCAAAAC T/- TTTTTTTTTG 2733 het 1920 hom 21 6 9 6 T 10 9 197112 CASAVA_Build 12 119240593 2I GGCCCAAGAG --/AT AGATTTTTAC 3070 hom 102 het 36 0 32 4 AT 0 1 197113 CASAVA_Build 12 119248370 1D TGGGTAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 14 0 10 4 T 15 14 197114 CASAVA_Build 12 119251329 1D GCCCGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 1908 het 183 hom 6 1 5 0 T 11 10 197115 CASAVA_Build 12 119251669 2I CTAATCTGCT --/TC TCTCTCTCTC 2650 het 2155 hom 29 8 9 12 TC 8 9 197116 CASAVA_Build 12 119256826 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1969 hom 19 6 10 4 A 11 10 197117 CASAVA_Build 12 119262276 1I CCAAAATAGC -/T TTTTTTTTTT 1943 hom 27 het 15 0 9 6 T 13 14 197118 CASAVA_Build 12 119265387 3D ACTACCTACT TTC/--- TTCTTCTTAT 2670 het 2670 ref 32 12 11 10 TTC 3 2 197119 CASAVA_Build 12 119268220 1I CCCTCACCCT -/C CCTTTTGCCC 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 C 2 3 197120 CASAVA_Build 12 119270297 4D CACCCTAAGG GCCT/---- CCCTGACCAC 3070 het 3070 hom 37 14 13 11 GCCT 1 0 197121 CASAVA_Build 12 119270363 3D TGTCTGCCAT CTC/--- CTCTTCAGAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 CTC 2 1 197122 CASAVA_Build 12 119274733 8D2M5D AAATGAGGAT AAGCATCCTTCCCCC/--------TT----- ATGAGATTAT 3070 hom 72 het 24 0 25 2 N/A 0 0 197123 CASAVA_Build 12 119283011 2D GAAAGACACC TT/-- TTTTTTTTTT 2841 het 269 hom 46 4 8 35 T 13 11 197124 CASAVA_Build 12 119323105 2I TAAAAAAAAA --/AC AACTCTACAA 3070 hom 110 het 43 0 34 9 AC 0 1 197125 CASAVA_Build 12 119334915 3D CCTGTGATCC CAG/--- CAGCACTTTG 3070 hom 36 het 20 0 13 7 CAG 2 1 197126 CASAVA_Build 12 119335352 1D ATCAAGGAAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 8 7 197127 CASAVA_Build 12 119347089 1I TCATGCCTCA -/C CCCCCCCGCC 2485 het 2485 ref 24 13 7 4 C 7 8 197128 CASAVA_Build 12 119355893 1D GATCTTGGCT C/- ACTGCAACCT 3070 het 1356 hom 20 3 9 8 C 1 0 197129 CASAVA_Build 12 119366648 3D AGAGGAAAAA AAG/--- AGGTCCTAAC 3070 het 3070 ref 37 21 16 4 AAG 1 0 197130 CASAVA_Build 12 119367219 2D ATATGACAGT AC/-- AAAAGTAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 8 AC 1 0 197131 CASAVA_Build 12 119375328 4D AAAGAAGCTC AAAG/---- AAAGAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 AAAG 2 1 197132 CASAVA_Build 12 119377026 2I TTAAATGAAT --/AC ACAGTCCTTG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 AC 1 2 197133 CASAVA_Build 12 119380125 4I ACATCTTTGC ----/CTCT CTATGACATG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 CT 1 3 197134 CASAVA_Build 12 119385317 3I AATGTCCAAC ---/TGG TGGTCTGGTT 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 TGG 1 2 197135 CASAVA_Build 12 119385579 2I TATAATGAGA --/CT CTGTCTCTAA 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 CT 1 2 197136 CASAVA_Build 12 119389385 1I GGTCAGAACA -/G ACTCTGAATA 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 G 0 1 197137 CASAVA_Build 12 119394364 1I TGCTTGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 10 11 197138 CASAVA_Build 12 119396629 1D AAAACAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2752 hom 31 11 10 11 A 15 14 197139 CASAVA_Build 12 119398305 2D GATTAATAAC AG/-- TACTAAGAAT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 AG 1 0 197140 CASAVA_Build 12 119424067 1I CTCGGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2816 het 1992 hom 16 6 8 2 A 14 15 197141 CASAVA_Build 12 119439235 1I CAACACTAAC -/T TTTTTTTTTT 2471 het 2471 ref 25 11 6 8 T 10 11 197142 CASAVA_Build 12 119452405 1D TAGTGATGAG A/- AAAAAAAAAG 1388 het 1388 ref 31 25 3 3 A 10 9 197143 CASAVA_Build 12 119455151 6D CTTTTTGTTC TCTGTT/------ TCTACTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 7 TCTGTT 1 0 197144 CASAVA_Build 12 119458449 1D TCTCCATAAG A/- AAAAAAAAAA 1151 het 1151 ref 41 33 3 5 A 12 11 197145 CASAVA_Build 12 119462317 1D ATTTATTATC T/- TTTTTTTTTT 2817 het 1465 hom 25 5 8 12 T 12 11 197146 CASAVA_Build 12 119463041 3D GTTTACTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 32 5 14 13 T 17 14 197147 CASAVA_Build 12 119465187 18D GGTGGTCAGG TTTGGAGAGAATGACATC/------------------ TCATTTATAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 10 TTTGGAGAGAATGACATC 1 0 197148 CASAVA_Build 12 119495772 1D GTCATTTATC A/- AAAAAAAAAA 951 het 951 ref 46 33 3 10 A 15 14 197149 CASAVA_Build 12 119500060 1D GTCTCATCCA T/- TGTATTATGG 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 T 2 1 197150 CASAVA_Build 12 119500199 3I CAGGCGCAAT ---/AAG AAGAGCGGAA 3070 hom 123 het 44 0 40 4 AAG 1 2 197151 CASAVA_Build 12 119500295 1I CACCCGCGCC -/G CCCCCCAACT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 G 0 1 197152 CASAVA_Build 12 119501858 1D TAGGGGGAAG T/- GTCTTGTTAG 3070 het 3070 hom 53 23 25 5 T 1 0 197153 CASAVA_Build 12 119504157 1I TCCGTTTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2909 hom 28 11 11 6 T 10 11 197154 CASAVA_Build 12 119505324 1I GACAATACTG -/T TTTTTTAGCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 6 7 197155 CASAVA_Build 12 119505844 7I ATTTCACTCC -------/TAACACT TCCCAGCCTT 3070 hom 84 het 35 0 25 10 TAACACT 0 1 197156 CASAVA_Build 12 119538497 1I GTTAATTTTA -/T CAAGTGTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 0 1 197157 CASAVA_Build 12 119542577 2D AAATGCATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 676 hom 36 4 16 16 T 14 12 197158 CASAVA_Build 12 119547855 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAAAAT 3070 het 96 hom 26 1 19 6 C 1 0 197159 CASAVA_Build 12 119549872 1D TTATTTACTT A/- AAAAAAATCG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 7 197160 CASAVA_Build 12 119565418 2I CTTGCCTCTC --/AG AGCTGCGGGC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AG 1 2 197161 CASAVA_Build 12 119573076 2D GGGGTGAAAC TG/-- TGTTTGGGAA 3070 hom 73 het 29 0 24 5 TG 2 1 197162 CASAVA_Build 12 119573367 3D AAAGGAACCA AAC/--- AACAATAATT 3070 hom 110 het 40 0 34 6 AAC 2 1 197163 CASAVA_Build 12 119578013 6D CAGTGCGTGC GTGCGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 84 het 35 0 24 14 GTGCGT 1 0 197164 CASAVA_Build 12 119578634 3I GAGCAAAATA ---/ATG ATGATGATGA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 ATG 3 4 197165 CASAVA_Build 12 119587884 17D CTAATCCGTT TTGCCATAAACCTAAAA/----------------- TTGCCCTTAA 164 het 164 ref 19 7 2 10 TTGCCATAAACCTAAAA 1 0 197166 CASAVA_Build 12 119651445 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 999 het 121 hom 13 1 4 8 T 17 16 197167 CASAVA_Build 12 119678051 1D TGGTGAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 11 10 197168 CASAVA_Build 12 119686060 2D ACAAAATGTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 9 9 A 11 9 197169 CASAVA_Build 12 119693738 3I TATACATAAT ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 hom 94 het 39 0 32 7 TTC 2 3 197170 CASAVA_Build 12 119694673 1D TTCTGTGGAT C/- CCTAGCACTT 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 C 3 2 197171 CASAVA_Build 12 119699762 16D CAGCACTTAC CCACCCTTTTACCATA/---------------- CCACCCTTTT 3070 het 3070 ref 36 25 9 13 CCACCCTTTTACCATA 2 1 197172 CASAVA_Build 12 119714535 1D CATTTCTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 9 8 197173 CASAVA_Build 12 119726079 1I CTCAAAAGTT -/A AATCAACATA 3070 het 3070 ref 58 27 24 7 A 2 3 197174 CASAVA_Build 12 119728384 1I TTATGGTCGA -/T TTTTTTTTTT 2337 het 2337 ref 36 11 12 13 T 16 17 197175 CASAVA_Build 12 119730136 1I CCTTATTAAA -/T TTATAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 2 3 197176 CASAVA_Build 12 119740525 4D TATTTTATAT ATTC/---- ATTATGAAGA 3070 het 3070 hom 46 20 22 7 ATTC 1 0 197177 CASAVA_Build 12 119741010 4D AAGTTAAAAT ATTA/---- TTTATACACA 3070 het 2799 hom 26 7 17 3 ATTA 1 0 197178 CASAVA_Build 12 119744178 1I AATAAACCAG -/A AAAAAAGAGA 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 A 6 7 197179 CASAVA_Build 12 119746062 1I CACAAAGACA -/T TTTTTTTTTT 2752 het 1961 hom 20 6 9 5 T 13 14 197180 CASAVA_Build 12 119749980 1I TCTCAAATAA -/T TTTTTTTTTT 2395 het 2395 ref 27 12 6 9 T 13 14 197181 CASAVA_Build 12 119758749 1D ACTGAGCCCC T/- GCCCAAATGC 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 T 1 0 197182 CASAVA_Build 12 119759175 1D GCTCTCTGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 10 9 197183 CASAVA_Build 12 119767911 1I GCCAGGTACT -/G GTTTTGCTCC 3070 het 3070 ref 39 15 12 12 G 1 2 197184 CASAVA_Build 12 119773628 1D ATCTCAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 T 11 10 197185 CASAVA_Build 12 119774292 2I TGATACCCAC --/AT GAGTTTGAAC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AT 0 1 197186 CASAVA_Build 12 119780206 1D ATGAACAACA G/- GAAAGCACTG 3070 het 3070 hom 24 12 12 1 G 2 1 197187 CASAVA_Build 12 119785539 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 81 hom 18 1 15 4 A 13 12 197188 CASAVA_Build 12 119788355 5D AAATGCAACA TAAAG/----- TAATGTGCTT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 TAAAG 1 0 197189 CASAVA_Build 12 119789845 2D GTCTTAAAAA TG/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 TG 1 0 197190 CASAVA_Build 12 119789941 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 9 8 197191 CASAVA_Build 12 119790655 4I CTTTTTTCTT ----/TTTC TTTTTTTGTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTTC 0 1 197192 CASAVA_Build 12 119797919 1D TCCAAGAAGG A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 A 7 6 197193 CASAVA_Build 12 119800213 1I CTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 9 10 197194 CASAVA_Build 12 119803135 2I GTCAATAAAC --/AT GTGAACAGAT 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 AT 0 1 197195 CASAVA_Build 12 119803987 1I AGCCAATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 11 12 197196 CASAVA_Build 12 119806995 4I TTTTTTTGGG ----/GGTT TTTTTTTTTT 3070 het 1837 hom 29 11 14 4 GGTT 0 1 197197 CASAVA_Build 12 119809167 1I GATATAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1603 hom 19 4 9 6 T 13 14 197198 CASAVA_Build 12 119811987 1D TGATTGTTAT G/- AAGGTAGGTC 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 G 1 0 197199 CASAVA_Build 12 119817932 1D TTATCTCACT A/- AATCCTCACA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 3 2 197200 CASAVA_Build 12 119825459 1I CGTGGACTCT -/C ACCCCCGCAG 3070 hom 65 het 23 0 19 4 C 0 1 197201 CASAVA_Build 12 119848111 8I CACAAGTCCC --------/GATTTTCA GATTTTCATG 3070 het 3070 hom 34 17 14 4 GATTTTCA 1 2 197202 CASAVA_Build 12 119862229 2D CGTGAAACAC TG/-- TACATATTCC 3070 het 3070 hom 45 15 25 6 TG 1 0 197203 CASAVA_Build 12 119873486 1D CCTAGACGAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 9 8 197204 CASAVA_Build 12 119880881 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1838 het 735 hom 25 4 9 12 T 14 15 197205 CASAVA_Build 12 119889710 4D GGCAGCAAAG CAGA/---- CAGAGGCGCT 2275 het 2275 ref 21 13 7 2 CAGA 2 1 197206 CASAVA_Build 12 119898381 1I AATAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 A 10 11 197207 CASAVA_Build 12 119898848 1D GGTGGCTCAT G/- CCTGTAATCC 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 G 1 0 197208 CASAVA_Build 12 119899111 1D CCCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2246 het 82 hom 16 2 9 5 A 15 14 197209 CASAVA_Build 12 119901920 4I CCGCTGGCGG ----/ACTC ACTCCCCGTC 2204 het 2204 ref 28 11 9 8 ACTC 1 2 197210 CASAVA_Build 12 119903375 1I ATTGAAGGCC -/T TGGGCCATTG 3070 het 2294 hom 32 9 15 8 T 1 2 197211 CASAVA_Build 12 119923093 2I GCTCCCTTTG --/TT AAGAACCGAG 3070 hom 80 het 32 0 25 7 T 0 2 197212 CASAVA_Build 12 119928825 2D TTTTAAAGAC AT/-- AGTAAAACAA 3070 het 1945 hom 18 5 11 2 AT 1 0 197213 CASAVA_Build 12 119930214 3D CCTATAATGG GAA/--- GAAGAAGGAT 3070 hom 75 het 31 0 26 7 GAA 3 2 197214 CASAVA_Build 12 119936817 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 488 het 266 hom 12 3 6 3 A 12 13 197215 CASAVA_Build 12 119942490 1D CAGTGAATTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 T 7 6 197216 CASAVA_Build 12 119945683 1D TCCATGTTGG C/- CGGGCTGGTC 1719 het 1719 ref 13 5 6 2 C 2 1 197217 CASAVA_Build 12 119949492 1D CAAAGCACTG A/- AATGGTCTTC 3070 het 3070 ref 50 25 15 11 A 3 2 197218 CASAVA_Build 12 119954384 2I GTCTCAAAAA --/AT ATATATATAT 1027 het 1027 ref 11 5 3 3 AT 7 8 197219 CASAVA_Build 12 119957720 10I AAACAAAACA ----------/AAACAAAACC AAACAACAAA 3070 hom 63 het 28 0 18 10 AAACAAAACC 0 1 197220 CASAVA_Build 12 119975847 2I GCAACCTCCA --/CT CTCTCCCACT 3070 hom 105 het 37 0 33 4 CT 2 3 197221 CASAVA_Build 12 119978069 1I7M1I CAGGCGCGAG -CACCGCG-/CCACCGCGC CCAGCCATCA 3070 hom 78 het 27 0 26 6 N/A 0 0 197222 CASAVA_Build 12 119979186 2I CCATCTCTAC --/TA AAACACAAAA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 TA 0 1 197223 CASAVA_Build 12 119983516 1I AGCCGGGCAT -/G GTGGCATGTG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 G 1 2 197224 CASAVA_Build 12 120001161 5D AAATCCCCAT AAAGA/----- AAAGAAAAGC 3070 hom 57 het 21 0 20 4 AAAGA 2 1 197225 CASAVA_Build 12 120018943 1D GTGACTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 20 1 16 4 T 13 12 197226 CASAVA_Build 12 120020298 3D TAGCAAAGGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 33 2 22 11 A 16 13 197227 CASAVA_Build 12 120020687 4I TTGGGCGACA ----/GAGC GAGACTCCAT 3070 hom 96 het 35 0 30 5 GAGC 0 1 197228 CASAVA_Build 12 120022134 1D TCTTTGACTA C/- CTATCCTGCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 2 1 197229 CASAVA_Build 12 120027800 1D15M4D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAATAAAAAG/-AAAAAAAAAAAATAA---- AAAGAAAGAA 3070 hom 76 het 25 0 24 5 N/A 0 0 197230 CASAVA_Build 12 120033891 3D GGTCGGTACA ATT/--- ATTATTATCA 3070 hom 120 het 47 0 41 7 ATT 3 2 197231 CASAVA_Build 12 120034705 2D ATAAAAAAAT AA/-- AAATAAATAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 5 3 197232 CASAVA_Build 12 120046193 1D TCAGACAAAA G/- CACCCTAAAT 3070 hom 141 het 48 0 48 1 G 1 0 197233 CASAVA_Build 12 120046644 13I GAAGCTTCCT -------------/GCCCCGTGTTGTG GCCTGGCAGG 3070 hom 90 het 37 0 28 9 GCCCCGTGTTGTG 0 1 197234 CASAVA_Build 12 120085760 4I AGATAGATAA ----/ATAG ATAGATAATA 3070 het 36 hom 24 1 15 8 ATAG 1 2 197235 CASAVA_Build 12 120086213 8D CATTTCTTTG TCACAGAA/-------- GGAATCACCC 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 TCACAGAA 1 0 197236 CASAVA_Build 12 120088209 4D TCAATCGAGA TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 37 11 19 10 TGTT 4 3 197237 CASAVA_Build 12 120094289 22D CCTCGTGATC TGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAG/---------------------- TGCTGGGATT 2802 het 2483 hom 12 8 7 0 TGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAG 1 0 197238 CASAVA_Build 12 120095139 1D AAAAAGAATC A/- TCAAAGTGTG 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 1 0 197239 CASAVA_Build 12 120097985 1I GCTTAAGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 9 10 197240 CASAVA_Build 12 120134561 17D GCCAGGAGCT CAAGACCAGCCTGGACA/----------------- CAAGACCAGC 2058 het 2058 ref 14 8 6 5 CAAGACCAGCCTGGACA 2 1 197241 CASAVA_Build 12 120137629 11D CTGTAGATGG TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 14 13 T 22 11 197242 CASAVA_Build 12 120138223 2I TGGAAGGAGA --/AT AATTATCTTG 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 AT 0 1 197243 CASAVA_Build 12 120142486 1I AGTTTGCAGA -/C CCCCCCCCTT 2229 het 1882 hom 25 9 7 9 C 8 9 197244 CASAVA_Build 12 120144585 3D TTTTTTCTTG TTT/--- TTTTTTTTGT 245 het 245 ref 20 4 2 14 T 11 8 197245 CASAVA_Build 12 120144908 3D TCTTGTCCCA TTC/--- TTTAGCTTGG 3070 het 3070 hom 32 9 20 6 TTC 1 0 197246 CASAVA_Build 12 120149295 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1127 het 1127 ref 25 8 8 9 A 14 15 197247 CASAVA_Build 12 120165559 1D CTCCTAACAC T/- TTGTACACAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 3 2 197248 CASAVA_Build 12 120174296 1D TCCTTGCCCT A/- AATTTATCAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 A 3 2 197249 CASAVA_Build 12 120174689 12I CTCCTAACCT ------------/CTGGTGATCCGC CTGCCTCAGC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 CTGGTGATCCGC 0 1 197250 CASAVA_Build 12 120179208 1I TTAGGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 867 hom 35 2 28 5 A 11 12 197251 CASAVA_Build 12 120179436 1I TTAAAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 1866 het 1866 ref 27 10 8 9 T 15 16 197252 CASAVA_Build 12 120187552 1I GGAAAGTGGT -/G AGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 64 31 27 6 G 0 1 197253 CASAVA_Build 12 120193684 1I GTAAAACCCA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 T 6 7 197254 CASAVA_Build 12 120215612 3D GCTGGGGCGG GAA/--- GAAGATCACA 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 GAA 2 1 197255 CASAVA_Build 12 120232439 4I TAAAAAAAAA ----/AGAG AGAGAGAATT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 AG 3 5 197256 CASAVA_Build 12 120254764 1I CTATAACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1998 hom 49 6 38 5 T 11 12 197257 CASAVA_Build 12 120262920 1I TGTGTGTGTG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 8 9 197258 CASAVA_Build 12 120279694 2I GGAAAGAAAG --/AA AGAGAGAAGA 3070 hom 59 het 23 0 18 5 A 1 3 197259 CASAVA_Build 12 120282436 1I ACAAAACAAC -/A AACAAAAAAA 3070 het 163 hom 32 1 28 3 A 2 3 197260 CASAVA_Build 12 120286390 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 52 het 20 0 18 3 A 7 8 197261 CASAVA_Build 12 120346897 3D ACCTTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 10 11 A 15 12 197262 CASAVA_Build 12 120382019 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1172 het 1172 ref 13 8 3 2 A 15 14 197263 CASAVA_Build 12 120398303 2D CAACATGGTG AA/-- ACCCTGTCTC 1313 hom 7 het 4 0 3 1 A 3 1 197264 CASAVA_Build 12 120405903 2D AACAACAACA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 94 het 39 0 27 12 AC 10 9 197265 CASAVA_Build 12 120539926 1I GAACCCGGGA -/G GCCGAGGTTG 3070 het 38 hom 10 1 8 1 G 1 2 197266 CASAVA_Build 12 120546038 1D AGGCGGGCCA T/- GGCGCGGTGC 2156 hom 32 het 15 0 9 6 T 1 0 197267 CASAVA_Build 12 120645436 4D GCGCCTGGCT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 44 het 17 0 14 3 TTTG 5 4 197268 CASAVA_Build 12 120652772 1D CTTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 A 11 10 197269 CASAVA_Build 12 120679430 1D CCTGGGCGGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 49 het 21 0 15 6 G 12 11 197270 CASAVA_Build 12 120691452 2D AAAAAAAGGC AA/-- AAAAAAAAAC 2141 het 9 hom 17 1 12 5 A 11 9 197271 CASAVA_Build 12 120698546 6D GAGACCCACC GCGTCT/------ GCCTCGTGCT 2626 het 725 hom 17 4 9 5 GCGTCT 1 0 197272 CASAVA_Build 12 120699091 1D TTTTAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 13 12 197273 CASAVA_Build 12 120702240 2I GTTCCCCCAG --/GT GTGTCTCCCA 3070 hom 47 het 20 0 14 6 GT 2 3 197274 CASAVA_Build 12 120711536 1I TCCCCACCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 92 het 34 0 28 6 A 9 10 197275 CASAVA_Build 12 120717070 1D GGCAGAGGGA C/- CCCCCCCTGG 3070 hom 39 het 19 0 12 7 C 8 7 197276 CASAVA_Build 12 120735612 3D AAAAATAAAT AAC/--- AACACACTTC 3070 hom 89 het 32 0 28 4 AAC 2 1 197277 CASAVA_Build 12 120737688 1I GTGCAGACTG -/C CCCCCCCCGC 3070 het 225 hom 23 1 14 8 C 8 9 197278 CASAVA_Build 12 120748557 1I AAGAAGCACG -/T TAATTCCAGG 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 1 2 197279 CASAVA_Build 12 120759172 8D TTTATGAGAT GGAGTTTC/-------- GCTCTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 GGAGTTTC 1 0 197280 CASAVA_Build 12 120771516 1D AGAGAGACTC T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 8 7 197281 CASAVA_Build 12 120780344 1D GTTTCACACA G/- GGAAATAGAC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 G 3 2 197282 CASAVA_Build 12 120788671 1I TGTTACGTTT -/A AAAAAAAAAA 2373 het 2373 ref 21 10 6 5 A 11 12 197283 CASAVA_Build 12 120793658 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2448 hom 25 7 13 5 A 12 11 197284 CASAVA_Build 12 120796105 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2767 hom 32 het 13 0 9 4 A 12 11 197285 CASAVA_Build 12 120798601 6D GTGTCTAAAA AATAAT/------ AATAATAAAA 3070 het 1821 hom 20 6 12 2 AAT 4 2 197286 CASAVA_Build 12 120799384 2D CTCCATCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 1587 het 715 hom 27 7 11 10 A 18 16 197287 CASAVA_Build 12 120806461 1D TTTTCCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2344 het 351 hom 19 4 6 9 T 17 16 197288 CASAVA_Build 12 120806765 1D CGCTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 1371 het 1371 ref 33 21 4 9 T 11 10 197289 CASAVA_Build 12 120806895 2D TGCACCTGTA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 37 15 16 8 TC 8 7 197290 CASAVA_Build 12 120837614 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 17 6 A 15 14 197291 CASAVA_Build 12 120839530 1D CCTGCCTTGG C/- CTCCTAAAGT 3070 het 442 hom 32 4 13 15 C 2 1 197292 CASAVA_Build 12 120841414 1I19M1I TCATTATTTA -TTTATTATTATTATTATTA-/TTTTATTATTATTATTATTAT TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 N/A 0 0 197293 CASAVA_Build 12 120844973 1I TTTGGAGACC -/A ACGAGTGCCA 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 A 1 2 197294 CASAVA_Build 12 120845059 5D GTTTGTCCTG TTCTT/----- TTCTTTTCTC 3070 het 1824 hom 36 12 19 5 TTCTT 2 1 197295 CASAVA_Build 12 120846313 1D CCCCCAGTGC T/- TTTGAGAGTG 3070 hom 78 het 29 0 27 5 T 4 3 197296 CASAVA_Build 12 120847972 3I AATGTCTCTA ---/AGG AGAAGGTGTA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AGG 0 1 197297 CASAVA_Build 12 120851698 4D ATCCCTCCTC TTTT/---- TCACAGTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 13 1 T 5 1 197298 CASAVA_Build 12 120852291 1I ATTGTCTCCA -/T AGTTTCACCT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 0 1 197299 CASAVA_Build 12 120852766 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTTCCCTC 2379 het 2379 ref 24 14 6 4 CT 2 1 197300 CASAVA_Build 12 120858840 1D CTAGGCAGTT G/- GGGGATACTG 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 G 5 4 197301 CASAVA_Build 12 120861275 1D GAATTCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 13 12 197302 CASAVA_Build 12 120884989 1D TGCAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 33 2 11 20 A 13 12 197303 CASAVA_Build 12 120894255 2I GCTCTCATTC --/TT TCTCTTGCCA 1178 het 1178 ref 49 41 3 5 T 1 3 197304 CASAVA_Build 12 120903598 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 2960 hom 24 9 11 4 A 6 7 197305 CASAVA_Build 12 120904202 1D AATAGTAGTA C/- CTACCTCCAG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 C 2 1 197306 CASAVA_Build 12 120917257 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2292 hom 18 8 8 2 A 10 9 197307 CASAVA_Build 12 120928304 3D CACACACCAC CAT/--- GCCTGGCTAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 CAT 1 0 197308 CASAVA_Build 12 120935635 13D GGGACAGAGA GTGACTGTTTAAT/------------- GTGACTGTTT 3070 het 3070 ref 41 24 12 12 GTGACTGTTTAAT 2 1 197309 CASAVA_Build 12 120941306 1D AAGCTGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 30 1 11 18 T 11 10 197310 CASAVA_Build 12 120941638 1D GGCTGGTCTC A/- AACTCCTGGC 2958 het 2958 ref 19 9 9 2 A 3 2 197311 CASAVA_Build 12 120941901 1I CTCCTGCTCT -/C CCCTCCCCCT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 C 3 4 197312 CASAVA_Build 12 120950101 4I ACTCCAGCCT ----/GGGC GGGCCACAGA 1500 het 1125 hom 8 3 5 0 GGGC 1 2 197313 CASAVA_Build 12 120958930 1D TCCCCAGTGT C/- CCCCGCAGGT 3044 het 3044 ref 36 22 8 6 C 5 4 197314 CASAVA_Build 12 120974484 1I CCTCTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1647 hom 19 7 9 3 A 12 13 197315 CASAVA_Build 12 120984938 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 25 1 19 5 A 12 11 197316 CASAVA_Build 12 120989456 2I TTGTGACTTT --/GG GGTTAGCGAA 2285 hom 35 het 14 0 8 6 G 2 4 197317 CASAVA_Build 12 121156831 2D TTCTCTCCCT TC/-- TCTTTCCCTG 3070 hom 122 het 44 0 40 4 TC 2 1 197318 CASAVA_Build 12 121163556 1D AAGCATAAAA G/- AAAGGACTTC 3070 hom 111 het 38 0 38 0 G 1 0 197319 CASAVA_Build 12 121166867 1D TCAGAATAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 10 9 197320 CASAVA_Build 12 121168857 1D AGATTGTTTA T/- TTTCTGCAAC 3070 hom 96 het 36 0 30 6 T 4 3 197321 CASAVA_Build 12 121170760 1D TCCCCCTCCC T/- CCCTTCTTCT 3070 hom 58 het 27 0 20 7 T 1 0 197322 CASAVA_Build 12 121172648 3D TGCAGTTGGC CTT/--- CTCTGTTCTG 3070 hom 105 het 37 0 33 7 CTT 1 0 197323 CASAVA_Build 12 121175832 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 29 0 16 14 A 15 14 197324 CASAVA_Build 12 121180164 1I GGACCCCCAC -/T TTGACATGAG 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 2 3 197325 CASAVA_Build 12 121183269 1D ACAGGTGCTT G/- GGGCTACAGA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 G 4 3 197326 CASAVA_Build 12 121184706 1I TTTTGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 25 1 15 9 T 13 14 197327 CASAVA_Build 12 121184946 1I GGCTCACTGC -/A AACCTCCGCC 3070 hom 27 het 11 0 9 2 A 2 3 197328 CASAVA_Build 12 121185482 1D CCTCTCTATC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 8 7 197329 CASAVA_Build 12 121188161 1D GATCTGTGTC T/- TGTCTGGAAC 3070 hom 88 het 35 0 26 9 T 2 1 197330 CASAVA_Build 12 121197143 2D TGTGTGTGCA CG/-- CGCGCGTGTG 3070 hom 42 het 27 0 22 6 CG 4 3 197331 CASAVA_Build 12 121205857 3I TGCCCGTTTA ---/ATT ATTATTTTTT 3070 het 1073 hom 14 4 8 2 ATT 2 3 197332 CASAVA_Build 12 121207226 4D TCCATCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 2450 het 2450 ref 25 10 7 9 AAAC 5 4 197333 CASAVA_Build 12 121211119 1D TGCCCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2082 hom 31 6 10 15 T 15 14 197334 CASAVA_Build 12 121247828 1D CCCTGGCCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2538 hom 21 9 10 2 T 10 9 197335 CASAVA_Build 12 121252706 1D CTTAAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 1748 het 1748 ref 32 21 5 6 T 13 12 197336 CASAVA_Build 12 121259395 2D TTAACTACAC AT/-- CTTCCATTTC 3061 het 3061 ref 26 16 8 2 AT 1 0 197337 CASAVA_Build 12 121264582 8D GAGACTGTCT CAAAAAAA/-------- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 36 18 13 7 CAAAAAAA 1 0 197338 CASAVA_Build 12 121269278 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAATAC 1032 het 1032 ref 12 7 3 2 A 7 8 197339 CASAVA_Build 12 121283729 1D GGCATGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1117 hom 30 7 13 10 T 15 14 197340 CASAVA_Build 12 121320751 1D AAGACATACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 10 9 197341 CASAVA_Build 12 121326438 2I ATGCCAAGAG --/CC CTGGGGCAGT 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 C 1 3 197342 CASAVA_Build 12 121328286 2I ACATAGCTAT --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 7 20 9 A 8 10 197343 CASAVA_Build 12 121329744 1I TAGTTAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 11 12 197344 CASAVA_Build 12 121332267 21D TAGTAGTTGA TTCTGTTAAAAAAAAAATGAT/--------------------- TTCCAGAGCT 3070 het 3070 hom 28 15 15 2 TTCTGTTAAAAAAAAAATGAT 1 0 197345 CASAVA_Build 12 121366147 6I TTCCTTTTCT ------/TTTTTC TTTTTTTTTT 1268 het 45 hom 14 1 9 4 TTTTTC 0 1 197346 CASAVA_Build 12 121367553 2D ATTTAGTCTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 AT 6 5 197347 CASAVA_Build 12 121376168 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 6 7 197348 CASAVA_Build 12 121387963 5I AAAAAAAAAG -----/AAAGA AAAGAAAAGA 1752 het 1752 ref 30 12 7 11 AAAGA 2 3 197349 CASAVA_Build 12 121392263 28D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------------- TTTTTTTTTT 2764 het 1423 hom 25 4 7 14 T 38 10 197350 CASAVA_Build 12 121393639 1D TTTACTAAAC T/- TTTTTTTTTT 1518 het 1518 ref 29 13 4 12 T 19 18 197351 CASAVA_Build 12 121394942 1I TAAATAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 9 15 10 A 9 10 197352 CASAVA_Build 12 121395494 1I CTAGAGCAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 8 9 197353 CASAVA_Build 12 121395824 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 T 11 12 197354 CASAVA_Build 12 121402318 2D TTAAAAACTA AT/-- ATGAATAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 AT 2 1 197355 CASAVA_Build 12 121416178 1I TGGGCTATTT -/A AAAAAAAAAA 2378 het 410 hom 12 2 9 1 A 15 16 197356 CASAVA_Build 12 121437971 1D CTACTGTCAC T/- TAAGAGTGTG 2904 het 2677 hom 15 6 7 2 T 2 1 197357 CASAVA_Build 12 121447823 1D GAAGAGTTCA G/- GCGTGTGGCT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 G 2 1 197358 CASAVA_Build 12 121457430 1D CTCCATCTGC A/- AAAAAAAAAA 1373 het 1373 ref 33 18 3 13 A 15 14 197359 CASAVA_Build 12 121458180 2D CCTGGATGAG TT/-- TTTTTTTTTT 2787 het 981 hom 15 5 7 3 T 12 10 197360 CASAVA_Build 12 121478378 3D AAAAGAACAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 AAG 5 4 197361 CASAVA_Build 12 121483403 1I CTCAGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 304 hom 25 1 17 7 A 10 11 197362 CASAVA_Build 12 121500683 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1119 het 531 hom 12 2 3 7 T 14 13 197363 CASAVA_Build 12 121505441 1I CTCCTAATAC -/A GAGCGCCTAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 0 1 197364 CASAVA_Build 12 121531970 1I TTCTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 A 11 12 197365 CASAVA_Build 12 121541201 1D ACTGACTCTG T/- AATACTCAGG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 1 0 197366 CASAVA_Build 12 121546676 1I CAAAAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 64 het 27 0 22 5 A 9 10 197367 CASAVA_Build 12 121548491 6I ATCTTGTCTC ------/AAACAA AAACAAAAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AAACAA 2 3 197368 CASAVA_Build 12 121557126 6D CTCTCTCTCT CTCTCC/------ AAGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 46 20 21 8 CTCTCC 1 0 197369 CASAVA_Build 12 121561422 1D GTGATGTGGG A/- CCTGCAGTCC 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 A 1 0 197370 CASAVA_Build 12 121562318 1I CAAAAATGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 9 10 197371 CASAVA_Build 12 121565082 1D GCAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 907 het 751 hom 9 4 2 3 A 17 16 197372 CASAVA_Build 12 121565312 1D TTTAAGACTC A/- AAAAAAAAAA 2884 het 2884 ref 27 13 6 9 A 11 10 197373 CASAVA_Build 12 121569889 6D TTACATAATG TTAAGT/------ TTAAGTAAGT 3070 het 3070 hom 52 23 24 8 TTAAGT 2 1 197374 CASAVA_Build 12 121609692 1D ACTAAAATAC A/- AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 6 5 197375 CASAVA_Build 12 121610074 9D CTTTTTAAAA AAAAATATT/--------- TTATTTTTGA 2954 het 2954 ref 18 11 8 0 AAAAATATT 1 0 197376 CASAVA_Build 12 121613509 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1866 het 1866 ref 19 9 7 3 A 13 14 197377 CASAVA_Build 12 121615753 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 1408 het 1408 ref 20 6 8 6 A 13 14 197378 CASAVA_Build 12 121627306 1I ATTATTTAAA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 46 20 13 13 T 7 8 197379 CASAVA_Build 12 121635544 1D ATTATGCACC T/- TTTTTTTTTT 1568 het 1568 ref 32 17 4 12 T 12 11 197380 CASAVA_Build 12 121649314 1D ACATTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2431 hom 26 10 12 4 T 12 11 197381 CASAVA_Build 12 121679675 1D ACTCAGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1257 hom 29 8 12 9 T 17 16 197382 CASAVA_Build 12 121685251 3D TGTAAAAAAC AAA/--- AAAAGATGAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 A 7 4 197383 CASAVA_Build 12 121697025 1D AATTAACAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 9 8 197384 CASAVA_Build 12 121697567 1D TCTGTCTCCC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 T 8 7 197385 CASAVA_Build 12 121698266 16I CTCTGTCTTT ----------------/TCCAGCTTCTGGTGGC TCCAGGCATC 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TCCAGCTTCTGGTGGC 0 1 197386 CASAVA_Build 12 121701318 1D TCCTTTCTTT G/- GCAGCTGAGT 2991 het 2991 ref 30 15 8 7 G 2 1 197387 CASAVA_Build 12 121724995 1I TAAACTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 11 12 197388 CASAVA_Build 12 121725213 2I CCTCCCACCC --/TT TTCTTTTTTT 1812 het 1812 ref 20 8 10 2 T 2 4 197389 CASAVA_Build 12 121739620 4I ATAAATAAAT ----/AAAC AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 20 8 9 3 AAAC 0 1 197390 CASAVA_Build 12 121740327 1D TCTCAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 A 12 11 197391 CASAVA_Build 12 121747702 1D GAGTGCAGGG T/- TCTGCAAAAT 2756 het 2756 ref 28 20 6 2 T 2 1 197392 CASAVA_Build 12 121749659 1D AATACAGACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 10 9 197393 CASAVA_Build 12 121785280 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1608 het 961 hom 16 4 6 6 A 14 15 197394 CASAVA_Build 12 121794234 2I ACAAAATGCT --/GA GATTACAGGC 3070 hom 54 het 23 0 18 5 GA 1 2 197395 CASAVA_Build 12 121820357 2D CCCGGTAGAC TT/-- TTTGTGGGGA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 5 3 197396 CASAVA_Build 12 121826515 2I GGTGGAACTC --/TA TATTAAAGTA 3070 het 3070 ref 49 30 17 2 TA 1 2 197397 CASAVA_Build 12 121827307 1I TTTTGTTTGG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 9 197398 CASAVA_Build 12 121836815 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 7 8 197399 CASAVA_Build 12 121844040 1I AATTAATGGG -/A AAAAAATTGA 3070 hom 50 het 21 0 17 4 A 6 7 197400 CASAVA_Build 12 121851275 4D CATTATGGAA AGAG/---- AGAGTTGTAT 3070 hom 69 het 25 0 23 3 AG 4 2 197401 CASAVA_Build 12 121863148 22I GGAGGCTGAG ----------------------/GCAGGAGAATGGCGTGAACCCT GTGGGTGGAG 2743 het 283 hom 9 2 6 1 GCAGGAGAATGGCGTGAACCCT 0 1 197402 CASAVA_Build 12 121863536 2I CACCTCTACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 12 197403 CASAVA_Build 12 121864933 7I AGCATTTTAG -------/AGTGAAT CTCAGCATCA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AGTGAAT 0 1 197404 CASAVA_Build 12 121874929 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAACCAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 6 7 197405 CASAVA_Build 12 121876494 9D ACTCCGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 1520 hom 21 6 12 8 A 20 11 197406 CASAVA_Build 12 121877256 1I AGAGAAAGAA -/C CCCTGCATAG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 3 4 197407 CASAVA_Build 12 121897673 1D CAGACCTGTT C/- CCTGCATGAG 3070 hom 51 het 18 0 16 2 C 3 2 197408 CASAVA_Build 12 121906407 1I GCTGGAGGTG -/C CGGGGTGGGG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 C 1 2 197409 CASAVA_Build 12 121908582 5D CTAACCTGTC CTCTT/----- CACCCCCATT 3070 hom 60 het 24 0 18 7 CTCTT 1 0 197410 CASAVA_Build 12 121909526 2I CCTGTCGGTG --/GC GGGGGGGCTC 1888 hom 27 het 11 0 6 5 GC 0 1 197411 CASAVA_Build 12 121911710 1I CCCATGGCTG -/C CCCCGTGACC 3070 hom 45 het 19 0 12 7 C 4 5 197412 CASAVA_Build 12 121912944 4D TTCACTCCTG GAGT/---- GAGTTTCCAT 3070 hom 43 het 16 0 15 1 GAGT 2 1 197413 CASAVA_Build 12 121916108 4D GCTTCATTTC CTTT/---- AAGAAAACAG 3070 hom 83 het 32 0 24 8 CTTT 1 0 197414 CASAVA_Build 12 121942506 3I AAAGCACAGT ---/GAA GAAGTAATTC 3070 hom 137 het 52 0 45 7 GAA 1 2 197415 CASAVA_Build 12 121943973 7I TTTGGTCAAC -------/AGTGGAT AGTTCATAAA 3070 hom 132 het 47 0 43 4 AGTGGAT 0 1 197416 CASAVA_Build 12 122020746 8D TGCCCGGCTA ATTTATTT/-------- ATTTATTTAT 2647 het 2647 ref 20 11 6 4 ATTT 5 3 197417 CASAVA_Build 12 122080142 2D TTGTGGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 73 27 25 23 TG 9 8 197418 CASAVA_Build 12 122103285 1I TTTATTTAAG -/T TTTTTTTTTT 1781 het 1781 ref 24 6 7 11 T 17 18 197419 CASAVA_Build 12 122122340 1D GCCAGGACTC A/- AAACCCGAGC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 4 3 197420 CASAVA_Build 12 122156911 1D TAATTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 1846 het 1846 ref 30 23 4 3 A 11 10 197421 CASAVA_Build 12 122164212 1I ACCCAACAAA -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 C 7 8 197422 CASAVA_Build 12 122182422 1I GGCAGGAAGG -/A AAAGAGAAGC 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 A 3 4 197423 CASAVA_Build 12 122185885 1D TAACATATGA C/- CCCCCCCCTT 3070 het 3070 hom 35 17 12 6 C 9 8 197424 CASAVA_Build 12 122205715 5D AAAAATAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 2105 het 459 hom 8 1 6 2 AAATA 3 2 197425 CASAVA_Build 12 122207884 1D TACTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 11 10 197426 CASAVA_Build 12 122214093 1I AGTATATTTG -/C AGACTAGCTT 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 C 0 1 197427 CASAVA_Build 12 122219210 3D CCCTTTCCAC CCT/--- CCTCAAACCT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 CCT 2 1 197428 CASAVA_Build 12 122226322 1D TCTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1593 het 26 hom 18 1 8 9 A 19 18 197429 CASAVA_Build 12 122228361 1I ATTTCAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1774 hom 28 8 19 1 C 0 1 197430 CASAVA_Build 12 122238913 1I GAGACTATTA -/T TAACAGGCTA 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 T 1 2 197431 CASAVA_Build 12 122250736 1D ATCTTGGGGG A/- AATCATTTCT 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 A 3 2 197432 CASAVA_Build 12 122251732 5I AAAGTTAAAC -----/TGTTT TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 TGTTT 3 4 197433 CASAVA_Build 12 122256803 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 10 11 197434 CASAVA_Build 12 122265154 3D AGGCAAGTTG TTT/--- TTTAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 T 6 3 197435 CASAVA_Build 12 122269376 3I18M4D GTTGCTTTCA ---GTTGTTGTGTGTGTGGTTTTTG/GTTGTTGTTGTGTGTGTGGTT---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 37 23 17 3 N/A 0 0 197436 CASAVA_Build 12 122273481 2D23M1D TGTGTGTGTG TATATGTACGTATGTATATGTATATA/--TATGTACGTATGTATATGTATAT- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 33 17 15 10 N/A 0 0 197437 CASAVA_Build 12 122298723 4D TCATATGTGA TACT/---- TAGTTTTGCT 3070 het 3070 ref 22 10 11 2 TACT 1 0 197438 CASAVA_Build 12 122303129 1D AAAATAGACT A/- CTCAGCCCTG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 1 0 197439 CASAVA_Build 12 122308646 1D GGCGGATCAT G/- GAAGTCAGGA 2989 het 1084 hom 15 3 8 4 G 2 1 197440 CASAVA_Build 12 122308872 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AGAGAAAATA 3070 het 1315 hom 41 13 19 10 AAAAG 1 0 197441 CASAVA_Build 12 122310312 3D TTTTTAAAAA CTG/--- CTGCTGCTAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CTG 3 2 197442 CASAVA_Build 12 122326414 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAGAA 2030 hom 14 het 7 0 5 2 A 7 8 197443 CASAVA_Build 12 122329262 1D TACTCCAGAA T/- TTTTTTTTTT 2390 het 264 hom 23 1 9 13 T 18 17 197444 CASAVA_Build 12 122342522 1I CAATGAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 17 18 16 T 15 16 197445 CASAVA_Build 12 122344758 1D CAAGAGGATG A/- ACGCCCTAAG 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 2 1 197446 CASAVA_Build 12 122355512 5D ATCATTTTGC TTCTT/----- TTATTTCCTG 3070 het 3070 ref 43 22 14 9 TTCTT 1 0 197447 CASAVA_Build 12 122359585 3D AAGAAAAAAA AAG/--- AAGAAAATGT 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 AAG 2 1 197448 CASAVA_Build 12 122376277 7D TTTGTCAAAA ATTTAGG/------- CAGGAGATAG 3070 het 3070 ref 44 25 19 1 ATTTAGG 1 0 197449 CASAVA_Build 12 122376616 1I AACAACATAA -/C CCCCCAAACA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 5 6 197450 CASAVA_Build 12 122381147 1D TCATTAAAAC A/- CCATCCCACT 3070 hom 42 het 26 0 14 12 A 1 0 197451 CASAVA_Build 12 122381961 6I GAGTAGGAAT ------/ATGTTG ATGTTATGTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 ATGTTG 0 1 197452 CASAVA_Build 12 122383624 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 24 0 22 3 A 15 14 197453 CASAVA_Build 12 122383792 1D CTTAACTCTA C/- CTCACATCAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 2 1 197454 CASAVA_Build 12 122388814 1D GCACTTGGGC A/- AGCAGGGGTG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 2 1 197455 CASAVA_Build 12 122398664 1D GACAAAAAAT A/- AAAGGACAGC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 4 3 197456 CASAVA_Build 12 122399911 1D CAGAATCTTA C/- GTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 C 1 0 197457 CASAVA_Build 12 122401361 12I AGGCCAGATG ------------/CAGTGGCCCACA CCTGTAATCC 3070 hom 81 het 29 0 26 3 CAGTGGCCCACA 0 1 197458 CASAVA_Build 12 122402567 14D TATTCTGCTG CCATGGATTTTTAC/-------------- CCATTTTATA 3070 hom 72 het 26 0 24 7 CCATGGATTTTTAC 1 0 197459 CASAVA_Build 12 122405369 1D AACAATGGAC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 7 197460 CASAVA_Build 12 122410747 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 655 hom 32 2 18 12 A 15 14 197461 CASAVA_Build 12 122416878 2D GCTTGAACTC AA/-- GAGACGGAGG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 2 0 197462 CASAVA_Build 12 122430216 7I CAGGCTGATC -------/TCAAACT TCAAACTTAT 3070 hom 93 het 39 0 30 9 TCAAACT 1 2 197463 CASAVA_Build 12 122433465 1D TGTCTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 2796 het 91 hom 24 2 15 7 T 13 12 197464 CASAVA_Build 12 122446028 1I TTTAAATTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 19 0 12 7 T 8 9 197465 CASAVA_Build 12 122448341 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 16 1 10 5 T 12 11 197466 CASAVA_Build 12 122467799 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2378 het 1390 hom 21 5 8 8 A 13 14 197467 CASAVA_Build 12 122490596 4I ACCCTGCCTT ----/TCTG TCTTTCTTTT 466 het 466 ref 14 5 3 6 TCTG 0 1 197468 CASAVA_Build 12 122499627 1D TAAAAATTTT A/- AAAAAAGAGC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 7 6 197469 CASAVA_Build 12 122500363 1D TTTCAAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 680 hom 40 3 25 12 A 14 13 197470 CASAVA_Build 12 122502116 1I3M4I CACAGTCCAG -ACA----/TACAAGGG CCTGCAGTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 5 N/A 0 0 197471 CASAVA_Build 12 122508930 1D GGAGAGGGGC G/- GGGGAGCGGC 3070 hom 53 het 21 0 14 7 G 5 4 197472 CASAVA_Build 12 122510007 1D GAGAATGAGG C/- CCAGGCGCGG 3006 hom 30 het 11 0 8 3 C 3 2 197473 CASAVA_Build 12 122520376 1D CCATTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 27 1 20 6 A 11 10 197474 CASAVA_Build 12 122521573 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1098 het 1098 ref 22 10 4 8 T 17 16 197475 CASAVA_Build 12 122523821 1D TCGAGACCAG C/- CTGGCCAACG 3070 hom 36 het 16 0 12 4 C 2 1 197476 CASAVA_Build 12 122524344 1I AAAACAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 27 1 20 6 A 10 11 197477 CASAVA_Build 12 122533121 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1408 het 1408 ref 28 14 4 10 T 15 14 197478 CASAVA_Build 12 122542735 1I AGAAAAAAAA -/T ATATATATAT 2396 het 1632 hom 14 5 7 2 T 0 1 197479 CASAVA_Build 12 122558042 1D CCAGCCTGGG T/- TGACAGAATG 3070 hom 32 het 18 0 14 4 T 2 1 197480 CASAVA_Build 12 122575388 1I ATCCCAGCAC -/T TTGGGAGGCC 3070 hom 53 het 22 0 15 7 T 2 3 197481 CASAVA_Build 12 122581514 1I AGGGAAGAAG -/A AGGGGAAAGG 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 A 1 2 197482 CASAVA_Build 12 122581616 1D ACTCTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 16 15 12 A 15 14 197483 CASAVA_Build 12 122583255 1I ACATCTTCTT -/G GGTAACTCGG 3070 het 1878 hom 20 5 11 4 G 2 3 197484 CASAVA_Build 12 122597600 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1757 het 588 hom 15 4 5 6 T 14 13 197485 CASAVA_Build 12 122607175 1I TCGTATAGGA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 6 7 197486 CASAVA_Build 12 122609677 4D ACAAATAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 7 AAAC 4 3 197487 CASAVA_Build 12 122623320 14D CTTTCCTTTG ATTCTGTGAGCAGA/-------------- ATCACCTTTT 3070 het 3070 ref 36 26 13 2 ATTCTGTGAGCAGA 1 0 197488 CASAVA_Build 12 122642951 1I CATGTCTTCC -/A GTCTTTAGGG 3070 hom 119 het 43 0 39 4 A 0 1 197489 CASAVA_Build 12 122650665 1D ATCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 9 8 197490 CASAVA_Build 12 122656559 2D GAAACCAAAA CT/-- CTCTGTTTGC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 CT 3 2 197491 CASAVA_Build 12 122658768 1D GTTGGTAAGC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 T 9 8 197492 CASAVA_Build 12 122663501 2D GCAGCAGCAC AT/-- GTTGATATTT 3070 het 3070 hom 55 17 35 6 AT 1 0 197493 CASAVA_Build 12 122690399 4I GCGTGCGTGC ----/GTGT GTGTATGTGT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 GT 2 4 197494 CASAVA_Build 12 122692678 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 11 12 197495 CASAVA_Build 12 122715837 3I GGTTTTGGTA ---/TGT TGTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 27 18 9 0 TGT 1 2 197496 CASAVA_Build 12 122716628 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AGAGAGATGC 3055 het 3043 hom 21 10 9 2 AAG 1 0 197497 CASAVA_Build 12 122717891 1I AGGTGAAGAG -/T TTTTTATAGG 2686 het 2686 ref 24 11 8 5 T 5 6 197498 CASAVA_Build 12 122718292 4D GTTTCTACAA TATT/---- TATATCTTAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 5 TATT 1 0 197499 CASAVA_Build 12 122733390 4D TCTGGTGTCA TATT/---- TCAGAAACCA 2948 het 2948 ref 20 12 7 2 TATT 1 0 197500 CASAVA_Build 12 122736391 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 747 het 747 ref 22 12 4 6 T 15 16 197501 CASAVA_Build 12 122746675 1D TAACAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 12 11 197502 CASAVA_Build 12 122753034 1I TCCTGTTGGA -/C CTCCACCCCC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 C 1 2 197503 CASAVA_Build 12 122753694 1D TATTATCATT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 1 0 197504 CASAVA_Build 12 122757757 1D ACCTACACTG T/- TTTTTTTTTT 1165 het 1165 ref 35 21 3 11 T 11 10 197505 CASAVA_Build 12 122877632 1D GGTGCAAAGT G/- GGCGTTTGCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 3 2 197506 CASAVA_Build 12 122887475 1I GCCTCAGCCT -/C CCGAGTAGCT 2473 hom 18 het 9 0 7 2 C 2 3 197507 CASAVA_Build 12 122915764 1D TTTAATCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 11 10 197508 CASAVA_Build 12 122928210 1I TTTGTGTGTT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 G 8 9 197509 CASAVA_Build 12 122929678 4D GCGCTCTGTG TGTC/---- TGTCTGTCTG 3070 hom 75 het 30 0 26 7 TGTC 3 2 197510 CASAVA_Build 12 122932104 1D TTTTGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 13 12 197511 CASAVA_Build 12 122967664 5D TTGGATGTAC TTTCT/----- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 TTTCT 2 1 197512 CASAVA_Build 12 122986030 4I TGGGGTTGTC ----/AGGA AGAGTGATCG 3070 het 1974 hom 22 6 14 2 AGGA 0 1 197513 CASAVA_Build 12 122993123 2D GAGCTCAGGC CA/-- CACGCATAAC 3070 het 3070 ref 40 20 13 10 CA 2 1 197514 CASAVA_Build 12 122993715 1I TGAGGATGAT -/A ATAAGGCATT 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 A 1 2 197515 CASAVA_Build 12 123010296 4I TTTTTGTTGG ----/AATT AATTAAAATG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 AATT 1 2 197516 CASAVA_Build 12 123039267 1D TTTTTAAAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 9 8 197517 CASAVA_Build 12 123040386 18I GATACTGAAT ------------------/TCTAATGACCAAATCCTA TCTATTCTTA 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 TCTAATGACCAAATCCTA 0 1 197518 CASAVA_Build 12 123044330 1D TCTGGGACTT C/- CTGATCATTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 C 2 1 197519 CASAVA_Build 12 123058267 14I GAGTAGACTA --------------/TTTTATTCATCCAT TTATCTCTTA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 TTTTATTCATCCAT 0 1 197520 CASAVA_Build 12 123066676 2D ACTCTTGGTG AA/-- TCTGCTAGGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 2 0 197521 CASAVA_Build 12 123069348 1I AGAAGAAATT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 A 7 8 197522 CASAVA_Build 12 123105162 1D TTCAGGGGAC G/- GGATATCTCC 3070 het 3070 hom 59 22 30 8 G 3 2 197523 CASAVA_Build 12 123116987 1D AGAGCTTCCA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 86 het 37 0 28 10 T 9 8 197524 CASAVA_Build 12 123134103 1D GGTGATTTGT A/- AAAAAAAAAA 2774 het 1578 hom 36 10 12 14 A 12 11 197525 CASAVA_Build 12 123142520 1D GTAATTTGTT A/- ACAGCAGCAA 3070 hom 120 het 47 0 41 7 A 2 1 197526 CASAVA_Build 12 123147873 1D CTCAGGCTGG T/- TTTTTTCGAA 3070 hom 51 het 22 0 16 7 T 7 6 197527 CASAVA_Build 12 123160586 4D ATTCTCAATA ATAG/---- ATAGGGAGGG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 ATAG 2 1 197528 CASAVA_Build 12 123161991 1I TCATCTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 411 hom 34 1 26 7 T 9 10 197529 CASAVA_Build 12 123163609 1I CATGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 2089 hom 18 het 8 0 6 2 C 3 4 197530 CASAVA_Build 12 123163804 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGGAAAAAG 2996 het 273 hom 26 2 14 10 AG 1 0 197531 CASAVA_Build 12 123169049 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 28 1 14 13 T 15 14 197532 CASAVA_Build 12 123171129 1D AGCAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 37 1 25 12 A 12 11 197533 CASAVA_Build 12 123175034 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2010 het 2010 ref 20 9 5 6 T 10 11 197534 CASAVA_Build 12 123178758 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 2058 het 2058 ref 23 13 8 2 T 8 9 197535 CASAVA_Build 12 123193415 1D GGTTTTGTAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 A 9 8 197536 CASAVA_Build 12 123195776 5D TGTTTCTTTC CTTCT/----- TTTTTTTTTT 9 het 9 ref 29 15 1 13 CTTCT 1 0 197537 CASAVA_Build 12 123201398 1D ACCTTGGAGG C/- CCAGGCAGGC 3070 het 3070 hom 58 22 24 13 C 3 2 197538 CASAVA_Build 12 123204643 1D GATCCTTCGC T/- TGTGCAGTTC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 2 1 197539 CASAVA_Build 12 123207443 2I TTTATAAATT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 A 9 11 197540 CASAVA_Build 12 123213086 2I CCTAGACATC --/TT TGGGAGAGCC 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 T 1 3 197541 CASAVA_Build 12 123217750 1I CTCGGGTCTG -/T TTTTTCAGCC 3070 hom 81 het 30 0 25 5 T 5 6 197542 CASAVA_Build 12 123223466 1I GATGAGAAGC -/T TGTCCCTGGG 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 1 2 197543 CASAVA_Build 12 123235184 2I GTGCCCTTTT --/CA CAGTCTGTTT 3070 hom 129 het 47 0 42 5 CA 1 2 197544 CASAVA_Build 12 123272369 4I CTAGCACCCT ----/CTCA CTCACCTCAG 3070 hom 111 het 44 0 36 8 CTCA 1 2 197545 CASAVA_Build 12 123272566 4D AATGTCTGTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 hom 123 het 50 0 40 15 TGTT 4 3 197546 CASAVA_Build 12 123283626 1D TATTGTATAT A/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 A 1 0 197547 CASAVA_Build 12 123291108 1D CCTCCCCACT C/- CCCCCAACAG 3070 hom 92 het 37 0 28 9 C 6 5 197548 CASAVA_Build 12 123294406 1D AAGCATAGTG C/- CCGAAGGGTA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 3 2 197549 CASAVA_Build 12 123300380 17I TGCCGGCCTG -----------------/TCCTGCCTTCATTCCCA TCCTACCAGA 3070 hom 105 het 43 0 34 12 TCCTGCCTTCATTCCCA 0 1 197550 CASAVA_Build 12 123301792 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 730 hom 24 2 19 3 A 13 14 197551 CASAVA_Build 12 123328212 12D CTCCCCTCTC TCCTCCTCCTCT/------------ TCCTCCTCCT 3070 hom 66 het 27 0 20 9 TCCTCCTCCTCT 2 1 197552 CASAVA_Build 12 123334440 1I CTTGAACATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 2065 hom 35 7 22 6 A 0 1 197553 CASAVA_Build 12 123345102 1I GCCCCCGCCG -/C CCCCCACCCA 3070 hom 49 het 19 0 13 6 C 5 6 197554 CASAVA_Build 12 123348191 1D CTACCTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 35 het 28 1 22 5 T 10 9 197555 CASAVA_Build 12 123363292 9D GCCCTCCCAT GCATATGAC/--------- GCATATGACA 3070 hom 102 het 38 0 33 7 GCATATGAC 2 1 197556 CASAVA_Build 12 123364178 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 14 1 11 3 A 15 14 197557 CASAVA_Build 12 123367689 1D GATGCCTGCT G/- GGGGTGGCAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 G 5 4 197558 CASAVA_Build 12 123370031 3D GGACCTAGAG CAT/--- CATCAGACTG 3070 hom 86 het 31 0 28 4 CAT 2 1 197559 CASAVA_Build 12 123373910 2D CCTGTGTATA TG/-- TGATACTCTT 2904 het 2904 ref 38 19 7 15 TG 2 1 197560 CASAVA_Build 12 123378706 2I ACCTGTGTGA --/CC TGGGACGTGC 3070 hom 69 het 30 0 22 8 C 0 2 197561 CASAVA_Build 12 123382119 1I GTTTTTAAAG -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 6 7 197562 CASAVA_Build 12 123389626 4D CTTAACCCAA CCAC/---- CCACCCACCC 3070 hom 38 het 16 0 12 4 CCAC 3 2 197563 CASAVA_Build 12 123402255 1I GCACATCCAC -/A AAATGGAGAC 3070 hom 117 het 46 0 38 8 A 3 4 197564 CASAVA_Build 12 123408336 2I TGTATGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 148 het 57 0 44 13 TG 5 6 197565 CASAVA_Build 12 123411323 1I CCCGGAGCCG -/C CTCTTCACTC 2770 het 2392 hom 28 11 11 6 C 1 2 197566 CASAVA_Build 12 123412333 3I GATTTCACAT ---/AAG AAGATGGATT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 AAG 1 2 197567 CASAVA_Build 12 123417775 17D CCTCTGGGGG GCACACACAGAGGCCCA/----------------- AACCCTTCTT 1971 het 1971 ref 23 16 7 1 GCACACACAGAGGCCCA 1 0 197568 CASAVA_Build 12 123466735 1D TAAAAAAAAA C/- ATCTCTATTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 C 1 0 197569 CASAVA_Build 12 123468978 1D AAGGGAAGGC G/- GGGCAGCTCT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 G 4 3 197570 CASAVA_Build 12 123494871 3D GGGCACTGGA GAG/--- GAGAAGCAGG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 GAG 2 1 197571 CASAVA_Build 12 123499148 13I ACAATGACCA -------------/GATGCTGCAGGAG GGTGGCCAAG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 GATGCTGCAGGAG 0 1 197572 CASAVA_Build 12 123502071 4I TGTATGTCTT ----/TCTG TCTGTCTGTC 3070 het 3070 ref 52 21 17 14 TCTG 3 4 197573 CASAVA_Build 12 123505209 11D TAAAATGGTA CGGCCACTTTT/----------- CGGCCACTTT 3070 hom 77 het 36 0 28 11 CGGCCACTTTT 1 0 197574 CASAVA_Build 12 123524918 1I AATACAGCTG -/T TTTTGAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 5 197575 CASAVA_Build 12 123529962 8D ATACACACAC ACACACAA/-------- ACACGCAGGG 3070 het 549 hom 39 7 12 27 ACACACAA 1 0 197576 CASAVA_Build 12 123540159 2I ACCATGGCAC --/CT CTCTGAAGCT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 CT 2 3 197577 CASAVA_Build 12 123557076 1D TGTGGCTCCA C/- CCGAGAAGCC 1840 het 1840 ref 19 10 6 3 C 3 2 197578 CASAVA_Build 12 123566156 2D ATATGAGTGT GA/-- GTGTGCATGT 3070 het 3070 hom 80 31 40 11 GA 1 0 197579 CASAVA_Build 12 123586394 2I AAAGGCATCC --/CA CACACCCTGG 3070 het 3070 ref 44 19 14 11 CA 2 3 197580 CASAVA_Build 12 123600664 1I GAGTGACCCA -/G ACCCCCAAAA 3070 hom 88 het 33 0 27 6 G 0 1 197581 CASAVA_Build 12 123629784 1D CATGCATAAG A/- AAAACAAAGG 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 5 4 197582 CASAVA_Build 12 123631680 1D GATCTGCCCA C/- CCTTAGCTTC 3070 het 3070 hom 20 10 8 2 C 3 2 197583 CASAVA_Build 12 123636461 4D TCCATCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 1639 hom 10 het 5 0 4 2 AAAT 5 4 197584 CASAVA_Build 12 123639970 1D TCATTTTAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 8 197585 CASAVA_Build 12 123662768 2D TTACACACAC AT/-- ACAGACACCT 3070 het 3070 ref 61 32 24 6 AT 1 0 197586 CASAVA_Build 12 123664481 2D CAGCATAGTA AG/-- ACCCTCATTG 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 AG 1 0 197587 CASAVA_Build 12 123693060 2I CCTTCATTCT --/GG GGACGGTACA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 G 2 4 197588 CASAVA_Build 12 123699940 9I GACCCGTGAC ---------/ACAGACCCT ACAGACCCTA 3070 hom 62 het 25 0 20 5 ACAGACCCT 1 2 197589 CASAVA_Build 12 123702376 1I GGTCTTGGGC -/T CTGGGTTTGA 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 T 0 1 197590 CASAVA_Build 12 123710062 1D ACCTCTGCCA T/- CTCAACCCCT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 1 0 197591 CASAVA_Build 12 123720338 1D TTTCTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 15 12 T 12 11 197592 CASAVA_Build 12 123722705 4I TGCGCACACG ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 ref 75 37 20 18 CA 5 7 197593 CASAVA_Build 12 123731080 2I GAGGGGGGGG --/GT TTTCACCATG 1611 het 1611 ref 19 13 5 1 GT 0 1 197594 CASAVA_Build 12 123750286 1D GGCATGGCTA G/- GGGGCCAGGG 3070 hom 91 het 48 1 41 6 G 5 4 197595 CASAVA_Build 12 123751638 2I TTCTTGATAA --/CT CTGTGCCATG 3070 het 3070 ref 39 19 10 10 CT 1 2 197596 CASAVA_Build 12 123755473 1D TCTGCTTCTT A/- GGGGTCGCAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 1 0 197597 CASAVA_Build 12 123759256 8I GCTTGTGTAT --------/TCTGAACA TCTGAACATG 3070 hom 113 het 41 0 37 4 TCTGAACA 1 2 197598 CASAVA_Build 12 123781716 1D CCTGGGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1766 hom 26 8 9 9 A 13 12 197599 CASAVA_Build 12 123783402 20I GCCGGGGAGG --------------------/CCCCTGGGCCTCGCTCCATC AGCGATGCAC 3070 het 3070 ref 31 14 16 3 CCCCTGGGCCTCGCTCCATC 0 1 197600 CASAVA_Build 12 123795889 1I GTAGTAGGTG -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 55 25 19 11 C 8 9 197601 CASAVA_Build 12 123802428 1D ATCTTCCAGA G/- GCTTCTCATC 3070 het 3070 ref 29 16 7 7 G 2 1 197602 CASAVA_Build 12 123805599 1I CCTGGGGAGA -/G GAACAGTCTG 3030 het 1948 hom 25 9 8 8 G 1 2 197603 CASAVA_Build 12 123806349 3D TATGCATCAG GCA/--- CTGTTGTAAG 3070 het 3070 ref 48 23 21 6 GCA 1 0 197604 CASAVA_Build 12 123807978 1D CCCAGACATG C/- AAGCGAGCCC 3070 het 3070 ref 46 22 12 13 C 1 0 197605 CASAVA_Build 12 123825516 4D TCTCCTGGTG GTGA/---- GTAAGTCTCA 3070 hom 102 het 38 0 34 6 GTGA 1 0 197606 CASAVA_Build 12 123826327 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3054 het 199 hom 25 2 10 13 A 19 18 197607 CASAVA_Build 12 123827485 2I ACAAGTTTAA --/GG GGGGAAAAGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 4 6 197608 CASAVA_Build 12 123843426 1I TCTTCTATCT -/G GGTCACCCAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 2 3 197609 CASAVA_Build 12 123843925 1I CGGGCGCGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 45 het 18 0 13 5 G 1 2 197610 CASAVA_Build 12 123869629 1D CCTGTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 23 3 14 6 A 14 13 197611 CASAVA_Build 12 123874675 1D ATTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 23 1 18 4 A 16 15 197612 CASAVA_Build 12 123880055 2D GCCTCGCTCA CT/-- CTGCTCCAGC 3070 het 3070 ref 36 20 13 6 CT 2 1 197613 CASAVA_Build 12 123888242 1D ACCAACCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 18 1 14 4 A 12 11 197614 CASAVA_Build 12 123901936 1I GCTGTTTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 9 10 197615 CASAVA_Build 12 123910037 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 27 0 23 4 A 11 10 197616 CASAVA_Build 12 123912532 1I GTGCTCACTC -/A ACAGCACAGG 3070 hom 120 het 44 0 39 5 A 1 2 197617 CASAVA_Build 12 123913192 1D TGTGTGGGTT C/- CCAGGGCTTC 3070 hom 118 het 42 0 37 6 C 3 2 197618 CASAVA_Build 12 123913718 2I AGCAGACGTT --/CA CACACACTCT 3070 hom 69 het 29 0 21 8 CA 3 4 197619 CASAVA_Build 12 123921127 1D ACAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 23 1 16 6 A 13 12 197620 CASAVA_Build 12 123925565 4I AAGATGGTAA ----/AAAC AAACAAACTA 3070 hom 85 het 39 0 29 10 AAAC 2 3 197621 CASAVA_Build 12 123934318 3I GGCTCCGTGA ---/GTG GGTGGACAGG 3070 hom 110 het 41 0 32 9 GTG 0 1 197622 CASAVA_Build 12 123935123 1D ACTGCACCTC A/- AAAAAAAAAA 2792 het 449 hom 17 1 9 8 A 15 14 197623 CASAVA_Build 12 123938520 1I GCCTGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 2980 het 90 hom 16 2 11 3 T 13 14 197624 CASAVA_Build 12 123946497 1D GAGACTCCGT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 54 hom 22 2 15 5 C 10 9 197625 CASAVA_Build 12 123948152 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 11 4 A 10 11 197626 CASAVA_Build 12 123948759 1D ACCCTGTCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 31 1 24 7 A 10 9 197627 CASAVA_Build 12 123979339 1D CTATCTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 486 hom 31 3 16 12 A 16 15 197628 CASAVA_Build 12 123980919 1I ATTTCTAATA -/T TTTTAAAAAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 4 5 197629 CASAVA_Build 12 123983455 1D ATGTGTTAAG A/- AAAAAATTAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 7 6 197630 CASAVA_Build 12 123986096 1I TCTTCAGATA -/T TTTTTTGGTG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 6 7 197631 CASAVA_Build 12 123992500 1I GGTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 9 10 197632 CASAVA_Build 12 123999247 12D27M82D AAACTCTGTC TCAAACAAACAAGCAAACAAACAAAACTCAAAAGCAAAAAAACATAATTCTCTAGACAGGCCTTCTAAAAAATAAATAATAATAATAAAATAAAAGAGAAGGCAAAGGGTCCCCTTCCCCT/------------GCAAACAAACAAAACTCAAAAGCAAAA---------------------------------------------------------------------------------- AATCATCCCG 3070 hom 38 het 8 0 10 6 N/A 0 0 197633 CASAVA_Build 12 123999976 4D CTGCTTAGCT GGGA/---- GGAAGTCCCC 3070 hom 62 het 23 0 18 6 GGGA 1 0 197634 CASAVA_Build 12 124006878 1I AATTATTAAA -/T TAATTGTTCA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 1 2 197635 CASAVA_Build 12 124011582 1I TTCTACTTTT -/G TAACTAACAT 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 G 0 1 197636 CASAVA_Build 12 124011688 2I TGCGCGCACG --/CA CACACACACA 3070 hom 55 het 27 0 14 13 CA 6 7 197637 CASAVA_Build 12 124018590 1I AAAAAAAAAA -/T AGTCTGGCTG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 0 1 197638 CASAVA_Build 12 124020419 1D CCCTGCCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 81 hom 21 1 12 8 A 11 10 197639 CASAVA_Build 12 124024789 1D TTAACAAGTT A/- AAAAGAGAAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 5 4 197640 CASAVA_Build 12 124024999 1I ATGCTGACCC -/G GGGGGCCGGT 3070 het 2774 hom 31 12 13 6 G 5 6 197641 CASAVA_Build 12 124058606 3I TCCTGGGTGA ---/TGC TGCTGCTGCT 3070 het 21 hom 36 1 23 12 TGC 4 5 197642 CASAVA_Build 12 124060119 3D AATTAGAGAT GGG/--- GGGGGGGTCT 3070 hom 58 het 23 0 19 4 G 10 7 197643 CASAVA_Build 12 124060601 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 32 1 22 10 A 12 11 197644 CASAVA_Build 12 124062219 1D ATATCACTAA T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 6 5 197645 CASAVA_Build 12 124066855 2I TTCTTCAGTG --/TT TTTTTTTTTT 2573 hom 24 het 13 0 9 4 T 14 16 197646 CASAVA_Build 12 124086574 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 9 8 197647 CASAVA_Build 12 124087084 1D ATGTTAACAC A/- GGGCACTATT 3070 hom 87 het 38 0 30 10 A 1 0 197648 CASAVA_Build 12 124088155 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 6 197649 CASAVA_Build 12 124090154 1I TCCAATAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 26 1 19 6 T 10 11 197650 CASAVA_Build 12 124094685 1D GGAGTCTCTC T/- CTGTCGCCCA 3070 het 84 hom 21 1 17 3 T 1 0 197651 CASAVA_Build 12 124102311 1I GAAAATACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3069 hom 29 11 8 10 T 11 12 197652 CASAVA_Build 12 124103393 7D CGCCTGGCTA ATTTTTT/------- ATTTTTTATT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 ATTTTTT 2 1 197653 CASAVA_Build 12 124108048 1I CTCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 33 9 9 15 A 15 16 197654 CASAVA_Build 12 124111183 1I TCCAAATTAG -/A AAAAAATGGG 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 A 6 7 197655 CASAVA_Build 12 124114980 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 2947 hom 39 het 17 0 12 5 A 11 12 197656 CASAVA_Build 12 124122379 2D TGTTGTTGAC AG/-- AGTTTCGCTC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 AG 2 1 197657 CASAVA_Build 12 124131141 2I ATCTCTTCTC --/TT TTAAGTATTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 2 4 197658 CASAVA_Build 12 124133925 1I CAGGAGTCAC -/T TGGGGGGCCA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 T 1 2 197659 CASAVA_Build 12 124140668 1D57M8D CCATCCATCC TGTCTATACATTCTTCTCTCCATCTACCCATTTACCCATTATCCATCTATCCATCCATTTATTATG/-GTCTATACATTCTTCTCTCTACCTACCTATTTACCCATCATCCATACATTCATCTAT-------- CTTCCACCCA 2345 hom 52 het 16 0 11 32 N/A 0 0 197660 CASAVA_Build 12 124140816 4D ATCCATCCAT CCAA/---- CTGTCTATAC 3070 het 3070 ref 72 57 8 13 CCAA 1 0 197661 CASAVA_Build 12 124143225 1I GGACTGACCT -/G AGACAGAAAC 3070 hom 51 het 20 0 16 4 G 0 1 197662 CASAVA_Build 12 124147933 1I TGTTTTACTT -/A AAAAAAAAAA 1511 het 979 hom 20 6 5 9 A 17 18 197663 CASAVA_Build 12 124153957 2I CACGACAAGG --/CA CACACATATC 3070 het 3070 ref 62 34 21 7 CA 3 4 197664 CASAVA_Build 12 124154037 4D TGTGTACATG TGTA/---- TGTATGGCTA 3070 het 3070 ref 69 35 29 6 TGTA 2 1 197665 CASAVA_Build 12 124160524 1I GGTGCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 15 11 T 12 13 197666 CASAVA_Build 12 124168488 1I GTTTCAGGGG -/A AAAAAAAAAA 2606 het 2606 ref 38 11 13 14 A 13 14 197667 CASAVA_Build 12 124176307 7D CATCGAAACA TGGCCAT/------- TGGCCATGAT 3070 het 3070 ref 51 26 21 7 TGGCCAT 2 1 197668 CASAVA_Build 12 124176457 1D TCCAAGTGAA T/- TTTTTTTTTT 1617 het 1512 hom 32 11 8 13 T 17 16 197669 CASAVA_Build 12 124192355 1D CCAGTCCTTG A/- AAGTGCCTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 3 2 197670 CASAVA_Build 12 124196355 2D CGTACCACCC CT/-- GTCACCATGG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 CT 1 0 197671 CASAVA_Build 12 124199320 1D CCCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2524 het 1965 hom 14 6 8 0 A 11 10 197672 CASAVA_Build 12 124206778 1D TAAGTGACAG A/- ACATCAGTCA 3070 hom 117 het 42 0 40 4 A 2 1 197673 CASAVA_Build 12 124218290 1D TCAAAGGTGG T/- TGGTTGAAGC 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 T 2 1 197674 CASAVA_Build 12 124225762 1I TCTATGGGAT -/G GAAATGAAAG 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 G 1 2 197675 CASAVA_Build 12 124226031 1D TGTTTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 1645 het 1645 ref 54 34 7 13 T 13 12 197676 CASAVA_Build 12 124230705 1D AATTTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 T 13 12 197677 CASAVA_Build 12 124242324 1I ATACTGGTTT -/A ATCCCCTTGG 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 A 1 2 197678 CASAVA_Build 12 124242969 1I GGAGAATTTT -/G CCCCTCCCCC 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 G 0 1 197679 CASAVA_Build 12 124244768 1I TTAACCCGTT -/G GGTGGGGGGG 1060 het 1060 ref 26 10 7 9 G 2 3 197680 CASAVA_Build 12 124251575 1I ATTTCTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 9 10 197681 CASAVA_Build 12 124261580 1D AAAAAAAAAA T/- GTGAAAACAA 3070 het 2847 hom 27 9 15 4 T 1 0 197682 CASAVA_Build 12 124262836 4I ATTAATAAAT ----/TAAC TAATTAATAT 3050 het 3050 ref 16 8 7 1 TAAC 0 1 197683 CASAVA_Build 12 124282384 1I TCTTTTGTGT -/C CCCCCCCCCA 2104 het 2104 ref 21 10 7 4 C 9 10 197684 CASAVA_Build 12 124286656 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTGAGA 2792 het 2792 ref 23 13 8 2 T 7 6 197685 CASAVA_Build 12 124328977 1I AATCTCCATC -/T TTTTTTTTTT 2251 het 2251 ref 34 13 8 13 T 16 17 197686 CASAVA_Build 12 124345389 1D TAAGTGGCAG A/- AAAAATGCAG 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 6 5 197687 CASAVA_Build 12 124357448 1D CTAGCCTTGG A/- AACACCCTGG 3070 het 3070 ref 43 20 19 5 A 3 2 197688 CASAVA_Build 12 124359267 1I ATTATTTTGT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 A 8 9 197689 CASAVA_Build 12 124368687 1D CAATAAAAGT A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 A 8 7 197690 CASAVA_Build 12 124370515 1I GACCCTGCCT -/A AAAAAAAAAA 2653 het 2346 hom 29 9 12 8 A 12 13 197691 CASAVA_Build 12 124395349 1D AAACAGCACC A/- AAGTGGAGCT 3070 hom 128 het 52 0 41 11 A 3 2 197692 CASAVA_Build 12 124403835 1D TCACTGCTGT G/- GGGGGTTGGC 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 G 6 5 197693 CASAVA_Build 12 124424932 1I CACAAACATG -/T TTTTTTTTTG 3027 het 3027 ref 32 20 8 4 T 9 10 197694 CASAVA_Build 12 124441314 2I CTGAAACCTC --/AA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 A 0 2 197695 CASAVA_Build 12 124452328 1I TTGATTGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 9 10 197696 CASAVA_Build 12 124464390 2I ATGGTAATTC --/TA TGTTTAACTT 3070 het 3070 ref 50 30 18 2 TA 0 1 197697 CASAVA_Build 12 124468763 1D TAGAAAAGAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 9 8 197698 CASAVA_Build 12 124471056 1I CATTTTTTCC -/T CTGGGCTTCT 3042 het 3042 ref 24 12 9 3 T 0 1 197699 CASAVA_Build 12 124478804 1I TAAATGACTC -/T TTTATTTGGC 3070 hom 48 het 21 0 17 5 T 3 4 197700 CASAVA_Build 12 124479866 1D GCCTAGATAA T/- TTTTTTTTTT 2434 het 2434 ref 25 16 6 3 T 11 10 197701 CASAVA_Build 12 124482074 1D ACCAGGTCTT C/- CTGTGGGCCA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 C 2 1 197702 CASAVA_Build 12 124482557 1D CATGGATCAT G/- GGGTGCTCTG 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 G 4 3 197703 CASAVA_Build 12 124484286 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAATGAT 3070 het 1792 hom 15 7 7 1 A 6 7 197704 CASAVA_Build 12 124489171 4D CTTCCTCCTT CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 hom 162 het 63 0 53 11 CTTC 3 2 197705 CASAVA_Build 12 124489275 1D ACAGGCCGTG T/- TTTTTGGTGT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 6 5 197706 CASAVA_Build 12 124489646 1D GTTCAGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2555 hom 33 10 15 9 T 11 10 197707 CASAVA_Build 12 124492810 10I CTAGTGACCA ----------/TAGTGATTCC TAGGATCAGG 3070 hom 126 het 47 0 39 8 TAGTGATTCC 0 1 197708 CASAVA_Build 12 124500181 1I AATTGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 10 11 197709 CASAVA_Build 12 124512900 1D GACTGTTTCT G/- TCTTCATGGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 0 197710 CASAVA_Build 12 124513874 1I GTGTGATGTG -/C CATTTCAGAG 3070 het 3070 ref 54 28 22 4 C 1 2 197711 CASAVA_Build 12 124528029 1D AGAACCTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 10 9 197712 CASAVA_Build 12 124565898 4D ATTCTCTCAC AAAT/---- ACATTCAAAC 3070 het 3070 hom 68 29 35 5 AAAT 1 0 197713 CASAVA_Build 12 124571042 1I TCTCTCTGCT -/G GGAACACACT 3070 het 3070 hom 22 7 11 4 G 2 3 197714 CASAVA_Build 12 124576632 8D GCTGCCCAGC TACCCCGT/-------- TACCAGCCTC 3070 het 2460 hom 35 12 15 9 TACCCCGT 1 0 197715 CASAVA_Build 12 124580733 1I TATTCCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 T 13 14 197716 CASAVA_Build 12 124587364 1I GATTATCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 A 9 10 197717 CASAVA_Build 12 124597854 5I CATAAAAGTA -----/GAGTT ATCTTGTGAT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 GAGTT 0 1 197718 CASAVA_Build 12 124602140 1I TTAACCTTTT -/G CTCTTTTCAT 3070 het 2634 hom 34 7 16 11 G 0 1 197719 CASAVA_Build 12 124607264 1D TCTGTGTTCC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 8 7 197720 CASAVA_Build 12 124608203 1D TGGCAGAGAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 9 8 197721 CASAVA_Build 12 124614859 1I CGTTCAGTGT -/G GAAAAAATAG 3070 hom 132 het 47 0 44 3 G 1 2 197722 CASAVA_Build 12 124714193 1I ATATTAATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 792 hom 28 2 17 9 T 9 10 197723 CASAVA_Build 12 124714807 5I ACATCTGTCC -----/TTGGG TTGGGAGGGT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TTGGG 1 2 197724 CASAVA_Build 12 124726521 5I CTATCTGGAG -----/AAAAT AAAATAAAGC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AAAAT 1 2 197725 CASAVA_Build 12 124727283 1I TTTTTTGTAG -/C CCTCTCCCTA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 2 3 197726 CASAVA_Build 12 124734854 1I TTTTTTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 T 10 11 197727 CASAVA_Build 12 124736659 1D TGACCAGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 48 0 36 12 T 10 9 197728 CASAVA_Build 12 124740172 1I TGTCTCAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 28 2 18 8 G 0 1 197729 CASAVA_Build 12 124743979 2I CTGTGTGTAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 213 hom 41 1 32 8 GT 6 7 197730 CASAVA_Build 12 124746296 2I TTAGTGACGT --/AC ACTAAAAGGA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 AC 1 2 197731 CASAVA_Build 12 124752839 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 36 het 17 0 12 6 T 9 8 197732 CASAVA_Build 12 124762823 1I TAGGGAAGTA -/C CTTGTCTTGA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 C 1 2 197733 CASAVA_Build 12 124765891 2D AGATGCAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 22 het 40 1 25 16 GT 19 18 197734 CASAVA_Build 12 124771211 1D CACACTTAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 10 9 197735 CASAVA_Build 12 124771781 2I20M2I ATATGTATGC --GTGTGTGTATGTGTGTGCAC--/ATGTGTGTGTATGTGTGTGCACGT GTGTGTGTGT 3070 het 1991 hom 55 14 24 25 N/A 0 0 197736 CASAVA_Build 12 124774949 1D GGTGGGGGGT G/- TTTTTTTTCT 3070 het 67 hom 43 1 35 7 G 1 0 197737 CASAVA_Build 12 124793549 1I GTGCCTGGCC -/T AAAAAAAAAA 3070 het 329 hom 19 1 17 1 T 0 1 197738 CASAVA_Build 12 124795590 2D AGTGTTCTCA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 102 het 47 0 35 13 AC 8 7 197739 CASAVA_Build 12 124802626 21I CTATAAACAG ---------------------/TTTTTGTTTTTTCTGTTATGA TTTCCTTTTA 3070 hom 54 het 16 0 19 2 TTTTTGTTTTTTCTGTTATGA 0 1 197740 CASAVA_Build 12 124806226 15D CCATTGGGTG GCGCTGTTATCTAGA/--------------- GCTCAAGCTT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 GCGCTGTTATCTAGA 1 0 197741 CASAVA_Build 12 124812872 1D TTTTCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1712 het 1712 ref 37 26 4 7 T 13 12 197742 CASAVA_Build 12 124814630 1D TGGTTGGCTT A/- AAAAATGCCT 3070 hom 57 het 25 0 18 7 A 6 5 197743 CASAVA_Build 12 124815240 1D TTAATTGGCG C/- CTTGGCATGA 3070 hom 147 het 55 0 49 7 C 2 1 197744 CASAVA_Build 12 124817348 2D TCTGTCTCAG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 114 het 44 0 39 7 A 10 8 197745 CASAVA_Build 12 124820565 1D ACTGGGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 37 1 26 10 A 15 14 197746 CASAVA_Build 12 124857457 1I TATTGACCTC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 324 hom 32 1 25 6 T 7 8 197747 CASAVA_Build 12 124889678 1I AGAGATATAA -/T TTTTATTGTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 4 5 197748 CASAVA_Build 12 124908857 1I TCGGCCTCCC -/A AATGTGCTGG 3070 het 2307 hom 16 6 8 2 A 2 3 197749 CASAVA_Build 12 124918676 1I TATATTTTAA -/T TTTTTTCTTT 1808 het 1030 hom 11 4 5 2 T 6 7 197750 CASAVA_Build 12 124918819 1I ATGATCTAGA -/G TGTGAGGCAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 G 0 1 197751 CASAVA_Build 12 124918890 3D TATGTAGCAC TTG/--- TTGTTGAGGG 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 TTG 3 2 197752 CASAVA_Build 12 124919176 5I AAGAATCGCT -----/CGAAC TGAACCCAGG 2390 het 2390 ref 13 6 6 1 CGAAC 0 1 197753 CASAVA_Build 12 124920694 1D GTAAGTTTCC T/- TGAGGCCTCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 2 1 197754 CASAVA_Build 12 124931407 1D AAATAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 T 13 12 197755 CASAVA_Build 12 124945186 1D CCCTTGATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 T 13 12 197756 CASAVA_Build 12 125016469 1D AATAACACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 112 hom 29 3 21 5 T 10 9 197757 CASAVA_Build 12 125016873 1I ATTTGGTTTA -/T TTTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 6 7 197758 CASAVA_Build 12 125018116 3D CTCTGGAACA GTT/--- GTTGGCCGAA 3070 hom 98 het 37 0 32 5 GTT 2 1 197759 CASAVA_Build 12 125023648 1D ACCTTACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 903 hom 40 4 22 15 A 17 16 197760 CASAVA_Build 12 125053385 1D GAGGGCGAAT C/- CCCTCATGAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 4 3 197761 CASAVA_Build 12 125072490 1I AGGTGACAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 9 10 197762 CASAVA_Build 12 125077907 1I ATGGAACTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 T 9 10 197763 CASAVA_Build 12 125084228 1I AACCTAGTGC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 A 7 8 197764 CASAVA_Build 12 125093395 1D AATGTTTAAG T/- ATTCAGAGAA 3070 het 3070 ref 41 25 15 1 T 1 0 197765 CASAVA_Build 12 125094220 1I AATTCCCAGA -/G TTGCACAGTG 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 G 0 1 197766 CASAVA_Build 12 125096001 1D ACAATAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 20 16 7 A 12 11 197767 CASAVA_Build 12 125105994 4I TTTACAGATG ----/GTGA ATGAAGCTGA 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 GTGA 0 1 197768 CASAVA_Build 12 125110890 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2501 het 603 hom 12 2 7 3 T 7 8 197769 CASAVA_Build 12 125112999 1I GGTGTTGGTT -/A AACCTGACGT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 2 3 197770 CASAVA_Build 12 125120335 3D AGCCCTACCT AGA/--- AGATGAAGAG 3070 het 3070 hom 43 14 22 9 AGA 2 1 197771 CASAVA_Build 12 125123274 1D CTTTTATTTT C/- CCCCACAAGG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 C 5 4 197772 CASAVA_Build 12 125123608 1I CACAAACTGA -/T TTTTTCAGGA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 5 6 197773 CASAVA_Build 12 125125398 1D AGGGAGACCA G/- GTGGAGGTAA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 G 2 1 197774 CASAVA_Build 12 125126293 1D TCCAGCCCAT A/- AGGCTCAGTG 3070 het 3070 ref 44 20 16 9 A 2 1 197775 CASAVA_Build 12 125128767 1D AAAGTTTAAA T/- TTTAAGCACC 3070 het 3070 hom 26 13 13 1 T 4 3 197776 CASAVA_Build 12 125134468 1D GTCCATGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 28 13 10 T 13 12 197777 CASAVA_Build 12 125147150 1D CTTAGTCCAC T/- TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 23 16 4 3 T 15 14 197778 CASAVA_Build 12 125150507 3I TAAAAAGATC ---/TTA TTATCTCCCT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 TTA 1 2 197779 CASAVA_Build 12 125216768 3I TTGGAGCAGG ---/TGA TGATCCTTGG 3070 hom 117 het 44 0 36 8 TGA 1 2 197780 CASAVA_Build 12 125228033 4D TCTATCTATC TATA/---- TATATATTCA 3070 hom 90 het 34 0 31 6 TA 5 3 197781 CASAVA_Build 12 125232575 6D TTCCCTAGTT CTGTCC/------ CTTTAGGTCC 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 CTGTCC 1 0 197782 CASAVA_Build 12 125246358 2I49M1I ATCAACAAAA --AGAGGACTTTTACATGCCAAATGGAGCGTGTGTTATCAGTGCAGGAGGG-/AGAGAGGACTTTTACATGCCAAATGGAGCGTGTGTTATCAGTGCAGGAGGGA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 32 24 3 N/A 0 0 197783 CASAVA_Build 12 125252207 3D TGAACATTTT TTA/--- TTGTTTCTGA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 TTA 1 0 197784 CASAVA_Build 12 125259566 7D ATTATGCACA CTTTCTT/------- CTTTGTTCTC 3070 hom 66 het 28 0 22 8 CTTTCTT 1 0 197785 CASAVA_Build 12 125272746 2D TTGAAATGAC AT/-- ATTTAAAATA 2853 hom 15 het 7 0 6 1 AT 2 1 197786 CASAVA_Build 12 125275141 1I ACACTATGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 9 10 197787 CASAVA_Build 12 125275505 1I ATTTGCTCTT -/G TTCCCCTTCC 3070 hom 98 het 34 0 33 1 G 0 1 197788 CASAVA_Build 12 125279863 1D ATATATTGGT G/- GGAGGAAATA 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 G 3 2 197789 CASAVA_Build 12 125293673 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 34 0 29 6 T 14 12 197790 CASAVA_Build 12 125300442 7D ATCAGAACTG AATCTTA/------- AATCTTAAAT 3070 het 3070 ref 48 25 18 7 AATCTTA 2 1 197791 CASAVA_Build 12 125302350 2D TTTTTTTCCC CT/-- GTTTTACTTA 2758 het 2758 ref 27 19 6 2 CT 1 0 197792 CASAVA_Build 12 125305053 1D CCATTGCACT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 9 8 197793 CASAVA_Build 12 125307411 1I GCCAGGCTGG -/T CTTGAACTTC 3070 hom 54 het 19 0 17 2 T 0 1 197794 CASAVA_Build 12 125312026 4I TTGCAGCAAC ----/ACAA ACAGATTAAG 3070 hom 105 het 45 0 36 9 ACAA 0 1 197795 CASAVA_Build 12 125314824 4I GCAGACAAAT ----/AGAG AGGGAAACCA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AG 1 3 197796 CASAVA_Build 12 125338918 1D AAATATATCC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 T 9 8 197797 CASAVA_Build 12 125362495 3I CAAACATGTC ---/CTT CTTCACATGG 3070 hom 62 het 23 0 20 4 CTT 1 2 197798 CASAVA_Build 12 125362876 1D CAGTCACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2922 hom 31 10 14 8 A 14 13 197799 CASAVA_Build 12 125363462 2D37M6D TGTATATATG TATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATAC/--TATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATAT------ ACACACACAC 2049 het 2049 ref 19 10 9 3 N/A 0 0 197800 CASAVA_Build 12 125365459 2I ACTTTGAAAC --/AT GTGTTGGAAT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AT 0 1 197801 CASAVA_Build 12 125390092 4D TTTTATGTGA TTTT/---- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 10 19 13 T 13 9 197802 CASAVA_Build 12 125393611 1I TGCTCAAAGC -/T TGGGGGGGTC 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 T 1 2 197803 CASAVA_Build 12 125403121 1D GTACAAATCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 T 10 9 197804 CASAVA_Build 12 125407719 2D CCTACCAAAT CA/-- CTCCTGGGTT 3070 het 3070 ref 49 25 17 8 CA 1 0 197805 CASAVA_Build 12 125408014 1D TAGGTTTATT G/- GTAGCAGTTG 3070 hom 108 het 44 0 37 8 G 2 1 197806 CASAVA_Build 12 125447654 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 7 A 12 11 197807 CASAVA_Build 12 125448398 4I TGCCCGCTAA ----/TTAT TTATAGCATT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTAT 1 2 197808 CASAVA_Build 12 125465120 1D AAAATAAAAA G/- ATTTTATGCT 3070 het 3070 hom 40 15 19 9 G 1 0 197809 CASAVA_Build 12 125465283 4D TTATAGAAAC AGAA/---- AGACACGGCC 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 AGAA 1 0 197810 CASAVA_Build 12 125471430 1D ATGAGAAATT A/- AATGACATGT 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 A 3 2 197811 CASAVA_Build 12 125471518 1D AGAGAAGGGG T/- TGTAAGAGAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 2 1 197812 CASAVA_Build 12 125471586 3I ATAGCAAACA ---/AGC AGCATAATGG 3070 het 3070 ref 34 23 10 2 AGC 1 2 197813 CASAVA_Build 12 125476170 5I AGCAAAACCA -----/ATAAC ATATGTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATAAC 0 1 197814 CASAVA_Build 12 125477465 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 15 10 A 15 14 197815 CASAVA_Build 12 125488503 2D ATGTTAACTC AT/-- TAATACTACA 3070 hom 138 het 48 0 46 4 AT 1 0 197816 CASAVA_Build 12 125491200 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2985 het 136 hom 19 1 9 9 T 15 14 197817 CASAVA_Build 12 125500584 1D GTGGGCCATC A/- AAAAGTTTCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 5 4 197818 CASAVA_Build 12 125502210 1I CATGGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 45 0 33 12 A 10 11 197819 CASAVA_Build 12 125502309 1I ACTTCTGATT -/A TTAAGGTGGC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 0 1 197820 CASAVA_Build 12 125520736 20I TGCTAAATCT --------------------/ACAGAATTTGTAAAATGACA AACTTTAAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 ACAGAATTTGTAAAATGACA 0 1 197821 CASAVA_Build 12 125534468 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2693 het 110 hom 19 1 11 7 A 17 16 197822 CASAVA_Build 12 125544499 1D AAGAGGCAGT G/- GAAACCCTGG 3070 hom 102 het 38 0 34 6 G 2 1 197823 CASAVA_Build 12 125548025 5D2M16I TTCTTGCTGT AGTAAGA----------------/-----GATGGTCTGGACTGGTTG CCGTAGTAAC 3070 hom 117 het 44 0 34 11 N/A 0 0 197824 CASAVA_Build 12 125558813 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 39 6 21 12 A 17 16 197825 CASAVA_Build 12 125559028 2D AGAAAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 1652 het 37 hom 37 1 6 30 A 13 11 197826 CASAVA_Build 12 125567872 1I CAATAAAGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 4 het 34 1 25 8 T 8 9 197827 CASAVA_Build 12 125571561 2D AAAATTTGTG TA/-- TATATATATA 1889 hom 18 het 9 0 7 2 TA 10 9 197828 CASAVA_Build 12 125573646 3I TAAACTTGGG ---/GTT TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 28 1 21 7 GTT 0 1 197829 CASAVA_Build 12 125573823 15D TACCTGTCTG TTTTACTTTTGTCTA/--------------- TTTTACTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTTTACTTTTGTCTA 2 1 197830 CASAVA_Build 12 125583294 1D GCTTTTTGGT G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 65 het 31 0 21 10 G 9 8 197831 CASAVA_Build 12 125590038 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 10 9 197832 CASAVA_Build 12 125593900 1I CATTCAGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 10 11 197833 CASAVA_Build 12 125595330 1D TGCTATAATC T/- TTTTTCTATA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 6 5 197834 CASAVA_Build 12 125596293 1I AACAATACAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 8 9 197835 CASAVA_Build 12 125597596 4I AAACTCAAAC ----/TATT TATTCTATAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TATT 1 2 197836 CASAVA_Build 12 125605770 4I TGGGATGTGG ----/CTGT CTTCTTTATC 3070 hom 144 het 50 0 49 1 CTGT 0 1 197837 CASAVA_Build 12 125607133 2D TAAACGAAAA AT/-- ATACTTTGGG 3070 hom 78 het 27 0 27 1 AT 2 1 197838 CASAVA_Build 12 125607258 1I CATCTCTATT -/A AAAAAATACA 1375 hom 9 het 5 0 3 2 A 6 7 197839 CASAVA_Build 12 125607751 5D AAATATTTAA AAAGT/----- AAAATAAATA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 AAAGT 1 0 197840 CASAVA_Build 12 125612924 4I TAACCATATA ----/TCTT TCTTTTGCAC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 TCTT 1 2 197841 CASAVA_Build 12 125614181 1D GGATAAAGTG C/- TCTACCAAAA 3070 het 3070 ref 50 29 16 6 C 1 0 197842 CASAVA_Build 12 125635083 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 115 het 46 0 35 11 A 9 8 197843 CASAVA_Build 12 125640949 1D GTTGGGGGAC A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 A 7 6 197844 CASAVA_Build 12 125670970 1D TGGGCAAGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 29 6 A 10 9 197845 CASAVA_Build 12 125673059 3I TTAAAAATTT ---/TTC TTCTTCAATA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTC 2 3 197846 CASAVA_Build 12 125674337 11I1M2D ATATTGAATC -----------GGA/TTCCAACTCATG-- GGTATAGTAT 3070 hom 99 het 33 0 34 1 N/A 0 0 197847 CASAVA_Build 12 125683325 1D TTTTTGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 26 0 16 10 T 11 10 197848 CASAVA_Build 12 125688241 1I CATTGATATG -/A AAAAAAATGC 3070 het 268 hom 38 1 35 2 A 7 8 197849 CASAVA_Build 12 125688793 1D ATATATAAAG A/- AAAAAAGACT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 7 6 197850 CASAVA_Build 12 125688962 4I30M1D CTGCACATTT ----TTTGTTTGTTTTTAATTTTTACTTATTTGAT/TTTGTTTGTTTGTTTTTAATTTTTACTTATTTGA- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 19 0 13 9 N/A 0 0 197851 CASAVA_Build 12 125702675 1D AAATGTGACC A/- AACAAAATAT 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 A 3 2 197852 CASAVA_Build 12 125707078 1D GTGTAGACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2772 hom 34 8 19 7 T 10 9 197853 CASAVA_Build 12 125709083 1I GACTTATTGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 6 7 197854 CASAVA_Build 12 125710675 1I TTAGCACACT -/G TCTACATAAA 3070 het 3070 hom 53 21 29 3 G 0 1 197855 CASAVA_Build 12 125720308 1I CTGGGTTACC -/T TTTTTTTTTA 2042 het 2024 hom 31 9 11 11 T 9 10 197856 CASAVA_Build 12 125723528 2I TTTGTTTTGT --/TG TTTGTTTGTT 3070 het 371 hom 31 3 14 14 TG 0 1 197857 CASAVA_Build 12 125724011 2D TTATTTTTTA TT/-- TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 27 16 11 1 T 7 5 197858 CASAVA_Build 12 125724712 1D ATTGTTCACT G/- TGGGCATATA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 1 0 197859 CASAVA_Build 12 125741798 3D TTTTGGCTGG TAA/--- CTTTGTTCCA 3070 hom 103 het 38 0 27 13 TAA 1 0 197860 CASAVA_Build 12 125742875 1I AAATAAACAA -/G GGGGGAGAAT 3070 hom 151 het 57 0 49 8 G 5 6 197861 CASAVA_Build 12 125753450 1I TTGTCTGAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 7 8 197862 CASAVA_Build 12 125755913 4D CCAAGCAAAT ACTG/---- ACTGGCTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ACTG 2 1 197863 CASAVA_Build 12 125762380 1D ATGTTCACCC A/- AACGCACTAT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 3 2 197864 CASAVA_Build 12 125766743 3I AAGGCAGGAC ---/CCA CCATTTAGTG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 CCA 1 2 197865 CASAVA_Build 12 125767878 1D CTTTCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 2458 het 1219 hom 37 7 9 21 T 17 16 197866 CASAVA_Build 12 125769311 3D AGAGGGACTA AAT/--- ACTTACAGAA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 AAT 1 0 197867 CASAVA_Build 12 125770100 1I TGCTATCAAA -/G GATGAATGCT 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 G 1 2 197868 CASAVA_Build 12 125774380 1D TTCTCAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 789 hom 42 3 29 10 T 12 11 197869 CASAVA_Build 12 125776180 3D TAGGTGTGTG TGT/--- GGGGGGGACT 3070 hom 75 het 29 0 22 7 TGT 1 0 197870 CASAVA_Build 12 125780171 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTC 3070 het 292 hom 24 1 19 5 A 1 0 197871 CASAVA_Build 12 125802774 1I ATTCTTCTGT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 A 7 8 197872 CASAVA_Build 12 125803574 1D TTTGTTTTAG T/- TTTTTGTTTT 3070 hom 165 het 58 0 56 2 T 6 5 197873 CASAVA_Build 12 125808526 12D GCTGGGAAAA AAAAAAAAAAAC/------------ AAAAAAATGC 3070 het 1076 hom 15 4 8 6 AAAAAAAAAAAC 1 0 197874 CASAVA_Build 12 125808593 1D AAGCTTGTGG C/- CATTTTTCGC 1455 het 1455 ref 15 6 5 4 C 2 1 197875 CASAVA_Build 12 125809080 3D TTAATTTTAA TAT/--- TATTAAATAT 2742 het 2655 hom 18 8 7 3 TAT 2 1 197876 CASAVA_Build 12 125822690 1I GTGGTCTCAC -/G GGCTTCAAGG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 2 3 197877 CASAVA_Build 12 125824569 6D CCATCCCGGG CCTGAT/------ CTTTGCCATC 2054 het 2054 ref 28 22 5 3 CCTGAT 1 0 197878 CASAVA_Build 12 125827426 2I TAGACAATTA --/TT TTATTTTTGA 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 T 2 4 197879 CASAVA_Build 12 125835847 1D AAACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1439 het 311 hom 10 1 5 4 A 17 16 197880 CASAVA_Build 12 125838658 1D TAACCAGGAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 9 8 197881 CASAVA_Build 12 125838696 1D TTTTTTTTTT A/- AGACGGAATC 796 het 796 ref 22 12 2 8 A 2 1 197882 CASAVA_Build 12 125839807 3D AAGTCTGACA TAC/--- TACTGGCCAG 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TAC 2 1 197883 CASAVA_Build 12 125840906 1D TACTAAAGTC A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 46 26 17 4 A 7 6 197884 CASAVA_Build 12 125846955 3D TCCTATTTGC TGT/--- TGTTGTTTGC 3070 het 3070 ref 42 25 15 5 TGT 3 2 197885 CASAVA_Build 12 125848057 1D AATTAATTCA C/- CAGAGTTGAG 3070 het 3070 ref 37 18 15 7 C 2 1 197886 CASAVA_Build 12 125850491 1D TATGTCACCT A/- ATGATTGTTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 2 1 197887 CASAVA_Build 12 125856318 1D CTCTCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 26 4 13 9 T 16 15 197888 CASAVA_Build 12 125859623 1I GCCCGACTAA -/T TTTTTTTTTT 1159 het 1151 hom 10 5 5 0 T 13 14 197889 CASAVA_Build 12 125866189 2D ATGTGTGCAC AT/-- GAGTGTATGT 3070 hom 234 het 88 0 77 11 AT 1 0 197890 CASAVA_Build 12 125866281 4D GTGTGTGCAT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 150 het 62 0 48 17 TG 9 7 197891 CASAVA_Build 12 125875751 1D TAATTCTTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 13 hom 37 1 36 0 A 10 9 197892 CASAVA_Build 12 125887149 1I GTCTTAATTT -/A AATCTTCATC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 2 3 197893 CASAVA_Build 12 125939528 3D ATTTGTCTCT GTG/--- GTTAGGGAGA 3070 het 3070 hom 52 21 30 2 GTG 1 0 197894 CASAVA_Build 12 125939710 1D GGATATGCAT G/- TGATGGAGGT 3070 het 3070 hom 53 20 23 12 G 1 0 197895 CASAVA_Build 12 125948315 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 219 hom 37 2 19 16 A 15 16 197896 CASAVA_Build 12 125949640 2I AATCTGCATC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 52 18 23 11 TG 8 9 197897 CASAVA_Build 12 125949720 1I CATTGCCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 A 9 10 197898 CASAVA_Build 12 125953337 2I TTCCTTTACT --/AA GAGTCACCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 2 197899 CASAVA_Build 12 125954892 3D CAAACAACTC GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 hom 90 het 38 0 30 13 GTT 4 3 197900 CASAVA_Build 12 125956517 2D18M2D29M4D CCATGTGTGT CCATGTGTGTGTCTCTGTGTGACTGTGTCTGTGTGTATGTGTGTGCATCTGAGTC/--GTGTGTGTGCATCTGAGT--CTGTGTGTGCATGCATCTCTGTGTGTCTG---- TGTGTGCATG 3070 het 3070 ref 59 43 12 19 N/A 0 0 197901 CASAVA_Build 12 125958171 1I AGAGTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 701 hom 24 3 12 9 A 15 16 197902 CASAVA_Build 12 125975710 1I AATAATAGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 9 197903 CASAVA_Build 12 125988667 1D ATTATCTGTC A/- ACAATTATTA 3070 hom 144 het 52 0 48 4 A 2 1 197904 CASAVA_Build 12 125992973 5I TTTTTGTGAT -----/TAAAG TAATGTTGAA 3070 hom 68 het 29 0 23 6 TAAAG 0 1 197905 CASAVA_Build 12 126015559 1I CCTAATCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 31 9 T 10 11 197906 CASAVA_Build 12 126016872 1D ATATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 32 1 26 5 T 11 10 197907 CASAVA_Build 12 126018944 1I AACAAATAAT -/G GGCAACCAAA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 G 2 3 197908 CASAVA_Build 12 126028572 1I ACAGCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 830 hom 41 2 26 13 A 11 12 197909 CASAVA_Build 12 126060380 1I CTTGGCAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 T 9 10 197910 CASAVA_Build 12 126061219 1I CATTTAAGAG -/C CCAGGAAAAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 2 3 197911 CASAVA_Build 12 126062697 1I ATGGAGCTAT -/G GGAGAATGAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 G 2 3 197912 CASAVA_Build 12 126065250 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAATACA 2157 het 2157 ref 12 6 6 0 A 6 7 197913 CASAVA_Build 12 126068963 3I GGGTAGTACC ---/GGG AGGAGAAGAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 3 197914 CASAVA_Build 12 126069124 3I AGTTTATTTT ---/CTA CAAAGAATTC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 CTA 0 1 197915 CASAVA_Build 12 126073157 1D CCAAGTTCTG C/- TCAGCTCAGC 3070 het 3070 hom 27 11 8 8 C 1 0 197916 CASAVA_Build 12 126073644 1D CTGGTAGAGC T/- TTCAGGAGAC 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 T 3 2 197917 CASAVA_Build 12 126078162 2I ACACACACAC --/AT AGACATACAT 3070 het 268 hom 26 1 21 4 AT 0 1 197918 CASAVA_Build 12 126078355 2D TATGTATGCG TA/-- TATGTGTGTG 3070 hom 69 het 28 0 24 5 TA 2 1 197919 CASAVA_Build 12 126087932 1D AGAAGCAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 13 24 9 A 10 9 197920 CASAVA_Build 12 126088327 2I AATACATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 TG 7 8 197921 CASAVA_Build 12 126089002 1D GTTTGGCTTA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 T 8 7 197922 CASAVA_Build 12 126092918 2D CAATATCATT CA/-- CTTGACACTT 3070 het 3070 hom 62 25 30 7 CA 1 0 197923 CASAVA_Build 12 126096763 5D ACAAAGAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 31 14 15 4 AAAAG 3 2 197924 CASAVA_Build 12 126101052 5I ATATATATAC -----/TATAT TATATTTGTA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TATAT 1 2 197925 CASAVA_Build 12 126110367 1D AGCCACTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 11 10 197926 CASAVA_Build 12 126117015 5D TGATTTGCTG TTAAC/----- TTATCTTCTG 3070 hom 90 het 31 0 31 1 TTAAC 1 0 197927 CASAVA_Build 12 126117292 1D ATTCCTTCAC A/- AGAGTGATTG 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 2 1 197928 CASAVA_Build 12 126119480 1I TTTCATTGGC -/A ATCTAAAGTG 3070 hom 108 het 45 0 36 9 A 1 2 197929 CASAVA_Build 12 126123766 1D43M1I ACTCTTACAG AAAAAAAAAAAACCCTCAATTCTCGGACTTAGATAATGTTTTCT-/-AAAAAAAAAACCCCTCAATTCTCGGACTTAGATAATGTTTTCTG GGAAAAAAAT 3070 hom 105 het 28 0 35 10 N/A 0 0 197930 CASAVA_Build 12 126157891 1D GTCTTCCATG T/- TTTTTTTTTT 1535 het 1535 ref 43 20 8 15 T 15 14 197931 CASAVA_Build 12 126177607 1I TCTTTTTTTG -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 6 7 197932 CASAVA_Build 12 126216046 1D CTATATCAAG A/- AAAAAAAAAA 2612 het 2612 ref 28 17 6 5 A 12 11 197933 CASAVA_Build 12 126218092 2I CAAGTATAAC --/TG TCTTTCAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 TG 0 1 197934 CASAVA_Build 12 126244443 2D TATGAGGGTC AG/-- AGAGAGGCAG 3070 hom 78 het 28 0 27 2 AG 4 3 197935 CASAVA_Build 12 126248683 1D TGTTGTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1963 hom 27 9 9 9 T 14 13 197936 CASAVA_Build 12 126255498 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2206 hom 26 7 11 8 T 12 11 197937 CASAVA_Build 12 126260005 2I ATGTCCATGG --/TA GCATTACTCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 TA 0 1 197938 CASAVA_Build 12 126267633 1D CCCATAAGTC T/- TTTTTTTTTT 2371 het 2371 ref 40 22 10 8 T 11 10 197939 CASAVA_Build 12 126270573 3D AGTTTCCTTG TCT/--- TCTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 46 19 17 12 TCT 4 3 197940 CASAVA_Build 12 126273318 2I ATTTTGTTTT --/TG TGTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 TG 2 3 197941 CASAVA_Build 12 126286927 10I TGTTTGTGTG ----------/TGTCTGTGTA TGTGTGTGCA 3070 het 3070 hom 74 33 25 16 TGTCTGTGTA 0 1 197942 CASAVA_Build 12 126286957 2D TGTGCGTATT TG/-- TGTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 84 35 28 22 TG 4 3 197943 CASAVA_Build 12 126287086 4I TACGTGTGTT ----/TGTG TGTGTAAGTG 3070 hom 190 het 93 1 75 17 TG 2 4 197944 CASAVA_Build 12 126288735 1D GTTGTGAAAC A/- AAGCCCTGTT 3070 het 3070 ref 46 21 21 5 A 3 2 197945 CASAVA_Build 12 126290284 1D GGAAGAAGAG A/- AAGGAGGGTT 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 A 3 2 197946 CASAVA_Build 12 126290395 4D CAGAGATTTT TTTA/---- TTTTATTTTA 506 het 506 ref 34 19 4 11 TTTA 1 0 197947 CASAVA_Build 12 126290874 2I AGTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 17 15 11 TG 7 8 197948 CASAVA_Build 12 126296438 9D GACTTTAATA ATGATAAAG/--------- ATGATAAAGG 3070 hom 129 het 45 0 44 4 ATGATAAAG 2 1 197949 CASAVA_Build 12 126326605 1D AGCATGGGGT G/- GGGGGTGGCC 3070 hom 97 het 41 0 31 10 G 6 5 197950 CASAVA_Build 12 126326963 2D30M12D TATCTGAAAT ACACACACACACGTATATATTACATATTATATACACACACACAC/--ACACACACACGTATATATTACATATTATAT------------ ACACACACAC 1991 het 1583 hom 34 7 6 34 N/A 0 0 197951 CASAVA_Build 12 126327532 3D ATATTTTCTC CTT/--- CTTACGATTT 3070 het 3070 hom 32 16 14 3 CTT 2 1 197952 CASAVA_Build 12 126327875 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 6 7 197953 CASAVA_Build 12 126379256 1I GCATTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 13 14 197954 CASAVA_Build 12 126379454 1D GATTGATTTA T/- GGGGAAAGCA 3070 hom 134 het 50 0 43 7 T 1 0 197955 CASAVA_Build 12 126381852 1D AAAATTATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 T 10 9 197956 CASAVA_Build 12 126388411 3I CCTCTAGAAT ---/CTC CTCCTCATTG 3070 hom 127 het 49 0 42 7 CTC 2 3 197957 CASAVA_Build 12 126398374 2I CTATTGATGG --/GT GTGTGTTCTG 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 GT 3 4 197958 CASAVA_Build 12 126401793 2D ACTGAAGGTT AG/-- AGAGTTACTG 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 AG 3 2 197959 CASAVA_Build 12 126424171 2D2M8I TTGAACGGCA ACTC--------/--TCATTAGTGA ACATCAGAAT 3070 het 3070 hom 38 19 19 1 N/A 0 0 197960 CASAVA_Build 12 126425264 1D CCTTCCTCTG T/- TCCCAGTTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 1 197961 CASAVA_Build 12 126427383 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 750 hom 32 4 19 9 A 14 15 197962 CASAVA_Build 12 126427640 1I TGTGTACCCC -/T ATTAACTTAG 3070 hom 129 het 45 0 43 2 T 0 1 197963 CASAVA_Build 12 126429372 4D AAGGAATTTT ACAA/---- AAAAAAAAAA 2340 het 743 hom 28 10 9 11 ACAA 1 0 197964 CASAVA_Build 12 126433843 1I AAGCCGCACT -/C CCCCCCCTCC 2143 het 2143 ref 24 13 8 3 C 7 8 197965 CASAVA_Build 12 126440151 2I GTGGGGGCAG --/GT GGGGGAGCTA 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 GT 0 1 197966 CASAVA_Build 12 126445692 13D TTACATGAGT CTACACATGTGTA/------------- CAATTGCATA 3070 het 3070 ref 44 28 11 9 CTACACATGTGTA 1 0 197967 CASAVA_Build 12 126451852 4D ATAAATCACA ATTT/---- ATTTATCCAC 3070 het 3070 ref 42 18 20 5 ATTT 2 1 197968 CASAVA_Build 12 126456020 11I GGATTACAGG -----------/CATGAGCCACC GCCCCGGCCC 3070 het 2076 hom 27 7 16 4 CATGAGCCACC 0 1 197969 CASAVA_Build 12 126476057 1I TGGTCCATGT -/G GTTCAGATGG 3070 het 3070 hom 49 17 20 12 G 1 2 197970 CASAVA_Build 12 126482694 1D ACAGCCCCCC T/- GAGCCACAGA 2202 het 2202 ref 36 16 8 12 T 1 0 197971 CASAVA_Build 12 126483898 1D AGCATATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 34 3 11 20 A 15 14 197972 CASAVA_Build 12 126485595 1I TCCATCTATT -/C CTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 1 2 197973 CASAVA_Build 12 126488202 1D TATTTTTTTT G/- GGGGGGGATA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 G 8 7 197974 CASAVA_Build 12 126495224 1I AATCTCCTGA -/T TTTTTTTTTT 1944 het 1944 ref 21 8 8 5 T 15 16 197975 CASAVA_Build 12 126499280 1D GAACTTTCAG C/- AACAACTGTG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 C 1 0 197976 CASAVA_Build 12 126499515 1I ATGGCCCATC -/T TGTCAGAAGG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 1 2 197977 CASAVA_Build 12 126499966 1D ATCCTCACCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 A 12 11 197978 CASAVA_Build 12 126508586 1D ATTTTCCAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 104 het 37 0 32 5 T 10 9 197979 CASAVA_Build 12 126508668 1D ATTTCCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 T 12 11 197980 CASAVA_Build 12 126512219 1I AGTTCTATCA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 6 7 197981 CASAVA_Build 12 126513220 52D CATAAAGGAA GAAAGGTAAATCAATGACTTCAGGATGTCAGGGCAAACAGGATAGTGGATAG/---------------------------------------------------- GATCTCTCAC 3070 het 3070 ref 38 28 15 4 GAAAGGTAAATCAATGACTTCAGGATGTCAGGGCAAACAGGATAGTGGATAG 1 0 197982 CASAVA_Build 12 126513665 4I TTCTTTTATT ----/GTTA GTTAGTTTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GTTA 1 2 197983 CASAVA_Build 12 126515865 2I CGTTGAAATC --/AG AGTTATGAGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AG 1 2 197984 CASAVA_Build 12 126518995 3D ATTCTAACTT CTA/--- CTCAGTGGGG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CTA 1 0 197985 CASAVA_Build 12 126527991 3D CTGAAAACCC ACG/--- ACTTTTATTA 3070 het 3070 hom 49 21 25 5 ACG 1 0 197986 CASAVA_Build 12 126537090 1I TTATATCATA -/G GCCCCCTCCC 3070 het 3070 hom 31 16 14 1 G 1 2 197987 CASAVA_Build 12 126553795 4D CAGTGTGTGC CTAT/---- CTAATACGCC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CTAT 1 0 197988 CASAVA_Build 12 126557523 6D AAATAAAAGA GTCACC/------ GTCACCGTGG 3070 hom 45 het 18 0 16 3 GTCACC 2 1 197989 CASAVA_Build 12 126558288 13I AATTTTTCAA -------------/ATCTTGACTGACC ATCTTCTCTT 3070 hom 114 het 43 0 38 7 ATCTTGACTGACC 0 1 197990 CASAVA_Build 12 126562620 1I TTGTAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 36 1 24 11 A 10 11 197991 CASAVA_Build 12 126563297 1D54M4D CAGATCCAAG AAGCTCGATGAGCTTCAAGCACAAGAAATGTGAAGAAAATCACTAGAAGACACATAATG/-AGCTCGATGAGCTTCAAGCACAAGAAATGTGAAGAAAATCACTAGAAGACACAT---- AATGATCCAG 3070 hom 158 het 36 0 53 23 N/A 0 0 197992 CASAVA_Build 12 126563530 1I TAAAAGGGTT -/G AAAAACAAAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 0 1 197993 CASAVA_Build 12 126563759 2D GGGTGGATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 80 het 37 0 28 9 AC 9 8 197994 CASAVA_Build 12 126564140 5D AAAAAAAAAT TATTA/----- TATATATTTT 2481 hom 15 het 10 0 6 4 TATTA 1 0 197995 CASAVA_Build 12 126564835 3D CATGGAAGAC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 37 10 A 12 9 197996 CASAVA_Build 12 126569587 1I TGTGTTGTTT -/C CCTCCCTGTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 2 3 197997 CASAVA_Build 12 126584390 8I ATACATTGGT --------/TACATTGG TTGTGTACCC 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 TACATTGG 0 1 197998 CASAVA_Build 12 126586046 1D AATTTTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 10 9 197999 CASAVA_Build 12 126588444 3D ATTTCTACCA ACC/--- CCCCCCCCCA 2645 hom 46 het 19 0 15 4 ACC 1 0 198000 CASAVA_Build 12 126590441 1I GCATGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 A 10 11 198001 CASAVA_Build 12 126590731 2D TGAAAAATAT TA/-- TGTTAGGGCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TA 1 0 198002 CASAVA_Build 12 126623806 3D TCATTGGGAG AAA/--- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 36 10 18 10 A 10 7 198003 CASAVA_Build 12 126624095 1D TCTTTGACAC A/- GAGCCTTCTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 1 0 198004 CASAVA_Build 12 126629363 1D TGGTTAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 12 11 198005 CASAVA_Build 12 126635064 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 8 8 A 13 12 198006 CASAVA_Build 12 126636782 12D ATGTTCTTGC AAAGGACTTGAT/------------ TTACGGCTGC 777 het 777 ref 40 22 2 20 AAAGGACTTGAT 1 0 198007 CASAVA_Build 12 126645481 3I AGCTTTGAAT ---/GCA GCAGCCCAAC 3070 hom 72 het 26 0 23 3 GCA 1 2 198008 CASAVA_Build 12 126647093 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2501 hom 21 het 8 0 8 0 A 16 14 198009 CASAVA_Build 12 126647258 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 4 A 23 10 198010 CASAVA_Build 12 126649920 3I ATCTTCCCTA ---/AAT AATTTCCAAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAT 1 2 198011 CASAVA_Build 12 126662443 1D TGGGCAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2162 hom 32 11 11 10 A 11 10 198012 CASAVA_Build 12 126691041 1D TAGAACTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 823 hom 35 2 25 8 A 11 10 198013 CASAVA_Build 12 126693208 4D CAACTCTCTC TCTA/---- TCTTTCTTTA 3070 hom 96 het 42 0 35 8 TCTA 1 0 198014 CASAVA_Build 12 126694466 5I ATGGTTTAAG -----/GACCT GTTGGCTGAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 GACCT 0 1 198015 CASAVA_Build 12 126696975 1I TAAGATAAAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 76 het 29 0 26 3 A 8 9 198016 CASAVA_Build 12 126711150 8I GTCGCTACAG --------/CTAAGCCA CTAAGCCAAG 3070 het 3070 hom 43 23 17 3 CTAAGCCA 1 2 198017 CASAVA_Build 12 126712640 3D GCAGGTCCTC ATT/--- GTTGAATCAG 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 ATT 1 0 198018 CASAVA_Build 12 126717197 1D ACCGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2465 het 2465 ref 37 15 9 13 A 17 16 198019 CASAVA_Build 12 126725932 4D GTTATTGGTG CTTT/---- CTTTCATGGG 3070 het 3070 hom 37 14 20 6 CTTT 2 1 198020 CASAVA_Build 12 126730282 1I CAACATGAGA -/T TTTTTTTTTT 2037 het 2037 ref 35 23 6 6 T 10 11 198021 CASAVA_Build 12 126740211 3D ATGTTATTCA CTT/--- CTTCAAAATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 7 CTT 2 1 198022 CASAVA_Build 12 126742617 1I TTTCTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 39 2 19 18 A 11 12 198023 CASAVA_Build 12 126744971 1I ATAATGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 36 3 27 6 T 13 14 198024 CASAVA_Build 12 126745862 4D TATCATATAT ATAC/---- ATATATGACA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 ATAC 1 0 198025 CASAVA_Build 12 126746927 1D GTGGAGGTGC T/- TGATGACGGT 3070 hom 128 het 55 0 39 16 T 2 1 198026 CASAVA_Build 12 126747147 1D AGTGGAAGTG A/- ATGATGTTGG 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 2 1 198027 CASAVA_Build 12 126749154 1D TGTTCTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 10 9 198028 CASAVA_Build 12 126750734 1I GCAGTTACTA -/C CTTGGAACCT 3070 het 3070 hom 47 24 20 3 C 1 2 198029 CASAVA_Build 12 126754038 1I AAACTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 33 0 18 15 A 12 13 198030 CASAVA_Build 12 126754518 5D TGTAAAAGTA TTCTC/----- TTCTCATAAA 3070 het 1011 hom 17 3 13 2 TTCTC 2 1 198031 CASAVA_Build 12 126758588 2D GTCTCCACAC AT/-- AGTCATTGTG 3070 hom 58 het 28 0 21 8 AT 1 0 198032 CASAVA_Build 12 126760798 1I ACAGCTTTGA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 T 6 7 198033 CASAVA_Build 12 126772866 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAATA 73 het 67 hom 16 1 1 16 A 9 8 198034 CASAVA_Build 12 126775541 1D TTCCTGTATA G/- CCTGCAGAAC 3070 hom 69 het 27 0 23 5 G 1 0 198035 CASAVA_Build 12 126781982 1D TTGAGGTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 41 3 30 8 A 13 12 198036 CASAVA_Build 12 126782474 3D GATGATTTTG GAA/--- GAAGACTTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 GAA 2 1 198037 CASAVA_Build 12 126783616 1I GCCAATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1082 hom 38 3 30 5 T 11 12 198038 CASAVA_Build 12 126789107 17I AATTGTAATG -----------------/CCCAGGATGGGGTTACC CCTCCTGCAG 3070 hom 75 het 32 0 25 7 CCCAGGATGGGGTTACC 0 1 198039 CASAVA_Build 12 126794592 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 31 1 25 5 A 14 11 198040 CASAVA_Build 12 126797688 1D TCTTACTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1927 hom 38 8 12 18 T 15 14 198041 CASAVA_Build 12 126802230 1I TCATGCTGCT -/A AATGAAGACA 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 A 2 3 198042 CASAVA_Build 12 126802564 2D TATTATATTC GT/-- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 18 23 2 GT 1 0 198043 CASAVA_Build 12 126805898 1I AACTGAAGCA -/G GGGCAAAGAT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 G 3 4 198044 CASAVA_Build 12 126817331 1D TTAGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 965 hom 36 3 25 8 T 12 11 198045 CASAVA_Build 12 126819377 1D TGATGTGGAA T/- TTGCAGTTCT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 3 2 198046 CASAVA_Build 12 126819645 7D ATAAACAATA CTGTACC/------- CTGTACCCTG 3070 hom 108 het 40 0 35 8 CTGTACC 2 1 198047 CASAVA_Build 12 126823938 1I TGTTAATAAT -/A GGGGCAAACA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 0 1 198048 CASAVA_Build 12 126825949 2D TCAAAACTTC AA/-- AGAGTCATTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 3 1 198049 CASAVA_Build 12 126826393 6I AAAAAAAAAA ------/GCTTCT AGCTTCTAAC 3070 hom 45 het 23 0 14 9 GCTTCT 0 1 198050 CASAVA_Build 12 126827022 2D CATAAAGATC AG/-- AGTCTTGCAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AG 2 1 198051 CASAVA_Build 12 126831279 1I ATCTGAACGA -/T TTTTTTTAAC 2071 het 17 hom 28 1 9 18 T 7 8 198052 CASAVA_Build 12 126832333 24D ACCAGTTACT ATTAGTAATATTATTACTAATACA/------------------------ ATTAGTAATA 3070 hom 66 het 26 0 23 6 ATTAGTAATATTATTACTAATACA 1 0 198053 CASAVA_Build 12 126838303 8D GTGTGTGCGC GTGTGCGT/-------- GTGTGCGCAT 3070 hom 125 het 45 0 40 8 GTGTGCGT 1 0 198054 CASAVA_Build 12 126839427 3D TGGGCCAGGC ATG/--- ATGTGAGATG 3070 het 3070 ref 57 28 20 10 ATG 2 1 198055 CASAVA_Build 12 126842703 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 10 11 198056 CASAVA_Build 12 126843120 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAATATA 2700 het 2700 ref 17 8 6 3 A 7 6 198057 CASAVA_Build 12 126857945 14I TTCATATTTT --------------/ATATATGTATATAA ATATATGTAT 1913 hom 10 het 4 0 4 0 ATATATGTATATAA 0 1 198058 CASAVA_Build 12 126858163 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2742 hom 18 het 8 0 7 2 A 11 10 198059 CASAVA_Build 12 126877988 15I TGCTCAGTCA ---------------/AGTTGTTATATTGCT CTTGTGGGAT 3070 hom 108 het 38 0 35 3 AGTTGTTATATTGCT 0 1 198060 CASAVA_Build 12 126879020 4D ATGTACAAGT ACAC/---- ACACACATTA 3070 het 3070 ref 59 35 20 4 AC 5 3 198061 CASAVA_Build 12 126890249 5I GACAGCAACA -----/TGAGC TGGATTGACC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 TGAGC 0 1 198062 CASAVA_Build 12 126892771 1D AATAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1557 hom 18 5 11 2 A 12 11 198063 CASAVA_Build 12 126905366 1I16M4D CTAAAGATGA -TTTTAGGAGCTTTGATAGAG/TTTTTAGGAGCTTTGAT---- AGAAGGGAGG 3070 het 3070 ref 42 24 17 11 N/A 0 0 198064 CASAVA_Build 12 126915864 1I CAAAAAAGTC -/A AAAAAACAGT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 6 7 198065 CASAVA_Build 12 126926059 3D CTCAATCCTT TGC/--- TTTCTTGTTC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 TGC 1 0 198066 CASAVA_Build 12 126941068 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 9 8 198067 CASAVA_Build 12 126941783 1D AAAAAAAAAA C/- AAAATTTTTC 3070 het 620 hom 24 5 15 4 C 1 0 198068 CASAVA_Build 12 126946465 1D TTGACTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 10 9 198069 CASAVA_Build 12 126949992 1I AAATAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 28 1 18 9 T 11 12 198070 CASAVA_Build 12 126951777 12I GCTCCAGGGT ------------/GTGCCTTCAAGA TTGCAGCCAA 3070 hom 48 het 22 0 20 2 GTGCCTTCAAGA 0 1 198071 CASAVA_Build 12 126953012 2D CTGCACACAT AA/-- AAAATATCAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 6 4 198072 CASAVA_Build 12 126953512 1D TGATACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 11 10 198073 CASAVA_Build 12 126954268 4D AGAGGAAAAC CAAT/---- CAGTCAGAAA 3070 hom 123 het 43 0 41 3 CAAT 1 0 198074 CASAVA_Build 12 126955179 3I AAAATAGATT ---/CGA TGATATAGTG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 CGA 0 1 198075 CASAVA_Build 12 126955453 1I ACTGAAAAAA -/C AATGGTTTGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 0 1 198076 CASAVA_Build 12 126955693 1I GTACCTAAAA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 8 198077 CASAVA_Build 12 126957483 1D TGGAAAATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 38 0 38 1 A 10 9 198078 CASAVA_Build 12 126958695 4D TTCCAAAGAA CAGT/---- CAGACTTCCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CAGT 1 0 198079 CASAVA_Build 12 126959315 18I TACTACATAT ------------------/AGAGATTACTACATAGAG AGAGATTACT 3070 hom 72 het 29 0 24 6 AGAGATTACTACATAGAG 0 1 198080 CASAVA_Build 12 126959649 3D CCATCTCAAA AAT/--- AAATAAATAA 3070 hom 63 het 23 0 22 7 AAT 1 0 198081 CASAVA_Build 12 126959879 7D GGAAGCCAGC CAAGTGT/------- CCCTTAACAG 3070 hom 30 het 13 0 11 4 CAAGTGT 1 0 198082 CASAVA_Build 12 126960117 1D GGAGGATGGC T/- TGAGGCTAGG 3070 hom 38 het 19 0 9 10 T 2 1 198083 CASAVA_Build 12 126962583 1D CTACCCATGC A/- AAAAAAATTC 3070 hom 108 het 39 0 35 4 A 8 7 198084 CASAVA_Build 12 126981711 2I CCCCTGCCAA --/CT CTCTCTTGCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CT 3 4 198085 CASAVA_Build 12 126982142 1D ATGTTCCTTC T/- GATATTCTCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 0 198086 CASAVA_Build 12 126983939 5D GCAGATAGTC TATTA/----- TATTTTTTAA 3070 hom 72 het 25 0 25 4 TATTA 1 0 198087 CASAVA_Build 12 126985250 1I ATTTTGAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 9 10 198088 CASAVA_Build 12 126986313 1I ACTTGGCACT -/A AAACAAAAGC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 3 4 198089 CASAVA_Build 12 126986568 4I TTATTACAAA ----/TATT TATTTTTAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TATT 1 2 198090 CASAVA_Build 12 127001744 1D CAAACTTTTA G/- GGTAATCAAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 3 2 198091 CASAVA_Build 12 127004952 3D AACATTAGCA TGT/--- TGTGTGTCTT 3070 hom 104 het 38 0 34 4 TGT 2 1 198092 CASAVA_Build 12 127005934 2D CACGGTGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 CT 2 1 198093 CASAVA_Build 12 127006933 1D31M1D TGTCTCTATT AAAAAAAAAAATGCAAAAATTAGCTGGGTGTTA/-AAAAAAAAAATGCAAAAATTAGCTGGGTGTT- ATAGTGGTGT 3070 hom 93 het 30 0 31 6 N/A 0 0 198094 CASAVA_Build 12 127007105 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 31 0 21 10 A 15 13 198095 CASAVA_Build 12 127007524 1D TAAATAATCC T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 7 6 198096 CASAVA_Build 12 127008175 9D GGGTAGTTGG AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 1537 het 358 hom 37 8 5 25 A 25 16 198097 CASAVA_Build 12 127011250 22D AAAGTTTTAT ACACACACACACACACACACAC/---------------------- ACACACACAC 3070 het 3 hom 35 1 26 19 AC 21 10 198098 CASAVA_Build 12 127011802 2D TCAGACAGCT GG/-- GGGCTCAGGC 3070 hom 71 het 26 0 22 4 G 5 3 198099 CASAVA_Build 12 127015538 1D ATTTAAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 102 het 40 0 33 7 A 9 8 198100 CASAVA_Build 12 127016011 4D CATTTTATAC TTAA/---- TTATTTCGCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTAA 1 0 198101 CASAVA_Build 12 127018440 5D GCTTTGTTGC TTAGA/----- TATTTCTTCC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 TTAGA 1 0 198102 CASAVA_Build 12 127020220 1I AGCTTATGGC -/T TTTCTTTGGT 3070 hom 125 het 47 0 41 6 T 3 4 198103 CASAVA_Build 12 127020692 1I ACATCATAGG -/T TTTTTTTTTT 1276 het 1276 ref 39 31 3 5 T 11 12 198104 CASAVA_Build 12 127023505 1D ACACTGTAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 42 0 35 9 T 9 8 198105 CASAVA_Build 12 127024647 1I AGTACATGTT -/A AGAGTTCACT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 1 2 198106 CASAVA_Build 12 127024999 5D ATTTTTCATA TTTTG/----- TTTTAATAGT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 TTTTG 1 0 198107 CASAVA_Build 12 127061575 1D ATTTTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 644 het 644 ref 28 19 3 6 T 12 11 198108 CASAVA_Build 12 127072971 4D TTTAAATTGC GTGA/---- GTGAGTTCAT 3070 het 3070 ref 40 23 13 5 GTGA 2 1 198109 CASAVA_Build 12 127074019 1D GGTTTTGAGG C/- CAACCCATCA 3070 het 3070 hom 38 12 18 9 C 2 1 198110 CASAVA_Build 12 127076733 3D TCAAAAAAAA AAC/--- AAACAAACAA 3070 het 152 hom 30 2 16 12 AAC 1 0 198111 CASAVA_Build 12 127083102 1I AGATCTAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 39 1 33 5 T 10 11 198112 CASAVA_Build 12 127088426 2D ATGTGCGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 GT 10 9 198113 CASAVA_Build 12 127089149 1I AGACTTTTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 9 198114 CASAVA_Build 12 127089656 1I CTAACTCAGC -/A AAGGGCATGG 3070 hom 105 het 47 0 35 12 A 2 3 198115 CASAVA_Build 12 127113964 1I GGCCAGTCTC -/T TAACTCCTGA 3070 hom 78 het 29 0 27 5 T 1 2 198116 CASAVA_Build 12 127117198 2D TCTCTTTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 50 het 33 1 27 6 CT 8 7 198117 CASAVA_Build 12 127118440 9D GAAAGGGTGG AAATTTTAT/--------- GGCTGATCTC 3070 hom 141 het 47 0 48 2 AAATTTTAT 1 0 198118 CASAVA_Build 12 127119622 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGGTCTCA 3070 hom 74 het 29 0 25 4 G 6 5 198119 CASAVA_Build 12 127129412 1I TTGGGGTTTT -/A ACACATAAAG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 A 1 2 198120 CASAVA_Build 12 127134044 1D ACTCAGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1939 hom 21 6 11 4 A 13 12 198121 CASAVA_Build 12 127138511 1I GGCACTGAGC -/A AAATGACCCT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 3 4 198122 CASAVA_Build 12 127138848 2D CATGTATTTA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 38 11 12 16 CT 9 8 198123 CASAVA_Build 12 127139823 2I ATTAAAAAAC --/AA AATTTAAGGA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 2 4 198124 CASAVA_Build 12 127141612 2D CCAGCACAGA AT/-- CAGGGAACAC 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 AT 1 0 198125 CASAVA_Build 12 127145782 7I GGGGATGTTT -------/AGGGGAC AGGCTCTCCC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 AGGGGAC 0 1 198126 CASAVA_Build 12 127148056 1I TACAGCCTTT -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 7 8 198127 CASAVA_Build 12 127150384 2I TCCATCACAC --/TG TGTCCGAATA 3070 het 3070 hom 42 11 25 6 TG 1 2 198128 CASAVA_Build 12 127150737 1D TTCAGGGATA C/- CCCTGAAGGA 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 C 4 3 198129 CASAVA_Build 12 127166319 1D AACAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 31 22 3 6 A 11 10 198130 CASAVA_Build 12 127188100 1D TGACTAAAAT G/- TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 G 1 0 198131 CASAVA_Build 12 127190912 2I GAGAAATGAC --/AG GGAACATTTC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 AG 0 1 198132 CASAVA_Build 12 127192123 1D TGTTTGCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1614 hom 45 10 22 15 T 14 13 198133 CASAVA_Build 12 127195634 2D TACATTTGAA AT/-- ATATATATTA 3070 het 3070 ref 44 19 20 6 AT 5 4 198134 CASAVA_Build 12 127195925 5I GGGAACCCAA -----/ACTCT ACTCTACTGC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 ACTCT 1 2 198135 CASAVA_Build 12 127200112 2D CGTTGTGGGG TT/-- TTAAAATAAA 2244 het 2244 ref 18 9 6 3 T 4 2 198136 CASAVA_Build 12 127200693 1I ATTACATCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 17 19 11 T 9 10 198137 CASAVA_Build 12 127201490 6D CAACAACAAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 643 hom 29 4 12 16 AT 10 7 198138 CASAVA_Build 12 127212766 2D ATACAGCGTG CA/-- CACACACATA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 CA 5 4 198139 CASAVA_Build 12 127214821 3D CTACCTCCAC CAT/--- CATCATCTCC 3070 het 3070 ref 58 30 22 8 CAT 3 2 198140 CASAVA_Build 12 127218399 1I CCTGAAAAGA -/C CCCCTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 C 4 5 198141 CASAVA_Build 12 127222523 1I AAAAGCAAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 7 8 198142 CASAVA_Build 12 127226709 1I TATATTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2164 hom 42 6 18 18 T 15 16 198143 CASAVA_Build 12 127232420 1I TGAGTATACT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 7 8 198144 CASAVA_Build 12 127233216 2I TAGGTATGAC --/AT AGCCCCTATA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 AT 0 1 198145 CASAVA_Build 12 127233340 3D ATTATTTCTC CTT/--- CTTCCCAACT 3070 het 3070 ref 55 28 22 8 CTT 2 1 198146 CASAVA_Build 12 127235683 3I ACTCTATTTT ---/TCA TCATTTTCTC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 TCA 1 2 198147 CASAVA_Build 12 127239413 10I AGTGAGAACA ----------/TGAGGGTGTG TGAGGGTGTG 3070 het 3070 ref 63 27 19 17 TGAGGGTGTG 1 2 198148 CASAVA_Build 12 127239486 4I12M2D GAGGGCATGT ----GTGAGAATGTAAGT/GTGAGTGAGAATGTAA-- GTGTGTAAGT 3070 het 2760 hom 54 11 33 19 N/A 0 0 198149 CASAVA_Build 12 127240211 4I ACCAGTGTTA ----/GTGT GTGTGCGGGT 3070 het 3070 ref 77 36 26 15 GT 2 4 198150 CASAVA_Build 12 127240490 2I39M4D ACTCTGTGTG --GTGTGTGTGCGTGTGTGAGACTATGAGACTGTTAGAGTATGTT/GTGTGTGTGTGCGTGTGTGAGACTATGAGACTGTTAGAGTA---- TGTGGGGGGT 3070 het 3070 ref 62 42 21 14 N/A 0 0 198151 CASAVA_Build 12 127240612 2I16M2I14M6D TGTATGTGAC --TGTGTGTGTATGAGTC--TGTGTCTGAGTAGCGTGTGT/TGTGTGTGTGTATGAGTCTGTGTGTCTGAGTAGC------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 39 30 11 7 N/A 0 0 198152 CASAVA_Build 12 127242758 18D TATATACATT TATATATATATATATATA/------------------ TATATGTATG 3070 hom 60 het 21 0 21 1 TA 11 2 198153 CASAVA_Build 12 127265979 1I TGCTAGGAAA -/C CCCCCCTTAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 C 6 7 198154 CASAVA_Build 12 127300408 5D CTAGGGACAC AGAAA/----- AGAAACACCC 3070 het 3070 ref 44 23 17 6 AGAAA 2 1 198155 CASAVA_Build 12 127305474 2D CCTGAGGAAT CG/-- CGCCACACTG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CG 2 1 198156 CASAVA_Build 12 127311196 1I CGTGAAATCA -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 T 6 7 198157 CASAVA_Build 12 127311556 1I TCTCATTCCC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 57 20 28 9 T 8 9 198158 CASAVA_Build 12 127314775 1I TTCTTCCTCA -/T TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 T 6 7 198159 CASAVA_Build 12 127314905 1D ACCCATATGT C/- CCGTCTACAG 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 C 3 2 198160 CASAVA_Build 12 127315935 2I CATTTAAATG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 15 17 7 A 9 11 198161 CASAVA_Build 12 127320320 1I TGCTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 A 11 12 198162 CASAVA_Build 12 127324827 3I ATGTATAACA ---/TTT TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 7 10 198163 CASAVA_Build 12 127339660 4I GCACGCTCAT ----/ACAC ACGCATGCAC 3070 hom 176 het 75 0 58 17 AC 1 3 198164 CASAVA_Build 12 127343433 1D GTTTTCTGTG T/- GTTGGTGTAG 3070 het 3070 hom 66 10 39 18 T 1 0 198165 CASAVA_Build 12 127343451 2D TAGGTATGTG TA/-- TGTGTGTGTG 3070 het 575 hom 55 4 17 35 TA 1 0 198166 CASAVA_Build 12 127343972 1D ACCTCCTTAC A/- GAATTTCAAA 3070 het 3070 ref 32 19 12 3 A 1 0 198167 CASAVA_Build 12 127345959 2D ATGAGAAAAC TG/-- AGACGTGTAG 3070 het 3070 ref 47 28 15 4 TG 1 0 198168 CASAVA_Build 12 127347548 1D TCAAATGGTC T/- TTTTTTTTTC 1129 het 1129 ref 46 35 3 8 T 10 9 198169 CASAVA_Build 12 127348891 1D GTTATGTTGA T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 7 6 198170 CASAVA_Build 12 127354727 11I TCTTTACCTG -----------/AGAACAAATGC AGAATCGAGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AGAACAAATGC 0 1 198171 CASAVA_Build 12 127354874 10I CAGCATTTTG ----------/GGATACCTGA GGTGGGTAGA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 GGATACCTGA 0 1 198172 CASAVA_Build 12 127357925 2D TCCAGATTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 8 A 13 11 198173 CASAVA_Build 12 127358849 1D CCTTGGCCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 T 10 9 198174 CASAVA_Build 12 127393083 8I CTCCCTCCTT --------/TTATTCTG TTCTTCTGTT 3070 hom 114 het 41 0 36 5 TTATTCTG 0 1 198175 CASAVA_Build 12 127393920 1D GACTCAGTCT A/- AAAAAAAAAA 2799 het 268 hom 23 1 14 8 A 17 16 198176 CASAVA_Build 12 127425489 1I AAACCATTCC -/G CAGCCTCAGC 2457 hom 21 het 10 0 7 3 G 0 1 198177 CASAVA_Build 12 127428618 3D TTTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 13 10 198178 CASAVA_Build 12 127428923 1I CAAGAGCAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 8 198179 CASAVA_Build 12 127443285 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 1279 het 1185 hom 18 8 3 7 A 17 16 198180 CASAVA_Build 12 127444197 1D CCCAGTTCCT G/- CTGTTATTCC 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 G 1 0 198181 CASAVA_Build 12 127445406 1D CTTATTTTCC A/- AAAAAAAAAA 1667 het 1667 ref 40 24 6 10 A 15 14 198182 CASAVA_Build 12 127450491 1D AGGCTGAACT A/- TCTACTGCCT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 A 1 0 198183 CASAVA_Build 12 127454221 1D CAAAACAAAA C/- AAAATCCTCA 3070 hom 108 het 45 0 37 9 C 1 0 198184 CASAVA_Build 12 127455475 33D GCAATGAACG TGCTGTCCACATGGAGGCCAGATAGGCAGGTGC/--------------------------------- AGCTGTCACC 3070 hom 77 het 25 0 24 7 TGCTGTCCACATGGAGGCCAGATAGGCAGGTGC 1 0 198185 CASAVA_Build 12 127460871 2I GAATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 114 het 48 0 39 9 AC 5 6 198186 CASAVA_Build 12 127470074 3D ACTAATCTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 38 1 28 10 T 16 13 198187 CASAVA_Build 12 127474953 1D TGCTAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 985 het 985 ref 54 40 4 10 A 13 12 198188 CASAVA_Build 12 127478746 4I TTTTTCCCTA ----/TAAC TAAAACTTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TAAC 0 1 198189 CASAVA_Build 12 127484293 2I AGAGTCCTCC --/TG TGGCTAGCAT 3070 het 3070 ref 35 12 14 9 TG 1 2 198190 CASAVA_Build 12 127495696 1I AATGTTACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 32 0 27 5 A 11 12 198191 CASAVA_Build 12 127536087 1I ACTGGGGAGT -/G GGGGTGCTAC 2906 het 2906 ref 28 15 9 4 G 4 5 198192 CASAVA_Build 12 127548874 1D TGTTCTATAT A/- AAAAAAAACC 3070 het 2336 hom 34 9 18 7 A 9 8 198193 CASAVA_Build 12 127553670 3D GTGAAGAAAA GTT/--- GTAGACTATC 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 GTT 1 0 198194 CASAVA_Build 12 127556408 1I ATGGCACTTG -/A CATTCCACAG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 0 1 198195 CASAVA_Build 12 127567101 1D CAAAGGAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 17 hom 33 3 28 3 A 10 9 198196 CASAVA_Build 12 127585875 4D ACAAAGAACT CAAA/---- CAAATTTACA 1768 het 1140 hom 9 3 5 3 CAAA 2 1 198197 CASAVA_Build 12 127587037 4I TGAAAAAAAA ----/AGAG AGAGAAGGTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 AG 2 4 198198 CASAVA_Build 12 127587248 2D AGGGGGTGCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 18 9 11 TG 9 8 198199 CASAVA_Build 12 127588627 3I GTAGTAGTAG ---/TAT TAGTATTTTG 3070 het 2622 hom 27 11 13 3 TAT 0 1 198200 CASAVA_Build 12 127588795 1D ATTTTTTTTG T/- ATTTTCAGTA 2693 het 2693 ref 19 10 7 3 T 1 0 198201 CASAVA_Build 12 127595141 1I CACAATTATA -/G GCGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 G 1 2 198202 CASAVA_Build 12 127624573 1I TCCACACAGT -/C CCAGAGGAGC 3070 hom 123 het 45 0 40 5 C 2 3 198203 CASAVA_Build 12 127627462 1I TTTTAAAGTG -/T TACCATCCAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 198204 CASAVA_Build 12 127633793 4D AACATATACA TAAG/---- TAAGAGTTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TAAG 2 1 198205 CASAVA_Build 12 127640951 1I GCTTAGAAAA -/T TGACAGTTGG 3070 hom 137 het 53 0 45 8 T 1 2 198206 CASAVA_Build 12 127649556 1I AGCCTGGGTG -/T TTTTTTGCCC 3070 het 1985 hom 24 9 10 5 T 6 7 198207 CASAVA_Build 12 127661705 1I CAGGAAGTCC -/G TTTGAAGCCC 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 G 0 1 198208 CASAVA_Build 12 127682754 1I TCACCAGTGC -/A AGCAAGGATT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 A 1 2 198209 CASAVA_Build 12 127702386 1I AAGGGGTCCA -/G ATTCCACAGA 3070 het 3070 hom 51 14 28 9 G 0 1 198210 CASAVA_Build 12 127724092 1I ATATAAAACA -/C CTTTGAAAAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 C 1 2 198211 CASAVA_Build 12 127732175 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACCC 1803 hom 43 het 20 0 12 10 AG 2 1 198212 CASAVA_Build 12 127745859 1D CTCTACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3033 het 2763 hom 21 9 7 6 T 12 11 198213 CASAVA_Build 12 127749629 2I CAGTGCAGAC --/TG TGTGCAAAAT 3070 het 3070 ref 61 31 23 7 TG 2 3 198214 CASAVA_Build 12 127753817 1D CTCCAATAGG C/- CCCAGTGTGT 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 C 4 3 198215 CASAVA_Build 12 127760997 1I CGCCGACTCT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 23 11 10 A 8 9 198216 CASAVA_Build 12 127766761 1D TTAAAAAAAA T/- TCAGATTAAG 3070 hom 93 het 36 0 31 6 T 2 1 198217 CASAVA_Build 12 127770915 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 A 12 11 198218 CASAVA_Build 12 127774810 2I CACCTGCCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 A 11 13 198219 CASAVA_Build 12 127783478 1D GCAAGAGAAG C/- CCCCCTTGCA 3070 hom 76 het 31 0 24 7 C 6 5 198220 CASAVA_Build 12 127787768 1I GATTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 29 21 11 A 10 11 198221 CASAVA_Build 12 127802523 2D CTGCTGAAAC TG/-- TGTTCTTAAG 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 TG 2 1 198222 CASAVA_Build 12 127802827 4I ACTGATGTAT ----/ATAC ATGTGCCAGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATAC 0 1 198223 CASAVA_Build 12 127803867 1D CCTCCCCCGT C/- CCTGTTAACA 3070 hom 141 het 49 0 46 4 C 3 2 198224 CASAVA_Build 12 127811648 1D CCGCACCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 117 hom 19 1 17 2 A 12 11 198225 CASAVA_Build 12 127829703 1I TCCTAGAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2222 hom 28 8 14 6 A 9 10 198226 CASAVA_Build 12 127836360 2I TTGGGGGCGG --/GT GGGTGGTAAT 3057 het 3057 ref 32 17 9 6 GT 0 1 198227 CASAVA_Build 12 127844284 1I AGTTTATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 16 10 T 10 11 198228 CASAVA_Build 12 127847892 1I TACCTTCTGA -/G GGGGGGCAGT 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 G 6 7 198229 CASAVA_Build 12 127853622 4D AGCAGTCAGG ATAA/---- ATGAGCCAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 5 ATAA 1 0 198230 CASAVA_Build 12 127854337 1I CGACACGACG -/A AATTGGACAG 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 A 2 3 198231 CASAVA_Build 12 127863387 1D TAGCCCCTGC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 8 7 198232 CASAVA_Build 12 127864422 4I ATTATTCCTC ----/AATA AATAAAGAGT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 AATA 1 2 198233 CASAVA_Build 12 127871155 4I TGTCATGTAG ----/ACTA ACTAAGTAGT 3070 het 3070 ref 63 31 26 6 ACTA 1 2 198234 CASAVA_Build 12 127876979 4I TGTATATATA ----/TATG TGTGTCTATA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TATG 0 1 198235 CASAVA_Build 12 127887405 1I CTCCTTCTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 10 198236 CASAVA_Build 12 127891763 4D TTTTTCCTCT TCTC/---- TCTCTCTATC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 TC 5 3 198237 CASAVA_Build 12 127899961 12D TAGAGAGACT AGAAAAGAGATA/------------ ATCACAGAGT 3070 het 3070 ref 35 26 10 6 AGAAAAGAGATA 1 0 198238 CASAVA_Build 12 127905163 1I CCCGGCTGAT -/T TTTTGTATTT 2531 het 1834 hom 12 5 6 1 T 5 6 198239 CASAVA_Build 12 127912292 1D CAAGGCAGTA C/- TTTCCCTTCC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 C 1 0 198240 CASAVA_Build 12 127913876 1D ATAATTTATT A/- TTTTTTTTTT 2626 het 2626 ref 21 11 8 2 A 1 0 198241 CASAVA_Build 12 127920438 1D GTGTATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 765 hom 28 3 15 10 T 17 16 198242 CASAVA_Build 12 127951135 1D AATACCAAAC T/- TTTTTTTTTT 2737 het 2470 hom 36 12 8 16 T 17 16 198243 CASAVA_Build 12 127955122 17D GAAAACAGTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3070 het 198 hom 25 4 14 13 T 28 11 198244 CASAVA_Build 12 127955580 4I TTCCCACCCT ----/AAAC AAACACTCAG 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 AAAC 1 2 198245 CASAVA_Build 12 127959828 2I TATTACTTTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 9 11 198246 CASAVA_Build 12 127973421 14D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1444 hom 20 6 12 4 A 24 10 198247 CASAVA_Build 12 127976734 2D TAATAATAAT AA/-- GAGTAGGAGA 1278 het 457 hom 10 2 3 5 A 2 0 198248 CASAVA_Build 12 127982422 6I CACGCACACA ------/CGCACG CACACACACA 3070 het 634 hom 42 6 17 19 CGCACG 0 1 198249 CASAVA_Build 12 127983647 1D TTTAGGACGT G/- GGGAAGCCCT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 G 4 3 198250 CASAVA_Build 12 128004242 2D CTAAAATAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 19 1 11 7 T 14 12 198251 CASAVA_Build 12 128005814 2D ATACAGTCTC TT/-- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 43 19 15 11 T 3 1 198252 CASAVA_Build 12 128022507 2D TTTTCCCTGA CT/-- CTCTGTCGCA 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 CT 3 2 198253 CASAVA_Build 12 128023004 3D TGACTGGGTG CTC/--- CTCCTTTCAC 3070 het 3070 hom 48 18 22 9 CTC 2 1 198254 CASAVA_Build 12 128025957 1I GTTTTTTATT -/C TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 C 0 1 198255 CASAVA_Build 12 128030251 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 11 12 198256 CASAVA_Build 12 128035707 3I TTATTTATTT ---/TTA TTATTATTTT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 TTA 2 3 198257 CASAVA_Build 12 128037269 6D49M14D AGACTGCCTC AAACAAAAACAAAAACAAAACACAAACTATATATACATATGTGTGTGTGTATATATAAATACACATATG/------AAACAAAAACAAAACACAAACTATATATACATATGTGTGTGTGTATATA-------------- TATATATACA 1639 het 1639 ref 22 28 4 2 N/A 0 0 198258 CASAVA_Build 12 128040592 1D TTTGGCTTTT A/- TTTATTTATT 3070 het 2910 hom 22 7 14 1 A 1 0 198259 CASAVA_Build 12 128045226 4D TCTCTCTGGT TCTC/---- TCTGTCTCTG 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 TC 3 1 198260 CASAVA_Build 12 128048133 1D TAATGAGGGG A/- TCAGTGGAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 1 0 198261 CASAVA_Build 12 128049494 5D TCCCAGCATA TATGT/----- TATAAACAGA 3070 het 3070 ref 57 27 22 11 TATGT 1 0 198262 CASAVA_Build 12 128053668 3I TTTTTTTTTT ---/TTC CTGTGTTGTA 1754 hom 16 het 14 0 5 9 TTC 0 1 198263 CASAVA_Build 12 128054118 6I AATAATAATA ------/AATAAT AATAATAATT 1876 hom 12 het 5 0 5 0 AAT 3 5 198264 CASAVA_Build 12 128054662 4D AAGTAGGTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2684 het 236 hom 36 5 11 24 T 20 16 198265 CASAVA_Build 12 128058506 2I CTGGTGATTT --/AA AAGTGTGCAG 3070 hom 106 het 40 0 34 6 A 2 4 198266 CASAVA_Build 12 128063005 1D TTTCTGTCTC T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 T 7 6 198267 CASAVA_Build 12 128063108 1D TTTGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 14 8 A 12 11 198268 CASAVA_Build 12 128069573 2D CATCCAGGGC CA/-- CACACACACT 3070 hom 147 het 62 0 47 15 CA 5 4 198269 CASAVA_Build 12 128077739 4D CTCAAAAAAT AAAA/---- AAAAGAAATA 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 A 8 4 198270 CASAVA_Build 12 128079053 3I ATAAGCCAGG ---/TCT TCTTCATTCA 3070 het 3070 hom 55 21 22 12 TCT 1 2 198271 CASAVA_Build 12 128081200 1D AACTCCGTCT C/- AAAAAAAAAA 2607 het 1348 hom 23 7 11 5 C 1 0 198272 CASAVA_Build 12 128084564 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1920 het 1920 ref 35 9 10 16 T 15 14 198273 CASAVA_Build 12 128100957 8I GTTTGTTACC --------/TTGAGGGT GTGTGTGCGA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 TTGAGGGT 0 1 198274 CASAVA_Build 12 128104435 1I TTCCTCAGAG -/A GGGGGGGGGT 3070 het 2258 hom 25 10 8 7 A 0 1 198275 CASAVA_Build 12 128105030 2D AGAAACAGAG TA/-- TATATATATA 3070 het 34 hom 44 1 38 5 TA 8 7 198276 CASAVA_Build 12 128106350 1I GGGTGCATTC -/T TTTTTTTTTT 1139 het 524 hom 15 3 4 8 T 13 14 198277 CASAVA_Build 12 128106372 4D TAATAGTATC ATTA/---- ATTCTTTTTT 2072 hom 11 het 12 0 6 6 ATTA 1 0 198278 CASAVA_Build 12 128122642 5D CAAAATTACA GAGAT/----- GAGATGGAGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 GAGAT 2 1 198279 CASAVA_Build 12 128126080 1I CAGGCTGTGG -/T TTTTGCCAGC 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 T 4 5 198280 CASAVA_Build 12 128126904 1D CTTGAGTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 9 8 198281 CASAVA_Build 12 128128156 2D ACGGACACAC AT/-- AAAGCAAAAA 3070 het 3070 ref 76 46 25 7 AT 1 0 198282 CASAVA_Build 12 128137202 3I ATATACAAAC ---/TTA TTATATATAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TTA 1 2 198283 CASAVA_Build 12 128147455 3I TCAAAACCGT ---/CCA CCATGTGGCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CCA 1 2 198284 CASAVA_Build 12 128152983 2I TCACACAATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 72 26 33 13 CA 6 7 198285 CASAVA_Build 12 128168077 1I ATGACCTTAA -/G GAAATGGCCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 1 2 198286 CASAVA_Build 12 128186153 1I GAACAAATAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 21 23 6 T 9 10 198287 CASAVA_Build 12 128188389 2I AAATAAGAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 10 12 198288 CASAVA_Build 12 128196575 1D CATACTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 T 12 11 198289 CASAVA_Build 12 128208884 1D48M1D GGTTTTTGAG AAAAAAAAAATAATGCATTTGCTTTTAGACATCTTGAGTTTAAGTTATCT/-AAAAAAAAATAATGCATTTGCTTTTAGACATCTTGAGTTTAAGTTATC- GTGTGATACC 3070 hom 187 het 56 0 63 8 N/A 0 0 198290 CASAVA_Build 12 128216190 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCTACAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 4 5 198291 CASAVA_Build 12 128221305 1I GACTCCAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 483 hom 23 4 17 2 A 11 12 198292 CASAVA_Build 12 128238103 1D CCCAGCTGTG C/- AATGGGAATG 3070 hom 132 het 51 0 45 7 C 1 0 198293 CASAVA_Build 12 128252511 1I TGCCTTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 33 0 29 4 A 10 11 198294 CASAVA_Build 12 128258256 1D AGCCAGTGAA T/- TTTTTTTATA 2723 het 2675 hom 23 8 7 8 T 8 7 198295 CASAVA_Build 12 128262963 3D CTTCAGATAA GAG/--- GAGGACAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 7 GAG 2 1 198296 CASAVA_Build 12 128263339 1I TGGCACTGAG -/A AAGGTATCAC 3070 het 3070 hom 55 24 26 5 A 2 3 198297 CASAVA_Build 12 128264763 1I AATTAGAGTG -/T CTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 T 0 1 198298 CASAVA_Build 12 128268222 1I AAAGGTAGCA -/T TTTTTTACAG 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 6 7 198299 CASAVA_Build 12 128271390 1I TTTAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 1817 het 1817 ref 27 12 7 8 A 13 14 198300 CASAVA_Build 12 128273414 1I TCTCACTACC -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 7 8 198301 CASAVA_Build 12 128278648 1I TTTTGGAGAA -/C CTGCCATTGA 3070 hom 102 het 40 0 33 7 C 1 2 198302 CASAVA_Build 12 128284367 1I TGGATTCAGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 19 7 12 0 A 8 9 198303 CASAVA_Build 12 128285899 2D CCCTAATGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 10 T 13 11 198304 CASAVA_Build 12 128286603 2D GATGCTATTT TG/-- TGTGTGTGTG 2065 het 146 hom 23 3 10 10 TG 15 14 198305 CASAVA_Build 12 128294728 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 1218 hom 10 het 4 0 4 0 A 7 6 198306 CASAVA_Build 12 128294987 1I GACAATGCTT -/A ACGCTATGGC 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 A 1 2 198307 CASAVA_Build 12 128299024 1D CAGGGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 13 12 198308 CASAVA_Build 12 128303739 1D GTGATAATTG A/- AAAAAAAAAA 2749 het 2749 ref 13 6 6 1 A 11 10 198309 CASAVA_Build 12 128335863 1D CTAAAAGTAC A/- AAAAAAAAAA 2547 hom 32 het 17 0 10 7 A 13 12 198310 CASAVA_Build 12 128338239 1I TATTCATGTT -/A AAAAAAGGTT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 A 6 7 198311 CASAVA_Build 12 128344978 1D CTCACCCAGT C/- TTTCAGCTGG 3070 het 3070 hom 47 19 21 8 C 1 0 198312 CASAVA_Build 12 128350127 1I AACAATCAGG -/T TTTTTTTTTT 2406 het 1568 hom 39 10 16 13 T 17 18 198313 CASAVA_Build 12 128355795 4I GAATATTGCT ----/GTAA GTATTACTGG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 GTAA 0 1 198314 CASAVA_Build 12 128373918 2I AAACAAACAG --/AA AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 10 198315 CASAVA_Build 12 128374411 1D GTAGGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 36 1 31 4 T 12 11 198316 CASAVA_Build 12 128389892 31I AGAACCCCAA -------------------------------/TTGCAGAGGTCAGCCTTCCGCTTAAGCAGCC ATCTCTTCCA 3070 hom 45 het 23 0 13 10 TTGCAGAGGTCAGCCTTCCGCTTAAGCAGCC 0 1 198317 CASAVA_Build 12 128390810 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 T 9 8 198318 CASAVA_Build 12 128396860 1I GCAGTCTCTA -/T TTTGTTAATC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 3 4 198319 CASAVA_Build 12 128419867 1D CTCATGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 T 11 10 198320 CASAVA_Build 12 128423090 1D AGCAGTGGCA T/- TAGATTTTCA 3070 hom 138 het 49 0 46 4 T 2 1 198321 CASAVA_Build 12 128424157 1I AAAACAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 8 9 198322 CASAVA_Build 12 128431056 2D TTGCAGACGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 35 0 26 10 TG 6 5 198323 CASAVA_Build 12 128432203 4I CTTTCCTTTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TCTT 2 3 198324 CASAVA_Build 12 128435014 1I TGCTCTGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 T 11 12 198325 CASAVA_Build 12 128463011 1I ATAAGTGCCA -/C CCCCTCCTCC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 C 4 5 198326 CASAVA_Build 12 128474701 1D ATTTTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 25 1 19 5 A 15 14 198327 CASAVA_Build 12 128488229 1D TGCTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 12 11 198328 CASAVA_Build 12 128501404 8D CAGGTGCCTG CCACCACA/-------- CCACCACACC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 CCACCACA 2 1 198329 CASAVA_Build 12 128516638 1D TTGATAATGC T/- TTTGTTATTG 3070 het 3070 ref 41 28 9 4 T 4 3 198330 CASAVA_Build 12 128519064 2D GTCAATAAGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 42 0 32 10 T 11 9 198331 CASAVA_Build 12 128532042 1D TTACAGAAGA G/- GAAATGCAAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 G 2 1 198332 CASAVA_Build 12 128536328 21D TAGGTAGTTA GGAAGGTATATTTGTCATGGT/--------------------- GGGAGAACAG 3070 het 3070 ref 76 52 32 3 GGAAGGTATATTTGTCATGGT 1 0 198333 CASAVA_Build 12 128537332 1D GGGGGCACCT A/- GCTATGTGGC 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 1 0 198334 CASAVA_Build 12 128537532 1I TTGCGTATGG -/A GGGGGGGGGT 2358 het 1434 hom 29 9 9 11 A 0 1 198335 CASAVA_Build 12 128542440 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 12 13 198336 CASAVA_Build 12 128545723 10I AAGCCAATGT ----------/TAAGCCTTAC TAATAATTTC 3070 het 3070 hom 44 19 23 3 TAAGCCTTAC 0 1 198337 CASAVA_Build 12 128547169 1D AACTTACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 19 4 A 10 9 198338 CASAVA_Build 12 128548748 5D GTCCAAAATC TTTTA/----- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 TTTTA 1 0 198339 CASAVA_Build 12 128550949 1I TATGGATGGC -/T TTAGTAAGCT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 2 3 198340 CASAVA_Build 12 128551510 1I TCTTTAGTCT -/C CCCCTGTAAA 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 C 4 5 198341 CASAVA_Build 12 128552498 2D TTTCTGTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 12 10 198342 CASAVA_Build 12 128559418 1D TTATCATTTT G/- CATGAGAAGC 3070 hom 99 het 43 0 34 10 G 1 0 198343 CASAVA_Build 12 128568994 2I TTGACTATAT --/TG TGTGTGTGTG 2398 het 2398 ref 36 19 11 6 TG 7 8 198344 CASAVA_Build 12 128570078 1I TTGTCAAAGC -/A AATCTATGAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 2 3 198345 CASAVA_Build 12 128571095 1D ATTGTGAAAA G/- ATTGTTATTG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 G 1 0 198346 CASAVA_Build 12 128572414 1D TAAAAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 T 12 11 198347 CASAVA_Build 12 128573263 1I AAAAAAATAC -/T TTTAGATTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 3 4 198348 CASAVA_Build 12 128580854 1D TGAGCAAAAA G/- CAACATACAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 1 0 198349 CASAVA_Build 12 128586912 1D ATAAGCTTCA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 8 7 198350 CASAVA_Build 12 128588440 1D TTGAAAACTC A/- AAACTGCAGA 3070 hom 81 het 33 0 27 7 A 4 3 198351 CASAVA_Build 12 128590566 1D TGGGCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 10 198352 CASAVA_Build 12 128599212 1D CTAACATCAA G/- GGGGGGTGAG 3070 hom 112 het 45 0 38 7 G 7 6 198353 CASAVA_Build 12 128600733 1D CATACTGGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 9 8 198354 CASAVA_Build 12 128602760 4I CCATATTAAA ----/ATCT ATCTAACATA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 ATCT 1 2 198355 CASAVA_Build 12 128608050 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 7 8 198356 CASAVA_Build 12 128616937 1I TATAAAAAGA -/G GGGGGGTCAG 2956 het 2956 ref 32 17 9 6 G 6 7 198357 CASAVA_Build 12 128622354 1I TAAGGAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 9 10 198358 CASAVA_Build 12 128633122 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 899 hom 28 6 13 9 T 13 11 198359 CASAVA_Build 12 128642727 1D TTTAGGGAGT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 106 het 40 0 34 6 A 8 7 198360 CASAVA_Build 12 128644335 1I TTGACATGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 8 9 198361 CASAVA_Build 12 128652215 1D GTCAGAACAC A/- CACATTTATA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 1 0 198362 CASAVA_Build 12 128663221 7I GTTAATTTGG -------/CCTTTAA CCCCAGGCAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 CCTTTAA 0 1 198363 CASAVA_Build 12 128672019 1I TGCTGTGCTT -/G GCACCACCGA 3070 het 3070 ref 54 21 22 11 G 1 2 198364 CASAVA_Build 12 128676960 1D TTTATGTGCC A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 2 1 198365 CASAVA_Build 12 128684811 1D TCTATACGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 24 0 16 8 A 12 11 198366 CASAVA_Build 12 128697600 2D GCCCAACCAC AT/-- GTTTTTATAC 586 het 586 ref 22 3 6 13 AT 1 0 198367 CASAVA_Build 12 128697620 2D ACATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 21 0 11 11 AT 10 9 198368 CASAVA_Build 12 128710103 1I ATAAATGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 10 11 198369 CASAVA_Build 12 128710817 7D GATGCAAGGA CAGCACC/------- AGGGAAAGAC 3070 hom 181 het 67 0 60 9 CAGCACC 1 0 198370 CASAVA_Build 12 128714445 1I TCAAATTAGG -/A AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 5 6 198371 CASAVA_Build 12 128716909 2I AAATAGAAAC --/TT TAATGCCTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 3 198372 CASAVA_Build 12 128717504 1I TTAATCTTAT -/A AAAAAAATTC 3070 het 5 hom 21 1 16 4 A 7 8 198373 CASAVA_Build 12 128718467 3I CCCTAAAATG ---/TTT TTGTTATCCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 5 198374 CASAVA_Build 12 128739939 4D GCTTCCCTGC CTCT/---- CTAAGTGAAC 3070 hom 98 het 36 0 32 4 CT 3 1 198375 CASAVA_Build 12 128753964 1I ACTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 813 hom 49 2 36 11 T 12 13 198376 CASAVA_Build 12 128754423 2I GGTAATAGGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 34 0 19 15 A 14 16 198377 CASAVA_Build 12 128761566 1I AACCTCCACT -/A AAAAAATCCC 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 A 6 7 198378 CASAVA_Build 12 128769582 10D AAAAAAAATG AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAGAAA 3070 het 1063 hom 30 10 12 10 A 16 6 198379 CASAVA_Build 12 128772847 1D ACTCTTCCCC T/- AGCTGGTGCC 3070 het 3070 ref 37 23 11 4 T 1 0 198380 CASAVA_Build 12 128778332 1I TTGAATGATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 9 10 198381 CASAVA_Build 12 128780029 1I ACTGGAATAC -/A CTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 0 1 198382 CASAVA_Build 12 128782166 1I CCACTGGAAA -/T TTTTTTTTTT 2636 het 2636 ref 24 10 11 3 T 13 14 198383 CASAVA_Build 12 128786636 1I TGTTTCCTTT -/C TTTTAGGTAA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 C 0 1 198384 CASAVA_Build 12 128787114 1I TATAGTATTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 649 hom 38 2 30 6 A 9 10 198385 CASAVA_Build 12 128798782 15D CTGGGGGAGG AAAAGAGGGAGTCAA/--------------- AAGCATGAAG 3070 het 3070 ref 26 17 11 3 AAAAGAGGGAGTCAA 1 0 198386 CASAVA_Build 12 128799962 3D GAAAAGAATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 31 3 12 16 T 17 14 198387 CASAVA_Build 12 128800122 1I GCCCCACTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 419 hom 19 1 14 4 T 9 10 198388 CASAVA_Build 12 128802041 8D CCTGCATCCA CCAGAGTC/-------- CCAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 23 11 9 7 CCAGAGTC 1 0 198389 CASAVA_Build 12 128807676 1D CTATAAAGCA T/- GTCTTAAAGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 0 198390 CASAVA_Build 12 128810412 1I CTTATTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 T 10 11 198391 CASAVA_Build 12 128814250 1D ATGGACCCCC A/- AGGCTGCAGG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 2 1 198392 CASAVA_Build 12 128815093 2D TGTGTTTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 15 het 38 1 25 13 TG 8 7 198393 CASAVA_Build 12 128816067 3D TGCATCTCCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 19 1 15 6 A 14 11 198394 CASAVA_Build 12 128816754 3I CTACTTAGAG ---/GTT ATTAGCCCTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 GTT 0 1 198395 CASAVA_Build 12 128818477 8D CAGAAAAACT TCCCTTTA/-------- TAAAAGCATC 3070 het 3070 hom 27 14 15 2 TCCCTTTA 1 0 198396 CASAVA_Build 12 128825514 6D GCACTGGGGA AATGTT/------ AACCATTATT 3070 het 3070 hom 44 19 24 4 AATGTT 1 0 198397 CASAVA_Build 12 128826959 2I CACCCACCCT --/TA TACCCCAATT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 TA 1 2 198398 CASAVA_Build 12 128827202 1D TTAACCATTT A/- TGCAAGTTCT 3070 het 3070 ref 47 25 18 5 A 1 0 198399 CASAVA_Build 12 128830838 1D TTGGTGGGGA G/- GGGGGGGGCC 2685 hom 27 het 11 0 9 2 G 9 8 198400 CASAVA_Build 12 128834912 1D TTTTTTTCAA T/- TTTTAAAGTA 3070 het 2896 hom 21 8 9 4 T 5 4 198401 CASAVA_Build 12 128837495 3D CAAGTTGCAG AAT/--- GATGAGGGGC 3070 het 3070 hom 43 15 26 4 AAT 1 0 198402 CASAVA_Build 12 128844575 1D AGTGTATGGG T/- TTTTTTTTTT 2622 het 2622 ref 24 12 8 4 T 11 10 198403 CASAVA_Build 12 128848343 1D GAGATTTCGG A/- GATACTAGTT 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 A 1 0 198404 CASAVA_Build 12 128849195 52D TGTGCAGAAG AGAGAAGGGGTGGAGGGAGATAAGACTGAGAAGGAAGTCAGGGTTCTGGCTT/---------------------------------------------------- AGAGAAGGGG 2918 hom 37 het 23 0 12 14 AGAGAAGGGGTGGAGGGAGATAAGACTGAGAAGGAAGTCAGGGTTCTGGCTT 2 1 198405 CASAVA_Build 12 128849885 47D TATATATGTG TATATATACATATTATATATGTATATATATGTGTATATATGTGTATA/----------------------------------------------- TATGTATATA 2840 hom 24 het 7 0 9 2 TATATATACATATTATATATGTATATATATGTGTATATATGTGTATA 1 0 198406 CASAVA_Build 12 128850873 1D GCAGCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2139 het 2139 ref 34 17 10 7 A 12 11 198407 CASAVA_Build 12 128866632 1I AAGTAGAGTC -/A GGGGTGTAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 198408 CASAVA_Build 12 128879184 8D GAAGGGAGGA AGGAAGGG/-------- AGGGAGGGAG 3070 hom 33 het 13 0 10 3 AGGAAGGG 1 0 198409 CASAVA_Build 12 128884704 9D CTCCTTTCCA CCAGGCACT/--------- CGGATGTGCT 3070 hom 108 het 40 0 35 7 CCAGGCACT 1 0 198410 CASAVA_Build 12 128917591 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 34 6 A 10 9 198411 CASAVA_Build 12 128919563 1D TTGCTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 35 0 27 8 T 13 12 198412 CASAVA_Build 12 128924240 7D ATGCCCTTTG TTTTCAT/------- TTTTCATTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TTTTCAT 2 1 198413 CASAVA_Build 12 128927672 20I ATATTATATT --------------------/AATAATTATATTATAATTAA TATAATTATG 2648 hom 18 het 8 0 7 1 AATAATTATATTATAATTAA 0 1 198414 CASAVA_Build 12 128929079 1I TGCAGATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 32 2 22 8 T 14 15 198415 CASAVA_Build 12 128945229 5D TCCTTGTTGG TTTCT/----- TGTAGTTTCT 3070 hom 114 het 42 0 37 9 TTTCT 1 0 198416 CASAVA_Build 12 128950361 2D AGCAAAAAGC CA/-- CACTCTCTCT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 CA 2 1 198417 CASAVA_Build 12 128955189 2I GAAACATGTC --/AT GTGTGCTCCC 2898 het 2898 ref 30 20 9 1 AT 0 1 198418 CASAVA_Build 12 128956856 1D CACTAAGCAG T/- TTTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 5 4 198419 CASAVA_Build 12 128963361 1I AGAGCTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 10 11 198420 CASAVA_Build 12 128966961 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1185 het 181 hom 10 3 3 4 A 18 16 198421 CASAVA_Build 12 128980317 3D CCTGTTTCCC TGT/--- TGTTGTCCCT 3070 hom 97 het 40 0 33 7 TGT 3 2 198422 CASAVA_Build 12 128981281 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAATGATG 2713 het 1552 hom 12 4 7 1 A 5 6 198423 CASAVA_Build 12 128981608 2I AAAGTATAAT --/AA AAAAAAAAAA 1796 het 1796 ref 17 7 6 4 A 11 13 198424 CASAVA_Build 12 128984049 1I CTCCCCACGG -/C CCCCACCCCT 3070 hom 66 het 26 0 19 7 C 4 5 198425 CASAVA_Build 12 128991276 2D ACAGTAACCA TT/-- TTTTTTTTTT 2651 het 129 hom 25 1 7 17 T 16 14 198426 CASAVA_Build 12 129004377 2D GGATGATGAG AA/-- AATACACCTG 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 A 4 2 198427 CASAVA_Build 12 129004572 1I ATTGCACCCC -/T GTCAATGTTC 3070 hom 91 het 35 0 28 7 T 0 1 198428 CASAVA_Build 12 129012822 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1715 hom 10 het 4 0 4 0 T 13 14 198429 CASAVA_Build 12 129021094 2D TATCCAGAAG AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 220 hom 44 4 23 17 A 10 8 198430 CASAVA_Build 12 129022111 1I TGTTATGTAG -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 5 6 198431 CASAVA_Build 12 129026425 4I GAGACAAGAG ----/AAAC AAACAAACAA 2967 het 2967 ref 37 19 8 10 AAAC 2 3 198432 CASAVA_Build 12 129028233 1I TCGCAAGGAC -/A AAAAAACCAA 3070 het 2370 hom 22 5 17 0 A 6 7 198433 CASAVA_Build 12 129031348 1D GTCTTGGAGG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 A 8 7 198434 CASAVA_Build 12 129034247 1D TGGTCATTTT G/- CTCAGTGGAG 3070 het 3070 hom 29 12 15 4 G 1 0 198435 CASAVA_Build 12 129038520 1D GGCACCAGCC A/- GGGGAAGTTT 3070 het 3070 hom 53 27 21 6 A 1 0 198436 CASAVA_Build 12 129043695 1I AACTATATTA -/T TTTTTATACC 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 T 5 6 198437 CASAVA_Build 12 129045308 3D53M12D CATCGTCACT ATCATCATCATCACCATCATCATCATTACCATTACCATCTTCGTCACCATTACCACCATCATCACCAT/---ATCATCATCACCATCATCATCATTACCATTACCATCTTCGTCACCATTACCAC------------ CATCATCACC 3070 het 3070 ref 73 57 36 29 N/A 0 0 198438 CASAVA_Build 12 129045865 19D CTTTGGAATT CACTACAGTTATCACCACA/------------------- CGCTACTGAC 3070 het 3070 ref 41 28 19 3 CACTACAGTTATCACCACA 1 0 198439 CASAVA_Build 12 129048237 1D TTCAGGGCCT C/- CTATTTCCTA 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 C 2 1 198440 CASAVA_Build 12 129049250 1I GTTTTAAATA -/T TTTTTTATAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 6 7 198441 CASAVA_Build 12 129050876 3I CTTACGTATT ---/TTG TTAAGGTTCA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 TTG 0 1 198442 CASAVA_Build 12 129052809 1I TGAAGGAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 T 9 10 198443 CASAVA_Build 12 129063205 8D27M2I15M4D GTATGAGTGT GTGAGAGCGAGTGTGTGAGTGTGAGAGTGAGTGTG--TGTGAGTGTGACAGCGTGA/--------GAGTGTGTGTGAGTGAGTGTGTGTGAGACTGTGTGTGTGACAGC---- GTGTGTCTGA 3070 het 3070 ref 42 46 16 6 N/A 0 0 198444 CASAVA_Build 12 129063330 1D27M4D GTGTGTGTTC GGGGGAAGAAAGATATAATGATAATGATGATA/-GGGGAAGAAAGATATAATGATAATGAT---- GATTAGATAG 3070 het 3070 ref 54 45 15 8 N/A 0 0 198445 CASAVA_Build 12 129063726 3I GAGGCAGAAT ---/TTC TTCTTCTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 TTC 2 3 198446 CASAVA_Build 12 129063912 1I CAAAAATCCC -/T TTTAATGCCC 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 T 3 4 198447 CASAVA_Build 12 129078005 4D GGCAGAAAAG AGAT/---- AGGGAGTTAT 3070 het 3070 ref 37 18 17 4 AGAT 1 0 198448 CASAVA_Build 12 129079089 2D GGTGGTAACA TC/-- TGTCGGGTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 9 TC 1 0 198449 CASAVA_Build 12 129083505 1D TTGGTATAAT A/- ACAATAAAGA 3070 hom 90 het 38 0 31 8 A 2 1 198450 CASAVA_Build 12 129084259 41D GCTAAAATTC AGATACAGGGGACTGAGGCATTCTCTCACTTGCTAAAATTT/----------------------------------------- AGATACAGGG 3070 hom 104 het 24 0 31 15 AGATACAGGGGACTGAGGCATTCTCTCACTTGCTAAAATTT 1 0 198451 CASAVA_Build 12 129085230 1I CATCATCCAG -/C TTCTCAGCGA 3070 hom 68 het 25 0 23 2 C 0 1 198452 CASAVA_Build 12 129085508 2I GAAAATCTAG --/GA GAGTCCACTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GA 1 2 198453 CASAVA_Build 12 129087527 1I TGGGAGAAAT -/G GGGAGATGAC 3070 het 2740 hom 32 10 12 10 G 3 4 198454 CASAVA_Build 12 129089896 1D ATCCAGTGGG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 55 23 22 10 A 8 7 198455 CASAVA_Build 12 129090559 1I GTGGTTCCTC -/A AAAAAGTTCA 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 A 5 6 198456 CASAVA_Build 12 129091759 1D ACTAATTGCC A/- AAAAAAGCCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 A 7 6 198457 CASAVA_Build 12 129093405 6D GCATACATTT ACCCAC/------ ACCTACACGC 3070 het 3070 hom 74 28 38 10 ACCCAC 1 0 198458 CASAVA_Build 12 129093955 10I TACACTACAT ----------/ACACACATGC ACACACATGC 3070 hom 192 het 100 0 60 42 ACACACATGC 1 2 198459 CASAVA_Build 12 129096377 2D TTCTCTTTAT AC/-- ACACACACAC 1080 het 1080 ref 39 24 3 14 AC 8 7 198460 CASAVA_Build 12 129100604 4D CAATCTGCAC ACAT/---- CCAGTGACAC 3070 het 3070 ref 43 22 19 4 ACAT 1 0 198461 CASAVA_Build 12 129103099 1D CTAGCATTAG C/- AGGGTCGCGA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 C 1 0 198462 CASAVA_Build 12 129105769 4I CCACACACAC ----/AAAT AACCAAACAT 3070 hom 93 het 35 0 27 8 AAAT 0 1 198463 CASAVA_Build 12 129109256 1D TTGCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 31 10 A 11 10 198464 CASAVA_Build 12 129110066 3D TTCCTCTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 34 1 20 16 T 15 12 198465 CASAVA_Build 12 129112132 4I GTGATAGAGT ----/GATA GATAGAGTGA 3070 het 3070 hom 46 18 27 1 GATA 1 2 198466 CASAVA_Build 12 129122814 2D ATCTGCCCTC TT/-- AACACATTTT 3070 het 3070 ref 35 21 13 5 T 2 0 198467 CASAVA_Build 12 129127574 1D CATCTACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 12 11 198468 CASAVA_Build 12 129129172 2D AGGTCTCAAA AC/-- AAAAAAATGT 3070 het 2284 hom 29 7 19 6 AC 1 0 198469 CASAVA_Build 12 129132549 1D TCTTTCTTCC T/- TTTCATAAAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 4 3 198470 CASAVA_Build 12 129136875 1D CTGTGCTCCT C/- TGCCTCGCTC 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 C 1 0 198471 CASAVA_Build 12 129137103 1I CTCCACTAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 221 hom 35 1 26 8 A 9 10 198472 CASAVA_Build 12 129137432 1I TGTGCAGCTT -/G GAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 G 1 2 198473 CASAVA_Build 12 129145916 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2537 het 279 hom 18 3 9 6 A 15 14 198474 CASAVA_Build 12 129146675 1D CGATGCCTGA G/- GACAGCCCTC 3070 het 3070 ref 42 16 12 15 G 2 1 198475 CASAVA_Build 12 129154315 2D GCTGTAAACC TA/-- TAAAACCACT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TA 2 1 198476 CASAVA_Build 12 129161167 2D CCCCATTGTC AG/-- GGGCAGTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 AG 1 0 198477 CASAVA_Build 12 129170341 3I CGTCGCTGTG ---/GTT GTTATGGCCG 3070 het 3070 ref 55 18 20 17 GTT 1 2 198478 CASAVA_Build 12 129170939 1I TTCTCACGAT -/G CCCACCGTAA 2824 het 2805 hom 27 11 8 8 G 0 1 198479 CASAVA_Build 12 129199054 1D CTGAGTGACC A/- AAAGGATGCC 3070 hom 99 het 42 0 32 10 A 4 3 198480 CASAVA_Build 12 129201376 3D AGCTGAAGGA CCC/--- CCCCCCCAGC 3070 hom 101 het 37 0 33 4 C 10 7 198481 CASAVA_Build 12 129201511 27I TATATGAAAA ---------------------------/GATGCATTGCAAGGAATTGGCTTATGT GATTCAGGGA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 GATGCATTGCAAGGAATTGGCTTATGT 0 1 198482 CASAVA_Build 12 129202530 10D ATTATTGAAG AAACACACAA/---------- GGGACACTGC 3070 het 164 hom 34 1 12 21 AAACACACAA 1 0 198483 CASAVA_Build 12 129204106 6D ACTGAAATAC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 24 0 16 10 A 19 13 198484 CASAVA_Build 12 129205510 2D TATATATGTC TG/-- TGTGTATATA 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 TG 3 2 198485 CASAVA_Build 12 129205761 26I CAGATGGGCA --------------------------/GACATTTGTCAAACAGGGAGAGAGTG GACATTTGTC 3070 hom 90 het 37 0 29 12 GACATTTGTCAAACAGGGAGAGAGTG 0 1 198486 CASAVA_Build 12 129206526 4D CAGAGGAAAC AGAA/---- AGAATCTCAG 3070 hom 108 het 37 0 37 3 AGAA 2 1 198487 CASAVA_Build 12 129210851 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 11 10 198488 CASAVA_Build 12 129222734 1D GCTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 43 0 36 7 A 12 11 198489 CASAVA_Build 12 129228583 1I TTATAAATTA -/G GGGGGGGAAG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 G 7 8 198490 CASAVA_Build 12 129229200 1D ATAAACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 9 6 T 13 12 198491 CASAVA_Build 12 129229558 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 1875 het 1875 ref 19 7 7 5 A 12 11 198492 CASAVA_Build 12 129232782 4D CCCATTCATC CTCT/---- CTCTGATGGA 3070 hom 120 het 45 0 40 6 CT 4 2 198493 CASAVA_Build 12 129235032 8D CACTCTCCCA TCTTAGCT/-------- GTCTGCAGTC 3070 het 3070 ref 34 14 12 9 TCTTAGCT 1 0 198494 CASAVA_Build 12 129241553 2D TAATAATAAT AA/-- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 A 8 6 198495 CASAVA_Build 12 129242568 6D CATGTATATG GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 53 20 26 10 GT 9 6 198496 CASAVA_Build 12 129247800 4D TGCCTGTGTT TGTG/---- TGTATGAGAG 3070 het 3070 hom 76 33 35 9 TG 3 1 198497 CASAVA_Build 12 129252592 1D GGAGTTGGGC T/- GACAAGTTTC 3070 het 3070 ref 50 25 18 8 T 1 0 198498 CASAVA_Build 12 129255995 7I5M2D TGAGAAGGGG -------ACAGGCC/CCGAACAACAGG-- CCTGACAACA 3070 het 1728 hom 29 8 17 7 N/A 0 0 198499 CASAVA_Build 12 129263130 1I TTCCCAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 37 1 31 5 T 11 12 198500 CASAVA_Build 12 129274354 4I CATGAGTTTT ----/GTGA GTGTGTGCGT 3070 het 3070 ref 85 35 34 16 GTGA 0 1 198501 CASAVA_Build 12 129274811 2I GAGTGTATGC --/GT GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 88 34 34 20 GT 4 5 198502 CASAVA_Build 12 129285605 1D TTGCAGGTTT G/- GGGGGCGGGG 3070 het 1294 hom 21 7 12 2 G 6 5 198503 CASAVA_Build 12 129288880 1D CTTTGGCAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 407 hom 34 1 29 4 T 10 9 198504 CASAVA_Build 12 129289244 1D TTACATTACA T/- TGCTGGGAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 2 1 198505 CASAVA_Build 12 129300984 1D AACAAGTTTT C/- TTCAGGGAGG 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 C 1 0 198506 CASAVA_Build 12 129306796 2I AGTTAGATAC --/AG AGTTTCCACA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AG 1 2 198507 CASAVA_Build 12 129313429 1D CAGAGATGTC T/- GAGAGAAGAT 3070 hom 115 het 42 0 38 4 T 1 0 198508 CASAVA_Build 12 129317737 1I ATCATTTCTA -/C GTGCTGTGAG 3070 hom 131 het 50 0 44 6 C 0 1 198509 CASAVA_Build 12 129336416 1D TTTTACATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 19 1 14 5 A 13 12 198510 CASAVA_Build 12 129344397 4D GAATCCACAG TTCT/---- TTTATTTAGT 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 TTCT 1 0 198511 CASAVA_Build 12 129344903 1D CTCCTGTAAT C/- CCACCATTTT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 3 2 198512 CASAVA_Build 12 129349518 1I CAAAGTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 17 28 7 T 10 11 198513 CASAVA_Build 12 129350896 4D TGTGTGTACA TATG/---- TGTGTATATG 3070 het 3070 ref 66 41 18 10 TATG 1 0 198514 CASAVA_Build 12 129351085 2D TATATGTGTA TG/-- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 64 31 25 9 TG 4 3 198515 CASAVA_Build 12 129353047 1D CCCTCACATG C/- TCAGAGGGAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 C 1 0 198516 CASAVA_Build 12 129355223 1I GGATATATTT -/A AAAGGGTAAA 3070 hom 39 het 29 0 14 15 A 3 4 198517 CASAVA_Build 12 129358242 5I TGTGTCTGGG -----/TCCTC TCCTCTTCTT 3070 hom 127 het 49 0 38 11 TCCTC 1 2 198518 CASAVA_Build 12 129367716 1I ATTCCATAGA -/C CCCCCCCGTG 3070 hom 96 het 39 0 31 8 C 7 8 198519 CASAVA_Build 12 129377767 1I TTTTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 10 11 198520 CASAVA_Build 12 129383790 1D TGCAGATCCC T/- GGGCTCCACC 3070 hom 98 het 37 0 31 6 T 1 0 198521 CASAVA_Build 12 129394120 6D TGAAGGATTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1431 het 808 hom 22 4 5 14 T 22 16 198522 CASAVA_Build 12 129396499 4D GATTTTCCTC ACTT/---- TCTTTTGGCG 3070 het 3070 hom 42 17 21 6 ACTT 1 0 198523 CASAVA_Build 12 129398268 1D GTCATCTCTT G/- GCAGCTCTTC 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 G 2 1 198524 CASAVA_Build 12 129420036 1I TCCTATTTCT -/C CTCAGCCTTG 3070 hom 27 het 12 0 9 3 C 1 2 198525 CASAVA_Build 12 129429076 1I CCCTTTTCCC -/T TTTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 51 21 20 10 T 5 6 198526 CASAVA_Build 12 129442297 1D CGACACCCAT G/- GGGGCATGCG 3070 hom 127 het 50 0 39 11 G 5 4 198527 CASAVA_Build 12 129454181 1I TAAAGCATAG -/A AAAAAGGTTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 5 6 198528 CASAVA_Build 12 129457396 1D CTGCCCACCT C/- CCAAAGTGCT 2636 het 2636 ref 24 11 8 5 C 3 2 198529 CASAVA_Build 12 129462052 1I AAAATAGCAT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 6 7 198530 CASAVA_Build 12 129468363 1I GAGAGAGAAT -/G GGGAGGGGAG 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 G 3 4 198531 CASAVA_Build 12 129479815 1D AGGCTTCAAC A/- AAAAAAGTGT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 7 6 198532 CASAVA_Build 12 129489943 8D GGGTGTGTGG GTGTGGGT/-------- GTGTGGGTGT 3070 het 1767 hom 29 9 16 6 GTGTGGGT 2 1 198533 CASAVA_Build 12 129509228 5D CATTCCCTAA TGTCG/----- TGTCTATGAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 TGTCG 1 0 198534 CASAVA_Build 12 129512463 1I AATTCACCGG -/A AAGTCTCACA 3070 hom 110 het 41 0 33 8 A 2 3 198535 CASAVA_Build 12 129524429 3I TAAGACTGAA ---/AGC AGCGGTCATT 3070 het 3070 hom 41 12 27 2 AGC 1 2 198536 CASAVA_Build 12 129537210 1I GATCTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 12 9 15 A 11 12 198537 CASAVA_Build 12 129537874 1I CGATAAGTGA -/G GTTCTTGCTC 3070 het 3070 ref 54 25 24 5 G 1 2 198538 CASAVA_Build 12 129538822 1D GTGGATGGCG A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 114 het 48 0 38 10 A 8 7 198539 CASAVA_Build 12 129542902 1D TCAAACTGGG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 8 7 198540 CASAVA_Build 12 129545137 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2041 het 1797 hom 23 6 12 7 A 13 14 198541 CASAVA_Build 12 129556552 1D TTATTTTTGT A/- AAAAAATGTT 3070 hom 85 het 34 0 29 5 A 7 6 198542 CASAVA_Build 12 129564022 1D AGGAGGGAGC T/- TTAACAGGCA 3070 hom 67 het 28 0 24 5 T 3 2 198543 CASAVA_Build 12 129577997 2D ATTTAAAAAC TG/-- TGTTCCTAAC 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 TG 2 1 198544 CASAVA_Build 12 129578247 2D CTTACAAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 10 A 13 11 198545 CASAVA_Build 12 129585851 1I TTAAAAAAAA -/G AAATTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 G 0 1 198546 CASAVA_Build 12 129588839 2I GCATTTCCAC --/AT AGTCACAATT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 AT 0 1 198547 CASAVA_Build 12 129595919 2I AAATTATAAC --/AT ATTATAAAAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AT 1 2 198548 CASAVA_Build 12 129602051 1I CTTAGATTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 8 9 198549 CASAVA_Build 12 129609341 3I CTTGCTAAAA ---/TGT TGTTAAATGA 3070 hom 98 het 39 0 33 6 TGT 1 2 198550 CASAVA_Build 12 129614830 2I CAGCACTGTG --/TT TTTTTTTCCC 3070 hom 55 het 23 0 18 5 T 7 9 198551 CASAVA_Build 12 129623892 2I GTGTTCGCGC --/GT GTGTGTGTGC 3070 hom 67 het 28 0 22 6 GT 4 5 198552 CASAVA_Build 12 129633908 3D ATCACCATTA CAT/--- CATCATCATC 3070 het 3070 ref 74 30 25 21 CAT 5 4 198553 CASAVA_Build 12 129646179 1I TGTGAGAACA -/G ATGCGCGTGC 3070 het 2776 hom 18 7 9 2 G 0 1 198554 CASAVA_Build 12 129657898 1D TTTAATAGAC G/- GGTGCCTCCA 3070 het 3070 hom 43 12 22 10 G 3 2 198555 CASAVA_Build 12 129676038 4D CCCACTCTTT CAAA/---- CAGTCATGAG 3070 hom 81 het 31 0 27 7 CAAA 1 0 198556 CASAVA_Build 12 129680366 13I GTCTTGGAGT -------------/ACCAAGGAGTACA ACCAAGGAGT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 ACCAAGGAGTACA 1 2 198557 CASAVA_Build 12 129682890 1D GTGATGTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 10 8 T 10 9 198558 CASAVA_Build 12 129685094 2D TAAAGATGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 33 1 22 10 T 13 11 198559 CASAVA_Build 12 129688465 1I GCCTTCTTGG -/A AATGCAAACT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 2 3 198560 CASAVA_Build 12 129697100 3D GCATCTCCAC AAG/--- AAGAATGACA 3070 het 3070 hom 27 11 13 6 AAG 2 1 198561 CASAVA_Build 12 129702384 2D TTTTGATGTT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 A 10 8 198562 CASAVA_Build 12 129709961 1I CCAGCTACTC -/G GGAGGCTGAG 2069 het 381 hom 7 1 5 1 G 2 3 198563 CASAVA_Build 12 129710558 2I TGGCTGGAGT --/AC AGTGGCACAA 1657 het 1657 ref 27 17 5 6 AC 0 1 198564 CASAVA_Build 12 129711335 1I ACAGCTGGCG -/T TGTCACGCAG 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 1 2 198565 CASAVA_Build 12 129712649 11I3M2I CAAGACCTGG -----------GGT--/ATTCTCTCCTCGGTCC CTCCAACAAA 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 N/A 0 0 198566 CASAVA_Build 12 129714522 2D ATATTGTGGG TT/-- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 8 6 198567 CASAVA_Build 12 129723545 1D CTCAGAAAAA G/- GGCAGAGATT 3070 het 3070 hom 39 17 14 8 G 3 2 198568 CASAVA_Build 12 129726031 23D CCACTCCCTT CCGTCCACCCCCATGCCTCCAGG/----------------------- CCGTCCACCC 3070 hom 55 het 32 0 15 23 CCGTCCACCCCCATGCCTCCAGG 2 1 198569 CASAVA_Build 12 129734571 1D CTCTCTGAAG C/- CTGCTGTCTG 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 C 2 1 198570 CASAVA_Build 12 129763636 2I AGAAGGGGAC --/AG AGAGACTGAA 3070 hom 120 het 48 0 40 8 AG 2 3 198571 CASAVA_Build 12 129766254 1I ACGTCCCCTT -/C CCCCCCCTCC 1355 hom 27 het 13 0 9 4 C 7 8 198572 CASAVA_Build 12 129767194 2I ACTGCCAGTT --/TC TCTTTCACAG 3070 hom 137 het 50 0 45 5 TC 1 2 198573 CASAVA_Build 12 129771152 1D ATGGAAGGGG A/- AAAAAATTCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 6 198574 CASAVA_Build 12 129775481 1D CAATTGCCAC A/- AAAAAGAACA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 6 5 198575 CASAVA_Build 12 129778929 1D CGCACTCACA T/- CACACACTCA 1754 het 1754 ref 82 31 8 44 T 1 0 198576 CASAVA_Build 12 129779210 14D CACTTGCACT CACACTCATACACA/-------------- CACACACTCA 936 het 348 hom 58 4 11 50 CACACTCATACACA 1 0 198577 CASAVA_Build 12 129782175 1I CTGTCCAGGG -/A GAGCTGGGGC 3070 hom 90 het 37 0 23 14 A 0 1 198578 CASAVA_Build 12 129783804 6D TAAAAAAAAA AAATAC/------ AAAAATACAA 24 het 24 ref 10 3 1 7 AAATAC 1 0 198579 CASAVA_Build 12 129783972 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 9 198580 CASAVA_Build 12 129784179 1I TTGGCTGCAG -/C CACCTGGGCC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 C 1 2 198581 CASAVA_Build 12 129784604 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 16 2 11 4 A 16 14 198582 CASAVA_Build 12 129786715 2I ACAGCCAGCA --/AC ACACAGTTAC 3070 het 3070 ref 49 27 21 1 AC 2 3 198583 CASAVA_Build 12 129806435 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 22 0 17 5 A 10 11 198584 CASAVA_Build 12 129808999 12D AGATATGGAT ACAGATGTAGGC/------------ ACGGATGTGG 3070 hom 80 het 32 0 24 10 ACAGATGTAGGC 1 0 198585 CASAVA_Build 12 129815831 3I CATGTCATGG ---/TGT TGATGTGGTG 3070 hom 195 het 80 0 65 15 TGT 0 1 198586 CASAVA_Build 12 129816617 1D TGACGTGATG A/- ATGTATTTTG 3070 het 3070 ref 55 26 25 5 A 2 1 198587 CASAVA_Build 12 129817274 18D CATCACCAAA ATCATCACCACCATCCCT/------------------ ATCATCACCA 3070 het 3070 ref 78 44 24 18 ATCATCACCACCATCCCT 1 0 198588 CASAVA_Build 12 129827261 1I GGACGATGCG -/C GCCGCAGGGC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 C 0 1 198589 CASAVA_Build 12 129829447 1I TTCCTTTTTG -/T TTTTTTTGCG 1926 het 1926 ref 30 14 6 10 T 7 8 198590 CASAVA_Build 12 129835801 1I GGGCTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 34 1 30 3 A 10 11 198591 CASAVA_Build 12 129835811 1I AAAAAAAAAA -/G CTGTAAACCA 3070 het 359 hom 38 1 34 3 G 0 1 198592 CASAVA_Build 12 129835917 1D GCTAACAGAC T/- TGCTTTACAA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 T 2 1 198593 CASAVA_Build 12 129837510 3I AAGAGGGTTG ---/TGA TGGTTACACA 3070 hom 111 het 41 0 36 5 TGA 0 1 198594 CASAVA_Build 12 129839264 1I CGCGTTTGCA -/T TTAGCAGAGC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 2 3 198595 CASAVA_Build 12 129844673 2D CAGAAAGTAC AT/-- GTTAGAATCA 3070 hom 78 het 27 0 25 2 AT 1 0 198596 CASAVA_Build 12 129864289 5D TGAAGTGACC AGAAG/----- GGAAGGGGGT 3070 hom 66 het 29 0 16 16 AGAAG 1 0 198597 CASAVA_Build 12 129868389 4D AAGGAGGTAA GAAG/---- GAAGGGGAGA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 GAAG 2 1 198598 CASAVA_Build 12 129874659 1D AGGCCAAGGC G/- GGCAGATCAC 3070 hom 63 het 22 0 21 1 G 3 2 198599 CASAVA_Build 12 129874786 2I TCAGGAGGCT --/GA GACAAGAGAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 GA 1 2 198600 CASAVA_Build 12 129877345 1I CTAAAAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 17 1 12 4 A 10 11 198601 CASAVA_Build 12 129880031 5I ATGCAGGCCA -----/GGCCT GGTGGCCAGG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 GGCCT 0 1 198602 CASAVA_Build 12 129883798 3D CACAAAACGG CCA/--- CGACACAAGG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CCA 1 0 198603 CASAVA_Build 12 129885960 4D TCTTCACTAT AATA/---- AATAGATATA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AATA 2 1 198604 CASAVA_Build 12 129894080 1D GCTATATACA C/- CCATATAGTA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 C 3 2 198605 CASAVA_Build 12 129897515 1I GAAATGAAAT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 G 0 1 198606 CASAVA_Build 12 129964966 2I ATGTATTGAA --/TT TTTCTGTAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 3 5 198607 CASAVA_Build 12 129966739 13D ATGGGGTAGG GCGCCTGACTGTC/------------- TAATGCACCT 3070 hom 55 het 21 0 16 7 GCGCCTGACTGTC 1 0 198608 CASAVA_Build 12 129978047 1I CCTATGTGGA -/C CCCCCTCTTC 3070 hom 52 het 23 0 16 7 C 5 6 198609 CASAVA_Build 12 129979452 1I AGTCCTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1060 hom 28 3 13 12 T 15 16 198610 CASAVA_Build 12 129980227 1I AGAATGTTTA -/G GACATACGGA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 G 1 2 198611 CASAVA_Build 12 129981972 1I CCAGCCTGGA -/T TAACATAGTG 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 T 1 2 198612 CASAVA_Build 12 129985506 8I TCCTTCCTTC --------/CTTTCTCT CTTTCTCTCT 2761 het 2421 hom 33 12 10 11 CTTTCTCT 1 2 198613 CASAVA_Build 12 129988543 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 2053 hom 25 5 20 0 A 8 7 198614 CASAVA_Build 12 129989417 3I TTTTTTTTTA ---/TTT AAGATACAAG 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 T 0 3 198615 CASAVA_Build 12 130005418 3I GAAATATGAT ---/CTC CTTCATTTGA 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 CTC 0 1 198616 CASAVA_Build 12 130011062 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTTTTGCATT 1308 het 1308 ref 31 15 4 12 TTA 1 0 198617 CASAVA_Build 12 130017291 1I ATTTCAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 37 3 24 10 T 10 11 198618 CASAVA_Build 12 130024304 6I CAGATATAAA ------/ACAAAG CCGGGGGTGC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 ACAAAG 0 1 198619 CASAVA_Build 12 130025292 11D AGGCAGAGGT CCCTGCTGTGG/----------- CCCTGCTCCG 3070 hom 69 het 27 0 23 5 CCCTGCTGTGG 1 0 198620 CASAVA_Build 12 130026723 2D GATCTAGCTA CT/-- CTCTTACTCA 3070 hom 84 het 30 0 27 3 CT 3 2 198621 CASAVA_Build 12 130031908 1D TGAGATGGTT C/- GTGTCTTTGT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 C 1 0 198622 CASAVA_Build 12 130036058 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 8 9 198623 CASAVA_Build 12 130036440 1D TTGTACTGCC T/- TTTCTCCTTT 3070 hom 83 het 29 0 28 1 T 4 3 198624 CASAVA_Build 12 130036517 1D CCCACAGATC T/- ATTCATCTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 1 0 198625 CASAVA_Build 12 130039271 4D AAGAGGGAGC TTCT/---- TTCTCTTATC 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TTCT 2 1 198626 CASAVA_Build 12 130042619 2D ACTCAGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 18 0 10 8 A 17 15 198627 CASAVA_Build 12 130046234 1D AACTGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 12 11 198628 CASAVA_Build 12 130087469 4D ACAGAATCTT ACTC/---- ACTGCATGGA 3070 hom 78 het 32 0 24 9 ACTC 1 0 198629 CASAVA_Build 12 130096004 1D TGTACAGGGA C/- CCCCCCCCAC 2121 het 21 hom 16 1 10 5 C 9 8 198630 CASAVA_Build 12 130103142 1I TGGTCTTTGT -/G GGGGGAGGAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 G 5 6 198631 CASAVA_Build 12 130116281 2D AGAGGTTTGC CT/-- CTCTCTTCCC 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 CT 4 3 198632 CASAVA_Build 12 130138226 1D AGTCCCCACG C/- CCCCCCCATG 2784 hom 36 het 16 0 10 6 C 8 7 198633 CASAVA_Build 12 130140885 1D CACTGCTGGT C/- TTTGGGTTCC 3070 hom 96 het 39 0 31 9 C 1 0 198634 CASAVA_Build 12 130160635 1D CTGGATTTTT A/- AAAAATTGTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 6 5 198635 CASAVA_Build 12 130160855 2D TTTTTTTCAC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 11 9 198636 CASAVA_Build 12 130162111 2D TTTTCTTCAT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 TG 1 0 198637 CASAVA_Build 12 130163476 1D GCACAAAGTT G/- GGGGGAATGA 3070 het 3070 ref 48 22 18 9 G 6 5 198638 CASAVA_Build 12 130166051 1D CGGTTAATCT C/- TCATAACCCA 3070 hom 93 het 33 0 28 5 C 1 0 198639 CASAVA_Build 12 130177619 1I AGGCTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 23 12 9 A 9 10 198640 CASAVA_Build 12 130183028 1I GTTGCAGCAC -/G CGGGCCCAGC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 G 0 1 198641 CASAVA_Build 12 130186210 3D TCCGTCCTGG TTC/--- CTCCTCATCT 3070 hom 45 het 19 0 14 7 TTC 1 0 198642 CASAVA_Build 12 130193108 12D TTCTTTACCA AAAGAATTTGGT/------------ AAAGAGTTAT 3070 hom 93 het 32 0 31 3 AAAGAATTTGGT 1 0 198643 CASAVA_Build 12 130193429 15D CCTGTGGTGA TGGTGGGACCAGGTC/--------------- CCACCGGAGC 3070 hom 102 het 34 0 35 1 TGGTGGGACCAGGTC 1 0 198644 CASAVA_Build 12 130200588 1D AATCAAGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 27 1 22 5 A 11 10 198645 CASAVA_Build 12 130200787 10D TCTCCTTCAC TATTTTATTT/---------- TATTTTATTT 3070 hom 44 het 21 0 15 8 TATTT 5 3 198646 CASAVA_Build 12 130206045 1I CACTCATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 22 10 T 10 11 198647 CASAVA_Build 12 130207245 2D TGAGAGTATA AT/-- ATGGTAGTTG 3070 hom 99 het 35 0 32 3 AT 2 1 198648 CASAVA_Build 12 130207349 35I AACAATACAG -----------------------------------/TCTAACTTTATTTTTAATGGCATTGATCTTTCTTC TCTAGCATGA 3070 hom 100 het 37 0 33 4 TCTAACTTTATTTTTAATGGCATTGATCTTTCTTC 0 1 198649 CASAVA_Build 12 130220883 1I CACTTTGGGA -/G GCCAAGGCGG 2965 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 2 198650 CASAVA_Build 12 130224757 4D TGATTCTGAT GTTA/---- GTTCTGTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 17 6 GTTA 1 0 198651 CASAVA_Build 12 130231734 1I AATCAGTAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 399 hom 38 1 34 3 A 8 9 198652 CASAVA_Build 12 130233235 5D CAACTTGAGA TTGAT/----- TAAAGTCTTA 3070 hom 57 het 22 0 19 4 TTGAT 1 0 198653 CASAVA_Build 12 130262966 1I CAACCACAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 8 9 198654 CASAVA_Build 12 130264913 27D GAGAATGTAC ACTGTACAGTGTAATACTGTACACTGT/--------------------------- ACAAGTATTA 3070 hom 36 het 7 0 13 2 ACTGTACAGTGTAATACTGTACACTGT 1 0 198655 CASAVA_Build 12 130265575 2I GAAGCGGGGT --/GG TGGTGGAGCA 2026 het 2026 ref 19 10 7 2 G 0 2 198656 CASAVA_Build 12 130269368 1I GCAGGTGGAC -/T CTGGCTTCCG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 0 1 198657 CASAVA_Build 12 130282330 6D CTTCCTCCTT CTCCTC/------ CTCCTCTTCC 1455 het 685 hom 12 3 4 7 CTC 4 2 198658 CASAVA_Build 12 130290695 4I CCAATATTTC ----/TTTT GAGTATATAG 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 T 0 4 198659 CASAVA_Build 12 130295008 1D TGCTCTGTGG T/- TCCCCAAGGG 2891 het 2891 ref 34 18 9 8 T 2 1 198660 CASAVA_Build 12 130308716 1I CAGAAATCCA -/G GGGAAGAACA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 G 3 4 198661 CASAVA_Build 12 130310642 4I ATGCATGGGA ----/GAGT GAGTGAGGGA 3070 hom 142 het 60 0 47 13 GAGT 1 2 198662 CASAVA_Build 12 130312755 3D TGCGGGAGAT GAG/--- GATCCAGGAT 3070 het 3070 hom 46 14 21 11 GAG 1 0 198663 CASAVA_Build 12 130314097 3D AGACAACAAT AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 378 hom 28 1 13 15 AAC 3 2 198664 CASAVA_Build 12 130319017 2I GGCTTAGGTG --/AA AAAAAACAAA 2696 het 358 hom 12 1 7 4 A 6 8 198665 CASAVA_Build 12 130322155 9D GATCACCATT ATCACCATC/--------- ATCACCATCA 3070 hom 213 het 81 0 68 19 ATCACCATC 2 1 198666 CASAVA_Build 12 130324328 2I AACAGAACAC --/AG GGGCTGCGGC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 AG 0 1 198667 CASAVA_Build 12 130328244 3D GCAAAAGACA AAC/--- AACATTTGGC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAC 2 1 198668 CASAVA_Build 12 130341161 2D CACATCCATG CA/-- CACACATACA 3070 het 3070 ref 92 73 8 12 CA 4 3 198669 CASAVA_Build 12 130341321 2I ACACCTGCAC --/GT ACACACCTGC 2344 het 606 hom 34 3 12 19 GT 0 1 198670 CASAVA_Build 12 130343326 1D TTCTCTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 253 hom 29 1 18 10 T 12 11 198671 CASAVA_Build 12 130354090 6D CCACCACCAT CATCAC/------ CATCACCATC 3070 hom 52 het 21 0 18 7 CATCAC 3 2 198672 CASAVA_Build 12 130354184 3I CACCATCATA ---/ACC ATCATTATAA 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 ACC 0 1 198673 CASAVA_Build 12 130366107 1I ACCTCTGTTT -/A AGGGTTCTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 198674 CASAVA_Build 12 130373082 4D TGTCTACAAG TATT/---- TATCCCATTA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 TATT 1 0 198675 CASAVA_Build 12 130374463 1I ATTCTCCTTG -/T TTTCTCCTCA 3070 hom 36 het 27 0 13 14 T 3 4 198676 CASAVA_Build 12 130386513 1D CCAGTGGGTT G/- GGTGGGGGGG 2712 hom 29 het 18 0 9 9 G 3 2 198677 CASAVA_Build 12 130395852 2D GAGCTGACTC TT/-- TGTCACCGGG 1403 het 1403 ref 46 32 3 12 T 3 1 198678 CASAVA_Build 12 130415260 1D TTTGATCACA G/- TGTCCGGCAA 3070 het 3070 ref 46 23 18 6 G 1 0 198679 CASAVA_Build 12 130438485 2D CTCATATTCA GT/-- GTTTCCACAA 3070 het 2082 hom 25 8 10 8 GT 2 1 198680 CASAVA_Build 12 130440211 19D GGACATTCTG GTGTCCAGGTCCTCACAAT/------------------- GTGTCCCCCT 3070 het 3070 ref 45 21 18 9 GTGTCCAGGTCCTCACAAT 1 0 198681 CASAVA_Build 12 130440633 3D CTCTTTCCTT CTC/--- CTCCTGGTTC 3070 het 3070 ref 54 24 25 5 CTC 2 1 198682 CASAVA_Build 12 130444941 1D CATAAGTAGC G/- TTTTTTAGTG 3070 het 3070 ref 37 18 19 0 G 1 0 198683 CASAVA_Build 12 130445853 6I GTGATGGAGG ------/GATGGT GATGGTGATG 3070 het 3070 hom 72 30 30 12 GATGGT 1 2 198684 CASAVA_Build 12 130448641 1I TCTCCCCCAG -/A AAATGGGTTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 3 4 198685 CASAVA_Build 12 130449662 4D GATGGTGTTG GTGA/---- TAATGGTAAT 3070 het 3070 hom 78 27 44 12 GTGA 1 0 198686 CASAVA_Build 12 130450336 1I GGAAGGATGA -/G GGTTGTGAGA 3070 het 3070 ref 40 26 11 3 G 2 3 198687 CASAVA_Build 12 130452677 2I GTTTTATTTG --/TT TTTTTTCACC 3070 het 3070 ref 53 30 11 12 T 6 8 198688 CASAVA_Build 12 130454624 2I CGTGTGACAC --/AG GGGAGAAGCT 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 AG 0 1 198689 CASAVA_Build 12 130458880 5D CAGGGCTGCC TGCCG/----- TGCCGTGCAC 3070 het 3070 hom 43 19 16 9 TGCCG 2 1 198690 CASAVA_Build 12 130459222 1I TAAGAAGTGT -/G GGGGCCTGGC 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 G 4 5 198691 CASAVA_Build 12 130486533 1I2M18D GCCAAGGGAC -CTAGGCCCCTTGCCAAGGTC/ACT------------------ AGCGCATGCT 3070 het 3070 ref 33 20 12 4 N/A 0 0 198692 CASAVA_Build 12 130489632 3D CTCCCCGCTC CCT/--- CCCGGCCCTC 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 CCT 1 0 198693 CASAVA_Build 12 130498658 1I GGGGACTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 11 12 198694 CASAVA_Build 12 130505293 4I ACAAAATCAC ----/ACAG ACAGAGTTGC 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 ACAG 1 2 198695 CASAVA_Build 12 130505571 1D CTGGCTCCTG C/- CCCCACCCCT 1591 het 1591 ref 28 21 5 2 C 5 4 198696 CASAVA_Build 12 130510827 1I GCTCCTCCCC -/T GCCCTCTCCA 2046 het 1423 hom 16 5 6 5 T 0 1 198697 CASAVA_Build 12 130515868 3I CCCCTCCCTT ---/TCC TCCTCCTCTC 3070 hom 68 het 33 0 22 11 TCC 2 3 198698 CASAVA_Build 12 130516638 1D AAAAAATTGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 2807 hom 22 6 12 4 A 9 8 198699 CASAVA_Build 12 130518198 1D AAGTCAGGCC T/- TTTTTTTTTT 1160 het 1160 ref 29 18 4 7 T 13 12 198700 CASAVA_Build 12 130520087 3I GCCGCACGCT ---/TGC GTGTGTCCTC 3070 het 1716 hom 22 7 10 5 TGC 0 1 198701 CASAVA_Build 12 130529450 2D ATTTTCAGTT TC/-- TTACACCCAT 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 TC 1 0 198702 CASAVA_Build 12 130532122 13D GGGGTGAAGT CACCCCACCCCTG/------------- CTTGTGTGTT 3070 hom 36 het 13 0 11 2 CACCCCACCCCTG 1 0 198703 CASAVA_Build 12 130542353 2D AAATTGAAAC AA/-- AATATAAATA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 4 2 198704 CASAVA_Build 12 130543007 6I3M4I GGACCAGCAG ------CTG----/CGTTGACTGGGGA TCTGGGACAG 3070 hom 108 het 38 0 35 4 N/A 0 0 198705 CASAVA_Build 12 130550013 1I TCCATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 26 1 19 6 A 11 12 198706 CASAVA_Build 12 130556973 1D CTGGGAGCCT G/- TCAGAAATGC 3070 hom 120 het 42 0 39 4 G 1 0 198707 CASAVA_Build 12 130559678 3I GTGAAGAAAT ---/CTC CTAAGGCTTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTC 0 1 198708 CASAVA_Build 12 130561742 6D TTTTTTTGAA AATGCC/------ AATGCCAAAG 3070 hom 51 het 20 0 18 3 AATGCC 2 1 198709 CASAVA_Build 12 130570034 2D GACTTCAAAT AA/-- ATAACCCAAC 3070 hom 51 het 20 0 17 5 A 3 1 198710 CASAVA_Build 12 130570642 6I AGACAAGGAT ------/ACAACA ACAACAACAA 3070 hom 89 het 42 0 26 16 ACA 4 6 198711 CASAVA_Build 12 130580107 1D GAGTTGCAAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 2892 hom 24 10 13 2 A 8 7 198712 CASAVA_Build 12 130607569 1I CAGGAGTCGG -/C GGGGGTGGGA 3070 het 2696 hom 28 9 16 3 C 0 1 198713 CASAVA_Build 12 130613131 1I GTGTCTTCAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 8 9 198714 CASAVA_Build 12 130616481 1I TACACGCATT -/C CCCCCTGCTC 3070 hom 70 het 28 0 20 8 C 5 6 198715 CASAVA_Build 12 130622295 2I ATGAATCTGC --/CT CTCTCTCTTT 3070 hom 88 het 35 0 29 7 CT 4 5 198716 CASAVA_Build 12 130622837 1D CCAGGTCCTG A/- ATCTCAGGAA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 2 1 198717 CASAVA_Build 12 130625130 44D CGTGCGGTGC ACCAGCAACCCCCGCTCAGCTCTGCTACCGTGAGCCCCTTCTCT/-------------------------------------------- ACCAGCAACC 2031 het 75 hom 19 3 11 9 ACCAGCAACCCCCGCTCAGCTCTGCTACCGTGAGCCCCTTCTCT 1 0 198718 CASAVA_Build 12 130640972 2D AGGTGTCCTT CC/-- CCCCCCCCAC 3032 het 1791 hom 30 11 12 7 C 10 8 198719 CASAVA_Build 12 130644253 2I GCTTTCCATA --/AC ACAAATACAA 3070 het 3070 ref 64 34 24 6 AC 1 2 198720 CASAVA_Build 12 130646986 2D AGGACTCATC AG/-- AGAGCCTGGA 3070 het 3070 hom 26 13 12 2 AG 3 2 198721 CASAVA_Build 12 130650100 4I CCTCTGTGTG ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 CA 5 7 198722 CASAVA_Build 12 130669429 3I CACATGAGTC ---/GCT GCTGCTCCTT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 GCT 2 3 198723 CASAVA_Build 12 130673752 2D TCTCGGTGAC AA/-- AGAGTCAGCT 2460 het 2460 ref 25 13 7 5 A 3 1 198724 CASAVA_Build 12 130679842 6D ACCCTGGCCT TGGCCC/------ TGGCCCTGGC 1041 het 1041 ref 30 21 3 7 TGGCCC 3 2 198725 CASAVA_Build 12 130690797 1D TCTGAGAACT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 5 het 23 1 15 8 G 10 9 198726 CASAVA_Build 12 130698267 2I CACATACATC --/CA CACACACACT 3070 hom 120 het 46 0 39 7 CA 4 5 198727 CASAVA_Build 12 130699059 3D TGTTGCACGG CCA/--- CCACATGTCA 3070 hom 31 het 14 0 9 7 CCA 2 1 198728 CASAVA_Build 12 130700018 1D CCAGGCTGGT C/- TTGAACTCCT 3070 hom 24 het 10 0 9 2 C 1 0 198729 CASAVA_Build 12 130700295 2D CTCCCCTCTC CT/-- CTCTGTCCTC 3070 hom 65 het 24 0 19 5 CT 3 2 198730 CASAVA_Build 12 130704729 3I TATGTGTAAC ---/CTT CTTAGAAGCC 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 CTT 1 2 198731 CASAVA_Build 12 130707359 3D TTTTATGATT ATG/--- ATGATGATGA 1175 het 1175 ref 16 10 3 4 ATG 5 4 198732 CASAVA_Build 12 130707581 6D13M3D GATGGTGATG ATTATTATGATGATAATGATGG/------ATGATGATTATGA--- TGGTGGTGAT 3070 het 3070 ref 69 35 32 24 N/A 0 0 198733 CASAVA_Build 12 130710442 1D AGGATAGAGG T/- TTGGGGGATG 3070 hom 84 het 35 0 23 13 T 3 2 198734 CASAVA_Build 12 130716068 1I GGGGATTTCT -/G GGGGACGCAT 2186 het 76 hom 10 1 5 4 G 4 5 198735 CASAVA_Build 12 130719235 1D TTTATTTTTT C/- TATCTTACTG 3070 het 3070 hom 34 10 16 10 C 1 0 198736 CASAVA_Build 12 130719280 1D TTCTTCATCC T/- TCCCCTATCC 3070 het 3070 hom 28 10 9 9 T 2 1 198737 CASAVA_Build 12 130722121 1I GGAGGGGGAA -/G GACGAGTTGC 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 G 1 2 198738 CASAVA_Build 12 130722419 1D CCTGAGCCCT G/- GGGGGGCGGC 3070 het 2290 hom 23 7 9 7 G 7 6 198739 CASAVA_Build 12 130726963 3D GGTGTGTGGA TGT/--- TGTGTGCGTC 3070 het 3070 ref 64 35 25 5 TGT 2 1 198740 CASAVA_Build 12 130727398 2I GTGAGTGCAC --/AT GTGTGTCTAT 3070 het 3070 ref 74 34 28 12 AT 0 1 198741 CASAVA_Build 12 130737801 2I TTGAACTTTG --/TT TGAGCGAAGT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 1 3 198742 CASAVA_Build 12 130744020 2I CCATGCCCCC --/CA CCACGCACAC 3070 hom 44 het 18 0 14 4 CA 0 1 198743 CASAVA_Build 12 130745347 1D CTATTCCAAC T/- TTTTTTTTTT 2740 het 126 hom 15 3 8 5 T 17 16 198744 CASAVA_Build 12 130746149 1D GTTTGTTCAA C/- CCCCCCACAC 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 C 7 6 198745 CASAVA_Build 12 130766248 5D ATTCAAATGT TTACA/----- TTACATCAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 TTACA 2 1 198746 CASAVA_Build 12 130776674 2I GTATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 225 hom 29 1 20 8 AC 7 8 198747 CASAVA_Build 12 130783401 2D TTTTGGGAGA CT/-- CTCAGTTGGG 3070 het 2195 hom 25 9 12 6 CT 2 1 198748 CASAVA_Build 12 130789474 14I TCACTGCAAC --------------/CTCAACCTCCCAGG CTCAAGCTAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CTCAACCTCCCAGG 0 1 198749 CASAVA_Build 12 130806891 2I CCAGTGAAAC --/AT ATATACCGTA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AT 2 3 198750 CASAVA_Build 12 130816314 3I TAAAACACTT ---/CTC ATAGAGTATT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 CTC 0 1 198751 CASAVA_Build 12 130819625 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 26 0 20 6 A 11 12 198752 CASAVA_Build 12 130821121 1I TTCTTGTGTA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 T 7 8 198753 CASAVA_Build 12 130830113 1I CCGCACTGAC -/T TGTGCTCATC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 1 2 198754 CASAVA_Build 12 130835784 1I AAGGTCTGGG -/A AAAAAATCAA 3070 het 2936 hom 31 7 13 11 A 6 7 198755 CASAVA_Build 12 130851558 2D AGTCAAATGG CA/-- CAGTTTCCCT 3070 het 3070 hom 46 13 19 15 CA 2 1 198756 CASAVA_Build 12 130851583 1I GTTTCAAAAT -/G GCGTTTCCAT 3070 het 2194 hom 44 6 19 19 G 1 2 198757 CASAVA_Build 12 130862058 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2866 hom 22 het 18 0 13 5 A 15 16 198758 CASAVA_Build 12 130862817 3I TTTTGTGAAA ---/GTT GTTGTCAGAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GTT 1 2 198759 CASAVA_Build 12 130862993 1I GAAAAAAATG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 6 7 198760 CASAVA_Build 12 130865283 1I AAAAAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 11 10 T 11 12 198761 CASAVA_Build 12 130869612 5D TGCACAAAAT AAGAA/----- AACAGGCCAC 2203 het 2203 ref 36 22 9 8 AAGAA 1 0 198762 CASAVA_Build 12 130870342 3I GTGAGACTCC ---/TCT GTCTCAAAAA 3070 hom 40 het 15 0 13 2 TCT 0 1 198763 CASAVA_Build 12 130871329 1I CCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 2348 het 2348 ref 18 7 7 4 A 9 10 198764 CASAVA_Build 12 130887175 1D ATGTCCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 24 1 17 6 A 11 10 198765 CASAVA_Build 12 130890375 1D GAACCTGGGA G/- GCGGAGGCTG 2669 het 2376 hom 18 8 8 2 G 2 1 198766 CASAVA_Build 12 130898932 4I ACACTTTACT ----/AGTA ATTTCAGCCA 2279 het 2279 ref 21 10 7 4 AGTA 0 1 198767 CASAVA_Build 12 130919390 2D TCAAAATCCT TC/-- TGTTTTTTTA 3070 hom 36 het 15 0 11 4 TC 1 0 198768 CASAVA_Build 12 130921520 1D CATAAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 27 0 13 14 T 12 11 198769 CASAVA_Build 12 130921921 4I25M1D7M1D AGACCATCCT ----AACACGGTGAAACCCCGTGTCTACTAAAAATACA/GGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACT-AAAATAC- AAAAAATTAG 1393 het 1393 ref 3 6 3 0 N/A 0 0 198770 CASAVA_Build 12 130922110 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 19 1 16 3 A 11 10 198771 CASAVA_Build 12 130922973 1I TCGGGCCTCA -/T TTGGGAGCTG 3070 hom 73 het 31 0 22 9 T 2 3 198772 CASAVA_Build 12 130923448 5I TGACAACCAC -----/TTTAT TTTATTTTAA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 TTTAT 1 2 198773 CASAVA_Build 12 130938959 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 11 12 198774 CASAVA_Build 12 130964574 4D CCAGCACAGT CGAG/---- CCTGTAGGGC 3070 hom 62 het 22 0 19 6 CGAG 1 0 198775 CASAVA_Build 12 130971078 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2526 hom 27 9 12 6 T 9 10 198776 CASAVA_Build 12 130974127 2D GGCGGCCATT TG/-- TGTGTCTTTG 3020 het 3020 ref 22 11 7 4 TG 3 2 198777 CASAVA_Build 12 130977674 2I TTTTAGAGAC --/AG GGGTTTTGCC 2646 het 2646 ref 21 10 7 4 AG 0 1 198778 CASAVA_Build 12 130997041 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 16 2 13 1 A 13 14 198779 CASAVA_Build 12 131007969 1D AATGTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1856 het 1856 ref 30 20 4 6 T 12 11 198780 CASAVA_Build 12 131016537 1I GGCTGATTTC -/A AAAAAAAAAA 789 het 789 ref 29 12 6 11 A 15 16 198781 CASAVA_Build 12 131021026 1I TTTGGCAGCC -/T CCAAATTGGA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 0 1 198782 CASAVA_Build 12 131030017 4D GAACTTTAAA TTGT/---- TTATTATACA 3070 het 3070 hom 33 16 16 2 TTGT 1 0 198783 CASAVA_Build 12 131052959 2I GCGCTGTATA --/CT CTCTGTGGGG 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 CT 2 3 198784 CASAVA_Build 12 131058452 1D GCGAGGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 23 9 T 11 10 198785 CASAVA_Build 12 131095679 2D CGAAAGCAGG TC/-- TGTCTTTGGC 3070 het 3070 ref 37 15 17 6 TC 1 0 198786 CASAVA_Build 12 131109567 4D TTGACAAGAA TAAT/---- TAATTATCAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 TAAT 2 1 198787 CASAVA_Build 12 131111832 1D AGATGAAAAG A/- AACATACAGC 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 A 3 2 198788 CASAVA_Build 12 131123727 1D CCACCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 31 4 11 16 T 17 16 198789 CASAVA_Build 12 131158694 5D TCATTCTTCC CCATG/----- CCATGCCCCA 3070 hom 57 het 22 0 17 6 CCATG 2 1 198790 CASAVA_Build 12 131176979 3D CATGACTCTC CTT/--- CTGTTGATAT 3070 het 3070 hom 45 16 20 13 CTT 1 0 198791 CASAVA_Build 12 131203256 1I GAGCAGGGTT -/G GGGGGGGTTC 1187 het 1187 ref 12 5 4 3 G 7 8 198792 CASAVA_Build 12 131203368 2D TCAGTGTGAC TG/-- GGGGGAGTTT 1511 het 1511 ref 12 5 5 2 TG 1 0 198793 CASAVA_Build 12 131208211 6D CACTACACAC ACATTA/------ CACTACACAC 987 het 987 ref 74 18 6 54 ACATTA 1 0 198794 CASAVA_Build 12 131208828 12D CACACACACC ACTACACACACT/------------ ACACACACAC 3070 hom 51 het 43 0 36 17 ACTACACACACT 1 0 198795 CASAVA_Build 12 131209834 1D CCACTGCCCC T/- GTGTGCTCCG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 1 0 198796 CASAVA_Build 12 131211236 1I GAGTTCACAG -/C CCCAGTGCCC 3070 hom 52 het 20 0 17 3 C 3 4 198797 CASAVA_Build 12 131212525 5D GTCATCAGAG GCCCT/----- GCCCTGCCCT 3070 hom 77 het 32 0 22 11 GCCCT 4 3 198798 CASAVA_Build 12 131220992 3D2M1I TGTGGTCGAG CCATG-/---TGT GCCCCAGCCC 3070 het 1833 hom 18 8 9 2 N/A 0 0 198799 CASAVA_Build 12 131230647 2I TGCACACGTG --/CA CACACATCCG 3070 hom 227 het 85 0 73 12 CA 3 4 198800 CASAVA_Build 12 131233422 1D TCCAGGGCTC A/- AATGGCCACC 3070 hom 119 het 44 0 34 11 A 3 2 198801 CASAVA_Build 12 131233904 1I TTTATCACGC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 7 8 198802 CASAVA_Build 12 131249026 1D26M1I TGTTAATCCA CCCCCCGAGCCAATGCTTCCCACACTT-/-CCCCAGAGCCAATGCTTCCCACACTTC CGCTTCAATC 2120 het 2120 ref 18 12 6 2 N/A 0 0 198803 CASAVA_Build 12 131251286 1I TGAATCAGGC -/A ATGTGAACAC 3070 hom 219 het 79 0 71 8 A 1 2 198804 CASAVA_Build 12 131251894 10I18M2I CAGATGCTGA ----------GGCCCCATCCAGTTGGGA--/GGCCCCATCCGGCCCCATCCAGGTGGGACC CCCCCCAGCC 2448 hom 25 het 9 0 9 2 N/A 0 0 198805 CASAVA_Build 12 131252143 1I GCCATATCCA -/C GAGACCAGCC 3070 hom 48 het 22 0 16 6 C 0 1 198806 CASAVA_Build 12 131252423 2D GGGACCAGCA CT/-- CTCTGACGGA 3070 hom 113 het 40 0 33 7 CT 3 2 198807 CASAVA_Build 12 131254668 3D ACCAGCCTCC CCA/--- GCTAATAAAA 3070 hom 84 het 33 0 25 9 CCA 1 0 198808 CASAVA_Build 12 131256950 1I GTTCGAGACC -/A GCCTGGCCAA 3070 hom 33 het 13 0 10 3 A 0 1 198809 CASAVA_Build 12 131258757 1I TTGGCCCCCC -/T TCTCAGGGGC 3070 hom 36 het 16 0 11 5 T 1 2 198810 CASAVA_Build 12 131263857 4D CAATTCTTAG AATC/---- AATCAATTTC 3070 hom 126 het 44 0 41 4 AATC 2 1 198811 CASAVA_Build 12 131263979 12I CACTCACACC ------------/CACACCCACAGT CACACACACG 3070 hom 121 het 48 0 36 12 CACACCCACAGT 0 1 198812 CASAVA_Build 12 131268087 4D ATCCCCCACT CATC/---- CATCCATCCA 3070 hom 118 het 51 0 35 16 CATC 5 4 198813 CASAVA_Build 12 131389737 2D CCTCTGTCTG TC/-- TCTCTCTCGG 3054 het 3054 ref 31 14 11 7 TC 5 4 198814 CASAVA_Build 12 131394695 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 25 0 15 10 A 13 11 198815 CASAVA_Build 12 131403895 1D GACTCCACAG A/- GCAGGGCCTG 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 1 0 198816 CASAVA_Build 12 131406878 3I TTATTTTTAT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 41 het 17 0 14 3 TTG 3 4 198817 CASAVA_Build 12 131412849 1D CTTCCCCTTC T/- TTTCCTTGAG 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 T 4 3 198818 CASAVA_Build 12 131417774 4D CATGTTTCTG TGTA/---- TGTATGTCTG 3070 het 2127 hom 69 11 28 35 TGTA 2 1 198819 CASAVA_Build 12 131417871 6I CATGTGTCTA ------/TGTGTG TGTGTGTGTT 3070 het 3070 hom 56 21 20 15 TG 4 7 198820 CASAVA_Build 12 131423030 1D ATAAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 15 0 13 3 T 13 12 198821 CASAVA_Build 12 131429008 1I GCTCCGTCCT -/C CCCCTCCCAG 3070 hom 39 het 15 0 11 4 C 4 5 198822 CASAVA_Build 12 131429484 4I CACGTGTGTC ----/TGTG TGTGTGCTCA 3070 hom 207 het 83 0 67 16 TG 3 5 198823 CASAVA_Build 12 131436589 3D CATCACCATC ACT/--- ATCATCACCA 3070 het 3070 ref 97 50 16 31 ACT 1 0 198824 CASAVA_Build 12 131459402 4I ATAAAAAATA ----/AAAT AAATAAGAAG 1895 het 1252 hom 10 4 4 2 AAAT 1 2 198825 CASAVA_Build 12 131507083 1I ACTCAACAAA -/T TTTTTTTTTT 2789 het 2789 ref 26 9 11 6 T 13 14 198826 CASAVA_Build 12 131509467 2D TCTCTCTCCG TC/-- TCTCTCTCTC 3038 het 3038 ref 43 28 9 7 TC 6 5 198827 CASAVA_Build 12 131513415 3I CAGTTGGCCA ---/GAG GAGGAGATGT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 GAG 2 3 198828 CASAVA_Build 12 131516854 1I AGTGATGATG -/C CCCCCCCCCA 1855 het 1855 ref 32 15 10 7 C 9 10 198829 CASAVA_Build 12 131520234 20I ATGTCTGTGT --------------------/GCATGTGTGCTATCCAGCAC GCATGTGTGC 3070 hom 81 het 36 0 23 13 GCATGTGTGCTATCCAGCAC 0 1 198830 CASAVA_Build 12 131545578 4D TTGAAATTCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 36 1 20 17 T 18 14 198831 CASAVA_Build 12 131551270 3D TCACCATCAT CAC/--- CACCATCACC 3070 hom 16 het 58 1 32 27 CAC 2 1 198832 CASAVA_Build 12 131556246 2D AGAAGCAAAA AT/-- AGACAGTGAG 3070 hom 66 het 23 0 23 1 AT 1 0 198833 CASAVA_Build 12 131556470 1D GTGAAAAGGC A/- AAACCCCAGG 1875 het 23 hom 17 1 7 9 A 4 3 198834 CASAVA_Build 12 131556995 1D ACACGGAATC A/- ACCCAAGTGT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 2 1 198835 CASAVA_Build 12 131557925 9D TGAAAAAGCG GAACTCACA/--------- GAAGCAGAGT 3070 hom 90 het 31 0 30 2 GAACTCACA 1 0 198836 CASAVA_Build 12 131565468 1D CAGAGTTGGT G/- GGGGGGGGGG 929 het 5 hom 15 0 5 10 G 11 10 198837 CASAVA_Build 12 131574830 2D GATCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 25 0 16 9 A 13 11 198838 CASAVA_Build 12 131590902 1I GTCCCAAAGA -/G GGGGCAGCAG 3070 hom 70 het 28 0 22 6 G 4 5 198839 CASAVA_Build 12 131622750 2D TGTGTACATG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 199 het 76 0 65 11 GT 6 5 198840 CASAVA_Build 12 131628560 3D GCTGCTCCCC CCA/--- CCACCCCGAA 3070 hom 38 het 15 0 13 3 CCA 2 1 198841 CASAVA_Build 12 131643522 1D GCTGCCCCCC A/- AACCCCCGTC 2919 hom 25 het 15 0 9 6 A 3 2 198842 CASAVA_Build 12 131677441 4I CCTGGGAGTA ----/CAGG CAGGCGTGAG 2343 het 2343 ref 29 16 9 4 CAGG 1 2 198843 CASAVA_Build 12 131691112 1D CCGGGTGCCC G/- CAGCTCACCT 3070 het 2818 hom 36 11 17 8 G 1 0 198844 CASAVA_Build 12 131698382 4D CCCAAAACTC AGTT/---- AGCCCAAAAA 3070 het 92 hom 45 2 23 24 AGTT 1 0 198845 CASAVA_Build 12 131698888 18D GTGGAAGCGT GTAGGGCAGGAGGCAAGG/------------------ GGAGGCAGGG 3070 het 3070 ref 30 16 12 5 GTAGGGCAGGAGGCAAGG 1 0 198846 CASAVA_Build 12 131704095 1D AGTGAGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 A 13 12 198847 CASAVA_Build 12 131704794 1D TTATCATAAT A/- AACTATTTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 3 2 198848 CASAVA_Build 12 131707362 1D CAGGCAGAGG A/- AAAGAAATGC 3070 hom 66 het 24 0 19 5 A 4 3 198849 CASAVA_Build 12 131715304 25D GGCTCCATCT CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAA/------------------------- CAAAACAAAA 2996 het 2996 ref 19 8 8 6 CAAAA 9 4 198850 CASAVA_Build 12 131721319 1D TGAACTCCCA C/- CCCCCAAGGA 2955 het 2955 ref 29 11 10 8 C 6 5 198851 CASAVA_Build 12 131726198 12I TTCACCGCAT ------------/CCCTCAACACAA CCCAAACTCT 3070 het 3070 hom 53 17 20 16 CCCTCAACACAA 0 1 198852 CASAVA_Build 12 131730726 1I CGGAGTCCTA -/G GACTTCTGGT 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 G 1 2 198853 CASAVA_Build 12 131731066 13I CTCAAGTGAT -------------/CCTCCCACTTCAG CCTCCCAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 CCTCCCACTTCAG 0 1 198854 CASAVA_Build 12 131732460 2D CACACACACC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 CA 8 7 198855 CASAVA_Build 12 131733464 1I GACTCCAGCC -/T GGGCAACAGG 3022 het 1356 hom 12 3 7 2 T 0 1 198856 CASAVA_Build 12 131740519 1I ATTGTTCAAA -/G CTTTAACATG 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 G 0 1 198857 CASAVA_Build 12 131740882 1D TTTACACTTA T/- TTTTTTTCGT 3070 het 1630 hom 20 5 11 4 T 8 7 198858 CASAVA_Build 12 131744463 2D CAACTCAGAC AT/-- ATTCTGCTCT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AT 2 1 198859 CASAVA_Build 12 131744815 4I TAACACGTGC ----/GTGT GTATGTGTAA 3070 het 3070 ref 86 41 33 12 GT 1 3 198860 CASAVA_Build 12 131754742 1D ACCTCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1870 hom 29 6 14 11 A 11 10 198861 CASAVA_Build 12 131756712 4D ACCTGCCCAT CTCA/---- CTGTTTCTTA 1768 het 1768 ref 16 9 6 1 CTCA 1 0 198862 CASAVA_Build 12 131760863 1D GAAAAGAAGG C/- CCCCCACACT 2915 het 1183 hom 11 4 7 0 C 6 5 198863 CASAVA_Build 12 131768003 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 527 hom 20 5 13 2 T 8 9 198864 CASAVA_Build 12 131768073 5D TGTGATCTCG GCTCA/----- CTGCAAGCTC 2107 hom 12 het 8 0 5 4 GCTCA 1 0 198865 CASAVA_Build 12 131777238 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 9 8 198866 CASAVA_Build 12 131787508 1I ACTGGAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2025 hom 40 11 14 15 T 15 16 198867 CASAVA_Build 12 131808913 1D TTTTTTTTTT G/- TTTTTTTTTT 1906 het 404 hom 18 5 8 5 G 1 0 198868 CASAVA_Build 12 131809217 2D AGGGATTAAA AT/-- ATTCAAACAT 3070 het 3070 hom 27 12 12 5 AT 2 1 198869 CASAVA_Build 12 131818085 4I TCATTTTCAT ----/TTTC TTTCTATCAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 TTTC 1 2 198870 CASAVA_Build 12 131823233 1I CAGCAAGGTG -/C CCTAGGACGG 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 C 2 3 198871 CASAVA_Build 12 131830319 1D ATACTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 1940 het 1940 ref 14 5 6 4 A 11 10 198872 CASAVA_Build 12 131835520 4D GCTTATATAC ATAT/---- ATATATATAT 770 het 70 hom 17 1 6 10 AT 11 9 198873 CASAVA_Build 12 131846181 6D TATATATATG TATACT/------ ATATGTGCTA 2305 het 2305 ref 27 20 6 3 TATACT 1 0 198874 CASAVA_Build 12 131852870 1D AATATATCTA T/- TTCATGTGAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 3 2 198875 CASAVA_Build 12 131857241 3D CCCATAAGCA AGG/--- AGAAGTCGCT 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 AGG 1 0 198876 CASAVA_Build 12 131858507 6D CTGGTCTGCT CTCCTC/------ CTCCTCCTCC 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 CTC 5 3 198877 CASAVA_Build 12 131859049 1D CTAAAAATAC A/- AACATTAGCC 3070 het 1949 hom 19 5 11 3 A 3 2 198878 CASAVA_Build 12 131860320 1D GGGCCTATCA G/- GGTAGTTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 G 3 2 198879 CASAVA_Build 12 131871372 2D TCCCACACAC CA/-- CACACACACG 3070 het 3070 hom 73 24 30 21 CA 5 4 198880 CASAVA_Build 12 131881296 2D ATAGCTCCAC AA/-- AAGTCTCTCT 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 A 4 2 198881 CASAVA_Build 12 131889733 1D9M2D AACAAAACAA CAACAACAACAA/-AACAACAAC-- AACAACAAAA 3070 hom 30 het 10 0 10 4 N/A 0 0 198882 CASAVA_Build 12 131890331 4D TCTCGGCCGG CTTT/---- CTCTTTCCTA 3070 het 3070 ref 37 17 13 9 CTTT 1 0 198883 CASAVA_Build 12 131897247 2D AGCTGAGGGG AC/-- ACAGTGAGAA 1338 het 1338 ref 13 4 3 7 AC 2 1 198884 CASAVA_Build 12 131897889 2D CTTTTATCTC TT/-- TGTCTTGTGT 2279 het 962 hom 16 4 7 5 T 3 1 198885 CASAVA_Build 12 131908068 1D CTCCACGTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 28 1 22 7 A 12 11 198886 CASAVA_Build 12 131912465 3D GCTCCTGCGG TAC/--- TACAAGAACA 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 TAC 2 1 198887 CASAVA_Build 12 131913508 3D TCCGGGCAGC GAG/--- GAGGAGGAGC 3070 het 3070 hom 37 14 15 9 GAG 4 3 198888 CASAVA_Build 12 131916582 14I AGGCGTAAAA --------------/TGTATGAATGAAAC TATACAACTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TGTATGAATGAAAC 0 1 198889 CASAVA_Build 12 131917723 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2478 het 1707 hom 20 4 7 9 A 13 14 198890 CASAVA_Build 12 131928056 2I CTCAGAGGGT --/AA AAAGCTCCAC 2455 het 2455 ref 22 12 6 4 A 3 5 198891 CASAVA_Build 12 131931740 5D ACATCAAAAT TAAAA/----- TAAATACAAC 3070 hom 30 het 12 0 11 3 TAAAA 1 0 198892 CASAVA_Build 12 131932441 8I AGTCCCCGAG --------/GGTGACTT GGTCCCAGGA 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 GGTGACTT 0 1 198893 CASAVA_Build 12 131936926 3D TCCCTAAAAT ATA/--- ATGTTAGGTA 3070 het 3070 hom 34 11 17 7 ATA 1 0 198894 CASAVA_Build 12 131939118 1I TGTGGCAGCA -/G GAAGTCTGAG 3070 hom 48 het 26 0 15 11 G 1 2 198895 CASAVA_Build 12 131942170 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 2566 het 1153 hom 13 4 6 3 A 7 8 198896 CASAVA_Build 12 131942513 1D GTTTCAAGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 9 8 198897 CASAVA_Build 12 131946940 1D GAGACACCCC T/- GCCAACATTA 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 T 1 0 198898 CASAVA_Build 12 131951127 3D GCATACAGAT AGA/--- AGAATTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 14 4 AGA 2 1 198899 CASAVA_Build 12 131969366 1D GAACATCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 T 13 12 198900 CASAVA_Build 12 131985229 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 9 8 198901 CASAVA_Build 12 132005404 1D CACCCGGCTA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 91 het 39 0 26 13 T 8 7 198902 CASAVA_Build 12 132021271 3D AGGCTGAGAC AGG/--- AGAATAGCTT 3070 hom 66 het 23 0 23 3 AGG 1 0 198903 CASAVA_Build 12 132024452 1I AAAAGTGGAA -/G CAATTAAGAT 3070 hom 118 het 47 0 39 8 G 0 1 198904 CASAVA_Build 12 132024631 4D ATGTGATCCC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 78 het 33 0 27 8 ATTT 4 3 198905 CASAVA_Build 12 132030883 1D ATTCCTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 222 hom 25 1 16 8 T 12 11 198906 CASAVA_Build 12 132032894 1D AGAGTAAAAC A/- CCAACTTACT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 1 0 198907 CASAVA_Build 12 132033668 1D CACCCCCTTG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 67 het 27 0 21 7 T 9 8 198908 CASAVA_Build 12 132058535 1I CGAGTTTTTT -/A AAAAAATAGC 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 6 7 198909 CASAVA_Build 12 132059255 2D TCTTGGGATA TT/-- TTGTTTTTCA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 4 2 198910 CASAVA_Build 12 132061534 1D TATTTTCCAA G/- GGCTGAAAGA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 G 3 2 198911 CASAVA_Build 12 132063868 1I11M1I ATCTCCCTTT -CTCCGGGGGAG-/CCTTGTGGGGAGT GTAGAGAAGA 3070 hom 42 het 18 0 14 8 N/A 0 0 198912 CASAVA_Build 12 132067328 1D TATTCCATCG T/- TATGGCTATA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 T 2 1 198913 CASAVA_Build 12 132074904 1I AAATCTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 9 10 198914 CASAVA_Build 12 132106019 1D GAAAAATAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 10 9 198915 CASAVA_Build 12 132106767 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 10 9 198916 CASAVA_Build 12 132107778 2D TTCTTTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 35 0 18 17 T 18 16 198917 CASAVA_Build 12 132108417 2I24M1D CAGAGTGAAA --CTGTCTCAGAAAAAAGAAAGAAAGA/CTCTGTCTCAGAAAAAAGAAAGAAAG- AAAACGTTTA 1784 hom 15 het 4 0 5 4 N/A 0 0 198918 CASAVA_Build 12 132109137 4I TAATATACAC ----/ACAT ACATACAAAG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 ACAT 1 2 198919 CASAVA_Build 12 132112272 1D CCTTGAACCT G/- GGTGGACTTG 3070 hom 140 het 54 0 45 9 G 3 2 198920 CASAVA_Build 12 132113786 1I CATTATTTCT -/C CCCGGCGTTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 3 4 198921 CASAVA_Build 12 132116403 1D ATGGCGTGAA C/- CCGGGAGGCA 3070 het 170 hom 13 1 10 2 C 3 2 198922 CASAVA_Build 12 132120090 1D TTTTTTTCAC T/- TTCCCCATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 3 2 198923 CASAVA_Build 12 132124953 1I TTAGACAGTT -/C TGCTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 0 1 198924 CASAVA_Build 12 132125218 2D AGACCCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 28 2 20 6 A 15 13 198925 CASAVA_Build 12 132125304 1I ATTGGAGTCG -/A ATGAGTTATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 2 198926 CASAVA_Build 12 132129702 3D TTGATTTTGT CTG/--- CTGTAGTGTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTG 2 1 198927 CASAVA_Build 12 132130977 1I CTAGTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 2536 het 734 hom 25 4 12 9 T 17 18 198928 CASAVA_Build 12 132132627 4I TCTGTTCAAA ----/ACTG ACAGTTTCTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACTG 0 1 198929 CASAVA_Build 12 132159820 2D AACAAGAGAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 AT 7 6 198930 CASAVA_Build 12 132163024 12I TTGCTATGAA ------------/ACATTATTTCAC AGAAGATAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 ACATTATTTCAC 0 1 198931 CASAVA_Build 12 132165290 2D TGTTTTGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 26 13 T 13 11 198932 CASAVA_Build 12 132173151 1I GAAGATTTTT -/G CTCTTGTATC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 198933 CASAVA_Build 12 132175876 1D ATTCATTTGA T/- TTTTTTTTTT 1679 het 1679 ref 19 10 5 4 T 13 12 198934 CASAVA_Build 12 132180894 2D CTTGAGCTAC AA/-- AAGTCTGACA 3070 het 2219 hom 30 5 24 1 A 4 2 198935 CASAVA_Build 12 132182056 3D TGGGAATCTC TCG/--- TCGGCTGTCC 3070 het 3070 hom 77 22 48 8 TCG 2 1 198936 CASAVA_Build 12 132182255 1I GGGGACCGGC -/T ATCAGCATAC 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 T 0 1 198937 CASAVA_Build 12 132189374 1D TGCCACTGGA C/- CCCAGCCTGG 3070 het 13 hom 15 1 13 1 C 4 3 198938 CASAVA_Build 12 132189420 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAAGAAAAA 3070 het 5 hom 26 1 16 9 AAG 0 1 198939 CASAVA_Build 12 132191014 1I AAAGATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1778 hom 33 5 21 7 T 15 16 198940 CASAVA_Build 12 132192148 1I AAACATTCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 9 10 198941 CASAVA_Build 12 132198896 1D TGTCCCTCCA C/- CCTCTGCCCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 3 2 198942 CASAVA_Build 12 132200376 1D CTGTCCCAAG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 7 198943 CASAVA_Build 12 132204606 3D TTCACCTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 269 hom 43 4 21 18 T 19 16 198944 CASAVA_Build 12 132206817 3I GTATTTACAG ---/AAC AAAATGTTAT 3070 hom 132 het 55 0 44 11 AAC 0 1 198945 CASAVA_Build 12 132210414 2D AACAACAACA AC/-- AACAAAGTTA 2550 het 1050 hom 43 8 7 29 AC 1 0 198946 CASAVA_Build 12 132211843 1D CTTATTTTTT A/- GAGACAGGGT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 1 0 198947 CASAVA_Build 12 132217872 1D CCTCATCTTT G/- TTTTGTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 1 0 198948 CASAVA_Build 12 132217994 13I TGACACTAGA -------------/TTTGAATTAAAAT TATATATACG 3070 hom 81 het 27 0 28 0 TTTGAATTAAAAT 0 1 198949 CASAVA_Build 12 132218929 1I AATCTGAGAA -/T TTTTTTTTTT 1981 het 630 hom 16 2 8 6 T 17 18 198950 CASAVA_Build 12 132221474 6I GAATTATATA ------/GTCTTT GTCTTCTAGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 GTCTTT 0 1 198951 CASAVA_Build 12 132224706 2D TGGAGCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 1721 het 195 hom 36 4 4 28 A 12 10 198952 CASAVA_Build 12 132227039 1D CCTCGACTTT G/- GAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 21 0 19 3 G 2 1 198953 CASAVA_Build 12 132227609 2I TAGTACATAC --/GT GTGTGAGGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GT 2 3 198954 CASAVA_Build 12 132230521 1D GGCCGTGGGG A/- AAAATTCACT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 5 4 198955 CASAVA_Build 12 132232320 4D ATACAAAAAT AAGC/---- AAGCCAGGCG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AAGC 2 1 198956 CASAVA_Build 12 132253530 1I AGCCAATTTT -/A ACATCATATT 3070 hom 59 het 24 0 20 4 A 1 2 198957 CASAVA_Build 12 132269051 1D TTGTTCAACA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 8 198958 CASAVA_Build 12 132272518 2D AGGTGGAGTC CT/-- CTTTTCTAAG 3070 hom 129 het 46 0 43 5 CT 2 1 198959 CASAVA_Build 12 132273918 1D AAATTTAATC T/- TCATTTCTGA 3070 hom 51 het 23 0 19 4 T 2 1 198960 CASAVA_Build 12 132275359 1I GCAGAATATC -/A AGAGTTCACC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 1 2 198961 CASAVA_Build 12 132276659 7D AGTAGAGACG AAGTTTC/------- ACCATGTTAG 3070 het 4 hom 15 1 14 1 AAGTTTC 1 0 198962 CASAVA_Build 12 132277594 6D GAGTGATCAG TCGAAC/------ TTGTTTGCCT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 TCGAAC 1 0 198963 CASAVA_Build 12 132278767 2D TACCATGCAC TT/-- TTTTTTTTTT 2145 hom 30 het 19 0 9 10 T 18 16 198964 CASAVA_Build 12 132283688 2D AGATCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 14 12 198965 CASAVA_Build 4 2460 3I CGGAGCGCCA ---/GTT GTTAAGCACC 3070 het 3070 ref 86 38 29 19 GTT 1 2 198966 CASAVA_Build 4 3936 1D CATCTCTACT A/- AAAATACAAA 2226 het 2226 ref 31 25 5 1 A 5 4 198967 CASAVA_Build 4 5957 1I GTTGTGGGGT -/G GGGGGGGAGG 2550 het 486 hom 10 1 6 3 G 7 8 198968 CASAVA_Build 4 7346 1I8M1I TAACATGGCC -GGCATGGT-/GGGCATGGTG GCACATGCCT 3070 hom 277 het 103 0 90 21 N/A 0 0 198969 CASAVA_Build 4 9946 1D TAGTTTGTCT C/- TGAGTCTTAT 1493 het 1493 ref 72 64 5 3 C 1 0 198970 CASAVA_Build 4 12977 1D AGACAGGAAG C/- TTTTGCCTCA 3070 het 2415 hom 27 9 9 10 C 1 0 198971 CASAVA_Build 4 13067 5I TGTAGACATG -----/CCACA CTACCAGGTG 3070 het 3070 hom 88 36 40 12 CCACA 0 1 198972 CASAVA_Build 4 25565 2I TAGATCCCAC --/TT GTCAATTTTT 3070 het 3070 hom 87 19 64 4 T 0 2 198973 CASAVA_Build 4 27549 1D TTAGCATGAA G/- GGCTGTTGAA 1458 hom 7 het 6 0 3 3 G 3 2 198974 CASAVA_Build 4 27801 1D TAAAATTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 10 9 198975 CASAVA_Build 4 27976 1D AGGTCCTGTA C/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 96 80 13 3 C 1 0 198976 CASAVA_Build 4 43693 1I GCTGTGGTCC -/G GGGGGTCCGG 3070 het 3070 ref 85 52 11 22 G 5 6 198977 CASAVA_Build 4 44943 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2357 het 1170 hom 33 7 11 15 T 13 14 198978 CASAVA_Build 4 58700 1D ATTAAATTGC T/- TTTGACTATA 3070 het 3070 ref 69 26 19 25 T 4 3 198979 CASAVA_Build 4 62593 6D AAGTATGAAA TGTAAG/------ TGCCTTCCAA 3070 hom 120 het 43 0 41 4 TGTAAG 1 0 198980 CASAVA_Build 4 63647 1D TCATTAAGTT C/- CTGTGAGTAG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 C 2 1 198981 CASAVA_Build 4 66722 1I TAACCTTATA -/G GGGTTCCCTT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 G 3 4 198982 CASAVA_Build 4 67215 1D GTGTTCTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 10 198983 CASAVA_Build 4 68948 1D AATGGATCTC T/- TAGATTAATT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 2 1 198984 CASAVA_Build 4 77314 1I TACACAAGCG -/A ATTCATACTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 198985 CASAVA_Build 4 79400 2I GGCAGATGAC --/TT TGCTCCCGGC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 T 1 3 198986 CASAVA_Build 4 79804 6I TCTCTTTTCT ------/TTTCTC TTTCTCTTTC 3070 hom 62 het 32 0 21 11 TTTCTC 2 3 198987 CASAVA_Build 4 86865 1I AAAGGCCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 518 hom 23 2 14 7 T 11 12 198988 CASAVA_Build 4 89019 1D TTTATATTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 10 9 198989 CASAVA_Build 4 89365 1D ATTTTTAGTA G/- GAGATGGGGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 2 1 198990 CASAVA_Build 4 91941 1I AGCCAGTGGG -/T TTTATCTTAT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 3 4 198991 CASAVA_Build 4 93563 1D CAAATACACC G/- TCCCAGCCCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 G 1 0 198992 CASAVA_Build 4 96326 1I CTTCACTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 42 2 29 11 A 13 14 198993 CASAVA_Build 4 98189 1D AGGCCCACGG A/- GGCAAGGTGA 3070 hom 99 het 34 0 29 5 A 1 0 198994 CASAVA_Build 4 102294 1D ACGAAACCCC T/- TCAGACACCG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 2 1 198995 CASAVA_Build 4 102595 1I AGGCCCATGG -/C GTGGTGCTGG 3070 hom 39 het 16 0 14 3 C 0 1 198996 CASAVA_Build 4 103135 1I CAGACACAGT -/G GCTCATGCCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 1 2 198997 CASAVA_Build 4 105247 1I9M2I GACAACCAAG -ACCCTCTTT--/AACCCTCTTTTG GGGTCCAGAT 3070 hom 54 het 20 0 19 7 N/A 0 0 198998 CASAVA_Build 4 105411 4I CTATGGCTTA ----/TATT TTAAAAATTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TATT 0 1 198999 CASAVA_Build 4 109275 1I ATAGGTCTGG -/T TTTACTCTTC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 3 4 199000 CASAVA_Build 4 114903 1I28M1D GAGATTGAGG -CCCATCAAAACATGGAGTTCATGTGAGCA/CCCCATCAAAACATGGAGTTCATGTGAGC- AAACAGGACT 3070 hom 69 het 19 0 24 2 N/A 0 0 199001 CASAVA_Build 4 115479 1I GGTGTCCGCA -/G GAGGCGCGGC 3070 hom 75 het 27 0 22 5 G 1 2 199002 CASAVA_Build 4 115749 1D GTTTTCTGCC A/- AAAAGCACAC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 A 5 4 199003 CASAVA_Build 4 115901 1I CAGTGCGTAG -/C CCTGCCTGGG 3070 hom 93 het 37 0 30 7 C 2 3 199004 CASAVA_Build 4 116714 1I AATTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 969 hom 30 4 16 10 T 15 16 199005 CASAVA_Build 4 117334 1D ATAATAAATT C/- CTTACTTAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 C 2 1 199006 CASAVA_Build 4 118758 1D AGGCTAAGGT C/- GGGTGGATCA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 C 1 0 199007 CASAVA_Build 4 119268 8I CAAAGGAGGC --------/AATCAGAT AATCAGATGT 3070 hom 48 het 23 0 15 8 AATCAGAT 1 2 199008 CASAVA_Build 4 121547 1D TTTTTTTCTT A/- CTCGGGACTG 3070 het 247 hom 33 1 29 3 A 1 0 199009 CASAVA_Build 4 124963 1D GTTATTCATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 444 hom 26 1 20 6 A 10 9 199010 CASAVA_Build 4 128711 2I ATATGCAAAG --/TC TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TC 0 1 199011 CASAVA_Build 4 130558 1I TGCTGGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1376 hom 33 3 29 1 T 10 11 199012 CASAVA_Build 4 136964 5D GACTCTCTTT CACTG/----- CTCCAATGTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CACTG 1 0 199013 CASAVA_Build 4 140045 4D TAAGTCTCTG TGTT/---- TGTTTATCTG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TGTT 2 1 199014 CASAVA_Build 4 142283 4I TTGATAGGCC ----/CTTA CTTCTTGTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CTTA 0 1 199015 CASAVA_Build 4 143177 1D ACATCTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 39 0 30 9 T 12 11 199016 CASAVA_Build 4 157369 1I TCCACACTTA -/T ACAGCCATCT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 0 1 199017 CASAVA_Build 4 172749 1D GTGTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 30 1 21 8 T 12 11 199018 CASAVA_Build 4 174219 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1782 het 862 hom 14 6 5 3 A 17 16 199019 CASAVA_Build 4 179375 1I ACGTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 29 1 18 10 T 11 12 199020 CASAVA_Build 4 189557 1I TCAGAGACCC -/A GCCCCCCAGA 3070 hom 90 het 33 0 26 7 A 0 1 199021 CASAVA_Build 4 190128 4I CATGTGTGAG ----/TGAC TGAGTGACTG 3070 hom 219 het 82 0 73 9 TGAC 0 1 199022 CASAVA_Build 4 191848 2D GCAGGAAAAC AT/-- GTGAACAAAT 3070 hom 84 het 30 0 27 3 AT 1 0 199023 CASAVA_Build 4 196974 1D ATCAAAACAT A/- AGAGTTCATG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 2 1 199024 CASAVA_Build 4 202869 1D AATTTACCAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 68 het 28 0 24 5 T 8 7 199025 CASAVA_Build 4 209207 2I TCTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2700 hom 33 het 15 0 11 4 A 16 18 199026 CASAVA_Build 4 211012 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 16 1 11 4 A 11 10 199027 CASAVA_Build 4 211783 2D ACACAGTAGC TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 32 0 24 9 TA 8 7 199028 CASAVA_Build 4 214748 1D TACTATGTTG A/- ATAACAGTGG 3070 hom 132 het 50 0 45 7 A 2 1 199029 CASAVA_Build 4 228781 4I AGACTGTTAT ----/GTCA ATCATTATGT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 GTCA 0 1 199030 CASAVA_Build 4 229597 4D CCTTTTTTTC TTTT/---- TCTTCAGCTC 1763 het 1763 ref 29 24 4 3 T 5 1 199031 CASAVA_Build 4 237254 2D TTTGTATAAG TA/-- TATATATATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TA 5 4 199032 CASAVA_Build 4 249875 1I CCATCCTGGC -/A AACACGGTGA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 2 3 199033 CASAVA_Build 4 250415 3D TAGAAACTTC TTT/--- GTTCCAATAT 3070 hom 75 het 27 0 26 3 T 3 0 199034 CASAVA_Build 4 251589 4D GCATAACACA TCAT/---- TCAAGGCACA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TCAT 1 0 199035 CASAVA_Build 4 252145 2I ATCTTTCATT --/TC TGTTTTTTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TC 0 1 199036 CASAVA_Build 4 263876 4I TAAAAACAAA ----/AAAT AAATAATTGA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 AAAT 1 2 199037 CASAVA_Build 4 271737 1I CTTTACAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 199 hom 31 2 25 4 T 10 11 199038 CASAVA_Build 4 282207 1I ACTTTTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 619 hom 37 2 25 10 A 11 12 199039 CASAVA_Build 4 288356 1D CCCGCAGCTG C/- CCCCCCCCTG 1313 hom 28 het 20 0 7 13 C 9 8 199040 CASAVA_Build 4 314242 3I AACTAATGAT ---/TAA TGATATTCAT 3070 het 2176 hom 20 6 12 2 TAA 0 1 199041 CASAVA_Build 4 315097 1D AAGTTCCTTT C/- TACTAGATTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 1 0 199042 CASAVA_Build 4 321213 2D GGGTGCGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 35 13 15 10 GT 9 8 199043 CASAVA_Build 4 321694 1I TCGGCCACAG -/C CTCAGCCTCC 3070 hom 83 het 31 0 26 5 C 1 2 199044 CASAVA_Build 4 323290 1I CAAGAATTCA -/G ACGTTAGTGA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 G 0 1 199045 CASAVA_Build 4 324532 1D TTTGAAGTTG T/- TTGCTATTGC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 3 2 199046 CASAVA_Build 4 333796 4I GTCACAGGGC ----/TGCT TCAGGAGCAC 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 TGCT 0 1 199047 CASAVA_Build 4 345104 4I ATATAATGTC ----/TCTT TCTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TCTT 1 2 199048 CASAVA_Build 4 349299 3D TGTGTTATTT TTG/--- TTGTTAAGTT 3070 het 3070 ref 39 25 11 6 TTG 2 1 199049 CASAVA_Build 4 350458 5D CTGCTAGACA TATTT/----- TATTTTATTT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 TATTT 3 2 199050 CASAVA_Build 4 358453 2I TGAATATAAG --/AA AATTCATCCT 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 2 4 199051 CASAVA_Build 4 364450 1D CCCCCTGCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 9 8 5 A 11 10 199052 CASAVA_Build 4 370439 1I CCCTACTTGA -/C CCTGTTCGGA 3070 het 2523 hom 26 8 10 8 C 2 3 199053 CASAVA_Build 4 377580 5D AAGAATTCTC TCTTT/----- TCTTTAGAGA 3070 het 3070 ref 34 20 13 4 TCTTT 2 1 199054 CASAVA_Build 4 378014 1I TATGTGTAAA -/T TGAAAAGTTA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 T 1 2 199055 CASAVA_Build 4 381480 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 10 9 199056 CASAVA_Build 4 394977 1I ACTTCATCTT -/A AAAAAAAAAA 2576 het 2576 ref 23 9 8 6 A 13 14 199057 CASAVA_Build 4 399013 1D TGTTTTAGTG A/- ATTTGGTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 A 2 1 199058 CASAVA_Build 4 402090 1I AGAGCGAGAC -/T TGACTCAGAA 272 het 272 ref 12 7 1 4 T 1 2 199059 CASAVA_Build 4 403098 1I TTCATTAGAA -/T TTTTTTTTTT 2510 het 921 hom 24 5 8 11 T 14 15 199060 CASAVA_Build 4 406940 1I ACATCTGCTG -/T TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 32 20 3 9 T 11 12 199061 CASAVA_Build 4 411775 1D TGTTGCCACA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 31 14 11 7 T 8 7 199062 CASAVA_Build 4 414314 7D CAACATGGTG AAATCCC/------- GTCTCTACTA 3065 het 3065 ref 21 10 9 4 AAATCCC 1 0 199063 CASAVA_Build 4 415149 1I CCTAGGTTCA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 T 7 8 199064 CASAVA_Build 4 420545 1I GAAATTATAA -/T TTTTTTTTTT 2093 het 2093 ref 21 10 6 5 T 11 12 199065 CASAVA_Build 4 422030 4D AGAGAAAGAT TCTG/---- TCTAAAAAAA 3070 het 300 hom 27 3 11 13 TCTG 1 0 199066 CASAVA_Build 4 429941 2D AAAACCAAAC AT/-- AATCATACGA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AT 1 0 199067 CASAVA_Build 4 431631 1D CTGGGAACTC A/- ACGACAAATG 3070 het 3070 hom 51 22 28 2 A 2 1 199068 CASAVA_Build 4 434456 1D CCGGGCGCGG T/- TGGCTCATGC 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 2 1 199069 CASAVA_Build 4 443362 1I CTCACACCTG -/T TAACTCCCAG 1232 het 1232 ref 16 10 3 3 T 1 2 199070 CASAVA_Build 4 450002 1D AAAAGGAATT A/- AGACACTCTA 3070 het 3070 ref 38 21 10 8 A 2 1 199071 CASAVA_Build 4 459412 3I CAGCTCCACA ---/ACT ACTACTAAAG 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 ACT 2 3 199072 CASAVA_Build 4 465365 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2165 hom 35 11 12 12 T 15 14 199073 CASAVA_Build 4 466833 2D CAGTAATGAC TG/-- TATGTTTCGA 3070 het 3070 ref 47 23 19 9 TG 1 0 199074 CASAVA_Build 4 476581 1D CCTTCTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 A 12 11 199075 CASAVA_Build 4 478138 1I GCCCATCTAA -/T TTTTTTTTTT 1945 het 1634 hom 12 5 5 2 T 11 12 199076 CASAVA_Build 4 479944 1I TTTGTGTGTG -/A GGGGGTAGAC 3070 het 2548 hom 27 6 13 8 A 0 1 199077 CASAVA_Build 4 480166 4I GTCACCTCCT ----/TATA TATATGCACC 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 TA 2 4 199078 CASAVA_Build 4 481212 1I GTGCTTATCA -/G ATGTCAATCG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 G 0 1 199079 CASAVA_Build 4 591705 1I TCATGATAAA -/T TTTTTTTTTT 1171 het 1171 ref 35 16 3 16 T 15 16 199080 CASAVA_Build 4 644774 4I AGTTGGATAA ----/ATGG ATGGATGGGT 3070 het 1452 hom 30 7 12 11 ATGG 2 3 199081 CASAVA_Build 4 687702 3D AGCTTACCAC TCT/--- GCCTCTTCCT 1315 het 1315 ref 23 12 6 6 TCT 1 0 199082 CASAVA_Build 4 695758 1D AATAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 11 10 199083 CASAVA_Build 4 722061 1I CCGTATCTCG -/C CTTTAATGCG 3070 hom 105 het 45 0 35 10 C 1 2 199084 CASAVA_Build 4 735196 1D GTGGCCGTTT C/- TGGTGTCTTC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 C 1 0 199085 CASAVA_Build 4 744164 1I54M10D CTCAAGTGAA -TTTTTTTTTAGGACATTAATCTGTCCTCGGCTGAGAAGAATCTGTGGTTCAGCCATCCACTGAG/TTTTTTTTTTAGGACATTAATCTGTCCTCGGCTGAGAAGAATCTGTGGTTCAGCC---------- ATGTTAGTTT 3070 het 807 hom 33 2 37 12 N/A 0 0 199086 CASAVA_Build 4 749651 1I TCTTCCCCCA -/G GCAACTTCTG 3070 hom 78 het 32 0 20 12 G 1 2 199087 CASAVA_Build 4 752263 2D ATTCTATTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 26 8 T 12 10 199088 CASAVA_Build 4 757850 2D ATCGGCACTC TG/-- TATCTAGCTC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TG 1 0 199089 CASAVA_Build 4 759301 4I GTGTGTGTGT ----/GAGA GAAAGAGAGA 3070 hom 80 het 30 0 25 5 GA 1 3 199090 CASAVA_Build 4 766778 1I GAACTTGGGA -/G GCGGAGCTTG 1788 hom 12 het 5 0 5 1 G 1 2 199091 CASAVA_Build 4 767660 5D CACCCTGCTC CTTGG/----- CACCCATGGC 3070 hom 120 het 43 0 41 3 CTTGG 1 0 199092 CASAVA_Build 4 772545 2I AGGTCCGGCC --/AG AGAGAGCCTC 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 AG 3 4 199093 CASAVA_Build 4 774731 2D TTTGTCTTTT TC/-- TCTGTCTCTC 3070 hom 52 het 23 0 16 8 TC 2 1 199094 CASAVA_Build 4 774907 1I TGTGGCTGCC -/T TGGCTGAGAT 2842 hom 24 het 9 0 7 2 T 1 2 199095 CASAVA_Build 4 784523 6D AAAAAAAAAA ATATAT/------ ATATATATAT 1417 hom 12 het 5 0 5 0 AT 10 7 199096 CASAVA_Build 4 786739 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 31 5 13 13 A 18 17 199097 CASAVA_Build 4 806074 4D CCTCTTCCTT TGTC/---- TGTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 TGTC 3 2 199098 CASAVA_Build 4 806662 1D TCCGAGCCTC A/- ACGTGCTCTG 3070 het 1227 hom 20 5 12 3 A 2 1 199099 CASAVA_Build 4 813010 7I GCTCCATCCC -------/CAGACAG CAGCCCCAGT 3070 het 2942 hom 26 10 10 6 CAGACAG 0 1 199100 CASAVA_Build 4 821159 1I TCCCAGCTCA -/C AGTTACCTAC 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 0 1 199101 CASAVA_Build 4 824864 4I TCAGAGAACA ----/TACT TTGTATTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TACT 0 1 199102 CASAVA_Build 4 829372 1I CCACAGAGTT -/G GGGGGGGGCC 2191 hom 33 het 16 0 11 5 G 8 9 199103 CASAVA_Build 4 830554 3D TCTATTTTGC TTT/--- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 20 9 11 1 T 11 8 199104 CASAVA_Build 4 878279 1D CACCGCAGAC A/- TGGTGACTGG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 1 0 199105 CASAVA_Build 4 943194 1D GTCGGGGCTT C/- CCCACAGAGC 3070 hom 90 het 35 0 28 7 C 4 3 199106 CASAVA_Build 4 943516 1I CCACGTGCAT -/G GGGCTGTTTA 3070 hom 105 het 44 0 33 11 G 3 4 199107 CASAVA_Build 4 953401 1I ATATATCTCC -/T TTTTTTTTTT 1440 het 176 hom 18 1 10 7 T 15 16 199108 CASAVA_Build 4 969175 1D CTGGACGGTT C/- CGTTCAGCGC 3070 hom 68 het 28 0 20 8 C 2 1 199109 CASAVA_Build 4 1017318 1I GACTCCTGGG -/C CACCTGCCAT 3070 hom 56 het 23 0 15 8 C 1 2 199110 CASAVA_Build 4 1043329 1D CCCCAAGCCT G/- GGCGGCCTGT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 G 3 2 199111 CASAVA_Build 4 1044344 1I AGAGGGATAA -/C CCATTCCCAC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 C 2 3 199112 CASAVA_Build 4 1048372 2D ATACGGCCTC TT/-- TTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 T 4 2 199113 CASAVA_Build 4 1049318 7I TGCAGTGGTA -------/TGATCAC TGATCACTGC 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 TGATCAC 1 2 199114 CASAVA_Build 4 1049845 15D CTAATGGCTG TTTATCTCATCCTAA/--------------- TGAGATACTA 2918 het 2918 ref 30 22 7 6 TTTATCTCATCCTAA 1 0 199115 CASAVA_Build 4 1052999 1I ATTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 A 11 12 199116 CASAVA_Build 4 1056073 1D GCACAGAGGA T/- TTTTAGGGTG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 5 4 199117 CASAVA_Build 4 1058705 1I CTGGATCCTT -/C CCATCCGCTA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 C 2 3 199118 CASAVA_Build 4 1076778 50D ACGCCAGGAC CAGGGTCTGCGTGCTCAGTGCTGACGCAGCCTGTGGTAGGGCAGAGGCTG/-------------------------------------------------- GGTGGATGGA 3070 het 3070 ref 28 27 11 4 CAGGGTCTGCGTGCTCAGTGCTGACGCAGCCTGTGGTAGGGCAGAGGCTG 1 0 199119 CASAVA_Build 4 1077169 2I ATTGTAACAA --/AT ATGCCAATAT 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 AT 1 2 199120 CASAVA_Build 4 1087410 5D TCACCACATT AACAA/----- AATAAATGAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 AACAA 1 0 199121 CASAVA_Build 4 1089089 1D CTCACCGGAG T/- CTCCCTTCCT 3070 hom 122 het 46 0 31 16 T 1 0 199122 CASAVA_Build 4 1089534 1I TAAAGCGTCC -/T TTCCACCGCA 3070 hom 171 het 60 0 57 3 T 2 3 199123 CASAVA_Build 4 1093538 1D CACCACAGAA C/- AACCCACTTC 3070 het 3070 ref 46 20 20 7 C 1 0 199124 CASAVA_Build 4 1134124 2D TGGGCGCCCA CT/-- CTCTGCAAGG 3070 hom 71 het 26 0 23 3 CT 3 2 199125 CASAVA_Build 4 1141990 1D TGAAATAATC T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 42 31 3 8 T 12 11 199126 CASAVA_Build 4 1174045 1D GAATAGACCT A/- ACACAAATGA 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 A 2 1 199127 CASAVA_Build 4 1177196 1I CTCTCCAGAG -/C CCCCCCCAGT 1141 het 1141 ref 20 10 4 6 C 7 8 199128 CASAVA_Build 4 1181424 1D62M1I GTAGGGAGAA TTATGAAGATAAAGCCAGAAATTAATGAGTAGAAAACAAATAAGTAAAAAGGAGAAATGATTG-/-TATGAAGATAAAGCCAGAAATTAATGAGTAGAAAACAAATAAGTAAAAAGGAGAAATGATTGT TTTTCTGAAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 20 N/A 0 0 199129 CASAVA_Build 4 1189380 3I CTGGCCTTCC ---/CTG CTGCCAGCCC 3070 hom 39 het 16 0 12 4 CTG 1 2 199130 CASAVA_Build 4 1206867 1D GGAGGCACCG C/- CCCCTGGACA 3070 hom 59 het 25 0 18 7 C 5 4 199131 CASAVA_Build 4 1212509 1D GGACACAGGA G/- GGGGGGTGCG 1617 hom 20 het 12 0 6 6 G 7 6 199132 CASAVA_Build 4 1215002 3I CCACAGCGGC ---/TCG TCAGCCTCAG 3070 hom 72 het 30 0 16 14 TCG 0 1 199133 CASAVA_Build 4 1247895 1I ATTCTTTTTC -/A AAATTGTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 3 4 199134 CASAVA_Build 4 1247971 1I GTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 9 10 199135 CASAVA_Build 4 1252158 1I ACTTTTGTTA -/T TTTATGTATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 3 4 199136 CASAVA_Build 4 1259570 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 22 1 14 7 A 12 13 199137 CASAVA_Build 4 1264946 5I TACTTGTCAG -----/TAAGT TAAAAGTAGA 3070 hom 138 het 49 0 45 5 TAAGT 0 1 199138 CASAVA_Build 4 1265324 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 2722 hom 15 het 8 0 6 2 A 5 6 199139 CASAVA_Build 4 1266980 3I ACCGTGGGAA ---/TGG TGGGTGGGCG 3070 het 3070 ref 93 50 21 22 TGG 1 2 199140 CASAVA_Build 4 1267528 9D TAGTGATGGC TGTACTGGT/--------- TAACCGTGGG 683 het 683 ref 38 30 3 10 TGTACTGGT 1 0 199141 CASAVA_Build 4 1268471 4D AGAGCCCTGA CGTC/---- CGTCCATCAG 3070 hom 63 het 23 0 20 3 CGTC 2 1 199142 CASAVA_Build 4 1269797 2I GTGGGAGGGG --/GT GTGTGAGCGA 3070 hom 64 het 27 0 18 9 GT 2 3 199143 CASAVA_Build 4 1277629 2I GCCCTGATGC --/CT CTCACAGCCT 3070 hom 140 het 51 0 45 6 CT 1 2 199144 CASAVA_Build 4 1280432 1I CCCTTCCTTG -/C CCCCCGTCCT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 5 6 199145 CASAVA_Build 4 1289547 20D GTGCGTGCAC GTGCGCACGCGTGCGTGTAA/-------------------- GGAGCTGTGT 3070 hom 57 het 19 0 20 6 GTGCGCACGCGTGCGTGTAA 1 0 199146 CASAVA_Build 4 1291195 1I AGCAGAGTTA -/T GCAGATTTGT 3070 hom 117 het 42 0 38 4 T 0 1 199147 CASAVA_Build 4 1294857 1D AGTCTGTCCT C/- CCATGGTTGG 3070 hom 52 het 22 0 16 7 C 3 2 199148 CASAVA_Build 4 1298182 1D ACCAAAAATG A/- AAAACTCAAC 3070 hom 76 het 32 0 25 10 A 5 4 199149 CASAVA_Build 4 1315553 1D CCCTGTGTGT G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 44 het 27 0 16 11 G 9 8 199150 CASAVA_Build 4 1318170 4I CTGCTGGAAG ----/CTTT CTCAGCCTGA 3070 hom 68 het 26 0 20 6 CTTT 0 1 199151 CASAVA_Build 4 1327829 1D TTCTTCTGGC T/- TTTTTTTTTG 1384 het 1384 ref 36 25 3 8 T 10 9 199152 CASAVA_Build 4 1338692 1I TGCCATGCAT -/G GGGGGGGGTC 3070 hom 40 het 23 0 16 7 G 8 9 199153 CASAVA_Build 4 1346905 1I GTTTGAGGGG -/C TACCACGGCC 3070 hom 73 het 30 0 22 8 C 0 1 199154 CASAVA_Build 4 1363700 3I GACCGTGTTC ---/TTT TCCCTGGGTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 1 4 199155 CASAVA_Build 4 1370506 1I GTAACAGTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 9 199156 CASAVA_Build 4 1375510 3D3M7D5M5D CATGTTTCTT ATCTGTCCTGCTGGTCTCTGCCG/---TGT-------ATCTC----- TGAATCTAAA 1902 het 902 hom 11 6 6 3 N/A 0 0 199157 CASAVA_Build 4 1468307 1I ATAAATGAAT -/G GACAGATATA 694 het 694 ref 69 48 4 17 G 1 2 199158 CASAVA_Build 4 1478322 1I GATCCTGTTG -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 6 7 199159 CASAVA_Build 4 1483457 1D CTGTTTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 25 0 16 9 A 11 10 199160 CASAVA_Build 4 1512809 3I CAAGCATTTG ---/CCC CCCGTGGTGG 1703 hom 21 het 10 0 6 4 C 3 6 199161 CASAVA_Build 4 1528007 1D ACAGAACAGT G/- GCCCCCGGGG 2628 het 1169 hom 29 7 9 13 G 2 1 199162 CASAVA_Build 4 1539676 1I GGGCAGCACG -/C CCCCCGCCCT 3070 hom 60 het 26 0 19 7 C 5 6 199163 CASAVA_Build 4 1544781 4D CACACACATT CACA/---- CACATTCACT 3070 hom 189 het 68 0 62 10 CA 4 2 199164 CASAVA_Build 4 1550238 25D TGCGTGCGCT AGTGCCCGCACCCGGTGTGTAGAAG/------------------------- GGCGCGAGCG 2067 hom 21 het 9 0 7 2 AGTGCCCGCACCCGGTGTGTAGAAG 1 0 199165 CASAVA_Build 4 1569357 1D GGCTGCAGGG A/- GCACCTGGGT 3070 hom 43 het 17 0 11 6 A 1 0 199166 CASAVA_Build 4 1577315 1I GCGGCTCCTC -/G GGGTGCCTCC 2385 hom 43 het 20 0 10 10 G 3 4 199167 CASAVA_Build 4 1582326 1D TTGGGAGGGA T/- TCCGCGACGT 1963 hom 26 het 11 0 6 5 T 2 1 199168 CASAVA_Build 4 1604856 4I TACTCATGCT ----/CACA CACATAGGTA 3070 hom 213 het 81 0 68 13 CA 2 4 199169 CASAVA_Build 4 1610490 8D GGTGAGGGGC CCCAAGGG/-------- CCCTGGGCTG 3070 hom 57 het 21 0 13 11 CCCAAGGG 1 0 199170 CASAVA_Build 4 1616751 5D GAGGCACAGG CCAGC/----- CCAGCCAAGC 3070 hom 69 het 29 0 15 14 CCAGC 2 1 199171 CASAVA_Build 4 1618714 1I TGAAACCCCC -/T CTCTACTAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 199172 CASAVA_Build 4 1631883 1D GCACTGTGGG A/- GGCTGAGGTG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 A 1 0 199173 CASAVA_Build 4 1639674 1I GTCAAGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 24 0 14 10 T 11 12 199174 CASAVA_Build 4 1643701 8D GAACCCAAGA ACCCACGG/-------- ACCCACGGAC 3070 hom 79 het 38 0 25 15 ACCCACGG 2 1 199175 CASAVA_Build 4 1646194 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 15 14 199176 CASAVA_Build 4 1661465 3D ACATCCATTT AGA/--- AGAACTGACA 2735 hom 17 het 22 0 9 13 AGA 2 1 199177 CASAVA_Build 4 1662344 4D CACACACATG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 92 het 42 0 27 21 CA 10 8 199178 CASAVA_Build 4 1667300 1I AGCATCTCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 780 hom 40 3 28 9 A 11 12 199179 CASAVA_Build 4 1669936 1I GTCAGGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 660 hom 22 3 14 5 A 10 11 199180 CASAVA_Build 4 1672000 1I GCAGTTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 22 11 A 10 11 199181 CASAVA_Build 4 1686403 3D TGCCCCAACC CCT/--- CCTCCTCCTC 3070 hom 94 het 35 0 30 5 CCT 5 4 199182 CASAVA_Build 4 1705026 1I16M1I AAAAAAAACC -TTTTTTTTTATTACCT-/TTTTTTTTTTATTACCTG GGCATGGTGG 3070 hom 86 het 29 0 28 4 N/A 0 0 199183 CASAVA_Build 4 1710834 2D CTCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 26 1 14 11 A 13 11 199184 CASAVA_Build 4 1715085 4I CTAAAAAAAA ----/AAAC AAAACAGAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AAAC 0 1 199185 CASAVA_Build 4 1715606 11D GCCCCCAGAG GGGGCAGCAGC/----------- CTGTGAGGAG 3070 hom 57 het 21 0 18 3 GGGGCAGCAGC 1 0 199186 CASAVA_Build 4 1717538 1I ATCCCGGGAA -/C CCTGGGTACC 3070 hom 66 het 32 0 19 13 C 2 3 199187 CASAVA_Build 4 1730626 2I AACTGGAGAA --/AC ACAAGAAGCT 2895 hom 41 het 15 0 11 4 AC 1 2 199188 CASAVA_Build 4 1732105 1D TGACTTAATC A/- ACAGGCGGGC 3070 hom 27 het 13 0 9 4 A 2 1 199189 CASAVA_Build 4 1743455 3D CTGGGAGCAC GCT/--- GGGCCTCGGC 874 hom 9 het 6 0 3 3 GCT 1 0 199190 CASAVA_Build 4 1757029 1I TGGGTGCAGT -/C CTGAGCCCAG 1899 het 1436 hom 18 7 7 4 C 1 2 199191 CASAVA_Build 4 1778926 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 42 het 22 0 14 9 GT 9 8 199192 CASAVA_Build 4 1781883 2D CTGCCTCCCC CT/-- GTCCCATAAG 3070 hom 44 het 20 0 14 7 CT 1 0 199193 CASAVA_Build 4 1787769 1D GTGGAGATTT G/- GAACCTGCAG 3070 hom 96 het 38 0 32 7 G 2 1 199194 CASAVA_Build 4 1845325 2I AACTTAAAAG --/TT AAGTGCTAAG 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 T 0 2 199195 CASAVA_Build 4 1899597 1D AAATAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1124 het 1124 ref 29 20 3 6 T 15 14 199196 CASAVA_Build 4 1937897 8I ATTGAAGAGA --------/CGTACATT TAGGGCTGGG 3070 hom 111 het 44 0 35 9 CGTACATT 0 1 199197 CASAVA_Build 4 1958300 2I CCTTCTCCCC --/CT GTCCCCTGAG 3070 hom 60 het 22 0 17 5 CT 0 1 199198 CASAVA_Build 4 2027926 7D CTCTCTCTGA AAAAAAG/------- AAAAAAGAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 AAAAAAG 4 3 199199 CASAVA_Build 4 2028879 6D GCCTCCCAAA GTGCTG/------ GGATTACAGG 3070 hom 39 het 14 0 14 1 GTGCTG 1 0 199200 CASAVA_Build 4 2039653 2I GTGTTTGAGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 861 hom 73 3 45 25 GT 6 7 199201 CASAVA_Build 4 2051893 1D CAGGGCGGAG C/- CCCCCCCCAC 1559 hom 24 het 12 0 8 4 C 9 8 199202 CASAVA_Build 4 2100201 1I CACGGGGGCA -/G GGGCCAAAGG 3070 hom 81 het 32 0 26 6 G 3 4 199203 CASAVA_Build 4 2111416 4D AAAGAAAGGC AGAG/---- CTCTCCATCT 3070 hom 54 het 21 0 19 4 AG 2 0 199204 CASAVA_Build 4 2114784 6D GAAAAATAGT AGAGAA/------ AATCAATGAA 3070 hom 129 het 45 0 44 3 AGAGAA 1 0 199205 CASAVA_Build 4 2117877 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 7 6 199206 CASAVA_Build 4 2120198 1D TCCCCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 24 1 22 2 A 11 10 199207 CASAVA_Build 4 2128072 2D CTGCACACTG GA/-- GTGCATGGGT 3070 hom 108 het 38 0 35 3 GA 1 0 199208 CASAVA_Build 4 2143923 3D GCCTCCAACA ATG/--- ATAATTCTTT 3070 hom 90 het 34 0 30 7 ATG 1 0 199209 CASAVA_Build 4 2145034 1I CATCTTTGCC -/A CCGCCCCGCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 199210 CASAVA_Build 4 2168164 1D GTGGCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 15 14 199211 CASAVA_Build 4 2178974 1D CCCTCAATAA T/- TTTTTTTAAA 2222 het 2222 ref 23 14 7 2 T 8 7 199212 CASAVA_Build 4 2241882 1I CAGCAGAGGC -/G GCAGAGTGGC 3070 hom 57 het 21 0 17 4 G 1 2 199213 CASAVA_Build 4 2250455 1D TTAGAATGTT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 343 hom 38 1 31 6 C 10 9 199214 CASAVA_Build 4 2256707 1I TGTAAGCCAA -/G GTACACACCC 3070 hom 84 het 35 0 24 11 G 1 2 199215 CASAVA_Build 4 2257426 2I GGTCCGCAGG --/CC TCTCTCCTGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 C 0 2 199216 CASAVA_Build 4 2261451 1D GGGACAGCCA G/- GCTGTGGCCA 3070 hom 114 het 43 0 27 16 G 2 1 199217 CASAVA_Build 4 2266488 1I AAAATTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 11 12 199218 CASAVA_Build 4 2266699 1I TTTGTTTTCG -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 7 199219 CASAVA_Build 4 2271272 1I TGTTCAGTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 55 het 21 0 19 2 A 9 10 199220 CASAVA_Build 4 2272664 1I TGCGCTATCA -/C CCCCCGTATT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 C 5 6 199221 CASAVA_Build 4 2273185 1D ACCTGGACAA C/- CCCCCACCAC 3070 hom 78 het 29 0 25 5 C 6 5 199222 CASAVA_Build 4 2281126 2I TAGTCCTTCA --/TT TTTCCAATGC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 3 5 199223 CASAVA_Build 4 2296475 1I CCAAAGACTC -/T TATCTTATTT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 1 2 199224 CASAVA_Build 4 2299584 1D ACTTCTGGGT A/- TTTACCCCAA 3070 het 3070 ref 44 22 21 1 A 1 0 199225 CASAVA_Build 4 2300330 1D AACTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2194 hom 44 14 13 17 T 16 15 199226 CASAVA_Build 4 2308086 2D GGCTTCCCCC TG/-- CCCCCCCCAC 2098 het 571 hom 23 6 6 11 TG 1 0 199227 CASAVA_Build 4 2319227 1I GAGGAAATCA -/C AAAGTATTGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 C 0 1 199228 CASAVA_Build 4 2321254 1I TTTATCGAGT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 A 8 9 199229 CASAVA_Build 4 2332804 1D CTCTCGGTTC A/- AAAAATACAA 3070 hom 87 het 33 0 28 6 A 6 5 199230 CASAVA_Build 4 2335027 2I GCTCTAACCT --/GG GCGGCTGCTT 3070 hom 78 het 28 0 23 5 G 1 3 199231 CASAVA_Build 4 2339947 1I GATTCAGCAG -/T TTTTAGGGTA 3070 hom 144 het 56 0 47 9 T 4 5 199232 CASAVA_Build 4 2340047 1D GTCATCCCCC T/- ACCCCTTCAT 3070 hom 132 het 54 0 44 11 T 1 0 199233 CASAVA_Build 4 2343998 2I TGACTCACCC --/CT GATTCGGGTC 3070 hom 64 het 27 0 21 6 CT 0 1 199234 CASAVA_Build 4 2347183 1D CGCCTGCCCT G/- GGGGCGGGAC 3070 hom 95 het 40 0 30 10 G 5 4 199235 CASAVA_Build 4 2347742 1D TTTCTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 11 10 199236 CASAVA_Build 4 2352690 7I ATGAGGAACT -------/GTTGTTC TGTTGGGAAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 GTTGTTC 0 1 199237 CASAVA_Build 4 2354462 1D CCCTGATAAA C/- CCATGAGATC 3070 het 1992 hom 21 6 14 1 C 3 2 199238 CASAVA_Build 4 2363264 1I ATTCTCTCTC -/T TCTTTTTTTT 1586 het 565 hom 31 4 13 14 T 1 2 199239 CASAVA_Build 4 2370223 1D AATGGGGGGT C/- GAGATCCAGG 3070 het 476 hom 35 7 13 15 C 1 0 199240 CASAVA_Build 4 2370653 1I GAGGGCACAA -/G GCTGGGTGGT 1291 het 406 hom 34 3 10 21 G 1 2 199241 CASAVA_Build 4 2371963 1I TGTCCCACCG -/C CAATTCGACA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 C 1 2 199242 CASAVA_Build 4 2377897 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 9 10 199243 CASAVA_Build 4 2378646 1D GACTCCTGGG C/- CCCACCATTG 3070 het 3070 hom 42 15 20 9 C 4 3 199244 CASAVA_Build 4 2384092 1D AACCACTGAA G/- ACAAGAAAAC 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 G 1 0 199245 CASAVA_Build 4 2401119 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 954 het 125 hom 9 1 3 5 T 16 14 199246 CASAVA_Build 4 2403270 1D CACTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 12 11 199247 CASAVA_Build 4 2408165 3D TTGCACTGCC TCA/--- TCATCTTCGT 2219 het 2219 ref 23 15 5 3 TCA 2 1 199248 CASAVA_Build 4 2409555 1I CTGGTGCCCC -/T GTGACGTCCC 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 0 1 199249 CASAVA_Build 4 2423259 10D CTGCAAGTCA GGCTGTGGGG/---------- GGAGCATGGG 3070 hom 123 het 40 0 40 3 GGCTGTGGGG 1 0 199250 CASAVA_Build 4 2425190 2I ATAAATGATT --/TC TGTGTCTATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TC 0 1 199251 CASAVA_Build 4 2425267 1D TTTCCCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 26 5 11 11 T 15 14 199252 CASAVA_Build 4 2433504 1I ATACTTTTTT -/A AAAAAAATGT 2274 het 2274 ref 28 15 8 5 A 7 8 199253 CASAVA_Build 4 2442353 1D AAATACTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 41 1 31 9 T 11 10 199254 CASAVA_Build 4 2445155 6D GGCCAGATGG TGAAAC/------ CCCGTCTCTA 3070 hom 33 het 12 0 11 3 TGAAAC 1 0 199255 CASAVA_Build 4 2445746 1D TAAAAACACA C/- AAAAAAATTA 2809 hom 18 het 7 0 7 0 C 1 0 199256 CASAVA_Build 4 2472098 2I TAAGCCTATA --/TT ACATTAGCAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 0 2 199257 CASAVA_Build 4 2486583 1D CACAGGGCCT G/- GGGGGTGGCT 3070 hom 42 het 15 0 14 2 G 6 5 199258 CASAVA_Build 4 2520602 1D AGCTGGAATT A/- ACAGGCGTGT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 2 1 199259 CASAVA_Build 4 2535051 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1173 hom 36 4 26 6 A 9 10 199260 CASAVA_Build 4 2568269 11I CAGCCTCTTC -----------/GAGGCCACAGA GAGGCCACAG 3070 hom 87 het 36 0 26 10 GAGGCCACAGA 0 1 199261 CASAVA_Build 4 2569437 1I CTCACCTGAA -/T TTTTTTTTTT 2593 het 1564 hom 18 5 8 5 T 11 12 199262 CASAVA_Build 4 2592234 3I ATTAGCCAGG ---/GGT GGTGGTGGTG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 GGT 3 4 199263 CASAVA_Build 4 2607526 1D AAAGGACGAA T/- TTTTTTTTTT 1844 het 1844 ref 39 28 5 6 T 13 12 199264 CASAVA_Build 4 2614161 1D AATCTACCTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 27 0 21 8 A 9 8 199265 CASAVA_Build 4 2615073 1I AGTAACTCTA -/C CCATTAAACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 2 3 199266 CASAVA_Build 4 2632593 1D TTTCATCCCT G/- TTCATTTGTC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 G 1 0 199267 CASAVA_Build 4 2646359 8D TGTCTCTACC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 2687 het 1662 hom 22 6 9 12 A 19 11 199268 CASAVA_Build 4 2651386 1D TATTGGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 9 6 T 13 12 199269 CASAVA_Build 4 2678441 1D AGGTCAGGAG T/- TCGAGATCAG 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 2 1 199270 CASAVA_Build 4 2689124 1D TTGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1913 het 932 hom 18 7 5 8 A 17 16 199271 CASAVA_Build 4 2692173 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 266 hom 34 5 16 13 A 17 16 199272 CASAVA_Build 4 2695321 4D GGTTTCTGGG TTTT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 65 het 28 0 22 6 T 6 2 199273 CASAVA_Build 4 2709465 1I ATGACCCAGC -/A GATCCAATGG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 0 1 199274 CASAVA_Build 4 2722205 1I TGACTTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 23 0 13 10 T 14 15 199275 CASAVA_Build 4 2736726 1I ATCTGGATAT -/A AAATATCCAG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 3 4 199276 CASAVA_Build 4 2738186 1I TCCATGGCAA -/G GGGGAATAAA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 G 4 5 199277 CASAVA_Build 4 2741730 1D CAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 12 11 199278 CASAVA_Build 4 2743312 1I AAAAAAAAAA -/G AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 G 0 1 199279 CASAVA_Build 4 2743499 1I AGGGCCACCT -/G GCACCCCCCC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 1 2 199280 CASAVA_Build 4 2744219 9I ATACTCAAGA ---------/CTGGGTCAT CTGGGTCATT 3070 het 3070 hom 27 9 9 9 CTGGGTCAT 1 2 199281 CASAVA_Build 4 2752256 1I AAAGGGCTTG -/A TTTAGGAACC 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 A 0 1 199282 CASAVA_Build 4 2754545 1I ATACCTTGGG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 T 8 9 199283 CASAVA_Build 4 2779637 2I CAGAAATTTA --/CT CTCTCATGAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CT 2 3 199284 CASAVA_Build 4 2784381 2I AAGTACACAC --/AT GTTGTGTATG 3070 hom 66 het 23 0 22 1 AT 0 1 199285 CASAVA_Build 4 2790915 1D CTGACTAATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 16 8 6 A 9 8 199286 CASAVA_Build 4 2793738 1D GCAGTGCAGT G/- GGTGCGAACA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 3 2 199287 CASAVA_Build 4 2796017 1I GGGCCCACCC -/A GATCTGCCCT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 0 1 199288 CASAVA_Build 4 2797120 2D CACAGACATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 64 29 22 15 CA 6 5 199289 CASAVA_Build 4 2810167 1I TTGTTTGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 10 9 T 11 12 199290 CASAVA_Build 4 2812516 1D TTTAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 6 T 11 10 199291 CASAVA_Build 4 2818934 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 11 12 199292 CASAVA_Build 4 2827581 1D GTTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 2306 het 121 hom 20 2 12 6 A 17 16 199293 CASAVA_Build 4 2835247 1I CCTTGTTTTT -/G TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 G 0 1 199294 CASAVA_Build 4 2838020 1D TTTTAAATCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2175 hom 27 8 12 7 T 12 11 199295 CASAVA_Build 4 2842466 1D CTGCATGCTG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 T 8 7 199296 CASAVA_Build 4 2884089 2I CATCTTACTC --/TG TGGCCCATGC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 TG 1 2 199297 CASAVA_Build 4 2892307 2D GTCTTGACTC TT/-- TATCCAGTTT 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 T 3 1 199298 CASAVA_Build 4 2896885 6D TCCTAAGCTA TTAATC/------ TTAAACTTCT 3070 het 3070 ref 51 26 22 4 TTAATC 1 0 199299 CASAVA_Build 4 2914370 2I CCTGTAGGAC --/GT GCAGGAGTCA 1157 het 1157 ref 19 12 5 2 GT 0 1 199300 CASAVA_Build 4 2931109 2D CAGACAAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 22 9 8 5 CT 2 1 199301 CASAVA_Build 4 2939623 1I GCCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2011 hom 25 9 12 4 T 11 12 199302 CASAVA_Build 4 2941202 1D GTGCCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 2175 het 922 hom 13 4 7 2 T 12 11 199303 CASAVA_Build 4 2947924 1I GCCTGAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 10 11 199304 CASAVA_Build 4 2957806 1D GAACATTTCC T/- TTTTTTTTTT 2533 het 2327 hom 17 7 6 4 T 11 10 199305 CASAVA_Build 4 2963523 1D ATATCAAACC A/- AATAATTTGA 3070 het 3070 ref 44 24 10 11 A 3 2 199306 CASAVA_Build 4 2964647 1I TGTATTTAAA -/G GTTTCAGAAT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 G 1 2 199307 CASAVA_Build 4 2992352 3I TCAGAAAAAA ---/AAG AAGGATGCTT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 AAG 1 2 199308 CASAVA_Build 4 3003844 2I TATCTCTACT --/AA AAAAAAAAAA 2778 het 866 hom 16 5 7 4 A 10 12 199309 CASAVA_Build 4 3010078 1I TGTGTATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 12 22 10 A 13 14 199310 CASAVA_Build 4 3010372 1I GGCACTCACA -/C GTGCATCTCT 3070 het 3070 hom 46 14 27 5 C 0 1 199311 CASAVA_Build 4 3023179 1D TGAATGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 16 8 A 13 12 199312 CASAVA_Build 4 3036400 6I CTCTTTTATG ------/AATATT AATACAAAAC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 AATATT 0 1 199313 CASAVA_Build 4 3080877 1I TCAGCCTCCT -/A AGTAGCTGGG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 1 2 199314 CASAVA_Build 4 3106494 1I TTGATCCTCC -/A ATCTTGGCCT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 1 2 199315 CASAVA_Build 4 3108123 1I TACTAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 10 11 199316 CASAVA_Build 4 3123627 1I AATTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 1479 het 893 hom 11 4 5 2 T 15 16 199317 CASAVA_Build 4 3129601 7I CCTGCAGTCT -------/CAACCTC CAGGGCTCAA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 CAACCTC 0 1 199318 CASAVA_Build 4 3144295 8D TATTAATAGT GATTCACA/-------- GGAAGAATTT 3070 het 3070 hom 43 22 22 1 GATTCACA 1 0 199319 CASAVA_Build 4 3168264 1D ACCCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1305 het 1305 ref 49 31 6 12 A 15 14 199320 CASAVA_Build 4 3182135 1I TGTGAGCAGT -/G GGGGGGGCCA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 G 7 8 199321 CASAVA_Build 4 3196241 2D CGTAGAGCTC TG/-- TGATTCCGTA 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 TG 2 1 199322 CASAVA_Build 4 3203192 1D GTGGAAACAA T/- TGAGTGTGTG 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 T 2 1 199323 CASAVA_Build 4 3204983 1D AGATGGCAGG C/- CAGGTATCAG 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 C 2 1 199324 CASAVA_Build 4 3213474 3I AAAATCACCA ---/TTC TTCCGTATTG 3070 hom 57 het 24 0 19 5 TTC 1 2 199325 CASAVA_Build 4 3237716 1I AGCGGCCCCA -/G GGCCGGTTCA 3070 hom 62 het 28 0 19 9 G 2 3 199326 CASAVA_Build 4 3242765 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2468 het 1698 hom 17 7 9 1 T 13 12 199327 CASAVA_Build 4 3366547 1D TACAAAAAAA C/- AAAACAAAAC 3070 het 1409 hom 22 6 12 4 C 1 0 199328 CASAVA_Build 4 3368440 1D ACAATTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 17 11 T 12 11 199329 CASAVA_Build 4 3377442 1D GAAAAAGTTG C/- CCCCCCAAAA 3070 het 1766 hom 20 6 10 4 C 7 6 199330 CASAVA_Build 4 3382004 1D ATTCTGTGCC T/- TTGGGGGGGC 3070 het 3006 hom 24 9 10 5 T 3 2 199331 CASAVA_Build 4 3434475 6I CCCCTGGGGT ------/AGTGGG AGGGGCAGAT 3070 hom 53 het 22 0 17 5 AGTGGG 0 1 199332 CASAVA_Build 4 3439855 2D GTGTGTGCGA GT/-- GTGTGTGAGC 3070 het 3070 hom 84 35 34 16 GT 4 3 199333 CASAVA_Build 4 3440062 4D TGACTGTGAG TGTA/---- TGTGTGTGTG 2696 het 2696 ref 75 45 12 23 TGTA 1 0 199334 CASAVA_Build 4 3440180 4D46M2D TGTGCATGTA TGAGTGTGTGTGCCTGTGTGCATGCCTGTGTGTGCATGTATGTCTGTGTATG/----TGTGTGTGCCTGTGTGCATGCCTGTGTGTGCATGTATGTCTGTGTA-- TGTGTGTATG 3070 het 1557 hom 75 16 35 46 N/A 0 0 199335 CASAVA_Build 4 3440268 2D15M4I TCTGCCTGTG TATGTGTCTGTGTGCGT----/--TGTGTCTGTGTGCGTGTGA GTGTGTGTGC 3070 hom 88 het 48 1 43 18 N/A 0 0 199336 CASAVA_Build 4 3440589 2I GTGTGCATTA --/GT GTGTGTGTGC 3070 hom 195 het 80 0 64 16 GT 4 5 199337 CASAVA_Build 4 3441582 1I CCTGGGAGTT -/A AGAGCTCTGC 2684 het 2684 ref 21 11 7 3 A 1 2 199338 CASAVA_Build 4 3444613 1D CTCAGTGTGG C/- CCAGGGGGCT 2061 het 2061 ref 19 12 5 2 C 3 2 199339 CASAVA_Build 4 3448597 4D GAGAGCTGTC CTCA/---- CTCAGCCAGG 3070 hom 29 het 15 0 10 6 CTCA 2 1 199340 CASAVA_Build 4 3448681 1I GCCGGGGCTG -/C TGCAGGAGCA 3070 het 2147 hom 20 7 9 4 C 0 1 199341 CASAVA_Build 4 3461705 1D TCTTCCTCCG C/- CCCCCCCACT 1230 het 1087 hom 16 4 3 9 C 8 7 199342 CASAVA_Build 4 3462128 1D TCATTTCTTC T/- CTCCCTGCTC 1416 het 1399 hom 17 6 7 4 T 1 0 199343 CASAVA_Build 4 3462933 8D TCACCCCAGC TTCCTTCT/-------- TTCCTTCTTC 2148 het 1687 hom 23 10 5 9 TTCCTTCT 2 1 199344 CASAVA_Build 4 3463030 4I CCTCCGCTTA ----/TTCC TTCCTTCCTT 3070 hom 33 het 21 0 12 9 TTCC 2 3 199345 CASAVA_Build 4 3463048 24D TTCTGTCTGT TCATTCATTTCTTCCTTCTCCCAC/------------------------ CTATTCATTC 3070 hom 54 het 21 0 18 5 TCATTCATTTCTTCCTTCTCCCAC 1 0 199346 CASAVA_Build 4 3464248 1D GACCCCTGTA C/- CCCCACAACT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 C 5 4 199347 CASAVA_Build 4 3475004 3D GCAGCCTCAG CCT/--- CCTGCGTTCA 2030 het 2030 ref 27 17 7 5 CCT 2 1 199348 CASAVA_Build 4 3476483 3I AGAAAAAAAT ---/AAG AAATAACAAA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 AAG 0 1 199349 CASAVA_Build 4 3479008 5I CATATATTTA -----/TACAT TACATTATCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TACAT 1 2 199350 CASAVA_Build 4 3479119 22D CATAAGTAGA CCAAGTTTTTAACTGTATTATC/---------------------- CCATTCTTTC 3070 het 3070 ref 37 22 15 3 CCAAGTTTTTAACTGTATTATC 1 0 199351 CASAVA_Build 4 3488645 2I CCTACGGCTG --/AC ACAGTCACCA 3070 hom 69 het 25 0 21 4 AC 1 2 199352 CASAVA_Build 4 3499937 1D CACAGCACCA C/- CCGCGTGCCA 3070 het 3070 ref 27 11 13 4 C 3 2 199353 CASAVA_Build 4 3507692 1I TGATTATGGA -/G GGGGTGCTCC 1860 het 1860 ref 31 16 6 9 G 4 5 199354 CASAVA_Build 4 3519877 2D CTGTGTGCAC AT/-- GTGTTAAGTC 3070 het 3070 ref 52 33 15 5 AT 1 0 199355 CASAVA_Build 4 3520117 1D TGTATGTTTG C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 C 1 0 199356 CASAVA_Build 4 3526397 2I GTGCCTGGCC --/TT TTTTTTTTTT 2974 hom 8 het 14 0 11 3 T 14 16 199357 CASAVA_Build 4 3532631 2D CCTGGGACTC TT/-- TTCCATTCTG 3070 het 3070 ref 47 26 14 12 T 4 2 199358 CASAVA_Build 4 3537886 1I AGAAGTAGGT -/A AAAATCCATG 2958 het 2958 ref 30 20 8 2 A 4 5 199359 CASAVA_Build 4 3538682 3I CACAATCACA ---/CAC CACATGCACC 3070 hom 141 het 53 0 46 7 CAC 1 2 199360 CASAVA_Build 4 3539558 4I ACATATAAAA ----/ACAC ACACAAAGTA 3070 het 3070 ref 46 18 14 14 AC 2 4 199361 CASAVA_Build 4 3539701 2D ACACACACAC AT/-- ATAAACCACA 3070 het 2697 hom 34 12 11 15 AT 2 1 199362 CASAVA_Build 4 3539777 2D AAACCACACA CG/-- CAAAGTACAC 3070 het 3070 hom 52 21 18 13 CG 1 0 199363 CASAVA_Build 4 3539810 2D GCACACACAA AG/-- TATACACACA 2626 het 215 hom 29 1 10 18 AG 1 0 199364 CASAVA_Build 4 3539834 2D GTGCACACAC AT/-- AAGCTACACA 3070 het 773 hom 27 6 12 10 AT 1 0 199365 CASAVA_Build 4 3540143 2I ACACACGAAC --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 75 30 32 13 CA 5 6 199366 CASAVA_Build 4 3542502 1D GGGAGGGGGG A/- CTTACGCAGG 3070 het 3070 ref 54 31 16 7 A 1 0 199367 CASAVA_Build 4 3543104 2D CCTGGGGATC CT/-- CTCTGCCTGC 3070 het 3070 ref 67 35 15 18 CT 3 2 199368 CASAVA_Build 4 3543136 3D ACCAGGATGA TTC/--- TTCTTCTTTG 3070 het 3070 ref 67 36 11 23 TTC 3 2 199369 CASAVA_Build 4 3543639 1D CATCTCCGGG C/- GGGACCGGGC 3070 het 3070 ref 56 29 20 7 C 1 0 199370 CASAVA_Build 4 3544569 1I CATGTGAGGT -/G GGGGGCTTGC 3070 het 3070 ref 71 35 30 7 G 5 6 199371 CASAVA_Build 4 3545817 1I TCAGAAAAAA -/C AAACAAAACA 375 het 375 ref 18 2 3 14 C 0 1 199372 CASAVA_Build 4 3546264 108D CGCAGTCACT TGACCAAGTAGCGGCCACGTTTGCGCCACACTTCCATAAACGTGACCAGTAAGGAAGCGACAAGCCTGAAGGGTCCTGACCATTTATTACTCAGGGTACAGCATGTCC/------------------------------------------------------------------------------------------------------------ TTATCCCTCT 3070 het 3070 ref 62 72 11 18 TGACCAAGTAGCGGCCACGTTTGCGCCACACTTCCATAAACGTGACCAGTAAGGAAGCGACAAGCCTGAAGGGTCCTGACCATTTATTACTCAGGGTACAGCATGTCC 1 0 199373 CASAVA_Build 4 3546534 1D ACCAACGTCT C/- GGGGAGAGGA 3070 het 3070 hom 62 25 29 10 C 1 0 199374 CASAVA_Build 4 3549122 1I CTACCTGAGC -/T TTGTTTTAAG 3070 het 3070 ref 59 34 19 6 T 2 3 199375 CASAVA_Build 4 3549315 1D GGGGCAGCCC A/- AGGAAGCAAA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 2 1 199376 CASAVA_Build 4 3549455 4D CCACCCACTT ACTC/---- ACCCTCTTAC 3070 het 3070 ref 54 26 19 12 ACTC 1 0 199377 CASAVA_Build 4 3549652 4I ATTCATTTAT ----/TTAC TCACTCTCCC 3070 het 3070 ref 101 51 28 23 TTAC 0 1 199378 CASAVA_Build 4 3550478 28D CCACCCATCT ATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCC/---------------------------- ATCCATCCAT 3070 het 3070 ref 77 60 30 6 ATCC 11 4 199379 CASAVA_Build 4 3551038 1D TTCCTCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 65 28 30 8 A 11 10 199380 CASAVA_Build 4 3551196 1D GTTATTAGAA G/- GGACAGTTTG 3070 het 3070 hom 66 26 35 6 G 3 2 199381 CASAVA_Build 4 3551534 1D GATTCGGCTC A/- ATAGTTTAAG 3070 het 3070 ref 66 37 25 4 A 2 1 199382 CASAVA_Build 4 3552999 2I CCTCAGGTGC --/CT GGCCCCAGCC 3070 het 3070 hom 69 30 31 8 CT 0 1 199383 CASAVA_Build 4 3554836 1I CCATTACATA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 62 39 20 3 T 6 7 199384 CASAVA_Build 4 3554923 3D CAGACATCTT CTC/--- CCAGTGTGTC 3070 het 3070 ref 69 47 20 4 CTC 1 0 199385 CASAVA_Build 4 3555344 2D CTGTGTGCCG AT/-- ACCTAATTGT 3070 het 3070 hom 63 27 30 6 AT 1 0 199386 CASAVA_Build 4 3555578 2I ACACACACAC --/AT ACACACCCAT 3070 het 3070 ref 94 45 36 16 AT 0 1 199387 CASAVA_Build 4 3557039 1D ATAGTTTCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 74 33 34 8 T 9 8 199388 CASAVA_Build 4 3557924 3I AGTTTATCAA ---/TAC TGTTCACAAT 3070 het 3070 ref 62 35 23 4 TAC 0 1 199389 CASAVA_Build 4 3559518 1D GTTCATCTGC A/- ACTTCCTGGT 3070 het 3070 hom 87 19 53 15 A 2 1 199390 CASAVA_Build 4 3563097 1I TGAAGCTATG -/T TTCTTTGTAC 3070 het 3070 hom 70 29 34 7 T 2 3 199391 CASAVA_Build 4 3564042 1D40M2D TTCTTTCAGG TTTTTTTTTTTTTGGAGGTCTTCATTTTTCATTCAGTTCTTAA/-TTTTTTTTTTTTGGAAGTCTTCATTTTTCATTCAGTTCTT-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 53 33 17 24 N/A 0 0 199392 CASAVA_Build 4 3565514 2I CATGTGTTTG --/TC TCTATGTGTG 3070 het 3070 ref 82 60 13 9 TC 1 2 199393 CASAVA_Build 4 3568207 8D CATTTCTTCT TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 3070 het 2099 hom 43 8 12 25 TTTC 5 3 199394 CASAVA_Build 4 3569274 1I GCTCTCAAAA -/G CTTCCTGACT 3070 het 3070 ref 58 29 16 13 G 0 1 199395 CASAVA_Build 4 3570419 3D TGTGCATGTG AGC/--- AGATGTGCAT 3070 het 3070 ref 101 60 35 6 AGC 1 0 199396 CASAVA_Build 4 3571055 4D GACGTGTGTT TGAG/---- TGTGAGCAGG 3070 hom 187 het 78 0 60 22 TGAG 1 0 199397 CASAVA_Build 4 3571108 4D36M2D GTGCACGTTT AGGCAGGTGTGCACATGTGTATGTGTGTAAGCAGGTGTGCAT/----AGGTGTGCACATGTGTATGTGTGTTAGCAGGTGTGC-- ATGTCTGTGA 3070 het 3070 ref 100 77 19 37 N/A 0 0 199398 CASAVA_Build 4 3571456 2D TCTGTATGCA TC/-- TGTGTGTGGG 3070 het 1386 hom 56 15 17 27 TC 1 0 199399 CASAVA_Build 4 3571750 1D CATTCCTTAC T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 70 32 21 17 T 8 7 199400 CASAVA_Build 4 3573210 1D GGCTGCTGTT G/- GGGGAATGGT 3070 het 3070 ref 47 24 15 9 G 5 4 199401 CASAVA_Build 4 3573881 1I10M6I ATCCTTGATC -TGTAGCAAAG------/AAGTAGCAAAGTGGACA TGGATGTGAA 3070 het 3070 ref 62 35 27 9 N/A 0 0 199402 CASAVA_Build 4 3574121 3D GGTAGTGAGA CTG/--- CTGCTGGGTC 3070 het 3070 hom 69 29 32 10 CTG 3 2 199403 CASAVA_Build 4 3575432 3D GGGTGCTGCT GCC/--- GCCGTACCAG 3070 het 3070 ref 63 26 18 20 GCC 2 1 199404 CASAVA_Build 4 3575782 3I TGTGGATTAG ---/CAT CAGGCCTCTT 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 CAT 0 1 199405 CASAVA_Build 4 3577087 1I CTTTCAGCCA -/C CCCCCTCCCC 3007 het 3007 ref 37 21 12 4 C 5 6 199406 CASAVA_Build 4 3577152 2I GTCTTGGCTC --/CA GAGACCTTGG 247 het 247 ref 32 19 2 12 CA 0 1 199407 CASAVA_Build 4 3577718 4D AAAGAGTGAA TGAG/---- TGAGTGAGTG 3070 het 3070 ref 98 69 17 17 TGAG 3 2 199408 CASAVA_Build 4 3578883 1D TCTTCCACGG C/- CCTCACCCCA 3070 het 3070 hom 58 27 22 9 C 3 2 199409 CASAVA_Build 4 3579003 1D GTGGCTCCCT C/- CCCGGCCCCC 3070 het 3070 hom 61 26 26 9 C 4 3 199410 CASAVA_Build 4 3580013 1I CTCTCAGCAT -/C CTAGCACGAT 3070 het 3070 ref 62 31 24 7 C 1 2 199411 CASAVA_Build 4 3580067 16D TAGAATGGAT CAGCAGTGGTGTCCCA/---------------- CAGCCCCACC 3070 het 3070 ref 53 43 15 11 CAGCAGTGGTGTCCCA 1 0 199412 CASAVA_Build 4 3580666 1D GGGCTCTCCC A/- AGCCCCGATG 3070 het 3070 hom 79 37 36 8 A 2 1 199413 CASAVA_Build 4 3580812 6D CGCTTACATG CAGACA/------ CAGATACATC 3070 het 3070 ref 104 60 37 14 CAGACA 1 0 199414 CASAVA_Build 4 3586376 1I CATCTCCCTG -/C CCCCCCGGGA 3070 hom 70 het 27 0 22 5 C 6 7 199415 CASAVA_Build 4 3588477 2D46M1D TAGACTGGTC TTTTTTTTTTTGTAATCAGAAATCCTTTATATTTACATAATTCTACCTG/--TTTTTTTTTGTAACCAGAAATCCTTTATATTTACATAATTCTACCT- GTATTTGGAA 3070 het 3070 ref 37 36 9 9 N/A 0 0 199416 CASAVA_Build 4 3589573 2D GGTGTTTCAG TC/-- ACATTTTTTC 3070 het 3070 ref 67 35 13 22 TC 1 0 199417 CASAVA_Build 4 3589606 1I TTCTTCTTTT -/A AAAAAATCTG 2973 het 2973 ref 62 32 12 18 A 6 7 199418 CASAVA_Build 4 3589870 1I GCATTGTTAT -/A AACTGTATTT 3070 het 3070 ref 62 30 23 9 A 2 3 199419 CASAVA_Build 4 3590352 20D ATTATAAAAC CATCAGATCTTGTGAGAACT/-------------------- CACTCTCTAT 3070 het 3070 ref 72 49 28 4 CATCAGATCTTGTGAGAACT 1 0 199420 CASAVA_Build 4 3590966 1D CATTTACACT G/- AAGATTTTAC 3070 het 3070 hom 88 40 46 3 G 1 0 199421 CASAVA_Build 4 3591618 1I CTAACGGATA -/G GGGTTCAATG 3070 het 3070 hom 59 23 27 9 G 3 4 199422 CASAVA_Build 4 3592244 1I CAGAAAAGGA -/G GGGGGGTTTG 3070 het 3070 ref 56 30 20 6 G 6 7 199423 CASAVA_Build 4 3593909 1I GGTCATGAAG -/A TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 75 34 36 6 A 0 1 199424 CASAVA_Build 4 3594153 2D GGCTTCCGGA CT/-- CTCTCTTAGG 3070 het 3070 ref 70 28 25 18 CT 4 3 199425 CASAVA_Build 4 3594307 1D ATTTTAGTTT C/- AGAGCCCTGA 3070 het 3070 ref 75 36 29 10 C 1 0 199426 CASAVA_Build 4 3594656 6D GGAGCTTAGA ATGTGG/------ ATGTGGATGA 3070 het 3070 hom 89 38 43 14 ATGTGG 2 1 199427 CASAVA_Build 4 3595036 1D TATATATATA T/- TTTTTTCTGT 233 het 233 ref 38 24 1 13 T 7 6 199428 CASAVA_Build 4 3595877 1I GCAGCAAGAC -/A GGGGGGAGCA 3070 het 1488 hom 28 6 12 10 A 0 1 199429 CASAVA_Build 4 3596034 1D CTGGGAAGGA C/- AGGGGGGAGC 3070 het 2413 hom 28 14 11 3 C 1 0 199430 CASAVA_Build 4 3597284 1D CAATGACTTG T/- CCCCCAGGGC 3070 het 3070 ref 42 17 12 13 T 1 0 199431 CASAVA_Build 4 3598163 1I CTCAGAGCCA -/C CGTGCTTCCT 3070 het 3070 ref 66 39 14 13 C 1 2 199432 CASAVA_Build 4 3600688 1D TCACCTTCCA T/- GATCCCCTTA 2991 het 2991 ref 51 34 11 7 T 1 0 199433 CASAVA_Build 4 3601267 3D CCAGCCCATT TAC/--- TGCTGGGGAA 3070 het 3070 ref 55 24 26 5 TAC 1 0 199434 CASAVA_Build 4 3601819 5D3M3D GCAATGTGGG GAGGTCAAAGC/-----CAA--- TATGACCTCT 3070 het 3070 ref 42 21 18 6 N/A 0 0 199435 CASAVA_Build 4 3603548 1I CAGCGCCTGT -/C ATGGGGCCAA 3070 het 3070 ref 42 18 13 11 C 0 1 199436 CASAVA_Build 4 3604073 2D TGTCCAGGAG TC/-- ACAGAGATGG 1305 het 1305 ref 58 33 6 19 TC 1 0 199437 CASAVA_Build 4 3604101 1D ATTCACCTCA G/- TTCCTGCAGT 2699 het 2699 ref 58 35 7 17 G 1 0 199438 CASAVA_Build 4 3606878 4I AGGCCCGTCC ----/GTCT GTCGGTGCAG 3070 hom 96 het 38 0 30 8 GTCT 0 1 199439 CASAVA_Build 4 3610532 2I AATGGAAAAC --/AG AAAAACAACA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AG 0 1 199440 CASAVA_Build 4 3613379 2I TTTTTTCCCA --/CT CTCTGGAACT 3070 het 2896 hom 26 11 11 4 CT 2 3 199441 CASAVA_Build 4 3614334 1I GTGTGGGGAC -/G GGGGGGTACT 2954 het 2711 hom 25 11 10 4 G 6 7 199442 CASAVA_Build 4 3614980 4D TGTTTGACTC ACAG/---- ACAGGCTGAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 ACAG 2 1 199443 CASAVA_Build 4 3618214 7D ACACGTTTTC CATGATA/------- AAAATGCACA 3070 het 3070 ref 32 18 9 6 CATGATA 1 0 199444 CASAVA_Build 4 3618705 4D CCCAGCAAAA AGAC/---- AGACGGCTGT 3070 hom 84 het 33 0 27 9 AGAC 2 1 199445 CASAVA_Build 4 3619261 6I GCTTCACGAG ------/TCTTTT TCTTTTTAAG 3070 hom 105 het 45 0 33 12 TCTTTT 1 2 199446 CASAVA_Build 4 3620325 1D TCCCAGCCTT A/- TGAGATGCGG 3070 hom 38 het 16 0 13 4 A 1 0 199447 CASAVA_Build 4 3622799 1D CAGCCAGCAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 9 8 199448 CASAVA_Build 4 3639597 1I GTCTGCAGCT -/A AGACCGCAAT 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 1 2 199449 CASAVA_Build 4 3651428 1I CCACGAGCCG -/T TGGATTCGGG 3070 hom 35 het 15 0 12 3 T 1 2 199450 CASAVA_Build 4 3665149 1D GAGAGAAAAA G/- GGGGGGGGTG 3070 het 215 hom 49 4 31 14 G 9 8 199451 CASAVA_Build 4 3676940 10I GGGCTGTCCT ----------/GTCTCTCCAC GGTGTTTAGC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 GTCTCTCCAC 0 1 199452 CASAVA_Build 4 3682762 1I CATTTTGGGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 354 hom 30 2 18 10 A 9 10 199453 CASAVA_Build 4 3686314 4D TGTGTGTGTG TGCA/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 189 het 70 0 51 19 TGCA 1 0 199454 CASAVA_Build 4 3688380 17I TCTCTGTCTT -----------------/CCAGCCAAGCTCAGCCA CCTACCCTGG 3070 hom 47 het 19 0 15 4 CCAGCCAAGCTCAGCCA 0 1 199455 CASAVA_Build 4 3689492 18I ATGGCAGACG ------------------/GCGCTGACTTCTCCCCGA GCCTCATCCC 3070 hom 56 het 21 0 18 4 GCGCTGACTTCTCCCCGA 0 1 199456 CASAVA_Build 4 3713427 8D ACAACTCTTC CCAGCCTG/-------- CCAGCCTGCC 3070 het 2038 hom 38 9 14 16 CCAGCCTG 3 2 199457 CASAVA_Build 4 3713500 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 344 hom 38 6 15 17 AC 10 9 199458 CASAVA_Build 4 3758497 1D AGGTTTACAG A/- AAAAGGAAAA 3070 hom 81 het 32 0 27 6 A 5 4 199459 CASAVA_Build 4 3776416 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 19 0 18 3 A 20 9 199460 CASAVA_Build 4 3782257 1I ACAGATCTTG -/C TGGGGGAGGC 3070 hom 70 het 27 0 23 4 C 0 1 199461 CASAVA_Build 4 3833431 4I CACATGCACT ----/CACA CACTTTTACA 3070 het 3070 hom 94 42 46 6 CA 1 3 199462 CASAVA_Build 4 3852417 1D GGGAGGAAAG A/- GGGGAGGGGA 2128 het 2128 ref 36 24 7 5 A 1 0 199463 CASAVA_Build 4 3869963 1D TTAGTTAACA C/- CCCGGGACAT 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 C 4 3 199464 CASAVA_Build 4 3875779 1I GCCTGGCTCA -/T TTTTTTTCTA 1728 het 1728 ref 20 10 7 3 T 7 8 199465 CASAVA_Build 4 3964406 10I GCACACACAT ----------/ATGCACACAC ATGCGCATGC 3070 het 2820 hom 21 8 10 3 ATGCACACAC 0 1 199466 CASAVA_Build 4 3969855 1I GGAGAAAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 26 het 13 0 8 5 A 6 7 199467 CASAVA_Build 4 3973750 6I TTTCTTTTTC ------/TTTTTT GAGACAGAGT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 0 6 199468 CASAVA_Build 4 3975918 4D GAAGAAAACA TAGT/---- TAATTGTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 9 5 TAGT 1 0 199469 CASAVA_Build 4 4019901 1I AGTTGGACAA -/G GGGATCTTGT 3070 het 3070 ref 38 18 12 9 G 3 4 199470 CASAVA_Build 4 4021482 5D TTTTTTATTT ATTTA/----- TTTTTTTTTG 2181 het 2181 ref 17 10 5 3 ATTTA 1 0 199471 CASAVA_Build 4 4022000 1D GGCTGTTGGG A/- AGGGGACAGG 3070 het 3070 ref 37 29 8 0 A 2 1 199472 CASAVA_Build 4 4023625 1D ATATTACCTT C/- CCTACCACCT 3019 het 3019 ref 50 36 7 7 C 3 2 199473 CASAVA_Build 4 4034634 5I GGCTAAGTGA -----/TCTAT TCTATTTACT 3070 het 3070 ref 59 38 9 12 TCTAT 1 2 199474 CASAVA_Build 4 4036099 3D AACCCTCCTG TTC/--- TTTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 41 31 9 3 TTC 1 0 199475 CASAVA_Build 4 4037432 1I CATATCTTTT -/A AACATTTTTG 3070 het 3070 ref 47 24 12 11 A 2 3 199476 CASAVA_Build 4 4037766 1I GATGGTTGGG -/T TTTATTTTCT 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 T 3 4 199477 CASAVA_Build 4 4037913 1I GACCTCCTTC -/T CCCAATTTTG 3070 het 3070 ref 51 31 13 7 T 0 1 199478 CASAVA_Build 4 4045082 1D TGGAAGACTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 10 het 22 1 17 4 A 9 8 199479 CASAVA_Build 4 4057385 1D GATAAGGGGT G/- GGGGGGTTCT 1852 hom 21 het 8 0 5 3 G 7 6 199480 CASAVA_Build 4 4059429 3D TATAAAACAA AAC/--- AAAATCCTTA 3070 het 3070 ref 37 17 13 10 AAC 1 0 199481 CASAVA_Build 4 4059973 1I TTTAATTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 8 9 199482 CASAVA_Build 4 4061117 1I ACAATGCCCC -/G GACAACTCCC 1957 het 1957 ref 46 35 5 6 G 1 2 199483 CASAVA_Build 4 4065323 2D CTGCTAAATT TG/-- TGTTGATTTG 3070 het 3070 ref 56 35 14 8 TG 2 1 199484 CASAVA_Build 4 4077401 2D ATTAAAACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2021 hom 22 7 9 7 T 13 11 199485 CASAVA_Build 4 4078453 3D AAATTATGTC AGA/--- AGGAGGTAAT 2395 het 2395 ref 20 12 5 3 AGA 1 0 199486 CASAVA_Build 4 4078957 1I ACATCTGCCT -/C CCAGGTTCAA 2306 het 2306 ref 20 12 6 2 C 2 3 199487 CASAVA_Build 4 4080135 7I TCCAAAGATT -------/AATTACA ATGTTTCTCA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 AATTACA 0 1 199488 CASAVA_Build 4 4081675 1I TCTAATTTTA -/G GGTGCAATAG 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 G 2 3 199489 CASAVA_Build 4 4087128 1D75M1D17M2I TTTTGGCTTC TTTTTGGATACGTTCCTTCTTTTCAGAGGTGAAAAGGGTTAAAAGGAGCTGTTGGCAATCATCTTAGGTGGGCGGGTTGAGTCCGGAGTACAGA--/-TTTTGGATACGTTCTTTCTTTTCAGAGGTGAAAAGGGTTAAAAGGAGCTGTTGGCAATCATCTTAGGTGGGTGAG-TGAGTCCGGAGTACAGACT CTGTCAGAGA 3070 het 3070 ref 44 57 9 5 N/A 0 0 199490 CASAVA_Build 4 4087305 1I AGTAGAAAAA -/G GAACACAAAC 3070 het 3070 hom 44 13 26 5 G 1 2 199491 CASAVA_Build 4 4088550 1I TACTGGTTTA -/G TTTAGAGGAG 3070 het 3070 ref 63 36 17 10 G 0 1 199492 CASAVA_Build 4 4091426 2D CCCACAGGCC GG/-- AGAGAGAGAC 3070 het 3070 ref 44 28 11 5 G 2 0 199493 CASAVA_Build 4 4093777 1I TTAACTGTAC -/A AAATTGATTG 1431 het 1431 ref 20 11 3 6 A 3 4 199494 CASAVA_Build 4 4094504 7I ACGGTCCTAC -------/TAATGTG TGATGTGTAA 3070 het 3070 hom 39 18 11 10 TAATGTG 0 1 199495 CASAVA_Build 4 4096155 1D TTGACCATTT C/- CCCATGAATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 4 3 199496 CASAVA_Build 4 4106079 1D TACCCAGAAG C/- CTTTCAATAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 2 1 199497 CASAVA_Build 4 4106892 1I AGAATCACCT -/G GGGGAGATTT 3070 het 3070 ref 44 26 9 9 G 4 5 199498 CASAVA_Build 4 4112599 3D CCCAACCAAC CTT/--- TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 77 39 15 23 CTT 1 0 199499 CASAVA_Build 4 4113059 2I GCCCTCTGAC --/TG TATAAATTAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 TG 0 1 199500 CASAVA_Build 4 4115133 3D TAGTACAAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 29 19 5 7 A 23 20 199501 CASAVA_Build 4 4115353 1D CTCCATTGCT A/- AAAAAAAAAT 2721 het 21 hom 21 1 7 15 A 10 9 199502 CASAVA_Build 4 4115410 4D AGCAAAAGAC TGTT/---- TGTTTGTGTC 3070 het 3070 ref 40 20 12 11 TGTT 2 1 199503 CASAVA_Build 4 4118679 3D TGAAATCAAT AAG/--- AAGAAGAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 5 AAG 3 2 199504 CASAVA_Build 4 4123438 5I TTTACCCAAT -----/GTATA GTCTTTTATC 2848 het 2848 ref 35 24 6 5 GTATA 0 1 199505 CASAVA_Build 4 4125107 1D AATTTTGGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 26 8 2 T 9 8 199506 CASAVA_Build 4 4130602 1I TAGCTAACAC -/T CCCCATCCTC 3070 het 3070 ref 40 21 9 10 T 0 1 199507 CASAVA_Build 4 4132990 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 10 11 199508 CASAVA_Build 4 4137593 2I CCAAACCCTC --/TT TGCACTTTTC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 1 3 199509 CASAVA_Build 4 4148396 2D GGGCTGTGAT AA/-- GGGGGTCCCC 3070 het 3070 ref 42 17 15 11 A 2 0 199510 CASAVA_Build 4 4148690 1I CATTGCCCCA -/G TCTCTGACCC 1887 het 1887 ref 42 25 8 9 G 0 1 199511 CASAVA_Build 4 4163956 4I CTTTGCCCTT ----/TGAA TGGTCACCAG 2161 het 2161 ref 27 15 5 7 TGAA 0 1 199512 CASAVA_Build 4 4164688 1D AAAAAAATTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 8 7 199513 CASAVA_Build 4 4184831 1D GCGTTCCCCC T/- GTCGGATAGT 1372 het 1372 ref 14 9 4 1 T 1 0 199514 CASAVA_Build 4 4187884 2I CAATATCGCA --/AG GGATGTACAT 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 AG 0 1 199515 CASAVA_Build 4 4189659 3I GTAATAAAAC ---/AAT AATTAATATT 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 AAT 1 2 199516 CASAVA_Build 4 4194422 4I GGAGGATGTC ----/GACA GCCAGCCACC 2769 het 2208 hom 28 9 12 7 GACA 0 1 199517 CASAVA_Build 4 4199716 1I AACTATGCCA -/G GGTAAGCCCT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 G 2 3 199518 CASAVA_Build 4 4227611 2I TAGGAGATGA --/CT CTGCTGTGAG 3070 het 744 hom 25 3 21 1 CT 1 2 199519 CASAVA_Build 4 4230296 3D CAAAATTTTA AAG/--- AAGATTTCTG 3070 het 3070 ref 33 15 13 7 AAG 2 1 199520 CASAVA_Build 4 4234084 1D ACCAATTTCT A/- AAAAGCAAAT 2324 het 2324 ref 20 11 5 4 A 5 4 199521 CASAVA_Build 4 4241409 10I4M3I TAGCTCACTC ----------CTAG---/TTGTTAGTCACTTGTTA GTCTCTTGTG 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 N/A 0 0 199522 CASAVA_Build 4 4246183 1D GGTCAACCAC A/- AGGTTTCAAA 3070 hom 83 het 35 0 27 8 A 2 1 199523 CASAVA_Build 4 4249380 1I33M1I TAGAAAATGT -GTAGCTCTACACCGTGGAATATTATGCAGCCTT-/GGTAGCTCTACACCATGGAATATTATGCAGCCTTA AAAAAAGAAT 1246 het 1246 ref 38 43 3 7 N/A 0 0 199524 CASAVA_Build 4 4251013 4I ATATGTAGAT ----/GATA GATAGATAGA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 GATA 3 4 199525 CASAVA_Build 4 4255126 5D CTTGTGCTCA TTGAG/----- TTGGTGCTTT 1677 het 1677 ref 52 42 5 5 TTGAG 1 0 199526 CASAVA_Build 4 4259833 4D AAACAGACAG CAGT/---- CAGTGACTCC 3070 hom 87 het 35 0 29 7 CAGT 2 1 199527 CASAVA_Build 4 4260224 4D CACTTCTGGG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 50 het 24 0 16 8 TA 9 7 199528 CASAVA_Build 4 4261409 1D TTGTCAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 5 A 13 12 199529 CASAVA_Build 4 4266009 5I CAACAAAAAT -----/TAAAA TAAATAAGAT 2858 het 2858 ref 46 35 6 5 TAAAA 0 1 199530 CASAVA_Build 4 4268738 1I AAAGTATATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 A 0 1 199531 CASAVA_Build 4 4276483 13I GTGACCCATG -------------/ATCTAGCCACTGC ACTCCAGCCT 2398 het 2398 ref 30 15 6 9 ATCTAGCCACTGC 0 1 199532 CASAVA_Build 4 4277483 10D GGCCCATAGA AGTGAGGAGT/---------- AATTCCTGCC 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 AGTGAGGAGT 1 0 199533 CASAVA_Build 4 4281250 1D CCCTCAACTT C/- TAAGAGCTTG 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 C 1 0 199534 CASAVA_Build 4 4283148 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1185 het 1185 ref 16 7 4 5 T 13 12 199535 CASAVA_Build 4 4284826 4I CCATCAATGG ----/ATGA ATGAATGGAC 3070 het 3070 ref 52 36 14 3 ATGA 1 2 199536 CASAVA_Build 4 4286801 1D TCCTCTTCAA C/- ATCATCTCAT 3070 het 3070 ref 57 29 22 7 C 1 0 199537 CASAVA_Build 4 4286905 1D GATTTCACCA T/- TTTTTCACCC 2167 het 2167 ref 45 36 6 4 T 6 5 199538 CASAVA_Build 4 4287072 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAGTCTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 A 3 5 199539 CASAVA_Build 4 4292035 1D ATGGAAGAAT C/- CCAAACTATA 3070 het 3070 hom 40 18 15 8 C 3 2 199540 CASAVA_Build 4 4302564 1D CTTTATCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 10 5 T 11 10 199541 CASAVA_Build 4 4303077 2I AGGCAGGTGG --/AT CACCTCAGCT 3070 hom 51 het 20 0 14 6 AT 0 1 199542 CASAVA_Build 4 4314580 2I AGGAATATGG --/AA AAAGTGTCTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 3 5 199543 CASAVA_Build 4 4328068 1I CTCATCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 463 hom 39 3 29 7 T 13 14 199544 CASAVA_Build 4 4328358 2I CAGAGTCTCA --/CT CTGTCACCCA 3070 hom 62 het 24 0 18 6 CT 1 2 199545 CASAVA_Build 4 4334115 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 1186 hom 15 4 10 1 T 6 7 199546 CASAVA_Build 4 4337336 1D AAGTCACAGT A/- ATTTTCCATA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 2 1 199547 CASAVA_Build 4 4339536 1D GCCTCGGCCT C/- CCAAAGTGCT 2891 het 690 hom 11 2 8 1 C 3 2 199548 CASAVA_Build 4 4342817 1D CGCGGCCACG C/- CCCCCCCAGT 1053 het 689 hom 15 3 3 9 C 8 7 199549 CASAVA_Build 4 4351098 6D ACCCAGGCTG GAGGGC/------ GAGGGCAGTG 3070 hom 113 het 40 0 35 6 GAGGGC 2 1 199550 CASAVA_Build 4 4354445 1D ATCTGAATTA T/- TTAGTTGGAT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 3 2 199551 CASAVA_Build 4 4357165 1I TAATTTTTTA -/T TTGTGAAACT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 2 3 199552 CASAVA_Build 4 4357573 3I CAATTTTAAG ---/AGT GTGAAGGGGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AGT 0 1 199553 CASAVA_Build 4 4357791 4I TTAATTTATT ----/ATTA ATTAATATAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 ATTA 1 2 199554 CASAVA_Build 4 4364562 1I GCAGATGGCA -/T TTTTTAATAC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 5 6 199555 CASAVA_Build 4 4378955 1I ACCTGGTGGC -/A AAGCCCCAAG 3070 het 3070 hom 51 14 25 12 A 2 3 199556 CASAVA_Build 4 4380718 1I CCAAGCTCCC -/G GGGGGGGCCT 1878 het 1682 hom 20 6 9 5 G 7 8 199557 CASAVA_Build 4 4385139 1I TTAAAAGGGG -/A AATTTGGGCA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 A 2 3 199558 CASAVA_Build 4 4385940 1D CCTCTGGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 10 9 199559 CASAVA_Build 4 4387221 1I GGCTACTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 10 199560 CASAVA_Build 4 4387305 1D GTGGGAATGG A/- AAGTGCTGCA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 3 2 199561 CASAVA_Build 4 4388681 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 67 hom 17 1 9 7 AAAG 4 3 199562 CASAVA_Build 4 4390088 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 3 A 13 12 199563 CASAVA_Build 4 4390349 1D CAGCCAAGGG T/- TTTGGGAGGT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 T 4 3 199564 CASAVA_Build 4 4396861 1I TGTGTGTGTG -/T TTTTTTTTGT 2548 het 2548 ref 16 10 6 0 T 8 9 199565 CASAVA_Build 4 4400646 29D AGAACGTGTA GTAAAATAACAAGTTTTGATTGGGTATAG/----------------------------- GTTGTTCTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 2 GTAAAATAACAAGTTTTGATTGGGTATAG 1 0 199566 CASAVA_Build 4 4400891 1D CTAAGTAGCT G/- GGATTACAGG 2180 het 652 hom 8 2 6 0 G 3 2 199567 CASAVA_Build 4 4401593 20D2M5D AGACACAGAG TGCTGATTGGTGCGTTTTTACAGAGTG/--------------------CA----- CTGATTGGTG 2326 het 1434 hom 12 7 5 0 N/A 0 0 199568 CASAVA_Build 4 4404127 4D GGAGTCTTTT TTTC/---- TCTTTTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTTC 1 0 199569 CASAVA_Build 4 4426119 1D CATCCTATAT C/- CCCCCCATTT 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 C 7 6 199570 CASAVA_Build 4 4428192 1D TCCTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2827 hom 40 9 13 18 T 14 13 199571 CASAVA_Build 4 4430356 1I TATGAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 10 11 199572 CASAVA_Build 4 4431338 1D GAGTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1046 het 1046 ref 29 16 4 9 T 15 14 199573 CASAVA_Build 4 4457146 1I AGTCCCTGGC -/A ATGAATGGCT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 1 2 199574 CASAVA_Build 4 4465701 1I AGGCATGTAC -/A ATGGCACCCA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 A 1 2 199575 CASAVA_Build 4 4471193 2I TAGATGAACT --/AA AAGTGTGTAA 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 A 2 4 199576 CASAVA_Build 4 4472477 1I GCTGCTAAAT -/G GGCTGAACAC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 G 2 3 199577 CASAVA_Build 4 4476324 2I TGGGAGAGAC --/AG AGGGGGCACA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 AG 1 2 199578 CASAVA_Build 4 4491870 4I CACACACACC ----/ACAT ACATACATAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 ACAT 2 3 199579 CASAVA_Build 4 4500979 1I TATTTTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 11 12 199580 CASAVA_Build 4 4501916 4D CTCAAGCAAT CCTC/---- CCTCCCACCT 3023 het 3023 ref 27 16 9 2 CCTC 2 1 199581 CASAVA_Build 4 4511409 1D TTTCATAGAC A/- AAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 7 6 199582 CASAVA_Build 4 4526964 2I GCTTGTCAGG --/CA CAGTTTCTGG 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 CA 1 2 199583 CASAVA_Build 4 4528100 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1857 hom 24 6 15 3 A 11 10 199584 CASAVA_Build 4 4557527 1D GTAGCTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 15 10 A 10 9 199585 CASAVA_Build 4 4563592 9D GAGAACACAT GGACACAGG/--------- GAGGGGAACA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 GGACACAGG 1 0 199586 CASAVA_Build 4 4579396 5D CAAGAGTTTG AGGTC/----- AGCCTGGGCA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 AGGTC 1 0 199587 CASAVA_Build 4 4585562 1I TGTGAAATGG -/A AAGTGTCTCT 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 A 2 3 199588 CASAVA_Build 4 4592431 2I CTCAAAACTC --/TA AAACACATTT 3070 het 3070 hom 57 21 30 6 TA 0 1 199589 CASAVA_Build 4 4598984 1D ATTTCTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2333 hom 29 10 11 8 T 11 10 199590 CASAVA_Build 4 4607994 1I AGTTAGTCAT -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 A 7 8 199591 CASAVA_Build 4 4619062 2D CAAATTAAAT GA/-- GATATGTATT 1340 het 1340 ref 46 41 3 4 GA 2 1 199592 CASAVA_Build 4 4621098 1D GGTCTGGGGG C/- AAATCTCATG 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 C 1 0 199593 CASAVA_Build 4 4631926 1D TTTCTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 1237 het 1237 ref 24 12 4 8 T 13 12 199594 CASAVA_Build 4 4647194 1D CTCACTTTTT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 136 hom 30 1 24 5 G 1 0 199595 CASAVA_Build 4 4650874 1I AGCATTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 900 hom 43 2 35 6 T 10 11 199596 CASAVA_Build 4 4656784 8I GAATGACTGC --------/AGGAGGCG AGAGGGGAGC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 AGGAGGCG 0 1 199597 CASAVA_Build 4 4658452 1D GTGTGCAGGT G/- GGGAGGATAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 G 4 3 199598 CASAVA_Build 4 4659500 1D AGTTGATCCA C/- CCCGCCTTGG 3070 hom 38 het 17 0 13 4 C 4 3 199599 CASAVA_Build 4 4659556 1I CGCGCCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 9 7 T 12 13 199600 CASAVA_Build 4 4662868 2D CTGATACTTA TC/-- TCTCAGCATT 3070 het 3070 hom 37 12 21 6 TC 3 2 199601 CASAVA_Build 4 4682854 4I TTTTCTTTGA ----/TTGT TTGTACTTTA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 TTGT 1 2 199602 CASAVA_Build 4 4683306 1I GTCCCCTGCA -/G GGACATGGAT 3070 hom 27 het 10 0 9 1 G 2 3 199603 CASAVA_Build 4 4686560 1I TTGTCTGTAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 29 7 20 2 A 7 8 199604 CASAVA_Build 4 4687750 8D TTTCTTTCTT TCTTTCTG/-------- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 TCTTTCTG 1 0 199605 CASAVA_Build 4 4688095 1D CTGGCCTAGA T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 7 6 199606 CASAVA_Build 4 4691327 4I ACATGTTCTC ----/AATT AATATAAACA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 AATT 0 1 199607 CASAVA_Build 4 4696596 2I AAAGGTAAAA --/AC ACCTTCAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 AC 1 2 199608 CASAVA_Build 4 4723017 1D AAAAGACACT C/- CCCCCCCCAG 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 C 9 8 199609 CASAVA_Build 4 4723294 1I13M1I ACTAAAATTC -TTCTCGAGCAAGA-/TTTCTCGAGCAAGAC CCAAGAACCC 3070 het 3070 ref 28 14 14 6 N/A 0 0 199610 CASAVA_Build 4 4725387 1D GGCACTTGAT A/- ATGTATTTGT 3070 het 3070 ref 46 23 18 6 A 2 1 199611 CASAVA_Build 4 4726795 4I ATCATTTCTT ----/AATC AGTCCCTAAT 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 AATC 0 1 199612 CASAVA_Build 4 4727025 2I TGTTTTTAAA --/TG TATTGTTCAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TG 0 1 199613 CASAVA_Build 4 4727368 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTG 2203 het 2203 ref 29 14 9 6 T 10 9 199614 CASAVA_Build 4 4733493 4D ATTATCCAGC TTAT/---- TTACTAACTG 3070 hom 138 het 52 0 46 10 TTAT 1 0 199615 CASAVA_Build 4 4737701 1D49M3D CTCCTCCCTC TTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTGGC/-TTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGT--- GGCTCAATCT 3070 het 3070 hom 29 15 15 5 N/A 0 0 199616 CASAVA_Build 4 4740488 2D TGATAATAAT CA/-- CATAACTACA 3070 het 3070 hom 47 20 24 4 CA 2 1 199617 CASAVA_Build 4 4746770 1I GCTGAGAGGA -/G GACTCACCAG 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 G 1 2 199618 CASAVA_Build 4 4756616 1D CTGTGTGAGC G/- GTGCAGTCCG 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 G 2 1 199619 CASAVA_Build 4 4761892 1D TGAAACCCAT C/- TTTTTTAAGC 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 C 1 0 199620 CASAVA_Build 4 4766773 1D GAGCAAAGTC G/- TTTTTTTTTT 3070 het 1604 hom 25 8 10 7 G 1 0 199621 CASAVA_Build 4 4767763 2D CTCCATTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 TG 7 6 199622 CASAVA_Build 4 4771440 18D TTTGGGGTGA GTCCCTTCTCCTCCCTGG/------------------ GTCCCTTCTC 3070 het 3070 ref 38 20 13 9 GTCCCTTCTCCTCCCTGG 2 1 199623 CASAVA_Build 4 4773825 1I AAAAGAACCC -/G GGGGGGACCA 3070 het 1858 hom 20 6 10 4 G 6 7 199624 CASAVA_Build 4 4797804 1I TTGGGAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 11 12 199625 CASAVA_Build 4 4816006 2D CCTTTCACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 24 12 A 12 10 199626 CASAVA_Build 4 4824333 4I ACCTGGTGTC ----/TCTT TCTCTTCTCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TCTT 0 1 199627 CASAVA_Build 4 4851660 1I GAACTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 10 11 199628 CASAVA_Build 4 4859642 2I GTTCTTCCTT --/TG TGTTCCATTG 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 TG 1 2 199629 CASAVA_Build 4 4860199 1D CTTGGGAAAC A/- GATTCTGTGA 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 A 1 0 199630 CASAVA_Build 4 4865944 1I CCAGGAAGAC -/A AAAAAAATGA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 A 7 8 199631 CASAVA_Build 4 4878821 8D CTATCTATCT ATCTATCC/-------- ATCTATCCAT 2312 het 2312 ref 37 15 5 18 ATCTATCC 3 2 199632 CASAVA_Build 4 4885209 1I AAGGGTGGGA -/G GGGTGGGAGG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 3 4 199633 CASAVA_Build 4 4897231 1D TAAATTGTGG C/- CCCCCCAACC 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 C 7 6 199634 CASAVA_Build 4 4897853 1D GATGCCCCCC G/- TCACAGGTTG 3070 het 3070 hom 47 16 24 8 G 1 0 199635 CASAVA_Build 4 4906988 23D TGCATTTCCT CTTTTGAAAGCGCCCCGAGAGAG/----------------------- GCTGCACCCA 3070 het 3070 ref 25 14 13 2 CTTTTGAAAGCGCCCCGAGAGAG 1 0 199636 CASAVA_Build 4 4911587 1D CTACAGGAAG C/- TAGCTTCTTC 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 C 1 0 199637 CASAVA_Build 4 4911970 10D GAGGGGAGGG GAGGGGAGGA/---------- GAGGAGGGCA 3061 hom 46 het 20 0 14 9 GAGGGGAGGA 1 0 199638 CASAVA_Build 4 4914525 6D AACAACATCA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 61 het 27 0 15 14 AC 12 9 199639 CASAVA_Build 4 4916399 1I TTGTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1300 hom 37 3 22 12 A 15 16 199640 CASAVA_Build 4 4941181 1D TGAAGCTGGC A/- AGTGATGAAG 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 A 2 1 199641 CASAVA_Build 4 4958734 1I TCACTTTGTT -/G ATTGTTTCCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 0 1 199642 CASAVA_Build 4 4983647 1D GTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 17 18 7 T 9 8 199643 CASAVA_Build 4 4989279 6I ACTAAGTTCT ------/ACAAGG ACAAGGACCT 3070 het 3070 ref 58 26 23 9 ACAAGG 1 2 199644 CASAVA_Build 4 4994698 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 379 hom 47 1 38 9 T 10 9 199645 CASAVA_Build 4 4997025 1D CCTGTGCAGA G/- TTTCAACACT 3070 het 3070 hom 47 20 21 7 G 1 0 199646 CASAVA_Build 4 4997695 1D TTCTCATACA C/- CCCCCCACAC 3070 hom 51 het 33 0 16 17 C 7 6 199647 CASAVA_Build 4 5004601 1I CCCAGGTCTC -/T TGAAATGTTC 3070 het 3070 hom 45 19 15 11 T 1 2 199648 CASAVA_Build 4 5013971 1D TATTTTTCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 10 9 199649 CASAVA_Build 4 5018577 5D AAGCTTATAT ATATA/----- ATATAAAATA 1738 het 1738 ref 15 10 4 2 ATATA 2 1 199650 CASAVA_Build 4 5034698 1I GGTGTATGCA -/C CGTGTCTTTT 3070 hom 135 het 52 0 44 8 C 1 2 199651 CASAVA_Build 4 5045989 2D CTGCTGCTGT CC/-- CCCCACAGCC 3070 hom 65 het 29 0 21 9 C 6 4 199652 CASAVA_Build 4 5046883 1I ATTTGCCAAC -/A CCCCCCGCCC 3070 het 377 hom 21 2 15 4 A 0 1 199653 CASAVA_Build 4 5057932 1D GAAACATTGG A/- AAAAAGTCAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 5 199654 CASAVA_Build 4 5060319 4I AATGGATATG ----/TTAA TTAGTCTGAT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 TTAA 0 1 199655 CASAVA_Build 4 5060406 1D TTATCAATCT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 26 15 11 1 A 7 6 199656 CASAVA_Build 4 5060516 1I TCAGACTGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 T 8 9 199657 CASAVA_Build 4 5060705 4D40M1D GGCAATTTGG ATAAATATAGTTGTGAATTAACACATTATCTTTCTAATTTCTGCT/----ATATAGTTGTGAATTAACACATTATCTTTCTAATTTCTGC- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 20 N/A 0 0 199658 CASAVA_Build 4 5062685 1D GCCCAAATAA T/- GCCTGGGTTG 3070 het 3070 hom 50 20 27 3 T 1 0 199659 CASAVA_Build 4 5073372 3D GTCAAAAGGG AGA/--- AGATTCTTCC 3070 hom 142 het 53 0 42 13 AGA 2 1 199660 CASAVA_Build 4 5094433 1D AGCCTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 19 9 T 11 10 199661 CASAVA_Build 4 5102369 2D GCCTGGCAAT CA/-- CACCCAGCTA 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 CA 2 1 199662 CASAVA_Build 4 5113226 4I GATTATACTT ----/ACTC ACGTATTCTA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 ACTC 0 1 199663 CASAVA_Build 4 5123325 1D AGGATATGGT A/- AGAGTTCCTT 3070 het 3070 hom 54 17 31 8 A 2 1 199664 CASAVA_Build 4 5128377 1I CAAGAACAGG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 7 8 199665 CASAVA_Build 4 5131919 2I TACATAAAAC --/TT TGCACTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 1 3 199666 CASAVA_Build 4 5132681 9I CGGCATGGTG ---------/ACTAGAGTT ACTAGAGTTA 3070 hom 83 het 36 0 28 8 ACTAGAGTT 1 2 199667 CASAVA_Build 4 5135359 1D TGTTCGTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 13 12 199668 CASAVA_Build 4 5138630 3D GTGCTACTTG GGA/--- GGAGAAGGGT 3070 het 3070 ref 36 22 12 4 GGA 2 1 199669 CASAVA_Build 4 5141855 1D TCTTTATTCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 10 9 199670 CASAVA_Build 4 5149138 4I TCACCACACA ----/CATC CATCCTCTCA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 CATC 1 2 199671 CASAVA_Build 4 5150133 1I TTGGCAGATT -/G TTAGTGTCTT 3070 hom 157 het 60 0 53 7 G 0 1 199672 CASAVA_Build 4 5170028 1I GATCATATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 9 10 199673 CASAVA_Build 4 5174994 12D ACTTGTTCAC TCATTCACTCAT/------------ TCATTCACTC 3070 het 416 hom 72 5 29 42 TCATTCACTCAT 1 0 199674 CASAVA_Build 4 5180254 1I GATTTAGAAT -/G GGCCTTATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 3 199675 CASAVA_Build 4 5189015 4I CCCTTTGCAG ----/CTCT CTCTAAGAGT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 CT 2 4 199676 CASAVA_Build 4 5190164 2D GAGCTAGCAC TT/-- TTTGAAAGGT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 5 3 199677 CASAVA_Build 4 5198693 1I TTTTTTTTTT -/C CCCTAGTATG 3070 het 3070 hom 39 11 16 12 C 3 4 199678 CASAVA_Build 4 5206096 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2956 het 2939 hom 42 11 14 17 T 12 13 199679 CASAVA_Build 4 5207608 2I AAGGTCATGC --/AG AGTCTGGCCT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 AG 1 2 199680 CASAVA_Build 4 5222526 1I TTTTCTTGTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 8 9 199681 CASAVA_Build 4 5245382 2I TTCTACTCTC --/TT GGCAAATTTC 3070 het 3070 hom 54 21 24 9 T 0 2 199682 CASAVA_Build 4 5271338 1D TGGAAAAGTT C/- TAAAAACTTA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 C 1 0 199683 CASAVA_Build 4 5287142 1I AGGGCTCAAT -/A AAAAAATATT 3070 hom 106 het 42 0 36 6 A 6 7 199684 CASAVA_Build 4 5319761 1I CATTGTTTGC -/A AAAGAGAAAA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 3 4 199685 CASAVA_Build 4 5343399 1I TATACATAAA -/G GAAAATATTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 1 2 199686 CASAVA_Build 4 5397939 1D ATAATTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1238 het 1238 ref 28 10 7 11 T 15 14 199687 CASAVA_Build 4 5466988 2D AGGAACACCT TG/-- TAATCAAATA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 TG 1 0 199688 CASAVA_Build 4 5477420 1I CTGAAATATG -/C CCCCCTGCTC 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 C 5 6 199689 CASAVA_Build 4 5481878 2D TCTAACAGTA TC/-- TGTCTTTTCA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TC 1 0 199690 CASAVA_Build 4 5482193 2I ATAAATATAT --/AA GTCATTGAAT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 0 2 199691 CASAVA_Build 4 5482600 1I TTCCTCTGTA -/G GGTAACATGC 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 G 2 3 199692 CASAVA_Build 4 5484139 1I CCAAAAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 T 11 12 199693 CASAVA_Build 4 5485424 3I TGTGAATAAT ---/AAC AACAATAATA 3070 het 3070 ref 55 26 27 2 AAC 1 2 199694 CASAVA_Build 4 5498584 2I CCCCAGGCAC --/AG AGAGCTCTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AG 2 3 199695 CASAVA_Build 4 5505853 2D AGAGATTAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 37 16 13 9 GA 10 9 199696 CASAVA_Build 4 5511217 1D CTATAATGGC T/- TGTTGAATTA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 2 1 199697 CASAVA_Build 4 5515950 1D GCTGTGTGCT G/- GGATGCCCTG 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 G 3 2 199698 CASAVA_Build 4 5516107 2I CTCACACACT --/CA CAGTCACACT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 CA 1 2 199699 CASAVA_Build 4 5519767 1I GAGGCCCCCA -/G GGGCTGCACG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 G 3 4 199700 CASAVA_Build 4 5523288 2I GAGCCATGCT --/CC CCATCTACCC 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 C 2 4 199701 CASAVA_Build 4 5552279 3I GGCCACAGTC ---/CTT CTGAGCTTGT 3070 hom 135 het 52 0 44 8 CTT 0 1 199702 CASAVA_Build 4 5555250 1D GGTAATTTAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 9 8 199703 CASAVA_Build 4 5563104 2D AAATATAAAG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 61 hom 25 1 16 9 C 12 10 199704 CASAVA_Build 4 5563948 1D ATGCAGACAT A/- AAAAAGAATG 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 6 5 199705 CASAVA_Build 4 5570726 1D CATCATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2782 hom 33 13 12 8 A 17 16 199706 CASAVA_Build 4 5583153 2D CAGTTACCGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 62 18 25 19 GT 8 7 199707 CASAVA_Build 4 5586781 1I GGGAAAGGGC -/T TACAGGCTGC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 1 2 199708 CASAVA_Build 4 5587566 1D AGGAGAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 A 10 9 199709 CASAVA_Build 4 5589412 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2314 hom 25 8 12 5 A 13 14 199710 CASAVA_Build 4 5601583 20D16M4D CCTTCCTTCC TTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTCTTTCTTTCTTCCGTCCC/--------------------TTCTTTCTTTCTTCCG---- TCCCTCCCTC 2492 het 2492 ref 21 13 7 7 N/A 0 0 199711 CASAVA_Build 4 5603802 1D CCACTGTACT C/- CAGACCCCAG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 2 1 199712 CASAVA_Build 4 5620861 1D TTTTTATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 11 10 199713 CASAVA_Build 4 5630670 1I AATGGAATAG -/A AGGTGGAAAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 1 2 199714 CASAVA_Build 4 5630868 1I TCTCCTTTCT -/C CCCAGCAGTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 3 4 199715 CASAVA_Build 4 5633427 10I5M16I TAAAGACTGA ----------ATTTG----------------/TATGGTTTGGATTTGTGTCCCCGCTTAAATC TCATGTTGAA 3070 hom 108 het 35 0 37 5 N/A 0 0 199716 CASAVA_Build 4 5636387 5D AGGGTTTGTA TATTT/----- TATTAGACTT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 TATTT 1 0 199717 CASAVA_Build 4 5642294 1I AATTCCTTTA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 43 11 25 7 T 6 7 199718 CASAVA_Build 4 5654149 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 A 13 12 199719 CASAVA_Build 4 5666298 1D54M2I ATTGCTTGAT GGAGTTTGTTTAATACTCAGGTAGTTTAGGAAGCCCAGTGGCTCTCACATTGATG--/-GAGTTTGTTTAATACTCAGGTAGTTTAGGAAGCCCAGTGGCTCTCACATTGATGTA TATATCTCTT 3070 het 3070 ref 34 33 14 10 N/A 0 0 199720 CASAVA_Build 4 5667030 1D CCTGGGACAC T/- GTTGCCTCCC 3070 het 3070 ref 41 27 9 8 T 1 0 199721 CASAVA_Build 4 5667461 1I CAAAAATTAG -/C CAGGTGTGAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 1 2 199722 CASAVA_Build 4 5669057 1I GAGGTCAAAC -/A GTAGACACTA 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 A 0 1 199723 CASAVA_Build 4 5669730 1D AACAGTACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 9 199724 CASAVA_Build 4 5678960 1D GTTCTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 21 3 14 4 T 20 19 199725 CASAVA_Build 4 5681372 1D CCTGTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 28 1 18 9 A 11 10 199726 CASAVA_Build 4 5684197 2I CAGTAGACTG --/GC GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 GC 0 1 199727 CASAVA_Build 4 5691024 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 20 1 16 3 A 13 14 199728 CASAVA_Build 4 5692488 1I TAATGTCTCA -/T TTTTTTACGT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 6 7 199729 CASAVA_Build 4 5694697 6I GTTAGTTTGC ------/TGAGGA TAAGAGTTTC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 TGAGGA 0 1 199730 CASAVA_Build 4 5702506 1D AAGGCATAGA C/- AATGGAAATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 0 199731 CASAVA_Build 4 5703875 4I AAGTATGGAT ----/GATA GATAGATGGG 3070 hom 145 het 56 0 45 12 GATA 1 2 199732 CASAVA_Build 4 5715700 2D CATTCATCAC AT/-- GTGTGTAAGT 3070 het 3070 hom 61 24 34 5 AT 1 0 199733 CASAVA_Build 4 5726194 3I TCCCGGCTTC ---/CCA CCCCCCAGAG 3070 hom 69 het 31 0 23 8 CCA 0 1 199734 CASAVA_Build 4 5737204 1D26M4D GCCTGTACCC GGGGTGTGCAGCACCTGCCAGGACAGGCAGC/-GGGTGTGCAGCACCTGCCAGGACAGG---- CAGCCAGCCA 3070 hom 74 het 28 0 25 15 N/A 0 0 199735 CASAVA_Build 4 5753504 4D CATCGCACAC ACTT/---- ACCAGCACCA 3070 het 3070 ref 39 24 11 5 ACTT 1 0 199736 CASAVA_Build 4 5758169 1D ATAAATAGCA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 30 het 21 0 11 10 T 9 8 199737 CASAVA_Build 4 5762369 1D CTCCTTAGTA T/- TTTTTATGGA 3070 het 3070 ref 41 27 9 5 T 6 5 199738 CASAVA_Build 4 5763022 4D TAGCTACCCC ATAA/---- ATGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 45 18 22 10 ATAA 1 0 199739 CASAVA_Build 4 5767124 2D GCTGCTTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 1826 het 970 hom 37 9 8 20 T 18 16 199740 CASAVA_Build 4 5773515 1D TATGAGTTAA C/- TTTACAGCAG 3070 het 3070 ref 54 33 19 2 C 1 0 199741 CASAVA_Build 4 5783539 9D CCTGTGGGCG TGGTGTGCA/--------- TGGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 40 15 12 16 TGGTGTGCA 2 1 199742 CASAVA_Build 4 5785364 1I TGAGGTTGGG -/A CACCATGGCT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 A 0 1 199743 CASAVA_Build 4 5797815 3D GCTTTCTTTT TTC/--- TTCTTCTTCT 2651 het 2651 ref 23 10 9 4 TTC 5 4 199744 CASAVA_Build 4 5798773 4D GCCAGAGGGC TTGT/---- TTGTGTCTTA 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 TTGT 2 1 199745 CASAVA_Build 4 5799846 1I TGAGGCTGAC -/T AGAGTTTCAT 1450 het 1450 ref 29 8 5 16 T 0 1 199746 CASAVA_Build 4 5799880 3I GCAACAAAAT ---/CAG CATGGGTTTC 3070 hom 75 het 39 0 24 15 CAG 0 1 199747 CASAVA_Build 4 5800716 5I AGCACGCACC -----/GTTTG GTTTGGCTTT 3070 het 3070 hom 59 26 25 8 GTTTG 1 2 199748 CASAVA_Build 4 5801053 2D ATAGAGCCTC AG/-- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 28 18 2 AG 1 0 199749 CASAVA_Build 4 5811704 1I GGAGGGCGGT -/G GGGGGCGGGT 3070 het 2818 hom 28 10 12 6 G 5 6 199750 CASAVA_Build 4 5811899 2I TGCAGATAAC --/TG TGCTTGAAAG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 TG 1 2 199751 CASAVA_Build 4 5824525 3D TTATTTTATT TTA/--- TTATTATTAT 2737 het 1773 hom 15 5 8 2 TTA 6 5 199752 CASAVA_Build 4 5824998 2D TTCAAGAAGC AA/-- ACAGACCAGG 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 A 3 1 199753 CASAVA_Build 4 5830465 3I ATGAAATTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 TTG 4 5 199754 CASAVA_Build 4 5844744 2I GAGAAAAACA --/AG TTGGGAAGAA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 AG 0 1 199755 CASAVA_Build 4 5846836 4D ATTTTTTTCC TTCT/---- TTCATTATGA 1340 het 1340 ref 11 6 3 2 TTCT 1 0 199756 CASAVA_Build 4 5860285 1I GAGAGTAACA -/G GGCTGCCTGC 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 G 2 3 199757 CASAVA_Build 4 5865509 1D AAAGGGTGCC T/- TGCCCTGGTC 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 T 2 1 199758 CASAVA_Build 4 5899228 1I CCCAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 28 2 20 6 T 11 12 199759 CASAVA_Build 4 5909541 3D30M3D CTAACATTAT CACCACCACCACCACCATCACCACCATCATCACCAT/---CACCACCACCACCATCACCACCATCATCAC--- CACCACCACC 2696 het 2696 ref 72 25 8 50 N/A 0 0 199760 CASAVA_Build 4 5927812 1D TCCACAGAAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 8 7 199761 CASAVA_Build 4 5928374 1I TGAATTGACA -/C TGGACACAGA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 0 1 199762 CASAVA_Build 4 5932484 1D AAAATATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 A 11 10 199763 CASAVA_Build 4 5955857 2D ATGCTGTCAG AT/-- ACACTGATTT 3070 hom 66 het 27 0 22 7 AT 1 0 199764 CASAVA_Build 4 5964717 4I ACAAACAAAC ----/AAAA ACAAACAAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 1 5 199765 CASAVA_Build 4 5973306 3D GCTTTCACCA TTT/--- GGCCAGGCTG 3070 het 2220 hom 15 5 9 2 T 3 0 199766 CASAVA_Build 4 5973596 6D TCCAGGAGTG GCAGGA/------ GCAGTGGACA 3070 het 3070 ref 40 21 12 9 GCAGGA 1 0 199767 CASAVA_Build 4 5982075 5I TTTAGGAATA -----/ACATT ACATTTCCTT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 ACATT 1 2 199768 CASAVA_Build 4 5983989 3D TTTCCCATGT AGA/--- AGAACACATC 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 AGA 2 1 199769 CASAVA_Build 4 5988837 1D ATGCTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 35 1 15 19 A 12 11 199770 CASAVA_Build 4 5989290 2I AGTCTAAAAC --/TG TTAACATGAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TG 0 1 199771 CASAVA_Build 4 5991214 1D GAACAGGCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 9 8 199772 CASAVA_Build 4 6000194 2D AAAACAACCC CT/-- GAGAGGCTAG 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 CT 1 0 199773 CASAVA_Build 4 6003333 1D ACTGTCTCCA C/- CCCCGTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 19 12 C 5 4 199774 CASAVA_Build 4 6003968 1I AGGGAATGAA -/G GGGGGGTGGT 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 G 6 7 199775 CASAVA_Build 4 6015624 14D CTTTTTTTTC TTTTCTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1177 hom 17 4 10 3 TTTTCTTTTTTTTT 1 0 199776 CASAVA_Build 4 6016662 1D GGGGGAAACG T/- TAACAGAACA 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 T 2 1 199777 CASAVA_Build 4 6016965 1I GCACTGGAAC -/A TCCTTGTCGA 3070 het 3070 ref 60 38 19 3 A 0 1 199778 CASAVA_Build 4 6017064 3D TCAAATTGTG TCA/--- TCAAGGTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 TCA 2 1 199779 CASAVA_Build 4 6020280 1I AAAGGAAAAC -/A GGAATTGGTT 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 A 0 1 199780 CASAVA_Build 4 6022083 1D AGGAGGTGGC A/- GGAGGAGGAA 3070 het 3070 hom 47 21 22 5 A 1 0 199781 CASAVA_Build 4 6024637 1D CTGCTTTCGA T/- TTTTTTTTTT 1103 het 614 hom 21 3 3 15 T 17 16 199782 CASAVA_Build 4 6027082 1D CGGGCGCCAA C/- TCGAGGCTCA 3070 hom 117 het 42 0 38 5 C 1 0 199783 CASAVA_Build 4 6039030 1D TAAATAACCC A/- ATGGGTCAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 2 1 199784 CASAVA_Build 4 6039167 2D AACAACGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 2416 hom 39 het 26 0 12 14 T 18 16 199785 CASAVA_Build 4 6068147 1I TGTTGATGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 392 hom 38 1 28 9 A 9 10 199786 CASAVA_Build 4 6122381 2D ATCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 37 0 17 20 A 17 15 199787 CASAVA_Build 4 6127814 1D AAAGAAAAGG A/- AAAAAAGTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 7 6 199788 CASAVA_Build 4 6129030 2I TTTTCTATAT --/TA TATATATATA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 TA 6 7 199789 CASAVA_Build 4 6137943 4I AATGAATGAA ----/TGAG TGAGTGAATA 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 TGAG 1 2 199790 CASAVA_Build 4 6143876 1D ATACCTGAAT G/- GGGGGAGATT 3070 hom 135 het 47 0 45 2 G 6 5 199791 CASAVA_Build 4 6147631 4D AAGATAGAAG AAAA/---- ATAAAAAGGA 1306 het 893 hom 9 4 3 3 A 5 1 199792 CASAVA_Build 4 6151183 14D AAAAAGAAAG AAAGAAAGAAAGAA/-------------- AGAAAGAAAG 3070 het 521 hom 16 2 15 2 AAAGAAAGAAAGAA 1 0 199793 CASAVA_Build 4 6155126 1D TTCAAGGCAC T/- GTCTTAGAAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 T 1 0 199794 CASAVA_Build 4 6166563 4D CGTGAATGAA TGAG/---- TGAGTGAGTG 3070 het 3070 ref 37 17 14 10 TGAG 3 2 199795 CASAVA_Build 4 6172201 1I ACAACAACAA -/C AAAAAAACCA 3070 het 2386 hom 21 8 12 1 C 0 1 199796 CASAVA_Build 4 6172809 1I CTAGCCACAC -/T TTTTTTTTTT 2519 het 67 hom 40 1 12 27 T 15 16 199797 CASAVA_Build 4 6173529 1I CACAAAGCAA -/T GCTCAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 0 1 199798 CASAVA_Build 4 6181192 1D CTTCAAGTGG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 86 het 33 0 25 8 A 8 7 199799 CASAVA_Build 4 6185283 1I AATAAAAAAA -/T AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 199800 CASAVA_Build 4 6191838 2D CTCCAGAAAC TT/-- TCACTATTTA 3070 hom 84 het 37 0 26 12 T 3 1 199801 CASAVA_Build 4 6198121 1D ATCCATACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 39 1 28 10 A 11 10 199802 CASAVA_Build 4 6198858 1I GCCAGGGGCT -/G GGGGGGAGGT 3070 hom 60 het 24 0 18 6 G 6 7 199803 CASAVA_Build 4 6211717 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 24 1 18 5 A 14 15 199804 CASAVA_Build 4 6211918 1I CAAATCTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 A 10 11 199805 CASAVA_Build 4 6212145 1D ATGCAAGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 10 9 199806 CASAVA_Build 4 6214182 1I AACTCAGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2235 hom 31 6 15 10 A 12 13 199807 CASAVA_Build 4 6221542 1D AAATAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 28 2 13 13 A 11 10 199808 CASAVA_Build 4 6222723 1D CCACCGCCAC G/- ATCCCCATCA 3070 hom 135 het 50 0 39 12 G 1 0 199809 CASAVA_Build 4 6223262 3I ACATCAACAC ---/CAT CATCACCTCT 3070 het 3070 ref 57 29 17 11 CAT 1 2 199810 CASAVA_Build 4 6224219 1D CCGTCTCGAT C/- CCCCCCCAAG 3070 het 3070 ref 75 37 23 16 C 8 7 199811 CASAVA_Build 4 6242831 1D AGCAGGCCAT G/- GGGGGGGCTG 3070 het 3070 hom 30 10 10 10 G 8 7 199812 CASAVA_Build 4 6242948 2D ATAGTTACAC AT/-- GTTTTGTTGC 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 AT 1 0 199813 CASAVA_Build 4 6250945 1I TGTTTTAGAC -/A GGGGGGAAAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 0 1 199814 CASAVA_Build 4 6253855 4I GCTGGGCAAA ----/CACT CATTCATTCA 3070 hom 94 het 38 0 32 6 CACT 0 1 199815 CASAVA_Build 4 6269050 1D TTACCACAAT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 8 7 199816 CASAVA_Build 4 6269536 12D CTTTTCTCCC TCTTTTCCTTCT/------------ TCTTTTGGAT 3070 hom 105 het 34 0 34 4 TCTTTTCCTTCT 1 0 199817 CASAVA_Build 4 6285447 12I TTCAGAGAAG ------------/GCTGGATCACCT GCGCCTCCTC 3070 hom 83 het 31 0 24 7 GCTGGATCACCT 0 1 199818 CASAVA_Build 4 6289942 1D TGGAGGAAGA G/- GAGGGACAAA 3070 het 3070 hom 36 13 20 4 G 2 1 199819 CASAVA_Build 4 6301939 1D AGGCCAGGAT G/- GGAACTGCCA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 G 3 2 199820 CASAVA_Build 4 6309970 3I AGTGCATTTC ---/TGT TGTTGGCCGA 2975 het 2975 ref 36 16 10 10 TGT 1 2 199821 CASAVA_Build 4 6315531 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 72 het 27 0 23 5 A 9 8 199822 CASAVA_Build 4 6326196 1D CTGCCTCAGG C/- TTCTGCCCAC 3070 hom 115 het 44 0 35 11 C 1 0 199823 CASAVA_Build 4 6327461 5D TGCAGTGGCA TGGCG/----- GTCTGATTTC 3070 hom 84 het 30 0 26 6 TGGCG 1 0 199824 CASAVA_Build 4 6343653 11I AGAGTGGGCG -----------/TGGCAGGGGCA TGGCGCGATG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TGGCAGGGGCA 0 1 199825 CASAVA_Build 4 6346157 1D CCATCAGTGA C/- CCCCCTTGCT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 C 6 5 199826 CASAVA_Build 4 6347108 1D TGGAGGTGTC A/- GCAGGCACAT 3070 hom 105 het 53 0 32 21 A 1 0 199827 CASAVA_Build 4 6351321 5D TGAGCCTGCC CCTCT/----- CCTCTCATCT 3070 het 3070 hom 50 21 24 7 CCTCT 2 1 199828 CASAVA_Build 4 6364814 1I TGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1930 het 499 hom 24 1 8 15 T 15 16 199829 CASAVA_Build 4 6371065 3I6M2I CAGGACCCGC ---TCTCCG--/AGGGCTGGGGA GAGATGAGCT 3070 hom 58 het 23 0 16 8 N/A 0 0 199830 CASAVA_Build 4 6374297 1D AAACAAAACC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 9 8 199831 CASAVA_Build 4 6374727 20D CCTGGACCCT TGTCGTCGCCAAGTCTGCCA/-------------------- TGTCCTACTT 3070 hom 60 het 22 0 20 5 TGTCGTCGCCAAGTCTGCCA 1 0 199832 CASAVA_Build 4 6376446 27D TCAGGAGGTT GAGGCAGGAGGATCACCTGAGCCTGGG/--------------------------- GAGGCAGGAG 3070 hom 48 het 27 0 17 10 GAGGCAGGAGGATCACCTGAGCCTGGG 2 1 199833 CASAVA_Build 4 6378530 4I CCTGCCCTCG ----/CCAC CCACCCGTGG 2658 het 763 hom 19 4 8 7 CCAC 1 2 199834 CASAVA_Build 4 6380602 7D GCCATGTCCA GCCCTCC/------- CCTCATCCCA 3070 het 3070 ref 35 15 15 7 GCCCTCC 1 0 199835 CASAVA_Build 4 6381540 14D GGATGGATGA TGGTGACCGGGTGC/-------------- TGGGCTATAG 3070 hom 70 het 29 0 21 9 TGGTGACCGGGTGC 1 0 199836 CASAVA_Build 4 6390444 9D CTGGCTGTAC TCGGGCATT/--------- TCTGAGGGTT 3070 het 3070 ref 35 19 11 6 TCGGGCATT 1 0 199837 CASAVA_Build 4 6393001 18D TGACCCCTGA GGTGCAATGCATCAGAGG/------------------ GCTCCTGATG 2720 het 2720 ref 19 14 8 2 GGTGCAATGCATCAGAGG 1 0 199838 CASAVA_Build 4 6402368 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 8 A 9 10 199839 CASAVA_Build 4 6403299 1D GTTCTCTCCC A/- AGGGGAGACC 3070 hom 96 het 34 0 32 4 A 2 1 199840 CASAVA_Build 4 6408465 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 8 9 199841 CASAVA_Build 4 6415523 1I CCCTTTCCCC -/G TTTGACTTTG 3070 hom 71 het 30 0 22 8 G 0 1 199842 CASAVA_Build 4 6425132 1I GGCACTGGCC -/A AGGCCACAGT 3070 hom 74 het 29 0 20 9 A 1 2 199843 CASAVA_Build 4 6426662 5I GTGTTAGTGT -----/GTCTG GACTCCTCCA 3070 hom 128 het 51 0 43 8 GTCTG 0 1 199844 CASAVA_Build 4 6440436 2I AACAGTGAAG --/AA AAAAAAAAAA 2635 het 2635 ref 25 8 9 8 A 12 14 199845 CASAVA_Build 4 6466810 16D TTTCCTCCTC CTGGCTGGAGCTAGAA/---------------- CTGGCTGGAG 3070 het 3070 ref 30 13 12 11 CTGGCTGGAGCTAGAA 2 1 199846 CASAVA_Build 4 6472067 1D AAAAAGAAAG A/- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 19 9 9 2 A 4 3 199847 CASAVA_Build 4 6474354 1D CACTCGGAGG C/- CCAGCCTCCC 3070 hom 63 het 37 1 32 4 C 3 2 199848 CASAVA_Build 4 6481709 17D TCCACAGACA ATGTGTAGATACATGCC/----------------- ATGTGTAGAT 3070 hom 87 het 33 0 29 10 ATGTGTAGATACATGCC 1 0 199849 CASAVA_Build 4 6487421 1D TACGATAGAT A/- AAAAAACAGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 7 6 199850 CASAVA_Build 4 6489534 1I CCAAATGCCC -/A AGTTGTCTTT 3070 hom 132 het 47 0 44 3 A 1 2 199851 CASAVA_Build 4 6502856 1D GGGGTGGAGT G/- GGGGGGTTCA 3070 hom 86 het 33 0 28 6 G 7 6 199852 CASAVA_Build 4 6507678 4I AGCACAAGTC ----/ACCT ACCTAGTGCT 3070 het 3070 ref 39 21 9 9 ACCT 1 2 199853 CASAVA_Build 4 6508544 1I CAGGCTGCAA -/C CGGGCCCACT 3070 hom 70 het 27 0 24 3 C 1 2 199854 CASAVA_Build 4 6511345 3I TGCTGAGCTG ---/GGT GCAGGGTGCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 GGT 0 1 199855 CASAVA_Build 4 6531154 1I AATAACAGGG -/C CCCTGTTCGA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 C 3 4 199856 CASAVA_Build 4 6535621 2I TATTAATAAG --/AT AATATGACTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 0 1 199857 CASAVA_Build 4 6557791 1I AAGTGCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 27 11 5 A 10 11 199858 CASAVA_Build 4 6579551 12D TACAGCCCTG CCACCCACCCAT/------------ CCACCCTCGC 3070 het 3070 ref 34 17 11 10 CCACCCACCCAT 1 0 199859 CASAVA_Build 4 6579759 1I TGAGCCTCAG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 7 8 199860 CASAVA_Build 4 6581152 7I10M2D GACCCTGGCG -------TCTGAGAGCCAG/TCTGTGTTCTGTGACCC-- TGTGTTCTGA 3070 hom 99 het 37 0 32 7 N/A 0 0 199861 CASAVA_Build 4 6582154 2D ATGAGAAAAC TG/-- AGGATTCTTG 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 TG 1 0 199862 CASAVA_Build 4 6608437 1D AACCAACCTG C/- CCCCCGGGTG 3070 hom 94 het 40 0 25 15 C 6 5 199863 CASAVA_Build 4 6615102 1I GAGTCGGGGG -/T GGGGGGTTGG 3070 hom 80 het 30 0 26 4 T 0 1 199864 CASAVA_Build 4 6636007 12D AGTCTCTGGC TGGGAGTCCATT/------------ TGCCCTGCTA 3070 het 3070 hom 52 23 26 6 TGGGAGTCCATT 1 0 199865 CASAVA_Build 4 6666455 3D GAAGGAAGGA AGG/--- AAAAAAGAGG 1378 het 46 hom 36 1 12 24 AGG 1 0 199866 CASAVA_Build 4 6682512 1I CTTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 1123 het 1123 ref 31 12 3 16 A 17 18 199867 CASAVA_Build 4 6685253 1I TTATACCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2970 hom 29 11 11 7 T 10 11 199868 CASAVA_Build 4 6692218 1D CTGCCTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 10 3 A 12 11 199869 CASAVA_Build 4 6700848 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1319 hom 24 6 14 4 T 12 11 199870 CASAVA_Build 4 6702027 2I GAGTTGGAAG --/CA CCTCTCCATG 3070 hom 81 het 33 0 24 9 CA 0 1 199871 CASAVA_Build 4 6702199 1D TACTTTATTT A/- TTTTTTCTTT 3070 het 2551 hom 21 6 13 2 A 1 0 199872 CASAVA_Build 4 6703849 1D TTGAATTTAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 1496 hom 26 4 17 5 A 8 7 199873 CASAVA_Build 4 6715027 1I ACACGATGCG -/C CCCAGACCCT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 C 3 4 199874 CASAVA_Build 4 6717688 4D GTCATGGTCA CACT/---- CACACATACG 3070 het 3070 hom 79 38 36 8 CACT 1 0 199875 CASAVA_Build 4 6717874 2I25M3D CATGTATGCA --CATGCACACTCACACTCATCCACACCCA/CTCATGCACACTCACACTCATCCACAC--- CAATACATGC 3070 het 3070 ref 83 52 49 10 N/A 0 0 199876 CASAVA_Build 4 6718287 1D TCCGCGGTGC T/- TTTTTTTTTT 1287 het 299 hom 14 3 5 6 T 15 14 199877 CASAVA_Build 4 6720506 1D TTCAGTGATC T/- TTTTTTTTTT 2079 hom 14 het 24 0 7 17 T 17 16 199878 CASAVA_Build 4 6722995 16I TGGCTCAGCA ----------------/GGAGTTGCACAGGAGT GCACAGGAGT 3070 het 3070 hom 49 19 20 11 GGAGTTGCACAGGAGT 0 1 199879 CASAVA_Build 4 6726550 1D GCATGCGTGC G/- GGGGGGTACG 3070 hom 51 het 18 0 14 4 G 7 6 199880 CASAVA_Build 4 6730693 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGA 2952 het 1729 hom 15 7 8 0 T 8 9 199881 CASAVA_Build 4 6732713 3I CCTGTCAGTC ---/TTA TTATTTGTTC 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 TTA 1 2 199882 CASAVA_Build 4 6735120 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1089 het 845 hom 15 3 7 7 A 14 13 199883 CASAVA_Build 4 6739508 3I GGCCTTGAGT ---/GAG GAGAAGGCAG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 GAG 1 2 199884 CASAVA_Build 4 6744639 4D GACTCCATCG CAAA/---- CAAACAAACA 2573 het 2573 ref 20 8 7 5 CAAA 6 5 199885 CASAVA_Build 4 6749402 10I GCCCTGGCCC ----------/TGAGCCTGAA TGACAGCAAA 3070 hom 126 het 45 0 40 5 TGAGCCTGAA 0 1 199886 CASAVA_Build 4 6750169 4I ATACTTCTAA ----/TATT TATTTATTTA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TATT 3 4 199887 CASAVA_Build 4 6751388 2D CACTGCAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 29 1 15 13 T 14 12 199888 CASAVA_Build 4 6757485 1D TGAATACATG A/- AATAGCTTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 2 199889 CASAVA_Build 4 6759939 2I GCTCTGAATT --/CA CACACTTCCC 3070 hom 106 het 44 0 36 8 CA 2 3 199890 CASAVA_Build 4 6760589 1D CCATTCTCTG A/- TGCCCCTATA 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 A 1 0 199891 CASAVA_Build 4 6761478 1D TGCGTTCTCA G/- CCTGCGTTCC 3070 hom 102 het 37 0 34 4 G 1 0 199892 CASAVA_Build 4 6769994 4D CAATCCTAAT AGTC/---- AGTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 27 10 12 7 AGTC 1 0 199893 CASAVA_Build 4 6777147 1I AGTGCAGAGA -/G GCCATGTGGG 3070 hom 96 het 35 0 29 6 G 1 2 199894 CASAVA_Build 4 6778976 2D CACAACGTAC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 60 21 23 16 CA 10 9 199895 CASAVA_Build 4 6794724 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2774 hom 30 het 16 0 8 8 A 15 14 199896 CASAVA_Build 4 6803997 1D AAATTATATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 9 199897 CASAVA_Build 4 6812272 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1002 het 383 hom 12 1 7 4 T 15 14 199898 CASAVA_Build 4 6820886 1I TTTCCGCCCC -/T GGCCTCGTCT 2551 het 2551 ref 22 9 6 7 T 0 1 199899 CASAVA_Build 4 6841596 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 10 11 199900 CASAVA_Build 4 6846267 1D GTGCTTTCTT A/- AAAAGTGGTC 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 5 4 199901 CASAVA_Build 4 6854306 1D GACGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1460 het 1460 ref 42 29 5 9 A 12 11 199902 CASAVA_Build 4 6862273 2D AATTATATCC CT/-- GTTTGCCAAT 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 CT 1 0 199903 CASAVA_Build 4 6867674 1I AGGGAACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 863 hom 26 2 19 5 A 11 12 199904 CASAVA_Build 4 6898729 2I CATTTTATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 22 0 18 4 A 11 13 199905 CASAVA_Build 4 6900491 1I TTTCCCCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 32 1 28 3 A 11 12 199906 CASAVA_Build 4 6908740 1I TTCTTGCTAC -/T TCAAACTGTG 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 1 2 199907 CASAVA_Build 4 6927493 2I AGTTCAGCAT --/CA CACCTTTTCC 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 CA 1 2 199908 CASAVA_Build 4 6932453 2D ATCTGCAGTG CC/-- CCCCCTCACC 3070 het 1443 hom 43 6 29 10 C 7 5 199909 CASAVA_Build 4 6940498 1D ATAAGGAAAC G/- CAGCTTCTTG 3070 het 3070 ref 36 24 11 1 G 1 0 199910 CASAVA_Build 4 6946012 2I AAATCATGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 10 12 199911 CASAVA_Build 4 6954226 4D TGGATGTGTT TCTG/---- TCTACTGTGT 3070 het 3070 ref 42 24 9 10 TCTG 1 0 199912 CASAVA_Build 4 6976887 5D41M9D AGAAGCCCGG AATCCTGTGGGATTGTGAGAACTGGTCTGTTGGGGATTCTGTTCTTCGGTGTCCC/-----GGTGGGATTGTGAGAACTGGTCTGTTGGGGATTCTGTTCTT--------- TGGCTCATTT 3070 hom 102 het 23 0 35 5 N/A 0 0 199913 CASAVA_Build 4 6985005 1D TCTGGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 158 hom 31 1 15 16 A 15 14 199914 CASAVA_Build 4 6988277 1D GTGAGTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 25 1 13 11 T 13 12 199915 CASAVA_Build 4 6990118 1D GGGGCACAAA C/- CCTGGGGTTG 3070 hom 132 het 46 0 44 3 C 3 2 199916 CASAVA_Build 4 6994271 1D CACATCTGTT C/- CTGTGACTTG 3070 hom 144 het 50 0 49 1 C 2 1 199917 CASAVA_Build 4 6996657 1I GCGTTCTGCC -/G GGGGGTTTGG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 G 5 6 199918 CASAVA_Build 4 6996950 1D CTTTGTAGGA T/- TTCATCCTGT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 3 2 199919 CASAVA_Build 4 7003218 1I CTTTATTAGA -/T TAAGGAAGTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 1 2 199920 CASAVA_Build 4 7004310 1I CCAATAAATA -/T ATTTGTCGAA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 0 1 199921 CASAVA_Build 4 7007236 4I GTTTTTAAGG ----/ACTA ACTGTTTTTT 3070 hom 73 het 28 0 24 4 ACTA 0 1 199922 CASAVA_Build 4 7010903 1I TCACCTGCTT -/C CATACTGGGG 3070 hom 81 het 32 0 26 6 C 1 2 199923 CASAVA_Build 4 7013839 1I CTGGCTTACA -/G GGTAGGCTCT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 G 2 3 199924 CASAVA_Build 4 7016779 1D ACAGACTAAT A/- ATAGTGTTAG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 A 2 1 199925 CASAVA_Build 4 7017800 2D TTTTTTTTTT TG/-- GCGATAGAGT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 TG 1 0 199926 CASAVA_Build 4 7021122 1I CCAAAGAAGC -/A ACTGAGACAC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 1 2 199927 CASAVA_Build 4 7038344 4I CCTAGATAAT ----/TAAA TAATCTTTAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAAA 0 1 199928 CASAVA_Build 4 7062428 3D CAGCGGCAGC AGT/--- AGTAGTATCA 2374 het 2374 ref 34 14 10 12 AGT 3 2 199929 CASAVA_Build 4 7072651 1I GAACCCCGCT -/G GGGCTCAGGT 3070 het 217 hom 34 1 19 14 G 3 4 199930 CASAVA_Build 4 7074287 1D TTGAAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 24 0 15 9 T 14 13 199931 CASAVA_Build 4 7078783 1D TTGATTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 778 hom 29 2 20 7 T 13 12 199932 CASAVA_Build 4 7079919 1D ACATATGTCA C/- CCCCCCCACA 3070 hom 88 het 34 0 28 7 C 8 7 199933 CASAVA_Build 4 7080249 2D43M4D CAGTCACATC CACACACAATCACCCCACACACATCACACACCCCCACAATCACCCCACA/--CACACAATCACCCCACACACATCACACACCCCCACAATCACCC---- CAATCACACA 3070 het 337 hom 30 5 30 9 N/A 0 0 199934 CASAVA_Build 4 7086858 1D AAAAAAAAAA T/- ATGAGACGCA 2536 het 140 hom 31 2 16 13 T 1 0 199935 CASAVA_Build 4 7088520 3D GCTGTGTCTT CTC/--- CTAGACAGAT 3070 hom 87 het 31 0 29 3 CTC 1 0 199936 CASAVA_Build 4 7101717 1D CTGTGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 18 9 T 12 11 199937 CASAVA_Build 4 7110527 1D AAAACAGCAA C/- CCTGCCTACC 3070 hom 108 het 39 0 35 4 C 3 2 199938 CASAVA_Build 4 7111176 1D CCAGGCCGAC T/- TTTCAGATGC 3070 hom 102 het 36 0 34 2 T 4 3 199939 CASAVA_Build 4 7114905 1I AACAGCTGGA -/C CCCCCCACCC 3070 hom 62 het 27 0 21 6 C 6 7 199940 CASAVA_Build 4 7119889 1I ATTTGAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 30 0 21 9 A 11 12 199941 CASAVA_Build 4 7121590 16I CAAGAACAGA ----------------/GGTGCTGGGAGAGCAG GGGCCGCGTG 3070 hom 54 het 22 0 17 5 GGTGCTGGGAGAGCAG 0 1 199942 CASAVA_Build 4 7122037 2I AAACCCCAAA --/TG TGGGATGTTG 3070 hom 126 het 47 0 41 6 TG 1 2 199943 CASAVA_Build 4 7122312 1I AAACTGGGAG -/T TATCGATACT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 2 199944 CASAVA_Build 4 7126617 1D CCATGAGACT G/- GGGGGGGTCC 3070 hom 81 het 32 0 21 11 G 8 7 199945 CASAVA_Build 4 7136512 1D CAGATTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3057 het 19 hom 25 1 12 12 T 19 18 199946 CASAVA_Build 4 7154743 1D ACGGCTTGGA C/- CAGCAGCAGC 3070 hom 37 het 20 0 14 6 C 2 1 199947 CASAVA_Build 4 7158248 1D CTGACTCTGC A/- AAAGAGTTCA 3070 hom 119 het 47 0 36 11 A 4 3 199948 CASAVA_Build 4 7166074 1I AGAGACTCAA -/T TTTTTTTTTT 1762 het 1762 ref 20 8 5 7 T 15 16 199949 CASAVA_Build 4 7178804 1D GAATTTTCAG T/- TTCTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 3 2 199950 CASAVA_Build 4 7183283 4D CATATCTGTG TGTC/---- TGTCAGTGTG 3070 hom 120 het 44 0 37 10 TGTC 2 1 199951 CASAVA_Build 4 7183960 2I TGTGAATGTG --/GT GTGTTGTGTG 3070 hom 54 het 40 1 25 14 GT 2 3 199952 CASAVA_Build 4 7184130 1D TGTGTGAATA G/- TGAGTGTGTT 3070 hom 141 het 71 0 58 14 G 1 0 199953 CASAVA_Build 4 7187405 3D CCTGTCTCTG CAT/--- CCTCCCTCCC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 CAT 1 0 199954 CASAVA_Build 4 7189754 1D ATGCTAGGTG T/- TGGAGGGGCT 3070 het 3070 hom 42 17 16 10 T 2 1 199955 CASAVA_Build 4 7207913 2D TACGTAGGAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 56 24 22 12 AC 7 6 199956 CASAVA_Build 4 7208030 4D CACACGTGTG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 72 34 23 15 CA 11 9 199957 CASAVA_Build 4 7222870 2I TTCACATGGT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 AG 8 9 199958 CASAVA_Build 4 7237313 1I AAAAAAAAAA -/T AAATACTTAT 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 T 0 1 199959 CASAVA_Build 4 7259294 1D TGACTCATGG T/- CGTGGCTGTG 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 1 0 199960 CASAVA_Build 4 7276501 1I7M14D GTTAAGTGGC -TGTTAAGTGCTGTTAAGGCCC/ATGTGAAG-------------- AGAGTCAGTC 3070 het 3070 ref 33 23 12 4 N/A 0 0 199961 CASAVA_Build 4 7300965 1I AGGTCACCGT -/G GGGGGGGCCC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 G 7 8 199962 CASAVA_Build 4 7330290 1D CACTCCCTCC G/- GACTCTGAGC 3070 hom 75 het 27 0 24 4 G 2 1 199963 CASAVA_Build 4 7368160 1I GAGTAGCCCA -/G GGGTCTGGGG 3070 hom 100 het 38 0 31 7 G 3 4 199964 CASAVA_Build 4 7375600 1I GGCCCTGCCC -/T GTTTTTTATC 3070 hom 99 het 35 0 31 4 T 0 1 199965 CASAVA_Build 4 7407649 1I ACATACACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 9 10 199966 CASAVA_Build 4 7411942 1I GCAAATAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 2553 hom 22 8 10 4 A 8 9 199967 CASAVA_Build 4 7415549 30D TCATCATCAC CATCACCATCATTACTACCAACATCACCAT/------------------------------ CACCACCATC 3070 het 3070 ref 73 58 26 5 CATCACCATCATTACTACCAACATCACCAT 1 0 199968 CASAVA_Build 4 7419103 3D GCGTGCCCCT CCC/--- CCCCTCTCTC 3070 hom 67 het 24 0 19 5 C 7 4 199969 CASAVA_Build 4 7429985 1I GGGCTGTGAC -/A GGGGGGGACA 3070 hom 99 het 40 0 32 8 A 0 1 199970 CASAVA_Build 4 7431027 2D ACAGTTCCAC AT/-- GGCTGGGGAG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AT 1 0 199971 CASAVA_Build 4 7439361 2D ATACATACAC AT/-- ATGCACACAC 2298 het 2298 ref 56 38 5 13 AT 2 1 199972 CASAVA_Build 4 7439731 2D ACACATGCAC AT/-- ACATACACAT 1812 het 1812 ref 19 12 5 3 AT 1 0 199973 CASAVA_Build 4 7440183 2D GCACATACAC AT/-- ATGTACACAC 3070 hom 17 het 73 1 52 20 AT 2 1 199974 CASAVA_Build 4 7445527 1D CCTCCCAGTC G/- GGGGGGGGGG 3070 het 233 hom 24 5 12 7 G 13 12 199975 CASAVA_Build 4 7447198 1I TGTGCAAAGG -/C CCCCAAATGC 3070 hom 47 het 19 0 14 5 C 4 5 199976 CASAVA_Build 4 7451688 1I TTTAATTTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 T 9 10 199977 CASAVA_Build 4 7458821 1D TGACCTGTCG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 54 22 20 13 T 9 8 199978 CASAVA_Build 4 7460571 1D GAATAGAAAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 8 7 199979 CASAVA_Build 4 7461015 2I TGGATGACAG --/TT TTTTTTTTTT 3028 het 3028 ref 28 11 8 9 T 10 12 199980 CASAVA_Build 4 7461609 1D TCTGAATTGC T/- TTTCTGTGTT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 4 3 199981 CASAVA_Build 4 7469354 2I ACACACTCAG --/AC ACACACACGC 3070 hom 235 het 87 0 78 9 AC 4 5 199982 CASAVA_Build 4 7471341 1I CCCCCCCCCC -/A CACCAGATTT 2632 het 494 hom 21 3 9 9 A 0 1 199983 CASAVA_Build 4 7472330 1I GATTGGCAAG -/C CCGTCTCAGA 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 C 2 3 199984 CASAVA_Build 4 7478919 28D CGGGGCTGGT GGCTTTGAGCCAGGGGAGGCCCGAGGAC/---------------------------- GGCTTTGCTG 2201 het 2201 ref 16 7 8 5 GGCTTTGAGCCAGGGGAGGCCCGAGGAC 1 0 199985 CASAVA_Build 4 7482891 1D ATTATTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 18 12 A 12 11 199986 CASAVA_Build 4 7487457 1I AGGTGGGGCT -/G GCCCTGGTGG 2576 hom 47 het 17 0 12 5 G 1 2 199987 CASAVA_Build 4 7501115 5D CTTCCATGTC TCCCT/----- TCCTTTCCTT 3070 hom 74 het 30 0 25 6 TCCCT 1 0 199988 CASAVA_Build 4 7512727 3I CCAGCAGTCC ---/CCA CTCCCCCTGC 3070 hom 65 het 26 0 18 8 CCA 0 1 199989 CASAVA_Build 4 7513807 1I AAATTATTCA -/T TCATTTCCTG 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 T 1 2 199990 CASAVA_Build 4 7523589 1D TAGTGACAAG A/- AGGTGCCATG 3070 het 3070 ref 53 28 20 5 A 2 1 199991 CASAVA_Build 4 7531961 1I CTCTCCACGT -/G GCCGCCCTGA 3017 het 3017 ref 40 22 11 7 G 1 2 199992 CASAVA_Build 4 7537602 9I CTGCTGTCCC ---------/TGCTGCCCA GGCCCTCCCC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TGCTGCCCA 0 1 199993 CASAVA_Build 4 7542372 1D AGACGGAGTC T/- GTGTTTTGGA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 0 199994 CASAVA_Build 4 7543150 1D GCCAGGGAGG T/- GGGGCTGCCT 3070 hom 51 het 18 0 16 2 T 1 0 199995 CASAVA_Build 4 7547417 1D AGTGGTTGGC G/- GTAAGGGGTG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 2 1 199996 CASAVA_Build 4 7551784 2I AGCACGAGTA --/TG TGTGCATGTG 3070 hom 144 het 57 0 48 9 TG 2 3 199997 CASAVA_Build 4 7552319 1I GCCATGCCCC -/A GGGAGACCCT 2834 het 2834 ref 20 9 9 2 A 0 1 199998 CASAVA_Build 4 7552390 1I TGGAGAGAAA -/G CCCCACAAGT 3070 hom 60 het 24 0 18 6 G 0 1 199999 CASAVA_Build 4 7552946 1I CTTCCTTACT -/C CCAGGCATGC 3070 hom 72 het 25 0 24 1 C 2 3 200000 CASAVA_Build 4 7553974 2D AGTGAAAAAC AG/-- AAGCAGCACA 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 AG 1 0 200001 CASAVA_Build 4 7554149 2I CGCTGGTAAC --/TG AGAATGGGCC 3070 hom 122 het 44 0 39 5 TG 0 1 200002 CASAVA_Build 4 7555422 1D AGCAGGGAAG C/- CGGCCTTGCC 3070 het 3070 hom 38 15 14 11 C 2 1 200003 CASAVA_Build 4 7560381 1I CAATGGGGGG -/A AAAAGTTAAG 3070 hom 80 het 31 0 26 5 A 4 5 200004 CASAVA_Build 4 7560629 4I GCAAAAACAC ----/TATA TACAAAAATC 3070 hom 66 het 28 0 22 6 TA 1 3 200005 CASAVA_Build 4 7560920 1I CTAGCACCCA -/G TCACCTCTTT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 G 0 1 200006 CASAVA_Build 4 7564007 2I AGGTACACAC --/AA AAAAAGCCAG 3070 hom 49 het 21 0 14 7 A 5 7 200007 CASAVA_Build 4 7565727 1D GACCCAGGTA C/- CCCTGCCTCA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 C 4 3 200008 CASAVA_Build 4 7581030 1I AGCTGCTACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 548 hom 23 2 20 1 T 11 12 200009 CASAVA_Build 4 7589461 1I CTCAGATGTG -/T GGGGGGGGGG 293 het 29 hom 20 0 4 16 T 0 1 200010 CASAVA_Build 4 7597771 1D GAGGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1147 hom 31 5 14 12 A 15 14 200011 CASAVA_Build 4 7603913 3D GTTCCATGGG TCT/--- TCTTCTTCCA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 TCT 3 2 200012 CASAVA_Build 4 7606738 1D AATCATACGG A/- AAGGCCATAA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 3 2 200013 CASAVA_Build 4 7614209 12D CAATCCATCT ATCCATTCATCC/------------ ATCTATCCAT 3070 het 3070 ref 69 38 29 13 ATCCATTCATCC 1 0 200014 CASAVA_Build 4 7618243 3D TGATGATATA ATG/--- ATGATAATGA 3070 het 3070 ref 73 41 26 11 ATG 2 1 200015 CASAVA_Build 4 7618605 3D11M21D GTGATGATGG TGATGATAATGGTAATGGTGATGATGGTGATAATG/---TGATAATGGTA--------------------- ATGGTGATGA 3070 het 3070 hom 68 26 37 30 N/A 0 0 200016 CASAVA_Build 4 7633784 1I AATTTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 11 12 200017 CASAVA_Build 4 7635648 3D TTGTTGAAAT GAA/--- GAAAATTGGG 3070 hom 32 het 14 0 11 5 GAA 2 1 200018 CASAVA_Build 4 7642023 4D ACCCGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 387 hom 17 het 21 0 6 15 TTTG 4 3 200019 CASAVA_Build 4 7653940 1D TTAAACCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 11 10 200020 CASAVA_Build 4 7668398 1D CTCATCACTT A/- ACAGTAGACA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 2 1 200021 CASAVA_Build 4 7671465 2D ATGTGCGCAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 2526 hom 27 10 14 5 AC 10 9 200022 CASAVA_Build 4 7688854 12D TCCAAAGGGA GACTTCCTTTGG/------------ GACTTGCTTT 3070 het 3070 hom 43 19 19 9 GACTTCCTTTGG 1 0 200023 CASAVA_Build 4 7692052 2D TGTGTGTGTG TA/-- TGCACACTTG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 TA 1 0 200024 CASAVA_Build 4 7692156 1I TGTGGGATGT -/G GGGGGGGTGT 3070 het 1110 hom 48 7 18 23 G 7 8 200025 CASAVA_Build 4 7692175 2D TTAGTGTGAA TG/-- TGTGTGACTG 3070 het 1345 hom 42 4 20 18 TG 4 3 200026 CASAVA_Build 4 7692547 4D12M2D GGTGTGTGTG TGTTTGTGAGAATATGTC/----TGTGAGAATATG-- TGTGTTTGTG 3070 het 1560 hom 52 7 32 19 N/A 0 0 200027 CASAVA_Build 4 7692678 4D GTGTGAGAGT GTGA/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 60 29 24 12 GTGA 1 0 200028 CASAVA_Build 4 7692821 2I GCCTATGTGA --/GT GTGTGAGTGT 3070 hom 188 het 77 0 60 17 GT 2 3 200029 CASAVA_Build 4 7693136 4I TATGTGAGAG ----/TGTT TGTGTGAGTG 3070 het 3070 ref 56 28 13 15 TGTT 0 1 200030 CASAVA_Build 4 7710020 4D GATGAGTAAA TAAC/---- TGAGTGTGTG 3070 het 3070 ref 54 29 21 9 TAAC 1 0 200031 CASAVA_Build 4 7723798 1D AACAACCATC A/- AAAAATAAGA 3070 het 3070 hom 48 15 29 6 A 6 5 200032 CASAVA_Build 4 7731757 1D CACATCCAGG A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 A 7 6 200033 CASAVA_Build 4 7737379 1D AACAGAAGAC A/- ATTCCCTGTC 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 A 2 1 200034 CASAVA_Build 4 7741338 1I TCCCTGACTT -/G GGGGAAATTA 3070 hom 138 het 52 0 46 6 G 4 5 200035 CASAVA_Build 4 7745794 20D CTGAAGGATA CCTCATCTTCACCCTTTCTT/-------------------- CCTCATCTTC 3070 hom 40 het 26 0 14 17 CCTCATCTTCACCCTTTCTT 2 1 200036 CASAVA_Build 4 7751481 1I CTCCTGTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 140 hom 32 1 23 8 T 9 10 200037 CASAVA_Build 4 7757657 1I ATTCCTGTTT -/C CCCGGAACCA 3070 hom 71 het 30 0 23 7 C 3 4 200038 CASAVA_Build 4 7777222 3I GTGGTGTTGG ---/TGA TGATGGTGGT 3070 het 3070 ref 87 16 19 52 TGA 1 2 200039 CASAVA_Build 4 7780055 3D CTGAAGGAGA CCC/--- CCCCCCCCCT 2420 het 384 hom 27 6 11 12 C 12 9 200040 CASAVA_Build 4 7788170 1D GAGCTGAACT G/- GAGAATCTGG 3015 het 3015 ref 21 11 8 3 G 2 1 200041 CASAVA_Build 4 7799136 1I CCCAGCGGAC -/G GGCCTGCTGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 G 2 3 200042 CASAVA_Build 4 7804181 4D AGGGCTCAGG AAGC/---- TTCTAATCAT 3070 het 3070 ref 41 18 16 9 AAGC 1 0 200043 CASAVA_Build 4 7808850 1I CGGCACCCGT -/G GCTTTCCACA 1324 het 1324 ref 24 10 5 9 G 1 2 200044 CASAVA_Build 4 7817166 1I TTAAAAATGC -/T TTAAAATGGT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 2 3 200045 CASAVA_Build 4 7836707 2I GAGAGCCTGC --/TT CACAGGCTGG 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 0 2 200046 CASAVA_Build 4 7849699 3I AAATAATAAT ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 TAA 4 5 200047 CASAVA_Build 4 7854684 4I AGACAAAAAA ----/AAAG AGAGAGGTAT 2809 het 2809 ref 29 14 8 7 AAAG 0 1 200048 CASAVA_Build 4 7854893 2D AGGGAGTGAC AG/-- AGAAAGGAGG 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 AG 2 1 200049 CASAVA_Build 4 7857102 10I GTGGCAAGAG ----------/TGCATGAGGA GATCATGCTA 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 TGCATGAGGA 0 1 200050 CASAVA_Build 4 7861115 25D TGTTGTGGTC ACCAAAAGGTAGCTGCTCAAAGATG/------------------------- ACCAAAAGGT 3066 het 3066 ref 44 25 11 15 ACCAAAAGGTAGCTGCTCAAAGATG 2 1 200051 CASAVA_Build 4 7868599 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 T 11 10 200052 CASAVA_Build 4 7874717 2D AAGGTGTTTA TT/-- AAGTCTCCAA 3070 het 3070 ref 52 30 16 7 T 2 0 200053 CASAVA_Build 4 7882733 1D GTTTAGGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 24 7 A 11 10 200054 CASAVA_Build 4 7882929 1I CTGGCAGAGT -/C TGGTGATGCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 C 0 1 200055 CASAVA_Build 4 7885298 1I TTCATATGTT -/A AAAAAAAAAA 2874 het 2874 ref 31 12 11 8 A 13 14 200056 CASAVA_Build 4 7889535 1I AAGCTGTTAT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 7 8 200057 CASAVA_Build 4 7892006 4I CAACACACAC ----/ACAT AAATATATAT 1974 het 1974 ref 15 7 5 3 ACAT 0 1 200058 CASAVA_Build 4 7898511 1D GCACAGGGGT G/- GGGGGGGCAA 3070 het 2558 hom 34 9 13 13 G 8 7 200059 CASAVA_Build 4 7900422 2I GGGGTACTCG --/GT GGGTGGGGCA 3070 hom 51 het 32 0 18 14 GT 0 1 200060 CASAVA_Build 4 7903648 2I CCATTGTAAT --/GG TTCTGCTGTT 3070 hom 178 het 65 0 58 7 G 0 2 200061 CASAVA_Build 4 7907354 1D CTTTCTTTTT A/- AAAAAAGCAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 6 200062 CASAVA_Build 4 7918833 1D AGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 2227 het 1446 hom 11 5 6 0 T 9 8 200063 CASAVA_Build 4 7920397 18D GTGCCAGGAA CCCAGTAAGTGCTTGTTT/------------------ CCCTCTGTGC 3070 het 3070 ref 39 22 19 8 CCCAGTAAGTGCTTGTTT 1 0 200064 CASAVA_Build 4 7922475 2D AGGATAAATG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 78 het 37 0 26 11 AC 8 7 200065 CASAVA_Build 4 7935024 1D AACCAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 19 18 12 T 13 12 200066 CASAVA_Build 4 7937138 1D TACTAACATA T/- TTAAATTCCC 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 3 2 200067 CASAVA_Build 4 7940370 1D ACACAAAGGA G/- GAATTTGTCT 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 G 2 1 200068 CASAVA_Build 4 7942332 3I TTTTTTTTTT ---/AAA AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 37 13 11 13 A 7 10 200069 CASAVA_Build 4 7950163 1I GTTTTTGTGG -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 7 8 200070 CASAVA_Build 4 7952964 27D3M12D GTGCGCATCT AGCACATTTAGCATTTAGCACATTTAGCTGCGCATTTAGCAC/---------------------------CTG------------ AGCTAAAATG 3070 het 3070 ref 54 33 27 5 N/A 0 0 200071 CASAVA_Build 4 7961551 4D60M6D GAAGTGAAAC CAAACAAACAAAGCTCCAACTTCTAGAGGCAACGGTCCAATTATAAAATCCTCTGGCTACATTCAATTGA/----CAAACAAAGCTCCAACTTCTAGAGGCAACGGTCCAATTATAAAATCCTCTGGCTACATTC------ AATTCAAGGT 3070 het 3070 hom 34 14 28 15 N/A 0 0 200072 CASAVA_Build 4 7967895 31I TTTTTTGTCT -------------------------------/TTTTGATAATACCCAAACAGGTGAGATGGTA TCTCACTGTG 2279 het 2279 ref 21 12 6 3 TTTTGATAATACCCAAACAGGTGAGATGGTA 0 1 200073 CASAVA_Build 4 7968115 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 1426 het 1426 ref 38 22 8 8 AG 1 0 200074 CASAVA_Build 4 7968448 4D CTAAGTACAA CTTT/---- CTTTCTCACT 2226 het 2226 ref 18 10 7 1 CTTT 2 1 200075 CASAVA_Build 4 7968645 2D GGCCTCCTCA CT/-- TACGCAATCA 1888 het 1888 ref 25 17 7 1 CT 1 0 200076 CASAVA_Build 4 7974114 1D ACCTGGCCAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 27 0 24 3 T 9 8 200077 CASAVA_Build 4 7975758 5D CTATTATAAG AAGAC/----- AAGACTCAAT 3070 het 3070 ref 47 24 19 8 AAGAC 2 1 200078 CASAVA_Build 4 7982987 30D CATGATTAAG TCATTGGCCACCGGTGGCTAGCTCAATCTC/------------------------------ TCATTGGCCA 3070 hom 50 het 23 0 17 12 TCATTGGCCACCGGTGGCTAGCTCAATCTC 2 1 200079 CASAVA_Build 4 7984860 1I AAAACTTCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 9 10 200080 CASAVA_Build 4 7998561 1I ATTGCGTTAG -/T TATCGATAAT 3070 hom 42 het 22 0 14 8 T 1 2 200081 CASAVA_Build 4 8001637 2I GCTCCATAGT --/AC ACACTCCATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AC 2 3 200082 CASAVA_Build 4 8007480 1I ATTGATGTTT -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 A 7 8 200083 CASAVA_Build 4 8029498 4D31M2I GTATACATAC ATAAACATACACACACGCATATACACACATACATG--/----ACATACACACACGCATATACACACATACATGTA TACACACACA 3070 het 3070 hom 68 19 35 38 N/A 0 0 200084 CASAVA_Build 4 8031352 1I AACCATTTTA -/C CAAAGGTCAG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 C 1 2 200085 CASAVA_Build 4 8034534 1D CTTCCTATCT G/- GGGACACAGC 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 G 4 3 200086 CASAVA_Build 4 8043901 1D CCTTCCCAGA G/- GATGCACAGC 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 G 2 1 200087 CASAVA_Build 4 8044029 1I TTGGCTTGGT -/C CGGACTGTGA 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 C 1 2 200088 CASAVA_Build 4 8044162 2D TTTGCACGTC TT/-- TTGGTGTCGT 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 T 4 2 200089 CASAVA_Build 4 8072682 1D GGTTTTAAAG A/- AATCTCAGTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 3 2 200090 CASAVA_Build 4 8083964 7D TGTCAGGCAG ACCCTGC/------- ACCTCATCTG 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 ACCCTGC 1 0 200091 CASAVA_Build 4 8089968 2D CACATGCAGG CA/-- CACACACACA 829 het 829 ref 73 60 3 11 CA 6 5 200092 CASAVA_Build 4 8094539 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 28 0 21 7 A 10 11 200093 CASAVA_Build 4 8104012 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1832 hom 17 het 10 0 7 3 A 10 11 200094 CASAVA_Build 4 8113849 1I GCCCAGACCC -/A GGGGGTGCCC 2348 het 1766 hom 22 10 8 4 A 0 1 200095 CASAVA_Build 4 8127877 7D CTATGGAGAC AGAAAGT/------- AGAAAGTAGA 3070 het 3070 hom 32 10 13 10 AGAAAGT 2 1 200096 CASAVA_Build 4 8137241 1I GCCTCTTCAT -/C CCCTCACTCT 3070 het 1428 hom 26 5 12 9 C 3 4 200097 CASAVA_Build 4 8138912 2D TGAAAACCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2802 hom 29 het 16 0 10 6 A 18 16 200098 CASAVA_Build 4 8143424 1D ACTCATGCTA T/- TTGCCAATAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 2 200099 CASAVA_Build 4 8143908 1D ATATATATAA T/- TATATATAAT 1446 hom 7 het 5 0 3 2 T 2 1 200100 CASAVA_Build 4 8167428 1I GCAGCCACCG -/C CCCCGTCCCC 3070 hom 41 het 17 0 13 4 C 4 5 200101 CASAVA_Build 4 8169445 1D AAACAGCTCC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 A 8 7 200102 CASAVA_Build 4 8199476 2I TTTTTTAAAT --/TC TGTTTTAATT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 TC 0 1 200103 CASAVA_Build 4 8201231 18I AAGCACATCG ------------------/CAGTGCAGGGCCCCAGCA CGGTGCTGGG 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 CAGTGCAGGGCCCCAGCA 0 1 200104 CASAVA_Build 4 8213995 1D CTATCTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 27 0 18 9 A 11 10 200105 CASAVA_Build 4 8233364 2I5M2I ATGTATGTGT --ATGCA--/ACATGCATC TGTGTGCATG 3070 het 3070 hom 68 18 25 27 N/A 0 0 200106 CASAVA_Build 4 8233390 14D GTGTGTATAT ATGTGAATGCACCC/-------------- GCATGTATGT 3070 het 1902 hom 68 12 18 54 ATGTGAATGCACCC 1 0 200107 CASAVA_Build 4 8233443 8I CACATGTGTG --------/TATGTGTC TATGTGTATA 3070 hom 214 het 78 0 72 7 TATGTGTC 0 1 200108 CASAVA_Build 4 8234353 5I GGGTGAGACT -----/GGTCA GGTTCTCCTC 3070 hom 77 het 30 0 21 9 GGTCA 0 1 200109 CASAVA_Build 4 8237079 1D TGAGCATGGC T/- CACTGCAGCC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 1 0 200110 CASAVA_Build 4 8243553 1D ACAGGCGTAA T/- CCACTGCGCC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 1 0 200111 CASAVA_Build 4 8250358 1I CAGCGAGGGG -/A CATGCCTAGG 1573 hom 29 het 13 0 6 7 A 0 1 200112 CASAVA_Build 4 8264153 1D TTCTCCCCTT C/- TACTCCTCAT 1558 het 380 hom 10 1 5 4 C 1 0 200113 CASAVA_Build 4 8266516 1D TCATCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 1439 het 489 hom 21 5 6 10 A 15 14 200114 CASAVA_Build 4 8268565 2I GTGGTCAGGC --/CG CGTGGGCTGC 3070 hom 65 het 26 0 16 10 CG 1 2 200115 CASAVA_Build 4 8275315 3I TGTTGTTGTT ---/GTC GTTGTTGTTT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 GTC 0 1 200116 CASAVA_Build 4 8276673 4I CACAAGTATA ----/CACG CACACACACA 3070 hom 210 het 74 0 68 6 CACG 0 1 200117 CASAVA_Build 4 8292058 2I CAGGCACATG --/CA CACACACACG 3070 het 3070 ref 85 36 28 21 CA 4 5 200118 CASAVA_Build 4 8303211 1D TACTGTTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 20 23 10 T 11 10 200119 CASAVA_Build 4 8306351 1I AGTTATTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1742 hom 22 6 13 3 T 9 10 200120 CASAVA_Build 4 8306951 4D TGGCTCAATC CATT/---- CATTCCTGCT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 CATT 2 1 200121 CASAVA_Build 4 8316426 18D GAACAGAGAC ACGCAGAGAGATATAGAG/------------------ ACGCAGAGAG 3070 het 3070 ref 49 21 12 20 ACGCAGAGAGATATAGAG 2 1 200122 CASAVA_Build 4 8323855 1D GGCTTCCTCA T/- TTTTTCTGCG 2625 het 2625 ref 33 13 7 13 T 6 5 200123 CASAVA_Build 4 8324371 1D GCCGAACGCT G/- CCTGTAGCCT 3070 het 3070 hom 48 19 22 8 G 1 0 200124 CASAVA_Build 4 8325031 2D CCGTGAGCGT GG/-- GGGGTCATGG 3070 hom 64 het 32 0 17 16 G 6 4 200125 CASAVA_Build 4 8330091 1D AGGGACTAGC T/- TTGGGAAGGG 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 3 2 200126 CASAVA_Build 4 8351147 1I ATGAAGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 11 12 200127 CASAVA_Build 4 8353793 2I TTGACTCACA --/CT CTTTATTATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CT 1 2 200128 CASAVA_Build 4 8367829 1D CTTTCCCTGG T/- CCTTCAGCAG 3070 hom 120 het 43 0 38 6 T 1 0 200129 CASAVA_Build 4 8374703 1I AGTTGATCTC -/T TCTTTTTATT 3070 hom 68 het 25 0 23 2 T 1 2 200130 CASAVA_Build 4 8377634 16D TTCCAAAGCC CAAGCTGTGCATACCA/---------------- CGCACGCTGC 3070 het 3070 ref 49 24 24 7 CAAGCTGTGCATACCA 1 0 200131 CASAVA_Build 4 8381163 1D ATGAATGAAT A/- GGGGGATGAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 1 0 200132 CASAVA_Build 4 8383300 1D AGAGGCCTTT G/- GGGGAGGTGG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 G 5 4 200133 CASAVA_Build 4 8386746 10I ACAGAAGCAC ----------/CAGGTTTTTG CAGTGACAAA 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 CAGGTTTTTG 0 1 200134 CASAVA_Build 4 8388941 1D ACACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2841 het 262 hom 24 2 10 13 A 11 10 200135 CASAVA_Build 4 8390150 1D CAAAATTGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2570 hom 25 9 12 5 T 10 9 200136 CASAVA_Build 4 8392404 3I TGAACATTTT ---/AAC AACATTAATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAC 1 2 200137 CASAVA_Build 4 8403336 13D AGACCTGCCC AATTCATTCCTTT/------------- AATTCATTAA 3070 hom 62 het 26 0 19 9 AATTCATTCCTTT 1 0 200138 CASAVA_Build 4 8406495 1D GTGACGAGGA G/- GTGGTCCTAT 3070 het 3070 ref 50 29 17 5 G 2 1 200139 CASAVA_Build 4 8429486 4D AGACCCCAGC TAGG/---- TAGGACTAGC 3070 hom 51 het 20 0 15 6 TAGG 2 1 200140 CASAVA_Build 4 8430088 8I GCGTCACTCG --------/GCTCTGCA GCTCTGCAGC 3070 het 3070 hom 34 11 11 12 GCTCTGCA 1 2 200141 CASAVA_Build 4 8460887 1I ACTGTCTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 32 1 15 16 A 14 15 200142 CASAVA_Build 4 8471628 8D GAGCAAAAAG ATACTAAA/-------- ATACTAAATG 3070 hom 48 het 18 0 17 2 ATACTAAA 2 1 200143 CASAVA_Build 4 8486676 3D TAGGAGTTAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 AAT 7 6 200144 CASAVA_Build 4 8492569 2D AGAAAGAAAC AA/-- AAGTCAGATA 3070 hom 99 het 35 0 33 3 A 4 2 200145 CASAVA_Build 4 8492799 1I TTCACGTGGA -/C CCCTTAAAGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 3 4 200146 CASAVA_Build 4 8509645 3D AAGACACCCG CCC/--- CCCCCCCCCA 2668 het 6 hom 17 1 11 5 C 12 9 200147 CASAVA_Build 4 8547934 1I CAGAGAGGTT -/A AAGTGACTTG 3070 hom 132 het 50 0 43 7 A 2 3 200148 CASAVA_Build 4 8555306 1I CCTGGCCACA -/G GGCCCTCTCC 3070 hom 100 het 43 0 31 12 G 2 3 200149 CASAVA_Build 4 8577569 1I AATGGGATGT -/G GGTGACCTTG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 2 3 200150 CASAVA_Build 4 8581842 1I GAACAGAGGA -/C CCCCCCAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 6 7 200151 CASAVA_Build 4 8584073 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 15 0 11 4 T 13 14 200152 CASAVA_Build 4 8594094 7I TACAGGGCTC -------/TTATTTT TTATTTTTTA 3070 hom 120 het 44 0 40 10 TTATTTT 2 3 200153 CASAVA_Build 4 8597144 1D TCCTGTGGTT G/- GGGGGGGCTG 3070 hom 68 het 33 0 21 12 G 8 7 200154 CASAVA_Build 4 8598077 1D TGTCCCCAAC G/- GGGGTCCTTC 3070 hom 47 het 18 0 12 6 G 5 4 200155 CASAVA_Build 4 8599840 2I CACCGCATCT --/CA CTTTCCTTAC 3070 hom 144 het 51 0 46 5 CA 0 1 200156 CASAVA_Build 4 8615341 1I CCAAATTGTA -/G AAAAATAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 200157 CASAVA_Build 4 8617745 1I TCTATAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 12 0 9 3 T 11 12 200158 CASAVA_Build 4 8620240 3D TTTTCACATT AAA/--- AAAGGGGCGA 3070 hom 84 het 31 0 27 5 A 6 3 200159 CASAVA_Build 4 8622146 4D CTTTAATGAA TATT/---- TAATATGACT 2119 hom 12 het 5 0 5 0 TATT 1 0 200160 CASAVA_Build 4 8634486 2I GATATGTGCT --/CA CAGTGCACAG 3070 hom 53 het 23 0 17 6 CA 1 2 200161 CASAVA_Build 4 8637145 1I ACTCTGAGCT -/G GGCTTTGTGC 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 2 3 200162 CASAVA_Build 4 8641892 1D CAAATAAAAC A/- AATTATCGTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 3 2 200163 CASAVA_Build 4 8648647 8D GACCTGCAGA CTTCCAGC/-------- CTTCCAGCCT 2400 het 2400 ref 29 17 8 6 CTTCCAGC 2 1 200164 CASAVA_Build 4 8648708 2I CAAGATAGAG --/TC TCTCTCTGTC 1161 het 1161 ref 20 12 3 5 TC 3 4 200165 CASAVA_Build 4 8652371 2D CTCTCCATCC CT/-- CTCCAGTCCC 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 CT 2 1 200166 CASAVA_Build 4 8654546 1I CCCTGGTCAA -/G GGGGGGGCGG 2605 het 2197 hom 26 9 9 8 G 7 8 200167 CASAVA_Build 4 8661674 4I CCATTCACTC ----/ACGT CCTCCCTCCC 1278 het 1217 hom 23 7 4 12 ACGT 0 1 200168 CASAVA_Build 4 8661855 4I ACTTACTCAC ----/TCAT TCATTGTCAC 2933 het 2933 ref 55 26 12 17 TCAT 1 2 200169 CASAVA_Build 4 8661916 4I ACTAATTTTC ----/TCAT TCAGTCATTC 3070 het 3070 hom 61 18 32 11 TCAT 0 1 200170 CASAVA_Build 4 8672467 1I GTGGCCTGGG -/C CCCACAGGGC 2591 hom 33 het 13 0 9 4 C 3 4 200171 CASAVA_Build 4 8729784 1I ATTAAAAATA -/G AATCAACATA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 G 0 1 200172 CASAVA_Build 4 8738343 2D CCTGTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 31 1 22 8 A 14 12 200173 CASAVA_Build 4 8744949 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 26 0 17 9 T 20 19 200174 CASAVA_Build 4 8752793 1D TTTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 16 0 11 5 A 12 11 200175 CASAVA_Build 4 8766201 22D CGCATCAACA ATGCGCATCAACTGAAATGCGC/---------------------- ATCAACTGGA 3070 hom 69 het 26 0 22 7 ATGCGCATCAACTGAAATGCGC 1 0 200176 CASAVA_Build 4 8772562 8I TCCCAACAAA --------/TTCACTCT TAACTAAGCT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TTCACTCT 0 1 200177 CASAVA_Build 4 8780143 1D GTATTGGGGG A/- TAGGACTTAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 0 200178 CASAVA_Build 4 8983685 1I AATTTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 10 11 200179 CASAVA_Build 4 8988270 1D TGTTCGATGC A/- ACACCAGACT 1200 het 1200 ref 47 34 4 9 A 2 1 200180 CASAVA_Build 4 8988767 2I CAATGTTGAA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 9 11 200181 CASAVA_Build 4 8988928 1D CAGGCAAGTA C/- CTATTCATAC 3070 het 3070 hom 33 12 19 4 C 2 1 200182 CASAVA_Build 4 8994293 1I ATACAAATAA -/G AGGTCCATCC 3070 hom 62 het 22 0 21 1 G 0 1 200183 CASAVA_Build 4 8995912 1I CATCTTATGT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 7 8 200184 CASAVA_Build 4 8996353 1D AAGCATCTAA T/- TTTTTTTTTT 2426 het 103 hom 18 3 5 10 T 11 10 200185 CASAVA_Build 4 8997549 1D AACAAAAAAA T/- CATTCGTTTT 2145 het 2145 ref 32 23 6 3 T 1 0 200186 CASAVA_Build 4 9000673 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 CT 2 1 200187 CASAVA_Build 4 9002153 1D TAATTCATGG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 7 200188 CASAVA_Build 4 9003527 4I TTTAAAAAAT ----/AATC TAAGTACTTA 1809 het 1809 ref 16 12 4 0 AATC 0 1 200189 CASAVA_Build 4 9004091 1D CAGGGCAGGA G/- GAGGGCTCTT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 G 2 1 200190 CASAVA_Build 4 9004955 1I AAAAAAAAAT -/G AATAAACGTA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 G 0 1 200191 CASAVA_Build 4 9008531 1D AAAGTCCGTT A/- AAAAAAAAAA 2155 het 1691 hom 15 5 6 4 A 12 11 200192 CASAVA_Build 4 9009798 2I TGGCCAAAAC --/TG TGCACCCACA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 TG 1 2 200193 CASAVA_Build 4 9013284 1D TCCAGAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 A 12 11 200194 CASAVA_Build 4 9030329 1I TTCTGCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 11 12 200195 CASAVA_Build 4 9041893 1I AAATGTAAGC -/A AAAAAAAAAA 2158 het 2158 ref 21 10 5 6 A 11 12 200196 CASAVA_Build 4 9044087 1D CAACTACTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2845 hom 22 7 11 5 A 10 9 200197 CASAVA_Build 4 9055424 1D AGGTAAGACA G/- AAACTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 1 0 200198 CASAVA_Build 4 9057173 1D TGGTGTTGGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 2219 hom 16 6 9 2 A 9 8 200199 CASAVA_Build 4 9058995 1D AATCAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 8 4 A 13 12 200200 CASAVA_Build 4 9062460 2D AATTGCTAAT AA/-- AGTTTTCAGA 3070 hom 24 het 13 0 9 5 A 3 1 200201 CASAVA_Build 4 9095311 1I TGTCACCACC -/T CCCAGGAATG 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 T 0 1 200202 CASAVA_Build 4 9096053 1I TGTTGCCGTT -/C CTCAATCTTG 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 C 1 2 200203 CASAVA_Build 4 9096159 1I AGTATGTGGA -/T TTTTTTTTTT 2761 het 2301 hom 14 7 6 1 T 10 11 200204 CASAVA_Build 4 9096528 2D TAATTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2596 hom 18 het 10 0 7 3 T 14 12 200205 CASAVA_Build 4 9099374 1I AATAAATCCC -/A AAAGGATAAA 3070 hom 60 het 25 0 19 6 A 3 4 200206 CASAVA_Build 4 9100016 1I ATTAAAGCAG -/T TCGATGTTTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 1 2 200207 CASAVA_Build 4 9101584 1I TGGTTGTGCT -/G GGGGTCTCAG 3070 het 3070 hom 38 15 13 10 G 4 5 200208 CASAVA_Build 4 9115318 4I GATGATTACT ----/ATTA ATTGTTATCA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 ATTA 0 1 200209 CASAVA_Build 4 9116807 1I TGCACACTGG -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 6 7 200210 CASAVA_Build 4 9140107 12I ACTTGTTCAG ------------/GCTTAAAAATAA GCTTACTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 GCTTAAAAATAA 0 1 200211 CASAVA_Build 4 9141506 1I GAAGAGGGTC -/T CAAAGCCCAT 3070 het 3070 ref 36 27 9 0 T 0 1 200212 CASAVA_Build 4 9144152 1D GGGCAGATGA G/- GGCCCGCTGG 967 het 967 ref 20 14 3 5 G 3 2 200213 CASAVA_Build 4 9148926 1D8M1D ACCTTGGCCT CCCAAAGTGC/-CCAAAGTG- TGGGATTACA 674 het 674 ref 21 18 2 4 N/A 0 0 200214 CASAVA_Build 4 9149122 1I TATTTTGACC -/A AAATATGTTA 1854 het 1854 ref 35 26 6 4 A 3 4 200215 CASAVA_Build 4 9158814 3I TTCATTATTA ---/TTC TTGGCAGATG 1677 het 1677 ref 36 31 4 1 TTC 0 1 200216 CASAVA_Build 4 9159945 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 2149 het 2149 ref 24 14 7 3 A 9 10 200217 CASAVA_Build 4 9161096 2I TATTTAAAAA --/AT AGTTTACAGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AT 0 1 200218 CASAVA_Build 4 9163911 1I ACATTGTCTC -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 47 35 11 1 A 6 7 200219 CASAVA_Build 4 9165044 1D TTTTAAAAAA G/- AGCTCAGAAA 2872 het 2872 ref 23 13 7 4 G 1 0 200220 CASAVA_Build 4 9166914 6D GAACTTTGTT AGAAGG/------ AGAAAAGATA 2862 het 2862 ref 26 14 8 8 AGAAGG 1 0 200221 CASAVA_Build 4 9170471 1I TTTTGTAGAG -/A GGGGGGGTCT 2316 het 2316 ref 18 10 5 3 A 0 1 200222 CASAVA_Build 4 9172299 3I CAGAGGGTGA ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 het 2797 hom 28 10 9 9 T 9 12 200223 CASAVA_Build 4 9172515 1D GTAACTCTAT G/- TAGAATTGTT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 G 1 0 200224 CASAVA_Build 4 9172636 1D TTATTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 20 1 13 6 T 11 10 200225 CASAVA_Build 4 9174416 1I TGAGAGGTGC -/A GGCAAATGAC 3070 het 3070 ref 43 31 9 3 A 0 1 200226 CASAVA_Build 4 9175132 6D ACACACACAC ACACAT/------ ACACATACAT 966 het 966 ref 19 11 3 7 ACACAT 2 1 200227 CASAVA_Build 4 9175470 1D ATTCTTCCTA T/- TGGAAACTTT 3070 het 3070 ref 58 43 9 6 T 2 1 200228 CASAVA_Build 4 9175646 1D CACTTAACAC A/- AATGTCTTTC 2242 het 2242 ref 39 29 5 5 A 3 2 200229 CASAVA_Build 4 9176760 6I AAACTGTCAA ------/GCTCTT GGCTCCTGGC 3070 het 3070 ref 49 22 14 13 GCTCTT 0 1 200230 CASAVA_Build 4 9179768 1I AATCAGTTTT -/C CCTCATGTGG 1359 het 1359 ref 40 35 3 2 C 2 3 200231 CASAVA_Build 4 9185012 1D ATCCGTTTTT A/- AATTTTTTTT 3070 het 2915 hom 26 12 13 1 A 3 2 200232 CASAVA_Build 4 9185185 2I CCAACCTCAG --/GT GATCTGCCCA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 GT 0 1 200233 CASAVA_Build 4 9189988 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTAGC 2998 het 2998 ref 21 11 7 3 A 1 0 200234 CASAVA_Build 4 9190075 1D AACTCCTGGG C/- TCAAATGATC 3070 het 2552 hom 15 6 7 2 C 1 0 200235 CASAVA_Build 4 9194585 5D CTCTGTCTCA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 6 AAAAC 3 2 200236 CASAVA_Build 4 9196742 4D TTGTTGTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 28 1 16 11 T 15 11 200237 CASAVA_Build 4 9197804 1D GCAGCGAAGG A/- AAAAGTTGAG 3070 het 3070 ref 47 34 9 4 A 5 4 200238 CASAVA_Build 4 9199279 1D GGGTTTTTTT G/- GGGGGGGGCA 3070 het 4 hom 17 1 13 3 G 9 8 200239 CASAVA_Build 4 9200146 4D GTTTCCCCTG TGTT/---- TGTTTGCCCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TGTT 2 1 200240 CASAVA_Build 4 9203566 6D GACTCCATCT ATCTCA/------ AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 11 0 10 1 ATCTCA 1 0 200241 CASAVA_Build 4 9207904 1I TGGCTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 23 8 6 T 10 11 200242 CASAVA_Build 4 9209472 4I GATCACCTGA ----/TGTC TGTCAGGAGT 3070 het 965 hom 11 2 9 0 TGTC 1 2 200243 CASAVA_Build 4 9209909 20I CCTGACACTG --------------------/GGTAACGTATAAAGAAAAGA GGTTTACTTG 3070 hom 24 het 11 0 8 3 GGTAACGTATAAAGAAAAGA 0 1 200244 CASAVA_Build 4 9212699 3D GTACAGATCT AGA/--- AGAAGAAGAA 3070 het 280 hom 23 2 10 11 AGA 6 5 200245 CASAVA_Build 4 9214954 4I CTCTCCGATA ----/AAGT AAGAGTAAAC 3070 het 3070 ref 51 37 10 4 AAGT 0 1 200246 CASAVA_Build 4 9215776 1D CAGTCAGTAA G/- GCGTTAAACA 1780 het 1780 ref 22 17 4 2 G 2 1 200247 CASAVA_Build 4 9217399 1I TTGATTCCCC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 A 7 8 200248 CASAVA_Build 4 9223871 1I ATTCTACCAT -/C TTAATGCAAG 3070 hom 51 het 23 0 17 6 C 0 1 200249 CASAVA_Build 4 9234789 1D CCTAAAACTT A/- AAAGTGTAAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 4 3 200250 CASAVA_Build 4 9239072 3D ATTTGTTGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 72 het 29 0 24 6 TTG 7 6 200251 CASAVA_Build 4 9244706 2D CAGCTAATTT TG/-- TATTTTTAGT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TG 1 0 200252 CASAVA_Build 4 9245155 3I AGATCTCATT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 11 14 200253 CASAVA_Build 4 9245490 1D AATTTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1203 hom 27 5 16 7 A 13 12 200254 CASAVA_Build 4 9249854 1I CACCTTGTGA -/C CCCCCCACTC 2579 hom 18 het 9 0 6 3 C 6 7 200255 CASAVA_Build 4 9251656 1D GACATTAAAT A/- AAGCTCTGAA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 3 2 200256 CASAVA_Build 4 9255378 2I CCTTCGCTGA --/CT CTCTTTTTGG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 CT 2 3 200257 CASAVA_Build 4 9255479 2I CGCGTGAAAA --/AG AGTGTCCTTC 2265 hom 18 het 9 0 7 2 AG 1 2 200258 CASAVA_Build 4 9257444 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1887 het 175 hom 12 2 6 4 A 15 14 200259 CASAVA_Build 4 9262517 6I TGCCTGCCAA ------/CGCCCT CCCAGCTGGG 2531 het 2531 ref 34 18 9 7 CGCCCT 0 1 200260 CASAVA_Build 4 9269440 2I TTTTGCTCAC --/AT GTTTTTTGTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AT 0 1 200261 CASAVA_Build 4 9270790 1I TCTTTCACCA -/T CAAAAATGTT 1352 het 1352 ref 31 26 3 2 T 0 1 200262 CASAVA_Build 4 9273599 5I AGCACAAGTA -----/AATAG AATAGATCAC 2610 het 2610 ref 54 44 7 3 AATAG 1 2 200263 CASAVA_Build 4 9274220 1D AATATAGTGT G/- GATGATCAGT 1868 het 1868 ref 57 50 5 2 G 2 1 200264 CASAVA_Build 4 9274326 1D TGTACCAGGG A/- CTTTAACTAA 3070 het 3070 ref 73 38 29 7 A 1 0 200265 CASAVA_Build 4 9277695 1I CCCGATACCT -/G TAAAGGGTCT 1562 hom 12 het 5 0 5 0 G 0 1 200266 CASAVA_Build 4 9282325 2I AGCTCCAGAG --/AA TATCAAAGAG 2305 het 2305 ref 34 21 7 7 A 0 2 200267 CASAVA_Build 4 9282516 3D AAGATGGGAC CAG/--- CAACTTCTAC 143 het 143 ref 41 34 1 6 CAG 1 0 200268 CASAVA_Build 4 9298347 1D CCGTCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 1462 het 449 hom 22 4 6 12 A 15 14 200269 CASAVA_Build 4 9309667 1I CCTGGGCCCC -/A GCCCTGAAAA 3070 hom 64 het 25 0 19 6 A 0 1 200270 CASAVA_Build 4 9315855 1I ACAAAGGCCT -/G GGGGGGGGCG 3070 het 393 hom 23 2 17 4 G 8 9 200271 CASAVA_Build 4 9322050 5D AGATAAGACC CCCCA/----- CATGGCTCTG 3070 hom 39 het 16 0 14 4 CCCCA 1 0 200272 CASAVA_Build 4 9329360 4D TTTAATGTCC TTCT/---- AAGTAAAAAA 954 het 954 ref 37 8 5 24 TTCT 1 0 200273 CASAVA_Build 4 9330373 1I TGTTCTATTG -/C CCCATTGGAT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 C 3 4 200274 CASAVA_Build 4 9333507 1D ATCCTACACA T/- CCTCAAAGTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 1 0 200275 CASAVA_Build 4 9335718 2D TCCTGTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 13 11 200276 CASAVA_Build 4 9338890 3D CCTGACCAAC ATG/--- ATGATGAAAC 3070 hom 44 het 18 0 15 4 ATG 3 2 200277 CASAVA_Build 4 9341987 1I TGGATGAGCC -/T TCCTTCCTCC 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 1 2 200278 CASAVA_Build 4 9364715 3D TCTCCTGCCA CAG/--- CAGCCTCCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 CAG 2 1 200279 CASAVA_Build 4 9370778 1I TTAAAATTAA -/T TTTTAATACT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 4 5 200280 CASAVA_Build 4 9377223 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 304 hom 24 1 19 4 A 11 12 200281 CASAVA_Build 4 9377391 1D AAAAAAAAAA T/- CCCAAAAGCA 3070 hom 27 het 29 1 22 6 T 1 0 200282 CASAVA_Build 4 9379210 1D GAATAGTGGT C/- CCTCTTTACC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 3 2 200283 CASAVA_Build 4 9388274 2I ACAAATGTCA --/GT GTGTGTGGCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 GT 3 4 200284 CASAVA_Build 4 9395004 1D AAGACCAGAT G/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 1 0 200285 CASAVA_Build 4 9403554 1D AGATGAGATT G/- GGGCATGTTC 3070 hom 71 het 28 0 24 4 G 4 3 200286 CASAVA_Build 4 9403690 1D TCTGCCTCCC G/- GGTTCAAGCC 3070 hom 33 het 12 0 10 2 G 3 2 200287 CASAVA_Build 4 9404227 3I ATTTATGCTT ---/TTC TCACAATATC 3070 het 3070 ref 43 28 10 5 TTC 0 1 200288 CASAVA_Build 4 9436254 2D TTAATCACAA TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 45 0 39 6 TG 1 0 200289 CASAVA_Build 4 9451502 1D ATAAAGATAT A/- CCTGACACTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 0 200290 CASAVA_Build 4 9451642 2D AAAAGAGGAC AA/-- AGAGAGAAAG 3070 hom 120 het 44 0 41 4 A 3 1 200291 CASAVA_Build 4 9462442 1I CCATTTTAAG -/A AAAAAACCAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 6 7 200292 CASAVA_Build 4 9464053 1D TGGAAAACAG A/- AAAAAATCAG 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 7 6 200293 CASAVA_Build 4 9469972 4I CTAAAGAACC ----/CTGA CTATTATAGG 3070 hom 69 het 30 0 23 7 CTGA 0 1 200294 CASAVA_Build 4 9474431 2D CTGACCACTC TT/-- TTGCTCGCTA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 4 2 200295 CASAVA_Build 4 9484971 1I TTTTGCTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1104 hom 36 3 26 7 A 9 10 200296 CASAVA_Build 4 9495168 1I GCTAGAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 782 hom 29 2 19 8 T 11 12 200297 CASAVA_Build 4 9499940 2I CTGAGTCCAG --/AA AGCAAGGAGA 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 1 3 200298 CASAVA_Build 4 9509665 1I GACAACTACT -/A ATGGCCATTT 3070 hom 129 het 46 0 42 4 A 1 2 200299 CASAVA_Build 4 9519226 8D CCACCTTCTC CCTTTCTT/-------- CATTACTTTT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 CCTTTCTT 1 0 200300 CASAVA_Build 4 9530281 1I AGCTGTCTTA -/C CTGGGGCCCT 3070 hom 59 het 22 0 19 3 C 1 2 200301 CASAVA_Build 4 9537912 12I CCACCACGCC ------------/TGACTAATTTTT TGTATTTAGT 3070 hom 33 het 15 0 12 4 TGACTAATTTTT 0 1 200302 CASAVA_Build 4 9556963 5D TTTGCAATTA TCTTG/----- TTCTATTATC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TCTTG 1 0 200303 CASAVA_Build 4 9561313 10I TTATTAAATG ----------/ACAAAAAATA ACAGATGCTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ACAAAAAATA 0 1 200304 CASAVA_Build 4 9562037 2I GTGGAGAGTG --/TA TAAAGATAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TA 1 2 200305 CASAVA_Build 4 9562350 1I AAGTTTATTT -/A TTAAAAAAAC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 1 200306 CASAVA_Build 4 9563249 4D CTGTCTCAGA TCTG/---- TCTGTCTTTT 3070 hom 56 het 24 0 19 7 TCTG 2 1 200307 CASAVA_Build 4 9565603 4D TTGGGAAAGG CAGT/---- CAGTCTCCCA 3070 hom 108 het 40 0 35 8 CAGT 2 1 200308 CASAVA_Build 4 9567486 1I TACCGAAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 58 het 31 0 28 3 T 7 8 200309 CASAVA_Build 4 9569609 1D GGAGAATTTG A/- AAAAAATTAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 6 200310 CASAVA_Build 4 9569712 5D ACGAGAAAGG AAAGT/----- AATCGGTAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 3 AAAGT 1 0 200311 CASAVA_Build 4 9570818 1I CGCAAGTCAA -/G GAAGTTATAC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 G 1 2 200312 CASAVA_Build 4 9574990 4I TTGCATTTCT ----/AACA AACAAGTGCC 3070 hom 141 het 52 0 47 5 AACA 1 2 200313 CASAVA_Build 4 9577335 1I AGGTCGAGCC -/A CTGCACTCCA 3070 hom 75 het 26 0 22 4 A 0 1 200314 CASAVA_Build 4 9577554 3I CATTAAACCA ---/AAC AACATTTCCT 3070 hom 135 het 47 0 46 1 AAC 1 2 200315 CASAVA_Build 4 9578552 1D TAGAACAAAA C/- AAAAGTTATA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 C 1 0 200316 CASAVA_Build 4 9581403 1I ACACAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 11 12 200317 CASAVA_Build 4 9583286 1D AAGTCTCAGT A/- GATTCAAAAG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 0 200318 CASAVA_Build 4 9584582 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 19 0 15 4 A 14 13 200319 CASAVA_Build 4 9591974 3D GGTTGTGGCA ATG/--- ATGATGATGG 3065 het 3065 ref 53 34 10 9 ATG 4 3 200320 CASAVA_Build 4 9663974 4I CCAACCAACC ----/AACA AACAAACAAC 3070 hom 96 het 39 0 31 8 AACA 2 3 200321 CASAVA_Build 4 9670390 2D CTTGTGGCTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 81 het 41 0 26 15 CA 9 8 200322 CASAVA_Build 4 9683461 4I TTGCTGGTCA ----/TTGC TAATTAATCT 3070 hom 122 het 46 0 38 8 TTGC 0 1 200323 CASAVA_Build 4 9702908 1D GGCTGACCCC T/- GGGTCCTTCT 3070 hom 51 het 21 0 14 7 T 1 0 200324 CASAVA_Build 4 9707307 1D CCTTGGAAAG C/- CCCCTCCTGT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 C 5 4 200325 CASAVA_Build 4 9707520 3I CGGTTCCAAG ---/AGA AGGAGTCCCG 3070 het 3070 ref 56 27 18 11 AGA 0 1 200326 CASAVA_Build 4 9728900 4I TTTTGGCGTC ----/TTTT TTTAAGCACG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 3 7 200327 CASAVA_Build 4 9730385 2D TCCCTGTGGG GC/-- GCGAGCTCAG 3070 hom 75 het 27 0 24 3 GC 2 1 200328 CASAVA_Build 4 9730755 3I ATACTTGAGT ---/TGC TGCTTTCAGC 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 TGC 1 2 200329 CASAVA_Build 4 9731579 4D GCGTGCTTTT CAGA/---- CAGTGGCAAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 8 CAGA 1 0 200330 CASAVA_Build 4 9731998 2I CACAGGAGAG --/CT CTGAATTTCT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 CT 1 2 200331 CASAVA_Build 4 9732838 1D ATCCCTTCTT G/- GGGGGCCCTA 3070 hom 92 het 34 0 30 7 G 6 5 200332 CASAVA_Build 4 9732980 2D TGGGCATAAC TT/-- TTCAGTTTGA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 T 4 2 200333 CASAVA_Build 4 9733128 3I TATCTGATCA ---/TCT TCAAGATCCC 3070 hom 77 het 41 0 27 14 TCT 0 1 200334 CASAVA_Build 4 9733273 4I GTCCCATTCT ----/TTCC TCTTAAACTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TTCC 0 1 200335 CASAVA_Build 4 9734872 2I42M1I CTGTTTTCAT --CCTTAATGTCTTCTCCCTGTGCCTGTTTCCGCTTCCCTGTTT-/TCTCTTAATGCCTTCTCCCTGTGCCTGTTTCCGCTTTCCTGTTTA AAAGGACACT 3070 hom 102 het 37 0 34 15 N/A 0 0 200336 CASAVA_Build 4 9735440 2I CATCTCCCCC --/CT GCCTTTGGGG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 CT 0 1 200337 CASAVA_Build 4 9737092 3D GTCAGAGGAA AGG/--- AGCCCAGGGA 3070 het 3070 ref 64 33 26 5 AGG 1 0 200338 CASAVA_Build 4 9738315 2I GATAATAGTG --/GA GAGAGAAGGT 3070 het 2606 hom 22 8 8 6 GA 3 4 200339 CASAVA_Build 4 9740379 2D GGTTTGGCTC AT/-- ATGTCATTCA 3070 het 3070 ref 59 31 18 10 AT 2 1 200340 CASAVA_Build 4 9746681 2I TTTTTGTCTC --/AG TGTTTAGGAT 3070 hom 150 het 53 0 46 7 AG 0 1 200341 CASAVA_Build 4 9747048 12D GGAGTGAGGA GGGGAGGGGAGG/------------ GGGGAGGGGT 3070 het 371 hom 22 4 12 11 GGGGAGGGGAGG 1 0 200342 CASAVA_Build 4 9747555 1D GGGGCTCTTA T/- TTTGAAGGTT 3070 het 3070 hom 59 23 25 12 T 4 3 200343 CASAVA_Build 4 9748388 2D TCAGGTTTTG CT/-- CTTAGATTTC 3070 het 3070 ref 45 25 14 7 CT 2 1 200344 CASAVA_Build 4 9749923 2D CTACTCAGTG TC/-- TCTCATTACT 3070 het 3070 hom 57 26 25 9 TC 3 2 200345 CASAVA_Build 4 9750359 1D TAGAAACAGG C/- CCCCCTCTCC 2752 het 2752 ref 42 24 8 10 C 6 5 200346 CASAVA_Build 4 9751981 2I28M2I CATAGTGAAC --CTAAAGATAGCCACAGAGGCAATAACTC--/CTCTAAAGATAGCCACAGAGGCAATAACTCCT CTCCTGACCT 3070 het 3070 ref 39 24 15 8 N/A 0 0 200347 CASAVA_Build 4 9752939 4D CAAGTATAAA TAGT/---- TACTGACACC 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 TAGT 1 0 200348 CASAVA_Build 4 9754028 4D GAGAGAACTT TGAA/---- TGAACAAATT 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 TGAA 2 1 200349 CASAVA_Build 4 9755049 3D GTGTGTGACA TGT/--- TGTCAGATCT 3070 het 3070 hom 48 15 27 7 TGT 2 1 200350 CASAVA_Build 4 9755336 65D GCAACCCCTG ATCTCCAGGCAAAGGAGCTCAGAATAACCTGGTGGCACTGCTTTTGTTCCCTGGTGGAAGTGTCT/----------------------------------------------------------------- AGGACTGCAG 3070 het 3070 ref 33 41 7 7 ATCTCCAGGCAAAGGAGCTCAGAATAACCTGGTGGCACTGCTTTTGTTCCCTGGTGGAAGTGTCT 1 0 200351 CASAVA_Build 4 9755615 2D AAACTGCCTC GA/-- AACTGCTGGT 3070 het 3070 hom 37 12 16 10 GA 1 0 200352 CASAVA_Build 4 9755960 4D GGCTGCCCTT GGAG/---- GGACTGACTA 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 GGAG 1 0 200353 CASAVA_Build 4 9756104 1D GACCATGGAG T/- TGGATGGCTG 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 T 2 1 200354 CASAVA_Build 4 9756650 3D TTTCCTTAAA CTT/--- CTTATAAGAG 3070 het 3070 ref 40 22 14 6 CTT 2 1 200355 CASAVA_Build 4 9757550 2I TCAAAGGCAG --/GT GTGGACTTTT 3070 het 3070 ref 45 29 13 3 GT 1 2 200356 CASAVA_Build 4 9758229 1I GCATGGGGAT -/G GGAGGCCTCA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 G 2 3 200357 CASAVA_Build 4 9758541 4D CCCAGACTAC TTGT/---- TTTAAGGAAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 5 TTGT 1 0 200358 CASAVA_Build 4 9760205 2D GACAGATGGC TT/-- TTCTGTCTTG 3070 het 3070 ref 42 26 10 6 T 4 2 200359 CASAVA_Build 4 9761892 1I AGCTCAGGGA -/C CCTGAGGTCT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 C 2 3 200360 CASAVA_Build 4 9768513 2D AGCATGGGTG AT/-- ATATCTTTTT 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 AT 3 2 200361 CASAVA_Build 4 9770910 4I AGGAAACATT ----/ACTG ACATCTAGAA 3070 hom 156 het 57 0 52 5 ACTG 0 1 200362 CASAVA_Build 4 9773987 2D TCACCATCAT TG/-- TGAGATTGAC 3070 hom 96 het 35 0 32 4 TG 2 1 200363 CASAVA_Build 4 9776691 2I AAGCTGAAAC --/CA CAGTTAACAG 3070 hom 57 het 38 0 20 18 CA 1 2 200364 CASAVA_Build 4 9777692 2D ACCTCACTTA AC/-- ACACTAGAGG 3070 hom 151 het 57 0 51 8 AC 3 2 200365 CASAVA_Build 4 9780846 5D AGCAGTTACT GGGGG/----- GGGGGGGGGT 3070 hom 82 het 34 0 26 8 G 14 9 200366 CASAVA_Build 4 9781637 1D GATTCTCCTG T/- TTTGACAGGT 3070 hom 114 het 46 0 39 8 T 4 3 200367 CASAVA_Build 4 9783501 2D TGCAGATTAC CT/-- CTGATACTAT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 CT 2 1 200368 CASAVA_Build 4 9785830 2D TAGACTGGAA AC/-- ACAAAGTTCT 3070 hom 154 het 54 0 52 3 AC 2 1 200369 CASAVA_Build 4 9786876 4I GTTCTTTCAC ----/TGTG TGCGCACTGA 3070 hom 151 het 57 0 51 6 TG 1 3 200370 CASAVA_Build 4 9786979 1D GAAGGCTGCT C/- CCCTGACTAA 3070 hom 156 het 59 0 52 7 C 4 3 200371 CASAVA_Build 4 9792413 4D CACTGACATG GAGA/---- GAGATGTCTG 3070 hom 172 het 58 0 58 3 GA 4 2 200372 CASAVA_Build 4 9793334 4D CACCTGGGTA ATAC/---- ATGTAATATC 3070 hom 129 het 45 0 44 3 ATAC 1 0 200373 CASAVA_Build 4 9797644 11D ACCACCGTGA CCTTGGATTGT/----------- CCATATTATC 3070 hom 127 het 47 0 41 7 CCTTGGATTGT 1 0 200374 CASAVA_Build 4 9798075 2I AGCGTATGAC --/TG TGACATCACT 3070 hom 162 het 62 0 53 9 TG 1 2 200375 CASAVA_Build 4 9800349 4D ACCAGGAGAG TTAA/---- TTAATTACCT 3070 hom 78 het 31 0 26 6 TTAA 2 1 200376 CASAVA_Build 4 9808226 1D ATATACCCAG T/- TAGGGGGATG 3070 hom 48 het 19 0 17 3 T 2 1 200377 CASAVA_Build 4 9811791 1D AGTAGGCTCT C/- GGGAAGGCTT 3070 hom 96 het 35 0 32 4 C 1 0 200378 CASAVA_Build 4 9812316 6I AGGAGCAGGA ------/GCAGGT GCAGGGTTAC 3070 hom 129 het 46 0 40 6 GCAGGT 0 1 200379 CASAVA_Build 4 9813706 2I GTTGTGAATT --/TC TGCAAATTTT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 TC 0 1 200380 CASAVA_Build 4 9844408 1I TTCCCTTAGC -/T CTTTTTCTGT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 0 1 200381 CASAVA_Build 4 9846076 1D GAGACTTTGG T/- TGAAAGTCCA 3070 hom 134 het 49 0 43 6 T 2 1 200382 CASAVA_Build 4 9847342 1I CCCCATGGAT -/A AATCATAAAG 3070 hom 135 het 53 0 45 8 A 2 3 200383 CASAVA_Build 4 9847438 1I CTGTCCTGAT -/C CTCCCAAGGG 3070 het 3070 ref 58 26 23 9 C 1 2 200384 CASAVA_Build 4 9852136 4I TCTTCATGGA ----/TTGG TAAGAACTGA 3070 hom 147 het 52 0 49 3 TTGG 0 1 200385 CASAVA_Build 4 9858069 1I TGGGATTGCT -/G GGTCAAATGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 2 3 200386 CASAVA_Build 4 9865339 1I ATTCATACTT -/A AAAAATACTT 3070 hom 126 het 45 0 40 5 A 5 6 200387 CASAVA_Build 4 9865422 1D CTGTCTGGAA T/- ACACCTTACT 3070 hom 129 het 46 0 43 4 T 1 0 200388 CASAVA_Build 4 9875465 1I CACAAATCTG -/A AAAAAATCCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 6 7 200389 CASAVA_Build 4 9876206 3I AAATTTTAGT ---/ATA ATCTTTAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ATA 0 1 200390 CASAVA_Build 4 9879847 2I AACTGGCTTA --/CT CTCGAGTGTG 3070 hom 151 het 53 0 51 2 CT 1 2 200391 CASAVA_Build 4 9884727 1I GGGAGAAGGC -/G GGTAAGGGTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 G 2 3 200392 CASAVA_Build 4 9885100 1D TCTTGAGACT A/- GGGGGAAGAG 3070 hom 132 het 55 0 45 12 A 1 0 200393 CASAVA_Build 4 9888380 1I TGCTGCCAAC -/T TGTCTTTCTG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 1 2 200394 CASAVA_Build 4 9895324 1I TCAAACATGG -/A AGCCTATGTG 3070 hom 202 het 74 0 67 7 A 1 2 200395 CASAVA_Build 4 9895562 1I GACAAACGTG -/A AAAACCAGAA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 A 4 5 200396 CASAVA_Build 4 9896034 1D GCTTTATTGA T/- TTTGTGTCCA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 4 3 200397 CASAVA_Build 4 9899197 3I GCTGACATGC ---/GGG GGAGGGGGGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 2 5 200398 CASAVA_Build 4 9910718 2D AAAACTTAAC TT/-- TTTTTGATCC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 7 5 200399 CASAVA_Build 4 9918198 3D CAAATGTTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 42 1 29 12 T 15 12 200400 CASAVA_Build 4 9924442 1I TTTTATATTT -/C CCTATATCGC 3070 hom 117 het 55 0 40 15 C 2 3 200401 CASAVA_Build 4 9928550 1D TGATAGATGC G/- ACAGCTTAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 6 G 1 0 200402 CASAVA_Build 4 9941019 1I AAGGTGGTAG -/T TTTTGGGGGG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 4 5 200403 CASAVA_Build 4 9950678 4D GAGGGAAGAC ATTT/---- ATATGGCCAA 3070 hom 165 het 60 0 55 11 ATTT 1 0 200404 CASAVA_Build 4 9950846 1D CACTGTTGGT G/- GGAGTGTAAA 3070 hom 150 het 54 0 50 5 G 3 2 200405 CASAVA_Build 4 9951442 1D GAATTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 10 9 200406 CASAVA_Build 4 9956300 1D GGACAGATAA T/- AAAATACCTT 3070 hom 144 het 54 0 49 6 T 1 0 200407 CASAVA_Build 4 9957429 1I TGCAGATAGC -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 134 het 51 0 45 6 T 6 7 200408 CASAVA_Build 4 9957817 1I TTGGGGGGGG -/T GGATGGTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 0 1 200409 CASAVA_Build 4 9974957 5D TGCCTGGATT CCCCC/----- CCCCCCCCCC 3070 het 46 hom 35 2 24 10 C 17 12 200410 CASAVA_Build 4 10009899 1I AAAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 5 6 200411 CASAVA_Build 4 10020129 1D GTACATGTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 65 het 33 0 23 10 A 10 9 200412 CASAVA_Build 4 10027922 1I ACGAGTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 A 12 13 200413 CASAVA_Build 4 10031674 2D TTTCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3026 hom 12 het 21 0 10 11 T 14 12 200414 CASAVA_Build 4 10040571 1I TAAATCATAA -/T TTTTTTATGG 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 6 7 200415 CASAVA_Build 4 10042481 4D TTAAGGGCCC AAAT/---- CCTCGAAGAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 AAAT 1 0 200416 CASAVA_Build 4 10047146 1I TTTCATATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 10 200417 CASAVA_Build 4 10048845 1I CTGAAACTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 T 9 10 200418 CASAVA_Build 4 10051701 5I TCGAATGCTC -----/TACTT TACGTAGTGA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 TACTT 0 1 200419 CASAVA_Build 4 10057084 1D CCAACTAAAA T/- TCAGAAAGTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 2 1 200420 CASAVA_Build 4 10064287 1I TTTGTATGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 9 10 200421 CASAVA_Build 4 10066915 1I TGCTCTGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 T 11 12 200422 CASAVA_Build 4 10089777 1I GGTCCAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 16 19 10 T 11 12 200423 CASAVA_Build 4 10095585 2D AAAAATAAAT AA/-- AAATAAAAAT 164 het 109 hom 17 1 2 16 A 5 3 200424 CASAVA_Build 4 10101660 1I CTAATTTTTG -/T TATTTTTAGT 1282 hom 12 het 6 0 5 1 T 1 2 200425 CASAVA_Build 4 10102104 2D CGAATGTAGT AA/-- ATTGGTGGGC 3070 het 3070 hom 45 20 22 5 A 3 1 200426 CASAVA_Build 4 10102493 1I ATATAGTAAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 0 1 200427 CASAVA_Build 4 10104426 1D AGGTAAGGTA C/- TTTCCCCATT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 C 1 0 200428 CASAVA_Build 4 10123937 1D ATTAATTTTT A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 A 7 6 200429 CASAVA_Build 4 10125960 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 20 7 10 3 A 9 10 200430 CASAVA_Build 4 10128730 1D ATCTTTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 13 12 200431 CASAVA_Build 4 10130765 1D TTAAGCCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2528 hom 35 13 11 12 T 12 11 200432 CASAVA_Build 4 10152321 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 1965 het 1965 ref 20 11 6 3 TA 6 5 200433 CASAVA_Build 4 10152602 1D CTCATATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 12 11 200434 CASAVA_Build 4 10152715 1I TTGTATAGCG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 8 9 200435 CASAVA_Build 4 10162154 2I TATATATATA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 647 hom 22 3 12 7 T 9 11 200436 CASAVA_Build 4 10224290 2D TCAGGGTCTC AG/-- ACACAGGAAC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 AG 1 0 200437 CASAVA_Build 4 10239035 1I GTTAGACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1654 hom 42 6 28 8 T 12 13 200438 CASAVA_Build 4 10245554 1I TCATTGCTGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 8 9 200439 CASAVA_Build 4 10262703 1I ACAGGAGATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 9 10 200440 CASAVA_Build 4 10264110 1I ATAAACTCTC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 8 9 200441 CASAVA_Build 4 10264713 84D CTTCCCTCAA GGAAATACCAATTCAAGATCAGTTTGCTGAGAAAGGTCCAACGTATTCCCCATTACATAGTCTCTTGTCCAGAATGGAAAATTG/------------------------------------------------------------------------------------ GGAAATACAC 3070 het 3070 ref 41 42 9 6 GGAAATACCAATTCAAGATCAGTTTGCTGAGAAAGGTCCAACGTATTCCCCATTACATAGTCTCTTGTCCAGAATGGAAAATTG 1 0 200442 CASAVA_Build 4 10274952 1D ATTAACAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 A 12 11 200443 CASAVA_Build 4 10282108 1D AACTCTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 11 10 200444 CASAVA_Build 4 10284973 1D GTGGAGGTAC A/- AAGGAGCCCA 3070 het 3070 ref 39 19 16 7 A 3 2 200445 CASAVA_Build 4 10301631 1D CCTGGTGAAA C/- ACCAGTAATA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 C 1 0 200446 CASAVA_Build 4 10311774 1I TTGCTTAGTC -/A AAATATCTCT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 3 4 200447 CASAVA_Build 4 10315184 1I TTGAAAAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3048 hom 26 8 9 9 T 10 11 200448 CASAVA_Build 4 10317761 1I GCTTAGGCCT -/C CCAAAGTGCT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 C 2 3 200449 CASAVA_Build 4 10322325 1I CTAAATTTAT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 86 het 35 0 29 6 A 7 8 200450 CASAVA_Build 4 10329211 1I TGGCACAATA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 6 7 200451 CASAVA_Build 4 10329322 1D AAAGAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 A 10 9 200452 CASAVA_Build 4 10331890 21D AGGAGGGAGG TGGGGGCTCTGAGGAGGGAGT/--------------------- TGGGGGCTGG 3070 het 737 hom 20 4 14 6 TGGGGGCTCTGAGGAGGGAGT 1 0 200453 CASAVA_Build 4 10337315 2I CAGCATATGA --/AT ATTCCAGGTG 3070 het 3070 hom 51 21 27 3 AT 1 2 200454 CASAVA_Build 4 10354416 1I TATAACCTAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 8 9 200455 CASAVA_Build 4 10360891 1D TCTCAGAAAG C/- CCCTCCTCAC 3070 het 3070 ref 53 26 22 6 C 4 3 200456 CASAVA_Build 4 10441552 4D CATTACAATT GAGA/---- GAGAGAGGTG 3070 het 3070 hom 32 15 13 5 GA 5 3 200457 CASAVA_Build 4 10444797 1I AGTCCATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 10 11 200458 CASAVA_Build 4 10445269 1I AGCTTTTGTC -/T TTGATTTGGC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 2 3 200459 CASAVA_Build 4 10449075 7D ACACTGCCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 304 het 278 hom 24 6 4 15 A 22 15 200460 CASAVA_Build 4 10450701 1I ACTTGCTGTG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 7 8 200461 CASAVA_Build 4 10451512 4D CCTGTAGTCA TAGC/---- TAGCACTCAG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TAGC 2 1 200462 CASAVA_Build 4 10452178 1D GAGAGGCAAA G/- GTGGGAGTGA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 G 2 1 200463 CASAVA_Build 4 10455872 1D TTTGTCTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 198 hom 25 2 13 10 T 10 9 200464 CASAVA_Build 4 10464964 12D GGAATGAGGG AATCCACCAAAC/------------ AGCAGAGATG 3070 het 3070 hom 36 18 14 7 AATCCACCAAAC 1 0 200465 CASAVA_Build 4 10466612 2I ACTTAGCAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 11 13 200466 CASAVA_Build 4 10469789 1D TTTAATCTTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 9 8 200467 CASAVA_Build 4 10475823 8D CTCCGTCTCA AAAAAAAG/-------- AAAAAAAGAA 3070 het 1742 hom 19 4 13 4 AAAAAAAG 2 1 200468 CASAVA_Build 4 10478263 1I AACAAGGGTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 49 15 25 9 T 7 8 200469 CASAVA_Build 4 10486176 1I CCTTTGCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 9 10 200470 CASAVA_Build 4 10492437 4I GATCCAAAAT ----/CTAA CATGATTCTT 3070 hom 163 het 57 0 55 2 CTAA 0 1 200471 CASAVA_Build 4 10492742 1D TTGGATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2314 hom 31 11 16 6 A 13 12 200472 CASAVA_Build 4 10493995 9D CCTGGATTAT AGACTTCTC/--------- AGTCTCTAAT 3070 het 3070 hom 36 16 20 4 AGACTTCTC 1 0 200473 CASAVA_Build 4 10499158 2I CTTTGCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 12 200474 CASAVA_Build 4 10501504 1D AAGATGAGAT A/- GGGGCAGGAG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 1 0 200475 CASAVA_Build 4 10523668 1D AACAAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 10 9 200476 CASAVA_Build 4 10536085 1I AGTATATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 9 10 200477 CASAVA_Build 4 10542008 4I TGTAACTAAC ----/ATTT ATTAAGCAAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 ATTT 0 1 200478 CASAVA_Build 4 10544950 8D TTGTGGGTCC TCTTGGCA/-------- TCTTGGCATT 3070 het 3070 ref 48 24 21 6 TCTTGGCA 2 1 200479 CASAVA_Build 4 10556024 1I TTAAATAAAA -/C CCATCTGATG 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 C 2 3 200480 CASAVA_Build 4 10556673 3I CTGATGTGGT ---/TGG TGCATCACAG 3070 het 3070 ref 53 30 16 7 TGG 0 1 200481 CASAVA_Build 4 10563240 1D GGATGTTGGG T/- GAGGGCACTT 3070 het 3070 hom 52 24 23 5 T 1 0 200482 CASAVA_Build 4 10564146 1D TTTGAAAGAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 9 8 200483 CASAVA_Build 4 10573984 1D GCTCAGTGGC A/- CATAATAAGC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 1 0 200484 CASAVA_Build 4 10578850 6D TGTCTCTACA AATAAT/------ AATAATAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 AAT 4 2 200485 CASAVA_Build 4 10579021 2D AACCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 219 hom 30 1 11 20 A 14 12 200486 CASAVA_Build 4 10579463 16D ATCAAACCAA ACAGTCTTGAAGATGT/---------------- ACAGATGTTT 3070 het 3070 hom 42 22 24 4 ACAGTCTTGAAGATGT 1 0 200487 CASAVA_Build 4 10580010 3I TCAGGGTATC ---/TAA TCAGCCATCC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TAA 0 1 200488 CASAVA_Build 4 10587024 8D GAGACTCAAA AAAGTGAG/-------- AAAGTGAGAA 3070 hom 72 het 30 0 23 9 AAAGTGAG 2 1 200489 CASAVA_Build 4 10600198 16I GCTGCCCAGA ----------------/CACATTGGTGAGTGTG CTCTTCATAT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 CACATTGGTGAGTGTG 0 1 200490 CASAVA_Build 4 10606813 1I GAATGCCTGC -/T TGAAGCACAT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 1 2 200491 CASAVA_Build 4 10607969 8D37M2D CACACACACG CACATACACACATACACATACACAGACACACACATACACAAGCATAC/--------CACATACACATACACAGACACACACATACACAAGCAT-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 24 14 10 16 N/A 0 0 200492 CASAVA_Build 4 10617987 1I CTCTGAGCCT -/A AGCCTGTTTC 3070 hom 156 het 57 0 52 5 A 1 2 200493 CASAVA_Build 4 10624244 2D GTGTGTGCAC GT/-- GTGTGTGAGT 3070 het 3070 ref 73 36 23 16 GT 4 3 200494 CASAVA_Build 4 10641653 4D GAAAAATGTG GTGT/---- GTGTGTGTAT 2250 het 354 hom 23 3 10 10 GT 6 4 200495 CASAVA_Build 4 10645489 1I TCACTATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 34 1 32 1 A 10 11 200496 CASAVA_Build 4 10650648 2D GAAACAACCA AT/-- ATCAATCAGC 3070 hom 120 het 43 0 40 5 AT 2 1 200497 CASAVA_Build 4 10655627 1D GGTCCTGGAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 T 8 7 200498 CASAVA_Build 4 10703027 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAACAAAG 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 5 6 200499 CASAVA_Build 4 10738855 1I ACATCTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 T 10 11 200500 CASAVA_Build 4 10753796 1D CTTTCGGAGG T/- TATTAGGTCA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 2 1 200501 CASAVA_Build 4 10764488 1I GCTCACATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 19 19 9 T 10 11 200502 CASAVA_Build 4 10778131 3D AAACAGCATT ACG/--- ACTTTAGGCT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 ACG 1 0 200503 CASAVA_Build 4 10788184 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2578 hom 23 6 11 6 A 9 10 200504 CASAVA_Build 4 10829932 1D TATTACTAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 113 het 47 0 39 8 T 10 9 200505 CASAVA_Build 4 10830984 1D TCTATAAGTA T/- TAACACATTG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 2 1 200506 CASAVA_Build 4 10832826 1D TTTATCAGTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 8 7 200507 CASAVA_Build 4 10835367 1D TGGTAAACAG T/- TTTTTTTTTT 1966 het 1966 ref 25 12 5 8 T 13 12 200508 CASAVA_Build 4 10856479 1D GTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1739 hom 23 5 10 8 T 13 12 200509 CASAVA_Build 4 10859583 1D TCCAGCCACC G/- AATGAATTGT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 G 1 0 200510 CASAVA_Build 4 10874700 1D CTCTGAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 30 1 25 4 T 14 13 200511 CASAVA_Build 4 10875656 1D ATTTTTGCTG T/- GATGGCAAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 0 200512 CASAVA_Build 4 10877841 1I ATTAATCAGG -/C CAACATTACC 3070 hom 114 het 47 0 39 8 C 1 2 200513 CASAVA_Build 4 10881317 2D AACTCTTCTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 21 0 15 6 TA 10 9 200514 CASAVA_Build 4 10900012 1D GTCTCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 138 het 59 0 46 13 T 11 10 200515 CASAVA_Build 4 10900545 45D TAGAAATGGA GAGCAGGGCATTAGCTCCACTTGGGCCAGAAGATTGCCTGTTGAG/--------------------------------------------- GAGCCAGGGA 3070 het 3070 ref 31 24 11 5 GAGCAGGGCATTAGCTCCACTTGGGCCAGAAGATTGCCTGTTGAG 1 0 200516 CASAVA_Build 4 10903586 13D GTCTATGTGA TGGAGTCTTGCTC/------------- TGTTGCCCAG 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 TGGAGTCTTGCTC 1 0 200517 CASAVA_Build 4 10910590 1I TATACAACAG -/A AAAAAAGTTG 3070 het 3070 hom 55 23 23 9 A 6 7 200518 CASAVA_Build 4 10940596 3D ATGTATTAAC TCT/--- TCTTTTCAGA 1783 het 1783 ref 14 8 5 1 TCT 2 1 200519 CASAVA_Build 4 10950776 1D GCATTTTTTA G/- AAGAGAGCAG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 G 1 0 200520 CASAVA_Build 4 10951607 1I TTATTGATGC -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 6 7 200521 CASAVA_Build 4 10958519 2D ACACACACAT CA/-- CACACACACA 3070 hom 24 het 43 2 29 15 CA 10 9 200522 CASAVA_Build 4 10962085 1D CTACACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 11 10 200523 CASAVA_Build 4 10984329 2I GCTTTTATTG --/TA TACAGTCAGT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TA 1 2 200524 CASAVA_Build 4 10987774 2D ATAAGACTGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 29 0 16 16 AT 11 10 200525 CASAVA_Build 4 10989418 2D TGCATCTGTC TA/-- TGTGTAAGAA 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 TA 1 0 200526 CASAVA_Build 4 11006774 1D TCAAAAAAGT A/- AAATTTTAAT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 A 4 3 200527 CASAVA_Build 4 11020160 1I TTGTAAGGGT -/G GGGGCTCCAT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 G 4 5 200528 CASAVA_Build 4 11036671 1I GAAAAAAACT -/A GGGAATAGCC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 0 1 200529 CASAVA_Build 4 11037087 1I CTTCAGAGGC -/G CCCCCCCCCA 3070 het 320 hom 23 2 14 7 G 0 1 200530 CASAVA_Build 4 11047692 3D CTTGAGAACA AAC/--- AACATCTGCT 3070 hom 103 het 40 0 38 2 AAC 2 1 200531 CASAVA_Build 4 11056749 4D CTTTAATGAT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 39 0 26 14 A 15 11 200532 CASAVA_Build 4 11063863 4I ATGGTGCGTG ----/TATA TATATATATA 3070 hom 51 het 27 0 18 9 TA 7 9 200533 CASAVA_Build 4 11065739 5D14M5D AAGAAGAAGG GAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAA/-----AGAAGAAGAGGAAG----- GAAGAGGAAG 3059 het 1410 hom 20 6 11 12 N/A 0 0 200534 CASAVA_Build 4 11073385 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 7 6 200535 CASAVA_Build 4 11074531 1D TTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 32 2 21 9 T 15 14 200536 CASAVA_Build 4 11117766 1D CCTTCAATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 9 8 200537 CASAVA_Build 4 11124057 1D TTCAGGGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 11 10 200538 CASAVA_Build 4 11138705 1D ACCTAAATGA G/- TTCCCACTGA 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 G 1 0 200539 CASAVA_Build 4 11139615 1D CACTTGCAAG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 16 20 12 T 8 7 200540 CASAVA_Build 4 11142415 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 A 8 7 200541 CASAVA_Build 4 11146359 2D TACAAGGCTC TG/-- TGCTTACTGA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 TG 2 1 200542 CASAVA_Build 4 11147365 5D TTTTTGCCTT AAGTC/----- AAGTAACTCA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 AAGTC 1 0 200543 CASAVA_Build 4 11147451 1D CTGTGGACAT A/- GAGTAGAGTA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 1 0 200544 CASAVA_Build 4 11147638 1D AAATAGAAAA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 24 0 13 11 T 2 1 200545 CASAVA_Build 4 11149086 6I TGTCAATAGA ------/TTTTCT TTTTGTTAAT 3070 het 3070 ref 48 30 14 4 TTTTCT 0 1 200546 CASAVA_Build 4 11151539 18D AAAGCTGTAC TGGGCTGCATGCAGCCTG/------------------ TGGGCTGCAG 3070 het 3070 ref 24 15 9 6 TGGGCTGCATGCAGCCTG 1 0 200547 CASAVA_Build 4 11153013 1I TTCTATATAC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 T 7 8 200548 CASAVA_Build 4 11155593 3D TTAAGACATA GTT/--- GTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 24 8 GTT 3 2 200549 CASAVA_Build 4 11155850 1D TTGTCACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1881 hom 31 9 17 5 T 13 12 200550 CASAVA_Build 4 11158384 4I AAAATACATA ----/AAAT AAATATATGC 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 AAAT 1 2 200551 CASAVA_Build 4 11160713 1D AAGTGTATTA T/- TCAACATATT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 2 1 200552 CASAVA_Build 4 11163395 1D CACCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1799 hom 23 6 10 7 A 17 16 200553 CASAVA_Build 4 11167073 1D TGCTGCAATG A/- AACTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 3 2 200554 CASAVA_Build 4 11174302 10D TAATAATAAT AAAAAAAAGG/---------- AAAAAAACAA 3070 het 1305 hom 15 3 12 0 AAAAAAAAGG 1 0 200555 CASAVA_Build 4 11198121 1I CAACTCCATA -/T TTTTTACATG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 5 6 200556 CASAVA_Build 4 11202520 14D CTCTCACTAC ATTATTATTATTCT/-------------- CATCATGTCA 3070 het 3070 ref 54 39 15 7 ATTATTATTATTCT 1 0 200557 CASAVA_Build 4 11205368 1I GGTTGAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 19 8 9 2 T 11 12 200558 CASAVA_Build 4 11212921 4I GGACACTACA ----/CTTT CTTAATGCAT 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 CTTT 0 1 200559 CASAVA_Build 4 11213243 1D AGTTAAATTG C/- ATAGGAAGTG 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 C 1 0 200560 CASAVA_Build 4 11222447 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCACC 2240 hom 12 het 5 0 5 0 G 4 3 200561 CASAVA_Build 4 11222677 3D TGCAAATGGG ATA/--- ATGATTTACT 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 ATA 1 0 200562 CASAVA_Build 4 11223180 9D GAATCTGAGG CCCAGAAGA/--------- CCTTGGTGAA 3070 het 3070 ref 39 23 15 3 CCCAGAAGA 1 0 200563 CASAVA_Build 4 11226775 1I AGCAAAGGTA -/T AATACTTGTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 0 1 200564 CASAVA_Build 4 11229730 1D GAACTGATGG A/- AAAACTTTGT 3070 hom 141 het 49 0 48 1 A 5 4 200565 CASAVA_Build 4 11233502 1D GTTAAGACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 60 25 27 8 T 10 9 200566 CASAVA_Build 4 11234255 2I CTTTTTGTAG --/TT TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 7 9 200567 CASAVA_Build 4 11239401 3I AGGGGGCTGA ---/TGT TGTTTGGAAA 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 TGT 1 2 200568 CASAVA_Build 4 11249633 1D GATGAAACCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 T 10 9 200569 CASAVA_Build 4 11258769 1I TCACATCTAG -/T TTTTTTTTTT 3031 het 3031 ref 28 10 8 10 T 15 16 200570 CASAVA_Build 4 11288087 1I TGCATGTGTC -/T TTACAGAAGA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 2 3 200571 CASAVA_Build 4 11305711 1D TGATTAAGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 9 8 200572 CASAVA_Build 4 11318807 2I TTGAATTGTT --/TC TGTGTCTTTG 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 TC 0 1 200573 CASAVA_Build 4 11319234 1I GATGGGGTTG -/T TTTTTTTTCT 2916 het 2916 ref 19 8 8 3 T 8 9 200574 CASAVA_Build 4 11327355 1D GATGGTAATC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 114 het 42 0 38 5 T 8 7 200575 CASAVA_Build 4 11331481 4D TATATCATGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 39 het 16 0 14 4 AT 9 7 200576 CASAVA_Build 4 11333944 3I ATGCTCTGAA ---/AAG AAGTATTTTC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AAG 1 2 200577 CASAVA_Build 4 11353986 5I AGGAGAAAAC -----/AAAAT AAAAGTATCA 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 AAAAT 0 1 200578 CASAVA_Build 4 11356808 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 785 het 423 hom 11 2 5 5 A 18 16 200579 CASAVA_Build 4 11366243 4D27M4I TCACAAGGAC ATATATATATATGGTCAAGATCATAAAATAT----/----ATATATATGGTCAAGATCATAAAATATATTA ATTAATTATA 3070 het 3070 ref 38 32 10 7 N/A 0 0 200580 CASAVA_Build 4 11366549 1D ATTTGAGTTG C/- TATGTAATAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 C 1 0 200581 CASAVA_Build 4 11367063 1D GGAGTTGTGC T/- GCTTTAAGAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 1 0 200582 CASAVA_Build 4 11368045 5D TCTAAGACTC CTCTT/----- CTATTTCCTA 3070 het 3070 ref 54 25 26 8 CTCTT 1 0 200583 CASAVA_Build 4 11368869 2I ACTAAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 2650 het 1401 hom 14 4 8 2 A 13 15 200584 CASAVA_Build 4 11373600 6D TAAACAAGAA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 AT 8 5 200585 CASAVA_Build 4 11374255 3I TGCTACCATC ---/ATG ATTTCCTTTT 3070 het 3070 hom 55 25 25 5 ATG 0 1 200586 CASAVA_Build 4 11374520 1D GGTGGGGGGT G/- GGGGGGGTAA 1656 het 1656 ref 24 11 5 8 G 8 7 200587 CASAVA_Build 4 11374716 8D TACCACTCTC TTCTCTGA/-------- TTCTCTGAGT 3070 het 3070 ref 35 19 16 4 TTCTCTGA 2 1 200588 CASAVA_Build 4 11377827 2I TCTGTGTGTA --/TG TGTGTGTACC 3070 het 3070 hom 57 23 26 8 TG 3 4 200589 CASAVA_Build 4 11400457 1I TTTATTTCTC -/T TTTTTTTTTT 1272 het 1272 ref 33 18 4 11 T 13 14 200590 CASAVA_Build 4 11464014 3I AGAAATGCTT ---/TAA TAATATAAAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 TAA 1 2 200591 CASAVA_Build 4 11465346 4D AATTATCATC AATA/---- AGAAAGTATG 3070 het 3070 ref 23 13 9 2 AATA 1 0 200592 CASAVA_Build 4 11470286 1D GGTCTCCCCC T/- ATCTCATGGT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 1 0 200593 CASAVA_Build 4 11473730 4D TTTTTCTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 TC 7 5 200594 CASAVA_Build 4 11476783 8I CACACACTGG --------/GGCCTACC GGCCTACCGG 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 GGCCTACC 1 2 200595 CASAVA_Build 4 11482273 1I AGTTAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 10 11 200596 CASAVA_Build 4 11496784 2I43M1D ACACACACAT --ACACACACATGTAAATAAAACACACATACACACACAAATGTACA/ACACACACACATGTAAATAAAACACACATACACACACAAATGCAC- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 52 34 14 20 N/A 0 0 200597 CASAVA_Build 4 11498346 4D ACTGATGACC CATT/---- CATTCATCCT 3070 het 3070 ref 56 27 24 8 CATT 2 1 200598 CASAVA_Build 4 11500865 4I AGAATAGAAG ----/AACA AAGAAGGCAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 AACA 0 1 200599 CASAVA_Build 4 11501271 1I AATAGACAGG -/T CTATGATAAA 3070 het 3070 ref 46 28 16 2 T 0 1 200600 CASAVA_Build 4 11502896 1I AGTGACATAT -/A AAAAACTCTC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 5 6 200601 CASAVA_Build 4 11504122 9I AAGATTTTCT ---------/TAGATATAA TAATAATAGC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 TAGATATAA 0 1 200602 CASAVA_Build 4 11506891 5I GCCTATCTTC -----/TCTTT TAACAGTCTA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 TCTTT 0 1 200603 CASAVA_Build 4 11507443 1D TGCTGTTCTC A/- ACAATAGTGA 3070 het 3070 ref 43 26 16 1 A 2 1 200604 CASAVA_Build 4 11507701 2D TGGTACCAGT AG/-- AGTGGGGTAC 3070 het 3070 hom 55 19 29 7 AG 2 1 200605 CASAVA_Build 4 11510355 1I TACTCACAAA -/G GGAAGACAAT 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 G 2 3 200606 CASAVA_Build 4 11512123 8D11M1D TATATATATA TATATATGTAATTTACCATG/--------TAATTTATCAT- AGGAATTAGC 3070 het 3070 ref 22 15 9 2 N/A 0 0 200607 CASAVA_Build 4 11536067 1D ATCCTATCAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 8 7 200608 CASAVA_Build 4 11536154 1I GTTGTGCATT -/C ATTTATATTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 C 0 1 200609 CASAVA_Build 4 11548336 2D ACTTGTTTTG TT/-- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 27 18 8 2 T 8 6 200610 CASAVA_Build 4 11548575 2I TTCATATCTC --/TT TTATTTTTTA 2984 het 2984 ref 23 11 7 5 T 2 4 200611 CASAVA_Build 4 11559770 1D CAAATCATGT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 52 23 17 14 A 8 7 200612 CASAVA_Build 4 11565573 1I CAAAGAAGAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 8 9 200613 CASAVA_Build 4 11570239 1I TGCTCTAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 9 10 200614 CASAVA_Build 4 11592977 1D18M1D TTTTCTATCT AAAAAAAAAAAAAAACAGGA/-AAAAAAAAAAAAAACAGG- AAAATACTAC 3070 het 234 hom 21 1 17 9 N/A 0 0 200615 CASAVA_Build 4 11602770 1D TGGAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 27 1 22 13 A 11 10 200616 CASAVA_Build 4 11603377 1D AATCAGTAAC A/- AAAAACAGTG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 6 5 200617 CASAVA_Build 4 11606862 1I TAAACCCATC -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 A 6 7 200618 CASAVA_Build 4 11608235 1I TTTGAGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 23 1 18 4 A 11 12 200619 CASAVA_Build 4 11611402 3D GTCATTACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1686 het 240 hom 18 3 6 9 T 17 14 200620 CASAVA_Build 4 11612714 1D GATCAAGCAA T/- ATCACTTCTG 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 T 1 0 200621 CASAVA_Build 4 11617670 1D19M5I ATATTTATCC TTTGAAAGTAATTCTGTGAC-----/-TTGAAAGTAATTCTGTGACTTTAG TTTAATCACA 3070 hom 123 het 30 0 42 3 N/A 0 0 200622 CASAVA_Build 4 11636087 1D TACATAGGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 918 hom 26 2 14 10 A 16 15 200623 CASAVA_Build 4 11665479 1I CCCACCTCTA -/C CCTGTGGTCG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 2 3 200624 CASAVA_Build 4 11666551 2D ATTATTAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 24 0 18 8 T 12 10 200625 CASAVA_Build 4 11669186 1D TTTATCACAG C/- CACCACTACC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 2 1 200626 CASAVA_Build 4 11688518 1D TGCTTTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 48 0 40 8 T 10 9 200627 CASAVA_Build 4 11689132 3I AAAACGAGCA ---/CTT CTTCATCCTT 3070 hom 105 het 45 0 36 9 CTT 1 2 200628 CASAVA_Build 4 11689260 4I CTTGTAATAC ----/CTAA CTAACTCTGT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 CTAA 1 2 200629 CASAVA_Build 4 11691152 3D35M1D CTTGTCCTAT ATAATGTTATTGCTTATATGTTGTTACCATCACTAATAT/---ATGTTATTGCTTATATGTTATTACCATCACTAATA- TTTTTTATCT 3070 hom 75 het 28 0 26 11 N/A 0 0 200630 CASAVA_Build 4 11693502 1D AGCTAATTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 103 het 38 0 35 4 T 8 7 200631 CASAVA_Build 4 11694626 1D AGAAGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 30 3 19 8 T 18 17 200632 CASAVA_Build 4 11695849 3I ACATTTTAAA ---/TAT TATTGTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TAT 1 2 200633 CASAVA_Build 4 11696069 3D GGTAAATAAT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 102 het 48 0 34 19 TTG 7 6 200634 CASAVA_Build 4 11696558 1I ACAGACTAAC -/T TTTAGAAAGG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 3 4 200635 CASAVA_Build 4 11697114 1I AGTATGCAGG -/T GGAAAAAATC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 0 1 200636 CASAVA_Build 4 11697176 1D AAAGACAATT A/- CAAATAGAAC 3070 hom 45 het 20 0 16 5 A 1 0 200637 CASAVA_Build 4 11700456 2I AACAGACAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 121 hom 37 1 25 11 A 10 12 200638 CASAVA_Build 4 11708041 1I TCTGGGTGAT -/A AAAAGAGTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 4 5 200639 CASAVA_Build 4 11708840 1D ATTCCCAAGA T/- TTACATAGCT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 3 2 200640 CASAVA_Build 4 11729712 2D ATTGATTTTA TG/-- TGTCATGCAC 3070 hom 96 het 36 0 31 6 TG 2 1 200641 CASAVA_Build 4 11732455 8D TAAGGTGCTA ACGTCTGT/-------- ACGTCTGTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 ACGTCTGT 2 1 200642 CASAVA_Build 4 11732663 6I30M4D TAAATTTAGG ------TTAATAACTATTAATACATGCATGCCCATGTGCA/TTAATATTAATAACTATTAATACATGCATGCCCATG---- TGCACACACA 3070 hom 48 het 26 0 17 22 N/A 0 0 200643 CASAVA_Build 4 11732823 2I ATGCACACAC --/AT ATGTGTATGT 3070 hom 69 het 36 0 24 12 AT 1 2 200644 CASAVA_Build 4 11733687 1D GTATATTGTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 144 het 53 0 48 6 A 9 8 200645 CASAVA_Build 4 11742857 5I AAGAGAAAGA -----/GAAAG GAATCAAGGC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 GAAAG 0 1 200646 CASAVA_Build 4 11751259 2D TCCAATTTTC CT/-- CTCTTAGCTG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 CT 3 2 200647 CASAVA_Build 4 11751711 1D AGAAACAAGA C/- CAAGCTCTAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 2 1 200648 CASAVA_Build 4 11752442 5D TTTGAAAAAT AAAGG/----- AAAGGTACTA 3070 hom 144 het 53 0 49 7 AAAGG 2 1 200649 CASAVA_Build 4 11773915 1I GTTTTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 32 0 19 13 A 11 12 200650 CASAVA_Build 4 11779653 2I TCTAAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 31 0 21 10 A 14 16 200651 CASAVA_Build 4 11786506 1I GTTGCATGGG -/T TTTTTTTTTT 1515 het 1515 ref 36 23 5 8 T 13 14 200652 CASAVA_Build 4 11787027 1D AAATTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1869 het 1869 ref 25 12 6 8 A 17 16 200653 CASAVA_Build 4 11799044 2D AAGAAAAGAC TT/-- ATAAAGTGAG 3070 het 2767 hom 29 7 19 3 T 2 0 200654 CASAVA_Build 4 11816121 3I AGGGATGTGC ---/AAT AATAAGGATA 3070 hom 157 het 56 0 53 3 AAT 1 2 200655 CASAVA_Build 4 11817443 1D TACAATGTGA T/- TTTTTTAATC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 6 200656 CASAVA_Build 4 11831180 1D TTTCATGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 641 hom 41 3 22 17 A 17 16 200657 CASAVA_Build 4 11837093 1I TATTGAATGC -/A TTATGGAAGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 0 1 200658 CASAVA_Build 4 11837690 2I TTTTTTTGTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 13 22 10 A 10 12 200659 CASAVA_Build 4 11840908 1I AACACTGAAC -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 T 6 7 200660 CASAVA_Build 4 11842744 1I TGTGGTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 10 11 200661 CASAVA_Build 4 11846677 1I CATTTTTAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 A 8 9 200662 CASAVA_Build 4 11846944 3D AGTAATAAAG AAT/--- ATTATTAGTA 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 AAT 1 0 200663 CASAVA_Build 4 11847397 1D GGTTACTAGT A/- TTGCATCACA 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 A 1 0 200664 CASAVA_Build 4 11847563 1I AATGTGATGA -/G TTGGGGGTTG 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 G 0 1 200665 CASAVA_Build 4 11855994 3I GCATTCTTGG ---/AAA AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 36 16 18 2 A 7 10 200666 CASAVA_Build 4 11856546 1D CAGGTAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 10 A 13 12 200667 CASAVA_Build 4 11857947 2I AAACTCAAAG --/CA CAGTGTTGAG 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 CA 1 2 200668 CASAVA_Build 4 11866121 2I GCTTTGTACA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 11 19 11 T 9 11 200669 CASAVA_Build 4 11866207 1I ATCTTTCACA -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 6 7 200670 CASAVA_Build 4 11876492 2I AAAAAATCAC --/TT TATGATTTCC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 1 3 200671 CASAVA_Build 4 11878821 1D ATAAATATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2415 hom 24 8 10 6 A 11 10 200672 CASAVA_Build 4 11898102 4I AACATTTGAC ----/AGAT AGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AGAT 0 1 200673 CASAVA_Build 4 11908729 1I GCCCTTCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 11 15 18 T 15 16 200674 CASAVA_Build 4 11912019 1I AAATTGACTT -/A ACAAGAAATA 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 A 1 2 200675 CASAVA_Build 4 11917054 1I GATTTTTTGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 T 8 9 200676 CASAVA_Build 4 11965074 1D CAACAAGATT A/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 A 1 0 200677 CASAVA_Build 4 11970756 1I TAGCTAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 A 9 10 200678 CASAVA_Build 4 11984952 1I TTCTTTCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 T 10 11 200679 CASAVA_Build 4 11992370 1D CAGCTTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 12 11 200680 CASAVA_Build 4 11992686 2D CATACACATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 A 12 10 200681 CASAVA_Build 4 11993808 1D GGTTGTACAG T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 38 11 20 8 T 7 6 200682 CASAVA_Build 4 11999245 1D TATTAGCGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 T 12 11 200683 CASAVA_Build 4 12168988 1D ACTTTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 1390 het 1390 ref 35 22 3 10 T 11 10 200684 CASAVA_Build 4 12171964 1D GGCACTCAAC A/- AATGTCAGTT 3070 het 3070 ref 51 29 18 5 A 3 2 200685 CASAVA_Build 4 12219609 1I TTCCTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 T 10 11 200686 CASAVA_Build 4 12223036 6I ATCCCAGAAC ------/TTAAAA TTAAATTAAA 3070 het 2794 hom 21 9 10 2 TTAAAA 0 1 200687 CASAVA_Build 4 12224909 1D TGTGTTTTAG T/- TTTTATCACT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 5 4 200688 CASAVA_Build 4 12228712 2D ATTGCCGTGG CC/-- AGAGTTCAAC 3070 het 3070 ref 50 24 17 13 C 2 0 200689 CASAVA_Build 4 12245814 1I AGAAGAAAGG -/T TTTTATCCCT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 4 5 200690 CASAVA_Build 4 12246815 1D ATAGGCTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1848 hom 27 8 15 4 T 15 14 200691 CASAVA_Build 4 12249138 1I TTGACTACCC -/T CATGTGCTTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 0 1 200692 CASAVA_Build 4 12250914 4D TCCCCTCCAG CGCT/---- CATGTTTACC 3070 het 3070 ref 46 22 19 9 CGCT 1 0 200693 CASAVA_Build 4 12255761 1D GCATTCTTGC T/- GTGTCAAAAC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 T 1 0 200694 CASAVA_Build 4 12256152 5I CTATAACATG -----/AATAT AATGTGTCAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 AATAT 0 1 200695 CASAVA_Build 4 12257439 1D TCTGACTCAT A/- ACAGGCACTA 3070 hom 81 het 29 0 27 3 A 2 1 200696 CASAVA_Build 4 12258275 2I AAATAGATCA --/AC ACAGACTTAA 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 AC 1 2 200697 CASAVA_Build 4 12258781 1D TCTTTGTTGC A/- AAAAAAAAAA 1177 het 1177 ref 41 31 4 6 A 11 10 200698 CASAVA_Build 4 12259088 4I30M2I19M2I CTGTATATAT ----TATATACATATGTGTATATATAATATATAC--GTGTTTATAATATGTATAC--/ATTATATATACATATGTGTATATATGATATATACATGTGTTTATAATATGTATACGT GTGTGTATAT 3070 het 1607 hom 10 4 7 2 N/A 0 0 200699 CASAVA_Build 4 12259545 2D TGCATACATA AT/-- ATATATATGT 2542 het 2542 ref 18 10 8 0 AT 5 4 200700 CASAVA_Build 4 12261617 2I GAGTGCAGTG --/GC GTGATCTTGG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 GC 0 1 200701 CASAVA_Build 4 12263399 3D CAAAAAAAAA AAC/--- CAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 8 AAC 1 0 200702 CASAVA_Build 4 12263552 1D GGTGTCTTGC A/- AAAGATTTTG 3070 het 3070 hom 41 11 21 10 A 4 3 200703 CASAVA_Build 4 12275944 3D ATGAATACAT AAC/--- AACATGATAA 3070 het 3070 ref 35 24 11 3 AAC 2 1 200704 CASAVA_Build 4 12278189 1I ACTGAATTAT -/C TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 C 0 1 200705 CASAVA_Build 4 12282159 3D TGAGTTGGCT GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 GAG 5 4 200706 CASAVA_Build 4 12282845 5I TAACCTTTGG -----/TATAT TATTCTGTTC 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 TATAT 0 1 200707 CASAVA_Build 4 12284638 1I AACCCAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 9 10 200708 CASAVA_Build 4 12289212 1D ATTACTTTGA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 T 7 6 200709 CASAVA_Build 4 12296895 1I TGGTTTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 10 11 200710 CASAVA_Build 4 12319657 1D TTGTGAAAAC A/- AAACAAAACA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 4 3 200711 CASAVA_Build 4 12323679 3I TAGTGGAGTC ---/CTT CTTCCTGGCC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 CTT 1 2 200712 CASAVA_Build 4 12326223 5D ATAAATTATA TATAT/----- TATATTATAT 2549 het 330 hom 7 1 6 0 TATAT 3 2 200713 CASAVA_Build 4 12335388 1I ATTGACACTC -/T TTCCTCCTTT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 T 2 3 200714 CASAVA_Build 4 12344060 1D CTAGAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 1322 het 1322 ref 30 17 5 8 T 19 18 200715 CASAVA_Build 4 12383506 3D CTGTCATTTG CAA/--- CAACATGGAT 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 CAA 2 1 200716 CASAVA_Build 4 12390577 1D TAGGAAGTGG T/- TCCTTCCCCT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 2 1 200717 CASAVA_Build 4 12391434 3I TGTATTCTTG ---/AAA AAAATAGATA 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 A 4 7 200718 CASAVA_Build 4 12408836 1D ATGGGCACTA T/- TGTTGTCCAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 2 1 200719 CASAVA_Build 4 12415177 1I GTTTTCTTAG -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 7 200720 CASAVA_Build 4 12422813 1I GGTGTGAGAT -/G GTATGTCATT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 G 1 2 200721 CASAVA_Build 4 12437066 1I CATGTAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 10 11 200722 CASAVA_Build 4 12440159 1I CCAGGACCTA -/G CTCACTGATG 3070 hom 135 het 54 0 46 8 G 0 1 200723 CASAVA_Build 4 12451145 1I ATGTAATGTC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 7 8 200724 CASAVA_Build 4 12452076 1D AAATAAACAA C/- CCCCCCCCCC 2311 hom 34 het 13 0 10 3 C 11 10 200725 CASAVA_Build 4 12453228 1D ACCCTGTCTC G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 105 het 48 0 34 15 G 10 9 200726 CASAVA_Build 4 12487778 1D GTGGATTAGG A/- AAAGACAACA 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 A 4 3 200727 CASAVA_Build 4 12496744 1I TTTAGGCTCG -/A TAAGGACTGG 3070 hom 150 het 58 0 50 8 A 0 1 200728 CASAVA_Build 4 12521188 1D AAAAGATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 27 3 A 12 11 200729 CASAVA_Build 4 12524782 2I AAAAAAAAAA --/AC AAGTCAGAAA 3070 hom 50 het 22 0 16 6 AC 0 1 200730 CASAVA_Build 4 12525168 2I TACTTCATGC --/AT ATATATATAT 3070 het 1739 hom 30 4 17 9 AT 7 8 200731 CASAVA_Build 4 12527109 2D TGGTAAATCA CT/-- GTTACTTTCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 CT 1 0 200732 CASAVA_Build 4 12527912 1I CTTCCAAAAC -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 6 7 200733 CASAVA_Build 4 12530154 1I CACAGATCAT -/G TTTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 G 0 1 200734 CASAVA_Build 4 12530826 1D18M1D ATCACGTTTT GTTTTTGTTTTTGTTTTTGT/-TTTTTGGTTTTGTTTTTG- TTTTTTTTGC 3070 het 1629 hom 34 10 15 10 N/A 0 0 200735 CASAVA_Build 4 12535040 3D AGGCGAATGT AGA/--- AGAAGCACCT 3070 het 3070 hom 55 21 33 2 AGA 2 1 200736 CASAVA_Build 4 12551732 2D AATCTTCAGC AA/-- AAGTTAAGCA 3070 het 3070 hom 58 26 25 8 A 4 2 200737 CASAVA_Build 4 12553558 1I TCCAATAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 8 9 200738 CASAVA_Build 4 12554132 1D AGTGATTTCC G/- GTTACATTTC 3070 het 3070 hom 56 19 32 6 G 2 1 200739 CASAVA_Build 4 12573363 1D AAACACACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 12 16 9 A 10 9 200740 CASAVA_Build 4 12574855 1I TCTTGCTGCA -/C CCATTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 C 2 3 200741 CASAVA_Build 4 12577169 1D CAGATGAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 403 hom 34 1 25 8 A 10 9 200742 CASAVA_Build 4 12577425 1I AAGTCATGTC -/T TTTGGCCATA 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 T 3 4 200743 CASAVA_Build 4 12607655 1I GTCGTATAAA -/G GGGGATTATT 3070 hom 100 het 42 0 33 9 G 4 5 200744 CASAVA_Build 4 12636034 9D TTCTTTTGCA AAACTACCT/--------- AAACTACCTC 3070 het 3070 hom 49 22 23 8 AAACTACCT 2 1 200745 CASAVA_Build 4 12637933 1I GCTATGAATG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 8 9 200746 CASAVA_Build 4 12702163 1I CAATAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3021 het 3021 ref 26 11 9 6 A 10 11 200747 CASAVA_Build 4 12702503 1D CAATTCCACT G/- CTAGGTATCC 1182 het 1182 ref 21 13 3 5 G 1 0 200748 CASAVA_Build 4 12709483 3D CACTAATATC AAT/--- ATAAATTTTG 3070 hom 132 het 50 0 45 7 AAT 1 0 200749 CASAVA_Build 4 12726734 1I AATATCCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 35 1 27 7 A 11 12 200750 CASAVA_Build 4 12734916 4I AGAAATTACG ----/CTAA CTTTCTCTGG 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 CTAA 0 1 200751 CASAVA_Build 4 12740132 1D CAGCTGCATC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 59 32 23 5 T 8 7 200752 CASAVA_Build 4 12740924 1D AGAAGGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 263 hom 36 3 18 16 A 15 14 200753 CASAVA_Build 4 12741385 1D GGCTCCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 A 11 10 200754 CASAVA_Build 4 12747228 1D AAAACCCTCC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 54 het 32 0 23 9 A 7 6 200755 CASAVA_Build 4 12748839 8D CCAGGAAGGC AGTGTGGT/-------- AGTGTGGTAT 3070 hom 117 het 44 0 39 7 AGTGTGGT 2 1 200756 CASAVA_Build 4 12750738 1D GCAGAAAACA G/- GACAGTTTAC 3070 het 3070 hom 55 25 26 6 G 2 1 200757 CASAVA_Build 4 12754492 2D GTGCACATCT CC/-- CCCCCCTAGA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 C 8 6 200758 CASAVA_Build 4 12763465 1D CAGAAGGCAA G/- GGGGGAGCAA 3070 het 3070 hom 51 22 18 11 G 6 5 200759 CASAVA_Build 4 12763684 4D21M1I ATCAAAAGCA AGTTAGTTACTTCCTAGATACAAGA-/----AGTTACTTCCTAGATACAAGAG GGTACAGACA 3070 het 3070 ref 27 17 13 5 N/A 0 0 200760 CASAVA_Build 4 12764575 1I GAATTTTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 9 10 200761 CASAVA_Build 4 12768651 1I ATACTGAATT -/A AAACAACATA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 3 4 200762 CASAVA_Build 4 12768971 9D CAAATGGAAC TTCCTCCAG/--------- TTCCTCCAGG 3070 het 3070 hom 34 15 16 6 TTCCTCCAG 2 1 200763 CASAVA_Build 4 12807032 2I AGACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 67 25 21 21 AC 8 9 200764 CASAVA_Build 4 12810495 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2525 het 1840 hom 23 6 9 8 A 12 14 200765 CASAVA_Build 4 12827548 1I GGGAGTTGAA -/C AATGAGAACA 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 C 0 1 200766 CASAVA_Build 4 12839814 1I AAAGACAAAG -/A AAGGCATTAC 1655 het 1655 ref 15 10 4 1 A 2 3 200767 CASAVA_Build 4 12874665 1I AATTGCATAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 7 8 200768 CASAVA_Build 4 12901219 1I ATCCATGCTT -/G GGTGCACACA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 2 3 200769 CASAVA_Build 4 12916343 1I AGGTGCGGAG -/C CATCCGGCCC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 C 1 2 200770 CASAVA_Build 4 12923461 1D ATTAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1341 het 1341 ref 30 18 3 9 A 15 14 200771 CASAVA_Build 4 12949477 1I TGTCTAGTGT -/G TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 0 1 200772 CASAVA_Build 4 12974346 4D AAAAAGAAAT AGTC/---- AGACAATTTT 3070 het 3070 hom 37 14 22 4 AGTC 1 0 200773 CASAVA_Build 4 13022991 1I TCCAGGTGGC -/A GCAAGAGTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 0 1 200774 CASAVA_Build 4 13044368 1I TTGAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 A 9 10 200775 CASAVA_Build 4 13146312 1I GTCTTACAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2609 hom 25 9 12 4 T 9 10 200776 CASAVA_Build 4 13165645 1I GTAGAATCGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 A 8 9 200777 CASAVA_Build 4 13170191 1D CTGTGCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 875 hom 51 2 42 10 A 12 11 200778 CASAVA_Build 4 13176202 19D CCCAGGCTGG AGTGCAGTGGAGCAATCTC/------------------- AGCTCACCGC 3070 het 3070 ref 29 16 14 1 AGTGCAGTGGAGCAATCTC 1 0 200779 CASAVA_Build 4 13185630 10D TGATTTTAAG TTTTTGTTTT/---------- TTTTTGTTTT 2612 het 2612 ref 23 9 9 5 TTTTTGTTTT 2 1 200780 CASAVA_Build 4 13207308 1I AGCCATGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 12 13 200781 CASAVA_Build 4 13217181 1I CAGATAATGT -/A GGTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 0 1 200782 CASAVA_Build 4 13229590 1I TTTAACTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 13 11 A 13 14 200783 CASAVA_Build 4 13232589 2D AAATTAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2672 het 290 hom 29 4 9 16 T 18 16 200784 CASAVA_Build 4 13246086 1I GAAAGAGTTG -/T TTTTTTTTTT 2695 het 2695 ref 30 17 8 5 T 11 12 200785 CASAVA_Build 4 13246380 1I CCATGAATGA -/T TTTTTATGCA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 5 6 200786 CASAVA_Build 4 13260045 2D3M6I CACTGACACA GCTTT------/--TTTTGGGAA GTTTTGGGAA 3070 het 3070 ref 26 16 7 7 N/A 0 0 200787 CASAVA_Build 4 13266676 1I GGAATACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 A 11 12 200788 CASAVA_Build 4 13267340 1D GACCATGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 912 hom 24 4 10 11 T 17 16 200789 CASAVA_Build 4 13267846 4I GCCAAAGTAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 AAAC 3 4 200790 CASAVA_Build 4 13288506 2I GTTTTAACAG --/GC AAGGTGAATT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 GC 0 1 200791 CASAVA_Build 4 13289075 2D GGTGTGACTC AT/-- AGACAGCAGG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 AT 1 0 200792 CASAVA_Build 4 13289279 1D GAGCTAGATT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 8 7 200793 CASAVA_Build 4 13290244 1I GAATGAATTT -/G AGATTCTTTA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 G 0 1 200794 CASAVA_Build 4 13293029 1I TTTGAGAAAC -/T TTTACCATCC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 3 4 200795 CASAVA_Build 4 13293313 1D AATTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 28 1 24 4 A 11 10 200796 CASAVA_Build 4 13294492 1D TTCAATCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 38 2 25 11 T 13 12 200797 CASAVA_Build 4 13295627 1D TGTTTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 2314 het 2314 ref 29 12 9 8 T 15 14 200798 CASAVA_Build 4 13298621 1I GCATAAGCAG -/A GCACCATGGA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 A 0 1 200799 CASAVA_Build 4 13302095 1I ATTGACTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 7 het 37 1 29 7 T 9 10 200800 CASAVA_Build 4 13313429 1D AAAAATATTA T/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 7 6 200801 CASAVA_Build 4 13313917 4D CATCTTTCTT TGTC/---- TGCCAGCCAC 3070 hom 76 het 29 0 23 7 TGTC 1 0 200802 CASAVA_Build 4 13334779 1D ATTTTGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 36 1 30 5 T 15 14 200803 CASAVA_Build 4 13338293 1I AAATAAGCAG -/T TTCATATTTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 2 3 200804 CASAVA_Build 4 13344962 2I GTAGCAACTC --/AT GTGATCTGCA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AT 0 1 200805 CASAVA_Build 4 13348196 2I TTACTTAGGG --/GT TTCCATTCCA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 GT 0 1 200806 CASAVA_Build 4 13351260 1I TCTAGGGTTC -/T TTTTTTATAG 3070 hom 36 het 13 0 12 1 T 6 7 200807 CASAVA_Build 4 13358188 1D ACATAGTGTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 314 hom 47 1 36 11 T 9 8 200808 CASAVA_Build 4 13359828 1I GGGCCCCATT -/A AAAATGGCTA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 4 5 200809 CASAVA_Build 4 13364172 1I AGTGTAATAT -/G GGGATAATAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 3 4 200810 CASAVA_Build 4 13373988 1D ACATTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 49 0 34 15 T 11 10 200811 CASAVA_Build 4 13379963 14D CTAAATATGG AAGTTTAACATCAA/-------------- AAGAACCCAT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AAGTTTAACATCAA 1 0 200812 CASAVA_Build 4 13384594 1I CTGATAATTG -/T TTTTTTTTTT 962 het 962 ref 32 22 4 6 T 11 12 200813 CASAVA_Build 4 13391026 1I CACAAATCTC -/T TAAGGTTGGG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 1 2 200814 CASAVA_Build 4 13403255 1I ATTACACTGA -/T TTTTTTTTTT 2266 het 2266 ref 25 11 6 8 T 10 11 200815 CASAVA_Build 4 13420104 1I AGAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 A 9 10 200816 CASAVA_Build 4 13425293 2D GCTTTTTAGG TA/-- TATATATATG 2312 het 605 hom 11 3 7 1 TA 5 4 200817 CASAVA_Build 4 13425478 1D ACTGCTCACT G/- GCAGCCCTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 1 200818 CASAVA_Build 4 13442188 1I TGTTGAAAAG -/C CCCCTTACTC 3070 het 3070 hom 38 19 15 4 C 4 5 200819 CASAVA_Build 4 13449475 1D AACACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 12 11 200820 CASAVA_Build 4 13453513 2D AGTTCCTCCT TC/-- TCTCTCTTCT 3070 hom 90 het 35 0 29 7 TC 4 3 200821 CASAVA_Build 4 13456425 1I ATTTGGGGCC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 55 22 20 13 A 8 9 200822 CASAVA_Build 4 13460656 3D AGATGTTTTG TCT/--- TCTTACAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 TCT 2 1 200823 CASAVA_Build 4 13461583 1I TGGAAGCTAC -/T GAGTGGAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 0 1 200824 CASAVA_Build 4 13470361 1I CCAATAAATA -/T TTTTTTGAAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 6 7 200825 CASAVA_Build 4 13470894 1D TTGTTACATT A/- AAAAAAAAAA 1051 het 1051 ref 32 23 4 8 A 13 12 200826 CASAVA_Build 4 13480662 2D GATCTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1008 het 1008 ref 59 35 4 22 TG 9 8 200827 CASAVA_Build 4 13493245 1I CAGGGACATT -/G GGACGGAGTC 3070 hom 111 het 43 0 32 11 G 2 3 200828 CASAVA_Build 4 13493945 10I ATCCTGAGCA ----------/AGTTTCTTTC AGTCTTATTT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 AGTTTCTTTC 0 1 200829 CASAVA_Build 4 13497433 4I TCACCCCCAC ----/CATT CATTCATACC 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 CATT 1 2 200830 CASAVA_Build 4 13498950 1I TTTCCCTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 65 het 25 0 21 4 T 9 10 200831 CASAVA_Build 4 13499090 1D TTAACATGTT C/- CTCTGCAACT 3070 het 3070 ref 37 16 14 8 C 2 1 200832 CASAVA_Build 4 13499220 1I TAATGGACTC -/T CTTTTTGTGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 0 1 200833 CASAVA_Build 4 13509919 1D TAATAAGGAC A/- AAGCAAATTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 3 2 200834 CASAVA_Build 4 13513113 1I GCAGTGTCTT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 C 8 9 200835 CASAVA_Build 4 13524940 1D ATAATAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 901 hom 30 2 25 3 T 11 10 200836 CASAVA_Build 4 13530444 1I TCAGGATTTT -/A AAATGTATCC 3070 hom 116 het 43 0 39 4 A 3 4 200837 CASAVA_Build 4 13534095 1D CAACTATGTC A/- ATTGTGAACT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 2 1 200838 CASAVA_Build 4 13539817 2I GAAATGGATA --/TC AAGTCTTAGA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 TC 0 1 200839 CASAVA_Build 4 13547265 1D AAGTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 38 1 35 2 A 12 11 200840 CASAVA_Build 4 13548231 26D ATTCAGCTAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 29 6 13 17 T 44 18 200841 CASAVA_Build 4 13551485 31D GACAAAAACC TATATATATGATATATATATCATACATATCA/------------------------------- TATATATATG 3070 hom 27 het 24 0 10 16 TATATATATGATATATATATCATACATATCA 2 1 200842 CASAVA_Build 4 13572549 1I TGTAAAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 673 hom 31 2 20 9 A 11 12 200843 CASAVA_Build 4 13575611 1D CAATGTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 190 hom 35 1 27 7 A 13 12 200844 CASAVA_Build 4 13576758 1I CAAACAAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 8 9 200845 CASAVA_Build 4 13579618 1I GTTTCATACA -/T TTTTTTAGCG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 6 7 200846 CASAVA_Build 4 13626260 1D AGCAGTCCCG T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 60 het 24 0 18 7 T 8 7 200847 CASAVA_Build 4 13627103 1D AACTCTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 45 2 36 7 T 13 12 200848 CASAVA_Build 4 13631776 3I TCAAGGTGGT ---/AGA AGAAGGGAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AGA 1 2 200849 CASAVA_Build 4 13647052 1I AAGCCTTTGG -/A ATTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 1 2 200850 CASAVA_Build 4 13662856 1I67M1I ACAGAAAAAA -AAAACAATAAAAAACAGGATAATTCCAATAATTGTTAAATTGTTCTTATCATTTGTTAAATACAATC-/TAAAACAATAAAAAACAGGATAATTCCAATAATTGTTAAATTGTTCTTATCATTTGTTAAATACAATCA GGGGAAAGCT 3070 het 103 hom 32 1 46 12 N/A 0 0 200851 CASAVA_Build 4 13663779 2D GGGTGAGTAC TA/-- TAAAAGCAGT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 TA 2 1 200852 CASAVA_Build 4 13671285 4I GGGCTTACCT ----/AATA AATCTACCTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AATA 0 1 200853 CASAVA_Build 4 13677825 1D AAAAGTGCAA T/- ATAACAGATG 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 T 1 0 200854 CASAVA_Build 4 13682343 2D CTAAACTCAT CC/-- CCCCTTCTTG 3070 hom 125 het 47 0 41 8 C 6 4 200855 CASAVA_Build 4 13688378 1I TGGTGACACC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 138 het 55 0 43 12 T 7 8 200856 CASAVA_Build 4 13692548 1D AAAACTCATC T/- CATCACCTAC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 1 0 200857 CASAVA_Build 4 13698476 1D TTATAGTCTG T/- TTACATCTCC 3070 hom 126 het 48 0 43 6 T 3 2 200858 CASAVA_Build 4 13701427 2D ATTTATTTTG CT/-- CACAATTTTG 3070 het 3070 ref 55 27 24 4 CT 1 0 200859 CASAVA_Build 4 13710866 2D GAGCTAACAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 113 het 44 0 38 7 TG 6 5 200860 CASAVA_Build 4 13722788 1D AGAAAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 37 0 23 14 T 11 10 200861 CASAVA_Build 4 13730306 13I GTGATTTCGA -------------/GTGGGCTGTTCTG ACAGCCCGGG 3070 hom 154 het 56 0 52 4 GTGGGCTGTTCTG 0 1 200862 CASAVA_Build 4 13749910 1D TGTGATTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 25 8 T 10 9 200863 CASAVA_Build 4 13753266 1D TAATTTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 20 2 13 7 A 12 11 200864 CASAVA_Build 4 13754360 1D AGCCTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 458 hom 32 2 24 6 T 12 11 200865 CASAVA_Build 4 13756186 2I ACCAATAGGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TG 6 7 200866 CASAVA_Build 4 13758894 1I ATCCCTTAAG -/A AAAAAATGAC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 6 7 200867 CASAVA_Build 4 13760252 1D TAATTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 306 hom 54 1 40 13 T 11 10 200868 CASAVA_Build 4 13765657 1I GATTAGCTTG -/T TTTCACTTAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 3 4 200869 CASAVA_Build 4 13766878 1D CCAACTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 34 1 28 6 A 12 11 200870 CASAVA_Build 4 13767078 1D TGACATCTGT A/- GAATTGTTCA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 1 0 200871 CASAVA_Build 4 13771859 2D CTAATCTATC TT/-- TTTTTTTTTT 2087 het 100 hom 41 3 13 26 T 20 18 200872 CASAVA_Build 4 13772927 4I GGAATTTCTG ----/CTTT CTATTTCAGG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 CTTT 0 1 200873 CASAVA_Build 4 13779438 1D TTTATATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 48 0 40 10 T 12 11 200874 CASAVA_Build 4 13780896 1D AGTGGGGGAG C/- TTTTTGAGTC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 1 0 200875 CASAVA_Build 4 13787700 1I TTGTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 37 2 25 10 A 11 12 200876 CASAVA_Build 4 13797849 78D AAGAATCAGA AATCCAAGTCTAGTTTCTATCCTTACATTGAGCAGTTATCAAGTGCAGACAGTCCAAGGAAGAGGATGTGAGTTTGGG/------------------------------------------------------------------------------ CAGAAGCTGT 3007 het 3007 ref 25 32 8 5 AATCCAAGTCTAGTTTCTATCCTTACATTGAGCAGTTATCAAGTGCAGACAGTCCAAGGAAGAGGATGTGAGTTTGGG 1 0 200877 CASAVA_Build 4 13799866 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAAGTAG 3070 hom 25 het 10 0 9 2 A 7 6 200878 CASAVA_Build 4 13804170 1I CAAATGATGG -/T TTTTATATGA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 4 5 200879 CASAVA_Build 4 13828467 1D TTTCCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 24 4 13 7 T 15 14 200880 CASAVA_Build 4 13838151 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2155 het 209 hom 12 2 6 5 A 14 12 200881 CASAVA_Build 4 13839877 1D TCAGTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 2862 het 2862 ref 26 13 8 5 T 12 11 200882 CASAVA_Build 4 13852588 1I TCCGATGAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 T 9 10 200883 CASAVA_Build 4 13860484 3D CTATATGTAA TAT/--- TATATGTCAC 3070 het 3070 ref 38 19 16 6 TAT 2 1 200884 CASAVA_Build 4 13861092 1I TATGACTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 A 13 14 200885 CASAVA_Build 4 13874742 1D ATTAGCAAGC A/- AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 7 6 200886 CASAVA_Build 4 13885649 2I ATTGGGGGGG --/GC GGGATATAGA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 GC 0 1 200887 CASAVA_Build 4 13888099 1I TTCTCTGTTT -/C CCCCCCCAGT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 C 7 8 200888 CASAVA_Build 4 13895210 1D AGGGACTAGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 1250 hom 37 4 19 14 T 9 8 200889 CASAVA_Build 4 13895240 6I ACTTAAAAAT ------/GTCTTA GTTTTCCATG 3070 het 2533 hom 30 6 12 12 GTCTTA 0 1 200890 CASAVA_Build 4 13897610 7I CTATAAGACC -------/AGCACTA AGCACTAAGC 3070 hom 108 het 49 0 36 13 AGCACTA 2 3 200891 CASAVA_Build 4 13901600 2I GTTTAGAGAC --/AA AATTTTATTG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 2 4 200892 CASAVA_Build 4 13919540 1D TCTGTTCTTC T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 8 7 200893 CASAVA_Build 4 13921659 1D AATCCTGAGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 9 8 200894 CASAVA_Build 4 13924376 9I AAAGTGCCTA ---------/GAACAACGT GAACAACGTT 3070 hom 107 het 43 0 36 8 GAACAACGT 1 2 200895 CASAVA_Build 4 13930327 1D CCATGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 251 hom 52 3 29 20 T 15 14 200896 CASAVA_Build 4 13932860 1D CCTTCTCTTT C/- CCCTTTCCAG 3070 hom 131 het 51 0 43 8 C 4 3 200897 CASAVA_Build 4 13947925 2D CAGTTAAACG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 28 1 9 19 A 12 10 200898 CASAVA_Build 4 13951409 3D TGCTTTTTTT TTG/--- TTGTTTTTAT 3070 hom 117 het 42 0 37 6 TTG 2 1 200899 CASAVA_Build 4 13951653 4I CACCAAGTCC ----/ACAG ACAGACTTAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ACAG 1 2 200900 CASAVA_Build 4 13953451 1D TCTCTTTTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 116 het 43 0 38 8 T 9 8 200901 CASAVA_Build 4 13953723 1D ATGTCATATT A/- TTATTAATTG 3070 het 3070 hom 27 10 15 4 A 1 0 200902 CASAVA_Build 4 13959217 7D AATAAAAATT AAAAACA/------- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 12 AAAAACA 3 2 200903 CASAVA_Build 4 13961248 1D TTCTCTGTTT G/- GAAAGATTAA 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 G 2 1 200904 CASAVA_Build 4 13963047 1I GGAACATCAC -/G GGGGGTGGTC 3070 het 2909 hom 23 8 12 3 G 5 6 200905 CASAVA_Build 4 13992121 1I CAAAAGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 12 13 200906 CASAVA_Build 4 13992519 1I TTATCCACTG -/C TTCACTTTCC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 0 1 200907 CASAVA_Build 4 13992603 4D ATTCAGAGAG AGAC/---- AGAAAGAGAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 AGAC 1 0 200908 CASAVA_Build 4 13993630 1D CATCATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 51 1 43 7 T 11 10 200909 CASAVA_Build 4 13994702 1I TTTTCTTGTA -/T AATGCTTCAT 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 T 0 1 200910 CASAVA_Build 4 13997385 4D CTCTGCCTGC ATAG/---- TGTTGGCTTT 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 ATAG 1 0 200911 CASAVA_Build 4 13997553 1I TTCTTTTTTT -/C TAGAAGGTTC 3070 hom 84 het 35 0 26 9 C 0 1 200912 CASAVA_Build 4 13999040 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 37 2 30 5 T 12 11 200913 CASAVA_Build 4 14001386 1I GAGGATAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 58 25 22 11 A 12 13 200914 CASAVA_Build 4 14001950 6I TGGCAAAGAT ------/TGTGTG TGTATGTGTG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TG 1 4 200915 CASAVA_Build 4 14003011 1I AGCTCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 10 11 200916 CASAVA_Build 4 14003602 1D TCGAAAACTT C/- CTTGTCTCCC 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 C 2 1 200917 CASAVA_Build 4 14017676 4D AAGTGGGTAA ACAG/---- ACAGCTCCTG 3070 het 3070 hom 49 21 24 5 ACAG 2 1 200918 CASAVA_Build 4 14017986 2D TCTTCACAAG CA/-- CACACACACA 2067 het 2067 ref 53 34 8 11 CA 8 7 200919 CASAVA_Build 4 14018004 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 1864 het 1864 ref 45 29 6 13 CA 9 8 200920 CASAVA_Build 4 14020369 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 10 9 200921 CASAVA_Build 4 14023985 1I AACCTAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1854 hom 26 6 16 4 A 11 12 200922 CASAVA_Build 4 14024801 1I CAGAGAGAAG -/A AAAAAACTGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 6 7 200923 CASAVA_Build 4 14028651 1D CAGAATGTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 10 9 200924 CASAVA_Build 4 14047661 3I GAAGAAGGGC ---/TGT TGTGAGAGTC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 TGT 1 2 200925 CASAVA_Build 4 14053409 1D CTGGCAAACA T/- GGTGAAACCC 3070 het 824 hom 21 3 13 5 T 1 0 200926 CASAVA_Build 4 14057132 2D TTTAGGAAAA TG/-- AGAACAGTTA 3070 het 3070 ref 59 33 23 4 TG 1 0 200927 CASAVA_Build 4 14058872 1I TCTTACTAAT -/C CCCCCCTCAG 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 C 6 7 200928 CASAVA_Build 4 14061110 1D TCAGCATGCC A/- ATTTCTCCTG 3070 hom 132 het 52 0 45 8 A 2 1 200929 CASAVA_Build 4 14062253 1D ACTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2643 het 2643 ref 25 14 7 4 T 13 12 200930 CASAVA_Build 4 14063840 1D CATGCTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2574 hom 25 8 11 6 T 13 12 200931 CASAVA_Build 4 14064955 5D AAAATTATGC AAATT/----- AAATATTTGT 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 AAATT 1 0 200932 CASAVA_Build 4 14066296 2D CTGATAATAA CT/-- CTATTATTTC 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 CT 2 1 200933 CASAVA_Build 4 14069114 5D CAAAACAAAC AAAAG/----- AAGTGCATGG 2788 het 2788 ref 19 12 6 7 AAAAG 1 0 200934 CASAVA_Build 4 14069962 2I TGGAGCTATA --/AC ACATTTCTGT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 AC 1 2 200935 CASAVA_Build 4 14073895 4D TTTTAAATTT CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 CTTC 3 2 200936 CASAVA_Build 4 14081884 1D TATTTAAATT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 G 1 0 200937 CASAVA_Build 4 14085658 5D CAACAGGGAA TACTT/----- TACTTTGCAT 3070 hom 141 het 52 0 47 7 TACTT 2 1 200938 CASAVA_Build 4 14086582 4D TATTTTTTAG TTAT/---- TTATTTATAA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 TTAT 3 2 200939 CASAVA_Build 4 14087465 4D AAGGAGAGGT AAGA/---- AAGATTTTGT 3070 hom 119 het 42 0 39 4 AAGA 2 1 200940 CASAVA_Build 4 14088556 3D54M2D TTTTGAAAAC ATTAAACAATTTTAGATTAAAAATATTTTTAAATATAAACCAATTTATATGTAAATATT/---AAACAATTTTAGATTAAAAATATTTTTAAATATAAACCAATTTATATGTAAATA-- TGTTTATATC 3070 het 3070 ref 30 20 14 14 N/A 0 0 200941 CASAVA_Build 4 14088948 4I CCAAAAATCT ----/GTAA GTAAGTCTGC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 GTAA 1 2 200942 CASAVA_Build 4 14089945 4D CAAGATAAAA TCTC/---- TCTCTGAATT 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 TC 4 2 200943 CASAVA_Build 4 14091284 4D AAGGACTAAT CTAA/---- CAGGAAAATA 3070 het 3070 ref 43 25 17 2 CTAA 1 0 200944 CASAVA_Build 4 14098467 6I AAGAAATAAA ------/TGAAAT TGAAACAAAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 TGAAAT 0 1 200945 CASAVA_Build 4 14098794 1I AAATGGTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 9 10 200946 CASAVA_Build 4 14099699 1I CAATAGCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 12 13 200947 CASAVA_Build 4 14100657 1I ATACAAATGA -/C AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 C 0 1 200948 CASAVA_Build 4 14101425 3I TTAAAAAAAT ---/TAA TAATAATAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 TAA 3 4 200949 CASAVA_Build 4 14107586 2I ATAAAATCCC --/CT CAGACTCTAT 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 CT 0 1 200950 CASAVA_Build 4 14117718 3D TTTATTCTTT CTG/--- TTTTTTTTTT 8 het 8 ref 38 23 1 14 CTG 1 0 200951 CASAVA_Build 4 14118274 1I GTAAACTGGC -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 54 24 23 7 T 6 7 200952 CASAVA_Build 4 14118368 1I TGCATGGCTT -/A TGTTCTCTGG 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 A 0 1 200953 CASAVA_Build 4 14122712 1I GTCAAGTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 T 9 10 200954 CASAVA_Build 4 14126079 3D AACTTTAAAA AAG/--- AGAAAACTAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 6 AAG 1 0 200955 CASAVA_Build 4 14127143 5I AAATAAGGCA -----/AGCAT AGCATAGCAT 3070 het 3070 ref 37 16 15 7 AGCAT 2 3 200956 CASAVA_Build 4 14135607 4D GATCTTTCTC AATT/---- AATTAATTTT 3070 het 3070 hom 32 9 16 8 AATT 3 2 200957 CASAVA_Build 4 14148143 1D CAAGAAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 11 10 200958 CASAVA_Build 4 14162352 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 495 hom 39 2 31 6 T 13 12 200959 CASAVA_Build 4 14165090 1I TTTCAGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 18 10 T 11 12 200960 CASAVA_Build 4 14165240 3D CAGGTGCCCG CCA/--- CCACCACACC 3070 hom 52 het 21 0 17 4 CCA 3 2 200961 CASAVA_Build 4 14165881 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 11 1 7 3 A 11 10 200962 CASAVA_Build 4 14177908 6D CGGTATTAGC TATTAT/------ TATTATATAC 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 TAT 4 2 200963 CASAVA_Build 4 14188920 1I CCCAAATCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 A 13 14 200964 CASAVA_Build 4 14189789 1I CCATCCCCCT -/G GCCTGTACCA 3070 het 3070 hom 43 21 18 4 G 1 2 200965 CASAVA_Build 4 14191744 3D TGTTTTTCAC TTG/--- TTGTTGAAAC 3070 het 3070 hom 49 25 22 5 TTG 3 2 200966 CASAVA_Build 4 14198901 1D AGCTGACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 12 11 200967 CASAVA_Build 4 14201531 1I AAATAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 10 11 200968 CASAVA_Build 4 14205178 2I AAAAAGAAAT --/TA TATGTTATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TA 1 2 200969 CASAVA_Build 4 14213931 1D AAAATGATAC A/- GTGGTAAGAA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 1 0 200970 CASAVA_Build 4 14229894 2D ACCATATTTC AA/-- AGACATTAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 3 1 200971 CASAVA_Build 4 14231885 1D ATCAGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 113 het 48 0 37 11 A 11 10 200972 CASAVA_Build 4 14232147 9I GACAGAAACA ---------/TAGTTTCTG TCAGATGAAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TAGTTTCTG 0 1 200973 CASAVA_Build 4 14234334 1D TATTTTCTAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 T 9 8 200974 CASAVA_Build 4 14251643 1I CACTAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 30 1 25 4 A 10 11 200975 CASAVA_Build 4 14252587 2D TATATAGTAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 48 het 22 0 16 8 GT 9 8 200976 CASAVA_Build 4 14265680 4D CTCCTTGAGG CTAA/---- CTATGAGAGC 3070 hom 81 het 28 0 28 2 CTAA 1 0 200977 CASAVA_Build 4 14282169 1I TGATCGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 34 1 29 4 T 10 11 200978 CASAVA_Build 4 14292268 1D ACAGAACACA G/- GTGGACAGCT 3070 hom 78 het 32 0 26 8 G 2 1 200979 CASAVA_Build 4 14313256 1I TGTTTAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 10 11 200980 CASAVA_Build 4 14314148 1D17M2D TGGGAGGCCT CCCCCAGCCATGTGGAACTG/-CCCCAGCCATGTGGAAC-- TGAGTCCATT 3070 hom 65 het 18 0 21 5 N/A 0 0 200981 CASAVA_Build 4 14323396 1D AGAGCTATGA C/- TTTAATTTAA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 C 1 0 200982 CASAVA_Build 4 14334077 1D ATATGGAACC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 259 hom 23 2 15 6 A 9 8 200983 CASAVA_Build 4 14334834 1I AACAAACATG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 7 8 200984 CASAVA_Build 4 14348297 1I GACACACACA -/C AAAAAAAGAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 0 1 200985 CASAVA_Build 4 14356713 4D ACATGTATAT AATA/---- AATACCATGA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AATA 2 1 200986 CASAVA_Build 4 14360241 1I CCCAGCATGA -/G TCTCCCATCA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 G 0 1 200987 CASAVA_Build 4 14362213 1D ATTTTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 34 1 21 12 T 13 12 200988 CASAVA_Build 4 14373241 5I ACATAGGTTG -----/AAATA AAATAAAAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAATA 1 2 200989 CASAVA_Build 4 14376800 1D TTCTAAATAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 33 0 25 8 A 9 8 200990 CASAVA_Build 4 14377132 8D TTAGGCAGCT AAAGGATC/-------- AACTGTGACA 3070 het 3070 ref 24 14 9 4 AAAGGATC 1 0 200991 CASAVA_Build 4 14385928 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 47 0 41 7 A 12 11 200992 CASAVA_Build 4 14390052 1I GATCACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 874 hom 28 2 19 7 A 15 16 200993 CASAVA_Build 4 14396367 1D GCCAGGGCCT G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 64 het 29 0 23 7 G 8 7 200994 CASAVA_Build 4 14399022 1I TCCTACCCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 9 10 200995 CASAVA_Build 4 14400209 1I TATTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 43 3 35 5 A 0 1 200996 CASAVA_Build 4 14428820 1I AATCAGAATC -/T TCTAGGGGTG 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 T 1 2 200997 CASAVA_Build 4 14444206 1D AAAGCAAGGG A/- AAAAAAAACG 3070 het 415 hom 34 1 29 4 A 9 8 200998 CASAVA_Build 4 14445132 17D ATGGAAAAGG TAAGGAAAAGTATGCTT/----------------- TAAGTTTTAC 3070 hom 98 het 35 0 33 9 TAAGGAAAAGTATGCTT 1 0 200999 CASAVA_Build 4 14448803 1D CCCTTTATGC T/- TGTGGTCCTA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 2 1 201000 CASAVA_Build 4 14456882 16I AATGATCTTA ----------------/ACAGCTCTGAGGAGGG ACAGCTTCAC 3070 het 3070 hom 31 9 19 4 ACAGCTCTGAGGAGGG 0 1 201001 CASAVA_Build 4 14466259 1I TGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 47 0 32 15 T 11 12 201002 CASAVA_Build 4 14466450 1I ACCCTGCTAC -/A AGCGCCCATC 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 A 1 2 201003 CASAVA_Build 4 14469766 2D GCAACTAAAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 11 9 201004 CASAVA_Build 4 14470350 3I TGCAAAGGAA ---/AGG AGAAGGTTTA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 AGG 0 1 201005 CASAVA_Build 4 14477158 1I TTTTTGTTTC -/T TTTTTTTCAT 1443 het 1443 ref 15 7 3 5 T 7 8 201006 CASAVA_Build 4 14477698 3I TCTCAGCTCA ---/CGG CGGCAACCTC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 CGG 1 2 201007 CASAVA_Build 4 14480191 1I ATGTAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 11 15 A 13 14 201008 CASAVA_Build 4 14484392 1D AGAAAGAAAT G/- GCTGGATATT 3070 het 3070 ref 23 13 8 3 G 2 1 201009 CASAVA_Build 4 14489373 1I TTCATAGATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 8 9 201010 CASAVA_Build 4 14522337 1D TAAGAACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 10 9 201011 CASAVA_Build 4 14526470 1D CTTCTTTTTT A/- TTTTTTTGTT 775 het 775 ref 36 26 5 5 A 1 0 201012 CASAVA_Build 4 14528935 1D CCTTTATCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 A 11 10 201013 CASAVA_Build 4 14535206 1I TACCTATGTA -/G GGGCAAGGGG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 G 3 4 201014 CASAVA_Build 4 14536462 1D CCAACCCACA G/- AGTCCTTGTG 3070 hom 120 het 47 0 39 8 G 1 0 201015 CASAVA_Build 4 14538098 4I CTCCCACTTA ----/TAAG TGAGAATATG 3070 hom 132 het 49 0 44 5 TAAG 0 1 201016 CASAVA_Build 4 14555546 1I AAAGAAATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 19 0 12 7 T 9 10 201017 CASAVA_Build 4 14557247 1I TAAGAATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 30 1 23 6 A 11 12 201018 CASAVA_Build 4 14565706 10I TTTCTTTAAT ----------/CCCATTTAAC CCCATGCCAC 3070 hom 87 het 34 0 28 6 CCCATTTAAC 0 1 201019 CASAVA_Build 4 14596017 2D TTTTCCACAG TC/-- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 51 20 16 15 TC 5 4 201020 CASAVA_Build 4 14596258 1I ACCCCCCCCC -/G CCATCTTACA 3070 hom 88 het 42 0 32 10 G 0 1 201021 CASAVA_Build 4 14597988 1D CTAATTACCT A/- ACCTAGGTAG 3070 hom 78 het 30 0 27 5 A 2 1 201022 CASAVA_Build 4 14616784 1D AGCTTTCATA T/- GGAATTTTAG 3070 hom 102 het 41 0 35 7 T 1 0 201023 CASAVA_Build 4 14622692 4I AATCTTTAAT ----/AGTC AGGCTGTTAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AGTC 0 1 201024 CASAVA_Build 4 14636531 1I CATGTATACA -/C CGGCTTAGGT 3070 hom 119 het 45 0 39 6 C 1 2 201025 CASAVA_Build 4 14643290 1I AATTTTTTTT -/A ATATTTTTAA 3070 het 256 hom 31 1 26 4 A 1 2 201026 CASAVA_Build 4 14645934 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 T 9 10 201027 CASAVA_Build 4 14649281 4I GGCTTAATAC ----/AACT AACTATTCAC 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 AACT 1 2 201028 CASAVA_Build 4 14660170 1I GGATTTGTGA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 7 8 201029 CASAVA_Build 4 14669044 1I TGATAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1247 het 1247 ref 38 27 4 7 T 11 12 201030 CASAVA_Build 4 14679702 1I GTATTGGAGG -/T TTTTTTTTTA 2520 het 2520 ref 32 18 8 6 T 9 10 201031 CASAVA_Build 4 14680943 4D GATCTTATTT AGAG/---- AGAGAGCTTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AG 5 3 201032 CASAVA_Build 4 14684502 4I AATACTTCCC ----/AACT AAGGAATGCC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 AACT 0 1 201033 CASAVA_Build 4 14687348 1I ATATCAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 10 12 7 A 10 11 201034 CASAVA_Build 4 14699291 1I TTTTGCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 22 2 12 8 A 12 13 201035 CASAVA_Build 4 14699303 1D AAAAAAAAAA T/- GGCAAAAACC 3070 het 729 hom 26 8 11 7 T 1 0 201036 CASAVA_Build 4 14702865 1I AGCAGTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 10 11 201037 CASAVA_Build 4 14704176 1D GCTTTCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 32 1 17 14 T 15 14 201038 CASAVA_Build 4 14704718 9I CGGAGCGGTG ---------/AGGGAGGAC AGGGAGGACG 3070 het 2858 hom 34 12 11 11 AGGGAGGAC 1 2 201039 CASAVA_Build 4 14708583 3I AAATATTTTG ---/TTT TTTGTTATTC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 3 6 201040 CASAVA_Build 4 14710237 1I AAACTCTTCT -/A AAAAAAAAAA 2948 het 2948 ref 26 15 8 3 A 10 11 201041 CASAVA_Build 4 14719183 1D CCTTTGCAGG T/- TTTTTTTTAA 1413 het 1413 ref 25 17 3 5 T 9 8 201042 CASAVA_Build 4 14719826 1I TCTAACAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 10 11 201043 CASAVA_Build 4 14722725 1I TTTGAGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 10 11 201044 CASAVA_Build 4 14728406 1I CAAATTGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 23 15 10 T 9 10 201045 CASAVA_Build 4 14735837 1D CTAAGGTGAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 47 20 23 6 T 9 8 201046 CASAVA_Build 4 14735990 1D ATGTTCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 11 10 201047 CASAVA_Build 4 14737394 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 1340 het 1340 ref 23 5 8 10 A 15 16 201048 CASAVA_Build 4 14742748 2D TCTTTGGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 T 12 10 201049 CASAVA_Build 4 14744238 1D GGTGAACATA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 2832 hom 25 7 14 4 T 8 7 201050 CASAVA_Build 4 14752117 3D AGGGTACAGT CTC/--- CTCCCACCAA 3070 het 3070 hom 46 15 24 9 CTC 2 1 201051 CASAVA_Build 4 14752954 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 24 1 13 10 A 17 16 201052 CASAVA_Build 4 14758805 1D AAAAGGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 260 hom 40 4 28 8 A 13 12 201053 CASAVA_Build 4 14763265 1D GTCCCTATGA T/- TCTGTTGTAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 1 201054 CASAVA_Build 4 14765295 4D TTTGTTTTGG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 8 TTGT 3 2 201055 CASAVA_Build 4 14771503 1I AGTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 23 5 T 10 11 201056 CASAVA_Build 4 14772228 2I TAAATTAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 306 hom 36 1 32 3 A 10 12 201057 CASAVA_Build 4 14773591 1D AAAGAATATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 108 het 39 0 36 4 A 9 8 201058 CASAVA_Build 4 14791608 1I CCAGTAATAA -/T TTAAATCTAC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 2 3 201059 CASAVA_Build 4 14792871 9D ATATACGAAT ATATGATAC/--------- ATATTTCATA 2983 hom 15 het 7 0 6 1 ATATGATAC 1 0 201060 CASAVA_Build 4 14802823 1D ACTCCAGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 28 1 25 4 A 11 10 201061 CASAVA_Build 4 14810809 1I TCCGTTGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 10 11 201062 CASAVA_Build 4 14813086 1D GGAATCAAGT A/- AATAGAAATG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 3 2 201063 CASAVA_Build 4 14813849 1I CCAAATCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 35 3 22 10 T 12 13 201064 CASAVA_Build 4 14813952 3I TGGTAGAAAG ---/AAT AATAACTACT 3070 hom 105 het 36 0 35 2 AAT 1 2 201065 CASAVA_Build 4 14815293 1I67M1D CTCAGTCAAG -CCAGCATGTAATCTTCTGCTGTCAGGAAGAGTAATGATGAGTGGTATACATTCTTCTGTTCTATGGGA/TCCAGCATGTAATCTTCTGCTGTCAGGAAGAGTAATGATGAGTGGTATACATTCTTCTGTTCTATGGG- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 23 0 19 31 N/A 0 0 201066 CASAVA_Build 4 14816249 1D CCACTGCAAA G/- GGTGAATTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 3 2 201067 CASAVA_Build 4 14817471 16D TATAAAAGTA TAGCTGAAAATGGGGT/---------------- GCTGAAAATG 3070 hom 53 het 17 0 17 5 TAGCTGAAAATGGGGT 1 0 201068 CASAVA_Build 4 14861252 3D TGTATCAGTG CTT/--- CTTCTATTTG 2216 hom 8 het 18 0 7 11 CTT 2 1 201069 CASAVA_Build 4 14864527 1D ATAATCTTGT A/- AAATGTATAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 3 201070 CASAVA_Build 4 14866985 4I TCCATCCCTC ----/CCTT GTTCTTCTAG 3070 hom 162 het 57 0 54 3 CCTT 0 1 201071 CASAVA_Build 4 14869575 4D ATTTTGCCCT GTTG/---- GTCAGGCTGT 3070 hom 75 het 26 0 24 3 GTTG 1 0 201072 CASAVA_Build 4 14876812 16D AGTAAGATAT AACAATTATAAATAGA/---------------- TATGCAACCA 3070 hom 108 het 38 0 37 4 AACAATTATAAATAGA 1 0 201073 CASAVA_Build 4 14884127 1I ACTTTATGAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 438 hom 28 1 22 5 A 9 10 201074 CASAVA_Build 4 14895977 5I TTTATAAAGT -----/AGAGA AAACAGAATT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AGAGA 0 1 201075 CASAVA_Build 4 14915359 1I ACCCTGTCTC -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 2 3 201076 CASAVA_Build 4 14917698 1D CAAGTGTGGG A/- AAAACTAAGA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 5 4 201077 CASAVA_Build 4 14917938 1D CCTTCCCCAC A/- GTTCCACCAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 0 201078 CASAVA_Build 4 14929141 1D AACACATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 470 hom 27 1 13 13 T 13 12 201079 CASAVA_Build 4 14930642 1D CTTTGTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 11 10 201080 CASAVA_Build 4 14939477 1D ATTTGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 37 2 25 10 T 13 12 201081 CASAVA_Build 4 14983659 1D GAAAAGGGGG A/- AAAAAAGTCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 6 201082 CASAVA_Build 4 14997246 1I TAAAACACGT -/G GTACCTTAGA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 G 1 2 201083 CASAVA_Build 4 15004690 1I ATTAAGGGGG -/A AAGTAAGGGC 3070 hom 123 het 44 0 40 4 A 2 3 201084 CASAVA_Build 4 15007775 1I GCAGGCAAAG -/A GAGAATGAGG 3070 het 3070 hom 31 8 19 4 A 0 1 201085 CASAVA_Build 4 15013707 1I CTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 11 11 T 14 15 201086 CASAVA_Build 4 15029439 3D TAGTTAAGTG TCC/--- TAAGACCACA 3070 het 3070 ref 50 27 17 8 TCC 1 0 201087 CASAVA_Build 4 15032283 1D TATTTCAATT A/- ATTTTTACAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 A 2 1 201088 CASAVA_Build 4 15032933 1D GTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 23 3 12 8 A 14 13 201089 CASAVA_Build 4 15034045 1I CTTCGCTTTC -/A AAGCTGTATG 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 2 3 201090 CASAVA_Build 4 15048472 3D ACCTCTGCAC TAA/--- TGAGAATTTG 3070 het 3070 ref 42 20 19 5 TAA 1 0 201091 CASAVA_Build 4 15051039 1D TTGACTCCAA C/- CCCAAAGGTA 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 C 4 3 201092 CASAVA_Build 4 15060961 3D CAGCCAACAC ATA/--- ATGACAGCCC 3070 het 3070 hom 38 14 13 11 ATA 1 0 201093 CASAVA_Build 4 15082114 1D GAAGGTGGGT G/- GGCTTGAACA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 G 3 2 201094 CASAVA_Build 4 15082351 1D TGTTGCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 38 0 26 12 A 14 13 201095 CASAVA_Build 4 15093598 1D GATCTATGCA T/- TAGTCCCTTC 3070 hom 117 het 42 0 40 3 T 2 1 201096 CASAVA_Build 4 15098680 1I AACCCCGTCT -/C CCCCCCTGCT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 6 7 201097 CASAVA_Build 4 15110033 1I AATGAATGTG -/C CACTCTGGTG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 C 1 2 201098 CASAVA_Build 4 15114356 1I CAGATGCTAA -/G GGTCCTTGAA 3070 hom 117 het 41 0 37 4 G 2 3 201099 CASAVA_Build 4 15122103 3D GGAGGAAGGG GAA/--- GAAGAAGAAC 3070 het 3070 ref 50 22 19 10 GAA 4 3 201100 CASAVA_Build 4 15136996 1D TAGTGATCTA C/- GAAATGCTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 C 1 0 201101 CASAVA_Build 4 15140725 2D CGGAGTCTCA CT/-- CTGTCGCCCA 981 hom 10 het 5 0 4 1 CT 2 1 201102 CASAVA_Build 4 15156432 8D GGCAGTAGAA ATGGGAAG/-------- ATGGGAAGAA 3070 het 3070 ref 44 25 18 5 ATGGGAAG 2 1 201103 CASAVA_Build 4 15158843 1I AAATTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 2060 het 2060 ref 21 7 7 7 T 13 14 201104 CASAVA_Build 4 15170813 1I TTGGCCTCTC -/A AAAGTGCTGG 3070 het 2111 hom 22 7 9 6 A 3 4 201105 CASAVA_Build 4 15172259 1I TTTCATATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 10 11 201106 CASAVA_Build 4 15183861 5I CAGTCCAATC -----/AAGTT GATACTTAAC 3070 hom 101 het 40 0 33 7 AAGTT 0 1 201107 CASAVA_Build 4 15189746 1I ATTTTTATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 8 9 201108 CASAVA_Build 4 15192946 4D TGAATACAGT TAAA/---- TAAGAGGTAA 3070 het 3070 hom 31 14 17 1 TAAA 1 0 201109 CASAVA_Build 4 15200543 1D TATACCAGTT A/- AAAGAAATGC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 4 3 201110 CASAVA_Build 4 15207150 2I GTTTTGATAT --/AA AAAGTTTCAT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 3 5 201111 CASAVA_Build 4 15207739 3D AACAATAAAA TGT/--- TGTTTAGGGG 3070 het 3070 ref 47 25 20 3 TGT 2 1 201112 CASAVA_Build 4 15211872 3I TCCAGAACAC ---/TTA TTATCTTAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTA 1 2 201113 CASAVA_Build 4 15212512 3D CCTTTAGAGT TCC/--- TCCTCCTTTG 3070 het 3070 ref 47 26 17 5 TCC 3 2 201114 CASAVA_Build 4 15213217 1D TTTATCAATT A/- AGTTTATGTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 2 1 201115 CASAVA_Build 4 15215251 1D TATCACAATA T/- ACGAGACATG 3070 het 3070 hom 45 14 24 8 T 1 0 201116 CASAVA_Build 4 15227105 13I AGGCAGGTCT -------------/CACTCCTGCCATG CACCCCCAAC 2422 het 2422 ref 49 30 11 8 CACTCCTGCCATG 0 1 201117 CASAVA_Build 4 15229650 16I CAGCACTTTG ----------------/GGAAGCAAAGGCAGGT GGAGTGCTTG 3070 het 3070 ref 21 10 10 3 GGAAGCAAAGGCAGGT 0 1 201118 CASAVA_Build 4 15230313 1I CTTAAGATTA -/G GAACAAGGTA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 G 1 2 201119 CASAVA_Build 4 15233380 4D GAGAATTGTC TTAG/---- TTACTCTAGA 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 TTAG 1 0 201120 CASAVA_Build 4 15234234 1D AATAAAAAAA T/- GACAATGAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 1 0 201121 CASAVA_Build 4 15245077 3D GTCTGACTAA TTT/--- TTTTTCTTTT 3070 het 2620 hom 24 10 9 6 T 8 5 201122 CASAVA_Build 4 15254292 1D ATGTCTGGCT A/- AATTTTTATA 3070 hom 32 het 25 1 22 2 A 3 2 201123 CASAVA_Build 4 15257090 1I ATATTATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 9 10 201124 CASAVA_Build 4 15263608 4D TATTGTAAAC TGTT/---- TGGTTGGATA 3070 het 3070 hom 34 12 22 0 TGTT 1 0 201125 CASAVA_Build 4 15264365 1I TTTGAGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 T 10 11 201126 CASAVA_Build 4 15276745 1I ACCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 13 14 201127 CASAVA_Build 4 15278764 1D CTCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2480 het 1245 hom 17 5 6 6 A 15 14 201128 CASAVA_Build 4 15288660 2D GCGCTTAACC TG/-- TGTGGCAACT 3070 hom 97 het 45 0 31 15 TG 3 2 201129 CASAVA_Build 4 15289335 3I CTTTTTGACC ---/AAA AAAATGATCT 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 4 7 201130 CASAVA_Build 4 15291711 1I TCTCAACCAC -/A AAAAAAATTT 2643 het 2643 ref 16 10 6 0 A 7 8 201131 CASAVA_Build 4 15306798 1D GAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 T 12 11 201132 CASAVA_Build 4 15306925 1D GGGAAGCCAC A/- AGATTGGACA 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 A 2 1 201133 CASAVA_Build 4 15315601 2I GTTTGTGATG --/TC TCTTTCTTGT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 TC 1 2 201134 CASAVA_Build 4 15341636 1D CACAATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2934 hom 29 8 12 9 T 13 12 201135 CASAVA_Build 4 15346658 1D TCTTTACTTG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 A 7 6 201136 CASAVA_Build 4 15351838 2I GAATTTGGCC --/CT GTTACTCACT 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 CT 0 1 201137 CASAVA_Build 4 15360416 1D TTGAAATTTA T/- TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 T 7 6 201138 CASAVA_Build 4 15370984 1I TAGCATTTCA -/T TTTTTTTTTT 1215 het 1215 ref 49 39 3 7 T 11 12 201139 CASAVA_Build 4 15381930 3I AGGTGTGTAC ---/ATT ATTACCAATT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 ATT 1 2 201140 CASAVA_Build 4 15432102 1I AATCCCTTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 9 11 A 9 10 201141 CASAVA_Build 4 15448799 1D ATGGTGGGCA T/- TTTTTTTTTT 1584 het 1584 ref 47 34 4 10 T 11 10 201142 CASAVA_Build 4 15472073 4I TTCTCATGAA ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 52 29 16 7 AGTG 1 2 201143 CASAVA_Build 4 15476573 1D CACCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1691 het 1691 ref 28 22 5 1 A 13 12 201144 CASAVA_Build 4 15476942 6D CTAGTTGTGG GATTTT/------ GAGCACATCA 3070 het 3070 hom 54 22 27 5 GATTTT 1 0 201145 CASAVA_Build 4 15483185 1I CCAGACATCT -/A AAAAAAAAAA 2149 het 2149 ref 31 12 8 11 A 11 12 201146 CASAVA_Build 4 15496625 1D TTAAAAAAAA G/- ATAAATCACT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 G 1 0 201147 CASAVA_Build 4 15538169 1D GCATTCGTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 10 9 201148 CASAVA_Build 4 15571607 1I GAGGAATGAC -/A AGAGAGAAGG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 A 1 2 201149 CASAVA_Build 4 15574759 1D TCTACAATAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 8 7 201150 CASAVA_Build 4 15578110 1I GAAAGGCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 9 10 201151 CASAVA_Build 4 15581533 1D ACTGTTATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 9 8 201152 CASAVA_Build 4 15587916 2I CCAGGCTTGC --/GT ATCTCTCTCT 3063 het 3063 ref 39 19 9 11 GT 0 1 201153 CASAVA_Build 4 15594109 2D GGAATTTTTC AA/-- AGTCACAGAG 3070 het 3070 ref 52 31 14 8 A 3 1 201154 CASAVA_Build 4 15596608 42I ACTTAAACAT ------------------------------------------/TTAAGTATGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGA TATAAATATT 3070 hom 78 het 26 0 27 4 TTAAGTATGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGA 0 1 201155 CASAVA_Build 4 15598289 1D CTTTTTTTTT C/- AACTTAAAGT 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 C 1 0 201156 CASAVA_Build 4 15599515 1D CACTGGACAC A/- AATTAAGAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 3 2 201157 CASAVA_Build 4 15624668 1D AGTCTAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 11 10 201158 CASAVA_Build 4 15628738 1I TATTTAAAAA -/T TTTTTTAATT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 T 6 7 201159 CASAVA_Build 4 15631924 1D TTAAAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 9 8 201160 CASAVA_Build 4 15633829 1I ACAAATTCCG -/C CCCTATCATC 3070 hom 102 het 40 0 33 7 C 3 4 201161 CASAVA_Build 4 15640082 1I CAAGTCATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 11 12 201162 CASAVA_Build 4 15642872 1D CTTCCTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 46 7 18 21 T 12 11 201163 CASAVA_Build 4 15643819 1I CTGGGGCAGC -/T TTCATTACAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 2 3 201164 CASAVA_Build 4 15651000 1I GCAGGAACAG -/A AGATTTTCAA 3070 hom 122 het 45 0 40 5 A 1 2 201165 CASAVA_Build 4 15669372 1D CATCTCCGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1619 hom 21 7 9 5 A 15 14 201166 CASAVA_Build 4 15671922 1I AAAAATGGAG -/C CCCCCCACTG 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 C 6 7 201167 CASAVA_Build 4 15684374 1D CTGTTGAAAG T/- TGAGAATTTC 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 T 2 1 201168 CASAVA_Build 4 15684975 4D AATGTTTGAG GAGA/---- TAGATACACC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 GA 2 0 201169 CASAVA_Build 4 15685252 1D AAAGTTAGTA T/- TTTTAACAGC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 5 4 201170 CASAVA_Build 4 15692644 3D AAAAAAAAAC AAG/--- AATAAACTAA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 AAG 1 0 201171 CASAVA_Build 4 15701187 1D GTCTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2641 hom 32 8 15 9 T 11 10 201172 CASAVA_Build 4 15702217 4D TACAATCAGA TAAT/---- TATTTTAAAC 3070 het 3070 hom 46 20 24 6 TAAT 1 0 201173 CASAVA_Build 4 15712530 2I TTTCAAGAGA --/CT CTCTTATTGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CT 2 3 201174 CASAVA_Build 4 15712898 5I TTAAGGCAGG -----/GAGCA TTTGGCTGGA 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 GAGCA 0 1 201175 CASAVA_Build 4 15728380 1D ATTTTCTATG A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 35 16 15 6 A 7 6 201176 CASAVA_Build 4 15745581 1D AAAGAGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 56 hom 32 2 13 17 T 12 11 201177 CASAVA_Build 4 15755145 1D AAACTGGTTT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 A 7 6 201178 CASAVA_Build 4 15768710 2I AAATGGGGTA --/AC AGTGTCTGCT 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 AC 0 1 201179 CASAVA_Build 4 15773426 1I TAGTTTAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 9 10 201180 CASAVA_Build 4 15783078 1D CAATCCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2732 hom 26 8 15 3 A 13 12 201181 CASAVA_Build 4 15783243 1D TTCCAAAATT C/- TAGGAGTTCC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 C 1 0 201182 CASAVA_Build 4 15809283 1D CAGGAGAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 A 11 10 201183 CASAVA_Build 4 15819376 1I CTTGGGTCCG -/T TGACAGCTTC 3070 het 3070 ref 34 18 7 9 T 1 2 201184 CASAVA_Build 4 15821195 4D TTAAATTCCT CTCA/---- CTCTAGCAGA 3070 het 3070 hom 47 21 23 4 CTCA 1 0 201185 CASAVA_Build 4 15821950 1I TCATCGAAAA -/C AAGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 C 0 1 201186 CASAVA_Build 4 15844748 1D AGCTGTAGAG T/- TATGTGATTT 3070 het 3070 hom 50 18 25 7 T 2 1 201187 CASAVA_Build 4 15845611 1I TTTTACCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 10 11 201188 CASAVA_Build 4 15850756 1I GGCACAAGTC -/T TCCCCTCCCT 3070 het 3070 hom 58 20 29 9 T 1 2 201189 CASAVA_Build 4 15859398 10D TTGCTGTTAG ACGGTCCAGC/---------- ATTTTGCTCC 3070 het 3070 ref 35 22 14 2 ACGGTCCAGC 1 0 201190 CASAVA_Build 4 15865139 1I AAAAACAAGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 A 8 9 201191 CASAVA_Build 4 15874690 1D AAAAATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 11 10 201192 CASAVA_Build 4 15881403 1I CTGCTGGAGC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 A 7 8 201193 CASAVA_Build 4 15885063 4D TTTTTTTTGT TTTG/---- TTTTGTTTTG 303 het 303 ref 26 9 4 13 TTTG 1 0 201194 CASAVA_Build 4 15891783 2I CCAGAGAAAC --/TG TAAAAACTGA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 TG 0 1 201195 CASAVA_Build 4 15901573 23D CCCACTTCAC ATATCAGGACACTGAGACCTTGG/----------------------- ATATGTTCAG 76 het 76 ref 50 28 1 29 ATATCAGGACACTGAGACCTTGG 1 0 201196 CASAVA_Build 4 15903816 1I AAAATATATG -/T AAGTGAAGAA 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 T 0 1 201197 CASAVA_Build 4 15911257 1I ATATGGAAGC -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 7 8 201198 CASAVA_Build 4 15915790 1D ATAATCCTCC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 9 8 201199 CASAVA_Build 4 15918432 9I GCATCACTCT ---------/CAAAGTTGA CAAAGTTGAG 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 CAAAGTTGA 1 2 201200 CASAVA_Build 4 15929570 2I TGCTAAGCCT --/AA AAAAAAAAAA 3009 het 3009 ref 26 13 8 5 A 10 12 201201 CASAVA_Build 4 15930928 4D GTATTGTGTG TAGA/---- TAGATAGGTA 3070 het 3070 ref 29 14 12 5 TAGA 2 1 201202 CASAVA_Build 4 15935853 2D GCTCTCAGGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 54 24 21 9 TC 7 6 201203 CASAVA_Build 4 15936007 2I GGTTTCTGGA --/GT GTGTCTTAGT 3070 het 3070 ref 53 26 24 3 GT 2 3 201204 CASAVA_Build 4 15948333 1I GGTTCTTTCA -/T TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 3 4 201205 CASAVA_Build 4 15960636 6I TTTCTTAACT ------/TAAGTA TAACTCTTCA 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 TAAGTA 0 1 201206 CASAVA_Build 4 15974903 1I AAATAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 17 10 A 13 14 201207 CASAVA_Build 4 16000339 1I AATTTTGAAC -/T GTCTACATAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 0 1 201208 CASAVA_Build 4 16021498 1I TTTCCCCCCC -/T CCCTCTCATC 3066 het 3066 ref 36 13 10 13 T 0 1 201209 CASAVA_Build 4 16022857 3D AGATATAAGC TTA/--- TTATAGCCAG 2580 het 2580 ref 36 14 9 13 TTA 2 1 201210 CASAVA_Build 4 16022873 1D TAGCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1638 het 1638 ref 33 13 5 15 T 17 16 201211 CASAVA_Build 4 16023483 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2298 het 2298 ref 23 11 7 5 A 15 16 201212 CASAVA_Build 4 16025793 4I CACTGGAGAT ----/AAAG AAAGGATACT 3070 het 3070 hom 34 10 22 2 AAAG 1 2 201213 CASAVA_Build 4 16026924 4D GGAGGGGAGG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 19 14 7 GT 13 11 201214 CASAVA_Build 4 16027390 3D CACTAAAAAA AGT/--- AATCACAGCA 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 AGT 1 0 201215 CASAVA_Build 4 16031016 8I GGATGTTACA --------/TTTCCATT TTTAGTTGTT 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 TTTCCATT 0 1 201216 CASAVA_Build 4 16032058 1D AAGCATTCTT A/- ATACACCAAT 3070 het 2547 hom 18 6 10 2 A 2 1 201217 CASAVA_Build 4 16052565 3I19M2D CTTAAGTGAT ---TGTCACACTAATGTGTATGTA/ATGTGTCACACTAATGTGTATG-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 23 17 7 N/A 0 0 201218 CASAVA_Build 4 16065299 1D AGATATTTAT A/- AGGGGTTTCC 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 A 2 1 201219 CASAVA_Build 4 16067413 1D TCACTGAGCT A/- AATCATTTCC 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 A 3 2 201220 CASAVA_Build 4 16068787 3I GCTCAGATCT ---/TCC TCCTCAGGGA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 TCC 1 2 201221 CASAVA_Build 4 16082740 1D TGAAACAACC A/- AAAAAACGTA 3070 het 3070 ref 35 17 11 8 A 7 6 201222 CASAVA_Build 4 16152611 1D ATTGAAAAGG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 8 7 201223 CASAVA_Build 4 16165817 2D TATGGAGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 24 1 13 11 T 16 14 201224 CASAVA_Build 4 16178107 12D GTGTGTGTGC GCGTGTGTGCAT/------------ GCGTGTGTGT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 GCGTGTGTGCAT 1 0 201225 CASAVA_Build 4 16198319 1D GCAGGAGAGT G/- GGGGTGCAAC 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 G 5 4 201226 CASAVA_Build 4 16198803 2D ACGACTTCTT AA/-- GAGATTACAG 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 2 0 201227 CASAVA_Build 4 16202595 1D GAAGTCGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 12 11 201228 CASAVA_Build 4 16203790 1D GAAATTGCAA T/- AATGCTCATG 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 T 1 0 201229 CASAVA_Build 4 16204811 1D TTATCATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 T 10 9 201230 CASAVA_Build 4 16218363 1D AGCTCTACTT A/- ATCACTCCCA 3070 het 3070 ref 56 24 24 9 A 2 1 201231 CASAVA_Build 4 16223765 9D AAGGCTGATT CAACATATG/--------- CAACATATGC 3070 het 3070 ref 28 11 10 8 CAACATATG 2 1 201232 CASAVA_Build 4 16225306 1I AAAAACAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1535 hom 29 15 10 4 C 0 1 201233 CASAVA_Build 4 16225368 3D TGAACAGATA CTT/--- CTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 5 CTT 2 1 201234 CASAVA_Build 4 16227416 1D TGGAGACATC T/- TTCTGTATCA 3070 hom 163 het 60 0 54 6 T 3 2 201235 CASAVA_Build 4 16230368 3I CGTAAGCATG ---/TAT GCCTTGATAA 3070 het 3070 hom 50 24 24 2 TAT 0 1 201236 CASAVA_Build 4 16234364 2D TGACTATCAA TG/-- TGCTGTCAAT 3070 het 3070 hom 18 7 8 3 TG 2 1 201237 CASAVA_Build 4 16246190 2D ATCAGTTAAA AG/-- AGTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 36 16 16 5 AG 2 1 201238 CASAVA_Build 4 16246397 1I GAAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3031 het 3031 ref 28 15 9 4 A 9 10 201239 CASAVA_Build 4 16249588 2I AAACCAACAC --/AG GGGTTTTGTG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AG 0 1 201240 CASAVA_Build 4 16262308 1I GATTTTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2759 hom 24 7 11 6 T 10 11 201241 CASAVA_Build 4 16270393 2D TCTATGTGTG TA/-- TATATATATA 1462 het 1462 ref 17 8 5 4 TA 10 9 201242 CASAVA_Build 4 16278875 2D TATACGATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AT 8 7 201243 CASAVA_Build 4 16297836 1D TATAAACTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 10 9 201244 CASAVA_Build 4 16319818 4I AGCTGTCTAT ----/TCTG TCTATCACCG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 TCTG 0 1 201245 CASAVA_Build 4 16324089 1I GTAAAGCTTT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 0 1 201246 CASAVA_Build 4 16329806 1I GCAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 497 hom 37 2 30 5 A 11 12 201247 CASAVA_Build 4 16333944 1I GTAACAGAAT -/A CCACAGACTG 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 0 1 201248 CASAVA_Build 4 16336609 2D TATTTATGTG TA/-- TATATATATA 870 het 870 ref 13 7 3 4 TA 7 6 201249 CASAVA_Build 4 16339206 1I AACTCCAAAT -/A TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 A 0 1 201250 CASAVA_Build 4 16339574 1D TAATCTCACT A/- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 5 4 201251 CASAVA_Build 4 16344075 3D AAGAATTTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 7 A 13 10 201252 CASAVA_Build 4 16346293 1I GAACGGACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 A 9 10 201253 CASAVA_Build 4 16368712 1I CACAAACATG -/A AGAGATGCGC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 A 1 2 201254 CASAVA_Build 4 16395730 1I TGAAGAACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 692 hom 40 2 35 3 T 9 10 201255 CASAVA_Build 4 16398677 1D AACCAAGTTT G/- GGGTACATGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 4 3 201256 CASAVA_Build 4 16401636 4I AGTAGGCAAT ----/CCAG CCAGGACTTA 3070 hom 144 het 50 0 49 1 CCAG 1 2 201257 CASAVA_Build 4 16410872 1D TACTGTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 29 1 23 5 A 11 10 201258 CASAVA_Build 4 16417354 4I AGGACTCAGA ----/AAGG AAGGCTAACA 3070 hom 151 het 56 0 50 6 AAGG 1 2 201259 CASAVA_Build 4 16420450 1D AAAACAAAAC A/- AAACAAACAA 1040 het 1040 ref 49 17 6 26 A 4 3 201260 CASAVA_Build 4 16425257 1D ATATGAGCAA C/- CCCTGTAATC 3070 hom 79 het 31 0 26 6 C 4 3 201261 CASAVA_Build 4 16427297 1I ATCCAACTAA -/T TTTTTTTGTA 2555 het 2129 hom 13 6 7 0 T 7 8 201262 CASAVA_Build 4 16436831 4D AGAAATATTA ATCT/---- ATCTAATATG 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 ATCT 2 1 201263 CASAVA_Build 4 16443341 1I ATAATGAAAC -/A AAAATTGCAC 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 A 4 5 201264 CASAVA_Build 4 16449925 3I GTTATTTATA ---/AAG AAGAAGGTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 AAG 2 3 201265 CASAVA_Build 4 16451966 1D CTGAATTTCC A/- GGAAAAGCAT 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 A 1 0 201266 CASAVA_Build 4 16471637 1D CTACAGCTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 14 7 A 10 9 201267 CASAVA_Build 4 16475143 1I TTCGCACAGA -/C AAGATGACAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 0 1 201268 CASAVA_Build 4 16481173 2D TGCTGAAGGG GT/-- GTGTATGTGT 3070 hom 86 het 33 0 29 4 GT 3 2 201269 CASAVA_Build 4 16482346 3I CTCTTTCTTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 26 0 18 8 TTC 0 1 201270 CASAVA_Build 4 16488704 2I AAGGAGAAAC --/AG AGAAATAATG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AG 1 2 201271 CASAVA_Build 4 16503038 4I TGTCATTGCC ----/TGAA TGAAGTATGG 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 TGAA 1 2 201272 CASAVA_Build 4 16514635 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 1877 het 643 hom 21 5 12 4 C 0 1 201273 CASAVA_Build 4 16524282 3D TGCATCTGGG TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 21 15 5 T 12 9 201274 CASAVA_Build 4 16528652 1I TTGCAATGGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 7 8 201275 CASAVA_Build 4 16529820 2D CCTTGTTGCT CA/-- TACAAAGCCT 3070 het 3070 ref 20 11 8 2 CA 1 0 201276 CASAVA_Build 4 16532747 2I TGTCAATATC --/TA TATATATATA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 TA 5 6 201277 CASAVA_Build 4 16533307 1I GCCCTAAAAT -/A AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 5 6 201278 CASAVA_Build 4 16535861 1D CCCAAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 11 10 201279 CASAVA_Build 4 16541217 2I AGTTCAATTT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 AG 8 9 201280 CASAVA_Build 4 16564565 1I CACTCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 10 11 201281 CASAVA_Build 4 16565768 1I ACAAACAAGT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 43 20 12 11 A 8 9 201282 CASAVA_Build 4 16586595 1D TGCTTCTTTA C/- CCTGCAGGCT 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 C 3 2 201283 CASAVA_Build 4 16592635 3I AAATTGAATC ---/ACA ACAACTAACT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 ACA 1 2 201284 CASAVA_Build 4 16596732 8D TATATACATA CATATATC/-------- TATATACACA 878 het 878 ref 23 15 4 6 CATATATC 1 0 201285 CASAVA_Build 4 16597581 1I CAAAACTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 10 11 201286 CASAVA_Build 4 16599842 2D TGTGAGAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 30 2 13 16 A 16 14 201287 CASAVA_Build 4 16619284 1D CCCCGGCTAA T/- TTTTGTATTT 3070 het 25 hom 19 1 17 1 T 5 4 201288 CASAVA_Build 4 16631084 1I AAATTAGTCC -/T TTTTTTTTTT 2749 het 2749 ref 31 12 11 8 T 13 14 201289 CASAVA_Build 4 16635082 1D CACTGTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 64 het 30 0 21 9 T 10 9 201290 CASAVA_Build 4 16640384 13D ATAAATCACA ACTGGAACCCAAG/------------- ACTGTCTTAG 3070 hom 123 het 43 0 39 6 ACTGGAACCCAAG 1 0 201291 CASAVA_Build 4 16656638 2D TCCAGTGAAA AG/-- AGAGTTTACC 3070 hom 83 het 35 0 28 7 AG 3 2 201292 CASAVA_Build 4 16657672 1D GGTCCAATGA G/- GCGATGCTCT 3070 hom 132 het 54 0 45 11 G 2 1 201293 CASAVA_Build 4 16661480 1D GCTGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 398 het 398 ref 33 23 1 9 T 11 10 201294 CASAVA_Build 4 16661819 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 20 het 10 0 8 3 TA 11 9 201295 CASAVA_Build 4 16668601 1D CATAGAATGG A/- AAAAAAAAAA 2731 het 28 hom 33 1 13 19 A 19 18 201296 CASAVA_Build 4 16671567 1D AACCATCAGA T/- CTCATGAGAA 3070 hom 75 het 29 0 24 6 T 1 0 201297 CASAVA_Build 4 16676805 1D ATGTTCATCA G/- GCTTGGTATG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 2 1 201298 CASAVA_Build 4 16677704 2D CGGATTAGAT TC/-- TCTCTCTGAT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 TC 4 3 201299 CASAVA_Build 4 16689454 1I TTAACTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 556 hom 39 3 26 10 T 15 16 201300 CASAVA_Build 4 16690658 1D AAAATCCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 627 hom 30 3 14 13 T 15 14 201301 CASAVA_Build 4 16709293 2D ACATGGGAAA CT/-- CTGTTCTGAG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 CT 2 1 201302 CASAVA_Build 4 16729332 1I AAAATTGAGC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 7 8 201303 CASAVA_Build 4 16740736 1I TTACCAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 9 10 201304 CASAVA_Build 4 16748663 1D TGAGTACCCA G/- GGCTCTATGC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 G 3 2 201305 CASAVA_Build 4 16751890 1D AATGACTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 10 9 201306 CASAVA_Build 4 16753869 1D TTAACATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 44 3 34 7 A 11 10 201307 CASAVA_Build 4 16754027 6D CTGTAGAAGA AGGAGG/------ AGGAGGAGGA 3070 hom 141 het 51 0 47 7 AGG 5 3 201308 CASAVA_Build 4 16755724 1D AAAAACTGGA T/- TATTTTTATA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 2 1 201309 CASAVA_Build 4 16762781 5D ATTTATGTTA TTTTC/----- TTAAGCTGCA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TTTTC 1 0 201310 CASAVA_Build 4 16771267 2I TGGTCCTGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 33 0 19 14 T 13 15 201311 CASAVA_Build 4 16773687 1D GCTAGTGTGA T/- TTTTTTGGGG 3070 hom 33 het 14 0 10 4 T 7 6 201312 CASAVA_Build 4 16773875 1I CTATGAATGT -/G GCTTCCTGGG 3070 hom 77 het 27 0 26 1 G 1 2 201313 CASAVA_Build 4 16775372 1I TCCAGATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 27 1 21 5 A 10 11 201314 CASAVA_Build 4 16798123 6D AAAGTTTGCG TTGACT/------ TAGCTGTAAG 3070 hom 126 het 48 0 43 7 TTGACT 1 0 201315 CASAVA_Build 4 16801239 1I GAAAGATCTG -/C CCCCCATGAC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 5 6 201316 CASAVA_Build 4 16803249 24D GTGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC/------------------------ GCGCGCGCAT 3070 hom 114 het 34 0 39 4 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC 1 0 201317 CASAVA_Build 4 16811647 1D ATACAGATGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 8 7 201318 CASAVA_Build 4 16815167 1I GCACTATTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2177 hom 36 11 16 9 A 15 16 201319 CASAVA_Build 4 16820900 1I TTGGCCTCCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2885 hom 34 9 21 4 T 8 9 201320 CASAVA_Build 4 16826266 1I GAAAATGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 10 11 201321 CASAVA_Build 4 16829794 1D CCTAACAGGG T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 T 7 6 201322 CASAVA_Build 4 16836455 9I CCCAGGACTA ---------/CACATATTG CCTGGGCAGC 3070 hom 124 het 47 0 39 8 CACATATTG 0 1 201323 CASAVA_Build 4 16838904 5I CCCTTGTAAG -----/GGATA TTGTATTCCT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 GGATA 0 1 201324 CASAVA_Build 4 16855643 1I GTAACATTTT -/G GGGGGCAATT 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 G 5 6 201325 CASAVA_Build 4 16856090 1D GGTGGGTGTG A/- AAAAAAACGT 3070 het 3070 ref 46 25 13 8 A 8 7 201326 CASAVA_Build 4 16860596 1I TTTGAGAGAG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 52 26 15 11 A 7 8 201327 CASAVA_Build 4 16861197 1D GTCTTGAGGA G/- TTAGGTAATA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 G 1 0 201328 CASAVA_Build 4 16869990 1I CCAATGCCAT -/C CCCCCCTCCC 2179 hom 15 het 7 0 6 1 C 6 7 201329 CASAVA_Build 4 16871441 1D CCACACTCAA G/- GGGAGGTATG 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 G 4 3 201330 CASAVA_Build 4 16872603 2D AAGTTTCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2622 het 222 hom 34 6 12 16 T 18 16 201331 CASAVA_Build 4 16882953 1I AAAATGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 24 28 4 T 10 11 201332 CASAVA_Build 4 16885210 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1485 het 1485 ref 21 6 10 5 A 13 14 201333 CASAVA_Build 4 16888813 1I ACAATATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 7 14 3 A 10 11 201334 CASAVA_Build 4 16897386 1D AGACAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 26 1 24 1 A 12 11 201335 CASAVA_Build 4 16898980 1I AAGCTAGAAA -/C TTTTTCATGC 3070 hom 99 het 39 0 31 8 C 0 1 201336 CASAVA_Build 4 16902845 3D ACAGCAGAGG TGT/--- TGTGCAGATG 3070 hom 108 het 38 0 37 3 TGT 2 1 201337 CASAVA_Build 4 16908268 4D CTATAAAGAA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TATT 3 2 201338 CASAVA_Build 4 16913680 2D ACGTGGACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 75 het 35 0 26 10 AC 9 8 201339 CASAVA_Build 4 16928738 1I TATTTCTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 9 10 201340 CASAVA_Build 4 16932870 1I TGGTAATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 35 1 25 9 A 14 15 201341 CASAVA_Build 4 16937215 1I CAAGGTCTGT -/A AAAAAAATTC 3070 hom 82 het 30 0 27 3 A 7 8 201342 CASAVA_Build 4 16940791 4I TGGTTAGAAA ----/TATC TATCACACAC 3070 hom 161 het 60 0 52 8 TATC 1 2 201343 CASAVA_Build 4 16964196 1D ATCGAGACCA T/- CCTGGCCAAC 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 1 0 201344 CASAVA_Build 4 16964250 1D AAAATTAGCT G/- GGTGTGGTGG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 3 2 201345 CASAVA_Build 4 16968419 1D CCCTTTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 16 7 A 12 11 201346 CASAVA_Build 4 16969427 1D TGAAGTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1481 hom 30 5 16 11 A 15 14 201347 CASAVA_Build 4 16969943 4I GCTCAGAAAC ----/TGTT TGTTCTACTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TGTT 1 2 201348 CASAVA_Build 4 16979963 1D CGAGATTGCA C/- CATTGCACCC 3070 hom 50 het 21 0 16 5 C 2 1 201349 CASAVA_Build 4 16995109 1I GACTCCGTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 655 hom 22 5 10 7 A 15 16 201350 CASAVA_Build 4 17003625 12D GTGGAAGGAG AGGGTGGAAGGA/------------ AAAAAGAAAG 3070 hom 36 het 14 0 13 4 AGGGTGGAAGGA 1 0 201351 CASAVA_Build 4 17008827 1D CTTAACAACT A/- AAAAAAAAAA 1372 het 1372 ref 36 28 3 5 A 12 11 201352 CASAVA_Build 4 17015944 1I AATGACAGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 8 9 201353 CASAVA_Build 4 17020969 1D CTCAATAACC A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 A 8 7 201354 CASAVA_Build 4 17026096 2I GAAATTTTTC --/TA TATTAAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TA 1 2 201355 CASAVA_Build 4 17026366 3D GCCTCTTTGA TGT/--- TCTGCAATTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 4 TGT 1 0 201356 CASAVA_Build 4 17027497 6I CAGTTATCTA ------/TCTAAG CAGTGCCCTT 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 TCTAAG 0 1 201357 CASAVA_Build 4 17036965 1D ACTTACTATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 10 9 201358 CASAVA_Build 4 17060095 27D TAAACTTTAT TTTATCCTTTATTAAAGGATAAATTAC/--------------------------- TTTATCCTTT 2465 het 2465 ref 23 16 6 8 TTTATCCTTTATTAAAGGATAAATTAC 1 0 201359 CASAVA_Build 4 17063194 1I ATTGAATCAC -/G GGGGGTGGAT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 G 5 6 201360 CASAVA_Build 4 17076412 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2959 het 323 hom 30 3 11 17 A 19 18 201361 CASAVA_Build 4 17077170 1I GAGTGTAAAG -/C CAGAACTCCC 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 C 1 2 201362 CASAVA_Build 4 17080436 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 575 hom 4 het 14 0 2 12 T 15 14 201363 CASAVA_Build 4 17084025 1D ACAAAAAATA C/- AAAAATTAGC 3070 hom 24 het 12 0 9 3 C 1 0 201364 CASAVA_Build 4 17092750 2D GACCCCTAGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 TC 7 6 201365 CASAVA_Build 4 17119355 1D ATTTAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 A 15 14 201366 CASAVA_Build 4 17119450 5I AGAAAAAGAC -----/AAGAA AATAGGCCAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAGAA 0 1 201367 CASAVA_Build 4 17128783 1D CCATCTGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 22 9 A 13 12 201368 CASAVA_Build 4 17133935 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2826 het 2537 hom 36 13 9 14 T 15 14 201369 CASAVA_Build 4 17136665 1D TTATTAAAAA T/- ATTAATTAAA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 1 0 201370 CASAVA_Build 4 17140082 1D AACCTAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 8 10 T 11 10 201371 CASAVA_Build 4 17145051 3I ATGAACAAAA ---/AAG GTATTAATTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAG 0 1 201372 CASAVA_Build 4 17181368 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 35 1 28 6 A 10 11 201373 CASAVA_Build 4 17182853 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 8 9 201374 CASAVA_Build 4 17184790 2I TGTTTTTCTC --/TT GTTAATCTGT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 0 2 201375 CASAVA_Build 4 17187454 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 37 het 17 0 12 5 A 10 9 201376 CASAVA_Build 4 17189264 5D ACTCAGTCCT ACCAC/----- ACCACACAGG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 ACCAC 2 1 201377 CASAVA_Build 4 17190742 2D TTTTTGAAAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AG 2 1 201378 CASAVA_Build 4 17192299 2D GTCTCTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 38 0 30 9 A 14 12 201379 CASAVA_Build 4 17198151 4D GTTGTTGTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 25 9 T 16 12 201380 CASAVA_Build 4 17198923 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 37 0 25 12 T 12 11 201381 CASAVA_Build 4 17202693 1D TGTGTGCACC T/- TGGGGGGGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 1 201382 CASAVA_Build 4 17203066 4I GATGTCTGGC ----/TTCT TTCTTTCAGC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTCT 1 2 201383 CASAVA_Build 4 17204244 2D ATCTAGTCAC AT/-- GAGTCCTCCA 3070 hom 72 het 28 0 24 5 AT 1 0 201384 CASAVA_Build 4 17209483 1I CAAGCTGTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 83 het 36 0 30 6 T 9 10 201385 CASAVA_Build 4 17216302 1D CCCCAAATAT A/- ATCCTGAGGG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 2 1 201386 CASAVA_Build 4 17219739 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATTGCTT 2957 hom 18 het 8 0 7 1 AGG 1 0 201387 CASAVA_Build 4 17220462 2I AAAAAAAAAA --/CG ACGGGGACTG 3070 hom 36 het 19 0 12 7 CG 0 1 201388 CASAVA_Build 4 17222114 4I TCCAAAAAAT ----/GTTA GTTAGTGCTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 GTTA 1 2 201389 CASAVA_Build 4 17222670 1I TCTGTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 8 9 201390 CASAVA_Build 4 17229456 2D3M4D4M17D TTAGGATGGT GACTTCGTGGATCTGCCTTCCTAGTTAGGA/--CTT----GATC----------------- TCCTGACTTC 3070 hom 48 het 15 0 16 1 N/A 0 0 201391 CASAVA_Build 4 17231414 3D GCATTGTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2036 het 280 hom 37 4 11 22 T 21 18 201392 CASAVA_Build 4 17235276 2D GGTCAGTCAC TG/-- TTTTCAGTAG 3070 hom 117 het 42 0 39 4 TG 1 0 201393 CASAVA_Build 4 17241501 1D TGTAATCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 25 13 T 12 11 201394 CASAVA_Build 4 17243355 2I TCCTAAAAGC --/AA AAAAAAAGGT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 7 9 201395 CASAVA_Build 4 17244655 5D TGCAAAAAAC AAAAT/----- AAAGCATTAT 3070 hom 74 het 35 0 24 14 AAAAT 1 0 201396 CASAVA_Build 4 17245606 1I AACAAGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 898 hom 32 2 25 5 T 10 11 201397 CASAVA_Build 4 17246397 1I GGATTACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1270 hom 27 3 21 3 A 13 14 201398 CASAVA_Build 4 17246763 1D AGTAAAGTGA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 9 8 201399 CASAVA_Build 4 17247401 1I AGTCCCCCTT -/A ACAGCAATTA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 1 2 201400 CASAVA_Build 4 17248394 2I TATTGGAGAC --/AG TGGAGAAGTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AG 0 1 201401 CASAVA_Build 4 17248720 2I CTCCCTCTCA --/CT CTGATGCCTC 3070 hom 100 het 42 0 31 11 CT 1 2 201402 CASAVA_Build 4 17249076 1I TGCCCAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 8 8 T 10 11 201403 CASAVA_Build 4 17250833 1D GATTACACGC G/- TGAGCCACCA 2264 hom 24 het 12 0 8 4 G 1 0 201404 CASAVA_Build 4 17251304 1I CAAATATTAA -/G AAAAAAGGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 201405 CASAVA_Build 4 17261622 1I TACTTTTCCT -/A AATTTTTTTT 2653 het 2653 ref 32 16 10 6 A 2 3 201406 CASAVA_Build 4 17273066 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 32 0 24 8 T 11 10 201407 CASAVA_Build 4 17282672 1I TCAAAGATGC -/A AAAAAGAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 5 6 201408 CASAVA_Build 4 17282980 1I TCAAAGTGCT -/A AAAAAAAATG 3070 het 429 hom 35 1 25 9 A 8 9 201409 CASAVA_Build 4 17284563 1I TCGGTGTACC -/A AAATCTCATA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 3 4 201410 CASAVA_Build 4 17287531 5D CATATATTTT GTACA/----- GTACAGTAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GTACA 2 1 201411 CASAVA_Build 4 17288692 1D AATCCAGCAT C/- CCTTTATGGT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 3 2 201412 CASAVA_Build 4 17290521 1D ATGAGTGGTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 9 8 201413 CASAVA_Build 4 17294819 2D12M10D TAATTACTAT TATATTATAGTATAAAATAATTAT/--TATTATATTATA---------- ATATAAAATA 2460 hom 12 het 7 0 5 2 N/A 0 0 201414 CASAVA_Build 4 17299000 1D TTTGTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 234 hom 34 1 29 4 T 12 11 201415 CASAVA_Build 4 17303751 5D AGGGGAACTG CAGGC/----- TACCCACTTG 3070 hom 45 het 17 0 16 3 CAGGC 1 0 201416 CASAVA_Build 4 17305244 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 29 2 13 14 A 15 16 201417 CASAVA_Build 4 17305725 4I TGCAAAGGCC ----/CTGG CTGGAATGTT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 CTGG 1 2 201418 CASAVA_Build 4 17305877 11I ACTGTTTTTC -----------/TGGGGTTTTTT TTTGTTGTTT 3070 hom 52 het 27 0 17 10 TGGGGTTTTTT 0 1 201419 CASAVA_Build 4 17309140 3I ACTGTAAGGG ---/AAC AACAACTGAG 3070 hom 129 het 53 0 44 9 AAC 2 3 201420 CASAVA_Build 4 17309917 15D TACAGCAAGA GAAATTATCCAAACT/--------------- GAAACAGAGA 3070 hom 78 het 25 0 27 2 GAAATTATCCAAACT 1 0 201421 CASAVA_Build 4 17310028 3I AAATGGAAGA ---/AAT AATGGCCATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAT 1 2 201422 CASAVA_Build 4 17314219 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 50 het 22 0 17 5 A 9 10 201423 CASAVA_Build 4 17334833 4D AACAAAATCT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 95 het 38 0 32 8 CA 11 9 201424 CASAVA_Build 4 17374295 5I TTGGCAGCGT -----/GAAAA GAAGAGGCTT 3070 hom 108 het 39 0 34 5 GAAAA 0 1 201425 CASAVA_Build 4 17439635 39D TAGCCACATT AAAAAAAGTGGCTTTTTTTTAAAGCCACTGTTTTAAAAA/--------------------------------------- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 34 23 11 5 AAAAAAAGTGGCTTTTTTTTAAAGCCACTGTTTTAAAAA 1 0 201426 CASAVA_Build 4 17456280 1D TAAAACATGT A/- AAAAAAACAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 7 201427 CASAVA_Build 4 17504100 1D AGTAAATGAA T/- TTAAGTATTA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 3 2 201428 CASAVA_Build 4 17505763 1D TAATATATAT A/- AAAAAAGTTT 2290 het 2011 hom 13 5 5 3 A 7 6 201429 CASAVA_Build 4 17550894 2D TGTATACATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 TA 8 7 201430 CASAVA_Build 4 17552574 1D CATGATAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 42 0 28 14 T 15 14 201431 CASAVA_Build 4 17565312 1D TTGGTAAGAT G/- GGGGGAGAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 G 6 5 201432 CASAVA_Build 4 17593242 1I TTTCTCCATT -/A ATCAGTGATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 1 2 201433 CASAVA_Build 4 17624539 1I TGCAGTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1437 hom 28 5 14 9 T 13 14 201434 CASAVA_Build 4 17630409 1I AGAAGACCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 9 10 201435 CASAVA_Build 4 17648322 1I TATATTCTGT -/G AACCATATTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 0 1 201436 CASAVA_Build 4 17649615 1I ATTCTACTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 417 hom 32 1 29 2 T 9 10 201437 CASAVA_Build 4 17657815 5D CATAAAAATA AAGAG/----- AATAGTATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAGAG 1 0 201438 CASAVA_Build 4 17657990 10D AAGAGGGGGC ATTTTCTTGT/---------- ATATCCAACA 2316 het 583 hom 22 6 5 11 ATTTTCTTGT 1 0 201439 CASAVA_Build 4 17661215 8D5M7D AGGATTGCTT GAACCCAGGGGTTCAAGACC/--------GGGTT------- AGCCTGGGCA 3070 hom 99 het 31 0 31 3 N/A 0 0 201440 CASAVA_Build 4 17783496 7D TCATCAGTTC ACAGAAA/------- ACCGACATGC 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 ACAGAAA 1 0 201441 CASAVA_Build 4 17794422 1D GAGGATGAAA G/- AGCAGTTCTC 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 G 1 0 201442 CASAVA_Build 4 17808031 1D GAGAAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 2006 het 2006 ref 42 30 5 8 T 13 12 201443 CASAVA_Build 4 17815970 1D TATTTTCACG T/- ATACATTTGC 3070 het 3070 hom 45 17 21 10 T 1 0 201444 CASAVA_Build 4 17818649 1I CATTATTCGG -/T TTTTCTGTTC 3070 het 3070 hom 44 19 24 1 T 4 5 201445 CASAVA_Build 4 17835935 2D CAGGTTGTAA AG/-- AATGTGGGAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 6 AG 1 0 201446 CASAVA_Build 4 17837825 1D GAGTGGGCAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 A 9 8 201447 CASAVA_Build 4 17848461 4D CACATAAAAT AGTC/---- AGGATATTAG 3070 het 3070 hom 30 13 16 3 AGTC 1 0 201448 CASAVA_Build 4 17856584 1I CTTAAATGAG -/A AACAATTTGA 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 A 2 3 201449 CASAVA_Build 4 17863920 1I ATCTCATAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 T 9 10 201450 CASAVA_Build 4 17868787 1D AAATCCATTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 9 8 201451 CASAVA_Build 4 17875179 1I ATTCTGCCCC -/T GGCCCTCCCA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 0 1 201452 CASAVA_Build 4 17886340 2I TAAGTCTGTG --/GT TTTTTTTTTG 3070 het 2643 hom 30 11 18 3 GT 0 1 201453 CASAVA_Build 4 17892166 1I ACCTTTTGAG -/T TACACATTCA 3070 hom 126 het 49 0 41 8 T 1 2 201454 CASAVA_Build 4 17897838 6D AACCTACCTA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 8 AAAAAC 3 2 201455 CASAVA_Build 4 17902749 1I AATGATAGAA -/C TTAATTCAGG 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 C 0 1 201456 CASAVA_Build 4 17903580 1I TTGGGATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 19 8 T 11 12 201457 CASAVA_Build 4 17909717 2I TTCCTGCAGG --/TC TACTCCCCAG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 TC 0 1 201458 CASAVA_Build 4 17910704 1I TTTGTTTATT -/A AAAAAAAAAT 2287 het 2287 ref 32 23 5 4 A 9 10 201459 CASAVA_Build 4 17925764 1D ACACTGCATG T/- TTTTTTTTTT 2200 het 2200 ref 32 14 8 10 T 16 15 201460 CASAVA_Build 4 17944272 1I CAGGGTGCAG -/C CCCCATAGCT 3070 hom 83 het 35 0 25 10 C 4 5 201461 CASAVA_Build 4 17949046 5I AAGTCTATTC -----/CCATG CCTGTGTCCT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 CCATG 0 1 201462 CASAVA_Build 4 17949152 1D GTACAAGGTG T/- TAAGGAAGGG 3070 het 2599 hom 18 7 9 2 T 2 1 201463 CASAVA_Build 4 17955831 2D GCCAAAAATA AG/-- AGAGAGATTT 3070 het 3070 hom 32 11 19 3 AG 4 3 201464 CASAVA_Build 4 17962527 1I TCATAGAGAT -/C TTTCACTTCC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 C 0 1 201465 CASAVA_Build 4 17967454 1I TATTTGGTAG -/T TTTTTTTTTT 2452 het 2452 ref 42 16 14 12 T 15 16 201466 CASAVA_Build 4 17970348 1D CTAAGGCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 11 10 201467 CASAVA_Build 4 17973856 1D CCCCATTGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 48 18 25 7 T 10 9 201468 CASAVA_Build 4 17975667 4D AGATTTGCAT GTAA/---- GTATTTCAAT 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 GTAA 1 0 201469 CASAVA_Build 4 17976057 1D ATGACTTCCA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 9 8 201470 CASAVA_Build 4 17980590 10I ACACATATAC ----------/GTGTATATAT GTGTATATAT 3070 het 3070 ref 35 21 10 5 GTGTATATAT 1 2 201471 CASAVA_Build 4 17983707 1D AAGCAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 12 11 201472 CASAVA_Build 4 17994739 1D ATGCCTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 11 10 201473 CASAVA_Build 4 18000415 23D AACTGGACAG GAAAAATTGCTTATTCTCCTAAA/----------------------- TTTTTACAGG 3070 het 3070 ref 28 18 12 3 GAAAAATTGCTTATTCTCCTAAA 1 0 201474 CASAVA_Build 4 18059684 1D ATATAATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 12 11 201475 CASAVA_Build 4 18066170 3D CCACAGTAGC CTT/--- CTTTCTCCTT 3070 het 3070 hom 53 24 23 7 CTT 2 1 201476 CASAVA_Build 4 18074415 4D GTTTGGGCAG GGAT/---- GGTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 23 15 6 GGAT 1 0 201477 CASAVA_Build 4 18074862 2D CACATATATA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 68 28 29 13 TG 5 4 201478 CASAVA_Build 4 18075748 4D ATGTACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 2507 hom 30 8 11 12 AC 11 9 201479 CASAVA_Build 4 18076532 1I ATCGACTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 10 11 201480 CASAVA_Build 4 18080359 4D23M1D CCATCACAAA AAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACA/----AAACAAACAAACAAACAAAAAAC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 11 11 N/A 0 0 201481 CASAVA_Build 4 18090870 1I GCGTGAATAG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 7 8 201482 CASAVA_Build 4 18090938 12D TCTGTGAAGG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2825 het 2825 ref 34 16 9 11 T 26 14 201483 CASAVA_Build 4 18092639 1I CAGGTGTCAC -/A GGGGTTTGTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 0 1 201484 CASAVA_Build 4 18108578 2D CCCAGCAGAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 AC 6 5 201485 CASAVA_Build 4 18111685 2I TTGGAGTGTT --/AG AGCTTCAAGT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AG 1 2 201486 CASAVA_Build 4 18117168 1D ATGTATGTTA T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 8 7 201487 CASAVA_Build 4 18132503 5I ATGGTAAGAT -----/AAGAC AAGACAAACA 3070 het 3070 hom 31 8 18 5 AAGAC 1 2 201488 CASAVA_Build 4 18140759 1I GTCTGAGCAT -/G GTGGCTCATG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 G 1 2 201489 CASAVA_Build 4 18147932 4D ATGTATTCAG ACAA/---- ACAATGAATG 3070 het 3070 hom 66 33 31 4 ACAA 2 1 201490 CASAVA_Build 4 18148488 1I AGGAAGCATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 9 10 201491 CASAVA_Build 4 18166881 1D CTTGGAAATA T/- GTCAGAATCC 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 T 1 0 201492 CASAVA_Build 4 18172181 7D TATGAAGAAA CTGCATT/------- CTGCATCAAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 CTGCATT 1 0 201493 CASAVA_Build 4 18173702 15D CCTTCTGAAA CTTCTGAAACTATTC/--------------- CTTCTGAAAC 3070 het 3070 ref 30 14 9 8 CTTCTGAAACTATTC 2 1 201494 CASAVA_Build 4 18183034 1D TGACTCATTT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 8 7 201495 CASAVA_Build 4 18203672 3I ATAATAAAAA ---/AAT AATAATTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AAT 2 3 201496 CASAVA_Build 4 18204950 1D GAATATTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 30 0 21 9 T 11 10 201497 CASAVA_Build 4 18234941 1I TCTGGAACTT -/C CTTGAAATTT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 C 1 2 201498 CASAVA_Build 4 18248913 1D ACACATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 662 hom 33 2 22 10 T 12 11 201499 CASAVA_Build 4 18270999 4I AATACACACA ----/CACT CACACACATA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 CACT 0 1 201500 CASAVA_Build 4 18272815 11D GAGAAAAAAA ATTTGCAAAAT/----------- ATTTGCAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 4 ATTTGCAAAAT 1 0 201501 CASAVA_Build 4 18283605 1D TTGGAATACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 228 hom 41 1 35 6 A 14 13 201502 CASAVA_Build 4 18295942 3I ACTCAACTTA ---/ATT AAGGAATGGA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 ATT 0 1 201503 CASAVA_Build 4 18305980 2D TGAAAAGGGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 14 het 24 0 13 11 TG 10 9 201504 CASAVA_Build 4 18306088 24D ACGAGAAAAG ATATATATATATATATATATATAT/------------------------ ATATATATAT 3070 het 200 hom 20 2 10 9 AT 19 7 201505 CASAVA_Build 4 18307962 7D GGTTCTGGTT TCAGTGA/------- TCTGCCTTGG 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TCAGTGA 1 0 201506 CASAVA_Build 4 18308393 2I AGAGGAAAAC --/TA TTTTTATGAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 TA 0 1 201507 CASAVA_Build 4 18308678 1I CTGCTTCTGT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 A 0 1 201508 CASAVA_Build 4 18327410 2D TACAGGTCAG CA/-- CACACACGCA 3070 het 3070 ref 52 25 22 7 CA 4 3 201509 CASAVA_Build 4 18342198 1I TCTAAAACAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 T 7 8 201510 CASAVA_Build 4 18356258 1I CTGTGATATA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 6 7 201511 CASAVA_Build 4 18363838 1I CAACATACTT -/C CAAAATCTTT 2453 hom 12 het 7 0 5 2 C 1 2 201512 CASAVA_Build 4 18364057 1I CAACATACTT -/C CAAAATCTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 1 2 201513 CASAVA_Build 4 18368806 1D CTTGGAAAAT G/- TTGATTTTTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 G 1 0 201514 CASAVA_Build 4 18370541 2D TTTATGTCCA TG/-- TGTGCTCAAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 TG 3 2 201515 CASAVA_Build 4 18386017 1D9M1D GTATAATAAT AAAAAAAACTA/-AAAAAAACT- AAAAAAAAAA 713 het 101 hom 17 2 5 10 N/A 0 0 201516 CASAVA_Build 4 18386122 1D CTATACCTAG A/- AAAACCCCAC 3070 hom 45 het 16 0 16 1 A 5 4 201517 CASAVA_Build 4 18389377 1I ACAACTTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 9 10 201518 CASAVA_Build 4 18402933 1D TATTCAACTA T/- TTTTCTCAAC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 5 4 201519 CASAVA_Build 4 18414426 1D AATAATCTAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 8 201520 CASAVA_Build 4 18414965 4I ACTGTAGGGA ----/TGGT TGGTTGGTTG 3070 het 3070 hom 39 10 13 16 TGGT 3 4 201521 CASAVA_Build 4 18423330 2D TTGTCCACAC AT/-- GAGACAATAA 3070 hom 116 het 41 0 39 2 AT 1 0 201522 CASAVA_Build 4 18425594 1D AACTATGACC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 9 8 201523 CASAVA_Build 4 18429114 1I GTTTGGACCT -/G GGGGTAACTG 3070 het 2930 hom 27 9 14 4 G 4 5 201524 CASAVA_Build 4 18444392 1D GGTATAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 43 0 31 12 A 12 11 201525 CASAVA_Build 4 18448721 3I TATTTGCTAC ---/TCA TCAGTGACAC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TCA 1 2 201526 CASAVA_Build 4 18456506 4D TGTGTGTGTT TGTG/---- TATGTGTGTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TG 2 0 201527 CASAVA_Build 4 18466314 2D GGCGTGGTGA TT/-- TATGCCTGTA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 3 1 201528 CASAVA_Build 4 18467899 1I TTGCTCATCA -/T TTTTCAGATT 3070 hom 116 het 46 0 38 8 T 4 5 201529 CASAVA_Build 4 18478049 4D AGAGAAAGGA GTTT/---- TTATATCACC 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 GTTT 1 0 201530 CASAVA_Build 4 18480145 1I GCCCTTGGAG -/A AAAAAAAAAA 2511 het 2511 ref 36 20 7 9 A 11 12 201531 CASAVA_Build 4 18484726 5D ATTATAATAA TATAT/----- TATATATAAT 2071 het 1904 hom 11 5 6 1 TATAT 2 1 201532 CASAVA_Build 4 18487412 3D ATATTAAGAA AGT/--- AGAAAAATAA 2478 het 2478 ref 26 14 7 6 AGT 1 0 201533 CASAVA_Build 4 18495398 1I ACTCCTGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 10 11 201534 CASAVA_Build 4 18505901 4D TTCTACTGGG TTAT/---- TTGTTTCATG 3070 het 3070 ref 44 21 17 8 TTAT 1 0 201535 CASAVA_Build 4 18509209 1I TGCAAATGAA -/C AAAACCCAAC 3070 hom 138 het 51 0 46 5 C 0 1 201536 CASAVA_Build 4 18513274 1I AAGTCATTTC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 8 9 201537 CASAVA_Build 4 18528023 1I TCACATATCT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 A 7 8 201538 CASAVA_Build 4 18535511 1D TAAATGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 A 12 11 201539 CASAVA_Build 4 18536762 3I GCAATGAAGA ---/AAT AATACCAGAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 AAT 1 2 201540 CASAVA_Build 4 18538926 1D AATGTAAGGC A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 A 7 6 201541 CASAVA_Build 4 18540899 1I TGGTCATGAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 8 9 201542 CASAVA_Build 4 18630323 1I CCTGCATGAA -/T TTTTTTTTTT 2777 het 2777 ref 23 7 9 7 T 13 14 201543 CASAVA_Build 4 18650085 1D AAGGCTCATT A/- AAAAAAAAAA 1337 het 1337 ref 53 41 6 6 A 11 10 201544 CASAVA_Build 4 18685371 1D CGAAAAAGGA T/- TAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 2 1 201545 CASAVA_Build 4 18704260 1D TTGTTTATTT G/- TTTGTTATGA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 G 1 0 201546 CASAVA_Build 4 18738132 1I AGGCTTACAC -/T TTTTTTTTTT 1441 het 1441 ref 31 9 10 12 T 17 18 201547 CASAVA_Build 4 18741810 2I TTGCTTTGAT --/AA AAAGTTTTGC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 A 3 5 201548 CASAVA_Build 4 18751047 1D GTTTTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 1697 het 1697 ref 42 25 5 12 T 15 14 201549 CASAVA_Build 4 18777339 1D AAAACCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 15 8 A 11 10 201550 CASAVA_Build 4 18794902 1D CAATAGGCAT A/- AAAAAATATA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 6 201551 CASAVA_Build 4 18816986 1D ATATATGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 11 10 201552 CASAVA_Build 4 18835795 1I GCGCCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 10 11 201553 CASAVA_Build 4 18843580 2I TATCAGGACA --/CT CTGTATTTTT 2807 het 2807 ref 29 20 8 1 CT 1 2 201554 CASAVA_Build 4 18845337 1D TGACCCTCAC T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 8 7 201555 CASAVA_Build 4 18852401 2D TACAAATCTC TG/-- TAGGAATTTG 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 TG 1 0 201556 CASAVA_Build 4 18863587 2D TAAAAATAAC TG/-- TAACAAAATG 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 TG 1 0 201557 CASAVA_Build 4 18870615 1D GGGTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 15 10 T 12 11 201558 CASAVA_Build 4 18872879 4I CTTTGGCTCT ----/AAGC ATTTATTTTC 3070 het 3070 hom 46 19 26 1 AAGC 0 1 201559 CASAVA_Build 4 18893328 1D ATATGGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 11 12 A 11 10 201560 CASAVA_Build 4 18901766 1I AGGTATTTTG -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 6 7 201561 CASAVA_Build 4 18916148 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 10 9 201562 CASAVA_Build 4 18927965 1I TTCATTTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 50 19 19 12 T 9 10 201563 CASAVA_Build 4 18937748 1D CACTGCAGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 T 9 8 201564 CASAVA_Build 4 18939105 2D GCTTTAAGAC TT/-- TGTCTTAAAT 3070 het 3070 hom 45 18 19 9 T 3 1 201565 CASAVA_Build 4 18959489 1I GGACTACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 27 4 T 10 11 201566 CASAVA_Build 4 18961206 3I TTAAAACACC ---/AAG AAGTCTCATA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 AAG 1 2 201567 CASAVA_Build 4 18978481 1D CTTCTATGGT A/- AAAAAATCTG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 A 7 6 201568 CASAVA_Build 4 18983152 1I CCAAAAGCAT -/A AAGGAACCTC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 2 3 201569 CASAVA_Build 4 18994851 1D AGCACACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 12 11 201570 CASAVA_Build 4 18995547 1I AGATTTGAGT -/G GGGGAAACAG 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 G 4 5 201571 CASAVA_Build 4 18996247 1D AGCATCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 A 11 10 201572 CASAVA_Build 4 19013182 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 2834 het 2834 ref 29 12 9 9 A 12 11 201573 CASAVA_Build 4 19015164 1I GAGAAATTCT -/G CATCCCTTAT 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 G 0 1 201574 CASAVA_Build 4 19022296 1D TTTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2005 hom 26 7 15 4 T 13 12 201575 CASAVA_Build 4 19025953 3I TAAGTAAGTG ---/TTT TTGTCATTTT 3070 het 3070 ref 65 27 29 9 T 2 5 201576 CASAVA_Build 4 19037157 9D AAAAGTTTCC ATACAAAGT/--------- ATACAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 11 21 5 ATACAAAGT 1 0 201577 CASAVA_Build 4 19051703 5D TTTTTTTTTT GTTTG/----- TTTGTTTTTT 891 het 891 ref 43 19 8 19 GTTTG 1 0 201578 CASAVA_Build 4 19066430 1D CTACTTAAGA C/- CTGCTTTTGC 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 C 2 1 201579 CASAVA_Build 4 19072302 1D TTTTGCCTTA G/- TTTAGCCTAT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 G 1 0 201580 CASAVA_Build 4 19086777 1D TATTTAATGA T/- TTTTTTTTTT 1380 het 1380 ref 33 27 3 3 T 12 11 201581 CASAVA_Build 4 19095310 10D ATAAAAATGT CAGATAACAC/---------- CAGATAACAC 3070 het 3070 ref 31 16 11 7 CAGATAACAC 2 1 201582 CASAVA_Build 4 19143423 3I GCTGCCACTC ---/CTT CTTATTCAGT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 CTT 1 2 201583 CASAVA_Build 4 19148305 2D AATTGTATTT TA/-- TATATATATA 1419 het 1419 ref 21 15 3 4 TA 9 8 201584 CASAVA_Build 4 19159413 3D AGAACTCTCG TTT/--- TTTTTTTTTT 2723 het 2050 hom 29 12 12 5 T 17 14 201585 CASAVA_Build 4 19159994 2D15M4D TAGTTAACAC TTTGGGTTATGGTACAATATT/--TGGGTTATGGTACAA---- TATTTATCTA 3070 het 3070 ref 44 23 19 6 N/A 0 0 201586 CASAVA_Build 4 19160189 1I ATCATCATGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 T 8 9 201587 CASAVA_Build 4 19163564 10D GCCCTCTGAG TAGCTATAAC/---------- TACAGGTGTG 3070 het 3070 hom 32 13 18 4 TAGCTATAAC 1 0 201588 CASAVA_Build 4 19165652 5I GATTGTATCA -----/TTACC TTACATAAGT 2070 het 2070 ref 21 8 5 8 TTACC 0 1 201589 CASAVA_Build 4 19165680 1I ATTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 1714 het 1714 ref 20 5 5 10 T 15 16 201590 CASAVA_Build 4 19171253 1D CAAAGACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 15 15 A 13 12 201591 CASAVA_Build 4 19172455 1D AATAAATTTG T/- CTCCCAAAAT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 1 0 201592 CASAVA_Build 4 19179079 2D ATCCTCTTTC AA/-- AAAGTCTAAA 3070 het 3070 hom 25 9 13 4 A 5 3 201593 CASAVA_Build 4 19187312 1D ATGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 899 hom 27 6 11 10 A 17 16 201594 CASAVA_Build 4 19204155 1D TATTATATAT G/- GAATATTATT 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 G 2 1 201595 CASAVA_Build 4 19211684 1I GAGTGTTTGA -/T AGAAGCTTAA 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 T 0 1 201596 CASAVA_Build 4 19229265 1D GATACTACTG A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 6 5 201597 CASAVA_Build 4 19384777 1I TAATATGTGT -/A AAAACTCCTG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 4 5 201598 CASAVA_Build 4 19430599 1D ATATGGTGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 T 9 8 201599 CASAVA_Build 4 19465702 1D CTTTGCTACA T/- CATGGCCAGG 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 T 1 0 201600 CASAVA_Build 4 19473068 1I AATTGTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 713 hom 43 2 35 6 T 11 12 201601 CASAVA_Build 4 19487044 1D GGAGGCACAC A/- AAAAAGAACT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 5 201602 CASAVA_Build 4 19488219 1D ACAGAAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 10 9 201603 CASAVA_Build 4 19490406 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTTCTCC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 3 2 201604 CASAVA_Build 4 19494492 1I TCTGCTCTAC -/T TTTTTTATTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 6 7 201605 CASAVA_Build 4 19508416 3D TAATAATAAG TAA/--- TAATATTATA 3070 hom 60 het 22 0 21 3 TAA 2 1 201606 CASAVA_Build 4 19509085 2I AGAATTCTTC --/AA GATACCCCAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 0 2 201607 CASAVA_Build 4 19515456 1I TTCCTATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 332 hom 48 1 39 8 A 9 10 201608 CASAVA_Build 4 19530149 4I TGTAATGGCC ----/TTCT TTGTCTCTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TTCT 0 1 201609 CASAVA_Build 4 19536478 1I CTGCCATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 A 10 11 201610 CASAVA_Build 4 19547702 1I CTTCCAAATA -/C TCCCAGCAAC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 0 1 201611 CASAVA_Build 4 19552718 1I TCATAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 2394 het 234 hom 28 3 15 10 A 15 16 201612 CASAVA_Build 4 19559686 1D TGAGGTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 13 12 201613 CASAVA_Build 4 19564446 1I AACTAGAAAT -/C AAAAGAATGT 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 C 0 1 201614 CASAVA_Build 4 19567430 3I TTAAAAACAC ---/AAT GAGATATCAT 1259 het 1259 ref 35 20 3 12 AAT 0 1 201615 CASAVA_Build 4 19568621 1I TTCCAGGGAC -/T AAAACCATAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 0 1 201616 CASAVA_Build 4 19578846 1I ACCTCTTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 9 10 201617 CASAVA_Build 4 19582684 2D TCCTCTAGTT TC/-- TGTGTGCTTT 3070 het 3070 hom 47 19 22 8 TC 1 0 201618 CASAVA_Build 4 19583015 1D ATTGTGTCCC A/- AAGAGAATTC 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 A 3 2 201619 CASAVA_Build 4 19601061 1D TAAGTGCCGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 9 8 201620 CASAVA_Build 4 19607543 5I TATATGTATC -----/TTTTA TTTGTTTGCT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 TTTTA 0 1 201621 CASAVA_Build 4 19612991 1I AGTAGAATAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 A 8 9 201622 CASAVA_Build 4 19618238 1I AGATGGCAAT -/A TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 A 0 1 201623 CASAVA_Build 4 19620094 1I TGTTTTTTGG -/T TTTTTTATGT 3070 het 3070 hom 46 24 19 3 T 6 7 201624 CASAVA_Build 4 19621319 1D TTTTTTGGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 10 9 201625 CASAVA_Build 4 19624550 1D TTTATTTTGC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 9 8 201626 CASAVA_Build 4 19630837 1I TGGTTTTAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 9 10 201627 CASAVA_Build 4 19657224 1D ATGTTAAAGG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 49 21 21 8 A 8 7 201628 CASAVA_Build 4 19660375 1I AGGCATCTGC -/A AAAGGCCCTC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 3 4 201629 CASAVA_Build 4 19665831 1D TATTGAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 11 10 201630 CASAVA_Build 4 19666134 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1748 het 1748 ref 24 10 6 8 A 12 11 201631 CASAVA_Build 4 19674793 2D GTATACACCC AA/-- AGTATTATAA 474 het 474 ref 38 22 2 15 A 3 1 201632 CASAVA_Build 4 19678845 2D GGATTGGGGC GG/-- GGGGGGGCAG 3070 hom 24 het 21 0 10 12 G 9 7 201633 CASAVA_Build 4 19701396 2D AAGGAGAGAC AG/-- AGAAAGACTA 3070 het 3070 hom 47 21 23 4 AG 2 1 201634 CASAVA_Build 4 19703349 4D GGTTTAGTTA GTTT/---- TAGTGCATTT 3070 het 3070 ref 31 20 10 3 GTTT 1 0 201635 CASAVA_Build 4 19705441 1D TAAAATCATA G/- GTTCTTAGTG 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 G 2 1 201636 CASAVA_Build 4 19709016 3D ATTTGGAAAA TTG/--- TTATGTTTGC 3070 het 3070 ref 43 23 20 2 TTG 1 0 201637 CASAVA_Build 4 19710839 1D AGTAAAAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 7 201638 CASAVA_Build 4 19722123 1D GCATTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 11 10 201639 CASAVA_Build 4 19729355 1D CATTATTCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 T 9 8 201640 CASAVA_Build 4 19729729 1I CTGAGTCCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 26 18 6 T 9 10 201641 CASAVA_Build 4 19741108 2D TATAAATAAA AT/-- ATATATATAT 2028 het 2021 hom 15 7 5 3 AT 6 5 201642 CASAVA_Build 4 19752374 1D GTAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 11 10 201643 CASAVA_Build 4 19765103 1D GATCTGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 10 13 A 12 11 201644 CASAVA_Build 4 19767596 3I TAAGTGTCAT ---/CTC CTTGCATTAG 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 CTC 0 1 201645 CASAVA_Build 4 19773381 1I AAGGGGTGGG -/T GGGGGGAATG 3070 het 3070 hom 42 18 14 10 T 0 1 201646 CASAVA_Build 4 19773999 2D TGTTATAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 AC 9 8 201647 CASAVA_Build 4 19779403 2I TGTCTGTGTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 GT 8 9 201648 CASAVA_Build 4 19781924 2I GTGTCTGTAC --/AT ATATATATAT 2554 het 1361 hom 26 12 8 6 AT 5 6 201649 CASAVA_Build 4 19784847 1D CACTGGAAAA G/- AGTAATCCTA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 G 1 0 201650 CASAVA_Build 4 19785596 1I TTAATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 T 11 12 201651 CASAVA_Build 4 19791240 1I TTTAATGCTG -/T TTTTTTTTTT 3054 het 3054 ref 32 16 7 9 T 11 12 201652 CASAVA_Build 4 19791972 1D ATCCTCTGCC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 A 8 7 201653 CASAVA_Build 4 19793106 1I TACTTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 26 22 5 A 10 11 201654 CASAVA_Build 4 19795194 1D AGGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 10 9 201655 CASAVA_Build 4 19806103 1D TGGAATTGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 57 24 24 9 A 10 9 201656 CASAVA_Build 4 19813656 1D CAAAAGTGAC A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 8 7 201657 CASAVA_Build 4 19821035 2I ATACATTATT --/TA TATAGAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 TA 2 3 201658 CASAVA_Build 4 19828867 4D GCATTTATCA TTTC/---- TTTGTGTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 TTTC 1 0 201659 CASAVA_Build 4 19829864 1I TTTGCTGTGC -/A GAAGCTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 201660 CASAVA_Build 4 19830398 2D AATTTTTGGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 T 11 9 201661 CASAVA_Build 4 19839223 1D TTGGTTTTTT A/- AACATTGGCA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 A 3 2 201662 CASAVA_Build 4 19840392 1D AATATTTTAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 A 9 8 201663 CASAVA_Build 4 19841060 3I GCAAAACACA ---/ATC ATCTGACTAT 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 ATC 1 2 201664 CASAVA_Build 4 19841737 1D AAAATAAAAT A/- AAAAAAAAAT 2724 het 2724 ref 30 14 9 8 A 10 9 201665 CASAVA_Build 4 19842092 1D TTGAACAACT A/- AATATTTCTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 A 3 2 201666 CASAVA_Build 4 19845230 2I TCAAATGAAA --/AC AGTCTTTTAT 3070 het 2796 hom 22 6 13 3 AC 0 1 201667 CASAVA_Build 4 19847597 1D CACACACACC A/- GATGTACTTA 3070 het 3070 hom 34 9 22 4 A 1 0 201668 CASAVA_Build 4 19847897 1D GTATTATACT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 A 10 9 201669 CASAVA_Build 4 19853266 4D CATTTGCATG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 47 22 22 4 GT 10 8 201670 CASAVA_Build 4 19856166 3D TTCAATTTAA AAT/--- AATAATCATA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 AAT 3 2 201671 CASAVA_Build 4 19871382 1I GATCTGTACC -/T TTTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 4 5 201672 CASAVA_Build 4 19885464 2D AGTTTCTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 1206 het 1206 ref 44 32 3 10 T 13 11 201673 CASAVA_Build 4 19901477 1I GTTTTCATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 9 15 T 14 15 201674 CASAVA_Build 4 19906557 1D GAGTACTAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 A 9 8 201675 CASAVA_Build 4 19908410 1D TTAAAAAAAA T/- CTCATGGGTT 3070 het 3070 hom 55 20 27 9 T 1 0 201676 CASAVA_Build 4 19910377 1D CCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 12 11 201677 CASAVA_Build 4 19925724 18D23M2D CTGTATTACC TGTAATAAAATAATTAATTATTATAATTAAAAATTATAAACAT/------------------TAGTAAAATTAAAAATTATAAAC-- GTGATCATAC 3070 het 3070 hom 29 16 23 3 N/A 0 0 201678 CASAVA_Build 4 19929359 1I ACATGAGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 T 9 10 201679 CASAVA_Build 4 19932700 4I ATAAGAATCT ----/GGAG GGAGGGGTGG 3070 het 3070 hom 44 10 20 14 GGAG 1 2 201680 CASAVA_Build 4 19941427 1I GGGAATGGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 8 9 201681 CASAVA_Build 4 19942258 4I AATACTGTGA ----/TGTC TGTCAGTCAC 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TGTC 1 2 201682 CASAVA_Build 4 19946648 1I TTTTATAACA -/C ATGTGCTGCC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 C 0 1 201683 CASAVA_Build 4 19971847 1I AGAATTTTTC -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 6 7 201684 CASAVA_Build 4 19994810 1D TCAGAGCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2626 hom 24 7 11 6 T 13 12 201685 CASAVA_Build 4 19998138 5D AAAAAACAGT GAAAA/----- GAATAGTATT 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 GAAAA 1 0 201686 CASAVA_Build 4 19998719 1D GTTTCATCTC T/- ATACATGTAG 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 1 0 201687 CASAVA_Build 4 20017663 2I AAAAATAAAC --/TG GAGAATATTC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TG 0 1 201688 CASAVA_Build 4 20019261 2I AGTTTGCTGA --/CT CTCTGCTGTG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 CT 2 3 201689 CASAVA_Build 4 20043463 1D AAAATTATAC A/- ATTAGGAGAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 2 1 201690 CASAVA_Build 4 20045031 1I CAACATGGAG -/A AACCCTATCT 3070 het 726 hom 11 3 7 1 A 2 3 201691 CASAVA_Build 4 20060682 1D CAGCTCAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 9 201692 CASAVA_Build 4 20066920 1I GTCCTCTTAA -/T TTTTTGCTCT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 5 6 201693 CASAVA_Build 4 20076686 2D TCTTTGAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 11 8 T 12 10 201694 CASAVA_Build 4 20081999 5I ATGAAGTTTA -----/GTTTT ATCATGAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 GTTTT 0 1 201695 CASAVA_Build 4 20086038 1D GAGGTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 23 15 11 T 15 14 201696 CASAVA_Build 4 20106990 1D ATTTGGTAAC T/- TCAATTATTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 10 T 2 1 201697 CASAVA_Build 4 20107787 1D ATTTCTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2974 hom 29 9 12 8 T 12 11 201698 CASAVA_Build 4 20107984 1D AAAACTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 11 10 201699 CASAVA_Build 4 20115668 1D GGCATATAGG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 22 11 9 3 A 8 7 201700 CASAVA_Build 4 20136084 2I GATGTTAAAC --/AT ATATATTATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AT 3 4 201701 CASAVA_Build 4 20140820 3I GTTATAGTGA ---/TTT TTTTTTTTTT 1938 hom 21 het 20 0 8 12 T 13 16 201702 CASAVA_Build 4 20143117 1D CATGCTGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 10 9 201703 CASAVA_Build 4 20144559 2I TCTTTCACAT --/TC TCTCTGTTAC 3070 hom 155 het 55 0 51 4 TC 2 3 201704 CASAVA_Build 4 20147495 2D TTTTTTACTC TT/-- ATATTTATAT 2058 het 1965 hom 12 4 5 3 T 2 0 201705 CASAVA_Build 4 20148105 1D CTGCTTGACC A/- AAATATTGTT 3070 het 3070 hom 47 20 21 7 A 4 3 201706 CASAVA_Build 4 20150104 1D TCCTCAGATA G/- GCAAAATTGA 3070 het 3070 ref 50 29 17 5 G 2 1 201707 CASAVA_Build 4 20150786 4D GGATTACTTG ATCA/---- AGGTCAGGCG 3070 hom 50 het 23 0 12 11 ATCA 1 0 201708 CASAVA_Build 4 20152574 1I3M1I GTTTCCAACT -TGT-/ATATA GGTTGGTCTT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 N/A 0 0 201709 CASAVA_Build 4 20161091 1I ATGCTTGCAG -/A GGGTTTTTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 0 1 201710 CASAVA_Build 4 20187700 1I GAGAGGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1372 hom 37 3 23 11 T 12 13 201711 CASAVA_Build 4 20206196 3I GATGTTCACT ---/ATC ATCAAGGAGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 ATC 1 2 201712 CASAVA_Build 4 20207605 1D AGCAGACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 11 10 201713 CASAVA_Build 4 20208882 2D TCAGGAAAAC AT/-- AAACCATAGT 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 AT 1 0 201714 CASAVA_Build 4 20209993 4D ATTGCATAAG ACTA/---- ACTATCAGAG 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 ACTA 2 1 201715 CASAVA_Build 4 20211047 4D ACCATAACGA GTTT/---- GTTTGAGTTT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 GTTT 2 1 201716 CASAVA_Build 4 20217203 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 A 12 13 201717 CASAVA_Build 4 20239498 5D AGCACTTTTA TTTTC/----- TTAAGCCAAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 6 TTTTC 1 0 201718 CASAVA_Build 4 20253549 4I ATAAACAAAG ----/AGAC AGAAATATTT 3070 het 2352 hom 23 8 14 1 AGAC 0 1 201719 CASAVA_Build 4 20255563 5I2M1I TATAGGTAGT -----GT-/TATGGGTA ACAAATGAGA 3070 het 3070 hom 39 17 21 2 N/A 0 0 201720 CASAVA_Build 4 20268030 1I ATTTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 9 10 201721 CASAVA_Build 4 20283268 1D AGAAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 954 het 954 ref 36 20 3 13 A 12 11 201722 CASAVA_Build 4 20287400 1D GTGGGGGAAC A/- AAAAAAAAAA 2314 het 1279 hom 34 11 9 14 A 17 16 201723 CASAVA_Build 4 20301583 1D TACTGGACAC A/- AATCTATGTC 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 3 2 201724 CASAVA_Build 4 20315904 2I CTGACCTTTC --/CT CTGTGTTCTG 3070 het 3070 ref 52 26 23 3 CT 1 2 201725 CASAVA_Build 4 20321529 1D AAACTATAAG T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 5 4 201726 CASAVA_Build 4 20346252 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 95 het 95 ref 19 3 1 15 T 17 16 201727 CASAVA_Build 4 20348165 9D AAGAGTAAGA GTCAGAAAT/--------- GGGCTGTGCT 3070 het 3070 ref 53 29 21 5 GTCAGAAAT 1 0 201728 CASAVA_Build 4 20373679 1D AGGCAGCAAG A/- AAGGAGAAGT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 3 2 201729 CASAVA_Build 4 20375803 4D CAATAAGTAG TTAT/---- TTAATGCCTT 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 TTAT 1 0 201730 CASAVA_Build 4 20377630 2D TCAGGCAAAC TG/-- TTTAATCTAA 3070 het 3070 ref 54 25 24 5 TG 1 0 201731 CASAVA_Build 4 20383350 2D TTGTTCCCTT TC/-- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 TC 5 4 201732 CASAVA_Build 4 20383769 2I GAAGTTAAAG --/AA AAAAAAAAAA 2863 het 1490 hom 26 8 9 9 A 13 15 201733 CASAVA_Build 4 20397569 5I GTTCTTTATC -----/TTTCT TTTATCAATG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 TTTCT 0 1 201734 CASAVA_Build 4 20401277 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 12 11 201735 CASAVA_Build 4 20415296 3I CTTCTCAAAA ---/TCT TCTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 TCT 1 2 201736 CASAVA_Build 4 20421186 2D AGGAAGGGGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 GA 8 7 201737 CASAVA_Build 4 20435545 1I TCATAATTGC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 6 7 201738 CASAVA_Build 4 20438530 2D CATCCCCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 33 0 23 11 A 15 13 201739 CASAVA_Build 4 20439936 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 21 0 18 3 T 11 10 201740 CASAVA_Build 4 20443548 9I TTGAATGACA ---------/GAAGGAAAG GAAGGGATTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 GAAGGAAAG 0 1 201741 CASAVA_Build 4 20445408 1I GAAAGGTATT -/G GGGAAATGCT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 G 3 4 201742 CASAVA_Build 4 20450217 2I TATCTATATT --/AG ATATATATAT 2498 hom 18 het 7 0 7 0 AG 0 1 201743 CASAVA_Build 4 20450547 1D TATCTTGCCC A/- AGGGTAACCA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 A 2 1 201744 CASAVA_Build 4 20452470 1D GGGCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 48 0 37 12 A 12 11 201745 CASAVA_Build 4 20458272 1I GCTCACTTTT -/G GAGACTCAGA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 1 2 201746 CASAVA_Build 4 20493581 1I CCCCGAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 9 10 201747 CASAVA_Build 4 20530138 2D TAAAAAAAAA AG/-- ATAGATCGGG 3070 hom 39 het 16 0 13 3 AG 1 0 201748 CASAVA_Build 4 20538966 1I AGATAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 35 1 26 8 T 11 12 201749 CASAVA_Build 4 20553846 1I AGGCATTGCA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 8 201750 CASAVA_Build 4 20555594 1I CACGTGTTTA -/T TACTTATTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 2 201751 CASAVA_Build 4 20563510 1D TAATAAAATA T/- TTTTTTGAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 7 6 201752 CASAVA_Build 4 20574055 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2394 het 2394 ref 15 9 6 1 A 11 10 201753 CASAVA_Build 4 20580507 4I ATAGGTATTA ----/AATT ATTTATGAAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 AATT 0 1 201754 CASAVA_Build 4 20582201 1D CAAACCATAC T/- TTTTTTTTTG 1153 het 1153 ref 26 22 3 1 T 10 9 201755 CASAVA_Build 4 20583128 1D GGGGCTGAAG A/- ATGGATGTTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 2 1 201756 CASAVA_Build 4 20588295 1I GTTACCAAAG -/T TAAGTAAAAA 2954 het 2954 ref 14 6 6 2 T 1 2 201757 CASAVA_Build 4 20590519 1D AGTTGAAGTC T/- TTAAGTCAAT 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 T 3 2 201758 CASAVA_Build 4 20597658 2I GCTTTCTGAG --/CT CTGTCTCTCA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 CT 1 2 201759 CASAVA_Build 4 20598134 1I TCATACCAAA -/G GAAGGGAATA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 G 1 2 201760 CASAVA_Build 4 20607487 1I CCTGAACTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 8 9 201761 CASAVA_Build 4 20607790 1D AGACTAGGAT G/- GGGGGAAAAC 3070 het 3070 ref 52 27 25 0 G 6 5 201762 CASAVA_Build 4 20612677 1I TTTGTTTCCA -/G GTAAGTTCAT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 G 1 2 201763 CASAVA_Build 4 20616249 4D TTATATTTCA TATT/---- TATTTATTAC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TATT 3 2 201764 CASAVA_Build 4 20619254 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 29 hom 22 1 13 8 T 9 10 201765 CASAVA_Build 4 20643507 8I GATACAGGCT --------/GGCTTGTG AAGCAACGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 GGCTTGTG 0 1 201766 CASAVA_Build 4 20648687 1D ATGCTGGGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 9 8 201767 CASAVA_Build 4 20650098 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 987 hom 28 4 15 9 A 14 13 201768 CASAVA_Build 4 20681121 1I TTTTTTTTTT -/A AAAGTGTCCA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 3 4 201769 CASAVA_Build 4 20691437 5D ATTTTATATA TTTAC/----- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 TTTAC 1 0 201770 CASAVA_Build 4 20698843 1I GAAATGTTGG -/C CCCCCTTCAA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 C 5 6 201771 CASAVA_Build 4 20703354 3I TGCTCCTTCA ---/GCG TAAGGGTAGA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 GCG 0 1 201772 CASAVA_Build 4 20704278 1D AGAAATATGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 9 8 201773 CASAVA_Build 4 20704803 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2183 hom 16 6 9 1 A 10 11 201774 CASAVA_Build 4 20706341 2D GTGCAAATGC TA/-- TGTTTCATTA 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 TA 1 0 201775 CASAVA_Build 4 20711634 2I TTTGTATGAT --/TC TGTTTGTGTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TC 0 1 201776 CASAVA_Build 4 20714359 4D CAATGTGCAG GTTA/---- GTTACATACG 1458 het 915 hom 6 2 3 1 GTTA 2 1 201777 CASAVA_Build 4 20720526 1I14M1D TCTTTGTGTA -TTTCCTCTAATTTTC/TTTTCCTCTAATTTT- CCTTCTTTTG 3070 het 3070 ref 31 21 12 4 N/A 0 0 201778 CASAVA_Build 4 20722014 1I GCTCTGACGC -/A GACAAAAGAT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 0 1 201779 CASAVA_Build 4 20730445 1D AGTAAGACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 10 9 201780 CASAVA_Build 4 20730918 5D CCTTACGAAG AAACA/----- AAAACAAAAA 553 het 15 hom 25 0 5 24 AAACA 1 0 201781 CASAVA_Build 4 20732896 1D GCAGATCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 14 13 201782 CASAVA_Build 4 20733768 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1245 hom 14 4 10 0 A 9 10 201783 CASAVA_Build 4 20740611 2I CAGAAATGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 A 11 13 201784 CASAVA_Build 4 20744379 1I AATGCCATTC -/A CTATTTGCTA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 0 1 201785 CASAVA_Build 4 20748600 1D GGCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 27 2 12 13 T 13 12 201786 CASAVA_Build 4 20749254 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 8 9 201787 CASAVA_Build 4 20750461 4D TGTCTTTCTC TCCG/---- TCCGTCCATA 3070 het 3070 ref 42 19 19 5 TCCG 2 1 201788 CASAVA_Build 4 20752588 1D AAATAACAAC A/- AAAAAAAAAA 2364 het 2364 ref 23 12 7 5 A 12 11 201789 CASAVA_Build 4 20754431 1D TCACAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2221 hom 23 10 9 4 T 12 11 201790 CASAVA_Build 4 20754591 1D GCCCAGCTAG T/- TTTTTTTTTT 1268 het 877 hom 8 4 3 1 T 12 11 201791 CASAVA_Build 4 20755701 1D ATCTTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 22 0 14 11 A 11 10 201792 CASAVA_Build 4 20757127 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2666 hom 21 9 11 2 A 10 9 201793 CASAVA_Build 4 20763426 1D GTTAGGAACT G/- GGCTGCACAG 3070 het 2841 hom 23 7 9 8 G 3 2 201794 CASAVA_Build 4 20764717 1I AAAAAAATGG -/A AAAAAAAAGG 2502 het 2502 ref 25 11 9 5 A 8 9 201795 CASAVA_Build 4 20768065 1D CAATGTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1149 hom 39 3 31 5 T 12 11 201796 CASAVA_Build 4 20785860 1D TAATTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 34 0 25 11 A 11 10 201797 CASAVA_Build 4 20789370 1D TACTTCACTT A/- ACTTCTCCCT 3070 hom 117 het 45 0 40 7 A 2 1 201798 CASAVA_Build 4 20789537 1D AACACCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3033 het 2116 hom 38 13 13 12 T 19 18 201799 CASAVA_Build 4 20793133 8I TTTCCTCTTT --------/TCCCTCCC TCCCTCCCCC 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 TCCC 2 4 201800 CASAVA_Build 4 20796954 1D AAGACTACAG C/- CAAATTGTCA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 C 2 1 201801 CASAVA_Build 4 20801456 4D AAAATACAAG AAGA/---- AAGAAACTCT 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 AAGA 2 1 201802 CASAVA_Build 4 20821401 4D TATTTTAGTA TTCC/---- TTCCAAGTAT 3070 het 3070 hom 29 11 14 6 TTCC 2 1 201803 CASAVA_Build 4 20822651 1D CATCACAGGA T/- TTATAAAAGC 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 T 3 2 201804 CASAVA_Build 4 20830552 1I TCCTTTTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 9 10 201805 CASAVA_Build 4 20851051 1D CATATGTAAC A/- AAACCTGCAC 3070 het 1917 hom 13 4 8 1 A 4 3 201806 CASAVA_Build 4 20860842 5I CATTTCTTTC -----/TTTCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 TTTCT 0 1 201807 CASAVA_Build 4 20863478 2D GCAAATCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2398 het 1233 hom 36 11 6 19 T 18 16 201808 CASAVA_Build 4 20866009 1I TTAAATTGTA -/C CCCCACTTCC 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 C 4 5 201809 CASAVA_Build 4 20866775 1I CTAGCAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 11 12 201810 CASAVA_Build 4 20868477 11D TCTCAAAAAA AAAAAAAAAAG/----------- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 22 12 11 4 AAAAAAAAAAG 1 0 201811 CASAVA_Build 4 20877124 1D CCAAGGAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 9 8 201812 CASAVA_Build 4 20878078 1I AAGGTAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2027 hom 25 8 9 8 A 13 14 201813 CASAVA_Build 4 20878972 2I TTCAAGTCTC --/AG TGTGTATTTT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 AG 0 1 201814 CASAVA_Build 4 20881704 1D AAGTCCCTGT C/- CCCAAAAAAA 1864 het 1205 hom 33 9 9 15 C 4 3 201815 CASAVA_Build 4 20889470 1D ATGTCCCCAA G/- GGCAGAGGGG 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 G 3 2 201816 CASAVA_Build 4 20902027 119D GTGTATGTGT GTGGAGTGTGCTAGAGTGTGCACCCATGAGTCTAGCATATGTTTATACAAACATTTGTGTACAAATAGGTATGTGTAGATGCACATACAAAATTATAAACCTCACTGATCTTAATAACC/----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ATTTTCTACA 2235 het 2235 ref 27 40 6 10 GTGGAGTGTGCTAGAGTGTGCACCCATGAGTCTAGCATATGTTTATACAAACATTTGTGTACAAATAGGTATGTGTAGATGCACATACAAAATTATAAACCTCACTGATCTTAATAACC 1 0 201817 CASAVA_Build 4 20911306 1D ATTGAAACTC T/- TAAGTTTCGA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 T 2 1 201818 CASAVA_Build 4 20915692 1D GTTTGAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 33 0 24 10 A 12 11 201819 CASAVA_Build 4 20918479 1I ATTTCCATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 9 10 201820 CASAVA_Build 4 20919692 4I ATGAACGTGC ----/TTAA TTAGAGACAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTAA 0 1 201821 CASAVA_Build 4 20921355 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 8 7 201822 CASAVA_Build 4 20922418 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 10 het 36 1 31 4 A 8 7 201823 CASAVA_Build 4 20946013 2I GTTCTCTGAA --/CT CTCTTTTACC 3070 hom 93 het 36 0 30 6 CT 2 3 201824 CASAVA_Build 4 20950982 4D AGATGTAGTA TCTC/---- TCTCATCTGT 3070 hom 99 het 40 0 34 7 TC 4 2 201825 CASAVA_Build 4 20952305 1I CTTCCTAAAT -/G TGCAAATTAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 201826 CASAVA_Build 4 20972414 1D TTCATTCTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 98 het 36 0 33 3 T 9 8 201827 CASAVA_Build 4 20983800 5I CAGTGAACAG -----/ATTAT ATTAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ATTAT 0 1 201828 CASAVA_Build 4 20984077 1I GATAAAATAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 8 9 201829 CASAVA_Build 4 20984690 5I CCTCCCAAGG -----/CCTGT TATTGGGATT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 CCTGT 0 1 201830 CASAVA_Build 4 20987122 2I ATAAAGCATT --/TC GCCAGCCCCG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TC 0 1 201831 CASAVA_Build 4 20988765 4I CTAACTTGTT ----/CAAA CATTCACTTC 3070 hom 111 het 45 0 37 8 CAAA 0 1 201832 CASAVA_Build 4 20994033 1D GTTATAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 32 1 23 8 T 11 10 201833 CASAVA_Build 4 20999708 1D TATTGTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 38 1 31 6 T 12 11 201834 CASAVA_Build 4 21003031 3D GCTAACTATT AAG/--- AAGATTATAA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AAG 2 1 201835 CASAVA_Build 4 21005661 15D TGGGCTCACA AAGCACTGGGCTCAC/--------------- AAGCACTGGG 3070 hom 37 het 22 0 13 9 AAGCACTGGGCTCAC 2 1 201836 CASAVA_Build 4 21008607 1D TAAAATTCAT A/- AAAATGACAT 3070 hom 123 het 53 0 42 11 A 5 4 201837 CASAVA_Build 4 21010381 1D AGTGAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 79 hom 36 1 24 11 T 15 14 201838 CASAVA_Build 4 21019810 1D AATCTTCAAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 9 8 201839 CASAVA_Build 4 21020928 1D TGGAGACTGT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 8 7 201840 CASAVA_Build 4 21063591 4I CAGGGTAAAG ----/AGAA GCTGTATGCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AGAA 0 1 201841 CASAVA_Build 4 21088968 4D TTTATTTACA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 63 het 28 0 21 9 TATT 4 3 201842 CASAVA_Build 4 21092861 1D AACCCCTGCC T/- TTTTTTTGTT 1141 hom 7 het 3 0 3 0 T 8 7 201843 CASAVA_Build 4 21093952 2I TATAATTTAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AT 7 8 201844 CASAVA_Build 4 21094727 1D CAATTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 6 T 12 11 201845 CASAVA_Build 4 21094918 1I GAGGCTGAGG -/T TGGGCAGATC 3070 hom 35 het 14 0 12 2 T 1 2 201846 CASAVA_Build 4 21112690 2I GGGAGAATTT --/TC TCTCTCTCTC 1698 het 1260 hom 24 6 12 10 TC 8 9 201847 CASAVA_Build 4 21115994 1D GTACTACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 785 hom 51 2 39 10 A 13 12 201848 CASAVA_Build 4 21119629 2I AGTTGAGCGC --/TA TGTTACTTAT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TA 0 1 201849 CASAVA_Build 4 21122070 2I CTTTAAAGCA --/AG ATTTTATTTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AG 0 1 201850 CASAVA_Build 4 21122809 4D AAGGAAGGAA GGAG/---- GGAGGGAGGG 2834 hom 36 het 23 0 15 8 GGAG 4 3 201851 CASAVA_Build 4 21136705 3D AATCAAAAAC ATT/--- ATCCAATTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 ATT 1 0 201852 CASAVA_Build 4 21143071 1I AAACAATTCT -/G TGCAATCATC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 0 1 201853 CASAVA_Build 4 21159299 1D TCTGAAGTCT A/- AAAAAAAAAA 1374 het 1374 ref 43 29 3 11 A 11 10 201854 CASAVA_Build 4 21162395 1D CACATTATAA T/- TTTTCATGAG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 5 4 201855 CASAVA_Build 4 21168393 1D CCATGGTACC A/- ACCTGGTCCT 3070 hom 111 het 45 0 37 9 A 2 1 201856 CASAVA_Build 4 21186230 1I TATCTTTTCC -/T TTCCCCTCCC 3070 hom 120 het 47 0 40 7 T 2 3 201857 CASAVA_Build 4 21188355 12D TCCATCTTAA AAACAAACAAAC/------------ AAACAAACAA 3070 hom 114 het 39 0 39 2 AAAC 6 3 201858 CASAVA_Build 4 21210192 3I GAAAAAAATG ---/ATA ATAACTACCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 ATA 1 2 201859 CASAVA_Build 4 21211832 1D TTCACAGGCA C/- CAGTGTCCTA 3070 hom 99 het 36 0 32 4 C 2 1 201860 CASAVA_Build 4 21222480 1D ATTTTTTGGA G/- GGGTGGGGGA 3070 hom 109 het 42 0 36 6 G 4 3 201861 CASAVA_Build 4 21233685 1D GTCATTTATA T/- TTTTTGTATA 3070 hom 96 het 36 0 33 6 T 6 5 201862 CASAVA_Build 4 21237111 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 105 het 42 0 35 10 T 9 8 201863 CASAVA_Build 4 21243121 1D TTTTCACTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 T 8 7 201864 CASAVA_Build 4 21247012 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 340 hom 27 1 25 1 A 9 10 201865 CASAVA_Build 4 21276233 1D TCACAGGGCA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 19 het 24 0 9 15 C 11 10 201866 CASAVA_Build 4 21290208 2I GGCTCTTCCT --/GA GAGGTCCAAT 3070 hom 123 het 45 0 40 5 GA 1 2 201867 CASAVA_Build 4 21306152 1I GTGCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 639 hom 37 2 24 11 T 11 12 201868 CASAVA_Build 4 21308758 1D GACAACTCCC T/- TGACACAGTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 1 201869 CASAVA_Build 4 21313712 1D GGCCCCCCAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 8 201870 CASAVA_Build 4 21322858 1D AAAAGTATTC A/- AAACAAAACA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 4 3 201871 CASAVA_Build 4 21330699 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAAGAAGA 1638 het 1504 hom 17 7 6 4 AG 0 1 201872 CASAVA_Build 4 21331252 3D GTTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2534 het 1134 hom 18 5 7 6 T 13 10 201873 CASAVA_Build 4 21335292 1I AGTGAGGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 17 10 T 12 13 201874 CASAVA_Build 4 21336957 3D AACAAATCAG TAC/--- TACTGAAATG 3070 het 3070 hom 43 17 21 7 TAC 2 1 201875 CASAVA_Build 4 21337781 1D GGTTAGTACT C/- TAGAATACTG 3070 het 3070 hom 60 26 26 10 C 1 0 201876 CASAVA_Build 4 21340308 1I TGCATGAAAT -/A AAATTAGTAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 A 3 4 201877 CASAVA_Build 4 21340452 4I ATCAAGAAAC ----/TATT TAAGTTGACA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 TATT 0 1 201878 CASAVA_Build 4 21340705 22D TCCCAATATC ACTGTTCAATCAACAGTGATTG/---------------------- AAGAATCACT 3070 het 3070 ref 46 34 17 4 ACTGTTCAATCAACAGTGATTG 1 0 201879 CASAVA_Build 4 21343407 1I GGGTATTCGG -/T TCTTGCCTCA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 1 2 201880 CASAVA_Build 4 21347754 1D TAAAAAAAAG A/- AAGTAAGTTC 3070 het 3070 ref 38 17 19 3 A 3 2 201881 CASAVA_Build 4 21357314 1D AAGAAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 A 10 9 201882 CASAVA_Build 4 21369469 19I GCCATATATG -------------------/CTTTGTTTCTGCCTGCTTC GGCTGCTTCT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 CTTTGTTTCTGCCTGCTTC 0 1 201883 CASAVA_Build 4 21371162 6D CAATTAGATA CATGTT/------ CATGTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 15 21 8 CATGTT 2 1 201884 CASAVA_Build 4 21372359 1D ACAAAAAAGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 A 9 8 201885 CASAVA_Build 4 21384464 8I TTTTTTTTTG --------/TTGTTTTT TTGTTTTTTT 3070 het 19 hom 29 1 12 16 TTGTTTTT 1 2 201886 CASAVA_Build 4 21388198 1D AAAATGGGAC A/- TTTTTATACC 3070 het 3070 ref 52 24 21 8 A 1 0 201887 CASAVA_Build 4 21392765 4D AAATGAAAAG GAGA/---- GAGAGAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 GA 5 3 201888 CASAVA_Build 4 21395982 3I GTGCAGCTAT ---/CAC CACAATTAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CAC 1 2 201889 CASAVA_Build 4 21397241 2D TTTATTTATT TA/-- TATGTTATTT 3070 het 1904 hom 21 6 13 2 TA 2 1 201890 CASAVA_Build 4 21398705 1D GAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 11 10 201891 CASAVA_Build 4 21404984 1D CCCAAAACTT A/- AAGTATAATT 3070 het 3070 hom 38 14 22 3 A 3 2 201892 CASAVA_Build 4 21408193 5D AAAACATCAG TTTTT/----- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 41 20 19 5 T 11 6 201893 CASAVA_Build 4 21412921 3D TGACTTTCTC CAA/--- CAACAAGTGA 3070 het 3070 hom 46 20 23 7 CAA 3 2 201894 CASAVA_Build 4 21414225 19D CTTTCTTTCA GCTCTTTGAAAAAAAGATC/------------------- ACAATTTTCA 3070 het 3070 ref 45 25 23 4 GCTCTTTGAAAAAAAGATC 1 0 201895 CASAVA_Build 4 21419862 4D CATTAGCATT TGAG/---- TAAGTAGACT 3070 het 3070 ref 57 30 24 6 TGAG 1 0 201896 CASAVA_Build 4 21437824 3D CTGCATCTTA AAT/--- AATAATACAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 7 AAT 3 2 201897 CASAVA_Build 4 21438739 1D AGAGTCATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 835 hom 18 2 8 8 A 13 12 201898 CASAVA_Build 4 21443330 1D ATTATCATAC T/- TTTAAGTTTT 795 hom 10 het 12 0 4 8 T 4 3 201899 CASAVA_Build 4 21446233 5I AACAATTATT -----/AGTAA AGTAATTATT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AGTAA 1 2 201900 CASAVA_Build 4 21446300 1D GTTTTCTTAC G/- TTTTTTTTTG 3070 het 3056 hom 27 14 8 5 G 1 0 201901 CASAVA_Build 4 21448426 1I GTAAGTCCAT -/G GAAGTTGTTC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 2 201902 CASAVA_Build 4 21450477 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 A 8 9 201903 CASAVA_Build 4 21461865 2I ATCCCACCCT --/GC AGCAGACAGA 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 GC 0 1 201904 CASAVA_Build 4 21462926 1D GAGAGTCTGT C/- CCGGGAAGGC 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 C 3 2 201905 CASAVA_Build 4 21470174 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1611 het 338 hom 10 2 6 2 A 13 12 201906 CASAVA_Build 4 21470349 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2492 hom 16 6 10 0 A 12 11 201907 CASAVA_Build 4 21471268 1D TATTTTATCT C/- ACCTAAATAT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 C 1 0 201908 CASAVA_Build 4 21471387 1D TACTGATACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 89 hom 33 1 25 7 A 12 11 201909 CASAVA_Build 4 21473737 1I CCTTAAGTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 8 9 201910 CASAVA_Build 4 21474678 1D GCTTTAACAC A/- AAAACAATTA 3070 het 3070 hom 41 21 19 2 A 5 4 201911 CASAVA_Build 4 21492240 1D TGTCCTTGAA T/- TTTTCAAGGG 3070 hom 138 het 48 0 47 2 T 5 4 201912 CASAVA_Build 4 21495673 1I ACAGTAGCCT -/C CCCCCCCACT 3070 het 2139 hom 30 7 16 8 C 7 8 201913 CASAVA_Build 4 21497540 3I TTACAAAAGC ---/TCT TCTTCTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TCT 2 3 201914 CASAVA_Build 4 21503044 1I ATCCAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 10 11 201915 CASAVA_Build 4 21507255 1I AAGGAAAATG -/T TAAGTGTGGT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 1 2 201916 CASAVA_Build 4 21507972 1I AGAATAAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 9 10 201917 CASAVA_Build 4 21524086 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3008 hom 28 10 10 8 T 11 10 201918 CASAVA_Build 4 21526595 1D TCTTCCATGG C/- CCTTTCTGCC 3070 het 2780 hom 40 7 27 7 C 3 2 201919 CASAVA_Build 4 21528357 1D TGACCTTGTT G/- TGTCATTCTA 3070 het 3070 ref 48 28 18 3 G 1 0 201920 CASAVA_Build 4 21539607 4D TAACAACAAC CTAA/---- CTGAGATATA 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 CTAA 1 0 201921 CASAVA_Build 4 21541958 1D GAAGCTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 21 8 T 12 11 201922 CASAVA_Build 4 21543601 1I ATAATCTATG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 6 7 201923 CASAVA_Build 4 21565190 1D ACCCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 31 1 20 10 A 15 14 201924 CASAVA_Build 4 21574280 2I AGGTTCTGAT --/CA CACATGGCCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CA 2 3 201925 CASAVA_Build 4 21577063 1D AGTTGGATGA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 7 201926 CASAVA_Build 4 21581302 2D TTACTTGTCC GA/-- TTTCCCTTTC 3070 hom 93 het 37 0 32 6 GA 1 0 201927 CASAVA_Build 4 21594494 1I ATTTTTACAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 108 het 43 0 35 8 A 8 9 201928 CASAVA_Build 4 21603821 1D ACTCCGCAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 9 8 201929 CASAVA_Build 4 21610917 1I AGAGGTACAA -/G GAGGAGCATG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 1 2 201930 CASAVA_Build 4 21642250 1D ATCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 40 1 34 5 A 12 11 201931 CASAVA_Build 4 21648928 2D ACTGTGGCCT GA/-- GAGACAGTTC 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 GA 3 2 201932 CASAVA_Build 4 21652852 2D TCAGTTCCAA AG/-- ATGTGAGCCA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AG 1 0 201933 CASAVA_Build 4 21654991 1I ACAACAGGGC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 8 9 201934 CASAVA_Build 4 21656598 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 6 7 201935 CASAVA_Build 4 21657952 1D TGTTTTCACA C/- TGCTGATAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 C 1 0 201936 CASAVA_Build 4 21708375 1I CTACAATTCT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 A 8 9 201937 CASAVA_Build 4 21728235 1D CATCAGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 181 hom 20 1 12 7 A 15 14 201938 CASAVA_Build 4 21815863 3I AATTTTCCTA ---/TTG TTGTATATTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTG 1 2 201939 CASAVA_Build 4 21824201 5D CAGCAACTAT TATAA/----- TGTAATGTGA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 TATAA 1 0 201940 CASAVA_Build 4 21826194 1D TCCTACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 A 11 10 201941 CASAVA_Build 4 21838955 3I TCCAGGGTTC ---/ACA ACACCATTCT 1917 het 523 hom 8 2 5 1 ACA 1 2 201942 CASAVA_Build 4 21847651 1I CATCATGCCC -/A AGGTCACCCA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 1 2 201943 CASAVA_Build 4 21854582 2I TTGACTCTTC --/GA CAATCCATGA 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 GA 0 1 201944 CASAVA_Build 4 21876469 1D TTCCCTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 T 12 11 201945 CASAVA_Build 4 21879284 1D GATAACCACA G/- GGAGTAGGAG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 G 3 2 201946 CASAVA_Build 4 21892669 1I AAAAGTAACC -/T AAATTTGACA 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 T 0 1 201947 CASAVA_Build 4 21898779 1D CTAGCCCTCA T/- TTTTTTTTTT 1819 het 1819 ref 50 32 5 13 T 12 11 201948 CASAVA_Build 4 21898899 1I TTACATTTCA -/T TTTTCTCTGA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 4 5 201949 CASAVA_Build 4 21901116 1I TGCTTCCAGC -/T TTTGCCCATT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 3 4 201950 CASAVA_Build 4 21901516 1D TAGAACCAAT A/- ATAAGTTCAA 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 A 2 1 201951 CASAVA_Build 4 21910997 1D ACTTGAATTT A/- AAAAAAAAAA 1605 het 1605 ref 50 35 7 8 A 17 16 201952 CASAVA_Build 4 21928446 7D CGTCTCAAAA AAAAAAC/------- AAAAAACAAA 2165 het 864 hom 15 6 8 5 AAAAAAC 3 2 201953 CASAVA_Build 4 21938074 1D AAGGAACGGA T/- TTTTTTTTTT 2931 het 1650 hom 24 6 12 6 T 16 15 201954 CASAVA_Build 4 21949502 1I TGGACTATTT -/C CCTTTATTCC 1860 het 1860 ref 53 45 5 4 C 2 3 201955 CASAVA_Build 4 21950046 1D CCAGCCCAGA C/- CCTGCAGCTA 3070 het 3070 hom 42 17 24 1 C 3 2 201956 CASAVA_Build 4 21952869 4D TCTGATATAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 49 hom 20 2 10 9 AT 10 8 201957 CASAVA_Build 4 21953983 1D TATGTCCTCC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 9 8 201958 CASAVA_Build 4 21958055 8I CATATCAGGT --------/AACTGAGC AATTGACCAG 3070 het 3070 ref 45 26 12 7 AACTGAGC 0 1 201959 CASAVA_Build 4 21959760 2D GAATCAAAAC AT/-- GTGGTATTAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 AT 1 0 201960 CASAVA_Build 4 21960286 3I TGAAAAAAAA ---/AAC AACTAGAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 AAC 1 2 201961 CASAVA_Build 4 21962273 4I CAAACATGGC ----/CAGA CTGCTTTTTT 3070 het 214 hom 26 2 11 13 CAGA 0 1 201962 CASAVA_Build 4 21965300 2D ATGCAGTCAT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 21 12 8 A 10 8 201963 CASAVA_Build 4 21965406 4I ACATGTTCTC ----/ACTT ACAAGTGGGA 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 ACTT 0 1 201964 CASAVA_Build 4 21973514 1D TCTCAGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 12 11 201965 CASAVA_Build 4 21981495 1D TATTTATTTA C/- AGTCAACTGA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 C 1 0 201966 CASAVA_Build 4 21986483 1I TTGACCTTTT -/A AACCACGTGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 3 201967 CASAVA_Build 4 21986898 3D CTGAAACAAT TTC/--- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TTC 1 0 201968 CASAVA_Build 4 21996285 2D ACTAAAACTC AA/-- AACAACTAAG 3070 het 3070 hom 44 20 18 7 A 4 2 201969 CASAVA_Build 4 22007495 5I TTGCCTTTCC -----/CTTTT CTTTTGTAAA 3070 het 3070 hom 42 12 29 1 CTTTT 1 2 201970 CASAVA_Build 4 22010244 3D CATGAGGCAT TAA/--- AGACCCAGTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 7 TAA 1 0 201971 CASAVA_Build 4 22019070 1D AATATTGAGG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 A 9 8 201972 CASAVA_Build 4 22029971 1I TCAAGGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 34 1 30 3 A 11 12 201973 CASAVA_Build 4 22033301 4I AACCTTGGTT ----/GAAA GAAAGAAATC 3070 hom 135 het 50 0 44 6 GAAA 2 3 201974 CASAVA_Build 4 22041534 1D2M17I CACAGGCCTG TGA-----------------/-GAGGCATCCGAGGAAAACG TGGTTTCATA 3070 het 2821 hom 26 13 9 4 N/A 0 0 201975 CASAVA_Build 4 22043150 1I TAAGATCAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 8 9 201976 CASAVA_Build 4 22044897 2I TGTAATATAC --/AT ATTAGATATA 1449 het 1449 ref 8 5 3 0 AT 1 2 201977 CASAVA_Build 4 22051313 1D TAGAATTAAC T/- TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 T 7 6 201978 CASAVA_Build 4 22055504 1D AAGACAACTG A/- AAAAAAAAAG 1610 het 1610 ref 44 32 4 8 A 10 9 201979 CASAVA_Build 4 22057759 1D GATTTTAAGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 103 het 40 0 35 5 G 11 10 201980 CASAVA_Build 4 22058127 1D CATGAAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 A 11 10 201981 CASAVA_Build 4 22069872 1D CAAAAGCAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 9 8 201982 CASAVA_Build 4 22087535 6D GTATAAGTGC CCACCA/------ CCATACCCAG 3070 het 2413 hom 21 6 11 4 CCA 3 1 201983 CASAVA_Build 4 22094708 1I CATGATTACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 T 8 9 201984 CASAVA_Build 4 22095999 3D TGGTCTCGAA CTC/--- CTGGCCTCAA 2706 het 2706 ref 20 7 8 5 CTC 1 0 201985 CASAVA_Build 4 22100975 2D AATGAAAAAC TG/-- TTTATTAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TG 1 0 201986 CASAVA_Build 4 22103731 1I CTGTCACCCA -/G GGTGGAGTGC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 G 2 3 201987 CASAVA_Build 4 22109645 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 9 A 8 7 201988 CASAVA_Build 4 22112646 1I GAATGTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 T 10 11 201989 CASAVA_Build 4 22114361 8I CATGAGGAAA --------/CGAAGTCT CTGACACCTC 3070 hom 165 het 59 0 51 8 CGAAGTCT 0 1 201990 CASAVA_Build 4 22117802 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3012 het 1443 hom 20 5 10 5 A 10 11 201991 CASAVA_Build 4 22122791 1I CCAGCTAATA -/T TCTGTATTTT 3070 hom 54 het 19 0 18 2 T 1 2 201992 CASAVA_Build 4 22123636 2D CAACAAAAAC TG/-- TGCTCAACTA 3070 hom 120 het 44 0 39 8 TG 2 1 201993 CASAVA_Build 4 22129594 2I TTTATGCAAC --/AG AGAGTCCAGC 3070 hom 84 het 29 0 27 2 AG 2 3 201994 CASAVA_Build 4 22129705 3I GAAGGATAAA ---/TTG TTGAAGATCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TTG 1 2 201995 CASAVA_Build 4 22132569 1D GGAGAAAATG T/- TTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 T 6 5 201996 CASAVA_Build 4 22133974 7I AAATGGTTGC -------/TTTTGAG ATTCTTTTGA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 TTTTGAG 0 1 201997 CASAVA_Build 4 22139477 1I AGCATAAAAA -/T ATATAAAGCA 3070 hom 44 het 20 0 15 5 T 0 1 201998 CASAVA_Build 4 22140784 3D AAGCAAAGGA AAG/--- AAGACAATAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AAG 2 1 201999 CASAVA_Build 4 22150855 1I TGTGCTTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 48 1 38 9 A 11 12 202000 CASAVA_Build 4 22151723 2D CTAGGATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 27 0 13 18 T 18 16 202001 CASAVA_Build 4 22152558 1I CCAATTGCTA -/C AAATTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 0 1 202002 CASAVA_Build 4 22157663 1I TCTTCCTCTC -/T TTTTCTGAGC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 4 5 202003 CASAVA_Build 4 22159611 1I GTCAAGCTCC -/A AAAATCTATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 5 202004 CASAVA_Build 4 22160060 3I GTTGCTTCTT ---/CAA CAATCGTTCA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 CAA 1 2 202005 CASAVA_Build 4 22167291 1I ACAGGAAACC -/A AGGGTGTGGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 2 202006 CASAVA_Build 4 22168012 1I CCTGTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 T 12 13 202007 CASAVA_Build 4 22168810 1I ATGATGATCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 9 202008 CASAVA_Build 4 22171648 1D TCCTCCCATT A/- AACAAATCAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 3 2 202009 CASAVA_Build 4 22174824 4D TAGGAACACT TTTA/---- TTTACACTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TTTA 2 1 202010 CASAVA_Build 4 22175428 1D AGAAATAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 448 hom 18 1 13 4 A 10 9 202011 CASAVA_Build 4 22182901 2D ATATATTTAC AT/-- GTGTGTATAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AT 1 0 202012 CASAVA_Build 4 22198888 3D ATGAAATTAA TAT/--- TATTAATATT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 TAT 2 1 202013 CASAVA_Build 4 22204807 2D CATCGCCAAA AC/-- CCAACAATTT 3070 hom 77 het 31 0 25 7 AC 1 0 202014 CASAVA_Build 4 22206433 4I GTTTGTCTAG ----/TTAA TTAACAGACC 2788 het 2788 ref 45 34 6 5 TTAA 1 2 202015 CASAVA_Build 4 22207052 3D CTTCTCTCTC ACA/--- ACAACATGTA 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 ACA 3 2 202016 CASAVA_Build 4 22243922 2I GGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 2533 het 2533 ref 32 17 6 9 TG 7 8 202017 CASAVA_Build 4 22292723 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 13 0 10 4 A 10 9 202018 CASAVA_Build 4 22333031 1D GGAAATCAAC T/- CAATATTTAC 3070 het 3070 hom 46 22 23 1 T 1 0 202019 CASAVA_Build 4 22333491 2D ACTTGCTTTT TC/-- TCTCTCATTA 3070 het 3070 ref 45 21 20 5 TC 4 3 202020 CASAVA_Build 4 22340607 1D TACTATTAAG A/- AAAAAAAAAG 1244 het 1244 ref 32 23 3 6 A 10 9 202021 CASAVA_Build 4 22343533 1D CTTTGTCTAG C/- CTAGTACATG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 C 2 1 202022 CASAVA_Build 4 22357740 4D AATAACACAA AGTT/---- AGATAACAGC 3070 het 3070 ref 32 19 12 2 AGTT 1 0 202023 CASAVA_Build 4 22361830 1D CCAGGCTGGA G/- TGCAGTGGCA 3070 het 881 hom 14 3 8 3 G 1 0 202024 CASAVA_Build 4 22363857 1D ATTTTTCTAT C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 C 9 8 202025 CASAVA_Build 4 22369420 2D AATCTTTGGG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 10 8 202026 CASAVA_Build 4 22370078 1D TTTTTTATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 A 10 9 202027 CASAVA_Build 4 22384321 1I TTGTACATAC -/T TTTTTAAAGC 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 5 6 202028 CASAVA_Build 4 22386651 1D GCAGGAACAG A/- AAAAAAAAAA 2205 het 2205 ref 48 21 8 19 A 15 14 202029 CASAVA_Build 4 22389939 3D TCTCCCTCTA CCC/--- CCCCCCCACC 3070 het 1914 hom 32 8 16 10 C 10 7 202030 CASAVA_Build 4 22393561 5I AAGTGCTGGG -----/ATTAC AGGCGTGAGC 2143 het 1408 hom 14 5 6 3 ATTAC 0 1 202031 CASAVA_Build 4 22394582 1D ATTGTTTTTC A/- AAAAGCCTCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 5 4 202032 CASAVA_Build 4 22400535 1I ATGCTACTGA -/T TTTTGTATGT 3070 het 3070 ref 57 28 23 6 T 4 5 202033 CASAVA_Build 4 22406336 1I TTGAATAAAC -/A GCATTTATGT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 0 1 202034 CASAVA_Build 4 22408491 10D TCCAGGATCA CACAGCCAAG/---------- CACATTAATG 3070 het 3070 ref 49 24 21 7 CACAGCCAAG 1 0 202035 CASAVA_Build 4 22413724 1D ATAACTGCTC A/- AATGGATATT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 A 3 2 202036 CASAVA_Build 4 22421380 1I TGTTGTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 9 10 202037 CASAVA_Build 4 22429771 1I ATCTGTGATT -/A AAATGTCTGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 4 202038 CASAVA_Build 4 22440038 1D GCCTGATGGC A/- AAACTTCTCC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 4 3 202039 CASAVA_Build 4 22469393 1D TGTGCAGGTC T/- TTTTTTTTTT 1412 het 1412 ref 34 21 5 8 T 15 14 202040 CASAVA_Build 4 22484950 1I CTTTCTACAT -/A AAAATTCAAC 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 4 5 202041 CASAVA_Build 4 22505424 1I TCATCCATTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 T 8 9 202042 CASAVA_Build 4 22548072 1D TTCTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2380 hom 37 14 14 9 T 18 17 202043 CASAVA_Build 4 22549367 8D ATAACAATGT AAACAAAA/-------- AAAGCCTATT 3070 het 3070 ref 38 21 15 5 AAACAAAA 1 0 202044 CASAVA_Build 4 22586235 1D TGGATCATGC T/- TTTTTTTTTT 1040 het 1040 ref 39 29 4 6 T 12 11 202045 CASAVA_Build 4 22679265 1I CTGCAGAAAT -/A GGATATGAGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 202046 CASAVA_Build 4 22752975 2I TAAATAAAAA --/AG GATATACATT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AG 0 1 202047 CASAVA_Build 4 22767002 1I TTATTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 25 1 18 6 T 13 14 202048 CASAVA_Build 4 22774542 1I GCTAATTGTC -/A AAAAAAAAAA 1192 het 1192 ref 46 31 4 11 A 11 12 202049 CASAVA_Build 4 22779046 1D TTTGGGAGGC T/- TAAGGGGGGC 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 T 2 1 202050 CASAVA_Build 4 22782078 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 10 9 202051 CASAVA_Build 4 22784239 4I ACATGTCATA ----/TATT TATTATTATT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TATT 1 2 202052 CASAVA_Build 4 22786292 3I TAAGATTTTA ---/AAT AATAATCATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AAT 2 3 202053 CASAVA_Build 4 22787084 1D AGGAATTCCA T/- TTTCTCCCTG 3070 hom 48 het 20 0 17 4 T 4 3 202054 CASAVA_Build 4 22788254 2I CCAATAAAAC --/AG AAGAAATAAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AG 0 1 202055 CASAVA_Build 4 22792206 1D CCAGAAGGAA T/- TTTTTTGTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 7 6 202056 CASAVA_Build 4 22792632 2I AGGAGAAAAA --/AG AAAATTTTAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AG 0 1 202057 CASAVA_Build 4 22801767 3D TTCTTTTATT AAC/--- AACATTTTAC 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 AAC 2 1 202058 CASAVA_Build 4 22808355 1I ATTTTAAAAA -/T ATATATATAT 2867 het 2313 hom 14 6 7 1 T 0 1 202059 CASAVA_Build 4 22829889 1D TTACTAAGAG A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 45 17 21 9 A 7 6 202060 CASAVA_Build 4 22835624 4D AAATTATCTT TCTC/---- TCTCTCTATC 3070 het 3070 hom 58 24 27 8 TC 5 3 202061 CASAVA_Build 4 22840081 1D TTTAAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 T 11 10 202062 CASAVA_Build 4 22840413 13D AAGATTTAAA ACCCATGAAATCT/------------- TAGATTTCAA 3070 het 3070 ref 52 28 24 5 ACCCATGAAATCT 1 0 202063 CASAVA_Build 4 22849125 1I TATAAATGTG -/A AAAAGTTCTG 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 A 4 5 202064 CASAVA_Build 4 22855284 2D TCTAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 4 A 13 11 202065 CASAVA_Build 4 22858794 1D CTATTCACAT A/- ACCACCTATT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 2 1 202066 CASAVA_Build 4 22866234 18D ATTTTTTAAA ATATATATATATATATAT/------------------ ATATATATAT 2858 hom 18 het 8 0 7 2 AT 15 6 202067 CASAVA_Build 4 22868014 5I ATAAAAGAGT -----/TAAAA TAAAAAGTTA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 TAAAA 1 2 202068 CASAVA_Build 4 22868597 2D AAATAAAGAC TT/-- TCTCAGGCAG 3070 hom 99 het 43 0 34 10 T 3 1 202069 CASAVA_Build 4 22870651 5D TTATAATAGA AAGAT/----- AGCTGTAAAA 3070 hom 126 het 47 0 42 8 AAGAT 1 0 202070 CASAVA_Build 4 22872772 1D CACATCACAA C/- CCAAGTGGGA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 C 3 2 202071 CASAVA_Build 4 22878746 1I CAGAATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 35 1 25 9 T 11 12 202072 CASAVA_Build 4 22885416 6I GTACCATTCC ------/AAGTCT TTCTATAGCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAGTCT 0 1 202073 CASAVA_Build 4 22897908 2I ATTCAGAAAA --/AG AGTTATTGTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AG 1 2 202074 CASAVA_Build 4 22899003 1D TTGTGTGTTG T/- TTTGATATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 3 202075 CASAVA_Build 4 22899483 1I TTTAAACTTT -/A TAATAAATTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 0 1 202076 CASAVA_Build 4 22900409 2I GTACACTGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 288 hom 29 1 25 3 A 11 13 202077 CASAVA_Build 4 22902399 1D36M1D AAGTCTTTAA GTAGAGGGAGAGATACGTAGGAAAAGGACTGAAAAGTA/-TAGAGGGAGAGATACGTAGGAAAAGGACTGAAAAGT- AAAAAGCAAA 3070 hom 193 het 51 0 65 10 N/A 0 0 202078 CASAVA_Build 4 22913069 1D GTGTGTGTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 81 het 29 0 26 3 G 10 9 202079 CASAVA_Build 4 22914502 5D AGCAAATGAA AAATT/----- AAATGAGTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AAATT 1 0 202080 CASAVA_Build 4 22943233 4D ATTGAGAAAT AGAG/---- AGATTTTCCT 3070 het 3070 hom 57 25 28 6 AG 3 1 202081 CASAVA_Build 4 22944511 2D AGTGTATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1184 het 1184 ref 51 40 4 8 TG 7 6 202082 CASAVA_Build 4 22946098 1I TTAGTGGATT -/A CGGAACTAAT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 0 1 202083 CASAVA_Build 4 22953004 2D AAAAGGAAAC AG/-- AGTTCACACC 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 AG 2 1 202084 CASAVA_Build 4 22970709 4D GTAGGTATAA ATAT/---- ATATCTATAT 3070 het 3070 ref 36 16 15 7 AT 4 2 202085 CASAVA_Build 4 22986254 1I GTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2545 het 2357 hom 20 8 7 5 A 11 12 202086 CASAVA_Build 4 22988895 1D AGGCTGAGGT G/- GGCGGTTCAC 3070 het 2786 hom 23 8 12 3 G 3 2 202087 CASAVA_Build 4 22990802 1D TTTAGGTATA T/- TTTAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 4 3 202088 CASAVA_Build 4 22991139 1I TACATTTGGG -/T TTATAATTTT 3070 hom 48 het 26 0 17 9 T 2 3 202089 CASAVA_Build 4 22993242 5D TTCTTTTATA TTATT/----- TTATTATTCT 3070 het 2869 hom 21 9 11 1 TTATT 2 1 202090 CASAVA_Build 4 22997312 1D ATTATAGTAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 39 0 29 10 T 8 7 202091 CASAVA_Build 4 22998878 1D ACAAAGAAAA T/- TTTTTTAGGA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 7 6 202092 CASAVA_Build 4 23000018 3I TTGACTTTCC ---/TCA TCAACAGTGA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 TCA 1 2 202093 CASAVA_Build 4 23000426 1D TCACAATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 41 0 31 11 T 11 10 202094 CASAVA_Build 4 23007548 1I TTGAGTTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 11 13 6 T 9 10 202095 CASAVA_Build 4 23015740 1I TTTAGAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 11 12 202096 CASAVA_Build 4 23017909 2I TCGTTGTTGG --/TT TTTATAGCCT 3070 het 3070 hom 54 20 26 8 T 3 5 202097 CASAVA_Build 4 23018233 1D TGCTTCTGTG T/- TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 T 7 6 202098 CASAVA_Build 4 23020831 5I TCTCTTATAT -----/TGAAG TGATATCTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TGAAG 0 1 202099 CASAVA_Build 4 23021455 1I GCCTTTTTTT -/A AATGCAGTTG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 2 3 202100 CASAVA_Build 4 23026914 1I CTACTAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 13 13 T 13 14 202101 CASAVA_Build 4 23030999 1D GCTTCTTACC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 T 9 8 202102 CASAVA_Build 4 23035106 1I GGGGCAGAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 6 7 202103 CASAVA_Build 4 23036237 8D TTTTTTCCTT TTCTTCTC/-------- TTCTTCTCTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TTCTTCTC 3 2 202104 CASAVA_Build 4 23053947 2I AATTGTATAT --/AC AGAGAAATCT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 AC 0 1 202105 CASAVA_Build 4 23062189 20D TCACACAGTC TTAAATAAACGTTTTAAGTT/-------------------- TTAGATTTAC 3070 het 3070 ref 29 21 13 1 TTAAATAAACGTTTTAAGTT 1 0 202106 CASAVA_Build 4 23083712 1D ATTCCGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2472 het 563 hom 22 3 10 9 T 12 11 202107 CASAVA_Build 4 23085733 1D TCACCGCCCC T/- ATTAGTCTCC 3070 het 3070 hom 50 19 25 6 T 1 0 202108 CASAVA_Build 4 23094476 1D CTGTGAAAAA T/- TTGGAGGCAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 T 3 2 202109 CASAVA_Build 4 23100107 1D CCAGAAGTCT C/- TAATAATAAT 3070 hom 45 het 23 0 15 9 C 1 0 202110 CASAVA_Build 4 23102692 1I GGAATCCTTT -/A AAAATACATT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 4 5 202111 CASAVA_Build 4 23105136 3I ATTCTATAGG ---/ATA ATAATATAGT 1865 het 1448 hom 14 5 6 3 ATA 2 3 202112 CASAVA_Build 4 23115744 4I AATTTTCCTT ----/AAAC AAAATCCATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAAC 0 1 202113 CASAVA_Build 4 23118664 1D AAATCAGAGG C/- TTTACAAAAT 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 C 1 0 202114 CASAVA_Build 4 23121856 1I ATTCATTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 8 20 3 T 9 10 202115 CASAVA_Build 4 23139561 1D ATTCGGGAGG A/- AAAGATCTCT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 4 3 202116 CASAVA_Build 4 23159157 1D AACGTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 12 11 202117 CASAVA_Build 4 23171090 1D AGGTTAATTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 T 9 8 202118 CASAVA_Build 4 23172779 1I CTTTTTATCT -/C CCCCCCTCTA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 C 6 7 202119 CASAVA_Build 4 23182830 1D TTATGGATAA G/- GCTCTGGGTG 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 G 2 1 202120 CASAVA_Build 4 23188054 4D TATTTTGTGA TTGT/---- TTGTGTGTTT 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 TTGT 2 1 202121 CASAVA_Build 4 23191288 1D ATAAAGATAG T/- TGTTATTTAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 T 2 1 202122 CASAVA_Build 4 23211568 1D TTCTATTAGG T/- TTTTAAAAAC 1475 het 1475 ref 15 10 4 1 T 5 4 202123 CASAVA_Build 4 23212542 1D CCAATTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 10 9 A 15 14 202124 CASAVA_Build 4 23213095 1I AGTGAGACTC -/T TGTCTCTACA 3070 het 3070 hom 25 9 16 0 T 1 2 202125 CASAVA_Build 4 23214707 1D TCATAATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 15 14 202126 CASAVA_Build 4 23222539 4I ATAAAAAGAG ----/AAAT AAAATAATTT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 AAAT 0 1 202127 CASAVA_Build 4 23224251 3D ATAAAATCAC ATG/--- ATTTTATTTA 3070 het 3070 ref 40 22 13 7 ATG 1 0 202128 CASAVA_Build 4 23231691 1I TTGGTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 2674 het 2610 hom 20 8 8 4 T 10 11 202129 CASAVA_Build 4 23236670 1D49M1I CAAAGAACTT AAAACACAGCTATCTTTTCATGTGGCAATTTCATTACTGAGTATATTTTC-/-AAACACAGCTATCTTTTCATGTGGCAATTTCATTACTGAGTATATTTTCA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 37 13 8 N/A 0 0 202130 CASAVA_Build 4 23245097 1I ATCATGTTGG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 7 8 202131 CASAVA_Build 4 23260444 1D AACTAGTGTG T/- TTAAGTTTTA 3070 het 3070 ref 34 13 13 9 T 3 2 202132 CASAVA_Build 4 23266043 1D AGTCACAGCC A/- GGAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 A 1 0 202133 CASAVA_Build 4 23266225 4I AAAAATAGAA ----/AAAC AAATAATAAG 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 AAAC 0 1 202134 CASAVA_Build 4 23266994 3I GTAATGTAAA ---/ATT ATTATGCAAC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 ATT 1 2 202135 CASAVA_Build 4 23268150 1I GATTGATTTC -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 6 7 202136 CASAVA_Build 4 23285213 1D TAAATAACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 21 7 T 10 9 202137 CASAVA_Build 4 23285802 1D TGGTCCATCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 T 10 9 202138 CASAVA_Build 4 23287692 2D CTTGAAAGTC AA/-- AAGAGAATGA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 4 2 202139 CASAVA_Build 4 23304413 2I TTTGAACACA --/CT GAGTATTATA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 CT 0 1 202140 CASAVA_Build 4 23306530 1I TGTTCATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 T 10 11 202141 CASAVA_Build 4 23307080 1I ATAATTACCC -/T TTTTTTTTTT 2666 het 2666 ref 23 14 9 0 T 10 11 202142 CASAVA_Build 4 23310562 1D AAGATCCTTT A/- AAAAAAAAAA 2852 het 2852 ref 32 16 11 5 A 14 13 202143 CASAVA_Build 4 23311922 5D CAAGAAACTT TAAAG/----- TAAGAGTTGT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 TAAAG 1 0 202144 CASAVA_Build 4 23315041 1D AGAAGAAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 50 18 25 7 A 9 8 202145 CASAVA_Build 4 23322631 1I ATATCAGGGA -/T CCCCCACCCC 3070 hom 83 het 32 0 28 4 T 0 1 202146 CASAVA_Build 4 23323358 1D TATTAAATAG A/- AAAAAACATC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 7 6 202147 CASAVA_Build 4 23323819 12D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2156 het 101 hom 11 2 7 4 A 24 12 202148 CASAVA_Build 4 23324394 2D12M2I TAAGAATAAC ATAAATTTTCATAT--/--AAATTTTCATATGA GTTTTCTTTT 3070 het 547 hom 33 2 17 16 N/A 0 0 202149 CASAVA_Build 4 23325182 3D GAGAAAACAA AAG/--- AAGAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 8 18 6 AAG 2 1 202150 CASAVA_Build 4 23326732 2I AGTTTTCATC --/CA TCTCTTTTTT 1564 hom 41 het 18 0 14 4 CA 0 1 202151 CASAVA_Build 4 23329944 1I AACTAGGAAG -/A AAAAATAGAG 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 A 5 6 202152 CASAVA_Build 4 23342620 1I ATAAAAATGC -/A AAAAAGTCAC 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 5 6 202153 CASAVA_Build 4 23348604 1I AGCCTTCATA -/T TCCAAGGCAA 3070 het 3070 hom 62 23 36 3 T 1 2 202154 CASAVA_Build 4 23357399 1I AGGAAGTCAA -/T TTGTGGTTGC 3070 hom 132 het 52 0 44 8 T 2 3 202155 CASAVA_Build 4 23359617 1D TTTTCTAAGG A/- AAAATTGTAT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 5 4 202156 CASAVA_Build 4 23359929 1I TCCGATGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 12 13 202157 CASAVA_Build 4 23364074 10D3M5D TTAGATGGTT CTGTGCTTTGCATCTGTA/----------CAT----- ATTGTGGGAT 3070 het 3070 ref 36 25 16 3 N/A 0 0 202158 CASAVA_Build 4 23368379 1D ATAATTAGGG A/- AAAAAAAAAA 2683 het 2683 ref 23 9 7 7 A 11 10 202159 CASAVA_Build 4 23369040 1I26M1D AGTATGTTAC -AGAATAGATCATGAAACAACAACAATA/TTTTATTGTTGTTGTTTCATGATCTAT- AAAGTATCTT 3070 het 3070 hom 40 20 25 4 N/A 0 0 202160 CASAVA_Build 4 23369460 2I CTTTCAAAAT --/AA AAACAACTAC 1915 het 1915 ref 19 10 5 4 A 3 5 202161 CASAVA_Build 4 23373242 3D GACATAAGAT TTA/--- TTGACTTCAT 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 TTA 1 0 202162 CASAVA_Build 4 23374075 1D TGATTAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 10 9 202163 CASAVA_Build 4 23376820 5D ATGTGAAAGT TTTAC/----- TTTACTTTAC 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 TTTAC 3 2 202164 CASAVA_Build 4 23377299 3D CAACTGGGCA AAC/--- AACAATACAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 AAC 2 1 202165 CASAVA_Build 4 23377808 1I ATTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 1705 het 1705 ref 15 5 5 5 T 10 11 202166 CASAVA_Build 4 23379232 1I AAAACTCTCG -/C CCCCCCATGG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 6 7 202167 CASAVA_Build 4 23381395 6I ATTATTATAC ------/ATAATA ATAATAATAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 ATA 3 5 202168 CASAVA_Build 4 23390589 1D AATCTCTAGA C/- CCCCCAGGGG 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 C 6 5 202169 CASAVA_Build 4 23393044 2I TGTCATCCAC --/AT ATATATGTTG 3070 het 3070 ref 59 25 22 12 AT 3 4 202170 CASAVA_Build 4 23394537 1I AGAAACACTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 7 8 202171 CASAVA_Build 4 23401539 2I TCAAATGTTA --/TT TTTTTGTCAG 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 5 7 202172 CASAVA_Build 4 23401849 4I AGGAACTGAG ----/ACTT ACTTATCTAT 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 ACTT 1 2 202173 CASAVA_Build 4 23408079 1D TTGTAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 A 11 10 202174 CASAVA_Build 4 23408439 3D CAACCAAAAA TAT/--- TTTTTGTTGC 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 TAT 1 0 202175 CASAVA_Build 4 23411689 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2672 het 2672 ref 34 15 11 8 T 17 16 202176 CASAVA_Build 4 23414242 1I AGGAATAATA -/T TTTATAGCCT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 3 4 202177 CASAVA_Build 4 23415849 1D GAACACTTAT C/- CCATTCCCTT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 C 3 2 202178 CASAVA_Build 4 23421085 1D AGAACTGATA C/- AGATTACTTT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 C 1 0 202179 CASAVA_Build 4 23422050 1D CCTTTACAGT C/- AAAAATCATT 3070 het 3070 hom 46 20 24 3 C 1 0 202180 CASAVA_Build 4 23425847 1D AACTTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 13 13 20 A 16 15 202181 CASAVA_Build 4 23427264 1D CCAGCGAGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 15 27 6 A 10 9 202182 CASAVA_Build 4 23433844 1I ATATTCCTGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 88 het 39 0 30 9 A 9 10 202183 CASAVA_Build 4 23434829 1I TTTTTTATTA -/G GTTTTTTTTT 3070 het 2072 hom 27 6 13 8 G 1 2 202184 CASAVA_Build 4 23445210 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 30 0 24 6 A 12 11 202185 CASAVA_Build 4 23449629 1I AGTTGACTAT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 147 het 54 0 49 5 A 7 8 202186 CASAVA_Build 4 23450531 2I AAAAAAAAAG --/AA AAGTTTGTGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 4 202187 CASAVA_Build 4 23455038 5I CATATTATAT -----/TATAG TAGAATAATC 1829 hom 10 het 5 0 4 1 TATAG 0 1 202188 CASAVA_Build 4 23455597 2D TATATTATAT AC/-- ACACACACAC 2046 hom 15 het 8 0 6 3 AC 7 6 202189 CASAVA_Build 4 23476958 4I TACAGCTCGC ----/CTGT CTTTCTTTAC 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 CTGT 0 1 202190 CASAVA_Build 4 23484345 3D CATCTCTTTA GAT/--- GATTCTCTAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 GAT 2 1 202191 CASAVA_Build 4 23496368 2I ACTTGCAAGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TG 8 9 202192 CASAVA_Build 4 23500939 1D GTAACGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 35 0 19 16 A 15 14 202193 CASAVA_Build 4 23503901 1D TAACAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 28 1 20 8 A 11 10 202194 CASAVA_Build 4 23505810 1D CTAAGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 23 0 19 4 T 12 11 202195 CASAVA_Build 4 23508377 3I CGCTCAGTGT ---/TGA TGCTGAAAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TGA 0 1 202196 CASAVA_Build 4 23509556 3D GAGGTGGGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 1580 hom 4 het 13 0 5 8 T 19 16 202197 CASAVA_Build 4 23509805 3D TGATGATCCA CCC/--- CCCCCCGGCC 3070 hom 58 het 23 0 17 6 C 9 6 202198 CASAVA_Build 4 23519239 1D AGGGAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 25 1 20 4 A 12 11 202199 CASAVA_Build 4 23521539 1D TTGTTATCTC T/- TTTTTTCAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 6 202200 CASAVA_Build 4 23554102 2D AATTAAAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 881 hom 34 4 9 22 T 18 16 202201 CASAVA_Build 4 23557284 6D GTGTGCCAGG AACTTA/------ AACTTGACAG 3070 het 3070 ref 27 16 8 7 AACTTA 1 0 202202 CASAVA_Build 4 23569739 2D TTACCAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 30 0 20 10 A 16 14 202203 CASAVA_Build 4 23571260 11D CCATGAGCCT ACTTGGGCAAG/----------- ACTTGGGCAG 3070 het 3070 ref 43 21 20 8 ACTTGGGCAAG 1 0 202204 CASAVA_Build 4 23586142 1D CTATTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 33 3 15 15 T 12 11 202205 CASAVA_Build 4 23592952 5D TAGTTTAAAC AAAAG/----- AAAAGTTTGT 3070 het 3070 ref 48 30 18 1 AAAAG 2 1 202206 CASAVA_Build 4 23593580 3D ACTTAATATT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTA 5 4 202207 CASAVA_Build 4 23596190 3D ATCTCTGCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 234 hom 26 3 15 8 T 19 16 202208 CASAVA_Build 4 23596337 1D GACCAATTAC T/- TATCTAAACG 3070 hom 105 het 43 0 36 9 T 2 1 202209 CASAVA_Build 4 23599360 4I ATTTATATAC ----/AGAG AGAGATAGAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AG 2 4 202210 CASAVA_Build 4 23601411 2I CCATCCTGAC --/AT GTGGGGTTTC 3070 hom 168 het 61 0 54 7 AT 0 1 202211 CASAVA_Build 4 23603390 8I GTTCCCATTT --------/TAAAAGAC TAAAAGACTG 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 TAAAAGAC 1 2 202212 CASAVA_Build 4 23611235 1I CAGCAGGTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 9 202213 CASAVA_Build 4 23619426 2D CTTTTGATAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 644 hom 31 3 19 10 A 12 10 202214 CASAVA_Build 4 23629490 1D ACTTTCACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 10 9 202215 CASAVA_Build 4 23632276 1D GATATATCAC A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 49 19 23 8 A 7 6 202216 CASAVA_Build 4 23638843 1I CTCCTCAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 10 202217 CASAVA_Build 4 23640550 1I ATTACCAGAG -/A AAAACATCTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 5 202218 CASAVA_Build 4 23644388 1D GTTAAAAAAG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 A 8 7 202219 CASAVA_Build 4 23645648 6D TGAAGACAAT GACATG/------ GAGCACTGAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 10 GACATG 1 0 202220 CASAVA_Build 4 23647340 2I TTTTTGTAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 11 13 202221 CASAVA_Build 4 23655262 1D CCAGCATTAA C/- GGGTTTCATT 3070 het 3070 ref 53 22 22 9 C 1 0 202222 CASAVA_Build 4 23662657 2D TGATTTGCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 11 11 A 16 14 202223 CASAVA_Build 4 23662761 1D TAAAGGGTAA G/- GGGCATCAAA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 G 4 3 202224 CASAVA_Build 4 23664218 1I GAAAAAATGA -/G GGGCAATAAG 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 G 3 4 202225 CASAVA_Build 4 23672246 4I TTCTCAATGC ----/AATA AATATCTGTG 3070 het 3070 hom 53 21 25 7 AATA 1 2 202226 CASAVA_Build 4 23676803 1I TTGCCTTCCG -/T TCTCCTTGGG 3070 het 3070 ref 52 26 18 8 T 1 2 202227 CASAVA_Build 4 23677571 10D TTGTTTTGGG TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 1579 hom 29 10 13 9 T 22 12 202228 CASAVA_Build 4 23677997 2I GAGAAACAGA --/AC ACACAATGCA 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 AC 2 3 202229 CASAVA_Build 4 23678926 10D TAATCAATGC CACGGAAGGA/---------- ATGATGATGG 3070 het 3070 ref 54 25 26 9 CACGGAAGGA 1 0 202230 CASAVA_Build 4 23688826 1D TTTCCTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 T 11 10 202231 CASAVA_Build 4 23704710 1D TCCAGCATAA C/- CACATGCCCT 3070 het 2685 hom 24 8 13 3 C 2 1 202232 CASAVA_Build 4 23714317 1I GCCTTCTTCC -/A AAAAAAAAAA 2350 het 1283 hom 39 8 15 16 A 16 17 202233 CASAVA_Build 4 23725643 1I GATTAATTAC -/T CTTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 T 0 1 202234 CASAVA_Build 4 23735391 1I GGTAGAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 11 12 202235 CASAVA_Build 4 23736413 1I AAGTTGTATA -/T GAAGATTAGA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 0 1 202236 CASAVA_Build 4 23750120 1D TAGAAACTTC T/- TAATGACACA 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 2 1 202237 CASAVA_Build 4 23788403 1I TTAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2324 hom 25 het 15 0 9 6 A 10 11 202238 CASAVA_Build 4 23797532 1I ACTTGCCTGC -/A AAAAAAAAAA 1866 het 1866 ref 22 12 6 4 A 10 11 202239 CASAVA_Build 4 23801674 1I AGGGTGCCTG -/A AATACTGCCC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 2 3 202240 CASAVA_Build 4 23814291 6D GATGAGAGAT AGAAAA/------ AGAAAGAGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AGAAAA 1 0 202241 CASAVA_Build 4 23832539 6D AATGGAATTG TTATAC/------ TTAAATTAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TTATAC 1 0 202242 CASAVA_Build 4 23836734 2I CCCACAAAAC --/AG GGGAAAGGAT 3070 hom 123 het 43 0 39 4 AG 0 1 202243 CASAVA_Build 4 23843850 1I TCCAAAGTGT -/C TTTGGAATTT 3070 hom 98 het 37 0 31 6 C 0 1 202244 CASAVA_Build 4 23863986 1I TTTTACTGCT -/C CTTTTTGTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 1 2 202245 CASAVA_Build 4 23864457 1I CTCACTTGCC -/T TAGTGCCAGC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 1 2 202246 CASAVA_Build 4 23871514 1D ATTAATGGTA T/- TATATTGAAT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 2 1 202247 CASAVA_Build 4 23872520 1D AGCATGTCAA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 8 7 202248 CASAVA_Build 4 23874178 8D GTGGGTGTAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 103 het 48 0 38 12 AC 14 10 202249 CASAVA_Build 4 23882107 1D GTCCTTTTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 14 het 40 1 32 7 T 10 9 202250 CASAVA_Build 4 23885947 4D TTAAATACGT TTAC/---- TTACACACAG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TTAC 2 1 202251 CASAVA_Build 4 23888250 2I AGCTGCTCTC --/TG TGAAGGTATA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 TG 1 2 202252 CASAVA_Build 4 23888889 1D TCCTGTCTCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 41 het 16 0 14 3 A 9 8 202253 CASAVA_Build 4 23892791 4D AAACATTTTT TGAA/---- TGAATGAAAG 3070 het 3070 hom 43 14 26 5 TGAA 3 2 202254 CASAVA_Build 4 23902191 1I CACTGGGCTC -/T TGTTCTCTGC 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 T 1 2 202255 CASAVA_Build 4 23906736 6D TGTGTGTATA TATATG/------ TATATGTGTG 2893 het 2130 hom 36 7 12 20 TATATG 2 1 202256 CASAVA_Build 4 23919863 1D GTGTGGAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 48 16 22 10 A 9 8 202257 CASAVA_Build 4 23922193 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 2202 hom 15 het 8 0 6 2 A 10 9 202258 CASAVA_Build 4 23923114 1D TTTTTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 11 10 202259 CASAVA_Build 4 23923355 1D TTCATCAACC A/- AAAAAAAAAA 1238 het 1238 ref 34 20 4 10 A 17 16 202260 CASAVA_Build 4 23931358 2D ATATAAAAAC AG/-- AGAAATGAAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 AG 2 1 202261 CASAVA_Build 4 23942832 1I GAACAGTGGG -/T TTTTTTTTTG 2797 het 2797 ref 41 23 10 8 T 9 10 202262 CASAVA_Build 4 23946824 2I CCACATCCTT --/TC TCTCTATCTT 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 TC 2 3 202263 CASAVA_Build 4 23954825 4D AGTATTCCAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TA 9 7 202264 CASAVA_Build 4 23955134 1I CAACATCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 10 11 202265 CASAVA_Build 4 23955990 1D AATTTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 2633 het 2633 ref 24 8 8 8 T 13 12 202266 CASAVA_Build 4 23961699 1D AAAAGAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 28 0 25 3 T 12 11 202267 CASAVA_Build 4 23963914 2I ATAATCAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 10 12 12 T 14 16 202268 CASAVA_Build 4 23965615 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 AAAC 3 4 202269 CASAVA_Build 4 23976975 2D CATTCACTGA AG/-- AGAGTTATCG 3070 het 3070 hom 42 16 23 5 AG 3 2 202270 CASAVA_Build 4 23985987 1D CATTTCAGTT A/- AATGATACAT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 3 2 202271 CASAVA_Build 4 23986747 1I TTGCACCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 559 hom 35 3 16 16 A 11 12 202272 CASAVA_Build 4 23992893 1D AACAATGGAG A/- AAAAAACTAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 6 202273 CASAVA_Build 4 24000827 1D AGAAAATTCC A/- AAAAGCAGCA 3070 hom 98 het 45 0 32 13 A 5 4 202274 CASAVA_Build 4 24004096 1D TGAGAAACGG C/- CCCTTCCTGT 3070 het 3070 ref 37 17 15 9 C 4 3 202275 CASAVA_Build 4 24009869 2I TCAGCGAAAA --/CC CTCAGCTTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 3 202276 CASAVA_Build 4 24010750 1D AAGTGATCCA C/- CCCGCCTCAG 1500 het 1500 ref 28 12 5 11 C 4 3 202277 CASAVA_Build 4 24012246 1I CGCACCCACC -/T TTCAGAGCTG 3070 het 3070 ref 51 30 15 6 T 2 3 202278 CASAVA_Build 4 24027045 4D TACAGTGTGG ATCA/---- ATCAAAGCAG 3070 hom 120 het 46 0 38 9 ATCA 2 1 202279 CASAVA_Build 4 24065294 1D TTGTTTCTAC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 8 7 202280 CASAVA_Build 4 24065624 1D AGATTGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 10 A 11 10 202281 CASAVA_Build 4 24072975 1D CCCGGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 17 0 12 5 T 15 14 202282 CASAVA_Build 4 24079700 1I AAAAGCTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 9 10 202283 CASAVA_Build 4 24084608 1D GAAAGGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 12 11 202284 CASAVA_Build 4 24085120 1I AATGATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 554 hom 45 3 35 7 A 10 11 202285 CASAVA_Build 4 24105633 1I AAAGAGGCTG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 52 14 22 16 T 7 8 202286 CASAVA_Build 4 24109756 1D TCAGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2236 het 2236 ref 42 14 10 18 A 17 16 202287 CASAVA_Build 4 24127029 1D ATGAAATGAG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 A 8 7 202288 CASAVA_Build 4 24131438 1I TTTATCTATC -/A TTCCTTAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 0 1 202289 CASAVA_Build 4 24132784 1D CCTGCCCATG A/- AAACTTTCCG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 4 3 202290 CASAVA_Build 4 24135153 1I CTCTAATATT -/A AAAGAAACTG 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 A 3 4 202291 CASAVA_Build 4 24135261 4I AAATAATGTG ----/GTTA GTTTCATACT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 GTTA 0 1 202292 CASAVA_Build 4 24136960 1I CTGAAAACTC -/T TAACACGTAA 3070 het 3070 ref 41 17 19 5 T 1 2 202293 CASAVA_Build 4 24141312 1D AAAAGAAAAT A/- AAGAAATAGA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 3 2 202294 CASAVA_Build 4 24141401 1D AAATAAAAAT G/- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 G 3 2 202295 CASAVA_Build 4 24151368 1D ACTTTTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 12 11 202296 CASAVA_Build 4 24158510 1D CATGTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1091 het 1091 ref 11 7 3 1 A 15 14 202297 CASAVA_Build 4 24162955 4D CTGAGAATAA AGAC/---- AGACAGTTCA 2241 het 2241 ref 29 19 8 4 AGAC 2 1 202298 CASAVA_Build 4 24166029 1D CAGAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1124 hom 21 3 15 5 A 12 11 202299 CASAVA_Build 4 24176764 1D CAAACCACCA T/- TTTTTTTTTT 1776 het 1776 ref 34 19 5 10 T 15 14 202300 CASAVA_Build 4 24180487 1I ATGATTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 9 10 202301 CASAVA_Build 4 24181009 1D TCCCATCCTA T/- ACATTCTTCT 3070 het 3070 hom 52 22 22 9 T 1 0 202302 CASAVA_Build 4 24184933 1I TCTCAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 720 het 199 hom 21 4 7 10 G 0 1 202303 CASAVA_Build 4 24205616 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2374 het 716 hom 27 2 15 10 A 17 18 202304 CASAVA_Build 4 24207090 3I GGAGAGCATT ---/GAA GAAGGAATAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 GAA 1 2 202305 CASAVA_Build 4 24207676 1I GATCGCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2779 hom 34 7 17 10 T 16 17 202306 CASAVA_Build 4 24214076 15I AGAGACCCTT ---------------/TACTGCTAATCCATC TTGGGTTACT 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 TACTGCTAATCCATC 0 1 202307 CASAVA_Build 4 24227189 8D GCTATAGTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 7 T 16 8 202308 CASAVA_Build 4 24235286 1I AAAGAATTGC -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 A 6 7 202309 CASAVA_Build 4 24238032 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2013 hom 30 5 20 5 A 11 12 202310 CASAVA_Build 4 24240885 2I GTTTGGCTAA --/CT CTCTCCTTCT 3070 hom 60 het 38 1 33 4 CT 2 3 202311 CASAVA_Build 4 24247023 1D CCTTAAATGG A/- AAAAAAAAAC 1332 het 1332 ref 52 44 3 5 A 10 9 202312 CASAVA_Build 4 24253159 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2962 het 2714 hom 19 8 9 2 A 10 11 202313 CASAVA_Build 4 24254587 4I ACACTATAAA ----/ATTT ATTTATTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 ATTT 2 3 202314 CASAVA_Build 4 24282081 10I CAATACAAGA ----------/ACAGCCTAAT ACACCAGGGG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 ACAGCCTAAT 0 1 202315 CASAVA_Build 4 24284560 3I TCCTCTTCAT ---/AAG AATAATAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAG 0 1 202316 CASAVA_Build 4 24318652 2D ATGAGATCTC TG/-- TCAGATATGT 3070 het 3070 ref 31 15 10 8 TG 1 0 202317 CASAVA_Build 4 24320383 1D AGAACCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 17 7 A 15 14 202318 CASAVA_Build 4 24333346 1I CAAAATCCCA -/T CTCTACTAAT 3070 het 2151 hom 24 7 13 4 T 0 1 202319 CASAVA_Build 4 24333652 1I CGTCTCACTC -/G GCAGGCCATA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 1 2 202320 CASAVA_Build 4 24344312 1D ACTCTGCTTC A/- AAAAAAAAAA 731 het 570 hom 22 5 3 14 A 19 18 202321 CASAVA_Build 4 24365504 1I AGAAGGGAGT -/C CCTTACAGGA 3070 hom 132 het 47 0 44 3 C 2 3 202322 CASAVA_Build 4 24373333 1I TTTTATTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1535 hom 26 5 14 7 A 15 16 202323 CASAVA_Build 4 24375730 7I CCATTTTAAA -------/TCTTTCT TCTTTCTGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TCTTTCT 1 2 202324 CASAVA_Build 4 24385168 9D TTTTGACCTA CTATATTTT/--------- CAATTTATGT 3070 hom 120 het 41 0 40 2 CTATATTTT 1 0 202325 CASAVA_Build 4 24387024 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 36 1 30 5 A 12 11 202326 CASAVA_Build 4 24397694 1D TTTAAATAAC A/- AAATAAATTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 4 3 202327 CASAVA_Build 4 24397829 4I TTCACAAGAC ----/TTAT TTATCCTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTAT 1 2 202328 CASAVA_Build 4 24400996 1D ATCCTGTCAG C/- CCTGTCAGCA 3070 hom 66 het 28 0 22 7 C 3 2 202329 CASAVA_Build 4 24404054 1I CACTCTACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 27 1 16 10 T 12 13 202330 CASAVA_Build 4 24404109 1D AGTGCAGTGG A/- ATATTCACAG 3070 hom 66 het 30 0 22 9 A 2 1 202331 CASAVA_Build 4 24407896 1I TACCAGCAGC -/T TCTCTCTGAT 3070 hom 64 het 38 0 31 7 T 1 2 202332 CASAVA_Build 4 24411827 1D CAGGGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 42 1 33 9 A 12 11 202333 CASAVA_Build 4 24438997 1I TACCGTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 38 1 24 13 A 14 15 202334 CASAVA_Build 4 24461169 1I AGAGGAGCAG -/A AGCTTGCAGG 3070 hom 123 het 45 0 40 5 A 1 2 202335 CASAVA_Build 4 24466360 3I TGGATTTAAT ---/CAA CAAGCCCTGA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 CAA 1 2 202336 CASAVA_Build 4 24466880 2D CAGCGAAGGC CT/-- CTCCTTGGAC 3070 hom 114 het 43 0 39 6 CT 2 1 202337 CASAVA_Build 4 24472357 1I TACTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 54 1 41 12 A 10 11 202338 CASAVA_Build 4 24484686 4D TTTCCTAAAA TTGT/---- TTGAACACAA 3070 het 2169 hom 18 5 11 4 TTGT 1 0 202339 CASAVA_Build 4 24487896 4D GTTTTTTGTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 2743 het 2743 ref 27 13 8 6 TGTT 6 5 202340 CASAVA_Build 4 24516313 5D GTGCCACCAC GCCCA/----- GCTAATTTTT 3070 het 2229 hom 24 7 13 4 GCCCA 1 0 202341 CASAVA_Build 4 24526007 1I ACCTGTGGAT -/A AAATAGACTG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 3 4 202342 CASAVA_Build 4 24542550 8D GGAGAGTATG TATATATA/-------- TATATATATA 3070 het 76 hom 19 1 15 6 TA 11 7 202343 CASAVA_Build 4 24547033 3I TTGCCACATA ---/TTT TTTTTATAAT 3070 het 1415 hom 18 4 13 1 T 5 8 202344 CASAVA_Build 4 24558545 1I AGAAGGAGGA -/T TTTTTTTTTT 2154 het 2154 ref 32 16 7 9 T 11 12 202345 CASAVA_Build 4 24566941 9D AACCTAGTTA ACACAAACT/--------- ACACAAACTA 3070 hom 138 het 52 0 46 8 ACACAAACT 2 1 202346 CASAVA_Build 4 24573649 1I TTGTAAAGTG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 8 9 202347 CASAVA_Build 4 24574913 4D GACCCTATCT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 20 0 12 8 A 19 15 202348 CASAVA_Build 4 24593407 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1230 het 951 hom 17 4 3 10 T 14 13 202349 CASAVA_Build 4 24593577 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTGTAGA 3070 het 1559 hom 15 4 11 0 T 5 6 202350 CASAVA_Build 4 24608604 1D ATGCAGAACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 20 19 5 T 9 8 202351 CASAVA_Build 4 24612281 1I ACCAAGAGGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 13 15 10 A 8 9 202352 CASAVA_Build 4 24612435 1D GAGGCTAGAA G/- CCTCAGCCTA 3070 het 3070 hom 58 22 28 8 G 1 0 202353 CASAVA_Build 4 24612541 1D TAAAGTCAGG A/- AACAACAAAC 3070 het 3070 hom 66 31 33 4 A 3 2 202354 CASAVA_Build 4 24616296 1D TGTATCCTTG A/- AAAAAAAAAA 2631 het 1064 hom 11 3 6 2 A 11 10 202355 CASAVA_Build 4 24630141 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 T 11 10 202356 CASAVA_Build 4 24637065 1I TCTGCACATC -/A AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 A 6 7 202357 CASAVA_Build 4 24644498 1I TCAGCAGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 10 202358 CASAVA_Build 4 24651720 1I AACCCTGAGT -/G AAGGGTTGAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 0 1 202359 CASAVA_Build 4 24652087 1D TCTTTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 T 12 11 202360 CASAVA_Build 4 24652778 1I GTGAAAGGGG -/T TTCCCCTTAT 3070 hom 98 het 38 0 33 5 T 2 3 202361 CASAVA_Build 4 24655943 1I TGCTAACCAA -/C TGCATTTCCA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 C 0 1 202362 CASAVA_Build 4 24658231 5D AGCTAGTTAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2050 het 1224 hom 33 10 8 15 T 23 18 202363 CASAVA_Build 4 24665517 2I TGAGGTGGCC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 41 13 14 14 AG 6 7 202364 CASAVA_Build 4 24667534 1D AGTATGTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 T 12 11 202365 CASAVA_Build 4 24668941 1I ATACCTGAAG -/T GGTTTCTATT 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 T 0 1 202366 CASAVA_Build 4 24686718 1D CTTGCAGGAA T/- TTGTTCAGGC 2580 het 2580 ref 24 11 8 5 T 3 2 202367 CASAVA_Build 4 24689522 1D ATTTACAAAA G/- AAAGAGGATT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 G 1 0 202368 CASAVA_Build 4 24696856 18D CGGTTTTCCA AGGACACAGGAGTTTCCT/------------------ AGGACACAGG 3070 het 3070 hom 35 14 18 15 AGGACACAGGAGTTTCCT 2 1 202369 CASAVA_Build 4 24702597 1I TGAGAGTGTT -/G GGCCTGAAAG 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 G 2 3 202370 CASAVA_Build 4 24709873 4I AGAAAGAAAG ----/AAGA AAGAGGAGAA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 AAGA 1 2 202371 CASAVA_Build 4 24722966 1D TCTTTGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 12 12 A 13 12 202372 CASAVA_Build 4 24727530 1I GCCACTAAGT -/G GCAGAGCCAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 202373 CASAVA_Build 4 24751639 1I AAAATATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 536 hom 37 2 24 11 A 14 15 202374 CASAVA_Build 4 24757195 1I CTAACAGAAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 49 1 43 5 A 8 9 202375 CASAVA_Build 4 24767124 1D CTTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 11 10 202376 CASAVA_Build 4 24772873 2I GGGAGCATTT --/AC ACACCATGGA 3070 hom 154 het 58 0 52 6 AC 2 3 202377 CASAVA_Build 4 24790813 1D ACAAGTATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 804 hom 19 3 12 4 A 15 14 202378 CASAVA_Build 4 24795579 1D CACTAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 13 12 202379 CASAVA_Build 4 24796451 4D TTGTTGAGAT AAAG/---- AAACCCAACT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 AAAG 1 0 202380 CASAVA_Build 4 24804067 1D ATTATCTGGC T/- TTTTTTTTTT 2319 hom 17 het 17 0 7 10 T 17 16 202381 CASAVA_Build 4 24822374 2I GGATGAAAAC --/AT ATATATATAT 1232 het 39 hom 31 1 5 25 AT 7 8 202382 CASAVA_Build 4 24839019 1D ACATTGAAAA G/- CAACCAAAAG 3070 hom 125 het 47 0 41 6 G 1 0 202383 CASAVA_Build 4 24846720 3D ATAAAAAATA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAC 5 4 202384 CASAVA_Build 4 24848063 1D ACTATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 47 2 27 19 T 12 11 202385 CASAVA_Build 4 24858117 1I TTTGAGTGCC -/T TACTGGGTGC 3070 hom 150 het 52 0 50 2 T 1 2 202386 CASAVA_Build 4 24859319 1D TGATGTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 34 2 27 5 T 13 12 202387 CASAVA_Build 4 24859500 4I CAGAGCTAAT ----/AAGA AATTAGGAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AAGA 0 1 202388 CASAVA_Build 4 24861734 3I TTTGGGAGGC ---/GTG GTAAAGGTGA 3070 hom 127 het 46 0 43 3 GTG 0 1 202389 CASAVA_Build 4 24872452 6I GAACATATTG ------/TATGAT TATATTTATA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TATGAT 0 1 202390 CASAVA_Build 4 24875228 1D CCAGTTTTGC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 9 8 202391 CASAVA_Build 4 24883851 1D AATATGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 37 1 29 7 T 12 11 202392 CASAVA_Build 4 24892300 2D ATTGAAAAAA CT/-- CTGATCGGGC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 CT 2 1 202393 CASAVA_Build 4 24894184 1D ATAAACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 29 1 22 6 A 15 14 202394 CASAVA_Build 4 24894891 2I CACATGAAAA --/AT TGTTCATAGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AT 0 1 202395 CASAVA_Build 4 24898288 1I TGGCCTGAAG -/T TTTCTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 3 4 202396 CASAVA_Build 4 24909182 1I TTTGGAGTTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 411 hom 33 1 31 1 T 8 9 202397 CASAVA_Build 4 24920342 1I GAGAACTGCC -/T TGAACCTGGG 3070 hom 44 het 16 0 14 2 T 1 2 202398 CASAVA_Build 4 24921220 1I ATAAGGTGAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 9 202399 CASAVA_Build 4 24927355 4I GAAAAATGTC ----/TGTT TGAGTCCTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TGTT 0 1 202400 CASAVA_Build 4 24929517 1I TTATTTTTTT -/G TGGGGGGCCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 202401 CASAVA_Build 4 24934128 1I TTCTGTTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 9 10 202402 CASAVA_Build 4 24964881 3D GAGAGGACAA AAG/--- AAGACAGATC 3070 hom 108 het 42 0 36 8 AAG 2 1 202403 CASAVA_Build 4 24983674 1D AGAACAATAC G/- GGGGGGGATC 3070 hom 101 het 44 0 32 14 G 8 7 202404 CASAVA_Build 4 24992668 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 10 9 202405 CASAVA_Build 4 24992842 2D TTCTTTTTTT TC/-- CCCCCCCTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 TC 1 0 202406 CASAVA_Build 4 24994268 1I CTTTCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 11 202407 CASAVA_Build 4 24995520 1I GACCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1046 hom 38 3 22 13 A 13 14 202408 CASAVA_Build 4 24998408 2I ACCACTTTTT --/TA TACTTGCTTA 3070 hom 132 het 51 0 44 7 TA 1 2 202409 CASAVA_Build 4 24999033 2I CTAAAATAAC --/AA AGAAATTCCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 3 202410 CASAVA_Build 4 24999400 2D TATTTTTACT AA/-- GAGTATTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 11 4 A 2 0 202411 CASAVA_Build 4 25003416 2D TGTGGGAAAA AC/-- AGTCTTCACA 3070 hom 108 het 44 0 37 8 AC 1 0 202412 CASAVA_Build 4 25008464 2D CCCTTTATAG TT/-- TTTTTTTTTT 2677 het 1057 hom 33 9 7 17 T 14 12 202413 CASAVA_Build 4 25010180 1I TCTGTGTATC -/T TTTTTTTATG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 7 8 202414 CASAVA_Build 4 25018423 3D AAAATTAAAC ATA/--- ATAAAAAATT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 ATA 2 1 202415 CASAVA_Build 4 25019244 2D CAGGTTTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 998 hom 33 het 30 0 13 17 A 14 12 202416 CASAVA_Build 4 25019256 3D AAAAAAAAAA AAT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 32 1 22 9 AAT 1 0 202417 CASAVA_Build 4 25023846 2I TGTAAGCAAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 31 0 22 10 A 9 11 202418 CASAVA_Build 4 25029988 1D GAATCAGCAG T/- GCTTAGATGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 0 202419 CASAVA_Build 4 25033474 14D ATGATATATA TGTGTGTGTGTGTG/-------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 86 het 36 0 30 10 TG 16 9 202420 CASAVA_Build 4 25036726 1I CTTAAGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 284 hom 44 1 31 12 T 11 12 202421 CASAVA_Build 4 25047503 1D60M5I AAACAAAACC AAAAAAAAAAACAAATAAACCCATAAAACAAAACAAACAAACAAGCAAAAACCCAGTATAT-----/-AAAAAAAAAACAAATAAACCCATAAAACAAAACAAACAAACAAGCAAAAACCCAGTATATTGTGA TGTGATTTTC 3070 hom 72 het 23 0 25 17 N/A 0 0 202422 CASAVA_Build 4 25052895 4D GGAGCTAGAG AGAA/---- AGGAAGGAAG 3070 hom 82 het 31 0 28 6 AGAA 1 0 202423 CASAVA_Build 4 25064653 1D GCTGCCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 43 0 27 16 A 15 14 202424 CASAVA_Build 4 25076777 1I GAGAGGTGGG -/A AGTCAGGTCA 3070 hom 96 het 40 0 29 11 A 1 2 202425 CASAVA_Build 4 25079340 2D TTTCTTTCTT TC/-- TTTTTTTTTT 1955 het 441 hom 20 2 8 10 TC 1 0 202426 CASAVA_Build 4 25085980 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 24 1 20 3 A 12 13 202427 CASAVA_Build 4 25088261 4D GCACACAAAG TCAT/---- TCACTGTGGC 3070 hom 123 het 44 0 42 6 TCAT 1 0 202428 CASAVA_Build 4 25092911 1I CCAAATGCCC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 A 8 9 202429 CASAVA_Build 4 25094535 1I ATAACATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 32 1 25 6 T 10 11 202430 CASAVA_Build 4 25096040 1I CTCACTTCCC -/T TTTTTGTCTA 3070 het 3070 ref 42 22 14 10 T 5 6 202431 CASAVA_Build 4 25101641 1D TAAATAAATT A/- AAAAAACTCC 3070 het 3070 ref 34 23 9 2 A 7 6 202432 CASAVA_Build 4 25103701 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 30 11 17 4 A 7 6 202433 CASAVA_Build 4 25105795 1D AGAAAAAAAA T/- ATGATCATCT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 1 0 202434 CASAVA_Build 4 25106183 1I GTCTCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 10 11 202435 CASAVA_Build 4 25107638 5I CTGGCTTGAC -----/CTGCT CTGCTCTGCT 1661 het 1661 ref 25 6 5 14 CTGCT 2 3 202436 CASAVA_Build 4 25110390 8I AACATTGTTT --------/TTTGTTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 TTTG 2 4 202437 CASAVA_Build 4 25112942 1D TGCAGACCAG T/- TTTTTGAATA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 6 5 202438 CASAVA_Build 4 25113512 8I GCCAAGGAGG --------/GAGGATCA CTTGAGCCTA 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 GAGGATCA 0 1 202439 CASAVA_Build 4 25114366 1I GCGCAGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 318 hom 22 1 14 7 T 10 11 202440 CASAVA_Build 4 25118472 1D TTGTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 2173 het 2173 ref 26 12 7 7 T 13 12 202441 CASAVA_Build 4 25124435 1I CGTCTCGGTC -/T CCCAGAGTGC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 0 1 202442 CASAVA_Build 4 25153572 1D AATATAATTA C/- CAATAGAATA 1954 het 1659 hom 8 4 4 0 C 2 1 202443 CASAVA_Build 4 25166855 1D TAGTTGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1870 hom 31 10 13 8 T 13 12 202444 CASAVA_Build 4 25173518 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2125 hom 36 12 10 14 T 15 14 202445 CASAVA_Build 4 25180491 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3005 hom 31 8 18 5 A 7 8 202446 CASAVA_Build 4 25185154 1I TGTCAAGGTG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 8 9 202447 CASAVA_Build 4 25237930 1D GACTCTGTTC A/- AAAAAAAAAA 2448 het 2425 hom 15 6 7 2 A 13 12 202448 CASAVA_Build 4 25238054 1I9M1D GTTGAGGCTG -AGTGAACTGT/CAGTGAACTG- TGATCATGCC 1937 het 1937 ref 24 17 8 3 N/A 0 0 202449 CASAVA_Build 4 25239174 1D CTTCTTTCTC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 T 8 7 202450 CASAVA_Build 4 25239626 1I CATCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 10 11 202451 CASAVA_Build 4 25239993 1D ACCCTCTCTC A/- AAAAAAAAAT 2350 het 2350 ref 23 13 5 5 A 10 9 202452 CASAVA_Build 4 25251289 1D CAAATGGGTG T/- TTTTTTGTTA 3070 het 3070 ref 27 16 8 4 T 7 6 202453 CASAVA_Build 4 25260619 1D CAGTTGCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 A 10 9 202454 CASAVA_Build 4 25261316 2I CACCAGGCCA --/AT ATAGCAGGGG 1537 het 1537 ref 14 9 4 1 AT 1 2 202455 CASAVA_Build 4 25284004 4D2M5I TTGTAGGCCT CACATG-----/----TGAGGGA TAGTCACTGC 3070 het 3070 hom 49 20 22 9 N/A 0 0 202456 CASAVA_Build 4 25287630 1I TTGGCTTGGT -/G GGTAGGCCTG 3070 hom 68 het 27 0 23 4 G 2 3 202457 CASAVA_Build 4 25289844 1I CAAAACGAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 9 10 202458 CASAVA_Build 4 25322830 1I CACTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 29 1 19 9 A 11 12 202459 CASAVA_Build 4 25337711 4D TGTTCTCATG TGGT/---- TGGTCGTCCC 3070 hom 47 het 18 0 16 2 TGGT 2 1 202460 CASAVA_Build 4 25340803 2I CTCAGCACCC --/TA GCCACCATGC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 TA 0 1 202461 CASAVA_Build 4 25343784 2D AACTTTGTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2366 hom 23 7 13 3 T 12 10 202462 CASAVA_Build 4 25346207 4D TCTTGATTTT ATTG/---- ATTATCTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 ATTG 1 0 202463 CASAVA_Build 4 25346302 3D TTTAGCTTAA TCT/--- TCTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 TCT 2 1 202464 CASAVA_Build 4 25347577 6D ATCCTACTGC CCTTTT/------ CCTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 30 16 10 6 CCTTTT 2 1 202465 CASAVA_Build 4 25348611 1I TACAGTTGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 9 10 202466 CASAVA_Build 4 25351023 1I GCATGGTGGC -/A CACACCTGTA 3070 het 1840 hom 18 4 11 3 A 0 1 202467 CASAVA_Build 4 25379749 1I ATTTCCTCAA -/T TTTTTATACG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 5 6 202468 CASAVA_Build 4 25406645 1D GGACTGGGAG A/- AAAAAAAAAA 2452 het 836 hom 22 5 7 10 A 13 12 202469 CASAVA_Build 4 25416313 1D TATGATGCTT C/- CTTTTACATA 3070 hom 138 het 50 0 47 4 C 2 1 202470 CASAVA_Build 4 25485799 7I TACTGCCTTC -------/AAGACAA AAGATAAAAG 3070 hom 135 het 46 0 46 1 AAGACAA 0 1 202471 CASAVA_Build 4 25486406 1I TTTTTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 981 hom 43 3 32 8 T 11 12 202472 CASAVA_Build 4 25510378 1I TTCCCTACAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 8 9 202473 CASAVA_Build 4 25542320 4I AAATATTAAT ----/AACA AACATATAGG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AACA 1 2 202474 CASAVA_Build 4 25549478 1D CTAAGATGGA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 8 7 202475 CASAVA_Build 4 25551318 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2311 hom 18 het 14 0 8 6 A 17 16 202476 CASAVA_Build 4 25558367 2I TATTGGTCAC --/AT GTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AT 0 1 202477 CASAVA_Build 4 25559377 1D ACCAACATTT G/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 41 25 15 1 G 1 0 202478 CASAVA_Build 4 25564164 6I CTCCCACTGA ------/CGTTTG CTGAGTGCCT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 CGTTTG 0 1 202479 CASAVA_Build 4 25567537 1I TGTCCTTCAC -/A TGCACACGTA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 0 1 202480 CASAVA_Build 4 25569237 3D TGAGGAGAAT GGC/--- AGACAACTGC 3070 het 3070 ref 47 27 18 3 GGC 1 0 202481 CASAVA_Build 4 25571807 4I ATATAATGTC ----/TAAT TATTTTTAAA 2195 het 2195 ref 12 6 5 1 TAAT 0 1 202482 CASAVA_Build 4 25578049 2D CTAGTCTCAC CT/-- CTCTTTTAGC 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 CT 3 2 202483 CASAVA_Build 4 25585504 2I ATTTGAGACA --/CT CTCTGGAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 CT 2 3 202484 CASAVA_Build 4 25591203 1D TTTAAAAAAA T/- TTTTCTAGAG 3070 hom 75 het 27 0 26 2 T 5 4 202485 CASAVA_Build 4 25592408 2D TAAGCCACTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 35 0 25 10 T 15 13 202486 CASAVA_Build 4 25596057 1D CACCACCCCA C/- CCCCCCAAGA 3070 het 2828 hom 35 8 15 13 C 7 6 202487 CASAVA_Build 4 25598651 1D TGTCTTCACA C/- CTCATGAGAG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 C 2 1 202488 CASAVA_Build 4 25618185 1D AAAGAAAATA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 9 8 202489 CASAVA_Build 4 25621767 1D TGATCCTGTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 9 8 202490 CASAVA_Build 4 25624141 8I CCTCTCACTC --------/CATCTCAG CATCAAGCAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 CATCTCAG 0 1 202491 CASAVA_Build 4 25630324 1I AACAAGAAAA -/G GGTAATATGG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 G 2 3 202492 CASAVA_Build 4 25632138 2D GTAAGTACAC AT/-- GTCATTTGAA 3070 het 3070 ref 35 12 12 13 AT 1 0 202493 CASAVA_Build 4 25635236 1I TTCTGAAGAT -/C CCCCCTTTTA 3070 hom 86 het 33 0 26 7 C 5 6 202494 CASAVA_Build 4 25641998 1D TAAAAAAAAA C/- ACAAAAAATT 2729 het 2729 ref 24 8 10 6 C 1 0 202495 CASAVA_Build 4 25659785 1I GAGATGAAGG -/A AATGAAGCAA 3070 hom 62 het 25 0 21 4 A 2 3 202496 CASAVA_Build 4 25662385 1I GTGCAAGCTT -/C TGGGGGAACC 3070 hom 83 het 31 0 28 3 C 0 1 202497 CASAVA_Build 4 25667434 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 11 10 202498 CASAVA_Build 4 25679778 2D TCATGCTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 38 0 25 13 T 15 13 202499 CASAVA_Build 4 25697312 1D AAACAGAACC G/- GAAAAGTGGC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 G 2 1 202500 CASAVA_Build 4 25701939 1I TTAATGGTGA -/T TTCTGAGATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 3 202501 CASAVA_Build 4 25719824 6D TGCCTTCCTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1785 het 20 hom 20 1 7 12 T 22 16 202502 CASAVA_Build 4 25725199 8D AAGAATGTAC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 hom 62 het 25 0 20 9 AT 10 6 202503 CASAVA_Build 4 25749870 1I CGGCCACAGA -/C CCCAATCTCT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 C 3 4 202504 CASAVA_Build 4 25754942 1I TTTGTTTCAA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 53 het 22 0 18 4 T 7 8 202505 CASAVA_Build 4 25755892 4I TACAAGCTGC ----/TCGT TCGTCCCAGA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 TCGT 1 2 202506 CASAVA_Build 4 25758988 1D AAATTTGGGA T/- TTTTTCCAGT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 6 5 202507 CASAVA_Build 4 25767627 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 11 10 202508 CASAVA_Build 4 25767812 3D CAAACAAACA AAC/--- AAACAAAAAC 1665 hom 24 het 14 0 9 5 AAC 1 0 202509 CASAVA_Build 4 25776433 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 T 10 9 202510 CASAVA_Build 4 25794922 5I AAAAAGAAAG -----/AAAGA AAAAAAAATG 1688 het 1688 ref 22 10 7 5 AAAGA 0 1 202511 CASAVA_Build 4 25795861 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1860 het 6 hom 15 0 5 10 A 15 14 202512 CASAVA_Build 4 25798190 4D CATCTTCTCG AAGT/---- AAGTATCACA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 AAGT 2 1 202513 CASAVA_Build 4 25813633 1D CCAGACTGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 4 A 10 9 202514 CASAVA_Build 4 25816360 1I TTGCCCAGGC -/T TGGAGTGCAG 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 T 1 2 202515 CASAVA_Build 4 25816718 1D TATATGCGTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 34 20 8 7 T 8 7 202516 CASAVA_Build 4 25817472 1D TCATACCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 127 hom 24 1 12 11 A 19 18 202517 CASAVA_Build 4 25818069 1D GTGTGTTTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 113 het 41 0 37 5 A 10 9 202518 CASAVA_Build 4 25819819 2I AAGAAAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 26 het 10 0 9 1 AT 8 9 202519 CASAVA_Build 4 25824989 6I GACGAAAGAA ------/AGAAAG AGAAAGAGAA 2217 het 2217 ref 20 8 5 7 AGAAAG 2 3 202520 CASAVA_Build 4 25848070 1D GATGGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 11 10 202521 CASAVA_Build 4 25866522 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1005 het 1005 ref 19 9 4 6 A 17 16 202522 CASAVA_Build 4 25866633 1D TTTGGGCCTC A/- AGTATTCCTT 3070 hom 66 het 28 0 22 7 A 2 1 202523 CASAVA_Build 4 25867010 1D TGGCTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 1423 het 1423 ref 32 17 4 11 A 15 14 202524 CASAVA_Build 4 25892855 6D TCTCTCTCTC TCTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 2472 hom 36 17 12 8 TCTTTT 1 0 202525 CASAVA_Build 4 25898430 4D GAAAAGAAAG AGAA/---- AGAAAGAAGA 2531 het 1492 hom 11 4 6 1 AGAA 3 2 202526 CASAVA_Build 4 25902095 1I CTGAAGGATG -/T TTATCACAAA 3070 het 3070 hom 43 18 25 0 T 2 3 202527 CASAVA_Build 4 25916757 1I CCACCCACCT -/C AGCCTCCCAA 1960 het 1960 ref 26 16 6 4 C 0 1 202528 CASAVA_Build 4 25937400 4D TGTGACTGTC AAAT/---- AAGGTAAATT 3070 het 3070 hom 47 19 23 7 AAAT 1 0 202529 CASAVA_Build 4 25938833 1I TTTTCACATC -/T TTTTTTTTTT 1374 het 1374 ref 37 25 4 8 T 13 14 202530 CASAVA_Build 4 25971316 1I TCATAGGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 30 3 15 12 T 16 17 202531 CASAVA_Build 4 25981800 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1379 het 1379 ref 16 6 4 6 A 17 16 202532 CASAVA_Build 4 26010244 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 11 10 202533 CASAVA_Build 4 26010418 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1383 hom 16 5 9 2 T 8 9 202534 CASAVA_Build 4 26022298 1D TAGAGTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 23 1 17 5 T 12 11 202535 CASAVA_Build 4 26067281 1D GAATAGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 9 A 13 12 202536 CASAVA_Build 4 26076201 1D AACTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 42 1 34 7 T 10 9 202537 CASAVA_Build 4 26089611 2I TTTTAAAAAA --/AG AGTAAAATCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AG 1 2 202538 CASAVA_Build 4 26090156 4D TTGAAATCTT TGAC/---- TGAGGTGGCT 3070 het 3070 ref 35 17 14 6 TGAC 1 0 202539 CASAVA_Build 4 26090853 1D CTATTCCTAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 A 9 8 202540 CASAVA_Build 4 26094211 1I AGTCTCTGAT -/G GAAGGACTAG 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 1 2 202541 CASAVA_Build 4 26117314 13D CAGTATCTAC TGTTGTTGTTAGT/------------- ATCTAGGGTT 3070 het 3070 ref 24 15 9 2 TGTTGTTGTTAGT 1 0 202542 CASAVA_Build 4 26120734 1I CCCTCAGTCC -/G GGGTAAAGCT 3070 het 3070 ref 50 21 19 10 G 3 4 202543 CASAVA_Build 4 26127228 1D TCACCCCTCC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 9 8 202544 CASAVA_Build 4 26130981 6D ATACACCTTA GCTTGC/------ TTGTGGACAG 3070 het 3070 ref 24 13 10 6 GCTTGC 1 0 202545 CASAVA_Build 4 26135830 1I GTGGTGGAAA -/T CTTTTTACTG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 0 1 202546 CASAVA_Build 4 26141487 1I TTGCAAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 19 15 13 T 12 13 202547 CASAVA_Build 4 26155387 1D AATGAGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 36 2 17 17 T 16 15 202548 CASAVA_Build 4 26170976 2I TTAACAAATT --/AA GTCTTCCAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 0 2 202549 CASAVA_Build 4 26178808 1D ACTCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 983 hom 33 4 21 8 T 15 14 202550 CASAVA_Build 4 26181475 2I CACAAGAAAT --/AA GAGTCATTGG 3070 hom 135 het 46 0 46 0 A 0 2 202551 CASAVA_Build 4 26181703 7I GTTTCTGGCG -------/ACAGCCC ACTTTCTGAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ACAGCCC 0 1 202552 CASAVA_Build 4 26198297 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 25 2 13 10 A 17 16 202553 CASAVA_Build 4 26211852 2D TGTGTATGTC TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TA 7 6 202554 CASAVA_Build 4 26215605 3D ATCCATCTCA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AAT 7 6 202555 CASAVA_Build 4 26232955 6D CCTAAAACTT AAAGTA/------ TAATAATAAT 2287 hom 27 het 10 0 10 1 AAAGTA 1 0 202556 CASAVA_Build 4 26235093 1D TAGTAATTGC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 71 het 30 0 24 6 T 9 8 202557 CASAVA_Build 4 26241516 2I ACTGGTCCTC --/GA GTTTTGTGCT 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 GA 0 1 202558 CASAVA_Build 4 26252352 1D CACGTCTCTG A/- GCTAAAGAAG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 1 0 202559 CASAVA_Build 4 26260688 1D CGGTGTTTGG T/- TTTTTGTCCT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 6 5 202560 CASAVA_Build 4 26288044 1I CTATAAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 23 2 13 8 T 13 14 202561 CASAVA_Build 4 26303844 1D AGACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 23 2 11 10 A 17 16 202562 CASAVA_Build 4 26315845 3D TTGTTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 76 het 34 0 26 8 TTG 5 4 202563 CASAVA_Build 4 26323858 1D TTAATAGGTC A/- AAAAAAATTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 7 202564 CASAVA_Build 4 26329032 6I TTTTTCTTTC ------/TAACTA TAAGTTTATA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TAACTA 0 1 202565 CASAVA_Build 4 26337546 2I AAATGAAGAG --/AA AATATTTAAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 2 4 202566 CASAVA_Build 4 26356953 2D TGCAGGTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2579 het 829 hom 24 6 9 9 T 18 16 202567 CASAVA_Build 4 26380269 1I TTTAAGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 871 hom 28 2 17 9 T 12 13 202568 CASAVA_Build 4 26380786 1D AGAAAAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 10 9 202569 CASAVA_Build 4 26381737 1I AGAAAAGGGG -/A AAGATCTCAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 3 202570 CASAVA_Build 4 26383165 1D TTTTCTGGGT G/- GGGGGGAGCC 3070 het 3070 hom 35 12 16 8 G 7 6 202571 CASAVA_Build 4 26392519 1D TCAAGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 9 10 7 T 13 12 202572 CASAVA_Build 4 26392657 1D ATCTGCTTAT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 7 202573 CASAVA_Build 4 26403395 1D TCTGAACAAT A/- ATCTGTTTTA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 2 1 202574 CASAVA_Build 4 26405983 3D GCTCCCTCAC CTT/--- CTCTTGGCTT 3070 het 3070 hom 50 25 21 4 CTT 1 0 202575 CASAVA_Build 4 26410665 1I CAGAGAATTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 8 9 202576 CASAVA_Build 4 26419211 1I CCAGCACTTT -/G GGAGGCCAAG 3070 het 1641 hom 17 4 11 2 G 2 3 202577 CASAVA_Build 4 26422216 5D AGCATGGAGA AGAGT/----- AGTCCAGAGA 3070 het 3070 ref 50 24 20 8 AGAGT 1 0 202578 CASAVA_Build 4 26423551 2D TCTATATATG TA/-- TATATATGTA 3070 het 2273 hom 22 8 9 5 TA 4 3 202579 CASAVA_Build 4 26426969 1I CTCACTTTAC -/T TTTTTTTATG 3070 hom 135 het 47 0 46 1 T 7 8 202580 CASAVA_Build 4 26441842 1I TTGCCTAAGG -/T TTTTCTCTAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 4 5 202581 CASAVA_Build 4 26450293 1I TTTTCCATCA -/C CCCCCCCGCC 2887 het 2887 ref 29 10 9 10 C 7 8 202582 CASAVA_Build 4 26466789 3D TCAAACATAT TCC/--- TCCAGTCTAA 3070 het 3070 ref 36 22 14 0 TCC 2 1 202583 CASAVA_Build 4 26466909 1D ATGAGATGAA C/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 C 1 0 202584 CASAVA_Build 4 26469003 1D AGACGTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 5 A 12 11 202585 CASAVA_Build 4 26521952 8D GTGTCTCAAA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 2867 het 2451 hom 15 5 8 4 AAAT 6 4 202586 CASAVA_Build 4 26571082 8D TGTGTATGTT TGTGTGTA/-------- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 44 24 17 5 TGTGTGTA 2 1 202587 CASAVA_Build 4 26574186 2D GCCTTGCAGA TC/-- TAATAAGGTA 3070 hom 102 het 35 0 35 2 TC 1 0 202588 CASAVA_Build 4 26604262 1D ATCAGAAAGA T/- TTTTTTCAGA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 T 7 6 202589 CASAVA_Build 4 26611535 1D CATTTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1200 hom 31 4 24 3 T 13 12 202590 CASAVA_Build 4 26623183 1I AGATTAATTT -/C TAGGTACCTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 0 1 202591 CASAVA_Build 4 26626510 1D ATTTAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1411 hom 41 5 23 13 T 15 14 202592 CASAVA_Build 4 26634191 1D TCCAGACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 247 hom 24 1 20 6 A 12 11 202593 CASAVA_Build 4 26640898 2D GGGGCCTAAC TT/-- AACTTGAAGG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 2 0 202594 CASAVA_Build 4 26643069 12I CATGGATCCT ------------/ACTCTTGATATC ACCCACGTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 ACTCTTGATATC 0 1 202595 CASAVA_Build 4 26643705 2D ATATCTAAGT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 TG 1 0 202596 CASAVA_Build 4 26644133 3D TTGGACACTG TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 12 9 202597 CASAVA_Build 4 26648505 2I AGGTGGAATG --/TT CTGTAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 2 202598 CASAVA_Build 4 26652720 1D GTCAGCAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 10 9 202599 CASAVA_Build 4 26654782 1D ACAATCCAAG A/- ATAATTCTGC 3070 hom 155 het 56 0 50 7 A 2 1 202600 CASAVA_Build 4 26658087 1I GTAACCAGGG -/T TAGAGAAAGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 202601 CASAVA_Build 4 26670921 1I TTCTCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 10 11 202602 CASAVA_Build 4 26671105 3D ATATTTTTAA TCT/--- TCTTGATTAC 3070 het 3070 hom 42 13 24 6 TCT 2 1 202603 CASAVA_Build 4 26690225 5D ATGATATAGC ATTCT/----- ATTTTATTTT 3070 het 3070 hom 30 8 20 2 ATTCT 1 0 202604 CASAVA_Build 4 26691360 3I TCTGGCCCTA ---/CTT CTCCTTGCTC 3070 het 3070 ref 51 29 16 6 CTT 0 1 202605 CASAVA_Build 4 26692859 1I TTATTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 9 7 T 11 12 202606 CASAVA_Build 4 26703638 1D GGTGCTTGCA G/- GAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 G 2 1 202607 CASAVA_Build 4 26704716 1D ACATGGGGGA C/- CCCCCAGCCA 2952 het 2952 ref 23 13 8 2 C 6 5 202608 CASAVA_Build 4 26710325 1D CAGTTCTTCT G/- TTGCCTTGGT 3070 het 3070 hom 50 21 21 9 G 1 0 202609 CASAVA_Build 4 26713392 4D TCTATCTATT TATC/---- TATCTAATTT 3070 het 3070 ref 42 17 19 7 TATC 2 1 202610 CASAVA_Build 4 26722749 1I TCTCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 2831 het 2831 ref 37 13 10 14 A 13 14 202611 CASAVA_Build 4 26723000 4I TTTACACCTG ----/GAAA ACAAGCCCTC 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 GAAA 0 1 202612 CASAVA_Build 4 26728540 2D TGTTTACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2407 hom 21 8 8 5 T 13 11 202613 CASAVA_Build 4 26761262 2I TAGGTGAGAA --/AG AGAGGAAAAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 AG 2 3 202614 CASAVA_Build 4 26793701 3I TTGCTTTCTG ---/GTT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 GTT 0 1 202615 CASAVA_Build 4 26794291 1I CACAAATATC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 202616 CASAVA_Build 4 26795755 1D ATTTTGATTG T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 6 202617 CASAVA_Build 4 26818111 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1678 hom 40 5 27 8 T 13 12 202618 CASAVA_Build 4 26822782 2I AGAACAATGC --/CA TTTATTGAGT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 CA 0 1 202619 CASAVA_Build 4 26825089 2I TTCTAAAAAC --/AT ATTAAATTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AT 1 2 202620 CASAVA_Build 4 26856955 3D GAATTCCTGA GCT/--- CAAGCAATCC 3070 hom 89 het 32 0 28 4 GCT 1 0 202621 CASAVA_Build 4 26864099 2I ATTTTATATC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 9 11 202622 CASAVA_Build 4 26870286 7I CAGTTTCTGA -------/ATTTACC ATTTCCAGAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 ATTTACC 0 1 202623 CASAVA_Build 4 26872779 1I GGGATTTAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 10 202624 CASAVA_Build 4 26878226 1D TTTTGCCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 12 11 202625 CASAVA_Build 4 26884574 1D TCAAGTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 43 1 30 12 T 12 11 202626 CASAVA_Build 4 26895374 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1561 hom 35 5 22 8 A 12 13 202627 CASAVA_Build 4 26902034 1D TGGGTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 41 1 33 7 T 11 10 202628 CASAVA_Build 4 26903739 1D AGGTGGAGAT A/- ATTACATCAT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 2 1 202629 CASAVA_Build 4 26916898 1D CCTTTTGCCA T/- GATTGTAAGT 3070 hom 21 het 46 1 36 9 T 1 0 202630 CASAVA_Build 4 26920898 1D TTCCAGGTAG T/- TCTCATTCTA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 2 1 202631 CASAVA_Build 4 26932644 1D GCTTATTTTA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 8 7 202632 CASAVA_Build 4 26935648 2I AAGCTGAGAG --/AA ATGTTAAGGC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 1 3 202633 CASAVA_Build 4 26943824 6I ACGGTACTCT ------/TAAGAA TATTACCTGC 3070 hom 74 het 32 0 24 8 TAAGAA 0 1 202634 CASAVA_Build 4 26946674 1D GCAAAACTAC A/- AAAAAAAAAT 1354 het 1354 ref 29 23 3 3 A 10 9 202635 CASAVA_Build 4 26961718 1D TTTAGAGAGG T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 7 6 202636 CASAVA_Build 4 26964775 2I CTCAGGGATC --/CA AGCTCTTTCA 3070 hom 28 het 15 0 9 6 CA 0 1 202637 CASAVA_Build 4 26967868 1I TTCTTACACA -/T TTGATGATTA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 2 3 202638 CASAVA_Build 4 26970301 1D GTGGTTGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 12 11 202639 CASAVA_Build 4 26971925 1I GGCAGGCTGC -/T TTCCTGTGCG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 2 3 202640 CASAVA_Build 4 26972016 1I GTCACTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 10 11 202641 CASAVA_Build 4 26980788 1D GTAGTGGGTT C/- CCCCTGAAGG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 C 5 4 202642 CASAVA_Build 4 26993365 3D TCAGGGTAAT AGC/--- TTCCAACTCC 3070 hom 87 het 32 0 30 4 AGC 1 0 202643 CASAVA_Build 4 27048793 1I TGGTTAAATA -/C CTGCGGACAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 1 2 202644 CASAVA_Build 4 27113012 1D TTAGTACAAG T/- TTTTTTTTTG 1202 het 1202 ref 49 38 3 8 T 10 9 202645 CASAVA_Build 4 27134289 1D AAATTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 1328 het 1328 ref 27 20 3 4 T 11 10 202646 CASAVA_Build 4 27194561 4I TTACATATAA ----/ACAT ACATACATAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ACAT 3 4 202647 CASAVA_Build 4 27195358 1I CTTCATGATT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 7 8 202648 CASAVA_Build 4 27202380 2I AATAAATAAC --/TG TGAAAGGAAA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 TG 1 2 202649 CASAVA_Build 4 27222506 1I TTTAGCCGTA -/T TTTTTGCTCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 5 6 202650 CASAVA_Build 4 27231517 1D GGGGTGGCTT G/- GGCAGAGCAC 2171 het 2171 ref 39 23 8 10 G 3 2 202651 CASAVA_Build 4 27233730 1I TGTATAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 9 10 202652 CASAVA_Build 4 27237643 1I TAACTGATCT -/A AATGAATGCA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 2 3 202653 CASAVA_Build 4 27239600 9I GGGGTGCCTT ---------/CTGCCATGA CTGCAAGTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 CTGCCATGA 0 1 202654 CASAVA_Build 4 27239962 6I AAAATTATAC ------/AAATAT AAAGTCCATA 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 AAATAT 0 1 202655 CASAVA_Build 4 27244705 2D CACATCAGAG TA/-- TATATATATA 2267 het 7 hom 17 0 7 10 TA 7 6 202656 CASAVA_Build 4 27244718 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 1847 het 324 hom 15 1 6 8 A 1 0 202657 CASAVA_Build 4 27246029 1D TTTCATTATA T/- TTTTTATTCA 3070 hom 69 het 32 0 29 3 T 6 5 202658 CASAVA_Build 4 27246210 4D CTTCTTCCTC CTCT/---- TTTTTTTTTT 150 het 150 ref 24 16 1 7 CT 2 0 202659 CASAVA_Build 4 27246691 4I ATAAGTGTTA ----/GTTT ATGTTGACCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 GTTT 0 1 202660 CASAVA_Build 4 27250266 6I AATGGTTTAT ------/CAATAA CAATAACAAT 2914 het 2914 ref 33 18 7 8 CAATAA 1 2 202661 CASAVA_Build 4 27250684 1D TTCAAACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3043 hom 25 10 10 5 A 14 13 202662 CASAVA_Build 4 27254697 3I GTGTCTTTTT ---/ATA ATGATACTGA 3070 het 2082 hom 19 5 13 1 ATA 0 1 202663 CASAVA_Build 4 27257239 4D AAATTATGTC TGTT/---- TGTGGCTTCT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 TGTT 1 0 202664 CASAVA_Build 4 27260696 5D TCCAAACTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2063 het 139 hom 24 3 7 14 T 21 16 202665 CASAVA_Build 4 27261697 1I ATTTTAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 A 9 10 202666 CASAVA_Build 4 27264219 3I AGAATGTAAG ---/ATT ATTATACTTC 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 ATT 1 2 202667 CASAVA_Build 4 27265485 1D AATCACAAAT A/- AAAAAACTAG 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 A 7 6 202668 CASAVA_Build 4 27269459 4I AATATTTTTC ----/TTTG TTTGTTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTTG 1 2 202669 CASAVA_Build 4 27274087 1I GAATTACTTA -/G GGGGGGGTTA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 G 7 8 202670 CASAVA_Build 4 27275719 1I GTCATTTACA -/T TTTTTTAGGC 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 T 6 7 202671 CASAVA_Build 4 27278344 1D ATTATTGTAT A/- ACATAGAGTA 3070 het 3070 hom 35 12 22 2 A 2 1 202672 CASAVA_Build 4 27285871 12D ATTTGTAATC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 20 0 17 5 T 23 11 202673 CASAVA_Build 4 27288546 2I TTGATATATA --/TT TTGTTTGTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 2 4 202674 CASAVA_Build 4 27294757 1D CCCACATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 35 1 29 5 A 11 10 202675 CASAVA_Build 4 27296192 1I TTTTTGACAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 47 0 38 9 A 8 9 202676 CASAVA_Build 4 27301050 1D GTGATTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 295 hom 33 2 29 3 T 12 11 202677 CASAVA_Build 4 27301718 3D ATGAAGTTGT TAG/--- TAGTCTGCTT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TAG 2 1 202678 CASAVA_Build 4 27309879 1I CACTCATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1300 hom 34 4 25 5 A 14 15 202679 CASAVA_Build 4 27330931 4D AACTGGGTGA GGCG/---- GGGAGAATGA 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 GGCG 1 0 202680 CASAVA_Build 4 27350920 1D TAACATACTA T/- TTTTTTTAGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 8 7 202681 CASAVA_Build 4 27352620 3D31M1I TTTGCTTTTA ATTATTATTATTTTTTAATAGCAAGTTGGCAAGA-/---ATTATTATTTTTTAATAGCAAGTTGGCAAGAT TTTTTTAAAA 3070 hom 108 het 29 0 37 6 N/A 0 0 202682 CASAVA_Build 4 27352850 1I GAAGGATTAA -/G ACAAATGGTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 0 1 202683 CASAVA_Build 4 27354316 1D CTTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 31 0 30 2 T 10 9 202684 CASAVA_Build 4 27354677 4D TATGTATGTA TGTT/---- TGTATATATG 3070 hom 132 het 47 0 45 3 TGTT 1 0 202685 CASAVA_Build 4 27359707 4I TTTATCTATT ----/CATA CAGTCATATT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 CATA 0 1 202686 CASAVA_Build 4 27361243 1I TGCAATTGTG -/A AAAAATGAAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 5 6 202687 CASAVA_Build 4 27362946 2I GCTATACAAC --/AT AGTACCAATG 3070 hom 123 het 43 0 42 1 AT 0 1 202688 CASAVA_Build 4 27367546 1I TTGGCTATCC -/A AAAGAAAAGC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 3 4 202689 CASAVA_Build 4 27385674 2D ATACACATAC AT/-- ATATATATAT 1661 het 28 hom 14 1 10 3 AT 7 6 202690 CASAVA_Build 4 27394487 7D GTATGTCCCG TGTGTAT/------- TGTGTATTGC 3070 hom 75 het 28 0 26 5 TGTGTAT 2 1 202691 CASAVA_Build 4 27394840 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 8 7 202692 CASAVA_Build 4 27397009 4D GTTCTCTCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1797 het 67 hom 31 2 9 20 T 22 18 202693 CASAVA_Build 4 27400034 1D TTTCTCTTCT A/- TATATTTTCC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 0 202694 CASAVA_Build 4 27407317 1D ATGTCCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 265 hom 29 1 25 3 T 13 12 202695 CASAVA_Build 4 27412659 4I TAATTGTTTC ----/TGAG TGAGTGGATC 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 TGAG 1 2 202696 CASAVA_Build 4 27415480 1D AAGTAGAGCT G/- GGGTTTCACC 1370 het 435 hom 9 1 3 5 G 4 3 202697 CASAVA_Build 4 27434371 1D TGAATGACCA G/- TTGTACAAGC 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 G 1 0 202698 CASAVA_Build 4 27441687 1D AATGTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 10 9 202699 CASAVA_Build 4 27461506 1I CACTTACATT -/A AAAAAAACAC 3070 hom 106 het 40 0 36 4 A 7 8 202700 CASAVA_Build 4 27495635 1D CTCAGTTTCA C/- CCTGTCATCC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 3 2 202701 CASAVA_Build 4 27503371 9I ATTGCATAAA ---------/ATGCATTTT ATTTACTGTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATGCATTTT 0 1 202702 CASAVA_Build 4 27509781 1D63M1D GTTATGGTGG AAAAAAAAAAGTTTTAAAGGTACACATTTTACCTCCACTTCTTGCCTTTTAGGATGGTTATGATA/-AAAAAAAAAGTTTTAAAGGTACACATTTTACCTCCACTTCTTGCCTTTTAGGATGGTTATGAT- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 12 24 28 N/A 0 0 202703 CASAVA_Build 4 27511069 1I CCTTTATTAA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 7 8 202704 CASAVA_Build 4 27519402 1D AATGTCTAGT C/- CCCCGAGAGT 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 C 5 4 202705 CASAVA_Build 4 27521189 1I CAGGTTCAGA -/T TTTTACTCTG 3070 het 3070 hom 48 19 26 3 T 4 5 202706 CASAVA_Build 4 27530064 1I TGACTACCTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 8 9 202707 CASAVA_Build 4 27534065 1I CAACCATGAA -/C AAATAATTAG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 C 0 1 202708 CASAVA_Build 4 27542715 4D GTTTTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 31 0 24 12 TTTG 4 3 202709 CASAVA_Build 4 27556519 1D ATAACGTCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 41 1 33 8 A 10 9 202710 CASAVA_Build 4 27568224 2D ACAGCTGTGA AC/-- ACACACACAC 1292 het 1292 ref 47 34 4 11 AC 10 9 202711 CASAVA_Build 4 27569341 1I AATTTGTATC -/A AAAAATCTCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 6 202712 CASAVA_Build 4 27579263 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 9 8 202713 CASAVA_Build 4 27580593 1I GCAAATTTGA -/C ATTAAATTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 202714 CASAVA_Build 4 27582016 2I TACACATAAA --/TC TCTTTATATA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TC 1 2 202715 CASAVA_Build 4 27592422 1D TGATACAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 135 het 50 0 45 5 A 10 9 202716 CASAVA_Build 4 27603458 2D TGAGATGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 46 1 34 11 T 15 13 202717 CASAVA_Build 4 27619747 1D ATTTTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 24 1 19 4 A 11 10 202718 CASAVA_Build 4 27630805 2I GTCTAGTCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 16 8 T 11 13 202719 CASAVA_Build 4 27642059 2I CATTTTTTTT --/GG GGGGGGGGAA 3070 hom 57 het 27 0 18 9 G 8 10 202720 CASAVA_Build 4 27643420 4D ATAATTAGAT AAGC/---- AAGAGCAAAT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 AAGC 1 0 202721 CASAVA_Build 4 27647752 1D TGTGATGGGA G/- GTGCTACCAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 2 1 202722 CASAVA_Build 4 27648889 1D TATGATTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 98 het 42 0 32 11 T 9 8 202723 CASAVA_Build 4 27656637 1D TGCCCAACTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 9 202724 CASAVA_Build 4 27658823 1D TATGAAGGTG T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 7 6 202725 CASAVA_Build 4 27658926 3D TCCTTCTGAG TTC/--- TTCTTTGATG 3070 hom 108 het 43 0 35 10 TTC 2 1 202726 CASAVA_Build 4 27672324 1D TAAATATATC T/- TTTTCATTCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 5 4 202727 CASAVA_Build 4 27698325 2D TATTCTACAC AT/-- GTCTTCATAA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 AT 1 0 202728 CASAVA_Build 4 27699951 1I ATGGCTGTTT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 7 8 202729 CASAVA_Build 4 27700576 2D ACACACACAC AT/-- ACAAATGAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 1 0 202730 CASAVA_Build 4 27703771 1I GTTTTTGTTC -/T TTTTTTTAGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 202731 CASAVA_Build 4 27706896 1I ACTTGTTTGG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 7 8 202732 CASAVA_Build 4 27721800 5I TATACACATT -----/ATTAA ATTAAATATT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 ATTAA 1 2 202733 CASAVA_Build 4 27725327 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1986 het 1986 ref 20 7 7 6 A 15 14 202734 CASAVA_Build 4 27725475 1I AAAAACAAAG -/A AAAAAAAAAA 2240 het 1454 hom 17 5 6 6 A 10 11 202735 CASAVA_Build 4 27728561 4I CGAAACAAAC ----/CTAT CTATCTCTCT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 CTAT 1 2 202736 CASAVA_Build 4 27730502 3D TCCTTTCCTT CTC/--- CTCAGTCTCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 8 CTC 2 1 202737 CASAVA_Build 4 27731235 1D GTTAAAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 752 hom 50 10 21 20 T 11 10 202738 CASAVA_Build 4 27731933 1I TACCATCAAA -/G AAAATAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 0 1 202739 CASAVA_Build 4 27733916 1I TGACTTTATC -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 7 8 202740 CASAVA_Build 4 27743783 1I CTGTCTGCTT -/C CCTACTTTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 2 3 202741 CASAVA_Build 4 27744682 1D CTTATAACTT A/- ACAATATGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 1 202742 CASAVA_Build 4 27744816 2I2M7D CTGTTGACAC --AGTAAACGC/TTAG------- TTAGTATTTG 3070 het 3070 hom 32 12 17 8 N/A 0 0 202743 CASAVA_Build 4 27755752 1I AATACAGAAA -/T TACTGGAGAC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 1 2 202744 CASAVA_Build 4 27757589 4D GAGCAAAAGA AAGT/---- AAGGTATCAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 AAGT 1 0 202745 CASAVA_Build 4 27758894 5I AACATTTTTA -----/AACTT AACTTAGGAG 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 AACTT 1 2 202746 CASAVA_Build 4 27761476 1I TTTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 11 12 202747 CASAVA_Build 4 27764390 2I GTAGGATGAC --/TG TAACTCACCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TG 0 1 202748 CASAVA_Build 4 27765042 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTATGAA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 5 6 202749 CASAVA_Build 4 27768887 5D GTCTATCATC TTAAT/----- TTAATGCTCA 3070 het 3070 ref 27 14 13 1 TTAAT 2 1 202750 CASAVA_Build 4 27770651 1I TAATAAAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 0 1 202751 CASAVA_Build 4 27778130 1D CTCCAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2516 hom 32 11 10 11 A 15 14 202752 CASAVA_Build 4 27780543 1I AATTTAATTG -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 T 6 7 202753 CASAVA_Build 4 27781991 1I TTTTTTTTTT -/G TAAATGGAGA 3070 het 121 hom 31 3 16 12 G 0 1 202754 CASAVA_Build 4 27791016 3D GGTAAAATGT GAG/--- GAGAACAAAA 2154 het 2154 ref 25 17 6 3 GAG 2 1 202755 CASAVA_Build 4 27796866 2D CAAAATTCAA CT/-- CCATTTTCCC 3070 het 3067 hom 22 7 13 2 CT 1 0 202756 CASAVA_Build 4 27798703 4D GTTTGACTCT CTTA/---- CTTTCTGCTT 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 CTTA 1 0 202757 CASAVA_Build 4 27799150 1I TCATTGCAAA -/T TTAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 2 3 202758 CASAVA_Build 4 27832705 1I AACAGGATTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 49 14 28 7 A 9 10 202759 CASAVA_Build 4 27842915 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2162 het 1785 hom 22 10 6 6 A 19 18 202760 CASAVA_Build 4 27844109 1D CCTCAAGTTG C/- CAGCAATAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 C 2 1 202761 CASAVA_Build 4 27847179 1D TTGTTAATGG A/- AAAAAAAAAA 1594 het 1594 ref 42 30 4 9 A 12 11 202762 CASAVA_Build 4 27857156 1D AGGACAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 A 11 10 202763 CASAVA_Build 4 27857288 4D CAATTCAGTG AACA/---- AACAGTGAAG 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 AACA 2 1 202764 CASAVA_Build 4 27859759 1I AATCAAAAAT -/A TTTTTTTCAA 3070 hom 54 het 24 0 18 6 A 0 1 202765 CASAVA_Build 4 27860661 3D GATTATTTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 721 hom 26 4 12 10 A 13 10 202766 CASAVA_Build 4 27862337 1D TAGTAGAGAT G/- GGGTTTCACC 3070 het 367 hom 16 1 12 3 G 4 3 202767 CASAVA_Build 4 27862638 1I ACCGAAACTA -/C AACACCAGAG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 0 1 202768 CASAVA_Build 4 27865753 1I CTGATTGAGG -/T TATCTGAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 1 2 202769 CASAVA_Build 4 27866605 1I AATTTACGAA -/G CAAATCGTAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 G 0 1 202770 CASAVA_Build 4 27869513 1I CTGGCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2247 hom 26 7 14 5 T 11 12 202771 CASAVA_Build 4 27871782 1D AATTAACACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 11 10 202772 CASAVA_Build 4 27874074 1D AAAATAAACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 21 12 13 T 10 9 202773 CASAVA_Build 4 27878387 1D AATTTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 37 1 16 20 T 13 12 202774 CASAVA_Build 4 27879447 1D TAGACAATTA C/- TATCCCACAG 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 C 1 0 202775 CASAVA_Build 4 27879868 1I AAGGGAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 8 9 202776 CASAVA_Build 4 27889045 1I TGCACACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 57 24 25 8 A 11 12 202777 CASAVA_Build 4 27894517 1D ACGATTACCA C/- AGAAATACAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 C 1 0 202778 CASAVA_Build 4 27896867 3D CCTCCAAAGA AAG/--- AAGAAGTAAA 2350 het 2350 ref 30 24 5 1 AAG 3 2 202779 CASAVA_Build 4 27897629 5I AGTCTCATGA -----/GGTCC GGTCCGATGG 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 GGTCC 1 2 202780 CASAVA_Build 4 27898185 1D CTATTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 930 hom 32 2 25 5 A 11 10 202781 CASAVA_Build 4 27905890 2D GTGGTCACAG CA/-- CACACACACA 3070 hom 78 het 34 0 25 11 CA 10 9 202782 CASAVA_Build 4 27917694 1D AATCCCCTGC A/- CTCTGACTTC 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 A 1 0 202783 CASAVA_Build 4 27922150 1I TGAATCTTTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 7 8 202784 CASAVA_Build 4 27925550 1I ATTGAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 9 10 202785 CASAVA_Build 4 27931757 2D TTTTAGAAAC AG/-- AATCTAAATA 3070 het 3070 ref 34 17 15 4 AG 1 0 202786 CASAVA_Build 4 27934332 5I AAGAATAATC -----/ATTGT ATTTTTATTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATTGT 0 1 202787 CASAVA_Build 4 27944517 4D CTAGGCACTT AAAG/---- TTTTTCTGAC 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 AAAG 1 0 202788 CASAVA_Build 4 27947576 4D ATGATAATAA TACT/---- TACAACAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 TACT 1 0 202789 CASAVA_Build 4 27947967 1D TCTTCATGTA T/- TTTTTGTATA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 6 5 202790 CASAVA_Build 4 27949184 1D GAAATTTTAG T/- TAACTCCCTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 2 1 202791 CASAVA_Build 4 27964434 2I ATTGCTTTAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AC 7 8 202792 CASAVA_Build 4 27981877 1I GCTTTTGGGC -/T TTCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 2 3 202793 CASAVA_Build 4 27989212 2I CAGATTTTTC --/TA TGTTAGATTT 3070 het 3070 hom 54 19 32 3 TA 0 1 202794 CASAVA_Build 4 27989780 4I AAAAAAAAGA ----/AAAC AAACAAATTC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AAAC 1 2 202795 CASAVA_Build 4 27990588 12I CAAACACAGT ------------/TTTTTTCATTTA AAATATTTAT 3070 het 3070 hom 27 12 15 1 TTTTTTCATTTA 0 1 202796 CASAVA_Build 4 27992948 1I GTAACGGGCC -/T TTTTTTTTTT 2855 het 223 hom 17 2 11 4 T 13 14 202797 CASAVA_Build 4 27995946 6I GTAAATTGAA ------/TTTATC TTTATAGAGA 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 TTTATC 0 1 202798 CASAVA_Build 4 28002059 1I GTGTATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 10 11 202799 CASAVA_Build 4 28002930 2I TTCAGTGAGA --/CT CTATGGAAGG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 CT 1 2 202800 CASAVA_Build 4 28003184 3D TTGATTGTGT GTG/--- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 45 23 21 1 GTG 1 0 202801 CASAVA_Build 4 28003542 1I AAGTATTACT -/A AGAGTCATAC 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 A 1 2 202802 CASAVA_Build 4 28004256 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 13 1 12 0 A 11 10 202803 CASAVA_Build 4 28004557 1D ATCTTCATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 9 8 202804 CASAVA_Build 4 28006737 1D AATCAAGGCC T/- TTAACACATA 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 T 3 2 202805 CASAVA_Build 4 28008237 1D ATACATGAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 10 9 202806 CASAVA_Build 4 28008461 1D CATATCTGCC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 9 8 202807 CASAVA_Build 4 28010498 2I TGCTTTTCTC --/CA CACTTCCTGC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 CA 1 2 202808 CASAVA_Build 4 28024267 5I TGTATACAAA -----/TAAAT TATCATGTAC 2939 het 2939 ref 19 10 6 3 TAAAT 0 1 202809 CASAVA_Build 4 28027286 1D GGCCCTGGGA C/- CCCCTCCCAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 5 4 202810 CASAVA_Build 4 28029665 1D TGTTTTACAT A/- AAAATAGCCC 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 A 5 4 202811 CASAVA_Build 4 28032102 1D AGTAATTGAT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 23 9 10 4 A 8 7 202812 CASAVA_Build 4 28038849 1I CAATGTGTCT -/G GCTTTTTGCC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 G 1 2 202813 CASAVA_Build 4 28051927 2I CTCAGGAAAC --/AT ATAATCATGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 1 2 202814 CASAVA_Build 4 28055051 2D GTGTTCACAC AT/-- ATTGTCTTAG 3070 het 3070 ref 52 28 22 2 AT 2 1 202815 CASAVA_Build 4 28062788 2D TTGTTAACAC TA/-- TTTTAATTAT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 TA 1 0 202816 CASAVA_Build 4 28063049 4I TGAAGAAAAA ----/AATT AATTTTGTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AATT 1 2 202817 CASAVA_Build 4 28071342 1I GATATTTTTT -/A ATTTGATATT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 1 2 202818 CASAVA_Build 4 28075734 3I TGATAATATT ---/TGA TGATATTTAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TGA 1 2 202819 CASAVA_Build 4 28076442 1I ACAGAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 42 0 35 7 A 10 11 202820 CASAVA_Build 4 28081581 3D ATATTAAAAT AAG/--- CACTAAAATA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AAG 1 0 202821 CASAVA_Build 4 28084088 13I AGCCCTCATG -------------/GATAACCTCTACA AGGGTTCTGC 3070 hom 138 het 50 0 40 10 GATAACCTCTACA 0 1 202822 CASAVA_Build 4 28085250 1I AAGGTATGAG -/A AAAAAATAGG 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 A 6 7 202823 CASAVA_Build 4 28086128 1D33M5D TCACTCTCTG AAAAAAAAAAATAATAATAGTAAAATCAGAAAAATAAAG/-AAAAAAAAAATAATAATAATAAAATCAGAAAAA----- TAACACGATT 3070 hom 93 het 24 0 30 7 N/A 0 0 202824 CASAVA_Build 4 28090989 1I GTAAAGCAGT -/G GGGAAGAGAC 3070 hom 105 het 45 0 36 9 G 3 4 202825 CASAVA_Build 4 28095924 8D GGCTACAAAC TATCAGCT/-------- TATCAGCTTA 3070 hom 114 het 42 0 38 8 TATCAGCT 2 1 202826 CASAVA_Build 4 28105294 1I CAAACAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 572 hom 20 3 10 7 A 13 14 202827 CASAVA_Build 4 28119388 3D ACAGTATATA TTC/--- TTATTGTGAT 3070 hom 111 het 39 0 37 4 TTC 1 0 202828 CASAVA_Build 4 28131686 20D AAATTTATCT TTCCTTCCTTCCTTCCTTCC/-------------------- TTCCTTCCTT 3070 hom 54 het 22 0 18 5 TTCC 10 5 202829 CASAVA_Build 4 28138335 4D TGTGTTTTTG TTAA/---- TTAATTTATT 3070 hom 132 het 46 0 45 2 TTAA 2 1 202830 CASAVA_Build 4 28139813 1I CTACTGTATC -/T TTTTTTAATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 202831 CASAVA_Build 4 28142058 1D CATGTCTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 122 hom 40 1 27 12 T 13 12 202832 CASAVA_Build 4 28147229 1D ACAACATATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 45 0 32 13 T 10 9 202833 CASAVA_Build 4 28154203 1D TTATTCTCTC T/- TTGAAACTTG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 3 2 202834 CASAVA_Build 4 28156397 1I AAAAAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 27 0 22 5 A 12 13 202835 CASAVA_Build 4 28156769 17D AACCAGTGAC CTGGGATCACTGGTGTG/----------------- CTGGGGCCAG 3070 hom 96 het 29 0 32 3 CTGGGATCACTGGTGTG 1 0 202836 CASAVA_Build 4 28158291 4D TTAGCTAGAC AGAA/---- AGAAATTAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 4 AGAA 2 1 202837 CASAVA_Build 4 28163384 1D TCTAAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 38 2 25 11 T 12 11 202838 CASAVA_Build 4 28165580 3D AGAAAATAAA TGT/--- TGTTGTAAGC 3070 hom 96 het 36 0 31 8 TGT 3 2 202839 CASAVA_Build 4 28166450 3D ATTAATGAAT AAG/--- AATAATAATG 3070 hom 93 het 33 0 32 3 AAG 1 0 202840 CASAVA_Build 4 28170295 4D CTGCTCTGCT TTTA/---- TTTATTTTCT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TTTA 2 1 202841 CASAVA_Build 4 28175134 2I AGATATATTC --/TA TGTCATTATG 3070 hom 138 het 51 0 46 5 TA 0 1 202842 CASAVA_Build 4 28182379 3I AAGAGAAAAA ---/ATG ATGATGAATT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ATG 2 3 202843 CASAVA_Build 4 28201642 1D GTACTATGCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 9 8 202844 CASAVA_Build 4 28218578 2D TTCAAATGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 41 0 36 6 T 14 12 202845 CASAVA_Build 4 28223158 1I CAATAGCATT -/A AAAAATAATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 5 6 202846 CASAVA_Build 4 28225684 1D ATCTCATGCC T/- TTTTTTATGA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 7 6 202847 CASAVA_Build 4 28233092 4D ATGCTCAGAG TGAA/---- TGAACAGTGT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 TGAA 2 1 202848 CASAVA_Build 4 28238026 1I GAAGAGTCTT -/A AAAAAAGCTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 6 7 202849 CASAVA_Build 4 28238436 1D TTGAGTTTTG T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 6 T 7 6 202850 CASAVA_Build 4 28244974 1D CTCTCCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 44 2 30 12 T 12 11 202851 CASAVA_Build 4 28245498 1D GCTCGATTTT A/- AAACATTAAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 4 3 202852 CASAVA_Build 4 28250834 1D AAATCTGTGA T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 8 7 202853 CASAVA_Build 4 28274550 1I TAGAAGAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 9 10 202854 CASAVA_Build 4 28284991 1I ATTTAAAAAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 7 8 202855 CASAVA_Build 4 28287912 1I TCTTGGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2085 hom 49 10 28 11 A 15 16 202856 CASAVA_Build 4 28292555 2I AATTTATCAC --/AT GTTCACACTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 0 1 202857 CASAVA_Build 4 28294060 4I AATAAAGCTT ----/AATA AAATAGGATT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AATA 0 1 202858 CASAVA_Build 4 28300656 3I TATTTCTCCT ---/ATG ATAAGAATTT 3070 hom 187 het 69 0 63 6 ATG 0 1 202859 CASAVA_Build 4 28301256 2D TATCCTTCTC TT/-- ATTAATTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 2 0 202860 CASAVA_Build 4 28307840 1D TCTTTAATTC A/- AAAACCCCGG 3070 hom 100 het 39 0 29 11 A 5 4 202861 CASAVA_Build 4 28308895 1D AGGTACCACA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 T 9 8 202862 CASAVA_Build 4 28314804 3I GAGAGACAAC ---/AAT GAGACAAATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAT 0 1 202863 CASAVA_Build 4 28319150 1I TAAAGAATGG -/C TAGCCCATGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 202864 CASAVA_Build 4 28320835 1D GAGAGAGAGA G/- AAAAAAAAAA 1042 het 501 hom 30 8 7 15 G 1 0 202865 CASAVA_Build 4 28324360 21I TATTTAATCA ---------------------/TATCTTTTGAATGAAGCAATC TATCTATTGA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 TATCTTTTGAATGAAGCAATC 0 1 202866 CASAVA_Build 4 28333005 3D AGAATCTACA GAC/--- GACGCTTTAT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 GAC 2 1 202867 CASAVA_Build 4 28334824 1D AAACTAGGTG T/- TTTTTTTTTT 2221 het 2221 ref 39 20 6 13 T 17 16 202868 CASAVA_Build 4 28351369 1D ATTTAAAGGA G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 73 het 30 0 25 5 G 6 5 202869 CASAVA_Build 4 28351491 1D AGTGTTTTCA C/- TAGAAAAGCA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 C 1 0 202870 CASAVA_Build 4 28354261 1D CCAGTGACTC G/- GGAGGCTGAG 3070 hom 30 het 12 0 10 2 G 3 2 202871 CASAVA_Build 4 28354778 14D GCAAATCAGT ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AC 13 6 202872 CASAVA_Build 4 28355616 1D GTGTGATGTT C/- CCCCTCCCTG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 5 4 202873 CASAVA_Build 4 28358803 1D CTCGCCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 641 hom 26 3 13 10 T 15 14 202874 CASAVA_Build 4 28367431 1D TCTGTGTCTA T/- TTTTTTTTTT 1505 het 1505 ref 54 36 5 14 T 11 10 202875 CASAVA_Build 4 28383952 2D AAATGAGTAC AT/-- GTCATCAATG 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 AT 1 0 202876 CASAVA_Build 4 28386139 4D ACGCCAAGAC CCTA/---- CCTAAGCAGT 3070 hom 117 het 42 0 40 4 CCTA 2 1 202877 CASAVA_Build 4 28395017 4D ATCCTATGTA ACTT/---- ACTATTTACC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ACTT 1 0 202878 CASAVA_Build 4 28400807 4D GGCAAAGTGT TAAC/---- TAACAGAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 TAAC 2 1 202879 CASAVA_Build 4 28419784 1D CTGGTGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 34 2 13 20 T 17 16 202880 CASAVA_Build 4 28421123 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAGAT 2841 het 2841 ref 23 10 7 6 A 7 8 202881 CASAVA_Build 4 28424821 1D AATCCTAGAT G/- TGAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 1 0 202882 CASAVA_Build 4 28428758 1D TAGTTGCTAT A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 88 het 36 0 29 7 A 7 6 202883 CASAVA_Build 4 28431576 1I TAAATCAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 29 11 T 11 12 202884 CASAVA_Build 4 28432046 2I4M1D TTCTATTATT --TGAAT/TATGAA- GTGCCAAACT 3070 hom 135 het 48 0 46 4 N/A 0 0 202885 CASAVA_Build 4 28437048 4I AAATGAAAAC ----/TATT TATGTTTTAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TATT 0 1 202886 CASAVA_Build 4 28437371 1D ATGGGGTCAT G/- GTATACAACG 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 G 2 1 202887 CASAVA_Build 4 28437593 2D AATACAATAT AA/-- GTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 2 0 202888 CASAVA_Build 4 28437677 6D AGGAAAAAAT AAAAGA/------ AAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 12 3 AAAAGA 2 1 202889 CASAVA_Build 4 28440219 1I GAAAAAAGAA -/T TTTTGTCTTT 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 T 4 5 202890 CASAVA_Build 4 28441149 1D AAGTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1770 hom 28 6 16 6 A 13 12 202891 CASAVA_Build 4 28443184 1I ATGAAAGAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 8 9 202892 CASAVA_Build 4 28446263 1I AGCTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 10 11 202893 CASAVA_Build 4 28446555 1D GTGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1302 hom 33 6 15 12 T 17 16 202894 CASAVA_Build 4 28447472 3D CCATCTCAAA TCT/--- TCTTACACTC 3070 het 3070 ref 42 23 17 5 TCT 2 1 202895 CASAVA_Build 4 28448797 1I TTTTAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 A 10 11 202896 CASAVA_Build 4 28455742 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 1451 het 1451 ref 13 5 5 3 A 9 10 202897 CASAVA_Build 4 28462248 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 8 9 202898 CASAVA_Build 4 28472461 1D CTTTGTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 12 11 202899 CASAVA_Build 4 28477644 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2178 het 2178 ref 43 25 6 13 T 13 12 202900 CASAVA_Build 4 28499254 4I TACTGAGTCA ----/TATT TGAGCATAGT 3070 hom 144 het 53 0 49 4 TATT 0 1 202901 CASAVA_Build 4 28509719 1I AATGCTTATG -/C CACTGTTGGT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 C 1 2 202902 CASAVA_Build 4 28526569 1D AGTTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 8 11 T 12 11 202903 CASAVA_Build 4 28527161 4I TGGATTTCTA ----/CTAT CTAAAAGTGT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 CTAT 0 1 202904 CASAVA_Build 4 28527354 1I CAACTTGGTC -/T TTAACTAACT 3070 hom 96 het 42 0 32 10 T 2 3 202905 CASAVA_Build 4 28529066 8I TTTGTCAAAC --------/AGAACAAT AGAACAATAT 3070 het 3055 hom 25 8 15 2 AGAACAAT 1 2 202906 CASAVA_Build 4 28529363 1D AGGTGTATTC A/- AAAAAATATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 7 6 202907 CASAVA_Build 4 28530236 2I AATGCTACAT --/TC TCTCTGTTTC 3070 hom 76 het 29 0 26 3 TC 2 3 202908 CASAVA_Build 4 28530769 3D AATATTCATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 615 hom 37 10 14 14 T 14 11 202909 CASAVA_Build 4 28531987 1D CCCATATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 A 12 11 202910 CASAVA_Build 4 28532697 1D AAGAAAAAAA G/- TAATGAAAGA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 G 1 0 202911 CASAVA_Build 4 28533792 1I CTGGAAATAA -/C CAAGACAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 C 1 2 202912 CASAVA_Build 4 28534514 1D TTATGCTTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 11 10 9 T 9 8 202913 CASAVA_Build 4 28535499 1D AATACTTGAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 7 6 202914 CASAVA_Build 4 28556320 1D TAACTCTATT A/- AAAAGCAGGC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 5 4 202915 CASAVA_Build 4 28606097 2D GGCTAGTTAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 11 9 202916 CASAVA_Build 4 28617330 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAGGATG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 5 6 202917 CASAVA_Build 4 28620343 1I ATCCTCTTCA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 6 7 202918 CASAVA_Build 4 28623659 1I CAATTAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2471 hom 32 11 9 12 A 12 13 202919 CASAVA_Build 4 28630452 1D ACTAAACATG A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 7 6 202920 CASAVA_Build 4 28641664 1I GTATTAAACC -/T TTTAATTATG 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 T 3 4 202921 CASAVA_Build 4 28644850 1I TTCTGGCCGA -/T TTTTTTGGTC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 6 7 202922 CASAVA_Build 4 28645195 1I GTGCTTGTCC -/A AGATGGCGAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 1 2 202923 CASAVA_Build 4 28647722 12D TATATATATA TATATATATATG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TATATATATATG 1 0 202924 CASAVA_Build 4 28647871 1I TATTATTTGT -/A AAAAAAGATG 3070 het 1459 hom 21 3 16 2 A 6 7 202925 CASAVA_Build 4 28652840 1D TATTCTTAGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 27 13 9 6 T 9 8 202926 CASAVA_Build 4 28661377 1D TAACATATAC T/- TTTTTATCAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 6 T 6 5 202927 CASAVA_Build 4 28677515 1I TTTTAGTAAC -/T ATTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 T 0 1 202928 CASAVA_Build 4 28704616 1D TAAGCAAATG A/- AAATGACCCT 3070 het 3070 ref 54 25 24 6 A 4 3 202929 CASAVA_Build 4 28708660 1D AACCTATTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 T 10 9 202930 CASAVA_Build 4 28724981 4D TGTTTTTAAC TCCT/---- TCCTGGTTGC 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 TCCT 2 1 202931 CASAVA_Build 4 28727185 1I CCACTGGAAA -/G GGGGGAGTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 G 5 6 202932 CASAVA_Build 4 28733325 1D GCTCAAAAAG A/- GAACAACTGT 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 A 1 0 202933 CASAVA_Build 4 28736238 3I CTTAATGTTG ---/TAA TGGCAAAATT 3070 het 3070 hom 63 30 28 5 TAA 0 1 202934 CASAVA_Build 4 28736850 1I TGTCTTGAAA -/T ATATATTCTA 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 T 0 1 202935 CASAVA_Build 4 28740334 1D CAGCATTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 9 20 7 T 10 9 202936 CASAVA_Build 4 28750097 1D TAAAGGGAAA T/- TTTGTACTTC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 4 3 202937 CASAVA_Build 4 28751973 1I CAAATTATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 9 10 202938 CASAVA_Build 4 28762851 2I TCCCTAATAT --/AA GAGTTGTGTA 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 A 0 2 202939 CASAVA_Build 4 28786814 2I TTCCTTTGCA --/GT GTGTTTCCAG 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 GT 2 3 202940 CASAVA_Build 4 28792747 2I ACAAAAAAAC --/TT AATTCTTAAA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 0 2 202941 CASAVA_Build 4 28796854 1D AAATTACGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 5 A 13 12 202942 CASAVA_Build 4 28800325 1D AGAAATAAAC T/- TGAGTGGAAT 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 T 2 1 202943 CASAVA_Build 4 28802630 1D TGAAATAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3028 hom 30 10 17 3 T 11 10 202944 CASAVA_Build 4 28826779 4D AATGATATAT AAAG/---- AAAGAATATA 3070 het 3070 ref 37 24 10 4 AAAG 2 1 202945 CASAVA_Build 4 28833982 6D GAATTTAAGC AAAACA/------ AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 14 11 AAAACA 2 1 202946 CASAVA_Build 4 28834726 1I ACTAATTGTT -/A AAACTGGAAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 3 4 202947 CASAVA_Build 4 28836208 1D CATTAAAAAA T/- AAACATTTTA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 T 1 0 202948 CASAVA_Build 4 28843068 3D GTCTTCTCAG CAC/--- CACATCATGC 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 CAC 2 1 202949 CASAVA_Build 4 28844309 1D AAATTCAACA C/- CCCTTCATGC 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 C 4 3 202950 CASAVA_Build 4 28847282 3I ACTTTGCCAT ---/ATA ATAATTGTTA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 ATA 1 2 202951 CASAVA_Build 4 28848842 1I CCTTCTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 11 12 202952 CASAVA_Build 4 28890612 1I GATATATACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 T 9 10 202953 CASAVA_Build 4 28923670 2D AAGTGTTTAG TT/-- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 29 16 13 1 T 9 7 202954 CASAVA_Build 4 28923764 3I TACTTAATAG ---/GAA GAACTACCAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 GAA 1 2 202955 CASAVA_Build 4 28927537 1I TCAAGAATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1856 hom 22 5 13 4 T 9 10 202956 CASAVA_Build 4 28930127 2D ACTTATTGAG TT/-- TTTTTTTTTA 1437 het 1437 ref 13 9 3 3 T 11 9 202957 CASAVA_Build 4 28930747 4I TTTTCAGGCA ----/TTAT TTATTTAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 TTAT 1 2 202958 CASAVA_Build 4 28953823 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 10 9 202959 CASAVA_Build 4 28956103 1D TGGAGTTGAT A/- AAAATCTGTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 5 4 202960 CASAVA_Build 4 28957775 1D TTCTGCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 36 2 26 8 A 11 10 202961 CASAVA_Build 4 28960296 4D TCCGCCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 75 het 31 0 26 7 AAAC 5 4 202962 CASAVA_Build 4 28969303 6I ACTGGGGATC ------/TTTATG TTTTTGTATG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 TTTATG 0 1 202963 CASAVA_Build 4 28982165 1D TTTCTTGGAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 9 8 202964 CASAVA_Build 4 28988068 1D GTTAACAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 10 9 202965 CASAVA_Build 4 29005565 1D TTTTTAGCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 33 0 21 12 T 17 16 202966 CASAVA_Build 4 29007484 1D TTATATCTGC T/- AGGAAATATG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 T 1 0 202967 CASAVA_Build 4 29020044 1D TTTTTAGTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 T 9 8 202968 CASAVA_Build 4 29023211 1D AAACCAAATA T/- TTTTCAAGTC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 5 4 202969 CASAVA_Build 4 29027058 2D TTTTTGAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 2612 het 1629 hom 40 8 7 25 T 13 11 202970 CASAVA_Build 4 29036771 1D ACATATTTCT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 1797 hom 36 6 15 15 C 10 9 202971 CASAVA_Build 4 29037864 6D TACATGTATC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 24 het 14 0 9 5 AT 13 10 202972 CASAVA_Build 4 29039720 4D TCAAATGAAT AATA/---- AATAAAACAT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 AATA 2 1 202973 CASAVA_Build 4 29041385 1I CTTAACTAGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 8 9 202974 CASAVA_Build 4 29043227 1I TACTTTTAAA -/T TTGGGCAGAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 2 3 202975 CASAVA_Build 4 29044830 1I ACAGAATTTC -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 61 het 28 0 21 7 A 6 7 202976 CASAVA_Build 4 29045791 3I TTATTAAAAT ---/AAC AATTATTCAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAC 0 1 202977 CASAVA_Build 4 29046253 4I ATCCATAGTA ----/CTTT CTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 17 4 CTTT 1 2 202978 CASAVA_Build 4 29049894 5D AAGCTTCTTT AAAAA/----- AAAAAAAAAT 1059 hom 10 het 18 0 4 14 A 14 9 202979 CASAVA_Build 4 29052121 1D ATTGTTTCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 10 9 202980 CASAVA_Build 4 29056336 7I ATACACACAC -------/ATGTACA CAGTTTACTG 3070 het 3070 hom 36 17 18 4 ATGTACA 0 1 202981 CASAVA_Build 4 29057313 1I AAAAAGTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2142 hom 20 5 11 4 T 9 10 202982 CASAVA_Build 4 29064718 2D CATATATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 18 15 8 TG 8 7 202983 CASAVA_Build 4 29092742 1D TTGTTAGAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 A 9 8 202984 CASAVA_Build 4 29111288 1I TCTAAACATA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 T 8 9 202985 CASAVA_Build 4 29112779 4D CAATTTGAAA TTAG/---- TTAATCATTA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 TTAG 1 0 202986 CASAVA_Build 4 29112872 2D ATTTTATCTC TT/-- TCTCTATATA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 3 1 202987 CASAVA_Build 4 29115757 1D TTTTATCTAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 9 8 202988 CASAVA_Build 4 29116128 4D ATATTTTATT TATA/---- TATTTGTTTA 3070 het 2849 hom 19 9 8 4 TA 3 1 202989 CASAVA_Build 4 29121479 2I GTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 AG 1 2 202990 CASAVA_Build 4 29122510 1D TATTTATATA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 7 6 202991 CASAVA_Build 4 29122614 4D AAAATTTGAG TAGT/---- TAAAGAGAGT 3070 het 3070 ref 29 17 11 3 TAGT 1 0 202992 CASAVA_Build 4 29124188 1D GCTTGTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 40 het 32 1 28 3 T 10 9 202993 CASAVA_Build 4 29125008 1I AGTACATATC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 8 9 202994 CASAVA_Build 4 29129307 5D AGCATGTAAC TACCT/----- TATATGTCTT 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 TACCT 1 0 202995 CASAVA_Build 4 29138589 1D GGTACTGGTA C/- AAAATCAGAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 1 0 202996 CASAVA_Build 4 29142318 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2280 hom 24 het 11 0 9 2 T 12 13 202997 CASAVA_Build 4 29142430 1D TGCACCCACT A/- AATGTGTCAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 3 2 202998 CASAVA_Build 4 29148248 2D TGTTGTCACC AA/-- GAGGTAGAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 A 2 0 202999 CASAVA_Build 4 29149365 1D AAAAAAAAAA C/- CATAAAATTT 3070 het 228 hom 26 2 21 3 C 2 1 203000 CASAVA_Build 4 29163521 1D TCTTTAATAC T/- TTACATCTGT 3070 het 3070 hom 51 22 25 5 T 3 2 203001 CASAVA_Build 4 29164288 8D TATATTTCAG AATATTCA/-------- GAATATTTCA 3070 hom 81 het 28 0 28 4 AATATTCA 1 0 203002 CASAVA_Build 4 29166821 2I AAAATAACTA --/AC AGGGTAAATT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AC 0 1 203003 CASAVA_Build 4 29176244 11D AATATTGACT ATACAATACCC/----------- AATACAATAA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 ATACAATACCC 1 0 203004 CASAVA_Build 4 29178013 2I ATTTTGTAGG --/TT TTATATATAT 1487 het 766 hom 10 2 5 3 T 2 4 203005 CASAVA_Build 4 29178748 3D TTAGGAAAAC ATA/--- ATAATACTAA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 ATA 3 2 203006 CASAVA_Build 4 29180694 1I AATTTTAATA -/T TTTTATTGGA 3070 hom 117 het 47 0 38 9 T 4 5 203007 CASAVA_Build 4 29187040 2I GTCTAAGTAC --/AT AATGATAATA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 AT 0 1 203008 CASAVA_Build 4 29187734 2I TGAAATAGAA --/TT ATTTTGTGAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 0 2 203009 CASAVA_Build 4 29192611 1I TACCTCTGTC -/T TTTGTCTCCT 3070 het 3070 hom 43 12 19 12 T 3 4 203010 CASAVA_Build 4 29196238 1I TTTCTATTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 31 1 24 6 T 10 11 203011 CASAVA_Build 4 29207697 1I TTTAATACCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 9 10 203012 CASAVA_Build 4 29208977 1D ACATTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 27 5 18 4 A 12 11 203013 CASAVA_Build 4 29219913 1I TCTTTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 26 1 18 7 A 13 14 203014 CASAVA_Build 4 29227434 1I ATGTACAAGG -/T TTTTTTTATG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 7 8 203015 CASAVA_Build 4 29231561 1D TCATTTTATG T/- TTTTTTGCAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 6 203016 CASAVA_Build 4 29237719 2I TATGAAATAC --/AT ATATGTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AT 2 3 203017 CASAVA_Build 4 29240980 2D TATATACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TG 9 8 203018 CASAVA_Build 4 29241132 4D TCAGACAGTT TATC/---- TAACTTGTAG 3070 het 3070 ref 55 29 24 4 TATC 1 0 203019 CASAVA_Build 4 29243952 1I TTCAGACTCA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 203020 CASAVA_Build 4 29245478 1I TAAGCATATG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 7 8 203021 CASAVA_Build 4 29250730 1D ATAAAAAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 48 0 42 8 T 10 9 203022 CASAVA_Build 4 29251586 1I AGTTTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 119 hom 47 1 35 11 T 11 12 203023 CASAVA_Build 4 29254396 1I AATAAACTTA -/C CTTTTATTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 2 203024 CASAVA_Build 4 29259305 1I CAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 2128 het 1037 hom 17 3 9 5 A 15 16 203025 CASAVA_Build 4 29262081 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 9 203026 CASAVA_Build 4 29262757 1I GTTTCAGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 895 hom 27 2 21 4 A 10 11 203027 CASAVA_Build 4 29263328 1I AAAATAACCC -/A TGGGAAAAAG 3070 hom 62 het 32 0 29 3 A 0 1 203028 CASAVA_Build 4 29265045 4I AAAATATAGG ----/TTAT TTATTTTTCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTAT 1 2 203029 CASAVA_Build 4 29265770 1I TATTTTCCTT -/G TTTTAAATTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 203030 CASAVA_Build 4 29272137 3D AAATTAACTT AAC/--- AAGTATTCAC 2988 hom 18 het 8 0 7 1 AAC 1 0 203031 CASAVA_Build 4 29273832 1D AGTGGAAAAA T/- ATATATAAAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 0 203032 CASAVA_Build 4 29276688 2D TCTACTGAAA AC/-- ACACAAAAAA 922 hom 9 het 5 0 3 2 AC 3 2 203033 CASAVA_Build 4 29279487 2I TAATATACAC --/AG AGTTTACAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AG 1 2 203034 CASAVA_Build 4 29280113 2D TTCCATATAT AA/-- GTGTGTAATA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 2 0 203035 CASAVA_Build 4 29280459 3D GTAATCCACT TAA/--- TAGTTTTCCA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TAA 1 0 203036 CASAVA_Build 4 29280676 1D AATTTTTTTT C/- TTTTTTCTTT 2967 het 100 hom 16 1 13 2 C 1 0 203037 CASAVA_Build 4 29281224 1I CCTATAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1846 hom 32 4 21 7 A 11 12 203038 CASAVA_Build 4 29286206 1D GCACAAAAAA G/- CAAGGGTTGC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 1 0 203039 CASAVA_Build 4 29291362 5D AAACATTGTT TAGTG/----- TAGTAACAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 6 TAGTG 1 0 203040 CASAVA_Build 4 29293214 1I CCTGAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 47 0 37 10 T 10 11 203041 CASAVA_Build 4 29294446 1D AGATATTGCA T/- TTTTTTTTTA 2936 het 2936 ref 31 16 9 6 T 10 9 203042 CASAVA_Build 4 29296133 1I TTCTTCTGTC -/T CATAATCAAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 0 1 203043 CASAVA_Build 4 29311041 2D ACTCATAATT AA/-- AAGTCTATTC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 4 2 203044 CASAVA_Build 4 29315037 3I ATTTAATCTG ---/TTA TTATGCTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 TTA 1 2 203045 CASAVA_Build 4 29322608 6D TTGATATGGA AGACCT/------ TTTTGTTGAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 AGACCT 1 0 203046 CASAVA_Build 4 29324716 1D GGTGATACAC A/- ACCATCACTA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 2 1 203047 CASAVA_Build 4 29328157 2I TATGATGAGG --/CA CACACAGTAT 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 CA 3 4 203048 CASAVA_Build 4 29337147 2I CAAAAAGAGG --/AA AAAAATGGTG 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 A 5 7 203049 CASAVA_Build 4 29339569 1D AAAAAAAAAA G/- CAACAACAAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 G 1 0 203050 CASAVA_Build 4 29342319 4I GGGAGGCTGA ----/GGTG GGCGGGCGGA 1897 het 1232 hom 12 5 4 3 GGTG 0 1 203051 CASAVA_Build 4 29345975 20D GTTGCATCAT ACACACACACACACACACAC/-------------------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 36 16 19 4 AC 21 11 203052 CASAVA_Build 4 29346481 2D TAGTTACTAA CT/-- CTGTAAGCAT 3070 het 3070 hom 38 14 23 2 CT 2 1 203053 CASAVA_Build 4 29346794 2D GTATGAGCCT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 TA 6 5 203054 CASAVA_Build 4 29477436 1D CTAATAATGG A/- AAAAAAAAAA 1473 het 1473 ref 47 28 4 15 A 15 14 203055 CASAVA_Build 4 29510430 1I CTAATAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 16 24 10 A 10 11 203056 CASAVA_Build 4 29511555 12D ATTTTATTGA TTATTTATTTAT/------------ TTATTTATTT 1915 het 931 hom 11 3 5 3 TTAT 6 3 203057 CASAVA_Build 4 29512121 1I ATGATTATGT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 A 6 7 203058 CASAVA_Build 4 29514431 10I AAGTATCTAT ----------/AATAGTTAAC ATAGTAAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 AATAGTTAAC 0 1 203059 CASAVA_Build 4 29515359 1D GAGGCCTCAC T/- GGAAGTTGAG 3070 het 3070 ref 66 33 29 4 T 1 0 203060 CASAVA_Build 4 29516370 4I ATAAAAAGAG ----/AAGA AAGGAGTAAA 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 AAGA 0 1 203061 CASAVA_Build 4 29522038 1I TCACAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 12 10 A 11 12 203062 CASAVA_Build 4 29523952 2I GGAACTGTGG --/CA CAGTTTTGTG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 CA 1 2 203063 CASAVA_Build 4 29528173 1I TGGTGATAAT -/A ATAGCAAATA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 1 2 203064 CASAVA_Build 4 29529025 1I TTATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2899 hom 20 8 9 3 A 10 11 203065 CASAVA_Build 4 29530683 4D AAAGGGATAC ATAG/---- ATAGATAATA 3070 het 3070 ref 30 18 11 3 ATAG 2 1 203066 CASAVA_Build 4 29557360 1I GAGAACACTG -/T TTTTTTTTTT 2812 het 1918 hom 31 9 10 12 T 15 16 203067 CASAVA_Build 4 29573252 3D TCGAATGCTC ATA/--- ATAAGTCCTA 3070 het 3070 ref 35 20 12 7 ATA 2 1 203068 CASAVA_Build 4 29574200 1D ACTCAGGCAG T/- TTTTTGCCAT 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 T 6 5 203069 CASAVA_Build 4 29583624 1D ATTCATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 12 11 203070 CASAVA_Build 4 29586193 1D TGAGATAAAT C/- TTATTAAGCT 3070 het 2891 hom 24 6 13 5 C 1 0 203071 CASAVA_Build 4 29623101 14D GCCAGGTGGG CCAGTTTTGGGACC/-------------- CCAGTGGTGG 3070 het 3070 ref 41 25 13 7 CCAGTTTTGGGACC 1 0 203072 CASAVA_Build 4 29646071 11I GATGGCTGAA -----------/GGACTCAAATC GGTCTTGCTG 3070 het 3070 hom 45 20 21 6 GGACTCAAATC 0 1 203073 CASAVA_Build 4 29681870 1I AATAAGGTGC -/T TTTTTTTTTT 948 het 948 ref 35 20 4 11 T 13 14 203074 CASAVA_Build 4 29684683 1I TATCAAACTC -/T TTTTTTTTCT 2317 het 2317 ref 13 7 6 0 T 8 9 203075 CASAVA_Build 4 29703111 4I GTTCACAAGA ----/TTCT TTCTACTGAA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 TTCT 1 2 203076 CASAVA_Build 4 29745150 2I AGATAAACAC --/AT ATTGTTTAGC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AT 1 2 203077 CASAVA_Build 4 29773403 1I AAAGATAAAT -/A AAAATCAGGA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 4 5 203078 CASAVA_Build 4 29793254 1I TTAGGTTAAC -/T TTAGGTTACT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 2 3 203079 CASAVA_Build 4 29793813 1D AAACCCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 10 9 203080 CASAVA_Build 4 29797804 1I TAGCTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 10 11 203081 CASAVA_Build 4 29800894 1I TGTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 1848 het 770 hom 17 4 6 7 T 16 17 203082 CASAVA_Build 4 29830646 2D GAAAAGTCAC AT/-- GTCTCTGTTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 AT 1 0 203083 CASAVA_Build 4 29858913 1I TTGTTTTATT -/C TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 C 0 1 203084 CASAVA_Build 4 29967496 1I TAAGTACTAC -/A AAAAAAAAAA 2945 het 2945 ref 33 10 10 13 A 13 14 203085 CASAVA_Build 4 29970955 1D TTCTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1273 het 1273 ref 27 21 4 3 T 17 16 203086 CASAVA_Build 4 30031083 1I ACGTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 11 12 203087 CASAVA_Build 4 30035936 1D CCTCCCAACC A/- AAAAAAAGCC 2410 het 2410 ref 25 18 6 3 A 8 7 203088 CASAVA_Build 4 30046804 3I ATTTTACAAA ---/TAT TATCACTTAA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 TAT 1 2 203089 CASAVA_Build 4 30053086 4D TCTGATTTCT TTAA/---- TTGTTATTTT 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 TTAA 1 0 203090 CASAVA_Build 4 30088158 2I GTAATTAAAC --/AT AGGCTAATTC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 AT 0 1 203091 CASAVA_Build 4 30092396 1I ACTGTTGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 10 11 203092 CASAVA_Build 4 30097698 1D ATCTTGAATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 26 11 15 1 A 9 8 203093 CASAVA_Build 4 30112694 1D ATCTGAGAAG A/- ATTAATCCTG 3070 het 3070 ref 36 17 13 10 A 2 1 203094 CASAVA_Build 4 30122079 1I TTTCTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 10 11 203095 CASAVA_Build 4 30135728 1I TTCTACTATT -/A AAAAAAAAAA 3027 het 3027 ref 30 11 10 9 A 11 12 203096 CASAVA_Build 4 30150474 9I AGCTGAGAAT ---------/GCGGGTACA GCGGGTACAG 3070 het 3070 ref 35 14 10 11 GCGGGTACA 1 2 203097 CASAVA_Build 4 30151399 1D GTGCTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 555 hom 34 5 14 15 T 15 14 203098 CASAVA_Build 4 30184202 1I GAGTTTTAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 8 9 203099 CASAVA_Build 4 30187316 4D ACTGTCAATC TAAG/---- TAAGATAAAT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 TAAG 2 1 203100 CASAVA_Build 4 30190016 2D GGAGAATAAA AT/-- ATAAGTATAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AT 2 1 203101 CASAVA_Build 4 30210355 1I TATATTTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 11 12 203102 CASAVA_Build 4 30217523 1D TATAATACAA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 8 7 203103 CASAVA_Build 4 30222423 1I GAATTGTAAT -/C CCCAGGGCTG 3070 het 3070 ref 44 22 11 11 C 3 4 203104 CASAVA_Build 4 30228626 1I CAGTGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2975 hom 32 10 15 7 A 15 16 203105 CASAVA_Build 4 30229267 28D AAAAAAAAAC TATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATA 2963 hom 18 het 9 0 7 5 TA 22 8 203106 CASAVA_Build 4 30231573 1I CTGTTGTTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 8 9 203107 CASAVA_Build 4 30235745 1D ACTTTTTGAA G/- GGGTTTTTTT 3070 het 2752 hom 21 9 10 2 G 4 3 203108 CASAVA_Build 4 30249078 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 2769 het 2769 ref 17 7 8 2 A 9 8 203109 CASAVA_Build 4 30264617 1D ACCCTACAGG A/- AAAAAAAAAA 1385 het 1385 ref 33 27 3 4 A 11 10 203110 CASAVA_Build 4 30265765 1D CGTAGGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2324 hom 26 10 11 5 T 13 12 203111 CASAVA_Build 4 30274749 8D GAAAAGGTTA TTATGCCC/-------- TTATGCCCGC 3070 het 3070 ref 36 20 15 5 TTATGCCC 2 1 203112 CASAVA_Build 4 30293247 1I ATTGGGGGAA -/C CCCCCCCCCA 3060 het 1787 hom 24 9 9 6 C 9 10 203113 CASAVA_Build 4 30295313 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 498 het 498 ref 15 7 2 7 A 17 16 203114 CASAVA_Build 4 30314280 4D GGATTTTTTC ATAA/---- ATACTGACTG 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 ATAA 1 0 203115 CASAVA_Build 4 30342580 12D TGTGTTTATG AGCCTAGAAAAT/------------ AGCCTAGAAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 6 AGCCTAGAAAAT 2 1 203116 CASAVA_Build 4 30344790 1I AGGTTATCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 A 9 10 203117 CASAVA_Build 4 30348257 2D TGTATACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 65 21 29 17 TG 9 8 203118 CASAVA_Build 4 30351603 1I TGATACATGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 T 8 9 203119 CASAVA_Build 4 30354343 1I ACTTATAGTT -/G GAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 1 2 203120 CASAVA_Build 4 30355969 2D TTACATCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 T 12 10 203121 CASAVA_Build 4 30361698 1I GCAGGGAAGG -/A AAAAAAACGC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 7 8 203122 CASAVA_Build 4 30365485 1D TTATATGTAC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 8 203123 CASAVA_Build 4 30368666 2I GTGTTAGGAC --/AG GGGAAAGAAC 3070 het 3070 hom 59 24 30 5 AG 0 1 203124 CASAVA_Build 4 30373231 1I ATGATATGAA -/C ATCTTCATTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 0 1 203125 CASAVA_Build 4 30376834 1I AAATGTAGGG -/A AAAAAAAAAA 2718 het 2718 ref 21 8 7 6 A 10 11 203126 CASAVA_Build 4 30403118 1I CATCAGAAAA -/G AAACAAAGCC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 0 1 203127 CASAVA_Build 4 30421153 1D ATTTTTTAGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 10 9 203128 CASAVA_Build 4 30436503 1D TGTATGGCTA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 8 7 203129 CASAVA_Build 4 30466912 1I ACAGATTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 10 11 203130 CASAVA_Build 4 30471138 1D TAATTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 20 7 T 11 10 203131 CASAVA_Build 4 30472135 2D TAGTAACCAC AT/-- GAGTGAAATA 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 AT 1 0 203132 CASAVA_Build 4 30480008 1D GTTGATTTAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 T 8 7 203133 CASAVA_Build 4 30485422 1I18M1D ATAATAAAAT -AAAAAAATAGTGAAATTGA/AAAAAAAATAGTGAAATTG- AAAAAAAAAA 2623 het 1342 hom 14 4 8 2 N/A 0 0 203134 CASAVA_Build 4 30489834 2D GAGGTTTCTC TG/-- GAAATAATCA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TG 1 0 203135 CASAVA_Build 4 30516189 2D AAAATGAAAA AC/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 9 15 5 AC 1 0 203136 CASAVA_Build 4 30518964 2I AAAGAATAAT --/AA AAAAAAAAAA 2036 het 1158 hom 14 4 6 4 A 12 14 203137 CASAVA_Build 4 30522041 1D AAAAAAATCA C/- CCCCCCCCCC 2409 het 927 hom 25 6 11 9 C 11 10 203138 CASAVA_Build 4 30529959 3I CAAATTATTA ---/TTC TTATGTAGCA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 TTC 0 1 203139 CASAVA_Build 4 30535538 1I AGTACAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 A 10 11 203140 CASAVA_Build 4 30536911 1D CTTTAGGTCG T/- TTTTTTTTTT 1688 het 1674 hom 18 7 5 6 T 12 11 203141 CASAVA_Build 4 30538574 1I AATGATCAAT -/A AAAAAAAACC 2110 het 2110 ref 17 10 6 1 A 8 9 203142 CASAVA_Build 4 30545003 2D TCAAATTAGT TC/-- TGTCAATTGC 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 TC 1 0 203143 CASAVA_Build 4 30547352 1D CCACAATGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2982 hom 21 8 11 2 T 10 9 203144 CASAVA_Build 4 30547768 2D AAGAGGCATA AG/-- AAAATATTGC 3070 het 3070 hom 37 17 20 0 AG 1 0 203145 CASAVA_Build 4 30558802 1D TTTATATTGC T/- TATTACATCT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 2 1 203146 CASAVA_Build 4 30569967 1I TTGGAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 2401 het 2401 ref 35 16 8 11 T 13 14 203147 CASAVA_Build 4 30574308 1I GTTTTTTCTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 7 8 203148 CASAVA_Build 4 30575335 1I ACAAATGGAC -/T TTTTTTTTTT 2617 het 489 hom 22 3 16 3 T 15 16 203149 CASAVA_Build 4 30581206 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 2314 het 1369 hom 9 3 6 0 G 2 3 203150 CASAVA_Build 4 30642371 1D AAATTAAAAG A/- AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 7 6 203151 CASAVA_Build 4 30667476 1D GAAAAGAAAG A/- GAGCCCAATG 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 1 0 203152 CASAVA_Build 4 30668906 2D TCAACAAACA AC/-- ACACACACGC 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 AC 5 4 203153 CASAVA_Build 4 30690307 1I TCATATACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 10 11 203154 CASAVA_Build 4 30696305 5D AGTCAGTTAA GTTAG/----- ATCTCTTTCA 3070 het 3070 hom 32 14 16 5 GTTAG 1 0 203155 CASAVA_Build 4 30696574 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1291 het 1291 ref 40 22 4 14 T 15 14 203156 CASAVA_Build 4 30721962 1I AAAAATAAGA -/T TTAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 2 3 203157 CASAVA_Build 4 30722025 2D TTTGTTACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 33 1 16 17 T 18 16 203158 CASAVA_Build 4 30731162 2D TATTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 688 hom 26 5 14 7 T 16 14 203159 CASAVA_Build 4 30740652 1I CAGGCCACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2372 hom 21 7 9 5 T 10 11 203160 CASAVA_Build 4 30742347 1I GAGGTTGAAA -/T TTTTGTCTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 4 5 203161 CASAVA_Build 4 30747625 4I GTTAACCAGC ----/ATTT ATTTAATTAT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 ATTT 1 2 203162 CASAVA_Build 4 30748868 4I TTCTAAAGAT ----/TCTA TCTATTATCT 3070 het 3070 ref 63 32 23 8 TCTA 1 2 203163 CASAVA_Build 4 30751229 1D TGAAGCAGTG A/- AAAAAAAAAA 2605 het 2605 ref 41 27 6 9 A 12 11 203164 CASAVA_Build 4 30760554 1I AGTGCGCCTA -/C TTTTTTTTTT 3070 het 2671 hom 32 9 21 2 C 0 1 203165 CASAVA_Build 4 30783328 1I GCTGCCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 27 2 17 8 T 11 12 203166 CASAVA_Build 4 30808753 1I ATGCTCTTCT -/G GGGGGGTGGT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 G 6 7 203167 CASAVA_Build 4 30809389 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1593 hom 21 6 12 3 A 14 13 203168 CASAVA_Build 4 30811476 8I CATGATTCAA --------/TTACCTCC GACTGGGTCC 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 TTACCTCC 0 1 203169 CASAVA_Build 4 30814484 2D TACATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 2212 het 2212 ref 22 11 7 5 TG 6 5 203170 CASAVA_Build 4 30815327 1I TCTAGTGTTT -/C CCCCCCCTAC 2445 het 1011 hom 16 4 7 5 C 7 8 203171 CASAVA_Build 4 30835962 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 A 12 13 203172 CASAVA_Build 4 30908367 1D GTCCCCCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2707 hom 26 9 12 5 T 13 12 203173 CASAVA_Build 4 30908719 1I GTTCTAATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 9 10 203174 CASAVA_Build 4 30914084 1D GAAATTCTTT C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 C 9 8 203175 CASAVA_Build 4 30915885 1I CCCATGTCTT -/C CTAGAGCTAG 3070 hom 122 het 48 0 39 9 C 1 2 203176 CASAVA_Build 4 30919269 1D TTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2469 het 1898 hom 29 10 9 10 T 14 13 203177 CASAVA_Build 4 30921943 1D ACCTTGATGC T/- TTCAGTAACA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 3 2 203178 CASAVA_Build 4 30929143 3D ATATTGTCTT GAG/--- GAGGAAGGGA 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 GAG 2 1 203179 CASAVA_Build 4 30948053 2D ACTTTTACTT AA/-- AGTCTTCAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 1 203180 CASAVA_Build 4 30952280 1D AATAAGTATA T/- TCAGGAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 1 203181 CASAVA_Build 4 30960545 1I CAGTTTTGCC -/A TTACTTTCGA 3070 hom 90 het 36 0 26 12 A 0 1 203182 CASAVA_Build 4 30961939 1I CAGGCTGGAG -/T TGTACTGGTG 3070 het 50 hom 27 1 18 12 T 1 2 203183 CASAVA_Build 4 30963894 2D TTCTGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 15 3 A 14 12 203184 CASAVA_Build 4 30964979 4I CTCCCCCAGC ----/CTAA CTGTCTACAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CTAA 0 1 203185 CASAVA_Build 4 30974278 1D ATAATTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 77 het 36 0 27 9 T 10 9 203186 CASAVA_Build 4 30982751 1D TAGCAGAACC A/- AATTTGGGAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 3 2 203187 CASAVA_Build 4 30983802 1I TTGTAGTACC -/T TTTTTTTTTT 3039 het 3039 ref 35 17 10 8 T 10 11 203188 CASAVA_Build 4 30986284 1D AAAGAGTCTT A/- AAATTATTTT 2218 het 1699 hom 21 6 9 6 A 4 3 203189 CASAVA_Build 4 30987361 8I GTGATTCAGA --------/TATATAAG TATATGACTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TATATAAG 0 1 203190 CASAVA_Build 4 30990937 1I TCAATCATAA -/C CCCTTTCTCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 3 4 203191 CASAVA_Build 4 30991149 2I ATTCCATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 TA 5 6 203192 CASAVA_Build 4 30993089 1D AAAACTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 39 2 24 13 T 15 14 203193 CASAVA_Build 4 30993637 1D TTTCTTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 A 12 11 203194 CASAVA_Build 4 31001567 1D ACGGGCTTAG A/- AAAAAACAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 6 203195 CASAVA_Build 4 31005787 2I CAGTATTCAT --/CA CACACACTAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 CA 3 4 203196 CASAVA_Build 4 31006773 2D ATTCTAAAAC AT/-- ATAGAAGAAT 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 AT 2 1 203197 CASAVA_Build 4 31009513 4I CTAACTTCTC ----/TGTT TGGTAGTTGA 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 TGTT 0 1 203198 CASAVA_Build 4 31012774 2I TATACACACT --/TA TATATATATA 2206 het 247 hom 7 1 5 1 TA 5 6 203199 CASAVA_Build 4 31014187 2D ATATCAAGAA AG/-- AAGACTAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 20 5 AG 1 0 203200 CASAVA_Build 4 31018612 1D AGAATGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 T 11 10 203201 CASAVA_Build 4 31020653 1D CTCGGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 18 20 11 A 13 12 203202 CASAVA_Build 4 31027005 2D TAGTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2919 hom 35 11 14 11 T 12 10 203203 CASAVA_Build 4 31033574 2D TCAAAACAAG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 TA 7 6 203204 CASAVA_Build 4 31034025 3I CACTGTAATC ---/ATG ATGTTTCCAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 ATG 1 2 203205 CASAVA_Build 4 31036389 5D ATTCTTTTAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 24 9 8 8 AAAAG 5 4 203206 CASAVA_Build 4 31047080 1I ACCAAAAAAT -/A AAAAAAATTA 1246 het 1246 ref 13 8 4 1 A 7 8 203207 CASAVA_Build 4 31047330 1D AGTTACAAAT A/- AGAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 A 2 1 203208 CASAVA_Build 4 31047759 1D ATTAAAGCTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 9 8 203209 CASAVA_Build 4 31049112 4D AACAAATCAA TATC/---- TAATCAACAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 TATC 1 0 203210 CASAVA_Build 4 31050837 1I CCTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTC 2594 het 684 hom 12 3 7 2 T 9 10 203211 CASAVA_Build 4 31051325 1I GTCAATCCTC -/A AAAGTAGGGC 2990 het 2990 ref 20 11 7 2 A 3 4 203212 CASAVA_Build 4 31051884 2D ATCTTTAAAA AC/-- TCCTAGTCTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 AC 1 0 203213 CASAVA_Build 4 31053891 1D ATTTAGTTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 A 10 9 203214 CASAVA_Build 4 31057453 1D TTTCTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 684 hom 30 4 12 14 T 12 11 203215 CASAVA_Build 4 31064024 1I TTTTATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 596 hom 26 3 13 10 T 13 14 203216 CASAVA_Build 4 31064035 4D TTTTTTTTTT TTGC/---- TTGCTTGCTT 2925 het 871 hom 23 5 10 9 TTGC 3 2 203217 CASAVA_Build 4 31069444 2D TACCTTCCTG TT/-- TTTTTTTAAA 925 het 174 hom 21 3 5 14 T 9 7 203218 CASAVA_Build 4 31076109 1D TTTTGCAAGA T/- TTTTTTTTTT 2787 het 2787 ref 24 9 9 6 T 15 14 203219 CASAVA_Build 4 31079284 1I TGGGATCCTT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 7 8 203220 CASAVA_Build 4 31080908 3I TATGGAAAAC ---/ATT ATGGAAATTT 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 ATT 0 1 203221 CASAVA_Build 4 31095705 1D TGATTTTTTT G/- GGGGGGACAG 3070 het 2740 hom 28 8 16 6 G 7 6 203222 CASAVA_Build 4 31099420 1D TGTCTTTCCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 49 22 15 13 T 9 8 203223 CASAVA_Build 4 31100116 4D ATAAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 AAAC 3 2 203224 CASAVA_Build 4 31100538 1D ACTACTTCTT C/- CCCTTTCATC 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 C 4 3 203225 CASAVA_Build 4 31102513 1D AAAAGGTCAC A/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 1 0 203226 CASAVA_Build 4 31105120 2I ATGGAAAGAG --/AC AATTTAGAGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AC 0 1 203227 CASAVA_Build 4 31106426 1I TATTATTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 12 13 203228 CASAVA_Build 4 31110897 2D TATGTAATTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 TA 8 7 203229 CASAVA_Build 4 31117903 1D TACTAAAAAA T/- ATCTTCATTT 3070 het 3070 ref 30 12 12 7 T 1 0 203230 CASAVA_Build 4 31120623 1D TGAGATGGAG T/- ATTGCTCTTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 1 0 203231 CASAVA_Build 4 31122738 2D TTTGGTAGAA CT/-- GTTAATTTTC 3070 hom 81 het 33 0 28 6 CT 1 0 203232 CASAVA_Build 4 31125385 1D AAAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 10 9 203233 CASAVA_Build 4 31132485 1D CAGCTTCCCC T/- ATTAACATCC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 1 0 203234 CASAVA_Build 4 31133462 3I TTATTGATAC ---/ATA ATAATTGTAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATA 1 2 203235 CASAVA_Build 4 31142868 5D GATTTTGTTA ATATG/----- ATATATCATG 3070 hom 87 het 32 0 30 4 ATATG 1 0 203236 CASAVA_Build 4 31143655 1D TTCACATATA T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 7 203237 CASAVA_Build 4 31146675 2D17M1D ATTATGGAGG TATATACTTCCTCCTCAACT/--TATACTTCCTCCTCAAC- TTTTGCAAAA 3070 hom 108 het 33 0 37 1 N/A 0 0 203238 CASAVA_Build 4 31151007 1I CAAACTATAC -/T TTTTTTATAT 3070 hom 75 het 36 0 25 11 T 6 7 203239 CASAVA_Build 4 31151415 2D TTTTTTTTTT TG/-- CCATTCTAAT 3070 het 179 hom 34 6 19 9 TG 1 0 203240 CASAVA_Build 4 31152933 2D TTGTAAATTA AT/-- ATTGGGTTTT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 AT 2 1 203241 CASAVA_Build 4 31154518 7D TTATAAGAGG CTAATCT/------- CCTTTATGAG 3070 hom 69 het 26 0 24 4 CTAATCT 1 0 203242 CASAVA_Build 4 31159147 5I AAAAGTTCTT -----/TAATC TAATATTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TAATC 0 1 203243 CASAVA_Build 4 31160999 3I TTAAGTGAGG ---/ACT ACTATTCCCT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ACT 1 2 203244 CASAVA_Build 4 31166761 6D4M2D AGCCTCCAGA AGTGGGAGAAGT/------AGAA-- AAATTTCTAT 3070 hom 114 het 40 0 38 5 N/A 0 0 203245 CASAVA_Build 4 31167402 2I GGTCTGAAAG --/TC TCAACCAAGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TC 1 2 203246 CASAVA_Build 4 31178016 2D TCTGTTGCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 28 1 19 9 A 12 10 203247 CASAVA_Build 4 31181903 1D CGGGTAAGGT A/- AAATCTCATA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 4 3 203248 CASAVA_Build 4 31183179 1I TATAAGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 11 203249 CASAVA_Build 4 31183795 2I AAAAAAAAAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 31 het 51 1 38 12 AC 6 7 203250 CASAVA_Build 4 31186082 22D GTGTCAGGAG TATATATATATATATATATATA/---------------------- TATATATATA 3070 hom 51 het 17 0 18 4 TA 20 9 203251 CASAVA_Build 4 31190282 2D TAAGAGAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 51 0 42 9 A 12 10 203252 CASAVA_Build 4 31198385 2I TATTTTATGA --/AT TAAGAAATTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 0 1 203253 CASAVA_Build 4 31199635 1I TCTTAACTTT -/A AAAAGTCCAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 4 5 203254 CASAVA_Build 4 31201826 1I TTCTGGAAGC -/T GTATGAGCAT 3070 hom 90 het 33 0 30 6 T 0 1 203255 CASAVA_Build 4 31202723 1I ATGTTTAGAA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 7 8 203256 CASAVA_Build 4 31203580 1D CCACCAGGGG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 89 het 35 0 30 6 A 8 7 203257 CASAVA_Build 4 31203952 2D TTCCTCTCTT TC/-- TCTCTCTTTG 2364 hom 21 het 19 0 7 12 TC 4 3 203258 CASAVA_Build 4 31210988 1D CAACACTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 28 2 22 5 T 11 10 203259 CASAVA_Build 4 31224527 2D AGGTAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 105 het 39 0 35 5 AT 7 6 203260 CASAVA_Build 4 31226175 3D GTTTTCTTTG TTT/--- TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 11 8 203261 CASAVA_Build 4 31240191 1D TCAGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 11 10 203262 CASAVA_Build 4 31244931 1I GTCCATTCTG -/A AAAATGATGC 3070 hom 113 het 43 0 38 5 A 4 5 203263 CASAVA_Build 4 31250139 15D TTTTGTCATA CCAAGAGCCTCTGTG/--------------- CCCCAGAATT 3070 het 3070 ref 44 29 15 5 CCAAGAGCCTCTGTG 1 0 203264 CASAVA_Build 4 31266802 1D TTTTAAAAAA T/- TTTTTTATAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 203265 CASAVA_Build 4 31274014 1D GGAATTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 25 0 21 4 A 13 12 203266 CASAVA_Build 4 31281744 1D CAGGCGTGAG C/- CCACCGCGCC 2880 hom 30 het 11 0 9 5 C 3 2 203267 CASAVA_Build 4 31283798 1I TATAATTTGT -/G GAAAAAAAAG 3070 het 371 hom 40 1 33 6 G 1 2 203268 CASAVA_Build 4 31287006 2D CCATGCTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 28 2 16 11 A 14 12 203269 CASAVA_Build 4 31287606 1D AATAGATGAT A/- GAGGGGTATG 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 1 0 203270 CASAVA_Build 4 31287934 1D TTATAGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 35 1 30 5 T 11 10 203271 CASAVA_Build 4 31293546 2D AAACAACAGC CA/-- TGTATTAGCT 3070 hom 105 het 42 0 35 8 CA 1 0 203272 CASAVA_Build 4 31301530 1I GTTTTATATA -/T TTTTTGAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 5 6 203273 CASAVA_Build 4 31301768 1D GGTAGAAAAT C/- TATTCTTTCA 3070 hom 78 het 30 0 27 5 C 1 0 203274 CASAVA_Build 4 31303732 3D AGCTACATTA AAC/--- AACAAATTTT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 AAC 2 1 203275 CASAVA_Build 4 31315059 1D CTATCAGCCT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 7 6 203276 CASAVA_Build 4 31320523 1D TGCTAATACT A/- ACTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 46 22 22 3 A 2 1 203277 CASAVA_Build 4 31322021 1I TATTTTCTAC -/A AAAAATGTTT 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 A 5 6 203278 CASAVA_Build 4 31322779 1D TCAAGATGAC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 8 7 203279 CASAVA_Build 4 31339159 2D CAGATTTTAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 10 15 5 AT 6 5 203280 CASAVA_Build 4 31351516 1D AGGTACTATG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 8 7 203281 CASAVA_Build 4 31354043 4I ATAAGGGATA ----/CATG AAAGTTGCTG 3070 hom 141 het 48 0 48 0 CATG 0 1 203282 CASAVA_Build 4 31356528 3I AAAAAAACTC ---/TCA TCAATACTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TCA 1 2 203283 CASAVA_Build 4 31369661 4D AGATAAAGCC TATG/---- TATGTATTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TATG 2 1 203284 CASAVA_Build 4 31388646 1D AAATACAGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 10 9 203285 CASAVA_Build 4 31392782 1I AAAAAGAAAA -/G ACAAAAATAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 0 1 203286 CASAVA_Build 4 31394902 1D GATTTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 2588 het 2453 hom 28 10 7 12 A 17 16 203287 CASAVA_Build 4 31404409 5I TTTTCCAAGA -----/TTTGT TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 TTTGT 3 4 203288 CASAVA_Build 4 31416043 1I ATGGTGTTCG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 7 8 203289 CASAVA_Build 4 31420323 1D ATAATTCTTT A/- AATTTCATTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 3 2 203290 CASAVA_Build 4 31523558 2D AAGGCAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2447 hom 19 7 9 3 A 13 11 203291 CASAVA_Build 4 31531146 5D AACAACTAAG AAGTA/----- AAGATAGATG 3070 het 3070 hom 50 21 23 7 AAGTA 1 0 203292 CASAVA_Build 4 31534725 1I AAATTTATGG -/A AAAAAACCAC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 6 7 203293 CASAVA_Build 4 31535082 1D TGCCAAACCT A/- AAAAAAAAAA 1184 het 1184 ref 30 22 3 5 A 12 11 203294 CASAVA_Build 4 31553832 1I ATTCAGTAAA -/G TCGTATTAAA 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 G 0 1 203295 CASAVA_Build 4 31563751 3I TTTTGTTTGT ---/TTG TTTTCTCCTC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TTG 0 1 203296 CASAVA_Build 4 31564371 2I ACACACACAC --/AT GAACACATAT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 AT 0 1 203297 CASAVA_Build 4 31564454 2I GTGTGTGTGC --/AT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 AT 0 1 203298 CASAVA_Build 4 31569519 1D TGCATGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3007 het 3007 ref 61 45 7 9 T 13 12 203299 CASAVA_Build 4 31573529 2I ATTGTAAAAC --/AT GTGTGTTTGA 1926 het 1926 ref 21 13 4 4 AT 0 1 203300 CASAVA_Build 4 31584562 1D TTCATTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 12 11 203301 CASAVA_Build 4 31591255 1D13M1I AGGTCACTCT GGTTATGCCTTAGC-/-GTTATGCCTTAGCA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 15 15 3 N/A 0 0 203302 CASAVA_Build 4 31593051 1I TTTGTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 T 10 11 203303 CASAVA_Build 4 31594963 17I GATAACATGT -----------------/CTGTGAATGCCCAAGTC CTTGATATAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 CTGTGAATGCCCAAGTC 0 1 203304 CASAVA_Build 4 31596754 1I CAGCAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 11 12 203305 CASAVA_Build 4 31597782 1I GAAAATAGTT -/A ACTACATGGT 3070 het 3070 hom 60 24 29 7 A 1 2 203306 CASAVA_Build 4 31600190 1D GTTGAATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 A 15 14 203307 CASAVA_Build 4 31601754 1D TCAGAATTGG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 8 7 203308 CASAVA_Build 4 31605813 4D TTCCTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 1483 het 1483 ref 20 7 4 9 TC 11 9 203309 CASAVA_Build 4 31606401 1I GCAATTTGCT -/C GTTGTAAAAC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 0 1 203310 CASAVA_Build 4 31610148 1D CTTTTCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 7 10 5 A 11 10 203311 CASAVA_Build 4 31610811 1D TTTTAACATT A/- AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 7 6 203312 CASAVA_Build 4 31625148 1D AAGACAGAAG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 40 20 15 6 A 8 7 203313 CASAVA_Build 4 31632641 1D GTATGATTAA T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 7 6 203314 CASAVA_Build 4 31637972 4I TTCCAGGACT ----/TTTA TTTGTCTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 TTTA 0 1 203315 CASAVA_Build 4 31638253 1D GCTCACACCT G/- TAATCCCAGC 3070 het 919 hom 10 2 7 1 G 1 0 203316 CASAVA_Build 4 31670952 1D ATAAAATCTC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 7 203317 CASAVA_Build 4 31673530 2I AAAAGAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 AT 5 6 203318 CASAVA_Build 4 31680901 2D TTTGACTGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 29 0 23 7 A 14 12 203319 CASAVA_Build 4 31682636 2I GCTGTAGTTT --/AA GAGTAGGAGG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 0 2 203320 CASAVA_Build 4 31685209 1D ATTTGTTCTC T/- TGGGTAGTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 2 1 203321 CASAVA_Build 4 31687657 2D TTTATATAAC TG/-- TGTGTTTGTA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TG 3 2 203322 CASAVA_Build 4 31693768 1I TTTCTCCATG -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 7 8 203323 CASAVA_Build 4 31695554 1D AGTTTTGCTA T/- ACATAATATC 3070 hom 72 het 32 0 25 8 T 1 0 203324 CASAVA_Build 4 31696202 1D AGTTATAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 10 9 203325 CASAVA_Build 4 31697403 1I TAGGCCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1587 hom 41 5 27 9 T 13 14 203326 CASAVA_Build 4 31699757 1I AGAGAGGGGC -/T CTTGTAAAGG 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 0 1 203327 CASAVA_Build 4 31703862 1D CACCAAACCA T/- TTTTTTTTCT 2457 hom 25 het 13 0 8 5 T 9 8 203328 CASAVA_Build 4 31706272 1D AAAATGAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 9 203329 CASAVA_Build 4 31713746 3D GGCCAGTGTT AAG/--- AAGGATATTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 AAG 2 1 203330 CASAVA_Build 4 31714878 32D TGAGTTCTAA GAGCCTTTTGGTAGAGTCTTTGGGTTTTCTAG/-------------------------------- GTATAGAATC 967 hom 5 het 5 0 2 3 GAGCCTTTTGGTAGAGTCTTTGGGTTTTCTAG 1 0 203331 CASAVA_Build 4 31716032 3I TAGTTATTTA ---/TCT TCTTCTGCTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TCT 2 3 203332 CASAVA_Build 4 31716966 44D CACTATGCCC ACATTTTTTTCTGTTAGGCATTCCAGGCCAAAGGGCTTCCTGTG/-------------------------------------------- CAGAGGCCAG 3070 hom 78 het 24 0 26 3 ACATTTTTTTCTGTTAGGCATTCCAGGCCAAAGGGCTTCCTGTG 1 0 203333 CASAVA_Build 4 31720391 4I CTATGTCCTT ----/ACTC TATCTATAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ACTC 0 1 203334 CASAVA_Build 4 31743953 1D TTACTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1675 hom 28 6 18 4 T 15 14 203335 CASAVA_Build 4 31747109 1D TTTTGATTTT A/- AAAATCTGTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 4 203336 CASAVA_Build 4 31751799 4D AGTTAAAACA AAAT/---- ATAAAAATAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AAAT 1 0 203337 CASAVA_Build 4 31754973 12I TTCTATTTAC ------------/ATAATATTATCA AATACATTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 ATAATATTATCA 0 1 203338 CASAVA_Build 4 31762654 2D AAGGAATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 30 0 22 10 A 17 15 203339 CASAVA_Build 4 31768670 1I TTCTGATGAC -/G CCTCTAGACT 3070 hom 95 het 38 0 32 6 G 0 1 203340 CASAVA_Build 4 31779867 1D AATCTAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1039 het 1039 ref 35 31 3 1 T 11 10 203341 CASAVA_Build 4 31788034 1D CATTATAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 41 0 32 9 T 11 10 203342 CASAVA_Build 4 31788319 1D GCTGAGAATG A/- TGGTTTCCAG 3070 hom 46 het 39 1 32 6 A 1 0 203343 CASAVA_Build 4 31795423 1D GGATAAAAAT G/- TAAGGGCATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 1 0 203344 CASAVA_Build 4 31806429 2D CAAAATTCTA AG/-- AGAGTTGGCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 3 2 203345 CASAVA_Build 4 31809449 1I GACAAAGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 98 het 38 0 33 5 T 9 10 203346 CASAVA_Build 4 31814550 4I CTGTCCTTGT ----/ATAA ATAATCCTTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 ATAA 1 2 203347 CASAVA_Build 4 31817151 1D TTGTAGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 A 12 11 203348 CASAVA_Build 4 31817432 4I TCAAACACAT ----/ACAA ACAAACAAGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 ACAA 2 3 203349 CASAVA_Build 4 31818893 1D AACTGGCTAG A/- AAACAACTTC 3070 het 3070 ref 33 16 17 0 A 4 3 203350 CASAVA_Build 4 31824993 1I AGTTCTCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 9 10 203351 CASAVA_Build 4 31826881 2I5M5D TCTTGATTCC --CCCCCTCCCT/AACCCCC----- TTTTTTTTTC 3070 het 931 hom 19 6 9 7 N/A 0 0 203352 CASAVA_Build 4 31827323 1D GTTGATTAGT A/- AAATAAGATT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 4 3 203353 CASAVA_Build 4 31829098 2D ATTAAACCTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 58 hom 24 2 11 12 T 11 9 203354 CASAVA_Build 4 31830147 1D TGACTATCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 13 7 A 10 9 203355 CASAVA_Build 4 31833230 1D GATAATGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 23 0 20 3 A 13 12 203356 CASAVA_Build 4 31834777 1D GGGAGCCCTG C/- CCCCTACCGA 2156 het 2148 hom 26 11 9 7 C 5 4 203357 CASAVA_Build 4 31843971 3D AACATCAGTC ATT/--- ATTATAAAAC 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 ATT 2 1 203358 CASAVA_Build 4 31847877 2D TCAATTTTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 AC 11 10 203359 CASAVA_Build 4 31848500 2D GTTGTCTGCA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 11 9 203360 CASAVA_Build 4 31849211 2D TAATGATATT AA/-- GAGTTTGGAC 3070 het 3070 ref 54 28 25 2 A 2 0 203361 CASAVA_Build 4 31852839 7D40M1D AGCATGGTTT ATTGAACATTGAACATTTTAAGCCCAATGTTGAGACCTACTGCTTGGA/-------ATTGAACATTTTAAGCCCAATGTTGAGACCTACTGCTTGG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 34 16 10 N/A 0 0 203362 CASAVA_Build 4 31858255 2I AAACAAAAAC --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 A 8 10 203363 CASAVA_Build 4 31859449 1D TAAGAAGGTT A/- ATCTATGGTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 2 1 203364 CASAVA_Build 4 31864846 5I TCTGAATATT -----/ACTTC ACAATATTTC 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 ACTTC 0 1 203365 CASAVA_Build 4 31866850 1I ATTTATTTAA -/T TTTTTTTCAA 2431 het 2431 ref 20 12 5 3 T 7 8 203366 CASAVA_Build 4 31869603 1I AAAAAATGTC -/T TTTTTTACTA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 6 7 203367 CASAVA_Build 4 31869954 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 11 12 203368 CASAVA_Build 4 31871797 1I TCAGTGATAT -/C CCAAATTGGA 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 C 2 3 203369 CASAVA_Build 4 31878614 1I CGCTCATTCC -/T TTGCAAACTG 2301 het 2301 ref 24 17 5 2 T 2 3 203370 CASAVA_Build 4 31880007 1I CCCTTGAGGG -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 7 8 203371 CASAVA_Build 4 31882045 1I ACTTACTAGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 8 9 203372 CASAVA_Build 4 31884476 1D AAAATTATAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 9 8 203373 CASAVA_Build 4 31885071 1D AGGGCACTGT A/- AAACTTCTAA 2978 het 2978 ref 24 10 7 7 A 4 3 203374 CASAVA_Build 4 31885122 16I TTTTGATTTG ----------------/AATGTATGACTTATTT GACACTTTAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 AATGTATGACTTATTT 0 1 203375 CASAVA_Build 4 31885362 3D TGTTTAAAAC ATA/--- ATAATCTAAT 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 ATA 2 1 203376 CASAVA_Build 4 31885644 1D GCACATATTC A/- GATTTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 A 1 0 203377 CASAVA_Build 4 31886472 2D TTTATTGTGA TT/-- TTGAATATAA 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 4 2 203378 CASAVA_Build 4 31895476 2D TGTGATTTTT TC/-- TTCTTCTTTT 320 het 320 ref 10 5 2 3 TC 1 0 203379 CASAVA_Build 4 31895557 3D CTCACTGCAA CCT/--- CCTCCGCCTC 3070 het 2817 hom 19 8 10 1 CCT 2 1 203380 CASAVA_Build 4 31899220 1I CTCTGAACTC -/T ATTTGTTTCC 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 T 0 1 203381 CASAVA_Build 4 31901398 1I CTCTTCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 10 11 203382 CASAVA_Build 4 31901744 1D AGCTTTACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 7 22 1 T 10 9 203383 CASAVA_Build 4 31907687 2D ATACAGACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 AT 6 5 203384 CASAVA_Build 4 31908157 1I TATCAAAAGA -/G GAAATGGTTC 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 G 1 2 203385 CASAVA_Build 4 31920483 3D CTCCGTCTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 996 hom 33 9 10 14 A 17 14 203386 CASAVA_Build 4 31920586 1D CAACTGAAGA C/- CCTTATAAAC 3070 het 3070 hom 40 16 23 2 C 3 2 203387 CASAVA_Build 4 31921369 1I AAATACCATT -/G TTTTAGGAAC 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 G 0 1 203388 CASAVA_Build 4 31923479 11I ACATGTACTA -----------/TAAACTGGAAT GCTATGAAAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 TAAACTGGAAT 0 1 203389 CASAVA_Build 4 31923567 1I AATGAAGAAG -/A AAAATCTGAA 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 A 4 5 203390 CASAVA_Build 4 31934350 1D TTTTAGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 A 11 10 203391 CASAVA_Build 4 31936276 1I ACCAAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 1715 het 1626 hom 23 5 5 13 T 13 14 203392 CASAVA_Build 4 31938306 1I CTTCACTTCC -/A AAAAAAAAAA 2918 het 2918 ref 30 17 7 6 A 10 11 203393 CASAVA_Build 4 31941295 1I GAAATCTAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 9 10 203394 CASAVA_Build 4 31945335 1D TTTAAACACT G/- GGAACCTGGC 2287 het 2287 ref 22 15 6 1 G 3 2 203395 CASAVA_Build 4 31946264 1D AGCCAAATGC G/- AATCACTAAG 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 G 1 0 203396 CASAVA_Build 4 31952464 1D AACTAATACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 10 9 203397 CASAVA_Build 4 31953962 7I CTGCACCCTC -------/AATGCAA AACAACTCCA 3070 het 2670 hom 31 10 14 7 AATGCAA 0 1 203398 CASAVA_Build 4 31962015 4D TGTATCTATC ATCT/---- ATCTATGTTT 3070 het 3070 ref 49 27 19 4 ATCT 2 1 203399 CASAVA_Build 4 31965797 1D CATAGAAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 10 9 203400 CASAVA_Build 4 32029958 1D CTTTTTGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 7 4 T 11 10 203401 CASAVA_Build 4 32182947 1D ACTTTTGCAT G/- TCAGGGATGA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 1 0 203402 CASAVA_Build 4 32198569 1D TGCTATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 20 21 15 T 13 12 203403 CASAVA_Build 4 32218054 1I TTGCTTAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 421 hom 34 1 27 6 A 9 10 203404 CASAVA_Build 4 32238528 2D AACCTATCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 32 4 17 11 T 13 11 203405 CASAVA_Build 4 32241246 1I CTTATTTAAC -/T TTTATCTTAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 3 4 203406 CASAVA_Build 4 32244620 1D TCATTCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 A 11 10 203407 CASAVA_Build 4 32244981 4I ATTTTTATGC ----/ACAA ACAGTCAGTC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 ACAA 0 1 203408 CASAVA_Build 4 32245657 1I ATATCTCATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 15 30 4 T 9 10 203409 CASAVA_Build 4 32245765 1D TATATTTTTT C/- TCTGATCTAT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 C 1 0 203410 CASAVA_Build 4 32247949 2I CCCAAAACAA --/AT AGTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 AT 0 1 203411 CASAVA_Build 4 32249855 1D TTATTTCCCC A/- AATAGATATT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 3 2 203412 CASAVA_Build 4 32250434 2D CCCCCAAGTC TT/-- AACTCATTTC 3070 het 3070 ref 36 21 15 1 T 2 0 203413 CASAVA_Build 4 32251021 8D AGCAGGCTTC TGCCTGGA/-------- TGCCTGGACA 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 TGCCTGGA 2 1 203414 CASAVA_Build 4 32256263 1D TCAGTGCAAT G/- CTACTGATTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 G 1 0 203415 CASAVA_Build 4 32257579 2D TACAGAATAC TT/-- TTTTTAATCT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 T 7 5 203416 CASAVA_Build 4 32260434 1D GGTTCTATTT A/- GGACCTTAAT 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 A 1 0 203417 CASAVA_Build 4 32264918 2D AGAAGAGAGT TA/-- TATATATATC 3070 het 3070 hom 53 25 23 7 TA 5 4 203418 CASAVA_Build 4 32265026 2I TATGTATAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 AC 6 7 203419 CASAVA_Build 4 32276922 1I GGACACTACT -/A AAAAAAAAAA 2800 het 2800 ref 34 11 8 15 A 13 14 203420 CASAVA_Build 4 32278765 1D CAATGTCCTC T/- TTTGTCTCAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 4 3 203421 CASAVA_Build 4 32279108 1I CTGTAGTCCC -/A AGCTACCCGG 2746 het 2746 ref 25 8 7 10 A 1 2 203422 CASAVA_Build 4 32279533 4D AAAAACACTT AGAA/---- AGAGACTTTA 3070 het 3070 ref 28 18 9 5 AGAA 1 0 203423 CASAVA_Build 4 32281685 1I CATTTTTTTT -/A AAACACCACA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 3 4 203424 CASAVA_Build 4 32282339 8I AGTTTCTAAC --------/CAATAAAA CATGTCCAGG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 CAATAAAA 0 1 203425 CASAVA_Build 4 32285682 1D ACGATATCTG T/- GTAGGTATAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 1 0 203426 CASAVA_Build 4 32285892 1D AATATCCTCT A/- AAAATATCTT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 A 5 4 203427 CASAVA_Build 4 32289050 8I GCAGGAGGAG --------/GGAGAGGA GGAGAGGATC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 GGAGAGGA 1 2 203428 CASAVA_Build 4 32310342 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 11 10 203429 CASAVA_Build 4 32312098 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2861 hom 22 6 12 4 T 8 9 203430 CASAVA_Build 4 32326371 1D TTTAACTAGC T/- CTCTAGCGAT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 1 0 203431 CASAVA_Build 4 32327775 1D TACTAAAGAT A/- AAAAAAAATT 2867 het 1991 hom 16 5 8 3 A 9 8 203432 CASAVA_Build 4 32328933 2D TTTTTTTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 10 7 A 12 10 203433 CASAVA_Build 4 32330393 1I CCTTGATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2488 hom 26 8 12 6 T 10 11 203434 CASAVA_Build 4 32334758 1D TGTTTTTCAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 A 8 7 203435 CASAVA_Build 4 32335974 1D GGCAAACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 18 7 A 12 11 203436 CASAVA_Build 4 32339377 1D ATCTCTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 14 8 3 T 12 11 203437 CASAVA_Build 4 32344036 2I GGGGTGTAGA --/GT GTTTCACCAT 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 GT 1 2 203438 CASAVA_Build 4 32345530 1D GCCCTGATGC T/- TTTTGATGCC 3070 het 3070 hom 50 14 30 6 T 5 4 203439 CASAVA_Build 4 32346002 1I GCCGAATTAG -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 A 6 7 203440 CASAVA_Build 4 32348312 3D TTATTTTTGA CTT/--- CTTTGTGACT 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 CTT 2 1 203441 CASAVA_Build 4 32349174 4D CCTGGGTGAG GTGA/---- GAGAAAACAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 GTGA 1 0 203442 CASAVA_Build 4 32353137 4D GATAAATGGG ACAA/---- ACAAAGTCTC 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 ACAA 2 1 203443 CASAVA_Build 4 32357951 2D GAGGTGAGTC AA/-- AGTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 53 27 21 6 A 3 1 203444 CASAVA_Build 4 32374065 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 2675 het 1208 hom 21 5 8 8 A 12 11 203445 CASAVA_Build 4 32396871 1D ATATTTTTAG A/- AAATAGTCTC 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 4 3 203446 CASAVA_Build 4 32409175 4D ATTAGCATAT TAAA/---- TAGTCATTGA 3070 het 3070 ref 35 21 12 5 TAAA 1 0 203447 CASAVA_Build 4 32417941 1D TTAAAAAAAT A/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 6 5 203448 CASAVA_Build 4 32422412 1I TCTCTCTAGC -/T ATAGCTGGAA 3070 het 3070 hom 34 11 22 1 T 0 1 203449 CASAVA_Build 4 32434786 1I AGAGAACCTT -/A AAATAGGATT 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 A 3 4 203450 CASAVA_Build 4 32449920 1I CCATAGGCCT -/G GGTTTCTCTA 3070 het 3070 hom 44 18 26 0 G 2 3 203451 CASAVA_Build 4 32450853 3D ATAAAATAAT AAA/--- AATAAACTAT 2043 het 991 hom 7 2 5 0 A 5 2 203452 CASAVA_Build 4 32461612 3D CAATACTGTC ATT/--- ATACAGTTCA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 ATT 1 0 203453 CASAVA_Build 4 32466185 1D TACTTTTGTC A/- AATATTTTTC 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 3 2 203454 CASAVA_Build 4 32547111 1I CTTTGTTTTG -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 6 7 203455 CASAVA_Build 4 32614621 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 755 het 755 ref 13 5 3 5 T 14 13 203456 CASAVA_Build 4 32615697 1D TTGGGAGATT A/- AAAAAAAATG 1303 het 1303 ref 39 33 3 3 A 9 8 203457 CASAVA_Build 4 32671585 1D TTAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 806 hom 28 3 18 7 A 13 12 203458 CASAVA_Build 4 32692215 1I GAAAATATTC -/A GGGCAAATCT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 0 1 203459 CASAVA_Build 4 32694154 1I AATTTCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 T 10 11 203460 CASAVA_Build 4 32698606 4I TAAAATGTTC ----/CTTT CTATTTTAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CTTT 0 1 203461 CASAVA_Build 4 32768434 1D AGACTCCACC A/- AAAAAAAAAA 885 het 885 ref 27 17 4 6 A 13 12 203462 CASAVA_Build 4 32785324 1D CACACCGGCA T/- TTTTTTTTTT 1073 het 185 hom 11 1 6 4 T 17 16 203463 CASAVA_Build 4 32789485 1D CTTTGCTAGA T/- TTTTTTTTTT 1271 het 1271 ref 52 43 3 6 T 11 10 203464 CASAVA_Build 4 32828283 1D CAAGAGAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 10 9 203465 CASAVA_Build 4 32862692 1I TTGCACAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 13 14 203466 CASAVA_Build 4 32906973 1I AGGACTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 11 12 203467 CASAVA_Build 4 32907403 1I AAACCACCCC -/T AACCCTAAAG 3070 hom 123 het 43 0 41 2 T 0 1 203468 CASAVA_Build 4 32917885 1D CTGTAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 22 2 15 5 T 15 14 203469 CASAVA_Build 4 32920078 3I CAGAAGCAAT ---/AAA AACAACAACA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 2 5 203470 CASAVA_Build 4 32931228 1D TGTTAAAGAT C/- AGGTTAGTGC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 C 1 0 203471 CASAVA_Build 4 32932766 1I AGTTATAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 565 hom 33 2 22 9 T 12 13 203472 CASAVA_Build 4 32932947 1I AAAACAGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 937 hom 29 2 19 8 T 9 10 203473 CASAVA_Build 4 32936808 1I AAGATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 12 13 203474 CASAVA_Build 4 32938296 1D CTTTCCCTTT G/- TTTTAAATCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 1 0 203475 CASAVA_Build 4 32950711 1I TATTGTACTA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 6 7 203476 CASAVA_Build 4 32952905 1I ATGCTTTCTC -/A AAAAAATTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 7 203477 CASAVA_Build 4 32957852 1D TAATGACAGT G/- GCCTTTCTTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 2 1 203478 CASAVA_Build 4 32961233 6D TATGTGAAAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 1411 hom 33 10 18 5 AC 10 7 203479 CASAVA_Build 4 32963643 1I TTTATTCTAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 8 203480 CASAVA_Build 4 32968474 1I GTGTAATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 403 hom 38 1 33 4 A 9 10 203481 CASAVA_Build 4 32969652 1I AAAAAATAAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 7 8 203482 CASAVA_Build 4 32970291 4I TCTATCGAGG ----/TGAT TGATTATATA 3070 hom 133 het 48 0 44 5 TGAT 1 2 203483 CASAVA_Build 4 32971373 2D TTTGTACACA CG/-- CTTGTTAATT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 CG 1 0 203484 CASAVA_Build 4 32973862 1D GTAGTATAAC A/- TTACGTAAAT 3070 hom 45 het 22 0 16 8 A 1 0 203485 CASAVA_Build 4 32981536 2I ATTAAATGAC --/AT ATTCTAGATT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 AT 1 2 203486 CASAVA_Build 4 32983109 1I TAAAAGAGTG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 A 8 9 203487 CASAVA_Build 4 32990540 1I AAAAGTATCA -/T TTTTTTTATT 3068 het 3068 ref 21 9 8 4 T 7 8 203488 CASAVA_Build 4 32995483 12I AAAGTTGGGT ------------/TTCACTGGGGAC TCATCCCTGT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 TTCACTGGGGAC 0 1 203489 CASAVA_Build 4 33009728 1I GATGATAGAT -/A AAAGGCTTTG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 3 4 203490 CASAVA_Build 4 33014931 1I GGTGTCAGGG -/T GATACTTGCC 3070 hom 72 het 35 0 25 10 T 0 1 203491 CASAVA_Build 4 33015255 2D TTTTTTTGTA TT/-- TCTGTGGTAT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 3 1 203492 CASAVA_Build 4 33015394 2D TTTAGTTTCA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 11 9 203493 CASAVA_Build 4 33020345 3D AATTATATAG AAT/--- AATATATAAG 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AAT 2 1 203494 CASAVA_Build 4 33022141 2D TAGAAGAAAT AA/-- AGTCATATAC 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 A 3 1 203495 CASAVA_Build 4 33026564 1I GATCTAAAAC -/T TTAATATGGG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 2 3 203496 CASAVA_Build 4 33026633 25D ATAATTTCTG ACTCATGAAGTCTGTGCCAACCAGT/------------------------- ACTCATGAAG 3070 hom 111 het 40 0 38 6 ACTCATGAAGTCTGTGCCAACCAGT 2 1 203497 CASAVA_Build 4 33028824 2D ACTTGCAAAC AA/-- AGAGTTGAAT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 3 1 203498 CASAVA_Build 4 33055982 1D TAAGTCTAGC T/- TTGACTTCTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 2 203499 CASAVA_Build 4 33107785 1I ACTTCAAGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 442 hom 24 1 20 3 A 9 10 203500 CASAVA_Build 4 33129626 1D CTACAGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2645 hom 32 12 14 6 T 15 14 203501 CASAVA_Build 4 33221164 1I GCTGATGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 A 10 11 203502 CASAVA_Build 4 33252799 4I GTTGTTTCTC ----/TCTT TGTGTTCCTA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TCTT 0 1 203503 CASAVA_Build 4 33294138 1D TAGGCAAAAC T/- GTAGATTTTA 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 1 0 203504 CASAVA_Build 4 33344000 1D CAACTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 2345 het 2345 ref 50 33 5 12 T 12 11 203505 CASAVA_Build 4 33384597 1D ATTTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 2710 hom 52 het 26 0 16 10 G 12 11 203506 CASAVA_Build 4 33406556 1D ACCTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 11 10 203507 CASAVA_Build 4 33510312 1D CTTATGTCCG A/- AAGATTTTTA 2381 het 2381 ref 33 27 5 1 A 3 2 203508 CASAVA_Build 4 33510831 2I8M1I TAAAATCTCT --TTTTTTAT-/CCATTTTTATA AATTACTTGT 1521 het 1521 ref 37 32 4 5 N/A 0 0 203509 CASAVA_Build 4 33510947 1I GCTCAAACTG -/A ACTCCCTTCT 3070 het 3070 ref 66 37 24 6 A 1 2 203510 CASAVA_Build 4 33512652 1I GCAAGGATGC -/A AAGTCCTCCA 2648 het 2648 ref 41 29 6 6 A 2 3 203511 CASAVA_Build 4 33512898 5D AGATGTCACC ATTTT/----- ATCTTATTTT 3070 het 3070 ref 64 41 21 3 ATTTT 1 0 203512 CASAVA_Build 4 33512985 1D TTCATCTGCT C/- TTATTTCCTT 3070 het 3070 ref 48 32 12 4 C 1 0 203513 CASAVA_Build 4 33513894 1I GTTACTTGAG -/T TAAACTTTGT 3070 het 3070 ref 75 42 15 18 T 1 2 203514 CASAVA_Build 4 33513930 1I9M2D CACACCTCTC -TTTTCTCATTC/TTTTTCTCAT-- TTTTTTCTCC 1228 het 1228 ref 54 43 3 13 N/A 0 0 203515 CASAVA_Build 4 33514084 1D18M1D TGGTATGTTA TTTTTTGTTATCTTTTTTTC/-TTTTTGTTATCTTTTTTT- CTAACAGTGG 3070 het 3070 ref 69 48 8 24 N/A 0 0 203516 CASAVA_Build 4 33514847 1I ACTTGTGAGG -/T TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 45 30 12 3 T 5 6 203517 CASAVA_Build 4 33515028 2D ATGAATCTGA TT/-- TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 38 19 8 14 T 8 6 203518 CASAVA_Build 4 33515545 4I CACTTTATTA ----/TGAC TAACTATAAA 1412 het 1412 ref 39 21 5 13 TGAC 0 1 203519 CASAVA_Build 4 33518820 5I TGAAATATTT -----/TCTAA TATAAAGTGA 1747 het 1747 ref 44 31 4 10 TCTAA 0 1 203520 CASAVA_Build 4 33518974 1D TAAAAGACAT A/- AATAGAAGTA 3070 het 3070 ref 69 52 12 6 A 3 2 203521 CASAVA_Build 4 33519389 4I TTCATTCTTA ----/CAGT CAGACTCAGT 2032 het 2032 ref 49 40 6 4 CAGT 0 1 203522 CASAVA_Build 4 33519453 2D GAAGAAATGA TG/-- TATTTTTTCT 3070 het 3070 ref 69 36 26 7 TG 1 0 203523 CASAVA_Build 4 33519858 3I TTAAGTTTTT ---/TTC TTAAAGTATT 3070 het 3070 ref 56 27 23 6 TTC 0 1 203524 CASAVA_Build 4 33520065 4D TTATTAAAAG AAAT/---- AAAGAAAATT 3070 het 3070 hom 51 17 26 11 AAAT 1 0 203525 CASAVA_Build 4 33520136 1D40M3D ATGTCCTTGA TTTTTTTTATACTTCCTATTTTAGATAACTTCATCTTCTTCTTA/-TTTTTTTATACTTCCGATTTTAGATAATTTCATCTTCTTC--- TTTTCTGTTC 3019 het 3019 ref 34 34 7 6 N/A 0 0 203526 CASAVA_Build 4 33520206 4D24M2D TCTTATGCTT CTAACTATGTTGCTAGCCATATTTCATCTA/----CTATGTTGCTAGCCATATTTCATC-- TGTTAATATA 3070 het 3070 ref 39 36 13 7 N/A 0 0 203527 CASAVA_Build 4 33520484 1I GGGCCCTAAT -/G TTTAACAGCA 3070 het 3070 hom 72 24 43 5 G 0 1 203528 CASAVA_Build 4 33520786 1I39M1D TAATCAAGCC -TATAGACCTAAAATAAATAAAAATAATGGCATTTGCAACT/ATATAGACCTAAAATAAACAAAAATAAAGGCATTTGCAAC- TTTTCTTTCA 3070 het 3070 ref 36 40 14 8 N/A 0 0 203529 CASAVA_Build 4 33521008 1D AACCATGTTC T/- TACTCTTTTT 3070 het 3070 ref 70 45 20 6 T 2 1 203530 CASAVA_Build 4 33521484 2D TTCAATAAAC AT/-- ATTCTCATTA 3070 het 3070 ref 57 32 20 9 AT 2 1 203531 CASAVA_Build 4 33521946 1D AGAAATTATT A/- AAAATAAACA 3070 het 3070 ref 46 28 13 7 A 5 4 203532 CASAVA_Build 4 33522233 3D20M4I20M4I ATTTAATATT TTGTTGATTGTGTAGAATTAATA----GAATTAATAAAAGTAAAAAT----/---TTGATTGTGTAGAATTAATAAAAGTAATTAATAAAAGTAAAAATGAAG AATGAATAAA 3070 het 3070 ref 52 49 11 14 N/A 0 0 203533 CASAVA_Build 4 33523143 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1058 hom 10 het 4 0 4 0 T 11 10 203534 CASAVA_Build 4 33523569 5D2M7D GCCTATCTAT TGGGGAACCTGCCC/-----AA------- TGATATTCAC 564 het 564 ref 32 29 2 3 N/A 0 0 203535 CASAVA_Build 4 33524676 6D46M4D TTTGTAAAAG AAAAGAAAAAAAAAGAATATGCTTGCCAAGAGAAGTTGTATCAAATCAAGACAGAT/------AAAAAAATCAATATGCTTGCCAAGAGAAGTTGTATCAAATAAAGAC---- AAATGTGTTT 3070 het 3070 ref 58 60 24 16 N/A 0 0 203536 CASAVA_Build 4 33524954 1D TGACCAGCAT G/- GGGGTGCTTG 3070 het 3070 hom 104 38 45 22 G 5 4 203537 CASAVA_Build 4 33530149 1I AGAATCCTCT -/A AAAATTTAAG 2282 het 2282 ref 42 35 5 2 A 4 5 203538 CASAVA_Build 4 33531564 3I TTAAGCACAG ---/AAA AAAAAAATGG 2725 het 2725 ref 48 31 7 11 A 7 10 203539 CASAVA_Build 4 33531860 2D ACATAAGAAA AG/-- AGAGCATATG 1737 het 1737 ref 53 43 5 5 AG 3 2 203540 CASAVA_Build 4 33533942 4D AACTAAACTC CTAA/---- CTGTTGCTTA 3070 het 3070 hom 63 19 36 15 CTAA 1 0 203541 CASAVA_Build 4 33534195 2D AAAGCCTAAC TT/-- AATATTAAAG 3070 het 3070 ref 51 39 8 4 T 2 0 203542 CASAVA_Build 4 33534289 4D42M4D CTGTTCCAGT TAGATATTTTTCTGAATCCAGAAGCTAGTAACATATAATATCTCTGTACA/----TATTTTTCTGAATCCAGAAGCTAGTAACATATAATATCTCTG---- TAACATCTTT 3070 het 3070 ref 65 53 19 17 N/A 0 0 203543 CASAVA_Build 4 33535306 2D5M4D22M1I46M1I CAGGAGCCAA ATATGTAAATGAAGAAGCTTTCAGAAGATTTCA-TGTCCAACGTTTAATTCATTCCTAGACATCTAGGACTTCTCAGAAG-/--ACGTA----AAGAAGCTTTCAGAAAACTTCATTGTCCAACGTTTAATTCATTCCTAGATATCTAGGAATTCTCAGAGGC CCCAAATATT 3070 het 3070 ref 40 55 21 24 N/A 0 0 203544 CASAVA_Build 4 33535541 1D TCACAAATAG A/- AATGTTTTCT 3070 het 3070 ref 88 45 39 8 A 3 2 203545 CASAVA_Build 4 33535752 1I TGCTTTCAAC -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 65 31 26 10 A 6 7 203546 CASAVA_Build 4 33536018 1D ACAGGTAAAT A/- AAAGGGTTGC 3070 het 3070 ref 68 32 30 7 A 4 3 203547 CASAVA_Build 4 33536112 2I AGTTTTTAAT --/AA AGAGAAGACC 3070 het 3070 ref 44 32 8 6 A 1 3 203548 CASAVA_Build 4 33536419 2I AAGGGCAATA --/AT GTACATTATT 3070 het 3070 ref 84 66 12 6 AT 0 1 203549 CASAVA_Build 4 33536584 1D AAAAAGGTTT G/- GGCATTATTC 3070 het 3070 ref 68 37 19 13 G 3 2 203550 CASAVA_Build 4 33536782 2D GTTTACACTC TA/-- AACTGTATCC 3070 het 3070 ref 70 48 12 10 TA 1 0 203551 CASAVA_Build 4 33537671 4D AATTTTCAAG TTAT/---- TTTTTTCAAA 2861 het 2861 ref 48 39 6 4 TTAT 1 0 203552 CASAVA_Build 4 33538145 2D TATAAATGAC TG/-- TGCAAATAAG 3070 het 3070 ref 67 43 7 19 TG 2 1 203553 CASAVA_Build 4 33538477 1I AAATATACTG -/A GACCCAATTT 3070 het 3070 ref 42 23 8 12 A 0 1 203554 CASAVA_Build 4 33603165 10D CCTCATCTTA ATTCTCTTCT/---------- ATTCTCTACA 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 ATTCTCTTCT 1 0 203555 CASAVA_Build 4 33618740 2D TACATATGTC AT/-- ATATGTGTCA 3070 het 3070 ref 28 17 10 2 AT 3 2 203556 CASAVA_Build 4 33683142 2D AGTCATAGCT TC/-- TGTTTTACAA 2952 het 2952 ref 51 38 8 6 TC 1 0 203557 CASAVA_Build 4 33683378 2I TCTTTTCATC --/AA AAATTGGTCT 3070 het 3070 ref 63 38 18 8 A 3 5 203558 CASAVA_Build 4 33685329 3D TGGTCATATA CAT/--- CTCAAGCTAA 2884 het 2884 ref 51 36 9 8 CAT 1 0 203559 CASAVA_Build 4 33685899 1D TTTGTCAATG A/- AATTCCCCAC 3070 het 3070 ref 37 25 9 5 A 3 2 203560 CASAVA_Build 4 33738817 63D CTTCCTTTAC AGAGTTTCACATCATCTCTGATTTTATCTTCCACCATCCTCATAACTCCATCTTCTCACAGCA/--------------------------------------------------------------- TGAGTTTTAC 3070 het 3070 ref 25 22 14 1 AGAGTTTCACATCATCTCTGATTTTATCTTCCACCATCCTCATAACTCCATCTTCTCACAGCA 1 0 203561 CASAVA_Build 4 33868273 2I CCAGACGTGG --/CT CTCAAAGGAG 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 CT 1 2 203562 CASAVA_Build 4 34023868 1I ATTTAAGTGA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 6 7 203563 CASAVA_Build 4 34028464 7D ACACCCTCAT CTACACA/------- CTACACATAT 3070 het 3070 hom 40 16 21 6 CTACACA 2 1 203564 CASAVA_Build 4 34029837 3I TGGCTGCCAT ---/AAC AAATTACCAC 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 AAC 0 1 203565 CASAVA_Build 4 34031233 1I TTTTGCGGGC -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 6 7 203566 CASAVA_Build 4 34031527 3I AAGCAAAGCT ---/ATA ATATTTCTCT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 ATA 1 2 203567 CASAVA_Build 4 34032207 4I CCTTGACTTA ----/TTAC TTCTCTGCTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TTAC 0 1 203568 CASAVA_Build 4 34037104 1D CCTGTTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 16 9 A 12 11 203569 CASAVA_Build 4 34043709 1D AGTCAAAAAA G/- GTAAAGATAG 3070 het 3070 hom 57 19 27 11 G 2 1 203570 CASAVA_Build 4 34044397 2D AATGGATGTG TC/-- TCTCTCTCTG 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 TC 5 4 203571 CASAVA_Build 4 34044572 2I TTGAGATTAT --/TG TGTGTCTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 TG 2 3 203572 CASAVA_Build 4 34046103 1I AAAGCTAAAA -/G AAGTGAAAAA 1345 het 1345 ref 31 17 8 6 G 0 1 203573 CASAVA_Build 4 34047071 1I GCCATAATGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 G 0 1 203574 CASAVA_Build 4 34055266 4I TTTATTAAGT ----/GATA GATAGATCAA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 GATA 1 2 203575 CASAVA_Build 4 34067722 4I ATTAATATTT ----/CTGA CTATGTGTAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 CTGA 0 1 203576 CASAVA_Build 4 34069114 1D ACATGTCAGG T/- TTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 T 7 6 203577 CASAVA_Build 4 34072143 1I TTCTAAAGGC -/A AAAGCTAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 3 4 203578 CASAVA_Build 4 34073633 6I ACACACACAC ------/ACACAG ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 ACACAG 0 1 203579 CASAVA_Build 4 34087967 1D ACAAAGGGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 T 10 9 203580 CASAVA_Build 4 34090976 2D TTCAGTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 T 12 10 203581 CASAVA_Build 4 34091147 1D TATCTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2651 hom 28 7 13 8 A 13 12 203582 CASAVA_Build 4 34091826 3I ATTATCTAAA ---/TAT TAGTCAGCTC 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 TAT 0 1 203583 CASAVA_Build 4 34095802 1I TTTCCAGTTA -/G GTTAGGCCAC 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 G 1 2 203584 CASAVA_Build 4 34096226 2D TATTTATAAC AT/-- GTGTGTATAT 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 AT 1 0 203585 CASAVA_Build 4 34098409 1D TATTTTCGGC G/- GGGGGGGGGC 2678 het 411 hom 14 3 7 4 G 10 9 203586 CASAVA_Build 4 34108719 1D GCTTTTCTCA T/- TTTTTTTTTG 2602 het 2602 ref 22 9 6 8 T 10 9 203587 CASAVA_Build 4 34117623 1D TTGTACTGGG T/- TTGAAAACCA 3070 het 3070 ref 31 19 7 7 T 3 2 203588 CASAVA_Build 4 34118142 1D ACACTACCCA T/- TTTTAGAAAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 T 5 4 203589 CASAVA_Build 4 34119196 2D GCACACACAC AT/-- GTGCACACAT 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 AT 1 0 203590 CASAVA_Build 4 34125585 1D CAATGAAAAA C/- CATTTTTATA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 C 2 1 203591 CASAVA_Build 4 34131177 1I GTGTATATAT -/A TTTATATGTA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 0 1 203592 CASAVA_Build 4 34132521 2I ACCCAGAGAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 AT 7 8 203593 CASAVA_Build 4 34149411 1D ACTTTCTTAC A/- TATGAGATTC 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 A 1 0 203594 CASAVA_Build 4 34151625 4I TCAATTTTCT ----/CTTA CTGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 CTTA 0 1 203595 CASAVA_Build 4 34153940 1I CTAAAAAATT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 A 6 7 203596 CASAVA_Build 4 34160599 1I GTAAAATATA -/T AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 T 0 1 203597 CASAVA_Build 4 34164384 1I TATTTAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 16 20 10 T 11 12 203598 CASAVA_Build 4 34165608 1D TGTAGGAGTT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 7 6 203599 CASAVA_Build 4 34170073 1I TCTACAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2119 hom 27 7 14 6 A 11 12 203600 CASAVA_Build 4 34174162 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1570 hom 17 4 9 5 A 13 12 203601 CASAVA_Build 4 34205284 1D TTGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 18 22 7 T 10 9 203602 CASAVA_Build 4 34207814 1I TATTTTGAAG -/T TTTTTTTTGT 3016 het 3016 ref 28 14 11 3 T 8 9 203603 CASAVA_Build 4 34209334 1I CCATCACCAT -/C CCATTTTTCA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 2 3 203604 CASAVA_Build 4 34211265 1I TAGGTAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 9 10 203605 CASAVA_Build 4 34211691 1I GTTTTCTCTG -/A CTGCAGCTAG 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 A 0 1 203606 CASAVA_Build 4 34211831 8D GGACAAGCGT ATACCTAA/-------- ATAAAGTCTA 3070 het 3070 ref 56 27 21 13 ATACCTAA 1 0 203607 CASAVA_Build 4 34216933 1D AATGTTTAAC T/- TTTTTTTTTA 2529 het 2529 ref 29 16 7 6 T 10 9 203608 CASAVA_Build 4 34218393 1I TACTTAAAAA -/T AGCTTTACAC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 0 1 203609 CASAVA_Build 4 34221774 1D GCCATAATAC T/- TAAGAAACAA 3070 het 3070 ref 48 23 21 5 T 2 1 203610 CASAVA_Build 4 34226233 1D CCCCTCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 43 1 31 12 A 12 11 203611 CASAVA_Build 4 34229425 2D50M1D TCCAGCACTG TCTCTCTGTGCAGCTCTCTTTTCTTCGTGTTCTACTCTGTGAATCCTAGCAGC/--TCTCTGTGCAGCTCTCTTTTCTTCGTGTTCTACTCTGTGAATCCTAGCAG- CTTAACCTCT 3070 het 3070 ref 34 22 14 8 N/A 0 0 203612 CASAVA_Build 4 34233254 1D AATTTACATA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 9 8 203613 CASAVA_Build 4 34246834 2I CATTAAAGAG --/AT ATGTGTAATG 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 AT 1 2 203614 CASAVA_Build 4 34248149 1I GAAAGAAAGG -/A AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 A 6 7 203615 CASAVA_Build 4 34286143 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2361 het 502 hom 19 4 8 7 T 16 15 203616 CASAVA_Build 4 34350748 1D GGAACTGACC A/- AAAAAAAAAA 1794 het 1794 ref 29 19 4 6 A 14 13 203617 CASAVA_Build 4 34368712 1I TAGTGGATAA -/T TTTTTACCTG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 5 6 203618 CASAVA_Build 4 34391697 4D AAAGTTAGTC CAGA/---- CAAAGAGATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CAGA 1 0 203619 CASAVA_Build 4 34392962 1D GTAGGTAGAG T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 6 203620 CASAVA_Build 4 34399373 2D GTTTGTTATA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 66 het 30 0 22 10 GT 9 8 203621 CASAVA_Build 4 34421992 2I CTCAGGAAAC --/TT AATAATCATA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 2 203622 CASAVA_Build 4 34443230 1I TTTTGTGCAG -/A GGGGTGCTTC 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 A 0 1 203623 CASAVA_Build 4 34447690 1I TAATCTATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 8 15 5 T 9 10 203624 CASAVA_Build 4 34450116 1D ATATTATATG C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 C 1 0 203625 CASAVA_Build 4 34451100 1I ATATTCTATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 8 9 203626 CASAVA_Build 4 34451212 1D ATATAGGCAT C/- ACTATTTAGA 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 C 1 0 203627 CASAVA_Build 4 34451915 2I TAAAAATATG --/TA TATATATATA 2684 het 2684 ref 22 13 7 2 TA 5 6 203628 CASAVA_Build 4 34455642 1D TATACTTGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 9 8 203629 CASAVA_Build 4 34505478 2D CTCTGTCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2534 het 491 hom 12 4 6 2 A 19 17 203630 CASAVA_Build 4 34513510 2I CAATTATATC --/TT TACAAACTTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 1 3 203631 CASAVA_Build 4 34515475 1D TGTGTGTGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 9 8 203632 CASAVA_Build 4 34523395 7D ATTCAGTAGT ATTTAAA/------- GTATTTAAAG 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 ATTTAAA 1 0 203633 CASAVA_Build 4 34526910 8D ATAGTTTTAT ATATATAC/-------- ATATATACAT 1663 het 1663 ref 12 5 4 3 ATATATAC 3 2 203634 CASAVA_Build 4 34530705 1I GGTATTTTCA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 6 7 203635 CASAVA_Build 4 34532418 1D GGACCTTTAA C/- CCCCATACTC 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 C 5 4 203636 CASAVA_Build 4 34541259 1I TATACTCATA -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 5 6 203637 CASAVA_Build 4 34549910 4D GAAAGATAAT ATAA/---- CGTTCCGTTC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 ATAA 1 0 203638 CASAVA_Build 4 34552700 1I CAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAC 1244 het 1244 ref 19 11 3 5 A 9 10 203639 CASAVA_Build 4 34554710 9D CACAATTGCT ATAAAGAGA/--------- ATAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 24 13 12 0 ATAAAGAGA 2 1 203640 CASAVA_Build 4 34555344 1D CTAAAACCAT A/- AAAAAACCTT 1757 het 1757 ref 17 10 5 3 A 7 6 203641 CASAVA_Build 4 34578401 2I CAATATACTC --/AA GAGTTAAAAG 2903 het 1483 hom 13 3 8 2 A 0 2 203642 CASAVA_Build 4 34581739 1D GATTTGGCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 10 10 T 10 9 203643 CASAVA_Build 4 34583012 6I AAGTTTTGGG ------/GATTTA GCAGCGTATT 3070 het 3070 hom 47 19 27 1 GATTTA 0 1 203644 CASAVA_Build 4 34584755 3I TCATGCTATT ---/CTC CTGAAAGTGA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 CTC 0 1 203645 CASAVA_Build 4 34587762 1I ATAAAACTTC -/A AAAAAATTTG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 6 7 203646 CASAVA_Build 4 34594007 4I AAAGAAAGAA ----/AGAG AGAGAGAAAG 1986 het 1986 ref 34 15 9 10 AG 3 5 203647 CASAVA_Build 4 34601917 1D TCCAGATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 11 10 203648 CASAVA_Build 4 34602576 4I GCAGTTCTGT ----/AATC AATCCCCAAC 3070 het 3070 ref 28 19 8 1 AATC 1 2 203649 CASAVA_Build 4 34602972 1D GTTACATGGA G/- CACCACTAAT 3070 het 3070 hom 48 24 23 1 G 1 0 203650 CASAVA_Build 4 34603977 1I TTGGAAGTGG -/T GTTCTGCTGA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 0 1 203651 CASAVA_Build 4 34610702 22D TTTGCGAAAT GTGTTGGTACTTGATCTTCCAA/---------------------- GTGTGTGGCT 3070 het 3070 hom 28 17 16 3 GTGTTGGTACTTGATCTTCCAA 1 0 203652 CASAVA_Build 4 34613015 1I CCACGCCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 9 10 203653 CASAVA_Build 4 34625214 4D TAATATATCA AACT/---- AATTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 14 15 1 AACT 1 0 203654 CASAVA_Build 4 34626893 1I AGACCAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 12 15 A 12 13 203655 CASAVA_Build 4 34628080 1D AACAACCACC A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 6 A 7 6 203656 CASAVA_Build 4 34634570 2D GGTCCAGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 6 A 13 11 203657 CASAVA_Build 4 34636998 1I TTAGTTCTTC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 8 9 203658 CASAVA_Build 4 34641979 2D ATATTTTGAA AT/-- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AT 2 1 203659 CASAVA_Build 4 34642711 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2742 hom 33 11 16 6 T 11 10 203660 CASAVA_Build 4 34643702 1I AATTGGATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 9 10 203661 CASAVA_Build 4 34656575 1I TTTGTTTAGC -/A AAAAAAAAAA 2216 het 2216 ref 23 12 6 5 A 14 15 203662 CASAVA_Build 4 34671793 3D TTTTTGTCTG GTA/--- GACTAGGGGG 3070 hom 43 het 21 0 14 9 GTA 1 0 203663 CASAVA_Build 4 34676054 2I TAGAAAAATA --/TT TTTTTTTTTT 2979 het 2979 ref 32 16 8 8 T 10 12 203664 CASAVA_Build 4 34689769 1D CCTGTTTAGA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 7 6 203665 CASAVA_Build 4 34719456 1I ATTCCTAGTA -/C CCCATAGTTA 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 C 3 4 203666 CASAVA_Build 4 34721132 1I TGTAAGCCTC -/T TTTTTTATTC 3070 het 3031 hom 23 8 12 3 T 6 7 203667 CASAVA_Build 4 34722236 8D TTTAGCATAG GAATGGCA/-------- TAATCATGGT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 GAATGGCA 1 0 203668 CASAVA_Build 4 34726768 1D TACTTACATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 T 10 9 203669 CASAVA_Build 4 34727545 1I GATTATAATG -/T TTTTCATTTA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 T 4 5 203670 CASAVA_Build 4 34728950 1D AATAGTCTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 10 9 203671 CASAVA_Build 4 34735622 1D CACTCATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 12 14 T 12 11 203672 CASAVA_Build 4 34742903 6D AGCTATGTAT TATATA/------ TATATAAAGT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 TA 6 3 203673 CASAVA_Build 4 34744799 5D TTGTTGGTGA CCTTC/----- GGCAAATCAT 3070 het 3070 hom 29 12 16 2 CCTTC 1 0 203674 CASAVA_Build 4 34746958 4I TTTCGTTGTT ----/TTTC TTTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 TTTC 0 1 203675 CASAVA_Build 4 34750436 1D GAATCTAAGC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 8 7 203676 CASAVA_Build 4 34754558 3I AATGGAAGTT ---/GGA GGATACAATG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 GGA 1 2 203677 CASAVA_Build 4 34754902 1I GCTTTTTTTT -/C TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 C 0 1 203678 CASAVA_Build 4 34777014 1I GATAAACTTT -/C CCCCCCAGGA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 C 6 7 203679 CASAVA_Build 4 34778547 1D GAGAAAGAGA C/- CCCCCCCCAT 3070 het 2991 hom 25 11 9 5 C 9 8 203680 CASAVA_Build 4 34795886 4I ATCTAGACTT ----/AGAA AGAGAGAATT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AGAA 0 1 203681 CASAVA_Build 4 34829086 1I CACCAAGGCC -/A AAAATGGCAC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 4 5 203682 CASAVA_Build 4 34843938 2I ATGAATAATT --/TG TGATTAAATT 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 TG 1 2 203683 CASAVA_Build 4 34861054 1I TAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 9 10 203684 CASAVA_Build 4 34874440 1D AAAAACAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 T 11 10 203685 CASAVA_Build 4 34875563 4D GGAAGGAAAC TATG/---- TATGTCACCC 3070 het 3070 ref 44 22 17 7 TATG 2 1 203686 CASAVA_Build 4 34877563 1D GCTCTGTAGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 A 9 8 203687 CASAVA_Build 4 34880027 4D TCCTTGCCTT CGAA/---- CGAACATTGG 3070 het 2144 hom 18 5 8 8 CGAA 2 1 203688 CASAVA_Build 4 34896106 4I TATATATATA ----/TATG TGTGTGTGTG 3060 het 1133 hom 12 3 8 1 TATG 0 1 203689 CASAVA_Build 4 34899828 1I AAAAAACATT -/A AAAGCCCTTA 3070 het 3070 hom 21 11 9 1 A 3 4 203690 CASAVA_Build 4 34900199 1I GTCATAAGAG -/C TTTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 C 0 1 203691 CASAVA_Build 4 34901067 1D GAGAGGAATC T/- TTTATATTAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 4 3 203692 CASAVA_Build 4 34901735 1I ACTGGTCTTC -/T TTTCCCCAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 3 4 203693 CASAVA_Build 4 34902420 2D TATTAGAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 17 13 13 AC 10 9 203694 CASAVA_Build 4 34924514 1I AGTAAACCGT -/A AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 6 7 203695 CASAVA_Build 4 34926435 1I TGGATCCCTT -/A AAAAAAGTCC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 6 7 203696 CASAVA_Build 4 34937722 2D GAGAGACAGG GA/-- GAGAGAGACC 3070 het 3070 ref 39 16 11 13 GA 5 4 203697 CASAVA_Build 4 34942020 2D TGGAAACATA CT/-- CTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 47 21 25 2 CT 2 1 203698 CASAVA_Build 4 34950575 1I ACATTTTAAA -/T TATAAAAGTG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 1 2 203699 CASAVA_Build 4 34960776 8D ACACACACAG ACAGACAA/-------- ACACACAAAC 3070 het 3070 hom 62 33 28 3 ACAGACAA 1 0 203700 CASAVA_Build 4 34963667 1I CATCTTCGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 9 10 203701 CASAVA_Build 4 34969771 2D TATATATATA TT/-- TGTATGTTAT 3070 het 3070 hom 41 19 18 5 T 3 1 203702 CASAVA_Build 4 34974178 7D TTTCCTTAGT AAATTTG/------- AAATTTGAAT 3070 hom 120 het 44 0 39 6 AAATTTG 2 1 203703 CASAVA_Build 4 34990639 1D TGGCACACGT A/- AACCTAAGTA 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 A 3 2 203704 CASAVA_Build 4 34995734 1D AAACTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 A 12 11 203705 CASAVA_Build 4 35004641 1I TATCTAATGA -/T TTATCACAAT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 T 2 3 203706 CASAVA_Build 4 35007989 1I TTCTTCCATT -/G GAAAAAAATA 3070 het 414 hom 33 1 30 2 G 1 2 203707 CASAVA_Build 4 35008242 1D AATAGAAAAC A/- AAATATTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 4 3 203708 CASAVA_Build 4 35008993 3I GATCACTCAG ---/AAA AAATAGTGAT 2666 het 2666 ref 27 18 6 3 A 3 6 203709 CASAVA_Build 4 35010595 1I AGCACCACAG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 7 203710 CASAVA_Build 4 35011055 1D TTATGATGTA G/- TTTTTTGAAC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 G 1 0 203711 CASAVA_Build 4 35012778 12D CAAATACCGT AAATCATCTCTC/------------ TCCAACTCAA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 AAATCATCTCTC 1 0 203712 CASAVA_Build 4 35018067 1D CTAATAAAAC T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 7 6 203713 CASAVA_Build 4 35025969 4D AGTAAAGAAA CTAT/---- CTGAGAGTAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CTAT 1 0 203714 CASAVA_Build 4 35028919 1I AAATCATCTC -/T TTTCACGTTT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 3 4 203715 CASAVA_Build 4 35030415 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 9 8 203716 CASAVA_Build 4 35030848 4D25M1D CTCATGCTTG TAAATAAATATTCATTTGTTCAACTCATAT/----TAAATATTCATTTGTTCAACTCATA- ATATCTTGAT 3070 hom 141 het 47 0 48 7 N/A 0 0 203717 CASAVA_Build 4 35031177 1D TTAAAAAATT A/- TAATAACATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 0 203718 CASAVA_Build 4 35031935 1D5M4I AATTTTAAAT GCTAAT----/-TTAATTTAA AAGTAAATTC 3070 hom 69 het 26 0 24 4 N/A 0 0 203719 CASAVA_Build 4 35033344 3I TAAGGAAAAC ---/AAT AATTGGAGGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AAT 1 2 203720 CASAVA_Build 4 35033515 3I ATAAGAAAAC ---/AAT AAAGCTGTAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AAT 0 1 203721 CASAVA_Build 4 35035886 1I CCGACTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 28 0 26 2 T 10 11 203722 CASAVA_Build 4 35038256 1D AATTTTAAGA T/- TGTTTTTCCT 3070 hom 102 het 38 0 35 5 T 2 1 203723 CASAVA_Build 4 35041569 1I TTTTCCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 26 1 16 9 T 11 12 203724 CASAVA_Build 4 35041673 3D ATATCTTGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 14 11 203725 CASAVA_Build 4 35051223 13D AAAAAAGTAT AGCTGGTCAGCAA/------------- AGCGGTACAA 3070 hom 90 het 32 0 31 4 AGCTGGTCAGCAA 1 0 203726 CASAVA_Build 4 35054228 1I GCATCAAGCT -/A AAAAACTTCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 5 6 203727 CASAVA_Build 4 35079838 1I TAAGTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 11 12 A 13 14 203728 CASAVA_Build 4 35086676 1D GATTTTGAGG C/- CCCCCCCAGC 2656 het 2656 ref 26 15 8 3 C 8 7 203729 CASAVA_Build 4 35086867 1D ATTTATGTTG T/- TTTTTTGACC 3070 het 3070 ref 35 20 9 7 T 7 6 203730 CASAVA_Build 4 35101936 1D AAGAATATGC T/- TTTTTTTTTT 1378 het 1378 ref 33 25 3 6 T 12 11 203731 CASAVA_Build 4 35142265 2D AATTGAACTT AA/-- GTCAACATTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 2 0 203732 CASAVA_Build 4 35196052 2D AACATGACTC TT/-- ATATTTTATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 0 203733 CASAVA_Build 4 35197027 1I AGAGGCTGTT -/A AAAATAGCCA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 4 5 203734 CASAVA_Build 4 35197681 1D CATCGGTTAT C/- TCTTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 1 0 203735 CASAVA_Build 4 35197856 1I TGCTTTCTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 8 9 203736 CASAVA_Build 4 35198140 1D GGTTTCCACC T/- CACAAATTGA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 T 1 0 203737 CASAVA_Build 4 35198722 1I42M2I GGTTTGTTTT -CCTCAGAGGGAAATCTACTGTCTTTCAATCATGTATTTTCAA--/GCTTCAGAGGGAAATCTACTGTCTTTCAATCATGTATTTTCAATT TTCTTTTAAT 3070 hom 114 het 30 0 38 10 N/A 0 0 203738 CASAVA_Build 4 35199212 2I GGTAGCATAT --/TC ACAGCTTTCA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 TC 0 1 203739 CASAVA_Build 4 35200025 3I TTTTAAAAAA ---/TAT TATATAAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAT 1 2 203740 CASAVA_Build 4 35201496 12D GGGAGGTGAA AACTTATAAAAT/------------ AGACTTCAGG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AACTTATAAAAT 1 0 203741 CASAVA_Build 4 35204506 2D CGTACAGTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 41 0 30 13 TG 8 7 203742 CASAVA_Build 4 35205156 8I AATAAATCTG --------/TCTAACAC TTGTTTTCTC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TCTAACAC 0 1 203743 CASAVA_Build 4 35205681 1I TTTGAGTTGA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 8 203744 CASAVA_Build 4 35247614 3I AAAGCCAATT ---/ATA ATAATAAGGT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 ATA 2 3 203745 CASAVA_Build 4 35251055 1D TTTTATGTAC T/- TTTAATAAAT 3070 het 3070 hom 34 17 17 1 T 4 3 203746 CASAVA_Build 4 35258371 4I GTTTTTGTTG ----/GTTT GTTTGTTTGC 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 GTTT 2 3 203747 CASAVA_Build 4 35259407 1I TATCTCCTAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 8 9 203748 CASAVA_Build 4 35268860 1D TACCAACTTT G/- CCAACTATTC 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 G 1 0 203749 CASAVA_Build 4 35278544 1D TTTTTACAGG A/- AAAAAAAGTT 2716 het 2716 ref 29 17 8 4 A 8 7 203750 CASAVA_Build 4 35279268 1D GCCTGCCACC A/- AAGGTAAAGA 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 A 3 2 203751 CASAVA_Build 4 35280429 1D TAAAATTATA T/- GTAATTTGGG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 1 0 203752 CASAVA_Build 4 35281264 1D TGCTTTGTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 10 9 203753 CASAVA_Build 4 35282044 2D CAAAAATAAA AG/-- AAAAGTAATA 3015 het 3015 ref 28 16 8 6 AG 1 0 203754 CASAVA_Build 4 35282333 7D AGTGAGTTTT TTCTGAC/------- TTACACAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 TTCTGAC 1 0 203755 CASAVA_Build 4 35282682 1D CCATTACCCC A/- AAATAAGAAG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 4 3 203756 CASAVA_Build 4 35283279 3D AGAGGAAAAA ATG/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 ATG 1 0 203757 CASAVA_Build 4 35286027 4I ATGCACAAAT ----/ACAC ACACAAATAA 3070 het 3070 ref 50 26 19 5 AC 2 4 203758 CASAVA_Build 4 35287519 1I GTTTGGGCAA -/T GATGTTTTGG 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 T 0 1 203759 CASAVA_Build 4 35293756 1D ATTTTAAACA T/- TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 7 6 203760 CASAVA_Build 4 35295745 1I AAAATCCTAG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 A 7 8 203761 CASAVA_Build 4 35298157 1D TGGGGAAATT G/- GACCAGTAGG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 G 2 1 203762 CASAVA_Build 4 35301727 4I AATAATAATA ----/ATAG ATAGAAATTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 ATAG 1 2 203763 CASAVA_Build 4 35318644 3I AATAACTATG ---/ATA ATATATAAAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 ATA 1 2 203764 CASAVA_Build 4 35323098 1D ATATATTCTG T/- TTTTTTTTTA 3003 het 3003 ref 22 13 7 2 T 10 9 203765 CASAVA_Build 4 35325499 1D TTCTTCGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 16 10 A 13 12 203766 CASAVA_Build 4 35334109 1D GAAAGTAATT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 8 7 203767 CASAVA_Build 4 35334986 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 27 1 12 14 T 13 14 203768 CASAVA_Build 4 35372214 1I CTTTGAATAT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 7 8 203769 CASAVA_Build 4 35372712 2I GCAAAAAAAA --/AC AAAAAATGCC 3070 hom 53 het 22 0 18 4 AC 0 1 203770 CASAVA_Build 4 35372938 2D CCAAGGTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 28 0 20 8 T 17 15 203771 CASAVA_Build 4 35373143 1I AGTGAGCAAT -/A AAAAATACAA 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 5 6 203772 CASAVA_Build 4 35374211 2D ATGCACACAC AT/-- GTGCACACGC 3070 hom 90 het 32 0 30 4 AT 1 0 203773 CASAVA_Build 4 35374862 2I AAAAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 17 1 14 2 A 11 13 203774 CASAVA_Build 4 35375577 2D CCCAGGAGCA GG/-- GGGGGGGATA 3070 hom 60 het 24 0 20 8 G 9 7 203775 CASAVA_Build 4 35381873 1D ATATAAGTAG T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 7 6 203776 CASAVA_Build 4 35385145 2D TTTTTTTTTT TG/-- TAATTCTGGG 3070 het 1392 hom 48 14 17 19 TG 1 0 203777 CASAVA_Build 4 35387667 1D TGTAGCTGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 14 2 T 10 9 203778 CASAVA_Build 4 35392017 4I TCTAAGAAAG ----/AAAC AAACAAAATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAAC 1 2 203779 CASAVA_Build 4 35392993 1D AGGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAG 1523 het 1523 ref 37 29 4 4 A 10 9 203780 CASAVA_Build 4 35393580 1D CACTTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 555 hom 30 2 16 13 A 13 12 203781 CASAVA_Build 4 35399904 1D GTTTTATTGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 62 het 24 0 21 3 A 9 8 203782 CASAVA_Build 4 35400075 1D CAAGGTTTTC A/- AATACTATCT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 A 3 2 203783 CASAVA_Build 4 35407795 1D AGTGATGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1410 hom 45 3 32 12 T 12 11 203784 CASAVA_Build 4 35422840 8I CATCATCTTG --------/ACACCAAA ACCTGGCAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ACACCAAA 0 1 203785 CASAVA_Build 4 35422949 1I GCAGCACATC -/A AAAACCTTGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 4 5 203786 CASAVA_Build 4 35424941 2I CCTGAATGAC --/AA AATATTCTGT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 2 4 203787 CASAVA_Build 4 35447307 2D GTGATATAAA AT/-- AGAGTCTTGG 3070 hom 126 het 47 0 43 5 AT 1 0 203788 CASAVA_Build 4 35449140 12D ATTGAACAAA GTTTTTTTTTTT/------------ GTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 5 GTTTTTTTTTTT 2 1 203789 CASAVA_Build 4 35453770 3D AGTGGATCTT AAG/--- AAGTTTAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 AAG 2 1 203790 CASAVA_Build 4 35454593 1I TGAAAAAAAA -/G AAAAACTCCA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 G 0 1 203791 CASAVA_Build 4 35456209 1I AGTGCCAGCA -/G GCCACTGTGC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 G 1 2 203792 CASAVA_Build 4 35459389 1D AAATTTATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 10 9 203793 CASAVA_Build 4 35481568 13I TAAAAATATT -------------/AAAATTAAATTGA AAAAAGAGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAAATTAAATTGA 0 1 203794 CASAVA_Build 4 35482016 2I TAATATACAC --/AT ATATATATTG 3070 hom 21 het 10 0 8 2 AT 4 5 203795 CASAVA_Build 4 35482921 1D AGTGTGTTTG A/- GAAAAGATGC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 A 1 0 203796 CASAVA_Build 4 35488043 2D TCATGCAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 1819 het 1038 hom 33 7 10 16 AC 1 0 203797 CASAVA_Build 4 35504977 14D ACATACATAA ATATATATATATAT/-------------- ATATATATAT 1647 hom 28 het 21 0 10 13 AT 15 8 203798 CASAVA_Build 4 35507117 1D TTTTCTTTAT A/- AAAAATCAGA 3070 hom 65 het 26 0 21 6 A 6 5 203799 CASAVA_Build 4 35521694 3D AAAACTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTG 4 3 203800 CASAVA_Build 4 35554908 4I CTCTTTCCTT ----/TCTC TCTCTCCTCA 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 TC 3 5 203801 CASAVA_Build 4 35559491 1I ACTAAATTTT -/A AAATTAATAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 3 4 203802 CASAVA_Build 4 35561007 1D GTTTCTGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2992 hom 29 7 18 4 A 13 12 203803 CASAVA_Build 4 35561779 1I CACATTTTTA -/T TGACTATACA 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 T 1 2 203804 CASAVA_Build 4 35562210 4D ACCACTTTTA CTTT/---- CTATCATCAT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 CTTT 1 0 203805 CASAVA_Build 4 35567907 1D ATTCTCGTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 T 8 7 203806 CASAVA_Build 4 35571099 3I ATATTGTAAC ---/ATA ATATTTTTAG 3070 hom 30 het 14 0 11 3 ATA 1 2 203807 CASAVA_Build 4 35574842 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 9 10 203808 CASAVA_Build 4 35576340 2I AAAAACTGCA --/CT GAGCTCTCTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CT 0 1 203809 CASAVA_Build 4 35582979 2I TGCCCAAGAC --/GA TACTGTTGTC 3070 hom 165 het 60 0 54 6 GA 0 1 203810 CASAVA_Build 4 35584326 1I TTCAAACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 9 10 203811 CASAVA_Build 4 35584973 3D AACATCAGTG TCA/--- TCATAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 24 14 6 TCA 2 1 203812 CASAVA_Build 4 35587965 4D TCAATGAAAT AAAC/---- AATTGCACAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 AAAC 1 0 203813 CASAVA_Build 4 35590885 1D GCATGTGAAA G/- CAACACTGAG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 G 1 0 203814 CASAVA_Build 4 35594797 3I AAAGTCTTTT ---/GAC GACTTTTATG 3070 hom 96 het 41 0 32 9 GAC 1 2 203815 CASAVA_Build 4 35597614 1I GAACATGAAG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 7 8 203816 CASAVA_Build 4 35598561 7I CATTGTTAGA -------/ACTTATC ACTTATCAGC 3070 hom 90 het 40 0 30 10 ACTTATC 1 2 203817 CASAVA_Build 4 35600669 2D TTGTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 32 0 25 8 T 12 10 203818 CASAVA_Build 4 35603425 2D AGTATAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 59 28 21 11 A 12 10 203819 CASAVA_Build 4 35604723 1D AGTTCAGCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 8 16 17 A 14 13 203820 CASAVA_Build 4 35608722 1D ATTTTTCCTT C/- CAAATTCATT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 C 2 1 203821 CASAVA_Build 4 35609128 3I ACTGAGTTTC ---/ATA ATAAGTGATA 2498 het 2498 ref 32 18 8 6 ATA 1 2 203822 CASAVA_Build 4 35630397 1D AGAAATTTAC A/- ATGTCTAATG 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 2 1 203823 CASAVA_Build 4 35648344 2I TAAAAATGCA --/TT GTTATATTAT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 0 2 203824 CASAVA_Build 4 35649502 1I CTCTGCTTTT -/C CCCCTCTCAT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 C 4 5 203825 CASAVA_Build 4 35650286 2I GACGTATCAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TA 5 6 203826 CASAVA_Build 4 35656616 4D ATGTAATCCA TAGT/---- TAAACTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 TAGT 1 0 203827 CASAVA_Build 4 35674341 1D TCAGCCAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 11 10 203828 CASAVA_Build 4 35674809 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 12 11 203829 CASAVA_Build 4 35694528 2D GAAATCTTTC AG/-- AGTTAAGAGA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 AG 2 1 203830 CASAVA_Build 4 35701980 2D TTTAATCAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 39 0 36 5 A 12 10 203831 CASAVA_Build 4 35706638 1I TTTTTTCCTG -/A AAAAAATCAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 7 203832 CASAVA_Build 4 35709684 1I ATTTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 23 1 18 4 T 13 14 203833 CASAVA_Build 4 35711026 1D CCTGATCTCA T/- TTTTTTGTGG 3070 hom 114 het 44 0 38 9 T 7 6 203834 CASAVA_Build 4 35711512 1D AATGGGGTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 26 1 19 6 T 11 10 203835 CASAVA_Build 4 35718720 2D ATCTAGAAAC TT/-- TGCTGAAGTT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 T 3 1 203836 CASAVA_Build 4 35734929 3D AAGACATTAT ATC/--- ATCATTTAGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ATC 2 1 203837 CASAVA_Build 4 35735071 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 33 1 27 5 T 11 10 203838 CASAVA_Build 4 35742224 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 23 0 14 10 T 15 13 203839 CASAVA_Build 4 35747045 1D AAGGTTTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 10 9 203840 CASAVA_Build 4 35749711 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTCT 1977 hom 21 het 9 0 8 1 T 8 9 203841 CASAVA_Build 4 35776073 1D TCGCACCTCC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 10 9 203842 CASAVA_Build 4 35779414 2I AGTACCAGAG --/AT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AT 0 1 203843 CASAVA_Build 4 35780005 4I GGCATTGCTC ----/TCTT TCTTTCTTGA 3070 hom 90 het 42 0 31 11 TCTT 2 3 203844 CASAVA_Build 4 35782220 1I CTCCCCCACC -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 103 het 40 0 33 7 T 7 8 203845 CASAVA_Build 4 35784496 2D TGTAAGATAT AA/-- AAGACAGTGT 3070 hom 111 het 44 0 37 8 A 4 2 203846 CASAVA_Build 4 35785836 5D CAATCATATC TTATG/----- TTATATTATA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TTATG 1 0 203847 CASAVA_Build 4 35787874 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCTCCCC 3070 hom 56 het 22 0 17 5 C 5 6 203848 CASAVA_Build 4 35797536 1I AACCAATTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 10 11 203849 CASAVA_Build 4 35806771 1D ACCTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 11 10 203850 CASAVA_Build 4 35817122 5D GTATGATTTC ATTTT/----- ATTAACCATG 3070 het 3070 hom 35 16 16 5 ATTTT 1 0 203851 CASAVA_Build 4 35827329 4D AACTCTTGTC CAGT/---- CAGTCATTTA 3070 het 3070 hom 54 20 27 8 CAGT 2 1 203852 CASAVA_Build 4 35830691 1I CTGAAGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 8 10 A 11 12 203853 CASAVA_Build 4 35835399 2D AATGGAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 37 9 A 13 11 203854 CASAVA_Build 4 35838669 1I CTGAATTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 39 1 33 5 A 10 11 203855 CASAVA_Build 4 35845102 4D ATAAAGAAAC AAAA/---- AAAAAGATTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 6 A 9 5 203856 CASAVA_Build 4 35854258 1D TACAAAACAT A/- GACAAAAATG 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 1 0 203857 CASAVA_Build 4 35861315 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 29 1 25 3 A 9 10 203858 CASAVA_Build 4 35862294 2D ATGCATAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 54 hom 35 2 26 7 AT 9 8 203859 CASAVA_Build 4 35873185 1I GCCCCATCTC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 203860 CASAVA_Build 4 35875970 2I CCGCAGCTCT --/TC TCTCCTTGTT 3070 hom 87 het 30 0 28 2 TC 2 3 203861 CASAVA_Build 4 35878049 1I AAATGTATGC -/A ATTTGATACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 2 203862 CASAVA_Build 4 35878253 1D CACTATTCCC T/- TTTTTTATTT 3070 het 4 hom 28 1 23 4 T 7 6 203863 CASAVA_Build 4 35883619 2D TGGTGTCCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 45 0 38 9 A 14 12 203864 CASAVA_Build 4 35890103 6D TCTCCTTTTT ATTAAC/------ ATAACCTCTC 748 het 373 hom 25 3 6 21 ATTAAC 1 0 203865 CASAVA_Build 4 35890689 1I AGACTTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 9 10 203866 CASAVA_Build 4 35893867 2D ACTTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 32 0 26 7 A 11 9 203867 CASAVA_Build 4 35901736 2D CCAGAGATGG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 CT 10 9 203868 CASAVA_Build 4 35903436 1D CAACTCCCAT G/- GGCAATGTGG 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 G 3 2 203869 CASAVA_Build 4 35923598 3I AGCGCAGACC ---/TTA TTATGAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 TTA 1 2 203870 CASAVA_Build 4 35934149 6D ATTTATTAGA TTATCT/------ TTATAATCTA 3070 het 3070 hom 28 11 14 5 TTATCT 1 0 203871 CASAVA_Build 4 35935341 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2902 hom 23 het 13 0 8 5 T 12 11 203872 CASAVA_Build 4 35935414 3I GCTCACTGCA ---/ACC ACCACCTCCC 3070 het 884 hom 16 2 14 0 ACC 2 3 203873 CASAVA_Build 4 35948462 1D TCTGTTTTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 9 8 203874 CASAVA_Build 4 35954036 1D AACATCAGCT A/- ATTCATGAGT 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 A 2 1 203875 CASAVA_Build 4 35971288 1I ACACAATTTT -/G GGGGAAGATT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 G 4 5 203876 CASAVA_Build 4 35975932 4D TTCATATAAT TGTG/---- TGTGTGTGTG 1736 het 1736 ref 37 18 10 10 TG 10 8 203877 CASAVA_Build 4 35979470 1D CTGCTGCTGG A/- AAAAAAATGA 1344 het 1344 ref 44 35 3 7 A 8 7 203878 CASAVA_Build 4 35979816 1D CATCACTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 28 8 T 11 10 203879 CASAVA_Build 4 35981617 1I GTCTAAGTTC -/A GTAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 A 0 1 203880 CASAVA_Build 4 35987014 1I ACTCCCAAAA -/G ATGTGTGAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 G 0 1 203881 CASAVA_Build 4 35991435 1D GTGAGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1161 hom 33 6 13 14 A 15 14 203882 CASAVA_Build 4 36010622 1D TCAGTGCCAG T/- TACCACCCCA 3070 het 3070 hom 47 22 19 6 T 2 1 203883 CASAVA_Build 4 36014723 1I ATTTCTAAGC -/A AAGCATGTAA 3070 het 3070 ref 48 28 13 7 A 2 3 203884 CASAVA_Build 4 36027155 4D GCGAGAAAAC TCTT/---- TCTGAGTTAC 3070 het 3070 hom 31 12 17 4 TCTT 1 0 203885 CASAVA_Build 4 36028015 1D AACATTCCTG T/- TTGCCAAGGA 3070 het 3070 ref 60 29 22 9 T 3 2 203886 CASAVA_Build 4 36030416 1D TAAAAATGCA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 53 27 20 6 T 8 7 203887 CASAVA_Build 4 36031886 1I GCAAAAAAAA -/T GATGAGAAAT 3070 het 274 hom 37 1 32 4 T 0 1 203888 CASAVA_Build 4 36032349 1I CTCCCCAGTA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 96 het 33 0 32 1 T 6 7 203889 CASAVA_Build 4 36032893 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 11 12 203890 CASAVA_Build 4 36033021 2I GAAGCAATGA --/CT TGGCTTGGCT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 CT 0 1 203891 CASAVA_Build 4 36036872 1D AAGCTCTCAT A/- AATCATTACT 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 A 3 2 203892 CASAVA_Build 4 36045644 1D TACTAAAGGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 396 hom 33 5 17 12 T 8 7 203893 CASAVA_Build 4 36050406 3D TTCCTATAAC ATA/--- ATGTTTTAAT 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 ATA 1 0 203894 CASAVA_Build 4 36062218 4D AACAATGCTT CCCC/---- CCCCCCTCCG 3070 het 1202 hom 36 10 19 7 C 10 6 203895 CASAVA_Build 4 36065032 1D TTTGAGAAGC A/- GCAAGTTTAG 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 1 0 203896 CASAVA_Build 4 36079967 1D GATAATGGCC T/- CTAGCTGCAT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 T 1 0 203897 CASAVA_Build 4 36088278 1D CTGAAATTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 9 8 203898 CASAVA_Build 4 36089106 1D CAGCCTGTTT G/- ATGAGATACA 3070 het 3070 ref 62 29 26 8 G 1 0 203899 CASAVA_Build 4 36090763 1I ATGTATAATT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 1238 hom 16 3 10 3 A 7 8 203900 CASAVA_Build 4 36099357 1D TTTGGCACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 8 10 6 A 10 9 203901 CASAVA_Build 4 36129698 2I TGAAAATCTC --/TT GTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 T 0 2 203902 CASAVA_Build 4 36129806 2D TCCCTCTCTC TT/-- GAGTCTTTCT 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 T 2 0 203903 CASAVA_Build 4 36143193 3D CAATATTTAG ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 ATT 5 4 203904 CASAVA_Build 4 36147618 1I TCCAGATTTA -/T TTTTTTAAGC 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 6 7 203905 CASAVA_Build 4 36153541 5D CATGTGCTTG TAATC/----- CCAGCTACTC 743 het 743 ref 14 4 3 8 TAATC 1 0 203906 CASAVA_Build 4 36154743 2D AGAAAACAAC AT/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 49 23 21 6 AT 1 0 203907 CASAVA_Build 4 36171041 1I CATGTATAGT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 A 7 8 203908 CASAVA_Build 4 36171693 1D GTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 16 10 T 11 10 203909 CASAVA_Build 4 36182797 1D TTGACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 23 16 10 A 11 10 203910 CASAVA_Build 4 36193117 4D AACTTTCTTA ATTT/---- ATTTTTAATT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 ATTT 2 1 203911 CASAVA_Build 4 36196361 24D ACAGCCTTTC TACTTATCATCAGTAGATAAGCCT/------------------------ ATCTACTGCT 3070 hom 129 het 43 0 44 1 TACTTATCATCAGTAGATAAGCCT 1 0 203912 CASAVA_Build 4 36206800 1D TGTTTTGTTC T/- TTTTTATAGT 2724 het 2724 ref 25 14 8 3 T 6 5 203913 CASAVA_Build 4 36212237 2I TATTTCTCTT --/TC TCTCTCTCTC 1917 het 1917 ref 24 12 7 5 TC 8 9 203914 CASAVA_Build 4 36214838 1I CTAAGTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 9 10 203915 CASAVA_Build 4 36220434 1I ATTACCCAGG -/C ATAGTGGCAC 3070 het 3070 ref 32 10 12 10 C 0 1 203916 CASAVA_Build 4 36237727 1I CCAATGCCAC -/T TTTTGCAGAA 3070 hom 101 het 41 0 34 7 T 4 5 203917 CASAVA_Build 4 36237771 1D AATATGAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 2912 hom 40 7 12 21 A 9 8 203918 CASAVA_Build 4 36240644 1D CTTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 T 10 9 203919 CASAVA_Build 4 36240840 1D TGTATAATTC T/- TTTTTTTTTT 1426 het 127 hom 11 2 4 5 T 17 16 203920 CASAVA_Build 4 36242472 1I AATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 10 11 203921 CASAVA_Build 4 36255791 2D TAGAGTTTTT TA/-- TGTGATCAAA 3070 het 3070 ref 30 15 14 3 TA 1 0 203922 CASAVA_Build 4 36257048 1I TGGCAAAAGG -/A ACTGTCAGCA 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 A 1 2 203923 CASAVA_Build 4 36257649 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 17 13 13 AC 8 9 203924 CASAVA_Build 4 36259387 1D GGGAGAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 34 2 20 12 A 17 16 203925 CASAVA_Build 4 36260377 2D ATGTGCAGTC AT/-- GTGTCACAAT 3070 het 3070 ref 54 25 23 10 AT 1 0 203926 CASAVA_Build 4 36266562 1D CTACCCCTTT C/- CCTGACAGGC 3070 het 3070 ref 58 32 21 6 C 3 2 203927 CASAVA_Build 4 36269663 1I TATATATTCA -/T TTTGAGCCAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 3 4 203928 CASAVA_Build 4 36272111 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2975 het 526 hom 17 2 9 6 A 16 17 203929 CASAVA_Build 4 36273883 2D ATCGATACAA TT/-- TCTTAACATA 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 T 3 1 203930 CASAVA_Build 4 36276828 1D TAGTGACATA T/- TTGATAAGGT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 T 3 2 203931 CASAVA_Build 4 36277041 1I TGATGTTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 A 9 10 203932 CASAVA_Build 4 36278148 1I ATTTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1126 hom 31 3 22 6 T 10 11 203933 CASAVA_Build 4 36279062 3D TGCACACGTA TGT/--- TTATAGCGGC 3070 het 1013 hom 11 3 8 1 TGT 1 0 203934 CASAVA_Build 4 36280267 1I TTATATAATC -/A ACCTAAAAGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 1 2 203935 CASAVA_Build 4 36285149 1I AAAAAAAAGA -/G AAAAAAGATA 3070 hom 28 het 20 0 19 1 G 0 1 203936 CASAVA_Build 4 36287125 1D GTGATAGGAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 8 7 203937 CASAVA_Build 4 36290664 1D CTCTGATGAA C/- CTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 C 2 1 203938 CASAVA_Build 4 36291706 1I CTCCACCAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 48 19 20 9 A 8 9 203939 CASAVA_Build 4 36299956 1D CAGGCGTGGT G/- GCACACACCT 3070 het 433 hom 11 1 9 1 G 2 1 203940 CASAVA_Build 4 36300927 4D TGTTCTGAAA CAGT/---- CAGTTTGGCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 7 CAGT 2 1 203941 CASAVA_Build 4 36301536 4D ACCAAGTCTT ACAA/---- ACAAATTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 26 3 ACAA 2 1 203942 CASAVA_Build 4 36302780 1D GTCCATAGGC A/- TACCTAACAT 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 A 1 0 203943 CASAVA_Build 4 36303400 5I TTTTTAACTT -----/TCCTC TTCACTAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TCCTC 0 1 203944 CASAVA_Build 4 36303574 1D GCCCAAACTT A/- ACAAGAGTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 2 1 203945 CASAVA_Build 4 36306430 1I TTTGCCCTAT -/A AACTTTTCCC 3070 het 3070 hom 45 22 21 2 A 2 3 203946 CASAVA_Build 4 36309032 1D CTGTAAGACT G/- GATTAAATCA 3070 het 3070 ref 49 26 19 5 G 2 1 203947 CASAVA_Build 4 36309466 2D TAGTGTAGAC TT/-- TATTTTTATG 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 T 3 1 203948 CASAVA_Build 4 36309583 1I TTCCTGTTTG -/T TTTTACAATG 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 T 4 5 203949 CASAVA_Build 4 36310471 1I ATGCACACTT -/A ACGTGTAGAC 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 A 1 2 203950 CASAVA_Build 4 36311133 3I AGTTTAAGAA ---/AAC AACACCATTT 3070 het 3070 ref 38 24 9 5 AAC 1 2 203951 CASAVA_Build 4 36312942 2D TTATGCCCTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 27 13 14 1 AT 7 6 203952 CASAVA_Build 4 36314172 1D AGCCAAGATC A/- CACCATTGCA 3070 het 1657 hom 18 4 8 6 A 1 0 203953 CASAVA_Build 4 36318173 1D CTACAACATC T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 113 het 39 0 38 2 T 7 6 203954 CASAVA_Build 4 36318695 1D AACTTCAGAG A/- AAAACCCTTC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 5 4 203955 CASAVA_Build 4 36319198 2D AATCAATATA AT/-- ATGTCAGACG 3070 het 3070 hom 37 9 22 6 AT 2 1 203956 CASAVA_Build 4 36337234 1D AAAACTCTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 A 10 9 203957 CASAVA_Build 4 36343179 1I AGAAGGTGAT -/G GCTTTGCTAT 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 G 1 2 203958 CASAVA_Build 4 36345578 1D AAAGGTTGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 10 24 5 A 10 9 203959 CASAVA_Build 4 36355890 1D ATCATTCCAC T/- TTTAAAGCTA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 4 3 203960 CASAVA_Build 4 36362278 1D TATGATTGAG T/- TTAAATCTAC 3070 het 3070 hom 46 15 23 9 T 3 2 203961 CASAVA_Build 4 36390469 1D GTGGTGTGTA T/- AGTGCTTGTA 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 T 1 0 203962 CASAVA_Build 4 36394055 1I TGCTGTGTGG -/A ATACCATGAT 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 A 1 2 203963 CASAVA_Build 4 36394519 1D CCGTTGGTGA G/- CACTCACATA 3070 het 3070 ref 48 25 21 3 G 1 0 203964 CASAVA_Build 4 36401292 1I TTTTTTTGCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 T 8 9 203965 CASAVA_Build 4 36403206 6D ATAATTAAAG AAAATT/------ ATAATTACCT 3070 het 3070 hom 29 11 15 4 AAAATT 1 0 203966 CASAVA_Build 4 36422568 1D TAATGGGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 16 hom 28 2 19 7 T 10 9 203967 CASAVA_Build 4 36424970 1D GAGATGACCT G/- GGGCATAGTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 G 4 3 203968 CASAVA_Build 4 36430806 1I AAACTTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2010 het 2010 ref 35 22 8 5 A 12 13 203969 CASAVA_Build 4 36432280 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2599 hom 26 6 18 2 A 9 8 203970 CASAVA_Build 4 36447994 4I TGGCGTCCTT ----/AATC ATCATTATTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AATC 0 1 203971 CASAVA_Build 4 36466528 1D TGCCAGAAAA G/- TAACCTATAT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 G 1 0 203972 CASAVA_Build 4 36466935 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2639 hom 21 het 11 0 7 4 A 9 10 203973 CASAVA_Build 4 36467092 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 1639 hom 17 het 9 0 6 3 A 15 14 203974 CASAVA_Build 4 36472197 1I CATTTCTACC -/A AAAAATCCTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 5 6 203975 CASAVA_Build 4 36477276 7D AAGGAAAGGA TAGCTTT/------- CTCAAGCCTG 3070 hom 108 het 42 0 37 7 TAGCTTT 1 0 203976 CASAVA_Build 4 36480205 3I ATCAAAAAAC ---/TAT TATTAGAACT 3070 het 58 hom 33 1 27 5 TAT 1 2 203977 CASAVA_Build 4 36486369 1D ATAACAATAC A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 6 5 203978 CASAVA_Build 4 36487178 1D ATTGATGTAA T/- TTTATTTTTT 3070 hom 154 het 54 0 52 2 T 4 3 203979 CASAVA_Build 4 36501293 4D TGGTGTGAAT GACA/---- GACAATTTCT 3070 hom 110 het 41 0 36 6 GACA 2 1 203980 CASAVA_Build 4 36513221 1I CTTAAGCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 10 14 A 11 12 203981 CASAVA_Build 4 36513843 1I TTACAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 14 1 10 3 T 10 11 203982 CASAVA_Build 4 36514400 2I AATAGCCCAC --/AG AGATGTTCAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AG 1 2 203983 CASAVA_Build 4 36517215 1D TTCTTTATAA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 T 8 7 203984 CASAVA_Build 4 36520449 1D TAGTTCGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 30 1 25 4 A 12 11 203985 CASAVA_Build 4 36523441 1D CACCAAGTCA T/- TTTTAGGCCA 3070 hom 160 het 59 0 54 5 T 5 4 203986 CASAVA_Build 4 36523882 2I AGTGTGCAGT --/AA AGTTGACCAT 3070 hom 172 het 62 0 58 4 A 1 3 203987 CASAVA_Build 4 36524611 3D TGTTTTTACC ACA/--- ATGTGTGGCT 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 ACA 1 0 203988 CASAVA_Build 4 36525530 1I AAAAGATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 33 0 30 3 T 10 11 203989 CASAVA_Build 4 36526284 4I TGCCTCTCAC ----/ATCA ATCAGTTAGA 3070 hom 117 het 45 0 37 8 ATCA 1 2 203990 CASAVA_Build 4 36535425 1I ATAGAGAAAC -/A AAAAAACCCT 3070 hom 46 het 21 0 16 5 A 6 7 203991 CASAVA_Build 4 36537272 2I AATGACTTAA --/TG ATGTTAGATC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TG 0 1 203992 CASAVA_Build 4 36544604 2I CTGCCAAAAG --/CA GAGATACAAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 CA 0 1 203993 CASAVA_Build 4 36546036 1D TGATTGTGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 10 9 203994 CASAVA_Build 4 36548630 2D CAGAGAAAAC AT/-- GTGCTTTCAG 3070 het 3070 hom 36 15 17 6 AT 1 0 203995 CASAVA_Build 4 36549531 1D TCTTCTCCGC T/- TTTCAAAATT 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 T 4 3 203996 CASAVA_Build 4 36549963 1D AAATTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 12 11 203997 CASAVA_Build 4 36557415 1I AAAAGTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 8 15 8 T 10 11 203998 CASAVA_Build 4 36558309 1D GAGAGAGAAT G/- GATTGGATTG 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 G 2 1 203999 CASAVA_Build 4 36562538 1I CTTTTACTGT -/A GAATGTAAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 1 204000 CASAVA_Build 4 36562910 3D TTAATTTTTG TAT/--- TATATCTTAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TAT 2 1 204001 CASAVA_Build 4 36569412 5D GTTGAGGGGC TAGTA/----- TTCCTGCAGC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 TAGTA 1 0 204002 CASAVA_Build 4 36578996 2D CTTAAAACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2441 hom 23 6 11 6 A 13 11 204003 CASAVA_Build 4 36586073 1D TAAGGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 11 12 A 11 10 204004 CASAVA_Build 4 36596421 1I ACAAATGCAC -/A AAGTCTACTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 2 3 204005 CASAVA_Build 4 36600956 1D TCCTTAGAAA T/- AACTCCACAG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 1 0 204006 CASAVA_Build 4 36602204 1I GCTAAACATT -/A AAGAATATAT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 2 3 204007 CASAVA_Build 4 36605165 1I AGGGAGAAAC -/A ACTAAGGGAG 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 A 1 2 204008 CASAVA_Build 4 36606821 1I TTCACAAAGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 8 9 204009 CASAVA_Build 4 36612474 1I AAAGAATTAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 8 9 204010 CASAVA_Build 4 36618994 2D GCCAACAAAC AT/-- ATGAAAAGAA 3070 het 2830 hom 19 9 10 0 AT 2 1 204011 CASAVA_Build 4 36621914 1D GAAATAATCT A/- TTATAGTATT 3070 het 3070 ref 40 23 17 0 A 1 0 204012 CASAVA_Build 4 36624376 1I GCTTTTTATG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 7 8 204013 CASAVA_Build 4 36630302 2D CAATAGTTTC TT/-- TTTTGCTGTG 3070 hom 63 het 26 0 22 5 T 6 4 204014 CASAVA_Build 4 36631935 1D TCCTTTTCAA T/- TTTTTTGCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 6 204015 CASAVA_Build 4 36632326 1D AATTTTTTTC A/- AAAAAAATCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 7 204016 CASAVA_Build 4 36641801 1I CAGTAGAAGC -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 6 7 204017 CASAVA_Build 4 36643380 1I ATTCTGTGGG -/T TTTTGACAGA 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 T 4 5 204018 CASAVA_Build 4 36644589 1I CTTGATCCAA -/T TTAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 2 3 204019 CASAVA_Build 4 36645395 1D AATTGCTGAG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 43 24 13 7 T 8 7 204020 CASAVA_Build 4 36646789 1I GACGGATGTC -/T TTTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 3 4 204021 CASAVA_Build 4 36648192 1I TTTTTGGTTT -/G GGGAAGAAAT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 G 3 4 204022 CASAVA_Build 4 36648373 1I CCATTATCAG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 6 7 204023 CASAVA_Build 4 36649661 3D CTTGTCAATC AAA/--- AAAAAAAATG 3070 hom 36 het 25 0 13 13 A 11 8 204024 CASAVA_Build 4 36651766 1D TAGTTTCAAA C/- CACTTGTCAA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 C 2 1 204025 CASAVA_Build 4 36657999 1D AGGTGACCAA T/- TTGGAGAGGG 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 T 3 2 204026 CASAVA_Build 4 36665550 2D GAAGAAAAAC TA/-- TGTTTATTCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 TA 1 0 204027 CASAVA_Build 4 36665824 5D TATTTTTTAA TTATT/----- TTATTTTATT 3070 het 898 hom 16 3 8 5 TTATT 3 2 204028 CASAVA_Build 4 36668675 1I ACTGAGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 A 10 11 204029 CASAVA_Build 4 36675669 1I ACATACACAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 7 8 204030 CASAVA_Build 4 36676924 4I AAACAATAAT ----/ACTC AGGAGTTCTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ACTC 0 1 204031 CASAVA_Build 4 36679991 1D CTCCTCACTT G/- GGGGCTGACG 3070 hom 48 het 27 0 17 10 G 5 4 204032 CASAVA_Build 4 36680054 1D CAGCATGTTG C/- CCGGCGCGGT 2325 het 2325 ref 26 14 7 5 C 3 2 204033 CASAVA_Build 4 36681152 1I GACTTTTTTT -/A ATGTGTTTAT 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 A 1 2 204034 CASAVA_Build 4 36690660 5D TATTTTAAAA TAACT/----- TAATATAATT 2315 het 2315 ref 19 11 6 3 TAACT 1 0 204035 CASAVA_Build 4 36690956 4I TAAAAATACC ----/TAAA TAAATAGAGT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TAAA 1 2 204036 CASAVA_Build 4 36691037 1D GACTTTTTAA T/- TTTTTTTTAT 2944 het 2690 hom 18 8 6 5 T 9 8 204037 CASAVA_Build 4 36693015 7D TATATATATA CACACGC/------- TATATATTAT 547 hom 5 het 7 0 2 6 CACACGC 1 0 204038 CASAVA_Build 4 36696019 1D GATTTTATTC T/- TTTTAAGTTT 3070 het 3070 hom 43 11 25 8 T 5 4 204039 CASAVA_Build 4 36696741 12I AAATAGGCAA ------------/ATAGCAAGCTTT ATTGCAGAAA 3070 hom 117 het 40 0 40 3 ATAGCAAGCTTT 0 1 204040 CASAVA_Build 4 36698217 2D AATTATTCAC TT/-- ATTATTTGAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 2 0 204041 CASAVA_Build 4 36698829 4D TGGTGGAGAA AGTT/---- AGAAAGAGGC 3070 het 3070 ref 42 25 16 3 AGTT 1 0 204042 CASAVA_Build 4 36701995 2I ATATCCAAAC --/AT GTGGCCACCA 3070 het 3070 hom 57 21 29 7 AT 0 1 204043 CASAVA_Build 4 36704030 1D TGCTTGAGGC T/- CCACTGGCTC 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 T 1 0 204044 CASAVA_Build 4 36708645 1I TTTATAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 9 10 204045 CASAVA_Build 4 36713136 1I CTTTCTAGAG -/A TTTTTTTAAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 204046 CASAVA_Build 4 36717186 5I TCAGTACAAA -----/TAGAT TAATCTTCCC 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 TAGAT 0 1 204047 CASAVA_Build 4 36717489 1D CCAATTTAAG C/- CCTAAGGCAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 C 3 2 204048 CASAVA_Build 4 36719316 1I ACACCTATTA -/C TAACCAGGTA 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 C 0 1 204049 CASAVA_Build 4 36721030 1D GGTGGCGGGA G/- GGGGGGTGCT 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 G 7 6 204050 CASAVA_Build 4 36729792 2D ATCTAAAGTC TT/-- TGAGAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 3 1 204051 CASAVA_Build 4 36734213 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1869 het 411 hom 28 6 7 17 A 19 18 204052 CASAVA_Build 4 36734478 1D TTCATAAATT G/- GTTGTTTTGG 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 G 2 1 204053 CASAVA_Build 4 36737232 1D GCGTGTAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 10 9 204054 CASAVA_Build 4 36738114 3I CTTTTGAGGT ---/TGA TATTTTATGA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TGA 0 1 204055 CASAVA_Build 4 36740549 1D ATAATTAATT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 6 204056 CASAVA_Build 4 36743037 1I GAAGGTCCCC -/A AAAAAATGTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 6 7 204057 CASAVA_Build 4 36745582 1D ATTCCACATA T/- AAGTGAGATA 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 T 1 0 204058 CASAVA_Build 4 36754808 2I CAGCAAAAAC --/AT AATAGAGTGC 3070 het 3070 ref 66 32 25 9 AT 0 1 204059 CASAVA_Build 4 36762991 1D ACTCAGTGAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 A 8 7 204060 CASAVA_Build 4 36774566 1I CAACACCCCA -/T TTTTACAATA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 4 5 204061 CASAVA_Build 4 36778624 1I TGTGCAGGAG -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 A 6 7 204062 CASAVA_Build 4 36778835 1I ACTGAGACTT -/G AAGAATGCAT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 G 0 1 204063 CASAVA_Build 4 36783662 2I AAAGTGTAAT --/AA AAAAAAAAAG 28 het 28 ref 17 6 1 10 A 9 11 204064 CASAVA_Build 4 36789343 1D TGTGACTATG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 8 7 204065 CASAVA_Build 4 36790242 4I GTTTTTTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 TTTG 3 4 204066 CASAVA_Build 4 36790254 4I TGTTTGTTTG ----/TTTT TTTTAATGAT 3070 het 132 hom 31 3 22 6 T 4 8 204067 CASAVA_Build 4 36793771 1D CCCCCCCGCC A/- AAAAAAAAAA 1264 het 1264 ref 23 10 6 7 A 15 14 204068 CASAVA_Build 4 36797051 1D CTTTTTACCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 9 8 204069 CASAVA_Build 4 36798397 9D GTAGGTAAGA CCGTGAGCT/--------- CCAGAAGCAA 3070 het 3070 hom 44 20 19 6 CCGTGAGCT 1 0 204070 CASAVA_Build 4 36801357 1D AGTCTTAATA C/- TTATTATCAT 3070 het 3070 hom 24 8 10 7 C 1 0 204071 CASAVA_Build 4 36801798 3I TACATCATGA ---/TAT TATTATTATT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TAT 3 4 204072 CASAVA_Build 4 36803615 1D ATAAAAAAAA T/- AAAAATAAAA 1533 het 1396 hom 10 3 4 3 T 1 0 204073 CASAVA_Build 4 36804389 8D AAATATGTGG TAAGCTGT/-------- TAAGCTGTTG 3070 hom 96 het 34 0 33 3 TAAGCTGT 2 1 204074 CASAVA_Build 4 36807314 1I ATTGTGGGAA -/C CTTTTAAGCA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 C 1 2 204075 CASAVA_Build 4 36811614 1I AAACAAATCC -/A AGACACATTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 204076 CASAVA_Build 4 36817868 1D CTATTATATT A/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 1 0 204077 CASAVA_Build 4 36819387 1I TTGGAGTCCA -/C AAGATAGAGA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 0 1 204078 CASAVA_Build 4 36822683 1I TGTAGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 T 10 11 204079 CASAVA_Build 4 36829601 2D CTGAAACACG TT/-- TTTTTTTTCC 3070 hom 144 het 55 0 49 6 T 10 8 204080 CASAVA_Build 4 36833745 3I TTCAGTAATC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 15 9 T 10 13 204081 CASAVA_Build 4 36836947 33D AGACTCTTTG GGAATCTTTATTTTCCAGGTACCTGCTGTCATT/--------------------------------- GGAATCTTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 10 GGAATCTTTATTTTCCAGGTACCTGCTGTCATT 2 1 204082 CASAVA_Build 4 36838911 2D ATATATATAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 60 het 23 0 18 5 AG 7 6 204083 CASAVA_Build 4 36841611 1D CTGAATTTAG A/- GCAACAATTT 3070 hom 168 het 59 0 56 3 A 1 0 204084 CASAVA_Build 4 36850717 5D AAGAAAAACC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1609 het 400 hom 27 5 5 18 T 21 16 204085 CASAVA_Build 4 36853055 1D AAATTCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 21 12 T 11 10 204086 CASAVA_Build 4 36857833 3D TTTGAATAAC ATT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 22 7 ATT 1 0 204087 CASAVA_Build 4 36866620 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2720 hom 33 8 23 2 A 12 11 204088 CASAVA_Build 4 36872129 5D TATTTTAGTC ATTTA/----- TGGTTTCCTT 3070 het 3070 hom 48 17 29 2 ATTTA 1 0 204089 CASAVA_Build 4 36874821 6D GCTCATAACT CTTATA/------ CTTATGTAAC 3070 het 3070 hom 43 15 24 5 CTTATA 1 0 204090 CASAVA_Build 4 36879152 1I TTATTCTGTC -/A TTTCTGGCTA 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 A 0 1 204091 CASAVA_Build 4 36895861 8I GGGAGTCCTC --------/CCTTGGGA CCTTGGGACT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 CCTTGGGA 1 2 204092 CASAVA_Build 4 36907191 1I CCAAATACCG -/T TAACTATTAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 1 2 204093 CASAVA_Build 4 36911058 1D ACATAGGCTA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 T 7 6 204094 CASAVA_Build 4 36916542 1I TTTTTATAAT -/A AAAAAAGCTA 3070 het 3070 ref 17 9 7 1 A 6 7 204095 CASAVA_Build 4 36931682 1D CTGTACACAT G/- TTTCAGATAT 3070 het 3070 hom 56 24 26 6 G 1 0 204096 CASAVA_Build 4 36932749 1I GAAAGTTAAT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 7 8 204097 CASAVA_Build 4 36942803 1D TGTAAAAAAA C/- ATTATATAAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 C 1 0 204098 CASAVA_Build 4 36946750 1I TGGCATGAGG -/A AATCAGTGTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 2 3 204099 CASAVA_Build 4 36955151 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3062 het 1418 hom 15 5 8 2 A 13 12 204100 CASAVA_Build 4 36959003 11D CCATTGGTGT CCTTTGTACAG/----------- ATTAGCCTCC 3070 het 3070 hom 45 17 24 9 CCTTTGTACAG 1 0 204101 CASAVA_Build 4 36966976 6I CCTATAACTG ------/ACTATA ACTATAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 ACTATA 1 2 204102 CASAVA_Build 4 36967905 1I CAGCAAAGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 52 23 23 6 T 9 10 204103 CASAVA_Build 4 36969257 3I GTAATAAAAC ---/TAT GACTAAGTAG 3070 het 3022 hom 35 12 18 5 TAT 0 1 204104 CASAVA_Build 4 36979909 15D TAGATCAAGG CATTGTTAGAAAGTA/--------------- CATTGTTAGA 3070 het 3070 ref 40 19 16 8 CATTGTTAGAAAGTA 1 0 204105 CASAVA_Build 4 36986911 1I ACTGATGGTA -/T TGGGCCCTAA 3070 hom 62 het 26 0 20 6 T 1 2 204106 CASAVA_Build 4 36988607 1D GTGGAAAACA T/- TTGCCTAATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 3 2 204107 CASAVA_Build 4 36998573 1D ACATAAAATT G/- AGAAGATTTG 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 G 1 0 204108 CASAVA_Build 4 37007056 1D TGGTTACATG A/- AAAAAAAAAA 877 het 877 ref 36 25 4 9 A 11 10 204109 CASAVA_Build 4 37018126 1D TAGTCCCTTG A/- AAAAATTAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 5 204110 CASAVA_Build 4 37037617 1D CTGCTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2967 hom 31 10 14 8 A 12 11 204111 CASAVA_Build 4 37037875 2D TTTTACACAC AT/-- GTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 44 27 14 4 AT 1 0 204112 CASAVA_Build 4 37056304 5I GAATTGAAAT -----/AAAAG AAATATGACA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AAAAG 0 1 204113 CASAVA_Build 4 37057395 2D CAGAACAAAC AG/-- AGACACAGAG 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 AG 2 1 204114 CASAVA_Build 4 37065988 1I TTAAATGATT -/A TGTGCCAGGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 0 1 204115 CASAVA_Build 4 37067803 1I ATCATACGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 11 12 204116 CASAVA_Build 4 37069893 2D TATTCTGCAC AT/-- GTCTTCATCA 3070 het 3070 hom 31 14 16 3 AT 1 0 204117 CASAVA_Build 4 37071214 2I TCCGGGGGTT --/GG GGGGGGAGAC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 G 6 8 204118 CASAVA_Build 4 37072997 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2648 het 1800 hom 15 6 9 0 T 11 12 204119 CASAVA_Build 4 37084070 1I TCTCTGAAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 6 7 204120 CASAVA_Build 4 37086263 1I GCAGGTCCCA -/C CCCCCACGGA 2765 hom 45 het 17 0 10 7 C 5 6 204121 CASAVA_Build 4 37096318 4I CCATACTAAT ----/ATAA ATAAACTGTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ATAA 1 2 204122 CASAVA_Build 4 37096649 1D TCTTTCTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 17 0 14 3 A 11 10 204123 CASAVA_Build 4 37105865 3D CAGGGATATG TTT/--- ATACAGTACC 3070 het 3070 hom 54 24 26 5 T 3 0 204124 CASAVA_Build 4 37107989 1D ACCTTGACAT A/- AAGGCTGAGT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 3 2 204125 CASAVA_Build 4 37108082 1D TAATTTTGAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 T 9 8 204126 CASAVA_Build 4 37110017 4I TGAAGCTCCC ----/TTTG TTTGCTTCTC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTTG 1 2 204127 CASAVA_Build 4 37118075 3D GCCTCCCATC TCT/--- TTGGAGGCCT 3070 het 3070 ref 41 25 11 5 TCT 1 0 204128 CASAVA_Build 4 37134216 1I CCTATGTGCA -/G GGTCAGATGT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 G 2 3 204129 CASAVA_Build 4 37144056 1I TGCTGTAATC -/T ACATTGTTGA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 0 1 204130 CASAVA_Build 4 37144706 1D ACCTGGTAAT G/- GGATAGGAAA 3070 het 3070 ref 42 24 17 1 G 3 2 204131 CASAVA_Build 4 37148388 6D GTGCTGTGTC TTTAAA/------ TTTAAAGATA 3070 het 3070 ref 28 14 11 5 TTTAAA 2 1 204132 CASAVA_Build 4 37148461 1I TGGGACATGG -/A AAAATATTTG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 4 5 204133 CASAVA_Build 4 37149358 5I AATATTCTCC -----/TAAGT TAAGTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TAAGT 1 2 204134 CASAVA_Build 4 37170064 1I TTATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 10 11 204135 CASAVA_Build 4 37188651 2D TGACCACTAC CA/-- CTAGGACTGC 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 CA 1 0 204136 CASAVA_Build 4 37189601 2I GATGCAAGAC --/AG AGTTGTCCTT 3070 het 3070 ref 45 22 22 1 AG 1 2 204137 CASAVA_Build 4 37190284 1D TGTTCCTGTA G/- GGGATGACCA 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 G 4 3 204138 CASAVA_Build 4 37191119 9D AAAAAAAAAA GAAAGAAAG/--------- AAAGAAAGAA 689 het 689 ref 28 16 4 12 GAAAGAAAG 1 0 204139 CASAVA_Build 4 37197298 2D ATTTTTAGGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 2733 hom 21 9 9 3 T 11 9 204140 CASAVA_Build 4 37200656 1D CAACATAGTA T/- CTGGGTATCA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 1 0 204141 CASAVA_Build 4 37202390 11D TAGTCATGGA GGCTTGATTGG/----------- GGCTGAGGAT 3070 het 3070 ref 41 22 13 8 GGCTTGATTGG 1 0 204142 CASAVA_Build 4 37203521 4I TTTTAAACTG ----/TATT TATTAGCAAG 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 TATT 1 2 204143 CASAVA_Build 4 37210534 1D TATTATTTTT A/- AAAATACTAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 5 4 204144 CASAVA_Build 4 37216085 4D ACAACCCTGT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 144 het 59 0 46 15 CA 9 7 204145 CASAVA_Build 4 37219081 6I GCTGGCTGAG ------/TTCACC TTCACCTTGA 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 TTCACC 1 2 204146 CASAVA_Build 4 37221222 1D CTTTGGTGGG T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 T 7 6 204147 CASAVA_Build 4 37222524 1I GGTCTTCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 9 10 204148 CASAVA_Build 4 37226824 5I TTAAAGACTT -----/AAAAC AAACTTTGGC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AAAAC 0 1 204149 CASAVA_Build 4 37227083 1I TGCAGGTCAG -/C ACCCGAGGGC 3070 hom 66 het 23 0 22 1 C 0 1 204150 CASAVA_Build 4 37238659 1I AGACACCTTG -/C CCCCTACATC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 4 5 204151 CASAVA_Build 4 37238835 2D TGATCCTAGA TT/-- TTCCCCCATT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 4 2 204152 CASAVA_Build 4 37241079 1D16M1I ATCTACAATT AGGGGACAAATTGTAGG-/-GGGGACAAATTGTAGGT TTTTTTCTTG 3070 hom 69 het 24 0 22 4 N/A 0 0 204153 CASAVA_Build 4 37241192 1D TCTAAGATTC T/- TTCAAATCAG 3070 hom 78 het 29 0 26 5 T 3 2 204154 CASAVA_Build 4 37241481 2I AGGAGGGAGT --/CC GCTCTCTCTC 3070 hom 90 het 35 0 28 7 C 0 2 204155 CASAVA_Build 4 37249578 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 1161 hom 12 het 6 0 4 2 AG 2 1 204156 CASAVA_Build 4 37274467 1D TTGCCACACC T/- TTTTTTTATC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 8 7 204157 CASAVA_Build 4 37283933 4D AGAGGAAGGA AGGG/---- AGGGAGGGAG 3070 hom 40 het 18 0 12 7 AGGG 3 2 204158 CASAVA_Build 4 37284050 4D AGAAGGAAGG AGAA/---- AGAAAGAAAA 2000 het 2000 ref 21 12 5 5 AGAA 3 2 204159 CASAVA_Build 4 37284257 4D AGAAGACAAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 37 16 12 10 AGAA 3 2 204160 CASAVA_Build 4 37285597 2D CTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2555 het 644 hom 25 5 9 11 T 18 16 204161 CASAVA_Build 4 37289128 3I ATTTAAAAAA ---/AAG AAGTGCTCTG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 AAG 1 2 204162 CASAVA_Build 4 37303927 1I ATAAAATGTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 45 11 29 5 A 7 8 204163 CASAVA_Build 4 37310189 4I GATCAGTTTT ----/TTTG TTTGTTTATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTTG 1 2 204164 CASAVA_Build 4 37317539 1I CAACAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 2752 het 2752 ref 27 11 8 8 A 11 12 204165 CASAVA_Build 4 37333260 2D GTGATGGGAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 30 8 12 10 AT 9 8 204166 CASAVA_Build 4 37345753 1D TCAATTTATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 52 24 21 8 T 9 8 204167 CASAVA_Build 4 37348228 1I TAATCGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 11 12 204168 CASAVA_Build 4 37349791 1D CCTTTACTTT C/- CAATAACCTT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 C 2 1 204169 CASAVA_Build 4 37352764 1D GATACAAAAG C/- CCAGTGAATT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 C 3 2 204170 CASAVA_Build 4 37375974 1D GGTTTTTTGG A/- GACATCTCTA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 1 0 204171 CASAVA_Build 4 37389422 1D GTCTCAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 A 10 9 204172 CASAVA_Build 4 37390060 1D CAATAGTGTC T/- TTCAAACATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 2 204173 CASAVA_Build 4 37420629 1D TTTCTGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 564 hom 26 2 19 5 T 13 12 204174 CASAVA_Build 4 37426206 1D TGTCACATTG C/- GTGAAAATCT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 C 1 0 204175 CASAVA_Build 4 37429776 1I ATTTTTTTTT -/A ATTTATGGAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 1 2 204176 CASAVA_Build 4 37441055 2D AGCTTCTGAT CA/-- CACACACACA 3070 hom 59 het 31 0 18 15 CA 9 8 204177 CASAVA_Build 4 37443415 1D CACATGTTTT A/- AGATGTATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 2 1 204178 CASAVA_Build 4 37446217 1D TTATTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 30 3 14 13 A 18 17 204179 CASAVA_Build 4 37447126 1I CCCAATTTTC -/A AAGTTTTTCC 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 A 2 3 204180 CASAVA_Build 4 37449855 1I GTCTAAACCC -/T TTACTTCATT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 2 3 204181 CASAVA_Build 4 37456579 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1333 het 1333 ref 52 39 3 14 GT 8 7 204182 CASAVA_Build 4 37459665 1D GCTGGATTAA T/- TTTTTTTTTT 2841 het 523 hom 17 3 9 5 T 15 14 204183 CASAVA_Build 4 37475906 2I TAACTGGGGG --/GT GGGGGGGGTC 3070 hom 40 het 18 0 11 7 GT 0 1 204184 CASAVA_Build 4 37477030 11I AATATCATGT -----------/CAGTCAGGATC CAGTCAGGAG 3070 het 3070 hom 51 16 22 13 CAGTCAGGATC 0 1 204185 CASAVA_Build 4 37478062 1I ATTGCTGGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 8 9 204186 CASAVA_Build 4 37479021 1D CTCTACCTTG T/- TTACTTCTTT 3070 het 3070 hom 50 16 27 9 T 3 2 204187 CASAVA_Build 4 37480019 1D AAAAATAAGC A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 8 7 204188 CASAVA_Build 4 37481513 1I GTTTTTAGTA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 6 7 204189 CASAVA_Build 4 37483917 1D GCCCCACCCG C/- CCCCCAACCA 2848 het 579 hom 21 3 9 10 C 6 5 204190 CASAVA_Build 4 37483944 5I TGGACTTCCT -----/CCTCA GCCAGGGCAC 3070 het 2133 hom 28 7 10 11 CCTCA 0 1 204191 CASAVA_Build 4 37484501 7I AACCTCTGCC -------/TCCCAGG TTCAAGTGAT 2550 het 2346 hom 12 6 6 0 TCCCAGG 0 1 204192 CASAVA_Build 4 37486865 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 A 10 9 204193 CASAVA_Build 4 37487987 1I ACAATGTAAA -/C CAAAGATACG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 C 1 2 204194 CASAVA_Build 4 37488394 2I AGAAAGTCTT --/TG TAACATCTGA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 TG 0 1 204195 CASAVA_Build 4 37491737 1I TAATTTTGTG -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 T 7 8 204196 CASAVA_Build 4 37507203 2I ACTACCATAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 15 5 A 10 12 204197 CASAVA_Build 4 37507448 1D AAAACATTAC A/- AAAGTAAGGT 3070 het 3070 ref 42 25 12 6 A 4 3 204198 CASAVA_Build 4 37511920 1D AATTCTCAGA T/- TGTGCTTCTA 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 T 2 1 204199 CASAVA_Build 4 37512257 1D AGGCTGAGGT A/- GGGGGGGATT 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 A 1 0 204200 CASAVA_Build 4 37512357 1D CTGTCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 13 12 204201 CASAVA_Build 4 37515905 1D AGTCAGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 12 11 3 T 11 10 204202 CASAVA_Build 4 37518891 1I GGGTGGCTTG -/C CCATAGGCCA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 2 3 204203 CASAVA_Build 4 37520216 4D ATGCATATAC TATA/---- TATATAAAAT 3070 het 3070 hom 20 9 10 3 TA 5 3 204204 CASAVA_Build 4 37520391 1D TTAAAGTAAT A/- GCAAAATATT 3070 het 2596 hom 28 6 18 4 A 1 0 204205 CASAVA_Build 4 37520685 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 65 het 26 0 23 3 T 10 9 204206 CASAVA_Build 4 37522229 2I GAGGGAAGGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 AT 5 6 204207 CASAVA_Build 4 37523926 1D GATCTAGTGT G/- GGGGGAGGTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 G 6 5 204208 CASAVA_Build 4 37524338 1D GCTGCTGCTG A/- AATGGTAGGG 3070 het 3070 hom 52 21 25 7 A 3 2 204209 CASAVA_Build 4 37526708 1D ATAATATTTT G/- AAATGTTCTA 3070 het 3070 ref 48 27 19 3 G 1 0 204210 CASAVA_Build 4 37529504 2I CTTTCTATGT --/CA TGGGGTTGGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CA 0 1 204211 CASAVA_Build 4 37530335 1I ATTTCTATGT -/A CCTGTCAGCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 204212 CASAVA_Build 4 37530414 35I CCGCCCTCCT -----------------------------------/GGTTCCTCCACCTGGGCTGGGCCAGCTGCTTTCTG GGTTGGGTGC 3070 hom 57 het 18 0 20 1 GGTTCCTCCACCTGGGCTGGGCCAGCTGCTTTCTG 0 1 204213 CASAVA_Build 4 37534592 1D CCTCAAAAAA G/- TGTTTGAGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 G 1 0 204214 CASAVA_Build 4 37539441 1D TATATTTTCA T/- TGTCACTTGG 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 T 2 1 204215 CASAVA_Build 4 37545848 4D CATCAGTTAT TCAG/---- TCAGTGTACA 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 TCAG 2 1 204216 CASAVA_Build 4 37554486 1I CAAAATTCTT -/C ACAATAAGAA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 C 0 1 204217 CASAVA_Build 4 37555032 4D GCCTCGTGAC AGAG/---- AGAGAGCTTG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AG 5 3 204218 CASAVA_Build 4 37564709 1I CCCAGCTAAG -/T TTTTTTTTTT 2285 het 2285 ref 35 16 8 11 T 12 13 204219 CASAVA_Build 4 37648958 1I GCCTCACTGG -/C CCCCCCCCAC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 C 8 9 204220 CASAVA_Build 4 37650249 1I CTGTCATCTC -/A GCACTTTGGG 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 0 1 204221 CASAVA_Build 4 37668336 1I AAACATTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 12 13 204222 CASAVA_Build 4 37669280 3D AGATATTGTC CTT/--- CTCAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 CTT 1 0 204223 CASAVA_Build 4 37676996 1I GGCACGGTGG -/A CTCTCGCCTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 0 1 204224 CASAVA_Build 4 37695075 1I TGGATGCCAT -/G GGGGAAGGAG 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 G 4 5 204225 CASAVA_Build 4 37696601 4I CGCTTTTCTT ----/TCTC CTTTGCTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 TC 0 2 204226 CASAVA_Build 4 37704097 1I GAGATTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 11 12 204227 CASAVA_Build 4 37726640 2I GGTAGAATTC --/AG AGTCTCCAGT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 AG 1 2 204228 CASAVA_Build 4 37737586 3I GTGCATTCTC ---/TCT TCTTGGTGCT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 TCT 1 2 204229 CASAVA_Build 4 37741484 1D GAGGAGGGAG T/- TTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 45 25 12 8 T 7 6 204230 CASAVA_Build 4 37747877 10D TTTTTCTGTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 41 15 19 9 TTTTG 4 2 204231 CASAVA_Build 4 37757123 1I GCTCCCACGG -/T TGGAGGGGTT 3070 het 2493 hom 29 8 13 8 T 1 2 204232 CASAVA_Build 4 37757352 1I GCGGCCCCTT -/A AATACATTCT 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 A 2 3 204233 CASAVA_Build 4 37757745 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 11 12 204234 CASAVA_Build 4 37758316 1D GACATCTTTT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 47 15 27 6 A 8 7 204235 CASAVA_Build 4 37764177 1I CGTAAACTAT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 A 7 8 204236 CASAVA_Build 4 37771222 1D GAAATTGATC A/- GGGGTTCAAG 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 A 1 0 204237 CASAVA_Build 4 37771671 5I CTCCAGAGTA -----/GCTGG GATTACAGGC 608 het 608 ref 20 13 2 5 GCTGG 0 1 204238 CASAVA_Build 4 37782766 2I CTTAAGGTTA --/TT TTTTTTTTTT 2091 het 1496 hom 18 6 7 5 T 11 13 204239 CASAVA_Build 4 37794147 5I CTTCCCTCTA -----/ATAAC AGGAAGACAC 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 ATAAC 0 1 204240 CASAVA_Build 4 37796410 1I GGGGCTTCCC -/T TAGATGCCTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 1 2 204241 CASAVA_Build 4 37801006 1I GATTTATTGT -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 7 8 204242 CASAVA_Build 4 37802231 1I CCAGGACATC -/A GACTCTTTTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 0 1 204243 CASAVA_Build 4 37812430 6I TTTTTCCCCT ------/AAGATA GAGATGTCCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AAGATA 0 1 204244 CASAVA_Build 4 37816800 1D TCTCAGTTGC G/- GGGGGCATCT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 G 6 5 204245 CASAVA_Build 4 37818348 21D TTTTGGAACT TGCCTACTTTGAATGACAGCA/--------------------- TGCATGTATG 3070 het 3070 ref 48 38 12 8 TGCCTACTTTGAATGACAGCA 1 0 204246 CASAVA_Build 4 37833430 1D GTTGGATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2968 hom 29 10 14 5 T 12 11 204247 CASAVA_Build 4 37837107 1I CCCAAAGCCC -/T TTTTCAAATG 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 T 4 5 204248 CASAVA_Build 4 37841963 1D AAGTGGCCCC T/- GTCTTCTTAC 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 1 0 204249 CASAVA_Build 4 37844005 3D TGCAGGGATG GAT/--- GATGACCTCT 3070 het 3070 ref 46 24 20 3 GAT 2 1 204250 CASAVA_Build 4 37857156 5D TGTTTGGCAC ATTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 122 het 53 0 41 13 ATTTT 1 0 204251 CASAVA_Build 4 37875168 1I ATTTAAAACA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 T 8 9 204252 CASAVA_Build 4 37879342 1D ACTGGGGGTT G/- GGGGGCCTGA 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 G 6 5 204253 CASAVA_Build 4 37891727 1I CACAATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 T 10 11 204254 CASAVA_Build 4 37892352 1I GTATTTTTAG -/T TAGAGACGGG 3070 het 3017 hom 24 8 15 1 T 1 2 204255 CASAVA_Build 4 37893196 1I TTGTTTTTTT -/G TTTTTTGAGA 3070 het 1493 hom 17 4 12 1 G 0 1 204256 CASAVA_Build 4 37902889 1I GCTTATGAAC -/A ATAGAAACTT 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 A 1 2 204257 CASAVA_Build 4 37904581 1D TCCACTCTGA C/- CTTTTTGCTG 3064 het 3064 ref 33 19 9 5 C 2 1 204258 CASAVA_Build 4 37906669 1I CTGCAAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 9 10 204259 CASAVA_Build 4 37913682 1I AGTTTCTAAG -/T TCTTTTATAT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 1 2 204260 CASAVA_Build 4 37918628 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 876 hom 16 4 11 1 A 15 14 204261 CASAVA_Build 4 37922143 4D TCCCTGGGCC TCTT/---- TGTTTCTTGT 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 TCTT 1 0 204262 CASAVA_Build 4 37926184 10I CTCAACTGAA ----------/GATATGCAAC TTACTTTTGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 GATATGCAAC 0 1 204263 CASAVA_Build 4 37928473 3D TTTGGGTTTA ATT/--- ATTTGCTCTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 ATT 2 1 204264 CASAVA_Build 4 37932280 2I GGATAAATGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 36 1 29 6 T 10 12 204265 CASAVA_Build 4 37936440 4D TGAAATAGAC TTAA/---- TTAATTAATT 3070 het 3070 hom 28 9 12 8 TTAA 4 3 204266 CASAVA_Build 4 37943695 1D TCTAGTTTCC T/- TTGTTTATCT 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 T 3 2 204267 CASAVA_Build 4 37948348 8I GTTATCTTAC --------/ATGGTAAA ATGGTAAAAT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 ATGGTAAA 1 2 204268 CASAVA_Build 4 37949148 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2869 het 2869 ref 20 10 8 2 T 12 13 204269 CASAVA_Build 4 37951837 1D TTTTGAGATA G/- GGGCCTCAGT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 G 4 3 204270 CASAVA_Build 4 37955070 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAATTT 3070 hom 38 het 15 0 13 2 AAAG 1 2 204271 CASAVA_Build 4 37955358 5I ATCCTGTTGC -----/CAAAT AACCTCACAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CAAAT 0 1 204272 CASAVA_Build 4 37955510 2D ACTGCGATAA AG/-- AGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 AG 2 1 204273 CASAVA_Build 4 37957849 1I ACCTTTCTCC -/A AACCCTCATT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 2 3 204274 CASAVA_Build 4 37965090 1D CAGTTTAGTG A/- ATTCACTACT 3070 hom 16 het 45 2 38 7 A 2 1 204275 CASAVA_Build 4 37966290 9I CTTACAGGCT ---------/ATGACATAC ATGATCAAAG 3070 hom 135 het 55 0 46 9 ATGACATAC 0 1 204276 CASAVA_Build 4 37966466 1D TTCTTTTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 42 0 36 6 G 1 0 204277 CASAVA_Build 4 37969639 1I ACTGATCCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 T 8 9 204278 CASAVA_Build 4 37970664 1I ACTAGATTGT -/A AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 56 23 28 5 A 6 7 204279 CASAVA_Build 4 37971564 1I GATGAAACCC -/T TTTTTTTTTC 2768 het 2768 ref 33 13 10 10 T 9 10 204280 CASAVA_Build 4 37980189 4D TCCTCCAGAT AAAG/---- AGAGGGCATC 3070 het 3070 hom 55 25 24 6 AAAG 1 0 204281 CASAVA_Build 4 37981931 1D GAGCATGCAG C/- CCCCTGCTGC 2973 het 2973 ref 32 13 11 8 C 5 4 204282 CASAVA_Build 4 38010615 1I ATGGATTCAT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 357 hom 42 1 37 4 A 6 7 204283 CASAVA_Build 4 38040532 1D AAAAAGATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 29 7 A 10 9 204284 CASAVA_Build 4 38044648 1I TGTTGGCACA -/T TCTTGTCTGC 3070 hom 120 het 46 0 39 7 T 1 2 204285 CASAVA_Build 4 38044861 1D GTTTAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 30 2 18 11 T 13 12 204286 CASAVA_Build 4 38048401 1D CCACATGTAC T/- TTTAAAAGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 4 3 204287 CASAVA_Build 4 38049902 6I CTGAACTCTA ------/CCTGTC CTGAATCATG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 CCTGTC 0 1 204288 CASAVA_Build 4 38055937 1D GGATTAGGGC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 8 7 204289 CASAVA_Build 4 38061045 7I TAGGTGAAAA -------/AGTGTGG GGTGGCCTCC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 AGTGTGG 0 1 204290 CASAVA_Build 4 38061121 1D AATTCTGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 A 12 11 204291 CASAVA_Build 4 38064664 1I GCGCCCTCAG -/T TATCTTTAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 2 204292 CASAVA_Build 4 38067714 19D GGGGAGGAAG AAGGGACCAGTCAAAGGGT/------------------- AGAGAAACAC 3070 hom 99 het 33 0 33 2 AAGGGACCAGTCAAAGGGT 1 0 204293 CASAVA_Build 4 38068514 22D TGAGAAGCAC AACCTCTAGGCCTGGCCTATAT/---------------------- AACCTCTAGG 3070 hom 83 het 38 0 27 13 AACCTCTAGGCCTGGCCTATAT 2 1 204294 CASAVA_Build 4 38071775 1I TTAGCACCAT -/C CCCCCCTTGG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 6 7 204295 CASAVA_Build 4 38080793 20I GTCCTCCACT --------------------/GTTATTGTGTCATTATCTAA GTCTTTTCGT 3070 hom 108 het 37 0 36 4 GTTATTGTGTCATTATCTAA 0 1 204296 CASAVA_Build 4 38089415 2D CGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 63 het 36 0 20 16 TG 10 9 204297 CASAVA_Build 4 38090300 1D AGGATTCAGC A/- CCCGTAATAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 1 0 204298 CASAVA_Build 4 38090909 6D CTTTATTTAA AAGAAG/------ AAGAAGAAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 10 AAG 9 7 204299 CASAVA_Build 4 38091922 2D GATTTACATT AA/-- AAAAAAAAAA 881 het 762 hom 52 7 6 40 A 13 11 204300 CASAVA_Build 4 38106086 1D ATCCCTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 600 hom 34 4 21 9 T 15 14 204301 CASAVA_Build 4 38110630 1D TGGGCATTTG A/- GTTGGTTCCA 2422 het 2422 ref 19 12 5 3 A 1 0 204302 CASAVA_Build 4 38154393 1D TGCTCTCTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 410 hom 28 1 21 7 T 10 9 204303 CASAVA_Build 4 38168946 2D TTCTCTTATC CT/-- CTCTCTCTCT 1214 het 1214 ref 47 34 3 11 CT 7 6 204304 CASAVA_Build 4 38173287 1I AAAAAGCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 65 het 32 0 21 11 A 9 10 204305 CASAVA_Build 4 38175881 8D GGAAGAAGGG AGGGAGGA/-------- AGGGAGGAAG 3070 hom 64 het 28 0 20 11 AGGGAGGA 2 1 204306 CASAVA_Build 4 38177856 1I ACTGTTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 40 0 28 12 A 12 13 204307 CASAVA_Build 4 38181620 2D TCACATGGAG AC/-- ACACAAATCA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 AC 3 2 204308 CASAVA_Build 4 38199104 1I CCACATGGAA -/C CCTGGATGAG 3070 hom 135 het 48 0 45 3 C 2 3 204309 CASAVA_Build 4 38200430 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 977 het 490 hom 19 4 4 11 A 17 18 204310 CASAVA_Build 4 38202714 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2256 het 19 hom 23 1 12 10 A 12 14 204311 CASAVA_Build 4 38205756 13D GCACCCCCCA CCCCACAGTGATG/------------- GTATTAGAAG 3070 het 3070 hom 22 8 13 4 CCCCACAGTGATG 1 0 204312 CASAVA_Build 4 38209082 1I CAGAGAGAGA -/C CCTGTCTCTA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 C 2 3 204313 CASAVA_Build 4 38219119 1D AATAAGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2939 hom 41 10 20 12 T 12 11 204314 CASAVA_Build 4 38223970 1I GATTATTCGA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 7 8 204315 CASAVA_Build 4 38224292 1I TTTGATTTTT -/G TATATGGTGA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 G 0 1 204316 CASAVA_Build 4 38228932 2I TGGCTTCAGG --/CT GGGCCTGGGC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 CT 0 1 204317 CASAVA_Build 4 38242510 14I TTTTCTTTTC --------------/TTTTTTCTTTCTTT TTTTTTTTTT 1351 hom 10 het 5 0 4 2 TTTTTTCTTTCTTT 0 1 204318 CASAVA_Build 4 38249446 1D ACTCCAGACT G/- GACAGAATGC 3070 hom 111 het 42 0 38 6 G 2 1 204319 CASAVA_Build 4 38254056 1I TTCAAAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 11 12 204320 CASAVA_Build 4 38260860 1D AGTGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 35 1 30 4 A 12 11 204321 CASAVA_Build 4 38268793 10I CCCATTACTT ----------/CCTGCTTTCA CCTGCTTGAA 3070 het 3070 hom 56 23 29 4 CCTGCTTTCA 0 1 204322 CASAVA_Build 4 38271291 1I AAAGGCCAAA -/G TGAATATAAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 0 1 204323 CASAVA_Build 4 38281080 1I TTCAGTCCAC -/A GAGTTTTTGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 0 1 204324 CASAVA_Build 4 38290726 1D TACATTTTCC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 9 8 204325 CASAVA_Build 4 38295962 1D CATCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 10 14 T 15 14 204326 CASAVA_Build 4 38312920 1I ATCACAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 337 hom 39 2 31 6 A 12 13 204327 CASAVA_Build 4 38315355 3D TTGTTCTTCC CAT/--- CATCATACGC 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 CAT 3 2 204328 CASAVA_Build 4 38316346 4I CAAATAGCTG ----/TTAT TTATTTCTAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 TTAT 1 2 204329 CASAVA_Build 4 38321448 1D AGGGGTAGAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 8 7 204330 CASAVA_Build 4 38330166 1D GCAAGACTCC A/- TATGAAAGAA 3070 het 3070 hom 21 8 9 5 A 1 0 204331 CASAVA_Build 4 38330594 1D TTTTTTTGGA G/- GGGGGGGCGT 1546 het 901 hom 39 7 12 20 G 8 7 204332 CASAVA_Build 4 38336244 1D TTCTCAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 10 11 T 15 14 204333 CASAVA_Build 4 38337300 4D GCTGTCATAC ATTA/---- ATTAACAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 ATTA 2 1 204334 CASAVA_Build 4 38339754 16D TTTTGTTTTT TTTTTGTTTTGTTTTG/---------------- GTTTTTTTTT 970 het 970 ref 35 18 10 11 TTTTTGTTTTGTTTTG 1 0 204335 CASAVA_Build 4 38352802 4I CAAGAAACAG ----/GAAA GAAACTGCTC 3070 hom 142 het 54 0 42 12 GAAA 1 2 204336 CASAVA_Build 4 38353407 1I TTTTGCCCTT -/C CCCCCCCCTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 C 8 9 204337 CASAVA_Build 4 38365033 1D GCTGCCCCAC A/- GTCATAACTC 3070 het 3070 ref 42 20 18 5 A 1 0 204338 CASAVA_Build 4 38380366 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTAGCTC 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 AG 2 1 204339 CASAVA_Build 4 38399222 1D TCATGAAATC T/- TTTTTTTTTT 1035 het 1035 ref 27 20 3 5 T 11 10 204340 CASAVA_Build 4 38431829 1D ACACAAACCC A/- AAACATACAT 3070 hom 111 het 41 0 35 7 A 4 3 204341 CASAVA_Build 4 38431960 1D ACATTCTATA C/- CACGGAACAA 3070 hom 96 het 34 0 31 8 C 2 1 204342 CASAVA_Build 4 38434682 1D TCAAAATAGG T/- TTTTTTTTTT 2827 het 2827 ref 33 11 9 13 T 15 14 204343 CASAVA_Build 4 38504031 5I TGCCCACCCT -----/CATCC CGGACTCCAG 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 CATCC 0 1 204344 CASAVA_Build 4 38509045 2D CATTCACAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2413 hom 23 6 11 7 A 14 12 204345 CASAVA_Build 4 38519214 1D GTAAAGACTA T/- TTAGAGAGTT 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 T 3 2 204346 CASAVA_Build 4 38520869 1I TATACTGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 11 13 13 T 11 12 204347 CASAVA_Build 4 38522569 1I TTTGAATGAG -/A AAATTAATAA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 3 4 204348 CASAVA_Build 4 38523743 1I TACAGAACTG -/T TAAGATAATA 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 T 1 2 204349 CASAVA_Build 4 38525533 1I CAAGGGGTCA -/G GGAATTCCCT 3070 hom 54 het 19 0 15 4 G 2 3 204350 CASAVA_Build 4 38531398 1D AGTATAATAA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 1301 hom 16 4 11 2 T 1 0 204351 CASAVA_Build 4 38533883 4I AAGAAAGTAA ----/AAAT AAATAAACAG 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 AAAT 1 2 204352 CASAVA_Build 4 38534170 1D AGCTTGTGAA G/- GGGCTTGGTC 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 4 3 204353 CASAVA_Build 4 38538550 1I CTCTGCTGAA -/T TTAAAAAAAA 1224 het 471 hom 21 6 8 7 T 2 3 204354 CASAVA_Build 4 38540300 1I TCCAATCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 55 25 22 8 T 9 10 204355 CASAVA_Build 4 38553205 1D ATTTTAGAAT A/- TTTTTTTCTA 2410 het 2410 ref 22 16 6 0 A 1 0 204356 CASAVA_Build 4 38556577 5I TCATCAGAAA -----/TGTGT TGTGTAGTGA 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 TGTGT 1 2 204357 CASAVA_Build 4 38557661 4I TTAAACAAAA ----/GCCC GCTGAACAGT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 GCCC 0 1 204358 CASAVA_Build 4 38557740 1D GGGTAAACAT A/- ACACAAAATT 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 A 2 1 204359 CASAVA_Build 4 38560769 1D ATGTGTGTGT G/- GTGTGTATGT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 G 2 1 204360 CASAVA_Build 4 38561022 1D TTTCTTGTCC T/- TTCTGACATA 3070 het 3070 ref 42 26 11 8 T 3 2 204361 CASAVA_Build 4 38574643 1D GAATTTAAAG T/- TATGTGTGCC 3070 het 3070 hom 60 26 26 8 T 2 1 204362 CASAVA_Build 4 38578242 1D CGATTATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 12 12 A 12 11 204363 CASAVA_Build 4 38578964 1D ATTTTACCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 10 9 204364 CASAVA_Build 4 38579338 3D GTCTGGCTCT GTC/--- GTCACCCAGG 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 GTC 2 1 204365 CASAVA_Build 4 38599908 1I GCATCTATAG -/A ATGCGTATTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 1 2 204366 CASAVA_Build 4 38607336 8D GCCACACCTG ACAAACTC/-------- AATAAGGTCA 2004 het 2004 ref 25 16 8 7 ACAAACTC 1 0 204367 CASAVA_Build 4 38618399 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 89 het 37 0 31 6 A 9 8 204368 CASAVA_Build 4 38620889 24D GACAGGACAT ACCCTGGGCCAAGAAAGTACACAC/------------------------ ACTGATGGAT 3070 het 3070 ref 34 20 16 6 ACCCTGGGCCAAGAAAGTACACAC 1 0 204369 CASAVA_Build 4 38621372 1I TAATCCAATA -/T TGGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 1 2 204370 CASAVA_Build 4 38637993 1D TTAATAGAAC T/- TTTCTAAGTC 3070 het 3070 ref 58 31 22 5 T 4 3 204371 CASAVA_Build 4 38639860 1D TACAAGCTAG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 7 T 9 8 204372 CASAVA_Build 4 38641083 1D AAATTATGAG A/- ATAAACTGTG 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 2 1 204373 CASAVA_Build 4 38646821 1I GCGTATTGAG -/C CATCGACGCT 3070 hom 123 het 47 0 40 7 C 1 2 204374 CASAVA_Build 4 38652223 1D TCTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1061 het 1061 ref 28 18 3 7 T 16 15 204375 CASAVA_Build 4 38656283 1I AGTAACTTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 39 22 16 1 A 7 8 204376 CASAVA_Build 4 38663013 1I ATGGGTTGAC -/A GGGGGAACTA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 0 1 204377 CASAVA_Build 4 38666450 8D TGTTGGCCAG GCTGGTCT/-------- GCTGGTCTCA 3070 hom 39 het 15 0 13 4 GCTGGTCT 2 1 204378 CASAVA_Build 4 38666667 4I TTCTTCTCTT ----/ACTC ACTTGCCCGA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 ACTC 0 1 204379 CASAVA_Build 4 38669222 1I TTTAACTGTC -/T TTTTTCTTTT 2379 het 2379 ref 26 11 9 6 T 5 6 204380 CASAVA_Build 4 38669690 2D TTTTCCATGA AC/-- ACACACACAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AC 5 4 204381 CASAVA_Build 4 38671477 1D CTGCAACAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 2720 hom 33 7 16 11 A 9 8 204382 CASAVA_Build 4 38681668 1D TAACTACAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 9 8 204383 CASAVA_Build 4 38689465 1I CTGCACTCAT -/A ACGTTTATCA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 1 2 204384 CASAVA_Build 4 38691323 1D AACCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1931 het 1318 hom 13 4 5 4 A 13 12 204385 CASAVA_Build 4 38691497 1I CTCACTGCAA -/C CTCTGCCTCC 2763 het 784 hom 11 3 7 1 C 1 2 204386 CASAVA_Build 4 38699410 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 2758 het 2460 hom 15 7 6 2 A 9 10 204387 CASAVA_Build 4 38716105 1I CTTGGTTTTG -/C TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 C 0 1 204388 CASAVA_Build 4 38722411 4D AGGCTGGAGA AGGG/---- AGGCGAGTCT 3070 het 3064 hom 35 9 20 6 AGGG 1 0 204389 CASAVA_Build 4 38729727 3D AAAAAGAAAA AAC/--- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 36 16 14 8 AAC 1 0 204390 CASAVA_Build 4 38742291 1D TTAATTTAAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 T 8 7 204391 CASAVA_Build 4 38743371 2D CATTCATCAA TT/-- TTTTTTTTTT 1230 het 1230 ref 33 19 3 11 T 18 16 204392 CASAVA_Build 4 38743792 2I TTAAAATGTT --/AA AGACATAATG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 1 3 204393 CASAVA_Build 4 38745472 1D TTTTGAACTC A/- AATTAAGTTG 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 A 3 2 204394 CASAVA_Build 4 38746812 2D GTTTAGAATC AG/-- ATATATTAGG 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 AG 1 0 204395 CASAVA_Build 4 38748899 2I ATGTCAAGAC --/AT ATTTCAATTC 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 AT 1 2 204396 CASAVA_Build 4 38751402 4D GTTCATCACT CAAA/---- CATTCAACTA 3070 het 3070 ref 55 30 17 9 CAAA 1 0 204397 CASAVA_Build 4 38751566 3I TTTTCCCCTC ---/CTT AGGTCACTAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 CTT 0 1 204398 CASAVA_Build 4 38755710 1D AACTAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 30 2 22 7 A 15 14 204399 CASAVA_Build 4 38756401 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2560 het 1089 hom 11 4 6 2 A 12 11 204400 CASAVA_Build 4 38756929 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 A 7 6 204401 CASAVA_Build 4 38760927 6I TTTTTGAGGA ------/ATGTTC ATGTTGCCAC 3070 het 3070 ref 59 28 26 5 ATGTTC 0 1 204402 CASAVA_Build 4 38769490 1I TAGAAATACA -/G GACATATATA 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 G 1 2 204403 CASAVA_Build 4 38770344 4D TTTCTTACTC AAAT/---- AAAATTAATC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 AAAT 1 0 204404 CASAVA_Build 4 38779979 2I14M4D ATACACACAC --ATATATATGTATACATAT/ATATATATATGTATAC---- ATATATATAT 2757 het 1603 hom 10 4 7 0 N/A 0 0 204405 CASAVA_Build 4 38780531 1I AGAATATGTT -/C CCCTCCTCCC 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 C 3 4 204406 CASAVA_Build 4 38781233 2D TTTTTGTATC TG/-- TAATTTCATA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 TG 1 0 204407 CASAVA_Build 4 38781811 1D AAGTCTCTAC A/- AAAAATTTAA 3070 het 947 hom 20 5 10 5 A 6 5 204408 CASAVA_Build 4 38781870 1I TTGGTGGCTT -/G GGCCTATAGT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 G 2 3 204409 CASAVA_Build 4 38791341 1I AGAATTGGAA -/G GGGAAAGTCG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 G 3 4 204410 CASAVA_Build 4 38792483 1D AATTTCAACG T/- TGAGTTTTGG 3070 het 3070 hom 59 23 27 10 T 2 1 204411 CASAVA_Build 4 38794686 1I GACTGGTTAT -/A AGGATCTGTG 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 1 2 204412 CASAVA_Build 4 38796179 1I TGAGCATATC -/T TTACAGGCCA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 2 3 204413 CASAVA_Build 4 38797942 4I TTAAAATAGG ----/TTAT TTGATTGTTC 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 TTAT 0 1 204414 CASAVA_Build 4 38803180 1I AACCTACAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 8 9 204415 CASAVA_Build 4 38803305 3D GCAGTTCCTC AAT/--- AAGTTAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 19 4 AAT 1 0 204416 CASAVA_Build 4 38816148 3I CAAGTGAAAA ---/AGG AGCACTTATG 3070 het 3070 ref 35 19 8 8 AGG 0 1 204417 CASAVA_Build 4 38830561 2D GTTACAAAGG TA/-- TGCGTCAACA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 TA 1 0 204418 CASAVA_Build 4 38831548 1I ATATTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 23 0 10 13 T 15 16 204419 CASAVA_Build 4 38831961 1I TACATAATGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 459 hom 23 1 12 10 A 9 10 204420 CASAVA_Build 4 38838442 1D ATGGATCAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 9 14 9 A 10 9 204421 CASAVA_Build 4 38839003 38D10M1D CTCTCCTCGA AAACCTTCAGTTGAAGACATGTAGTCCAGACTTCTCAGCATGACATACA/--------------------------------------CATGACATAC- AGGTCCTTCC 3070 het 3070 ref 46 41 16 11 N/A 0 0 204422 CASAVA_Build 4 38843292 1I TAAGATACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 11 12 204423 CASAVA_Build 4 38843536 1I AAAAGGAAGG -/A AAACAGCCAC 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 3 4 204424 CASAVA_Build 4 38846611 1I TCTCAGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1118 hom 32 4 14 14 T 13 14 204425 CASAVA_Build 4 38857548 1I ATTCATCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 9 9 8 T 10 11 204426 CASAVA_Build 4 38871181 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2438 het 424 hom 13 3 8 2 T 14 13 204427 CASAVA_Build 4 38880707 1I ATATGCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 A 10 11 204428 CASAVA_Build 4 38881118 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTCTTTCT 1544 het 1544 ref 22 7 8 7 T 5 4 204429 CASAVA_Build 4 38892789 1D GGAGGAATAA T/- TTTTTTTTTT 2841 het 2841 ref 34 14 7 13 T 17 16 204430 CASAVA_Build 4 38896888 1I TGTTTTTCAC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 7 8 204431 CASAVA_Build 4 38904164 2I GACAGAATAT --/AC ACAAGAGAGT 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 AC 1 2 204432 CASAVA_Build 4 38908476 1D ACACCACTTA C/- CTCTGTGTGC 3070 het 3070 hom 62 26 29 7 C 2 1 204433 CASAVA_Build 4 38917458 1D CCTTTGGTTT A/- AAAAAAAAAA 2525 het 2525 ref 25 17 7 1 A 12 11 204434 CASAVA_Build 4 38921163 1I GAATATTCTA -/C CCTAGTACAT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 C 2 3 204435 CASAVA_Build 4 38928166 11D TCCCCCATGA TCAAGTGGGCT/----------- TCAAGTGGGC 2904 hom 15 het 7 0 6 1 TCAAGTGGGCT 2 1 204436 CASAVA_Build 4 38936176 1I TAAGTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 10 11 204437 CASAVA_Build 4 38939954 1I TACTACTGGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 9 204438 CASAVA_Build 4 38953019 1I ATTTCTCAAA -/G GTATTTCCAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 G 1 2 204439 CASAVA_Build 4 38956824 1D TTTTGATGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 T 8 7 204440 CASAVA_Build 4 38959456 1D CGTTGACGTG T/- TTTTCCCTTG 2752 het 2752 ref 26 16 8 2 T 5 4 204441 CASAVA_Build 4 38960939 2I TTCTGCGTAA --/AC AGTCATCTAC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 AC 0 1 204442 CASAVA_Build 4 38961408 1I CTCTGTTGTG -/A TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 12 25 4 A 0 1 204443 CASAVA_Build 4 38962179 6D TTTTCTATCC CTTTCT/------ GTCTTCTCAT 3070 het 3070 hom 37 15 22 1 CTTTCT 1 0 204444 CASAVA_Build 4 38963069 3D23M2I AACAAGACCC CATCATCTCCTAGGAAAAAAAAAAAG--/---CATCTCCTAGGAAAAAAAAAAAGAC ACACACACAA 3070 het 3070 ref 35 22 18 6 N/A 0 0 204445 CASAVA_Build 4 38963255 3D GATGGCTGTT ATC/--- ATCAGCATCC 3070 het 3070 ref 41 22 18 4 ATC 2 1 204446 CASAVA_Build 4 38963973 4D TATTAAGCAG AATC/---- AATCAGCCCA 3070 hom 108 het 37 0 37 1 AATC 2 1 204447 CASAVA_Build 4 38964134 4D AAAACATACA TTGT/---- TTGTTTGGAA 3070 hom 127 het 48 0 43 8 TTGT 2 1 204448 CASAVA_Build 4 38964255 3D GGAGTACATA CTT/--- CTTCTTCTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 CTT 4 3 204449 CASAVA_Build 4 38964776 3I TCCTAGTACA ---/AAT AATAATCTAC 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 AAT 2 3 204450 CASAVA_Build 4 38968387 1D GATTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1533 hom 24 7 10 7 A 14 13 204451 CASAVA_Build 4 38968828 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1601 het 1295 hom 27 8 10 9 A 15 16 204452 CASAVA_Build 4 38972514 2I TGGTGAAACC --/CT GTCTCTACTA 3070 het 2071 hom 20 5 12 3 CT 0 1 204453 CASAVA_Build 4 38974266 3D TTTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 14 11 204454 CASAVA_Build 4 38995811 1D TTCCTATTTT A/- ACATTATTTT 3070 het 3070 ref 42 19 21 2 A 2 1 204455 CASAVA_Build 4 38996172 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 12 11 204456 CASAVA_Build 4 38999974 1I CCTGCCTGTT -/A TAGTCTTAGC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 0 1 204457 CASAVA_Build 4 39006196 1D TTTTTCCCCC T/- ATCTCCAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 1 0 204458 CASAVA_Build 4 39014344 1I GCAGATCCAC -/A ACCACAGAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 2 204459 CASAVA_Build 4 39026899 1I GCCAAAGAGT -/A TTATTTTCAA 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 0 1 204460 CASAVA_Build 4 39027087 1I CAGCAAAAGA -/G AAATTTTCCC 3070 hom 120 het 48 0 41 7 G 0 1 204461 CASAVA_Build 4 39028204 2I TTAAAGACAG --/AA AAAGAGAAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 5 204462 CASAVA_Build 4 39033579 1I CCAACACACA -/T TAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 1 2 204463 CASAVA_Build 4 39043331 1D ATTTTCACCG C/- CCCCCCCCAG 2853 het 65 hom 20 2 8 10 C 9 8 204464 CASAVA_Build 4 39063831 4D TTTTGTTTGA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 TTGT 3 2 204465 CASAVA_Build 4 39064347 1I GAGGATATGA -/T TTTTTTTTTT 2773 het 2773 ref 27 10 8 9 T 13 14 204466 CASAVA_Build 4 39067117 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 15 1 10 4 A 13 14 204467 CASAVA_Build 4 39073835 4D TTCTTTTTCC TTCT/---- TTCTTCCTTT 3070 het 3070 ref 31 19 12 1 TTCT 2 1 204468 CASAVA_Build 4 39077373 1D TTCTCTGAAG A/- AAAAAAAAAG 2692 het 2692 ref 27 19 7 2 A 10 9 204469 CASAVA_Build 4 39086770 1I TTGCAAGAGA -/T TTTAGCCTCA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 3 4 204470 CASAVA_Build 4 39086971 1I TAGAAAAAAA -/C ATACAGCAAC 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 C 0 1 204471 CASAVA_Build 4 39087311 3D TTTAATTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2885 hom 27 10 11 6 T 15 12 204472 CASAVA_Build 4 39092320 2D CTGTTTTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 14 12 204473 CASAVA_Build 4 39095120 1D AAAAAAAGGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 7 6 204474 CASAVA_Build 4 39097433 1I GACTTTATAA -/T TATAAAATAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 2 204475 CASAVA_Build 4 39104706 1D CATCCAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 6 T 13 12 204476 CASAVA_Build 4 39110305 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 35 0 32 3 A 10 11 204477 CASAVA_Build 4 39110983 1D AACCTCTGCC T/- TCCCGGGTTC 3070 hom 15 het 26 1 23 2 T 2 1 204478 CASAVA_Build 4 39114729 1I CTCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 9 10 204479 CASAVA_Build 4 39122295 12I ATTAGCTGGA ------------/TTCTCTTAAAAT TGATGTTTTA 3070 hom 87 het 31 0 29 3 TTCTCTTAAAAT 0 1 204480 CASAVA_Build 4 39146887 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1008 hom 35 5 21 9 A 15 14 204481 CASAVA_Build 4 39168375 3I AGGTCCCGAT ---/AAC AACACTATGT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 AAC 1 2 204482 CASAVA_Build 4 39174755 1I TTGTATGATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 8 9 204483 CASAVA_Build 4 39174960 1D AACTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 10 9 204484 CASAVA_Build 4 39176012 1I CTAAAAATAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 263 hom 33 1 26 6 A 9 10 204485 CASAVA_Build 4 39177202 1D CTTTTGGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 11 10 204486 CASAVA_Build 4 39195220 1D TACTACTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1885 hom 26 6 11 9 T 17 16 204487 CASAVA_Build 4 39210471 4I CTTCCTTGCC ----/CTCA CTATGATTGT 3070 hom 59 het 24 0 19 6 CTCA 0 1 204488 CASAVA_Build 4 39213687 2I AATGTCAAAC --/AA AGAGATAAAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 3 204489 CASAVA_Build 4 39214364 1D GAAAGAGTGT A/- GGTTCTGAAT 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 A 1 0 204490 CASAVA_Build 4 39216132 5D ATGCCCAGCC TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 TTTTA 4 3 204491 CASAVA_Build 4 39255446 1D CCTTTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 477 hom 37 4 20 13 T 15 14 204492 CASAVA_Build 4 39256096 1D GGTAAATCGT A/- GTCTTTTAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 1 0 204493 CASAVA_Build 4 39290025 1I AAAGGGAGAT -/G GGAGATGCGG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 G 2 3 204494 CASAVA_Build 4 39299863 1I CATGCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 675 hom 29 2 17 10 T 13 14 204495 CASAVA_Build 4 39303458 1I ATCATTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 29 2 17 10 T 10 11 204496 CASAVA_Build 4 39309686 1I AAAAAAAAAA -/T AAATAAATAT 3070 hom 36 het 17 0 14 3 T 0 1 204497 CASAVA_Build 4 39314724 1D TATAAAACAA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 9 8 204498 CASAVA_Build 4 39378940 3I GTGGAAGAGG ---/CCA CCATTTGTGT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 CCA 1 2 204499 CASAVA_Build 4 39404571 1I ATGTGGCTAG -/T TTTGTCTGTC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 3 4 204500 CASAVA_Build 4 39411348 1D CGGGCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 753 hom 26 5 14 7 T 19 18 204501 CASAVA_Build 4 39468149 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3 hom 19 1 16 2 A 9 10 204502 CASAVA_Build 4 39472915 1D AATACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1612 hom 12 het 5 0 5 0 A 11 10 204503 CASAVA_Build 4 39477439 1I CGCTCTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 37 1 22 14 T 13 14 204504 CASAVA_Build 4 39483827 1I AAATGCAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 29 het 14 0 10 4 T 9 10 204505 CASAVA_Build 4 39487628 1D AGCCTCCCGA G/- TAGCCAGCAC 3070 het 2183 hom 20 7 9 4 G 1 0 204506 CASAVA_Build 4 39488274 4D TCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 25 8 15 3 AAAC 5 4 204507 CASAVA_Build 4 39515555 1I GGTAGCCCTT -/A ATTTTATGTA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 1 2 204508 CASAVA_Build 4 39519051 1I ATTACAGGTG -/T TAAGTTACTG 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 1 2 204509 CASAVA_Build 4 39521772 2D TTATTAACTC TT/-- ATATTATTTT 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 T 2 0 204510 CASAVA_Build 4 39547513 1I TATTAGCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 A 10 11 204511 CASAVA_Build 4 39551623 1I CATTATATGT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 8 9 204512 CASAVA_Build 4 39555333 10I GTTATGGCTA ----------/ATCAGACATT ATCAGAAATA 3070 hom 119 het 46 0 39 7 ATCAGACATT 0 1 204513 CASAVA_Build 4 39562930 1D ACATATGTAT A/- GGGGGGAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 A 1 0 204514 CASAVA_Build 4 39565895 5D ATAGCAAAAT AACAA/----- AACAAAACAA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 AACAA 5 4 204515 CASAVA_Build 4 39578694 6I GTACAAATGG ------/TAAATA TAAATATAAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 TAAATA 1 2 204516 CASAVA_Build 4 39579282 11D CTTTTCTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 20 9 204517 CASAVA_Build 4 39583874 1I AGGAGGGAAG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 7 8 204518 CASAVA_Build 4 39584024 2D GAGATGAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 18 1 8 9 A 13 11 204519 CASAVA_Build 4 39584773 1D CTCTAAAAAA G/- AGGGGTGGGT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 G 1 0 204520 CASAVA_Build 4 39586806 4I TGGGAGGCTG ----/AGGC AGGCAGGCAG 3070 het 2895 hom 31 13 12 6 AGGC 3 4 204521 CASAVA_Build 4 39591104 1D TAATGACTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 26 4 16 6 C 1 0 204522 CASAVA_Build 4 39593057 1D ACAAAAATGA T/- TTTTTTTTTT 2482 het 2482 ref 22 12 7 3 T 12 11 204523 CASAVA_Build 4 39594220 1D AAAACAACAA C/- AACAAAAAAA 3001 het 354 hom 16 4 7 5 C 1 0 204524 CASAVA_Build 4 39595031 1I CAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 13 14 204525 CASAVA_Build 4 39596372 1D CAAAAGCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 10 9 204526 CASAVA_Build 4 39606298 2D CCAGACAGTT CA/-- CAGTCAACTT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 CA 2 1 204527 CASAVA_Build 4 39615362 5D ATATGTCATA TAATT/----- TAAATATGTC 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 TAATT 1 0 204528 CASAVA_Build 4 39617495 1I ACCTAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 29 0 23 6 A 10 11 204529 CASAVA_Build 4 39618727 5D CCCAGGCTGG AGCGC/----- AGAGGCGCTC 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 AGCGC 1 0 204530 CASAVA_Build 4 39624225 1I TCATCTCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 670 hom 38 3 23 12 A 13 14 204531 CASAVA_Build 4 39636621 1D ATTTCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 20 1 12 7 T 11 10 204532 CASAVA_Build 4 39639069 1I AAGCAATCCT -/C CCACCTCGCT 2802 het 2802 ref 21 11 8 2 C 2 3 204533 CASAVA_Build 4 39644920 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 2571 hom 18 het 8 0 6 2 AGG 0 1 204534 CASAVA_Build 4 39647976 2D ATGTAGAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 32 0 17 15 T 16 14 204535 CASAVA_Build 4 39648458 1D TCAAATGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 14 20 16 A 15 14 204536 CASAVA_Build 4 39665264 1D GAATAATTGA T/- TGGACTTTAT 2329 het 2329 ref 28 16 5 7 T 2 1 204537 CASAVA_Build 4 39670548 1I TCCTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2860 hom 25 9 11 5 T 11 12 204538 CASAVA_Build 4 39685867 1I ATAGCTGGAA -/C CTCCATTTTG 3070 hom 56 het 25 0 17 8 C 1 2 204539 CASAVA_Build 4 39697799 6I TTTAGATCAT ------/CTGTAC CTTTTGTCCT 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 CTGTAC 0 1 204540 CASAVA_Build 4 39705566 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAGAAAA 3070 het 2302 hom 22 10 11 1 G 0 1 204541 CASAVA_Build 4 39707678 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2697 hom 22 8 11 3 T 10 11 204542 CASAVA_Build 4 39710444 1I TACCTTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 T 11 12 204543 CASAVA_Build 4 39715981 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2616 het 611 hom 14 4 6 4 A 12 11 204544 CASAVA_Build 4 39728173 1I CTTGAGCCTA -/G GAATTTGAGA 3070 het 2646 hom 25 8 12 5 G 1 2 204545 CASAVA_Build 4 39730033 1D TATGCTTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 35 0 28 8 T 10 9 204546 CASAVA_Build 4 39730982 1D AAAACAGTGT C/- ATTAGCCATT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 1 0 204547 CASAVA_Build 4 39745372 1D CCTGGCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 31 2 20 9 T 14 13 204548 CASAVA_Build 4 39751613 1D ACACATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 9 12 7 T 15 14 204549 CASAVA_Build 4 39771603 4D TGTATTTGTA TTAT/---- TTATTTATTT 1975 hom 10 het 6 0 4 2 TTAT 4 3 204550 CASAVA_Build 4 39782425 2D TTATTTTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 7 12 3 T 12 10 204551 CASAVA_Build 4 39785942 1D CCTATGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3021 hom 35 10 15 10 T 15 14 204552 CASAVA_Build 4 39794954 4D GCTGTCATTC TAAT/---- TGTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 TAAT 1 0 204553 CASAVA_Build 4 39801942 1D TAACAAGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 11 10 204554 CASAVA_Build 4 39810850 1D TACTTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 12 11 204555 CASAVA_Build 4 39812408 1I GGGTGTGTCC -/T TTCTGGGGAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 2 3 204556 CASAVA_Build 4 39812915 6D TTCCTTCCTT CCTTTC/------ TCTCTCTCTC 1174 het 1174 ref 14 9 3 2 CCTTTC 1 0 204557 CASAVA_Build 4 39834743 1D TGAGTATCCC T/- AATGAGAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 1 0 204558 CASAVA_Build 4 39839066 4D GAGACCAAAA ACTC/---- AATCAATCAA 3070 het 3070 ref 38 19 18 3 ACTC 1 0 204559 CASAVA_Build 4 39846608 3I TTATGGATTT ---/TAC TACACCTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 TAC 1 2 204560 CASAVA_Build 4 39856442 1D CCACCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2663 het 2366 hom 23 9 10 4 A 11 10 204561 CASAVA_Build 4 39862375 2I TTCATCTGCC --/TT TTTTTTTTTT 2760 het 2266 hom 19 5 7 7 T 11 13 204562 CASAVA_Build 4 39865303 4D GAATCTTTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 AAAC 3 2 204563 CASAVA_Build 4 39865509 1D AATTGTTCTA T/- TTTTTTGTAG 2870 het 2602 hom 23 8 8 7 T 7 6 204564 CASAVA_Build 4 39868607 1D ATGGAGGGGG A/- AAAAAACTCC 3070 hom 94 het 38 0 26 12 A 7 6 204565 CASAVA_Build 4 39872235 3D TCATTTTTCT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 42 het 21 0 15 7 TTA 7 6 204566 CASAVA_Build 4 39884594 10D TCTTTGGGCA GTAACTTGCT/---------- GAAAATTATA 3070 het 3070 ref 31 20 12 1 GTAACTTGCT 1 0 204567 CASAVA_Build 4 39905194 4I ACAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 AAAC 2 3 204568 CASAVA_Build 4 39910244 1I TTGGTAACAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 7 8 204569 CASAVA_Build 4 39912198 1I AAACACGAGT -/C CTTTGGTAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 C 1 2 204570 CASAVA_Build 4 39914646 4D TCAACTAAAA AAAT/---- ACAAAAATTA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 AAAT 1 0 204571 CASAVA_Build 4 39924464 3D CTCCACCTGT TGG/--- CGGGAGCCAA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 TGG 1 0 204572 CASAVA_Build 4 39957601 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 9 10 204573 CASAVA_Build 4 39965706 1I CTTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 17 0 11 6 T 11 12 204574 CASAVA_Build 4 39967460 2D ACTCCGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 14 12 204575 CASAVA_Build 4 39996205 1I GCGTAGCTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 1522 hom 35 9 15 11 T 7 8 204576 CASAVA_Build 4 39996241 2D GGGTTCTCTC TA/-- TGTTGTTCAG 3070 het 2883 hom 39 9 18 13 TA 1 0 204577 CASAVA_Build 4 39997805 6D GACTGGGACC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 1214 hom 26 6 14 6 T 16 10 204578 CASAVA_Build 4 40002363 4I CCAACGGAGG ----/CTTC CTGGTGCTAA 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 CTTC 0 1 204579 CASAVA_Build 4 40011687 1I CATATTCAGT -/C ACATTGTGCT 1932 het 1932 ref 16 11 4 1 C 0 1 204580 CASAVA_Build 4 40015865 1D GACTTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2703 hom 25 9 10 7 A 15 14 204581 CASAVA_Build 4 40025578 1D AATGCATACA T/- TGCAGGTCAG 3070 het 3070 ref 48 24 17 8 T 2 1 204582 CASAVA_Build 4 40026447 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1721 het 1255 hom 14 5 6 3 A 12 11 204583 CASAVA_Build 4 40033261 1D TTGATCTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 10 9 204584 CASAVA_Build 4 40033801 1I ATCTAGGAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 A 8 9 204585 CASAVA_Build 4 40035478 1I TAGCCCTGTT -/C TTTCTGTCCA 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 C 0 1 204586 CASAVA_Build 4 40035627 2D TCTGTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 2996 het 893 hom 34 10 16 8 TC 7 6 204587 CASAVA_Build 4 40035898 1D TTAAAAATAC A/- AAAAATCAGC 3070 het 2295 hom 20 7 10 3 A 6 5 204588 CASAVA_Build 4 40045278 2D TATTTTTAGA AT/-- ATATTATTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AT 3 2 204589 CASAVA_Build 4 40049414 3D AAAGTTTATC AAT/--- TTTATTACTC 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 AAT 1 0 204590 CASAVA_Build 4 40050495 1D ATGTGTACAA T/- TGCCTGCGGT 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 T 2 1 204591 CASAVA_Build 4 40054877 1D TTTAAAAAAA T/- AATAATAATA 2473 het 1750 hom 16 5 7 5 T 1 0 204592 CASAVA_Build 4 40063538 2I ATTCAAAACA --/CT CTTACAAACT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CT 1 2 204593 CASAVA_Build 4 40064217 1D AAAAATTATC T/- TTTTTCACAA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 6 5 204594 CASAVA_Build 4 40065545 2D CCCCGTCTCT AC/-- TAAAAATACA 2723 het 334 hom 10 1 8 1 AC 1 0 204595 CASAVA_Build 4 40070926 1I TTATCATCTT -/A ACAATTTCTG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 1 2 204596 CASAVA_Build 4 40072984 1I TTATTATTAC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 8 9 204597 CASAVA_Build 4 40073113 1D ACTGCAGATG T/- CCCAGGGTCT 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 T 1 0 204598 CASAVA_Build 4 40073743 1D GCTTGAGTCC A/- GGAGCTCAGT 3070 hom 81 het 30 0 27 4 A 1 0 204599 CASAVA_Build 4 40077216 15D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1404 hom 27 6 15 8 A 26 11 204600 CASAVA_Build 4 40081329 1I ATTTTTAAAT -/A CTCACATATA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 0 1 204601 CASAVA_Build 4 40087718 1D CTACTGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 13 12 204602 CASAVA_Build 4 40111631 1D ATGTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 40 1 31 9 A 13 12 204603 CASAVA_Build 4 40115339 1I GCACACCCCC -/A AGCAAGGTCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 2 204604 CASAVA_Build 4 40116248 1D TGGGAGGCAT C/- CCCCCCTGGG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 C 7 6 204605 CASAVA_Build 4 40121755 1D CCAACCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 A 11 10 204606 CASAVA_Build 4 40128794 1I CAGGCTAATT -/A TAAAAAAAAA 1960 het 185 hom 10 1 5 4 A 0 1 204607 CASAVA_Build 4 40130542 1D AACACATGGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 9 8 204608 CASAVA_Build 4 40131391 10D ATCAGTTTTA CTTTGCCCAC/---------- AGTGCCAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CTTTGCCCAC 1 0 204609 CASAVA_Build 4 40138049 1I AAAAGGAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 A 11 12 204610 CASAVA_Build 4 40141933 4I CTGTAGTCCC ----/AGCT AGCCACAGGG 3070 het 504 hom 15 5 10 1 AGCT 0 1 204611 CASAVA_Build 4 40145075 2I GTGTGTTTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 GT 7 8 204612 CASAVA_Build 4 40149464 1I ACTACTGCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 9 10 204613 CASAVA_Build 4 40150614 1I AGAGGTCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 T 11 12 204614 CASAVA_Build 4 40184714 1D CAGAGGAGGG A/- AAAAAACGGA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 7 6 204615 CASAVA_Build 4 40204115 4D TGAAATTCAC CTAA/---- CTTTCTTATG 3070 het 3070 ref 30 18 9 4 CTAA 1 0 204616 CASAVA_Build 4 40211713 1I CTGTCAAAGG -/C CAAGAGTTAA 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 C 1 2 204617 CASAVA_Build 4 40212154 1I GAGTGGGACA -/G TCTAAGACAT 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 G 0 1 204618 CASAVA_Build 4 40220638 1I GCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2564 het 1846 hom 23 7 10 6 A 13 14 204619 CASAVA_Build 4 40222644 1D CCCTGGGGCT G/- GCCTGGCAGT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 G 2 1 204620 CASAVA_Build 4 40229434 1I TTTTTAAATA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 2438 hom 25 9 9 7 T 7 8 204621 CASAVA_Build 4 40234052 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3053 hom 27 10 9 8 T 10 11 204622 CASAVA_Build 4 40234337 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 T 7 6 204623 CASAVA_Build 4 40234757 6D AGGACTACAG GCGTGT/------ GCGTGTGCCA 3070 het 3070 ref 31 14 13 5 GCGTGT 2 1 204624 CASAVA_Build 4 40254524 1D ACCCCACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 23 3 A 11 10 204625 CASAVA_Build 4 40257214 1I AGGTGCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 A 10 11 204626 CASAVA_Build 4 40260208 1I CTGTGCTTGT -/A ATTATACTGC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 1 2 204627 CASAVA_Build 4 40268803 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1909 hom 18 6 8 4 A 11 12 204628 CASAVA_Build 4 40269141 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 11 10 204629 CASAVA_Build 4 40277249 1I GGCACGTGGG -/A AAGGCCAGAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 2 3 204630 CASAVA_Build 4 40355062 1D AAGATAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1897 het 1897 ref 15 7 4 4 A 11 10 204631 CASAVA_Build 4 40369150 1D CCCCCTCTTC A/- AAAAAAAAAA 1643 het 724 hom 27 6 7 14 A 19 18 204632 CASAVA_Build 4 40371696 10D GTTCAAGGGA TTCTTGTGCC/---------- TCAGCCTCCC 3070 het 2823 hom 17 6 11 0 TTCTTGTGCC 1 0 204633 CASAVA_Build 4 40373617 1I TTATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 T 10 11 204634 CASAVA_Build 4 40375087 1I CTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 36 3 16 17 T 13 14 204635 CASAVA_Build 4 40378346 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1791 het 1791 ref 18 6 5 7 A 10 11 204636 CASAVA_Build 4 40382402 1D AAATTAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1407 hom 16 4 8 4 T 12 11 204637 CASAVA_Build 4 40385807 3I AATTTCTGAA ---/TTT TTTTTTTTTT 2224 het 2224 ref 34 18 11 5 T 15 18 204638 CASAVA_Build 4 40387970 1I CTGGTTCTCC -/A AACTACAGCT 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 2 3 204639 CASAVA_Build 4 40400176 10I11M6I AAGGTTCCTG ----------TTCCTCCGCTG------/TGAACCGAGATTGCGCCACTGCACTCC AGAAACAGGA 3070 hom 42 het 15 0 11 5 N/A 0 0 204640 CASAVA_Build 4 40400597 1I CCAGCTAAAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 1330 hom 15 4 9 2 T 7 8 204641 CASAVA_Build 4 40407505 1I CATTTTCCCC -/T ATCCCCAGAC 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 T 0 1 204642 CASAVA_Build 4 40412209 1D TTCTTGTCTC A/- AAAAAAAATA 1497 het 1497 ref 16 9 5 2 A 9 8 204643 CASAVA_Build 4 40419379 1D AGGGTTACCA C/- CCTGGTTCAG 3070 het 3070 ref 46 24 15 8 C 3 2 204644 CASAVA_Build 4 40419572 20D ACATGAGTGG TCTGACCCTCATCTGCCTCT/-------------------- TCCTGCTCCC 3070 het 3070 ref 49 31 27 11 TCTGACCCTCATCTGCCTCT 1 0 204645 CASAVA_Build 4 40425341 2I TTCTGTAAAC --/GA GAGTTTAAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GA 1 2 204646 CASAVA_Build 4 40427333 2I GAAGAAGAAC --/AG TAATATTTGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AG 0 1 204647 CASAVA_Build 4 40427958 1D ACAATATGCT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 36 0 28 9 A 9 8 204648 CASAVA_Build 4 40428325 2D TTTGAGGAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 16 14 204649 CASAVA_Build 4 40429924 42D TTTTCTTTTC TTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTCCTTCCTTCCT/------------------------------------------ TCCTTCCTTC 3070 hom 58 het 23 0 18 9 TTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTCCTTCCTTCCT 1 0 204650 CASAVA_Build 4 40442654 2D TATATATGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 115 hom 29 1 18 10 A 16 14 204651 CASAVA_Build 4 40449596 65I TCTGCAGAGA -----------------------------------------------------------------/TAATGTAGCTTAACTCTGAAGCCAGCAATTTGTCATGGAGAAAAATTTGTATGATGTGAAATAAC GTCTCTTTGT 2988 hom 18 het 6 0 7 0 TAATGTAGCTTAACTCTGAAGCCAGCAATTTGTCATGGAGAAAAATTTGTATGATGTGAAATAAC 0 1 204652 CASAVA_Build 4 40460178 3I AGAGGAAACT ---/TGG TGGAGCAATA 3070 hom 157 het 56 0 50 6 TGG 1 2 204653 CASAVA_Build 4 40464979 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2501 het 1013 hom 32 5 11 16 T 15 14 204654 CASAVA_Build 4 40480262 1I AAGCAACAAG -/A AAAAAATCGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 6 7 204655 CASAVA_Build 4 40482451 5I TGGAATTAAA -----/ATGAC ATACTTCAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 ATGAC 0 1 204656 CASAVA_Build 4 40499113 1D AAATTTTATA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 43 23 16 5 T 9 8 204657 CASAVA_Build 4 40499406 4I TGGATGTGTA ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 99 het 41 0 33 8 TGTT 3 4 204658 CASAVA_Build 4 40506501 3I AAACCCACAA ---/ATT ATTTCTGATT 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 ATT 1 2 204659 CASAVA_Build 4 40508295 12I CACTGCACTC ------------/CAGCCTAGGCGA CAGAGTAAGA 3070 hom 28 het 17 0 10 7 CAGCCTAGGCGA 0 1 204660 CASAVA_Build 4 40508425 3I CTTGAGATAA ---/AAG AAGTGCTGCA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 AAG 1 2 204661 CASAVA_Build 4 40509399 3D GTGAAATCTT GAG/--- GAGTTTGTGT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 GAG 2 1 204662 CASAVA_Build 4 40523148 1I TCAACCCACG -/T TTTTTTTTTT 2081 het 2067 hom 29 8 8 13 T 13 14 204663 CASAVA_Build 4 40528186 1D GAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1741 hom 39 9 21 10 A 10 9 204664 CASAVA_Build 4 40530341 1D ATATCATACC T/- TTTTGTAGTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 5 4 204665 CASAVA_Build 4 40530887 1D GAATTCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 34 1 30 4 T 12 11 204666 CASAVA_Build 4 40531308 2D GCTGCTGCGG GA/-- GAGTCATGAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 GA 2 1 204667 CASAVA_Build 4 40540216 9D GCCAAGCTGT TTTTATAAA/--------- ACAAGCATGG 3070 het 3070 ref 47 25 20 6 TTTTATAAA 1 0 204668 CASAVA_Build 4 40546664 1I ACACCCAGCT -/A ATTTTTGTAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 1 2 204669 CASAVA_Build 4 40548513 8D TATATATATA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 248 het 68 hom 7 1 2 4 T 20 12 204670 CASAVA_Build 4 40550146 4D GGATCCTGTC CCCA/---- CCCACCTCTT 3070 het 3070 ref 59 30 24 6 CCCA 2 1 204671 CASAVA_Build 4 40551565 3D GTCCATCTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 1322 het 439 hom 17 3 7 9 A 19 16 204672 CASAVA_Build 4 40552510 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2859 het 2859 ref 31 19 9 3 A 11 10 204673 CASAVA_Build 4 40553469 1D GGCAGAAATG C/- CCCGTGCAGA 3070 het 3070 hom 42 17 17 9 C 4 3 204674 CASAVA_Build 4 40558586 7D TGTTCTATTG TTTTCTT/------- TTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 40 21 17 7 TTTTCTT 2 1 204675 CASAVA_Build 4 40567782 2D CCAGCCATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 4 AT 6 5 204676 CASAVA_Build 4 40567949 1D AGAGTCTCAC T/- CTGTTGCCCA 3070 hom 67 het 24 0 20 4 T 1 0 204677 CASAVA_Build 4 40572579 1D TTCTGCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 41 0 33 10 A 11 10 204678 CASAVA_Build 4 40580485 2D AGAGACTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 2595 het 8 hom 31 1 15 16 A 18 16 204679 CASAVA_Build 4 40589807 1I AATCTGTGTC -/A CTTAGCTACT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 A 0 1 204680 CASAVA_Build 4 40590380 1D TTTGCTATTT A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 A 7 6 204681 CASAVA_Build 4 40594004 1I CCGGGTGGGC -/A AAACAGGCTC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 A 3 4 204682 CASAVA_Build 4 40595419 1D GATTTCAGCC A/- AAGCCAGCAC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 3 2 204683 CASAVA_Build 4 40597531 4D GAGCCCGGGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1288 het 1288 ref 27 9 7 11 T 18 14 204684 CASAVA_Build 4 40610081 4D TGTAATTCTC AAAT/---- AAATAAACAA 3070 het 3070 ref 61 29 28 6 AAAT 2 1 204685 CASAVA_Build 4 40615012 2D ACTGGCTAGT AC/-- ACAGTTACTG 3070 het 3070 ref 26 16 9 2 AC 2 1 204686 CASAVA_Build 4 40636642 1I CAGAGAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 9 10 204687 CASAVA_Build 4 40636873 3D TGCACAGGAT GAG/--- GAGAACAGGT 3070 het 3070 ref 35 16 15 8 GAG 2 1 204688 CASAVA_Build 4 40637916 1D TATTTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 T 13 12 204689 CASAVA_Build 4 40642262 1D GCTATAACTC T/- TAATTTTCCT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 2 1 204690 CASAVA_Build 4 40646034 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 56 het 22 0 16 6 CT 1 2 204691 CASAVA_Build 4 40648030 1I TATGTTTACA -/T GTATGGGTGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 0 1 204692 CASAVA_Build 4 40648960 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 14 2 11 3 A 21 18 204693 CASAVA_Build 4 40651762 1D TCTAACTACT G/- GGCTCCACAG 3070 hom 111 het 38 0 37 2 G 3 2 204694 CASAVA_Build 4 40661233 1D AAACAAATCA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 T 7 6 204695 CASAVA_Build 4 40675701 1I GAACTCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 10 11 204696 CASAVA_Build 4 40676210 1I GGATTTTACG -/T TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 1 2 204697 CASAVA_Build 4 40677292 12D ACGAGGGGGC ACTGCAGAGCCA/------------ ACTGCAGAGC 3070 hom 98 het 41 0 29 17 ACTGCAGAGCCA 2 1 204698 CASAVA_Build 4 40678163 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AGACAGAGCA 3070 het 3070 hom 31 14 16 5 AAAG 1 0 204699 CASAVA_Build 4 40679561 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2928 het 2928 ref 27 14 9 4 A 12 11 204700 CASAVA_Build 4 40680356 1D TAATTATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 40 0 32 8 T 13 12 204701 CASAVA_Build 4 40682057 1I GTCTTTTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 434 hom 25 1 23 1 A 9 10 204702 CASAVA_Build 4 40683993 1D ATACTAAGCA T/- ATCATCAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 1 0 204703 CASAVA_Build 4 40686306 1D AGAAACTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 7 17 8 T 10 9 204704 CASAVA_Build 4 40688948 3D CCTTTTTTGT TTG/--- TTGCTTGTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 6 TTG 2 1 204705 CASAVA_Build 4 40689143 1I GATGGGGGGG -/A GGTCTTTCTA 3070 hom 5 het 22 0 16 6 A 0 1 204706 CASAVA_Build 4 40699688 2I AATAAAATCC --/TA TATGTTTCCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TA 1 2 204707 CASAVA_Build 4 40719628 2D CACTGTTATT AA/-- TAGTTAAGTC 3070 het 3070 hom 44 16 22 7 A 2 0 204708 CASAVA_Build 4 40724139 22D ATATTGTTAC ATATATATATATATATATATAT/---------------------- ATATATATAT 3070 het 1055 hom 12 3 11 1 AT 20 9 204709 CASAVA_Build 4 40731013 3D TGGTTCATTA GAT/--- GATAATACAC 3070 het 3070 hom 46 20 19 10 GAT 2 1 204710 CASAVA_Build 4 40735747 1D AACTCAGACA T/- GATTTGCACT 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 T 1 0 204711 CASAVA_Build 4 40736610 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2991 het 1942 hom 37 10 10 17 A 16 17 204712 CASAVA_Build 4 40740522 1D AGTGTATAAT C/- CTAGTCACCA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 C 2 1 204713 CASAVA_Build 4 40741074 2I AGAACCAATA --/AT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 AT 0 1 204714 CASAVA_Build 4 40742768 3D TGAAACATTT TTA/--- TATTCAGAGA 3070 het 3070 ref 22 13 9 1 TTA 1 0 204715 CASAVA_Build 4 40743369 1I TCTCCAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 A 11 12 204716 CASAVA_Build 4 40749542 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTCTTTTTTT 3070 het 2132 hom 22 11 10 2 TTC 2 1 204717 CASAVA_Build 4 40755065 1D AGAGAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 1813 het 1813 ref 46 30 5 12 A 13 12 204718 CASAVA_Build 4 40759122 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 21 3 T 11 10 204719 CASAVA_Build 4 40797238 1D CTCTTGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 12 11 204720 CASAVA_Build 4 40803237 1I GATTAGGCAC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 204721 CASAVA_Build 4 40814828 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 A 11 12 204722 CASAVA_Build 4 40815924 1I AAATAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 36 1 26 9 T 12 13 204723 CASAVA_Build 4 40824856 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAG 2465 het 2465 ref 20 11 7 2 A 9 10 204724 CASAVA_Build 4 40834936 1D TGAGACTGCA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 3 2 204725 CASAVA_Build 4 40835283 1I GACTATATAC -/A AAAAGAAACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 4 5 204726 CASAVA_Build 4 40838079 18D GTCAAAAATA TGTGTGTGTCTGTGTGTG/------------------ TGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 60 27 17 20 TGTGTGTGTCTGTGTGTG 2 1 204727 CASAVA_Build 4 40838935 2D GACTGTGACT CA/-- CTACTTTCTA 3070 het 3070 ref 45 24 16 8 CA 1 0 204728 CASAVA_Build 4 40848399 1D GAATGACAGC T/- TTTTTTGACA 3070 het 3070 ref 36 18 13 7 T 7 6 204729 CASAVA_Build 4 40856074 4D GGAACAGATG AATT/---- AATATAAAGT 3070 het 3070 ref 34 19 15 1 AATT 1 0 204730 CASAVA_Build 4 40861976 1D GGTGTAGCAA G/- TCACTTAACT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 G 1 0 204731 CASAVA_Build 4 40866988 1D AAACTATTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 7 6 204732 CASAVA_Build 4 40868153 1D34M2D CATAGCTTCC TTGCAAAGGTAACAGGTGGCTCTAACAATAATAGCAA/-TGCAAAGGTAACAGGTGGCTCTAACAATAATAGC-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 21 4 N/A 0 0 204733 CASAVA_Build 4 40877957 1D ATTCAATTCC A/- AGCAGGCACA 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 A 2 1 204734 CASAVA_Build 4 40882493 1D ATTTTCCATG C/- CCTATAACCG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 3 2 204735 CASAVA_Build 4 40886862 1D CGTGCTATTA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 40 25 12 4 T 8 7 204736 CASAVA_Build 4 40892803 1I GTGTGGTGGC -/G GGCGCCTGTA 1912 het 1277 hom 9 4 5 0 G 2 3 204737 CASAVA_Build 4 40893730 1I CCAGCACTAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 40 11 19 10 T 7 8 204738 CASAVA_Build 4 40895931 1I37M1I TTATATTTTT -GGGGGGGACACAATTTAACCCAAACAGATGCCCTCAA-/GGGGGGGGACACAATTTAACCCAAACAGATGCCCTCAAT TAGAACTGAC 3070 het 3070 hom 44 23 26 7 N/A 0 0 204739 CASAVA_Build 4 40900826 3I GATATCAGAG ---/AAT AATGTTTAAG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 AAT 1 2 204740 CASAVA_Build 4 40913882 1D TGTGAGTGGG T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 7 6 204741 CASAVA_Build 4 40914252 1D TCTAATGGGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 A 9 8 204742 CASAVA_Build 4 40914375 4I ATTACTTGTT ----/CCTA CCTGTGACGT 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 CCTA 0 1 204743 CASAVA_Build 4 40918883 1D CTTTTTCTAG A/- AAAATTCTAC 3070 hom 115 het 43 0 39 5 A 5 4 204744 CASAVA_Build 4 40921369 1I TTGGTATTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 208 hom 37 1 25 11 T 9 10 204745 CASAVA_Build 4 40925305 4D GTCTGCCTGC CTGT/---- CTGTCTGTCT 3070 het 3070 hom 46 20 23 5 CTGT 4 3 204746 CASAVA_Build 4 40929445 5I AGGTGACAGA -----/AAAGG AAAGGAGTGC 3070 het 3070 ref 52 31 15 6 AAAGG 1 2 204747 CASAVA_Build 4 40930271 2I AAAAATAAAA --/AT AGTGTCAACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AT 0 1 204748 CASAVA_Build 4 40930564 1I AGCATAAACA -/G GAACAGCAGC 3070 hom 89 het 34 0 29 5 G 1 2 204749 CASAVA_Build 4 40934418 1I GCAGCAAACC -/A AAAATGAAAG 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 4 5 204750 CASAVA_Build 4 40936904 1D AGACACTGGC A/- AGTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 36 20 11 6 A 2 1 204751 CASAVA_Build 4 40938330 1D GATCCCCCCC A/- AAAAAGCAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 A 6 5 204752 CASAVA_Build 4 40938898 2D GCTGTGGCCC TA/-- GACATTACAG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 TA 1 0 204753 CASAVA_Build 4 40939400 1D TATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1469 hom 20 7 10 3 A 12 11 204754 CASAVA_Build 4 40944109 2D TTAGATACAC AT/-- ATACAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 AT 2 1 204755 CASAVA_Build 4 40951330 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2548 het 2548 ref 37 17 8 12 T 14 13 204756 CASAVA_Build 4 40960285 2D CTTTCTGGGC AA/-- AGAGTACGTC 3070 het 3070 hom 45 20 23 4 A 3 1 204757 CASAVA_Build 4 40964006 1D GTTAAGGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 29 1 22 6 T 11 10 204758 CASAVA_Build 4 40966786 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 6 7 204759 CASAVA_Build 4 40978545 2I TGGTCTCAAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 TG 7 8 204760 CASAVA_Build 4 41029229 1I ACCCTACCTC -/A AAAAAAAAAA 2870 het 1590 hom 24 5 10 9 A 15 16 204761 CASAVA_Build 4 41031957 1D AATATGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3056 het 3056 ref 38 15 12 12 T 13 12 204762 CASAVA_Build 4 41041401 3D TCTGGATTTT ATA/--- ATATCTGTGG 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 ATA 2 1 204763 CASAVA_Build 4 41042692 1I TGTTGTTGTT -/G GGGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 7 8 204764 CASAVA_Build 4 41068421 1I TGCTGCCCCC -/T GTCCCAGTTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 T 0 1 204765 CASAVA_Build 4 41088774 1I TCCAAAATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 T 7 8 204766 CASAVA_Build 4 41089559 1I TCATCCCAGC -/A CTGTGGGAGG 3070 het 2775 hom 25 10 12 3 A 0 1 204767 CASAVA_Build 4 41169755 1D GCTGTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 953 het 953 ref 28 19 3 7 T 13 12 204768 CASAVA_Build 4 41286858 4D CTTTTAAAAA TAGT/---- TAGTTAATTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 TAGT 2 1 204769 CASAVA_Build 4 41306017 2D CCACCTTATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 41 2 28 11 T 14 12 204770 CASAVA_Build 4 41310007 1I TATTTGGGGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 71 het 32 0 24 8 T 7 8 204771 CASAVA_Build 4 41318279 1D TTCCATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 30 1 17 12 T 15 14 204772 CASAVA_Build 4 41334886 2I TTTGTTGTTG --/TT TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 2 4 204773 CASAVA_Build 4 41338886 6D ATAGTGGCCT AAACCA/------ AAATTCTGAC 3070 het 3070 ref 39 18 18 5 AAACCA 1 0 204774 CASAVA_Build 4 41339088 1D AAAAGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 2869 het 2869 ref 31 12 9 10 T 12 11 204775 CASAVA_Build 4 41357881 5I CCAGCTTGAA -----/CAAGT AGGCTTTCAA 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 CAAGT 0 1 204776 CASAVA_Build 4 41358693 3D AAAAATGAAT AAA/--- ATAGTGCCAT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 4 1 204777 CASAVA_Build 4 41364743 1D TGTCGCTACC A/- AAAAAAAAAA 2573 het 1686 hom 21 8 6 7 A 15 14 204778 CASAVA_Build 4 41371423 4D CCCAACCTAC TGAA/---- TGAACATTAT 3070 het 3070 ref 56 35 15 6 TGAA 2 1 204779 CASAVA_Build 4 41375010 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 11 12 204780 CASAVA_Build 4 41406055 3I TATGGTAAAC ---/ATT AGCCGTTTCT 3070 het 3070 hom 61 26 28 7 ATT 0 1 204781 CASAVA_Build 4 41409736 1D GAAAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 11 10 204782 CASAVA_Build 4 41412921 1D TAGAGAAGCC A/- AAAAAAAAAA 2481 het 1936 hom 33 12 8 13 A 13 12 204783 CASAVA_Build 4 41430376 1I ACCATTGTGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 8 9 204784 CASAVA_Build 4 41443496 2D AAAAGGGATC CT/-- CTCTGGGTTT 2270 het 2270 ref 24 13 7 5 CT 3 2 204785 CASAVA_Build 4 41451012 1D AACCCAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1382 hom 36 6 17 13 A 13 12 204786 CASAVA_Build 4 41452185 1D CCACTGGGGG T/- TTTCCGGGCC 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 T 4 3 204787 CASAVA_Build 4 41455300 1D TTTTTCGGTC T/- TTTTTTTCAT 2499 het 2499 ref 22 11 6 5 T 8 7 204788 CASAVA_Build 4 41461388 2D CCACTAGGGC AG/-- AGAGAGAGAG 2908 het 2908 ref 35 18 8 10 AG 10 9 204789 CASAVA_Build 4 41463166 1D AAATGAACCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 T 10 9 204790 CASAVA_Build 4 41467027 1I ATGACACACA -/C AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 C 0 1 204791 CASAVA_Build 4 41475357 1I GGATTCATAG -/T GAAAACATTA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 0 1 204792 CASAVA_Build 4 41478818 1D ATGCAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 11 10 204793 CASAVA_Build 4 41480844 1I ATTTAAACTA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 7 8 204794 CASAVA_Build 4 41501801 1I GACGCTTTCT -/G GGGTTGTTGC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 G 3 4 204795 CASAVA_Build 4 41524068 1I TGAGCAAGAG -/C ATTGACATGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 204796 CASAVA_Build 4 41591891 3D GTAATTTTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 1624 het 201 hom 21 4 7 10 T 21 18 204797 CASAVA_Build 4 41633830 1D GATCTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1564 het 1564 ref 26 15 4 7 T 15 14 204798 CASAVA_Build 4 41647839 2D AGTACTACAC TT/-- TTTTTAATTA 3070 hom 129 het 46 0 44 3 T 7 5 204799 CASAVA_Build 4 41671874 4D CAGAAACAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 111 het 49 0 37 13 AAAC 5 4 204800 CASAVA_Build 4 41672660 1I AGAAGAAGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 204801 CASAVA_Build 4 41673240 1I CCTGACCTTG -/T TTCTAAGCTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 2 3 204802 CASAVA_Build 4 41675698 2I ACACACACAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 41 0 27 14 A 9 11 204803 CASAVA_Build 4 41680030 1I TCCCCAACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 29 0 18 11 T 11 12 204804 CASAVA_Build 4 41683143 2D GGTACTGGCT AC/-- ACAGTTTTTG 3070 hom 82 het 35 0 27 12 AC 2 1 204805 CASAVA_Build 4 41683467 3I CTAAGGAAAA ---/GGT GTGTGTGTAT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 GGT 0 1 204806 CASAVA_Build 4 41684093 1D TTTCTGTTTG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 342 hom 47 1 41 6 T 9 8 204807 CASAVA_Build 4 41686515 1I CACAAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 10 204808 CASAVA_Build 4 41687104 3I ACAGTTTACG ---/TGA TGATTTCCAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TGA 1 2 204809 CASAVA_Build 4 41690943 3I AGAAAAAAAA ---/AAG AAGTTATAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAG 1 2 204810 CASAVA_Build 4 41693934 1I TTCCTAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 322 hom 33 2 22 9 A 12 13 204811 CASAVA_Build 4 41697009 1I TCAGTGTATG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 A 8 9 204812 CASAVA_Build 4 41698926 1I TTCCAAGTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 77 hom 37 1 32 4 T 9 10 204813 CASAVA_Build 4 41700550 1I AATTTTTTTT -/C CTCATTCCGT 3070 het 49 hom 45 1 41 3 C 1 2 204814 CASAVA_Build 4 41703461 4D ACCCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 38 1 24 13 A 18 14 204815 CASAVA_Build 4 41704378 6D ACAAAAAATT AGCCGG/------ AGCCGGGCAT 3070 hom 75 het 26 0 26 5 AGCCGG 2 1 204816 CASAVA_Build 4 41704595 2D TCATTATCTC TT/-- GTCTGATTTA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 2 0 204817 CASAVA_Build 4 41708825 4D ATCAATATAT AAAG/---- AGAGATGAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 AAAG 1 0 204818 CASAVA_Build 4 41711330 1I ACTCCGTCGC -/A AAAAAAAAAA 2550 het 39 hom 10 1 8 1 A 14 15 204819 CASAVA_Build 4 41713570 8D TATAACATGG TCTATCTA/-------- TCTATCTATC 3070 hom 129 het 45 0 44 2 TCTA 8 6 204820 CASAVA_Build 4 41714150 2D TTTTTCTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 8 T 13 11 204821 CASAVA_Build 4 41715760 1D24M1D AAACTCACGC AAAAAAAAAATCTGTATTTCCTTATA/-AAAAAAAAATCTGTATTTCCTTAT- TTTTTTTTCA 3070 hom 69 het 20 0 24 2 N/A 0 0 204822 CASAVA_Build 4 41721880 1D AGCTACCAAC A/- ACATGGCCAG 3070 hom 60 het 22 0 20 3 A 2 1 204823 CASAVA_Build 4 41726205 1D CATATCAGGA C/- CCCCACCAGG 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 C 5 4 204824 CASAVA_Build 4 41726429 1I GTGAGCGAAA -/G GTCTGCAGAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 1 2 204825 CASAVA_Build 4 41727374 5I TTTTTTTTTT -----/GGGGG GGGCTCTTTC 1136 het 1136 ref 29 12 9 8 G 3 8 204826 CASAVA_Build 4 41730857 26D TTTGTAATAC AAAAATTTGAGAAAACACAGTAATAG/-------------------------- AAAAATACTC 3070 hom 57 het 17 0 20 2 AAAAATTTGAGAAAACACAGTAATAG 1 0 204827 CASAVA_Build 4 41731216 1D GCCACCCCCC G/- GTCCCTGGCA 3070 hom 55 het 25 0 18 7 G 2 1 204828 CASAVA_Build 4 41732549 10I GGATTACAAG ----------/CGTGAGCCAC CGTGCCCGGC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 CGTGAGCCAC 0 1 204829 CASAVA_Build 4 41733840 1D TTTGAAATGA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 106 het 42 0 36 7 T 9 8 204830 CASAVA_Build 4 41736688 4I AATATGTATC ----/AGAT AGTGTGATAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AGAT 0 1 204831 CASAVA_Build 4 41738066 1I GAAGCGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1568 hom 26 6 15 5 T 10 11 204832 CASAVA_Build 4 41745296 1D AACTCACTAG C/- ATAACGTCTG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 C 1 0 204833 CASAVA_Build 4 41749803 1I AAAATGAGAA -/C CCAGTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 2 3 204834 CASAVA_Build 4 41752946 1I ATATTAAGGA -/T TTTTTAAATA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 5 6 204835 CASAVA_Build 4 41756536 1I TGTAGTTTAT -/A AAAACTACAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 4 5 204836 CASAVA_Build 4 41764089 1I TGTTAATTCC -/A TACTAATCAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 0 1 204837 CASAVA_Build 4 41765020 1I AACTTAACTC -/T TTTTTTTTTT 1174 het 167 hom 15 2 5 8 T 15 16 204838 CASAVA_Build 4 41765554 1I GTAGCTAATT -/A AAGTGTTTTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 3 204839 CASAVA_Build 4 41768757 4D CTGTTCAGAT TGTC/---- TGTTTCTTCT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 TGTC 1 0 204840 CASAVA_Build 4 41779010 5D AAAAATAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AAATA 3 2 204841 CASAVA_Build 4 41780450 2I AATGTCAAAC --/TT TTAATGAACA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 2 4 204842 CASAVA_Build 4 41784370 1D TGTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 29 3 21 5 T 14 13 204843 CASAVA_Build 4 41785802 4I TGTTTCTTAC ----/TTTG TTTGTATCTA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TTTG 1 2 204844 CASAVA_Build 4 41789396 4D GGTTTTTTTG GTTT/---- GTTTGTTTTC 2523 hom 27 het 12 0 8 5 GTTT 3 2 204845 CASAVA_Build 4 41793766 1I ATGGCTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1941 hom 35 7 20 8 A 13 14 204846 CASAVA_Build 4 41836366 1D TTTATTTCAG A/- AAAAAAAAAA 1344 het 1344 ref 40 29 4 7 A 13 12 204847 CASAVA_Build 4 41892055 1I CCGGGCGCAG -/T GGCTCACGCT 1715 het 1715 ref 18 7 5 7 T 0 1 204848 CASAVA_Build 4 41911203 3D GTTATTTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1540 hom 34 11 10 13 T 15 12 204849 CASAVA_Build 4 41912863 1D GATCAATGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 9 204850 CASAVA_Build 4 41915030 1I AAGTAAAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 8 9 204851 CASAVA_Build 4 41917899 3I AATAAATGGC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 A 10 13 204852 CASAVA_Build 4 41929717 1D AGAACATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 11 10 204853 CASAVA_Build 4 41935372 1I GATCTTAATC -/T TTTTTTTTTT 1957 het 1957 ref 23 13 5 5 T 10 11 204854 CASAVA_Build 4 41936887 3I GTAAATGTGC ---/ATG ATATGTGTGT 3070 hom 116 het 47 0 38 9 ATG 0 1 204855 CASAVA_Build 4 41939480 1D TAGCTACATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 10 9 204856 CASAVA_Build 4 41946527 2D TTTTTCCCCC CT/-- GAGACAGAGT 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 CT 1 0 204857 CASAVA_Build 4 41951274 1D CCAATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 12 11 204858 CASAVA_Build 4 41966097 2I TAGCAGAGAA --/AT ATATATATAT 1057 het 871 hom 8 4 3 1 AT 6 7 204859 CASAVA_Build 4 41992728 4I TGCTAAAAAT ----/ACAA ACAATTAGCC 1787 hom 15 het 9 0 6 3 ACAA 1 2 204860 CASAVA_Build 4 41996828 1I CTTTCTTTTC -/T TTTCTTTCTT 759 hom 12 het 7 0 4 3 T 3 4 204861 CASAVA_Build 4 42013150 1I ACAAACAAAC -/A AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 3 4 204862 CASAVA_Build 4 42023228 4D AAGAAAGGGA GGAG/---- GGAGGGAGGG 3070 hom 47 het 19 0 16 4 GGAG 5 4 204863 CASAVA_Build 4 42028594 1D CATCTCTACT A/- AAAAATACAA 3070 hom 72 het 25 0 25 1 A 6 5 204864 CASAVA_Build 4 42030176 1D TAGGCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 30 0 27 3 T 11 10 204865 CASAVA_Build 4 42034223 21D GCTTTGTTGT ACCTTCTGCTTTTGTTGTTGC/--------------------- ACCTTCTACT 3070 hom 162 het 56 0 53 12 ACCTTCTGCTTTTGTTGTTGC 1 0 204866 CASAVA_Build 4 42040095 1D GGGAAACACA G/- GGGAAAAAAA 3070 het 354 hom 40 1 35 6 G 4 3 204867 CASAVA_Build 4 42040489 1D GTCTCTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 31 0 30 3 A 10 9 204868 CASAVA_Build 4 42040869 2D GACAATTGGG AA/-- AAAAAAACAT 3070 hom 73 het 40 1 35 4 A 9 7 204869 CASAVA_Build 4 42042137 1I GGGTCCTTGA -/G GACCCTCCCA 3070 hom 123 het 49 0 41 8 G 1 2 204870 CASAVA_Build 4 42053043 1I GTCCACATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1953 hom 35 5 24 6 A 12 13 204871 CASAVA_Build 4 42069743 1I TGAATTGGCT -/G GGCCCTGCCA 3070 hom 87 het 37 0 27 10 G 2 3 204872 CASAVA_Build 4 42075225 1D ACAATTTCTA T/- TTTTTAGATA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 5 204873 CASAVA_Build 4 42076671 1D TGCATGCTCA T/- TTTTTTTTTT 1407 het 1407 ref 25 18 3 4 T 12 11 204874 CASAVA_Build 4 42079594 1D TCAAATAATT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 77 het 30 0 25 5 A 9 8 204875 CASAVA_Build 4 42084687 1I TTTTTTTTCT -/C TTTTTTTTTT 2935 hom 48 het 22 0 17 5 C 0 1 204876 CASAVA_Build 4 42086716 1D AGATGGCACC A/- ACTGCACTCC 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 2 1 204877 CASAVA_Build 4 42092789 1D TGGCAAGACC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 8 7 204878 CASAVA_Build 4 42093109 3D TAACTTAGAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 30 2 21 8 A 16 13 204879 CASAVA_Build 4 42095599 1D CCCCAGTCAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2475 hom 20 7 9 5 T 9 8 204880 CASAVA_Build 4 42102111 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 8 7 204881 CASAVA_Build 4 42114111 1D GTGAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 2809 het 2809 ref 24 11 8 5 A 12 11 204882 CASAVA_Build 4 42115136 4I TTATTGTATT ----/TACC TGCCTATGAA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 TACC 0 1 204883 CASAVA_Build 4 42116798 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAAAC 3070 het 1840 hom 23 5 15 3 C 0 1 204884 CASAVA_Build 4 42117542 2I TGAGCTAGAA --/CT CTCTTTTTTT 3070 het 320 hom 27 6 17 4 CT 2 3 204885 CASAVA_Build 4 42127080 1I CCTGCCTGTT -/C CCCTGTACAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 C 3 4 204886 CASAVA_Build 4 42128276 1I ACATAACTGG -/C TAAGGTTTCT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 C 0 1 204887 CASAVA_Build 4 42130059 2D AGCGCTCTCT TC/-- TCTGTTAGTC 3070 het 3070 ref 60 28 25 10 TC 2 1 204888 CASAVA_Build 4 42132218 7D AAAAAAAAAA AAAAAAC/------- AAAAAAAAAA 2091 het 1625 hom 13 6 6 4 AAAAAAC 1 0 204889 CASAVA_Build 4 42134826 1D GGCACTGATG C/- TAGAAGGGCA 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 C 1 0 204890 CASAVA_Build 4 42135841 3I AAGTCCTGAT ---/TAA TGTGTGAATC 3070 hom 157 het 57 0 53 4 TAA 0 1 204891 CASAVA_Build 4 42137697 4I ACGTACATAA ----/TTAG TTAATTATTT 3070 hom 136 het 54 0 45 9 TTAG 0 1 204892 CASAVA_Build 4 42143547 1I AAATGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 26 12 14 A 11 12 204893 CASAVA_Build 4 42165792 2I CTGTTTGAAA --/CT CTGCATGTTT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 CT 1 2 204894 CASAVA_Build 4 42166626 2I TACAATTTCC --/AT ATGAGTCTAG 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 AT 1 2 204895 CASAVA_Build 4 42170594 1I TAATTTTTGT -/G GTTTTTTTTT 1770 het 490 hom 14 5 7 2 G 1 2 204896 CASAVA_Build 4 42175354 1D AAAACCACAT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 50 het 33 1 29 5 A 7 6 204897 CASAVA_Build 4 42178974 1I CTACTCGGGA -/G GCTGAGGCAC 3070 hom 80 het 29 0 25 4 G 1 2 204898 CASAVA_Build 4 42192389 1D TATTTATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 T 12 11 204899 CASAVA_Build 4 42195469 1D TAATAATACT A/- AAAAAAAAAA 1381 het 1381 ref 37 25 3 9 A 11 10 204900 CASAVA_Build 4 42207300 1D AGGCATAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 11 10 204901 CASAVA_Build 4 42222990 3D AATTTTCTAC CTT/--- CTTTATAGTG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 CTT 2 1 204902 CASAVA_Build 4 42246219 1I AATAGGGGGG -/A AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 A 6 7 204903 CASAVA_Build 4 42257350 1I TTTAATGAGT -/A AAGGAACAGG 3070 hom 93 het 41 0 32 9 A 2 3 204904 CASAVA_Build 4 42279956 3I TACACAAATT ---/CTA CTGACACAGG 3070 hom 159 het 60 0 53 7 CTA 0 1 204905 CASAVA_Build 4 42287693 1I TAAAATGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 507 hom 32 3 25 4 A 11 12 204906 CASAVA_Build 4 42291219 2D AGCATAGAAT AC/-- ACAGTAAAAA 3070 hom 135 het 49 0 46 4 AC 2 1 204907 CASAVA_Build 4 42296919 1D ATCAGAACTC A/- AAATTCTTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 4 3 204908 CASAVA_Build 4 42297813 2I TTTTCTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 2955 hom 63 het 23 0 22 1 TC 0 1 204909 CASAVA_Build 4 42298149 1I TTCTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 22 1 18 3 A 10 11 204910 CASAVA_Build 4 42298692 2D GAACTCAGTG TT/-- TCACAATATA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 3 1 204911 CASAVA_Build 4 42298771 1I GTCTTAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 10 11 204912 CASAVA_Build 4 42301205 8I AGCACACACT --------/GACATAAA GGTGCTCAGT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 GACATAAA 0 1 204913 CASAVA_Build 4 42302208 1D GTTCACATGT A/- AAAAATAGCC 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 6 5 204914 CASAVA_Build 4 42303286 1D AGTAGAGAAG C/- TAGTCTTGGG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 1 0 204915 CASAVA_Build 4 42306934 2D TGGCCCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 37 1 21 17 T 16 14 204916 CASAVA_Build 4 42307357 2D CTTTGTGTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 28 1 18 9 A 16 14 204917 CASAVA_Build 4 42308033 1I AAGGAAGATA -/T AGGTGAATAT 3070 hom 141 het 56 0 48 8 T 0 1 204918 CASAVA_Build 4 42308378 4D GCACCTGAAC TCCA/---- TCCATCCTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TCCA 2 1 204919 CASAVA_Build 4 42308881 3I CAGAGAAGAT ---/AAA AAAGTGGCAA 3070 hom 135 het 47 0 45 2 A 3 6 204920 CASAVA_Build 4 42310113 1I49M2I AAAGTACAGT -CCCCCCTCAATATCCATGAGGGATTAGTTCCAGGACCTCCCATGGATAC--/CCCCCCCTCAATATCCATGAGGGATTAGTTCCAGGACCTCCCATGGATACAA AAATCCATGG 3070 hom 120 het 38 0 41 8 N/A 0 0 204921 CASAVA_Build 4 42310341 1I TAAACTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 9 10 204922 CASAVA_Build 4 42310661 1D CCTGGCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 15 0 10 6 T 12 11 204923 CASAVA_Build 4 42310871 1I CAATCCTGTT -/A ATCTATGAAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 204924 CASAVA_Build 4 42332897 36D GCTTAATACA CACACACACACACACACACACACACACACACACACG/------------------------------------ CACACACACA 2928 het 783 hom 25 6 7 15 CACACACACACACACACACACACACACACACACACG 1 0 204925 CASAVA_Build 4 42333181 4D CGGGTAGGGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 87 het 33 0 28 9 GA 8 6 204926 CASAVA_Build 4 42343882 9I CCTCTAAACT ---------/GCCACAAGG GCCAAGTCAA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 GCCACAAGG 0 1 204927 CASAVA_Build 4 42347956 5D CCTCCCCAGC CATGT/----- AAGTCCATTA 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 CATGT 1 0 204928 CASAVA_Build 4 42350069 5I46M4I TCATTTTCCC -----CATTTGCCACACAACAAATTCTATAATTAGCATATTTTGTGTGTGT----/CATAGCATTTGCCACACAACAAATTCTATAATTAGCATATTTTGTGTGTGTTTTG TTTGTCTCCT 3070 hom 217 het 51 0 71 11 N/A 0 0 204929 CASAVA_Build 4 42356821 1D CGTTTGTGGG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 T 9 8 204930 CASAVA_Build 4 42367874 18I AACTATTTTT ------------------/TCCCCTTTTTCCTTGAAC TGTGGTGACA 3070 hom 120 het 41 0 41 2 TCCCCTTTTTCCTTGAAC 0 1 204931 CASAVA_Build 4 42383225 2I TTTATTTTTC --/TA TGTGTCTGTA 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 TA 0 1 204932 CASAVA_Build 4 42404857 1I CCAGAATCAG -/T TTTTTTTTTT 2110 het 2110 ref 14 7 6 1 T 11 12 204933 CASAVA_Build 4 42405834 1D TTTTTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 11 10 204934 CASAVA_Build 4 42412079 2D GTGTTGAACA CT/-- CTTGGTCACA 3070 het 3070 ref 37 25 9 3 CT 2 1 204935 CASAVA_Build 4 42418724 1D7M14I AAGTCTCTGT CCCTCCCC--------------/-CCTCCCCACCATAGTTTCTTA TGTGTTCTTC 3070 het 3070 ref 19 10 9 3 N/A 0 0 204936 CASAVA_Build 4 42419831 1I AAATATGATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 A 10 11 204937 CASAVA_Build 4 42424063 1D CAAACAGACA T/- TTTTAACAGG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 5 4 204938 CASAVA_Build 4 42426841 4D TTCAAAAGTA GCCT/---- GAGAACACTT 3070 het 3070 ref 37 18 19 2 GCCT 1 0 204939 CASAVA_Build 4 42429536 4I2M1I TTTCTTGGTT ----AT-/GCAAATA TCAGAATTCA 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 N/A 0 0 204940 CASAVA_Build 4 42430638 15D TTCAAAGTGA TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2669 het 1681 hom 26 9 9 10 T 31 16 204941 CASAVA_Build 4 42431582 1I TGCAGAGGTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 8 9 204942 CASAVA_Build 4 42433006 1I AATAAAGAAC -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 42 12 25 5 A 6 7 204943 CASAVA_Build 4 42434344 1D AAATAATTAC A/- AAAATCAGAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 5 4 204944 CASAVA_Build 4 42435701 1D AGTATGCAGA T/- TCACGAAACA 3070 het 3070 ref 55 29 19 9 T 2 1 204945 CASAVA_Build 4 42435981 7I GTAAATTCAA -------/CAAAATC AAAAATCAAT 3070 het 3070 hom 53 22 28 5 CAAAATC 0 1 204946 CASAVA_Build 4 42440455 1I TTTAAAAAAA -/T AGTAAAAGTT 3070 het 3070 ref 37 15 17 5 T 0 1 204947 CASAVA_Build 4 42451751 2I GTTTTGATGG --/TT TTTTTTTTTT 1355 het 1355 ref 29 16 6 7 T 10 12 204948 CASAVA_Build 4 42452976 1I GTTTGTTGAG -/A ATAAGTGTAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 1 2 204949 CASAVA_Build 4 42453292 1I GTTCAACAAA -/C CTGGCAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 C 1 2 204950 CASAVA_Build 4 42465638 1D CCACTTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 10 9 204951 CASAVA_Build 4 42471083 2D CATATATACC AT/-- ATATATATAC 3070 het 2584 hom 22 9 11 2 AT 5 4 204952 CASAVA_Build 4 42471218 6D TGTGTGTGTG TGTATA/------ TATATATATA 2343 het 1106 hom 15 4 7 7 TGTATA 1 0 204953 CASAVA_Build 4 42475020 3I ATAAGCTATC ---/ATT ATTATTATTT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 ATT 3 4 204954 CASAVA_Build 4 42475484 3D TGATAAAACT GTG/--- GTGCTTTAAA 3070 het 3070 ref 57 30 25 2 GTG 2 1 204955 CASAVA_Build 4 42478482 4D GTATATTATT ATTA/---- ATTATTTTAC 3070 het 3070 ref 47 26 18 5 ATTA 2 1 204956 CASAVA_Build 4 42509495 1D AGTTCTATCA C/- AATAATGACT 3070 het 3070 ref 49 27 16 6 C 1 0 204957 CASAVA_Build 4 42517667 3I ACGGGAGAAA ---/GAT GTAGGCTGGG 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 GAT 0 1 204958 CASAVA_Build 4 42536577 4I ATATAGTTGT ----/TGAA TGAATGAATG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 TGAA 4 5 204959 CASAVA_Build 4 42538152 1I AAGCTTACTC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 204960 CASAVA_Build 4 42538943 1I AGCCACTTAG -/T TTTATGCTGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 3 4 204961 CASAVA_Build 4 42542276 1D CTAATGGTCA C/- AGGTTTTGTA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 C 1 0 204962 CASAVA_Build 4 42543166 3D ATTTTAATAA TGT/--- TGTAGTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 11 7 TGT 2 1 204963 CASAVA_Build 4 42547062 1D GTAGAATGAG T/- TAGTGGGGAG 3070 het 3070 ref 31 23 7 1 T 2 1 204964 CASAVA_Build 4 42548386 5D TTACCATTAT GAAAC/----- GAAACACCCT 3070 hom 58 het 29 0 22 11 GAAAC 2 1 204965 CASAVA_Build 4 42549251 1I GGGAGAAATA -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 6 7 204966 CASAVA_Build 4 42552441 2I GACAATAGCT --/AA AGTCAGGAAT 3070 hom 172 het 61 0 57 4 A 1 3 204967 CASAVA_Build 4 42552970 1D ACTTAAATAG T/- TTCATTTAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 3 2 204968 CASAVA_Build 4 42555554 1I TTACATGGTA -/G GTGTGTATTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 1 2 204969 CASAVA_Build 4 42556799 1D TTGTCAACTT C/- CATAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 C 2 1 204970 CASAVA_Build 4 42563215 3I GATTTCTTCT ---/AAG AAGGCTTCTC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AAG 1 2 204971 CASAVA_Build 4 42578858 1D TAACTTACAG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 8 7 204972 CASAVA_Build 4 42581918 1D AGGGTTTCCA T/- TTCTTCCTGA 2894 het 2894 ref 37 23 9 5 T 3 2 204973 CASAVA_Build 4 42587944 2I ACATAACTTT --/TA TATGCAATGG 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 TA 1 2 204974 CASAVA_Build 4 42593211 1D GAGGCAAAAA G/- CAGAAGGCCA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 G 1 0 204975 CASAVA_Build 4 42595026 3D GAACATTTGA TCT/--- TCATCTAGAA 3070 het 3070 hom 44 20 22 3 TCT 1 0 204976 CASAVA_Build 4 42595586 2I TATGTAGTGT --/TC TCTGTCAAGA 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 TC 1 2 204977 CASAVA_Build 4 42612874 1I ATCATTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 757 hom 35 3 24 8 A 12 13 204978 CASAVA_Build 4 42627834 1I AAAATAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 10 11 204979 CASAVA_Build 4 42628351 1I GTCCTTTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 T 9 10 204980 CASAVA_Build 4 42629227 10I TCACCGCAGT ----------/TTGCTTTCCA TTGCCATCTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTGCTTTCCA 0 1 204981 CASAVA_Build 4 42634050 6D ATTGAGGTCT TTTTTA/------ TTTTTATTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 8 TTTTTA 3 2 204982 CASAVA_Build 4 42634117 1D TCACCTTGTG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 T 8 7 204983 CASAVA_Build 4 42635643 1I TACGTGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 24 15 12 T 11 12 204984 CASAVA_Build 4 42636110 1I ATAATATGAA -/T TTTTGTACGT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 4 5 204985 CASAVA_Build 4 42637962 4D ATGACTAGCT GTAA/---- GTGAGGTCCC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 GTAA 1 0 204986 CASAVA_Build 4 42645009 2D TTTCTAGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 32 0 16 16 T 14 12 204987 CASAVA_Build 4 42677032 1D ATCTTTCTTC T/- TTGACGTAGG 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 T 3 2 204988 CASAVA_Build 4 42698629 4I AAGGAATGTA ----/GAAG GAGAGCAGGG 3070 hom 63 het 29 0 21 8 GAAG 0 1 204989 CASAVA_Build 4 42721286 1I TCATCTGCTT -/C TCTCTGAAAT 3070 hom 75 het 26 0 25 1 C 0 1 204990 CASAVA_Build 4 42722829 1I GTTACTAGTT -/A GTAATGTTAC 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 0 1 204991 CASAVA_Build 4 42731926 2D AAAGGAAAAC AG/-- AACATAAAAG 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 AG 1 0 204992 CASAVA_Build 4 42761599 1I TCTACAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 8 9 204993 CASAVA_Build 4 42764814 2D TGCCTCATCA TT/-- GTTTCTTACT 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 T 2 0 204994 CASAVA_Build 4 42764899 2I TTTAACACAC --/TG TGTGTAGCAT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 TG 2 3 204995 CASAVA_Build 4 42765916 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 13 12 204996 CASAVA_Build 4 42766925 1D AAATAACGAG C/- TTTTTGCTGC 3070 het 3070 hom 36 14 13 10 C 1 0 204997 CASAVA_Build 4 42773598 2D TGAACCATAA TT/-- TTTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 T 5 3 204998 CASAVA_Build 4 42775984 2I TATATAAAAG --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 10 204999 CASAVA_Build 4 42776713 5D AATATCTATT ATTTA/----- ATTTAATATT 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 ATTTA 2 1 205000 CASAVA_Build 4 42782020 1I TCAAAACTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 450 hom 34 2 26 6 T 9 10 205001 CASAVA_Build 4 42785390 5D TGTTCTAGAA AACTT/----- AACATAGTGA 3070 het 3070 hom 43 16 24 5 AACTT 1 0 205002 CASAVA_Build 4 42788238 4I GGTAGAGATA ----/TAGT TAAAGGAATA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TAGT 0 1 205003 CASAVA_Build 4 42799071 1D TCTAAGACAC A/- AAAAAACAGC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 7 6 205004 CASAVA_Build 4 42800576 4I10M4D TATGCATGTA ----TATTCACATGTGTA/TGTGTATTCACATG---- TGTATGTATG 3070 hom 168 het 63 0 56 11 N/A 0 0 205005 CASAVA_Build 4 42804945 2I TGTGCATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 TG 7 8 205006 CASAVA_Build 4 42806519 2D AAAAGGAAAC TA/-- TTATACTACT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TA 1 0 205007 CASAVA_Build 4 42807204 8I TGATGCACTT --------/TATAGCTC TAGTTTCTCT 3070 hom 126 het 47 0 41 6 TATAGCTC 0 1 205008 CASAVA_Build 4 42812260 1D CACAGAGAAG A/- CAAAAGAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 1 0 205009 CASAVA_Build 4 42814504 1I ATCAGAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 4 hom 37 1 30 6 A 9 10 205010 CASAVA_Build 4 42819418 2D AAAAATAAAA AT/-- AAAAAAATAA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 AT 1 0 205011 CASAVA_Build 4 42819549 1I TATGATTTTT -/C TTATACATAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 0 1 205012 CASAVA_Build 4 42823401 1D ATTTTAAAGA G/- GATGTTTCTA 3070 hom 105 het 42 0 35 8 G 2 1 205013 CASAVA_Build 4 42827462 1D GGTATGCCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 9 8 205014 CASAVA_Build 4 42834139 2D ATATTTTGAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 38 0 31 8 AT 6 5 205015 CASAVA_Build 4 42842435 4D CTAAGTAGTG TCTT/---- TCTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 40 23 15 5 TCTT 2 1 205016 CASAVA_Build 4 42843074 3I TTTAAGAAAA ---/CTT CTTCTATCAT 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 CTT 1 2 205017 CASAVA_Build 4 42843181 8I CCCAGGGAAC --------/ACTGAAAG ACTTAGGGTC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 ACTGAAAG 0 1 205018 CASAVA_Build 4 42844233 2D CTTTTTCCTG CT/-- CTTTCTTCCT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 CT 2 1 205019 CASAVA_Build 4 42844323 1I TCATTAAAAA -/C CTTTATCTAT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 C 1 2 205020 CASAVA_Build 4 42844960 1D TGATGTTTCA T/- TTGTTGACTG 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 T 3 2 205021 CASAVA_Build 4 42845130 1D CCCTTTAAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 A 9 8 205022 CASAVA_Build 4 42848441 1I TCATTTTATG -/A AGGCCAGCAT 2691 het 78 hom 11 1 9 1 A 1 2 205023 CASAVA_Build 4 42848481 1D GCAGAGACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 13 0 8 5 A 11 10 205024 CASAVA_Build 4 42852638 1D GTGAAAGGAA G/- GGATCCAGTT 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 G 3 2 205025 CASAVA_Build 4 42853990 3I TTGATGTCAA ---/TTC TTCTTTGCAC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 TTC 1 2 205026 CASAVA_Build 4 42872222 1D AAGTTTAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 11 hom 35 1 13 21 T 10 9 205027 CASAVA_Build 4 42872857 4I GATTAAAAAG ----/CAAA CAAATATTTT 3070 het 1715 hom 18 6 11 1 CAAA 1 2 205028 CASAVA_Build 4 42873616 1D ACACAGGAAC A/- AAAAAGCCAA 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 A 6 5 205029 CASAVA_Build 4 42873998 2I GCAACCCTAG --/CC CCAAGGTGGG 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 C 2 4 205030 CASAVA_Build 4 42874942 3I ACTGAGAAAT ---/ACA ACGACTTTCT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 ACA 0 1 205031 CASAVA_Build 4 42877716 1D CTGTAATCAA C/- CCTCCAGAGA 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 C 3 2 205032 CASAVA_Build 4 42878442 19D TTCTTTACCA TTTACCAGTCATTGCTTTC/------------------- TTTACCAGTC 3070 het 3070 ref 29 17 16 2 TTTACCAGTCATTGCTTTC 1 0 205033 CASAVA_Build 4 42881465 2D TCCAACAAAC AT/-- GTGGGTCAGA 3070 het 3070 ref 41 19 17 7 AT 1 0 205034 CASAVA_Build 4 42885021 1D ACGTCACTGT G/- CTGGCATATG 3070 het 3070 ref 61 29 27 5 G 1 0 205035 CASAVA_Build 4 42887128 6I GAAAGTCAAG ------/TTCTTC ATACCAAAGT 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 TTC 0 2 205036 CASAVA_Build 4 42899424 1D TTATAGTAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 T 9 8 205037 CASAVA_Build 4 42899981 1D CGCTAATTTT A/- ATTTATCTCT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 2 1 205038 CASAVA_Build 4 42904839 1D TAAAAAAAAA C/- AAGATAAAAA 3070 het 461 hom 32 2 26 4 C 1 0 205039 CASAVA_Build 4 42914921 1I ATACTTTCCA -/T TTTTAAAAAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 4 5 205040 CASAVA_Build 4 42919635 1I GGTTCTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 255 hom 35 1 25 9 A 14 15 205041 CASAVA_Build 4 42932137 1D GAAGAAACAA T/- TTTTTAATGC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 6 5 205042 CASAVA_Build 4 42938580 1D ATTTTAAAAA G/- TTTCCAAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 1 0 205043 CASAVA_Build 4 42940881 5D TTTGGGGGGG GGGGT/----- GGATTTCTTA 3070 hom 17 het 25 1 19 6 GGGGT 1 0 205044 CASAVA_Build 4 42943070 1I CCACATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 57 hom 20 1 13 6 T 13 14 205045 CASAVA_Build 4 42948832 2D CTGTTTCTAT AA/-- AAGAGTGATG 3070 hom 117 het 45 0 38 8 A 4 2 205046 CASAVA_Build 4 42955103 5D AAAGTACCTC CTCCT/----- CCCTTTCAAG 3070 hom 123 het 46 0 42 7 CTCCT 1 0 205047 CASAVA_Build 4 42969028 1I ACGTAAAAAC -/A ATATATTATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 2 205048 CASAVA_Build 4 42986601 4I AAGTATAATT ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 10 14 205049 CASAVA_Build 4 42996102 1D CCTATGATCA T/- TATTAGGAGG 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 2 1 205050 CASAVA_Build 4 43007386 27D GACCACAGGC TATTTTCCCCACTCTCTACCCACAGGG/--------------------------- TATTTTCCCC 3070 het 3070 ref 38 23 8 21 TATTTTCCCCACTCTCTACCCACAGGG 2 1 205051 CASAVA_Build 4 43012366 5I TTCAATAACT -----/TGAAA TGATAATTTC 3070 hom 79 het 29 0 27 2 TGAAA 0 1 205052 CASAVA_Build 4 43025129 2D AAACACTAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 75 het 34 0 27 7 TA 8 7 205053 CASAVA_Build 4 43035510 1I TTAACAGTTG -/T TTTTAATTGA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 4 5 205054 CASAVA_Build 4 43040958 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 G 9 8 205055 CASAVA_Build 4 43057420 1D TTTATTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 112 het 45 0 38 8 A 11 10 205056 CASAVA_Build 4 43069300 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1065 hom 48 4 38 6 T 11 12 205057 CASAVA_Build 4 43075006 1D TAATTATTCT A/- GTATTTATTG 3070 hom 157 het 55 0 53 2 A 1 0 205058 CASAVA_Build 4 43077273 21D TCTTTCTTCC CCATCCAATCAGTGATGAAGG/--------------------- CCATCCAATC 3070 het 3070 ref 35 14 8 17 CCATCCAATCAGTGATGAAGG 2 1 205059 CASAVA_Build 4 43077401 7D TCCATTCTTT ACTTAGA/------- ACAATATCGC 3070 hom 81 het 40 0 29 11 ACTTAGA 1 0 205060 CASAVA_Build 4 43095128 1I ATTGTACGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1392 hom 46 4 29 13 T 13 14 205061 CASAVA_Build 4 43106129 1I AAAAAAAAAA -/T TGCTTAGGAA 3070 het 391 hom 20 2 16 2 T 1 2 205062 CASAVA_Build 4 43119757 1D CCCCCTTGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 116 het 45 0 38 7 A 10 9 205063 CASAVA_Build 4 43125435 2D AAGGACAGGG GT/-- GTCAGTAGAA 1499 hom 20 het 35 0 6 30 GT 2 1 205064 CASAVA_Build 4 43129080 1D AAAAATGAAG A/- AAAAAACCAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 6 205065 CASAVA_Build 4 43131193 4I AGAAATTAAC ----/CAAA CAGACAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 CAAA 0 1 205066 CASAVA_Build 4 43146284 3D GCCAGTGTCC AGT/--- AGTCCCCAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 7 AGT 2 1 205067 CASAVA_Build 4 43157578 1D ACAATTATCA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 8 205068 CASAVA_Build 4 43171407 1D GTAAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 742 hom 28 3 20 5 T 13 12 205069 CASAVA_Build 4 43183960 1I AAATATTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 10 205070 CASAVA_Build 4 43203389 3D ACATAAACAA TAT/--- TAAATAATTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 6 TAT 1 0 205071 CASAVA_Build 4 43209081 6D CATAGACACA TATTTG/------ TAGTCTTTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TATTTG 1 0 205072 CASAVA_Build 4 43225085 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 10 9 205073 CASAVA_Build 4 43225265 1I ATGCTGTCAG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 205074 CASAVA_Build 4 43226681 1D AATCAGATGC A/- AAGATAATTA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 3 2 205075 CASAVA_Build 4 43227838 1I TCTAATTTGA -/T TTTTTTATAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 6 7 205076 CASAVA_Build 4 43230486 1D GAGGAAGTAC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 96 het 41 0 32 11 A 8 7 205077 CASAVA_Build 4 43234579 5I AGGAAAATCC -----/AAATA AAATAAACTC 3070 hom 63 het 30 0 22 8 AAATA 1 2 205078 CASAVA_Build 4 43237439 1I TAATAAATTC -/A AAAAAACAAA 3070 het 195 hom 34 1 26 7 A 6 7 205079 CASAVA_Build 4 43238817 1D ATTTTCTGAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 9 8 205080 CASAVA_Build 4 43238978 4D AAGGAAACTA TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTCT 5 4 205081 CASAVA_Build 4 43244083 1D TTTTCTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 268 hom 43 1 35 7 T 12 11 205082 CASAVA_Build 4 43245695 1I GGATAGTTTG -/T TGTCAATTGG 3070 hom 84 het 32 0 26 6 T 1 2 205083 CASAVA_Build 4 43247542 4I TCCAATTACA ----/TTCT TTAAGTTATT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TTCT 0 1 205084 CASAVA_Build 4 43248983 1I TTTTCCTTTT -/G TTTATCTGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 205085 CASAVA_Build 4 43250922 1I ATAGGTGGAA -/G GGACTTGCCT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 G 2 3 205086 CASAVA_Build 4 43252948 1D TATCGAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 32 2 22 9 T 11 10 205087 CASAVA_Build 4 43253709 2I CTCTATTGCA --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 8 10 205088 CASAVA_Build 4 43255574 1D TCTCTCTTTT A/- AAAAAACAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 6 205089 CASAVA_Build 4 43256253 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2313 het 1386 hom 13 5 7 1 A 10 11 205090 CASAVA_Build 4 43262368 13D CCGGTGTCTA TGTACGGTGTCTC/------------- TGTACGGTGT 3070 hom 108 het 43 0 35 17 TGTACGGTGTCTC 2 1 205091 CASAVA_Build 4 43268717 5I CTTCTACACT -----/AAGTA TAGAACAAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAGTA 0 1 205092 CASAVA_Build 4 43274902 1D AAGCAGAAAT G/- AAAAAATAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 1 0 205093 CASAVA_Build 4 43315007 1D GAAACAGCAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 8 7 205094 CASAVA_Build 4 43316426 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 6 7 205095 CASAVA_Build 4 43316789 2D CCTGTAAAAT AA/-- AAAAAAAATA 3070 hom 53 het 23 0 17 7 A 10 8 205096 CASAVA_Build 4 43320572 1I TATTTACCCA -/T TTATCTACTC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 2 3 205097 CASAVA_Build 4 43328822 1I AGAGAAAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 135 hom 46 1 41 4 T 9 10 205098 CASAVA_Build 4 43351679 1I CTCCACCTCT -/G GGGGCAGAGC 1245 hom 10 het 4 0 4 0 G 4 5 205099 CASAVA_Build 4 43357268 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 14 6 A 11 10 205100 CASAVA_Build 4 43363254 1D CCAATAAAAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 T 8 7 205101 CASAVA_Build 4 43364662 1D CCAAACTTCC T/- GGGGGCTTCG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 1 0 205102 CASAVA_Build 4 43364992 3D ATTCTTCTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2799 hom 34 11 19 5 T 14 11 205103 CASAVA_Build 4 43366230 1I TCACACCCCC -/T GGATTCTGCC 3070 hom 117 het 42 0 38 4 T 0 1 205104 CASAVA_Build 4 43373471 2I TCTGTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 TC 8 9 205105 CASAVA_Build 4 43390341 1D TATTGGTGCA T/- TTGATTTTGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 3 2 205106 CASAVA_Build 4 43394125 5D ATAGTGTGCC TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 hom 123 het 50 0 42 9 TGTTT 5 4 205107 CASAVA_Build 4 43394651 1I TTGAAGGTGA -/T TTTTTTCTGG 2044 het 2044 ref 27 14 6 7 T 6 7 205108 CASAVA_Build 4 43399368 6I TGTCTTCAGA ------/TAGTCT TAGTTGGTAA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 TAGTCT 0 1 205109 CASAVA_Build 4 43409661 1I AACTGGAGGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 8 9 205110 CASAVA_Build 4 43412462 2D CTGATAAATC TA/-- TAATACACTC 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 TA 2 1 205111 CASAVA_Build 4 43414141 2I TATATTTTAT --/TA TATTTTTTTA 3070 het 2964 hom 21 9 8 4 TA 1 2 205112 CASAVA_Build 4 43423237 2I CACTATCAAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 GT 8 9 205113 CASAVA_Build 4 43427835 1I ATAAGAGAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 9 10 205114 CASAVA_Build 4 43450385 1D ATCAAAACCA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 T 8 7 205115 CASAVA_Build 4 43465140 3I TGAAATCTAT ---/GAG GAGGAGCCAT 3070 hom 138 het 54 0 43 11 GAG 2 3 205116 CASAVA_Build 4 43467356 5I4M4D AATCAGATAA -----AAATTACC/GTAAGAAAT---- TAGAAGTCAA 881 het 881 ref 41 19 3 20 N/A 0 0 205117 CASAVA_Build 4 43471813 6D TTCTGTTTTC GTTTTT/------ GTTTTGAGAT 3070 het 3070 hom 30 11 19 2 GTTTTT 1 0 205118 CASAVA_Build 4 43474214 1I CTCCATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 26 0 16 10 A 10 11 205119 CASAVA_Build 4 43476491 1D TTATGAGACA G/- GTGAGTTTAT 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 G 2 1 205120 CASAVA_Build 4 43482657 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 17 2 9 6 A 16 15 205121 CASAVA_Build 4 43497897 4I ACACTGCTAT ----/AAAG AAATACCTGA 3070 het 3070 ref 34 23 8 3 AAAG 0 1 205122 CASAVA_Build 4 43518900 9D CAGCACTGGG CTGACATCC/--------- CCATTCCAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 6 CTGACATCC 1 0 205123 CASAVA_Build 4 43521578 15I CTATCTACAG ---------------/ATAGTTTGACCTCAT ATACATAGAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATAGTTTGACCTCAT 0 1 205124 CASAVA_Build 4 43521804 1D ATCAATTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 35 0 26 10 A 13 12 205125 CASAVA_Build 4 43524832 1D TTAATTTCTA T/- TTGGTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 T 3 2 205126 CASAVA_Build 4 43526007 1D TTTTGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 679 hom 41 2 31 8 T 12 11 205127 CASAVA_Build 4 43529225 1D GATTAATATT A/- TTGCCCCATT 3070 het 3070 ref 27 17 9 2 A 1 0 205128 CASAVA_Build 4 43534456 1D ATAGACCTCA T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 84 het 31 0 28 5 T 7 6 205129 CASAVA_Build 4 43537159 2D CATCACTATG AA/-- AAATGTTCCA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 5 3 205130 CASAVA_Build 4 43540195 1D ACAAATACAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 47 15 29 3 A 9 8 205131 CASAVA_Build 4 43551602 1D AGTATTATAT A/- AAATACCTCT 3070 hom 42 het 19 0 14 5 A 4 3 205132 CASAVA_Build 4 43556259 1D TTAATTATTG C/- CTCAATTTCA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 C 2 1 205133 CASAVA_Build 4 43559553 2D GCATTTAACT AC/-- ACACACACAA 3070 het 3070 ref 51 22 19 11 AC 5 4 205134 CASAVA_Build 4 43573832 1I GATTGCTATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 63 hom 28 1 22 5 A 9 10 205135 CASAVA_Build 4 43605308 4D CTTTTTTTAG TTAC/---- TTACATATTC 3070 het 3070 ref 40 19 19 3 TTAC 2 1 205136 CASAVA_Build 4 43612494 1I ACAGAACTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 575 hom 35 2 24 9 A 12 13 205137 CASAVA_Build 4 43623147 1I CACCAAGAAA -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 6 7 205138 CASAVA_Build 4 43629039 1I AAACATAAAG -/A AAAACAAGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 5 205139 CASAVA_Build 4 43630490 2I TTTAAGACTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 21 9 T 14 16 205140 CASAVA_Build 4 43633585 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 17 14 205141 CASAVA_Build 4 43639101 1I AAAAGGCAGG -/A AAAAAATATT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 6 7 205142 CASAVA_Build 4 43650150 1D TATTATTAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 41 0 34 7 A 10 9 205143 CASAVA_Build 4 43652484 1D TAAGCTTTCA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 8 7 205144 CASAVA_Build 4 43653120 1D AAATTGTGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 8 205145 CASAVA_Build 4 43717667 1D CAGTTATTAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 9 8 205146 CASAVA_Build 4 43734820 1D TTATATTGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 10 9 205147 CASAVA_Build 4 43796116 1D CATTGGCGTG T/- TGTGTCTGTT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 2 1 205148 CASAVA_Build 4 43818140 1D GTGCAAAGAG A/- AGAACTTTCT 3070 het 3070 ref 55 25 24 6 A 2 1 205149 CASAVA_Build 4 43832417 2D ACATACAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 AT 6 5 205150 CASAVA_Build 4 43832655 1I AGTTGCAGGC -/T ATTTTCTCAG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 0 1 205151 CASAVA_Build 4 43834111 1D TTTTCCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 T 11 10 205152 CASAVA_Build 4 43839288 1D GAGTGAGGAT A/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 1 0 205153 CASAVA_Build 4 43845978 3D TTCTTGTCTC CTT/--- ATTTTTTATC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 CTT 1 0 205154 CASAVA_Build 4 43850990 1D TGCCCTTAGG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 46 17 27 2 T 8 7 205155 CASAVA_Build 4 43865376 1D AATAAATACT A/- AAAAAAAAAA 412 het 412 ref 18 12 4 2 A 15 14 205156 CASAVA_Build 4 43865395 1I AAAAAAGAAA -/G AAAAAAAAGA 698 het 698 ref 24 12 8 4 G 0 1 205157 CASAVA_Build 4 43868557 1I GGAGTCTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 9 10 205158 CASAVA_Build 4 43880381 1D TACAGAAACT A/- AATGTCAATA 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 A 3 2 205159 CASAVA_Build 4 43880846 2D ACACACACAC AT/-- GTGCACACAC 3070 het 3070 ref 56 28 24 4 AT 1 0 205160 CASAVA_Build 4 43882522 2I GATTTCCTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 T 12 14 205161 CASAVA_Build 4 43891962 1I AAATACATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 11 12 205162 CASAVA_Build 4 43906272 2I CTACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 AC 8 9 205163 CASAVA_Build 4 43921679 3D AGGAGACATC ACT/--- ACTTCTTAAC 3070 hom 123 het 44 0 41 4 ACT 2 1 205164 CASAVA_Build 4 43977907 3I GGATTAGCAC ---/AAT GAGAGCCAGT 3070 het 3070 ref 45 29 11 5 AAT 0 1 205165 CASAVA_Build 4 43985706 1D GTATATATCA T/- TTTTTTCTAT 1442 het 1442 ref 13 7 3 3 T 7 6 205166 CASAVA_Build 4 43992313 2I TAAGATAAAC --/AT ATTTTATTTG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AT 1 2 205167 CASAVA_Build 4 44007831 4D CCTCTTAAGG CAAA/---- CAGTTTTCTA 3070 het 3070 ref 36 19 14 6 CAAA 1 0 205168 CASAVA_Build 4 44031190 1I TCCTCGCTAG -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 7 8 205169 CASAVA_Build 4 44034470 4D TATATATATA TATG/---- TGTATATATA 687 het 687 ref 15 8 5 2 TATG 1 0 205170 CASAVA_Build 4 44037326 1D TCATGATCCA C/- CCCGCCTCGG 3070 het 917 hom 15 3 8 4 C 4 3 205171 CASAVA_Build 4 44049384 2I GAATAAAGAC --/TT CAGATTTTTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 0 2 205172 CASAVA_Build 4 44052715 6I ATTTTATAGC ------/TAAAGT TAAATTGCAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TAAAGT 0 1 205173 CASAVA_Build 4 44053864 1D CATTTGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 17 14 A 13 12 205174 CASAVA_Build 4 44059544 1I TTAAAGGTAA -/T TTTTTTTTTT 1261 het 1261 ref 23 11 3 9 T 15 16 205175 CASAVA_Build 4 44060284 3D GAGATGCTGT AAG/--- AAGGACCAAG 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 AAG 2 1 205176 CASAVA_Build 4 44064651 1I TGATAGGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 A 12 13 205177 CASAVA_Build 4 44074887 5D AAAAAAAAAT CAAAC/----- CACCTCTCTG 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 CAAAC 1 0 205178 CASAVA_Build 4 44079505 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 10 12 A 13 14 205179 CASAVA_Build 4 44079800 1I ACTAGCTGAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 8 9 205180 CASAVA_Build 4 44080917 1D GCCTATTATC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 9 8 205181 CASAVA_Build 4 44099976 1D AGCAAAATAG A/- ATTTGTCAAA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 2 1 205182 CASAVA_Build 4 44100202 2D GGCTACCATT AA/-- AAAAAAAAAA 2746 het 243 hom 24 4 7 13 A 16 14 205183 CASAVA_Build 4 44106001 1D GTCAAAAGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 65 het 40 1 31 8 A 10 9 205184 CASAVA_Build 4 44106568 1D AGAGTATATT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 48 het 28 0 17 11 A 8 7 205185 CASAVA_Build 4 44106619 1D GGGAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 11 10 205186 CASAVA_Build 4 44115227 2D TATAACTTAT CA/-- CAGAGGTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 5 CA 2 1 205187 CASAVA_Build 4 44123108 1I AGGAAAAATT -/A AAAAAACTAG 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 6 7 205188 CASAVA_Build 4 44124289 2D AACAAAAGAC TG/-- TGATGAAAGA 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 TG 2 1 205189 CASAVA_Build 4 44131772 1I ACTGATTTAA -/G TTCATACTCC 3070 hom 148 het 51 0 50 1 G 0 1 205190 CASAVA_Build 4 44138013 1I TACTACTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 8 12 A 10 11 205191 CASAVA_Build 4 44138949 1D AAAACTGCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 10 9 205192 CASAVA_Build 4 44140539 4I ACTGATTATG ----/AGAA AGAAAGAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AGAA 2 3 205193 CASAVA_Build 4 44172883 1D GGAAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2458 hom 17 6 9 2 A 12 11 205194 CASAVA_Build 4 44178427 1I GCTGCCTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 8 9 205195 CASAVA_Build 4 44182354 7I CATATTTATG -------/TAACTAC TTTATGTGAG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TAACTAC 0 1 205196 CASAVA_Build 4 44187852 1D AATCAAAACC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 9 8 205197 CASAVA_Build 4 44189743 2D TGATTTAGAC TT/-- AGGTCCATTT 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 2 0 205198 CASAVA_Build 4 44192795 2D GACTTGTAGA AC/-- ACCATTAAGT 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 AC 2 1 205199 CASAVA_Build 4 44193977 1D TTCTTTTGAG A/- AGTGTCTGTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 2 1 205200 CASAVA_Build 4 44198711 2I AGAACCACTA --/CT CTCTCTTCAA 3070 hom 72 het 31 0 23 8 CT 3 4 205201 CASAVA_Build 4 44199994 4I ATCGATTAAA ----/CTGT CTAATTATTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 CTGT 0 1 205202 CASAVA_Build 4 44201804 4I TCATAGCGTA ----/ACAG ACAGACAGAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 ACAG 2 3 205203 CASAVA_Build 4 44204074 4D ACCAGATTTA ATAG/---- ATAGTGAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 22 0 ATAG 2 1 205204 CASAVA_Build 4 44204856 6I TGTAAAGCAC ------/AGCTGT AGTAACTGGC 3070 hom 138 het 49 0 47 2 AGCTGT 0 1 205205 CASAVA_Build 4 44207682 10D AGAAGCTCAA TAAATATCTT/---------- TGGAATAATT 3070 het 3070 hom 39 17 21 5 TAAATATCTT 1 0 205206 CASAVA_Build 4 44210950 1D ACTGTGTAAG C/- CAATTCCTCT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 C 2 1 205207 CASAVA_Build 4 44211366 1I TATTATACTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 8 9 205208 CASAVA_Build 4 44212196 1I TTCTTAGTTA -/C TATAGTTTGC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 0 1 205209 CASAVA_Build 4 44217871 2I AGATACATGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 33 1 22 10 T 12 14 205210 CASAVA_Build 4 44218266 1I TATTTTTTTC -/T TTTTTTTGAT 3070 het 93 hom 28 1 24 3 T 7 8 205211 CASAVA_Build 4 44250411 2D TTATCTAAAC TG/-- TAAACAGCTT 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 TG 1 0 205212 CASAVA_Build 4 44251024 1D GACAAGTCAG A/- AAAAAAGAAC 3070 hom 105 het 41 0 36 6 A 7 6 205213 CASAVA_Build 4 44253774 4D ATATGCTTGG AATT/---- AATTAAGTTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 AATT 2 1 205214 CASAVA_Build 4 44273534 1I AGATCCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 13 11 T 13 14 205215 CASAVA_Build 4 44275443 1I AATTTTACTT -/A AAAAAAAAAG 2193 het 2193 ref 27 15 7 5 A 9 10 205216 CASAVA_Build 4 44276860 1D TACTAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 14 10 A 11 10 205217 CASAVA_Build 4 44278507 1D CACATGGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 A 13 12 205218 CASAVA_Build 4 44279735 1D GGACAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 A 10 9 205219 CASAVA_Build 4 44282134 2D TTAACTCACC TA/-- TATATATATA 3070 hom 61 het 24 0 21 4 TA 7 6 205220 CASAVA_Build 4 44282617 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1623 hom 15 het 7 0 6 1 A 12 11 205221 CASAVA_Build 4 44282775 2D AGTGAAACTC TG/-- TCTCAAAATA 2686 het 1023 hom 11 3 7 1 TG 1 0 205222 CASAVA_Build 4 44283234 1D AATAAAAAGG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 44 23 15 7 T 8 7 205223 CASAVA_Build 4 44284922 1I ACAAACATAT -/A AAAAAAGTTG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 6 7 205224 CASAVA_Build 4 44285519 2D ACAAAAGGTG GC/-- GGGGGGAGGC 3070 het 149 hom 27 3 11 13 GC 1 0 205225 CASAVA_Build 4 44285912 1I CTCCTAATTT -/G TAAGACATAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 G 0 1 205226 CASAVA_Build 4 44289735 2D TTTATGTGTA TG/-- TGTTTGTATG 3070 het 1756 hom 21 5 14 2 TG 2 1 205227 CASAVA_Build 4 44295996 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 11 10 205228 CASAVA_Build 4 44297410 1I CCATAGACAA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 7 8 205229 CASAVA_Build 4 44298149 4D TCACACCAAT TATC/---- TATCTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 20 17 3 TATC 2 1 205230 CASAVA_Build 4 44300293 4D TTTGGTTATC TGTT/---- TGTCTGTTAT 1391 het 1391 ref 14 10 3 3 TGTT 1 0 205231 CASAVA_Build 4 44305468 3D CTCTTTTCTC CTT/--- CTTCTTCTCC 3070 het 3070 ref 50 24 21 6 CTT 3 2 205232 CASAVA_Build 4 44318704 1I GTTATTAAAG -/T AAGTGAATTG 3070 het 3070 hom 42 12 26 4 T 0 1 205233 CASAVA_Build 4 44326503 2D TCTATGTAAC AT/-- ATAATAATCT 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 AT 2 1 205234 CASAVA_Build 4 44330495 1I ACAAGCTAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 13 28 7 A 9 10 205235 CASAVA_Build 4 44334984 3D AGTTTCAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2660 het 82 hom 40 2 12 26 T 19 16 205236 CASAVA_Build 4 44339221 1D TCTTTGTATA C/- CATCACTGTA 3070 het 3070 ref 39 23 11 6 C 2 1 205237 CASAVA_Build 4 44352626 2D TGAATATTAC AG/-- AGACACATGA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 AG 2 1 205238 CASAVA_Build 4 44356107 7I AACATAAGAG -------/TAGGAAA CAAAGACATA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TAGGAAA 0 1 205239 CASAVA_Build 4 44357492 5D TTGGTGAATG GAATT/----- GGTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 6 GAATT 1 0 205240 CASAVA_Build 4 44358355 2I ATTTGTTGCA --/AT ATATGCATTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 AT 2 3 205241 CASAVA_Build 4 44362442 1I GCTTAAAATC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 8 205242 CASAVA_Build 4 44363552 1I ATAATAACTT -/C CTGTAAACTT 3070 hom 12 het 31 1 28 2 C 1 2 205243 CASAVA_Build 4 44363945 1D AAAAGTTCTC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 8 7 205244 CASAVA_Build 4 44369560 2D CACACATTAT AG/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 45 18 24 4 AG 1 0 205245 CASAVA_Build 4 44371039 1I AAAAACTCTC -/T TTTCCCTTTC 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 T 3 4 205246 CASAVA_Build 4 44372436 3D AGGGCTCTGT GAA/--- GATCGAATGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 GAA 1 0 205247 CASAVA_Build 4 44376553 1D AATAGAGTAC A/- AAAAACTGGT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 6 5 205248 CASAVA_Build 4 44379982 1I TTATTATACT -/A TCACATAATG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 0 1 205249 CASAVA_Build 4 44385784 1D AATTCCCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 11 10 205250 CASAVA_Build 4 44385964 1D TTTAAAAGGT A/- AATGACTAAT 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 3 2 205251 CASAVA_Build 4 44386553 1I TATGTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 32 2 22 8 A 14 15 205252 CASAVA_Build 4 44386928 3D GGCTAATGAT GAA/--- GAACTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 GAA 2 1 205253 CASAVA_Build 4 44390279 4D ATGCTTCCTG AAGA/---- AAGAAAGGAT 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 AAGA 2 1 205254 CASAVA_Build 4 44391576 4D AACAAGTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 283 het 283 ref 23 10 5 9 TTTG 1 0 205255 CASAVA_Build 4 44392860 1I AACTAAAAGG -/T TTTTGTCTTC 3070 het 3070 ref 39 16 20 3 T 4 5 205256 CASAVA_Build 4 44394485 3D ATTTTTACAA CAG/--- TTATTTCTAT 3070 het 3070 ref 33 17 16 1 CAG 1 0 205257 CASAVA_Build 4 44403083 2I AGAAATAATC --/TT TAAGTGTTAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 T 1 3 205258 CASAVA_Build 4 44404334 1D TCTCTTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 30 1 20 10 A 13 12 205259 CASAVA_Build 4 44405278 22D GTCTTATAAG CACATAGGAACTGTCTTATAAT/---------------------- CACATATGAC 3070 het 3070 hom 43 21 23 9 CACATAGGAACTGTCTTATAAT 1 0 205260 CASAVA_Build 4 44406575 1D TGTCACTTCC A/- AAAAAAAAAA 2337 het 2337 ref 29 12 9 8 A 13 12 205261 CASAVA_Build 4 44409304 6D TGTATCTGCT TATAAA/------ TATATATTAA 3070 het 3070 ref 30 12 15 5 TATAAA 1 0 205262 CASAVA_Build 4 44413294 2I GATTATATAT --/AC ACACACACAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AC 4 5 205263 CASAVA_Build 4 44417831 1D GTGTCCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 20 18 10 A 12 11 205264 CASAVA_Build 4 44418404 7D TAATAAACAT TATATAA/------- TATATAATTT 3070 het 3070 hom 25 9 15 3 TATATAA 2 1 205265 CASAVA_Build 4 44421354 1I TATTTTTATA -/T TTAAATGGAT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 2 3 205266 CASAVA_Build 4 44421909 5D TTTGAAGACC TATTA/----- TATTCTAAGC 3070 het 3070 hom 59 23 28 10 TATTA 1 0 205267 CASAVA_Build 4 44422541 3I CTCTGGCATC ---/ACG ACAAGACAGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ACG 0 1 205268 CASAVA_Build 4 44425505 1I TTTGAATAGG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 7 8 205269 CASAVA_Build 4 44430059 6D ACTGTGTTTA AAAAAT/------ AAAAATAAAG 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 AAAAAT 2 1 205270 CASAVA_Build 4 44430581 1D CTGATTTTCC T/- TATATTGAAC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 2 1 205271 CASAVA_Build 4 44431144 1I AATCATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 T 10 11 205272 CASAVA_Build 4 44437752 1D CTGACTAATA C/- ATGTGCCCAT 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 C 1 0 205273 CASAVA_Build 4 44439892 4D GCCTTCTCTC ATAT/---- ATTCACCTGC 3070 het 3070 hom 48 17 27 5 AT 3 1 205274 CASAVA_Build 4 44447238 4I TGTGTGTGTC ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 87 het 38 0 29 9 TTTA 2 3 205275 CASAVA_Build 4 44458718 1D CACATGGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2116 hom 32 9 19 4 A 10 9 205276 CASAVA_Build 4 44462712 8I TGGTGTCTCT --------/ATAAATAA ATAAATAAAT 3070 het 664 hom 37 6 22 9 ATAA 2 4 205277 CASAVA_Build 4 44465950 1I TTTTTTTTTT -/G TGGGTTTAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 G 0 1 205278 CASAVA_Build 4 44466032 1D AATTATCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 29 5 T 11 10 205279 CASAVA_Build 4 44468132 2I CTGAGGTTAC --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 GA 7 8 205280 CASAVA_Build 4 44488046 7D TGGGGCAGGT GCAGAAA/------- GACGTAAGTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 6 GCAGAAA 1 0 205281 CASAVA_Build 4 44488578 1I AAATACAAAC -/T TTCTTGGAAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 2 3 205282 CASAVA_Build 4 44506929 1D TAGAGAAACC T/- TTTTCCAATG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 5 4 205283 CASAVA_Build 4 44509846 1I TTCAGTGCTT -/C CCTTCAGGGG 3070 het 2083 hom 21 6 11 4 C 2 3 205284 CASAVA_Build 4 44514745 1I AGGAATGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 T 10 11 205285 CASAVA_Build 4 44519230 1I AGGCATCAAA -/T TTTAAGATTA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 3 4 205286 CASAVA_Build 4 44523040 1I TTTTTAAAAC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 7 8 205287 CASAVA_Build 4 44529794 2I TCTTATTCAT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 TC 8 9 205288 CASAVA_Build 4 44544612 1D AACCTGAAGA T/- TTAACTATAT 3070 hom 154 het 59 0 52 8 T 3 2 205289 CASAVA_Build 4 44553288 1D TTTTTTTTTT C/- TGAGACAGAG 2742 hom 24 het 11 0 8 3 C 1 0 205290 CASAVA_Build 4 44555937 1I AACTCTGCCG -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 T 7 8 205291 CASAVA_Build 4 44561277 2D TATCTCAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 490 het 15 hom 22 1 5 16 A 16 14 205292 CASAVA_Build 4 44562525 2D TTTTGAAGAC TT/-- ATGACTATGT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 2 0 205293 CASAVA_Build 4 44563371 2D ATGTTATTGG TA/-- TATAAGAATG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TA 3 2 205294 CASAVA_Build 4 44563870 5I ATTTTATCAA -----/AAGCT TTTTCTGTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAGCT 0 1 205295 CASAVA_Build 4 44566749 1D TCAGGGCCAT G/- GGGCATTCTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 G 4 3 205296 CASAVA_Build 4 44568324 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 108 het 46 0 37 10 TA 8 7 205297 CASAVA_Build 4 44573702 7I TCATTTTATA -------/GATGAAT TAGAGATCTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 GATGAAT 0 1 205298 CASAVA_Build 4 44576019 1D CAAAGGAAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 10 9 205299 CASAVA_Build 4 44591734 3I TAGAAATATA ---/TGC TAAATGTTAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 TGC 0 1 205300 CASAVA_Build 4 44593918 2D TGCTTTCTTC CA/-- CAGTGTCCTT 3070 het 3070 ref 30 15 14 4 CA 2 1 205301 CASAVA_Build 4 44596968 2D ATTTTATCAC AT/-- GCTTTCTTGT 3070 het 3070 hom 37 13 21 6 AT 1 0 205302 CASAVA_Build 4 44598198 1D ATTTGTTTTG T/- TTTTTTTATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 205303 CASAVA_Build 4 44599103 1D TGTTGGCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 303 hom 31 3 16 13 A 11 10 205304 CASAVA_Build 4 44600419 1I ACCCAGATAA -/T TTTTTTTGTA 2033 het 1034 hom 8 3 5 0 T 7 8 205305 CASAVA_Build 4 44602563 1I ATTTGTGGAA -/T TTTTTTTTCA 2823 het 2823 ref 30 18 8 4 T 8 9 205306 CASAVA_Build 4 44602617 1I ATTTATAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 9 10 205307 CASAVA_Build 4 44603471 1D TTGCAAAATG A/- AAAAGACTCT 3070 het 3070 ref 28 13 8 9 A 5 4 205308 CASAVA_Build 4 44619629 1D CCACTGAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 10 9 205309 CASAVA_Build 4 44626129 1I TTAGTGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 37 1 30 6 T 11 12 205310 CASAVA_Build 4 44631075 1D ATAAGCAACA T/- TATTATGCTA 3070 hom 77 het 31 0 27 6 T 2 1 205311 CASAVA_Build 4 44636637 1I AATTCATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 35 1 29 5 T 11 12 205312 CASAVA_Build 4 44645086 1D ATTGAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1886 het 1886 ref 41 30 5 6 A 12 11 205313 CASAVA_Build 4 44647809 1I ATTGGATTGC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 T 8 9 205314 CASAVA_Build 4 44650954 2D CTTGCTTCAC TT/-- TATGCTCCAT 3070 hom 141 het 52 0 48 5 T 3 1 205315 CASAVA_Build 4 44651088 1I GGCAAAAGTG -/A AACATCCTAT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 2 3 205316 CASAVA_Build 4 44656014 2I CCAAAATTTC --/TT TGTTTGTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 3 205317 CASAVA_Build 4 44656236 1I TTCTCTGACT -/G TTTTTAAAAA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 G 0 1 205318 CASAVA_Build 4 44659381 1D TGGATTCCTG T/- TTTTCCTTCT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 5 4 205319 CASAVA_Build 4 44664245 1I TAATTACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 894 hom 27 3 20 4 T 15 16 205320 CASAVA_Build 4 44669800 1D TATAATACTG C/- CTGCTTGTTA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 C 2 1 205321 CASAVA_Build 4 44674174 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 14 12 205322 CASAVA_Build 4 44678948 6D CCAGCACTTT GAGAGG/------ TGGAGGCTGG 3070 het 3070 ref 25 14 11 1 GAGAGG 1 0 205323 CASAVA_Build 4 44690134 1D CATTAGTAAG T/- TCAATCCGAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 4 T 2 1 205324 CASAVA_Build 4 44691199 1I AGGTCGCTGT -/G GGTCTGCTCC 3070 het 3070 ref 56 31 20 5 G 2 3 205325 CASAVA_Build 4 44695169 1I AGGTTGGGGG -/T GGTCTCACTA 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 0 1 205326 CASAVA_Build 4 44696507 1D AGAGAGTACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 T 11 10 205327 CASAVA_Build 4 44705546 3D AGAAGGCTAC CAG/--- AGAGCTTGCT 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 CAG 1 0 205328 CASAVA_Build 4 44709803 1D TTTCCTGATG C/- TTGCCAATTA 3070 het 3070 ref 72 32 21 19 C 1 0 205329 CASAVA_Build 4 44709844 4D49M2I ACAAACAAAC AAATAAAATGAAAATATGAAGACTGCTAGGAAGGAAAAACACAGGATGCTCTC--/----AAAATGAAAATATGAAGACGGTTAGGAAGGAAAAACACAGGATGCTCTCTG TGTTTTTATA 3070 het 3070 ref 67 58 11 44 N/A 0 0 205330 CASAVA_Build 4 44710037 4D CTTTGTCTTA TTAT/---- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 83 42 35 10 TTAT 1 0 205331 CASAVA_Build 4 44710136 3I CTCTTCTGAA ---/CTC CTCTAGCACT 3070 het 3070 ref 69 39 20 13 CTC 1 2 205332 CASAVA_Build 4 44710285 4I5M5I TATAAAATCC ----AACAA-----/GATAAACAATTGAG ACTAAATAAA 3070 het 3070 ref 50 27 21 5 N/A 0 0 205333 CASAVA_Build 4 44710693 1I TTTATATAAC -/T TTTATAATTA 3070 het 3070 ref 58 29 20 15 T 3 4 205334 CASAVA_Build 4 44711456 1D TTCATCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 11 10 205335 CASAVA_Build 4 44717499 1D TTTGTCCCAG A/- AAAGAAGAGC 2719 het 2719 ref 42 27 7 9 A 4 3 205336 CASAVA_Build 4 44718731 11I88M1D ATGGAAACAA -----------TGATTTTGGCAATGTACTAGGTAAAGTTAGATATAATCATTGGGGAAAGTTGGCTGAAAATAACACAGTCTTTCTTTTTACTATTTTTG/TGTCAATTTCCTGATTTTGGCAATGTACTAGGTTAAGTTAGATATAATCATTGGGGAAAGTTGGCTGAAAATAACACAGTCATTCTTTTTACTATTTTT- TAAATTCTTA 2936 het 2936 ref 47 63 7 12 N/A 0 0 205337 CASAVA_Build 4 44723855 1D CATTGTTTCC A/- TACCATTAAC 3070 het 1074 hom 56 6 45 6 A 1 0 205338 CASAVA_Build 4 44730157 2I TACTATGAAA --/CT CTCTATTTCC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CT 2 3 205339 CASAVA_Build 4 44767039 1I CCTGATCTCT -/C CCTTTGGAAT 3070 hom 92 het 36 0 30 6 C 2 3 205340 CASAVA_Build 4 44767587 2I TGTAGAACTG --/CC TGAGTCAATT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 C 0 2 205341 CASAVA_Build 4 44768726 1I GTTTGTGAGA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 T 7 8 205342 CASAVA_Build 4 44772618 4I TCGTGGACTC ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AAAG 3 4 205343 CASAVA_Build 4 44776067 1D TCTTTTTTTT C/- CTTTGTTAAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 2 1 205344 CASAVA_Build 4 44781818 1I63M2D TTTCTGAGAT -AAAAAAAATTGAATGTTCACTGTTCATGTTACTTTTCTTCTCTCAGTAGAACACCGCATAAACTG/AAAAAAAAATTGAATGTTCACTGTTCATGTTACTTTTCTTCTCTCAGTAGAACACCGCATAAAC-- TGAAAGGAAT 3070 hom 75 het 27 0 26 29 N/A 0 0 205345 CASAVA_Build 4 44784465 1D CTTTTAGAGC T/- TGATAAACCA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 2 1 205346 CASAVA_Build 4 44785542 10D AGACTCAGAC TTAAAAATCT/---------- TTAAAAATCT 3070 hom 120 het 49 0 41 10 TTAAAAATCT 2 1 205347 CASAVA_Build 4 44786432 3D AAAAGAGTAA AGT/--- AGTAGTTGCC 3070 hom 154 het 55 0 52 3 AGT 3 2 205348 CASAVA_Build 4 44787910 1D TTGAAACTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 7 205349 CASAVA_Build 4 44789087 1D GGTTGCGGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 70 het 33 0 24 10 A 9 8 205350 CASAVA_Build 4 44790868 1D CTTCTGCCAT G/- ATTGTAAGTT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 G 1 0 205351 CASAVA_Build 4 44794615 1D GGTCTGGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2843 hom 30 7 20 5 A 10 9 205352 CASAVA_Build 4 44795943 1D GAAATACAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 68 het 26 0 24 2 T 10 9 205353 CASAVA_Build 4 44797142 1D AATTTTATGT G/- TCTACTTTAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 G 1 0 205354 CASAVA_Build 4 44803536 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTTTTT 2247 het 1825 hom 12 5 7 0 T 12 11 205355 CASAVA_Build 4 44808379 1D AAATACAAAT A/- AAAGTTCTTA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 4 3 205356 CASAVA_Build 4 44810296 1I CTTGGATCTC -/A ATTTGTTAAT 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 A 1 2 205357 CASAVA_Build 4 44814284 1D TGTTAGATCA T/- TTTCATCCTG 3070 het 3070 hom 47 18 22 9 T 4 3 205358 CASAVA_Build 4 44816600 1I TACTGATGCT -/A AGCTACAGTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 1 2 205359 CASAVA_Build 4 44817477 10I AAATCATCTT ----------/TTAAAATATC TTAAATTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 TTAAAATATC 0 1 205360 CASAVA_Build 4 44817961 3I GTCAGTTGCT ---/ACA ACATTTATCT 3070 het 3070 ref 47 16 20 11 ACA 1 2 205361 CASAVA_Build 4 44819409 3D TCATTGCTGT TGA/--- TGATAATCTT 3070 het 3070 hom 50 18 26 9 TGA 2 1 205362 CASAVA_Build 4 44825209 2I AACGTGTGAA --/GT GTGTGTGTTT 3070 het 2805 hom 21 7 11 3 GT 4 5 205363 CASAVA_Build 4 44835302 2D ATAAAGTCTC TT/-- TGCTACAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 3 1 205364 CASAVA_Build 4 44838039 1I AAACAAATCA -/T TTTCACTTCT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 T 3 4 205365 CASAVA_Build 4 44838424 11D GTTGGAAGTA ATTATGATTTT/----------- TAATTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 ATTATGATTTT 1 0 205366 CASAVA_Build 4 44845346 1I GCCTTATCTT -/C TGCACTCTTG 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 C 0 1 205367 CASAVA_Build 4 44846554 1I CTAATGGAAT -/G GGGAAGATAT 1067 het 1067 ref 36 29 3 4 G 3 4 205368 CASAVA_Build 4 44860408 3D TGGCAGGGAA TTC/--- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 TTC 2 1 205369 CASAVA_Build 4 44860854 1D CATGTGCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 17 10 T 12 11 205370 CASAVA_Build 4 44867955 2D TCCTTCAGTA CT/-- GCTCTTTCAG 3070 hom 45 het 19 0 16 4 CT 1 0 205371 CASAVA_Build 4 44872304 1D AGCTTATGCA C/- GTTTTCTTAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 C 1 0 205372 CASAVA_Build 4 44884765 14I AGCATCAACA --------------/CTGGAGTCAGACCC CTTATTATGT 3070 hom 72 het 28 0 24 5 CTGGAGTCAGACCC 0 1 205373 CASAVA_Build 4 44887833 1I ATAAACAATC -/T TATTTGGATA 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 T 1 2 205374 CASAVA_Build 4 44895048 1I CTATGAAAAT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 A 7 8 205375 CASAVA_Build 4 44901563 2I GTTTCTTTGC --/GT GTGTGTGTCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 GT 4 5 205376 CASAVA_Build 4 44911964 1D GCACCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 A 11 10 205377 CASAVA_Build 4 44926812 1D TTTATTTTTT C/- CCTATAAGAA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 C 3 2 205378 CASAVA_Build 4 44927171 1I AAACTGAGCT -/A GGAATGGCTA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 0 1 205379 CASAVA_Build 4 44936399 16D AGTTGACTTT AAGTAAAGGAAATTAC/---------------- AAGTAAAGGA 3070 hom 78 het 33 0 27 13 AAGTAAAGGAAATTAC 2 1 205380 CASAVA_Build 4 44955256 2D TGAGAGGCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 A 12 10 205381 CASAVA_Build 4 44972478 1I AGAAGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 14 15 205382 CASAVA_Build 4 44975080 2D TATTACAATC TT/-- GAGTATTAGA 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 T 2 0 205383 CASAVA_Build 4 44986650 1I TGAAATTTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 8 9 205384 CASAVA_Build 4 44990964 2D TGAAATGCAC AT/-- GTTTTGTAAT 3070 het 3070 hom 50 22 25 4 AT 1 0 205385 CASAVA_Build 4 44993102 1D TCACCTCCCT A/- AAATATATAC 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 4 3 205386 CASAVA_Build 4 44995190 1D GATAGTCGAA T/- TAGTCTCTTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 2 1 205387 CASAVA_Build 4 45009177 1D ATGGTACTGG T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 2 1 205388 CASAVA_Build 4 45011252 1D TCAAAAACAA T/- TTCTGGAATC 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 T 3 2 205389 CASAVA_Build 4 45012568 2I CCTTCCATCC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 781 hom 27 2 16 9 CT 8 9 205390 CASAVA_Build 4 45015488 1I CTTCAAAAAT -/A TTTTTTTGAA 3070 hom 62 het 25 0 21 4 A 0 1 205391 CASAVA_Build 4 45017966 1D TGTCTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 496 hom 29 3 12 14 T 12 11 205392 CASAVA_Build 4 45018552 1D AACTTTTACC T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 T 7 6 205393 CASAVA_Build 4 45030878 1D GCTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 817 hom 30 5 14 11 T 13 12 205394 CASAVA_Build 4 45033442 1I ATTTCCACTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 9 205395 CASAVA_Build 4 45036658 2D TGTGTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 1472 het 1055 hom 13 3 7 3 TG 7 6 205396 CASAVA_Build 4 45037456 1D CAAATATACC A/- AACCTTACCT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 3 2 205397 CASAVA_Build 4 45039511 1D AGTTGACTTT A/- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 18 0 14 5 A 1 0 205398 CASAVA_Build 4 45043103 1I TTATATTTCC -/A AAAGTCATTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 4 205399 CASAVA_Build 4 45048586 1D TGTCCTCAGC A/- CCTGGATGAA 3070 het 2511 hom 20 6 13 1 A 1 0 205400 CASAVA_Build 4 45068213 1D TTATTATGTA C/- CAGGCATTAC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 C 2 1 205401 CASAVA_Build 4 45077332 4D TTTTCCTACT TAAA/---- TTAAGTATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 4 TAAA 1 0 205402 CASAVA_Build 4 45083227 1I TGTCATCTCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 423 hom 39 1 27 12 T 8 9 205403 CASAVA_Build 4 45084472 1I TTCAAAAAAA -/C AAAAAACCTT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 C 0 1 205404 CASAVA_Build 4 45085607 4D TTGTTAGCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 626 hom 34 10 13 12 T 20 16 205405 CASAVA_Build 4 45087925 16D GGATTCCAGA GGTCCATTGAGAGAGT/---------------- GGGCCACTCC 3070 het 3070 ref 41 23 16 4 GGTCCATTGAGAGAGT 1 0 205406 CASAVA_Build 4 45091373 6I GAGTAATTGG ------/ACTTAT ACTTAACTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ACTTAT 0 1 205407 CASAVA_Build 4 45207987 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 25 1 18 6 T 14 13 205408 CASAVA_Build 4 45225159 1D TGCCTAGTAT G/- ACTATTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 G 1 0 205409 CASAVA_Build 4 45249439 1D TTTCGTCAGG A/- AAAAAGTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 6 5 205410 CASAVA_Build 4 45249998 4I CTTCTCCCCA ----/CACT CACTCTCCTC 3070 hom 129 het 46 0 42 4 CACT 1 2 205411 CASAVA_Build 4 45252348 1D AGTTCAGAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 T 10 9 205412 CASAVA_Build 4 45260464 1I AACATATGAG -/T TATTCACAAG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 2 205413 CASAVA_Build 4 45265832 3D GCAGGAGGAG GCA/--- GCAGCAGCAA 3070 hom 109 het 43 0 36 8 GCA 4 3 205414 CASAVA_Build 4 45275329 1I ATTAAAAAAA -/C ATTTTTTGGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 0 1 205415 CASAVA_Build 4 45277489 1D GCACATGTAC A/- AAAAAGGAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 6 5 205416 CASAVA_Build 4 45280448 1D TGGATCAGTC T/- TGGAAGGTTG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 2 1 205417 CASAVA_Build 4 45281543 2I ATCTGTGAGT --/TC CTCAGAGACT 3070 hom 95 het 34 0 32 3 TC 0 1 205418 CASAVA_Build 4 45287035 2D AAGTATAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 31 0 22 13 A 14 12 205419 CASAVA_Build 4 45292534 1D CTTTGCATCA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 8 7 205420 CASAVA_Build 4 45296759 1I AGTATGGAAG -/A AAATATTTTC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 3 4 205421 CASAVA_Build 4 45298758 2D GCTTAATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 18 8 T 17 15 205422 CASAVA_Build 4 45306067 4D AGAGGCAAAA ACAG/---- ACAGAGTTTC 3070 het 3070 ref 35 15 12 9 ACAG 2 1 205423 CASAVA_Build 4 45311337 1D TCCCAGCCTT C/- CCCCCACCAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 C 6 5 205424 CASAVA_Build 4 45325085 1D ATTTTTATTT C/- TTTTTGTTAG 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 C 1 0 205425 CASAVA_Build 4 45336070 1D ACACAAGCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 9 8 205426 CASAVA_Build 4 45340783 1D TAACCAAGAC T/- TTAGAGGAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 3 2 205427 CASAVA_Build 4 45356078 1I AATAAGTATG -/A AAAAGTGTTA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 4 5 205428 CASAVA_Build 4 45357111 1D TAAAGTTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 10 9 205429 CASAVA_Build 4 45368267 1D GACTCCTTCT A/- AAAAAAAAAA 1606 het 1606 ref 17 6 5 7 A 17 16 205430 CASAVA_Build 4 45392292 1D AGCATTTCCC A/- ACACCAAAAT 3070 hom 132 het 49 0 45 6 A 2 1 205431 CASAVA_Build 4 45395206 7I AAGAAATAAC -------/TTCTGTT ATATAAGATA 3070 hom 105 het 36 0 35 1 TTCTGTT 0 1 205432 CASAVA_Build 4 45421515 2D ATGGAACCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 31 3 17 11 A 16 14 205433 CASAVA_Build 4 45422006 2D GGATCATATC AA/-- GTTAAAAAGC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 2 0 205434 CASAVA_Build 4 45424828 9I CTCTTCTTCA ---------/CTCTCATAC CTCTCATACT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 CTCTCATAC 1 2 205435 CASAVA_Build 4 45448486 1D GATTTCTATT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 8 7 205436 CASAVA_Build 4 45457672 1D GCTCTTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 30 0 21 9 A 12 11 205437 CASAVA_Build 4 45462910 4I ACAAATATGA ----/CACT CAATCAAAAA 1935 het 1701 hom 13 5 4 4 CACT 0 1 205438 CASAVA_Build 4 45464895 1D TTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 1855 het 101 hom 23 2 6 15 T 13 12 205439 CASAVA_Build 4 45488771 1I TGTGGGAGTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 A 7 8 205440 CASAVA_Build 4 45494322 1I TAGCCCCACA -/C CCCCCAACAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 5 6 205441 CASAVA_Build 4 45496371 1I ATTAATTATA -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 3 4 205442 CASAVA_Build 4 45499098 1D AATTCTTGGC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 T 9 8 205443 CASAVA_Build 4 45505715 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 39 1 26 12 T 13 12 205444 CASAVA_Build 4 45505890 23D GGCTGAGCAC GGTGGCTCATGCCAGTGGGGCGT/----------------------- GGTGGCTCAC 3070 hom 58 het 19 0 19 5 GGTGGCTCATGCCAGTGGGGCGT 1 0 205445 CASAVA_Build 4 45507811 1D ATCTCTCCCT A/- ATCTCCCCCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 2 1 205446 CASAVA_Build 4 45530144 2I CAATTTTCTC --/AA AATTATTGAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 2 4 205447 CASAVA_Build 4 45537681 1I ATTCTCACAA -/G TGGTGAATAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 G 0 1 205448 CASAVA_Build 4 45545657 1D CTATGTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 35 0 31 4 A 11 10 205449 CASAVA_Build 4 45552278 1D CAGGTTTTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 8 205450 CASAVA_Build 4 45561731 1I CATGAGGAAT -/C TTTGTGATGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 0 1 205451 CASAVA_Build 4 45585675 1D ATATTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 24 1 23 0 T 12 11 205452 CASAVA_Build 4 45592193 4D GCCACCTCCT AACA/---- AAGACTGCCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AACA 1 0 205453 CASAVA_Build 4 45605766 1I ACATAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 32 1 21 10 A 12 13 205454 CASAVA_Build 4 45609286 2I ATCTAAACTC --/AT GTGACTGTTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AT 0 1 205455 CASAVA_Build 4 45619344 5I TTCTCACTTT -----/ACATG ACATGCTCCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ACATG 1 2 205456 CASAVA_Build 4 45623722 2I CCATGAAGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 26 1 20 5 A 10 12 205457 CASAVA_Build 4 45625877 5I TCAGAAAGAA -----/TTAGG TTTGGTATAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TTAGG 0 1 205458 CASAVA_Build 4 45630733 2D TCCCTCACAT TC/-- TCTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 TC 2 1 205459 CASAVA_Build 4 45630851 1D CCATCCCCAC T/- GCCATTCCCA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 T 1 0 205460 CASAVA_Build 4 45634393 1I CTGATTTTTC -/A AAACTTCTCA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 A 3 4 205461 CASAVA_Build 4 45635489 1I CCTCAGCCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 T 9 10 205462 CASAVA_Build 4 45635668 1D AATTAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 A 11 10 205463 CASAVA_Build 4 45644140 2I AAGAGCGAAA --/CT CTGTCTCAAA 1671 het 993 hom 9 3 5 1 CT 1 2 205464 CASAVA_Build 4 45654332 1D AGCCTCAGCT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 8 7 205465 CASAVA_Build 4 45670490 5D TACAGTAAGC TAAGA/----- TAATTTATTA 3070 het 3070 ref 19 11 8 2 TAAGA 1 0 205466 CASAVA_Build 4 45674178 1D AATTTTTCAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 T 8 7 205467 CASAVA_Build 4 45703153 2D ATGAATTATA AC/-- ACACGAAACA 3070 het 3017 hom 23 7 14 2 AC 3 2 205468 CASAVA_Build 4 45704614 1I AATTCATTGA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 6 7 205469 CASAVA_Build 4 45705429 6D TCATGATTTA ATAATC/------ ATAACAAATG 3070 het 3070 ref 31 22 9 1 ATAATC 1 0 205470 CASAVA_Build 4 45708463 1D AGGACTCACA G/- GGGAAAGCTG 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 G 4 3 205471 CASAVA_Build 4 45719751 18D ATACATACAC ATATATATATATATATAT/------------------ ATATATATAT 3070 het 64 hom 26 1 21 10 AT 14 5 205472 CASAVA_Build 4 45720763 1D TGGGGAAGGT G/- GGATGGTTTA 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 G 3 2 205473 CASAVA_Build 4 45721637 1I GCACGTCTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 8 9 205474 CASAVA_Build 4 45724483 4I AACATAGATG ----/CTAA CTAACATCCT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 CTAA 1 2 205475 CASAVA_Build 4 45728824 2D TTTTTTTTTT CC/-- CCCTCCTACA 532 het 532 ref 32 15 4 13 C 5 3 205476 CASAVA_Build 4 45729406 2I AGAGGGAGGA --/AG GAAAGTCATG 3070 het 3070 ref 42 24 9 9 AG 0 1 205477 CASAVA_Build 4 45742383 1D TTAAGAAAAG A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 22 9 10 5 A 7 6 205478 CASAVA_Build 4 45749003 1D GCCTTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 12 11 205479 CASAVA_Build 4 45749057 4D CAGATATTCT TCTA/---- TCTAATTGAA 3070 het 3070 ref 32 14 8 11 TCTA 2 1 205480 CASAVA_Build 4 45750218 4I TGGTTGCAGA ----/TTTG TTTATTTCTC 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 TTTG 0 1 205481 CASAVA_Build 4 45758649 1I GTTTATTTTA -/T TTTTTTTTAT 721 het 495 hom 4 1 3 0 T 8 9 205482 CASAVA_Build 4 45775847 1D AAAAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 T 12 11 205483 CASAVA_Build 4 45777886 3D ATGTTTCATT TAC/--- TATCTCAGCT 3070 het 3070 ref 42 25 15 3 TAC 1 0 205484 CASAVA_Build 4 45781862 1I TAATAAGAGA -/T TTTTTTTTTT 1160 het 1160 ref 32 24 3 5 T 10 11 205485 CASAVA_Build 4 45783735 3I AGCAGCCTCT ---/ATG ATGATTTTCT 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 ATG 1 2 205486 CASAVA_Build 4 45797251 1D AAATAAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 A 10 9 205487 CASAVA_Build 4 45800060 2I2M6D ATTGATTGAT --GAGGCCAT/TGGA------ TTACATACTT 3070 het 3070 hom 34 16 19 3 N/A 0 0 205488 CASAVA_Build 4 45803564 1D TTACTGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 5 T 11 10 205489 CASAVA_Build 4 45840218 1D TTGTTGGCAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 19 7 5 T 9 8 205490 CASAVA_Build 4 45872714 2D CACAGCCAAA CC/-- ATATCAAAAC 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 C 2 0 205491 CASAVA_Build 4 45890459 2D AAATATATAC AT/-- GTGTTTATAT 3070 het 3070 ref 34 18 16 1 AT 1 0 205492 CASAVA_Build 4 45913976 1I TTTTATTTTT -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 6 7 205493 CASAVA_Build 4 45918319 2D AAACTTTATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1288 hom 17 3 10 5 AT 8 7 205494 CASAVA_Build 4 45923511 4I CAAGGCCCTG ----/CCAT CCATCCTCAG 3070 het 3070 ref 47 29 14 4 CCAT 1 2 205495 CASAVA_Build 4 45931968 1D CACTTAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 10 9 205496 CASAVA_Build 4 45933695 2D TATGTAACTC AT/-- ATTCTATAAG 3070 het 3070 ref 34 21 11 4 AT 2 1 205497 CASAVA_Build 4 45937761 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 25 2 13 10 A 12 11 205498 CASAVA_Build 4 45949275 1D AATGAAGGCT A/- AAAAAGTTTT 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 A 6 5 205499 CASAVA_Build 4 45949948 1D TGTAAATATC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 47 15 24 9 T 9 8 205500 CASAVA_Build 4 45952061 2I AAAGTGTAAC --/TT AAGATAATAT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 0 2 205501 CASAVA_Build 4 45958620 1I TTTAATGTCA -/G GTTTTTAGAA 3070 het 3070 hom 44 12 27 5 G 1 2 205502 CASAVA_Build 4 45959827 5D AAAAGAATAG AATAT/----- AAGACAAATA 3070 het 3070 ref 30 16 14 4 AATAT 1 0 205503 CASAVA_Build 4 45960931 1D ACACAACTGA T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 7 6 205504 CASAVA_Build 4 45964844 3D TATGACAGAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 45 19 17 10 AAC 5 4 205505 CASAVA_Build 4 45967769 1I CCTACTATAT -/A AAAAAAAAAA 2241 het 2241 ref 24 9 8 7 A 13 14 205506 CASAVA_Build 4 45969838 1I CCCCTGACAG -/A AAATTTAAAC 2379 het 2379 ref 26 10 7 9 A 3 4 205507 CASAVA_Build 4 45984063 3I TCCAGCTTTG ---/TTC TTCTTGTTTA 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 TTC 1 2 205508 CASAVA_Build 4 45985666 1I GAAAGTAGAC -/A AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 A 6 7 205509 CASAVA_Build 4 45987188 4I ACGTAGAATG ----/TCTT TCTATTTAAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TCTT 0 1 205510 CASAVA_Build 4 45996450 2D GGTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1511 het 1509 ref 37 9 5 24 T 16 14 205511 CASAVA_Build 4 46005645 1D TTGTCAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 11 10 205512 CASAVA_Build 4 46009009 2I TAAAAATGTC --/AT GTGAAGAATA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 AT 0 1 205513 CASAVA_Build 4 46020179 1D CTCAGATATC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 8 7 205514 CASAVA_Build 4 46035056 3I TGGAAAATAA ---/CTT CTCTAGGAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 CTT 0 1 205515 CASAVA_Build 4 46038592 1D CAGTCCTCAG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 51 27 20 5 T 7 6 205516 CASAVA_Build 4 46038866 4I CACTTTTCAC ----/AATT AACAGAGTTG 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 AATT 0 1 205517 CASAVA_Build 4 46045713 1D AATAAAATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 471 hom 12 1 11 0 A 9 8 205518 CASAVA_Build 4 46047909 1D AAAGGAAGAC G/- GGGGGCTATT 3070 het 2785 hom 28 9 12 8 G 6 5 205519 CASAVA_Build 4 46048770 2I TACCTGTCCA --/CT CTTACTTGTT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 CT 1 2 205520 CASAVA_Build 4 46056698 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1914 hom 22 6 14 2 A 12 13 205521 CASAVA_Build 4 46066324 1D CTACAGGCTG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 A 8 7 205522 CASAVA_Build 4 46234665 2I CATCATTTAG --/AA AAGAGTATTT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 2 4 205523 CASAVA_Build 4 46237622 1I GCATTTTGAG -/T TTGGATTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 3 205524 CASAVA_Build 4 46255750 1D TAAGTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 2766 het 11 hom 30 1 6 23 A 11 10 205525 CASAVA_Build 4 46276376 20I ATATGGAAGG --------------------/CTTTCATTCTTTTATAATGT CTTTCTGTCT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 CTTTCATTCTTTTATAATGT 0 1 205526 CASAVA_Build 4 46312829 1I AGTATAATTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 9 10 205527 CASAVA_Build 4 46323779 1I GAGGTCATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 22 8 6 T 8 9 205528 CASAVA_Build 4 46339447 1D GGATCCTTTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 A 9 8 205529 CASAVA_Build 4 46343241 1I TTCCTCTATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 9 10 205530 CASAVA_Build 4 46404085 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 12 9 2 A 13 12 205531 CASAVA_Build 4 46413586 1I TTGTTGTTTA -/G GAATTTTATA 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 G 1 2 205532 CASAVA_Build 4 46414936 1D TAATTAACAT A/- TGAATAACTT 3070 het 3070 ref 55 25 24 6 A 1 0 205533 CASAVA_Build 4 46415582 1D TTAACAGTCA T/- TTGAGAAATT 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 T 3 2 205534 CASAVA_Build 4 46426195 4I CCATCTCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 AAAC 3 4 205535 CASAVA_Build 4 46428225 1I CTCCTTCAGC -/T TTTTTGAATT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 5 6 205536 CASAVA_Build 4 46443326 2I CAGTGGAAAC --/AA AGAGGTTTAT 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 A 1 3 205537 CASAVA_Build 4 46444855 1I TCTGATTTAC -/A ATTAAAGAAC 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 1 2 205538 CASAVA_Build 4 46447299 1I GATATTTACC -/A AAAATAACTT 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 A 4 5 205539 CASAVA_Build 4 46447910 1I TTCCCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 19 12 T 10 11 205540 CASAVA_Build 4 46448124 1I AGAGTGTATA -/C CATGTTATTT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 C 1 2 205541 CASAVA_Build 4 46448596 3D CTGTAGCCTT GTA/--- GTAGTATAGT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 GTA 3 2 205542 CASAVA_Build 4 46448679 1I ATACGGGCTC -/T TTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 T 6 7 205543 CASAVA_Build 4 46455039 8D ACTTTCTAAT GAGGTATA/-------- GAGCTAAACT 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 GAGGTATA 1 0 205544 CASAVA_Build 4 46462099 1I CATTGCAGGC -/G GTAAGGAGAG 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 G 1 2 205545 CASAVA_Build 4 46465128 13D GTCTCCAATA TCTAGCTGCTTCT/------------- TCTCCTCTCG 3070 het 3070 ref 59 34 22 5 TCTAGCTGCTTCT 1 0 205546 CASAVA_Build 4 46465729 1D GATAACATAG A/- AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 33 22 10 2 A 6 5 205547 CASAVA_Build 4 46467436 2I GAGAGACCAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 9 11 205548 CASAVA_Build 4 46486779 1D TAGGTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 A 11 10 205549 CASAVA_Build 4 46509145 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 12 11 205550 CASAVA_Build 4 46567105 1I GAAAAAAAAA -/C ATAACTCAAA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 C 0 1 205551 CASAVA_Build 4 46570446 1D GCTATTACTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 8 7 205552 CASAVA_Build 4 46574547 4D CCTGGTACAC TGTT/---- TGTGGGAATG 3070 het 3070 hom 49 21 21 8 TGTT 1 0 205553 CASAVA_Build 4 46580156 1I CCTTTCTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 9 10 205554 CASAVA_Build 4 46593420 1I AACAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 10 11 205555 CASAVA_Build 4 46608086 1D TTTACAAAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 9 8 205556 CASAVA_Build 4 46609869 3D TGTACACTTC ATG/--- ATGTTTAAGG 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 ATG 2 1 205557 CASAVA_Build 4 46611719 1I AAAACAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 40 2 32 6 T 10 11 205558 CASAVA_Build 4 46620118 1D ATCTTGAGAT A/- AAAGTCAATT 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 4 3 205559 CASAVA_Build 4 46627410 1I AAGAAATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 9 10 205560 CASAVA_Build 4 46629885 4D ACATGAACAG TACC/---- AAAAAGATTA 3070 het 3070 ref 37 19 16 6 TACC 1 0 205561 CASAVA_Build 4 46651176 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1210 het 644 hom 6 2 3 1 A 6 7 205562 CASAVA_Build 4 46659050 3D GATACAAAAT TAA/--- TATACAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 TAA 1 0 205563 CASAVA_Build 4 46664129 1D TACTTTGAAC T/- TTTTTTTTTT 1600 het 1600 ref 36 22 4 10 T 13 12 205564 CASAVA_Build 4 46667482 4D AGCCATGACT TTTA/---- TTTGTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 14 23 5 TTTA 1 0 205565 CASAVA_Build 4 46676819 3D GGTTCTAACA TCT/--- TCTAGTAATA 3070 het 3070 ref 40 22 17 5 TCT 2 1 205566 CASAVA_Build 4 46687964 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAGA 2705 het 1451 hom 17 6 7 5 A 9 8 205567 CASAVA_Build 4 46688496 22I GGAACTTGGA ----------------------/CTCGTTACTTATCTTTCTAAGC CTCAATTTCC 3070 het 3070 hom 44 19 22 5 CTCGTTACTTATCTTTCTAAGC 0 1 205568 CASAVA_Build 4 46699854 1D GCTTTATAAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 A 9 8 205569 CASAVA_Build 4 46703917 1I CTGTTTGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 11 12 205570 CASAVA_Build 4 46704650 20D GTATATATAT ATATATATATATATATATAA/-------------------- AATCAAGTTT 3070 het 118 hom 18 1 18 3 ATATATATATATATATATAA 1 0 205571 CASAVA_Build 4 46714396 1I AATGATTTAT -/G TTTTTCACAC 3070 het 3070 ref 59 25 24 10 G 0 1 205572 CASAVA_Build 4 46716267 1D GGAAATTTAA T/- TTTCTCATAG 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 T 4 3 205573 CASAVA_Build 4 46739148 20D AATATCAATG CATGTGTATGTGTATGTGTA/-------------------- CATGTATGTG 1689 hom 16 het 10 0 6 4 CATGTGTATGTGTATGTGTA 1 0 205574 CASAVA_Build 4 46739225 4D AAATACGTGT GTGA/---- GTATGTGCAC 626 het 132 hom 8 1 2 5 GTGA 1 0 205575 CASAVA_Build 4 46743477 1D TAGTATTAGG A/- AATCTGTAAC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 3 2 205576 CASAVA_Build 4 46750926 1D ATTTACCAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 42 0 33 11 T 10 9 205577 CASAVA_Build 4 46751363 1I ATGGGCAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 29 0 25 4 T 11 12 205578 CASAVA_Build 4 46772276 1D TTAAACTGAC T/- TTCCAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 T 3 2 205579 CASAVA_Build 4 46784055 1I TAGCATTAAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 0 1 205580 CASAVA_Build 4 46796608 1I AAAATCACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 9 10 205581 CASAVA_Build 4 46810973 1D ATTCCAAGGC G/- TATGAAGAGA 3070 hom 148 het 57 0 50 7 G 1 0 205582 CASAVA_Build 4 46816285 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 29 1 20 8 T 15 14 205583 CASAVA_Build 4 46819403 2D GTCTCAAAGG AC/-- ACTGGGTGCT 3070 hom 117 het 43 0 40 4 AC 2 1 205584 CASAVA_Build 4 46823467 1D GTAGAGGAGA T/- TAAGAATCAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 1 205585 CASAVA_Build 4 46833300 1I TTAAAAAAAA -/T ATATATAAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 0 1 205586 CASAVA_Build 4 46834107 2I GTCCTTTGCT --/AG GTTTCTGGCA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 AG 0 1 205587 CASAVA_Build 4 46844072 1D TTCTTTTTTT C/- CTTTCCTCCT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 2 1 205588 CASAVA_Build 4 46846541 1I TCTCAAATCA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 6 7 205589 CASAVA_Build 4 46847421 2I CCACATATAT --/AC ATACACACAC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 AC 0 1 205590 CASAVA_Build 4 46853434 1I TCTAGATTTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 8 9 205591 CASAVA_Build 4 46855899 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2729 het 2729 ref 28 15 9 4 A 10 11 205592 CASAVA_Build 4 46856284 1D CTGAGGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 113 het 50 0 36 15 T 13 12 205593 CASAVA_Build 4 46867052 1I AAAGAAAGAC -/A GAGTTTTTCA 3070 hom 156 het 57 0 52 5 A 0 1 205594 CASAVA_Build 4 46871396 1D ACTTAGATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 10 9 205595 CASAVA_Build 4 46878929 1I TTGTCTTGTT -/G GAGGTTAAAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 1 2 205596 CASAVA_Build 4 46889900 3D TATGTGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 37 18 11 12 TTG 7 6 205597 CASAVA_Build 4 46900172 3I GACTTATCAG ---/AGA AGGAGAGTCC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 AGA 0 1 205598 CASAVA_Build 4 46902831 2I TCACAGGATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 8 8 A 10 12 205599 CASAVA_Build 4 46904468 2I ACAGGAGCCA --/AT TATTCACCCT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AT 0 1 205600 CASAVA_Build 4 46904572 6I CATGGCTTGG ------/AACTCC AACTAATTTC 3070 hom 96 het 39 0 31 8 AACTCC 0 1 205601 CASAVA_Build 4 46906574 1D GTACTTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 A 13 12 205602 CASAVA_Build 4 46931262 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2572 hom 24 7 13 4 A 13 14 205603 CASAVA_Build 4 46942849 1I CTCTCATTCT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 C 8 9 205604 CASAVA_Build 4 46956778 1I ATGAATCTGA -/G TGCTCCTGTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 0 1 205605 CASAVA_Build 4 46967546 1D GCACTAACCC A/- ACTTCACCTT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 2 1 205606 CASAVA_Build 4 46968775 1I ACACATTAAT -/A AACTTTGTTA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 2 3 205607 CASAVA_Build 4 46969747 17D GTGAACCGTT ACTGTAATGATGAGTTC/----------------- ACTGTAGTGA 3070 hom 122 het 42 0 40 8 ACTGTAATGATGAGTTC 1 0 205608 CASAVA_Build 4 46975390 1I AAGCCCTAGG -/T TTTTTGCCTT 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 T 5 6 205609 CASAVA_Build 4 46978833 3D ATTAAAAAAA GAT/--- GAATTGTTAA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 GAT 1 0 205610 CASAVA_Build 4 46983367 1D AAAAGACAAG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 7 6 205611 CASAVA_Build 4 46983908 2D GGTGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 42 26 13 4 AG 8 7 205612 CASAVA_Build 4 46998241 2D TGAGATCCCC AT/-- CTCTACAATA 3070 het 2200 hom 23 7 13 3 AT 1 0 205613 CASAVA_Build 4 47008277 1I AAAGGAAAGC -/A AGGAGAGTGA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 1 2 205614 CASAVA_Build 4 47009196 1I TATTAGCTGC -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 46 13 26 7 A 6 7 205615 CASAVA_Build 4 47012826 1I ACTTAAAAAT -/G TATATAATAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 0 1 205616 CASAVA_Build 4 47018366 1D TCAAATCATA G/- GAATGAACTA 3070 het 3070 ref 46 22 20 6 G 2 1 205617 CASAVA_Build 4 47018545 2D TTCCATTGAC TT/-- TGTGATTTTT 3070 het 3070 ref 57 33 20 4 T 3 1 205618 CASAVA_Build 4 47020246 1I TATTCATGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 7 8 205619 CASAVA_Build 4 47025692 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2762 het 2762 ref 18 7 6 5 A 13 14 205620 CASAVA_Build 4 47039170 1I GGCACCCCAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 7 8 205621 CASAVA_Build 4 47091248 5I AGTGTGAGGC -----/ACTTA ACGAGAACCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 ACTTA 0 1 205622 CASAVA_Build 4 47127746 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 2760 het 264 hom 29 3 12 16 AG 9 7 205623 CASAVA_Build 4 47135376 1I CTCAACAATC -/A AAAAAAAAAA 2714 het 2494 hom 24 9 8 7 A 15 16 205624 CASAVA_Build 4 47139557 2D AAATTAACTC AA/-- GATGCATCTT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 2 0 205625 CASAVA_Build 4 47146006 1I CTGTGAGACA -/C ATACATATTA 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 C 0 1 205626 CASAVA_Build 4 47146681 1I AAGCCAGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 9 10 205627 CASAVA_Build 4 47149332 4I TGTTCAAAAC ----/TAAG TAATTGAACA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TAAG 0 1 205628 CASAVA_Build 4 47159950 1I CCACCCTCAA -/G GGGGGGAGGC 3070 hom 62 het 26 0 21 5 G 6 7 205629 CASAVA_Build 4 47164994 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 13 12 205630 CASAVA_Build 4 47175000 5D TGTTAAAGAT ACTGA/----- ACTGAAGAGT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 ACTGA 2 1 205631 CASAVA_Build 4 47182156 1D GTCTAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2835 hom 35 10 10 15 T 12 11 205632 CASAVA_Build 4 47182610 4I CACGCATTCT ----/CACA CACACACCTT 3070 hom 10 het 16 0 11 5 CA 3 5 205633 CASAVA_Build 4 47188066 6I TTTGCCATGG ------/TAACAC TAACACTGGT 3070 het 2227 hom 26 5 18 3 TAACAC 1 2 205634 CASAVA_Build 4 47197861 4I GGGTTTTGCC ----/AAGA AAGAAGTGAG 3070 hom 137 het 51 0 46 5 AAGA 1 2 205635 CASAVA_Build 4 47206023 1I TTTTTATTCG -/T TTTACAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 3 4 205636 CASAVA_Build 4 47208060 1D AAAAGAACTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 T 9 8 205637 CASAVA_Build 4 47227861 1I GTATCAGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 T 9 10 205638 CASAVA_Build 4 47229975 1D TAGGGATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 10 9 205639 CASAVA_Build 4 47232092 1I CTAAAAGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 13 14 205640 CASAVA_Build 4 47240611 2I TATATTATGT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 AC 8 9 205641 CASAVA_Build 4 47243112 4I TGTCTGAAAC ----/AAAG AGAGATGCTT 3070 het 3070 ref 57 26 25 6 AAAG 0 1 205642 CASAVA_Build 4 47243865 1I ACCATTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 A 11 12 205643 CASAVA_Build 4 47257560 1I GTTTGGGAAG -/C CTAGTGTCCA 3070 het 3070 hom 55 24 24 7 C 1 2 205644 CASAVA_Build 4 47267577 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 12 11 205645 CASAVA_Build 4 47270659 1I AGTAGGAACA -/T TTTTTTTTTT 1083 het 1083 ref 37 25 3 9 T 11 12 205646 CASAVA_Build 4 47273126 4D ACATTGGTCT TAGA/---- TAGAGGGAGT 3070 het 3070 ref 37 21 13 6 TAGA 2 1 205647 CASAVA_Build 4 47282115 2I TGAATTTAAA --/TT TCTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 3 205648 CASAVA_Build 4 47304380 1D ACCCAACCTG T/- TGTTTGAAAG 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 T 2 1 205649 CASAVA_Build 4 47377533 3D TTAATTGATT ATC/--- TTTTTTTTGA 3070 het 3050 hom 20 9 9 2 ATC 1 0 205650 CASAVA_Build 4 47381706 1D AAAACAAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 A 9 8 205651 CASAVA_Build 4 47512089 1I GTCCTGATTT -/C TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 C 0 1 205652 CASAVA_Build 4 47514070 2D ATATAACAAA AT/-- ATATATATAT 1994 het 1994 ref 16 6 5 5 AT 7 6 205653 CASAVA_Build 4 47520891 1D ATGCTATTCC T/- TTTTTTTTTT 1578 het 1578 ref 35 16 5 14 T 16 15 205654 CASAVA_Build 4 47535776 1I TTTGTAAAAT -/G GGGGGGGGCA 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 G 8 9 205655 CASAVA_Build 4 47538877 1D GACAGTGACT G/- GGGGGGGGGG 2758 het 1480 hom 31 5 9 18 G 11 10 205656 CASAVA_Build 4 47544741 1D CCTTCACTTT A/- AAACAGTATT 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 4 3 205657 CASAVA_Build 4 47546727 1D GTATTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 15 14 205658 CASAVA_Build 4 47553276 3D CCCTCCCAAA TAG/--- TAGAACCCTC 3070 het 3070 ref 41 26 13 3 TAG 2 1 205659 CASAVA_Build 4 47558401 5D TAGAATAAAA TTTAT/----- TTTAACAAGG 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 TTTAT 1 0 205660 CASAVA_Build 4 47564604 2I AAAGACTTTT --/TA TATACAACTG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 TA 2 3 205661 CASAVA_Build 4 47565231 5I AAAGGCAAAC -----/AAAAT AAACTCACTG 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 AAAAT 0 1 205662 CASAVA_Build 4 47571485 3I CAGGTTGACA ---/AAT AACTCCAATT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 AAT 0 1 205663 CASAVA_Build 4 47573737 4I AAGACTGAGC ----/AAAT AAATATTAGG 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 AAAT 1 2 205664 CASAVA_Build 4 47579495 4D CATTTTCAGA TTGT/---- TTGTTTCCAG 3070 het 3070 ref 41 20 19 3 TTGT 2 1 205665 CASAVA_Build 4 47585340 1D AACAAAAAAA C/- ACCACTCTAC 2036 het 2036 ref 23 15 6 3 C 1 0 205666 CASAVA_Build 4 47590687 13D CATACATTTC AGTGATCAGAAAT/------------- AGTGATCAGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 AGTGATCAGAAAT 2 1 205667 CASAVA_Build 4 47591350 1D ACCACTTACA T/- TTCATTACAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 3 2 205668 CASAVA_Build 4 47594944 4D TTTCAATCAC AAAT/---- AAACAACTGC 3070 het 3070 ref 48 25 19 10 AAAT 1 0 205669 CASAVA_Build 4 47601682 9I ATCTTTTTCC ---------/AAACCCAAT AAAAGTAATA 3070 het 3070 ref 45 20 17 9 AAACCCAAT 0 1 205670 CASAVA_Build 4 47605197 1D GACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 11 10 A 13 12 205671 CASAVA_Build 4 47605285 4D ATTCTGTCAT ACTA/---- ACTAACAGGC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 ACTA 2 1 205672 CASAVA_Build 4 47622143 3D GAAACAGTAT GGA/--- GGAGATTCCT 3070 het 3070 ref 44 24 19 2 GGA 2 1 205673 CASAVA_Build 4 47624397 5I AGTAATACTC -----/AAATT TAATGATTAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 AAATT 0 1 205674 CASAVA_Build 4 47626656 1D GAAGGAAAAA G/- TGATAACACG 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 G 1 0 205675 CASAVA_Build 4 47631858 16I CTGTAGTGAA ----------------/GAAATACTTGCCAGCT GATATTGAAG 3070 het 3070 ref 59 29 28 2 GAAATACTTGCCAGCT 0 1 205676 CASAVA_Build 4 47634948 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2844 het 2833 hom 26 10 9 7 A 13 12 205677 CASAVA_Build 4 47648983 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1872 het 1371 hom 9 3 6 0 A 10 11 205678 CASAVA_Build 4 47651799 1I TTAAGTGCTC -/A ACGACTGTAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 1 2 205679 CASAVA_Build 4 47662698 1D AAAAGAACAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 26 11 10 6 A 9 8 205680 CASAVA_Build 4 47670980 1I TAGTATCATA -/C CATTTTATTT 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 C 1 2 205681 CASAVA_Build 4 47671146 2D TTTTTAAAAC AA/-- GAGTCTGTTT 3070 het 3070 hom 34 12 19 5 A 2 0 205682 CASAVA_Build 4 47682535 1I TCTTCCCCCA -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 C 7 8 205683 CASAVA_Build 4 47683880 4I CTTGACTGAT ----/AGAA AGAACATAGC 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 AGAA 1 2 205684 CASAVA_Build 4 47684418 2I ACACTCTAAT --/TA AAGATGGGAA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 TA 0 1 205685 CASAVA_Build 4 47692291 4D35M1I TTTATTCTTG CTATCTATTTCATTATTTCTCCCTTCACTTCTTGTATCA-/----CTATTTCATTATTTCTCCCTTCACTTCTTGTATCAT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 16 7 N/A 0 0 205686 CASAVA_Build 4 47695395 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 1937 hom 16 6 10 1 A 8 7 205687 CASAVA_Build 4 47697515 1D GTGGGGGAAG C/- GGGGGGGTGG 2893 het 2893 ref 21 7 8 6 C 1 0 205688 CASAVA_Build 4 47699359 4I GAGATGAAAT ----/AGTA AGGCGTCAAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 AGTA 0 1 205689 CASAVA_Build 4 47704444 1D ACCTTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 11 10 205690 CASAVA_Build 4 47705384 1D8M4D AAGTATTTAT CCCATTACATCTG/-CCATTACA---- TCTATTTTAT 3070 het 3070 ref 29 22 7 4 N/A 0 0 205691 CASAVA_Build 4 47708074 1I AACTAAGAAG -/A AAAAAAAATT 1750 het 1750 ref 25 11 6 8 A 8 9 205692 CASAVA_Build 4 47708117 1I CCTGGGAGAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 A 8 9 205693 CASAVA_Build 4 47708187 2D ATGCACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 AC 9 8 205694 CASAVA_Build 4 47709423 30D CCTTTGGATT TGATCAAGTTGGATAGAGTTGATCAAACCC/------------------------------ TGATCAAGTT 3070 het 3070 ref 26 19 10 5 TGATCAAGTTGGATAGAGTTGATCAAACCC 2 1 205695 CASAVA_Build 4 47711196 1D TTCAGAATTG A/- AAAGCAAGAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 4 3 205696 CASAVA_Build 4 47714268 2I GCAGTCACTC --/TT TGGCTGCTTA 3070 het 2046 hom 26 7 15 4 T 1 3 205697 CASAVA_Build 4 47715060 4D CCAAGGATCT GTAA/---- GTAAGGAAGG 3070 het 3070 ref 41 19 18 7 GTAA 2 1 205698 CASAVA_Build 4 47718082 4I5M2I CATTGAGTCA ----AAGTC--/GATGATTTCCG CCTCATTTTA 3070 het 3070 ref 31 20 10 2 N/A 0 0 205699 CASAVA_Build 4 47718664 2D CATTGGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 TA 7 6 205700 CASAVA_Build 4 47726660 1D AGAAACACGG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 A 7 6 205701 CASAVA_Build 4 47735586 1D GTCACCTTTT A/- CAAGGTGTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 A 1 0 205702 CASAVA_Build 4 47737885 3D TTAGCCAAGT GTG/--- GTAGCATGTC 3070 het 3070 hom 45 17 24 5 GTG 1 0 205703 CASAVA_Build 4 47742689 3I AGGGACCAGG ---/CTT CTTCTATTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 CTT 1 2 205704 CASAVA_Build 4 47757853 5I ACTAATAAAG -----/AAGAA AAGAGAGAAG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 AAGAA 0 1 205705 CASAVA_Build 4 47771151 1D CCAAGATTAT A/- AAAAGGAAAT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 5 4 205706 CASAVA_Build 4 47774294 1I AGCAAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 10 11 205707 CASAVA_Build 4 47783760 1I CCCAGTCTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 10 205708 CASAVA_Build 4 47795722 1D ACATACAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 A 10 9 205709 CASAVA_Build 4 47811808 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 11 10 205710 CASAVA_Build 4 47816853 2D GCATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 102 het 41 0 33 10 AC 7 6 205711 CASAVA_Build 4 47817644 1I CCACTTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 45 1 37 7 A 10 11 205712 CASAVA_Build 4 47822937 2D TTTCTTCTGC CT/-- CTGTCACCCC 3070 het 343 hom 37 2 17 19 CT 2 1 205713 CASAVA_Build 4 47822949 1D CTGTCACCCC T/- GAGACAGAAA 3070 het 856 hom 42 5 18 19 T 1 0 205714 CASAVA_Build 4 47823442 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 7 8 205715 CASAVA_Build 4 47828092 2D ACATATAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2047 hom 37 12 12 14 T 18 16 205716 CASAVA_Build 4 47828218 4D CTGGACTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 TTTG 4 3 205717 CASAVA_Build 4 47829999 1D TATTCTGCTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 27 1 21 5 G 2 1 205718 CASAVA_Build 4 47831963 1I AGTAAGGTAG -/A AGTGTGCCAG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 1 2 205719 CASAVA_Build 4 47834064 4D TAGAAGCAAA TTAT/---- TTATGTGTTT 3070 het 3070 ref 52 22 24 6 TTAT 2 1 205720 CASAVA_Build 4 47838440 1I ACCAATTGTC -/T TTTTTTTTTT 829 het 829 ref 23 11 6 6 T 10 11 205721 CASAVA_Build 4 47845709 1D TTTGGTTTTC T/- GTTCCTGTGT 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 T 1 0 205722 CASAVA_Build 4 47860646 3D TGCTTAAAGC TTA/--- TTATAAGAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 10 TTA 2 1 205723 CASAVA_Build 4 47863020 2D AGAGAGGTAG CC/-- CCCCCAGAGC 3070 hom 110 het 44 0 35 9 C 7 5 205724 CASAVA_Build 4 47869042 1I CACAAGGCAG -/A AAATCTGTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 3 4 205725 CASAVA_Build 4 47869435 1I TATACCATTC -/A GCACCTTGCT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 A 0 1 205726 CASAVA_Build 4 47870207 12I TTGGCATCTC ------------/AGGTTGTTTGGT AGGCTGAAGA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 AGGTTGTTTGGT 0 1 205727 CASAVA_Build 4 47871438 2D ATCTCAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 A 13 11 205728 CASAVA_Build 4 47872761 8I TGAACCTACA --------/AATCAGCC AATCAGCCAG 3070 het 3070 hom 49 15 24 10 AATCAGCC 1 2 205729 CASAVA_Build 4 47878363 6D AGGAGAATAG CTTGAA/------ CCTGGGAGGC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 CTTGAA 1 0 205730 CASAVA_Build 4 47878463 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAGAAAA 227 het 227 ref 16 4 1 11 A 6 5 205731 CASAVA_Build 4 47879059 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1567 het 1567 ref 23 11 8 5 A 15 16 205732 CASAVA_Build 4 47884209 1D AATAAATACT A/- AAAAAAAAAA 2525 het 19 hom 16 1 9 7 A 17 16 205733 CASAVA_Build 4 47902431 4D TACCACTTCA CACT/---- CACTAGGACA 3070 het 3070 hom 39 19 17 5 CACT 2 1 205734 CASAVA_Build 4 47902928 1I AGTAGATTAG -/T GGTTGCCAGG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 0 1 205735 CASAVA_Build 4 47908192 1I TCAAAAAAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 T 7 8 205736 CASAVA_Build 4 47908886 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1625 het 29 hom 6 1 4 1 T 1 0 205737 CASAVA_Build 4 47911512 1D CCTGTGGTCT C/- AGCTTCTAGG 2309 het 2309 ref 17 10 5 3 C 1 0 205738 CASAVA_Build 4 47913285 1D GTTCTTTTTT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 A 8 7 205739 CASAVA_Build 4 47914731 1D CTTCCTAGAG A/- AAAAAAAAAA 2584 het 2584 ref 26 13 8 5 A 13 12 205740 CASAVA_Build 4 47919921 1D ATATATACAC A/- AAAAAATGTT 3070 het 2874 hom 21 7 11 4 A 7 6 205741 CASAVA_Build 4 47930115 1D CAATTGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1010 hom 35 8 16 11 T 20 19 205742 CASAVA_Build 4 47930305 2D CCAAGGATCA CC/-- CCAGACAATT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 C 4 2 205743 CASAVA_Build 4 47930414 1I AGAAAATGTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 8 9 205744 CASAVA_Build 4 47946589 2D GTGGGAAAAC TG/-- TAGTTTTCAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 TG 1 0 205745 CASAVA_Build 4 47950347 1I TGTCCAATTC -/T TTTTTTTTTT 2152 het 1089 hom 29 7 9 13 T 17 18 205746 CASAVA_Build 4 47954574 4I TCCACATGCC ----/TCCT CATTTACCTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TCCT 0 1 205747 CASAVA_Build 4 47955517 3D GTCTTTTCAA AAT/--- CACTTGGAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 AAT 1 0 205748 CASAVA_Build 4 47957394 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 10 11 205749 CASAVA_Build 4 47962239 8I ACATATATAC --------/ATATATAT ACACACATAT 1510 hom 10 het 4 0 4 0 AT 0 4 205750 CASAVA_Build 4 47963613 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 21 1 16 4 A 14 13 205751 CASAVA_Build 4 47970920 3I TATTTATAAG ---/ATC ATCATTATAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATC 1 2 205752 CASAVA_Build 4 47998663 1D TGTTTTCACA T/- TTTTTTCTGC 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 7 6 205753 CASAVA_Build 4 48000191 1D GAAGGGTAGT G/- GGGTTGGGGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 4 3 205754 CASAVA_Build 4 48016530 1I ACTCCGACTC -/A AAAAAAAAAA 2911 het 196 hom 12 1 9 2 A 15 16 205755 CASAVA_Build 4 48022458 3D GGCCACCGAC AGG/--- AGAAGGGATA 3070 hom 81 het 29 0 28 4 AGG 1 0 205756 CASAVA_Build 4 48023625 1I GACCCCCAAA -/T TTATATCTCC 3070 hom 113 het 44 0 38 6 T 2 3 205757 CASAVA_Build 4 48033281 2D GAATTATCAC AT/-- GTCATAAAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 AT 1 0 205758 CASAVA_Build 4 48040860 1I TGAGCATGAG -/T TTTGTTAAGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 3 4 205759 CASAVA_Build 4 48042765 4I TAGACATTAT ----/GAAA GATTTTGTAA 3070 hom 122 het 46 0 41 5 GAAA 0 1 205760 CASAVA_Build 4 48043610 2D TCTATTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 34 13 6 15 T 20 18 205761 CASAVA_Build 4 48048887 1I AATATTGGAA -/T TGCTTTTAAC 3070 het 3070 hom 56 27 23 6 T 1 2 205762 CASAVA_Build 4 48051241 1D GTTACGGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 35 0 29 6 T 11 10 205763 CASAVA_Build 4 48054150 1D TATTTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 11 10 205764 CASAVA_Build 4 48058399 1I ATTAAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 10 11 205765 CASAVA_Build 4 48058599 3D TTTTCATATG TCT/--- TCTTTTAATT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TCT 2 1 205766 CASAVA_Build 4 48063596 1I GTAATGTTTG -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 T 7 8 205767 CASAVA_Build 4 48068826 2D ACATATATAC AT/-- ATATATATAT 1671 het 1671 ref 21 11 5 5 AT 6 5 205768 CASAVA_Build 4 48092220 1D ATTTTTTTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 10 9 205769 CASAVA_Build 4 48098975 1I CTGCCCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 30 1 24 5 T 14 15 205770 CASAVA_Build 4 48101194 1I CATTATATCC -/T TTCCTCTTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 2 3 205771 CASAVA_Build 4 48108378 1D ATCTTCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1432 hom 44 5 33 7 T 12 11 205772 CASAVA_Build 4 48108792 1I GTTGAGGAAA -/T TTCGTAAATT 3070 het 3070 ref 43 27 12 4 T 2 3 205773 CASAVA_Build 4 48110002 3D ACTCTGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 30 4 11 15 A 15 12 205774 CASAVA_Build 4 48115626 2D ACATTCTACA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 GT 7 6 205775 CASAVA_Build 4 48115884 1I TCTGTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1393 hom 24 4 16 4 T 11 12 205776 CASAVA_Build 4 48120050 1D CATTTTTGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 10 9 205777 CASAVA_Build 4 48124733 4I TGACAATCTG ----/CTTC CTTCCTTCCT 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 CTTC 2 3 205778 CASAVA_Build 4 48132144 1I GTTGAAGGGG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 6 7 205779 CASAVA_Build 4 48134220 1D TTAGGGTCTT A/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 A 1 0 205780 CASAVA_Build 4 48135558 5D TTTTATCTTA TTATC/----- TCTTTGAATA 3070 het 3070 ref 37 22 13 5 TTATC 1 0 205781 CASAVA_Build 4 48135909 3D CTGTGTTATC ACA/--- GAGAATTTTG 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 ACA 1 0 205782 CASAVA_Build 4 48151722 2D GGAAGTAGAA AG/-- AGAGTTTATG 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 AG 3 2 205783 CASAVA_Build 4 48153441 3D ACACACACAC CAA/--- CAACCAAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 CAA 2 1 205784 CASAVA_Build 4 48162743 1I AGTTAGCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 40 0 33 7 A 11 12 205785 CASAVA_Build 4 48164257 1I GAAAAGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 10 11 205786 CASAVA_Build 4 48165464 1I CCCCACCCCC -/T GACAGGCCCC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 0 1 205787 CASAVA_Build 4 48170798 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 79 het 36 0 26 10 T 9 8 205788 CASAVA_Build 4 48173665 1D TAACTTTCAC A/- AATTCAATTA 3070 hom 94 het 41 0 31 12 A 3 2 205789 CASAVA_Build 4 48175962 8D CTGCTATGAC CATGCCTA/-------- CATGCCTATG 3070 het 3070 ref 31 14 11 8 CATGCCTA 2 1 205790 CASAVA_Build 4 48177420 1D CCTTCCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 40 0 30 10 T 11 10 205791 CASAVA_Build 4 48188345 1D CCTGACCGCA C/- GGTTGGATTA 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 C 1 0 205792 CASAVA_Build 4 48191464 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1965 hom 32 7 15 11 A 11 10 205793 CASAVA_Build 4 48193208 4D ATTGAGTCCT AAGA/---- AAGAAATTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 6 AAGA 2 1 205794 CASAVA_Build 4 48201614 4D TTTTTACTAT AATA/---- AATAGTATAA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AATA 2 1 205795 CASAVA_Build 4 48204235 4D AGCCTGTATA AAAG/---- AAAGAAAGAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAAG 3 2 205796 CASAVA_Build 4 48221938 16D TTTTTAAAGG TATATATATATATATA/---------------- TATATATATA 3070 het 283 hom 21 1 13 8 TA 17 9 205797 CASAVA_Build 4 48224441 1D ATGCCCGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 36 2 19 15 A 15 14 205798 CASAVA_Build 4 48229005 1D AAAAGGAAGT A/- AAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 6 5 205799 CASAVA_Build 4 48232058 11D AGGATCAGGA CCACTAAAAAC/----------- CCATTTTCCA 3070 het 3070 ref 38 18 18 4 CCACTAAAAAC 1 0 205800 CASAVA_Build 4 48235086 16D AAATACATGC TTTTAGAATAATTATA/---------------- TTAAGAATCT 3070 hom 51 het 18 0 17 4 TTTTAGAATAATTATA 1 0 205801 CASAVA_Build 4 48243753 1D GTATGATTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 9 205802 CASAVA_Build 4 48247079 1I CAATCCTGCT -/A AAAAAAAATC 3027 het 3027 ref 30 15 7 8 A 8 9 205803 CASAVA_Build 4 48249215 1D AGAACTTATA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 7 205804 CASAVA_Build 4 48258983 1D TGCATAAGTG A/- AAAAAAAAAA 1139 het 1139 ref 52 40 4 8 A 11 10 205805 CASAVA_Build 4 48262059 1I TAAGTAAGGG -/A AAAAAAGGCA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 6 7 205806 CASAVA_Build 4 48263191 2D TGGAAGTTGT AA/-- AAAAGTGTTT 3070 het 3070 hom 40 14 21 8 A 6 4 205807 CASAVA_Build 4 48288857 20D ATAAAGCTCT TATATATATATATATATATA/-------------------- TATATATATA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TA 16 6 205808 CASAVA_Build 4 48290130 1I TCTTTATTCA -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 6 7 205809 CASAVA_Build 4 48290343 18D TGGTCTCAAA CTGCCAGCCTCAGGTGAT/------------------ CTGCCAGCCT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 CTGCCAGCCTCAGGTGAT 2 1 205810 CASAVA_Build 4 48290953 6D AATACATGAT TATAAG/------ TATATTATTT 3070 het 3070 ref 29 16 13 2 TATAAG 1 0 205811 CASAVA_Build 4 48291725 1I CCCATTTAAC -/A AAAAAGCTTG 3070 het 3070 hom 38 9 16 13 A 5 6 205812 CASAVA_Build 4 48296237 1D AGTATGGTAA T/- TTTTTAAAAC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 6 5 205813 CASAVA_Build 4 48320660 2I TATAAAATAC --/CT CTTTTATATG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 CT 1 2 205814 CASAVA_Build 4 48330656 2D AACTGACCCA TG/-- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 54 20 27 8 TG 2 1 205815 CASAVA_Build 4 48334371 1I ACTGGAAAAA -/C CCCATGTCGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 3 4 205816 CASAVA_Build 4 48336261 1I TCCACATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 628 hom 33 2 24 7 A 11 12 205817 CASAVA_Build 4 48350582 6D CAGCTGCAAA AGCAGC/------ AGCAGCAGCA 2552 het 1084 hom 26 5 9 13 AGC 8 6 205818 CASAVA_Build 4 48353481 2D GCATATATAT AA/-- AATGTATATA 3070 hom 17 het 9 0 8 1 A 4 2 205819 CASAVA_Build 4 48354545 1D TTTTAAAACA T/- TTTTTAAGAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 5 205820 CASAVA_Build 4 48354934 3I TAACTAGAAA ---/TAT TATGCAATTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TAT 1 2 205821 CASAVA_Build 4 48355630 1D TATAAACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 10 9 205822 CASAVA_Build 4 48360112 4I AATATATAAT ----/TAAA TTAATTTAAT 2890 hom 21 het 10 0 8 2 TAAA 0 1 205823 CASAVA_Build 4 48363158 12D AAATAAAAAG TAAATAAATAAA/------------ TAAATAAATA 3070 het 2921 hom 16 6 9 5 TAAA 7 4 205824 CASAVA_Build 4 48366463 5D TTATATATCC CTTAT/----- ATTATTATTA 1927 het 1927 ref 17 13 4 0 CTTAT 1 0 205825 CASAVA_Build 4 48376466 1D TGAATGTTCT A/- ACACAAAGAA 3070 hom 120 het 41 0 41 0 A 2 1 205826 CASAVA_Build 4 48390782 1I GCCCAAAGGC -/A TGCAAGGAAG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 A 0 1 205827 CASAVA_Build 4 48396573 1D CCTGGATCAG T/- TTACTGGTGT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 3 2 205828 CASAVA_Build 4 48399680 1D ATGTTGAGTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 8 7 205829 CASAVA_Build 4 48402332 1I TATTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2871 het 2871 ref 31 15 10 6 A 13 14 205830 CASAVA_Build 4 48407187 1D TGATGTTTTT G/- CCACTTTTAG 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 G 1 0 205831 CASAVA_Build 4 48436952 5D TCAAGAGACT GAAAA/----- GAAAAGTCAC 3070 het 3070 hom 28 13 13 4 GAAAA 2 1 205832 CASAVA_Build 4 48440717 2I CTCCCTTTCC --/CT CTGTCTTCCC 3070 hom 80 het 31 0 27 4 CT 1 2 205833 CASAVA_Build 4 48448613 1I AGAGATTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1779 hom 37 5 17 15 T 15 16 205834 CASAVA_Build 4 48449147 13I CTCCGGATCT -------------/GCCCCTGGAGCTG GCCCCTGGAG 3070 hom 102 het 45 0 34 12 GCCCCTGGAGCTG 1 2 205835 CASAVA_Build 4 48450525 5D TTTTAAGAAC TTTAT/----- AATTTTAACT 3070 het 3070 ref 33 18 13 6 TTTAT 1 0 205836 CASAVA_Build 4 48461141 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 58 het 26 0 19 7 A 7 6 205837 CASAVA_Build 4 48467745 2D AGAATCAAAG CA/-- CAGTTCTTTT 3070 het 3070 hom 43 21 22 1 CA 2 1 205838 CASAVA_Build 4 48468552 3I CCAGAAGAAC ---/ATG ATGCTGTCAT 3070 het 3070 hom 43 12 26 5 ATG 1 2 205839 CASAVA_Build 4 48480556 1D AACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 14 9 A 12 11 205840 CASAVA_Build 4 48485693 3I CTTTACAGAG ---/GAT GAAACTTAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GAT 0 1 205841 CASAVA_Build 4 48493533 2D GGACTTGTCT AA/-- AGAGCAACTA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 A 3 1 205842 CASAVA_Build 4 48504099 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 919 het 919 ref 36 22 4 10 A 13 12 205843 CASAVA_Build 4 48555996 1I TTATTGATGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 8 9 205844 CASAVA_Build 4 48568166 1D TCCTCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 2084 het 2084 ref 37 12 9 16 T 14 13 205845 CASAVA_Build 4 48582087 4I AAGAGCAGAA ----/AAAC AAACATGTAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 AAAC 1 2 205846 CASAVA_Build 4 48593546 1D CGTCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 17 15 14 A 11 10 205847 CASAVA_Build 4 48604200 1D GGAAGTATAG A/- AAACAGGCCG 3070 hom 52 het 21 0 16 5 A 4 3 205848 CASAVA_Build 4 48612581 2D AAGGGGACTC TG/-- AACAAATGTA 3070 het 3070 ref 35 18 15 5 TG 1 0 205849 CASAVA_Build 4 48631891 1D CAGATACTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 8 7 205850 CASAVA_Build 4 48650008 3I CTTATAATCT ---/TAC TACCCCTATA 1834 het 1834 ref 37 30 4 3 TAC 1 2 205851 CASAVA_Build 4 48659700 1D AATGGGGGTT G/- GGGGGGGGGG 2113 het 111 hom 13 1 7 6 G 11 10 205852 CASAVA_Build 4 48667287 1D TCCCCCAGAT A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 7 6 205853 CASAVA_Build 4 48674946 1D TGTATTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3067 het 2268 hom 29 7 7 15 A 12 11 205854 CASAVA_Build 4 48685234 1D TCTCTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 13 12 205855 CASAVA_Build 4 48697614 2D GCTTTAAAGA CT/-- CTAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 CT 2 1 205856 CASAVA_Build 4 48703031 1I GAACGATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 10 11 205857 CASAVA_Build 4 48710406 1D ATTTCTCTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 10 9 205858 CASAVA_Build 4 48728286 1D CCTGGAGCAT G/- GGGGGCCAAA 3070 het 3070 ref 50 22 18 10 G 6 5 205859 CASAVA_Build 4 48751693 2D GTTTTTAGGG AT/-- ATATATATAT 1869 het 1869 ref 34 26 4 5 AT 8 7 205860 CASAVA_Build 4 48752366 1D TTTTCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2035 hom 34 7 16 11 T 15 14 205861 CASAVA_Build 4 48762141 1D GGTCAAAAAC A/- GACCACAATG 3070 het 3070 hom 32 9 19 5 A 1 0 205862 CASAVA_Build 4 48762627 2D CTCAAAAAAT AA/-- AGTTTACCAC 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 A 3 1 205863 CASAVA_Build 4 48792688 15D ATTCCATTCC ATTCCATTCCATTCT/--------------- ATTCCACTCA 2652 het 1608 hom 15 5 10 1 ATTCCATTCCATTCT 1 0 205864 CASAVA_Build 4 48825776 1I TCTAATCGGG -/T TGATTCCAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 1 2 205865 CASAVA_Build 4 48837568 10D ATTCCATTCA ATTCCGTTCC/---------- ATTCCGTTCC 956 het 956 ref 77 55 3 35 ATTCCGTTCC 2 1 205866 CASAVA_Build 4 48852456 5D AATAAATTCC CTTGT/----- ATTCATTCCA 2271 het 2271 ref 103 64 11 29 CTTGT 1 0 205867 CASAVA_Build 4 48855210 3D ATCCCATAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 101 45 25 31 T 14 11 205868 CASAVA_Build 4 48865388 2D TAATTTTTAC TA/-- ATTTTTACAT 449 het 449 ref 35 17 4 16 TA 1 0 205869 CASAVA_Build 4 48866115 3I TCTCAGAAAA ---/AAC AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 65 24 13 28 AAC 0 1 205870 CASAVA_Build 4 48866735 3D TGCTATCCCT CCC/--- CCTCCCCCCA 9 het 9 ref 10 1 1 8 C 5 2 205871 CASAVA_Build 4 48872375 1I GTGCGTAGGA -/C CCTCCGAGCC 3070 het 2264 hom 51 6 29 16 C 2 3 205872 CASAVA_Build 4 48880320 1D TTTGTTTATT A/- TTTTTAAGAC 3070 het 3070 ref 61 32 18 11 A 1 0 205873 CASAVA_Build 4 48884655 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 50 22 20 9 T 7 8 205874 CASAVA_Build 4 48885156 1I GATCGGCATG -/C TTTTTATTAC 3070 het 3070 ref 47 32 11 4 C 0 1 205875 CASAVA_Build 4 48886536 1I CATAGTGAAA -/C CCTGTCTTTA 2849 het 2849 ref 30 22 7 1 C 2 3 205876 CASAVA_Build 4 48886736 4I AAAAAAGAAA ----/AAAG AAAAAATTTC 2026 het 1437 hom 17 8 5 4 AAAG 0 1 205877 CASAVA_Build 4 48890750 3I AGGCAGGAGA ---/ATG GCTTGAACTT 1974 het 1974 ref 25 14 5 6 ATG 0 1 205878 CASAVA_Build 4 48891319 3I47M1D TGGTTCCCAA ---AATGACAACAGTAACATTAAAGATCACTGATTACAGATCACCACAACA/AACAATGACAACAGTAGCATTAAAGATCACTCATTACAGATCACCATAAC- GATTCAATAA 3070 het 3070 ref 99 85 27 91 N/A 0 0 205879 CASAVA_Build 4 48892436 4I24M1I TGTACCACAA ----TTCTTTAATGCTCTTTTTTAAAAA-/TTCTTTCTTTAATGATCTTTTTAAAAAAT TGTTGATCAA 3070 het 3070 ref 93 56 37 14 N/A 0 0 205880 CASAVA_Build 4 48894058 4I CTATGTGAGG ----/GACA GACATTCAAA 3070 het 3070 ref 94 57 32 5 GACA 1 2 205881 CASAVA_Build 4 48895240 1I TCTGGAATCC -/T TTTTTGAGGG 3070 het 3070 ref 85 62 11 12 T 5 6 205882 CASAVA_Build 4 48903212 3I AACTTACAAG ---/AAA AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 21 10 12 A 8 11 205883 CASAVA_Build 4 48904335 1I CCACTTACGT -/A AAAAAAAAAG 464 het 464 ref 50 30 4 16 A 9 10 205884 CASAVA_Build 4 48904403 2D TTTGTTTGTT TC/-- TTTTTGCAGC 3070 het 3070 ref 54 22 19 21 TC 1 0 205885 CASAVA_Build 4 48904544 2I ATAAACAAAC --/AA AAAGAGTTAA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 A 3 5 205886 CASAVA_Build 4 48904982 1I CAAATTATCC -/T GTTGATTTGG 3070 het 3070 hom 55 12 42 1 T 0 1 205887 CASAVA_Build 4 48905058 1I17M1I GACCACCTTT -TTATGTCTTTCTCTGTC-/GTAATGTCATTCTCTGTCT TTTTTTTATC 2195 het 2195 ref 38 32 6 6 N/A 0 0 205888 CASAVA_Build 4 48907404 15I ACTAAGGAGT ---------------/GCTGAGATCAGACCA GCCCCATCTC 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 GCTGAGATCAGACCA 0 1 205889 CASAVA_Build 4 48908823 1I CCGTAGCTGG -/A GACCCCAGTT 3070 het 3070 ref 70 37 17 16 A 0 1 205890 CASAVA_Build 4 48912603 2D ATGCTTTTTC AA/-- AAGTTTCCAA 1338 het 1338 ref 51 41 3 9 A 4 2 205891 CASAVA_Build 4 48912701 1I TCCCTGAATT -/A TAAAAGGGAT 2874 het 2874 ref 87 59 7 21 A 0 1 205892 CASAVA_Build 4 48912718 5D GATTTCTTTT CCTTC/----- AAGGTACAAC 3070 het 3070 ref 82 57 11 18 CCTTC 1 0 205893 CASAVA_Build 4 48912779 1D AATTCCCCAG A/- AAAAATAACA 3070 het 3070 hom 64 23 30 13 A 6 5 205894 CASAVA_Build 4 48914307 4I CTGATCCTTA ----/CTGT CTATTTTCCT 3070 het 3070 ref 84 43 33 8 CTGT 0 1 205895 CASAVA_Build 4 48914803 1D AAAGGAAAAA T/- GTTGTCATGC 3070 het 3070 ref 87 37 38 13 T 1 0 205896 CASAVA_Build 4 48915416 1I TCCAGAATCT -/C ATGTCCTTAT 3070 het 3070 hom 55 23 28 4 C 0 1 205897 CASAVA_Build 4 48915469 1D29M2D GTTTGCAAAA GTCTTAACTCATTCCAAATTTTAAAAATTCAA/-TCTTAACTCATTCCAAATTTAAAAAATTC-- AGTCTCATCT 2202 het 2202 ref 68 67 5 22 N/A 0 0 205898 CASAVA_Build 4 48915793 1D GAAGAATCTG C/- CCCCCCACCC 3070 het 3070 ref 95 49 29 17 C 7 6 205899 CASAVA_Build 4 48917854 3D TAGAAAAAAA AAC/--- ACAGAGAGGA 865 het 865 ref 91 72 4 20 AAC 1 0 205900 CASAVA_Build 4 48920786 1D TTACAAGGCT G/- GTCTTCACTG 2295 het 2295 ref 96 81 6 9 G 2 1 205901 CASAVA_Build 4 48922470 3D CCGAATCTTA TTC/--- TTCTGTCCCT 2394 het 2394 ref 60 43 6 15 TTC 2 1 205902 CASAVA_Build 4 48922560 1I GCCACTATGC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 95 30 50 15 T 8 9 205903 CASAVA_Build 4 48922649 1I TGAAGCTATG -/A AAACGCCTTT 540 het 540 ref 48 40 2 7 A 3 4 205904 CASAVA_Build 4 48924265 1I GAAACTTCAA -/G AAGGCTTCAG 3070 het 3070 ref 79 53 16 10 G 0 1 205905 CASAVA_Build 4 48924396 1I TGAAAAGGGG -/T TTAATTGGCT 3070 het 3070 hom 66 31 25 10 T 2 3 205906 CASAVA_Build 4 48928882 2D CTTCTCACAT TG/-- CAAAATACAA 2783 het 2783 ref 74 53 7 18 TG 1 0 205907 CASAVA_Build 4 48934047 1D GCCAGAAATT A/- AAAAAGTGCT 3070 het 3070 ref 76 55 11 10 A 6 5 205908 CASAVA_Build 4 48934266 1I CACAAGTCAT -/C CATGAAATGC 3070 het 3070 ref 49 33 15 1 C 1 2 205909 CASAVA_Build 4 48934479 3D CTAAAGTATC AAT/--- GATGACTTGG 3070 het 3070 ref 74 58 13 4 AAT 1 0 205910 CASAVA_Build 4 48935162 2D GCTATAACCT AA/-- AAAAAAACAG 2834 het 2834 ref 56 39 7 14 A 9 7 205911 CASAVA_Build 4 48936819 2D AACTTTTCTC TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 65 29 17 19 T 10 8 205912 CASAVA_Build 4 48937501 2D TTTTATTTAT TA/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 102 19 30 53 TA 1 0 205913 CASAVA_Build 4 48938006 3I14M1D ACAAACATTT ---TATTTTTATTTTTAT/TTATTTTTTTATTTTTA- TTTTTTTGAG 1386 het 1386 ref 40 27 3 11 N/A 0 0 205914 CASAVA_Build 4 48938483 1D GCAAATAAAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 62 48 11 3 T 8 7 205915 CASAVA_Build 4 48941295 2D TTAAAACAAT AA/-- CATAATTATT 3070 het 3070 ref 70 49 14 10 A 2 0 205916 CASAVA_Build 4 48945808 1I TATACACCCC -/T CCGTGGTATT 3070 het 3070 ref 74 37 16 21 T 0 1 205917 CASAVA_Build 4 48952278 1D TTTTCGAGAT A/- AATCTTGCTA 2934 het 2934 ref 98 71 7 21 A 3 2 205918 CASAVA_Build 4 48952302 1D ATTGTTTATT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 72 44 10 19 A 7 6 205919 CASAVA_Build 4 48953651 1I TCAAAGTGGA -/T TCTGTTTCCC 3070 het 3070 ref 93 73 8 13 T 1 2 205920 CASAVA_Build 4 48955702 5I TTTTGGGGGG -----/ACTCA ACTCTACTGC 3070 het 3070 ref 100 47 36 17 ACTCA 0 1 205921 CASAVA_Build 4 48961952 3D CATAACAAGA CCC/--- CCCCATCTCT 3070 het 3070 hom 95 35 56 4 C 7 4 205922 CASAVA_Build 4 48963111 1I ATAAAAAAAA -/G TTAGCCAGGT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 G 0 1 205923 CASAVA_Build 4 48969095 2D GAAATGAAAC AG/-- GGGATATTAC 1982 het 1982 ref 29 22 5 2 AG 1 0 205924 CASAVA_Build 4 49003361 1I GCCAAAGGCT -/C CGGCCGCTGA 3070 het 3070 hom 95 13 71 14 C 1 2 205925 CASAVA_Build 4 49004644 6D TGCTACTGCT TTTTCG/------ TTTTCGTTTT 3070 hom 39 het 23 0 14 9 TTTTCG 2 1 205926 CASAVA_Build 4 49004895 1D ATTATAAGTG A/- AAATGTGGCG 3070 het 3070 ref 101 37 18 52 A 4 3 205927 CASAVA_Build 4 49016268 1I ATTTTATGGC -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 84 26 38 20 T 7 8 205928 CASAVA_Build 4 49024757 1D14M1D TGCTGGTGTC AAAAACACAACGTGGA/-AAACCACAACGTGG- GAACCACAGA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 N/A 0 0 205929 CASAVA_Build 4 49184352 1D TAAAATGAAT G/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 76 59 8 12 G 1 0 205930 CASAVA_Build 4 49185202 4D GTATGTTTTG ACTT/---- ACTTAGTTAA 2450 het 2450 ref 104 90 6 10 ACTT 2 1 205931 CASAVA_Build 4 49187642 1D CAAAATATAC A/- AAAAAACTCA 1383 het 1383 ref 95 66 4 26 A 7 6 205932 CASAVA_Build 4 49187667 2I ACTTCACAGT --/AA AAAAAAAAAT 2619 het 2619 ref 89 53 6 30 A 9 11 205933 CASAVA_Build 4 49187712 2D CTAACTATAC TT/-- TTTTTTAGAA 962 het 962 ref 94 71 3 21 T 8 6 205934 CASAVA_Build 4 49188942 1D CATCCCATTT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 81 het 49 1 44 4 A 8 7 205935 CASAVA_Build 4 49189836 1I TGTTAAGACA -/T CAAATGCAAT 3070 het 3070 ref 60 32 25 3 T 0 1 205936 CASAVA_Build 4 49192034 1I TCCTTTCACA -/T AATAAATTCT 3070 het 3070 ref 88 67 10 11 T 0 1 205937 CASAVA_Build 4 49192372 2D85M2I GACGGCATAA CTCTCTGAAAATACTAAAGTTAATGAATTGTATACTTTAAATGAGTGAATTGCATGGCGTGTTCATTATTTCTCAATAAACCTGTTA--/--CTCTGAAAATACTAAAGTTAATGAATTGTATACTTTAAATGAGTGAATTGCATGGTGTGTTCATTATTTCTCAATAAACCTGTTACC TCCCCACCCC 3070 het 3070 ref 70 116 12 10 N/A 0 0 205938 CASAVA_Build 4 49192563 2D CAACATGTCC TT/-- TTTATAGAAA 1617 het 1617 ref 96 89 5 6 T 5 3 205939 CASAVA_Build 4 49192874 1I CCCAAATATA -/T TTTTTTGACT 3070 het 3070 ref 51 23 10 18 T 6 7 205940 CASAVA_Build 4 49192905 1D GGCTGCTGCA G/- GGCCAAGAGA 3070 het 3070 hom 54 16 17 21 G 3 2 205941 CASAVA_Build 4 49192945 2D GGTAGCCCAA TC/-- TCTCCCCTTC 3070 het 3070 ref 67 38 14 15 TC 3 2 205942 CASAVA_Build 4 49197219 1I CATGTTATGT -/A AATTCAACTA 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 A 2 3 205943 CASAVA_Build 4 49197342 1I ATGTGATATA -/C CTTCCAGTGG 3070 het 3070 ref 78 47 21 10 C 1 2 205944 CASAVA_Build 4 49198573 1D ACGGTTTTCC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 8 7 205945 CASAVA_Build 4 49199073 4D GAGGTCTTTC TTTT/---- CACTCTCAAT 3070 het 3070 ref 84 65 13 13 T 4 0 205946 CASAVA_Build 4 49199303 1I TTAGGTCGCT -/A TGGAGAGTTT 2275 het 2275 ref 93 80 6 7 A 0 1 205947 CASAVA_Build 4 49199931 5D ACTCAATAAA ATAAC/----- ATATCATGAT 3070 het 3070 ref 95 53 35 9 ATAAC 1 0 205948 CASAVA_Build 4 49201169 4D TTTCTCTTTC CTTT/---- CTAATTCTTC 1836 het 1836 ref 53 43 4 10 CTTT 1 0 205949 CASAVA_Build 4 49202085 1I CCTCACATTT -/G TCAATGGTAG 3070 het 3070 ref 69 48 15 6 G 0 1 205950 CASAVA_Build 4 49202420 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 40 25 11 4 A 7 6 205951 CASAVA_Build 4 49203846 4D GAAATTATGC TTCT/---- TTCTTACATG 3070 het 3070 ref 58 48 8 2 TTCT 2 1 205952 CASAVA_Build 4 49205579 3D CTTTTTTTTT GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 het 506 hom 33 6 15 12 G 13 10 205953 CASAVA_Build 4 49213181 1I TCTGTCATTT -/A TAAATAGGAC 3070 het 3070 ref 93 46 32 15 A 0 1 205954 CASAVA_Build 4 49215841 1D CGCGGTGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 66 1 29 37 T 11 10 205955 CASAVA_Build 4 49217763 5I TCAGGAATTA -----/GATTT AAGTTCTTAA 3070 het 3070 ref 53 27 16 10 GATTT 0 1 205956 CASAVA_Build 4 49219049 1I34M1I TTGTCAAATG -TTTTTTCTGCACCTGTTGATATAATCATATTAGA-/TTTTTTTCTGCGCCTGTTGATATAATTATATTAGAT TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 99 50 27 79 N/A 0 0 205957 CASAVA_Build 4 49222052 1D AAGTCTTTTA T/- TAATTTAGAA 2029 het 2029 ref 92 79 5 8 T 2 1 205958 CASAVA_Build 4 49226984 1I TACAAAAAGA -/T TTTTTCTAAA 1253 het 1253 ref 56 51 3 2 T 5 6 205959 CASAVA_Build 4 49230261 1I AACTCAAATC -/A ATAGTTCAGC 3070 het 3070 ref 94 51 30 14 A 1 2 205960 CASAVA_Build 4 49233225 1I ACTGAAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 62 34 9 19 T 11 12 205961 CASAVA_Build 4 49233399 3I CCCCTCATTA ---/CTT CTTAAATTAT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 CTT 1 2 205962 CASAVA_Build 4 49233712 1D ATTATTACTC A/- TTATTATTAT 3070 hom 78 het 40 0 27 13 A 1 0 205963 CASAVA_Build 4 49236607 1I GCTAGCAAGA -/T TTATCTCGAA 3070 het 3070 ref 45 28 11 6 T 2 3 205964 CASAVA_Build 4 49238405 1D TCTCTGCCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 84 60 10 14 T 9 8 205965 CASAVA_Build 4 49238798 1D GATTGTCCCA T/- TTTGATCTCA 1577 het 1577 ref 56 46 4 7 T 4 3 205966 CASAVA_Build 4 49244545 1D CTGTTCATAA T/- TTTTAGGGGA 3070 het 3070 ref 94 60 17 18 T 5 4 205967 CASAVA_Build 4 49244919 1D TAGGGAAGAA G/- GGGGATGATA 3070 het 3070 ref 69 37 25 8 G 5 4 205968 CASAVA_Build 4 49245390 1D TAACTCAAAT A/- GGGGAAATGT 2559 het 2559 ref 59 47 6 6 A 1 0 205969 CASAVA_Build 4 49245508 2D TATTTTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1569 hom 98 15 68 15 AT 6 5 205970 CASAVA_Build 4 49245534 2D CTCTCTCTCT AC/-- ATATATATAT 3070 het 585 hom 92 8 70 15 AC 1 0 205971 CASAVA_Build 4 49245824 4D GGAGAAGGCA GACT/---- GAGGAATGTT 1841 het 1841 ref 68 50 5 17 GACT 1 0 205972 CASAVA_Build 4 49246501 1I GGATTAGACA -/C TTTTTACTAG 2568 het 2568 ref 43 30 6 7 C 0 1 205973 CASAVA_Build 4 49247936 4D AAAAATTAAC GAAG/---- TAAGTCAAAA 1584 het 1584 ref 83 72 4 11 GAAG 1 0 205974 CASAVA_Build 4 49248095 1I TCTTACCTTT -/A TAATGTTAGT 1261 het 1261 ref 37 27 3 7 A 0 1 205975 CASAVA_Build 4 49248140 3D CATTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTTTG 159 het 159 ref 45 27 4 14 TTG 1 0 205976 CASAVA_Build 4 49249420 1D45M1D AGGACTCAAC AGAAAATATATTCCCCAAATGCCCATAAGAATTCCTACTTCAAACCG/-GAAAATATATTCCCCAAATGCCCATAAGAATTCCTACTTCAAGCC- TCAGACTTCA 1702 het 1702 ref 71 82 5 1 N/A 0 0 205977 CASAVA_Build 4 49249751 1D TTTAAAATGT C/- TTTAAAAGCT 3070 het 3070 ref 80 58 9 14 C 1 0 205978 CASAVA_Build 4 49250824 1D AAAAGTTAGC A/- AGGGGTGTTG 2147 het 2147 ref 53 40 5 10 A 2 1 205979 CASAVA_Build 4 49250979 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 99 50 31 25 A 8 7 205980 CASAVA_Build 4 49252895 1D TTAAACATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 T 11 10 205981 CASAVA_Build 4 49260103 2D TTGTATTTTG CA/-- ATGTGAGAAG 2214 het 2214 ref 79 66 5 15 CA 1 0 205982 CASAVA_Build 4 49261291 2D GTTATATAAC AG/-- GGGGTGGTAA 1204 het 1204 ref 89 79 3 7 AG 1 0 205983 CASAVA_Build 4 49261797 1D CTGACAAAAG T/- TTAAACACTG 3070 het 3070 ref 83 50 28 5 T 3 2 205984 CASAVA_Build 4 49264878 1D CAGGAAGATG A/- AAGAAATTTT 1823 het 1823 ref 55 47 4 4 A 3 2 205985 CASAVA_Build 4 49267889 5D AATTAATGCT GTGAA/----- GTGAAGTTAT 705 het 705 ref 99 92 3 6 GTGAA 2 1 205986 CASAVA_Build 4 49272233 1D GCTGAAAGAT G/- CACAGGTACA 3070 het 3070 hom 64 28 26 10 G 1 0 205987 CASAVA_Build 4 49274154 1D CCTATTTAGT G/- GGGGGTGGTC 1604 het 1604 ref 64 38 5 22 G 6 5 205988 CASAVA_Build 4 49280403 1I TTAAATGGTT -/A AAAAAAAAAG 2754 het 2754 ref 67 56 6 5 A 9 10 205989 CASAVA_Build 4 49281477 2I TGCTTAACTC --/TT TTTGTTTGTT 2966 het 2966 ref 48 40 7 1 T 3 5 205990 CASAVA_Build 4 49281614 1I CTATGGCTGC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 73 32 21 20 A 7 8 205991 CASAVA_Build 4 49281678 2D TTTTTAAACC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 58 19 22 18 T 11 9 205992 CASAVA_Build 4 49297868 4I AAAGAGCATT ----/AAAG AAAGAATTGT 3070 het 3070 ref 92 72 12 8 AAAG 1 2 205993 CASAVA_Build 4 49298147 3I TGAAATAAGG ---/AAA AACAATACAA 2942 het 2942 ref 61 46 7 8 A 2 5 205994 CASAVA_Build 4 49300584 3D TGATTTAAAA AAG/--- AAGATCAAAA 3070 het 3070 ref 100 79 11 13 AAG 2 1 205995 CASAVA_Build 4 49303748 1D25M1I CTTTTATATA TTTTTTTTCTATTTTTAGTAAAGACA-/-TTTTTTTCTATTTTTAGTAAAGACAG GGTTTCACCA 3070 het 3070 ref 83 42 7 43 N/A 0 0 205996 CASAVA_Build 4 49304152 1D CCATGCTAAA G/- GGAAGCTTAC 1259 het 1259 ref 64 55 3 6 G 3 2 205997 CASAVA_Build 4 49305016 1I CCATTCTATC -/A GGTCAACATT 3070 het 3070 ref 97 58 32 7 A 0 1 205998 CASAVA_Build 4 49305818 10D AGAAAAGAAA AGAAAAGAAT/---------- AGAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 91 50 24 32 AGAAAAGAAT 1 0 205999 CASAVA_Build 4 49306508 2D CTTAAAAAAA AG/-- AAAAAAATTA 3070 hom 9 het 18 0 13 5 AG 1 0 206000 CASAVA_Build 4 49307445 1I CACTCTAAAA -/G TTTCAGACTT 3070 het 3070 ref 71 48 15 8 G 0 1 206001 CASAVA_Build 4 49308846 2I5M3I TCCTCATAAA --AAATA---/ATAAATAAAT AAATAAAATG 1793 het 1793 ref 71 55 4 21 N/A 0 0 206002 CASAVA_Build 4 49309046 1D GAGAGAGAGA G/- AAAATATATA 3070 het 3070 hom 44 11 17 18 G 1 0 206003 CASAVA_Build 4 49309591 1I TTTGGTTTGG -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 48 25 14 10 T 6 7 206004 CASAVA_Build 4 49310866 2D6M1D50M1D TGAAATACCC TGTGAGTCAAAAAAGTATTCACAAGGGGAACTGGAATGTATTTGGAACAAACTTGTTATA/--TGAGTC-AAAAAGTATTCACAAGGGGAACTGGAATGTATTTGGAACAAACTTGTTAT- AAAATCTCAT 3070 het 3070 ref 62 57 16 36 N/A 0 0 206005 CASAVA_Build 4 49310959 3I AAGGTGACAA ---/CAT CTTTCCTGCT 3070 het 3070 ref 64 29 22 13 CAT 0 1 206006 CASAVA_Build 4 49311875 2D24M1D AGGCCAAAGT GAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGGA/--AGAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGG- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 88 76 20 42 N/A 0 0 206007 CASAVA_Build 4 49312982 1D CATGTAAAAA G/- AATAAATTCC 3070 het 3070 ref 83 65 10 10 G 1 0 206008 CASAVA_Build 4 49316894 1D CAAAATCTTA C/- TAAAGATAAC 2380 het 2380 ref 77 63 6 8 C 1 0 206009 CASAVA_Build 4 49318129 1I CAGCAAGGCT -/G GGGGAGGGGC 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 G 4 5 206010 CASAVA_Build 4 49326319 1I AAGTTTATAG -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 42 30 9 3 A 6 7 206011 CASAVA_Build 4 49326979 1D CTCAAAAAAA T/- AAACCTAGAA 3070 het 3070 ref 68 30 25 15 T 1 0 206012 CASAVA_Build 4 49327361 1D AGAAACCCTC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 76 49 18 9 A 9 8 206013 CASAVA_Build 4 49343438 5D TGGAATCGTA CGGAT/----- TGGAATGGAA 793 het 793 ref 87 57 12 22 CGGAT 1 0 206014 CASAVA_Build 4 52356777 1I CACACATCAC -/A AAAAAGTCTC 3070 het 3070 hom 62 15 32 15 A 5 6 206015 CASAVA_Build 4 52363409 1I CACACATCAC -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3055 hom 16 8 7 1 A 6 7 206016 CASAVA_Build 4 52364043 1I CAGCTCTATC -/A AAAGGAAAGT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 3 4 206017 CASAVA_Build 4 52373856 2I TCAAAGACCT --/AA ACAAATATCC 2557 het 2557 ref 57 44 6 7 A 1 3 206018 CASAVA_Build 4 52383084 1D TCACAGAGTT A/- AATCTTTCTT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 3 2 206019 CASAVA_Build 4 52385439 4D TTAAACTGCA TTGT/---- TTAAGACTGT 3070 het 3070 hom 65 25 35 7 TTGT 1 0 206020 CASAVA_Build 4 52409112 4I TAATTTAATA ----/TTTC TTTTTCAAAC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TTTC 0 1 206021 CASAVA_Build 4 52410766 4D ATGTGTGTGT GTGC/---- GTGCGTGTGT 3070 het 3070 hom 53 22 18 14 GTGC 2 1 206022 CASAVA_Build 4 52422852 4D GTTCACGTTT AATA/---- AATATAAATG 3070 het 3070 ref 38 22 16 3 AATA 2 1 206023 CASAVA_Build 4 52438903 4I TGTCCCTGTT ----/AGAC AGAGGGAGAG 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AGAC 0 1 206024 CASAVA_Build 4 52443042 7I CATTGCAAAT -------/TATACTC TAAAATCTTG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TATACTC 0 1 206025 CASAVA_Build 4 52451008 1D GCTTCTCCTT A/- ACTCCCCTGC 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 A 2 1 206026 CASAVA_Build 4 52470198 1I CTGCAAAGGG -/A AAAACTCTTC 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 A 4 5 206027 CASAVA_Build 4 52475747 1D ATTTTATGTC T/- TTTTTTTTTT 2000 het 1237 hom 43 12 9 23 T 19 18 206028 CASAVA_Build 4 52489958 1D ATCCCTTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1785 hom 34 10 14 11 T 15 14 206029 CASAVA_Build 4 52513020 1D GTTTTCCACC A/- GTTGATTGAA 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 A 1 0 206030 CASAVA_Build 4 52524886 1D GCTTATGTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 9 8 206031 CASAVA_Build 4 52537796 1D GCTCAAGAGC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 7 6 206032 CASAVA_Build 4 52551118 1I GGGCGTGGGA -/C CCTCCGAGCC 3070 hom 54 het 21 0 15 6 C 2 3 206033 CASAVA_Build 4 52568268 1I TGTCTGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 T 9 10 206034 CASAVA_Build 4 52586284 2D TTGATAAGGT CA/-- CACATTCCAA 3070 het 3070 ref 61 30 24 7 CA 3 2 206035 CASAVA_Build 4 52617484 1I GCCCCCTGAC -/T TTGTTCAAAC 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 T 2 3 206036 CASAVA_Build 4 52638339 4D TGTTTCCTTC CTCT/---- CTCTCCTTCC 3070 hom 38 het 19 0 13 7 CT 4 2 206037 CASAVA_Build 4 52639032 1D AAAGGGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 36 0 29 7 A 13 12 206038 CASAVA_Build 4 52642751 1I CAATGTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 661 hom 32 2 28 2 T 10 11 206039 CASAVA_Build 4 52644017 3D AACAGCCTTT AAA/--- AAAAAGGAGT 3070 hom 122 het 44 0 40 6 A 8 5 206040 CASAVA_Build 4 52644974 1D AGATCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 38 0 25 14 A 15 14 206041 CASAVA_Build 4 52657685 1D TGTTTTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 461 hom 40 3 21 18 A 13 12 206042 CASAVA_Build 4 52661094 1D TAAGGAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 44 1 31 12 T 12 11 206043 CASAVA_Build 4 52665240 2I AAAAAAATAT --/AG AGTTAATAAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AG 1 2 206044 CASAVA_Build 4 52665747 3I AAATCACTCA ---/CTC CTCATGAAGT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 CTC 1 2 206045 CASAVA_Build 4 52669015 1I AGACAGCAAG -/A CCAACCTCTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 0 1 206046 CASAVA_Build 4 52671737 4I CCATATGATT ----/CATA CCAACTATAT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 CATA 0 1 206047 CASAVA_Build 4 52677017 1I TACCCAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 27 1 22 4 T 12 13 206048 CASAVA_Build 4 52678491 1D CATGATACTC T/- TTCGTTTAAG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 3 2 206049 CASAVA_Build 4 52683439 1I GCTGTGAGAC -/A GGGACATTTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 0 1 206050 CASAVA_Build 4 52684718 3I TACACATTTT ---/TTG TTGTTATTGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTG 1 2 206051 CASAVA_Build 4 52688326 1D TCTGTTTTTG T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 8 7 206052 CASAVA_Build 4 52694465 2D TCAGAAGAAG AC/-- AGGAAGATAA 3070 hom 69 het 26 0 24 5 AC 1 0 206053 CASAVA_Build 4 52705459 1D TTGTTATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 42 0 32 10 T 11 10 206054 CASAVA_Build 4 52708374 1D CTCTCCCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 33 1 17 15 T 15 14 206055 CASAVA_Build 4 52709376 1I ACAGTCCCCC -/T GGCTCTCCAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 0 1 206056 CASAVA_Build 4 52715606 4D CCAGAAACTG TTTT/---- TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 12 8 206057 CASAVA_Build 4 52721220 3D ATTATTCTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 T 13 10 206058 CASAVA_Build 4 52726115 1D TGATTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 8 T 11 10 206059 CASAVA_Build 4 52727174 2D TTTTGTTGTC AT/-- TGCTTTTGGT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AT 1 0 206060 CASAVA_Build 4 52731439 17I CAGCAGAGGC -----------------/TGCAGAACAGCAAATAT TGCTGAACAG 3070 hom 49 het 22 0 14 8 TGCAGAACAGCAAATAT 0 1 206061 CASAVA_Build 4 52732348 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 7 206062 CASAVA_Build 4 52734494 1D TGTAGCTGTA C/- CCCCAAATCC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 5 4 206063 CASAVA_Build 4 52739567 1D52M1I GGAAATTATT AAAAAGAACCAAATAGAAATTCTGTAATTGAAAAGTTTAATAACTGAAATAGT-/-AAAAGAACCAAATAGAAATTCTGTAATTGAAAAGTTTAATAACTGAAATAGTA AAAAAAAAAA 3070 hom 132 het 28 0 45 3 N/A 0 0 206064 CASAVA_Build 4 52742715 4D AAAAAAAAAA AGGG/---- GGGGGGGATT 3070 het 100 hom 18 2 13 5 AGGG 1 0 206065 CASAVA_Build 4 52746182 1D AAGGAAAACA G/- ATTTTTCAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 1 0 206066 CASAVA_Build 4 52747318 4D GTATAGTCAA GTCT/---- GAGAATTATG 3070 het 3070 hom 47 20 25 5 GTCT 1 0 206067 CASAVA_Build 4 52757070 2D AGCAGAGCTC AG/-- AGTTTGCCGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AG 2 1 206068 CASAVA_Build 4 52764282 1I AATTTATGAC -/G TTTTTAAGTG 3070 hom 132 het 48 0 43 5 G 0 1 206069 CASAVA_Build 4 52766360 1D AAAAGTAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 100 het 40 0 34 6 T 9 8 206070 CASAVA_Build 4 52777313 1I TTTCTGCCTT -/C CATTTTGTTA 2102 hom 15 het 8 0 6 2 C 1 2 206071 CASAVA_Build 4 52786812 1I GATCTCCCAT -/G TGTTGGACAA 3070 hom 151 het 52 0 51 1 G 0 1 206072 CASAVA_Build 4 52787665 1I TAGTAGGAGC -/A AGAAAACAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 1 2 206073 CASAVA_Build 4 52797333 1D TATTTATTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 9 8 206074 CASAVA_Build 4 52801092 1I TGATTCAGCA -/T TAAGGACTTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 2 206075 CASAVA_Build 4 52813460 1D CTCCCCTTGA G/- GGGGCCTCTT 3070 hom 123 het 45 0 38 7 G 5 4 206076 CASAVA_Build 4 52815541 1D TTTGTAATGC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 8 206077 CASAVA_Build 4 52819493 20D38M13I GAGCCTTTTA TGTGCACACAGGGCCCCATCTGTGCACACAGGGCCCCATCTATGACACTAGGTGTAGA-------------/--------------------TGTGCACACAGGGCCCCATCTATGACACTAGGTGTGGAGGAGATTGCTGGT GGGCAACTAA 3070 hom 130 het 32 0 42 18 N/A 0 0 206078 CASAVA_Build 4 52823886 3I AGAACAGATC ---/ATG ATAATTACTA 3070 het 3070 hom 56 23 28 5 ATG 0 1 206079 CASAVA_Build 4 52826643 18D ATACCTTTAT GAGGTATACCTTTATGAG/------------------ GTATAACATC 3070 het 3070 ref 47 27 19 5 GAGGTATACCTTTATGAG 1 0 206080 CASAVA_Build 4 52839458 1D AAAAAAAAGG C/- CAGGGGTTGC 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 C 2 1 206081 CASAVA_Build 4 52843016 1D ATACCACATG T/- TCTCACTTAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 2 1 206082 CASAVA_Build 4 52844165 1D ATAATCTCTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 53 26 20 8 T 9 8 206083 CASAVA_Build 4 52854248 2I ACTTTTTGAC --/TG TTTTGTAATA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 TG 0 1 206084 CASAVA_Build 4 52854560 1I CAGTTAACTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 A 8 9 206085 CASAVA_Build 4 52889307 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 8 9 206086 CASAVA_Build 4 52891574 1D ATTTTTCAGC T/- CCCAAATTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 6 T 1 0 206087 CASAVA_Build 4 52893624 4D TATTGTAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 AAAT 5 4 206088 CASAVA_Build 4 52894934 1D AGTTTATAAT A/- AAAAAAAATA 2408 het 2408 ref 26 11 8 7 A 9 8 206089 CASAVA_Build 4 52895926 4I CAGCAAATCC ----/CTAT CTATCATAAA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 CTAT 1 2 206090 CASAVA_Build 4 52896037 1I TCAAAATGTT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 7 8 206091 CASAVA_Build 4 52896627 1D TACACAAATA G/- ATTATTGGCC 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 G 1 0 206092 CASAVA_Build 4 52896708 2I2M1I CCAAAAATTA --GA-/ATGAC CTCTTCATCA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 N/A 0 0 206093 CASAVA_Build 4 52897115 4D GTAAATATTC TGTT/---- TGTTAGAGGT 3070 het 3070 ref 45 28 11 8 TGTT 2 1 206094 CASAVA_Build 4 52912604 8I GCAGACCCTG --------/CACTTGAC CACTTGACGG 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 CACTTGAC 1 2 206095 CASAVA_Build 4 52921534 1D CAATGAAGAG T/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 T 7 6 206096 CASAVA_Build 4 52926303 1I TCAAAAAAAA -/T AACAAATAAA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 T 0 1 206097 CASAVA_Build 4 52937428 3D CAGACAGTCA TTT/--- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 T 11 8 206098 CASAVA_Build 4 52939859 12I ATACGCAAGT ------------/ATCAACAGCCGA ATCAACCGAG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 ATCAACAGCCGA 0 1 206099 CASAVA_Build 4 52957594 3D GTCTGTATAT CCA/--- CTTGGATGAA 90 het 90 ref 28 17 2 11 CCA 1 0 206100 CASAVA_Build 4 52957643 3D AATTAAACTG TTT/--- GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 9 T 3 0 206101 CASAVA_Build 4 52978395 1I ACAAAAAGCA -/G GGGGAGACAA 3070 het 3070 hom 57 20 29 8 G 4 5 206102 CASAVA_Build 4 52978672 1I CCTGCAGTAA -/G GAGTAAGGAG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 1 2 206103 CASAVA_Build 4 52979803 2D ACTACCTCAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 15 12 13 AC 10 9 206104 CASAVA_Build 4 52986415 1D ACCATTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 14 11 A 12 11 206105 CASAVA_Build 4 52996697 1I AAAAAGAAAA -/C CCAATAAACA 3070 het 3070 hom 18 9 8 1 C 2 3 206106 CASAVA_Build 4 53173131 1D ACACTAATTG A/- AAAAACTAGG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 6 5 206107 CASAVA_Build 4 53238724 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 27 0 13 14 T 15 14 206108 CASAVA_Build 4 53283369 1D GGGCGGTCCT G/- GGGGGGGGGT 2054 het 13 hom 18 1 11 6 G 10 9 206109 CASAVA_Build 4 53316889 1I AATGGAGATC -/T TTTTTTTTTT 2015 het 2015 ref 26 13 9 4 T 14 15 206110 CASAVA_Build 4 53436379 1I CACAGCCCAC -/A ATCCCTTGGA 3070 het 3070 hom 43 18 13 12 A 1 2 206111 CASAVA_Build 4 53437076 1I TGGCCAGATG -/C CCTCCAGAAA 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 C 2 3 206112 CASAVA_Build 4 53441212 1D TGCAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 2352 het 2192 hom 17 7 7 3 T 14 13 206113 CASAVA_Build 4 53441541 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2674 het 1524 hom 23 7 10 6 A 15 14 206114 CASAVA_Build 4 53469601 1I ATTTTTTTTT -/A ACTCAAATTT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 1 2 206115 CASAVA_Build 4 53479089 1D TGGAGTCACA G/- GGCTGAGGAC 3070 hom 95 het 35 0 29 7 G 3 2 206116 CASAVA_Build 4 53488230 1D ACTAAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 2141 het 2141 ref 25 15 5 5 T 13 12 206117 CASAVA_Build 4 53489833 1D AAATCAGACC A/- AAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 7 6 206118 CASAVA_Build 4 53517835 1I AGGGGAAAAG -/A AAACAGGGAT 2574 het 2574 ref 43 22 8 13 A 3 4 206119 CASAVA_Build 4 53519002 2I CAGGAGAAAT --/AA AGTCAGACAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 1 3 206120 CASAVA_Build 4 53522486 1D AGTGGGAAAA C/- CAGCCTCCCT 3070 het 3070 ref 59 31 20 8 C 2 1 206121 CASAVA_Build 4 53546733 2I CAGATGACAC --/TT TGCAATTCCA 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 T 1 3 206122 CASAVA_Build 4 53547154 1I AAGGGTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 10 11 206123 CASAVA_Build 4 53585629 1I GTCTCAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 33 3 15 15 T 13 14 206124 CASAVA_Build 4 53586475 1I TTTCACTGCC -/A AAGTAGGACT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 2 3 206125 CASAVA_Build 4 53586885 3I TTATGTTCTT ---/ATC ATGTACTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATC 0 1 206126 CASAVA_Build 4 53590164 1D AAAATCTTAC G/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 G 1 0 206127 CASAVA_Build 4 53605560 4I TCCCTCCCTC ----/CTTT CTTTTTTCCT 3070 hom 87 het 39 0 28 11 CTTT 1 2 206128 CASAVA_Build 4 53606850 1I TTGTGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 915 hom 28 2 23 3 A 10 11 206129 CASAVA_Build 4 53620539 1D CTCCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 37 0 29 9 T 11 10 206130 CASAVA_Build 4 53625362 1D AATGGAAGGG T/- GGAGACTTAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 1 0 206131 CASAVA_Build 4 53634661 1D GTTGCATGAA T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 8 7 206132 CASAVA_Build 4 53652291 2D AAACTAGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 13 11 206133 CASAVA_Build 4 53654679 1D AAGGTAATAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 8 7 206134 CASAVA_Build 4 53656336 2D CATAATCTGC TA/-- TATATATATA 3070 hom 141 het 52 0 46 8 TA 7 6 206135 CASAVA_Build 4 53656758 10I ACTCGTCATT ----------/TATATAGGTA TACATTAGGT 2451 hom 12 het 6 0 5 1 TATATAGGTA 0 1 206136 CASAVA_Build 4 53663790 7I AATGTAAAAC -------/AATAAGG AATAAGGTAC 3070 hom 63 het 30 0 22 8 AATAAGG 1 2 206137 CASAVA_Build 4 53702570 1D40M2I GTCAAATTTG AAAAAAAAAAAAACATTAAATCAGTTAGAACTCTTTGAAAG--/-AAAAAAAAAAAACATTAAATCAGTTAGAACTCTTTGAAAGTC TCTACACATT 3070 hom 114 het 33 0 38 10 N/A 0 0 206138 CASAVA_Build 4 53727757 1D AATGCCCACC A/- AAAAAAAAAA 2928 het 2928 ref 40 21 10 10 A 16 15 206139 CASAVA_Build 4 53728687 1I GAAAGAGGAG -/C AGTTCTTTCT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 C 0 1 206140 CASAVA_Build 4 53735878 1D GTTTTGCATG T/- TTGTGACGGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 3 2 206141 CASAVA_Build 4 53738362 4D GGTTTATTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 72 het 28 0 24 6 TTTG 5 4 206142 CASAVA_Build 4 53744589 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 11 10 206143 CASAVA_Build 4 53751154 1I TACTTGACTA -/G CTGAGAAACA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 G 0 1 206144 CASAVA_Build 4 53764445 1I AAAGAAAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 24 12 12 0 A 8 9 206145 CASAVA_Build 4 53772166 1D ACTCCATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 35 2 25 8 A 15 14 206146 CASAVA_Build 4 53783552 1D CCAAATAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 10 9 206147 CASAVA_Build 4 53803394 1I ATAAAAGAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 8 9 206148 CASAVA_Build 4 53818706 3D TTCAAATGAT ATC/--- ATAGTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ATC 1 0 206149 CASAVA_Build 4 53845478 2D GAATGGACAG AT/-- GTGTATTTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 3 AT 1 0 206150 CASAVA_Build 4 53872567 1I TTGATTCACA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 991 hom 30 4 21 5 T 0 1 206151 CASAVA_Build 4 53878031 1D ACTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 2277 het 2277 ref 27 12 6 9 A 17 16 206152 CASAVA_Build 4 53880476 3D TTTTTTTTTT AGA/--- AGGAGTCTCG 3070 het 50 hom 22 1 15 6 AGA 1 0 206153 CASAVA_Build 4 53882085 1I CAAATAGCTC -/T TTTAAGGTCT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 3 4 206154 CASAVA_Build 4 53886461 1I ATTTTATCAA -/T TGCAAATGGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 206155 CASAVA_Build 4 53897966 1D GATGGGTGTA T/- TAGTCTACTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 2 1 206156 CASAVA_Build 4 53907051 5D ATAAATAAAA GAAAT/----- AAGATATTTA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 GAAAT 1 0 206157 CASAVA_Build 4 53915785 1D TCATAGCTCA C/- TGTAGCCTTG 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 1 0 206158 CASAVA_Build 4 53923609 1I AAAATAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 42 2 28 12 A 11 12 206159 CASAVA_Build 4 53925656 2D CCAACAAACC AG/-- AGTCTTCTTA 3070 hom 151 het 55 0 51 6 AG 2 1 206160 CASAVA_Build 4 53928343 1I CTAAAAGTAC -/A AAAAAATAGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 6 7 206161 CASAVA_Build 4 53928497 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 15 1 12 2 A 14 13 206162 CASAVA_Build 4 53929508 2D ACATAAAAGT CA/-- CACCATCTTA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 CA 2 1 206163 CASAVA_Build 4 53937532 10D AACAAACAAA AAACCTAGAC/---------- AAACCTAGAG 3070 hom 69 het 26 0 23 4 AAACCTAGAC 1 0 206164 CASAVA_Build 4 53941102 5D AACTTGTACG TGAAT/----- ATTCATAGCA 3070 hom 123 het 45 0 42 5 TGAAT 1 0 206165 CASAVA_Build 4 53942678 12D ATTTGCATTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 1883 het 110 hom 24 2 6 17 T 24 12 206166 CASAVA_Build 4 53944600 1I CAGAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 599 het 599 ref 33 23 3 7 A 11 12 206167 CASAVA_Build 4 53949269 1D TACTGATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 30 0 21 9 T 13 12 206168 CASAVA_Build 4 53950380 1D CAAGTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 11 10 206169 CASAVA_Build 4 53956844 1I TATTTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 29 1 22 6 T 13 14 206170 CASAVA_Build 4 53957332 1D AATTAGAATC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 69 het 27 0 23 7 T 9 8 206171 CASAVA_Build 4 53957842 1I AGATTGAGCA -/T TTTTTTAACA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 6 7 206172 CASAVA_Build 4 53959562 1I TGTGATATTA -/T TTTAAGTGTA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 3 4 206173 CASAVA_Build 4 53971896 1D AGAATAAGGT G/- GGGGGGGCTG 3070 hom 79 het 33 0 26 7 G 8 7 206174 CASAVA_Build 4 53975463 1D GCATGTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 37 2 23 13 A 13 12 206175 CASAVA_Build 4 53989520 3D TTCAGTCTGG TCT/--- TCTTCTGTAT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 TCT 3 2 206176 CASAVA_Build 4 53994442 1D TTGATGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 900 hom 31 2 21 8 T 11 10 206177 CASAVA_Build 4 53996751 2D GATGATACAC GT/-- GTGTGTGCGT 3070 hom 81 het 32 0 28 6 GT 4 3 206178 CASAVA_Build 4 53997002 1I ATAGGAAGCG -/T TAGTTTACAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 1 2 206179 CASAVA_Build 4 54004297 2D AGGCTACTGA AT/-- ATAAAGTGCA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 AT 2 1 206180 CASAVA_Build 4 54005098 1D TTAAAGCAAT A/- AAAACGTGTT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 5 4 206181 CASAVA_Build 4 54017470 9D AAGGCTGGTA TTTTAGCAG/--------- TATGGCATGT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 TTTTAGCAG 1 0 206182 CASAVA_Build 4 54020980 4D CTATGAAATA AATT/---- AATTAATTAC 3070 hom 75 het 32 0 25 9 AATT 3 2 206183 CASAVA_Build 4 54021790 2I CTTCTTAGCC --/TA TATTTGTGAT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 TA 1 2 206184 CASAVA_Build 4 54023280 4I ACAGGCCAAG ----/TGTT TGTTAACTAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TGTT 1 2 206185 CASAVA_Build 4 54024563 3I TAGGCCTATC ---/GAA GAAGATTTGG 3070 hom 99 het 44 0 34 10 GAA 1 2 206186 CASAVA_Build 4 54025413 31I CAACATGAAA -------------------------------/AAGAACTATAAAAACTACGCATTGTTCATTT AAGATGTTTA 3070 hom 42 het 16 0 15 3 AAGAACTATAAAAACTACGCATTGTTCATTT 0 1 206187 CASAVA_Build 4 54027081 1D TTGTTTTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 38 1 32 6 A 10 9 206188 CASAVA_Build 4 54035699 1I CTACTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 33 4 T 10 11 206189 CASAVA_Build 4 54035996 2I CCAGCCCAGA --/CT CTACTTCCAG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CT 1 2 206190 CASAVA_Build 4 54040562 4D AGATGACTTT TCTA/---- TCTATCTTTT 3070 hom 148 het 56 0 50 10 TCTA 2 1 206191 CASAVA_Build 4 54051064 1I TCATATAAGG -/A AAAAAACAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 6 7 206192 CASAVA_Build 4 54057413 1I TCCTGTCTTT -/A AAAGACTGCT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 3 4 206193 CASAVA_Build 4 54063238 1D GAGATATTGT G/- GGTTTGGTTC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 3 2 206194 CASAVA_Build 4 54063859 1D TGGTCATATC T/- TTTTTTTTTT 2293 hom 34 het 17 0 11 6 T 15 14 206195 CASAVA_Build 4 54066190 1I TCAAGATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 17 1 10 7 T 13 14 206196 CASAVA_Build 4 54069356 1I TAATTTGAGA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 55 het 22 0 19 3 T 6 7 206197 CASAVA_Build 4 54069865 1I TCCATGCTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 9 10 206198 CASAVA_Build 4 54073158 10I AATTTGGAAG ----------/CAAAAATCTA TTTTTCAATG 3070 hom 93 het 31 0 31 1 CAAAAATCTA 0 1 206199 CASAVA_Build 4 54073303 1D TCTGGTAATT A/- AAAAAAACTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 7 206200 CASAVA_Build 4 54074029 1D ATACCAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 29 0 22 7 T 11 10 206201 CASAVA_Build 4 54075422 1I GGGCTTGTGT -/G GGGGAACTCT 3070 hom 75 het 30 0 24 10 G 4 5 206202 CASAVA_Build 4 54075586 2I TTGGGTGAGG --/AC ACAGTCAAAC 3070 hom 133 het 51 0 44 7 AC 1 2 206203 CASAVA_Build 4 54080591 4I7M4D TCTGACACAC ----ACACACATGCG/TCTGACACACA---- CGCACATGCA 2682 het 2682 ref 47 16 11 23 N/A 0 0 206204 CASAVA_Build 4 54082903 1I TTTTCATTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 T 7 8 206205 CASAVA_Build 4 54087034 2I TCTAGAAAAG --/AA AAAAAATATT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 6 8 206206 CASAVA_Build 4 54089605 1D CTGTGGATAA G/- GGGGGGACTA 3070 hom 111 het 45 0 36 10 G 7 6 206207 CASAVA_Build 4 54090878 1I CAGAGACTAG -/A AAAAAATGTA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 6 7 206208 CASAVA_Build 4 54095345 2I GGAGGGTCTC --/TT GAGCCTAGGA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 0 2 206209 CASAVA_Build 4 54096035 1I AGCACCAATG -/T TTTTCTCTCT 3070 hom 66 het 44 1 40 3 T 4 5 206210 CASAVA_Build 4 54096471 5D TTTATCATTC TATTT/----- TGTTAGTGAA 3070 hom 90 het 34 0 30 8 TATTT 1 0 206211 CASAVA_Build 4 54097255 3I TCACTCCACA ---/TCT TCTTCAAGAG 3070 hom 108 het 42 0 35 7 TCT 1 2 206212 CASAVA_Build 4 54100313 1I TTTTTGAGAC -/A CTGTCTCACT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 0 1 206213 CASAVA_Build 4 54102073 1I AAAAAAAAGA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 18 1 12 5 G 0 1 206214 CASAVA_Build 4 54102669 1D GTCTGAGTCA T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 T 2 1 206215 CASAVA_Build 4 54104453 1D GGAAAAGAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 9 8 206216 CASAVA_Build 4 54108843 1I GAACCTGACA -/G GGGACCTACC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 3 4 206217 CASAVA_Build 4 54109046 1I GTGATGGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 936 hom 29 3 15 11 A 13 14 206218 CASAVA_Build 4 54113753 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1499 het 286 hom 14 1 6 7 A 17 18 206219 CASAVA_Build 4 54135374 1D TCAGGACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 166 hom 39 1 35 3 A 10 9 206220 CASAVA_Build 4 54135906 1D TAGATATTTC G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 19 0 18 1 G 1 0 206221 CASAVA_Build 4 54143021 12I TAGAAACCTA ------------/AGTAGGGAGAGT AGAATATCAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AGTAGGGAGAGT 0 1 206222 CASAVA_Build 4 54151440 10I GCTGTCAAGA ----------/ACAGAAGTAG TACAGGCTGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 ACAGAAGTAG 0 1 206223 CASAVA_Build 4 54156900 1I TCTACAAAAA -/G CCTCTTTGGC 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 G 0 1 206224 CASAVA_Build 4 54173630 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2812 het 1523 hom 19 5 9 5 T 12 13 206225 CASAVA_Build 4 54175905 4I AATTTGTTCA ----/TCTG TCTTTGAACA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 TCTG 0 1 206226 CASAVA_Build 4 54177646 4I ATCAATATGC ----/CAGT CATTCACTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 CAGT 0 1 206227 CASAVA_Build 4 54192632 1D ATATTTTTTT A/- ATGCCCTAGG 2575 het 2575 ref 33 22 7 4 A 2 1 206228 CASAVA_Build 4 54229207 6D ATTTTATGTC TTGGGG/------ TTGGGGTTGC 1455 het 1455 ref 24 10 4 10 TTGGGG 2 1 206229 CASAVA_Build 4 54230790 1D CTGGGGTATG A/- AAAAAACTGT 3070 het 3070 ref 42 25 15 3 A 7 6 206230 CASAVA_Build 4 54231871 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 15 12 1 T 9 8 206231 CASAVA_Build 4 54233707 2I AGACACAGCC --/AG GAAATATAAA 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 AG 0 1 206232 CASAVA_Build 4 54264528 1I CTTAACTCAT -/A AAAATAAAAC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 4 5 206233 CASAVA_Build 4 54279870 3I TCTTGGACTT ---/CTC AGCCTCCAGA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 CTC 0 1 206234 CASAVA_Build 4 54293590 1I TTTCTGATAC -/A AGGTTAGAAT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 1 2 206235 CASAVA_Build 4 54305330 4D GTAGTGCATG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 54 18 13 26 CA 11 9 206236 CASAVA_Build 4 54311672 1D AGTGGGGGTT G/- GGGGGTTGGC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 G 6 5 206237 CASAVA_Build 4 54312413 1D CATACACCAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 59 31 20 10 A 9 8 206238 CASAVA_Build 4 54335524 2I CCCAAAAACT --/CA CACACACACA 2675 het 2675 ref 36 14 10 12 CA 7 8 206239 CASAVA_Build 4 54337433 1D TTTCCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2997 hom 33 13 12 8 A 15 14 206240 CASAVA_Build 4 54339630 1I ATATTTTAAA -/T TTTTCTCACT 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 T 4 5 206241 CASAVA_Build 4 54346063 1I TTGGCCAAAG -/A AAAAACCTGA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 5 6 206242 CASAVA_Build 4 54353594 11D TTAAAAGGAA CAAAAACTTTC/----------- CAAGGACTCC 3070 hom 54 het 19 0 19 4 CAAAAACTTTC 1 0 206243 CASAVA_Build 4 54355163 3D ACTATCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2151 het 305 hom 35 5 12 19 T 21 18 206244 CASAVA_Build 4 54356171 1D AAAAAGCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 9 8 206245 CASAVA_Build 4 54369472 1I ATGGGAATTG -/A AAAAAAATGG 982 hom 15 het 34 0 6 28 A 7 8 206246 CASAVA_Build 4 54371842 1D ACAGATAGGA G/- CCAGGTTAGA 3070 hom 91 het 36 0 31 6 G 1 0 206247 CASAVA_Build 4 54373658 1D TGTAGTCACA G/- GGCCCAAATT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 3 2 206248 CASAVA_Build 4 54378039 1D TGGGCCTGTA C/- CCCCAACTCA 3070 hom 138 het 50 0 43 7 C 5 4 206249 CASAVA_Build 4 54381768 1D TTAAGTTTTG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 7 206250 CASAVA_Build 4 54397962 1I GAGACACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 9 10 206251 CASAVA_Build 4 54401766 1D AGAAGACAGA G/- GGTTGGTCTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 G 3 2 206252 CASAVA_Build 4 54420101 1I ATCCTTGACA -/T TCCTGGGCAC 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 T 1 2 206253 CASAVA_Build 4 54432713 1I TAACAATTGA -/C CATTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 C 1 2 206254 CASAVA_Build 4 54437357 1I AAAAAAAAAA -/G AAGAAGAAGA 3070 het 406 hom 26 1 15 10 G 0 1 206255 CASAVA_Build 4 54437766 1I TGGGTCTTGC -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 5 6 206256 CASAVA_Build 4 54444544 1D TTTAGCAGGA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 8 7 206257 CASAVA_Build 4 54444753 1I TTTCTTTACG -/T TTTTTTGTGC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 6 7 206258 CASAVA_Build 4 54444945 1D CATTTTTTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 10 9 206259 CASAVA_Build 4 54447325 5D TTTGTAGCAC ATCCA/----- GTGCTACAAA 3070 hom 105 het 42 0 35 9 ATCCA 1 0 206260 CASAVA_Build 4 54447842 1I ATAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 9 10 206261 CASAVA_Build 4 54462130 1I TCCTTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 34 1 26 7 A 10 11 206262 CASAVA_Build 4 54477482 5D2M4D ACTGAGCAAC ATCCATGGACA/-----TG---- TCCATGGGAC 3070 het 3070 ref 52 29 25 4 N/A 0 0 206263 CASAVA_Build 4 54478482 1D ATGTAGTAGG T/- GCTCAATAAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 T 1 0 206264 CASAVA_Build 4 54480461 1D AAAAAAACCC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 A 8 7 206265 CASAVA_Build 4 54502029 1D ACGGACAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 712 hom 25 4 14 7 A 12 11 206266 CASAVA_Build 4 54521712 1I GGGTAGAGAC -/G AAGAAGAGGC 3070 hom 39 het 26 0 14 12 G 0 1 206267 CASAVA_Build 4 54542814 2I TGGGATAAGA --/CT CTCATCAGCA 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 CT 1 2 206268 CASAVA_Build 4 54564467 1I AAAACTGGGG -/A AAAAAAAAAA 2659 het 2659 ref 28 13 6 9 A 11 12 206269 CASAVA_Build 4 54566750 1D ATATGCCATT G/- GGGTGGGGGA 3070 het 3070 hom 54 23 25 7 G 4 3 206270 CASAVA_Build 4 54580169 1I ACCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 11 15 0 A 9 10 206271 CASAVA_Build 4 54580820 1I TATTATTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 9 10 206272 CASAVA_Build 4 54595329 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 12 11 206273 CASAVA_Build 4 54597716 1I CCACAACCAC -/A AAAAAAAAAG 1290 het 1290 ref 21 10 6 5 A 9 10 206274 CASAVA_Build 4 54613048 3I CTGCCAAAAC ---/CTT CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 CTT 1 2 206275 CASAVA_Build 4 54637875 20D AAGGAATCAT TTGTACTGATAAATAAACAA/-------------------- TTAAAAATTT 1595 het 1595 ref 27 14 7 14 TTGTACTGATAAATAAACAA 1 0 206276 CASAVA_Build 4 54645418 1I GAAAAATTAC -/A AAAAAAAAAA 1935 het 1935 ref 38 26 7 5 A 10 11 206277 CASAVA_Build 4 54655982 1D CCACCCCCCA C/- CCCCCTCTCC 3070 hom 61 het 24 0 19 5 C 6 5 206278 CASAVA_Build 4 54656804 1D GAAGAAGAAA G/- GGGGGGGGGC 3070 hom 9 het 25 0 16 9 G 10 9 206279 CASAVA_Build 4 54664221 2D GGGCAACTGG CT/-- CTCTCCTCAG 3070 het 3070 ref 29 13 13 4 CT 3 2 206280 CASAVA_Build 4 54682242 6D GTGTATGATA TATAAG/------ TATATGATTT 3070 het 3070 ref 45 23 21 4 TATAAG 1 0 206281 CASAVA_Build 4 54683785 1D GAGGGCTGTA T/- TCTGGATAAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 2 1 206282 CASAVA_Build 4 54687258 2D ACCCAATAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1598 hom 24 6 10 8 T 16 14 206283 CASAVA_Build 4 54688401 1I AAAATTAGCA -/G GGTGTAGTGG 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 G 2 3 206284 CASAVA_Build 4 54688984 1I TATTTTTAGG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 8 9 206285 CASAVA_Build 4 54690337 1I AGTCTTTAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 16 19 0 T 9 10 206286 CASAVA_Build 4 54693146 1D GTGGCTAGAA G/- AGGACTATTA 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 G 1 0 206287 CASAVA_Build 4 54696872 1D ACTCAATGGT A/- AAAAAAAAAA 2345 het 2345 ref 22 10 6 6 A 15 14 206288 CASAVA_Build 4 54702822 1D TGCTGAAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 35 het 23 0 19 4 A 10 9 206289 CASAVA_Build 4 54703245 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1502 hom 20 4 13 5 A 13 12 206290 CASAVA_Build 4 54706328 3D ATGCATATCT TGG/--- TGGAAATCTG 3070 het 3070 ref 50 27 20 5 TGG 2 1 206291 CASAVA_Build 4 54707391 2D AATTTTTTTT TC/-- TTTTTTCAGA 2039 het 2039 ref 23 9 7 8 TC 1 0 206292 CASAVA_Build 4 54707741 2I GGAAATTTGC --/AA AGAGTTGAGG 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 1 3 206293 CASAVA_Build 4 54708355 1D TACTTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 10 206294 CASAVA_Build 4 54709009 4D GAAGCAGGAG AATC/---- GCTTGAACCC 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 AATC 1 0 206295 CASAVA_Build 4 54719885 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 TA 7 8 206296 CASAVA_Build 4 54720625 1I CTAGGTATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2718 hom 24 8 11 5 T 12 13 206297 CASAVA_Build 4 54745513 5D AGATTGAAAA TAAAT/----- TAAAAAGGAA 3070 hom 90 het 31 0 31 1 TAAAT 1 0 206298 CASAVA_Build 4 54760974 1D TCTTTTTATA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 2796 hom 19 7 10 2 T 9 8 206299 CASAVA_Build 4 54762962 1I AAATGATCAG -/T TTTCATGATG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 3 4 206300 CASAVA_Build 4 54782863 1D TTCCGGGGGG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 8 7 206301 CASAVA_Build 4 54783600 1D TCCTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 2393 het 2386 hom 40 12 8 21 T 15 14 206302 CASAVA_Build 4 54824919 1D GCGTGTAGGA T/- TTTTTTTTTT 2624 het 2624 ref 24 13 6 6 T 15 14 206303 CASAVA_Build 4 54825759 1D GGGTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 1876 het 1876 ref 34 17 6 11 A 17 16 206304 CASAVA_Build 4 54830734 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2010 het 1253 hom 14 6 7 1 T 13 12 206305 CASAVA_Build 4 54841164 14I CCTGGCACAT --------------/TGTAGGTCCCCCAG AATCATCATC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TGTAGGTCCCCCAG 0 1 206306 CASAVA_Build 4 54846716 1I GTGATGCTAT -/A TCAGCTACAG 3070 hom 135 het 54 0 44 10 A 0 1 206307 CASAVA_Build 4 54852446 1I CAAGCATATG -/A AAAAAATGCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 6 7 206308 CASAVA_Build 4 54852774 1I AGCACTATTC -/A ACGATAGCAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 206309 CASAVA_Build 4 54857292 2D TTTGCAGAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 179 hom 45 3 11 31 T 16 14 206310 CASAVA_Build 4 54868090 1I AGTACTTCAA -/T AACTTATGGA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 0 1 206311 CASAVA_Build 4 54870499 5D TATTTATAAG TTATA/----- TATTTCATGT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 TTATA 1 0 206312 CASAVA_Build 4 54870635 3I GATGTAGACA ---/ATG ATGTTAACTG 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 ATG 1 2 206313 CASAVA_Build 4 54871076 3I ACAAATAAAA ---/AAT AATAATACAG 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 AAT 2 3 206314 CASAVA_Build 4 54885116 1I CTCCACAACA -/T ATGCCTATCA 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 T 0 1 206315 CASAVA_Build 4 54894040 1D GCACTGCCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 10 9 206316 CASAVA_Build 4 54895143 4D TTATATATAT TAGA/---- TATATAGCTA 1254 het 1254 ref 14 10 4 1 TAGA 1 0 206317 CASAVA_Build 4 54906326 10D TTGACAAAAT CCAGTATTGC/---------- TTTATGATTA 3070 hom 84 het 28 0 29 0 CCAGTATTGC 1 0 206318 CASAVA_Build 4 54909726 1I TGCCTTCATC -/A AAAGGACTAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 3 4 206319 CASAVA_Build 4 54918636 18D GTGTTTGCAA TTTTCCTCCAATCTAGTG/------------------ TTTGGAAGAG 3070 hom 105 het 35 0 35 5 TTTTCCTCCAATCTAGTG 1 0 206320 CASAVA_Build 4 54922257 1D AGTACTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 A 13 12 206321 CASAVA_Build 4 54923246 1D TTTTTTTTTT A/- AAAGAAATAA 3070 hom 56 het 26 0 19 7 A 4 3 206322 CASAVA_Build 4 54930904 26I ATAGGAGTAA --------------------------/TTAATCATAAGCGTTTTTTTTTTTGC TTACCTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTAATCATAAGCGTTTTTTTTTTTGC 0 1 206323 CASAVA_Build 4 54936059 1I AACTCTGCAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 932 hom 43 3 32 8 T 8 9 206324 CASAVA_Build 4 54946774 1D CATGAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 912 hom 42 4 33 6 A 12 11 206325 CASAVA_Build 4 54957858 8D AACTACGAAT TTATCCTA/-------- TTATCCTATG 3070 hom 98 het 40 0 31 11 TTATCCTA 2 1 206326 CASAVA_Build 4 54965054 3I CCCTGGGGTG ---/TGA TGGTGTCAAC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 TGA 0 1 206327 CASAVA_Build 4 54966416 1I TTCACGTGTG -/T TGAAACCTGG 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 1 2 206328 CASAVA_Build 4 54969432 2D AAGAAGTAAG AA/-- AATTGACTTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 4 2 206329 CASAVA_Build 4 54975148 1I TTTAGTATAC -/T TTTTTTATTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 6 7 206330 CASAVA_Build 4 54980375 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 11 12 206331 CASAVA_Build 4 54995678 1D CTCAGGGCAC G/- GGGGGAAAAG 3070 het 3070 hom 27 14 10 3 G 6 5 206332 CASAVA_Build 4 54995882 1D TTGCAGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 11 10 206333 CASAVA_Build 4 55004023 1I TTGCTCTTTA -/T TTTTTTTTTC 1348 het 1348 ref 42 31 3 8 T 9 10 206334 CASAVA_Build 4 55008775 2D CTTTTCACAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 34 0 23 12 A 14 12 206335 CASAVA_Build 4 55020223 1D ACTGCAACTC A/- ACAAGGCCTA 3070 hom 93 het 37 0 31 8 A 2 1 206336 CASAVA_Build 4 55020804 5I TTATGCCTGT -----/CTTTA CTTTAATTTC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 CTTTA 1 2 206337 CASAVA_Build 4 55021447 9I TTGAAGCATG ---------/TGATCTTTT TTCAAAGGCC 3070 hom 21 het 11 0 8 3 TGATCTTTT 0 1 206338 CASAVA_Build 4 55024706 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 84 het 29 0 28 1 A 8 7 206339 CASAVA_Build 4 55027564 11D TCTTTTATTT TCCTTTTATCC/----------- GCCTGTTGTG 3070 hom 34 het 16 0 11 5 TCCTTTTATCC 1 0 206340 CASAVA_Build 4 55039996 2I TCTCTCTCTC --/TT CTCACTCTCA 3070 hom 38 het 26 0 13 13 T 0 2 206341 CASAVA_Build 4 55043294 1D TTCCCTTCTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 9 8 206342 CASAVA_Build 4 55056092 1I AGAGAGGTGC -/T TTAGTAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 3 206343 CASAVA_Build 4 55059376 1I GTTTCGTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 27 1 25 1 A 9 10 206344 CASAVA_Build 4 55062940 2D ACCCTTAATG AC/-- ACACACACAC 1213 het 1213 ref 37 24 3 10 AC 7 6 206345 CASAVA_Build 4 55085107 1I TATTTTGGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 10 206346 CASAVA_Build 4 55162725 1I ACCCTTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 10 11 206347 CASAVA_Build 4 55167272 1I TAGTTGTGCT -/G CAGCTGGTTC 3070 hom 68 het 25 0 22 3 G 0 1 206348 CASAVA_Build 4 55169892 4D AATTTTTATA TAGT/---- TAAAGTTTTC 3070 het 3070 ref 39 21 17 2 TAGT 1 0 206349 CASAVA_Build 4 55220938 1I AAACGCAGTG -/T CCTCCAGAGT 3070 hom 117 het 46 0 38 8 T 0 1 206350 CASAVA_Build 4 55230135 1I TAAAAGAGGA -/C CCCCCCCCCC 1923 het 726 hom 19 2 5 12 C 10 11 206351 CASAVA_Build 4 55243992 2D ACCTTCCGAT GG/-- GGCCTATGTG 3070 het 3070 ref 56 33 20 5 G 4 2 206352 CASAVA_Build 4 55268823 2D AAGAGGAGAC AG/-- AGGTACAGAG 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 AG 2 1 206353 CASAVA_Build 4 55271531 3I GTGCAGTGAC ---/ATG ATCTCGATTC 3070 hom 100 het 40 0 32 8 ATG 0 1 206354 CASAVA_Build 4 55275290 1D CACAATGAGG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 9 8 206355 CASAVA_Build 4 55276880 1D CAGAGCAAAG T/- TACTAGAACT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 2 1 206356 CASAVA_Build 4 55283783 6D24M2D TATTTTTATA TATATGTATATATATTTATATATATGTATTTA/------TATATATATTTATATATATGTATT-- TATATATATA 1480 hom 10 het 5 0 4 3 N/A 0 0 206357 CASAVA_Build 4 55303704 1D TTTCACATGA G/- GGGGGTGGCG 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 G 6 5 206358 CASAVA_Build 4 55304058 1D TTCAGGAAGC A/- CCACCTGGGC 3070 het 3070 ref 38 21 11 7 A 1 0 206359 CASAVA_Build 4 55304195 1D GCTAGAAGTC T/- TGAGATCAGG 3070 het 3070 ref 49 27 13 9 T 2 1 206360 CASAVA_Build 4 55305064 1I TATGGATCCT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 56 33 17 6 A 6 7 206361 CASAVA_Build 4 55307978 1D GCACAGAGAG T/- GTCAAACAGC 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 T 1 0 206362 CASAVA_Build 4 55319722 1I GCCTGCTACC -/G AGTTAATTGC 3070 hom 120 het 42 0 40 2 G 0 1 206363 CASAVA_Build 4 55389103 1D GGAAATCTAG A/- AAAAATGGAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 6 5 206364 CASAVA_Build 4 55393440 1D GGTGGCAAGG A/- AAAAAAAAAC 1399 het 1399 ref 28 21 3 6 A 10 9 206365 CASAVA_Build 4 55398086 1I ATTTCAATTC -/A AAAACAGCCT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 4 5 206366 CASAVA_Build 4 55400697 1I AGAAAATCAG -/A AAAAAATATC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 6 7 206367 CASAVA_Build 4 55400942 1I CACTATATAT -/A TTTTTTTTAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 1 206368 CASAVA_Build 4 55401857 2D CGTGCACACA TG/-- TGTGTGGGAA 3070 hom 48 het 20 0 15 5 TG 4 3 206369 CASAVA_Build 4 55402301 1D GATGATATAA C/- TTGATTACCA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 1 0 206370 CASAVA_Build 4 55402759 1D TGACCCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 11 10 206371 CASAVA_Build 4 55403834 1I ATTGTTTATA -/T TTTGGCCTGA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 T 3 4 206372 CASAVA_Build 4 55406280 1I TTTTTTAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 9 10 206373 CASAVA_Build 4 55412181 1I GATGGGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 47 2 39 6 T 11 12 206374 CASAVA_Build 4 55435721 1D AATGTTCAAA T/- TTTTTTTTTT 1561 het 1561 ref 23 15 5 3 T 17 16 206375 CASAVA_Build 4 55443545 1D TTACCGTTCC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 7 206376 CASAVA_Build 4 55444162 1D TTACTAAGAA T/- TTTTTGAGGG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 6 5 206377 CASAVA_Build 4 55444302 10D AATGTGAATG AAAACTCACC/---------- AAAATATTAA 3070 hom 30 het 11 0 11 3 AAAACTCACC 1 0 206378 CASAVA_Build 4 55508415 1D CAACTGATTG A/- AATGAAGCCC 3070 hom 114 het 45 0 37 8 A 3 2 206379 CASAVA_Build 4 55513846 1I ACTCCCACAG -/T GTAGACAAGA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 T 0 1 206380 CASAVA_Build 4 55517568 1I CTTTCAGGAT -/G GTGGAAATCA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 G 1 2 206381 CASAVA_Build 4 55523689 4D GAAAATAGAG CTTT/---- CTGCCACATG 3070 het 3070 ref 46 21 17 10 CTTT 1 0 206382 CASAVA_Build 4 55523778 15D TCCCTTGAGC AGTTTAATGAGACTT/--------------- AGTCCTTCAG 3070 het 3070 ref 42 22 17 7 AGTTTAATGAGACTT 1 0 206383 CASAVA_Build 4 55530984 1D AAGAAGAATG A/- GAAGAGCAGT 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 A 1 0 206384 CASAVA_Build 4 55532656 1I AATACATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 12 11 11 T 9 10 206385 CASAVA_Build 4 55533487 1I TCAGAAAGCT -/A AATTTTTTTT 3070 hom 91 het 33 0 30 3 A 2 3 206386 CASAVA_Build 4 55535590 4I GGGGTCTCTC ----/TCTT TCTAACACCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TCTT 0 1 206387 CASAVA_Build 4 55536614 1D ATGAATCATG T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 33 16 15 4 T 7 6 206388 CASAVA_Build 4 55541160 1I TATTAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 10 11 206389 CASAVA_Build 4 55542892 1D CCTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 40 1 17 23 A 13 12 206390 CASAVA_Build 4 55549235 1D GTAGATATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 10 9 206391 CASAVA_Build 4 55550879 3I TGAACAACCA ---/TTG TTGTGTCAAC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 TTG 1 2 206392 CASAVA_Build 4 55570942 1I CACTACTACC -/A AAAAAAAAAA 1687 het 1687 ref 38 13 11 14 A 11 12 206393 CASAVA_Build 4 55575260 3D ACTCTTTTTT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TAA 1 0 206394 CASAVA_Build 4 55578553 1D38M1D AAGAGAGTTT AAAAAAAAAAAATCAGCCTGAGACATACAGGGAAAGTACT/-AAAAAAAAAAATCAGCCTGAGACATACAGGGAAAGTAC- TGAAAACCCA 3070 het 3070 hom 40 19 19 21 N/A 0 0 206395 CASAVA_Build 4 55583067 1I GCGAATATAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 7 8 206396 CASAVA_Build 4 55625028 3I TGAGAAAGTA ---/GAT TTATAAAACA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 GAT 0 1 206397 CASAVA_Build 4 55626085 3I TCCACCGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 TTG 3 4 206398 CASAVA_Build 4 55627692 1I TCCCTAGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 T 9 10 206399 CASAVA_Build 4 55633593 1D CTCACTGGTA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 87 het 35 0 30 7 T 8 7 206400 CASAVA_Build 4 55638478 1I CTGTTTTAAC -/A ATCTCTAAAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 2 206401 CASAVA_Build 4 55685630 1I TTCACACAGT -/G GGTGTGCAAG 3070 hom 72 het 26 0 22 4 G 2 3 206402 CASAVA_Build 4 55688741 1D AAAGTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 12 8 A 12 11 206403 CASAVA_Build 4 55700291 1D ACCATCACAT A/- ATACTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 15 16 2 A 2 1 206404 CASAVA_Build 4 55709578 2D AAATTAAAAG CA/-- TATATATCCC 3070 hom 93 het 36 0 32 5 CA 1 0 206405 CASAVA_Build 4 55712391 1I TTTTTTTTTG -/T GTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 0 1 206406 CASAVA_Build 4 55720061 2I TATCACTCCC --/CA GCCCACCCAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 CA 0 1 206407 CASAVA_Build 4 55722983 1I TCATTTTGGC -/A AAAAAGATTC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 5 6 206408 CASAVA_Build 4 55723134 2I TAAAATTTCT --/TC TTTCTCATAT 3070 het 3070 ref 36 25 9 2 TC 0 1 206409 CASAVA_Build 4 55725533 1I ATGAACTCAT -/C CGTTTTTTAT 1528 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 2 206410 CASAVA_Build 4 55729717 4I17M1D TCTTGGAGGC ----TTTATTTCTTTTTACTCT/TTTGTTTATTTCTTTTTACTC- TTTTTTCTCT 3070 hom 45 het 14 0 16 3 N/A 0 0 206411 CASAVA_Build 4 55732836 1I AATACACACC -/T TTTTTTTTTT 2640 het 457 hom 16 2 9 5 T 12 13 206412 CASAVA_Build 4 55734445 4D ATACACATGC ACAT/---- ACATACATAC 3070 hom 151 het 64 0 51 13 ACAT 4 3 206413 CASAVA_Build 4 55735576 1I ATGTAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 44 0 34 10 T 10 11 206414 CASAVA_Build 4 55736102 2I46M1D AAGTGGAAAA --AAGGGTGCAGAACAGCGTTTCTATTATGCTATGGCACATGCCTGCGT/AGAAAGGTGCAGAACAGCGTTTCTATTATGCTATGGCACATGCCTGCG- TGCTCACGCA 3070 hom 96 het 34 0 33 18 N/A 0 0 206415 CASAVA_Build 4 55746351 4D CTCACATGTT AGAA/---- AGAGCCCCTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 8 AGAA 1 0 206416 CASAVA_Build 4 55758307 4D AGCAAGACTG ACAA/---- ACAAAAAAGA 2629 het 2629 ref 35 25 7 5 ACAA 2 1 206417 CASAVA_Build 4 55758433 2D AACGCTACAC AT/-- ATGTTTAATA 2815 het 2815 ref 37 27 7 5 AT 2 1 206418 CASAVA_Build 4 55785841 2I TATTTAAAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 39 hom 35 1 29 5 A 9 11 206419 CASAVA_Build 4 55798239 1I TTGTTAAGAC -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 6 7 206420 CASAVA_Build 4 55805199 1I CTTTTGCCAT -/A ATCTGCTGAA 3070 het 3070 hom 39 14 24 1 A 1 2 206421 CASAVA_Build 4 55806162 6I ACTGATTTTG ------/TTTATA TTTATATCAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 TTTATA 1 2 206422 CASAVA_Build 4 55812988 1I AATAAAAAAA -/T AATAATGCTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 T 0 1 206423 CASAVA_Build 4 55814188 1D ATATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 7 A 11 10 206424 CASAVA_Build 4 55816807 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 27 12 A 12 11 206425 CASAVA_Build 4 55821646 1I AATTTTAGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 22 14 10 A 9 10 206426 CASAVA_Build 4 55822334 2I AAAAGTCAAG --/TT CACTTTCAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 0 2 206427 CASAVA_Build 4 55829492 1I AGTATGGCAT -/C TGGGTTCTGA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 C 0 1 206428 CASAVA_Build 4 55831395 1I CTCTGACACA -/T AATCAGAATT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 0 1 206429 CASAVA_Build 4 55832673 1I CCTAGGCTCA -/G GTGATCCTCC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 1 2 206430 CASAVA_Build 4 55832880 1I GCTGCACAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 8 9 206431 CASAVA_Build 4 55835454 2I TTTGTTAAAC --/AT ATGTCTCCCT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AT 1 2 206432 CASAVA_Build 4 55835659 1D CAAATGATGT A/- AAACTCACAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 4 3 206433 CASAVA_Build 4 55836074 1I AGTGCTCCAG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 6 7 206434 CASAVA_Build 4 55836416 2D TGGTTTAATG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 A 11 9 206435 CASAVA_Build 4 55843485 2I GCTGTATCTC --/AT ATGTTTTGGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AT 1 2 206436 CASAVA_Build 4 55864474 2I AAATATGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 9 16 9 AT 6 7 206437 CASAVA_Build 4 55890687 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 10 11 206438 CASAVA_Build 4 55892923 3D AAATCAGAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 28 5 A 17 14 206439 CASAVA_Build 4 55905523 10I AAACTCCTAC ----------/AGAGAAACTG CCAGGAAACT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 AGAGAAACTG 0 1 206440 CASAVA_Build 4 55907850 3D GCCCCAAATT CTC/--- CTTTTTCCCG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 CTC 1 0 206441 CASAVA_Build 4 55918501 1D TAGGCTCTTG A/- AGCCTGGAGA 3070 het 3070 hom 35 17 18 0 A 2 1 206442 CASAVA_Build 4 55929294 2I CAGAGCTAGA --/CT CTGTCTCAAA 1165 hom 7 het 4 0 3 1 CT 1 2 206443 CASAVA_Build 4 55933860 1D GAATTCCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 36 2 24 11 A 14 13 206444 CASAVA_Build 4 55942057 12D TAATATATTA TATATAATGCCT/------------ TATATAATGC 3070 het 2202 hom 21 6 11 7 TATATAATGCCT 2 1 206445 CASAVA_Build 4 55945294 1I ATTTTAGTTC -/T ATCTCCTGGC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 T 0 1 206446 CASAVA_Build 4 55952664 1I CAAGCGATTC -/T TTCTGCCTCA 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 2 3 206447 CASAVA_Build 4 55958835 3D TTTTTGTTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 20 0 11 10 T 14 11 206448 CASAVA_Build 4 55964501 1I AAGTTTTTTT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 7 8 206449 CASAVA_Build 4 55975221 1I CATGAAATTT -/A TTAAATATTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 0 1 206450 CASAVA_Build 4 55982840 1D CTTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 11 10 206451 CASAVA_Build 4 55985698 4I CATCTCTTAT ----/AATA AGAGGTATTA 3070 het 3070 ref 43 23 19 1 AATA 0 1 206452 CASAVA_Build 4 55986378 2D GGTTTTTAAC AA/-- GCTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 2 0 206453 CASAVA_Build 4 55989664 3D TGCATGTTTT AAC/--- AACTACCAAC 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 AAC 2 1 206454 CASAVA_Build 4 55991139 3D CAGTGTTTGC TGG/--- TGGTGGTGAT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 TGG 3 2 206455 CASAVA_Build 4 55992632 2D CCAAAGAAAC AG/-- AAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 10 7 AG 1 0 206456 CASAVA_Build 4 55995517 1I ATTTAACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 10 11 206457 CASAVA_Build 4 55995807 1I GTACATAGAG -/A AATTTGAACC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 2 3 206458 CASAVA_Build 4 56005993 6I GGTTCTGGTG ------/CTTTTC CTTCTTGCTC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 CTTTTC 0 1 206459 CASAVA_Build 4 56010096 1D TTCCACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 185 hom 36 1 29 6 A 13 12 206460 CASAVA_Build 4 56010738 1D GCCCTACAGT A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 7 6 206461 CASAVA_Build 4 56011693 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 17 8 A 13 12 206462 CASAVA_Build 4 56017002 1D AATAAACTTT G/- GGGGGGGGGC 3070 hom 62 het 31 0 22 9 G 10 9 206463 CASAVA_Build 4 56017559 1D ATTACTAGAT A/- AACTTTTCCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 3 2 206464 CASAVA_Build 4 56024151 8D AACAAATGAC TGTTTAAT/-------- TGTTTAATAA 3070 het 3070 ref 24 13 10 3 TGTTTAAT 2 1 206465 CASAVA_Build 4 56026889 4I AAATAATAAC ----/AATA AATAAATAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AATA 2 3 206466 CASAVA_Build 4 56028718 1I CATTGCTAAT -/A ATCTCATGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 206467 CASAVA_Build 4 56030054 1D TCTATTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2025 hom 21 8 9 5 T 13 12 206468 CASAVA_Build 4 56039065 1I CTTTTACAGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 8 9 206469 CASAVA_Build 4 56042632 1I CTTAAAGAAT -/C CCCAATGGAT 3070 hom 111 het 45 0 37 8 C 3 4 206470 CASAVA_Build 4 56051019 1I GAATGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 11 12 206471 CASAVA_Build 4 56052300 1I AGTGAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 12 13 206472 CASAVA_Build 4 56052448 1D TAAAAAAGTA T/- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 T 7 6 206473 CASAVA_Build 4 56052736 1D GAGTACATAG T/- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 34 12 15 8 T 7 6 206474 CASAVA_Build 4 56056808 1D14M1D AAACACAAAC TTTTTTTAAAAAAACA/-TTTTTTAAAAAAAC- AAAAAACTGC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 N/A 0 0 206475 CASAVA_Build 4 56057206 1I AAAAAAAAAA -/C CTGTGCCAGC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 C 1 2 206476 CASAVA_Build 4 56058920 1D TTAGCAACCT A/- AAAGAAGTAC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 4 3 206477 CASAVA_Build 4 56059007 2D TGACAATGCT AG/-- GTTTAGAGCT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 AG 1 0 206478 CASAVA_Build 4 56060101 1D GTTGTCAACT G/- GCTTATGTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 2 1 206479 CASAVA_Build 4 56072213 5I CCTATCTATC -----/TAGTA TAATTTTAAT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 TAGTA 0 1 206480 CASAVA_Build 4 56073313 1D TTTGGTAAGG T/- TATCTGTCAG 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 2 1 206481 CASAVA_Build 4 56075425 1I ACATTTTTAT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 2587 hom 29 8 10 12 C 9 10 206482 CASAVA_Build 4 56077251 2D AGCAGATTAA TC/-- TGTTTCTCCT 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 TC 1 0 206483 CASAVA_Build 4 56077446 4D GCTATTCATG CTTT/---- CTTTCGGTTA 3070 het 3070 ref 35 22 13 3 CTTT 2 1 206484 CASAVA_Build 4 56084416 1D AAGGGATAAT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 45 17 23 6 A 8 7 206485 CASAVA_Build 4 56088958 1D CCTGTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2858 het 2302 hom 23 9 7 7 A 15 14 206486 CASAVA_Build 4 56089271 2D ACTCCACCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1857 het 1857 ref 12 7 4 1 A 13 11 206487 CASAVA_Build 4 56091032 2D CTGAAGGGAG AC/-- ACTTGCATTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 AC 2 1 206488 CASAVA_Build 4 56096100 1D GAAAGACCTC T/- TTATCAGTAT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 3 2 206489 CASAVA_Build 4 56098723 1I AAAAAACAAA -/T TAAATAAATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 1 2 206490 CASAVA_Build 4 56102768 3D AAAAGAACAT AAC/--- AACTCCTTAC 3070 het 3070 hom 27 13 14 1 AAC 2 1 206491 CASAVA_Build 4 56102971 1I TGTTATAATG -/T TCTATGCTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 5 T 1 2 206492 CASAVA_Build 4 56103095 1D AGAAACACCG T/- TGTCTACTAA 2429 het 1210 hom 11 5 6 0 T 2 1 206493 CASAVA_Build 4 56110128 1D TGCTGGGATT A/- ACAGGCGCGA 3070 het 2676 hom 21 8 8 6 A 2 1 206494 CASAVA_Build 4 56111645 1I ACCCCACCTG -/C CCCCCCCACC 3070 het 2110 hom 20 8 11 1 C 7 8 206495 CASAVA_Build 4 56116972 5D AATTCTGTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 36 19 8 10 TTTTG 5 4 206496 CASAVA_Build 4 56117760 1I TATTTATAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 9 10 206497 CASAVA_Build 4 56120262 3I GAAAATTGGA ---/AAC AACTCACATT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 AAC 1 2 206498 CASAVA_Build 4 56121114 1I CAAAAAAAAA -/G GGGGGGGGGG 2455 het 1360 hom 38 6 11 21 G 10 11 206499 CASAVA_Build 4 56127733 5I CTGAGAAGGT -----/CACAA TTACTTAAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CACAA 0 1 206500 CASAVA_Build 4 56131586 1D AGCATTCAAT A/- AATGTTGCTA 3070 het 3070 hom 45 21 22 3 A 3 2 206501 CASAVA_Build 4 56133011 2I CTCCTTCTCA --/TT TTTCTCTGTT 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 T 3 5 206502 CASAVA_Build 4 56133194 1D AACTTAATAT G/- GGGGGAATTA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 G 6 5 206503 CASAVA_Build 4 56134805 11D TTATCACTAG TTTTTGTTTGT/----------- TTTTTGTTTG 1613 het 1613 ref 22 11 4 8 TTTTTGTTTGT 2 1 206504 CASAVA_Build 4 56141904 1D CAATGTCTAG A/- AAAAAACCGT 2259 het 2259 ref 30 20 5 7 A 7 6 206505 CASAVA_Build 4 56148853 1D GTACAATTTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 T 7 6 206506 CASAVA_Build 4 56188320 1I AATTTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2814 hom 25 8 13 4 T 11 12 206507 CASAVA_Build 4 56190971 1D ATACTTAGTC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 96 het 41 0 32 9 T 8 7 206508 CASAVA_Build 4 56192790 2D ATGCACACAC AT/-- GTTTATAGCA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 AT 1 0 206509 CASAVA_Build 4 56199439 1D ACTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 32 0 24 9 T 11 10 206510 CASAVA_Build 4 56199970 9I TTTCTCCCTA ---------/TTTATGGCT TTTCTTCCAT 3070 het 3070 hom 45 18 26 1 TTTATGGCT 0 1 206511 CASAVA_Build 4 56211129 1D GATTGTTTAG T/- TTTTTTACTG 3070 hom 117 het 44 0 36 9 T 7 6 206512 CASAVA_Build 4 56224175 1D TACCAAAAAT A/- CAAAAAATTA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 A 1 0 206513 CASAVA_Build 4 56226964 1I TTTATTTATG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 T 7 8 206514 CASAVA_Build 4 56237328 1I AGTCCAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 10 11 206515 CASAVA_Build 4 56242654 1I TAGGTCACTT -/A ACAAGATTAG 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 A 1 2 206516 CASAVA_Build 4 56250098 8D TCCCTCTCAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 2467 het 1754 hom 14 5 6 4 AAAC 5 3 206517 CASAVA_Build 4 56251889 1D GGCTTACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 29 0 19 11 A 13 12 206518 CASAVA_Build 4 56255599 1I TCCATCACAT -/A AAACAGAACC 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 3 4 206519 CASAVA_Build 4 56265857 4D TTGGGGTTCT CTTA/---- CTTTGATTCC 3070 het 3070 hom 38 13 19 7 CTTA 1 0 206520 CASAVA_Build 4 56274708 1I AAAGTGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 11 12 206521 CASAVA_Build 4 56287850 1I CTGGATCTCA -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 T 7 8 206522 CASAVA_Build 4 56293936 1D CTGCTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1957 hom 32 10 14 8 T 11 10 206523 CASAVA_Build 4 56295288 1I GATGTTGGCA -/G GGCTGTGGAG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 G 2 3 206524 CASAVA_Build 4 56298825 1D CTAGGCATAG A/- AGGGACTTAA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 2 1 206525 CASAVA_Build 4 56313606 1D TAGAAGTCAT A/- AAAAAATGCA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 7 6 206526 CASAVA_Build 4 56323699 1D AAAATTCAAA T/- CATTATAGAT 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 T 1 0 206527 CASAVA_Build 4 56330054 3D GTGATAGAAA AAG/--- AAGGAGAAGA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AAG 2 1 206528 CASAVA_Build 4 56335399 1D GGACATGCAT A/- GGTGAAAGTG 3070 hom 140 het 53 0 47 7 A 1 0 206529 CASAVA_Build 4 56339459 1D CTATAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2373 hom 58 9 25 24 T 16 15 206530 CASAVA_Build 4 56367317 1D TCATCTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 30 0 25 7 A 11 10 206531 CASAVA_Build 4 56369461 14D TATGCAACAT TTTATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 hom 27 het 13 0 9 5 TTTATATATATATA 1 0 206532 CASAVA_Build 4 56378908 2D GTTATGCAGC AT/-- ATGACTGTAC 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 AT 2 1 206533 CASAVA_Build 4 56383904 2I AATAGTAAAC --/AT ATGTGTGTAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AT 1 2 206534 CASAVA_Build 4 56410065 6I GCTACCACCG ------/ATGGGT ATGTCATCAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 ATGGGT 0 1 206535 CASAVA_Build 4 56412251 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 13 12 206536 CASAVA_Build 4 56428488 1I GTATTTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 19 11 A 16 17 206537 CASAVA_Build 4 56433318 2I AGAAAATGAC --/TG TAGCTCAACT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 TG 0 1 206538 CASAVA_Build 4 56448843 1D4M5I AGGTAGCCAA GGCTA-----/-GATATATCC GAAAGATATA 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 N/A 0 0 206539 CASAVA_Build 4 56459404 3D TTTAGCATTG TTA/--- TTGAAGTGCT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 TTA 1 0 206540 CASAVA_Build 4 56464071 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 1095 het 1095 ref 21 6 7 8 A 17 16 206541 CASAVA_Build 4 56481282 14I TTCATGAAAT --------------/TATGTGCTTACAAA ATCAGTGGAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TATGTGCTTACAAA 0 1 206542 CASAVA_Build 4 56482740 1I CAAGAAAGCT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 9 206543 CASAVA_Build 4 56487077 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2986 hom 23 8 10 5 A 12 14 206544 CASAVA_Build 4 56501231 4I CAAGAAGTTA ----/AGTT AGTTAGCGTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AGTT 1 2 206545 CASAVA_Build 4 56505263 1I GCTTGCTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 177 hom 34 2 25 7 T 9 10 206546 CASAVA_Build 4 56507643 1D TGAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 10 9 206547 CASAVA_Build 4 56520416 2I GTTTTAAATC --/TG TTGTTACAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TG 0 1 206548 CASAVA_Build 4 56522088 3I CATGAAGAGA ---/TGT TGTTGAAAAT 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 TGT 1 2 206549 CASAVA_Build 4 56523030 1D AAAACTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2705 hom 28 8 11 9 T 11 10 206550 CASAVA_Build 4 56523607 1D TCTTTGAAAC T/- TCTTCCATGA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 T 2 1 206551 CASAVA_Build 4 56523654 1D TTTAAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 21 1 10 11 T 14 13 206552 CASAVA_Build 4 56549069 1I ATAAAAAAGG -/T TATAAAAATA 3070 hom 105 het 36 0 35 1 T 1 2 206553 CASAVA_Build 4 56558620 1I CTTGGACAAG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 T 7 8 206554 CASAVA_Build 4 56562684 1I TATTTGAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 9 10 206555 CASAVA_Build 4 56565850 2D AATGCTGCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 573 hom 28 5 9 15 T 18 16 206556 CASAVA_Build 4 56584145 1I TCCCTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 1282 het 1282 ref 23 16 3 4 A 11 12 206557 CASAVA_Build 4 56585749 1I CAGTGTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 T 14 15 206558 CASAVA_Build 4 56593370 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 26 2 22 2 A 13 12 206559 CASAVA_Build 4 56597647 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 8 206560 CASAVA_Build 4 56603274 4I TTCCTTTCCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 2010 het 2010 ref 31 15 8 8 TTTC 3 4 206561 CASAVA_Build 4 56611683 2I GTGGGCAGGG --/AA AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 41 12 25 4 A 6 8 206562 CASAVA_Build 4 56616372 3I AAAGAGGAAA ---/CAT CATTACTCCA 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 CAT 1 2 206563 CASAVA_Build 4 56620199 4D CACCTCTACA AAAC/---- AAACAAACAA 2726 het 2726 ref 27 15 6 6 AAAC 6 5 206564 CASAVA_Build 4 56621275 1D AATGGACAAA G/- GTGCTGTGAG 3070 het 3070 hom 53 20 24 9 G 2 1 206565 CASAVA_Build 4 56623990 5D AAGGAAGGAA GAAAG/----- GAAAGGAAGG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 GAAAG 2 1 206566 CASAVA_Build 4 56628851 4D ATTCATTCAA AAAT/---- AAATATTTAT 3070 het 3070 hom 31 9 20 4 AAAT 2 1 206567 CASAVA_Build 4 56632429 1D TCTTTCTTTC T/- TTTCTTTTTT 435 het 435 ref 41 24 7 10 T 4 3 206568 CASAVA_Build 4 56634291 1I TGATGATGAG -/T TTTTTGTCGT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 5 6 206569 CASAVA_Build 4 56646278 1D TCTCCCTTTA T/- TTTTTTTTTA 1370 het 1370 ref 40 30 3 8 T 10 9 206570 CASAVA_Build 4 56652288 2D AGAGTAGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 36 4 13 22 T 15 13 206571 CASAVA_Build 4 56658270 2D TAAGGGCTCT GC/-- TGCTTGAAGT 3070 het 3070 hom 55 25 28 2 GC 1 0 206572 CASAVA_Build 4 56662041 16D TATTTATAGA GAAGCCTCTTGCTTTC/---------------- TAGTTAAAGG 3070 het 3070 ref 30 22 10 2 GAAGCCTCTTGCTTTC 1 0 206573 CASAVA_Build 4 56663193 1D TGCATTTACA T/- TTTTCTGATT 3070 het 3070 ref 45 28 16 1 T 5 4 206574 CASAVA_Build 4 56665326 7D CTCAAAAAAC AAACACA/------- AAAAAACAAA 343 het 343 ref 42 23 4 17 AAACACA 1 0 206575 CASAVA_Build 4 56667088 1I GGATGAGGCA -/G ACTGTACTTG 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 G 0 1 206576 CASAVA_Build 4 56668077 1I AAAACATTGG -/T GTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 0 1 206577 CASAVA_Build 4 56668473 1D TTCTTTGGCC T/- TTGGACTTTC 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 3 2 206578 CASAVA_Build 4 56670268 4I TATTCTTATT ----/CTAA CTATTTTCTT 2372 het 2372 ref 23 16 5 2 CTAA 0 1 206579 CASAVA_Build 4 56671994 1D AAGAAAAATT A/- AAAAAGGAAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 6 5 206580 CASAVA_Build 4 56672290 2I GTAGGAAAAA --/TG GGGATGGAGG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TG 0 1 206581 CASAVA_Build 4 56673450 1D CTCTGGCTAG T/- TGGGGGGACC 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 2 1 206582 CASAVA_Build 4 56673906 1D TTTAAGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 12 11 206583 CASAVA_Build 4 56674049 4D CAATTAACTT AGTC/---- AGTGTGTGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 6 AGTC 1 0 206584 CASAVA_Build 4 56674484 1D TATTTTTAGA G/- GGGAAATGAG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 G 4 3 206585 CASAVA_Build 4 56679180 1I CATTTTGTAT -/A ATCCAAAGGC 3070 hom 96 het 36 0 31 5 A 1 2 206586 CASAVA_Build 4 56679664 5D TAAAATATAT ATAAA/----- ATAAAATAAA 2718 het 2357 hom 19 7 8 5 ATAAA 3 2 206587 CASAVA_Build 4 56680429 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1261 hom 16 3 9 4 T 10 11 206588 CASAVA_Build 4 56682568 1D CTCTGTCTTG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 9 8 206589 CASAVA_Build 4 56683110 1I CCATCTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 9 10 206590 CASAVA_Build 4 56684871 2I TTTAAAATCA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 9 11 206591 CASAVA_Build 4 56689967 1I TTATAAAACC -/T TTTTGTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 4 5 206592 CASAVA_Build 4 56701460 1I CCTTCTACTA -/T TGAATTTTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 1 2 206593 CASAVA_Build 4 56740085 1D GACTCATGGA G/- GGGGAAGAAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 G 5 4 206594 CASAVA_Build 4 56749801 5I TACCTATCTC -----/AAAAT TAAACCATAA 3070 hom 71 het 29 0 21 8 AAAAT 0 1 206595 CASAVA_Build 4 56784148 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 28 1 21 6 T 12 11 206596 CASAVA_Build 4 56791995 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAATTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 8 206597 CASAVA_Build 4 56794052 4I AATTAGATTA ----/TTTG TTTACTTATA 3070 hom 53 het 20 0 18 2 TTTG 0 1 206598 CASAVA_Build 4 56800966 1D TCAATTATTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 126 het 44 0 42 2 T 8 7 206599 CASAVA_Build 4 56808211 3I GATCAGTCTT ---/AGG ACAGTGAATA 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 AGG 0 1 206600 CASAVA_Build 4 56808773 1D CATCTTACAG A/- AAAAAAAAAA 2360 het 2360 ref 27 17 9 2 A 13 12 206601 CASAVA_Build 4 56815731 1D CCCTAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 2040 het 2040 ref 20 8 7 5 A 11 10 206602 CASAVA_Build 4 56815820 1D GAGGTCAGGA T/- TTTTGAGACC 3070 het 2883 hom 15 6 8 1 T 5 4 206603 CASAVA_Build 4 56816163 1D ATTTTTCTCA T/- GATTTCTAGC 3070 het 3070 ref 34 24 8 2 T 1 0 206604 CASAVA_Build 4 56818450 1D GTCTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 2045 het 431 hom 23 3 6 14 A 19 18 206605 CASAVA_Build 4 56822285 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2509 het 1948 hom 29 5 8 16 T 14 15 206606 CASAVA_Build 4 56838378 1D CATGATTTAT A/- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 33 23 5 6 A 13 12 206607 CASAVA_Build 4 56846368 1D AGATAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 11 10 206608 CASAVA_Build 4 56848201 2I ATGTGCAGCA --/CT CTATACTTGG 3070 hom 63 het 27 0 21 6 CT 1 2 206609 CASAVA_Build 4 56855146 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 32 1 20 11 A 14 15 206610 CASAVA_Build 4 56861269 1D27M1D ACCGCTGCCC AAAGCCATAGTCCTGCCCTCAGGGCCAAC/-AAGCCATAGTCCTGCCCTCAGGGCCAA- CCCCAGACAT 3070 hom 96 het 31 0 31 7 N/A 0 0 206611 CASAVA_Build 4 56869218 22D AGAAAGTCAC ATTCCAGCACCATCCTGTCTAA/---------------------- ATTTGATCTC 3070 hom 132 het 44 0 45 5 ATTCCAGCACCATCCTGTCTAA 1 0 206612 CASAVA_Build 4 56869416 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 A 10 9 206613 CASAVA_Build 4 56885836 15D ATGTTTGAGG TCATGGATATCCAAC/--------------- TTACCCTGAT 3070 hom 99 het 34 0 34 3 TCATGGATATCCAAC 1 0 206614 CASAVA_Build 4 56887189 4D CTTAAGAACC GCAG/---- GCAGGCATTA 3070 hom 84 het 30 0 27 3 GCAG 2 1 206615 CASAVA_Build 4 56891983 2D AAATTAATGC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 5 hom 29 1 11 17 A 11 9 206616 CASAVA_Build 4 56898605 5I TTGCTTTTTT -----/AAAGA AAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 AAAGA 1 2 206617 CASAVA_Build 4 56898704 3D TTAAGTGATT ATG/--- ATGGAGGCTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 8 ATG 2 1 206618 CASAVA_Build 4 56899234 4I AAATATAATC ----/TTCT TTCTTTAATA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 TTCT 1 2 206619 CASAVA_Build 4 56900754 2I GTAGGAAAAA --/AG AGTTAATTGT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 AG 1 2 206620 CASAVA_Build 4 56904264 3D22M2D TCTGTCAAAA AACAAACAAACAAACAAAAAAATACAT/---AAACAAACAAACAAAAAAATAC-- ATATATATAT 3070 het 2123 hom 20 6 15 5 N/A 0 0 206621 CASAVA_Build 4 56920036 1I TTGTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 T 11 12 206622 CASAVA_Build 4 56929803 1D AAAAAAAAAA C/- AAATGTAAAT 3070 het 2429 hom 24 10 10 5 C 1 0 206623 CASAVA_Build 4 56934749 2D6M1I ATGCATACAG TTCATGTA-/--GATGAAT GTTCCATGTA 3070 hom 96 het 34 0 33 4 N/A 0 0 206624 CASAVA_Build 4 56935291 15D ACTCTGTCTC AGAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAGG 3070 het 2437 hom 26 10 17 7 AGAAAAAAAAAAAAA 1 0 206625 CASAVA_Build 4 56944086 1I AAATACAAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 7 8 206626 CASAVA_Build 4 56944842 1I AAATAATACT -/A GGGGAAATGC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 0 1 206627 CASAVA_Build 4 56946703 1I GTTTTTGTTA -/T TTTTTTTTTA 3021 het 3021 ref 24 10 7 7 T 9 10 206628 CASAVA_Build 4 56946856 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 2375 hom 23 11 9 3 C 0 1 206629 CASAVA_Build 4 56950334 1I TATTGATTCC -/A AGAATTTCAT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 1 2 206630 CASAVA_Build 4 56954463 1I TTAAATTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 A 9 10 206631 CASAVA_Build 4 56955781 2D GGCACCAGAT TA/-- TTATTATTTT 2161 hom 27 het 13 0 10 3 TA 1 0 206632 CASAVA_Build 4 56956130 1I TCCTTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 A 12 13 206633 CASAVA_Build 4 56958062 2D TGGCTATACT CA/-- GTGTCCACAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 CA 1 0 206634 CASAVA_Build 4 56958975 1I AGGAAAAAAG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 A 7 8 206635 CASAVA_Build 4 56959419 1I TGTTTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 12 13 206636 CASAVA_Build 4 56964121 1D GGAATTAATT A/- AATAATTGAA 3070 het 3070 hom 55 22 27 8 A 3 2 206637 CASAVA_Build 4 56964349 1I AGAGAAGTTT -/A AATCATCAGA 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 A 2 3 206638 CASAVA_Build 4 56964404 4I ACCATAATGA ----/AAAG AAATAAGGCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AAAG 0 1 206639 CASAVA_Build 4 56965511 1I AGCATCTAGG -/T TAAGTCATTA 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 1 2 206640 CASAVA_Build 4 56965603 4D CTTTCATGAT TGTC/---- TGAATTTTTA 3070 het 3070 ref 43 25 16 4 TGTC 1 0 206641 CASAVA_Build 4 56970387 1I TTGCTATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 9 10 206642 CASAVA_Build 4 56973938 2I TGTGGGTCTT --/CA CCACCCCCAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CA 0 1 206643 CASAVA_Build 4 56981882 1D TCTCTAGACC A/- GGGGTCCCCA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 1 0 206644 CASAVA_Build 4 56982756 1I TGATTCCATT -/A AGTTATGTCA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 1 2 206645 CASAVA_Build 4 56983872 1I TAGCAATCTG -/T TTTTAACAAG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 4 5 206646 CASAVA_Build 4 56994321 1D GGTATTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 692 hom 35 2 24 10 A 15 14 206647 CASAVA_Build 4 56994628 1I AACTGTTTTT -/C TTTTTTTTGA 3070 het 138 hom 24 3 15 6 C 0 1 206648 CASAVA_Build 4 56997802 1D CGCCTGTAAT C/- CCCAGCTACT 1717 het 1270 hom 8 3 4 1 C 4 3 206649 CASAVA_Build 4 56997980 2I TGATGCCATG --/GT GTGTGTGTGT 2421 het 2421 ref 32 16 12 4 GT 8 9 206650 CASAVA_Build 4 57006196 1I TGAGCCTCTG -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 T 7 8 206651 CASAVA_Build 4 57006944 5I ACCTGTTTTG -----/TTGGA TTGATCTTAA 3070 het 3070 ref 50 27 20 4 TTGGA 0 1 206652 CASAVA_Build 4 57009129 2D AGGGTTTCAC TG/-- TGTTGGCCAG 3070 het 3070 ref 18 8 7 3 TG 2 1 206653 CASAVA_Build 4 57025324 2I GTAGGAAGGA --/CT CTCTGATCTC 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 CT 2 3 206654 CASAVA_Build 4 57030812 1I TTTTCCTTCC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 7 8 206655 CASAVA_Build 4 57031002 4D GTAGCAAGAA TAAC/---- TCAGTCGAAG 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 TAAC 1 0 206656 CASAVA_Build 4 57038052 1D AGTCCTTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 10 9 206657 CASAVA_Build 4 57050990 1D TTGATTATTA T/- AGGGGAATGT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 T 1 0 206658 CASAVA_Build 4 57055102 2I CTATTGCACA --/CT CTGGGTAAGA 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 CT 1 2 206659 CASAVA_Build 4 57060312 5D GGGATCTAAT TAAAC/----- TAAAGAGCTT 3059 het 3059 ref 23 16 7 1 TAAAC 1 0 206660 CASAVA_Build 4 57062345 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 2883 hom 29 10 15 4 CT 2 1 206661 CASAVA_Build 4 57081479 1D AGTTTTGTAG A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 7 6 206662 CASAVA_Build 4 57093294 1D GAATTGTGCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 9 8 206663 CASAVA_Build 4 57093886 3D CATGAACCCC CCT/--- ATCAAATTTT 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 CCT 1 0 206664 CASAVA_Build 4 57094030 2D TTCTCTCTCC CT/-- CTGTCATTCT 3070 het 3070 hom 48 18 26 5 CT 2 1 206665 CASAVA_Build 4 57108166 3D ACTAATTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1425 het 742 hom 44 12 5 27 T 17 14 206666 CASAVA_Build 4 57109161 1I TCTCTTTCTG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 T 8 9 206667 CASAVA_Build 4 57111882 1D TCTCTAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 32 2 19 11 A 12 11 206668 CASAVA_Build 4 57112428 1D AGTTCAATTC G/- GGGGTGTCAG 3070 hom 111 het 49 0 38 12 G 5 4 206669 CASAVA_Build 4 57114921 1D TTCCTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 11 10 206670 CASAVA_Build 4 57116699 1I GTTGGCATAC -/A AAAAATCAGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 206671 CASAVA_Build 4 57120278 1I TAGCAATCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 T 9 10 206672 CASAVA_Build 4 57123815 1D CTTTCTAAAC T/- TTTTTTTAGG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 8 7 206673 CASAVA_Build 4 57125057 2D ATCTGTGGAA TT/-- TTTTTTTTTT 2523 het 94 hom 26 1 10 15 T 18 16 206674 CASAVA_Build 4 57136018 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 2624 hom 15 het 6 0 6 0 A 5 6 206675 CASAVA_Build 4 57171223 2I CCAAATACTT --/AA ACAGCCAACT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 1 3 206676 CASAVA_Build 4 57182228 6D TCTCATACTC TTTATT/------ TATTCCTATG 3070 het 3070 ref 37 22 15 2 TTTATT 1 0 206677 CASAVA_Build 4 57193739 2D TTGTCGAACA CC/-- GTTTTCCCAA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 C 2 0 206678 CASAVA_Build 4 57197852 4D GACACTGTGC TAGG/---- TAGGGCAAGA 3070 het 3070 ref 51 25 22 5 TAGG 2 1 206679 CASAVA_Build 4 57208534 12D GTTGGGGGCC GGGGTGTGGGCG/------------ GGGGGGATGG 3070 het 1023 hom 21 7 16 4 GGGGTGTGGGCG 1 0 206680 CASAVA_Build 4 57221492 1D TGAAAAAAAA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 8 7 206681 CASAVA_Build 4 57224732 1D GTAGGTGCTC T/- GTGTAGTTGC 3070 hom 54 het 21 0 19 3 T 1 0 206682 CASAVA_Build 4 57245137 3D CTTTCTATGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 15 15 T 16 13 206683 CASAVA_Build 4 57248207 4D GACGCAGTGG AGAA/---- AGAAAGGGCT 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 AGAA 2 1 206684 CASAVA_Build 4 57248767 2I CCTCTCAACA --/GT GTGTTTGCTC 3070 hom 53 het 21 0 18 3 GT 2 3 206685 CASAVA_Build 4 57263464 2I GAAATCATAA --/AT GTCTTTACTG 3070 hom 120 het 49 0 41 8 AT 0 1 206686 CASAVA_Build 4 57270577 1I TGTGGGTCAC -/T TTTTTCAGAT 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 T 5 6 206687 CASAVA_Build 4 57279269 1D TAGCAAAGAC T/- TGGAACCAAC 1647 het 237 hom 6 1 4 1 T 2 1 206688 CASAVA_Build 4 57281534 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 40 0 33 8 A 9 8 206689 CASAVA_Build 4 57293046 1D AGCAGCGAAC G/- GGGGGGGGGA 2404 het 1963 hom 32 9 9 14 G 10 9 206690 CASAVA_Build 4 57293566 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 31 1 23 7 T 13 12 206691 CASAVA_Build 4 57294983 1D CAACATGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 10 9 206692 CASAVA_Build 4 57301990 1D ATTATAATTA G/- ATTAATAATT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 G 1 0 206693 CASAVA_Build 4 57309200 1D ACCAAAAAAA T/- ATAACAATTA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 1 0 206694 CASAVA_Build 4 57332394 1D CACAGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 10 11 A 12 11 206695 CASAVA_Build 4 57338120 2D GGAATGTATC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 11 9 206696 CASAVA_Build 4 57339601 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2378 hom 22 6 11 5 A 13 14 206697 CASAVA_Build 4 57340490 1I ATCACTTGAG -/C CCAGAAGTCC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 C 2 3 206698 CASAVA_Build 4 57359006 1D GATTCTAAGG C/- TAATTCCAGA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 1 0 206699 CASAVA_Build 4 57378561 3D ATGACCTGAG GTC/--- GTCAGGAGTT 3070 hom 45 het 19 0 14 5 GTC 2 1 206700 CASAVA_Build 4 57380541 1D TTTTTTCTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 35 4 24 8 C 1 0 206701 CASAVA_Build 4 57384356 1D GCAGATCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 9 7 T 12 11 206702 CASAVA_Build 4 57390101 1I GCAAAAGAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 9 10 206703 CASAVA_Build 4 57391369 4D AATCACTTGA ACCG/---- ACCGGTGAGA 3070 hom 60 het 21 0 20 1 ACCG 2 1 206704 CASAVA_Build 4 57391562 1D ACCCAAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 26 1 16 9 A 15 14 206705 CASAVA_Build 4 57394668 1D CCGTAGGCAG T/- TAGGATCACC 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 2 1 206706 CASAVA_Build 4 57395461 1D TAGAAACTTT A/- CCCCTGAAGC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 1 0 206707 CASAVA_Build 4 57399089 2D CCTGGGTGAC AG/-- AGCAGGACTC 2030 hom 18 het 15 0 6 9 AG 2 1 206708 CASAVA_Build 4 57399259 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 143 hom 27 2 23 3 T 11 10 206709 CASAVA_Build 4 57399344 2I ACCCAGGAAG --/TC AACATTAGCC 3070 hom 60 het 21 0 21 1 TC 0 1 206710 CASAVA_Build 4 57402093 4D TATTTATTTA TTTT/---- CATAGAGACA 2565 hom 29 het 13 0 9 5 T 4 0 206711 CASAVA_Build 4 57412148 1D ACCAAAAAAG A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 7 6 206712 CASAVA_Build 4 57416100 1I CTTTTAATTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 7 8 206713 CASAVA_Build 4 57416587 1I TTATTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 8 9 206714 CASAVA_Build 4 57420520 1D GCCCGGCCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 10 9 206715 CASAVA_Build 4 57421281 1D GGGAGGCTGA G/- GGGGGCAGAT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 G 6 5 206716 CASAVA_Build 4 57422649 1I GGCTAGGATC -/T TTTTTTTTTT 1870 het 1870 ref 50 19 13 18 T 11 12 206717 CASAVA_Build 4 57434840 4I GAGACAAAAG ----/AAGT GAGTTTAAGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AAGT 0 1 206718 CASAVA_Build 4 57436091 1I ATCGCATGCC -/A AAAAAACGAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 6 7 206719 CASAVA_Build 4 57439594 1I TTTTCCCCCC -/T AGCACTTCTA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 0 1 206720 CASAVA_Build 4 57441237 1D TTTTTGAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 A 10 9 206721 CASAVA_Build 4 57443688 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 24 0 20 4 T 13 12 206722 CASAVA_Build 4 57456422 1D TTTTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2058 hom 30 7 13 10 T 11 10 206723 CASAVA_Build 4 57460148 1I GTTCAGGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2149 hom 25 8 8 9 T 11 12 206724 CASAVA_Build 4 57461523 2I CCTTGGGGAT --/AG AGAGAGACTC 3070 hom 50 het 23 0 16 7 AG 3 4 206725 CASAVA_Build 4 57477952 4D ACTGTTAACA TCTG/---- TCTTTGTGAT 3070 het 3070 hom 55 25 27 4 TCTG 1 0 206726 CASAVA_Build 4 57490424 4D CACACAAAAA AATT/---- TTTAAGTTGA 3070 het 3070 hom 23 12 10 4 AATT 1 0 206727 CASAVA_Build 4 57493512 1D CACTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 11 10 206728 CASAVA_Build 4 57499843 4D TACTGGTATA TAAG/---- TAGTATGTAA 3070 het 3070 ref 37 22 14 2 TAAG 1 0 206729 CASAVA_Build 4 57517559 3I AAGTGATAGC ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 ref 30 13 8 9 TAT 5 6 206730 CASAVA_Build 4 57519575 1D TAGAGGGGGG A/- AAAGCAGAGG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 4 3 206731 CASAVA_Build 4 57520451 1D TCTTTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 631 hom 37 3 24 11 T 13 12 206732 CASAVA_Build 4 57521112 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 168 hom 19 1 16 2 T 10 9 206733 CASAVA_Build 4 57521994 4I TTTCATGGCT ----/CTAA CTAACTGCGT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 CTAA 1 2 206734 CASAVA_Build 4 57522495 2I TAAAATGGTT --/AA AAAGTGTCCT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 3 5 206735 CASAVA_Build 4 57523289 17D TTGCTGGAAA AGGATGACAACTTGGGC/----------------- AGCCACCTTA 3070 het 3070 ref 29 19 10 6 AGGATGACAACTTGGGC 1 0 206736 CASAVA_Build 4 57525927 1D AATTGAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 17 10 T 13 12 206737 CASAVA_Build 4 57526617 22D CCAAAGTATG GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/---------------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 36 13 12 14 GT 17 6 206738 CASAVA_Build 4 57535575 1D CCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2138 het 357 hom 17 1 6 10 A 17 16 206739 CASAVA_Build 4 57545032 1D AAGTGATCTG C/- CTGCCTCGGC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 2 1 206740 CASAVA_Build 4 57545790 1D TGCACACTGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 48 22 19 9 T 9 8 206741 CASAVA_Build 4 57548325 9D AGGCTTATAA CTCTTCTCT/--------- CTCTTCTCTC 3070 hom 111 het 41 0 38 5 CTCTTCTCT 2 1 206742 CASAVA_Build 4 57555854 8D AGTTGAAATG AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 14 11 7 A 16 8 206743 CASAVA_Build 4 57567658 1I TTCCCCACGC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 22 10 8 T 8 9 206744 CASAVA_Build 4 57569943 5I GTGGAGAAAA -----/GACTT GAGAAGGGCA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 GACTT 0 1 206745 CASAVA_Build 4 57573579 1I ACCCTGAGTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 7 8 206746 CASAVA_Build 4 57576007 2I TGATAGGTGG --/GT GTGTGAGAAG 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 GT 2 3 206747 CASAVA_Build 4 57577556 3D ATAATATAAT AAG/--- AAATTTAGTA 2066 het 2066 ref 15 9 5 3 AAG 1 0 206748 CASAVA_Build 4 57582583 1I GAGTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 G 0 1 206749 CASAVA_Build 4 57585255 4I ATTCAACTAA ----/TACT TACATATGTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TACT 0 1 206750 CASAVA_Build 4 57585958 1D TTGCCACTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 9 8 206751 CASAVA_Build 4 57598306 1I GGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 10 11 206752 CASAVA_Build 4 57600855 1D AGCCTCACAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 10 9 206753 CASAVA_Build 4 57603284 1I AAAAATTTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 7 8 206754 CASAVA_Build 4 57607256 2D ACAGTTCTGT TC/-- TACCTCAGGA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TC 1 0 206755 CASAVA_Build 4 57615178 1I CTACCTGTAA -/G GGGAGGCTCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 3 4 206756 CASAVA_Build 4 57616576 3I CGCGGTTCTC ---/CTT CTGGACTGCT 3070 hom 69 het 24 0 22 2 CTT 0 1 206757 CASAVA_Build 4 57629805 1I CATTTGCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 10 11 206758 CASAVA_Build 4 57629955 4D CCTCACCCAG CTCA/---- CCCATAAGCC 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 CTCA 1 0 206759 CASAVA_Build 4 57632128 1D TTGATATATT G/- GGGGGGAATG 3070 het 3070 ref 57 28 22 7 G 7 6 206760 CASAVA_Build 4 57633573 7I CTGCTGCCTA -------/TAAAGGT GCCACCACCA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 TAAAGGT 0 1 206761 CASAVA_Build 4 57634517 2D ACCCTGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 13 11 206762 CASAVA_Build 4 57634982 7D CTCTCTCTCT CTCTCTC/------- TCTTTTTTCT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 CTCTCTC 1 0 206763 CASAVA_Build 4 57636373 1D CCTGGCCCCT G/- CAGGAGTGAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 1 0 206764 CASAVA_Build 4 57636573 1I CAAAAACATT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 206765 CASAVA_Build 4 57638052 1I ACAGAAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 79 het 34 0 27 7 A 6 7 206766 CASAVA_Build 4 57639610 1I GAGTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 751 hom 42 3 28 11 T 12 13 206767 CASAVA_Build 4 57639770 1D TCTTGAACAA T/- AGAAAGTTCC 3070 hom 107 het 40 0 36 4 T 1 0 206768 CASAVA_Build 4 57640087 3D CTCTTTGCTG TCT/--- TCTTGTTAAA 3070 hom 135 het 52 0 45 8 TCT 2 1 206769 CASAVA_Build 4 57646505 4D GATAGTCAGT TGTA/---- TGTAGTTTTC 3070 hom 129 het 47 0 43 6 TGTA 2 1 206770 CASAVA_Build 4 57648830 20D GGCTTATGCC TGTAATCCCAACATTTTGGG/-------------------- AGGCTGAGGC 3070 hom 63 het 22 0 20 9 TGTAATCCCAACATTTTGGG 1 0 206771 CASAVA_Build 4 57649060 1D CCTGGCTAAT C/- TTTTGTTTTG 3070 het 348 hom 21 1 16 4 C 1 0 206772 CASAVA_Build 4 57658576 5D GTATTGCCTC ACTTA/----- ACTTCACAAA 3070 het 3070 ref 37 16 18 3 ACTTA 1 0 206773 CASAVA_Build 4 57677644 1I TCAAGGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 11 12 206774 CASAVA_Build 4 57684482 1D GCTATATATC T/- TTTTTTTTTT 2781 het 2781 ref 45 22 10 13 T 17 16 206775 CASAVA_Build 4 57695431 1D AGTCCCCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 12 11 206776 CASAVA_Build 4 57698313 1D CAGATAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 33 1 24 8 T 13 12 206777 CASAVA_Build 4 57708560 1D ATCCAAGAGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 114 het 43 0 38 6 T 8 7 206778 CASAVA_Build 4 57709485 1I TGAAACAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 T 13 14 206779 CASAVA_Build 4 57716317 3D GTTCACAGAA AAG/--- AAGTGAAACT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 AAG 2 1 206780 CASAVA_Build 4 57717867 4D ATATGCACAC ACAT/---- ATATATATAT 3070 het 3036 hom 28 10 17 1 ACAT 1 0 206781 CASAVA_Build 4 57732354 1I CACCTGGCCT -/G GGGACCAGCC 3070 hom 126 het 50 0 37 13 G 3 4 206782 CASAVA_Build 4 57744724 10D AAACAAACAA ACACACACAC/---------- ACACACACAC 3070 hom 48 het 16 0 17 0 AC 16 11 206783 CASAVA_Build 4 57747241 1I ATGGAAGACG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 615 hom 42 2 34 6 T 9 10 206784 CASAVA_Build 4 57752414 3I ACACTTGAAC ---/CTT CTTTTAATTC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 CTT 1 2 206785 CASAVA_Build 4 57760318 3I GCATAAACTC ---/AAA GAAGCTTGGC 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 A 0 3 206786 CASAVA_Build 4 57778993 1D AAACCTTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 10 9 206787 CASAVA_Build 4 57783578 31D TGTTTTTTGG TTACATGGTTGAATTGTATAGTGGTGAAGTC/------------------------------- TGGGATTTTA 3070 hom 63 het 22 0 22 7 TTACATGGTTGAATTGTATAGTGGTGAAGTC 1 0 206788 CASAVA_Build 4 57790781 4I TGGCATAGAG ----/TAGC TAGCTGCTCC 3070 hom 132 het 55 0 41 14 TAGC 1 2 206789 CASAVA_Build 4 57796106 1D TCTTGGCCTG A/- AGTGATCCAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 2 1 206790 CASAVA_Build 4 57815778 1I TCTTGGAGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 8 9 206791 CASAVA_Build 4 57825783 1D ATACTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 28 1 11 16 T 15 14 206792 CASAVA_Build 4 57827748 12I ATATTGGAGG ------------/CTGTTTGAAGGA CTAACCTCAT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 CTGTTTGAAGGA 0 1 206793 CASAVA_Build 4 57831947 1I ACAACTTTTT -/C CCCCCAGCTT 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 C 5 6 206794 CASAVA_Build 4 57844191 45I AGCAGACACA ---------------------------------------------/TACCAGAGTGGAGGGATGTCTAGGCTTCAATCCCATCATGTATGT TATCCTTCAG 3070 hom 105 het 30 0 36 4 TACCAGAGTGGAGGGATGTCTAGGCTTCAATCCCATCATGTATGT 0 1 206795 CASAVA_Build 4 57845522 1I TTCAAAGGGG -/A AAATGTATCT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 3 4 206796 CASAVA_Build 4 57868150 2D GGTAAAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 13 11 206797 CASAVA_Build 4 57868688 3D AGCCTTTCTG AAT/--- AATATCCAGA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 AAT 2 1 206798 CASAVA_Build 4 57870524 2D TGTATGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 99 het 43 0 34 9 TG 9 8 206799 CASAVA_Build 4 57871415 1I TATCTTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 35 1 30 4 T 10 11 206800 CASAVA_Build 4 57875487 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1779 het 75 hom 8 1 5 2 A 15 14 206801 CASAVA_Build 4 57881703 2D CAGATTTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 5 A 14 12 206802 CASAVA_Build 4 57887807 4I TAAGAAGATC ----/TTTG TTAGTTGCAG 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 TTTG 0 1 206803 CASAVA_Build 4 57889611 1D ACACATGGGG A/- ACTGTCATGG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 2 1 206804 CASAVA_Build 4 57891866 1I TGTATTCTTT -/A CCATCTATTA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 0 1 206805 CASAVA_Build 4 57893928 2D3M10I GTTTAGAAAG CACAG----------/--CAGTATTATTGGT TCTTGGTAAG 3070 het 3070 ref 46 26 16 6 N/A 0 0 206806 CASAVA_Build 4 57895667 1D GTGGGTTGGT G/- GATCCTGGAT 3070 het 3070 ref 56 29 22 6 G 2 1 206807 CASAVA_Build 4 57901538 1D ATGTTGTGAG A/- AGAGATATTT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 2 1 206808 CASAVA_Build 4 57902835 4I GGATTTTTAG ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTTA 1 2 206809 CASAVA_Build 4 57920555 2I TCAAAAACTC --/AT GTGAACACAG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 AT 0 1 206810 CASAVA_Build 4 57934927 9I TTAAATAGGC ---------/ATGATTGGT TAAATCACTG 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 ATGATTGGT 0 1 206811 CASAVA_Build 4 57951029 1I CTGAACAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 11 12 206812 CASAVA_Build 4 57955784 1I AGATGCAGAT -/A AAAAATTCAG 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 A 5 6 206813 CASAVA_Build 4 57968127 1D TCCCATGTTT A/- AAAAAAGGAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 6 206814 CASAVA_Build 4 57991218 3D CTGTATTAAC TGA/--- TGATGGTGGG 3070 het 3070 ref 53 22 19 14 TGA 2 1 206815 CASAVA_Build 4 57999945 1D TTTTTTTTTT G/- GGATGGAGTC 2672 hom 31 het 15 0 11 4 G 3 2 206816 CASAVA_Build 4 58000419 6D AATGGAACAG AAGAGA/------ GTCCAGAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 19 5 AAGAGA 1 0 206817 CASAVA_Build 4 58001179 5D GACTCCATCT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 20 15 206818 CASAVA_Build 4 58003009 7D CAATCACGTT TCTGTTA/------- TCTGTTAAGT 3070 hom 99 het 34 0 33 4 TCTGTTA 2 1 206819 CASAVA_Build 4 58013215 4D TCTTCCTCTT TGAC/---- TGTATTATTT 3070 het 3070 ref 37 22 14 6 TGAC 1 0 206820 CASAVA_Build 4 58014792 1I CTGAGGCCAC -/T GAAGCCTGCC 3070 het 3070 hom 38 12 14 12 T 0 1 206821 CASAVA_Build 4 58024650 1D AGTTTTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 A 11 10 206822 CASAVA_Build 4 58034149 1D CTGCACCCCC T/- GTCCAACCAG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 1 0 206823 CASAVA_Build 4 58037005 2D TTTAAAGGCT TA/-- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 TA 1 0 206824 CASAVA_Build 4 58039301 1D TTAGAATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 A 11 10 206825 CASAVA_Build 4 58045822 3I TTTTCAAAAT ---/AGC AGCAGCAGCA 3070 het 3070 hom 44 19 16 9 AGC 3 4 206826 CASAVA_Build 4 58048947 3I GCAGAAAGAG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 11 14 206827 CASAVA_Build 4 58074700 1I TCCCTATCAT -/A AATTTTATAT 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 A 2 3 206828 CASAVA_Build 4 58097702 3I AGGTTTTTAA ---/CTT CTTTGCCATG 2914 het 2914 ref 16 9 6 1 CTT 1 2 206829 CASAVA_Build 4 58135099 1D GACACTCAAT A/- AATGTTTGAG 3070 het 3070 hom 22 9 10 4 A 3 2 206830 CASAVA_Build 4 58136903 2D GAACTCTGAC AT/-- ATATATCACC 3070 het 3070 hom 36 15 17 6 AT 4 3 206831 CASAVA_Build 4 58138158 1D AAAGTATATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 T 10 9 206832 CASAVA_Build 4 58140170 6D CATTACACTG GGATTA/------ GGGATTAGGG 3070 het 3070 ref 39 19 19 4 GGATTA 1 0 206833 CASAVA_Build 4 58158007 1D AAGTGTAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 14 9 T 10 9 206834 CASAVA_Build 4 58160103 2D TTGGTTTCCT GA/-- GTAAGATGGG 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 GA 1 0 206835 CASAVA_Build 4 58175813 1D TAATAGCAAC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 107 het 42 0 36 6 T 9 8 206836 CASAVA_Build 4 58185153 1I CATTTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 10 11 206837 CASAVA_Build 4 58188146 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 16 1 11 5 A 12 11 206838 CASAVA_Build 4 58199525 2I AAAGAAATCA --/TG TGATTTTTGC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TG 1 2 206839 CASAVA_Build 4 58199920 1D AAGTTAACCA T/- TTGGAATATG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 3 2 206840 CASAVA_Build 4 58201677 1I GAATTAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 10 206841 CASAVA_Build 4 58203546 3I TGGGACCATG ---/ATA ATAATAGTAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATA 2 3 206842 CASAVA_Build 4 58208915 1D TGGGATTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 12 11 206843 CASAVA_Build 4 58244260 1I CTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 8 9 206844 CASAVA_Build 4 58244581 1I AGTAAAACTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 9 206845 CASAVA_Build 4 58246655 1I TTATCTCCAT -/C AAAGTTTCAG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 C 0 1 206846 CASAVA_Build 4 58248584 2D CGGGGAGCTA AC/-- ACATCACACA 3070 hom 89 het 36 0 29 10 AC 2 1 206847 CASAVA_Build 4 58250499 1D TATACATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 28 1 23 4 T 12 11 206848 CASAVA_Build 4 58256428 4I ATCACTGGAA ----/AGCT AGCTCACATT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 AGCT 1 2 206849 CASAVA_Build 4 58257849 1D CTTAACGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 29 1 23 5 T 12 11 206850 CASAVA_Build 4 58258954 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 8 9 206851 CASAVA_Build 4 58262133 1D TATTGTTGCC A/- TTTTTATTTC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 1 0 206852 CASAVA_Build 4 58263099 4D TTAATCTATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 23 0 18 6 T 16 12 206853 CASAVA_Build 4 58263454 2I CATTTTAGAA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 9 11 206854 CASAVA_Build 4 58263625 3I11M1D CAGCAGAAGT ---GTTTTGTAATTC/AACATTCTACAATT- TCATTGTAGA 3070 hom 42 het 18 0 15 4 N/A 0 0 206855 CASAVA_Build 4 58264008 1I GTGGGCATCC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 8 9 206856 CASAVA_Build 4 58264194 4I TCTATTGAGG ----/TGAC TGACCATATA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TGAC 1 2 206857 CASAVA_Build 4 58264312 1D GTGGAATTAA C/- TTTTCTATGT 3070 het 19 hom 26 1 24 2 C 1 0 206858 CASAVA_Build 4 58264404 1I TGTTTTTGTT -/G CTGTTGTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 0 1 206859 CASAVA_Build 4 58265529 1I CACTGTCAGT -/G GGGTATTAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 3 4 206860 CASAVA_Build 4 58265867 6I GATGGATTTC ------/TTGTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TTGTTT 0 1 206861 CASAVA_Build 4 58266586 1D GTAAATCTTA G/- GTGTGATTGC 3070 hom 96 het 40 0 33 9 G 2 1 206862 CASAVA_Build 4 58269399 1D AAGTTTTCTA G/- CATAACCTAT 3070 hom 90 het 42 0 31 12 G 1 0 206863 CASAVA_Build 4 58281569 1I GACTCCTCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 638 hom 19 2 15 2 A 11 12 206864 CASAVA_Build 4 58281839 1I CTCCTCCATA -/T TCCCTTTACT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 1 2 206865 CASAVA_Build 4 58282687 1I CCTTGTAAAA -/T TTTTATGTCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 4 5 206866 CASAVA_Build 4 58283021 1I CCAATATATA -/T TTTTTTAATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 6 7 206867 CASAVA_Build 4 58285317 3D TGGCAAAATT AAG/--- AAGATTTCAC 3070 hom 99 het 38 0 33 6 AAG 2 1 206868 CASAVA_Build 4 58286372 1I TATTGGTTGC -/A AAAAAATTGT 3070 het 367 hom 35 1 31 3 A 6 7 206869 CASAVA_Build 4 58286811 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 6 7 206870 CASAVA_Build 4 58287245 1D TCAAATGAGA T/- TCACTCACCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 1 206871 CASAVA_Build 4 58294916 1I TCTTCCTATT -/C AATAATAATT 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 C 0 1 206872 CASAVA_Build 4 58347929 6D AAAGTTCTAG AATGTA/------ AATCCCAGAA 3070 hom 73 het 28 0 25 4 AATGTA 1 0 206873 CASAVA_Build 4 58360484 1D AGAATTGAGG A/- AAAAAAGTGG 3070 hom 123 het 48 0 38 10 A 7 6 206874 CASAVA_Build 4 58377549 1I TGGTTATTAT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 A 7 8 206875 CASAVA_Build 4 58405358 1D CTACTTGGGA G/- GATAGATCAC 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 G 2 1 206876 CASAVA_Build 4 58407092 1I TAACTCCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 10 11 206877 CASAVA_Build 4 58411582 1D AAGGCCAGGA C/- ACCCTTGTGT 3070 het 3070 ref 52 25 23 6 C 1 0 206878 CASAVA_Build 4 58419764 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 AC 6 7 206879 CASAVA_Build 4 58425594 1D ATAAGCAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 10 13 10 A 10 9 206880 CASAVA_Build 4 58429877 32D TCTGTCCTTT TATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------- TATATATATA 2393 hom 21 het 9 0 6 7 TA 24 8 206881 CASAVA_Build 4 58442296 1D ATTAATATCT C/- TGACATGATG 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 C 1 0 206882 CASAVA_Build 4 58446484 1D GCTTTTTTTT A/- AAATTATTAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 4 3 206883 CASAVA_Build 4 58472005 12D CTTGTCTTTG TATAATATTTAA/------------ TATAATATTT 3070 het 2890 hom 23 8 9 10 TATAATATTTAA 2 1 206884 CASAVA_Build 4 58474212 2I TCTATCTCTC --/TA TATATATGCA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 TA 3 4 206885 CASAVA_Build 4 58478285 1D TTTAAAAAAA T/- TTTTCTGTTG 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 5 4 206886 CASAVA_Build 4 58486214 3I ACAAAACAGC ---/AAA AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 A 8 11 206887 CASAVA_Build 4 58486411 1I TGCAACATCT -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 6 7 206888 CASAVA_Build 4 58497663 1D TACCTGTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 10 9 206889 CASAVA_Build 4 58502359 1D AATAATTAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 8 206890 CASAVA_Build 4 58503209 1I GGAGAGCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 9 10 206891 CASAVA_Build 4 58514619 4I AAGAAAGAAA ----/GAGG GAGGGAGGGA 1694 het 1694 ref 23 12 5 6 GAGG 3 4 206892 CASAVA_Build 4 58515913 1I AAGTTTGTTT -/C TTGCATACTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 0 1 206893 CASAVA_Build 4 58517597 1D ATAAAACTCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 8 7 206894 CASAVA_Build 4 58519434 1I CTTTATTAGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 T 7 8 206895 CASAVA_Build 4 58520705 2I GCCATTTCAC --/AT GTCTCTATCT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 AT 0 1 206896 CASAVA_Build 4 58535704 13D TACAGGTGTG AGCCACCGCGTCC/------------- AGCCTATGAC 3070 het 3070 ref 30 21 11 1 AGCCACCGCGTCC 1 0 206897 CASAVA_Build 4 58545471 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 9 8 206898 CASAVA_Build 4 58550128 1D GATTAAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 11 10 206899 CASAVA_Build 4 58567875 1D CTTTCATGAT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 A 8 7 206900 CASAVA_Build 4 58573072 1D CACTTTTGAC A/- AGGGTGTTCA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 A 2 1 206901 CASAVA_Build 4 58593026 1D CTTCTCAGAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 9 8 206902 CASAVA_Build 4 58598370 1I ATTAACGCTG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 206903 CASAVA_Build 4 58614223 1D TTATAATTGG T/- GACCAAAGTG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 1 0 206904 CASAVA_Build 4 58616624 1D TCTTTAGGGC A/- GGGGCAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 1 0 206905 CASAVA_Build 4 58619271 1D GTTTTTGATG T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 7 6 206906 CASAVA_Build 4 58624633 1I AGTAATGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 9 10 206907 CASAVA_Build 4 58625652 2D TGTTCCTATA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 22 0 17 7 T 16 14 206908 CASAVA_Build 4 58628941 1D AATTCACAAG A/- AAAAAACAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 6 206909 CASAVA_Build 4 58630294 1I TTTTTCAGCC -/A AAAAAAAAAA 2625 het 2625 ref 28 11 6 11 A 10 11 206910 CASAVA_Build 4 58630338 1D CCGAGCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 116 hom 34 1 21 12 T 15 14 206911 CASAVA_Build 4 58633866 2D TAGAGTATTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 AT 6 5 206912 CASAVA_Build 4 58639749 1I GTTATTTGAT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 7 8 206913 CASAVA_Build 4 58643083 2I AAGTTCAATT --/GA AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 GA 0 1 206914 CASAVA_Build 4 58647402 1I32M1I TTGTGATACG -TTTGGTTTAAATTAAACCCATACTATAGCTTC-/ATTTGGTTTAAATTAAACCCATACTATAGCTTCT TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 33 19 17 5 N/A 0 0 206915 CASAVA_Build 4 58647505 3I CAAATGCAGG ---/TTT TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 8 11 206916 CASAVA_Build 4 58648006 1D GAATTCTTAA T/- TTTTTTTTTA 2667 het 2667 ref 22 13 7 2 T 10 9 206917 CASAVA_Build 4 58650696 1D GACACTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 12 11 206918 CASAVA_Build 4 58652467 1D CAAATTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 38 1 19 19 T 15 14 206919 CASAVA_Build 4 58653921 1D TTATATCTCC T/- TTTTCTGTTG 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 T 5 4 206920 CASAVA_Build 4 58654875 4I AGAAAAGATG ----/AGTA AGTAAGTGAA 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 AGTA 1 2 206921 CASAVA_Build 4 58657005 1I TGAGTGGCTC -/T TTTCCAATTA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 T 3 4 206922 CASAVA_Build 4 58658089 1D TTCAAGTGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 22 14 7 T 9 8 206923 CASAVA_Build 4 58659099 1D ATATGAAAAC A/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 A 1 0 206924 CASAVA_Build 4 58659200 1I TGTTACAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 9 10 206925 CASAVA_Build 4 58659345 1D ATTCATTAAT A/- ATATGGTTAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 2 1 206926 CASAVA_Build 4 58661341 1D TCAGCTTAAG A/- AGCTTTTGGA 3070 het 3070 ref 42 25 10 8 A 2 1 206927 CASAVA_Build 4 58661999 1D TCCTTTTCAA T/- TTTTTGGAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 6 5 206928 CASAVA_Build 4 58663323 20D TCTGCTGTTT TTTTGTTTTGTTTTGTTTTG/-------------------- TTTTGTTTTG 3070 het 1814 hom 36 8 14 15 TTTTG 7 3 206929 CASAVA_Build 4 58664182 1D CCCAAGACCG C/- GAATTCAATT 3070 het 3070 hom 52 24 21 7 C 1 0 206930 CASAVA_Build 4 58665964 1D ACAAGTTATG A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 7 6 206931 CASAVA_Build 4 58666534 3I TTGTCTGAGA ---/GCT GAGTAGTATA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 GCT 0 1 206932 CASAVA_Build 4 58668381 1D CATATTTAAA G/- TAATAATCTA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 G 1 0 206933 CASAVA_Build 4 58668956 1I CATTGCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 10 11 206934 CASAVA_Build 4 58669754 2I ACTCACAATC --/TT TTTTTTTTTG 3021 het 3021 ref 39 20 11 8 T 9 11 206935 CASAVA_Build 4 58670473 2D TCTGGTTCCC TG/-- CTAAGATAAA 3070 het 3070 ref 50 27 20 4 TG 1 0 206936 CASAVA_Build 4 58670648 1I ATATTTATCC -/T TTTTTACCTT 3070 het 3070 hom 40 11 24 5 T 5 6 206937 CASAVA_Build 4 58671167 1D GGCCCTATCT G/- GGAAAGGGTC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 G 3 2 206938 CASAVA_Build 4 58671608 1D AAGAAGTGAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 A 9 8 206939 CASAVA_Build 4 58671804 5D TTTTTTTAAA TGTCT/----- TGTCTTTAAC 1922 het 1922 ref 26 15 6 5 TGTCT 2 1 206940 CASAVA_Build 4 58672359 4I AGGGTTGTTT ----/AGTG GATACAGAGT 3070 het 3070 ref 52 28 20 4 AGTG 0 1 206941 CASAVA_Build 4 58675776 3D65M6I AGGAAATGTT ATGATAATAATATAAGCAAATATGAAGTACTTTTATGCAAAAGCTTAGACTAAATGCAATCAACATGA------/---ATAATAATATAAGCAAATATGAAGTACTTTTATGCAAAAGCTTAGACTAAATGCAATCAACATGAAATCCT AATCCTAAAT 3070 het 3070 ref 51 40 31 3 N/A 0 0 206942 CASAVA_Build 4 58679289 1D3M6D GTATGCACCT GGTACTGGAT/-GTA------ CTCCTAGGTA 3070 het 3070 hom 43 21 20 5 N/A 0 0 206943 CASAVA_Build 4 58682304 1D AGATATATCT A/- AGACAATTTC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 2 1 206944 CASAVA_Build 4 58700795 3D CAAATTTGGT GAA/--- GAAGAACATA 3070 het 3070 hom 27 13 12 5 GAA 3 2 206945 CASAVA_Build 4 58703290 1D TTTACTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 12 11 206946 CASAVA_Build 4 58711505 1D AAACCAGTGC A/- AAAAAGCCTG 3070 hom 81 het 32 0 26 6 A 6 5 206947 CASAVA_Build 4 58717359 1I ATAACATTGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 8 9 206948 CASAVA_Build 4 58723237 1D AGTCTTCGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 T 12 11 206949 CASAVA_Build 4 58725137 1I GCAAATTTTC -/T TTTTTCCCCA 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 T 5 6 206950 CASAVA_Build 4 58733616 1D AGTTAACGTC A/- AAAGACTTCA 3070 hom 89 het 36 0 30 7 A 4 3 206951 CASAVA_Build 4 58740569 1D AATTACATTG A/- TTTTTCAAGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 0 206952 CASAVA_Build 4 58754523 1D AAAAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 11 10 206953 CASAVA_Build 4 58755414 18D ATGTTTATAC ATATACATATGTGTGTAT/------------------ ATATACATAT 3070 hom 90 het 31 0 31 10 ATATACATATGTGTGTAT 2 1 206954 CASAVA_Build 4 58758057 4D GTAGAGTCAG CAGT/---- CAAACTGAGT 3070 het 3070 hom 44 19 21 7 CAGT 1 0 206955 CASAVA_Build 4 58769583 1I ATGAAATAGG -/C ATTGTATTGG 3070 het 3070 hom 52 21 28 3 C 0 1 206956 CASAVA_Build 4 58807568 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2413 het 584 hom 11 3 7 1 A 13 12 206957 CASAVA_Build 4 58808108 1D AATGACATTC A/- AAACCTCCCA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 4 3 206958 CASAVA_Build 4 58820930 3I TGCAAATTAA ---/AAC AACAAGATAC 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 AAC 1 2 206959 CASAVA_Build 4 58822920 1I TACTGTAGGA -/T TGTTGACAAG 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 T 1 2 206960 CASAVA_Build 4 58840476 1I TTTTACCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 11 12 206961 CASAVA_Build 4 58845061 1D ATTAACAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 504 hom 14 2 7 6 T 14 13 206962 CASAVA_Build 4 58856314 3D GGAGCGACCT GAG/--- GAGGAGCAGT 3070 het 3070 ref 24 11 9 5 GAG 3 2 206963 CASAVA_Build 4 58884753 3I TGAGATCACA ---/ATC ATCTATTATA 3070 het 3070 ref 62 31 26 5 ATC 1 2 206964 CASAVA_Build 4 58895041 1I TGAGATGAAG -/C TTCCAGAGGA 2930 het 2930 ref 25 15 7 3 C 0 1 206965 CASAVA_Build 4 58895694 1D GAGAAAAAAG A/- GTACAAAGAA 2825 het 2825 ref 17 9 6 2 A 1 0 206966 CASAVA_Build 4 58901691 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAGAG 1834 het 1834 ref 13 5 4 4 A 8 7 206967 CASAVA_Build 4 58903904 1I GAGAAATCTT -/A AAAAAAATTT 2752 het 2752 ref 29 18 6 5 A 7 8 206968 CASAVA_Build 4 58911945 1I ATATGAAAAA -/G TAATTATTGC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 G 0 1 206969 CASAVA_Build 4 58923137 1D CCACCAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2057 hom 26 10 11 5 T 11 10 206970 CASAVA_Build 4 58926472 1I AGCAAATACT -/C CCCAATCAAG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 C 3 4 206971 CASAVA_Build 4 58926814 4I AGACAGAAAC ----/TCAG TCAATCAGTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TCAG 0 1 206972 CASAVA_Build 4 58929712 1D ATTGTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1717 hom 36 8 9 19 T 15 14 206973 CASAVA_Build 4 58931819 1D TATTTTCTTT A/- TGCAATCCAC 3070 het 3070 ref 48 26 14 9 A 1 0 206974 CASAVA_Build 4 58951015 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTCCAAT 1599 het 868 hom 7 3 4 0 T 6 5 206975 CASAVA_Build 4 58957532 1D AAATAACAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 10 9 206976 CASAVA_Build 4 58970221 7I GTTGTTGTTG -------/TTGTTGT TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 31 16 11 7 TTGTTGT 1 2 206977 CASAVA_Build 4 58976301 1I GAAAAGTGTG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 47 het 33 1 30 2 A 7 8 206978 CASAVA_Build 4 58978682 1D TTGATATCTA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 9 8 206979 CASAVA_Build 4 58981074 1I ATTTTTAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 9 10 206980 CASAVA_Build 4 58997072 1I TATGACAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 9 9 8 T 11 12 206981 CASAVA_Build 4 59056279 1D GGAAAAAAAT A/- AAAATAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 A 5 4 206982 CASAVA_Build 4 59057499 1I AGTGGTGGAC -/G GGCGAGCGAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 G 2 3 206983 CASAVA_Build 4 59058423 5I CTTTAAAATT -----/CACTG CTCTTGGTTT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 CACTG 0 1 206984 CASAVA_Build 4 59060435 2D CTAGCTCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 954 hom 32 7 11 15 A 13 11 206985 CASAVA_Build 4 59061690 1I GAAAATTGGC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 A 7 8 206986 CASAVA_Build 4 59063665 1I26M2I AGATGGAGAC -AAAATCAGTGTTATACATTGGTTTAT--/AAAAATCAGTGTTATACATTGGTTTATAG AGTCTGGCTT 3070 het 3070 hom 41 20 28 2 N/A 0 0 206987 CASAVA_Build 4 59067883 2D AAGCACAAAC AT/-- ATGATTTCAG 3070 het 3070 ref 33 21 12 0 AT 2 1 206988 CASAVA_Build 4 59071090 1D TATTTATTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 9 8 206989 CASAVA_Build 4 59071703 1I ATTCTCTTAT -/G TATCTTTTAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 0 1 206990 CASAVA_Build 4 59072927 1D GATATCATTT C/- TTGCTTGTTC 3070 het 3070 hom 45 19 23 4 C 1 0 206991 CASAVA_Build 4 59080993 1I GCTTTAGAGA -/C CCTGAAGGTC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 2 3 206992 CASAVA_Build 4 59084400 1I CTGAAATTAT -/A TCCATCTGCT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 A 0 1 206993 CASAVA_Build 4 59087605 1I TTTCTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 10 11 206994 CASAVA_Build 4 59090257 1I ATAAATGAAC -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 A 7 8 206995 CASAVA_Build 4 59091061 10D TAAATGCAAA TATAGATATG/---------- TATAGATATG 3070 het 3070 ref 43 27 16 8 TATAGATATG 2 1 206996 CASAVA_Build 4 59101647 1D CTGTGACTGT A/- GCCCCGCAGA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 1 0 206997 CASAVA_Build 4 59104772 1I GCTACAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 300 hom 33 1 26 6 T 9 10 206998 CASAVA_Build 4 59110743 1I AATTGTCTTA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 7 8 206999 CASAVA_Build 4 59111259 9D TTTTAATTAC TGAATATTA/--------- TGAATATTAC 3070 het 3070 hom 30 14 15 5 TGAATATTA 2 1 207000 CASAVA_Build 4 59117631 1I CTTAAGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 10 11 207001 CASAVA_Build 4 59117964 1D CTATTATATG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 8 7 207002 CASAVA_Build 4 59124028 15I ATTGGAGAAA ---------------/GGACTAAATATATAT ATTTAGAAAG 3070 het 3070 hom 37 13 25 2 GGACTAAATATATAT 0 1 207003 CASAVA_Build 4 59128102 1D ATTGCATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 39 hom 37 1 31 5 T 11 10 207004 CASAVA_Build 4 59130427 3D CAAGAACAAC TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 61 37 17 11 TTA 4 3 207005 CASAVA_Build 4 59136782 1D TGAAGGGAGG A/- AAAAAGTGAC 3070 het 3070 hom 45 14 23 9 A 6 5 207006 CASAVA_Build 4 59144222 2D TATTGGGTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 AT 6 5 207007 CASAVA_Build 4 59147361 1D TTAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 23 1 10 12 A 11 10 207008 CASAVA_Build 4 59150978 1D GGTGGATCCC A/- AATGAATGGA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 3 2 207009 CASAVA_Build 4 59155761 1D TGTTAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 A 12 11 207010 CASAVA_Build 4 59157234 2I ATATAGCATC --/AT ATATATATAT 1473 het 1473 ref 9 4 4 1 AT 7 8 207011 CASAVA_Build 4 59159597 1D AATATATTAC A/- TAGATTTTAA 3070 het 3070 hom 37 9 21 9 A 1 0 207012 CASAVA_Build 4 59160575 2D CAGAAACATG AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 10 8 207013 CASAVA_Build 4 59162142 1I GACCAGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 10 11 207014 CASAVA_Build 4 59167567 2D AGAATATCTC TT/-- TGAAGTTTAA 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 T 3 1 207015 CASAVA_Build 4 59168273 1D AGGGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 987 het 987 ref 38 29 3 7 A 11 10 207016 CASAVA_Build 4 59169750 1D ATTTGAATAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 A 8 7 207017 CASAVA_Build 4 59187558 1D CAGTTATAAA T/- TAGCCTATCA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 2 1 207018 CASAVA_Build 4 59189373 3I AATACAAAGC ---/TAA TAATGCTCTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TAA 1 2 207019 CASAVA_Build 4 59192879 2D ATGAGCACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 39 7 18 14 T 24 22 207020 CASAVA_Build 4 59195064 2D CACTGAAAGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 60 het 33 0 21 12 AC 9 8 207021 CASAVA_Build 4 59196309 3D AGGGAGATCT TTC/--- TTTCTTTCTT 1651 hom 24 het 12 0 8 4 TTC 1 0 207022 CASAVA_Build 4 59213900 15I ATTGTGACAA ---------------/ATTGTTTGATGGTTT AAGTTTTCAC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 ATTGTTTGATGGTTT 0 1 207023 CASAVA_Build 4 59228505 1I CCAAATATAC -/T TTTTTTTATG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 7 8 207024 CASAVA_Build 4 59238541 1I TGAAAATGTG -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 T 6 7 207025 CASAVA_Build 4 59241296 3I GCTCCATGGT ---/ATA ATGAGTATTT 3070 hom 114 het 40 0 37 3 ATA 0 1 207026 CASAVA_Build 4 59247118 1D AAGTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1804 hom 24 6 11 7 A 12 11 207027 CASAVA_Build 4 59248570 1D TTTAAATACA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 T 9 8 207028 CASAVA_Build 4 59256744 2I CTCAAGAGCA --/AC AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 AC 0 1 207029 CASAVA_Build 4 59257319 17I GAAGTCATTA -----------------/TGTTAAGCTAAATAAGC CAAGCACAAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 3 TGTTAAGCTAAATAAGC 0 1 207030 CASAVA_Build 4 59269767 1I TGAGGGCTCT -/G TTCTGTTCCA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 G 0 1 207031 CASAVA_Build 4 59278369 2D GCAGAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 2146 hom 20 7 9 6 AG 7 6 207032 CASAVA_Build 4 59289762 2I GAACATATTT --/TA TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 TA 0 1 207033 CASAVA_Build 4 59294702 5I TTTTATTTAT -----/CTCTA CTCCATTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 CTCTA 0 1 207034 CASAVA_Build 4 59299585 1I TGCTTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 13 5 T 10 11 207035 CASAVA_Build 4 59299724 1D TCATTTCATG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 9 8 207036 CASAVA_Build 4 59299843 4D TCTGAGACTT AAAG/---- AAGCAACTTA 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 AAAG 1 0 207037 CASAVA_Build 4 59309437 1D ATACATAACT G/- GTATTCACAA 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 G 2 1 207038 CASAVA_Build 4 59312229 1I GAAAACATCA -/T TTTTTCCATC 3070 het 3070 ref 43 27 9 7 T 5 6 207039 CASAVA_Build 4 59312595 1D CTGGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1328 het 906 hom 11 3 3 5 T 11 10 207040 CASAVA_Build 4 59320289 4I40M8D AAATAAAAAA ----TAATTAAAGAAAGTGGTTACCTTCACATGGTAAGATTACATTTGTTTT/TAATTAATTAAAGAAAGTGGTTACCTTCACATGGTAAGATTACA-------- TTTTTTTTCT 2988 het 2988 ref 14 9 7 3 N/A 0 0 207041 CASAVA_Build 4 59326006 5D AACTTCTTAT TGAAA/----- TGAATCATTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 8 TGAAA 1 0 207042 CASAVA_Build 4 59329062 2D39M4D GACGAACAGC AGAGACAATGGGTGCTGTAATCCCAGAGAGCTATGGAGAAATGTG/--AGACAATGGGTGCTGTAATCCCAGAGAGCTATGGAGAAA---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 27 21 6 N/A 0 0 207043 CASAVA_Build 4 59336443 2I ATTATAAGGG --/TA TAGTTAATAC 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 TA 1 2 207044 CASAVA_Build 4 59345245 1D TACATATTAC T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 T 8 7 207045 CASAVA_Build 4 59364334 3D ACATGGCTGG GGA/--- GGTCTCATAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 GGA 1 0 207046 CASAVA_Build 4 59365575 1D TAGGAAGAGG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 36 18 12 6 T 7 6 207047 CASAVA_Build 4 59366418 5D TCTGTTGACT TATAA/----- TATGTTACAT 3070 het 3070 hom 43 20 21 6 TATAA 1 0 207048 CASAVA_Build 4 59366692 1D TTTCCTGATG T/- TTTTCCCTGT 3070 het 3070 ref 51 26 18 9 T 5 4 207049 CASAVA_Build 4 59366788 1I ATTTTATAAG -/A ACATGTCTTA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 1 2 207050 CASAVA_Build 4 59369103 2D ACTCAGGAAA CT/-- CTCTGTATCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 CT 3 2 207051 CASAVA_Build 4 59370915 1I ACACGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 34 1 28 5 T 10 11 207052 CASAVA_Build 4 59371879 4I AATAAATGCC ----/AATT AATTTTTTTG 2052 het 2052 ref 24 15 5 4 AATT 1 2 207053 CASAVA_Build 4 59373821 1D CAATCCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 10 9 207054 CASAVA_Build 4 59377110 1D CTGTTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 24 0 20 4 A 12 11 207055 CASAVA_Build 4 59389222 2D CACAAAAGCA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 23 hom 29 1 10 18 T 11 9 207056 CASAVA_Build 4 59394972 1I GTGTGGGACC -/T AGAAATAGGC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 0 1 207057 CASAVA_Build 4 59395830 4I TTAGACAGAA ----/AGAC AGAAAATTCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AGAC 0 1 207058 CASAVA_Build 4 59396891 1I ACATTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 891 hom 34 2 28 4 T 10 11 207059 CASAVA_Build 4 59400265 1I CTCTCATAGA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 6 7 207060 CASAVA_Build 4 59401641 1I TGTCTTACAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 8 9 207061 CASAVA_Build 4 59403050 1I GGGGTTGGAG -/C CCCCATACAG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 C 4 5 207062 CASAVA_Build 4 59404961 2I TAAAAATGAT --/AA AAAAAAAAAA 2610 het 2610 ref 30 16 8 6 A 12 14 207063 CASAVA_Build 4 59412144 1I GAGACACAAC -/A AAAAAAAGAG 1951 het 1951 ref 11 5 4 2 A 7 8 207064 CASAVA_Build 4 59414488 4I CAATTGGCTC ----/TCTG TCTATTATTG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TCTG 0 1 207065 CASAVA_Build 4 59424139 2D TGCAATTCAT TA/-- TATGTCTTAG 3070 het 3070 ref 41 18 15 11 TA 2 1 207066 CASAVA_Build 4 59427493 3I TAATACTCCA ---/CTG CTAAGATAGA 3070 hom 160 het 56 0 54 2 CTG 0 1 207067 CASAVA_Build 4 59484584 1D CTTCTGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 30 4 9 17 A 11 10 207068 CASAVA_Build 4 59487429 2D GTGCTTTTAA TT/-- TTGTTTTTAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 4 2 207069 CASAVA_Build 4 59489298 1D68M4D GAGCTGCTAG AAAAAAAACCTGCTCAGAAATAATTTATTTTAATATATTACATATTTTAAAAAATGTTTTCCTCTCTCATTCT/-AAAAAAACCTGCTCAGAAATAATTTATTTTAATATATTACATATTTTAAAAAATGTTTTTCTGTCTCA---- TTATTAATAG 3070 hom 66 het 24 0 23 12 N/A 0 0 207070 CASAVA_Build 4 59491241 2D AAAGAAAATC AT/-- ATGAATGTGT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 AT 2 1 207071 CASAVA_Build 4 59491446 4D23M1I GATGAAAATA TATTTATTTTAACACTATTAAACATTT-/----TATTTTAACACTATTAAACATTTA ATATATACTG 3070 hom 81 het 25 0 28 3 N/A 0 0 207072 CASAVA_Build 4 59492023 4I TGGCCTACTA ----/TTTG TTTGGTAACT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TTTG 1 2 207073 CASAVA_Build 4 59492358 1I TTACAAAAAA -/G AAGAATATTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 0 1 207074 CASAVA_Build 4 59497599 7D AGCAGAAGTC TTACATA/------- TTACATACTA 3070 hom 48 het 19 0 17 4 TTACATA 2 1 207075 CASAVA_Build 4 59501421 2I TAAATATTTT --/TG TGTTTCTGTT 3070 hom 144 het 56 0 48 8 TG 1 2 207076 CASAVA_Build 4 59503162 1D CCCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 43 0 26 17 T 15 14 207077 CASAVA_Build 4 59515681 22D GGATTAGGAT ACACACACACACACACACACAC/---------------------- ACACACACAC 3070 hom 57 het 19 0 20 3 AC 20 9 207078 CASAVA_Build 4 59518624 1D CACATTCTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 7 207079 CASAVA_Build 4 59520124 1I TACATGATTT -/G TTTCCCCCTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 0 1 207080 CASAVA_Build 4 59523109 1D ATATTCAGGT A/- AAAAATAATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 6 5 207081 CASAVA_Build 4 59523342 1I TAAATTATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 10 207082 CASAVA_Build 4 59524643 1I AGGTTTCATG -/A AAAAAACATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 7 207083 CASAVA_Build 4 59531767 1D TATTTTTTAA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 8 7 207084 CASAVA_Build 4 59540672 1I CAATTACCAC -/A AAAAAAAAAA 1426 het 1426 ref 38 25 4 9 A 11 12 207085 CASAVA_Build 4 59548619 1D ATACAGAAAT A/- TTTTTTAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 A 1 0 207086 CASAVA_Build 4 59550836 1I TTTTTCTCCA -/T TTTTTTTTTT 2976 het 2976 ref 28 15 8 5 T 10 11 207087 CASAVA_Build 4 59560637 1D CCCAGCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 12 11 207088 CASAVA_Build 4 59563060 4D ATATATATAT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 48 het 17 0 17 3 AG 10 8 207089 CASAVA_Build 4 59565174 1D CTTTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 30 1 19 10 T 17 16 207090 CASAVA_Build 4 59573596 1I GAATTTTTAG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 7 8 207091 CASAVA_Build 4 59576738 1I TCAATTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 A 10 11 207092 CASAVA_Build 4 59580901 1D TACACAATAA T/- TTTTTTTTAC 2559 het 2559 ref 23 12 6 5 T 9 8 207093 CASAVA_Build 4 59581191 2I GGGATCTCTA --/TT TTTTTTCATG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 6 8 207094 CASAVA_Build 4 59583882 3D CTGTTAAATC AGA/--- AAGAGAATTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AGA 1 0 207095 CASAVA_Build 4 59587108 1I AATAATTGAT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 7 8 207096 CASAVA_Build 4 59589262 2D GGTGGGAAAC AG/-- AGATAACAGA 3070 het 3070 ref 38 24 14 0 AG 2 1 207097 CASAVA_Build 4 59590165 4I AGGAAGATAA ----/TATT TATTAGAATT 2199 het 2199 ref 19 13 6 0 TATT 1 2 207098 CASAVA_Build 4 59603813 1D TGAAAAATTG A/- AAAATAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 5 4 207099 CASAVA_Build 4 59614200 3D TTGAAATTCC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 64 het 28 0 22 6 TTG 7 6 207100 CASAVA_Build 4 59614385 1I GCCTGGCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 32 1 23 8 T 11 12 207101 CASAVA_Build 4 59615429 1D TGGTTATTTG C/- TCTTTTAGGC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 207102 CASAVA_Build 4 59625534 3D CATATTTGAT AAA/--- AAAAAAAAGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 11 8 207103 CASAVA_Build 4 59642811 12D TCTTTCTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2999 het 1797 hom 31 12 11 10 T 27 15 207104 CASAVA_Build 4 59643436 1I GGAGAAAAAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 7 8 207105 CASAVA_Build 4 59645886 2I TAAAAAAAAA --/AT TTGTGCAATA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 AT 0 1 207106 CASAVA_Build 4 59647774 1I ATAAAAATTA -/C TGATTGACGT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 C 0 1 207107 CASAVA_Build 4 59655085 1D ACAATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 30 10 T 12 11 207108 CASAVA_Build 4 59667983 107D AGATAAAGCT GTTCTTTTTCTCTGTGTAGGGAGGACAGCTCTCACATGAGGGTCTTCTGATCTACTTTCAGAGAAGGTAAAGATCAAAGCGTCTTTCTAGCACGCACTCTTTCTACG/----------------------------------------------------------------------------------------------------------- ACCTGCTTCA 2799 het 2799 ref 28 33 7 14 GTTCTTTTTCTCTGTGTAGGGAGGACAGCTCTCACATGAGGGTCTTCTGATCTACTTTCAGAGAAGGTAAAGATCAAAGCGTCTTTCTAGCACGCACTCTTTCTACG 1 0 207109 CASAVA_Build 4 59676641 1I AATGCAGCAC -/A AAAAACCTCA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 5 6 207110 CASAVA_Build 4 59687054 1D CTGGATATTC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 78 het 34 0 27 8 T 8 7 207111 CASAVA_Build 4 59688584 4I TTTAATAAAC ----/TATT TATGAATAGT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 TATT 0 1 207112 CASAVA_Build 4 59689632 2I TTTAGTTATA --/TT TGTTATGAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 3 207113 CASAVA_Build 4 59690190 1I CTTAGATTTA -/T TTTTTAAATG 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 5 6 207114 CASAVA_Build 4 59693512 1D ATTCTAATGA T/- TTTCAGCCCC 3070 hom 135 het 50 0 46 6 T 4 3 207115 CASAVA_Build 4 59697103 6D CTATTCTTAC TTCAAT/------ TTCAATTTTA 3070 hom 102 het 37 0 34 5 TTCAAT 2 1 207116 CASAVA_Build 4 59702684 4D AAGAATACAA ACTT/---- ACTTATAATT 3070 hom 129 het 46 0 44 5 ACTT 2 1 207117 CASAVA_Build 4 59703531 1D GTATTAACTA T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 7 6 207118 CASAVA_Build 4 59704918 5D ATGCATGAAA TGTAT/----- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 TGTAT 1 0 207119 CASAVA_Build 4 59705395 3D GAGTAAAAAG TGA/--- TGATGAAGTA 3070 het 2207 hom 26 6 16 5 TGA 3 2 207120 CASAVA_Build 4 59705503 1D AAATCTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 T 12 11 207121 CASAVA_Build 4 59705602 1D CAGATTTCAT A/- GTATAAATTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 1 0 207122 CASAVA_Build 4 59708592 1D TCTTTGAGAT A/- GGGGACAATA 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 A 1 0 207123 CASAVA_Build 4 59710305 4D66M2D CAGAATAGAT CTAACTGAGGAAAGACTCTCATAACTTGAAGACCAGTTTTTCAAATAAACTCAGTTAGACAAAATGTAGGAA/----CTGAGGAAAGACTCTCATAACTTGAAGACCAGTTTTTCAAATAAACTCAGTTAGACAAAATGTAGG-- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 26 28 16 18 N/A 0 0 207124 CASAVA_Build 4 59712161 3I GAGGAACTAG ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 A 9 12 207125 CASAVA_Build 4 59713713 1D TAGAATTAGG A/- AAAAAAAAAA 2713 het 2713 ref 38 19 8 11 A 11 10 207126 CASAVA_Build 4 59722962 1I56M5D AGTATGAATA -CCAAAAAAAGCATTCTCCTAAGAATACTATGCCACATCTAAAAAAACAAAAAATAATAACT/TCAAAAAAAAGCATTCTCCTAAGAATACTATGCCACATCTAAAAAAACAAAAAATAA----- TAATATTATC 3070 het 3070 ref 38 31 30 8 N/A 0 0 207127 CASAVA_Build 4 59723112 2D GTATTGAGCC AT/-- ATCCACATAC 3070 het 3070 ref 43 28 11 5 AT 2 1 207128 CASAVA_Build 4 59723828 1D AGAAAGTCCG A/- GGGGGAAATT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 A 1 0 207129 CASAVA_Build 4 59725183 1I TGTCTTACTA -/G AAAAAAATTG 1893 het 1893 ref 34 24 4 6 G 0 1 207130 CASAVA_Build 4 59725654 1D CTATAGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 11 10 207131 CASAVA_Build 4 59726848 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 9 7 A 14 16 207132 CASAVA_Build 4 59727106 1I GTGATACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 A 11 12 207133 CASAVA_Build 4 59727227 2D CATTTAATTT GG/-- TGTAGTTCAG 3070 het 3070 ref 25 16 7 3 G 2 0 207134 CASAVA_Build 4 59730636 3I TAAAAAAGAG ---/ATA ATAACAAGTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 ATA 1 2 207135 CASAVA_Build 4 59736199 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 1699 hom 17 4 12 1 A 9 8 207136 CASAVA_Build 4 59740033 1D ATTAAAAAAC A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 7 6 207137 CASAVA_Build 4 59741827 1D TATGCCCAGA G/- GGTAGAAGGG 3070 het 3070 hom 46 12 28 7 G 3 2 207138 CASAVA_Build 4 59741930 1D AAGGTCATTG C/- CCCTCTCAAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 C 4 3 207139 CASAVA_Build 4 59747894 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCATCAT 3070 het 3070 hom 48 19 19 10 C 6 5 207140 CASAVA_Build 4 59765998 1D CTTTAACTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 10 9 207141 CASAVA_Build 4 59771869 4D TATATATTTA AATT/---- ATTTATTTCT 3070 het 1464 hom 17 3 14 1 AATT 1 0 207142 CASAVA_Build 4 59781788 1I CTTATTATTT -/G GATGCCCTTT 3070 het 3070 ref 25 12 8 6 G 1 2 207143 CASAVA_Build 4 59786338 1D GACCTCTCCT G/- GAAACTGGGC 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 G 2 1 207144 CASAVA_Build 4 59795611 2D TGAAATATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 12 10 207145 CASAVA_Build 4 59808321 1D GTATTAGTAA G/- CAATTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 G 1 0 207146 CASAVA_Build 4 59810651 1I AATAAAGAAT -/A TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 0 1 207147 CASAVA_Build 4 59810849 1D AGAGAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 12 11 207148 CASAVA_Build 4 59819383 1I AATAACAACA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 7 8 207149 CASAVA_Build 4 59827864 1I GGAGATTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 9 10 207150 CASAVA_Build 4 59828034 2D GGAGAACGTT AG/-- AGAGAGAGTG 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 AG 5 4 207151 CASAVA_Build 4 59828724 1I AGATAAGTAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 8 9 207152 CASAVA_Build 4 59832078 1D TATGGTCTGA G/- AGAGAGAAGG 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 G 1 0 207153 CASAVA_Build 4 59833207 1I ATGTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2639 hom 35 8 21 6 A 10 11 207154 CASAVA_Build 4 59834344 4D TACACCGTTA GTTT/---- GAGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 50 20 25 8 GTTT 1 0 207155 CASAVA_Build 4 59853316 1I AAACAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 456 hom 20 1 16 3 A 10 11 207156 CASAVA_Build 4 59861837 1D GATTCAATGG T/- TTTTTTTTTT 1023 het 1023 ref 31 24 3 5 T 11 10 207157 CASAVA_Build 4 59874197 1I GTTTTTCGGG -/T TTTTTTTTTG 2058 het 1755 hom 16 5 6 5 T 9 10 207158 CASAVA_Build 4 59915850 4D AGCAATTTTG ATAA/---- ATAAATTTTT 3070 het 3070 ref 27 17 8 6 ATAA 2 1 207159 CASAVA_Build 4 59925928 2I24M1I GGAAAAAAAA --AGAGAGAGAGAGAGAGAAACAGTC-/AGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACAGTCT AAGGGGCAAA 3070 het 3070 ref 40 17 14 15 N/A 0 0 207160 CASAVA_Build 4 59928608 1I TCAAAACTAT -/A AAAAAACCTA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 A 6 7 207161 CASAVA_Build 4 59929141 1I TTAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 A 9 10 207162 CASAVA_Build 4 59930977 1I TACTGTAAGC -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 A 7 8 207163 CASAVA_Build 4 59931190 1I GATTTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 T 10 11 207164 CASAVA_Build 4 59935190 1D CTCATCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 13 12 207165 CASAVA_Build 4 59938701 2I AATAATGGGC --/TA TATATATTTT 2165 het 2165 ref 22 10 8 4 TA 3 4 207166 CASAVA_Build 4 59947875 7I GCTGTGCAAA -------/AACACTG GGTAAGCAGT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 AACACTG 0 1 207167 CASAVA_Build 4 59948742 1D CTGATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 11 10 207168 CASAVA_Build 4 59950664 1D AATTTATAAG A/- AAAAACAAAT 3070 het 3070 hom 37 18 17 3 A 6 5 207169 CASAVA_Build 4 59950738 9D ACATGCAGCC AATAATCAT/--------- AATAATCATA 3070 het 3070 ref 39 26 7 7 AATAATCAT 2 1 207170 CASAVA_Build 4 59953231 1I TATAGAAAAA -/C CAAATAACTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 1 2 207171 CASAVA_Build 4 59956603 1D GCTCACTGTT A/- ACCTTCACTT 3070 het 3070 ref 28 16 9 6 A 2 1 207172 CASAVA_Build 4 59964220 1D CTATTTTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 9 207173 CASAVA_Build 4 59966267 1I TTATTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 11 12 207174 CASAVA_Build 4 59966548 1I TGTATTGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 T 9 10 207175 CASAVA_Build 4 59966634 2I ATAGCTTTTC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 GT 8 9 207176 CASAVA_Build 4 59969928 1D CAGGCCTGCA C/- TAAAAGAGCT 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 C 1 0 207177 CASAVA_Build 4 59974097 9D GTAAAATAAT AAAAAAATA/--------- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 3 AAAAAAATA 2 1 207178 CASAVA_Build 4 59974180 1I GTATTGATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 7 8 207179 CASAVA_Build 4 59974690 2D GTAAATTTTT TC/-- TGTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TC 1 0 207180 CASAVA_Build 4 59975174 1I TATTCTACTC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 7 8 207181 CASAVA_Build 4 59976123 6D AGTTTCAGGT CTTAAA/------ CTTAAATCTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 CTTAAA 2 1 207182 CASAVA_Build 4 59979057 3D TAGTCTAACA ACC/--- AAAAAAGTCC 2796 het 2796 ref 24 17 6 3 ACC 1 0 207183 CASAVA_Build 4 59992815 1I TTATGACAGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 8 9 207184 CASAVA_Build 4 59996752 1I ACCCCTCCCC -/A CCAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 13 18 2 A 0 1 207185 CASAVA_Build 4 59997263 2D AATAACAAAC AT/-- ATTTTCAGAC 3070 het 3070 ref 41 22 13 7 AT 2 1 207186 CASAVA_Build 4 60003562 1I TTAAAACATA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 8 9 207187 CASAVA_Build 4 60004460 4D TTCCCATATG CTTT/---- CTTTCTAATT 3004 het 2533 hom 18 8 7 4 CTTT 2 1 207188 CASAVA_Build 4 60004584 3D ACTCGTTAAC ATT/--- AGGTATATCT 3070 hom 30 het 15 0 10 5 ATT 1 0 207189 CASAVA_Build 4 60005209 1I TGATACACAC -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 6 7 207190 CASAVA_Build 4 60009132 30D TGAAATAATT TATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 3070 het 508 hom 15 3 9 5 TA 20 5 207191 CASAVA_Build 4 60010685 1D TTGTTAGGTG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 8 7 207192 CASAVA_Build 4 60011302 1I AAGAGAATGA -/T TCCCCTAGGG 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 T 1 2 207193 CASAVA_Build 4 60020283 1D AAATAATTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 T 8 7 207194 CASAVA_Build 4 60025488 2D GGAAATTTCT CA/-- CACACACAGA 3070 het 3070 hom 30 16 13 1 CA 5 4 207195 CASAVA_Build 4 60025738 1I TTGTTGGCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 9 10 207196 CASAVA_Build 4 60030001 3D CACTAAAACA AAC/--- AACAGGAAAG 3070 het 3070 hom 46 21 22 4 AAC 2 1 207197 CASAVA_Build 4 60037057 8I GCTGTGCAAA --------/AACTCTTT AACTCTTTAG 2452 het 2424 hom 17 5 5 7 AACTCTTT 1 2 207198 CASAVA_Build 4 60042549 2I TAATGTGATT --/TC TCTCCAGATT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 TC 2 3 207199 CASAVA_Build 4 60046317 7D GGCACATCTA GACAATG/------- GACTATTATT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 GACAATG 1 0 207200 CASAVA_Build 4 60047757 4D TTTGCTATAA TTAT/---- TTAAACTTCA 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 TTAT 1 0 207201 CASAVA_Build 4 60049599 3I GTACATAGAA ---/ATT ATGCCTTTTG 3070 hom 88 het 33 0 30 3 ATT 0 1 207202 CASAVA_Build 4 60061237 1I TCTTATATAA -/T TTTTAGCTTA 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 T 4 5 207203 CASAVA_Build 4 60062255 3D AATTATCTGA GAG/--- GAACCTCTTT 3070 het 3070 hom 52 24 24 4 GAG 1 0 207204 CASAVA_Build 4 60064120 1I TTCTTTGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 11 12 207205 CASAVA_Build 4 60068368 7I CCTGAAGCTG -------/TATTGGT TTTAGCCATT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 TATTGGT 0 1 207206 CASAVA_Build 4 60082211 1I ATTAGACTTT -/A AAAAAAAAAA 690 het 690 ref 29 6 4 19 A 13 14 207207 CASAVA_Build 4 60082239 1D AAGACATTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 387 hom 32 5 19 8 T 9 8 207208 CASAVA_Build 4 60086661 1I ATTTTGTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 9 10 207209 CASAVA_Build 4 60111301 1D CTTCACCATG T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 7 6 207210 CASAVA_Build 4 60131626 1D CTGGCGAGGA G/- TTGTAGTCCT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 G 1 0 207211 CASAVA_Build 4 60133721 1D AGGCTACCAA C/- CAAAAAAGTC 1622 het 1622 ref 18 10 5 3 C 2 1 207212 CASAVA_Build 4 60141746 1I AATTATAGTT -/G TGTTAGTTGT 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 G 0 1 207213 CASAVA_Build 4 60142270 5D ACTCTCATAA CTAGT/----- CTAAAGTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 17 5 CTAGT 1 0 207214 CASAVA_Build 4 60150116 1D ACAGACAATT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 135 het 51 0 44 7 A 8 7 207215 CASAVA_Build 4 60159332 1D AAATTAGTAC A/- GATTAACATC 3070 hom 87 het 31 0 30 3 A 1 0 207216 CASAVA_Build 4 60159436 3I GGAATAAATT ---/AAG GAGGAAAAAC 3070 hom 138 het 55 0 47 8 AAG 0 1 207217 CASAVA_Build 4 60167500 21D CTTCAACAGT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/--------------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 29 0 23 11 A 31 10 207218 CASAVA_Build 4 60185332 1I TACGCGCTGG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 6 7 207219 CASAVA_Build 4 60187239 1D ATCAATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 337 hom 33 1 28 4 A 12 11 207220 CASAVA_Build 4 60192430 1I CCAGGATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 26 3 11 12 A 11 12 207221 CASAVA_Build 4 60192467 1D ATACATACAT A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 60 het 30 0 21 10 A 8 7 207222 CASAVA_Build 4 60222341 5I GTGAATGCTT -----/TAAAG TATTTTTGAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TAAAG 0 1 207223 CASAVA_Build 4 60227277 1I TGAAAGGGAA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 7 8 207224 CASAVA_Build 4 60231045 3D GTTTGATAAC AAT/--- AACAAAATTA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 AAT 1 0 207225 CASAVA_Build 4 60231310 1I TCAAGGATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 31 1 26 4 A 11 12 207226 CASAVA_Build 4 60232683 1D CTTTCTCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 13 12 207227 CASAVA_Build 4 60236509 1I TAATCCTAGC -/A ACTCTGGGAG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 1 2 207228 CASAVA_Build 4 60237802 3I TCAATCTGCC ---/AGT AGTAGAGACT 3070 hom 126 het 48 0 41 7 AGT 1 2 207229 CASAVA_Build 4 60250661 8D AACTAATTTT AAGAAGCA/-------- AAGAAGTATT 3070 hom 114 het 40 0 39 2 AAGAAGCA 1 0 207230 CASAVA_Build 4 60261835 1D TATCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 300 hom 34 1 25 8 T 11 10 207231 CASAVA_Build 4 60262765 1I TATTTAGAAA -/T TTTTTTTTTT 997 het 997 ref 31 24 3 4 T 13 14 207232 CASAVA_Build 4 60271334 1D TAGAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 11 10 207233 CASAVA_Build 4 60271685 118D CCTCGTCACT TTCAGGTACGCAAATCAGACTCAGATTTGGTCTTTTCACATAGTCCCACATTTCTCAGAGGCTTTGTTCACTTCTTTTTACTCTTTTTTCTCTAAACTTCTCTTCTCGCTTCATTTCA/---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TTCATTTGAT 1772 hom 12 het 5 0 5 1 TTCAGGTACGCAAATCAGACTCAGATTTGGTCTTTTCACATAGTCCCACATTTCTCAGAGGCTTTGTTCACTTCTTTTTACTCTTTTTTCTCTAAACTTCTCTTCTCGCTTCATTTCA 1 0 207234 CASAVA_Build 4 60277506 1I CCAAGATCAC -/A TCTGAGTCTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 0 1 207235 CASAVA_Build 4 60277938 2D TGACAACTGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 30 7 T 11 9 207236 CASAVA_Build 4 60289096 2D ACACACATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AT 7 6 207237 CASAVA_Build 4 60289600 1D TATATTGGCC T/- TATTTTGTGT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 2 1 207238 CASAVA_Build 4 60300015 1I AGTCCCTCGC -/T TTTTTTTTTT 2349 het 2349 ref 21 12 7 2 T 11 12 207239 CASAVA_Build 4 60312771 1I ATTACCTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 10 11 207240 CASAVA_Build 4 60361946 1I TTCTGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 11 12 207241 CASAVA_Build 4 60386433 1D GCTAGTTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 9 8 207242 CASAVA_Build 4 60391492 1D GATATAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 10 9 207243 CASAVA_Build 4 60397908 16I CATATAATGT ----------------/AGATAATTTCTAACAA AGTACTTAAA 3070 het 3070 ref 40 23 17 0 AGATAATTTCTAACAA 0 1 207244 CASAVA_Build 4 60401021 3D TCTTTTATAG TAA/--- TAATTCTGTG 3070 het 3070 ref 31 18 13 1 TAA 2 1 207245 CASAVA_Build 4 60407829 4I ATTTATCTGA ----/TAAT TAATTATATT 3070 het 3070 hom 37 18 14 5 TAAT 1 2 207246 CASAVA_Build 4 60410036 1I CTTAATTTTA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 7 8 207247 CASAVA_Build 4 60430976 1I TCGCACCTGA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 T 6 7 207248 CASAVA_Build 4 60435480 1D TTGTTTTCTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 T 8 7 207249 CASAVA_Build 4 60446290 1I TCCTGGGTTT -/G GGGGTGGGGG 3070 het 2266 hom 15 6 9 0 G 4 5 207250 CASAVA_Build 4 60453661 22D TATACACATA TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/---------------------- TGTGTGTGTG 3070 het 2570 hom 21 8 10 9 TG 19 8 207251 CASAVA_Build 4 60466146 4D AATTATATCC ACAA/---- ACAAACTTCC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 ACAA 2 1 207252 CASAVA_Build 4 60470515 1I AACTATCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 8 10 A 11 12 207253 CASAVA_Build 4 60493237 1D TTATGTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 26 11 8 T 13 12 207254 CASAVA_Build 4 60514893 4D TGTTTGAAAA TACT/---- TAAACTGTTT 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 TACT 1 0 207255 CASAVA_Build 4 60517055 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 10 9 207256 CASAVA_Build 4 60525352 2I TGACACAAAG --/GT AAACATTCGC 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 GT 0 1 207257 CASAVA_Build 4 60526677 1D TTATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 T 12 11 207258 CASAVA_Build 4 60529536 2D ATTCTTTTAC TT/-- CAGGTCTATT 3070 het 3070 ref 29 18 9 4 T 2 0 207259 CASAVA_Build 4 60529861 1D TTGCAGTTTC T/- TTTTGAATCT 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 T 5 4 207260 CASAVA_Build 4 60539092 2D TGAAATTGAT AA/-- GAGTATATCA 3070 het 3070 hom 24 12 10 4 A 2 0 207261 CASAVA_Build 4 60547826 1I AAAAGAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 883 hom 40 3 29 8 T 10 11 207262 CASAVA_Build 4 60547976 1I TGAGGGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 804 hom 44 4 30 10 A 10 11 207263 CASAVA_Build 4 60548184 2I GGACATGACC --/TA TCCATCCATG 3070 het 3070 hom 41 20 17 4 TA 0 1 207264 CASAVA_Build 4 60548603 1D TGAAGAAAAG A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 88 het 34 0 30 4 A 8 7 207265 CASAVA_Build 4 60551214 1I CCACTCTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 8 9 207266 CASAVA_Build 4 60608686 1D GCATTATTCT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 9 8 207267 CASAVA_Build 4 60613518 2D TATTTATTCT TA/-- TATATGCCTC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TA 3 2 207268 CASAVA_Build 4 60613670 1I ATGTACCTTT -/A AGAAAGAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 2 207269 CASAVA_Build 4 60614445 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1336 hom 32 4 21 7 T 15 14 207270 CASAVA_Build 4 60615037 1I TTACACAGTT -/A AAAACTATAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 4 5 207271 CASAVA_Build 4 60616453 1D TTATTCCAGA T/- CTTATCAAAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 1 0 207272 CASAVA_Build 4 60618423 1I GCAAGAGGAT -/A TGTCAATTGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 207273 CASAVA_Build 4 60622520 2D AATTAAAGAC TT/-- TGAGTAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 6 T 3 1 207274 CASAVA_Build 4 60622761 1I AAATGTACAA -/G ATGATTCTAA 3070 hom 160 het 57 0 54 3 G 0 1 207275 CASAVA_Build 4 60623933 3I TGTAATTCCT ---/AGA AGACTAGTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AGA 1 2 207276 CASAVA_Build 4 60625187 5D AAAAGTTAAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 23 0 17 8 A 17 12 207277 CASAVA_Build 4 60625645 2I ATAGGTAAAC --/TG TGTATCATGG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TG 1 2 207278 CASAVA_Build 4 60628235 1D TGCTGATTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 10 9 207279 CASAVA_Build 4 60629240 3D GACATAATAC ATA/--- ATATTTTGTA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 ATA 2 1 207280 CASAVA_Build 4 60630109 2D ACAGGTAAAA CT/-- CTCTCCCTGG 3070 hom 79 het 29 0 23 8 CT 3 2 207281 CASAVA_Build 4 60630418 2D GCCAGCAATC TT/-- TGTCGTTCTG 3070 hom 84 het 33 0 25 8 T 3 1 207282 CASAVA_Build 4 60632367 2D CAGTAAATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 26 0 21 5 A 15 13 207283 CASAVA_Build 4 60637442 1I ACCCCATCTT -/A AAAAAATTAA 3070 hom 96 het 41 0 31 10 A 6 7 207284 CASAVA_Build 4 60641690 1D TTCACCAAAG A/- AAAGATACCA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 A 4 3 207285 CASAVA_Build 4 60645977 1D TTTCTGTGAC A/- ATAACACAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 1 207286 CASAVA_Build 4 60655124 1D TCTATTACTG C/- CCCCCCCTCC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 8 7 207287 CASAVA_Build 4 60657592 1I12M1D TGCATGTTTA -TTTTTTAATCGTA/TTTTTTTAATCGT- AAAATTGCTT 3070 hom 132 het 47 0 45 3 N/A 0 0 207288 CASAVA_Build 4 60660561 1D TGGTAAATCC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 7 207289 CASAVA_Build 4 60664203 1D CTATCTTCCA C/- ATTTAAAGAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 0 207290 CASAVA_Build 4 60675400 3I AATACAGTTG ---/TTA TTATTTCAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTA 1 2 207291 CASAVA_Build 4 60679640 1D GCAAACCAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 10 9 207292 CASAVA_Build 4 60687483 1I TCATGATCCA -/C CCCCCTCAGC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 5 6 207293 CASAVA_Build 4 60687960 2D TTTTTTTTTT TC/-- CCCTGCATTC 3070 het 35 hom 36 1 26 11 TC 1 0 207294 CASAVA_Build 4 60692152 2I CTCAGATCAC --/TG TGTTAGTGAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TG 1 2 207295 CASAVA_Build 4 60699574 1I TTTTGATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 11 0 7 4 T 10 11 207296 CASAVA_Build 4 60705401 1D ATACAAAGAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 9 8 207297 CASAVA_Build 4 60715086 1I GTTACCACAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 7 207298 CASAVA_Build 4 60717534 2I TCATGTACCC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 AT 4 5 207299 CASAVA_Build 4 60718207 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1710 hom 10 het 4 0 4 0 A 11 10 207300 CASAVA_Build 4 60718404 3I AAAAAATAGT ---/AAC AACATAAAAA 1495 hom 21 het 10 0 8 2 AAC 1 2 207301 CASAVA_Build 4 60724511 4D TGGAGGAAAC AAAT/---- AAGTAAAAAC 3070 hom 102 het 36 0 35 6 AAAT 1 0 207302 CASAVA_Build 4 60727170 1D GTAATTGAAC A/- AAAAAATGAC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 7 6 207303 CASAVA_Build 4 60728473 1D TTTAATTTAG A/- AAAAAACTAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 7 6 207304 CASAVA_Build 4 60730405 2I CACAACATAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 22 0 14 8 T 12 14 207305 CASAVA_Build 4 60731789 1I TGTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1714 hom 28 8 11 9 T 13 14 207306 CASAVA_Build 4 60733026 1I GTGCACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3061 het 3061 ref 31 11 11 9 A 13 14 207307 CASAVA_Build 4 60734478 1I AGAAAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 37 1 30 6 A 11 12 207308 CASAVA_Build 4 60735194 1I AGAAAAAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 8 9 207309 CASAVA_Build 4 60742328 1I TTCTGCTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 38 0 32 6 T 10 11 207310 CASAVA_Build 4 60743440 2D AATAAATGAC AG/-- AGGAAAATTT 3070 hom 129 het 45 0 44 3 AG 2 1 207311 CASAVA_Build 4 60748409 4D ACTACATATG TTAT/---- TTTAAGTGTC 2851 het 2851 ref 16 7 6 3 TTAT 1 0 207312 CASAVA_Build 4 60751868 1D AGCGTGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 588 hom 26 2 17 7 A 13 12 207313 CASAVA_Build 4 60751943 2D AAAGCTAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 8 A 13 11 207314 CASAVA_Build 4 60758170 1D CACAAAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 32 0 25 7 T 11 10 207315 CASAVA_Build 4 60767731 1I GCTTTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1083 hom 25 4 14 7 A 13 14 207316 CASAVA_Build 4 60817049 1D CTTAATCATC T/- TTTTTTAATT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 7 6 207317 CASAVA_Build 4 60817256 2D ATACAGAATA AC/-- CACCACCACT 3070 hom 138 het 50 0 43 7 AC 1 0 207318 CASAVA_Build 4 60820579 2I GACTATTAAC --/AT ATTAATTTTC 3070 hom 132 het 53 0 45 8 AT 1 2 207319 CASAVA_Build 4 60822139 2I ACAAAATTAC --/AT ATATATATAT 2651 het 2651 ref 16 8 6 2 AT 6 7 207320 CASAVA_Build 4 60823462 1I GCTTGCAATT -/A TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 207321 CASAVA_Build 4 60824545 1D TTTACTTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 9 8 207322 CASAVA_Build 4 60828172 1I TTGTAATATA -/T TTTTTTTAAG 2917 het 2917 ref 27 17 6 4 T 7 8 207323 CASAVA_Build 4 60840447 4I TCAGTCAAAG ----/AGTT AGTTATCAAT 3070 het 3070 hom 38 16 15 8 AGTT 1 2 207324 CASAVA_Build 4 60841385 1D AATCTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 278 hom 33 1 29 4 T 11 10 207325 CASAVA_Build 4 60845294 1I AAGTGCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1626 hom 44 7 30 7 T 12 13 207326 CASAVA_Build 4 60849632 1I ATCCAACAAT -/A AAAAAGGAGT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 5 6 207327 CASAVA_Build 4 60851826 1I GCCTAAATTA -/C CCCCTTATCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 4 5 207328 CASAVA_Build 4 60853293 2I TACTATATAT --/TA TATATATATA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TA 5 6 207329 CASAVA_Build 4 60857622 1I CTCAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 24 1 19 5 A 11 12 207330 CASAVA_Build 4 60860298 1I GACGGGGTTT -/C ACCACGTTGG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 C 0 1 207331 CASAVA_Build 4 60869974 3I GACTGGGTAA ---/TTT ATAAAGAAAA 3070 hom 132 het 50 0 45 6 T 0 3 207332 CASAVA_Build 4 60883710 3D GTATGAGGCA ATT/--- ATTGTGATCA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 ATT 2 1 207333 CASAVA_Build 4 60885476 1I TTTTAAAGGA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 207334 CASAVA_Build 4 60890680 1I TCTAGAAAAA -/G AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 G 0 1 207335 CASAVA_Build 4 60896581 1I ACTTAACACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 10 207336 CASAVA_Build 4 60897265 1I GTATCACCCC -/T GCTAATAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 207337 CASAVA_Build 4 60900256 1I AGTGATAGTG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 8 9 207338 CASAVA_Build 4 60902131 5I ACTATTTCTC -----/TTTTT TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 7 12 207339 CASAVA_Build 4 60903105 1I TTTCAAAAAT -/A AAAAAGGGGA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 5 6 207340 CASAVA_Build 4 60904556 1I ACAATTGGAG -/A AAAAAACTAC 2846 het 1187 hom 13 3 6 4 A 6 7 207341 CASAVA_Build 4 60907850 2I AAAAAAAAAA --/AC ACAGAAAAGT 3070 het 2123 hom 34 8 18 8 AC 1 2 207342 CASAVA_Build 4 60909459 2D GTATCAAAAA CC/-- ACAATTACTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 C 2 0 207343 CASAVA_Build 4 60916472 11I TGCACAAGCA -----------/CTCTTCTCTTG TCTGCCATCA 3070 hom 87 het 33 0 28 5 CTCTTCTCTTG 0 1 207344 CASAVA_Build 4 60926610 2D CATTGTACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 32 2 18 14 A 19 17 207345 CASAVA_Build 4 60931723 1D AATACAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 26 22 5 T 11 10 207346 CASAVA_Build 4 60937085 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCAGTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 C 4 5 207347 CASAVA_Build 4 60942228 1D TTAGGGGTAC A/- AATGGTTCTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 2 207348 CASAVA_Build 4 60945750 1D CATATTAGAG T/- TTTTTCCTAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 5 207349 CASAVA_Build 4 60945838 1I GTTTATAGGC -/A AAAAACTTGG 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 A 5 6 207350 CASAVA_Build 4 60946034 11D TTATCATGTT GTAGATGTTAA/----------- GTAGTTGTAC 3070 het 3070 ref 40 23 18 3 GTAGATGTTAA 1 0 207351 CASAVA_Build 4 60947610 1I ACCCAGAGAT -/A ACTATCCTGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 207352 CASAVA_Build 4 60948257 3D AAAAAATTTG ATT/--- ATTTACTAAC 3070 het 3070 hom 26 11 14 2 ATT 2 1 207353 CASAVA_Build 4 60948811 13D TAAAAAGTTT TTGGGTGAGTTAA/------------- TTGGAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 27 12 5 TTGGGTGAGTTAA 1 0 207354 CASAVA_Build 4 60953635 1I TCCTTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 45 1 37 7 A 10 11 207355 CASAVA_Build 4 60954206 3I CATACATATT ---/TTC TTATTATACA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTC 0 1 207356 CASAVA_Build 4 60956064 1I AAGGATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 10 11 207357 CASAVA_Build 4 60961630 1I GTTACTTTTA -/T TTTTCAATTC 3070 hom 72 het 26 0 25 10 T 4 5 207358 CASAVA_Build 4 60962314 3D ATTTACACTC CCA/--- CCAACAGTGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CCA 2 1 207359 CASAVA_Build 4 60963213 1I AATTTAAAGT -/A AGTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 2 207360 CASAVA_Build 4 60964612 1D TAGTCTCGCT A/- AGCTGTCTGT 3070 hom 26 het 14 0 13 1 A 2 1 207361 CASAVA_Build 4 60965263 1D TCCTTGTTAA T/- TTTCTGTCTT 1962 hom 10 het 5 0 4 3 T 4 3 207362 CASAVA_Build 4 60966479 1I TCAGCTATTG -/A TGCTTGTATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 1 207363 CASAVA_Build 4 60967053 6I CTTCTGGAAG ------/CTTTGT CCCAGAGGGG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 CTTTGT 0 1 207364 CASAVA_Build 4 60967723 1D CTGGGGTAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 20 0 17 4 A 10 9 207365 CASAVA_Build 4 60977235 1D TATTTAATTT A/- AAAAAGTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 A 6 5 207366 CASAVA_Build 4 60982478 1I ATGTTGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 15 10 T 10 11 207367 CASAVA_Build 4 60984346 1D ACCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2344 hom 27 8 12 7 T 11 10 207368 CASAVA_Build 4 60989179 1I GGATGGAATG -/T TTTTTATTTG 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 T 5 6 207369 CASAVA_Build 4 60990558 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1946 het 1946 ref 42 24 9 9 T 15 14 207370 CASAVA_Build 4 60996548 2I AAATAATTTG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 8 10 207371 CASAVA_Build 4 61004599 5I AATATGGTAC -----/TAAAT TAAATTAGGC 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 TAAAT 1 2 207372 CASAVA_Build 4 61004992 6I CAACGCTTGG ------/GCCCAA GCTATCATCC 3070 hom 63 het 22 0 19 3 GCCCAA 0 1 207373 CASAVA_Build 4 61005089 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 2108 het 2108 ref 22 12 7 3 T 9 10 207374 CASAVA_Build 4 61007880 1D TTTGTATATA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 8 7 207375 CASAVA_Build 4 61009696 1D TTTTGAACTC T/- TCCCCCCCGC 2457 het 2457 ref 23 10 7 6 T 2 1 207376 CASAVA_Build 4 61009748 1I GAAAAAAAAA -/C AAAAAACATC 2779 het 607 hom 24 4 10 10 C 0 1 207377 CASAVA_Build 4 61010371 2D GAGAGGTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 27 6 10 13 T 12 10 207378 CASAVA_Build 4 61011222 2D AATAGATCAC AT/-- GTTAGGTCAC 3070 het 3070 ref 38 27 10 2 AT 1 0 207379 CASAVA_Build 4 61012332 2D GGTGAGTAAC AG/-- GGGTTCGTGG 3070 het 3070 ref 57 27 25 6 AG 1 0 207380 CASAVA_Build 4 61012587 4D CTGAGCAGCT GAGA/---- GTTTATTTCC 3070 het 3070 ref 45 29 13 4 GA 2 0 207381 CASAVA_Build 4 61016755 1D AAGTGTATAG C/- CCTAAACGCC 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 C 3 2 207382 CASAVA_Build 4 61020486 1D ATTTGAAATT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 A 8 7 207383 CASAVA_Build 4 61020873 1I AACATTTATA -/T TTACTATTTA 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 T 2 3 207384 CASAVA_Build 4 61024870 1I AAACAATGCT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 8 9 207385 CASAVA_Build 4 61025028 3I AATCTCCTAC ---/ACA ACGATAAAGT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 ACA 0 1 207386 CASAVA_Build 4 61026235 1D CTAGAAAGTT C/- CTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 C 2 1 207387 CASAVA_Build 4 61026521 5I AAGCTATAGA -----/TTCTT TTCTTAGAGG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 TTCTT 1 2 207388 CASAVA_Build 4 61027506 1D AAGTGAAATT A/- AATGACCATG 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 A 3 2 207389 CASAVA_Build 4 61027857 4D AGGCCCTATC TTGT/---- TTAATTTATC 3070 het 3070 ref 32 15 14 5 TTGT 1 0 207390 CASAVA_Build 4 61031429 2I CAGGCTCAAA --/GC GCGTAAGGGC 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 GC 1 2 207391 CASAVA_Build 4 61032546 4I TCATCTTGTA ----/TCTC TCTATCAGAC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 TC 1 3 207392 CASAVA_Build 4 61032894 1D AAACAGGTGT A/- AAGTGAAGGT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 3 2 207393 CASAVA_Build 4 61033033 1I CCTATTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 209 hom 29 3 17 9 A 13 14 207394 CASAVA_Build 4 61034198 1D AAATAGAGAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 8 7 207395 CASAVA_Build 4 61034404 1I ATTAGTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 T 10 11 207396 CASAVA_Build 4 61034831 9I TCATTACTAA ---------/CACTTTTTT CACTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 CACTTTTTT 1 2 207397 CASAVA_Build 4 61034933 2I ATATATTAAT --/CA CAGTTATTCT 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 CA 1 2 207398 CASAVA_Build 4 61035880 13D ATATGTCTAT TCCATTAGTTCTG/------------- TCCCTCTAGA 3070 hom 78 het 28 0 27 3 TCCATTAGTTCTG 1 0 207399 CASAVA_Build 4 61036077 1D ACTTTGAAGA C/- CTTTTTCCCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 2 1 207400 CASAVA_Build 4 61036803 4D TAAATAACTT ACTC/---- AAGAAGGGCA 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 ACTC 1 0 207401 CASAVA_Build 4 61037097 1D AAAAATTTAA T/- TTTTTTATTT 3070 het 2348 hom 31 7 18 7 T 7 6 207402 CASAVA_Build 4 61038151 1D TACAATAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2732 hom 33 9 14 10 A 13 12 207403 CASAVA_Build 4 61039777 3I AGATTCTGTT ---/TTA ATGGCTGGCG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTA 0 1 207404 CASAVA_Build 4 61040874 1D GTGGAAAATG A/- AGAGTAGCTC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 2 1 207405 CASAVA_Build 4 61048076 1D CCCCTCCCCC T/- ACCCAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 T 1 0 207406 CASAVA_Build 4 61051077 8D TTTTCTTCTT TTTTTCTC/-------- TTTCCTTTTT 84 het 84 ref 32 21 2 11 TTTTTCTC 1 0 207407 CASAVA_Build 4 61051408 4D CTTTCTTTTC CTTT/---- CTTTTTCTCT 3070 het 44 hom 25 1 13 11 CTTT 2 1 207408 CASAVA_Build 4 61051585 1D GAGAAAAAAA T/- ATTACTGCAT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 1 0 207409 CASAVA_Build 4 61051765 1D GATCAGAAAA T/- TTGGTAGAAG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 3 2 207410 CASAVA_Build 4 61051849 1D TGCCTAACTT G/- CATAACAGAT 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 G 1 0 207411 CASAVA_Build 4 61052017 4I TTGTACTTCC ----/ACTT ACTTATTCGA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 ACTT 1 2 207412 CASAVA_Build 4 61052606 4I AGAGCGAAAT ----/TCTA TCTATCTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 TCTA 1 2 207413 CASAVA_Build 4 61054472 10I GACTGTCCCA ----------/GAGCCTGGGG GAACTCACTG 3070 het 3070 ref 50 32 16 2 GAGCCTGGGG 0 1 207414 CASAVA_Build 4 61066057 1D TGCTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 11 10 207415 CASAVA_Build 4 61071496 1I ACAATGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 14 9 A 13 14 207416 CASAVA_Build 4 61075987 1D TTTGCTTATA T/- TTTTTTGTGC 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 7 6 207417 CASAVA_Build 4 61078927 4I GAAGACACAA ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 AAAC 1 2 207418 CASAVA_Build 4 61081295 1I AACTAAAAAG -/A AGAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 51 29 22 0 A 1 2 207419 CASAVA_Build 4 61082820 14D CATGGTGGCT CATGCCTGTAATCC/-------------- CATCACATTG 3070 het 3070 ref 35 20 14 3 CATGCCTGTAATCC 1 0 207420 CASAVA_Build 4 61083157 1I AATATTCAGG -/A AAAAAAACAC 2913 het 2210 hom 14 6 6 2 A 7 8 207421 CASAVA_Build 4 61084259 3I TTCATTTAAT ---/ATC ATCACCCTGT 3070 het 3070 ref 56 28 23 5 ATC 1 2 207422 CASAVA_Build 4 61085020 8D TTTTTGTTTG TTTGTTTT/-------- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 49 15 18 17 TTTGTTTT 2 1 207423 CASAVA_Build 4 61087130 3D CACATTGGTA TAT/--- TCTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 TAT 1 0 207424 CASAVA_Build 4 61097014 1D TCTATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 30 3 22 6 A 13 12 207425 CASAVA_Build 4 61100614 1D AAACAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 6 A 13 12 207426 CASAVA_Build 4 61102954 1I TGGATCACAA -/T TTTTTGCTGC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 5 6 207427 CASAVA_Build 4 61103038 1D CTTCTTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 T 11 10 207428 CASAVA_Build 4 61109265 1D AAGAAGATGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 A 9 8 207429 CASAVA_Build 4 61111373 1D GAGTGAAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 10 9 207430 CASAVA_Build 4 61115779 1D ACTTCTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 20 1 16 3 T 11 10 207431 CASAVA_Build 4 61120508 1D ATCCAAAAAA G/- TATTGTTATG 3070 het 3070 ref 57 35 21 1 G 1 0 207432 CASAVA_Build 4 61121270 2I TATATGTGTG --/TA TATGTGTGTG 2497 het 2497 ref 24 15 7 2 TA 1 2 207433 CASAVA_Build 4 61123326 1I ACATATAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 10 11 207434 CASAVA_Build 4 61124360 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 17 19 6 A 10 9 207435 CASAVA_Build 4 61125122 1D ATTTAAAAAG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 8 7 207436 CASAVA_Build 4 61128664 1I TTTGTCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 23 1 T 10 11 207437 CASAVA_Build 4 61130803 2D GCTGCAGAAC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 T 11 9 207438 CASAVA_Build 4 61132515 1I ATTTCTCTTT -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 A 6 7 207439 CASAVA_Build 4 61136423 1D CTGAGACTCA G/- AACGGGCCAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 G 1 0 207440 CASAVA_Build 4 61136682 1D ACAAGATAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 10 9 207441 CASAVA_Build 4 61136880 1D AATGTGGTGT G/- GGGGGGGCAT 2616 het 2616 ref 28 18 6 4 G 8 7 207442 CASAVA_Build 4 61165593 2I TCCACGGAGG --/AC ACAGAAACTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AC 1 2 207443 CASAVA_Build 4 61177586 1D TAGCAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 11 10 207444 CASAVA_Build 4 61178019 1D3M8I AAGCATATAA CATA--------/-ATATTTGGTTT ACTTTTTCTA 3070 hom 129 het 45 0 44 3 N/A 0 0 207445 CASAVA_Build 4 61187066 2D CCCAAATGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 40 0 32 10 T 12 10 207446 CASAVA_Build 4 61189003 1D GTAAAATGGG A/- AAAATGCTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 5 4 207447 CASAVA_Build 4 61192891 3I TTTCTATCTC ---/ATT ATTTTTCTTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ATT 1 2 207448 CASAVA_Build 4 61194090 1I14M14I ACAACTAAAA -TTAGACAACATTCA--------------/TTTTGTTTATTTTTATTGTTTATTTTATT AATATTTTTA 3070 het 3070 ref 33 24 11 2 N/A 0 0 207449 CASAVA_Build 4 61204028 3I TTCAGAGTTG ---/TGT TGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 TGT 1 2 207450 CASAVA_Build 4 61205993 1D TGAGTTTTAA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 7 6 207451 CASAVA_Build 4 61208430 2D ATCTGTGGAA AG/-- ATAAGGTTCT 3070 het 3070 hom 37 16 19 7 AG 1 0 207452 CASAVA_Build 4 61216749 1D AAAGAAATGA G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 7 G 5 4 207453 CASAVA_Build 4 61221903 6D AGTGGACAAA ACAAAG/------ ACAAAGATTT 3070 het 3070 ref 39 23 13 6 ACAAAG 2 1 207454 CASAVA_Build 4 61223915 1D AGTAAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 A 11 10 207455 CASAVA_Build 4 61228387 17I TCTAATGTGG -----------------/AAATCTAAAAACAATAT ATTTGTAGTC 3070 hom 81 het 29 0 27 4 AAATCTAAAAACAATAT 0 1 207456 CASAVA_Build 4 61230953 1I TAAAAAAAAA -/T ATATCTGACT 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 T 0 1 207457 CASAVA_Build 4 61232018 7D CCCATTAGAA ACAAGAC/------- ACAAGACATA 3070 hom 90 het 33 0 29 7 ACAAGAC 2 1 207458 CASAVA_Build 4 61235064 4I TGGGTTCTAT ----/AATA AATATATCTG 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 AATA 1 2 207459 CASAVA_Build 4 61235967 1D ACAGGAGCTG A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 6 5 207460 CASAVA_Build 4 61242435 1I AAGAAATAGA -/G AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 207461 CASAVA_Build 4 61243967 2I TATCACAAAC --/TT TTTTGTTGGT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 4 6 207462 CASAVA_Build 4 61260175 1I TAGTACTACT -/G ATTTGCAGCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 207463 CASAVA_Build 4 61262369 2D ACAAAGTATG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 35 0 28 8 T 11 9 207464 CASAVA_Build 4 61268431 1I AATAATATAC -/A AAAAAAATCG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 7 8 207465 CASAVA_Build 4 61270106 1D TTTCCTTCCC A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 A 7 6 207466 CASAVA_Build 4 61275781 1D GATATAAGAA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 26 11 12 5 T 8 7 207467 CASAVA_Build 4 61276240 1I ATTTATTACC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 11 25 6 T 8 9 207468 CASAVA_Build 4 61278264 2I TTTCTAGGGA --/AT ATATATATAT 1414 het 1414 ref 16 8 4 5 AT 6 7 207469 CASAVA_Build 4 61285436 1I GAGCTGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 26 11 11 4 T 10 11 207470 CASAVA_Build 4 61304453 6I GACACTTATG ------/ACACCT ACACCTACAC 3070 het 3070 hom 40 13 14 13 ACACCT 2 3 207471 CASAVA_Build 4 61304523 123D CCACATACTA TAGGTCTATTTACCTTAGTTTCAATTACCTGATACAACATATCCAGCTTTCAACAGAAAATTATATTCAGTAAGATAGAACATACTCGGACTGTGGGGAAAAATAAACAAAAACTAAATTTGT/--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TTAAAGGAAA 2222 het 2222 ref 24 39 6 14 TAGGTCTATTTACCTTAGTTTCAATTACCTGATACAACATATCCAGCTTTCAACAGAAAATTATATTCAGTAAGATAGAACATACTCGGACTGTGGGGAAAAATAAACAAAAACTAAATTTGT 1 0 207472 CASAVA_Build 4 61305825 1D GCAGAAACAA C/- CTAAATTCCA 3070 het 3070 hom 56 24 25 8 C 2 1 207473 CASAVA_Build 4 61311089 1D CCCCAGCATT G/- GAAAAGCACT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 G 2 1 207474 CASAVA_Build 4 61314689 1I ACTCAATGTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 T 7 8 207475 CASAVA_Build 4 61315086 1I TCCAATTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 11 24 2 T 9 10 207476 CASAVA_Build 4 61316968 3D AAAACGCACT TCA/--- TCATGATTTA 3070 het 3070 ref 42 20 14 9 TCA 2 1 207477 CASAVA_Build 4 61318861 2I ACAAATAAGC --/AA AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 27 16 9 3 A 8 10 207478 CASAVA_Build 4 61325536 1D TTATATATAT A/- AAAGATATTA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 4 3 207479 CASAVA_Build 4 61339891 1I GATTCTCCTG -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 6 7 207480 CASAVA_Build 4 61342078 3I CACCACAATC ---/CTT CTCCTAAATT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 CTT 0 1 207481 CASAVA_Build 4 61349547 1I CATCTCCTTT -/G CATTATCGAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 G 0 1 207482 CASAVA_Build 4 61349720 1D TTCTGGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 42 4 16 22 T 13 12 207483 CASAVA_Build 4 61402118 1I ATGAAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 10 11 207484 CASAVA_Build 4 61419649 1D CAAACTGGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 11 15 7 A 10 9 207485 CASAVA_Build 4 61423128 3I ATTTCTTTTA ---/ATG ATGTTTTGTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 ATG 1 2 207486 CASAVA_Build 4 61425556 1D ACCCTAAATG C/- CCCCTCAGTG 3070 hom 120 het 43 0 40 4 C 5 4 207487 CASAVA_Build 4 61428059 1I TAAGAATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 10 11 207488 CASAVA_Build 4 61432037 1I ATTAGAATTC -/T TCCAGGTGAA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 1 2 207489 CASAVA_Build 4 61435406 1I AATTAATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2167 hom 19 5 10 4 T 9 10 207490 CASAVA_Build 4 61437812 1I CAAAGTATAA -/T TGGGCTCATC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 1 2 207491 CASAVA_Build 4 61438155 1I ATTATTGGAG -/C GGGGGGGACA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 C 0 1 207492 CASAVA_Build 4 61444128 4I TATTAATAGA ----/TTAG TTAATTATAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TTAG 0 1 207493 CASAVA_Build 4 61446699 2D TTCTTATGTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 AT 8 7 207494 CASAVA_Build 4 61449779 1D TGAATACAAA G/- AATAACTGTT 3070 het 3070 hom 40 13 23 5 G 1 0 207495 CASAVA_Build 4 61451695 1I CTTTTTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 T 10 11 207496 CASAVA_Build 4 61451848 1I TACAGGCACA -/T TGGCACTATA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 1 2 207497 CASAVA_Build 4 61453402 1I GTCCAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 A 13 14 207498 CASAVA_Build 4 61467927 1D ACATGAAGGA C/- CTCTTCAAGG 2399 het 1694 hom 11 4 5 2 C 2 1 207499 CASAVA_Build 4 61483175 27D GTAGTTATTT TGTGTGTGTGGGGTGTGTGTGTGTGTG/--------------------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3000 hom 28 15 17 4 TGTGTGTGTGGGGTGTGTGTGTGTGTG 1 0 207500 CASAVA_Build 4 61483448 1D TCTTAGTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 11 23 11 T 12 11 207501 CASAVA_Build 4 61488796 2D AAATTTTTTT TG/-- TTTGTTTTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TG 1 0 207502 CASAVA_Build 4 61491824 1I TGCAGGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 A 10 11 207503 CASAVA_Build 4 61495374 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 42 0 34 8 T 10 11 207504 CASAVA_Build 4 61509801 1I AAAGACAGAC -/T TTTTTCAGTA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 5 6 207505 CASAVA_Build 4 61516179 3D CAAAAAGGTT ATC/--- ATCACCATCA 3070 hom 166 het 61 0 56 6 ATC 2 1 207506 CASAVA_Build 4 61517472 1I CCTTCTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 9 10 207507 CASAVA_Build 4 61519315 1I ATTATAAATA -/T TTTTTTACAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 6 7 207508 CASAVA_Build 4 61524831 1D AAGTTTAGAG A/- AAAAAAAGAG 2399 hom 12 het 5 0 5 0 A 8 7 207509 CASAVA_Build 4 61528832 3D TTCGAGCCTG GAT/--- GATGATGATG 3070 hom 138 het 51 0 44 9 GAT 4 3 207510 CASAVA_Build 4 61533017 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 1427 het 1427 ref 10 4 4 3 A 10 9 207511 CASAVA_Build 4 61534879 1D TGCCCCTCTG A/- AAAGACAATA 3070 hom 120 het 44 0 40 5 A 4 3 207512 CASAVA_Build 4 61541215 1D TTTAGTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 12 11 207513 CASAVA_Build 4 61575091 4D GTATTCAATC TATT/---- TGAGTTTCAC 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 TATT 1 0 207514 CASAVA_Build 4 61585880 7I CAACTATTAA -------/TTTTTAT TTTTTAATTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TTTTTAT 0 1 207515 CASAVA_Build 4 61587566 5D AGAATAAAAA TAAAG/----- TATTTTTCTC 3070 het 3070 ref 27 15 12 3 TAAAG 1 0 207516 CASAVA_Build 4 61589265 1D ACAAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 A 11 10 207517 CASAVA_Build 4 61593998 4D CGTGAGACTT ACTC/---- ACTACCATGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 ACTC 1 0 207518 CASAVA_Build 4 61595751 5I AGGAATCTTA -----/ATCTT ATCTTATTTG 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 ATCTT 1 2 207519 CASAVA_Build 4 61600464 1D TTAAGATGTG T/- TTTTTTTTTT 1846 het 1846 ref 45 32 4 10 T 13 12 207520 CASAVA_Build 4 61600774 1I TACTGGAGAC -/G GCAATCAAGA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 G 1 2 207521 CASAVA_Build 4 61603197 1D TATGGAAAGA G/- TGGGTGTTGA 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 G 1 0 207522 CASAVA_Build 4 61612290 4D TTGTGCATGC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 18 13 10 GT 8 6 207523 CASAVA_Build 4 61618277 1D ATAAATAGGA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 8 7 207524 CASAVA_Build 4 61619806 4I ATCGTTTATC ----/TATT TGTTTACTGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TATT 0 1 207525 CASAVA_Build 4 61619979 1I CTGGTATAAT -/C ATTTTTGTAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 0 1 207526 CASAVA_Build 4 61621391 1I CCACCTAATT -/A AAAAAAAAAA 2451 het 2451 ref 16 8 6 2 A 10 11 207527 CASAVA_Build 4 61624362 1D TAGTGCAGCC A/- ATGCCCTCTC 3070 hom 38 het 19 0 13 6 A 2 1 207528 CASAVA_Build 4 61625992 1D GAAAAGGATA C/- ATTTCTGGAG 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 C 1 0 207529 CASAVA_Build 4 61627846 1I ACTCAACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 10 11 207530 CASAVA_Build 4 61631861 1I ATAAGACTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 T 8 9 207531 CASAVA_Build 4 61633747 1I GTTTCATCGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 10 11 207532 CASAVA_Build 4 61640724 3I ATATGCCTGA ---/AAG AAGAAGACCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAG 2 3 207533 CASAVA_Build 4 61652173 1D TACTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 28 2 13 13 T 15 14 207534 CASAVA_Build 4 61674934 2D CTAATGAGGC TG/-- TGTCTCTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TG 2 1 207535 CASAVA_Build 4 61681898 1D TTAGTTAAGT G/- TTTCTTGATC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 1 0 207536 CASAVA_Build 4 61684942 1D ACTTAATACT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 8 7 207537 CASAVA_Build 4 61706837 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2144 het 1958 hom 25 8 6 11 T 13 14 207538 CASAVA_Build 4 61708262 4I AAATTTCCTC ----/TTAA TTATGTATAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTAA 0 1 207539 CASAVA_Build 4 61711796 3D CAGGTAGAAA ATT/--- ATTATATTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 ATT 2 1 207540 CASAVA_Build 4 61712044 3D TCAGTTTGTA AAT/--- AATATCAAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 1 AAT 2 1 207541 CASAVA_Build 4 61719026 1I11M2I TAATAATAGC -AAAAAAATCAC--/AAAAAAAATCACTT ATGATAGGAA 3070 het 36 hom 28 1 17 15 N/A 0 0 207542 CASAVA_Build 4 61722213 1I TATGAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 11 12 207543 CASAVA_Build 4 61731163 1I TTCATGTTTT -/A TTCATATTCA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 0 1 207544 CASAVA_Build 4 61733111 1I ACATATGCAC -/A AAAAAAAAAA 1893 het 1893 ref 47 36 5 6 A 11 12 207545 CASAVA_Build 4 61733435 2D ACTAGATAAA AC/-- AGAAGAATTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 AC 1 0 207546 CASAVA_Build 4 61738792 1D TGTGGGCTAA C/- CCATTTGAGC 3070 het 3070 hom 40 16 18 8 C 3 2 207547 CASAVA_Build 4 61740151 1D CATAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 25 1 20 4 A 12 11 207548 CASAVA_Build 4 61741080 1I AATTACAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 11 207549 CASAVA_Build 4 61746888 4D TTTATCGATC TAAA/---- TAAATATTAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 3 TAAA 2 1 207550 CASAVA_Build 4 61752229 2I TCACCCAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 302 hom 32 1 26 5 T 11 13 207551 CASAVA_Build 4 61758859 1I TGGTTTGTTT -/C CCCCCTTCCC 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 C 5 6 207552 CASAVA_Build 4 61766630 1D TAAGTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 11 10 207553 CASAVA_Build 4 61767254 3I ACAAGGTAAT ---/AAC AAGATCAGAT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 AAC 0 1 207554 CASAVA_Build 4 61775107 2I TGTTAGTAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 10 12 207555 CASAVA_Build 4 61775346 6I TTATATCTAA ------/ATGATC ATGAAATCTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATGATC 0 1 207556 CASAVA_Build 4 61775450 2D GGAGTAACAC TT/-- TGTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 3 1 207557 CASAVA_Build 4 61775918 5I TTTTTCTTTG -----/ACTGA ACTGAACTGA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 ACTGA 2 3 207558 CASAVA_Build 4 61777839 1I GAAGTACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 T 10 11 207559 CASAVA_Build 4 61778211 1I GAGACCCTGT -/C TCTTAAATAT 3070 hom 39 het 17 0 13 4 C 0 1 207560 CASAVA_Build 4 61793207 2D CTTTGCTTAT TG/-- TATGCTATAT 3070 hom 144 het 54 0 49 8 TG 1 0 207561 CASAVA_Build 4 61794201 3D TCAGGCAGAT AGC/--- AGCTGTCTGT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AGC 2 1 207562 CASAVA_Build 4 61797878 2D GGAAACAAAC AG/-- AGTGACAAAA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 AG 2 1 207563 CASAVA_Build 4 61801004 1I TTAGATGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 39 1 28 10 T 14 15 207564 CASAVA_Build 4 61810320 2I TTGAAATATT --/AA AAGAGAGACC 3070 hom 157 het 57 0 53 4 A 2 4 207565 CASAVA_Build 4 61814584 11I GATCTTTCTG -----------/GCTTTGGGACT ACTTTAGACA 3070 hom 120 het 41 0 41 3 GCTTTGGGACT 0 1 207566 CASAVA_Build 4 61816147 1I TTGACTTCAC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 100 het 40 0 33 7 T 8 9 207567 CASAVA_Build 4 61828729 3I CTTTATTTTC ---/AAG AAGAAGTATA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAG 2 3 207568 CASAVA_Build 4 61853488 1D TGCAAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 12 11 207569 CASAVA_Build 4 61859046 1I GTAAGATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 T 15 16 207570 CASAVA_Build 4 61875641 1D TTTTACTCAG T/- TTTTTTTTTT 2808 het 2808 ref 34 17 9 8 T 13 12 207571 CASAVA_Build 4 61881486 1D AAAGTAAATG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 7 6 207572 CASAVA_Build 4 61884812 4D ACGGTCTATC TGTT/---- TGGGCTTTTC 3070 het 3070 ref 56 27 23 10 TGTT 1 0 207573 CASAVA_Build 4 61885374 1I TTGCCCTTTG -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 7 8 207574 CASAVA_Build 4 61894927 1D AGAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 2509 het 2319 hom 23 11 7 6 A 13 12 207575 CASAVA_Build 4 61895990 1D ATGCTGTGAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 37 10 20 7 A 8 7 207576 CASAVA_Build 4 61902136 5I TTAGCATTTT -----/TTATA TGTAGATGAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTATA 0 1 207577 CASAVA_Build 4 61903933 4D GACTGAGCCC TTTA/---- TATCCAAGTC 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 TTTA 1 0 207578 CASAVA_Build 4 61924706 1I TTAAATGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 293 hom 36 1 34 1 T 10 11 207579 CASAVA_Build 4 61946744 1D ATCAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 565 hom 42 3 34 5 T 11 10 207580 CASAVA_Build 4 61951364 1I CCTGGCCTTT -/G CCTCTTTGTG 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 G 0 1 207581 CASAVA_Build 4 61954809 1I AACATGCAGA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 8 9 207582 CASAVA_Build 4 61960408 4I TTGTGGTCTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 TTTG 3 4 207583 CASAVA_Build 4 61965917 1D TTTGAGGTGA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 8 7 207584 CASAVA_Build 4 61966018 1D GCCAAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 48 0 42 6 T 11 10 207585 CASAVA_Build 4 61974760 1I CATCGGGAAT -/G GGGGGGGTGC 3070 hom 113 het 48 0 34 14 G 7 8 207586 CASAVA_Build 4 61974881 2D TTCCCATAGA CG/-- AGGCTACACT 3070 hom 111 het 41 0 36 6 CG 1 0 207587 CASAVA_Build 4 61975433 2D GAAAGCACTC AG/-- GGGTGCAGAG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AG 1 0 207588 CASAVA_Build 4 61981670 5I TGTGAATAGC -----/TTTTT TTTTTTTTTA 2775 hom 39 het 32 0 14 18 T 9 14 207589 CASAVA_Build 4 61985204 1I ACTTGATATC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 69 hom 31 2 16 13 A 8 9 207590 CASAVA_Build 4 61985597 1I AAATGCTGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 8 9 207591 CASAVA_Build 4 61986644 1D ATCTCCTTCC T/- TTTTTTATTT 3070 het 585 hom 17 2 12 3 T 7 6 207592 CASAVA_Build 4 61989002 2I ATACATCACA --/GT GTGTTGTTGG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 GT 2 3 207593 CASAVA_Build 4 61989833 2D CCTCTCACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 25 0 15 10 T 14 12 207594 CASAVA_Build 4 61993371 1I TCTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 281 hom 28 1 23 4 A 9 10 207595 CASAVA_Build 4 61995717 4I CTTTCTGTCC ----/CTCA CTCAGTAATC 3070 hom 129 het 46 0 43 3 CTCA 1 2 207596 CASAVA_Build 4 61996588 1D TACACTTGCT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 8 7 207597 CASAVA_Build 4 61997809 2D AATGCAAGAC TG/-- TACCTAGGCA 3070 het 3070 hom 23 12 11 0 TG 1 0 207598 CASAVA_Build 4 62000628 21D TTCATCCTTG CCTTCTGCCCAGTTCTGCTTC/--------------------- CCTTCTGCCC 3070 het 3070 ref 61 36 18 13 CCTTCTGCCCAGTTCTGCTTC 2 1 207599 CASAVA_Build 4 62001342 1D AGTGATAAAA C/- CATAGGTGGC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 C 2 1 207600 CASAVA_Build 4 62028915 1I TGGACAATAT -/G GTGAAACCCT 3070 hom 53 het 19 0 17 2 G 1 2 207601 CASAVA_Build 4 62033228 3I GTAAAAACTA ---/TGT TGTTGAACTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TGT 1 2 207602 CASAVA_Build 4 62039012 1D CTCAATATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 30 1 25 4 A 12 11 207603 CASAVA_Build 4 62044527 2I GAAAGTAAGA --/CT CATATATTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CT 0 1 207604 CASAVA_Build 4 62054138 1D ATCTTTTAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 10 9 207605 CASAVA_Build 4 62060453 1D TATATATGTT G/- GCAGTGAAGT 3070 hom 63 het 34 0 25 10 G 2 1 207606 CASAVA_Build 4 62063752 1I TTATATGGTA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 6 7 207607 CASAVA_Build 4 62064688 1D TAAAAAATAC T/- TGTGTGAAGC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 2 1 207608 CASAVA_Build 4 62066714 1D GATACACATA T/- TAAGTAATAC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 2 1 207609 CASAVA_Build 4 62073461 3I TCATATTTTA ---/AAG AAGAAGGAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAG 2 3 207610 CASAVA_Build 4 62081066 1D TTAGATGTTT A/- AAAAAAAAAA 1551 het 1551 ref 42 31 5 7 A 13 12 207611 CASAVA_Build 4 62081787 1I AGCATTTGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 9 207612 CASAVA_Build 4 62083418 1D TATTGAGGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 8 207613 CASAVA_Build 4 62095588 1D TTTTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 37 24 4 9 T 12 11 207614 CASAVA_Build 4 62100487 2I TAACAGGCTC --/AT ATATGTCACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AT 2 3 207615 CASAVA_Build 4 62108970 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 8 7 207616 CASAVA_Build 4 62114501 1D TATGTTTGCA G/- GGTTGGTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 8 G 3 2 207617 CASAVA_Build 4 62119306 1D CAGGATTAAT G/- GGGGGTTGCT 3070 hom 56 het 38 1 31 7 G 6 5 207618 CASAVA_Build 4 62125464 2I AGTGAATAAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 103 hom 34 1 22 11 TG 8 9 207619 CASAVA_Build 4 62131912 2D TCACTAGCTG TA/-- TGTTTGATAT 3070 hom 99 het 36 0 33 4 TA 1 0 207620 CASAVA_Build 4 62150387 31D AAGTAAACGG TTAATAAATAAACGCTTGATCCATGCTAAAA/------------------------------- TGACCTCCCT 3070 hom 108 het 32 0 37 2 TTAATAAATAAACGCTTGATCCATGCTAAAA 1 0 207621 CASAVA_Build 4 62159111 1I AAAGGAAATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 10 207622 CASAVA_Build 4 62174738 1I TTTAAAGGTA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 7 8 207623 CASAVA_Build 4 62176812 1D CATCACTGAG C/- TCATTCAGCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 0 207624 CASAVA_Build 4 62189581 1D ATAAATCCTA T/- TTTTTTTTCG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 T 9 8 207625 CASAVA_Build 4 62228617 8I4M1D GAATTTATGA --------CCACA/AATGGAATTCAC- AACTTTAGTG 3070 hom 93 het 32 0 32 5 N/A 0 0 207626 CASAVA_Build 4 62233069 17D GGATTCTGTG CTTTTCTGTTTGTTGTA/----------------- TTTTTCAGTA 3070 hom 90 het 32 0 31 6 CTTTTCTGTTTGTTGTA 1 0 207627 CASAVA_Build 4 62248629 2I ATATGAAAAA --/AG AAATTTAATT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AG 0 1 207628 CASAVA_Build 4 62256798 1D ACAGTCTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 9 207629 CASAVA_Build 4 62260336 1D TCATTGCAAC A/- AAAATTATAT 3070 het 3070 ref 46 21 21 5 A 5 4 207630 CASAVA_Build 4 62262532 18I CATGTAAAAT ------------------/ACGCACACACACACACAC ACGCACACAC 3070 hom 44 het 29 0 15 15 ACGCACACACACACACAC 0 1 207631 CASAVA_Build 4 62273922 1I AAAAAAAACC -/A AAAAAAAAAC 2848 het 2210 hom 17 9 8 0 A 9 10 207632 CASAVA_Build 4 62274079 8I GATTTGATGA --------/CAGGGAGG AAATGGAGAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CAGGGAGG 0 1 207633 CASAVA_Build 4 62320098 1I AATCAATAAG -/C CCTTTTATAG 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 C 2 3 207634 CASAVA_Build 4 62332751 1I GTTGACTCAC -/T TTTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 6 7 207635 CASAVA_Build 4 62336244 1I AAAATGATAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 7 8 207636 CASAVA_Build 4 62340539 3D GCTTAGAAAT TTC/--- TTCTTCCAGG 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 TTC 3 2 207637 CASAVA_Build 4 62346061 2I TTTCTAGATT --/AA GTTTCACTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 0 2 207638 CASAVA_Build 4 62350350 2D CTGATAATGA AT/-- ATAATTTTGA 3070 het 3070 hom 55 24 24 7 AT 2 1 207639 CASAVA_Build 4 62355335 1D AAAATAAGCA T/- TTTTAAACAC 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 5 4 207640 CASAVA_Build 4 62355649 1D TTTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 12 11 207641 CASAVA_Build 4 62356602 1I AGCGGATGCT -/G GAATAAATAC 3070 het 3070 ref 56 24 23 9 G 1 2 207642 CASAVA_Build 4 62372375 1D AATCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 12 7 A 10 9 207643 CASAVA_Build 4 62375230 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 18 10 7 1 A 11 9 207644 CASAVA_Build 4 62376216 1D ATAAAAGATG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 8 7 207645 CASAVA_Build 4 62411997 5D GCTTACAAAT ATATC/----- ATATTAGTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 4 ATATC 1 0 207646 CASAVA_Build 4 62413580 1I AAGCTACTTT -/A AAAAAAATTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 8 207647 CASAVA_Build 4 62418932 1I AAGGACAAAT -/A ACCAGATTAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 1 2 207648 CASAVA_Build 4 62420722 1D CCTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2119 het 2119 ref 36 18 6 13 T 15 14 207649 CASAVA_Build 4 62424600 2D TATCCAATTT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 TG 1 0 207650 CASAVA_Build 4 62432663 1I TGCCTCAGTT -/A ATGCATGTAG 3070 het 3070 ref 47 25 21 1 A 1 2 207651 CASAVA_Build 4 62439256 15D TTTGATTTAT TATATATGCAAATTA/--------------- TATATATTAG 3070 het 3070 ref 36 24 14 5 TATATATGCAAATTA 1 0 207652 CASAVA_Build 4 62439522 1I GATTAGAAAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 7 8 207653 CASAVA_Build 4 62440496 1D TTCTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2291 hom 24 9 11 5 T 13 12 207654 CASAVA_Build 4 62447330 3I TGCCATTTTG ---/AAC ATGCCTACTC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 AAC 0 1 207655 CASAVA_Build 4 62447508 4D ACTTTCTTGC CTCA/---- CTATCTGCCT 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 CTCA 1 0 207656 CASAVA_Build 4 62452991 1D AACTACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 40 2 28 11 A 11 10 207657 CASAVA_Build 4 62458782 1D ATAAACATAT A/- AAATATATTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 4 3 207658 CASAVA_Build 4 62459205 1D TGGCAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 12 11 207659 CASAVA_Build 4 62460152 1I GCTACTGAGG -/A AAAAAAAAAA 2990 het 2990 ref 26 11 10 5 A 11 12 207660 CASAVA_Build 4 62511493 3D TTATATTATT TAA/--- TAACATGCTT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 TAA 2 1 207661 CASAVA_Build 4 62526652 1D CTTGCTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 10 9 207662 CASAVA_Build 4 62536181 1D TCCCTTTTCT C/- TCCTATTAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 C 1 0 207663 CASAVA_Build 4 62545844 1I CAACTCACTA -/T TGTGGTTTTT 3070 hom 121 het 47 0 40 7 T 1 2 207664 CASAVA_Build 4 62559018 1I CTTATGAAAA -/T GGGAACATTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 0 1 207665 CASAVA_Build 4 62562212 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3018 het 1693 hom 19 6 10 3 T 10 11 207666 CASAVA_Build 4 62571345 7D TGGACAAACT AAATTGA/------- AAATTGAAAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AAATTGA 2 1 207667 CASAVA_Build 4 62622417 4I GTTCTTTTTT ----/CTAC CTACCACCTT 3070 hom 90 het 33 0 29 4 CTAC 1 2 207668 CASAVA_Build 4 62628174 2I CAATGTGATA --/AC ACATCATTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AC 1 2 207669 CASAVA_Build 4 62630453 1D GCATAAAAAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 9 8 207670 CASAVA_Build 4 62630613 4I GCCCTAACTT ----/AGTC AGTCTTTAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AGTC 1 2 207671 CASAVA_Build 4 62632274 5I GTTTGGAGCC -----/CTAAA CTATTCTTTT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 CTAAA 0 1 207672 CASAVA_Build 4 62642704 1D GTGGGGTATG A/- AAAAAAACTC 3070 hom 86 het 31 0 27 5 A 8 7 207673 CASAVA_Build 4 62657594 1D AGTCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 37 2 31 4 A 12 11 207674 CASAVA_Build 4 62663484 1D CTTCTTAGAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 8 207675 CASAVA_Build 4 62665956 1I AAAACTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 11 207676 CASAVA_Build 4 62675264 1I TATAACCTTT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 7 8 207677 CASAVA_Build 4 62688575 8D CATATTTACT TGTACAAA/-------- TGTATAAACC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 TGTACAAA 1 0 207678 CASAVA_Build 4 62737511 1I AGTAAAAACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 9 10 207679 CASAVA_Build 4 62753004 1I GATCTTCTGA -/T TTTTGGTCTG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 4 5 207680 CASAVA_Build 4 62755280 3D TTCTTCTTCT TTC/--- TCCTTCTCCT 3070 het 2477 hom 33 13 13 7 TTC 1 0 207681 CASAVA_Build 4 62756513 2D ATGGAAGAAA CT/-- CTTTTAAATT 3070 het 3070 hom 31 10 17 5 CT 2 1 207682 CASAVA_Build 4 62757062 4D GAAATACAAC ACAT/---- ACACCTGTGT 3070 het 3070 hom 56 18 30 9 ACAT 1 0 207683 CASAVA_Build 4 62757718 3D TGGGACAGTA AAG/--- AAATATTTTT 3070 het 3070 ref 31 20 8 6 AAG 1 0 207684 CASAVA_Build 4 62758736 2I TGGATATGAC --/TT AACGCAAAGG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 0 2 207685 CASAVA_Build 4 62760399 1D ACTTACTTTA C/- CAAAAATATA 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 C 2 1 207686 CASAVA_Build 4 62761119 1D TACTACAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 A 10 9 207687 CASAVA_Build 4 62766810 4D GAAAACTGGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 TTTG 3 2 207688 CASAVA_Build 4 62770355 3D GCCGAGAAAG ATT/--- ATTAATTGGG 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 ATT 2 1 207689 CASAVA_Build 4 62770479 2D AGCTAAACGC TA/-- TGAGTTTGGT 3070 het 3070 hom 53 21 23 11 TA 1 0 207690 CASAVA_Build 4 62790645 1D AAAATAAAAA T/- TAAAAAAATA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 2 1 207691 CASAVA_Build 4 62829268 4I CTGAAAACAC ----/TTTT TTTTTCCAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 5 9 207692 CASAVA_Build 4 62853346 1D ATAAAGTGAT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 78 het 30 0 25 6 A 8 7 207693 CASAVA_Build 4 62864609 1D AATTCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 122 hom 33 1 19 13 T 12 11 207694 CASAVA_Build 4 62876329 1I ATATGGTAAA -/C TTAATTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 0 1 207695 CASAVA_Build 4 62877886 50I CCCAAGCGAG --------------------------------------------------/CACCTCAGCCTCCTGAGCAATAGCAGCTGGCTGGGACTACAGGTATGTGC CACCACATAC 3070 hom 48 het 18 0 15 8 CACCTCAGCCTCCTGAGCAATAGCAGCTGGCTGGGACTACAGGTATGTGC 0 1 207696 CASAVA_Build 4 62881675 1I TAACATGATG -/A AAAAAAAAAA 1507 het 1507 ref 44 27 5 12 A 13 14 207697 CASAVA_Build 4 62884999 1I ATTTGACAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 10 207698 CASAVA_Build 4 62901065 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2403 het 2403 ref 43 27 6 10 A 13 12 207699 CASAVA_Build 4 62902545 2D ACATATATGA AT/-- ATATATATAT 961 het 961 ref 25 16 3 6 AT 7 6 207700 CASAVA_Build 4 62918974 2I TCAAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 86 het 34 0 29 5 A 9 11 207701 CASAVA_Build 4 62922141 1I TAGGGGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 187 hom 28 1 26 1 T 9 10 207702 CASAVA_Build 4 62932210 1I TGTATTATCA -/T TTTTTTATAT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 6 7 207703 CASAVA_Build 4 62932302 1D TGGCCTGTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 10 9 207704 CASAVA_Build 4 62935132 2I TGCTTGACAC --/AT GAGGACACTA 2882 hom 24 het 10 0 9 1 AT 0 1 207705 CASAVA_Build 4 62945969 1D AGAAATTGCT A/- AAAAAAATGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 8 7 207706 CASAVA_Build 4 62991487 1D ACACCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2276 het 14 hom 18 0 6 12 A 19 18 207707 CASAVA_Build 4 62999758 2D AATAATAAAC AT/-- GTAAATTAGT 3070 hom 135 het 51 0 46 7 AT 1 0 207708 CASAVA_Build 4 63012126 3I ACCATGACAC ---/ATT ATTAATTTAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 ATT 1 2 207709 CASAVA_Build 4 63012821 1D GAATAATGTG C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 C 9 8 207710 CASAVA_Build 4 63013508 2D GCTGGAACTC AA/-- AAGTTTCAAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 4 2 207711 CASAVA_Build 4 63014875 2I CATGGCGAAT --/CA CAGTTATTGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CA 1 2 207712 CASAVA_Build 4 63024537 4D TTGCTTTTGT TTTG/---- TTTCAGAAAG 3070 hom 81 het 29 0 27 3 TTTG 1 0 207713 CASAVA_Build 4 63025469 1I TGCTGTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 10 11 207714 CASAVA_Build 4 63035150 1I AAATTAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 26 1 19 6 T 11 12 207715 CASAVA_Build 4 63036191 1D TTTGGCCGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 16 10 T 11 10 207716 CASAVA_Build 4 63039580 1I AGGCAGCGCG -/T CTGGAGTTGT 3070 hom 38 het 14 0 13 1 T 0 1 207717 CASAVA_Build 4 63039751 1I CAGCGTGGAA -/G GGGGACCCCA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 4 5 207718 CASAVA_Build 4 63081079 1D AGGTATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 23 1 18 4 A 11 10 207719 CASAVA_Build 4 63081156 1D GTCGAGGTTA A/- AAAAAATCTG 3070 hom 33 het 17 0 12 5 A 8 7 207720 CASAVA_Build 4 63081252 3D AATATACAAA AAT/--- ATACGTAAAA 2825 hom 15 het 8 0 6 3 AAT 1 0 207721 CASAVA_Build 4 63082932 2I GTCATGGATT --/AG AAAAGATAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AG 0 1 207722 CASAVA_Build 4 63083772 1D GATCAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 43 0 35 8 A 12 11 207723 CASAVA_Build 4 63097255 1I TTTGGATGTA -/G AATTGTTTGT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 G 0 1 207724 CASAVA_Build 4 63106262 1D AAACCCAGTT G/- GGGGCTTCTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 5 4 207725 CASAVA_Build 4 63110404 1D GCCCTCATAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 10 9 207726 CASAVA_Build 4 63112535 1D AGTCAATGAA G/- ATTTCTGAGT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 G 1 0 207727 CASAVA_Build 4 63123532 4I TTCTTTTGAC ----/ACAA ACACACACAT 3070 hom 96 het 34 0 30 4 ACAA 0 1 207728 CASAVA_Build 4 63128525 1I GTAAAGTGTC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 8 207729 CASAVA_Build 4 63132362 1D TAGGGAAGAC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 8 7 207730 CASAVA_Build 4 63135849 1D CTGGCAATGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 9 8 207731 CASAVA_Build 4 63139550 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 36 3 27 6 A 12 11 207732 CASAVA_Build 4 63141831 3D AGAACTTTTT ATC/--- ATCTTGAATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 ATC 2 1 207733 CASAVA_Build 4 63148176 3I TAAGCCTGAA ---/TCC TCCAACTAAT 3070 hom 120 het 41 0 41 0 TCC 1 2 207734 CASAVA_Build 4 63172281 1I CACCTATTGT -/C CCAGCTACTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 2 3 207735 CASAVA_Build 4 63177909 1I GATTCTTGCC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 7 8 207736 CASAVA_Build 4 63183188 1D CACGGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 2500 hom 15 het 7 0 6 1 C 4 3 207737 CASAVA_Build 4 63183677 1D TCATGCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 376 hom 27 3 19 5 A 12 11 207738 CASAVA_Build 4 63184860 1D TTTTTTCATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 43 0 38 7 T 10 9 207739 CASAVA_Build 4 63185177 4D ACATTAAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 AAAC 4 3 207740 CASAVA_Build 4 63185396 1I CATCTATCAC -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 111 het 38 0 38 0 A 7 8 207741 CASAVA_Build 4 63185715 1I TCAAATAAAG -/A AAAAAATGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 207742 CASAVA_Build 4 63186852 1D TATTCAAAGG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 8 7 207743 CASAVA_Build 4 63187524 1D AATAAGCAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 9 8 207744 CASAVA_Build 4 63187836 6I TTATAAAAGC ------/TAGTAT TGTTATAAGA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 TAGTAT 0 1 207745 CASAVA_Build 4 63188337 2D TGTAAATAAA CT/-- CTCTAATCAA 3070 hom 69 het 28 0 24 6 CT 3 2 207746 CASAVA_Build 4 63189095 7I TCACTAACAG -------/ATGAATA TATATACAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ATGAATA 0 1 207747 CASAVA_Build 4 63196344 1I CATTTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 25 1 17 7 T 11 12 207748 CASAVA_Build 4 63201500 1I CTGAAATTTA -/T TTTCTTCTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 3 4 207749 CASAVA_Build 4 63205051 1D AAAATTTTAG T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 7 6 207750 CASAVA_Build 4 63206890 4D GGTTATATGT GATA/---- GATAATTTTA 3051 het 2405 hom 17 5 7 5 GATA 2 1 207751 CASAVA_Build 4 63218077 2D GTATTTGGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 108 het 47 0 37 12 TA 7 6 207752 CASAVA_Build 4 63221689 3I CTAATTGGTA ---/TTC TTCAAATAAC 3070 hom 148 het 57 0 50 7 TTC 1 2 207753 CASAVA_Build 4 63223939 1D GTAATATCCC T/- TTTGTTTCTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 4 3 207754 CASAVA_Build 4 63224974 1I AACAAATTAG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 8 9 207755 CASAVA_Build 4 63226996 1D TTGGTTTACA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 8 7 207756 CASAVA_Build 4 63229094 1I TTCAACTGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 9 10 207757 CASAVA_Build 4 63239443 4D GCATACTTTA GTTT/---- GTTTGTCACT 3070 het 3070 hom 44 18 23 5 GTTT 2 1 207758 CASAVA_Build 4 63239681 1I TATTATAGTA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 19 8 8 3 T 6 7 207759 CASAVA_Build 4 63240358 1I TAAATTTAGG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 7 8 207760 CASAVA_Build 4 63241196 4I CAACTCACTG ----/CAAC CTCTGCCTCC 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 CAAC 0 1 207761 CASAVA_Build 4 63244618 4D AACTGTCAGC AGTA/---- AGTAAGTTAT 3070 het 3070 ref 22 12 8 4 AGTA 2 1 207762 CASAVA_Build 4 63245527 4D CAAATCTAAT AAAC/---- AAGTGCTTTG 3070 het 3070 ref 27 12 12 5 AAAC 1 0 207763 CASAVA_Build 4 63253829 1I TTACATTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 11 12 207764 CASAVA_Build 4 63259126 4I GAAGTATTTT ----/AGTC AGCAGTTAGC 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 AGTC 0 1 207765 CASAVA_Build 4 63260508 1D ATGAAGGCTG A/- ATTAAGACCC 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 A 2 1 207766 CASAVA_Build 4 63270222 4D ATTTCCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 168 hom 28 3 14 13 T 18 14 207767 CASAVA_Build 4 63297163 1D GGAGCCTGTC A/- GGGGGGTAAG 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 1 0 207768 CASAVA_Build 4 63299948 1D TTATTAATAT A/- AATGAAATGA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 3 2 207769 CASAVA_Build 4 63301099 1D ATATTTATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 10 9 207770 CASAVA_Build 4 63302512 1I CAACAGCTGG -/A AAGCCCTGGA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 2 3 207771 CASAVA_Build 4 63313967 1I TCATTGGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 11 12 207772 CASAVA_Build 4 63315863 1I CAACTGGACC -/A AATACCCTGC 3070 het 3070 ref 55 25 23 7 A 2 3 207773 CASAVA_Build 4 63315990 1D TAAGAAATAT G/- GGGGGGACAC 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 G 7 6 207774 CASAVA_Build 4 63319559 1D TGTATTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 12 11 207775 CASAVA_Build 4 63330397 12D TTCTTCTTCT TTCTTCTTCTCC/------------ TTCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 TTCTTCTTCTCC 2 1 207776 CASAVA_Build 4 63331658 2D16M14D CAGAGCAAGA CTCTGTTGCAACAACAACACCAAAAAAAAAAA/--CTGTTGCAACAACAAC-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 13 12 8 1 N/A 0 0 207777 CASAVA_Build 4 63333281 2D ACTTAAGAAA AT/-- AATGAAGAAT 3070 het 3070 hom 45 18 26 1 AT 1 0 207778 CASAVA_Build 4 63334184 3D TTGTATACAC AGT/--- AGATTTCCAT 3070 het 3070 hom 43 19 20 7 AGT 1 0 207779 CASAVA_Build 4 63335387 1D GAGGTGAGAC A/- ATAGCCTCTA 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 A 2 1 207780 CASAVA_Build 4 63336092 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAATACA 3070 het 2527 hom 22 7 12 4 A 7 6 207781 CASAVA_Build 4 63336897 3D CCCTTCTAAC CTA/--- CTTACTAAGT 3070 het 3070 hom 36 17 16 4 CTA 1 0 207782 CASAVA_Build 4 63337077 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 1 0 207783 CASAVA_Build 4 63341059 1D AAATAATAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 2812 hom 30 7 18 6 A 8 7 207784 CASAVA_Build 4 63343311 3I ATTAATTTTT ---/TTC TTTTTCTAAT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 TTC 0 1 207785 CASAVA_Build 4 63345870 1I TTACTGCAGT -/A AAATTACAAC 3070 het 3070 ref 49 22 22 5 A 3 4 207786 CASAVA_Build 4 63347317 4I GTTAACACAT ----/AGTC AGTATACATG 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 AGTC 0 1 207787 CASAVA_Build 4 63348879 4I TTTTGATAGT ----/ATCC ATCCATTGTG 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 ATCC 1 2 207788 CASAVA_Build 4 63349285 1D CAACTTTTTT A/- CAGCACCATT 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 1 0 207789 CASAVA_Build 4 63349588 1D AAATGATGTT G/- GTAATTTGAT 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 G 2 1 207790 CASAVA_Build 4 63352219 1D TCTGTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 12 11 207791 CASAVA_Build 4 63355861 10D GGGAAGGCAG GCCCCTGCCA/---------- GCTGTAACAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 14 GCCCCTGCCA 1 0 207792 CASAVA_Build 4 63367602 1I TCATAAATAA -/T TTTTTTTTGC 2554 het 2554 ref 25 12 6 7 T 8 9 207793 CASAVA_Build 4 63382430 2D TCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 31 0 28 12 T 11 9 207794 CASAVA_Build 4 63388501 1I AAGTAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 11 12 207795 CASAVA_Build 4 63390180 4I CTTTTCTACT ----/TAGA TAGTAAATTC 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 TAGA 0 1 207796 CASAVA_Build 4 63404025 1I TGTGCATATG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 80 het 32 0 27 5 A 7 8 207797 CASAVA_Build 4 63405313 4D TATGTTACAT TAAC/---- TATTTAATCA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 TAAC 1 0 207798 CASAVA_Build 4 63406795 1D ATTTAAATAC A/- AATACATCTA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 3 2 207799 CASAVA_Build 4 63411004 1I TTCAGATATT -/A AAGTGATTGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 3 207800 CASAVA_Build 4 63414043 1I ATATATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 255 hom 31 1 16 14 T 14 15 207801 CASAVA_Build 4 63419323 1I GAAATTCTGT -/A AAAAAACATG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 6 7 207802 CASAVA_Build 4 63423987 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 30 1 20 9 A 11 10 207803 CASAVA_Build 4 63424422 10D ACACAGTACT GGTAGTCCAA/---------- GCTAAAGCAA 3070 hom 57 het 22 0 20 6 GGTAGTCCAA 1 0 207804 CASAVA_Build 4 63424779 1I TAGAAGAGGA -/C ACCAAAAATT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 C 0 1 207805 CASAVA_Build 4 63428841 5D GTAATACACA TAACT/----- TAGAATTGAG 3070 hom 99 het 39 0 34 8 TAACT 1 0 207806 CASAVA_Build 4 63430319 1I ATTTTAGAAT -/C AGTTCTCTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 0 1 207807 CASAVA_Build 4 63431073 1I GTTGTCACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 444 hom 44 2 33 9 T 9 10 207808 CASAVA_Build 4 63439586 34D CTGCCAAACT TTCCAAGTGGCTGCATCCACTTGGCTGCATCCAA/---------------------------------- GTCTTTCCAA 3070 hom 51 het 17 0 18 3 TTCCAAGTGGCTGCATCCACTTGGCTGCATCCAA 1 0 207809 CASAVA_Build 4 63442379 1I ACACACAATA -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 6 7 207810 CASAVA_Build 4 63450828 3I GTTTGATTAC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 30 0 22 8 A 10 13 207811 CASAVA_Build 4 63451905 1I CCAAAACCAA -/C TAAAAGTCTA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 C 0 1 207812 CASAVA_Build 4 63452963 15D ATGGTGAGGT TAGGTAGCACAGTGA/--------------- GGAAGCACAG 3070 hom 96 het 31 0 32 6 TAGGTAGCACAGTGA 1 0 207813 CASAVA_Build 4 63456555 2D GTATCCAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 39 0 27 13 T 13 11 207814 CASAVA_Build 4 63458239 2I CACGCACTTG --/AC ACACACACAC 1409 hom 24 het 18 0 9 9 AC 6 7 207815 CASAVA_Build 4 63463518 3D GATTTGTCTG TCT/--- TCTTATACTA 3070 hom 126 het 48 0 43 8 TCT 2 1 207816 CASAVA_Build 4 63468189 1I AAGGGGTGAT -/A AGACACCATC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 1 2 207817 CASAVA_Build 4 63472923 2I CATATATATA --/TT TAATTTCACA 3070 hom 82 het 32 0 28 4 T 1 3 207818 CASAVA_Build 4 63476643 14I4M1I AACAGCATAA --------------CGAG-/TAATAAATAAAATTTGAGC TAGCCAGAGA 3070 hom 60 het 23 0 21 4 N/A 0 0 207819 CASAVA_Build 4 63484975 1D GCATGGTGCC T/- TTAGCCCCTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 3 2 207820 CASAVA_Build 4 63485835 1I AAACTGATAT -/A AAAACCTATT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 4 5 207821 CASAVA_Build 4 63486912 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2283 hom 18 het 8 0 6 2 T 9 10 207822 CASAVA_Build 4 63488109 2D ACTTTTGAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 31 0 22 9 T 16 14 207823 CASAVA_Build 4 63494064 1D TTCCATTTCT C/- CCCCCTCCCT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 C 6 5 207824 CASAVA_Build 4 63494536 1D TTCTTTTGAC T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 8 7 207825 CASAVA_Build 4 63500160 4D GACTAATAAT AATA/---- AATAGTCTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AATA 2 1 207826 CASAVA_Build 4 63501037 1I AATTGCAAAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 80 het 35 0 26 9 T 8 9 207827 CASAVA_Build 4 63501555 3D AGGGGAGAAA AAT/--- AATACATTCC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 AAT 2 1 207828 CASAVA_Build 4 63508335 1D GTAATTATCT A/- AGAAGAATGT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 2 1 207829 CASAVA_Build 4 63508450 15I TAGATAACTG ---------------/TTTTAATTGAAAATT TTAAAAATAT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 TTTTAATTGAAAATT 0 1 207830 CASAVA_Build 4 63517759 1D AAAGAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 42 0 34 9 T 12 11 207831 CASAVA_Build 4 63529613 1I AATAATCTGC -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 6 7 207832 CASAVA_Build 4 63540799 1D GAGGCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2986 het 113 hom 25 2 9 14 T 12 11 207833 CASAVA_Build 4 63542385 1D TTTTTTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 15 2 8 5 T 11 10 207834 CASAVA_Build 4 63544473 2I GAGCCCAGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2692 hom 33 10 15 8 T 10 12 207835 CASAVA_Build 4 63546709 4D CCAGACTAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 6 AG 8 6 207836 CASAVA_Build 4 63553215 1D CTCAAAGACA T/- TTTTTCACAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 6 5 207837 CASAVA_Build 4 63555868 1D CTACCATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 11 10 207838 CASAVA_Build 4 63561912 1D TAAACACTTC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 9 8 207839 CASAVA_Build 4 63577213 1D TTTATATTCA T/- TTTTTTTTTC 2887 het 2887 ref 26 14 6 6 T 10 9 207840 CASAVA_Build 4 63585033 1D GAATAACTCC T/- TTCTTCCCAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 T 3 2 207841 CASAVA_Build 4 63586424 1D TCCCATTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 10 9 207842 CASAVA_Build 4 63587846 2D CTTATGAAAT AA/-- GTTAACCTTT 3070 het 3070 ref 35 20 9 7 A 2 0 207843 CASAVA_Build 4 63590103 3D GGGCCTAGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 9 T 15 12 207844 CASAVA_Build 4 63591810 1D AGAGACATTT C/- CCTATTGTCT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 C 3 2 207845 CASAVA_Build 4 63594413 1D AGTTTATTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 20 23 5 T 10 9 207846 CASAVA_Build 4 63597222 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCTCTGGC 3070 het 3070 ref 36 15 16 6 C 5 4 207847 CASAVA_Build 4 63599167 3D GTCAAATCCT ATC/--- ATCTATTCGT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 ATC 2 1 207848 CASAVA_Build 4 63599769 1D AATCTCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 19 1 12 6 A 13 12 207849 CASAVA_Build 4 63600676 1D GGCCTTCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 A 10 9 207850 CASAVA_Build 4 63606301 8I CCAGAGGCCA --------/GCACCCAG CTAGCAGAAC 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 GCACCCAG 0 1 207851 CASAVA_Build 4 63612227 1I AGAAAATCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 10 12 T 11 12 207852 CASAVA_Build 4 63613706 4D6M1I CAGAAGTGTC TCTTTATGTC-/----TATGTCT TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 41 24 17 5 N/A 0 0 207853 CASAVA_Build 4 63614831 4I ATGTCAAGAG ----/AGAT AGTTTGAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AGAT 0 1 207854 CASAVA_Build 4 63621614 1I GTTAAAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 11 207855 CASAVA_Build 4 63628453 2D TAATTAACAC AT/-- GTTGTGGGAA 3070 het 3070 ref 44 25 14 10 AT 1 0 207856 CASAVA_Build 4 63633080 1I TTAATAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 10 11 207857 CASAVA_Build 4 63634560 1I GGCTCTTAAT -/G GATGTGTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 G 1 2 207858 CASAVA_Build 4 63638899 1I TATGTCTGGC -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 T 6 7 207859 CASAVA_Build 4 63642408 1I CAAAACCAAA -/C AACTTATAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 207860 CASAVA_Build 4 63642992 3I AATTTACTTG ---/AAT ATGACTTCAC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AAT 0 1 207861 CASAVA_Build 4 63648389 1D ATAGAGACAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 23 het 10 0 8 2 A 9 8 207862 CASAVA_Build 4 63653774 2D GTGTGTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 AT 6 5 207863 CASAVA_Build 4 63663339 1I CCAACATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 10 11 207864 CASAVA_Build 4 63676814 5D GTTAGCATAG TTTTC/----- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 43 25 15 4 TTTTC 1 0 207865 CASAVA_Build 4 63678481 2I TAAGATACAT --/AC AGAGAGAGAG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 AC 0 1 207866 CASAVA_Build 4 63678782 2D AAATAATTAT AC/-- TAAATAAATA 2669 het 988 hom 9 2 6 1 AC 1 0 207867 CASAVA_Build 4 63681571 1D TAATTTCTGA T/- TTTTACATAG 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 5 4 207868 CASAVA_Build 4 63686249 2D CCTCTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 117 het 44 0 39 6 TG 10 9 207869 CASAVA_Build 4 63689276 1I TTTTTAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 12 13 207870 CASAVA_Build 4 63696945 1I GGACACGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 10 11 207871 CASAVA_Build 4 63700340 1D TGTTTGTCTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 9 8 207872 CASAVA_Build 4 63700997 1I CTCTGTATAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 7 8 207873 CASAVA_Build 4 63709163 2I TTGCAATGAT --/AA AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 8 10 207874 CASAVA_Build 4 63711139 69D ACAAGTTGTT TGTATTGCATCTTTAATCATGGAAGGGATAATGATTTATCTTGCCTGTGCATGATTCACATTTTGCATA/--------------------------------------------------------------------- TTGGTTTACT 3070 het 3070 ref 37 49 11 5 TGTATTGCATCTTTAATCATGGAAGGGATAATGATTTATCTTGCCTGTGCATGATTCACATTTTGCATA 1 0 207875 CASAVA_Build 4 63720254 3D AAGAAATAAT ATA/--- ATAATTGAAA 2853 het 2198 hom 24 5 9 10 ATA 2 1 207876 CASAVA_Build 4 63720289 3D ATGTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 20 1 8 11 T 15 12 207877 CASAVA_Build 4 63721463 1D GAGAATACCA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 T 7 6 207878 CASAVA_Build 4 63731100 1D GAGGAAAAAC A/- GAGAGAATAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 4 A 1 0 207879 CASAVA_Build 4 63734875 1I TGACATTTTC -/T GTAGGAAGGA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 T 0 1 207880 CASAVA_Build 4 63740547 1D AGCTACAGAT G/- GGTCTTACAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 3 2 207881 CASAVA_Build 4 63741708 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 11 12 207882 CASAVA_Build 4 63743879 1D ATTAATCTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 420 hom 33 2 19 12 T 9 8 207883 CASAVA_Build 4 63744446 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATGA 3070 het 1044 hom 14 3 8 3 A 7 8 207884 CASAVA_Build 4 63755160 1I TAAAAATCAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 8 9 207885 CASAVA_Build 4 63756037 1D TCAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 2881 het 2881 ref 17 8 7 2 T 1 0 207886 CASAVA_Build 4 63757933 1I GGGTAGGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 9 10 207887 CASAVA_Build 4 63761592 2D AGTGTGTTTT TA/-- TATATATATA 2826 hom 18 het 8 0 7 2 TA 6 5 207888 CASAVA_Build 4 63764065 1D TTCATCAAAG T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 T 7 6 207889 CASAVA_Build 4 63767305 1D GGGTCTCTGT C/- CCAGGAAGAT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 C 3 2 207890 CASAVA_Build 4 63769018 1D GTTTAAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2489 hom 17 6 9 2 A 9 8 207891 CASAVA_Build 4 63770478 1I AAAAAAAAAA -/T AATTCATTTG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 0 1 207892 CASAVA_Build 4 63776519 1D TACTTCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 704 hom 30 2 21 7 A 12 11 207893 CASAVA_Build 4 63779860 1D TTATCTTGAC T/- TTTTTTTTTT 2801 het 2801 ref 41 22 11 8 T 12 11 207894 CASAVA_Build 4 63780251 1D AATAATTCTA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 8 7 207895 CASAVA_Build 4 63780943 1D TTATATTCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 10 9 207896 CASAVA_Build 4 63782896 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAACCTA 2476 het 2476 ref 27 15 10 2 A 7 6 207897 CASAVA_Build 4 63787541 4D TTTATCTGAT ACTC/---- ACAAGTTTGT 3070 het 3070 hom 32 11 15 8 ACTC 1 0 207898 CASAVA_Build 4 63787728 4I AATTAATATC ----/AGAT AGTTGATTAG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AGAT 0 1 207899 CASAVA_Build 4 63787892 1D AGAAAGAGTC T/- TTTGGGTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 T 4 3 207900 CASAVA_Build 4 63789094 4D AAAACTAAAT AAAG/---- AAACTAAAAA 2735 het 2735 ref 23 14 7 2 AAAG 1 0 207901 CASAVA_Build 4 63791394 1D TATTCATATA T/- TTTTTTATTC 1446 het 1446 ref 9 6 3 0 T 7 6 207902 CASAVA_Build 4 63799244 1I GCAGAAATCA -/C CCGTCTTCTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 2 3 207903 CASAVA_Build 4 63805256 6D GGTTTTAATT GAATTC/------ ATAATTCCTA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 GAATTC 1 0 207904 CASAVA_Build 4 63807203 1D AAGTCTTAAA G/- GGTAATTAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 3 2 207905 CASAVA_Build 4 63807686 1I TGATTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 44 1 40 3 T 10 11 207906 CASAVA_Build 4 63810809 2D17M1I TGGAGGTGAC TGTGTGCTTGCTAGTAACC-/--TGTGCTTGCTAGTAACCT TTTTTTTTTT 2054 het 1162 hom 18 8 5 13 N/A 0 0 207907 CASAVA_Build 4 63817926 1D TTGTGTGTGT G/- TTTTTAAGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 1 0 207908 CASAVA_Build 4 63821613 5D TTTTTCAAAC TAATT/----- TATTACAAGC 3070 hom 57 het 22 0 20 4 TAATT 1 0 207909 CASAVA_Build 4 63823448 2I GCGTGGCAAC --/AG ACACCCATTC 3070 hom 90 het 34 0 28 6 AG 0 1 207910 CASAVA_Build 4 63824866 4I ACACACTACA ----/TAAT ATAATTTCAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TAAT 0 1 207911 CASAVA_Build 4 63825386 4D CAGCATTCTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 43 1 34 8 A 14 10 207912 CASAVA_Build 4 63826233 1I TCAGCAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 9 10 207913 CASAVA_Build 4 63826799 1I ACAGAAATGC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 8 9 207914 CASAVA_Build 4 63828035 1I AGCCATACAG -/C CCAAAGCAAT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 C 2 3 207915 CASAVA_Build 4 63828409 1I GCTAGCCATA -/T GCAGAAGATT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 0 1 207916 CASAVA_Build 4 63829675 2D2M3D AAACATTATA TGCACTT/--CA--- AGTATGAGTA 3070 hom 89 het 34 0 29 5 N/A 0 0 207917 CASAVA_Build 4 63831520 2I AAATTCAGAC --/TA TTATGTAGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TA 0 1 207918 CASAVA_Build 4 63834012 1D GTACCTACCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 45 het 45 1 35 9 T 9 8 207919 CASAVA_Build 4 63834586 2I TTGAGGTAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 10 12 207920 CASAVA_Build 4 63842441 2D CTACTATCAC AT/-- GTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 AT 1 0 207921 CASAVA_Build 4 63844274 4I TGCTAATAAT ----/AGAG AGAATGAAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AG 1 3 207922 CASAVA_Build 4 63845410 1D TGCTTACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 44 0 32 14 A 11 10 207923 CASAVA_Build 4 63854644 1I TCTTACTGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 26 3 T 9 10 207924 CASAVA_Build 4 63861837 1D TTTTAGTTTT G/- GGGGGTAGGT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 G 6 5 207925 CASAVA_Build 4 63864710 1D CACTTAGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 9 207926 CASAVA_Build 4 63867661 2I ATTAAATTTA --/AT ATCTTTTTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 2 207927 CASAVA_Build 4 63868369 2D AAATATTTAC AT/-- ATAAAGTGTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AT 2 1 207928 CASAVA_Build 4 63870187 1D TCAGAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 20 6 A 11 10 207929 CASAVA_Build 4 63880410 1D GTTGCCAGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 38 0 26 12 T 10 9 207930 CASAVA_Build 4 63905964 4D ATTAATCCTT TATC/---- TATGTTCCAT 3070 hom 101 het 36 0 34 2 TATC 1 0 207931 CASAVA_Build 4 63908562 1I TTAATAAAAT -/A GTAAAAAGTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 0 1 207932 CASAVA_Build 4 63920677 2I TTCCATTGAC --/TT ATATTCAAAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 2 207933 CASAVA_Build 4 63922238 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAAAGAAGA 3070 hom 43 het 20 0 13 7 AAG 0 1 207934 CASAVA_Build 4 63924564 1D AGAAAGAGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 10 9 207935 CASAVA_Build 4 63931564 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAGGATG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 6 5 207936 CASAVA_Build 4 63936730 3I TTCAAATAAC ---/AAT AACAACAGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAT 0 1 207937 CASAVA_Build 4 63943834 15D AATAACTATC TTTATAATTTAGACT/--------------- TTTATCATTC 3070 hom 69 het 25 0 24 4 TTTATAATTTAGACT 1 0 207938 CASAVA_Build 4 63943918 4D TTATCTATCT TATC/---- TATCTATCTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TATC 3 2 207939 CASAVA_Build 4 63949508 5D AAACATCTTC CTTAT/----- CTTCTATGGC 3070 hom 111 het 40 0 38 3 CTTAT 1 0 207940 CASAVA_Build 4 63952633 6D AATATTTGTG TATATA/------ TATATATATA 3070 het 42 hom 19 1 14 6 TA 11 8 207941 CASAVA_Build 4 63953099 1D ATTACAGGAT A/- TTTTTATATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 0 207942 CASAVA_Build 4 63953815 1I TGCCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 21 0 16 5 A 11 12 207943 CASAVA_Build 4 63954973 4I ACAGACTTAC ----/TTAT AGTTAGAGAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TTAT 0 1 207944 CASAVA_Build 4 63958993 1D GCCAAACAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 37 3 24 11 T 15 14 207945 CASAVA_Build 4 63960041 1D AAAGATTCAA T/- GCCATCCCCA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 1 0 207946 CASAVA_Build 4 63963264 1I TATTACATTG -/A AAAAAAGAGC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 6 7 207947 CASAVA_Build 4 64005640 5D ATATTAATAT ATAAA/----- ATAATAGATA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 ATAAA 1 0 207948 CASAVA_Build 4 64110788 1D TATCCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 11 10 207949 CASAVA_Build 4 64140995 4D CTAATATCAC AATT/---- AAAAGAACTA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AATT 1 0 207950 CASAVA_Build 4 64146736 1D CTTACTTGTT C/- TTTAAAAATA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 1 0 207951 CASAVA_Build 4 64147425 1D CTAAATAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 323 hom 29 1 23 7 T 12 11 207952 CASAVA_Build 4 64156835 1D CATGCAAGTG A/- AAACCGAATA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 4 3 207953 CASAVA_Build 4 64164408 1D TATGGTAACC T/- TTTTTCTCTC 3070 hom 114 het 47 0 39 9 T 6 5 207954 CASAVA_Build 4 64165951 1D TTTCTAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 40 2 31 7 A 20 19 207955 CASAVA_Build 4 64168404 1I ATATTATAAC -/T TTCTACTTCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 3 207956 CASAVA_Build 4 64170798 1D TATGAGAAGA T/- AGATTTCAGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 1 0 207957 CASAVA_Build 4 64171396 1I TGCCTATTCA -/T TTGTCCTTGG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 2 3 207958 CASAVA_Build 4 64184953 3D TTGCATTACA ATT/--- ATTATATTAT 3070 hom 75 het 30 0 25 7 ATT 2 1 207959 CASAVA_Build 4 64187225 1I TCCTGCCCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 30 0 20 10 T 9 10 207960 CASAVA_Build 4 64200867 2I TTCTGTCAAA --/TT TTATTCTTTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 4 207961 CASAVA_Build 4 64203118 3I14M1I AATTAAAAAA ---AAATAAATATATAT-/AATAAATAAATATATATA AAAAAAAGAA 2479 hom 12 het 5 0 5 2 N/A 0 0 207962 CASAVA_Build 4 64206367 2I ATTTTTATAT --/AC ACACACATAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AC 3 4 207963 CASAVA_Build 4 64206733 1D24M1D AAGCAAGTAG AAAAAAAATCTGTTAAATTGAACAGA/-AAAAAAATCTGTTAAATTGAACAG- AAAAAACACA 3070 hom 66 het 23 0 23 4 N/A 0 0 207964 CASAVA_Build 4 64207101 7D CTGTGCACTG AGTAATC/------- AGTAATCAGA 3070 hom 93 het 32 0 32 3 AGTAATC 2 1 207965 CASAVA_Build 4 64215731 1D GGCTTATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 814 hom 42 6 23 13 T 17 16 207966 CASAVA_Build 4 64216817 34D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATACAC/---------------------------------- ACACACACAT 3070 hom 42 het 9 0 15 3 ATATATATATATATATATATATATATATATACAC 1 0 207967 CASAVA_Build 4 64217728 1I AGATTAGTAA -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 207968 CASAVA_Build 4 64221095 2D TCTTAACCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 13 11 207969 CASAVA_Build 4 64223863 2D CATATGCCAC AT/-- ATATATATAT 903 het 903 ref 27 20 2 6 AT 7 6 207970 CASAVA_Build 4 64245198 4I TACATACTAT ----/ATAA ATAAATACAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATAA 1 2 207971 CASAVA_Build 4 64248927 1D TGATGCAGGA T/- TTTTTCCTTG 3070 hom 87 het 40 0 30 11 T 6 5 207972 CASAVA_Build 4 64264084 2I GGGAGTGGGG --/AC ACACACTTTA 3070 hom 143 het 55 0 46 9 AC 3 4 207973 CASAVA_Build 4 64265652 1I TATTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 11 207974 CASAVA_Build 4 64265799 1D GGTTAGTCAG T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 6 207975 CASAVA_Build 4 64266150 1D AAGTTACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 42 0 33 9 A 11 10 207976 CASAVA_Build 4 64269874 1D CTTTCTGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 10 9 207977 CASAVA_Build 4 64282968 2I GATTGCAAAC --/AG AAAATATCAC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 AG 0 1 207978 CASAVA_Build 4 64283966 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 71 hom 10 1 9 0 T 1 0 207979 CASAVA_Build 4 64289209 1I AATTACACAA -/G AGGCAAATGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 207980 CASAVA_Build 4 64293353 2I AGTGTGTAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 115 hom 32 1 20 11 AC 6 7 207981 CASAVA_Build 4 64300008 1I CAATTAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1086 hom 32 3 23 6 A 11 12 207982 CASAVA_Build 4 64303029 1D AGCTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 11 10 207983 CASAVA_Build 4 64315097 1I TGTTATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 10 11 207984 CASAVA_Build 4 64315548 1D CCACGCCCAG C/- CCCCCCTTGG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 C 7 6 207985 CASAVA_Build 4 64316167 3D CTAAAATATA ATC/--- ATATTAGCAT 3070 hom 105 het 40 0 35 8 ATC 1 0 207986 CASAVA_Build 4 64321901 2I ACACACACAG --/CA CACACACACA 3070 het 456 hom 41 2 34 5 CA 7 8 207987 CASAVA_Build 4 64333689 33D TTGATTCTGA TTCCACAGGAATTAACACAAGTTAGCTTTTTTT/--------------------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 19 8 TTCCACAGGAATTAACACAAGTTAGCTTTTTTT 1 0 207988 CASAVA_Build 4 64344309 1I TACTCACTGA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 7 8 207989 CASAVA_Build 4 64344761 3D TTTCTGGAGC ATA/--- ATAAGTGAGC 3070 hom 60 het 25 0 20 6 ATA 2 1 207990 CASAVA_Build 4 64345944 1D AATCAATTTA C/- AAAGTTTGTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 0 207991 CASAVA_Build 4 64347195 1I ATGAAGGATG -/A AAAAAATAGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 6 7 207992 CASAVA_Build 4 64348536 2I TTCTTGCCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 889 hom 49 2 30 17 T 13 15 207993 CASAVA_Build 4 64350567 2D AACATTTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AT 7 6 207994 CASAVA_Build 4 64351496 3I TTACAATGCA ---/ACG TACAGGTAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ACG 0 1 207995 CASAVA_Build 4 64364434 1D AACTGTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 29 1 18 11 T 11 10 207996 CASAVA_Build 4 64367444 3I AGAAACTATA ---/TTG TTGTCATACT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TTG 1 2 207997 CASAVA_Build 4 64381808 1I TCAGAAGTTA -/C CAAGAGTGAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 1 2 207998 CASAVA_Build 4 64382860 2I GATATATATC --/TA TATATATATA 3070 het 894 hom 14 2 8 4 TA 6 7 207999 CASAVA_Build 4 64389208 1I AGGGCTCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 10 208000 CASAVA_Build 4 64389573 1I GTTTCGAAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 8 9 208001 CASAVA_Build 4 64389913 1I ATCCATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 34 1 30 3 A 10 11 208002 CASAVA_Build 4 64401643 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 33 het 18 0 10 8 T 9 8 208003 CASAVA_Build 4 64402066 1I TTCTCATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 28 0 21 7 T 10 11 208004 CASAVA_Build 4 64403047 1D TTTTTACATG A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 24 0 18 6 A 1 0 208005 CASAVA_Build 4 64404937 3D ACACGTGGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 1371 het 37 hom 18 1 6 12 T 17 14 208006 CASAVA_Build 4 64405706 1I ATTTTATAGA -/G GGGGGAAACT 3070 hom 117 het 45 0 38 7 G 5 6 208007 CASAVA_Build 4 64411466 21D ATTTTAGATC TTTCTTGTGGGCATTTAGCTT/--------------------- TTTCTTGTGG 3070 hom 33 het 14 0 12 7 TTTCTTGTGGGCATTTAGCTT 1 0 208008 CASAVA_Build 4 64413365 1D GCACAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 138 hom 44 2 34 8 A 12 11 208009 CASAVA_Build 4 64415944 1I TTCTCTTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 76 het 32 0 26 6 T 9 10 208010 CASAVA_Build 4 64417768 5D CATTTAATAC TTAAG/----- TTAACTAATA 3070 hom 105 het 38 0 36 5 TTAAG 1 0 208011 CASAVA_Build 4 64432926 1I TTTCAATATT -/A ATAAGAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 208012 CASAVA_Build 4 64492342 1I CAATCTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 28 1 19 8 A 13 14 208013 CASAVA_Build 4 64588987 1I TAACTTACTG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 8 9 208014 CASAVA_Build 4 64602483 1I GTACAACAGT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 9 208015 CASAVA_Build 4 64633857 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 18 0 14 4 A 17 16 208016 CASAVA_Build 4 64635840 1D TACTCATTAG T/- TAGTTACTCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 208017 CASAVA_Build 4 64640216 1D AGAAGTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 12 11 208018 CASAVA_Build 4 64662698 2D TAATAAAATG TA/-- TATATAGATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TA 4 3 208019 CASAVA_Build 4 64663231 2I GTCACCTAAC --/TT AAACAATGCT 3070 hom 108 het 44 0 35 9 T 0 2 208020 CASAVA_Build 4 64680189 1I ATAATTAAAT -/A AAAAAACTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 6 7 208021 CASAVA_Build 4 64713902 5D CTAGTGCAAT TTTCC/----- TTTCCTTTCC 3070 hom 93 het 42 0 32 11 TTTCC 4 3 208022 CASAVA_Build 4 64723591 1I ATTTGTCATA -/T CTTACTGCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 208023 CASAVA_Build 4 64762278 1D GTAGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 2058 het 22 hom 19 1 9 9 T 17 16 208024 CASAVA_Build 4 64781164 1I ACTACATTTC -/T TTCCCATTAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 2 3 208025 CASAVA_Build 4 64782395 5I GAGTTCTCAT -----/TTATC TTATGTTATG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TTATC 0 1 208026 CASAVA_Build 4 64792951 1D AGGTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 34 1 32 1 T 11 10 208027 CASAVA_Build 4 64804837 1I ACTCTAATAA -/T TTTTAATAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 4 5 208028 CASAVA_Build 4 64810388 1D TCAAACAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1011 hom 31 3 19 9 T 15 14 208029 CASAVA_Build 4 64812468 1I AGAAAACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 566 hom 29 2 21 6 T 11 12 208030 CASAVA_Build 4 64822176 3D AACAGAATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 27 2 14 11 T 19 16 208031 CASAVA_Build 4 64826121 1I CTGAAAATTT -/C TTTTAAATAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 0 1 208032 CASAVA_Build 4 64826430 3D AATATATTTC AGA/--- AGATGTATAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AGA 2 1 208033 CASAVA_Build 4 64828068 1D GTTAATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 11 10 208034 CASAVA_Build 4 64828562 2I TCTATGAAAT --/AA GTTATATTAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 2 208035 CASAVA_Build 4 64832795 1D TAGTGAAAGG A/- ACACCATCAT 3070 hom 174 het 64 0 56 8 A 2 1 208036 CASAVA_Build 4 64838626 1D TAATAGGCCA T/- TATGTCCCTC 3070 hom 144 het 52 0 47 5 T 2 1 208037 CASAVA_Build 4 64841981 1I ATATTGTTAA -/T TTTTTTACAG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 6 7 208038 CASAVA_Build 4 64843687 3D ATAGGAGATG TTA/--- TTATCAATCA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 TTA 2 1 208039 CASAVA_Build 4 64850916 1D TTTTTTCTAA T/- TTTGAGGGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 4 3 208040 CASAVA_Build 4 64851554 1D AATTTTACAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 7 208041 CASAVA_Build 4 64861080 1I ACCCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 878 hom 32 4 19 9 A 14 15 208042 CASAVA_Build 4 64863921 1D TCTGCTACCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 120 het 48 0 41 8 T 9 8 208043 CASAVA_Build 4 64864320 5I CCCATTATTC -----/AGATA TATAGAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AGATA 0 1 208044 CASAVA_Build 4 64897448 3D TATAAAAAAC GTT/--- TTTTTTTTTT 1978 hom 15 het 10 0 6 4 GTT 1 0 208045 CASAVA_Build 4 64897499 9I AGGCTGTAGT ---------/GCAATGGAA GCAATGGAAT 3070 hom 22 het 10 0 8 7 GCAATGGAA 1 2 208046 CASAVA_Build 4 64898422 5D GCATTTACTT AAATA/----- AAAAGTTATC 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AAATA 1 0 208047 CASAVA_Build 4 64899608 1I AAAAGGGAAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 9 10 208048 CASAVA_Build 4 64899834 12D GATCCTCCCA CCTCAGCCTCCC/------------ AAAGTTCTGG 3070 hom 66 het 23 0 23 3 CCTCAGCCTCCC 1 0 208049 CASAVA_Build 4 64900316 1D CCTAGCCCTG A/- AAAGAAAAAT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 4 3 208050 CASAVA_Build 4 64902115 1D CACCAGAAAT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 8 7 208051 CASAVA_Build 4 64903729 1D TCTCCAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 10 9 208052 CASAVA_Build 4 64905915 5D TTAAAACTAT GAAAA/----- GAAAAGTTAA 3070 hom 71 het 27 0 24 3 GAAAA 2 1 208053 CASAVA_Build 4 64906417 1D TGAAAAAACG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 351 hom 43 1 36 6 A 10 9 208054 CASAVA_Build 4 64907829 1D GATGATTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 10 9 208055 CASAVA_Build 4 64908571 1I ACCCACTTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 7 8 208056 CASAVA_Build 4 64909390 4D AGCAGCCCTT TGTC/---- TGTCAGCCTC 3070 hom 102 het 37 0 34 7 TGTC 2 1 208057 CASAVA_Build 4 64913174 1I ACTAAAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 288 hom 33 1 26 6 T 9 10 208058 CASAVA_Build 4 64913522 1I GCTTCATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 552 hom 44 2 35 7 A 12 13 208059 CASAVA_Build 4 64915220 2I GAAGGAATAT --/AA GTCATTCTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 0 2 208060 CASAVA_Build 4 64915567 1D GTTTGAAGGA G/- GGTGAGGGTC 3070 hom 60 het 24 0 21 4 G 3 2 208061 CASAVA_Build 4 64915872 1D TATGAATATC T/- AATGACATTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 0 208062 CASAVA_Build 4 64915983 1D AAATAATAAT G/- ACCTTCAAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 1 0 208063 CASAVA_Build 4 64916603 8D GTTTTCTTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 hom 84 het 37 0 29 12 TTTG 6 4 208064 CASAVA_Build 4 64916759 3I CAGGCGCACG ---/CCA CCACCACACC 3070 hom 36 het 13 0 13 1 CCA 2 3 208065 CASAVA_Build 4 64918837 3D TTATCTCCAG TTA/--- TTATCTTAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 TTA 2 1 208066 CASAVA_Build 4 64922171 2D GTTTTATGCT AA/-- GATAGAAATA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 2 0 208067 CASAVA_Build 4 64927208 4I49M2D TTGTATCAAT ----TTTGTTTATAAACTAAATTATTTAAAATTAGTTCTTTGTTAAGTAAAACTA/TTTATTTATTTATAAACTAAATTATTTAAAATTAGTTCTTTGTTAAGTAAAAC-- TATGTATATA 3070 hom 60 het 23 0 21 10 N/A 0 0 208068 CASAVA_Build 4 64946349 4I TAAAAAGTAA ----/TTAT TTATCTTTAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TTAT 1 2 208069 CASAVA_Build 4 64946393 5I TCATTAAACA -----/TTCCT TTATTTTATA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 TTCCT 0 1 208070 CASAVA_Build 4 64947463 1D AGAGGCTTTA C/- TGGCCCAACC 3070 hom 129 het 52 0 43 10 C 1 0 208071 CASAVA_Build 4 64951375 1I TTTCTGTGAT -/G AAACATTCCC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 0 1 208072 CASAVA_Build 4 64952187 1D AAAGAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 24 6 A 11 10 208073 CASAVA_Build 4 64955327 1D ATTACTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 12 11 208074 CASAVA_Build 4 64959221 1D ATTTTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1182 hom 28 3 17 8 A 15 14 208075 CASAVA_Build 4 64962649 4I CTCTTTCTTC ----/TAAT TAAAGAGTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TAAT 0 1 208076 CASAVA_Build 4 64968393 1I ATATTATGCC -/T TTTTATAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 4 5 208077 CASAVA_Build 4 64981633 1I TTTAGGGGCT -/A GGGGAGGGGG 3070 hom 51 het 20 0 16 4 A 0 1 208078 CASAVA_Build 4 64982231 1D GAGATCGAGA C/- CATCCTGGCT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 2 1 208079 CASAVA_Build 4 65017033 1D TTGTTATTAC A/- AAGGAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 2 208080 CASAVA_Build 4 65091249 2D TAACCCACAC AT/-- GAGATAAGCA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 AT 1 0 208081 CASAVA_Build 4 65093637 1D TCTACAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 A 14 13 208082 CASAVA_Build 4 65099615 3I ATTATTAAAT ---/TTA TTATTAATTA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TTA 2 3 208083 CASAVA_Build 4 65116586 2D GGGCTGACAC AG/-- AGAACAATTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AG 2 1 208084 CASAVA_Build 4 65116670 5D CCAAAGGAGG TATAC/----- AGTAATGATA 3070 hom 54 het 20 0 14 7 TATAC 1 0 208085 CASAVA_Build 4 65117890 1D CCCTTTTTTT C/- CCCGTTTTAA 3070 hom 85 het 35 0 29 8 C 4 3 208086 CASAVA_Build 4 65118795 1I TTCACAGAAG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 7 8 208087 CASAVA_Build 4 65119212 1D AAAGACAGCT G/- GGGGGATGGC 3070 hom 84 het 31 0 29 4 G 6 5 208088 CASAVA_Build 4 65130253 1D TAGATTCAAA T/- TTCCACAAAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 3 2 208089 CASAVA_Build 4 65134026 1I TTAGTGGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 11 12 208090 CASAVA_Build 4 65135127 1I AGGAAGTATT -/A AAACTCATAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 3 4 208091 CASAVA_Build 4 65138988 1D ATTCCCATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 30 1 21 9 A 14 13 208092 CASAVA_Build 4 65143023 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 580 hom 36 2 27 7 A 11 12 208093 CASAVA_Build 4 65164562 3I TGAAAATAAA ---/AAC AACAAGAAAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 AAC 1 2 208094 CASAVA_Build 4 65165588 1D18M2D TATGAACACA TTTTTTTTTAAAAAAAAACTA/-TTTTTTTTAAAAAAAAAC-- TGTTTCTTTG 3070 hom 81 het 24 0 28 2 N/A 0 0 208095 CASAVA_Build 4 65167418 2D ATTTTGTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 34 0 24 12 T 14 12 208096 CASAVA_Build 4 65167919 2I ACTTACACTC --/AT GTAATGAATC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AT 0 1 208097 CASAVA_Build 4 65170017 1I TCACTAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 882 hom 52 2 40 10 T 10 11 208098 CASAVA_Build 4 65189874 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 18 6 A 12 11 208099 CASAVA_Build 4 65190254 1D TATTTTGGTT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 8 7 208100 CASAVA_Build 4 65193356 1I TTTAACTGTA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 8 9 208101 CASAVA_Build 4 65202593 9I TGTGAATCAA ---------/TTAAACCTC TTTTGTTGAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TTAAACCTC 0 1 208102 CASAVA_Build 4 65202753 1D AACCTTCATA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 9 8 208103 CASAVA_Build 4 65202901 4D GTTTGTCAGT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 AC 8 6 208104 CASAVA_Build 4 65203284 1D ATTTTTTTTT A/- AATTTTTCTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 3 2 208105 CASAVA_Build 4 65203397 13I CTAAAAATCA -------------/CCTAGGTTTTAAG CCCTGAATGC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 CCTAGGTTTTAAG 0 1 208106 CASAVA_Build 4 65204885 1I CCTTTTAATT -/A GGAATACCAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 0 1 208107 CASAVA_Build 4 65205546 4I ACACTTTATT ----/TGAC TGATATTATA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TGAC 0 1 208108 CASAVA_Build 4 65206787 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 TA 7 5 208109 CASAVA_Build 4 65207498 1I16M3D AGCAGATAGT -AAAAAAAGTAATTTGCACT/AAAAAAAAGTAATTTGC--- ACTACATTTT 3070 hom 108 het 34 0 37 3 N/A 0 0 208110 CASAVA_Build 4 65208068 2I TATAGTATAC --/CT TTTTGGTAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CT 0 1 208111 CASAVA_Build 4 65208575 2D TGATTGAGCT TA/-- TTTCTATTGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TA 1 0 208112 CASAVA_Build 4 65209202 13D CAATGTTTTA CTGTTCCACAGTT/------------- CTACCTTTTT 3070 hom 93 het 32 0 32 2 CTGTTCCACAGTT 1 0 208113 CASAVA_Build 4 65211139 6D TAATTTTATT TATCTC/------ CAAAAAAATC 3070 hom 66 het 23 0 23 3 TATCTC 1 0 208114 CASAVA_Build 4 65211633 1I TTTACCTCAA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 8 9 208115 CASAVA_Build 4 65218609 2D AACAAAACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 24 0 18 6 T 13 11 208116 CASAVA_Build 4 65220666 3D TCAAATGTTA ATC/--- ATCTCCTTTG 3070 hom 102 het 38 0 29 10 ATC 2 1 208117 CASAVA_Build 4 65223707 2I AAAAGCGTTC --/AA AGTCTCTCCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 1 3 208118 CASAVA_Build 4 65225734 7D TCTTCTGGCA AAAAAAT/------- AAAAAATAAA 3070 hom 79 het 28 0 27 3 AAAAAAT 2 1 208119 CASAVA_Build 4 65249277 1I TATTACATCA -/T TGCCAACTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 2 208120 CASAVA_Build 4 65258608 1D AAGAAAAAAA T/- GAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 1 0 208121 CASAVA_Build 4 65259784 1D ATCAGGCATA T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 6 208122 CASAVA_Build 4 65261796 1D TTAAGTAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 116 het 47 0 39 8 T 10 9 208123 CASAVA_Build 4 65270668 1I TCTCAACTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 407 hom 27 1 22 4 T 8 9 208124 CASAVA_Build 4 65278442 2D CTGGCCTCTT TC/-- TCTCTGTGCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TC 3 2 208125 CASAVA_Build 4 65287228 1I TACAATAATG -/A CCATGAGCTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 1 208126 CASAVA_Build 4 65293813 1D TTACCTGATT G/- CTCTGGCCAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 G 1 0 208127 CASAVA_Build 4 65306435 2I AATTTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TG 6 7 208128 CASAVA_Build 4 65309972 1I TAGTTGAAGC -/T TTTTTTTATA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 208129 CASAVA_Build 4 65312494 1I CCCAACCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 T 10 11 208130 CASAVA_Build 4 65314628 1I CCCCCTGCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 28 7 A 12 13 208131 CASAVA_Build 4 65322646 1D TATCACTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 23 4 A 11 10 208132 CASAVA_Build 4 65330731 1D GAAAAAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 28 1 17 10 T 11 10 208133 CASAVA_Build 4 65333688 4I37M3D TTCTGAACAC ----AGTAAGAAGTTAAAGCATTTTCAATGCTTCTTCAAAGATT/AGTAAGTAAGAAGTTAAAGCATTTTCAATGCTTCTTCAAAG--- ATTTTTTCCC 3070 hom 157 het 40 0 53 4 N/A 0 0 208134 CASAVA_Build 4 65338738 1D AGTGACTACT C/- AATTGCATAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 1 0 208135 CASAVA_Build 4 65343734 1I CTAGTGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 722 hom 33 2 25 6 T 11 12 208136 CASAVA_Build 4 65345646 13D ACTTTAAGCA AACTCTTACACCT/------------- ACAGGTTTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 4 AACTCTTACACCT 1 0 208137 CASAVA_Build 4 65351048 1D AAAGAGAGAA G/- AATCAAATTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 1 0 208138 CASAVA_Build 4 65354362 4D GTTCCTGAAC TTTT/---- TTATTTGCAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 6 2 208139 CASAVA_Build 4 65356829 1I GTAAACAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 542 hom 37 5 16 16 T 15 16 208140 CASAVA_Build 4 65357136 2I ACTCCTATAG --/TA TATAAGTAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TA 2 3 208141 CASAVA_Build 4 65359983 1D TTATCCTTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 26 4 C 1 0 208142 CASAVA_Build 4 65361951 1D ATCCTCTGGT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 105 het 37 0 35 3 A 9 8 208143 CASAVA_Build 4 65394129 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 55 het 26 0 23 3 T 10 9 208144 CASAVA_Build 4 65402155 1D GAGCTATCTG A/- AATTGAGATT 2440 hom 15 het 6 0 6 0 A 3 2 208145 CASAVA_Build 4 65404616 1D CATTATATAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 8 7 208146 CASAVA_Build 4 65405727 1I GAGTCATAGC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 96 het 42 0 33 9 A 8 9 208147 CASAVA_Build 4 65416137 1I TAGGATTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 27 10 A 10 11 208148 CASAVA_Build 4 65418230 1D GTGCTTTGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 10 9 208149 CASAVA_Build 4 65419026 5D AAAGAAATGA TAGTT/----- TAATCTTAGT 3070 hom 114 het 41 0 39 5 TAGTT 1 0 208150 CASAVA_Build 4 65432326 1I TACTTGCAGG -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 8 208151 CASAVA_Build 4 65435153 1D GCATAGCCGT C/- CGGAAACATC 3070 hom 75 het 35 0 22 14 C 2 1 208152 CASAVA_Build 4 65440063 1D TTTTTATAAA T/- TTTTAATGAC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 5 4 208153 CASAVA_Build 4 65440463 1I GAGACTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 30 1 16 13 T 14 15 208154 CASAVA_Build 4 65444053 1I ATGATGTTGA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 9 208155 CASAVA_Build 4 65447164 1I TCCCAGGGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 629 hom 40 3 32 5 A 9 10 208156 CASAVA_Build 4 65449675 1D AATGAGCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 24 0 11 15 A 15 14 208157 CASAVA_Build 4 65457787 1D GTATTGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 520 hom 44 2 25 18 T 15 14 208158 CASAVA_Build 4 65470465 1D CACCAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 695 hom 28 3 17 8 A 16 15 208159 CASAVA_Build 4 65470921 1D ACCTGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 A 11 10 208160 CASAVA_Build 4 65471225 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 896 het 99 hom 25 1 10 16 AAAG 1 0 208161 CASAVA_Build 4 65473986 1D TAATTAAGTA G/- GTGAAAATAA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 G 2 1 208162 CASAVA_Build 4 65477612 4D TCATTGCAAG TTGT/---- TTGTTTTATA 3070 hom 93 het 35 0 32 5 TTGT 2 1 208163 CASAVA_Build 4 65502658 34D ACTCTGGTGG TTTGTTTAGCAATCCTGCCTTAGGAAATTAAAGT/---------------------------------- TTTGTTTAGC 3070 hom 34 het 17 0 11 13 TTTGTTTAGCAATCCTGCCTTAGGAAATTAAAGT 1 0 208164 CASAVA_Build 4 65512714 1D CCCCTCTTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 10 9 208165 CASAVA_Build 4 65526375 1I GTGTGCTAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 9 10 208166 CASAVA_Build 4 65532370 1I GCACTCCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 A 15 16 208167 CASAVA_Build 4 65557300 1D TCTCTAAATG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 9 8 208168 CASAVA_Build 4 65569362 1D AGGATTCTTT G/- GCTCCGAGGA 3070 hom 123 het 43 0 39 6 G 2 1 208169 CASAVA_Build 4 65569947 1D TGCCTTATCA T/- AACTCACTCA 3070 hom 123 het 47 0 40 8 T 1 0 208170 CASAVA_Build 4 65577110 13I ATATATTTAT -------------/TGTACTACTATAA TGTTTCTGAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 TGTACTACTATAA 0 1 208171 CASAVA_Build 4 65596082 4I TCTCTTCTGT ----/GTTA GTTTACTATT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 GTTA 0 1 208172 CASAVA_Build 4 65625212 1D ATCAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 23 7 T 13 12 208173 CASAVA_Build 4 65637457 1I TTTTTTGGAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 36 0 26 10 T 8 9 208174 CASAVA_Build 4 65639398 1D TAAAAAATTT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 8 7 208175 CASAVA_Build 4 65643676 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 914 hom 32 3 25 4 A 14 15 208176 CASAVA_Build 4 65645391 1D TTAAATAGTT A/- ACTAGTCTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 1 208177 CASAVA_Build 4 65653997 1D CTGGGTATAG A/- AAAAAACATA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 7 6 208178 CASAVA_Build 4 65657363 4I ATTAGAACAG ----/AAGA AAGGCAGAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 AAGA 0 1 208179 CASAVA_Build 4 65663778 1I AGTCTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 40 1 31 8 A 10 11 208180 CASAVA_Build 4 65671423 1D TGTTTTGCAC A/- AAGTGCAGTT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 A 3 2 208181 CASAVA_Build 4 65684223 1D CAGAATATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 296 hom 32 1 21 11 T 14 13 208182 CASAVA_Build 4 65685825 1I TATGAAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 25 hom 32 1 24 7 T 9 10 208183 CASAVA_Build 4 65693652 101D TGTTCTAGAG GGTTTATCAAGTGACTTAGGCTATATGAGGGGCAGGTGAAGACTACCAGTCTTTCTACCCGCAACCCAGTCAGGGGTCTCTGCCTGCTCTAAATATGGATA/----------------------------------------------------------------------------------------------------- GCCTGACTTT 3070 hom 27 het 9 0 10 2 GGTTTATCAAGTGACTTAGGCTATATGAGGGGCAGGTGAAGACTACCAGTCTTTCTACCCGCAACCCAGTCAGGGGTCTCTGCCTGCTCTAAATATGGATA 1 0 208184 CASAVA_Build 4 65705914 1D ATGTCTTGTA T/- TTAATAGATA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 3 2 208185 CASAVA_Build 4 65706919 1D ATACTCAGCC T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 66 het 32 0 23 10 T 8 7 208186 CASAVA_Build 4 65720212 1D AAAACATATT C/- CATTATTGAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 C 2 1 208187 CASAVA_Build 4 65720317 8I TTATAGCTGC --------/CTGGTTAT CTGGTTATTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CTGGTTAT 1 2 208188 CASAVA_Build 4 65730932 2I AAAACAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 19 0 16 3 A 12 14 208189 CASAVA_Build 4 65735878 1I AGTCTCTTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1463 hom 43 4 29 10 A 13 14 208190 CASAVA_Build 4 65743976 4D TCCCTGGCTC CCAT/---- CAGCTCAGTC 3070 hom 102 het 37 0 32 6 CCAT 1 0 208191 CASAVA_Build 4 65752751 1D GGGTGGTGGA T/- TTTAAGTTTT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 4 3 208192 CASAVA_Build 4 65766144 1D GGAAAAAAAA T/- TAAAAAGGAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 2 1 208193 CASAVA_Build 4 65769277 1D ACATATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 23 1 14 8 A 13 12 208194 CASAVA_Build 4 65786046 1D TGGTAGAGGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 8 208195 CASAVA_Build 4 65794086 2D CTTTAGGCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 15 13 208196 CASAVA_Build 4 65812234 1I TTAAATTATT -/A AAAGATTAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 3 4 208197 CASAVA_Build 4 65812544 1D GTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 38 1 29 8 A 13 12 208198 CASAVA_Build 4 65814686 1I TCCACCTCAT -/C CCCCCCACCA 3070 hom 104 het 39 0 34 5 C 6 7 208199 CASAVA_Build 4 65824725 2D GAACTAAATT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 47 0 41 7 A 11 9 208200 CASAVA_Build 4 65856273 1D CCTCTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 32 1 21 11 A 12 11 208201 CASAVA_Build 4 65858044 1I TAAGATAGGC -/A AAAAAAATAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 7 8 208202 CASAVA_Build 4 65865655 1D TTGTGTGGCA C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 108 het 40 0 34 6 C 9 8 208203 CASAVA_Build 4 65873776 1D CAAGCAGCTA C/- CCCCCCAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 7 6 208204 CASAVA_Build 4 65876962 1D ATGTTTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 860 hom 55 2 42 11 T 11 10 208205 CASAVA_Build 4 65883970 1D ACACATTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 9 8 208206 CASAVA_Build 4 65892170 1D AATATTAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 10 9 208207 CASAVA_Build 4 65895496 1I AATGCGAGTG -/A AAAAAGTGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 5 6 208208 CASAVA_Build 4 65898683 1D AAAATGTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 9 208209 CASAVA_Build 4 65901101 1I CTTCTCTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 28 1 24 3 T 10 11 208210 CASAVA_Build 4 65901576 4I TTATTAAATG ----/AAAT AAAGATATTT 2035 hom 15 het 6 0 6 0 AAAT 0 1 208211 CASAVA_Build 4 65924336 2D TGTTTGTTCA CT/-- CTCTCTTCTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CT 4 3 208212 CASAVA_Build 4 65926553 1I AAATTCTAAT -/A AAAAATTGCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 5 6 208213 CASAVA_Build 4 65944748 1D ACTACCACTG A/- AAAGCAGGCC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 A 4 3 208214 CASAVA_Build 4 65953599 1D ATAAAACGCC T/- TATAGGGCAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 2 1 208215 CASAVA_Build 4 65955828 5I GTTAAAATGC -----/TAAGT TAAGACATTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TAAGT 0 1 208216 CASAVA_Build 4 65956244 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 68 het 26 0 22 4 T 9 10 208217 CASAVA_Build 4 65956881 1D ACTTTTATGC A/- GCCAAAAAAC 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 1 0 208218 CASAVA_Build 4 65964833 1I TTAAAAGCTT -/C CCACAGTTGT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 2 3 208219 CASAVA_Build 4 65975384 1I GAGTTACTGG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 8 208220 CASAVA_Build 4 65982620 1I GTTGTGGACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 9 208221 CASAVA_Build 4 66002287 1D CTACGGATTT G/- CTGCCACTAA 3070 hom 59 het 22 0 17 5 G 1 0 208222 CASAVA_Build 4 66005382 1I TAAAAGCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 9 10 208223 CASAVA_Build 4 66022199 1I TTGTAAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 28 2 18 8 T 11 12 208224 CASAVA_Build 4 66031174 1D TTAGAGGATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 10 9 208225 CASAVA_Build 4 66041709 1I TATATTCTAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 8 9 208226 CASAVA_Build 4 66043314 7D AAGAGGAAGG AAGAAGA/------- AAGAAGAAAG 3070 hom 82 het 38 0 30 10 AAGAAGA 3 2 208227 CASAVA_Build 4 66049137 2D TATGTGTGCG TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TA 8 7 208228 CASAVA_Build 4 66050116 1D AAGTAATCTT A/- AGCCAAAAGG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 2 1 208229 CASAVA_Build 4 66058345 1D TACATACTTC T/- TTTTTTTTTT 2251 het 770 hom 27 7 8 12 T 19 18 208230 CASAVA_Build 4 66067883 1I TTCAATTAGG -/A AAAGAGGAAG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 3 4 208231 CASAVA_Build 4 66080921 1I CCAATAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 664 hom 26 2 20 4 T 11 12 208232 CASAVA_Build 4 66087669 2D GAAGTTGTTT AA/-- ATACAATATT 3070 hom 120 het 46 0 41 7 A 3 1 208233 CASAVA_Build 4 66091083 1I CACAACAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 A 10 11 208234 CASAVA_Build 4 66093255 1D ATGAAGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 646 hom 25 2 19 6 A 12 11 208235 CASAVA_Build 4 66095170 1D AAGTAACTCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 9 8 208236 CASAVA_Build 4 66097865 1I TCTAAGTTGA -/T CTTTTTCTAG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 0 1 208237 CASAVA_Build 4 66099314 2I ATTTGTGCAT --/TA TATATATATA 3070 het 426 hom 24 1 20 3 TA 6 7 208238 CASAVA_Build 4 66109693 7D GTCATAGGCA TATAGGG/------- TATCCAGGGT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 TATAGGG 1 0 208239 CASAVA_Build 4 66119635 1I GTTTACAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 29 0 23 6 A 13 14 208240 CASAVA_Build 4 66137560 1I CTAACAGACG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 414 hom 35 1 29 5 T 9 10 208241 CASAVA_Build 4 66145772 1D ATTTTTTACT A/- AAAAAAAAAA 2489 hom 38 het 29 0 12 19 A 11 10 208242 CASAVA_Build 4 66145805 1D TCTTAAGGGG A/- AAAAAATAGC 3070 hom 50 het 29 0 17 12 A 7 6 208243 CASAVA_Build 4 66150642 1D ATAGAAAGAT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 8 7 208244 CASAVA_Build 4 66151655 1D TGAAGCCTGT A/- AAAAAATCTG 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 7 6 208245 CASAVA_Build 4 66151790 1D TATTGTAGAT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 7 208246 CASAVA_Build 4 66152397 56I AAAAGAAAAT --------------------------------------------------------/AAAAATGTTACCTCATTTCTGTTTCAAATCTTTGTTTTATGATAATCTTCCAATAC AAAACACAAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 AAAAATGTTACCTCATTTCTGTTTCAAATCTTTGTTTTATGATAATCTTCCAATAC 0 1 208247 CASAVA_Build 4 66157924 1I AAGCTAGATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 173 hom 38 1 25 12 T 9 10 208248 CASAVA_Build 4 66163589 1I AAATTTGATT -/A TAAAAACTTA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 0 1 208249 CASAVA_Build 4 66177503 1D GTTTCTATAC T/- TTCATATCTA 3070 hom 129 het 49 0 44 6 T 3 2 208250 CASAVA_Build 4 66188134 1I ATCTTCAAGT -/G GGGCTTATCC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 3 4 208251 CASAVA_Build 4 66205268 1I GTGTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 35 2 25 8 G 0 1 208252 CASAVA_Build 4 66209124 7D ATGGGCCACT TGAGGCA/------- TGAGCAAAGT 3070 hom 99 het 33 0 34 2 TGAGGCA 1 0 208253 CASAVA_Build 4 66219052 3I GGGCAAGGAA ---/TCC TCCTGACGAC 3070 hom 52 het 25 0 15 10 TCC 1 2 208254 CASAVA_Build 4 66219626 1I ACAAACAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 10 11 208255 CASAVA_Build 4 66228562 4D CTGAGAAGAA TATT/---- TATTTCCCAA 3070 hom 80 het 31 0 26 5 TATT 2 1 208256 CASAVA_Build 4 66229777 1I CATCAAGTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 8 9 208257 CASAVA_Build 4 66232994 1I CAAAATGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 10 11 208258 CASAVA_Build 4 66234069 1I TAGTGATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 10 11 208259 CASAVA_Build 4 66240848 1I CTTTAAATTG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 97 het 38 0 33 5 A 8 9 208260 CASAVA_Build 4 66245794 1I AACCTCAGAG -/A AAAAAATCAG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 6 7 208261 CASAVA_Build 4 66257602 3I AGAACTAAAC ---/ATT ATTAATATCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATT 1 2 208262 CASAVA_Build 4 66260955 1I TATGACAGTC -/T TTATTTTTTT 3070 het 654 hom 25 3 17 5 T 2 3 208263 CASAVA_Build 4 66283731 1D AGTTATATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 92 het 44 0 29 15 T 10 9 208264 CASAVA_Build 4 66301411 2D CATGCATATA CG/-- TATATATATA 3070 hom 44 het 21 0 15 7 CG 1 0 208265 CASAVA_Build 4 66311443 1I CTTTATCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 23 1 19 3 T 10 11 208266 CASAVA_Build 4 66311683 1D ACATGTGGTA T/- TTTGTTTTAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 4 3 208267 CASAVA_Build 4 66329890 1I AGCACTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 339 hom 23 2 14 7 A 11 12 208268 CASAVA_Build 4 66342167 1I CTATCCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 32 2 25 5 T 10 11 208269 CASAVA_Build 4 66349493 3I AAAAATACAG ---/AAT AAAGAGACAC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAT 0 1 208270 CASAVA_Build 4 66369923 16D AAAATACTGC ATTATTTCACTTCTAT/---------------- ATGTGGAATC 3070 hom 126 het 43 0 42 7 ATTATTTCACTTCTAT 1 0 208271 CASAVA_Build 4 66370759 1I AAATTCTTTC -/T TTGTTATATT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 2 3 208272 CASAVA_Build 4 66376856 1D TTAACTCATG A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 8 7 208273 CASAVA_Build 4 66384149 2I TTTGCTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 T 12 14 208274 CASAVA_Build 4 66387261 3D TGTATGTCTA GTT/--- GTTGTTGTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 7 GTT 4 3 208275 CASAVA_Build 4 66392720 1D ATATTAATTG C/- CATTTGTTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 2 1 208276 CASAVA_Build 4 66393427 1I ACTCTTTGTC -/T TTTGGTTTTG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 3 4 208277 CASAVA_Build 4 66394617 1D AAGAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 34 0 29 6 A 12 11 208278 CASAVA_Build 4 66398070 1I TACTTCTTAT -/G AGGTATAGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 208279 CASAVA_Build 4 66401700 3D AAGGAATCAC CTA/--- CTAACTAATC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CTA 2 1 208280 CASAVA_Build 4 66403007 1D TAAATTTCAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 8 208281 CASAVA_Build 4 66403165 3D ATTTCCATGA AAC/--- AATACTAAGT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AAC 1 0 208282 CASAVA_Build 4 66403802 5I AATCCAGTAA -----/GGGCT GTAGATGATT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 GGGCT 0 1 208283 CASAVA_Build 4 66404707 6I CTATGGGAAT ------/TTGAGG TTGAGGTAAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 TTGAGG 1 2 208284 CASAVA_Build 4 66405965 4I TTGAGCTGAG ----/ACAC ACAATGGGGT 3070 het 570 hom 19 2 12 5 AC 1 3 208285 CASAVA_Build 4 66418774 1D CCATTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 1838 het 1838 ref 51 40 4 7 A 12 11 208286 CASAVA_Build 4 66423622 8D TCTTACACTT TACAATGC/-------- TACAATGCTG 3070 hom 111 het 44 0 38 7 TACAATGC 2 1 208287 CASAVA_Build 4 66437779 3D TTTCTACAAT AGA/--- AGAAGTCATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AGA 2 1 208288 CASAVA_Build 4 66438229 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 587 het 34 hom 8 1 2 6 A 16 14 208289 CASAVA_Build 4 66462489 1D GTAACTCGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 32 1 26 5 T 11 10 208290 CASAVA_Build 4 66466424 2D AAAATATCTT AA/-- GAGAGAATAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 0 208291 CASAVA_Build 4 66471151 1D TTCAGCATAT G/- TGTCTATAAC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 1 0 208292 CASAVA_Build 4 66471563 1D AAGTCAGTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 9 8 208293 CASAVA_Build 4 66481972 1D TTATTTATTT A/- TTTTCTTAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 1 0 208294 CASAVA_Build 4 66483394 1I CCATTAAAAA -/C AATCACACTA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 C 0 1 208295 CASAVA_Build 4 66577017 2D GTTTCAAGTC TT/-- TATAAGAATG 3070 hom 90 het 37 0 31 7 T 3 1 208296 CASAVA_Build 4 66579574 1D TCAGAGAAAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 9 8 208297 CASAVA_Build 4 66584635 1I GACTGGCCAG -/A AATATGATTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 2 3 208298 CASAVA_Build 4 66604547 1D TATGTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 48 1 41 6 A 11 10 208299 CASAVA_Build 4 66630509 1I TTTTTTGTCC -/A AAAAAAAAAA 2503 het 867 hom 31 3 13 15 A 15 16 208300 CASAVA_Build 4 66632808 1D CTTGATTCGC T/- TTTTTTTTTT 1420 het 1420 ref 42 31 4 7 T 13 12 208301 CASAVA_Build 4 66634406 1I AATATGTTAT -/C TTTTCTTAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 208302 CASAVA_Build 4 66648574 1D TAAATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 12 11 208303 CASAVA_Build 4 66665613 2D TTTTTTATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TA 6 5 208304 CASAVA_Build 4 66668634 9D GATCATATCT GTAATATCC/--------- TTGCCAGGAA 3070 hom 99 het 33 0 34 2 GTAATATCC 1 0 208305 CASAVA_Build 4 66674498 1I ATACATAGAA -/T CTGAAAAATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 0 1 208306 CASAVA_Build 4 66677106 1D GTGTACATAC A/- AAAATCTAGT 3070 hom 166 het 61 0 56 6 A 5 4 208307 CASAVA_Build 4 66677614 5I TCAAAAAAAC -----/AAACA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 AAACA 0 1 208308 CASAVA_Build 4 66678502 1D TGTAGTACTG A/- AATGCTGTCT 3070 hom 151 het 54 0 51 10 A 3 2 208309 CASAVA_Build 4 66679076 1I ATTAGCTATG -/A AAAATTACAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 4 5 208310 CASAVA_Build 4 66680875 1I TATTCAAGTC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 7 8 208311 CASAVA_Build 4 66681308 43D GACTTAAATG TTAGACCTAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGACTTAAACA/------------------------------------------- TTAGACCTAA 3070 hom 42 het 26 0 15 23 TTAGACCTAAAAATCAATTCAAGATGGATTAAAGACTTAAACA 1 0 208312 CASAVA_Build 4 66682738 2D TCTCACTAAC AA/-- AAAGTAATTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 5 3 208313 CASAVA_Build 4 66690625 4I TTCCCCCTTA ----/TCTT TCTTACTTTT 3070 hom 91 het 36 0 29 7 TCTT 1 2 208314 CASAVA_Build 4 66696578 1D CATTAACTTA C/- TGTGCCAGGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 1 0 208315 CASAVA_Build 4 66697056 1D AAACTATTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 19 0 16 4 T 10 9 208316 CASAVA_Build 4 66713392 1D TTTTTTTTTT A/- CCTTTTCTCC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 1 0 208317 CASAVA_Build 4 66745052 2D TACCAAGATG TT/-- TAGGAAGCAC 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 3 1 208318 CASAVA_Build 4 66747909 1D TCCTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 30 1 23 6 T 12 11 208319 CASAVA_Build 4 66753199 1D TCTCTTAGGG A/- AAAAAAAAAG 1155 het 1155 ref 50 35 3 13 A 10 9 208320 CASAVA_Build 4 66759548 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 10 208321 CASAVA_Build 4 66762207 1D TCAAAAGATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 9 208322 CASAVA_Build 4 66767684 1I ATATGACAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 9 10 208323 CASAVA_Build 4 66770498 1D ATTCTGTTCA T/- TTTACTGCAT 3070 hom 105 het 43 0 36 8 T 4 3 208324 CASAVA_Build 4 66772724 2I ATCTAAAAAA --/AT AATGTTAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 0 1 208325 CASAVA_Build 4 66777914 2D TATATTTTCC AA/-- CCCCAGATTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 0 208326 CASAVA_Build 4 66789237 1I GTGTGGGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 16 1 10 6 A 11 12 208327 CASAVA_Build 4 66790672 1I CAGCACCCCA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 8 208328 CASAVA_Build 4 66794502 1I AATGATACTG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 101 het 36 0 34 2 A 6 7 208329 CASAVA_Build 4 66794928 1D ATTAATTGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 10 9 208330 CASAVA_Build 4 66848231 3D GCAGAAACTT CTC/--- CTCTTCCTCC 3070 het 3070 ref 47 18 19 12 CTC 2 1 208331 CASAVA_Build 4 66875907 1D CATTTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 1345 het 1345 ref 36 28 3 5 A 11 10 208332 CASAVA_Build 4 66888584 2I TTTTATCATG --/TA TATATATGAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TA 3 4 208333 CASAVA_Build 4 66936992 1D CACATGTATG T/- TTTTTTTTTT 1133 het 1133 ref 34 26 4 4 T 15 14 208334 CASAVA_Build 4 67053885 1D ACACTGCTAT A/- AAAAAATACC 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 7 6 208335 CASAVA_Build 4 67060362 1D GCCATGACAT A/- AAAAAAAAAA 879 het 879 ref 49 39 3 7 A 11 10 208336 CASAVA_Build 4 67062884 1D ATATATATAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 10 9 208337 CASAVA_Build 4 67067296 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGTTGCACA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 AG 1 0 208338 CASAVA_Build 4 67071300 1D CTAATGCTGT C/- CCCTCCCCCC 1685 hom 27 het 11 0 5 6 C 4 3 208339 CASAVA_Build 4 67072327 1D TTGACAAAAG C/- CCAAGTGACG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 3 2 208340 CASAVA_Build 4 67073031 4I GCATAAACAG ----/TAAA TAAAATATAG 3070 hom 105 het 38 0 33 5 TAAA 1 2 208341 CASAVA_Build 4 67074667 1I TTATTCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 11 208342 CASAVA_Build 4 67085213 2I CAGTTTTTTT --/TA AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TA 0 1 208343 CASAVA_Build 4 67100255 2D CTATTCTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 44 5 23 16 A 18 16 208344 CASAVA_Build 4 67162283 1D TGTTGGTAGA T/- TTTTTTTTTT 2266 het 2266 ref 38 25 7 6 T 12 11 208345 CASAVA_Build 4 67185059 1I ACCCTGGGCC -/A GGGGGAGGAC 3070 hom 158 het 56 0 52 4 A 0 1 208346 CASAVA_Build 4 67244475 1D GAAAGGCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 11 10 208347 CASAVA_Build 4 67283346 1D TAGAGAGTGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 9 8 208348 CASAVA_Build 4 67293218 13I TTTCTTTTCT -------------/TTTCTTTCTTTCC TTTCTTTCTT 3070 hom 51 het 29 0 18 11 TTTCTTTCTTTCC 0 1 208349 CASAVA_Build 4 67293244 10D CTTTCTTTCT TCTTTTGTGC/---------- TCTCTCTCTT 1624 het 1624 ref 29 5 7 20 TCTTTTGTGC 1 0 208350 CASAVA_Build 4 67293935 1D CTTGAGCTGG A/- AGGACAAATA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 2 1 208351 CASAVA_Build 4 67294398 4I GGCTGCTTGC ----/AGCG AGCGGTTCAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 AGCG 1 2 208352 CASAVA_Build 4 67297176 1D ATAAAAAGGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 9 8 208353 CASAVA_Build 4 67297802 2I TACAACCCTA --/GT TTACTTGAGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GT 0 1 208354 CASAVA_Build 4 67305034 1I TAGGCAATGA -/T TTTTTTGGAT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 6 7 208355 CASAVA_Build 4 67306339 2D TTTTGTTAAT TA/-- TAAAAAATAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TA 2 1 208356 CASAVA_Build 4 67307187 1D TATGTTTAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 8 208357 CASAVA_Build 4 67309124 5D5M1D GAAGCTTTAA AGTTCAAATGA/-----ACATG- AGTATTTGAA 3070 hom 111 het 37 0 38 4 N/A 0 0 208358 CASAVA_Build 4 67312716 1I TCTAGCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 36 1 28 7 T 10 11 208359 CASAVA_Build 4 67313195 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 37 2 20 16 T 17 16 208360 CASAVA_Build 4 67319209 1I AAAGGGTTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 7 8 208361 CASAVA_Build 4 67322168 1D GTATTTATGA G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 25 6 G 5 4 208362 CASAVA_Build 4 67322670 3D TTCATATCGC TAT/--- TATTATCAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 TAT 3 2 208363 CASAVA_Build 4 67325172 2D TAACCTAAAA AC/-- ACTATCTACA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 AC 2 1 208364 CASAVA_Build 4 67330617 1D ATAACTTAAT A/- AAGGATTATC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 3 2 208365 CASAVA_Build 4 67339907 1I AATACAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 631 hom 50 5 36 9 T 12 13 208366 CASAVA_Build 4 67340396 4I AAGTACTGTA ----/TCTC TCTCTCTCAA 3070 hom 85 het 34 0 27 7 TC 4 6 208367 CASAVA_Build 4 67344508 1D ACTTCATTTT A/- AAAAAGAGAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 6 5 208368 CASAVA_Build 4 67345903 5D TATTTTAATA GTATG/----- CTTAGTGGAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GTATG 1 0 208369 CASAVA_Build 4 67346383 1I GAAGTCATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 9 10 208370 CASAVA_Build 4 67348248 2D TGTTTTCTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 24 1 20 4 A 14 12 208371 CASAVA_Build 4 67349206 1D TAGTTTACTA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 9 8 208372 CASAVA_Build 4 67350390 14D TCCCCACTCA GTCTGTAGCATTAG/-------------- GTCATGTGCT 3070 hom 86 het 29 0 27 6 GTCTGTAGCATTAG 1 0 208373 CASAVA_Build 4 67356009 1I TCAGTTGTCT -/G CAAAGAGGCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 0 1 208374 CASAVA_Build 4 67360562 2D CTGAGAGAGC AG/-- AGAGAGAGAG 1484 het 1484 ref 35 24 5 6 AG 10 9 208375 CASAVA_Build 4 67362114 1I CAAAGGGTCA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 7 8 208376 CASAVA_Build 4 67373388 1D TGGTCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 590 hom 33 4 15 14 T 13 12 208377 CASAVA_Build 4 67375207 1D CTTTAGATAA C/- CTGATGACTA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 C 2 1 208378 CASAVA_Build 4 67381241 1D TGATGATAAA G/- GGGGGAGATT 3070 hom 106 het 44 0 35 9 G 6 5 208379 CASAVA_Build 4 67383453 12D TTTCTCTCTC TCTCTCTTTCTT/------------ TCTTTCTTTC 3070 het 317 hom 14 3 9 6 TCTCTCTTTCTT 1 0 208380 CASAVA_Build 4 67383910 2I TTTTAATCTT --/AA GAGAAAAATT 2817 het 2817 ref 21 12 6 3 A 0 2 208381 CASAVA_Build 4 67389738 1I GTGAGATGTG -/C CTTTGACTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 208382 CASAVA_Build 4 67393120 1D AAAATGTTGG C/- CAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 2 1 208383 CASAVA_Build 4 67417366 1I ATAATGAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 444 hom 28 1 20 7 T 9 10 208384 CASAVA_Build 4 67418657 2D CTAACATTTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 11 9 208385 CASAVA_Build 4 67422824 3D GTAAAAATTC TTG/--- TTAATTGTAT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TTG 1 0 208386 CASAVA_Build 4 67430146 2D GTTTTTTCTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 CT 9 8 208387 CASAVA_Build 4 67434750 1D TAGAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 21 9 19 T 15 14 208388 CASAVA_Build 4 67436036 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1465 het 1465 ref 28 15 5 8 A 13 14 208389 CASAVA_Build 4 67441422 4D TAATATAATG GATA/---- AAGAATATTT 3070 hom 63 het 25 0 22 5 GATA 1 0 208390 CASAVA_Build 4 67443644 18D ATCCCAGAAT ATTTTCATGAAGTAAAAG/------------------ ATTTTAAATT 3070 hom 87 het 29 0 30 1 ATTTTCATGAAGTAAAAG 1 0 208391 CASAVA_Build 4 67443778 1I AGAAAGAAGG -/A AAAAAATCTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 6 7 208392 CASAVA_Build 4 67449421 2I CTTGACAAGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 9 11 208393 CASAVA_Build 4 67455590 1D ATAATTTATC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 8 7 208394 CASAVA_Build 4 67473502 1I CTTATTTTTG -/T TAACAGATAC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 1 2 208395 CASAVA_Build 4 67480743 1I TTAAAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 2836 het 517 hom 12 2 7 3 A 13 14 208396 CASAVA_Build 4 67487316 4D ATAACCCAAA TAAG/---- TAAGAAATGA 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 TAAG 2 1 208397 CASAVA_Build 4 67490706 4I GTATTTTCAA ----/AGAC AGAATTCTAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AGAC 0 1 208398 CASAVA_Build 4 67492499 3I GGATAAGAAG ---/AGA AGATTTTCAG 3070 het 3070 hom 53 24 26 3 AGA 1 2 208399 CASAVA_Build 4 67494400 2I TATGTATATA --/CT CTCTCTCTCT 2585 het 2288 hom 26 10 10 6 CT 6 7 208400 CASAVA_Build 4 67503136 1D CCAGAGGCAT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 105 het 36 0 35 3 G 9 8 208401 CASAVA_Build 4 67508167 1D AGAAGATTCC T/- TTTGTTAGTT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 4 3 208402 CASAVA_Build 4 67529072 1I GGCTAACAGT -/C AACAAATTCT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 0 1 208403 CASAVA_Build 4 67541151 1D ACTGGTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 11 10 208404 CASAVA_Build 4 67545817 1D TAACAAGCTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 A 9 8 208405 CASAVA_Build 4 67547550 1D ATCTATTGAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 41 19 13 10 A 9 8 208406 CASAVA_Build 4 67548971 7I TCTGTTTTTA -------/TTATTAT TTATTAACTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 TTATTAT 0 1 208407 CASAVA_Build 4 67554363 1D CTTTTGTTCG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 T 9 8 208408 CASAVA_Build 4 67556145 1I AGTCTTTAGT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 14 16 4 A 8 9 208409 CASAVA_Build 4 67561922 2D AAATTACATC TA/-- TTCACATTTT 3070 het 3070 hom 26 14 11 2 TA 1 0 208410 CASAVA_Build 4 67563633 1D AACCACACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 18 10 T 13 12 208411 CASAVA_Build 4 67563890 4D ATTGTTGTGG CTGA/---- CTGTTAGCTG 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 CTGA 1 0 208412 CASAVA_Build 4 67577184 1D AATTGACTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 10 9 208413 CASAVA_Build 4 67580780 1D GAATATAAAA G/- TAATATTAAT 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 G 1 0 208414 CASAVA_Build 4 67600266 1D GGTTCTCAGC A/- AAAAAAAAAA 1112 het 1112 ref 32 16 3 13 A 15 14 208415 CASAVA_Build 4 67601189 1D TATGGCCATA G/- GGGGAATTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 G 5 4 208416 CASAVA_Build 4 67602132 3D TTGTACAGTT TTG/--- TTGTTGTGGC 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 TTG 3 2 208417 CASAVA_Build 4 67602206 1I GTTGAAGTAC -/A GCCTATACAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 208418 CASAVA_Build 4 67612186 3I CGATGTGCGC ---/TCT TTTTTGGTTC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TCT 0 1 208419 CASAVA_Build 4 67634675 1I TTCTAAAGGG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 39 10 22 7 A 6 7 208420 CASAVA_Build 4 67636230 10I AGTCATTATG ----------/GGTCGTCACA GTGAGGAGAG 3070 hom 117 het 47 0 39 8 GGTCGTCACA 0 1 208421 CASAVA_Build 4 67638452 1I TTAAATGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 26 0 22 4 T 10 11 208422 CASAVA_Build 4 67639651 1D84M1I AACAACACAC AAAAAAAAGAAAAATATTTACATCTGGATTGTATAGAGAACTTTTTAGAAGAATGAAGAGAAGATTATTAAATTAGGAAAAGGAC-/-AAAAAAAGAAAAATATTTACATCTGGATTGTATAGAGAACTTTTTAGAAGAATGAAGAGAAGATTATTAAATTAGGAAAAGGACT TTTTTTCCTT 3070 het 547 hom 39 5 34 26 N/A 0 0 208423 CASAVA_Build 4 67639944 1D TTTGCTTCCT A/- AAAAAAAAAA 1213 het 1213 ref 35 28 3 4 A 11 10 208424 CASAVA_Build 4 67642390 2I TCCAAAAGTC --/CT CTCTTTATTG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 CT 2 3 208425 CASAVA_Build 4 67653921 1D TTGGTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 874 het 874 ref 39 33 3 3 A 12 11 208426 CASAVA_Build 4 67665926 1I AAAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 408 hom 32 1 25 6 A 9 10 208427 CASAVA_Build 4 67673099 1D GTATTTATAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 52 hom 40 4 34 2 A 9 8 208428 CASAVA_Build 4 67680717 1D TCTGCCATGA T/- TGTAAGTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 2 1 208429 CASAVA_Build 4 67681616 1D AGGTTGTGGG A/- AAAAAAATGC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 8 7 208430 CASAVA_Build 4 67682208 6D AAAGAAAGAA AGGAAG/------ AAAGGAAGAA 2617 het 568 hom 15 2 6 7 AGGAAG 1 0 208431 CASAVA_Build 4 67699194 4D ACAGTTTTGG CTCT/---- CTCTCTCTTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 CT 6 4 208432 CASAVA_Build 4 67701681 2D TCTGTGAAGA AT/-- ATGTTAGAAT 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 AT 2 1 208433 CASAVA_Build 4 67705490 1D TGACTCCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 20 0 20 1 A 10 9 208434 CASAVA_Build 4 67709405 2I TCTTTCTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TG 8 9 208435 CASAVA_Build 4 67719867 7D TATCTAAAGC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1189 het 1189 ref 26 13 4 9 A 23 16 208436 CASAVA_Build 4 67720949 1I CACTTCCAGA -/G GGGGGTGCAA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 G 5 6 208437 CASAVA_Build 4 67731363 1I TAAAGTATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 9 10 208438 CASAVA_Build 4 67731799 1D AGTTTTTGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 11 7 T 10 9 208439 CASAVA_Build 4 67733332 5I TATTTTATTA -----/TATAT TATATCTTCT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TATAT 1 2 208440 CASAVA_Build 4 67737741 5D TAGAGCTGCA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2158 het 167 hom 22 3 7 12 T 21 16 208441 CASAVA_Build 4 67743116 1I AGAGAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 729 hom 26 3 22 1 A 11 12 208442 CASAVA_Build 4 67744788 1D GATATGTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 19 1 14 4 A 11 10 208443 CASAVA_Build 4 67748713 1D AGAATCTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 69 hom 51 1 41 9 T 10 9 208444 CASAVA_Build 4 67753101 4D AAATATCAGT TTAA/---- TTAAGTTGGG 3070 het 3070 hom 39 16 18 7 TTAA 2 1 208445 CASAVA_Build 4 67755654 1I ATTCAATAAA -/T TGTTGTTATC 3070 het 3070 hom 54 26 27 1 T 1 2 208446 CASAVA_Build 4 67815731 1I TTCAGGTCTG -/A ATTCAAGAAT 3070 het 3070 hom 47 17 22 8 A 1 2 208447 CASAVA_Build 4 67838447 1D CACCAAAAAT A/- ACTAGGCAAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 2 1 208448 CASAVA_Build 4 67841075 1D TCCTATGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 9 8 208449 CASAVA_Build 4 67852905 3I TACCTCTGGC ---/TCT TCTTGTGCAC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 TCT 1 2 208450 CASAVA_Build 4 67871354 1I TGATGTGATA -/G GAAAGAAAAT 2105 het 2105 ref 16 8 5 3 G 1 2 208451 CASAVA_Build 4 67876521 3I CGGAACCTGA ---/AAG TAGTTAGGAC 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 AAG 0 1 208452 CASAVA_Build 4 67879947 20D AAGCCCTCCC GACCTTCTGACTTCTTCCAA/-------------------- GAGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 46 24 20 6 GACCTTCTGACTTCTTCCAA 1 0 208453 CASAVA_Build 4 67881997 1I CCCAACAATG -/C CCCAAAACTC 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 C 3 4 208454 CASAVA_Build 4 67886260 1I GTTTAAGGTC -/A AAAAAGATAG 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 5 6 208455 CASAVA_Build 4 67886552 4I CAACTTTACC ----/CTTG CTTGTATCAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 CTTG 1 2 208456 CASAVA_Build 4 67887108 1I ACACATGTGT -/C CCCTGTGCCT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 C 3 4 208457 CASAVA_Build 4 67898492 3I TTCTGCATGG ---/CAT CATCCAGAGT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 CAT 1 2 208458 CASAVA_Build 4 67903535 1D TACCTGGAAG A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 A 7 6 208459 CASAVA_Build 4 67908879 1D ATCATTTTGA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 2913 hom 32 10 20 2 T 8 7 208460 CASAVA_Build 4 67913075 21D CCAGTGCCAT GCCCCTTTCATCGAAAATCAG/--------------------- GCCCCTTTCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 10 GCCCCTTTCATCGAAAATCAG 2 1 208461 CASAVA_Build 4 67922724 1I TTTAGTGTTG -/T TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 55 25 28 2 T 6 7 208462 CASAVA_Build 4 67928004 1D TAAAGAAATT A/- AAAATACAAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 5 4 208463 CASAVA_Build 4 67942608 3D GTAAGATGTT GAA/--- GAAGGATAAT 2992 het 2992 ref 28 13 9 6 GAA 2 1 208464 CASAVA_Build 4 67952701 1D ATAAACCTAA T/- TTGTTTGTAG 2113 het 2113 ref 22 11 6 5 T 3 2 208465 CASAVA_Build 4 67968373 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 2269 het 90 hom 11 2 7 2 A 13 10 208466 CASAVA_Build 4 67977432 1I TCTGTGATGC -/T TTTTTTTTTT 2170 het 2170 ref 41 15 11 15 T 15 16 208467 CASAVA_Build 4 67978366 4I CCCATTCACG ----/AATA AATAAATAGG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 AATA 2 3 208468 CASAVA_Build 4 67982656 1D TAAATCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 25 2 19 4 A 13 12 208469 CASAVA_Build 4 67984656 4D GTACACACAC ACAT/---- ACATTTTGCA 3070 het 3070 ref 33 15 15 4 ACAT 2 1 208470 CASAVA_Build 4 67990220 1I TTGGGGGGTG -/A GGGGGCAGGG 2272 het 2272 ref 17 9 6 2 A 0 1 208471 CASAVA_Build 4 67993253 1D AAAATCAACT A/- AATGTGACCC 3070 hom 70 het 30 0 21 9 A 3 2 208472 CASAVA_Build 4 67995144 1I GAAAGTACTT -/C TGATAGAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 0 1 208473 CASAVA_Build 4 68003721 3D CAGTATAGAA AGG/--- AGGAGGGAAA 3070 het 3070 ref 29 17 12 1 AGG 3 2 208474 CASAVA_Build 4 68016752 1D AATATGTTGG A/- CAAAAGGAGG 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 A 1 0 208475 CASAVA_Build 4 68020758 2D AGAAAAAACA TG/-- TGAGTTAGAA 3070 het 3070 hom 26 11 15 1 TG 2 1 208476 CASAVA_Build 4 68022385 1D CATAAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 37 1 30 6 T 11 10 208477 CASAVA_Build 4 68024814 1D AAGAGCCCTG T/- TAAGTACTCC 3070 hom 70 het 29 0 21 8 T 2 1 208478 CASAVA_Build 4 68031673 1D TCAATGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2436 het 2436 ref 20 13 6 1 A 11 10 208479 CASAVA_Build 4 68032079 1D ACTTTTTAAC A/- AAAAAGTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 6 5 208480 CASAVA_Build 4 68033783 1I GGAATCTTAA -/C CCCCCCCAAT 2683 het 2683 ref 26 12 7 7 C 7 8 208481 CASAVA_Build 4 68037725 2I AAGCAACTAG --/CT CTTAGTCCTG 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 CT 1 2 208482 CASAVA_Build 4 68042901 2I CTATTGGTAA --/TC TCTGAGTATG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TC 1 2 208483 CASAVA_Build 4 68046112 5I4M7D AAGTGTTGGG -----TGGCTCCCAAA/ATTACAGGC------- GTGAGCCACC 3070 het 820 hom 18 4 10 4 N/A 0 0 208484 CASAVA_Build 4 68050255 1I AAATAAATTA -/T TTTTTTAAGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 208485 CASAVA_Build 4 68050565 9D TACAAAGAAG TAACAAGTA/--------- TATCTGTTGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 4 TAACAAGTA 1 0 208486 CASAVA_Build 4 68050712 4D ATAAAAAGAT AAAG/---- AAACAACAAC 3070 het 3070 ref 34 20 12 5 AAAG 1 0 208487 CASAVA_Build 4 68061582 1I CCACAGAACT -/G GTAAGATAAT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 G 1 2 208488 CASAVA_Build 4 68071617 2I CAGAGGGAGA --/CT CTCTCTCAAA 2650 het 2650 ref 27 13 7 7 CT 3 4 208489 CASAVA_Build 4 68071967 2I ATGTGTTGAT --/AC ACACAAGTTA 3070 het 3070 hom 46 20 25 1 AC 2 3 208490 CASAVA_Build 4 68072681 7D ATTCAAACAG GAAGAGA/------- GAAGAGAGGA 3070 het 3070 ref 23 13 9 6 GAAGAGA 2 1 208491 CASAVA_Build 4 68090255 3D ATAGAATCAT ACA/--- ACATGTATCC 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 ACA 2 1 208492 CASAVA_Build 4 68104766 3I GTGCTTATTT ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 AAC 3 4 208493 CASAVA_Build 4 68106487 1D ATCTACTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 12 12 A 16 15 208494 CASAVA_Build 4 68108544 1D TTTAGAGTGT C/- CTTTATCTGA 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 C 2 1 208495 CASAVA_Build 4 68112253 1D AACGATTGTT A/- AAAAAAAAAA 2540 het 2540 ref 37 18 10 9 A 15 14 208496 CASAVA_Build 4 68115682 1I GTTCTCAACT -/G GGGGGGAGGA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 G 6 7 208497 CASAVA_Build 4 68117794 4D CATTATAAAC TTGT/---- TTAATTTTTG 3070 het 3070 hom 31 15 16 4 TTGT 1 0 208498 CASAVA_Build 4 68136667 3D CGACGACGAC GAT/--- GATGATGATG 3070 het 3070 ref 44 22 14 10 GAT 8 7 208499 CASAVA_Build 4 68140440 1I ATTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 632 hom 36 2 24 10 T 11 12 208500 CASAVA_Build 4 68150632 2I AAGTTAACAC --/AT GTTTGTCACT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 0 1 208501 CASAVA_Build 4 68151126 4D ACCATGACTG TGCT/---- TGCTGGGTCA 3070 hom 94 het 39 0 26 14 TGCT 2 1 208502 CASAVA_Build 4 68153132 2D TTGAACCAGT TC/-- TCTCTTACTT 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 TC 3 2 208503 CASAVA_Build 4 68156720 3D GAAAAATAAA ACC/--- ACCACCACCA 3070 het 3033 hom 32 9 15 9 ACC 7 6 208504 CASAVA_Build 4 68157114 1D AAAAAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 T 13 12 208505 CASAVA_Build 4 68161932 3D ATCAGCTACA ATG/--- ATGATGATGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 ATG 5 4 208506 CASAVA_Build 4 68163195 2I CAACAAAAAC --/AT GTGTGGCAGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AT 0 1 208507 CASAVA_Build 4 68174840 2I TCCTGCATCT --/AA GTTTGGTTAC 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 A 0 2 208508 CASAVA_Build 4 68180614 1D ATTTTTGAAA T/- TGATACATGT 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 T 2 1 208509 CASAVA_Build 4 68184064 35I ACATATACAT -----------------------------------/CTTGTTGTTCAATCTAGTAATTTCTCTCTTTTCTA CTAGTAGTAC 3070 het 3070 hom 38 18 19 3 CTTGTTGTTCAATCTAGTAATTTCTCTCTTTTCTA 0 1 208510 CASAVA_Build 4 68195994 2D TTTAAGTAAC TT/-- GTGTGGCTAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 2 0 208511 CASAVA_Build 4 68210179 4I ATAAGTTTAA ----/GTGG GTTAACAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 GTGG 0 1 208512 CASAVA_Build 4 68215519 2D AATAAAAAAC AG/-- ATATATTATT 3070 het 3070 ref 24 13 7 5 AG 1 0 208513 CASAVA_Build 4 68215880 2I AACTAAATAC --/AT AGTTATATTT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AT 0 1 208514 CASAVA_Build 4 68219151 8I ATCTTTATAA --------/ATTCCATG ATTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 ATTCCATG 0 1 208515 CASAVA_Build 4 68222135 1D TACATAATTA T/- TTTTTGTAGT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 6 5 208516 CASAVA_Build 4 68224080 10D AAGAAGAAAG GAAAGGAAAA/---------- GAAAGGAAAA 2235 het 2235 ref 27 17 5 7 GAAAGGAAAA 2 1 208517 CASAVA_Build 4 68229761 1I GATTTTTTTT -/A AAAAAGTAGA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 5 6 208518 CASAVA_Build 4 68230405 3I AAAAGTGTCA ---/TAC AAAATTAGGA 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 TAC 0 1 208519 CASAVA_Build 4 68231886 1D TTTTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 1872 het 1872 ref 22 12 5 5 T 15 14 208520 CASAVA_Build 4 68232957 9I AAGACACAAG ---------/GTTCTTTAT ATATGCATTA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 GTTCTTTAT 0 1 208521 CASAVA_Build 4 68238083 1D GGTTCCTGCC A/- ACTACTTAGG 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 A 2 1 208522 CASAVA_Build 4 68239584 1D22M1I CACAAATTAT AAAAAGTTAAAATTTATCAAAAC-/-AAAAGTTAAAATTTATCAAAACT TATGCGTACA 3070 het 3070 ref 44 23 22 4 N/A 0 0 208523 CASAVA_Build 4 68243874 1D CACTCCTATC A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 36 15 20 3 A 7 6 208524 CASAVA_Build 4 68244462 3I CAATGAAGTA ---/ATC ATATTCTCTA 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 ATC 0 1 208525 CASAVA_Build 4 68247864 3I6M4I CACATACACA ---ATATAC----/TACACATACAATG CCTGTTTGGG 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 N/A 0 0 208526 CASAVA_Build 4 68248854 2D TTTTTTTTTT TC/-- CTTCTTCCGA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 TC 1 0 208527 CASAVA_Build 4 68251003 2D GAAAGAAAAC TA/-- GGCGATCACA 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 TA 1 0 208528 CASAVA_Build 4 68251521 4I CCTTATTCTC ----/TCTT TTCACATAAT 3070 het 2825 hom 22 7 11 4 TCTT 0 1 208529 CASAVA_Build 4 68255942 1D TTTATTTTTT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 1907 hom 29 8 11 10 G 8 7 208530 CASAVA_Build 4 68263814 4I TTTTTCCTTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 TTTC 3 4 208531 CASAVA_Build 4 68266218 1I TGCAGCTCTT -/G GCAGATGTTA 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 G 1 2 208532 CASAVA_Build 4 68267789 2D AAGATAAAGA AC/-- ACAACACTTC 3070 het 3070 ref 24 11 11 3 AC 2 1 208533 CASAVA_Build 4 68268024 1I TAGCAAAGCT -/A AAAAAAAATG 1404 het 1404 ref 24 20 3 1 A 8 9 208534 CASAVA_Build 4 68284514 1I TTATTAACTT -/A ACTCGATAAT 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 A 1 2 208535 CASAVA_Build 4 68291275 1D CATACTATTC T/- TTTTTTTTTT 3040 het 3040 ref 28 13 7 8 T 11 10 208536 CASAVA_Build 4 68300699 2I ATTTAAGCAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 T 10 12 208537 CASAVA_Build 4 68301121 2D AGTTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 hom 54 het 34 0 19 15 TG 1 0 208538 CASAVA_Build 4 68304181 1D GGAGAATTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 A 10 9 208539 CASAVA_Build 4 68304922 5I20M5I AGTAATATAC -----TCCTTTCTTTATATATACTT-----/GGTAGGTATGGCCAGATTTATGCTTCAGAA AGTGTATTGT 3070 hom 90 het 28 0 31 3 N/A 0 0 208540 CASAVA_Build 4 68306633 1D ATTATGCATA G/- CATTTAACAT 3070 het 3070 ref 46 25 18 4 G 1 0 208541 CASAVA_Build 4 68322263 1I ACCTACCACA -/G GAGAATCTAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 G 1 2 208542 CASAVA_Build 4 68336458 1I TCTCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 11 12 208543 CASAVA_Build 4 68354119 2D ACTTGAACCC GG/-- GAGGGGGAAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 3 1 208544 CASAVA_Build 4 68354194 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 24 1 14 9 A 15 16 208545 CASAVA_Build 4 68355970 1I TAGAAGTATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 8 9 208546 CASAVA_Build 4 68356326 1I GAAAGGAAAC -/A GAAGTGGCAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 0 1 208547 CASAVA_Build 4 68373762 2I GCTTTTAGTT --/AA AGAGACTTGG 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 1 3 208548 CASAVA_Build 4 68377759 1D AACAGTAGCG T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 4 T 2 1 208549 CASAVA_Build 4 68382576 1I ACCTAAAGGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 8 9 208550 CASAVA_Build 4 68382844 1I GTCAGAGAAG -/T TAAGTTGCTG 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 T 1 2 208551 CASAVA_Build 4 68386116 7I ATGTTACAAA -------/GAAAAAT GAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 GAAAAAT 1 2 208552 CASAVA_Build 4 68395103 1I ACAGATAACA -/T TACTTTATAT 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 1 2 208553 CASAVA_Build 4 68400038 1D CCTGCTTTCA T/- TTCGGTTTCC 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 T 3 2 208554 CASAVA_Build 4 68403324 3D AATCCCAGCA CTT/--- TGGGAGGCCA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CTT 1 0 208555 CASAVA_Build 4 68403566 4D AGACTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 19 1 11 8 A 20 16 208556 CASAVA_Build 4 68409416 4I TATATAACAT ----/AGGA AGAAAATAAC 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 AGGA 0 1 208557 CASAVA_Build 4 68412044 1D TTCAGATTTC A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 7 6 208558 CASAVA_Build 4 68419471 1I GATGAATACC -/A AAGCCAAGAG 3070 hom 151 het 56 0 51 5 A 2 3 208559 CASAVA_Build 4 68422635 1I TCTATAGGAC -/A TAAATCAGTG 3070 hom 169 het 60 0 57 3 A 0 1 208560 CASAVA_Build 4 68431897 1D AACAACACAA G/- AATTGTTTAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 1 0 208561 CASAVA_Build 4 68450791 1D CGCTCAAGAA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 69 het 32 0 23 10 T 8 7 208562 CASAVA_Build 4 68453145 1D TGTGAAGTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 T 9 8 208563 CASAVA_Build 4 68459046 1I AAAAGTCACC -/A AAAAATTAGA 3070 hom 83 het 34 0 28 6 A 5 6 208564 CASAVA_Build 4 68474542 1I CACCACACAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 10 208565 CASAVA_Build 4 68487488 2D TGTGTGTGTG TC/-- GCTATTGAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TC 1 0 208566 CASAVA_Build 4 68491350 1D TTTCCTGCAA G/- GGGGGAGGGT 3070 hom 96 het 33 0 32 1 G 6 5 208567 CASAVA_Build 4 68495040 2I AAGATGTGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 29 0 23 6 A 12 14 208568 CASAVA_Build 4 68497253 2D ATTCTCGGTG CC/-- CCTCTCGATT 3070 hom 102 het 36 0 34 3 C 4 2 208569 CASAVA_Build 4 68499902 1D TGGGGGGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 49 1 43 6 T 13 12 208570 CASAVA_Build 4 68507634 1D GAAGAATTCC A/- AAAGCAATTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 4 3 208571 CASAVA_Build 4 68512977 3I TTTAGTGTTT ---/AGC CTTGTTCATA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AGC 0 1 208572 CASAVA_Build 4 68515355 3D GAGACAATAG CAA/--- CAACATACTT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 CAA 2 1 208573 CASAVA_Build 4 68515728 1I TTTCTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 2428 hom 18 het 12 0 7 5 T 10 11 208574 CASAVA_Build 4 68515738 1I TTTTTTTTTT -/A AATTATACTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 2 3 208575 CASAVA_Build 4 68525923 1I CTATTTGGGC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 254 hom 22 1 17 4 T 7 8 208576 CASAVA_Build 4 68538263 1D TTAACAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 10 9 208577 CASAVA_Build 4 68538640 5I AGAGAGACTC -----/AATAT AAAACCCCTC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AATAT 0 1 208578 CASAVA_Build 4 68538946 3I TACCAAAATC ---/TTG TTATCAAATT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TTG 0 1 208579 CASAVA_Build 4 68561822 1D ACTGGCCTGC T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 6 5 208580 CASAVA_Build 4 68573369 1I AGCTGTAGGG -/C CCCTGAAAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 3 4 208581 CASAVA_Build 4 68576383 2I TGTGTGCGTG --/CA CACACACACA 3070 het 218 hom 30 1 17 12 CA 8 9 208582 CASAVA_Build 4 68580091 1I TCACTTTCCT -/G GGGGGGGGGC 3070 hom 48 het 20 0 10 10 G 9 10 208583 CASAVA_Build 4 68588869 1I AAGGAAAGCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 133 hom 32 1 26 5 T 8 9 208584 CASAVA_Build 4 68589291 12I ACAGCGTAAA ------------/ATTTGATGTTAT TTCTGGAAGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 ATTTGATGTTAT 0 1 208585 CASAVA_Build 4 68590049 4D TTTTTTAGCC TTAT/---- TTGTCATTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TTAT 1 0 208586 CASAVA_Build 4 68592175 1D TTAACAAATT A/- CCATAAACTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 0 208587 CASAVA_Build 4 68594571 3D58M4D AGGTTCTTAG TGTTGTTGTCAAGGGCACAGGTTCTGAAAATCGTCAGTCCTTCTTTTCCTTCTTTTCTTCCTTCA/---TGTTGTCAAGGGCACAGGTTCTGAAAATCGTCAGTCCTTCTTTTCCTTCTTTTCTTCC---- TTTTCTTTCT 3070 hom 144 het 33 0 49 10 N/A 0 0 208588 CASAVA_Build 4 68595355 12D GCCTCAAAAA AAAAAAAAAAAG/------------ AAAGAAAAGG 3070 hom 69 het 26 0 24 11 AAAAAAAAAAAG 1 0 208589 CASAVA_Build 4 68597483 1D GCTTCTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 11 10 208590 CASAVA_Build 4 68597888 1I CTTACTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 40 2 24 14 T 15 16 208591 CASAVA_Build 4 68601500 1D AGAGTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 45 0 37 8 T 11 10 208592 CASAVA_Build 4 68606176 7D ATGGTATATC TACAAAA/------- TAAATATTAT 1868 het 228 hom 38 4 10 25 TACAAAA 1 0 208593 CASAVA_Build 4 68609377 4D AAACATACTC TATT/---- TAATAAAGTA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 TATT 1 0 208594 CASAVA_Build 4 68614081 1I TAAATGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1081 hom 30 4 20 6 A 12 13 208595 CASAVA_Build 4 68618640 1D TCTTTGGGGG C/- TCCAGTATAA 3070 hom 90 het 31 0 31 1 C 1 0 208596 CASAVA_Build 4 68621986 1I CTTAAGAGAC -/G GGGGGGAAGA 3070 hom 126 het 45 0 40 5 G 6 7 208597 CASAVA_Build 4 68635919 1I CTATGTATAG -/A AAACAAAGAC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 3 4 208598 CASAVA_Build 4 68640534 1D TTTAGATCAT A/- AATGCTGTAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 3 2 208599 CASAVA_Build 4 68641035 4I GTTTTATTAC ----/TTTA AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTTA 0 1 208600 CASAVA_Build 4 68643171 1D CTATAAAGCA T/- TTTTTTTACC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 8 7 208601 CASAVA_Build 4 68644444 1D AAAAAAAAAA C/- CAGACTAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 C 2 1 208602 CASAVA_Build 4 68645906 1D AGATTCTAAC A/- ATTAGGACAT 3070 hom 120 het 47 0 41 7 A 2 1 208603 CASAVA_Build 4 68653273 1I TGCTTGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1128 hom 40 4 29 7 T 12 13 208604 CASAVA_Build 4 68655363 2I AAACACTTAA --/TT TTTCATTCAT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 3 5 208605 CASAVA_Build 4 68683865 1D TATTGAATGG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 A 9 8 208606 CASAVA_Build 4 68686680 1I TACCACACTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 8 208607 CASAVA_Build 4 68691556 1I CATAATCTCA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 8 208608 CASAVA_Build 4 68694799 1I GATAATCTGG -/C TAATATTGAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 208609 CASAVA_Build 4 68704074 1D AAAAGAATGA T/- TTTTTTATGG 3070 hom 85 het 33 0 29 5 T 7 6 208610 CASAVA_Build 4 68722499 4D GTAACTAACC TGCT/---- TTTGATTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 TGCT 1 0 208611 CASAVA_Build 4 68726432 1I CTTAAAAGAT -/G TTTATAATGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 208612 CASAVA_Build 4 68727052 1D AACGTTGCCT C/- CAGAGAAAGT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 C 2 1 208613 CASAVA_Build 4 68734315 3D CCCATCCTGT AAC/--- AACAACTCCT 3070 hom 117 het 43 0 38 8 AAC 3 2 208614 CASAVA_Build 4 68734538 1I GTTTTTTGGA -/T TTTTTTGTCC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 6 7 208615 CASAVA_Build 4 68734933 1I ATAAGACTAT -/G GGACTAAGTC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 G 2 3 208616 CASAVA_Build 4 68740335 3I TTAATCGTTC ---/AGG AGAAGTGTAG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AGG 0 1 208617 CASAVA_Build 4 68755705 2D TTAATATCTG AA/-- ATATACGAGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 3 1 208618 CASAVA_Build 4 68757019 1I GTGTCAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1334 hom 41 3 34 4 A 11 12 208619 CASAVA_Build 4 68757537 1I GGCGGCCCTG -/A AAAAAAGAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 6 7 208620 CASAVA_Build 4 68758618 1D TTAAAAATTT G/- CAGACACCAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 1 0 208621 CASAVA_Build 4 68759480 1D GTGGACAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 8 208622 CASAVA_Build 4 68765680 1D AAAATAGATA G/- CATGTGTAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 G 1 0 208623 CASAVA_Build 4 68766465 1I GGATATTTAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 47 0 38 9 A 8 9 208624 CASAVA_Build 4 68766604 1I TAGAGCTCCT -/C CCCAGTAAAA 3070 hom 114 het 43 0 35 8 C 3 4 208625 CASAVA_Build 4 68778209 1I CAATAGCTAC -/T TTTTTTTACC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 7 8 208626 CASAVA_Build 4 68779352 5D TTTAAATGCA TTTCC/----- TTTCCTGCTC 3070 hom 84 het 30 0 29 4 TTTCC 2 1 208627 CASAVA_Build 4 68779746 1D TACGCATTAT A/- AAAAAATATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 6 208628 CASAVA_Build 4 68808863 2D ATGCTTGGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 9 A 14 12 208629 CASAVA_Build 4 68864495 2I AAAAACAAAC --/AG AATTATTCCA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 AG 0 1 208630 CASAVA_Build 4 68873305 4D GATGACACAT AACC/---- AACAGTTGTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 AACC 1 0 208631 CASAVA_Build 4 68875740 4D TGCCTCCCTC TCTT/---- TATCAGCTAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 TCTT 1 0 208632 CASAVA_Build 4 68880222 1D AAATCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 A 13 12 208633 CASAVA_Build 4 68883583 2D CACCCCATTA CT/-- CTTTCATAAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 CT 2 1 208634 CASAVA_Build 4 68887921 8I ATGCACGTAC --------/ACACACAG ACACACAGAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 ACACACAG 2 3 208635 CASAVA_Build 4 68891213 1D GTTGACTTTC T/- TTTAACCTAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 4 3 208636 CASAVA_Build 4 68892643 1I CTTAAACTTG -/A AAAAAACCCA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 6 7 208637 CASAVA_Build 4 68893906 2I CCAAAACCGC --/TG TCTTATAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TG 0 1 208638 CASAVA_Build 4 68902923 1D AAATTCACAA T/- ATTGAGTTTC 3070 het 3070 ref 52 28 21 5 T 1 0 208639 CASAVA_Build 4 69010902 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1763 het 41 hom 6 1 4 1 A 11 12 208640 CASAVA_Build 4 69056353 1I GCATTGTTCA -/T TTTTTTTTTG 2076 hom 12 het 6 0 5 1 T 9 10 208641 CASAVA_Build 4 69064995 2D TACTTTGTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 687 hom 14 2 12 1 T 13 11 208642 CASAVA_Build 4 69066380 2I TGTGTTTTTA --/AT ATATTTTTGA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 AT 2 3 208643 CASAVA_Build 4 69075525 3I CAAACTGAGC ---/CTG CTTTTTTCTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CTG 0 1 208644 CASAVA_Build 4 69086559 1I TTTAGTTTTT -/A TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 0 1 208645 CASAVA_Build 4 69124935 3D TTTTACTTCC TTG/--- TTGTTTTTTC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TTG 2 1 208646 CASAVA_Build 4 69131514 1I CTCGTTAATA -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 33 het 17 0 11 6 C 8 9 208647 CASAVA_Build 4 69134759 2I AGAAAAAAAA --/AC AACCCCAATA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 AC 0 1 208648 CASAVA_Build 4 69140551 1I TTTCCCCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 10 11 208649 CASAVA_Build 4 69142931 1D AAAAAAAGCT G/- AATTAGTGCT 3070 het 195 hom 21 1 19 2 G 1 0 208650 CASAVA_Build 4 69143362 1D TACATGAATG A/- AAAACCTGAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 5 4 208651 CASAVA_Build 4 69147661 1I AAGTGGCTTA -/C CACAGGCCAA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 C 1 2 208652 CASAVA_Build 4 69159626 2D TGCAGAATAT AA/-- GATTCTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 2 0 208653 CASAVA_Build 4 69171983 1D ACTATAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 12 1 9 2 A 12 11 208654 CASAVA_Build 4 69204720 1D TTTTTTTTTT G/- TACATTCCAG 1424 het 424 hom 5 1 4 0 G 1 0 208655 CASAVA_Build 4 69258254 1I TATATTTGAG -/T TTTTTTGATA 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 6 7 208656 CASAVA_Build 4 69404319 1D AGTTTCCCAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 471 hom 13 1 11 1 T 10 9 208657 CASAVA_Build 4 69451563 1I TTGTAGTAAA -/C ATTTCCTGAA 1923 het 1923 ref 10 5 4 1 C 0 1 208658 CASAVA_Build 4 69567962 1I TTCTTTTTCA -/C TTGTTTTTAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 0 1 208659 CASAVA_Build 4 69588048 1I GACAGGTTTC -/A AAAACTATTG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 A 4 5 208660 CASAVA_Build 4 69627951 1D TTTGACTTCA T/- CTTTTTCAAC 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 T 1 0 208661 CASAVA_Build 4 69628969 5D CCAGCTTTTT ATTTC/----- ATTTCACTTA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 ATTTC 2 1 208662 CASAVA_Build 4 69632747 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2454 het 72 hom 21 2 12 7 T 12 13 208663 CASAVA_Build 4 69654162 1D AGGAGCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 818 hom 28 3 19 6 T 15 14 208664 CASAVA_Build 4 69691436 1I CAAAGTGTTG -/A AAGAAAAACA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 3 208665 CASAVA_Build 4 69702828 1D GACTTAAAAC A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 8 7 208666 CASAVA_Build 4 69707570 1I GGTATAAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 10 208667 CASAVA_Build 4 69708467 1I AACCAAAGCC -/T GTTTCTTCAT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 0 1 208668 CASAVA_Build 4 69712334 2I CCAAGGAGAC --/TT TTCTGGCTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 4 208669 CASAVA_Build 4 69712669 1I TTGTCTGTTC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 208670 CASAVA_Build 4 69715416 4D TACACTGATA AATG/---- AATGAATAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 AATG 2 1 208671 CASAVA_Build 4 69718928 1D TTATCTCAAG A/- AAAAAACCCA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 A 7 6 208672 CASAVA_Build 4 69722200 1I AAAAATATAG -/A ATTAAACCCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 1 2 208673 CASAVA_Build 4 69725557 1I AAATTGTTAC -/T TTTTTTTATA 1428 hom 7 het 5 0 3 2 T 7 8 208674 CASAVA_Build 4 69767954 1I TATTTTTCTA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 7 8 208675 CASAVA_Build 4 69773547 1D AATGGAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 28 0 25 3 T 11 10 208676 CASAVA_Build 4 69774166 1D CAAAAAAGCA T/- TTTTAACAAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 T 5 4 208677 CASAVA_Build 4 69808681 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 13 11 208678 CASAVA_Build 4 69811890 14I ACAAATCTAC --------------/ATATCTAGTGATAT ATATATAGTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 ATATCTAGTGATAT 0 1 208679 CASAVA_Build 4 69811910 1I3M3D ATATATATGT -GTGTGT/AGTG--- GTTTGTATGT 3070 het 423 hom 21 3 8 10 N/A 0 0 208680 CASAVA_Build 4 69822538 1I GCCCCAAAAC -/T GGCCATAAAC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 0 1 208681 CASAVA_Build 4 69823985 1I ATATCAGATA -/G ATACGGAACT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 0 1 208682 CASAVA_Build 4 69829387 1D TCCCAAAAAT A/- ATCTGTTCAC 3070 hom 108 het 43 0 37 7 A 2 1 208683 CASAVA_Build 4 69835062 8D CAGCTACTCA GGAATTTT/-------- GGAATTTTGA 3070 hom 114 het 40 0 38 5 GGAATTTT 2 1 208684 CASAVA_Build 4 69841124 3I TAGCATAGAT ---/ATC ATCACCAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 ATC 1 2 208685 CASAVA_Build 4 69842812 18D TCCACTGGAG ATATATATATATATATAT/------------------ ATATATATAT 3070 hom 39 het 19 0 14 8 AT 17 8 208686 CASAVA_Build 4 69854999 1D TTTCTTTCTT C/- CTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 2 1 208687 CASAVA_Build 4 69858622 1D AGGAAACTTT A/- AAAAATGTTT 3070 het 3070 hom 23 11 12 1 A 6 5 208688 CASAVA_Build 4 69861527 1I31M1I CCTACACCAG -TTTTTTTTGTATTTGCCTTAGATTGGATAAG-/TTTTTTTTTGTATTTGCCTTAGATTGGATAAGT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 13 12 N/A 0 0 208689 CASAVA_Build 4 69861568 1I TTTTTTTTTT -/A AAAGCATAAT 3070 het 267 hom 28 2 18 8 A 3 4 208690 CASAVA_Build 4 69861691 1I GGAGATTTTA -/T TTTTTACCAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 6 208691 CASAVA_Build 4 69861953 1D AAGATAAAAA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 27 13 12 4 T 8 7 208692 CASAVA_Build 4 69862190 1D AATAAGAATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 9 8 208693 CASAVA_Build 4 69862935 1I TACAGGTGAG -/A AAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 6 7 208694 CASAVA_Build 4 69865424 1D AGCCTATGAT A/- AGATATAGAA 3070 het 3070 hom 46 17 28 1 A 2 1 208695 CASAVA_Build 4 69871033 1D ATAGCTTTTC A/- AAATTCTGCT 3070 het 3070 hom 42 14 26 4 A 4 3 208696 CASAVA_Build 4 69874877 1D TACAATCCAC T/- TTATTTCAGA 3070 het 3070 ref 30 18 11 2 T 3 2 208697 CASAVA_Build 4 69878475 1D TGTATGTCTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 48 het 39 1 31 8 A 9 8 208698 CASAVA_Build 4 69882933 1D TTCAAAATTT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 2557 hom 20 6 12 3 A 8 7 208699 CASAVA_Build 4 69883464 1D TTTCTCCCTG T/- TTTTTTTAAA 2593 het 2593 ref 28 17 8 3 T 8 7 208700 CASAVA_Build 4 69886133 1I CTGTTCCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 42 1 36 5 T 10 11 208701 CASAVA_Build 4 69895933 13I GGTTCAAGCA -------------/AGCCTCTTGCCTC AGCCTCTCAC 3070 hom 85 het 32 0 29 4 AGCCTCTTGCCTC 0 1 208702 CASAVA_Build 4 69897892 6D CAAAGTATTT GTATTA/------ GTATGTCCTG 3070 hom 93 het 32 0 32 3 GTATTA 1 0 208703 CASAVA_Build 4 69899163 3I TATATTTAAT ---/AAC AGAGCAATTA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 AAC 0 1 208704 CASAVA_Build 4 69899233 4I GAGATGTTAG ----/AAGT AAGAAAAAAT 3070 hom 36 het 22 0 13 9 AAGT 0 1 208705 CASAVA_Build 4 69900735 1D ACTATCATAT G/- ATTCATAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 G 1 0 208706 CASAVA_Build 4 69902336 1D AACATACCTA T/- TAGCTAGTTA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 2 1 208707 CASAVA_Build 4 69904013 2I ATATACATAC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 TA 6 7 208708 CASAVA_Build 4 69914769 1D TATACCCAGA C/- CCTTCACTTA 3070 het 3070 ref 39 28 11 1 C 3 2 208709 CASAVA_Build 4 69916940 1D GCTGACGGAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 9 8 208710 CASAVA_Build 4 69919075 1I ACCATAAAAA -/T AATTTTCTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 0 1 208711 CASAVA_Build 4 69941311 2D ACACGCATGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 5 hom 45 3 40 3 AT 6 5 208712 CASAVA_Build 4 69941823 1I TTCTGTTTCC -/A AAAAAAAATA 1357 het 495 hom 8 1 3 4 A 8 9 208713 CASAVA_Build 4 69942142 2D CCTCCTATTC TG/-- TACCCATATG 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 TG 1 0 208714 CASAVA_Build 4 69942703 1I CATCTTGTGG -/T GGGGGGGCCC 3070 het 3070 hom 31 8 10 13 T 0 1 208715 CASAVA_Build 4 69945656 1D ATCTTTGTCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 10 9 208716 CASAVA_Build 4 69959951 11I AGAGTTAAAA -----------/CTGGGAGCAAC TCCAGTTCAG 3070 het 3070 ref 45 23 10 12 CTGGGAGCAAC 0 1 208717 CASAVA_Build 4 69969951 2D CTTTAGCTGT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 10 8 208718 CASAVA_Build 4 69974055 1D AGAGCTTTGG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 8 7 208719 CASAVA_Build 4 69974809 1I TCCTTGGGTG -/A AAAATCTTCC 2391 het 2391 ref 19 12 5 2 A 4 5 208720 CASAVA_Build 4 69977604 1D GTTTAAAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 10 9 208721 CASAVA_Build 4 69980361 1I TTACTATCAG -/A AAAATCTGTT 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 A 4 5 208722 CASAVA_Build 4 69981674 1D AATTATTTTT C/- CTACATTTAC 3070 het 3070 hom 42 10 27 5 C 2 1 208723 CASAVA_Build 4 69982704 1I GTTGTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 15 27 8 A 10 11 208724 CASAVA_Build 4 69984179 1I ACCTTTCTTT -/C TTTCTCTTGG 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 C 0 1 208725 CASAVA_Build 4 69984735 1I AATGTTTTGG -/A AAAAAATATT 2875 het 2875 ref 27 15 8 4 A 6 7 208726 CASAVA_Build 4 69988031 1I GCATGGCAGA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 T 7 8 208727 CASAVA_Build 4 69988656 1I CTAAAGTGTG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 7 8 208728 CASAVA_Build 4 69990790 1D AAAATAAATT A/- ATATATAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 2 1 208729 CASAVA_Build 4 69992859 8I CACATCGTAG --------/GACTAACA GACAGAGTGA 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 GACTAACA 0 1 208730 CASAVA_Build 4 70000640 1D TAAGATTATA T/- TTTTTATGAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 T 6 5 208731 CASAVA_Build 4 70001955 1D ATCATATTTT A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 42 19 17 8 A 7 6 208732 CASAVA_Build 4 70003415 1I TGTGGTTGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 9 10 208733 CASAVA_Build 4 70007724 1D GAAAGAATAC A/- TTATAATTTT 3070 het 3070 hom 37 19 17 1 A 1 0 208734 CASAVA_Build 4 70010776 3D AATACCATAT AGA/--- AGAATATTTA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 AGA 2 1 208735 CASAVA_Build 4 70021093 4D43M1I ACATGTCCTA TTTGTTTCTAAATAGTAATTCTATGATGTATAAAATTAAACTTTTGT-/----TTTCTAAATAGCAATTCTATGATGTATAAAATTAAACTTTTATG TTCTAATTGC 1746 het 1746 ref 40 45 4 4 N/A 0 0 208736 CASAVA_Build 4 70022075 1D CCAGTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 A 13 12 208737 CASAVA_Build 4 70033391 5I TAAAACTCTT -----/GTAAA GTAATTTATT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 GTAAA 0 1 208738 CASAVA_Build 4 70035559 2D CAAACCAGAA AT/-- ATATATATAA 3070 het 3070 ref 27 18 8 2 AT 5 4 208739 CASAVA_Build 4 70035974 1I TTGAGGAAAA -/C AAAAAGGAAC 3070 het 2479 hom 32 8 17 7 C 0 1 208740 CASAVA_Build 4 70067962 1I ACTTTATTAC -/A TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 0 1 208741 CASAVA_Build 4 70068860 4I AGGCACAAGG ----/CTTA CTATTTGTCT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 CTTA 0 1 208742 CASAVA_Build 4 70069463 1I CTTAGCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1728 hom 18 4 12 2 T 11 12 208743 CASAVA_Build 4 70069837 1D TCCCTCATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 T 10 9 208744 CASAVA_Build 4 70070964 1I TTTTTTTTTT -/C CTATTTCATC 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 C 1 2 208745 CASAVA_Build 4 70072150 5D GTTTCTTACA TTGAG/----- AAGTTGACTA 3070 het 3070 ref 32 20 12 0 TTGAG 1 0 208746 CASAVA_Build 4 70074374 4I ACATTTTAAC ----/TTTA TTTATTATTA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 TTTA 1 2 208747 CASAVA_Build 4 70074451 1I GCAGAGGGCT -/G GGGGGGTACC 1850 het 1850 ref 22 13 7 2 G 6 7 208748 CASAVA_Build 4 70074945 1I CCTAACTCTC -/T TGAATTCTAT 1471 hom 7 het 4 0 3 1 T 1 2 208749 CASAVA_Build 4 70075554 1D TTTAAATTAC T/- CACAGTTTCC 3070 het 3070 ref 32 14 14 6 T 1 0 208750 CASAVA_Build 4 70076097 1I AGCACGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 10 11 208751 CASAVA_Build 4 70083148 1D CAAAAACTTG A/- AAAAATATTA 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 A 6 5 208752 CASAVA_Build 4 70087726 1I ATATCCGTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 9 10 208753 CASAVA_Build 4 70088808 4I GGGAGGGAAT ----/ATTA ATTGATAGGA 3070 het 3070 ref 27 14 7 6 ATTA 0 1 208754 CASAVA_Build 4 70088994 2D TTTTAAACAT TG/-- TGTTATATTT 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 TG 2 1 208755 CASAVA_Build 4 70090405 3D ACAGTTATGT ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 ATA 4 3 208756 CASAVA_Build 4 70120571 1I GGCAGTTCAA -/C CCCTTTAGTT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 C 3 4 208757 CASAVA_Build 4 70125060 1D CAACCGAGAG A/- AAAAAAAAAA 2891 het 337 hom 24 2 8 14 A 13 12 208758 CASAVA_Build 4 70132198 1I TAAAACAGTA -/T TTTTTTTTAA 2932 het 2932 ref 23 9 8 6 T 8 9 208759 CASAVA_Build 4 70136535 4D CTAGCAAGAC AAAT/---- AAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AAAT 1 0 208760 CASAVA_Build 4 70143269 1I AAATTAAATG -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 6 7 208761 CASAVA_Build 4 70156113 1D AGACGCAGTC A/- AAAAAAAAAA 2793 het 1825 hom 27 10 9 9 A 16 15 208762 CASAVA_Build 4 70157177 1D GGATGAAATG T/- TTTTCCATTT 3070 het 3070 ref 42 28 10 4 T 5 4 208763 CASAVA_Build 4 70158615 1I ACATATAAGG -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 7 8 208764 CASAVA_Build 4 70164095 1I CTAGACTCAG -/T TTTAATCTAT 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 T 3 4 208765 CASAVA_Build 4 70168391 1D GGCTAGACTT C/- TTTCCTCATC 3070 het 3070 ref 30 11 16 4 C 1 0 208766 CASAVA_Build 4 70173986 1D ATAAATTAGC T/- TTGGGTGTGT 3070 het 3070 ref 55 35 13 7 T 3 2 208767 CASAVA_Build 4 70174276 1D TTGTTGATAA C/- TGGACCAAAG 3070 het 3070 ref 65 48 13 8 C 1 0 208768 CASAVA_Build 4 70174398 1I GAATAAATTT -/C TAAGCAACAA 3070 het 3070 ref 52 29 16 7 C 0 1 208769 CASAVA_Build 4 70175808 4I TTCCCATGAT ----/AGTC AGTAAGTGTC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AGTC 0 1 208770 CASAVA_Build 4 70192047 1I GGGTTGATGC -/T AGAAGTGGAA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 0 1 208771 CASAVA_Build 4 70199743 1I GCCCATAAGA -/C ATAAAAGATT 3070 het 2092 hom 15 5 8 2 C 0 1 208772 CASAVA_Build 4 70201533 3I AAATTTCCGC ---/AAT AATAATTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 AAT 2 3 208773 CASAVA_Build 4 70203966 1D TTTCAGCAAA G/- TCTCAGGATA 3070 het 1958 hom 14 5 8 1 G 1 0 208774 CASAVA_Build 4 70209476 1I ATTCTGAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 10 11 208775 CASAVA_Build 4 70215211 1I CAAAGAACAG -/A AAAATGAGGT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 4 5 208776 CASAVA_Build 4 70215483 1D TTTTTTTTTT C/- CTGAGACAGA 1569 het 1569 ref 35 21 9 6 C 2 1 208777 CASAVA_Build 4 70225427 3I TTGCTTTTGG ---/TGT TGTTTTAGAC 2441 het 2353 hom 13 5 6 2 TGT 1 2 208778 CASAVA_Build 4 70234789 1D ATCCCTCATC A/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 19 8 4 A 1 0 208779 CASAVA_Build 4 70254327 1D TATTTCCCTG T/- TTTTTTTTTT 1108 het 1108 ref 37 32 3 3 T 12 11 208780 CASAVA_Build 4 70282114 1I GTTGAAAAAA -/T TAGAAACAAC 3070 het 3070 ref 56 44 10 2 T 1 2 208781 CASAVA_Build 4 70282513 1D AACAAACAAT G/- GGGGAAACAA 3070 het 3070 ref 58 33 17 8 G 5 4 208782 CASAVA_Build 4 70282965 1D11M1D ATAAATTAGC TTTGGGTGTGTCT/-TTGGGTATGTC- TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 49 38 9 6 N/A 0 0 208783 CASAVA_Build 4 70283933 3D CCTAGATTTC AGA/--- AGATTTATGG 3064 het 3064 ref 49 37 9 7 AGA 2 1 208784 CASAVA_Build 4 70333366 4I ATGTAACAAG ----/AATA AATAGTGAAA 3070 hom 99 het 40 0 33 9 AATA 1 2 208785 CASAVA_Build 4 70335811 2D TATATAAAGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 23 0 15 8 AT 7 6 208786 CASAVA_Build 4 70340656 1I TAGATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2034 hom 27 6 11 10 A 13 14 208787 CASAVA_Build 4 70346915 4D TCTCGTTTTC TCTG/---- TCTGTCTGTC 3070 hom 99 het 43 0 34 12 TCTG 4 3 208788 CASAVA_Build 4 70349992 2D AAATTGACAC TT/-- GATATTGTTG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 2 0 208789 CASAVA_Build 4 70351627 7I AATGGTATAC -------/TTAATAG TTGAATAGTG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTAATAG 0 1 208790 CASAVA_Build 4 70352097 1D CAATGCAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 10 9 208791 CASAVA_Build 4 70352530 1D8M2D14M3D GCAATAGTAA TTATTTATATGTGTTATGTTTATTTTTA/-TATTTATA--TGTTATTTTTATTT--- AAGAATACAA 1987 het 1987 ref 37 36 5 11 N/A 0 0 208792 CASAVA_Build 4 70353931 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 12 11 208793 CASAVA_Build 4 70356417 1I AACTGTGTAT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 7 8 208794 CASAVA_Build 4 70357240 1I ATATAAAGAG -/A AAAAAATTCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 6 7 208795 CASAVA_Build 4 70364493 3I CAAATTGTAC ---/TAT TATTATTAGA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 TAT 2 3 208796 CASAVA_Build 4 70366027 18I GAAACTGTGA ------------------/CAGAAACTGGGCTGGGTT CAGAAATGGA 3070 hom 78 het 28 0 26 3 CAGAAACTGGGCTGGGTT 0 1 208797 CASAVA_Build 4 70366210 1I TGCTTAGGTA -/G GGAAAAAAAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 2 3 208798 CASAVA_Build 4 70366742 2I TCAGATGTTC --/AG ATATGTCCAG 3070 hom 66 het 23 0 22 1 AG 0 1 208799 CASAVA_Build 4 70371623 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 22 0 19 4 T 9 10 208800 CASAVA_Build 4 70378639 3D CAAAAAAACA AAC/--- AACAACAACA 2918 het 2918 ref 26 13 6 9 AAC 4 3 208801 CASAVA_Build 4 70385998 2D AGGAAACATC AT/-- GTGCAGAAAA 3070 het 3070 ref 42 27 11 4 AT 1 0 208802 CASAVA_Build 4 70386754 6I AATGCCAACA ------/ATTATC ATTTATTCTT 2913 het 2356 hom 18 6 6 6 ATTATC 0 1 208803 CASAVA_Build 4 70397268 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAGTAAAC 3070 het 107 hom 44 2 32 10 C 0 1 208804 CASAVA_Build 4 70398318 1D CTCCACGAAG A/- AAAAAGTTTA 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 A 6 5 208805 CASAVA_Build 4 70403290 1I ACCTCTCTGG -/T GGGGATCCTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 208806 CASAVA_Build 4 70404987 1D ACCATATTTC A/- GGTACCATCC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 1 0 208807 CASAVA_Build 4 70410825 1D GTATTTTTAA T/- TTGCATTCAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 3 2 208808 CASAVA_Build 4 70413023 3D CCAGCATCTG TTT/--- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 7 T 10 7 208809 CASAVA_Build 4 70414317 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 9 8 208810 CASAVA_Build 4 70422522 3I GAAATTAGAA ---/ATC ATCATATTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ATC 1 2 208811 CASAVA_Build 4 70423858 1I TATAAACGGA -/T GTGCTGTCAT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 0 1 208812 CASAVA_Build 4 70424423 11D TCAGCGATAA TGCAGATTAAC/----------- TTCTTGCCAT 244 het 244 ref 38 18 2 20 TGCAGATTAAC 1 0 208813 CASAVA_Build 4 70424692 2I GTTGTCGTTT --/AC CTCAGGAATA 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 AC 0 1 208814 CASAVA_Build 4 70425009 2I AACTTATGAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 26 0 16 10 A 9 11 208815 CASAVA_Build 4 70426569 1I GACATGTCTC -/T TAAGTGCTTA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 T 1 2 208816 CASAVA_Build 4 70426729 1I TTTCTGGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 9 10 208817 CASAVA_Build 4 70429364 1D TTTCCTCCCC G/- ACCCAGGATT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 1 0 208818 CASAVA_Build 4 70430300 4D CTACTACATT CTTA/---- CTTAATTTGT 3070 het 3070 hom 38 18 17 6 CTTA 2 1 208819 CASAVA_Build 4 70432304 2D GGTTCTGCAT TC/-- GGTATGGAGG 3070 het 3070 hom 43 15 21 8 TC 1 0 208820 CASAVA_Build 4 70432413 1D GGAGATTAAC A/- TTTGAGTGAT 3070 het 3070 hom 29 14 15 2 A 1 0 208821 CASAVA_Build 4 70434825 1I ATTTTCTGTA -/T TTGGTGATTA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 2 3 208822 CASAVA_Build 4 70435114 1I TGGCTTGCTG -/T GTCTTCTGGC 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 T 0 1 208823 CASAVA_Build 4 70436331 1I GCCCAGCTTT -/A AAATTTCTCT 2874 het 2874 ref 21 12 7 2 A 3 4 208824 CASAVA_Build 4 70436807 5D AAAATGTAGA TAAAT/----- TAGATGTCAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 4 TAAAT 1 0 208825 CASAVA_Build 4 70437149 1I TTAGAAAGAT -/A AAAAGTTAAG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 4 5 208826 CASAVA_Build 4 70438544 11D22M4I TGATTTATGA CTCACCATAGTCTCACAGTTTTCTCATATTTTT----/-----------CTCACAGTTTTCTCATATTTTTTTAC TACTTCTCTC 3070 het 3070 hom 41 24 29 3 N/A 0 0 208827 CASAVA_Build 4 70439503 2D CAAAGAATGA GT/-- GTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 GT 2 1 208828 CASAVA_Build 4 70439584 1D ATGAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 A 11 10 208829 CASAVA_Build 4 70440802 2D20M4I21M8D GGTAGTGAAC GTGTGTGTGTGTGTGATTAGAT----AGATAGATGATAGATAGATGGATAGATAA/--GTGTGTGTGTGTGATTAGATGGACAGATAGATGATAGATAGATGG-------- ATAGAGAGAC 3070 het 3070 ref 42 35 16 16 N/A 0 0 208830 CASAVA_Build 4 70442516 1D CTAATGCTAT C/- CCCCCCCCCC 1253 hom 10 het 4 0 4 0 C 11 10 208831 CASAVA_Build 4 70446502 1I CCAGTTTCTG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 7 8 208832 CASAVA_Build 4 70447508 1D AAAACACGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 34 1 20 13 A 13 12 208833 CASAVA_Build 4 70449058 1D TCTATCAGAG A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 A 7 6 208834 CASAVA_Build 4 70451843 1D CAAATACTGA G/- GGCAGAATAC 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 G 3 2 208835 CASAVA_Build 4 70452133 1D CATAAAAAAA C/- ACCTATCCCC 2492 het 2492 ref 24 17 6 1 C 1 0 208836 CASAVA_Build 4 70452775 5D AATAGAAAAC AAAAA/----- AAAAAAAAGG 3070 het 472 hom 21 6 8 10 A 13 8 208837 CASAVA_Build 4 70453312 1I ATGTAAAATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 8 9 208838 CASAVA_Build 4 70453546 1D ATATCAGAAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 8 7 208839 CASAVA_Build 4 70453624 1I AAAAAATCAA -/T TGAATCCAGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 1 2 208840 CASAVA_Build 4 70454310 1D AACTAAACAC A/- AAAAATGATT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 A 6 5 208841 CASAVA_Build 4 70459948 3D AAGCCATTCC AAG/--- AAGGACAGGC 3070 het 3070 ref 43 21 19 5 AAG 2 1 208842 CASAVA_Build 4 70460925 1D TCCCCCCCCC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 80 het 34 0 27 8 A 9 8 208843 CASAVA_Build 4 70461782 4I AATTGGAAGG ----/AGTA AGTCTCTACT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 AGTA 0 1 208844 CASAVA_Build 4 70461862 1D TGGATGAATG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 A 8 7 208845 CASAVA_Build 4 70462814 1D AAAAGTTGGG T/- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 7 6 208846 CASAVA_Build 4 70463123 1I AGTCCTTAAT -/C CATCTTGAGT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 C 1 2 208847 CASAVA_Build 4 70464199 1D AAAATACACA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 14 het 22 1 19 3 T 9 8 208848 CASAVA_Build 4 70464774 1D AGGCTTCACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 A 10 9 208849 CASAVA_Build 4 70464823 14I TGCAGATACA --------------/AAATGGACACATGT AAATGAGTAG 1078 het 1078 ref 30 19 4 9 AAATGGACACATGT 0 1 208850 CASAVA_Build 4 70465135 1D11M1D ACAGATATAG AAAAAAAACTCTA/-AAAAAAACTCT- AAATGTACGT 3070 het 3070 ref 38 25 19 4 N/A 0 0 208851 CASAVA_Build 4 70466204 3I TAAAGGCAAC ---/TGT TGTTGTCGTT 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 TGT 2 3 208852 CASAVA_Build 4 70467618 5D TTCCTGCTTA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 30 11 11 11 AAAAT 3 2 208853 CASAVA_Build 4 70467957 1I CCAGCTCAAG -/C AGTTGTCTTA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 C 0 1 208854 CASAVA_Build 4 70469675 2I TTTGTTGGGC --/AT ATGACTGGTG 3070 het 3070 ref 34 23 10 1 AT 1 2 208855 CASAVA_Build 4 70471071 1I55M1D TGTTCAGTTT -ATAAAATATTCAGTGTATATTTCTTTTCTAGACATTATCATAGTTTCATCACCAAT/AATAAAATATTCAGTGTATATTTCTTTTCTAGACATTATCATAGTTTCATCACCAA- TATTGTTAAA 3070 het 3070 ref 37 22 19 12 N/A 0 0 208856 CASAVA_Build 4 70471199 1I ATTATTATGC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 7 8 208857 CASAVA_Build 4 70472460 1I GTGAATCTTG -/T TTTATTTTAC 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 T 3 4 208858 CASAVA_Build 4 70472614 4D AGAGGAGAAT CTTG/---- CCACAACTTA 3070 het 3070 ref 29 16 10 5 CTTG 1 0 208859 CASAVA_Build 4 70473283 2D17M2I TATATACATG TATATATATATACATGTAC--/--TATATATATACATGTACAT ATATATATAC 2375 het 2282 hom 18 9 9 4 N/A 0 0 208860 CASAVA_Build 4 70474433 1D TATCCTAAAA C/- CTCTGACAAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 C 2 1 208861 CASAVA_Build 4 70474670 9D AATGACTGCT TTTAATGCA/--------- TTGAGCAAAT 3070 het 3070 ref 44 28 16 6 TTTAATGCA 1 0 208862 CASAVA_Build 4 70487735 1D GATTGGGTCA T/- TTTTTTTTTA 1243 het 1243 ref 43 31 4 8 T 10 9 208863 CASAVA_Build 4 70502524 5I AAGCAATAAA -----/AACTC AACAGTTGTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 AACTC 0 1 208864 CASAVA_Build 4 70510554 1I CTGCCATTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 9 10 208865 CASAVA_Build 4 70511421 1I TCAGTGAAGT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 7 8 208866 CASAVA_Build 4 70513362 1D TAACCTCACT A/- AAAAAGACAG 3070 het 3070 hom 56 21 30 5 A 6 5 208867 CASAVA_Build 4 70531626 2I TTAATTTTTA --/TC TGTTTTTATT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TC 0 1 208868 CASAVA_Build 4 70540611 1I TGAGAGGTGA -/T GACATTAATT 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 T 0 1 208869 CASAVA_Build 4 70548606 2I AAAAATAGTT --/TA TGTTAATCCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TA 0 1 208870 CASAVA_Build 4 70552492 1I CTTCTACTGG -/T TTAACAACTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 2 3 208871 CASAVA_Build 4 70553636 2I GTTGTTTATA --/CT CTTAACATTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 CT 1 2 208872 CASAVA_Build 4 70553930 4I TGTCTTTATT ----/TTTA TTTATTTATA 2798 hom 21 het 9 0 8 1 TTTA 2 3 208873 CASAVA_Build 4 70554590 2D38M4D ACTTGCAGTA ATATATCTTTTGCCTTCACACTTGGAACACAGCATGGGTGTTAA/--ATATCTTTTGCCTTCACACTTGGAACACAGCATGGGTG---- TTAATATTTT 3070 hom 108 het 32 0 37 4 N/A 0 0 208874 CASAVA_Build 4 70570901 2I GGCTCAGACC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 37 11 15 11 AG 6 7 208875 CASAVA_Build 4 70579325 1D CTTTTTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 13 0 11 2 T 11 10 208876 CASAVA_Build 4 70579518 1D TTTGTTGCCA T/- TTGCTTTTGG 1431 het 1431 ref 16 10 3 3 T 3 2 208877 CASAVA_Build 4 70580698 1I TGATTAAGAT -/A AAAAAATAAT 3070 het 2505 hom 19 7 10 2 A 6 7 208878 CASAVA_Build 4 70581939 1I TTTAGACCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 9 10 208879 CASAVA_Build 4 70583493 4I TAAAGGAGAA ----/ATAG ATAGATTCCC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATAG 1 2 208880 CASAVA_Build 4 70585140 2I TGATGAACAC --/AT GTGTGCCTAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AT 0 1 208881 CASAVA_Build 4 70587367 2D ATATAAATAC TA/-- TATGTCTATT 2866 het 2427 hom 14 6 7 1 TA 2 1 208882 CASAVA_Build 4 70587703 4I TTCAGGTGAG ----/TATT TATGACTTTG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TATT 0 1 208883 CASAVA_Build 4 70603490 1D ACCGTCTTTC T/- TTTTTAATCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 5 208884 CASAVA_Build 4 70608087 1D TTCACTTCAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 9 8 208885 CASAVA_Build 4 70614499 1I AAGATCTGTG -/T CACTACAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 T 0 1 208886 CASAVA_Build 4 70614667 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 208887 CASAVA_Build 4 70617424 4D ATATGAAAAT AAGA/---- AAGATTTTGA 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 AAGA 2 1 208888 CASAVA_Build 4 70637332 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 10 9 208889 CASAVA_Build 4 70665630 2D ATGTGCACAC AT/-- GTGTTAAAAT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 AT 1 0 208890 CASAVA_Build 4 70678496 1D CAGACAAACT A/- TGGAATGGGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 A 1 0 208891 CASAVA_Build 4 70688643 26D TAGTTTGACA TCATCAGCTTGATTATATTTCCTATG/-------------------------- TCAGTCATGA 3070 het 3070 ref 43 29 19 3 TCATCAGCTTGATTATATTTCCTATG 1 0 208892 CASAVA_Build 4 70690988 1D CATTATGAAG A/- AAGGCCAGGC 3070 het 3070 hom 30 9 19 3 A 3 2 208893 CASAVA_Build 4 70695297 1I TCTCTTTACC -/T TTTTTTATTA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 6 7 208894 CASAVA_Build 4 70700493 1D ATTCTATGGA C/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 C 1 0 208895 CASAVA_Build 4 70737177 4D TAGACAATAT CTAA/---- CTGTTATAAA 3070 het 3070 hom 42 17 20 8 CTAA 1 0 208896 CASAVA_Build 4 70737394 1D TCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1285 het 296 hom 26 5 5 17 A 15 14 208897 CASAVA_Build 4 70748968 1D ATGCTTTAGC A/- AAAATTTTCC 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 5 4 208898 CASAVA_Build 4 70772556 6I TGGAAACTGA ------/AAAGAG AAAAATTATG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 AAAGAG 0 1 208899 CASAVA_Build 4 70776172 8I TTTCCTCTAA --------/ATTGTAAT ATTGTAATAT 3070 het 3070 hom 56 20 31 5 ATTGTAAT 1 2 208900 CASAVA_Build 4 70781896 2D TTAAATATAT AA/-- GACTATTTAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 A 2 0 208901 CASAVA_Build 4 70784104 15I6M1D ACTTCTGTAT ---------------ACCCACA/TATTGTGGGTGTTGGACCCAC- AGCCCAACAC 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 N/A 0 0 208902 CASAVA_Build 4 70794577 1D TTTCCCATGG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 8 7 208903 CASAVA_Build 4 70796094 3D AATAAATAGT ACA/--- ACAAGTAAGC 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 ACA 2 1 208904 CASAVA_Build 4 70802818 1I CTTAATCTGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 A 8 9 208905 CASAVA_Build 4 70811846 5D TGTAGGTTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 2819 het 2819 ref 33 19 11 5 TTTTG 4 3 208906 CASAVA_Build 4 70812240 3D GTACCAGCAA CAT/--- GGTATTAATT 3070 het 3070 hom 28 9 11 8 CAT 1 0 208907 CASAVA_Build 4 70815913 2D TAATAAACTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 AT 7 6 208908 CASAVA_Build 4 70817482 1D CAGAGCTAAT G/- GGTAGCAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 G 3 2 208909 CASAVA_Build 4 70822449 1I TCTGATTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 16 12 16 A 15 16 208910 CASAVA_Build 4 70822760 3D ATGCTTCAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 1125 het 754 hom 39 8 4 28 T 19 16 208911 CASAVA_Build 4 70823631 1I AAGTAATGCG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 9 10 208912 CASAVA_Build 4 70825862 4D AAAATCTATC TATT/---- GGTAATGAGG 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 TATT 1 0 208913 CASAVA_Build 4 70832007 1I GATTCTAAAA -/T TTTGTAGACT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 3 4 208914 CASAVA_Build 4 70838770 1D CTCCTTGGGC A/- GAAAGAATCT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 1 0 208915 CASAVA_Build 4 70843255 1D CATGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 13 12 208916 CASAVA_Build 4 70846157 2D CAATTGTGTG TT/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 3 1 208917 CASAVA_Build 4 70846752 1D GTTTACTAAG T/- TTTCTAGTGG 3070 het 3070 ref 36 16 17 4 T 4 3 208918 CASAVA_Build 4 70848048 17D TAACATTCAT GGCATTTTCCCTTTAGA/----------------- GGCAGTACTG 3070 het 3070 ref 39 24 15 6 GGCATTTTCCCTTTAGA 1 0 208919 CASAVA_Build 4 70850022 3I GAATGTTTGT ---/ACC GCCCTCTACA 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 ACC 0 1 208920 CASAVA_Build 4 70851211 1I CTAACTGTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 11 12 208921 CASAVA_Build 4 70865669 1I AAGATTAATT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 41 het 17 0 14 3 A 7 8 208922 CASAVA_Build 4 70865803 12I CTATATGTCA ------------/TTGCAATTTTTT TTACCAAATT 3070 het 2331 hom 15 6 7 2 TTGCAATTTTTT 0 1 208923 CASAVA_Build 4 70881890 1I TGGTACCTGT -/G GCCTGCAGGC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 G 1 2 208924 CASAVA_Build 4 70900787 3D AGAGTGACTT GAA/--- GAAACACCAC 3070 het 3070 hom 52 25 24 3 GAA 2 1 208925 CASAVA_Build 4 70901454 2I CTTCTGAGAT --/AA AGTCTCTGTC 3070 het 3070 ref 45 21 22 2 A 1 3 208926 CASAVA_Build 4 70905887 2I TTTACCCTTC --/AA AGTCAGACAT 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 1 3 208927 CASAVA_Build 4 70907990 1D AATTTCTAGG A/- AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 7 6 208928 CASAVA_Build 4 70910005 8I AGATGTCTTG --------/TTGTATCC TTGTCTCAGT 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 TTGTATCC 0 1 208929 CASAVA_Build 4 70914752 1I TGAAGCTTAG -/T TTCACTGAAT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 2 3 208930 CASAVA_Build 4 70980270 2D ATGTATATAC AT/-- ATATATATAT 2357 het 1865 hom 15 6 7 3 AT 8 7 208931 CASAVA_Build 4 70998535 1D GCCCACTCTC A/- ACCACTGGTG 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 2 1 208932 CASAVA_Build 4 71002818 1D AGCATGGCAT A/- AAAACAAAGA 3070 het 2951 hom 18 6 11 1 A 5 4 208933 CASAVA_Build 4 71007675 2D ATTCTAAATA AC/-- ACACTGCATT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 AC 3 2 208934 CASAVA_Build 4 71007787 1D TTTTTAGCAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 8 7 208935 CASAVA_Build 4 71011053 3I ATGTTTTCTT ---/TTC TGTGTAATGA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 TTC 0 1 208936 CASAVA_Build 4 71029834 1I GCCCAAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 10 11 208937 CASAVA_Build 4 71035800 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 9 10 208938 CASAVA_Build 4 71039432 10D TAAACTTTTC AATTTGTTTT/---------- TTCCCCTTAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 AATTTGTTTT 1 0 208939 CASAVA_Build 4 71039996 4D ATTCATTCAA TTAT/---- TTATTTAAGA 3070 het 3070 ref 22 13 8 4 TTAT 2 1 208940 CASAVA_Build 4 71043118 1I TATCTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 28 1 13 14 A 13 14 208941 CASAVA_Build 4 71043980 2I CAAAAAAAAA --/AT TTGCTTATTT 3070 het 3070 ref 33 12 14 7 AT 0 1 208942 CASAVA_Build 4 71045710 1D TAAAAAAGCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 13 16 14 A 10 9 208943 CASAVA_Build 4 71046201 1D TAGTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 12 11 208944 CASAVA_Build 4 71049068 3I ACATATTATT ---/TTA TTATTACATT 3070 het 1863 hom 15 4 10 1 TTA 2 3 208945 CASAVA_Build 4 71050012 1I GGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 A 9 10 208946 CASAVA_Build 4 71052836 1D AGCAAAGAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 9 8 208947 CASAVA_Build 4 71057179 1D TTATTTTGAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 9 8 208948 CASAVA_Build 4 71058600 4I CAGGACAAAT ----/ACAA ACAATCAACT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 ACAA 1 2 208949 CASAVA_Build 4 71060330 1D GCATATCCTC T/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 T 5 4 208950 CASAVA_Build 4 71061052 1D GTTTTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 11 10 208951 CASAVA_Build 4 71062834 1I TATTCTGTAG -/T CATTTGTATT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 0 1 208952 CASAVA_Build 4 71064191 2D ATGCAGCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 2845 het 2845 ref 34 14 10 10 T 14 12 208953 CASAVA_Build 4 71068638 1D TAATACTGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2722 hom 20 6 12 2 A 9 8 208954 CASAVA_Build 4 71069409 1I TCCAAGATTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 66 het 36 0 23 13 A 8 9 208955 CASAVA_Build 4 71069458 1D TTACATAAAT A/- AAACCATAAA 3070 het 3070 ref 28 11 8 9 A 4 3 208956 CASAVA_Build 4 71069672 2D GAACTAACAC TT/-- ATATAATTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 T 2 0 208957 CASAVA_Build 4 71070798 3I ACAGTCAAGG ---/TTA TTATTTTTCC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TTA 1 2 208958 CASAVA_Build 4 71082856 1I TACAAAGCAC -/T TCTTTCTAGG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 1 2 208959 CASAVA_Build 4 71084172 4I GGATTGCATT ----/GACA GAAGTTGTTG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 GACA 0 1 208960 CASAVA_Build 4 71084339 2I AATTAGCCGC --/AG AAACATTTAG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AG 0 1 208961 CASAVA_Build 4 71107857 1I GAACTCATCC -/T TTTTTATGGC 2089 het 2089 ref 18 12 6 0 T 5 6 208962 CASAVA_Build 4 71122174 1D TTAAGGACAA T/- CATGTGCTGA 2744 het 2723 hom 18 8 7 3 T 1 0 208963 CASAVA_Build 4 71126242 1D AAATTTGGAG A/- AAAAAACCAC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 7 6 208964 CASAVA_Build 4 71134093 1I TGATTGCCAG -/A AAAAACTTGC 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 5 6 208965 CASAVA_Build 4 71136814 2D ACAAAAAAAG AC/-- ACAAAAACAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 2 AC 2 1 208966 CASAVA_Build 4 71137484 1D TTTAACGATG T/- TTATTTTCAT 3070 het 3070 hom 39 16 19 6 T 3 2 208967 CASAVA_Build 4 71142042 1D AATTTAATAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 9 8 208968 CASAVA_Build 4 71142491 4D TTCTTCTATA TTTC/---- TTTATAAACA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TTTC 1 0 208969 CASAVA_Build 4 71148069 1D ATTTAAGTAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 9 8 208970 CASAVA_Build 4 71153542 2I AAGTATAATT --/AA AAAAAAAAAG 2867 het 2867 ref 20 12 7 1 A 9 11 208971 CASAVA_Build 4 71171273 1D TTTATATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 30 0 19 12 A 11 10 208972 CASAVA_Build 4 71198323 1D CACTGTGGTC A/- AAAAAAAAAA 2155 het 2155 ref 43 27 5 11 A 15 14 208973 CASAVA_Build 4 71204032 18D CTTGTTTCAT TAGACTTGACTATTGTAA/------------------ TAGACTTGAC 3070 het 3070 ref 30 13 12 16 TAGACTTGACTATTGTAA 2 1 208974 CASAVA_Build 4 71209799 1I GGGTGGGGGT -/A GGGGGTAGGG 3035 hom 18 het 7 0 7 0 A 0 1 208975 CASAVA_Build 4 71210718 1D CATCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 26 1 14 11 A 12 11 208976 CASAVA_Build 4 71213749 3D AAAAGCTTGT TAG/--- TAGTGTAAGT 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TAG 2 1 208977 CASAVA_Build 4 71217567 1D AAGAAAATGT C/- CCAGAAGGAT 3070 het 3070 hom 48 19 22 8 C 3 2 208978 CASAVA_Build 4 71224133 1D TCTTTGCACC A/- GTGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 27 1 A 1 0 208979 CASAVA_Build 4 71226530 1I AACATCTGTC -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 7 8 208980 CASAVA_Build 4 71237135 1I TCTTGGCACA -/T TGTTAGATAC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 1 2 208981 CASAVA_Build 4 71243392 1I TTGCAAGCTG -/T GAAAAGGGGA 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 T 0 1 208982 CASAVA_Build 4 71243712 2I GAAAGAGTTC --/TG TGTTACATTC 3070 het 3070 ref 44 25 12 7 TG 1 2 208983 CASAVA_Build 4 71244859 1D AGCTGTGGAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 A 9 8 208984 CASAVA_Build 4 71245283 3D TAACAAACAA GGG/--- CATTTTCATG 3070 het 3070 ref 33 17 14 4 G 3 0 208985 CASAVA_Build 4 71245965 1D GAGAAAAGAG C/- CCATTAATGT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 C 3 2 208986 CASAVA_Build 4 71247865 3I CATTTACCTT ---/ATC ATTACAACAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 ATC 0 1 208987 CASAVA_Build 4 71248060 2I GTTGAGGATG --/AT ATTTCCATAA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 AT 1 2 208988 CASAVA_Build 4 71250156 7D CCTTATACAT GTTGATG/------- GTTGATGGTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 8 GTTGATG 2 1 208989 CASAVA_Build 4 71250492 3I AAAAAAAAAA ---/AAC CAAAAAAAGT 3070 hom 64 het 33 0 19 14 AAC 0 1 208990 CASAVA_Build 4 71250584 1D AAAAAAAAAA C/- ATTCCAAACC 3070 het 3070 hom 38 13 20 9 C 1 0 208991 CASAVA_Build 4 71258565 1D CTCTCAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3013 hom 27 10 15 2 A 13 12 208992 CASAVA_Build 4 71264812 2I CAGATATTAC --/AG TTGCAGAAAG 3070 hom 132 het 47 0 44 3 AG 0 1 208993 CASAVA_Build 4 71266622 1D GAAGCCCCTA T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 84 het 36 0 26 10 T 8 7 208994 CASAVA_Build 4 71269429 7D GTTAAAAAAT GGGAAAA/------- GATCAGGGTG 3070 het 3070 ref 49 26 23 2 GGGAAAA 1 0 208995 CASAVA_Build 4 71269784 1I ATCTAGCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 10 11 208996 CASAVA_Build 4 71270103 2D AGTGGTAGTC TT/-- TTAAAAATGT 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 T 4 2 208997 CASAVA_Build 4 71271445 1I AACCAGCCGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 14 hom 52 2 46 4 A 9 10 208998 CASAVA_Build 4 71271545 1D ATATCACAAC A/- ATGAGAGCTG 3070 het 3070 ref 49 23 21 6 A 2 1 208999 CASAVA_Build 4 71272030 1I TTGCTTTTCC -/A AGTCCCTTTG 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 A 1 2 209000 CASAVA_Build 4 71272257 1I ATTTTATCCA -/C CCCATCTCCT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 C 3 4 209001 CASAVA_Build 4 71281755 9D GGGAAGGAGA GAGGGGAGG/--------- GAGGGGAGGG 1710 het 230 hom 8 2 4 7 GAGGGGAGG 3 2 209002 CASAVA_Build 4 71282913 2D CCTGCGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 2999 het 2999 ref 32 13 8 12 TG 7 6 209003 CASAVA_Build 4 71284322 1I GGGTGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 10 11 209004 CASAVA_Build 4 71285046 2D ATAACCACAC AT/-- GTCTGATGGC 3070 het 3070 ref 33 21 8 6 AT 1 0 209005 CASAVA_Build 4 71286748 2I GTGTATATGT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 11 12 11 AC 8 9 209006 CASAVA_Build 4 71288580 2I TTTTCAGCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 15 5 T 10 12 209007 CASAVA_Build 4 71297859 1I AGTTGGAAGG -/A AAAAAACTAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 6 7 209008 CASAVA_Build 4 71306216 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 A 10 11 209009 CASAVA_Build 4 71316807 4D GGTACTTTTC TCTG/---- TCTGAGTAGC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TCTG 2 1 209010 CASAVA_Build 4 71317939 1D CTTCTTGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 24 14 11 A 10 9 209011 CASAVA_Build 4 71343630 1I AATTTACCTT -/A AAAAAAAAAA 2952 het 2952 ref 40 21 11 8 A 10 11 209012 CASAVA_Build 4 71351305 1I TGTCTCTGAG -/C CTGGTTCACC 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 C 1 2 209013 CASAVA_Build 4 71352866 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 A 10 9 209014 CASAVA_Build 4 71358546 1D TGATTGATCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 A 10 9 209015 CASAVA_Build 4 71363114 1D CCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 11 10 209016 CASAVA_Build 4 71363475 3D CTCACAACTT TAG/--- TAATACCAGA 3070 het 337 hom 29 2 12 15 TAG 1 0 209017 CASAVA_Build 4 71363506 1I TTCAAACCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2806 hom 30 7 15 8 A 9 10 209018 CASAVA_Build 4 71373750 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2450 hom 25 11 12 2 A 14 11 209019 CASAVA_Build 4 71378363 3D ACTGCCAATC ATA/--- ATAACTAATC 3070 het 3070 ref 36 23 11 4 ATA 2 1 209020 CASAVA_Build 4 71379147 1D GGATCTCCTC A/- GAGATTCCTG 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 1 0 209021 CASAVA_Build 4 71380911 1D GACATTTGAC A/- AAAGAAAACT 3070 het 3070 ref 54 25 21 9 A 4 3 209022 CASAVA_Build 4 71382454 4D AGAAAGTCCT TAGA/---- TAAAGAGAGA 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 TAGA 1 0 209023 CASAVA_Build 4 71383033 3D GAAATGTATT CAA/--- CAATGGAATA 3070 het 3070 ref 49 27 21 1 CAA 2 1 209024 CASAVA_Build 4 71385759 1D TATTTTTTTT A/- AAAAACTATA 3070 het 3005 hom 18 8 10 0 A 6 5 209025 CASAVA_Build 4 71389395 1D ATCATGACTC A/- AAAAAAATCA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 8 7 209026 CASAVA_Build 4 71394296 33I TGCAGAATAC ---------------------------------/TAAGGAGGGTGATCCCTAGCCCTCCAAAGTCAT TAGTTTCAAA 3070 het 3070 hom 25 13 11 3 TAAGGAGGGTGATCCCTAGCCCTCCAAAGTCAT 0 1 209027 CASAVA_Build 4 71398233 2I ACTTAAGATG --/AC TCAGGCCAGG 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 AC 0 1 209028 CASAVA_Build 4 71399569 1D AGCAATCTAC A/- AATTCAATGC 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 3 2 209029 CASAVA_Build 4 71399972 1D CTCACCTTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 A 9 8 209030 CASAVA_Build 4 71402506 6I ATATTAATAT ------/TAATAC TAAATGTTAA 1930 het 1930 ref 16 12 4 0 TAATAC 0 1 209031 CASAVA_Build 4 71405890 4I CATTTTTTTA ----/CTTT CTAACTGTAT 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 CTTT 0 1 209032 CASAVA_Build 4 71413520 1D AGTCACCTTT A/- AAAAAAGTCT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 7 6 209033 CASAVA_Build 4 71414217 1I ACCCAAGCTT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 0 1 209034 CASAVA_Build 4 71415326 7I TCAAAATGCA -------/ATATGGC TCTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 52 19 30 3 ATATGGC 0 1 209035 CASAVA_Build 4 71417276 2I CATGAAAGAC --/TG AAGAAATATA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 TG 0 1 209036 CASAVA_Build 4 71417560 2I TCTTCATAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 10 12 209037 CASAVA_Build 4 71417850 1D ACTCTATAGG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 7 209038 CASAVA_Build 4 71419819 4D ATAACAGAAT AAAA/---- GAAAGCATAC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 4 0 209039 CASAVA_Build 4 71420317 1D ATGAAGTTAA T/- TTTTTTATAA 927 het 927 ref 16 11 2 3 T 7 6 209040 CASAVA_Build 4 71421722 2I GAAAGAAAAG --/AA AAAAAAAATT 2037 het 1429 hom 14 3 5 6 A 8 10 209041 CASAVA_Build 4 71422507 1D CATCTATTAG A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 A 7 6 209042 CASAVA_Build 4 71422640 1I ACCGATGTGG -/C CAGGCATGGC 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 C 1 2 209043 CASAVA_Build 4 71424965 2D TTAACAGGGG AA/-- AAGTTAGCAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 A 4 2 209044 CASAVA_Build 4 71428534 1I CTAAATCTCT -/C TGGGACTAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 209045 CASAVA_Build 4 71430298 1I CAGATCCTTT -/A ACATATGTTG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 1 2 209046 CASAVA_Build 4 71434756 17I CAAAGCCAGG -----------------/ACCATCAAAGACCATCC GTGTCTTCCA 3070 het 3070 ref 38 23 11 6 ACCATCAAAGACCATCC 0 1 209047 CASAVA_Build 4 71438723 1D CTTTATTCTT A/- AAATATCTTT 3070 het 3070 hom 28 7 19 3 A 4 3 209048 CASAVA_Build 4 71440222 1D GAAAAAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 32 1 25 6 T 12 11 209049 CASAVA_Build 4 71440997 1D TCCTTTTATT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 A 8 7 209050 CASAVA_Build 4 71444466 3I AGAATTTAGT ---/TAA TAATAATGTA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 TAA 2 3 209051 CASAVA_Build 4 71452889 1I GAAAACCAAG -/C AAAAAAGAAA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 0 1 209052 CASAVA_Build 4 71458259 1D AATAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 988 hom 27 4 15 8 A 11 10 209053 CASAVA_Build 4 71497671 4D CCATACTCAC AAAT/---- AGTTTATTTT 3070 het 2429 hom 24 8 14 3 AAAT 1 0 209054 CASAVA_Build 4 71503034 3D GTTCACTTTT TTA/--- TTTTTATTTG 3070 het 3070 hom 31 10 16 7 TTA 1 0 209055 CASAVA_Build 4 71516825 1D CAAAATAGAC A/- AAACTCCCTG 3070 hom 117 het 43 0 39 5 A 4 3 209056 CASAVA_Build 4 71526560 1D GGCATTTCAC T/- TTTTTTTTTT 1231 het 1231 ref 41 30 4 7 T 11 10 209057 CASAVA_Build 4 71760655 1D GTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 26 1 18 7 T 14 13 209058 CASAVA_Build 4 71776681 2D AAGAACAGAC TG/-- TAGTTAGACT 1966 het 1966 ref 29 19 5 5 TG 1 0 209059 CASAVA_Build 4 71784861 1I GTATCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 1831 het 1831 ref 26 10 6 10 T 15 16 209060 CASAVA_Build 4 71785059 1D TAGTAGAGAT G/- GGCGGTTTCA 3070 hom 66 het 24 0 19 5 G 3 2 209061 CASAVA_Build 4 71805128 1I ATTATTAGCA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 7 8 209062 CASAVA_Build 4 71806663 1D CAGCTCAGGA T/- TTTTTTTTTA 1138 het 1138 ref 31 20 3 9 T 10 9 209063 CASAVA_Build 4 71817919 3D AAATATATCT TAA/--- TAATACGTAG 3070 het 3070 ref 25 17 8 1 TAA 2 1 209064 CASAVA_Build 4 71832081 1I AGGTGTGTGC -/A AAAAAAAAAA 2894 het 2367 hom 40 10 14 16 A 13 14 209065 CASAVA_Build 4 71834105 1D ATCAAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 599 hom 32 4 14 14 T 15 14 209066 CASAVA_Build 4 71872664 1I TCAGGAATTC -/A ACACCAGCCT 3070 hom 59 het 21 0 18 3 A 1 2 209067 CASAVA_Build 4 71875685 1I8M9D GCAAACAGAA -AGAGAATAATGACTTAT/TACTAAATA--------- CTCTTTGAGT 3070 het 3070 hom 50 28 31 3 N/A 0 0 209068 CASAVA_Build 4 71885745 1D CTATGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 1565 het 1565 ref 31 13 7 12 A 18 17 209069 CASAVA_Build 4 71895255 1I CAATAAGTAC -/A AGAAAAGCTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 2 209070 CASAVA_Build 4 71897224 1I TAAAACTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 10 11 209071 CASAVA_Build 4 71906008 4I CCGTCTCAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 14 het 19 1 15 3 AAAT 3 4 209072 CASAVA_Build 4 71908063 1D CAGAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2901 het 481 hom 12 1 7 4 T 13 12 209073 CASAVA_Build 4 71913124 4I CACAGGAGGG ----/GACT GACTATCTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 GACT 1 2 209074 CASAVA_Build 4 71922909 1I AATTTCATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 9 10 209075 CASAVA_Build 4 71929857 2D TCTTAGGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 1304 het 1076 hom 23 6 6 11 T 16 14 209076 CASAVA_Build 4 71938736 1I TACGGGGAAA -/G TTTGAGTGGT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 0 1 209077 CASAVA_Build 4 71941362 1I ATTTGTGAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 9 10 209078 CASAVA_Build 4 71952315 2D GTCTCCCAAA GT/-- GTGCTGGGAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 GT 2 1 209079 CASAVA_Build 4 71955159 1D CACTGATCTC T/- TTTTTTTTTT 2405 het 262 hom 28 4 8 16 T 19 18 209080 CASAVA_Build 4 71960144 1D AATTTGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 T 11 10 209081 CASAVA_Build 4 71961076 1D GCCGAGATGG C/- CGCCACTGCA 3070 hom 33 het 17 0 12 5 C 2 1 209082 CASAVA_Build 4 71975599 2I ATGAGTTTGA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 9 11 209083 CASAVA_Build 4 71976677 4I CTACATGAGT ----/TAGA TAGAACTGGG 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TAGA 1 2 209084 CASAVA_Build 4 71977698 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 25 4 A 12 10 209085 CASAVA_Build 4 71978866 4D TCCTGTAGCC TTTT/---- TTTTGAGACG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 8 4 209086 CASAVA_Build 4 71979510 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 237 hom 39 1 35 3 A 11 10 209087 CASAVA_Build 4 71983786 2I ACATATACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 24 hom 33 1 19 13 AC 7 8 209088 CASAVA_Build 4 71996479 1D TAAGGCCATC T/- TTTTTTTTTT 1726 het 1726 ref 34 12 7 15 T 17 16 209089 CASAVA_Build 4 71998500 1I GAATTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 11 12 209090 CASAVA_Build 4 72011585 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 21 2 16 3 A 13 14 209091 CASAVA_Build 4 72023292 8D GTCACTAATT CCTAAATC/-------- CCTAAATCTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CCTAAATC 2 1 209092 CASAVA_Build 4 72025258 1D AGGGCATTAA T/- TTTTTTTTTT 2148 het 2148 ref 27 15 6 6 T 17 16 209093 CASAVA_Build 4 72027439 5D TGAAAGACTC AAAAT/----- AAAGAACTGG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AAAAT 1 0 209094 CASAVA_Build 4 72080786 1D ACAGAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 26 2 12 12 A 15 14 209095 CASAVA_Build 4 72099174 1D TGCAATCGAA C/- CTAGAACTCA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 2 1 209096 CASAVA_Build 4 72099718 12D AGAATACTAT AAACACCTCTAC/------------ AAACACCTCT 3070 hom 20 het 8 0 7 1 AAACACCTCTAC 2 1 209097 CASAVA_Build 4 72104364 1I ATACCTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 9 10 209098 CASAVA_Build 4 72113186 4I ACAATATTTC ----/TTTT TTTTTTTTCT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 8 12 209099 CASAVA_Build 4 72116683 7I GCCTGTCTCG -------/CTACCCT TCAATCTCCC 2825 hom 18 het 7 0 7 0 CTACCCT 0 1 209100 CASAVA_Build 4 72132865 1I CCGGGAGGTG -/T TTTTTTTGAA 2858 het 2858 ref 20 10 7 3 T 7 8 209101 CASAVA_Build 4 72144825 2I CTTGATACTC --/TT AACACCAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 0 2 209102 CASAVA_Build 4 72151711 1I ACATGCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 10 11 209103 CASAVA_Build 4 72166919 1D AAATAACTGT C/- CCCCCCACCA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 C 7 6 209104 CASAVA_Build 4 72179013 1D ATTATAAATA G/- GCCTCCTGCT 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 G 2 1 209105 CASAVA_Build 4 72179394 2D AAGGTCTCTC TG/-- TCTTCTCCTG 3070 het 3070 ref 46 28 17 4 TG 1 0 209106 CASAVA_Build 4 72192292 1D TTCTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 11 10 209107 CASAVA_Build 4 72192452 1D CCATGTCTAA T/- TTTTAATTTT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 5 4 209108 CASAVA_Build 4 72194009 1I GAGGGAGGTA -/C AACAATAATG 2991 het 2991 ref 34 14 8 12 C 0 1 209109 CASAVA_Build 4 72201525 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2262 het 941 hom 11 3 7 1 A 15 14 209110 CASAVA_Build 4 72249130 4D TGAAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AAAC 4 3 209111 CASAVA_Build 4 72279939 2D TCAGAATAAC AT/-- AAGTCAGTCT 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 AT 1 0 209112 CASAVA_Build 4 72283198 1D AGCCTGTAAT G/- GTCATGAACA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 G 2 1 209113 CASAVA_Build 4 72293192 1D GAAGCAAGCC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 9 8 209114 CASAVA_Build 4 72304371 3I GTGATTTTGA ---/GGG TTCATTACTT 3070 hom 117 het 45 0 38 7 G 0 3 209115 CASAVA_Build 4 72314657 1D TAGAATCATG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 23 12 5 A 9 8 209116 CASAVA_Build 4 72329355 1I TGGACCATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 701 hom 34 3 21 10 T 13 14 209117 CASAVA_Build 4 72331328 1I CTTTTGGCTG -/T TTTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 44 10 24 10 T 6 7 209118 CASAVA_Build 4 72334725 1I TTTTCTTAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 9 10 209119 CASAVA_Build 4 72359988 1D TACAATACTT C/- CTGAAAAGTT 3070 het 3070 hom 51 16 29 7 C 2 1 209120 CASAVA_Build 4 72361170 1D GATCTTCTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 14 12 6 T 9 8 209121 CASAVA_Build 4 72391163 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1234 het 1234 ref 23 15 4 4 A 11 12 209122 CASAVA_Build 4 72423148 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1583 het 1583 ref 41 25 4 12 T 14 13 209123 CASAVA_Build 4 72490904 1I GAGCCAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 36 0 26 10 T 10 11 209124 CASAVA_Build 4 72515800 2D TAAGGAAAAC AG/-- TATGTTTGAC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AG 1 0 209125 CASAVA_Build 4 72532901 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 906 hom 23 het 22 0 5 18 A 19 18 209126 CASAVA_Build 4 72536681 1D CACTGCAGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 88 het 32 0 30 2 T 9 8 209127 CASAVA_Build 4 72552476 2I TCCCATAGTC --/TT ATATTGTTAT 3070 hom 131 het 52 0 45 7 T 0 2 209128 CASAVA_Build 4 72553317 1D ATGCTCCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 910 hom 18 2 9 7 A 11 10 209129 CASAVA_Build 4 72568516 1D GATGTTGAGC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 9 8 209130 CASAVA_Build 4 72570161 1D CACAGATAAT A/- ATGCACATGT 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 A 2 1 209131 CASAVA_Build 4 72570328 1D GTTTTTCTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 26 11 3 T 8 7 209132 CASAVA_Build 4 72571252 1I GTTTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 10 11 209133 CASAVA_Build 4 72573633 4I AATGAGTTTT ----/AAAC AAATATGATT 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 AAAC 0 1 209134 CASAVA_Build 4 72574034 6D GGGATGGTAA TAGTAC/------ TTATCTCAAA 3070 het 3070 hom 48 18 28 4 TAGTAC 1 0 209135 CASAVA_Build 4 72575620 1D TATGATTTTT A/- TAGGGTATCT 3070 het 2823 hom 17 6 9 3 A 1 0 209136 CASAVA_Build 4 72578330 1D TCCTTTTCAT C/- CCCCTAACCA 3070 het 1849 hom 26 5 15 6 C 5 4 209137 CASAVA_Build 4 72578370 1D TAAACACCTC A/- AAAGTTTTTG 3070 het 2990 hom 26 8 10 8 A 4 3 209138 CASAVA_Build 4 72583656 1I TTGAGGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 10 11 209139 CASAVA_Build 4 72584305 9D TCTTCCAGAT AACATAATG/--------- TTATCCAAAT 3070 het 3070 ref 52 35 19 5 AACATAATG 1 0 209140 CASAVA_Build 4 72587823 1D TAGTTTGGTC T/- TTTTTTTTTT 1838 het 1838 ref 30 11 7 12 T 13 12 209141 CASAVA_Build 4 72589245 3D TGTGTTTCAT GGG/--- GGGGGGGGTG 2768 het 1493 hom 22 9 8 6 G 11 8 209142 CASAVA_Build 4 72593990 1I TAGGGAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 T 11 12 209143 CASAVA_Build 4 72602468 1D GGTGAGTGCA C/- CTGGCACCTG 3070 het 3070 ref 45 19 15 11 C 2 1 209144 CASAVA_Build 4 72604228 2I AAGAACATCA --/TT TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 8 10 209145 CASAVA_Build 4 72606620 5D CCTTTTCTAC CCTGT/----- CTATCAGGTA 3070 het 3070 ref 44 23 21 1 CCTGT 1 0 209146 CASAVA_Build 4 72614054 3I TGGCCAAATT ---/AGC AGCAGCCCCA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 AGC 2 3 209147 CASAVA_Build 4 72619168 1D TTTAAATCTG A/- AAAAAAAAAA 3016 het 3016 ref 28 12 7 9 A 12 11 209148 CASAVA_Build 4 72622011 2D TATACATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 57 het 27 0 20 8 TG 7 6 209149 CASAVA_Build 4 72622682 2I TTGTTGACTA --/AT ATATTTTTAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 AT 2 3 209150 CASAVA_Build 4 72625309 1D CATGAACATT A/- AATTATTTGT 3070 het 3070 ref 58 29 24 5 A 3 2 209151 CASAVA_Build 4 72628482 1I AAGTGTTACA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 7 8 209152 CASAVA_Build 4 72637435 6I TACTATTACT ------/ATGTAA ATGTAAATTA 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 ATGTAA 1 2 209153 CASAVA_Build 4 72644998 4I TTATATTCTC ----/TCTT TGGTTTTTTA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 TCTT 0 1 209154 CASAVA_Build 4 72647958 1D TCATGATTTT A/- TCTAGAGACG 3070 hom 90 het 38 0 31 8 A 1 0 209155 CASAVA_Build 4 72648815 4D TCACTGTCAC TGTT/---- TGTCTTCCTT 3070 het 3070 hom 45 18 25 2 TGTT 1 0 209156 CASAVA_Build 4 72650150 1I AAAGGGGAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 113 het 43 0 36 7 T 7 8 209157 CASAVA_Build 4 72650849 1I TCTGACTTCA -/T TTTTTCTCCA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 5 6 209158 CASAVA_Build 4 72652507 1D GACATTTGTT G/- TTAATGTCAT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 G 1 0 209159 CASAVA_Build 4 72654808 30D TGAAGCAACT TAACTCATCATTTCAGCCTCTGAGTAGAGG/------------------------------ TAAAACCTAT 3070 het 3070 hom 31 15 16 4 TAACTCATCATTTCAGCCTCTGAGTAGAGG 1 0 209160 CASAVA_Build 4 72657255 1I GGTGGGGGGA -/G GGGGGAACAA 3070 hom 93 het 36 0 28 8 G 5 6 209161 CASAVA_Build 4 72657959 1D TTTATTCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2341 hom 19 7 11 1 T 9 8 209162 CASAVA_Build 4 72662266 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 9 8 209163 CASAVA_Build 4 72681089 1D ATTTTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 29 1 25 3 T 11 10 209164 CASAVA_Build 4 72750599 1I CTATGAAGTT -/A AATGTTGCAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 2 3 209165 CASAVA_Build 4 72762228 2I CTGTTACACT --/AA GAGTCCTCGA 3070 het 3070 hom 47 17 22 8 A 0 2 209166 CASAVA_Build 4 72763335 6I TCTTTTCCTT ------/TTTTTC TTCTTCTTCT 3070 het 499 hom 41 7 17 17 TTTTTC 0 1 209167 CASAVA_Build 4 72777674 1I TATAAGTTGG -/C CCCCTGACGC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 C 4 5 209168 CASAVA_Build 4 72778202 4D GCAGACTCAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1582 hom 28 8 12 9 T 20 16 209169 CASAVA_Build 4 72779356 2I GTTAAAATTA --/AC TAGACAGGTA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 AC 0 1 209170 CASAVA_Build 4 72783770 1I GATTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 38 1 26 11 T 10 11 209171 CASAVA_Build 4 72789692 1I AATTTAAGCT -/C AATTCCCTGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 0 1 209172 CASAVA_Build 4 72792667 1D TAGGTAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 T 12 11 209173 CASAVA_Build 4 72792798 1D CTATTTTTGG A/- CTTTTCATTT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 1 0 209174 CASAVA_Build 4 72799472 1D AGCTGATTTC A/- AAAACATTTT 3070 het 3070 hom 29 13 16 0 A 5 4 209175 CASAVA_Build 4 72802284 1D CCATTACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2959 hom 26 10 9 7 T 11 10 209176 CASAVA_Build 4 72806680 1I GCAGAACAGC -/A AAGATTGCTG 3070 hom 123 het 43 0 40 3 A 2 3 209177 CASAVA_Build 4 72812090 2D ACATTACCAC AT/-- GTTACTGATT 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 AT 1 0 209178 CASAVA_Build 4 72831508 3D ACTGGAGGTG GGA/--- GGAGACCAAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 7 GGA 2 1 209179 CASAVA_Build 4 72835482 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAACG 3070 het 131 hom 30 3 15 12 A 10 8 209180 CASAVA_Build 4 72836422 1I AATTCGTAAT -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 A 6 7 209181 CASAVA_Build 4 72838066 1I CAAAGGAGGC -/A AAAAAAAAAA 2198 het 2198 ref 34 11 10 13 A 13 14 209182 CASAVA_Build 4 72840690 1D TAATGCTAAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 A 7 6 209183 CASAVA_Build 4 72842077 1I GAAAAATGGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 8 9 209184 CASAVA_Build 4 72842191 3I TAATGAAAAT ---/GAC GATCTGTATT 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 GAC 0 1 209185 CASAVA_Build 4 72844300 3D CAAGTCTTTT ACC/--- CCTATTTTAA 3070 het 3070 hom 34 17 15 3 ACC 1 0 209186 CASAVA_Build 4 72873267 2I AAGAAAAGAA --/AG AGAGAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AG 2 3 209187 CASAVA_Build 4 72884649 1D CTTCACTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 34 1 25 8 T 13 12 209188 CASAVA_Build 4 72886343 4D AGAGTAAATT TAAC/---- TAGCATATTT 3070 het 3070 hom 26 11 15 3 TAAC 1 0 209189 CASAVA_Build 4 72887572 1I AAACCATTAT -/A ATAATAAGTC 3070 hom 105 het 44 0 35 9 A 1 2 209190 CASAVA_Build 4 72916916 1D CCTCTTTTTT C/- CCCCCCCTTT 3070 hom 84 het 35 0 27 9 C 8 7 209191 CASAVA_Build 4 72934616 1I TATAAGTTTG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 7 8 209192 CASAVA_Build 4 72945458 2D TTTGTCCTAA AT/-- ATCCCTCTTT 3070 hom 126 het 44 0 43 2 AT 2 1 209193 CASAVA_Build 4 72947459 2D CTTATGTATA TG/-- TGTGTGTGTA 1218 hom 33 het 15 0 12 3 TG 5 4 209194 CASAVA_Build 4 72956420 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2799 het 319 hom 10 1 6 3 A 13 12 209195 CASAVA_Build 4 72964837 1D GACAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 34 0 25 9 A 12 11 209196 CASAVA_Build 4 72967202 2D ATATGCATTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 TA 7 6 209197 CASAVA_Build 4 72967898 5D TATGGGAATC TATTT/----- TATTTTATTT 3070 het 73 hom 19 2 14 4 TATTT 3 2 209198 CASAVA_Build 4 72976349 1D AGGTGGTTTT C/- CCCTCACAGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 4 3 209199 CASAVA_Build 4 72979670 1D TATTCCAAAC A/- ATAGAAAAAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 1 209200 CASAVA_Build 4 72984787 1I TCTTTGAAAG -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 7 8 209201 CASAVA_Build 4 72985192 3D GTGAAGTGAC TTT/--- TTTTTTTGTT 3070 hom 16 het 31 1 27 4 T 10 7 209202 CASAVA_Build 4 72986440 2D16M1D TGTGATCATT AAAAAAAAAAAAGCCCCCT/--AAAAAAAAAAGCCCCC- ATCCTACCTG 3070 hom 69 het 25 0 24 5 N/A 0 0 209203 CASAVA_Build 4 72989428 12I AATTAAGTAG ------------/TGCTTTTATCAA TGTTCATTGA 3070 hom 102 het 41 0 35 7 TGCTTTTATCAA 0 1 209204 CASAVA_Build 4 73008926 13D GGTGGGGTTG GAGCCCTCACTCA/------------- GAGCCCCCAT 3070 hom 78 het 27 0 26 2 GAGCCCTCACTCA 1 0 209205 CASAVA_Build 4 73010378 3D AAGCCAGTAA CTT/--- CTTTATAAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CTT 2 1 209206 CASAVA_Build 4 73017835 1D TGAGACAGAG C/- CTGCAGTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 C 2 1 209207 CASAVA_Build 4 73046292 2I AGCTATATTC --/CT ACATTTTCTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CT 0 1 209208 CASAVA_Build 4 73048033 3D AATTATTTTC AAT/--- AATAACACTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAT 2 1 209209 CASAVA_Build 4 73051714 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 706 hom 22 2 17 3 A 12 13 209210 CASAVA_Build 4 73053981 1D TGGTAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 46 3 22 21 T 17 16 209211 CASAVA_Build 4 73057311 4I CTTGGTTTAC ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TTGT 2 3 209212 CASAVA_Build 4 73057449 6D GAATAGCTTG GACCAC/------ AGGTGCGTGC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 GACCAC 1 0 209213 CASAVA_Build 4 73059008 41I CCTAAGATAT -----------------------------------------/AATAGACTATTCCCCCTTATCCATGGGAGATACATTCCAAC AACCCCAGTG 3070 hom 78 het 29 0 27 7 AATAGACTATTCCCCCTTATCCATGGGAGATACATTCCAAC 0 1 209214 CASAVA_Build 4 73059629 1I CAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 8 9 209215 CASAVA_Build 4 73060640 1D CCATGAAGCT C/- TGTCCACTAA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 C 1 0 209216 CASAVA_Build 4 73070386 2D TAGTGCCCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 24 0 17 7 T 17 15 209217 CASAVA_Build 4 73080012 6D GACAGTTTTA TCTTTG/------ TCTTTGTCTC 3070 hom 76 het 31 0 26 8 TCTTTG 2 1 209218 CASAVA_Build 4 73087658 1D AAAGGCCCAG A/- AAAAACAATG 3070 hom 129 het 46 0 40 6 A 6 5 209219 CASAVA_Build 4 73092956 1I GAATTGGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 44 0 31 13 T 11 12 209220 CASAVA_Build 4 73103296 1D TGCTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 16 7 T 13 12 209221 CASAVA_Build 4 73107715 4I GAAGTTAAAA ----/TTTC TTTCTCATTC 3070 hom 135 het 48 0 45 3 TTTC 1 2 209222 CASAVA_Build 4 73108013 2D ATCTCTGAGG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 99 het 46 0 34 12 AC 8 7 209223 CASAVA_Build 4 73108586 6I TAAGCTAAAT ------/TATTGG TATGTCAGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TATTGG 0 1 209224 CASAVA_Build 4 73110317 1I AAAATCTTCC -/A CTAAAATTGG 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 0 1 209225 CASAVA_Build 4 73110564 5D TTAAGGAAAA TAGTT/----- TAAGGAATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TAGTT 1 0 209226 CASAVA_Build 4 73110945 1D AACCAGTACC T/- TCTGGCCTCT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 2 1 209227 CASAVA_Build 4 73118029 1D TTGTAATAAT A/- AAAAAATGTG 3070 hom 178 het 61 0 60 2 A 7 6 209228 CASAVA_Build 4 73120079 1I CATAGTTTAG -/C CCCCCCCTAA 3070 hom 95 het 34 0 30 4 C 7 8 209229 CASAVA_Build 4 73123105 1D ATCATTCCTG T/- TTTTTAATTC 3070 hom 105 het 46 0 42 4 T 6 5 209230 CASAVA_Build 4 73127857 2I TGTGGAGAAC --/CT CTGCTAGGGT 3070 hom 102 het 35 0 32 3 CT 1 2 209231 CASAVA_Build 4 73129332 1I GATTATTATT -/A TTTTTTTCTG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 0 1 209232 CASAVA_Build 4 73130325 8D ATGCTGTACT GAAAAGAG/-------- AAAAAATAAT 3070 hom 144 het 49 0 49 3 GAAAAGAG 1 0 209233 CASAVA_Build 4 73131760 1D GTAAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 20 7 A 12 11 209234 CASAVA_Build 4 73133322 4I TAACTTATCT ----/TATC TTTTTTTTCA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TATC 0 1 209235 CASAVA_Build 4 73139880 3I GTAATTCTTG ---/TAA TGATAATAAA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TAA 0 1 209236 CASAVA_Build 4 73141768 3D CCACTTGGCA ATC/--- ATCATCATCA 3070 hom 93 het 41 0 32 10 ATC 6 5 209237 CASAVA_Build 4 73142979 1I AATAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 34 2 29 3 A 11 12 209238 CASAVA_Build 4 73146660 1I TGGTACTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 40 1 31 8 T 11 12 209239 CASAVA_Build 4 73147524 5D GACTTTTGAG AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AAAAC 3 2 209240 CASAVA_Build 4 73150092 4D GAAACTCCTG ATCA/---- TATGTTAGTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATCA 1 0 209241 CASAVA_Build 4 73151186 1I41M1D TTCCAAAATA -GGTGGTGGGATGGGCACAAGTTAGATGTTTCTGTTCCAAAAG/TGGTGGTGGGATGGGCACAAGTTAGATGTTTCTGTTCCAAAA- GGAGAAACAG 3070 hom 129 het 33 0 44 7 N/A 0 0 209242 CASAVA_Build 4 73151631 1D ATGAGCAACA G/- TCCTCTCCCT 3070 hom 78 het 33 0 26 8 G 1 0 209243 CASAVA_Build 4 73152208 1D CCTTCTTCAG T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 7 209244 CASAVA_Build 4 73153443 1I TTATCTTATC -/T TTTTTTCCTG 3070 het 20 hom 29 1 23 5 T 6 7 209245 CASAVA_Build 4 73158574 31D GGCATAGAGT GGTTTCACTTTCCATGGGTTTCACTTTCCAG/------------------------------- GGTTTCACTT 3070 hom 111 het 38 0 38 5 GGTTTCACTTTCCATGGGTTTCACTTTCCAG 1 0 209246 CASAVA_Build 4 73159486 1I CTTTAACTTT -/A AAAAGATTAT 3070 hom 48 het 20 0 17 6 A 4 5 209247 CASAVA_Build 4 73159551 1I AAAGAGACAA -/T TATAAATATG 3070 hom 57 het 21 0 20 2 T 1 2 209248 CASAVA_Build 4 73160761 1D TGTTATGGAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 9 8 209249 CASAVA_Build 4 73166073 1I TTAAGAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 793 hom 28 2 17 9 T 14 15 209250 CASAVA_Build 4 73168100 1D TTTTTGAAAT A/- ACTTTATTGG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 2 1 209251 CASAVA_Build 4 73169637 1I TAATGTGCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 9 10 209252 CASAVA_Build 4 73172143 3D GTGTAGGTAA TCT/--- TCTTCAGTTG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TCT 2 1 209253 CASAVA_Build 4 73182558 1D ACACCACAAA T/- TTTTTCTCTA 3070 hom 160 het 56 0 54 2 T 6 5 209254 CASAVA_Build 4 73183044 1D ATATTATGAG T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 78 het 33 0 27 7 T 8 7 209255 CASAVA_Build 4 73188071 1I AATAAATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 10 209256 CASAVA_Build 4 73203673 1D TGGTATAGCT A/- AAAAAATTTG 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 A 7 6 209257 CASAVA_Build 4 73234098 1I TTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 706 hom 29 2 22 5 T 11 12 209258 CASAVA_Build 4 73275477 4I TATTTTAGCT ----/AACA AACAAAGCAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AACA 1 2 209259 CASAVA_Build 4 73281686 1I TTTGTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 1198 het 1198 ref 30 18 4 8 T 11 12 209260 CASAVA_Build 4 73289702 1D CTCTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 1536 het 1536 ref 33 24 4 6 A 11 10 209261 CASAVA_Build 4 73366397 1I TACTATCAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 8 9 209262 CASAVA_Build 4 73369026 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2714 het 110 hom 14 2 8 4 A 17 16 209263 CASAVA_Build 4 73386885 1D AAATGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 32 1 28 3 A 13 12 209264 CASAVA_Build 4 73395933 1D ACATTTGACA T/- TTTTTTTTTA 1402 het 1402 ref 41 31 4 6 T 10 9 209265 CASAVA_Build 4 73413277 1D TTGCAAATAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 9 8 209266 CASAVA_Build 4 73446589 2D AAAATTATAT AA/-- GTTATCTCCT 3070 hom 138 het 54 0 46 8 A 2 0 209267 CASAVA_Build 4 73446746 1I CTTTCTACTA -/G ATTGTTAAGT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 0 1 209268 CASAVA_Build 4 73464019 1D AAACAGTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 827 hom 27 2 15 10 A 16 15 209269 CASAVA_Build 4 73474493 24D ATATTTTTCT AATGATAAGGAGAGAGAGAAGGAA/------------------------ AAGAAGAGAT 3070 het 3070 ref 35 25 13 2 AATGATAAGGAGAGAGAGAAGGAA 1 0 209270 CASAVA_Build 4 73478852 1I AACAGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 10 11 209271 CASAVA_Build 4 73488045 1I TATTAGATGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 8 9 209272 CASAVA_Build 4 73492448 2D GAATATGCTG TA/-- TATAGTTGGT 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 TA 3 2 209273 CASAVA_Build 4 73494145 1D TCTTTATTGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 A 9 8 209274 CASAVA_Build 4 73494567 4I TTGCTACTTG ----/ATCT ATCTTAGTAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 ATCT 1 2 209275 CASAVA_Build 4 73495384 1D AATTAAAGAG T/- TTCAAAATGT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 3 2 209276 CASAVA_Build 4 73498521 1D AAATAATTTT A/- GGGGAAGTTA 3070 het 2839 hom 25 8 12 5 A 1 0 209277 CASAVA_Build 4 73498968 1I ACAAGTGGCA -/T TATTATTTTC 2936 het 2936 ref 29 20 8 1 T 1 2 209278 CASAVA_Build 4 73499711 4D TAACTATCAA TAAT/---- TAATTCATAT 3070 het 3070 ref 39 21 18 0 TAAT 2 1 209279 CASAVA_Build 4 73500183 2D ACTTTAATAT TA/-- TATATATATA 1913 het 1913 ref 22 17 4 1 TA 6 5 209280 CASAVA_Build 4 73509280 1D GTCTTGGGGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 8 7 209281 CASAVA_Build 4 73512625 1D CTGAACACCT A/- AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 A 7 6 209282 CASAVA_Build 4 73515409 1I CAAAATCATT -/A AAAAAAAAAA 2984 het 2984 ref 29 11 12 6 A 13 14 209283 CASAVA_Build 4 73518966 16D CTAAGACATG AACTCGTGTCTTTTAA/---------------- CTCTTAACTG 3070 het 3070 ref 33 19 16 5 AACTCGTGTCTTTTAA 1 0 209284 CASAVA_Build 4 73538573 1I ACTGGATAGA -/T TTTTGACTGT 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 T 4 5 209285 CASAVA_Build 4 73540202 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 1293 het 1293 ref 18 8 5 6 A 15 14 209286 CASAVA_Build 4 73553333 1D ATGTATTATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 13 16 12 A 10 9 209287 CASAVA_Build 4 73580309 2I CACAGTAACC --/TA TATATATATT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TA 4 5 209288 CASAVA_Build 4 73582332 2I TTATCATCAG --/AA AAAAAAAGTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 7 9 209289 CASAVA_Build 4 73586387 1D TTCCTGAGGG T/- TTTTTTATCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 7 6 209290 CASAVA_Build 4 73586542 1D AGCAATGAAG C/- CTACTTGATC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 2 1 209291 CASAVA_Build 4 73594389 1D AAGACACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 45 2 35 8 A 12 11 209292 CASAVA_Build 4 73594656 1D CCTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 29 1 15 14 A 13 12 209293 CASAVA_Build 4 73611443 11I CAAATATTAG -----------/GTATGACCACT GTGAACAAGG 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 GTATGACCACT 0 1 209294 CASAVA_Build 4 73612796 1I TTCTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1637 het 1637 ref 25 12 5 8 A 11 12 209295 CASAVA_Build 4 73626756 1I TTTTGTTTTC -/T TTTGTTTTGA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 3 4 209296 CASAVA_Build 4 73631031 1D TACAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 12 11 209297 CASAVA_Build 4 73635321 1I GTTTAGAGAG -/A AAAAACAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 A 5 6 209298 CASAVA_Build 4 73637619 88D AATATCCATG AATGAAGAAATGAAGAAATGCGTGAATGAATGAGAGCAGTTTGAGTCGGAAGGGGTATGTGAAATTAGCATGCATCTTCTTTTGGCTA/---------------------------------------------------------------------------------------- AATAGTCATT 3070 hom 51 het 17 0 16 7 AATGAAGAAATGAAGAAATGCGTGAATGAATGAGAGCAGTTTGAGTCGGAAGGGGTATGTGAAATTAGCATGCATCTTCTTTTGGCTA 1 0 209299 CASAVA_Build 4 73644803 1I CCAAAACTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 681 hom 16 2 11 3 A 12 13 209300 CASAVA_Build 4 73651383 1I TGGGAGTAAG -/A AATCTCCACA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 2 3 209301 CASAVA_Build 4 73651987 1D ACCAGCCTGG A/- AAGGAGGGGG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 3 2 209302 CASAVA_Build 4 73653244 1D TGGGTTTGAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 46 het 24 0 16 8 T 9 8 209303 CASAVA_Build 4 73658984 2I GGCTTGGAAA --/CT CTGAATGGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CT 1 2 209304 CASAVA_Build 4 73659645 5D TCAGGAAAAT AGTCA/----- AGTGTTCTGA 3070 hom 114 het 41 0 38 5 AGTCA 1 0 209305 CASAVA_Build 4 73665396 3I TTACATGTAA ---/TAT TATACATATG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TAT 1 2 209306 CASAVA_Build 4 73665463 2D TTATTTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 GT 7 6 209307 CASAVA_Build 4 73666004 2I45M4I GGTTCATCTC --TTTTTTTTTCCTAAAAATGTCTTAGCTATATACACTTCAGAAAAT----/TTTTTTTTTTTCCTAAAAATGTCTTAGCTATATACACTTCAGAAAATAAAC AAGCAAGCAA 3070 hom 36 het 15 0 13 12 N/A 0 0 209308 CASAVA_Build 4 73666124 1D GGGAAGGGAG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 A 8 7 209309 CASAVA_Build 4 73667310 1D ATTTACTACC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 8 209310 CASAVA_Build 4 73668092 10D CTTCATTAAC AATCTGTATT/---------- AATGTAGAGG 3070 hom 141 het 50 0 48 3 AATCTGTATT 1 0 209311 CASAVA_Build 4 73668765 1I CCTCCTAAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 9 10 209312 CASAVA_Build 4 73674169 1I CATTCCCCCC -/T CTTTATCATC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 0 1 209313 CASAVA_Build 4 73695526 1D CCAGATCACA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 9 8 209314 CASAVA_Build 4 73696409 1I AGAAGTGAAT -/A AAAAATCATA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 5 6 209315 CASAVA_Build 4 73706103 2D ACCTATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1498 het 627 hom 31 11 5 16 T 18 16 209316 CASAVA_Build 4 73727356 1D ACTTGCCATT A/- ACAGAGGTTT 3070 hom 114 het 39 0 36 3 A 2 1 209317 CASAVA_Build 4 73743621 1D CAGGTCAATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 9 8 209318 CASAVA_Build 4 73747938 3I TAGGCCTCTT ---/GAA GAAGAGAATT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 GAA 1 2 209319 CASAVA_Build 4 73769169 1I AATTTACGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 7 5 A 10 11 209320 CASAVA_Build 4 73770307 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 2718 het 1277 hom 11 4 6 1 A 10 11 209321 CASAVA_Build 4 73771021 1D CATGACCTAT A/- AAAAAACCTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 6 209322 CASAVA_Build 4 73772736 3D AAAAATCAAA CAC/--- CACATGTTCT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 CAC 2 1 209323 CASAVA_Build 4 73788375 1D ACTCCAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 32 1 21 10 T 15 14 209324 CASAVA_Build 4 73840600 1I ACAGAAGTAG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 7 8 209325 CASAVA_Build 4 73842635 1D ATTTTTCCCC T/- TTAATTTTGT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 3 2 209326 CASAVA_Build 4 73853418 1I TAGTAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 871 hom 37 2 27 8 A 13 14 209327 CASAVA_Build 4 73854042 12D3M3D3M1D CTGGTGTAGT GGTGGGCACCTGTAGTCCCAGC/------------TAG---CAG- TACTCGGGAG 3070 hom 60 het 21 0 21 1 N/A 0 0 209328 CASAVA_Build 4 73854130 2D GAGCTGAGAC TG/-- TGCCATTGTA 1544 hom 10 het 9 0 4 5 TG 2 1 209329 CASAVA_Build 4 73854183 1I TCTCAAAGAG -/A CAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 0 1 209330 CASAVA_Build 4 73862339 1D88M3D CCAAACAATA GGGTACCGTAGCTTAGCTAAGTTGACATATAAAATTAACCTCACACACATTATACTTGAAAGAAGACCTAGGCTTACGTTGTTCCTCTTCTA/-GGTACCGTAGCTTAGCTAAGTTGACATATAAAATTAACCTCACACACATTATACTTGAAAGAAGACCTAGGCTTACGTTGTTCCTCTT--- CAAAATTGGC 3070 het 376 hom 58 3 54 38 N/A 0 0 209331 CASAVA_Build 4 73864110 1I AAGATGAAAA -/G AAGTTTGTCC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 0 1 209332 CASAVA_Build 4 73865535 1D GTTGTCTAGC A/- AAAGGGCATA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 A 4 3 209333 CASAVA_Build 4 73872235 1D GTTAAGCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 33 2 25 6 A 12 11 209334 CASAVA_Build 4 73875578 2I GCGTTTATTT --/AA AAAAAAAAAA 1358 het 194 hom 32 3 5 24 A 12 14 209335 CASAVA_Build 4 73877031 4D TTAGAAACAC AAAG/---- GGAGATATTA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 AAAG 1 0 209336 CASAVA_Build 4 73884404 1I TTTTATGAGG -/C CAGCATCATC 3070 hom 24 het 13 0 9 4 C 1 2 209337 CASAVA_Build 4 73887801 4I CCAAGCTTTC ----/TTCT TTCTAACACT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TTCT 1 2 209338 CASAVA_Build 4 73888116 20D TAATAACTCG TGACAATGAGTTATTACGAC/-------------------- TGACAAGAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 4 TGACAATGAGTTATTACGAC 1 0 209339 CASAVA_Build 4 73896931 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1186 hom 21 3 13 5 T 15 14 209340 CASAVA_Build 4 73905823 1I GTGATAGAGG -/A AATACAGACG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 3 209341 CASAVA_Build 4 73914496 5D TGAAGACGTC AAAAG/----- AAAAGAAAAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAAAG 2 1 209342 CASAVA_Build 4 73914974 1D AACAAATCAA C/- CCCAAAGCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 4 3 209343 CASAVA_Build 4 73924811 1I GCTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 T 10 11 209344 CASAVA_Build 4 73929728 2I ATAGCCTCTC --/TT ATTGTTTTAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 0 2 209345 CASAVA_Build 4 73930945 1I CTAGCCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 14 9 T 10 11 209346 CASAVA_Build 4 73937494 1I GAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 389 hom 33 2 28 3 A 9 10 209347 CASAVA_Build 4 73941495 1I AAATTATGAT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 6 7 209348 CASAVA_Build 4 73943551 1D CTTGAAGAAA G/- AAAAAAAAAG 3070 het 1062 hom 35 4 24 7 G 1 0 209349 CASAVA_Build 4 73953902 1I AAAATTGGAG -/A AAAAAAGAAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 6 7 209350 CASAVA_Build 4 73963611 1D GGATGTTTGG T/- TTTTTGTCGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 6 5 209351 CASAVA_Build 4 73970438 1D ATTTGTTACA T/- TTTTTGCCTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 6 5 209352 CASAVA_Build 4 73972507 4I CTAATATGAT ----/AAAC AATATGTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAAC 0 1 209353 CASAVA_Build 4 73974885 1D AAGTAAATAA T/- TTTTATTGAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 5 4 209354 CASAVA_Build 4 73975154 2D CCCCCACCCC CT/-- GACAGGCCCC 2830 hom 21 het 8 0 8 1 CT 1 0 209355 CASAVA_Build 4 73975839 3I TTTGGTGGGG ---/TTT TTTATTATAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 3 6 209356 CASAVA_Build 4 73981097 2I TACCCAACAC --/TG TGCATTCCAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TG 1 2 209357 CASAVA_Build 4 73982367 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCACC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 4 3 209358 CASAVA_Build 4 73982483 1I TGGCCAGGAA -/G GGGGGCTTTA 3070 hom 71 het 28 0 22 6 G 5 6 209359 CASAVA_Build 4 73994177 2D32M2I CATACTAAAC TGTGCAATGAAGGAATCAACTCGACTTTGGCCTA--/--TGCAATGAAGGAATCAACTCGACTTTGGCCTACT CTCTCTGTTT 3070 het 3070 ref 44 29 21 10 N/A 0 0 209360 CASAVA_Build 4 73994839 1D AAAAAAAAAA G/- CCATTGTAGT 3070 het 240 hom 36 1 26 10 G 1 0 209361 CASAVA_Build 4 73997574 3I AGATTTGTTG ---/AAT GACTTTGCCC 3070 het 1983 hom 16 4 8 4 AAT 0 1 209362 CASAVA_Build 4 74009257 1I CCTTCTTGGG -/A AAAAATGTCT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 5 6 209363 CASAVA_Build 4 74012898 4I CAATTTCCTT ----/AATC AGATACGCCA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 AATC 0 1 209364 CASAVA_Build 4 74023220 1D TGGCTGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1701 hom 42 11 15 16 A 17 16 209365 CASAVA_Build 4 74026352 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 A 13 12 209366 CASAVA_Build 4 74043937 2D GTATTTGCCA TT/-- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 50 22 17 11 T 9 7 209367 CASAVA_Build 4 74046820 1D GTAGATTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 39 1 31 7 A 11 10 209368 CASAVA_Build 4 74071963 1I TGACAGAAAA -/C TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 C 0 1 209369 CASAVA_Build 4 74080596 1D CTCAATCTCC T/- GACCTTGTAA 3070 het 1411 hom 19 4 13 3 T 1 0 209370 CASAVA_Build 4 74083573 2D CAAGAAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3037 het 1627 hom 37 11 12 14 T 16 14 209371 CASAVA_Build 4 74112685 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2329 hom 29 8 16 5 A 10 11 209372 CASAVA_Build 4 74123749 1I CGTGTTTGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 9 10 209373 CASAVA_Build 4 74134419 1D ATACGTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 779 hom 25 3 11 11 T 15 14 209374 CASAVA_Build 4 74137625 1I TGCGTCCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 10 11 209375 CASAVA_Build 4 74148835 10D ACTCCATCTC AAAAAAAAAA/---------- GAAAAAAAAA 2681 het 2232 hom 13 6 7 3 A 10 0 209376 CASAVA_Build 4 74182017 1I TAGAGAGCCT -/A TTTTTTTTTT 2071 het 2071 ref 25 16 6 3 A 0 1 209377 CASAVA_Build 4 74182436 1I TTTAACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 A 10 11 209378 CASAVA_Build 4 74215192 1I TAAAGATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3001 hom 24 9 11 4 T 12 13 209379 CASAVA_Build 4 74237881 1I ATTGTATGAC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 8 209380 CASAVA_Build 4 74252714 2I AGCCTGGGGG --/AC AGAGTGAGAC 3070 hom 50 het 21 0 17 4 AC 0 1 209381 CASAVA_Build 4 74271547 2I ACACACAGAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 AC 6 7 209382 CASAVA_Build 4 74276041 3D TAAGAGATTA TGT/--- TGTTGCTATA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 TGT 2 1 209383 CASAVA_Build 4 74289504 1I CACAAAATAC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 7 8 209384 CASAVA_Build 4 74294219 1I TCCCTTACGC -/A AAAAAAGATC 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 6 7 209385 CASAVA_Build 4 74329806 1D TGGTTTCTTC T/- TAGAAAGAAG 3070 het 3070 ref 43 20 18 8 T 2 1 209386 CASAVA_Build 4 74332504 1D TTTTCTATTC T/- TTAGATCTTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 T 3 2 209387 CASAVA_Build 4 74336158 24D TGGTGTAGGT TACACCATGGATGTTGGTGCCTCC/------------------------ TACTGGTCCT 3070 het 3070 ref 32 23 13 3 TACACCATGGATGTTGGTGCCTCC 1 0 209388 CASAVA_Build 4 74345673 1I TATTTTTATC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 8 209389 CASAVA_Build 4 74350318 4D TCTTTTCCTT AGGG/---- AAACATCCTT 3070 het 3070 ref 38 25 11 4 AGGG 1 0 209390 CASAVA_Build 4 74356958 1I GGATTAAATC -/T TTTTTTTTTT 2035 het 1081 hom 30 6 10 14 T 17 18 209391 CASAVA_Build 4 74395788 1I CTACTACTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 A 10 11 209392 CASAVA_Build 4 74414405 11I CCTGGTTTTG -----------/CCCTCCTTTCA CGTTTGATTA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 CCCTCCTTTCA 0 1 209393 CASAVA_Build 4 74416114 5D TCTTTTATCC TTTTT/----- TTGCCTTGAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 7 2 209394 CASAVA_Build 4 74416358 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 10 9 209395 CASAVA_Build 4 74429545 1I CTGTTGCCTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 T 8 9 209396 CASAVA_Build 4 74438604 4D CTACCAGACT TATA/---- TATATCTAAG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 TA 4 2 209397 CASAVA_Build 4 74448942 1D GTCTCAGCCC A/- AAATCTCCTT 1676 hom 10 het 4 0 4 0 A 4 3 209398 CASAVA_Build 4 74489167 1D CATCCTAGGT A/- AAAAAAAAAA 1270 het 1270 ref 25 19 3 3 A 13 12 209399 CASAVA_Build 4 74495822 1I CAAATTTATG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 37 0 27 10 A 8 9 209400 CASAVA_Build 4 74506760 1D AATCAACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 9 209401 CASAVA_Build 4 74524525 2D TGTGTATATG TA/-- TATATATGTA 3070 hom 72 het 33 0 25 11 TA 4 3 209402 CASAVA_Build 4 74527352 3D GAGAAAAAAT GAA/--- GAACTATGAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GAA 2 1 209403 CASAVA_Build 4 74541679 3I CTTTCCATTG ---/TAC TACTGCAACA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TAC 1 2 209404 CASAVA_Build 4 74545370 1D CCCCAATACT A/- AAAATAAGTC 3070 hom 69 het 27 0 24 5 A 5 4 209405 CASAVA_Build 4 74548374 12D AGAGGTTGCA GAGGTTGAATCT/------------ GGGAGCCAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 5 GAGGTTGAATCT 1 0 209406 CASAVA_Build 4 74551291 1D AATCATCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 10 9 209407 CASAVA_Build 4 74552364 1I AGAAAATAGA -/T TTTTTTAGTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 6 7 209408 CASAVA_Build 4 74553236 1D ATTTTTAAAT A/- TATATATATA 3070 het 2227 hom 16 6 8 2 A 1 0 209409 CASAVA_Build 4 74554631 23D TCCACAATAA TTTTAAAATAGTTTTTAAAATAG/----------------------- TTTTAAAATA 3070 hom 75 het 29 0 26 10 TTTTAAAATAGTTTTTAAAATAG 1 0 209410 CASAVA_Build 4 74572983 1D CTCAGTTTTG T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 8 7 209411 CASAVA_Build 4 74575003 1D GATTTTGTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 G 1 0 209412 CASAVA_Build 4 74584968 1I CAAGTGCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 32 16 9 T 10 11 209413 CASAVA_Build 4 74591195 1D TGGTCAGTTA T/- TTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 T 7 6 209414 CASAVA_Build 4 74596196 1D ATTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 27 2 23 3 A 13 12 209415 CASAVA_Build 4 74604833 4I CTTGATTAGC ----/TTAA TTATCAACCC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTAA 0 1 209416 CASAVA_Build 4 74606050 1I ATATGCTGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 8 9 209417 CASAVA_Build 4 74615629 5D TTAACTGTCA CCCTT/----- CCCTTCTGTT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 CCCTT 2 1 209418 CASAVA_Build 4 74662611 25I GCTCTCTTCT -------------------------/TTTCTTTATTTCTGGTCCCTAAAGG GACCTAGTTA 3070 hom 84 het 27 0 28 2 TTTCTTTATTTCTGGTCCCTAAAGG 0 1 209419 CASAVA_Build 4 74665687 1I TTTCTTAAGG -/T TGTTCTGGCA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 1 2 209420 CASAVA_Build 4 74666943 3D53M4D TTGAACATAA TCTTCTTATAGGGCAAAAAAAATCCAAGGTCATTAATTTAAAAAATTTGTTTTGTTTTTG/---TCTTATAGGGCAAAAAAAATCCAAGGTCATTAATTTAAAAAATTTGTTTTGTT---- TTTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 34 15 11 N/A 0 0 209421 CASAVA_Build 4 74668341 3I GTAGACCGAG ---/TTC TTCTTTTGTG 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 TTC 1 2 209422 CASAVA_Build 4 74680293 4D TAATTGTATA TATT/---- AAGATTTAAG 2450 het 2450 ref 19 11 6 4 TATT 1 0 209423 CASAVA_Build 4 74683308 1D CCCTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 9 8 209424 CASAVA_Build 4 74685309 1I CAATTGCCAT -/A AAAAAGATCC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 5 6 209425 CASAVA_Build 4 74687172 4I AGGGTCCACC ----/TAAG TGTTACATGC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 TAAG 0 1 209426 CASAVA_Build 4 74691221 6D AGCCTTATAG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 2088 hom 40 15 15 12 T 16 10 209427 CASAVA_Build 4 74692311 1D4M7D TCTTTCTTTT AAAGAACCCTCC/-AAGA------- AGGTGGTTCT 3070 hom 81 het 27 0 27 4 N/A 0 0 209428 CASAVA_Build 4 74697063 3I CAGTTTTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 940 het 471 hom 29 6 12 11 TTC 0 1 209429 CASAVA_Build 4 74699940 4I AAAGACTTGG ----/TAGA TAGATATAAG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 TAGA 1 2 209430 CASAVA_Build 4 74701429 1D TCTCCAAAAC G/- AAACTGTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 G 1 0 209431 CASAVA_Build 4 74709403 1I AGATTTTTGG -/A AAAATCCCAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 4 5 209432 CASAVA_Build 4 74712206 1I TTCCTATGTA -/T TTTTTTTTGA 2416 het 2416 ref 25 17 5 3 T 8 9 209433 CASAVA_Build 4 74725543 1D CCATGCTTGT A/- GGGTATTACT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 1 0 209434 CASAVA_Build 4 74726116 1I TGTTTTATAG -/T TTTCATTGTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 3 4 209435 CASAVA_Build 4 74727391 1I GTTCCATTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 6 7 209436 CASAVA_Build 4 74756018 1D TCCCTTTCCT G/- GTCTGCTAAG 3070 hom 90 het 34 0 27 9 G 2 1 209437 CASAVA_Build 4 74761284 3D AAGAGAGGTG AAT/--- AATAAGTCCA 3070 hom 132 het 48 0 45 4 AAT 2 1 209438 CASAVA_Build 4 74799976 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 55 het 27 0 19 8 T 9 8 209439 CASAVA_Build 4 74801956 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 321 hom 34 1 27 7 A 12 11 209440 CASAVA_Build 4 74805141 5I GATCAAATGA -----/TTAGT TTAGGTTAGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TTAGT 0 1 209441 CASAVA_Build 4 74812648 1D TGGTAGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 T 12 11 209442 CASAVA_Build 4 74820464 1I CAGTGAGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 12 13 209443 CASAVA_Build 4 74822531 1I TTAGTCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 515 hom 43 2 30 11 T 10 11 209444 CASAVA_Build 4 74823414 1D TAATTACCTG T/- TATTGTAACA 3070 hom 114 het 48 0 39 10 T 2 1 209445 CASAVA_Build 4 74826379 1I AAAACAAAAT -/A AAAAATATTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 5 6 209446 CASAVA_Build 4 74826733 1D CTTTTTGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 39 0 28 11 A 10 9 209447 CASAVA_Build 4 74829015 1I AAAATCTTTC -/T GGAAATGATG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 0 1 209448 CASAVA_Build 4 74833030 2D TAAAACAAAC TA/-- TGATTAACAG 3070 hom 72 het 27 0 25 5 TA 1 0 209449 CASAVA_Build 4 74836545 1I CAAAAAAAGG -/A AAAAATGAAA 1192 het 196 hom 33 4 8 21 A 5 6 209450 CASAVA_Build 4 74842013 3D TTGTAGTTTG TGT/--- TTGAATTTCC 3070 hom 81 het 31 0 26 6 TGT 1 0 209451 CASAVA_Build 4 74894163 1I TCAGGAAAGA -/T TTTTACTTAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 4 5 209452 CASAVA_Build 4 74912819 1D TCTTTTTATC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 10 9 209453 CASAVA_Build 4 74917311 1D GTTGAATTAA T/- TGCCTAGGAG 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 2 1 209454 CASAVA_Build 4 74925012 1I TCAAATGGTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 8 9 209455 CASAVA_Build 4 74927051 1I AACATACTTA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 6 7 209456 CASAVA_Build 4 74927163 1D GTATATTCTA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 7 6 209457 CASAVA_Build 4 74929755 1I AATTTATAAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 7 8 209458 CASAVA_Build 4 74929967 2D TTGTGTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 72 hom 32 3 18 12 T 12 10 209459 CASAVA_Build 4 74931057 1I TCGTGATCTG -/C CCCCCTTGGC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 5 6 209460 CASAVA_Build 4 74939074 1D ACTCGACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 48 1 36 11 T 12 11 209461 CASAVA_Build 4 74940235 1D ATTTGTTGGC G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 63 het 25 0 17 8 G 9 8 209462 CASAVA_Build 4 74941439 1D TTATTAAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 9 8 209463 CASAVA_Build 4 75010062 1I AATGTTTGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 9 10 209464 CASAVA_Build 4 75013638 1D AAAAAGTAAC A/- ACTCCCTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 1 209465 CASAVA_Build 4 75016244 9I TGAATTATGG ---------/GGGTGATTA TTCCATGCTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 GGGTGATTA 0 1 209466 CASAVA_Build 4 75029792 3I GCATAACTTC ---/CTT CTTCCCTCTG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 CTT 1 2 209467 CASAVA_Build 4 75032990 1D CACATAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 36 1 28 9 A 12 11 209468 CASAVA_Build 4 75033506 3D GTGGAGAAAC AAG/--- AACTTGGTTG 3070 hom 151 het 54 0 51 7 AAG 1 0 209469 CASAVA_Build 4 75059657 9I AGTCCCAGAT ---------/AGTCACCTC ACTTGGGAGG 3070 hom 63 het 22 0 21 1 AGTCACCTC 0 1 209470 CASAVA_Build 4 75069435 2D TGTAGCCTAA GT/-- GTGTACAGTG 3070 hom 57 het 21 0 20 4 GT 3 2 209471 CASAVA_Build 4 75074676 1I GTGACTTGAT -/G GGTGACATTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 2 3 209472 CASAVA_Build 4 75075551 1I ACTGGACACC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 209473 CASAVA_Build 4 75077234 1I GAAATGGCTG -/A AAATAAAGAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 3 4 209474 CASAVA_Build 4 75077867 6D GGAAAACTGA GTATAT/------ TTGCAGCAGA 3070 hom 93 het 34 0 30 5 GTATAT 1 0 209475 CASAVA_Build 4 75101125 1I TCTAAATCTC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 7 8 209476 CASAVA_Build 4 75120727 1I CAATAGGTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 5 hom 43 1 36 6 T 8 9 209477 CASAVA_Build 4 75146790 1I GAGAAGACTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 T 8 9 209478 CASAVA_Build 4 75160581 1D GGTAAACATC T/- TTTTTTTTTT 2438 het 110 hom 17 1 10 6 T 17 16 209479 CASAVA_Build 4 75192083 1D TGGCACTATT G/- TCTATAGAAC 3070 het 3070 ref 28 15 7 6 G 1 0 209480 CASAVA_Build 4 75220277 1I CAAGGACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 29 1 22 6 T 10 11 209481 CASAVA_Build 4 75227829 1D GCTGGAAAGC A/- TACGTGCACT 3070 hom 157 het 56 0 53 3 A 1 0 209482 CASAVA_Build 4 75240491 1D CATGTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 29 1 14 15 A 15 14 209483 CASAVA_Build 4 75247657 3D AAATTGAGCA TTT/--- TTTTTTTTCC 3070 hom 68 het 27 0 22 5 T 11 8 209484 CASAVA_Build 4 75256519 4D TCGAATGGAT AAAC/---- AAATATTGGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAAC 1 0 209485 CASAVA_Build 4 75262640 2D TCATGGAAAC AT/-- AGAGTTAATG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 1 0 209486 CASAVA_Build 4 75268394 6D TAATATATTG TTCTTA/------ TTCTTATTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 TTCTTA 2 1 209487 CASAVA_Build 4 75272704 2D GTATATACTC TG/-- TGATTTCATT 3070 hom 96 het 37 0 33 6 TG 2 1 209488 CASAVA_Build 4 75283462 5I TAGCTTGACT -----/TAAAG TAAGGTAGCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TAAAG 0 1 209489 CASAVA_Build 4 75288479 1D CAATTTGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1152 hom 30 3 23 4 T 13 12 209490 CASAVA_Build 4 75294758 1I TTTGCTGTGC -/A GAAGCTCTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 0 1 209491 CASAVA_Build 4 75304674 1I TTGGTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 37 1 28 8 T 11 12 209492 CASAVA_Build 4 75308220 4I AAACAAATAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AAAT 3 4 209493 CASAVA_Build 4 75315173 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 19 3 15 1 A 14 13 209494 CASAVA_Build 4 75317619 4D TTAGTAATTA TTAC/---- TTATATTCTA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 TTAC 1 0 209495 CASAVA_Build 4 75324071 1I AGTATAATTT -/A TAAAAAAAAA 1656 het 1656 ref 20 6 10 4 A 0 1 209496 CASAVA_Build 4 75326782 5I AATAAGTAAA -----/AAAAT AAAATAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAAT 1 2 209497 CASAVA_Build 4 75329094 2D TTGTAATACT TA/-- TATGTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 5 TA 2 1 209498 CASAVA_Build 4 75330063 1D TTTTCAATAA T/- TTTTTTTATT 2616 het 2616 ref 17 9 6 2 T 8 7 209499 CASAVA_Build 4 75334603 1I TCTGAATGTT -/G GCCTGCCTTG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 1 2 209500 CASAVA_Build 4 75339412 2I TAAAAGTAAT --/TA TAGCTGCAAG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TA 1 2 209501 CASAVA_Build 4 75345505 4D TAAAAAAAAC AAAG/---- AAACAATTAA 3070 het 3070 hom 30 9 19 3 AAAG 1 0 209502 CASAVA_Build 4 75346637 5I AAAAGACAAA -----/TATAT TAATGGGGAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TATAT 0 1 209503 CASAVA_Build 4 75358594 1I AACAGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2426 hom 37 7 16 14 T 10 11 209504 CASAVA_Build 4 75365212 1D TTGTTCAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 26 3 T 12 11 209505 CASAVA_Build 4 75367586 1I TAAAACCTGG -/C CTTATTTATT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 C 1 2 209506 CASAVA_Build 4 75399764 2D TGAACCAAAC AT/-- GTGTCTTAAA 3070 het 3070 ref 54 26 22 7 AT 1 0 209507 CASAVA_Build 4 75409443 1D AATATGGCAC T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 T 8 7 209508 CASAVA_Build 4 75411464 2I AAATTCCATG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 AT 6 7 209509 CASAVA_Build 4 75417892 1D AGGCAAAAAA T/- GTATACTATA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 1 0 209510 CASAVA_Build 4 75418666 1I GTTACAGGAG -/T TTTTTTGGGG 3070 hom 96 het 41 0 26 15 T 6 7 209511 CASAVA_Build 4 75420030 1I AATAAGGAGT -/C CTTGGCAAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 2 209512 CASAVA_Build 4 75420587 1D GAGTAATCCA G/- GGGGAGATGA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 G 5 4 209513 CASAVA_Build 4 75421289 14D GAGATTTTAT ACAACATTAACAAA/-------------- ACAACACCTG 3070 het 3070 hom 40 21 22 5 ACAACATTAACAAA 1 0 209514 CASAVA_Build 4 75423387 1I ATATCTTCTT -/A TTTTATTTAT 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 A 0 1 209515 CASAVA_Build 4 75426949 1I AAAAATAAAC -/A AAATTTTCTT 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 A 3 4 209516 CASAVA_Build 4 75431339 2I CAACCCCCCC --/CA AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 CA 0 1 209517 CASAVA_Build 4 75434089 3D TAATAATAAA AAT/--- AAATAAATAG 2179 het 797 hom 11 4 7 1 AAT 1 0 209518 CASAVA_Build 4 75434230 1D TAAAAACAGT A/- AAAACCTTGT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 5 4 209519 CASAVA_Build 4 75434890 1I ATTTCCCTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 9 10 209520 CASAVA_Build 4 75440392 1I TAAAATAAAT -/A AAAAAAAAGA 2922 het 2922 ref 20 10 8 2 A 8 9 209521 CASAVA_Build 4 75442719 1I TAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 569 hom 20 2 16 2 A 10 11 209522 CASAVA_Build 4 75445573 1I TATTACTACA -/T TCAATATATG 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 1 2 209523 CASAVA_Build 4 75445973 2I TCTCGAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AT 5 6 209524 CASAVA_Build 4 75446704 1I TACTAATTAC -/A ATAGAGACTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 1 2 209525 CASAVA_Build 4 75447045 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAAGAAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AG 0 1 209526 CASAVA_Build 4 75447240 1I AGCACAGGGA -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 7 8 209527 CASAVA_Build 4 75447354 1I GTCAGCATGA -/C CCCATTCTCC 3070 hom 123 het 46 0 40 6 C 3 4 209528 CASAVA_Build 4 75448650 2I ACTTACAAAC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 9 11 209529 CASAVA_Build 4 75450247 1I TTGAAAAAGC -/T TTTTTTTTTT 1775 het 193 hom 23 1 6 16 T 15 16 209530 CASAVA_Build 4 75469152 1D TTCATCCCTC T/- TTTTTTTTTT 2348 het 440 hom 35 4 13 18 T 17 16 209531 CASAVA_Build 4 75475839 1D TATCATTTGC A/- AAAAACTTAG 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 A 6 5 209532 CASAVA_Build 4 75477931 3D GGTAAAAGAA AAG/--- AAGATTTTGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AAG 2 1 209533 CASAVA_Build 4 75478892 1D AAAGTAGACT A/- AAAAGGACAA 3070 hom 73 het 28 0 24 4 A 5 4 209534 CASAVA_Build 4 75481847 2D TGATTATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 7 T 12 10 209535 CASAVA_Build 4 75485548 1D15M1D TTCTTTCCTT CCTTCCTTCCTTCCTTC/-CTTTCTTCCTTTCTT- TTTCTTCCTT 3070 het 2000 hom 27 6 16 11 N/A 0 0 209536 CASAVA_Build 4 75486419 1I ATTTTTAAAA -/G CTTGTGTAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 209537 CASAVA_Build 4 75487009 1D GCATCTTTAA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 6 209538 CASAVA_Build 4 75491629 9I GGACTTTAAG ---------/AGATTGAGA GTCATATTAG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AGATTGAGA 0 1 209539 CASAVA_Build 4 75494992 1D GGCATGAACC A/- AAAAAAAAAA 800 het 800 ref 51 39 2 12 A 11 10 209540 CASAVA_Build 4 75496617 2D TTAGGTTTAT TG/-- TGTTTCAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TG 2 1 209541 CASAVA_Build 4 75499790 1I TATTCATTCT -/G TTATTCTCTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 209542 CASAVA_Build 4 75531472 4I CTTTATTGTA ----/TGTC TATCTGTTGG 1418 het 1418 ref 14 9 3 2 TGTC 0 1 209543 CASAVA_Build 4 75544230 3D GTTTACATTC CCA/--- CCGAGAGTGC 3070 het 3070 ref 53 28 17 10 CCA 1 0 209544 CASAVA_Build 4 75546050 1I AATTAACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 214 hom 25 1 20 4 T 10 11 209545 CASAVA_Build 4 75569830 1I AAAGCAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 36 1 27 8 A 10 11 209546 CASAVA_Build 4 75575537 2D TCATTCAGTC TA/-- TGTTTCATCA 3070 het 3070 ref 54 29 21 5 TA 1 0 209547 CASAVA_Build 4 75579640 1D TTGTTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 9 8 209548 CASAVA_Build 4 75599308 1D TTAAGAGATC A/- AAAAAAGCAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 7 6 209549 CASAVA_Build 4 75599998 2D GAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 1228 het 630 hom 14 4 4 6 AG 1 0 209550 CASAVA_Build 4 75621330 1I ACTAGGTGGC -/A ATCTGGTGTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 2 209551 CASAVA_Build 4 75621550 1I ATGAGAAATG -/A AAAAAGAAAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 5 6 209552 CASAVA_Build 4 75629678 1D GTATCACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 46 1 29 16 A 14 13 209553 CASAVA_Build 4 75631672 1I GTGCCTTCTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 9 209554 CASAVA_Build 4 75634678 2D GCATAATTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 40 1 35 5 T 14 12 209555 CASAVA_Build 4 75639720 1I AGCATGATAT -/G GGGATGAAAG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 G 3 4 209556 CASAVA_Build 4 75738612 1I GAAATGGTAC -/A AAAAATAGGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 5 6 209557 CASAVA_Build 4 75739504 1I TAGAAATGTA -/T TTTTTTATAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 6 7 209558 CASAVA_Build 4 75741303 1D AGACATTTGC G/- GCAGCCCTTT 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 G 2 1 209559 CASAVA_Build 4 75746183 1I TATTAATAGG -/C AATTTTTCCC 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 C 0 1 209560 CASAVA_Build 4 75747541 26I CATCATGTTT --------------------------/CAAATATGCTTTACCAGGATTGTGAC ACTTCAAACA 3070 het 3070 hom 43 23 21 3 CAAATATGCTTTACCAGGATTGTGAC 0 1 209561 CASAVA_Build 4 75749801 16D ATGACTTGAA TTATATGACTTGAATT/---------------- ATTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 41 25 20 3 TTATATGACTTGAATT 1 0 209562 CASAVA_Build 4 75750119 2D AAACCACCAG AA/-- AAAAATATAT 3070 het 387 hom 15 1 10 4 A 7 5 209563 CASAVA_Build 4 75754030 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTTTTGCTC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 AG 1 2 209564 CASAVA_Build 4 75758879 1D GTCAAGGTGG T/- TTGAAAGTGT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 3 2 209565 CASAVA_Build 4 75761268 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1291 hom 18 5 9 6 A 10 9 209566 CASAVA_Build 4 75761771 1D TATTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 11 10 209567 CASAVA_Build 4 75771125 1D TAACCATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 12 11 209568 CASAVA_Build 4 75797238 3D TAGTGGGTTT GTA/--- GTAGTACTCC 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 GTA 3 2 209569 CASAVA_Build 4 75814296 1D TACTACGGGA T/- TTTTTTTTTT 1420 het 1420 ref 38 28 4 6 T 12 11 209570 CASAVA_Build 4 75817714 1D ATTTAATTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3045 hom 18 7 9 2 A 10 9 209571 CASAVA_Build 4 75823200 1I ATATATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 T 10 11 209572 CASAVA_Build 4 75831291 4D TGCATTGAGG TTTT/---- TTTATTTTAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 5 T 7 3 209573 CASAVA_Build 4 75834046 1D TTTATTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 29 0 26 3 T 11 10 209574 CASAVA_Build 4 75839573 1D TGGGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 20 18 6 A 11 10 209575 CASAVA_Build 4 75839820 1D AGGAGAATCC T/- AGGGAAATCT 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 T 1 0 209576 CASAVA_Build 4 75844453 1D TTGTAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 33 3 27 3 A 12 11 209577 CASAVA_Build 4 75851236 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 7 8 209578 CASAVA_Build 4 75852210 5I GTGAAATTGA -----/TTTCT TTTATTTACT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTTCT 0 1 209579 CASAVA_Build 4 75856899 10I TGTTCATTCC ----------/TTTTCTTTCA TTTTTCTCTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTTTCTTTCA 0 1 209580 CASAVA_Build 4 75859783 2D CAGCAACAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 31 1 20 10 T 15 13 209581 CASAVA_Build 4 75860308 1D AAACATCTTC A/- AAAGCTGTCA 3070 hom 129 het 46 0 42 4 A 4 3 209582 CASAVA_Build 4 75871319 19D GAATAGCTGT AATGCTATTTCAACTTAAA/------------------- AATGCTATTT 3070 hom 84 het 35 0 29 14 AATGCTATTTCAACTTAAA 1 0 209583 CASAVA_Build 4 75880323 3D CCTATGTCTC CTT/--- CTTTTCTGCT 3070 hom 132 het 47 0 41 9 CTT 2 1 209584 CASAVA_Build 4 75880677 1I CTCAAGTCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 3 het 32 1 26 5 T 8 9 209585 CASAVA_Build 4 75882512 1I TGAAATGTAA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 T 7 8 209586 CASAVA_Build 4 75882992 6I AATTTTAAAC ------/ATGACT ATGACTATGT 3070 hom 112 het 49 0 38 11 ATGACT 1 2 209587 CASAVA_Build 4 75883387 5I TTTCTTGGGC -----/TATCT TAGGCACCTG 3070 hom 168 het 60 0 55 5 TATCT 0 1 209588 CASAVA_Build 4 75887682 1I GGAAGACCCC -/G TCTCAAGGAA 1323 hom 10 het 21 0 5 16 G 0 1 209589 CASAVA_Build 4 75891021 1D AATAATGTTG T/- TTTTGTAATA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 5 4 209590 CASAVA_Build 4 75898061 1D TCCAAAAAAA G/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 33 0 31 2 G 1 0 209591 CASAVA_Build 4 75905369 1I CCTTTGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 27 1 21 5 A 10 11 209592 CASAVA_Build 4 75908220 2D GTATAATTAT TG/-- TGTTAATTAA 3070 het 3070 ref 21 12 8 2 TG 2 1 209593 CASAVA_Build 4 75911345 1D AATCTAAATT G/- GAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 G 2 1 209594 CASAVA_Build 4 75925131 1I TGAGAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2345 hom 26 10 12 4 T 13 14 209595 CASAVA_Build 4 75938948 4D TGGGTCTCAC CTGA/---- CTGACTGTTC 3070 het 3070 hom 33 12 14 13 CTGA 2 1 209596 CASAVA_Build 4 75940398 1D AGATACTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 28 0 18 10 A 14 13 209597 CASAVA_Build 4 75940710 1I TGTTTGTTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 8 9 209598 CASAVA_Build 4 75941894 1D TTTTTTGTGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 56 het 22 0 18 4 T 9 8 209599 CASAVA_Build 4 75944887 4D TTTGGGAATT AGAC/---- AGGCTTAGCT 3002 het 3002 ref 24 16 7 2 AGAC 1 0 209600 CASAVA_Build 4 75948535 1D GAAGAAAGGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 9 8 209601 CASAVA_Build 4 75963435 1D ATGCTGTTGG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 A 8 7 209602 CASAVA_Build 4 75971686 1I TAATGGAAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 8 9 209603 CASAVA_Build 4 75987261 1I TAGAAGCTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 9 10 209604 CASAVA_Build 4 76033177 1I TAAATCTAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 9 209605 CASAVA_Build 4 76050274 1D TCTAATAAAA T/- TTCATCTTGA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 3 2 209606 CASAVA_Build 4 76051461 1I CCTGGAACAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 915 hom 34 3 29 2 A 9 10 209607 CASAVA_Build 4 76067772 2D CTCAAAAAAA AT/-- AAAAAGAAAA 1016 het 584 hom 14 2 4 8 AT 1 0 209608 CASAVA_Build 4 76068562 3I TTTACTATTT ---/TTA TTTTTTATTT 2352 hom 15 het 6 0 6 1 TTA 0 1 209609 CASAVA_Build 4 76175762 1D CACTTACAAT A/- AAAAAAAAAA 1329 het 1329 ref 39 34 3 2 A 13 12 209610 CASAVA_Build 4 76197728 2D ACTGATTTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 151 het 57 0 51 7 AC 6 5 209611 CASAVA_Build 4 76202127 1D TGGCAGGAGG C/- AGACAGTTTC 3070 hom 70 het 26 0 23 3 C 1 0 209612 CASAVA_Build 4 76226426 1I TAGTCACCAG -/A AAAAAAAAAA 1263 het 1263 ref 45 36 3 6 A 11 12 209613 CASAVA_Build 4 76236133 4D AAAAAAAGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 10 10 13 TTTG 5 4 209614 CASAVA_Build 4 76243141 2I TTTAAGTCTC --/TT TGTTAAATTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 1 3 209615 CASAVA_Build 4 76248461 2D GGCATTAATA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 1474 hom 37 10 16 11 C 11 9 209616 CASAVA_Build 4 76263805 1I AAATGATCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 8 9 209617 CASAVA_Build 4 76267141 1I AAAGAAAGAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 42 12 20 10 A 6 7 209618 CASAVA_Build 4 76278749 1I CTCTCTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 24 0 19 5 A 11 12 209619 CASAVA_Build 4 76287095 3D AAAGCAATTG TGA/--- TGATAATAAA 3070 het 3070 hom 38 12 20 9 TGA 2 1 209620 CASAVA_Build 4 76287487 2D ACTTACATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 34 0 26 8 A 15 13 209621 CASAVA_Build 4 76298988 1I TTTGCTTTGT -/G GCTACCATGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 1 2 209622 CASAVA_Build 4 76327192 1I CAGAACCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 22 4 A 10 11 209623 CASAVA_Build 4 76342916 1D GTTCCTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 36 1 22 13 T 15 14 209624 CASAVA_Build 4 76343216 1I CTGGTCACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 804 hom 20 2 14 4 T 11 12 209625 CASAVA_Build 4 76359228 2D AATTTTGGGG GT/-- GTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 GT 2 1 209626 CASAVA_Build 4 76364413 1I ACGTACAGAT -/G GGTTTTTGGT 3070 hom 38 het 16 0 12 4 G 2 3 209627 CASAVA_Build 4 76365225 1D GGCAATGCCT C/- GCCCTGCTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 3 C 1 0 209628 CASAVA_Build 4 76375325 1D AACCACCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 34 1 15 18 T 17 16 209629 CASAVA_Build 4 76387363 1I GAATCTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 802 hom 30 3 23 4 T 10 11 209630 CASAVA_Build 4 76388908 1D AAGTTTCAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 8 209631 CASAVA_Build 4 76393056 2D GAATAATACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 48 2 31 15 A 16 14 209632 CASAVA_Build 4 76397447 1D TTCAATTCCC A/- CCTATGAGTG 3070 het 2865 hom 17 6 10 1 A 1 0 209633 CASAVA_Build 4 76399412 1I GTGAAGCGGG -/A AAAAAAAAAA 2820 het 2820 ref 32 12 10 10 A 11 12 209634 CASAVA_Build 4 76403947 1I CTCCTTTACT -/G AACACACACC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 0 1 209635 CASAVA_Build 4 76407983 1I GACATTCAAA -/G AAGAATTTAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 0 1 209636 CASAVA_Build 4 76408813 2D TACAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 11 9 209637 CASAVA_Build 4 76410615 4I CATATATATC ----/ATAT ATATATATAT 2733 hom 15 het 9 0 6 3 AT 7 9 209638 CASAVA_Build 4 76411302 1D54M1D AGTGAGAAAA GGGGCCATGTGAGTAGCCTCTAGAAGAATGTGGGCAGCCTCCAGAAGCTGGAAAAG/-GGGCCACGTGAGTAGCCTCTAGAAGAATGTGGGCAGCCTCCAGAAGCTGGAAAA- ACCAGGAAAA 3070 het 165 hom 29 2 25 24 N/A 0 0 209639 CASAVA_Build 4 76412505 9D GCTAGACTTC AAAGAGAAA/--------- AAAGAGAAAA 3070 hom 99 het 36 0 31 10 AAAGAGAAA 2 1 209640 CASAVA_Build 4 76423818 1D AACAAACATC A/- CACTACCTGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 1 0 209641 CASAVA_Build 4 76425550 1I ATAAAAAATT -/A GCATAAAAAC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 0 1 209642 CASAVA_Build 4 76426012 12D CAAGTATGTA TGTTTGTTTGTT/------------ TGTTTGTTTG 3070 hom 57 het 30 0 19 12 TGTT 8 5 209643 CASAVA_Build 4 76428033 1I CTCAGTAAGT -/G ATAGCAATGA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 0 1 209644 CASAVA_Build 4 76479714 1D CAGTCATGCT A/- AAAAAAACTC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 8 7 209645 CASAVA_Build 4 76480900 1D AAAGCAATGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 10 9 209646 CASAVA_Build 4 76482656 14D TATGCTCTTG ACAAAGTGAATACA/-------------- ACACACAGGG 3070 het 3070 ref 45 29 22 1 ACAAAGTGAATACA 1 0 209647 CASAVA_Build 4 76491154 1D AAGAGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 40 1 32 8 T 12 11 209648 CASAVA_Build 4 76491692 2D TTTTGTCTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1145 hom 35 7 14 15 A 14 12 209649 CASAVA_Build 4 76500197 1D TTTTGTCTCC T/- TTCTCTGGCC 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 3 2 209650 CASAVA_Build 4 76500883 2I GTGCTCTCCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 TG 5 6 209651 CASAVA_Build 4 76501689 4D AATAAATAAA AAAC/---- AAAATAAAAT 3070 het 1175 hom 18 4 11 3 AAAC 1 0 209652 CASAVA_Build 4 76504546 3D AAGGGCCAAA AAG/--- AAGGAGTGGG 3070 het 3070 hom 38 15 21 4 AAG 2 1 209653 CASAVA_Build 4 76511220 9D ATAATAAAAG AAAAAAAGA/--------- AAAAAAAATA 2322 het 1634 hom 12 4 7 4 AAAAAAAGA 1 0 209654 CASAVA_Build 4 76512972 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 8 9 209655 CASAVA_Build 4 76513272 5D AGAAAAACTT AAAAC/----- AAGGGTCTAA 3070 het 3070 hom 42 17 22 6 AAAAC 1 0 209656 CASAVA_Build 4 76518458 1D TTAAGGAATC A/- AACTTGACTT 3070 het 3070 hom 46 17 25 5 A 3 2 209657 CASAVA_Build 4 76521730 1I TTGAGACTGC -/A ATGTATGCTC 3070 het 3070 hom 54 25 21 8 A 1 2 209658 CASAVA_Build 4 76528556 2D ATCGCAGGAC TG/-- TGTGTCACTC 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 TG 3 2 209659 CASAVA_Build 4 76529171 1D ATACCCCTTT C/- CCCACTCCCA 3070 hom 87 het 34 0 28 7 C 4 3 209660 CASAVA_Build 4 76531726 2D TAAGAAACAT AA/-- AAAGTTATTC 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 5 3 209661 CASAVA_Build 4 76531785 1D AAAAGGACGC A/- TTTTTTTATT 2683 het 2683 ref 19 13 6 3 A 1 0 209662 CASAVA_Build 4 76538703 1D AAGTTGCAGT A/- AAAACTGGCA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 5 4 209663 CASAVA_Build 4 76551452 1I TATAATAAAT -/A AAAAAAAAAA 1745 hom 12 het 7 0 4 3 A 10 11 209664 CASAVA_Build 4 76554401 1D TCTCTAGGTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 8 7 209665 CASAVA_Build 4 76565516 9D AACCAGTCCC AGTGAGATG/--------- AGCCAGGTAC 3070 het 3070 ref 24 10 11 4 AGTGAGATG 1 0 209666 CASAVA_Build 4 76574168 1I ACTAAACAAA -/T TGATTATAAA 3070 het 3070 ref 44 16 20 8 T 1 2 209667 CASAVA_Build 4 76584679 1I ACCATAAATA -/T TCTAGAAGAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 2 209668 CASAVA_Build 4 76594985 4D TTCCTAAGAT TCTA/---- AGGGTTTTAG 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 TCTA 1 0 209669 CASAVA_Build 4 76606547 1I TCCTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1404 hom 45 5 17 23 T 13 14 209670 CASAVA_Build 4 76611220 1I AATAAAAGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 8 9 209671 CASAVA_Build 4 76618818 2I TCTCAAAAAA --/AC AAACACACAC 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 AC 0 1 209672 CASAVA_Build 4 76620537 3D CTGACAGCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 27 2 18 8 T 15 12 209673 CASAVA_Build 4 76621859 3D GAGTTGGAAC ATT/--- ATAGTCCCAG 3070 het 3070 ref 41 23 15 6 ATT 1 0 209674 CASAVA_Build 4 76626242 2I CTATAAAACA --/CT GTTTCAATAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 CT 0 1 209675 CASAVA_Build 4 76627119 1I AGATTTGAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 9 10 209676 CASAVA_Build 4 76631510 1I TTTTGTTTAC -/T TTTTGGGTAA 3070 hom 46 het 19 0 15 4 T 4 5 209677 CASAVA_Build 4 76634718 2I GTCAAACCAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 43 16 19 8 TA 5 6 209678 CASAVA_Build 4 76639016 4D ACCTCCAAAT AGAC/---- AGTACCAATT 3070 het 3070 ref 62 28 29 7 AGAC 1 0 209679 CASAVA_Build 4 76642279 2D GAGACTAAAA AC/-- ACAATACAAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AC 2 1 209680 CASAVA_Build 4 76648504 1D ATACAGTTGA C/- CCCTTGAACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 4 3 209681 CASAVA_Build 4 76657231 1I TGTGGTTTAT -/G GGGGGGCACC 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 G 6 7 209682 CASAVA_Build 4 76665366 1I CATGGGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 10 11 209683 CASAVA_Build 4 76665946 3I TCACTTGATG ---/ATT ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 ATT 3 4 209684 CASAVA_Build 4 76679638 1I CTGAGGTCTG -/T TCTTCAGGAG 3070 het 3070 ref 44 27 11 6 T 1 2 209685 CASAVA_Build 4 76692667 1I TTTTTATTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 8 A 0 1 209686 CASAVA_Build 4 76692888 3D TTTATTTATT AAA/--- AAAAAAAAAA 1603 het 60 hom 14 1 6 8 A 15 12 209687 CASAVA_Build 4 76693034 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 10 9 209688 CASAVA_Build 4 76695476 1I ATAAACGATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 8 9 209689 CASAVA_Build 4 76707558 7D CAGCGCCCGG CCAAAAT/------- CCGCACATCT 3070 hom 27 het 11 0 10 5 CCAAAAT 1 0 209690 CASAVA_Build 4 76711099 1D TCTAATCATC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 9 8 209691 CASAVA_Build 4 76727889 1D AAAGCGGTGG A/- AGCCATGGTA 3070 het 3070 ref 45 29 13 4 A 2 1 209692 CASAVA_Build 4 76731982 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 1934 het 183 hom 6 1 5 0 A 7 8 209693 CASAVA_Build 4 76750013 1D CCCAAAATCC A/- AAAAAAAAAA 939 het 939 ref 37 27 3 7 A 15 14 209694 CASAVA_Build 4 76773294 1D TTTGTATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 A 10 9 209695 CASAVA_Build 4 76791706 1I AGGTATAGCT -/C TACTAAATAT 3070 het 3070 hom 46 12 28 6 C 0 1 209696 CASAVA_Build 4 76792565 1D AAAAAAAAAA C/- AAACAAACAA 386 het 386 ref 16 8 5 3 C 1 0 209697 CASAVA_Build 4 76793253 1D TATTGCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 11 10 209698 CASAVA_Build 4 76826057 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 535 het 535 ref 18 8 4 6 A 15 16 209699 CASAVA_Build 4 76844154 1D TAGATTTTCA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 8 7 209700 CASAVA_Build 4 76848716 1I TTATAGAGAC -/A AGGGTCTCAC 2453 het 2453 ref 19 10 6 3 A 1 2 209701 CASAVA_Build 4 76859511 1I GTACTGAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 A 9 10 209702 CASAVA_Build 4 76862447 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2374 hom 22 8 12 2 T 12 11 209703 CASAVA_Build 4 76869826 1I GGCGTTATTT -/A AAAAAAAAAA 1754 het 1754 ref 32 15 6 11 A 15 16 209704 CASAVA_Build 4 76872162 1I CTAGACTCTT -/A AAAGTGTCTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 3 4 209705 CASAVA_Build 4 76881756 1I TACAAATTTG -/A AGCTGAGCTC 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 1 2 209706 CASAVA_Build 4 76893153 1D TCTAAGTAGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 9 8 209707 CASAVA_Build 4 76897294 2I AATGGAATAA --/CT CTGTGCATAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 CT 1 2 209708 CASAVA_Build 4 76902672 1I TTTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 10 11 209709 CASAVA_Build 4 76905815 1I GTACCAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1090 hom 32 4 16 12 T 14 15 209710 CASAVA_Build 4 76908628 1I ACTAGTATCT -/A ATTAATAGAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 1 2 209711 CASAVA_Build 4 76913543 2D AAAAGAAACT AA/-- AATATACTAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 4 2 209712 CASAVA_Build 4 76914091 1D ATATCTGTGC T/- TTTTTTTCGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 T 8 7 209713 CASAVA_Build 4 76914835 4D CACTAAACAT TCTC/---- TTTCTTCTCT 3070 het 3070 hom 33 15 18 1 TC 2 0 209714 CASAVA_Build 4 76921938 1D ATGTCTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 13 13 9 A 10 9 209715 CASAVA_Build 4 76926634 2D GAGACATAAC TG/-- TGTTAAATAG 3070 het 3070 hom 45 21 22 3 TG 2 1 209716 CASAVA_Build 4 76929460 3I TTTGTGTTGC ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 TGT 4 5 209717 CASAVA_Build 4 76930225 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 25 0 18 9 A 11 10 209718 CASAVA_Build 4 76931089 1I CTTAGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 12 13 209719 CASAVA_Build 4 76931978 1D TATATTTACC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 76 het 33 0 26 8 A 9 8 209720 CASAVA_Build 4 76937053 1D GAGTTACAGA T/- TTTTTTTTTT 2732 het 304 hom 22 1 7 14 T 15 14 209721 CASAVA_Build 4 76937652 2I CATTATTCTC --/TT TCTTTTTTCT 3070 hom 36 het 25 0 13 12 T 1 3 209722 CASAVA_Build 4 76938999 5I TTTCAAACAA -----/GTTTT GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 GTTTT 3 4 209723 CASAVA_Build 4 76939367 1I TTGTTTTTTG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 0 1 209724 CASAVA_Build 4 76940696 3I ATAATGATGC ---/TTT TTTTTTTTTT 2712 het 2370 hom 35 10 13 12 T 15 18 209725 CASAVA_Build 4 76943265 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2794 het 717 hom 15 2 9 4 A 13 14 209726 CASAVA_Build 4 76946601 1D TACAGTTCTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 9 8 209727 CASAVA_Build 4 76947846 2D TAATATGCTC TT/-- TTGGTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 T 4 2 209728 CASAVA_Build 4 76949334 21D GCACCTTCTC TTTAGATTACTTACTAGCCGG/--------------------- TATTCTAGTA 3070 hom 81 het 24 0 28 6 TTTAGATTACTTACTAGCCGG 1 0 209729 CASAVA_Build 4 76949487 1I TCAGTCCAAG -/A CTGGCAGTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 0 1 209730 CASAVA_Build 4 76957822 1D GGCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 15 14 209731 CASAVA_Build 4 76958044 2D16M1D TGGTCCTCTC TTATGCATATCTCAGTAAT/--ATGCATATCTCAGTAA- TTGGCACCAT 3070 het 3070 ref 45 24 23 7 N/A 0 0 209732 CASAVA_Build 4 76959358 2D CCTGGGTGAC AA/-- GAGCAAAACT 3070 het 2395 hom 15 6 7 2 A 2 0 209733 CASAVA_Build 4 76960399 5I GCATAGAAAA -----/GATAT CTCCCGTGAG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 GATAT 0 1 209734 CASAVA_Build 4 76963548 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 830 het 830 ref 7 4 3 0 T 8 9 209735 CASAVA_Build 4 76967499 1D TGCAGAATAT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 524 hom 21 3 12 7 G 10 9 209736 CASAVA_Build 4 76982031 1D CATGGTTGAG A/- GCTCTCAGCT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 A 1 0 209737 CASAVA_Build 4 76999415 1D AACTACAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 32 1 22 9 T 13 12 209738 CASAVA_Build 4 77001619 1I CAACAATGAT -/G GGGGGACAAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 5 6 209739 CASAVA_Build 4 77008334 2I CTCAAAGTAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 10 12 209740 CASAVA_Build 4 77010032 1D TCACAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 258 hom 40 1 37 4 A 11 10 209741 CASAVA_Build 4 77016362 4I TACCCCAGAA ----/AGAG AGAGAAAGAG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 AG 2 4 209742 CASAVA_Build 4 77017558 2I6M1D AAAGAAAGAG --AGAAAGA/AAAGAAAG- AAGAAGAGGA 3070 hom 50 het 15 0 16 4 N/A 0 0 209743 CASAVA_Build 4 77017850 1D TTCCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 23 9 T 12 11 209744 CASAVA_Build 4 77020016 1I TTTACTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 10 11 209745 CASAVA_Build 4 77022717 2I GTTCTCAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 14 16 209746 CASAVA_Build 4 77026189 1I TCTGTCTTAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 51 0 13 38 G 0 1 209747 CASAVA_Build 4 77034036 4D ACCTTTCATT CTCC/---- CTCTTTTTTT 995 het 995 ref 53 25 8 22 CTCC 1 0 209748 CASAVA_Build 4 77036062 1I CTATTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 A 10 11 209749 CASAVA_Build 4 77039960 4I TCCAAACCAA ----/TGGC CAAAACTGCT 3070 het 3070 ref 45 27 14 4 TGGC 0 1 209750 CASAVA_Build 4 77041698 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1059 hom 13 3 9 1 A 13 12 209751 CASAVA_Build 4 77059230 1I TGATATAGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 9 10 209752 CASAVA_Build 4 77096585 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 41 3 20 18 T 14 13 209753 CASAVA_Build 4 77102059 4D GTTTAAAGAG GAGA/---- GACTTTTTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 4 GA 3 1 209754 CASAVA_Build 4 77114890 4D TGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 2796 hom 15 het 8 0 6 4 AAAC 3 2 209755 CASAVA_Build 4 77218839 1I CTATTTTTTG -/T TTAACCTTTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 2 3 209756 CASAVA_Build 4 77241931 1D TCCATCTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 A 10 9 209757 CASAVA_Build 4 77248540 3I TTTAATGTTT ---/ATC ATCAAAACTA 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 ATC 1 2 209758 CASAVA_Build 4 77248793 1D GGCAGTAATG C/- CCCCCTGAGA 3070 het 3070 ref 39 25 10 7 C 6 5 209759 CASAVA_Build 4 77249423 1D TTTTATCACC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 9 8 209760 CASAVA_Build 4 77250288 1D AAAACATTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 T 10 9 209761 CASAVA_Build 4 77284501 1D TTCGTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1527 het 1527 ref 33 21 6 7 A 15 14 209762 CASAVA_Build 4 77293354 1D GGGTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2969 hom 31 10 11 10 A 13 12 209763 CASAVA_Build 4 77313506 2D TTCTTTTAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 44 0 25 20 T 14 12 209764 CASAVA_Build 4 77353236 1D CCTGCCTCTT C/- TGCGGTGTCT 3070 hom 108 het 40 0 35 6 C 1 0 209765 CASAVA_Build 4 77366290 1I CGACGGAGTC -/A AAAGGAATGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 4 209766 CASAVA_Build 4 77367178 4I TCTTTCGAAT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 51 het 20 0 18 4 TTTG 3 4 209767 CASAVA_Build 4 77368268 1I CCTGAATACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 423 hom 30 1 27 2 T 9 10 209768 CASAVA_Build 4 77369111 1I TAAATTTCCC -/A AACTTTTAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 2 3 209769 CASAVA_Build 4 77377529 2D GGCCTTAGAG TT/-- TTTTTTTTTT 2870 het 6 hom 18 1 11 6 T 13 11 209770 CASAVA_Build 4 77385032 2D AAGTGTTGAC AT/-- ATGTTTTCTC 2602 het 2602 ref 18 12 6 1 AT 2 1 209771 CASAVA_Build 4 77405787 8I TGCTTTTTGT --------/TATTCATA TATTCATAAG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TATTCATA 1 2 209772 CASAVA_Build 4 77415245 1I AATTCATGTA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 6 7 209773 CASAVA_Build 4 77417725 1D GCAGTTTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2286 hom 18 7 9 3 A 11 10 209774 CASAVA_Build 4 77423423 2D GATTATTAAC AT/-- GTGATTTTGC 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 AT 1 0 209775 CASAVA_Build 4 77426980 1D ACAATTTGAC T/- TCCTCTCTTC 3070 hom 45 het 16 0 16 1 T 2 1 209776 CASAVA_Build 4 77430833 18I AGTTCTGCCT ------------------/CACTGGGGTTCCAGGTGC CACTGGGGTA 3070 hom 40 het 16 0 14 2 CACTGGGGTTCCAGGTGC 0 1 209777 CASAVA_Build 4 77439495 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 1312 het 509 hom 5 1 3 2 A 5 6 209778 CASAVA_Build 4 77440052 1I GACATGGGCA -/T ATTAATGGGG 3070 het 3070 ref 43 17 18 8 T 0 1 209779 CASAVA_Build 4 77447847 1I TACTTAAATA -/G GGGGACCCAA 3070 het 3070 ref 35 14 19 2 G 4 5 209780 CASAVA_Build 4 77491481 1D TGTACGATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 10 9 209781 CASAVA_Build 4 77496550 1D AAAACAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 151 hom 32 1 28 4 T 11 10 209782 CASAVA_Build 4 77508072 1D TAGTAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 39 3 14 22 T 15 14 209783 CASAVA_Build 4 77511168 1D TTCCTCTAAC A/- GAGGACAGAG 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 A 1 0 209784 CASAVA_Build 4 77520414 3I TGGAGGGATC ---/AGA AGAAGACAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AGA 2 3 209785 CASAVA_Build 4 77528974 2D GGCTCAGCAC AG/-- AGAGAGAGAG 1140 het 1140 ref 39 28 3 8 AG 8 7 209786 CASAVA_Build 4 77542803 2D TTATTCCATC TG/-- TGTCTGTTTT 3070 het 3070 hom 53 26 23 4 TG 2 1 209787 CASAVA_Build 4 77542990 1I GAGGAAAAAG -/A AATGAAATGA 3070 hom 112 het 45 0 35 10 A 2 3 209788 CASAVA_Build 4 77549522 1I TAAAATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 7 5 A 10 11 209789 CASAVA_Build 4 77557779 1D AAGAAGTGCC T/- TTTGCCTCCC 3070 het 3070 hom 26 12 12 4 T 4 3 209790 CASAVA_Build 4 77559529 1I GTACAGCATG -/C TATGTGATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 0 1 209791 CASAVA_Build 4 77574409 2D AAGGTTTTAC TT/-- TTTTTTTTTT 2831 het 612 hom 33 6 13 14 T 18 16 209792 CASAVA_Build 4 77575034 1D TCTTCTAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 15 10 A 11 10 209793 CASAVA_Build 4 77586592 3D TCGGTGAAAT GGC/--- GGCGGTGGGG 2757 het 2757 ref 24 12 7 5 GGC 2 1 209794 CASAVA_Build 4 77593462 1I AATTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 10 11 209795 CASAVA_Build 4 77607223 2I CCCAGAAAAG --/TT TTTTTTTTTT 2276 het 1064 hom 24 4 11 9 T 14 16 209796 CASAVA_Build 4 77612877 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 T 12 11 209797 CASAVA_Build 4 77615104 1D ACTCTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2485 hom 27 10 14 4 A 13 12 209798 CASAVA_Build 4 77627090 1I AGGCAACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2495 hom 33 7 19 7 A 10 11 209799 CASAVA_Build 4 77629032 10D TGAGGTCAAA ACTTGTTTTT/---------- ATCCCCAATT 3070 het 3070 ref 36 19 18 5 ACTTGTTTTT 1 0 209800 CASAVA_Build 4 77631068 1I TCACTAGCCC -/A ATATTACACA 3070 het 3070 ref 46 29 14 3 A 1 2 209801 CASAVA_Build 4 77636965 1D TCTTACTCAT C/- CTTTCCATTT 3070 het 3070 hom 52 22 26 5 C 2 1 209802 CASAVA_Build 4 77639623 6I AAATACTTAG ------/TATAAC AATAGGATTT 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 TATAAC 0 1 209803 CASAVA_Build 4 77661460 2I TGTATGTATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 202 hom 38 2 29 7 TG 6 7 209804 CASAVA_Build 4 77662329 1D TGATTGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 10 3 T 13 12 209805 CASAVA_Build 4 77668517 4D TCTTCTTCTT CTTC/---- TTTTTTTTTT 878 het 878 ref 33 11 11 12 CTTC 1 0 209806 CASAVA_Build 4 77669912 3D TCCAAGAGCT ACC/--- CCGACTTATT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 ACC 1 0 209807 CASAVA_Build 4 77673138 1D GTGACAGCTG C/- TGACTAATGG 3070 het 3070 ref 46 27 10 10 C 1 0 209808 CASAVA_Build 4 77674718 2I TACAAAAAAA --/AT GTAGTCTGAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 AT 0 1 209809 CASAVA_Build 4 77675074 1I TTGACTTCCT -/C CTTAAGGACC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 C 1 2 209810 CASAVA_Build 4 77681475 4I AATAAACGTG ----/CTAA CTAAGATGGC 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 CTAA 1 2 209811 CASAVA_Build 4 77682220 3D CAATTGTGAT GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 hom 94 het 51 0 37 17 GAG 6 5 209812 CASAVA_Build 4 77682310 1I ACATTCATCA -/C CCACAGTCTA 3070 het 3070 hom 56 23 24 9 C 2 3 209813 CASAVA_Build 4 77683686 1D ATACCAGGTT A/- GGCTACAGTA 3070 het 3070 hom 54 26 25 5 A 1 0 209814 CASAVA_Build 4 77729079 1D AAAAATAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 A 10 9 209815 CASAVA_Build 4 77740514 1D TACATGGCTT G/- CTCCTTCCTG 3070 hom 117 het 47 0 40 8 G 1 0 209816 CASAVA_Build 4 77751498 1D GTGTGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 31 1 24 7 T 12 11 209817 CASAVA_Build 4 77765685 4D AGCCTCTCCC TCTG/---- TCTGTCTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 9 TCTG 2 1 209818 CASAVA_Build 4 77769024 1D ACAGGTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 12 11 209819 CASAVA_Build 4 77788684 1D AAGACCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 37 1 28 8 T 11 10 209820 CASAVA_Build 4 77789163 1I GAGGACAAAA -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 38 20 18 0 T 6 7 209821 CASAVA_Build 4 77799210 1I TAAACAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 44 0 31 13 A 11 12 209822 CASAVA_Build 4 77812754 1I GATACATGCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 T 8 9 209823 CASAVA_Build 4 77817122 7D TCCGTCTCAC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 868 het 363 hom 7 2 3 2 A 23 16 209824 CASAVA_Build 4 77825565 1D AAAAAATCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 A 10 9 209825 CASAVA_Build 4 77826191 2D AATGATAGCC AT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AT 1 0 209826 CASAVA_Build 4 77830871 1I GATGGTTACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 9 10 209827 CASAVA_Build 4 77834157 2I AGAAAAAAAA --/AC AACAAAACTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AC 0 1 209828 CASAVA_Build 4 77834543 2D TTTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTGTG 3070 hom 118 het 43 0 38 7 T 9 7 209829 CASAVA_Build 4 77840931 1D ATGAAATATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 10 9 209830 CASAVA_Build 4 77858538 2I TATTGGTAGG --/TA TAGGAATTGA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 TA 1 2 209831 CASAVA_Build 4 77859883 4I GAATGAAAAA ----/CACT CACCCCTGTT 3070 het 3070 hom 36 17 19 0 CACT 0 1 209832 CASAVA_Build 4 77874463 3D ATCTCTTAGT TAA/--- ATTATATATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TAA 1 0 209833 CASAVA_Build 4 77875013 3D GGGATATGAT ATA/--- ATGTCAAGTA 3070 het 3070 hom 43 15 27 2 ATA 1 0 209834 CASAVA_Build 4 77889407 1I CATGGATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 10 11 209835 CASAVA_Build 4 77898635 1D CTGGGGATTT A/- AAAAAAAAAA 1807 het 1807 ref 34 17 6 11 A 17 16 209836 CASAVA_Build 4 77914887 4D TTTTTTGGGG TTTT/---- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 22 12 5 T 10 6 209837 CASAVA_Build 4 77924797 1D TAATTTTATA G/- TTGCTGATTC 3070 het 3070 ref 53 28 19 8 G 1 0 209838 CASAVA_Build 4 77937560 7D TTCTTGTATT TTTGTTG/------- TTTGAACATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTTGTTG 1 0 209839 CASAVA_Build 4 77939354 2D ACGAAGCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 12 10 209840 CASAVA_Build 4 77939960 1I GCCCCATCTC -/T TTAGCTTTCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 3 209841 CASAVA_Build 4 77940697 1D ATAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 10 9 209842 CASAVA_Build 4 77941272 1D CCCGACCCAA C/- CCCTCCTGGT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 C 4 3 209843 CASAVA_Build 4 77944730 1D AACCACCTTA T/- TTAATTGGCT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 3 2 209844 CASAVA_Build 4 77944749 1D CTTCTGGGTC T/- TTTTTTTTTC 1206 hom 9 het 22 0 5 18 T 10 9 209845 CASAVA_Build 4 77953097 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 209846 CASAVA_Build 4 77953808 3D TCCCAAAGTG CAT/--- TAAACGACAC 3070 hom 57 het 23 0 20 5 CAT 1 0 209847 CASAVA_Build 4 77956906 1D TTTCTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 503 hom 23 2 13 8 T 12 11 209848 CASAVA_Build 4 77963588 1D TCCCCTCCCA C/- CCACACACCC 3070 hom 124 het 46 0 38 9 C 3 2 209849 CASAVA_Build 4 77965365 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1792 het 1792 ref 28 16 4 9 A 15 14 209850 CASAVA_Build 4 77975909 1I TTAATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3047 hom 21 het 11 0 8 3 T 10 11 209851 CASAVA_Build 4 77979185 2I ATCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 3 T 12 14 209852 CASAVA_Build 4 77980215 3D TCTTCTCTTC TCT/--- TCTTCTTTCT 3070 hom 33 het 18 0 14 4 TCT 3 2 209853 CASAVA_Build 4 77981630 1D CTCACTATAT G/- TTAATTCCTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 1 0 209854 CASAVA_Build 4 77982311 4D CCCAGCTAAT TTTA/---- TTTATTTATT 2369 hom 15 het 9 0 6 5 TTTA 6 5 209855 CASAVA_Build 4 77983111 1D GATCCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 24 0 18 6 T 13 12 209856 CASAVA_Build 4 77984257 1I AGGGATAGAC -/A CTGCTAACAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 209857 CASAVA_Build 4 77987291 2D AGGAATGATT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 192 hom 42 2 24 16 A 11 9 209858 CASAVA_Build 4 77987880 1D AACCCACCAC A/- AAATGGATAG 3070 hom 87 het 37 0 28 9 A 4 3 209859 CASAVA_Build 4 78001728 4I9M1D GGGTAAGACC ----ATGTCTTGGA/ATGTATGTCTTGG- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 10 N/A 0 0 209860 CASAVA_Build 4 78008011 3I GTCTGTTTGC ---/AGG AGAAGTTTCC 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 AGG 0 1 209861 CASAVA_Build 4 78011966 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 22 0 19 3 A 13 12 209862 CASAVA_Build 4 78014224 1I TGTGTGTGAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 79 het 36 0 27 9 T 8 9 209863 CASAVA_Build 4 78014855 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1671 het 1178 hom 17 5 7 5 A 12 13 209864 CASAVA_Build 4 78015399 2I CTTTTAAAAC --/TT TATTTTTATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 3 209865 CASAVA_Build 4 78016150 1D TTAATCCATT A/- AAAAATTAAT 3003 het 3003 ref 22 11 9 3 A 6 5 209866 CASAVA_Build 4 78021337 3I TTAAATAAAA ---/TAG TAGAAGCTAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 TAG 1 2 209867 CASAVA_Build 4 78021470 1D TTGAATTGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 10 9 209868 CASAVA_Build 4 78022118 1D AACTCGGTAT A/- GAATTCCAGT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 1 0 209869 CASAVA_Build 4 78022276 1I TAGTGACAGA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 6 7 209870 CASAVA_Build 4 78023587 10I TCCTCTCTCT ----------/CCCTCTCTCC CCCTCTCTCC 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 CCCTCTCTCC 1 2 209871 CASAVA_Build 4 78026064 2I GTGGACTAGT --/TA ATAGGCCTCT 3070 het 3070 ref 47 20 14 13 TA 0 1 209872 CASAVA_Build 4 78029432 4D AAATTAGGGC TGGG/---- TGTGGTGGTT 1839 het 1839 ref 20 16 4 0 TGGG 1 0 209873 CASAVA_Build 4 78035155 1D AAAGAAAAAT A/- AAGCCATCTG 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 A 3 2 209874 CASAVA_Build 4 78048571 2D TATCTTTATC CT/-- CTTTCTCCTC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 CT 2 1 209875 CASAVA_Build 4 78063805 5D ACAGTAAGTA AAGTT/----- AATATATTGT 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 AAGTT 1 0 209876 CASAVA_Build 4 78121922 1D AAGATATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 42 1 27 14 T 14 13 209877 CASAVA_Build 4 78184773 4I ATATGAACTT ----/CTAA CTAACTAAGC 3070 hom 153 het 57 0 51 6 CTAA 2 3 209878 CASAVA_Build 4 78219805 2D TTTTTGAAAC AG/-- AGTCTCTCTC 3070 hom 47 het 24 0 16 8 AG 2 1 209879 CASAVA_Build 4 78225128 1D GCTTTACTGC A/- AATTCTAGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 3 2 209880 CASAVA_Build 4 78244845 6D CTTTTCTGAC AACTGG/------ AGCTCAAACA 3070 hom 126 het 43 0 43 0 AACTGG 1 0 209881 CASAVA_Build 4 78246072 1D AACAGAAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 10 9 209882 CASAVA_Build 4 78250507 1D TAAAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 2541 het 28 hom 13 1 8 4 T 15 14 209883 CASAVA_Build 4 78256359 2I TCTTTAATTC --/AG ACTTTTCCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AG 0 1 209884 CASAVA_Build 4 78257253 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 9 8 209885 CASAVA_Build 4 78260760 2I GAATTCACTT --/TG TGTTTATCCT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 TG 1 2 209886 CASAVA_Build 4 78274064 1I CTAATAAGGA -/C CCCCCCCAAC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 C 7 8 209887 CASAVA_Build 4 78282069 1D CCATCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 2584 het 2537 hom 19 8 7 4 A 14 13 209888 CASAVA_Build 4 78282651 1I AAGGGCTGTA -/G GGGAATCAAA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 G 3 4 209889 CASAVA_Build 4 78284099 1I TATTTTAATG -/T TTATATTTTA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 2 3 209890 CASAVA_Build 4 78300369 1D TCCCAGTACA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 27 11 16 0 T 9 8 209891 CASAVA_Build 4 78305610 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 9 7 9 T 11 12 209892 CASAVA_Build 4 78310468 1I CATGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 A 10 11 209893 CASAVA_Build 4 78320546 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2122 het 2122 ref 15 6 6 3 T 13 14 209894 CASAVA_Build 4 78328228 1I ACAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 T 10 11 209895 CASAVA_Build 4 78329953 1D GGGTGGTAGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 T 9 8 209896 CASAVA_Build 4 78332342 1D ATTTCACCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 T 11 10 209897 CASAVA_Build 4 78334151 1D CCTGAAGTCG T/- TTTTAGCAGG 3070 het 3070 hom 49 23 23 4 T 5 4 209898 CASAVA_Build 4 78336826 1I ATGAGAGAAG -/T TTACAGGTGG 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 T 2 3 209899 CASAVA_Build 4 78342170 3D AAATGTCAAC GTG/--- GTGGGTAACA 3070 het 3070 hom 50 20 24 8 GTG 2 1 209900 CASAVA_Build 4 78354290 1D TGGGGTATGA T/- TTTTTTGGCT 3070 het 3070 hom 50 17 20 13 T 7 6 209901 CASAVA_Build 4 78357748 2D AAGGAGTGAG GA/-- GAGGCACAAC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 GA 2 1 209902 CASAVA_Build 4 78360634 1I TAGTGTCTAA -/T AAATACCACT 3070 het 3070 ref 53 30 21 2 T 0 1 209903 CASAVA_Build 4 78369748 1D ACTTGTACTT G/- CTGAGCCTAG 3070 het 3070 ref 65 36 22 7 G 1 0 209904 CASAVA_Build 4 78375142 1D GCAGTCTCTT G/- GGGGGGGTCT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 8 7 209905 CASAVA_Build 4 78447813 2D GCTAATAAAC AG/-- GGGGCATTAG 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 AG 1 0 209906 CASAVA_Build 4 78487625 1I TTGTTGGGGT -/G GGGGGGGCGG 2541 het 2541 ref 27 16 8 3 G 7 8 209907 CASAVA_Build 4 78498919 1D CAGGGAAGAG C/- CCAAGATTGC 3070 hom 31 het 15 0 10 6 C 3 2 209908 CASAVA_Build 4 78514597 4D AGAACTCACT CTGA/---- CTACGTTTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 8 CTGA 1 0 209909 CASAVA_Build 4 78521379 1I AGAAGTCTTC -/T TAAGAAGGAA 3070 hom 156 het 63 0 52 11 T 1 2 209910 CASAVA_Build 4 78523155 3D ACAACTACTT CTC/--- CTCTTCCACC 3070 hom 132 het 50 0 42 9 CTC 2 1 209911 CASAVA_Build 4 78545946 1D TCAAAAAAAA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 7 6 209912 CASAVA_Build 4 78564763 1I ACATAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 24 14 10 T 11 12 209913 CASAVA_Build 4 78590502 1I GGCGACCATC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 1416 hom 31 7 17 7 T 8 9 209914 CASAVA_Build 4 78591161 6D CAAACTTCCC CCTCTT/------ CCTCTTCTTC 3070 hom 55 het 20 0 16 5 CCTCTT 2 1 209915 CASAVA_Build 4 78591366 1D ATTAAGTTAT G/- GGGGGAGTCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 G 6 5 209916 CASAVA_Build 4 78591872 1D AATGGCCTGG C/- CCTGTAGCCA 3070 hom 123 het 44 0 40 4 C 3 2 209917 CASAVA_Build 4 78592735 1I CCTTTTTTTT -/C CTCTGATTTA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 C 1 2 209918 CASAVA_Build 4 78593590 1I CTTCCCTGGA -/T TTTTGGACGT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 4 5 209919 CASAVA_Build 4 78595674 1I CTTGGAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 273 hom 30 1 25 4 T 10 11 209920 CASAVA_Build 4 78602605 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 209921 CASAVA_Build 4 78607859 2D CTATTAATGG CA/-- CACACACACA 3070 hom 111 het 47 0 38 9 CA 6 5 209922 CASAVA_Build 4 78640411 1I AATATTTGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 9 10 209923 CASAVA_Build 4 78640704 1I AGCTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 38 0 32 6 A 10 11 209924 CASAVA_Build 4 78642654 1D ATGGGAGAGG A/- AGACCCATGA 3070 hom 129 het 48 0 43 6 A 2 1 209925 CASAVA_Build 4 78767532 1I TAGTTTTTTT -/G TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 G 0 1 209926 CASAVA_Build 4 78793587 4I AGAAGTCCTC ----/TCTT TACCACAGAG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TCTT 0 1 209927 CASAVA_Build 4 78799229 4I CCAATAATAG ----/ACAA ACAGAGAGAC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 ACAA 0 1 209928 CASAVA_Build 4 78801341 1D AAAAGTAGGT G/- GGGCACAGTG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 4 3 209929 CASAVA_Build 4 78804740 2D CAGTAGGATC AA/-- GAGAGAAGGG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 2 0 209930 CASAVA_Build 4 78812387 4D ACAATTTGTT TATC/---- TAGTCACTCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TATC 1 0 209931 CASAVA_Build 4 78839339 1D CAACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 965 het 965 ref 38 16 5 17 A 19 18 209932 CASAVA_Build 4 78856326 1D GTGGGAAAAA G/- AATATCTCAT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 G 1 0 209933 CASAVA_Build 4 78858215 1I ATGTTTCCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 10 209934 CASAVA_Build 4 78863166 2D GAAAATATTA AT/-- AGTCTGTTAC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 AT 1 0 209935 CASAVA_Build 4 78865120 1I TGTTCAATGG -/T TATCATGTTG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 1 2 209936 CASAVA_Build 4 78876719 2I GCATCTACTT --/TC TGTTTCACAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TC 0 1 209937 CASAVA_Build 4 78877164 5D ATAAAGACAT AACTC/----- AATTTCTTAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AACTC 1 0 209938 CASAVA_Build 4 78880206 1D TACTGGTGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 10 9 209939 CASAVA_Build 4 78887765 1I TCTTGTGATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 9 209940 CASAVA_Build 4 78905548 1I GCTTTCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 32 1 25 6 A 11 12 209941 CASAVA_Build 4 78907924 1I TGGGAGGCTG -/C AGGCAGGTAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 0 1 209942 CASAVA_Build 4 78910795 5I AGGTACTTAC -----/CATAT AACAAATTGA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 CATAT 0 1 209943 CASAVA_Build 4 78916577 1I TAGTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 23 1 19 3 A 11 12 209944 CASAVA_Build 4 78921903 1I TACAAAAAAC -/A GATGCCTCTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 0 1 209945 CASAVA_Build 4 78922688 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 11 12 209946 CASAVA_Build 4 78922820 3D GTGCCTAGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 22 0 14 8 T 19 16 209947 CASAVA_Build 4 78926458 1I GACTCCCTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 47 het 27 0 19 8 A 9 10 209948 CASAVA_Build 4 78927435 2D CAAAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 4 CT 2 1 209949 CASAVA_Build 4 78935136 1I TGTCCCCTGC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 7 8 209950 CASAVA_Build 4 78940244 1D ATACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 11 10 209951 CASAVA_Build 4 78953475 7D TATTAGATAG ATTAGAA/------- ATAGATTAGA 3070 hom 36 het 30 0 13 18 ATTAGAA 1 0 209952 CASAVA_Build 4 78965642 4D ATTACCCCAT AAAC/---- AAAGTATAAC 3070 hom 135 het 47 0 46 4 AAAC 1 0 209953 CASAVA_Build 4 78981995 1I AGTGCAATAC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 100 het 39 0 33 6 T 6 7 209954 CASAVA_Build 4 78985377 1I ACATAGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 10 11 209955 CASAVA_Build 4 78987753 1I AAATGAAATT -/G TCCCCTCAGG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 0 1 209956 CASAVA_Build 4 79001828 3D TTATTCAGCA AAC/--- ATTTACTGAG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AAC 1 0 209957 CASAVA_Build 4 79004179 1D TGCATCACAG T/- TTTTTTTTTT 2444 het 1227 hom 40 6 10 25 T 19 18 209958 CASAVA_Build 4 79032306 1D TAGTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 13 12 209959 CASAVA_Build 4 79033160 4I TTAAGGAGAG ----/GTGA GTATGTTATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GTGA 0 1 209960 CASAVA_Build 4 79044263 1D ATCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 17 0 13 5 A 13 12 209961 CASAVA_Build 4 79047679 2D CCTCCCTCCG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 40 het 16 0 12 4 TC 6 5 209962 CASAVA_Build 4 79049297 2D ATGAATGTGA AC/-- ACCAGGAAAC 3070 hom 129 het 49 0 44 6 AC 2 1 209963 CASAVA_Build 4 79061951 1D TCGTGCAGAG T/- TTTTTTTTTT 1234 het 1234 ref 32 18 5 9 T 15 14 209964 CASAVA_Build 4 79064410 7I CTATTAATCA -------/GTGGTGT GTGTGTTTCG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GTGGTGT 0 1 209965 CASAVA_Build 4 79069948 2I GGTTTTATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 29 0 26 3 A 11 13 209966 CASAVA_Build 4 79085684 1D TGTACTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 33 1 29 4 T 11 10 209967 CASAVA_Build 4 79099786 4I ATATAAAAAC ----/AAAT AAGAACATAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AAAT 0 1 209968 CASAVA_Build 4 79106889 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 30 1 17 12 A 13 12 209969 CASAVA_Build 4 79115696 1D TTGCTGAGAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 209970 CASAVA_Build 4 79121876 3D CATTATTTAT TAA/--- TATTAGTGTG 3070 hom 108 het 43 0 37 8 TAA 1 0 209971 CASAVA_Build 4 79125143 1I GTTTTTCTAA -/T TTTTTATTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 5 6 209972 CASAVA_Build 4 79135219 1D TGTACCCTGA C/- CCGTTCCATC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 3 2 209973 CASAVA_Build 4 79135764 2D GCGCCAACAC AG/-- AGAAACACAG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 AG 2 1 209974 CASAVA_Build 4 79138581 1D CTGAGCCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 185 hom 35 1 24 11 T 19 18 209975 CASAVA_Build 4 79139276 1D TGCATGTGAC A/- AGTCTGGACA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 2 1 209976 CASAVA_Build 4 79140070 1I ATGCACAGTC -/A AAAAATCCAC 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 5 6 209977 CASAVA_Build 4 79144865 5D GTTTACTACA TTTAT/----- TTTATTTGTT 3070 hom 120 het 46 0 41 7 TTTAT 2 1 209978 CASAVA_Build 4 79145244 1I TTTGTAATCA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 9 209979 CASAVA_Build 4 79146595 13D AAATCTCTAT AACTTTTGGTGTG/------------- AACTTAAAAC 3070 hom 78 het 26 0 27 6 AACTTTTGGTGTG 1 0 209980 CASAVA_Build 4 79149483 1D TAATATTGTG A/- CTTTATAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 1 0 209981 CASAVA_Build 4 79154908 1D CCAAGCAGAT G/- TTAGCACCGT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 G 1 0 209982 CASAVA_Build 4 79166510 1D TAATTTCTTA T/- TTTTTAGGTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 6 5 209983 CASAVA_Build 4 79167006 1D AGCCACTGTT C/- CTGGCCCCTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 2 1 209984 CASAVA_Build 4 79167999 1I GGGAGGCTGA -/G GGGGGGCAGA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 6 7 209985 CASAVA_Build 4 79170051 1I TAAATTTACT -/G GGTTTTTTTT 3070 het 255 hom 31 1 30 0 G 2 3 209986 CASAVA_Build 4 79190388 1I ATTATCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 10 11 209987 CASAVA_Build 4 79190879 1D AATCTGAACG T/- TTTCTAAGAT 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 T 4 3 209988 CASAVA_Build 4 79200321 4D GCACTTTACA TACT/---- TTATCTCATT 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 TACT 1 0 209989 CASAVA_Build 4 79204488 1D AATAAATTCC T/- TTTTTCATAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 6 5 209990 CASAVA_Build 4 79209110 1I AAGAAAAGCA -/T TTGTGTCTAC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 2 3 209991 CASAVA_Build 4 79209765 1I TTATTGCCCC -/T GATGTGAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 0 1 209992 CASAVA_Build 4 79211975 1I GTGCAACATT -/A AGAGTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 18 10 10 A 1 2 209993 CASAVA_Build 4 79212218 1I GTTGTCGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 10 11 209994 CASAVA_Build 4 79212983 1D TAAAAACTTA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 T 8 7 209995 CASAVA_Build 4 79218084 1D GCCTTGTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 38 1 24 15 A 13 12 209996 CASAVA_Build 4 79222971 1D TGATCAGCTG A/- AAACTTAATT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 4 3 209997 CASAVA_Build 4 79229840 3I ATATAAAAGT ---/TTG AGCCAATTGC 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 TTG 0 1 209998 CASAVA_Build 4 79230062 1I CCCAATAGTT -/A ACTTTTTCTG 3070 hom 104 het 40 0 35 5 A 1 2 209999 CASAVA_Build 4 79230262 1I TGCAAACTTG -/T TGACTGAGAA 3070 hom 117 het 50 0 40 10 T 1 2 210000 CASAVA_Build 4 79237843 1I TCACTATCAT -/G AGAACAGCAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 G 0 1 210001 CASAVA_Build 4 79241293 1D AATAACTCGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 10 9 210002 CASAVA_Build 4 79252988 3I AAATTTTTAC ---/TTA TTTATTATTT 3070 het 2616 hom 15 6 8 1 TTA 0 1 210003 CASAVA_Build 4 79254807 4D GCTCTCTGTT TGTC/---- TGTTATTGGT 2611 het 885 hom 9 3 6 0 TGTC 1 0 210004 CASAVA_Build 4 79282310 1I TAACTTATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 9 10 210005 CASAVA_Build 4 79301354 1D CTTTATAAAG A/- AAAGGAAAGT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 4 3 210006 CASAVA_Build 4 79309962 1I ACTGAAACAA -/G AACTTGGGAC 3070 het 3070 ref 44 27 12 5 G 0 1 210007 CASAVA_Build 4 79324032 4D GAAAAGTTCA AAAT/---- AAATAACAAC 3070 hom 90 het 31 0 31 2 AAAT 2 1 210008 CASAVA_Build 4 79336783 1D TTTAGATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 11 10 210009 CASAVA_Build 4 79338119 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 31 0 23 8 A 13 12 210010 CASAVA_Build 4 79345370 1D CTTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2843 hom 41 15 15 11 T 15 14 210011 CASAVA_Build 4 79369890 1D AGCACAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 13 15 A 13 12 210012 CASAVA_Build 4 79373696 4D GAAAATGAAA TAGT/---- TAGAAGACAT 3070 het 3070 ref 48 25 20 5 TAGT 1 0 210013 CASAVA_Build 4 79383834 4D CCACTAGCAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 244 hom 27 5 10 12 AT 9 7 210014 CASAVA_Build 4 79386926 1D GATCTGGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 51 29 14 8 A 10 9 210015 CASAVA_Build 4 79394176 15I TTTACTTATT ---------------/TGTCTTTATTTATTA TGTCTTTATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TGTCTTTATTTATTA 0 1 210016 CASAVA_Build 4 79401514 5D TAGATCCTGT AGTAA/----- ATAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 46 21 17 9 AGTAA 1 0 210017 CASAVA_Build 4 79403091 1D TTGGAACAAC T/- TACTCAATTA 3070 hom 101 het 38 0 33 5 T 2 1 210018 CASAVA_Build 4 79411454 1D ATTACCATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 28 0 24 5 T 10 9 210019 CASAVA_Build 4 79422791 1D ACATTGAAGT A/- AAACCCATTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 4 3 210020 CASAVA_Build 4 79438476 2I TTATAAGGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 19 7 11 1 TA 6 7 210021 CASAVA_Build 4 79441555 1D CTTGAAGAGT A/- AAAAAAAAAA 2796 het 2796 ref 36 20 7 9 A 13 12 210022 CASAVA_Build 4 79466334 1I TATAAAGATC -/T GTCTGGTGGA 3070 het 3070 ref 43 16 17 10 T 0 1 210023 CASAVA_Build 4 79472893 4I TGTGCTATAC ----/TCTG TCTTTCATTC 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 TCTG 0 1 210024 CASAVA_Build 4 79483488 1I AATATTTTGG -/A AGTCCTTAAC 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 1 2 210025 CASAVA_Build 4 79487928 2D TTGGGATGTG TA/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2268 hom 40 13 19 9 TA 1 0 210026 CASAVA_Build 4 79495449 1D AGGAGGTACA T/- ATACAAACAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 1 0 210027 CASAVA_Build 4 79498731 3D TGGGGATAAT AAC/--- AGTGCCTACT 3070 het 3070 ref 33 15 16 3 AAC 1 0 210028 CASAVA_Build 4 79499470 1I ATACTTTTCT -/G GTTATAAGTC 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 G 1 2 210029 CASAVA_Build 4 79503039 1D GACTGAGTCT G/- GGATCTTTAT 3070 het 3070 ref 39 22 9 9 G 3 2 210030 CASAVA_Build 4 79520522 7I GCAATGTACT -------/GGGAGTG GGCGACAGAG 3070 het 3070 ref 52 29 22 1 GGGAGTG 0 1 210031 CASAVA_Build 4 79522072 5D AGGTATAATA AAAAT/----- TCAGCAAAAG 3070 het 3070 ref 27 14 13 2 AAAAT 1 0 210032 CASAVA_Build 4 79524915 1D ATACCGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2692 hom 22 9 9 4 A 12 11 210033 CASAVA_Build 4 79532914 5I ATTACTGGGC -----/AGATT ATTCAGTTGG 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 AGATT 0 1 210034 CASAVA_Build 4 79533588 3I AACTGAAAGT ---/TTG TACGTTTTGA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 TTG 0 1 210035 CASAVA_Build 4 79534732 1D TTATTCTGTT C/- CACTGGTCTA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 C 2 1 210036 CASAVA_Build 4 79540795 2I AAGCTGTGAA --/TC TCTCTCTGTC 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 TC 3 4 210037 CASAVA_Build 4 79542305 2I GAATTAAAAC --/TG TGTGGAAATA 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 TG 2 3 210038 CASAVA_Build 4 79545585 1D GGTAATGGAA T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 7 6 210039 CASAVA_Build 4 79547754 1I CTTTCTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 10 11 210040 CASAVA_Build 4 79550633 1I ATAATGATTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 2720 hom 15 6 8 1 A 8 9 210041 CASAVA_Build 4 79562765 3I AGGAGAGAAT ---/GTG GTGTCCTTGT 3070 het 3070 ref 49 20 20 9 GTG 1 2 210042 CASAVA_Build 4 79563613 12I AAAGTGCTGG ------------/GATTACAGGCAT GAGCCACTGC 3070 hom 41 het 18 0 11 7 GATTACAGGCAT 0 1 210043 CASAVA_Build 4 79568508 1I AAAAGTATTC -/T TTTTTTTTTT 2768 het 2768 ref 22 8 8 6 T 11 12 210044 CASAVA_Build 4 79575919 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 9 9 A 13 12 210045 CASAVA_Build 4 79581816 1D AATATTATGG A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 7 6 210046 CASAVA_Build 4 79588848 4D CCATGGAAAC AAAT/---- AACGAAATAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 5 AAAT 1 0 210047 CASAVA_Build 4 79593066 1I TTAAGAAAGA -/T TATAAACATG 3070 het 3070 hom 34 8 19 7 T 1 2 210048 CASAVA_Build 4 79593935 1I40M2D TGTGATCATA -CACTGCACTGCAGCTTGGTGACAGAGCAAGACCCTATCTCAA/CCACTGCACTGCAGCTTGGTGACAGAGCAAGACCCTATCTC-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 28 23 6 N/A 0 0 210049 CASAVA_Build 4 79595457 7I GTTTTTACAT -------/GTCAAAA GCCTCCCTTT 3070 het 3070 ref 37 16 18 3 GTCAAAA 0 1 210050 CASAVA_Build 4 79596416 1I CCGCCTCCCA -/G GATCAAGTGA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 G 1 2 210051 CASAVA_Build 4 79602294 2D GCTTGTAATC CT/-- CTAGCACTTT 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 CT 2 1 210052 CASAVA_Build 4 79605876 15D AGAGGGCCAT GCTGGCCCTGGTTAG/--------------- GCCTTGGCAT 3070 het 3070 ref 32 20 13 6 GCTGGCCCTGGTTAG 1 0 210053 CASAVA_Build 4 79609809 1I AAAAGTACTG -/T TTTGGTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 3 4 210054 CASAVA_Build 4 79613981 2I TGCATCATCT --/TA TATATAATAC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TA 3 4 210055 CASAVA_Build 4 79615082 1D TCATGTCCTT C/- CCCCATTGTC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 C 5 4 210056 CASAVA_Build 4 79616597 2D AACAAATACA GG/-- GCCCCATGTA 3070 het 3070 hom 56 25 26 6 G 3 1 210057 CASAVA_Build 4 79617168 1D CTTTCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 38 2 19 17 A 15 14 210058 CASAVA_Build 4 79623946 14D AAAAAAAAAA CTCTCTCTCTCTCT/-------------- CTATATATAT 668 hom 15 het 8 0 5 6 CT 8 1 210059 CASAVA_Build 4 79631022 1I AAAATCCTTC -/A AAAAAAATCA 2161 hom 12 het 11 0 5 6 A 7 8 210060 CASAVA_Build 4 79631049 1D CAGGAGCTGG T/- TTTTTTTTTA 1096 hom 7 het 12 0 3 9 T 10 9 210061 CASAVA_Build 4 79635478 4I TATGGTGTTC ----/TTAG TTGATCAGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TTAG 0 1 210062 CASAVA_Build 4 79645931 1D GTCATTCTCC A/- TCCATCTTTG 2428 het 2428 ref 21 14 6 1 A 1 0 210063 CASAVA_Build 4 79646935 1I ATGGGCTGCA -/C CCAATGTCCA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 C 2 3 210064 CASAVA_Build 4 79649343 1D CATAAGAAAA G/- GTTATATGCT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 G 2 1 210065 CASAVA_Build 4 79652697 1I GTACAATGAC -/A AAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 A 5 6 210066 CASAVA_Build 4 79655502 2D GTATGCTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 9 T 16 14 210067 CASAVA_Build 4 79658601 12D TTTTGTTGTG TATATATATATA/------------ TATATATATA 1261 het 428 hom 11 2 4 5 TA 15 9 210068 CASAVA_Build 4 79660435 1D GTTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2709 hom 23 10 9 4 T 13 12 210069 CASAVA_Build 4 79661824 1D ATCAATGCCG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 20 13 6 T 10 9 210070 CASAVA_Build 4 79673027 2D TAATTGTGTG TA/-- TATATACACC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 TA 4 3 210071 CASAVA_Build 4 79681818 1I TTGCTCATGA -/T TTTCACTTGA 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 3 4 210072 CASAVA_Build 4 79684125 4I GTCTGTACCA ----/TTTT TTCTGCTTTG 3070 het 3070 ref 55 30 18 7 T 2 6 210073 CASAVA_Build 4 79684645 3I TTATCATAGG ---/TCT TCTTTGGCAA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 TCT 1 2 210074 CASAVA_Build 4 79692759 1D ATGACCATAT A/- TAGGAAAGTA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 1 0 210075 CASAVA_Build 4 79696031 1I CCTATCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 21 10 A 12 13 210076 CASAVA_Build 4 79702406 1I AAGCAGTTAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 7 8 210077 CASAVA_Build 4 79703705 3D AGCTTGGTCA CGT/--- CTTCTGCCAT 3070 hom 70 het 34 0 21 14 CGT 1 0 210078 CASAVA_Build 4 79723361 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 10 9 210079 CASAVA_Build 4 79734493 1I TGCTTCCAAG -/T TTTGGCAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 3 4 210080 CASAVA_Build 4 79742418 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1071 het 1071 ref 21 10 5 6 A 19 18 210081 CASAVA_Build 4 79746973 1D CAGAAAGAGA T/- GCTGAGATGC 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 T 1 0 210082 CASAVA_Build 4 79760141 1I TACATAGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 10 11 210083 CASAVA_Build 4 79765136 2I CCTATATAAA --/AG AGCAACCTGA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 AG 1 2 210084 CASAVA_Build 4 79765690 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2178 het 696 hom 24 5 10 9 T 16 14 210085 CASAVA_Build 4 79766056 1D AATATTTGAG A/- AAAAAATGAC 2582 het 21 hom 10 1 7 2 A 7 6 210086 CASAVA_Build 4 79780528 3I CTTTCCTATA ---/TTG TTCATGTATT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 TTG 0 1 210087 CASAVA_Build 4 79784524 1D CTTACTGGGG A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 A 7 6 210088 CASAVA_Build 4 79792338 1D GTTGTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 27 1 14 12 A 15 14 210089 CASAVA_Build 4 79793383 10D AGGCAGAGAG AGAGAGAGGC/---------- AGAGAGAGAC 2738 het 2738 ref 25 13 12 1 AGAGAGAGGC 1 0 210090 CASAVA_Build 4 79794330 4I TTTAACAATC ----/TAAG TATTTATATT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 TAAG 0 1 210091 CASAVA_Build 4 79812964 1I GATGCTCATC -/T TTTGTTTTTT 2278 het 2278 ref 36 24 5 7 T 3 4 210092 CASAVA_Build 4 79820140 3I AAGAAAAAGA ---/AGC AGCAGCAGCA 3070 het 3070 hom 50 14 24 12 AGC 4 5 210093 CASAVA_Build 4 79840977 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 2123 het 615 hom 23 2 11 10 A 16 17 210094 CASAVA_Build 4 79841346 1D GTTTTCACAG T/- TTTCCCCCCA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 T 4 3 210095 CASAVA_Build 4 79849184 1I CAAAAAAATT -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 6 7 210096 CASAVA_Build 4 79863845 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1937 het 1937 ref 26 11 8 7 T 11 10 210097 CASAVA_Build 4 79864959 1D AAACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1716 hom 20 8 12 0 A 15 14 210098 CASAVA_Build 4 79867306 2D CTTCCTTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 31 6 9 16 T 17 15 210099 CASAVA_Build 4 79869055 1D GCTTTATAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 10 9 210100 CASAVA_Build 4 79928555 1D GATCTAAGGA T/- TTTTTTTTTT 1853 het 1853 ref 45 28 5 13 T 17 16 210101 CASAVA_Build 4 79931872 12D AGAAGTGGAA TCATAACAATAT/------------ TTAGCATTTT 3070 het 3070 ref 44 30 15 6 TCATAACAATAT 1 0 210102 CASAVA_Build 4 79934412 1I ATCTGTGTTG -/C CTGGGGTGCA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 C 1 2 210103 CASAVA_Build 4 79998964 4I CAACTTAGAG ----/TTAA TTAATGAAGC 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 TTAA 1 2 210104 CASAVA_Build 4 80012396 2D CTTTCGTCAC AT/-- GTCTCTTTCA 3070 het 3070 ref 36 16 15 7 AT 1 0 210105 CASAVA_Build 4 80049551 1I ATTTTTTTTT -/A ATGTAAACCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 1 2 210106 CASAVA_Build 4 80058409 5D CTGGATAGTA TATTT/----- TAATCTTACT 3070 het 1292 hom 23 3 16 5 TATTT 1 0 210107 CASAVA_Build 4 80065530 6I CAGTTCCCCA ------/TTTCAT TTTCATTTTC 3070 het 3070 hom 47 20 18 9 TTTCAT 1 2 210108 CASAVA_Build 4 80071059 6D ATGCACACAT TATATA/------ TATATATATA 3070 het 345 hom 10 1 9 0 TA 13 10 210109 CASAVA_Build 4 80073613 4D AGAAGCATAG GAGT/---- GAGAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 20 18 4 GAGT 1 0 210110 CASAVA_Build 4 80086149 1I TTTTTTCATA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 8 9 210111 CASAVA_Build 4 80088367 24I TTATTCACTT ------------------------/CTCTGATTTTAGTTGTGAGAAAAC CTCTCTCTCT 3070 hom 83 het 30 0 28 4 CTCTGATTTTAGTTGTGAGAAAAC 0 1 210112 CASAVA_Build 4 80097511 1I GATAAATAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 6 7 210113 CASAVA_Build 4 80099813 1I CTAAATATCC -/T ACAGTGCACA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 210114 CASAVA_Build 4 80103679 2D TCCCAGGATC AG/-- AGAGATACAG 3070 hom 147 het 53 0 49 4 AG 3 2 210115 CASAVA_Build 4 80108794 4D AAAGACTATC CTTT/---- CTTTCTCTAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 CTTT 2 1 210116 CASAVA_Build 4 80110994 4D CATTCCCCCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 51 17 21 14 TTTA 4 3 210117 CASAVA_Build 4 80115346 1I CCTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 447 hom 27 1 19 7 T 9 10 210118 CASAVA_Build 4 80126279 1I AGAACCATGC -/A GTCCAACTTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 0 1 210119 CASAVA_Build 4 80135181 4I51M1I ACAAAAAAAC ----AAAAACATGTTTCCTAGATGTTTGATAATGCTAATGCTATCGTAAATGGGA-/AAAGAAAAACATGTTTCCTAGATGTTTGATAATGCTAATGCTATCGTAAATGGGAT TTTTTTTTTT 3070 het 1828 hom 35 10 25 13 N/A 0 0 210120 CASAVA_Build 4 80139877 3I TATTTTAATT ---/ATC ATTAATTTCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATC 0 1 210121 CASAVA_Build 4 80141592 1I TTCTGTTTGT -/C TGTTGTTGGT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 0 1 210122 CASAVA_Build 4 80144007 1D TCGTTTCAGA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 8 7 210123 CASAVA_Build 4 80146140 1I TTTTGGACAG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 7 8 210124 CASAVA_Build 4 80146729 1D77M1I ATGCATTTTT GTCAGTGATAGGACACAAGTGATGTTATGTCCCTCTCGTGTATTTCATCAAGGGCAAATAGTGTCAGTTTGCTCCATT-/-TCAGTGATAGGACACAAGTGATGTTATGTCCCTCTCGTGTATTTCATCAAGGGCAAATAGTGTCAGTTTGCTCCATTA TTGGTGATGT 3070 hom 244 het 50 0 82 6 N/A 0 0 210125 CASAVA_Build 4 80149386 1I ATAGACTTGT -/A AAAAATATTG 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 5 6 210126 CASAVA_Build 4 80150131 1D ATTTTTTGTC T/- TCTGCTAGCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 1 210127 CASAVA_Build 4 80151271 1D TATGAATGAA T/- GAACTATTCA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 1 0 210128 CASAVA_Build 4 80151436 3D GAAGAAACAA TAT/--- TGTGAAAATG 3070 hom 90 het 31 0 29 2 TAT 1 0 210129 CASAVA_Build 4 80152191 5I TACAACAAAA -----/AAAAC AAACAGCCAC 3070 hom 41 het 20 0 14 6 AAAAC 0 1 210130 CASAVA_Build 4 80153158 1D AAAACAAACT A/- ACTCCTGTGA 3070 het 19 hom 24 1 21 3 A 2 1 210131 CASAVA_Build 4 80158222 1D27M4D GGTAATTTAT AAAAAAAACAGAAACTTACTGGCTCACAGTTT/-AAAAAAACAGAAACTTACTGGCTCACA---- GTTTTTGAGG 3070 hom 108 het 33 0 37 1 N/A 0 0 210132 CASAVA_Build 4 80158360 2D AGAAGGGCAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 105 het 48 0 35 13 AG 10 9 210133 CASAVA_Build 4 80158959 10D TGTGTTGGTG AGTCCCACAT/---------- AGAAATCAGT 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 AGTCCCACAT 1 0 210134 CASAVA_Build 4 80181381 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 15 16 210135 CASAVA_Build 4 80191038 1D TCAGAGAAAG A/- AAAGGAGACC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 4 3 210136 CASAVA_Build 4 80197094 1D CTTATATCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 80 het 29 0 26 4 T 9 8 210137 CASAVA_Build 4 80200220 3D TATGACCATT ATC/--- ATGATAACAA 3070 hom 132 het 46 0 45 2 ATC 1 0 210138 CASAVA_Build 4 80201156 2D TTCAATTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 12 10 210139 CASAVA_Build 4 80204946 1I TGATAACTTA -/G TTCAAACTGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 210140 CASAVA_Build 4 80205906 10D ATTGTTGGGG ACACACACAT/---------- ACACACACAT 3070 hom 96 het 39 0 33 9 ACACACACAT 2 1 210141 CASAVA_Build 4 80206947 1D GGAGTGTAGG T/- TAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 42 1 39 2 T 2 1 210142 CASAVA_Build 4 80208623 1I AACAGTGAAA -/T GGAAAAAAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 210143 CASAVA_Build 4 80229719 3D GCAAAGAGTT CTA/--- CTGCAAATAG 3070 het 3070 ref 43 19 17 9 CTA 1 0 210144 CASAVA_Build 4 80229928 4I ACACTTGAAC ----/TATA TATATCTCAT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 TA 2 4 210145 CASAVA_Build 4 80231123 1D CAATCATCCT A/- AAATCATCAA 3070 het 3070 hom 46 13 24 11 A 4 3 210146 CASAVA_Build 4 80244705 1D TTGTTGATTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 T 8 7 210147 CASAVA_Build 4 80245032 1I TTTATCCATG -/T ACATGCAAAG 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 T 0 1 210148 CASAVA_Build 4 80246798 6I TGATGGGGCA ------/CACATG CACATGCACA 3070 het 3070 hom 66 28 24 14 CACATG 1 2 210149 CASAVA_Build 4 80250420 4D TATATACATG TATA/---- TATATGTATA 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 TA 4 2 210150 CASAVA_Build 4 80255057 4D AATTTTTTAA TACT/---- TACAGGGGTG 3070 het 3070 ref 36 20 12 7 TACT 1 0 210151 CASAVA_Build 4 80263196 4D AGAACTGTAA CACT/---- CACCGCGAGG 2603 het 2603 ref 17 7 6 6 CACT 1 0 210152 CASAVA_Build 4 80292249 1I ATTTCTCAAG -/A ATTATAATCC 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 A 1 2 210153 CASAVA_Build 4 80296508 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TA 6 7 210154 CASAVA_Build 4 80306135 5I GAAGGATGAC -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 TTTCT 2 3 210155 CASAVA_Build 4 80309773 1I TACCTTATAC -/A AAAATTAACT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 4 5 210156 CASAVA_Build 4 80311112 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 10 9 210157 CASAVA_Build 4 80314670 1D TGAAGGTTAC A/- CCCTGCTGTG 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 1 0 210158 CASAVA_Build 4 80323620 4D TACTTACTGT TTTG/---- TTTGTTTTAG 3070 hom 99 het 36 0 34 5 TTTG 2 1 210159 CASAVA_Build 4 80330635 1I TGTCTCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1276 hom 37 4 28 5 T 12 13 210160 CASAVA_Build 4 80331516 1D GCATCTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 22 1 13 8 T 14 13 210161 CASAVA_Build 4 80334384 1I TAATTGAATA -/C CTGTCGTTGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 2 210162 CASAVA_Build 4 80338169 1D TTAAAGGTAA T/- TTAGTTTCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 2 210163 CASAVA_Build 4 80346140 1D CTGTTGCATT G/- GTCTATGTGT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 G 2 1 210164 CASAVA_Build 4 80353742 3D ATAAAATGAA CTT/--- CTTATGATTA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 CTT 2 1 210165 CASAVA_Build 4 80363825 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 1592 het 282 hom 11 2 5 4 A 15 14 210166 CASAVA_Build 4 80368770 4D TCTGGATTGT TTCA/---- TTCAGGGTAA 3070 hom 123 het 42 0 41 5 TTCA 2 1 210167 CASAVA_Build 4 80369575 4D CTGGACTGTC TGTT/---- TGATCTATGT 3070 hom 95 het 35 0 30 7 TGTT 1 0 210168 CASAVA_Build 4 80370690 1I TGATTCCTAC -/A AAAAGAAACC 3070 hom 54 het 29 0 18 11 A 4 5 210169 CASAVA_Build 4 80382453 2I TAGTTTCAGC --/TG TAGTTCCAGC 3070 hom 168 het 60 0 54 6 TG 0 1 210170 CASAVA_Build 4 80384517 1D GTAATACTAA G/- CCATAGGCAT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 1 0 210171 CASAVA_Build 4 80391816 1D AAAGTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 11 10 210172 CASAVA_Build 4 80392192 3I CTCAGCCATA ---/AAG AAGAATGAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AAG 1 2 210173 CASAVA_Build 4 80449487 1I ACTTCAGCCA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 7 8 210174 CASAVA_Build 4 80451219 1I GGTGTCCTGG -/A AAAGGTTTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 4 210175 CASAVA_Build 4 80462668 2I TTTATAGGTG --/TA TGTGTGTGTG 825 hom 36 het 26 0 13 14 TA 0 1 210176 CASAVA_Build 4 80468450 1I CATAGAATAG -/T TGCTGACTTA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 1 2 210177 CASAVA_Build 4 80537972 11D GGATTTCTTT ATATATTCTGG/----------- ATATTAATCC 3070 het 3070 ref 41 23 15 7 ATATATTCTGG 1 0 210178 CASAVA_Build 4 80630306 7D TTGTTATTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 18 11 210179 CASAVA_Build 4 80641086 1D GTCACCTTAT A/- GGGGAAAAAA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 1 0 210180 CASAVA_Build 4 80644724 1D CATTAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 34 3 20 11 A 15 14 210181 CASAVA_Build 4 80647380 4D GAAGTTTCTC AGTT/---- AGCATAATAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AGTT 1 0 210182 CASAVA_Build 4 80649826 1I AGACTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1545 hom 25 5 15 5 T 15 16 210183 CASAVA_Build 4 80665855 1I TCATTTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 848 hom 29 2 22 5 T 10 11 210184 CASAVA_Build 4 80668464 1D CCTGGATAGA C/- TTCTTCATGT 3070 hom 69 het 26 0 22 5 C 1 0 210185 CASAVA_Build 4 80669786 1I CCAACTTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 9 10 210186 CASAVA_Build 4 80676350 2I AATTTTTCTA --/TT TTGTCTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 4 210187 CASAVA_Build 4 80691403 2D AATAAAATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AT 7 6 210188 CASAVA_Build 4 80695684 1I CCTGGGTGGG -/C GCAAATCCTC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 0 1 210189 CASAVA_Build 4 80701225 1I AAAGCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 16 8 T 11 12 210190 CASAVA_Build 4 80708479 6I TTTGAGTCTT ------/TAATTG TAATTTTTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TAATTG 0 1 210191 CASAVA_Build 4 80713946 2D ATTCCCACTC TG/-- TATTATTTAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TG 1 0 210192 CASAVA_Build 4 80727931 1I ATAATAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 233 hom 18 1 11 6 A 9 10 210193 CASAVA_Build 4 80748412 2I CATTTTTTTC --/AT ATGTTTTTTG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 AT 1 2 210194 CASAVA_Build 4 80763703 1D GGAGGTTGTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 7 210195 CASAVA_Build 4 80770700 1D AGCATATGTA T/- TTACTCCCGC 3070 hom 106 het 41 0 36 5 T 3 2 210196 CASAVA_Build 4 80774959 1I AATCAAACAC -/A TTTTTTTGAG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 0 1 210197 CASAVA_Build 4 80775849 1D CCACCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3035 het 110 hom 25 3 11 11 T 12 11 210198 CASAVA_Build 4 80782821 1I TAATCTATGT -/G GCTAATTTCA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 G 1 2 210199 CASAVA_Build 4 80792948 4I CTTTACAGAT ----/TAGA TAGTCTTCCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TAGA 0 1 210200 CASAVA_Build 4 80799358 1D AACAAACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 27 1 21 7 A 12 11 210201 CASAVA_Build 4 80805062 1I ATTGTTTAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 349 hom 37 1 31 5 T 9 10 210202 CASAVA_Build 4 80805882 6I TAAACGCTTT ------/AAAAAA AAAAATGTCA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 5 11 210203 CASAVA_Build 4 80806063 1D ATTAAAAAAA C/- CTTTTAGAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 C 2 1 210204 CASAVA_Build 4 80807311 1D CCTGTATCCT C/- CCTCTGACAC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 3 2 210205 CASAVA_Build 4 80807943 1D TGTGAAGAAT C/- CAAATTCTAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 2 1 210206 CASAVA_Build 4 80813192 1I GATCTTCAAC -/A AAGCAATCAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 2 3 210207 CASAVA_Build 4 80818498 1D GTAAATTGTC T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 6 210208 CASAVA_Build 4 80822687 4D ACACAAAATC TTTG/---- TTTGTCATAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTTG 2 1 210209 CASAVA_Build 4 80823768 6I AAAATTGAGA ------/TAAAAT TAAAATAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TAAAAT 1 2 210210 CASAVA_Build 4 80828972 1I ATTTTCTGCC -/T CATGAAGTCT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 T 0 1 210211 CASAVA_Build 4 80829951 1I TGGCAGACCA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 8 210212 CASAVA_Build 4 80830528 3I ACATCCACAC ---/CAA CATCTGTTAT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 CAA 0 1 210213 CASAVA_Build 4 80860514 1D CCAAGTAGCT G/- GGGGCATCAG 3070 hom 84 het 29 0 28 1 G 5 4 210214 CASAVA_Build 4 80861658 1D ATGAAAATTT A/- AATAGTTACA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 3 2 210215 CASAVA_Build 4 80864732 1D TACTGTTAAT A/- ATAATTGGAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 1 210216 CASAVA_Build 4 80865272 1I CCTTTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 13 3 T 10 11 210217 CASAVA_Build 4 80873293 2I AAGAAAAGAC --/AG ATAGTTCAAT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 AG 0 1 210218 CASAVA_Build 4 80875097 1I TTATCATTCC -/T TTGGTGTAGG 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 T 2 3 210219 CASAVA_Build 4 80876015 1I GGGTTACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 11 12 A 15 16 210220 CASAVA_Build 4 80881928 1D TAGACTGACA G/- ATCTATAGGA 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 G 1 0 210221 CASAVA_Build 4 80883970 1D CTCTTTTATA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 37 23 10 5 T 8 7 210222 CASAVA_Build 4 80893954 4I GTCAATTAAA ----/AAAC AAACAAATAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAAC 1 2 210223 CASAVA_Build 4 80903731 1D TTGAAAAAGG A/- AAAATATAGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 5 4 210224 CASAVA_Build 4 80906271 1D TTGACTTTTT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 8 7 210225 CASAVA_Build 4 80907683 1D TTTCAGGGAC A/- AAAAAAATCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 210226 CASAVA_Build 4 80914692 1I AATAAAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 10 11 210227 CASAVA_Build 4 80915890 1D CAGTAGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 29 1 20 8 A 15 14 210228 CASAVA_Build 4 80922971 1D ATGGCAGGCA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 T 8 7 210229 CASAVA_Build 4 80927153 15I GCAATGTACT ---------------/AATTGCCAGTAATTG CCAGAGATTC 3070 het 2699 hom 29 6 17 6 AATTGCCAGTAATTG 0 1 210230 CASAVA_Build 4 80929696 14D ACAGGTGTAT TTGCCCAATGTCAG/-------------- TACCCCCATT 3070 het 3070 ref 38 30 8 6 TTGCCCAATGTCAG 1 0 210231 CASAVA_Build 4 80933694 4D AGGAAATAAT AGAA/---- AGCACAAATG 2665 het 2665 ref 20 14 6 0 AGAA 1 0 210232 CASAVA_Build 4 80936607 3D CCCTCCTTCT TTC/--- TTTTCTTCTT 3031 het 3031 ref 26 10 10 7 TTC 1 0 210233 CASAVA_Build 4 80941513 1D ACATTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 41 3 30 8 A 14 13 210234 CASAVA_Build 4 80945419 1D CAAGCTAGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 10 9 210235 CASAVA_Build 4 80950221 2I ATATGAGGTA --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 GT 5 6 210236 CASAVA_Build 4 80951474 34D GGATTATGGA ATATATATGTATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------- ATATATATAT 3070 het 506 hom 15 3 11 3 ATATATATGTATATATATATATATATATATATAT 1 0 210237 CASAVA_Build 4 80961195 1D GTGACGGGAG A/- AATCTCCGAA 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 A 3 2 210238 CASAVA_Build 4 80962801 2D TTACAAAAAT AA/-- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 30 12 14 6 A 10 8 210239 CASAVA_Build 4 80970139 1I AGCTGCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 T 10 11 210240 CASAVA_Build 4 80973827 1D ATATAGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 46 0 39 8 A 12 11 210241 CASAVA_Build 4 80975180 1D GACTGGCATC T/- TTTACTTAGC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 4 3 210242 CASAVA_Build 4 80980446 1I TCTAGATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 10 11 210243 CASAVA_Build 4 80985854 1D ATTTAATAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 10 9 210244 CASAVA_Build 4 80989129 1D GATGTTAAGT G/- GCTTTGCAAA 3070 het 3070 ref 56 23 20 13 G 2 1 210245 CASAVA_Build 4 80991373 3D AAATATGATT GCA/--- AATAACAAAC 3070 hom 105 het 39 0 36 5 GCA 1 0 210246 CASAVA_Build 4 80993794 1D CTGGAGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 29 1 23 5 A 12 11 210247 CASAVA_Build 4 81011034 1I ACTTCATTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 210248 CASAVA_Build 4 81012701 8D ACATGTTTAC TGAATGAA/-------- TGAATGAATG 3070 het 1699 hom 35 11 14 13 TGAA 7 5 210249 CASAVA_Build 4 81013088 1I CTGAATCATC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 8 9 210250 CASAVA_Build 4 81018745 1D TTACCATTTT A/- TTGCTAGCAT 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 A 1 0 210251 CASAVA_Build 4 81021199 1I CTACCTATAG -/A AAAAAGTCTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 5 6 210252 CASAVA_Build 4 81023296 1I AATGAAAAAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 A 7 8 210253 CASAVA_Build 4 81026378 5I TCTCACCCTC -----/GAAGA GAAGAATTCA 3070 het 3070 ref 49 20 21 8 GAAGA 1 2 210254 CASAVA_Build 4 81027495 1D ACTAAGCATA T/- TAACAGCCTA 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 T 2 1 210255 CASAVA_Build 4 81028160 1D AGTAAGTTAG A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 7 6 210256 CASAVA_Build 4 81028616 2D10M1D TCCAGTTATA TCTCTTTCACATA/--TCTTTCACAT- AAAAATAAAC 3070 het 3070 ref 52 33 21 2 N/A 0 0 210257 CASAVA_Build 4 81039573 1I ATCACTCTCC -/T TTTTTTTTTT 2892 het 2313 hom 25 10 9 6 T 13 14 210258 CASAVA_Build 4 81044295 1D TTTCAACTTT A/- AACTAAACAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 3 2 210259 CASAVA_Build 4 81049725 2D AGGAAGAAAA CT/-- CTGCTGATTT 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 CT 2 1 210260 CASAVA_Build 4 81051164 3D AAATTCTAAA AAC/--- AAGGCAATGC 3070 het 3070 ref 55 32 20 5 AAC 1 0 210261 CASAVA_Build 4 81059977 1D ACTCCTTAAT A/- AACTCCCTTT 2929 het 1333 hom 11 4 6 2 A 3 2 210262 CASAVA_Build 4 81061930 4D TTGTTTGTTT GTTG/---- GTTGGTTGGT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 GTTG 4 3 210263 CASAVA_Build 4 81065466 1D CACTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 13 12 210264 CASAVA_Build 4 81067229 2I ATATATGTGC --/GT GTGTGTGTGT 2950 het 538 hom 15 3 10 2 GT 6 7 210265 CASAVA_Build 4 81069916 1I GCAAATATAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 A 8 9 210266 CASAVA_Build 4 81074721 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 2555 het 2555 ref 34 17 9 8 A 13 14 210267 CASAVA_Build 4 81075694 1D37M1D GCTGAACTGG AAAAAAAAAAGGGAGCCATAAAACTGGAGAAAATGCCAG/-AAAAAAAAAGGGAGCCATAAAACTGGAGAAAATGCCA- AAGGAGCTTT 2481 het 2481 ref 21 16 9 9 N/A 0 0 210268 CASAVA_Build 4 81077243 4D TTTTACTTTT AATA/---- AATACATTAG 3070 het 3070 ref 30 16 11 6 AATA 2 1 210269 CASAVA_Build 4 81092273 1D TTCTAGCAAA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 2320 hom 16 6 8 2 T 7 6 210270 CASAVA_Build 4 81105264 9D TGCGGCCTCC GAGCCATAA/--------- GAGCCATAAA 2125 het 2125 ref 20 9 8 3 GAGCCATAA 2 1 210271 CASAVA_Build 4 81120031 1I AATTTTAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 A 8 9 210272 CASAVA_Build 4 81130409 1D ATTTAGAAAA C/- CCTAAATATT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 C 3 2 210273 CASAVA_Build 4 81134766 6D AACCCTGTTC CTCCTG/------ AGAATTACAT 3070 het 3070 ref 37 17 19 1 CTCCTG 1 0 210274 CASAVA_Build 4 81135520 1I AAAAATTATA -/G GTTGATTTCC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 G 1 2 210275 CASAVA_Build 4 81141348 1D CCATTGCAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2493 hom 28 6 19 3 T 9 8 210276 CASAVA_Build 4 81144669 4D GGTTCTTCCT GTAG/---- GCTCTAGGGA 3070 het 3070 ref 37 21 12 6 GTAG 1 0 210277 CASAVA_Build 4 81150225 1D TGTTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 11 10 210278 CASAVA_Build 4 81157714 1I CTTAAAGCAC -/A CAACCTATAC 3070 het 3070 hom 54 22 21 11 A 0 1 210279 CASAVA_Build 4 81171434 20D TTTGAACTGG GTGTGTGCATGCACACACAT/-------------------- GTGTGTGCGT 3070 het 3070 ref 41 24 18 4 GTGTGTGCATGCACACACAT 1 0 210280 CASAVA_Build 4 81183449 3I CTGCATTCCA ---/GCC TATTGTGCCA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 GCC 0 1 210281 CASAVA_Build 4 81189305 1I AGGTATTCTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 8 9 210282 CASAVA_Build 4 81194782 3D AAACAGTGCA GAG/--- GAAATCTAAC 3070 hom 72 het 27 0 24 4 GAG 1 0 210283 CASAVA_Build 4 81197881 1D TTACCATAAT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 8 7 210284 CASAVA_Build 4 81198858 1I CTGTAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 41 0 36 5 A 10 11 210285 CASAVA_Build 4 81207867 4D TCCTGATGAG ATTC/---- ATTCTCATCC 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 ATTC 2 1 210286 CASAVA_Build 4 81209388 4I TAAGACAGGG ----/ATCT ATCTAGATTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 ATCT 1 2 210287 CASAVA_Build 4 81212967 2D GCCGGAACTC TT/-- GACGAATCCC 1095 het 1095 ref 19 9 6 4 T 2 0 210288 CASAVA_Build 4 81217848 2D ATAAACTAAC AG/-- AAAGGCAAAT 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 AG 1 0 210289 CASAVA_Build 4 81229915 1I TTTTTGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 9 10 210290 CASAVA_Build 4 81232645 9D TTTGTTTTGT TTTGTTTTG/--------- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 26 4 TTTGTTTTG 1 0 210291 CASAVA_Build 4 81239695 30D ATATCTTCTT TATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 2378 hom 15 het 8 0 6 2 TA 21 6 210292 CASAVA_Build 4 81240627 1I GTACTTGGGG -/A AAAATACTAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 4 5 210293 CASAVA_Build 4 81247280 1I TCTTTAATTT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 6 7 210294 CASAVA_Build 4 81269852 1I TGTGTTAACG -/T TTTTTTTTTT 1340 het 1340 ref 52 39 3 10 T 10 11 210295 CASAVA_Build 4 81331640 5I CCACGGTTAC -----/TATAT TATATTACAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TATAT 1 2 210296 CASAVA_Build 4 81343917 1D GGGACACACA C/- CCCCCCCCAC 1304 hom 13 het 13 0 6 7 C 9 8 210297 CASAVA_Build 4 81345248 1I TGTATGTGAT -/A ACGACCAGTA 3070 hom 138 het 49 0 46 3 A 1 2 210298 CASAVA_Build 4 81345931 2I CTGGGAAATA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 19 9 T 10 12 210299 CASAVA_Build 4 81348085 2I CCCTCAAATG --/CA CACACACACT 3070 hom 73 het 37 0 25 12 CA 4 5 210300 CASAVA_Build 4 81350090 8D CACATAAAAC TATATATA/-------- TATATATATA 3070 hom 41 het 24 0 20 7 TA 12 8 210301 CASAVA_Build 4 81351790 6D ATCAGAGGTA TTTGAC/------ TTTGAGGCTG 3070 hom 96 het 39 0 32 8 TTTGAC 1 0 210302 CASAVA_Build 4 81356908 4I TGTACAGTAT ----/TAAG TTAGAAGTGT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TAAG 0 1 210303 CASAVA_Build 4 81364408 2D TTGTTGTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 29 1 26 2 T 12 10 210304 CASAVA_Build 4 81366575 6D TCATGAAACA TTTTCT/------ TTTTCTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 7 TTTTCT 3 2 210305 CASAVA_Build 4 81367727 1D TATGACCAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 40 0 33 8 T 10 9 210306 CASAVA_Build 4 81368394 1I AATATTTTTA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 6 7 210307 CASAVA_Build 4 81370058 2D CTCTATTCTG TT/-- TCACTGATTC 3070 hom 129 het 47 0 44 5 T 3 1 210308 CASAVA_Build 4 81372325 1I TTTTTATTTC -/T TATATTTTCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 210309 CASAVA_Build 4 81375495 1D CGACTAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 21 1 15 5 T 13 12 210310 CASAVA_Build 4 81377107 4D CCGTCCCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 11 AAAC 5 4 210311 CASAVA_Build 4 81378934 1I CAGCAGGGTA -/T CTTAAAGACT 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 T 0 1 210312 CASAVA_Build 4 81387645 1D CTCTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 25 0 24 1 T 11 10 210313 CASAVA_Build 4 81410544 1I GACAGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 1179 het 1179 ref 48 31 6 11 T 15 16 210314 CASAVA_Build 4 81445119 2I ATGAAAAGAG --/AA AGAGAAGGAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 1 3 210315 CASAVA_Build 4 81451348 4D ACCCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 32 1 16 16 A 19 15 210316 CASAVA_Build 4 81452021 4D CCATATGAAG CGTA/---- CGTATCACAC 3070 hom 102 het 40 0 34 7 CGTA 2 1 210317 CASAVA_Build 4 81458277 1D GGGGGATGCT A/- AAATGTTCTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 4 3 210318 CASAVA_Build 4 81459186 1D AGTTTCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 36 0 28 8 T 14 13 210319 CASAVA_Build 4 81476746 5D CCCCAGCTAC CCCCG/----- CTGCAGGGTG 3070 hom 72 het 27 0 25 4 CCCCG 1 0 210320 CASAVA_Build 4 81492911 2I TGATCATAAC --/AG AATTAAAACT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AG 0 1 210321 CASAVA_Build 4 81496287 1D TTCCCCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 T 11 10 210322 CASAVA_Build 4 81502296 1D TACTGGGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 110 hom 40 1 31 8 T 13 12 210323 CASAVA_Build 4 81502695 1I GCAATTGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 10 210324 CASAVA_Build 4 81509134 1D TTGAGAAAGC A/- AACACCTGTG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 3 2 210325 CASAVA_Build 4 81539226 1D ACAGACACTT C/- TCAAAAGAAG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 1 0 210326 CASAVA_Build 4 81549013 1D AACTTTTGCT G/- GTTTTTTTTC 3070 hom 55 het 27 0 18 9 G 2 1 210327 CASAVA_Build 4 81571545 1I CTCCATCTCT -/C CCCCCCTTCC 3070 het 152 hom 37 1 21 15 C 6 7 210328 CASAVA_Build 4 81580504 1D CTGGCGGGTG C/- CCCTCTGGGA 3070 hom 29 het 20 0 15 5 C 4 3 210329 CASAVA_Build 4 81587298 1I TTTTTATTTG -/T TTTTTTTTTT 503 het 208 hom 9 2 6 1 T 10 11 210330 CASAVA_Build 4 81588885 1D TGAACATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 9 210331 CASAVA_Build 4 81650039 1I TGCTGCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 34 1 18 15 T 14 15 210332 CASAVA_Build 4 81706642 1D TGACTGTTTT C/- CTCTGGTAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 2 1 210333 CASAVA_Build 4 81715875 1D TTTGCTCTTG C/- TTTTATAGTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 1 0 210334 CASAVA_Build 4 81716375 5D TAAAAAAAAA AATAT/----- ATATATATAT 2413 hom 12 het 5 0 5 0 AATAT 1 0 210335 CASAVA_Build 4 81747594 2I GTGGAGAAAC --/AG AGAGAAAGTG 3070 hom 106 het 41 0 35 6 AG 2 3 210336 CASAVA_Build 4 81755137 1I TGGTTTCCCA -/T TTTTTTCACA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 6 7 210337 CASAVA_Build 4 81772472 3D ATGCTTTAAG TTA/--- TTATTAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 TTA 3 2 210338 CASAVA_Build 4 81772892 1D ATTTTCAAGC T/- TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 45 31 6 8 T 12 11 210339 CASAVA_Build 4 81774656 2D GTCATTTCAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 TA 6 5 210340 CASAVA_Build 4 81785540 1D TTAGCCTTAG T/- TTTTTCTTTT 3070 hom 117 het 42 0 39 5 T 6 5 210341 CASAVA_Build 4 81787875 1D CTAGTTGTTC T/- TTTTATTTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 5 4 210342 CASAVA_Build 4 81793606 1I CAAATGGCCT -/C CCTACTGATC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 2 3 210343 CASAVA_Build 4 81808337 1I TTTAAATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 37 1 32 4 T 11 12 210344 CASAVA_Build 4 81822754 1D GCATACCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 40 0 29 11 T 12 11 210345 CASAVA_Build 4 81834021 1D ATCTGTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 6 A 11 10 210346 CASAVA_Build 4 81850757 1I GAAATAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 26 1 18 7 T 12 13 210347 CASAVA_Build 4 81872487 1D TTCTGCTTAC T/- TTTTTCCAGA 3070 hom 126 het 47 0 41 6 T 6 5 210348 CASAVA_Build 4 81911686 8I ATGCATATTA --------/CTGAGTAT CTTCTCAGAT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 CTGAGTAT 0 1 210349 CASAVA_Build 4 82002980 2I TTATATATTT --/TA TATATATATA 3070 hom 26 het 16 0 9 7 TA 5 6 210350 CASAVA_Build 4 82021744 1D GTTGGCCTCT A/- TCTTGCCTCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 1 0 210351 CASAVA_Build 4 82052127 1D GCCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 42 1 38 3 A 11 10 210352 CASAVA_Build 4 82065536 7D GGATTTTTAA ATGCAAC/------- ATGATTTACG 3070 het 3070 hom 51 22 27 4 ATGCAAC 1 0 210353 CASAVA_Build 4 82088619 18D GAGTGATTCA CACCCACCAAAATGTTTC/------------------ CAGTGTATTA 3070 hom 93 het 30 0 32 3 CACCCACCAAAATGTTTC 1 0 210354 CASAVA_Build 4 82089725 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 11 12 210355 CASAVA_Build 4 82103635 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTAAAAAA 3070 het 164 hom 31 1 27 3 T 4 5 210356 CASAVA_Build 4 82110353 1D GTAGCTAGGA C/- TACAGGCATG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 0 210357 CASAVA_Build 4 82113482 1D TTACTTTTTT A/- AAAAAACCTT 3070 hom 94 het 38 0 31 8 A 7 6 210358 CASAVA_Build 4 82114799 2D GTGTATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 33 0 23 11 AT 7 6 210359 CASAVA_Build 4 82120399 1D TGCATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 35 1 28 6 T 11 10 210360 CASAVA_Build 4 82144918 20D TCATCACTTC CTCACTTTAAGACATCCTGA/-------------------- AATATGAATA 3070 hom 135 het 43 0 46 5 CTCACTTTAAGACATCCTGA 1 0 210361 CASAVA_Build 4 82149076 1D GATGTGATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 9 210362 CASAVA_Build 4 82155154 6I AAAAAAACTT ------/AAAAAC AATGTTCCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAAAC 0 1 210363 CASAVA_Build 4 82155665 4I CGTTTCCTGA ----/CAGT CAGCTCCTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CAGT 0 1 210364 CASAVA_Build 4 82160692 1D GAGGTTTGCT G/- TAGGATTACT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 G 1 0 210365 CASAVA_Build 4 82170615 1I TTGGAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 209 hom 33 2 22 9 A 11 12 210366 CASAVA_Build 4 82174426 1D TGCTTGTAAG T/- TTTTTTGTCA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 7 6 210367 CASAVA_Build 4 82191197 1I TCATAGTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 43 1 35 7 A 10 11 210368 CASAVA_Build 4 82197386 4D GCAATTTTAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 51 het 21 0 18 5 AT 8 6 210369 CASAVA_Build 4 82199839 1D ATGTCTTGGG A/- AAAAAAGCAA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 7 6 210370 CASAVA_Build 4 82203562 14D CTGACAGTGG AAAGACTCTGAATA/-------------- AAAGCAATTG 3070 hom 81 het 28 0 28 3 AAAGACTCTGAATA 1 0 210371 CASAVA_Build 4 82203924 3D TGGCGTGGAT CTA/--- CTAAGGGATA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 CTA 2 1 210372 CASAVA_Build 4 82215693 1D TTCTTACCAC A/- AAAAAAAAAA 955 het 955 ref 30 21 3 6 A 13 12 210373 CASAVA_Build 4 82287110 2I TGTCAATATT --/AA AAATATGCTG 3070 hom 154 het 57 0 52 5 A 3 5 210374 CASAVA_Build 4 82360022 1D TATCTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 13 12 210375 CASAVA_Build 4 82368654 1D GAAAATAAAT A/- AGTAAGTATA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 2 1 210376 CASAVA_Build 4 82387522 1D AGAGTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2710 hom 40 16 13 12 A 15 14 210377 CASAVA_Build 4 82562445 1I GAATTCTCAC -/A GGGAGGGATT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 0 1 210378 CASAVA_Build 4 82565375 1D TGAGATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 T 11 10 210379 CASAVA_Build 4 82566334 1D TGGCCTTGTA C/- AAGTTATTAT 3070 het 3070 hom 32 9 21 3 C 1 0 210380 CASAVA_Build 4 82590567 2D TGACTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 AG 2 1 210381 CASAVA_Build 4 82601204 5D CACAGATGGT CTGCA/----- CACACCCTTA 3070 het 3070 hom 56 27 26 8 CTGCA 1 0 210382 CASAVA_Build 4 82607299 1I TTAAGGGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 52 26 23 3 A 9 10 210383 CASAVA_Build 4 82609833 2D GTGTATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 AC 9 8 210384 CASAVA_Build 4 82612394 4D TTGTGCAGTC GTGA/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 44 18 15 12 GTGA 1 0 210385 CASAVA_Build 4 82612920 4D GAAACAAGGG AAGA/---- AAGAGACCTA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 AAGA 2 1 210386 CASAVA_Build 4 82624011 6D TTATAGTAAA TATACT/------ TATATTTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 20 2 TATACT 1 0 210387 CASAVA_Build 4 82639988 1I CCACAAACAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 94 het 42 0 32 10 T 7 8 210388 CASAVA_Build 4 82640029 1D GCTGCCACCC T/- TTTTTTTTTT 2348 het 2348 ref 38 12 9 17 T 11 10 210389 CASAVA_Build 4 82640534 1D TATTGATTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 7 210390 CASAVA_Build 4 82642645 1D CATCTTGTCC A/- ACCTTTGCAT 3070 het 3070 hom 57 23 30 4 A 2 1 210391 CASAVA_Build 4 82649881 1I GATTTTTTTT -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 6 7 210392 CASAVA_Build 4 82653745 1D TTTTAATTTG C/- TTTTTTGCCA 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 C 1 0 210393 CASAVA_Build 4 82654513 13I AATTGGTATC -------------/CTTAGAACACCTA CACAGTCCAG 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 CTTAGAACACCTA 0 1 210394 CASAVA_Build 4 82664627 1D ATTGTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 11 10 210395 CASAVA_Build 4 82695011 1I TTGTGCATTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 21 8 1 T 8 9 210396 CASAVA_Build 4 82702245 1D TTTATTTCTA T/- TATAAGAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 2 1 210397 CASAVA_Build 4 82702628 2I TTCCTATATC --/TT AGCTTTTTCA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 0 2 210398 CASAVA_Build 4 82709998 3D AGTGAAGAAT ATA/--- ATAACTACGA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 ATA 2 1 210399 CASAVA_Build 4 82712606 1I TATTACTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 32 1 23 8 T 13 14 210400 CASAVA_Build 4 82719927 2D ATTGCTTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 32 2 12 20 A 13 11 210401 CASAVA_Build 4 82726229 1D TGTTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 31 1 24 7 T 12 11 210402 CASAVA_Build 4 82727280 1D AGTTTACTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 26 0 20 7 A 12 11 210403 CASAVA_Build 4 82735358 3I TAATGATATT ---/TAA TAATATCACT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TAA 1 2 210404 CASAVA_Build 4 82743774 6D TCTGGTTTCC AAATCT/------ TTGACTCCAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AAATCT 1 0 210405 CASAVA_Build 4 82747867 1I ACATATGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 34 0 22 12 T 11 12 210406 CASAVA_Build 4 82751761 18D AAAGAGGGAG GCAGGGACGCTGTAACCT/------------------ GCATCTCTGC 3070 het 3070 ref 37 19 18 5 GCAGGGACGCTGTAACCT 1 0 210407 CASAVA_Build 4 82761684 1I ACTATTGAGC -/A GACAGTTACA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 0 1 210408 CASAVA_Build 4 82763876 1I CATAATAAGA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 837 hom 27 4 17 6 T 1 2 210409 CASAVA_Build 4 82769430 1D TTCTCTTTCT A/- AATTTTCCAC 3070 het 63 hom 22 1 17 5 A 3 2 210410 CASAVA_Build 4 82772281 1D TCATGCCTGG T/- TATTCAATGT 3070 hom 160 het 60 0 54 7 T 2 1 210411 CASAVA_Build 4 82774020 18D ATGATCCACC TGCTTCGGCCTCCCAAAG/------------------ TGCTGGGATT 3070 hom 54 het 18 0 19 0 TGCTTCGGCCTCCCAAAG 1 0 210412 CASAVA_Build 4 82782734 1D ATTCAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1430 hom 34 8 21 6 A 19 18 210413 CASAVA_Build 4 82790883 4D TAAAGCCTTA TCAC/---- TCACTGTTAA 3070 het 3070 ref 37 20 12 8 TCAC 2 1 210414 CASAVA_Build 4 82797847 2I TTTGAGGGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 T 10 12 210415 CASAVA_Build 4 82805117 1I TCTGAAACTC -/T TCAGGACACT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 1 2 210416 CASAVA_Build 4 82805880 1D GGGCAAGAGA G/- GTTAAATAGC 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 G 2 1 210417 CASAVA_Build 4 82806639 1D TGTAACATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1724 hom 39 13 12 14 T 17 16 210418 CASAVA_Build 4 82835472 1I AAGGAAAATG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 8 9 210419 CASAVA_Build 4 82855657 2I CCAGCAAGCT --/GA GATACACTGG 1957 het 1957 ref 24 12 5 7 GA 1 2 210420 CASAVA_Build 4 82858615 4I TTAACAAAAC ----/AGAT AGACCACTAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AGAT 0 1 210421 CASAVA_Build 4 82865919 1I TGTAATATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2284 hom 26 6 12 8 A 12 13 210422 CASAVA_Build 4 82867595 1I TGAAAAATTG -/C TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 C 0 1 210423 CASAVA_Build 4 82883324 2D AATTGATGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 114 het 47 0 39 11 CA 9 8 210424 CASAVA_Build 4 82884210 5I GTGGCCTTGG -----/GCCTC TCGTGGTTGC 3070 hom 93 het 35 0 29 6 GCCTC 0 1 210425 CASAVA_Build 4 82890232 2D AGTTCCACTC TT/-- TTACTTCCAA 3070 het 3070 hom 58 26 30 3 T 4 2 210426 CASAVA_Build 4 82890457 6I CTTTACATTC ------/CTTCTA CTTCTACTAC 3070 het 3070 ref 40 22 12 7 CTTCTA 1 2 210427 CASAVA_Build 4 82896024 1I GTTGCTTTTT -/C CTTCAGCTCC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 C 1 2 210428 CASAVA_Build 4 82898629 1D TATGAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1596 hom 27 5 12 10 A 15 14 210429 CASAVA_Build 4 82905513 1I TGCCACCAAG -/A AAAAATGATT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 5 6 210430 CASAVA_Build 4 82907423 1D TACAGATAAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 T 8 7 210431 CASAVA_Build 4 82908874 1I ACAGAGATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 10 11 210432 CASAVA_Build 4 82910492 1D GAGGCAAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 9 het 32 1 17 14 A 8 7 210433 CASAVA_Build 4 82926892 20I TGAGACTTAC --------------------/ATCAGTGTGCACCTTTGCCG GTAAAGGACT 3070 hom 138 het 52 0 45 9 ATCAGTGTGCACCTTTGCCG 0 1 210434 CASAVA_Build 4 82928718 1D GGAGAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 20 0 13 9 A 13 12 210435 CASAVA_Build 4 82930427 1I AGCTGCAAAG -/C CCTCTGGGAG 3070 hom 102 het 41 0 33 8 C 2 3 210436 CASAVA_Build 4 82931162 1I ATCTACTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 10 11 210437 CASAVA_Build 4 82934287 1D CACAAGGCAA G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 88 het 43 0 26 18 G 9 8 210438 CASAVA_Build 4 82951554 1I GGTGAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 1593 het 1593 ref 22 13 4 5 T 10 11 210439 CASAVA_Build 4 82953127 2I AGCAAGACTC --/TT TTATTTCTGT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 T 2 4 210440 CASAVA_Build 4 82961050 1D15M3D CGACTACCTC TTTTTTTTATAGATAATGT/-TTTTTTTATAGATAA--- TTTATTGACT 3070 het 3070 ref 43 24 18 11 N/A 0 0 210441 CASAVA_Build 4 82962743 1D TGTGTGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1778 hom 38 11 13 14 A 16 15 210442 CASAVA_Build 4 82968646 1D TAATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2391 het 366 hom 15 2 8 5 T 13 12 210443 CASAVA_Build 4 82976427 1D CTATTTCAGT G/- GTTGGTAAAC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 2 1 210444 CASAVA_Build 4 82980733 1I TGGCTATAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 8 9 210445 CASAVA_Build 4 82984574 1I GTTAAAATAT -/G AAAATATGTG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 0 1 210446 CASAVA_Build 4 82995538 1I GGAGGCCTCA -/C AATCATGGCA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 C 0 1 210447 CASAVA_Build 4 82996441 1I ATCTCTTTAG -/A AAAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 A 6 7 210448 CASAVA_Build 4 83006574 1D CTTCATTTTA T/- TTTATTGAGT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 4 3 210449 CASAVA_Build 4 83011705 1I CCTTGGGGCT -/C CCCAGACCGG 3070 hom 81 het 31 0 26 5 C 3 4 210450 CASAVA_Build 4 83012777 1I AAGACTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1661 hom 34 5 22 7 A 10 11 210451 CASAVA_Build 4 83013506 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 21 1 18 2 A 12 11 210452 CASAVA_Build 4 83015362 1D CCCTATGTAA G/- GAAGGCCACA 3070 het 3070 ref 54 30 18 6 G 2 1 210453 CASAVA_Build 4 83023232 1I TCCAACCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 A 10 11 210454 CASAVA_Build 4 83029698 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 79 het 48 0 40 8 T 9 8 210455 CASAVA_Build 4 83035198 1D TAGTAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 425 hom 15 1 12 2 A 11 10 210456 CASAVA_Build 4 83043615 1D AGAAACTGAC A/- GATAATGAAG 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 1 0 210457 CASAVA_Build 4 83055664 1I AACTTCCTTC -/A TAGCATCTAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 0 1 210458 CASAVA_Build 4 83070673 1I GACACATTTC -/A AAAAAAGCCC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 6 7 210459 CASAVA_Build 4 83070866 1I GTTTTTGTGG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 T 7 8 210460 CASAVA_Build 4 83071893 1D AACTCAGAAA T/- TTTTTTTTTT 1774 het 1774 ref 15 9 6 0 T 11 10 210461 CASAVA_Build 4 83077867 5D CCCTTTCTTT GACTA/----- GGAAAGGGAA 3070 het 1451 hom 12 3 9 0 GACTA 1 0 210462 CASAVA_Build 4 83080031 1D CAAAAACTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2810 hom 29 9 20 0 A 11 10 210463 CASAVA_Build 4 83083886 1I TAGATATTCC -/A AATACCCTGA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 2 3 210464 CASAVA_Build 4 83089137 1I TAGTGCTGCA -/T TTTTTTCAAT 3070 het 2289 hom 17 6 11 0 T 6 7 210465 CASAVA_Build 4 83108451 1I TGAATATGCA -/C CAAAAGCACA 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 C 1 2 210466 CASAVA_Build 4 83110524 1I34M1I GTTTGGAGTA -TTTTTTACTTATTGTTTTTTTAACTTGCTCTCTC-/TTTTTTTACTTATTGTTTTTTTAACTTGCTCTCTCT AACTAGAATG 3070 het 3070 ref 41 26 14 8 N/A 0 0 210467 CASAVA_Build 4 83111531 2I ACTTTCCGTA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 T 9 11 210468 CASAVA_Build 4 83118556 1I AAATTACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 A 11 12 210469 CASAVA_Build 4 83119865 1D TAATGGGATT A/- ATTTAAATAA 3070 het 3070 hom 40 14 24 3 A 2 1 210470 CASAVA_Build 4 83120841 1D TTTAAGTGTT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 8 7 210471 CASAVA_Build 4 83121264 1I GTGCTCCCCA -/C CCCTCCATTT 3070 het 3070 hom 49 15 24 10 C 3 4 210472 CASAVA_Build 4 83131035 1D TTATCTTTAT A/- AACAAAAGAT 3070 het 3070 ref 34 17 15 4 A 3 2 210473 CASAVA_Build 4 83137775 3I TACATAACTT ---/TTA TTAGAGTATG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTA 1 2 210474 CASAVA_Build 4 83140339 1I CAGCTGTAAC -/A AAATTACCAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 3 4 210475 CASAVA_Build 4 83144320 3I CAAAACTAGA ---/AAC AACAAGGCAC 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 AAC 1 2 210476 CASAVA_Build 4 83144520 3D TCCCTTCTTG CTT/--- CTTCTGATAC 3070 het 3070 hom 35 11 14 11 CTT 2 1 210477 CASAVA_Build 4 83145644 1D TTTATAATTC A/- AAAAAACATT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 7 6 210478 CASAVA_Build 4 83151038 1D TTTTTTCCTG T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 8 7 210479 CASAVA_Build 4 83158826 1D TACACAAATA T/- TTTTAATCAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 5 4 210480 CASAVA_Build 4 83170092 1D ACAGTTAATA C/- CCAGGTTACC 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 C 3 2 210481 CASAVA_Build 4 83183440 4D AGACAAAGGA CACT/---- CTCTGCTCTT 3070 het 3070 ref 44 19 20 7 CACT 1 0 210482 CASAVA_Build 4 83189829 12I CTACCAAAGG ------------/TTTCATAATTAT TAGATGATTC 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 TTTCATAATTAT 0 1 210483 CASAVA_Build 4 83208957 1I GTAAATATAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 8 9 210484 CASAVA_Build 4 83213190 1D TTTTTAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 10 9 210485 CASAVA_Build 4 83223002 2D TAATTACCAC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 11 9 210486 CASAVA_Build 4 83225011 1I AGAGAGGGAA -/G GGGGGGTCAC 3070 hom 114 het 45 0 35 10 G 6 7 210487 CASAVA_Build 4 83225616 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1066 het 584 hom 15 4 3 8 A 15 16 210488 CASAVA_Build 4 83227548 1I GAAAAGAGGT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 0 1 210489 CASAVA_Build 4 83230017 6D GTGGAAACAG GCTTCT/------ GCTAGTGAAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 8 GCTTCT 1 0 210490 CASAVA_Build 4 83231471 1I TGACAGTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 743 hom 42 2 33 7 A 11 12 210491 CASAVA_Build 4 83234667 1I AATTGGGATG -/A AAAAAAATAT 3070 het 345 hom 44 1 41 2 A 7 8 210492 CASAVA_Build 4 83244999 1D GGTGGAGGGG A/- TCTGAGCAGG 3070 hom 60 het 23 0 15 8 A 1 0 210493 CASAVA_Build 4 83245357 1D GACTGCTATT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 8 7 210494 CASAVA_Build 4 83264860 2D TCCCTTACGA CC/-- CTTTTCCAAC 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 C 3 1 210495 CASAVA_Build 4 83268304 9D CTGGAAGAGG TGAGGAAGC/--------- TGAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 6 TGAGGAAGC 1 0 210496 CASAVA_Build 4 83277377 1D AAAATACAAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 8 7 210497 CASAVA_Build 4 83292073 1D TGCCCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 A 12 11 210498 CASAVA_Build 4 83293724 1D CTGGGAGAAC T/- TCCCCAACCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 2 1 210499 CASAVA_Build 4 83302024 1I GATACTACAA -/C CCAACAACAC 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 C 2 3 210500 CASAVA_Build 4 83305169 1D ACAATTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 12 11 210501 CASAVA_Build 4 83314807 1I CGACTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 10 9 12 A 10 11 210502 CASAVA_Build 4 83317014 1I AAGTTTAGAG -/A AAAAAGAATA 3070 het 124 hom 18 1 16 1 A 5 6 210503 CASAVA_Build 4 83326337 1I CAGCCACTGC -/A AAAAACATGC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 A 5 6 210504 CASAVA_Build 4 83329002 3D AGTCTTGGGT AAG/--- AAGAACAAAG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 AAG 2 1 210505 CASAVA_Build 4 83330480 2D TAAAAACATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 26 1 22 3 A 14 12 210506 CASAVA_Build 4 83333690 1D AAAGAAAAAA C/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 C 1 0 210507 CASAVA_Build 4 83334065 1I TCAGGGAAAG -/T TCTGATATCA 3070 het 3070 ref 54 30 19 5 T 1 2 210508 CASAVA_Build 4 83336270 1D TCCAGATCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 T 10 9 210509 CASAVA_Build 4 83339107 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2755 hom 24 7 12 6 A 11 10 210510 CASAVA_Build 4 83339666 1D TAATTAGAGA C/- AATTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 C 1 0 210511 CASAVA_Build 4 83340080 1D TAAAACTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 A 11 10 210512 CASAVA_Build 4 83343395 1D CATGAAGGAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 A 9 8 210513 CASAVA_Build 4 83343793 3D GGGTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TTG 1 0 210514 CASAVA_Build 4 83345627 1I AAGACACAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 6 7 210515 CASAVA_Build 4 83351726 1I TCTCCAAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 10 11 210516 CASAVA_Build 4 83380693 14D GAAAGAAAGG AAGAAAGAAAGAAA/-------------- AAGAAAGAAA 1797 het 1797 ref 18 11 4 4 AAGAAAGAAAGAAA 2 1 210517 CASAVA_Build 4 83383802 2I TAAGATAGAT --/AG ATATATATAC 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 AG 0 1 210518 CASAVA_Build 4 83390616 4I AGTATAAAGT ----/CAAA CAAAGGCTTA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 CAAA 1 2 210519 CASAVA_Build 4 83398317 1D TTGATATCTT A/- AAAAAAAAAA 1347 het 1347 ref 36 28 4 4 A 12 11 210520 CASAVA_Build 4 83417239 1I TGATTCTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 A 10 11 210521 CASAVA_Build 4 83419434 4I ACAAGAAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 AAAC 1 2 210522 CASAVA_Build 4 83431977 1D CCTCCATTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 7 6 210523 CASAVA_Build 4 83434399 74D AGGCAGAAAG GTCTAGATGGTTGAGTGGTCATGCTAAGGTTCATTTTAACATACTGTGGTTCACTTTAACATTCATTCCTCCCT/-------------------------------------------------------------------------- CCCCAACTCA 3070 hom 30 het 12 0 11 3 GTCTAGATGGTTGAGTGGTCATGCTAAGGTTCATTTTAACATACTGTGGTTCACTTTAACATTCATTCCTCCCT 1 0 210524 CASAVA_Build 4 83445543 1I AAGTTTTTCA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 2 210525 CASAVA_Build 4 83448640 3D TAACCTGATA ACT/--- AATTAATACT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 ACT 1 0 210526 CASAVA_Build 4 83451982 1D TTGTGGCCGA G/- GACTGCCTTT 3070 hom 70 het 27 0 23 4 G 2 1 210527 CASAVA_Build 4 83458027 2I CAGAGACCTT --/CA CAGCAGCTCC 3070 hom 56 het 23 0 17 6 CA 1 2 210528 CASAVA_Build 4 83459263 5D AATGCTGGTT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 57 het 27 0 20 9 AAAAC 5 4 210529 CASAVA_Build 4 83464093 24I GCGTGATCTC ------------------------/GGCTCACTGCAACGGCGTGATCTT GGCTCACTGC 3070 hom 36 het 12 0 13 0 GGCTCACTGCAACGGCGTGATCTT 0 1 210530 CASAVA_Build 4 83470783 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 94 hom 23 1 20 2 A 13 14 210531 CASAVA_Build 4 83471547 1I ACTCCAGGGG -/A AAAAAAATAA 3070 het 514 hom 35 2 27 6 A 7 8 210532 CASAVA_Build 4 83484631 1I ACATAAAAGT -/A AAAAGTGGAA 3070 hom 101 het 43 0 34 9 A 4 5 210533 CASAVA_Build 4 83485308 1D ACCAGATACT A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 106 het 41 0 36 5 A 8 7 210534 CASAVA_Build 4 83486585 1D AATCATATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 34 0 24 10 T 10 9 210535 CASAVA_Build 4 83492053 2D ATTCTTGTTA CC/-- GTTTGAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 C 2 0 210536 CASAVA_Build 4 83492972 1D GATCTATCAT A/- AAAAAACTTT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 7 6 210537 CASAVA_Build 4 83495455 1I TGTAAATGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 349 hom 39 1 37 1 A 9 10 210538 CASAVA_Build 4 83509753 4I ATTTGGATAC ----/TCTA TCTATTAACC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TCTA 1 2 210539 CASAVA_Build 4 83510705 1D GACCCCAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 40 0 34 8 T 10 9 210540 CASAVA_Build 4 83511387 5D TTTTTCATCT TAAAA/----- TAAATCAAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 8 TAAAA 1 0 210541 CASAVA_Build 4 83549284 1D ATAATCCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 22 1 13 8 T 13 12 210542 CASAVA_Build 4 83551015 1D AGCCAGTTGT G/- GGGTTTTTTT 2058 het 38 hom 12 1 9 2 G 4 3 210543 CASAVA_Build 4 83558078 1I CCCTACCATA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 8 9 210544 CASAVA_Build 4 83563226 20D AATCTGAATT AAATCTAGAGTTCAAAGCCC/-------------------- AAATCTAGAG 3070 hom 81 het 33 0 28 8 AAATCTAGAGTTCAAAGCCC 2 1 210545 CASAVA_Build 4 83563975 20D TAATGACTTA GTCACATTTGTAATGACTTT/-------------------- GTCATAACCA 3070 hom 120 het 38 0 40 6 GTCACATTTGTAATGACTTT 1 0 210546 CASAVA_Build 4 83564765 1D TTAAATTACA T/- TTTTTACAGA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 6 5 210547 CASAVA_Build 4 83566867 1I ATTCTAACAT -/A AAAATGATGC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 4 5 210548 CASAVA_Build 4 83571202 2I GCGGTGTGGC --/TT TGCCTCTTGT 3070 hom 77 het 28 0 20 8 T 1 3 210549 CASAVA_Build 4 83572093 1D TGAATAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 637 hom 31 3 20 8 T 14 13 210550 CASAVA_Build 4 83573163 1D ATTAATTTCC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 9 8 210551 CASAVA_Build 4 83575075 2I CAGAGCGAGA --/CT CTGTCTTTAA 3070 hom 57 het 24 0 18 6 CT 1 2 210552 CASAVA_Build 4 83578609 1D GGCAAGGAGA T/- TACTTGAGTC 3070 hom 60 het 24 0 19 6 T 2 1 210553 CASAVA_Build 4 83582736 1D CAATCTATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 T 10 9 210554 CASAVA_Build 4 83584403 1I AGCACTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 14 15 210555 CASAVA_Build 4 83585413 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 100 het 39 0 34 5 A 10 9 210556 CASAVA_Build 4 83622185 7D CTTTTTTTTG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2359 het 2359 ref 28 12 9 7 T 17 10 210557 CASAVA_Build 4 83638196 1D GCACACTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 9 11 T 15 14 210558 CASAVA_Build 4 83673354 6D TTTAACTGGT TATAAC/------ TATAACATCT 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 TATAAC 2 1 210559 CASAVA_Build 4 83674293 2I AGTAGGCCAC --/CA CAACTTACAG 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 CA 1 2 210560 CASAVA_Build 4 83686110 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 A 10 9 210561 CASAVA_Build 4 83689319 2D TTTTGCACAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 AT 6 5 210562 CASAVA_Build 4 83699067 3I AGATCCACAA ---/AAG AAGTGAAAAT 3070 het 1395 hom 14 3 11 0 AAG 1 2 210563 CASAVA_Build 4 83700297 1D GTGTTCACGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 11 10 210564 CASAVA_Build 4 83702925 3I GGTGGCTCTC ---/CTT TATCAACCGG 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 CTT 0 1 210565 CASAVA_Build 4 83705818 6I TATCTGAGTT ------/GGGGGC GGGGGGCGGT 3052 het 3052 ref 33 18 8 7 GGGGGC 0 1 210566 CASAVA_Build 4 83718107 1I ATGGAGAATG -/A GTCAATGTAA 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 A 0 1 210567 CASAVA_Build 4 83726388 1I AAACGGGGGA -/G GGGGGGGCAT 3070 hom 53 het 23 0 16 7 G 7 8 210568 CASAVA_Build 4 83737922 1D TAAATGGTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 T 10 9 210569 CASAVA_Build 4 83757296 1D GGGTGATGGA G/- TGGAGCAGCT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 G 1 0 210570 CASAVA_Build 4 83766936 1I AAAATGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 10 13 T 11 12 210571 CASAVA_Build 4 83774671 1I CTCCCCCCCC -/T CATCATTTTT 3070 het 1805 hom 29 7 12 10 T 0 1 210572 CASAVA_Build 4 83782289 1I CTCACATACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 T 9 10 210573 CASAVA_Build 4 83787524 2D TCCAAAACTC TT/-- TAACAACTCA 3070 hom 138 het 51 0 46 8 T 3 1 210574 CASAVA_Build 4 83787926 1D ACCGTGCTGT A/- AAAACTCCGG 3070 het 3070 ref 55 26 23 6 A 5 4 210575 CASAVA_Build 4 83788716 2D GCTCTGTGTT GG/-- TTTCCAAGAG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 G 2 0 210576 CASAVA_Build 4 83790856 4D CTGGGTGACA GAGT/---- GAGAACTTGT 3070 het 811 hom 25 3 13 10 GAGT 1 0 210577 CASAVA_Build 4 83790873 1D AACTTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 831 hom 23 5 9 9 A 12 11 210578 CASAVA_Build 4 83791016 2D AATTATATAT AA/-- GATTACATAT 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 A 2 0 210579 CASAVA_Build 4 83791137 2D GAAAAATAAC TG/-- TATTTTTCAA 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 TG 1 0 210580 CASAVA_Build 4 83799012 1I GGTATCAGGA -/T GCTGCTGGTC 975 hom 9 het 6 0 2 4 T 0 1 210581 CASAVA_Build 4 83800629 2I AATAATCAAC --/AT GTGTACAGGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AT 0 1 210582 CASAVA_Build 4 83804619 2D CAAAAGTGCA AG/-- GGGGGGGGAA 3070 het 292 hom 35 5 17 13 AG 1 0 210583 CASAVA_Build 4 83806294 1I ATAATAACTA -/G AAAATGAATT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 G 0 1 210584 CASAVA_Build 4 83813422 1I AGATGATGTG -/A TTGTCTTTGT 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 A 0 1 210585 CASAVA_Build 4 83822561 1I TCTACAGACG -/T TTTTTTTACA 3070 hom 91 het 36 0 30 6 T 7 8 210586 CASAVA_Build 4 83825838 1I TGCAGTGAGC -/T GAGATCACAC 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 0 1 210587 CASAVA_Build 4 83826996 1D ACTAATTAAC A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 70 het 28 0 24 4 A 8 7 210588 CASAVA_Build 4 83827363 5D13M4D AAAAAAAAAA AAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAG/-----AAAGAAAGAAAGA---- AAAGAAAGAA 3070 hom 23 het 16 0 17 4 N/A 0 0 210589 CASAVA_Build 4 83829548 6D ACACCACACT AAAAAG/------ AAAGAGTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 12 8 AAAAAG 1 0 210590 CASAVA_Build 4 83831188 4D CATTTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 32 0 20 12 TTTG 3 2 210591 CASAVA_Build 4 83834835 2I TCAATAACTC --/TT TGCAGATCCA 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 1 3 210592 CASAVA_Build 4 83846375 1D TCTATTAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 14 18 13 T 10 9 210593 CASAVA_Build 4 83849097 13I AATAAATAAT -------------/AATAATAGCTACC ATTGACTGAG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 AATAATAGCTACC 0 1 210594 CASAVA_Build 4 83851072 2D AAAACGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 42 het 20 0 15 6 AG 9 8 210595 CASAVA_Build 4 83851527 2I TTGAAGGGTG --/TT TTACTGGCAT 3070 het 3070 ref 49 24 16 9 T 2 4 210596 CASAVA_Build 4 83851883 3D ACCTTGTCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 21 11 A 15 12 210597 CASAVA_Build 4 83853502 1D GATTTACAGC T/- TATATAGCAA 3070 het 3070 hom 79 34 36 9 T 2 1 210598 CASAVA_Build 4 83876786 1D ACTTTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 12 11 210599 CASAVA_Build 4 83887129 9D GCAGACACAA GGGCGTCAG/--------- GGGGAGAGGA 3070 hom 25 het 12 0 10 6 GGGCGTCAG 1 0 210600 CASAVA_Build 4 83894642 1I TGCCACAGGA -/G GGGGTCTGGG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 4 5 210601 CASAVA_Build 4 83904908 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2446 het 2446 ref 32 17 6 9 T 13 14 210602 CASAVA_Build 4 83922776 1D AACAGCTTTT C/- CCCACACATC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 C 4 3 210603 CASAVA_Build 4 83927486 1D TGGTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 2118 het 2118 ref 40 23 6 12 T 13 12 210604 CASAVA_Build 4 83939331 1D TCCCCCCCCC A/- AAAAAAAACT 2529 het 1926 hom 22 9 8 5 A 9 8 210605 CASAVA_Build 4 83942159 3I TATTTCACTT ---/AGC AGAATGTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AGC 0 1 210606 CASAVA_Build 4 83944581 1D AAAGTGAGAA T/- AATACCTACC 3070 hom 111 het 45 0 38 8 T 1 0 210607 CASAVA_Build 4 83944857 1D TCAATATAGT A/- AAATCCATGT 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 4 3 210608 CASAVA_Build 4 83947394 1D AGACAGTCCT A/- AAAATGTACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 5 4 210609 CASAVA_Build 4 83952311 1I ATGCAGAGAC -/G GTTCTTATTT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 G 1 2 210610 CASAVA_Build 4 83954876 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 41 19 16 6 TA 5 6 210611 CASAVA_Build 4 83955998 1D ACTTTTTTTT C/- CATTTTTTAA 3070 het 2506 hom 31 7 23 1 C 2 1 210612 CASAVA_Build 4 83973710 1D GTTAAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 894 hom 25 2 17 6 A 17 16 210613 CASAVA_Build 4 83983850 2D GAGATTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 28 1 11 16 T 12 10 210614 CASAVA_Build 4 83985639 5I AATTCCCAAA -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 AAAAC 3 4 210615 CASAVA_Build 4 83986887 8D TACTTCATTA TTTTTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 TTTTTTTG 1 0 210616 CASAVA_Build 4 83989930 1I TTAAGATGTG -/A AAATTCAGAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 3 4 210617 CASAVA_Build 4 83997529 1I ATTTTCCAGA -/C TGCTTTAACT 3070 het 9 hom 47 1 40 6 C 0 1 210618 CASAVA_Build 4 84008705 1D CTAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 1 0 210619 CASAVA_Build 4 84012379 5I CTGTGGCTTA -----/TTTTG TTTTATTTAT 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 TTTTG 0 1 210620 CASAVA_Build 4 84012853 2D CTATCAAAAC TA/-- TATAAGTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TA 3 2 210621 CASAVA_Build 4 84016285 4D GGATAAATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1698 het 547 hom 18 6 5 7 T 20 16 210622 CASAVA_Build 4 84017561 1D ACTCAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 12 11 210623 CASAVA_Build 4 84017876 7I CTGCATTACA -------/TTTCTTT TTTCTTTTTT 3070 het 2503 hom 23 8 9 6 TTTCTTT 2 3 210624 CASAVA_Build 4 84020758 2D GAAGTAAGAT TC/-- TGTCTCAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 TC 1 0 210625 CASAVA_Build 4 84026234 1D AGAGCCAAGA T/- TGGAACTTGC 3070 het 3070 hom 36 16 18 4 T 2 1 210626 CASAVA_Build 4 84028876 1D AGAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1814 hom 29 5 14 10 A 15 14 210627 CASAVA_Build 4 84031904 4D GGGGTGTTAT ATTA/---- ATTCCAATTA 3070 hom 111 het 41 0 37 5 ATTA 1 0 210628 CASAVA_Build 4 84034453 2D ACCACTGCTT TG/-- TGTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 48 22 19 8 TG 2 1 210629 CASAVA_Build 4 84041850 14D24M1D TTAAGGAGTT TAGAGTATGTATGGTAGGCTATGTATAAAATTCATTGAT/--------------TAGGCTATGTATAAAATTCATTGA- TTTTTTTTTT 3070 het 2693 hom 28 10 15 14 N/A 0 0 210630 CASAVA_Build 4 84045719 2I CTTAATCGTC --/AG AGTCTCCTTC 3070 hom 151 het 53 0 51 2 AG 1 2 210631 CASAVA_Build 4 84048262 1D ACTCCCATTT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 7 6 210632 CASAVA_Build 4 84049089 1D TACAGATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1954 hom 23 9 10 4 T 11 10 210633 CASAVA_Build 4 84050616 1D CAAGTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2943 hom 20 7 9 6 A 11 10 210634 CASAVA_Build 4 84051479 1I TTAAAAAGAT -/G GGGGTCTCGG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 G 4 5 210635 CASAVA_Build 4 84053770 1D TTTTAGGTTC A/- GGGGTACATG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 1 0 210636 CASAVA_Build 4 84062032 1D AACAGTGAGA C/- CCCCCCATCT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 C 7 6 210637 CASAVA_Build 4 84062770 2I TTTTATTAAC --/AG TGTCTTTTGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AG 0 1 210638 CASAVA_Build 4 84064462 2I AAACAAGAAA --/AT ATATAATTTA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 AT 2 3 210639 CASAVA_Build 4 84076857 1D TCACACATAT A/- AATTTTATGT 3070 hom 99 het 42 0 34 10 A 3 2 210640 CASAVA_Build 4 84077237 3D AGATGAATGA AAT/--- AATATTTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 19 3 AAT 2 1 210641 CASAVA_Build 4 84082311 1D ATATCAGCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 9 8 210642 CASAVA_Build 4 84084039 10D TCAATACTGA TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2979 het 1868 hom 20 7 8 6 T 25 15 210643 CASAVA_Build 4 84084776 1I GATATATACT -/A AAATACTGCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 4 210644 CASAVA_Build 4 84088927 1D TATTTGACCA T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 7 6 210645 CASAVA_Build 4 84096948 1D GTGGAGGGGT G/- GGAGGAGTCT 2968 het 2968 ref 21 12 8 1 G 3 2 210646 CASAVA_Build 4 84097585 2D ATTAAATCTC TT/-- GTCTCAGAAA 3070 het 3070 ref 59 35 22 2 T 2 0 210647 CASAVA_Build 4 84100499 15I ACACCAGCGG ---------------/TTAATTTTTAAATTT TGTGTAGAGT 3070 hom 113 het 42 0 34 10 TTAATTTTTAAATTT 0 1 210648 CASAVA_Build 4 84102976 1D AAACACAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 10 9 210649 CASAVA_Build 4 84103859 1D AGCAACCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 713 hom 39 2 30 7 A 13 12 210650 CASAVA_Build 4 84104234 1D CCCTCCCTCC T/- TTTTTTTTTT 2267 het 2267 ref 17 9 6 2 T 12 11 210651 CASAVA_Build 4 84110128 1I CAGATCTCCA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 102 het 41 0 33 8 T 6 7 210652 CASAVA_Build 4 84111128 5D TAATACTACC TGATT/----- TTAGACTGCC 3070 het 3070 hom 32 10 19 7 TGATT 1 0 210653 CASAVA_Build 4 84111715 1I AATTGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3023 hom 36 10 19 7 A 12 13 210654 CASAVA_Build 4 84118275 1I GGACCAGAAA -/T TTCAAAGTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 3 210655 CASAVA_Build 4 84120746 1D CAAATCACTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 71 het 30 0 26 5 A 9 8 210656 CASAVA_Build 4 84134884 1I GCCAAGAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 1146 hom 21 4 15 2 T 8 9 210657 CASAVA_Build 4 84138679 7I GAGATAGCAG -------/CATTGCA CTCCAACTCG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CATTGCA 0 1 210658 CASAVA_Build 4 84141527 2I CCCGCAGTTT --/GA GAGTAACCTG 3070 hom 73 het 29 0 25 4 GA 1 2 210659 CASAVA_Build 4 84146782 1I ATAAAAGCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 418 hom 35 1 28 6 A 9 10 210660 CASAVA_Build 4 84153555 1D26M2I CACAGGGAGA TTCATTGAGAGTTAAACTTATTTTGAA--/-TCATTGAGAGTTAAACTTATTTTGAAAG AGACGTTTTG 3070 het 3070 hom 47 26 24 9 N/A 0 0 210661 CASAVA_Build 4 84154027 1I ATCCAGCAAA -/T TAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 1 2 210662 CASAVA_Build 4 84160028 1D TTTAAGATTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 2707 hom 27 8 16 3 A 9 8 210663 CASAVA_Build 4 84166425 8I TCACTGCAAG --------/CTCTGCCT CTCTGCCTCC 3070 het 1868 hom 15 5 9 1 CTCTGCCT 1 2 210664 CASAVA_Build 4 84167884 1I ATCAGATATT -/A TTGATGCTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 1 210665 CASAVA_Build 4 84174710 1D TTTAGTAGAG A/- ACGGGGTTTC 1944 hom 9 het 8 0 6 2 A 2 1 210666 CASAVA_Build 4 84174826 1I CCGGCCGAAA -/G GGGGGGATAT 3070 het 1775 hom 22 7 12 3 G 6 7 210667 CASAVA_Build 4 84176357 25D AGGCTGAGAT CACTTGAGGCCTGAGAGATCTGAGA/------------------------- GGGAGGATCA 3070 hom 46 het 18 0 15 5 CACTTGAGGCCTGAGAGATCTGAGA 1 0 210668 CASAVA_Build 4 84176436 2D CATAGTGAGA CC/-- CCCCCCCCCG 760 het 132 hom 10 2 3 5 C 11 9 210669 CASAVA_Build 4 84176950 4I TGTAATTTTT ----/ATAG ATATGGATGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATAG 0 1 210670 CASAVA_Build 4 84178806 4D ACCTGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTTG 4 3 210671 CASAVA_Build 4 84180938 2D TTATGTTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 33 0 19 16 T 18 16 210672 CASAVA_Build 4 84186522 1D AGAATGTAAA T/- TAGTTCAGCC 3070 het 3070 ref 64 46 12 9 T 2 1 210673 CASAVA_Build 4 84187622 1I GTCCCAGCTA -/C TTGGGACGCT 3070 hom 74 het 29 0 24 5 C 0 1 210674 CASAVA_Build 4 84191363 1D ATCGCTTGAG C/- CCAGGAGTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 3 2 210675 CASAVA_Build 4 84196110 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 19 1 13 5 T 14 13 210676 CASAVA_Build 4 84198252 1I TGCTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 11 12 210677 CASAVA_Build 4 84199999 4D TCAGCCTCCC GAGT/---- GAGTAGCTGG 1391 hom 10 het 5 0 4 1 GAGT 2 1 210678 CASAVA_Build 4 84202753 4D TTTCATGGTC TGTT/---- TAAGATCATG 3070 hom 120 het 42 0 40 2 TGTT 1 0 210679 CASAVA_Build 4 84204512 1D AGACCTTGTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 2958 hom 30 7 18 5 A 9 8 210680 CASAVA_Build 4 84214134 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 13 14 210681 CASAVA_Build 4 84217383 1I AAAAGGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 12 13 210682 CASAVA_Build 4 84223731 3D TTTCTCAAAC AGA/--- AGGAGTTTTG 3070 het 3070 ref 45 20 18 10 AGA 1 0 210683 CASAVA_Build 4 84228031 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1052 hom 19 5 13 1 A 14 15 210684 CASAVA_Build 4 84230930 6D TAAGCCAGGA AATTCG/------ AATTCGATAA 3070 hom 51 het 19 0 18 3 AATTCG 2 1 210685 CASAVA_Build 4 84231164 1I AAGGACACAC -/A AAGAGTTTTG 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 A 2 3 210686 CASAVA_Build 4 84234452 10D CAATCCAAAT ATCATACAGA/---------- ATGTTATTTT 3070 het 3070 hom 53 25 24 7 ATCATACAGA 1 0 210687 CASAVA_Build 4 84236584 1D TGTGAATTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 10 9 210688 CASAVA_Build 4 84238913 2D AGAATAAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 25 1 21 3 T 13 11 210689 CASAVA_Build 4 84259158 1D TCTGACATGT G/- TAACTAATCC 3070 het 3070 hom 58 22 29 7 G 1 0 210690 CASAVA_Build 4 84261538 1I ATGATCATTG -/C CTGGATCCAT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 C 1 2 210691 CASAVA_Build 4 84262207 1D TGACGGAAAG T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 T 8 7 210692 CASAVA_Build 4 84273625 1D TCCTGAGCAT A/- GAGGCTCAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 1 0 210693 CASAVA_Build 4 84287284 2D TGACAGATGC AG/-- AGAGCCTTAT 3070 hom 143 het 52 0 46 7 AG 3 2 210694 CASAVA_Build 4 84288683 7I TCCCTTTAAA -------/GTCAGTT GTTTAATGCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GTCAGTT 0 1 210695 CASAVA_Build 4 84289895 1D CTGGTGCTCC T/- TTTCATTTGG 3070 hom 110 het 42 0 36 6 T 4 3 210696 CASAVA_Build 4 84300864 1I TTTGATGTAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 8 9 210697 CASAVA_Build 4 84303193 1I GAAATGAATC -/A CTCAAAAACT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 0 1 210698 CASAVA_Build 4 84304097 1D ACGCCTGGCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 T 9 8 210699 CASAVA_Build 4 84314590 1I TTTCTGACAC -/T TGGCAAAGTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 1 2 210700 CASAVA_Build 4 84321498 1I TTTAATGATT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 36 het 31 0 13 18 A 7 8 210701 CASAVA_Build 4 84321591 1I CACTACTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 23 1 17 5 A 13 14 210702 CASAVA_Build 4 84324244 5D AGATTGAAAC AACTT/----- AATTTAAGAT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AACTT 1 0 210703 CASAVA_Build 4 84324494 2I ACACAAAGTC --/TT TATTTTCTAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 1 3 210704 CASAVA_Build 4 84329674 1D TATTCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 11 10 210705 CASAVA_Build 4 84333513 1I GAGAGGCTCC -/T TACCTCTTCC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 1 2 210706 CASAVA_Build 4 84336761 5D ATAAATAAAC AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 AAATA 5 4 210707 CASAVA_Build 4 84344152 1I ACAGAGGCTG -/C CCCCCTTGCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 5 6 210708 CASAVA_Build 4 84360410 1D TGTGTTTTTT G/- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 40 23 17 0 G 1 0 210709 CASAVA_Build 4 84362051 2D CTATTAAAAT AA/-- AATAAATTTG 3070 het 3070 hom 41 17 23 2 A 4 2 210710 CASAVA_Build 4 84365509 1D AAAACGTTGT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 8 7 210711 CASAVA_Build 4 84380945 1I GCGAAGATTC -/T TTTCAGTTCC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 3 4 210712 CASAVA_Build 4 84387119 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAAAA 2964 het 1473 hom 14 5 7 2 A 11 12 210713 CASAVA_Build 4 84392159 3I TAATAAATAG ---/AAT TATTAACTAG 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 AAT 0 1 210714 CASAVA_Build 4 84398013 4I ATATGGAGAA ----/AAAT AAAGCAGTGA 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 AAAT 0 1 210715 CASAVA_Build 4 84406543 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1610 hom 24 9 11 4 T 10 9 210716 CASAVA_Build 4 84408037 1I AGATTTAGTG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 7 8 210717 CASAVA_Build 4 84413353 4I AAATAAAATT ----/ATAC ATATATGTGT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 ATAC 0 1 210718 CASAVA_Build 4 84414719 3I ATTTGTTGAT ---/GAA GTGCAAATTC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 GAA 0 1 210719 CASAVA_Build 4 84415593 1D CCAAGTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1530 hom 27 7 12 8 T 12 11 210720 CASAVA_Build 4 84443319 1I GAATTCTTGC -/A AAAAAAATAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 8 210721 CASAVA_Build 4 84443622 3I TATTTTAGAC ---/AAT AAGGAAAATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAT 0 1 210722 CASAVA_Build 4 84444197 1I AAAACAGGAG -/A AAAACAAACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 5 210723 CASAVA_Build 4 84448274 1D CTAACTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 26 1 20 5 T 15 14 210724 CASAVA_Build 4 84450538 1I AGAGAGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 26 1 19 6 T 12 13 210725 CASAVA_Build 4 84453118 3D AGAATGGCGT GAA/--- TTTGGGAGGC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 GAA 1 0 210726 CASAVA_Build 4 84459353 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAACCA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 C 0 1 210727 CASAVA_Build 4 84474022 1D TCATCTGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 981 hom 24 4 13 7 A 13 12 210728 CASAVA_Build 4 84477089 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1172 het 472 hom 17 5 3 9 T 15 14 210729 CASAVA_Build 4 84488744 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1901 het 1901 ref 19 9 6 4 A 17 16 210730 CASAVA_Build 4 84508653 1D TTAAAACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 38 2 27 9 A 13 12 210731 CASAVA_Build 4 84514203 1I GCCCCATAAC -/A AAAAACAAAT 3070 hom 103 het 41 0 35 6 A 5 6 210732 CASAVA_Build 4 84515799 1D TACGTTGGCT C/- CTTTCAGCCA 3070 hom 72 het 29 0 23 6 C 2 1 210733 CASAVA_Build 4 84584669 1D GCAGTTCTCC T/- TGCCCCAACC 3070 het 3070 hom 21 9 12 0 T 2 1 210734 CASAVA_Build 4 84631436 1I AGAATCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 36 1 27 8 T 10 11 210735 CASAVA_Build 4 84633068 1D GTTTCCTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 9 8 210736 CASAVA_Build 4 84638583 4I AGAAAAAGGG ----/AAGA AAGAAAGAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAGA 2 3 210737 CASAVA_Build 4 84642096 4D TCTTCTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2298 het 1755 hom 14 5 8 1 TTTC 3 2 210738 CASAVA_Build 4 84656569 8D CATATCCCCC TTGATTCA/-------- TTGATTCATG 3070 hom 123 het 51 0 42 11 TTGATTCA 2 1 210739 CASAVA_Build 4 84660918 1D TGAGTAATGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 T 9 8 210740 CASAVA_Build 4 84661523 1I TTCCAGGTTC -/A AGCAATTCTC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 2 210741 CASAVA_Build 4 84665039 1D AGGGAAGTAA T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 49 het 21 0 17 5 T 7 6 210742 CASAVA_Build 4 84673369 1D ATATTCATAG T/- TACGGGTGTT 3070 hom 90 het 33 0 29 4 T 2 1 210743 CASAVA_Build 4 84674915 1D TTCATAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 25 1 14 10 T 15 14 210744 CASAVA_Build 4 84689344 3I GACCCATCTG ---/AAA AAAAAAAAAA 2837 het 2837 ref 31 11 12 8 A 14 17 210745 CASAVA_Build 4 84695572 17D AATCGATCAT TTAATCATTTTATGGAA/----------------- GCTGATGTCA 3070 het 3070 ref 42 21 23 4 TTAATCATTTTATGGAA 1 0 210746 CASAVA_Build 4 84696740 2I CTCAACGCTA --/TT TTTTTTTTTC 1298 het 1298 ref 28 17 6 5 T 9 11 210747 CASAVA_Build 4 84697696 1D TGATGAGCTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 9 8 210748 CASAVA_Build 4 84705673 1D TAATTATTGA T/- TTTTTTTTGT 2652 het 2652 ref 25 14 7 4 T 9 8 210749 CASAVA_Build 4 84709722 4D ACCTTGACTA TGTC/---- ATCTGTGAGA 3070 het 3070 ref 58 30 24 7 TGTC 1 0 210750 CASAVA_Build 4 84711616 1D ATTTTTGGCC T/- TTTAAAATTT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 T 4 3 210751 CASAVA_Build 4 84714674 4I TGTGTGAGAT ----/AGAG AGACAGTTGT 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 AG 1 3 210752 CASAVA_Build 4 84728490 1I AGTATCTGCT -/G CCAATGTGCC 3070 hom 138 het 53 0 47 6 G 0 1 210753 CASAVA_Build 4 84740506 3I GCACTAATCC ---/CAT CATGAGTGCT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 CAT 1 2 210754 CASAVA_Build 4 84742735 2D54M1D CCCTCTCTTA AGAACTAAGACCTGCTGCCATTGCAAAGGGGAATTGGATAAAATTTTGAAGTCTCTA/--AACTAAGACCTGCTGCCATTGCAAAGGGGAATTGGATAAAATTTTGAAGTCTCT- AGGGGTGGCA 3070 het 104 hom 24 1 18 18 N/A 0 0 210755 CASAVA_Build 4 84743968 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 19 1 18 0 A 22 19 210756 CASAVA_Build 4 84744998 1D ATGGAATGGC T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 7 6 210757 CASAVA_Build 4 84745725 1I AAGGAGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 30 1 24 5 A 12 13 210758 CASAVA_Build 4 84746131 1D TTACAAACAA G/- GGTTGTTTGT 3070 hom 73 het 28 0 24 5 G 3 2 210759 CASAVA_Build 4 84746619 1D AAGGAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 T 11 10 210760 CASAVA_Build 4 84747033 1I AGAAAAATCT -/C CATCAGATAA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 C 1 2 210761 CASAVA_Build 4 84747388 1I ATTCTGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 35 0 31 4 T 9 10 210762 CASAVA_Build 4 84748794 9D TTTTATACAT GTGTACAAC/--------- GTGTACAACG 3070 hom 63 het 26 0 22 6 GTGTACAAC 2 1 210763 CASAVA_Build 4 84750237 1D GTCTCTACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 18 0 13 6 T 10 9 210764 CASAVA_Build 4 84750391 2D CACCCTGCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 18 9 A 17 15 210765 CASAVA_Build 4 84750407 2D AAAAAAAAAA AT/-- TCCCTTGTCA 3070 het 187 hom 29 5 17 8 AT 1 0 210766 CASAVA_Build 4 84752082 3D AAAGTTCCTC TTG/--- TTGTTGATTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TTG 3 2 210767 CASAVA_Build 4 84752829 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTTACC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 7 8 210768 CASAVA_Build 4 84762010 2I ATTTGTGGTT --/AC AGAGTATATC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AC 0 1 210769 CASAVA_Build 4 84762902 9I AAAGTGTTCA ---------/AGAGGAAGC AGAACATAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AGAGGAAGC 0 1 210770 CASAVA_Build 4 84763511 1I GAGAGGTCCA -/C CATCCTCCAG 3070 hom 47 het 18 0 15 3 C 1 2 210771 CASAVA_Build 4 84769862 1I TGGGTTTGAG -/T TTTTTTATTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 7 210772 CASAVA_Build 4 84775212 1D TGCCTGTGTC T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 T 8 7 210773 CASAVA_Build 4 84779178 4D CAGACTAATA GACT/---- GACTAAGGCT 3070 het 3070 ref 32 13 16 3 GACT 2 1 210774 CASAVA_Build 4 84796172 1D AAATGACTTG T/- TTTTTTTTTT 1977 het 1977 ref 48 29 7 12 T 13 12 210775 CASAVA_Build 4 84801156 3D ATTACTTAGC AGG/--- AGATTAGATT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 AGG 1 0 210776 CASAVA_Build 4 84803290 2D AAGGAAAAAA AG/-- AGTTGATTTA 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 AG 2 1 210777 CASAVA_Build 4 84804992 4D CCCACTGTGA TGCC/---- TTCTGCCTAG 3070 het 3070 ref 29 16 11 5 TGCC 1 0 210778 CASAVA_Build 4 84808590 1I AGTTTCTTCA -/T TTTTCTCCTA 3070 het 3070 ref 40 25 14 1 T 4 5 210779 CASAVA_Build 4 84811232 1D CAGGTTTCTT A/- AATTAGGCAA 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 A 3 2 210780 CASAVA_Build 4 84811326 2D CCACAGTAAG CA/-- CTAAGCAAAT 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 CA 1 0 210781 CASAVA_Build 4 84811948 1D GACTCACTCA T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 38 17 16 7 T 7 6 210782 CASAVA_Build 4 84812353 2D ACTATATATA TC/-- ATTGTTCAGC 3070 het 3070 ref 41 20 15 8 TC 1 0 210783 CASAVA_Build 4 84816127 1D AACATGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 T 11 10 210784 CASAVA_Build 4 84817568 1D TTCTCAAATG T/- ACCCATGTTT 3070 het 3070 ref 49 25 19 6 T 1 0 210785 CASAVA_Build 4 84828889 1I CACCCTGGGT -/G GGCAGGGCCA 3070 hom 107 het 41 0 35 6 G 2 3 210786 CASAVA_Build 4 84830258 4D TTCTTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTTTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTTC 2 1 210787 CASAVA_Build 4 84832479 2I CCTGCAGGCC --/AT AGTTTTGTGA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AT 0 1 210788 CASAVA_Build 4 84837107 1D GATTTTTACT A/- AAGTAGGTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 2 210789 CASAVA_Build 4 84840342 1D ATACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2742 hom 5 het 24 1 9 14 A 12 11 210790 CASAVA_Build 4 84844286 1I TAGTATGTAG -/T TTTTTTATTT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 6 7 210791 CASAVA_Build 4 84845217 2D GATTTGATAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 92 het 45 0 33 15 AG 10 9 210792 CASAVA_Build 4 84849413 1I AGGAAGGCAG -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 7 210793 CASAVA_Build 4 84860319 1I TTTGAATTAG -/A ATTTCATTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 2 210794 CASAVA_Build 4 84901725 1D ACACACCAGA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 7 6 210795 CASAVA_Build 4 84909303 1D GCAGGAAACA T/- TTTTTTTTTT 1655 het 1655 ref 36 27 4 5 T 13 12 210796 CASAVA_Build 4 84927662 1I ATGTGATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 10 11 210797 CASAVA_Build 4 84939108 1D AAATCTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 27 10 T 12 11 210798 CASAVA_Build 4 84978722 1I ATCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 26 1 17 8 A 11 12 210799 CASAVA_Build 4 84979853 2D15M1D GGTCCTTGAC TTAGGATGGTTCGACAGT/--AGGATGGTTCGACAG- TTTTTTGAAT 3070 hom 84 het 29 0 29 5 N/A 0 0 210800 CASAVA_Build 4 84990425 1I GGGCAGGAGT -/G GGGGGTCGCA 965 hom 5 het 4 0 2 2 G 5 6 210801 CASAVA_Build 4 84999162 1D ATTGTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 11 10 210802 CASAVA_Build 4 85020535 4D TAGTTAAATC ATAG/---- ATGGAGTATA 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 ATAG 1 0 210803 CASAVA_Build 4 85021263 1D TTTAGTGGGG T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 63 32 24 7 T 7 6 210804 CASAVA_Build 4 85023402 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 het 1035 hom 17 3 14 0 G 4 5 210805 CASAVA_Build 4 85027657 1I51M1D CAGTAAGTGA -GGGGTTATCAGACCGTCAACTTTCTAAAGATAGTTTCTGATGTGTGAATAAG/GGGGGTTATCAGACCGTCAACTTTCTAAAGATAGTTTCTGATGTGTGAATAA- GGAAGCATTT 3070 het 3070 hom 43 30 33 5 N/A 0 0 210806 CASAVA_Build 4 85029972 1D TATTTAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 11 10 210807 CASAVA_Build 4 85038150 5D CAATGTAACT ATTGA/----- ATTAGTTAAC 3070 het 3070 hom 47 19 25 5 ATTGA 1 0 210808 CASAVA_Build 4 85038995 1D AAGAGTGTTT A/- AATCTCCCTC 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 A 3 2 210809 CASAVA_Build 4 85054165 2I ACTTACTTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 T 12 14 210810 CASAVA_Build 4 85086568 1D CAAATACCCC T/- CACACATACA 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 T 1 0 210811 CASAVA_Build 4 85098401 1I TTATTCCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1578 hom 22 5 11 6 T 11 12 210812 CASAVA_Build 4 85112713 3D CATCATCATT ATC/--- ATCATCATCA 3070 het 3070 ref 50 22 21 11 ATC 7 6 210813 CASAVA_Build 4 85114879 1D AGTTGGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 11 10 210814 CASAVA_Build 4 85122057 3D CCTTGAGACA CCC/--- CCCCCCCGAC 3070 het 431 hom 27 6 9 12 C 10 7 210815 CASAVA_Build 4 85142862 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 26 0 21 6 AT 7 6 210816 CASAVA_Build 4 85155529 6I GTTGTGCAGG ------/TGTAAA AGTGACCTTC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TGTAAA 0 1 210817 CASAVA_Build 4 85166688 1I AAGACTGGCA -/G GCAGATTACT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 1 2 210818 CASAVA_Build 4 85173585 1D AAATAAACAA T/- ATAATTTCTG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 1 0 210819 CASAVA_Build 4 85182438 2I TTTTGGAGTT --/TC TTAGGGTGGG 3070 hom 91 het 35 0 30 5 TC 0 1 210820 CASAVA_Build 4 85304164 1I TTCCTGCTTA -/T GCCAGCTCAA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 T 0 1 210821 CASAVA_Build 4 85370163 1D TGAGACAAGG C/- AAGTCCCTTC 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 C 1 0 210822 CASAVA_Build 4 85375241 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 10 11 210823 CASAVA_Build 4 85380516 1I GCTGGTCTTG -/A AACTCCTGGA 3070 het 2437 hom 22 6 15 1 A 2 3 210824 CASAVA_Build 4 85382992 1D TTTGCAAGAT A/- AAAAAAAAAT 816 het 816 ref 41 32 3 6 A 10 9 210825 CASAVA_Build 4 85383428 16I CAGCACTTTA ----------------/AAACATTGAATGTTTT AAACATTGAA 3070 het 3070 ref 45 18 14 13 AAACATTGAATGTTTT 0 1 210826 CASAVA_Build 4 85388589 6D GCACACACTT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 45 het 26 0 16 11 AC 11 8 210827 CASAVA_Build 4 85391436 1D AAAATAAAAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 8 7 210828 CASAVA_Build 4 85391933 1D AAAAAAAAAA T/- AAAGGAAGTT 2028 het 2028 ref 30 22 5 4 T 1 0 210829 CASAVA_Build 4 85392472 1D GATTTCTCAT A/- AGCAATCCAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 2 1 210830 CASAVA_Build 4 85398922 4I TACCTGGAAT ----/GATG GATGCCTGGA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 GATG 1 2 210831 CASAVA_Build 4 85402163 1D CTAATTTAAT A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 A 8 7 210832 CASAVA_Build 4 85410808 1I TGAACACAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 23 14 14 T 9 10 210833 CASAVA_Build 4 85411848 3D GTCTAGTAGA AAC/--- AACATTGAAT 3070 het 3070 ref 34 17 15 5 AAC 2 1 210834 CASAVA_Build 4 85411990 2D ACTGGCAAAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 11 9 210835 CASAVA_Build 4 85430444 1D CAACATAGGC A/- AATCAATAAA 3070 het 3070 ref 29 17 7 5 A 3 2 210836 CASAVA_Build 4 85445784 1D ATATTAAATT A/- AAAAATTTAT 3070 het 3070 hom 35 13 21 3 A 6 5 210837 CASAVA_Build 4 85450211 1D CCATTCTTCC T/- TTCATCACAC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 3 2 210838 CASAVA_Build 4 85507708 1I TCCAGCCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 9 10 210839 CASAVA_Build 4 85520897 1D TGAGAAGTAG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 8 7 210840 CASAVA_Build 4 85521145 3D AAGACAAGAG TTC/--- TTCTTTTACT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTC 2 1 210841 CASAVA_Build 4 85521318 11I GATAAGATTA -----------/ATAGTAGTAAT ATAATAAGAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 ATAGTAGTAAT 0 1 210842 CASAVA_Build 4 85523509 1I CATTTCAACT -/G GGTTGCACAT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 G 2 3 210843 CASAVA_Build 4 85523762 5D GTTTTTTTAA ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 ATTTT 3 2 210844 CASAVA_Build 4 85536164 1I TACTTATGGC -/A TCATATTGGC 3070 hom 103 het 39 0 35 4 A 0 1 210845 CASAVA_Build 4 85542677 2D TCACACTCAA CC/-- CCCCACTCAA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 C 6 4 210846 CASAVA_Build 4 85556971 1I AATATGTATC -/T TTTTTGCAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 5 6 210847 CASAVA_Build 4 85590653 2D ATGTGCAAAC AT/-- AAAAATATAC 3070 het 3070 hom 30 8 21 1 AT 1 0 210848 CASAVA_Build 4 85597683 1D GTACCAAAAC A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 A 7 6 210849 CASAVA_Build 4 85615202 3D GCCTCCATGG TCA/--- GTCAGGTTGG 3070 hom 90 het 33 0 31 4 TCA 1 0 210850 CASAVA_Build 4 85623399 1I AAGCCACGCG -/T CTGGCAGGGC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 0 1 210851 CASAVA_Build 4 85628946 1I AATAACTGGC -/A AAAAAAAAAA 2473 het 2473 ref 24 12 8 4 A 14 15 210852 CASAVA_Build 4 85630983 12I AGGAAGGCAA ------------/GAAGGAAGGCAG GAAGGAAGGA 3070 hom 88 het 36 0 27 9 GAAGGAAGGCAG 0 1 210853 CASAVA_Build 4 85631218 1I CACAAACTAG -/A AAAAAAAAAA 2249 het 1931 hom 28 6 8 14 A 14 15 210854 CASAVA_Build 4 85649025 1I CAGATGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 39 0 23 16 A 13 14 210855 CASAVA_Build 4 85649326 1I AGTTCTCAGG -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 T 7 8 210856 CASAVA_Build 4 85651679 1I TACTACGGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 9 10 210857 CASAVA_Build 4 85657003 1I GCAACCTCCA -/C CCACCAGGTC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 C 2 3 210858 CASAVA_Build 4 85668467 1D GAACCAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 41 3 32 6 A 13 12 210859 CASAVA_Build 4 85670081 1D CCCAAATCTG T/- TTTTTTTATA 3070 het 184 hom 36 1 27 8 T 8 7 210860 CASAVA_Build 4 85671551 2D TCGAAAAAGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TG 7 6 210861 CASAVA_Build 4 85675330 1D TGCAGCCATT A/- AAAAAAGATA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 7 6 210862 CASAVA_Build 4 85677712 1I TTCTGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 A 13 14 210863 CASAVA_Build 4 85684415 2D ATTTTATTTA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 11 9 210864 CASAVA_Build 4 85691277 1I TAAAGTGATG -/A AAACTCAGAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 3 4 210865 CASAVA_Build 4 85694107 1D TCTACAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 11 10 210866 CASAVA_Build 4 85696210 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 17 1 10 6 A 14 13 210867 CASAVA_Build 4 85702956 1I AGCCAAAAAT -/G AAATGTTGTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 210868 CASAVA_Build 4 85705056 1I TCAAAAAAAA -/G GGGGGGGGGA 1668 hom 22 het 19 0 8 11 G 9 10 210869 CASAVA_Build 4 85707684 1I ACACACACAC -/A ACAAAAAAAA 3070 hom 9 het 35 2 28 5 A 1 2 210870 CASAVA_Build 4 85720788 4I AATGAAGAAA ----/AGTG AGTGTCTATG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AGTG 1 2 210871 CASAVA_Build 4 85742111 8D TACATACATG CATACATA/-------- CATACATACA 3070 hom 60 het 22 0 21 7 CATA 6 4 210872 CASAVA_Build 4 85765046 1D ATGTTGTGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 350 hom 41 1 37 4 T 10 9 210873 CASAVA_Build 4 85775200 15I TCAATAATTT ---------------/AATATTTTCCTTAGC AATATTTTCC 3070 hom 108 het 38 0 37 5 AATATTTTCCTTAGC 0 1 210874 CASAVA_Build 4 85808402 4I TAAAGAAGCA ----/CTAT CTTAGACCAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CTAT 0 1 210875 CASAVA_Build 4 85809320 2I AGACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 34 het 29 1 25 3 AT 6 7 210876 CASAVA_Build 4 85839222 1D AGGCAAACTG T/- TTTTTTTTTT 1327 het 1327 ref 43 26 3 14 T 13 12 210877 CASAVA_Build 4 85861014 1I GAAAAAAAAA -/T CACAACATGG 3070 het 358 hom 34 1 30 3 T 0 1 210878 CASAVA_Build 4 85866966 1I CCATGCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 10 11 210879 CASAVA_Build 4 85869864 1D TTTAATGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 12 11 210880 CASAVA_Build 4 85887021 5I ATTTTAGAAA -----/TAAGT TAATTGAGGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TAAGT 0 1 210881 CASAVA_Build 4 85903601 1I ACAAATACCC -/A AATGCATGTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 2 3 210882 CASAVA_Build 4 85907444 1I GCCACTGTCT -/G TACTCTTATA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 G 0 1 210883 CASAVA_Build 4 85922548 1I AACAGTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 40 1 31 8 T 12 13 210884 CASAVA_Build 4 85929495 1I GAAAACAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 A 9 10 210885 CASAVA_Build 4 85939070 1I TGTCCATTTC -/T TGTAGTTGAA 3070 hom 151 het 63 0 51 12 T 1 2 210886 CASAVA_Build 4 85951112 3I AAAAGAAAAC ---/ATG AAGTAAATAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 ATG 0 1 210887 CASAVA_Build 4 85968470 1D AAAGGGGGTT A/- AGTAACACAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 2 1 210888 CASAVA_Build 4 85992096 4I CTGGCAACAA ----/TAAC TAATAATAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TAAC 0 1 210889 CASAVA_Build 4 86011064 1I ACAGGGCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 A 12 13 210890 CASAVA_Build 4 86013799 1I AAGAAAGCAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 6 7 210891 CASAVA_Build 4 86047928 2I GGCCCAGTCA --/CT CTGTACCAGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CT 1 2 210892 CASAVA_Build 4 86105965 1D AGGATGCAGC G/- GGGGGGGGCC 2438 hom 21 het 11 0 9 2 G 9 8 210893 CASAVA_Build 4 86107967 1D AGCACTTTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 51 het 24 0 18 7 G 10 9 210894 CASAVA_Build 4 86115723 2I CACATACATG --/CA CACACACACA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 CA 5 6 210895 CASAVA_Build 4 86118225 1D CTATTACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 43 0 34 9 A 12 11 210896 CASAVA_Build 4 86143298 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 891 het 80 hom 9 1 4 4 A 18 13 210897 CASAVA_Build 4 86146807 1D TCTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 28 0 20 8 A 11 10 210898 CASAVA_Build 4 86147917 2D CAAAAGAAAC AA/-- GAGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 A 2 0 210899 CASAVA_Build 4 86158941 1D TAGCTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 13 12 210900 CASAVA_Build 4 86162024 9D CTGAGGTTTA AAAATAAGG/--------- AAAATAAGGG 3070 het 3070 hom 31 14 18 6 AAAATAAGG 2 1 210901 CASAVA_Build 4 86174035 1D GGAGATAACC A/- ATTAGGTCTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 2 1 210902 CASAVA_Build 4 86185276 1I AAGATTAGAG -/A AAAAAAAACG 3070 het 303 hom 15 1 13 1 A 8 9 210903 CASAVA_Build 4 86193125 1I ATATTGCTTT -/G TGAGTCAAGT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 G 0 1 210904 CASAVA_Build 4 86203993 1D ACCCCATAAG A/- AAAAAAAAAA 2900 het 2900 ref 24 10 12 2 A 12 11 210905 CASAVA_Build 4 86207991 1D GTTCTAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 A 10 9 210906 CASAVA_Build 4 86215898 1I TATTTACCCA -/T TTTTGGTGAA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 T 4 5 210907 CASAVA_Build 4 86217903 4D GCTATATCTC TCTT/---- CTGCCTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 18 2 TCTT 1 0 210908 CASAVA_Build 4 86222006 1D TAATATTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 85 het 42 0 32 10 T 10 9 210909 CASAVA_Build 4 86223463 2D GATACTAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 A 13 11 210910 CASAVA_Build 4 86224726 3D GAAATCATAC TTG/--- TTGTTATCCT 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 TTG 2 1 210911 CASAVA_Build 4 86231512 1D GGGGCAGACC T/- TTTTTTTTTT 2854 hom 33 het 24 0 12 13 T 17 16 210912 CASAVA_Build 4 86235638 1D CTACACTAGC T/- TTTACAGGCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 4 3 210913 CASAVA_Build 4 86244438 12D CTTCTCTTAC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 22 1 17 7 T 23 11 210914 CASAVA_Build 4 86247639 2I AATACAGAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 37 1 26 10 T 10 12 210915 CASAVA_Build 4 86288912 2I TAACTAATCA --/AC AGTCTGGGTT 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 AC 0 1 210916 CASAVA_Build 4 86295284 1I AGCATGGTAA -/T TTTAAGGAAT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 3 4 210917 CASAVA_Build 4 86297275 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 10 11 210918 CASAVA_Build 4 86327644 1D CTTTTGAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 10 9 210919 CASAVA_Build 4 86347671 1I GTGGATAAAG -/A GATGTATATG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 0 1 210920 CASAVA_Build 4 86348820 4D AACCCATTTT CTTA/---- CTTACTCTGA 3070 het 3070 hom 31 13 18 1 CTTA 2 1 210921 CASAVA_Build 4 86351111 1I CCTTCATTCA -/G TCTTGTAATG 3070 het 3070 ref 47 28 13 6 G 0 1 210922 CASAVA_Build 4 86354324 23I TATCCTTGTA -----------------------/TGGCTTTGGTATCAGAGTAACGC TGGCTTCATA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TGGCTTTGGTATCAGAGTAACGC 0 1 210923 CASAVA_Build 4 86354783 9I GTTTTTCTGT ---------/TTTTTTATG TTTTTTATGT 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 TTTTTTATG 1 2 210924 CASAVA_Build 4 86354951 1D AAACTTCCAT C/- CGTATTTTCT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 C 2 1 210925 CASAVA_Build 4 86367168 1D TCTGGGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 11 10 210926 CASAVA_Build 4 86370948 1I CTAAGATAAG -/A CCTGCTCTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 0 1 210927 CASAVA_Build 4 86373748 1D CCACCTCCAG C/- CTATACAACA 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 C 2 1 210928 CASAVA_Build 4 86389521 1D ACTTCAACTT C/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 C 1 0 210929 CASAVA_Build 4 86389845 2D GAGTGCTTAC TA/-- TATAGTATCT 3070 het 3070 hom 42 16 21 7 TA 3 2 210930 CASAVA_Build 4 86391198 1D ACCAATCTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 T 10 9 210931 CASAVA_Build 4 86391313 4D CCTCTATTTC AGTA/---- AGTATTAAGA 3070 het 3070 hom 41 15 23 6 AGTA 2 1 210932 CASAVA_Build 4 86393983 1D TTATTTTCCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 20 12 14 T 10 9 210933 CASAVA_Build 4 86394035 7I ATTGTGGTGA -------/TTTTCAT TTCCCTGGAG 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 TTTTCAT 0 1 210934 CASAVA_Build 4 86394810 17I GCTAGTTCCC -----------------/AAATTGCTAAATCCCAA AATGCCATTG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AAATTGCTAAATCCCAA 0 1 210935 CASAVA_Build 4 86394936 1I TGCACCTTAA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 6 7 210936 CASAVA_Build 4 86396545 1I TCTGTCTGTT -/G TACCATGATT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 G 0 1 210937 CASAVA_Build 4 86399761 3D CGTCTTAGTT TCA/--- TCATTTAATG 3070 het 3070 ref 54 23 21 11 TCA 2 1 210938 CASAVA_Build 4 86429624 1D ATTCAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1119 hom 33 4 16 14 A 15 14 210939 CASAVA_Build 4 86449899 1I TAGCATGCTG -/T TTTGGTAACT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 T 3 4 210940 CASAVA_Build 4 86464665 1D ATCTGATTAC T/- TTTCATACTA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 4 3 210941 CASAVA_Build 4 86469873 1I TGAACCAAAA -/T CGCACCACTG 3070 het 2129 hom 15 6 9 0 T 0 1 210942 CASAVA_Build 4 86481144 1D TTGGTATAGC A/- AAACATGTCC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 4 3 210943 CASAVA_Build 4 86481434 1D AACACACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2014 hom 31 11 14 6 T 17 16 210944 CASAVA_Build 4 86484444 5D TTATCTAAAA TTATT/----- TGTTGTTATT 3070 het 3070 ref 32 17 11 8 TTATT 1 0 210945 CASAVA_Build 4 86513641 2I TTCCCCTACT --/TC TCCTTCTTAT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 TC 1 2 210946 CASAVA_Build 4 86542910 1D TTGACTGAAC T/- TTCAGAGCAA 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 T 3 2 210947 CASAVA_Build 4 86550391 4D ATAAACTAAC TTCT/---- ATATGCACTG 3070 het 3070 hom 32 15 14 5 TTCT 1 0 210948 CASAVA_Build 4 86550577 9I TGTATTAAGA ---------/GGTAGAGCC GGTAGAGCCT 3070 het 3070 ref 40 14 14 12 GGTAGAGCC 1 2 210949 CASAVA_Build 4 86558036 3I GTCATGTCTG ---/CAT CATCTCTCCA 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 CAT 1 2 210950 CASAVA_Build 4 86559150 1I ATCAAAATAA -/T TTTTACTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 T 4 5 210951 CASAVA_Build 4 86562350 1D TCAGATTGGC T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 7 6 210952 CASAVA_Build 4 86576691 2D AAGCTCTTTT TC/-- TCTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 TC 3 2 210953 CASAVA_Build 4 86647079 1I CTTTTTTTTT -/C CCCCCCATGT 3070 hom 92 het 35 0 26 9 C 6 7 210954 CASAVA_Build 4 86653737 1I CCTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 A 10 11 210955 CASAVA_Build 4 86656791 1I GTATTTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1771 hom 24 5 14 5 T 10 11 210956 CASAVA_Build 4 86656874 1I AGATTTAGTC -/T TTATGTTTGG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 2 3 210957 CASAVA_Build 4 86657573 1D AAAATACTGA T/- TTGCTAAATT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 3 2 210958 CASAVA_Build 4 86659992 1I CTACCTCTTA -/G TCTTGTTCAT 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 G 0 1 210959 CASAVA_Build 4 86672277 1D GTGCAGTGAC T/- ATGAAGATAA 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 T 1 0 210960 CASAVA_Build 4 86688247 3D ATTTAAATAC TAT/--- TATTATTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 TAT 3 2 210961 CASAVA_Build 4 86691191 1I TATCTAGATA -/C TTTTATTTCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 0 1 210962 CASAVA_Build 4 86692016 1I TCTCTGAGGG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 7 8 210963 CASAVA_Build 4 86694389 1D GTCACCTATG C/- CTTCTCTCTA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 C 2 1 210964 CASAVA_Build 4 86695015 4D GCCCAGCTGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 936 hom 8 het 7 0 3 4 T 16 12 210965 CASAVA_Build 4 86695163 3D AGCCAGTTCT TTC/--- TTATAGTGGC 2716 het 2716 ref 22 13 8 3 TTC 1 0 210966 CASAVA_Build 4 86696048 1D GGTGGCTCAT G/- GGGGGAAACT 3070 hom 93 het 33 0 29 4 G 6 5 210967 CASAVA_Build 4 86697430 2I CACTGCTCAG --/TT CTGTGGATTT 3070 hom 122 het 45 0 38 7 T 0 2 210968 CASAVA_Build 4 86697846 2D CCCACCACTC TT/-- TATTCTCTCC 3070 hom 105 het 37 0 32 5 T 3 1 210969 CASAVA_Build 4 86699186 2D GAAAGCTTTC AT/-- CTTAGCTTAA 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 AT 1 0 210970 CASAVA_Build 4 86701710 1I GTTACTTTTT -/C CCCCTTATTG 3070 hom 138 het 53 0 46 7 C 4 5 210971 CASAVA_Build 4 86702598 2I TATGTGAATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 27 12 11 TG 7 8 210972 CASAVA_Build 4 86702711 1D ATGGAGATTT A/- GACTTTTATG 3070 het 3070 ref 55 36 15 4 A 1 0 210973 CASAVA_Build 4 86704639 1D TAATGGGTGC A/- GCACACCAAC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 0 210974 CASAVA_Build 4 86712930 2I CAAACCAAAC --/AT AGACCATCAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AT 0 1 210975 CASAVA_Build 4 86716395 3I TCACGAGGTC ---/AGG AGATCGAGAC 2154 hom 12 het 6 0 5 1 AGG 0 1 210976 CASAVA_Build 4 86718927 3I TGATGTTACT ---/ATC ATCATCATCA 3070 hom 96 het 39 0 31 8 ATC 5 6 210977 CASAVA_Build 4 86735162 1D CTTTCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 T 11 10 210978 CASAVA_Build 4 86737807 1D GGGCAGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 20 7 6 T 12 11 210979 CASAVA_Build 4 86739849 1D TATTAAATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2959 hom 26 8 13 6 T 10 9 210980 CASAVA_Build 4 86742224 1D AGGCCCAGTG T/- TTTTTCTAAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 T 6 5 210981 CASAVA_Build 4 86746690 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 16 3 8 5 A 12 11 210982 CASAVA_Build 4 86747932 16D3M8D GAGGAAGTAT CAAAAATACTTCCTCATTTAGCCCAGG/----------------TTT-------- TGTTGGAGCC 3070 het 3070 hom 20 8 10 8 N/A 0 0 210983 CASAVA_Build 4 86757275 12D TATATATTTA TAAATATATATT/------------ TAAATATATA 1294 het 1127 hom 11 3 4 5 TAAATATATATT 2 1 210984 CASAVA_Build 4 86779789 1D CTGTAATTTC T/- TTTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 5 4 210985 CASAVA_Build 4 86781083 13I AAACAATTTT -------------/TTGGCACCTATAC TTGGATACAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 TTGGCACCTATAC 0 1 210986 CASAVA_Build 4 86782753 7I CTCTTCTTTC -------/TCTCATA TCTCACAATA 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 TCTCATA 0 1 210987 CASAVA_Build 4 86783388 3D TCTACTTTTC TTT/--- TTTATTTTCC 811 het 811 ref 9 4 3 2 T 6 3 210988 CASAVA_Build 4 86791235 1D TCTGCATGGG A/- AAAATATTCC 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 5 4 210989 CASAVA_Build 4 86791973 1D TTAAATTAAT G/- ATTTCCTCTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 G 1 0 210990 CASAVA_Build 4 86794898 3I ACGGGAGTGG ---/GAA GATTGGGAAG 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 GAA 0 1 210991 CASAVA_Build 4 86795694 1I GCACGGTGGC -/T CATGCCTGTA 3070 het 2749 hom 18 7 10 1 T 0 1 210992 CASAVA_Build 4 86796593 4I CTAATATGAT ----/AGAC AGGACTTTAG 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 AGAC 0 1 210993 CASAVA_Build 4 86796973 1D AATCAGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 3 A 10 9 210994 CASAVA_Build 4 86797138 1D TTAAAAAAAA T/- GTTTACAGCA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 1 0 210995 CASAVA_Build 4 86797338 3I CTCCTTAGCC ---/TTA TTATTTTATT 3070 het 2726 hom 30 8 18 4 TTA 1 2 210996 CASAVA_Build 4 86801443 1D TGAAATTACA T/- TAATTGGAGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 T 2 1 210997 CASAVA_Build 4 86809873 2I TATATATGTG --/AT ATATATATAG 218 hom 5 het 4 0 2 2 AT 4 5 210998 CASAVA_Build 4 86813995 1I ACTGCCAGGG -/C CGTATTTTCA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 C 1 2 210999 CASAVA_Build 4 86823354 3D TATTGATAAT AAC/--- AAAAACATGG 2918 het 2918 ref 16 9 7 0 AAC 1 0 211000 CASAVA_Build 4 86830126 1I TCCACTTCTC -/A AGGGGGAATG 3070 het 3070 ref 58 29 24 5 A 1 2 211001 CASAVA_Build 4 86836361 1D TAAAATTAAA T/- TACATATTGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 1 211002 CASAVA_Build 4 86846109 2D ATAAAATATC AA/-- GAGGGGAAAG 3070 het 3070 hom 33 16 16 2 A 2 0 211003 CASAVA_Build 4 86847595 1I CTGAGATAAG -/A AACGTTATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 3 211004 CASAVA_Build 4 86861584 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 2727 het 2421 hom 22 7 12 3 A 12 13 211005 CASAVA_Build 4 86870612 4D GAGACAGGGT CTCA/---- CTCTGTCACC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 CTCA 1 0 211006 CASAVA_Build 4 86870960 2I ACAAACAAAC --/TT AAGCTTATCT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 0 2 211007 CASAVA_Build 4 86871342 13I CCACAAAACC -------------/ACCACATGCTACA ACCTTCTTAT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 ACCACATGCTACA 0 1 211008 CASAVA_Build 4 86874545 1I TATTTGTGTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 7 8 211009 CASAVA_Build 4 86882667 1I AGTGTTTGAG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 A 7 8 211010 CASAVA_Build 4 86883724 5I TAGCCTACGT -----/GACAG GACAGGGCGA 3070 het 3070 ref 39 20 8 11 GACAG 1 2 211011 CASAVA_Build 4 86884871 4D TGTGACATTC CTGA/---- CTGACAGGAC 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 CTGA 2 1 211012 CASAVA_Build 4 86892645 2D TTGTTACATT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 97 het 36 0 33 5 A 11 9 211013 CASAVA_Build 4 86896386 4D CTTAATAGTT AATA/---- AAGTAGCTGA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AATA 1 0 211014 CASAVA_Build 4 86900241 1D TTCTTCTGAA G/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 G 1 0 211015 CASAVA_Build 4 86903645 3D GAACACCTAC CAA/--- CAACAAGAGG 3070 het 3070 ref 34 17 9 9 CAA 3 2 211016 CASAVA_Build 4 86905046 2D ATTCAGAAAG TT/-- TATACTAATT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 3 1 211017 CASAVA_Build 4 86907838 1I ATTATTAAAG -/A AAAAAGAAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 5 6 211018 CASAVA_Build 4 86917957 4I GTTAAATAAG ----/TGAA TGAATGAATG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TGAA 4 5 211019 CASAVA_Build 4 86925718 1I GTAAAACAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 9 211020 CASAVA_Build 4 86926163 1D CACTACTACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2086 hom 32 7 20 5 T 10 9 211021 CASAVA_Build 4 86938244 1I GTTTACTACT -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 7 211022 CASAVA_Build 4 86949021 1I GTAAAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 A 10 11 211023 CASAVA_Build 4 86972078 1D GACTCTATCT A/- AAAAAAAAAA 2493 het 651 hom 37 4 10 23 A 17 16 211024 CASAVA_Build 4 86980328 5I AGGCATGAGC -----/CACCA CACCACGCCC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 CACCA 1 2 211025 CASAVA_Build 4 86988353 1I ACATGCATGA -/C TTTAAATGAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 0 1 211026 CASAVA_Build 4 86994133 1I GGTCAAAAAC -/A AAAAAACAAA 701 hom 7 het 7 0 3 4 A 6 7 211027 CASAVA_Build 4 86999123 1I TGGTACTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 711 hom 39 2 30 7 A 10 11 211028 CASAVA_Build 4 87000109 1I GCTTACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 10 11 211029 CASAVA_Build 4 87004789 2D GGAAAATCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 44 0 34 11 T 14 12 211030 CASAVA_Build 4 87012950 1I AACTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 T 9 10 211031 CASAVA_Build 4 87017123 1I TTTTATTTAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 9 211032 CASAVA_Build 4 87021638 1D GGGTTTTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 10 9 211033 CASAVA_Build 4 87023959 1I ACAAATTATG -/A AAGCCATACA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 2 3 211034 CASAVA_Build 4 87038164 2D TAATACACAC AT/-- ATATATATAT 1799 hom 30 het 13 0 10 4 AT 8 7 211035 CASAVA_Build 4 87072168 1I AGTAACTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 A 9 10 211036 CASAVA_Build 4 87091526 1I CCCCTATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 10 13 T 10 11 211037 CASAVA_Build 4 87137806 10I TCCAAATTGG ----------/TTTCTAACTT TTTCTAACTT 3070 hom 48 het 26 0 17 10 TTTCTAACTT 1 2 211038 CASAVA_Build 4 87140634 1I CCACCCCCCA -/C CCCCCCCCAA 2217 hom 15 het 17 0 8 9 C 8 9 211039 CASAVA_Build 4 87143010 4I25M1D CATCCTGGCT ----AACACAGTGAAACCCTGTCTCTACTA/AACAAACACAGTGAAACCCTGTCTCTACT- AAAAAAAATA 2045 hom 12 het 6 0 5 1 N/A 0 0 211040 CASAVA_Build 4 87145005 3D AAACATGATT TTA/--- TTATATGTAA 3070 hom 172 het 62 0 58 5 TTA 2 1 211041 CASAVA_Build 4 87147175 2I AAGGGGAGAC --/AG ATCTTGCTTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 AG 0 1 211042 CASAVA_Build 4 87147931 2D21M7D TTACTGAGAC AACAAAAAAAAAAATCAGATGAGTATGTAC/--CAAAAAAAAAAATCAGATGAG------- TTATGCCCAT 3070 hom 120 het 37 0 40 8 N/A 0 0 211043 CASAVA_Build 4 87150052 1D ACCTTTTAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 9 8 211044 CASAVA_Build 4 87176608 1I AGAACTTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 A 11 12 211045 CASAVA_Build 4 87252326 1D TAACTTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 12 11 211046 CASAVA_Build 4 87267382 1D TAGCTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 34 2 16 16 A 17 16 211047 CASAVA_Build 4 87300874 4D TGCCAAAGCT TTAA/---- TTAGTGAAAA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 TTAA 1 0 211048 CASAVA_Build 4 87301168 7D GGAGAATACA ATGGAGC/------- CCATGTGAAC 3070 hom 135 het 47 0 45 5 ATGGAGC 1 0 211049 CASAVA_Build 4 87301769 4D TTAATTTGGG ATGA/---- ATGAAGTGCC 3070 hom 108 het 45 0 36 11 ATGA 2 1 211050 CASAVA_Build 4 87437927 5I CTCTACTCTT -----/GACTC TACTCTAATT 3070 het 3070 hom 52 20 23 9 GACTC 0 1 211051 CASAVA_Build 4 87440653 1D GTTTTCAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 10 9 211052 CASAVA_Build 4 87442210 1D TTTTAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2627 hom 26 7 13 6 A 11 10 211053 CASAVA_Build 4 87444492 1D GATGTTTTTT G/- TTTCTTCACC 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 G 1 0 211054 CASAVA_Build 4 87452148 2D GCAGACTCAT AA/-- AAAACTATTA 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 A 6 4 211055 CASAVA_Build 4 87454202 1D CTACAGCCAC A/- AAAAAACAGC 3070 het 3070 hom 49 20 20 11 A 7 6 211056 CASAVA_Build 4 87457090 1D ATGAGAGGGA T/- TTTTTAATGC 2335 het 2335 ref 31 19 6 6 T 6 5 211057 CASAVA_Build 4 87474935 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 A 11 10 211058 CASAVA_Build 4 87475142 2I ACATGTATGT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 41 11 23 7 TA 5 6 211059 CASAVA_Build 4 87476426 5I TTTTAAATTG -----/TTTTC TTTTAAGTTG 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 TTTTC 0 1 211060 CASAVA_Build 4 87479034 3I GTTTAGTGTT ---/AAC AACAAAATTT 3070 het 3070 ref 45 22 21 2 AAC 1 2 211061 CASAVA_Build 4 87479149 1D TTTGTAGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 12 24 6 A 10 9 211062 CASAVA_Build 4 87480437 4D CACATATTGT ATTA/---- GTTCGTTTTC 3070 het 3070 ref 47 27 17 4 ATTA 1 0 211063 CASAVA_Build 4 87482718 2I TCTTCCTGTC --/AA AGAGCTCATT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 1 3 211064 CASAVA_Build 4 87484073 2I AAAAGATAAC --/AT TATTTATGTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 AT 0 1 211065 CASAVA_Build 4 87509066 1I GCAGCAGCTT -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 6 7 211066 CASAVA_Build 4 87511402 3D CATCATTAAT ATC/--- ATCATTATTT 3070 het 3070 ref 58 36 21 4 ATC 2 1 211067 CASAVA_Build 4 87518671 1I TACTCTTTTC -/T GACATATTAA 3070 het 3070 hom 57 24 25 8 T 0 1 211068 CASAVA_Build 4 87535254 1D TCAATAAAAA C/- CCCAGTATGT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 4 3 211069 CASAVA_Build 4 87542347 1D CTAAGAGGAC T/- TTTTTTTTTT 2140 het 2140 ref 40 26 5 10 T 11 10 211070 CASAVA_Build 4 87580805 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1971 hom 29 9 10 11 A 15 14 211071 CASAVA_Build 4 87583884 1I ATCACGTCCA -/T CCTTTCAGCA 3070 het 3070 hom 70 29 30 11 T 0 1 211072 CASAVA_Build 4 87670246 1D TTGTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1824 het 1524 hom 29 13 6 12 T 17 16 211073 CASAVA_Build 4 87716952 1D ACTCCGTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 18 0 15 3 A 12 11 211074 CASAVA_Build 4 87723365 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 T 9 10 211075 CASAVA_Build 4 87806489 6I GTAGACTTGC ------/ATCAAG ATTAAGGACA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATCAAG 0 1 211076 CASAVA_Build 4 87818572 1D CATGCATACC A/- AAAAAAATGT 922 het 922 ref 44 38 3 4 A 8 7 211077 CASAVA_Build 4 87859312 1D CTCCCACTCT C/- CCCACTCAAG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 C 4 3 211078 CASAVA_Build 4 87989795 1D GAGCAAAAAG A/- AAAAAAACGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 7 211079 CASAVA_Build 4 88009323 1D TTAATTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 17 1 14 2 A 14 13 211080 CASAVA_Build 4 88019230 1I GAGGTAGCTG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 6 7 211081 CASAVA_Build 4 88020029 2D GTTTTGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 35 9 16 10 T 17 15 211082 CASAVA_Build 4 88023397 1D ATTCTCCATG C/- TACTTTTAAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 C 1 0 211083 CASAVA_Build 4 88024176 1I CCTGGGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 10 11 211084 CASAVA_Build 4 88027835 2I CACCAGTGGG --/CA CATTCAAATA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 CA 1 2 211085 CASAVA_Build 4 88031611 1D ACCCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 36 1 28 7 A 12 11 211086 CASAVA_Build 4 88031835 1I CAAATAATAG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 56 26 21 9 A 7 8 211087 CASAVA_Build 4 88037932 2I CTGTTCCAAG --/AT ATATAGCATG 3070 het 3070 hom 57 24 26 7 AT 2 3 211088 CASAVA_Build 4 88040363 3I CAGGCGCCTG ---/CCA CCACACCTGG 3070 het 1206 hom 11 3 8 0 CCA 1 2 211089 CASAVA_Build 4 88040884 1I AGAGAAGCTG -/C CCCGCCCATG 3070 hom 104 het 42 0 33 9 C 3 4 211090 CASAVA_Build 4 88047219 4I TCCATCTCAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AAAT 4 5 211091 CASAVA_Build 4 88048630 1I CAACAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 39 3 22 14 T 14 15 211092 CASAVA_Build 4 88057733 2D TAAGGAAGGA AG/-- AGAGAGTGAG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 AG 4 3 211093 CASAVA_Build 4 88058048 3D GGCAGTTGAA ATG/--- ATAAGTATTT 3070 hom 117 het 46 0 38 10 ATG 1 0 211094 CASAVA_Build 4 88059904 1I TCCTAAAAAT -/A TTTTTCTTAG 3070 hom 60 het 27 0 20 7 A 0 1 211095 CASAVA_Build 4 88061496 1I ATGAAAGCTT -/A GGTCACTCCA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 0 1 211096 CASAVA_Build 4 88067976 1D GCTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 898 hom 25 4 19 3 A 15 14 211097 CASAVA_Build 4 88073348 3I CATGGCTATC ---/CTT CTTTTTTATT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTT 1 2 211098 CASAVA_Build 4 88079301 6D AACATGATCA AGAAAG/------ AGAAAGGGCC 3070 het 3070 ref 59 30 25 9 AGAAAG 2 1 211099 CASAVA_Build 4 88079463 5D TAAGTGACTT GACTC/----- TGTGACTCAA 3070 het 3070 ref 51 28 20 7 GACTC 1 0 211100 CASAVA_Build 4 88082029 4D AATCTGAAAC AAAA/---- AGACAATTGA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 5 1 211101 CASAVA_Build 4 88084142 1D TACCCAAAAT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 8 7 211102 CASAVA_Build 4 88084550 2D TTTCTGGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 19 0 13 6 T 14 12 211103 CASAVA_Build 4 88085496 12D TTTCTTTTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 1742 het 1742 ref 26 12 7 11 T 23 11 211104 CASAVA_Build 4 88088234 1I TTCTTGGTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 9 10 211105 CASAVA_Build 4 88094033 2D GTAGCTGGCG CA/-- CCACCACGCC 3063 het 3063 ref 22 13 8 3 CA 1 0 211106 CASAVA_Build 4 88106767 1D GGCTCACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 A 13 12 211107 CASAVA_Build 4 88126111 4D ATTACCACTA ATTG/---- ATAATACTGT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 ATTG 1 0 211108 CASAVA_Build 4 88131622 4D CTCCATCTCC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 20 0 15 5 A 15 11 211109 CASAVA_Build 4 88143363 2D GCCCAGGGAA TC/-- TCAGGTGTAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 TC 2 1 211110 CASAVA_Build 4 88148236 2D TGGTTTGTTA CT/-- GTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 CT 1 0 211111 CASAVA_Build 4 88160064 3I AGGGGTCGGG ---/GGT GGGGGGCAGT 2022 hom 36 het 16 0 11 5 GGT 0 1 211112 CASAVA_Build 4 88160194 3I GACGATTGTT ---/GTG GTGTGAGAGC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 GTG 1 2 211113 CASAVA_Build 4 88164778 1D AGGATCCTGC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 8 7 211114 CASAVA_Build 4 88170828 1D TACACTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 39 1 26 12 T 12 11 211115 CASAVA_Build 4 88174981 4I TTTTAGGTAT ----/CAGA CAATGAGTCA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 CAGA 0 1 211116 CASAVA_Build 4 88178169 6D TACTATAATA AATTAT/------ AATAAGACTG 3070 het 3070 ref 22 14 8 1 AATTAT 1 0 211117 CASAVA_Build 4 88184002 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1732 het 1732 ref 27 9 6 12 T 11 10 211118 CASAVA_Build 4 88205687 1I AGGTGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 13 15 A 13 14 211119 CASAVA_Build 4 88205979 1D CATTATTTTT C/- CCCCCCCTTT 3041 het 3041 ref 36 23 7 6 C 8 7 211120 CASAVA_Build 4 88206765 12D ACCCTGTCTC AAAACAAAAACA/------------ AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 21 6 AAAACA 4 2 211121 CASAVA_Build 4 88208258 5I GATAAATAAC -----/AAAAA GAAACTTAGG 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 A 0 5 211122 CASAVA_Build 4 88217474 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 45 18 19 10 T 8 7 211123 CASAVA_Build 4 88228350 1I AGTTAGGATT -/G CAATCTGGGT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 0 1 211124 CASAVA_Build 4 88228952 4I TGTATTTTTG ----/TATT TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 25 7 10 8 TATT 4 5 211125 CASAVA_Build 4 88235981 1I TTGAACTCTT -/A ACTACTTTAC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 1 2 211126 CASAVA_Build 4 88242253 1I GCCTGAAAAA -/T GCAGTTGTAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 211127 CASAVA_Build 4 88242565 4D TAAATCAAAG TCTC/---- TCTCTTGGTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TC 4 2 211128 CASAVA_Build 4 88247270 1I TCAGCTGCCA -/G TGGAGACAGG 3070 hom 85 het 33 0 24 9 G 0 1 211129 CASAVA_Build 4 88250913 1I TTCTTAATTC -/A AAAATCATAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 4 5 211130 CASAVA_Build 4 88258025 1I GACAGGTTGT -/C CCCCCCTTCC 3070 hom 101 het 38 0 32 6 C 6 7 211131 CASAVA_Build 4 88258486 2I AAATGCACAC --/AT GTTTTTTTAC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AT 0 1 211132 CASAVA_Build 4 88259210 7I CTTTCATTTT -------/CCAGCTG CCACACAGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CCAGCTG 0 1 211133 CASAVA_Build 4 88261203 2D AGCATCTGGC AG/-- AGATGATCAG 3070 hom 72 het 37 0 33 4 AG 2 1 211134 CASAVA_Build 4 88267188 1I TGTATATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 10 11 211135 CASAVA_Build 4 88275027 2D AAAACCTAGT TG/-- CGGTTGTTCC 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 TG 1 0 211136 CASAVA_Build 4 88275744 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 8 7 211137 CASAVA_Build 4 88277668 1I TGGTTGTCAC -/T TAAGTCAGAG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 1 2 211138 CASAVA_Build 4 88278205 1I TCTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 T 13 14 211139 CASAVA_Build 4 88278691 1D GTGTGTGTGT G/- TGTGTGTCTT 1002 hom 13 het 23 0 4 19 G 1 0 211140 CASAVA_Build 4 88278826 3I AATTTATCAA ---/ATT ATTATACTGG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 ATT 1 2 211141 CASAVA_Build 4 88280649 5D ATTACCATTA TATAT/----- TATATTATAT 3070 hom 30 het 16 0 11 6 TATAT 5 4 211142 CASAVA_Build 4 88282952 1I AATTTTTGTG -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 T 6 7 211143 CASAVA_Build 4 88292747 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 8 9 211144 CASAVA_Build 4 88293032 1D GTAATGCTCA C/- TGGCCTGCCG 3070 hom 80 het 30 0 27 3 C 1 0 211145 CASAVA_Build 4 88296347 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGGGGGA 1745 het 1428 hom 21 9 7 5 G 10 9 211146 CASAVA_Build 4 88308992 2D ATACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AT 6 5 211147 CASAVA_Build 4 88310045 2D TCTCCCTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 29 4 11 14 A 13 11 211148 CASAVA_Build 4 88314077 1D TAAGACTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 11 10 211149 CASAVA_Build 4 88324501 3D AAAATGTCTT ATC/--- ATCATACTCT 3070 het 3070 ref 35 19 15 3 ATC 2 1 211150 CASAVA_Build 4 88337374 46D GAAGAACCTG TGACTTGCTTCTAATTGACGGAATGTGGGAAAGTGATGAGATGCCA/---------------------------------------------- CTCTCTTGAT 3070 het 3070 hom 38 20 23 9 TGACTTGCTTCTAATTGACGGAATGTGGGAAAGTGATGAGATGCCA 1 0 211151 CASAVA_Build 4 88339842 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 34 1 27 6 A 12 11 211152 CASAVA_Build 4 88345589 8D ACTCAAGAAA ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 15 14 15 AC 13 9 211153 CASAVA_Build 4 88349360 1I ACAATCAGAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 7 8 211154 CASAVA_Build 4 88354592 28D CACATAACAG ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 3070 hom 33 het 12 0 11 7 AT 22 8 211155 CASAVA_Build 4 88359674 2I AGCTTAGGGC --/AA AGAGTCAAGA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 1 3 211156 CASAVA_Build 4 88385033 1I TACTAGAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1052 hom 47 4 29 14 A 13 14 211157 CASAVA_Build 4 88385774 1I TTCAAGACCA -/G CCTGGCCAAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 0 1 211158 CASAVA_Build 4 88387586 1D CCCAACTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 41 0 31 10 T 11 10 211159 CASAVA_Build 4 88390785 6D GAAAAAAAAG TATATA/------ TATATATATA 2132 hom 12 het 8 0 5 3 TA 10 7 211160 CASAVA_Build 4 88399716 1D CTTCCTCCCT C/- CACCATGAGA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 C 2 1 211161 CASAVA_Build 4 88401843 1D TTTACAAGGC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 9 8 211162 CASAVA_Build 4 88407417 1I CTACTAAGTG -/C CATATTTGGG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 1 2 211163 CASAVA_Build 4 88412471 3I CAGACAAATT ---/ATA ATGATTGTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ATA 0 1 211164 CASAVA_Build 4 88432699 1D CCTTTACTTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 8 7 211165 CASAVA_Build 4 88437503 1I TTGCGTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 10 11 211166 CASAVA_Build 4 88442828 1D AGGTGATCTG C/- CCCCCTTGGC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 6 5 211167 CASAVA_Build 4 88444057 4I AATTGTTTTT ----/GTTA GTGACTTTTA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 GTTA 0 1 211168 CASAVA_Build 4 88450417 1I TGCTGTACTT -/A ACTTCTGTAG 3070 hom 51 het 22 0 17 5 A 1 2 211169 CASAVA_Build 4 88451212 1D AGTGACCTCT G/- GTTGTCCTCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 2 1 211170 CASAVA_Build 4 88493908 1I CGGCCTTGTA -/G GGGGGGGCAA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 G 7 8 211171 CASAVA_Build 4 88496060 2D AGCCTGGGCA AC/-- AGAGTGAAAC 3070 hom 71 het 27 0 22 5 AC 1 0 211172 CASAVA_Build 4 88500316 1I73M2D TTCATCTGAG -TTTTTTTCAATGTACAGATATTTCACCTCATATAATTGAATCTAGCAATCTTTTCTTTTTAAGGCTTCATTCAAT/TTTTTTTTCAATGTACAGATATTTCACCTCATATAATTGAATCTAGCAATCTTTTCTTTTTAAGGCTTCATTCA-- ATATGTCAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 26 N/A 0 0 211173 CASAVA_Build 4 88505927 1I GTTTTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 35 1 30 4 A 10 11 211174 CASAVA_Build 4 88506008 1D GTGTTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 1675 het 1675 ref 23 17 4 2 A 13 12 211175 CASAVA_Build 4 88516012 4I ACATTTTCTA ----/TTTC TTTATTTCTG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TTTC 0 1 211176 CASAVA_Build 4 88516856 1I ATTTGAGAAA -/T TAAAATGGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 211177 CASAVA_Build 4 88519960 5D ATAGTAATAG TATAT/----- TATAGTATAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TATAT 1 0 211178 CASAVA_Build 4 88521937 2D CCCCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 24 1 15 8 A 16 14 211179 CASAVA_Build 4 88533820 1I ATTAGCTTCT -/A ATCTGACCAC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 A 1 2 211180 CASAVA_Build 4 88535245 1I GCAATGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 32 2 21 9 T 10 11 211181 CASAVA_Build 4 88551735 1D TTATTACTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 113 het 46 0 38 8 A 11 10 211182 CASAVA_Build 4 88551867 2I GGCATTGGTG --/GA GTGATCTTTC 3070 hom 81 het 38 0 28 10 GA 0 1 211183 CASAVA_Build 4 88552260 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 15 0 11 4 A 11 12 211184 CASAVA_Build 4 88552420 1I TCCGATAGTA -/G AGGGATATCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 0 1 211185 CASAVA_Build 4 88555283 1I TCTTTAACTG -/A AAAAAACAGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 6 7 211186 CASAVA_Build 4 88558300 1D ATAACAGCGA T/- TTTTTAGGGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 6 5 211187 CASAVA_Build 4 88559037 1D CCCCCAATAG A/- AAAGAGGTTT 3070 hom 45 het 18 0 14 6 A 4 3 211188 CASAVA_Build 4 88568710 5D AGACAATGGG ATATT/----- ATATTATTTA 3070 hom 69 het 25 0 21 6 ATATT 2 1 211189 CASAVA_Build 4 88578761 1I GTATACAGCT -/A AGTAAGTGGC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 2 211190 CASAVA_Build 4 88581022 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 10 11 211191 CASAVA_Build 4 88600142 3I AGATTAGGCT ---/TAC TCTGTAGCTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TAC 0 1 211192 CASAVA_Build 4 88604541 1D ATTTTAAGTA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 9 8 211193 CASAVA_Build 4 88606081 4D CTTTCCCTAC AGTA/---- AGTGTTACTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AGTA 1 0 211194 CASAVA_Build 4 88607618 1D AAAGCTGGGG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 8 7 211195 CASAVA_Build 4 88612255 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 20 1 15 4 A 17 16 211196 CASAVA_Build 4 88614576 1D TGGACTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 12 11 211197 CASAVA_Build 4 88618616 2D ACATCTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2759 hom 33 11 14 8 T 16 14 211198 CASAVA_Build 4 88620760 2D TGTCACTTGC TA/-- TAAACTTTAC 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 TA 2 1 211199 CASAVA_Build 4 88623260 1D ATCACTGCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1054 hom 28 5 11 12 T 15 14 211200 CASAVA_Build 4 88631435 1D TGTTTGTGAT A/- GGGGGAGGAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 6 A 1 0 211201 CASAVA_Build 4 88632961 8D GTCCTGCTGG CACAGGAC/-------- TTTGTGGCTG 3070 het 3070 hom 51 25 18 9 CACAGGAC 1 0 211202 CASAVA_Build 4 88640072 1D ATTCATAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 A 10 9 211203 CASAVA_Build 4 88642146 2D CTCCTATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2297 het 2297 ref 26 14 7 5 T 13 11 211204 CASAVA_Build 4 88642846 1I TTCTTGTTCC -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 T 6 7 211205 CASAVA_Build 4 88647632 1D CACTAATCCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 T 8 7 211206 CASAVA_Build 4 88648393 1I TTTTGGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 T 10 11 211207 CASAVA_Build 4 88658952 2D GGGAAGAAAA AG/-- AGAGAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 10 23 7 AG 3 2 211208 CASAVA_Build 4 88666129 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 8 7 211209 CASAVA_Build 4 88668044 1I TGTTTTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 10 11 211210 CASAVA_Build 4 88668379 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 7 8 211211 CASAVA_Build 4 88670140 2I GTTGTTTGTA --/TG TGTGTCTAAT 3070 hom 150 het 60 0 50 10 TG 2 3 211212 CASAVA_Build 4 88674336 1I GGATGGGGAG -/A TATATTCCTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 211213 CASAVA_Build 4 88680576 4I CTCTTTCATT ----/GGGA CTGACCTCAC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 GGGA 0 1 211214 CASAVA_Build 4 88681332 1D TAGCTACCCC T/- GAACCAATTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 T 1 0 211215 CASAVA_Build 4 88685022 3I AACAAAAAGA ---/TGT TGTCTACAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TGT 1 2 211216 CASAVA_Build 4 88689604 1I AATTCTGAAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 51 18 24 9 T 7 8 211217 CASAVA_Build 4 88690599 1D ACTCAAGTAG C/- TTTTTAGCAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 1 0 211218 CASAVA_Build 4 88691685 1I TTGCTATTGT -/C CCCCCCACTC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 C 6 7 211219 CASAVA_Build 4 88694939 1D AAAAAAGACC A/- AAAAAAACGG 816 het 816 ref 21 11 4 6 A 8 7 211220 CASAVA_Build 4 88700370 4I GCCTCAGCCT ----/CCCA AAGTGCTGAG 3070 het 3070 hom 17 9 8 0 CCCA 0 1 211221 CASAVA_Build 4 88709464 10I4M19I CTTATAACAT ----------TGTT-------------------/AACAATGTTATGTTTAACATAACAAGTTTAACA AAACTTGCAA 3070 het 3070 hom 28 15 18 0 N/A 0 0 211222 CASAVA_Build 4 88718799 1D GGGGCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 20 2 9 9 T 15 14 211223 CASAVA_Build 4 88724418 2D CACACCCACA AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 hom 34 10 19 7 AC 5 4 211224 CASAVA_Build 4 88730268 2D TGTATATATC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 23 0 18 6 AT 8 7 211225 CASAVA_Build 4 88732702 4I ATGCTCAACA ----/TCAC TCACTAATCA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 TCAC 1 2 211226 CASAVA_Build 4 88734878 1I CTATGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 A 12 13 211227 CASAVA_Build 4 88755341 3D CAGCAGCGAT AGC/--- AGCAACAGCA 3070 het 3070 ref 64 29 21 16 AGC 2 1 211228 CASAVA_Build 4 88765710 1D CTAAAGCTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 T 10 9 211229 CASAVA_Build 4 88767851 1I TGAGGGAATT -/C AGAGCAGATT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 0 1 211230 CASAVA_Build 4 88768362 3D ATTGATATTT TAA/--- TAATTTCATT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 TAA 2 1 211231 CASAVA_Build 4 88769037 4D GCAGACAGTG TGTC/---- TGTCTTATTC 3070 hom 86 het 33 0 30 6 TGTC 2 1 211232 CASAVA_Build 4 88771379 2D CTAATTGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 35 0 30 5 A 14 12 211233 CASAVA_Build 4 88771972 9D AGAAAATGTT GGAGAACTG/--------- ATGTGTAATC 3070 hom 126 het 44 0 43 6 GGAGAACTG 1 0 211234 CASAVA_Build 4 88785197 5I TTATATATCC -----/TATCA TATGTGTATT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TATCA 0 1 211235 CASAVA_Build 4 88788111 1I GTGTTATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 9 10 211236 CASAVA_Build 4 88789343 1D ATCAGCTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 10 9 211237 CASAVA_Build 4 88790469 1D ATATCAACAC A/- AGAGTGGCTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 2 1 211238 CASAVA_Build 4 88801220 4D TTTGTGTGTG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 TGTT 3 2 211239 CASAVA_Build 4 88804242 1D CAATTCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 15 13 T 13 12 211240 CASAVA_Build 4 88811533 1D TGAAATTGAG A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 7 6 211241 CASAVA_Build 4 88813303 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2880 het 540 hom 25 4 10 11 A 15 14 211242 CASAVA_Build 4 88819225 32D GTATCATACA TTACTTAATTACTTGTCCATCTTTCTTCTCTT/-------------------------------- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 34 19 15 4 TTACTTAATTACTTGTCCATCTTTCTTCTCTT 1 0 211243 CASAVA_Build 4 88822911 1I TTGTATCCTA -/T GTCTGCTCCC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 0 1 211244 CASAVA_Build 4 88823936 3D GGATCTCCGC TCT/--- TCTTCTTACA 3070 het 3070 hom 50 20 24 8 TCT 3 2 211245 CASAVA_Build 4 88830581 1D GCTCACCTTC T/- GTCAGATAAG 3070 het 3070 ref 54 25 22 7 T 1 0 211246 CASAVA_Build 4 88832474 1I CCAGGGTCCT -/C ATGCTGGGTG 3070 het 3070 ref 28 10 8 10 C 0 1 211247 CASAVA_Build 4 88918036 1D TCTTATAGTT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 7 211248 CASAVA_Build 4 88938693 2I AACTAACCTG --/CA CACAATGTGC 3070 het 1284 hom 14 3 10 1 CA 2 3 211249 CASAVA_Build 4 88941230 6D TTAAATAGAA TAAAAT/------ TAAGATAGGA 3070 het 3070 hom 35 14 20 3 TAAAAT 1 0 211250 CASAVA_Build 4 88941538 3D CTCTGAAGAA CTC/--- CTCATGGAAG 3070 het 3070 hom 49 22 26 2 CTC 2 1 211251 CASAVA_Build 4 88949702 1I TAAACAAACA -/G CATGGTGTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 0 1 211252 CASAVA_Build 4 88950049 1D3M1D ATGATATAAA GGCTA/-GCT- AAAGATTAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 N/A 0 0 211253 CASAVA_Build 4 88950393 2I AGCATGACTC --/TG TGCAAAAACA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TG 1 2 211254 CASAVA_Build 4 88953554 5D GCATTCATCT TTTAA/----- TTTATTAATT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 TTTAA 1 0 211255 CASAVA_Build 4 88955611 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2011 het 1476 hom 20 11 6 3 T 14 13 211256 CASAVA_Build 4 88962261 1D TCTTGGCTTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 9 8 211257 CASAVA_Build 4 88967287 1D GTGGCATATC G/- GATGTGCAGC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 G 2 1 211258 CASAVA_Build 4 88969552 2D TCTCTTAAAA CT/-- CTATAAATTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 CT 2 1 211259 CASAVA_Build 4 88969899 1D AAAATGAGCA T/- TTTTTGTGGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 6 5 211260 CASAVA_Build 4 88970999 1I TTAGATATGA -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 211261 CASAVA_Build 4 88987885 1D ATAGAGAAAG A/- AAAGTGCACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 4 3 211262 CASAVA_Build 4 88988743 1D TTAATGAAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 10 9 211263 CASAVA_Build 4 88991900 1I GGGTGGGGGG -/A AGGGGAGAGG 3070 het 306 hom 11 2 8 2 A 1 2 211264 CASAVA_Build 4 88992039 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 27 1 23 4 A 14 12 211265 CASAVA_Build 4 88992136 3I ATTTCTAGTG ---/TTC TTCTACAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 TTC 1 2 211266 CASAVA_Build 4 88992528 1I AAGAAAATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 9 10 211267 CASAVA_Build 4 88992780 1D AACTCTTGTG T/- TTTTTCAGCT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 T 6 5 211268 CASAVA_Build 4 88995465 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAATGAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 7 6 211269 CASAVA_Build 4 88995535 2D10M1I AAACTAAAGG TTTTTTTTTCAC-/--TGACTTTCACT CTTGGAAAGG 3070 het 3070 hom 24 11 16 4 N/A 0 0 211270 CASAVA_Build 4 88995703 1I CTTCCTGGGC -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 7 8 211271 CASAVA_Build 4 88996810 4D TAGCCTGTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 AAAC 4 3 211272 CASAVA_Build 4 88999859 3D AAATAAAACA AAC/--- AACAACAATA 3070 het 3070 ref 39 23 16 2 AAC 3 2 211273 CASAVA_Build 4 89000688 6D GCTAGAGGTT TCACAC/------ TCACACTCTT 3070 het 3070 ref 50 28 17 6 TCACAC 2 1 211274 CASAVA_Build 4 89001570 1I TTTCTGAAAG -/A AGATCAGCGT 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 A 1 2 211275 CASAVA_Build 4 89002333 1I ACTTCTATTC -/A AAAAAACACC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 6 7 211276 CASAVA_Build 4 89004653 4I GCTTCCCACC ----/GTGG TCACAGATTG 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 GTGG 0 1 211277 CASAVA_Build 4 89007333 2D AATAGCTGCA TT/-- TTTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 40 21 14 8 T 7 5 211278 CASAVA_Build 4 89007652 1I TCTCTCCTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 T 8 9 211279 CASAVA_Build 4 89018879 3I AGTTTCTGGC ---/ACA ACAACAAGAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 ACA 2 3 211280 CASAVA_Build 4 89019492 6D TTATTTAAAG CAAAAA/------ CAAAAACAAA 3070 hom 75 het 33 0 24 12 CAAAAA 3 2 211281 CASAVA_Build 4 89019615 5D ATTGTGAGAT ATATC/----- ATATGTCATG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 ATATC 1 0 211282 CASAVA_Build 4 89021860 4D AAAAAACAGG AAGA/---- AAGAAAGAAA 3070 hom 45 het 16 0 15 1 AAGA 5 4 211283 CASAVA_Build 4 89022018 2I AATAATAGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2812 hom 20 6 12 2 T 10 12 211284 CASAVA_Build 4 89024664 1I TTCTTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 A 10 11 211285 CASAVA_Build 4 89025657 4D TCTCCACCTG CTGT/---- CTATGACTTC 3070 het 3070 ref 53 34 15 5 CTGT 1 0 211286 CASAVA_Build 4 89030604 1D GAGACACAAT A/- AAAAAAAGAA 2906 het 2906 ref 19 11 6 2 A 8 7 211287 CASAVA_Build 4 89032295 4I AGGCATTGGC ----/CAAT ATGACCAAAG 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 CAAT 0 1 211288 CASAVA_Build 4 89034188 5I AAGAAGTCGA -----/TTAGG TTAGGAGTTC 3070 het 3070 hom 51 19 19 13 TTAGG 1 2 211289 CASAVA_Build 4 89042139 1D TGTGTTTAAC T/- TTCACACAAT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 3 2 211290 CASAVA_Build 4 89043132 2I GACCAAAAAA --/TG AGATGTTGTT 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 TG 0 1 211291 CASAVA_Build 4 89043472 1I GTTTTTGTTT -/G TTTTTTTGAG 1755 het 1755 ref 24 12 6 6 G 0 1 211292 CASAVA_Build 4 89045554 4I TTGATCCTGC ----/CTAA CTGTTTCTGA 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 CTAA 0 1 211293 CASAVA_Build 4 89049264 1D CACTCCCTAG C/- CTCAAGGAAG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 C 2 1 211294 CASAVA_Build 4 89049359 3D TAAAATGTAA TTT/--- TAATCTTTCA 3070 het 3070 ref 27 18 8 3 T 4 1 211295 CASAVA_Build 4 89052509 4D GTCACGACAG ATGA/---- ATGACTCATC 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 ATGA 2 1 211296 CASAVA_Build 4 89053294 1I AAAAAGAGAG -/A AAAATATATT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 4 5 211297 CASAVA_Build 4 89054805 1D TGGCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 9 4 A 15 14 211298 CASAVA_Build 4 89055794 4I TCTAGCTTTT ----/ACAG ACAAAGATGT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 ACAG 0 1 211299 CASAVA_Build 4 89056494 4D20M2I TATATATAAC TTAATTATGTTCTAACTAAATATA--/----TTATGTTCTAACTAAATATATG TGTGTGTGTA 3070 het 2369 hom 25 6 20 3 N/A 0 0 211300 CASAVA_Build 4 89057674 1D AAGTAGACCT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 9 8 211301 CASAVA_Build 4 89058500 3D CCTGCTAAAC GTT/--- ATTATTAATT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 GTT 1 0 211302 CASAVA_Build 4 89058882 3D TAGGAGGAGA AGG/--- AGGAGGAGGA 2465 het 602 hom 13 4 7 2 AGG 7 6 211303 CASAVA_Build 4 89091399 1D TTTCTTTCAG A/- ATTAGTACCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 2 1 211304 CASAVA_Build 4 89115732 1I GTGCGTTTTT -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 G 1 2 211305 CASAVA_Build 4 89116131 2I GCAGGTCTCC --/TG TGGAACAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TG 1 2 211306 CASAVA_Build 4 89123707 3D AAGGGTAATT ATC/--- ATATCCATCA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 ATC 1 0 211307 CASAVA_Build 4 89124143 1I ACTTAATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 A 10 11 211308 CASAVA_Build 4 89126637 15I GCCAGTAATT ---------------/AAATTTAATTTCACA AATGAGACTT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 AAATTTAATTTCACA 0 1 211309 CASAVA_Build 4 89129854 1I TGGTTTTTGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 1303 hom 20 5 13 2 A 8 9 211310 CASAVA_Build 4 89133051 4D AGGTCTACAC ACTA/---- ACTACTCATA 3070 het 3070 ref 35 19 12 7 ACTA 2 1 211311 CASAVA_Build 4 89133233 10D TGCTAAAAAC AACTCAGAAA/---------- AACTCAGAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 8 AACTCAGAAA 2 1 211312 CASAVA_Build 4 89138637 1D AAAACAAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 13 13 8 A 10 9 211313 CASAVA_Build 4 89144055 3I ATAGTTTCAG ---/GAA GAAGATTTCA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 GAA 1 2 211314 CASAVA_Build 4 89152070 3D GGTTTTCAAT GGG/--- GGGGGGGGGG 977 het 130 hom 22 2 8 13 G 13 10 211315 CASAVA_Build 4 89152645 1I CATGCAGGAT -/A AATCATACCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 2 3 211316 CASAVA_Build 4 89152848 3D TTTCCAGAAC TTT/--- TTTATCATCC 3070 hom 63 het 25 0 22 5 T 6 3 211317 CASAVA_Build 4 89154663 3I CACTGTCTCT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 26 9 A 15 18 211318 CASAVA_Build 4 89168005 1I GTAAGTGTCT -/G GGGCTTCCCC 3070 hom 88 het 36 0 27 9 G 3 4 211319 CASAVA_Build 4 89192469 1D CTTTGAGACA G/- GGTCTCACTC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 G 3 2 211320 CASAVA_Build 4 89222476 1I GCATATACTC -/T ACCCAGAACC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 T 0 1 211321 CASAVA_Build 4 89226056 3I GTTGCAGTCT ---/CTG AAATACAGGT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 CTG 0 1 211322 CASAVA_Build 4 89229704 1I ATATATATAT -/A AAAAAACATA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 7 211323 CASAVA_Build 4 89230153 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1885 hom 18 het 7 0 6 1 A 13 12 211324 CASAVA_Build 4 89242772 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1629 hom 18 4 14 0 A 13 14 211325 CASAVA_Build 4 89244840 1I AGCTTTGGGG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 42 1 35 6 A 0 1 211326 CASAVA_Build 4 89248328 5D AAGCAAAGGG TTAAT/----- TTAAGGGTTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTAAT 1 0 211327 CASAVA_Build 4 89248536 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 313 hom 22 1 14 7 A 9 10 211328 CASAVA_Build 4 89251002 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATTGCC 3070 het 317 hom 42 2 30 10 T 1 0 211329 CASAVA_Build 4 89251407 1D ACATCACACT A/- AAAAAGCAAT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 6 5 211330 CASAVA_Build 4 89252263 1I CCCAGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1512 hom 40 7 23 10 A 13 14 211331 CASAVA_Build 4 89259793 3I TCTTGCTATG ---/TTT TTTTAGCAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 4 7 211332 CASAVA_Build 4 89262520 2I AAAGGGGCTG --/TT AAGCCAGGGA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 T 0 2 211333 CASAVA_Build 4 89282266 1D TGAAAGGGGG A/- AAAAATCTCC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 6 5 211334 CASAVA_Build 4 89293406 1I AAACAAGAGC -/A GGGCATGTAT 2327 hom 12 het 6 0 5 1 A 0 1 211335 CASAVA_Build 4 89299295 7D GGGACAAGCC AAACACT/------- CCCGCCTCCG 2339 het 2339 ref 24 12 7 6 AAACACT 1 0 211336 CASAVA_Build 4 89300421 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1906 hom 22 8 10 4 A 13 14 211337 CASAVA_Build 4 89304193 1I CCTTTATATA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 8 9 211338 CASAVA_Build 4 89307315 5D GTCAGCCAGC TGAAA/----- TGAACTCTTA 3070 hom 94 het 37 0 28 12 TGAAA 1 0 211339 CASAVA_Build 4 89308662 1I GCTTCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 23 2 11 10 A 13 14 211340 CASAVA_Build 4 89309042 1I CACTCAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 13 14 211341 CASAVA_Build 4 89309223 1D AGTAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 2726 het 1177 hom 24 6 8 10 T 17 16 211342 CASAVA_Build 4 89311537 1D CTGGAAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 10 9 211343 CASAVA_Build 4 89316334 1I ATTATTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 25 1 22 2 T 10 11 211344 CASAVA_Build 4 89317565 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 247 hom 24 2 19 3 A 10 11 211345 CASAVA_Build 4 89319253 1D TGGTTACCAT G/- GGCCTTAGGC 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 G 3 2 211346 CASAVA_Build 4 89328819 1D CTATTTCTAC A/- AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 7 6 211347 CASAVA_Build 4 89329199 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 8 9 211348 CASAVA_Build 4 89331769 1I ATGAATCAGC -/A AATTCATTTC 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 A 2 3 211349 CASAVA_Build 4 89336963 1D GAAGATTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1588 hom 33 10 13 10 A 15 14 211350 CASAVA_Build 4 89342527 6D TCTCTACAAT TATTTA/------ TATATATATA 1066 hom 10 het 7 0 4 3 TATTTA 1 0 211351 CASAVA_Build 4 89343253 5D CAAATTATAC TTTAA/----- TTTAATGAAA 3070 het 3070 hom 36 17 17 4 TTTAA 2 1 211352 CASAVA_Build 4 89350161 3D CCTAGTGGTA GAT/--- CACTCTTTGA 3070 het 3070 hom 37 15 19 5 GAT 1 0 211353 CASAVA_Build 4 89355022 1D CTGAACTCAA C/- TCCTGGGCTC 1976 het 1976 ref 25 9 8 9 C 1 0 211354 CASAVA_Build 4 89364049 2D CAGAAAGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 47 0 16 31 T 14 12 211355 CASAVA_Build 4 89364677 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1631 hom 25 4 9 12 T 9 10 211356 CASAVA_Build 4 89372645 4D AAATTCCATT TATC/---- TATTTTTATA 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 TATC 1 0 211357 CASAVA_Build 4 89375025 1I GAAGAATGTC -/A TTGGTATTTT 1431 het 1431 ref 32 23 4 5 A 0 1 211358 CASAVA_Build 4 89396062 1I TGCCTCAGCC -/T TGCAGAGTAG 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 T 1 2 211359 CASAVA_Build 4 89399754 1I GAGCAGTCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 9 10 211360 CASAVA_Build 4 89416890 1I2M8D TTGTTGGACA -ATGACTGTCC/CAT-------- TCGCTAGATG 3070 het 3070 hom 43 16 22 7 N/A 0 0 211361 CASAVA_Build 4 89421821 4I AGTTTATAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 120 het 52 0 41 11 AAAC 3 4 211362 CASAVA_Build 4 89446748 1I AAGACAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 15 16 211363 CASAVA_Build 4 89455819 1D ATTGATAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 10 9 211364 CASAVA_Build 4 89457459 1D TTCACAATTC T/- TTTTTTTGTT 2185 het 2185 ref 24 11 6 7 T 8 7 211365 CASAVA_Build 4 89462500 1I AGAGGCCTAA -/G CACCAAATAC 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 G 0 1 211366 CASAVA_Build 4 89472754 1D TGCGGGGGTT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 hom 27 10 10 8 G 9 8 211367 CASAVA_Build 4 89482286 1D CTTATTCTTG T/- TCCCGTTCTT 1410 het 1410 ref 23 14 3 6 T 2 1 211368 CASAVA_Build 4 89488198 3D ATTTTATGCC AAG/--- AATTATCTAG 3070 hom 48 het 18 0 16 2 AAG 1 0 211369 CASAVA_Build 4 89494846 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 20 0 15 7 A 10 9 211370 CASAVA_Build 4 89495188 2I AATTTTCCCA --/TT CTCTCATTTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 0 2 211371 CASAVA_Build 4 89496108 5I AAGACATTTC -----/TATTT TATTTTATCA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TATTT 1 2 211372 CASAVA_Build 4 89499060 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AC 7 6 211373 CASAVA_Build 4 89500259 1D AAAAACTAAG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 8 7 211374 CASAVA_Build 4 89501071 1I AAGTATACTT -/A AAAAAAAAAA 3034 hom 27 het 11 0 9 2 A 10 11 211375 CASAVA_Build 4 89502503 1I CCAACTTTTA -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 7 8 211376 CASAVA_Build 4 89505263 1I TAAACCATTA -/T TTTTTTACAG 3056 het 3056 ref 24 15 8 1 T 6 7 211377 CASAVA_Build 4 89505356 1I AAGTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 10 11 211378 CASAVA_Build 4 89507181 1I GAAAATTAGT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 39 16 12 11 A 7 8 211379 CASAVA_Build 4 89510007 1I AAAAAAAAAA -/G ACAAACCCTG 3070 het 2100 hom 26 7 12 7 G 0 1 211380 CASAVA_Build 4 89512675 16D GATTATTCAC TCATTAAAGAGAGTGA/---------------- TCATTAAAGA 3070 het 3070 ref 47 21 16 15 TCATTAAAGAGAGTGA 2 1 211381 CASAVA_Build 4 89512795 1D AAGCAAGAAC A/- AAAAAACCAC 3070 hom 108 het 45 0 37 9 A 7 6 211382 CASAVA_Build 4 89515109 1D ACTGAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 A 11 10 211383 CASAVA_Build 4 89525200 1D TCCGTCTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 6 A 11 10 211384 CASAVA_Build 4 89547742 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 847 het 847 ref 27 17 3 7 T 13 12 211385 CASAVA_Build 4 89597080 1I CTGCCCGCCC -/G GGGACACTTT 3070 hom 44 het 19 0 12 7 G 3 4 211386 CASAVA_Build 4 89665194 1I GGCCATCCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 8 9 211387 CASAVA_Build 4 89689495 1D AACTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 11 10 211388 CASAVA_Build 4 89710937 8D TTATTTTATT TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 1903 het 489 hom 13 1 5 7 TTTA 6 4 211389 CASAVA_Build 4 89836693 2D TAATGAATAC AT/-- ATGTTGACAG 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 AT 2 1 211390 CASAVA_Build 4 89838747 38D TGAAAAAAAG CAAGTCTTTCTAAAGCATGGGGCCCAGGGCCAAGGCCC/-------------------------------------- CCTCTTATCT 3070 het 3070 ref 21 16 9 3 CAAGTCTTTCTAAAGCATGGGGCCCAGGGCCAAGGCCC 1 0 211391 CASAVA_Build 4 89839148 1I TCCTCACCTT -/C CCCCCCACCG 2316 het 2316 ref 29 11 9 9 C 6 7 211392 CASAVA_Build 4 89843877 6I TTGTTTCTGA ------/GGATAG GGAAAATGGC 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 GGATAG 0 1 211393 CASAVA_Build 4 89851591 1D GTGTTTGGCA T/- TTTGTTATAG 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 T 4 3 211394 CASAVA_Build 4 89851707 1D TTTCAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 11 10 211395 CASAVA_Build 4 89852206 1D GATTTCATTC T/- TTTTTCATGA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 6 5 211396 CASAVA_Build 4 89852716 1I CTAAATCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 12 13 211397 CASAVA_Build 4 89857726 1I TTTCTAGGCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 T 8 9 211398 CASAVA_Build 4 89859772 1D TCCTCCTTCT C/- CCCCCCTTCT 1558 het 1558 ref 30 12 5 13 C 7 6 211399 CASAVA_Build 4 89866155 3D CACTCTTTAA TTC/--- TTAAGTTTAC 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 TTC 1 0 211400 CASAVA_Build 4 89866474 3I TGAAGAATAT ---/AAG AAGTTAGTTA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 AAG 1 2 211401 CASAVA_Build 4 89866822 2D TTTTAAAAAA AC/-- ACAATTTTTG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 AC 2 1 211402 CASAVA_Build 4 89869243 2I GTTTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 127 het 127 ref 33 18 3 12 TG 0 1 211403 CASAVA_Build 4 89874294 2D12M2I GGGAAAAATC AGTGATCAACTGAT--/--TGATCAACTGATGA GAGACTGGTT 3070 het 3070 ref 30 18 14 1 N/A 0 0 211404 CASAVA_Build 4 89890834 2I GGCAGTAAGA --/GG TCAGGACTGT 3070 het 3070 ref 55 31 23 1 G 0 2 211405 CASAVA_Build 4 89910738 1I AGCTTAAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 25 het 37 1 22 14 A 6 7 211406 CASAVA_Build 4 89917303 1I AGATGGAGAC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 T 7 8 211407 CASAVA_Build 4 89922176 1D ATAATAAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 1848 hom 17 4 9 4 A 8 7 211408 CASAVA_Build 4 89936887 1D TTCAACTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 12 11 211409 CASAVA_Build 4 89937448 1I GTTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 1980 het 1980 ref 27 10 8 9 T 13 14 211410 CASAVA_Build 4 89943729 3I AAACATTTGT ---/TGA TATTACTGTG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 TGA 0 1 211411 CASAVA_Build 4 89944886 2I TAAAATAGAG --/AT ATTTTTAACT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AT 1 2 211412 CASAVA_Build 4 89945847 1I TGAAAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 T 12 13 211413 CASAVA_Build 4 89949828 3D TTCTTAGAGA ATG/--- ATAAGTGAAG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 ATG 1 0 211414 CASAVA_Build 4 89958325 1D GCCCAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 963 hom 20 2 14 4 T 11 10 211415 CASAVA_Build 4 89966000 2I AAAATGTCAA --/TG TTTTTTTAAA 936 hom 21 het 24 0 8 16 TG 0 1 211416 CASAVA_Build 4 89975613 1D CAGGGACTGG T/- TTAATGGAGG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 3 2 211417 CASAVA_Build 4 89977137 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 19 0 17 2 A 11 10 211418 CASAVA_Build 4 89978365 2I CTGAAACCTA --/AT CCCCCAGGGA 3070 hom 81 het 35 0 27 8 AT 0 1 211419 CASAVA_Build 4 89978901 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2599 hom 18 het 8 0 7 1 A 12 11 211420 CASAVA_Build 4 90003185 18I AATATATACA ------------------/TATACATATATATATATG TATATATTTG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 TATACATATATATATATG 0 1 211421 CASAVA_Build 4 90024012 3D TTACAATTGA AAT/--- TACCACAGAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 AAT 1 0 211422 CASAVA_Build 4 90047376 1I TTCCATAGAT -/G GATTCCATCT 3070 het 3070 hom 54 24 28 2 G 1 2 211423 CASAVA_Build 4 90052389 52D TGAATCAATG GGCTGAGTAAGGAAGATCCACTCTCACCAAATGTTGCAGGCACCATCCAATT/---------------------------------------------------- GGCTGAGGAC 3070 het 3070 ref 33 30 14 6 GGCTGAGTAAGGAAGATCCACTCTCACCAAATGTTGCAGGCACCATCCAATT 1 0 211424 CASAVA_Build 4 90053197 3D GGAGGAGGAG GAA/--- GAAGAAGAAG 2533 het 1408 hom 28 11 11 7 GAA 6 5 211425 CASAVA_Build 4 90067608 1I TTTGGATGTC -/T TTTTTTTTTT 2677 het 2677 ref 34 17 10 7 T 12 13 211426 CASAVA_Build 4 90068528 5D TAAGTCCGTT TAGTC/----- TAAAGTCCAA 3070 het 3070 ref 27 18 8 2 TAGTC 1 0 211427 CASAVA_Build 4 90068888 1I GGGTTTCTTG -/T TGGGAGCATA 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 T 1 2 211428 CASAVA_Build 4 90070210 1D ACCGAGCTCA T/- TTTTTTTTTA 1234 het 1234 ref 37 29 3 6 T 10 9 211429 CASAVA_Build 4 90076102 1I GAGATCAGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 A 8 9 211430 CASAVA_Build 4 90080528 4D GAAAACTTAG GGAA/---- ATTGTATCCT 3070 het 3070 ref 44 20 20 7 GGAA 1 0 211431 CASAVA_Build 4 90082768 1I ATAGAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3043 het 3043 ref 17 8 8 1 A 13 14 211432 CASAVA_Build 4 90082837 1I AAAAAGCTAA -/C CAATGCAAGA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 C 1 2 211433 CASAVA_Build 4 90090383 1D AAAATCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2089 hom 29 8 13 8 T 15 14 211434 CASAVA_Build 4 90105747 1D TTTTTAAGTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 9 8 211435 CASAVA_Build 4 90113306 1D CTAGGCATAA T/- TTTTTTTTTT 2921 het 1519 hom 38 9 8 21 T 17 16 211436 CASAVA_Build 4 90113761 4I CCCTTATCCT ----/ATTA ATTGTTTTAA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 ATTA 0 1 211437 CASAVA_Build 4 90120764 6D CAATAACAAA TATAAT/------ TATGCTAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 4 TATAAT 1 0 211438 CASAVA_Build 4 90121333 1I ACGAAAGGCA -/C CAAGACGCAG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 C 1 2 211439 CASAVA_Build 4 90129383 4D CTCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 48 het 24 0 15 9 AAAC 5 4 211440 CASAVA_Build 4 90130864 1I TGATTACAGA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 6 7 211441 CASAVA_Build 4 90132448 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 21 0 14 7 T 13 12 211442 CASAVA_Build 4 90133101 4I TTAAGTGAAG ----/AAGA AACAGAAAAA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 AAGA 0 1 211443 CASAVA_Build 4 90134165 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 25 2 21 2 A 15 16 211444 CASAVA_Build 4 90135013 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 26 1 20 5 A 13 12 211445 CASAVA_Build 4 90137743 4D AAAAAAAAAA TTAT/---- AATTATAATC 1243 het 1243 ref 40 17 10 16 TTAT 1 0 211446 CASAVA_Build 4 90142351 7D ACCCAACGGC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 2383 hom 35 12 18 6 A 18 11 211447 CASAVA_Build 4 90143458 2D AGCAATTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 522 hom 24 2 10 12 A 13 11 211448 CASAVA_Build 4 90145156 2D CATGTCATGG TT/-- TTTTTTTTGG 3070 hom 78 het 29 0 25 7 T 10 8 211449 CASAVA_Build 4 90146198 1I TTGTCTTCCA -/G GGTTTTTATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 3 211450 CASAVA_Build 4 90146396 1I AGTCATAGGT -/G GTGCAGCCTT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 G 1 2 211451 CASAVA_Build 4 90148245 1D ATTTCCGAGA T/- CTGTCGGAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 1 0 211452 CASAVA_Build 4 90153669 2D TTGCTCAATT AC/-- AGTCATGCAC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 AC 1 0 211453 CASAVA_Build 4 90156363 1D GCCTTAGTTT A/- AAAAAAAAAA 2465 het 798 hom 29 4 10 15 A 13 12 211454 CASAVA_Build 4 90156375 1I AAAAAAAAAA -/C ACACAATTTT 3070 het 748 hom 28 5 16 7 C 0 1 211455 CASAVA_Build 4 90164024 2D CAGTACCCAC AT/-- GAGGCTTACC 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 AT 1 0 211456 CASAVA_Build 4 90165054 1I GATTCAGTAG -/A TATGAGGTGT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 0 1 211457 CASAVA_Build 4 90169127 5I TTTTACATGC -----/TTTAT TTTATCATTC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TTTAT 1 2 211458 CASAVA_Build 4 90172463 1D GAGTCTACCT A/- TAACTGTTTA 2567 het 2567 ref 17 10 6 1 A 1 0 211459 CASAVA_Build 4 90178637 1I AGAAAGCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 10 11 211460 CASAVA_Build 4 90181739 3I CTCACACAGT ---/GAG AAGAGAGTTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 GAG 0 1 211461 CASAVA_Build 4 90185418 1D AAGGAAAAAA C/- ATTTCAGAAG 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 C 1 0 211462 CASAVA_Build 4 90186861 1D TCTTTTCTGC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 7 6 211463 CASAVA_Build 4 90197630 1I ACATTATTCA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 6 7 211464 CASAVA_Build 4 90198317 3D GTGTATATGT ACC/--- ACATTTTCTT 3070 het 2709 hom 28 6 13 9 ACC 1 0 211465 CASAVA_Build 4 90200797 1D CCTTTTATCA T/- TTTTTTATTG 2012 het 2012 ref 17 10 5 2 T 7 6 211466 CASAVA_Build 4 90201020 4I TCTAACTCTT ----/TTAA TTGTGATGTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 TTAA 0 1 211467 CASAVA_Build 4 90215537 4I AAAGAGAGAG ----/AGAA AGAGACCATA 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 AGAA 0 1 211468 CASAVA_Build 4 90220163 1D CTATATAGAG A/- AAGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 3 2 211469 CASAVA_Build 4 90227174 2D TTCTTCTCTC TT/-- TTTTTCTTTA 3070 het 2445 hom 19 5 13 2 T 7 5 211470 CASAVA_Build 4 90227420 1D GATGTTGGCA T/- TTAGTGCTAT 2902 het 2876 hom 15 6 6 3 T 3 2 211471 CASAVA_Build 4 90230195 1D AGCCCCCTTT C/- CAGGGGAGTG 3070 het 2379 hom 22 7 9 7 C 2 1 211472 CASAVA_Build 4 90232721 1D CCTATTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 6 A 11 10 211473 CASAVA_Build 4 90237763 1D CTTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 10 9 211474 CASAVA_Build 4 90245910 1I GATACCCGGC -/T TTGGGGGGAC 3070 het 3070 hom 50 21 17 12 T 2 3 211475 CASAVA_Build 4 90257645 2I ACAAATTGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 T 12 14 211476 CASAVA_Build 4 90267257 1I GGGAGGCCAA -/G GGGGGGCAGA 3070 het 2600 hom 22 8 11 3 G 6 7 211477 CASAVA_Build 4 90271447 1D AAAAGTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 T 11 10 211478 CASAVA_Build 4 90275611 9I CCACTTATGT ---------/CTATTAGAA CTATTAAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 CTATTAGAA 0 1 211479 CASAVA_Build 4 90284433 1I TTCTCTCTCC -/T TGATGCTCTG 3070 het 3070 hom 39 16 23 0 T 1 2 211480 CASAVA_Build 4 90286860 1D TGGAGTGCCG T/- TGGCACAATC 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 T 2 1 211481 CASAVA_Build 4 90292996 4D TATACAGTTA TTGT/---- TTGTCAATTA 2591 het 2591 ref 17 10 7 2 TTGT 2 1 211482 CASAVA_Build 4 90294770 1I CTCAGGAAAG -/T TTTTTTTTTT 1157 het 1157 ref 43 27 4 12 T 11 12 211483 CASAVA_Build 4 90334399 3D GGAACAGCAT AAA/--- AAACTTATGA 3070 het 2919 hom 34 8 19 8 A 6 3 211484 CASAVA_Build 4 90337141 1I CCCTAAGCCC -/T GATTTGACCA 3070 het 3070 ref 59 33 22 4 T 0 1 211485 CASAVA_Build 4 90341336 1D TCTTTTAATA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 8 7 211486 CASAVA_Build 4 90341443 1D TGGTTTCAAG A/- AAAAGTGATT 3070 het 3070 hom 38 12 24 2 A 5 4 211487 CASAVA_Build 4 90345383 4D ATAAAAGAAT ATTG/---- ATTTGAAGGG 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 ATTG 1 0 211488 CASAVA_Build 4 90358225 1D TTTCAGAATA T/- TCATATATAA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 T 2 1 211489 CASAVA_Build 4 90358460 1D GGAGGTGGGG C/- CGGGTGGGAG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 C 2 1 211490 CASAVA_Build 4 90370603 3D GTTGCAATGT GCC/--- TCCTTTGAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 4 GCC 1 0 211491 CASAVA_Build 4 90374647 1I GTGCATACCA -/G AGGCTGGGAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 211492 CASAVA_Build 4 90375280 2I TCAGACACTG --/AT ATGGTTAAGC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 AT 1 2 211493 CASAVA_Build 4 90378292 2I GTGCATTTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 251 hom 36 1 21 14 AC 8 9 211494 CASAVA_Build 4 90381381 1I AGGAGATGAT -/A AAAAAAAAAA 2810 het 2810 ref 29 14 8 7 A 10 11 211495 CASAVA_Build 4 90386030 1D GGTAATTTGA T/- GGAAATTTCA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 1 0 211496 CASAVA_Build 4 90411751 1I AAAACTTGTA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 39 25 11 3 T 6 7 211497 CASAVA_Build 4 90425526 1I TATAATAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2175 hom 20 7 11 2 A 9 10 211498 CASAVA_Build 4 90436807 2D ATAAAGACAC AT/-- GTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 54 23 26 11 AT 1 0 211499 CASAVA_Build 4 90443801 1D GAAGATGATC A/- GGGGAGGAAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 1 0 211500 CASAVA_Build 4 90444074 2D AAAGTAACTC AT/-- GTAATATTTC 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 AT 1 0 211501 CASAVA_Build 4 90452136 1D CAAATTAGGG A/- ACCCAAATCC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 2 1 211502 CASAVA_Build 4 90452442 2I CATTGGTTCT --/GA GTTATTTGGC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 GA 0 1 211503 CASAVA_Build 4 90475074 7D TCCTTTAAAA GTGCCAG/------- GTGTCAGGCC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 GTGCCAG 1 0 211504 CASAVA_Build 4 90476799 1I AAAAATAAAC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 7 8 211505 CASAVA_Build 4 90478964 1I AAGCACAATT -/G TGAAGGGAAT 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 G 0 1 211506 CASAVA_Build 4 90483936 3D TTTCTTTTGC GTT/--- GTGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 GTT 1 0 211507 CASAVA_Build 4 90495822 1I TTGCAGCTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 8 9 211508 CASAVA_Build 4 90497530 1D TGCATGTAGC A/- AAAACATGGC 3070 het 3070 ref 51 32 17 3 A 5 4 211509 CASAVA_Build 4 90502776 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 24 2 13 9 T 13 12 211510 CASAVA_Build 4 90508588 1D AAATCTCTTT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 3053 hom 34 9 12 13 C 10 9 211511 CASAVA_Build 4 90512457 1I AAATTTGTGT -/A AAAATGTAAT 3070 het 3070 ref 56 26 24 6 A 4 5 211512 CASAVA_Build 4 90526660 1I CTTCCTGATC -/T TTTTTTTTTT 2687 het 2687 ref 41 20 8 13 T 13 14 211513 CASAVA_Build 4 90535528 2D TAAAAATATG TA/-- TATATATATA 2873 het 2238 hom 15 6 8 1 TA 8 7 211514 CASAVA_Build 4 90536378 1D TTGGTGATAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 9 8 211515 CASAVA_Build 4 90537599 1D TGTACTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 12 11 211516 CASAVA_Build 4 90539907 1D ATACCTGAAA T/- TTGGCCTTCC 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 T 3 2 211517 CASAVA_Build 4 90577600 1D TGTGACTTCC T/- TTTTTTTTTT 2825 het 47 hom 25 2 11 12 T 19 18 211518 CASAVA_Build 4 90584158 2D GACCCAAAGC CA/-- CATATATTAC 3070 hom 132 het 52 0 44 8 CA 2 1 211519 CASAVA_Build 4 90597178 1D AAAGAATTAC T/- GTACTAGCCA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 1 0 211520 CASAVA_Build 4 90597620 1D CTGTAGGACA C/- CATTGAGTGT 3070 hom 93 het 39 0 30 9 C 2 1 211521 CASAVA_Build 4 90613327 1D CTGATGAGTG A/- AAAAAAAAAA 2974 het 2974 ref 28 13 8 8 A 12 11 211522 CASAVA_Build 4 90614092 1D ACATAGTCCT C/- CTTGGTTTAG 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 C 2 1 211523 CASAVA_Build 4 90622522 1D TGTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1353 het 1353 ref 26 17 5 4 T 15 14 211524 CASAVA_Build 4 90628155 1I TTGAATATTC -/T TTTAGAGCAC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 3 4 211525 CASAVA_Build 4 90641011 1D TTTGATAGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 8 14 13 T 10 9 211526 CASAVA_Build 4 90649449 2I ATGGCTGACA --/TG TGTTTTTTCA 3070 hom 82 het 33 0 27 6 TG 1 2 211527 CASAVA_Build 4 90650756 1I CAGTGTTGGA -/G GGTGGGGCCT 3070 hom 111 het 44 0 35 9 G 2 3 211528 CASAVA_Build 4 90651141 11D ATGTTAGGAA GTTATAAAGAT/----------- GGGCTGAAGG 3070 hom 108 het 36 0 37 4 GTTATAAAGAT 1 0 211529 CASAVA_Build 4 90651449 2D ATGGAGACTC GA/-- TAACAGCTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GA 1 0 211530 CASAVA_Build 4 90654652 5I CTACCCGATG -----/TTCTT CCTATTCAGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTCTT 0 1 211531 CASAVA_Build 4 90655631 1D TTTTTTTTTT A/- ACCTCCTTAT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 A 2 1 211532 CASAVA_Build 4 90657759 4D TTGCTTATGT ATTC/---- ATTCAATCAT 3070 hom 157 het 54 0 52 3 ATTC 2 1 211533 CASAVA_Build 4 90658264 1I ATTTTTTTTT -/G GGGGGGGGAG 3070 hom 80 het 34 0 26 8 G 8 9 211534 CASAVA_Build 4 90668480 28D TGTCTTATAC TAAGCAAATGAACATATATATGTTCATT/---------------------------- TAAGCAAATG 3070 hom 39 het 20 0 14 10 TAAGCAAATGAACATATATATGTTCATT 2 1 211535 CASAVA_Build 4 90672500 1D CAGTGGCATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 10 9 211536 CASAVA_Build 4 90678326 1D TAAAAGTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 11 10 211537 CASAVA_Build 4 90686619 1I TTACCACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 631 hom 35 2 28 5 T 10 11 211538 CASAVA_Build 4 90688350 2I CCTATGGAAT --/GA GAGGAAGTAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 GA 1 2 211539 CASAVA_Build 4 90696128 1I ATGATAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1403 hom 23 4 17 2 T 10 11 211540 CASAVA_Build 4 90700344 4I CATCGGTCCT ----/CAGA CAGACTTACC 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 CAGA 1 2 211541 CASAVA_Build 4 90706752 1D TCTATTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 26 0 25 1 T 12 11 211542 CASAVA_Build 4 90710956 2I ACTGTTTAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 40 0 29 11 A 11 13 211543 CASAVA_Build 4 90757004 3I GTCTGTGTTC ---/CTT CTTCTTTAAG 3070 het 3070 hom 60 23 27 10 CTT 2 3 211544 CASAVA_Build 4 90773368 1I GGGCAGCCTT -/A AAGCGGGCCC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 2 3 211545 CASAVA_Build 4 90775263 1I AAAGAAGTCA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 T 7 8 211546 CASAVA_Build 4 90802062 1D CTGCAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 22 11 T 11 10 211547 CASAVA_Build 4 90822127 1D TGTAATAGTA T/- TTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 6 5 211548 CASAVA_Build 4 90838756 1I TTTCATAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 9 10 211549 CASAVA_Build 4 90852082 1D AAAACAGAGC T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 8 7 211550 CASAVA_Build 4 90854905 1I TGGACTCCTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 8 9 211551 CASAVA_Build 4 90855619 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 3 A 7 6 211552 CASAVA_Build 4 90855740 4D TTTCCTCTGT TTTA/---- TTTATTTTGC 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TTTA 2 1 211553 CASAVA_Build 4 90856158 1D AACTCACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 11 10 211554 CASAVA_Build 4 90879313 4I AAAGGCTTTA ----/AGAT AGATAGCTAG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AGAT 1 2 211555 CASAVA_Build 4 90897279 3I GCTATGATAG ---/TTA TTATTATACA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTA 2 3 211556 CASAVA_Build 4 90904830 3D TAGTCTCGAT CTC/--- CTGACCTCAT 3070 hom 45 het 16 0 15 3 CTC 1 0 211557 CASAVA_Build 4 90912843 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 6 T 11 10 211558 CASAVA_Build 4 90919375 1D CAACAGCTGC A/- AAAAAAAAAA 1717 het 1717 ref 46 32 4 10 A 12 11 211559 CASAVA_Build 4 90931539 1I CACATGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 11 12 211560 CASAVA_Build 4 90934884 1I AGATGCAGAT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 2741 hom 31 8 17 6 A 7 8 211561 CASAVA_Build 4 90942599 1D TTTTAATAGC T/- TTTTTTTTTT 2768 het 592 hom 25 6 8 11 T 17 16 211562 CASAVA_Build 4 90951397 6D AGGTCTTATA TATCAC/------ TATATTTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 TATCAC 1 0 211563 CASAVA_Build 4 90956512 5D ACCATATGAT GATGG/----- GTATGTTAAT 3070 het 3070 ref 29 14 13 4 GATGG 1 0 211564 CASAVA_Build 4 90962341 1I GTATCTTGCT -/C CCTGCCTCCA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 C 2 3 211565 CASAVA_Build 4 90965902 1I TGCCCCACCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 11 12 211566 CASAVA_Build 4 90968819 1D CCCATTATGT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 8 7 211567 CASAVA_Build 4 90992812 1D TAGCATTTAA C/- CCCCCACATT 3070 het 3070 hom 59 22 28 9 C 6 5 211568 CASAVA_Build 4 91004088 1I TTTTACCTTC -/T TGTCTTTCTG 3070 het 3070 ref 51 29 20 2 T 1 2 211569 CASAVA_Build 4 91010654 3D GTAATTTTAA ATT/--- GTATGCTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 19 6 ATT 1 0 211570 CASAVA_Build 4 91042296 7I TTAGGTAAAA -------/ATAAAAC AAGAGTATGT 3070 het 1855 hom 13 4 7 2 ATAAAAC 0 1 211571 CASAVA_Build 4 91042949 1D ATAAATCAAA G/- TATCTAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 G 1 0 211572 CASAVA_Build 4 91056539 1D TTAGATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 41 0 32 9 A 12 11 211573 CASAVA_Build 4 91090499 1D TTGTGCACAT G/- GACAAGTATG 3070 het 3070 ref 37 22 10 9 G 2 1 211574 CASAVA_Build 4 91093119 1I TAAGGAAAGA -/C AAAATAAGAT 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 C 0 1 211575 CASAVA_Build 4 91096654 1D TAGCTAATTA T/- TATACCTAAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 2 1 211576 CASAVA_Build 4 91096855 2D CACCGGTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 965 hom 29 9 13 7 T 16 14 211577 CASAVA_Build 4 91123415 5I AATCAATAAG -----/AAAAT AAAATATAGC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AAAAT 1 2 211578 CASAVA_Build 4 91125564 1I GAATCACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 25 4 T 12 13 211579 CASAVA_Build 4 91144267 1I TATTAAGGCC -/T TTTTTTGTCC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 6 7 211580 CASAVA_Build 4 91156060 1D TATGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 13 12 211581 CASAVA_Build 4 91156313 1D GCCTCAGCCT C/- CCAAAGTGCT 3070 het 1066 hom 25 4 14 7 C 3 2 211582 CASAVA_Build 4 91160150 6I TTGTTTAAAA ------/TAAACT TAAAATATAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 TAAACT 0 1 211583 CASAVA_Build 4 91167159 4I CTTTTGTGTC ----/TCTT TCTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 TCTT 1 2 211584 CASAVA_Build 4 91180253 7D ATCACTAGCA ACAAAAG/------- ACAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 ACAAAAG 2 1 211585 CASAVA_Build 4 91189138 1I GGAGATAGGT -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 6 7 211586 CASAVA_Build 4 91195092 1D CAGACCCTGG A/- AAATGTATTC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 4 3 211587 CASAVA_Build 4 91197666 13I TCTGTTAGGA -------------/TGGCTGCCATGGC CTCCTAACTG 3070 het 3070 hom 57 26 24 8 TGGCTGCCATGGC 0 1 211588 CASAVA_Build 4 91201689 13I GCTTGAAAAA -------------/TTCTGTGGGACTC TTAAATTACT 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 TTCTGTGGGACTC 0 1 211589 CASAVA_Build 4 91202013 1I ATTTTTAAAG -/A AAAACAACAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 4 5 211590 CASAVA_Build 4 91214557 5I AATGAGTGAA -----/AAGTT AAATAATACA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAGTT 0 1 211591 CASAVA_Build 4 91220000 3D TGTTTAAATA ATT/--- ATTATATTTC 3070 het 3070 ref 41 20 18 6 ATT 2 1 211592 CASAVA_Build 4 91221384 1D CTCTTTTTTT C/- CCCTCTAATT 3070 het 3070 ref 26 11 13 2 C 4 3 211593 CASAVA_Build 4 91222220 1I TGCGGTAACC -/T TTTCATTTAG 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 T 3 4 211594 CASAVA_Build 4 91226830 4D GTTTGCTTGC TTGT/---- TTGTTTTTGC 2684 het 2068 hom 22 7 7 10 TTGT 2 1 211595 CASAVA_Build 4 91228558 3I TTTATAATCT ---/TAG TAGAAAACAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 TAG 1 2 211596 CASAVA_Build 4 91229959 5D CTTATCCTCT CTCCA/----- CTCCACTCCA 3070 het 3070 ref 34 16 14 7 CTCCA 3 2 211597 CASAVA_Build 4 91232955 1I CCTTTTTTTT -/A AAAGCAAGAA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 A 3 4 211598 CASAVA_Build 4 91284461 3D AGGAAAAGTG TGC/--- TGCTATTCAT 3070 het 3070 ref 54 25 23 8 TGC 2 1 211599 CASAVA_Build 4 91311389 3I TTTTAAAAAT ---/TTC TTATTTGCAT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 TTC 0 1 211600 CASAVA_Build 4 91328687 1I AATTATTTTC -/A TGGACTTCTT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 0 1 211601 CASAVA_Build 4 91339771 5I CTCCTTTGCC -----/TCTCT TCTCAAGGAA 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 TCTCT 0 1 211602 CASAVA_Build 4 91342377 1D TAAGTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2708 het 1451 hom 24 9 10 5 T 15 14 211603 CASAVA_Build 4 91349944 1D TTGTCTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 9 T 15 14 211604 CASAVA_Build 4 91359032 4I TGTCTTTACA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 AAAT 4 5 211605 CASAVA_Build 4 91389257 1I AATAAAATCA -/T TTTGTGGCAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 T 3 4 211606 CASAVA_Build 4 91404863 1D TCTAATACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 55 23 25 8 T 10 9 211607 CASAVA_Build 4 91420965 8I GAGAAGGTCT --------/TTAACCTA TTAATCTAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 TTAACCTA 0 1 211608 CASAVA_Build 4 91459820 2I AGCAAGACTC --/TG TCTCAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 TG 0 1 211609 CASAVA_Build 4 91468513 1D GATTCTCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 10 9 211610 CASAVA_Build 4 91471994 1D GTAAGACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 T 14 13 211611 CASAVA_Build 4 91474728 1I CTTTGCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 10 11 211612 CASAVA_Build 4 91477796 1D GTTTTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 T 11 10 211613 CASAVA_Build 4 91481851 4D ACTTGTCAAC CTGA/---- CTATTAGGCT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 CTGA 1 0 211614 CASAVA_Build 4 91490048 2I GAGTTTAAGT --/AA AAAGTGTTCA 3070 het 3070 ref 55 24 23 8 A 3 5 211615 CASAVA_Build 4 91494973 1I TAACTTCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 23 7 5 T 9 10 211616 CASAVA_Build 4 91498446 1I ATTCAGATTT -/A AAAATGAAGT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 4 5 211617 CASAVA_Build 4 91503783 1D GGGCAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 21 12 6 A 10 9 211618 CASAVA_Build 4 91601133 3D TTCAAATAAT AAG/--- AAGCCCTCAC 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 AAG 2 1 211619 CASAVA_Build 4 91670125 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 2579 het 975 hom 14 6 6 2 A 1 0 211620 CASAVA_Build 4 91671571 1D TGCAGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2429 het 2429 ref 48 27 9 12 T 17 16 211621 CASAVA_Build 4 91686291 1I TGGCTGAAAT -/A AGTTTGACAG 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 A 1 2 211622 CASAVA_Build 4 91687371 4I TGCCTATTGT ----/TAAG TAATGCCAAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 TAAG 0 1 211623 CASAVA_Build 4 91697029 2I TCTATATGTG --/TA TATATATATA 1676 het 1676 ref 23 15 5 3 TA 8 9 211624 CASAVA_Build 4 91704862 3I ATTCATTTTG ---/AGT TTTTTTTTTT 3070 het 2763 hom 34 10 17 7 AGT 0 1 211625 CASAVA_Build 4 91705471 5I GATTGTTTTC -----/TTAAT TTATTTTCAG 2402 het 2402 ref 22 13 5 4 TTAAT 0 1 211626 CASAVA_Build 4 91707208 4I ACAAAAACAA ----/AAAC AAACAAAAAA 2975 het 2975 ref 34 17 10 7 AAAC 1 2 211627 CASAVA_Build 4 91707482 1I TGTCTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 2296 het 1109 hom 19 5 10 4 T 16 17 211628 CASAVA_Build 4 91719190 14I5M2I4M3I5M6I TGTTGTCTAT --------------TAAAA--AAAG---CTTGA------/GATTGCTTCTTTACTGAAAGGAAAGATAATTGAGTCAAG CTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 15 14 3 N/A 0 0 211629 CASAVA_Build 4 91719869 1I TTCAGAAATG -/A AAAAATTACA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 5 6 211630 CASAVA_Build 4 91733851 3D GCACTGTATA TAT/--- TATTGTTGTA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 TAT 2 1 211631 CASAVA_Build 4 91735682 4I AACTGGGCTT ----/AGAA AGCTTGTATT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 AGAA 0 1 211632 CASAVA_Build 4 91741149 1D TTCAAATCTA T/- TTTTTTCATT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 7 6 211633 CASAVA_Build 4 91743799 1I TTCTCTTACC -/A ACAATACTTT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 A 1 2 211634 CASAVA_Build 4 91745186 1I CGCTTCCACG -/C TGTGGGAGGT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 C 0 1 211635 CASAVA_Build 4 91746379 3I GAGAGTCCTA ---/GTT GTTGTTATTA 3070 hom 106 het 43 0 36 7 GTT 2 3 211636 CASAVA_Build 4 91749656 4I TCCTTTTGAT ----/AGAA AGAACAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AGAA 1 2 211637 CASAVA_Build 4 91751296 1D TGGTCTCGAA C/- TCCTGACCTC 2234 het 1319 hom 13 3 5 6 C 1 0 211638 CASAVA_Build 4 91755850 1D GAAAGTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 523 hom 33 3 22 9 T 12 11 211639 CASAVA_Build 4 91763520 1D GATGGCAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 14 0 12 4 T 10 9 211640 CASAVA_Build 4 91764577 1I GCTAAGTGAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 70 hom 40 1 36 3 A 8 9 211641 CASAVA_Build 4 91768180 1D ATTTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 3 T 11 10 211642 CASAVA_Build 4 91770313 1I AACTGTATGA -/T TTCTATACTG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 2 3 211643 CASAVA_Build 4 91778062 1I TCCAAAGGCC -/T CTTTTCATTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 211644 CASAVA_Build 4 91785767 1D TTATTTATTT C/- CTATTCAGGG 3070 het 3070 hom 47 18 23 7 C 2 1 211645 CASAVA_Build 4 91790393 4D TCCGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 2364 het 2315 hom 24 10 7 8 AAAC 6 5 211646 CASAVA_Build 4 91791863 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1077 hom 33 8 14 12 A 12 11 211647 CASAVA_Build 4 91793011 3D CTGTCTTACT AGA/--- AGAATCCAAG 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 AGA 2 1 211648 CASAVA_Build 4 91793242 2I AACTGCCATC --/TA TTTCTTACCA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 TA 0 1 211649 CASAVA_Build 4 91800454 2D AAATCAACCT AA/-- GTGTCCATCG 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 A 2 0 211650 CASAVA_Build 4 91800836 3D TTTGCAGGAT TTA/--- TGATAAGAAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 TTA 1 0 211651 CASAVA_Build 4 91801133 4I CTTGGCACAT ----/AGTC AGTGCTCAAT 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 AGTC 0 1 211652 CASAVA_Build 4 91805504 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 25 3 12 10 T 12 11 211653 CASAVA_Build 4 91815791 2D CACATGATCT AA/-- AATTTATATA 3070 hom 35 het 16 0 13 4 A 4 2 211654 CASAVA_Build 4 91831646 2D ATATACACAC AT/-- GTATTATATA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 AT 1 0 211655 CASAVA_Build 4 91831731 2D ACATATCACA TG/-- TGTGTATATC 3070 het 3070 ref 51 31 19 1 TG 3 2 211656 CASAVA_Build 4 91831873 2D ATATACACAC AT/-- ATATGTTATT 3070 het 3070 ref 49 27 18 5 AT 3 2 211657 CASAVA_Build 4 91832210 18D TCAATGTGTG TATATATATATATATATA/------------------ TATATATATA 3070 hom 48 het 20 0 17 5 TA 17 8 211658 CASAVA_Build 4 91836573 1D AAACTGGTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 120 het 45 0 40 6 T 9 8 211659 CASAVA_Build 4 91837569 1D ACATAAAAAA C/- CAATATTTCA 3070 het 3070 ref 38 24 12 3 C 2 1 211660 CASAVA_Build 4 91847704 1D TTTCTACCTT A/- AAAAAAAAAT 2519 het 1435 hom 16 5 7 4 A 10 9 211661 CASAVA_Build 4 91852262 1I AATTTTTTTC -/A AAAAAAGTAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 6 7 211662 CASAVA_Build 4 91855124 8I TAGTCATTGT --------/GGTGATGC GGTGATGCTC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 GGTGATGC 1 2 211663 CASAVA_Build 4 91856951 1D TAATGTTTGC A/- CAGTGACAAA 3070 het 3070 ref 58 30 24 5 A 1 0 211664 CASAVA_Build 4 91860476 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 9 8 211665 CASAVA_Build 4 91861542 1I CCAATGGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 A 9 10 211666 CASAVA_Build 4 91876812 1D TATTAGGTCA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 T 8 7 211667 CASAVA_Build 4 91877960 1D TGCTTCATTC T/- TTTTACTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 5 4 211668 CASAVA_Build 4 91883478 4D GATTAAATTA TAAC/---- TAATAGCAAA 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 TAAC 1 0 211669 CASAVA_Build 4 91897972 1D GACTGTGGAG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 7 6 211670 CASAVA_Build 4 91905266 4D TCCATCCAAG TTTC/---- CTTCCAATCA 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 TTTC 1 0 211671 CASAVA_Build 4 91907481 1I TGTAGAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 10 11 211672 CASAVA_Build 4 91907855 1I AACAGGGTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 595 hom 37 2 25 10 T 9 10 211673 CASAVA_Build 4 91918954 1I TGGTTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 A 10 11 211674 CASAVA_Build 4 91925901 1I AAGTTGTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 9 10 211675 CASAVA_Build 4 91926684 1D TTTAGAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 8 7 211676 CASAVA_Build 4 91930723 1D TCTGGATACA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 8 7 211677 CASAVA_Build 4 91933726 1I ATATACCACA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 T 6 7 211678 CASAVA_Build 4 91936414 1I TTTGTCCAGG -/A ATTTATTCAT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 1 2 211679 CASAVA_Build 4 91938713 1I CATTTGGTGG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 A 7 8 211680 CASAVA_Build 4 91940887 1D23M3D TCCAAATCGA TTTTTAATGAAACCCATGGGTTTTAGG/-TTTTAATGAAACCCATGGGTTTT--- AGATCAGAAA 3070 het 3070 hom 33 15 21 3 N/A 0 0 211681 CASAVA_Build 4 91942742 3D TCAAGTAGTA ATT/--- ATTAATGCTG 3070 het 2846 hom 32 10 20 3 ATT 2 1 211682 CASAVA_Build 4 91943074 2D TTCTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 T 11 9 211683 CASAVA_Build 4 91943391 1I TGTTTTTGTC -/T TTTTTTTAAA 2832 het 2034 hom 17 6 7 4 T 7 8 211684 CASAVA_Build 4 91943549 1I CCCCACCCCC -/T TGACAGGCCT 3070 het 2281 hom 24 7 14 3 T 1 2 211685 CASAVA_Build 4 91944578 1D GTGTAAGGAA G/- GGGGTCCAGT 3070 het 3070 ref 35 23 10 3 G 5 4 211686 CASAVA_Build 4 91945259 5I TGAACTATAA -----/TAATT TAGAGTTTGT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 TAATT 0 1 211687 CASAVA_Build 4 91945532 1D TGTTGGGTGT C/- CTTTGGGAGC 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 C 2 1 211688 CASAVA_Build 4 91947826 1D TTACATTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 798 hom 37 2 28 8 A 13 12 211689 CASAVA_Build 4 91949911 1I AGGTAAAAAA -/T AAAAAGTTAG 3070 het 2892 hom 22 8 10 4 T 0 1 211690 CASAVA_Build 4 91950066 4I ACCCTGTCTC ----/TAAA TAAATAAATG 3070 het 3070 hom 41 11 23 7 TAAA 2 3 211691 CASAVA_Build 4 91952041 4D TAGCTGTATT AGTC/---- AGGGTTCTTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 AGTC 1 0 211692 CASAVA_Build 4 91952083 10D GAATATATAT ATACACACAC/---------- ACACACACAC 1212 hom 15 het 17 0 6 13 ATACACACAC 1 0 211693 CASAVA_Build 4 91955352 1I GTCAGAGAGT -/G CTCAGGGAAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 G 0 1 211694 CASAVA_Build 4 91958793 1D GTTTTAGTCA T/- TTGTTTTTAG 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 T 3 2 211695 CASAVA_Build 4 91972260 2D TATGTGACTC TT/-- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 9 7 211696 CASAVA_Build 4 91978658 1D ATTTCATAAT A/- TTTTTTTTAA 1516 het 1516 ref 15 8 4 3 A 1 0 211697 CASAVA_Build 4 91981311 3I TGAAAACCTC ---/AGT AGCCAATGTA 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 AGT 0 1 211698 CASAVA_Build 4 91982202 1D GATTTCTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 10 hom 40 1 33 6 T 10 9 211699 CASAVA_Build 4 91983410 1I TGAGTCAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1381 hom 55 4 42 9 A 10 11 211700 CASAVA_Build 4 91984332 4I TTGTGTATAT ----/ATAG ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 ATAG 4 5 211701 CASAVA_Build 4 91986140 1D TATTTATAGA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 T 8 7 211702 CASAVA_Build 4 91986650 2D GTATAGGTAC AT/-- GTGATATTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 7 AT 1 0 211703 CASAVA_Build 4 91986917 1D TCCCAGCCTC T/- TGATAATCAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 2 1 211704 CASAVA_Build 4 91992287 1D AAGAGAAGTC A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 A 7 6 211705 CASAVA_Build 4 91993787 1D AAGCCAATAC T/- TTTAAAGACC 3070 het 3070 ref 37 22 11 6 T 4 3 211706 CASAVA_Build 4 91995163 2I GCACGAGAGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 44 14 17 13 GT 7 8 211707 CASAVA_Build 4 92002530 1I TTCTCAAATG -/A AAAGTCAATT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 3 4 211708 CASAVA_Build 4 92011302 2D AAAAATTAAC TT/-- TTCATTTTGT 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 4 2 211709 CASAVA_Build 4 92014612 1D TTTTTCCCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 15 9 A 10 9 211710 CASAVA_Build 4 92032792 1I TAATTTCTAA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 T 6 7 211711 CASAVA_Build 4 92039068 1D CTCTGGTTTT G/- TTTTTAATGC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 G 1 0 211712 CASAVA_Build 4 92057082 1D GAGACACATG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 16 8 8 0 A 7 6 211713 CASAVA_Build 4 92058755 1D CGTGCAAATG A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 7 6 211714 CASAVA_Build 4 92060433 4D AGGATGTATT TAAA/---- TAAGTTCCAT 3070 het 3070 ref 29 14 14 4 TAAA 1 0 211715 CASAVA_Build 4 92061486 1I TTCTTAATTA -/T TTGTACCTAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 2 3 211716 CASAVA_Build 4 92073864 2D CTTTTGGAAG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 11 9 211717 CASAVA_Build 4 92074638 1I TCTTTTGCCC -/A CTGAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 0 1 211718 CASAVA_Build 4 92076332 2I TTGTGGAAAC --/AG AGAATTTAAT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 AG 1 2 211719 CASAVA_Build 4 92086814 3I AAAAAAAAAA ---/GAG AGAGATTATA 3070 het 722 hom 42 4 17 21 GAG 0 1 211720 CASAVA_Build 4 92087168 3D GGTGGAACAA TCC/--- TCCTCTGTTA 3070 het 3070 ref 58 28 22 10 TCC 2 1 211721 CASAVA_Build 4 92093517 1I ATTTCATTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 T 9 10 211722 CASAVA_Build 4 92094085 1D GCAATAAGAG A/- AAAATTACAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 5 4 211723 CASAVA_Build 4 92094238 2I TGATTTTTAC --/TG ATAAATACTT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 TG 0 1 211724 CASAVA_Build 4 92094964 1I TACATTTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 339 hom 60 1 55 4 A 9 10 211725 CASAVA_Build 4 92099872 4I ATGATCAGAT ----/AAAG AAAGAGACTT 3070 hom 51 het 26 0 17 9 AAAG 1 2 211726 CASAVA_Build 4 92120170 1I CTAAAAAAAA -/T ATAATAAACT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 0 1 211727 CASAVA_Build 4 92134364 6D19M1I TAAGCAACAT GTAGAGATGGAAACCCCATCTCTAC-/------AGGGAAACCCCATCTCTACA AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 37 28 10 8 N/A 0 0 211728 CASAVA_Build 4 92134776 1D TCCATTTTTT A/- AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 7 6 211729 CASAVA_Build 4 92138898 2D CATTACACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 721 hom 41 5 19 17 T 12 10 211730 CASAVA_Build 4 92140054 5D GTTTCTGAGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2894 het 894 hom 22 4 10 9 T 16 11 211731 CASAVA_Build 4 92146557 1I TCTAACAGTT -/A TTTTTGATGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 211732 CASAVA_Build 4 92167541 1I GTTAATTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 T 9 10 211733 CASAVA_Build 4 92167616 1D TATGCAGAAT A/- AAATGCATGT 3070 het 3070 hom 41 13 21 8 A 4 3 211734 CASAVA_Build 4 92168886 1D ATGTGTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 32 8 19 7 A 11 10 211735 CASAVA_Build 4 92169098 1D AAGCTTCAGC A/- AATAAAAAGT 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 A 3 2 211736 CASAVA_Build 4 92170183 2I TTATCTATTA --/AT ATCATTAATT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AT 1 2 211737 CASAVA_Build 4 92170915 1I71M1D TTCTCTGATT -AAAAAAAAAGAACCAAATGGAGCAAATTAATTCATCTCTTTTTTTTCATCTGTAAATCCAAAAGCTGTGTGA/AAAAAAAAAAGAACCAAATGGAGCAAATTAATTCATCTCTTTTTTTTCATCTGTAAATCCAAATGCTGTATG- AAAGCTGTAT 3070 het 3070 ref 39 31 24 7 N/A 0 0 211738 CASAVA_Build 4 92173234 1I ACAAATAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 A 10 11 211739 CASAVA_Build 4 92174557 4I CCTTTTTAAA ----/TTGT TTGTTAAAAT 3070 het 3070 ref 49 30 13 6 TTGT 1 2 211740 CASAVA_Build 4 92174715 2D AAAATTTCAT AC/-- ACCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 AC 2 1 211741 CASAVA_Build 4 92177759 3D TCTACTTTTC CTT/--- CTTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 CTT 2 1 211742 CASAVA_Build 4 92178631 1I ATAAAAAGAT -/C TCATGTGAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 211743 CASAVA_Build 4 92185657 4D CCCTTAACAA TAAC/---- TAGTGTTTAT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TAAC 1 0 211744 CASAVA_Build 4 92186537 1D ATTCTTACAC T/- TTTCTATGGC 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 T 4 3 211745 CASAVA_Build 4 92188543 5D TATTTTTCTT CTTTA/----- CTTTTTGTTC 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 CTTTA 1 0 211746 CASAVA_Build 4 92207804 1D CAGGTATGAG C/- CACTGCACCC 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 C 2 1 211747 CASAVA_Build 4 92216423 1I GCCTAAATTA -/C TACCAAGCTT 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 C 0 1 211748 CASAVA_Build 4 92216506 1D AACCATGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 12 11 211749 CASAVA_Build 4 92237510 1I ATTAAGGCTG -/T TTATTGGAAG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 2 3 211750 CASAVA_Build 4 92240365 2I TGGGCAAGAT --/AA AAAAAAAAAA 2557 het 2557 ref 23 14 7 2 A 10 12 211751 CASAVA_Build 4 92240545 6D CAACAGTTAC TATTAT/------ TATTATTATT 3070 het 3070 ref 21 10 9 7 TAT 6 4 211752 CASAVA_Build 4 92242468 1D GATGTTAAAA T/- CCAGGCTGGG 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 T 1 0 211753 CASAVA_Build 4 92242881 2D AAACAAACTT AC/-- AGTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 AC 1 0 211754 CASAVA_Build 4 92245581 1D AACAGTAAAC A/- AAAAAAAAAA 2064 het 602 hom 16 7 8 2 A 15 14 211755 CASAVA_Build 4 92250472 2I CTTCACTAGG --/AA AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 7 9 211756 CASAVA_Build 4 92254025 1D GATATCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 13 12 211757 CASAVA_Build 4 92255760 1D TGGTCAACTC T/- TTTTTTATAC 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 7 6 211758 CASAVA_Build 4 92261297 1D TGCTGACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 11 10 211759 CASAVA_Build 4 92268134 1I ACTCCCAGAT -/G CTCAGTCCTT 3070 het 3070 ref 43 25 10 8 G 0 1 211760 CASAVA_Build 4 92269645 1I ATTTAACTAT -/G GAAATAGGAT 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 G 1 2 211761 CASAVA_Build 4 92271506 1D TTCTCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 2373 het 2373 ref 27 12 8 9 T 15 14 211762 CASAVA_Build 4 92274596 1I CCCTGTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 10 11 211763 CASAVA_Build 4 92275913 1D GAAGGAAAGG A/- AAAATGTTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 5 4 211764 CASAVA_Build 4 92277187 2I ATAAAAATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 15 0 10 5 T 11 13 211765 CASAVA_Build 4 92283140 1I ATTTGAACTC -/T TTTTTTGGTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 6 7 211766 CASAVA_Build 4 92286755 4I TATCTTCTTC ----/TTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTCT 0 1 211767 CASAVA_Build 4 92306893 3D TGAAAATGTA GTT/--- GTTGTTGTTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 GTT 4 3 211768 CASAVA_Build 4 92313007 1I GTGTTAATGT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 7 8 211769 CASAVA_Build 4 92314997 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 36 4 17 15 T 13 12 211770 CASAVA_Build 4 92316381 1I TACCAGTACC -/A TGCTGTTTTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 0 1 211771 CASAVA_Build 4 92318585 3I GACAGTGGGG ---/TGT TAAAGTCTCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TGT 0 1 211772 CASAVA_Build 4 92321117 1D TAGATTGGGC T/- AGTTAACTGC 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 1 0 211773 CASAVA_Build 4 92332103 1D ACCTTGGCTG A/- AATAAGAAAA 3070 het 3070 ref 58 24 23 11 A 3 2 211774 CASAVA_Build 4 92333997 1I GTTTTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 T 10 11 211775 CASAVA_Build 4 92338534 1D CTGTTTCAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 49 22 17 11 A 9 8 211776 CASAVA_Build 4 92340359 1D TTTTAGTTGA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 8 7 211777 CASAVA_Build 4 92343824 1D ATACTATGTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 41 23 11 8 A 9 8 211778 CASAVA_Build 4 92347527 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 9 8 211779 CASAVA_Build 4 92361748 1D ATTGGAAAAT A/- AAAAATATGC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 6 5 211780 CASAVA_Build 4 92363227 1I TAAAATAATG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 7 8 211781 CASAVA_Build 4 92376211 5I ATTTTTTATT -----/TTTCA AAAATCATAT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 TTTCA 0 1 211782 CASAVA_Build 4 92379003 1I ATTTTAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 13 14 211783 CASAVA_Build 4 92387476 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2425 het 1580 hom 15 7 6 2 A 15 14 211784 CASAVA_Build 4 92390133 1I ATAAAAAAAA -/C AAAACAGCTT 3070 het 2402 hom 30 9 12 9 C 0 1 211785 CASAVA_Build 4 92397727 2I GGCAACTAAC --/TA TGTTTATTCC 3070 hom 74 het 33 0 28 5 TA 0 1 211786 CASAVA_Build 4 92401904 3D CTCAAATGAA AAC/--- AACAACAGTG 3070 hom 120 het 46 0 41 9 AAC 3 2 211787 CASAVA_Build 4 92402391 3I GCTCTCAAAC ---/CTT CTTGGAAGAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CTT 1 2 211788 CASAVA_Build 4 92403027 1I TTATCATATG -/A AAAAAAAAAA 2396 het 2396 ref 24 11 6 7 A 10 11 211789 CASAVA_Build 4 92404307 2D AGGAAGAGAC TG/-- TTGTAATTTT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 TG 1 0 211790 CASAVA_Build 4 92425422 1D CTTCAATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3007 hom 30 9 9 13 T 17 16 211791 CASAVA_Build 4 92428323 2I TATACACTCG --/TA TATATATATA 2604 het 2604 ref 24 11 9 4 TA 7 8 211792 CASAVA_Build 4 92441715 2D TAAAATATAG TA/-- TATATATATA 2151 het 1659 hom 17 6 5 6 TA 8 7 211793 CASAVA_Build 4 92442987 2D CCCCTAGATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 12 10 211794 CASAVA_Build 4 92447536 1I TCTATGATGC -/G TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 G 0 1 211795 CASAVA_Build 4 92448148 1I TACGAAATGC -/T TTTAGCCAAG 3070 het 3070 hom 53 23 27 3 T 3 4 211796 CASAVA_Build 4 92448780 1D GTGCATTCTC A/- GTTCTGAAAA 3070 het 3070 hom 49 24 24 1 A 1 0 211797 CASAVA_Build 4 92449527 2I TAAAAATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 TG 6 7 211798 CASAVA_Build 4 92489882 1D AGAGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1005 het 1005 ref 36 27 3 6 T 11 10 211799 CASAVA_Build 4 92495641 5D CATACCTTGG ATAGA/----- ATAGCATTAT 1252 het 1252 ref 45 39 3 5 ATAGA 1 0 211800 CASAVA_Build 4 92512005 13D CACCGTAGGA CCTAGGTGATGAG/------------- CTTTCTACCC 3070 het 3070 hom 42 21 21 3 CCTAGGTGATGAG 1 0 211801 CASAVA_Build 4 92523174 1I ATCATTATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 11 14 T 12 13 211802 CASAVA_Build 4 92524600 5I CAACATGATA -----/TTAAG TTAGATTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTAAG 0 1 211803 CASAVA_Build 4 92553130 1I AGGAAACAAA -/C AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 C 0 1 211804 CASAVA_Build 4 92568098 1D CATGCTTAGT C/- CAGGGATATA 3070 het 3070 hom 37 13 23 1 C 2 1 211805 CASAVA_Build 4 92574372 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1279 het 1279 ref 28 20 3 5 T 10 11 211806 CASAVA_Build 4 92584633 1I ATTCTTTTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 9 10 211807 CASAVA_Build 4 92585587 1I TTTCTCATTT -/G TAGCCATCTT 1940 het 1940 ref 30 14 7 9 G 0 1 211808 CASAVA_Build 4 92586385 1I TTCCTCATAC -/T TTTTTTGCCA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 6 7 211809 CASAVA_Build 4 92587571 2I CCCCCTAAAC --/TA CTGCTATTTC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 TA 0 1 211810 CASAVA_Build 4 92590290 3I TGGCTGGAGA ---/TTG TTTGTTTTTA 3070 het 3070 hom 57 20 30 7 TTG 0 1 211811 CASAVA_Build 4 92591262 1I TTCTAGTTCA -/T AAGATGGTAC 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 T 0 1 211812 CASAVA_Build 4 92599320 1I GTCTTTTTTT -/A AAAAACAGAA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 5 6 211813 CASAVA_Build 4 92610620 1I CTGAAATGGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 8 9 211814 CASAVA_Build 4 92633623 1D GTTTATTATG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 29 11 18 0 A 8 7 211815 CASAVA_Build 4 92638633 1D CTATTTATGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 T 10 9 211816 CASAVA_Build 4 92643761 1D TTGGAAATTA T/- TTGTTTTGAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 3 2 211817 CASAVA_Build 4 92644893 4D CCTATTTTAA TAGT/---- TATTTAGCCA 3070 hom 75 het 29 0 26 7 TAGT 1 0 211818 CASAVA_Build 4 92648495 2D AAACATGGTG GC/-- GCATTTATCC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 GC 2 1 211819 CASAVA_Build 4 92654800 1I ATCTGGGTTC -/A AAAAATAGAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 5 6 211820 CASAVA_Build 4 92658076 1D TGGTTTCACA G/- GGGGGGTATG 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 G 7 6 211821 CASAVA_Build 4 92660480 1I AAACTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 12 13 211822 CASAVA_Build 4 92661183 1D TTACATTAGG T/- TATTTCTTCT 3070 het 926 hom 17 3 12 2 T 2 1 211823 CASAVA_Build 4 92667138 2I TCCTTTGATG --/CA CAGTCATTAG 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 CA 1 2 211824 CASAVA_Build 4 92668395 2D GCGCCCAGCC CA/-- AGTGCTAATA 3070 het 3070 hom 27 14 12 1 CA 1 0 211825 CASAVA_Build 4 92670525 1D GGAAAATAAA T/- TTTAGTTTTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 4 3 211826 CASAVA_Build 4 92670859 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2953 het 2953 ref 29 10 8 11 T 16 14 211827 CASAVA_Build 4 92672878 1D CATTCTCTAC A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 A 7 6 211828 CASAVA_Build 4 92675615 1I53M3I GAGGTGAGGA -GACGGAATAAAATCTCACAAAATGAAAAATAAAAAACAACAAGAATAACCAAA---/GGACGGAATAAAATCTCACAAAATGAAAAATAAAAAACAACAAGAATAACCAAATCT TCTTCCACTA 3070 het 3070 ref 35 27 10 12 N/A 0 0 211829 CASAVA_Build 4 92677993 1D AAACCACATG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 8 7 211830 CASAVA_Build 4 92687147 1D TTGAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 795 hom 26 4 12 10 T 15 14 211831 CASAVA_Build 4 92688738 1D ATTCCTTCAA T/- TTTTTTTTTT 2700 het 2700 ref 30 16 8 6 T 13 12 211832 CASAVA_Build 4 92690009 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 A 7 8 211833 CASAVA_Build 4 92690100 1I TCATTGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 T 11 12 211834 CASAVA_Build 4 92692324 1D GATGGCTAAA C/- TACCCTCAAA 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 C 1 0 211835 CASAVA_Build 4 92693630 4I ATTTTAAGAA ----/AGAT AGATAGATAT 3070 het 3070 ref 51 28 17 6 AGAT 2 3 211836 CASAVA_Build 4 92696469 4I TATCTGTAAA ----/CTTT CTGTTAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 CTTT 0 1 211837 CASAVA_Build 4 92698285 1I AATAAAAAAA -/T ATATATTTCA 1933 het 1161 hom 10 4 4 2 T 0 1 211838 CASAVA_Build 4 92698432 1D ATTATTGGTT C/- CCATGTTATT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 C 3 2 211839 CASAVA_Build 4 92699945 4D AGAAAAATTA TATT/---- TATTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 12 18 6 TATT 2 1 211840 CASAVA_Build 4 92700468 4D AGTTAAAAGG AAAC/---- AAACACTTTT 3070 het 3070 ref 51 32 15 6 AAAC 2 1 211841 CASAVA_Build 4 92703685 22D AATTAGATAT AGTGTTCCATATCTACACACAC/---------------------- AGTGTTCCAT 3070 het 3070 ref 42 26 12 14 AGTGTTCCATATCTACACACAC 1 0 211842 CASAVA_Build 4 92707614 1D TATGTTTATT A/- AATTTTCTGC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 3 2 211843 CASAVA_Build 4 92707876 1I ACTACCCCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 8 9 211844 CASAVA_Build 4 92708383 1I TTAGCTGAGA -/G GGTTCGCTGT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 G 2 3 211845 CASAVA_Build 4 92708583 1I CAAGGTTTGG -/A ATATTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 1 2 211846 CASAVA_Build 4 92708979 1I ATCTTGATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 T 9 10 211847 CASAVA_Build 4 92710483 1I CCTGGAGGAT -/G GTGGCCTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 G 1 2 211848 CASAVA_Build 4 92712984 1D AAAAATCTAT A/- AAAAAAAAAA 1883 het 1292 hom 24 8 11 5 A 16 15 211849 CASAVA_Build 4 92713050 1I ACTTAGGCAT -/C CCCTCCACCC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 C 3 4 211850 CASAVA_Build 4 92714431 1D GAGGTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 11 10 211851 CASAVA_Build 4 92717174 2D TGTTTTCAAT TA/-- TATACTACAG 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 TA 3 2 211852 CASAVA_Build 4 92718002 2D ATTTTATCTC TT/-- ATTATGTGCA 3070 het 3070 ref 31 19 11 2 T 2 0 211853 CASAVA_Build 4 92720908 2I AAATCTGCAA --/CT CTCTGGTAGA 3070 het 3070 hom 67 27 30 10 CT 2 3 211854 CASAVA_Build 4 92725028 1I CTGAATTACT -/A ATAATATGGA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 1 2 211855 CASAVA_Build 4 92728150 5D AGTGAGCAAG AAGTT/----- AAGATATTAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 4 AAGTT 1 0 211856 CASAVA_Build 4 92732764 3D CTTCTACTAC AAG/--- AACTGTAACC 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 AAG 1 0 211857 CASAVA_Build 4 92732942 1D GATGGCTATT G/- GGGGATTGTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 5 4 211858 CASAVA_Build 4 92734315 2D TTAATTCTGA TT/-- TTGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 48 28 18 3 T 4 2 211859 CASAVA_Build 4 92754467 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAAAC 873 het 873 ref 45 25 3 18 AC 1 0 211860 CASAVA_Build 4 92771997 1D GATCTTAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2266 hom 23 6 13 4 A 13 12 211861 CASAVA_Build 4 92772222 5I TTACCAAAAT -----/AAATA AAATCAGAAA 3070 het 2843 hom 33 9 20 4 AAATA 0 1 211862 CASAVA_Build 4 92792120 3D AGATCAATAA TGT/--- TATATTTACA 3070 het 3070 hom 24 8 13 4 TGT 1 0 211863 CASAVA_Build 4 92813765 2D TAGACATTGG TT/-- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 10 8 211864 CASAVA_Build 4 92825898 1I CCTTCTCTTA -/T TTTTACTACT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 4 5 211865 CASAVA_Build 4 92828693 1D TGTGGTTTAG T/- TTTTTATTTC 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 T 6 5 211866 CASAVA_Build 4 92844453 1D TTTATTGAGA T/- TTTTATCTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 5 4 211867 CASAVA_Build 4 92845060 2D GTTTAACCTG AT/-- ATCTAAGTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AT 2 1 211868 CASAVA_Build 4 92845583 1D TTTTCACCAG T/- TTTTCCCAGC 3070 hom 58 het 34 0 24 12 T 5 4 211869 CASAVA_Build 4 92849272 4I TAAAGTTAAC ----/CAGT CAGAGGAGTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CAGT 0 1 211870 CASAVA_Build 4 92860701 1D GAACTTTGTG T/- TTAAAAATAG 2933 het 2933 ref 25 15 7 3 T 3 2 211871 CASAVA_Build 4 92863986 5D AAAAGAAATT AAGTA/----- GAGAAGAGGA 3070 het 3070 hom 28 10 16 5 AAGTA 1 0 211872 CASAVA_Build 4 92867192 4I ATCTCCTCGA ----/TTTG TTTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TTTG 0 1 211873 CASAVA_Build 4 92870424 4I TTCAGTCACA ----/ATCT ATCCTCAATT 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 ATCT 0 1 211874 CASAVA_Build 4 92872506 4D TAAAATTGAG AAAA/---- AAAACCCATA 3070 het 3070 ref 44 27 11 7 A 8 4 211875 CASAVA_Build 4 92873309 4I TAAATTATAA ----/AAAC AAACTAGATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAC 1 2 211876 CASAVA_Build 4 92879939 13I GATATTTAAA -------------/GAAAATTGCTACT GGAGATAATG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 GAAAATTGCTACT 0 1 211877 CASAVA_Build 4 92880922 14I TCTCCTGCAC --------------/TTACCATCCTTCAA TTCATTAGTG 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 TTACCATCCTTCAA 0 1 211878 CASAVA_Build 4 92889209 6D TAGATTAACA CTACTG/------ TGAATGAAAC 3070 het 3070 ref 41 23 13 6 CTACTG 1 0 211879 CASAVA_Build 4 92890563 3D AAAAGGACTT TTC/--- TTTTGGCTCA 3070 het 3070 hom 32 12 17 5 TTC 1 0 211880 CASAVA_Build 4 92902274 2I TTTCTTTTTC --/AT ATATATATAT 2009 het 1649 hom 15 4 6 5 AT 6 7 211881 CASAVA_Build 4 92905502 16I AAAATAATTT ----------------/TGTGGGCCAGGCCCAA GGCCCCCCTG 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 TGTGGGCCAGGCCCAA 0 1 211882 CASAVA_Build 4 92908096 1D TCTGGCTAAT A/- ACTTCTTAGC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 2 1 211883 CASAVA_Build 4 92940147 4D CTCTCTAGAA ACAG/---- ACAGAATGGC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 ACAG 2 1 211884 CASAVA_Build 4 93017191 1D TGTAACCCCA T/- TGTGTATAGG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 2 1 211885 CASAVA_Build 4 93038891 1I AATGAAATAG -/A AAAAAAATAG 3070 hom 85 het 35 0 29 6 A 7 8 211886 CASAVA_Build 4 93053567 1D TAAAATGATG C/- TCTGAGTATA 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 C 1 0 211887 CASAVA_Build 4 93079989 1D AATATATTCT A/- AAAAAAATTT 2253 het 2253 ref 22 15 5 2 A 8 7 211888 CASAVA_Build 4 93089518 1I GACTAAAGGC -/G TTGCATATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 0 1 211889 CASAVA_Build 4 93091452 1D TTCTAGTTTT A/- CACATTATTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 0 211890 CASAVA_Build 4 93108323 2D CCTGGAACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 36 0 23 14 A 14 12 211891 CASAVA_Build 4 93126746 3D AAGGATTTTT TTA/--- TTATGACTAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 TTA 2 1 211892 CASAVA_Build 4 93156578 2D AGAATGTAAC AT/-- AGGATAAACT 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 AT 1 0 211893 CASAVA_Build 4 93162392 1I ATATTTTTTT -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 6 7 211894 CASAVA_Build 4 93176952 1I TCCCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 2676 het 2676 ref 31 11 9 11 T 11 12 211895 CASAVA_Build 4 93196262 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2061 het 2061 ref 20 11 5 4 A 12 11 211896 CASAVA_Build 4 93226144 1I AACAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 16 11 A 10 11 211897 CASAVA_Build 4 93238601 1D GTTGATGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 T 12 11 211898 CASAVA_Build 4 93293113 1D AAACATTCAG A/- ATGTAAGTGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 2 1 211899 CASAVA_Build 4 93325828 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 18 8 7 3 A 10 11 211900 CASAVA_Build 4 93334515 1I AAATAATGAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 49 19 19 11 A 7 8 211901 CASAVA_Build 4 93419090 2D ATCATTTCTT TA/-- TGTTTCATAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 TA 1 0 211902 CASAVA_Build 4 93466210 1D TGCTTACATG A/- AAAAAAATAG 1386 het 1386 ref 33 26 3 6 A 8 7 211903 CASAVA_Build 4 93489184 1D ACTAGAGTGC T/- TTTTTTTTTG 1309 het 1309 ref 37 26 3 8 T 10 9 211904 CASAVA_Build 4 93500666 1D ATAGAATAAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 16 16 6 A 9 8 211905 CASAVA_Build 4 93516830 1D GAGAGGCCTG C/- CCCTGCAACA 1968 het 1968 ref 23 15 5 3 C 4 3 211906 CASAVA_Build 4 93529679 9I CAGTTAAAAG ---------/GACCCATTT GACCCATTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 GACCCATTT 1 2 211907 CASAVA_Build 4 93545891 1D TCAGTAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 A 13 12 211908 CASAVA_Build 4 93547256 4D GGCAGGAGAT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 40 18 10 13 AG 8 6 211909 CASAVA_Build 4 93565128 4D GTTCTCATGA CTAT/---- CTAAATTATA 3070 het 3070 ref 28 15 12 3 CTAT 1 0 211910 CASAVA_Build 4 93567955 4I TTATTGTAAA ----/TAAT TAAGTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 TAAT 0 1 211911 CASAVA_Build 4 93594288 4I AAATATAAAT ----/AATA AATAATGACA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 AATA 1 2 211912 CASAVA_Build 4 93596336 1D GCTTTCCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 280 hom 26 4 9 14 A 11 10 211913 CASAVA_Build 4 93605453 1I GAGTGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 11 12 211914 CASAVA_Build 4 93607005 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 TG 6 7 211915 CASAVA_Build 4 93608226 2D GAACCTAGAC TG/-- TGTCACTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 22 6 TG 2 1 211916 CASAVA_Build 4 93617135 2I CAATGAAATG --/AA AAGTTATTTA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 2 4 211917 CASAVA_Build 4 93627928 4D TTGTGGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 19 16 9 TTTG 5 4 211918 CASAVA_Build 4 93646778 1I GAAAATTGTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 52 20 24 8 T 8 9 211919 CASAVA_Build 4 93652222 1D GACCATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 11 10 211920 CASAVA_Build 4 93660550 2I ACATATTGAT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 A 9 11 211921 CASAVA_Build 4 93666397 1I ATTCATTAGA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 6 7 211922 CASAVA_Build 4 93671961 1I TAATTCTCAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 8 9 211923 CASAVA_Build 4 93685384 1D TAAAGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 15 9 A 11 10 211924 CASAVA_Build 4 93687845 1I GAAAAGGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 11 12 211925 CASAVA_Build 4 93720040 11I CAAAATGTCA -----------/ATTTTGTATAT GAGACTGTGA 3070 het 3070 hom 22 11 12 0 ATTTTGTATAT 0 1 211926 CASAVA_Build 4 93720504 3D TCATGTAATA AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 AAG 3 2 211927 CASAVA_Build 4 93720581 1D AAGAGTACCA T/- TTTCCTACCT 3070 het 3070 hom 33 17 16 0 T 4 3 211928 CASAVA_Build 4 93720788 1D ACAGCCTACA C/- TATATTATTT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 C 1 0 211929 CASAVA_Build 4 93720911 1I AATTCTCACA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 8 9 211930 CASAVA_Build 4 93721069 3I TATTTGTTTT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 het 2812 hom 32 13 12 7 TTG 0 1 211931 CASAVA_Build 4 93723523 1D AATAATATTT G/- CTAATTGTCA 3070 het 2866 hom 24 7 17 0 G 1 0 211932 CASAVA_Build 4 93723830 2D48M2I AGATAATAAT TATATATATATATATACACACACATACACATATATAATATACATATAATT--/--TATATATATATACACACACACATACACATATATAATATACATATAATTTA TATATATAAA 2560 het 2560 ref 15 14 9 3 N/A 0 0 211933 CASAVA_Build 4 93724098 2I CACATATATG --/TA TATATATATA 2727 het 2727 ref 29 14 9 6 TA 6 7 211934 CASAVA_Build 4 93726217 1I ATTTAATGTT -/A AAAAAGATTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 5 6 211935 CASAVA_Build 4 93730707 1D ACATGTAAAA G/- CTTTGCAACA 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 G 1 0 211936 CASAVA_Build 4 93732998 1I ATTTATAGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 8 9 211937 CASAVA_Build 4 93754621 1I AGTTCAACAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 T 8 9 211938 CASAVA_Build 4 93756444 1I GGTTGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 523 hom 37 2 32 3 T 10 11 211939 CASAVA_Build 4 93760071 1I TACACATGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 9 10 211940 CASAVA_Build 4 93781468 1D TTGTTACTTT A/- TTAAATTTAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 0 211941 CASAVA_Build 4 93781618 1D CTGGCCAATA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 50 het 21 0 17 4 T 9 8 211942 CASAVA_Build 4 93786650 2D AATCTTGACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 62 18 30 17 A 12 10 211943 CASAVA_Build 4 93787060 12D AGTCTTTGAA TTCTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 79 37 37 7 TTCTTTTTTTTT 1 0 211944 CASAVA_Build 4 93796647 1I AAGAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 11 12 211945 CASAVA_Build 4 93798124 6I TAGGAGAAAG ------/AAAAGT AAGACACAAT 3070 hom 103 het 42 0 35 8 AAAAGT 0 1 211946 CASAVA_Build 4 93811431 4D ATGAAAACTT ACTC/---- ACTATCATGA 3070 hom 111 het 45 0 36 10 ACTC 1 0 211947 CASAVA_Build 4 93816437 1I TCACTGCAAG -/C TCCGCCTCCC 2165 hom 18 het 7 0 6 1 C 0 1 211948 CASAVA_Build 4 93818285 7D TTGCTTACTT TCTACTC/------- TCTTTAGATC 3070 hom 120 het 41 0 41 2 TCTACTC 1 0 211949 CASAVA_Build 4 93820092 1I AAATTGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 705 hom 39 2 32 5 A 11 12 211950 CASAVA_Build 4 93822260 1D AGAAAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 11 10 211951 CASAVA_Build 4 93827357 2D ATTTTTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 1428 het 316 hom 26 5 4 17 T 14 12 211952 CASAVA_Build 4 93833195 2D AAACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2294 het 390 hom 14 1 6 7 A 13 11 211953 CASAVA_Build 4 93834749 1D CTTTTGTAAA T/- TTTTTGAAGG 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 6 5 211954 CASAVA_Build 4 93839859 1D TATTTTATCT G/- TAGAAGCATG 3070 het 3070 ref 34 20 14 0 G 1 0 211955 CASAVA_Build 4 93850449 4I TTGCTAAAAG ----/AGTT AGAAGAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AGTT 0 1 211956 CASAVA_Build 4 93852307 2I TAAAGTATAT --/AA AAGAGTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 4 211957 CASAVA_Build 4 93863063 5I TTATAATAAT -----/ATAAG AATAGAAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATAAG 0 1 211958 CASAVA_Build 4 93869050 4I TAGCTCTACT ----/GTTA GTTGCTAAAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GTTA 0 1 211959 CASAVA_Build 4 93869997 1I ACAAAACAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1299 hom 57 4 43 10 A 9 10 211960 CASAVA_Build 4 93871406 1I CAATAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 38 2 30 6 T 11 12 211961 CASAVA_Build 4 93890665 1D CACATAGACC A/- AAGAAAGAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 3 2 211962 CASAVA_Build 4 93902623 1D TGCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 512 hom 23 2 19 2 A 12 11 211963 CASAVA_Build 4 93920169 1D CATTTGCCTC A/- AGAAAGTTAA 3070 het 141 hom 43 1 36 6 A 2 1 211964 CASAVA_Build 4 93975366 1D TGAAAGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 13 4 A 12 11 211965 CASAVA_Build 4 93984880 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1115 hom 25 5 14 6 A 15 16 211966 CASAVA_Build 4 93988393 1D CATTCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 590 hom 51 3 33 15 T 15 14 211967 CASAVA_Build 4 94027727 1I TTAGAATCAA -/C TGGATCTTGA 3070 hom 120 het 42 0 40 2 C 0 1 211968 CASAVA_Build 4 94035898 3D TGTGCCAGAC ATT/--- ATACCAGGCA 3070 het 3070 hom 36 14 20 4 ATT 1 0 211969 CASAVA_Build 4 94037414 1I GCCTTCTCTG -/T TTTTCCCCAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 5 211970 CASAVA_Build 4 94052667 1D ATATGTACAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 A 8 7 211971 CASAVA_Build 4 94071284 1I TAAAATCCTT -/A AAAAAAATTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 8 211972 CASAVA_Build 4 94094070 2I ATTTTAAAAT --/AC AGTTTCCACA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AC 0 1 211973 CASAVA_Build 4 94127938 1I ATATTAAAAC -/A AAAAAATATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 6 7 211974 CASAVA_Build 4 94152850 1I CTATAAGGAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 338 hom 35 1 29 5 A 9 10 211975 CASAVA_Build 4 94187701 1D TATACCATCC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 9 8 211976 CASAVA_Build 4 94194510 5D TTGGTAGTAT TTTTA/----- TATTATTGTA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 TTTTA 1 0 211977 CASAVA_Build 4 94198286 25I TGCCAGATTC -------------------------/AGTGAAGTTTCAAGTAAACTTCTCA AGTGAAGTTT 3070 het 3070 hom 29 10 18 4 AGTGAAGTTTCAAGTAAACTTCTCA 0 1 211978 CASAVA_Build 4 94201374 3I TTTCTTGTTT ---/TTG TTTTTTTTTT 1793 hom 11 het 18 1 15 2 TTG 0 1 211979 CASAVA_Build 4 94204299 5D AATTTATTAA AATAT/----- AATATATATA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AATAT 2 1 211980 CASAVA_Build 4 94208868 1I TCCTATTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 11 12 211981 CASAVA_Build 4 94221306 1I GCAGTGTATG -/A ATGTAATGTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 2 211982 CASAVA_Build 4 94248799 1D CTGACATGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 913 hom 23 8 14 1 T 10 9 211983 CASAVA_Build 4 94268878 4I CGGCATGAGC ----/CTGA CTATTTCTTA 3070 het 3070 hom 58 26 26 6 CTGA 0 1 211984 CASAVA_Build 4 94269991 1I TAGACCTTAA -/G ATTAGAACTT 3070 het 3070 ref 53 24 24 5 G 0 1 211985 CASAVA_Build 4 94284919 5I TTCTGTTGCT -----/TAGAG TAAACAACAA 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 TAGAG 0 1 211986 CASAVA_Build 4 94286877 1D TAAGTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 42 3 36 3 A 13 12 211987 CASAVA_Build 4 94318247 1D ACTCAACTTG A/- AAAAAAAAAA 1258 het 1258 ref 33 22 5 7 A 12 11 211988 CASAVA_Build 4 94318963 3I TTTTAAAAAA ---/TCT TCTTTATGTT 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 TCT 1 2 211989 CASAVA_Build 4 94335642 1I AGCTCCACTG -/T TTTGAGAGTT 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 T 3 4 211990 CASAVA_Build 4 94353998 4I TCGGGGCTTT ----/CACA CACAGTTCAG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 CA 2 4 211991 CASAVA_Build 4 94448053 1D CTGCATTTTT A/- ATTTTTTCGA 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 A 2 1 211992 CASAVA_Build 4 94454916 2D ACGATGATTT CA/-- CACACACACA 3070 hom 75 het 32 0 22 10 CA 9 8 211993 CASAVA_Build 4 94457498 1D TCTCCTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 28 1 20 7 T 12 11 211994 CASAVA_Build 4 94465884 1D CTCATTTTTC T/- TCTTTAAACT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 2 1 211995 CASAVA_Build 4 94468448 2D TGATCTGCCC CT/-- GTTTATCTCT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 CT 1 0 211996 CASAVA_Build 4 94470085 1D ACTTATTGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 38 0 30 9 A 13 12 211997 CASAVA_Build 4 94475235 1I AAACATCTCT -/G ATCATTTTAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 G 0 1 211998 CASAVA_Build 4 94475869 1D TTCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 12 11 211999 CASAVA_Build 4 94483855 1I ATCAAAAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 7 8 212000 CASAVA_Build 4 94494990 2D TATAAATAAG AT/-- ATATATATAT 2407 hom 15 het 8 0 5 4 AT 8 7 212001 CASAVA_Build 4 94507379 1I TTTTTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 2511 het 125 hom 18 1 12 5 T 13 14 212002 CASAVA_Build 4 94508581 1I ATAACTAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 9 10 212003 CASAVA_Build 4 94512546 1D ATTATAGTAA G/- AACACTTTTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 1 0 212004 CASAVA_Build 4 94542101 1D TTGGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 31 0 22 9 T 13 12 212005 CASAVA_Build 4 94548546 1D GCTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 30 9 T 11 10 212006 CASAVA_Build 4 94552505 1D GAGGTTGAGG A/- TGTAATGAGC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 1 0 212007 CASAVA_Build 4 94554860 2D TCTGACATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TA 10 9 212008 CASAVA_Build 4 94559249 6D ATGATTTTCC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 38 0 19 22 T 22 16 212009 CASAVA_Build 4 94560879 4I AAATATGGAA ----/ATTT ATTTATTTGT 1681 hom 15 het 9 0 6 3 ATTT 2 3 212010 CASAVA_Build 4 94576179 1I CCCATTTCTT -/A AAAAAAGGTA 3070 het 50 hom 50 1 39 10 A 6 7 212011 CASAVA_Build 4 94577566 14I AGAGAAAAAC --------------/AGAGTTTTAATGTA AGTTTTGTCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AGAGTTTTAATGTA 0 1 212012 CASAVA_Build 4 94581664 1I CCTCTTTCTC -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 7 8 212013 CASAVA_Build 4 94582038 1I AACTAAGAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 9 10 212014 CASAVA_Build 4 94598124 1I GATGCACAGA -/T AGAGACATCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 212015 CASAVA_Build 4 94611083 15D TTTTCTGTTA TGATATTGTAAAATG/--------------- TGGCTCATTC 3070 hom 39 het 15 0 14 2 TGATATTGTAAAATG 1 0 212016 CASAVA_Build 4 94635494 1D AATAACAGGA T/- TTTTGCCATC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 5 4 212017 CASAVA_Build 4 94636295 1D TCCTGATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 21 1 18 2 A 15 14 212018 CASAVA_Build 4 94637226 1D GGTGGTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 T 13 12 212019 CASAVA_Build 4 94657422 1I ATTTGTAATT -/A TAAAGCTTTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 0 1 212020 CASAVA_Build 4 94658128 1I CATACATGTA -/C TATGTATGTA 1365 hom 7 het 4 0 3 1 C 0 1 212021 CASAVA_Build 4 94658191 5D ATGTATATAC ATACA/----- TGTACATGTA 1672 hom 10 het 5 0 4 1 ATACA 1 0 212022 CASAVA_Build 4 94701087 28D TAAATATTTT TATTTAATATTTATTTGATAAATATTTA/---------------------------- TATTTAATAT 3027 hom 21 het 12 0 8 7 TATTTAATATTTATTTGATAAATATTTA 2 1 212023 CASAVA_Build 4 94711839 1I ATCATAAACC -/A TATTAGGGAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 0 1 212024 CASAVA_Build 4 94757075 2I AGGCTGAGGC --/AG GAGAATGGCG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AG 0 1 212025 CASAVA_Build 4 94764371 2D ATGATCAATC TA/-- TTTTTTTAAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TA 1 0 212026 CASAVA_Build 4 94773314 1D CAATACTCTC A/- TAATGGGTCC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 1 0 212027 CASAVA_Build 4 94775121 2D TTACTTCTCC TT/-- TTCTTGGTCA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 4 2 212028 CASAVA_Build 4 94786460 1D AAGACTATCC A/- AAGGAGGGAA 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 3 2 212029 CASAVA_Build 4 94791092 1I GCAAAAAAAA -/T ATTCATTCTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 1 212030 CASAVA_Build 4 94800766 1D ACATGTGAGT A/- AAAAGTTTAA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 A 5 4 212031 CASAVA_Build 4 94808548 1D AGTTGTTCTC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 9 8 212032 CASAVA_Build 4 94809669 1D ACATGTACAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 212033 CASAVA_Build 4 94837936 1I ATACATTATA -/T TCTTTAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 2 212034 CASAVA_Build 4 94873096 1D TTTAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 39 0 29 10 A 13 12 212035 CASAVA_Build 4 94876520 1I TCATACTTGT -/A AACAACCCCA 3070 hom 123 het 42 0 42 0 A 2 3 212036 CASAVA_Build 4 94876983 1D ATGGCTCCAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 26 0 20 7 T 9 8 212037 CASAVA_Build 4 94888882 6I CCCAAAAAAA ------/TAACTT TAATGTGTGC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 TAACTT 0 1 212038 CASAVA_Build 4 94919383 1I TCTCTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 36 1 27 8 T 13 14 212039 CASAVA_Build 4 94928491 1I GACTCCGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 18 2 14 2 A 10 11 212040 CASAVA_Build 4 94930725 1I TTAACTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 13 14 212041 CASAVA_Build 4 94934200 1I CCATCTGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 11 12 212042 CASAVA_Build 4 94978972 1D GGGGTGGGGA G/- GGGGGGGGTG 2332 hom 30 het 16 0 10 6 G 9 8 212043 CASAVA_Build 4 94988169 1D TGAAGTTAAT C/- CCCATTGTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 C 4 3 212044 CASAVA_Build 4 95000327 2D GAGCATCCAG AT/-- ATATATATAT 1130 het 1130 ref 23 20 3 0 AT 8 7 212045 CASAVA_Build 4 95006135 1I GAGGTAGGTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 50 20 20 10 A 7 8 212046 CASAVA_Build 4 95008158 2D AAGTTGTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 13 11 212047 CASAVA_Build 4 95008648 1I AGTATGCACT -/A AAAAAAATTG 3070 het 414 hom 35 1 30 4 A 7 8 212048 CASAVA_Build 4 95013635 8I GTACACACAT --------/ATATATAC ATATATACAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ATATATAC 1 2 212049 CASAVA_Build 4 95023193 1D CATTTCAGTC T/- TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 7 6 212050 CASAVA_Build 4 95024149 11D CTTTACTCTA ATATAGTATTT/----------- TGTTTTTCTT 651 het 651 ref 19 13 2 7 ATATAGTATTT 1 0 212051 CASAVA_Build 4 95026232 5D TGATTATTTT AGTTA/----- AAAGTGCAAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 AGTTA 1 0 212052 CASAVA_Build 4 95026369 1I GTAGTAAAGA -/C CAGTGTCAAT 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 C 1 2 212053 CASAVA_Build 4 95027257 1D GCACAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 818 het 662 hom 11 3 3 5 T 15 14 212054 CASAVA_Build 4 95027669 2D GATTCTCAAA GG/-- GTAAAGTTGT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 G 3 1 212055 CASAVA_Build 4 95030492 1D AAATGTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 10 9 212056 CASAVA_Build 4 95040558 9D GTTCCTCTTA GCTGTCTTT/--------- GCTGTCTTTC 3070 het 3070 hom 42 19 21 4 GCTGTCTTT 2 1 212057 CASAVA_Build 4 95041676 12I CCTTTAATTC ------------/CTCACAACACAA CTGATCCAAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 CTCACAACACAA 0 1 212058 CASAVA_Build 4 95044177 1I CAACAAGCCT -/G GTGGTCAGAC 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 G 1 2 212059 CASAVA_Build 4 95050235 1D GATGTTGAGG T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 T 7 6 212060 CASAVA_Build 4 95063582 1I GCTTATTTAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 8 9 212061 CASAVA_Build 4 95073601 1D AGCTGATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 11 10 212062 CASAVA_Build 4 95075314 1I ATACAATCAA -/G ATTCAGTCAG 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 G 0 1 212063 CASAVA_Build 4 95081816 3D AAAATCTCTA ACC/--- ATTCCAGAAC 3070 het 3070 ref 48 30 16 4 ACC 1 0 212064 CASAVA_Build 4 95085610 1D AACCTAAATG C/- CCATCAATGA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 C 3 2 212065 CASAVA_Build 4 95088466 1D TTTTCAGGGT A/- AAAATCAATG 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 5 4 212066 CASAVA_Build 4 95090011 2I ACAGGCACAG --/AA AATCAAATAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 2 4 212067 CASAVA_Build 4 95090299 1D TTAAAATTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 180 hom 32 1 30 1 A 10 9 212068 CASAVA_Build 4 95090673 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 9 10 212069 CASAVA_Build 4 95092862 1D TTATGAAACC A/- GCATTGCCCT 3070 het 3070 ref 45 32 12 1 A 1 0 212070 CASAVA_Build 4 95094917 2D TGCTGTTGGT AG/-- AAATGCAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 AG 1 0 212071 CASAVA_Build 4 95096949 1D TTTCTTCTTG T/- AGTTTAACAT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 1 0 212072 CASAVA_Build 4 95106133 1D CATAAGACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 62 het 29 0 21 8 T 10 9 212073 CASAVA_Build 4 95109171 2I GCAAAACTAT --/AA AGAGAGAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 3 212074 CASAVA_Build 4 95110002 1I GATGTAGATC -/T TTTTTTAGTT 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 6 7 212075 CASAVA_Build 4 95124611 1I ATGAGAATAG -/A GCCCTCATAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 212076 CASAVA_Build 4 95126736 1I TGTTAGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 27 1 21 5 T 10 11 212077 CASAVA_Build 4 95172058 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 15 12 A 13 12 212078 CASAVA_Build 4 95196238 1D TCTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 1888 het 437 hom 21 2 8 11 T 14 13 212079 CASAVA_Build 4 95196804 1D CTTGACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 6 T 11 10 212080 CASAVA_Build 4 95198031 3D GTGGAAAATG ATT/--- ATAAGTATTG 3070 hom 90 het 32 0 30 3 ATT 1 0 212081 CASAVA_Build 4 95204043 5I TATTTCCTCC -----/ATTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 ATTTT 0 1 212082 CASAVA_Build 4 95204142 1D TTCTGTTCAA G/- TGATTTCTAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 1 0 212083 CASAVA_Build 4 95210023 3I GGAAAATAAA ---/GAT GACAGAACAA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 GAT 0 1 212084 CASAVA_Build 4 95212473 4D TATAGATGGC CTCT/---- CTCTCTTTTG 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 CT 5 3 212085 CASAVA_Build 4 95214152 1D TTGTACTCAC A/- ATGGAGAATA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 2 1 212086 CASAVA_Build 4 95219971 1D AGATTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 516 hom 31 2 22 7 T 11 10 212087 CASAVA_Build 4 95231243 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 65 het 32 0 28 4 A 10 9 212088 CASAVA_Build 4 95235739 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 T 10 9 212089 CASAVA_Build 4 95236256 4I TTTCCAATAC ----/TATG TATGTTTAAT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 TATG 1 2 212090 CASAVA_Build 4 95236516 2I TTTTTTTTTT --/GA GAGAGAGTCT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 GA 3 4 212091 CASAVA_Build 4 95238989 1D TGGGAAAAAA T/- TTCTTTTGGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 3 2 212092 CASAVA_Build 4 95253127 8I GGGAAGAAAG --------/GAAGTTAT AGCTACATAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GAAGTTAT 0 1 212093 CASAVA_Build 4 95254675 5I GGGATCAATC -----/TTCCT TTCAATTGTG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 TTCCT 0 1 212094 CASAVA_Build 4 95259090 1I ACTATGCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 11 12 212095 CASAVA_Build 4 95259574 1I AAAAAAAGTA -/G GGGGGGGGGA 3070 het 1563 hom 19 5 9 5 G 9 10 212096 CASAVA_Build 4 95263276 4D TGCTCATCTC AAAT/---- AAAAAAGAAG 3070 hom 66 het 23 0 23 1 AAAT 1 0 212097 CASAVA_Build 4 95266629 1D TATATTTTTT A/- AAAAATTGGC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 5 212098 CASAVA_Build 4 95273096 10D AGATTTTGGG TTTGTTTTGT/---------- TTTGTTTTGT 2210 het 2210 ref 23 11 5 7 TTTGT 6 4 212099 CASAVA_Build 4 95276931 1D AGGAAGGGAA G/- GGGGGGAGGG 2233 hom 13 het 14 0 7 7 G 7 6 212100 CASAVA_Build 4 95282314 4D GACCAAGCAG AAGA/---- AAGAATTTCA 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 AAGA 2 1 212101 CASAVA_Build 4 95284079 2D AAATGGAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 32 0 24 8 A 17 15 212102 CASAVA_Build 4 95290050 1I GAACACATTC -/T TTTTTATGGC 2144 het 2144 ref 29 16 6 7 T 5 6 212103 CASAVA_Build 4 95300555 2D TATACCCAGG TT/-- TTTTTTGGGG 3070 het 2315 hom 31 11 13 8 T 8 6 212104 CASAVA_Build 4 95301686 2D CCCCAGATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2913 het 719 hom 26 4 10 12 T 16 14 212105 CASAVA_Build 4 95306793 1D AATAATACTT A/- CCAGGTTCTT 3070 het 3070 hom 32 14 18 0 A 1 0 212106 CASAVA_Build 4 95309202 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 441 het 354 hom 11 1 3 7 A 11 12 212107 CASAVA_Build 4 95309250 2D ACCAAATGAC AT/-- AGAATTTTCA 3070 hom 36 het 18 0 13 6 AT 1 0 212108 CASAVA_Build 4 95309269 1I TCAGAGAATG -/A AAAAAAAACC 2956 hom 21 het 19 0 8 11 A 8 9 212109 CASAVA_Build 4 95312564 4D ATGACATTTT TAAA/---- TAAATACATC 3070 hom 75 het 26 0 26 1 TAAA 2 1 212110 CASAVA_Build 4 95315114 2I GAATTATATA --/AC AGACAGGAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AC 0 1 212111 CASAVA_Build 4 95315952 1D TTGGTGCCTT C/- GAGATTTCAG 3070 hom 126 het 51 0 43 8 C 1 0 212112 CASAVA_Build 4 95322543 8I CATTATATTA --------/AATCACTT AATCCTCACA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AATCACTT 0 1 212113 CASAVA_Build 4 95326649 2I GTCATTAGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 9 T 14 16 212114 CASAVA_Build 4 95333967 9D CCGTGTAGTT GGGATTACA/--------- GGCGCATGCC 1638 het 1638 ref 25 16 6 6 GGGATTACA 1 0 212115 CASAVA_Build 4 95334539 1D GTCTCATTGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 51 14 26 11 T 9 8 212116 CASAVA_Build 4 95337020 4D CGGAATAAAG ATTA/---- ATTAAATTAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 6 ATTA 2 1 212117 CASAVA_Build 4 95338606 1D AGACTGTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 22 2 11 9 A 17 16 212118 CASAVA_Build 4 95339094 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 17 8 7 2 A 10 11 212119 CASAVA_Build 4 95346487 1I TTTCGCCATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 2696 hom 16 7 7 2 A 8 9 212120 CASAVA_Build 4 95364766 1D TTTTAGAACA T/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 T 6 5 212121 CASAVA_Build 4 95365474 1I CTTGGCTTGT -/A AAGGTGATCT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 2 3 212122 CASAVA_Build 4 95368809 1D TCTTGCAGTG A/- AAAAAAAAAA 1511 het 1511 ref 29 22 4 4 A 12 11 212123 CASAVA_Build 4 95369976 1D ATGTGTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 32 1 26 6 T 13 12 212124 CASAVA_Build 4 95373011 4I ACACAAAAAT ----/AGCC AGGTGTGGTG 3070 hom 109 het 41 0 34 7 AGCC 0 1 212125 CASAVA_Build 4 95379105 2I ATGAGGAAAC --/AA AGTGGATACA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 3 212126 CASAVA_Build 4 95379550 1D62M2I TTGCAGTCTT AACAGACAGTATCATCCTGCGTATTAAACACTAGGGATGTTTTTATGCTGTTTGTTTTGAAAG--/-ACAGACAGTATCATCCTGCGTATTAAACACTAGGGATGTTTTTATGCTGTTTGTTTTGAAAGTT TTTGTTTTTG 3070 hom 120 het 30 0 41 2 N/A 0 0 212127 CASAVA_Build 4 95382382 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2332 het 1439 hom 12 4 7 1 T 10 11 212128 CASAVA_Build 4 95387293 3I TAATTGCTTA ---/TTG TTGTTTTGAT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 TTG 1 2 212129 CASAVA_Build 4 95389551 1D AGGATCATTC T/- AGTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 46 14 28 4 T 1 0 212130 CASAVA_Build 4 95395913 7I ATGAGGAAAA -------/TTTGATT TTTGATTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 TTTGATT 1 2 212131 CASAVA_Build 4 95397011 1I AGTTTGTATT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 7 8 212132 CASAVA_Build 4 95403079 2I8M1D AAAAAAAAAA --AAAGAAAGA/AGAAAGAAAG- AAAGAAATGG 2466 het 221 hom 22 2 9 14 N/A 0 0 212133 CASAVA_Build 4 95403111 1I TTGGTTACAG -/A AAAAAAAAAA 2748 het 1859 hom 27 6 7 14 A 10 11 212134 CASAVA_Build 4 95405575 1D TTTGGGGTAG A/- AATACATCAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 3 2 212135 CASAVA_Build 4 95407255 6I TATCAGCCTT ------/AAACTA AAAAGATTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAACTA 0 1 212136 CASAVA_Build 4 95416893 14D TTAGGTCATA AGCCATAATTTACC/-------------- TGTTCTATAT 3070 het 3070 ref 24 13 11 3 AGCCATAATTTACC 1 0 212137 CASAVA_Build 4 95421153 4D AACAATAGAA AGTT/---- AGTAGACTGT 3070 het 3070 ref 45 23 19 5 AGTT 1 0 212138 CASAVA_Build 4 95424751 2D TTGGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 21 4 T 14 12 212139 CASAVA_Build 4 95425276 4D CTTCAATATT TATC/---- TATATGACCA 3070 hom 96 het 35 0 33 5 TATC 1 0 212140 CASAVA_Build 4 95428437 1I ATTTGTCCCC -/T TTAATGTCTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 2 3 212141 CASAVA_Build 4 95429271 1D GGTTTTCGTT G/- GTTTAGGTTT 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 G 2 1 212142 CASAVA_Build 4 95444200 1I ATTACACTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 T 9 10 212143 CASAVA_Build 4 95447334 1I GTCAAACTAT -/A AAACAAGTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 3 4 212144 CASAVA_Build 4 95456635 11I CTTCCCTGCA -----------/TATTAATACAG GTAGCCACAA 1083 het 1083 ref 42 26 3 14 TATTAATACAG 0 1 212145 CASAVA_Build 4 95477118 10D TTCTATTTGG TGTTTCGTTT/---------- TGTTTCGTTT 3070 hom 69 het 41 0 23 19 TGTTTCGTTT 3 2 212146 CASAVA_Build 4 95488608 1I TCAATCCTTA -/C ACACAAACTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 0 1 212147 CASAVA_Build 4 95495190 1D AAAGAATAGG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 8 7 212148 CASAVA_Build 4 95497427 1I ATTTGTACAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 8 9 212149 CASAVA_Build 4 95499450 4D GAGAATTAAA AAAC/---- AAACAGCAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AAAC 2 1 212150 CASAVA_Build 4 95500580 6D ATGAACAATT TAATTC/------ TAGTTGGTTA 3070 het 3070 ref 24 13 10 5 TAATTC 1 0 212151 CASAVA_Build 4 95502190 1D GATTTTATAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 9 8 212152 CASAVA_Build 4 95506725 1D ATAACTAGCG T/- TAAGATGATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 2 1 212153 CASAVA_Build 4 95507380 1I TATGCCAGTA -/C CATACTGTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 1 2 212154 CASAVA_Build 4 95511981 1D AGATATTCTT A/- AAAGTAGTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 3 212155 CASAVA_Build 4 95513580 4D AGTAGAACTT TATA/---- TATTTCCCTC 3070 hom 87 het 32 0 29 5 TA 3 1 212156 CASAVA_Build 4 95516107 5D CTAATACACT ATTTA/----- ATTTAATTAT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 ATTTA 2 1 212157 CASAVA_Build 4 95516849 1D CACCTGTAGT C/- CCAGCTACTC 3070 het 2369 hom 22 7 13 2 C 3 2 212158 CASAVA_Build 4 95516969 1I AACCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1652 het 867 hom 16 6 6 4 A 12 13 212159 CASAVA_Build 4 95517531 4I TAGCACACAC ----/TAAA TAAAGCCAAG 3070 het 3070 ref 60 34 18 8 TAAA 1 2 212160 CASAVA_Build 4 95517652 2I GTCCACAGAC --/TG TGTATGTGTG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TG 1 2 212161 CASAVA_Build 4 95517801 1D CTGTTTTTTT C/- ATATTGTATT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 C 1 0 212162 CASAVA_Build 4 95519221 1I ATTGCTCACA -/C CATATGTAGA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 C 1 2 212163 CASAVA_Build 4 95522842 1I CCTCCTTGAT -/C CTCGGACTGC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 1 2 212164 CASAVA_Build 4 95526646 1I GGGGATAACT -/A AAAAGGAGTG 3011 het 825 hom 11 3 8 0 A 4 5 212165 CASAVA_Build 4 95532914 3I TCAAAATGGC ---/AAA ACCCCATCTC 2759 het 2759 ref 16 9 6 1 A 1 4 212166 CASAVA_Build 4 95563370 1D AAAAAATTAG A/- AAAAAAATGA 2729 het 2729 ref 26 12 10 4 A 8 7 212167 CASAVA_Build 4 95571449 1D AGAGAAAAAC A/- AAAGAAAATA 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 A 4 3 212168 CASAVA_Build 4 95571521 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2468 het 1142 hom 27 8 7 12 T 19 18 212169 CASAVA_Build 4 95581896 1I CTGCCAAACA -/T TTTTTTTTTT 2085 het 1551 hom 25 6 10 9 T 13 14 212170 CASAVA_Build 4 95585880 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGATATTTA 3070 het 1198 hom 23 4 11 8 AG 0 1 212171 CASAVA_Build 4 95589678 7I GCTTGCGACC -------/TAAATTT TATTATCTAT 3070 het 3070 ref 45 27 10 8 TAAATTT 0 1 212172 CASAVA_Build 4 95589780 1D GCTATTGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 10 9 212173 CASAVA_Build 4 95601699 2I TATTAAGAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 10 12 212174 CASAVA_Build 4 95602046 1I AGAAAAAAAT -/A AAAGAGGACT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 3 4 212175 CASAVA_Build 4 95625484 1D17M1I CATTTCTCTT AACACTTTCACCATTTAC-/-ACACTTTCACCATTTACT TCGTGTTAGC 3070 het 3070 ref 49 28 24 6 N/A 0 0 212176 CASAVA_Build 4 95638165 3D CACTGTTACA GTT/--- GTTGTTGGAA 3070 het 3070 ref 39 24 10 7 GTT 3 2 212177 CASAVA_Build 4 95648308 3D GCACTGACAT AAG/--- AACATTTCCT 3070 het 3070 hom 38 16 21 2 AAG 1 0 212178 CASAVA_Build 4 95652795 1D GATTATTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 21 7 9 T 10 9 212179 CASAVA_Build 4 95678461 7D ATGGTTAAGT TTGAGTA/------- TTGAGAACAG 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 TTGAGTA 1 0 212180 CASAVA_Build 4 95687006 1I TGACATTAGG -/C CCCCCCCCAC 2716 het 2443 hom 17 8 6 3 C 8 9 212181 CASAVA_Build 4 95694947 2I GTATCTGCAA --/TG TGTGTGTACA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TG 3 4 212182 CASAVA_Build 4 95695206 3D GCTTTGATGT TTG/--- TTAAGTTAGG 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 TTG 1 0 212183 CASAVA_Build 4 95695424 3D GATGGGGTTT CCC/--- CGCCATGTTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 4 1 212184 CASAVA_Build 4 95707683 1D TACAGATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1086 hom 32 3 23 6 T 13 12 212185 CASAVA_Build 4 95708580 1D TTTATAGAAA C/- CCTTTATTGA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 C 3 2 212186 CASAVA_Build 4 95716460 1D CTCATTTTTT G/- TAAGTCCCGA 3070 het 3070 hom 49 14 27 8 G 1 0 212187 CASAVA_Build 4 95727458 1D ATGTAAAACC A/- AAAAAAAAAA 2688 het 805 hom 22 4 7 11 A 15 14 212188 CASAVA_Build 4 95729907 5D TCTTTCTTTC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 het 14 hom 19 1 10 9 TTTCT 5 4 212189 CASAVA_Build 4 95730104 1I GTGCACCACC -/A TGCCCAGCTA 3070 hom 28 het 12 0 9 3 A 0 1 212190 CASAVA_Build 4 95736938 5D ATTGAACCAA TATAT/----- TATATTATAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 TATAT 3 2 212191 CASAVA_Build 4 95753973 3I TTAAATTTAG ---/AAA AAAATATATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 4 7 212192 CASAVA_Build 4 95759527 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 18 1 12 5 T 12 13 212193 CASAVA_Build 4 95763369 3I TGTCTGCTGC ---/CCA TGGTCAAAAT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 CCA 0 1 212194 CASAVA_Build 4 95766480 2D CAGTTGTAAC AG/-- ATATTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 AG 1 0 212195 CASAVA_Build 4 95780675 1D CAATGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 12 8 T 16 15 212196 CASAVA_Build 4 95802412 1D CCAAGGGAAT C/- CTGAAACATG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 C 2 1 212197 CASAVA_Build 4 95802998 1D TCCTTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 7 7 A 13 12 212198 CASAVA_Build 4 95804666 1D TATTGTATTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 9 8 212199 CASAVA_Build 4 95805289 1D GCAAATTCCA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 7 6 212200 CASAVA_Build 4 95805750 1D CCCCCCAATT G/- TTTTTCAATC 3070 het 3070 hom 34 17 15 3 G 1 0 212201 CASAVA_Build 4 95812209 1D TGTCATAGAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 A 9 8 212202 CASAVA_Build 4 95813762 3D TTTTAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1730 hom 24 6 11 10 A 13 10 212203 CASAVA_Build 4 95818822 4D AACTAGAATA AACT/---- AACTAGCAAC 3070 het 3070 hom 37 15 18 6 AACT 2 1 212204 CASAVA_Build 4 95825011 2I AAAGGGCACA --/CT CTCAGAATAA 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 CT 1 2 212205 CASAVA_Build 4 95829316 3D AAAGAAAACA TGT/--- TGTACATAAT 3070 het 3070 hom 36 17 14 6 TGT 2 1 212206 CASAVA_Build 4 95839421 4I TTTAGAAAAC ----/AAAT AAGATTGGAG 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 AAAT 0 1 212207 CASAVA_Build 4 95850913 1I AAACCAACAA -/C AAAAAAACAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 0 1 212208 CASAVA_Build 4 95852745 2D ACAAATTGTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 AC 9 8 212209 CASAVA_Build 4 95853300 2D ATTTACTTAT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 38 4 14 20 TG 1 0 212210 CASAVA_Build 4 95853509 9D GGCTGTATTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1630 hom 9 het 21 1 11 9 T 21 12 212211 CASAVA_Build 4 95868212 1D CATCCTGTAA G/- GGGGGGTCAG 3070 hom 115 het 44 0 37 7 G 7 6 212212 CASAVA_Build 4 95880078 1I TCTGTATGAT -/A ACCCGTTCTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 1 2 212213 CASAVA_Build 4 95888624 4I GTTATGTTAT ----/GTTA TTCATCCAGT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 GTTA 0 1 212214 CASAVA_Build 4 95895653 1D CCTGGAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 28 0 21 7 T 11 10 212215 CASAVA_Build 4 95897041 1I29M3D AAAAACTGTT -AAAAAAAAAAATGACTTAGATCACACACTTGG/AAAAAAAAAAAATGACTTAGATCACACACT--- TGGTGACCAG 3070 het 3070 ref 38 22 17 5 N/A 0 0 212216 CASAVA_Build 4 95908887 2D AGGCATAGTC TT/-- AATATATTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 2 0 212217 CASAVA_Build 4 95910356 5D TCGTTTCTGT GTTTG/----- TTTTTTTTTT 573 het 153 hom 33 2 7 24 GTTTG 1 0 212218 CASAVA_Build 4 95914015 4D TGTAATATGA AAAC/---- AAAAACTGAA 3070 het 3070 ref 34 15 15 6 AAAC 1 0 212219 CASAVA_Build 4 95922503 1D TTAATGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 27 2 18 7 T 13 12 212220 CASAVA_Build 4 95927980 3D CAATATCAAT GTG/--- GTAACCCACA 3070 het 3070 ref 32 22 7 5 GTG 1 0 212221 CASAVA_Build 4 95929725 1D AATAAAAAAA T/- CACTTGAATT 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 T 1 0 212222 CASAVA_Build 4 95929978 1D TATAGCTTAT A/- AAAAATATAC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 A 6 5 212223 CASAVA_Build 4 95943017 3D CAGGTAATAA TTC/--- TTCTCTCTAG 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 TTC 2 1 212224 CASAVA_Build 4 95944040 1D AGAAAAAAAA C/- ACATTATTTT 2097 het 2097 ref 15 8 7 0 C 1 0 212225 CASAVA_Build 4 95953170 2D TAGTTTAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 8 T 13 11 212226 CASAVA_Build 4 95963923 2D ATCCTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 13 11 212227 CASAVA_Build 4 95966848 2I AAATGGAAAC --/AG ATGCATAATT 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 AG 0 1 212228 CASAVA_Build 4 95973367 2D ACTCTTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2488 het 867 hom 28 7 11 10 A 19 17 212229 CASAVA_Build 4 95976085 1D CCTCCCCCCT C/- CCCCCACCCC 1554 hom 10 het 4 0 4 0 C 6 5 212230 CASAVA_Build 4 95983850 1I ATTAAATTTG -/A AACTTTAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 2 3 212231 CASAVA_Build 4 95984174 1D GTGGTCCCCA G/- GGGCTGGGGT 3070 het 2851 hom 24 9 14 1 G 4 3 212232 CASAVA_Build 4 95985265 1I CTAAAAGATG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 7 8 212233 CASAVA_Build 4 95987020 4D GAAACTACTC AAAA/---- AAAAAAAACG 3070 het 2979 hom 21 8 11 4 A 12 8 212234 CASAVA_Build 4 95987797 2I ACAATGAGAC --/TG TGTCATTTGC 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 TG 1 2 212235 CASAVA_Build 4 95988373 1I24M2I TAGAAGAAAA -GGAAGCTAGATATCAGTTAAGCTC--/GGGAAGCTAGATATCAGTTAAGCTCTT TCAATCTATG 3070 het 3070 ref 41 26 22 4 N/A 0 0 212236 CASAVA_Build 4 95988802 2D AGTGACATGG AA/-- AGTCATTGGA 3070 het 3070 ref 48 30 16 2 A 3 1 212237 CASAVA_Build 4 95990451 2D TTTTTAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 12 10 212238 CASAVA_Build 4 95991226 1I AATTCTCAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 T 9 10 212239 CASAVA_Build 4 95991443 2D AGAATGACTC TT/-- TGTCAAACCA 3070 het 3070 hom 36 18 18 1 T 3 1 212240 CASAVA_Build 4 95994296 4I TACTGTGAAG ----/CTCT CTCTCTATTC 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 CT 3 5 212241 CASAVA_Build 4 95995976 4I GTTAATCAAA ----/TTAG TTCTTGTGCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TTAG 0 1 212242 CASAVA_Build 4 96000073 1D TTATCCAGTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 8 7 212243 CASAVA_Build 4 96010556 2D ACTTCCTGCC AA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 50 24 18 10 A 2 0 212244 CASAVA_Build 4 96020229 3D GACAATACAA ATT/--- ATTATTATTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 ATT 4 3 212245 CASAVA_Build 4 96027411 1D CAGATTGACC A/- AAAAAAAAAA 2225 het 2225 ref 21 9 6 6 A 12 11 212246 CASAVA_Build 4 96029116 1I AAGACACTAT -/A AAAAACATTC 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 5 6 212247 CASAVA_Build 4 96033949 4D GGATGATATT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 41 19 19 5 AAAC 5 4 212248 CASAVA_Build 4 96035224 2D TTAATGTCTC TT/-- AAGTTCTTCA 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 T 2 0 212249 CASAVA_Build 4 96038893 2I ACTTTAAACA --/CT CTTCATTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 CT 1 2 212250 CASAVA_Build 4 96039531 9D CTACAACTTT TCAGGCCAC/--------- TACAAAGATG 2934 het 2934 ref 19 10 8 3 TCAGGCCAC 1 0 212251 CASAVA_Build 4 96040513 1D AGTGGCCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 16 15 212252 CASAVA_Build 4 96042779 1I AATTTTTCTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 T 7 8 212253 CASAVA_Build 4 96046089 2D TTGTTTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 14 12 212254 CASAVA_Build 4 96053139 1I GGTGTGCTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 T 9 10 212255 CASAVA_Build 4 96058857 1D GACACTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 13 12 212256 CASAVA_Build 4 96096981 1I AAGAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 10 11 212257 CASAVA_Build 4 96101102 12D TTGCTGGAAT GCTCATTTCATG/------------ GCTCAAACTC 3070 het 3070 ref 49 26 20 7 GCTCATTTCATG 1 0 212258 CASAVA_Build 4 96108517 1I AAGTAAATAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 500 hom 29 3 9 17 T 8 9 212259 CASAVA_Build 4 96121385 1D TTATCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 34 1 22 11 T 11 10 212260 CASAVA_Build 4 96133057 1D GTATGTAATC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 9 8 212261 CASAVA_Build 4 96134870 1D TATGTGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 8 T 13 12 212262 CASAVA_Build 4 96135563 1D CGTTGACATA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 6 212263 CASAVA_Build 4 96140423 2D TTGAATTGTA TC/-- TCTGTCTTAG 3070 hom 99 het 39 0 33 7 TC 2 1 212264 CASAVA_Build 4 96141527 1D15M5D TTCCTGGAAG AATTAAGATGGTATTTCTTAA/-TTAAAGGTAGTAATT----- TACCATCAAG 3070 hom 66 het 23 0 23 4 N/A 0 0 212265 CASAVA_Build 4 96153912 1I TAGATGTCTG -/T TTTCACTTGT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 3 4 212266 CASAVA_Build 4 96156250 5D21M1D TGTCAAAATG AGTGAAGTGAACATATTACTTCAAGGC/-----AGTGAACATATTACTTCAAGG- AGATAATTGA 3070 het 3070 ref 37 28 11 3 N/A 0 0 212267 CASAVA_Build 4 96163723 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 13 12 212268 CASAVA_Build 4 96165833 3D ACACTTTGTT AGA/--- AGAAGGAGGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 AGA 2 1 212269 CASAVA_Build 4 96169243 4I ACATTTTCTT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 21 het 11 0 8 4 TTTA 3 4 212270 CASAVA_Build 4 96173479 1D CCAGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 12 11 212271 CASAVA_Build 4 96174816 2I ATTCCATGTT --/TA TATATATATA 2851 het 2851 ref 29 13 9 7 TA 8 9 212272 CASAVA_Build 4 96196961 5D GCCTGAAAAC AAACA/----- AAACAAAACA 3053 het 3053 ref 33 16 10 7 AAACA 4 3 212273 CASAVA_Build 4 96199805 2I CTATTATGGT --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 8 10 212274 CASAVA_Build 4 96201220 5I ATTGTTGTTA -----/AAATG TCATTAACTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AAATG 0 1 212275 CASAVA_Build 4 96219632 10I TGTAGAATGT ----------/GAAATAATAC CACAATTAAG 3070 hom 123 het 44 0 41 4 GAAATAATAC 0 1 212276 CASAVA_Build 4 96222389 1D AACTGTTCAA T/- TTTTTTTTAA 2828 het 2828 ref 16 9 6 1 T 9 8 212277 CASAVA_Build 4 96224545 1I ATATGTGTAT -/A TGTGTATATA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 0 1 212278 CASAVA_Build 4 96233589 24D ATTACTATTC CTGCTGAGGTTTATAATTCTATGT/------------------------ CTGCTGAGGT 3070 hom 66 het 39 0 23 19 CTGCTGAGGTTTATAATTCTATGT 2 1 212279 CASAVA_Build 4 96236224 2I TTCTGCATTT --/TC TGTTTTTTCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TC 0 1 212280 CASAVA_Build 4 96243848 1I GGTAAATAGT -/A AAAGCCTAAT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 3 4 212281 CASAVA_Build 4 96258492 1D GAGCTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 1654 het 1654 ref 37 29 4 5 T 11 10 212282 CASAVA_Build 4 96269223 3D TACAGTTTAT TTC/--- TTATGTTATA 3070 het 3070 hom 37 11 16 12 TTC 1 0 212283 CASAVA_Build 4 96284653 3D ACACCAGGCC TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 2573 hom 29 7 14 8 T 12 9 212284 CASAVA_Build 4 96290629 2D ATTTAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 1873 het 1247 hom 25 7 8 12 A 16 14 212285 CASAVA_Build 4 96307163 4D TTATAGAATA TATG/---- TATGTATGTC 3070 het 3070 ref 47 25 18 5 TATG 3 2 212286 CASAVA_Build 4 96309930 3D CACTCCACAA AGT/--- AGACGCTCCA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AGT 1 0 212287 CASAVA_Build 4 96317583 1D CACCCAGAGC G/- CCCCCCATAT 3070 het 3070 ref 46 24 13 10 G 1 0 212288 CASAVA_Build 4 96318632 4D ATTTCTCACA TTTC/---- TTTCTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 13 20 8 TTTC 2 1 212289 CASAVA_Build 4 96320180 1I TGATGACAGA -/C CCCCCCCCAC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 C 8 9 212290 CASAVA_Build 4 96320317 4I CTTACTTACT ----/AACA AACAAACATT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 AACA 2 3 212291 CASAVA_Build 4 96323558 1D GTAAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2150 hom 37 11 18 9 A 12 11 212292 CASAVA_Build 4 96323877 4I TTCAATAAAG ----/GAAA GAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 GAAA 2 3 212293 CASAVA_Build 4 96326152 1I CTATACAGAT -/A ACAACATAAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 1 2 212294 CASAVA_Build 4 96338741 4D ATGGATGGAA AGAC/---- AGACCACAAG 3070 het 3070 ref 59 29 22 12 AGAC 2 1 212295 CASAVA_Build 4 96345180 1I TTCCAGTCCC -/A AAAGGACACC 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 3 4 212296 CASAVA_Build 4 96373714 1I ATATATAGTA -/T TTGAATTGCT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 2 3 212297 CASAVA_Build 4 96404386 1I AAAATAGGGT -/A CATCCTACTT 3070 het 3070 ref 57 32 17 8 A 0 1 212298 CASAVA_Build 4 96410597 1I AGACAATGGT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 6 7 212299 CASAVA_Build 4 96412233 1I TGTCTCTTCA -/G ATAGACTTTC 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 G 0 1 212300 CASAVA_Build 4 96425981 1D TTTCTGTGTG T/- AAGGATGCGG 3070 het 3070 hom 51 22 23 7 T 1 0 212301 CASAVA_Build 4 96429084 1D CCACATAAGG T/- TAATATTTAC 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 T 2 1 212302 CASAVA_Build 4 96430518 1D TTTGGTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2766 hom 27 9 12 6 T 13 12 212303 CASAVA_Build 4 96450605 1D AGACAGTAGA T/- TTTTAAGTGT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 5 4 212304 CASAVA_Build 4 96450897 1I TGGCAGCCTG -/T TGTCAAATGA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 1 2 212305 CASAVA_Build 4 96460597 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 18 1 13 4 A 16 15 212306 CASAVA_Build 4 96479667 12I AAAAAACAGC ------------/TTTATGATACTA TTAAGGTCAT 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 TTTATGATACTA 0 1 212307 CASAVA_Build 4 96485204 4I TTGATTAAAC ----/TCTT CAATCAAAAG 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 TCTT 0 1 212308 CASAVA_Build 4 96486253 2I TTTCATTTTC --/AA AAGTTTTTTG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 2 4 212309 CASAVA_Build 4 96490660 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 9 A 12 11 212310 CASAVA_Build 4 96491176 1D AACATCTAGA T/- TATTGTTTGA 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 2 1 212311 CASAVA_Build 4 96497310 1D CTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 T 11 10 212312 CASAVA_Build 4 96509373 1I ATCTCAATTT -/G GGTGCTAAAT 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 G 2 3 212313 CASAVA_Build 4 96516403 2I ATATATATCT --/TA TATGTGTATG 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 TA 1 2 212314 CASAVA_Build 4 96518570 1I AAAGCCTACG -/T TAACTATCAT 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 T 1 2 212315 CASAVA_Build 4 96520618 2D TTAAGAAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 836 hom 25 6 10 9 T 18 16 212316 CASAVA_Build 4 96522633 1D ACCGTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 29 1 15 13 A 15 14 212317 CASAVA_Build 4 96525201 1D ATTTGTGCCC A/- GGGGGAGGTC 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 A 1 0 212318 CASAVA_Build 4 96527254 1D TGCTTTTATG T/- TTTCTTTGAA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 T 4 3 212319 CASAVA_Build 4 96535004 1D GAATAAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 A 11 10 212320 CASAVA_Build 4 96561662 1D CTATGGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 12 11 212321 CASAVA_Build 4 96569466 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 het 346 hom 36 3 23 10 C 0 1 212322 CASAVA_Build 4 96575495 2D TAATTATGTT TA/-- TGTTAGTGAC 3070 het 3070 ref 53 30 19 5 TA 1 0 212323 CASAVA_Build 4 96578245 4D CCATTTACAG ATAT/---- ATATTGGCAC 3070 het 3070 hom 43 14 22 10 AT 4 2 212324 CASAVA_Build 4 96578624 2D TGAAAATATC AT/-- ATAAATAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 AT 2 1 212325 CASAVA_Build 4 96579568 2I TTTTTTTTTT --/TG TTTGTTTCCT 3070 het 1423 hom 40 5 15 20 TG 0 1 212326 CASAVA_Build 4 96592431 1D ACTTTCTGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 10 9 212327 CASAVA_Build 4 96609753 1D ATTTCCTTTC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 9 8 212328 CASAVA_Build 4 96613081 1I TGTAAAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 17 13 A 13 14 212329 CASAVA_Build 4 96623235 1D ATGCAGTAAT A/- AAAAAAAAAA 1854 het 1510 hom 9 5 4 0 A 11 10 212330 CASAVA_Build 4 96627691 1I ATAAAACTGC -/T TTTTTGCCTA 3070 het 3070 ref 53 28 21 4 T 5 6 212331 CASAVA_Build 4 96630220 1D GAGAAGGGGA C/- CCCAGATGGA 3070 het 3070 ref 48 19 17 13 C 4 3 212332 CASAVA_Build 4 96638884 1D ACATACAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 40 0 15 25 T 12 11 212333 CASAVA_Build 4 96640152 1I ACATGAGGAT -/A AATCCCTCCA 3070 hom 140 het 51 0 47 4 A 2 3 212334 CASAVA_Build 4 96648538 15I AAATGATGGA ---------------/CACTGTTATTATTAT CATTATCATC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 CACTGTTATTATTAT 0 1 212335 CASAVA_Build 4 96661398 1D TTTCTTTTTT C/- TTTTTTTTTT 2665 het 11 hom 18 1 15 2 C 1 0 212336 CASAVA_Build 4 96663078 5I TGCCAGGGAC -----/TTGTG CAGAGCAAAG 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 TTGTG 0 1 212337 CASAVA_Build 4 96663148 3D ACAGTGTGTT TCA/--- TCAACACTGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TCA 2 1 212338 CASAVA_Build 4 96675419 1I AACTGGGTAC -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 6 7 212339 CASAVA_Build 4 96700275 17D TCCCTGATGT TAAGTGACACATGACTA/----------------- TATATTTGTA 3070 hom 96 het 34 0 33 6 TAAGTGACACATGACTA 1 0 212340 CASAVA_Build 4 96704632 3I TTGAGATAAT ---/ACG ACATTTTCAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ACG 0 1 212341 CASAVA_Build 4 96722093 1D ATAGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 1808 het 1808 ref 41 34 4 3 T 11 10 212342 CASAVA_Build 4 96744841 1I CTGTACTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 8 9 212343 CASAVA_Build 4 96746761 1I CAGCCACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 10 11 212344 CASAVA_Build 4 96760966 1D TTTCCTGGAG A/- AAAAGACCAA 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 5 4 212345 CASAVA_Build 4 96766238 1I TCTGGTTCCA -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 6 7 212346 CASAVA_Build 4 96772785 1I TCATCAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 13 19 11 A 13 14 212347 CASAVA_Build 4 96778750 1I34M1D AGTATCTAGC -TTTTTTTTAAGCTTATATTGGTTTACCCCCACTGA/TTTTTTTTTAAGCTTATATTGGTTTACCCCCACTG- AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 28 0 25 12 N/A 0 0 212348 CASAVA_Build 4 96779024 1I AAGCTGTAAT -/A TTTTTTGCTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 212349 CASAVA_Build 4 96799756 1D TTTGAATTCC A/- AATGTGGAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 2 212350 CASAVA_Build 4 96800019 1I ATTTAGTTAC -/T TTATTTCCTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 3 212351 CASAVA_Build 4 96803538 1D TGTGGGTGGT A/- TTTTTGCTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 7 A 1 0 212352 CASAVA_Build 4 96811689 1I TCAATTTTTA -/T TTATTTTGCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 3 212353 CASAVA_Build 4 96811975 1D CAGCAAAAAG A/- AAAAAAACTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 8 7 212354 CASAVA_Build 4 96813567 1I GGAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 779 hom 29 2 22 5 A 13 14 212355 CASAVA_Build 4 96822377 5I GAGATCCAGG -----/TAGTA TAGTATAGTG 3070 hom 102 het 35 0 34 6 TAGTA 1 2 212356 CASAVA_Build 4 96824324 1D GGTATTTGAC A/- GCCAGAATAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 0 212357 CASAVA_Build 4 96825093 4D TAATATTTGA TTTC/---- TTTGTTTTTC 3070 hom 110 het 42 0 37 6 TTTC 1 0 212358 CASAVA_Build 4 96831356 1I TAAAATTAGT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 9 212359 CASAVA_Build 4 96833154 1D TGGCTCCCCC T/- GATGCATGCC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 1 0 212360 CASAVA_Build 4 96834803 2I TCAAATGAAT --/CA CAGAAGAAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CA 1 2 212361 CASAVA_Build 4 96838082 1I TTTAATCTTG -/A GAAAATAAGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 212362 CASAVA_Build 4 96844115 1D CTTTTGTATG T/- TCTTCTTTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 212363 CASAVA_Build 4 96847840 9I AAACCAAAGT ---------/TGACTTCTG TGTTCTAGCC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TGACTTCTG 0 1 212364 CASAVA_Build 4 96848071 1I AAGAGTTTTT -/A AAAACAACAG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 4 5 212365 CASAVA_Build 4 96849566 1I AAAAAAACCA -/C CAATTTTTAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 212366 CASAVA_Build 4 96865326 1I CACAACCCCA -/T AAAAAACAAA 3070 hom 86 het 35 0 33 2 T 0 1 212367 CASAVA_Build 4 96866018 1I AGGAATACTG -/T TATTATTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 2 212368 CASAVA_Build 4 96866248 1D TCTTTGTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 9 212369 CASAVA_Build 4 96866913 1D TATTCTCAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 7 212370 CASAVA_Build 4 96868267 3D AAAAAAAAAA AAC/--- AAGTTTAATG 3070 het 463 hom 49 14 28 7 AAC 1 0 212371 CASAVA_Build 4 96868634 2D AAAGGCAGCT CA/-- CAGTATGGCA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 CA 2 1 212372 CASAVA_Build 4 96871425 11I CAGCTGACTT -----------/CCGGAGAAAGA CCGGAGGAGC 3070 hom 123 het 49 0 41 8 CCGGAGAAAGA 0 1 212373 CASAVA_Build 4 96871821 1D CCATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 11 10 212374 CASAVA_Build 4 96872316 1I AAAATCTGGT -/C TTCTACTGCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 0 1 212375 CASAVA_Build 4 96880476 2I TAAAGGATAA --/AT ATAAGAGTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 1 2 212376 CASAVA_Build 4 96881756 3D CCTTTAACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 180 hom 37 3 21 13 T 19 16 212377 CASAVA_Build 4 96882654 2I TCTGTAAAAT --/AA AAAGTCATTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 5 212378 CASAVA_Build 4 96883260 1I TCTTCCTGCT -/C CCTCAGCAGC 3070 hom 102 het 35 0 35 1 C 2 3 212379 CASAVA_Build 4 96896277 6D ATATATATAA TATTAT/------ TATGTATCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TAT 3 1 212380 CASAVA_Build 4 96901713 4I CTACATCTTC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 27 0 20 7 A 12 16 212381 CASAVA_Build 4 96907333 3D GATGGTTCTC AAG/--- AATAGACCAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAG 1 0 212382 CASAVA_Build 4 96909770 7D GAAACAATAC TGAAATG/------- TATATGGGAC 3070 hom 90 het 31 0 30 3 TGAAATG 1 0 212383 CASAVA_Build 4 96909980 1D TACAGTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 17 16 212384 CASAVA_Build 4 96912864 1I TTTCTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 40 1 22 17 A 12 13 212385 CASAVA_Build 4 96913660 1D CTTTTTGATG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 8 7 212386 CASAVA_Build 4 96914058 1D TATTTTGATA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 7 212387 CASAVA_Build 4 96914543 3I ATGGTACTAA ---/AAG AAGAACAGAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AAG 1 2 212388 CASAVA_Build 4 96915376 11D CTTTTACTAC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 25 0 18 16 T 23 12 212389 CASAVA_Build 4 96915856 1I ATCTCTTAGA -/T TTGATAAATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 3 212390 CASAVA_Build 4 96917720 5I CTACCCAAAG -----/GAAAA GAAATTAATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GAAAA 0 1 212391 CASAVA_Build 4 96920710 1I AGCTTTGAAA -/T TTTTAAGCCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 4 5 212392 CASAVA_Build 4 96925113 3D AACTGAAGTG TTT/--- TTTTTTTGTT 1138 het 47 hom 26 1 11 14 T 10 7 212393 CASAVA_Build 4 96929497 2D TCAAAGAAGC TA/-- TAACTCTTCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TA 2 1 212394 CASAVA_Build 4 96930868 1D TGGGCAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 758 hom 25 3 14 8 A 16 15 212395 CASAVA_Build 4 96931695 4I TGGGGCTTGT ----/CAGA CAGACAGTGG 2193 hom 12 het 5 0 5 0 CAGA 1 2 212396 CASAVA_Build 4 96938488 1D TTTATTTTAG A/- CATTTAAAGA 3070 hom 68 het 31 0 23 9 A 1 0 212397 CASAVA_Build 4 96942712 2I CTAGCTGTGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 9 11 212398 CASAVA_Build 4 96942919 3D TTTTCTTTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTA 4 3 212399 CASAVA_Build 4 96945162 3D ACTTCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 13 7 A 17 14 212400 CASAVA_Build 4 96945751 3I ATTTGTGGGC ---/ATG ATAAGAGATT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 ATG 0 1 212401 CASAVA_Build 4 96948483 2I CAGATATAAC --/TA TGTGAGAATG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TA 0 1 212402 CASAVA_Build 4 96948628 3I1M2D TGCATAATGA ---AGC/CTTA-- ATCCTAAAAC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 N/A 0 0 212403 CASAVA_Build 4 96949499 1I AAAATTCCCC -/T TGCTGTTACT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 2 212404 CASAVA_Build 4 96949580 2I TTAGATGACT --/AA AAAAGAGTCA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 A 4 6 212405 CASAVA_Build 4 96952784 1D GTAAGTAGGC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 8 7 212406 CASAVA_Build 4 96953062 1I TCTTCTCCCC -/T TCCCCCACCA 3070 hom 128 het 50 0 41 9 T 1 2 212407 CASAVA_Build 4 96953153 1D AAAGAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 11 10 212408 CASAVA_Build 4 96954301 3D GATGATATTT AGG/--- AGATTAAACA 3070 hom 114 het 41 0 39 4 AGG 1 0 212409 CASAVA_Build 4 96956413 1I TAGCATTCTA -/T TTGATATTAA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 2 3 212410 CASAVA_Build 4 96957105 1I CATGCATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 47 3 36 8 T 10 11 212411 CASAVA_Build 4 96964558 1I CCCCAAACAA -/T TCCAAGTGGG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 1 2 212412 CASAVA_Build 4 96965281 4D GATTGGATGA TATT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 8 TATT 1 0 212413 CASAVA_Build 4 96967085 3I ACACTTTAGA ---/TAT TATTATTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TAT 2 3 212414 CASAVA_Build 4 96969566 2D AAAAAAAAAA AG/-- GAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 AG 1 0 212415 CASAVA_Build 4 96970224 4D TGTTGGACAT GTAA/---- GTGAGAAAGG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 GTAA 1 0 212416 CASAVA_Build 4 96971973 1I TCTTGAATAT -/A ATATTTGGTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 212417 CASAVA_Build 4 96973652 1D TTTGGGTAAT C/- ATTTAAGCTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 212418 CASAVA_Build 4 96982123 1D AGAACAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 21 1 15 5 T 11 10 212419 CASAVA_Build 4 96983871 1D TACATTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 8 A 10 9 212420 CASAVA_Build 4 96990233 1I TGACATATTG -/C CCCCTACCCA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 C 4 5 212421 CASAVA_Build 4 96995658 1D26M7D GGAAAAGCTA TACATCAAAGAAAACATCTGTGTGTCAAAGAGAG/-ACATCAGAGAAAACATCTGTGTGTCA------- AAGAGAGAAG 3070 hom 120 het 33 0 41 3 N/A 0 0 212422 CASAVA_Build 4 96995852 1I TTGAGCAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 51 2 35 14 A 10 11 212423 CASAVA_Build 4 97003420 1D ATGCTGGTGG T/- TTTTTTTTTA 952 het 952 ref 39 33 3 6 T 10 9 212424 CASAVA_Build 4 97004034 4D TGTATGAAAG ATTT/---- ATTTCTCTAA 3070 hom 111 het 44 0 37 9 ATTT 2 1 212425 CASAVA_Build 4 97017963 1D ACATGCACCT A/- AGCCTTTGGC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 2 1 212426 CASAVA_Build 4 97018358 1I ATGGGAATGC -/G ATAACTTTTC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 0 1 212427 CASAVA_Build 4 97019237 1I TTAATAAATT -/A AAAAAGGGAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 5 6 212428 CASAVA_Build 4 97022018 4D GAGCATAGTA TGTC/---- TGTCAATTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TGTC 2 1 212429 CASAVA_Build 4 97022972 2I GCACAAGGGG --/AA AAAAAAACCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 7 9 212430 CASAVA_Build 4 97023610 1D TTTCACTGAC T/- TTTTGCTCTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 5 4 212431 CASAVA_Build 4 97028997 1D AATTTATAGG A/- AAAAAATGTA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 A 7 6 212432 CASAVA_Build 4 97064453 4I TGATGGAGCT ----/AAGA AACATATTAC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AAGA 0 1 212433 CASAVA_Build 4 97076020 1I TTTGACACAG -/A AAAAAAAAAA 1832 het 1832 ref 43 29 5 9 A 10 11 212434 CASAVA_Build 4 97130196 1I34M1I CTGCAGCCCC -GACAACCATTAATTTGAGCTTTTTGCCTCAGCAA-/TGACAACCATTAATTTGAGCTTTTTGCCTCAGCAAT TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 16 0 21 4 N/A 0 0 212435 CASAVA_Build 4 97138368 1I TGTAGTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 11 12 212436 CASAVA_Build 4 97142769 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 47 21 19 7 T 5 4 212437 CASAVA_Build 4 97144502 1D GATCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 15 20 10 T 11 10 212438 CASAVA_Build 4 97168321 1D AGCTCAAAAA T/- TTTAAAAAAA 3070 hom 169 het 64 0 57 7 T 4 3 212439 CASAVA_Build 4 97188314 4I CATAATATAA ----/TTGT TTGCTTTTAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TTGT 0 1 212440 CASAVA_Build 4 97191943 8D TCTTTCTTTC CTTTCTTT/-------- CTTTCTTTCT 3070 hom 108 het 48 0 37 12 CTTT 7 5 212441 CASAVA_Build 4 97210343 5I AAAGTAACTT -----/CTTTA CTTTACAATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CTTTA 1 2 212442 CASAVA_Build 4 97219842 1D GCAAAGAAGG A/- AGACTGTGGA 3070 hom 186 het 64 0 61 5 A 2 1 212443 CASAVA_Build 4 97219989 1D AAACTCTATT A/- AAAATTGTCC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 5 4 212444 CASAVA_Build 4 97240137 1I GGAGAAAATA -/G GGGGGGAGAT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 G 6 7 212445 CASAVA_Build 4 97240427 4D TTCCAATCAT CAAA/---- CAATTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 CAAA 1 0 212446 CASAVA_Build 4 97251451 1D CAATATCACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 T 10 9 212447 CASAVA_Build 4 97252227 1I GGAAACATGT -/A AAAAAAGGTA 3070 het 3070 hom 46 14 21 11 A 6 7 212448 CASAVA_Build 4 97252554 1I TCTGTCTCCA -/G GCTGGAGTGC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 1 2 212449 CASAVA_Build 4 97261487 3D GATAATGGTG AAA/--- AACATGGCAA 3070 hom 147 het 55 0 49 7 A 5 2 212450 CASAVA_Build 4 97271349 1D TTCTTGAACT C/- CTTTCAGTGG 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 C 2 1 212451 CASAVA_Build 4 97275525 2D CTAAAAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 11 9 A 14 12 212452 CASAVA_Build 4 97308354 11I AGTAATACAA -----------/AAAGGAAAAAG AAAGGAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AAAGGAAAAAG 1 2 212453 CASAVA_Build 4 97310910 4I AAGAAAACAG ----/AACA AAAAGGCAAC 3070 hom 123 het 43 0 39 4 AACA 0 1 212454 CASAVA_Build 4 97323427 5D GAGCACTTTC TGTCT/----- TGGCAAAGCT 3070 het 3070 ref 41 23 14 5 TGTCT 1 0 212455 CASAVA_Build 4 97343161 1D CATGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1296 het 1296 ref 35 24 5 6 A 12 11 212456 CASAVA_Build 4 97355306 2I CATTCTACAC --/TG TTATTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TG 0 1 212457 CASAVA_Build 4 97361049 1D ATCTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 T 11 10 212458 CASAVA_Build 4 97362770 5I ACAGTAAAAG -----/TTATC TTATTACCTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 TTATC 0 1 212459 CASAVA_Build 4 97374386 1I AAAAAAAAAA -/T AAAAATCAGT 3070 het 1419 hom 40 10 17 13 T 0 1 212460 CASAVA_Build 4 97379162 1I AAAGTTAACA -/C ATTATCCTAG 3070 hom 163 het 59 0 55 4 C 0 1 212461 CASAVA_Build 4 97403350 1D ACAGCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 12 11 212462 CASAVA_Build 4 97407469 5D AAGGGTACAC ATATT/----- ATATTACAAA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 ATATT 2 1 212463 CASAVA_Build 4 97411980 1I AAAGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 10 11 212464 CASAVA_Build 4 97416482 4I GCACACACAC ----/ACAG ACACACACAC 3070 het 45 hom 32 2 15 15 ACAG 0 1 212465 CASAVA_Build 4 97424073 1I CTGGTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 A 13 14 212466 CASAVA_Build 4 97455878 1D TACCCTGTGA T/- TTTTTTATCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 7 6 212467 CASAVA_Build 4 97460362 4D GATTCAACTT ATTA/---- ATTTTATATA 3070 het 3070 ref 30 19 10 6 ATTA 1 0 212468 CASAVA_Build 4 97463067 3D ATATTGAATA TAT/--- TATATGTTAT 3070 het 1278 hom 13 3 9 1 TAT 2 1 212469 CASAVA_Build 4 97464005 10D CAAGATCATG CCACCGCACT/---------- CCAGCCTGGG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 CCACCGCACT 1 0 212470 CASAVA_Build 4 97471081 1I ACACTTGACC -/A AAAAAGAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 6 212471 CASAVA_Build 4 97483255 1I TTTGAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 13 14 212472 CASAVA_Build 4 97484144 1I6M2I4M2I TGGCATTTGT -TCACAA--ATGC--/CTCTCAATGATACAT CTGTCTCTGT 3070 het 3070 hom 41 19 25 6 N/A 0 0 212473 CASAVA_Build 4 97489528 5D TGGCTGTGAT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 281 hom 24 4 11 10 A 21 16 212474 CASAVA_Build 4 97492080 1D AAAATGGCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 249 hom 34 4 15 15 T 10 9 212475 CASAVA_Build 4 97492796 4I CACATGGTAC ----/ATTG ATTGATGTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ATTG 1 2 212476 CASAVA_Build 4 97493958 1D TTCACAGGTA T/- TTTTTTATGG 3070 hom 93 het 35 0 32 5 T 7 6 212477 CASAVA_Build 4 97499437 1I TCTTTGTATT -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 A 6 7 212478 CASAVA_Build 4 97520607 2D ATGTATAAAC TT/-- AATTTTCAAG 3070 het 3070 hom 28 10 15 7 T 2 0 212479 CASAVA_Build 4 97522084 4D AGGTTATCTC TCTT/---- ATTCCCTGAA 2424 het 2424 ref 22 13 6 3 TCTT 1 0 212480 CASAVA_Build 4 97523642 1I GCCATTTTTT -/A AAAAATTAGG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 5 6 212481 CASAVA_Build 4 97531835 1D AATGTCTGAT C/- CTCTTTACTG 3070 hom 136 het 53 0 42 11 C 2 1 212482 CASAVA_Build 4 97532683 2D GTATGAATTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 77 het 45 1 38 6 TG 8 7 212483 CASAVA_Build 4 97536299 4D TTTGTTATTT TTTG/---- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 11 5 TTTG 1 0 212484 CASAVA_Build 4 97541455 1D ACTGTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 2612 hom 4 het 19 0 9 10 T 10 9 212485 CASAVA_Build 4 97568955 1I GTTCCAACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 T 9 10 212486 CASAVA_Build 4 97612618 9I TGAGTCACAG ---------/CTGATACTC CTGCAACAAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 CTGATACTC 0 1 212487 CASAVA_Build 4 97625431 2I CTCATCTGAC --/TT TTGGTTCTTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 2 4 212488 CASAVA_Build 4 97627672 1D TTCCATTGGT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 G 2 1 212489 CASAVA_Build 4 97636008 1D TAGATTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 675 hom 30 2 21 7 A 14 13 212490 CASAVA_Build 4 97642742 1D GCTAGTTTCC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 95 het 38 0 36 2 T 7 6 212491 CASAVA_Build 4 97643015 1D GCAATTTATG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 85 hom 43 2 40 1 T 8 7 212492 CASAVA_Build 4 97643739 2I TCTCAGTAAC --/TA TTTTCACAGG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TA 0 1 212493 CASAVA_Build 4 97644194 9I ATAGTTTTAA ---------/TACCTTCCC TACCAGAAAC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 TACCTTCCC 0 1 212494 CASAVA_Build 4 97645168 2D TTTTTCTAAG AA/-- AAGTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 4 2 212495 CASAVA_Build 4 97646750 1I AGAGATTTGG -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 6 7 212496 CASAVA_Build 4 97648633 5D AAAAACTAAG ATAAA/----- ATAAAAACTT 3070 het 3070 hom 30 8 22 2 ATAAA 2 1 212497 CASAVA_Build 4 97649867 1D ATAGGGCAGT G/- GGTCAGAGTC 3070 hom 166 het 61 0 56 5 G 3 2 212498 CASAVA_Build 4 97651194 1D AAGAACACAG A/- GAAGGAATTC 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 A 1 0 212499 CASAVA_Build 4 97652608 1I GATAAAAAAA -/C AGATCTATTG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 C 0 1 212500 CASAVA_Build 4 97654061 3D AAGACACATC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 13 7 A 13 10 212501 CASAVA_Build 4 97654206 1I TGGGATGCAA -/G GATGTTTCAA 3070 hom 47 het 52 1 36 16 G 1 2 212502 CASAVA_Build 4 97654569 4I TCAAATTATC ----/TTTG TTTGTGGATT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TTTG 1 2 212503 CASAVA_Build 4 97657807 4D GAAAGTCTTG CAAC/---- CAACCACAGT 3070 het 3070 ref 48 24 19 8 CAAC 2 1 212504 CASAVA_Build 4 97664191 1I TTTATAAAGG -/A AAAAAAACAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 8 212505 CASAVA_Build 4 97665556 7D TGTCTGACTT GACTACA/------- AATCAGGGGT 3070 het 3070 ref 47 24 23 2 GACTACA 1 0 212506 CASAVA_Build 4 97667079 1I TCCATAAATC -/A ACTACTATGT 3070 het 3070 hom 70 31 34 5 A 1 2 212507 CASAVA_Build 4 97667866 2D CAGTATACTC TT/-- ATGACAAGAA 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 T 2 0 212508 CASAVA_Build 4 97669373 1D TAGAAAAAAA C/- ATTTCCAAAG 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 C 1 0 212509 CASAVA_Build 4 97669621 14D TATTCCTGTA GCTTAAAATTCTGT/-------------- GCTTTGGGAT 3070 het 3070 ref 41 25 16 6 GCTTAAAATTCTGT 1 0 212510 CASAVA_Build 4 97670190 1I GTTCTTTTGA -/T TTTTCACTCA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 T 4 5 212511 CASAVA_Build 4 97670546 1I ATTTGATTTT -/G GTCTAACATG 3070 hom 135 het 55 0 46 9 G 1 2 212512 CASAVA_Build 4 97672101 6I TGACTACAGT ------/AACCTC AACCCAGCAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AACCTC 0 1 212513 CASAVA_Build 4 97677277 1I ACAAATGTGC -/A GTGTTACTGA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 0 1 212514 CASAVA_Build 4 97684732 1D TGTTCTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 21 1 14 6 T 13 12 212515 CASAVA_Build 4 97692358 1D GGTGTACAAA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 62 het 25 0 21 4 T 8 7 212516 CASAVA_Build 4 97692646 1I ATTGGTAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 347 hom 38 2 27 9 T 9 10 212517 CASAVA_Build 4 97700613 1I CGAAAGGAAA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 93 hom 36 1 29 6 T 3 4 212518 CASAVA_Build 4 97716065 1D TAATTTAGCC T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 7 6 212519 CASAVA_Build 4 97722747 1I TGAATTTATG -/C TTTAAAAAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 0 1 212520 CASAVA_Build 4 97734093 4D TCTCTTTGTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 33 10 15 9 TC 8 6 212521 CASAVA_Build 4 97734791 1I ACAGCAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1963 hom 15 4 9 2 A 9 10 212522 CASAVA_Build 4 97744967 1I GGATTAGGGA -/T TGGGGATATT 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 T 1 2 212523 CASAVA_Build 4 97747532 1I TTGATAGAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 8 9 212524 CASAVA_Build 4 97747780 1I TTACTCTGCC -/A AAAAAATCTC 2578 het 2578 ref 14 7 6 1 A 6 7 212525 CASAVA_Build 4 97748041 1D AATTTGCCTT C/- CCTCCTATCA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 C 3 2 212526 CASAVA_Build 4 97752464 3D AGAAAGAGGG TAA/--- AATTAGTGTT 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 TAA 1 0 212527 CASAVA_Build 4 97754171 1D AAACATTATA G/- CCTCATTAGT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 G 1 0 212528 CASAVA_Build 4 97754644 2D TGTTATTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 1458 hom 23 4 12 8 TG 9 8 212529 CASAVA_Build 4 97755177 5D AATACATAAA TATTT/----- TATTATATTG 3070 het 3070 hom 36 13 21 4 TATTT 1 0 212530 CASAVA_Build 4 97765802 3I AGAAAGTATA ---/ATG ATGGTTCAGG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 ATG 1 2 212531 CASAVA_Build 4 97782100 1D TATTTGACAG C/- CCCCCCCAGT 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 C 8 7 212532 CASAVA_Build 4 97788355 1I AGCCTGACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 9 10 212533 CASAVA_Build 4 97793756 1I CCCGTGGCCA -/C CAATGGACCA 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 C 1 2 212534 CASAVA_Build 4 97797948 1D CAATCTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 308 hom 32 4 11 17 A 13 12 212535 CASAVA_Build 4 97802469 1D TATATGTGTT A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 hom 25 11 10 5 A 7 6 212536 CASAVA_Build 4 97807036 4I ACAAATAAAT ----/AGAA AGCTATACAT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 AGAA 0 1 212537 CASAVA_Build 4 97812569 4D CAGACCGAGG GCCA/---- GCCAGCCCAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 GCCA 2 1 212538 CASAVA_Build 4 97813338 2D TATATACATT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 TA 6 5 212539 CASAVA_Build 4 97815621 1D GATACATGGC A/- AAAAGGTATG 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 5 4 212540 CASAVA_Build 4 97815809 2I TTGTTTGTTA --/TG TGTTTTACTC 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 TG 1 2 212541 CASAVA_Build 4 97817765 2D AATGCCAAAC AG/-- AATTCAAACT 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 AG 1 0 212542 CASAVA_Build 4 97820952 1D AATCACTCAT G/- GAATTTCTGA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 G 2 1 212543 CASAVA_Build 4 97860872 1D CTATGTTGTC T/- GTTAGTCTGA 932 het 932 ref 16 13 2 2 T 1 0 212544 CASAVA_Build 4 97870433 1I ATGAAGGCTG -/C AACTCTCACA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 C 0 1 212545 CASAVA_Build 4 97873314 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2975 hom 37 15 13 9 A 11 10 212546 CASAVA_Build 4 97900307 1I TATCAAATGC -/T TTGTCTGCAT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 T 2 3 212547 CASAVA_Build 4 97916743 2D ACTTGCTCTT TC/-- TCTCTCTCTA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 TC 5 4 212548 CASAVA_Build 4 97939724 1D CGTTATGAGA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 8 7 212549 CASAVA_Build 4 97943809 2D AAATTCTTCT TC/-- TGAGTCTATA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 TC 1 0 212550 CASAVA_Build 4 97954209 1I ATAATCATTG -/A AAAAAAGTTC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 6 7 212551 CASAVA_Build 4 97964623 1D GTATTTTGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 17 18 6 A 10 9 212552 CASAVA_Build 4 97975607 1I GTTCTTGACA -/G CTACACTGTG 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 G 0 1 212553 CASAVA_Build 4 97976955 1D TTACTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 13 12 212554 CASAVA_Build 4 97985423 1D CATTGTTTTT A/- AAACTAGGCA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 4 3 212555 CASAVA_Build 4 98002597 1D GACTTCTCAG C/- CTATAAAACT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 2 1 212556 CASAVA_Build 4 98007055 1I TATTTATGAC -/A AACCCACAGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 3 212557 CASAVA_Build 4 98016355 1I ATTGATTGCC -/T TTTTTTATAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 212558 CASAVA_Build 4 98032827 1D CTCTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 12 11 212559 CASAVA_Build 4 98046425 1I AGACTGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 A 13 14 212560 CASAVA_Build 4 98129108 2I TAAGGGAAAC --/AG AGCATGAAAG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AG 1 2 212561 CASAVA_Build 4 98135523 1I AATGAGGCAT -/A AAATAATATT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 3 4 212562 CASAVA_Build 4 98204193 1D AGTTTAAAAG A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 6 212563 CASAVA_Build 4 98243070 3D CAAAAATATC TAG/--- TCAAAATTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TAG 1 0 212564 CASAVA_Build 4 98250967 1D AGGGACAGTA G/- GTGTCTGTGG 3070 hom 132 het 50 0 44 6 G 2 1 212565 CASAVA_Build 4 98369707 3I AAGAAGAATG ---/ACC ACCACACAAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 ACC 1 2 212566 CASAVA_Build 4 98507573 1D ACTTGCCAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 A 9 8 212567 CASAVA_Build 4 98520363 4D AAGGATTGAG TTCT/---- TTCATTGGTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 TTCT 1 0 212568 CASAVA_Build 4 98525099 1D TTTTATATAT A/- TTTTATATAT 1812 het 1812 ref 15 8 4 3 A 1 0 212569 CASAVA_Build 4 98560089 2D AAAAAAGGAT AA/-- GTTCATGTCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 A 2 0 212570 CASAVA_Build 4 98561203 1I AAGAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 A 10 11 212571 CASAVA_Build 4 98561344 1D GGAAGTAAAA C/- AAGGTATTCC 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 C 1 0 212572 CASAVA_Build 4 98561564 1D ATAGAGACTC T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 7 6 212573 CASAVA_Build 4 98634901 1D GGAGTAAGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 45 hom 54 1 42 11 T 10 9 212574 CASAVA_Build 4 98637161 1D CATCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1195 het 1195 ref 37 24 3 10 T 15 14 212575 CASAVA_Build 4 98639674 5D ATATTAAAAA CAAAC/----- CAAGTAAATT 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 CAAAC 1 0 212576 CASAVA_Build 4 98657778 1I TTAGTGTCAA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 7 8 212577 CASAVA_Build 4 98662255 1I AAATATACAA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 212578 CASAVA_Build 4 98718277 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 29 1 10 19 T 18 16 212579 CASAVA_Build 4 98723734 6I CTTAGAGTGT ------/AGGAAA TATTATTCCC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AGGAAA 0 1 212580 CASAVA_Build 4 98739998 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 28 1 19 8 A 14 13 212581 CASAVA_Build 4 98752424 1D GTAAAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 32 1 25 6 A 11 10 212582 CASAVA_Build 4 98756304 1D AAATAAAGCC A/- TGTTAAGTGC 2873 hom 18 het 10 0 7 5 A 1 0 212583 CASAVA_Build 4 98775904 4D AACAAAGATC GAAA/---- GAGACAAAGA 1975 hom 10 het 4 0 4 0 GAAA 1 0 212584 CASAVA_Build 4 98799613 1I ACAGAACTGG -/A AAGGGATCTA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 2 3 212585 CASAVA_Build 4 98803226 26D TAAATAATGC AATCATATAAATGTTCTGTCACTGTA/-------------------------- AATCATATAA 3070 hom 72 het 23 0 24 6 AATCATATAAATGTTCTGTCACTGTA 2 1 212586 CASAVA_Build 4 98808937 3I TAATGTATAG ---/GAA GATAGAGTAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GAA 0 1 212587 CASAVA_Build 4 98812524 1D ATTTTTGTAA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 2560 hom 16 7 8 1 T 8 7 212588 CASAVA_Build 4 98813848 1D CGGCTTTATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 11 10 212589 CASAVA_Build 4 98818565 1I ATGTAAGTAC -/A AATCAAATTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 212590 CASAVA_Build 4 98820981 2I ACCATTACGC --/TA TGTTACCCAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TA 0 1 212591 CASAVA_Build 4 98834628 1I ATTAAAACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 10 212592 CASAVA_Build 4 98845496 1D TTTGTCTAAC T/- TAGAAATTCT 783 het 783 ref 11 5 4 2 T 2 1 212593 CASAVA_Build 4 98849679 2I TAAAATGAAT --/TG TGTTATTGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TG 1 2 212594 CASAVA_Build 4 98850295 1I TGTATGCACA -/T TTTTTTATGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 7 212595 CASAVA_Build 4 98862270 1D CCAGGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 756 het 756 ref 31 16 4 11 A 13 12 212596 CASAVA_Build 4 98867897 1I CATGGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 664 hom 34 3 22 9 T 11 12 212597 CASAVA_Build 4 98872916 1D AATCAGCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 10 9 212598 CASAVA_Build 4 98875247 1I ACATCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 875 hom 21 2 17 2 A 13 14 212599 CASAVA_Build 4 98885439 3I CAAAAAAACA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 37 3 13 21 AAC 0 1 212600 CASAVA_Build 4 98924887 1D TATTACAAAG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 8 7 212601 CASAVA_Build 4 99025028 1D AGAAAAGCTC T/- TCTGACCTAC 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 T 2 1 212602 CASAVA_Build 4 99071812 15D TTGGCTTGAA GTTTTTTTGTTTTTG/--------------- GTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 32 0 31 4 GTTTTTTTGTTTTTG 1 0 212603 CASAVA_Build 4 99079503 2I ATCAGATCCA --/TT TGGTCCAATG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 1 3 212604 CASAVA_Build 4 99082670 2D TTAAACTGTC TT/-- TTGAATTTAT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 4 2 212605 CASAVA_Build 4 99083721 1I AGACGAATTC -/A CATTGAAAAG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 0 1 212606 CASAVA_Build 4 99087019 1D AGATTTGTTC T/- TTTAGCTTTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 4 3 212607 CASAVA_Build 4 99113947 1I AGGGTGCAAG -/C CCCAAGCCTT 3070 hom 42 het 19 0 14 5 C 3 4 212608 CASAVA_Build 4 99119443 2I AGGATGACTC --/AG AGCAGAACCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AG 1 2 212609 CASAVA_Build 4 99124247 1I CTTGTGATAT -/A TCTAAGATAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 212610 CASAVA_Build 4 99124976 16I TTTGCTGATT ----------------/TCCATGGTGTAAATAC ACCCGCAACA 3070 hom 141 het 49 0 44 5 TCCATGGTGTAAATAC 0 1 212611 CASAVA_Build 4 99132271 1D AAGCTTTTTA G/- TTTAATTAAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 1 0 212612 CASAVA_Build 4 99136767 30I CAACAAAAAC ------------------------------/AAAGATTAATAAATGGGACCTAATTAAACT AAAGAGCTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AAAGATTAATAAATGGGACCTAATTAAACT 0 1 212613 CASAVA_Build 4 99136920 1D AAGAACAAAC A/- GCCCCCTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 A 1 0 212614 CASAVA_Build 4 99144218 2D AGAGCTACTC TT/-- TTAGCAACTT 3070 hom 108 het 42 0 36 9 T 4 2 212615 CASAVA_Build 4 99185396 1D CATGCTCATC A/- GCTTATGGCT 3070 hom 72 het 26 0 24 3 A 1 0 212616 CASAVA_Build 4 99190624 1I TTTATTTTTT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 62 het 25 0 19 6 A 8 9 212617 CASAVA_Build 4 99199816 1D ATATCAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 39 2 24 13 A 16 15 212618 CASAVA_Build 4 99229887 1D TGCCAACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 39 1 32 6 T 13 12 212619 CASAVA_Build 4 99231885 4D TGAGTAATAA TAAC/---- TATCATTTAC 3070 hom 120 het 46 0 41 8 TAAC 1 0 212620 CASAVA_Build 4 99236580 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 11 10 212621 CASAVA_Build 4 99259781 1D AAAGAATGCC T/- TTTTTTTTTT 2256 het 2256 ref 37 26 5 6 T 11 10 212622 CASAVA_Build 4 99262285 1I TGAGACAATT -/G GGGCTTTCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 3 4 212623 CASAVA_Build 4 99265737 1I CTGTCCCAGA -/G GGGCACCGAC 3070 hom 77 het 28 0 24 4 G 3 4 212624 CASAVA_Build 4 99303309 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 41 het 16 0 14 4 A 10 9 212625 CASAVA_Build 4 99466095 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 A 11 12 212626 CASAVA_Build 4 99475963 1I ACTTCTTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1089 hom 38 4 20 14 T 14 15 212627 CASAVA_Build 4 99608597 4D TACAGGTGTG AGCC/---- AGCCACCTTG 3070 hom 40 het 16 0 13 4 AGCC 2 1 212628 CASAVA_Build 4 99637889 1D CAGTCAAGGG T/- TATTTCTAGC 3070 hom 98 het 38 0 32 7 T 2 1 212629 CASAVA_Build 4 99649120 1D TATCTCATAA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 6 5 212630 CASAVA_Build 4 99655938 1D TCATTCCAGG A/- AAAAATGTAT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 6 5 212631 CASAVA_Build 4 99670905 8D CACATATTAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 16 12 7 AC 11 7 212632 CASAVA_Build 4 99680217 2D AGCCTCAACT CA/-- CAGCTTGACT 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 CA 2 1 212633 CASAVA_Build 4 99686197 5I TATTGTGTCT -----/TAAAA TAATAGATGT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 TAAAA 0 1 212634 CASAVA_Build 4 99691593 1D AATCCTCTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2437 hom 32 12 11 9 T 12 11 212635 CASAVA_Build 4 99691833 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1769 hom 10 het 6 0 4 2 T 15 14 212636 CASAVA_Build 4 99694256 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAT 1993 het 1767 hom 17 6 7 4 A 10 9 212637 CASAVA_Build 4 99699315 5D TCAAACAGTA TTACT/----- AGACAGTAAC 3070 het 3070 ref 45 23 19 6 TTACT 1 0 212638 CASAVA_Build 4 99704760 1I TCATTTGTTG -/C CCCCAAATTG 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 C 4 5 212639 CASAVA_Build 4 99705615 3D GGGGGCCTTA AAG/--- AACTGAGGAG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 AAG 1 0 212640 CASAVA_Build 4 99708112 4D CTAGCCTCTT TGAG/---- TTTCACTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 TGAG 1 0 212641 CASAVA_Build 4 99713943 5D AGTTTGGTTT AGTTC/----- ATTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 47 26 21 1 AGTTC 1 0 212642 CASAVA_Build 4 99714101 1D TGATGCAGAG A/- AACCAGTTCA 3070 het 3070 ref 55 29 22 4 A 3 2 212643 CASAVA_Build 4 99715696 2D CTGATTCCCT TC/-- TCTCTTTCTG 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 TC 3 2 212644 CASAVA_Build 4 99719687 6D AGTGTTTAAC CAAAGG/------ ACAGGGCTCT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 CAAAGG 1 0 212645 CASAVA_Build 4 99728070 3D TCAAAAACAG CAA/--- CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 CAA 7 6 212646 CASAVA_Build 4 99753311 1D GGGCAAAACC T/- TTTTTTTTTT 2473 het 1579 hom 37 9 12 16 T 17 16 212647 CASAVA_Build 4 99758436 1D AATGCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 11 10 212648 CASAVA_Build 4 99758745 3D TCTGTTATTA CCT/--- CCTCCTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 CCT 3 2 212649 CASAVA_Build 4 99760348 3I CGCTATGTAA ---/CTT CAAAGCTAGG 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 CTT 0 1 212650 CASAVA_Build 4 99761963 1I49M1D CTCATTCCCA -CCCCCCCCGCAGCCCCTGGCAACCATTAATCTGCTTTCTGTCTCTATGAT/CCCCCCCCCGCAGCCCCTGGCAACCATTAATCTGCTTTCTGTCTCTATGA- TTTTGCCTAT 1955 het 1955 ref 21 23 7 11 N/A 0 0 212651 CASAVA_Build 4 99765080 2D CACTTAAGAC TT/-- TAGATTCCTC 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 T 3 1 212652 CASAVA_Build 4 99774976 3D TGGGGAGAAT GAG/--- GAGAAGATAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 GAG 2 1 212653 CASAVA_Build 4 99779659 1D GACTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1061 hom 44 7 12 25 T 17 16 212654 CASAVA_Build 4 99797559 1I AGGTTCCCCC -/A AAACGGCCCG 3070 het 3070 ref 42 25 12 5 A 3 4 212655 CASAVA_Build 4 99843173 3I TTGCCTTAAA ---/GAG AAGGAAATTC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 GAG 0 1 212656 CASAVA_Build 4 99853469 1I GGTAGATATG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 53 22 25 6 T 8 9 212657 CASAVA_Build 4 99856432 1I GAGGAATATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 9 10 212658 CASAVA_Build 4 99857158 2I GTTGTGGAAC --/TG TGAGTGCAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 TG 1 2 212659 CASAVA_Build 4 99858880 2D TCTAACTGAC TT/-- AGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 2 0 212660 CASAVA_Build 4 99861894 1D ATAAAGCTAG T/- TATTTCCCAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 2 1 212661 CASAVA_Build 4 99876443 1I TTTTGCATAG -/A AAACCTGGCC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 3 4 212662 CASAVA_Build 4 99892514 2D ATTCCTTTCC AG/-- AGTTTTTTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AG 2 1 212663 CASAVA_Build 4 99893769 1I ACATGACTAT -/A TTTTTCAGCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 1 212664 CASAVA_Build 4 99894024 1D TTTAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 21 7 T 12 11 212665 CASAVA_Build 4 99895000 1D ATTGGAATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 9 8 212666 CASAVA_Build 4 99928457 1D GGGGGTCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 37 0 27 10 A 10 9 212667 CASAVA_Build 4 99948475 1I ATAATTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 10 11 212668 CASAVA_Build 4 99958728 1D ACCCACCCCC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 9 8 212669 CASAVA_Build 4 99972141 4I AAGGAAGGGC ----/AGGA ACGAAATAAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AGGA 0 1 212670 CASAVA_Build 4 99989411 1D TCCAGACCCC A/- AAGAGAGGGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 2 212671 CASAVA_Build 4 100116109 3D ACTCAACGCT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 72 het 28 0 25 5 AAC 4 3 212672 CASAVA_Build 4 100124421 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 25 1 18 6 T 13 12 212673 CASAVA_Build 4 100127874 1I TATGGTAGGG -/A AAAATAAAGA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 4 5 212674 CASAVA_Build 4 100134514 1D CAAAACTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 22 1 14 7 T 13 12 212675 CASAVA_Build 4 100138708 1D AGAAAAAAAC A/- AAAACAAAAC 345 het 345 ref 27 13 3 12 A 5 4 212676 CASAVA_Build 4 100151218 1I GCTCTAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 35 1 28 6 T 10 11 212677 CASAVA_Build 4 100168120 1D GGTTAACTAC G/- TAGTCCTAGG 3070 het 21 hom 41 1 34 6 G 1 0 212678 CASAVA_Build 4 100170955 1D TATAGTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 779 hom 39 4 24 11 T 15 14 212679 CASAVA_Build 4 100173427 1D GGGAGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1374 het 1374 ref 38 31 4 3 T 13 12 212680 CASAVA_Build 4 100205544 4D TTCCAACTCC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 78 het 38 0 26 13 TTTA 4 3 212681 CASAVA_Build 4 100206908 3D TAATAGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 90 het 41 0 30 11 TTG 7 6 212682 CASAVA_Build 4 100209570 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 291 hom 7 het 10 0 3 7 A 13 12 212683 CASAVA_Build 4 100209601 2D AACTATAGCC GA/-- GTCTCATGAC 3070 hom 34 het 20 0 11 9 GA 1 0 212684 CASAVA_Build 4 100213353 4I TAAATGCTAA ----/GTTT GTTTGTTCGT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 GTTT 1 2 212685 CASAVA_Build 4 100214875 3I CCTATGTTTC ---/AGG AGGTGAGCAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AGG 1 2 212686 CASAVA_Build 4 100219542 1D AGACATTATG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 8 7 212687 CASAVA_Build 4 100219609 3D ACAGTGAAAG GAA/--- GAATCAGGAC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 GAA 2 1 212688 CASAVA_Build 4 100220679 4D CGCTTCTTTC TTTT/---- ATGGGGTAGA 3070 hom 83 het 33 0 23 13 T 4 0 212689 CASAVA_Build 4 100226458 5I CGTGACTAAT -----/ATATC TATAGCACAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ATATC 0 1 212690 CASAVA_Build 4 100229612 4D GTCGGTTTAC TCTT/---- TCTTTGTTTG 3070 hom 69 het 32 0 22 11 TCTT 2 1 212691 CASAVA_Build 4 100234506 3I AATCCAGTCT ---/ATC GTCGTTGGGC 1424 hom 7 het 3 0 3 0 ATC 0 1 212692 CASAVA_Build 4 100238984 1I GTTCAAACTT -/C CTCCTTTAGC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 1 2 212693 CASAVA_Build 4 100239459 4I GGTACCTCAC ----/AGTT AGGCTACTCA 1707 hom 24 het 10 0 6 4 AGTT 0 1 212694 CASAVA_Build 4 100241355 1D TATGTGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 A 10 9 212695 CASAVA_Build 4 100243026 2D TGCGGAGGGA CT/-- CTCTGGTGAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 CT 3 2 212696 CASAVA_Build 4 100243324 3D TGAAATCAAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 13 10 212697 CASAVA_Build 4 100243488 1D AGTTAATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 41 0 32 10 A 10 9 212698 CASAVA_Build 4 100243720 1I TTTTATGACA -/T TAATTTCTTG 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 1 2 212699 CASAVA_Build 4 100245792 6D GGGGAGGAAA CGATGT/------ CGATGTCCTT 2942 hom 21 het 10 0 8 2 CGATGT 2 1 212700 CASAVA_Build 4 100251700 1I7M1D AAGGAAGAGT -TAACTCAC/GTGAGTTA- ACTCTTCCTT 2704 hom 59 het 22 0 10 12 N/A 0 0 212701 CASAVA_Build 4 100253159 2D ACATAGGATG AT/-- ATTGTTTTTC 3070 hom 72 het 30 0 25 6 AT 2 1 212702 CASAVA_Build 4 100258337 1I GAAAATACTT -/A AAATGTCAAC 3070 hom 163 het 61 0 55 6 A 3 4 212703 CASAVA_Build 4 100258675 1D AAAAAATAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 10 9 212704 CASAVA_Build 4 100263423 2I ATTGCAGTTA --/AT ATGATAGAGT 3070 hom 47 het 19 0 16 3 AT 1 2 212705 CASAVA_Build 4 100265080 1D GGGTAACTCC A/- ACATGTAGAC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 2 1 212706 CASAVA_Build 4 100266181 1I CTAATCCCCC -/A AACCCCTAAG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 2 3 212707 CASAVA_Build 4 100266471 3I GGGATCTAAC ---/ATT ATACTACACA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATT 0 1 212708 CASAVA_Build 4 100268986 1I TTGTATTATC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 8 9 212709 CASAVA_Build 4 100272699 1D GTGGGTGTAT G/- GTGTGTTTCT 3070 hom 42 het 20 0 15 6 G 2 1 212710 CASAVA_Build 4 100273812 1D CTCCTGGAAA T/- TTAGGTCGAC 3070 het 3070 ref 31 19 10 4 T 3 2 212711 CASAVA_Build 4 100277310 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 10 9 212712 CASAVA_Build 4 100283190 1I TTATTTCTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 9 10 212713 CASAVA_Build 4 100286275 3I ATTTATACTC ---/TTT GTTTCCACTT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 0 3 212714 CASAVA_Build 4 100286582 1D TTTTGCTTCA T/- TTTTGTCTCA 3070 hom 156 het 57 0 52 6 T 5 4 212715 CASAVA_Build 4 100288909 5D CACTAAGGAA GCAAC/----- GCAGCTTGGT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 GCAAC 1 0 212716 CASAVA_Build 4 100293103 5D TAAATGTAAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 AAAAT 3 2 212717 CASAVA_Build 4 100298481 1D TCAGTGTAAT G/- GGTTATTCCT 3070 hom 99 het 34 0 31 4 G 3 2 212718 CASAVA_Build 4 100300207 1D GCTGCTTGAA G/- ATTTCCTGAT 3070 hom 114 het 41 0 38 4 G 1 0 212719 CASAVA_Build 4 100303923 3D TTTCTATTGT GGC/--- AGCTGACATC 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 GGC 1 0 212720 CASAVA_Build 4 100309581 1I TGTCAAATGC -/T TTTTTTGTGC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 6 7 212721 CASAVA_Build 4 100310082 2D CTAGGAGGAT TA/-- TATGTTTCCA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 TA 2 1 212722 CASAVA_Build 4 100335963 1I CAGGATATAA -/T TTTTTTTTTT 2649 het 2649 ref 26 11 8 7 T 11 12 212723 CASAVA_Build 4 100338517 1I TGTCTCTTGG -/T TTCTCCACAT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 2 3 212724 CASAVA_Build 4 100340150 1D GTTGCAGGGG A/- TGTGCTACAC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 1 0 212725 CASAVA_Build 4 100341803 1D CAAGCTGTAT A/- GAGTCTTCAA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 1 0 212726 CASAVA_Build 4 100346750 1D GGATTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 T 12 11 212727 CASAVA_Build 4 100353181 2D AGATAATACA GT/-- GTTCTCCCAT 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 GT 2 1 212728 CASAVA_Build 4 100353737 1I ATTTTCTCGA -/T GTTGGTTCCA 3070 het 3070 hom 53 23 26 4 T 0 1 212729 CASAVA_Build 4 100360960 1I TGTTTTATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1318 hom 19 5 9 5 T 9 10 212730 CASAVA_Build 4 100369435 1D TATTGGCTAT G/- GGGTTTGTTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 4 3 212731 CASAVA_Build 4 100369539 1D ATTGAAGGTC T/- TTTTCTGCAT 2695 hom 15 het 7 0 6 1 T 5 4 212732 CASAVA_Build 4 100369633 1D GTTGAACCAG C/- CCTTGCATCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 3 2 212733 CASAVA_Build 4 100376659 1I GAGCACAGCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 T 8 9 212734 CASAVA_Build 4 100377223 1D TTTTTTCTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 10 9 212735 CASAVA_Build 4 100387090 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTCT 2765 het 2765 ref 26 13 7 7 T 9 8 212736 CASAVA_Build 4 100391128 1D TCAAAATATC T/- TATGTACCAC 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 T 2 1 212737 CASAVA_Build 4 100396701 1I TTTGGCCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 31 2 23 6 T 11 12 212738 CASAVA_Build 4 100396786 3D TTAAGAGCAT AAG/--- AAGTACTCTA 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 AAG 2 1 212739 CASAVA_Build 4 100400186 1D TTAGGGAGGA C/- CTCTCTCTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 2 1 212740 CASAVA_Build 4 100408169 1D TATTTCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 635 hom 35 2 19 14 T 13 12 212741 CASAVA_Build 4 100416343 1D ATATTTTATT A/- AAAAAAAAAA 1459 het 1244 hom 22 8 5 9 A 13 12 212742 CASAVA_Build 4 100424137 3D TGGACTCTAC TGT/--- TGTTGATCCT 2334 het 2334 ref 44 37 6 3 TGT 2 1 212743 CASAVA_Build 4 100442816 5D ATGATATCAT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2268 hom 15 het 15 0 6 10 A 16 11 212744 CASAVA_Build 4 100443698 1D ATGTGGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 11 10 212745 CASAVA_Build 4 100445484 1D ATTGAAGTCA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 2270 hom 22 7 9 7 C 9 8 212746 CASAVA_Build 4 100456811 4D ATTTAAACTT TAAC/---- TAATTAAATC 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 TAAC 1 0 212747 CASAVA_Build 4 100457026 1I ATCCTAGGTC -/T TTTTTTTTTT 2714 het 2714 ref 21 9 7 5 T 10 11 212748 CASAVA_Build 4 100461831 1D TCACTTCCCA C/- CCCCCCCCGG 3070 het 3070 ref 32 11 11 10 C 9 8 212749 CASAVA_Build 4 100462923 1I CACCCAATAG -/A AAAGCAAAGG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 3 4 212750 CASAVA_Build 4 100465730 1I TAAAAATATA -/T TTTTGTTGTA 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 4 5 212751 CASAVA_Build 4 100472412 21D CCTCCTCATT CTCTCTATTCTTCTCCTCACC/--------------------- CTCTCTATTC 3070 hom 75 het 35 0 26 16 CTCTCTATTCTTCTCCTCACC 2 1 212752 CASAVA_Build 4 100473440 4D GACATGATAT CTTC/---- CTTTTTTATG 3042 het 3042 ref 30 16 8 6 CTTC 1 0 212753 CASAVA_Build 4 100475188 1D CTGTGCCACT C/- TATAACAACA 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 C 1 0 212754 CASAVA_Build 4 100479693 3D CTAGACAACG CCC/--- CCCCCCCCCC 2658 het 345 hom 29 5 9 17 C 14 11 212755 CASAVA_Build 4 100480064 1I GTGCTTTCAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 8 9 212756 CASAVA_Build 4 100480601 1D CTCCAAAAAA T/- AAAAAAGAAA 2143 het 2143 ref 23 11 7 6 T 1 0 212757 CASAVA_Build 4 100484850 5I ACATTTTCTT -----/AACTC AACAAGTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 AACTC 0 1 212758 CASAVA_Build 4 100486708 10D GGAGCTGCAT AGGTCACCTA/---------- AGGAAAGGTC 3070 het 3070 ref 30 20 8 10 AGGTCACCTA 1 0 212759 CASAVA_Build 4 100487777 6I AAATTTAACA ------/ATTTAT ATTTATACTT 2947 het 2947 ref 16 7 6 3 ATTTAT 1 2 212760 CASAVA_Build 4 100489842 2I TCTCCACTTC --/TG TGTGTTACTT 3070 het 3070 ref 56 29 22 5 TG 2 3 212761 CASAVA_Build 4 100490032 1D ACATGTATTT A/- AAAACTGGAG 3070 het 3070 ref 35 20 8 8 A 5 4 212762 CASAVA_Build 4 100491402 3D ATAAAGCAAC AAT/--- AATAACAGTG 3070 het 3070 ref 47 27 17 4 AAT 2 1 212763 CASAVA_Build 4 100492392 5I GTTTTGTCAG -----/ACTTA ACTTCTTGTG 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 ACTTA 0 1 212764 CASAVA_Build 4 100494653 4I AGAGAAAGAG ----/AGAT AGAAGTAGTA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 AGAT 0 1 212765 CASAVA_Build 4 100497032 3I CTTTGTAGAG ---/AGA AGATGTTTAG 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 AGA 1 2 212766 CASAVA_Build 4 100499005 1D ATGATGGGTA C/- CATCTGATTT 2845 het 2845 ref 20 12 6 3 C 2 1 212767 CASAVA_Build 4 100505392 1I TATGCTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 T 10 11 212768 CASAVA_Build 4 100507803 4D AATGGTTGGA GAAT/---- GTGGAACTAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 GAAT 1 0 212769 CASAVA_Build 4 100513575 3D AGTTTTTCTT CTA/--- CTGCTTTCAC 3070 het 3070 ref 33 18 11 6 CTA 1 0 212770 CASAVA_Build 4 100514599 3D14M2I TGCAAATACT ATCATCTTATAACCCCC--/---ATCTTATAACCCCCCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 20 11 4 N/A 0 0 212771 CASAVA_Build 4 100516550 1D TCCCCTTCTC T/- TTTTTTATAT 2592 het 2592 ref 26 16 7 4 T 7 6 212772 CASAVA_Build 4 100516749 10D GAATGCATAT ATATGTATGC/---------- ATATGTATAT 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 ATATGTATGC 1 0 212773 CASAVA_Build 4 100519202 1I AACAATAGGG -/C AAAGGAAGCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 C 0 1 212774 CASAVA_Build 4 100519323 2I ATGTAGCTTT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 A 9 11 212775 CASAVA_Build 4 100520470 2D ACTCTAAGCT AA/-- AAAAAGAGTC 3070 het 3070 ref 35 18 13 7 A 7 5 212776 CASAVA_Build 4 100534929 1D CCAAAAAAAC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 75 het 33 0 25 9 A 7 6 212777 CASAVA_Build 4 100545505 4D AAGTATAAAA AGAT/---- AGACTTGAAG 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AGAT 1 0 212778 CASAVA_Build 4 100555472 1D TCTCGGGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 12 11 212779 CASAVA_Build 4 100569618 2I ATGGGAAGCA --/TC TCTCCTTATT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 TC 2 3 212780 CASAVA_Build 4 100577022 1I ATATTAATCT -/A AAAATTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 4 5 212781 CASAVA_Build 4 100601328 12D AATGCTATCC ATAGGTTTATAA/------------ ATAATCTCTT 3070 het 3070 ref 43 21 21 6 ATAGGTTTATAA 1 0 212782 CASAVA_Build 4 100620957 1I TTCTTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 1217 het 1217 ref 42 28 4 10 T 11 12 212783 CASAVA_Build 4 100662528 1I CATAATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 38 0 32 6 T 11 12 212784 CASAVA_Build 4 100664613 1I GAAACACTCT -/C ATCTATTTCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 0 1 212785 CASAVA_Build 4 100664787 4D CTATTTACTG CTAT/---- CTATTTAGTT 3070 hom 117 het 41 0 40 3 CTAT 2 1 212786 CASAVA_Build 4 100668389 5D TTTCTCAATT AAAAG/----- AAGTTTATAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAAAG 1 0 212787 CASAVA_Build 4 100670708 1I TCATCTGCCA -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 6 7 212788 CASAVA_Build 4 100671303 1I TTACCCTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 429 hom 41 1 33 7 T 9 10 212789 CASAVA_Build 4 100672035 1I TGTTTCCTAC -/A AAAAAAATGT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 7 8 212790 CASAVA_Build 4 100673989 1D GATACCTTGC G/- GGAACATACC 3070 hom 111 het 41 0 37 5 G 3 2 212791 CASAVA_Build 4 100676141 4I TTTCTTCTAA ----/CAGT CAGGCCACTC 3070 hom 74 het 27 0 23 4 CAGT 0 1 212792 CASAVA_Build 4 100681930 1D CATGTGGTGG A/- AAAAAAAAGA 1343 het 1343 ref 36 26 3 7 A 9 8 212793 CASAVA_Build 4 100685214 5I CTTTCCTCTT -----/TTATC TTTATCTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TTATC 0 1 212794 CASAVA_Build 4 100686497 4D TACCATTCTC CTTT/---- CTTTCTTTAT 3070 hom 103 het 42 0 35 8 CTTT 3 2 212795 CASAVA_Build 4 100688376 1D ATTTGATTTA T/- AGAAACAAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 1 0 212796 CASAVA_Build 4 100688463 1I CAACAAATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 9 212797 CASAVA_Build 4 100689116 1I TTTAAAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 562 hom 41 2 31 8 T 10 11 212798 CASAVA_Build 4 100690287 1D CAGCAAAAAG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 88 het 40 0 32 8 A 8 7 212799 CASAVA_Build 4 100691253 16D TTTAGATAAG ATTTATAGTTCAGAGA/---------------- ATTTATAGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 9 ATTTATAGTTCAGAGA 2 1 212800 CASAVA_Build 4 100692107 1D AAGAGGAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 46 hom 21 1 16 4 T 10 9 212801 CASAVA_Build 4 100696719 1I CCCACTCCTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 9 212802 CASAVA_Build 4 100701132 2D TATGTGAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 1153 het 224 hom 26 5 4 17 T 16 14 212803 CASAVA_Build 4 100705582 3D AAAATGATTC TAT/--- TATTAATCCA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 TAT 2 1 212804 CASAVA_Build 4 100707131 1D AAGTTGGGAG T/- TGAGGAGATG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 2 1 212805 CASAVA_Build 4 100715285 2D ACCATGTAAC TT/-- TGGAATGTTT 3070 hom 148 het 56 0 50 8 T 3 1 212806 CASAVA_Build 4 100721802 1D GCATTTAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 8 212807 CASAVA_Build 4 100772908 1D CCCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2379 hom 38 8 19 11 A 11 10 212808 CASAVA_Build 4 100779051 1D AACATTATTT A/- AAAGTTGCGT 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 A 4 3 212809 CASAVA_Build 4 100781398 1I AAAAATTAAG -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 6 7 212810 CASAVA_Build 4 100784928 1D TGATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 11 10 212811 CASAVA_Build 4 100787804 1I AAAATGAGGC -/T TGTGCTTTCA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 1 2 212812 CASAVA_Build 4 100813744 1D CAGCAAATGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 16 8 2 A 10 9 212813 CASAVA_Build 4 100816681 1D GTAACAAAAA C/- ATGGAATCAA 3070 het 3070 ref 31 21 10 0 C 1 0 212814 CASAVA_Build 4 100820723 3I AGCTTGTTTG ---/TTC TTCTCTGGAA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 TTC 1 2 212815 CASAVA_Build 4 100826608 1I GGCTTATGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 56 22 31 3 A 9 10 212816 CASAVA_Build 4 100834607 2D TATAAGGAAC TG/-- TGAAAAACAT 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 TG 2 1 212817 CASAVA_Build 4 100838029 1D TAAGACTGGG A/- ATTTGAAACT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 2 1 212818 CASAVA_Build 4 100845544 1D CACTTACTTA G/- TTTCCTTGTT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 G 1 0 212819 CASAVA_Build 4 100849778 1I TTATATTTTC -/T TCTTCCTCAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 212820 CASAVA_Build 4 100850583 1D TGAGTGAATT A/- AATTCCTATA 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 A 3 2 212821 CASAVA_Build 4 100869339 1I ACCAAAAATA -/C CTTTTACTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 2 212822 CASAVA_Build 4 100872488 1I AGAAAAATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 9 10 212823 CASAVA_Build 4 100888241 2D ATTTCTGCTC TT/-- TGCAAATGAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 7 T 3 1 212824 CASAVA_Build 4 100894522 1D ATCAAATAAT G/- AGTGAATGAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 1 0 212825 CASAVA_Build 4 100895014 3D GGAGGAAGAA GAG/--- GAGAAAAACA 3070 hom 91 het 33 0 31 5 GAG 2 1 212826 CASAVA_Build 4 100897738 1D AAAAACCTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 24 10 10 5 A 9 8 212827 CASAVA_Build 4 100902315 1I ACATTATATG -/A AACAGGGGAT 3070 hom 147 het 53 0 48 5 A 2 3 212828 CASAVA_Build 4 100904970 1D TGAAACTTGA C/- CCCCAGTGTT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 C 5 4 212829 CASAVA_Build 4 100914859 1D TCAGTGCCCC G/- GCAGGGACAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 G 2 1 212830 CASAVA_Build 4 100916793 1I9M4I CAACAAAGAT -AAAAAAGAC----/CAAAAAACACAAAG AAGGGCATTA 2842 het 2842 ref 24 17 6 2 N/A 0 0 212831 CASAVA_Build 4 100924000 1I GCAAAAATGC -/T TATGCATGTT 3070 het 3070 hom 39 16 22 1 T 1 2 212832 CASAVA_Build 4 100928042 5D TATATCATGG TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 33 15 8 11 TGTTT 4 3 212833 CASAVA_Build 4 100930595 1I AGTGAGAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 13 12 A 12 13 212834 CASAVA_Build 4 100941486 1D ATGGGGGGGG C/- CAAGGGGCTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 C 2 1 212835 CASAVA_Build 4 100943668 2D AACAAATAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 T 13 11 212836 CASAVA_Build 4 100945175 10D CTATCTCAAA AAGGCAAGGC/---------- AAGGCAAGGC 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 AAGGC 4 2 212837 CASAVA_Build 4 100947056 8I CAAGCCCGAA --------/AAGACCTC AACCTTTCTT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 AAGACCTC 0 1 212838 CASAVA_Build 4 100955787 1D TGCTGTGCTG T/- TTAGTCCTCA 3070 het 3070 ref 57 28 26 3 T 3 2 212839 CASAVA_Build 4 100958869 1D ACTTCCCTGC A/- AAAAAAAAAG 1354 het 1354 ref 49 37 4 9 A 10 9 212840 CASAVA_Build 4 100960598 2I AAGAAATAAC --/AT AAAATGAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 AT 0 1 212841 CASAVA_Build 4 100989281 5D CATCTCACAA TTTAG/----- TTTAGCCTCA 3070 het 3070 hom 40 15 24 5 TTTAG 2 1 212842 CASAVA_Build 4 101008852 1D AGGGGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 1181 het 1181 ref 34 25 3 6 T 11 10 212843 CASAVA_Build 4 101193719 1D TAACTGATTA T/- TTTTGGGGGG 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 5 4 212844 CASAVA_Build 4 101194629 1I CATTGCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 T 10 11 212845 CASAVA_Build 4 101280892 1D TTGCTTTCGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 11 10 212846 CASAVA_Build 4 101315569 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 38 0 29 10 T 11 10 212847 CASAVA_Build 4 101348033 3D GACAAAAAGT GTG/--- GTGTTCTGAG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 GTG 2 1 212848 CASAVA_Build 4 101385575 2I GGCATCAGCA --/GT GTGTGGGGGG 3070 hom 114 het 42 0 37 5 GT 2 3 212849 CASAVA_Build 4 101386447 4D ACTCATTCTT CTCA/---- CTCGGTCATG 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 CTCA 1 0 212850 CASAVA_Build 4 101386918 1D CAAATTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 27 7 T 13 12 212851 CASAVA_Build 4 101387387 1I TCAATAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 T 10 11 212852 CASAVA_Build 4 101392504 1I ATATAAGTAA -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 6 7 212853 CASAVA_Build 4 101396076 1D CTTGTTCACA T/- TTTTTTTTTT 1366 het 1366 ref 40 30 4 6 T 11 10 212854 CASAVA_Build 4 101396483 2D AAGAAGGGAC TT/-- TTATTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 4 2 212855 CASAVA_Build 4 101411534 1I GGAATGTAAG -/T TGAAAAAGCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 2 212856 CASAVA_Build 4 101412784 2D TCTCTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 244 hom 22 3 11 8 TC 10 9 212857 CASAVA_Build 4 101419148 1I TTCTCTGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 861 hom 27 2 23 2 T 10 11 212858 CASAVA_Build 4 101425868 1I TGTCTCAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 10 11 212859 CASAVA_Build 4 101431953 1D GTTGTTGTTG T/- TTGTTTGTTT 2350 het 2350 ref 49 10 15 25 T 3 2 212860 CASAVA_Build 4 101448520 6D AAATGCTTTA TTAGTT/------ TTAGGGGCTA 3070 het 3070 ref 50 27 19 6 TTAGTT 1 0 212861 CASAVA_Build 4 101449711 1D TTTTTCTAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 9 8 212862 CASAVA_Build 4 101450159 3D ATTTTGGAGT TGA/--- TAGGAGGTTA 3070 het 3070 hom 48 23 23 5 TGA 1 0 212863 CASAVA_Build 4 101455654 1I ACTAATGACA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 7 8 212864 CASAVA_Build 4 101460741 1I TGCTTCCAAT -/G CGTAGAGTCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 0 1 212865 CASAVA_Build 4 101464447 2D AATTTATTAT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TG 1 0 212866 CASAVA_Build 4 101487521 2D GTATAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 28 0 19 9 T 16 14 212867 CASAVA_Build 4 101488227 6I ATTTTTATTT ------/TATATA TATATATATA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TA 6 9 212868 CASAVA_Build 4 101493506 1D ACTTTTAGAC A/- GGTCTTCATC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 0 212869 CASAVA_Build 4 101524477 2D AATTTGCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 13 11 212870 CASAVA_Build 4 101528788 1D CCACATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 11 10 212871 CASAVA_Build 4 101529440 1I CTTTAGAGTT -/A ACGGTTCTTT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 1 2 212872 CASAVA_Build 4 101531230 1I CCATCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 10 11 212873 CASAVA_Build 4 101534581 4D CACCTTTGTA GTTT/---- GTTTGTTTTT 3070 hom 79 het 38 0 24 14 GTTT 3 2 212874 CASAVA_Build 4 101558259 1D GGTTAAGATA T/- TGCCATCGTA 3070 hom 153 het 56 0 50 7 T 2 1 212875 CASAVA_Build 4 101567633 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 893 het 893 ref 30 18 4 8 C 1 0 212876 CASAVA_Build 4 101569903 3I TTGATTAAAA ---/TAG TAGTTTTTAC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TAG 1 2 212877 CASAVA_Build 4 101571393 2D AGACTCTGAA AC/-- ACAGTTAAGG 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 AC 2 1 212878 CASAVA_Build 4 101571902 2I TTACAATACA --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 93 het 40 0 30 10 TC 6 7 212879 CASAVA_Build 4 101574559 17D AATAGCCTAC CAAGCAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAGC 3070 het 2668 hom 20 10 10 5 CAAGCAAAAAAAAAAAA 1 0 212880 CASAVA_Build 4 101577641 2I GGTCTGATAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 12 212881 CASAVA_Build 4 101582739 1D AGGCTGTCTT C/- ACTATTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 C 1 0 212882 CASAVA_Build 4 101582995 1I TCTTGAATCT -/C CCAAGTTTCC 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 C 2 3 212883 CASAVA_Build 4 101586512 1I TTAATAATAT -/A AAAAATAACT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 5 6 212884 CASAVA_Build 4 101595690 1I GGGTGAAAAG -/T TTTTTTTTTT 1528 het 929 hom 25 4 7 14 T 15 16 212885 CASAVA_Build 4 101595721 1I GTACTAAAAA -/T GTTGTTTCAT 3070 hom 46 het 29 0 16 13 T 0 1 212886 CASAVA_Build 4 101599485 2I TGTGTACACC --/AT ATATATATAT 3070 het 311 hom 41 1 36 4 AT 5 6 212887 CASAVA_Build 4 101644760 3D ATACAGAGAT AGG/--- AGCTGAAGGG 3066 het 3066 ref 16 8 7 5 AGG 1 0 212888 CASAVA_Build 4 101650096 3I GCTAATGTTT ---/TAG TAGTAATTTA 3070 het 3070 hom 51 19 23 9 TAG 1 2 212889 CASAVA_Build 4 101652017 1I GACAGTTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 11 10 A 11 12 212890 CASAVA_Build 4 101656184 1I GGTTTGGTTT -/G GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 G 1 2 212891 CASAVA_Build 4 101672021 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 424 hom 26 3 12 12 TG 10 9 212892 CASAVA_Build 4 101712753 1I TAAATAAAAT -/G ATGTTTTGGT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 G 0 1 212893 CASAVA_Build 4 101714024 3D TTCATTGAAC ATA/--- ATGATTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 ATA 1 0 212894 CASAVA_Build 4 101718379 4I TCTAGGAACA ----/TTTC TTTCAGGTTC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TTTC 1 2 212895 CASAVA_Build 4 101723438 1I TACTTGTGCC -/T TAGATTGTGG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 1 2 212896 CASAVA_Build 4 101733192 2D AGGAGGAGAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 11 9 212897 CASAVA_Build 4 101736510 1I CATTAGAAGA -/C ATGAATGGAT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 C 0 1 212898 CASAVA_Build 4 101738562 1D TTGTAGCACC T/- TTTTGTGAAC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 5 4 212899 CASAVA_Build 4 101741652 2D TGGGCTGAAA AC/-- ACATCTTCTC 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 AC 2 1 212900 CASAVA_Build 4 101746092 2D TATGTATATA TG/-- TGTGTGTATA 3070 hom 65 het 23 0 22 1 TG 4 3 212901 CASAVA_Build 4 101746531 4I CCAATATGTA ----/TGTG TATGTTTGCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TG 0 2 212902 CASAVA_Build 4 101747473 3D CTGTAATAAT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 42 19 13 11 TTG 4 3 212903 CASAVA_Build 4 101751386 1D GCAACCTTAT A/- GAATTGGTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 1 0 212904 CASAVA_Build 4 101755497 1I TATTGAACTC -/T TAAGTATTTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 1 2 212905 CASAVA_Build 4 101763208 32D ACGTGCATTT GAGAACACCTTATTAAAGGTGTTCTCAATATA/-------------------------------- GAGAACACCT 3070 hom 63 het 32 0 21 16 GAGAACACCTTATTAAAGGTGTTCTCAATATA 2 1 212906 CASAVA_Build 4 101767439 6I ATAAATAAAT ------/AAAGTC AAAAAGTAAC 3070 hom 53 het 20 0 16 4 AAAGTC 0 1 212907 CASAVA_Build 4 101778284 1D GAATGGATTT A/- AAAAATACCA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 6 5 212908 CASAVA_Build 4 101779476 5I AGAAAGAAAC -----/GAAAA GAAAAGAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 GAAAA 3 4 212909 CASAVA_Build 4 101788861 2I CTTAAGAGAA --/GT GGGATTGATA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 GT 0 1 212910 CASAVA_Build 4 101789095 1I CCTGATTAGT -/A AATGAGTGAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 2 3 212911 CASAVA_Build 4 101798059 2I TTCCACAAAC --/AT GTGTTAACCT 3070 hom 144 het 58 0 48 10 AT 0 1 212912 CASAVA_Build 4 101810990 1I GACCATGCAA -/T TTAGGACCGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 3 212913 CASAVA_Build 4 101812172 1D ACATGTTAAT A/- ACTCCATTGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 1 212914 CASAVA_Build 4 101817360 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 575 hom 15 3 7 5 T 14 13 212915 CASAVA_Build 4 101818096 1I TAGGACGTGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 8 9 212916 CASAVA_Build 4 101820133 2D CATAGAAAAC TG/-- TTATGTTTGG 3070 het 3070 hom 48 24 22 2 TG 1 0 212917 CASAVA_Build 4 101826259 1D ATACCCATGT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 9 8 212918 CASAVA_Build 4 101851062 1I GAGCAGAATA -/C CCAATAGTTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 2 3 212919 CASAVA_Build 4 101852661 1I AATGCAAAAT -/A AAAAATCTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 212920 CASAVA_Build 4 101875209 6D AATAAGTGAT AAAATG/------ AAAAAAAAGT 1739 het 1739 ref 15 9 4 3 AAAATG 1 0 212921 CASAVA_Build 4 101880026 1D TTTCTTTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 10 9 212922 CASAVA_Build 4 101886975 2D ATAAAGAAAG AA/-- ATAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 17 4 A 3 1 212923 CASAVA_Build 4 101888861 1I ATTCTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1566 hom 22 4 12 6 A 10 11 212924 CASAVA_Build 4 101900748 1I ACGATCATTA -/C CTGGGCACAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 2 212925 CASAVA_Build 4 101902787 4D GTATATTTAG TGTT/---- TGTTTGGTCT 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 TGTT 2 1 212926 CASAVA_Build 4 101906852 1D TATTCTAAAT G/- AAGTCACTCA 3070 het 3070 hom 63 30 26 7 G 1 0 212927 CASAVA_Build 4 101909502 2I ATTGTTTAAA --/GT AAAACTTATT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GT 0 1 212928 CASAVA_Build 4 101910984 1D CTTTTATGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 9 212929 CASAVA_Build 4 101917323 21D CCTATCTCTA CAGAGGGAGGGTGGAGTAGCT/--------------------- CAGGCTGTTA 3070 het 3070 ref 33 18 17 6 CAGAGGGAGGGTGGAGTAGCT 1 0 212930 CASAVA_Build 4 101922064 1I CTCGTCATTT -/A ACATTAGGTA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 1 2 212931 CASAVA_Build 4 101928013 3D AAACAGACCA GAC/--- GACCAGTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 GAC 2 1 212932 CASAVA_Build 4 101940601 2I AGGTTGGGGT --/TG TGGTTTAATA 3070 hom 101 het 43 0 32 11 TG 1 2 212933 CASAVA_Build 4 101951994 5I TATAGCCTAC -----/CATAT CATATGCACT 3070 het 3070 hom 62 28 29 5 CATAT 1 2 212934 CASAVA_Build 4 101958513 1D AATGATGAAG T/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 7 6 212935 CASAVA_Build 4 101963352 3D TTATGCCTTT TTG/--- AAAGGAATTC 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 TTG 1 0 212936 CASAVA_Build 4 101969487 1D TACCAGAGAA G/- CTCATTAGAG 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 G 1 0 212937 CASAVA_Build 4 101969775 4D ACATAGCTCA AGAC/---- AGACAGTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AGAC 2 1 212938 CASAVA_Build 4 101973557 1D AGTAAAAAGA G/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 20 15 9 G 1 0 212939 CASAVA_Build 4 101977063 1D ATAATGATGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 9 8 212940 CASAVA_Build 4 101978259 2D TTTCAAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 2872 het 2872 ref 24 12 8 4 A 13 11 212941 CASAVA_Build 4 101993615 2D AATATTCCAT TG/-- TGTGTGTGTG 1315 het 1315 ref 54 39 3 15 TG 6 5 212942 CASAVA_Build 4 101998347 1D TATGCTTGAA T/- TTTTTGTGGA 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 T 6 5 212943 CASAVA_Build 4 101998739 2D TCAAACTGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 18 1 10 9 A 12 10 212944 CASAVA_Build 4 101998751 1D AAAAAAAAAA T/- AATAACAATA 2659 het 51 hom 18 2 9 7 T 1 0 212945 CASAVA_Build 4 101999105 1I TTTTGTCCTC -/T TTTTTTTCCA 3003 het 3003 ref 26 14 10 2 T 7 8 212946 CASAVA_Build 4 102001755 1I AAAATTGTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 8 9 212947 CASAVA_Build 4 102002973 2I TTTTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTA 1506 het 1506 ref 21 11 4 6 T 9 11 212948 CASAVA_Build 4 102009478 2D AAATACTTTG TA/-- TAAGTTCCCT 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 TA 2 1 212949 CASAVA_Build 4 102012611 4I ATTTTTCTAT ----/ATTA ATTGTTTCAA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 ATTA 0 1 212950 CASAVA_Build 4 102015091 1I AATATAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 10 11 212951 CASAVA_Build 4 102021708 5D ATAGTGAAAT AACTC/----- AAAAGTGAAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 7 AACTC 1 0 212952 CASAVA_Build 4 102033985 2I AAGTGTACAC --/AT ATTCTTTCAG 2112 hom 18 het 10 0 5 5 AT 1 2 212953 CASAVA_Build 4 102043806 1I ATAGAGACAC -/A AAAAAACCCT 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 6 7 212954 CASAVA_Build 4 102044982 4I CCAATAATAG ----/ACAA ACAGAGAGCC 1867 het 1867 ref 11 6 4 1 ACAA 0 1 212955 CASAVA_Build 4 102047212 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 7 8 212956 CASAVA_Build 4 102047713 2I TTTTACTGAG --/GA AAGTCTGAAA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 GA 0 1 212957 CASAVA_Build 4 102051079 1I TTGGCTGGAG -/T TTTTTAATGT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 5 6 212958 CASAVA_Build 4 102051631 2I ACATGCCCTG --/TT TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 7 9 212959 CASAVA_Build 4 102051844 1I ACTTATTTTA -/T CGCCCAAATA 3070 het 3070 ref 55 30 23 2 T 0 1 212960 CASAVA_Build 4 102052840 1D ACAGAGATTA T/- ATGTGGCCCA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 1 0 212961 CASAVA_Build 4 102068260 1I TTCTCTCCCC -/T ATCCTCAAGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 1 212962 CASAVA_Build 4 102077799 4I TGATTTTAGC ----/TCTG TCTGTCTGAA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 TCTG 2 3 212963 CASAVA_Build 4 102077987 1I TAATCCCTGC -/A GCAGCTTGGT 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 A 0 1 212964 CASAVA_Build 4 102083405 1I TTTAGAATAG -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 7 8 212965 CASAVA_Build 4 102084101 1D GCTAAGGATG T/- TTAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 T 3 2 212966 CASAVA_Build 4 102084201 2D ACAAAAAAAC CA/-- CAGAGTGCCC 3070 het 3070 hom 45 17 22 8 CA 2 1 212967 CASAVA_Build 4 102099536 1I TACTCACACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 11 12 212968 CASAVA_Build 4 102099942 1D TTTTTAATCA T/- TTCTAGATTA 3070 het 3070 hom 40 18 17 6 T 3 2 212969 CASAVA_Build 4 102103782 1I CCCCTTCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 9 10 212970 CASAVA_Build 4 102106256 1D CAACATTTAA T/- TGGTGGAAGA 3070 het 3070 ref 37 15 18 5 T 2 1 212971 CASAVA_Build 4 102124497 1I ACTATTCTGT -/C ATTTGCATTT 3070 het 3070 hom 46 16 26 4 C 0 1 212972 CASAVA_Build 4 102148415 1I TTCATTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 29 0 25 4 A 10 11 212973 CASAVA_Build 4 102150383 1I TCTGGGCCTT -/A AAAAAAAAAA 1820 het 1820 ref 29 14 7 8 A 13 14 212974 CASAVA_Build 4 102150541 1D CAGTTAAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 A 10 9 212975 CASAVA_Build 4 102156832 1D ATCTTTTTAT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 G 10 9 212976 CASAVA_Build 4 102166840 4D CATGAAAAAA AAAG/---- AAATTATAAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 AAAG 1 0 212977 CASAVA_Build 4 102171141 1D TTTTGTGTGT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 G 1 0 212978 CASAVA_Build 4 102171258 3D TTTGTAAAAA CTC/--- AAAAGACACT 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 CTC 1 0 212979 CASAVA_Build 4 102176598 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1991 het 826 hom 14 6 5 3 T 12 11 212980 CASAVA_Build 4 102234643 1I CTTTTACTTT -/A AAAAGTAGCC 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 4 5 212981 CASAVA_Build 4 102244635 1I GCATTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 11 12 212982 CASAVA_Build 4 102257623 4I ACCACTGAGA ----/TTCT TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TTCT 0 1 212983 CASAVA_Build 4 102309918 1D AGTAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1819 hom 40 5 17 18 T 11 10 212984 CASAVA_Build 4 102310355 5D TTGAAATAAC AAAAG/----- AAAAGTGGCC 3070 het 3070 hom 42 20 22 1 AAAAG 2 1 212985 CASAVA_Build 4 102310451 1D CATAGAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 10 9 212986 CASAVA_Build 4 102311531 1I CAATTCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 11 19 14 A 15 16 212987 CASAVA_Build 4 102318012 1I AATTAAGCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 A 10 11 212988 CASAVA_Build 4 102333970 1I TTTTAACTTT -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 6 7 212989 CASAVA_Build 4 102340203 1D GAAAGATCCA G/- GGATCACTTT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 G 3 2 212990 CASAVA_Build 4 102345750 1I AGTTGATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 21 18 4 A 10 11 212991 CASAVA_Build 4 102348015 1D AACAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 A 12 11 212992 CASAVA_Build 4 102359823 1I AGAAGCTCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 8 9 212993 CASAVA_Build 4 102360888 19D AGTGTCTGTT ATCAAACAGCTCTCTTACA/------------------- CATTCTCTAT 3070 het 3070 ref 36 23 18 2 ATCAAACAGCTCTCTTACA 1 0 212994 CASAVA_Build 4 102361640 1D AAAACGCATA T/- TTTGAGAAGT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 4 3 212995 CASAVA_Build 4 102363048 2D ACAGTTATCA AG/-- AGCTAGATTA 3070 het 3070 ref 51 24 24 4 AG 2 1 212996 CASAVA_Build 4 102365446 3D CATGAAGATA TTT/--- TTATTAAATA 3070 het 3070 hom 42 20 21 3 T 5 2 212997 CASAVA_Build 4 102370536 1I TCTTTAAAAT -/A AAAAAAAAAT 2063 het 2063 ref 15 6 5 4 A 9 10 212998 CASAVA_Build 4 102372869 1D AGCTTTGTAG A/- AAAAAGGAAT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 6 5 212999 CASAVA_Build 4 102373213 4D TTTGCTTTAC TTTG/---- TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 TTTG 1 0 213000 CASAVA_Build 4 102373914 2D TTTACAGGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 T 13 11 213001 CASAVA_Build 4 102376472 2D AAACATAGTC AT/-- GTGAAAAGCA 3070 het 3070 ref 52 25 19 8 AT 1 0 213002 CASAVA_Build 4 102382385 4D CTCATTAATG GTTT/---- ATTTACTAAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 5 GTTT 1 0 213003 CASAVA_Build 4 102382713 1D ATATTGGTTT A/- AATAAAAAAA 2262 het 2262 ref 17 11 5 1 A 3 2 213004 CASAVA_Build 4 102389347 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 15 1 11 3 A 13 12 213005 CASAVA_Build 4 102396384 13D AAAAATGCTA TATTAGTTTGCTC/------------- TCTGAATAGA 3070 het 3070 hom 41 22 23 7 TATTAGTTTGCTC 1 0 213006 CASAVA_Build 4 102404631 15D ACAGGGCAAG AAAAAGAAAGTTAAC/--------------- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 31 21 10 3 AAAAAGAAAGTTAAC 1 0 213007 CASAVA_Build 4 102409561 1I CTTTGAACAC -/A TATGGCCCCC 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 0 1 213008 CASAVA_Build 4 102413320 4I TAGGATAGAT ----/ATTA ATTGTTTTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATTA 0 1 213009 CASAVA_Build 4 102416050 3D GGTTTTTTTT TTG/--- TTTTTTGTTT 3070 het 2197 hom 21 8 9 4 TTG 1 0 213010 CASAVA_Build 4 102417159 24D GCATTATGGC TAGGACCTGATATTTTCAAAATAT/------------------------ TAGGACCTGA 3070 het 3070 ref 32 19 16 2 TAGGACCTGATATTTTCAAAATAT 1 0 213011 CASAVA_Build 4 102421761 1I AGAATGTATC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 7 8 213012 CASAVA_Build 4 102427947 1D TTAACCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 11 13 T 14 13 213013 CASAVA_Build 4 102431318 8D TTAACTAGGC TATTCAGT/-------- TATTCAGTTA 3070 het 3070 ref 49 28 18 7 TATTCAGT 2 1 213014 CASAVA_Build 4 102434725 3I TAATCATTTA ---/TAT TATTAAGGCC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TAT 1 2 213015 CASAVA_Build 4 102483766 1D TTTCTCTGAA T/- TTTTCTACTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 5 4 213016 CASAVA_Build 4 102495126 1I AGGATGTGAG -/A AAAAATAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 5 6 213017 CASAVA_Build 4 102555974 1D AAATATGACC A/- AAAAAAAGGC 2743 het 2743 ref 30 16 7 7 A 8 7 213018 CASAVA_Build 4 102582786 1D ACTGCCCTGA T/- TTTTTTTTTT 1805 het 1378 hom 33 8 6 19 T 19 18 213019 CASAVA_Build 4 102588844 1D CAATAATTGA T/- TTTTAGAATC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 5 4 213020 CASAVA_Build 4 102596965 1I TTTGTTGATC -/T TTTCAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 3 4 213021 CASAVA_Build 4 102623423 1D TTCTGAATGC T/- TCTGTAAAGG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 1 213022 CASAVA_Build 4 102624008 1D AAAAAAACTA T/- AACAGAATAG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 1 0 213023 CASAVA_Build 4 102628996 1I TTTCTTAGTA -/T TTTTCTCTCT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 4 5 213024 CASAVA_Build 4 102635591 1I AATCAAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1613 hom 39 4 27 8 A 11 12 213025 CASAVA_Build 4 102646462 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 21 1 17 4 T 11 10 213026 CASAVA_Build 4 102651223 1D GATGGCTTCA T/- CCACACTTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 0 213027 CASAVA_Build 4 102687412 6I ATTGAACCAG ------/TTTTGC TTTTCAAAGA 3070 hom 126 het 47 0 43 6 TTTTGC 0 1 213028 CASAVA_Build 4 102688472 3I ATAGGGAAAT ---/AGC AGGAAAAACA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AGC 0 1 213029 CASAVA_Build 4 102695036 4I ATGCTGCAAC ----/AGTT AGCGCAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGTT 0 1 213030 CASAVA_Build 4 102695545 2D TCACTCAAAT AA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 10 8 213031 CASAVA_Build 4 102696259 1D GTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 A 10 9 213032 CASAVA_Build 4 102696563 2I TATTTTCAGT --/AG ACAGGATTTC 3070 hom 54 het 21 0 19 6 AG 0 1 213033 CASAVA_Build 4 102696791 6D47M34D AAGACTTGAA AAAAATAAAAATCAGAAATCACCAAAACAGTATTAAAAGAGTACAAATATATATAGAATAATATATTAGAATCTAATAATAATATAT/------AAAGATCAGAAATCACCAAAACAGTATTAAAAGAGTACAAATATATA---------------------------------- TAGAATAATC 3070 hom 72 het 20 0 25 8 N/A 0 0 213034 CASAVA_Build 4 102700312 1D ATGTAGAGTC A/- AAAAAATCTA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 7 6 213035 CASAVA_Build 4 102701086 1I AAGAAAGGAC -/T TTTGCTTTTT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 3 4 213036 CASAVA_Build 4 102706143 1D CAAAGCCTCC A/- AAAAAATTGG 2411 hom 12 het 5 0 5 1 A 7 6 213037 CASAVA_Build 4 102715953 1D ATAGGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 T 11 10 213038 CASAVA_Build 4 102719096 2D TCGGCCTCCC AA/-- AGTGTTGGGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 1 213039 CASAVA_Build 4 102719700 1I TTATTGGGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 9 10 213040 CASAVA_Build 4 102721417 1D AGTTTGGTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 9 8 213041 CASAVA_Build 4 102725404 1I GAAAATAAAA -/C ATTTTAAACC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 C 0 1 213042 CASAVA_Build 4 102751965 1D CCAAAAAAAA C/- AAACAGTATT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 C 1 0 213043 CASAVA_Build 4 102757705 2D TTTTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 11 9 213044 CASAVA_Build 4 102763156 1D AGCTAGGGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 A 9 8 213045 CASAVA_Build 4 102777823 1D CCCCCAAATT C/- TAAGGAAAAA 3070 hom 126 het 44 0 42 2 C 1 0 213046 CASAVA_Build 4 102780421 2D TGTGAACCAC TG/-- TGCCTGGCTA 3070 hom 78 het 28 0 25 3 TG 2 1 213047 CASAVA_Build 4 102781671 1D AAATATTTTG A/- AAAATGTGAT 3070 hom 141 het 50 0 47 4 A 5 4 213048 CASAVA_Build 4 102786010 2I CGGAGATAAC --/AG AGAGATTCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AG 2 3 213049 CASAVA_Build 4 102793292 1D CCTATGAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 196 hom 43 1 38 4 T 9 8 213050 CASAVA_Build 4 102826901 2I TTAACTGTGC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 10 29 6 T 9 11 213051 CASAVA_Build 4 102827657 3D TCTCCCTGCA ATG/--- ATGGTTGCTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 8 ATG 2 1 213052 CASAVA_Build 4 102828480 6I AAGGGAATAA ------/TCCTTC TCCCATGTGC 3070 het 3070 hom 50 17 25 8 TCCTTC 0 1 213053 CASAVA_Build 4 102828978 1I TCTATGGTTA -/T TATTTTTCAG 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 1 2 213054 CASAVA_Build 4 102837240 3D GCCTAGAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 14 9 A 13 10 213055 CASAVA_Build 4 102840429 1D75M3I ACTAAGGAAG AAAAAAAACTGCCTATGAAACCATGATATTCCATCAATGTTTAGATAAACCTAGGTTCTATAGATGTTAAAATGTG---/-AAAAAAACTGCCTATGAAACCATGATATTCCATCAATGTTTAGATAAACCTAGGTTCTATAGATGTTAAAATGTGAAA AAAAATTCAT 3070 het 3070 ref 30 21 18 19 N/A 0 0 213056 CASAVA_Build 4 102844577 1I ATTAATTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 T 8 9 213057 CASAVA_Build 4 102856960 4D ACCTGAAAAG AAAC/---- AAACAGTCTG 3070 het 3070 ref 28 15 13 2 AAAC 2 1 213058 CASAVA_Build 4 102866106 2I TGCTACTGAC --/AT ATAGCAGGTA 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 AT 1 2 213059 CASAVA_Build 4 102885971 1D AATTTATGAT G/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 G 1 0 213060 CASAVA_Build 4 102887828 1I GTGTGTAGAG -/C TTTTATTATT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 0 1 213061 CASAVA_Build 4 102904828 1D AATTTTTTTT G/- CAACTTTTAG 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 G 1 0 213062 CASAVA_Build 4 102908041 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 T 11 10 213063 CASAVA_Build 4 102910739 1I TTAGAATATA -/G TTACATGTGC 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 G 0 1 213064 CASAVA_Build 4 102918245 1D CATGCCACAC T/- TTTTTTTTTT 1691 het 1691 ref 41 22 6 13 T 17 16 213065 CASAVA_Build 4 102918359 5I TTTTCCAGAA -----/GCCTT GCATACAGGG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 GCCTT 0 1 213066 CASAVA_Build 4 102935022 1I TCAATGCTTT -/G TGATCTTTTA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 G 0 1 213067 CASAVA_Build 4 102935242 1D ATATGCCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 38 0 16 22 T 10 9 213068 CASAVA_Build 4 102935538 2D AATAATTCAC TG/-- TGTTCTTTTA 3070 het 3070 ref 43 24 17 3 TG 2 1 213069 CASAVA_Build 4 102944347 4I GTCACAAAAA ----/CACT TACAGACCAT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 CACT 0 1 213070 CASAVA_Build 4 102946532 1I TGTTTAAAAA -/C AAAATAAAAA 3070 hom 66 het 34 0 23 11 C 0 1 213071 CASAVA_Build 4 102955967 5D TGTCACACTC TTGTT/----- TTTTATAGTC 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 TTGTT 1 0 213072 CASAVA_Build 4 102957880 1D AGTTGGAAAT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 A 8 7 213073 CASAVA_Build 4 102968324 1I ATTTACTTCA -/T TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 5 6 213074 CASAVA_Build 4 102968564 14D TGAGTGAATT TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 het 950 hom 21 4 12 9 TA 13 6 213075 CASAVA_Build 4 102970425 3D TTTTTATTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 T 13 10 213076 CASAVA_Build 4 102974823 1D AGATCAGTAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 9 8 213077 CASAVA_Build 4 102996566 4D CTCAGAACTT AAAG/---- GAAGGAGATC 3070 het 3070 hom 45 12 27 7 AAAG 1 0 213078 CASAVA_Build 4 103000603 1D CCTGACTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1830 hom 25 5 12 8 T 10 9 213079 CASAVA_Build 4 103007659 1I GAAAGAGCAT -/C AGAGAATAAA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 C 0 1 213080 CASAVA_Build 4 103013297 1D TACTCAGCCA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 8 7 213081 CASAVA_Build 4 103015388 2D GGTGTGGTGC AG/-- AGACTGTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 20 3 AG 2 1 213082 CASAVA_Build 4 103019172 1I TGCCTATGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 9 10 213083 CASAVA_Build 4 103034647 1I CAAAAATATC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 7 8 213084 CASAVA_Build 4 103041943 1D TTGTTTTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 0 213085 CASAVA_Build 4 103051720 1D AATTCCCAGT C/- CCTAGAAGAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 C 3 2 213086 CASAVA_Build 4 103060973 1I GTGATTTGGG -/A TCATCACTAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 0 1 213087 CASAVA_Build 4 103064532 1I ATTCTCAGAT -/A GTCACAGCCG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 0 1 213088 CASAVA_Build 4 103065284 3I AAGGGAATCT ---/TAG TGTTTTTGGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAG 0 1 213089 CASAVA_Build 4 103069368 1D CATAATAATT C/- CCAAATATTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 3 2 213090 CASAVA_Build 4 103076367 2I AATATATATG --/AT ATATATATAT 3052 het 1505 hom 15 4 9 2 AT 5 6 213091 CASAVA_Build 4 103080431 1I TCTAAGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 10 11 213092 CASAVA_Build 4 103092051 1I TTTATAAAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 A 8 9 213093 CASAVA_Build 4 103098238 1D GTGTTAGCCA G/- GATGGTCTCG 3027 het 3027 ref 17 8 7 3 G 2 1 213094 CASAVA_Build 4 103098603 1D CTACAAACAC T/- TTTTTTTTTT 1344 hom 16 het 14 0 4 10 T 13 12 213095 CASAVA_Build 4 103099325 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2397 het 2397 ref 25 11 9 5 T 10 11 213096 CASAVA_Build 4 103105520 1D CCACCTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3024 hom 27 10 10 8 A 13 12 213097 CASAVA_Build 4 103127177 1D AGAACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 11 10 213098 CASAVA_Build 4 103150282 1D CGTCTCTACT A/- AAAATACAAA 2921 hom 18 het 7 0 7 0 A 5 4 213099 CASAVA_Build 4 103152583 1I AATAAAAAAT -/C AACTCTCTTA 3070 hom 108 het 45 0 34 11 C 0 1 213100 CASAVA_Build 4 103161340 1I AAAGATATAG -/A AATGTTCAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 2 3 213101 CASAVA_Build 4 103161789 2I TTTTCCATGT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 TA 6 7 213102 CASAVA_Build 4 103174213 1D ACATCTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 9 22 11 T 10 9 213103 CASAVA_Build 4 103187613 1D AAGATAGATC T/- TTTTTAAGTC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 6 5 213104 CASAVA_Build 4 103191003 2I ATGAAAGAAC --/AT ATTTATTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 AT 1 2 213105 CASAVA_Build 4 103197567 1I TCTTAAGCAA -/G GGTCTGCTCT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 G 2 3 213106 CASAVA_Build 4 103201937 1D TTTAATCTTG T/- TTTTAGGAAG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 5 4 213107 CASAVA_Build 4 103213418 2D TGCATATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 2143 hom 24 9 12 4 TA 7 6 213108 CASAVA_Build 4 103219012 10I CTTTTTGAAA ----------/AAGGTAACAT ATATGCAAGC 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 AAGGTAACAT 0 1 213109 CASAVA_Build 4 103220975 1I GATAAATACC -/A GGGGGCAGAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 0 1 213110 CASAVA_Build 4 103221446 1D AGAGAAGATA C/- CTTTCTTTGA 3070 het 3070 hom 41 16 24 2 C 2 1 213111 CASAVA_Build 4 103242875 1I CTCTAAATTG -/A AAAGTAAAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 3 4 213112 CASAVA_Build 4 103244425 1I AATAATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 T 14 15 213113 CASAVA_Build 4 103245024 1D ATGCCACCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 A 10 9 213114 CASAVA_Build 4 103245690 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 A 11 10 213115 CASAVA_Build 4 103247888 1D ATGCTAAATG A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 A 7 6 213116 CASAVA_Build 4 103249626 1D ATTATATATG T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 213117 CASAVA_Build 4 103250199 1D AGACAGAATA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 C 9 8 213118 CASAVA_Build 4 103251479 1D ATGTAAATAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 9 8 213119 CASAVA_Build 4 103253917 1D GGGACAAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 23 11 6 T 10 9 213120 CASAVA_Build 4 103260006 1I TTTGCTCTTG -/T TTTTTCCAGT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 5 6 213121 CASAVA_Build 4 103260403 1I TGTGCTTAGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 A 7 8 213122 CASAVA_Build 4 103295875 1I GGGAGGCGGA -/G CTTGCAGTGA 2384 hom 18 het 7 0 6 1 G 0 1 213123 CASAVA_Build 4 103295962 3D ACAAACAAAC AAA/--- AAAAAAAGAT 2396 het 479 hom 17 4 9 4 A 10 7 213124 CASAVA_Build 4 103306393 3I CAGTGTGCAA ---/TAC TACTAGCCTG 3070 het 3070 hom 55 18 22 15 TAC 1 2 213125 CASAVA_Build 4 103311689 1D TATTACAGAA T/- ATGCATTATT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 1 0 213126 CASAVA_Build 4 103321266 1D CTCAGATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 25 1 13 11 A 17 16 213127 CASAVA_Build 4 103321487 1D GAAAATAAGG A/- TATCTTATAT 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 A 1 0 213128 CASAVA_Build 4 103324016 1I TGGGGACTCA -/G GGGGGAAGAG 3070 het 2993 hom 26 10 13 3 G 5 6 213129 CASAVA_Build 4 103326287 1I AGACCACGGA -/G GCTCTTCCAC 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 G 1 2 213130 CASAVA_Build 4 103327642 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 14 2 9 5 A 12 11 213131 CASAVA_Build 4 103329247 1D TGATTGTGTG T/- GTGTGTGCAT 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 T 1 0 213132 CASAVA_Build 4 103334625 1I AGAAGAGACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 66 hom 31 1 10 20 A 9 10 213133 CASAVA_Build 4 103336999 3I GTTACAAAAA ---/CTT CTAAGCAACA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 CTT 0 1 213134 CASAVA_Build 4 103355295 4D CAAGTCTGAG TATT/---- TATTATGAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 6 TATT 2 1 213135 CASAVA_Build 4 103361105 1D CAAAAGAAGA C/- ATTTATGCAG 3070 het 2594 hom 15 6 9 0 C 1 0 213136 CASAVA_Build 4 103361887 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 10 11 213137 CASAVA_Build 4 103370152 1I CACCCCCCCC -/T CACCCCTGAT 3070 het 2456 hom 30 8 13 9 T 0 1 213138 CASAVA_Build 4 103370501 1D AACAGGCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 A 10 9 213139 CASAVA_Build 4 103372493 1I GATTATGATT -/A TACTTTAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 0 1 213140 CASAVA_Build 4 103382307 1I ATCATCTGGC -/T TTTAAAGCCA 2405 het 2405 ref 20 11 6 3 T 3 4 213141 CASAVA_Build 4 103393340 1I GTCGTTTTTC -/G GGGGCGAGCG 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 G 4 5 213142 CASAVA_Build 4 103404796 3I CAGGCATTGA ---/CTT CTTCTCTCTA 3070 het 3070 hom 53 22 27 4 CTT 1 2 213143 CASAVA_Build 4 103405514 2D GTGCAGGGAG AA/-- AACACACACA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 4 2 213144 CASAVA_Build 4 103409343 1D TGGATACATT A/- AAAAAAAAAC 1312 het 1312 ref 42 35 4 3 A 10 9 213145 CASAVA_Build 4 103410400 1I CTGATATCAC -/A TACAGAGTCT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 0 1 213146 CASAVA_Build 4 103416681 1D ATTAATAGTC T/- TAACAACCAA 3070 het 3070 ref 38 25 11 2 T 2 1 213147 CASAVA_Build 4 103422799 1D ATTAAATGGT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 33 13 11 10 G 9 8 213148 CASAVA_Build 4 103425023 1I CAGGAAACTA -/T TAATGATGGC 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 T 1 2 213149 CASAVA_Build 4 103425555 4D ACTGAAATTC TCTA/---- TCTAAGAAGC 3070 het 3070 hom 37 14 21 3 TCTA 2 1 213150 CASAVA_Build 4 103436512 1D AGAAGTCATC T/- TTTTAAGTGA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 5 4 213151 CASAVA_Build 4 103437428 2I GTGTAAGGTA --/AC AGTTAACCAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 AC 0 1 213152 CASAVA_Build 4 103438974 4I TGACTTCACA ----/GAGG AAGAAAGTCA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 GAGG 0 1 213153 CASAVA_Build 4 103446697 1D ACCCACTTTC A/- ATGTATAGCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 1 213154 CASAVA_Build 4 103481254 2I TTTGCCAGCT --/GA GAGACAGTTC 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 GA 2 3 213155 CASAVA_Build 4 103494250 1I GCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 11 12 213156 CASAVA_Build 4 103495933 1I GATTTGAATC -/T TTTAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 3 4 213157 CASAVA_Build 4 103507280 1D CCTATTCAGT A/- AAATGGTGCT 3070 het 3070 ref 29 18 10 3 A 4 3 213158 CASAVA_Build 4 103524596 1D CAAACAGCCA C/- CCCAGTTTTG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 C 4 3 213159 CASAVA_Build 4 103534197 1D AGACCCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 28 1 16 11 A 15 14 213160 CASAVA_Build 4 103542492 1D AAGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 A 11 10 213161 CASAVA_Build 4 103546437 5I ACATTCATGT -----/GCTAG GCTAGGGATT 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 GCTAG 1 2 213162 CASAVA_Build 4 103560116 1I AAATGCATTT -/A AATGTCACAA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 2 3 213163 CASAVA_Build 4 103563304 1D AAAACTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3027 hom 26 7 14 5 T 11 10 213164 CASAVA_Build 4 103564593 16I GGTGGGCTTG ----------------/TGGCCCCTCTAACCAA TGGGGTGTAG 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 TGGCCCCTCTAACCAA 0 1 213165 CASAVA_Build 4 103569578 1D GAAAAAAGAT G/- GAATGAAAGA 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 G 2 1 213166 CASAVA_Build 4 103570990 4D CTCATCTGAG TTGT/---- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 13 2 TTGT 1 0 213167 CASAVA_Build 4 103573906 1D AATTACTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2098 hom 23 7 14 3 A 13 12 213168 CASAVA_Build 4 103589860 2D TATACTCATC AA/-- AGAGTTCATC 3070 het 3070 ref 51 26 21 5 A 3 1 213169 CASAVA_Build 4 103591519 1D AAAAGTTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 A 8 7 213170 CASAVA_Build 4 103597577 1I TTTCTTAAGT -/A TATGCTTCTG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 0 1 213171 CASAVA_Build 4 103608851 7D TTGCACTCCT CAGCCTC/------- CAGAAGTGTG 3070 het 3070 hom 53 22 30 3 CAGCCTC 1 0 213172 CASAVA_Build 4 103609562 4I AAATTAACAT ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 TTTA 1 2 213173 CASAVA_Build 4 103610868 1I TTTGAGACTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 7 8 213174 CASAVA_Build 4 103627132 1I AAATGGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 9 10 213175 CASAVA_Build 4 103656766 1I ATTTCCATTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 8 9 213176 CASAVA_Build 4 103665448 2D CTCAGGACAC TG/-- TGGCGAGCTT 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 TG 2 1 213177 CASAVA_Build 4 103667111 2D TCTCTTTTTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 GT 9 8 213178 CASAVA_Build 4 103677919 2I AGCCCTCTTT --/CA CAGTTTCATG 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 CA 1 2 213179 CASAVA_Build 4 103680757 1D TATCCATTTA T/- TAAGCATTTA 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 T 2 1 213180 CASAVA_Build 4 103681517 1I ACGTAGAATT -/G TCCAAGTGTA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 G 0 1 213181 CASAVA_Build 4 103701458 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 694 hom 53 6 23 25 T 14 13 213182 CASAVA_Build 4 103701488 2D GTGTGTGTGT GC/-- GCCTGATAAT 1662 het 1592 hom 47 14 17 17 GC 2 1 213183 CASAVA_Build 4 103719832 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1433 het 735 hom 6 2 3 1 A 15 14 213184 CASAVA_Build 4 103723978 3D13M9D GAAGAGTATT CTCCTATTTACAAGTAATTATCTGG/---ATGTTAACAAAAA--------- ATTGGAAACA 3070 het 3070 ref 35 21 15 5 N/A 0 0 213185 CASAVA_Build 4 103730786 1D TTGATGTTTT G/- GGGGTACCAC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 G 5 4 213186 CASAVA_Build 4 103741537 4D AAATAAAGTT AAAA/---- AAAGTTTGAA 3070 het 3070 ref 33 20 13 0 A 7 3 213187 CASAVA_Build 4 103743577 1I GTAGCTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 10 14 T 10 11 213188 CASAVA_Build 4 103748854 1D CTTTAGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 T 13 12 213189 CASAVA_Build 4 103752136 1I TCCATCATTA -/G GGTACCAGGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 2 3 213190 CASAVA_Build 4 103761744 1D GGCAAGGATG C/- CTTAAATATG 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 C 2 1 213191 CASAVA_Build 4 103765476 2I CTTTTCTCAT --/TC TGTCTTCCTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 TC 0 1 213192 CASAVA_Build 4 103767125 4I CGCATCTCCC ----/AACT AACAGGACAC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 AACT 0 1 213193 CASAVA_Build 4 103772496 1D CCTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 11 10 213194 CASAVA_Build 4 103773379 1I GAAAAGAAGC -/T TTAATAAAGC 3070 het 3070 ref 50 27 15 8 T 2 3 213195 CASAVA_Build 4 103773979 1D AGTACATAGT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 27 3 G 2 1 213196 CASAVA_Build 4 103774110 1I AGTTGTTAGG -/C CTCTTTCAAA 3070 het 3070 hom 40 14 26 0 C 1 2 213197 CASAVA_Build 4 103774694 1D GGAACCTAGT G/- GGCATGCAGG 3070 het 3070 ref 50 26 20 5 G 3 2 213198 CASAVA_Build 4 103775416 1I TGTGACTAAG -/T TAACTTCTCA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 1 2 213199 CASAVA_Build 4 103778677 1I AGTTTGAGTG -/T TCTTGTTTCC 3070 het 3070 ref 55 31 16 8 T 1 2 213200 CASAVA_Build 4 103792171 4D TTTATTATTT TTAA/---- TTGACACAAT 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 TTAA 1 0 213201 CASAVA_Build 4 103808562 3D CCATTTCTCT AAG/--- AAGCTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 16 6 AAG 2 1 213202 CASAVA_Build 4 103810360 11D ACTCCATATC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2230 het 2230 ref 29 14 7 11 A 23 12 213203 CASAVA_Build 4 103817129 1D CAGGAAAATG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 53 26 18 10 A 9 8 213204 CASAVA_Build 4 103829554 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 85 het 85 ref 5 1 1 3 A 12 11 213205 CASAVA_Build 4 103833070 1D GCTGCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1061 het 1061 ref 38 29 3 6 A 12 11 213206 CASAVA_Build 4 103850489 1I AAAAAAATTC -/T TAGGTCCGAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 1 2 213207 CASAVA_Build 4 103866303 1I AATAATTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 522 hom 35 2 23 10 A 11 12 213208 CASAVA_Build 4 103903065 11D ATTCTGTTTA TTAAGAAATAC/----------- TTAAGAAATA 3070 het 3070 ref 40 20 16 8 TTAAGAAATAC 1 0 213209 CASAVA_Build 4 103911832 1D ATCAGGGAGG A/- GGGGGTAAGA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 A 1 0 213210 CASAVA_Build 4 103917906 3D TATAAAAATA TTC/--- TTCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 TTC 2 1 213211 CASAVA_Build 4 103918242 3D ATATGAGTTC ATA/--- ATGAGTTAAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 ATA 1 0 213212 CASAVA_Build 4 103921590 5D AATTTGAATG TTAAC/----- TTATCATTGG 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 TTAAC 1 0 213213 CASAVA_Build 4 103922515 1I TGTGATTAAT -/A ATACTCCTTT 3070 het 3070 hom 47 20 18 9 A 1 2 213214 CASAVA_Build 4 103923597 1I CTGTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 1828 het 1828 ref 24 11 7 6 A 13 14 213215 CASAVA_Build 4 103923915 4D ACAAACAAAT AAAC/---- AAACAAACCG 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 AAAC 3 2 213216 CASAVA_Build 4 103924173 2I TTTAAAAATA --/TT GTTTTTAGCC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 0 2 213217 CASAVA_Build 4 103926150 19D CTCTATGTTG CCCAGGCTTGTCTCAAACT/------------------- CCCAGGCTTA 3070 het 3070 ref 28 18 11 2 CCCAGGCTTGTCTCAAACT 1 0 213218 CASAVA_Build 4 103927601 1I TTCAAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 10 11 213219 CASAVA_Build 4 103928193 2D TGTGGCTAAC TT/-- ATAAACTTTA 3070 het 3070 hom 35 10 21 7 T 2 0 213220 CASAVA_Build 4 103929354 3D TTGTATAGCC ATA/--- ATAACTTCTA 3070 het 3070 hom 45 14 28 3 ATA 2 1 213221 CASAVA_Build 4 103931257 4I GATTGCTTAG ----/AATT AATAATTATT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 AATT 0 1 213222 CASAVA_Build 4 103940405 1D11M1I12M1I11M1D ATCGCATTCA CCTTTGAGTGCC-GGTATGTGCCAG-CAACATATATGT/-CTTTGAGTGCCTGCTATGTGCCAGTCACCATATATG- GGGGTGCTGT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 N/A 0 0 213223 CASAVA_Build 4 103940476 1D5M1I11M1I33M1I TATAAATGCT CTGAAA-GGTTCTGACCG-GTTTTTTTTAAAAAAAGCAATAGTATAAAAAAG-/-TGAAATGGTTCTGACCGATTTTTTTTTAAAAAAAGCAATAGTATAAAAAAGA CACCCTTGTC 1868 hom 10 het 4 0 4 7 N/A 0 0 213224 CASAVA_Build 4 103950179 4I GAAAACAAGC ----/AAAT GAGTCCACTG 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 AAAT 0 1 213225 CASAVA_Build 4 103951603 1I CAGAGCTGTC -/T TGAGACAGAA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 T 1 2 213226 CASAVA_Build 4 103952284 5D AAAGTGGGTA CATGC/----- ACTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 23 17 7 CATGC 1 0 213227 CASAVA_Build 4 103953309 1I GTACACAAAT -/A CGGACTAAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 213228 CASAVA_Build 4 103954567 1I AGAAAATGAC -/T TTTTTTTTTG 2931 het 2931 ref 21 8 8 5 T 9 10 213229 CASAVA_Build 4 103961875 2I TGCAGCTGTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 T 9 11 213230 CASAVA_Build 4 103968011 3D CCTTTTCCTT CTC/--- CTTCTCGGAA 2647 het 1354 hom 17 6 7 4 CTC 1 0 213231 CASAVA_Build 4 103973294 1D CCTGTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2250 het 1347 hom 19 6 5 8 A 17 16 213232 CASAVA_Build 4 103976075 2D ATAAGCTAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 39 17 14 9 AT 6 5 213233 CASAVA_Build 4 103981450 1I GAACTTTAGT -/G GATACAGGTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 G 1 2 213234 CASAVA_Build 4 103983929 2D ACCTGTGGCA AG/-- AGTCCTGGAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 AG 2 1 213235 CASAVA_Build 4 103990593 1I TTGCATATAT -/G CTATATTTCA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 G 0 1 213236 CASAVA_Build 4 103992301 4D CATGTAACTA GGTT/---- TTGGCCCATG 3070 het 3070 ref 26 15 8 6 GGTT 1 0 213237 CASAVA_Build 4 103993620 2I ATCTTGAACA --/TG TGAGACAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 TG 1 2 213238 CASAVA_Build 4 104000109 1I ATTTGATTTG -/T TTTTTTTTTT 2404 het 2404 ref 22 9 9 4 T 11 12 213239 CASAVA_Build 4 104012551 4I GACCATATAC ----/TAGT TAAATACAGG 3070 het 3070 hom 50 25 19 6 TAGT 0 1 213240 CASAVA_Build 4 104014720 1D CTCTGTCTTC A/- AAAAAAAAAA 2716 het 2271 hom 31 9 10 13 A 16 15 213241 CASAVA_Build 4 104025746 2I AGGATGAAAC --/TA GACATGCTAT 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 TA 0 1 213242 CASAVA_Build 4 104028029 5I TATAATAATA -----/ATATT ATAACAATAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 ATATT 0 1 213243 CASAVA_Build 4 104028495 5D TTGTGTTTTC ACAGA/----- GATAGACTCT 3070 het 3070 ref 51 37 13 1 ACAGA 1 0 213244 CASAVA_Build 4 104028648 8D28M4I GGCTTGTGTC TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTTAAAC----/--------TGTTTGTGTGTGTGTGTGTATTTTAAACTGTT TGACTCAGTG 1857 het 1857 ref 27 32 4 19 N/A 0 0 213245 CASAVA_Build 4 104028758 1D ATTTGAAGAT C/- AATTGGTAAT 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 C 1 0 213246 CASAVA_Build 4 104029785 3I TATGTCCAAA ---/ATT ATTGTTCTTT 3070 het 3070 ref 60 35 18 7 ATT 1 2 213247 CASAVA_Build 4 104030225 1I GAATAAAGAC -/T TTTTCCCTGC 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 4 5 213248 CASAVA_Build 4 104030582 3D ACTGCGTCAC ATT/--- ATGATTGTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 8 ATT 1 0 213249 CASAVA_Build 4 104036920 2I CAAACCTGAC --/AA GAGATCATCC 2304 het 2304 ref 42 34 5 3 A 0 2 213250 CASAVA_Build 4 104041674 1D CTTCTGTCAT G/- TGAAATAATT 3070 het 3070 ref 59 45 13 1 G 1 0 213251 CASAVA_Build 4 104041932 2D AGAGGACCTA AC/-- ACAGCCTGCA 3070 het 3070 ref 55 31 12 12 AC 2 1 213252 CASAVA_Build 4 104042046 1I AGACTATTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 55 31 17 7 A 9 10 213253 CASAVA_Build 4 104043970 4I ACAACATTGT ----/TTGC TAATTGAGCA 1396 het 1396 ref 31 22 3 6 TTGC 0 1 213254 CASAVA_Build 4 104044206 1D ATAATAGAGG T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 88 70 12 6 T 8 7 213255 CASAVA_Build 4 104045077 2I AATAAAAAAC --/AT ATTTTCATAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 AT 1 2 213256 CASAVA_Build 4 104046338 1D51M1D ATTTCTAAAA CTTTTGAAAACATTTTAAGGCTATTGTCTCTTCATGTGCTTATTTTTTACATA/-TTTTGAAAGCATTTTAAGGCTGTTGTCTCTTCATGTGTTTAATTTTTACAT- AAAACAATGA 1845 het 1845 ref 32 40 4 6 N/A 0 0 213257 CASAVA_Build 4 104048783 7D TAGAAATAGA GAAGTAG/------- GATTAAATAG 2945 het 2945 ref 39 24 7 10 GAAGTAG 1 0 213258 CASAVA_Build 4 104049181 1D AGACTAAATG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 84 39 40 5 A 7 6 213259 CASAVA_Build 4 104049441 6I ATCAGTAGCC ------/CTATCA CTAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 48 37 7 4 CTATCA 0 1 213260 CASAVA_Build 4 104049903 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2229 het 2229 ref 31 15 7 9 A 13 14 213261 CASAVA_Build 4 104052745 2D CCTCCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 13 11 213262 CASAVA_Build 4 104054831 4I2M3D AGTCTGGGTG ----CACTG/GTGTCA--- GATGAATCAG 3070 het 3070 ref 29 17 9 4 N/A 0 0 213263 CASAVA_Build 4 104060330 12D TTTTCCCAAG GTCTTAGCAACT/------------ AGCAGACAAG 3070 het 3070 ref 27 14 13 7 GTCTTAGCAACT 1 0 213264 CASAVA_Build 4 104064300 3I CTCCTTAAGC ---/TGA TAAGCAACTT 2395 het 2395 ref 12 7 5 0 TGA 0 1 213265 CASAVA_Build 4 104070128 2D AGGAAGAGGA AT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 33 14 4 AT 1 0 213266 CASAVA_Build 4 104072252 1I ATATCACCTT -/G GGAATCAGAA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 G 2 3 213267 CASAVA_Build 4 104076321 1D AATAATACTC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 8 7 213268 CASAVA_Build 4 104079750 1D ACCAATAAGG A/- AAAAAAAAAA 2305 het 2305 ref 31 20 5 6 A 12 11 213269 CASAVA_Build 4 104083773 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2217 het 2217 ref 29 15 7 7 A 12 13 213270 CASAVA_Build 4 104085442 2D CTCAAATATA CT/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 53 41 10 3 CT 1 0 213271 CASAVA_Build 4 104087644 1D GAATGAGCTT G/- GGTGGGCCAG 1287 het 1287 ref 37 31 3 3 G 3 2 213272 CASAVA_Build 4 104091863 2D TATCCCTAGA AC/-- ACACTTAGTA 3070 het 3070 ref 52 31 17 5 AC 3 2 213273 CASAVA_Build 4 104091991 1D ATGAGCAAAA G/- TTAACAGATA 3070 het 3070 ref 46 37 7 3 G 1 0 213274 CASAVA_Build 4 104100810 2I TTGACTATAT --/TA TATATATATA 2523 het 2523 ref 16 7 6 3 TA 5 6 213275 CASAVA_Build 4 104113492 2I27M1I AAGATGAAAC --GTGATTTTAATTTTAAAATTAATTTTT-/TAGTGATTTTAATTTTACGATTAGTTTTTA TAATTACTTG 1305 het 1305 ref 37 39 3 3 N/A 0 0 213276 CASAVA_Build 4 104133697 1I ATTCTGCCCC -/T GGCCCCTCCC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 0 1 213277 CASAVA_Build 4 104150525 1I TAGGTCAGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 T 8 9 213278 CASAVA_Build 4 104150847 2D GATCAAGGCA CC/-- CCAGCATCTT 3070 het 3070 ref 34 20 10 6 C 4 2 213279 CASAVA_Build 4 104158310 2I GACCTTTACA --/CT GTTTTACTTC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 CT 0 1 213280 CASAVA_Build 4 104159271 1D CACCCATAGA G/- GGGGAGTGAG 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 G 5 4 213281 CASAVA_Build 4 104161769 1D ACCTTTGCTA G/- GAGTCTGTTT 3070 het 3070 ref 32 16 10 8 G 2 1 213282 CASAVA_Build 4 104162092 1I ATTTACTAAT -/A AAAAAACATT 3070 het 1633 hom 17 5 10 2 A 6 7 213283 CASAVA_Build 4 104171618 1D AAGAGAAGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 9 8 213284 CASAVA_Build 4 104227168 1D AAACAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3059 hom 37 9 20 9 A 13 12 213285 CASAVA_Build 4 104230069 1D TCTCTTGGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 9 8 213286 CASAVA_Build 4 104242952 5D TATATATATA TTTTT/----- TTTTTTTTCC 2208 het 2061 hom 24 7 7 10 T 13 8 213287 CASAVA_Build 4 104244932 1D TTCTGATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 19 10 T 11 10 213288 CASAVA_Build 4 104245887 6D CGGGCCCCTC TAAGAA/------ TATGATAAAA 3070 het 1745 hom 21 4 13 6 TAAGAA 1 0 213289 CASAVA_Build 4 104249195 4D AAGGGTAGAC TAAA/---- GACTTCACTT 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 TAAA 1 0 213290 CASAVA_Build 4 104270351 1D TAAAATAAAA T/- AAAAAACAAA 781 het 781 ref 26 14 3 10 T 1 0 213291 CASAVA_Build 4 104277802 1I CTTTCTGAGG -/A AAGGCAGTTT 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 A 2 3 213292 CASAVA_Build 4 104279658 49D4M26D3M27D GTCATATATT CTTCCCAGCACCTTGGAAAAGTTCATATCCTGTGTACATTTTGCATTTCTGATTAAAAAGTATAAAGTGAAACAAAAACATTTTCTCCCACTTATCTTGTTCACTACAG/-------------------------------------------------TGAT--------------------------ATT--------------------------- TACCTAGAAG 1373 het 1373 ref 20 30 3 4 N/A 0 0 213293 CASAVA_Build 4 104281295 3D AGATAGTGCC TTA/--- TTATTGGTGG 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 TTA 2 1 213294 CASAVA_Build 4 104284212 1D GGACACTTCA C/- CCTTCAAATC 3070 het 3070 hom 53 23 27 3 C 3 2 213295 CASAVA_Build 4 104290701 1D TCATCCTCTT A/- AAAAACTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 A 6 5 213296 CASAVA_Build 4 104292743 1I TTATGACAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 9 8 7 A 9 10 213297 CASAVA_Build 4 104304378 4D TCAAACAAAT AAAA/---- AAAAACCCCT 3070 het 3070 hom 35 13 16 10 A 9 5 213298 CASAVA_Build 4 104309855 1D GTCAGGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 10 22 8 A 12 11 213299 CASAVA_Build 4 104311665 2D AGGAAGAGAG AC/-- TGCAACACAA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 AC 1 0 213300 CASAVA_Build 4 104317906 13D CCTCAACACT TCAGGGACCCATC/------------- TCCTGGTTCT 3070 het 3070 hom 41 16 24 2 TCAGGGACCCATC 1 0 213301 CASAVA_Build 4 104323636 4I GATTAAAACT ----/ACTA ACTAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 ACTA 1 2 213302 CASAVA_Build 4 104333398 8D CCATCTTTAG GAAGACAT/-------- GAATTAGAAT 3070 het 3070 ref 47 22 18 9 GAAGACAT 1 0 213303 CASAVA_Build 4 104342197 1D TCAGACTATG A/- AAAGTTTGTC 3070 het 3070 hom 51 22 23 7 A 4 3 213304 CASAVA_Build 4 104356762 2I AGCACATTCT --/AC AGTTAATTCT 3070 hom 95 het 37 0 32 5 AC 0 1 213305 CASAVA_Build 4 104385308 1D TGCCCATACA T/- TTTTTTCGTT 3070 het 3070 ref 24 15 8 2 T 7 6 213306 CASAVA_Build 4 104389811 1D TATTTTGTTC T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 43 29 10 4 T 7 6 213307 CASAVA_Build 4 104390615 1I AAGCTTTTTT -/A TTTACAGAAT 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 A 0 1 213308 CASAVA_Build 4 104398885 1I CCAGGTCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 19 8 5 T 9 10 213309 CASAVA_Build 4 104401515 1I CAGAATGATT -/G ATGTCTAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 G 0 1 213310 CASAVA_Build 4 104425899 1D ACGGAGGGGG A/- AATGGTCCAT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 3 2 213311 CASAVA_Build 4 104444964 1D TGGTTATCTA G/- GTGTCTTCAT 3070 het 3070 ref 48 26 19 4 G 2 1 213312 CASAVA_Build 4 104453408 1D TTCTAACTGC G/- GGGGGGGATG 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 G 8 7 213313 CASAVA_Build 4 104457187 2D TGGTTGACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2979 hom 32 11 16 5 T 12 10 213314 CASAVA_Build 4 104470231 1I AAGCAGTTAC -/A GGGGCAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 A 0 1 213315 CASAVA_Build 4 104477037 4D CCTTCCTTTG TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 het 2238 hom 40 11 17 15 TTCC 5 4 213316 CASAVA_Build 4 104489011 1I TGAAAGGAAT -/A AAAAGCAAAC 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 4 5 213317 CASAVA_Build 4 104520535 1I GCAATATTTA -/C CACAAGTTGA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 C 1 2 213318 CASAVA_Build 4 104590484 1D TTGCTACAGG T/- TTTTTTTTTT 2680 het 2680 ref 43 30 6 7 T 12 11 213319 CASAVA_Build 4 104594844 1D TTCAAATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 11 10 213320 CASAVA_Build 4 104633351 4D TCAAAAAAAA AAAT/---- AAAATAAAAT 126 het 103 hom 21 3 2 17 AAAT 1 0 213321 CASAVA_Build 4 104636555 1I ATTATATAAA -/G GGGGAGTTCC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 4 5 213322 CASAVA_Build 4 104636644 1D TTGTGAGGCC T/- TCCCCAGCCA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 2 1 213323 CASAVA_Build 4 104639965 4D TCCAGTCCTC CAGT/---- CCAACCAACA 3070 hom 136 het 49 0 44 6 CAGT 1 0 213324 CASAVA_Build 4 104641386 1D TCTAGAACAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 45 0 34 12 A 9 8 213325 CASAVA_Build 4 104645452 6I GCTGCTTCTG ------/CTCCTT CTCCTTCTCC 3070 hom 76 het 41 0 23 18 CTCCTT 2 3 213326 CASAVA_Build 4 104645754 1D TATTAGGTGA C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 8 7 213327 CASAVA_Build 4 104647604 4D TACTCTAGTC ATTA/---- ATTAACAAGC 3070 het 3070 hom 45 23 21 1 ATTA 2 1 213328 CASAVA_Build 4 104657491 5I ATACATTGTA -----/AATTT AATTTAATTC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AATTT 1 2 213329 CASAVA_Build 4 104658634 5I GTAGATTCCT -----/TAGAG TATTCTTTCT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TAGAG 0 1 213330 CASAVA_Build 4 104659699 5I CTTGTCACTG -----/TTTCC TTTATTTTAG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TTTCC 0 1 213331 CASAVA_Build 4 104660632 2I CCTCTTCTGA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 11 213332 CASAVA_Build 4 104664175 4I AACACTTAAT ----/TTTC TTTCTTTCTT 2313 hom 27 het 18 0 10 8 TTTC 2 3 213333 CASAVA_Build 4 104666748 8D ATCACATGGC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 2753 het 89 hom 20 1 9 14 A 19 11 213334 CASAVA_Build 4 104667813 4D35M4D ATCCATTTTA AATTAATATTGTGTGTTCATGTATGTATAGACATACATAATAC/----AATATTGTGTGTTCATGTATGTATAGACATACATA---- ATACATATGC 3070 hom 117 het 27 0 40 5 N/A 0 0 213335 CASAVA_Build 4 104672948 1D CCTTACATGG C/- CCTAAAGCAT 3070 hom 157 het 60 0 53 7 C 3 2 213336 CASAVA_Build 4 104674709 4D CGTTTTTGAA TCTC/---- TCTCTCTCAC 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TC 6 4 213337 CASAVA_Build 4 104676002 4D TGTAAAACTT AGAG/---- AGAAAAATGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AG 3 1 213338 CASAVA_Build 4 104676671 2D TTTTTTACAC TT/-- ATTGTTACTA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 2 0 213339 CASAVA_Build 4 104677101 2D GTTGGTCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 39 0 31 9 T 13 11 213340 CASAVA_Build 4 104678438 1D TTTTTCTTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 9 8 213341 CASAVA_Build 4 104680525 1D TTTTCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 38 1 35 3 A 11 10 213342 CASAVA_Build 4 104682140 1I ATACTGGCCC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 T 8 9 213343 CASAVA_Build 4 104682490 1D TGCACATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 20 1 19 1 T 11 10 213344 CASAVA_Build 4 104684155 2D TGGAAAAAAA AT/-- AAATATGCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 1 0 213345 CASAVA_Build 4 104688713 2D ATCAGAAGAT TG/-- TCTCTCCCCG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TG 1 0 213346 CASAVA_Build 4 104691412 4I GGCTGGTCTC ----/AGTT AGGCTTACTC 3070 hom 96 het 40 0 32 8 AGTT 0 1 213347 CASAVA_Build 4 104694493 1I GAAGGGACAT -/A GGGGTGGGGC 2513 hom 24 het 10 0 7 3 A 0 1 213348 CASAVA_Build 4 104696886 1D TGTAGAGGCA G/- GGATTGAGGA 2219 het 1127 hom 15 8 5 2 G 3 2 213349 CASAVA_Build 4 104702260 5I TATATAAAAA -----/TAAAC TCAAAATAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TAAAC 0 1 213350 CASAVA_Build 4 104704590 1D AATCCAATTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 7 213351 CASAVA_Build 4 104706684 4I CACAGAAATA ----/TAAG TAACTGTCAG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TAAG 0 1 213352 CASAVA_Build 4 104719791 12I TCTTTAAATT ------------/GCAGAGGACTAA GAAATTATTT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 GCAGAGGACTAA 0 1 213353 CASAVA_Build 4 104731199 1I GCAATTAGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 10 213354 CASAVA_Build 4 104734451 1I GTTTGTTATG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 6 7 213355 CASAVA_Build 4 104734788 1I AAAAATAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 515 hom 19 2 9 8 T 13 14 213356 CASAVA_Build 4 104735526 4I TATATAATAC ----/TGTT TGTTACCTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TGTT 1 2 213357 CASAVA_Build 4 104752261 1I AAGCATTTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 8 9 213358 CASAVA_Build 4 104755353 2I TGCCAAACTC --/AT AACATACTCT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 AT 0 1 213359 CASAVA_Build 4 104756909 2I CATACGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 TG 8 9 213360 CASAVA_Build 4 104757853 4I CTACAGAAAA ----/AGTT AGTTAGTTAT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 AGTT 2 3 213361 CASAVA_Build 4 104759316 1D TACGATATTG A/- ATTCCTCCAA 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 A 2 1 213362 CASAVA_Build 4 104761508 5I TTTAAAAAAT -----/AAAAA AAAGATTCCA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 3 8 213363 CASAVA_Build 4 104766436 4I CAGAATTTGA ----/AGAT AGATAGGGCC 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 AGAT 1 2 213364 CASAVA_Build 4 104773669 2I TTTGTCCCTC --/TT TTACTGACAT 3070 het 3070 hom 29 8 18 3 T 2 4 213365 CASAVA_Build 4 104774011 4I AATTTATTTT ----/ATTA ATTATTATTT 1680 het 1680 ref 11 5 5 1 ATTA 1 2 213366 CASAVA_Build 4 104775128 1D TAATCAGAGT A/- ACAGAATGCA 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 A 2 1 213367 CASAVA_Build 4 104781035 1I ATGTAGAGAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 8 9 213368 CASAVA_Build 4 104782949 1D30M1D TTTGTCAATT AAAAAATGAGTAAAAATAGAAAAAATGTTGCT/-AAAAATGAGTAAAAATAGAAAAAATGTTGC- TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 17 15 12 1 N/A 0 0 213369 CASAVA_Build 4 104786084 1D CCACAGGAAA T/- TTGACATTTA 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 T 3 2 213370 CASAVA_Build 4 104790127 1D TGCTTCATTG T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 7 6 213371 CASAVA_Build 4 104797830 4D CAGTGTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 177 het 177 ref 29 16 3 13 TTTG 1 0 213372 CASAVA_Build 4 104887696 1D AATATGCAAA T/- CGAAGGTAAA 2806 het 1851 hom 11 4 6 1 T 1 0 213373 CASAVA_Build 4 104913239 1I ATTCTTAGAT -/C CCCCCTACTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 C 5 6 213374 CASAVA_Build 4 104936135 1I GCAGATTGTA -/T GTACATATAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 0 1 213375 CASAVA_Build 4 104957580 1D GTGTAACTTC T/- TTTTTTTTTT 2335 het 841 hom 16 3 6 7 T 13 12 213376 CASAVA_Build 4 104961848 1D CAATCCCGTT C/- ATCACCAACC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 C 1 0 213377 CASAVA_Build 4 104964058 1D CCATAGGTGA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 39 hom 20 2 9 10 T 9 8 213378 CASAVA_Build 4 104965091 2I CTTTCATGAT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TC 0 1 213379 CASAVA_Build 4 104965864 3D TACAATTGTA CTT/--- CTTCTCTCTA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 CTT 2 1 213380 CASAVA_Build 4 104982728 1D AAAGAGGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 10 9 213381 CASAVA_Build 4 104997303 2D GCACAGACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 48 het 26 0 17 10 AC 8 7 213382 CASAVA_Build 4 104999444 1I GGTCGAACTC -/A AGAGTTCATG 3070 het 2785 hom 21 7 13 1 A 1 2 213383 CASAVA_Build 4 105006458 1D TTTGCCAGTA T/- TTTGTTGAGG 3070 het 3070 ref 41 22 13 7 T 4 3 213384 CASAVA_Build 4 105016664 2D AGAGAGTGGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 26 9 11 7 TA 7 6 213385 CASAVA_Build 4 105022341 9I TATAAATAAA ---------/TTTATTTAT TTATTGATTG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 TTTATTTAT 0 1 213386 CASAVA_Build 4 105025140 1D ATAATAATTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 9 8 213387 CASAVA_Build 4 105025796 1I AACATTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 10 11 213388 CASAVA_Build 4 105029259 3D CATGTGAAAC ATA/--- ATGAGTGCAA 3070 het 3070 ref 20 9 9 3 ATA 1 0 213389 CASAVA_Build 4 105031583 2I TGCCTCAGTG --/AT ATACATCTTG 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 AT 1 2 213390 CASAVA_Build 4 105031896 4D TCTTAGTATT GCTA/---- GCTGACTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 16 5 GCTA 1 0 213391 CASAVA_Build 4 105047021 1I TATCAACAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 8 9 213392 CASAVA_Build 4 105050941 3D AGGATGCAGC TAT/--- AATAAGGTGT 3070 het 3070 hom 45 16 23 7 TAT 1 0 213393 CASAVA_Build 4 105056612 1D TAAAGTATAT G/- TGAGGATGTG 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 G 1 0 213394 CASAVA_Build 4 105056986 1D TATTTGAAAG T/- TTTTTATGAA 3070 het 3070 ref 41 23 15 6 T 6 5 213395 CASAVA_Build 4 105058711 1D AGCCACCATA T/- TTTTTTTAAT 2796 het 2796 ref 19 11 6 2 T 8 7 213396 CASAVA_Build 4 105079403 5D AGAGAGGAGA GGAGG/----- GGAGGGGAGG 1659 het 443 hom 17 4 7 6 GGAGG 3 2 213397 CASAVA_Build 4 105088834 1D TTTCAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 15 9 T 11 10 213398 CASAVA_Build 4 105095914 4I TGGTGCATCT ----/TAAA TAATTAGAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TAAA 0 1 213399 CASAVA_Build 4 105099817 1I GGTCGGTGGG -/A ATGTTAATTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 1 2 213400 CASAVA_Build 4 105100363 1D ATAAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 37 1 28 8 A 11 10 213401 CASAVA_Build 4 105107733 2I TAATGTGTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 32 0 24 8 T 10 12 213402 CASAVA_Build 4 105108804 1D TTTTTTCCCC T/- TTTTTTTTTG 1168 het 1168 ref 37 27 3 7 T 10 9 213403 CASAVA_Build 4 105116392 1D AAAAATGTGG A/- AGTGACTTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 1 213404 CASAVA_Build 4 105119305 1D AGAACTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 38 2 29 7 A 12 11 213405 CASAVA_Build 4 105126350 1D AAAAAAAAAA C/- AGAGAGATAA 2750 het 2750 ref 25 13 9 4 C 1 0 213406 CASAVA_Build 4 105130581 1I GATTTACTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 412 hom 39 1 29 9 T 9 10 213407 CASAVA_Build 4 105134638 1I TGGTAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 10 11 213408 CASAVA_Build 4 105135197 1I ATTGTGAAAG -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 6 7 213409 CASAVA_Build 4 105248601 1I ACAGAACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 10 11 10 A 10 11 213410 CASAVA_Build 4 105291093 1D TAAAGAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 12 11 213411 CASAVA_Build 4 105291764 2I TGTGACAAAC --/TT CTCTCTCTTT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 0 2 213412 CASAVA_Build 4 105308138 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 38 0 29 10 A 10 9 213413 CASAVA_Build 4 105316278 7D AACCTTGTGA AAAAGGT/------- AAAAGGTGCC 3070 hom 138 het 52 0 44 10 AAAAGGT 2 1 213414 CASAVA_Build 4 105318310 1D CACAGTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 248 hom 39 1 27 11 A 14 13 213415 CASAVA_Build 4 105332601 3I6M3I ATCCTCACCC ---TTCTGA---/TCATCCTCACCC GTCTCCATTG 3070 hom 132 het 48 0 43 7 N/A 0 0 213416 CASAVA_Build 4 105336823 4D TAGTCATGTA ACTT/---- ACTTGTTTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 8 ACTT 2 1 213417 CASAVA_Build 4 105349208 1D ACCACAGAGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 6 213418 CASAVA_Build 4 105361819 4D GAGAGGTTAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 28 het 32 1 23 10 AC 11 9 213419 CASAVA_Build 4 105367013 2D AAATATTAAT TC/-- TGTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TC 1 0 213420 CASAVA_Build 4 105367659 10D CAGAATGTGG TATCCCCCTT/---------- TATGGCTTTG 3070 hom 111 het 40 0 37 6 TATCCCCCTT 1 0 213421 CASAVA_Build 4 105372819 3I TTTAACTCAT ---/TAG TAGTTCTTTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TAG 1 2 213422 CASAVA_Build 4 105386528 3D GGTCAATGTT TTC/--- TTTTTTCATT 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TTC 1 0 213423 CASAVA_Build 4 105390772 4I ATAGGAAAAG ----/AAGA AAGATCCAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAGA 1 2 213424 CASAVA_Build 4 105391460 2I AACATTCTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 38 1 30 7 A 13 15 213425 CASAVA_Build 4 105395241 1I CTAGTAAGAA -/C CACATAGCAC 3070 hom 51 het 24 0 18 6 C 1 2 213426 CASAVA_Build 4 105398063 1I AAAAAATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 22 10 T 11 12 213427 CASAVA_Build 4 105407824 1D AGAGAAACTT C/- CCCAATATTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 4 3 213428 CASAVA_Build 4 105414036 1D TACACATTTG A/- AAAAAGGCAA 3070 hom 175 het 61 0 59 2 A 6 5 213429 CASAVA_Build 4 105435297 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 10 9 213430 CASAVA_Build 4 105439652 1D CAAGAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 12 11 213431 CASAVA_Build 4 105455170 1I CTGGGCAACA -/G AGTGAGACTC 3070 hom 42 het 16 0 14 2 G 0 1 213432 CASAVA_Build 4 105491059 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 192 hom 31 1 23 7 T 14 13 213433 CASAVA_Build 4 105493402 1D AAAAGAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 24 10 A 13 12 213434 CASAVA_Build 4 105504776 2D CTCCGCCCTC CT/-- CTCTCTCTCT 1168 het 1168 ref 36 28 3 6 CT 6 5 213435 CASAVA_Build 4 105509994 1D38M1D CCATTATTTG AAAAAATAAACTTAGCCCTGTGTTCTAAGGTTGGATTTTA/-AAAAATAAACTTAGCCCTGTGTTCTAAGGTTGGATTTT- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 26 0 34 1 N/A 0 0 213436 CASAVA_Build 4 105510176 3D TTATTTTTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 14 11 213437 CASAVA_Build 4 105530751 7D TATATATTTC TTTTTCT/------- TTTTTCTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TTTTTCT 2 1 213438 CASAVA_Build 4 105531376 1I ACCCAAATAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 8 213439 CASAVA_Build 4 105537445 3D ACAAAGTAAA TAG/--- TAGTCTGTAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TAG 2 1 213440 CASAVA_Build 4 105538747 2D CCCTCTCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 36 2 15 19 A 18 16 213441 CASAVA_Build 4 105541957 2D AGTTAAACTC TT/-- TTTATCCACG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 5 3 213442 CASAVA_Build 4 105546633 1D AGAAATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 26 0 21 5 A 13 12 213443 CASAVA_Build 4 105562905 1I TTTGTATTTA -/C CTTGCCCTGT 3070 hom 132 het 47 0 42 5 C 1 2 213444 CASAVA_Build 4 105598290 1I CAAATGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 10 11 213445 CASAVA_Build 4 105599246 3D TTAGGTACAT CGG/--- CTTTTCTTGG 3070 hom 119 het 45 0 40 6 CGG 1 0 213446 CASAVA_Build 4 105608541 1D TCATGGTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 407 hom 34 1 29 5 A 10 9 213447 CASAVA_Build 4 105609000 1I TTTTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 37 2 21 14 T 15 16 213448 CASAVA_Build 4 105614397 3I TCTTAAAACA ---/TTG TTAATAGCAC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TTG 0 1 213449 CASAVA_Build 4 105638572 3D CATGATCATC ATT/--- GTTATCCAGA 3070 het 3070 ref 51 36 12 4 ATT 1 0 213450 CASAVA_Build 4 105644975 1D TTGAAACTTA T/- CTCATGTTCA 3070 het 3070 ref 41 17 17 8 T 1 0 213451 CASAVA_Build 4 105665787 1I GCCTGACAGG -/C CCCCCCATCA 3070 hom 106 het 40 0 36 4 C 6 7 213452 CASAVA_Build 4 105669875 4I CCAAGGACAG ----/AATC AATCACGGAT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 AATC 1 2 213453 CASAVA_Build 4 105670308 1I GAACAAACCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 48 21 17 10 T 8 9 213454 CASAVA_Build 4 105677211 1D CATTCATCAA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 T 8 7 213455 CASAVA_Build 4 105683084 3I ACCAGTTGAG ---/AGA AGAACATAAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 AGA 1 2 213456 CASAVA_Build 4 105692233 1I CTTTACAAAA -/C ATCAAAAGGG 3070 hom 126 het 52 0 42 10 C 0 1 213457 CASAVA_Build 4 105701965 1I CATTGTTAAG -/T TGAATATTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 1 2 213458 CASAVA_Build 4 105717387 1D TTTTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 40 1 33 7 A 11 10 213459 CASAVA_Build 4 105717939 5D ATATAAAAAA TACTT/----- TAGTTCTTTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TACTT 1 0 213460 CASAVA_Build 4 105725706 2D AATTTTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 AT 6 5 213461 CASAVA_Build 4 105726955 1D AATTATTCAT A/- GAAAACACAT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 A 1 0 213462 CASAVA_Build 4 105727711 3D CAATGGCCAT ATA/--- ATAATTTTTG 3070 hom 117 het 42 0 38 4 ATA 2 1 213463 CASAVA_Build 4 105728164 4I GATTCCCAAT ----/CAAA CCTTTTAATG 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 CAAA 0 1 213464 CASAVA_Build 4 105728555 3D TATGTTCTTC TCT/--- TCTTATTTCT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 TCT 2 1 213465 CASAVA_Build 4 105729426 4I TATTCCCTTG ----/TAAT TAATTCTGTT 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 TAAT 1 2 213466 CASAVA_Build 4 105731841 1D TTCACAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 13 12 213467 CASAVA_Build 4 105742636 13D TTATTTCTTC CTTTCTTTCTTTT/------------- CTTTCTTTCT 2443 het 1289 hom 16 3 6 11 CTTTCTTTCTTTT 2 1 213468 CASAVA_Build 4 105744084 3D GCTTAGTTTG TTC/--- TTCTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 TTC 2 1 213469 CASAVA_Build 4 105744623 1D TGGAATGTTC T/- TTGTGTGTCT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 3 2 213470 CASAVA_Build 4 105748106 1I CAAAAGCCAC -/A AAAATCTGGC 3070 het 3070 hom 56 26 26 4 A 4 5 213471 CASAVA_Build 4 105750895 1D TCTTGGCTAT A/- AGGAATAGTT 3070 het 3070 ref 54 30 20 4 A 2 1 213472 CASAVA_Build 4 105751961 1I TTGAGATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 T 9 10 213473 CASAVA_Build 4 105755583 4D CTTTGGGAGT TTGA/---- TTATTAAATG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TTGA 1 0 213474 CASAVA_Build 4 105762864 2I TATTAGTCCA --/TT TTTTCATGCT 2178 het 2178 ref 14 8 5 3 T 4 6 213475 CASAVA_Build 4 105769477 1D ACATTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 12 11 213476 CASAVA_Build 4 105770905 1D CTAAAACTGT A/- AAAAAAAAAA 2660 het 2660 ref 25 8 8 9 A 15 14 213477 CASAVA_Build 4 105771668 1D TATTTTTTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 135 hom 28 2 17 9 A 9 8 213478 CASAVA_Build 4 105776617 1D TTTGATCTCA T/- TTTTCCCCCT 3070 het 3070 hom 31 16 14 1 T 5 4 213479 CASAVA_Build 4 105782439 1I ATACAATGGG -/A AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 A 6 7 213480 CASAVA_Build 4 105784287 1D GAAAAATTCA T/- TTAGACTAAC 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 T 3 2 213481 CASAVA_Build 4 105790142 1D GCTTAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 9 8 213482 CASAVA_Build 4 105795521 1D GGCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 20 18 12 A 10 9 213483 CASAVA_Build 4 105797026 2I GATTTGTACA --/CT CTGTGTATTA 3070 hom 135 het 49 0 44 5 CT 1 2 213484 CASAVA_Build 4 105805433 1D ACTACATGTG C/- AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 55 29 21 5 C 1 0 213485 CASAVA_Build 4 105814152 1I GGTCTATCAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 82 het 31 0 28 3 T 7 8 213486 CASAVA_Build 4 105821920 1I GGGAGATAAA -/G GTGAGACTCC 2655 het 470 hom 16 3 8 5 G 1 2 213487 CASAVA_Build 4 105823430 1I TTAGTTTCCA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 8 213488 CASAVA_Build 4 105825355 1I TCATTTCTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 9 213489 CASAVA_Build 4 105840462 1D CTGAGATCCT G/- ATGTCTATGT 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 G 1 0 213490 CASAVA_Build 4 105848471 1I ACATTAAGGA -/C CCAAAGGTAG 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 2 3 213491 CASAVA_Build 4 105854257 1I TGTGTGTGAA -/G TAGAGCTATG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 0 1 213492 CASAVA_Build 4 105861069 1D TCATAAAAGT G/- TACACCAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 15 6 G 1 0 213493 CASAVA_Build 4 105871574 4D GGAAGTAAAT AAAC/---- AATATCTAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 AAAC 1 0 213494 CASAVA_Build 4 105873070 1D TCCCCCCCTG A/- AAAAAATCTT 3070 hom 71 het 30 0 24 7 A 7 6 213495 CASAVA_Build 4 105892503 1D CACACACATA C/- CCCCCAAAAA 3070 hom 117 het 46 0 40 8 C 6 5 213496 CASAVA_Build 4 105903421 1I CCTCTAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 T 9 10 213497 CASAVA_Build 4 105913347 1I TACTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 27 0 21 6 A 10 11 213498 CASAVA_Build 4 105919779 4I CATTCTTGCC ----/GTAT ATACAGTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 GTAT 0 1 213499 CASAVA_Build 4 105955072 2D AGATGTAGAG AA/-- ATAGGAATGC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 3 1 213500 CASAVA_Build 4 105984384 1D CTAAAACTAC A/- AAAAAAAAAA 2413 het 2304 hom 23 10 5 8 A 17 16 213501 CASAVA_Build 4 106001579 1D TTTTTTGTAC A/- GAGCTTAATC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 1 0 213502 CASAVA_Build 4 106011860 2D TATCTGTAAG TA/-- TGTTTCTGCA 3070 het 3070 ref 41 25 14 3 TA 1 0 213503 CASAVA_Build 4 106014098 3I GGATTCATAT ---/AAG AAGCCGGCTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 AAG 1 2 213504 CASAVA_Build 4 106019908 5D CTTTTACCAG ATTTT/----- ATTTCTATTA 3070 het 3070 hom 31 13 18 3 ATTTT 1 0 213505 CASAVA_Build 4 106033143 1D TGGGAAAGTT C/- TTCTGGACAT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 C 1 0 213506 CASAVA_Build 4 106047724 2D ACCGACACAG AC/-- ACACACACAC 2078 het 2078 ref 56 39 5 12 AC 7 6 213507 CASAVA_Build 4 106049181 1I ATAAAAGATA -/G TAAGTGTTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 213508 CASAVA_Build 4 106060830 1D TGATGAACTG A/- AAAAAAAAAA 940 het 940 ref 49 38 3 9 A 12 11 213509 CASAVA_Build 4 106146941 1I TTACTATTAC -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 A 6 7 213510 CASAVA_Build 4 106173562 1D ACAAATTTAC A/- AAAAAAAAAA 2680 het 567 hom 17 4 8 5 A 12 11 213511 CASAVA_Build 4 106191826 1I CAACTGAAGG -/A AAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 6 7 213512 CASAVA_Build 4 106196328 2I AATGATGAGA --/AC ACATGGACAC 3070 hom 114 het 46 0 37 9 AC 1 2 213513 CASAVA_Build 4 106201526 1I ACTCCACAGT -/G GAGGTCTGCC 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 G 1 2 213514 CASAVA_Build 4 106213862 1I GGTTATCTTT -/A GTTGCAAGAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 0 1 213515 CASAVA_Build 4 106240130 1I TTCTAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 13 14 213516 CASAVA_Build 4 106240967 1D TTTTTGTGTG T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 8 7 213517 CASAVA_Build 4 106241265 1D ATGATAATAG A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 A 7 6 213518 CASAVA_Build 4 106241327 4D GGCAAAGGAC ACAA/---- ACAGACACTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 7 ACAA 1 0 213519 CASAVA_Build 4 106247802 1D GTAACCAGAG A/- AATGGTTCTA 3070 het 3070 ref 37 21 13 4 A 3 2 213520 CASAVA_Build 4 106252709 1D ATGCTATACC T/- TAATTCTTTG 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 T 2 1 213521 CASAVA_Build 4 106253956 4D TATGTTAATG ATAA/---- ATAGTCTGAG 3070 het 3070 ref 27 18 7 3 ATAA 1 0 213522 CASAVA_Build 4 106254021 2I AGTATGTAGG --/TT TTATATATAT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 2 4 213523 CASAVA_Build 4 106254608 1I GCCTGTGGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 8 9 213524 CASAVA_Build 4 106263177 1I AGCCCAGGGT -/A AGCCCTTGGC 3070 hom 105 het 37 0 34 3 A 1 2 213525 CASAVA_Build 4 106263552 4D TAATATTTAT TTGC/---- TTGCTTGCTT 3070 het 2953 hom 27 8 16 5 TTGC 4 3 213526 CASAVA_Build 4 106270415 1I AGGACAAGGG -/C CGAAAGGGCT 3070 hom 100 het 38 0 29 9 C 1 2 213527 CASAVA_Build 4 106274302 1D GTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2229 het 273 hom 20 3 8 9 T 17 16 213528 CASAVA_Build 4 106277635 1I CACTTTTCTC -/T TGACTTACCA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 1 2 213529 CASAVA_Build 4 106277872 3I GTGTCATTCT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 TTC 0 1 213530 CASAVA_Build 4 106284076 1I AGTACAACAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 511 hom 22 2 17 3 A 8 9 213531 CASAVA_Build 4 106288480 1I CGCAGCGTTG -/A GAGTTGCAAG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 0 1 213532 CASAVA_Build 4 106297794 3D ATTATTAAAA TAT/--- TAATTCATTT 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 TAT 1 0 213533 CASAVA_Build 4 106300610 1I CTCCGTCTCA -/G GAAAAAAAAA 2689 het 2310 hom 14 7 6 1 G 1 2 213534 CASAVA_Build 4 106321070 7D TATTGAGTTC TTTTAAG/------- TTTTATCTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 TTTTAAG 1 0 213535 CASAVA_Build 4 106321249 1D CATTTTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 T 13 12 213536 CASAVA_Build 4 106335664 1I CTGTATAGCA -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 6 7 213537 CASAVA_Build 4 106351670 1D GTTCACTGAG A/- ACTAACTAGA 3070 het 3070 hom 58 26 30 2 A 2 1 213538 CASAVA_Build 4 106357023 1I TTCATCGTAA -/T TTCAGTGCTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 2 3 213539 CASAVA_Build 4 106362306 1D GTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTAT 2324 het 899 hom 11 3 6 2 T 9 8 213540 CASAVA_Build 4 106366684 1I GCCAAAATAC -/T TTGTTTTTTA 3070 het 87 hom 43 1 39 3 T 2 3 213541 CASAVA_Build 4 106382545 1D TACAGCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 42 1 17 24 T 15 14 213542 CASAVA_Build 4 106382674 3D CTCTGAGCTG TTC/--- TTCTTCTAGG 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 TTC 3 2 213543 CASAVA_Build 4 106386882 1I TCTGACATAT -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 6 7 213544 CASAVA_Build 4 106388249 5D GGTTCTTTTG TTTAC/----- TTTAACCTAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 3 TTTAC 1 0 213545 CASAVA_Build 4 106394153 2D TTAGATCCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 13 11 213546 CASAVA_Build 4 106411281 6D AGATACATGT TATATA/------ TATATATATA 3070 het 78 hom 22 2 11 9 TA 12 9 213547 CASAVA_Build 4 106417445 4D TAAATGTGAT CCCC/---- CCCCCCCGCT 3070 hom 16 het 23 1 16 7 C 11 7 213548 CASAVA_Build 4 106428352 1D TGGCAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 T 11 10 213549 CASAVA_Build 4 106440252 4D AATATGAGAT CAAC/---- AATACAGAAA 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 CAAC 1 0 213550 CASAVA_Build 4 106445581 2D TACAGGATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2631 hom 37 12 21 6 A 13 11 213551 CASAVA_Build 4 106464750 5I CCATGGAATA -----/CTATG CAGCCATAAA 1917 het 1917 ref 21 16 4 1 CTATG 0 1 213552 CASAVA_Build 4 106480209 2D CCGTACTATT TC/-- TGTTTTACTA 3070 het 3070 ref 44 22 20 3 TC 1 0 213553 CASAVA_Build 4 106480745 4D25M4I GCATTGTGTG TATATATAACACATTTCCTTCATTCATTC----/----TATAACACATTTCCTTCATCCATTCATCT ATTGATGGAC 3070 hom 56 het 29 1 29 3 N/A 0 0 213554 CASAVA_Build 4 106483959 1D TTTCAAGCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 10 9 213555 CASAVA_Build 4 106495642 1I AATGTGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 12 12 11 T 13 14 213556 CASAVA_Build 4 106495812 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 1958 hom 24 5 13 6 T 8 9 213557 CASAVA_Build 4 106510279 16I GTCTCTAGCA ----------------/CTTGGGGAAAAAGAGT CTTGGAGTCC 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 CTTGGGGAAAAAGAGT 0 1 213558 CASAVA_Build 4 106521353 1D TTGTTTTCAT A/- AAAAATATGT 3070 het 3070 hom 46 16 26 4 A 6 5 213559 CASAVA_Build 4 106522614 1D TATAATTTTC T/- TTAATTTCTG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 3 2 213560 CASAVA_Build 4 106523611 1D CCTGTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 9 8 213561 CASAVA_Build 4 106524509 1I ATTAAAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 40 1 30 9 A 10 11 213562 CASAVA_Build 4 106531072 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAA 2513 het 1688 hom 13 5 7 1 A 10 11 213563 CASAVA_Build 4 106532490 4D AATAAAAAAA GAGT/---- ATGAGTAAAG 3070 het 3070 hom 39 20 17 3 GAGT 1 0 213564 CASAVA_Build 4 106542047 5D TTTTATTGTG ATAAA/----- ATATCCATAA 3070 het 3070 ref 34 20 14 1 ATAAA 1 0 213565 CASAVA_Build 4 106544072 3D ATAGAATCTC CTT/--- AAGGGAATTT 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 CTT 1 0 213566 CASAVA_Build 4 106547752 1I TACAAGCATA -/T GTGAAAGTCC 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 T 0 1 213567 CASAVA_Build 4 106548141 1D AGACTTGTAA T/- TTCACTGTTC 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 T 3 2 213568 CASAVA_Build 4 106548699 1I GGAAACAAAC -/A AATTATAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 2 3 213569 CASAVA_Build 4 106577868 1I TGGTTTCTGA -/G GCTCTACAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 G 1 2 213570 CASAVA_Build 4 106586529 5I ATAACAGTAA -----/ATAAT ATAAGTTGTG 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 ATAAT 0 1 213571 CASAVA_Build 4 106600986 4D AGGTCATATG TAAA/---- TACTACGCCA 3070 het 3070 ref 35 17 16 6 TAAA 1 0 213572 CASAVA_Build 4 106601775 3I AATGGCAACT ---/GAA GAATGATGAG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 GAA 1 2 213573 CASAVA_Build 4 106602815 1D GCACTAGGTT A/- AAAAAAAAAA 1984 het 1984 ref 42 30 5 7 A 12 11 213574 CASAVA_Build 4 106608285 2I ATGGTGAAAC --/AG AGAAAGTGAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AG 1 2 213575 CASAVA_Build 4 106628612 1D AACATAACTG T/- TCAACAGGTG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 2 1 213576 CASAVA_Build 4 106631116 1I CAGAAATTGT -/C CCCCATTTTG 3070 hom 119 het 48 0 40 8 C 4 5 213577 CASAVA_Build 4 106632676 1D TATAAATTTC T/- TTTTTTTTTC 1127 het 1127 ref 37 30 4 3 T 10 9 213578 CASAVA_Build 4 106635092 1D ACAGTCAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 30 0 21 10 A 10 9 213579 CASAVA_Build 4 106637777 4D CCCCATTGTT GGGG/---- GGGGGGGGTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 12 8 213580 CASAVA_Build 4 106639631 1I GTGATAACTC -/T TTTTTTTTTT 1175 hom 7 het 4 0 3 1 T 15 16 213581 CASAVA_Build 4 106648079 1I AGCAGATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 39 2 30 7 T 13 14 213582 CASAVA_Build 4 106649034 1I TAGCCTTGCC -/T TTTTTCCTCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 5 6 213583 CASAVA_Build 4 106679675 9I AAAGGACAAA ---------/TTATCAACC TTATCAACCA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 TTATCAACC 1 2 213584 CASAVA_Build 4 106682566 1D GCTGTTTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 32 hom 36 1 29 6 T 10 9 213585 CASAVA_Build 4 106683823 5I TGGAAAGAAG -----/GCATC GCATCTGCAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 GCATC 1 2 213586 CASAVA_Build 4 106686161 2I CTAATAGGAG --/AT ATATATATAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 6 7 213587 CASAVA_Build 4 106688762 1I TTATTCAATC -/T TAAAACCTAG 3070 hom 101 het 39 0 34 5 T 1 2 213588 CASAVA_Build 4 106690633 2I TCATAGTAGC --/TA TGTTATGTAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TA 0 1 213589 CASAVA_Build 4 106695363 2I AGATAATTAC --/AT AAAACATCTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AT 0 1 213590 CASAVA_Build 4 106699423 1D CTAGTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1163 hom 23 5 11 7 T 11 10 213591 CASAVA_Build 4 106699657 1I ACAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1000 hom 29 5 20 4 A 11 12 213592 CASAVA_Build 4 106704276 1D CTAACCTTAG T/- TTTTAGTAGT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 5 4 213593 CASAVA_Build 4 106712791 6I CCTTGCACTC ------/CAAATT CAAATAAAAA 3070 hom 92 het 35 0 29 6 CAAATT 0 1 213594 CASAVA_Build 4 106713666 1D TATTCAAGTG C/- CTTTGCTCAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 1 213595 CASAVA_Build 4 106717706 1I CTTTCTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 8 9 213596 CASAVA_Build 4 106720717 5I TTTGGATCTT -----/TTCTC TTTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 TTCTC 0 1 213597 CASAVA_Build 4 106721798 1D TTCCTTCTGT C/- CCCTCTCAAT 3070 het 3070 hom 38 14 20 5 C 4 3 213598 CASAVA_Build 4 106722907 1D GCTTATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 8 T 13 12 213599 CASAVA_Build 4 106725776 1D AGTAACCCTA T/- TTTTCCCATT 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 T 5 4 213600 CASAVA_Build 4 106726104 3D TAAAAATTCA CAT/--- CACCACTGGA 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 CAT 1 0 213601 CASAVA_Build 4 106768637 1D GGAAAAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2988 hom 34 7 24 3 A 12 11 213602 CASAVA_Build 4 106847923 1D CCTTGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 1938 het 1938 ref 29 12 5 12 T 15 14 213603 CASAVA_Build 4 106885493 1D TATAGATCTA T/- TAGGAAATAG 3070 hom 120 het 46 0 41 7 T 2 1 213604 CASAVA_Build 4 106889415 4D TCTGGGAGAA AGTT/---- AGAGAAGTCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AGTT 1 0 213605 CASAVA_Build 4 106889788 2D AGAAAAAAAG AA/-- ACGTAAAATG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 3 1 213606 CASAVA_Build 4 106890216 1D ATCCATAGGC A/- AAAAAAAAAA 2029 het 2029 ref 29 19 5 5 A 16 15 213607 CASAVA_Build 4 106900774 1D AAAAATAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 30 1 25 4 A 19 18 213608 CASAVA_Build 4 106908101 6D10M4D TTCAATGGTT TTATTAGGTTTTATTAGGTT/------GGTTCTATGA---- TTATTAGGAT 3070 hom 78 het 26 0 26 2 N/A 0 0 213609 CASAVA_Build 4 106908538 1D AAAATGATGT G/- TTTTTTTTCA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 G 1 0 213610 CASAVA_Build 4 106910966 1D TTCCTTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 33 1 29 4 T 11 10 213611 CASAVA_Build 4 106915610 1D ATCAAACTTA G/- GTTTCGTCTT 3070 hom 42 het 21 0 16 6 G 2 1 213612 CASAVA_Build 4 106932394 2D AAATACAGTA TT/-- CCAAATGCAT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 2 0 213613 CASAVA_Build 4 106935955 3D CATTTCTTAA TAG/--- TAGTGCTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 TAG 2 1 213614 CASAVA_Build 4 106939339 22I TCTGAGCAGG ----------------------/TGTGCAATCACCCAGACTTTGT TATTCCATTT 3070 hom 63 het 22 0 22 1 TGTGCAATCACCCAGACTTTGT 0 1 213615 CASAVA_Build 4 106958917 3D TGACAAAAGT AGG/--- AGATGTTTTA 3070 hom 75 het 27 0 26 3 AGG 1 0 213616 CASAVA_Build 4 106961488 1I AAATTTCTAA -/T TAAAAATGTG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 1 2 213617 CASAVA_Build 4 106966527 5D TTTTGTATAC TTATA/----- TTATCTATGA 3070 het 3070 ref 27 16 10 6 TTATA 1 0 213618 CASAVA_Build 4 106982281 1I GTTTCTATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 A 9 10 213619 CASAVA_Build 4 106999229 1I AATGCACCGT -/C CCTCACGGCA 3070 hom 69 het 29 0 21 8 C 2 3 213620 CASAVA_Build 4 106999978 4D TCAAACAATA AAAC/---- AAAACTCAGC 3070 hom 108 het 42 0 37 9 AAAC 1 0 213621 CASAVA_Build 4 107007610 1D GAGAGGAAAC A/- ATGCACGTGA 3070 hom 90 het 36 0 30 7 A 2 1 213622 CASAVA_Build 4 107012637 1I CCCCCCAAAA -/T TTATATGTTG 3070 hom 114 het 43 0 37 6 T 2 3 213623 CASAVA_Build 4 107018318 1D TCTCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 2693 het 2693 ref 35 13 10 12 A 11 10 213624 CASAVA_Build 4 107041441 2D CCCTTGGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1950 het 1950 ref 46 20 6 20 T 20 18 213625 CASAVA_Build 4 107069389 2D TGAAATAATC AT/-- ATGGTGTCTA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 AT 2 1 213626 CASAVA_Build 4 107069539 1I ATAGACACAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 435 hom 25 1 23 1 T 8 9 213627 CASAVA_Build 4 107072828 1D TCGTTTACAA C/- TTCAGTGTCC 3070 hom 132 het 52 0 44 9 C 1 0 213628 CASAVA_Build 4 107077055 5I AGCCTTCCTT -----/TGGGA TGGGAAGGTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TGGGA 1 2 213629 CASAVA_Build 4 107085786 2I AGATAATAAC --/TG AATATATTTA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 TG 0 1 213630 CASAVA_Build 4 107096759 2D ATCTTCTAAC TG/-- TATGATCTAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TG 1 0 213631 CASAVA_Build 4 107106624 3I GACTTGTTAG ---/AGA AGAAGACACT 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 AGA 2 3 213632 CASAVA_Build 4 107108287 1D TAAAGATCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2860 hom 26 10 12 4 T 9 8 213633 CASAVA_Build 4 107108882 11D ACTTTTCTCA GTATTTTTATT/----------- GTTTAGAGAA 3070 het 3070 ref 37 26 15 2 GTATTTTTATT 1 0 213634 CASAVA_Build 4 107120082 2D AGCTAACAAA AG/-- AGGGATTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 AG 2 1 213635 CASAVA_Build 4 107130158 9I TAATCCAAGA ---------/AGATTAGCC AGATTAGCCA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 AGATTAGCC 1 2 213636 CASAVA_Build 4 107151036 3I GGTGGATCAG ---/TGT TGTTTATCTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TGT 1 2 213637 CASAVA_Build 4 107160024 1I CTTGCACGTT -/C CCTTAGGTAT 3070 het 3070 hom 59 24 25 10 C 2 3 213638 CASAVA_Build 4 107165194 1D CAGAGTAAAA T/- TTCCTACTCC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 3 2 213639 CASAVA_Build 4 107170730 1I ATATCTCTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 8 9 213640 CASAVA_Build 4 107177695 1I TCTGCAAGTC -/A AACCACAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 9 7 A 2 3 213641 CASAVA_Build 4 107183447 2D CACTGAACAA CT/-- CTGTCTGTAA 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 CT 2 1 213642 CASAVA_Build 4 107185625 1D38M1D ATATGAGGCA TTTTTTTTTTCAGATTTCTGAAATGGGAATGTATCTTTCT/-TTTTTTTTTCAGATTTCTGAAATGGGAATGTATCTTTC- TTTTTTTTTT 2950 het 2950 ref 25 14 8 14 N/A 0 0 213643 CASAVA_Build 4 107192218 2I CTGGAATGCT --/GA TAATATGACA 3070 het 3070 hom 50 21 28 1 GA 0 1 213644 CASAVA_Build 4 107196158 6D GTTCAATTAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 76 hom 29 1 15 14 AC 12 9 213645 CASAVA_Build 4 107197036 2I TCTCTAAGTA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 TC 6 7 213646 CASAVA_Build 4 107199809 3D GTTAAATGTG TAA/--- TAATAATTCA 3070 het 3070 ref 43 21 21 2 TAA 3 2 213647 CASAVA_Build 4 107200766 5D AAACTGCAGT TATCC/----- TATCCAGAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 4 TATCC 2 1 213648 CASAVA_Build 4 107222830 7I GTGGACTGAA -------/TAAAGTG TAGTACATAT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 TAAAGTG 0 1 213649 CASAVA_Build 4 107226739 1D AAAACCCTCC A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 7 6 213650 CASAVA_Build 4 107229644 1I ACATGTATCC -/T TTTTTTTTTT 2906 het 2906 ref 39 26 7 6 T 11 12 213651 CASAVA_Build 4 107234428 5D TCCCTGAACC TAAAA/----- TAAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 TAAAA 2 1 213652 CASAVA_Build 4 107239236 3D TCTAGACTGG AAT/--- AATAATAGTT 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 AAT 3 2 213653 CASAVA_Build 4 107240883 8I ACATCACTTA --------/TTTGTTCT CATATTTGGT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TTTGTTCT 0 1 213654 CASAVA_Build 4 107243256 1D ACAATTTAGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 34 14 19 4 A 9 8 213655 CASAVA_Build 4 107251599 2D ATAAAGAGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 A 12 10 213656 CASAVA_Build 4 107252835 1D CCCTGATATC A/- TCAGGATTCC 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 A 1 0 213657 CASAVA_Build 4 107274640 1I AACAAAAAAA -/T AAAACAAAAC 3070 het 2953 hom 29 9 18 2 T 0 1 213658 CASAVA_Build 4 107305600 4I AAAAAAATTA ----/ATTT ATTTAATAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 ATTT 1 2 213659 CASAVA_Build 4 107309877 2I TAAAAAGAAC --/AG AGTTGGAGGA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 AG 1 2 213660 CASAVA_Build 4 107312236 3I ATTTATGCTG ---/ATA ATGTTTCCAC 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 ATA 0 1 213661 CASAVA_Build 4 107333404 1I TTTTATTTGG -/T TTTTCAGGCA 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 T 4 5 213662 CASAVA_Build 4 107336590 4D TATTTTTAAG AATT/---- AATTAGATAC 3070 het 3070 ref 41 23 15 5 AATT 2 1 213663 CASAVA_Build 4 107342787 1D AGATACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 42 0 31 11 T 12 11 213664 CASAVA_Build 4 107343890 2D ATATTTTCAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 443 hom 24 1 15 8 AT 10 9 213665 CASAVA_Build 4 107346843 1I AAACAGATGT -/G GGGGGTAATG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 G 5 6 213666 CASAVA_Build 4 107361173 1I ATTCCATGAC -/A AAGCTGAATT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 2 3 213667 CASAVA_Build 4 107364922 1I TAATAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 10 11 213668 CASAVA_Build 4 107368508 6D ACAGTAACAG TAACAT/------ TAAGAAATAA 3070 het 3070 ref 34 16 19 2 TAACAT 1 0 213669 CASAVA_Build 4 107368949 1I CTTTCGGTTA -/T TTTTTTTTTT 2389 het 1934 hom 26 9 10 7 T 13 14 213670 CASAVA_Build 4 107370362 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 T 9 10 213671 CASAVA_Build 4 107371829 1D GAAGGGCAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 10 9 213672 CASAVA_Build 4 107377149 2D CAAAAGCAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 12 10 213673 CASAVA_Build 4 107380435 2D GTAATCATAT AA/-- AGTCTTTCAG 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 A 3 1 213674 CASAVA_Build 4 107380988 1D TAGATAAGAA T/- TTGGAAATGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 3 2 213675 CASAVA_Build 4 107384214 5D AAAAGTTTAA AAAGT/----- AAAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 AAAGT 1 0 213676 CASAVA_Build 4 107385135 1D CAACCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 12 11 213677 CASAVA_Build 4 107391087 5D TTTCTTCCCT AAATA/----- AAATGAGAAA 3070 het 3070 hom 36 16 19 7 AAATA 1 0 213678 CASAVA_Build 4 107392993 3D TATTTATTTT TAG/--- TAGTAAGAAT 3070 het 3070 ref 33 20 12 3 TAG 2 1 213679 CASAVA_Build 4 107396282 3D CTCCTCTCTC CTT/--- CTGTCTTCTT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 CTT 1 0 213680 CASAVA_Build 4 107404850 1D TTAAATGAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 213681 CASAVA_Build 4 107405020 11D AAGTCAGCAG CTCACAAAAGT/----------- GTATTCAGTG 3070 het 3070 hom 33 12 18 5 CTCACAAAAGT 1 0 213682 CASAVA_Build 4 107406826 1I TCTTCCCCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 9 10 213683 CASAVA_Build 4 107412745 2D AGATTTAAAC AG/-- AACAAAGTTT 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 AG 1 0 213684 CASAVA_Build 4 107418687 2I AATTTTACTA --/TG TTTGCATTTT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 TG 0 1 213685 CASAVA_Build 4 107421910 3D CTTCTAATCA TTT/--- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 41 19 18 7 T 11 8 213686 CASAVA_Build 4 107435522 2D AACACTGGAC TA/-- TGTTAATGTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 TA 1 0 213687 CASAVA_Build 4 107441788 3D AATTATATAT ATA/--- ATTTGTTCTG 2057 het 1325 hom 8 3 5 0 ATA 1 0 213688 CASAVA_Build 4 107441891 5D TATTATTCTC TACTT/----- TAATTTCAAA 3070 het 3070 ref 24 11 13 3 TACTT 1 0 213689 CASAVA_Build 4 107445902 3D TTAAATTAAG AAT/--- AATTAATAAT 3070 het 3070 hom 26 14 12 2 AAT 2 1 213690 CASAVA_Build 4 107446706 1I ACCTTCTCTT -/G GGGGGTCTGG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 5 6 213691 CASAVA_Build 4 107447220 1I AGTCAAGGGT -/C TACCAAGGTA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 C 0 1 213692 CASAVA_Build 4 107453072 3I AACAAGTGTT ---/GAG GAGAATGTGG 3070 het 3070 hom 30 12 18 0 GAG 1 2 213693 CASAVA_Build 4 107460763 6D AGGTTGACTT ATACTC/------ AATGTAAAAT 3070 het 3070 ref 36 24 11 3 ATACTC 1 0 213694 CASAVA_Build 4 107462904 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1943 het 1943 ref 18 7 6 5 A 11 12 213695 CASAVA_Build 4 107466126 1D TATTTTTCTT A/- AAAATTCTTA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 A 5 4 213696 CASAVA_Build 4 107469649 1I ACTTATTTAC -/T TTTTTTTTTT 1930 het 1930 ref 32 8 11 13 T 17 18 213697 CASAVA_Build 4 107473221 2D51M6I ACAGAGATAC ATATATATATATATATACATATATATATAAGTTGGTTCACTTTTTTATGTATC------/--ATATATATATATATACATATATATATAAGTTGGTTCACTTTTTTATGTATCTATAGA TATAGATATA 3070 het 3044 hom 18 8 10 7 N/A 0 0 213698 CASAVA_Build 4 107474446 2I CTAACTGTTG --/CT CTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 CT 1 2 213699 CASAVA_Build 4 107474883 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2794 het 2167 hom 32 10 12 10 T 15 14 213700 CASAVA_Build 4 107476860 1D GCTGGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 959 het 959 ref 22 13 3 8 A 12 11 213701 CASAVA_Build 4 107480889 1I GTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 T 11 12 213702 CASAVA_Build 4 107482149 4D TTTATTGAAT AGAG/---- AGTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 16 19 1 AG 3 1 213703 CASAVA_Build 4 107490447 4I AACTGGACAT ----/AACA AACACTTCAG 3070 het 3070 hom 44 14 24 6 AACA 1 2 213704 CASAVA_Build 4 107491720 5I GATACTACTT -----/ATATG ATAACCCCAA 3070 het 3070 ref 61 28 24 9 ATATG 0 1 213705 CASAVA_Build 4 107499456 14I TCTTTTACTT --------------/TTTGTAGAAATGTG TTATCATTAT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 TTTGTAGAAATGTG 0 1 213706 CASAVA_Build 4 107505995 1I ACATATGGCT -/G GGGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 G 3 4 213707 CASAVA_Build 4 107520022 1D TATGCAATTG T/- TTTTATAGAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 5 4 213708 CASAVA_Build 4 107521010 4D TTAAATTGGA TTGT/---- TTGCTTTTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TTGT 1 0 213709 CASAVA_Build 4 107524990 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 442 hom 21 1 16 4 A 15 16 213710 CASAVA_Build 4 107527058 1I ACTCTGAGGG -/T TCAGGACTTT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 1 2 213711 CASAVA_Build 4 107529773 1D GACTGTTGGA G/- GAAGTCTGGA 3070 hom 129 het 45 0 43 3 G 2 1 213712 CASAVA_Build 4 107531272 1I TCTAGCATAT -/A AAAATCATTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 4 5 213713 CASAVA_Build 4 107539466 1I AAAAAGAAAC -/A AAAAAAATCT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 7 8 213714 CASAVA_Build 4 107540346 6I GCTTTAGACT ------/TTATAA TTAACTGTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTATAA 0 1 213715 CASAVA_Build 4 107552439 1D AACCAAACTG T/- TTTTTTTTTT 1531 het 1531 ref 27 18 6 3 T 11 10 213716 CASAVA_Build 4 107555176 9D GACTTAAAGA ATGTGATTC/--------- ATGTGATTCA 3070 hom 117 het 47 0 40 11 ATGTGATTC 2 1 213717 CASAVA_Build 4 107596409 11I23M5I22M5I TATTTACCTC -----------ATGAGGGTAAAATGAATTAAAAC-----AGTGCTAAGAAAAAAATTTGGC-----/ATGAGTTTATTATGAGGGTAAAATGAATTAAAACAGTAAAGTGCTAAGAAAAAAATTTGGCATAAA ATAGCTCAAT 2279 het 2279 ref 20 17 6 4 N/A 0 0 213718 CASAVA_Build 4 107666958 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1424 het 265 hom 17 5 6 7 A 19 18 213719 CASAVA_Build 4 107671465 4I AATCATTTCA ----/AAAT AAATAAATAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AAAT 2 3 213720 CASAVA_Build 4 107683759 7D AACCCTAATC TTAAAAG/------- TTAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 TTAAAAG 1 0 213721 CASAVA_Build 4 107699726 1I CAATTTTGGC -/T TCTGTCGCCA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 1 2 213722 CASAVA_Build 4 107709656 1D AATTTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 30 2 20 9 T 15 14 213723 CASAVA_Build 4 107722917 3D GCTGAGATTT ATC/--- ATGTTTCAGC 3070 het 3070 ref 54 34 18 4 ATC 1 0 213724 CASAVA_Build 4 107730875 1D TGTTTGGTGG T/- TGAGATGCAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 2 1 213725 CASAVA_Build 4 107734029 1I TTGATACAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 8 9 213726 CASAVA_Build 4 107737219 13I AAGGAGTATG -------------/AGAGGTATTCCCT AGAAACCAAA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 AGAGGTATTCCCT 0 1 213727 CASAVA_Build 4 107738170 1D TCCTTAATAC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 21 het 40 1 32 9 A 8 7 213728 CASAVA_Build 4 107745903 1D AAGAAACACT C/- CTTTTCAGAC 3070 het 3070 hom 43 21 18 6 C 2 1 213729 CASAVA_Build 4 107748082 3I TAACTGTATG ---/CCA ATTTTATTTT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 CCA 0 1 213730 CASAVA_Build 4 107749135 5D AAAAGAAGGT AAAAG/----- AAATGAGTAA 3070 hom 169 het 60 0 57 5 AAAAG 1 0 213731 CASAVA_Build 4 107750522 2I CCACTTCAGG --/GA GTGCACAACG 3070 hom 76 het 30 0 23 7 GA 0 1 213732 CASAVA_Build 4 107757278 4D ATAGCTTAAG GTTT/---- GTTTAATTTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 GTTT 2 1 213733 CASAVA_Build 4 107769561 2I AGGAACAACA --/CT CTCAAATTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CT 1 2 213734 CASAVA_Build 4 107773956 1I TTTCTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2075 hom 44 7 24 13 T 11 12 213735 CASAVA_Build 4 107775838 1D TTATTATCTT G/- AGATTTAGGT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 1 0 213736 CASAVA_Build 4 107799478 1I CTCCGGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1903 hom 31 10 17 4 T 12 13 213737 CASAVA_Build 4 107819195 4D AATTTGGATA TTAG/---- GCATAGTAAA 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 TTAG 1 0 213738 CASAVA_Build 4 107855960 1D GACTTGACAG A/- AAAAAATTAA 3033 het 3033 ref 27 16 9 2 A 7 6 213739 CASAVA_Build 4 107864066 1I AGAGGTTTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 C 0 1 213740 CASAVA_Build 4 107864420 1I GTTTGACTTC -/T TTTTGTTACA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 4 5 213741 CASAVA_Build 4 107871684 1D TAGAAACATC T/- TTTTAATATT 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 T 5 4 213742 CASAVA_Build 4 107874930 1I CTGAAGATCA -/T TAACATTAAC 3070 hom 61 het 35 0 19 16 T 1 2 213743 CASAVA_Build 4 107880314 2I AGTTTGTCTC --/AG TGCACTTTAC 3070 hom 123 het 51 0 42 9 AG 0 1 213744 CASAVA_Build 4 107883252 2I TAGGTGGTGA --/TG GGAGAGTGTA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 TG 0 1 213745 CASAVA_Build 4 107895921 2I TTGTTTTAGT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 TA 5 6 213746 CASAVA_Build 4 107897699 2I ACATAAAAAC --/AT AGAAAAATTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AT 0 1 213747 CASAVA_Build 4 107897901 1D AAACCCCGTC T/- CTACTAAAAT 1230 het 330 hom 6 1 3 2 T 1 0 213748 CASAVA_Build 4 107897945 1D GTGGTGGGCA C/- CTGTAGTCCC 1359 het 1359 ref 13 5 4 4 C 2 1 213749 CASAVA_Build 4 107904052 1I CACTCTACAG -/T TTTATCAAGT 3070 het 3070 ref 44 29 13 2 T 3 4 213750 CASAVA_Build 4 107906087 1I TCCTGTATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 11 12 213751 CASAVA_Build 4 107908951 9D GAACACCAAT GGGCTCTTA/--------- GGGTCCCCAA 3070 het 3070 hom 54 24 23 13 GGGCTCTTA 1 0 213752 CASAVA_Build 4 107918293 1D AAAAGATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 16 7 T 12 11 213753 CASAVA_Build 4 107926945 2D TTTTTCTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 713 hom 38 8 15 15 T 13 11 213754 CASAVA_Build 4 107927646 1D TTAAAATCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 12 19 8 T 10 9 213755 CASAVA_Build 4 107944288 1D TAAGATGAAG T/- TTTTTCAACG 3070 hom 138 het 53 0 46 7 T 6 5 213756 CASAVA_Build 4 107947083 1D TATATCCCAG A/- AAAAACTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 5 213757 CASAVA_Build 4 107950849 3D TCTTCTTCTC CTT/--- CTTTCTTCTT 3070 het 2342 hom 38 7 20 11 CTT 2 1 213758 CASAVA_Build 4 107950940 3D TCTTTTCTCT TTC/--- TTCTTCTTCT 2442 het 1512 hom 27 7 10 10 TTC 5 4 213759 CASAVA_Build 4 107952934 10D AAACACACAC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 het 435 hom 30 5 13 13 AT 10 5 213760 CASAVA_Build 4 107976561 15D ACTGCCCTTC AAATGTTAGATTTGT/--------------- TATGTCTATA 3070 het 3070 ref 37 22 17 5 AAATGTTAGATTTGT 1 0 213761 CASAVA_Build 4 107996425 5D AAATTTTCTT TAATC/----- TAATTAGATA 3070 het 3070 ref 22 12 10 2 TAATC 1 0 213762 CASAVA_Build 4 108002527 1I AATGTGAATA -/C AGAGCTCTGG 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 C 0 1 213763 CASAVA_Build 4 108004058 2I ACGTTTTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 TA 6 7 213764 CASAVA_Build 4 108017162 4D GTTCTCATGA TAGT/---- TAGTGAGTTC 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 TAGT 2 1 213765 CASAVA_Build 4 108025273 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 1887 het 1810 hom 16 6 5 5 A 11 10 213766 CASAVA_Build 4 108030018 1I TCCTTGGAAT -/C CATATCCCTC 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 C 1 2 213767 CASAVA_Build 4 108091125 4D GGTTTTGCAT CTCA/---- CTCAGCGTGA 3070 het 3070 ref 36 20 14 5 CTCA 2 1 213768 CASAVA_Build 4 108099622 4I ATAAGAAAGG ----/TTAA TTAATATATG 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 TTAA 1 2 213769 CASAVA_Build 4 108109221 5D ATATTTACTT TTAAG/----- TAAAGTTTCT 3070 het 3070 ref 43 24 18 5 TTAAG 1 0 213770 CASAVA_Build 4 108178412 1I CATTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 10 11 213771 CASAVA_Build 4 108178674 1D TAGAATCAAA G/- GTTGGAATGA 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 G 2 1 213772 CASAVA_Build 4 108187586 1D TAGAGGGGGG A/- AAAAACTGAC 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 6 5 213773 CASAVA_Build 4 108196380 1D TAAAAAATTC A/- AAAAAAAAAA 886 het 885 ref 12 5 5 3 A 17 16 213774 CASAVA_Build 4 108204244 1I AATAAACATT -/C CATAAGTAAT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 C 1 2 213775 CASAVA_Build 4 108213710 2I GGAGGGAGAG --/GT GTGTGGGCGG 3070 het 2001 hom 24 11 8 5 GT 2 3 213776 CASAVA_Build 4 108227121 1I AATTGGCAAA -/T TGTGTATTAC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 1 2 213777 CASAVA_Build 4 108232604 1D AATGAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 13 12 213778 CASAVA_Build 4 108233658 1I GTCTTTAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 9 10 213779 CASAVA_Build 4 108241053 1I CCAGACTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 9 10 213780 CASAVA_Build 4 108252794 1I AAGGTAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 12 13 213781 CASAVA_Build 4 108270021 4D GTAAAATAAC TGTT/---- TGGACAAACG 3070 hom 105 het 40 0 36 6 TGTT 1 0 213782 CASAVA_Build 4 108286483 1I TTTCTTAAAC -/T AGAAAAATAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 213783 CASAVA_Build 4 108300241 2D TGAGAATCTG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 A 11 9 213784 CASAVA_Build 4 108302975 1D TGCATTATAA G/- AAAAGAGATC 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 G 1 0 213785 CASAVA_Build 4 108345557 2I GCTCAGCGGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 40 9 17 14 GT 7 8 213786 CASAVA_Build 4 108353981 2I AAGCAGTCTG --/CA GGAATTTAGG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CA 0 1 213787 CASAVA_Build 4 108360256 1I ACTAATGTTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 8 9 213788 CASAVA_Build 4 108362990 1I AGCAGCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 11 12 213789 CASAVA_Build 4 108365677 4I TACAACCATC ----/TATT TAATTCGTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TATT 0 1 213790 CASAVA_Build 4 108366320 1D ATTAGCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 11 10 213791 CASAVA_Build 4 108368480 11I CTAAACCTAA -----------/AGAAAGATATC AACATTCAAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AGAAAGATATC 0 1 213792 CASAVA_Build 4 108373386 3I GACAGAGAGT ---/AGA AGGATGGTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AGA 0 1 213793 CASAVA_Build 4 108381625 6I GTATCCATTA ------/ATTAAT ATTAATATTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ATTAAT 1 2 213794 CASAVA_Build 4 108384137 2I CTGCAGGGTG --/GA GAGAGAGAGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 GA 4 5 213795 CASAVA_Build 4 108384503 1I AAAACGAAGG -/A AAAAAAACAG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 7 8 213796 CASAVA_Build 4 108385023 5D TTTATACATT AAATA/----- AAAGTATCAT 3070 hom 123 het 43 0 42 6 AAATA 1 0 213797 CASAVA_Build 4 108389462 1D ATGATCCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 134 hom 37 2 30 5 A 11 10 213798 CASAVA_Build 4 108412037 1D CTATAAACTG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 75 het 34 0 26 10 T 8 7 213799 CASAVA_Build 4 108412431 1I TCTTTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1733 hom 24 6 10 8 T 11 12 213800 CASAVA_Build 4 108414186 1D TATTTTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2535 hom 21 8 9 4 T 13 12 213801 CASAVA_Build 4 108428403 1D CATAAATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 14 5 A 15 14 213802 CASAVA_Build 4 108429685 1D CCAGACTCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 T 10 9 213803 CASAVA_Build 4 108438347 1D TATGCTGCAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 13 11 11 A 9 8 213804 CASAVA_Build 4 108471710 1D TGTTTGGCTA G/- CTGCCAAACT 1975 het 1975 ref 38 20 6 12 G 1 0 213805 CASAVA_Build 4 108512339 1I AAAACATTAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 8 9 213806 CASAVA_Build 4 108532660 2I TTTTTGTCTC --/TG TATGCAGGAA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TG 0 1 213807 CASAVA_Build 4 108535014 5I TTCTTAACAA -----/TAATT TAGAGAACAT 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 TAATT 0 1 213808 CASAVA_Build 4 108535866 1D TATCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 13 8 A 13 12 213809 CASAVA_Build 4 108536774 1D TAGATATGGG T/- TTTCACCTTG 2878 het 2491 hom 15 6 7 2 T 4 3 213810 CASAVA_Build 4 108540953 4D GGTTATTTAT AAGG/---- AAGGCAATTC 3070 hom 75 het 30 0 26 7 AAGG 2 1 213811 CASAVA_Build 4 108554466 1I GGTCGGGACC -/A AGGTAAGAAA 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 A 1 2 213812 CASAVA_Build 4 108557502 2I AACATTAATA --/AC ACACCAATAT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 AC 2 3 213813 CASAVA_Build 4 108563366 1D CCTTGGTGAT G/- AAATCATTTG 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 G 1 0 213814 CASAVA_Build 4 108564551 1D TAAGAGCAAC A/- AAGCTGCTGC 3070 het 3070 ref 40 20 10 10 A 3 2 213815 CASAVA_Build 4 108564984 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 30 0 26 6 A 9 8 213816 CASAVA_Build 4 108567417 1I GCAGTTAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 11 12 213817 CASAVA_Build 4 108567853 1D AAAGCTTTTC T/- TTTTCCCCTT 3070 het 3070 hom 40 18 15 7 T 5 4 213818 CASAVA_Build 4 108568672 2D TAATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 AT 9 8 213819 CASAVA_Build 4 108589682 1I TTGTTTTGAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 7 8 213820 CASAVA_Build 4 108590858 1I AATATTCTTA -/T CCCTGACAGG 3070 het 3070 hom 42 10 22 10 T 0 1 213821 CASAVA_Build 4 108590923 1D CCCCTTTAAA T/- TGTCAGGCCC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 2 1 213822 CASAVA_Build 4 108592264 1D GTAAAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 35 8 A 11 10 213823 CASAVA_Build 4 108606277 2I CTCTTGCCCT --/TC TCTACCTTCT 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 TC 1 2 213824 CASAVA_Build 4 108607258 5I GAAAAGCTGT -----/TAAAA TAAAGTCACA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TAAAA 0 1 213825 CASAVA_Build 4 108610443 1I GTATTGAGGG -/A AAACAGAAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 3 4 213826 CASAVA_Build 4 108613639 9D GTCTAATAAA GGGTAAAAT/--------- GGGTAAAATT 3070 hom 81 het 34 0 28 7 GGGTAAAAT 2 1 213827 CASAVA_Build 4 108613827 2I AGAAAAAAAC --/AT GTAAATTGTT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 AT 0 1 213828 CASAVA_Build 4 108614311 1I TAAAATCAAT -/G GAGAAAATGG 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 G 1 2 213829 CASAVA_Build 4 108615615 1D TTAATTGCTC T/- TTTTTTCATA 3070 hom 120 het 51 0 41 10 T 7 6 213830 CASAVA_Build 4 108615874 7I ACGCACACAC -------/ACACACA ACACACACAA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 ACACACA 1 2 213831 CASAVA_Build 4 108617251 1I GATGGGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 21 1 18 2 T 10 11 213832 CASAVA_Build 4 108619176 1D CATAGCACCA G/- GCAAAATTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 G 2 1 213833 CASAVA_Build 4 108624146 1I CAGAATACAG -/A AAAAAGCAGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 5 6 213834 CASAVA_Build 4 108624229 1I TTAAGAAATG -/A AAAAAAGCCT 2616 het 2616 ref 26 17 6 3 A 6 7 213835 CASAVA_Build 4 108625384 1I AACACCATCG -/A AAAAAAAAAG 2419 het 2419 ref 17 8 6 3 A 9 10 213836 CASAVA_Build 4 108627201 1D AAATAGAGGC A/- AAAAAATAAT 3070 hom 123 het 49 0 42 9 A 7 6 213837 CASAVA_Build 4 108627542 1D TCTCCCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 11 10 213838 CASAVA_Build 4 108629509 4D TTAAAGAGAT AAAC/---- AAATTAATGA 3070 hom 114 het 40 0 39 4 AAAC 1 0 213839 CASAVA_Build 4 108631150 2I TCACAATAGC --/AT AAACATGGAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 AT 0 1 213840 CASAVA_Build 4 108631567 1I TTAAAAGCTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 24 hom 42 1 36 6 A 8 9 213841 CASAVA_Build 4 108632231 1I GATAGTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 A 11 12 213842 CASAVA_Build 4 108634262 1I AAATCAATAT -/A AAAAAATTAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 6 7 213843 CASAVA_Build 4 108634821 1I TTATTTGCTC -/T TTTTGCGAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 4 5 213844 CASAVA_Build 4 108637747 1I TTGTCTGGTA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 6 7 213845 CASAVA_Build 4 108639125 1D TGTACTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2676 hom 28 8 16 4 A 13 12 213846 CASAVA_Build 4 108639470 1I TGTAAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 9 10 213847 CASAVA_Build 4 108648830 3I AATAGTATAT ---/TAG TAGATTACAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 TAG 1 2 213848 CASAVA_Build 4 108664594 6D ACACAGCAAG ATAGAA/------ ATAGAAATAC 3070 het 3070 hom 33 13 16 6 ATAGAA 2 1 213849 CASAVA_Build 4 108668689 4D TTTAAAAAAG AAAA/---- AAAAAAAGAA 2739 het 2043 hom 12 5 7 2 A 11 7 213850 CASAVA_Build 4 108690428 1I GCAGAGGTTG -/T TGTTTCTGAA 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 T 1 2 213851 CASAVA_Build 4 108700584 1D ATTTCTGAGA T/- TGTTTTTACC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 2 1 213852 CASAVA_Build 4 108717712 2I ATGGATTCTA --/TG TGTCAGGCAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TG 1 2 213853 CASAVA_Build 4 108722186 1I CAACAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 33 1 26 6 A 12 13 213854 CASAVA_Build 4 108722248 1D AACAAGAAGA G/- GCTAACTATC 3070 het 3070 ref 37 13 10 14 G 2 1 213855 CASAVA_Build 4 108729670 3I TTAAAACAAG ---/ACA ACAATTGTCT 3070 het 3070 ref 33 22 7 4 ACA 1 2 213856 CASAVA_Build 4 108733119 1I GCCCACACTT -/C CCCATGCAAG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 C 3 4 213857 CASAVA_Build 4 108734735 3D TCAGTAAGCT AGA/--- AGAAGTGGAT 3070 het 3070 ref 44 24 19 3 AGA 2 1 213858 CASAVA_Build 4 108738168 24D GTTGAGGTTT TCCCATTAATTTCCCATTAATTAA/------------------------ AAAAAGCCTA 3070 het 3070 ref 24 17 9 4 TCCCATTAATTTCCCATTAATTAA 1 0 213859 CASAVA_Build 4 108751331 1D AATGATATGG T/- TTTGGCTCTG 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 4 3 213860 CASAVA_Build 4 108755091 1D AAACTTAATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 A 9 8 213861 CASAVA_Build 4 108755158 2I TGAACAAAAA --/AC ACCACTATTG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 AC 1 2 213862 CASAVA_Build 4 108755575 1D TAAAACTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 24 0 14 10 T 12 11 213863 CASAVA_Build 4 108755700 1D AATTTTTTTT C/- TTCTGGAACA 3070 het 3070 ref 41 23 13 6 C 1 0 213864 CASAVA_Build 4 108771622 1D ATGCACAAAA T/- TATGTAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 T 2 1 213865 CASAVA_Build 4 108773117 1I AATACTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 11 12 213866 CASAVA_Build 4 108786914 6D ATATATATAT ATACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 ref 30 17 11 5 ATACAC 1 0 213867 CASAVA_Build 4 108787234 2D TCTGACAGAC CA/-- CAGTCTACAC 3070 het 3070 hom 45 22 18 5 CA 2 1 213868 CASAVA_Build 4 108797121 1I AAGACTCCAC -/A AATTCCTCAT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 A 2 3 213869 CASAVA_Build 4 108798814 1D AGTGACTCAC A/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 7 6 213870 CASAVA_Build 4 108798959 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 2980 het 2615 hom 33 11 9 13 A 15 14 213871 CASAVA_Build 4 108800452 1D AACATCTTTG C/- CCCCCCAGCT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 C 7 6 213872 CASAVA_Build 4 108804251 1I TGCAATACTG -/T TCTTTCAATG 3070 het 3070 ref 45 24 12 9 T 1 2 213873 CASAVA_Build 4 108820998 1D GAAGCAAGTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 9 8 213874 CASAVA_Build 4 108823970 1D AATGGCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 39 0 28 12 A 11 10 213875 CASAVA_Build 4 108827550 9D TCCAAGTCAC TCTAACACT/--------- TCCAATCTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 6 TCTAACACT 1 0 213876 CASAVA_Build 4 108828581 1D TTCATGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 42 1 35 6 A 16 15 213877 CASAVA_Build 4 108833384 2D ACACGGTGTG TA/-- TATATATATA 2942 het 2942 ref 44 28 8 9 TA 9 8 213878 CASAVA_Build 4 108834676 1D GTAGTAATAC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 115 het 45 0 38 7 T 9 8 213879 CASAVA_Build 4 108835129 1D AGACATGGTT G/- GGAATTCACT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 G 3 2 213880 CASAVA_Build 4 108835557 1D TAACTGGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 29 1 21 7 A 11 10 213881 CASAVA_Build 4 108837662 3D3M2I CTTTGGTCAC TTAATT--/---ATTAC TGGGAGAAGC 3070 hom 155 het 52 0 49 5 N/A 0 0 213882 CASAVA_Build 4 108841619 1I CAAAAAAAAA -/T AATAACAAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 0 1 213883 CASAVA_Build 4 108844020 1I AGTCATATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 828 hom 39 4 24 11 A 14 15 213884 CASAVA_Build 4 108845557 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 11 12 213885 CASAVA_Build 4 108851130 5D GGGGTCCGAA GGGAG/----- TAAGTGGATG 3070 hom 99 het 36 0 34 6 GGGAG 1 0 213886 CASAVA_Build 4 108854379 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 229 hom 24 1 18 5 A 9 10 213887 CASAVA_Build 4 108857298 1I ATGATATTCA -/T TTATATCTGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 3 213888 CASAVA_Build 4 108857687 1D TACTAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 9 A 12 11 213889 CASAVA_Build 4 108857936 1I CAACAGGTTT -/A AAAATGGGTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 4 5 213890 CASAVA_Build 4 108871570 1I ATATACATAT -/A TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 A 0 1 213891 CASAVA_Build 4 108881107 1D AGGCCCTCTT G/- GTGGCAGAAA 3070 het 3070 ref 53 24 20 10 G 2 1 213892 CASAVA_Build 4 108886518 5D TAAAAAGTAT AGTAA/----- AGTAACTATA 3070 het 3070 hom 27 12 13 5 AGTAA 2 1 213893 CASAVA_Build 4 108887830 4D GAAAAATAGC AGAT/---- AGATAAATTC 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 AGAT 2 1 213894 CASAVA_Build 4 108890919 3I AATCAAATAA ---/AAG AAGTTATAAA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 AAG 1 2 213895 CASAVA_Build 4 108909640 3I GTCTCTAGAA ---/TTT TTTTATTTCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 4 7 213896 CASAVA_Build 4 108916220 1D CGAGCATCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 409 hom 35 1 30 5 T 10 9 213897 CASAVA_Build 4 108920665 1I AAAAGTAATA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 3 4 213898 CASAVA_Build 4 108924512 1I CCTTATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 29 2 22 5 A 13 14 213899 CASAVA_Build 4 108924532 1I AAATCAAGAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 1060 hom 32 6 17 9 A 8 9 213900 CASAVA_Build 4 108928777 1D GCAGAGGGTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 116 hom 42 5 29 8 G 12 11 213901 CASAVA_Build 4 108942685 1D GAATTCTTCA G/- TCTTTACATG 3070 het 3070 hom 49 22 19 10 G 1 0 213902 CASAVA_Build 4 108946302 1D CTTTCACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 8 A 12 11 213903 CASAVA_Build 4 108958428 1D AGGAGGAAAT G/- GGGGAGATGT 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 G 5 4 213904 CASAVA_Build 4 108962089 1D GTTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 10 9 213905 CASAVA_Build 4 108967259 1I GGTTGAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 T 11 12 213906 CASAVA_Build 4 108970446 1I TTCCAACGTG -/C GTGAATAACA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 C 0 1 213907 CASAVA_Build 4 108992677 1I GTCATAATAA -/T TTTTTTTTTT 2983 het 2983 ref 27 10 10 7 T 15 16 213908 CASAVA_Build 4 108994986 2D TCATAAAAGT TC/-- TGTGTTTAAC 3070 het 3070 ref 53 24 22 8 TC 1 0 213909 CASAVA_Build 4 108999275 3D CCTGCAGCTT TGC/--- TGCTGCTATC 3070 het 3070 ref 48 24 17 10 TGC 3 2 213910 CASAVA_Build 4 109000565 1D AGGATTACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 29 17 8 T 10 9 213911 CASAVA_Build 4 109013277 1D CCCTTCTCTT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 8 7 213912 CASAVA_Build 4 109020433 1I TTTTAAGGGT -/A AAAATGAAAT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 4 5 213913 CASAVA_Build 4 109024695 1I ATGTTTTCAA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 6 7 213914 CASAVA_Build 4 109025106 1D TTTAAACAAA G/- GGGGGGGAAA 3070 hom 41 het 19 0 14 5 G 8 7 213915 CASAVA_Build 4 109031735 1D CTGTTTTTCT C/- CCCCCCATTA 3070 hom 55 het 22 0 18 4 C 7 6 213916 CASAVA_Build 4 109031931 1D ACAGTTAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 154 hom 35 1 29 6 A 10 9 213917 CASAVA_Build 4 109032716 1D TAGGAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 2055 het 2055 ref 37 19 9 9 A 15 14 213918 CASAVA_Build 4 109033040 2D ACCTCCACTC AG/-- AATCCCTCTG 3070 hom 51 het 20 0 18 3 AG 1 0 213919 CASAVA_Build 4 109034798 1I ACCCTGAAAC -/G GGGGAGGCAG 3070 hom 102 het 38 0 30 8 G 4 5 213920 CASAVA_Build 4 109035461 2I TGACAAATGA --/AG AGAGTAACAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AG 2 3 213921 CASAVA_Build 4 109038869 1I TTCCCTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 10 11 213922 CASAVA_Build 4 109039131 2D ACCTAGAGTA AT/-- ATGTTTTATG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AT 2 1 213923 CASAVA_Build 4 109077620 1D AGGACACTAG T/- CATGAAAGTA 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 T 1 0 213924 CASAVA_Build 4 109081217 1D AACATTTTGG T/- TTTTTTTTCA 371 het 371 ref 27 14 3 10 T 9 8 213925 CASAVA_Build 4 109081838 2I ATTTAACAGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 AT 6 7 213926 CASAVA_Build 4 109087486 1I CCTGAGAGAG -/A GAGAGAGTGG 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 A 0 1 213927 CASAVA_Build 4 109094854 1D TGACTGTGGC T/- TGTGCCACCA 2964 het 2964 ref 41 26 10 5 T 2 1 213928 CASAVA_Build 4 109096112 4D CCCAAAACAT AATC/---- AAATCACAAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 AATC 1 0 213929 CASAVA_Build 4 109103420 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 2679 het 671 hom 12 2 7 3 A 9 10 213930 CASAVA_Build 4 109131761 1D ATGCTTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 11 10 213931 CASAVA_Build 4 109151028 1I GGCCATGCTG -/T TTTTTCAGCG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 5 6 213932 CASAVA_Build 4 109172731 5D CATTTTTCCC TCTTT/----- TCTTTAGCTT 3070 hom 87 het 31 0 29 3 TCTTT 2 1 213933 CASAVA_Build 4 109177256 1I AAGAGGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 36 2 25 9 T 14 15 213934 CASAVA_Build 4 109202248 1D TTTTTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 30 0 22 8 A 13 12 213935 CASAVA_Build 4 109214429 1D CCTCTGATAA C/- CCCCCCCCCT 3070 hom 30 het 23 0 16 7 C 10 9 213936 CASAVA_Build 4 109216632 1I GTAGCTCCCT -/A AAAGAGCTAA 3070 hom 93 het 36 0 29 7 A 3 4 213937 CASAVA_Build 4 109218651 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 8 213938 CASAVA_Build 4 109219831 1I TGAAGAGTCT -/C CGAATGCCTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 C 1 2 213939 CASAVA_Build 4 109220403 1D ATTCGGGTGG A/- AAAAAAAAAG 1133 het 1133 ref 33 26 4 4 A 10 9 213940 CASAVA_Build 4 109226309 4I GGCGTTTGAC ----/TCTA TCTATAGAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TCTA 1 2 213941 CASAVA_Build 4 109229351 14I TCAAAAGAAT --------------/AACATCTGAAGTAA AAATCTCCTA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 AACATCTGAAGTAA 0 1 213942 CASAVA_Build 4 109232059 2D ACGGGGGGGG GA/-- AAAAAAAGGA 3070 hom 60 het 29 0 25 5 GA 1 0 213943 CASAVA_Build 4 109233298 4D AATCAACCAA CTAT/---- CTAAGTGTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 CTAT 1 0 213944 CASAVA_Build 4 109238348 1I AACCTAGACA -/T TTTTTTAATA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 6 7 213945 CASAVA_Build 4 109240124 2D TATGTGTATG TA/-- TATATATATA 473 hom 7 het 4 0 3 1 TA 8 7 213946 CASAVA_Build 4 109248113 1I GCTTATTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 213947 CASAVA_Build 4 109267749 1D ATTTTGGCAG A/- AAAAAACAGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 6 213948 CASAVA_Build 4 109274772 1I CAAATTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1742 hom 41 4 29 8 A 14 15 213949 CASAVA_Build 4 109288894 1I AAAAAAAAAA -/C ATTTATCAAG 3070 het 732 hom 35 2 26 7 C 0 1 213950 CASAVA_Build 4 109314902 1D AGGCAAGCCA T/- TTTAACCTCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 4 3 213951 CASAVA_Build 4 109317824 5I CTGGCTTTCA -----/TTCTT TTCTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TTCTT 1 2 213952 CASAVA_Build 4 109317890 17I GTGAACTCGG -----------------/CTCACTGTAACCTCTGC CTCCCAGGTT 3070 hom 66 het 28 0 22 7 CTCACTGTAACCTCTGC 0 1 213953 CASAVA_Build 4 109321037 3I GAAGGAGAAA ---/AAG AAGAAAGAGG 3070 hom 36 het 20 0 13 7 AAG 1 2 213954 CASAVA_Build 4 109321491 3D AGAAGAAAAC GAG/--- GAGCAGGGAA 3070 hom 73 het 28 0 23 8 GAG 2 1 213955 CASAVA_Build 4 109321809 2D AGAATGTAAA CT/-- CTATGAGCAG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 CT 2 1 213956 CASAVA_Build 4 109341455 1I GTTTTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 T 10 11 213957 CASAVA_Build 4 109342440 1D TACTGATGTT A/- AACAGATAAG 3070 hom 92 het 38 0 31 9 A 3 2 213958 CASAVA_Build 4 109349614 3I TAGCCTCTAG ---/TCT TCTTCCTGCC 3070 hom 78 het 34 0 24 10 TCT 1 2 213959 CASAVA_Build 4 109350406 1D GTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 621 hom 39 5 17 17 T 15 14 213960 CASAVA_Build 4 109356738 1I GAGACGGAGT -/C TCACTCTGTC 3070 het 48 hom 18 1 9 8 C 0 1 213961 CASAVA_Build 4 109374818 6I TGTTTACCCA ------/AAAGTC ATTCAGAAGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AAAGTC 0 1 213962 CASAVA_Build 4 109385339 1D ACTACACAGC A/- ATACGAAAGA 3070 hom 141 het 50 0 48 3 A 2 1 213963 CASAVA_Build 4 109389136 1I TTCAACATTA -/T ACCCTTAGAA 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 T 0 1 213964 CASAVA_Build 4 109392788 2I AATTTTGAAT --/TC TCTCTCATTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TC 3 4 213965 CASAVA_Build 4 109393651 1D TCCTGGGGGC G/- GGGGGGGGAT 3070 hom 19 het 26 1 19 6 G 9 8 213966 CASAVA_Build 4 109403019 1D AGGTGCTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 135 het 49 0 45 4 T 10 9 213967 CASAVA_Build 4 109410496 8D AAATTTGATG TTCCTGAT/-------- TCCAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 5 TTCCTGAT 1 0 213968 CASAVA_Build 4 109417021 2D TCACCAACTC TG/-- TGTTTTGTGA 3070 hom 208 het 74 0 69 5 TG 2 1 213969 CASAVA_Build 4 109435805 1D TCTCAAAAAA T/- AATACAATTT 3070 het 3070 hom 39 13 25 1 T 1 0 213970 CASAVA_Build 4 109447477 1D TTTCTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 32 3 18 11 T 15 14 213971 CASAVA_Build 4 109452957 24D GAAGAGTGAA GGAAGGAAGGAGGGAGGGAGGGAG/------------------------ GGAAGGAAGA 3070 hom 53 het 21 0 17 7 GGAAGGAAGGAGGGAGGGAGGGAG 1 0 213972 CASAVA_Build 4 109459408 2D ATTTCCTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 21 0 14 7 T 13 11 213973 CASAVA_Build 4 109460684 2D AAATCTCTTT AA/-- AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 10 8 213974 CASAVA_Build 4 109460995 4D GCCCTTGACC TTTT/---- TAAACTTTAC 3070 hom 117 het 42 0 40 3 T 5 1 213975 CASAVA_Build 4 109473211 1I AGTTTAAGTA -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 144 het 50 0 49 1 T 6 7 213976 CASAVA_Build 4 109485497 1I ATTAATCCAC -/T TGAAGGTCTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 213977 CASAVA_Build 4 109486250 2D GTTAAAATGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 36 het 46 1 37 9 TG 8 7 213978 CASAVA_Build 4 109503030 3I ACAAATGTAA ---/TCT TCTCCTTTTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TCT 1 2 213979 CASAVA_Build 4 109503790 1D GGTTTAGTCT A/- AAAAAAAAAA 1772 het 1772 ref 40 29 4 7 A 11 10 213980 CASAVA_Build 4 109506032 5I TTCAGAGCAA -----/TAACC GGTTATTAGT 3070 hom 99 het 35 0 34 4 TAACC 0 1 213981 CASAVA_Build 4 109507988 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 13 4 T 13 12 213982 CASAVA_Build 4 109509105 1D CATCCTGGCC A/- ACATGGTGAA 3070 het 201 hom 15 1 10 4 A 2 1 213983 CASAVA_Build 4 109512317 1I GATTATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 11 12 213984 CASAVA_Build 4 109538153 1D TACATGTACA C/- CCCCACACAT 3070 hom 200 het 75 0 69 6 C 5 4 213985 CASAVA_Build 4 109548072 2D GTATCTATTT TA/-- TATATATATA 1981 hom 15 het 11 0 6 5 TA 10 9 213986 CASAVA_Build 4 109590409 1D TGCTTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 12 11 213987 CASAVA_Build 4 109593070 1D TGTTCAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 12 11 213988 CASAVA_Build 4 109639988 14D TGAGCCCAGC TATATATATATATA/-------------- TATATATATA 3070 hom 43 het 21 0 15 7 TA 15 8 213989 CASAVA_Build 4 109640789 9I TGAAATTGGC ---------/TCCAAGGAG CCTCAAATCA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 TCCAAGGAG 0 1 213990 CASAVA_Build 4 109647652 2I ATGCTAAAAA --/CT CTCAATAAAC 3070 het 3070 hom 14 7 7 0 CT 1 2 213991 CASAVA_Build 4 109650577 1D ATTATTTAGA T/- TTTTTTTCGG 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 8 7 213992 CASAVA_Build 4 109654182 1D CTTGATGAGT G/- GGGGGGGGAT 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 G 9 8 213993 CASAVA_Build 4 109665153 3I CCACACTACC ---/ATA ATAATTTTGT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 ATA 1 2 213994 CASAVA_Build 4 109665533 1D TCATTGTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1528 hom 33 10 13 10 A 15 14 213995 CASAVA_Build 4 109671552 19D CAGTAATTAC AGCTAAACTCAATTATACA/------------------- AGCTAAACTC 3070 het 3070 ref 51 25 18 12 AGCTAAACTCAATTATACA 1 0 213996 CASAVA_Build 4 109673719 1D TGTCCCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 11 12 T 13 12 213997 CASAVA_Build 4 109675145 1D ATATAAAATT A/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 1 0 213998 CASAVA_Build 4 109700121 1I AGGAAAAAAA -/T AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 T 0 1 213999 CASAVA_Build 4 109705169 1I TGCAAAACTA -/T GCTGTATTCT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 0 1 214000 CASAVA_Build 4 109709404 1I CACAACAAAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 8 9 214001 CASAVA_Build 4 109710573 1I GTGGGCACAA -/G GTCAGGAGTT 3070 het 2387 hom 20 6 11 3 G 1 2 214002 CASAVA_Build 4 109714277 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2387 het 2268 hom 26 10 11 5 A 13 14 214003 CASAVA_Build 4 109715852 1D TTCCCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 1858 het 913 hom 14 4 6 4 A 17 16 214004 CASAVA_Build 4 109745573 3I CTCTATTAAA ---/AAC AAAAAAAAAA 1267 het 1267 ref 15 6 8 1 AAC 0 1 214005 CASAVA_Build 4 109752764 2D ACGTTTTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 16 15 A 16 14 214006 CASAVA_Build 4 109754117 4D TGTTTTAAGC TAAG/---- TGTTATTACC 3070 het 3070 hom 22 7 15 1 TAAG 1 0 214007 CASAVA_Build 4 109759342 1I ACCTGGCTAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 2 3 214008 CASAVA_Build 4 109759663 1D GGACAGAGAC G/- TAAACAACAG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 G 1 0 214009 CASAVA_Build 4 109764673 1D GGCTTTTTTT C/- CCCCAGTCTT 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 C 5 4 214010 CASAVA_Build 4 109768957 2D GTTCTGTGAC TG/-- TGTTTTATTG 3070 het 3070 hom 29 13 16 1 TG 2 1 214011 CASAVA_Build 4 109774136 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 8 9 214012 CASAVA_Build 4 109775139 2D GAGGGCTGAC AG/-- ACAATAAATG 3070 het 3070 hom 36 14 17 7 AG 1 0 214013 CASAVA_Build 4 109776243 2I AAGAAAACAC --/TT GGGATTGCCA 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 T 0 2 214014 CASAVA_Build 4 109776945 1D26M2D CCCAAAATGA TTTTTTTTTTTCTCTTTTTAAGGAATTAC/-TTTTTTTTTTCTCTTTGTAAGGAATT-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 20 25 7 N/A 0 0 214015 CASAVA_Build 4 109786423 4I AAATCAGGCT ----/TTTC TTCTTCTTCA 3070 het 3070 hom 66 29 33 4 TTTC 0 1 214016 CASAVA_Build 4 109796858 4I AAATTTACTT ----/GATA AATATCTACC 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 GATA 0 1 214017 CASAVA_Build 4 109797189 4I CTAGAAAAAT ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 CA 7 9 214018 CASAVA_Build 4 109805072 1D TTCTTGAACC T/- TTTTTTTTTT 2324 het 2324 ref 29 17 5 7 T 12 11 214019 CASAVA_Build 4 109805135 3D TCAGGCATTA TAG/--- TAGCAAATTT 1777 het 1777 ref 25 18 5 3 TAG 2 1 214020 CASAVA_Build 4 109809881 1D CAGGAAAGAT C/- CCCCCAGGGA 3070 het 3070 hom 36 9 21 8 C 6 5 214021 CASAVA_Build 4 109811844 1I TTTTTTGTAG -/A AGATGGGGTT 2743 het 655 hom 12 2 7 3 A 1 2 214022 CASAVA_Build 4 109814117 4D GAGGATAGAC AAAT/---- AGGTCAGTAA 3070 het 3070 hom 46 17 24 9 AAAT 1 0 214023 CASAVA_Build 4 109821763 4I TTATTTCCCC ----/TTCT TTCTAATTAT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 TTCT 1 2 214024 CASAVA_Build 4 109832755 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 AC 5 6 214025 CASAVA_Build 4 109833041 12D GAGGAAGGGA ATGAACATTCGT/------------ ATTGCAGTGT 3070 het 3070 ref 36 20 17 3 ATGAACATTCGT 1 0 214026 CASAVA_Build 4 109835608 2I CTGTGGGTAG --/AT ATGAGAATTG 3070 het 3070 hom 57 23 30 4 AT 1 2 214027 CASAVA_Build 4 109879152 1I TATGACCCAG -/T ACACTGGAGG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 214028 CASAVA_Build 4 109911481 5D CAGAAAAGAT AACAG/----- GAGAGTTTAC 3070 het 3070 ref 45 24 17 6 AACAG 1 0 214029 CASAVA_Build 4 109923496 7I AACTTGCTCT -------/CAATTTG ACAGAGTTGA 3070 het 985 hom 12 2 7 3 CAATTTG 0 1 214030 CASAVA_Build 4 109930444 8I GTTACCAGAG --------/GGTCAGGA GGTCAGGATG 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 GGTCAGGA 1 2 214031 CASAVA_Build 4 109931455 1I GTATCCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 214 hom 26 2 11 13 T 15 16 214032 CASAVA_Build 4 109933934 1I CCAGTCACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 T 10 11 214033 CASAVA_Build 4 109936381 1I TTTCCTAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 8 9 214034 CASAVA_Build 4 109939247 2D TTTTCTTGAG AT/-- AGAGTTTTGC 3070 het 3070 hom 21 9 10 3 AT 1 0 214035 CASAVA_Build 4 109940321 1I ATATTCTTCT -/A TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 0 1 214036 CASAVA_Build 4 109946109 3I GCTGATGTAG ---/TTA TTATAGAAGT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 TTA 1 2 214037 CASAVA_Build 4 109947308 1I TGCATTTTTT -/G TAGAGACAGG 2898 het 2898 ref 18 11 7 0 G 0 1 214038 CASAVA_Build 4 109947704 3I AGGAACTTGG ---/TGA TGAATTAGAT 3070 het 3070 ref 53 32 18 3 TGA 1 2 214039 CASAVA_Build 4 109949792 1D TGCCAAAATA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 9 8 214040 CASAVA_Build 4 109950139 2D GTTTAGGTTG AA/-- AAAGTCTTCT 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 A 5 3 214041 CASAVA_Build 4 109950582 1D GAAAATCCTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 7 6 214042 CASAVA_Build 4 109955983 1D AATATAATTT A/- AAAAATAGTT 3070 het 3070 hom 37 9 24 4 A 6 5 214043 CASAVA_Build 4 109958668 5D ACAAATTCTG AATAA/----- AATAAGAGGT 3070 het 3070 hom 34 13 18 6 AATAA 2 1 214044 CASAVA_Build 4 109961325 1I AACAAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 A 14 15 214045 CASAVA_Build 4 109962649 3D CTAATGGTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3010 het 83 hom 16 1 7 8 T 17 14 214046 CASAVA_Build 4 109986903 1I ACAGAATTCC -/A GATCAATTTC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 0 1 214047 CASAVA_Build 4 109995984 1I GTAAAGCTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 349 hom 39 1 33 5 T 9 10 214048 CASAVA_Build 4 109996850 2D GTTAGGAAAC AG/-- AGGTTTTACT 3070 het 3070 ref 33 18 15 1 AG 2 1 214049 CASAVA_Build 4 110009505 2D ATGGAAGGAA AG/-- AGAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 39 16 15 9 AG 2 1 214050 CASAVA_Build 4 110014527 1D ATGTAATCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 10 9 214051 CASAVA_Build 4 110015071 1I ATCCAGAGGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 8 9 214052 CASAVA_Build 4 110019990 1I TTGCTCCATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 22 9 9 T 9 10 214053 CASAVA_Build 4 110022300 1I TCATAAAATT -/A TAAGCCTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 0 1 214054 CASAVA_Build 4 110023995 3D GTAAGATGAG AAC/--- AACAAAAGAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 AAC 2 1 214055 CASAVA_Build 4 110024211 1D TTAAAACAAA T/- GTTTTCAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 T 1 0 214056 CASAVA_Build 4 110032711 10I GGATAATGCT ----------/GCAAGTAGTG GAAATAAAAC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 GCAAGTAGTG 0 1 214057 CASAVA_Build 4 110038585 1D TAATTTCTAC A/- CAAAAGAGTC 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 1 0 214058 CASAVA_Build 4 110039591 8I TCTATATCTA --------/TATATCTC TATATCTATA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TATATCTC 0 1 214059 CASAVA_Build 4 110045514 1D GCTGCTTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 40 het 51 1 42 8 T 10 9 214060 CASAVA_Build 4 110048420 1D TTAGGACACT A/- ATACCAGCCT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 2 1 214061 CASAVA_Build 4 110052036 3D3M5D9M2D CAATACTCTA TAGATTTTTCATATAATTGTTC/---ATT-----TAAAAATCT-- ATTTAATCTT 3070 het 3070 ref 34 21 13 4 N/A 0 0 214062 CASAVA_Build 4 110053867 13D CTCTAGCTCC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTA 2967 het 920 hom 10 3 7 3 T 22 9 214063 CASAVA_Build 4 110061339 1I ATATATCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 405 hom 39 1 33 5 A 9 10 214064 CASAVA_Build 4 110062007 4I TAGCTATATT ----/TCTA TCTATTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TCTA 1 2 214065 CASAVA_Build 4 110064308 1I CTTGGATGAA -/T TAATGCCATA 3070 het 3070 ref 50 23 17 10 T 1 2 214066 CASAVA_Build 4 110068101 1I GAGTTCCCAG -/T TTTGAGGCAG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 3 4 214067 CASAVA_Build 4 110078199 2I GCTCCCCACA --/CC CCTGGAATCT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 C 2 4 214068 CASAVA_Build 4 110086163 1I TCTTAGAAAA -/T TTTGCCTGGT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 3 4 214069 CASAVA_Build 4 110089171 2D TATAAATGAT AA/-- GTGTAAATTT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 2 0 214070 CASAVA_Build 4 110095302 1D TATATAATAG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 39 10 23 6 A 8 7 214071 CASAVA_Build 4 110101544 9I GGTATGCAAG ---------/CAGAAACCT GTAGCACTAA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 CAGAAACCT 0 1 214072 CASAVA_Build 4 110103347 1I ATTATTACTA -/T TTGTCTATGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 3 214073 CASAVA_Build 4 110105039 1D TTGTATAAAA G/- TTTACTCAAC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 G 1 0 214074 CASAVA_Build 4 110106864 2D TCATCCATTC AT/-- ATGTTTTCTG 3070 het 3070 hom 43 19 21 4 AT 2 1 214075 CASAVA_Build 4 110110499 2I CTACCACCAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 AT 6 7 214076 CASAVA_Build 4 110127988 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 21 0 12 11 T 11 10 214077 CASAVA_Build 4 110132261 10D AAATACTTTC TGCACACACA/---------- TGCACACATA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 TGCACACACA 1 0 214078 CASAVA_Build 4 110133439 1D GTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 195 hom 24 1 22 1 T 10 9 214079 CASAVA_Build 4 110142499 1I TTAAAAGTAC -/T TATCACAAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 214080 CASAVA_Build 4 110145557 3I GGAAAAACAA ---/GTT GTTAATTACA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 GTT 1 2 214081 CASAVA_Build 4 110148415 1D GTGTTCTGAA G/- TGCCATGATA 3070 het 3070 ref 53 28 21 5 G 1 0 214082 CASAVA_Build 4 110149353 8D TACACATACA TGCGCGCG/-------- CACACACACA 941 het 941 ref 41 23 5 17 TGCGCGCG 1 0 214083 CASAVA_Build 4 110150905 1D TGCAGAAAGA C/- CTCCACACTG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 2 1 214084 CASAVA_Build 4 110152037 1D GTTGGCAGGT C/- AAACTAGGAA 3070 het 3070 ref 46 27 12 7 C 1 0 214085 CASAVA_Build 4 110154912 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 23 10 1 A 11 12 214086 CASAVA_Build 4 110155034 1D TCTTCAAATG A/- AAAATTTGTT 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 A 5 4 214087 CASAVA_Build 4 110155617 3D GCAGTCGTCC TAA/--- TAGAGCCATC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 TAA 1 0 214088 CASAVA_Build 4 110160697 4I ATGATATACT ----/AGAG AGAGAAGCAA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 AG 2 4 214089 CASAVA_Build 4 110161112 2D AGATTATTAT GG/-- GGGGGGGGGG 1851 het 25 hom 16 0 6 10 G 13 11 214090 CASAVA_Build 4 110164872 1I GGACATACAT -/A AACCCCATCA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 2 3 214091 CASAVA_Build 4 110165383 4I ATTCGAGTTT ----/CTAA CTTTCTTCCA 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 CTAA 0 1 214092 CASAVA_Build 4 110168052 1I AGATCAGAGA -/G GACTTTGCAG 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 G 1 2 214093 CASAVA_Build 4 110171652 2I CCAAAACTCC --/AT TTTATGCCGT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 AT 0 1 214094 CASAVA_Build 4 110181978 1I CCCCTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 A 9 10 214095 CASAVA_Build 4 110182145 1I TACTTCTTCA -/G GAATTATTTC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 G 1 2 214096 CASAVA_Build 4 110183726 3I GCTCACCCTT ---/CTC CTCTGTAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 CTC 1 2 214097 CASAVA_Build 4 110184192 1I ACAGCCAGTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 8 9 214098 CASAVA_Build 4 110192533 1D TTCAAAGATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 9 8 214099 CASAVA_Build 4 110197244 1I CAAAAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 11 12 214100 CASAVA_Build 4 110203172 12D AAAATAAATT CTGTACACAAAG/------------ CTTTGTGTAA 3070 het 3070 hom 18 7 10 2 CTGTACACAAAG 1 0 214101 CASAVA_Build 4 110214140 5I TAACATTTCA -----/TTGTT GATTGCTAGA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TTGTT 0 1 214102 CASAVA_Build 4 110239147 6D TTATGATCAA TATTAT/------ GCATCATTTT 3070 het 3070 ref 44 26 15 5 TAT 2 0 214103 CASAVA_Build 4 110240235 1I ATAAAAAAAA -/T AAAGAAAAAT 2707 het 2707 ref 19 12 7 0 T 0 1 214104 CASAVA_Build 4 110241023 1D TTTTTGTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 13 12 214105 CASAVA_Build 4 110245200 1D CCTCTAACTC T/- TAACTACCAA 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 T 2 1 214106 CASAVA_Build 4 110246190 3D TTAAATAATC TTG/--- TTGGTGACAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 8 TTG 2 1 214107 CASAVA_Build 4 110246527 1I AGCTGTAAAG -/T TTTCTGTCAA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 T 3 4 214108 CASAVA_Build 4 110249294 4D TTAATAACTC CTCT/---- CTCTTTCTCC 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 CT 4 2 214109 CASAVA_Build 4 110249372 2D GGTTTTTTAT TA/-- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 31 21 7 3 TA 1 0 214110 CASAVA_Build 4 110253117 5D GAAAAAAAAA ACAGT/----- GTTTCTATTC 2329 het 2329 ref 17 10 7 2 ACAGT 1 0 214111 CASAVA_Build 4 110254029 2D ATATGGATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 47 21 24 3 TG 7 6 214112 CASAVA_Build 4 110279817 1D AGTTCCTTGT A/- GATTCTGGAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 1 0 214113 CASAVA_Build 4 110349940 1D ATAATGCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 10 9 214114 CASAVA_Build 4 110407259 1D TACTACGACC A/- AAAAAAAAAA 1735 het 1735 ref 30 17 4 9 A 13 12 214115 CASAVA_Build 4 110438187 1I ATGATTATCT -/G CATGAATAAT 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 G 0 1 214116 CASAVA_Build 4 110440787 1I AAACCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2069 het 2069 ref 30 14 7 9 A 15 16 214117 CASAVA_Build 4 110443674 1I GGCCTGGGCC -/A GGGGCCGAAG 1912 het 1089 hom 16 7 6 3 A 0 1 214118 CASAVA_Build 4 110444346 1I ATCTCCCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 A 11 12 214119 CASAVA_Build 4 110445106 5I GTCTATTCCA -----/TCTTC TCTTCTCTGT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 TCTTC 1 2 214120 CASAVA_Build 4 110450246 13D TAAATATAAA AGGTGATAATATG/------------- AGGGATCTTC 3070 het 3070 ref 38 21 17 3 AGGTGATAATATG 1 0 214121 CASAVA_Build 4 110452837 1D GGAGTTTATT G/- TAAAGATTAT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 G 1 0 214122 CASAVA_Build 4 110453743 4D TTGCTGAGGG CTTT/---- CTTTCTGTCA 3070 het 3070 ref 45 26 15 6 CTTT 2 1 214123 CASAVA_Build 4 110460690 1D GATGGCCTTC T/- TTTTACCAGG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 5 4 214124 CASAVA_Build 4 110493546 3I TTTAGGGAGG ---/TTT TTTTTTTTTT 2823 het 2823 ref 35 18 12 5 T 13 16 214125 CASAVA_Build 4 110494175 1I19M17I TTCTGACTCA -TTTTTTGGGCGGGGAGGGG-----------------/TTTTTTTGGGCGGGGAGGGGGTAGTTATAACAACAGA GTACAGCAAA 3070 het 3070 ref 27 19 11 2 N/A 0 0 214126 CASAVA_Build 4 110496658 2D CTTCCTCGAC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 45 19 14 13 CA 9 8 214127 CASAVA_Build 4 110497298 2D GTCGGACGAC TT/-- TTTTTTTTTT 2623 het 275 hom 13 3 6 4 T 17 15 214128 CASAVA_Build 4 110500540 1D TTCAGAGCGA G/- AACCCAACTG 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 G 1 0 214129 CASAVA_Build 4 110519087 2I TAGGAGAGAA --/AC ACAGAAAAGG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 AC 1 2 214130 CASAVA_Build 4 110524281 18D CAGTGAAGCT TTTGGAACCCAGTGAAGC/------------------ TTTTCAACCC 3070 het 3070 ref 42 23 17 8 TTTGGAACCCAGTGAAGC 1 0 214131 CASAVA_Build 4 110565469 2I GTCTCATGTC --/TT TATTTTTCTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 1 3 214132 CASAVA_Build 4 110587951 1D TAAAAAAAAA G/- TTTCAAAAAA 3070 hom 129 het 48 0 43 7 G 1 0 214133 CASAVA_Build 4 110603497 5I TAAATACTTG -----/CTTTT CTTTTTCAGG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 CTTTT 1 2 214134 CASAVA_Build 4 110700079 17I ACCCTACTGT -----------------/AAGCTAGCTGTGCGAAA AATTGGTTTA 3070 hom 72 het 24 0 25 3 AAGCTAGCTGTGCGAAA 0 1 214135 CASAVA_Build 4 110719861 1I TAAACCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 30 0 15 15 T 13 14 214136 CASAVA_Build 4 110730791 4D TAATTCTAAG AGTA/---- AGTAATAACC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AGTA 2 1 214137 CASAVA_Build 4 110736117 1I AGTACAATTA -/T TGGTGATGAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 1 2 214138 CASAVA_Build 4 110741714 1D ATCTTTTTTT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 8 7 214139 CASAVA_Build 4 110744905 4I TGTTCACGTG ----/TTTA TCTGCTGACC 2045 hom 12 het 5 0 5 0 TTTA 0 1 214140 CASAVA_Build 4 110747815 4D TTAACATCCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTTC 5 4 214141 CASAVA_Build 4 110749671 2D ACAAATGGGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 29 het 21 0 10 11 TC 8 7 214142 CASAVA_Build 4 110754459 2I GTATATACTC --/TA TCCATTTTCC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 TA 0 1 214143 CASAVA_Build 4 110757657 3D CTTTGTCCTA ACC/--- ATATTGTTGT 3070 het 3070 ref 35 21 11 6 ACC 1 0 214144 CASAVA_Build 4 110759374 1I TTAAATAGTT -/A ACATAGTCTA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 A 1 2 214145 CASAVA_Build 4 110762059 1I ATATTTGAGG -/A AAAAAAAAAG 866 het 866 ref 35 28 3 4 A 9 10 214146 CASAVA_Build 4 110770758 5D GCTTTTTTTC TTTTT/----- ATCAGATTAA 3070 het 3070 hom 29 15 14 1 T 5 0 214147 CASAVA_Build 4 110771175 4D AATTCTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 TTTG 4 3 214148 CASAVA_Build 4 110774040 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 2895 het 60 hom 10 1 6 3 T 8 7 214149 CASAVA_Build 4 110783242 1I TTCCTTTTTG -/A AATCAGGCTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 2 3 214150 CASAVA_Build 4 110788828 2D ATGGAAGGAA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 AG 5 4 214151 CASAVA_Build 4 110789589 4D TGATGGAGTT TTTA/---- TTTATTTTAT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TTTA 2 1 214152 CASAVA_Build 4 110794723 1D AAATGTGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 87 hom 17 1 13 3 T 10 9 214153 CASAVA_Build 4 110799886 1I CCCACCTCAG -/C AATCAGAGGA 3070 hom 65 het 26 0 21 5 C 0 1 214154 CASAVA_Build 4 110805549 2D TAACTCTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 32 1 18 14 A 12 10 214155 CASAVA_Build 4 110807158 1I GTATGATGAT -/G GAGCATCTCT 3070 het 3070 hom 78 30 35 13 G 1 2 214156 CASAVA_Build 4 110822681 4D GTGAGTTCTC TGGT/---- TGGGTGTGAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TGGT 1 0 214157 CASAVA_Build 4 110824671 1D TCCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1609 het 1609 ref 27 13 6 8 T 15 14 214158 CASAVA_Build 4 110825516 1I CCTCATTTAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 A 8 9 214159 CASAVA_Build 4 110825844 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 405 hom 42 1 32 9 T 9 10 214160 CASAVA_Build 4 110829495 5I TTTAAGGCAG -----/TTCTC TTCTCTGCTA 3070 het 2902 hom 26 11 9 6 TTCTC 1 2 214161 CASAVA_Build 4 110854938 1I TTGTCAAAGG -/T TATGTTCTTC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 1 2 214162 CASAVA_Build 4 110856077 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTTATTTATT 837 het 837 ref 20 4 4 12 TTA 1 0 214163 CASAVA_Build 4 110867537 1I TAACTCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2677 hom 39 10 16 13 T 15 16 214164 CASAVA_Build 4 110872637 17I TGGTTCTTAC -----------------/AACTCTTCTTCCAGAGA AACTCCCTAG 3070 hom 120 het 43 0 41 4 AACTCTTCTTCCAGAGA 0 1 214165 CASAVA_Build 4 110887967 1I TTTAAAAAAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 7 8 214166 CASAVA_Build 4 110896923 1I GAAGGAAAAG -/A AGGAGGGAGG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 1 2 214167 CASAVA_Build 4 110896993 3D GGAAGAGATG GAA/--- GAAGAAGGAG 3070 hom 56 het 22 0 19 5 GAA 3 2 214168 CASAVA_Build 4 110898429 5I AAGGATAATT -----/TTTAA TTTGGAAAAA 3070 hom 75 het 26 0 25 1 TTTAA 0 1 214169 CASAVA_Build 4 110899871 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 0 1 214170 CASAVA_Build 4 110909499 2I88M4D AAATAGCTTT --ACACACACACACACACAAATGACAAATTGGTCATTCTGGAAACTGGCTTTTGACACAGTGATCTAGAATGAAATATGCCAGTTACGCACTTT/ACACACACACACACACACAAATGACAAATTGGTCATTCTGGAAACTGGCTTTTGACACAGTGATCTAGAATGAAATATGCGAGTTACACA---- TCATGGTTCC 3070 het 3070 hom 58 34 53 14 N/A 0 0 214171 CASAVA_Build 4 110939126 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAGACCA 3070 het 446 hom 35 2 25 8 A 5 6 214172 CASAVA_Build 4 110951089 1D GAGATTGGAA T/- TTTTTTTTTT 820 het 820 ref 29 21 2 6 T 15 14 214173 CASAVA_Build 4 110951410 2I TCCCTTTATT --/CA CAGTCAACTG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 CA 1 2 214174 CASAVA_Build 4 110961586 3D ATTTCTCAGA ATT/--- ATTTATTTGG 3070 het 3070 hom 45 15 26 6 ATT 2 1 214175 CASAVA_Build 4 110969791 1D TAATTGTTTA C/- GTTTCTTCCT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 C 1 0 214176 CASAVA_Build 4 110974450 1I AGGCTAATTC -/T TTTTAGCAGT 3070 het 3056 hom 36 9 19 8 T 4 5 214177 CASAVA_Build 4 110975102 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 936 het 332 hom 6 1 5 0 T 11 12 214178 CASAVA_Build 4 110977949 1I ATATAATGAC -/T TACCAGTATT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 1 2 214179 CASAVA_Build 4 110978448 4I TGGCACGATC ----/TCGG TCGGCTCACT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TCGG 1 2 214180 CASAVA_Build 4 110979113 1D CTTGTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 11 10 214181 CASAVA_Build 4 110994642 2I CCAGCTTTGT --/TC TTTTTGCTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TC 0 1 214182 CASAVA_Build 4 111021932 1I GAGAAAAAAA -/G GTGTCAGAAA 3070 hom 160 het 59 0 54 5 G 1 2 214183 CASAVA_Build 4 111027744 4I AGCTGAACAC ----/AGAG AGCGTAGAGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AG 1 3 214184 CASAVA_Build 4 111028561 1I ATCATGGCAA -/G TCAGATAAGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 0 1 214185 CASAVA_Build 4 111030644 9D AACAAGGGGT CATCAAATG/--------- CATCAAATGA 3070 hom 111 het 45 0 38 8 CATCAAATG 2 1 214186 CASAVA_Build 4 111032677 2I ATCAATATCA --/AT ATATATATAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AT 4 5 214187 CASAVA_Build 4 111041941 1D GTTCATGGGT C/- CCCCTCCCAG 3070 hom 92 het 38 0 31 8 C 5 4 214188 CASAVA_Build 4 111042663 3D AAATTATGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 46 0 31 15 T 17 14 214189 CASAVA_Build 4 111116912 2I AAATATGTTT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 55 21 15 19 AC 6 7 214190 CASAVA_Build 4 111134637 1I TTGGTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 8 11 11 T 13 14 214191 CASAVA_Build 4 111163318 1D TCATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1716 het 1716 ref 28 16 5 7 T 15 14 214192 CASAVA_Build 4 111194544 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1405 het 527 hom 6 2 4 1 A 12 11 214193 CASAVA_Build 4 111204851 5D GCGATGAGGA GGTGG/----- GGATCACCAT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 GGTGG 1 0 214194 CASAVA_Build 4 111204969 1D GATGTCAGGA G/- GGGGCCAAGA 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 G 5 4 214195 CASAVA_Build 4 111207494 1I ACACATTAGG -/T TATTTGTCCT 3070 het 2306 hom 17 6 10 1 T 1 2 214196 CASAVA_Build 4 111209927 1D TTAAGCTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 T 11 10 214197 CASAVA_Build 4 111230304 2D CTTGCCCAAT GA/-- GAGCTTATGG 3070 het 3070 ref 57 31 21 7 GA 2 1 214198 CASAVA_Build 4 111232371 2D AAAGCCACCC CT/-- CTGTCTACTA 3070 het 3070 ref 48 22 22 7 CT 2 1 214199 CASAVA_Build 4 111236413 1I TCCAGGGTGG -/A AACAGGTGTA 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 A 2 3 214200 CASAVA_Build 4 111238803 1I GGATACCGTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 43 21 13 9 A 8 9 214201 CASAVA_Build 4 111239864 1D TTGCACTGTT A/- AGACTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 A 2 1 214202 CASAVA_Build 4 111241096 1I CTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 8 12 8 T 9 10 214203 CASAVA_Build 4 111244389 9D AGTTAATGGA AGTGTAAAG/--------- ATCTCATTTT 3070 het 3070 ref 48 23 23 4 AGTGTAAAG 1 0 214204 CASAVA_Build 4 111252035 1D AACCTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 11 10 214205 CASAVA_Build 4 111252747 2I ACTGAAAGTC --/TT TGAGCTGGGA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 1 3 214206 CASAVA_Build 4 111262304 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 492 hom 15 2 8 5 A 9 10 214207 CASAVA_Build 4 111272496 1D AGGATAGGGG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 A 7 6 214208 CASAVA_Build 4 111286303 2D GAGACTGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3010 hom 34 11 21 2 A 12 10 214209 CASAVA_Build 4 111298164 1D TAGTCCCAGC T/- ACTCATGAGG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 0 214210 CASAVA_Build 4 111300128 1I AGCCAAGTCT -/C CCTTCTCTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 C 2 3 214211 CASAVA_Build 4 111303190 1D CTCATGCAAT C/- CCACCCACCT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 C 3 2 214212 CASAVA_Build 4 111310054 4D ATGTTGGCCA GGCT/---- GGCTGGCCTG 1840 het 690 hom 8 2 4 3 GGCT 2 1 214213 CASAVA_Build 4 111314770 1D AAAGACAGTC T/- TTTTTTTTTT 1798 het 1281 hom 21 8 7 6 T 17 16 214214 CASAVA_Build 4 111320173 4D AAAACAAGAA TATT/---- TATTTTCATT 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 TATT 2 1 214215 CASAVA_Build 4 111320996 4I TGTATGTATG ----/TATT TATTTATAGG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TATT 1 2 214216 CASAVA_Build 4 111322217 1D AACTACAGGG T/- TAACTAAGAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 2 1 214217 CASAVA_Build 4 111324218 1D TACAGATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 T 10 9 214218 CASAVA_Build 4 111325953 1I GGAGCTTTGC -/A AATGTTCCAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 2 3 214219 CASAVA_Build 4 111332798 1D TCCATCCAAG A/- AAAAAAAAAA 2578 het 2036 hom 22 10 8 4 A 14 13 214220 CASAVA_Build 4 111348270 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 168 hom 24 1 15 8 A 13 12 214221 CASAVA_Build 4 111359618 1D CAAGTCTCAA G/- GAACTTCCCA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 G 2 1 214222 CASAVA_Build 4 111367371 1D AAGTACAATT A/- AAAAAAAAAA 2725 het 146 hom 20 2 10 8 A 13 12 214223 CASAVA_Build 4 111371816 1I GATTCTCCTG -/C CTCAGCCTCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 2 214224 CASAVA_Build 4 111385215 1I GTATGGAACT -/A AAAAAACAGC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 6 7 214225 CASAVA_Build 4 111388267 1I GTCTATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2196 hom 37 10 14 13 T 13 14 214226 CASAVA_Build 4 111388672 6D10M16D CACGAGAGTG CCCTATGGGCTAGCAGTGACCATGGCTGGGTT/------GAGGAGGCAG---------------- GTTGAGGGGG 3070 het 3070 ref 38 25 16 9 N/A 0 0 214227 CASAVA_Build 4 111391221 1D ATGTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 12 11 214228 CASAVA_Build 4 111397487 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 709 het 709 ref 27 19 2 6 TTC 1 0 214229 CASAVA_Build 4 111398065 1I ATATTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2883 het 2204 hom 21 10 7 4 T 10 11 214230 CASAVA_Build 4 111400004 1I CAGGCTAGCT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 8 9 214231 CASAVA_Build 4 111405082 1I TCCAGTTTTA -/T TTTTTTTGCT 3070 het 2244 hom 23 7 11 5 T 7 8 214232 CASAVA_Build 4 111406460 3D GCCAAGTTAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1618 hom 19 9 9 1 T 15 12 214233 CASAVA_Build 4 111410819 1D CTCAGGTGAT C/- CGCCTGCCTT 3070 het 499 hom 13 1 9 3 C 2 1 214234 CASAVA_Build 4 111411136 2I CATATTTTAA --/TT TTTTTTTTTT 1264 het 746 hom 35 3 9 23 T 14 16 214235 CASAVA_Build 4 111414365 1I GGCTCAAAAA -/G TTCCCCCACT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 0 1 214236 CASAVA_Build 4 111417386 1D TAGGAGAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 39 0 20 19 T 16 15 214237 CASAVA_Build 4 111427752 1I CATAGTGAGA -/C CCCCATCTCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 4 5 214238 CASAVA_Build 4 111430151 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 13 11 214239 CASAVA_Build 4 111431179 1I TCTTCCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 42 0 32 10 T 11 12 214240 CASAVA_Build 4 111431841 1I TATAAAAAAA -/G TACAAAGAGC 3070 hom 100 het 40 0 34 6 G 0 1 214241 CASAVA_Build 4 111431997 1D TCTGTCAATT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 8 7 214242 CASAVA_Build 4 111439970 1D TCTCCTCACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 28 0 21 8 T 10 9 214243 CASAVA_Build 4 111442029 1D TCTAGCCAAT C/- CCCCCACAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 C 6 5 214244 CASAVA_Build 4 111443033 1I CCATGTTGCA -/G TATGTGTCAG 3070 hom 160 het 58 0 54 4 G 0 1 214245 CASAVA_Build 4 111446558 5I TATATGGAAC -----/TATTT TGTTTTTTCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TATTT 0 1 214246 CASAVA_Build 4 111454693 8D GTTATAAAAG TTATTATA/-------- TTATTATATT 3070 het 1557 hom 19 4 14 1 TTATTATA 3 2 214247 CASAVA_Build 4 111457983 1D GAAAGATTTG A/- AATCTTTTGC 3070 hom 114 het 44 0 36 8 A 3 2 214248 CASAVA_Build 4 111471262 1I GTCTCCACAC -/A AATCTCATGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 3 214249 CASAVA_Build 4 111485621 1D ATCTGTTTTA T/- TTTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 T 6 5 214250 CASAVA_Build 4 111509582 1I ACTAACCTTT -/C CTGAGCCTCA 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 C 1 2 214251 CASAVA_Build 4 111510497 1I ATATTTCTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 9 10 214252 CASAVA_Build 4 111521571 10D3M8D CTGTGACTCA TTGGCACCCTGAAAGATAGGG/----------GAA-------- ACAATAGAAA 3070 het 3070 ref 38 23 14 4 N/A 0 0 214253 CASAVA_Build 4 111523071 1D AACCATAAGC A/- CCAAAATATA 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 A 1 0 214254 CASAVA_Build 4 111526305 2I TGTGGAAGTC --/AG AAAATTACAT 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 AG 0 1 214255 CASAVA_Build 4 111535532 9D TAAATCATTT CAATGACTG/--------- CAATTACTGG 3070 het 3070 hom 29 16 13 2 CAATGACTG 1 0 214256 CASAVA_Build 4 111553231 1I TAGCTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 15 12 T 11 12 214257 CASAVA_Build 4 111589298 1D GAATTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1691 hom 35 5 15 16 T 15 14 214258 CASAVA_Build 4 111599036 3I GAAAAACACC ---/AAG ACCTTATAAT 3070 het 3070 hom 46 13 28 5 AAG 0 1 214259 CASAVA_Build 4 111619044 1D AATAATCTGT A/- AAATAATTTC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 4 3 214260 CASAVA_Build 4 111652367 1D CATTCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 8 13 15 T 13 12 214261 CASAVA_Build 4 111666082 1I AGAGAGAATC -/T TTCACCCGTT 3070 het 3070 hom 42 12 26 4 T 2 3 214262 CASAVA_Build 4 111670525 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTG 2260 het 972 hom 9 3 5 1 A 7 8 214263 CASAVA_Build 4 111670687 1I GTCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 9 14 8 A 9 10 214264 CASAVA_Build 4 111674819 1D AGGCAATAGT G/- GGACTCTCCC 3070 hom 94 het 34 0 31 3 G 3 2 214265 CASAVA_Build 4 111680403 3D CAGCATTCAT ATC/--- ATCACCTAAG 3070 het 3070 ref 22 10 10 3 ATC 2 1 214266 CASAVA_Build 4 111697081 11D ATAATGTTTC AATGTGTACAT/----------- ACATCTTAGT 3070 het 3070 ref 35 18 17 5 AATGTGTACAT 1 0 214267 CASAVA_Build 4 111706075 1D CATTCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 13 12 214268 CASAVA_Build 4 111717120 1D AATTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 A 12 11 214269 CASAVA_Build 4 111726602 1D ACCTGTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 16 1 13 2 T 13 12 214270 CASAVA_Build 4 111731147 4D7M23I CCTTTTTTAA TCACTGAGAAA-----------------------/----GGAGAAAAGGCTTAAAAGGGCTTAAAACCT CCATGACAAG 3070 het 3070 ref 40 25 19 0 N/A 0 0 214271 CASAVA_Build 4 111746783 1I GAGGTGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2036 hom 27 7 12 8 T 13 14 214272 CASAVA_Build 4 111750775 4D ATATACAGAT ACAC/---- ACACACTAAG 3070 hom 33 het 20 0 12 10 AC 5 3 214273 CASAVA_Build 4 111789819 4D TAACAAAAAC AAAT/---- AAAGAATAGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAAT 1 0 214274 CASAVA_Build 4 111797344 1D TGGTATCTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 48 0 38 11 T 10 9 214275 CASAVA_Build 4 111801078 1D GGAAATTAGA C/- CTTTTTCAGA 3070 hom 45 het 17 0 16 2 C 2 1 214276 CASAVA_Build 4 111811481 1I TGTACTACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 129 het 47 0 42 5 T 9 10 214277 CASAVA_Build 4 111824629 1I GCATTGGGGT -/G GGGGGGGCGG 3070 hom 33 het 13 0 10 3 G 7 8 214278 CASAVA_Build 4 111835034 1I TTTTTTGCTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 222 hom 32 1 26 5 T 8 9 214279 CASAVA_Build 4 111836316 1D AAATAACTAT A/- AAAAATTAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 6 5 214280 CASAVA_Build 4 111836672 1I CTGTATGTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 411 hom 36 1 31 4 T 9 10 214281 CASAVA_Build 4 111848089 1I GAGGCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 728 hom 39 2 32 5 A 10 11 214282 CASAVA_Build 4 111889510 1D AAGAAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 2073 het 2073 ref 53 33 7 13 T 15 14 214283 CASAVA_Build 4 111895475 3D GCTACACATG TCT/--- TCTTTTATTT 3070 het 3070 hom 46 18 24 5 TCT 2 1 214284 CASAVA_Build 4 111905628 1I AATAATGCAC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 7 8 214285 CASAVA_Build 4 111909230 2D TGATGGTAAT GA/-- GAGGTGAAAG 3070 hom 111 het 41 0 37 5 GA 2 1 214286 CASAVA_Build 4 111911477 4I ATTCTATAAA ----/TAAT TTCAGCATTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TAAT 0 1 214287 CASAVA_Build 4 111914846 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2954 hom 44 12 19 14 TG 9 8 214288 CASAVA_Build 4 111928460 1I TTTTTAATGG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 8 9 214289 CASAVA_Build 4 111951335 1D TAATTAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 9 8 214290 CASAVA_Build 4 111951588 2I GGAGGGAAGC --/CT TTATAGGCCA 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 CT 0 1 214291 CASAVA_Build 4 111954674 1D TACAGCCACA C/- CCCACATCAT 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 C 4 3 214292 CASAVA_Build 4 111958843 1D GATAATAGTA T/- TTTGGGGATA 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 T 4 3 214293 CASAVA_Build 4 111970682 1D TGACAACATT A/- AAATTCATTG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 4 3 214294 CASAVA_Build 4 111972789 4D ATGTTCCTGA TTGT/---- TAGAATAATT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 TTGT 1 0 214295 CASAVA_Build 4 111979514 12I GAGTGACATG ------------/TGCATTTATGCA TGAACTACCA 3070 hom 99 het 35 0 33 3 TGCATTTATGCA 0 1 214296 CASAVA_Build 4 111983396 2D GAAGATTCCT AA/-- GAGAGGCTGC 3070 het 3070 ref 46 18 21 7 A 2 0 214297 CASAVA_Build 4 111993716 1I CGCTTTCTTT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3035 hom 30 8 14 8 A 6 7 214298 CASAVA_Build 4 112000561 4I ATATATATAT ----/ATAC ATATATTTTA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 ATAC 0 1 214299 CASAVA_Build 4 112018421 2I CAGTTAAGAT --/TG CTGGACACTA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 TG 0 1 214300 CASAVA_Build 4 112019160 2D TAGTTAACTC TG/-- TGGGTAGGAG 3070 het 3070 hom 53 21 28 5 TG 2 1 214301 CASAVA_Build 4 112023501 1D CGCTTTGTTC A/- GGGGGATGCC 1661 het 1661 ref 36 25 5 7 A 1 0 214302 CASAVA_Build 4 112037735 1I CTTTCTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 515 hom 31 2 24 5 T 11 12 214303 CASAVA_Build 4 112042109 6I GAATAGTTGA ------/TTGTAG TTGTATGAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TTGTAG 0 1 214304 CASAVA_Build 4 112050975 1D TGCAAAATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 178 hom 39 1 34 4 T 10 9 214305 CASAVA_Build 4 112059849 1D CACGGGTTCT G/- GGGGTTAGGA 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 5 4 214306 CASAVA_Build 4 112060910 1D AGTCTATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 47 0 38 10 T 11 10 214307 CASAVA_Build 4 112062125 1I TTTAAGAATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 9 214308 CASAVA_Build 4 112064046 1D ATCATTTTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 45 het 23 0 16 7 G 11 10 214309 CASAVA_Build 4 112206058 1D TATATTTTTC T/- CCAGAAACAG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 1 0 214310 CASAVA_Build 4 112217954 4D CTGAAATCAT AACA/---- AACAATCATA 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 AACA 2 1 214311 CASAVA_Build 4 112218680 1D CCTGCCAACC A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 8 7 214312 CASAVA_Build 4 112224136 1I CACAGACATA -/T CATAAAATAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 0 1 214313 CASAVA_Build 4 112225650 4D AAATATTCTA TATT/---- TATGTTTTTG 3070 het 1980 hom 15 4 9 4 TATT 1 0 214314 CASAVA_Build 4 112231439 1D6M6D TATAATTTCA GATACAAGGCTGG/-CCACAA------ GCGTGGTGGC 3070 hom 69 het 24 0 23 5 N/A 0 0 214315 CASAVA_Build 4 112231961 1D GACTTCAACA C/- CCCCTTTTCA 3070 het 3070 hom 56 26 26 6 C 5 4 214316 CASAVA_Build 4 112234174 1I ATTAAAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 8 9 214317 CASAVA_Build 4 112242825 11D TGTTGAATGA ATCAATAGCTT/----------- TTGAATTTTA 3070 het 3070 ref 28 21 8 4 ATCAATAGCTT 1 0 214318 CASAVA_Build 4 112243323 3I TATATAAGTT ---/ATA ATAAGTTATA 2392 hom 12 het 5 0 5 0 ATA 1 2 214319 CASAVA_Build 4 112253337 1D CCTCTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 T 13 12 214320 CASAVA_Build 4 112259719 1D AAATCTGAAG C/- TTCTGTACTG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 C 1 0 214321 CASAVA_Build 4 112260940 3I CCATTCATGG ---/CTT CTTCTCCTCA 3070 hom 113 het 45 0 38 7 CTT 1 2 214322 CASAVA_Build 4 112261837 1I TTAGCTACCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 9 10 214323 CASAVA_Build 4 112268633 2D CAGAAGTCCC TT/-- TTTTTTGCCA 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 T 8 6 214324 CASAVA_Build 4 112277383 2D TCCCTAATAT AC/-- AGAGTCTCTG 3070 het 3070 ref 38 18 14 11 AC 1 0 214325 CASAVA_Build 4 112281106 1D ATAAATACAT A/- AATACATAAA 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 A 3 2 214326 CASAVA_Build 4 112283099 14D TGTTGGTAGA GAAACAGCACTGAG/-------------- GAAACCTCAA 3070 het 3070 ref 27 22 9 4 GAAACAGCACTGAG 1 0 214327 CASAVA_Build 4 112284501 2D ATGCACACAC AT/-- GTGTACACAT 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 AT 1 0 214328 CASAVA_Build 4 112284923 3I ATTAACTGAC ---/CAA CAACAACTGG 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 CAA 2 3 214329 CASAVA_Build 4 112285263 1I TGAATCCCTC -/T CCTAAATGCA 3070 hom 88 het 42 0 35 7 T 0 1 214330 CASAVA_Build 4 112286135 1D ATTTTTAACA T/- TTTTTTTTGC 1305 het 1305 ref 43 32 3 8 T 9 8 214331 CASAVA_Build 4 112287596 1D AATTCTTTTC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 2612 hom 26 11 12 3 T 7 6 214332 CASAVA_Build 4 112297915 2D GTATTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 26 10 T 12 10 214333 CASAVA_Build 4 112299929 1I ATAGACATAG -/A AAAAACATTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 5 6 214334 CASAVA_Build 4 112302918 1D TTATTAAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 8 214335 CASAVA_Build 4 112310302 3I ATTCCCAAAG ---/TAT TATAAATCAT 2745 hom 15 het 7 0 6 1 TAT 1 2 214336 CASAVA_Build 4 112315305 3I GGCAGATAAG ---/GAT GGTGTTTGAA 3070 hom 128 het 47 0 42 5 GAT 0 1 214337 CASAVA_Build 4 112328935 4I ATTCATTAAG ----/AGTT AGAGATTAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AGTT 0 1 214338 CASAVA_Build 4 112331451 4I TGTTAAACTA ----/AATT AATCTAATTA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AATT 0 1 214339 CASAVA_Build 4 112344752 2I GAGAACATTA --/AG AGAGAAAGAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AG 2 3 214340 CASAVA_Build 4 112346498 4I CTTTCTCTCA ----/TTCT TTCTTTTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TTCT 1 2 214341 CASAVA_Build 4 112349454 1D GTTTAATGAC A/- GGGGTGTTAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 1 0 214342 CASAVA_Build 4 112359645 1D TCTGTAGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 10 10 6 T 10 9 214343 CASAVA_Build 4 112361962 1D AGCAACAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 T 9 8 214344 CASAVA_Build 4 112367069 1D TTTCCCCTGC T/- TTTTAATTCA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 5 4 214345 CASAVA_Build 4 112367478 1I ATGGTAAAAG -/A AAAAAAGGGG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 6 7 214346 CASAVA_Build 4 112372004 1D ATGAAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 10 9 214347 CASAVA_Build 4 112376782 1D TTTTGCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 16 0 10 7 A 13 12 214348 CASAVA_Build 4 112381313 2D ACATAAACAC TG/-- TGACAGAAGA 3070 het 3070 ref 56 24 24 10 TG 2 1 214349 CASAVA_Build 4 112400238 2I GATGAAATGA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 1349 hom 21 5 15 1 TG 4 5 214350 CASAVA_Build 4 112402508 4I GATATGTAAT ----/AAAC AAATCTGCTT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 AAAC 0 1 214351 CASAVA_Build 4 112409634 1D TCAAAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 2224 het 1063 hom 20 5 6 10 A 17 16 214352 CASAVA_Build 4 112417645 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 7 6 214353 CASAVA_Build 4 112458734 2D ACTGAAGAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3007 hom 33 9 9 15 AC 6 5 214354 CASAVA_Build 4 112460292 5D TTTGTAGAGT TTACA/----- TTACATTTCA 1891 het 1891 ref 17 10 4 4 TTACA 2 1 214355 CASAVA_Build 4 112466446 3D AGGTGTGAAA CTT/--- CTTCCACTTG 3070 het 3070 hom 42 18 18 7 CTT 2 1 214356 CASAVA_Build 4 112467175 4D ACATAAATCT AACA/---- AACAAACACC 3070 het 3070 ref 41 22 16 5 AACA 3 2 214357 CASAVA_Build 4 112470121 1D AAAATACCCC A/- AATAGCAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 3 2 214358 CASAVA_Build 4 112471440 1I AGTTGGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 10 11 9 A 9 10 214359 CASAVA_Build 4 112483541 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 454 hom 15 2 10 3 A 11 10 214360 CASAVA_Build 4 112494762 1D ATTACTGAGT G/- GGAACATTTG 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 G 3 2 214361 CASAVA_Build 4 112495810 1I CCAAAAACCT -/C CAACATAAGA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 C 1 2 214362 CASAVA_Build 4 112496608 2I AAAAGAAAAA --/AG AAAAAAAAAG 3070 het 3051 hom 29 14 13 2 AG 0 1 214363 CASAVA_Build 4 112497544 3D CTGACGAGGG TGA/--- TGATAAGAAG 3070 het 3070 ref 45 20 14 12 TGA 2 1 214364 CASAVA_Build 4 112498715 4D TGTCAGTTGT TAAA/---- TAGTTATGTT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 TAAA 1 0 214365 CASAVA_Build 4 112502887 4D TTGTTTTTTT TTTG/---- TTGTTGTTGT 3070 het 2345 hom 27 7 18 3 TTTG 1 0 214366 CASAVA_Build 4 112505723 1I TAGCAAAGAC -/A TTAAATCAAT 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 A 0 1 214367 CASAVA_Build 4 112511124 2D AAGTATAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2663 het 2663 ref 15 7 6 2 A 12 10 214368 CASAVA_Build 4 112526529 1I GTGGTCCTCA -/C AAAAAGAACA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 C 0 1 214369 CASAVA_Build 4 112543835 1D ATAGTCCAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 10 9 214370 CASAVA_Build 4 112567394 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1125 het 1125 ref 23 16 4 4 A 14 13 214371 CASAVA_Build 4 112573222 4D TTTATGGTTT TCAA/---- TCAATCTGGA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TCAA 2 1 214372 CASAVA_Build 4 112577654 10D TTGTCAGTAA GCTTCTAGTC/---------- AATAGTACGC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 GCTTCTAGTC 1 0 214373 CASAVA_Build 4 112581414 5D CACCCAGAAA TAACT/----- TAAGAAGAGT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 TAACT 1 0 214374 CASAVA_Build 4 112583575 3D TGCTTGTACG TCT/--- TCTTTTGAGA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 TCT 2 1 214375 CASAVA_Build 4 112586149 1D TTGGGTGGGG A/- CACAGCCAAC 3070 hom 75 het 26 0 25 1 A 1 0 214376 CASAVA_Build 4 112587231 1D CTAAAAAAAG T/- ACATACCTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 0 214377 CASAVA_Build 4 112588110 2D TTCAGAGCTC TT/-- GAGTGACCAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 0 214378 CASAVA_Build 4 112595922 1D ACCTGGTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 26 3 14 9 A 14 13 214379 CASAVA_Build 4 112605185 4I CTGAAAAAAT ----/AAAC AAAGAATCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAAC 0 1 214380 CASAVA_Build 4 112607433 1I CAGAGAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 11 12 214381 CASAVA_Build 4 112617047 5I GGAGAAGTCT -----/TTAAG TTGAGAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TTAAG 0 1 214382 CASAVA_Build 4 112622669 2D GAAAGAAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 2367 het 1275 hom 32 8 7 18 A 18 16 214383 CASAVA_Build 4 112623286 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 389 hom 15 het 11 0 6 5 AAG 1 0 214384 CASAVA_Build 4 112627757 1I TGAGTCACCC -/A AAAAAAAAAA 3050 het 2503 hom 34 12 15 7 A 17 18 214385 CASAVA_Build 4 112640103 1D AACCACATGA G/- GTAACTCTGC 3070 hom 123 het 49 0 42 7 G 2 1 214386 CASAVA_Build 4 112652945 1D AGCATTCTGT A/- ATACATTCAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 1 214387 CASAVA_Build 4 112660357 5I ACAAATGGGC -----/TTAGA TTAGTTGCCC 3070 hom 108 het 46 0 36 10 TTAGA 0 1 214388 CASAVA_Build 4 112686821 1D ACAAATAATC T/- TTTTTTTTTT 995 het 995 ref 29 20 4 5 T 17 16 214389 CASAVA_Build 4 112703130 4I ATTTAATTTA ----/TATT TATTATTTTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TATT 1 2 214390 CASAVA_Build 4 112751995 1I AATCTGGTGA -/C CACATAGAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 1 2 214391 CASAVA_Build 4 112767889 5D GTTCTTGTGC TGTGT/----- TTTTCAGCTC 2769 het 2769 ref 17 9 7 2 TGTGT 1 0 214392 CASAVA_Build 4 112780297 1D GGCTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 11 10 214393 CASAVA_Build 4 112789914 2I GAAGGCAGAC --/AT TGACGGAGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 0 1 214394 CASAVA_Build 4 112811480 3I CTGAAGGTTA ---/ATT ATATGTCTAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 ATT 0 1 214395 CASAVA_Build 4 112816600 2D GCCACTCCCC CT/-- GTCACATGCC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CT 1 0 214396 CASAVA_Build 4 112824819 1I TTTGCAGGAG -/A AAAAAAAAAA 2438 het 2438 ref 25 10 8 7 A 14 15 214397 CASAVA_Build 4 112827398 2D TGCTAGTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 29 0 18 11 A 14 12 214398 CASAVA_Build 4 112833932 1I CTGTGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 512 hom 36 3 24 9 A 11 12 214399 CASAVA_Build 4 112834241 2D TATTTTTTTC TG/-- TGTGTTTTTT 3070 het 2839 hom 22 7 12 3 TG 3 2 214400 CASAVA_Build 4 112839959 1D TTTGCTGATT G/- GACACAAAAT 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 G 2 1 214401 CASAVA_Build 4 112842181 1I ACAGAAAATA -/G GGGAAAAAAA 3070 hom 50 het 41 1 35 5 G 3 4 214402 CASAVA_Build 4 112845961 6I ATATATAGAT ------/ATATAG ATATAGATAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATATAG 2 3 214403 CASAVA_Build 4 112853356 1D ATCAACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 12 11 214404 CASAVA_Build 4 112900406 1D AAATACAATT A/- AAAACCAATC 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 5 4 214405 CASAVA_Build 4 112904644 1I TGACCAACAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 22 8 9 5 A 8 9 214406 CASAVA_Build 4 112912157 4I ATATATACAC ----/ACAT ACACTTTCTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ACAT 0 1 214407 CASAVA_Build 4 112934695 4D AGCAAAACAG ACTC/---- ACTATTTCAT 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 ACTC 1 0 214408 CASAVA_Build 4 112935813 1I AGTAAAGTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 8 9 214409 CASAVA_Build 4 112936645 1D GAGGAGGGTC T/- TTTTTTTTTT 2958 het 2958 ref 32 14 8 10 T 11 10 214410 CASAVA_Build 4 112938157 10D ACAAATATAC ATCTGCATTG/---------- ATTGGATATT 3070 het 3070 ref 55 28 26 7 ATCTGCATTG 1 0 214411 CASAVA_Build 4 112939428 2D AATAACAAAA AG/-- AATATCCCTT 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 AG 1 0 214412 CASAVA_Build 4 112944493 1I TAGTAGAGTT -/G GGGGTTTCAC 3070 het 1503 hom 14 5 8 1 G 4 5 214413 CASAVA_Build 4 112956717 2I GAGAGAGTAT --/AC ACACACACAC 1493 het 1493 ref 17 10 5 2 AC 6 7 214414 CASAVA_Build 4 112963984 1I TTAATCCCCC -/T GCTTAATAAA 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 T 0 1 214415 CASAVA_Build 4 112967843 1I AGTCATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 A 10 11 214416 CASAVA_Build 4 112970226 1D15M1D TTGAATATTC TTTTTTTTTTTTGAATA/-TTTTTTTTTTTGAAT- TTCTTATATG 3070 het 3070 ref 39 22 12 11 N/A 0 0 214417 CASAVA_Build 4 112978728 2I ATTAATTGCC --/TA TATATTTAGT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 TA 2 3 214418 CASAVA_Build 4 112984179 1D GATCCACCCA C/- CTCGGCCTCC 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 C 2 1 214419 CASAVA_Build 4 112993818 2I TCTGTAAAAC --/GT GTGTGATCTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 GT 2 3 214420 CASAVA_Build 4 112998411 6D AAGAAAGAGA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 5 AAAAAG 3 2 214421 CASAVA_Build 4 112998545 1I AACATACGTG -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 T 6 7 214422 CASAVA_Build 4 113014190 1I ACTACGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1091 hom 19 5 12 2 A 16 17 214423 CASAVA_Build 4 113018828 1D TAGATCTGTT C/- TTCCTTGAGC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 C 1 0 214424 CASAVA_Build 4 113019947 1I TTTTGTGTTC -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 6 7 214425 CASAVA_Build 4 113024212 1D CTGTTCTAAC T/- GCTCTTACAA 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 T 1 0 214426 CASAVA_Build 4 113025048 1D ATCTTCAATA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 T 9 8 214427 CASAVA_Build 4 113027000 2D TGAAAATATT TA/-- TGATTGCTTA 3070 het 3070 ref 40 18 18 5 TA 1 0 214428 CASAVA_Build 4 113028754 1I TATCTTGCTC -/A AAACCCCATA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 3 4 214429 CASAVA_Build 4 113030575 1D CAACAAAAAG A/- AAGAATACAC 3070 het 3070 ref 41 21 20 1 A 3 2 214430 CASAVA_Build 4 113032035 1I AGAACAGTGA -/T TTTAAGCCCT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 3 4 214431 CASAVA_Build 4 113033080 1D CTACTTTCCT A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 7 6 214432 CASAVA_Build 4 113044895 1I AAACCTCTTG -/C CCCCCTCATC 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 C 5 6 214433 CASAVA_Build 4 113057562 4I GACATAGTCC ----/CTCT CTCTCAAGTT 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 CT 2 4 214434 CASAVA_Build 4 113060124 2D CTGCCTGTAC CT/-- CTCTTATAGT 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 CT 3 2 214435 CASAVA_Build 4 113078929 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2407 hom 26 7 15 4 A 9 10 214436 CASAVA_Build 4 113091135 4D GTTCCGTTGG TCTA/---- TCTGTTTTGG 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 TCTA 1 0 214437 CASAVA_Build 4 113094194 3D GTGGGAGGAT TTC/--- TTTATTATCT 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 TTC 1 0 214438 CASAVA_Build 4 113113736 3D TTCTTTTTCT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 TTC 3 2 214439 CASAVA_Build 4 113114490 1I GCAGTTTGAC -/T TCCTCTTTAC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 T 1 2 214440 CASAVA_Build 4 113130889 2D67M1I TCTCTCACAT ACACACACACACACACACACAGCAAGGTAAAATCTGTCACTTTTCAATATATATTTCCTGGATATTTTG-/--ACACACACACACACACACAGCAAGGTAAAATCTGTCACTTTTCAATATATATTTCCTGGATATTTTGA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 24 19 20 N/A 0 0 214441 CASAVA_Build 4 113138589 2D AAAAGGGAAG AC/-- ACCTTGAAGA 3070 het 3070 hom 40 13 17 11 AC 2 1 214442 CASAVA_Build 4 113140441 4I AAAATAAAAT ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AAAG 3 4 214443 CASAVA_Build 4 113144717 4I ATCCAAGGTG ----/CTTT CTAACTATGA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 CTTT 0 1 214444 CASAVA_Build 4 113145397 4D CAGGTCTATT TGAC/---- TGACTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 20 16 1 TGAC 2 1 214445 CASAVA_Build 4 113165316 24I GTAAGCTTAA ------------------------/GTTAATTATAGGGAAACAAAGAAT GTTACCTTTT 3070 het 3070 hom 52 22 23 8 GTTAATTATAGGGAAACAAAGAAT 0 1 214446 CASAVA_Build 4 113173937 1D ATGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3002 hom 30 10 10 10 A 13 12 214447 CASAVA_Build 4 113183406 1D TATGCAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 10 9 214448 CASAVA_Build 4 113183876 1D AGGAAAAATA T/- TTGTAACAGG 3070 het 3070 hom 61 26 27 8 T 3 2 214449 CASAVA_Build 4 113193963 3D TAATGTACAA ATG/--- ATCCAGTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 ATG 1 0 214450 CASAVA_Build 4 113195618 1D TAGTGAGAGG T/- TTTTTTTTTA 1293 het 1293 ref 43 28 4 12 T 10 9 214451 CASAVA_Build 4 113196545 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 909 het 909 ref 28 13 6 9 C 0 1 214452 CASAVA_Build 4 113198781 1D AAATTTTTTA G/- TTAAAAACAC 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 G 1 0 214453 CASAVA_Build 4 113203802 1D AAGACACATC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 8 7 214454 CASAVA_Build 4 113206867 1D GACACATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 11 10 214455 CASAVA_Build 4 113214286 1D TTTGTGGCTC G/- GGGTCATCAT 2259 het 2259 ref 15 6 5 4 G 4 3 214456 CASAVA_Build 4 113225432 4D ATGAAAGAGC CAAA/---- CAGAGAAGTG 3070 het 3070 hom 43 18 22 5 CAAA 1 0 214457 CASAVA_Build 4 113234351 3I GTTCTCAACA ---/AAT AATAGTTGTA 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 AAT 1 2 214458 CASAVA_Build 4 113246875 1D ATATGTACAT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 1 0 214459 CASAVA_Build 4 113257068 4I ATTTGTGTGT ----/GTGA GTGTGTGCGT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 GTGA 0 1 214460 CASAVA_Build 4 113261710 1D CTGATTCCTT A/- TGGAGAACTA 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 1 0 214461 CASAVA_Build 4 113262599 6I TAAAAATACA ------/AAAATT AGCAGGGTGT 3070 het 986 hom 22 6 13 3 AAAATT 0 1 214462 CASAVA_Build 4 113266043 1D CTATAATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 10 9 214463 CASAVA_Build 4 113275531 1D CCGCCCCCCA C/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 C 1 0 214464 CASAVA_Build 4 113284631 2I AACAGGAAAC --/AG TTCTTTAAAA 3070 het 3070 hom 50 19 27 4 AG 0 1 214465 CASAVA_Build 4 113289687 7D4M9D ATCCCACTCT ATTTTGGGATTTTGATATCA/-------GAGT--------- AATATTTTGA 3070 hom 96 het 31 0 33 1 N/A 0 0 214466 CASAVA_Build 4 113295863 2D TGGTTTCATT TG/-- TGTGTCTGCA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 TG 3 2 214467 CASAVA_Build 4 113300248 2D AATCAATCAA TG/-- TGATGTATCA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TG 2 1 214468 CASAVA_Build 4 113309271 1D TATATTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 12 11 T 11 10 214469 CASAVA_Build 4 113317409 4D GTCAGTACTC TCTG/---- TATAACCACA 3070 het 3070 hom 33 12 17 8 TCTG 1 0 214470 CASAVA_Build 4 113320626 1D GCACAGCCCT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 10 9 214471 CASAVA_Build 4 113324210 1I AAAAATACTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 9 10 214472 CASAVA_Build 4 113328252 3I ATTTTGGTGC ---/TAA TAATTACTTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TAA 1 2 214473 CASAVA_Build 4 113338521 1D CAAAAACTAC A/- GTAGTGTTGA 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 A 1 0 214474 CASAVA_Build 4 113345236 1D CACTACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 12 11 214475 CASAVA_Build 4 113356660 1I CTATACACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 A 9 10 214476 CASAVA_Build 4 113359527 1D TGGTGAGTGA G/- GGGGTCCTGC 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 G 5 4 214477 CASAVA_Build 4 113364645 1D AATTTTTTGT A/- TTTTTAATAG 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 1 0 214478 CASAVA_Build 4 113383058 1I TTTATAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 9 10 214479 CASAVA_Build 4 113395892 1I TATCTAAGAT -/A ACACTATATA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 1 2 214480 CASAVA_Build 4 113398344 5D AGCTAATGAA TTTGT/----- TTTAATTGTT 3070 het 3070 ref 24 11 11 4 TTTGT 1 0 214481 CASAVA_Build 4 113405505 1D ACAAAATAAC T/- TTTTTTTTTA 983 het 983 ref 37 32 3 2 T 10 9 214482 CASAVA_Build 4 113414494 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1549 hom 16 4 10 2 A 11 12 214483 CASAVA_Build 4 113418329 6D CAGACTTCAA AATGAT/------ AATACTGAAT 3070 het 3070 ref 38 23 13 4 AATGAT 1 0 214484 CASAVA_Build 4 113420282 1D TTTGTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 2714 het 2280 hom 20 9 10 1 T 13 12 214485 CASAVA_Build 4 113422336 4D TCCCTCTTTC TTTT/---- GTCAAAACAT 3070 het 3070 ref 54 32 17 6 T 4 0 214486 CASAVA_Build 4 113425500 1D ACAAAGAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 900 hom 29 3 21 5 A 17 16 214487 CASAVA_Build 4 113436712 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1260 het 752 hom 11 5 3 3 A 17 16 214488 CASAVA_Build 4 113472691 3D AGGATCAATA TGG/--- TATCCTGATT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 TGG 1 0 214489 CASAVA_Build 4 113509634 1D CAGCCTTTAC T/- TCTTTTTTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 2 1 214490 CASAVA_Build 4 113512817 1D ACTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 22 11 4 7 T 15 14 214491 CASAVA_Build 4 113532576 1D AGTCCACAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 9 8 214492 CASAVA_Build 4 113534535 4D CATGTGTGAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AT 9 7 214493 CASAVA_Build 4 113538430 1D GCAGCTTCTT A/- AAATATATAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 7 A 4 3 214494 CASAVA_Build 4 113556240 1I32M1D ACTCTGTCTC -AAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAACAAAAAAGA/AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAACAAAAAAG- AAAAAAAAGA 2500 het 412 hom 15 2 7 12 N/A 0 0 214495 CASAVA_Build 4 113559354 6I GGAGCTGAAA ------/AATGAT AAGTTACTCC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AATGAT 0 1 214496 CASAVA_Build 4 113560082 1I AGGAAATTAG -/A AAGGGAGGGA 3070 het 2663 hom 20 9 8 3 A 2 3 214497 CASAVA_Build 4 113561447 4D ATAGAGAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 1775 hom 26 7 13 6 AG 11 9 214498 CASAVA_Build 4 113565571 8I AAACAAACAA --------/ACAAACAG ACAAACAACA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 ACAAACAG 0 1 214499 CASAVA_Build 4 113567059 1I CCCGCCCCTC -/T TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 27 7 6 14 T 10 11 214500 CASAVA_Build 4 113567956 62D ATTATTATAT ACATGTTTGATATAAAACATGTATTTTTAAAAATAGTATTTTTAAAAATAGTATTTTTAAAA/-------------------------------------------------------------- ATTGATTTTT 3070 hom 63 het 19 0 22 4 ACATGTTTGATATAAAACATGTATTTTTAAAAATAGTATTTTTAAAAATAGTATTTTTAAAA 1 0 214501 CASAVA_Build 4 113576238 1D AAATGCTGGC A/- AAAAAAGGTA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 7 6 214502 CASAVA_Build 4 113576902 3D GGGTAGATAC TAT/--- TATTATTCTC 3070 het 3070 hom 33 14 13 9 TAT 3 2 214503 CASAVA_Build 4 113577891 4D AAGACAAAAT AAAG/---- ACATTTGCAG 3070 het 3070 ref 40 23 14 5 AAAG 1 0 214504 CASAVA_Build 4 113581126 1D TCAATAAATA T/- TTGTTGAATG 3070 het 3070 ref 41 23 14 5 T 3 2 214505 CASAVA_Build 4 113583321 2D TCAATAAAGC TT/-- TTTTTTTTTA 3004 het 236 hom 28 3 15 10 T 11 9 214506 CASAVA_Build 4 113583352 3D ATAGTCTTGC AAA/--- AAAAAAAAAG 1401 het 1401 ref 29 7 5 18 A 12 9 214507 CASAVA_Build 4 113585130 1I TTTAAATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 20 6 10 4 A 10 11 214508 CASAVA_Build 4 113589329 1D AAGAGAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 30 1 12 17 A 11 10 214509 CASAVA_Build 4 113590067 3D TTAAAGTACA AAC/--- CATTTTTCTA 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 AAC 1 0 214510 CASAVA_Build 4 113619904 5D TTTCTCTAAA CTTCT/----- CTTCTCGCTT 2698 het 2492 hom 11 5 6 0 CTTCT 2 1 214511 CASAVA_Build 4 113627573 4D TATACTACAT AGAG/---- AAACAGAAAA 3070 het 2647 hom 17 7 8 3 AG 2 0 214512 CASAVA_Build 4 113728670 1D TTATTTCCTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 9 8 214513 CASAVA_Build 4 113761469 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1207 het 1054 hom 20 7 5 8 A 19 18 214514 CASAVA_Build 4 113790520 2D AGTTTTCTCT AC/-- AGTTTTCATC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AC 1 0 214515 CASAVA_Build 4 113807270 1D AGCTGTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 7 6 T 11 10 214516 CASAVA_Build 4 113817860 20D CCTGTCAGAA AAATAAATAAATAAATAAAT/-------------------- AAATAAATAA 3070 het 579 hom 12 2 9 3 AAAT 10 5 214517 CASAVA_Build 4 113827734 1D TGCATGGTTC A/- AAAAAAAAAA 2377 het 2377 ref 17 7 7 3 A 13 12 214518 CASAVA_Build 4 113831298 1I TTATTAAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 408 hom 31 1 27 3 A 8 9 214519 CASAVA_Build 4 113854539 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1633 het 466 hom 10 2 6 2 A 11 12 214520 CASAVA_Build 4 113858396 1I TAAAAAAAAA -/T ATATTTATAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 0 1 214521 CASAVA_Build 4 113859520 22D GGGATTACAG GCATGAGCCACCGCACCCGGTC/---------------------- GCATGAGCCA 3070 het 2688 hom 13 9 9 0 GCATGAGCCACCGCACCCGGTC 1 0 214522 CASAVA_Build 4 113864483 2D AGTTGATATG AT/-- ATATGCATTG 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 AT 3 2 214523 CASAVA_Build 4 113872974 1I ACCAATCCTG -/C TTCCCGAGTA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 C 0 1 214524 CASAVA_Build 4 113895123 2I TTTTTTTTTT --/GG GGGGGGGCGT 3070 het 489 hom 25 5 16 4 G 7 9 214525 CASAVA_Build 4 113898683 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 22 13 4 6 T 12 11 214526 CASAVA_Build 4 113902239 11D ATAAATAAAT AAATAAAAATA/----------- AAATAAAAAT 3070 het 1159 hom 11 3 9 5 AAATAAAAATA 2 1 214527 CASAVA_Build 4 113911302 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTCTCTCTCT 2217 het 2009 hom 29 10 10 9 CT 7 6 214528 CASAVA_Build 4 113911946 1D TGGTCTCGAA C/- CCCCGATCTC 3070 het 2271 hom 23 6 11 6 C 5 4 214529 CASAVA_Build 4 113912196 1I CTGGGGAAAC -/T TTTTTTTTTT 2173 het 1412 hom 16 5 6 5 T 13 14 214530 CASAVA_Build 4 113930082 1I CCAAGGAGGT -/A AGAGAAAGGC 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 A 1 2 214531 CASAVA_Build 4 113936112 1I CTAGATTAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 8 9 214532 CASAVA_Build 4 113937071 2I50M1I CTATATATAT --ACACACACACACACATACATATCATAAAACTTACCTTTTTAACTATTAAA-/ACACACACACACACACATACATATCATAAAACTTACCTTTTTAACTATTAAAT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 12 8 7 2 N/A 0 0 214533 CASAVA_Build 4 113942567 1D CCATTCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 T 12 11 214534 CASAVA_Build 4 113955035 12D AGAGCGTTTT TTTGTTTTTTTG/------------ TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 21 9 4 TTTGTTTTTTTG 1 0 214535 CASAVA_Build 4 113962377 1I GAGTCATAGA -/T TTTTTTTTTT 2036 het 2036 ref 28 10 7 11 T 15 16 214536 CASAVA_Build 4 113965943 1D AAAGGATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 10 9 214537 CASAVA_Build 4 113971223 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 1 0 214538 CASAVA_Build 4 113981777 5I CTTCACTGCC -----/TGAAG TGAAGACTGG 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 TGAAG 1 2 214539 CASAVA_Build 4 113998837 3I TAAGTGACAA ---/TAT TATTACTGAC 3070 hom 69 het 32 0 24 8 TAT 1 2 214540 CASAVA_Build 4 114011794 1D TAGCTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 10 13 T 13 12 214541 CASAVA_Build 4 114076249 1D CAGTTTGAGA C/- CAGCCTGGGC 3070 het 3070 hom 25 12 11 3 C 2 1 214542 CASAVA_Build 4 114080082 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2231 hom 15 het 9 0 6 3 T 10 11 214543 CASAVA_Build 4 114134318 1D GGCAACTGCA T/- TTTTTTTTTT 2450 het 2450 ref 23 9 7 7 T 12 11 214544 CASAVA_Build 4 114141510 4I ACTACTTCTT ----/TGTC TATTTTCCTG 3070 hom 129 het 53 0 44 9 TGTC 0 1 214545 CASAVA_Build 4 114141633 2I TCACTTCCTT --/TC TCTTTTTCCT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TC 1 2 214546 CASAVA_Build 4 114142161 1I CTCCATATTT -/C TAATTAAGTG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 0 1 214547 CASAVA_Build 4 114148715 1I AAGCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 897 hom 34 4 15 15 T 15 16 214548 CASAVA_Build 4 114151551 3D ATACACACAT TAA/--- TATACCTCTA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 TAA 1 0 214549 CASAVA_Build 4 114154514 1I AAAATCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 36 1 28 7 T 10 11 214550 CASAVA_Build 4 114161787 1D AGGGAAGGGC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 8 7 214551 CASAVA_Build 4 114172942 2D GGGCACAAAC TG/-- TGTGGAGAGC 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 TG 3 2 214552 CASAVA_Build 4 114174065 2D AATCTAGGAA AC/-- ACAGAGAAAT 3070 het 3070 hom 44 13 29 2 AC 2 1 214553 CASAVA_Build 4 114175180 1I ATTATCTTTT -/A TATCTGTAGA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 0 1 214554 CASAVA_Build 4 114180139 1D GATTTACATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 T 10 9 214555 CASAVA_Build 4 114188285 2D GTTTTGTTTT AA/-- AAAAAAAGAG 3070 hom 87 het 32 0 30 4 A 9 7 214556 CASAVA_Build 4 114207746 1I TGGCGAGATG -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 8 214557 CASAVA_Build 4 114218594 3D GAGTGCCCTT GGG/--- GGGAAACTCA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 G 6 3 214558 CASAVA_Build 4 114220334 1D TTGGAGGAAA T/- TAAACATTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 2 1 214559 CASAVA_Build 4 114222306 1D TTACAAAGCT A/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 A 1 0 214560 CASAVA_Build 4 114222985 1D CACAAGGTAT C/- TTCCTGCCTC 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 C 1 0 214561 CASAVA_Build 4 114230463 1I AAAAGCTGAT -/G AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 26 8 17 1 G 0 1 214562 CASAVA_Build 4 114232700 1I TTAAATGTCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 7 8 214563 CASAVA_Build 4 114233197 4I TGAATAAGTT ----/ACTC ACTATGTTCT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 ACTC 0 1 214564 CASAVA_Build 4 114239867 3I CCCAAATGGT ---/CAA CAACAACAAT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 CAA 3 4 214565 CASAVA_Build 4 114253802 1I TTTTTTTTTT -/C CCCTGATTAG 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 C 3 4 214566 CASAVA_Build 4 114255168 1D CATCCCTAAA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 9 8 214567 CASAVA_Build 4 114262467 1I GGGGAAATCT -/C CCCCCCCCAC 2132 het 2132 ref 32 19 8 5 C 8 9 214568 CASAVA_Build 4 114265824 2D TGGTTTTTCC AA/-- AAGTCTATTT 3070 het 3070 hom 50 21 25 6 A 4 2 214569 CASAVA_Build 4 114268072 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 11 10 214570 CASAVA_Build 4 114274614 1D GTGATTTACA C/- TACAGCAAGG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 C 1 0 214571 CASAVA_Build 4 114283613 1I GTTAATCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 10 11 214572 CASAVA_Build 4 114287281 1D CTTATTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 12 11 214573 CASAVA_Build 4 114292507 5D CCATCTCTAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1146 hom 16 6 8 3 A 17 12 214574 CASAVA_Build 4 114297487 2D TGTGTGTGTG AC/-- ACACAAACAG 3070 het 3070 ref 21 12 9 1 AC 3 2 214575 CASAVA_Build 4 114300382 2I CCGGCTAATT --/TA TTTATATATA 2112 het 774 hom 11 4 6 1 TA 0 1 214576 CASAVA_Build 4 114322599 1D CAGGCTGAAA G/- GGAACAAGGG 3070 het 3070 hom 52 20 28 6 G 3 2 214577 CASAVA_Build 4 114331084 1D CATTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 1386 het 1386 ref 31 26 3 2 T 11 10 214578 CASAVA_Build 4 114332970 2I ACACACAGAC --/AT GTGTGTATAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 AT 0 1 214579 CASAVA_Build 4 114347252 3D GGCATCTGTG CTC/--- CTCAGCACTC 3070 het 3070 ref 30 12 11 9 CTC 2 1 214580 CASAVA_Build 4 114347717 2I CGTGCACACG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 CA 8 9 214581 CASAVA_Build 4 114352504 1I CTCAGAAGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 T 8 9 214582 CASAVA_Build 4 114373299 1I GAATGTCATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 A 9 10 214583 CASAVA_Build 4 114384858 6D ATAACTATTG AGTTCC/------ TACTTGGTGC 3070 het 3070 ref 44 23 17 6 AGTTCC 1 0 214584 CASAVA_Build 4 114387639 1D TAAGCAGAGA G/- GGGGGAAGAT 3070 het 3070 hom 40 19 19 3 G 6 5 214585 CASAVA_Build 4 114404806 1I CTCATAACAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 7 8 214586 CASAVA_Build 4 114405328 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2672 hom 31 11 16 4 A 14 15 214587 CASAVA_Build 4 114418118 1I TAGAGGCAAG -/A AAAAGGCTTT 3070 het 3070 ref 32 14 16 2 A 4 5 214588 CASAVA_Build 4 114440311 1D ACGACATCTC A/- AAAAAAAAAA 1732 het 1732 ref 23 11 5 7 A 18 17 214589 CASAVA_Build 4 114532380 5I TTTATTGTGG -----/TTTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 10 15 214590 CASAVA_Build 4 114533826 1I TACATGTAAA -/T TTTTTTTTAA 2829 het 2829 ref 29 17 7 5 T 8 9 214591 CASAVA_Build 4 114538215 1D GCCTGGTGCT G/- TTATTAAGAT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 G 1 0 214592 CASAVA_Build 4 114559813 1I GTATCTCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 23 8 5 A 8 9 214593 CASAVA_Build 4 114562502 4D TATTTTATAT TCTC/---- TCTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 TC 3 1 214594 CASAVA_Build 4 114562629 4I TTTAAAATTC ----/TCTT TCTTTTTATA 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 TCTT 1 2 214595 CASAVA_Build 4 114565071 9I TTTCTCTAAC ---------/TACTAATTT TAAGGCACAG 3070 het 3070 hom 19 8 10 2 TACTAATTT 0 1 214596 CASAVA_Build 4 114574733 1I CCAATGACTA -/C TGTATGACTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 214597 CASAVA_Build 4 114575802 2I TCTGGAAGGC --/AA AAAAAAAAAA 1887 het 1887 ref 37 9 12 16 A 15 17 214598 CASAVA_Build 4 114583324 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2152 het 592 hom 22 6 8 8 T 14 13 214599 CASAVA_Build 4 114587446 1D CTTTTCTTGA T/- TCCAATGAGT 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 T 2 1 214600 CASAVA_Build 4 114588861 4D AATTTCAAAT AGAA/---- AGAGAGGAAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 AGAA 1 0 214601 CASAVA_Build 4 114590524 3D CACTTTGTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 273 hom 27 3 13 11 T 15 12 214602 CASAVA_Build 4 114590838 14I AGCCTGGCCA --------------/ACATGGCAAAGCCC TGTCTCTAAT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 ACATGGCAAAGCCC 0 1 214603 CASAVA_Build 4 114597117 4D AGCTTGGACT ATCC/---- ATCCTCCTTT 3070 het 3070 hom 46 18 28 0 ATCC 2 1 214604 CASAVA_Build 4 114608556 1I AACTAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 T 11 12 214605 CASAVA_Build 4 114610777 2D ATTCAGACTC TT/-- TGACTTTATC 2520 het 2520 ref 36 26 7 3 T 3 1 214606 CASAVA_Build 4 114626735 1I CCTCCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 12 12 T 13 14 214607 CASAVA_Build 4 114637423 3D CCTGACATAG CAT/--- CATCAGAGAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 CAT 2 1 214608 CASAVA_Build 4 114637671 1D TTTTAGATTT A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 A 7 6 214609 CASAVA_Build 4 114640635 1I TCTACTGATA -/C TTATTTGAGA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 C 0 1 214610 CASAVA_Build 4 114645527 1D GAGAAACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 13 12 214611 CASAVA_Build 4 114651469 2D ATCTTTAGCA AC/-- ACAGCTATTA 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 AC 2 1 214612 CASAVA_Build 4 114657239 1D AAATAGAAAA T/- TTTTATCAGA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 5 4 214613 CASAVA_Build 4 114660126 1D CCAAAGACTT A/- AAAAAAAAAC 1294 het 1294 ref 43 33 3 7 A 10 9 214614 CASAVA_Build 4 114660723 12D AGTGTTTGTT GTTCTAGGCCGG/------------ GCGTGGTGGC 3037 het 3037 ref 25 16 9 3 GTTCTAGGCCGG 1 0 214615 CASAVA_Build 4 114661586 3I GTGAACCATG ---/ATC ATCACATCAC 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 ATC 1 2 214616 CASAVA_Build 4 114667867 1D AGCAATACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 11 10 214617 CASAVA_Build 4 114678683 1D TATAGTCAGC T/- TTTTTTTTTC 1319 het 1319 ref 37 30 3 4 T 10 9 214618 CASAVA_Build 4 114695587 1I CTAGAACATG -/A AAAAAATGAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 214619 CASAVA_Build 4 114716993 4D CAGTATAGAG ACTT/---- AAAACAATGA 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 ACTT 1 0 214620 CASAVA_Build 4 114718362 1D TCGTATACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 21 10 T 12 11 214621 CASAVA_Build 4 114719299 3D AGATAACTTT AAC/--- AATACATAGA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AAC 1 0 214622 CASAVA_Build 4 114719589 1I53M2D CTCCTTTCTT -CAAAAACCAAAGACTATCTCTTAACTTTATAGAATAAATGGAAAAAGGCAAACTG/CCAAAAACCAAAGACTGTCTCTTAACTTTATAGAATAAATGGAAAAAGGCAAAC-- TACAAATCAG 3070 hom 151 het 38 0 51 7 N/A 0 0 214623 CASAVA_Build 4 114723185 4D AGCTGCTCTT ACTG/---- AGGAACTTTC 3070 hom 87 het 30 0 30 1 ACTG 1 0 214624 CASAVA_Build 4 114729494 2D GTCAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 33 1 25 7 A 13 11 214625 CASAVA_Build 4 114731355 1D TCTTTAAAAC A/- AAAGTAACAT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 4 3 214626 CASAVA_Build 4 114783342 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1980 het 1980 ref 30 17 5 8 T 12 11 214627 CASAVA_Build 4 114835871 4I AAGGAATGAC ----/AGTT AGAAGAAATT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AGTT 0 1 214628 CASAVA_Build 4 114837525 1I GGTCCCATTA -/C GGAGTACAGA 3070 het 3070 ref 55 26 22 7 C 0 1 214629 CASAVA_Build 4 114838380 1I CCTCAAATAG -/A AGTCCTTGGA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 1 2 214630 CASAVA_Build 4 114841289 3I GTTCACTTTC ---/CCT CCTCCTGACG 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 CCT 2 3 214631 CASAVA_Build 4 114845544 1D ATGGCAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1106 hom 30 5 14 11 A 12 11 214632 CASAVA_Build 4 114849813 6I AAATCATCTC ------/AATTCT TTGAGTATCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AATTCT 0 1 214633 CASAVA_Build 4 114876738 1I TAGTAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1477 hom 43 5 27 11 A 13 14 214634 CASAVA_Build 4 114880993 1I AGCCAATCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 A 9 10 214635 CASAVA_Build 4 114887693 1D TACATATTAA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 20 8 9 5 T 8 7 214636 CASAVA_Build 4 114887911 2I AATTTTGAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 22 0 13 9 T 14 16 214637 CASAVA_Build 4 114922618 3I CTCTGGAGAT ---/AAG AAGAGAAAAG 3070 hom 88 het 33 0 30 3 AAG 1 2 214638 CASAVA_Build 4 114944192 1I ATTAATAAGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 8 9 214639 CASAVA_Build 4 114950700 1D GACCTACAGA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 38 17 17 6 T 8 7 214640 CASAVA_Build 4 114961598 1D GCAAGCAAAC A/- AAAAAAAAAA 1729 het 1729 ref 33 22 5 6 A 11 10 214641 CASAVA_Build 4 114969545 2D CTAATGTGTG TA/-- TATATATATA 1406 het 1406 ref 26 18 3 5 TA 10 9 214642 CASAVA_Build 4 115001369 5D AAATGACTCC AAAAG/----- AAAAGAGAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAAAG 2 1 214643 CASAVA_Build 4 115003885 5D TAACTGGATT TATAA/----- TATATTTTCT 3070 hom 117 het 44 0 38 7 TATAA 1 0 214644 CASAVA_Build 4 115005366 2I TTAAGTATAA --/AT ATATATAACA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AT 3 4 214645 CASAVA_Build 4 115006338 1D TGTTCATTTT A/- TTATCTAGTA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 1 0 214646 CASAVA_Build 4 115010122 1D GCATTTATTA T/- TTTTTTAATA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 7 6 214647 CASAVA_Build 4 115010325 1I GAAATTCCTC -/A AAAAAAACAG 3070 het 95 hom 34 1 28 5 A 7 8 214648 CASAVA_Build 4 115042083 4D AATAAAAATA AAAT/---- AAAGTCATTT 3070 hom 60 het 21 0 21 1 AAAT 1 0 214649 CASAVA_Build 4 115042317 2I GAAACATATA --/TT TATATATATA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 1 3 214650 CASAVA_Build 4 115042460 42D TTAATCATGC TACCCTGTAACTTCCATCAAATTAGCATGCTTGCGGATGGTA/------------------------------------------ TACCCTGTAA 3070 hom 44 het 23 0 14 11 TACCCTGTAACTTCCATCAAATTAGCATGCTTGCGGATGGTA 2 1 214651 CASAVA_Build 4 115044692 2D CATGCCCAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 14 12 214652 CASAVA_Build 4 115048135 1I AATATGAAAA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 214653 CASAVA_Build 4 115048922 2D AGTATTGAGG GT/-- GATGGGACAT 3070 hom 90 het 33 0 30 4 GT 1 0 214654 CASAVA_Build 4 115049192 2I GTAATTAATC --/TT TATATAAAGG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 3 214655 CASAVA_Build 4 115053709 1I GCTAAATAAA -/T TCTGTAATTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 1 2 214656 CASAVA_Build 4 115054011 2I CTAGATAGTC --/TT TTCCCTGACT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 4 214657 CASAVA_Build 4 115055085 1I ACAGCCCAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 366 hom 42 1 34 7 A 8 9 214658 CASAVA_Build 4 115057134 1I ACGTTCTCTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 9 214659 CASAVA_Build 4 115060554 1I TTTATTAAAG -/C ATTTTTTTTT 3070 het 588 hom 32 3 24 5 C 0 1 214660 CASAVA_Build 4 115068393 1I TTGAATGGGG -/T ATGTGGTGGG 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 0 1 214661 CASAVA_Build 4 115086615 1D TCTTTAAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 10 9 214662 CASAVA_Build 4 115087341 2D AATTTATTTT CA/-- CACACGTTAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 CA 3 2 214663 CASAVA_Build 4 115089183 1I TATTCTAGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 8 9 214664 CASAVA_Build 4 115106957 1I TAGTAGAGAT -/A AAAAAATGAC 3070 hom 135 het 54 0 46 8 A 6 7 214665 CASAVA_Build 4 115109972 1D ATTTTAACCC T/- TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 7 6 214666 CASAVA_Build 4 115111668 1D TAGGGCATGG A/- AAAAAATGCC 1398 het 1398 ref 20 11 3 6 A 7 6 214667 CASAVA_Build 4 115155833 9I ACATTTGTTG ---------/AATACATGA ATGAATATTT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 AATACATGA 0 1 214668 CASAVA_Build 4 115161030 1I TGAAATGGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 9 10 214669 CASAVA_Build 4 115161127 2I TAGAAAAAAC --/AT ATATATTTAT 496 het 20 hom 12 1 5 6 AT 3 4 214670 CASAVA_Build 4 115169334 4D GTTGTTGTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 1110 het 500 hom 33 6 6 22 T 14 10 214671 CASAVA_Build 4 115169712 1D AAAATATGCA T/- TTTTTTGTGC 3070 hom 93 het 34 0 30 5 T 7 6 214672 CASAVA_Build 4 115173141 3I TCTTTCTTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 24 0 17 7 T 12 15 214673 CASAVA_Build 4 115180218 5D TGAATGAATG GAATT/----- GAAGTGGGAT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 GAATT 1 0 214674 CASAVA_Build 4 115181494 2I AGAGAGGCAA --/TC TGGAGTGGAC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 TC 0 1 214675 CASAVA_Build 4 115181721 1D GGCTAAGATC A/- AGATCAGAGA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 2 1 214676 CASAVA_Build 4 115228908 4D AAATTTCATT AAAC/---- AAACAAGACT 3070 het 3070 hom 48 22 25 3 AAAC 2 1 214677 CASAVA_Build 4 115228997 4D TAACAATGAC CAGA/---- CAATGACCCC 3070 het 3070 hom 45 21 24 2 CAGA 1 0 214678 CASAVA_Build 4 115230646 3D ATATTAAACT AAG/--- AAGAAGGCTA 3070 het 3070 hom 33 16 16 3 AAG 3 2 214679 CASAVA_Build 4 115231059 1I ACTTTTTTTT -/C CCCCCACACT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 C 5 6 214680 CASAVA_Build 4 115243414 1I TCAACTGATG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 214681 CASAVA_Build 4 115248624 4D CCTTTCTATG AGTA/---- AGTGTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AGTA 1 0 214682 CASAVA_Build 4 115249049 1I GAATGAGGTT -/C CTAACTAAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 1 2 214683 CASAVA_Build 4 115252453 1D AAGAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1223 hom 37 4 19 15 T 15 14 214684 CASAVA_Build 4 115262425 1D TAATTCTATG C/- CAATACCTCT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 C 2 1 214685 CASAVA_Build 4 115266202 1D GGCAGTCCAT G/- CCTCTGAAAA 3070 het 3070 ref 39 26 11 2 G 1 0 214686 CASAVA_Build 4 115277348 1I ATTCCTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 33 1 27 5 T 11 12 214687 CASAVA_Build 4 115293575 1D TGAAGAAAGA C/- CCCCCCCGCC 3070 het 68 hom 33 2 14 17 C 8 7 214688 CASAVA_Build 4 115310099 1D TCATATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 T 11 10 214689 CASAVA_Build 4 115316623 4I GCTAAAACAT ----/AGAA AGAGTCACCT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 AGAA 0 1 214690 CASAVA_Build 4 115330131 1D ATTTTAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 23 9 A 11 10 214691 CASAVA_Build 4 115337953 1D ACTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 10 9 214692 CASAVA_Build 4 115343019 1D ATTGTCCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 31 0 21 13 A 12 11 214693 CASAVA_Build 4 115349254 1D CTATAGGCAC T/- TTTTTTTTGT 977 het 977 ref 47 39 3 5 T 9 8 214694 CASAVA_Build 4 115351339 1D ATTTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 11 10 214695 CASAVA_Build 4 115356620 1I AAGACATCCC -/T ATGATTACTG 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 0 1 214696 CASAVA_Build 4 115358561 1D TTAGGAACAA C/- AAAGGGGATA 3070 het 3070 ref 25 12 12 2 C 1 0 214697 CASAVA_Build 4 115360084 2I GGAACAGAAT --/AG AGAGTCCAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AG 2 3 214698 CASAVA_Build 4 115371105 1D TTAATACAGT A/- AATATAGCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 3 2 214699 CASAVA_Build 4 115372981 1D ACCAGAAAAA G/- GTGATGTCAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 G 2 1 214700 CASAVA_Build 4 115373217 1D TGACAAAGAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 9 8 214701 CASAVA_Build 4 115375885 7I GATCTAGCAA -------/TTCCACT TTCCACTCCT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 TTCCACT 1 2 214702 CASAVA_Build 4 115376382 1I AAAGGGTGGG -/A GGGGGATGAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 0 1 214703 CASAVA_Build 4 115377878 4I TTTTTCTTCC ----/TTCT TTATTTCTTT 3070 hom 54 het 26 0 19 7 TTCT 0 1 214704 CASAVA_Build 4 115378078 1I CACAAATGGT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 8 9 214705 CASAVA_Build 4 115378784 1I ATAACTAACA -/T TTTTTGGATG 3070 het 3070 ref 50 23 22 5 T 5 6 214706 CASAVA_Build 4 115379941 1I CTTTTTTTTT -/G GGGGGGGCTC 1666 het 1175 hom 9 3 4 2 G 7 8 214707 CASAVA_Build 4 115382885 1D GGTTTTATTA T/- TTTGAGGCTT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 4 3 214708 CASAVA_Build 4 115385443 1D TCAGTTCTGC T/- GATATTGGTT 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 T 1 0 214709 CASAVA_Build 4 115389973 1D CCCATTAATG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 412 hom 35 4 13 18 C 10 9 214710 CASAVA_Build 4 115395102 1I CAACAAAAGT -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 7 8 214711 CASAVA_Build 4 115400276 1I GTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 365 hom 20 1 17 2 T 9 10 214712 CASAVA_Build 4 115403552 1I GTTTAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 10 11 214713 CASAVA_Build 4 115404084 8D TATGTGAATG TTCATGCA/-------- TTCATGCACG 3070 hom 108 het 41 0 37 6 TTCATGCA 2 1 214714 CASAVA_Build 4 115415243 1D TGTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTA 1080 het 1080 ref 48 37 3 8 T 10 9 214715 CASAVA_Build 4 115422296 4I CTCTTGTGTG ----/AGAT AATTTTAAAT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AGAT 0 1 214716 CASAVA_Build 4 115422494 1D CGAGGTCATT G/- CTAAGCAATT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 G 1 0 214717 CASAVA_Build 4 115432088 3I GGACTTCTTC ---/AAG AAGAACTACA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AAG 1 2 214718 CASAVA_Build 4 115437844 1I AGCTTTGTTC -/T TTTTTGATCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 5 6 214719 CASAVA_Build 4 115447860 1I TGACATTTAG -/T TTGGAGAGGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 3 214720 CASAVA_Build 4 115454204 1D AGATGATGTT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 8 7 214721 CASAVA_Build 4 115455906 1D CCAAAAAGTC A/- AAAAACAACA 3070 het 3070 ref 42 24 18 0 A 6 5 214722 CASAVA_Build 4 115459059 1D TTGTTAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 10 9 214723 CASAVA_Build 4 115467878 1I CATTCTAAAC -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 6 7 214724 CASAVA_Build 4 115470749 1I CAATGTGAAT -/A TTTCTGGTGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 0 1 214725 CASAVA_Build 4 115501790 1I62M1I GTAAAAAGAG -AAAAAAACTTAACACACTTGAAAAGGCTACCTTTTGAAACCACACATGGCTTGTATAAGGAT-/AAAAAAAACTTAACACACTTGAAAAGGCTACCTTTTGAAACCACACATGGCTTGTATAAGGATA AAAAAAATCA 3070 hom 232 het 61 0 78 5 N/A 0 0 214726 CASAVA_Build 4 115503610 1D AATCAAAAAA T/- TTTATTTTAC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 T 4 3 214727 CASAVA_Build 4 115508693 2I ATAGTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 36 0 31 5 TG 0 1 214728 CASAVA_Build 4 115518010 1D GTCCGGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 73 het 30 0 22 8 T 6 5 214729 CASAVA_Build 4 115520128 4I TGAGAACAAC ----/AACA AACAAACAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AACA 2 3 214730 CASAVA_Build 4 115527197 1I TTTGCAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1841 hom 20 4 11 5 A 13 14 214731 CASAVA_Build 4 115531219 4I AGGCACCATT ----/CTTA CTTTCTTTTG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 CTTA 0 1 214732 CASAVA_Build 4 115535277 1I AATTCGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 33 1 22 10 A 13 14 214733 CASAVA_Build 4 115536047 1I ATGAAAACTC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 9 214734 CASAVA_Build 4 115546574 8D CACACACTTT TATATATA/-------- TATATATATA 3070 hom 33 het 20 0 12 8 TA 12 8 214735 CASAVA_Build 4 115549434 1I GGGAAAAAAA -/G GTTTCTACGT 3070 het 3070 hom 52 18 27 7 G 1 2 214736 CASAVA_Build 4 115549882 9D CTTCACAAAT CTCTCTCTC/--------- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 36 10 22 5 CTCTCTCTC 1 0 214737 CASAVA_Build 4 115550556 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2463 hom 26 6 15 6 A 10 11 214738 CASAVA_Build 4 115553029 1I CACTCCAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 9 10 214739 CASAVA_Build 4 115558465 5I TTAAAATAAA -----/AATAT AATATAGTAG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AATAT 1 2 214740 CASAVA_Build 4 115561447 1D GTGGAGGTCT G/- GGGGGGTTCC 3070 het 3070 hom 23 11 10 3 G 7 6 214741 CASAVA_Build 4 115565640 1I TTTTGTCAGG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 T 8 9 214742 CASAVA_Build 4 115573086 1I ACTTGGTAGA -/T TTTTTTATCC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 6 7 214743 CASAVA_Build 4 115573625 2D TCTGAGACTC TT/-- TTCTCAGCTT 3070 het 3070 hom 46 20 23 4 T 4 2 214744 CASAVA_Build 4 115579666 1D GGTCATGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 10 9 214745 CASAVA_Build 4 115580339 2D ATTTGATAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 12 20 11 AC 9 8 214746 CASAVA_Build 4 115583312 1D GAAGAAGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 86 het 35 0 27 9 T 10 9 214747 CASAVA_Build 4 115584445 2D ACTTTGAGTC TG/-- GAGATAATAG 3070 het 3070 ref 33 15 15 4 TG 1 0 214748 CASAVA_Build 4 115594673 1I GATCTCGCAC -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 6 7 214749 CASAVA_Build 4 115595462 2D19M5D TTGTAATTTT TATAGTTTTTTATTAAATTAGTATAT/--TAGTTTTTTATTAAATTAG----- TATGTTATAC 3070 het 3070 ref 26 18 11 1 N/A 0 0 214750 CASAVA_Build 4 115596192 2I GTAAATAAAC --/AT ATGTGTCGAA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 AT 1 2 214751 CASAVA_Build 4 115596266 12I TCTTTTTTTT ------------/TTATCTTTTTTA TTTTAACGAA 3070 het 3070 ref 32 19 9 5 TTATCTTTTTTA 0 1 214752 CASAVA_Build 4 115597057 3I CTGAAATTAA ---/AAC AACAACACAA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 AAC 2 3 214753 CASAVA_Build 4 115597420 1I ACCGTGTTAG -/C CAGGATGGTC 892 hom 5 het 2 0 2 1 C 1 2 214754 CASAVA_Build 4 115598387 1D GGGACTGGAA G/- GGGGAAAGAT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 G 5 4 214755 CASAVA_Build 4 115599292 8D TCAGTCATTT TAAGTACA/-------- AGCCTCAAGT 3070 het 3070 ref 43 26 17 6 TAAGTACA 1 0 214756 CASAVA_Build 4 115599401 6D TTTTGTTGTG AATTGA/------ AATTCGGAAC 3070 het 3070 ref 30 20 9 3 AATTGA 1 0 214757 CASAVA_Build 4 115599602 1I TAAGAGGCTC -/T TGGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 T 1 2 214758 CASAVA_Build 4 115603662 1I TCACTAAAGC -/A AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 6 7 214759 CASAVA_Build 4 115606103 3I GTTAGTCACC ---/TCT TTTCACCCAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TCT 0 1 214760 CASAVA_Build 4 115607355 1I TTAATAGGAT -/C CGTGCTCCAT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 C 1 2 214761 CASAVA_Build 4 115607478 10D6M6D ATGGCACTTC AGTGAAATGAAATTTCAGTGAA/----------AAGTTC------ ATGAAGCTTC 3070 het 3070 ref 38 29 12 7 N/A 0 0 214762 CASAVA_Build 4 115609523 1I GATTTATTTC -/A AAAAAAACGT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 7 8 214763 CASAVA_Build 4 115610328 2I CCAAAATGAT --/AA GTGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 0 2 214764 CASAVA_Build 4 115618138 1D CTATGAAACC A/- AAAAAGTATT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 6 5 214765 CASAVA_Build 4 115620176 1D GACACAAATC T/- TGGAAGGCCA 3070 het 3070 ref 49 24 18 8 T 2 1 214766 CASAVA_Build 4 115623430 1I ATATAACTTC -/T TTTCTCAACC 3070 hom 141 het 49 0 48 1 T 3 4 214767 CASAVA_Build 4 115624594 1I ACAGTAAAGT -/A AAATTTTAAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 4 214768 CASAVA_Build 4 115625206 2I ACCTCAGTAA --/AT AGATCATTTA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AT 0 1 214769 CASAVA_Build 4 115625533 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 T 8 7 214770 CASAVA_Build 4 115629442 14D CTCAGAAGTC TATTACTATGTTAA/-------------- AAGTTATGGT 3070 het 3070 ref 35 17 19 5 TATTACTATGTTAA 1 0 214771 CASAVA_Build 4 115632929 4I AAATTTCATA ----/AAAT AAATAGGTAT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 AAAT 1 2 214772 CASAVA_Build 4 115633883 3D CAATTAGAAA TAT/--- TATTCTAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 TAT 2 1 214773 CASAVA_Build 4 115635783 10D AATAAAAATA AAATAAAATT/---------- ATACAAAAAT 656 het 656 ref 14 8 5 5 AAATAAAATT 1 0 214774 CASAVA_Build 4 115636123 4D AGGCAAGAAA AAAG/---- AAAGAAGGAA 3070 het 3070 hom 46 24 19 3 AAAG 2 1 214775 CASAVA_Build 4 115640644 1D TAAATTAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 9 8 214776 CASAVA_Build 4 115642285 2I TTTAGAGATT --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 8 10 214777 CASAVA_Build 4 115649317 12I GTAAGACCAG ------------/AGTGGGCTTCCT AGGAAGCATC 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 AGTGGGCTTCCT 0 1 214778 CASAVA_Build 4 115653602 1I ATTTCTGGAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 8 9 214779 CASAVA_Build 4 115658005 1D AATGATCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1293 hom 13 5 8 0 A 12 11 214780 CASAVA_Build 4 115667967 1I TTAAATTCAG -/A AACAGATGAC 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 2 3 214781 CASAVA_Build 4 115669141 1I50M9I TTTATCTGCA -TTTTTTTCCTTAAAAAGTTTCTAATAATAATTGGAGAGTTCTCTTGATAT---------/TTTTTTTTCCTTAAAAAGTTTCTAATAATAATTGGAGAGTTCTCTTGATATTTTAATTTG TTTAATTTGT 3070 het 3070 ref 51 34 30 8 N/A 0 0 214782 CASAVA_Build 4 115670231 3I GTATTTGCTT ---/CTC CTTTCACCAT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 CTC 0 1 214783 CASAVA_Build 4 115672364 4D TACCAAACAC TTAG/---- AAAGAATTAA 3070 het 3070 ref 29 19 7 4 TTAG 1 0 214784 CASAVA_Build 4 115674400 3I AAAACAATAT ---/GGA GGAGGGTCCT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 GGA 1 2 214785 CASAVA_Build 4 115694559 16D ATGCACAAAC AAAGCAAGGAAAGCAT/---------------- AAAGCAAGGA 2949 het 2949 ref 49 30 9 14 AAAGCAAGGAAAGCAT 2 1 214786 CASAVA_Build 4 115696707 1D AACAGACACG T/- TTTTCCACTT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 T 5 4 214787 CASAVA_Build 4 115705850 1D TTTATCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3028 hom 49 11 23 15 T 13 12 214788 CASAVA_Build 4 115707533 2D GTGTGTATGC GT/-- GTGTGTGTTA 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 GT 5 4 214789 CASAVA_Build 4 115710619 1I TCAGTAAGTA -/T TTTTTTTTTG 908 het 908 ref 24 11 6 7 T 9 10 214790 CASAVA_Build 4 115711346 1D GTTCTGCAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 935 hom 33 3 10 20 T 10 9 214791 CASAVA_Build 4 115712734 3I TACATCATAC ---/TAT TATTCTACGT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 TAT 1 2 214792 CASAVA_Build 4 115714213 1I GAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 hom 10 het 23 1 16 6 G 0 1 214793 CASAVA_Build 4 115736709 2I GGTCTTGTGA --/CT CTGCAGCTGT 2781 het 2781 ref 31 23 6 2 CT 1 2 214794 CASAVA_Build 4 115738249 1D TTAAACGCAT A/- ACGTTTGTGT 3070 het 3070 ref 29 20 9 1 A 2 1 214795 CASAVA_Build 4 115755281 1D CGTGGGCTTC T/- ATACAAATAA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 1 0 214796 CASAVA_Build 4 115756497 14D TGGGTATCAG GCAGCAGAGGCTGC/-------------- AGAACAGCGG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 GCAGCAGAGGCTGC 1 0 214797 CASAVA_Build 4 115763365 1I CTGTTCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 229 hom 24 1 21 2 T 10 11 214798 CASAVA_Build 4 115770750 1D AAGCATGAGC T/- TGTGACAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 2 1 214799 CASAVA_Build 4 115799312 1I CACAATGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 42 1 36 5 A 9 10 214800 CASAVA_Build 4 115813774 1D GGAGTGACCA T/- TTTTAATCAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 5 4 214801 CASAVA_Build 4 115819084 2D ATCATTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 14 12 214802 CASAVA_Build 4 115823016 1D AATTTAAATA T/- TTTTTTGTTC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 T 7 6 214803 CASAVA_Build 4 115835028 3D AAATTATTTC ATT/--- ATTATTTCTT 3070 hom 101 het 37 0 34 3 ATT 3 2 214804 CASAVA_Build 4 115839511 1D GTCCAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 1297 het 1297 ref 34 18 5 13 T 15 14 214805 CASAVA_Build 4 115857140 2D TATATTGAAT AA/-- GTGTCGAACA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 2 0 214806 CASAVA_Build 4 115859402 3D CCCTTTTCTT CCC/--- CCAAACTTGT 3070 het 3070 hom 34 14 19 4 C 5 2 214807 CASAVA_Build 4 115865231 2D TGAGAACACA GT/-- GTTATCCACT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 GT 2 1 214808 CASAVA_Build 4 115876015 1D GTCTCTCTTA C/- CCTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 C 3 2 214809 CASAVA_Build 4 115882977 1I TTCCTTCTCA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 T 6 7 214810 CASAVA_Build 4 115886260 2D GAGGTTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 7 A 13 11 214811 CASAVA_Build 4 115895103 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2599 het 1117 hom 17 5 8 4 A 14 15 214812 CASAVA_Build 4 115901366 1I AAAAGAGAAC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 8 9 214813 CASAVA_Build 4 115906945 2D TATATGTGTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 21 0 16 7 TA 9 8 214814 CASAVA_Build 4 115919331 1I ATTTTGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 12 13 214815 CASAVA_Build 4 115924467 1D AGCTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1603 het 1603 ref 44 31 4 9 T 13 12 214816 CASAVA_Build 4 115931513 2D CACAAATGAC CT/-- CTCTCTTAAT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 CT 4 3 214817 CASAVA_Build 4 115931633 4I GCATTAAGGA ----/ATTG ATTATCTTAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 ATTG 0 1 214818 CASAVA_Build 4 115933905 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 2505 het 2505 ref 23 15 6 7 A 10 9 214819 CASAVA_Build 4 115937371 4D GCCTAGACAA AAGT/---- AAGTGACAGT 3070 het 3070 hom 40 16 18 8 AAGT 2 1 214820 CASAVA_Build 4 115940621 4I ATAGCAGTCT ----/AACA AACATTTGTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 AACA 1 2 214821 CASAVA_Build 4 115941569 2I CTTTAAATTG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 16 26 1 T 8 10 214822 CASAVA_Build 4 115948637 3D ACCGAATAAG AAA/--- CCTTTCAAGC 3070 het 3070 ref 48 27 18 3 A 3 0 214823 CASAVA_Build 4 115953018 2D ACACATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 26 8 14 5 AC 9 8 214824 CASAVA_Build 4 115953617 4D TAGGAAACAC TAAA/---- TATTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 TAAA 1 0 214825 CASAVA_Build 4 115966717 4D GCACACACTC ACTT/---- ACGCAACAAT 3070 het 3070 ref 47 26 20 3 ACTT 1 0 214826 CASAVA_Build 4 115973570 14D GTCATCTGAG TCAAAGCCAGATAT/-------------- TCAAGTCTTC 3070 het 3070 ref 52 28 23 6 TCAAAGCCAGATAT 1 0 214827 CASAVA_Build 4 115979436 1D AGATCAATAC A/- AAAAAAAATA 2672 het 2672 ref 30 18 8 4 A 9 8 214828 CASAVA_Build 4 115983587 3I GCTTATGGTC ---/ACT ACTATTTCAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 ACT 1 2 214829 CASAVA_Build 4 115995837 1D AATCTTTGGG T/- TGTCTCTAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 7 T 2 1 214830 CASAVA_Build 4 115995900 1D ATCCCATTTG C/- CCATTTTTGC 3070 het 3070 hom 38 9 21 8 C 3 2 214831 CASAVA_Build 4 116036240 1I AACTCATTTT -/A AGAAGCCAGC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 1 2 214832 CASAVA_Build 4 116036636 1I TAAATAAAGC -/A CTAAAGAATG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 0 1 214833 CASAVA_Build 4 116039356 5I AATTTTGCAC -----/TTAAG TTATTAGAAT 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 TTAAG 0 1 214834 CASAVA_Build 4 116041623 1D CACTATATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 11 10 214835 CASAVA_Build 4 116045873 3I GAAATAAAGC ---/TTG TTAAGTGGCT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 TTG 0 1 214836 CASAVA_Build 4 116049145 1D GGCCCTTCCA T/- TTTTATGTGA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 5 4 214837 CASAVA_Build 4 116051748 1I AGAACACATT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 37 16 18 3 A 6 7 214838 CASAVA_Build 4 116053750 1D TAAAATTATA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 8 7 214839 CASAVA_Build 4 116059166 1D AAAAATAAAT A/- AAAAAAAAAT 861 hom 10 het 5 0 4 1 A 10 9 214840 CASAVA_Build 4 116065040 1D TTAAGGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2312 hom 34 8 17 11 A 11 10 214841 CASAVA_Build 4 116066306 5D CCAATAGAAT AGGTG/----- AGGTTTAGTG 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 AGGTG 1 0 214842 CASAVA_Build 4 116076136 1I TCAAAGGCAT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 6 7 214843 CASAVA_Build 4 116080290 1I TAGAACTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 31 0 23 8 A 10 11 214844 CASAVA_Build 4 116085364 1D TTGTGAAGAT A/- ACCACATCTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 1 214845 CASAVA_Build 4 116091488 2I AAAATGTCAC --/TT TATTATTCTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 1 3 214846 CASAVA_Build 4 116112635 7I TTTTGAATAT -------/TAGGGTC ACCTTAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 TAGGGTC 0 1 214847 CASAVA_Build 4 116117076 1D TAATATTCAG A/- AAATAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 A 4 3 214848 CASAVA_Build 4 116125028 8I GTGATCCACC --------/TGCATCGG CATCCCAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TGCATCGG 0 1 214849 CASAVA_Build 4 116129661 3D TTGTCACCTC CTT/--- GACTCAGCCC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 CTT 1 0 214850 CASAVA_Build 4 116135551 1I AATTATCTGC -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 7 8 214851 CASAVA_Build 4 116144134 1D AAGTCACTGA C/- AAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 C 1 0 214852 CASAVA_Build 4 116153353 1I TCTCATGTTT -/A TTGCAACATT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 214853 CASAVA_Build 4 116174408 1I CTTCTGTAAT -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 26 7 17 2 A 6 7 214854 CASAVA_Build 4 116197962 3I CCAGAGAGAG ---/AGA AAAAGGAGAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 AGA 0 1 214855 CASAVA_Build 4 116202227 1I GGGGTCTGTC -/A GGGGGTGAGG 1562 het 1562 ref 18 12 4 2 A 0 1 214856 CASAVA_Build 4 116208604 1I CGGTGTTTGG -/T TTTTTTGTCC 3070 het 1536 hom 13 5 8 0 T 6 7 214857 CASAVA_Build 4 116221261 1I ATAAAAACTC -/A ATTAAAAGAT 3070 het 3070 ref 31 22 7 2 A 1 2 214858 CASAVA_Build 4 116221313 1I GTGTGTGTGT -/A GTAATAATGA 2297 het 2297 ref 28 19 5 4 A 0 1 214859 CASAVA_Build 4 116221705 2I AAAATAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 10 12 A 10 12 214860 CASAVA_Build 4 116225483 1D GTTGTAGCCA C/- CCCCCCCACA 1897 het 1897 ref 28 15 5 8 C 8 7 214861 CASAVA_Build 4 116228925 2I TCTAAAGTTA --/TT ATTTTTTTTT 594 het 594 ref 27 9 3 15 T 0 2 214862 CASAVA_Build 4 116229990 3I AAAATGTAGG ---/AAA ATCTTTTAAA 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 A 1 4 214863 CASAVA_Build 4 116231526 1I CTTCTTCACA -/T TTGTAATGAA 3070 hom 20 het 39 1 33 5 T 2 3 214864 CASAVA_Build 4 116235487 3D TTTGATCTAG AAC/--- TTCTAGCCCC 3070 hom 132 het 51 0 45 11 AAC 1 0 214865 CASAVA_Build 4 116241411 3D GCTTCACTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 25 11 T 14 11 214866 CASAVA_Build 4 116255807 1I TATATTAAAG -/A AAAAAATTTA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 6 7 214867 CASAVA_Build 4 116257622 1D TCAATAGAAG A/- AAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 7 6 214868 CASAVA_Build 4 116275854 2I CAATAGATGC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 414 hom 40 1 30 9 A 9 11 214869 CASAVA_Build 4 116277360 1D TCTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 11 10 214870 CASAVA_Build 4 116282891 2D GAATATCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 25 1 16 8 A 16 14 214871 CASAVA_Build 4 116291303 1I AAATGGAAAG -/C TTTTGATCTG 3070 hom 78 het 27 0 25 2 C 0 1 214872 CASAVA_Build 4 116301496 2D ATATGCATAC AT/-- ATGTTAGACA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AT 2 1 214873 CASAVA_Build 4 116301610 4I GTGCTAACAT ----/TAAC TATTTAATTT 3070 hom 126 het 43 0 43 0 TAAC 0 1 214874 CASAVA_Build 4 116308133 5D ACTGATATTC TGAGT/----- TATTTGTTAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TGAGT 1 0 214875 CASAVA_Build 4 116308529 1I GCTTTCATTA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 6 7 214876 CASAVA_Build 4 116309349 1D GATGGGTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 10 9 214877 CASAVA_Build 4 116309556 1I TGGTGCTTTT -/G GGTCTCCTGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 2 3 214878 CASAVA_Build 4 116321850 1D CTAACATAAT A/- TTTGTTAATC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 0 214879 CASAVA_Build 4 116323601 2D AATTAGAGTC TG/-- TGCCATACAG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 TG 2 1 214880 CASAVA_Build 4 116331526 1I TTTTACTCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 43 hom 35 1 31 3 T 9 10 214881 CASAVA_Build 4 116334241 1I TCATTTTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 10 11 214882 CASAVA_Build 4 116339503 3D GGCTGAAGGC TGT/--- TGTTCAGATT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TGT 2 1 214883 CASAVA_Build 4 116342201 2I GGTTAACAGA --/GT GAGACCCTGT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 GT 0 1 214884 CASAVA_Build 4 116346000 4I ATATTTGGTT ----/TTTG TTTGTTAGGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTTG 1 2 214885 CASAVA_Build 4 116348108 1D ATTATTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 24 1 15 9 A 13 12 214886 CASAVA_Build 4 116359476 1D TATTTTTTTT A/- AAAAGCGAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 5 A 5 4 214887 CASAVA_Build 4 116361020 3D ATTTAAGAGA TGT/--- TGTAAAAGCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TGT 2 1 214888 CASAVA_Build 4 116368055 10I TTATAAAAGG ----------/ATATCCAAAT GACCAAGGAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 ATATCCAAAT 0 1 214889 CASAVA_Build 4 116375156 1I ATAAAGAGAA -/G TATGGTTCCT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 G 0 1 214890 CASAVA_Build 4 116376627 4D70M1D TTGGATTAAT TTAGTTATTCTGTGGTTTTTTCTTTTTCTAGTTGATAACATTTGTCTTTAACTTGCCTATTTCTCCACTATTCGT/----TTATTCTGTGGTTTTTTCTTTTTCTAGTTGATAACATTTGTCTTTAACTTGCCTATTTCTCCACTATTCG- TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 25 0 40 6 N/A 0 0 214891 CASAVA_Build 4 116386902 1D TCATCTTTTA C/- ATGAGAAAAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 C 1 0 214892 CASAVA_Build 4 116392663 1I CTGGAGAGCA -/T TTTTTCTAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 5 6 214893 CASAVA_Build 4 116393333 4I AGCATTTATG ----/CTTT CTATTTTCCC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 CTTT 0 1 214894 CASAVA_Build 4 116394354 2I GTGAGCACAC --/GT GTGTGTGTGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 GT 4 5 214895 CASAVA_Build 4 116394842 22D TGTGTGTGTG TGTGTGTGTATATATATATATA/---------------------- TATATATATA 3070 hom 87 het 30 0 29 3 TGTGTGTGTATATATATATATA 1 0 214896 CASAVA_Build 4 116395189 7D TTTTTCTTTC TTTCTTT/------- TTTTTTTTTT 2938 het 37 hom 18 1 14 5 TTTCTTT 1 0 214897 CASAVA_Build 4 116396833 4D15M1I ACGAATAAAT AATCAATTATATTCAAAGG-/----AATTATATTCAAAGGC TTTTATATGA 3070 hom 105 het 35 0 36 4 N/A 0 0 214898 CASAVA_Build 4 116397593 1D GCTTCCTCTC T/- TAACTCGTCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 1 214899 CASAVA_Build 4 116397740 1I AAGAGCTCAG -/T AAAAACATAA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 0 1 214900 CASAVA_Build 4 116401836 4D CCACCCGCCT TGGC/---- CTCCCAAAGT 2968 het 1359 hom 15 4 7 8 TGGC 1 0 214901 CASAVA_Build 4 116418312 4I GTAGCAGACT ----/TTAA TATCCCACTT 3070 hom 157 het 62 0 53 9 TTAA 0 1 214902 CASAVA_Build 4 116418715 2D AAAATAAAAA AC/-- ACAATATTCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 AC 2 1 214903 CASAVA_Build 4 116425617 2I ATCACATAAC --/AT ATTTTTATTT 3070 hom 71 het 28 0 23 5 AT 1 2 214904 CASAVA_Build 4 116429312 1I CAGATGGGGC -/T TTTTTGTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 5 6 214905 CASAVA_Build 4 116434948 1I CTATATTGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 8 9 214906 CASAVA_Build 4 116444386 1D AAAGATAACC T/- CTTACTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 1 0 214907 CASAVA_Build 4 116444582 1D TAAATCTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2166 hom 19 6 9 4 T 10 9 214908 CASAVA_Build 4 116454056 2D ACTTACAATT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 11 9 214909 CASAVA_Build 4 116454577 4D GCAAATACAT AAAG/---- AAAGGAGAAC 3070 het 3070 hom 47 20 23 6 AAAG 2 1 214910 CASAVA_Build 4 116454860 18D GTATATATAT ATATATATATATACACAC/------------------ ACACACACAC 3070 het 481 hom 22 2 16 10 ATATATATATATACACAC 1 0 214911 CASAVA_Build 4 116455762 8I ATGATGTACC --------/ACATAATG ACATAATGAC 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 ACATAATG 1 2 214912 CASAVA_Build 4 116458075 1I CACAGGACAA -/C CTGAAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 C 1 2 214913 CASAVA_Build 4 116458259 7I CACTGGACAT -------/GTGCCTC GTCTGTTTCT 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 GTGCCTC 0 1 214914 CASAVA_Build 4 116458884 1I ACTTTAAAAA -/C AATAGAGAAT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 C 0 1 214915 CASAVA_Build 4 116461483 1I ATATGCACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 T 9 10 214916 CASAVA_Build 4 116466265 1D ATTAAATCAG A/- AAAAATAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 6 5 214917 CASAVA_Build 4 116467274 1I CAAGTATGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 9 10 214918 CASAVA_Build 4 116469179 14D AACTTTGATC TATATAGATAGATA/-------------- TATATAGAGA 3070 het 3070 ref 22 13 9 1 TATATAGATAGATA 1 0 214919 CASAVA_Build 4 116470360 5I ATTTCTCTGA -----/TTATT TTATTTTTCT 3070 het 2338 hom 17 6 9 2 TTATT 1 2 214920 CASAVA_Build 4 116474402 1D TGACTTTACA C/- TAGATTGTTT 3070 het 741 hom 41 3 21 19 C 1 0 214921 CASAVA_Build 4 116476570 1I TCACCAGTTG -/A AAGATATTTG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 2 3 214922 CASAVA_Build 4 116482208 1I CTAAAGGAAG -/A TAGGTGATGT 3070 hom 132 het 51 0 44 7 A 0 1 214923 CASAVA_Build 4 116483401 1D TTTGTTCAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 1951 hom 16 6 9 1 T 8 7 214924 CASAVA_Build 4 116484312 1I AATTTTAATC -/A ATTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 1 2 214925 CASAVA_Build 4 116484626 1D ATGTGTTTTT C/- CATTTCCTCC 3070 het 3070 hom 52 26 22 5 C 2 1 214926 CASAVA_Build 4 116485991 1D AAATGAGTTT C/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 38 20 16 3 C 1 0 214927 CASAVA_Build 4 116499477 5I TAAATACACA -----/TATAT TATGTTATAT 1858 het 1858 ref 18 12 4 2 TATAT 0 1 214928 CASAVA_Build 4 116500148 1I TCACCTAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 A 9 10 214929 CASAVA_Build 4 116522129 3D CCGTCTGAGA TGT/--- TGTTGTACAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TGT 3 2 214930 CASAVA_Build 4 116526499 1D GCTGGAGGAG C/- TTTTGGGCTG 3070 het 3070 ref 42 21 20 1 C 1 0 214931 CASAVA_Build 4 116528482 2D GCAAATCTCC CA/-- CACAGTGCTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 4 CA 3 2 214932 CASAVA_Build 4 116530239 1I CAACAAAGAT -/A AAAAAAAAAG 2660 het 2660 ref 19 12 7 0 A 9 10 214933 CASAVA_Build 4 116531084 1I TTGTTTTTTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 1970 hom 21 8 9 4 A 8 9 214934 CASAVA_Build 4 116533253 2D AGTTAGAAAG GT/-- GTGATCATTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 GT 2 1 214935 CASAVA_Build 4 116538716 1D CACTAATTTT G/- TTTGTGTAAT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 G 1 0 214936 CASAVA_Build 4 116540775 1D ATGTATTCAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 8 7 214937 CASAVA_Build 4 116542922 6D4M7D CAATACCAAA AATTTGTCTTTTATTTA/------TCTT------- TACTGCTATC 3070 het 3038 hom 15 7 9 4 N/A 0 0 214938 CASAVA_Build 4 116546527 1I ATATTTGTAC -/A AAAAAATATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 7 214939 CASAVA_Build 4 116551360 2I GGCTTACAGC --/AT ATATATATAT 3045 het 3045 ref 29 13 8 8 AT 5 6 214940 CASAVA_Build 4 116553256 1D CCTGGGGAGG T/- TGAGGCTGCA 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 2 1 214941 CASAVA_Build 4 116553690 1D CAGAGCAAAA G/- AAAAGTACAC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 G 1 0 214942 CASAVA_Build 4 116562255 1I AAGAAAAGGT -/A AAAGCTGTAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 3 4 214943 CASAVA_Build 4 116563984 5I TTACAGACAA -----/TTGTC TTGTTTTGAT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 TTGTC 0 1 214944 CASAVA_Build 4 116564110 1D GTACAGGACT C/- CATGAAGAGC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 C 2 1 214945 CASAVA_Build 4 116575688 2D CTTATCCTGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 A 11 9 214946 CASAVA_Build 4 116577778 43I AGAGTGGTTA -------------------------------------------/TGGATAGCACATGTGCCCCCAACTTCCCCTTTGCAGGCCAAGG TGGAATGTGT 3070 het 3070 ref 39 26 11 3 TGGATAGCACATGTGCCCCCAACTTCCCCTTTGCAGGCCAAGG 0 1 214947 CASAVA_Build 4 116580763 1I TCATGCGTAT -/A ATTTTTGCAC 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 A 1 2 214948 CASAVA_Build 4 116583492 1D CATATTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 10 9 12 T 13 12 214949 CASAVA_Build 4 116583777 3I TATATTCTAA ---/AAT AATATTTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 AAT 1 2 214950 CASAVA_Build 4 116584158 1D TTTCGTTTAG A/- AAGAGAGGCA 3070 het 3070 ref 46 28 14 8 A 3 2 214951 CASAVA_Build 4 116587037 11I ATTAAACTAA -----------/ATGTTGATTTC ACATTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 25 17 2 ATGTTGATTTC 0 1 214952 CASAVA_Build 4 116587238 1D TCATCACCTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 9 8 214953 CASAVA_Build 4 116594361 4I CTTCTGCCCC ----/TTCT TTCTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 TTCT 1 2 214954 CASAVA_Build 4 116597020 1I GATATATTTC -/A AAGGTGACAC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 2 3 214955 CASAVA_Build 4 116597200 1D CAAAGTAAAG A/- ATTTTGGGAG 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 2 1 214956 CASAVA_Build 4 116599505 1D CCCCGCTGGG A/- TGAGTAGATG 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 A 1 0 214957 CASAVA_Build 4 116601183 1D AGAGACAAAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 8 7 214958 CASAVA_Build 4 116604130 1I TCGATTCTGT -/C CCAGCGCTTA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 C 2 3 214959 CASAVA_Build 4 116606485 1D CTTGTAGGGT A/- AAAGAGACTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 4 3 214960 CASAVA_Build 4 116607331 1I ACTCTCTCTC -/A AAAAAAAGAA 2412 het 2412 ref 19 10 6 3 A 7 8 214961 CASAVA_Build 4 116610741 2D TTTTTTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 12 10 214962 CASAVA_Build 4 116611121 1D TTTGGAAAAA T/- TTCTTTATTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 3 2 214963 CASAVA_Build 4 116611421 4I TAAGCTGAAT ----/TAAA TAGTTTTAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TAAA 0 1 214964 CASAVA_Build 4 116611499 4D TCTTCTGTTT ACTA/---- ACTATTCTAA 3070 hom 60 het 21 0 20 2 ACTA 2 1 214965 CASAVA_Build 4 116612810 1D ACAATAACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 135 het 55 0 46 9 T 10 9 214966 CASAVA_Build 4 116614113 1I ATTATTTTCA -/G GTTGCCAACA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 1 2 214967 CASAVA_Build 4 116616300 2D ATGTTGTTTA AG/-- AAAAAAATGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AG 1 0 214968 CASAVA_Build 4 116617020 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTAAGCTC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 4 5 214969 CASAVA_Build 4 116617567 3I AGAATGAGAG ---/AAA AAAATATTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 4 7 214970 CASAVA_Build 4 116617750 4I ATATCACTGA ----/TAAT TAGAGAAATG 3070 hom 141 het 49 0 48 1 TAAT 0 1 214971 CASAVA_Build 4 116621501 5D ACCCTGTCTC ACAAA/----- ACAAAACAAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 ACAAA 4 3 214972 CASAVA_Build 4 116626490 1I TAAAAATATC -/A AAATGTAAGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 4 214973 CASAVA_Build 4 116627374 3D TATGATATAT ATC/--- ATATCATATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ATC 1 0 214974 CASAVA_Build 4 116627954 1I TTTTACATCC -/A AAAAAAATTA 1636 het 1636 ref 23 12 7 4 A 7 8 214975 CASAVA_Build 4 116647135 2D AAGGAGAAAC AG/-- ATAATTCCAC 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 AG 1 0 214976 CASAVA_Build 4 116650113 1I TGTGACTATA -/T TTTGGAGAGA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 3 4 214977 CASAVA_Build 4 116651211 1I ATATTATGTT -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 A 6 7 214978 CASAVA_Build 4 116657487 2D AAAGCGAAAG AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 10 8 214979 CASAVA_Build 4 116657845 1I GGCCTCACAA -/G GTACTTGACT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 G 1 2 214980 CASAVA_Build 4 116658644 1D TATTTTATAC A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 A 8 7 214981 CASAVA_Build 4 116662263 2D CCAGCTACTC TT/-- TGTAACTTCT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 3 1 214982 CASAVA_Build 4 116664210 1D AAAAGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 9 4 A 11 10 214983 CASAVA_Build 4 116666975 8D47M3I ACATTTAACC ATTTAAATTCTATGTCATTTCTTTTTAAATTACTACCATTAAAAGTATTATCAAA---/--------TCTATGTCATTTCTTTTTAAATTACTACCATTAAAAGTATTATCAAACAT CATTTCTATC 2153 het 2153 ref 25 22 5 9 N/A 0 0 214984 CASAVA_Build 4 116669771 1D CCAGTAACTG T/- ATGCCATATC 3070 het 3070 hom 35 13 15 10 T 1 0 214985 CASAVA_Build 4 116670577 3D TTTGTAGGAC TTA/--- TTATTTTCTT 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 TTA 2 1 214986 CASAVA_Build 4 116678541 1I ACGTTAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 139 hom 36 1 26 9 T 11 12 214987 CASAVA_Build 4 116681037 1I TTTCAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 1298 het 1298 ref 42 30 4 8 T 13 14 214988 CASAVA_Build 4 116705972 1D CATCAATGTA T/- TTAAGTCTCA 3070 het 3070 ref 33 15 13 7 T 3 2 214989 CASAVA_Build 4 116726483 1I GGTATAATAC -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 T 6 7 214990 CASAVA_Build 4 116727748 4I CGAATGGGAG ----/TTCA TTCATGATTT 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 TTCA 1 2 214991 CASAVA_Build 4 116728490 5D ATGGACACAA GGAAG/----- GGAAGGGAAC 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 GGAAG 2 1 214992 CASAVA_Build 4 116732139 4D CCAGGATTTC GTCT/---- TTCTCTACTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 8 GTCT 1 0 214993 CASAVA_Build 4 116733083 2I ATGGTAAAAC --/AT GTGTGTTTGA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 AT 0 1 214994 CASAVA_Build 4 116733495 4I CCTGTTTTCT ----/TTTG TTTAAAATGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TTTG 0 1 214995 CASAVA_Build 4 116743780 1I CCACATTTTT -/A AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 6 7 214996 CASAVA_Build 4 116745118 3D ATTTTCTCTC CTT/--- ATTTGCTGTT 3070 het 3070 hom 46 21 22 4 CTT 1 0 214997 CASAVA_Build 4 116747253 1D TAATGGCCTA C/- CAGCATTTTC 3070 hom 151 het 55 0 51 5 C 2 1 214998 CASAVA_Build 4 116748660 8D CCTCTCCAGT CCATGTCA/-------- CCAATATTTC 3070 hom 108 het 37 0 37 2 CCATGTCA 1 0 214999 CASAVA_Build 4 116751180 1I AGTTATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 T 10 11 215000 CASAVA_Build 4 116758039 1I TTTTAACCAT -/A AAAAATACTT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 5 6 215001 CASAVA_Build 4 116760786 1I TTTTCTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 10 11 215002 CASAVA_Build 4 116763408 2I ATAATTAAGC --/AT ATATATATAT 2790 het 2790 ref 29 12 7 10 AT 8 9 215003 CASAVA_Build 4 116766248 1I GAAGAAGAAG -/A AAAAAAGAGA 3070 het 48 hom 35 1 28 6 A 6 7 215004 CASAVA_Build 4 116810453 2I TTAGTCATTT --/TA TATATATATA 3070 het 2818 hom 15 6 8 1 TA 6 7 215005 CASAVA_Build 4 116825592 6D TATAAAACAG AGCCAT/------ TTAATTTATA 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 AGCCAT 1 0 215006 CASAVA_Build 4 116899149 1D ATACGTGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 215007 CASAVA_Build 4 116929106 2I CGATGTTTGC --/TG TGAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TG 1 2 215008 CASAVA_Build 4 116930336 1D TCTTCTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 11 10 215009 CASAVA_Build 4 116934726 4D GATGTGTTTA TATT/---- TAAACTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 TATT 1 0 215010 CASAVA_Build 4 116943590 5I AATTAACAAA -----/TATCT TAAAGGACAG 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 TATCT 0 1 215011 CASAVA_Build 4 116947124 6I TACAAATGCA ------/TGGATC TGTAGCAAAC 3070 het 3070 ref 43 18 20 5 TGGATC 0 1 215012 CASAVA_Build 4 116958611 1D TTAGATTTCC T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 7 6 215013 CASAVA_Build 4 116960716 7I7M3D ATTTTGGTTA -------TATATAAATT/TTCTGGGTCTTTCA--- TGGTTATATA 3070 het 3070 hom 30 9 20 6 N/A 0 0 215014 CASAVA_Build 4 116963357 1D CCTCCTTGTA C/- TTTTATCATA 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 C 1 0 215015 CASAVA_Build 4 116969935 1D AATTCTCCCA T/- TTTTTTTTTT 1897 het 1897 ref 42 25 6 11 T 11 10 215016 CASAVA_Build 4 116969964 1I AATTTTATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 19 8 13 T 9 10 215017 CASAVA_Build 4 116972881 1D AATAAAAAAA T/- ATTTAAATTT 2381 het 1093 hom 14 5 6 3 T 1 0 215018 CASAVA_Build 4 116989492 1I CTTAAACAAG -/A AAAATTTTAT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 A 4 5 215019 CASAVA_Build 4 116995992 1I AAAGTCTACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 9 10 215020 CASAVA_Build 4 116998133 1I ACCCAGAACT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 7 8 215021 CASAVA_Build 4 117013888 2D GCACTTGCAG GA/-- GAGAGCCAGC 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 GA 3 2 215022 CASAVA_Build 4 117015923 2I TAAATTAAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 AC 5 6 215023 CASAVA_Build 4 117018747 1I GGGAACCCTT -/C CCCCCGTTTG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 C 5 6 215024 CASAVA_Build 4 117026640 1I CAAAACCCGT -/G GGGGTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 4 5 215025 CASAVA_Build 4 117027959 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 A 12 13 215026 CASAVA_Build 4 117032972 1D TATTCAAAAT A/- AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 7 6 215027 CASAVA_Build 4 117033343 19D GACTTCATTC GCACCATTAACTCTCCTGG/------------------- GCCTCTGACT 3070 het 3070 ref 30 12 15 8 GCACCATTAACTCTCCTGG 1 0 215028 CASAVA_Build 4 117035273 2D TGATTGCTCT TC/-- TCTGTTAGCC 3070 het 3070 ref 45 22 18 7 TC 2 1 215029 CASAVA_Build 4 117046968 1I TGACACATAA -/C AAATGTATGT 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 C 0 1 215030 CASAVA_Build 4 117059583 1I AAAAAAAAAA -/C ACACACATAT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 C 0 1 215031 CASAVA_Build 4 117061470 1I CCAGCTTCCA -/G GGCGGCGGTC 2306 het 2306 ref 28 8 9 11 G 2 3 215032 CASAVA_Build 4 117064144 2D ACACACACAC AT/-- GTATACACAC 3070 het 3070 ref 42 17 20 5 AT 1 0 215033 CASAVA_Build 4 117066112 46I ATAAGTGGTG ----------------------------------------------/TGGGGGAAACTGGATATCCATGTGTAGAGCAATAAGACTAGACTCC TATCATTCAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 8 TGGGGGAAACTGGATATCCATGTGTAGAGCAATAAGACTAGACTCC 0 1 215034 CASAVA_Build 4 117066681 1D TATGTGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 181 hom 25 3 7 16 A 12 11 215035 CASAVA_Build 4 117066889 1D34M4I GAAGAGGTAC AATAAGGAGTTTAATAAAATTATTACTTTTTAGAT----/-ATAAGGAGTTTAATAAAATTATTACTTTTTAGATAAAG AAAGAAGCAC 3070 het 3070 ref 37 25 18 6 N/A 0 0 215036 CASAVA_Build 4 117079724 2I TACTTGTCAC --/TT AATGCTACCT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 0 2 215037 CASAVA_Build 4 117082616 2I AAATATAAGA --/CT CTATATATAC 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 CT 1 2 215038 CASAVA_Build 4 117084594 6D CTTAACAACA ACAATT/------ ACACTAGCCT 3070 het 3070 ref 47 21 23 7 ACAATT 1 0 215039 CASAVA_Build 4 117092124 1D TTTTGTCTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 10 9 215040 CASAVA_Build 4 117092839 3I CGTGAAAGAA ---/AAG AAAAATATTA 1887 het 1887 ref 17 10 4 3 AAG 0 1 215041 CASAVA_Build 4 117097177 2I ATCTTCTCTC --/TT GTTTGATAAT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 0 2 215042 CASAVA_Build 4 117098659 5I GTAGTTTGTA -----/GAAAG GAATTTTCTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 GAAAG 0 1 215043 CASAVA_Build 4 117099338 2D TTCCCTTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 34 0 19 15 T 14 12 215044 CASAVA_Build 4 117105565 5D AACAGTGGTC ATAAG/----- ATATTTTAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATAAG 1 0 215045 CASAVA_Build 4 117108768 2D CCATGATTAT AA/-- GTTTCCTGAG 3070 hom 89 het 33 0 30 4 A 2 0 215046 CASAVA_Build 4 117124154 1I ATTAAAAAAA -/C ATTTGGCTCA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 0 1 215047 CASAVA_Build 4 117125084 1D AAAGGGGCAC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 8 7 215048 CASAVA_Build 4 117125735 1I TTATTGCATA -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 7 215049 CASAVA_Build 4 117128032 1D CCCAAAATAG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 215050 CASAVA_Build 4 117131920 1I GATCAGCCAG -/T TGTTATTTTA 3070 hom 12 het 44 1 38 5 T 1 2 215051 CASAVA_Build 4 117134813 1I AAGACTGTCT -/A AACTTGAGTG 3070 het 2201 hom 36 14 19 3 A 2 3 215052 CASAVA_Build 4 117139616 1I ATTCATTCCA -/G GCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 G 1 2 215053 CASAVA_Build 4 117154026 1D GAGACATCAC A/- AACTAGTACC 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 A 3 2 215054 CASAVA_Build 4 117157571 1D CTGGTGGCAT A/- ACTTATCCAA 3070 hom 102 het 39 0 31 9 A 2 1 215055 CASAVA_Build 4 117170351 2D GAAAATTTGG GA/-- GATTGGAGCT 3070 hom 87 het 35 0 29 8 GA 2 1 215056 CASAVA_Build 4 117172767 2I ACAGGCTATA --/TT TACAAAATTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 1 3 215057 CASAVA_Build 4 117174696 1I ATAAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 A 12 13 215058 CASAVA_Build 4 117180408 2D GGCATTTATA TT/-- ATTGCAACTC 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 2 0 215059 CASAVA_Build 4 117182984 1I ATTATTTGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 9 10 215060 CASAVA_Build 4 117190693 1D GCATTATTTA G/- GTAACTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 G 2 1 215061 CASAVA_Build 4 117191365 2D ACTTTTAAAA CT/-- CTCACTCACA 3070 het 3070 ref 33 21 10 4 CT 2 1 215062 CASAVA_Build 4 117205468 1D TAGTAACAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 47 22 17 8 A 9 8 215063 CASAVA_Build 4 117210301 5I TTAAGCAAAA -----/AGAAC AGAACAGAAT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 AGAAC 1 2 215064 CASAVA_Build 4 117214802 1D ATTGATTTTT A/- AATACTGAAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 3 2 215065 CASAVA_Build 4 117216398 5D GATTACAGTG TTTTC/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 96 het 35 0 32 5 TTTTC 1 0 215066 CASAVA_Build 4 117217793 1I AGCTACTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 11 12 215067 CASAVA_Build 4 117219631 1I GGGTACATGC -/G CACAAAGTGC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 0 1 215068 CASAVA_Build 4 117225538 1D AATGAATTAA C/- TTTGATTAAG 3070 het 3070 hom 28 11 12 7 C 1 0 215069 CASAVA_Build 4 117227163 3I AAAAGAAGAA ---/AAT AATTACTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 AAT 1 2 215070 CASAVA_Build 4 117258195 1D GCAACAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 39 0 31 8 A 14 13 215071 CASAVA_Build 4 117262368 1I GAATGGGGGT -/C CATGAAATCC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 1 2 215072 CASAVA_Build 4 117275599 1D GTGAGACATC T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 T 7 6 215073 CASAVA_Build 4 117280980 4D ACTGCAGCCT CAAA/---- CAAACTCATA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 CAAA 2 1 215074 CASAVA_Build 4 117281681 4I65M2D ATGTGAGACT ----TTGAAATTTGTGAATGAAAACAAATTCAGAATTAGGTAAGGAGAGACTGTAATTAAAAGCAAGACTA/TTGATTGAAATTTGTGAATGAAAACAAATTCAGAATTAGGTAAGGAGAGACTGTAATTAAAAGCAAGAC-- TTGCAATAAG 3070 het 3070 ref 41 31 14 19 N/A 0 0 215075 CASAVA_Build 4 117284638 1D AACACAGGAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 9 8 215076 CASAVA_Build 4 117295372 1D AAGATGAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 10 9 215077 CASAVA_Build 4 117298080 1D CATGCATACT C/- CCCTGGCTAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 4 3 215078 CASAVA_Build 4 117302858 19D TTGAGAAGGC TACCCTTTCTCCATGGAGT/------------------- TACCTTTGCT 3070 het 3070 ref 26 18 9 3 TACCCTTTCTCCATGGAGT 1 0 215079 CASAVA_Build 4 117310097 1D CTGCTTGGGG T/- TTTCTGGGCT 3070 het 3070 ref 50 25 23 3 T 4 3 215080 CASAVA_Build 4 117313616 1I TTCATAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 T 11 12 215081 CASAVA_Build 4 117314322 5I ATTCTCATTT -----/GATTC TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 GATTC 0 1 215082 CASAVA_Build 4 117315948 1I GTTGTTTTTT -/A AAAAAAAATC 2621 het 2621 ref 23 11 6 6 A 8 9 215083 CASAVA_Build 4 117316127 3I TCCATTGCTA ---/AGG AGGAGCTAGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AGG 1 2 215084 CASAVA_Build 4 117320380 1I ACATTTTTTT -/A AAAATTACTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 4 5 215085 CASAVA_Build 4 117322275 1I CACAAATTTT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 6 7 215086 CASAVA_Build 4 117326363 4I GGATGAAGAC ----/AGCT AGGTGCTATT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AGCT 0 1 215087 CASAVA_Build 4 117327243 4D TGGCTTTGAG TTTC/---- TTTCTATTGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 5 TTTC 2 1 215088 CASAVA_Build 4 117330713 1I TTTTATTTAA -/T AAAGCAGTGG 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 0 1 215089 CASAVA_Build 4 117331214 1I GATAAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 A 10 11 215090 CASAVA_Build 4 117336692 1D AAATATTTCC T/- ATTGTTCCAT 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 1 0 215091 CASAVA_Build 4 117337897 2D TATTGATAAC TA/-- TATATATGTG 3070 het 3070 ref 58 31 23 4 TA 4 3 215092 CASAVA_Build 4 117339196 1D AAGAATAAGT A/- AAAAAGGATA 3070 het 3070 hom 45 15 25 6 A 6 5 215093 CASAVA_Build 4 117346744 4D CCAACAACAG ACAA/---- ACAGAGAGCC 2312 hom 15 het 6 0 6 0 ACAA 1 0 215094 CASAVA_Build 4 117348807 1D GTTTAGATTC T/- TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 27 18 4 5 T 13 12 215095 CASAVA_Build 4 117362559 2I TGTTTAAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 11 13 215096 CASAVA_Build 4 117368759 2I TTGTAAAAAC --/TG GAAAAATTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TG 0 1 215097 CASAVA_Build 4 117375688 10I ATACTGACTC ----------/TCCAATATAT TCCAGCAAGA 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 TCCAATATAT 0 1 215098 CASAVA_Build 4 117378608 1D GAGACAGATT A/- TTTTTGAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 1 0 215099 CASAVA_Build 4 117378982 4D CAGGTATATA TGTT/---- TAACAATCAT 3070 het 3070 hom 24 9 15 2 TGTT 1 0 215100 CASAVA_Build 4 117380089 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1444 het 1444 ref 23 8 6 9 T 15 16 215101 CASAVA_Build 4 117382954 2I CCTCCACAAA --/AT AGTTTTTATA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 AT 0 1 215102 CASAVA_Build 4 117385602 14I GTTCTCTTTA --------------/ATGATTTTAAATAC ATTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 20 18 1 ATGATTTTAAATAC 0 1 215103 CASAVA_Build 4 117389386 1D AAACCCGATC A/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 1 0 215104 CASAVA_Build 4 117399399 1D GTCAGTAGTG C/- CCCTTTTGTC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 C 4 3 215105 CASAVA_Build 4 117400538 1D CTGGAGCTAC A/- GGGGCCAAGT 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 A 1 0 215106 CASAVA_Build 4 117411589 1D TCATGTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 8 T 12 11 215107 CASAVA_Build 4 117414266 8I TTTTACATTG --------/TGAAAAAT TGAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 TGAAAAAT 1 2 215108 CASAVA_Build 4 117422767 1D AAAACATAAC A/- TATTAACTAT 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 A 1 0 215109 CASAVA_Build 4 117427001 1I AAAATAAACA -/T TAAGCTCCCT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 1 2 215110 CASAVA_Build 4 117428829 1D CTTAATCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 10 9 215111 CASAVA_Build 4 117434966 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 8 215112 CASAVA_Build 4 117444552 2I CTGGAAAAAC --/CA CAGTTACTCA 3070 hom 59 het 24 0 17 7 CA 1 2 215113 CASAVA_Build 4 117453166 3I TTGGCTCCTC ---/ATT ACTTATGCAC 3070 hom 87 het 30 0 29 1 ATT 0 1 215114 CASAVA_Build 4 117463919 1D TATTTGAGTT C/- TTGATTTCAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 0 215115 CASAVA_Build 4 117466095 2I AATCTTACAG --/TA TATATATATA 3070 het 422 hom 32 1 26 5 TA 5 6 215116 CASAVA_Build 4 117467533 3I CAAATCAAAC ---/GAA GGATAACAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 GAA 0 1 215117 CASAVA_Build 4 117475412 4D ATTTTTAAAC ATAA/---- ATAGTTTATA 3070 het 3070 hom 41 19 20 5 ATAA 1 0 215118 CASAVA_Build 4 117484499 1D TTTTTCTACC T/- TTTTTTTTTT 2332 het 2332 ref 35 22 6 7 T 13 12 215119 CASAVA_Build 4 117504813 1I ATTAGTTTGC -/A AATGGATAAT 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 A 2 3 215120 CASAVA_Build 4 117540283 1D CTTGGCTGGA T/- TTTTTTTTTT 2168 het 1266 hom 15 5 7 5 T 13 12 215121 CASAVA_Build 4 117590848 1I TCACACTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 T 9 10 215122 CASAVA_Build 4 117592279 1D TACTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 11 10 215123 CASAVA_Build 4 117607708 1D AGTTATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 A 11 10 215124 CASAVA_Build 4 117624356 2D TATGTTATAA AT/-- ATATATATAT 2658 het 2165 hom 14 6 6 2 AT 7 6 215125 CASAVA_Build 4 117626729 1D AAATTTGAAA T/- GATTTGTAAT 3070 het 3070 ref 40 27 9 4 T 1 0 215126 CASAVA_Build 4 117634504 1D GACAGCATGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 8 7 215127 CASAVA_Build 4 117643600 1D TATAACAACT A/- AATAATGACC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 3 2 215128 CASAVA_Build 4 117652787 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1396 hom 29 5 19 5 A 13 12 215129 CASAVA_Build 4 117654612 1I TAATTATGGT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 7 8 215130 CASAVA_Build 4 117664962 1I AATCTTTAAG -/A AAAAAAGACT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 6 7 215131 CASAVA_Build 4 117735069 1D GAAAAAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1789 het 1789 ref 38 25 5 8 T 12 11 215132 CASAVA_Build 4 117744787 17I AAAGTCCTCC -----------------/CCATTCTCTCCACCCCT TTCCTTAAGT 3070 hom 135 het 47 0 45 3 CCATTCTCTCCACCCCT 0 1 215133 CASAVA_Build 4 117750948 2D ATACAAAAAC AT/-- ATATAAATCT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 3 2 215134 CASAVA_Build 4 117753400 4D CCTTTCTTAG AGGC/---- ATGTATGAAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AGGC 1 0 215135 CASAVA_Build 4 117754495 1D GGATATCCAG A/- AAAAAATGTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 7 6 215136 CASAVA_Build 4 117775738 4I ATAGAAAAAT ----/AAAA AAGTTATTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 2 6 215137 CASAVA_Build 4 117780057 1I ATTATATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 104 hom 37 1 31 5 A 10 11 215138 CASAVA_Build 4 117781555 1D CACTATTCAG A/- AATTTATTTA 3070 hom 129 het 45 0 44 2 A 3 2 215139 CASAVA_Build 4 117788338 1I TTATTAATAT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 7 8 215140 CASAVA_Build 4 117791580 4I AGAGAGAGAC ----/AGAG AGAGTCCCTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 2 4 215141 CASAVA_Build 4 117795961 1I ATTTATGAGA -/C CATAATCAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 2 215142 CASAVA_Build 4 117800691 1D TCTTCTCTAC A/- AACCTGACAA 3070 hom 84 het 30 0 26 4 A 3 2 215143 CASAVA_Build 4 117801124 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 141 hom 20 1 17 2 A 9 10 215144 CASAVA_Build 4 117802189 1I ACAATAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 58 hom 39 1 32 6 A 7 8 215145 CASAVA_Build 4 117802847 1D TATTTCTGGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 42 0 36 6 A 10 9 215146 CASAVA_Build 4 117803500 1I TTTTATTTAC -/T TATCAAACAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 2 215147 CASAVA_Build 4 117805209 1I ACTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 24 2 17 5 T 12 13 215148 CASAVA_Build 4 117812605 5I AAGAATTGTC -----/TGTTA TAACAATTAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TGTTA 0 1 215149 CASAVA_Build 4 117812908 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 7 8 215150 CASAVA_Build 4 117816192 1I CAAAATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 30 3 17 10 A 15 16 215151 CASAVA_Build 4 117829727 1I TAGATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2325 hom 28 6 17 5 A 10 11 215152 CASAVA_Build 4 117837991 1I GGTGGAAGAA -/C CACTATTCAA 3070 het 3070 hom 50 17 24 9 C 1 2 215153 CASAVA_Build 4 117847635 1I ATCAAAACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 9 10 215154 CASAVA_Build 4 117854121 1D TTGATCTTTA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 155 het 60 0 52 9 T 8 7 215155 CASAVA_Build 4 117862382 1D GGCCTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 31 1 26 4 A 11 10 215156 CASAVA_Build 4 117865575 1D ATGAGGTTTT G/- CATATGACCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 G 1 0 215157 CASAVA_Build 4 117867129 1I TAAGTACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 9 10 215158 CASAVA_Build 4 117867857 1I ACTATCCCCC -/T GGTAACGTAG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 0 1 215159 CASAVA_Build 4 117868128 1I TAATTTTGGC -/A AAAAAAAATA 1520 het 1520 ref 27 19 5 3 A 8 9 215160 CASAVA_Build 4 117868561 1I AAACACTTTT -/A TATAAAGACA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 0 1 215161 CASAVA_Build 4 117878504 1D TATCAGTTGT G/- CCTTGAACTA 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 G 1 0 215162 CASAVA_Build 4 117883496 1D AATCCTTCAG A/- AAAATATAAT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 5 4 215163 CASAVA_Build 4 117891548 4D ATTTTGAAGT CAGA/---- CAGATCTGAG 3070 het 3070 hom 31 14 15 4 CAGA 2 1 215164 CASAVA_Build 4 117894730 8D TTGGCTGGTC CGAGGTGG/-------- CCACAGCTGC 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 CGAGGTGG 1 0 215165 CASAVA_Build 4 117894839 1D GTCTCAGATT G/- GGTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 G 3 2 215166 CASAVA_Build 4 117906723 1I CTCTTAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 11 12 215167 CASAVA_Build 4 117907703 1I ACATGATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 34 4 13 17 A 16 17 215168 CASAVA_Build 4 117910268 2D TTGGTTGAAG TA/-- TATATATATA 935 hom 12 het 6 0 5 1 TA 8 7 215169 CASAVA_Build 4 117911869 1I GGTAGAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 11 12 215170 CASAVA_Build 4 117913894 4I TAATTTTACT ----/TAAA TAAAATTTTC 2499 het 2499 ref 19 12 6 1 TAAA 1 2 215171 CASAVA_Build 4 117929691 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 494 hom 31 5 16 10 A 13 12 215172 CASAVA_Build 4 117939112 3D TGAGTCCAAA CAT/--- CATCGACTCT 3070 hom 92 het 33 0 30 5 CAT 2 1 215173 CASAVA_Build 4 117941675 3D ATAAGGAAAA AAG/--- AAGTCTAGAA 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 AAG 2 1 215174 CASAVA_Build 4 117945154 1D GTTTTTTTTT A/- ATTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 2 1 215175 CASAVA_Build 4 117952626 7D CTCTGGGCCA GGGGCTG/------- GGGGCTGGTG 3070 hom 77 het 28 0 21 7 GGGGCTG 2 1 215176 CASAVA_Build 4 117960297 1I ACGGAATTGG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 7 8 215177 CASAVA_Build 4 117971581 1I GGCAGACATG -/A AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 53 23 20 10 A 4 5 215178 CASAVA_Build 4 117977120 1I AGAAAAAAAT -/C CACATAAGTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 2 215179 CASAVA_Build 4 117978862 1I TTTTAAAGCA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 7 8 215180 CASAVA_Build 4 117981596 1D TTGAGTAGAC A/- AAAAAAAAAA 1098 het 1098 ref 36 26 3 7 A 11 10 215181 CASAVA_Build 4 117983497 1I AAATATGCTT -/G GTAGCAACCA 3070 het 3070 ref 40 15 16 9 G 1 2 215182 CASAVA_Build 4 117987641 4D TAAAATCTGA TTAT/---- TTGTGTTCTT 3070 het 3022 hom 27 7 19 3 TTAT 1 0 215183 CASAVA_Build 4 117989162 1I CCCTACCCCC -/A ACCCCACGAC 704 het 704 ref 16 11 5 0 A 1 2 215184 CASAVA_Build 4 118004030 2I TTAAGCACAC --/AT GTTAGTATCT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AT 0 1 215185 CASAVA_Build 4 118010570 3I TAATATTAAA ---/TAT TATACATAAA 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 TAT 1 2 215186 CASAVA_Build 4 118010734 4D AAAATGTAAC ATTA/---- ATTATATTTT 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 ATTA 2 1 215187 CASAVA_Build 4 118012743 1D ATATATACAT A/- TATATATATA 1300 het 84 hom 13 1 3 9 A 1 0 215188 CASAVA_Build 4 118025165 1I CAAACGGAAC -/A GAAAAAAGCA 3070 hom 69 het 26 0 22 4 A 0 1 215189 CASAVA_Build 4 118040188 1I ACCATTTTCT -/A AACTAAATTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 2 3 215190 CASAVA_Build 4 118041552 3D AATCCTCATC ATT/--- GTTTGCTGTG 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 ATT 1 0 215191 CASAVA_Build 4 118050135 1I ATTTCGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 26 0 17 9 A 11 12 215192 CASAVA_Build 4 118056298 1I ATATTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 1102 het 1102 ref 26 17 4 5 T 13 14 215193 CASAVA_Build 4 118063330 1D TAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 580 hom 38 3 30 7 A 11 10 215194 CASAVA_Build 4 118070779 3D ATATACGTTA TTC/--- TTAATTGAAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 TTC 1 0 215195 CASAVA_Build 4 118073734 1D AGGAAAAGAC T/- TTTTTTCGCA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 7 6 215196 CASAVA_Build 4 118074873 2D TTGTTATAAC TT/-- TGCTTTTTGT 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 T 3 1 215197 CASAVA_Build 4 118077340 3I ACAACACTAA ---/TCT TCTTGTATAT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 TCT 1 2 215198 CASAVA_Build 4 118079302 1I GAATGCTTAA -/T TTTTTTTTTG 2868 het 2868 ref 31 17 8 6 T 9 10 215199 CASAVA_Build 4 118080280 2I TGTCCTAGAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 AC 6 7 215200 CASAVA_Build 4 118080824 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAACAATAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 ATA 1 2 215201 CASAVA_Build 4 118091862 6D TCTGACTATC ATACTT/------ AGATTTGTTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 6 ATACTT 1 0 215202 CASAVA_Build 4 118095392 2D AATCTCTTCA TG/-- TGAGGTTGAT 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 TG 2 1 215203 CASAVA_Build 4 118101147 4D TTTTCTTTCA TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 9 TTCT 4 3 215204 CASAVA_Build 4 118101223 1I15M1D CTTTTCCTTC -TTTTTTGTCCCTTCCT/TTTTTTTGTCCCTTCC- TTTGTTCCCC 3070 het 3070 ref 33 19 18 2 N/A 0 0 215205 CASAVA_Build 4 118101501 4I TACCTACTTG ----/AATT AATAAATGAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 AATT 0 1 215206 CASAVA_Build 4 118103522 3I GCTATTAGTA ---/GTT AAGTATTTGG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 GTT 0 1 215207 CASAVA_Build 4 118108323 2D ACATTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 675 hom 26 5 12 9 T 12 10 215208 CASAVA_Build 4 118109785 1I AGGCTGCAGA -/T TTTTGCCAAC 3070 het 3070 hom 42 22 18 2 T 4 5 215209 CASAVA_Build 4 118112336 1D AACCTTTAGC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 47 16 27 6 T 8 7 215210 CASAVA_Build 4 118112777 1I ATTATCATGA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 T 6 7 215211 CASAVA_Build 4 118113457 8D62M1D GAAAATGGAT GAAAGACAGAAAGCGCGCTTTCTCATTTTATCTCAGGAAATAATAATTCCAAAATGCCCAAGCTAGTAATA/--------GAAAGCGCACTTTCTCATTTTATCTCAGGAAATAATAATTCCAAAATGCCCAAGCTAGTAAT- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 31 32 12 17 N/A 0 0 215212 CASAVA_Build 4 118113729 1D AAGGGAACAT A/- AAAGTAACCT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 4 3 215213 CASAVA_Build 4 118113944 2D TAACCATACA TG/-- TCAAATTAAT 3070 het 3070 ref 38 25 12 2 TG 1 0 215214 CASAVA_Build 4 118119330 3D10M6I TTGAAATGAA ATGAAATGAAAAA------/---AAAAAAAAAACTAAGT AATTGTGTCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 N/A 0 0 215215 CASAVA_Build 4 118166762 4D AGAATTTATC AGAG/---- AGAGAGATTG 3070 hom 72 het 28 0 24 5 AG 5 3 215216 CASAVA_Build 4 118169182 1D AAAATACAAT A/- GGGGAGAAGA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 1 0 215217 CASAVA_Build 4 118180648 1D ATCCAGAAAG A/- AAGGAAAAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 3 2 215218 CASAVA_Build 4 118219131 4I AAATAAGTGT ----/TTAG TTACTCAGAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 TTAG 0 1 215219 CASAVA_Build 4 118240905 1I TCTAGAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 10 11 215220 CASAVA_Build 4 118242206 1I GGTGAGAAAA -/G AGCTGAACTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 215221 CASAVA_Build 4 118248351 1D CCCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 29 2 18 11 T 12 11 215222 CASAVA_Build 4 118250668 1I AGTTAATTAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 8 9 215223 CASAVA_Build 4 118251264 7D ACAGAGAATA CATACTT/------- CATAATTCCA 3070 het 3070 ref 39 20 19 4 CATACTT 1 0 215224 CASAVA_Build 4 118266210 2D TCAGCAGCTG CT/-- GGAACCTTGA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 CT 1 0 215225 CASAVA_Build 4 118278936 2D ACAAAATCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2911 het 2911 ref 33 18 8 7 A 14 12 215226 CASAVA_Build 4 118300783 1D CATTTAAATA G/- TCTTTGCTTT 3070 het 3070 hom 34 18 14 2 G 1 0 215227 CASAVA_Build 4 118308327 1I ACAATATTTT -/C CAAAATCATA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 1 2 215228 CASAVA_Build 4 118311573 5I CACAGAACTA -----/TAGAT TAGTATAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 TAGAT 0 1 215229 CASAVA_Build 4 118314170 2I CTTATTTAAA --/AT ATGTTTTTTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AT 1 2 215230 CASAVA_Build 4 118336643 1D GAAAAAGGAA C/- CCTTATACAT 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 C 3 2 215231 CASAVA_Build 4 118345367 1D CCTTCATGAC A/- AAAACCCTCA 3070 het 3070 ref 39 16 17 8 A 5 4 215232 CASAVA_Build 4 118351960 1I ATAATCTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 9 10 215233 CASAVA_Build 4 118352677 9I AGAATCAAAA ---------/CTAATCATC CTAATCATCA 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 CTAATCATC 1 2 215234 CASAVA_Build 4 118356716 1I AAAAACAAGG -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 5 6 215235 CASAVA_Build 4 118363571 5I AAAATACACT -----/TTAAG TTATCAATTC 3070 hom 111 het 47 0 38 9 TTAAG 0 1 215236 CASAVA_Build 4 118365418 1I AACAGAGATA -/C AACAGGTGAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 215237 CASAVA_Build 4 118366660 2D AAAATAAGAC AT/-- AATGTATATT 3070 hom 95 het 36 0 31 5 AT 1 0 215238 CASAVA_Build 4 118370011 3I TTGGAAAAAC ---/AAT AAATGCTTAT 3070 hom 157 het 54 0 53 1 AAT 0 1 215239 CASAVA_Build 4 118371203 2I ACCAGGAGAA --/AC ACACACACAC 3070 het 374 hom 25 1 17 7 AC 7 8 215240 CASAVA_Build 4 118371815 4I GAAATTTTCA ----/AAGT AATTATATGG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 AAGT 0 1 215241 CASAVA_Build 4 118373512 2I AGAACAAAAC --/TA TTATTTATTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 0 1 215242 CASAVA_Build 4 118373762 3I TGAGGATTCT ---/ATG ATGATGACTG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 ATG 2 3 215243 CASAVA_Build 4 118376526 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 11 10 215244 CASAVA_Build 4 118377460 1D AGCGAAGTTC A/- ACACAAGTAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 2 1 215245 CASAVA_Build 4 118378173 3D CTGACACCTT ATC/--- ATAAACAGTA 3070 hom 102 het 39 0 35 8 ATC 1 0 215246 CASAVA_Build 4 118379210 1I ATCAGAGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 701 hom 32 2 25 5 T 9 10 215247 CASAVA_Build 4 118382180 3I AGCAGGTGGT ---/ACA ACAAGTATAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 ACA 1 2 215248 CASAVA_Build 4 118382926 6I TCATAAAACC ------/TTATAG TTATAGTTAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTATAG 1 2 215249 CASAVA_Build 4 118387931 4D AAAAATACTT TGTC/---- TAACACACAT 3070 het 3070 ref 24 14 8 3 TGTC 1 0 215250 CASAVA_Build 4 118388513 2I TGTATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 TA 7 8 215251 CASAVA_Build 4 118389741 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 21 1 15 6 A 17 16 215252 CASAVA_Build 4 118390504 1D CTGTTCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 13 12 215253 CASAVA_Build 4 118393273 2I AAGCGGCCTC --/TT TTTACTCTCT 2764 hom 18 het 12 0 7 5 T 3 5 215254 CASAVA_Build 4 118418275 4I TAGTAGACTA ----/AGTG ATTACACCAC 3070 het 3070 hom 54 19 29 6 AGTG 0 1 215255 CASAVA_Build 4 118423233 1D AGATATTTTT A/- AAAACCTCAA 3070 hom 95 het 35 0 32 3 A 5 4 215256 CASAVA_Build 4 118433340 1D TTTATTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 791 hom 26 2 11 13 T 17 16 215257 CASAVA_Build 4 118460284 2I ATACAAAGAC --/TT TTTAAAACAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 3 5 215258 CASAVA_Build 4 118473124 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 38 0 33 5 AC 9 8 215259 CASAVA_Build 4 118486066 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 924 hom 17 3 12 2 A 10 9 215260 CASAVA_Build 4 118507652 11D GTCTAACTTG TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1943 het 1943 ref 31 14 8 11 T 27 16 215261 CASAVA_Build 4 118521475 3D TAACACAAAT TTA/--- TTATTATTTT 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 TTA 3 2 215262 CASAVA_Build 4 118543840 2I AAAAAATTAA --/CT CACCTTTCTC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 CT 0 1 215263 CASAVA_Build 4 118544925 6D GCAGAAATCC TAAACA/------ TAAACAAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 3 TAAACA 2 1 215264 CASAVA_Build 4 118579302 1D TTTCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 11 10 215265 CASAVA_Build 4 118581314 1I CCTTGTTCCC -/A AAAGACAGTA 3070 hom 144 het 56 0 47 9 A 3 4 215266 CASAVA_Build 4 118581668 1I TGAGTGGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3027 hom 27 8 14 5 A 9 10 215267 CASAVA_Build 4 118597049 10D5M1I ACATACACAC ACACACTTATACGTG-/----------ACGTGT ATGTTTACGA 3070 het 3070 ref 26 14 13 4 N/A 0 0 215268 CASAVA_Build 4 118609417 2D CAGATCTGAC AG/-- GGGATGCTAG 3070 het 3070 ref 37 20 12 7 AG 1 0 215269 CASAVA_Build 4 118626209 1D AATCAGTATG C/- TAATGTGGTT 3070 het 3070 ref 60 27 26 8 C 1 0 215270 CASAVA_Build 4 118630042 1D TAAAAAAAAA T/- ATCCCCGCTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 1 0 215271 CASAVA_Build 4 118634380 2D TAATAGTCAC TT/-- TTAAAATATA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 4 2 215272 CASAVA_Build 4 118648850 1D ATAGACTAAG C/- TTTTGTAACG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 C 1 0 215273 CASAVA_Build 4 118657816 2D TTGTCAACAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 T 12 10 215274 CASAVA_Build 4 118661954 1D CAGCCATTGC A/- AAAAACATGC 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 6 5 215275 CASAVA_Build 4 118668571 1I CAAGACATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 9 10 215276 CASAVA_Build 4 118671163 2D TTAAAAGTTG TA/-- TATAAAGTAT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 TA 3 2 215277 CASAVA_Build 4 118672387 1I CACGTAAGTG -/C CCAGCTAGCA 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 C 2 3 215278 CASAVA_Build 4 118673515 3D TACTCATAGG AAT/--- AATAAGTCTA 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 AAT 2 1 215279 CASAVA_Build 4 118676848 1I AAGATTGAGT -/A AACAGTCTGT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 2 3 215280 CASAVA_Build 4 118677737 4D TTTGAAAAAA GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 GTTT 4 3 215281 CASAVA_Build 4 118679539 1I AGATAAACTG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 7 8 215282 CASAVA_Build 4 118680973 1D GAGTTTTTTT C/- TTAACCAAAG 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 C 1 0 215283 CASAVA_Build 4 118693564 1I TAGAGTTATG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 8 9 215284 CASAVA_Build 4 118693791 1D GAAGGCCATG T/- TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 5 4 215285 CASAVA_Build 4 118701511 3D GCAAATGTAG GGT/--- GTCCTGAATT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 GGT 1 0 215286 CASAVA_Build 4 118703172 1I CCCACTAATT -/A TAGGATATGC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 0 1 215287 CASAVA_Build 4 118705707 2D ATTTAAACTC TT/-- AACATTATAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 2 0 215288 CASAVA_Build 4 118706125 1D TATGAAAGGA T/- TTTTCTTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 5 4 215289 CASAVA_Build 4 118708605 2I GCTAAAAAGT --/TA TATTACCTAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TA 1 2 215290 CASAVA_Build 4 118708730 1D TATACACAAG T/- TTTTTTTATG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 7 215291 CASAVA_Build 4 118712324 1I AGGGAGTGGG -/A ATTTCATCCA 3070 hom 117 het 51 0 39 12 A 1 2 215292 CASAVA_Build 4 118713610 4I ACAGCAGGGA ----/GAAG GAAAGGGAAG 3070 hom 99 het 41 0 33 9 GAAG 0 1 215293 CASAVA_Build 4 118744528 1I ACAGTATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1960 hom 21 5 8 8 A 10 11 215294 CASAVA_Build 4 118745902 5D TGTTCTGTGA TGTGC/----- TGTGCTGCCA 3070 het 3070 ref 33 17 16 5 TGTGC 2 1 215295 CASAVA_Build 4 118747224 1I GGGAATTACA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 T 7 8 215296 CASAVA_Build 4 118774317 1D16M1I TCTTCAGTTC AAAAAAAAATCAACAGA-/-AAAAAAAATCAACAGAT TTTAGATGCA 3070 hom 48 het 21 0 17 5 N/A 0 0 215297 CASAVA_Build 4 118780974 3D CTTATGAAAA TAT/--- TATTGTATCA 3070 hom 138 het 49 0 47 3 TAT 2 1 215298 CASAVA_Build 4 118781540 3D GTGATCACAG CAA/--- CAACAACAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 6 CAA 5 4 215299 CASAVA_Build 4 118807153 1I AGATATTTCC -/A AAGTTATTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 A 2 3 215300 CASAVA_Build 4 118812031 1D CTCAATAAAA G/- ATGTAACATT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 G 1 0 215301 CASAVA_Build 4 118815926 3D AACTCCAACT CAA/--- CAACAACAAC 3070 hom 117 het 42 0 38 5 CAA 7 6 215302 CASAVA_Build 4 118816643 1D AGCTAAAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 50 het 53 1 40 12 A 9 8 215303 CASAVA_Build 4 118827568 1I GGGTTATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 A 11 12 215304 CASAVA_Build 4 118859873 1D TGGCTGAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 A 10 9 215305 CASAVA_Build 4 119000490 1I ACCTAATTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 29 0 23 6 C 0 1 215306 CASAVA_Build 4 119010016 4D AACAAAAAAT AAAC/---- AAAATATTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 AAAC 1 0 215307 CASAVA_Build 4 119101284 4I CTGTTCTTTG ----/CAGT CAGTCATTTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 CAGT 1 2 215308 CASAVA_Build 4 119109836 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 31 0 29 2 T 17 16 215309 CASAVA_Build 4 119110169 1I TATTTCTGAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 42 het 28 0 15 13 A 8 9 215310 CASAVA_Build 4 119120478 5I ACAGAATAAC -----/AAAAA AAAAAAAGAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 7 12 215311 CASAVA_Build 4 119125523 1I TCTAAAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 35 0 24 11 A 8 9 215312 CASAVA_Build 4 119131815 1D TCAAGGCTAC T/- TATGAACACC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 1 215313 CASAVA_Build 4 119141988 1I AAAAATCTGG -/A AATAGTTATC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 2 3 215314 CASAVA_Build 4 119153235 4D TACGAAAAAT ACAA/---- ACAATCAGCA 3070 hom 93 het 35 0 31 5 ACAA 2 1 215315 CASAVA_Build 4 119165243 1D TCTTCTTAAT A/- AATTATCCAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 3 2 215316 CASAVA_Build 4 119165957 5D AATGGCTCAA ACAAG/----- ACAAATGCTT 3070 hom 90 het 32 0 31 3 ACAAG 1 0 215317 CASAVA_Build 4 119167664 4D32M1D TGATGTAGCC CCAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGTTGCCCCCCT/----CCAAACAAAAAAAAAAAAAATTGTTGCCCCCC- AGCATAGATA 3070 hom 66 het 18 0 23 2 N/A 0 0 215318 CASAVA_Build 4 119170625 1D TTTTATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 34 3 20 12 T 16 15 215319 CASAVA_Build 4 119176043 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 T 12 11 215320 CASAVA_Build 4 119183466 2D GCTTCACTAA TC/-- TCTCTCTCTT 3070 hom 92 het 36 0 30 6 TC 5 4 215321 CASAVA_Build 4 119187526 1I GCAGCACAGA -/C CACCTAACAA 3070 hom 117 het 49 0 37 12 C 1 2 215322 CASAVA_Build 4 119198691 11D AATTATTACC ACTTATGAGCA/----------- AATATTATAT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 ACTTATGAGCA 1 0 215323 CASAVA_Build 4 119200258 1I CCCAGCTAAG -/C GGAAGCCAGA 3070 hom 72 het 26 0 23 3 C 0 1 215324 CASAVA_Build 4 119209747 4D TGTGCATCAG ATCA/---- GTCAGAAGAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 ATCA 1 0 215325 CASAVA_Build 4 119210417 4I54M3D TGTTTTTGAC ----CAGTTATTATTTTTCCTCTTATTTCACACTCCATAAATGGAACAGCATGTTCCTTTG/CAATCAGTTATTATTTTTCCTCTTATTTCACACTCCATAAATGGAACAGCATGTTCCT--- TTGTTATTTA 3070 hom 138 het 36 0 47 12 N/A 0 0 215326 CASAVA_Build 4 119216353 3D GGGCTGTTTG ATT/--- TTTTTCTTGT 2376 hom 15 het 6 0 6 0 ATT 1 0 215327 CASAVA_Build 4 119217071 1I TAATCCCATA -/T TTCTCAGAGG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 2 3 215328 CASAVA_Build 4 119222014 2D TGCAAGTGAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 132 het 54 0 44 12 TG 7 6 215329 CASAVA_Build 4 119232829 1I ATTTTCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 26 3 21 2 T 11 12 215330 CASAVA_Build 4 119233629 1I AGGGGCAGAG -/A AAAATAACAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 5 215331 CASAVA_Build 4 119238652 1I ATTACTGTGG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 9 215332 CASAVA_Build 4 119248340 1D TGTCTTAAAT A/- AGATAGAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 1 215333 CASAVA_Build 4 119249501 3D AACAACTGGG AAC/--- CTCATGATTA 3070 hom 90 het 32 0 30 3 AAC 1 0 215334 CASAVA_Build 4 119255397 1I GATAATATTT -/C CCCCCCCTAA 3070 hom 77 het 34 0 26 8 C 7 8 215335 CASAVA_Build 4 119256643 3D AACTGCTGTG AGA/--- AGGAGAGTCA 3070 hom 81 het 31 0 28 5 AGA 1 0 215336 CASAVA_Build 4 119262288 1D GATGAGGAAG C/- ATAAGAGAAT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 C 1 0 215337 CASAVA_Build 4 119263097 1D TCAGTTTTTT C/- TTTCTTTTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 1 0 215338 CASAVA_Build 4 119285349 1D TTCCAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 38 1 33 4 A 12 11 215339 CASAVA_Build 4 119301277 1D GCTCCTGAGG C/- TTCTGCATTC 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 C 1 0 215340 CASAVA_Build 4 119313738 2D GGCATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 33 0 25 8 TG 10 9 215341 CASAVA_Build 4 119344892 1D CCATCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 14 13 215342 CASAVA_Build 4 119351906 4D TGGGAAAAAG AAGT/---- AAGATTGCTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 AAGT 1 0 215343 CASAVA_Build 4 119356230 1D GGGAAGGACC A/- GTGGAGAGGA 3070 het 3070 ref 59 29 25 6 A 1 0 215344 CASAVA_Build 4 119362596 1D TTTTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 8 A 13 12 215345 CASAVA_Build 4 119367842 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCCAAAT 3070 het 721 hom 41 2 34 5 C 7 6 215346 CASAVA_Build 4 119375652 16I AAAAAAAAAG ----------------/GAAGGAAGGAAGGAAA GAAGGAAGGA 3070 hom 62 het 23 0 19 5 GAAGGAAGGAAGGAAA 0 1 215347 CASAVA_Build 4 119378068 5D TAAAAGAAAC TAAAT/----- TAAAATATAA 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 TAAAT 1 0 215348 CASAVA_Build 4 119382116 3I GCAACTTCTT ---/CTC CTTAGTTTCT 3070 hom 138 het 58 0 44 14 CTC 0 1 215349 CASAVA_Build 4 119396034 2D TACCCAAGAC TG/-- TCAGTAAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 21 8 TG 1 0 215350 CASAVA_Build 4 119400642 2D ACATATAAGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2580 hom 34 8 22 4 AT 9 8 215351 CASAVA_Build 4 119401088 4D CCCTGTGACC CAGT/---- CAAAGTTGAC 3070 het 3070 ref 49 25 22 4 CAGT 1 0 215352 CASAVA_Build 4 119404853 2D GAATAACCTG CA/-- CAGATTGATG 3070 het 3070 ref 35 16 14 7 CA 2 1 215353 CASAVA_Build 4 119408115 1D AATGTAGGAC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 7 6 215354 CASAVA_Build 4 119411677 4I AGCCATCTTC ----/GAAA GAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 GAAA 3 4 215355 CASAVA_Build 4 119413053 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2843 hom 26 9 15 2 T 13 12 215356 CASAVA_Build 4 119417135 1D TAAGTGCTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 9 8 215357 CASAVA_Build 4 119420980 2D ACTTTAAAAG TT/-- TATCAAAATC 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 T 3 1 215358 CASAVA_Build 4 119434380 1D TACACATTGC T/- GGGTTATAAA 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 T 1 0 215359 CASAVA_Build 4 119443410 2D TATGTTTACT TG/-- TATTGTCTCT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 TG 1 0 215360 CASAVA_Build 4 119449706 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 10 11 215361 CASAVA_Build 4 119450078 2D GCCTGGAGCA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 162 het 61 0 51 12 TC 6 5 215362 CASAVA_Build 4 119454913 1D AATTTTCTTC T/- TTTTTTATGC 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 T 7 6 215363 CASAVA_Build 4 119457667 1D ACTGCAAATG A/- AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 20 7 11 2 A 7 6 215364 CASAVA_Build 4 119471545 1D CTGAACACAA T/- GAACAGGGAA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 T 1 0 215365 CASAVA_Build 4 119477003 1D ATTAAATTTT A/- AAAAAGGTGA 3070 hom 111 het 42 0 37 7 A 6 5 215366 CASAVA_Build 4 119491340 4I ACATAAGGCT ----/GAAA GAGTTATGTC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 GAAA 0 1 215367 CASAVA_Build 4 119496782 1D TGCCACACAG C/- CCTGTTCTGG 3070 hom 102 het 37 0 31 6 C 3 2 215368 CASAVA_Build 4 119503688 1D TGTGAAGGAC A/- ATATGCCCTC 3070 het 3070 ref 52 28 17 8 A 2 1 215369 CASAVA_Build 4 119504647 1I GCTGCTCAAT -/A AATGTTTTTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 2 3 215370 CASAVA_Build 4 119507076 1D TCACATATGT G/- AGTTTCTATG 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 G 1 0 215371 CASAVA_Build 4 119509905 1D ATTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 20 9 A 11 10 215372 CASAVA_Build 4 119510628 1D CACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 28 1 23 4 A 12 11 215373 CASAVA_Build 4 119513995 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1819 het 1812 hom 20 6 6 8 A 15 16 215374 CASAVA_Build 4 119525035 1I AGCTAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3041 hom 26 8 13 5 A 10 11 215375 CASAVA_Build 4 119527918 3I AACCAGAAAT ---/AAA AAAACCACCT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 4 7 215376 CASAVA_Build 4 119535261 1I AGGCAGCAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 12 15 12 T 9 10 215377 CASAVA_Build 4 119537718 1D CATTTCCAGA G/- GACTTCTCAT 3070 het 3070 ref 61 28 25 8 G 2 1 215378 CASAVA_Build 4 119541973 1I GGTGACCTCT -/A GCAATTGAAA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 0 1 215379 CASAVA_Build 4 119545304 4I CCAAAGGTAG ----/GGTC ATAAAACCAC 1797 het 1797 ref 11 5 4 2 GGTC 0 1 215380 CASAVA_Build 4 119552664 2D ATAAAATGTC TT/-- ATATATGAAT 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 T 2 0 215381 CASAVA_Build 4 119556450 1I AGCTGAGTGT -/G GGTGGCACAT 3070 het 1095 hom 13 3 8 2 G 2 3 215382 CASAVA_Build 4 119556993 1I TACTCTTCTT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 8 9 215383 CASAVA_Build 4 119559538 2I AAACCAAAGG --/AA AAAAAAATTA 1857 het 1857 ref 12 7 4 1 A 7 9 215384 CASAVA_Build 4 119580794 1D TGGGTAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 12 1 8 3 A 15 14 215385 CASAVA_Build 4 119591807 1I AACTTAAAAG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 54 40 11 3 A 7 8 215386 CASAVA_Build 4 119606713 1D CAAGGAGTGG A/- GGGGGAATGC 3070 het 3070 ref 73 54 16 5 A 1 0 215387 CASAVA_Build 4 119609036 1D CTGAAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3031 het 745 hom 22 4 7 11 T 13 12 215388 CASAVA_Build 4 119610456 1I TCAAAAAAAA -/C AAAAACCATC 3070 het 789 hom 16 4 11 1 C 0 1 215389 CASAVA_Build 4 119617515 1D AGTAGACGTG C/- CAGTGTTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 C 2 1 215390 CASAVA_Build 4 119619956 1I TGTATACTTT -/A AAATCATCTC 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 3 4 215391 CASAVA_Build 4 119630368 1D ACTTCTAGAC A/- ATACGTAATT 3070 hom 63 het 28 0 22 7 A 2 1 215392 CASAVA_Build 4 119633705 3D TGGATTGATA AGG/--- AGGAGGGGAG 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 AGG 3 2 215393 CASAVA_Build 4 119637906 7D GTAGCTTATC AAGAAAA/------- GAGGTTTATT 2774 het 2774 ref 28 18 9 3 AAGAAAA 1 0 215394 CASAVA_Build 4 119638603 1D AAACTATGTA T/- TTTGCATCTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 4 3 215395 CASAVA_Build 4 119640788 4D AAAGCTGCAA AGAT/---- AGATAGTCTC 3070 het 3070 hom 21 8 13 0 AGAT 2 1 215396 CASAVA_Build 4 119641061 16D AGTATAATTT GAAGATATGAAAGAAA/---------------- GAGCAAATCG 2636 het 2636 ref 19 9 7 8 GAAGATATGAAAGAAA 1 0 215397 CASAVA_Build 4 119646097 5D TCCTGCCCAT AAAAG/----- AAAAGCACGC 3070 het 3070 ref 24 13 11 3 AAAAG 2 1 215398 CASAVA_Build 4 119646501 1D TTATTAAATC T/- TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 23 15 4 4 T 15 14 215399 CASAVA_Build 4 119650310 1D AGTAACATAG T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 T 7 6 215400 CASAVA_Build 4 119650776 4I ATATAGTAAG ----/AAGT AAGTTAAACC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAGT 1 2 215401 CASAVA_Build 4 119654541 3I AGCAAAACTT ---/CAA CAACAAGAAC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 CAA 2 3 215402 CASAVA_Build 4 119656434 1I CTTTATTACT -/C CTTTCAGAGT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 1 2 215403 CASAVA_Build 4 119657025 1I TGGAGGGGAA -/G TTGATATGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 0 1 215404 CASAVA_Build 4 119660787 1I48M3D TTCTTTAGAA -AAAAAAGGTTAGGTAGCTGCTACAGTTTGGAAGCAAATGTTAAGAAAGCAA/GAAAAAAGGTTAGGTAGCTGCTATAGTTTGGAAGCAAATGTTAAGAAAG--- AAAGTTTTGA 1878 het 1878 ref 19 18 4 2 N/A 0 0 215405 CASAVA_Build 4 119661174 20D TGCTGTATTC GTTTGATTTTTTTTCTTTTT/-------------------- GTTTTATTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 6 GTTTGATTTTTTTTCTTTTT 1 0 215406 CASAVA_Build 4 119663436 5I ATGTTGTTAC -----/TGTCT TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TGTCT 0 1 215407 CASAVA_Build 4 119663787 1I AACATAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 8 9 215408 CASAVA_Build 4 119665997 7I ATTTGAAGAG -------/TAATAGA TAAAGACACT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TAATAGA 0 1 215409 CASAVA_Build 4 119669241 2D GAGATAACCT CA/-- GTGACAGGGA 3070 hom 105 het 41 0 35 8 CA 1 0 215410 CASAVA_Build 4 119670944 3I CATCAGACCA ---/TCT TCTTTTAACT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TCT 1 2 215411 CASAVA_Build 4 119677181 1D TCCTAGGCTC T/- TTTTTTTTTT 2061 het 1412 hom 18 5 6 7 T 13 12 215412 CASAVA_Build 4 119677416 1I TCTCCCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 10 11 215413 CASAVA_Build 4 119677797 2I AGGTGTAAAC --/AT AAAAGAATTA 3070 het 3070 ref 40 29 8 3 AT 0 1 215414 CASAVA_Build 4 119682208 1D TAGATACATA G/- GCTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 36 16 12 9 G 2 1 215415 CASAVA_Build 4 119689293 1I ATCAAAAGTA -/T TTTAACTTAA 3070 het 3070 ref 22 10 7 5 T 3 4 215416 CASAVA_Build 4 119689967 1D CAGGGGGGCA T/- TTTTTTTTCA 2941 het 2941 ref 26 14 8 4 T 9 8 215417 CASAVA_Build 4 119693411 2D AGAGCTGGGC TG/-- TGTGCATTAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 TG 3 2 215418 CASAVA_Build 4 119696199 1I ATAGAGATGC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 8 9 215419 CASAVA_Build 4 119697087 1I ATTTATACTG -/T TTTTTTTTTA 2161 het 2161 ref 22 15 6 1 T 9 10 215420 CASAVA_Build 4 119706167 12D TCTCACTATG GGATCTCACTAT/------------ GAGCCCAGGC 3070 hom 51 het 20 0 18 4 GGATCTCACTAT 1 0 215421 CASAVA_Build 4 119728774 4I AGTTACATGG ----/CCAA CCAAGCCTGA 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 CCAA 1 2 215422 CASAVA_Build 4 119733628 4D TGTCTCTAGA TAGC/---- TAGCTAGCTA 3070 het 3070 ref 47 21 14 13 TAGC 5 4 215423 CASAVA_Build 4 119752908 2D AGAAGAGGTC AG/-- AGAGGGAGAT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 AG 3 2 215424 CASAVA_Build 4 119783638 1I ACATATAACA -/T TCCTAGAGTT 3070 het 2703 hom 15 6 9 0 T 1 2 215425 CASAVA_Build 4 119804252 2D ATATATACCT AC/-- ACCTCAAGGG 3070 het 3070 ref 64 46 14 5 AC 2 1 215426 CASAVA_Build 4 119804430 4I GTCACTTGTG ----/CTTT CTGTTTTTAA 3070 het 3070 hom 82 39 38 5 CTTT 0 1 215427 CASAVA_Build 4 119811577 2D CTTATTTCTC TG/-- TCTCTCCCCC 3040 het 923 hom 11 3 8 0 TG 1 0 215428 CASAVA_Build 4 119812044 4D CAGAGTAAAC AAAT/---- AAATAACTTC 3070 het 3070 ref 37 20 14 6 AAAT 2 1 215429 CASAVA_Build 4 119818918 1I CTTTTTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 877 hom 18 2 8 8 A 11 12 215430 CASAVA_Build 4 119833308 1D CAATTCACTC A/- AAAGAGTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 14 5 A 4 3 215431 CASAVA_Build 4 119850083 1I TTGACCTTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 60 28 27 5 A 9 10 215432 CASAVA_Build 4 119865683 1D CCTTTATAAC G/- TTTCGGCCTG 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 G 1 0 215433 CASAVA_Build 4 119873848 1D TTTCTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 T 12 11 215434 CASAVA_Build 4 119873984 1I TATATACATA -/T GTTTAATAAA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 T 0 1 215435 CASAVA_Build 4 119893500 1I CCCTGTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 7 8 A 10 11 215436 CASAVA_Build 4 119896726 6D GAAGGAAAAG AGAGAA/------ AGACCATTTC 3070 het 3070 hom 33 10 23 0 AGAGAA 1 0 215437 CASAVA_Build 4 119906433 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 10 11 215438 CASAVA_Build 4 119961265 1D GAGTGATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 11 10 215439 CASAVA_Build 4 119981722 1I ATACGGGGTA -/G GGTAGGCAGG 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 G 2 3 215440 CASAVA_Build 4 119985784 1D CATAACCTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 T 10 9 215441 CASAVA_Build 4 119986440 1D CCATCTGCAC T/- TTTGTTCCCA 3070 het 3070 ref 34 18 11 6 T 4 3 215442 CASAVA_Build 4 119987571 2I GAGAAGGGAA --/GG GAAAGGAAGG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 1 3 215443 CASAVA_Build 4 119988941 1I CAAATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2510 het 2510 ref 34 10 11 13 T 15 16 215444 CASAVA_Build 4 119989528 4I TGTAGATAAA ----/TTAT TTAATTGAAG 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 TTAT 0 1 215445 CASAVA_Build 4 119992482 8I GTGGGGGAAA --------/GGGCATAT GGGCATATTT 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 GGGCATAT 1 2 215446 CASAVA_Build 4 119995728 1D TTACTAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 8 13 A 13 12 215447 CASAVA_Build 4 120008063 4I TTCCTATTAG ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 87 het 41 0 29 12 TTTC 2 3 215448 CASAVA_Build 4 120008073 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 795 het 748 hom 35 5 12 18 TC 0 1 215449 CASAVA_Build 4 120008348 1I CAATTTTCTC -/A AAAAAACCTA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 6 7 215450 CASAVA_Build 4 120008755 1I TTTACATATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 8 9 215451 CASAVA_Build 4 120011879 1D TCTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1089 het 1089 ref 46 32 3 11 T 11 10 215452 CASAVA_Build 4 120024317 1I TCTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2932 hom 26 9 15 2 T 10 11 215453 CASAVA_Build 4 120027430 4I CCTTCAAAGG ----/GTCT GTCTCTTCCA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 GTCT 1 2 215454 CASAVA_Build 4 120035155 22D TGGGGGAACG TCGGGGGAACGTCGGGGGAACA/---------------------- TCAGGGGAAC 2527 het 2527 ref 25 17 9 5 TCGGGGGAACGTCGGGGGAACA 1 0 215455 CASAVA_Build 4 120042636 1I GTATGGTCAA -/G CAAAAGTAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 0 1 215456 CASAVA_Build 4 120044847 3D GAGTTTAAAA ATT/--- ATTATTAGCA 3070 het 3070 ref 34 18 11 6 ATT 3 2 215457 CASAVA_Build 4 120045441 1I GTTACCTTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 8 215458 CASAVA_Build 4 120053114 1I AAATTTAGGT -/A AAATCTTCCT 3070 hom 96 het 33 0 32 1 A 3 4 215459 CASAVA_Build 4 120055615 1D AAAGTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 11 10 215460 CASAVA_Build 4 120058267 2I GCATATATGA --/AT ATGTTTGTCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AT 1 2 215461 CASAVA_Build 4 120059866 1I GATTGAGCCT -/C CCCTGTCTCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 3 4 215462 CASAVA_Build 4 120060012 1D TAATTGACTG A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 45 12 26 7 A 6 5 215463 CASAVA_Build 4 120064492 1D GACTGCACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 956 hom 22 4 13 5 A 18 17 215464 CASAVA_Build 4 120066444 9I ATAACAATTA ---------/CAGATAGCC CAGTATAGAG 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 CAGATAGCC 0 1 215465 CASAVA_Build 4 120081099 1I CAAGCTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 9 10 215466 CASAVA_Build 4 120081508 1D TGGTGCTCCT C/- CGGGTTCTGC 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 C 2 1 215467 CASAVA_Build 4 120090699 3I CACAATAGAA ---/AAC AACTGCCACA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 AAC 1 2 215468 CASAVA_Build 4 120094204 1I AACTGTAGCC -/T TTTTTTTTTT 2908 het 2908 ref 34 16 9 9 T 11 12 215469 CASAVA_Build 4 120095276 3I AGTATCCTTC ---/TGT AGATATAGAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TGT 0 1 215470 CASAVA_Build 4 120096349 2D TGTGACTCTC AT/-- GTGAAGAATG 3070 het 3070 ref 33 21 10 4 AT 1 0 215471 CASAVA_Build 4 120099229 1D GATGATCCTG A/- GTAACTCTGC 3070 het 3070 hom 55 20 27 8 A 1 0 215472 CASAVA_Build 4 120105104 1D AAAGTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3065 het 2128 hom 17 7 9 1 A 11 10 215473 CASAVA_Build 4 120106534 1I GATTTTTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 20 9 8 3 A 8 9 215474 CASAVA_Build 4 120110019 3I GTAAAAAAGT ---/ACA ACGTTTCTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ACA 0 1 215475 CASAVA_Build 4 120112467 2D GTTATGTTCT CC/-- CATCCATGAG 3070 hom 123 het 45 0 40 5 C 3 1 215476 CASAVA_Build 4 120120715 3D ATGAAAATAA ATC/--- ATATTAGTTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 ATC 1 0 215477 CASAVA_Build 4 120121111 1I TTCTTTTCCC -/A CCCTTCCCCA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 0 1 215478 CASAVA_Build 4 120123552 20D TAATGGAAGC TACTCAGATGAGTAGCTTCT/-------------------- TTAGTGCAAC 3070 het 3070 ref 34 18 16 6 TACTCAGATGAGTAGCTTCT 1 0 215479 CASAVA_Build 4 120124378 12I ATATTTCTAA ------------/CAATCTCTCTCC CAAGCTACGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CAATCTCTCTCC 0 1 215480 CASAVA_Build 4 120125799 1I AGCAGGGTTT -/A GGGGGAAGGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 0 1 215481 CASAVA_Build 4 120133294 4I CCTCTCCATG ----/ACCT ACCTACTCAC 3070 het 3070 ref 53 25 19 9 ACCT 1 2 215482 CASAVA_Build 4 120133804 4D GAGAGAGAAG ACAA/---- ACAAAATGTG 3070 het 3070 ref 36 18 16 6 ACAA 2 1 215483 CASAVA_Build 4 120140204 12D GTATGTATGC ATGTATTTATTT/------------ ATGTAGAGAT 3070 het 3070 ref 33 19 14 4 ATGTATTTATTT 1 0 215484 CASAVA_Build 4 120147926 2I TATAGGCATA --/CT CTCTATTTTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CT 2 3 215485 CASAVA_Build 4 120158147 2D ATTTTCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 27 0 16 11 A 14 12 215486 CASAVA_Build 4 120160162 2D TATGTAACTC TG/-- TGTGTGTAGA 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 TG 4 3 215487 CASAVA_Build 4 120161584 1I TGGAATATTG -/A GTTCATTTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 0 1 215488 CASAVA_Build 4 120162088 1D TGCTTGGTAG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 6 215489 CASAVA_Build 4 120164015 1I CTATGTCTTC -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 7 8 215490 CASAVA_Build 4 120165290 1D TTTATAAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 A 8 7 215491 CASAVA_Build 4 120167410 3D CTGAGAACCA AAG/--- AAGTGGTCCC 3070 het 3070 hom 41 20 17 4 AAG 2 1 215492 CASAVA_Build 4 120168495 1I CCTTGTTTTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 A 8 9 215493 CASAVA_Build 4 120170424 1I CTCAATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 10 5 T 13 14 215494 CASAVA_Build 4 120179501 1D TTTCCAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 7 T 12 11 215495 CASAVA_Build 4 120182696 4D CTAAAAGGAA CAGG/---- CAGGCGCTGA 3070 hom 90 het 36 0 31 9 CAGG 2 1 215496 CASAVA_Build 4 120182874 1I GCCTTGAGAC -/G GTGATTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 G 1 2 215497 CASAVA_Build 4 120186926 1I CAGAAGGTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 8 9 215498 CASAVA_Build 4 120187672 1D TGTTTATTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 10 9 215499 CASAVA_Build 4 120188161 1D TAGTGGAGGT A/- AACTTAAAAT 3070 het 3070 ref 50 23 22 5 A 3 2 215500 CASAVA_Build 4 120198680 2D TTTGTGTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 74 het 33 0 24 10 TG 10 9 215501 CASAVA_Build 4 120209931 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1259 hom 39 4 16 20 T 12 11 215502 CASAVA_Build 4 120210171 7I AGCAGTAGGA -------/TGTAGCT TGCAGGGAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TGTAGCT 0 1 215503 CASAVA_Build 4 120210277 1D AACCAAGCTA G/- GGCAGAACAC 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 G 3 2 215504 CASAVA_Build 4 120221362 3I TATTCTTTAA ---/AGC TATTCAGGAC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 AGC 0 1 215505 CASAVA_Build 4 120222364 1D AGAATACTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 T 10 9 215506 CASAVA_Build 4 120228923 2I CCTGCTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 T 10 12 215507 CASAVA_Build 4 120231173 1I GTTTATTGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 21 21 9 T 9 10 215508 CASAVA_Build 4 120246938 1I GAAACTCAGG -/T TAAGAGAATT 3070 het 3070 hom 51 19 27 5 T 1 2 215509 CASAVA_Build 4 120253921 1I CCTAACTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 209 hom 29 1 26 2 T 10 11 215510 CASAVA_Build 4 120257034 1D GTACATGTGG A/- AAAATGATAT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 5 4 215511 CASAVA_Build 4 120263923 23I CAATTTGTTC -----------------------/AATATAAATCCACTTGTGGTTTA CAGAAATCCC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AATATAAATCCACTTGTGGTTTA 0 1 215512 CASAVA_Build 4 120264822 1I CTTTCAAAGG -/A AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 6 7 215513 CASAVA_Build 4 120273105 2I CTAGTCTATA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 GT 6 7 215514 CASAVA_Build 4 120273761 3D ATATTGCAGA AAT/--- AATAATAGCA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 AAT 3 2 215515 CASAVA_Build 4 120274122 1I TAGCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 T 15 16 215516 CASAVA_Build 4 120280550 1I GGGCAGGTTG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 7 8 215517 CASAVA_Build 4 120289717 1I CTCATTACTG -/C CAGGTGAATG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 C 1 2 215518 CASAVA_Build 4 120291766 1D TGTTAGGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 10 9 215519 CASAVA_Build 4 120292792 1D2M1D5M14I TACTCAACTA TAGTATTTA--------------/-AG-ATTGAGTAAGAATCAATCT TACTTGTGAA 3070 het 3070 ref 37 21 18 2 N/A 0 0 215520 CASAVA_Build 4 120300922 1D CTTTTTGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1177 hom 33 7 14 12 T 13 12 215521 CASAVA_Build 4 120301547 2I TATAAATAAC --/TA TGTATTATTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TA 0 1 215522 CASAVA_Build 4 120306296 1I AATGTTATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 954 hom 27 4 14 9 T 9 10 215523 CASAVA_Build 4 120309705 8I CCACCAACAA --------/AAAATTTC AAAATTTCAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 AAAATTTC 1 2 215524 CASAVA_Build 4 120312420 2D AAACACACAA AC/-- ACACACACAC 2934 het 2934 ref 22 12 9 1 AC 9 8 215525 CASAVA_Build 4 120316833 1D TTGAACAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 10 9 215526 CASAVA_Build 4 120317665 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 A 8 7 215527 CASAVA_Build 4 120331992 1D CCCTAATGTG T/- GTTAGTTCAG 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 T 1 0 215528 CASAVA_Build 4 120333250 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2357 het 981 hom 18 5 8 5 A 15 16 215529 CASAVA_Build 4 120342332 1I TCAAACCATT -/C CCTTTGAAAA 3070 hom 24 het 9 0 8 1 C 2 3 215530 CASAVA_Build 4 120343269 1D GAGATGGATT A/- AAAGACTTAA 3062 het 2129 hom 15 5 7 3 A 4 3 215531 CASAVA_Build 4 120346316 8D CCTTTCCATC ACTAAGAT/-------- ACTAAGATTC 3070 het 3070 ref 23 11 10 4 ACTAAGAT 2 1 215532 CASAVA_Build 4 120350758 2I ACCCACACAC --/AT GTCCCTCAAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AT 0 1 215533 CASAVA_Build 4 120352509 1D AGAAAGGTTT A/- TTCAAAATCA 3070 hom 111 het 41 0 37 5 A 1 0 215534 CASAVA_Build 4 120354512 4I CAGTACACTT ----/AGGA AGGAAGGTTT 3070 het 3070 ref 37 25 8 4 AGGA 1 2 215535 CASAVA_Build 4 120356983 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2214 hom 28 6 11 12 A 15 14 215536 CASAVA_Build 4 120359602 5I GAACATATTT -----/GCATA GCAGTGATTC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 GCATA 0 1 215537 CASAVA_Build 4 120359757 5D CTTTATCAAC TATTA/----- TATTAGTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 TATTA 2 1 215538 CASAVA_Build 4 120363484 3I AAATAATAAA ---/TAT TATATTCCCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 TAT 1 2 215539 CASAVA_Build 4 120373778 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 12 11 T 12 11 215540 CASAVA_Build 4 120376046 1I TAATTTTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 45 12 23 10 T 8 9 215541 CASAVA_Build 4 120379905 1I CTTTCTTGTT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 7 8 215542 CASAVA_Build 4 120382115 1D34M2I CAAGTTGACA TTTTTTCTTTCAGTACTTTAAAGATTTTGCTTCTC--/-TTTTTCTTTCAGTACTTTAAAGATTTTGCTTCTCTG TGTTTTAGCT 3070 het 2585 hom 39 7 19 24 N/A 0 0 215543 CASAVA_Build 4 120384464 3I ATTTAATACT ---/ATA ATACTATTTA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 ATA 1 2 215544 CASAVA_Build 4 120391510 1I TCAAGTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 28 1 18 9 T 11 12 215545 CASAVA_Build 4 120392225 4D ATGTCATCTG CAAA/---- CAGAGACAAT 3070 het 3070 hom 20 9 11 2 CAAA 1 0 215546 CASAVA_Build 4 120403113 5D ACTGTACTCT TACAG/----- TAAAGTAAGC 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 TACAG 1 0 215547 CASAVA_Build 4 120405809 2D ACTTGTACAC TG/-- TAACTAGATA 3070 het 3070 hom 37 17 17 5 TG 1 0 215548 CASAVA_Build 4 120411533 4D ATTGGATGTC TGTT/---- TGTTCACACT 3070 het 3070 ref 34 23 9 3 TGTT 2 1 215549 CASAVA_Build 4 120413843 1I TTTGAGCCCA -/G GGAGGTCGAG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 G 2 3 215550 CASAVA_Build 4 120413919 1D GTCCTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 27 2 14 12 A 15 14 215551 CASAVA_Build 4 120414167 1I ACAAATGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 43 0 32 11 T 9 10 215552 CASAVA_Build 4 120423323 1I GATATAGGAA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 T 6 7 215553 CASAVA_Build 4 120426861 1I AACATAGGTC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 8 9 215554 CASAVA_Build 4 120431656 1I GAGATTACCT -/G TTTATAGAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 G 0 1 215555 CASAVA_Build 4 120431874 1D GGTAACCATA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 T 8 7 215556 CASAVA_Build 4 120434432 1D AAGTGTCTTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 8 7 215557 CASAVA_Build 4 120435082 4D GCTTTATTTC GTTA/---- GTTGTCATTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 7 GTTA 1 0 215558 CASAVA_Build 4 120435867 2I CATTTATTTT --/TA TGTTGATTCA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 TA 0 1 215559 CASAVA_Build 4 120439534 4I CAGGTCATAA ----/AAAC AAACACACAC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AAAC 1 2 215560 CASAVA_Build 4 120444082 1D AGGTGATCCG C/- CCGCCTCGGC 1522 het 75 hom 6 1 4 1 C 3 2 215561 CASAVA_Build 4 120446199 4I GAGCAGAGTT ----/TAAC TAGTAGGCAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TAAC 0 1 215562 CASAVA_Build 4 120449941 8D ATATATCCCA AATAATTT/-------- AAAGACTCAG 3070 het 3070 ref 48 29 17 3 AATAATTT 1 0 215563 CASAVA_Build 4 120457525 1D ATTAAGGACA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 13 18 8 T 8 7 215564 CASAVA_Build 4 120460631 1D TGTTAACAAC T/- CTGTGCTTGT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 1 0 215565 CASAVA_Build 4 120460701 3D TAAAACATTC AGT/--- AGTTAAATTG 3070 het 3070 ref 26 14 11 3 AGT 2 1 215566 CASAVA_Build 4 120460917 11D TTTCAACATG TTAAATTGCTA/----------- TTACAGTTAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 TTAAATTGCTA 1 0 215567 CASAVA_Build 4 120462785 1D52M5I TTCTTATCTT AGAACCAACTTCATACTGTGATGTGGAAGCTTAAAGTTCAGGAAATCACCTAA-----/-GAACCAACTTCATACTGTGATGTGGAAGCTTAAAGTTCAGGAAATCACCTAACTACT CTATGTCAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 12 N/A 0 0 215568 CASAVA_Build 4 120463912 4D ATGTTAGATA TTGT/---- TTGATTTTTT 1060 het 1060 ref 19 12 5 2 TTGT 1 0 215569 CASAVA_Build 4 120471402 2D AAAAGCAAGC GA/-- GAGGGGGAAG 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 GA 2 1 215570 CASAVA_Build 4 120471742 1D ACATGTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 16 25 13 T 12 11 215571 CASAVA_Build 4 120471755 1D TTTTTTTTTC T/- CCCTGTTTCT 3070 het 3070 hom 53 16 26 11 T 1 0 215572 CASAVA_Build 4 120473822 1I TTAATAATGA -/C TTTTGCTTGT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 C 0 1 215573 CASAVA_Build 4 120475875 1I AATGAGTAGC -/T TTTTTTTAAT 2867 het 2867 ref 18 10 7 1 T 7 8 215574 CASAVA_Build 4 120476035 1I ATTAAACCTT -/C CCTTAATCTT 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 C 2 3 215575 CASAVA_Build 4 120478905 1I CCCAGGTAAG -/T TTTTTCTTTT 2897 het 2897 ref 19 12 6 1 T 5 6 215576 CASAVA_Build 4 120482817 1I ACATGTTTTT -/G AGTGAATTAC 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 G 0 1 215577 CASAVA_Build 4 120485814 1I GAGTGTAGAA -/G GTCAGATGGA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 G 1 2 215578 CASAVA_Build 4 120486524 1D AGCTAGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 12 11 215579 CASAVA_Build 4 120487067 2D GTACCTAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3068 het 2245 hom 19 7 7 5 T 13 11 215580 CASAVA_Build 4 120491765 1I AAGAGCATCA -/G GGGTAAGACA 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 G 3 4 215581 CASAVA_Build 4 120500087 1D AAAACATTTA T/- TTTTTTTTTT 2728 het 2728 ref 21 8 8 6 T 11 10 215582 CASAVA_Build 4 120500781 1D TGTGTTTGTG T/- TTTTTTTTGA 2710 het 2710 ref 22 11 7 4 T 9 8 215583 CASAVA_Build 4 120501861 1I CCAGACACTG -/T TTCCAACCAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 2 3 215584 CASAVA_Build 4 120505347 8I ATTGGGTGAG --------/CAGGGAAT CACAAGGAAA 2382 het 2382 ref 28 20 5 3 CAGGGAAT 0 1 215585 CASAVA_Build 4 120510610 1I TTTTCAATAA -/C CCTGAAAGGT 2868 het 2868 ref 33 19 7 7 C 2 3 215586 CASAVA_Build 4 120512078 18D GCTTGATGAT CAAAGGCCTTTCAGACTC/------------------ CAAAGGCCTT 2763 het 2763 ref 26 19 8 4 CAAAGGCCTTTCAGACTC 1 0 215587 CASAVA_Build 4 120512245 3I CCTTTACTTG ---/CTT CTCCCTGACT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 CTT 0 1 215588 CASAVA_Build 4 120516605 1D TGAATTAAAT G/- GCTGTACTGT 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 G 2 1 215589 CASAVA_Build 4 120516729 5I TATTCATTCT -----/CATAA CATAATAAAA 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 CATAA 1 2 215590 CASAVA_Build 4 120527114 1D CATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 11 10 215591 CASAVA_Build 4 120529575 2I CCTGCACAAG --/CT CTCTCTCTCT 2429 het 2429 ref 17 9 6 2 CT 5 6 215592 CASAVA_Build 4 120531031 10D TCCTGAAACA TTTATTTTAT/---------- TTTATTTTAT 3070 het 2632 hom 17 8 10 3 TTTAT 4 2 215593 CASAVA_Build 4 120537124 2I TCTCTGAAAC --/AT GTGCTGTGTC 2858 het 754 hom 10 2 6 2 AT 0 1 215594 CASAVA_Build 4 120540609 1I GCAGTACCCC -/A AGCAGGGATT 1479 het 1479 ref 21 12 4 5 A 1 2 215595 CASAVA_Build 4 120542383 2D GTATCAGGCC AA/-- AGAGTGAAGC 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 A 3 1 215596 CASAVA_Build 4 120543079 1D GTGATCTTTC T/- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 T 7 6 215597 CASAVA_Build 4 120545103 1D ACTGCTGCTG C/- CCCTGCCCTG 3070 het 2299 hom 20 7 8 5 C 4 3 215598 CASAVA_Build 4 120551968 4D TGAGGTCTTT TATC/---- TATTTAAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 TATC 1 0 215599 CASAVA_Build 4 120563935 2D CATGGTGAAA CT/-- CTGACTCTAT 2765 het 2765 ref 19 12 6 1 CT 2 1 215600 CASAVA_Build 4 120596905 3D TGTTTTTGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 24 4 15 6 T 13 10 215601 CASAVA_Build 4 120597614 4D TGGCATGCTC TCAG/---- TCAAAGGGGT 3070 het 2931 hom 16 7 8 2 TCAG 1 0 215602 CASAVA_Build 4 120602092 10I ATGCTAATAA ----------/TTTAGCTGTG TTTCAGCAAT 2406 het 2406 ref 28 19 5 4 TTTAGCTGTG 0 1 215603 CASAVA_Build 4 120608737 1I TTCTCTCCCC -/T GTTACAACAA 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 T 0 1 215604 CASAVA_Build 4 120609939 1I ATAGGGTGCT -/C TTTAATACCT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 C 0 1 215605 CASAVA_Build 4 120610208 1I CGAAGTTTTT -/A ATCTCACAAG 2906 het 2906 ref 18 11 6 1 A 1 2 215606 CASAVA_Build 4 120623528 3D ACAAGATTAG AAA/--- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 44 20 22 3 A 10 7 215607 CASAVA_Build 4 120631954 2D ATATATATAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 TA 9 8 215608 CASAVA_Build 4 120632758 6D CAACTTACTT ATTCTC/------ ATAGGCTCAG 3070 het 3070 hom 43 16 22 9 ATTCTC 1 0 215609 CASAVA_Build 4 120632864 3I CTGAGGTAGA ---/GTT GTTGATGACC 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 GTT 1 2 215610 CASAVA_Build 4 120643521 4I AAAATGTTTT ----/CTTC CTTCATTTAT 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 CTTC 1 2 215611 CASAVA_Build 4 120644548 1D AAACTTACTT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 6 A 7 6 215612 CASAVA_Build 4 120649330 4D TACCTTCTGA TACT/---- TACTTTAAGA 3070 het 3070 ref 39 26 11 3 TACT 2 1 215613 CASAVA_Build 4 120650546 1I AAGTCTAAAA -/G GCAAGGCACT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 G 1 2 215614 CASAVA_Build 4 120650669 4D GAGAGGAAGG AGTT/---- AGAAGAAACA 3070 het 3070 hom 31 9 16 8 AGTT 1 0 215615 CASAVA_Build 4 120658009 1D ACAAGGAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 23 8 13 4 A 9 8 215616 CASAVA_Build 4 120658103 1D CTGCTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 15 14 215617 CASAVA_Build 4 120658210 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2810 hom 30 9 11 10 T 12 11 215618 CASAVA_Build 4 120661420 1D TTATGTAAGT G/- GCAGCAAATA 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 G 2 1 215619 CASAVA_Build 4 120663413 3D ACACCATTAA AAT/--- TTGTAAGACA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 AAT 1 0 215620 CASAVA_Build 4 120663973 4I AACATGAAGA ----/TCTG TCTTTCAATA 3070 het 3070 ref 62 31 27 4 TCTG 0 1 215621 CASAVA_Build 4 120666317 1D AGGAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 A 11 10 215622 CASAVA_Build 4 120668170 12D TCACATTGTA GGATAAAATATT/------------ GTACATTTTA 3070 het 3070 ref 47 34 14 6 GGATAAAATATT 1 0 215623 CASAVA_Build 4 120668657 1D TATGGAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 10 9 215624 CASAVA_Build 4 120669043 3I TCTAACTGAT ---/AAG GAGCTAAATA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 AAG 0 1 215625 CASAVA_Build 4 120681101 1I AGTGGTGGTT -/C CCCAAGAAAA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 C 3 4 215626 CASAVA_Build 4 120689713 2I AGGTCCACCC --/CT GAGTAATTTA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 CT 0 1 215627 CASAVA_Build 4 120692310 2D TTCATTACTG AT/-- ATACCCTCTG 3070 hom 84 het 33 0 29 7 AT 2 1 215628 CASAVA_Build 4 120693510 1I AAAATAAGTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 A 8 9 215629 CASAVA_Build 4 120693992 1I GCTAAATTAC -/T TTCAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 2 3 215630 CASAVA_Build 4 120699682 1D TAACCTTTAT A/- AAAAATATCT 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 A 6 5 215631 CASAVA_Build 4 120700722 1D TAAGTCACTG T/- GGTCAATAGT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 1 0 215632 CASAVA_Build 4 120701828 1D AAGAAAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 13 26 8 A 10 9 215633 CASAVA_Build 4 120703096 1D2M4D ATTCCTGACC ATGAAAA/-TG---- GTCAGCACAC 3070 het 3070 ref 38 21 16 4 N/A 0 0 215634 CASAVA_Build 4 120704636 1D ATGATGAATG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 8 7 215635 CASAVA_Build 4 120706565 3D TATTAATTAA TAT/--- TATTATAATT 2143 het 2143 ref 12 7 5 1 TAT 3 2 215636 CASAVA_Build 4 120714976 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 G 3 4 215637 CASAVA_Build 4 120715244 1D ATTATAACTC T/- AAGAAACAAA 3070 het 3070 hom 40 16 23 2 T 1 0 215638 CASAVA_Build 4 120720444 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2083 hom 27 6 17 4 A 12 11 215639 CASAVA_Build 4 120729132 2D TTGCTTCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3013 het 786 hom 22 5 9 8 A 16 14 215640 CASAVA_Build 4 120730078 1I TTTACTAAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 7 8 215641 CASAVA_Build 4 120733613 1D GTGGGGTTAC A/- TATTCATGTA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 1 0 215642 CASAVA_Build 4 120735089 1D GATGAAATTT G/- AGTTGGATTT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 G 1 0 215643 CASAVA_Build 4 120737908 1D TCTGTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 13 12 215644 CASAVA_Build 4 120744225 1I AACTATAGAA -/T TTTTCAAATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 4 5 215645 CASAVA_Build 4 120746338 1D GGCATCTGTT A/- ATGACCTGCT 3070 hom 98 het 41 0 33 8 A 2 1 215646 CASAVA_Build 4 120747973 3D CTCCTAAACA TCT/--- TCTCATGGTA 3070 het 3070 ref 51 22 23 8 TCT 2 1 215647 CASAVA_Build 4 120754337 1I GGGGGTTTTG -/A AAAAATATTC 3070 hom 44 het 19 0 15 6 A 5 6 215648 CASAVA_Build 4 120756219 1D TACTAAGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 38 1 23 14 A 13 12 215649 CASAVA_Build 4 120757345 1D CGTGAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 12 11 215650 CASAVA_Build 4 120759309 1I CAACAAATGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 8 9 215651 CASAVA_Build 4 120759439 1D GGATTAAATT G/- GCTGTTTTAG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 G 2 1 215652 CASAVA_Build 4 120762251 4D ATAGATAGAT AGAC/---- AGACAGATAG 3070 hom 158 het 57 0 53 5 AGAC 2 1 215653 CASAVA_Build 4 120770520 1I AGTGATATAA -/G AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 49 26 16 7 G 0 1 215654 CASAVA_Build 4 120784232 1I AAAATTAATG -/A AAGACCAGAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 2 3 215655 CASAVA_Build 4 120785512 35D TTCTTTGTAA AGTCTGTGTTATTCCATTATAGCAACAGAAAATGG/----------------------------------- ACTAAGACAA 1256 het 10 hom 31 0 6 33 AGTCTGTGTTATTCCATTATAGCAACAGAAAATGG 1 0 215656 CASAVA_Build 4 120789684 1D TTTTGTTGTT G/- TTCTGAGAAA 3070 het 3070 ref 38 25 11 2 G 1 0 215657 CASAVA_Build 4 120792000 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 8 9 215658 CASAVA_Build 4 120792360 1I ACTTTCCCAC -/A ATTCAGTAAG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 1 2 215659 CASAVA_Build 4 120799302 1D ATTTTGTTTA T/- TCATTCTTCA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 2 1 215660 CASAVA_Build 4 120799847 1I TATATTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 10 11 215661 CASAVA_Build 4 120800306 1D GACTGTGATT G/- TAGCCAGCAC 3070 hom 129 het 47 0 42 5 G 1 0 215662 CASAVA_Build 4 120807992 1D TGTCTAGATA T/- TTGACATAGC 3070 hom 135 het 49 0 46 4 T 3 2 215663 CASAVA_Build 4 120808992 1D TCATGATTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 10 9 215664 CASAVA_Build 4 120816027 4D AAACAAAAAA TTCC/---- TTCATTTGTC 3070 het 3070 ref 34 15 11 9 TTCC 1 0 215665 CASAVA_Build 4 120824557 4I ATTCATGAAT ----/GTGC GTGCGTGCTT 3070 hom 118 het 49 0 40 9 GTGC 2 3 215666 CASAVA_Build 4 120826297 1D TTACTTATAA T/- TTTTTTTTTT 2790 hom 18 het 13 0 7 6 T 13 12 215667 CASAVA_Build 4 120827208 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 194 hom 34 2 30 4 A 8 7 215668 CASAVA_Build 4 120828963 4D TATATAACTG ACTT/---- ACTTATGATA 3070 hom 108 het 38 0 37 4 ACTT 2 1 215669 CASAVA_Build 4 120834144 3I ATATGCAAAC ---/AAG AAGTGTGTAA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 AAG 1 2 215670 CASAVA_Build 4 120841862 1D TGGAAAACAT A/- AAAAAGACCC 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 A 6 5 215671 CASAVA_Build 4 120843471 1D ATCTACACTT A/- ACCATAGGAT 3070 hom 90 het 32 0 30 3 A 2 1 215672 CASAVA_Build 4 120843567 5I AACACAAGGA -----/AGGAG AGGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AGGAG 1 2 215673 CASAVA_Build 4 120846727 4D AGGAAGCTGA AGGG/---- AGGAAGATTT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 AGGG 1 0 215674 CASAVA_Build 4 120868719 4I AGAGACAAAC ----/CTCT AGGAATTCAT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 CT 0 2 215675 CASAVA_Build 4 120874974 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2276 hom 23 6 9 8 T 10 11 215676 CASAVA_Build 4 120878433 1D TTACCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 12 11 215677 CASAVA_Build 4 120878685 1I TTTTTAATAT -/G ATTTTTTTAA 3070 het 2650 hom 23 9 11 3 G 0 1 215678 CASAVA_Build 4 120879226 1D TACTTAGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 9 215679 CASAVA_Build 4 120886929 3D AGTGGTTATG TGA/--- TGATACTCAC 3070 hom 96 het 37 0 32 7 TGA 2 1 215680 CASAVA_Build 4 120893409 1I TCTTCTAGGA -/T TTTTTTTTTG 1917 het 1917 ref 21 11 5 5 T 9 10 215681 CASAVA_Build 4 120893460 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 8 7 215682 CASAVA_Build 4 120896394 1D CAAGATACCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 67 het 28 0 21 7 T 9 8 215683 CASAVA_Build 4 120896898 1I ATCCTTTGTT -/C TTCTTATTTC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 0 1 215684 CASAVA_Build 4 120897075 10D AAGCAATGAA AAGATCATTC/---------- AAGATCATTC 3070 hom 53 het 35 1 31 6 AAGATCATTC 2 1 215685 CASAVA_Build 4 120899037 1D TATTTTCCTG A/- AAAAAAAAAA 1577 het 1577 ref 38 29 5 5 A 13 12 215686 CASAVA_Build 4 120910435 2D TATTTTTATC TT/-- GTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 2 0 215687 CASAVA_Build 4 120911695 1D TAAGATTCAT A/- ATAAAAATTC 3070 hom 108 het 42 0 36 8 A 2 1 215688 CASAVA_Build 4 120916557 1D AAGACCAGAG T/- TTTTTTTTTT 2982 het 2016 hom 26 10 9 7 T 12 11 215689 CASAVA_Build 4 120922656 2D CCAGTTTCAC AT/-- GATACTGCAT 3070 hom 87 het 30 0 29 2 AT 1 0 215690 CASAVA_Build 4 120929971 2D TGGGGAAAAC AT/-- GTGTAGATTA 3070 het 3070 hom 24 8 15 2 AT 1 0 215691 CASAVA_Build 4 120934264 2I ATGCAAACTT --/TG TGGTGCTGTA 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 TG 1 2 215692 CASAVA_Build 4 120937002 3D TAACACAGAG AGA/--- AGATCTGTGT 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 AGA 2 1 215693 CASAVA_Build 4 120940663 1I AAAGTCAGGC -/A ACCCTGGTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 2 215694 CASAVA_Build 4 120941010 1D GCAAAAATTT A/- AGTCTAATTT 3070 hom 93 het 38 0 32 10 A 2 1 215695 CASAVA_Build 4 120942233 1D GTGTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 51 4 33 14 T 14 13 215696 CASAVA_Build 4 120945713 4D TGAAACCTTC AATA/---- AATGTCAATT 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 AATA 1 0 215697 CASAVA_Build 4 120947279 4D GCAAGGCTGA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 10 het 27 1 24 3 AT 11 9 215698 CASAVA_Build 4 120952830 4D ATCATACATT TCTC/---- TCTGGCCTGT 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 TC 3 1 215699 CASAVA_Build 4 120954844 4D TGTTTTTATC TTAA/---- TTTATTCCTT 3070 het 3070 hom 40 20 20 2 TTAA 1 0 215700 CASAVA_Build 4 120959288 2D TGACTCTACT GG/-- CTGAAGAAAA 3070 het 2414 hom 49 7 23 21 G 2 0 215701 CASAVA_Build 4 120959860 1D CCTTCCTTTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 2345 hom 16 5 10 1 T 8 7 215702 CASAVA_Build 4 120964628 1D TAACATTCAT G/- GATATGTTGT 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 G 2 1 215703 CASAVA_Build 4 120964755 1I GGTTGGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1419 hom 32 3 23 6 T 12 13 215704 CASAVA_Build 4 120970368 1D TATATTACGG A/- AAAAAACAAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 7 6 215705 CASAVA_Build 4 120975871 1D CACTTACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 12 11 215706 CASAVA_Build 4 120980660 1D TCTGACCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 32 0 21 11 T 15 14 215707 CASAVA_Build 4 120983599 1D CTTTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 33 1 24 8 A 15 14 215708 CASAVA_Build 4 121000943 2D AAGGACAAAC AG/-- AAATCAGCTA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 AG 1 0 215709 CASAVA_Build 4 121005281 1D AACTCAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 11 10 215710 CASAVA_Build 4 121013691 1D TATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 40 1 31 8 T 10 9 215711 CASAVA_Build 4 121024182 4D CATGGTGGCA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 35 3 11 21 T 16 12 215712 CASAVA_Build 4 121026659 1I TACTTCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 477 hom 11 1 9 1 T 11 12 215713 CASAVA_Build 4 121033788 1I TTAAAAAAAA -/T ATTTGTAATT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 0 1 215714 CASAVA_Build 4 121044405 2D1M4I AATGATTCTG TTG----/--GGACA AATAGATATT 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 N/A 0 0 215715 CASAVA_Build 4 121048068 5D TTGTTTCTTA TTTAC/----- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 TTTAC 1 0 215716 CASAVA_Build 4 121050569 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 35 het 27 0 12 15 TA 9 8 215717 CASAVA_Build 4 121051397 1D GTGGGGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 T 12 11 215718 CASAVA_Build 4 121058531 4D CTCCCAAGAC TCAA/---- TCAGGAAGAA 3070 het 3070 ref 23 14 8 3 TCAA 1 0 215719 CASAVA_Build 4 121075031 1D TGCCCAGTAT C/- TTGATTGCAT 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 C 1 0 215720 CASAVA_Build 4 121075367 1I ACATGACTGA -/T TTTTCAGTGC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 4 5 215721 CASAVA_Build 4 121076347 1I ATAACTCTAT -/A AAGTAGATAT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 2 3 215722 CASAVA_Build 4 121081020 1I AGAAAACAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 10 215723 CASAVA_Build 4 121084425 4I AAACGCTCGT ----/CTAA CTATCCCCTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CTAA 0 1 215724 CASAVA_Build 4 121084494 32D AACAGGGAGA ACTGGTATCTTTCCATGAGTACAGCTGCTCCC/-------------------------------- ACAGCATCTA 3070 het 3070 ref 23 14 11 4 ACTGGTATCTTTCCATGAGTACAGCTGCTCCC 1 0 215725 CASAVA_Build 4 121084942 1D CCCAAAGAGG T/- TTTTCTGTGC 1254 het 1254 ref 33 25 3 5 T 5 4 215726 CASAVA_Build 4 121087522 2D CCAAATTATT CC/-- CCTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 C 4 2 215727 CASAVA_Build 4 121095416 4I TTTTTCTCTG ----/TCTC TCTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TC 3 5 215728 CASAVA_Build 4 121108191 1D CTCAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 716 het 716 ref 23 10 4 10 A 17 16 215729 CASAVA_Build 4 121112219 1I CCTGCTAATC -/A AAATGACAAC 3070 hom 120 het 48 0 40 8 A 3 4 215730 CASAVA_Build 4 121114791 2I ATGTTCTCGC --/CA CACACACAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 CA 4 5 215731 CASAVA_Build 4 121117386 6I AATTAAAACA ------/TTTTGT TTTATACACA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 TTTTGT 0 1 215732 CASAVA_Build 4 121117853 1I CTCGGCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 8 12 A 12 13 215733 CASAVA_Build 4 121122039 1I AGAGCTTGAA -/T TTTAGTGCTG 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 T 3 4 215734 CASAVA_Build 4 121126990 4I ACATAGGTAC ----/TATG TATGTATGTA 3070 het 73 hom 32 2 28 2 TATG 2 3 215735 CASAVA_Build 4 121129008 1D TACTTCACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 10 9 215736 CASAVA_Build 4 121133630 2D TTTTATTAAA AT/-- ATATATATAT 2668 het 2668 ref 16 7 6 3 AT 7 6 215737 CASAVA_Build 4 121158935 4D TCAAGAAAGC TGTT/---- TGTCAATTAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 5 TGTT 1 0 215738 CASAVA_Build 4 121165573 1I ACATGTAACT -/G GAATCCCAGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 1 2 215739 CASAVA_Build 4 121170463 7I GAGGAAAGAA -------/GAGTGTT GAGTGCATAC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 GAGTGTT 0 1 215740 CASAVA_Build 4 121172656 12I ATTGATTATA ------------/AGAATACAGGAT AGAAAAGTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 AGAATACAGGAT 0 1 215741 CASAVA_Build 4 121201586 1I GTGCACTGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 A 9 10 215742 CASAVA_Build 4 121202535 1D ACAAGTTTTG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 8 7 215743 CASAVA_Build 4 121206637 1D TTCACGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 11 10 215744 CASAVA_Build 4 121207921 1I CGCAGCTTTT -/C CCCGAGAAAT 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 C 3 4 215745 CASAVA_Build 4 121211972 4D GATACACAAA TACT/---- TACAACTGCC 3070 het 3070 ref 45 26 17 4 TACT 1 0 215746 CASAVA_Build 4 121215958 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 7 6 215747 CASAVA_Build 4 121220734 1D CACAGAACTT A/- AAAATCTATG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 5 4 215748 CASAVA_Build 4 121247159 1D TATTTCTGTG T/- TTTCTATCTT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 T 4 3 215749 CASAVA_Build 4 121254267 1D TGTGAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2991 hom 30 7 16 7 T 11 10 215750 CASAVA_Build 4 121265267 1D AAGATAATAT A/- TGCTGGGCTC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 1 0 215751 CASAVA_Build 4 121304156 2D ATTCTATATT TG/-- TGTTTCGGTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TG 2 1 215752 CASAVA_Build 4 121362218 1D CATTCGTTTA T/- TTTTTTTTTT 2018 het 2018 ref 36 22 6 9 T 15 14 215753 CASAVA_Build 4 121482207 2D ATGAGCACAG TT/-- TTTTATATGA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 6 4 215754 CASAVA_Build 4 121485805 1D ATTAGAAGCG T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 143 het 52 0 48 4 T 8 7 215755 CASAVA_Build 4 121495326 1D GTGCACTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 52 0 41 11 T 11 10 215756 CASAVA_Build 4 121500099 3I AGTGACCTTA ---/ATT AGTCAGGAGA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 ATT 0 1 215757 CASAVA_Build 4 121508387 3I AGAAGAAGAT ---/GAA GAAGAAGAAG 3070 hom 108 het 43 0 35 8 GAA 4 5 215758 CASAVA_Build 4 121511129 3D TAATTGTTAA ATC/--- ATCAAGTCTA 3070 hom 90 het 32 0 31 6 ATC 2 1 215759 CASAVA_Build 4 121513013 2I AAAATAACAC --/GT TTCATTCCTA 3070 hom 144 het 50 0 49 1 GT 0 1 215760 CASAVA_Build 4 121517069 2I ATTGGGATGA --/AT TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AT 0 1 215761 CASAVA_Build 4 121530626 2D ATGCGAGCAC AT/-- GAGTCCTGCA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 AT 1 0 215762 CASAVA_Build 4 121537683 3I TTCTCTTCTC ---/CTT CTTCTTATTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CTT 2 3 215763 CASAVA_Build 4 121540558 1I GTAAGAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 34 1 24 9 T 11 12 215764 CASAVA_Build 4 121550869 1D GTAAAAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 27 0 18 9 A 12 11 215765 CASAVA_Build 4 121551073 1I TAGCCAGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 27 0 22 5 A 10 11 215766 CASAVA_Build 4 121581864 1D GCTGAACTTG C/- CACAGTGGTC 3070 het 3070 ref 38 18 18 4 C 2 1 215767 CASAVA_Build 4 121617066 2D ATATATACAC AT/-- ATATATATAT 2413 het 2413 ref 25 14 6 5 AT 6 5 215768 CASAVA_Build 4 121622301 1I AAAAGGCTTT -/C AGGAATTCTT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 C 0 1 215769 CASAVA_Build 4 121624434 1I GAAGAGTGAA -/G GGGGGAACTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 G 5 6 215770 CASAVA_Build 4 121625021 1I TTTAATAATG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 7 8 215771 CASAVA_Build 4 121625579 1I TAGCAAGAGA -/G GGGGAAAAAG 3070 het 3070 ref 57 29 21 7 G 4 5 215772 CASAVA_Build 4 121651031 2I AAATGATCTG --/AT ATGGAGCTGA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 AT 1 2 215773 CASAVA_Build 4 121664806 1I ACGTATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1443 hom 33 5 25 3 T 12 13 215774 CASAVA_Build 4 121673571 1D TGGTACCAGC T/- TCCTCTTTGT 2362 het 2362 ref 29 22 5 2 T 2 1 215775 CASAVA_Build 4 121680830 1D TATTAAACCG C/- ATCTTCACCA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 C 1 0 215776 CASAVA_Build 4 121681553 2D AAGTGAAAAC AT/-- GTGATGTTTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 AT 1 0 215777 CASAVA_Build 4 121687173 6I AGGAAAGGAA ------/AGAATG TTATAAAATA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 AGAATG 0 1 215778 CASAVA_Build 4 121687249 1I ATTTTTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3033 hom 31 7 18 6 T 11 12 215779 CASAVA_Build 4 121692127 5I TTTTAGAGAC -----/TTTTA TTTTAATCTA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TTTTA 1 2 215780 CASAVA_Build 4 121692310 4D CCTTCCGTCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 2072 het 1075 hom 31 7 11 13 TTCC 4 3 215781 CASAVA_Build 4 121695129 1I CCTTGTTCCC -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 7 8 215782 CASAVA_Build 4 121697010 2I TTTTTCTAAT --/GA GAGAGAAGAT 2843 het 2843 ref 35 24 7 4 GA 3 4 215783 CASAVA_Build 4 121721180 1I TCTTAGAGAG -/T TTTTTTTTTT 2121 het 2121 ref 46 29 6 11 T 13 14 215784 CASAVA_Build 4 121724216 8I AGAAAGTCTA --------/AACTAATT AACTAATTTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AACTAATT 1 2 215785 CASAVA_Build 4 121737806 1D CATTCATGTT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 8 7 215786 CASAVA_Build 4 121739848 1I AGATTGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 12 13 215787 CASAVA_Build 4 121747908 1I AAAACCTTAT -/C TTGCAAAGTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 215788 CASAVA_Build 4 121750927 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 9 8 215789 CASAVA_Build 4 121753440 1D TAATTCAATA T/- AGGGCAATTA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 1 0 215790 CASAVA_Build 4 121758735 1I ATGCAGCAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 629 hom 40 2 33 5 T 9 10 215791 CASAVA_Build 4 121761270 4I AATATTTTAG ----/ATTA ATTAAAGCAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ATTA 1 2 215792 CASAVA_Build 4 121764972 1D CTTTACTGCC T/- CATTGTTGGA 3070 het 3070 ref 48 25 22 1 T 1 0 215793 CASAVA_Build 4 121766471 1I TATCCAATTG -/C CAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 C 1 2 215794 CASAVA_Build 4 121766825 1I ATTTTAATTT -/A AAAAAATTAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 6 7 215795 CASAVA_Build 4 121769473 1D TCATTGTCTC G/- TAAAGATATC 3070 het 3070 ref 41 19 17 7 G 1 0 215796 CASAVA_Build 4 121772059 1I CCCAACTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 11 12 215797 CASAVA_Build 4 121795483 4D AGATAAAGAA AAAC/---- AAACCAAAAG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 AAAC 2 1 215798 CASAVA_Build 4 121796186 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 9 215799 CASAVA_Build 4 121810573 3I AATCTAGGTG ---/TTA TTATGAAGGC 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TTA 1 2 215800 CASAVA_Build 4 121810956 2D GGACTCTGTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 70 het 42 1 35 8 T 11 9 215801 CASAVA_Build 4 121813399 1I GAATAATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 11 12 215802 CASAVA_Build 4 121814195 1D CACAGGAGCT G/- GGTGAGGTCT 3070 hom 120 het 45 0 40 6 G 3 2 215803 CASAVA_Build 4 121821592 1I CCTCAAACTT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 7 8 215804 CASAVA_Build 4 121838407 1I AACAGATGTG -/A AGCTACCACA 3070 het 3070 ref 29 17 7 5 A 1 2 215805 CASAVA_Build 4 121838555 5D ATAAGTATAC AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 37 het 27 0 15 14 AAATA 3 2 215806 CASAVA_Build 4 121841769 1I AAAAAGAGGT -/A AAAAAAAAAA 1850 het 1739 hom 16 6 6 4 A 10 11 215807 CASAVA_Build 4 121847306 10I TCATTTGGGC ----------/AAAACTGTAA AAAACTGGTT 2380 hom 12 het 7 0 5 2 AAAACTGTAA 0 1 215808 CASAVA_Build 4 121850312 1D AGAACAGTGG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 136 het 52 0 45 7 T 8 7 215809 CASAVA_Build 4 121852070 1D TACCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1610 het 9 hom 8 0 5 3 T 17 16 215810 CASAVA_Build 4 121858532 1I ATGCTTAATA -/T GTTCTCTTTC 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 0 1 215811 CASAVA_Build 4 121860580 2I AGTCAGAAAC --/TG TGTCTTGTAT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 TG 1 2 215812 CASAVA_Build 4 121865880 1D TATACAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 29 2 18 9 T 12 11 215813 CASAVA_Build 4 121871390 2D CTTCAATGCT AA/-- ATATTTATAG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 3 1 215814 CASAVA_Build 4 121873213 1I ACAATAAAAT -/A TTTTTAAACA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 0 1 215815 CASAVA_Build 4 121876657 1I TGTATGTCCA -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 116 het 43 0 38 5 T 7 8 215816 CASAVA_Build 4 121890679 1I AGAGCACCTG -/A AAAGTGGCTA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 A 3 4 215817 CASAVA_Build 4 121892896 1I GGGTAAAATA -/T TTTTAAAAAT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 4 5 215818 CASAVA_Build 4 121898491 9I TTCTCTTCTC ---------/CTTCTCCTT CTTCTTCTTC 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 CTTCTCCTT 0 1 215819 CASAVA_Build 4 121899751 5D TCAGAGCACC TCTAG/----- TCTAGATGAT 3070 het 3070 ref 47 23 16 11 TCTAG 2 1 215820 CASAVA_Build 4 121910626 8D TATTTATTTA TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 230 hom 30 2 9 20 TTTG 5 3 215821 CASAVA_Build 4 121911070 2D CTCATTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 14 12 215822 CASAVA_Build 4 121916525 2D TTCAAAACTT TC/-- TGTTCCCTCT 3070 het 3070 ref 39 19 18 4 TC 1 0 215823 CASAVA_Build 4 121920537 2D AAACAAACAA AC/-- AATATATATA 1429 het 1429 ref 25 13 4 12 AC 1 0 215824 CASAVA_Build 4 121921034 1D GGGCAACAGA G/- CGAGACTCTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 G 1 0 215825 CASAVA_Build 4 121925936 1D AAAAAAAAAA T/- ATTCCTATTA 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 T 1 0 215826 CASAVA_Build 4 121934379 2D TAAAATTAAC AG/-- AGTAGATTTT 3070 het 3070 ref 44 26 14 5 AG 2 1 215827 CASAVA_Build 4 121942486 5I TTTCTGTAAT -----/ATATA ATATATAATT 2875 het 2875 ref 18 10 7 1 ATATA 1 2 215828 CASAVA_Build 4 121950568 1I TCTCCCATCA -/C CCCCCAGATG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 C 5 6 215829 CASAVA_Build 4 121951790 1I TAAAACTCCA -/T TTAATTCTAT 2360 het 2360 ref 19 13 6 0 T 2 3 215830 CASAVA_Build 4 121953049 2I TCGTTATTCC --/CT GTCTTTTGGA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 CT 0 1 215831 CASAVA_Build 4 121958130 8I AAGAGAAGAG --------/AGAAAGAC ATATGTTGAT 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 AGAAAGAC 0 1 215832 CASAVA_Build 4 121958840 1D ATTCACACAC A/- AAACATGCGC 3070 het 3070 ref 48 24 15 10 A 4 3 215833 CASAVA_Build 4 121960042 7D TAAAAATAGC CATGGCA/------- CATGGCACAT 3070 het 1385 hom 14 4 8 4 CATGGCA 3 2 215834 CASAVA_Build 4 121962349 1I CACAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 8 8 A 13 14 215835 CASAVA_Build 4 121966297 4D ATAATATGTG TTGT/---- TTTTCTTACT 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 TTGT 1 0 215836 CASAVA_Build 4 121972293 1I CTTATACTAC -/T TTATAAAGAG 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 2 3 215837 CASAVA_Build 4 121988429 1D GGTTATAAAA G/- ATTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 G 1 0 215838 CASAVA_Build 4 121993409 1I ATATCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 15 1 13 1 T 13 14 215839 CASAVA_Build 4 122009052 1I AAATGAGTTA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 7 8 215840 CASAVA_Build 4 122012372 2D CTACTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 6 A 14 12 215841 CASAVA_Build 4 122013617 1D TTTTTATTTT A/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 1 0 215842 CASAVA_Build 4 122025041 1I AAATGTTCTT -/G TTATAGTTCC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 0 1 215843 CASAVA_Build 4 122026373 1I CACTCCAGTC -/T GGGAGACAGA 3070 het 3070 hom 33 12 9 12 T 0 1 215844 CASAVA_Build 4 122039738 7D CTCTCTTCAG CTGATTA/------- CTGAGACCCT 3070 het 3070 hom 43 20 22 2 CTGATTA 1 0 215845 CASAVA_Build 4 122050446 4D AGAACAATCA CTCT/---- CTATCATAAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 CT 3 1 215846 CASAVA_Build 4 122050676 1D CATATGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 9 19 8 A 12 11 215847 CASAVA_Build 4 122056081 2I GGGAGAACAA --/AG AGAGACTTCC 3070 hom 123 het 48 0 40 8 AG 2 3 215848 CASAVA_Build 4 122058285 2D GTCAGACATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 30 2 10 18 A 16 14 215849 CASAVA_Build 4 122070321 1D ATTGAACTCC T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 8 7 215850 CASAVA_Build 4 122070684 1I TTTTCAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 A 11 12 215851 CASAVA_Build 4 122072370 1D AAAAACCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 180 hom 27 3 10 14 T 10 9 215852 CASAVA_Build 4 122072909 1I TTTTAAAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 9 10 215853 CASAVA_Build 4 122088879 2I TCCAGGAGAG --/AC ATCACATATC 3070 hom 36 het 19 0 13 6 AC 0 1 215854 CASAVA_Build 4 122099448 4D TGTTTCCGAA TCTT/---- TCTTTCATTC 3070 het 3070 hom 47 21 23 5 TCTT 2 1 215855 CASAVA_Build 4 122104608 1D TAAAAACATA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 7 6 215856 CASAVA_Build 4 122105035 1D ATAAATAGAA T/- TTTTATAGGA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 5 4 215857 CASAVA_Build 4 122105561 1I TCTTTAAAAA -/T AACTACATAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 215858 CASAVA_Build 4 122108471 1D GGGAATTCAG A/- AATGTCAAGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 3 2 215859 CASAVA_Build 4 122113285 2I TACTTTATGT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 11 215860 CASAVA_Build 4 122119170 1D GAATTGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 17 1 12 4 T 13 12 215861 CASAVA_Build 4 122119352 2I GCCCGGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 1524 hom 10 het 5 0 4 1 T 10 12 215862 CASAVA_Build 4 122121692 1I CTTTGCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 16 7 A 11 12 215863 CASAVA_Build 4 122127779 3I GCCTGAAATT ---/TTC TTTTTTTGTT 3070 hom 39 het 14 0 13 1 TTC 0 1 215864 CASAVA_Build 4 122128149 1D TATTTCTGTG T/- ATATCAGTGG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 1 0 215865 CASAVA_Build 4 122132175 1I AGAAGATACG -/T TTTTATCCAT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 T 4 5 215866 CASAVA_Build 4 122142785 1I ATGAACTCAC -/A AAAAAACTTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 6 7 215867 CASAVA_Build 4 122144248 2D GTTTAAAAAA AC/-- AAAAAAAAGA 1976 hom 23 het 14 0 7 8 AC 1 0 215868 CASAVA_Build 4 122145279 1I TAAAATTGTA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 6 7 215869 CASAVA_Build 4 122148412 9D GAATCCTTGA AAAAAAAAG/--------- AAAAAAAAGA 3070 het 6 hom 40 1 31 12 AAAAAAAAG 2 1 215870 CASAVA_Build 4 122150994 2D ATAGCTAAAC AA/-- AAAAGAAAGG 3070 hom 138 het 54 0 46 10 A 6 4 215871 CASAVA_Build 4 122151636 1I AAAATTCAAA -/G CCAATTTATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 215872 CASAVA_Build 4 122158119 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 9 8 215873 CASAVA_Build 4 122158286 1I CCAAGCCTGG -/C TAATATTTTT 3070 hom 64 het 24 0 21 3 C 0 1 215874 CASAVA_Build 4 122172174 1I TACTAGACTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 52 26 17 9 A 8 9 215875 CASAVA_Build 4 122173031 1I CTTGTGTCTC -/T TTGACTTCTT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 2 3 215876 CASAVA_Build 4 122173910 4I60M1D CTTGATTACA ----AATTTAATGAAGAAAATAATCTGTTATAATTCTTATAGATGTTTATTAGTTTTTAGATTTA/AAGTAATTTAATGAAGAAAATAATCTGTTATAATTCTTATAGATGTTTATTAGTTTTTAGATTT- AAAAAAAAAC 3070 het 1805 hom 26 4 19 17 N/A 0 0 215877 CASAVA_Build 4 122180746 1I TTGGTTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 9 10 215878 CASAVA_Build 4 122194078 3D AATGCCAATG AGA/--- AGAATAATGA 3070 het 3070 hom 42 20 18 5 AGA 2 1 215879 CASAVA_Build 4 122210837 1D AACAATAATG A/- ATAATCATAC 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 A 2 1 215880 CASAVA_Build 4 122212385 2I AAAAAAAAAA --/AC AAACGAGGGA 2215 het 12 hom 16 0 8 8 AC 0 1 215881 CASAVA_Build 4 122240703 1D GGTTATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 9 9 T 12 11 215882 CASAVA_Build 4 122277297 1D CCATCTGAAC A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 A 6 5 215883 CASAVA_Build 4 122341245 4D AGAACTGTTG CAAA/---- CACTTAATGC 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 CAAA 1 0 215884 CASAVA_Build 4 122364223 1D TAGAAAAGGT A/- AAAATGCCTC 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 A 5 4 215885 CASAVA_Build 4 122366774 6I CAAAAAAGAG ------/AGAAAC AGAAATAGAC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 AGAAAC 0 1 215886 CASAVA_Build 4 122367550 4D GCTCTGCTCA TTGC/---- TTAATCAAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 TTGC 1 0 215887 CASAVA_Build 4 122376535 1D GCAGAGTTCT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 95 het 37 0 32 6 A 9 8 215888 CASAVA_Build 4 122380224 4D CCATGAGGCT TGTA/---- TGTACAATTC 3070 hom 81 het 30 0 28 4 TGTA 2 1 215889 CASAVA_Build 4 122387668 1D GTAATCTCAC T/- TTTTTTTTTT 1437 het 1437 ref 29 15 5 9 T 11 10 215890 CASAVA_Build 4 122387861 1I GGTATTCGAG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 6 7 215891 CASAVA_Build 4 122390745 1D TAACAAACCC A/- GAGAGGTACA 3070 hom 93 het 34 0 31 4 A 1 0 215892 CASAVA_Build 4 122399166 4D ATTTAGGGTC TCTA/---- TCTGACAGTG 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 TCTA 1 0 215893 CASAVA_Build 4 122406071 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1254 hom 28 3 19 6 A 14 15 215894 CASAVA_Build 4 122425392 1I CAACAAGGAT -/A GACAGCTTAC 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 0 1 215895 CASAVA_Build 4 122431556 1D TCCCCCCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 208 hom 13 2 10 1 A 10 9 215896 CASAVA_Build 4 122436271 1I TGAAAATTAT -/A AAAACACTGA 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 A 4 5 215897 CASAVA_Build 4 122439535 4D GCCTTGTGAT AGAA/---- AGAAAATTAA 3070 het 3070 hom 37 20 17 4 AGAA 2 1 215898 CASAVA_Build 4 122441728 4D CATTTTTACT TGAC/---- TAAGTTCTAG 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 TGAC 1 0 215899 CASAVA_Build 4 122464546 2D GTGTGTGTGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 95 het 40 0 31 9 AC 7 6 215900 CASAVA_Build 4 122465748 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 9 10 215901 CASAVA_Build 4 122470666 1I AGAACCATGG -/T TAAGTCCTGG 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 1 2 215902 CASAVA_Build 4 122478295 1D CCTGTACGTT G/- TGCACATGTA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 G 1 0 215903 CASAVA_Build 4 122486666 2D ATAATTACTC TG/-- TGAATAATTT 3070 het 3070 hom 41 18 21 3 TG 2 1 215904 CASAVA_Build 4 122492449 1I AAAGTAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 A 13 14 215905 CASAVA_Build 4 122495072 1I TCTTTAGATA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 6 7 215906 CASAVA_Build 4 122500576 1I AACACTATTA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 31 8 19 4 T 7 8 215907 CASAVA_Build 4 122504552 2I GAAGGGAAAA --/AG AGAAAAGCCT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 AG 1 2 215908 CASAVA_Build 4 122507160 1D ATGTGGGACA G/- GGATGGCCTG 3070 hom 129 het 46 0 42 4 G 3 2 215909 CASAVA_Build 4 122517443 1D CTTAACAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 10 9 215910 CASAVA_Build 4 122522682 1D GTTTTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 11 10 215911 CASAVA_Build 4 122530468 3D ACAGAACAAA AAG/--- AAGGAGAGGG 3070 het 3070 hom 38 18 15 7 AAG 2 1 215912 CASAVA_Build 4 122532989 4I GGGACTGGGC ----/TGGA TGGAGGCTGT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 TGGA 1 2 215913 CASAVA_Build 4 122542886 1I TGTATTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2863 hom 33 9 13 11 T 12 13 215914 CASAVA_Build 4 122547330 1D TATGTGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 594 hom 20 2 13 5 T 13 12 215915 CASAVA_Build 4 122547808 1D TTCTGCAAAG A/- ATGATGGTAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 1 215916 CASAVA_Build 4 122577093 1D CATTTGTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 T 11 10 215917 CASAVA_Build 4 122587490 14D CAGGTTGGGT CAAAGTGGCTGGGG/-------------- CAAAGTGGCT 1730 het 492 hom 8 1 4 4 CAAAGTGGCTGGGG 2 1 215918 CASAVA_Build 4 122589089 1D CACCGGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 A 10 9 215919 CASAVA_Build 4 122589434 3D CTAGAATTTC ATA/--- ATATTGCTTT 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 ATA 2 1 215920 CASAVA_Build 4 122599615 1I58M1D CCGCTAAGCC -TTTTTTTTTTAAAGAGATATTCTCTGTAGTAAGCACATAAAGAAATAAGATTATGGAGA/TTTTTTTTTTTAAAGAGATATTCTCTGTAGTAAGCACATAAAGAAATAAGATTATGGAG- AAAGATACGT 3070 het 3070 ref 39 32 26 7 N/A 0 0 215921 CASAVA_Build 4 122600964 1D ACTTTGATTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 9 8 215922 CASAVA_Build 4 122601675 12D CCATTGTCCT GGTTAGCAGTAA/------------ GGGGAGAGGG 3070 het 3070 ref 50 32 19 2 GGTTAGCAGTAA 1 0 215923 CASAVA_Build 4 122603214 1I TTAGTCTGAA -/T TTTAACAGGA 3070 het 3070 ref 53 32 16 5 T 3 4 215924 CASAVA_Build 4 122606449 8D AATAAATAAC TAAATAAG/-------- TAAATAAGTG 3070 het 3070 hom 22 11 11 4 TAAATAAG 2 1 215925 CASAVA_Build 4 122606760 5I ATATATAAAT -----/ATATA ATATATTTTT 1646 het 1646 ref 14 7 4 3 ATATA 1 2 215926 CASAVA_Build 4 122608172 25I TTTTAAGTTG -------------------------/AATGAACCAAACACCCAGAGATAGA AATGAAAACC 3070 het 3070 hom 16 8 10 1 AATGAACCAAACACCCAGAGATAGA 0 1 215927 CASAVA_Build 4 122617418 1I CAAAAATAAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 8 9 215928 CASAVA_Build 4 122630620 1D TGGAGAACTT C/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 53 23 21 9 C 1 0 215929 CASAVA_Build 4 122633390 1D GATTCTTAAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 T 8 7 215930 CASAVA_Build 4 122639414 4I TTAAATCAGA ----/TTGT TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TTGT 1 2 215931 CASAVA_Build 4 122639590 1I CACTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 9 10 215932 CASAVA_Build 4 122640986 4I GTCACACAGT ----/CAGG CAGGCTAACT 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 CAGG 1 2 215933 CASAVA_Build 4 122647103 2D TACTAGTCTA GT/-- GTGTGTGTGT 438 het 438 ref 47 18 8 23 GT 6 5 215934 CASAVA_Build 4 122653994 1I CAGCTCATGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 8 9 215935 CASAVA_Build 4 122666146 1I ATTGCAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 10 11 215936 CASAVA_Build 4 122667498 2D TGGTTACTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 27 25 215937 CASAVA_Build 4 122669054 1I GATTTCTCAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 293 hom 54 1 46 7 T 7 8 215938 CASAVA_Build 4 122670721 1D TATTTTTGTT C/- TCACTGTTCT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 C 1 0 215939 CASAVA_Build 4 122674701 1I ATCATATGGT -/A AAAAGGGCTA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 4 5 215940 CASAVA_Build 4 122677137 5I AGCCCCTAGT -----/CATAC CATAGAATCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CATAC 0 1 215941 CASAVA_Build 4 122679003 1D ATTGTCTGTG T/- TTTCTGCTCA 3070 het 3070 ref 52 33 18 2 T 4 3 215942 CASAVA_Build 4 122681343 2D TTCCTAAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 12 10 215943 CASAVA_Build 4 122689099 5D TTGCAACCCC TGCTT/----- TGCTTTGCTT 3070 het 3070 ref 27 15 9 9 TGCTT 4 3 215944 CASAVA_Build 4 122697659 1I TCTACTATCA -/T TCATTCTCTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 1 2 215945 CASAVA_Build 4 122698614 2D TCTTCTAGTT CA/-- CAGTTTCTGT 3070 het 3070 ref 50 20 20 11 CA 2 1 215946 CASAVA_Build 4 122702248 3D TTCGTTATGT TTG/--- TTGTTGACAT 3070 het 3070 ref 45 20 19 8 TTG 3 2 215947 CASAVA_Build 4 122703470 1D TCCATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2344 het 558 hom 20 3 6 12 A 17 16 215948 CASAVA_Build 4 122708819 1D TGTTAGAAGG A/- AAACTAACAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 4 3 215949 CASAVA_Build 4 122709757 12D CATTCTTAAA GAAAAGAATTTT/------------ CAACCCAGAA 3070 hom 36 het 14 0 13 3 GAAAAGAATTTT 1 0 215950 CASAVA_Build 4 122722584 6D TACCTAAAAT GTATGA/------ GTATAAGAAG 3070 het 3070 ref 52 24 25 5 GTATGA 1 0 215951 CASAVA_Build 4 122724317 1I AGGTACGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 10 11 215952 CASAVA_Build 4 122724838 1I ATGTGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 11 12 215953 CASAVA_Build 4 122729507 2D GAATCTTGCC AA/-- AGAGACCAGA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 3 1 215954 CASAVA_Build 4 122729815 1I GAGTGGTGTA -/G TATCTCACCT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 G 0 1 215955 CASAVA_Build 4 122730754 1D TTCCCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 12 11 215956 CASAVA_Build 4 122731234 2D ATTATAAACA CT/-- GTCACTGGTA 3070 het 3070 ref 44 20 18 9 CT 1 0 215957 CASAVA_Build 4 122733378 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAGAAAAA 3070 het 1855 hom 22 6 12 4 AG 0 1 215958 CASAVA_Build 4 122737344 2D AGAGAATAAC AT/-- TTTTTTTTTT 1795 het 431 hom 26 4 8 15 AT 1 0 215959 CASAVA_Build 4 122740503 4I ACATGTAAAT ----/AGAC AGACAGAGTC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AGAC 1 2 215960 CASAVA_Build 4 122744765 3I TTTAATTTTA ---/TAT ACAATGCTAC 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 TAT 0 1 215961 CASAVA_Build 4 122750430 1D TAATAGTGAG T/- TTTTTTTATA 3070 het 848 hom 34 6 13 15 T 8 7 215962 CASAVA_Build 4 122750452 1D TAGACAGTAC T/- TTTTGCCCTT 3070 het 960 hom 27 2 15 11 T 5 4 215963 CASAVA_Build 4 122770471 2D ACAAATTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 38 0 18 21 A 12 10 215964 CASAVA_Build 4 122778632 1I TTTGCTTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 355 hom 43 1 35 7 T 9 10 215965 CASAVA_Build 4 122781542 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 761 hom 24 5 12 7 A 16 14 215966 CASAVA_Build 4 122789020 1D ACACAGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 11 10 215967 CASAVA_Build 4 122792899 1D CCCCACCCCA G/- AACCTTCATA 2255 het 2255 ref 21 11 5 5 G 1 0 215968 CASAVA_Build 4 122795628 5D CTGAAAAGAA GGAAT/----- GAAGAAATCA 3070 het 3070 ref 33 16 13 7 GGAAT 1 0 215969 CASAVA_Build 4 122800382 8D ATTGGTCTGT CTGCCTAC/-------- TGTATGAGTA 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 CTGCCTAC 1 0 215970 CASAVA_Build 4 122807182 2D CTTCTTTCTC AT/-- ATGTTTATGA 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 AT 2 1 215971 CASAVA_Build 4 122811208 2D GCTCAGACCT CA/-- GTCTGCTTAG 3070 het 3070 ref 27 11 12 6 CA 1 0 215972 CASAVA_Build 4 122830570 1D TAGTAGGCTT G/- GTGAGTTGTC 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 2 1 215973 CASAVA_Build 4 122831777 5D CGAAGATAAT TATAA/----- TATATTCTTA 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 TATAA 1 0 215974 CASAVA_Build 4 122831930 1D TAGGTATGCC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 30 1 26 3 A 10 9 215975 CASAVA_Build 4 122832146 1D TACCGCACCC T/- CCCCCCACCT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 T 1 0 215976 CASAVA_Build 4 122835150 3I CCACCATGCC ---/CAG CAGCTAATTT 3070 het 2607 hom 17 7 8 2 CAG 1 2 215977 CASAVA_Build 4 122846479 1D GAGAGTCAGG A/- AGTCTGCATT 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 2 1 215978 CASAVA_Build 4 122851361 1D GTCCAGCAGC A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 45 26 11 8 A 7 6 215979 CASAVA_Build 4 122858661 13I10M1D AAGGTTAATG -------------GACACTTGACA/GAAAACTGAGTCTGACACTTGAC- CTGTTTTCCT 3070 het 3070 ref 30 22 8 9 N/A 0 0 215980 CASAVA_Build 4 122859289 1I AAACTGCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 10 11 215981 CASAVA_Build 4 122863863 1D28M2I TAATCAGGAG AAAAAAAAATCAAACCAGTCACAACTGAG--/-AAAAAAAATCAAACCAGTCACAACTGAGAC ACATTCTACA 3070 het 3070 hom 39 18 26 7 N/A 0 0 215982 CASAVA_Build 4 122872828 8I TTTACTAACA --------/TTCACATT TAGATACCCA 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 TTCACATT 0 1 215983 CASAVA_Build 4 122881320 3D CCCTGACTAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2810 hom 24 12 9 3 A 15 12 215984 CASAVA_Build 4 122884362 3D TTTTAAACAT TAA/--- TTATTTAGAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 5 TAA 1 0 215985 CASAVA_Build 4 122887634 1D ATGATCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 21 8 2 T 11 10 215986 CASAVA_Build 4 122891586 2I AAGCATTTTT --/TA TATGTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 TA 1 2 215987 CASAVA_Build 4 122901488 1I TATATAAAAA -/G GCTACTATTA 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 G 1 2 215988 CASAVA_Build 4 122901729 1D TGATTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 12 11 215989 CASAVA_Build 4 122908946 1D AATCACCATA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 49 29 15 5 T 7 6 215990 CASAVA_Build 4 122912705 1I AAGGCTGTTG -/T TAACTGTTAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 1 2 215991 CASAVA_Build 4 122920302 9I CCGAGTAGCT ---------/GGGATTACA GGTGCCTGCC 1922 het 1922 ref 15 8 6 2 GGGATTACA 0 1 215992 CASAVA_Build 4 122924726 2D TCAAAAACAC AA/-- ACTTTATCAT 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 A 3 1 215993 CASAVA_Build 4 122941159 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 10 11 215994 CASAVA_Build 4 122954676 3I TATGGCACAC ---/TTA TTACTATATA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 TTA 1 2 215995 CASAVA_Build 4 122981446 1D AAATATATTC T/- TTTTTTTTTT 2555 het 777 hom 21 2 7 12 T 15 14 215996 CASAVA_Build 4 122997727 1I ATGCTTTATC -/T TTTTTTTTTT 2363 het 2363 ref 37 11 13 13 T 15 16 215997 CASAVA_Build 4 123019057 2I CAACTGACTG --/AA CAGACTCAGG 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 A 0 2 215998 CASAVA_Build 4 123088783 1D CTTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2962 hom 29 11 14 5 A 14 13 215999 CASAVA_Build 4 123089446 1I CTCTTTGCGG -/T TTTTTTTTTT 913 het 913 ref 37 16 9 12 T 10 11 216000 CASAVA_Build 4 123100284 1I86M1D AATGTTCATA -ATATACATTAATATTTTCATCACTAAACAGTTTTTAAGAACATGATTCATTTACCTCTATAGATTATTTTTTAATGTAATAAATTCT/CATATACATTAATATTTTCATCACTAAACAGTTTTTAAGAACATGATTCATTTACCTCTATAGATTATTTTTTAATGTAATAAATTC- TTTTTTTTGT 3070 het 1633 hom 44 8 42 13 N/A 0 0 216001 CASAVA_Build 4 123109695 1D CTAATGAAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 24 0 22 2 T 9 8 216002 CASAVA_Build 4 123124208 1D TTGATGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 14 13 216003 CASAVA_Build 4 123125385 1I TGTAACTCAG -/T TTTTTTCATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 216004 CASAVA_Build 4 123127448 8D AAGATAGTTG TATGAAAT/-------- AATAAGTTAC 3070 hom 102 het 36 0 35 4 TATGAAAT 1 0 216005 CASAVA_Build 4 123131028 1D CAAAAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 31 1 22 8 T 11 10 216006 CASAVA_Build 4 123162034 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 8 9 216007 CASAVA_Build 4 123162664 1I CTTTTTATAT -/C CACTTGACTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 C 1 2 216008 CASAVA_Build 4 123164472 4I CAACTAAAAC ----/AAAG ATAGATAAAT 2245 het 2245 ref 19 11 6 2 AAAG 0 1 216009 CASAVA_Build 4 123165108 4I TATGGTTATG ----/TATT TAATTTTCTA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 TATT 0 1 216010 CASAVA_Build 4 123165666 1I GAAAATGTGA -/T TATATACACA 3070 het 3070 hom 43 9 28 6 T 1 2 216011 CASAVA_Build 4 123166060 1D TGATTCTTAT A/- AAAAAGAAAT 3070 het 2595 hom 20 7 9 5 A 6 5 216012 CASAVA_Build 4 123166113 2I TTAAAAAAAA --/AC AAAAACAAAA 2912 het 1733 hom 17 5 8 4 AC 0 1 216013 CASAVA_Build 4 123168757 1D AATAGTCCCT A/- ATAAGTTTCT 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 A 2 1 216014 CASAVA_Build 4 123171902 4D GGGTTTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TTTG 4 3 216015 CASAVA_Build 4 123182839 5I TTTGCCCAGC -----/TAATA TTTTGTATTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TAATA 0 1 216016 CASAVA_Build 4 123192151 1D GTTCAACCAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 T 9 8 216017 CASAVA_Build 4 123198633 1D CTGTTGCCCA G/- GCTGGAGTGC 1140 het 951 hom 9 3 3 3 G 2 1 216018 CASAVA_Build 4 123199316 6D CTATTGTTAT TTTGTA/------ TTTGTATTTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 TTTGTA 2 1 216019 CASAVA_Build 4 123200941 1D GTTAAGTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 13 11 T 13 12 216020 CASAVA_Build 4 123216371 4I ATGGCATTTG ----/GCCA GCCTGGCTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 GCCA 0 1 216021 CASAVA_Build 4 123232447 1I TCTCAAAAAA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 7 8 216022 CASAVA_Build 4 123234987 3I GATATGTTGG ---/ACA AAGGGATGAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 ACA 0 1 216023 CASAVA_Build 4 123236274 5D AGCAAAAAGT CTTAC/----- CTTACCTGGA 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 CTTAC 2 1 216024 CASAVA_Build 4 123236754 1D TAATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 25 1 16 8 A 12 11 216025 CASAVA_Build 4 123258059 1D GCAGCTGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1416 hom 22 4 12 6 A 13 12 216026 CASAVA_Build 4 123269308 1D TTAAAGTAAG A/- AAAAAAAAAA 1209 het 1209 ref 35 25 5 5 A 11 10 216027 CASAVA_Build 4 123276258 1D GGAGCTTTTT G/- TTTGGGGTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 1 0 216028 CASAVA_Build 4 123285754 1I CTGGGTGTTA -/C CCAAGGCCAA 3070 hom 88 het 36 0 29 7 C 2 3 216029 CASAVA_Build 4 123303341 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2565 hom 33 9 19 5 A 10 9 216030 CASAVA_Build 4 123323559 1I TTATTCTTGA -/C CTTCATACGT 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 C 1 2 216031 CASAVA_Build 4 123344976 1I TAGGATAGTA -/T TTTTGCCATT 3070 het 3070 hom 59 22 33 4 T 4 5 216032 CASAVA_Build 4 123353504 1D CTATTAAAGC A/- AATTGTAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 A 3 2 216033 CASAVA_Build 4 123359301 1I AATCAATGGG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 6 7 216034 CASAVA_Build 4 123362594 1I ATAGAGGTAT -/G GCAAACTTGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 1 2 216035 CASAVA_Build 4 123387572 2D GATTAGTAAC AT/-- ATGTCTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 AT 2 1 216036 CASAVA_Build 4 123391824 5I CTGAAGCAGG -----/TAATA TAATACATAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TAATA 1 2 216037 CASAVA_Build 4 123395242 1I CTATTGTCCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 9 216038 CASAVA_Build 4 123411252 1I GATTGTAGGA -/G GGGGGGGATG 2750 het 2750 ref 29 15 9 5 G 7 8 216039 CASAVA_Build 4 123435881 2D CAGTAAGACA CT/-- CCACGAGAAG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 CT 1 0 216040 CASAVA_Build 4 123441868 1D TTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 8 6 A 11 10 216041 CASAVA_Build 4 123447681 1D CAAAGTAATT G/- GGACAGGAAG 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 G 3 2 216042 CASAVA_Build 4 123460145 2D TGATTTATAA TT/-- TTTTTTTTTT 1469 het 859 hom 17 5 4 9 T 20 18 216043 CASAVA_Build 4 123461409 1D AAGTGATTAA T/- GATAGCTTTG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 1 0 216044 CASAVA_Build 4 123462445 1I CTAGGTTGTT -/G GGGTTGTTTT 3070 hom 76 het 31 0 26 5 G 3 4 216045 CASAVA_Build 4 123463045 2I GTCCACTTTA --/TC TGTTAGAGCC 3070 het 3070 ref 53 23 22 8 TC 0 1 216046 CASAVA_Build 4 123477199 2I AAAATTAACA --/TT TAAGTTCTAC 3070 hom 120 het 41 0 41 0 T 1 3 216047 CASAVA_Build 4 123495082 1I CTTTTGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 11 12 216048 CASAVA_Build 4 123502614 2D CTCCTTAATA AT/-- AACTGTAATT 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 AT 1 0 216049 CASAVA_Build 4 123527740 5D AGTATGGCCA TTTTC/----- TTTTCACGAT 3070 hom 51 het 18 0 18 1 TTTTC 2 1 216050 CASAVA_Build 4 123536270 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2903 hom 31 11 9 11 A 13 14 216051 CASAVA_Build 4 123542663 1D ACCTTGGGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 25 15 12 T 10 9 216052 CASAVA_Build 4 123576651 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2736 hom 19 7 9 3 A 12 13 216053 CASAVA_Build 4 123576828 1D CCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 10 9 216054 CASAVA_Build 4 123587118 1I TCTTTTAATC -/T TTTTTCCTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 5 6 216055 CASAVA_Build 4 123606268 3D TATAATCTCT TGG/--- TGGTGTGCTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TGG 2 1 216056 CASAVA_Build 4 123614829 2D CCATTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 1243 het 1243 ref 44 34 3 8 TG 7 6 216057 CASAVA_Build 4 123621192 28D TTAGAAAGTG GATCTCTCTGAGGAGGAACCCTTAGGTA/---------------------------- GGGAGAATTG 1922 het 1922 ref 17 22 5 1 GATCTCTCTGAGGAGGAACCCTTAGGTA 1 0 216058 CASAVA_Build 4 123643107 5D ATTAACTGTT TAATG/----- TAACCTTCAG 3070 het 3070 ref 36 21 13 5 TAATG 1 0 216059 CASAVA_Build 4 123664490 1I AGGGTAAAAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 8 9 216060 CASAVA_Build 4 123678888 1D TCTGCGTGAG A/- AAAAAAAAAC 1074 het 1074 ref 45 35 3 7 A 10 9 216061 CASAVA_Build 4 123694906 1I CAAGGCAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 51 2 34 15 A 12 13 216062 CASAVA_Build 4 123723780 1I GTGGGGCCAA -/T GGGGGGCTTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 0 1 216063 CASAVA_Build 4 123736883 1D ATTTTAGACC T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 7 6 216064 CASAVA_Build 4 123758888 1D TCCTTAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 14 12 T 12 11 216065 CASAVA_Build 4 123778185 1I GCAGTCCAGC -/T ACACATGATG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 0 1 216066 CASAVA_Build 4 123799422 5D CTCTTCTGTC TTTTA/----- TTTGATTCTT 3070 het 3070 ref 45 22 22 4 TTTTA 1 0 216067 CASAVA_Build 4 123832550 4I GAGAATTTTT ----/TTTC TTTATTATTT 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 TTTC 0 1 216068 CASAVA_Build 4 123834625 2D GCAAAGACTC AT/-- GTGGCAGAAA 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 AT 1 0 216069 CASAVA_Build 4 123842045 1D GAAAAATGTC A/- AAAGACCTAC 3070 het 3070 ref 66 35 26 6 A 4 3 216070 CASAVA_Build 4 123847908 5I ATTATCATTT -----/AACTA GTTTCCCCAC 3070 het 3070 hom 24 8 16 0 AACTA 0 1 216071 CASAVA_Build 4 123848622 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2730 het 2730 ref 23 10 9 4 T 12 11 216072 CASAVA_Build 4 123851965 5D TCCTGATTGG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 11 8 A 15 10 216073 CASAVA_Build 4 123855104 1I TACAGAAACT -/G GCCAGGCGTG 1638 het 1638 ref 14 9 4 1 G 1 2 216074 CASAVA_Build 4 123871376 2D ATTATCACAT AA/-- GTTATAATTA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 2 0 216075 CASAVA_Build 4 123880713 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 8 9 216076 CASAVA_Build 4 123884817 1I TTAGCCTGTT -/A ACTGTTTCGT 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 A 1 2 216077 CASAVA_Build 4 123885607 1I AAAAAACAAA -/C CCTGTTCCCT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 C 2 3 216078 CASAVA_Build 4 123890138 4I TTCATGCATT ----/AATA TTTTCCTTTG 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 AATA 0 1 216079 CASAVA_Build 4 123909399 1I CTGGGCCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 A 9 10 216080 CASAVA_Build 4 123911316 3D TTTAAAAGTT CAA/--- CAGAAAAGTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 CAA 1 0 216081 CASAVA_Build 4 123923239 2D GAGTATGGTC TG/-- TGGTTTGTGT 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 TG 2 1 216082 CASAVA_Build 4 123948632 1I GCTTCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3019 het 2297 hom 19 7 9 3 A 9 10 216083 CASAVA_Build 4 123959802 1D CCAGTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 1277 het 1277 ref 24 9 4 11 T 17 16 216084 CASAVA_Build 4 123993579 1I TTTTCTGAGG -/C CCTTATTTAT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 2 3 216085 CASAVA_Build 4 124002237 1D CTGTCCTTTG T/- CCCCACTGTT 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 T 1 0 216086 CASAVA_Build 4 124012521 1D GATGAGAAAG A/- AATCAACGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 3 2 216087 CASAVA_Build 4 124050681 1D GCAACCATGA T/- TTAACAGAGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 3 2 216088 CASAVA_Build 4 124050894 1D ATAAAGAAAC A/- AAAAAATCTA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 7 6 216089 CASAVA_Build 4 124052630 1I TATCAGTTTG -/T TTTTTTATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 6 7 216090 CASAVA_Build 4 124070308 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 10 216091 CASAVA_Build 4 124071534 1D14M20D AAATCTTATG TTTTAAAAAATCTTATGTTTTAAATGTGGCAGCAG/-TTTAAAAAATCTTA-------------------- AGTATAGACA 3070 het 1450 hom 29 6 7 20 N/A 0 0 216092 CASAVA_Build 4 124095436 1I GTTAGATCCA -/C CCCCCTGCAA 3070 hom 103 het 39 0 34 5 C 5 6 216093 CASAVA_Build 4 124097110 24D CGTATGATAC TAAGGAGAGCATCAGTTGATAAAG/------------------------ TAAGGAGAGC 3070 hom 72 het 26 0 25 10 TAAGGAGAGCATCAGTTGATAAAG 2 1 216094 CASAVA_Build 4 124114870 1I TTGCATGATA -/T TAAAAAAAAG 3070 het 121 hom 22 1 20 1 T 1 2 216095 CASAVA_Build 4 124121966 2I GGCTCTCTAT --/TC TGTTTCATTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TC 0 1 216096 CASAVA_Build 4 124128671 1D TTGTTGGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 25 0 21 4 T 11 10 216097 CASAVA_Build 4 124146710 2I ACTTCTTCAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 21 9 T 11 13 216098 CASAVA_Build 4 124147511 2I33M1I TTATTTTTTT --TTTCCATTTGCAAAGTTATTTTCTTTTACTCTC-/TGTTTCCATTTGCAAAGTTATTTTCTTTTACTCTCT TTTTTTTTTC 3070 het 284 hom 34 1 36 5 N/A 0 0 216099 CASAVA_Build 4 124151007 1D TTTTAATGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 9 8 216100 CASAVA_Build 4 124159890 1I CCCAAGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 T 11 12 216101 CASAVA_Build 4 124164910 1D CAGACCCCCC A/- AAAAAAAATC 3070 het 229 hom 26 1 22 3 A 9 8 216102 CASAVA_Build 4 124166159 1D TAACTTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 36 2 25 9 T 11 10 216103 CASAVA_Build 4 124168574 1I ACAAGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 25 1 18 6 T 13 14 216104 CASAVA_Build 4 124184727 1D ATCCCACTTG T/- TTACAGTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 3 2 216105 CASAVA_Build 4 124185786 5D AGTTTTTGTT TCTTC/----- TATTTCTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 TCTTC 1 0 216106 CASAVA_Build 4 124185923 1I GTATTTCTAC -/A AAAATCAAAT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 4 5 216107 CASAVA_Build 4 124187963 1D39M1I TGATGTCGAA CATTTTTTCATATAGTTATTGGCCATCTTTCTTTTGCGCA-/-ATTTTTTCATATAGTTATTGGCCATCTTTCTTTTGCGCAT TTTTTTTATT 3070 hom 158 het 43 0 56 4 N/A 0 0 216108 CASAVA_Build 4 124188308 1I GTTTAAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 39 1 26 12 T 12 13 216109 CASAVA_Build 4 124195023 1D TTGAGCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 26 7 T 12 11 216110 CASAVA_Build 4 124198416 2D ACAAATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 37 het 29 1 24 5 AC 10 9 216111 CASAVA_Build 4 124199349 2D CTCCCACAAC AT/-- GTGGGAATTA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 AT 1 0 216112 CASAVA_Build 4 124208212 1I GTATACTAGG -/A AAAAATATTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 5 6 216113 CASAVA_Build 4 124209342 1D ACACAGATAG T/- TTTTTTGAAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 7 6 216114 CASAVA_Build 4 124212091 1D GTCCCCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 19 1 15 3 A 15 14 216115 CASAVA_Build 4 124213411 1I TGATTTATTC -/A AAATGCATTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 3 4 216116 CASAVA_Build 4 124215050 3D CATTCTTTTT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 37 1 29 8 TTC 1 0 216117 CASAVA_Build 4 124216582 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 21 2 16 4 A 11 10 216118 CASAVA_Build 4 124224030 2I TTCTTCAGTC --/TG TTGATGAGAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TG 0 1 216119 CASAVA_Build 4 124226243 1D TTAGGTCTTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 T 8 7 216120 CASAVA_Build 4 124235685 6D TGTGTGTGTG TGTATA/------ TATATATATA 1051 hom 15 het 8 0 5 3 TGTATA 1 0 216121 CASAVA_Build 4 124236316 1I AAAACTGATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 73 hom 41 1 38 2 A 9 10 216122 CASAVA_Build 4 124237967 1I AGTCAGAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 738 hom 35 2 26 7 A 11 12 216123 CASAVA_Build 4 124254001 4I CTGTACTGTC ----/AGTT AGAGCCTTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AGTT 0 1 216124 CASAVA_Build 4 124258860 1D TAACACAAAC A/- AAAAAATATG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 7 6 216125 CASAVA_Build 4 124258959 2I TTATATATAT --/TA TATATATATA 726 hom 5 het 3 0 2 1 TA 7 8 216126 CASAVA_Build 4 124261853 1I AGTCAAAAAG -/T TAAAAAAAAA 156 het 101 hom 21 2 5 14 T 1 2 216127 CASAVA_Build 4 124263355 1D AGAAAACTAC T/- TTTTTTTTTG 1087 het 1087 ref 42 33 4 6 T 10 9 216128 CASAVA_Build 4 124265157 1D ACGAGTTAAT G/- GGTATAGCAC 3070 hom 30 het 11 0 11 1 G 3 2 216129 CASAVA_Build 4 124270789 1D ATATATATAT A/- TTTTTTAATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 1 0 216130 CASAVA_Build 4 124271669 1D GAACATTTTG T/- TTTGGTGAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 4 3 216131 CASAVA_Build 4 124272522 2D CACAGCAGCT GC/-- ACCATTTTAT 696 hom 7 het 20 0 3 18 GC 1 0 216132 CASAVA_Build 4 124275833 4I ATTAAAAATC ----/TCTT TAACAAATTA 3070 hom 107 het 43 0 35 8 TCTT 0 1 216133 CASAVA_Build 4 124285959 1D CCTTAAAGTT G/- GCTTCAGTTT 3070 hom 114 het 45 0 39 7 G 2 1 216134 CASAVA_Build 4 124287403 1D TCATTTTTTT C/- CCTCATGATT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 C 3 2 216135 CASAVA_Build 4 124290404 16D AGGAAATAGC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 28 9 T 26 10 216136 CASAVA_Build 4 124296232 5I TGTTAAAAAA -----/ATAGT ATAACTATCT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 ATAGT 0 1 216137 CASAVA_Build 4 124301282 1I GAGTTTGGGC -/T TCTATGCATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 1 2 216138 CASAVA_Build 4 124302631 1I TCAGCTGGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 8 9 216139 CASAVA_Build 4 124304961 12D TATTATTGGA TATTTTTTGTTT/------------ TATTTTTTGT 3070 hom 57 het 26 0 20 9 TATTTTTTGTTT 2 1 216140 CASAVA_Build 4 124315419 2I TTTTCTGATC --/TT TTTTTTAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 6 8 216141 CASAVA_Build 4 124325803 4D ATAGTTAACC TTTA/---- TTTAGCTACT 3070 hom 119 het 45 0 40 7 TTTA 2 1 216142 CASAVA_Build 4 124331967 1D CTCTGGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 55 2 29 24 T 13 12 216143 CASAVA_Build 4 124336059 7I TAAAAGGTAG -------/TATGTCT TAGATGGGAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TATGTCT 0 1 216144 CASAVA_Build 4 124336612 1D ACCATCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 553 hom 21 2 15 4 T 13 12 216145 CASAVA_Build 4 124343628 1D ACTCCATCTC T/- TAAGTAAATA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 T 2 1 216146 CASAVA_Build 4 124343783 1I TTAGAAGGAA -/T TCTTGCTCTT 3070 het 6 hom 19 1 14 4 T 1 2 216147 CASAVA_Build 4 124347592 2D ACTGAGTAAC TG/-- TACTCACAAG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TG 1 0 216148 CASAVA_Build 4 124384414 1I ACTTGAGTCC -/T GGAGTTTAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 216149 CASAVA_Build 4 124385481 1D TTAAATTGGG A/- AAAAATATAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 6 5 216150 CASAVA_Build 4 124393089 1I TCTTACGTGA -/T TTTTTTCCAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 6 7 216151 CASAVA_Build 4 124404208 2D GCCAACAAAC AT/-- ATGAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AT 2 1 216152 CASAVA_Build 4 124408433 1I TCTGCTACTA -/C AGTAGTGATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 0 1 216153 CASAVA_Build 4 124410371 1I CCTTAATGCA -/G TCTTTTCTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 0 1 216154 CASAVA_Build 4 124412472 3D TCCTAATATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 41 0 32 10 T 13 10 216155 CASAVA_Build 4 124420022 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 11 10 216156 CASAVA_Build 4 124423378 2D ATTTAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 13 8 A 14 12 216157 CASAVA_Build 4 124423456 3I AAGATGAGGG ---/GAA GAAAATACCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GAA 1 2 216158 CASAVA_Build 4 124430397 1I CTGCTAAGCA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 T 7 8 216159 CASAVA_Build 4 124438324 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 13 0 10 3 A 11 12 216160 CASAVA_Build 4 124441358 3D GTTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 14 11 216161 CASAVA_Build 4 124443186 1D GCAGGAGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 31 1 23 8 T 11 10 216162 CASAVA_Build 4 124447122 2D CAAAAAGCTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 TA 7 6 216163 CASAVA_Build 4 124455790 1D CAAATTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 30 1 23 6 T 12 11 216164 CASAVA_Build 4 124459366 5D17M2I CCTATCTCTT AAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGG--/-----AAAAAAAAAAAGGGGGGGA AACAGTGTAT 3070 hom 69 het 24 0 23 4 N/A 0 0 216165 CASAVA_Build 4 124461307 4I TGCTATAAAA ----/AAAG AAAAAATTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 AAAG 0 1 216166 CASAVA_Build 4 124461776 2I ACTTATATTT --/AA TAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 0 2 216167 CASAVA_Build 4 124462189 1D GGAGAAAGGG C/- CCACAAGCCA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 C 3 2 216168 CASAVA_Build 4 124468683 1I TGAAACCAGT -/C CCAAATTTCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 2 3 216169 CASAVA_Build 4 124472029 1D TTTTTTTAAT A/- ATGTTTTTTG 3070 hom 24 het 9 0 8 1 A 2 1 216170 CASAVA_Build 4 124474149 5I ATTCTTCTCT -----/CTTCC CTTCTTTATT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 CTTCC 0 1 216171 CASAVA_Build 4 124491585 1D GAGTTACACA C/- AAAAAGTTCC 3070 hom 121 het 47 0 40 7 C 1 0 216172 CASAVA_Build 4 124500113 2D TGTTTGAGGA TT/-- TTTTTTTTGA 3070 het 105 hom 34 3 15 17 T 10 8 216173 CASAVA_Build 4 124501951 1D AAAAAACATT A/- AAAAAAAAAA 2483 het 2483 ref 24 12 8 5 A 13 12 216174 CASAVA_Build 4 124502144 11I ATTTAATTTC -----------/CCAGAGCAATT CTACAAAGAT 3070 het 3070 hom 47 19 25 4 CCAGAGCAATT 0 1 216175 CASAVA_Build 4 124506880 4I CTACCCCCTC ----/TCTT TCTTCCTGCC 3070 hom 115 het 45 0 38 7 TCTT 1 2 216176 CASAVA_Build 4 124507552 2I AAAAAAAAGC --/CA CACACACACC 3070 hom 83 het 34 0 26 8 CA 4 5 216177 CASAVA_Build 4 124516962 1I ATTACAATGT -/A AAACTGTAGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 4 216178 CASAVA_Build 4 124523642 1D TTTTAGTCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 384 hom 46 1 39 8 A 10 9 216179 CASAVA_Build 4 124543693 3D CTGCCCTCTC CTT/--- CTTTCTCCTT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 CTT 2 1 216180 CASAVA_Build 4 124545204 4D8M6I AGTCCTCAGT CTCACTAACTCC------/----CTAACTCCCTAAGA CTAAGTGATA 3070 hom 96 het 35 0 33 4 N/A 0 0 216181 CASAVA_Build 4 124554305 1D GTCAGAAACA C/- CCAAGTTCCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 3 2 216182 CASAVA_Build 4 124556285 1D GAGACTTGGG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 8 7 216183 CASAVA_Build 4 124556370 2I AAAGTTTGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 11 13 216184 CASAVA_Build 4 124566367 2D ACTCCATTGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 74 het 44 0 27 17 AT 8 7 216185 CASAVA_Build 4 124569143 5I TTTCCAGAAG -----/TTTAC TTTACCAATG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTTAC 1 2 216186 CASAVA_Build 4 124578935 1I GAGTGGCAGG -/C AGTTAGTATA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 216187 CASAVA_Build 4 124586327 12D TCTGTCTCAA AAAAATAAAAAT/------------ AAAAATAAAA 3070 hom 60 het 21 0 21 2 AAAAAT 4 2 216188 CASAVA_Build 4 124597387 3D AATAATTCTT ATA/--- ATAATTATAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 ATA 2 1 216189 CASAVA_Build 4 124601347 1I CATGGATGTA -/T TTTCTGAGAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 3 4 216190 CASAVA_Build 4 124602476 2D AGGATGGTCT CA/-- GTTTCCTGAC 2992 het 1494 hom 15 3 7 5 CA 1 0 216191 CASAVA_Build 4 124603479 1I ATAACTGTAT -/A CATGCACGCT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 0 1 216192 CASAVA_Build 4 124603978 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 11 10 216193 CASAVA_Build 4 124622955 1I ATCACTTGGC -/T TTATGTGAAA 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 T 2 3 216194 CASAVA_Build 4 124627787 1I CAAAAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 9 10 216195 CASAVA_Build 4 124631282 1I TTTTCTTGTA -/T TATCTTTGTC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 1 2 216196 CASAVA_Build 4 124633757 3I TGGAATTCTT ---/ATG ATGGGCTTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATG 1 2 216197 CASAVA_Build 4 124639965 4D AAACTGCAGA AGAT/---- AGATAGTTTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AGAT 2 1 216198 CASAVA_Build 4 124643832 2I GTCAGGCTGG --/TC TCGAACTCCT 1312 het 1312 ref 10 5 3 2 TC 1 2 216199 CASAVA_Build 4 124647744 1D11M1D GAGCTGTCTC AAAAAAAACAATA/-AAAAAAACAAT- AAAAAAAATA 3070 het 139 hom 21 2 11 11 N/A 0 0 216200 CASAVA_Build 4 124660950 2I CATCAAAAAA --/AG AGTCAAAATG 3070 het 3070 hom 55 22 28 5 AG 1 2 216201 CASAVA_Build 4 124676207 1D GATCAAAATA G/- CAGCACAAAG 3070 het 2885 hom 19 6 10 3 G 1 0 216202 CASAVA_Build 4 124680823 2D GAACAGTCTC TT/-- TTAAGATTAC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 4 2 216203 CASAVA_Build 4 124687488 4D CACTCGATGG CTCT/---- CTGAGAGTAG 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 CT 3 1 216204 CASAVA_Build 4 124692814 10D GGGAACTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 1593 hom 26 6 12 8 T 21 11 216205 CASAVA_Build 4 124694203 10I56M4I CTGGATCTGA ----------AAGGGGTGGGAGCTGCAGAGGGGTCTGTTTGTTTTTCAAGCCCTCCTGGAGATTCT----/ACCTCTGGGGAAGGGGTGGGAGCTGCAGAGGGGTCTGTTTGTTTTTCAAGCCCTCCTGGAGATTCTCTCA CTCACCAGAG 3070 het 3070 ref 19 18 9 7 N/A 0 0 216206 CASAVA_Build 4 124697716 2I TATATGTATC --/TA TGTGATGCCA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 TA 0 1 216207 CASAVA_Build 4 124698029 1I GACCCTGTCT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 A 8 9 216208 CASAVA_Build 4 124698518 1D TAAGGCATCC T/- TAAAGGTCCA 3070 het 3070 ref 60 28 24 8 T 2 1 216209 CASAVA_Build 4 124698752 2I AAAGTCACTT --/GA GACTTTCTTC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 GA 1 2 216210 CASAVA_Build 4 124701152 40D GGCTATGGGT GATAGATTCTGTGGTATTCTTTTGATGGCTACTCCTGAAA/---------------------------------------- GATAGATTCT 3070 hom 57 het 27 0 17 19 GATAGATTCTGTGGTATTCTTTTGATGGCTACTCCTGAAA 2 1 216211 CASAVA_Build 4 124701492 2D TCTTGATTTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 AT 7 6 216212 CASAVA_Build 4 124701642 1I AAGTTTATTT -/A AAAAATTCTA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 5 6 216213 CASAVA_Build 4 124702713 2I TATAGGTAAC --/AT ATGTGGGAAC 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 AT 1 2 216214 CASAVA_Build 4 124705115 4D CTAAAGAAAC TATT/---- TACATTTGAT 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 TATT 1 0 216215 CASAVA_Build 4 124705277 1D GATCTTGTCT G/- TAAGTATGAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 G 1 0 216216 CASAVA_Build 4 124714096 4D TGCTATATCC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 41 16 17 9 TTAT 3 2 216217 CASAVA_Build 4 124714592 2D TCTTGGGAGG TT/-- TTGTAGGAAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 T 4 2 216218 CASAVA_Build 4 124718785 2I ACAGAGAAAC --/AG ACAGAGAGAG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 AG 0 1 216219 CASAVA_Build 4 124734112 2D GTTGGAGAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 14 12 216220 CASAVA_Build 4 124740647 4D TGTGGCTCTC TCTT/---- CTGTTCTCAG 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 TCTT 1 0 216221 CASAVA_Build 4 124753965 1D TTGCTTTTTC T/- TTTCTAATTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 4 3 216222 CASAVA_Build 4 124765494 1I CTATTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 28 2 20 6 T 10 11 216223 CASAVA_Build 4 124782851 1I GAACTCCTGG -/A TTCAAGCAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 216224 CASAVA_Build 4 124800315 13D GAAGAGAACT AAAGACTCATCAG/------------- AAACTTCTTG 3070 hom 81 het 27 0 28 1 AAAGACTCATCAG 1 0 216225 CASAVA_Build 4 124802488 1I GCCTAATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 T 11 12 216226 CASAVA_Build 4 124807369 2I TGTTCTGAAC --/AA AACTGCCTGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 2 4 216227 CASAVA_Build 4 124822238 7I ATCATTAAAC -------/TTATATA ATATATACCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTATATA 0 1 216228 CASAVA_Build 4 124826231 1D TGTGGAAGGC T/- TACAGGGTCC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 2 1 216229 CASAVA_Build 4 124831194 1I GAAACCACCA -/C CATGATTCAA 3070 hom 95 het 36 0 30 6 C 1 2 216230 CASAVA_Build 4 124895441 1D TTTCAATGTG T/- TTTTTTTTTT 1070 het 1070 ref 44 30 3 11 T 12 11 216231 CASAVA_Build 4 124946230 1I TGTGTTCTAC -/A AACAGTGTAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 3 216232 CASAVA_Build 4 124954698 1D GCTATTTATA T/- CACAAGCTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 9 T 1 0 216233 CASAVA_Build 4 124958647 1D ATGTGGTGGG A/- AATTAATTGG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 A 3 2 216234 CASAVA_Build 4 124961261 2D GAGGCATCAT TA/-- TATATACAGT 3070 hom 90 het 39 0 31 9 TA 4 3 216235 CASAVA_Build 4 124979216 2D CTCACAGAAG AA/-- AAGTGTTTGT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 A 4 2 216236 CASAVA_Build 4 124979620 1I TCTAATATTT -/A AAAAATTGTC 3070 het 181 hom 36 1 30 5 A 5 6 216237 CASAVA_Build 4 124981213 2D TCAAAAAATA TG/-- TGACAGGAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TG 2 1 216238 CASAVA_Build 4 124987541 4D TGGTCTAATG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 34 het 21 0 13 10 TA 11 9 216239 CASAVA_Build 4 124988578 2D GCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 25 1 12 13 T 16 14 216240 CASAVA_Build 4 125006162 1I ACTAAAAAAA -/T AAAAACGAAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 216241 CASAVA_Build 4 125015810 1D CAGGTGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 26 1 18 7 T 14 13 216242 CASAVA_Build 4 125017929 1I ATTATTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 31 3 17 11 T 15 16 216243 CASAVA_Build 4 125049156 1I CTTCCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1211 het 1211 ref 32 16 5 11 A 13 14 216244 CASAVA_Build 4 125051937 4I TATTGTGAAA ----/ATTT ATTTAGGTAG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 ATTT 1 2 216245 CASAVA_Build 4 125055200 3I TTGAAATTTT ---/AAG AAGATGGGTT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 AAG 1 2 216246 CASAVA_Build 4 125057704 1I GGAGTTACTG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 7 8 216247 CASAVA_Build 4 125067165 1D CAGTTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 11 10 216248 CASAVA_Build 4 125095676 1D TTTCTGTGAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 T 8 7 216249 CASAVA_Build 4 125104749 6D AAATGTGTAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 93 het 45 0 31 17 AC 12 9 216250 CASAVA_Build 4 125107381 1D GACTTCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 15 4 A 12 11 216251 CASAVA_Build 4 125117212 4D AGTATCTCTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 1120 het 219 hom 47 4 5 39 TG 11 9 216252 CASAVA_Build 4 125123202 2D ATGTATTACA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 AT 7 6 216253 CASAVA_Build 4 125125557 1D TTTTTTTTTT A/- TTTCTCTACC 2619 het 2619 ref 33 15 11 7 A 1 0 216254 CASAVA_Build 4 125133557 1I GTACCTCACT -/G GACACAAAAG 3070 het 3070 hom 51 18 28 5 G 1 2 216255 CASAVA_Build 4 125137117 1I GATCTCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 12 13 216256 CASAVA_Build 4 125137310 1D TTCAGAGTTT A/- GACTGTAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 1 0 216257 CASAVA_Build 4 125137573 8I AAGGAGTGTT --------/TCTTTGGC TCACTGTTAC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 TCTTTGGC 0 1 216258 CASAVA_Build 4 125146444 2I AGATCAGCCT --/AG AGATCTTCTG 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 AG 1 2 216259 CASAVA_Build 4 125156750 4D TTAAAAAAAC ACTT/---- AATCCATAAC 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 ACTT 1 0 216260 CASAVA_Build 4 125163017 1D ACATACTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 10 9 216261 CASAVA_Build 4 125165466 1I AGGGTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3058 hom 27 10 12 5 A 10 11 216262 CASAVA_Build 4 125199841 1I AATAAAACCT -/A ATGATATCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 2 216263 CASAVA_Build 4 125216422 1I CCAGGAGCTG -/T TTTTTTTTTG 1298 het 1298 ref 20 14 3 3 T 9 10 216264 CASAVA_Build 4 125220984 1I TGTCAATGGC -/T TTTTTTTTTT 2184 het 2184 ref 19 10 5 4 T 11 12 216265 CASAVA_Build 4 125222782 1I TATTTTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 21 12 T 13 14 216266 CASAVA_Build 4 125227585 1I AAGTAAGCTC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 6 het 34 1 29 4 T 6 7 216267 CASAVA_Build 4 125238991 1I AAAAATTGCA -/T TTTCACAGTC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 3 4 216268 CASAVA_Build 4 125246942 1D AAGTTTAAGT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 216269 CASAVA_Build 4 125261361 1D TGCAATTAGC A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 23 10 11 4 A 7 6 216270 CASAVA_Build 4 125275187 8D AAGAAAGAAA GGAGGGAG/-------- GGAGGGAGGG 3070 het 715 hom 36 6 20 13 GGAG 6 4 216271 CASAVA_Build 4 125284312 7D TTCTTTTTTC TTTTTCT/------- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 12 TTTTTCT 2 1 216272 CASAVA_Build 4 125303623 1I CCTTGAAATA -/C TTTTTATCTG 3070 het 3070 hom 42 15 26 1 C 0 1 216273 CASAVA_Build 4 125339621 4I AATTCCTGGC ----/CTGT CTGTGTTCTG 3070 het 3070 ref 39 18 19 2 CTGT 1 2 216274 CASAVA_Build 4 125342956 1D TTTCCTTCTC G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 G 1 0 216275 CASAVA_Build 4 125366193 1I ATAAAGACTT -/A AAAATCATAG 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 A 4 5 216276 CASAVA_Build 4 125368083 1I GAATGTTAAA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 6 7 216277 CASAVA_Build 4 125393019 1I TGACAACCCA -/C CCCTGCCTCT 3070 hom 93 het 38 0 30 8 C 3 4 216278 CASAVA_Build 4 125393254 1I GAGGTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 13 11 15 T 13 14 216279 CASAVA_Build 4 125394540 1D AAATTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 A 11 10 216280 CASAVA_Build 4 125396285 1I CTTTTTAAAT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 7 8 216281 CASAVA_Build 4 125398762 1I AACTCAAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 9 10 216282 CASAVA_Build 4 125399719 1D CTTACACAAA C/- CCATGCAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 C 3 2 216283 CASAVA_Build 4 125402841 3D ATTTATAATA ATC/--- ATCATAACTA 1601 het 1601 ref 15 9 5 2 ATC 2 1 216284 CASAVA_Build 4 125402935 3D AAATTTGTGC AAT/--- AATAATTATC 3070 het 3070 hom 32 15 17 1 AAT 3 2 216285 CASAVA_Build 4 125418013 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 T 11 10 216286 CASAVA_Build 4 125418307 1I CACCATGCCT -/G GTCCACACTC 3070 hom 93 het 40 0 31 9 G 1 2 216287 CASAVA_Build 4 125422570 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 570 hom 26 2 21 3 A 12 13 216288 CASAVA_Build 4 125455921 2D CACCTAAATG TT/-- TTTTTTTTTT 1753 het 1000 hom 30 8 4 18 T 16 14 216289 CASAVA_Build 4 125458841 1D AGTTATAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1950 hom 36 10 17 9 A 15 14 216290 CASAVA_Build 4 125462772 4D ATTCTTATAT AATA/---- AATATATTAC 3070 het 2694 hom 24 6 14 4 AATA 2 1 216291 CASAVA_Build 4 125467577 4D CTAACAAATA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 AAAC 2 1 216292 CASAVA_Build 4 125487322 1D TCCCTGTGGG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 7 216293 CASAVA_Build 4 125501337 1D CTCTTTTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 37 1 30 6 A 11 10 216294 CASAVA_Build 4 125511610 1D GTTTGCTCTT C/- CCCCCCCCCG 1611 het 1611 ref 22 13 5 4 C 10 9 216295 CASAVA_Build 4 125514720 7D GGGCAGCTGT GGATCCA/------- GCTGGGGATC 3070 het 3070 hom 44 21 20 7 GGATCCA 1 0 216296 CASAVA_Build 4 125539163 1D ATATTTTCAA T/- TTTTTTTGGC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 8 7 216297 CASAVA_Build 4 125543099 4D TGTGACCTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 116 het 46 0 38 14 TTTG 4 3 216298 CASAVA_Build 4 125549035 1D CAAACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 24 1 21 3 T 11 10 216299 CASAVA_Build 4 125567568 1I TACATAGTAA -/C TTATTGTTTA 3070 hom 151 het 56 0 51 5 C 0 1 216300 CASAVA_Build 4 125568034 1I TTTGGAGATA -/C CAGCTAAACA 3070 hom 129 het 51 0 43 8 C 1 2 216301 CASAVA_Build 4 125579821 1I AGTGAGACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 27 1 23 3 T 11 12 216302 CASAVA_Build 4 125590021 1D CCAGCCTCTG C/- TTTCAGTTGT 3070 hom 108 het 43 0 35 9 C 1 0 216303 CASAVA_Build 4 125619644 1D TCCACATCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 123 het 51 0 41 11 T 10 9 216304 CASAVA_Build 4 125624607 1I ATGAACTGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 9 10 216305 CASAVA_Build 4 125633880 1I CCGTCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 473 hom 14 1 10 3 A 9 10 216306 CASAVA_Build 4 125652292 1D ATGTTAAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 77 het 31 0 25 6 A 10 9 216307 CASAVA_Build 4 125654579 1I CTAAAAGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 30 1 23 6 A 10 11 216308 CASAVA_Build 4 125662844 5D TATAAATTAT TTGTA/----- TAAATTTGTA 1679 het 1420 hom 24 5 6 13 TTGTA 1 0 216309 CASAVA_Build 4 125704757 2I CAGATTTTTT --/TC TGTTTTTTTT 3070 het 795 hom 34 4 19 11 TC 0 1 216310 CASAVA_Build 4 125714542 1I AACAAAACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 11 12 216311 CASAVA_Build 4 125715919 1D GTTGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 11 10 216312 CASAVA_Build 4 125723491 1D CTCCCATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 A 11 10 216313 CASAVA_Build 4 125730708 2I GCTTCATTCA --/CT CTTATGGGCT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 CT 1 2 216314 CASAVA_Build 4 125736343 5I ACACCAAAGT -----/CTATA CTTAGATATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTATA 0 1 216315 CASAVA_Build 4 125740702 1D TTTTGACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 30 0 26 5 T 13 12 216316 CASAVA_Build 4 125758393 7D GGAAAAGTGC AGTATTA/------- AGTATTAGAG 3070 hom 70 het 33 0 23 12 AGTATTA 2 1 216317 CASAVA_Build 4 125759943 1I GCTTTTTATT -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 7 8 216318 CASAVA_Build 4 125775864 1D TTTAGATTGC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 50 22 17 12 T 8 7 216319 CASAVA_Build 4 125781067 1I ATAAATAGAA -/G GTATCCAGTG 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 G 1 2 216320 CASAVA_Build 4 125786858 1I AATAATAATG -/A TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 0 1 216321 CASAVA_Build 4 125795730 1I ATAGATGATT -/A TGTCATATGT 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 A 0 1 216322 CASAVA_Build 4 125799170 1D AAAAAATGAT A/- AAATTGAACC 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 4 3 216323 CASAVA_Build 4 125804851 2I AATCAGTCAC --/GG GGGGGGGAAA 3070 het 3070 ref 51 22 18 11 G 7 9 216324 CASAVA_Build 4 125823345 1I TGTTTTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 8 9 216325 CASAVA_Build 4 125826402 3D GTTAGTTTTT CCC/--- CCATTTTCAC 3070 het 3070 ref 42 21 20 2 C 5 2 216326 CASAVA_Build 4 125830530 2I TTACATAATT --/TG TGTTTTTTAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TG 1 2 216327 CASAVA_Build 4 125841216 4D TTCTGATAAA AATT/---- AATGACTTCC 3070 het 3070 ref 37 18 16 5 AATT 1 0 216328 CASAVA_Build 4 125842168 1I GAAATATTTC -/T GAGATTAGGT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 0 1 216329 CASAVA_Build 4 125845706 1D CTCAAAAAAA C/- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 C 1 0 216330 CASAVA_Build 4 125849853 1I CATGATATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 375 hom 49 1 43 5 A 9 10 216331 CASAVA_Build 4 125871496 1I ATAGTATTTT -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 6 7 216332 CASAVA_Build 4 125871826 1I GATGCTGGCA -/T TGTCCATAAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 1 2 216333 CASAVA_Build 4 125874702 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1892 het 1892 ref 20 6 5 9 A 12 13 216334 CASAVA_Build 4 125876201 1D AAAATTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2969 hom 27 7 16 4 T 12 11 216335 CASAVA_Build 4 125877856 1D CTGTCTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2548 hom 28 12 13 3 T 13 12 216336 CASAVA_Build 4 125885354 10I AAAGAAAGAA ----------/AGAGAAAGAG AGAGAAAGAG 3070 het 2564 hom 23 9 9 5 AGAGAAAGAG 1 2 216337 CASAVA_Build 4 125887066 1D GCGTGCCAGA T/- TTAGTCCTAG 3070 het 3070 hom 32 10 18 5 T 3 2 216338 CASAVA_Build 4 125893367 6I CTCTCTACAA ------/ATACAC ATACACATAC 3070 het 3070 hom 41 16 14 11 ATACAC 1 2 216339 CASAVA_Build 4 125901877 5I ATTAATCTAA -----/AATAG AATCAAGTTA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AATAG 0 1 216340 CASAVA_Build 4 125902597 1D AAAGGGGAGA T/- TTGTTGCAGA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 3 2 216341 CASAVA_Build 4 125902799 1D GAGAGACAGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 7 216342 CASAVA_Build 4 125912842 4I GATAGGATTA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 TTTG 3 4 216343 CASAVA_Build 4 125923590 1I TTTCCTTTTT -/C TTATCCTTTA 3070 het 3070 hom 56 25 29 2 C 0 1 216344 CASAVA_Build 4 125932143 1D TTTTTTCCTG A/- AAAAGAAGTT 3070 het 3070 hom 33 9 23 2 A 5 4 216345 CASAVA_Build 4 125934440 1I ACAAACATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 A 9 10 216346 CASAVA_Build 4 125934725 4I TATATTACTC ----/TATT TAAAGATACA 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 TATT 0 1 216347 CASAVA_Build 4 125935201 6D TCCAGAACTT AAAAAA/------ GAAATATGGT 3070 het 3070 ref 44 21 22 2 A 6 0 216348 CASAVA_Build 4 125937678 7D TAAATATATT AACAATC/------- AACAAACATA 3070 het 3070 ref 32 18 13 6 AACAATC 1 0 216349 CASAVA_Build 4 125941184 1D TTCCCCCCCC T/- GTTACCTTCT 3070 het 3070 ref 55 30 16 10 T 1 0 216350 CASAVA_Build 4 125947868 4I AGTGTCTAAC ----/AAAT AATAGGTGTC 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 AAAT 0 1 216351 CASAVA_Build 4 125949364 1D AATATACCTT A/- AAGATCTCTG 3070 het 2785 hom 20 6 13 1 A 3 2 216352 CASAVA_Build 4 125949979 1I TTAATCATCT -/A AAAATCTCAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 4 5 216353 CASAVA_Build 4 125955722 1I TGTTATAGTA -/G GTAGGTAGTC 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 G 1 2 216354 CASAVA_Build 4 125964987 4D TTTAATAGAG AATT/---- AGAGGTCTTT 1455 het 1455 ref 8 3 3 2 AATT 1 0 216355 CASAVA_Build 4 125970535 2I TTAATGGGAT --/TG TTTTTTTTTT 2871 het 2871 ref 30 17 8 5 TG 0 1 216356 CASAVA_Build 4 125981292 1D TCAACAAACC T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 T 8 7 216357 CASAVA_Build 4 126002305 1I CTTTTTTTGC -/A AAAAAAAAAA 2050 het 1802 hom 23 6 8 9 A 12 13 216358 CASAVA_Build 4 126006107 1D AAATGTTTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 9 8 216359 CASAVA_Build 4 126012108 4D GAAGGGTTAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 1927 hom 20 4 10 6 TTTA 5 4 216360 CASAVA_Build 4 126020515 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1534 het 1534 ref 31 14 5 12 A 17 16 216361 CASAVA_Build 4 126032801 1I TAAGTCTGTT -/G CCTTATCCCA 3070 hom 144 het 57 0 49 8 G 0 1 216362 CASAVA_Build 4 126040264 2I GAAAAATAAC --/AT TAAAATAGAA 3070 hom 52 het 22 0 18 4 AT 0 1 216363 CASAVA_Build 4 126049134 3I AGAGGTAGGA ---/TTG TTTCCATATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTG 0 1 216364 CASAVA_Build 4 126053623 1D TTATTTTGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 9 8 216365 CASAVA_Build 4 126055775 1D TTCAGGTATA T/- TTGGTGGGAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 3 2 216366 CASAVA_Build 4 126056475 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 17 0 14 4 T 18 16 216367 CASAVA_Build 4 126060338 1I AAGGTGTGTC -/A AAATATTATC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 4 216368 CASAVA_Build 4 126061731 1D TTGTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 8 hom 33 1 31 3 G 1 0 216369 CASAVA_Build 4 126066814 4D CAGTCCACAT TATC/---- TAATTTTTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TATC 1 0 216370 CASAVA_Build 4 126067101 3I GTAGGAAAAA ---/AAG AGAAAAAGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAG 0 1 216371 CASAVA_Build 4 126068224 3D TACAGTACTT TTC/--- TTTTTTTTCA 3070 hom 61 het 24 0 21 3 TTC 1 0 216372 CASAVA_Build 4 126068296 1I TATTGATATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 9 10 216373 CASAVA_Build 4 126068885 10I8M6I AAGAAATTTA ----------TCTTGGAG------/TCTGTTAAATTCTTAAAGAATTTA AGCTGTTATA 3070 hom 87 het 28 0 29 3 N/A 0 0 216374 CASAVA_Build 4 126070026 3D ATTTATTGTA TTC/--- TTCTGTGATT 3070 hom 114 het 41 0 39 6 TTC 2 1 216375 CASAVA_Build 4 126070980 1D TGTCTTAATA T/- TTTTTTCATT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 7 6 216376 CASAVA_Build 4 126071479 1I TCAACATACT -/C TTTTTTTGGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 0 1 216377 CASAVA_Build 4 126077640 1D ATGGCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 32 1 26 5 T 13 12 216378 CASAVA_Build 4 126080065 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 29 1 21 7 A 13 14 216379 CASAVA_Build 4 126082544 5I AAATATTTAA -----/TACTT TACTTTATAG 1974 hom 10 het 4 0 4 0 TACTT 1 2 216380 CASAVA_Build 4 126083671 1D CTACGCACAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 107 het 38 0 36 2 T 9 8 216381 CASAVA_Build 4 126083861 1D ATTATTAAGT A/- AAATAAAGGG 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 4 3 216382 CASAVA_Build 4 126087878 1D CTTTTAGGCC T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 114 het 44 0 39 7 T 8 7 216383 CASAVA_Build 4 126100262 8D GAAGATATAT ATATATAG/-------- ATATATAGAT 2200 hom 15 het 8 0 6 3 ATATATAG 3 2 216384 CASAVA_Build 4 126101235 1D ACATGTGGGG A/- ATTTCAGATG 3070 hom 104 het 41 0 36 5 A 2 1 216385 CASAVA_Build 4 126108192 3D TTAACTTTTA AAC/--- AATAGCTCGT 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 AAC 1 0 216386 CASAVA_Build 4 126113859 2I GTCAGGAAAC --/AT ATGAAAGACA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AT 1 2 216387 CASAVA_Build 4 126114907 4I AAATCACCCT ----/GGAG GGAGGGAAGG 3070 hom 137 het 49 0 46 3 GGAG 1 2 216388 CASAVA_Build 4 126119003 1D GAACCTAGAC T/- TTACTATAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 T 3 2 216389 CASAVA_Build 4 126130990 9I AATGATGAAA ---------/AATTAAGCT AATTAAGCTA 3070 het 3070 hom 33 13 13 8 AATTAAGCT 1 2 216390 CASAVA_Build 4 126133753 1D CTCTGACTCT A/- AAAAAAAAAA 1715 het 1715 ref 29 20 4 6 A 13 12 216391 CASAVA_Build 4 126135928 1I TGGACTCAGA -/T TTTTTTACCA 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 T 6 7 216392 CASAVA_Build 4 126136303 1D TTACCACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 10 9 216393 CASAVA_Build 4 126143698 1D AGAAAACCAA C/- TTTTTCCTCT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 1 0 216394 CASAVA_Build 4 126154413 1I AAAAGATAAC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 7 8 216395 CASAVA_Build 4 126156497 1I AGTCATTAGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 A 8 9 216396 CASAVA_Build 4 126156921 1I TAAGGAATTC -/T TTTAACACCA 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 T 3 4 216397 CASAVA_Build 4 126157968 1I AGATGGCTGT -/G TATACTGTGC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 0 1 216398 CASAVA_Build 4 126158645 1D TATTCATACA T/- TTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 7 6 216399 CASAVA_Build 4 126160447 1I ATATGCTACT -/G GGGCGTGCTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 3 4 216400 CASAVA_Build 4 126161979 4D14M4D AAAACCACTA ACTTACTTACATGTGCATAACA/----ACTTACATGTGCAT---- AACAAACCTT 3070 hom 84 het 29 0 29 2 N/A 0 0 216401 CASAVA_Build 4 126165323 1I ATTGTCTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 19 19 10 A 10 11 216402 CASAVA_Build 4 126165651 1I TCTTGTTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 9 10 216403 CASAVA_Build 4 126175323 1I TGATACATAA -/T TTTTTTACCA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 6 7 216404 CASAVA_Build 4 126178709 4I CAGGGAGTTG ----/TATC TATCTCAGGG 3070 het 3070 hom 41 13 25 3 TATC 1 2 216405 CASAVA_Build 4 126179134 1I TTTTTGTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 876 hom 42 13 24 5 C 0 1 216406 CASAVA_Build 4 126185235 1I GGAAATACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 T 11 12 216407 CASAVA_Build 4 126190189 4D ATCTGCTAAA TAAT/---- TATTTTACTC 3070 het 3070 hom 26 14 12 2 TAAT 1 0 216408 CASAVA_Build 4 126193299 1I ATCGTAAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 9 10 216409 CASAVA_Build 4 126194829 1D ACCTGTAAAA T/- TAAGTATTGG 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 T 2 1 216410 CASAVA_Build 4 126200110 1I TAATATTCAT -/A AATACTCTTA 3070 het 3070 hom 34 17 17 0 A 2 3 216411 CASAVA_Build 4 126201395 1I TTGTATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 16 14 T 10 11 216412 CASAVA_Build 4 126206121 3D GAGGATCTAA TGC/--- TGCTGCTGAT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 TGC 3 2 216413 CASAVA_Build 4 126208795 1I TGGTGATATG -/C TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 C 0 1 216414 CASAVA_Build 4 126215014 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 14 12 1 A 9 10 216415 CASAVA_Build 4 126215786 2I GAGTCAAGGG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 9 11 216416 CASAVA_Build 4 126216734 2I AGGAGCGTTC --/AG AGAGTTAGAC 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 AG 2 3 216417 CASAVA_Build 4 126221154 2I GTAAAGCATG --/AT ATATGTGGTA 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 AT 2 3 216418 CASAVA_Build 4 126223081 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1450 het 1450 ref 24 14 4 7 A 15 14 216419 CASAVA_Build 4 126224985 1I TATGACTTCA -/G GGGGGTGGCA 3070 het 3070 ref 56 28 21 7 G 5 6 216420 CASAVA_Build 4 126226472 1D TCCCCTATTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 T 9 8 216421 CASAVA_Build 4 126229697 3D TCTCATCTCC TTT/--- GCCAAGTCAT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 3 0 216422 CASAVA_Build 4 126235149 2D TTAGAAAAAC CT/-- CTGTCTCCAT 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 CT 2 1 216423 CASAVA_Build 4 126236176 1D CACAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 930 hom 55 6 24 25 A 17 16 216424 CASAVA_Build 4 126238775 1D TCTATTCTTC T/- AATCATTTAT 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 T 1 0 216425 CASAVA_Build 4 126246780 1I GATATTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 34 1 23 10 T 10 11 216426 CASAVA_Build 4 126255025 1D ATACTGATGC T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 7 6 216427 CASAVA_Build 4 126258566 1D GGATACGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 T 12 11 216428 CASAVA_Build 4 126260034 6D ACATATACAT ATACAC/------ ATATATACAA 3070 het 3070 hom 36 17 16 5 ATACAC 1 0 216429 CASAVA_Build 4 126267048 4D CACACACACA CACT/---- CACAGACGTA 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 CACT 1 0 216430 CASAVA_Build 4 126267257 1D TCCTGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 14 7 T 11 10 216431 CASAVA_Build 4 126273367 1D TACATAGGTT G/- GGGGGGGCCT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 G 8 7 216432 CASAVA_Build 4 126277798 1I TATTTTATAA -/C CTTGAAAATT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 1 2 216433 CASAVA_Build 4 126293505 1D CTCCATTCTT G/- CCAGTGTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 G 1 0 216434 CASAVA_Build 4 126300312 1I CATAGAATAA -/T TTTTTTATAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 6 7 216435 CASAVA_Build 4 126308477 3D AAGACTGTGT CCC/--- CCCCCCCCCC 1573 het 459 hom 14 6 4 4 C 13 10 216436 CASAVA_Build 4 126316503 3D ATGATGTGTT AGA/--- AGAAGATTAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 AGA 3 2 216437 CASAVA_Build 4 126317011 1I GTCTCAAAAA -/C AAAAAAGAGA 2506 het 1883 hom 16 5 9 2 C 0 1 216438 CASAVA_Build 4 126317104 1D TATTTCATCC A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 A 8 7 216439 CASAVA_Build 4 126317661 1D AGTTCTAGTC A/- AAATACCAGA 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 A 4 3 216440 CASAVA_Build 4 126319571 3I ATCAATAATA ---/GAG GAGAGAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 GAG 1 2 216441 CASAVA_Build 4 126320813 1I CTAAACTCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 7 8 216442 CASAVA_Build 4 126324957 1D TTTTTTCCTT C/- CCCGTAGCAG 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 C 4 3 216443 CASAVA_Build 4 126331889 2D ATCATACATC AA/-- AAAAAAAAAA 2885 het 1198 hom 24 6 10 8 A 16 14 216444 CASAVA_Build 4 126335299 24D TCAAAATAAC CAAAGAGAAATCTAAAGAAACCAA/------------------------ AATCTAAAGA 3070 het 3070 ref 36 24 15 1 CAAAGAGAAATCTAAAGAAACCAA 1 0 216445 CASAVA_Build 4 126340582 1D TCCACAGTTA T/- TTATTGTATG 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 3 2 216446 CASAVA_Build 4 126341661 1I AGGCGAAGCA -/G CAAATGCTGA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 0 1 216447 CASAVA_Build 4 126346047 1I GTAGACATCT -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 A 7 8 216448 CASAVA_Build 4 126363948 4D AATAGAAGAA TTAT/---- TTATTTTCTG 3070 het 3070 hom 35 8 22 6 TTAT 2 1 216449 CASAVA_Build 4 126365728 1I TTACATACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 9 10 216450 CASAVA_Build 4 126368707 5D TTTTTTAGTG GTTTT/----- GTTTTACTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 5 GTTTT 2 1 216451 CASAVA_Build 4 126369215 1D ACTTGTACAG T/- TTAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 3 2 216452 CASAVA_Build 4 126372162 1D GAGCTTTGAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 8 7 216453 CASAVA_Build 4 126403068 2I CCTTTGTATC --/TT TGTTTTTTTT 921 het 921 ref 44 22 11 11 T 1 3 216454 CASAVA_Build 4 126422890 1I TGAAGAAGGG -/A AAGAAATAAA 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 A 2 3 216455 CASAVA_Build 4 126424303 1I TTTGAGGCAT -/A AGAAAGAGCT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 A 1 2 216456 CASAVA_Build 4 126425531 2D ATAATTGCAC GA/-- GAGCTAATTC 3070 het 3070 ref 29 18 8 4 GA 2 1 216457 CASAVA_Build 4 126425729 5I ATGTCAAATG -----/AAACA AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 AAACA 2 3 216458 CASAVA_Build 4 126427777 2D ACACACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 AT 6 5 216459 CASAVA_Build 4 126428679 1D TTTTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 T 12 11 216460 CASAVA_Build 4 126433305 1I ATAATTTCCG -/A AACTTGGAAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 2 3 216461 CASAVA_Build 4 126433947 1D TTGTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 11 10 216462 CASAVA_Build 4 126434619 1I CCAGAACATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 A 9 10 216463 CASAVA_Build 4 126448178 2I TTAACTAGAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 AT 7 8 216464 CASAVA_Build 4 126450825 4I GTTTTTGTTT ----/TTTC TTTGTTTGTT 3070 het 2359 hom 23 9 13 1 TTTC 0 1 216465 CASAVA_Build 4 126452160 1D TAAAATAATA G/- TATAAGGTGT 2992 het 2992 ref 22 11 7 5 G 1 0 216466 CASAVA_Build 4 126453505 1I TCCCACAGGC -/A AAAAAAAAAC 2342 het 2342 ref 29 16 7 6 A 9 10 216467 CASAVA_Build 4 126464951 1I GGTCAGGGGC -/T TTGTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 2 3 216468 CASAVA_Build 4 126469578 1I ATGTTAATGA -/T TGAAAAAATA 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 T 1 2 216469 CASAVA_Build 4 126470826 2I ACTTCAAGTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 9 11 216470 CASAVA_Build 4 126477443 4I CTATGAAAAC ----/AAAT AAAATTAGGC 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 AAAT 0 1 216471 CASAVA_Build 4 126518656 1I ATTTAGACAA -/T TTAAAAACTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 2 3 216472 CASAVA_Build 4 126520428 1D TGTATATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 A 11 10 216473 CASAVA_Build 4 126522067 4D TAAAATTATG TTTA/---- TTCTATACTG 3070 het 3070 ref 48 25 19 6 TTTA 1 0 216474 CASAVA_Build 4 126524147 5D AAAAGTTTGA TGTAT/----- TGTAAGAATT 3070 het 3070 ref 54 29 20 7 TGTAT 1 0 216475 CASAVA_Build 4 126542350 5I CCCTTTTATA -----/AACAG AATTATGCTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AACAG 0 1 216476 CASAVA_Build 4 126548084 1I AAAGAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 10 11 216477 CASAVA_Build 4 126552462 2D TGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TA 8 7 216478 CASAVA_Build 4 126554209 1I42M1I CAGAATAAGA -GTAAGTGTGGCGTTTTTAAAAACATTGAGTTCTACATGGTAG-/CTTAAGTGTGGCGTTTTTAAAAACATTGAGTTCTACATGGTAGA AAAAAAATCT 3070 hom 117 het 35 0 40 5 N/A 0 0 216479 CASAVA_Build 4 126559506 5D TATGTGCAAT AAATA/----- AAATAATGTT 3070 hom 82 het 33 0 28 6 AAATA 2 1 216480 CASAVA_Build 4 126568175 1I GTTTTATGTA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 6 7 216481 CASAVA_Build 4 126571267 1I TTGAGGTGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 10 216482 CASAVA_Build 4 126572461 1D CCCTAGGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 10 9 216483 CASAVA_Build 4 126573424 4D ATATCTTATG ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AT 8 6 216484 CASAVA_Build 4 126576799 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 10 11 216485 CASAVA_Build 4 126578098 1I CCAAGACTTA -/C TTCCAAGAGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 216486 CASAVA_Build 4 126583559 2I CCAAATAAAA --/AG AGTAAAATAT 3070 hom 106 het 39 0 36 3 AG 1 2 216487 CASAVA_Build 4 126597126 4D AACTGGCAGA TAAT/---- TAATGTCTGA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TAAT 2 1 216488 CASAVA_Build 4 126614397 1D AAGGATGCAG T/- TTCATTTGTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 3 2 216489 CASAVA_Build 4 126617259 1D GCACAGCAGT A/- ATCTACCAGA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 2 1 216490 CASAVA_Build 4 126625888 2I GTTTATAAAC --/TT TTAAAATTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 2 4 216491 CASAVA_Build 4 126636154 1I GAGAAAAGTG -/A AAATATTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 3 4 216492 CASAVA_Build 4 126640722 5D ACTAATCAGA TAACT/----- TAACTTTATT 3070 het 3070 hom 33 15 13 7 TAACT 2 1 216493 CASAVA_Build 4 126654902 1D GCATATAAAA G/- TTATGTGTAC 3070 het 3070 hom 50 15 30 5 G 1 0 216494 CASAVA_Build 4 126659620 1D ATGTTACCAG A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 A 7 6 216495 CASAVA_Build 4 126672562 51D CCTCTGGTAA CCATCCTTCTACTCTCTATCTCCATGAGTTCAATGTTTTAATTTTTAGCTC/--------------------------------------------------- CCAGAAATAA 3070 het 3070 ref 18 18 10 5 CCATCCTTCTACTCTCTATCTCCATGAGTTCAATGTTTTAATTTTTAGCTC 1 0 216496 CASAVA_Build 4 126688132 4D ATAAAATATC ATTA/---- ATTGTTAAAT 2039 het 2039 ref 19 12 7 0 ATTA 1 0 216497 CASAVA_Build 4 126700104 2I TGAAAGCTTT --/AA AGTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 1 3 216498 CASAVA_Build 4 126701026 1I ATTCTCCCCC -/T TCAGCCTCTC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 1 2 216499 CASAVA_Build 4 126710344 1D12M2D CACAGGGAGA CCCTGTTTCTACCAA/-CCTGTTTCTACC-- AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 29 0 26 5 N/A 0 0 216500 CASAVA_Build 4 126710526 5D CCTCTATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 38 1 27 12 A 17 12 216501 CASAVA_Build 4 126713222 5D CCTCTTGTTA TTAAT/----- TTATAGTTTT 3070 hom 118 het 44 0 42 4 TTAAT 1 0 216502 CASAVA_Build 4 126718885 4I AAACTTTAAA ----/AAAT AATAATTTTG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AAAT 0 1 216503 CASAVA_Build 4 126737386 1D ACAAGAGTTA G/- TATAAAGCTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 0 216504 CASAVA_Build 4 126743015 2D GCACAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 49 0 43 6 A 13 11 216505 CASAVA_Build 4 126774794 2I CCTGCTAAAC --/TA TATATATATA 3070 het 2990 hom 32 9 16 7 TA 8 9 216506 CASAVA_Build 4 126775731 1I TCCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 12 13 216507 CASAVA_Build 4 126775894 1D ACCTTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 A 12 11 216508 CASAVA_Build 4 126797008 1D TGAGGTATTG A/- GTATCTGTAA 3070 hom 160 het 65 0 54 13 A 1 0 216509 CASAVA_Build 4 126847538 1D GTTCCCTTGT C/- CCCCCTTGAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 6 5 216510 CASAVA_Build 4 126854831 2D CATGTGCGCG CA/-- CACACACACA 626 het 626 ref 45 30 3 13 CA 9 8 216511 CASAVA_Build 4 126867072 1I CTTTAAGACA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 8 216512 CASAVA_Build 4 126909597 27I ATTTCAGTAG ---------------------------/GATGCCTAAGAAATACTTAAATATAAA GATGTAATTC 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 GATGCCTAAGAAATACTTAAATATAAA 0 1 216513 CASAVA_Build 4 126914511 1I ATAGGAGATT -/A AAAAAAAAAA 1733 het 1660 hom 28 7 7 14 A 16 17 216514 CASAVA_Build 4 126921744 1D TTTTAATTTG A/- AAAAAAAAAA 1062 het 1062 ref 37 31 4 3 A 11 10 216515 CASAVA_Build 4 126926108 1I TGGAGGCAGT -/G GGGGGATCTC 3070 het 2201 hom 21 6 11 4 G 5 6 216516 CASAVA_Build 4 126928224 1I GTTTTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 11 12 216517 CASAVA_Build 4 126937093 1D AATACAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 11 10 216518 CASAVA_Build 4 126947266 1D ATCTTACCTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 8 7 216519 CASAVA_Build 4 126951029 1D CCATCCAAGT A/- GCTGGGATTA 2918 het 2918 ref 16 8 7 1 A 1 0 216520 CASAVA_Build 4 126953908 5D CCAGTGTCTC TTAGT/----- TTAGTTTTAC 3070 het 3070 ref 43 23 17 6 TTAGT 2 1 216521 CASAVA_Build 4 126954605 1I CTTAAATAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 9 10 216522 CASAVA_Build 4 126954741 1D TTAGATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1663 hom 15 4 9 2 T 12 11 216523 CASAVA_Build 4 126957107 8D AGTAATCAAC AATAAATA/-------- AATAAATAAA 3070 het 416 hom 24 4 17 4 AATA 8 6 216524 CASAVA_Build 4 126958221 5D AAAACAGTAA TTTAT/----- TTTAAAGTAT 3070 het 3070 ref 42 20 18 5 TTTAT 1 0 216525 CASAVA_Build 4 126960513 5I TATAAATAGG -----/ATTAT ATTATATGTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 ATTAT 1 2 216526 CASAVA_Build 4 126963959 1D TCAATCAATT A/- AAACTGACTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 4 3 216527 CASAVA_Build 4 126964619 1D GCTCAGTCAT A/- AAAAAACTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 7 6 216528 CASAVA_Build 4 126969283 1I GATGTTAAGC -/T TTGGTTTATC 3070 het 3070 ref 59 32 18 9 T 2 3 216529 CASAVA_Build 4 126972443 2I TTTTTAATAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 48 het 22 0 16 6 AT 6 7 216530 CASAVA_Build 4 126976658 1I TACCCTGTTC -/A AAAAAAAAAA 1219 het 1219 ref 26 11 4 11 A 15 16 216531 CASAVA_Build 4 126977776 1D TCCTTTTCAG A/- CAGTTTTAAG 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 A 1 0 216532 CASAVA_Build 4 126991426 1D CTTCTCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2638 hom 21 8 9 5 T 11 10 216533 CASAVA_Build 4 126992286 1D TTTTTCTGTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 1609 hom 21 4 14 3 T 8 7 216534 CASAVA_Build 4 126994843 1I TTCCTTGGGG -/A AAAAAATCTG 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 A 6 7 216535 CASAVA_Build 4 126998149 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 253 hom 29 1 19 9 T 12 11 216536 CASAVA_Build 4 127007278 2I TAAAGCAAAT --/AC ACACAACAAA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 AC 2 3 216537 CASAVA_Build 4 127008376 1D CAAAACTTTG T/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 7 6 216538 CASAVA_Build 4 127009027 1D GTGAATCAAT A/- AATGTGATTA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 3 2 216539 CASAVA_Build 4 127017037 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 9 10 216540 CASAVA_Build 4 127017442 1I TTATAATCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 49 20 19 10 T 8 9 216541 CASAVA_Build 4 127026265 32D TCCTACTCTC TTTCTCTTTCTGCTTTCTATTTCCTACTCTCT/-------------------------------- TTCTATTTCT 3070 hom 81 het 29 0 28 6 TTTCTCTTTCTGCTTTCTATTTCCTACTCTCT 1 0 216542 CASAVA_Build 4 127029135 2I GGCATGATAG --/AA AAAAGATATA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 4 6 216543 CASAVA_Build 4 127029519 4I TGGCCAAAAC ----/AAAT AATTTCTAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAAT 0 1 216544 CASAVA_Build 4 127034283 1I TGATAAATCA -/T TCACATTCTA 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 1 2 216545 CASAVA_Build 4 127037085 2I ATGCTAAAAA --/CT CTCAATAAAC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 CT 1 2 216546 CASAVA_Build 4 127039511 4D CCCTCTCTTC CTCT/---- CTCTCTCTTC 2178 het 2178 ref 25 9 6 11 CT 6 4 216547 CASAVA_Build 4 127041013 19I AATTAGGAAT -------------------/CACCTATACAGGTGAATAG GAGCAATATT 3070 het 3070 hom 27 14 14 2 CACCTATACAGGTGAATAG 0 1 216548 CASAVA_Build 4 127044307 14D TAAATAAAAC CACATACCTTTATT/-------------- CACATAGCTC 3070 het 3070 ref 28 14 11 6 CACATACCTTTATT 1 0 216549 CASAVA_Build 4 127048880 2D TATGCATACA TT/-- TTTTTGTGAG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 7 5 216550 CASAVA_Build 4 127051817 2I TTAAATAAAG --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 40 14 13 13 CT 7 8 216551 CASAVA_Build 4 127066713 1I ACATACAGCT -/G GGAGTCAGTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 G 2 3 216552 CASAVA_Build 4 127067355 1D GCCATCACCC T/- TTGCACTTCA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 3 2 216553 CASAVA_Build 4 127067758 1I ACATTAGGGG -/T TTTTTTTTTT 2827 het 1834 hom 27 9 11 7 T 11 12 216554 CASAVA_Build 4 127071502 1D ATGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 13 12 216555 CASAVA_Build 4 127077602 1I TAATGGGTAC -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 A 7 8 216556 CASAVA_Build 4 127084994 1D ATTATATTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 43 0 34 10 T 10 9 216557 CASAVA_Build 4 127089796 1D TATAAAAGGG T/- TTTGATGGAG 3070 hom 153 het 55 0 51 4 T 4 3 216558 CASAVA_Build 4 127099460 1D AAACAACAAT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 A 7 6 216559 CASAVA_Build 4 127112508 2D GGTGAAGCAG GA/-- GAGAGAGAGA 1385 het 1385 ref 43 28 4 12 GA 8 7 216560 CASAVA_Build 4 127119045 4D ACTGTCACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 39 22 13 6 AAAC 3 2 216561 CASAVA_Build 4 127119441 2I CAAGACTGTC --/TT AACATTTAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 0 2 216562 CASAVA_Build 4 127123494 1D ACGTAGCTAT A/- AAATCATTAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 4 3 216563 CASAVA_Build 4 127124482 5D GATGTGAATA ACTTT/----- ACTTATTACA 3070 het 3070 ref 27 16 9 4 ACTTT 1 0 216564 CASAVA_Build 4 127126486 1D GAACTTTTCG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2875 hom 21 8 13 0 T 9 8 216565 CASAVA_Build 4 127127838 2D AAATATATAC TA/-- TATATATATA 2005 hom 15 het 10 0 6 4 TA 9 8 216566 CASAVA_Build 4 127135900 1D CTATCTGCAG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 T 8 7 216567 CASAVA_Build 4 127137298 1D CTTTTTTCCC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 8 7 216568 CASAVA_Build 4 127140361 1I TTTTGTTGTG -/A TAACCGCATA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 216569 CASAVA_Build 4 127144020 1D GATATCAAGA C/- CAGCCTGGCT 1469 het 1469 ref 17 7 3 7 C 2 1 216570 CASAVA_Build 4 127144219 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 19 1 13 5 A 13 12 216571 CASAVA_Build 4 127144486 1D GATCAGTGAA G/- ATCATCCTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 G 1 0 216572 CASAVA_Build 4 127146111 10D AAATCATAAC ATCAAATTTA/---------- ATCAGCAAGT 3070 het 3070 ref 38 20 18 5 ATCAAATTTA 1 0 216573 CASAVA_Build 4 127152430 3I9M1D CTGACATTAT ---AAGATTCTTA/AAGAAGATTCTT- ACACTCTCTT 3070 het 3070 ref 36 21 14 5 N/A 0 0 216574 CASAVA_Build 4 127153211 2I AATTATAAGG --/AT ATATATATAT 3070 het 2624 hom 19 6 9 4 AT 7 8 216575 CASAVA_Build 4 127153551 1D CTAAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2778 hom 32 12 17 4 A 14 13 216576 CASAVA_Build 4 127160415 4D TTTGGTAGAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 38 4 17 18 T 16 12 216577 CASAVA_Build 4 127163264 1I TGGCTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 10 11 216578 CASAVA_Build 4 127218878 1D CAGTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 11 10 216579 CASAVA_Build 4 127240147 3D GACTTCTAAT AAC/--- TAATTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 21 13 2 AAC 1 0 216580 CASAVA_Build 4 127259099 1I GGTGTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 9 10 216581 CASAVA_Build 4 127264923 1I TTTCTTCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 A 9 10 216582 CASAVA_Build 4 127309143 1I AGATTTAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 9 10 216583 CASAVA_Build 4 127315129 1D TAGCAGAGCT A/- AAAGTCTCTT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 4 3 216584 CASAVA_Build 4 127319727 1I TTGAATAATT -/A AAAAAATATA 2148 het 2148 ref 17 6 6 5 A 6 7 216585 CASAVA_Build 4 127347630 1I TCTGCATCCA -/T TGAGATAATC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 1 2 216586 CASAVA_Build 4 127356245 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 17 1 11 6 A 15 14 216587 CASAVA_Build 4 127367975 1I AAGATGTTAA -/T TTTTAAAAGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 4 5 216588 CASAVA_Build 4 127377527 3D TCATCTTATG ATT/--- ATATTTTACC 3070 hom 105 het 41 0 36 6 ATT 1 0 216589 CASAVA_Build 4 127379904 1I AATAGAACTT -/A AAAATATGCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 5 216590 CASAVA_Build 4 127380770 1I AGTTCTTTTG -/T AAATATTGAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 0 1 216591 CASAVA_Build 4 127391629 1D TATTTTTTAC T/- TTTTTTTATT 883 hom 13 het 7 0 5 2 T 8 7 216592 CASAVA_Build 4 127395413 6D GTTGAATTAA TTTAAT/------ TTTAAGATTG 3070 hom 129 het 44 0 44 3 TTTAAT 1 0 216593 CASAVA_Build 4 127397731 2I TTGTTTATAA --/CT CTCTTTTGCC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CT 2 3 216594 CASAVA_Build 4 127401003 1D ACAAACCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 12 11 216595 CASAVA_Build 4 127411610 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 10 9 216596 CASAVA_Build 4 127412540 1D ACAAATGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 21 0 15 6 A 11 10 216597 CASAVA_Build 4 127414127 1D AAATTTATTC A/- AAAATATGTT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 5 4 216598 CASAVA_Build 4 127418685 2D CAGTCTTTCT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 126 het 50 0 43 8 AC 7 6 216599 CASAVA_Build 4 127420637 1I TCATTAGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 9 10 216600 CASAVA_Build 4 127421243 9D GAAAAGTGTG AGAATCAGT/--------- AGAATCAGTA 3070 hom 132 het 51 0 45 14 AGAATCAGT 2 1 216601 CASAVA_Build 4 127462484 1D ATTAAGTTTG A/- ATGGACAGCT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 A 2 1 216602 CASAVA_Build 4 127466888 1D ATGGTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 188 hom 41 1 30 10 T 14 13 216603 CASAVA_Build 4 127468006 14D ATTGTATTAA TAAGCTAGAGATCC/-------------- TAGGTGTTTT 3070 hom 72 het 26 0 24 4 TAAGCTAGAGATCC 1 0 216604 CASAVA_Build 4 127472154 2I CATCATCTAT --/AC AGTTTTTCAC 3070 hom 114 het 47 0 39 8 AC 0 1 216605 CASAVA_Build 4 127481504 1D TTCTAAATAG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 T 8 7 216606 CASAVA_Build 4 127482253 3I TTTATTCTGA ---/TTT TTTTTTTTTT 2679 het 2679 ref 28 12 12 5 T 10 13 216607 CASAVA_Build 4 127482333 3I GTACCTAGGT ---/TTT TTTTTTTCTG 1155 het 1155 ref 24 7 5 12 T 8 11 216608 CASAVA_Build 4 127485233 1D AGGGGAAGAG A/- GGGGAGGGGC 891 het 275 hom 6 1 3 2 A 1 0 216609 CASAVA_Build 4 127485362 1I AGGAATACGC -/A GGGAGATATT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 0 1 216610 CASAVA_Build 4 127489719 5D ATGTCTACAC AATAT/----- AAGTTGATTA 3070 het 3070 hom 24 10 13 3 AATAT 1 0 216611 CASAVA_Build 4 127502847 1I ATACATTTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 T 8 9 216612 CASAVA_Build 4 127511088 4D GCATATACAT ACAC/---- ACACACACAT 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 AC 6 4 216613 CASAVA_Build 4 127512558 1I TAATCATTTT -/A AAAATGGCAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 5 216614 CASAVA_Build 4 127528619 1I TTTCATAAAG -/A TTATTTCATA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 0 1 216615 CASAVA_Build 4 127543742 1D ATTTATTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 10 9 216616 CASAVA_Build 4 127545324 1D TCCTGATGCA G/- GGGGGGACTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 G 7 6 216617 CASAVA_Build 4 127557716 4I TAACCCTTAC ----/TAGT CTTTGTTGGT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TAGT 0 1 216618 CASAVA_Build 4 127559289 1I ATTTTTTTTG -/T TGATTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 1 2 216619 CASAVA_Build 4 127561032 1D CTCCAAATGA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 40 18 15 8 T 8 7 216620 CASAVA_Build 4 127565412 1I CCATTATAGT -/A AAACAGCCTA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 3 4 216621 CASAVA_Build 4 127567721 1D CACACTTATT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 A 7 6 216622 CASAVA_Build 4 127578510 3I ATTATATAAT ---/AAG AAGAATTATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAG 1 2 216623 CASAVA_Build 4 127582244 1D AGTTATTTAT G/- AGTTTTCTTT 3070 het 792 hom 26 3 21 2 G 1 0 216624 CASAVA_Build 4 127582673 3D CACAGAAATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 30 1 26 3 T 13 10 216625 CASAVA_Build 4 127584101 1D ATATAAAAGT A/- AAAATTGCAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 5 4 216626 CASAVA_Build 4 127585536 1I CATCATCCAA -/T TCCCTTTATC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 2 216627 CASAVA_Build 4 127594686 1D TTGCCCAGGG C/- TCCACTCTGG 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 C 1 0 216628 CASAVA_Build 4 127600530 1I TTATCTCCAT -/A AAAATCATTT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 4 5 216629 CASAVA_Build 4 127615370 4D ATCATTCTCT TAAC/---- TAACTGTAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 TAAC 2 1 216630 CASAVA_Build 4 127623774 5D CTGAAGTTTT TAAAA/----- TAAAATATTA 3070 het 3070 ref 33 17 16 0 TAAAA 2 1 216631 CASAVA_Build 4 127630131 4I TTATGCCGCT ----/ATCA ATCATCCATG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 ATCA 1 2 216632 CASAVA_Build 4 127632359 4D TAGAGTACTA GAGT/---- GAGTCCCAAA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 GAGT 2 1 216633 CASAVA_Build 4 127632835 3D1M2I TAACAAAAGG TGTA--/---AAC CTGTGTACTC 3070 het 3070 ref 51 25 24 4 N/A 0 0 216634 CASAVA_Build 4 127633878 1I AATTTCCCAG -/T TTTACAGCAG 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 3 4 216635 CASAVA_Build 4 127646529 1I TGTAGTCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 A 9 10 216636 CASAVA_Build 4 127647212 2I ATAATATTTA --/GT GTGCCACACA 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 GT 1 2 216637 CASAVA_Build 4 127651136 4I TTTGTAACAC ----/AAAG AAAGAATCAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 AAAG 1 2 216638 CASAVA_Build 4 127651799 1I ACTTAATGTA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 T 6 7 216639 CASAVA_Build 4 127654195 12D CCCCTTATTT TGTGGTCTCAAG/------------ TGTAATTTCT 3070 het 3070 ref 32 21 13 1 TGTGGTCTCAAG 1 0 216640 CASAVA_Build 4 127658542 1I AGATTAATAT -/A AAAAATTACA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 5 6 216641 CASAVA_Build 4 127659401 1I ATTCTTGTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 9 10 216642 CASAVA_Build 4 127668092 1I ACAGAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 26 1 12 13 A 13 14 216643 CASAVA_Build 4 127669516 6D GACCAACCCC TCCTCT/------ TCCTCTTCCT 3070 het 3070 ref 27 9 9 11 TCCTCT 3 2 216644 CASAVA_Build 4 127682142 6D ATATCTATAC CTATAT/------ CTATATCTAT 2608 het 2608 ref 36 22 11 4 CTATAT 3 2 216645 CASAVA_Build 4 127685260 2I GATCAGAAAT --/AG AGACCTTCAC 3070 hom 108 het 39 0 35 4 AG 1 2 216646 CASAVA_Build 4 127691994 1I TTGACAAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 9 10 216647 CASAVA_Build 4 127698112 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAGGAT 2738 hom 21 het 10 0 8 2 A 7 6 216648 CASAVA_Build 4 127701873 2I TCTCTCTCTC --/TA TATATATATA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 TA 5 6 216649 CASAVA_Build 4 127707268 1I GCAATGTATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 870 hom 27 3 22 2 T 11 12 216650 CASAVA_Build 4 127713610 1I ATAAAATAAT -/A ATGTATACAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 1 2 216651 CASAVA_Build 4 127720407 22D AGCCATGTGG TTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------- TTTTTCCAGA 3070 het 2290 hom 26 11 13 3 TTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT 1 0 216652 CASAVA_Build 4 127730709 1I AGTATACTAA -/T TTTTTTTTTT 1824 het 1453 hom 20 6 5 9 T 13 14 216653 CASAVA_Build 4 127732899 1D AATATGGGGG A/- AAAAAATTCC 3070 hom 97 het 38 0 31 7 A 7 6 216654 CASAVA_Build 4 127741801 1D CTGCATTTTA T/- TTTTTTTTTT 1749 het 1749 ref 46 34 4 9 T 12 11 216655 CASAVA_Build 4 127742561 1D TTGAAGCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 67 het 29 0 23 6 T 10 9 216656 CASAVA_Build 4 127745960 1D TGTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 19 1 15 3 A 12 11 216657 CASAVA_Build 4 127751540 1I CAATTACAGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 A 7 8 216658 CASAVA_Build 4 127761991 1I GTGACACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 A 12 13 216659 CASAVA_Build 4 127787966 1D GCATTTACTC T/- TAAGGCTAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 1 216660 CASAVA_Build 4 127797460 1I TCATATTGCC -/T TTTTTTTTTT 2037 het 2037 ref 29 8 10 11 T 13 14 216661 CASAVA_Build 4 127808033 1I TATAAATGTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 7 8 216662 CASAVA_Build 4 127808502 1I TCAATGTTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 8 216663 CASAVA_Build 4 127817259 1D TAAAAAAACA C/- CCATTTTACT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 3 2 216664 CASAVA_Build 4 127827410 1D TTTTTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 266 hom 33 1 29 3 A 12 11 216665 CASAVA_Build 4 127833014 2D ACGAGGGACA AG/-- AGAGAGGAAT 3070 hom 111 het 42 0 37 6 AG 4 3 216666 CASAVA_Build 4 127841889 1D CTAAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 16 8 T 13 12 216667 CASAVA_Build 4 127850718 1I AGACAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 39 1 30 8 A 10 11 216668 CASAVA_Build 4 127853961 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 6 5 216669 CASAVA_Build 4 127874723 1I CTTCTTTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 T 8 9 216670 CASAVA_Build 4 127877362 2D GTTTTTCTTT TA/-- TATATATATA 2538 het 642 hom 16 2 6 8 TA 8 7 216671 CASAVA_Build 4 127879256 1I GTATTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 A 11 12 216672 CASAVA_Build 4 127887994 3D ACAAAAATGA AAC/--- AATATAATAT 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 AAC 1 0 216673 CASAVA_Build 4 127890225 1D ATCAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2338 hom 26 11 11 4 T 13 12 216674 CASAVA_Build 4 127908249 1I CTCAAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 21 3 16 2 A 10 11 216675 CASAVA_Build 4 127909575 1I GTTGCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 10 11 216676 CASAVA_Build 4 127910382 2I TATGAGTGCT --/TA TTTTTTTTTA 1442 het 929 hom 9 3 4 3 TA 0 1 216677 CASAVA_Build 4 127913956 1I TCATGCCTGT -/A AATCCCAGCA 3070 het 3070 hom 21 7 12 2 A 2 3 216678 CASAVA_Build 4 127914224 1D AAAAAATCTC A/- AAAAAAAAAA 2628 het 2447 hom 20 8 8 4 A 15 14 216679 CASAVA_Build 4 127917271 1D GAAAGAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3040 hom 33 12 15 6 A 14 13 216680 CASAVA_Build 4 127920475 1I AATTCTTCCT -/G GATGCAGAAC 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 G 1 2 216681 CASAVA_Build 4 127930391 1I ATTAACACAC -/A AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 6 7 216682 CASAVA_Build 4 127932421 4D AATTCAGTGT GCCA/---- GCTAAATTTA 3070 het 3070 ref 26 13 13 1 GCCA 1 0 216683 CASAVA_Build 4 127933155 1I GAACAGCCAA -/G GGTGGCAGCT 3070 het 3070 ref 58 26 23 9 G 2 3 216684 CASAVA_Build 4 127936785 1I AATCTTTCTC -/T TTTTTTAGAT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 6 7 216685 CASAVA_Build 4 127945954 4D CTGTCTTATT TCTG/---- TCTTATTTAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 TCTG 1 0 216686 CASAVA_Build 4 127955340 1I GGACACAAAC -/A AATGGAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 3 216687 CASAVA_Build 4 127964291 1I TACATAGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 9 10 216688 CASAVA_Build 4 127966266 5D GGAAATTAAA AAAAT/----- AAAATAAAAC 3070 het 3070 hom 41 13 24 6 AAAAT 2 1 216689 CASAVA_Build 4 127967905 1I AGCTAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 11 12 216690 CASAVA_Build 4 127969113 1I CTGCTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 11 12 216691 CASAVA_Build 4 127972477 2I AACACCAGGA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 9 11 216692 CASAVA_Build 4 127973093 14D ACACAAGAAC TGTCATACAAGAAT/-------------- TGCTAAAAGG 3070 het 3070 ref 38 24 13 3 TGTCATACAAGAAT 1 0 216693 CASAVA_Build 4 127974876 2I CTAAGAGGGA --/AG TTTATAGTTA 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 AG 0 1 216694 CASAVA_Build 4 127980780 4I ATGCCAACTC ----/ACTT ACTGGGACAT 3070 het 3070 ref 61 31 23 7 ACTT 0 1 216695 CASAVA_Build 4 127982480 1D TCTGCCCAGA C/- CTAGAATCTA 3070 het 3070 ref 57 27 22 8 C 2 1 216696 CASAVA_Build 4 127983481 1D CTAGGCAGAT A/- GGGGCAGGTC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 A 1 0 216697 CASAVA_Build 4 127985789 1I GTACAAATTG -/A AATAAGTCTT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 A 2 3 216698 CASAVA_Build 4 127988891 1D CGTAGTGAGA C/- CCTGTCACTA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 C 3 2 216699 CASAVA_Build 4 127989555 1I ATTTCTGAGC -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 6 7 216700 CASAVA_Build 4 127990334 1D AGGCATCCAG A/- AAAAAAAAAA 2851 het 2851 ref 33 14 8 11 A 11 10 216701 CASAVA_Build 4 127991943 1I TTTATCACTT -/A AAAATTAGCC 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 4 5 216702 CASAVA_Build 4 127994382 6D ATATCTGTAG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2370 het 1896 hom 25 10 6 10 T 16 10 216703 CASAVA_Build 4 127995901 1I TTTGAAGATT -/G GGGGTTAAAC 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 G 4 5 216704 CASAVA_Build 4 128031091 1I TTCTTGGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 27 1 22 4 A 12 13 216705 CASAVA_Build 4 128032279 2I ATTCAAATAT --/GA GAGAGATGTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 GA 3 4 216706 CASAVA_Build 4 128033850 2D TAATAGATTC TA/-- TATATTAGAC 3070 het 3070 hom 26 8 13 6 TA 3 2 216707 CASAVA_Build 4 128035263 14D ACCCATCTAG ACAAAGATTTACAT/-------------- ACAAGAGATT 3070 het 3070 ref 58 36 23 3 ACAAAGATTTACAT 1 0 216708 CASAVA_Build 4 128041437 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 9 8 216709 CASAVA_Build 4 128043075 1I CAAACAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 49 het 25 0 16 9 A 9 10 216710 CASAVA_Build 4 128046390 1I ACTTTTTTTT -/A AAAAAAAGTG 2713 het 2713 ref 29 19 6 4 A 7 8 216711 CASAVA_Build 4 128047545 1I CTAAGACATA -/T TTTAGAAATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 3 4 216712 CASAVA_Build 4 128054711 1D TGGAAGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 10 8 T 13 12 216713 CASAVA_Build 4 128055059 1I TAAATTCTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 9 10 216714 CASAVA_Build 4 128057113 2I TCCCTCCTTT --/AA AAAAAAAAAA 2618 het 2618 ref 29 14 8 7 A 12 14 216715 CASAVA_Build 4 128061750 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2694 hom 16 8 7 1 A 10 9 216716 CASAVA_Build 4 128063341 1D CTAGCTAAAA G/- TTTGTAAACA 3070 het 3070 ref 36 25 9 2 G 1 0 216717 CASAVA_Build 4 128066593 1D TATTTACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 11 10 216718 CASAVA_Build 4 128078757 1D ACAACATATG T/- ATTTCTCCAA 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 T 1 0 216719 CASAVA_Build 4 128080745 2I TTAAATAGTC --/TT TTTTTTTTTT 2838 het 1463 hom 27 6 13 8 T 13 15 216720 CASAVA_Build 4 128082167 1D AAGTTCAGGG C/- TTCCACAGGA 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 C 1 0 216721 CASAVA_Build 4 128087145 2D GGGTGACTCC AA/-- AAAAAAAAAA 2129 het 5 hom 30 1 15 14 A 12 10 216722 CASAVA_Build 4 128098842 1I GAGGAGACAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 8 9 216723 CASAVA_Build 4 128099067 1D AAAAACTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 22 2 10 10 A 12 11 216724 CASAVA_Build 4 128101308 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2394 het 1108 hom 19 4 6 9 A 12 13 216725 CASAVA_Build 4 128101857 1D CCTCCACTTA C/- CCTGTCTCTT 3070 het 3070 hom 49 23 22 5 C 3 2 216726 CASAVA_Build 4 128103627 1I TGTGCTAACT -/C AAATAATTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 216727 CASAVA_Build 4 128107572 1D CAAAATAATG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 8 7 216728 CASAVA_Build 4 128118337 3I TATGCATATG ---/ATA ATTATTTTAA 3070 hom 133 het 49 0 44 5 ATA 0 1 216729 CASAVA_Build 4 128119970 2D AAAGTATAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 23 5 10 8 A 16 14 216730 CASAVA_Build 4 128128559 1I ATAGTATGGC -/T TTTATTTTCA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 3 4 216731 CASAVA_Build 4 128137748 1D TTGTTAAAAG C/- CCAGGTTTTG 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 C 3 2 216732 CASAVA_Build 4 128139489 1I TGGTATTTTG -/A AAAAAAAAAA 1272 het 1272 ref 39 21 5 13 A 15 16 216733 CASAVA_Build 4 128140769 1I TGGTTAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 39 2 17 20 A 11 12 216734 CASAVA_Build 4 128141403 1D ATCAAAAAAA C/- ATTTCATATC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 C 1 0 216735 CASAVA_Build 4 128144706 1D GGATGAAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 68 het 27 0 23 5 A 10 9 216736 CASAVA_Build 4 128152728 1D GAAAATTACC A/- AAAAAAAGGG 3070 het 2981 hom 30 10 15 5 A 8 7 216737 CASAVA_Build 4 128153965 1D TTTCAGAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 10 9 216738 CASAVA_Build 4 128158201 1I TTTAATTTTC -/T TTTTGAAATT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 4 5 216739 CASAVA_Build 4 128172802 1I GTTTATTCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 9 10 216740 CASAVA_Build 4 128180267 1D CTAGCAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 A 10 9 216741 CASAVA_Build 4 128182975 1D TTGAAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 10 9 216742 CASAVA_Build 4 128212019 1D GGCAAATCTG C/- CTTCCTGAAA 3070 het 3070 ref 43 18 21 4 C 2 1 216743 CASAVA_Build 4 128214190 3D CAAATTTAAA TCT/--- TCTTCTTGCA 3070 het 3070 hom 56 26 25 7 TCT 3 2 216744 CASAVA_Build 4 128229082 1I TATATCTGAT -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 6 7 216745 CASAVA_Build 4 128270499 1I ACTTTTACAC -/T GTTGGTGGGA 2447 hom 12 het 5 0 5 0 T 0 1 216746 CASAVA_Build 4 128519458 2I TTCTGTAATC --/CT TTTTTAGAGG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 CT 0 1 216747 CASAVA_Build 4 128540713 3D TGGAGAAAAA AAT/--- AATGAGATAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAT 2 1 216748 CASAVA_Build 4 128550027 1D ATCACATGTG T/- TTTTAACCCC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 T 5 4 216749 CASAVA_Build 4 128576042 2I AAATACTATG --/CT AAGTGAAAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CT 0 1 216750 CASAVA_Build 4 128588969 1D GTATATTGTT A/- AAAAAAAAAA 1788 het 1788 ref 35 24 5 9 A 12 11 216751 CASAVA_Build 4 128612716 1I TTATCTTACC -/T TTTTTTTTTT 2953 het 2953 ref 34 14 8 12 T 11 12 216752 CASAVA_Build 4 128621534 1I ATTTTTTCAG -/A AAAAAATTCT 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 A 6 7 216753 CASAVA_Build 4 128625319 1D GAGTTTAAAT C/- CATCATAGGG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 C 2 1 216754 CASAVA_Build 4 128633010 1I TGAAACAAAC -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 A 7 8 216755 CASAVA_Build 4 128651115 1I TACTTACCTC -/A AAAAACATGC 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 A 5 6 216756 CASAVA_Build 4 128683618 2D ATGCTGGGAA CT/-- CTGCAAGGAA 3070 het 3070 hom 50 22 21 8 CT 2 1 216757 CASAVA_Build 4 128766369 2I ACATAAGTTG --/TT TCTGAGTCAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 1 3 216758 CASAVA_Build 4 128813073 1D GCGGTGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 36 3 22 11 T 16 15 216759 CASAVA_Build 4 128832568 2D CCATGGTATG TA/-- TATATATATA 1134 het 1134 ref 19 9 3 7 TA 9 8 216760 CASAVA_Build 4 128938208 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 2524 hom 15 het 22 0 8 14 T 17 18 216761 CASAVA_Build 4 128959489 1I TTAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 960 het 960 ref 35 21 3 11 A 13 14 216762 CASAVA_Build 4 128980913 1I TTAGTTCCTA -/C ATGTTAACAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 216763 CASAVA_Build 4 129088382 1D TCCAAGTACC A/- TGGATTTATC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 1 0 216764 CASAVA_Build 4 129108378 2D ACATTTAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 AT 6 5 216765 CASAVA_Build 4 129118379 1D TTAGAATAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 10 9 216766 CASAVA_Build 4 129157334 1D GAGCCAAGAT C/- CATGCCACTG 3070 hom 51 het 20 0 17 4 C 2 1 216767 CASAVA_Build 4 129186161 1D TAAAAGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2752 hom 33 10 19 5 T 11 10 216768 CASAVA_Build 4 129218123 1D CCGCCCCTGC A/- AAAAAAAAAA 897 het 897 ref 17 13 3 1 A 11 10 216769 CASAVA_Build 4 129281430 1D ATTGTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 578 het 578 ref 22 15 2 5 T 11 10 216770 CASAVA_Build 4 129290031 1D AAGTTGAGTT A/- AAAAACCCAC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 6 5 216771 CASAVA_Build 4 129299623 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 11 12 216772 CASAVA_Build 4 129306066 1D AATTGGACTT A/- AAAAAATTCA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 7 6 216773 CASAVA_Build 4 129311478 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 33 3 18 12 T 17 16 216774 CASAVA_Build 4 129311711 1D TCCATAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 12 11 216775 CASAVA_Build 4 129351439 2D GCACGAGTAA TT/-- TAAAACCTGC 3070 het 3070 hom 24 9 14 2 T 3 1 216776 CASAVA_Build 4 129379629 4I CAAGAAAAAG ----/AAAT AAAAGTCATC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 AAAT 0 1 216777 CASAVA_Build 4 129396872 5D GGTGATCTGT TTTAC/----- TTTACTTAAA 2846 het 2846 ref 29 16 8 6 TTTAC 2 1 216778 CASAVA_Build 4 129397074 4I GATTTTTTTC ----/CTGT CTATTTCCAA 3070 het 3070 ref 49 30 16 4 CTGT 0 1 216779 CASAVA_Build 4 129403554 1I CTGCTGATGT -/C CCCACATTTA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 C 3 4 216780 CASAVA_Build 4 129416950 1I TGTATTAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 9 10 216781 CASAVA_Build 4 129431234 1I GTTTCCCCTT -/A ACAATACCTA 3070 het 3070 ref 61 27 19 15 A 1 2 216782 CASAVA_Build 4 129432854 1D AGGGAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2287 het 2287 ref 28 9 7 12 T 13 12 216783 CASAVA_Build 4 129439471 1I TATAAAACAG -/T TTTTTTTTTA 2012 het 2012 ref 26 14 6 6 T 9 10 216784 CASAVA_Build 4 129445407 2I CATATATGTT --/TG TGTGTGTTGT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 TG 3 4 216785 CASAVA_Build 4 129459237 2I CAATGACTGA --/TT TTTAACTGGA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 3 5 216786 CASAVA_Build 4 129487903 1D TTGTCCTTTT A/- AAAAAAAAAA 2579 het 2579 ref 22 9 8 5 A 13 12 216787 CASAVA_Build 4 129489997 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 814 hom 16 2 11 3 A 11 12 216788 CASAVA_Build 4 129534841 1D CCAACATGGC A/- AAAACTGCAT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 5 4 216789 CASAVA_Build 4 129550032 1D ACAAGGTTGC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 9 8 216790 CASAVA_Build 4 129554828 1I ATATGTGAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 408 hom 37 1 32 4 T 9 10 216791 CASAVA_Build 4 129567708 2D AAATTAAAAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TA 6 5 216792 CASAVA_Build 4 129590620 5I CATTTTCACA -----/CACAC CACACCACAC 3070 hom 117 het 51 0 37 14 CACAC 3 4 216793 CASAVA_Build 4 129590635 1D CACACCACAC A/- CACACACACA 3070 het 1328 hom 48 4 14 32 A 1 0 216794 CASAVA_Build 4 129605008 1I TGGTGATCAG -/A AAAAAAGATG 3070 het 3070 hom 39 12 25 2 A 6 7 216795 CASAVA_Build 4 129618130 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 9 10 216796 CASAVA_Build 4 129618683 1I TCTCACATAC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 8 9 216797 CASAVA_Build 4 129629614 1I GAGATAAAAC -/A GCACAATTTA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 A 0 1 216798 CASAVA_Build 4 129630019 1D GAGTATTATC T/- TTTTTTTTTT 955 het 955 ref 25 12 3 11 T 17 16 216799 CASAVA_Build 4 129636339 1D AAGCTCATGG A/- TTGGCTGCTT 3070 het 3070 hom 47 15 22 10 A 1 0 216800 CASAVA_Build 4 129641775 1D ACCCTGCTCT G/- GGAGCCACTA 3070 het 3070 ref 52 20 18 14 G 3 2 216801 CASAVA_Build 4 129654899 3I TAAGAAGAGA ---/CAC CACCCGGGAT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 CAC 1 2 216802 CASAVA_Build 4 129655386 1I TGGTTCTCCT -/C TTTCCGTCTT 3070 het 3070 hom 45 13 28 4 C 0 1 216803 CASAVA_Build 4 129663545 1D ATTTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1847 hom 28 5 18 5 T 12 11 216804 CASAVA_Build 4 129711329 21I GAAAACTAAA ---------------------/GCCATACCTTATTAGACTGTT TGAGAGCACG 3070 hom 84 het 31 0 28 6 GCCATACCTTATTAGACTGTT 0 1 216805 CASAVA_Build 4 129712413 1I GATATACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 355 hom 25 1 18 6 A 9 10 216806 CASAVA_Build 4 129712722 1D ACAACATAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 9 216807 CASAVA_Build 4 129722681 1D CCCACCTAAG C/- CCCCCCAAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 7 6 216808 CASAVA_Build 4 129728216 1I ATTACAAAAG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 7 8 216809 CASAVA_Build 4 129740913 1I AAACTTTCTT -/C CCCCCCACCC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 6 7 216810 CASAVA_Build 4 129745164 2I GGAAATAGGG --/AA AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 8 10 216811 CASAVA_Build 4 129746877 2D CTGGAGGAGG AT/-- ATTGTTTTGA 3070 het 3070 hom 38 15 20 5 AT 2 1 216812 CASAVA_Build 4 129749209 1I TAACTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 19 7 A 13 14 216813 CASAVA_Build 4 129749739 1I ACATCTTCAA -/T TTTTTAAATT 3070 het 3070 hom 53 18 29 6 T 5 6 216814 CASAVA_Build 4 129755524 1I CCTTCTTGGG -/C CTTCAGACGA 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 C 1 2 216815 CASAVA_Build 4 129756219 5D11M1D CATATAAACT TAAAGTAAAGAAATGGA/-----TAAAGAAATGG- AAAAAAATAT 3070 het 2273 hom 45 9 16 22 N/A 0 0 216816 CASAVA_Build 4 129758422 4I AGACCCAAAT ----/AAAC AAAATTAGAA 3070 het 3070 hom 25 7 12 6 AAAC 0 1 216817 CASAVA_Build 4 129759887 2D CAATAGCTAC AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 486 hom 35 6 9 20 A 10 8 216818 CASAVA_Build 4 129762118 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2679 hom 15 het 6 0 6 0 A 9 10 216819 CASAVA_Build 4 129768104 1D AATATCAAAC A/- AAATGTTATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 A 4 3 216820 CASAVA_Build 4 129779615 2I TGTTAGGTAT --/AG AGAGGCTTGG 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 AG 2 3 216821 CASAVA_Build 4 129779923 2I TTCTGAAGAT --/AA AAATTCCAAT 3070 het 3070 hom 47 21 19 7 A 3 5 216822 CASAVA_Build 4 129787512 3D ATTTATCCCA GTG/--- GTGGTGGTGG 3070 het 3070 ref 53 26 17 14 GTG 5 4 216823 CASAVA_Build 4 129787662 14D AGAAAAAGGA AAGTGACACCTACT/-------------- AAGCCCTCAT 3070 het 3070 ref 36 23 11 5 AAGTGACACCTACT 1 0 216824 CASAVA_Build 4 129794848 2D CTCAGTTCTC TT/-- GTTTGCCTTC 3070 het 3070 hom 45 21 23 1 T 2 0 216825 CASAVA_Build 4 129799279 3D AAGTCAGGTT AAG/--- AAGAAGAAAA 1644 het 1644 ref 24 9 6 9 AAG 3 2 216826 CASAVA_Build 4 129805894 85D GTCCACAGAG CTTAGACCTAGAAAATACACTGATGTTATAAAATTTCTGGACTGTTAGAACTGACCCTACATGCTTTATACAAAACTTATACAGC/------------------------------------------------------------------------------------- CTTACTTCCA 1406 het 1406 ref 13 19 3 2 CTTAGACCTAGAAAATACACTGATGTTATAAAATTTCTGGACTGTTAGAACTGACCCTACATGCTTTATACAAAACTTATACAGC 1 0 216827 CASAVA_Build 4 129840719 1D AAAGTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1794 het 1794 ref 27 15 5 7 T 13 12 216828 CASAVA_Build 4 129857802 4D AACCAGGCAA ATCT/---- ATACCTATAT 3070 het 3070 hom 36 15 21 2 ATCT 1 0 216829 CASAVA_Build 4 129858882 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2906 het 2203 hom 20 9 9 3 A 13 12 216830 CASAVA_Build 4 129860826 1I TATACCTGAC -/G GGGGGGGGCT 1451 het 1451 ref 19 5 7 7 G 8 9 216831 CASAVA_Build 4 129871837 5D CCTCAAAAAA GAAAG/----- GAAAAGAAAA 1342 hom 5 het 7 0 4 3 GAAAG 1 0 216832 CASAVA_Build 4 129883183 3D AAATGACAAT TTG/--- TTAACAACTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTG 1 0 216833 CASAVA_Build 4 129885516 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1558 het 739 hom 12 4 5 3 T 13 14 216834 CASAVA_Build 4 129890987 1D AGGGAAATTC T/- TTTTTTTTTT 2049 het 931 hom 35 9 9 17 T 19 18 216835 CASAVA_Build 4 129891509 1D AGGATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 36 3 26 7 T 13 12 216836 CASAVA_Build 4 129903395 7I4M4I TAAAAAATAT -------AAAT----/ATTTAAAAAATATAA GTATACACTA 3061 hom 21 het 6 0 8 1 N/A 0 0 216837 CASAVA_Build 4 129903552 1D TATGTTATTG T/- TTTTTTTTTT 2498 het 486 hom 19 1 6 12 T 11 10 216838 CASAVA_Build 4 129912589 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 11 10 216839 CASAVA_Build 4 129921891 2I TGGAAATCCC --/AT ATGTTACTGA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AT 1 2 216840 CASAVA_Build 4 129927877 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 36 het 16 0 12 4 A 8 7 216841 CASAVA_Build 4 129929977 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 646 hom 33 2 18 13 A 13 14 216842 CASAVA_Build 4 129930604 4D AGAGAGAAAC GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 87 het 37 0 29 8 GA 11 9 216843 CASAVA_Build 4 129932328 1I GTATGGCGGT -/G AGCGCCTATA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 G 0 1 216844 CASAVA_Build 4 129935765 1I AGGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 9 10 216845 CASAVA_Build 4 129940966 1D AGTAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 45 1 36 8 A 13 12 216846 CASAVA_Build 4 129945952 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 946 het 946 ref 10 6 4 0 T 10 11 216847 CASAVA_Build 4 129950018 4I TAAAAACCCA ----/CTTC CTTGCTTGGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CTTC 0 1 216848 CASAVA_Build 4 129956618 1I TCAACAATAC -/T TTTTTTTTTT 2925 het 2925 ref 42 15 13 14 T 15 16 216849 CASAVA_Build 4 129957905 4I CCTGGCTTCC ----/TGAG TAACTGCGAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TGAG 0 1 216850 CASAVA_Build 4 129959883 1D GCAATGGTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 745 hom 51 10 19 22 T 10 9 216851 CASAVA_Build 4 129960720 5D TTTGGGAAGA TTTCT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2710 hom 28 9 15 4 TTTCT 1 0 216852 CASAVA_Build 4 129962099 2D TGGCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 784 het 784 ref 21 7 3 11 T 18 16 216853 CASAVA_Build 4 129966993 1I AACAGAGTTT -/C ACTCTTGTCA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 C 0 1 216854 CASAVA_Build 4 129969162 1I AACCCTCATT -/A ACTCAAGATC 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 1 2 216855 CASAVA_Build 4 129996434 1I TTGTTTTTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 11 14 6 T 8 9 216856 CASAVA_Build 4 129999209 1D GGTTTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 2024 het 925 hom 22 6 7 9 T 17 16 216857 CASAVA_Build 4 130000168 4D GTGTATGTGT GTGA/---- GTATGCGTGT 3070 het 3070 hom 79 36 32 17 GTGA 1 0 216858 CASAVA_Build 4 130015114 1I AAAAAATATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 8 9 216859 CASAVA_Build 4 130015645 5D GTTAAAAATC AAATT/----- AAAGTATATG 2634 het 2634 ref 22 11 7 5 AAATT 1 0 216860 CASAVA_Build 4 130033800 3D ATGCCTAAAC TAT/--- TATTCACTTA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 TAT 2 1 216861 CASAVA_Build 4 130042277 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 A 10 11 216862 CASAVA_Build 4 130043682 1D CAGTTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 15 10 A 11 10 216863 CASAVA_Build 4 130046130 1I CACTTTAGAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 8 9 216864 CASAVA_Build 4 130046415 1D TTTTAGACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 11 10 216865 CASAVA_Build 4 130047301 4D67M11D TGCTCATCTT AGAAGGAGTTTGGGGAAATTATGAAGTTCACTCATTTAATAAATACTGAAATGAGTGCCTGTTACATGCTACATACTACTGT/----GGAGTTTGGGGAAATTATGAAGTTCACTCATTTAATAAATACTGAAATGAGTGCCTGTTACATGCTA----------- GCTAGGTGCT 3070 het 3070 ref 40 38 24 6 N/A 0 0 216866 CASAVA_Build 4 130048355 1D ATTGAAAGTC A/- AGAGTTTCCA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 2 1 216867 CASAVA_Build 4 130059803 1D TCAGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 2642 het 2642 ref 25 15 7 3 A 11 10 216868 CASAVA_Build 4 130060344 1I ACAGAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 13 21 11 A 10 11 216869 CASAVA_Build 4 130064245 1I TCTATATCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 9 10 216870 CASAVA_Build 4 130069440 2D TCCGTCTCGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 A 14 12 216871 CASAVA_Build 4 130072554 1D TTTCTATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2973 hom 25 9 14 2 T 13 12 216872 CASAVA_Build 4 130076722 1D CAGTCTATTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 5 hom 28 1 14 14 T 9 8 216873 CASAVA_Build 4 130090590 1D AGTAAGCTTC T/- TTTGTGACCC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 4 3 216874 CASAVA_Build 4 130103451 1I TCACCCAACT -/A AATCTTGAAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 2 3 216875 CASAVA_Build 4 130130562 1D AAGTGGCAAT A/- AAAAAATCTC 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 A 7 6 216876 CASAVA_Build 4 130144760 2D AAAAATTTTC AA/-- AAGAGTAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 4 2 216877 CASAVA_Build 4 130152189 1I TACCTAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 10 11 216878 CASAVA_Build 4 130156953 2I CAGGCCCCAG --/TA TGTGTTGTTC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 TA 0 1 216879 CASAVA_Build 4 130175176 2D GTTCTAAAGC TA/-- TATATATATA 1691 het 1691 ref 27 16 4 7 TA 10 9 216880 CASAVA_Build 4 130177759 1D ACTTTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1628 het 1628 ref 35 27 5 4 A 12 11 216881 CASAVA_Build 4 130207845 1I TAAACATGAG -/A AAAAAAAAAA 1137 het 1137 ref 36 29 3 4 A 11 12 216882 CASAVA_Build 4 130210109 4I TCCTAAGCAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 TTTA 2 3 216883 CASAVA_Build 4 130225038 1D ATAGTACCAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 A 9 8 216884 CASAVA_Build 4 130234907 1I TTAAAACGTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 T 7 8 216885 CASAVA_Build 4 130239493 1I ACTGTTGGGA -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 14 21 11 G 1 2 216886 CASAVA_Build 4 130240938 1I TGTATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 14 20 18 T 13 14 216887 CASAVA_Build 4 130242663 1D ATTTATGGAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 T 9 8 216888 CASAVA_Build 4 130244177 2I ACATAAAATT --/AC AGTTTCAGGT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 AC 0 1 216889 CASAVA_Build 4 130245364 1I TAAACATCTG -/T TTTCTATTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 3 4 216890 CASAVA_Build 4 130253648 3D TCAAAATAAA AAC/--- AAGATATATT 3070 het 3070 hom 32 10 17 7 AAC 1 0 216891 CASAVA_Build 4 130254204 1D GTCAAGCAGA T/- TCTCTCTTCT 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 T 2 1 216892 CASAVA_Build 4 130254378 2I TTGCCACAGG --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 8 10 216893 CASAVA_Build 4 130271809 1D CGTCACCTCA G/- GACCACTGTG 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 G 2 1 216894 CASAVA_Build 4 130297823 1D ACCTGTCCAG A/- AAAATTAAAA 2249 het 2249 ref 26 13 8 5 A 5 4 216895 CASAVA_Build 4 130304725 1D GATATATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 11 10 216896 CASAVA_Build 4 130304826 7D4M1I GACTCACAGT CAATTAACCTG-/-------TCTGC AGGGCTGGGG 3070 het 3070 hom 29 15 14 3 N/A 0 0 216897 CASAVA_Build 4 130316536 1D TAAAATGATC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 T 8 7 216898 CASAVA_Build 4 130319349 2D TATATAATAC AT/-- ATATATATAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 AT 5 4 216899 CASAVA_Build 4 130331311 2D ATAATCTTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 13 9 7 AT 7 6 216900 CASAVA_Build 4 130342818 6I TCTGAATTTG ------/AAAATT AAAATTACAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AAAATT 1 2 216901 CASAVA_Build 4 130351158 1I ACAATTAAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 15 16 9 T 8 9 216902 CASAVA_Build 4 130351373 1I TCTTAGAAGG -/C CCATAAAAGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 2 3 216903 CASAVA_Build 4 130353493 1D GTTTCTTGAC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 T 8 7 216904 CASAVA_Build 4 130354291 3D TTTTGGTGCT ACA/--- ACATTTAACA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 ACA 2 1 216905 CASAVA_Build 4 130355725 1I TTTATAGCAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 A 8 9 216906 CASAVA_Build 4 130376108 2D TAATCCCCAC AT/-- GTCAAGAGTG 3070 het 3070 hom 55 23 29 3 AT 1 0 216907 CASAVA_Build 4 130378767 2D ATCATTCAGG TT/-- TTTTTTTTTT 2989 het 1601 hom 22 6 10 9 T 13 11 216908 CASAVA_Build 4 130380416 1D GAATGACTTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 9 8 216909 CASAVA_Build 4 130388683 4D ATTATGTAAC AATT/---- AACCATATTT 3070 het 3070 ref 51 26 21 7 AATT 1 0 216910 CASAVA_Build 4 130394383 1I GGTAGATGAG -/A AAAAAGATAC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 A 5 6 216911 CASAVA_Build 4 130394540 66D TTCCCTACAG TTTCTAACTTTCTCAGAGCTAAGAGCAAAGCCTAAGAGCAAAGTTAGAAAGTGTATTTCCCTACAC/------------------------------------------------------------------ TTTCTAACTT 3070 het 3070 ref 34 31 18 7 TTTCTAACTTTCTCAGAGCTAAGAGCAAAGCCTAAGAGCAAAGTTAGAAAGTGTATTTCCCTACAC 1 0 216912 CASAVA_Build 4 130397022 4D AAAAAAGAAA ACAC/---- ACACACACAC 2202 het 1772 hom 28 8 12 10 AC 10 8 216913 CASAVA_Build 4 130400407 1D TAGGAGAAAG A/- AAAGGCAACC 3070 het 3070 ref 36 17 17 4 A 4 3 216914 CASAVA_Build 4 130405784 1I CAAGACTACA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 61 28 26 7 T 7 8 216915 CASAVA_Build 4 130411269 1I TATAAAGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 9 10 216916 CASAVA_Build 4 130414693 1I CCAGTGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 38 1 34 3 T 10 11 216917 CASAVA_Build 4 130416016 12D CTAGGGATGC CCAGATAGCTGG/------------ TGAACATATG 3070 het 3070 ref 44 28 17 5 CCAGATAGCTGG 1 0 216918 CASAVA_Build 4 130416472 3D GTCTATCTCT TCA/--- TCATCATCAT 3070 het 3070 hom 46 16 21 11 TCA 6 5 216919 CASAVA_Build 4 130426138 2I TTGAATAATT --/TA ATTTAATTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 TA 0 1 216920 CASAVA_Build 4 130426941 4D TGCCTACTTA ATGT/---- AATAGTCTCC 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 ATGT 1 0 216921 CASAVA_Build 4 130431505 1I GCAACCCCTG -/C CTTTTCTTTT 2511 het 2511 ref 23 15 7 1 C 1 2 216922 CASAVA_Build 4 130432451 1I GCCTTTTTTT -/C CAAGGTTCTT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 C 1 2 216923 CASAVA_Build 4 130435183 12I AGCCGGCCTG ------------/TTTTATTTTTAA TTTTATGTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 TTTTATTTTTAA 0 1 216924 CASAVA_Build 4 130440288 2I TATTTGAAAT --/AA AAAAAAAAAA 2270 het 2270 ref 28 9 8 11 A 11 13 216925 CASAVA_Build 4 130442181 4I TTTTCAAAAC ----/TGTT TGGTGATTGT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 TGTT 0 1 216926 CASAVA_Build 4 130443192 2D22M2I TTTGTAACTG TATATATATATATACAAGCTGTCT--/--TATATATATATACAAGCTGTCTTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 15 18 9 N/A 0 0 216927 CASAVA_Build 4 130448260 1I CTTACAAGGG -/A AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 A 6 7 216928 CASAVA_Build 4 130451736 8D ACATACTGCT GGCCTGTA/-------- GAAAGACTGT 3070 het 3070 ref 47 26 21 3 GGCCTGTA 1 0 216929 CASAVA_Build 4 130451929 1I GATCTTTGAC -/A GTTTTCACAT 3070 het 3068 hom 27 9 16 2 A 0 1 216930 CASAVA_Build 4 130453618 2I TGTCAGATGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2822 hom 34 12 12 10 T 13 15 216931 CASAVA_Build 4 130463339 5D AAGCAAGGCC AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 53 22 24 12 AAACA 4 3 216932 CASAVA_Build 4 130463523 1I GCAAAAAAAA -/C CACCAAAAAC 3070 het 3070 hom 62 29 25 8 C 1 2 216933 CASAVA_Build 4 130504442 3D TTTAAATTTA CTG/--- CTGCTGGCAG 3070 het 2789 hom 33 8 19 7 CTG 3 2 216934 CASAVA_Build 4 130573104 1D29M2I TATATATACA CCCCCCCCACACACATATATACACATGCAC--/-CCCCCCCACACACATATATACACATGCACTA TATATATATA 3070 het 232 hom 14 1 16 2 N/A 0 0 216935 CASAVA_Build 4 130574217 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2282 hom 23 5 17 1 T 9 8 216936 CASAVA_Build 4 130580959 1I GGTTATATAT -/A ATTTACTAGT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 1 2 216937 CASAVA_Build 4 130585381 1I ATTTCTAAGA -/C CCCCCCAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 C 6 7 216938 CASAVA_Build 4 130588992 1I AATGGAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 16 1 14 1 A 11 12 216939 CASAVA_Build 4 130592021 1D GACTAGACAC T/- TCTCAAAAAA 3070 het 2996 hom 19 8 9 2 T 2 1 216940 CASAVA_Build 4 130592246 4D TGTGGAAGAC TGTG/---- TGGTGATTCC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TG 3 1 216941 CASAVA_Build 4 130592491 3D GAAACAGAAT AAC/--- ATCATGTTCT 3070 hom 60 het 28 0 21 9 AAC 1 0 216942 CASAVA_Build 4 130598995 1D CTTTTATGGC T/- TTTTTTTGGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 7 216943 CASAVA_Build 4 130607328 1D GTCAAGCATC A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 A 7 6 216944 CASAVA_Build 4 130608005 4I AAAGTTTCCG ----/CTTT CTATCATTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CTTT 0 1 216945 CASAVA_Build 4 130619240 4I CTAAATCTAA ----/TTTG TTTGTCTCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTTG 1 2 216946 CASAVA_Build 4 130627004 18D4M96D TTAGAGTAAT TTCACCTATGAAGTGGAAAATTTTACTACACTTCTCACAGTTTTTATGAGGACTAAAAGTTTTCATATATGTAAAATACATAGACGAGTGTCTGGCACACATTAAGTATTAGTACTCA/------------------AATT------------------------------------------------------------------------------------------------ ATAAATAAAG 3070 hom 24 het 11 0 9 7 N/A 0 0 216947 CASAVA_Build 4 130632275 2D TTGAACAAAG AA/-- GATATTTTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 0 216948 CASAVA_Build 4 130639293 16D AATTTTCAGG TTTATTTATTTATTTA/---------------- TTTATTTATT 3070 hom 96 het 35 0 33 6 TTTA 9 5 216949 CASAVA_Build 4 130643895 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 30 het 17 0 11 6 AC 10 9 216950 CASAVA_Build 4 130643955 1D CATAAAAAAT A/- ATGAAATCAT 3032 hom 18 het 8 0 7 1 A 2 1 216951 CASAVA_Build 4 130656130 5D4M6D5M1I TTTTGTTCCG AACCCAGGATGTGACATTTC-/-----AGGA------ACTTCT CCTTCTTCAT 3070 hom 78 het 24 0 26 3 N/A 0 0 216952 CASAVA_Build 4 130659367 1I ATATTTCCTC -/T TTAGTTGCCT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 2 3 216953 CASAVA_Build 4 130676677 1I TGTTAATATC -/A AAAAAATTTC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 6 7 216954 CASAVA_Build 4 130688140 1I CCTACTTGTT -/G GGAGTGTGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 2 3 216955 CASAVA_Build 4 130690233 1D CTAAACACAG A/- TTCATCATCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 0 216956 CASAVA_Build 4 130695481 2I ATAATCGTGG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 9 11 216957 CASAVA_Build 4 130697206 1D TTTGCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1316 het 1316 ref 39 34 3 2 A 11 10 216958 CASAVA_Build 4 130714363 5D CAAAATAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 63 het 22 0 22 4 AAATA 4 3 216959 CASAVA_Build 4 130714499 5D CAGGTCTACC GTAGT/----- GTAGTGCTGA 3070 hom 88 het 33 0 30 5 GTAGT 2 1 216960 CASAVA_Build 4 130753323 1D GGTAAGGGGG A/- AAAAGACCAA 2316 het 2316 ref 24 18 6 1 A 5 4 216961 CASAVA_Build 4 130760550 1I AAACTTTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 8 6 A 10 11 216962 CASAVA_Build 4 130764658 3D ATCTGTGTTA TTC/--- TTTTAGTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 18 3 TTC 1 0 216963 CASAVA_Build 4 130769312 1I TATAGGAATA -/T TAAATTTGTC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 1 2 216964 CASAVA_Build 4 130769667 2I AAAATGAGAG --/TT ATAATTGTGG 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 T 0 2 216965 CASAVA_Build 4 130776126 3I TATAAACTGA ---/AAC AACAAGACAC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 AAC 1 2 216966 CASAVA_Build 4 130797603 1I ACAACATATG -/T CTGGTGAGGC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 0 1 216967 CASAVA_Build 4 130803918 1D TACAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 11 10 216968 CASAVA_Build 4 130835657 1D TAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 386 hom 7 het 3 0 3 0 A 15 14 216969 CASAVA_Build 4 130839465 9D GCTTTGGAGG CAAAAGAGA/--------- CTTTGGGTCC 3070 hom 111 het 41 0 37 6 CAAAAGAGA 1 0 216970 CASAVA_Build 4 130840806 7I AAAAGGCACA -------/ATACAGG ATACAGGATG 3070 hom 114 het 49 0 38 11 ATACAGG 1 2 216971 CASAVA_Build 4 130841229 5D TAGAATAAGT TAAGG/----- TAAGTAACTC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TAAGG 1 0 216972 CASAVA_Build 4 130843639 2D AACTCTGCTC TG/-- TGTTTGAAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TG 2 1 216973 CASAVA_Build 4 130845797 1D AGGGGTGGTT G/- AAAGAATCAG 3070 hom 99 het 40 0 33 8 G 1 0 216974 CASAVA_Build 4 130854637 1D GAATAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 13 12 216975 CASAVA_Build 4 130855378 3D ACAAGATGAT AAG/--- AACACTTTAT 3070 hom 78 het 27 0 27 2 AAG 1 0 216976 CASAVA_Build 4 130856105 1D AAAGAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 12 11 216977 CASAVA_Build 4 130865832 13I GTCCTCCTGG -------------/GGCACAAAAGGAA GGCCACCTGA 3070 hom 129 het 46 0 44 4 GGCACAAAAGGAA 0 1 216978 CASAVA_Build 4 130868324 2I ACACATATTC --/AT ATATATGTTA 3070 hom 129 het 45 0 43 2 AT 3 4 216979 CASAVA_Build 4 130872604 1D52M18D ATGACCACTT AACATTGTTTTCTAAACAGACATTAAAATACACAGAGTTTCAGCTCATTGTAGATATATATATATATATAT/-ACATTGTTTTCTAAACAGACATTAAAATACACAGAGTTTCAGCTCATTGTAG------------------ ATATATATAT 3070 hom 123 het 35 0 42 14 N/A 0 0 216980 CASAVA_Build 4 130873830 2D ACAATGGTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 28 1 19 9 A 13 11 216981 CASAVA_Build 4 130875154 1I CTGGTATTTG -/C AATTAGTGTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 0 1 216982 CASAVA_Build 4 130879183 1I GTCTAGAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 751 hom 36 2 24 10 A 13 14 216983 CASAVA_Build 4 130884662 2I ATTTTATAAT --/AA AAAAGTCATA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 4 6 216984 CASAVA_Build 4 130891133 6D AAATAAAATA AAATGT/------ AAATGTAAAT 3070 hom 126 het 48 0 43 8 AAATGT 2 1 216985 CASAVA_Build 4 130893249 1I GAAGTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 52 het 32 0 27 5 A 9 10 216986 CASAVA_Build 4 130894390 18D TATTATTGTC ATTATTATTATTATTATT/------------------ ATTATTATTA 3070 hom 57 het 31 0 20 14 ATT 12 6 216987 CASAVA_Build 4 130898591 1D AAAGCAGGGC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 9 8 216988 CASAVA_Build 4 130899508 1I TCCTCTCCTA -/C CTTATCCTCA 3070 hom 154 het 60 0 51 9 C 1 2 216989 CASAVA_Build 4 130902491 5I GAATATGCAT -----/ATATG ATATGATATA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 ATATG 1 2 216990 CASAVA_Build 4 130905592 1I ACTCTGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 A 11 12 216991 CASAVA_Build 4 130921385 1I30M3D CAACTTTCAA -TATTCACAATTTGATGAGTTAATTACTAGGTTA/TTATTCACAATTTGATGAGTTAATTACTAGG--- TTATTTGTTA 3070 hom 117 het 34 0 40 2 N/A 0 0 216992 CASAVA_Build 4 130922914 4D GCAATACGGA AGGC/---- AGATTAAATT 3070 hom 63 het 24 0 21 4 AGGC 1 0 216993 CASAVA_Build 4 130929526 2D GCAGGGAAGA CT/-- CTCTGATCCT 3070 hom 105 het 39 0 34 6 CT 3 2 216994 CASAVA_Build 4 130935456 1I AATTACTTAC -/A TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 0 1 216995 CASAVA_Build 4 130936405 1I AAAAAATAAT -/G GAAGTAGTAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 2 216996 CASAVA_Build 4 130948618 4I ATTTCTCAAA ----/TCTC TCTACTACTT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TC 1 3 216997 CASAVA_Build 4 130961037 1I AATCAACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 10 216998 CASAVA_Build 4 130972513 1I ACACACACTG -/A GGGGGGGGGA 3070 het 372 hom 35 1 28 6 A 0 1 216999 CASAVA_Build 4 130979703 1D AACAAAAGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 32 0 27 5 A 12 11 217000 CASAVA_Build 4 130983058 4I ATAGAGAAAT ----/AAAC AAAGGCAGTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AAAC 0 1 217001 CASAVA_Build 4 130994204 1D AGGCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 38 1 28 9 A 12 11 217002 CASAVA_Build 4 131000525 4D AAAGTATAAT AAAG/---- AAAAAAATTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAAG 1 0 217003 CASAVA_Build 4 131000673 1D GTGTGACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 21 0 16 5 A 15 14 217004 CASAVA_Build 4 131002956 1D TTGTTTGTTG T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 6 217005 CASAVA_Build 4 131005486 1I CTTTGTAAAG -/T TTTTCCCTGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 5 217006 CASAVA_Build 4 131007906 1D AATTTAATTA T/- TTTTTAAATA 3070 hom 54 het 21 0 18 4 T 6 5 217007 CASAVA_Build 4 131029823 1I AGAAAAATAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 9 217008 CASAVA_Build 4 131038547 1D ATTTATAAGG A/- AAAGAAGTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 4 3 217009 CASAVA_Build 4 131046075 1I ATAAATATTG -/T TTTTTTATTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 6 7 217010 CASAVA_Build 4 131046483 1D AGCCAATTGT A/- GGGGAACCGT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 1 0 217011 CASAVA_Build 4 131050487 1I TGTAAAAGTT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 7 8 217012 CASAVA_Build 4 131051948 1D AAAAAAAAAA C/- ATCTAAGTTT 3070 het 471 hom 36 2 31 4 C 1 0 217013 CASAVA_Build 4 131053629 4I TACAAAGACA ----/TACT TAGTGTCATT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TACT 0 1 217014 CASAVA_Build 4 131061872 1I TGTTAAATGA -/T ATCAAACAGC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 0 1 217015 CASAVA_Build 4 131063412 1D ATAGGTGCAG A/- AAAAAAACAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 8 7 217016 CASAVA_Build 4 131066815 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 9 217017 CASAVA_Build 4 131075519 1I GGAAAACTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1085 hom 49 4 38 7 T 10 11 217018 CASAVA_Build 4 131078235 3D TTTTTTTAAT GAG/--- TTGTCATAGT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 GAG 1 0 217019 CASAVA_Build 4 131078469 4I GTGAGCTTGA ----/ACTG ACTGCAACAA 3070 hom 154 het 54 0 52 2 ACTG 1 2 217020 CASAVA_Build 4 131078815 1I TGAGCAGTGA -/C CCCCTGCAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 4 5 217021 CASAVA_Build 4 131100886 2I TGTAGCATAG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 T 9 11 217022 CASAVA_Build 4 131102571 1I ATCTGCAAAT -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 6 7 217023 CASAVA_Build 4 131107793 3I TACACCAACC ---/TAA TAATAATAAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 TAA 3 4 217024 CASAVA_Build 4 131109680 2I CTCATTACAT --/AA AACTCTTATT 3070 het 3070 ref 54 28 22 4 A 2 4 217025 CASAVA_Build 4 131114197 1D AGTAGGAAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 13 18 8 T 10 9 217026 CASAVA_Build 4 131116806 1D GGAGGAAAGG A/- AAAAAAAAAG 1002 het 1002 ref 44 32 3 9 A 10 9 217027 CASAVA_Build 4 131134006 6D CAACCTGACC AATCGG/------ CACTCCCCAC 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 AATCGG 1 0 217028 CASAVA_Build 4 131138701 4D GGCAGAACTC AGTT/---- GGTGCCAATA 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 AGTT 1 0 217029 CASAVA_Build 4 131149252 1I TTTCTGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2604 hom 28 7 11 10 A 10 11 217030 CASAVA_Build 4 131152562 1D ATATAAATAA T/- TTTTATACTT 3070 het 1477 hom 16 4 9 3 T 5 4 217031 CASAVA_Build 4 131156137 1D GTCACTAAAC T/- TTTAAAATGA 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 T 4 3 217032 CASAVA_Build 4 131171714 1I GTCATAATGC -/A AATATGCAGG 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 A 2 3 217033 CASAVA_Build 4 131175982 1I AAAAAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 10 11 217034 CASAVA_Build 4 131192748 1I CCTTGCACTT -/C CCGGGTGAGG 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 C 2 3 217035 CASAVA_Build 4 131193109 15D GATTCACAAC GAGGAACTGGGCATG/--------------- GCCCAGTTCC 3070 het 3070 hom 29 13 14 6 GAGGAACTGGGCATG 1 0 217036 CASAVA_Build 4 131194568 1D CATGCACAGT G/- GGGGTTGACT 3070 het 3070 hom 44 14 24 7 G 5 4 217037 CASAVA_Build 4 131202145 1D TCTGTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 12 11 217038 CASAVA_Build 4 131204247 1D TCTTATAAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 10 9 217039 CASAVA_Build 4 131206626 4D GAGACTCCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 1962 hom 23 6 16 1 AAAC 6 5 217040 CASAVA_Build 4 131212009 1I AATTTATGTA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 24 12 12 0 T 7 8 217041 CASAVA_Build 4 131215746 2I AATAAAATTA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 AT 5 6 217042 CASAVA_Build 4 131217605 5I TGAGATTAGC -----/TTCTT TTATTAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTCTT 0 1 217043 CASAVA_Build 4 131223137 4I GTTTCCCATG ----/CTCT CTAATATGTA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 CT 1 3 217044 CASAVA_Build 4 131223511 1D AACATTCAAA T/- GCTTGGACAC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 1 0 217045 CASAVA_Build 4 131224509 3I TTTTAAAGAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 AAC 3 4 217046 CASAVA_Build 4 131232411 11D TTTATGGCCT TGTGTGTGAGG/----------- TGTAGCTTCC 3070 het 3070 ref 35 25 12 2 TGTGTGTGAGG 1 0 217047 CASAVA_Build 4 131233874 6I4M2D3M15I AAAACTTATA ------TCAATGGTT---------------/GTCGACTTAA--GTTATGCGACTTAAAAAC TCAAGTCGCA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 N/A 0 0 217048 CASAVA_Build 4 131238426 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTGGC 1586 het 1586 ref 11 7 4 0 A 5 6 217049 CASAVA_Build 4 131239519 1D TTCTGTGACC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 42 0 34 8 T 9 8 217050 CASAVA_Build 4 131240896 3I ATAGGTTTCA ---/AAT AATAAGACTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AAT 1 2 217051 CASAVA_Build 4 131244228 1D AAATAAAATT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 A 8 7 217052 CASAVA_Build 4 131244905 1I AATAGTAGAA -/T TGAATTTACA 3070 het 3070 ref 54 32 17 5 T 1 2 217053 CASAVA_Build 4 131245219 1D CACTTCTTTT A/- AAAAAAAAAG 1878 het 1878 ref 22 13 4 5 A 10 9 217054 CASAVA_Build 4 131253013 1D AATTAACTCA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 9 8 217055 CASAVA_Build 4 131253409 1I TTTAAAACAC -/T TCTTCTTTTA 2149 het 2149 ref 23 17 5 1 T 1 2 217056 CASAVA_Build 4 131253481 1I AAGATACAAT -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 6 7 217057 CASAVA_Build 4 131254323 1D CAGTCATATG T/- TTGAGAATTT 3070 het 3070 ref 59 29 23 7 T 3 2 217058 CASAVA_Build 4 131257777 1D TTTTAGGAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 32 het 33 1 25 7 T 10 9 217059 CASAVA_Build 4 131260518 7D AATTAAATAT TAAGACC/------- TGAAACTATA 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 TAAGACC 1 0 217060 CASAVA_Build 4 131261469 2I ACATGGACAC --/AT AGTGGGAAAT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 AT 0 1 217061 CASAVA_Build 4 131263391 2D CTCTGTCTCA AC/-- AACAACAACA 2704 het 2704 ref 28 11 9 9 AC 1 0 217062 CASAVA_Build 4 131264280 1D TTTCTTCCTT A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 7 6 217063 CASAVA_Build 4 131268089 1I AAAGGATAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 9 10 217064 CASAVA_Build 4 131270388 1I ATAAAATAGG -/A AACTGTAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 2 3 217065 CASAVA_Build 4 131273746 1I AATTTATCAC -/A AAAAAAAAAA 3012 het 3012 ref 32 13 8 11 A 11 12 217066 CASAVA_Build 4 131277405 1D AACCAACAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 9 8 217067 CASAVA_Build 4 131278881 1D TTTAATACTT G/- AGAAAGGGCT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 G 1 0 217068 CASAVA_Build 4 131280013 1D AATCTAATCT A/- AAAAAATGCC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 7 6 217069 CASAVA_Build 4 131308394 1D TTGATTTATC T/- TTTTCCCATC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 5 4 217070 CASAVA_Build 4 131313620 1D GCACTCTCTA G/- TGTGTGCTTT 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 G 1 0 217071 CASAVA_Build 4 131321033 1D CACCCCATTC T/- TTTTTTTATG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 8 7 217072 CASAVA_Build 4 131322058 1D5M1D ACAGAGTTCG TCTTAGA/-CTTAG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 N/A 0 0 217073 CASAVA_Build 4 131325331 2D TCAGTTACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 13 11 217074 CASAVA_Build 4 131343080 2D ACCAGTCAGT GC/-- ACACTTCCTC 3070 het 3070 ref 38 17 13 9 GC 1 0 217075 CASAVA_Build 4 131351358 1I ACAGGGTCAT -/G GGGTCATGAA 3070 hom 105 het 40 0 33 7 G 3 4 217076 CASAVA_Build 4 131354544 2D GAATCCACAC AT/-- AGAGACATAC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 AT 1 0 217077 CASAVA_Build 4 131358698 1D TATGGTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 27 1 16 10 T 15 14 217078 CASAVA_Build 4 131360431 1I TTGAATGTAT -/A AAATAGTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 3 4 217079 CASAVA_Build 4 131365977 1D CTGGGAATGC G/- TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 34 2 20 12 G 1 0 217080 CASAVA_Build 4 131426275 1I GCTATTAGTA -/G GTAAAGACTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 1 2 217081 CASAVA_Build 4 131437084 1D GACTCAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 10 25 9 A 12 11 217082 CASAVA_Build 4 131440423 4D ATTTATAACC CTAA/---- CTTTCAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CTAA 1 0 217083 CASAVA_Build 4 131451752 1I TTAGGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 463 hom 35 5 24 6 G 0 1 217084 CASAVA_Build 4 131471934 2D GCATGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 GT 6 5 217085 CASAVA_Build 4 131473321 3I AACATGCAAA ---/CCT CCTATCAGAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CCT 1 2 217086 CASAVA_Build 4 131488493 1I CAAATCTCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 8 9 217087 CASAVA_Build 4 131498570 2I ATTTTTACTT --/AA GACAATAAAT 3070 hom 77 het 31 0 26 5 A 0 2 217088 CASAVA_Build 4 131523018 1D CAGCCAGGAA G/- GGGGTTGTAC 3070 het 3070 hom 45 17 17 13 G 5 4 217089 CASAVA_Build 4 131534643 1I CACCAACTAG -/T TTTAGAATCT 3070 hom 157 het 58 0 53 5 T 3 4 217090 CASAVA_Build 4 131537289 4D ATGTCTACTT AAAC/---- AATATCATTA 3070 hom 87 het 30 0 30 1 AAAC 1 0 217091 CASAVA_Build 4 131540207 1D TTATCCATTT G/- TTTTCCCAGA 3070 het 3070 ref 36 20 11 8 G 1 0 217092 CASAVA_Build 4 131546473 1D TAGGAAAGCA C/- CACATTATTA 3070 het 3070 ref 40 21 17 4 C 2 1 217093 CASAVA_Build 4 131547050 1I GATAGGATTG -/T TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 6 7 217094 CASAVA_Build 4 131548204 1I ATTTGCTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 9 10 217095 CASAVA_Build 4 131548504 1I TTTAAGTTGA -/T TTTTGTATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 5 217096 CASAVA_Build 4 131548946 1D TTTAACAATA T/- TAACTCTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 2 1 217097 CASAVA_Build 4 131549529 1I GTTTCAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 10 11 217098 CASAVA_Build 4 131553078 1D CGATAAATTT A/- AAAAAAATCG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 8 7 217099 CASAVA_Build 4 131557213 2D ATTTAAAAAC TT/-- TATTTTACTG 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 3 1 217100 CASAVA_Build 4 131558553 2I ACTCTTGTAA --/TT ACCACATAAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 0 2 217101 CASAVA_Build 4 131562742 1I ATAGGAGGGG -/A AAAAGAAGGA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 4 5 217102 CASAVA_Build 4 131564289 1I GATAAAGGTT -/A AAAAATGTGA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 5 6 217103 CASAVA_Build 4 131565303 1D AAGGACTTAA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 7 217104 CASAVA_Build 4 131586272 3D TGGTAAGATT CAG/--- CACTGAATTC 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 CAG 1 0 217105 CASAVA_Build 4 131591300 2I AGGTGAAAAC --/AG ACTTATAGAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AG 0 1 217106 CASAVA_Build 4 131607782 5D TGAAACTTAG AATTT/----- ATTAATATAT 3070 het 3070 ref 20 12 8 4 AATTT 1 0 217107 CASAVA_Build 4 131612262 1I ATAGATTAGA -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 G 3 4 217108 CASAVA_Build 4 131614712 1I AAAAAAGGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 8 9 217109 CASAVA_Build 4 131618035 4I TATTAAGCTC ----/ATTT ATAATTTGTG 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 ATTT 0 1 217110 CASAVA_Build 4 131619579 2D CTAGATTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 40 het 23 0 14 9 AT 9 8 217111 CASAVA_Build 4 131624549 1I ATAACATCGG -/A AAAAACCCTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 5 6 217112 CASAVA_Build 4 131646573 1D CCAGGTAGGT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 52 21 28 4 A 8 7 217113 CASAVA_Build 4 131650973 2D TTGTTGACTC TT/-- TGATTAAATA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 3 1 217114 CASAVA_Build 4 131652424 1D ATTCATAAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 T 10 9 217115 CASAVA_Build 4 131654897 2D GCCTAATTAT GA/-- GAGTTATTGT 3070 het 3070 hom 47 21 25 2 GA 2 1 217116 CASAVA_Build 4 131666529 1I GAGAGAGAGG -/A AAAAAAAAAT 2499 het 2499 ref 22 13 7 2 A 9 10 217117 CASAVA_Build 4 131673042 1D CCATAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2891 hom 34 10 16 8 A 13 12 217118 CASAVA_Build 4 131679254 1D TGAGAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 A 11 10 217119 CASAVA_Build 4 131683483 3D AGCATTGAGG TAC/--- TACTTCTGAC 3070 het 3070 ref 33 16 16 2 TAC 2 1 217120 CASAVA_Build 4 131687919 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 A 8 9 217121 CASAVA_Build 4 131704635 1D CCTGACAGAC G/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 G 6 5 217122 CASAVA_Build 4 131729521 7D AATTACTCTT TACAAAA/------- TACTATTTTG 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 TACAAAA 1 0 217123 CASAVA_Build 4 131742325 1I GACGACTTGT -/C CGGAATTCAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 1 2 217124 CASAVA_Build 4 131745035 4D ATTTACATAC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 ATTT 6 5 217125 CASAVA_Build 4 131751597 4D ATCCCTTGGA ATTT/---- ATTAACCCCA 3070 het 2372 hom 22 5 16 3 ATTT 1 0 217126 CASAVA_Build 4 131757789 1D CATGGTGAAA C/- CCCCTCTCTA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 5 4 217127 CASAVA_Build 4 131772042 4I TCATATTATA ----/AAAT AAATACTCAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAAT 1 2 217128 CASAVA_Build 4 131798366 1I TAAGCATATG -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 6 7 217129 CASAVA_Build 4 131803594 1I TGTATTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 12 13 217130 CASAVA_Build 4 131806023 1I CTGTCTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 9 10 217131 CASAVA_Build 4 131808533 1I ACATACACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 T 11 12 217132 CASAVA_Build 4 131815055 1D TTATTTATAT C/- CCTTTCAATA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 C 3 2 217133 CASAVA_Build 4 131815875 1D AAGAGAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 10 9 217134 CASAVA_Build 4 131816627 2D ATTAATAAAA AC/-- AGAGAAGGTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AC 1 0 217135 CASAVA_Build 4 131817248 1I TAAGTGCTCC -/T TTTTTGGAGA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 T 5 6 217136 CASAVA_Build 4 131817627 2D TCCCCCTTCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 48 23 23 3 CT 6 5 217137 CASAVA_Build 4 131819609 2I GCTCAAAACA --/TT GTTATTCATC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 2 217138 CASAVA_Build 4 131821840 2D AGGCTTGTCA CT/-- CTGTCAGTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 2 1 217139 CASAVA_Build 4 131822112 5D ATGTCTTATA TAATG/----- TAAGAGGGAG 3070 het 3070 hom 34 15 18 4 TAATG 1 0 217140 CASAVA_Build 4 131827825 1D GATCAGAGAA G/- GAGGAGAGAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 2 1 217141 CASAVA_Build 4 131828312 1D ATCTTCCTTC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 8 7 217142 CASAVA_Build 4 131835351 1D TCCAAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 12 11 217143 CASAVA_Build 4 131836155 2D CCACTTCTTA TC/-- TCTTCCATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 7 TC 2 1 217144 CASAVA_Build 4 131836441 1I GTAACACTGT -/G ATAATGGTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 217145 CASAVA_Build 4 131836821 19D TTTGCATTTC TAAATGTTTGTTGAATCAA/------------------- TAAAATCAGA 3070 hom 81 het 26 0 28 5 TAAATGTTTGTTGAATCAA 1 0 217146 CASAVA_Build 4 131837599 3D TAATAGTAAA AAT/--- AATATTTTTA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AAT 2 1 217147 CASAVA_Build 4 131838217 3D ATACTACTAA TAC/--- TACTAATACT 1992 hom 15 het 9 0 5 5 TAC 2 1 217148 CASAVA_Build 4 131838779 5I TTTCCAAAAC -----/CTGAT TATTATTGTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 CTGAT 0 1 217149 CASAVA_Build 4 131843416 2I AATCTGCAAA --/AG AGTCATTAGC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AG 1 2 217150 CASAVA_Build 4 131850554 1I AGACATATTA -/C CTCTTGAAAG 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 C 1 2 217151 CASAVA_Build 4 131850857 4I AATAGGAAAT ----/AGAA AGAGATCTAC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 AGAA 0 1 217152 CASAVA_Build 4 131851671 1I AAAAAAAAAA -/T AAGCCACTTT 2810 het 1924 hom 19 7 9 4 T 0 1 217153 CASAVA_Build 4 131852925 1I AACTTTCTCA -/T GTCTAATTCT 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 T 0 1 217154 CASAVA_Build 4 131881508 1I AAATTTTAAG -/T TTTTTTTTAC 2144 het 1873 hom 16 6 7 3 T 8 9 217155 CASAVA_Build 4 131885470 2D TGGTTTATTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 11 9 217156 CASAVA_Build 4 131888296 1D TAACAGTGAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 7 217157 CASAVA_Build 4 131890648 3I TTAAGGAAAT ---/AAA AAAGTTTCAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 3 6 217158 CASAVA_Build 4 131913965 1D ATTAAGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 110 hom 37 1 30 7 A 11 10 217159 CASAVA_Build 4 131914119 1I ATGTAGGGAT -/G GGTGGTAATG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 2 3 217160 CASAVA_Build 4 131915320 1I GTATACTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2009 hom 37 6 22 9 A 13 14 217161 CASAVA_Build 4 131925460 3D TGCACATTTG GTC/--- GTCACTGAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GTC 2 1 217162 CASAVA_Build 4 131929948 1D AACATGAGAT A/- CTTATTTAAT 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 A 1 0 217163 CASAVA_Build 4 131935191 1D TTTGCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 25 9 A 12 11 217164 CASAVA_Build 4 131935203 1D AAAAAAAAAA C/- TAGCGATAAA 3070 hom 40 het 32 1 24 7 C 1 0 217165 CASAVA_Build 4 131935498 2I TATATATAGT --/TA TATATATATA 2361 hom 15 het 6 0 6 0 TA 5 6 217166 CASAVA_Build 4 131936190 1D TGTATTTCGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 42 0 33 10 T 9 8 217167 CASAVA_Build 4 131937029 1I ATCATTTATC -/T TTTAACTTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 3 4 217168 CASAVA_Build 4 131940301 4D TTTCTGTTCC TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 69 het 31 0 24 10 TATT 5 4 217169 CASAVA_Build 4 131957495 1I TCCTTCTCAA -/T TTTTTTGGGA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 6 7 217170 CASAVA_Build 4 131973324 1I CAAGGATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 482 hom 35 1 23 11 A 12 13 217171 CASAVA_Build 4 131997963 1I GAAACTACCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3068 hom 35 8 16 11 T 9 10 217172 CASAVA_Build 4 131999369 1I TGAATAGATA -/T TTTTTCTGAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 5 6 217173 CASAVA_Build 4 132000690 1D AATGTGATAG A/- AAAAAAAAAA 1368 het 1368 ref 29 20 4 6 A 13 12 217174 CASAVA_Build 4 132001835 5I TAATAATTAA -----/TGAAT TATGTTGAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TGAAT 0 1 217175 CASAVA_Build 4 132001979 1I TACAATGTCC -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 103 het 42 0 35 7 T 6 7 217176 CASAVA_Build 4 132008127 1D TAGGTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 36 0 33 3 T 11 10 217177 CASAVA_Build 4 132017003 3I GGTTAATTTA ---/CAC TAAAGGTATA 3070 hom 48 het 26 0 17 9 CAC 0 1 217178 CASAVA_Build 4 132017050 2D CACGTTTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 2042 hom 20 het 17 0 7 10 A 16 14 217179 CASAVA_Build 4 132019295 14D AATATATTAC ATATTACATATTAT/-------------- ATATTATGTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 ATATTACATATTAT 1 0 217180 CASAVA_Build 4 132019433 5D TATATAATAT ATATG/----- ATATGTTACA 3070 hom 24 het 10 0 8 3 ATATG 2 1 217181 CASAVA_Build 4 132019717 2I GCCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 11 13 217182 CASAVA_Build 4 132020349 1D TGCTATAACC A/- GTTGCATATG 3070 hom 86 het 35 0 29 6 A 1 0 217183 CASAVA_Build 4 132021798 4D ATATAATAAT AAAG/---- AAATGTCTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAAG 1 0 217184 CASAVA_Build 4 132031768 1I AAAATAGAGA -/G GGGATTTGAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 3 4 217185 CASAVA_Build 4 132042699 2I CATGCACACT --/TA TATATATATA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TA 7 8 217186 CASAVA_Build 4 132046926 4D TTTTAAATTA ATTT/---- GTTTATATAT 3070 hom 38 het 14 0 13 2 ATTT 1 0 217187 CASAVA_Build 4 132048130 1I AAGTTACATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 9 10 217188 CASAVA_Build 4 132067275 2I CATTAATTTG --/AA AAGAGACCTT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 A 2 4 217189 CASAVA_Build 4 132067641 5D TTACTAGTTG AATAA/----- AATAAGTTAG 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 AATAA 2 1 217190 CASAVA_Build 4 132067910 48I TACTAAAATC ------------------------------------------------/AAGGCATCAGTGGGGTTGGAGTCCTTTATGGAGGCTTTCTGGAAAAAA AAATTTCTTA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 AAGGCATCAGTGGGGTTGGAGTCCTTTATGGAGGCTTTCTGGAAAAAA 0 1 217191 CASAVA_Build 4 132068234 5D TTAGACTTTC CTTTG/----- TTTATTTAGT 2673 het 2673 ref 24 10 7 7 CTTTG 1 0 217192 CASAVA_Build 4 132068417 1I CCTTTTTAGG -/T TTTTTTTACT 2276 het 1899 hom 12 5 6 1 T 7 8 217193 CASAVA_Build 4 132068505 1D TCCTTGGATG T/- TTTTGCAATA 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 T 5 4 217194 CASAVA_Build 4 132073745 1D AAAGAGGGAA G/- CTGCTAATCA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 G 1 0 217195 CASAVA_Build 4 132075301 1D TCTGAAAAAG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 2656 hom 21 7 10 4 T 9 8 217196 CASAVA_Build 4 132078767 1I TTCTAAGCGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 11 12 7 T 9 10 217197 CASAVA_Build 4 132079490 1D TGTTTTACTT G/- TTTTCTGGTG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 G 1 0 217198 CASAVA_Build 4 132083410 1D CAGTTTTCGT A/- ATTAAGAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 2 1 217199 CASAVA_Build 4 132090017 1D TAAAATATCA C/- CTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 C 2 1 217200 CASAVA_Build 4 132090934 1I CAAACAATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 T 9 10 217201 CASAVA_Build 4 132107755 1I CTGTCTCAAT -/A AAAAAAAATA 1923 het 1923 ref 19 10 5 4 A 8 9 217202 CASAVA_Build 4 132116267 1I ATGTTTCCCG -/T TTTTTATATA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 T 5 6 217203 CASAVA_Build 4 132121335 1D CTAAGAAAAT A/- AAAGAGCATT 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 A 4 3 217204 CASAVA_Build 4 132126794 1I TGCTTGAGAA -/T TTTTTCCTTC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 5 6 217205 CASAVA_Build 4 132153359 3D ATGCATTTTC ATA/--- ATACTTCTTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 ATA 2 1 217206 CASAVA_Build 4 132218074 1D ACTAATTATA C/- TGAAAATACA 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 C 1 0 217207 CASAVA_Build 4 132219833 1I CAGACTTACC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 8 9 217208 CASAVA_Build 4 132250319 1I CTGGTCAATA -/G GTACAAATTT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 G 1 2 217209 CASAVA_Build 4 132252428 4D TCTTGTTCTC TTGA/---- TTATTTTTCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTGA 1 0 217210 CASAVA_Build 4 132256231 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1368 hom 37 4 22 11 A 15 16 217211 CASAVA_Build 4 132260030 1I TTTAAAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 32 2 24 6 T 13 14 217212 CASAVA_Build 4 132268501 27D AATCTAATAG AATTTGATTTGAGTCAACTCAAATTCC/--------------------------- AATTTGATTT 3070 hom 54 het 35 0 19 20 AATTTGATTTGAGTCAACTCAAATTCC 2 1 217213 CASAVA_Build 4 132275200 2I AAATATGAAC --/AA AAATTAGGAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 3 5 217214 CASAVA_Build 4 132278983 2I AATGAAAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 13 15 217215 CASAVA_Build 4 132279902 4I AGAAAGACAC ----/AAAT AAATAAAATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAAT 1 2 217216 CASAVA_Build 4 132282854 1D TTTTTGGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 9 217217 CASAVA_Build 4 132291861 2I CTTTATAAAT --/TG TGTTTATTAA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TG 1 2 217218 CASAVA_Build 4 132292613 1I TTTAAGTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 9 10 217219 CASAVA_Build 4 132293962 1D TAATACAGTA T/- AACAATGATT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 0 217220 CASAVA_Build 4 132294447 2D GGGCTGAAAC AT/-- ATATATTAAT 3070 hom 102 het 36 0 34 3 AT 4 3 217221 CASAVA_Build 4 132295422 4I AAGCAAAATA ----/AAAT AAATAATAAA 3070 hom 38 het 16 0 13 3 AAAT 1 2 217222 CASAVA_Build 4 132295563 1D AGGGAGAGTG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 8 217223 CASAVA_Build 4 132295995 1D AAGTCATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 617 hom 25 2 17 7 A 15 14 217224 CASAVA_Build 4 132300586 4I TAATTTACTT ----/AATC AGGATCAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AATC 0 1 217225 CASAVA_Build 4 132329095 1D ATGTGGAACC A/- AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 32 12 6 15 A 19 18 217226 CASAVA_Build 4 132338755 1D ATGGTTATGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 10 9 217227 CASAVA_Build 4 132367948 1D GAAAGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1997 hom 37 5 20 12 T 17 16 217228 CASAVA_Build 4 132385528 2D TTAGTTTATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 TA 6 5 217229 CASAVA_Build 4 132398310 6D TGTTTATCTT AGCTCA/------ CATTTTAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 AGCTCA 1 0 217230 CASAVA_Build 4 132419037 4D TTAACTCGTT TGAC/---- TGACTGACTA 3070 het 3070 hom 48 20 24 6 TGAC 3 2 217231 CASAVA_Build 4 132430245 1I GAGAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 2764 het 2517 hom 31 8 9 14 A 15 16 217232 CASAVA_Build 4 132447035 1D AAACTACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 12 11 217233 CASAVA_Build 4 132464525 1I CCCCCTTGTT -/G TGTGCAGCCT 2100 het 2100 ref 26 8 6 12 G 0 1 217234 CASAVA_Build 4 132486876 2I GCAAAGCTTA --/TT TTTAGAGAGT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 3 5 217235 CASAVA_Build 4 132489449 2I TATTTATTTA --/TT TTTTTTTTTG 2634 het 778 hom 16 2 8 6 T 9 11 217236 CASAVA_Build 4 132489971 4I ATAATATTAA ----/TTGT TTAAGTATAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TTGT 0 1 217237 CASAVA_Build 4 132492922 1I AACTGAGTTC -/T TGTTAATTTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 1 2 217238 CASAVA_Build 4 132510040 2I ATACACACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 AC 7 8 217239 CASAVA_Build 4 132524565 2D GCAGATTCTC TG/-- AGAGATTTTC 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 TG 1 0 217240 CASAVA_Build 4 132537127 22D AATTTATATT TATATATCTGTAGATAGATATA/---------------------- TATATATCTG 3070 het 3070 ref 20 12 9 4 TATATATCTGTAGATAGATATA 1 0 217241 CASAVA_Build 4 132538260 1D AATCACTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2413 hom 27 6 12 9 T 12 11 217242 CASAVA_Build 4 132551921 2D TGACAATAAC AG/-- ATGATTAATA 3070 het 3070 ref 24 14 7 3 AG 1 0 217243 CASAVA_Build 4 132567001 1I AAAGGAGGAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 7 8 217244 CASAVA_Build 4 132570908 2I AATTAAGCAC --/TT TTGTTGTGAT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 T 2 4 217245 CASAVA_Build 4 132576000 1D TTTTTAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 11 10 217246 CASAVA_Build 4 132585536 1I TGCCCCTGCC -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 6 7 217247 CASAVA_Build 4 132632460 6I CTAAATGTCA ------/CTGAAG CTGAAGCAGC 2339 het 2339 ref 27 19 6 2 CTGAAG 1 2 217248 CASAVA_Build 4 132639200 1D GAAAATACAG A/- AAACAATAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 4 3 217249 CASAVA_Build 4 132650990 5D TCCTCTTGTA TTTAC/----- TTTACTTGTA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 TTTAC 2 1 217250 CASAVA_Build 4 132658107 9D ACGATAATAA CTTTTATAT/--------- CTTGCCTTAC 3070 het 3070 ref 34 27 9 5 CTTTTATAT 1 0 217251 CASAVA_Build 4 132658663 5I AAAAAAGAAA -----/AAGAT AAGAGTGGTT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 AAGAT 0 1 217252 CASAVA_Build 4 132662771 1I ACTATTTTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 8 9 217253 CASAVA_Build 4 132663685 3D AACCTTTATA TAT/--- TATTATGATC 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 TAT 3 2 217254 CASAVA_Build 4 132674009 1D TGGAGGGTTC T/- TTTTTTTTTT 1156 het 1156 ref 51 38 4 9 T 11 10 217255 CASAVA_Build 4 132681366 1I TTTGAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 12 13 217256 CASAVA_Build 4 132682407 1D AGTGAGTTAG A/- AAATGCCTGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 4 3 217257 CASAVA_Build 4 132686811 1D CTAAATAAGG T/- TTTTCCCATG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 5 4 217258 CASAVA_Build 4 132691420 1I TTTTTCAGAA -/G CTACATATAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 G 0 1 217259 CASAVA_Build 4 132697151 1I AGCAAATACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 9 10 217260 CASAVA_Build 4 132731138 1D ATCCTATCTT A/- AAAAAAAAAA 2405 het 287 hom 22 5 10 7 A 17 16 217261 CASAVA_Build 4 132740623 1I AGTAATAAAG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 7 8 217262 CASAVA_Build 4 132742282 1D ATTGTAAATC T/- TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 35 9 8 18 T 17 16 217263 CASAVA_Build 4 132743051 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 444 het 444 ref 21 6 3 12 T 1 0 217264 CASAVA_Build 4 132744022 1D ATTTATTGGC T/- TTTAAATATC 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 T 4 3 217265 CASAVA_Build 4 132758186 6D TCCATTCATG TGTTTA/------ TGTTTATCAC 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 TGTTTA 2 1 217266 CASAVA_Build 4 132758947 1I AGTTTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 10 11 217267 CASAVA_Build 4 132766915 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2156 het 2156 ref 28 14 6 8 A 12 11 217268 CASAVA_Build 4 132770682 1I ACAGTATAAT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 A 8 9 217269 CASAVA_Build 4 132771904 2D TATTAGCATG TA/-- TATAATTGCA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 TA 3 2 217270 CASAVA_Build 4 132777744 1I ATAGAGAAAC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 7 8 217271 CASAVA_Build 4 132778476 25I CAAAGAAAAG -------------------------/CTGAGGGATTTCATCAACACTAGAC CTGTTCTGCA 2609 het 2609 ref 26 17 6 4 CTGAGGGATTTCATCAACACTAGAC 0 1 217272 CASAVA_Build 4 132779281 1I CAAAAACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 10 11 217273 CASAVA_Build 4 132782348 1D ATCATCAGAG A/- AATGCAAATC 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 3 2 217274 CASAVA_Build 4 132790423 6I AGATATAGAT ------/ATATAG ATATAGATAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 ATATAG 2 3 217275 CASAVA_Build 4 132797689 1D GTGATCCTAT A/- TTTTTACATC 3070 het 3070 hom 62 28 32 2 A 1 0 217276 CASAVA_Build 4 132798014 1I TTTTGCTTCA -/C TTTTTTTCTG 2360 het 2360 ref 44 36 6 2 C 0 1 217277 CASAVA_Build 4 132798125 1D GATACAAGTG T/- TAAGTTATTG 3070 het 3070 ref 56 27 25 5 T 2 1 217278 CASAVA_Build 4 132799679 5I TTTATGTCAC -----/TTATA TTTAATGTAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TTATA 0 1 217279 CASAVA_Build 4 132799771 1I TCAGTTTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 9 10 217280 CASAVA_Build 4 132800950 1D ATATATATAT A/- TATATATATG 3070 het 3070 hom 34 9 23 4 A 1 0 217281 CASAVA_Build 4 132801238 1D GCTCTATAGC A/- TGGTCGCATG 3070 het 3070 ref 62 39 17 6 A 1 0 217282 CASAVA_Build 4 132803546 1D TGAAGAACAT C/- TCTCTGTCAA 3070 het 3070 ref 68 54 11 3 C 1 0 217283 CASAVA_Build 4 132804580 1D TTTCTTTTCA T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 98 33 58 7 T 7 6 217284 CASAVA_Build 4 132805006 1D GCTAGCACTC T/- TCGGATACTT 3070 het 3070 ref 65 35 24 6 T 2 1 217285 CASAVA_Build 4 132805626 1I TATCTCATAA -/C ATCATCCACC 3070 het 3070 ref 83 46 26 11 C 0 1 217286 CASAVA_Build 4 132805869 3D TGGTTGAGAA CAC/--- AGACTGAGAC 3070 het 3070 ref 78 48 26 6 CAC 1 0 217287 CASAVA_Build 4 132808606 2D AACTTAAAAC TT/-- AAAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 2 0 217288 CASAVA_Build 4 132808862 6D GCCCACAATT TCACCC/------ CTTACCACAA 1995 het 1995 ref 32 26 5 1 TCACCC 1 0 217289 CASAVA_Build 4 132809441 6I CACTGATGCA ------/CTGATG CGTGACAATG 3070 het 3070 ref 65 36 26 3 CTGATG 0 1 217290 CASAVA_Build 4 132809587 1D TATTCTCCAC T/- TTACCATGTA 3070 het 3070 ref 77 57 11 10 T 3 2 217291 CASAVA_Build 4 132809741 1D CAAGAAGTCA G/- GGGGTCAATG 2940 het 2940 ref 27 16 7 5 G 5 4 217292 CASAVA_Build 4 132811931 3D TCAAACTAAC TCT/--- TCTTCTGTTT 3070 het 3070 ref 73 37 25 13 TCT 3 2 217293 CASAVA_Build 4 132814691 3I GCTACCTTTG ---/TTT TTTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 66 33 22 11 T 3 6 217294 CASAVA_Build 4 132815128 3D AAAAGAGCAA CAG/--- TAACAAGTAC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 CAG 1 0 217295 CASAVA_Build 4 132818828 4I TGTACAACTT ----/TTTA TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 43 28 10 5 TTTA 0 1 217296 CASAVA_Build 4 132820327 1D CTTCATTAAC T/- TTTTCACTGC 3070 het 3070 ref 37 28 8 1 T 5 4 217297 CASAVA_Build 4 132820612 4D TAATTTAAAT ATTA/---- ATTAGTTATG 3070 het 2674 hom 17 6 10 2 ATTA 2 1 217298 CASAVA_Build 4 132820694 1D AATGCAATAG A/- AAAAAAAAAA 1951 het 1951 ref 19 10 5 4 A 11 10 217299 CASAVA_Build 4 132824530 2I GCAGGGCACT --/GG TGTAGATGGG 3070 het 3070 ref 63 36 13 14 G 0 2 217300 CASAVA_Build 4 132824604 1I TTATGGGGGG -/T CACACTGCAT 3070 het 3070 hom 94 38 49 7 T 0 1 217301 CASAVA_Build 4 132824867 3D AATACAGGAC ATA/--- ATAATATGCT 3070 het 231 hom 25 1 21 3 ATA 3 2 217302 CASAVA_Build 4 132825340 1I TGAATTAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 412 hom 30 1 27 2 T 9 10 217303 CASAVA_Build 4 132826815 4I TTGACTGTCT ----/TAAA TAAAGTTTCC 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 TAAA 1 2 217304 CASAVA_Build 4 132828882 1D ATAATACAAT G/- TACGTACAGT 1703 het 1703 ref 87 75 4 8 G 1 0 217305 CASAVA_Build 4 132832398 4D AAGCCCCATC CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 125 hom 65 3 26 39 CAAA 5 4 217306 CASAVA_Build 4 132833018 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1064 hom 44 5 29 10 A 13 12 217307 CASAVA_Build 4 132833139 1I TAAGCTGAGG -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 72 46 16 10 A 6 7 217308 CASAVA_Build 4 132834046 4I TGGTGTTGAG ----/TGCC TGCAGCTTTT 3070 hom 97 het 42 0 23 19 TGCC 0 1 217309 CASAVA_Build 4 132834190 5D CATCTTCCTT CTGCA/----- CTGCCCTAGC 3070 het 3070 ref 69 39 22 10 CTGCA 1 0 217310 CASAVA_Build 4 132835014 1D GAAGTTTTTT G/- TTTCATTGCA 2776 het 2776 ref 62 47 6 9 G 1 0 217311 CASAVA_Build 4 132835436 1D ATATTGTCTC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 T 8 7 217312 CASAVA_Build 4 132835925 1D GCTGGTAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 26 11 11 T 10 9 217313 CASAVA_Build 4 132836302 4D TGTAATGTCC TTTA/---- TTGTCTGTTT 1804 het 1804 ref 67 58 5 5 TTTA 1 0 217314 CASAVA_Build 4 132837426 6I GTGCTGGGAT ------/TACAGG TACAGGCGTG 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 TACAGG 1 2 217315 CASAVA_Build 4 132841707 3I AAAAAGTCTG ---/ACA ACACCTCCAT 3070 het 3070 ref 65 36 23 6 ACA 1 2 217316 CASAVA_Build 4 132842456 1D CCCAGGGGGA G/- GGACTCAGGG 3070 het 3070 hom 46 18 18 10 G 3 2 217317 CASAVA_Build 4 132842614 1D TGCTGTTTTT G/- TTCTCCATGG 3070 het 3070 ref 41 16 16 10 G 1 0 217318 CASAVA_Build 4 132843707 1D GTTAAAAAAT A/- GTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 19 11 7 1 A 1 0 217319 CASAVA_Build 4 132843858 1D TTTAAAATTG T/- TATGTATTTG 2722 het 2722 ref 24 15 7 2 T 2 1 217320 CASAVA_Build 4 132843986 2D TCTTTACAAC TT/-- TTTTTTTATT 3028 het 3028 ref 22 10 8 4 T 9 7 217321 CASAVA_Build 4 132844995 1I GTGAATGTAA -/G AATGTTTAAT 3070 hom 256 het 88 0 86 2 G 0 1 217322 CASAVA_Build 4 132845286 13D TGACCTCATT ATTGAATAAATTG/------------- ATTGAATAAA 3070 het 3070 ref 76 33 42 6 ATTGAATAAATTG 2 1 217323 CASAVA_Build 4 132845356 1D TTCCACAGAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 66 26 32 9 T 8 7 217324 CASAVA_Build 4 132845488 1D AAATTAATGC A/- AAAATGTGGA 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 A 5 4 217325 CASAVA_Build 4 132845620 1D ATTTGTTTTG T/- AAGATCCTCG 3070 het 3070 hom 41 11 25 5 T 1 0 217326 CASAVA_Build 4 132846380 1I45M3D AAACGAAAGC -TATGTAAAAAGTGTGATCATTCGGCTTTAATTTTCAAAATATGATAAC/TTATGTAAAAAGTGTGATTATTAGGCTTTAATTTTTAAAATATGAT--- AATAAAATAA 2317 het 2317 ref 40 49 5 8 N/A 0 0 217327 CASAVA_Build 4 132846842 2I ATTGTACTGT --/AA AGTGTGTAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 1 3 217328 CASAVA_Build 4 132847345 2I CGCCGTGCGC --/AG AGTTTCATAA 3070 het 3070 ref 50 36 10 4 AG 1 2 217329 CASAVA_Build 4 132848284 6D GCTTCAACTG AAAGTC/------ AGTAGCTGCA 3070 het 3070 ref 61 39 18 7 AAAGTC 1 0 217330 CASAVA_Build 4 132849786 4D AAATTATAAA ACTT/---- ACTAAAGTAA 2202 het 2202 ref 46 36 7 3 ACTT 1 0 217331 CASAVA_Build 4 132850308 1I CTCTCTTCTC -/A GTTTCTTGTC 2726 het 2726 ref 31 21 6 4 A 0 1 217332 CASAVA_Build 4 132852471 1D CATGATAATA T/- TAATATGCTG 2908 het 2908 ref 28 20 6 2 T 2 1 217333 CASAVA_Build 4 132853397 1I CAGAGTGACT -/G TCTGCCTCTC 3070 het 3070 hom 81 33 35 13 G 0 1 217334 CASAVA_Build 4 132854781 4I TTTCTCTTAA ----/TTTC TTTCTTACAG 3070 het 3070 hom 51 26 23 2 TTTC 1 2 217335 CASAVA_Build 4 132855335 1D CTAGGAATAT A/- AAAAAATAGG 3070 het 3070 ref 42 32 8 9 A 7 6 217336 CASAVA_Build 4 132855606 1D TCAATAAGAG T/- TTCAAACTGA 3070 het 3070 ref 73 39 22 13 T 3 2 217337 CASAVA_Build 4 132856921 1I ACAAGATTTT -/A AAAAAATATA 2671 het 2671 ref 16 9 7 0 A 6 7 217338 CASAVA_Build 4 132857390 1D AAGTGCATAT A/- AAAAATTGTA 3070 het 3070 ref 37 23 8 6 A 6 5 217339 CASAVA_Build 4 132858384 4D43M1D GAGCTGGAGA CAATCAATCACATTTATTTTTCATCTCCTTAATATTGATATATAAAAG/----AAATCACATTTATTTTTTGTCTCCTTAATATTGATATATAAAA- TCAGGTTAAA 3070 het 3070 ref 43 42 13 11 N/A 0 0 217340 CASAVA_Build 4 132858942 1D TTCAATTGTC T/- TTTTTTTTGC 1366 het 1366 ref 40 31 4 5 T 9 8 217341 CASAVA_Build 4 132860645 1I27M2I AATATATCAT -AAAATTGAATTATTCTATAAATAGTAT--/AAAAATTGAATTATTCTATAAATAGTATTA TGTCTGTATT 3070 het 3070 ref 36 34 7 1 N/A 0 0 217342 CASAVA_Build 4 132861989 7D AAAAAAAAAA CAAAAAC/------- CTCCCAAGAT 2353 het 2353 ref 28 19 8 6 CAAAAAC 1 0 217343 CASAVA_Build 4 132907728 2I TAAAGATGAA --/AC AGTGTTTTTC 2219 het 2219 ref 33 27 5 1 AC 0 1 217344 CASAVA_Build 4 132909246 17D45M1D CATCTAATAA ATCAATCCTATCTATCTATCTATCTATCTAAATAATTCAACAATATGAAGTAGATTAAAAAAC/-----------------ATCTATCTATCTAAATAATTCAATAATATGCAGTAGATTAAAAAA- ACAACTTTAT 3070 het 3070 ref 48 44 10 14 N/A 0 0 217345 CASAVA_Build 4 132910236 3D TATGACTTGT ATA/--- ATAACATCCA 1013 het 1013 ref 27 18 3 8 ATA 2 1 217346 CASAVA_Build 4 132910465 1D AAAGTAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 66 37 26 3 A 11 10 217347 CASAVA_Build 4 132911085 2I TAAGGACCAA --/AC ATGTATACAG 3070 het 3070 hom 57 28 28 1 AC 0 1 217348 CASAVA_Build 4 132915656 4D9M1I34M4D TCTATTTTTC TCATTATTATTTA-TTTATCCCAAATCTTTTATCTGTGATCATTTTCCTTTG/----CATTATTTATTTTATCCAAAATCTTTTATCTGTGATCATTTTCC---- TTTGAAATTT 3070 het 3070 ref 37 41 10 13 N/A 0 0 217349 CASAVA_Build 4 132918731 1I CAAAATAATA -/G CTGAAGAATT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 G 0 1 217350 CASAVA_Build 4 132929962 1I TTCAACTAAT -/A AGATTATTAG 1876 het 1876 ref 29 19 4 6 A 1 2 217351 CASAVA_Build 4 132930338 1I ATAATCTGAG -/A ATAAAAAAAA 3027 het 3027 ref 55 36 7 12 A 1 2 217352 CASAVA_Build 4 132933314 17I GACTGCTAAA -----------------/AAAACAAACAAACAAAC AAAAAAAAAA 3070 het 1314 hom 35 13 15 7 AAAACAAACAAACAAAC 0 1 217353 CASAVA_Build 4 132935233 2I AATATTTCAC --/AG GGTTTGACTC 3070 het 3070 ref 53 36 14 3 AG 0 1 217354 CASAVA_Build 4 132936328 1I AGTAAAAAAA -/G AATAGAGGGA 2271 het 2271 ref 53 40 5 8 G 0 1 217355 CASAVA_Build 4 132937669 3D TTCTATTAGT TAA/--- TAATTCTACA 3056 het 3056 ref 40 30 7 7 TAA 2 1 217356 CASAVA_Build 4 132938385 2I TTTCATAGAC --/TG TGTCATTAAT 3070 het 3070 ref 43 30 8 5 TG 1 2 217357 CASAVA_Build 4 132940634 2D AGTGGAGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 12 5 A 12 10 217358 CASAVA_Build 4 132941331 3I ATTTTACACA ---/TAT TATGAAAATA 3070 het 3070 ref 38 27 10 1 TAT 1 2 217359 CASAVA_Build 4 132942257 1D GAAGTACTGT A/- AATAATTATA 3070 het 3070 ref 34 23 7 5 A 3 2 217360 CASAVA_Build 4 132944117 1D TGTACTGAGT G/- GAAAAAAATG 1472 het 1472 ref 47 37 4 8 G 2 1 217361 CASAVA_Build 4 132944589 2I ATTCTCCTGC --/CT ATCAGCCTCC 778 het 778 ref 24 21 2 2 CT 0 1 217362 CASAVA_Build 4 132944687 3D TTGGTCAGGC TGG/--- TGGTCTCCAA 3070 het 3070 ref 49 31 14 6 TGG 2 1 217363 CASAVA_Build 4 132945019 1D ATAAGCACCT A/- GGGGGTGGGT 3070 het 3070 ref 54 31 16 8 A 1 0 217364 CASAVA_Build 4 132945299 7D AATGGCCTTT AAGTGAG/------- AAGAAACAAT 3070 het 3070 ref 37 26 9 4 AAGTGAG 1 0 217365 CASAVA_Build 4 132945652 1D TGGTTGGTCC A/- ACAGGAATAA 1565 het 1565 ref 42 35 4 4 A 2 1 217366 CASAVA_Build 4 132946470 6D CAAAGCAAGG ATCACC/------ AAAGTTTTAA 3070 het 3070 ref 93 55 24 18 ATCACC 1 0 217367 CASAVA_Build 4 132946497 1D CAAAAAGGTT A/- AAAATAATAC 3070 het 3070 ref 96 59 13 24 A 5 4 217368 CASAVA_Build 4 132946633 1I GAATCTTGCA -/T TTGAGAACAC 3070 het 3070 ref 55 34 15 6 T 2 3 217369 CASAVA_Build 4 132946948 1I TAAACATTTC -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 47 36 8 3 A 6 7 217370 CASAVA_Build 4 132948053 1I TCTCATTTTT -/A AAACCATCAG 2193 het 2193 ref 42 29 8 6 A 3 4 217371 CASAVA_Build 4 132948827 1D ACAAAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 A 11 10 217372 CASAVA_Build 4 132950700 4D TGGAGAAAAG AAAA/---- AAAAATAAAA 1035 het 1035 ref 28 17 3 14 A 9 5 217373 CASAVA_Build 4 132950748 1D GGAAGATGCC T/- GGAGGAGAAA 3070 het 3070 ref 37 21 7 10 T 1 0 217374 CASAVA_Build 4 132952195 4D TTCATGAACA ATTT/---- ATTTAATTAT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 ATTT 2 1 217375 CASAVA_Build 4 132953559 1D GCTTTTGGGG A/- ACAAGTGGTT 3070 het 3070 hom 102 38 55 9 A 2 1 217376 CASAVA_Build 4 132954003 1D ATACAATGAC T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 72 42 25 6 T 7 6 217377 CASAVA_Build 4 132954175 3D CAAAATCTGT TTG/--- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 89 38 48 5 TTG 1 0 217378 CASAVA_Build 4 132956386 4D31M18D CTTAATTGTT CTAACTAATGTTCTAACTAATTGTTAGAACAATTGTTAATTGTTCTAACAATC/----CTAATGTTCTAACTAATTGTTAGAACAGTTG------------------ TTAATTGTTC 3070 het 3070 ref 52 58 12 3 N/A 0 0 217379 CASAVA_Build 4 132956507 1D17M1I AAATAACCAA CTTTTTGTTTCATTAAAC-/-ATTTTGTTTCATTAAACT TTTGTATTTT 2159 het 2159 ref 40 32 6 7 N/A 0 0 217380 CASAVA_Build 4 132960014 1I GCTCTCTTTT -/G TCTGCCATGT 3070 het 3070 hom 81 35 40 6 G 0 1 217381 CASAVA_Build 4 132960806 2I TTTCTTTCGG --/TT TTTTCCTGTT 3070 het 3070 ref 44 33 9 2 T 4 6 217382 CASAVA_Build 4 132961501 6I GTTTGTAAGC ------/AACTTT AACATTTTAA 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 AACTTT 0 1 217383 CASAVA_Build 4 132962836 3D AAGAAAGAAG GAA/--- AAAAACAAAT 3070 het 3070 ref 54 33 20 3 GAA 1 0 217384 CASAVA_Build 4 132964264 1I GAATAATTTG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 A 6 7 217385 CASAVA_Build 4 132964570 1I GTCATTAAAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 53 32 13 8 A 7 8 217386 CASAVA_Build 4 132964708 1D ATAATGCAAT G/- GGCATACCAA 2306 het 2306 ref 47 40 5 2 G 3 2 217387 CASAVA_Build 4 132965193 1D25M2D ACAAAACCAG CTTTTTTTCTTTGGCTTCCAGAACACAT/-TTTTTTTCTTTGGCTTCCAGAACAC-- GTCCTCTTGG 3070 het 3070 ref 84 52 37 14 N/A 0 0 217388 CASAVA_Build 4 132966150 3D GAAAAGAGAA GAC/--- GGCTATTTGA 3070 het 3070 ref 57 36 13 10 GAC 1 0 217389 CASAVA_Build 4 132966738 1D GAATGATGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 73 52 10 11 T 10 9 217390 CASAVA_Build 4 132967526 2I13M2I GTGGAAAGTC --TGAAGGTTTTTTA--/TTTGAAGGTTTTTTAAC AGAGTTGCAG 2248 het 2248 ref 48 43 5 2 N/A 0 0 217391 CASAVA_Build 4 132967807 9I CTTTGGAGGC ---------/AAGTTCTAT AAGTTCTTTT 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 AAGTTCTAT 0 1 217392 CASAVA_Build 4 132967864 1I GCATATGGAT -/A AAAAATAAAG 852 het 852 ref 33 25 2 6 A 5 6 217393 CASAVA_Build 4 132967945 1D GACTGGAAAA T/- GGGAACTTTT 3070 het 3070 ref 32 20 7 5 T 1 0 217394 CASAVA_Build 4 132968311 1D ACAAGCCTTA T/- TTTTTTTTCC 2299 het 2299 ref 60 50 5 5 T 9 8 217395 CASAVA_Build 4 132969052 1I ATATCTCCTC -/A AGAGTTCTTC 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 A 1 2 217396 CASAVA_Build 4 132971338 1D CAACTCCTCT A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 36 24 8 5 A 7 6 217397 CASAVA_Build 4 132974051 1D AATTAGGAAA G/- TTTTTAGAGA 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 G 1 0 217398 CASAVA_Build 4 132977083 1D TGTCAAATAA C/- CAAAAACCTC 2304 het 2304 ref 37 26 5 6 C 2 1 217399 CASAVA_Build 4 132981591 3D TACATATTTT TTC/--- TTCTCAAATC 1177 het 1177 ref 34 31 3 2 TTC 2 1 217400 CASAVA_Build 4 132982346 2I TAAGTGCTGG --/GA TATTACAGGT 3070 het 3070 ref 43 34 8 1 GA 0 1 217401 CASAVA_Build 4 132993652 1D TGTGTCAGAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 T 9 8 217402 CASAVA_Build 4 132998782 1D AATTTGGAAT A/- AAACTAATAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 4 3 217403 CASAVA_Build 4 132999157 2D TACTATAAAA AC/-- ACTGAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 34 11 2 AC 2 1 217404 CASAVA_Build 4 132999942 4D TTTTCAAACC TTTG/---- TTTGGTTTCT 2230 het 2230 ref 53 44 5 7 TTTG 2 1 217405 CASAVA_Build 4 133000151 5D TATTTTAAAA AAATT/----- AAAATATCCT 3070 het 3070 ref 58 33 20 9 AAATT 1 0 217406 CASAVA_Build 4 133000726 1D ATCACACATA T/- TTTTTCATGT 3070 het 3070 ref 52 31 19 2 T 6 5 217407 CASAVA_Build 4 133000937 8I AAAGTTTCAA --------/AAATAAAG AACTTTAAAA 2393 het 2393 ref 34 25 5 4 AAATAAAG 0 1 217408 CASAVA_Build 4 133002226 4I GTATCACAGA ----/TATT TAAACACAAA 2342 het 2342 ref 43 31 6 6 TATT 0 1 217409 CASAVA_Build 4 133005959 4I ATATAGTTAA ----/TATC TTTTTTTTTA 1571 het 1571 ref 35 25 4 6 TATC 0 1 217410 CASAVA_Build 4 133006068 1D TAAGCAATAG A/- AAAACAAATT 1099 het 1099 ref 33 26 3 4 A 5 4 217411 CASAVA_Build 4 133008144 3D TATCAGCTTA AGG/--- AGATTTTGGG 3070 het 3070 hom 28 9 19 0 AGG 1 0 217412 CASAVA_Build 4 133008840 3I GTACCTGATA ---/TCT TCTACATTTC 1866 het 1866 ref 31 24 5 2 TCT 1 2 217413 CASAVA_Build 4 133009071 1I ACCCAATTTT -/C TAAAAGGCAA 1627 het 1627 ref 33 25 4 4 C 0 1 217414 CASAVA_Build 4 133013248 1D CAATATGAGT A/- TTTTTTTATG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 1 0 217415 CASAVA_Build 4 133013501 1D AATTGTTATC T/- TTTTTTAACT 1508 het 1508 ref 25 20 4 1 T 7 6 217416 CASAVA_Build 4 133014018 1I CTGATGTGAC -/A AAAAGAAGCA 1612 het 1612 ref 33 26 4 3 A 4 5 217417 CASAVA_Build 4 133015949 1I GAAGATAGGG -/A CTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 A 0 1 217418 CASAVA_Build 4 133016070 4D GAATTAATAG CTAT/---- CTTAGTAAGG 3070 het 3070 ref 35 26 8 4 CTAT 1 0 217419 CASAVA_Build 4 133016268 1I ATACTGTACA -/T ACTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 T 0 1 217420 CASAVA_Build 4 133016899 3I TAGTAAGGTA ---/AAC AGATCAGAAG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 AAC 0 1 217421 CASAVA_Build 4 133017424 1D TTAATTTGCT G/- TTTTTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 18 16 7 G 1 0 217422 CASAVA_Build 4 133019554 2D GTTTATTGAC AA/-- AGAGATAGTT 3070 het 3070 ref 45 33 11 1 A 3 1 217423 CASAVA_Build 4 133019618 2I TTTAATTATA --/AC ATGAGATTAA 3070 het 3070 ref 44 29 9 6 AC 0 1 217424 CASAVA_Build 4 133020153 4D AAGCACCCCA TAAC/---- TAACTACTTT 2743 het 2743 ref 61 44 6 18 TAAC 2 1 217425 CASAVA_Build 4 133024546 4I ACCATTATAA ----/AAAG AAGGAAAATA 3070 het 3070 ref 41 25 9 7 AAAG 0 1 217426 CASAVA_Build 4 133025692 2D GTTCTTATTG AT/-- ATGTTATTTA 3070 het 353 hom 13 1 8 4 AT 2 1 217427 CASAVA_Build 4 133026064 1I AAATCAAATG -/A ATTTTTTTAT 3070 het 2697 hom 28 8 16 4 A 1 2 217428 CASAVA_Build 4 133026799 1I ACTGGAAGTC -/G TTTTGTTTCT 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 G 0 1 217429 CASAVA_Build 4 133026897 1D ACCTAGTAAG T/- TTTTTTCTCT 2921 het 2921 ref 20 14 6 0 T 7 6 217430 CASAVA_Build 4 133027125 4D33M1I TGTAACAAAA TGTCTGGGCCTCTATAAAATATTATATTGAATAAAAT-/----TGGGCCTCTATAAAATATTATATTGAATAAAATA AAAAAGTTGA 3070 het 3070 ref 27 21 9 9 N/A 0 0 217431 CASAVA_Build 4 133027381 1I TCGGTATTGA -/T TTATATGGGT 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 T 2 3 217432 CASAVA_Build 4 133027603 1D AATCCAGGAG T/- TTTTTTTTTT 2440 het 2440 ref 21 7 6 8 T 13 12 217433 CASAVA_Build 4 133027790 1I ATTTGTTGAT -/A GGGGAGAGGA 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 A 0 1 217434 CASAVA_Build 4 133029457 3I TTAGCTTTCC ---/TCT TCTTTATTAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TCT 1 2 217435 CASAVA_Build 4 133029683 1D GTTGTCTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 13 22 11 T 10 9 217436 CASAVA_Build 4 133035056 1D TTTTCCATTA T/- TAGTATTCTG 3070 het 3070 ref 59 30 26 3 T 2 1 217437 CASAVA_Build 4 133036119 1I106M1I TTGCCTTCAG -AGGCTAAGTTTCTAATATAATAACAATTTGAGTCTTTACCACTTCTCTCTAGAATCGTGATTTAGACTAGGTTATTAGAGTAAACAATATGATTCCAATTTTTTTC-/AAGGCTAAGTTTCTAATATAATAACAATTTGAGTCTTTACCACTTCTCTCTAGAATCGTGATTTAGACTAGTTTATTAGAGTAAACAATATGATTCCAAATTTTTTCT TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 35 48 16 26 N/A 0 0 217438 CASAVA_Build 4 133036271 1D TTCTGGGGGG A/- AAATGACATA 3070 het 3070 ref 51 33 8 11 A 4 3 217439 CASAVA_Build 4 133036347 5D TCTTTGTCTT TATTC/----- AATTTAACAA 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 TATTC 1 0 217440 CASAVA_Build 4 133036633 1D ACAGAACACT A/- AGAGCTATTC 3070 het 3070 ref 56 32 19 6 A 2 1 217441 CASAVA_Build 4 133036704 3D CTTTCCATCC TCT/--- TCTTATTCCC 3070 het 3070 ref 64 45 14 5 TCT 2 1 217442 CASAVA_Build 4 133037134 1D ATCTGAACTA T/- TTTCTTCTAT 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 T 4 3 217443 CASAVA_Build 4 133037658 4D CACCAAAACC CTAT/---- CTATCAGTAG 3070 het 3070 ref 45 31 11 4 CTAT 2 1 217444 CASAVA_Build 4 133037924 1I TTTTTTTCTA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 6 7 217445 CASAVA_Build 4 133041341 5I ACAAAGAATT -----/AGATA AAAGAAGATT 1121 het 1121 ref 49 42 3 4 AGATA 0 1 217446 CASAVA_Build 4 133042827 1D TTCCCAGATA T/- TTTTTTCCGC 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 7 6 217447 CASAVA_Build 4 133043194 1I40M3D ATGTATCACA -TTACCTAATAAATAACATATTACTAAAACAGAGAGCAACCAAA/TTTACCTAACAAGTAACATATTACTAAAACAGAGAGCAACC--- AGTGTTTTAC 3070 het 3070 ref 58 55 12 3 N/A 0 0 217448 CASAVA_Build 4 133048037 1I ATGCAGATAC -/G ATAAGATCTG 3070 het 3070 ref 51 39 7 5 G 0 1 217449 CASAVA_Build 4 133048103 2I ATTAATTTAC --/TG TATACATATA 1374 het 1374 ref 41 30 3 8 TG 0 1 217450 CASAVA_Build 4 133049706 3I TATATCAGAT ---/AAG AAGATGTAAA 3070 het 3070 hom 63 23 25 15 AAG 1 2 217451 CASAVA_Build 4 133051709 1D CAAAGACCAG T/- CACATCGAAG 3070 het 3070 ref 56 36 16 4 T 1 0 217452 CASAVA_Build 4 133056368 3D AGAAGGTAAT CTC/--- CTGCTTGTGG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 CTC 1 0 217453 CASAVA_Build 4 133056985 1I AGGTCCTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 A 9 10 217454 CASAVA_Build 4 133057204 2D TCTTAGAGCC AA/-- AAGGACCCTT 3070 het 3070 ref 39 27 8 5 A 4 2 217455 CASAVA_Build 4 133058436 1D TATATACATA T/- TATGTATATA 3070 het 3070 ref 49 32 14 4 T 2 1 217456 CASAVA_Build 4 133058574 1I ATTACTGAGG -/A TCAACTTTCA 3070 het 3070 ref 48 33 8 7 A 0 1 217457 CASAVA_Build 4 133059496 4D TTAAATAGAC ACTT/---- AATCATATAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 4 ACTT 1 0 217458 CASAVA_Build 4 133061076 1I TTGGTAATAA -/T TTTTTTTTTT 2498 het 2498 ref 27 13 6 8 T 11 12 217459 CASAVA_Build 4 133064676 4I TGTTAAAAAC ----/TGTT TGTCTGAGCT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 TGTT 0 1 217460 CASAVA_Build 4 133067980 1D9M2I AAAATAGGTT AAAAAAAGTC--/-AAAAAAGTCTA TGTTATTAGC 1780 het 1780 ref 49 29 9 13 N/A 0 0 217461 CASAVA_Build 4 133068610 2D TCTGGGAGGG GA/-- GACACCTGAG 3070 het 3070 ref 62 43 14 6 GA 2 1 217462 CASAVA_Build 4 133069330 3D AGGCTGGAGT GTA/--- GTAGTAGTGC 2787 het 2787 ref 40 25 10 5 GTA 3 2 217463 CASAVA_Build 4 133069625 1D CTCATCGTCT A/- AAATAAAAGA 3070 het 3070 hom 65 30 31 4 A 4 3 217464 CASAVA_Build 4 133070562 4I AACAGCAAAG ----/CAAA CAAACAAAAG 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 CAAA 2 3 217465 CASAVA_Build 4 133073073 4I AAATATAATT ----/AATA GTTACTCAGC 3070 het 3070 ref 52 34 13 5 AATA 0 1 217466 CASAVA_Build 4 133073151 4I37M4I TTTTACTAAA ----TGAATTTTTCTTTATGTTTTATGCATAAGCTTCCCTG----/TGACTGAATTTTTCTTTATGTTTTATGCTTAAGCTTCTCTGCTTT CTTTCTATTT 3070 het 3070 ref 50 47 12 1 N/A 0 0 217467 CASAVA_Build 4 133073400 1D ACTGGACTTT A/- AAAAAAATAC 1374 het 1374 ref 34 30 3 1 A 8 7 217468 CASAVA_Build 4 133074847 3I TGTATAAGAC ---/ACA TACTGTTATT 3070 het 3070 ref 40 25 7 8 ACA 0 1 217469 CASAVA_Build 4 133075072 2I CAAAACAGTA --/AT ATATATATAA 3070 het 3070 ref 70 44 18 8 AT 4 5 217470 CASAVA_Build 4 133075912 1I TTCTCAGATG -/A AAAAAGACAG 3070 het 3070 ref 38 23 10 5 A 5 6 217471 CASAVA_Build 4 133076793 2D TTGAAGACAG AT/-- ATAAGCAGAT 3070 het 3070 ref 47 31 9 8 AT 2 1 217472 CASAVA_Build 4 133078099 1I ACAAATGGCC -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 67 30 28 9 A 5 6 217473 CASAVA_Build 4 133078688 2D ACAGAAAGAC AA/-- ACACTGCATG 3070 het 3070 ref 58 47 9 4 A 3 1 217474 CASAVA_Build 4 133080090 1D GAAAATGTAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 42 30 9 3 A 9 8 217475 CASAVA_Build 4 133080323 1D CAGAAGAAGG A/- AAAAAAAAAT 2259 het 2259 ref 26 19 5 3 A 10 9 217476 CASAVA_Build 4 133083352 1I TCAACCCAGC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 68 20 37 11 T 7 8 217477 CASAVA_Build 4 133084571 2I ATCCATTTTG --/AC ACACACACCT 2950 het 2950 ref 45 31 8 6 AC 4 5 217478 CASAVA_Build 4 133084827 4D TCCAATAGTC AGTA/---- CAAAACTACG 3070 het 3070 ref 46 29 13 10 AGTA 1 0 217479 CASAVA_Build 4 133085033 1I AGTAACTTTT -/A AAAAAATTTG 3070 het 3070 ref 46 29 9 8 A 6 7 217480 CASAVA_Build 4 133085210 4D ATTTAAAAAG AATA/---- AACAAGTTAG 3070 het 3070 ref 42 26 13 7 AATA 1 0 217481 CASAVA_Build 4 133085698 2D GTATAGCTTA TT/-- TTCTCTCTTT 3070 het 3070 ref 56 38 16 3 T 4 2 217482 CASAVA_Build 4 133086149 4D ACCACAAAAC TTGT/---- TTTTTACTCA 3070 het 3070 ref 72 48 17 10 TTGT 1 0 217483 CASAVA_Build 4 133087898 1I CTCCAACTGC -/T TTTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 53 39 8 6 T 3 4 217484 CASAVA_Build 4 133088408 1D AAAACACTTT C/- CCCTAAGCAT 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 C 4 3 217485 CASAVA_Build 4 133089087 1I TATTGTTCAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 7 8 217486 CASAVA_Build 4 133089195 1D22M1D GCTTTGATAC AAAAAATCATTTGACACAAATGAT/-AAAAATCATTTGACACAAATGA- TTTTTTTTTT 2141 het 2141 ref 18 15 5 2 N/A 0 0 217487 CASAVA_Build 4 133090370 1I TTTTGAAATC -/A TTACAGTGGC 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 0 1 217488 CASAVA_Build 4 133091574 2D AGATATTATC TT/-- TTATACATTT 3070 het 3070 ref 45 32 11 3 T 4 2 217489 CASAVA_Build 4 133092261 3I GGCATGTCAC ---/GTT GTTCTTTGAA 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 GTT 1 2 217490 CASAVA_Build 4 133092557 2I TTGTTTGTTT --/TG GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 10 11 TG 0 1 217491 CASAVA_Build 4 133093577 1I GAAAATTCAG -/A AAAAAGTACC 3070 het 3070 ref 64 45 11 8 A 5 6 217492 CASAVA_Build 4 133094233 1D CTTCTCTAAT A/- AAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 60 31 18 11 A 7 6 217493 CASAVA_Build 4 133094497 1D TGAATGAGAA T/- TAAATGTTTA 2705 het 2705 ref 48 37 6 5 T 2 1 217494 CASAVA_Build 4 133095178 4D AATTTCTTTG GTTT/---- GTTTGTTTGT 2551 het 2551 ref 39 28 8 5 GTTT 4 3 217495 CASAVA_Build 4 133095343 4I ATCATGATTG ----/ATTA ATTTTGTTCA 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 ATTA 0 1 217496 CASAVA_Build 4 133095468 4I GTGTGTATCA ----/TTTG TTTATTTTTC 3070 het 3070 hom 66 35 30 1 TTTG 0 1 217497 CASAVA_Build 4 133096109 1I TTTGCCAATA -/T TAGTATTATC 3070 het 3070 ref 46 22 22 2 T 1 2 217498 CASAVA_Build 4 133097692 1I ATATTTTTTC -/T TTTCACTTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 3 4 217499 CASAVA_Build 4 133098457 1I CCATTGTCTT -/G GGGATTGACA 3070 het 3070 ref 40 28 8 4 G 3 4 217500 CASAVA_Build 4 133102228 4I ACAGAACAAC ----/AGTT AGGATAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AGTT 0 1 217501 CASAVA_Build 4 133102506 1I ATCTTCTTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 35 0 23 12 T 9 10 217502 CASAVA_Build 4 133104596 9D CTTTGACCTC AGGCTAATA/--------- AATACTACTT 3070 het 3070 hom 49 20 24 8 AGGCTAATA 1 0 217503 CASAVA_Build 4 133105994 4D AAAGAGAACA AATG/---- GTATGATATC 3070 het 3070 ref 40 25 12 4 AATG 1 0 217504 CASAVA_Build 4 133107149 1I ACTTCAAATG -/A AAAAAAAAGG 2772 het 2772 ref 85 64 9 12 A 8 9 217505 CASAVA_Build 4 133107598 4D AAATGTTCTT CTTC/---- TTTTTTTTTT 91 het 91 ref 33 19 2 14 CTTC 1 0 217506 CASAVA_Build 4 133109795 1I TCAGTTAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 59 43 13 3 A 8 9 217507 CASAVA_Build 4 133110534 1I AAAATAAAAG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 49 31 13 5 A 7 8 217508 CASAVA_Build 4 133111092 1I TAAAAATTAG -/A AAAACCATAC 3070 het 3070 hom 55 27 26 2 A 4 5 217509 CASAVA_Build 4 133111226 5D ATTTTCTAAG AAATA/----- AAATAAAACT 3070 het 3070 ref 35 25 9 6 AAATA 2 1 217510 CASAVA_Build 4 133111459 1I TACTATATAC -/T TTTATAATCC 1888 het 1888 ref 32 25 4 3 T 3 4 217511 CASAVA_Build 4 133112104 8D ATCTAACTTG ACTCAAAT/-------- ACTTCTAAGT 3070 het 3070 ref 50 38 13 3 ACTCAAAT 1 0 217512 CASAVA_Build 4 133120040 1D TATACTTATA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 36 het 13 0 13 2 T 7 6 217513 CASAVA_Build 4 133136340 2D CACCAAACTA AC/-- ACAGGAACAC 3070 hom 154 het 55 0 52 4 AC 2 1 217514 CASAVA_Build 4 133144015 2D AGACAGAGCA AG/-- AGAGAGAGAG 1073 het 1073 ref 43 35 3 5 AG 9 8 217515 CASAVA_Build 4 133147028 1I TTTATTGTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 46 het 20 0 15 5 T 9 10 217516 CASAVA_Build 4 133154875 1D AGAAATTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 T 11 10 217517 CASAVA_Build 4 133160320 1I GAATTTTGAC -/T TTTTTCTCTG 3070 het 3070 hom 41 21 18 2 T 5 6 217518 CASAVA_Build 4 133166013 14D GGAAAGTTCT TAAGGTTCTGTTCA/-------------- TTGCTAGTCC 3070 het 3070 hom 27 13 15 2 TAAGGTTCTGTTCA 1 0 217519 CASAVA_Build 4 133175919 1D TCAGCCTTTC A/- AAAAAAAAAG 1810 het 1810 ref 48 39 6 3 A 10 9 217520 CASAVA_Build 4 133188620 1D TTTAAACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 7 6 A 10 9 217521 CASAVA_Build 4 133189325 2I ATTTTCCCTC --/TT GTTTCTAATA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 0 2 217522 CASAVA_Build 4 133193899 5D TTTTAAAAGA TTTTG/----- TTTTGTTATC 3070 het 3070 ref 40 23 15 6 TTTTG 2 1 217523 CASAVA_Build 4 133196577 4D CCATTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2813 het 2813 ref 27 11 10 10 TTTG 5 4 217524 CASAVA_Build 4 133213917 1I ACAAGAGGTT -/G GGGGTGGGGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 4 5 217525 CASAVA_Build 4 133214590 1D AATATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 515 het 515 ref 16 6 2 8 T 19 18 217526 CASAVA_Build 4 133215052 1D AACGCTGGGC A/- TTATAATTAT 3070 het 1052 hom 35 3 16 16 A 1 0 217527 CASAVA_Build 4 133215069 1D TTATAACATG T/- TTTGATGAGA 3070 het 1668 hom 34 5 16 13 T 4 3 217528 CASAVA_Build 4 133221410 1D5M8I ATTGTGTAAT AATCAC--------/-GTCTCTGATCTTT AATATAATCA 3070 het 3070 ref 54 29 23 5 N/A 0 0 217529 CASAVA_Build 4 133222256 3I GCTACAATAA ---/TAT TATCATACTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 TAT 1 2 217530 CASAVA_Build 4 133224445 11I ACAACAACTT -----------/TTTACATAGCA TTTACATTGT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 TTTACATAGCA 0 1 217531 CASAVA_Build 4 133236463 1I AATTTACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 T 11 12 217532 CASAVA_Build 4 133239061 1I CCTTCCTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 9 10 A 13 14 217533 CASAVA_Build 4 133239600 2D ATACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1133 hom 23 7 12 4 AT 6 5 217534 CASAVA_Build 4 133248785 1D GTACAAGGGC T/- TTTTAGCAGA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 5 4 217535 CASAVA_Build 4 133249825 1I ATTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 9 10 217536 CASAVA_Build 4 133250516 1I GAAAAAACTC -/A ACAGATGAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 1 2 217537 CASAVA_Build 4 133250798 1D ACCATAATAG T/- TTCACAGCCA 3070 het 3070 ref 57 30 22 6 T 3 2 217538 CASAVA_Build 4 133253339 1D AACCCAGAAG T/- TTTCTCCTTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 4 3 217539 CASAVA_Build 4 133254393 1I AGCTTCATCA -/G GGTCCTCCCT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 G 2 3 217540 CASAVA_Build 4 133255749 5D TGCAAACGAA TAACT/----- TAAACTTATC 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 TAACT 1 0 217541 CASAVA_Build 4 133256860 4I CTATCCTCTT ----/AATA AATTTATCAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 AATA 0 1 217542 CASAVA_Build 4 133258374 1D TTCCTTTTGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 1523 hom 18 5 10 3 A 9 8 217543 CASAVA_Build 4 133279641 3D ATTGAATAGG AGA/--- AGAACACAGG 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 AGA 2 1 217544 CASAVA_Build 4 133281883 2D CAAGTGTCTT AG/-- AGAGAAGTCA 3070 het 3070 ref 50 25 22 4 AG 3 2 217545 CASAVA_Build 4 133286297 4I GCTGCTGATC ----/ACTA ACTACTTTCA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 ACTA 1 2 217546 CASAVA_Build 4 133290006 2D TAAAGGATTC AG/-- AGTTATCTAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 AG 2 1 217547 CASAVA_Build 4 133291822 1D TTTAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 2671 het 2671 ref 21 10 7 4 T 11 10 217548 CASAVA_Build 4 133308336 1I GCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 23 1 18 4 T 10 11 217549 CASAVA_Build 4 133317449 3D TTGGATTACC ATA/--- ATGTTTCTTG 3070 het 3070 hom 32 10 19 8 ATA 1 0 217550 CASAVA_Build 4 133356127 1D AAAATCACTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2521 hom 23 7 12 4 A 10 9 217551 CASAVA_Build 4 133358183 1I GACCTGATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 33 2 18 13 T 12 13 217552 CASAVA_Build 4 133358195 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAGGAG 3070 het 388 hom 28 2 19 7 A 6 7 217553 CASAVA_Build 4 133361138 1I ACAAAATGTG -/T TTTTAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 16 28 4 T 4 5 217554 CASAVA_Build 4 133371229 2D CTGCTTCCAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 27 10 6 A 11 9 217555 CASAVA_Build 4 133373278 4D ATGTTCCCGT ATGG/---- ATGGATAAGC 3070 hom 126 het 46 0 43 6 ATGG 2 1 217556 CASAVA_Build 4 133374003 3D TTGCTTTGTA ACT/--- ACTACTACCC 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 ACT 3 2 217557 CASAVA_Build 4 133383631 4I AACATAAACA ----/AACT AAGAAGCCAA 3070 het 3070 ref 41 21 9 11 AACT 0 1 217558 CASAVA_Build 4 133391605 1I TCTAATCAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 9 10 217559 CASAVA_Build 4 133405244 1D AATAAACAAG A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 A 7 6 217560 CASAVA_Build 4 133405449 1D TTGTAAACAT A/- AAGGTTTGTA 3070 het 3070 ref 35 24 8 3 A 3 2 217561 CASAVA_Build 4 133407233 1I TGTGTTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 11 12 217562 CASAVA_Build 4 133411924 1I ATGATTACGG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 T 7 8 217563 CASAVA_Build 4 133416626 4D4M3D ATGAAGAGTT CAGGCTAGCAT/----CTAG--- CAGAAGTAAA 3070 het 3070 ref 40 23 16 3 N/A 0 0 217564 CASAVA_Build 4 133417147 3D CAGCAGACAT GAA/--- GAAGAGGGGT 3070 het 3070 ref 41 22 16 5 GAA 2 1 217565 CASAVA_Build 4 133423546 2D AAGGAATTAA AT/-- TTTACTGAAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 AT 1 0 217566 CASAVA_Build 4 133423649 1D TTGTAATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 31 0 23 8 A 11 10 217567 CASAVA_Build 4 133428790 1I TAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 9 10 217568 CASAVA_Build 4 133429743 1D TGACTTCCTC T/- TTGCTGATTT 2303 het 2303 ref 27 18 7 2 T 3 2 217569 CASAVA_Build 4 133434495 1D ACTGTATGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 T 10 9 217570 CASAVA_Build 4 133448231 1I GTTCTTCTAT -/A GTTGGGCACC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 A 0 1 217571 CASAVA_Build 4 133450832 1I TTCTGTAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 13 14 217572 CASAVA_Build 4 133450916 1D GCTTTTTTTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 G 10 9 217573 CASAVA_Build 4 133452881 1I TTGAAGAAAA -/T ATAAACTGGA 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 T 0 1 217574 CASAVA_Build 4 133453175 1D TCTTGTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 11 10 217575 CASAVA_Build 4 133455321 2D GAATACAAAC AG/-- AAATAATAAG 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 AG 1 0 217576 CASAVA_Build 4 133456429 1D GCCATGACCA C/- CCGATGGTCC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 C 3 2 217577 CASAVA_Build 4 133458781 2I TAATTAATAA --/AG ATAATTAAGT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 AG 0 1 217578 CASAVA_Build 4 133458885 2D TAAAGTGTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 38 15 14 10 AT 6 5 217579 CASAVA_Build 4 133470012 2I CTTCAGAAAC --/AT ATTATTATTT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 AT 1 2 217580 CASAVA_Build 4 133471010 2D TTGCATTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 11 11 A 14 12 217581 CASAVA_Build 4 133474096 1D TTTACACATT A/- ATATTAAGTG 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 A 2 1 217582 CASAVA_Build 4 133474509 1D CTCTGTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 14 23 11 T 12 11 217583 CASAVA_Build 4 133475049 1I GAGAAACCTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 8 9 217584 CASAVA_Build 4 133476465 1D AAAAACAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 47 17 20 11 A 9 8 217585 CASAVA_Build 4 133477162 1D AGCTACTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1975 hom 27 6 13 8 T 11 10 217586 CASAVA_Build 4 133478775 1D TCACACCACT G/- CCCTCCAGCC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 G 1 0 217587 CASAVA_Build 4 133483407 1I CAACAGTGTG -/T TTTTTTCTAG 3070 het 2795 hom 25 9 10 6 T 6 7 217588 CASAVA_Build 4 133484505 4I TTCTTTCAAT ----/AGTC AGGCCCCTCT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 AGTC 0 1 217589 CASAVA_Build 4 133490889 1I AACTTTATTT -/A TCCTAACTAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 0 1 217590 CASAVA_Build 4 133495433 1I AGAAATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 T 11 12 217591 CASAVA_Build 4 133497163 8I ATTCTTTTCC --------/AATCAATG AATCAATGTC 3070 het 2720 hom 35 7 17 11 AATCAATG 1 2 217592 CASAVA_Build 4 133504211 1D TACAGACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 553 hom 36 5 20 11 A 11 10 217593 CASAVA_Build 4 133504410 1I ATTTGTGCTG -/T TTTTAAACCA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 T 4 5 217594 CASAVA_Build 4 133505292 1D ATTTTAATTA T/- TCTTTAACTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 2 1 217595 CASAVA_Build 4 133510448 1I CTAAATCAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 9 10 217596 CASAVA_Build 4 133511613 2D ATATATACAC AT/-- ATGTATATAT 3070 het 2779 hom 26 8 17 1 AT 2 1 217597 CASAVA_Build 4 133517539 2D TGTGCAAAAG AA/-- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 31 15 14 4 A 9 7 217598 CASAVA_Build 4 133518663 1D TAAGCTCCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 8 217599 CASAVA_Build 4 133519519 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1975 het 1330 hom 16 5 7 4 A 11 10 217600 CASAVA_Build 4 133520104 1D CAGGTATCAA T/- TGCAGATGCT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 T 2 1 217601 CASAVA_Build 4 133520487 2D AGGTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 736 hom 32 7 16 10 T 16 14 217602 CASAVA_Build 4 133526840 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 815 hom 22 6 12 4 A 13 14 217603 CASAVA_Build 4 133532388 1I AACTGCACAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 15 10 15 A 8 9 217604 CASAVA_Build 4 133534810 4D TTTTAAAAAG ATGA/---- ATGAATATAT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 ATGA 2 1 217605 CASAVA_Build 4 133535232 3I ATAAAATGTT ---/ATC TTCTATTTTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ATC 0 1 217606 CASAVA_Build 4 133535317 1D ATTAGTGATA T/- TTAGTTAATT 3070 het 3070 hom 32 13 19 0 T 3 2 217607 CASAVA_Build 4 133539856 1I TTATTTTTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 8 9 217608 CASAVA_Build 4 133545229 1I ATTACCATAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 8 9 217609 CASAVA_Build 4 133545460 1D AGAAAATATT G/- GATCTGTTTC 3070 het 3070 hom 29 8 20 1 G 2 1 217610 CASAVA_Build 4 133549521 2D TTTTTGTGTG TT/-- TTTTTTTTAC 3070 het 2701 hom 27 8 16 3 T 10 8 217611 CASAVA_Build 4 133557997 1I CAGAGAAACA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 2997 hom 34 11 20 3 G 0 1 217612 CASAVA_Build 4 133559780 2I TGGTGGGACT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 AG 6 7 217613 CASAVA_Build 4 133560408 1I ACAAATTTAG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 A 6 7 217614 CASAVA_Build 4 133572710 2I ATACTTTAAA --/AC AGTTTTACCC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AC 0 1 217615 CASAVA_Build 4 133582024 3D CCCTTGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 99 het 40 0 33 9 TTG 4 3 217616 CASAVA_Build 4 133582533 5D AATGATATAG TAATT/----- TAATTTCCTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TAATT 2 1 217617 CASAVA_Build 4 133582862 2I CTAATGAATC --/TT TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 8 10 217618 CASAVA_Build 4 133584926 49D4M6D7M23D ACATGTATTA TAGGGTTTTGTGATTGCCTATAAGCTATCATTAAGTGAAAAGCATGTGGAATGTGACCTTTTCCAATAATTTAATTTTTATGAACTTAT/-------------------------------------------------AATG------TATCCCA----------------------- AATGAATAAA 3070 hom 69 het 21 0 23 5 N/A 0 0 217619 CASAVA_Build 4 133587812 1I GGGTAAGGCT -/C TGAGACTTGC 3070 hom 81 het 33 0 26 7 C 0 1 217620 CASAVA_Build 4 133593755 1I CAAAGTTCCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 59 27 26 6 A 9 10 217621 CASAVA_Build 4 133605527 1D TGAGTAAAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 18 13 2 T 10 9 217622 CASAVA_Build 4 133649382 16D TTGGCTCACT GCAACCTCTGCCTCCC/---------------- AGGTTCAAGT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 GCAACCTCTGCCTCCC 1 0 217623 CASAVA_Build 4 133653026 4I TTCGATTATT ----/AATA AATAATTTTA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AATA 1 2 217624 CASAVA_Build 4 133653808 1D CTAGTTTAAG A/- GTCTTTGATG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 0 217625 CASAVA_Build 4 133665043 8D CAACATTGGC TTACAAAA/-------- TTACTGTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTACAAAA 1 0 217626 CASAVA_Build 4 133666039 1D TTCATTGAGG A/- AGTTTATTAA 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 A 2 1 217627 CASAVA_Build 4 133666777 1I TTTATCAGAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 8 9 217628 CASAVA_Build 4 133667551 15D CTGGTTTGCA GTTTGAGTGTCTCTG/--------------- GTTATGGCAT 3070 het 3070 ref 36 22 12 4 GTTTGAGTGTCTCTG 1 0 217629 CASAVA_Build 4 133667699 1D TAATAATTCC A/- AAAAAATACA 3070 het 2631 hom 16 6 8 2 A 7 6 217630 CASAVA_Build 4 133667823 18D ATGGGTATAT TATAACTTTCTTTAGGAG/------------------ TATAACTTTC 3070 het 3070 hom 28 13 16 3 TATAACTTTCTTTAGGAG 1 0 217631 CASAVA_Build 4 133668810 1I TAAATGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 10 11 217632 CASAVA_Build 4 133669974 1D AAAATACATC T/- TTTTTTGGTA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 7 6 217633 CASAVA_Build 4 133670445 1I GACAAAGCTA -/G TCATCATTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 217634 CASAVA_Build 4 133671390 4I AAAATACTTA ----/TTGT TTGATATTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TTGT 0 1 217635 CASAVA_Build 4 133672480 1I ATTTTAAAAG -/A ACCATCCTAG 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 A 1 2 217636 CASAVA_Build 4 133672817 1I TAACTTCCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 584 hom 38 2 30 6 A 9 10 217637 CASAVA_Build 4 133672975 1I TCTGACATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 501 hom 36 2 29 5 A 10 11 217638 CASAVA_Build 4 133676014 1D TATTTCTGTA G/- ATTTGATAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 1 0 217639 CASAVA_Build 4 133684483 2I CTTCAGAGAC --/TG TGACATTAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TG 1 2 217640 CASAVA_Build 4 133685254 1I ACTAAATAGC -/T TCTGCACAGC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 1 2 217641 CASAVA_Build 4 133686205 6D ATGTACCCTA AAACTT/------ AAACTTAAAG 3070 hom 39 het 16 0 11 5 AAACTT 2 1 217642 CASAVA_Build 4 133686892 1I TCACCCTTCT -/A ACAGAGCGTA 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 A 1 2 217643 CASAVA_Build 4 133690081 1I GACTCAGCTC -/A AAAAAAAAAA 2562 het 2416 hom 22 7 7 8 A 10 11 217644 CASAVA_Build 4 133690314 4D CAACATGTGT AAAA/---- ATGTCTTAGC 3070 hom 111 het 39 0 38 3 A 5 1 217645 CASAVA_Build 4 133698144 1D TCTGGATTTT C/- CTAGGCCCAG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 C 2 1 217646 CASAVA_Build 4 133698255 4I TTGGAATCTT ----/CTAA CTGACAAACA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 CTAA 0 1 217647 CASAVA_Build 4 133701229 4D CTAACATAAA TTAG/---- TTGATCAATA 3070 het 2784 hom 19 6 10 4 TTAG 1 0 217648 CASAVA_Build 4 133702236 4D GTAACTAATG AATT/---- AATTAATGAG 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 AATT 2 1 217649 CASAVA_Build 4 133715900 2I AAAGAGAGAC --/AT ATCAAATTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 2 217650 CASAVA_Build 4 133717899 4D GTGAGAAACT CAAA/---- CAACTCAGTA 1448 het 1448 ref 32 13 6 13 CAAA 1 0 217651 CASAVA_Build 4 133720130 12I AGAAGGCTAG ------------/GCGTAGATCAAT GCCAATAGCA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 GCGTAGATCAAT 0 1 217652 CASAVA_Build 4 133725189 20D10M1D CTCCCATCCT TTTACCTTCTCTCCCATCCCTTCTATAATAC/--------------------TTCTATAATA- ATTTTTTTCA 3070 hom 69 het 27 0 24 6 N/A 0 0 217653 CASAVA_Build 4 133732865 4I GATGGAGAGC ----/CTCT GGTGCTTCGG 3070 het 3070 hom 45 17 17 11 CT 0 2 217654 CASAVA_Build 4 133750759 3D TTTCTTAAAT TTA/--- TTGAGACCCT 3070 het 3070 hom 26 11 15 1 TTA 1 0 217655 CASAVA_Build 4 133756219 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATCC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 AT 5 4 217656 CASAVA_Build 4 133756339 1I AAGAGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2821 hom 22 9 9 4 T 11 12 217657 CASAVA_Build 4 133761647 3D6M2D ATCCAACTAT GTACATTTATG/---CAATTA-- TAATAAAACC 3070 hom 75 het 23 0 26 3 N/A 0 0 217658 CASAVA_Build 4 133761890 1I GTCTATGTTT -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 6 7 217659 CASAVA_Build 4 133763056 1D TAATTTTGTC A/- ATTTGAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 A 2 1 217660 CASAVA_Build 4 133763864 3I GGTGATTAGC ---/TCT TCATCTGGCA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TCT 0 1 217661 CASAVA_Build 4 133764191 1I CCATAACCAC -/A AAATGAACTT 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 A 3 4 217662 CASAVA_Build 4 133764478 1I TTTTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 11 12 217663 CASAVA_Build 4 133765857 5D TATTGTCAAA TATAT/----- TATATTTGTA 3070 het 3070 ref 25 16 7 2 TATAT 2 1 217664 CASAVA_Build 4 133770447 1D37M5I GGCAATCACT AAAAGTCAGGAAACAACAGATGCTGGAGAGGATGTGGA-----/-AAAGTCAGGAAACAACAGATGCTGGAGAGGATGTGGAGAAAT GAAATGAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 14 9 N/A 0 0 217665 CASAVA_Build 4 133771073 1I TTTAATAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 8 9 217666 CASAVA_Build 4 133778495 1D TATTTGAATC T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 54 32 16 6 T 7 6 217667 CASAVA_Build 4 133779048 2I CATTTTAAAA --/CT CTGTTAATTT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 CT 1 2 217668 CASAVA_Build 4 133798628 1D TAGGGGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 T 11 10 217669 CASAVA_Build 4 133800596 1D GAGTAAAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 10 9 217670 CASAVA_Build 4 133801980 1D ATTAACCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 A 12 11 217671 CASAVA_Build 4 133804112 1D ATTATAATAA T/- TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 7 6 217672 CASAVA_Build 4 133811058 4D GCTATTTCTT TATC/---- TATGTAATAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TATC 1 0 217673 CASAVA_Build 4 133816775 1I GAAGTTTCAA -/C CTTGCATCTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 1 2 217674 CASAVA_Build 4 133822921 2D ATACACACAC AT/-- ATATATCAAT 3070 het 186 hom 26 1 9 17 AT 4 3 217675 CASAVA_Build 4 133826114 2D GCAGTGAGCC GA/-- GATTGTGCCA 3070 hom 110 het 40 0 36 5 GA 2 1 217676 CASAVA_Build 4 133828401 1I TCTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 52 het 30 1 28 1 T 9 10 217677 CASAVA_Build 4 133837579 1I TTTAAAAAAA -/T ATATAGATAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 0 1 217678 CASAVA_Build 4 133838720 8D AACAAGATGA GATGAGAG/-------- GATGTCTCCT 3070 hom 81 het 30 0 27 4 GATGAGAG 1 0 217679 CASAVA_Build 4 133840490 16D TTAGGTACTT ACACACACACACACAC/---------------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 12 16 28 AC 13 5 217680 CASAVA_Build 4 133840650 2I AAATATTATT --/CA GTCACATAAG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CA 0 1 217681 CASAVA_Build 4 133843919 1I CTATTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 25 1 20 4 A 10 11 217682 CASAVA_Build 4 133844624 2D TTGCCAAATT TC/-- TGTGTGTAAC 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 TC 1 0 217683 CASAVA_Build 4 133848322 1D TAAACTTCCA C/- TTTTTAAGAA 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 C 1 0 217684 CASAVA_Build 4 133848410 1D ATGATGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 12 11 217685 CASAVA_Build 4 133849056 30D AGATCTATTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------------------ TTTTTTTTTT 3020 het 2343 hom 25 10 8 7 T 40 10 217686 CASAVA_Build 4 133856775 1D TAAATCATTG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 9 8 217687 CASAVA_Build 4 133858196 1I CTTCCCATTT -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 G 3 4 217688 CASAVA_Build 4 133865884 1D ACCTTTATTC T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 T 7 6 217689 CASAVA_Build 4 133870509 1D TAACAGAGAA C/- CAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 5 C 2 1 217690 CASAVA_Build 4 133873468 1I ATCAATACAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 8 9 217691 CASAVA_Build 4 133873851 4I AAGAAGACTC ----/AAAT AAATGTGTAG 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 AAAT 1 2 217692 CASAVA_Build 4 133874288 1D GCTAAAAAAA T/- AAACTTTAAT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 1 0 217693 CASAVA_Build 4 133877177 1D CATTTAACAC T/- AATTGCCTCT 3070 het 3070 hom 51 18 30 3 T 1 0 217694 CASAVA_Build 4 133877817 2D GGTTTTAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 43 4 22 18 T 16 14 217695 CASAVA_Build 4 133878865 9D TGTATTTACA CAGGCATTT/--------- CAGGCTATGT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 CAGGCATTT 1 0 217696 CASAVA_Build 4 133879384 2I AAAAAGAAAT --/AC AGTCACACAA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 AC 0 1 217697 CASAVA_Build 4 133888514 1D CAATTACCTC T/- TATAGACTCC 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 T 2 1 217698 CASAVA_Build 4 133890801 1D TCTAACTTGC G/- TATGTCTGCT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 G 1 0 217699 CASAVA_Build 4 133891214 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTGTATT 2574 het 174 hom 10 1 6 3 T 5 6 217700 CASAVA_Build 4 133893303 2I TCTGAAAGAC --/AG AGTGTATAAT 2712 het 871 hom 12 2 6 4 AG 1 2 217701 CASAVA_Build 4 133898290 3I AACATAAAAT ---/TAA TAATAAGATG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 TAA 2 3 217702 CASAVA_Build 4 133900653 1D ATGATAATTC A/- TTATTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 1 0 217703 CASAVA_Build 4 133901363 9I5M1I ATTAGGTAAA ---------TAGGA-/TTACTTGACTATCAT GAGCCTTTGT 3070 het 3070 ref 34 19 15 2 N/A 0 0 217704 CASAVA_Build 4 133909631 2I GTATATAGAT --/TA AAAAATCTTC 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TA 0 1 217705 CASAVA_Build 4 133912709 4I TAATATAACT ----/CAAA CAAGATCGTC 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 CAAA 0 1 217706 CASAVA_Build 4 133914060 3I42M1D CATGTTTTCT ---AAGATGAGAAATGAATTATACAATTGGATAAAAGTAAGTATTG/AAGAAGATGAGAAATGAATTATACAATTGGATAAAAGTAAGTATT- GGACGAGTTC 3070 het 3070 ref 28 18 12 12 N/A 0 0 217707 CASAVA_Build 4 133915659 2I ATTTATAATG --/TA TGTTATATAA 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 TA 0 1 217708 CASAVA_Build 4 133916135 3D ATTCAGGCAA CTT/--- CTTTGCTACT 3070 het 1324 hom 36 3 19 15 CTT 2 1 217709 CASAVA_Build 4 133916165 1D AAGGATAATC T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 45 9 22 14 T 7 6 217710 CASAVA_Build 4 133919787 1D GAAGATGGGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 A 8 7 217711 CASAVA_Build 4 133921551 1D GATTTTAATT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 37 21 8 8 A 8 7 217712 CASAVA_Build 4 133937823 1D ACTAGTTGTA T/- TCCTAAGCTT 3070 het 3070 hom 24 7 14 3 T 2 1 217713 CASAVA_Build 4 133949700 1I ACATAATTTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 7 8 217714 CASAVA_Build 4 133958125 2D TTTGACTTTG TC/-- TCTTTCTCGC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 TC 2 1 217715 CASAVA_Build 4 133959723 1I CTTTTTTTTT -/C TTCCCTAGTG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 0 1 217716 CASAVA_Build 4 133960550 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 A 11 10 217717 CASAVA_Build 4 133967534 1D TTTATTTCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 T 10 9 217718 CASAVA_Build 4 133978011 3D CCAAATTTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 17 7 A 13 10 217719 CASAVA_Build 4 133980618 1I AGAAAAAAAA -/T CAAATGCTAC 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 T 0 1 217720 CASAVA_Build 4 133982677 1D GATCCGCCTG C/- CTCAGCCTCC 3070 het 2147 hom 17 6 9 2 C 2 1 217721 CASAVA_Build 4 133982980 1D CTTTAATGAT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 37 22 11 5 A 8 7 217722 CASAVA_Build 4 133984894 3I TACATAATAC ---/AAA TTGTTTCATA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 0 3 217723 CASAVA_Build 4 133985073 1D TTATAGGGGT A/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 1 0 217724 CASAVA_Build 4 133986014 1D CCTGGTTCCA T/- TTTAGTCATG 3070 het 3070 hom 49 18 25 7 T 4 3 217725 CASAVA_Build 4 133991885 3I TTTCTTATAA ---/CTT CTTAGAATTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CTT 1 2 217726 CASAVA_Build 4 133992965 10D TTCACTTATG CAAATATGCA/---------- CATACTTTCC 3070 hom 93 het 34 0 32 5 CAAATATGCA 1 0 217727 CASAVA_Build 4 133993753 8I AGGAGTATCA --------/AAGTCTAT AAGTCTATTC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 AAGTCTAT 1 2 217728 CASAVA_Build 4 133994465 1I GTGTGTGTGA -/T TTTTGGGCTA 2560 het 206 hom 40 4 8 28 T 4 5 217729 CASAVA_Build 4 133999617 4I GTGGCACCAT ----/CACA CACAGCTCAC 3070 hom 48 het 17 0 17 1 CA 2 4 217730 CASAVA_Build 4 134006817 3D TCCTATTTCC TAT/--- TATTGTTGCT 3070 hom 108 het 38 0 36 4 TAT 2 1 217731 CASAVA_Build 4 134009642 6D AAGAAAAAAG AAAAAA/------ AATAAAAAAG 598 het 148 hom 43 2 5 40 A 8 2 217732 CASAVA_Build 4 134010679 1I AAGACTAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 692 hom 40 2 30 8 A 9 10 217733 CASAVA_Build 4 134013550 2I AAAGTAAGAC --/TG TGTCTCAAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TG 1 2 217734 CASAVA_Build 4 134016460 5D AATAATGACT TATAA/----- TATAGTATTT 3070 hom 63 het 27 0 22 6 TATAA 1 0 217735 CASAVA_Build 4 134017548 1I TGCCTACATC -/A AAAAAAGAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 7 217736 CASAVA_Build 4 134017778 10D ACTAACAAAA AGAGAGAGAG/---------- AGAGAGAGAC 3070 hom 72 het 29 0 26 4 AG 9 4 217737 CASAVA_Build 4 134018400 2I AGTGAAGGAC --/AA AAAAATACTT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 A 5 7 217738 CASAVA_Build 4 134020455 1I ATATCATTGG -/T CATCAGAGAA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 0 1 217739 CASAVA_Build 4 134021084 1D GGTACAAATA T/- TATATATATA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 2 1 217740 CASAVA_Build 4 134022761 1D TAATTTTTAC T/- TTGCCAGAGA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 3 2 217741 CASAVA_Build 4 134025483 1I CATCCCTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 324 hom 21 1 17 3 T 9 10 217742 CASAVA_Build 4 134026183 1D TGGCAACCTT A/- TTTTTTTTAT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 A 1 0 217743 CASAVA_Build 4 134026948 5I CTGTTCAAGT -----/TAAAC TAAAGGATTC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 TAAAC 0 1 217744 CASAVA_Build 4 134028579 4I CAGCAATATG ----/GAGA GAAAGGGAAT 3070 hom 51 het 19 0 17 4 GA 1 3 217745 CASAVA_Build 4 134029744 2I CTTGCAACTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 21 0 14 7 A 11 13 217746 CASAVA_Build 4 134031713 4I TTAGCAAAAG ----/TATC TAGTACTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TATC 0 1 217747 CASAVA_Build 4 134033444 4I TTCAGGAAAA ----/TAGT TAGAGGATCA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TAGT 0 1 217748 CASAVA_Build 4 134033660 1D AATACACAAC T/- TTATGAGTTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 3 2 217749 CASAVA_Build 4 134034037 1D CTCCCCAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 26 0 19 8 T 10 9 217750 CASAVA_Build 4 134035513 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 8 9 217751 CASAVA_Build 4 134036363 1D ATGCCTAAAT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 70 het 30 0 27 4 A 8 7 217752 CASAVA_Build 4 134036836 1D CCAAAAAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 8 217753 CASAVA_Build 4 134040196 8D TGTGTATGTG TATATATA/-------- TATATATATA 3070 hom 58 het 24 0 20 5 TA 13 9 217754 CASAVA_Build 4 134040441 2D ATTATGAGAC TT/-- TTATTTTTAT 3070 hom 51 het 23 0 18 6 T 4 2 217755 CASAVA_Build 4 134041212 5D CCTATTTCAG CAATA/----- CAATTCTATG 3070 hom 132 het 46 0 45 4 CAATA 1 0 217756 CASAVA_Build 4 134041418 1D TCCAGAAGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 10 9 217757 CASAVA_Build 4 134042302 5I TCCACGTCCC -----/TAACA TAAGTATCTT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 TAACA 0 1 217758 CASAVA_Build 4 134043970 7D GGACTGTTGT GGGGTGG/------- GGGGAGGGAG 989 hom 7 het 3 0 3 0 GGGGTGG 1 0 217759 CASAVA_Build 4 134045350 1D TAGTTAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 10 9 217760 CASAVA_Build 4 134045669 8D CTTTGTCTCA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 2854 hom 21 het 6 0 8 2 AAAT 6 4 217761 CASAVA_Build 4 134066355 1D TAGAACTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 11 10 217762 CASAVA_Build 4 134244059 2D AATGAAAAAC AT/-- ATTTAGACCC 3070 het 3070 hom 50 22 26 2 AT 2 1 217763 CASAVA_Build 4 134252558 1D GTGCAAGATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 9 8 217764 CASAVA_Build 4 134255289 3I CTTTTAGCTG ---/AAA AAAAAAAAAA 2910 het 2910 ref 24 8 7 9 A 11 14 217765 CASAVA_Build 4 134259095 1D TCAATAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 59 23 26 10 T 11 10 217766 CASAVA_Build 4 134259852 1I TCACTGGATG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 A 8 9 217767 CASAVA_Build 4 134261607 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1709 hom 32 7 22 3 A 9 10 217768 CASAVA_Build 4 134267218 2I GCAGTAATAG --/AC ACAGTGTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 AC 1 2 217769 CASAVA_Build 4 134268471 1I TCGACTAGAG -/T GAAATAAATT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 0 1 217770 CASAVA_Build 4 134271946 2D CATACTAGAC TT/-- AAATTTTCAG 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 T 2 0 217771 CASAVA_Build 4 134275407 4I ATATTTGTTG ----/AATA AATAAATGAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AATA 1 2 217772 CASAVA_Build 4 134285012 1I ATTTGACTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 T 9 10 217773 CASAVA_Build 4 134300734 4D TCTGAAGTTT ATTG/---- ATTTACTATT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 ATTG 1 0 217774 CASAVA_Build 4 134301012 1D ATATCCTCAC T/- TTTTTTTTTT 2761 het 2761 ref 23 11 7 5 T 12 11 217775 CASAVA_Build 4 134305907 1D TCTAGACTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 11 10 217776 CASAVA_Build 4 134333633 1I CAGAAAAAAA -/T AATCATGTCA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 0 1 217777 CASAVA_Build 4 134333931 5I TTATTTTTTA -----/AAGAT AAGATATTAA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 AAGAT 1 2 217778 CASAVA_Build 4 134339530 3I AGTCCTAGAT ---/ATA ATAACAATAA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 ATA 1 2 217779 CASAVA_Build 4 134348175 1D ATTTGTGAGG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 9 8 217780 CASAVA_Build 4 134352935 10I GACAGATTGT ----------/AGAAGAAGTG AGAAGAATTA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 AGAAGAAGTG 0 1 217781 CASAVA_Build 4 134353946 1I AACATTCATG -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 6 7 217782 CASAVA_Build 4 134357137 46D AGGCAGGAGG ATAATCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA/---------------------------------------------- AACCCCGTCT 3070 het 3070 ref 29 19 12 4 ATAATCTGAGGTCAGAAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA 1 0 217783 CASAVA_Build 4 134358293 1D CTATTTTATG T/- TATACTTTAA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 T 2 1 217784 CASAVA_Build 4 134360222 1D TACAATTGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 10 9 217785 CASAVA_Build 4 134361688 5I TATTAAGTGG -----/GTCTT GTTAGAAATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 GTCTT 0 1 217786 CASAVA_Build 4 134361800 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 668 hom 40 2 31 8 C 1 0 217787 CASAVA_Build 4 134363240 5D TAAAACAGAC AAACA/----- AAACAAAAGT 3070 hom 114 het 46 0 38 10 AAACA 2 1 217788 CASAVA_Build 4 134363871 11D TAATGTGGAG GTCCAAATTCA/----------- GTGTTTGCTA 3070 hom 72 het 27 0 25 6 GTCCAAATTCA 1 0 217789 CASAVA_Build 4 134364290 2I TGCAAAAAGC --/AG AGAGTTATGT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AG 2 3 217790 CASAVA_Build 4 134364766 1I GACATATGGC -/A AACTTACTGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 3 217791 CASAVA_Build 4 134365001 1D CTGCAATAAC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 8 7 217792 CASAVA_Build 4 134365827 1D CACCCTTTTA T/- TTTTTTCAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 7 6 217793 CASAVA_Build 4 134366418 1I69M2I GACCAAGATA -GTTTAAAACATATGCATATTTATACACACATACACACTCACAAAAATCTGCATACATTGTACCTGAATG--/CGTTTAAAACATATGCATATTTATACACACATACACACTCACAAAAATCTGCATACATTGTACCTGAATGTA TATGTTTTAT 3070 hom 190 het 36 0 64 8 N/A 0 0 217794 CASAVA_Build 4 134370422 3I TTTCAGTCTC ---/AGA AGAAGAAGTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AGA 2 3 217795 CASAVA_Build 4 134372056 3I AAATCTGATG ---/TTA TTATTTATTT 3070 hom 91 het 36 0 31 5 TTA 1 2 217796 CASAVA_Build 4 134384024 1I TCAAGAAAGT -/A AAAACTTCAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 4 5 217797 CASAVA_Build 4 134386938 1I GTTTGAAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 A 8 9 217798 CASAVA_Build 4 134401216 4D TGACTACAAG TATT/---- TATTCCATTA 3070 het 3070 hom 26 9 14 4 TATT 2 1 217799 CASAVA_Build 4 134403335 1D ACTCCATAAA G/- GAGTTGTCTG 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 G 2 1 217800 CASAVA_Build 4 134410081 1D TGGATAAGCC A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 8 7 217801 CASAVA_Build 4 134411347 4D TTGTGTTCTT TCTC/---- TATCTAGTTG 3070 het 3070 ref 39 23 15 3 TC 2 0 217802 CASAVA_Build 4 134411745 1I AACTTTTTGT -/A TTAATAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 0 1 217803 CASAVA_Build 4 134417465 1D GCTCAGAGGA T/- TTTTTTTTTT 2091 het 2091 ref 42 22 6 14 T 15 14 217804 CASAVA_Build 4 134420965 2D24M2D TTTTCTATTC GTGTGTGTGTGTGTTTATATGTAAACAT/--GTGTGTGTGTGTTTATATGTAAAC-- GTGTGGTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 20 7 N/A 0 0 217805 CASAVA_Build 4 134423191 3D AAAAATAATA AAT/--- AATAATAATA 1842 het 70 hom 8 2 5 1 AAT 7 6 217806 CASAVA_Build 4 134424869 1D TTTCTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1910 het 1910 ref 26 11 9 6 T 13 12 217807 CASAVA_Build 4 134438332 1D AGGCTGGTAG T/- TTTACTAACC 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 T 4 3 217808 CASAVA_Build 4 134440617 1I TTTTTCCCTG -/A AAAAAAAAAA 2896 het 2896 ref 28 14 7 7 A 11 12 217809 CASAVA_Build 4 134441595 3D AAGAAGTTAA AAT/--- AATAATAATA 1442 het 1442 ref 11 7 3 1 AAT 5 4 217810 CASAVA_Build 4 134449901 1D TCTTCCCTGA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 7 6 217811 CASAVA_Build 4 134453560 1D AAATACACAA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 48 het 23 0 17 7 T 8 7 217812 CASAVA_Build 4 134464006 1I ATATTCATCA -/G GGGTTTGGCT 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 G 3 4 217813 CASAVA_Build 4 134480728 1I CCAAGACTTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 8 9 217814 CASAVA_Build 4 134483099 5I GATTCTTACT -----/TAAGA TATTTGTTCT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TAAGA 0 1 217815 CASAVA_Build 4 134494818 4I TACAACTATG ----/TAAC TGACATAATA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TAAC 0 1 217816 CASAVA_Build 4 134496715 2D CAAAGACATG TT/-- TTGGTAACCA 3070 het 3070 ref 49 29 15 6 T 4 2 217817 CASAVA_Build 4 134504547 6D TTGATATACT TATTTA/------ TATTTATATG 3070 het 3065 hom 27 8 18 7 TATTTA 2 1 217818 CASAVA_Build 4 134505252 2D TAATATAATT AA/-- AAATAATTAT 3070 het 1691 hom 18 4 11 3 A 5 3 217819 CASAVA_Build 4 134516792 6I ATGAATAAAT ------/AAATAA AAATAAAACA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 AAATAA 1 2 217820 CASAVA_Build 4 134527831 1D ATTAACATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 26 1 21 5 A 11 10 217821 CASAVA_Build 4 134527979 1D TGGTGCTTTT G/- GGGTTCAAAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 G 4 3 217822 CASAVA_Build 4 134545481 1D TCCCCTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 136 hom 33 1 10 22 T 12 11 217823 CASAVA_Build 4 134552166 2D CATGTGTGTG TA/-- GGCACGCACA 2867 het 2867 ref 24 15 7 2 TA 1 0 217824 CASAVA_Build 4 134613439 1D CTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 63 het 27 0 22 6 T 9 8 217825 CASAVA_Build 4 134617811 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 AT 9 8 217826 CASAVA_Build 4 134685159 1D TATGATGGAG A/- AAAAAAGATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 7 6 217827 CASAVA_Build 4 134686252 1I ACCTCAAAAA -/G GTTCCAGCTT 3070 hom 111 het 43 0 35 8 G 1 2 217828 CASAVA_Build 4 134689404 1D AACTGACATG A/- AGTTTTAAAT 3070 het 2011 hom 16 7 8 1 A 2 1 217829 CASAVA_Build 4 134690990 1D TTGGTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 1668 het 1668 ref 35 22 4 9 T 12 11 217830 CASAVA_Build 4 134692769 1D TTCAGAGTTC T/- TTGTTTTTAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 3 2 217831 CASAVA_Build 4 134697705 1D TTTCTACTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 376 hom 32 1 28 4 T 10 9 217832 CASAVA_Build 4 134704617 1D ATAATTGTGT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 8 7 217833 CASAVA_Build 4 134705076 2D ACAAAAACTC TT/-- TTGAAATTAA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 T 4 2 217834 CASAVA_Build 4 134705134 1I CATTGCAGTG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 27 het 16 0 10 6 T 7 8 217835 CASAVA_Build 4 134705319 1D34M1I TATTTTTTAC AACCTCTTCTGATTTTACACCCTGTTTGTTCACTT-/-ACCTCTTCTGATTTTACACCCTGTTTGTTCACTTA AAAAACTGAC 3070 hom 99 het 36 0 34 10 N/A 0 0 217836 CASAVA_Build 4 134710036 1D TTTGTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1169 hom 37 3 20 14 T 12 11 217837 CASAVA_Build 4 134712602 2I AGCCAATCAC --/AT TGAGATGACA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 217838 CASAVA_Build 4 134712726 8D GCAGGGAAGA AATGTAAC/-------- AATGTGTAAG 3070 het 3070 ref 48 24 22 7 AATGTAAC 1 0 217839 CASAVA_Build 4 134799572 1I TTCTTCTGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 18 15 13 T 9 10 217840 CASAVA_Build 4 134800945 1D GGAAATGAAG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 T 7 6 217841 CASAVA_Build 4 134802628 3I CTTCTTTATC ---/CAA CAATCTATGC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 CAA 1 2 217842 CASAVA_Build 4 134804139 5I TTCTTATGAC -----/TAGAT TAAACAGTTC 3070 het 3070 ref 44 24 19 1 TAGAT 0 1 217843 CASAVA_Build 4 134819397 10I TTGATCTAAA ----------/CAAGAGTTAT GCTTTTATGG 3070 het 3070 ref 34 18 16 1 CAAGAGTTAT 0 1 217844 CASAVA_Build 4 134821339 21D9M6D GAAAACATAA TGTGTAGTTTATACTACTGAGATGTGTAGTTTATAC/---------------------ATGTGTAGT------ TACTGAGATG 3070 het 3070 ref 27 21 7 2 N/A 0 0 217845 CASAVA_Build 4 134823749 3I GGACTTAAGG ---/ACC ACCTTCATCA 3070 het 3070 ref 57 26 25 6 ACC 1 2 217846 CASAVA_Build 4 134833439 2D ATAAAGGGAC AG/-- AGAAAAATCT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 AG 2 1 217847 CASAVA_Build 4 134839765 2D TATGTAGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 12 10 217848 CASAVA_Build 4 134849226 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACTTCC 3070 het 1320 hom 26 6 13 7 C 0 1 217849 CASAVA_Build 4 134858901 1I CTGACTCTCC -/A AATAATCTTC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 2 3 217850 CASAVA_Build 4 134860271 2D AATTTTAAAA TT/-- TTATATATAA 2804 het 2804 ref 20 11 8 1 T 4 2 217851 CASAVA_Build 4 134861605 1D GCTAATGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 20 18 3 T 10 9 217852 CASAVA_Build 4 134862393 2D ACTTGTTTCC TG/-- TGTGTGTGTG 1291 het 1291 ref 54 43 3 9 TG 6 5 217853 CASAVA_Build 4 134881390 1D AAATGAAGAC A/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 1 0 217854 CASAVA_Build 4 134926460 4D AAAGAAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AAAG 4 3 217855 CASAVA_Build 4 134927243 4D TTTTTTTAAT TTTA/---- TTTATTTATT 220 hom 10 het 15 0 4 11 TTTA 3 2 217856 CASAVA_Build 4 134935869 1D TTTTATTTTT A/- ACTTAATCTA 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 A 2 1 217857 CASAVA_Build 4 134943328 2I CTCATAAAAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 A 9 11 217858 CASAVA_Build 4 134955644 1D TCAGAATCAC A/- AAACTACATG 3070 hom 83 het 32 0 29 3 A 4 3 217859 CASAVA_Build 4 134963044 1D TTCCTTTTTA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 36 het 14 0 13 2 T 8 7 217860 CASAVA_Build 4 134968234 4D TTTTATATTG TCTT/---- TCTAACTGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TCTT 1 0 217861 CASAVA_Build 4 134980100 1D ATTTGGGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 113 het 46 0 39 7 T 10 9 217862 CASAVA_Build 4 134980607 1D TTAAATTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 10 9 217863 CASAVA_Build 4 134992334 1D CCCATGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 37 1 30 7 A 13 12 217864 CASAVA_Build 4 134999762 1I AGAAAAATAG -/A AAAAATAGTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 217865 CASAVA_Build 4 135005533 1D CATGTTATTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 95 het 38 0 32 6 A 10 9 217866 CASAVA_Build 4 135011153 4I18M1D TTAAAAAAGC ----TAAGTGACACATCAAAAAT/TAAGTAAGTGACACATCAAAAA- ATCATTAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 4 N/A 0 0 217867 CASAVA_Build 4 135011565 1D GAGAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 A 12 11 217868 CASAVA_Build 4 135014939 6D GTCTATTTCC CTCTCT/------ CTCTCTCTCT 3070 hom 37 het 46 1 37 9 CT 11 8 217869 CASAVA_Build 4 135028478 1I GTTTGGGACA -/T CCAATATTGA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 0 1 217870 CASAVA_Build 4 135030701 1D CCCTGCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 12 11 217871 CASAVA_Build 4 135034753 4D TGAACATCAA CTTT/---- CTTTCATATT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 CTTT 2 1 217872 CASAVA_Build 4 135040584 2D TTTATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TA 7 6 217873 CASAVA_Build 4 135046607 1D GATTTTAGAA T/- TTGTTTTCTA 3070 hom 117 het 42 0 39 5 T 3 2 217874 CASAVA_Build 4 135049754 2I GATTTTTTTT --/TC TTTTTGTTGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TC 0 1 217875 CASAVA_Build 4 135065594 1D AATTGTATAT A/- AAAAATTAGC 3070 het 3070 ref 33 22 9 3 A 6 5 217876 CASAVA_Build 4 135075943 2I GGTTGTCCCC --/CT GAGTCCCTGG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 CT 0 1 217877 CASAVA_Build 4 135083061 3I ATTACTTAAC ---/ACA ACATTAGCAC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 ACA 1 2 217878 CASAVA_Build 4 135099768 1I GCAAAATTTC -/T TTTAAGTATC 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 T 3 4 217879 CASAVA_Build 4 135101991 1D GAATCCCTAA G/- CCTAGCTGGG 3070 het 3070 hom 43 12 22 10 G 1 0 217880 CASAVA_Build 4 135104943 1I AAAAATTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 A 10 11 217881 CASAVA_Build 4 135113977 1D AGAGCATAGG A/- AAAAAAAAAA 1529 het 1529 ref 40 29 4 7 A 11 10 217882 CASAVA_Build 4 135138102 1I ATGTCTTATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 8 9 217883 CASAVA_Build 4 135142721 3D TCTTCAGATC ATA/--- ATAATAATTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 7 ATA 3 2 217884 CASAVA_Build 4 135147507 1I GCAATGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 10 11 217885 CASAVA_Build 4 135147947 1D TTACTTTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 10 9 217886 CASAVA_Build 4 135165350 1I TTTTAAAAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 80 het 29 0 27 2 T 8 9 217887 CASAVA_Build 4 135169044 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 40 1 25 14 T 13 12 217888 CASAVA_Build 4 135175617 1I GAAAACTTTA -/T TTTTGTCTTA 3070 hom 120 het 49 0 39 10 T 4 5 217889 CASAVA_Build 4 135176048 1I GCTAAAATAA -/G TCAAGTAATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 217890 CASAVA_Build 4 135177662 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 26 1 12 13 A 15 14 217891 CASAVA_Build 4 135183792 2I CAGCACAATT --/TC TGTTATTTTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TC 0 1 217892 CASAVA_Build 4 135184289 1D AAAGAAAAAA C/- AAAATACATC 3070 het 3070 ref 46 26 17 4 C 1 0 217893 CASAVA_Build 4 135205946 1I TTTATCTAAT -/G ATTAGTGATG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 0 1 217894 CASAVA_Build 4 135219257 1D GTTTTGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 38 4 13 21 T 17 16 217895 CASAVA_Build 4 135220022 1I CATCTTTACT -/A AAAAAAAAAT 2256 hom 21 het 8 0 7 1 A 9 10 217896 CASAVA_Build 4 135244652 5I GTAGCTTCTT -----/TAAAC TAGTGACATT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 TAAAC 0 1 217897 CASAVA_Build 4 135245096 1I ACCCATATGC -/A CATATAAGCT 3070 het 3070 ref 52 27 17 8 A 0 1 217898 CASAVA_Build 4 135260866 1D TGTTCTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2462 het 1591 hom 23 6 8 10 T 15 14 217899 CASAVA_Build 4 135267199 1D CCCTTTAGTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 9 8 217900 CASAVA_Build 4 135285185 1D CTACCAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 526 hom 23 3 10 12 A 16 15 217901 CASAVA_Build 4 135286957 1I ATTTTTAATG -/A TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 0 1 217902 CASAVA_Build 4 135294272 4I TATTTTCTTA ----/AGAT AGATAGAGTC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 AGAT 1 2 217903 CASAVA_Build 4 135319093 1I AGCCAGAGTG -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 7 8 217904 CASAVA_Build 4 135320731 1D TACTGTAAAA T/- TGTCCACAGA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 2 1 217905 CASAVA_Build 4 135325519 1D CTGCACTGTT A/- TTTTTATTTG 3070 het 3070 ref 46 20 21 5 A 1 0 217906 CASAVA_Build 4 135329926 1I TCTCTTCAAA -/T TTGCATTTTG 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 T 2 3 217907 CASAVA_Build 4 135337420 1D ACTGACTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 T 12 11 217908 CASAVA_Build 4 135339143 1I TAGTTATGAG -/A AAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 A 6 7 217909 CASAVA_Build 4 135345346 1I TTTTTTTTTT -/G TGTTTTTGTT 3070 het 1689 hom 32 6 23 3 G 0 1 217910 CASAVA_Build 4 135359311 2I TTCTCTGGGA --/TT TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 8 10 217911 CASAVA_Build 4 135369094 1D CTGCATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 15 12 T 13 12 217912 CASAVA_Build 4 135375891 8D GAAGCACAAA AAAATAAG/-------- AAAATACAAA 3070 het 3070 hom 37 19 17 3 AAAATAAG 1 0 217913 CASAVA_Build 4 135387235 2D TCCCCCCCCC CT/-- CCCCACAACA 958 het 34 hom 7 1 2 5 CT 1 0 217914 CASAVA_Build 4 135406136 1I AGGAGACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 10 11 217915 CASAVA_Build 4 135451882 1I ATTAGCCTGG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 6 7 217916 CASAVA_Build 4 135453945 1D AATTGTGTGA T/- TTTTTTTTAT 2103 het 2103 ref 24 17 5 2 T 9 8 217917 CASAVA_Build 4 135468724 2D CAGGAGTTTT GC/-- GGGGGGGGAC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 GC 1 0 217918 CASAVA_Build 4 135470016 1D AGGTTAAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 10 9 217919 CASAVA_Build 4 135470599 2D TTAAAAAATA AG/-- ACATTATGAA 3070 het 3070 ref 29 18 10 3 AG 1 0 217920 CASAVA_Build 4 135472221 1I TTCTCCTTAC -/T TTTTTTTTCT 2732 het 2732 ref 22 13 7 2 T 8 9 217921 CASAVA_Build 4 135472753 1D TTTAATTATC T/- TTTTTATTAT 3070 het 3070 hom 38 11 26 1 T 6 5 217922 CASAVA_Build 4 135478726 3I TCATTTCAAT ---/GAA GAGTCTGTTT 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 GAA 0 1 217923 CASAVA_Build 4 135481435 1D ACATTTTACA T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 T 7 6 217924 CASAVA_Build 4 135489868 3D TTTATGATAA AAT/--- AATATGTTGA 3070 het 3070 hom 45 16 26 4 AAT 2 1 217925 CASAVA_Build 4 135493046 1D GCATGTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 T 11 10 217926 CASAVA_Build 4 135504518 1I ATTTTTCTTC -/T TTTAGAATTA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 T 3 4 217927 CASAVA_Build 4 135517456 1D TTAAAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 11 10 217928 CASAVA_Build 4 135520211 1I CATTCCAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 12 13 217929 CASAVA_Build 4 135522631 1I TTAGTCATAG -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 7 8 217930 CASAVA_Build 4 135523449 1D GTTTATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 11 10 217931 CASAVA_Build 4 135526741 2I ATAGTGTGTG --/TA TATATATATA 2743 het 2644 hom 18 7 9 2 TA 5 6 217932 CASAVA_Build 4 135534457 2D GCACAAACCC TT/-- TTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 49 18 22 9 T 8 6 217933 CASAVA_Build 4 135543404 1D AATCTTAATT A/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 1 0 217934 CASAVA_Build 4 135543817 4D AACAAACATT CAAA/---- CAAACAACAA 3070 het 3070 ref 27 14 8 7 CAAA 2 1 217935 CASAVA_Build 4 135548014 1D TACTCTTTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 8 7 217936 CASAVA_Build 4 135551576 1I CATCCCACTT -/A AACCTCTGTC 3070 het 3070 hom 43 14 26 3 A 2 3 217937 CASAVA_Build 4 135552647 1I ATTATTTGTA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 T 6 7 217938 CASAVA_Build 4 135566078 1D ACTCTATCAG A/- AAAAAAAAAA 1227 het 1227 ref 15 10 3 2 A 15 14 217939 CASAVA_Build 4 135568601 1I TGAAATCAGG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 6 7 217940 CASAVA_Build 4 135570038 5I GAAAAAAAGC -----/ATAGG ATAGGATTGT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 ATAGG 1 2 217941 CASAVA_Build 4 135573569 4I CCTGGAAACA ----/TAGT TAGACACTCT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TAGT 0 1 217942 CASAVA_Build 4 135587246 12I CACATGAAGC ------------/CTGTAGATGAAT AGGGACGTTG 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 CTGTAGATGAAT 0 1 217943 CASAVA_Build 4 135606532 1D GTAGAAAGTC A/- AAAAAGTATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 6 5 217944 CASAVA_Build 4 135615302 1D GAATTCCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1907 hom 23 6 10 8 A 11 10 217945 CASAVA_Build 4 135615714 1I TTGTTGCAGC -/T TTTTTCACTC 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 T 5 6 217946 CASAVA_Build 4 135617726 2I CTCTGGACTC --/TA TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 TA 0 1 217947 CASAVA_Build 4 135625486 1D CTACTTCAAG A/- ATGAATTGCA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 A 2 1 217948 CASAVA_Build 4 135630299 1D AGCATTATTT A/- AATAGATTAG 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 A 3 2 217949 CASAVA_Build 4 135632834 4I GATGAACAAT ----/TATG TATGTGCTAA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 TATG 1 2 217950 CASAVA_Build 4 135635434 1D GAGCATCACC T/- TGACTTCAAA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 T 2 1 217951 CASAVA_Build 4 135640012 1D ATAAAGACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 52 het 33 0 18 15 T 10 9 217952 CASAVA_Build 4 135640640 8D CATAAAATGT TATATGTA/-------- TATATGTATA 3070 het 3070 ref 44 20 14 12 TATATGTA 3 2 217953 CASAVA_Build 4 135647948 1I ATTTCTGCCT -/A AGGAGACAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 1 2 217954 CASAVA_Build 4 135651590 16I45M1D AAAACAAGAA ----------------CCCCAAATGGCTAGGATCTGATTAATAACTGAGAGATAATTTTTGC/CCCCTGTATCAGTCAGCCCCAAATGGCTAGGATCTGATTAATAACTGAGAGATAATTTTTG- CCATTTTTCC 3070 hom 167 het 44 0 55 13 N/A 0 0 217955 CASAVA_Build 4 135656098 1D TAAAAACGTA T/- TTTTATAGTG 3070 hom 117 het 43 0 40 5 T 5 4 217956 CASAVA_Build 4 135661670 1I GAAAAAAAAA -/C CTACTGTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 C 1 2 217957 CASAVA_Build 4 135665308 1I TGAGCTTAAA -/G GTTTGTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 1 2 217958 CASAVA_Build 4 135667277 1I CACATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 676 hom 36 2 26 8 A 11 12 217959 CASAVA_Build 4 135667757 4D AGGCATAGGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 40 3 23 14 T 19 15 217960 CASAVA_Build 4 135684252 1I ATCAAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 23 6 T 12 13 217961 CASAVA_Build 4 135701968 2I GGTAAGGCTC --/AT GTGTGTGATT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AT 0 1 217962 CASAVA_Build 4 135704106 2I AAAGAAAGAA --/AG AGAAAAAAGA 2648 hom 18 het 17 0 9 8 AG 1 2 217963 CASAVA_Build 4 135706552 2I CCTAGATTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 21 10 T 10 12 217964 CASAVA_Build 4 135720562 5D TTCTTTTTCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 34 2 18 15 T 21 16 217965 CASAVA_Build 4 135726297 1D AAAATGAAAT A/- AAAAAAAAAA 1347 het 1347 ref 46 32 5 11 A 12 11 217966 CASAVA_Build 4 135727537 1D TTTAAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 158 hom 26 1 19 7 A 11 10 217967 CASAVA_Build 4 135728855 1D ATTTGTTGGG A/- AAAAAAAAAC 1162 het 1162 ref 37 26 4 7 A 10 9 217968 CASAVA_Build 4 135737031 1D CTTTCACCAC T/- TTTATTCAAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 4 3 217969 CASAVA_Build 4 135740930 1D TTGTCACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1002 hom 46 5 27 14 T 15 14 217970 CASAVA_Build 4 135742822 2I TTAATAAGAC --/TG TGTGAGAAAA 3070 hom 88 het 34 0 30 4 TG 2 3 217971 CASAVA_Build 4 135748566 3D TGAGGTAACT AAG/--- AAGAACTTAC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AAG 2 1 217972 CASAVA_Build 4 135753630 1I ACACGAGATG -/A AAAAAATCAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 6 7 217973 CASAVA_Build 4 135756034 6D TTAGGGAGAG GAGAGA/------ GAGAGAGAGA 3070 het 17 hom 30 1 19 10 GA 11 8 217974 CASAVA_Build 4 135763611 5I GACCTTGCAG -----/TGGCA TGGCATGGCA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TGGCA 2 3 217975 CASAVA_Build 4 135765277 5D GATGCTAATT ATTAC/----- AAATTGTCAC 3070 hom 172 het 59 0 57 5 ATTAC 1 0 217976 CASAVA_Build 4 135770519 1D TTATGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 12 11 217977 CASAVA_Build 4 135770531 1D TTTTTTTTTT C/- TTGGTTCTAT 3070 het 14 hom 32 2 23 7 C 1 0 217978 CASAVA_Build 4 135772308 1D GAGTTTTTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 8 217979 CASAVA_Build 4 135774242 1I GATCATTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 333 hom 43 1 41 1 T 10 11 217980 CASAVA_Build 4 135779246 12D TCTCTGGCGA TTCTCATTTCCC/------------ TTCTCATTTC 3070 hom 93 het 33 0 29 6 TTCTCATTTCCC 2 1 217981 CASAVA_Build 4 135786094 3D TAAATATATA GAT/--- GATGAACACA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 GAT 2 1 217982 CASAVA_Build 4 135791156 1D TATGGCTACC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 42 0 34 8 T 9 8 217983 CASAVA_Build 4 135794303 1D TGTGAATACC A/- ATGTTTTAGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 2 1 217984 CASAVA_Build 4 135795719 2I TGTTTTTTTT --/AA CAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 0 2 217985 CASAVA_Build 4 135797753 1D TTTATATGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 T 9 8 217986 CASAVA_Build 4 135809635 27I TAAAGTTATC ---------------------------/AACTCAGTAGAAAGGTCAGTTTTTATT AGTAGCATAA 3070 hom 108 het 39 0 37 5 AACTCAGTAGAAAGGTCAGTTTTTATT 0 1 217987 CASAVA_Build 4 135942493 1D CTCTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 1468 het 1468 ref 25 13 4 8 T 19 18 217988 CASAVA_Build 4 135958492 1I TTGTTTTTTT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 6 7 217989 CASAVA_Build 4 135984763 1D AAATTTTGGT C/- TTATATATAT 3070 het 1468 hom 18 3 13 2 C 1 0 217990 CASAVA_Build 4 136014306 1I GAGAAGTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 A 10 11 217991 CASAVA_Build 4 136025759 1D CTACCCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 11 10 217992 CASAVA_Build 4 136028334 1I AAAAGTTTTT -/C CTTTTACATA 2358 het 2358 ref 24 16 7 1 C 1 2 217993 CASAVA_Build 4 136041217 1D TGTTCTTTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 70 het 35 0 24 11 T 9 8 217994 CASAVA_Build 4 136054251 1D TATTACCTGC A/- AATTAACTGG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 3 2 217995 CASAVA_Build 4 136054407 2D GCACTGAATT AA/-- GTCTTTAAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 2 0 217996 CASAVA_Build 4 136054783 1D TGTAACCAAA T/- TAAAAACATC 3070 hom 76 het 30 0 26 4 T 2 1 217997 CASAVA_Build 4 136055657 9I ACTCCTTGGG ---------/GAAAACAGA GAAAACAGAG 3070 hom 60 het 27 0 21 12 GAAAACAGA 1 2 217998 CASAVA_Build 4 136056833 4I AACACTATAA ----/CTGC CTGCTTATGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CTGC 1 2 217999 CASAVA_Build 4 136061143 1I GGCTGGGCGT -/G GGGGGCTCAC 3070 hom 51 het 19 0 15 4 G 5 6 218000 CASAVA_Build 4 136062068 1D30M2D TAACAAGTAT AAAAAAAAAAAGATCTTGACTTGTAGTGTTTAC/-AAAAAAAAAAGATCTTGACTTGTAGTGTTT-- GCCACTTTCT 3070 hom 117 het 38 0 40 4 N/A 0 0 218001 CASAVA_Build 4 136067314 2I TACTGGGTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 441 hom 21 1 12 8 AT 6 7 218002 CASAVA_Build 4 136070164 1I CATAATTTGG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 8 218003 CASAVA_Build 4 136070640 1I CCAACCCAGT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 109 het 46 0 37 9 A 7 8 218004 CASAVA_Build 4 136073951 2I GAAACCCCAC --/TG TGTCTTCTCA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TG 1 2 218005 CASAVA_Build 4 136075894 6I GAATGTTTAC ------/TTAAAA TTGAAGTTGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTAAAA 0 1 218006 CASAVA_Build 4 136076502 1I CTGCCTTTTT -/C AGCTTCTGGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 218007 CASAVA_Build 4 136082104 2I AGGCACTGTG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 9 11 218008 CASAVA_Build 4 136082277 4D CTTAGGTAAT GGCC/---- GGGGGGGGCG 3070 hom 96 het 39 0 32 8 GGCC 1 0 218009 CASAVA_Build 4 136098465 1D AAAAAGAAGT A/- AAAAGACTCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 5 4 218010 CASAVA_Build 4 136115000 1D AATGAAAAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 10 9 218011 CASAVA_Build 4 136120369 1D TACACAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 41 0 26 15 T 13 12 218012 CASAVA_Build 4 136123717 1D TTTTTAAAGA G/- TGCTTTCAGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 1 0 218013 CASAVA_Build 4 136125745 1I AAAGATAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 8 9 218014 CASAVA_Build 4 136126270 4D ATAAAAAAAC AAAG/---- AAAGATAAAG 3070 hom 60 het 23 0 21 4 AAAG 2 1 218015 CASAVA_Build 4 136126760 1D TATTTATAAG A/- ATTTATTTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 1 218016 CASAVA_Build 4 136131708 3D ACCAAAAGAG AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 36 0 18 18 A 12 9 218017 CASAVA_Build 4 136132500 1I AAGAATTCGA -/G AAATAGAGAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 0 1 218018 CASAVA_Build 4 136136089 1I GACTTTGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 9 10 218019 CASAVA_Build 4 136137832 1I GTTACTCATA -/T TTACCCTTGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 3 218020 CASAVA_Build 4 136139103 1I TCTCTATATA -/T TTTTTTCATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 6 7 218021 CASAVA_Build 4 136139500 1I CCACTGGTAA -/C CATATTTTCA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 1 2 218022 CASAVA_Build 4 136143204 1I TTATATATTA -/C CATAAAGGCA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 C 1 2 218023 CASAVA_Build 4 136145206 1I AGGAAATCTG -/A AAAAAGAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 6 218024 CASAVA_Build 4 136149220 23I CCTTTTTGCT -----------------------/AACTTGGTCAGCACAGAGCATTC AGTCAAAACT 3070 hom 102 het 32 0 35 2 AACTTGGTCAGCACAGAGCATTC 0 1 218025 CASAVA_Build 4 136149768 1I TTGTTTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 853 hom 30 5 14 11 T 14 15 218026 CASAVA_Build 4 136151804 1I CTGCTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 33 1 26 6 A 0 1 218027 CASAVA_Build 4 136153634 1D ATTGAGAAAC T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 8 7 218028 CASAVA_Build 4 136154349 2D ACACGATGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 37 1 27 9 T 17 15 218029 CASAVA_Build 4 136154765 1I CCTTGATTTT -/A TTCTTTTTCA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 0 1 218030 CASAVA_Build 4 136156470 1D ACTAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 624 hom 41 2 29 10 T 12 11 218031 CASAVA_Build 4 136157257 2D TAATATATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 35 het 22 0 14 8 TA 8 7 218032 CASAVA_Build 4 136164016 1D ATTACTTATC A/- AAAAGAAGTA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 5 4 218033 CASAVA_Build 4 136166537 1D TCAAAGTGTC T/- TTTTAGACAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 5 4 218034 CASAVA_Build 4 136169236 2I ACTCTATCTC --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 74 het 30 0 25 8 A 9 11 218035 CASAVA_Build 4 136177457 1I CTTTGATGAA -/C CTTTTTTTTG 3070 het 256 hom 31 1 21 9 C 1 2 218036 CASAVA_Build 4 136183870 3D TGCCTATGTT TTG/--- ACTCTGACCC 3070 het 3070 hom 41 17 21 5 TTG 1 0 218037 CASAVA_Build 4 136185986 1I AGTTAAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 9 10 218038 CASAVA_Build 4 136195922 2D TCTTTCTTTC TT/-- TCTTTCTTTC 1693 het 993 hom 27 7 8 12 T 3 1 218039 CASAVA_Build 4 136196496 1D TAATTGTTCA G/- TTAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 G 1 0 218040 CASAVA_Build 4 136197640 1I ATAAATGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 10 11 218041 CASAVA_Build 4 136199454 1D TGCCTTTTCC A/- AAACCACCCT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 4 3 218042 CASAVA_Build 4 136202816 1I AATTCAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 10 11 218043 CASAVA_Build 4 136203875 2D CTGGAAAATG AA/-- AAAAAAAAGT 3070 hom 23 het 28 0 9 20 A 10 8 218044 CASAVA_Build 4 136205773 1I CACCCTCTTC -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 6 7 218045 CASAVA_Build 4 136207347 19D GCTCTCAGCT GTAAGAGGGGACCCTGAAA/------------------- GTGGGTAGCC 3070 het 3070 hom 33 18 16 4 GTAAGAGGGGACCCTGAAA 1 0 218046 CASAVA_Build 4 136207760 2D TTTTGATTAC TA/-- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 45 17 25 5 TA 1 0 218047 CASAVA_Build 4 136214125 1D AATTGTCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 10 9 218048 CASAVA_Build 4 136229165 1I AGTCAAAGAA -/C AAGAAAACTG 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 C 0 1 218049 CASAVA_Build 4 136229281 1D TTGTCAACAA C/- AAAAATAAAT 2693 het 2693 ref 18 11 6 1 C 1 0 218050 CASAVA_Build 4 136229837 1I ATGTTGTTTG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 6 7 218051 CASAVA_Build 4 136230426 1I TGGTTTATAA -/C TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 C 0 1 218052 CASAVA_Build 4 136231275 2D CCCTGGTGAC AG/-- AGTGAGACTC 1520 het 1520 ref 12 6 5 1 AG 2 1 218053 CASAVA_Build 4 136231459 4D CAATTTAAAC AAAT/---- AAACCTTATT 3070 het 3070 hom 27 14 13 0 AAAT 1 0 218054 CASAVA_Build 4 136231963 1I CATGGCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 940 hom 29 4 23 2 A 11 12 218055 CASAVA_Build 4 136235671 3I GTTTCCGCAT ---/AAA ACTTGAAAAG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 1 4 218056 CASAVA_Build 4 136261145 2I GTTTTTTTTT --/TC TCTCTCTTTA 3070 hom 101 het 43 0 34 9 TC 3 4 218057 CASAVA_Build 4 136274315 1D CAGACTTACC A/- AATTTTTCCC 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 A 3 2 218058 CASAVA_Build 4 136279594 6D CCCCTATAGA ATTCTC/------ CAAAGGATTT 2638 het 2638 ref 22 14 6 2 ATTCTC 1 0 218059 CASAVA_Build 4 136289884 24D AGTGTGTGTG TGTATATATATATATATATATATA/------------------------ TATATATATA 3070 het 1037 hom 27 4 15 10 TGTATATATATATATATATATATA 1 0 218060 CASAVA_Build 4 136290333 1I AAAGTAAACA -/T TTTTTTGGAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 6 7 218061 CASAVA_Build 4 136290720 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTG 2936 het 2936 ref 34 14 10 10 T 10 9 218062 CASAVA_Build 4 136301868 10D CAGGGGCATT GGCTGAGGCA/---------- CTTTTCTACC 3070 het 3070 hom 36 16 18 6 GGCTGAGGCA 1 0 218063 CASAVA_Build 4 136304042 1D AATAAAGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 T 10 9 218064 CASAVA_Build 4 136307172 4D ATGTATATGT AGAG/---- AGAGAGAGAT 2571 het 2387 hom 15 7 8 1 AG 6 4 218065 CASAVA_Build 4 136330658 1D ATTTTTGTCA T/- TTAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 3 2 218066 CASAVA_Build 4 136331550 2I TGAAACACAG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 9 11 218067 CASAVA_Build 4 136337136 1D TAATTTTTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 A 10 9 218068 CASAVA_Build 4 136341026 1I TTTATTTGAA -/T TATTCCAATA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 1 2 218069 CASAVA_Build 4 136343590 2I TTTTTAACTC --/AT GTACATTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 AT 0 1 218070 CASAVA_Build 4 136345171 1D GATTTATGGT G/- GGGGGGATTG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 G 7 6 218071 CASAVA_Build 4 136345674 1D ACATGATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 11 10 218072 CASAVA_Build 4 136347111 4I GTGGCCCATA ----/CGTC AGTATACAGC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 CGTC 0 1 218073 CASAVA_Build 4 136348385 1D CACATACCAT G/- GGAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 G 3 2 218074 CASAVA_Build 4 136350884 1I ACTACTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 8 9 218075 CASAVA_Build 4 136351487 5I TAGTAGCTAA -----/AAGAT AAGATAATTT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 AAGAT 1 2 218076 CASAVA_Build 4 136354682 5D4M1D CCTCTCTCTC TAGAGTCAAT/-----TCAA- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 N/A 0 0 218077 CASAVA_Build 4 136357996 1D TTTTTCTTTT A/- AAAAAAACAG 3070 het 2429 hom 27 7 15 5 A 8 7 218078 CASAVA_Build 4 136362332 2D TTATAGTCAC TT/-- ATATTAAATA 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 T 2 0 218079 CASAVA_Build 4 136363757 4D TTTTGGTAAG TAAT/---- CCAGTGATTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 12 TAAT 1 0 218080 CASAVA_Build 4 136366218 5D AAAGATAGTT GAGAG/----- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 32 20 9 4 GAGAG 2 1 218081 CASAVA_Build 4 136368269 3D TTCTGTAGAA AAG/--- AAGATTTAAA 3070 het 3070 ref 47 25 19 5 AAG 2 1 218082 CASAVA_Build 4 136369096 2D CATCCAAAAC TT/-- TATTTTTGTC 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 T 3 1 218083 CASAVA_Build 4 136370013 3D TCCTTCTTTC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 TAT 5 4 218084 CASAVA_Build 4 136373328 2D AGTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2022 het 1171 hom 18 4 9 5 T 14 12 218085 CASAVA_Build 4 136378954 1I CTGGATACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 10 11 218086 CASAVA_Build 4 136387201 4D TCTTGACGCA TAAT/---- TATTTTGCAT 3070 het 3070 hom 31 11 17 5 TAAT 1 0 218087 CASAVA_Build 4 136402370 3I TCTACAAAAA ---/CTT CTTCAAAAAG 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 CTT 1 2 218088 CASAVA_Build 4 136405948 4I AATCCAAAAT ----/AGAC AGTCTAAATA 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 AGAC 0 1 218089 CASAVA_Build 4 136409248 1D TAACCATAGT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 1233 hom 23 6 11 6 G 10 9 218090 CASAVA_Build 4 136421377 1D TGACATCATT A/- AAAAATGAGC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 6 5 218091 CASAVA_Build 4 136422417 2D GTCCATTGAC AG/-- AATTACAAAG 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 AG 1 0 218092 CASAVA_Build 4 136431855 1I AATAATTTGT -/A AAGAACAAAT 3070 hom 154 het 60 0 52 8 A 2 3 218093 CASAVA_Build 4 136433326 1D AATTGACTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 10 9 218094 CASAVA_Build 4 136437750 1I AGAAAAAAAA -/T AATAACCATA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 0 1 218095 CASAVA_Build 4 136448387 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTTCTT 2333 het 2150 hom 12 5 6 1 T 7 8 218096 CASAVA_Build 4 136511713 1D CCATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 10 8 T 11 10 218097 CASAVA_Build 4 136541165 1D TTTGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 858 hom 30 2 23 6 A 13 12 218098 CASAVA_Build 4 136558234 1D TACTTATGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 9 8 218099 CASAVA_Build 4 136564528 4D TATCTAGAAA TAAG/---- TAATAGTATA 2042 het 2042 ref 13 7 5 1 TAAG 1 0 218100 CASAVA_Build 4 136569298 1D ACTAGCCAGT G/- CTATGTAAAT 3070 hom 160 het 60 0 54 8 G 1 0 218101 CASAVA_Build 4 136575273 5D TCATTAAATA TTTTC/----- TTTTCTTTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TTTTC 2 1 218102 CASAVA_Build 4 136595427 1I AAATAAGAAA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 1 2 218103 CASAVA_Build 4 136597079 1D TTTTTATAGA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 C 9 8 218104 CASAVA_Build 4 136604105 1D GCTTCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 T 12 11 218105 CASAVA_Build 4 136620149 1D AAAGTATAAA G/- TGAGGAGTGG 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 G 1 0 218106 CASAVA_Build 4 136629886 3I GAAGAAATGT ---/TTA TTTAGATCCT 3070 het 3070 ref 41 27 11 3 TTA 0 1 218107 CASAVA_Build 4 136631182 2D TTGTCCCTGC TT/-- CCTGAGAAGT 3070 het 3070 ref 46 26 15 6 T 2 0 218108 CASAVA_Build 4 136631855 7D GGATATAGAG GTAAAAT/------- GTGCAGCCTC 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 GTAAAAT 1 0 218109 CASAVA_Build 4 136633538 8D TGCTTGTTTA CTGATTTG/-------- CTGATTACTG 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 CTGATTTG 1 0 218110 CASAVA_Build 4 136643280 1D AGAAAAAGTA T/- ACTATAATGT 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 T 1 0 218111 CASAVA_Build 4 136685264 2I GACCCAGAAA --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 8 10 218112 CASAVA_Build 4 136688864 3I TCAAGTCTCT ---/AGA AGCTTTGTCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AGA 0 1 218113 CASAVA_Build 4 136691631 1D TTCTCACTTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 9 23 3 A 9 8 218114 CASAVA_Build 4 136695558 1D ATAAGTGAAT A/- TAATGAATCT 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 A 1 0 218115 CASAVA_Build 4 136707287 1I AGATTATGGT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 A 7 8 218116 CASAVA_Build 4 136710400 3D CTATGTGCTC CTT/--- AAGTCACATT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 CTT 1 0 218117 CASAVA_Build 4 136716396 1I GGTTATTTTG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 A 7 8 218118 CASAVA_Build 4 136732556 1D TTGCAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2035 hom 39 7 16 17 T 13 12 218119 CASAVA_Build 4 136741976 1I ACACAATTGG -/A AAAAAACTGG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 6 7 218120 CASAVA_Build 4 136754351 1I AAATAAAAGC -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 6 7 218121 CASAVA_Build 4 136761296 1D ATTCAGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 A 13 12 218122 CASAVA_Build 4 136764277 1I CAATACAATC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 8 9 218123 CASAVA_Build 4 136772558 1D AGTTTTTTTT G/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 G 1 0 218124 CASAVA_Build 4 136772921 1D GAAGCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 11 10 218125 CASAVA_Build 4 136777902 2I TGCTTTCATT --/TC TCTCTGTCTT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 TC 2 3 218126 CASAVA_Build 4 136778388 1D TCTCACCTCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 9 8 218127 CASAVA_Build 4 136779426 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 11 12 218128 CASAVA_Build 4 136785888 1D TAGTCTAGGA T/- ATGTCTTTAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 0 218129 CASAVA_Build 4 136786865 1D ACACATTCTG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 A 7 6 218130 CASAVA_Build 4 136854359 2D CTCCCTCCCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 22 het 16 0 8 8 CT 8 7 218131 CASAVA_Build 4 136855151 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 13 12 218132 CASAVA_Build 4 136856287 3D AATGCTACTA TTT/--- TAAATATGAG 3070 hom 87 het 36 0 30 8 T 4 1 218133 CASAVA_Build 4 136860747 4D AAAGCACTGC CTGA/---- CTAACAGTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 7 CTGA 1 0 218134 CASAVA_Build 4 136861899 1I ACTCTTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 522 hom 28 2 20 6 T 14 15 218135 CASAVA_Build 4 136862867 2I TGTGGGGTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 44 hom 53 1 41 11 TG 6 7 218136 CASAVA_Build 4 136863373 1D GTTTATACAG T/- TTTCCTATCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 4 3 218137 CASAVA_Build 4 136868180 3I ATGGAAGTGG ---/AAT AATATTGTAA 3070 hom 181 het 65 0 60 5 AAT 1 2 218138 CASAVA_Build 4 136871215 2I32M4D AAAAAGTGTG --TATATATATATATGCTTCTTGTATATATATATACAC/TATATATATATATATGCTTCTTGTATATATATAT---- ACACACACAC 2648 het 408 hom 9 2 6 9 N/A 0 0 218139 CASAVA_Build 4 136872894 1D ATAATTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 32 0 25 7 A 13 12 218140 CASAVA_Build 4 136892902 1I AGATAAGTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 9 10 218141 CASAVA_Build 4 136899460 3D TAAAATCAAA AGC/--- AGCAAGTTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 8 AGC 2 1 218142 CASAVA_Build 4 136902985 1I TATTGATATG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 9 218143 CASAVA_Build 4 136917795 3D ATTTTTATAT TCA/--- TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 29 0 29 1 TCA 1 0 218144 CASAVA_Build 4 136921582 3D TAAGAATGGG ATA/--- ATAATGCTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 ATA 2 1 218145 CASAVA_Build 4 136926561 4I TTTAAAATAA ----/ACTG ACAAGCATGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ACTG 0 1 218146 CASAVA_Build 4 136929492 1D GCATACAATC T/- TTTTTTTTTT 1654 het 1654 ref 35 19 6 11 T 17 16 218147 CASAVA_Build 4 136933406 1I AGACTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 35 1 28 6 A 10 11 218148 CASAVA_Build 4 136951150 2I AGACAACTGT --/AG ATCTTATGCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AG 0 1 218149 CASAVA_Build 4 136953594 8D AAACTAACCA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 117 het 45 0 40 8 AAAC 5 3 218150 CASAVA_Build 4 136954255 1D GAAACCTAAA G/- ACTTCACCAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 1 0 218151 CASAVA_Build 4 136967718 1D AGTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 28 0 24 4 A 12 11 218152 CASAVA_Build 4 136968762 1D AATTCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 15 14 218153 CASAVA_Build 4 136977137 1I AAGTTTAGAA -/C CGCTGGTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 218154 CASAVA_Build 4 136977284 4D TTCTCTATGA CTCT/---- CTCACATTTC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CT 3 1 218155 CASAVA_Build 4 136982680 2D CAACATCCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 46 0 29 17 A 14 12 218156 CASAVA_Build 4 136983127 1D TCTTCTCCTA T/- TTTTTTGTTC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 T 7 6 218157 CASAVA_Build 4 136991243 1I CTTGTATAAG -/T TTTTTAATAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 5 6 218158 CASAVA_Build 4 136994916 1I TCTTGACTTA -/T TTGTAGTCAT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 2 3 218159 CASAVA_Build 4 136995369 2I CAAGACTCCG --/AA AAAAAAAAAA 2626 hom 17 het 27 1 18 8 A 15 17 218160 CASAVA_Build 4 136998439 1D CAAATGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1630 hom 21 8 9 5 A 16 15 218161 CASAVA_Build 4 137002752 9I CTCATCCCTC ---------/CAGGAATGT CAGTCCTCCC 3070 hom 144 het 53 0 49 5 CAGGAATGT 0 1 218162 CASAVA_Build 4 137004836 23I CTTTAACATA -----------------------/ACATTTGTATGTAGAAGTACAGT ACATTTGTAT 3070 hom 21 het 8 0 8 1 ACATTTGTATGTAGAAGTACAGT 0 1 218163 CASAVA_Build 4 137006595 1D TGATAGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 10 9 218164 CASAVA_Build 4 137007412 1D TGAGGGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 32 2 24 6 T 11 10 218165 CASAVA_Build 4 137021103 2D AAAAAGAAAC TA/-- TTGTTATTTT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TA 1 0 218166 CASAVA_Build 4 137025004 1D TCATTTCCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 97 het 37 0 32 5 T 9 8 218167 CASAVA_Build 4 137029183 2I AAGAAACTAT --/AA AAAAAAAAGC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 8 10 218168 CASAVA_Build 4 137031720 1I TCTATTCATA -/T TTTTTGTGTA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 5 6 218169 CASAVA_Build 4 137058971 1I ATCTACTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 29 2 24 3 T 13 14 218170 CASAVA_Build 4 137059872 6I TTAAAAACTT ------/TATATC TATGGCATTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TATATC 0 1 218171 CASAVA_Build 4 137064710 1D ACTGGCGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 30 3 15 12 T 13 12 218172 CASAVA_Build 4 137092491 1D CTGGGCAACA T/- AGGGAGACCC 3070 hom 77 het 28 0 25 3 T 1 0 218173 CASAVA_Build 4 137104553 1D CTTAAAAAAA C/- ATCCTAGAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 C 1 0 218174 CASAVA_Build 4 137104650 1D TAATTTCACC A/- AAATGTCTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 4 3 218175 CASAVA_Build 4 137105632 1I TCTATACTAT -/C CCTACTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 C 2 3 218176 CASAVA_Build 4 137112269 4I AACTACAGGG ----/TTTA TTTAACTGGA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 TTTA 1 2 218177 CASAVA_Build 4 137116109 1I ACTCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 32 2 26 4 A 11 12 218178 CASAVA_Build 4 137123002 2I ATATAAACAC --/AT GTGTGTATAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 0 1 218179 CASAVA_Build 4 137125141 2I GTTCATATCC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 85 het 34 0 29 5 T 9 11 218180 CASAVA_Build 4 137126194 2I ACTGAGATAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 10 12 218181 CASAVA_Build 4 137127293 3D ACCAAACTGA TGT/--- TGTTCTTTTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TGT 2 1 218182 CASAVA_Build 4 137136149 1I ATAAACACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 888 hom 25 2 19 4 T 11 12 218183 CASAVA_Build 4 137144622 1I ACCATATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 10 11 218184 CASAVA_Build 4 137149124 23D CTGAGGGCAG CCCAGCACTGGCTGGCAGGTGCT/----------------------- CCTCAGCATA 3070 hom 48 het 13 0 16 3 CCCAGCACTGGCTGGCAGGTGCT 1 0 218185 CASAVA_Build 4 137160570 1I AGACTTCGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 920 hom 25 3 10 12 A 15 16 218186 CASAVA_Build 4 137163792 4I AATTAAATTG ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AAAC 1 2 218187 CASAVA_Build 4 137164211 1I AAACTATTAT -/G AAAAAAAAAG 3070 hom 59 het 24 0 20 4 G 0 1 218188 CASAVA_Build 4 137166058 1I ATATCTAGCC -/A AAAAAAAAAA 1066 het 1066 ref 33 21 4 8 A 13 14 218189 CASAVA_Build 4 137184793 1D TGGAGTAGGA T/- TTTTAAACCA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 5 4 218190 CASAVA_Build 4 137200402 3I CATTGTAAAT ---/AGA ATGAAGTAAA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 AGA 0 1 218191 CASAVA_Build 4 137201149 1D CATTCTTTAT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 24 11 11 4 A 8 7 218192 CASAVA_Build 4 137288648 2D GGTAGTTGAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 54 het 24 0 18 7 GT 12 11 218193 CASAVA_Build 4 137288844 1D ATTCTCAGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 10 9 218194 CASAVA_Build 4 137291481 1D TTATAAATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 18 0 15 4 A 10 9 218195 CASAVA_Build 4 137291777 1I AGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 9 10 218196 CASAVA_Build 4 137293124 1D CCACAGTTAC T/- GTCATCTGTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 1 0 218197 CASAVA_Build 4 137307171 1D CCTGTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 11 10 218198 CASAVA_Build 4 137341003 2I TAGGCATGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 TA 5 6 218199 CASAVA_Build 4 137353181 1D TAGTTACATA T/- TTTTTTTATA 2361 het 2361 ref 17 8 5 4 T 8 7 218200 CASAVA_Build 4 137364539 1D AATTTTACGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 A 10 9 218201 CASAVA_Build 4 137366554 1I GAAAGTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 503 hom 34 3 22 9 T 13 14 218202 CASAVA_Build 4 137373196 1I TACAAATCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 404 hom 27 1 22 4 A 9 10 218203 CASAVA_Build 4 137373523 1I CCCTAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 11 12 218204 CASAVA_Build 4 137375650 1D GGAACACGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 839 hom 33 3 20 10 T 17 16 218205 CASAVA_Build 4 137379547 1D AGACAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 1 0 218206 CASAVA_Build 4 137380524 1D GACCCCCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 12 11 218207 CASAVA_Build 4 137384504 2I AGCCAGTTGT --/GG GGGGGTGTGC 1374 het 1374 ref 27 17 3 7 G 5 7 218208 CASAVA_Build 4 137386079 2D TAGTTCAATG AA/-- AAGTCTGCTT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 4 2 218209 CASAVA_Build 4 137388934 2I TATAATAAGA --/AC ACAGGTTTAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AC 1 2 218210 CASAVA_Build 4 137389976 2I TTGTCCAATA --/TT TGCTTACTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 3 218211 CASAVA_Build 4 137392230 30D CTGATTAAGA AACAGATACACAATACCCAGCAAATATCCC/------------------------------ AACAGATACA 3070 hom 48 het 33 0 17 21 AACAGATACACAATACCCAGCAAATATCCC 2 1 218212 CASAVA_Build 4 137406876 1I ATAAGGAATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 27 11 8 8 T 8 9 218213 CASAVA_Build 4 137421392 1D CAAAATAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 T 9 8 218214 CASAVA_Build 4 137425835 1I AATATGTCAA -/T TTTTTCCAAC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 T 5 6 218215 CASAVA_Build 4 137447826 1I TTAAATAATG -/C CCCCCCCCAG 3070 het 180 hom 27 1 21 5 C 8 9 218216 CASAVA_Build 4 137448371 1D AATACAACAT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 8 7 218217 CASAVA_Build 4 137451528 1D TTTTTGATGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 9 8 218218 CASAVA_Build 4 137453321 1D CTGGAAAATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 586 hom 55 2 44 9 T 10 9 218219 CASAVA_Build 4 137454848 1D11M4I5M1I4M2D TGTTATTTAC GAAGGAAACAAA----TACAC-TCTTCA/-AAAGACACAGAATTCTACACAGCTT-- ATAAGAACAA 2493 het 2172 hom 10 6 6 3 N/A 0 0 218220 CASAVA_Build 4 137461285 1D GAAATGGCAG T/- TGGTGGTGGC 3070 hom 65 het 25 0 20 6 T 2 1 218221 CASAVA_Build 4 137467214 4I TAAAGATAAT ----/AGAG AGTAGATACC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AG 1 3 218222 CASAVA_Build 4 137484801 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1074 het 1074 ref 47 37 3 7 A 11 10 218223 CASAVA_Build 4 137488651 1I AAGAAAATTT -/A AATCTGAGTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 3 218224 CASAVA_Build 4 137490438 4I TGTGTTAAAT ----/ACTA ACTAAGTCTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 ACTA 1 2 218225 CASAVA_Build 4 137526581 1D TTGGAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 23 1 18 4 A 13 12 218226 CASAVA_Build 4 137530744 1I TTCATTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 12 13 218227 CASAVA_Build 4 137552270 1I CTGTCTCTAT -/A AAAAAAAAAA 2662 het 2662 ref 20 12 6 2 A 10 11 218228 CASAVA_Build 4 137571400 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAAAA 3005 het 3005 ref 27 13 8 6 A 12 13 218229 CASAVA_Build 4 137584932 3I ACATAGAAAA ---/GAT GCATGTATGA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 GAT 0 1 218230 CASAVA_Build 4 137588023 19I TTATAGAGGC -------------------/ATGATAGGCATATTATAAA ATGCACACAC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 ATGATAGGCATATTATAAA 0 1 218231 CASAVA_Build 4 137591616 4I47M2I TGTATAAAAT ----TCTCTCTCTCTCTCTATGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATAT--/TCTCTCTCTCTCTCTCTCTATGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATAC GCCTTTGAAA 3070 het 3070 ref 26 15 16 5 N/A 0 0 218232 CASAVA_Build 4 137596271 2I CAGTGTACTA --/TT TTATATATAT 3070 het 3070 ref 39 23 10 6 T 2 4 218233 CASAVA_Build 4 137597586 1D AGAATATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 11 10 218234 CASAVA_Build 4 137601692 6I ATTCAAAGAC ------/TCGCTT TCTCTTTCTC 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 TCGCTT 0 1 218235 CASAVA_Build 4 137607462 1I TTTAAGGAGT -/A AATATATTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 3 218236 CASAVA_Build 4 137621281 1I AAAATAACAA -/C AAAAACCAAG 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 C 0 1 218237 CASAVA_Build 4 137622706 3I TATCCAAAAC ---/TAT TATTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 TAT 1 2 218238 CASAVA_Build 4 137623378 1D TTCATCATGG A/- AAAAATATAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 A 6 5 218239 CASAVA_Build 4 137628180 3D AAAACTGTAT ATA/--- ATAAGTGTTT 3070 het 3070 ref 42 23 13 7 ATA 2 1 218240 CASAVA_Build 4 137628949 5I AGCTGTACTT -----/ATAAA ATAATTTCCA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 ATAAA 0 1 218241 CASAVA_Build 4 137642295 4D TTGAATTTTT GTGA/---- GTATTTTAAA 3070 hom 84 het 31 0 28 4 GTGA 1 0 218242 CASAVA_Build 4 137647188 2D TGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 32 het 28 0 16 12 TA 8 7 218243 CASAVA_Build 4 137647678 1I CTGAATAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 34 1 30 3 T 10 11 218244 CASAVA_Build 4 137650973 3D ATGCTGATGA TAC/--- TAATTGACTT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 TAC 1 0 218245 CASAVA_Build 4 137658094 1I ATTTCTACAA -/T TTTTTATATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 5 6 218246 CASAVA_Build 4 137658551 3D GATAATGGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 29 8 T 13 10 218247 CASAVA_Build 4 137672565 4I ACTTATTCTC ----/TATT TATATTTCAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TATT 0 1 218248 CASAVA_Build 4 137722334 4D TTCTTCCTTC CTTT/---- CTTTCTTTTT 2369 het 2249 hom 32 12 14 8 CTTT 3 2 218249 CASAVA_Build 4 137761725 2D AATTCAAAAC TG/-- TATTTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 13 15 1 TG 1 0 218250 CASAVA_Build 4 137763142 1D GAGAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 11 10 218251 CASAVA_Build 4 137774442 1I AAATTTTTTT -/A AAAAATTCCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 5 6 218252 CASAVA_Build 4 137775196 1D ATCTGTGATC T/- TTTTTTATAA 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 T 7 6 218253 CASAVA_Build 4 137778096 1I TTTAACTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2683 hom 31 8 14 9 T 10 11 218254 CASAVA_Build 4 137798580 1I TTTCTGCCAG -/A AAAAAAGACT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 A 6 7 218255 CASAVA_Build 4 137799137 1D TCCTTCATGC T/- TTTTTTTTTT 1797 het 1797 ref 32 18 6 8 T 17 16 218256 CASAVA_Build 4 137804816 2I TGGAGCATGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 CT 1 2 218257 CASAVA_Build 4 137805725 1I CTACAGAAGT -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 6 7 218258 CASAVA_Build 4 137807857 1I TGCTACTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 A 10 11 218259 CASAVA_Build 4 137808206 8D ACTCTGTCTC AGAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 1646 het 1646 ref 21 16 5 7 AGAAAAAA 1 0 218260 CASAVA_Build 4 137808482 1D TATAGAATTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 9 8 218261 CASAVA_Build 4 137812419 1D TACCCCATGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 10 9 218262 CASAVA_Build 4 137820507 10D GAGAGAGGGG GAGAGAGAGA/---------- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 35 15 13 9 GA 13 8 218263 CASAVA_Build 4 137822634 1I75M2D TTTTTGGTCT -CGATTCTAACAGTAAAAAATAAACGAGAGCTTGGTCATCTGTAGGGATCTTTCTGGGGTCCATTCTAAGACACACTT/GGGATTCTAACAGTAAAAAATAAACGAGAGCTTGGTCATCTGTAGGGATCTTTCTGGGGTCCATTCTAAGACACAC-- TTAAAATATA 3070 het 3070 ref 24 20 12 26 N/A 0 0 218264 CASAVA_Build 4 137839169 7I GTTAAATAAA -------/AAATCCT ACTGTTAAGC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 AAATCCT 0 1 218265 CASAVA_Build 4 137839719 1D CAGGATGATC T/- TTTTGTTTAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 5 4 218266 CASAVA_Build 4 137866727 1I AATTTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 T 12 13 218267 CASAVA_Build 4 137873438 1D GACTTCCTCT C/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 23 1 15 7 C 1 0 218268 CASAVA_Build 4 137875277 1D CATTCGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 20 7 A 11 10 218269 CASAVA_Build 4 137900182 1D GTGAAAATGG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 42 20 13 10 A 8 7 218270 CASAVA_Build 4 137908372 1D TGTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 1941 het 1941 ref 49 33 5 13 T 13 12 218271 CASAVA_Build 4 137925741 2D TTAAAATTGA CC/-- CATGTACTCA 3070 hom 144 het 51 0 49 4 C 3 1 218272 CASAVA_Build 4 137932486 3I CCCCTTCTCC ---/CTT CTTCTTTCAC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CTT 2 3 218273 CASAVA_Build 4 137933483 1D GCCTGTTTTT A/- AACTCGATTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 3 2 218274 CASAVA_Build 4 137933888 4D TCATGAAAAC CATG/---- CATGATACAG 3070 hom 78 het 29 0 27 4 CATG 2 1 218275 CASAVA_Build 4 137957694 1D CTGGAAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 7 218276 CASAVA_Build 4 137959035 1D CCTTTCTTAC T/- TTTTTCCCTT 3070 het 153 hom 30 1 25 5 T 6 5 218277 CASAVA_Build 4 137960223 1I CATTTGAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 26 2 19 5 A 11 12 218278 CASAVA_Build 4 137961638 1I AGAATAAAAT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 7 8 218279 CASAVA_Build 4 137967035 1D ATGTTTTACT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 27 0 23 5 A 8 7 218280 CASAVA_Build 4 137969004 1I TTTGAGCAAA -/C AATAGTCATG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 0 1 218281 CASAVA_Build 4 137971863 4I AAAATGAGAT ----/TAAG TAATTTTATA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TAAG 0 1 218282 CASAVA_Build 4 137974837 1I AAAGTAAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 8 9 218283 CASAVA_Build 4 137990559 1I TGGATCTGCT -/A GGAAGAAGAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 218284 CASAVA_Build 4 138007039 1D TGTTTTTTAG T/- TTTTTTATTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 7 6 218285 CASAVA_Build 4 138007137 5D GAAATTAATC TAATA/----- TAATATGTTT 3070 hom 78 het 27 0 26 3 TAATA 2 1 218286 CASAVA_Build 4 138013198 1I CAATAAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 10 16 T 15 16 218287 CASAVA_Build 4 138020179 1D AAAAACCTAG A/- AAGGCTAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 23 4 A 3 2 218288 CASAVA_Build 4 138020670 1D GAATTAAAAA C/- TTTTTCTCTG 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 C 1 0 218289 CASAVA_Build 4 138025444 1I AAAAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 10 11 218290 CASAVA_Build 4 138038806 1D CAATTAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 A 12 11 218291 CASAVA_Build 4 138052670 1I AGTAAATAAA -/C CCTTATCTTC 3070 het 3070 ref 44 27 17 0 C 2 3 218292 CASAVA_Build 4 138054007 5D TGAATTCCTA CCCAC/----- CCCACCCCCC 3070 hom 7 het 23 1 17 7 CCCAC 2 1 218293 CASAVA_Build 4 138054810 1I TGCTTGCTGG -/A TGGGTTATAT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 A 0 1 218294 CASAVA_Build 4 138085444 1I ATTTCCGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 9 10 218295 CASAVA_Build 4 138093976 1I TATTTTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 715 hom 33 3 25 5 A 10 11 218296 CASAVA_Build 4 138103588 4I CTCTTATCTC ----/TAAT TAATTATGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TAAT 1 2 218297 CASAVA_Build 4 138107217 1I CTTTTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 19 1 14 4 A 10 11 218298 CASAVA_Build 4 138116943 1D CTATGCTGAG A/- AAAAAATTTG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 7 6 218299 CASAVA_Build 4 138162000 5D TTTCATATTT TATTA/----- TATGTTTAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 5 TATTA 1 0 218300 CASAVA_Build 4 138163458 2I ATTTTTTGTA --/TT TTTTTAGTAG 1431 hom 7 het 5 0 3 2 T 5 7 218301 CASAVA_Build 4 138165203 1I ACCAAACAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 9 10 218302 CASAVA_Build 4 138165878 1I AGGAATTGGC -/A AAAAAAACAT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 7 8 218303 CASAVA_Build 4 138166379 1I ATGCCACAGA -/G GGGCAAAAGA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 3 4 218304 CASAVA_Build 4 138168180 2I AGAATATTTG --/AA AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 9 218305 CASAVA_Build 4 138170590 1I TAGCATGCTG -/T TTTGGTTACT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 3 4 218306 CASAVA_Build 4 138171589 1I CAAAAACAAA -/C AAAAAAAACT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 C 0 1 218307 CASAVA_Build 4 138172058 1I AGAAAGAAAT -/A AAAAAACATC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 6 7 218308 CASAVA_Build 4 138181594 1I TTTCTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 657 hom 43 2 28 13 T 10 11 218309 CASAVA_Build 4 138182026 5D TTTCATATAA AGAAG/----- AGAAGTTTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 7 AGAAG 2 1 218310 CASAVA_Build 4 138185156 2D TCATATTTTT TC/-- TCTGTCATTT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TC 2 1 218311 CASAVA_Build 4 138185247 1D ATTTTTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 31 het 16 0 11 6 T 10 9 218312 CASAVA_Build 4 138186615 1D AATTTATTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 8 218313 CASAVA_Build 4 138188129 1D ACTTAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 10 9 218314 CASAVA_Build 4 138197017 1D GGGCAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 11 10 218315 CASAVA_Build 4 138201256 1I GGTATAAATG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 7 8 218316 CASAVA_Build 4 138201358 1D ATTTGAAATT A/- AAAAAATTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 7 6 218317 CASAVA_Build 4 138209201 2D CATTTTGTAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 99 het 37 0 34 5 TG 6 5 218318 CASAVA_Build 4 138215218 1D GTTTTAAACC A/- AAAAAAAAAA 2052 het 2052 ref 34 19 6 10 A 13 12 218319 CASAVA_Build 4 138219348 2D CCCTACTCCC CT/-- CTCTTCCCAG 3070 het 3070 ref 47 28 16 4 CT 3 2 218320 CASAVA_Build 4 138220126 22D CAGCCCAAAC TTAATTCTTAATATTTTAATGG/---------------------- TGTCATTTCA 3070 het 3070 ref 32 22 9 5 TTAATTCTTAATATTTTAATGG 1 0 218321 CASAVA_Build 4 138226959 3D ATTTTTAGTT TTC/--- TTCTTCTCCT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 TTC 3 2 218322 CASAVA_Build 4 138232739 1I GTGGGAAACA -/T AACACATCGG 2607 het 2607 ref 22 16 6 0 T 0 1 218323 CASAVA_Build 4 138233128 4I TGTTAAAGAT ----/ACCA ACCAAGTCAT 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 ACCA 1 2 218324 CASAVA_Build 4 138233927 1I TAAAATTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 11 11 T 13 14 218325 CASAVA_Build 4 138238240 1D TTGCAAACTC T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 T 8 7 218326 CASAVA_Build 4 138242325 2D CCTGAAACAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 11 9 218327 CASAVA_Build 4 138242381 1D TATCAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 11 10 218328 CASAVA_Build 4 138278641 3D AGCCATCTTA TTT/--- TTATCAAGCC 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 T 5 2 218329 CASAVA_Build 4 138291842 1D TTAGAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 11 10 218330 CASAVA_Build 4 138375251 1I CGAATGAGTC -/T TTAGGGTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 3 218331 CASAVA_Build 4 138388212 1D ACCTAAATTA T/- ATCATTAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 1 0 218332 CASAVA_Build 4 138390502 1D ATTTATCACA T/- TGCATTTTAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 2 1 218333 CASAVA_Build 4 138392640 1D AAAAAAACTG A/- AAAAAAACAT 3070 het 2584 hom 36 9 23 5 A 8 7 218334 CASAVA_Build 4 138393259 2D GATATTACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 18 29 6 AC 6 5 218335 CASAVA_Build 4 138397834 1D CTAGTGTTTC T/- TTTTATATAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 4 T 5 4 218336 CASAVA_Build 4 138398143 2I CTTTCTCTCA --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CT 5 6 218337 CASAVA_Build 4 138399476 1I GTCTTCAGAC -/T TTTTTTTATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 7 8 218338 CASAVA_Build 4 138400898 2D AAAAGGGAGG CA/-- CAGTCTTCCT 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 CA 2 1 218339 CASAVA_Build 4 138414443 4I TAAACATATT ----/TCTC TCTACTACAT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 TC 1 3 218340 CASAVA_Build 4 138414603 1I CCATTAGTAA -/T TTTTTAACAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 5 6 218341 CASAVA_Build 4 138415610 2I TTTTAAAAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 AT 6 7 218342 CASAVA_Build 4 138417110 1D TAATTGATAA T/- GTAATTAATA 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 T 1 0 218343 CASAVA_Build 4 138419066 4D ATCTTTCCAG TTTC/---- TTATAAAGCT 3070 het 3070 ref 33 21 11 2 TTTC 1 0 218344 CASAVA_Build 4 138424036 4D CATTTATATT AATA/---- AATAAATAGA 3070 het 3070 hom 32 13 16 5 AATA 3 2 218345 CASAVA_Build 4 138430543 1D TAATAGTAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 10 9 218346 CASAVA_Build 4 138433537 26D ATTGCTTGGC CAAAATCTTTGTAATGCTAAGCATTA/-------------------------- CAAAATCTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 CAAAATCTTTGTAATGCTAAGCATTA 1 0 218347 CASAVA_Build 4 138434362 1I CAAGTGATTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 8 218348 CASAVA_Build 4 138438154 3D TTGCCTCCTC CTT/--- CTCAGTGAAC 3070 het 3070 hom 47 20 23 5 CTT 1 0 218349 CASAVA_Build 4 138439555 5I TGATTATTTC -----/AAATA AAATAAAATG 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 AAATA 1 2 218350 CASAVA_Build 4 138440787 1D TTTTAGACAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 15 9 8 A 9 8 218351 CASAVA_Build 4 138442776 3D TCATTCAATA TCC/--- TCCTAACACT 3070 het 3070 ref 30 17 12 3 TCC 2 1 218352 CASAVA_Build 4 138448976 3D ATGGGTCCCC TTT/--- ATTATCAGAT 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 T 3 0 218353 CASAVA_Build 4 138451520 1D CCGAGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1939 het 1939 ref 25 15 6 4 A 13 12 218354 CASAVA_Build 4 138455271 1I GGTGTTACCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 493 hom 39 2 33 4 T 9 10 218355 CASAVA_Build 4 138457982 4D TTGTTTTAAG TTTA/---- TTTTTCTCTT 3070 hom 84 het 35 0 29 8 TTTA 1 0 218356 CASAVA_Build 4 138458797 3D GTGGACTATG ACC/--- ACATTATTTC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 ACC 1 0 218357 CASAVA_Build 4 138459497 1D TGAATGTTGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 8 7 218358 CASAVA_Build 4 138460170 1I ACATTGAAGG -/A AAAAAATCTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 7 218359 CASAVA_Build 4 138463217 8D GAACAGTGCT AAAGCAAC/-------- AAAGTAGCTA 3070 hom 87 het 29 0 30 1 AAAGCAAC 1 0 218360 CASAVA_Build 4 138469138 1D CTGTTTGTGA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 132 het 55 0 44 11 T 7 6 218361 CASAVA_Build 4 138473426 1D TTCACACCAA T/- TTTTTTGGCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 7 6 218362 CASAVA_Build 4 138482812 1I AAAATCAGCT -/G GGTATGGTGG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 2 3 218363 CASAVA_Build 4 138483429 4I AAGGAAGGAC ----/AGAA AGATTTTTTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AGAA 0 1 218364 CASAVA_Build 4 138484921 2D ATGAAAAGAC AA/-- TGACACAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 2 0 218365 CASAVA_Build 4 138490857 1D GGATGTAGAG A/- AAAAGGAACA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 5 4 218366 CASAVA_Build 4 138500480 1I ATTTCTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 27 1 23 3 T 10 11 218367 CASAVA_Build 4 138504578 7I TCAAATACGA -------/AAAGAAC AAAGACTGAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAAGAAC 0 1 218368 CASAVA_Build 4 138513594 1I GCTGCTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 673 hom 32 2 27 3 A 11 12 218369 CASAVA_Build 4 138542583 1I TCAGCATGCC -/A AAAAAAAATC 3070 het 441 hom 29 1 20 8 A 8 9 218370 CASAVA_Build 4 138544905 1D CAATTCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 30 1 22 8 T 15 14 218371 CASAVA_Build 4 138546398 9D ACAGGTTAGT TTGTTGTTG/--------- TTGTTGTGGT 469 hom 12 het 8 0 5 3 TTG 5 2 218372 CASAVA_Build 4 138563640 1I GCCACATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 41 2 36 3 T 11 12 218373 CASAVA_Build 4 138582351 6I GTAGAAGCAC ------/TATTTT TATTCAGATG 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 TATTTT 0 1 218374 CASAVA_Build 4 138586337 10D TGTCTCAATT TAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 TAAAAAAAAA 1 0 218375 CASAVA_Build 4 138587014 1I TTAATAAATA -/T TAGGAGGACA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 1 2 218376 CASAVA_Build 4 138588084 1I AGTTACTTGG -/T TTAAGGAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 T 2 3 218377 CASAVA_Build 4 138588360 2I CACCTGCAAT --/TG AATACAAACA 2686 het 2686 ref 24 16 6 2 TG 0 1 218378 CASAVA_Build 4 138592509 3I8M2D CATGCCCAAC ---ACTATTTCTA/ACTACTATTTC-- TGTCTTTCGT 3070 het 3070 ref 36 19 18 5 N/A 0 0 218379 CASAVA_Build 4 138601762 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 2591 het 1746 hom 15 5 7 3 T 10 9 218380 CASAVA_Build 4 138603864 1I CTGAACAAAG -/T TGAATTAGCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 218381 CASAVA_Build 4 138604024 2I CTGGATTCTC --/AG AAAGATAGGT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AG 0 1 218382 CASAVA_Build 4 138615263 1D AGAAACTTGA T/- TTAGCTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 3 2 218383 CASAVA_Build 4 138620137 13D CACCCGGATC AGTTCCTATATAT/------------- AGATTCTTGG 1399 het 1399 ref 22 16 4 2 AGTTCCTATATAT 1 0 218384 CASAVA_Build 4 138631664 2I CAATAACTAT --/GA CAGTTAATGT 3070 hom 72 het 25 0 23 2 GA 0 1 218385 CASAVA_Build 4 138642882 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2789 het 1587 hom 15 4 7 4 A 11 12 218386 CASAVA_Build 4 138645176 3I GTAATTTGTT ---/ATG ATAATCCTCT 3070 het 3070 hom 49 18 28 3 ATG 0 1 218387 CASAVA_Build 4 138645780 1D AGAACAGCAT G/- GGGGGAAACT 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 G 6 5 218388 CASAVA_Build 4 138653477 3D GTCTCTGTAG AAA/--- AAAAAAAAAA 2326 het 190 hom 26 3 8 15 A 15 12 218389 CASAVA_Build 4 138662868 1D CAGCTACTGG A/- TGGCCATCTG 3070 het 3070 hom 32 12 17 6 A 1 0 218390 CASAVA_Build 4 138668253 8D AAATGGCAGT CAATGATC/-------- CACATTCAGT 3070 het 3070 ref 36 20 13 8 CAATGATC 1 0 218391 CASAVA_Build 4 138675726 2I TAAAACAACT --/TC TCAGATAACC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TC 1 2 218392 CASAVA_Build 4 138683627 1I AGACAGCCTC -/G GGGGGGAGTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 G 6 7 218393 CASAVA_Build 4 138684201 1D GAGAAGGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1898 hom 33 5 15 14 A 13 12 218394 CASAVA_Build 4 138684312 4D TTAAAGACTG CCTC/---- CCTCATATTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CCTC 2 1 218395 CASAVA_Build 4 138688947 1D AAGATTATAC A/- TAAATAATAG 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 A 1 0 218396 CASAVA_Build 4 138689024 1I TCACTGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 A 11 12 218397 CASAVA_Build 4 138698833 1I TTAAAATGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 9 10 218398 CASAVA_Build 4 138704126 1I CCCTAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 9 10 218399 CASAVA_Build 4 138704478 2I TCCTTTTAAT --/TC TCTGTTAACT 3070 hom 80 het 33 0 25 8 TC 1 2 218400 CASAVA_Build 4 138707183 1I TTAATTCTGA -/T TAACAATCTT 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 T 1 2 218401 CASAVA_Build 4 138707644 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 475 hom 47 4 28 15 A 13 12 218402 CASAVA_Build 4 138711029 3D CTGTGGTCTG TGC/--- AGTGACTGTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TGC 1 0 218403 CASAVA_Build 4 138714138 1D CCTCTAACCA T/- TTTTCATGTG 3070 hom 78 het 31 0 26 6 T 5 4 218404 CASAVA_Build 4 138714410 2I AAATTCCAAA --/AT ATCTTTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 1 2 218405 CASAVA_Build 4 138715105 3D GGGAGACACC TAA/--- TAATATGTAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TAA 2 1 218406 CASAVA_Build 4 138715822 1I ACAAATCACA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 218407 CASAVA_Build 4 138717655 1I TTAAAGGATT -/A AAAAAAAAAG 2918 het 2918 ref 31 17 9 5 A 9 10 218408 CASAVA_Build 4 138723026 7I GACTATCTAT -------/TTTGTGA ATCAGATAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTTGTGA 0 1 218409 CASAVA_Build 4 138725521 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 22 het 39 1 34 4 T 9 10 218410 CASAVA_Build 4 138740819 1I CTGAAAATAT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 7 8 218411 CASAVA_Build 4 138758865 2I GGGAAAAATG --/TA TGTTTGGGGA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TA 0 1 218412 CASAVA_Build 4 138765997 1I AGCACATTCT -/A GTCCATAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 0 1 218413 CASAVA_Build 4 138769586 1I TGGAAAATAC -/A AAAATAATCC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 4 5 218414 CASAVA_Build 4 138776178 3D GAAGAGAAAG AGA/--- AGGAGAGGGA 3070 hom 59 het 24 0 18 8 AGA 1 0 218415 CASAVA_Build 4 138776762 1D GTTATTCATG T/- TTTTAGCAGC 3070 hom 72 het 26 0 25 2 T 5 4 218416 CASAVA_Build 4 138781053 1I TTTTAAAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 30 0 21 9 T 9 10 218417 CASAVA_Build 4 138783277 2I GGTGTGAGGG --/GT GTGTGTGTGT 2721 het 2220 hom 27 7 9 11 GT 8 9 218418 CASAVA_Build 4 138787734 1D TGTTTTAAGC T/- ATTAAGTTTG 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 1 0 218419 CASAVA_Build 4 138803284 1D CAATAAATAG A/- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 4 3 218420 CASAVA_Build 4 138807954 1D TGCCATGTTG C/- CCAGGCTAGT 2663 het 2663 ref 18 11 7 0 C 3 2 218421 CASAVA_Build 4 138819058 5D TCAAATAATC TTATA/----- TATTAAAATG 3070 het 3070 hom 40 13 24 5 TTATA 1 0 218422 CASAVA_Build 4 138824438 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTTATTT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 3 2 218423 CASAVA_Build 4 138826068 1I AAGGAATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 10 11 218424 CASAVA_Build 4 138827468 2I CAGCAGGTGA --/GT GTGCAGGGGG 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 GT 1 2 218425 CASAVA_Build 4 138834047 2D TTATAGTTTG TA/-- TATATATATA 3070 het 153 hom 31 2 19 12 TA 7 6 218426 CASAVA_Build 4 138840254 2I TTATTGGAAT --/AC ACAGCACACT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AC 1 2 218427 CASAVA_Build 4 138841072 1I CACTTGATTC -/T TTTTTTTTTT 2134 het 2134 ref 28 7 9 12 T 14 15 218428 CASAVA_Build 4 138850399 1D TTATTTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 28 1 19 8 T 12 11 218429 CASAVA_Build 4 138854991 4I GACTTTAGTT ----/TCTC TCTCCTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TC 2 4 218430 CASAVA_Build 4 138857994 1I AAATTATTGT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 8 9 218431 CASAVA_Build 4 138859606 1D GTCGTTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 39 4 18 17 T 16 15 218432 CASAVA_Build 4 138861056 1I TGCCAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 158 hom 39 1 33 5 A 10 11 218433 CASAVA_Build 4 138863119 1D TTTTCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 16 9 A 11 10 218434 CASAVA_Build 4 138867883 1D CAAGAACTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 9 8 218435 CASAVA_Build 4 138877386 1I GTCTTTAGTG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 7 8 218436 CASAVA_Build 4 138878048 1D TATTTGATTG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 25 13 7 5 T 8 7 218437 CASAVA_Build 4 138879538 1D GTCTATAAGG T/- TTTTCAACAC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 5 4 218438 CASAVA_Build 4 138881773 1D TCTACAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 35 2 26 7 A 11 10 218439 CASAVA_Build 4 138894527 2D8M9I3M3I TTGTATTTTA GCCATAACAT---------GGA---/--CATAGGATTTGTATACAGGATTT ATACAACATA 3070 het 3070 ref 38 26 18 4 N/A 0 0 218440 CASAVA_Build 4 138895536 1D CAATTTTCAA T/- CTTTGCTTCC 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 T 1 0 218441 CASAVA_Build 4 138898248 1D TTAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 12 11 218442 CASAVA_Build 4 138899642 1D TCCAACAAAA G/- TTTAGAACCA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 G 1 0 218443 CASAVA_Build 4 138900281 1I GTCTCCACGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 9 10 218444 CASAVA_Build 4 138901294 2I ATGTTGGGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 TG 8 9 218445 CASAVA_Build 4 138904600 1D TCAAAAAGTT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 9 8 218446 CASAVA_Build 4 138915911 2I TCTCTCTCTC --/TG TCTCTCTCTC 3070 het 8 hom 28 1 14 13 TG 0 1 218447 CASAVA_Build 4 138919806 1I GGCACAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 796 hom 41 4 23 14 T 14 15 218448 CASAVA_Build 4 138922210 1I TTCAAGCAAA -/T TTTTTTTTTC 2748 het 2748 ref 27 16 9 2 T 9 10 218449 CASAVA_Build 4 138923621 11D CACTCAATGC CAAACACATAG/----------- CAAACACATA 3070 het 3070 ref 36 23 15 8 CAAACACATAG 1 0 218450 CASAVA_Build 4 138929625 1D TTATGCAGCC A/- AACAGACATA 1939 het 1939 ref 13 9 4 0 A 3 2 218451 CASAVA_Build 4 138932179 1D ATCTGTCAGG A/- AACTAAATGA 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 A 3 2 218452 CASAVA_Build 4 138936207 1I AAAGACTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 8 9 218453 CASAVA_Build 4 138939080 4D ATACAATATC TGGA/---- TGGATTTTGC 3070 hom 92 het 41 0 32 10 TGGA 2 1 218454 CASAVA_Build 4 138941703 2I TACAGTGTTC --/AT ATATGGAAGT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 AT 2 3 218455 CASAVA_Build 4 138943714 1D CTCGCTGAGC A/- CATTAATTCA 3070 het 3070 ref 53 26 24 3 A 1 0 218456 CASAVA_Build 4 138948162 2I TTTTGAACTC --/CT AGCCTCATGT 3070 hom 57 het 24 0 18 6 CT 0 1 218457 CASAVA_Build 4 138952028 2I TGCTAAACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 45 0 33 12 A 14 16 218458 CASAVA_Build 4 138960129 1D CTCTTTATTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 T 7 6 218459 CASAVA_Build 4 138969657 1D AACATCATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 15 22 9 T 12 11 218460 CASAVA_Build 4 138981120 6D AATACGCTAA TTATCT/------ TTATTTGATC 3070 hom 105 het 39 0 36 5 TTATCT 1 0 218461 CASAVA_Build 4 138984632 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 16 1 13 2 A 11 12 218462 CASAVA_Build 4 138993841 1I GAAAACAATT -/A AAAAAAAAAA 2071 het 2071 ref 41 17 9 15 A 13 14 218463 CASAVA_Build 4 139002749 1D TAAATCAAAC G/- TAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 0 218464 CASAVA_Build 4 139004631 4D ACTGTATATA GACT/---- GACAGGGACA 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 GACT 1 0 218465 CASAVA_Build 4 139006052 3I CTCACATTTA ---/TAT TATTTGCCAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TAT 1 2 218466 CASAVA_Build 4 139006712 1I TCTAAGCTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 438 hom 26 1 19 6 T 9 10 218467 CASAVA_Build 4 139011129 1I CAGTGGTGTG -/A ATCTTGGCTC 3070 hom 29 het 17 0 13 4 A 1 2 218468 CASAVA_Build 4 139011928 4D TTAAGAAATT ATAA/---- ATAGAGAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 ATAA 1 0 218469 CASAVA_Build 4 139017627 12I ATTTTATTTG ------------/TTTTGTTTTTGT TTTTGTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 TTTTGT 1 3 218470 CASAVA_Build 4 139025019 1D TCCATTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1644 het 1644 ref 28 19 6 3 A 12 11 218471 CASAVA_Build 4 139031204 2D ACCCTCATGA TT/-- TTTTACCTAA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 T 6 4 218472 CASAVA_Build 4 139031384 2D CATATATATA AC/-- AGTGTATATA 3070 het 3070 hom 37 17 16 6 AC 1 0 218473 CASAVA_Build 4 139036963 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 9 10 218474 CASAVA_Build 4 139042313 2I TCATAAAAGC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 TA 5 6 218475 CASAVA_Build 4 139051060 1I CCTGCATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 29 2 19 8 A 14 15 218476 CASAVA_Build 4 139076015 1D GGGGTAAGAT G/- AAATACGCTA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 1 0 218477 CASAVA_Build 4 139080567 1D ATACAAAATA C/- CCATGACACC 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 C 3 2 218478 CASAVA_Build 4 139081053 2D AGTCAAAAAA TT/-- TTTTTAATGA 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 T 7 5 218479 CASAVA_Build 4 139081305 4I GGCATAGAAA ----/TGGC AAACAGATAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TGGC 0 1 218480 CASAVA_Build 4 139081525 1D TCAGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 17 11 A 12 11 218481 CASAVA_Build 4 139085477 30D ATATATATAT ATATATATATATATATATATACATACATAC/------------------------------ ATACATACAC 3070 het 314 hom 10 2 12 1 ATATATATATATATATATATACATACATAC 1 0 218482 CASAVA_Build 4 139098164 1D GCACACTTCC A/- GGGGGCACCA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 1 0 218483 CASAVA_Build 4 139121308 10D GTTTTCAAAA TGTAGAAGCC/---------- CAATCAAGGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TGTAGAAGCC 1 0 218484 CASAVA_Build 4 139122857 1D TACACTGTAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 9 8 218485 CASAVA_Build 4 139123082 1I TTGAATTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 10 11 218486 CASAVA_Build 4 139123626 1I GATAGAAAAT -/A AAAAATATTA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 5 6 218487 CASAVA_Build 4 139133306 1I TTGATCTATC -/A CTAAAGCAGT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 0 1 218488 CASAVA_Build 4 139133517 4I AATAATCAAC ----/TAAA TAGGAGAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 TAAA 0 1 218489 CASAVA_Build 4 139135204 1I AAACTATCTC -/A AAAGACAAAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 3 4 218490 CASAVA_Build 4 139168137 1D CATGTAGTGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 9 8 218491 CASAVA_Build 4 139169643 26I GTTAGTTGTA --------------------------/ATTGTTAGAATATTAACAATTCTATG ATTGTTAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 ATTGTTAGAATATTAACAATTCTATG 0 1 218492 CASAVA_Build 4 139170181 4I GCGAAGACAG ----/CTCA CTGTCACTCC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 CTCA 0 1 218493 CASAVA_Build 4 139174335 1D AGCGAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 10 9 218494 CASAVA_Build 4 139185800 5I GTGCACATGT -----/GTGCC CTGGGCCTGG 3070 hom 34 het 16 0 12 4 GTGCC 0 1 218495 CASAVA_Build 4 139193310 4D CCAGAGTAGC TAGA/---- TAGAGAGTGT 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 TAGA 2 1 218496 CASAVA_Build 4 139195360 1I CTCATCTCAA -/C CCTAGGTCTC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 2 3 218497 CASAVA_Build 4 139197536 10D GCAGAAAACT CTTGCAGGAA/---------- CTTGCAGGAA 3070 het 3070 ref 57 24 21 13 CTTGCAGGAA 2 1 218498 CASAVA_Build 4 139206197 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 23 1 22 0 A 13 12 218499 CASAVA_Build 4 139207178 4I TAAACAATAA ----/AAAG AAAGAAAGGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AAAG 2 3 218500 CASAVA_Build 4 139208676 1I TAGTCTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 31 1 18 12 A 15 16 218501 CASAVA_Build 4 139209792 1I AATAGTTATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 8 9 218502 CASAVA_Build 4 139221829 3I TCTCTTGAGT ---/AAC ACCACAGTTC 3070 hom 168 het 62 0 54 8 AAC 0 1 218503 CASAVA_Build 4 139225727 1I TTGTTAAGAG -/A AAAAATCCTC 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 A 5 6 218504 CASAVA_Build 4 139228963 2D AGCTAGATAC AG/-- AGTGTCCACT 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 AG 2 1 218505 CASAVA_Build 4 139242594 1D AATTAATATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 9 8 218506 CASAVA_Build 4 139246473 4D TATGTGTGAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 1632 hom 22 6 9 8 TG 11 9 218507 CASAVA_Build 4 139248085 1I CGTTTCGAGA -/T TATCATTATG 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 1 2 218508 CASAVA_Build 4 139260923 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 578 hom 22 5 12 5 A 17 16 218509 CASAVA_Build 4 139268600 1D TAGCAATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 28 3 9 16 A 11 10 218510 CASAVA_Build 4 139270182 2D GCAAACTATG TA/-- CCAGATGTTG 3070 het 3070 ref 50 24 16 11 TA 1 0 218511 CASAVA_Build 4 139274357 1I ATTGTGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 26 21 8 T 10 11 218512 CASAVA_Build 4 139287230 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 6 7 218513 CASAVA_Build 4 139288425 1D AGACCTTCAA G/- TACTTGCTTA 3070 het 3070 ref 38 21 15 3 G 1 0 218514 CASAVA_Build 4 139300986 1I GAAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 10 11 218515 CASAVA_Build 4 139310331 1D GTCTATGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 14 13 11 A 10 9 218516 CASAVA_Build 4 139315577 1I CACAAGGCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 8 9 218517 CASAVA_Build 4 139320652 1D AGATGACAAG C/- TTTTTCTCCA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 C 1 0 218518 CASAVA_Build 4 139323060 1I GGGAAAATCC -/A AAAAATCCCA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 5 6 218519 CASAVA_Build 4 139325399 1I ATTTGCATAG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 151 het 58 0 51 7 A 6 7 218520 CASAVA_Build 4 139333190 2D ATATCAAGAC TT/-- TTTTGTAGCT 2715 het 2715 ref 21 13 7 1 T 6 4 218521 CASAVA_Build 4 139338751 4D AAACCAGAAA AAAC/---- AAACAAACAG 3070 het 3070 hom 32 11 14 9 AAAC 3 2 218522 CASAVA_Build 4 139349137 1D TAGTCACCAC A/- AAAGTCATGT 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 A 4 3 218523 CASAVA_Build 4 139349404 5I GGCAATACTC -----/TTATG TTATTATAAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TTATG 0 1 218524 CASAVA_Build 4 139357748 1D CAAAGCAGCA T/- TCAGGTAGCA 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 T 2 1 218525 CASAVA_Build 4 139363470 1I43M1D ATTTTAAAGT -AAAAAAAAGACATATTTATCTTTAATTAAAACTAAGTGGCAGGT/AAAAAAAAAGACATATTTATCTTTAATTAAAACTAAATGGCAGG- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 30 0 34 7 N/A 0 0 218526 CASAVA_Build 4 139367181 1D CAGCGAGAGG T/- ACAGTGAAGC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 1 0 218527 CASAVA_Build 4 139374557 1D TCCTTTCCCA G/- GGGAAAACTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 G 4 3 218528 CASAVA_Build 4 139375168 1I AGAAAAGTAG -/T TTTTTTTTTT 1752 het 1752 ref 29 18 6 5 T 11 12 218529 CASAVA_Build 4 139376012 1D TTTTTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 A 11 10 218530 CASAVA_Build 4 139388300 1I AAAATATCTT -/A AGAGAGCTAA 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 A 1 2 218531 CASAVA_Build 4 139389788 1I TTTTGTGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 T 12 13 218532 CASAVA_Build 4 139390195 4D TTATTTTATG ATTA/---- ATTACCTGGA 3070 het 3070 ref 46 27 18 2 ATTA 2 1 218533 CASAVA_Build 4 139392244 1I TTATTATACA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 123 het 49 0 41 8 T 6 7 218534 CASAVA_Build 4 139396422 2D GTCCAGAATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 73 het 40 0 24 17 TG 10 9 218535 CASAVA_Build 4 139400809 1I TACTGAAGTT -/G GGGGGGGGTG 2539 het 2539 ref 32 17 10 5 G 8 9 218536 CASAVA_Build 4 139441699 2I AAAACTGGCC --/AA AAAAAAAAAA 2453 het 1168 hom 29 5 11 13 A 14 16 218537 CASAVA_Build 4 139447513 2I AATATTTCCC --/CT GTCATTGTTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 CT 0 1 218538 CASAVA_Build 4 139455101 1D GTCTTTTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 28 0 23 7 A 10 9 218539 CASAVA_Build 4 139455703 1D CCTGTTTTTG T/- TATCAGTATC 3070 het 3070 hom 40 17 20 5 T 2 1 218540 CASAVA_Build 4 139456515 1I AGCTAGGTTT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 6 7 218541 CASAVA_Build 4 139468578 1D ATTCATTTAC A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 A 8 7 218542 CASAVA_Build 4 139472622 1I CCATGGAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 9 10 218543 CASAVA_Build 4 139486257 1I TCAAAGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 29 7 A 11 12 218544 CASAVA_Build 4 139487129 1I CCACTACAAC -/T TTTATGTAAC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 3 4 218545 CASAVA_Build 4 139490329 1D CAGCCCCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 12 12 11 A 12 11 218546 CASAVA_Build 4 139491545 2D TTGTGATAAC AT/-- ATTATTCAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AT 2 1 218547 CASAVA_Build 4 139491713 1D AATGAAGATT A/- AAAGAAGTAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 4 3 218548 CASAVA_Build 4 139493126 2D AAATTATAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 12 10 218549 CASAVA_Build 4 139499040 1I AAAAAAAGAG -/A AATTTTAGAC 1954 hom 18 het 9 0 7 2 A 2 3 218550 CASAVA_Build 4 139503119 5D CAGAAAATAA ATAAC/----- ATAAGAGGAT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 ATAAC 1 0 218551 CASAVA_Build 4 139507069 1D ATTGCTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 47 0 39 9 T 12 11 218552 CASAVA_Build 4 139512542 1I TTACTACAAC -/T TTTCAAGACA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 3 4 218553 CASAVA_Build 4 139516291 1I TAAAAAGTTA -/T TTTTTTGAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 6 7 218554 CASAVA_Build 4 139522401 1D CTACTTATAA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 7 6 218555 CASAVA_Build 4 139527587 1D CATTCCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 249 hom 38 1 32 5 A 12 11 218556 CASAVA_Build 4 139563742 1D TTGAACAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 12 11 218557 CASAVA_Build 4 139572056 1I GATTCTCTTG -/T TGAGTGTAAG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 1 2 218558 CASAVA_Build 4 139574948 1D AGACAATGTA T/- CAGAATCTCA 3070 het 3070 hom 34 15 14 6 T 1 0 218559 CASAVA_Build 4 139585945 1I GATGATATCA -/T TTCCAGATGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 218560 CASAVA_Build 4 139587691 1I TAACTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3022 hom 31 8 13 10 T 11 12 218561 CASAVA_Build 4 139589280 1I TCTCCAATCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 10 218562 CASAVA_Build 4 139590954 4I ACTAATTGCC ----/CTTA CTTGCTTAAG 3070 hom 60 het 29 0 24 5 CTTA 0 1 218563 CASAVA_Build 4 139596832 1I GGGATTTGGG -/T TTTTTTTATA 1327 het 1327 ref 20 14 5 1 T 7 8 218564 CASAVA_Build 4 139601162 1D AAGTTGTTTC T/- TTTTCTTATC 3070 het 3070 ref 56 29 23 4 T 5 4 218565 CASAVA_Build 4 139603992 1I ACTTTTACTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 8 9 218566 CASAVA_Build 4 139610547 1D TTTAACTTTC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 8 7 218567 CASAVA_Build 4 139612326 3I TCTACTTGCC ---/TGT TGTTGGTGTG 3070 het 3070 ref 37 24 8 5 TGT 1 2 218568 CASAVA_Build 4 139614581 1D ATGCATAATT G/- GTCTCCATAG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 G 2 1 218569 CASAVA_Build 4 139633866 78D ATCTTTGTAT AAATGCCAGTGTACGACTGTAATTCCGAGAAAGAGTTTCCAAAACAGTATTCCAGCATGTTCCTCCATTTTTGAAAAA/------------------------------------------------------------------------------ AACCGCTGGC 3070 het 3070 ref 29 29 12 5 AAATGCCAGTGTACGACTGTAATTCCGAGAAAGAGTTTCCAAAACAGTATTCCAGCATGTTCCTCCATTTTTGAAAAA 1 0 218570 CASAVA_Build 4 139636815 1D GCATCTTTTG C/- CTAAAATTCC 3070 hom 102 het 37 0 34 5 C 2 1 218571 CASAVA_Build 4 139656334 2D TTCAAGTGGG TA/-- TATACAGAGG 3070 hom 116 het 44 0 39 5 TA 3 2 218572 CASAVA_Build 4 139660579 1I TAGGAGGTAG -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 7 8 218573 CASAVA_Build 4 139666743 1I ACAGAGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 11 12 218574 CASAVA_Build 4 139669945 2I GGAACTTCTT --/AC AGTCTACACC 3070 hom 132 het 49 0 43 6 AC 0 1 218575 CASAVA_Build 4 139678997 3I TTCAAAAGGG ---/AAA AAAAGTTTCT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 4 7 218576 CASAVA_Build 4 139679108 1I TGCAAAAAAC -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 7 8 218577 CASAVA_Build 4 139681285 1I GGCATATAAA -/C CCCTTCACTA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 C 3 4 218578 CASAVA_Build 4 139682470 12I TATATTTTCA ------------/AGTTAGCAATGC CGTAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 AGTTAGCAATGC 0 1 218579 CASAVA_Build 4 139686882 1I AAAACGGTAC -/A AAGACAAGGA 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 2 3 218580 CASAVA_Build 4 139688286 4D TTTGCACAGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2591 hom 15 het 8 0 6 2 A 18 14 218581 CASAVA_Build 4 139698704 15I TTCAGAAAAA ---------------/AATACTCATAATAGT AATGCATACA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 AATACTCATAATAGT 0 1 218582 CASAVA_Build 4 139699607 2D TACTCTTCCC CT/-- GTCTCTAGAA 3070 het 2842 hom 30 10 17 3 CT 1 0 218583 CASAVA_Build 4 139708374 16D ATCCCCAAGA ACACACACACATGCAT/---------------- ACACACACAC 3070 hom 158 het 56 0 54 5 ACACACACACATGCAT 1 0 218584 CASAVA_Build 4 139709146 1I AAAGAAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 10 11 218585 CASAVA_Build 4 139713069 4I TTCCAGCCAG ----/ACAA ACAGTCCACC 3070 hom 156 het 60 0 52 8 ACAA 0 1 218586 CASAVA_Build 4 139713631 1D AGCTATCCCT C/- CCCCCTCCCC 3070 hom 45 het 18 0 16 5 C 6 5 218587 CASAVA_Build 4 139714688 11I TCTTTTTGTC -----------/TTGTTTTTGTT TTGTTTTTAG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 TTGTTTTTGTT 0 1 218588 CASAVA_Build 4 139739223 2I ACAGGCTAAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 TG 8 9 218589 CASAVA_Build 4 139748172 2I AAGGAGACTT --/TC TGTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 TC 0 1 218590 CASAVA_Build 4 139752872 2D ATGTATATAT AC/-- ACACACACAC 2433 het 2433 ref 35 19 9 8 AC 6 5 218591 CASAVA_Build 4 139779116 14D AGTGAAAGTA GAAGACAAATAACT/-------------- GAAGTGTGGG 3070 hom 105 het 36 0 34 5 GAAGACAAATAACT 1 0 218592 CASAVA_Build 4 139786908 2D TACTCTGTGT CA/-- CAGTTATTTG 3070 hom 148 het 51 0 50 1 CA 2 1 218593 CASAVA_Build 4 139802663 1D TTTTAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 A 12 11 218594 CASAVA_Build 4 139807261 1I CCAGCAGCCA -/C CACACTTTTC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 C 1 2 218595 CASAVA_Build 4 139815760 4D GGAACTATTG GTTT/---- GTTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 49 27 20 7 GTTT 3 2 218596 CASAVA_Build 4 139816478 1D TTCTAATAGG T/- TTTTTATTGA 3070 het 2626 hom 29 9 16 4 T 6 5 218597 CASAVA_Build 4 139829767 1D TGTTTAAAAA G/- CACACAAGAC 3070 het 3070 ref 28 19 8 1 G 1 0 218598 CASAVA_Build 4 139837698 1D TATAAACAGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 8 218599 CASAVA_Build 4 139848588 1D TTTTCCTCCT C/- CCCCAGCTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 5 4 218600 CASAVA_Build 4 139852132 1I GACTTAGGGC -/A GGTATGAAAG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 0 1 218601 CASAVA_Build 4 139866658 5I ACGGCTAACT -----/TAGAG TATTGTTTGT 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 TAGAG 0 1 218602 CASAVA_Build 4 139870999 2D ATATCAAACT AA/-- AGACTCTGCA 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 A 3 1 218603 CASAVA_Build 4 139872349 2I GGAGTGTTCA --/TT TTTTTTTTTG 2752 het 2752 ref 28 15 7 6 T 9 11 218604 CASAVA_Build 4 139884617 1D GCTTGTAAAA G/- TAAAACTTTC 3070 het 3070 hom 49 19 20 11 G 1 0 218605 CASAVA_Build 4 139904081 36D ATAGATAGAT AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAC/------------------------------------ AGACAGACAG 3070 het 2071 hom 24 11 13 6 AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAC 1 0 218606 CASAVA_Build 4 139908902 1I CTCCCCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2272 hom 28 7 11 10 T 10 11 218607 CASAVA_Build 4 139909606 5D GTGGAATTGC TTTGA/----- TTTATTTTAT 3070 het 3070 ref 40 20 20 1 TTTGA 1 0 218608 CASAVA_Build 4 139917108 1D AGCATCCAAT G/- GGGAAAAAAA 2131 het 2131 ref 21 11 6 5 G 4 3 218609 CASAVA_Build 4 139934280 6I GAAGGAAAAA ------/AGAAAG AAAGAAAGAG 1941 het 1941 ref 17 10 4 3 AGAAAG 0 1 218610 CASAVA_Build 4 139936817 1I TTATCCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 11 12 218611 CASAVA_Build 4 139962084 1D AAGAGATTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 17 14 8 A 10 9 218612 CASAVA_Build 4 139974615 1I TCTACTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 A 11 12 218613 CASAVA_Build 4 139999930 1I AGAAATTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 9 10 218614 CASAVA_Build 4 140007684 7I14M8I GCATACACCA -------CACACACACCACAC--------/CACACCCCACACACACCACACGATACACT AATACACACC 3070 het 3070 ref 89 64 18 23 N/A 0 0 218615 CASAVA_Build 4 140008019 2D ACACAACATG CA/-- CACACACACA 1247 het 1247 ref 76 51 3 23 CA 8 7 218616 CASAVA_Build 4 140015538 2I ATCTGTAGGT --/GC CAATGTAGAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 GC 0 1 218617 CASAVA_Build 4 140016631 3I CACATAAAAC ---/AAG AAGGAATCCA 3070 het 3070 hom 54 17 22 15 AAG 1 2 218618 CASAVA_Build 4 140019424 1D GACCTATGAA T/- TTTTTTTTTT 831 het 831 ref 26 17 2 7 T 15 14 218619 CASAVA_Build 4 140020334 2I TCCCATCTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 A 12 14 218620 CASAVA_Build 4 140032940 1I ATTTTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 10 11 218621 CASAVA_Build 4 140047045 2D GGGTTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 21 het 12 0 8 4 TG 9 8 218622 CASAVA_Build 4 140047270 4D TAATTCCAAC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TA 9 7 218623 CASAVA_Build 4 140050769 1D TGTTACTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 11 10 218624 CASAVA_Build 4 140051209 1I ATTCATCCCA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 23 0 21 2 G 0 1 218625 CASAVA_Build 4 140053319 1I TACCTGACCG -/A TGCTGGAAAC 3070 hom 90 het 34 0 28 6 A 0 1 218626 CASAVA_Build 4 140054292 1D CCTTCCTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 40 0 30 10 T 10 9 218627 CASAVA_Build 4 140056156 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 714 hom 19 3 13 3 A 15 14 218628 CASAVA_Build 4 140062447 1I AGCTACTAGG -/C GGGGCTGAGG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 0 1 218629 CASAVA_Build 4 140068406 2I ACAGTACATC --/TA TATGTTTGCA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 TA 1 2 218630 CASAVA_Build 4 140073956 1I TTCCTTGTGA -/C CCCCCCACTC 359 het 3 hom 4 0 1 3 C 6 7 218631 CASAVA_Build 4 140074258 1D TGTGTGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 704 hom 37 2 24 11 T 13 12 218632 CASAVA_Build 4 140076248 2D AAGTCACTAT AA/-- AAAGATTTCT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 A 5 3 218633 CASAVA_Build 4 140077611 2D GGCATTACTC TA/-- TTCATGAGAG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 TA 1 0 218634 CASAVA_Build 4 140077701 1D GAGGTTTGGA G/- GGAACAAAGA 3070 hom 64 het 24 0 20 4 G 3 2 218635 CASAVA_Build 4 140079750 2D TGGATAAATA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 24 0 18 9 T 15 13 218636 CASAVA_Build 4 140080797 14I TGTATTTCCC --------------/GGTTCCAAAGGACA GGTTCCAAAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 GGTTCCAAAGGACA 1 2 218637 CASAVA_Build 4 140082694 1I AATTTTCTTC -/T TTCTTCTTTT 2367 het 108 hom 24 1 9 14 T 2 3 218638 CASAVA_Build 4 140083740 6D TGCTCCACCT GGGAGG/------ TGGAGGTTAC 3070 hom 75 het 28 0 26 5 GGGAGG 1 0 218639 CASAVA_Build 4 140084897 1D TTTTTTTTTT A/- AATTAAAACA 3070 hom 72 het 30 0 26 4 A 3 2 218640 CASAVA_Build 4 140091097 8I TTCTTCTGAG --------/CCTCTCTC CCTCTCTCCT 3070 hom 101 het 39 0 31 8 CCTCTCTC 1 2 218641 CASAVA_Build 4 140091683 1I AGCCCATAAC -/A ATCTACCTCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 218642 CASAVA_Build 4 140097469 1I GAGTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 916 hom 44 3 36 5 A 10 11 218643 CASAVA_Build 4 140099501 1D GAGTATAGAA T/- TCATTGCTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 1 218644 CASAVA_Build 4 140119606 1I GTTATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2201 het 1500 hom 18 5 6 7 T 10 11 218645 CASAVA_Build 4 140128141 1I AGATTTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 153 hom 28 1 22 5 T 10 11 218646 CASAVA_Build 4 140131881 1I ATCTCAGCTA -/C TCAAGAGGCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 C 0 1 218647 CASAVA_Build 4 140172865 1D GTCAGTGGCA G/- GGGGATGGGG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 G 5 4 218648 CASAVA_Build 4 140179975 1D GACAATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 907 hom 36 2 29 5 T 11 10 218649 CASAVA_Build 4 140181511 1D TACAGGAAGT A/- AAAAAAAAAA 812 het 812 ref 39 31 3 5 A 11 10 218650 CASAVA_Build 4 140182535 2I AATCTAGCCA --/AT TTACTTTCCC 3070 het 3070 hom 55 20 30 5 AT 0 1 218651 CASAVA_Build 4 140184737 1I AAGGGCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 11 12 218652 CASAVA_Build 4 140218238 3D AGAAATATTT CTC/--- CTACTTGTGT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 CTC 1 0 218653 CASAVA_Build 4 140218464 1I TTATAGAAGG -/A AAAAATAAAT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 A 5 6 218654 CASAVA_Build 4 140221566 3D AAAAAAACCC AAG/--- GAGAAGCCCT 2687 het 2687 ref 38 16 12 10 AAG 1 0 218655 CASAVA_Build 4 140226829 2I CCAAGCTGTC --/TT AAGTTTTTCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 0 2 218656 CASAVA_Build 4 140235326 5D CTGAGGGAGA AAGAT/----- AAGACTTGTG 3070 hom 123 het 43 0 42 1 AAGAT 1 0 218657 CASAVA_Build 4 140254459 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 30 0 25 5 A 15 14 218658 CASAVA_Build 4 140258558 1I ATTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 195 hom 23 1 17 5 A 13 14 218659 CASAVA_Build 4 140259558 1D GGGAAATTTG A/- AAATCAGAAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 4 3 218660 CASAVA_Build 4 140268881 1D CTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 A 11 10 218661 CASAVA_Build 4 140272403 1D TCATAATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 15 14 A 14 13 218662 CASAVA_Build 4 140295028 3D ATTATCTTTT TAA/--- TAATACAAGA 3070 het 3070 hom 38 14 21 5 TAA 2 1 218663 CASAVA_Build 4 140295346 8D AAGTCATCCC TCTGCTAA/-------- CCTGACACCA 3070 het 3070 ref 45 27 17 5 TCTGCTAA 1 0 218664 CASAVA_Build 4 140322630 1I TTGGAAGTAC -/T GAGTTATGTT 3070 het 3070 hom 54 22 22 10 T 0 1 218665 CASAVA_Build 4 140323734 6D ATCTTTATTA TAAGTT/------ TAAAAGTCAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 TAAGTT 1 0 218666 CASAVA_Build 4 140333522 3D GCTCAGGATA CTT/--- CTTCTACACA 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 CTT 2 1 218667 CASAVA_Build 4 140343146 1D TTGGATTTAT A/- AAAAAAAAAA 1225 het 1225 ref 16 11 3 2 A 11 10 218668 CASAVA_Build 4 140351394 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1821 het 1657 hom 34 12 7 15 T 17 16 218669 CASAVA_Build 4 140377109 1I AACCTTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 11 12 218670 CASAVA_Build 4 140399621 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2402 het 2402 ref 29 16 7 6 T 17 16 218671 CASAVA_Build 4 140409847 2D TATACAAATA TT/-- TTCTAGCATT 3070 het 3070 ref 30 13 13 7 T 4 2 218672 CASAVA_Build 4 140425503 2I AATTTCACTC --/TT GTTTCCCAGG 3070 het 1630 hom 21 7 10 4 T 0 2 218673 CASAVA_Build 4 140429081 1D CTCTGACACA T/- TTTTGTGCCT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 5 4 218674 CASAVA_Build 4 140451973 2D TTACAGGGCA AG/-- AGAGAAAAAG 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 AG 3 2 218675 CASAVA_Build 4 140462208 1I CCCGAGTAGC -/T TGGGACTACA 1058 het 42 hom 5 1 4 0 T 1 2 218676 CASAVA_Build 4 140497540 1D TACAAGTATA T/- TTTATAACAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 4 3 218677 CASAVA_Build 4 140497591 1D CAGCCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 2205 het 2205 ref 18 7 6 5 T 13 12 218678 CASAVA_Build 4 140498796 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1021 het 1021 ref 27 15 3 9 T 13 14 218679 CASAVA_Build 4 140502553 1D TATAATATTC A/- GAGTTCTTCT 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 1 0 218680 CASAVA_Build 4 140503428 2D ACGTACAAAA AT/-- ATGAATTTTG 3070 het 3070 ref 45 24 17 7 AT 2 1 218681 CASAVA_Build 4 140506624 1D TCTATTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2586 hom 34 9 15 10 T 15 14 218682 CASAVA_Build 4 140517823 1D AACATGGTAC T/- TCTCTATATG 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 T 2 1 218683 CASAVA_Build 4 140552527 2I AATAACACTC --/TT ATAATAATAG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 0 2 218684 CASAVA_Build 4 140553881 2D TTGTTTTTTT TG/-- TGTGTTTGTT 3070 het 2686 hom 21 7 12 3 TG 3 2 218685 CASAVA_Build 4 140556057 1D AATCCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 762 het 762 ref 21 7 4 10 T 19 18 218686 CASAVA_Build 4 140558907 1D TTCCCATTCC T/- TTTTTTTTTT 863 het 863 ref 27 11 3 14 T 19 18 218687 CASAVA_Build 4 140560638 1D GCAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 11 10 218688 CASAVA_Build 4 140575498 1D TAAATTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2525 hom 35 9 19 7 T 15 14 218689 CASAVA_Build 4 140607189 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1017 het 1017 ref 26 14 4 8 T 12 11 218690 CASAVA_Build 4 140637532 4I AATAATTCTG ----/ATAT ATAAAGAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 AT 1 3 218691 CASAVA_Build 4 140650843 16D CTGACAGCTA CAGATCAGCACAACAG/---------------- CTGCTCTCCA 3070 hom 137 het 46 0 41 8 CAGATCAGCACAACAG 1 0 218692 CASAVA_Build 4 140656895 1D CATGGTGAAA C/- CCCCATCTCT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 C 5 4 218693 CASAVA_Build 4 140658080 15D AATCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 20 1 15 5 A 27 12 218694 CASAVA_Build 4 140662031 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 41 1 35 6 A 12 11 218695 CASAVA_Build 4 140666651 4D GTTGTTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 31 10 13 8 TTTG 5 4 218696 CASAVA_Build 4 140702714 1I GACAAATACT -/C CTGATACAGT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 C 1 2 218697 CASAVA_Build 4 140705894 1I TGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTG 1484 het 1484 ref 17 7 6 5 T 9 10 218698 CASAVA_Build 4 140707026 1I CTCGTGATTC -/A ACCCACTTTG 2823 het 2369 hom 14 6 6 2 A 1 2 218699 CASAVA_Build 4 140707520 1D AGAGGTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1640 hom 19 5 10 5 A 13 12 218700 CASAVA_Build 4 140711235 2D CATAACTATC AG/-- AGAGATTTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 3 2 218701 CASAVA_Build 4 140712516 2I AAATGAGGAC --/AT GTGTTATTTC 3070 hom 98 het 37 0 33 4 AT 0 1 218702 CASAVA_Build 4 140725375 2D CTCAAGGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 22 1 10 11 A 18 16 218703 CASAVA_Build 4 140726784 1I AATTCCCCAT -/C CCCCCCACGC 3070 hom 110 het 41 0 33 8 C 6 7 218704 CASAVA_Build 4 140728524 2D GTGCTACAGC AG/-- AGTCAAAGAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AG 2 1 218705 CASAVA_Build 4 140730855 4I TGTGTTGGGG ----/ATGC ATGCATGCAT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 ATGC 3 4 218706 CASAVA_Build 4 140731184 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2880 het 110 hom 12 2 8 2 A 15 14 218707 CASAVA_Build 4 140751025 1I TGGGCCCTCC -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 A 6 7 218708 CASAVA_Build 4 140752777 1I CCCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2632 het 1016 hom 36 4 15 17 A 16 17 218709 CASAVA_Build 4 140771506 1D AGCCAAATGA G/- GAGACAAGAG 3070 het 3070 ref 41 20 17 7 G 2 1 218710 CASAVA_Build 4 140806719 7D TGCGCGTGTG TGCGTGT/------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 37 16 16 9 TGCGTGT 1 0 218711 CASAVA_Build 4 140810871 3D GCGGGGGGGG GGC/--- GGTTAACAGA 2700 het 630 hom 13 3 7 4 GGC 1 0 218712 CASAVA_Build 4 140811509 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1182 het 1182 ref 28 9 6 13 A 17 18 218713 CASAVA_Build 4 140812113 1I TCTGTCGCCC -/G GGGCTGGAGT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 G 3 4 218714 CASAVA_Build 4 140820837 1D CAATGTTTAT A/- ATTATTGTGA 3070 het 3070 hom 53 21 29 3 A 2 1 218715 CASAVA_Build 4 140821228 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTAGTGGA 3070 het 3070 hom 42 10 26 6 T 5 4 218716 CASAVA_Build 4 140821626 1D TGTTTTAGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 10 9 218717 CASAVA_Build 4 140822847 2D AATTGGTGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 17 6 A 14 12 218718 CASAVA_Build 4 140842573 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 21 0 15 6 A 12 13 218719 CASAVA_Build 4 140846257 1I AGGAAGAAGT -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 7 8 218720 CASAVA_Build 4 140855380 1D ATCAGGGAGG C/- CAGAGAAAGA 1232 het 1232 ref 30 19 5 6 C 2 1 218721 CASAVA_Build 4 140856802 3I TCACTGGCTA ---/AAG AAGTCAATCC 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 AAG 1 2 218722 CASAVA_Build 4 140857172 3I TTCAGAAAGT ---/ATC ATCATCAGTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 ATC 2 3 218723 CASAVA_Build 4 140857858 1I GATAATGGAG -/C CCCCCCACCC 3070 het 2617 hom 25 11 12 2 C 6 7 218724 CASAVA_Build 4 140871489 2D GAGAGCATGG CT/-- CTGGGAAGTC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 CT 2 1 218725 CASAVA_Build 4 140877964 14I AGGAACTTGT --------------/CTGATGTCCCACAG CTGGTGGTGG 3070 het 3070 hom 40 10 11 19 CTGATGTCCCACAG 0 1 218726 CASAVA_Build 4 140882754 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 26 1 16 9 T 17 16 218727 CASAVA_Build 4 140885905 3I TCAGGAGCCA ---/CAG CAGCAGGTTC 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 CAG 2 3 218728 CASAVA_Build 4 140887054 1D TAAAAATTTT C/- CTACCCCTTA 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 C 2 1 218729 CASAVA_Build 4 140889368 6I GCAATTTCAA ------/GTAACT GCTCCGAGGT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 GTAACT 0 1 218730 CASAVA_Build 4 140890498 1I AACCCCCCCC -/G CACCCTATTC 3070 het 2738 hom 34 9 16 9 G 0 1 218731 CASAVA_Build 4 140904220 1I GCATTGGATT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 8 218732 CASAVA_Build 4 140917365 20I AGATATGGCT --------------------/TCCATGGGAAAAGGACATGA TCCTGGGATG 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 TCCATGGGAAAAGGACATGA 0 1 218733 CASAVA_Build 4 140921228 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1735 het 474 hom 21 6 8 7 T 18 17 218734 CASAVA_Build 4 140922113 8D GAGCATTTTC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 837 hom 21 3 15 7 AT 11 7 218735 CASAVA_Build 4 140980074 2D GTCCAACAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2971 het 861 hom 22 7 10 5 T 16 14 218736 CASAVA_Build 4 140991251 7D GACCCTCGAT CCTCCCA/------- CCTCAGCCTC 3070 het 3070 ref 21 11 9 7 CCTCCCA 1 0 218737 CASAVA_Build 4 140999057 6D GATTCTTGGC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1971 het 1971 ref 29 16 8 6 T 20 14 218738 CASAVA_Build 4 141009986 1D AAAATTTTTG T/- TTTTAATATG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 5 4 218739 CASAVA_Build 4 141013384 1I GTTTAGAGTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 2217 hom 30 8 16 6 A 7 8 218740 CASAVA_Build 4 141020784 3D CTCAAAATTG AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 A 12 9 218741 CASAVA_Build 4 141045712 3D GTACCATGGT AAG/--- AAGCTTGGAC 3070 het 3070 ref 52 25 22 10 AAG 2 1 218742 CASAVA_Build 4 141072782 5I TAACTTTCTC -----/CTATT CTCAGATTTT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 CTATT 0 1 218743 CASAVA_Build 4 141076248 2D GGTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2536 hom 26 10 11 6 T 12 10 218744 CASAVA_Build 4 141095930 1I AAAACTTTAC -/T TTTTTTTTTT 2928 het 2928 ref 32 15 10 7 T 10 11 218745 CASAVA_Build 4 141101464 1D GAAGGAAGAG A/- AAAAAAAAAT 1305 het 1305 ref 39 32 4 4 A 10 9 218746 CASAVA_Build 4 141125046 2I TTCTGTGTTC --/CT CTTGCTTTGT 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 CT 1 2 218747 CASAVA_Build 4 141137716 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAATATT 2220 het 1478 hom 8 3 5 0 A 7 6 218748 CASAVA_Build 4 141138966 2D AAAATAGATT TC/-- TGTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 TC 1 0 218749 CASAVA_Build 4 141141526 16D AGCTACTTGG GAAGGCTGAGGCAGGA/---------------- GAATCACTTG 1293 het 1293 ref 8 5 3 0 GAAGGCTGAGGCAGGA 1 0 218750 CASAVA_Build 4 141142650 3D TCACACACTT ATC/--- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 23 5 ATC 1 0 218751 CASAVA_Build 4 141149197 1I GGTCTTACTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 8 9 218752 CASAVA_Build 4 141158900 1D AATGTCAAAG T/- GGAAAATGAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 T 1 0 218753 CASAVA_Build 4 141159548 3I ACTTAAAAAT ---/CAA AAATGAAGTC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 CAA 0 1 218754 CASAVA_Build 4 141159616 1D TGAAGAATAA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 8 7 218755 CASAVA_Build 4 141161015 1I TTGAGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 T 11 12 218756 CASAVA_Build 4 141164720 3D AAATAGATAC TAT/--- TATTATCCAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TAT 3 2 218757 CASAVA_Build 4 141174029 1D GAAGAGGTAC G/- GTATGGGAAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 G 2 1 218758 CASAVA_Build 4 141176387 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 18 2 9 7 A 15 14 218759 CASAVA_Build 4 141177846 1I CCTCTGCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 16 19 15 A 12 13 218760 CASAVA_Build 4 141178821 1D AACCACAGAA C/- CACAGAACTT 3070 het 3070 ref 52 29 20 3 C 2 1 218761 CASAVA_Build 4 141183247 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 10 9 218762 CASAVA_Build 4 141184732 1I AGAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 11 12 218763 CASAVA_Build 4 141190277 1I GTTGCCTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 23 16 11 T 9 10 218764 CASAVA_Build 4 141190489 1D AATCACAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 12 11 T 11 10 218765 CASAVA_Build 4 141193140 1D CATATATTTC T/- TTTTTTTTTT 1545 het 1545 ref 30 9 7 14 T 17 16 218766 CASAVA_Build 4 141198571 1D AGTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 70 het 30 0 23 7 T 10 9 218767 CASAVA_Build 4 141198666 1D TTAAAAATGC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 6 5 218768 CASAVA_Build 4 141198874 1I CTCAGAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2251 hom 24 6 13 5 T 10 11 218769 CASAVA_Build 4 141199171 2D ATAATACATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 27 het 12 0 10 3 TA 7 6 218770 CASAVA_Build 4 141231680 1D CAACAACAAC A/- AACAACAAAA 2166 het 290 hom 33 2 9 22 A 3 2 218771 CASAVA_Build 4 141233477 2I ACCAAAAAGA --/AG AAAATTTGAG 3070 hom 111 het 46 0 38 8 AG 0 1 218772 CASAVA_Build 4 141237503 1I ATCAAGGTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 218773 CASAVA_Build 4 141238238 1I GAGTGGCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 11 12 218774 CASAVA_Build 4 141262754 1I TTTTGAGTGA -/T TTTTTTTTGA 2988 het 2988 ref 24 14 7 3 T 8 9 218775 CASAVA_Build 4 141266040 2D ATTTAAAAAC TT/-- TAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 T 3 1 218776 CASAVA_Build 4 141268028 4I AAGGAGTGAC ----/AGAT AGAAAGTGTG 3070 het 3070 hom 52 17 30 5 AGAT 0 1 218777 CASAVA_Build 4 141290791 1D CTTTCAAGTC T/- ATTTGTTGCT 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 T 1 0 218778 CASAVA_Build 4 141304891 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 10 9 218779 CASAVA_Build 4 141305861 1I TGGAATTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 27 3 19 5 A 11 12 218780 CASAVA_Build 4 141307668 1D AAATAAATCC T/- TTTTTTTTTT 3064 het 1317 hom 23 5 8 10 T 15 14 218781 CASAVA_Build 4 141307941 1I TGGGATTACA -/G GCGTGAGCCA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 G 1 2 218782 CASAVA_Build 4 141308198 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 10 9 218783 CASAVA_Build 4 141310014 4I CCTTTAAAAC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 TTTG 2 3 218784 CASAVA_Build 4 141317332 1D CCAAAGTGCT G/- GGATTACAGG 3070 het 1152 hom 19 3 13 5 G 3 2 218785 CASAVA_Build 4 141327246 1D CTCTGAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 11 10 218786 CASAVA_Build 4 141343709 3I CAGGTGTGAG ---/CCA CCACCACATC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 CCA 2 3 218787 CASAVA_Build 4 141355793 5I TCGTTGCCAG -----/GCTGA GCTAAGTCCC 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 GCTGA 0 1 218788 CASAVA_Build 4 141372144 1I AACACCCCCC -/G CCCCGTCGAA 2879 het 916 hom 22 6 10 6 G 0 1 218789 CASAVA_Build 4 141424846 1I AATAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 10 11 218790 CASAVA_Build 4 141442016 2D TACAAATATT AA/-- TTCCAACACA 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 A 2 0 218791 CASAVA_Build 4 141447378 1I8M6I AGGAAGTATG -TTGTAGGT------/TTTGTAGGTATGAGC AGGAGAAGGT 3070 het 3070 ref 43 21 19 5 N/A 0 0 218792 CASAVA_Build 4 141456974 2D CACAAACATA CC/-- CATTCTTTAG 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 C 3 1 218793 CASAVA_Build 4 141467248 2D TATAGGCAGA CC/-- CCCCCCCCTA 3070 het 61 hom 31 2 18 11 C 10 8 218794 CASAVA_Build 4 141468043 2D TTCAATACTG AA/-- AAAAAAAATC 3070 hom 33 het 25 0 12 14 A 10 8 218795 CASAVA_Build 4 141472595 1D12M5I21M1I GGAGCAGGCA TCTTACATGGCAG-----GAGCAGGAGGAAGAGAGAGAT-/-CTTACATGGCAGGAGCAGAGCAGGAGGAAGAGAGAGATA GGGGAGGTGC 3070 het 2047 hom 26 6 16 8 N/A 0 0 218796 CASAVA_Build 4 141472964 20D TGGAGTCATC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTT 2353 het 2140 hom 21 7 9 5 T 30 10 218797 CASAVA_Build 4 141473642 12D CTGATATATT TCCAAACAGCAC/------------ TCAAACCTCC 3070 het 3070 hom 61 27 32 7 TCCAAACAGCAC 1 0 218798 CASAVA_Build 4 141484553 2I AAATAAAAAC --/AT AAAATATTTC 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AT 0 1 218799 CASAVA_Build 4 141488751 1D CACATAGTTA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 8 7 218800 CASAVA_Build 4 141489180 10I GTATATATAT ----------/ACACACACAC ACGCACACAC 2971 het 2971 ref 24 13 8 3 AC 1 6 218801 CASAVA_Build 4 141490853 1I TCTGTCTGCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 8 9 218802 CASAVA_Build 4 141498475 2I ACATCTTCTC --/TT TTTCTCCCCT 3070 hom 116 het 48 0 38 10 T 3 5 218803 CASAVA_Build 4 141499726 4D TTTCATTTTG CTCA/---- CTATTTTGTG 3070 het 3070 ref 38 17 16 8 CTCA 1 0 218804 CASAVA_Build 4 141506784 8D CTTTTCTTTC TTTCTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 27 0 16 13 TTTCTTTT 1 0 218805 CASAVA_Build 4 141528896 1D CTTGTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 910 het 910 ref 32 25 2 5 A 11 10 218806 CASAVA_Build 4 141543319 1D CTCAGCAAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 9 8 218807 CASAVA_Build 4 141548191 1D CAATGGCTGC A/- AAAAAAAAAA 2844 het 2638 hom 33 10 9 14 A 17 16 218808 CASAVA_Build 4 141584030 4D GAGTTTCTTC TTAT/---- TTATCTTCAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTAT 2 1 218809 CASAVA_Build 4 141586728 1I TGGCCTGAAG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 7 8 218810 CASAVA_Build 4 141590364 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 13 5 A 11 10 218811 CASAVA_Build 4 141595502 4D40M4D ATTCCCTTAT GGAAAATCCTTTTAGTATCTGTGGAGTATGCTGTGGAACTCCCACTTT/----TACCCTTTTAGTATCTGTGGAGTATGCTGTGGAACTCCCA---- CTTACTAATG 3070 hom 117 het 32 0 40 3 N/A 0 0 218812 CASAVA_Build 4 141598921 1I GTGCATCCAG -/T ATTTAGTTCA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 0 1 218813 CASAVA_Build 4 141606295 1D CATTACATTA T/- TTATTAACAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 3 2 218814 CASAVA_Build 4 141606766 3D ATGAAAGTGC AGA/--- AGGTGAATGC 3070 hom 129 het 48 0 44 6 AGA 1 0 218815 CASAVA_Build 4 141608658 8D TAATATTCAC TATTAAAT/-------- TATTCTATTA 3070 hom 48 het 20 0 17 5 TATTAAAT 1 0 218816 CASAVA_Build 4 141608728 5D GAATATTCAC TATTA/----- TATTATTCAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TATTA 2 1 218817 CASAVA_Build 4 141620982 1D AACCTATGAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 T 7 6 218818 CASAVA_Build 4 141639917 4D TGTTTCTGTT GCTA/---- GCTACTATCC 3070 hom 144 het 55 0 48 8 GCTA 2 1 218819 CASAVA_Build 4 141698393 3D TGCCAAACTC TTA/--- TTATGTATGC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TTA 2 1 218820 CASAVA_Build 4 141701353 1I ATTTTGCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 36 1 31 4 A 12 13 218821 CASAVA_Build 4 141723333 1I AAGTATAGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 21 11 9 1 A 8 9 218822 CASAVA_Build 4 141724588 1D ATATACAAGA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 T 8 7 218823 CASAVA_Build 4 141746340 7I AAACGCCTTG -------/AAGGGAA AGGGGTACCC 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 AAGGGAA 0 1 218824 CASAVA_Build 4 141747520 1D GAAAGCACCC T/- CCTACCCACC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 1 0 218825 CASAVA_Build 4 141750210 1D42M4I GGGGGCAGAG AAAAAAAAAATGGCCTCCACCCATTGTGTTTCTCCATGAGCTT----/-AAAAAAAAATGGCCTCCACCCATTGTGTTTCTCCATGAGCTTTGAC TGTGAGTGAG 3070 hom 99 het 26 0 33 4 N/A 0 0 218826 CASAVA_Build 4 141755526 1D AATCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1894 het 1894 ref 31 17 5 9 A 17 16 218827 CASAVA_Build 4 141765015 1I GGTTCAGAAG -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 6 7 218828 CASAVA_Build 4 141765104 4D CCTGATTTAG CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 81 het 37 0 28 11 CAAA 4 3 218829 CASAVA_Build 4 141789514 1D TGTTCTCTGG C/- TCCTCCCACC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 C 1 0 218830 CASAVA_Build 4 141835401 1I TTTAAAGTCT -/A GAAAGTGATG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 0 1 218831 CASAVA_Build 4 141836780 13D5M6D AAAAGAGGCG GGCCAGGCGTGATGGCTCACGCCT/-------------GGCTC------ GTAATCCCAG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 N/A 0 0 218832 CASAVA_Build 4 141838318 1D GGAAGATCTG T/- TTCATAGCAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 3 2 218833 CASAVA_Build 4 141842454 1D GCTGCCCCAC A/- TGTTATTTTC 3070 hom 128 het 45 0 42 5 A 1 0 218834 CASAVA_Build 4 141847733 1D TATTACCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 11 10 218835 CASAVA_Build 4 141896457 1I CTGCAGCCCA -/G GGCCGCGGGC 1534 hom 40 het 17 0 10 7 G 2 3 218836 CASAVA_Build 4 141900844 4D ACTTCTCTCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 1797 het 1125 hom 22 4 8 10 TTCC 4 3 218837 CASAVA_Build 4 141922366 1D GGAGAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 43 1 33 9 T 12 11 218838 CASAVA_Build 4 141930311 9I AAAAGGAAGA ---------/AAAAGAAAG AAAAGAAAGA 3070 hom 76 het 32 0 24 8 AAAAGAAAG 1 2 218839 CASAVA_Build 4 141940214 1I ACTTGACATA -/T CCACTTGGCT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 0 1 218840 CASAVA_Build 4 141970864 1I TCAATATCTT -/C CACCTCCCTC 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 C 1 2 218841 CASAVA_Build 4 141994184 1D CCCGTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1909 hom 35 10 17 8 A 16 15 218842 CASAVA_Build 4 142009533 1I TAAGATATCC -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 6 7 218843 CASAVA_Build 4 142013163 3I GAAACTATTA ---/CAG CAGAACAGAT 3070 hom 129 het 51 0 43 8 CAG 1 2 218844 CASAVA_Build 4 142029647 1D AAACAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 18 14 14 T 11 10 218845 CASAVA_Build 4 142033509 1I TTAAAAAAAA -/T AATAAGCTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 0 1 218846 CASAVA_Build 4 142034840 1D CAAAATAGGC A/- TTAATAAATC 3070 hom 123 het 51 0 42 9 A 1 0 218847 CASAVA_Build 4 142038884 2I GATGCACACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 41 1 30 10 T 12 14 218848 CASAVA_Build 4 142039382 1I TTCTAACTCC -/T TATTTAAATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 1 2 218849 CASAVA_Build 4 142040438 1I GAAAATTTTT -/C CCCCAAAGTG 3070 hom 90 het 36 0 29 7 C 4 5 218850 CASAVA_Build 4 142041064 1D GACTATAGCT A/- AGTAACTCAG 3070 hom 96 het 40 0 31 9 A 2 1 218851 CASAVA_Build 4 142041919 3I TAAATAATAA ---/ATC ATCAGTCCAT 3070 hom 144 het 50 0 49 1 ATC 1 2 218852 CASAVA_Build 4 142046327 30D TCCTGTAGGT TGGACTCAGCAAAAATGTCTCAAACTTTTG/------------------------------ TGGACTCAGT 3070 het 3070 ref 47 28 16 12 TGGACTCAGCAAAAATGTCTCAAACTTTTG 1 0 218853 CASAVA_Build 4 142052534 1D TATAGAAAAA T/- ATCCCTAAGT 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 T 1 0 218854 CASAVA_Build 4 142069838 3D GAGAAGTATT TAA/--- TACTACAGCG 3070 hom 96 het 36 0 31 6 TAA 1 0 218855 CASAVA_Build 4 142071516 11I TTAACGACAA -----------/TGGAAAGGCCG TGGAAAGGTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TGGAAAGGCCG 0 1 218856 CASAVA_Build 4 142071916 1I AACTAAGGGC -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 6 7 218857 CASAVA_Build 4 142090288 1D ACCCCCCCCC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 59 23 18 18 A 9 8 218858 CASAVA_Build 4 142094127 2D TAATAAAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 31 2 15 14 T 13 11 218859 CASAVA_Build 4 142102685 1D4M1I CTCTCTCTCT ACTCT-/-CTCTA CTCTCTCTCT 2688 het 1353 hom 42 9 17 16 N/A 0 0 218860 CASAVA_Build 4 142104162 8I AAATGGAGAA --------/AAGTTTGC AAGTTTGCAA 3070 hom 76 het 36 0 26 10 AAGTTTGC 1 2 218861 CASAVA_Build 4 142111074 1I CACTATCCCC -/T CTCCCCACCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 0 1 218862 CASAVA_Build 4 142111225 1I AGGCTTTAAA -/C TACTCATCAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 0 1 218863 CASAVA_Build 4 142136934 1I GATTGTTAGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 T 7 8 218864 CASAVA_Build 4 142137551 1I GATTCATGAG -/C CCAATACATA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 C 2 3 218865 CASAVA_Build 4 142138280 13I GATTGCGCCA -------------/CTGCACTCCAGCC CTGCACTCCA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 CTGCACTCCAGCC 1 2 218866 CASAVA_Build 4 142139508 1I AAAAATAGTG -/C AGCTTCATAT 3070 het 3070 hom 54 21 22 11 C 0 1 218867 CASAVA_Build 4 142139606 15D CACGAAGCAG GCTGCTGCTGCTGCT/--------------- GCTGCTGACA 3070 het 3070 hom 40 22 18 3 GCT 7 2 218868 CASAVA_Build 4 142141274 1D TTTGACTTTG T/- TCTTGGCACA 3070 het 3070 hom 46 19 18 10 T 2 1 218869 CASAVA_Build 4 142142851 3D TTTTCCTAGA TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 24 12 5 T 12 9 218870 CASAVA_Build 4 142143189 21D GGTCTTGCCT TAAAAATAATACCATTTGGCC/--------------------- TAATACCACT 3070 het 3070 ref 42 28 14 7 TAAAAATAATACCATTTGGCC 1 0 218871 CASAVA_Build 4 142143458 10I AAGTCAGCTT ----------/TAATTATCTC TAAGGTCTCT 3070 het 3070 hom 47 18 19 10 TAATTATCTC 0 1 218872 CASAVA_Build 4 142146876 26D GTATATATAT ACATACATATATACGTATATATATAC/-------------------------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 29 21 13 5 ACATACATATATACGTATATATATAC 1 0 218873 CASAVA_Build 4 142151673 3D TTCCTATTTA ATG/--- ATATTATTAA 3070 het 2693 hom 25 7 17 3 ATG 1 0 218874 CASAVA_Build 4 142164025 1D ACTTTTCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 11 10 218875 CASAVA_Build 4 142164166 1I CTGAAATTAA -/T TTTTTTATAT 3070 hom 99 het 34 0 33 1 T 6 7 218876 CASAVA_Build 4 142170886 2D AATGGCTATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 12 10 218877 CASAVA_Build 4 142202568 1D TTCAGGAAAG A/- GAATAAATCT 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 A 1 0 218878 CASAVA_Build 4 142206160 1I TTATTTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 44 0 33 11 T 10 11 218879 CASAVA_Build 4 142206846 1D TATATGTGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 41 0 23 19 A 12 11 218880 CASAVA_Build 4 142214271 1I CAAGCTCGGG -/T GGGGGAAGTC 3070 hom 135 het 47 0 46 1 T 0 1 218881 CASAVA_Build 4 142215943 4I GTCCTCAGGC ----/AGGT AGGTCCATAC 3070 hom 125 het 49 0 40 9 AGGT 1 2 218882 CASAVA_Build 4 142220660 1D TGAAAAGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 A 10 9 218883 CASAVA_Build 4 142228127 2D ACCTTTTCTT TC/-- TCTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 15 20 1 TC 2 1 218884 CASAVA_Build 4 142232948 1D CTCCCTGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 10 11 1 A 11 10 218885 CASAVA_Build 4 142236532 2D TAAACTTCAC AT/-- GTTACATAAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 AT 1 0 218886 CASAVA_Build 4 142248428 12I TCCTATTTGA ------------/TATATTTATATT ATGGCCTCAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TATATT 0 2 218887 CASAVA_Build 4 142252934 1I ATCGATGGTC -/T TTACAATTTG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 2 3 218888 CASAVA_Build 4 142261599 4D GCTTGGACTC AGTT/---- GGTGACAACA 3070 hom 153 het 54 0 50 6 AGTT 1 0 218889 CASAVA_Build 4 142284734 1D GGAAAAAAAA C/- CCACAAAACT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 3 2 218890 CASAVA_Build 4 142287191 2I CAATATGTCT --/CA CAGAAAAACT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 CA 1 2 218891 CASAVA_Build 4 142289986 1D TTATCTCTTG C/- CCCCCTCCCA 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 C 6 5 218892 CASAVA_Build 4 142296533 2I AAGAAAAGTC --/TA TGGTGGTTAG 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 TA 0 1 218893 CASAVA_Build 4 142298292 1D TATCATGTTT A/- AAAAACTCTA 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 6 5 218894 CASAVA_Build 4 142299067 1D TCACTCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 263 hom 34 1 26 7 A 13 12 218895 CASAVA_Build 4 142307920 2D AAGTGGAAAA AC/-- AGTCCATGCT 2303 het 2303 ref 22 14 5 3 AC 1 0 218896 CASAVA_Build 4 142313133 1D TTTTGAGATA T/- CGTGGACTTA 3070 het 3070 ref 44 23 12 9 T 1 0 218897 CASAVA_Build 4 142341699 16I7M5I TTATTTCAGA ----------------TCTTTAC-----/CTCACATGAATTAGTTACGTTACTCTGT CAATCTTTAC 3070 het 3070 hom 46 22 25 3 N/A 0 0 218898 CASAVA_Build 4 142342136 1D14M1D AAGGGTTTAC AAAGAAATTTTTCCAG/-AAGAAATTTTTCCA- GTCACCTTTC 3070 het 3070 ref 36 26 13 2 N/A 0 0 218899 CASAVA_Build 4 142342233 3I TAGTCTTGCA ---/GCT ATTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 GCT 0 1 218900 CASAVA_Build 4 142344415 1I GTCAGCTCAT -/G GTCTTCTTGG 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 G 1 2 218901 CASAVA_Build 4 142347866 4D AAATTAAAAT AGAG/---- AGGTTATACT 3070 het 3070 hom 25 10 12 7 AG 3 1 218902 CASAVA_Build 4 142348570 1D AACAGAAAAC A/- AAAAAAAGCG 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 A 8 7 218903 CASAVA_Build 4 142349816 13D GGAGGACTGG AGTTATAATTAAA/------------- AGTTATAATT 3070 het 3070 ref 28 12 9 11 AGTTATAATTAAA 2 1 218904 CASAVA_Build 4 142350654 5I TTAGTCACAG -----/ATGAT ATAATTGTCT 3070 het 3070 ref 41 24 10 7 ATGAT 0 1 218905 CASAVA_Build 4 142351517 3D TTCAGGAAAA CTT/--- CTTGACAGAG 3070 het 3070 ref 47 24 18 6 CTT 2 1 218906 CASAVA_Build 4 142352285 2I ACTTACTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 T 10 12 218907 CASAVA_Build 4 142354524 1D CGCCCAAGGG C/- TGAAGAGTGC 3070 het 2500 hom 22 9 10 3 C 1 0 218908 CASAVA_Build 4 142355851 4D AGATCTGGAC TTTG/---- TTGAGGAAAT 3070 het 3070 hom 41 15 22 6 TTTG 1 0 218909 CASAVA_Build 4 142391359 1D TATTTTGACC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 T 10 9 218910 CASAVA_Build 4 142397965 1D TTATTACCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 10 9 218911 CASAVA_Build 4 142406435 4I TATTTGCAAC ----/ACAA ACAAAGGATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ACAA 1 2 218912 CASAVA_Build 4 142419049 1D GGAGGATACC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 T 8 7 218913 CASAVA_Build 4 142424496 1I ATTTTATGAC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 372 hom 50 1 44 5 T 7 8 218914 CASAVA_Build 4 142427467 1D CTTAAAAAAA T/- AATAGCCATT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 1 0 218915 CASAVA_Build 4 142430265 1D TTGCATGGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 10 9 218916 CASAVA_Build 4 142431422 1I ATCTCTTTCA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 6 7 218917 CASAVA_Build 4 142438770 7D TCTTTCTTTC TTTCTTT/------- TTTCTTTTTT 1613 het 1613 ref 23 10 7 7 TTTCTTT 3 2 218918 CASAVA_Build 4 142439932 1D TCTAAATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 14 15 T 13 12 218919 CASAVA_Build 4 142448440 3I CTTGTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TTG 3 4 218920 CASAVA_Build 4 142448548 2D CAATCTGTAT TC/-- TCTCTTTGGC 3070 hom 120 het 41 0 40 2 TC 3 2 218921 CASAVA_Build 4 142449542 1D AGAAGAGGTT C/- GGGGGAAATG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 1 0 218922 CASAVA_Build 4 142463736 1D TTGTTTCCCC T/- GCATTTTCTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 0 218923 CASAVA_Build 4 142470447 1D CTCACAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2486 hom 29 8 13 8 A 13 12 218924 CASAVA_Build 4 142475286 2I CAACGTCACA --/CT CTTTTTCCCC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 CT 1 2 218925 CASAVA_Build 4 142483914 1I TCTGCTGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 9 10 218926 CASAVA_Build 4 142493451 1D CCCTCAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 32 1 27 4 A 13 12 218927 CASAVA_Build 4 142493948 1D ACTTCCTGTT A/- AAAAAAAAAA 1255 het 1255 ref 35 16 3 16 A 15 14 218928 CASAVA_Build 4 142533737 1I TCATAAAGCC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 39 0 32 7 T 7 8 218929 CASAVA_Build 4 142554985 1D GGCTGGTGGA G/- GGGGGCAGAG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 6 5 218930 CASAVA_Build 4 142559483 4D TCCTATACAG TTGT/---- TTGAACTCCT 3070 het 3070 ref 32 15 12 9 TTGT 1 0 218931 CASAVA_Build 4 142560129 1D AATTTTAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2101 hom 15 5 7 3 T 10 9 218932 CASAVA_Build 4 142561583 2D TTTTTTATTT TC/-- TGTCTTGTGC 2621 het 2621 ref 25 10 7 8 TC 1 0 218933 CASAVA_Build 4 142561627 2D TTTTTTCTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 26 het 22 0 15 8 T 11 9 218934 CASAVA_Build 4 142569258 1D AATTTCCACT G/- AAAAATTTCT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 G 1 0 218935 CASAVA_Build 4 142570228 1D CATTGATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 A 10 9 218936 CASAVA_Build 4 142572103 2D TCAAGCATTC AA/-- GAGAGAGTAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 7 A 2 0 218937 CASAVA_Build 4 142575531 4D CTTGCTGTTC CCCA/---- ATTCATATGA 3070 het 3070 ref 67 32 29 8 CCCA 1 0 218938 CASAVA_Build 4 142583127 2D TATGTCAATT TG/-- TGTGTGTGTG 964 het 964 ref 43 25 3 16 TG 7 6 218939 CASAVA_Build 4 142585852 3D CAAAAAAAAA TAT/--- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 TAT 1 0 218940 CASAVA_Build 4 142595997 4I ATTCTGAGAT ----/ACAC ACGTGCACAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AC 1 3 218941 CASAVA_Build 4 142603653 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1669 het 1669 ref 20 7 6 7 T 13 12 218942 CASAVA_Build 4 142608475 3D TGTAGTTGAT GAG/--- GAGAAGTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 GAG 2 1 218943 CASAVA_Build 4 142613066 5D TTTTAAAGAA AACTC/----- AATAGGATTT 3070 het 3070 ref 43 25 13 6 AACTC 1 0 218944 CASAVA_Build 4 142616411 1I TGTCAACCAA -/C CATTTCTGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 1 2 218945 CASAVA_Build 4 142618786 4D CAATTCACAA ACAT/---- GGAATATTTT 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 ACAT 1 0 218946 CASAVA_Build 4 142626045 1D TTTTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 12 11 218947 CASAVA_Build 4 142637837 1D ATCTGTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2594 hom 38 8 17 14 A 12 11 218948 CASAVA_Build 4 142667705 6D7M6D CATAGTAGTT ACATAAACTATGTACATAC/------ATTCTGT------ ATAAACCATC 3070 het 3070 ref 37 20 19 8 N/A 0 0 218949 CASAVA_Build 4 142675664 1I CTTTATTGCT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 7 8 218950 CASAVA_Build 4 142675809 1D CTTTAAACAA G/- ACAACAGTGA 3070 het 3070 ref 52 24 17 11 G 1 0 218951 CASAVA_Build 4 142676050 3D AAAAAAAAAA AAC/--- CACTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 AAC 1 0 218952 CASAVA_Build 4 142676189 3D TCTGCAGTTA CTT/--- TCCCCACTCA 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 CTT 1 0 218953 CASAVA_Build 4 142678046 5I AGAAGCCATT -----/GTGTG GTGTGGTTGT 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 GTGTG 1 2 218954 CASAVA_Build 4 142678410 1I ATAAAAAAAA -/C AACAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 C 0 1 218955 CASAVA_Build 4 142682065 1D ACCAAGACAA C/- CCCTTTCCCC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 C 4 3 218956 CASAVA_Build 4 142682436 1D AAGTTAGTGA G/- GAGAAGAACC 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 G 2 1 218957 CASAVA_Build 4 142683007 1D TTAGATGAAT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 3070 ref 39 16 10 13 G 10 9 218958 CASAVA_Build 4 142698779 1D GCATTCTGTA G/- TTCTCCTTGT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 G 1 0 218959 CASAVA_Build 4 142701264 4D TTTATAATAC AATA/---- AATAAATAAT 3070 het 2009 hom 15 6 8 2 AATA 3 2 218960 CASAVA_Build 4 142711326 14I TTAAATACTG --------------/TATTAGGACTCCTT TATTAGGACT 3070 het 3070 hom 29 10 11 9 TATTAGGACTCCTT 1 2 218961 CASAVA_Build 4 142725045 1D TAGATGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 38 2 31 5 A 11 10 218962 CASAVA_Build 4 142740807 3I TGATCATTTG ---/TCT TCTTATTGCT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TCT 1 2 218963 CASAVA_Build 4 142747150 2I TTTTTTTTTT --/AA AAAAAACTAT 3070 het 232 hom 26 5 21 0 A 6 8 218964 CASAVA_Build 4 142749683 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 A 9 8 218965 CASAVA_Build 4 142757187 1D GTCAGCAAGA C/- CCAAGAACCA 3070 het 3070 ref 43 20 21 2 C 3 2 218966 CASAVA_Build 4 142757263 17I CTTGTGTGGT -----------------/GTGTATTAGCTCTTGAA GTTCTCCAAG 3070 het 2500 hom 21 7 13 3 GTGTATTAGCTCTTGAA 0 1 218967 CASAVA_Build 4 142758645 7I AGGGAGGGCG -------/CTAAACA CTAAACACTA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 CTAAACA 1 2 218968 CASAVA_Build 4 142759878 1D TACATTATGC T/- TTTTTTCACA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 7 6 218969 CASAVA_Build 4 142766802 2I CAATTTTCAC --/TA TGTTTGAGCA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TA 0 1 218970 CASAVA_Build 4 142815530 13D CAGGCTGGAC TGGGTGTTCTACT/------------- TGGGGTCTCT 3070 het 3070 hom 17 7 7 5 TGGGTGTTCTACT 1 0 218971 CASAVA_Build 4 142819209 1D ATTTCGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 807 hom 21 3 13 5 T 17 16 218972 CASAVA_Build 4 142858876 1I CAAGTCAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 12 13 218973 CASAVA_Build 4 142865182 3I TGACAGAAAT ---/AAG AAGAGAGAAG 3070 hom 126 het 46 0 42 4 AAG 1 2 218974 CASAVA_Build 4 142875969 1I GTGGAGCTTG -/C AGTGAGCTGA 2395 het 2395 ref 13 7 6 0 C 0 1 218975 CASAVA_Build 4 142876143 1D ACAGAATGAC T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 T 6 5 218976 CASAVA_Build 4 142880335 3I CATTAAAAAG ---/ATT ATTCATCATG 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 ATT 1 2 218977 CASAVA_Build 4 142884252 2D GGTAGTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 9 T 13 11 218978 CASAVA_Build 4 142886496 1I GTAAAAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 9 10 218979 CASAVA_Build 4 142887320 2I ATGAAGAAAC --/TG TATGTTACCT 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 TG 0 1 218980 CASAVA_Build 4 142888213 1D GAGACACAGC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 A 9 8 218981 CASAVA_Build 4 142889154 1I CACAGAGCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 A 9 10 218982 CASAVA_Build 4 142889704 4D TTCTGCACAG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 36 17 16 5 AAAC 5 4 218983 CASAVA_Build 4 142889854 1I AGTTTATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 10 11 218984 CASAVA_Build 4 142891783 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 321 hom 14 1 11 2 A 9 10 218985 CASAVA_Build 4 142915062 1D GTGACCCCCC T/- CCCAGGGATG 3070 hom 81 het 32 0 26 6 T 1 0 218986 CASAVA_Build 4 142919879 1D GGAGAGAAAA C/- TTTCACCTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 218987 CASAVA_Build 4 142922943 2D AAATGATCAC TT/-- AATTATTATT 3070 het 3070 hom 21 9 10 3 T 2 0 218988 CASAVA_Build 4 142935443 1I CTCAATCTTC -/T TCCATAAAAT 3070 hom 169 het 62 0 57 5 T 1 2 218989 CASAVA_Build 4 142940099 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 16 17 2 T 9 8 218990 CASAVA_Build 4 142940929 1D ACATTGTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 T 10 9 218991 CASAVA_Build 4 142947079 1D CACACAAACA T/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 50 25 20 6 T 7 6 218992 CASAVA_Build 4 142947279 2D GGCATATCTT TG/-- TGTGTGTGTG 1275 het 1275 ref 32 25 3 5 TG 6 5 218993 CASAVA_Build 4 142952141 1I GTACAACTAT -/A AACTGCGTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 2 3 218994 CASAVA_Build 4 142954189 2D GACAAAGAGA AG/-- AGAAAGATTT 3070 hom 108 het 43 0 36 9 AG 2 1 218995 CASAVA_Build 4 142954851 1I AAAATGATTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 10 218996 CASAVA_Build 4 142965949 1D ATTTTATCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 9 8 218997 CASAVA_Build 4 142971683 1I ATATCCTCTC -/A AAACGGGGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 3 4 218998 CASAVA_Build 4 142983623 1D CTATGTTTTT A/- AAAAAATTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 6 218999 CASAVA_Build 4 142983960 3D TACGGATGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 1715 het 367 hom 38 6 4 30 A 15 12 219000 CASAVA_Build 4 143009883 1D TTCAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 36 1 30 6 A 11 10 219001 CASAVA_Build 4 143048832 1I CAAAAAAAAA -/T TTTTAAAAGA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 4 5 219002 CASAVA_Build 4 143058089 3D GAGTAACCAA TAT/--- TATTACCTTG 3070 het 3070 ref 42 18 20 5 TAT 2 1 219003 CASAVA_Build 4 143062863 3D CGTTTAATGA AAT/--- AATAATCACC 3070 het 3070 ref 36 17 15 7 AAT 3 2 219004 CASAVA_Build 4 143068502 4D TTACACATTG ATAT/---- ATATACACAT 3070 het 3070 hom 46 19 24 6 AT 4 2 219005 CASAVA_Build 4 143069021 3D TGAAGGCTCT AAC/--- AACGTCTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 14 3 AAC 2 1 219006 CASAVA_Build 4 143070289 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1833 het 1833 ref 21 11 5 5 T 13 12 219007 CASAVA_Build 4 143073573 1D AAAATAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 16 8 T 12 11 219008 CASAVA_Build 4 143074827 1D TGTAAATGAT A/- ACTATAACCA 3070 het 3070 hom 45 21 18 6 A 2 1 219009 CASAVA_Build 4 143085331 19I TCTATGTGTC -------------------/TGTTTTTGTACCAGTACCA TGCTGCTTTG 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 TGTTTTTGTACCAGTACCA 0 1 219010 CASAVA_Build 4 143085780 1D ATGCTAATTA T/- TTTTTTCACA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 7 6 219011 CASAVA_Build 4 143089170 4D TGTGTGTGTA TGTG/---- TGTATATATA 385 het 167 hom 18 1 3 14 TG 3 1 219012 CASAVA_Build 4 143112382 2D ACCAACATGG CA/-- CACATGTATT 3070 het 3070 ref 27 17 9 3 CA 3 2 219013 CASAVA_Build 4 143113428 1D AATTCTGTGT G/- GGGGGGTCCA 3070 het 3070 ref 41 24 10 7 G 7 6 219014 CASAVA_Build 4 143115156 1I ATTCTTTCAA -/G AACACAAATC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 G 0 1 219015 CASAVA_Build 4 143133989 1I AACCTGAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 691 hom 27 2 17 8 T 14 15 219016 CASAVA_Build 4 143136745 1D TGACAACAAA T/- GAAGATGCCC 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 T 1 0 219017 CASAVA_Build 4 143146484 2D AATAAAACTC TT/-- TTCCACTTTC 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 T 4 2 219018 CASAVA_Build 4 143150603 1D ATTTTAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 11 10 219019 CASAVA_Build 4 143158260 4I GGAAAATAAC ----/AGTG AGCAGATCAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AGTG 0 1 219020 CASAVA_Build 4 143159443 1I TTTTATCTAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 8 9 219021 CASAVA_Build 4 143159649 1I GGACAATTGA -/T TTTTCCCCCA 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 T 4 5 219022 CASAVA_Build 4 143165795 1D TTCTATGGTG T/- TAAATACTCC 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 2 1 219023 CASAVA_Build 4 143166654 4I GGGGAACATA ----/TTAT TTATTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 TTAT 1 2 219024 CASAVA_Build 4 143167573 4I TCATCCCAGC ----/CTCT CTATCTTAAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 CT 1 3 219025 CASAVA_Build 4 143174450 1D GTGTTTTTTT A/- ATAGAGATGG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 1 219026 CASAVA_Build 4 143184232 1D ATGAGGAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 10 9 219027 CASAVA_Build 4 143184689 2I AAGATCAGAA --/AG AGAAAAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AG 1 2 219028 CASAVA_Build 4 143186674 1I TATTGGTAAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 7 8 219029 CASAVA_Build 4 143187880 2I CTAAGGGCAC --/CA CAGTTTTTTT 3070 hom 90 het 40 0 30 10 CA 1 2 219030 CASAVA_Build 4 143193297 1I GCAAAGAAAA -/G AACAGTAGCA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 G 0 1 219031 CASAVA_Build 4 143194191 8I GTACCTGTAG --------/TCATGGCC TCATGGCCCA 3070 hom 120 het 45 0 40 6 TCATGGCC 1 2 219032 CASAVA_Build 4 143195194 1I GAGGGTCCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 245 hom 39 1 32 7 T 9 10 219033 CASAVA_Build 4 143195482 2D TCTCTATATC TG/-- TGTTAACTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TG 2 1 219034 CASAVA_Build 4 143196251 1I GTGTTTTAAA -/T AGCATTTGTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 0 1 219035 CASAVA_Build 4 143197736 9I GAAGTAATTA ---------/CATTGGGAG CATTGGGAGA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 CATTGGGAG 1 2 219036 CASAVA_Build 4 143197855 1I ATAGTATGTT -/A AAAAATCACT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 5 6 219037 CASAVA_Build 4 143206822 1I ACATTGTTGT -/A AGGCAAAGTT 3070 hom 117 het 49 0 40 9 A 1 2 219038 CASAVA_Build 4 143218562 1I CTTTAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1134 hom 38 4 30 4 A 10 11 219039 CASAVA_Build 4 143218788 1I GGATAAGTAG -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 7 8 219040 CASAVA_Build 4 143222606 1I ACCTTAAAAG -/A AAAAAAACTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 7 8 219041 CASAVA_Build 4 143229108 2I AATGTGTGCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 388 hom 52 1 37 14 TG 8 9 219042 CASAVA_Build 4 143230265 1I TTACTTTACA -/T AACATCTCAC 3070 hom 120 het 42 0 40 2 T 0 1 219043 CASAVA_Build 4 143231000 1D GTTGCTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 523 hom 39 2 30 7 T 13 12 219044 CASAVA_Build 4 143231310 1I AATAGTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 41 1 34 6 T 10 11 219045 CASAVA_Build 4 143234498 1I TAGCAAAAGG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 7 8 219046 CASAVA_Build 4 143248994 57D CGCTTCTAAC ACCTCAAATATCCTCACAATCATCAAATGTGAACCTAGATAAAATACCATGTATAAA/--------------------------------------------------------- ACAACAGTCT 3070 hom 75 het 25 0 26 1 ACCTCAAATATCCTCACAATCATCAAATGTGAACCTAGATAAAATACCATGTATAAA 1 0 219047 CASAVA_Build 4 143249744 1D TAACCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 27 1 17 9 T 12 11 219048 CASAVA_Build 4 143268078 1D ACAAAAAAAA C/- AACACCAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 C 1 0 219049 CASAVA_Build 4 143283965 5I GCATCTGTAC -----/CCCAT TGAGATATTA 3070 hom 99 het 39 0 31 8 CCCAT 0 1 219050 CASAVA_Build 4 143305849 8I TATCATTAGT --------/ATTCAACA ACTCAGAGTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATTCAACA 0 1 219051 CASAVA_Build 4 143315236 1I TATTGACTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 T 8 9 219052 CASAVA_Build 4 143316227 1I AAAGTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 10 11 219053 CASAVA_Build 4 143317865 2D TATGGTATGG AA/-- AAAAAAAATC 3070 het 74 hom 28 2 12 14 A 10 8 219054 CASAVA_Build 4 143320165 18I TTAGCTCTGT ------------------/GAAAAATGATGCTAATAG GAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 GAAAAATGATGCTAATAG 0 1 219055 CASAVA_Build 4 143324172 4I TTATAGATGA ----/CTTT CTTTTCTGCT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 CTTT 1 2 219056 CASAVA_Build 4 143327691 1D TCACAGGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 88 het 37 0 29 8 A 10 9 219057 CASAVA_Build 4 143330815 2I TTTTTGTTTT --/TG TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TG 0 1 219058 CASAVA_Build 4 143338749 1D TTATAAAAAT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 72 het 33 0 29 6 A 8 7 219059 CASAVA_Build 4 143339139 1D ATTTTTACTT A/- AAAAAAAAAT 1681 het 1681 ref 35 25 4 7 A 10 9 219060 CASAVA_Build 4 143349431 1I CTATTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 11 219061 CASAVA_Build 4 143375521 7D AAAGCCATAA AGAGAAG/------- AGAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 AGAGAAG 2 1 219062 CASAVA_Build 4 143381834 1D CTCATCTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 8 12 T 10 9 219063 CASAVA_Build 4 143390020 1I TCTTTAAAAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 7 8 219064 CASAVA_Build 4 143400197 3D AAAAATATAA AAT/--- AATAATAATA 2459 het 2294 hom 15 7 6 2 AAT 5 4 219065 CASAVA_Build 4 143401198 1D AAAAAAAAAA T/- TTTGAGAACA 1593 het 1593 ref 30 16 9 5 T 4 3 219066 CASAVA_Build 4 143409904 1I CTCCCCCCTC -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 T 6 7 219067 CASAVA_Build 4 143411750 1I ATTCTCCATG -/T TGGTCAGGCT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 T 1 2 219068 CASAVA_Build 4 143417903 4D ATTTACTCTC CTGA/---- CTATTTCTTT 3070 het 3070 ref 20 12 8 1 CTGA 1 0 219069 CASAVA_Build 4 143421711 1D ATTTATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 T 12 11 219070 CASAVA_Build 4 143421942 1I TAGCTAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 13 14 219071 CASAVA_Build 4 143430799 18D TCTTTCTTCC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 3070 het 1928 hom 33 9 20 10 T 29 11 219072 CASAVA_Build 4 143434933 1I TCCAGCCCCT -/A AAGCTTCTGA 3070 het 3070 hom 53 20 22 11 A 2 3 219073 CASAVA_Build 4 143436680 1D CGTGATTTGC A/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 A 1 0 219074 CASAVA_Build 4 143437587 15D CCAAGAAATG TCACTTGAAGTTACT/--------------- TCACTTGAAG 3070 het 3070 ref 43 28 17 4 TCACTTGAAGTTACT 2 1 219075 CASAVA_Build 4 143450729 1D AAAGCACAGG T/- TTTTTTTTTT 1163 het 1163 ref 34 23 5 6 T 13 12 219076 CASAVA_Build 4 143451281 1I GCCCCAGTAC -/T TTTTTTTTTT 2482 het 1949 hom 33 9 8 16 T 14 15 219077 CASAVA_Build 4 143455834 3I CTAAGTATGT ---/ACA ATTATGTGTC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 ACA 0 1 219078 CASAVA_Build 4 143466168 1D TTATGTATAC A/- AGTTCATTCT 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 A 2 1 219079 CASAVA_Build 4 143468727 4D CACTGCATGG CTAA/---- CTCAGTGTTG 3070 het 3070 ref 32 19 9 5 CTAA 1 0 219080 CASAVA_Build 4 143469350 1I AATTTTGGAG -/T TTTTTCTTCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 5 6 219081 CASAVA_Build 4 143470001 1I AGAAGTGAAA -/G GTTGGGTGGA 3070 hom 81 het 34 0 24 10 G 1 2 219082 CASAVA_Build 4 143474321 1I AATGAGTTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 8 9 219083 CASAVA_Build 4 143478611 1D AATTTTGCAC T/- CTAGAAGTGA 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 T 1 0 219084 CASAVA_Build 4 143479006 1I ACTTAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 1263 het 1263 ref 10 4 3 3 T 9 10 219085 CASAVA_Build 4 143481016 6I TTTTTTTCTC ------/TCTCTT TTTAAAATTT 3070 hom 74 het 27 0 25 2 TCTCTT 0 1 219086 CASAVA_Build 4 143482031 4I TAGGCATTTG ----/AGTC AGTAACATTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AGTC 0 1 219087 CASAVA_Build 4 143482408 1D TTGCAGGTGG C/- CTCCAGGATC 3070 het 3070 ref 52 25 22 6 C 2 1 219088 CASAVA_Build 4 143484088 1D GTTAAGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 A 11 10 219089 CASAVA_Build 4 143486320 1D GAGTAAAAAC A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 39 18 14 9 A 7 6 219090 CASAVA_Build 4 143496466 1D GAGAGAAGCC T/- TTTTTTTTTT 2866 het 2866 ref 28 10 10 8 T 12 11 219091 CASAVA_Build 4 143498284 2D AGATGATTTT CA/-- CAGTCTTTTC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 CA 2 1 219092 CASAVA_Build 4 143499829 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 12 11 219093 CASAVA_Build 4 143503262 1D ACACAGCCAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 7 6 219094 CASAVA_Build 4 143504623 3I AGATGGGAGA ---/GGG GTGAGGGTGG 3070 het 3070 ref 46 23 13 10 G 1 4 219095 CASAVA_Build 4 143506374 1I TTTTTACAAT -/G TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 G 0 1 219096 CASAVA_Build 4 143506938 2I TGTTGCTCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2511 hom 26 8 14 4 A 12 14 219097 CASAVA_Build 4 143511828 3D ATCCAAATGC AGA/--- AGAATGAAAC 3070 het 3070 ref 38 18 13 9 AGA 2 1 219098 CASAVA_Build 4 143517727 5I AGTCTAACTG -----/GTTAA GTTATTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 GTTAA 0 1 219099 CASAVA_Build 4 143528988 1D GGAAAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 11 10 219100 CASAVA_Build 4 143539232 5D GAAATAAAAA TAAAT/----- TAAATGCAAA 3070 het 3070 hom 27 8 17 4 TAAAT 2 1 219101 CASAVA_Build 4 143556055 2I AAACCACAAT --/GA GATACCATCT 3070 het 2903 hom 20 7 10 3 GA 1 2 219102 CASAVA_Build 4 143564104 4D ACATGACCTA ACAG/---- ACAAAGTATT 3070 het 3070 ref 41 23 16 4 ACAG 1 0 219103 CASAVA_Build 4 143582420 1D AAGAAATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 974 hom 36 4 23 10 T 15 14 219104 CASAVA_Build 4 143612928 1D TCATTGTAGG A/- AAAAAAAAAA 1938 het 1938 ref 39 28 5 6 A 14 13 219105 CASAVA_Build 4 143615884 4I AAAAGCAAAT ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 AAAC 1 2 219106 CASAVA_Build 4 143635170 2D ATTTTACTCT CA/-- GTTTTCTTGC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 CA 1 0 219107 CASAVA_Build 4 143637560 1D TAAAAAAAAA G/- GGGGGGGGAA 3070 het 102 hom 37 3 22 12 G 9 8 219108 CASAVA_Build 4 143667466 1I TAAAATTCTC -/A ATTTATGTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 219109 CASAVA_Build 4 143667842 3D ATGCCAATAT TAA/--- TAATAAAATA 2373 het 2373 ref 19 12 7 0 TAA 3 2 219110 CASAVA_Build 4 143672129 1D CCTGTGGACA T/- TTGTGTCGTC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 3 2 219111 CASAVA_Build 4 143676363 1D CATCATTCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 54 20 30 4 T 9 8 219112 CASAVA_Build 4 143676843 2I GAAATTGAAC --/AA AGTCTTATAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 3 219113 CASAVA_Build 4 143682122 1D GACTAGGCAC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 42 20 15 8 T 7 6 219114 CASAVA_Build 4 143683138 4D TTTCTTGCTT TTAC/---- TTAATTAATA 3070 het 3070 hom 40 16 18 8 TTAC 1 0 219115 CASAVA_Build 4 143691222 3D TATATATATA TAT/--- TTTTTTTTTT 1924 het 97 hom 13 1 5 7 TAT 1 0 219116 CASAVA_Build 4 143699259 1D AGTGGGTGTT G/- GGGGGGCAGT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 G 7 6 219117 CASAVA_Build 4 143700511 1I CACTCATGAA -/C ATAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 C 0 1 219118 CASAVA_Build 4 143705056 11D AAAAAAAAAA AAGAAAGAAAG/----------- AAAGAAAGAA 3070 het 499 hom 28 3 13 16 AAGAAAGAAAG 1 0 219119 CASAVA_Build 4 143708757 1D TTTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 2919 het 4 hom 28 1 10 17 T 12 11 219120 CASAVA_Build 4 143710492 1D CCTCTCATAC A/- TAAATTTTCT 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 A 1 0 219121 CASAVA_Build 4 143724460 1D GCCTTTTCCA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 T 8 7 219122 CASAVA_Build 4 143726917 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 51 16 23 12 A 7 8 219123 CASAVA_Build 4 143769058 1D AGATATACCT A/- AATGCTAGAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 3 2 219124 CASAVA_Build 4 143771228 1D AGCAAACAAG A/- AAGTGAATAA 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 A 3 2 219125 CASAVA_Build 4 143773521 1D GGTAGATTTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 8 219126 CASAVA_Build 4 143817484 1I CTAAAACCAT -/A AAAAAACCCT 3036 het 3036 ref 22 9 8 5 A 6 7 219127 CASAVA_Build 4 143825919 1I AAGAGAGGAG -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 7 8 219128 CASAVA_Build 4 143831050 1D CAATTTCCCA C/- CCTCTTCAGT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 C 3 2 219129 CASAVA_Build 4 143834541 4D AAGATCTGCT TCTC/---- TCTATGTGTC 2784 het 2784 ref 31 16 9 6 TC 3 1 219130 CASAVA_Build 4 143841287 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTGCAGC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 6 5 219131 CASAVA_Build 4 143863637 3I TCCTACATCA ---/AAT AATAAACCAA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 AAT 1 2 219132 CASAVA_Build 4 143868095 2I GTAATTGGTG --/AA AATATCATTA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 2 4 219133 CASAVA_Build 4 143869553 1D AGAACTTATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 9 8 219134 CASAVA_Build 4 143870117 4I TATAGCAGTG ----/GAGT GAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 69 25 32 12 GAGT 0 1 219135 CASAVA_Build 4 143870580 1I TGTCTCCACT -/A AAACCTCAAA 3070 hom 132 het 48 0 43 5 A 3 4 219136 CASAVA_Build 4 143871569 1I GTTTTTTTTT -/A AAATTTAATT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 3 4 219137 CASAVA_Build 4 143872375 1D GAGATTTTCA G/- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 G 4 3 219138 CASAVA_Build 4 143879218 1D TAATAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 A 9 8 219139 CASAVA_Build 4 143885609 1I CTGTTGAATG -/T TTTATTATAT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 3 4 219140 CASAVA_Build 4 143888479 1I GTCAAGGGGT -/G GGGGGAGCTG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 G 5 6 219141 CASAVA_Build 4 143890475 4I GAAAATAAAT ----/CAAA CAATTATAAA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 CAAA 0 1 219142 CASAVA_Build 4 143892093 2I TTTGTTTCCA --/CT CTCTCTCTTT 3070 het 3070 ref 49 33 13 3 CT 4 5 219143 CASAVA_Build 4 143898331 6I CAATTATGAA ------/TAAATC TATAAACATC 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 TAAATC 0 1 219144 CASAVA_Build 4 143906446 1D AAGCTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 13 12 219145 CASAVA_Build 4 143915084 2D ATCAATTTGT TC/-- TTTTTCTGCC 3070 het 3070 ref 49 30 15 5 TC 1 0 219146 CASAVA_Build 4 143935561 2I GTGTATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 AT 5 6 219147 CASAVA_Build 4 143944090 1I CTTCTTTACA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 7 8 219148 CASAVA_Build 4 143948400 2I CTGTAAGAAT --/AA AAGAGTGTAA 3070 het 3070 ref 68 32 25 11 A 2 4 219149 CASAVA_Build 4 143948936 3D ATTCACAAAA CTT/--- CTCAAATTGA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 CTT 1 0 219150 CASAVA_Build 4 143957406 4I ATTTAACAAC ----/TATT TATTAAGTAC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 TATT 1 2 219151 CASAVA_Build 4 143984302 1I CCATAATTTC -/T TTAACTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 T 2 3 219152 CASAVA_Build 4 143987867 4D AAATCCGCCC TGAA/---- TGTGTTGGGG 3070 het 3070 hom 28 15 11 4 TGAA 1 0 219153 CASAVA_Build 4 143992351 1D TAGGGGCTTA T/- AATTAAGTTA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 1 0 219154 CASAVA_Build 4 144000208 1D TGTGAAGTTG A/- AAAAAAAAAG 1367 het 1367 ref 37 32 3 2 A 10 9 219155 CASAVA_Build 4 144007132 1D CATTCCATGC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 T 7 6 219156 CASAVA_Build 4 144048939 1D TTTCTATTCC T/- TTTTTTTTTT 1691 het 1691 ref 32 22 4 7 T 13 12 219157 CASAVA_Build 4 144108307 1I GAATTGGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 A 10 11 219158 CASAVA_Build 4 144141326 1D CAGCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 876 hom 26 2 20 7 A 13 12 219159 CASAVA_Build 4 144142584 1I TTGAAAGGGC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 8 9 219160 CASAVA_Build 4 144146408 1D TGGACTTGGA G/- GTGCCACTGA 3070 het 3070 ref 53 24 22 8 G 2 1 219161 CASAVA_Build 4 144146974 2I TGGCTGAGCT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 2109 hom 19 6 9 4 A 9 11 219162 CASAVA_Build 4 144156861 2I AAAGTTTCTC --/TT GTTATTAATA 3070 hom 93 het 36 0 30 6 T 0 2 219163 CASAVA_Build 4 144163444 1I ATTTCAAGAG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 6 7 219164 CASAVA_Build 4 144163580 2D TTTACATGTT TC/-- TCTCTCTTCT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 TC 4 3 219165 CASAVA_Build 4 144165912 2I CAGGGCACGA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 315 hom 41 1 27 13 AG 6 7 219166 CASAVA_Build 4 144172161 1D AGACTCCACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 19 13 3 A 10 9 219167 CASAVA_Build 4 144174098 4D TACCCCATAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 23 het 18 0 13 6 AT 11 9 219168 CASAVA_Build 4 144176764 1D TCCTTTATTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 A 9 8 219169 CASAVA_Build 4 144177048 1D TTCATTAGAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 7 219170 CASAVA_Build 4 144190520 8D TCATACACAT ACACGCAA/-------- ACAGTTTGAG 3070 het 3070 hom 35 17 18 1 ACACGCAA 1 0 219171 CASAVA_Build 4 144223151 1D CCTTACATGG C/- AAAGCAAAGG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 C 1 0 219172 CASAVA_Build 4 144225335 2D TGACATTCTC TG/-- GAATGCTGAA 3070 het 3070 ref 51 25 18 9 TG 1 0 219173 CASAVA_Build 4 144226792 2I AACCTCATGG --/TT TTTGGGGGGG 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 T 3 5 219174 CASAVA_Build 4 144229937 1D AGAGTTTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 T 9 8 219175 CASAVA_Build 4 144234028 2I CATTCTTGCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2828 hom 26 7 11 8 A 10 12 219176 CASAVA_Build 4 144235852 1D AAAACTTTTC T/- TTGAGCTATT 3070 het 3070 hom 32 16 16 0 T 3 2 219177 CASAVA_Build 4 144236871 1I TCGTGACTAA -/T TTTTTTTTTT 2197 het 2197 ref 26 12 7 7 T 10 11 219178 CASAVA_Build 4 144237525 1I CCAGAAACTC -/A AAAATAACGT 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 4 5 219179 CASAVA_Build 4 144246891 3D AAAAAAAAAA AAC/--- ATTAAAAAAA 1165 hom 12 het 6 0 5 2 AAC 1 0 219180 CASAVA_Build 4 144254912 4D ACAAGTGAAC TCAG/---- TCAGGATTTC 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 TCAG 2 1 219181 CASAVA_Build 4 144256888 1D TTCAAATCCA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 219182 CASAVA_Build 4 144257416 1I CAGGTGGGTG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 219183 CASAVA_Build 4 144259155 1I TAATATTATA -/T TTTTAAGTGC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 4 5 219184 CASAVA_Build 4 144259948 3D TTTAAAACAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 29 1 20 8 A 17 14 219185 CASAVA_Build 4 144261113 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 11 10 219186 CASAVA_Build 4 144262181 1D AGGCTGTGAC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 219187 CASAVA_Build 4 144269878 1I ATTAATTCAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 8 9 219188 CASAVA_Build 4 144277220 5D AATGCAGCAT GAAAA/----- GAAGATTTAG 3070 hom 78 het 32 0 27 8 GAAAA 1 0 219189 CASAVA_Build 4 144277692 1D CTCCGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 743 hom 33 3 12 19 A 11 10 219190 CASAVA_Build 4 144283431 2D ACTATCCTAA AT/-- ATATATATGC 3070 hom 60 het 21 0 21 1 AT 5 4 219191 CASAVA_Build 4 144291269 1I TACATTTTGA -/T TTTGTTTTTG 3070 hom 77 het 30 0 26 4 T 3 4 219192 CASAVA_Build 4 144293452 1I GTGATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 10 11 219193 CASAVA_Build 4 144305836 1D TTAAGTCTTC T/- CTCAAAAAGA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 1 0 219194 CASAVA_Build 4 144313255 1D AAGATCGCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 19 0 12 7 T 10 9 219195 CASAVA_Build 4 144330866 3D CATAGGGTAA TAG/--- TAGCAGATTT 3070 hom 135 het 52 0 46 9 TAG 2 1 219196 CASAVA_Build 4 144331097 1I AGTTTCTCAC -/T TTAGGGTCAC 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 2 3 219197 CASAVA_Build 4 144335498 1D CCTATATTAC T/- TTTTTTTTTT 1451 het 1451 ref 52 38 4 10 T 15 14 219198 CASAVA_Build 4 144349708 5D TTTAAGTTTA CTTAT/----- CTTATAAATT 3070 hom 78 het 27 0 27 4 CTTAT 2 1 219199 CASAVA_Build 4 144350430 1I AATATCTAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 8 9 219200 CASAVA_Build 4 144353196 1I TTTATTTTCC -/T TTTTTGAATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 5 6 219201 CASAVA_Build 4 144361236 1D TGCATCATGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 9 8 219202 CASAVA_Build 4 144365230 3I GAAATCACTT ---/GAA GAGCTTTTTA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 GAA 0 1 219203 CASAVA_Build 4 144367138 5I CAAAAGACCA -----/GTCAT GTCATTTTAT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 GTCAT 1 2 219204 CASAVA_Build 4 144368206 3D GACCATCCTA GTT/--- GTTTGAGACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GTT 2 1 219205 CASAVA_Build 4 144368851 5I ATGAGCAAAA -----/GACTT GAGCAGGCAC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 GACTT 0 1 219206 CASAVA_Build 4 144374503 1I ATATATTGGA -/T TTTTTTAAGG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 6 7 219207 CASAVA_Build 4 144391953 1I CCATCTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 9 12 A 11 12 219208 CASAVA_Build 4 144395865 4I GAGAGGGAAT ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 hom 90 het 41 0 31 10 GA 7 9 219209 CASAVA_Build 4 144397707 1I CTATTTAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 397 hom 41 1 35 5 T 9 10 219210 CASAVA_Build 4 144405792 1D TTCAGTAACA G/- AATAAAACTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 1 0 219211 CASAVA_Build 4 144406652 1D CAGCTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 668 hom 43 2 36 6 A 11 10 219212 CASAVA_Build 4 144408554 7I AGAGAAATGT -------/GGTTGGA GGTTGGAGCC 3070 hom 61 het 26 0 17 9 GGTTGGA 1 2 219213 CASAVA_Build 4 144411418 1D ACATATATGA T/- ACATATAATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 0 219214 CASAVA_Build 4 144420313 6D GCCAAGACAC TCTTTT/------ TCTTTTTCTT 3070 hom 48 het 24 0 15 9 TCTTTT 4 3 219215 CASAVA_Build 4 144423692 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 11 10 219216 CASAVA_Build 4 144426087 3I ATAGCTAACA ---/CTC CTGAAGTGCA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CTC 0 1 219217 CASAVA_Build 4 144446581 4I ATGGGCAAGG ----/GTGA GTGAGTGTGT 3070 hom 174 het 64 0 57 7 GTGA 1 2 219218 CASAVA_Build 4 144456674 1D AGCAGGAGGA T/- TTTGGAAACC 3070 hom 76 het 28 0 22 6 T 4 3 219219 CASAVA_Build 4 144459475 1D TGAATGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 129 hom 43 1 29 13 T 14 13 219220 CASAVA_Build 4 144467278 1I GTTTTAGTAC -/A AAAAAAATCC 3070 hom 86 het 33 0 28 5 A 7 8 219221 CASAVA_Build 4 144467806 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 495 hom 23 2 17 4 T 13 14 219222 CASAVA_Build 4 144476024 1D AATTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 2346 hom 20 het 11 0 6 5 T 5 4 219223 CASAVA_Build 4 144490512 4D CAGAGAGAAG AGAT/---- AGATCTCCTC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AGAT 2 1 219224 CASAVA_Build 4 144494200 1I GCTATTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 24 0 17 7 T 12 13 219225 CASAVA_Build 4 144497081 1I TTTCATACCC -/A ATAGAGGAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 1 2 219226 CASAVA_Build 4 144508156 1D AAATGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1207 het 1207 ref 41 27 3 11 T 15 14 219227 CASAVA_Build 4 144526588 1I ACAAAAATTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 A 8 9 219228 CASAVA_Build 4 144565566 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 10 219229 CASAVA_Build 4 144591494 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 10 10 A 12 11 219230 CASAVA_Build 4 144592503 1D GTGCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 12 11 219231 CASAVA_Build 4 144603172 1D CAAAATACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 12 11 219232 CASAVA_Build 4 144609823 1D TGAACAAAAG A/- AAACTGAATT 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 A 4 3 219233 CASAVA_Build 4 144619041 1I AACTTTTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 17 13 5 T 9 10 219234 CASAVA_Build 4 144623311 1I AATGTTTCTT -/A ATAAATAATA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 1 2 219235 CASAVA_Build 4 144627007 1I ATATTGTAAT -/A AATTAAATAG 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 A 2 3 219236 CASAVA_Build 4 144630986 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 A 12 13 219237 CASAVA_Build 4 144631440 1I CAAAGCAACC -/A GAAAACAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 A 0 1 219238 CASAVA_Build 4 144631849 1D TTATTAGAGC T/- TAAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 T 2 1 219239 CASAVA_Build 4 144633287 1I TTAAAACCCT -/A AAAAAACTGG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 6 7 219240 CASAVA_Build 4 144647075 1I ATTTTATGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 T 8 9 219241 CASAVA_Build 4 144651528 2D TACCTAAGAC TA/-- TAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 TA 2 1 219242 CASAVA_Build 4 144655474 1D TGGCCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 11 10 219243 CASAVA_Build 4 144657317 1I CATCATTAAT -/G GAAGATTACT 3070 het 3070 hom 53 21 25 7 G 1 2 219244 CASAVA_Build 4 144663939 1D CAGGAATACG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 7 5 T 10 9 219245 CASAVA_Build 4 144690486 1D TTTTTAAATC A/- GGGGTGTATT 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 1 0 219246 CASAVA_Build 4 144691742 1I GTAGTTTTGA -/T TTGCATTTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 2 3 219247 CASAVA_Build 4 144692979 4D TTTAGATGTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 CTTT 3 2 219248 CASAVA_Build 4 144693541 3D AAGTAAAATA AGT/--- AGGTAAGATT 3070 het 3070 hom 30 13 16 2 AGT 1 0 219249 CASAVA_Build 4 144695080 3D AAATTTCTAT TAG/--- TAGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 20 5 TAG 2 1 219250 CASAVA_Build 4 144699182 1I AAGGAGTAAC -/T TTTTTTTTTT 2778 het 2778 ref 31 16 8 7 T 12 13 219251 CASAVA_Build 4 144712085 5I AGAATGGCCT -----/AAGAA AAGAAAGAAG 3070 hom 78 het 34 0 26 8 AAGAA 1 2 219252 CASAVA_Build 4 144713352 2I TATATATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 TG 8 9 219253 CASAVA_Build 4 144728367 1I GGTTCTTTGG -/A GATCTCTCAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 219254 CASAVA_Build 4 144737375 1D CCATCTCTAT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 7 6 219255 CASAVA_Build 4 144740370 12I GTCTATTCTT ------------/GGGCTAGATTCA GGGCTAGATT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 GGGCTAGATTCA 1 2 219256 CASAVA_Build 4 144740826 1D TAAGTGAAGT A/- AACTCAGGAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 3 2 219257 CASAVA_Build 4 144741567 1D TTCTAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2464 hom 38 10 10 18 T 15 14 219258 CASAVA_Build 4 144747397 1D TCTAGAAGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 9 8 219259 CASAVA_Build 4 144750298 1D CATGTCATCA T/- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 7 6 219260 CASAVA_Build 4 144772809 1I CAGTGAAATC -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 7 8 219261 CASAVA_Build 4 144775336 2I GCCAGGGAAA --/CT CTGCTAAGAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CT 1 2 219262 CASAVA_Build 4 144777855 1D TGATAAATAT A/- ATGGTCTTTT 3070 het 3070 ref 49 24 18 8 A 2 1 219263 CASAVA_Build 4 144781924 3D AAAAGGAGAT AAA/--- AAAGAAGCCT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 A 6 3 219264 CASAVA_Build 4 144784027 1I CACAATGTTT -/A TATTATATAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 0 1 219265 CASAVA_Build 4 144787853 1D GCAGAAGAAA T/- TTCTATGTGA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 3 2 219266 CASAVA_Build 4 144795427 1I AATGACTCTT -/A AAACTGTATT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 3 4 219267 CASAVA_Build 4 144832022 1D TGGAAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 20 17 1 A 10 9 219268 CASAVA_Build 4 144832474 1D AAGGAAAATA T/- TCAATATAAA 3070 het 3070 hom 41 12 24 6 T 2 1 219269 CASAVA_Build 4 144848631 1D TACTTGTCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 10 9 219270 CASAVA_Build 4 144848965 1I TGTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 G 0 1 219271 CASAVA_Build 4 144852529 1D AGAAGACAAC A/- AAACGGAAGT 3070 het 3070 ref 30 16 9 7 A 4 3 219272 CASAVA_Build 4 144855459 1I GTGCTATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 10 11 219273 CASAVA_Build 4 144857117 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2725 hom 19 6 10 3 T 9 10 219274 CASAVA_Build 4 144873761 4D ATAAACATAG TAAC/---- TAACATAAGT 3070 het 3070 ref 44 21 21 5 TAAC 2 1 219275 CASAVA_Build 4 144876010 2I GTTTTTTTTT --/TG ATGTTATCTT 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 TG 0 1 219276 CASAVA_Build 4 144877318 1I ACTTTGAGAA -/T AACATAATAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 0 1 219277 CASAVA_Build 4 144878837 2I TGTAATATGA --/CT CTGCTGATTC 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 CT 1 2 219278 CASAVA_Build 4 144882653 1I ACAACAACAA -/C AACAATAAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 0 1 219279 CASAVA_Build 4 144886704 1I TTTGCCCTGC -/T AACTTCATGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 0 1 219280 CASAVA_Build 4 144887137 1I ATTACCTTGA -/T TTTTTTTCCC 2817 het 2817 ref 24 15 7 2 T 7 8 219281 CASAVA_Build 4 144887339 2D TATTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 1176 het 845 hom 7 3 3 1 AG 2 1 219282 CASAVA_Build 4 144889530 1I TGTAAAAAAA -/T CTGTTCAGAA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 0 1 219283 CASAVA_Build 4 144890733 2I AGCACCTTCC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 CT 6 7 219284 CASAVA_Build 4 144891796 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 A 6 7 219285 CASAVA_Build 4 144892332 1I TGTTACAGGG -/A ATGGTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 1 2 219286 CASAVA_Build 4 144895942 1D TAGACACAAT A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 7 6 219287 CASAVA_Build 4 144900255 1I51M7D2M6I AATAAAAAAA -GGAAGAATTTGATCCAGTAAAATTGTAAAAACAGAAACTATTCATGTAAATATGAATACA------/TGGAACAATTTGATCCAGTAAAATTGTAAAAACAGAAACTATTCATGTAAAT-------CATTTTTT TTACTATATG 3070 het 3070 ref 33 27 21 6 N/A 0 0 219288 CASAVA_Build 4 144901427 6I2M2I2M1I AATAGGCCAT ------TA--TG-/GCAAAATAGTTGT GCAAAGCATG 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 N/A 0 0 219289 CASAVA_Build 4 144901679 1D TGATACAATA T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 T 7 6 219290 CASAVA_Build 4 144902837 1I TCAGTAGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 11 12 219291 CASAVA_Build 4 144905250 8D CTACAATTTG AAGATTTC/-------- CACCCCAAAT 2556 het 2556 ref 27 21 6 5 AAGATTTC 1 0 219292 CASAVA_Build 4 144905972 1I ACGTCTTTCC -/A TCCCCACCTC 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 0 1 219293 CASAVA_Build 4 144906690 1I TGATGTTTGG -/T TTTTTTGTTC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 6 7 219294 CASAVA_Build 4 144907345 5D CTTCCCTTTC CCCTT/----- CCCTTCCCTT 3070 hom 51 het 31 0 16 17 CCCTT 5 4 219295 CASAVA_Build 4 144909391 1D CTCATCATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 8 9 6 T 10 9 219296 CASAVA_Build 4 144910829 1D GGCTTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 6 T 11 10 219297 CASAVA_Build 4 144911118 1I ATTCCTAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 T 9 10 219298 CASAVA_Build 4 144922500 2D AGAATTAAAC TG/-- AGAAATTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TG 1 0 219299 CASAVA_Build 4 144931476 1D AAGAAAGGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 10 9 219300 CASAVA_Build 4 144932522 4I ACAGAATTTG ----/TCTT TCTGTGACTG 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 TCTT 0 1 219301 CASAVA_Build 4 144936402 6D AAAACTACAG AAACAC/------ AAACACAAAC 3070 het 3070 ref 35 20 14 4 AAACAC 2 1 219302 CASAVA_Build 4 144938055 2D AGAAAATAAC AT/-- GTGTGCTTAT 3070 het 3070 ref 23 14 8 2 AT 1 0 219303 CASAVA_Build 4 144939467 1D ACTCATGCAA G/- GGGTAGACTC 3070 het 3070 hom 37 15 17 7 G 4 3 219304 CASAVA_Build 4 144946865 1I CAATAATGGC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 7 8 219305 CASAVA_Build 4 144948413 5I AAAAATGAAT -----/GAAAA GAAAAGTAGA 1663 het 1663 ref 25 19 4 2 GAAAA 1 2 219306 CASAVA_Build 4 144951051 1I AGAATATTTT -/G TTTTTAATTT 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 G 0 1 219307 CASAVA_Build 4 144954109 4I CATAAAAATA ----/CTTT CTAACATTAT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 CTTT 0 1 219308 CASAVA_Build 4 144955686 1D ATATTTGGTC T/- TTTGATATAA 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 T 4 3 219309 CASAVA_Build 4 144956697 1D CATCTGAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 T 10 9 219310 CASAVA_Build 4 144957989 2D AATTAATTTT TC/-- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 TC 1 0 219311 CASAVA_Build 4 144958584 1I ATTATGTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 T 9 10 219312 CASAVA_Build 4 144959752 16D TGTTTAGGAG TTGACAAATGCCTCAA/---------------- GGAAAAGTGG 3070 het 3070 ref 51 30 18 7 TTGACAAATGCCTCAA 1 0 219313 CASAVA_Build 4 144962024 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1583 hom 17 5 8 4 A 13 12 219314 CASAVA_Build 4 144967306 3D TATTAAGGTC ATT/--- ACTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 21 11 10 3 ATT 1 0 219315 CASAVA_Build 4 144983152 1D ATTAAGATTT A/- AAAAAAATTG 1416 het 1416 ref 22 16 3 3 A 8 7 219316 CASAVA_Build 4 144983622 1D CCCTGAAGTT G/- GAAAGTCTTG 3070 het 3070 ref 63 44 11 8 G 2 1 219317 CASAVA_Build 4 144984959 1D ACCTTTAGTA G/- GGTTAGTAGG 3070 het 3070 ref 59 39 14 6 G 3 2 219318 CASAVA_Build 4 144986209 1D GTGTCTTTTT C/- GGTTTTCTGT 2848 het 2848 ref 21 13 6 2 C 1 0 219319 CASAVA_Build 4 144988449 1I AGGACCTAGG -/C AAGGAGGGTA 1891 het 1891 ref 32 23 4 5 C 0 1 219320 CASAVA_Build 4 144994589 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 A 11 10 219321 CASAVA_Build 4 144995991 2I CCTTAAATAC --/AG AGTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 46 31 12 3 AG 1 2 219322 CASAVA_Build 4 144999298 2D27M1I AAATGCTTAT AAAGTTAGATCATCTATTTTTCCAAGCAA-/--AGTTAGATCATCTATTTTTCCAAGCAAT ATTCTTCATG 3070 het 3070 ref 46 41 11 3 N/A 0 0 219323 CASAVA_Build 4 144999676 3I TCATGACACA ---/TCT TCTCAGCAGC 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 TCT 1 2 219324 CASAVA_Build 4 145000030 1I ATTCTTCCTA -/T TTTTCTTTTA 2340 het 2340 ref 42 29 5 8 T 4 5 219325 CASAVA_Build 4 145013488 1D GAGAGGGTTG A/- AGGGGGCAGG 3070 hom 45 het 18 0 15 4 A 2 1 219326 CASAVA_Build 4 145017794 2I AGATATGGGG --/AA AAAAAACCAC 3070 het 3070 ref 46 36 8 2 A 6 8 219327 CASAVA_Build 4 145020954 1D CCCCTAAAAT A/- GGGTTGCATC 2354 het 2354 ref 41 32 6 5 A 1 0 219328 CASAVA_Build 4 145026564 1D ATAAAAATTG T/- TTTTTATATC 1932 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 5 219329 CASAVA_Build 4 145028204 1I ATGCAGAGGA -/G GGAGGGATAA 3070 het 2765 hom 27 8 13 6 G 2 3 219330 CASAVA_Build 4 145028380 2D ATGTTTTGTC AT/-- ATTAGTGAGG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 AT 2 1 219331 CASAVA_Build 4 145038668 1D AAGACAGAAA C/- TTTTAGATTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 0 219332 CASAVA_Build 4 145042026 2D48M1D TTAAAATGAG AAAAAAAAAATAAAATCTTACAATCCCAACACTCAGAGATACACCCGGAAT/--AAAAAAAATAAAACCTTACAATCCCAACACTCAGAGATACACCCGGAA- TTTTTTTTCA 3070 hom 42 het 14 0 15 5 N/A 0 0 219333 CASAVA_Build 4 145042245 1I AAGGATTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 28 1 18 9 T 10 11 219334 CASAVA_Build 4 145042944 2D TGGATCCCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 37 1 15 21 A 18 16 219335 CASAVA_Build 4 145044409 1D TGTAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 11 10 219336 CASAVA_Build 4 145054588 2D TGTGTAACTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 37 het 37 1 30 6 AT 6 5 219337 CASAVA_Build 4 145064573 1I TGCCCACTTT -/A TGGGGGAAAT 3070 hom 59 het 23 0 20 3 A 0 1 219338 CASAVA_Build 4 145068245 1I AGATCCTCAA -/G GTTCATTCAT 1370 het 1370 ref 39 31 3 5 G 1 2 219339 CASAVA_Build 4 145080387 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 11 10 219340 CASAVA_Build 4 145094530 1I ATATTGAATA -/G GAAATTTAAT 3070 het 376 hom 21 1 18 2 G 1 2 219341 CASAVA_Build 4 145099962 1D TACATTCCCA C/- CAAGTGTATA 3070 hom 72 het 26 0 23 3 C 2 1 219342 CASAVA_Build 4 145100839 2I AATTTTAGGA --/TT TTTTTTTCCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 9 219343 CASAVA_Build 4 145102298 1D AATTTCTACT G/- TAATTCAAGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 1 0 219344 CASAVA_Build 4 145104024 1D GTATATATTG A/- AAAAACTTAC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 6 5 219345 CASAVA_Build 4 145105282 1I TTGAGGCCAA -/G TCTTAATGTG 3070 hom 57 het 20 0 19 1 G 0 1 219346 CASAVA_Build 4 145105951 1I ACCTTCAGTA -/G GGTTAGTAGG 3070 het 1393 hom 21 5 9 7 G 2 3 219347 CASAVA_Build 4 145111158 3I TAAACCGGAG ---/TTA CTATATATGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TTA 0 1 219348 CASAVA_Build 4 145111858 1D ACAAAAAGCA T/- TATTCTAGAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 2 1 219349 CASAVA_Build 4 145113820 3I TGCAGAAGAC ---/ATT ATTTCATTCC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 ATT 1 2 219350 CASAVA_Build 4 145114938 2D TTAATGTGAA AT/-- ATGTTTTTTA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 AT 2 1 219351 CASAVA_Build 4 145116543 1I AGTGGGGAAC -/A GGGGCAGAGG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 0 1 219352 CASAVA_Build 4 145116578 1I29M1I ACAAAAAAAA -AATTTAAAAAATAACTCGTTCTCTTTCTC-/TAATTTAAAAAATAACTCATTCTCTTTCTCG TTAGGGAAAT 3070 hom 24 het 12 0 9 9 N/A 0 0 219353 CASAVA_Build 4 145117014 4I TTTCTTTTAC ----/AATA AATAAACTTC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AATA 1 2 219354 CASAVA_Build 4 145117427 1I TTTACAGAGG -/T TTTTTGTTTT 3070 het 554 hom 35 2 27 7 T 5 6 219355 CASAVA_Build 4 145117519 1D TATGAGCCAG T/- TTTCTTAACC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 4 3 219356 CASAVA_Build 4 145119317 2I TCTTAAGGAA --/TT TTAGGTTTAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 2 4 219357 CASAVA_Build 4 145133599 1I ACAGTGAAGT -/A AAAAAATGTC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 6 7 219358 CASAVA_Build 4 145133855 11D CTGAATTGAG ACTTGCCAATA/----------- ACCAGTTATA 3070 hom 54 het 19 0 19 2 ACTTGCCAATA 1 0 219359 CASAVA_Build 4 145134860 2D CAGAGCAAAT TA/-- TGTTACCAAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TA 1 0 219360 CASAVA_Build 4 145137972 2I GGGCAAATGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 10 12 219361 CASAVA_Build 4 145140680 1I AGCTCTCTTA -/C TACCAAAGCC 2097 het 2097 ref 47 37 5 5 C 0 1 219362 CASAVA_Build 4 145144848 1D ATAAAAATTG T/- TTTTTATATC 3070 het 3070 ref 53 37 11 6 T 6 5 219363 CASAVA_Build 4 145149233 1D AGTCTAAGAT A/- TTGGTATTTC 3070 het 3070 ref 42 29 9 4 A 1 0 219364 CASAVA_Build 4 145151775 1I CCTGAGCTCA -/G GAGTTGGAGA 3070 hom 52 het 21 0 17 4 G 1 2 219365 CASAVA_Build 4 145153130 3D AAACAATCTT GAA/--- GAAGAACACA 2181 het 2181 ref 29 21 6 2 GAA 3 2 219366 CASAVA_Build 4 145153543 2D GCAACAAAAG AA/-- AAAAATAAAT 1371 het 1371 ref 35 31 3 1 A 7 5 219367 CASAVA_Build 4 145157484 1I GTTGGCTCCA -/T TCTCCTTGTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 2 219368 CASAVA_Build 4 145172782 2D GGGTGAAAGG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 36 het 25 0 13 12 CT 10 9 219369 CASAVA_Build 4 145198584 4I TTCTCTCTTC ----/TTAT TTATTTCTCT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 TTAT 1 2 219370 CASAVA_Build 4 145209159 1I ACCTTTAGTA -/G GGTTAGTAGG 3070 het 3070 ref 62 40 16 6 G 2 3 219371 CASAVA_Build 4 145211482 2D CAGTTGATGT TG/-- TAGTCCATTA 1837 het 1837 ref 31 25 4 2 TG 1 0 219372 CASAVA_Build 4 145212665 2D TATAATGGAC AG/-- AGATGCCTTG 1690 het 1690 ref 39 33 4 2 AG 2 1 219373 CASAVA_Build 4 145214360 3I TAACCCGGAG ---/TTA TTATATATAT 2274 het 2274 ref 38 28 5 5 TTA 1 2 219374 CASAVA_Build 4 145219675 4I100M3I TGTCCTGTAG ----TGTCTGGTGAAGGGAAGGTAGAGGTTCTAATTGCATTTCTAAAGAGTTAAGTGGGAAGTGGGGAACAGGGGCAGAGGAGGAAAGAGAAAAAAAGAAAAAA---/GGAATGTCTGGTGAAGGGAAGGTAGAGGTTCTAATTGCATTTCTAAAGAGTTAAGTAGGAAGTGGGGAACAGGGGCAGAGGAGGAAAGAGAAAAAAACAAAAAAAAT AATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 40 56 10 9 N/A 0 0 219375 CASAVA_Build 4 145219967 2D TATTTTGCGG TT/-- TTTTTTTTTT 1883 het 1883 ref 31 25 4 2 T 12 10 219376 CASAVA_Build 4 145223458 1D GGCATATGAA T/- GAGCAATGAA 3070 het 3070 ref 42 28 8 6 T 1 0 219377 CASAVA_Build 4 145223740 1I GATGTGCCTT -/G TCATGACGCA 1783 het 1783 ref 37 29 4 4 G 0 1 219378 CASAVA_Build 4 145226167 4D GTATTATATT GAGA/---- GAGAGAGTGT 3070 het 2818 hom 17 7 10 0 GA 5 3 219379 CASAVA_Build 4 145228283 1I ATGAACACCA -/T GGTGAGCAGG 2147 het 2147 ref 61 48 5 8 T 0 1 219380 CASAVA_Build 4 145240679 1D AGGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2760 het 2745 hom 25 11 8 6 A 13 12 219381 CASAVA_Build 4 145246982 1I CACAGGAACA -/T TTTTTTTTTT 905 het 905 ref 36 22 4 10 T 11 12 219382 CASAVA_Build 4 145248131 1I AATTGGATTT -/A TTTTTTTATT 3020 het 9 hom 19 1 13 5 A 0 1 219383 CASAVA_Build 4 145248150 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 339 hom 7 het 12 0 3 9 T 15 13 219384 CASAVA_Build 4 145250659 1I TAATTGGATT -/A AATTAACCTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 2 3 219385 CASAVA_Build 4 145251407 12D TGTGTGTGTT TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 30 0 25 7 TG 11 5 219386 CASAVA_Build 4 145256090 2I TTACTATCAT --/TC ATCTTCTGAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TC 0 1 219387 CASAVA_Build 4 145259982 1D AGCTCTCTTA C/- TACCGAAGCC 1381 het 1381 ref 14 9 4 1 C 1 0 219388 CASAVA_Build 4 145260522 2D GAAAACTAAC AA/-- GAGAGACTGC 3070 het 1768 hom 19 4 11 4 A 2 0 219389 CASAVA_Build 4 145264745 4D TATAATAATT TAAG/---- TAATTAATAA 3070 het 1430 hom 14 4 10 0 TAAG 1 0 219390 CASAVA_Build 4 145265998 3D GGACTTTATC TTT/--- AAGGCAGTGG 3070 het 3070 ref 51 30 15 7 T 3 0 219391 CASAVA_Build 4 145268678 1I ATGCAGAGGA -/G GGAGGGATAA 1887 het 1887 ref 28 18 6 4 G 2 3 219392 CASAVA_Build 4 145269269 1I CTACCAGACC -/A CTCAGCTTTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 0 1 219393 CASAVA_Build 4 145275658 1I AAGAAAACAT -/A AGGGAGAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 7 8 A 1 2 219394 CASAVA_Build 4 145275731 4D GCAGCAAAAG AAAA/---- AAAAATAAAT 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 9 5 219395 CASAVA_Build 4 145279562 1I GTAGAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 11 219396 CASAVA_Build 4 145281273 1D AAGTTAGTGC A/- AAAAAACTAC 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 7 6 219397 CASAVA_Build 4 145281532 1D GGCATGGTAA G/- GTGGTAGACA 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 G 2 1 219398 CASAVA_Build 4 145288521 1D TTTTCTTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 9 8 219399 CASAVA_Build 4 145295923 4D CCCTGTTATT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 24 13 10 1 TC 8 6 219400 CASAVA_Build 4 145301684 4D TCTTTAGTTC TGTT/---- TGTTATGAAT 3070 het 3070 ref 36 21 15 0 TGTT 2 1 219401 CASAVA_Build 4 145309315 1D ATGAATCATA C/- CCCAAATCTC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 C 4 3 219402 CASAVA_Build 4 145314132 1I ACCTACACTC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 7 8 219403 CASAVA_Build 4 145328428 4D GAACCGTTAA TTGT/---- TTGTATACTA 3070 het 3070 hom 40 16 22 4 TTGT 2 1 219404 CASAVA_Build 4 145343268 16D TCCTGTGGTT TCTCTCTCTCTCTCTC/---------------- TCTCTCTCTC 3070 het 280 hom 30 3 11 19 TC 15 7 219405 CASAVA_Build 4 145348039 3I TGTTAATAAT ---/TAG TAGTATTCTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TAG 1 2 219406 CASAVA_Build 4 145352689 3I CCAGAAAGAT ---/AAC AAACACAGAG 3070 hom 105 het 44 0 36 8 AAC 0 1 219407 CASAVA_Build 4 145356042 1I ACACAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 26 0 17 9 A 10 11 219408 CASAVA_Build 4 145363466 10I ACTCCATTTA ----------/GTTTTAAACT GTTTTAAACT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 GTTTTAAACT 1 2 219409 CASAVA_Build 4 145375157 1I CAGCCAGGCA -/G TGGTTACCAT 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 G 0 1 219410 CASAVA_Build 4 145383304 1I GTTAAACCTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 8 9 219411 CASAVA_Build 4 145387715 1D GGTCCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 1441 het 612 hom 24 4 6 14 T 17 16 219412 CASAVA_Build 4 145404450 1I ACTTAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 11 12 219413 CASAVA_Build 4 145415449 1D CCATGTTATC A/- AAAAGTGACC 3070 het 3070 hom 30 9 15 7 A 5 4 219414 CASAVA_Build 4 145416609 1D ATTTATATCC A/- AAATGGGCTC 3070 het 3070 ref 40 23 10 9 A 4 3 219415 CASAVA_Build 4 145421864 1D TTATATTGTG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 A 9 8 219416 CASAVA_Build 4 145422555 18D AAGCTCTGCA TCTGTGGAGAGCTCTGTG/------------------ TCTGTGGAGA 3070 het 3070 hom 30 12 11 12 TCTGTGGAGAGCTCTGTG 2 1 219417 CASAVA_Build 4 145425116 1I TTTAAGAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 9 10 219418 CASAVA_Build 4 145427749 1D TACAGGTACT G/- GGTAGGCCGT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 G 3 2 219419 CASAVA_Build 4 145441827 1D AGTGCCCACC A/- AAAAGCTCCA 3070 het 3070 ref 52 23 21 9 A 5 4 219420 CASAVA_Build 4 145444983 1I GTGTGTTAGG -/A AAAAGAATTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 4 5 219421 CASAVA_Build 4 145447330 1D AACTAACTCA T/- AATCTGGCAC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 1 0 219422 CASAVA_Build 4 145455148 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1090 hom 44 3 33 8 T 11 12 219423 CASAVA_Build 4 145461871 1I TTCACTGGGC -/T TTTTTTTTTT 2582 het 2582 ref 32 13 8 11 T 13 14 219424 CASAVA_Build 4 145471790 1I CAGTCAAGAT -/C CAATTAAAAG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 C 1 2 219425 CASAVA_Build 4 145472524 43I ACATAAAAGC -------------------------------------------/TGAAAGAAACAAATATGCTGAAGATACCACATACACTTAAAGG TTATTGACTA 3070 hom 60 het 20 0 21 2 TGAAAGAAACAAATATGCTGAAGATACCACATACACTTAAAGG 0 1 219426 CASAVA_Build 4 145492358 1I TAATAAACAC -/G GCTTTTAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 2 219427 CASAVA_Build 4 145497566 1I CCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 30 0 25 5 A 10 11 219428 CASAVA_Build 4 145497977 1I GAAAGAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 10 219429 CASAVA_Build 4 145515753 2D AAATTATTTG TA/-- TATTTTCTTC 3070 hom 147 het 57 0 48 9 TA 2 1 219430 CASAVA_Build 4 145517476 1I TATTTTTATT -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 43 het 51 1 47 3 A 7 8 219431 CASAVA_Build 4 145523357 1D ATTTCTAAAA T/- TCAGGTATTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 T 2 1 219432 CASAVA_Build 4 145523635 1I ACCTCAGTTG -/A AAAAATGAGA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 5 6 219433 CASAVA_Build 4 145526408 1I TTTCTGACAT -/G CCCTGAAAGC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 G 0 1 219434 CASAVA_Build 4 145539939 29I ATACAAAAAA -----------------------------/ATCAGCTGGGCATGGTGGCCGGCACCTGT ATGTAGTCCC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 ATCAGCTGGGCATGGTGGCCGGCACCTGT 0 1 219435 CASAVA_Build 4 145609975 1I TTGTCTGTAC -/G GGGGGGGGGC 2476 het 2476 ref 28 9 10 9 G 9 10 219436 CASAVA_Build 4 145653841 1D AACAACAGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 80 het 33 0 27 7 T 9 8 219437 CASAVA_Build 4 145667732 1I TTCTCAAAAG -/A AGACATTTAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 1 2 219438 CASAVA_Build 4 145670325 1D ACCATTGGCT A/- AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 27 16 5 6 A 11 10 219439 CASAVA_Build 4 145674666 1D AAAGATATAC A/- AAAAAAACCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 8 7 219440 CASAVA_Build 4 145689936 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 2449 het 57 hom 9 1 6 2 T 13 12 219441 CASAVA_Build 4 145690596 1I TAGAAGAAGG -/T GTGTCCAGTC 3070 hom 53 het 23 0 17 6 T 0 1 219442 CASAVA_Build 4 145701909 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTACTC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AG 1 2 219443 CASAVA_Build 4 145704555 2I CACCTACAGG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 9 11 219444 CASAVA_Build 4 145704676 1I CATCATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 10 11 219445 CASAVA_Build 4 145728174 4D AGCCATTATC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 51 hom 38 4 33 1 TG 10 8 219446 CASAVA_Build 4 145733327 1I TCCAAACTAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 A 6 7 219447 CASAVA_Build 4 145736188 1I GTAAGATCAC -/A AGTTGGGTTT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 A 1 2 219448 CASAVA_Build 4 145753752 2D ATAGATAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 30 0 13 17 A 12 10 219449 CASAVA_Build 4 145769320 4I ACAACAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 AAAC 4 5 219450 CASAVA_Build 4 145769364 2I GGTAGAATAC --/CA CACACAAAAA 3070 hom 60 het 39 0 21 18 CA 3 4 219451 CASAVA_Build 4 145770017 1I TATGTAAGAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 A 6 7 219452 CASAVA_Build 4 145775913 1I AGTACCAGAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 2355 hom 21 8 12 1 G 0 1 219453 CASAVA_Build 4 145782647 1D CAACTCAATC A/- AGATCAGCCA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 2 1 219454 CASAVA_Build 4 145788295 4I TTAATAAGTT ----/TAAC TAAATACTAA 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 TAAC 0 1 219455 CASAVA_Build 4 145788591 1D CAGGCATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 21 8 A 12 11 219456 CASAVA_Build 4 145789838 1I TTTATGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 11 12 219457 CASAVA_Build 4 145792364 1I ACAAGACCTA -/T TCTGTCCACT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 1 2 219458 CASAVA_Build 4 145793405 1D TCCAGGTAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 A 9 8 219459 CASAVA_Build 4 145796356 4I AGTCAGTAAC ----/TCTT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 TCTT 0 1 219460 CASAVA_Build 4 145810408 1D TGTGGTAAGA G/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 G 1 0 219461 CASAVA_Build 4 145824664 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 1643 het 1643 ref 18 8 5 5 A 10 11 219462 CASAVA_Build 4 145831387 2D GTTACAAATC TA/-- TGTGAAGAAT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 TA 1 0 219463 CASAVA_Build 4 145833494 3I AAGCCATCAA ---/GAG GAGGAGCCAA 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 GAG 2 3 219464 CASAVA_Build 4 145851649 4I AGTTGCAAGT ----/CCTA CCTCCCCTTA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 CCTA 0 1 219465 CASAVA_Build 4 145870418 1I TCAGGATATC -/A TACATAAGTA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 0 1 219466 CASAVA_Build 4 145870845 1D TCTAAGAAAA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 7 6 219467 CASAVA_Build 4 145875220 1I TGAGTCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 A 13 14 219468 CASAVA_Build 4 145876285 1D ATTAAAATAC T/- TATTGCCAAT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 T 2 1 219469 CASAVA_Build 4 145881745 1D ATTGTAAAAT A/- TATTTTTTTA 3070 het 348 hom 28 1 23 5 A 1 0 219470 CASAVA_Build 4 145882638 2D TGTGTATGTG TA/-- TATATATATG 472 het 291 hom 35 3 5 27 TA 5 4 219471 CASAVA_Build 4 145882677 4D ACACACACAC ACAT/---- ACATACATAC 3070 hom 72 het 33 0 25 9 ACAT 5 4 219472 CASAVA_Build 4 145885379 1D ACATTTACTA G/- GGGGGGATTG 3070 hom 90 het 34 0 31 5 G 7 6 219473 CASAVA_Build 4 145889354 4I TGATTAAAAT ----/AAAC AAACACTTTA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 AAAC 1 2 219474 CASAVA_Build 4 145894610 4I AAAAATAAAC ----/AAAT AAAACTAATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAT 0 1 219475 CASAVA_Build 4 145902666 1I ACATAGACAA -/G TGGGAACAAG 3070 hom 84 het 38 0 29 9 G 0 1 219476 CASAVA_Build 4 145905965 1D CATGTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 40 1 25 14 T 12 11 219477 CASAVA_Build 4 145906644 1I CTCATTATGG -/A AAAAAAAAAA 1153 het 1153 ref 43 31 3 9 A 10 11 219478 CASAVA_Build 4 145915317 1I AATAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 9 10 219479 CASAVA_Build 4 145938312 4D CTAAACCAAG GTTA/---- GTTCTTTTAA 3070 het 3070 hom 22 8 9 6 GTTA 1 0 219480 CASAVA_Build 4 145998480 1I CATATCAGTG -/A AAAAAAAAAA 1146 het 1146 ref 35 25 3 7 A 10 11 219481 CASAVA_Build 4 146059475 1I TCTACTTTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 42 16 19 7 T 8 9 219482 CASAVA_Build 4 146124664 1D ATTTCAAGAC A/- GAAATAAATT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 A 1 0 219483 CASAVA_Build 4 146128584 1D GTTTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 het 100 hom 28 1 24 4 G 1 0 219484 CASAVA_Build 4 146143504 1I GCACACGTGC -/A AGTTTATTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 2 219485 CASAVA_Build 4 146148471 1D AAAACCCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 219 hom 13 3 8 2 A 13 12 219486 CASAVA_Build 4 146167355 1I AGGCAGTGAA -/G GAAGTACAAG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 1 2 219487 CASAVA_Build 4 146204075 2I CAGATTAAAC --/AT ATAAATTTAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AT 1 2 219488 CASAVA_Build 4 146207085 1D TCTTAAGAAC T/- TTTTTTTTTT 1323 het 1323 ref 44 31 3 11 T 11 10 219489 CASAVA_Build 4 146207380 1I TTTCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 35 1 30 4 A 10 11 219490 CASAVA_Build 4 146250687 1D TGATTCTGTA T/- TTTTTTTTTT 2622 het 2622 ref 47 26 9 12 T 16 15 219491 CASAVA_Build 4 146263414 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 A 11 12 219492 CASAVA_Build 4 146272602 1D CATTTACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1075 hom 34 3 12 19 T 13 12 219493 CASAVA_Build 4 146281470 3I TGCTAGAAAC ---/ATT AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATT 0 1 219494 CASAVA_Build 4 146315921 1I AAGAACATCC -/A AAGTAGGCAG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 2 3 219495 CASAVA_Build 4 146327106 1D ATTACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 25 0 19 6 A 11 10 219496 CASAVA_Build 4 146327607 1I CAAGTAGCTA -/G TAGCTAGTCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 0 1 219497 CASAVA_Build 4 146363273 1D TGTATAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 11 10 219498 CASAVA_Build 4 146363633 3I TAAAGCAATT ---/ATA ATAATATATA 2881 hom 21 het 12 0 8 4 ATA 2 3 219499 CASAVA_Build 4 146370737 1I TGTTATACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 29 0 18 11 A 12 13 219500 CASAVA_Build 4 146374098 2I CTTTCATAAA --/AT ATGTTATACA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 1 2 219501 CASAVA_Build 4 146394614 1D TATATATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 13 12 219502 CASAVA_Build 4 146397364 2D ACAGAGTACC TT/-- CTTAAGGGCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 0 219503 CASAVA_Build 4 146398038 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2817 hom 30 8 15 7 T 12 13 219504 CASAVA_Build 4 146424202 1I AACAATTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2277 hom 16 6 8 2 A 11 12 219505 CASAVA_Build 4 146425503 1I TGTTTAGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 A 9 10 219506 CASAVA_Build 4 146462798 1D AGCCTGGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 38 2 27 9 A 12 11 219507 CASAVA_Build 4 146472178 1D TTCTCTCAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 89 hom 28 2 22 5 T 10 9 219508 CASAVA_Build 4 146475305 1I CCATCTCTAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 8 9 219509 CASAVA_Build 4 146490685 1D ACCGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 58 22 22 14 A 11 10 219510 CASAVA_Build 4 146495475 3I GGAATATTAT ---/TAA TAATAACCCT 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 TAA 2 3 219511 CASAVA_Build 4 146500050 2I GTCAATATCA --/AC AGTCATATTA 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 AC 0 1 219512 CASAVA_Build 4 146516838 2I TGGAATCGCC --/AA AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 A 8 10 219513 CASAVA_Build 4 146517318 1I CTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2878 het 2878 ref 21 12 7 2 T 11 12 219514 CASAVA_Build 4 146535046 1I AATATGTAGA -/T TTTTTCAATC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 5 6 219515 CASAVA_Build 4 146536825 1D TGTTGTGCAG A/- AAAAAACTAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 7 6 219516 CASAVA_Build 4 146539691 1I CTATATTTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 8 9 219517 CASAVA_Build 4 146568402 2I ACTTTTTGTA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 300 hom 42 1 30 11 TC 7 8 219518 CASAVA_Build 4 146603188 1I CATTGTGAGC -/A AACTATTGCA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 2 3 219519 CASAVA_Build 4 146630834 1D CACAAGTGAC A/- AATGTTGACC 3070 het 3070 hom 60 25 30 5 A 3 2 219520 CASAVA_Build 4 146642244 1D TTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 13 12 219521 CASAVA_Build 4 146642324 1D TTGGATTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 12 11 219522 CASAVA_Build 4 146651905 1I TTTTAGAGAC -/A GCTCTCACTC 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 A 0 1 219523 CASAVA_Build 4 146654825 5D TGATGACCTT ACTTA/----- ACTTTAATTA 3070 het 3070 ref 39 19 17 7 ACTTA 1 0 219524 CASAVA_Build 4 146660000 2D GCCCAGCTGA AC/-- CTTTTTTTTT 1936 het 1936 ref 25 13 5 8 AC 1 0 219525 CASAVA_Build 4 146660267 2I AAAAAAAAAA --/AG AACCCACTTT 3070 het 376 hom 31 1 25 5 AG 0 1 219526 CASAVA_Build 4 146687894 7D ACCATAACTC AGTAAAT/------- AGAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 35 19 15 6 AGTAAAT 1 0 219527 CASAVA_Build 4 146688504 1I CTGATCTGCC -/T TGCTGAAAGG 3070 het 3070 hom 59 27 30 2 T 1 2 219528 CASAVA_Build 4 146693895 1D TTAACTAAGA T/- TTTTATCAGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 5 4 219529 CASAVA_Build 4 146697640 3D AGAACCCAAC CTT/--- CTCTGATATT 3070 het 3070 hom 38 19 18 2 CTT 1 0 219530 CASAVA_Build 4 146699287 1D55M2I CAAACTGATA CCTGAATTTTGCTGTGTTTCCATTTTTTAGAGATTTTTATCATTTTTTTCTCTCTC--/-CTGAATTTTGCTGTGTTTCCATTTTTTAGAGATTTTTATCATTTTTTTCTCTCTCTT GGCATTCTTT 3070 het 3070 hom 34 12 18 16 N/A 0 0 219531 CASAVA_Build 4 146700848 1D TTTCCTAGTG A/- AAAGCCAATT 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 A 4 3 219532 CASAVA_Build 4 146702066 1I AAATCTAGAG -/T TTAATTCTAT 3070 het 3070 hom 25 7 17 1 T 2 3 219533 CASAVA_Build 4 146706942 2D GCCTCAGGTG CC/-- CAGGGAGGAT 3070 het 3070 ref 34 17 10 9 C 3 1 219534 CASAVA_Build 4 146707514 1D CACGTCCCCC A/- CACCAGCACC 3070 het 3070 ref 41 19 12 11 A 1 0 219535 CASAVA_Build 4 146709121 2D CCAGACAAAC AA/-- GTCTGCATAA 3070 het 3070 ref 50 26 19 6 A 2 0 219536 CASAVA_Build 4 146713296 1D ACCTGAGGGT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 62 het 27 0 21 6 G 10 9 219537 CASAVA_Build 4 146717267 1I AATGGAAAGC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 418 hom 21 1 19 1 A 7 8 219538 CASAVA_Build 4 146731894 1D TCTCTACAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 11 14 1 T 10 9 219539 CASAVA_Build 4 146745185 1I CATAACAATT -/A AAAAGTCCTC 3070 het 3070 hom 50 16 30 4 A 4 5 219540 CASAVA_Build 4 146749186 1I AAGTACCCCC -/T CCCCCCAACA 3070 het 2496 hom 27 9 14 4 T 0 1 219541 CASAVA_Build 4 146773364 1D TCACTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2243 hom 31 10 12 9 T 13 12 219542 CASAVA_Build 4 146778971 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 10 11 219543 CASAVA_Build 4 146789579 1I ACAGAGTGAG -/A ACTCTGTCTC 2603 het 2603 ref 25 15 6 4 A 1 2 219544 CASAVA_Build 4 146797980 1I GAAATATAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 9 10 219545 CASAVA_Build 4 146805214 3D CAGGATAAAT AAC/--- AACAACAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 AAC 3 2 219546 CASAVA_Build 4 146812094 1D ATTATGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 5 T 11 10 219547 CASAVA_Build 4 146813030 1I GTCTATCTGG -/T TGTTGAAAAG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 1 2 219548 CASAVA_Build 4 146815047 1D GATAAAATGT G/- CAGAACAAAG 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 G 1 0 219549 CASAVA_Build 4 146816935 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2037 het 790 hom 11 2 8 1 A 18 16 219550 CASAVA_Build 4 146824721 1I CAATCCAATT -/A AAAAATGGGC 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 A 5 6 219551 CASAVA_Build 4 146827612 2D TGTGGGGGGG GC/-- GGTTTCCTTC 3070 het 2082 hom 23 9 9 5 GC 1 0 219552 CASAVA_Build 4 146828650 1I TGCAAAAATC -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 7 8 219553 CASAVA_Build 4 146841809 4I GCAACAGGAC ----/TTAA TTAACCTCAC 2425 het 2425 ref 15 9 6 0 TTAA 1 2 219554 CASAVA_Build 4 146859880 5D GGAAACTTAT ACATG/----- ACTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 ACATG 1 0 219555 CASAVA_Build 4 146866203 1I TTCAGCAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 44 11 28 5 A 8 9 219556 CASAVA_Build 4 146871305 1I TATGTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 48 3 41 4 A 10 11 219557 CASAVA_Build 4 146883135 15D CTTTTTCTTG TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2111 het 981 hom 14 4 7 5 T 25 10 219558 CASAVA_Build 4 146885455 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 948 hom 24 4 10 10 A 12 13 219559 CASAVA_Build 4 146886783 4D ATCTCTTCAC TTTG/---- TTTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 TTTG 2 1 219560 CASAVA_Build 4 146887993 1I TTTTTTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 12 13 219561 CASAVA_Build 4 146901323 1D AGTTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 38 2 14 22 T 17 16 219562 CASAVA_Build 4 146933136 1D AGATATATAA T/- TTTTTTTTTT 2033 het 2033 ref 19 7 6 6 T 11 10 219563 CASAVA_Build 4 146937226 13D TTTGTTCCTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTG 3040 het 1776 hom 21 10 7 4 T 22 9 219564 CASAVA_Build 4 146940611 8I GGCCTTTTTT --------/TTACAGCC TTACAGCCAT 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 TTACAGCC 1 2 219565 CASAVA_Build 4 146944527 1D TAACTTCATA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 12 7 T 10 9 219566 CASAVA_Build 4 146946921 1D GCCCAGCTAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 9 8 219567 CASAVA_Build 4 146948657 1D AGAGTACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 13 12 219568 CASAVA_Build 4 146969760 1I AAGAAACAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 8 9 219569 CASAVA_Build 4 146972458 5I TAGTGATTCA -----/TTATT TTATTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 TTATT 1 2 219570 CASAVA_Build 4 146983827 1I TACTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 A 13 14 219571 CASAVA_Build 4 146989840 1D ATAATTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 11 10 219572 CASAVA_Build 4 146991874 12D AGGAAACTTC AGATAGATAGAT/------------ AGATAGATAG 3070 het 3070 ref 60 29 25 11 AGAT 6 3 219573 CASAVA_Build 4 146994577 1I AGTCTCAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 A 9 10 219574 CASAVA_Build 4 146996188 1I GCTCCCTTTG -/C CTTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 52 21 22 9 C 1 2 219575 CASAVA_Build 4 147059652 1D AGGCCAGGAG T/- TTTGAGACCA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 4 3 219576 CASAVA_Build 4 147093678 1I TGAAAGTTCA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 6 7 219577 CASAVA_Build 4 147094649 5D AAGAGGAGGA TCATT/----- TTAACATGCA 3070 hom 90 het 36 0 31 8 TCATT 1 0 219578 CASAVA_Build 4 147096087 1D TTAATTCAGA T/- TAACAACCAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 219579 CASAVA_Build 4 147096577 1D TTACTTGAAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 160 het 60 0 54 6 T 9 8 219580 CASAVA_Build 4 147097594 1D AATTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 495 hom 13 1 10 2 T 12 11 219581 CASAVA_Build 4 147098369 12D TTTCTCTCTC TCTTTCTCTCTT/------------ TCTTTCTCTC 2237 het 335 hom 15 5 7 4 TCTTTCTCTCTT 1 0 219582 CASAVA_Build 4 147112350 1D AATACCCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 314 hom 36 3 21 13 A 13 12 219583 CASAVA_Build 4 147114205 7D GATGAAAGTA GGTTTTG/------- GTATCAAAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 4 GGTTTTG 1 0 219584 CASAVA_Build 4 147116379 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 19 18 7 A 9 8 219585 CASAVA_Build 4 147121832 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 11 12 219586 CASAVA_Build 4 147130242 1I TCTCAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 287 hom 37 1 32 4 A 9 10 219587 CASAVA_Build 4 147132902 2I GTCTCTTTAG --/TT TTTTTTTTGC 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 8 10 219588 CASAVA_Build 4 147134141 1D TGCAGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 14 13 219589 CASAVA_Build 4 147148321 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 35 het 13 0 9 4 T 6 7 219590 CASAVA_Build 4 147148880 5D TCCCTCTCTC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 TTTCT 5 4 219591 CASAVA_Build 4 147176790 1I CTGGGGACTT -/G GGGGGGGGAA 2215 hom 29 het 13 0 9 4 G 8 9 219592 CASAVA_Build 4 147196952 1I AAGAAAGTTT -/G GCTTTGCTGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 1 2 219593 CASAVA_Build 4 147210231 1D TCTTTATTCC T/- TATATTTAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 2 1 219594 CASAVA_Build 4 147222198 1I TTACCAATAC -/A TTTTTTTATT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 0 1 219595 CASAVA_Build 4 147233259 1D ACAAGGTCTA T/- TTTCGACTCT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 4 3 219596 CASAVA_Build 4 147249992 7I CAAATTAAAC -------/TTAAACT TTTTTAAAAG 3070 het 2974 hom 24 6 12 6 TTAAACT 0 1 219597 CASAVA_Build 4 147268551 6D TTTTCTGAAA TCAGTT/------ TCAGAAAATA 3070 het 3070 ref 32 18 14 1 TCAGTT 1 0 219598 CASAVA_Build 4 147268845 1D TTTTATAAAC T/- TTTTCTTTAA 3070 het 3070 ref 40 21 19 0 T 5 4 219599 CASAVA_Build 4 147276331 1D ACAATAGTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 T 10 9 219600 CASAVA_Build 4 147306821 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 845 het 845 ref 38 26 5 7 C 1 0 219601 CASAVA_Build 4 147315134 1D AAAAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2676 het 2270 hom 20 6 8 6 T 11 10 219602 CASAVA_Build 4 147324074 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 11 12 219603 CASAVA_Build 4 147324353 5D TTTTTTATTA TTTAT/----- TTCAGTAGTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 TTTAT 1 0 219604 CASAVA_Build 4 147324746 1I TGCGTGAAGA -/C CTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 C 1 2 219605 CASAVA_Build 4 147329462 1D GTTTATCCTG T/- TGCATTTAAG 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 T 2 1 219606 CASAVA_Build 4 147333720 1I AACCTGAACA -/T TTTTAGATGG 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 T 4 5 219607 CASAVA_Build 4 147345039 5D CCACCAACCA GCCAT/----- TCCCCCATCT 3070 het 3070 ref 48 26 16 7 GCCAT 1 0 219608 CASAVA_Build 4 147351238 1D GGCACTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 12 9 2 T 11 10 219609 CASAVA_Build 4 147355524 15D AGGCAGGAGG GTGGGAGGTGGGGCT/--------------- GTGGCCGTAG 3070 het 3070 ref 38 23 12 6 GTGGGAGGTGGGGCT 1 0 219610 CASAVA_Build 4 147377057 1D ACTTCCAAAT C/- CGCTTTTCCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 C 2 1 219611 CASAVA_Build 4 147418443 5D GAATATAACT TTTTA/----- TTTTATTAAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 TTTTA 2 1 219612 CASAVA_Build 4 147444467 3D TTACGATAGA TAT/--- TATTGTCATA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 TAT 2 1 219613 CASAVA_Build 4 147444673 1D CATAGAAAAC A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 A 8 7 219614 CASAVA_Build 4 147446185 1I ATAATAAAAG -/A AAAAAAAAAC 2375 het 2375 ref 16 7 8 1 A 9 10 219615 CASAVA_Build 4 147448474 4D GTATATTCTC TCTT/---- TAAGCACCCC 3070 het 3070 hom 30 7 18 8 TCTT 1 0 219616 CASAVA_Build 4 147459419 1D CAACTCTACA C/- TTCCAGCTGC 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 C 1 0 219617 CASAVA_Build 4 147500850 4I ACCAACTTCC ----/TAAA TAGTCTCCAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 TAAA 0 1 219618 CASAVA_Build 4 147504736 4D GAGAAGACCA AAAT/---- AAATAAGAGA 3070 het 3070 ref 44 21 16 8 AAAT 2 1 219619 CASAVA_Build 4 147517694 1I GTAAAGTACA -/T TTTTTTTTTA 2489 het 2489 ref 22 11 6 5 T 9 10 219620 CASAVA_Build 4 147537407 1I AAAATCACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 10 11 219621 CASAVA_Build 4 147556825 10I AGGCAAAAAC ----------/TCCAAACACT TCAGTAGGGT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 TCCAAACACT 0 1 219622 CASAVA_Build 4 147575612 1I GCAAGAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 T 10 11 219623 CASAVA_Build 4 147578632 1D GAAAAATTAC A/- AGAAGGTGAT 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 A 2 1 219624 CASAVA_Build 4 147583833 4I ACATTAATTG ----/CTCC CTGTCAGTGG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 CTCC 0 1 219625 CASAVA_Build 4 147587178 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2228 het 1490 hom 24 10 8 6 A 17 16 219626 CASAVA_Build 4 147590699 4D AGCTGAGCTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 AAAC 4 3 219627 CASAVA_Build 4 147606996 1D CTGGAAGTGG C/- CCCACTTGGC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 C 4 3 219628 CASAVA_Build 4 147612798 2D TGGGTACAAA TG/-- TGTTAGAGCA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 TG 2 1 219629 CASAVA_Build 4 147614734 1I AAATAAAAGA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 G 1 2 219630 CASAVA_Build 4 147617551 1D TTCTGCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 10 11 A 12 11 219631 CASAVA_Build 4 147622005 9D CCTGGGTCCT TGCTGCTGC/--------- TGCTGCTGCT 2880 het 2880 ref 34 15 10 10 TGC 7 4 219632 CASAVA_Build 4 147643180 1D TTTCTACAGT A/- AATGCTCATA 3070 het 3070 ref 39 16 16 8 A 3 2 219633 CASAVA_Build 4 147660874 1I TCCGGGGATA -/G GGGGGTCTTC 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 G 5 6 219634 CASAVA_Build 4 147680239 1D ATTCTGTTGT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 8 7 219635 CASAVA_Build 4 147691348 5I CTTTTGAGAA -----/ATTAG ATAAGTTATT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 ATTAG 0 1 219636 CASAVA_Build 4 147716188 2D CTCCTAAGTA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 41 14 14 13 TC 10 9 219637 CASAVA_Build 4 147723230 2D GAAGCAAGGA TG/-- TGTTTAGGGA 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 TG 2 1 219638 CASAVA_Build 4 147725874 3D CTGATGAGCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1830 hom 26 10 11 6 A 15 12 219639 CASAVA_Build 4 147725960 18D CAAAGCTGTC CTGGGCCACATGTGGCCT/------------------ CTGGGCCACA 3070 het 3070 ref 33 24 13 4 CTGGGCCACATGTGGCCT 1 0 219640 CASAVA_Build 4 147729850 7D CTACATTAAA CTGTAAG/------- CTTCATGAGG 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 CTGTAAG 1 0 219641 CASAVA_Build 4 147730308 9D GATATTTGCA GGGGGAAAT/--------- GTTCCAGACA 3070 het 3070 ref 39 16 15 10 GGGGGAAAT 1 0 219642 CASAVA_Build 4 147732687 1D TTAGGAGGGG A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 31 11 7 15 A 7 6 219643 CASAVA_Build 4 147748111 1D AATTATTTTG A/- AAAGTTGATG 3070 het 3070 hom 41 17 18 8 A 4 3 219644 CASAVA_Build 4 147750244 3D TTAAACTTCC ATT/--- ATTCAATTTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 ATT 2 1 219645 CASAVA_Build 4 147750756 1I ACAATATTAA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 T 6 7 219646 CASAVA_Build 4 147756699 3I TAAAATGGAG ---/ATT ATATCAGTAC 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 ATT 0 1 219647 CASAVA_Build 4 147773721 2I GCGTGTGTCA --/GC GCGCGCGCGC 2073 het 2073 ref 46 18 13 15 GC 6 7 219648 CASAVA_Build 4 147774736 1I TCAGGAATAA -/T TCCCTCTTGT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 1 2 219649 CASAVA_Build 4 147774810 1I CACCCCGCCA -/C CCCAAACTCT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 C 3 4 219650 CASAVA_Build 4 147793455 1I AAGCAGATTT -/G GGTCCTAGTG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 G 2 3 219651 CASAVA_Build 4 147800547 1D TGAGGAAATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 9 8 219652 CASAVA_Build 4 147813412 37D CAGCATTTCC AAAACATGTTTTTAAACCATGGTTTAAAGGATGGTTT/------------------------------------- AAAACAGGTT 3070 het 3070 ref 43 24 19 11 AAAACATGTTTTTAAACCATGGTTTAAAGGATGGTTT 1 0 219653 CASAVA_Build 4 147817043 3D CTCATCGTCA TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 1309 hom 24 6 13 5 TCT 6 5 219654 CASAVA_Build 4 147824668 1I GCTTTTTTTT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 G 9 10 219655 CASAVA_Build 4 147828091 4I GACATTTTAC ----/CAAT CATTCTTTTC 2940 het 2940 ref 15 9 6 0 CAAT 0 1 219656 CASAVA_Build 4 147835481 4D TCTTATTCTT TAAC/---- TACTATCCAT 3070 het 3070 hom 28 14 13 3 TAAC 1 0 219657 CASAVA_Build 4 147862667 6D TTCACAATAG ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 87 het 41 0 29 12 AC 10 7 219658 CASAVA_Build 4 147882647 2I CAGAAGCCCA --/TG CAGGGTCTAA 3070 het 3070 ref 52 28 18 6 TG 0 1 219659 CASAVA_Build 4 147926465 3D AAACTGAAAT AAG/--- AGAGTTTGAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 AAG 1 0 219660 CASAVA_Build 4 147928500 1I ATCTGCCCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 33 1 20 12 T 10 11 219661 CASAVA_Build 4 147930396 1I GATTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2497 hom 25 7 8 10 A 10 11 219662 CASAVA_Build 4 147979002 1D GTCAACTGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 10 9 219663 CASAVA_Build 4 147998381 1I GAGTAGCTCT -/G ATGTTTAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 219664 CASAVA_Build 4 148024001 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 26 21 7 T 9 10 219665 CASAVA_Build 4 148041643 1I TTCTTTTGGT -/G GGGGGGGTCA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 G 7 8 219666 CASAVA_Build 4 148050181 1I GCCTCCCACC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 8 9 219667 CASAVA_Build 4 148085416 1D CTCCCTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 11 10 219668 CASAVA_Build 4 148111674 1I AATATTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 19 1 13 5 T 11 12 219669 CASAVA_Build 4 148115592 1I CTCCTCCCTT -/C CCCCACCACA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 C 4 5 219670 CASAVA_Build 4 148116553 20D TGAAAAAGAC CCTTATAAGGCTCTGAGTTG/-------------------- CCTTATAAGG 3070 het 3070 ref 47 27 20 10 CCTTATAAGGCTCTGAGTTG 1 0 219671 CASAVA_Build 4 148176008 1D GCCCTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 122 het 48 0 40 8 A 12 11 219672 CASAVA_Build 4 148177680 1D TTTAGGGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 36 0 31 5 A 11 10 219673 CASAVA_Build 4 148184217 1I GGGAATGATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 8 9 219674 CASAVA_Build 4 148189691 1I TTGCTCTTAT -/A TATTTGTTTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 0 1 219675 CASAVA_Build 4 148198195 1D AGAAATAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 10 9 219676 CASAVA_Build 4 148200572 13D AAGAGGGTAG ATAGTGGAGACAA/------------- ATAGTCTGTG 3070 hom 120 het 39 0 40 4 ATAGTGGAGACAA 1 0 219677 CASAVA_Build 4 148243178 14D TCTCAAAAAA AAAAAAAGAAAAAG/-------------- AAAAAAAGAA 1788 het 1788 ref 20 12 6 7 AAAAAAAGAAAAAG 1 0 219678 CASAVA_Build 4 148243525 1D AAATGGAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 9 8 219679 CASAVA_Build 4 148243820 1I GGCCACTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 28 4 14 10 T 11 12 219680 CASAVA_Build 4 148244412 12I GAAGCCTGGG ------------/GAGGGAGTTGGT GAGGCAAGCT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 GAGGGAGTTGGT 0 1 219681 CASAVA_Build 4 148245185 1D CACTTCCTCC T/- TATAATTGAG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 2 1 219682 CASAVA_Build 4 148246427 1I AATTCAACAC -/A CCTTTATGAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 0 1 219683 CASAVA_Build 4 148252475 1D CTCATATCCC G/- CCCCCCCCCC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 G 1 0 219684 CASAVA_Build 4 148259469 1I GTTCCTGTTC -/T TTCACTTCAT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 2 3 219685 CASAVA_Build 4 148263020 1D TAGACCAAGT A/- AAAAAACTAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 7 6 219686 CASAVA_Build 4 148305428 2I CTCTTAAATG --/TA TATATATATC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 TA 4 5 219687 CASAVA_Build 4 148310018 1I ATGTGTGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 A 9 10 219688 CASAVA_Build 4 148310236 1D TGTGTATAAG A/- AAAATGAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 5 4 219689 CASAVA_Build 4 148315552 1I CCCCAGTCCA -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 52 28 21 3 T 6 7 219690 CASAVA_Build 4 148320620 1D GGAAGACTAC A/- AGGCAGATGG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 2 1 219691 CASAVA_Build 4 148330635 1D ATAATAATCA T/- TTTTTTTTTT 2687 het 2687 ref 22 10 9 4 T 12 11 219692 CASAVA_Build 4 148336632 1D TTATCTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 29 2 9 18 T 15 14 219693 CASAVA_Build 4 148343820 2I ACCATGATCT --/TA TAATTATCAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TA 1 2 219694 CASAVA_Build 4 148352342 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 72 hom 25 2 17 7 T 12 11 219695 CASAVA_Build 4 148352765 2I TGTTGGCCAC --/AT ATATGTCTTC 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 AT 2 3 219696 CASAVA_Build 4 148354881 1I CAATTTTTTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 14 8 11 A 8 9 219697 CASAVA_Build 4 148365277 1D8M1D ATGCAGCCAT AAAAAAGAAT/-AAAAAGAA- TGAGTTCATG 1469 hom 7 het 8 0 3 5 N/A 0 0 219698 CASAVA_Build 4 148374742 6D ATCATAAAGG TCTTCA/------ TCTTCATCAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 5 TCTTCA 2 1 219699 CASAVA_Build 4 148379440 6D7M14D TCCAACTCCT TACTCATTATGAGAACTCATTATGATC/------TTACCAG-------------- TTACTCATTA 3070 het 3070 ref 34 25 14 3 N/A 0 0 219700 CASAVA_Build 4 148380484 1I AAACGGCAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 A 8 9 219701 CASAVA_Build 4 148382555 1I GCTGAAACAT -/A GTCAAGTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 0 1 219702 CASAVA_Build 4 148382686 1D CAAAACAAAG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 7 6 219703 CASAVA_Build 4 148384618 1I ACTCAACCCC -/A AAACCCAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 3 4 219704 CASAVA_Build 4 148386469 1D ATTAACCATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 10 9 219705 CASAVA_Build 4 148388421 1I ATTTTTTTTT -/G TTTAAACTTG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 G 0 1 219706 CASAVA_Build 4 148390466 2I TCAGCTGGGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 9 11 219707 CASAVA_Build 4 148391602 1D20M1D TTCAGTTTTC AAAAAAAAAATTACTAGACATG/-AAAAAAAAATTACTAGACAT- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 20 15 2 N/A 0 0 219708 CASAVA_Build 4 148392118 1I TACTATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 A 13 14 219709 CASAVA_Build 4 148399870 6I AAAACAGAGA ------/TGTATC TACAGACCAA 2405 het 2405 ref 15 10 5 0 TGTATC 0 1 219710 CASAVA_Build 4 148399949 1D CAAACCTGAC A/- AAAACAAGAA 2072 het 2072 ref 14 8 5 1 A 5 4 219711 CASAVA_Build 4 148406296 3D ACTGGTGTCA TCT/--- TCTTACCAGT 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 TCT 2 1 219712 CASAVA_Build 4 148413592 6I CCTCTTTATC ------/TTTTAT TTTTGACAGT 3070 het 3070 ref 53 31 15 7 TTTTAT 0 1 219713 CASAVA_Build 4 148415630 1D GCTTGGAGAC T/- TGAGTCTGCA 3017 het 3017 ref 25 12 7 6 T 2 1 219714 CASAVA_Build 4 148416411 1I GCAGGATGAA -/C CAGAAGATAT 3070 het 3070 hom 47 12 24 11 C 1 2 219715 CASAVA_Build 4 148417065 1I TAAGGGCCCA -/C TTCCTGGTTT 3070 het 2716 hom 36 8 20 8 C 0 1 219716 CASAVA_Build 4 148422052 1D CAATAGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 A 11 10 219717 CASAVA_Build 4 148430573 2D22M1D CTGGGGTGAC AGAGTGAGACTCTGTCTCAAAGAGA/--AGTGAGACTCTGTCTCAAAGAG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 12 3 N/A 0 0 219718 CASAVA_Build 4 148439273 1D ACTCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 A 11 10 219719 CASAVA_Build 4 148455415 1I20M2D GGGAAAGGTG -AACTCCCCATGGCTCTTCCATC/AAACTCCCCATGGCTCTTCCA-- TCAAATGAAA 3070 hom 123 het 42 0 42 7 N/A 0 0 219720 CASAVA_Build 4 148457621 1I ACAGTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 29 2 21 6 A 13 14 219721 CASAVA_Build 4 148480572 1I TATCAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 36 0 28 8 A 9 10 219722 CASAVA_Build 4 148481162 1D TAGAAACATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 169 hom 52 1 39 12 A 10 9 219723 CASAVA_Build 4 148485121 4D TTAGTAAATA ATTT/---- ATTTATGCAC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 ATTT 2 1 219724 CASAVA_Build 4 148490104 34I CAGAAGTCAC ----------------------------------/GATACTTAGAGCAATGCTTCTCACATTTCAGCAT GAAGCAGAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 GATACTTAGAGCAATGCTTCTCACATTTCAGCAT 0 1 219725 CASAVA_Build 4 148490912 8D33M2D GGAAGGAAAG AAAGAAACAAAGAAACAAAGAAACAAAGAAAGAAAGAAAAGAA/--------AAAGAAACAAAGAAACAAAGAAAGAAAGAAAAG-- AAAAAAGAAA 3070 hom 24 het 14 0 8 13 N/A 0 0 219726 CASAVA_Build 4 148492788 1I ATCAGTTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 10 219727 CASAVA_Build 4 148493644 12I11M1I GTTAAAAAAA ------------AAAACTAAAAT-/ATAAAATAAAATAAAAATAAAATA AAAAAAAACA 3070 hom 36 het 12 0 13 2 N/A 0 0 219728 CASAVA_Build 4 148495638 8D CATATGTTCA TTCCTTTG/-------- TTCCTTTGTT 3070 hom 120 het 48 0 40 9 TTCCTTTG 2 1 219729 CASAVA_Build 4 148497341 4I GAAACAAAAC ----/AAAT AAACAAATGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAT 0 1 219730 CASAVA_Build 4 148508622 13I AACAATAGCT -------------/AACATTGATTGAG AACATACTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AACATTGATTGAG 0 1 219731 CASAVA_Build 4 148512318 3I ATTAGGGAGA ---/TTT TATATAGAGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 1 4 219732 CASAVA_Build 4 148514543 1I CAGGTTTTTG -/T GTGGACAAAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 0 1 219733 CASAVA_Build 4 148516964 1I TTAGTATGAT -/A TTTTATGTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 0 1 219734 CASAVA_Build 4 148538384 1D TACTGTCTGA G/- AAACACATCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 0 219735 CASAVA_Build 4 148538628 1I TGAGGCTGGG -/C ATGGTGGATC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 0 1 219736 CASAVA_Build 4 148556805 1D GGAGCTTAAA C/- CCCCAGACTC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 C 5 4 219737 CASAVA_Build 4 148559908 1I TGCCTAATTT -/A AAAAAAAAAA 2691 het 2691 ref 26 12 8 6 A 11 12 219738 CASAVA_Build 4 148564255 1I AAAGAAACAG -/A AATCAATAGA 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 A 2 3 219739 CASAVA_Build 4 148564448 1D GACCTCAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 14 12 7 T 10 9 219740 CASAVA_Build 4 148565803 1D TGCGGTTTTT C/- CTTCACCTCA 3070 het 3070 ref 54 30 21 5 C 2 1 219741 CASAVA_Build 4 148566382 1D CAGAGAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1041 hom 32 8 12 12 T 15 14 219742 CASAVA_Build 4 148568356 1I TACTGCATAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 8 9 219743 CASAVA_Build 4 148573084 2D GTCTCTTGTC TT/-- TTTTGTAATA 3070 het 3070 ref 41 26 14 1 T 6 4 219744 CASAVA_Build 4 148581313 1D TGGTAATAAA T/- TTTCCAAAAA 3070 het 3070 hom 50 18 30 2 T 4 3 219745 CASAVA_Build 4 148583494 1D TTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 12 15 12 A 10 9 219746 CASAVA_Build 4 148596913 1I CCCTCCCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 43 1 34 8 A 10 11 219747 CASAVA_Build 4 148598932 3I ATAATTTTGT ---/AAA GCCTATATTC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 0 3 219748 CASAVA_Build 4 148601688 1D AACCAGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 9 11 A 13 12 219749 CASAVA_Build 4 148604834 1I AAAATAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 9 10 219750 CASAVA_Build 4 148605711 1I AGTCTTACTC -/T TTTTTTTTTT 2695 het 2695 ref 29 15 9 5 T 10 11 219751 CASAVA_Build 4 148606243 1D TAAGACCAGC A/- AAAAACCACC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 6 5 219752 CASAVA_Build 4 148611164 1D GTCTTCCATC A/- ACTGATACCC 3070 hom 54 het 19 0 18 1 A 2 1 219753 CASAVA_Build 4 148615727 1I CTAAAAGTTC -/A AAAGGAAATT 3070 het 3070 ref 42 20 20 2 A 3 4 219754 CASAVA_Build 4 148620993 3D TGTCCCTCAT CTC/--- CTCTCCCACC 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 CTC 2 1 219755 CASAVA_Build 4 148629149 2I TCCAAAACTC --/AT GTAATGAGTC 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 AT 0 1 219756 CASAVA_Build 4 148639166 2I GGCAGCTTTT --/GA GAGTAGTTTC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 GA 1 2 219757 CASAVA_Build 4 148643225 1D CATCCAGTTT C/- CAACTCCCAT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 C 2 1 219758 CASAVA_Build 4 148643455 1D AAAATATGTA T/- TTAGCCTAAT 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 T 3 2 219759 CASAVA_Build 4 148647813 1D CTTATTTTGA G/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 G 6 5 219760 CASAVA_Build 4 148657596 1I TTCTTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 11 12 219761 CASAVA_Build 4 148716711 1I AGATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 10 11 219762 CASAVA_Build 4 148720652 2I TTCAACACTC --/TT TACTATTTGT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 1 3 219763 CASAVA_Build 4 148735377 1I GCACTGTGCT -/C CTATCATGTA 3070 hom 126 het 51 0 42 9 C 1 2 219764 CASAVA_Build 4 148736124 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 704 het 153 hom 6 1 3 3 A 17 16 219765 CASAVA_Build 4 148738230 1D ACTTGCTACC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 20 9 2 A 9 8 219766 CASAVA_Build 4 148739677 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2173 hom 16 7 7 2 A 11 12 219767 CASAVA_Build 4 148740265 1D GAGCTCTCAG A/- GAGGTCTACG 3070 het 3070 ref 40 21 10 10 A 1 0 219768 CASAVA_Build 4 148743233 1I CCCAAGCAAT -/C CCCCCCACCT 3070 hom 79 het 31 0 27 4 C 6 7 219769 CASAVA_Build 4 148764247 1I AATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 20 0 16 4 T 12 13 219770 CASAVA_Build 4 148775330 1D GAGGATGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 36 1 28 7 T 12 11 219771 CASAVA_Build 4 148777386 2I AAAAATGGGC --/AA AAGACCTGAA 3070 hom 135 het 46 0 45 1 A 2 4 219772 CASAVA_Build 4 148777863 1I ATTCATCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 330 hom 33 1 26 6 A 12 13 219773 CASAVA_Build 4 148778195 1D TGCTGTTGTC A/- AAAAACAAAA 3070 hom 141 het 54 0 47 7 A 6 5 219774 CASAVA_Build 4 148783130 1I GCATGAGCCA -/C CACACCTGGC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 C 1 2 219775 CASAVA_Build 4 148784975 1D TGCAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 26 3 18 5 A 15 14 219776 CASAVA_Build 4 148788590 1D TTATATTTAC G/- GATTTATTAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 1 219777 CASAVA_Build 4 148793334 1D ACGAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2338 hom 30 het 17 0 10 7 A 12 11 219778 CASAVA_Build 4 148801863 1D TCTGCTCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 839 hom 33 3 19 11 A 15 14 219779 CASAVA_Build 4 148801878 1D AAAAAAAAAA C/- ACCCTGTAAT 3070 het 951 hom 36 6 20 10 C 1 0 219780 CASAVA_Build 4 148808603 3I CAAAAAAAAA ---/AAG AATAAGACCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAG 0 1 219781 CASAVA_Build 4 148809838 1D GAAAAAAAAT G/- TTTTTTTTAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 G 1 0 219782 CASAVA_Build 4 148831603 5D TACAGGACTT AAAAC/----- AACTACATGA 3070 hom 80 het 28 0 25 4 AAAAC 1 0 219783 CASAVA_Build 4 148833906 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 517 hom 21 2 9 10 A 17 16 219784 CASAVA_Build 4 148840745 1D TAGTCTGAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 10 9 219785 CASAVA_Build 4 148842502 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 1297 het 1297 ref 35 24 4 7 A 12 11 219786 CASAVA_Build 4 148847053 1D ACTCTGTATC A/- AAAAAAAAAA 767 het 767 ref 17 11 2 4 A 17 16 219787 CASAVA_Build 4 148851726 1D TTATACCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 12 11 219788 CASAVA_Build 4 148852422 3D AATAAAACAG CAA/--- CAGCTTAGAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CAA 1 0 219789 CASAVA_Build 4 148852793 7D TACTGAAAAT TCTTCTG/------- AAAAGAATTT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 TCTTCTG 1 0 219790 CASAVA_Build 4 148862862 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 A 11 10 219791 CASAVA_Build 4 148874615 1D TAGGGGGGCG C/- CTATACATAT 3070 hom 68 het 26 0 23 4 C 2 1 219792 CASAVA_Build 4 148889596 6D ACATAAGATA ACTTTT/------ ACTTTTGAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 ACTTTT 2 1 219793 CASAVA_Build 4 148907969 1D AGAATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 33 1 26 6 T 13 12 219794 CASAVA_Build 4 148912098 5I AAAATGTATG -----/ATTAA ATTATTTTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATTAA 0 1 219795 CASAVA_Build 4 148918702 2D GGTTTGTGAC AG/-- GGGAGATCCT 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 AG 1 0 219796 CASAVA_Build 4 148921162 1I GGAGACTAGG -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 7 8 219797 CASAVA_Build 4 148928054 1I TGATGGAAGC -/G GGTGGGGGAG 3070 hom 68 het 28 0 22 6 G 2 3 219798 CASAVA_Build 4 148928740 1I AATTTGATTT -/G TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 219799 CASAVA_Build 4 148933922 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 13 12 219800 CASAVA_Build 4 148956334 1D GTGGTGGTGG T/- TTCATGCCTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 3 2 219801 CASAVA_Build 4 148964923 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1132 het 1132 ref 33 20 3 10 A 13 12 219802 CASAVA_Build 4 148965789 2D TGGCTGATGC CT/-- CTGTAATCCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CT 2 1 219803 CASAVA_Build 4 148977256 1I TCCTTAAATC -/T TAAGTACCAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 1 2 219804 CASAVA_Build 4 148979075 1I CTTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 30 1 21 8 A 10 11 219805 CASAVA_Build 4 148979147 1D CTCTTCCTCC T/- CTTCTTCTTC 3070 hom 96 het 39 0 31 11 T 1 0 219806 CASAVA_Build 4 148981096 3D GTTTTAAAAT GTG/--- GTAACCATGC 3070 het 3070 ref 47 25 18 5 GTG 1 0 219807 CASAVA_Build 4 148991857 1D TGACTAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 39 0 33 7 T 15 14 219808 CASAVA_Build 4 148998136 1I TTAATCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 10 11 219809 CASAVA_Build 4 148998945 1D CAAAATTGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 64 het 43 1 37 5 T 9 8 219810 CASAVA_Build 4 149008528 2D TGTTTCTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 14 12 219811 CASAVA_Build 4 149011164 1D GTGGCTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 528 hom 28 2 19 7 T 15 14 219812 CASAVA_Build 4 149017866 1D CTGTGCAATA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 8 7 219813 CASAVA_Build 4 149021510 1D TTTTTACACT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 63 het 39 1 34 4 A 8 7 219814 CASAVA_Build 4 149023064 2I ACTCCGTTTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 182 hom 28 2 25 1 A 14 16 219815 CASAVA_Build 4 149028044 1I CATTCATCTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 7 8 219816 CASAVA_Build 4 149030269 3D ACATACTTTG TCT/--- TCTTTACAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TCT 2 1 219817 CASAVA_Build 4 149030895 4D CATTACTACT TTGA/---- TTATCAATGG 3070 hom 90 het 34 0 28 7 TTGA 1 0 219818 CASAVA_Build 4 149033175 18D AGCAGCATGG GGGAGTGTGGGGTTGGCT/------------------ GGGAGTGTGG 3070 hom 90 het 39 0 29 14 GGGAGTGTGGGGTTGGCT 2 1 219819 CASAVA_Build 4 149034742 1D TAAATACTTT G/- GGTGTGGGAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 3 2 219820 CASAVA_Build 4 149038789 3I GCCTTAGGCT ---/TGA GCATTTCTTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TGA 0 1 219821 CASAVA_Build 4 149040324 1I TCATCTCTGG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 219822 CASAVA_Build 4 149040478 1D ACGTGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 26 1 22 3 T 15 14 219823 CASAVA_Build 4 149047148 1I AGATAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 10 11 219824 CASAVA_Build 4 149052245 1I TTACAGGCGT -/G GAGCCACCGC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 1 2 219825 CASAVA_Build 4 149052539 1D TCCTCCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 26 1 20 5 T 12 11 219826 CASAVA_Build 4 149055194 1I ATCTTCAGCA -/T TTTTTGTACA 3070 hom 23 het 23 0 7 16 T 5 6 219827 CASAVA_Build 4 149060169 1D TTAAAAACAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 17 hom 27 1 24 2 T 9 8 219828 CASAVA_Build 4 149061243 1I TTGGTTACAT -/A ACAATCCTTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 2 219829 CASAVA_Build 4 149071915 1D ATTAAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 28 1 21 7 A 14 13 219830 CASAVA_Build 4 149090444 1I AATTGCATTC -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 219831 CASAVA_Build 4 149092005 1D GTATAGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 42 0 25 17 T 15 14 219832 CASAVA_Build 4 149094241 5D TTGTTTTCTC TCTTT/----- TATTTCCTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TCTTT 1 0 219833 CASAVA_Build 4 149142250 1I AAGTTGGATT -/C CTAGGTATTT 2946 hom 15 het 6 0 6 0 C 1 2 219834 CASAVA_Build 4 149200123 1I ACTCTCAAAA -/T ATTTCATTAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 1 219835 CASAVA_Build 4 149202215 1D AAGAATAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 174 hom 32 1 29 3 T 12 11 219836 CASAVA_Build 4 149212237 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAAAC 1075 hom 12 het 21 0 5 18 AAC 1 0 219837 CASAVA_Build 4 149215378 1D GCTGCTCCCC A/- AGGCTCTGCT 3070 hom 135 het 51 0 39 12 A 2 1 219838 CASAVA_Build 4 149219051 4I TTCTGCAGAA ----/TAAG TAAGTTTTCA 3070 hom 135 het 48 0 44 4 TAAG 1 2 219839 CASAVA_Build 4 149221467 1D TCTGTATATA T/- TTTTTTATTA 3070 hom 102 het 36 0 34 3 T 7 6 219840 CASAVA_Build 4 149237295 1I TAAATGACTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 61 15 25 21 A 8 9 219841 CASAVA_Build 4 149241476 1D TGAAATATTA T/- TCAGCCTTAT 3070 hom 99 het 39 0 32 7 T 2 1 219842 CASAVA_Build 4 149242486 1D TCTCAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 39 0 32 10 A 12 11 219843 CASAVA_Build 4 149250617 3D GAGCTAAAAA ATT/--- ATTATTGTCA 3070 hom 108 het 42 0 37 8 ATT 3 2 219844 CASAVA_Build 4 149256366 1I ATTTTTGTGA -/G GGGGAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 4 5 219845 CASAVA_Build 4 149258129 4D AACATATCAC ACTT/---- ACGTGCCTCC 3070 hom 75 het 30 0 25 8 ACTT 1 0 219846 CASAVA_Build 4 149262596 13I AGATTTGCAC -------------/ATGTCACCTGCTT ATGTCACCTG 3070 hom 105 het 38 0 35 5 ATGTCACCTGCTT 1 2 219847 CASAVA_Build 4 149276312 1D TTTCAATTTA G/- GAGCAACCAT 3070 hom 42 het 17 0 15 3 G 2 1 219848 CASAVA_Build 4 149276673 6D AAAAAAAAAA AAAAAC/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AAAAAC 1 0 219849 CASAVA_Build 4 149280037 1D AGAATCCTTC A/- AAATCTCCCT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 A 4 3 219850 CASAVA_Build 4 149291866 2I ATTTACTCAC --/AT GTCCTTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 0 1 219851 CASAVA_Build 4 149293837 1I CCCAGGCTGG -/A AGTTCAGTGA 3070 hom 54 het 25 0 18 7 A 1 2 219852 CASAVA_Build 4 149294329 1D ACCATGAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 416 hom 34 1 28 5 A 9 8 219853 CASAVA_Build 4 149300983 1D CAAGATTTCC T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 84 het 34 0 24 10 T 7 6 219854 CASAVA_Build 4 149301693 2D CTGGGTCCCA GG/-- GCAATAAATA 3070 hom 78 het 39 0 27 12 G 3 1 219855 CASAVA_Build 4 149311039 4D TCAGCATAAT AAAA/---- AAATTCATTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 7 3 219856 CASAVA_Build 4 149346060 2D TCAATTTCTC TG/-- TATCCTTCCA 3070 hom 123 het 45 0 40 6 TG 1 0 219857 CASAVA_Build 4 149352345 1D GTTTTCCCAG C/- CTCTGCATTC 3070 hom 141 het 53 0 47 6 C 2 1 219858 CASAVA_Build 4 149353739 1D CAATGATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 40 1 20 19 T 13 12 219859 CASAVA_Build 4 149360691 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 26 3 T 10 11 219860 CASAVA_Build 4 149362889 1D CGGAATGAAG C/- ACAGCATGAA 3070 hom 75 het 32 0 26 7 C 1 0 219861 CASAVA_Build 4 149364741 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 34 1 28 6 A 11 10 219862 CASAVA_Build 4 149376319 1I ACCAGGAGAA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 8 9 219863 CASAVA_Build 4 149378239 23D TTCAATAATT GTAGAAGTTGGAGCACTGCCCAA/----------------------- AAACAAAATG 3070 hom 7 het 23 1 16 10 GTAGAAGTTGGAGCACTGCCCAA 1 0 219864 CASAVA_Build 4 149395675 1D ATGCTCACTG C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 81 het 32 0 26 6 C 9 8 219865 CASAVA_Build 4 149400054 1D TTTAATATGC A/- AAATTTGGAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 A 4 3 219866 CASAVA_Build 4 149409529 4D ACAATGAATG AATA/---- AAGGCCTAGT 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 AATA 1 0 219867 CASAVA_Build 4 149412064 1D AGAAAGGCTG T/- TTTTTTGGCC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 7 6 219868 CASAVA_Build 4 149418695 4D AAGTCTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1612 hom 23 5 13 5 TTTG 7 6 219869 CASAVA_Build 4 149435148 1D CACAAAACAG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 8 7 219870 CASAVA_Build 4 149435281 1D TCATTGATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1909 hom 25 6 16 3 A 11 10 219871 CASAVA_Build 4 149443005 5I2M1D AATTGAGTAA -----ACA/GGTATAC- TCCTGTGAAC 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 N/A 0 0 219872 CASAVA_Build 4 149444742 1D CTGAGTTTCC T/- TTTTCCGCCT 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 T 5 4 219873 CASAVA_Build 4 149447773 1D TTAAAAATGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 44 het 36 1 29 7 A 10 9 219874 CASAVA_Build 4 149452684 5I CACATTTTAC -----/TTTAT TTTGTTTATT 3070 het 3070 ref 53 33 16 4 TTTAT 0 1 219875 CASAVA_Build 4 149452912 5I GTTATTTACA -----/TTTAC TTTATGAGTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TTTAC 0 1 219876 CASAVA_Build 4 149458373 1D CAGAAAAAGC T/- TTTTTTTAAA 2292 het 2292 ref 33 15 7 11 T 8 7 219877 CASAVA_Build 4 149458481 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 641 hom 14 2 9 3 T 9 10 219878 CASAVA_Build 4 149464471 1I GCTGTGGACC -/T GGAGCTGTTC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 0 1 219879 CASAVA_Build 4 149466114 5D TGAAGTTATG ACATT/----- ACATTAATGT 3070 het 3070 ref 57 32 21 5 ACATT 2 1 219880 CASAVA_Build 4 149468664 1D CTCTGGGTTT A/- ACTTCAACAC 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 A 2 1 219881 CASAVA_Build 4 149471125 1I AAATGTAGTC -/T TTTTTATATC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 5 6 219882 CASAVA_Build 4 149471793 1D GTGCAAAAGG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 A 8 7 219883 CASAVA_Build 4 149471887 1I TGGGATAAAC -/G GAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 G 1 2 219884 CASAVA_Build 4 149473026 1I TGGGAATGTC -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 42 10 30 2 T 6 7 219885 CASAVA_Build 4 149474262 1I GAGAGACACA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 45 13 21 11 T 8 9 219886 CASAVA_Build 4 149487428 1I ACATGTCAAG -/T TTGCATTATG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 2 3 219887 CASAVA_Build 4 149487864 1I AACTGGCATG -/T TATTTTAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 2 219888 CASAVA_Build 4 149490249 1D TGGCTTGGGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 142 het 54 0 47 8 A 9 8 219889 CASAVA_Build 4 149491254 1I ATGTGCTCCT -/C CCTCTGCTTT 3070 het 3070 hom 55 22 24 9 C 2 3 219890 CASAVA_Build 4 149497502 24D TAAGCACGAC TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/------------------------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 16 25 15 TG 18 6 219891 CASAVA_Build 4 149499238 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 11 10 219892 CASAVA_Build 4 149506359 3I ACAGTTTTTC ---/TTG TTATTAATTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 TTG 0 1 219893 CASAVA_Build 4 149518983 1D CACCTCCACC A/- AAAAAAAAAA 1316 het 1316 ref 35 22 4 9 A 13 12 219894 CASAVA_Build 4 149521835 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2585 hom 23 8 11 5 A 13 12 219895 CASAVA_Build 4 149525078 1I TAAGAATTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 8 9 219896 CASAVA_Build 4 149532559 1I ATAACGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 10 11 219897 CASAVA_Build 4 149540229 2D AAAAATTTAT AC/-- ACCTTACATA 3070 het 3070 ref 22 13 7 3 AC 2 1 219898 CASAVA_Build 4 149545686 3I AAATTGTCTT ---/ATG CTGCTCACAT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 ATG 0 1 219899 CASAVA_Build 4 149548289 1D CTATCAGAGG C/- CCCCCCTTCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 7 6 219900 CASAVA_Build 4 149559698 1I TTGTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 T 11 12 219901 CASAVA_Build 4 149563830 1D TTCCTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 A 13 12 219902 CASAVA_Build 4 149579406 1D CTTTTCTGTG T/- TTTTACACTA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 5 4 219903 CASAVA_Build 4 149615142 1D TAGGCAAGAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 7 219904 CASAVA_Build 4 149618459 1D TGTCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 40 0 32 8 A 12 11 219905 CASAVA_Build 4 149628541 2D GGTGCTGCCC AG/-- AGAATCTGTA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AG 2 1 219906 CASAVA_Build 4 149638252 1I TCAGTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 46 0 36 10 T 10 11 219907 CASAVA_Build 4 149641941 1I CCTTCATTTC -/A ACCTTGGTGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 2 219908 CASAVA_Build 4 149653358 7I TTTAGCTTGT -------/TTTGAAG ACAGGAGCTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTTGAAG 0 1 219909 CASAVA_Build 4 149654010 1D TACTGTAGAG A/- AAAAAACCCA 1207 het 1207 ref 44 36 3 5 A 7 6 219910 CASAVA_Build 4 149660931 1D TCTCTGGTTG C/- CCTTAACATT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 3 2 219911 CASAVA_Build 4 149668174 1D CAGATGAAAG T/- TTTTTTTAGG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 8 7 219912 CASAVA_Build 4 149669476 4I AAGACAAGAA ----/AAAG AAAGAAAAGG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAAG 1 2 219913 CASAVA_Build 4 149681141 1I AAAACAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 22 1 19 2 A 13 14 219914 CASAVA_Build 4 149698241 1D ATGCTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 11 10 219915 CASAVA_Build 4 149699553 5D CCTATAAAAT TAAAG/----- TAAACACCAG 3070 hom 81 het 32 0 28 6 TAAAG 1 0 219916 CASAVA_Build 4 149719418 1D GCTAAAGAAG A/- AAAAAGCACA 3070 hom 149 het 54 0 50 4 A 6 5 219917 CASAVA_Build 4 149722732 1I GGTCCTGGGC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 9 219918 CASAVA_Build 4 149727072 6I CTAAAATAAC ------/TTGGTA TTGGTCATTC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TTGGTA 0 1 219919 CASAVA_Build 4 149742939 1I AAAATGGTCA -/T TTTTTATGTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 5 6 219920 CASAVA_Build 4 149743985 2I CACTATTGAT --/TG TATAAATTGT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 TG 0 1 219921 CASAVA_Build 4 149751059 1D GTTTTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 27 1 19 7 T 14 13 219922 CASAVA_Build 4 149751504 1I TGGAATCTTT -/G TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 0 1 219923 CASAVA_Build 4 149753652 1D ATTTCAAAGC A/- AAAAAACCAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 7 6 219924 CASAVA_Build 4 149763370 1D ATCGCATCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 27 1 20 7 A 13 12 219925 CASAVA_Build 4 149763736 2D ACATCAGAGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 10 11 6 AT 8 7 219926 CASAVA_Build 4 149780349 1I ATTTGATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 34 0 22 12 T 10 11 219927 CASAVA_Build 4 149851817 1I TTTGGCGGGA -/G GGGGGGGGTG 3070 het 65 hom 24 1 14 9 G 8 9 219928 CASAVA_Build 4 149854328 1D CAAGGGAGGT A/- AAAAAAAAAA 1656 het 1656 ref 49 31 5 13 A 15 14 219929 CASAVA_Build 4 149872267 1I CCGCTTTTGC -/T TGTTGGAATG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 219930 CASAVA_Build 4 149905661 1D TATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 11 10 219931 CASAVA_Build 4 149926570 4D GGGTTATAAC AAAT/---- AAGCCAAATA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 AAAT 1 0 219932 CASAVA_Build 4 149930802 9D GCCTTGGGGT GGCTTGAGA/--------- GGCTCCTCTC 3070 het 3070 hom 35 17 15 6 GGCTTGAGA 1 0 219933 CASAVA_Build 4 149931582 1D GGTTGAAAGA G/- CGGCAGATAA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 G 1 0 219934 CASAVA_Build 4 149937897 1D GGATAAGATC T/- TTTGGAGTGA 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 T 4 3 219935 CASAVA_Build 4 149938822 4D TAAACATAAA CTCT/---- CTCTATATGT 1171 het 745 hom 7 2 3 2 CT 4 2 219936 CASAVA_Build 4 149939016 1D TATGAGTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 10 9 219937 CASAVA_Build 4 149948887 1I GGGCGTGAGG -/A AAAATAATTC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 4 5 219938 CASAVA_Build 4 149949878 2I AAATTCACCA --/TT TTGGGTGTGC 3070 het 2709 hom 27 8 16 3 T 2 4 219939 CASAVA_Build 4 149952319 1I AAAACATGTA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 T 6 7 219940 CASAVA_Build 4 149962431 1D ATATGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 11 10 219941 CASAVA_Build 4 149967390 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1560 hom 12 het 5 0 5 0 T 6 7 219942 CASAVA_Build 4 149968650 1I TTCTGTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 31 1 26 4 A 10 11 219943 CASAVA_Build 4 149971677 1D TAAATTCTGT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 9 8 219944 CASAVA_Build 4 149973838 6D ACTTTCAGGG GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 140 het 56 0 47 9 GT 8 5 219945 CASAVA_Build 4 149981776 2I GAATTTTTAC --/TA TATACTGCAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 TA 2 3 219946 CASAVA_Build 4 149985296 1D ATTTTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 T 11 10 219947 CASAVA_Build 4 149995616 3I TTAATGGTAA ---/CTT CTTCCTACTT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 CTT 1 2 219948 CASAVA_Build 4 149999280 10I TGAATTCCAC ----------/AAAAGAGGCA AAAAGAGGCA 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 AAAAGAGGCA 1 2 219949 CASAVA_Build 4 150004792 1I CCAGCCTGGG -/T AACACAGTGA 3070 het 1899 hom 13 6 7 1 T 0 1 219950 CASAVA_Build 4 150005490 2D TCTTAATAAT CA/-- TTCTGTACTT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 CA 1 0 219951 CASAVA_Build 4 150016363 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 6 A 10 11 219952 CASAVA_Build 4 150018874 3D AAAATCTAAT GAA/--- GAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 GAA 2 1 219953 CASAVA_Build 4 150036401 1D CTTTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 610 hom 34 2 23 9 T 12 11 219954 CASAVA_Build 4 150040750 1I GATGAGTGAG -/A AAACCCTTTC 3070 het 3070 ref 47 30 16 1 A 3 4 219955 CASAVA_Build 4 150047409 1I AAGTTTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 11 219956 CASAVA_Build 4 150048710 4I CTAACTTTGT ----/GGTG AAATAAGGTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 GGTG 0 1 219957 CASAVA_Build 4 150050827 2D CAATATATGA AG/-- AGTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 AG 2 1 219958 CASAVA_Build 4 150057806 1D GGCACGTAAT A/- AAGTACTCAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 3 2 219959 CASAVA_Build 4 150058452 1I TCAATGGGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 9 219960 CASAVA_Build 4 150066000 1D GGATGCAAGG A/- AAAAGGTCTG 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 5 4 219961 CASAVA_Build 4 150067195 1D GTATTCCAGT G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 G 9 8 219962 CASAVA_Build 4 150070809 1D AAAAACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 471 hom 39 3 28 8 A 14 13 219963 CASAVA_Build 4 150076998 1I TATTTTTTTC -/T TTTCTATTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 3 4 219964 CASAVA_Build 4 150079317 1I CATTCTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 23 10 T 10 11 219965 CASAVA_Build 4 150080656 1I48M2D CTTTCTTTTC -TTTTTTATTGGCAATTCAAAATTCAGTATCTATGATTTGCAAGGAAACAT/TTTTTTTATTGGCAATTCAAAATTCAGTATCTATGATTTGCAAGGAAAC-- AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 40 25 27 6 N/A 0 0 219966 CASAVA_Build 4 150089802 1I TTCTTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 727 hom 50 3 37 10 T 11 12 219967 CASAVA_Build 4 150114560 1D GTCAGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 9 8 219968 CASAVA_Build 4 150122827 2D AAGGTCTCAA AT/-- ATATTTTAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AT 3 2 219969 CASAVA_Build 4 150130086 1D AGCTGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 581 hom 27 3 16 9 T 15 14 219970 CASAVA_Build 4 150135219 2I CCTGGGTGAC --/AA GAGCAAAACT 3070 hom 57 het 22 0 19 6 A 0 2 219971 CASAVA_Build 4 150153615 1D CAACAATACC T/- TGTTCAGTAA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 2 1 219972 CASAVA_Build 4 150158322 2D TCTTTCTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 CT 8 7 219973 CASAVA_Build 4 150161497 4D TGCCTATAAC AACA/---- AACAAACAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AACA 3 2 219974 CASAVA_Build 4 150166653 4I TAGACTTTTT ----/CAAA CAGTCTCAAA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 CAAA 0 1 219975 CASAVA_Build 4 150169587 1D CTGCGTCAGA C/- CCCTAACTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 4 3 219976 CASAVA_Build 4 150172992 1I GGAAAGAAAA -/G GTTTTGTATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 1 2 219977 CASAVA_Build 4 150176630 1I ACTCAATGTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 A 8 9 219978 CASAVA_Build 4 150193762 3I GGAAATTGAC ---/ATA ATATTTTTAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 ATA 1 2 219979 CASAVA_Build 4 150196130 1I GCAGTCAATC -/T TTTTTTATAT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 6 7 219980 CASAVA_Build 4 150199535 1D GTGTAGCAGA C/- TACAGTAACT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 0 219981 CASAVA_Build 4 150202560 1I AGACTTAAAG -/A GACATGATTT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 0 1 219982 CASAVA_Build 4 150207072 1D AGAAAACAAG A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 7 219983 CASAVA_Build 4 150208529 3I ATTAAAACTA ---/AAG AAAGAGATAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAG 0 1 219984 CASAVA_Build 4 150209898 2I CCTTCATGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 35 0 24 11 A 12 14 219985 CASAVA_Build 4 150212529 1I AAAAAAGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 25 1 19 5 A 11 12 219986 CASAVA_Build 4 150218282 12D ATTTATTTTG AAGTAATTTCAT/------------ AAGTAATTTC 3070 het 2377 hom 20 6 11 3 AAGTAATTTCAT 2 1 219987 CASAVA_Build 4 150218407 4D TTTCTCTCTC TCTT/---- TGTTTCTCCT 3070 het 664 hom 13 3 9 1 TCTT 1 0 219988 CASAVA_Build 4 150224271 1I CAGGCAGGGC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 116 het 46 0 39 7 T 8 9 219989 CASAVA_Build 4 150282419 1I CAAAGACTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 396 hom 41 1 35 5 T 9 10 219990 CASAVA_Build 4 150284752 10D TCTCCTTTTC TTTCTTTCTT/---------- TTTCTTTCTT 3070 hom 82 het 38 0 28 11 TTTCTTTCTT 2 1 219991 CASAVA_Build 4 150287794 1I CTTGCTTCTC -/A GGGGGGGGTA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 0 1 219992 CASAVA_Build 4 150288254 2D TTTCCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 32 0 23 9 T 13 11 219993 CASAVA_Build 4 150289391 3I AGTGGGAAAA ---/AAT AATAATAAGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAT 2 3 219994 CASAVA_Build 4 150315577 2D77M4I ATAACACTTT ACCACCTCTCTGGGTATCCCTTAACCCAGTTAAGTTGACACATAAAATTAACCATCACAATCTAATAACTGTAAATTGC----/--CACCTCTCTGGGTATCCCTTAACCCAGTTAAGTTGACACATAAAATTAACCATCACAATCTAATAACTGTAAATTGCCTGA CTGACTAAGA 3070 het 3070 hom 50 24 25 26 N/A 0 0 219995 CASAVA_Build 4 150320736 2I CAATTTCAGC --/AA AGTCTCAGGA 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 A 1 3 219996 CASAVA_Build 4 150364317 2I ACAAATTTAT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TA 0 1 219997 CASAVA_Build 4 150369456 10I CTCTTCTATT ----------/CTAATACTGA TGCATTGTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CTAATACTGA 0 1 219998 CASAVA_Build 4 150429380 1D GCCAAAAACA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 8 7 219999 CASAVA_Build 4 150447841 1D TTATTGGAGG A/- AAAGGATTAT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 A 4 3 220000 CASAVA_Build 4 150454082 1I AGAAAGGAGG -/C CCCCCCGTTT 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 C 6 7 220001 CASAVA_Build 4 150479392 1I CATTCATTTC -/A AAAAATTTAT 3070 het 3070 ref 55 32 19 4 A 5 6 220002 CASAVA_Build 4 150490248 2D TGTCTAGATG TT/-- TTATCTGAAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 T 4 2 220003 CASAVA_Build 4 150491925 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 20 0 13 8 A 17 16 220004 CASAVA_Build 4 150506332 1I ATCTAAGCTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 47 24 14 9 A 8 9 220005 CASAVA_Build 4 150511111 2D CATCATTTGC AT/-- ATATATATAT 1701 het 1701 ref 45 35 4 7 AT 7 6 220006 CASAVA_Build 4 150511484 2I7M10I TTATTTTGTT --AATTCTT----------/AAAATAAATAACAAAATAA TATAGATAAA 3070 het 3070 ref 35 22 18 1 N/A 0 0 220007 CASAVA_Build 4 150532728 1D ATTTTGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 42 5 15 22 T 13 12 220008 CASAVA_Build 4 150542980 1I GTGAGTTTAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 A 7 8 220009 CASAVA_Build 4 150546492 4D ATATATCTTC ATAT/---- ATATATATAT 1024 hom 7 het 5 0 3 3 AT 10 8 220010 CASAVA_Build 4 150558423 1D CCCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1662 het 1662 ref 36 21 4 11 T 15 14 220011 CASAVA_Build 4 150558772 1D CAGGTTATGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 10 9 220012 CASAVA_Build 4 150565020 2D ATGGCATAAC AT/-- ATGGAATTTC 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 AT 2 1 220013 CASAVA_Build 4 150580563 1I GTTGCTATTC -/T TTTTTTTTTT 1433 het 1433 ref 29 12 6 11 T 14 15 220014 CASAVA_Build 4 150584726 5D AGGTTTCGCT ATCAA/----- TTCAAAGGAG 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 ATCAA 1 0 220015 CASAVA_Build 4 150609193 1I CTTCTGCAGA -/T TTAAACATCC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 2 3 220016 CASAVA_Build 4 150619584 2D TAACAAATCA TT/-- TAATAAATAT 3070 hom 99 het 42 0 34 10 T 3 1 220017 CASAVA_Build 4 150622536 1D TTTGGGGGGG T/- TGGTTTTCTT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 2 1 220018 CASAVA_Build 4 150627600 4I TTTCTCAAAC ----/AGAA AGAAAGAGTC 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 AGAA 1 2 220019 CASAVA_Build 4 150650180 1D ATATGACTGG A/- AAAAAACAAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 7 6 220020 CASAVA_Build 4 150669009 1D TTAAGGCATT A/- AAATATTTTA 2752 het 2752 ref 23 15 6 2 A 4 3 220021 CASAVA_Build 4 150680776 1I ACACAGCAAC -/A AAAACAAGCC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 4 5 220022 CASAVA_Build 4 150684357 1D AAAAAAAGTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 9 8 220023 CASAVA_Build 4 150686421 1D AAAAGTGGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 10 9 220024 CASAVA_Build 4 150692322 1D TACTATTCAT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 A 8 7 220025 CASAVA_Build 4 150692479 4D CTATCACTGC CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 CT 9 7 220026 CASAVA_Build 4 150695977 1I GGATGCACAC -/A ACGTGAACTT 3070 het 3070 hom 55 24 23 8 A 1 2 220027 CASAVA_Build 4 150701879 1D TTGGCCCATT C/- TTTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 C 1 0 220028 CASAVA_Build 4 150705416 2D AATAAATTCC TA/-- TATATATATA 3070 het 2999 hom 23 8 7 8 TA 7 6 220029 CASAVA_Build 4 150716469 3D TTCCAGGCGC ATG/--- ATATCATGTC 3070 hom 81 het 28 0 28 2 ATG 1 0 220030 CASAVA_Build 4 150718276 1I ATGCCTCTAG -/C TTTGTTCATT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 C 0 1 220031 CASAVA_Build 4 150722910 50D TGCTGTAGAC ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 24 het 10 0 9 4 AT 31 6 220032 CASAVA_Build 4 150723523 1D CTCTTTCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 A 10 9 220033 CASAVA_Build 4 150739252 4D AATTCTCAAC TTTA/---- TTTGTCATTA 3070 het 3070 hom 29 12 17 2 TTTA 1 0 220034 CASAVA_Build 4 150739606 2D ACTGGATGGC AT/-- ATATATATAT 1031 het 1031 ref 36 29 3 8 AT 6 5 220035 CASAVA_Build 4 150740590 4I ACTATGCAAG ----/TTGA TTATTTGCTT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 TTGA 0 1 220036 CASAVA_Build 4 150741811 6D5M3D ACCTAAGATT AGAAGATTAGAATC/------CTACA--- TTTCTAACAA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 N/A 0 0 220037 CASAVA_Build 4 150744323 1D AGGAATAGTT A/- AAAAAAAAAA 1455 het 1455 ref 38 21 4 14 A 11 10 220038 CASAVA_Build 4 150746404 10D CCCCAACTCC TGAGTCACTG/---------- AGTCAGTGAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 4 TGAGTCACTG 1 0 220039 CASAVA_Build 4 150752569 3I AACAATAATT ---/TTA TTATTATTTA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TTA 2 3 220040 CASAVA_Build 4 150752692 2D ATGGGGGAAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 40 13 18 10 GA 10 9 220041 CASAVA_Build 4 150753316 2I AAATTAATAT --/AC AGTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AC 0 1 220042 CASAVA_Build 4 150755267 3I GGCAACATTG ---/GAA GAAGAAGAAT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 GAA 3 4 220043 CASAVA_Build 4 150755737 1D TTAGATGTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 T 9 8 220044 CASAVA_Build 4 150760765 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 10 9 220045 CASAVA_Build 4 150767031 10I TAAGACATAC ----------/TTCTAATCCT TATTTTGCTA 2319 het 2319 ref 28 20 5 3 TTCTAATCCT 0 1 220046 CASAVA_Build 4 150767251 1I AAAATTGTTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 47 15 28 4 A 7 8 220047 CASAVA_Build 4 150779500 35D ATCAGGGTTT AGTTTTGCCTGCTTCTAAGTCCTAAACTGGCAAAA/----------------------------------- AGTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 47 25 10 20 AGTTTTGCCTGCTTCTAAGTCCTAAACTGGCAAAA 2 1 220048 CASAVA_Build 4 150783646 1D TTTTTAACTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 9 8 220049 CASAVA_Build 4 150787944 1D TCTAAGAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 9 220050 CASAVA_Build 4 150790790 17I CATATTGGTG -----------------/TAGGGTAGGCCCCTAAT CCAATACGTT 3070 het 3070 hom 41 15 24 4 TAGGGTAGGCCCCTAAT 0 1 220051 CASAVA_Build 4 150791007 2D AATTTCTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 1776 het 1776 ref 35 13 5 17 T 18 16 220052 CASAVA_Build 4 150822574 1I AGTTGTTTCC -/A AAAATCTGCT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 4 5 220053 CASAVA_Build 4 150852296 3D AAAGCAAAGG TCA/--- TTTGCTTACA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 TCA 1 0 220054 CASAVA_Build 4 150852762 1I CTCCAGGATT -/C CCAGGGTTCA 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 C 2 3 220055 CASAVA_Build 4 150881287 2I TCTTTCAATC --/AG AGAGGCTCAG 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 AG 2 3 220056 CASAVA_Build 4 150884091 1D AGTCCTATAC A/- TTCCCAGTTA 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 1 0 220057 CASAVA_Build 4 150900626 5I GGAAGGAAGG -----/AAGGA AAGGGAAGGG 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 AAGGA 0 1 220058 CASAVA_Build 4 150982647 1D GTCAGTGATT A/- AAAAAAAAAA 2315 het 2315 ref 38 19 6 15 A 15 14 220059 CASAVA_Build 4 151053897 1I TTGGTTTACA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 7 8 220060 CASAVA_Build 4 151062155 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAAAAC 2370 hom 12 het 5 0 5 0 A 10 9 220061 CASAVA_Build 4 151062552 1D TTGAATAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 44 1 34 10 A 15 14 220062 CASAVA_Build 4 151064331 1D ATAGTGAAAC G/- GGAAAGGTTC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 G 3 2 220063 CASAVA_Build 4 151070158 1I GGCTATGAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 A 9 10 220064 CASAVA_Build 4 151154961 1I TTTTAAAACA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 8 9 220065 CASAVA_Build 4 151156884 9D CCTGTCTTCT TCTGAGACC/--------- TCTGAGACCT 3070 hom 30 het 16 0 9 8 TCTGAGACC 2 1 220066 CASAVA_Build 4 151157813 1I GATTCCATTT -/G TGAAATTTAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 220067 CASAVA_Build 4 151158410 1I ATCTTCAGAG -/A AAGTAATAAG 3070 hom 117 het 46 0 38 8 A 2 3 220068 CASAVA_Build 4 151158645 1I ATACACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 38 1 25 12 A 10 11 220069 CASAVA_Build 4 151183603 1D CTGATTTTAA T/- TTTTTTTGTT 1687 het 1687 ref 21 13 5 3 T 8 7 220070 CASAVA_Build 4 151200397 1I TTGCACAACA -/T TGTGAATATA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 T 1 2 220071 CASAVA_Build 4 151209930 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1398 het 218 hom 12 1 11 0 A 11 10 220072 CASAVA_Build 4 151212083 1I ACTAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 42 0 36 6 A 11 12 220073 CASAVA_Build 4 151213900 1I CTTGGCACAT -/A AGTGAACAGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 220074 CASAVA_Build 4 151214755 1I TGTAACCACC -/A AAGAGAATTA 3070 hom 81 het 31 0 24 7 A 2 3 220075 CASAVA_Build 4 151215744 2I CATACGTGTG --/TA TGTGTGTGTC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TA 0 1 220076 CASAVA_Build 4 151216859 2D GATTTTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 35 2 17 16 T 16 14 220077 CASAVA_Build 4 151217914 2D GTGTGTATGC GT/-- GTGTGTGCGT 3070 hom 118 het 45 0 39 8 GT 4 3 220078 CASAVA_Build 4 151222122 1D ACAGCCAAAA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 8 7 220079 CASAVA_Build 4 151227109 2D22M2D ATTCTTTTTA TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGA/--TTTTTATTTTTTTTTTGAGACT-- GTCTCACTCT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 N/A 0 0 220080 CASAVA_Build 4 151228486 1I GGCTGGCTTT -/G GGGGGAAAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 5 6 220081 CASAVA_Build 4 151228631 1I GATGCTACTG -/A GGCCTTCATT 3070 hom 13 het 34 1 29 4 A 0 1 220082 CASAVA_Build 4 151228998 1D GGTCCTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 27 9 T 11 10 220083 CASAVA_Build 4 151229685 12I CAGATATTCC ------------/AAAATCTGAAAA AAAATCTGAA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 AAAATCTGAAAA 0 1 220084 CASAVA_Build 4 151237775 1D ATTTCTAGCC T/- TTTTTTTTTT 2694 het 1073 hom 33 5 13 16 T 17 16 220085 CASAVA_Build 4 151243556 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 119 het 56 0 41 16 TG 7 6 220086 CASAVA_Build 4 151243708 3D AGTATAAGTT GAG/--- GAGACATCCT 3070 hom 165 het 59 0 55 6 GAG 2 1 220087 CASAVA_Build 4 151244192 5D ATAGTTTCCA AAATT/----- AAATTTGTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 AAATT 2 1 220088 CASAVA_Build 4 151245378 1D AAATTACACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 29 1 22 6 A 10 9 220089 CASAVA_Build 4 151251069 1I ATGTTAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 35 1 27 7 T 10 11 220090 CASAVA_Build 4 151252174 1D TCCAGAAGAG C/- TTTTCCCTAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 1 0 220091 CASAVA_Build 4 151254052 1D TTGTTCAGGG T/- TTTCTGTTTC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 4 3 220092 CASAVA_Build 4 151254300 1D AGAACCAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 24 1 19 5 T 12 11 220093 CASAVA_Build 4 151258916 1D TTTACCAGAT A/- AAAAACCTGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 6 5 220094 CASAVA_Build 4 151266804 1I GATACGACAG -/A AAAATGTTTT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 A 4 5 220095 CASAVA_Build 4 151279277 4I GGACTCTTAT ----/TCTC TCTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 TC 1 3 220096 CASAVA_Build 4 151285816 1D ATGGTGACTC T/- TGACTTTCAC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 2 1 220097 CASAVA_Build 4 151288076 1D ATTATTTTGA T/- ATAAACAGGT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 1 0 220098 CASAVA_Build 4 151288262 1D ATTTGTATTG T/- AAAAACTGGG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 0 220099 CASAVA_Build 4 151288984 1D AATTCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 26 0 17 9 T 13 12 220100 CASAVA_Build 4 151292527 2D GCTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 166 het 76 hom 20 1 1 18 A 12 10 220101 CASAVA_Build 4 151294167 2D GTGCCACCAC AT/-- GCCTGGCTAA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 AT 1 0 220102 CASAVA_Build 4 151297770 3D TTCTCACCTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 28 0 16 13 T 15 12 220103 CASAVA_Build 4 151305401 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 10 9 220104 CASAVA_Build 4 151320555 1D GTTGATCCTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 44 0 38 7 A 9 8 220105 CASAVA_Build 4 151326316 1D ATTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 28 2 23 4 A 15 14 220106 CASAVA_Build 4 151329845 1I TTATTTGGCC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 9 220107 CASAVA_Build 4 151342407 1D AGAAAATACC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 45 0 36 10 A 10 9 220108 CASAVA_Build 4 151367434 1D AATAAGTTGA T/- TTTTCCCATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 5 4 220109 CASAVA_Build 4 151377710 1D TTAATAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 10 9 220110 CASAVA_Build 4 151377843 5D AACTATAATT ATATC/----- AGATTGTTCT 3070 hom 93 het 34 0 32 4 ATATC 1 0 220111 CASAVA_Build 4 151400442 1D TGCTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 542 hom 37 2 21 15 T 13 12 220112 CASAVA_Build 4 151405514 8D GGGGGTGCCC CAACAAAA/-------- CAACAGTGGC 3070 hom 81 het 27 0 28 1 CAACAAAA 1 0 220113 CASAVA_Build 4 151407119 3I CCAGATTTTT ---/CTC CTCTGTGTAG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 CTC 1 2 220114 CASAVA_Build 4 151408035 4D GAGTCAAAAA AAAC/---- AAACAACAAC 3070 hom 24 het 43 1 39 5 AAAC 2 1 220115 CASAVA_Build 4 151409613 6I AACAAAACAA ------/AAACTT AAGAGCTAAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AAACTT 0 1 220116 CASAVA_Build 4 151415945 1I GGCAAAAACT -/A GAAGCATTCC 3070 het 198 hom 13 1 12 0 A 0 1 220117 CASAVA_Build 4 151427232 1D AGAAACACCT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 38 het 19 0 13 6 A 9 8 220118 CASAVA_Build 4 151442199 1D TAAATGTTTT G/- AAAAAAAGGT 3070 hom 108 het 45 0 37 9 G 1 0 220119 CASAVA_Build 4 151442856 3D TTTCTATGAA ATT/--- ATTATTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 27 5 ATT 3 2 220120 CASAVA_Build 4 151445097 1I AAACTAATAT -/A AGTACTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 1 2 220121 CASAVA_Build 4 151446613 10D ATATTACCAC AAGCACTAGA/---------- ATATCCCTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 5 AAGCACTAGA 1 0 220122 CASAVA_Build 4 151447260 5I ATTTTTAAAG -----/ACAGT ACATTAGAAG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 ACAGT 0 1 220123 CASAVA_Build 4 151454443 4D ATATATAATG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 42 het 19 0 15 5 TA 11 9 220124 CASAVA_Build 4 151471387 5D ACCATATATG TGCAA/----- CAGGTGGAAC 3070 hom 93 het 35 0 30 8 TGCAA 1 0 220125 CASAVA_Build 4 151473265 1I AAAACATTTC -/T AAAAAAAGCT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 0 1 220126 CASAVA_Build 4 151475373 1I AAGACAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 9 10 220127 CASAVA_Build 4 151485459 2D TGCTGAAAAT TA/-- TGTTTTATGG 3070 hom 138 het 48 0 46 2 TA 1 0 220128 CASAVA_Build 4 151488548 4I TGTACAATGC ----/TGTA TGTAGCCTCT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TGTA 1 2 220129 CASAVA_Build 4 151500582 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 14 1 10 3 A 10 11 220130 CASAVA_Build 4 151510285 2I ACTTTTTGAC --/AT AGATTTTGCT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AT 0 1 220131 CASAVA_Build 4 151515686 1D GTAAGAGTAA G/- GGGGGGAATT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 G 7 6 220132 CASAVA_Build 4 151521424 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 11 10 220133 CASAVA_Build 4 151522357 31I AACTCAATGT -------------------------------/TTAACTTTTTGAGAAACTGCCAAGCTTTTCC AAAGAATGTG 3070 het 3070 ref 51 30 18 6 TTAACTTTTTGAGAAACTGCCAAGCTTTTCC 0 1 220134 CASAVA_Build 4 151527708 1I CACTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2607 het 2607 ref 23 11 7 5 T 10 11 220135 CASAVA_Build 4 151532464 1D TTCAGCTCAC A/- CCCTTCTAAC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 1 0 220136 CASAVA_Build 4 151539236 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1031 hom 21 4 12 5 T 11 12 220137 CASAVA_Build 4 151542729 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1864 het 1864 ref 37 15 7 15 A 19 18 220138 CASAVA_Build 4 151542871 1D GCAGTAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 12 11 220139 CASAVA_Build 4 151546494 1D TCATCTCTAT G/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 G 1 0 220140 CASAVA_Build 4 151554567 5I TTCATCTCTC -----/ACTTT AATCACAGAA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 ACTTT 0 1 220141 CASAVA_Build 4 151557237 1I CTGAACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 14 13 13 A 13 14 220142 CASAVA_Build 4 151557585 1D4M6I GTTACCAGTT GGACA------/-GATATATTAT AAATATGGAA 3070 het 3070 hom 45 20 23 3 N/A 0 0 220143 CASAVA_Build 4 151559502 1D GAGAGAGAAG C/- CAAACAGGCA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 C 2 1 220144 CASAVA_Build 4 151571596 1I AGAGAAGGGG -/A AAAAAATCAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 6 7 220145 CASAVA_Build 4 151572993 3I CACCTGAAAT ---/ATA ATGTGATAGC 3070 hom 75 het 26 0 25 1 ATA 0 1 220146 CASAVA_Build 4 151578120 3D TATATATATA TAT/--- TATAAAATTA 525 het 525 ref 13 4 3 7 TAT 2 1 220147 CASAVA_Build 4 151579941 1D CTAGCATCTG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 A 8 7 220148 CASAVA_Build 4 151581390 5D AAATAAAAAC TTAGA/----- TTAAAGTAGG 3070 het 3070 ref 40 22 16 4 TTAGA 1 0 220149 CASAVA_Build 4 151582385 6D CCATGTTATG TATTTA/------ TATTTAAAAC 3070 het 3070 hom 33 13 16 7 TATTTA 2 1 220150 CASAVA_Build 4 151606889 1D TAAATAAGAG A/- ACACACTCTT 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 A 2 1 220151 CASAVA_Build 4 151624091 1I20M1I TCTATTTCTC -TTTTTTCCTTTTTTTAAGTT-/TTTTTTTCCTTTTTTTAAGTTA AAAAAAATAG 3070 hom 86 het 29 0 29 2 N/A 0 0 220152 CASAVA_Build 4 151628203 2D AACATAAAAC AG/-- AAAGTTATAA 3070 het 3070 ref 32 14 15 4 AG 1 0 220153 CASAVA_Build 4 151629360 1I ATTTAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 21 7 A 10 11 220154 CASAVA_Build 4 151650171 1D ATAGAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 12 11 220155 CASAVA_Build 4 151657308 1D CAGAAACAAT A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 A 7 6 220156 CASAVA_Build 4 151669103 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 19 1 17 3 A 15 14 220157 CASAVA_Build 4 151702704 5I TTCAATTATT -----/TTATG TTATATTTGC 3070 hom 109 het 42 0 36 6 TTATG 0 1 220158 CASAVA_Build 4 151703411 1I TTTGAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 30 0 24 7 T 10 11 220159 CASAVA_Build 4 151716780 2D AAAAAAAAAA GG/-- AGGAGGGGAG 93 het 93 ref 22 7 2 14 G 2 0 220160 CASAVA_Build 4 151718023 1I TCATTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 11 12 220161 CASAVA_Build 4 151720898 1I TCCGAGATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 281 hom 45 1 38 6 T 9 10 220162 CASAVA_Build 4 151725075 1D TCCACCCCAT C/- CCCCCCCCCA 2324 hom 19 het 12 0 6 7 C 10 9 220163 CASAVA_Build 4 151735827 2D AGAAAACTGA CT/-- CTGTAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 CT 2 1 220164 CASAVA_Build 4 151742649 1I AATAAACGAC -/T CTGTAATACC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 0 1 220165 CASAVA_Build 4 151745007 1I GACTATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 695 hom 35 3 25 7 A 11 12 220166 CASAVA_Build 4 151761695 1I CCTTCTTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 11 12 220167 CASAVA_Build 4 151785015 1D TTAGTCAAGC A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 7 6 220168 CASAVA_Build 4 151798798 1D AAAATAGATT C/- CCCCCCTTCT 3070 hom 91 het 36 0 30 6 C 7 6 220169 CASAVA_Build 4 151818440 5I GAAAAAAGAA -----/AAGAG AAGAGAAAAG 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AAGAG 1 2 220170 CASAVA_Build 4 151824667 1D AGAATAATGG T/- TAAGAAATAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 2 1 220171 CASAVA_Build 4 151831282 1I TCCACATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 27 9 A 11 12 220172 CASAVA_Build 4 151848767 1D TATTAGAAAG A/- AAACACTAAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 4 3 220173 CASAVA_Build 4 151879955 1D ATGGAACATA T/- TAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 2 1 220174 CASAVA_Build 4 151881246 2I AAAGAATGGT --/AA AAAAAAAAAA 1093 het 1093 ref 36 11 5 20 A 16 18 220175 CASAVA_Build 4 151886032 4I AGATGAGCCT ----/TAAA TAAAGGGCAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TAAA 1 2 220176 CASAVA_Build 4 151909345 3I GAGGAAACCC ---/TCT TCTTCTGTGA 3070 hom 118 het 48 0 40 8 TCT 2 3 220177 CASAVA_Build 4 151911189 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 2801 hom 24 het 14 0 9 5 AC 11 9 220178 CASAVA_Build 4 151917382 7D ACTGCACTCC AGCCTGG/------- ATGACAAAGT 3070 hom 45 het 19 0 16 5 AGCCTGG 1 0 220179 CASAVA_Build 4 151923525 1D CAAGAACTGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 A 9 8 220180 CASAVA_Build 4 151946623 1D TTAATGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1219 hom 40 3 24 14 A 14 13 220181 CASAVA_Build 4 151951036 2D GACTTTCCTT TA/-- TATACCGGAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TA 3 2 220182 CASAVA_Build 4 151953764 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 575 het 102 hom 23 3 3 18 A 15 14 220183 CASAVA_Build 4 151970428 1D TTACATGTCT A/- AAAAAACCTC 3070 hom 99 het 41 0 33 9 A 7 6 220184 CASAVA_Build 4 152021123 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 596 hom 31 2 16 13 A 17 16 220185 CASAVA_Build 4 152024926 4I AGATATTAAA ----/AAAG AGAGAACCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAAG 0 1 220186 CASAVA_Build 4 152028371 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2304 het 85 hom 15 2 9 4 A 18 17 220187 CASAVA_Build 4 152039261 3I AAAAAATAAT ---/AAG AAGACTAGAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAG 1 2 220188 CASAVA_Build 4 152041909 1D AAAAAACAAA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 100 het 40 0 34 6 T 8 7 220189 CASAVA_Build 4 152065767 1D CCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 23 1 17 5 A 14 13 220190 CASAVA_Build 4 152074302 1D TACTTATTTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 34 0 26 9 A 8 7 220191 CASAVA_Build 4 152090368 2I GGCAAGGAAA --/CT CTCGTAAGTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CT 1 2 220192 CASAVA_Build 4 152102327 5D ACATAATATG AAATA/----- AAATAACTTT 3070 hom 99 het 34 0 34 2 AAATA 2 1 220193 CASAVA_Build 4 152103622 1D GCTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 1850 hom 12 het 5 0 5 0 A 11 10 220194 CASAVA_Build 4 152143300 1I AGATGATATT -/A AAAAAAAAAA 2463 het 2463 ref 24 12 6 6 A 11 12 220195 CASAVA_Build 4 152171777 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAC 1239 het 1239 ref 24 15 3 6 A 10 9 220196 CASAVA_Build 4 152194986 1I CCGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1757 het 1757 ref 35 16 7 12 A 15 16 220197 CASAVA_Build 4 152199111 13D CTAGCTACTC GGGAGGATGAGGT/------------- GGGAGGATCA 3070 hom 42 het 14 0 11 6 GGGAGGATGAGGT 1 0 220198 CASAVA_Build 4 152204478 4I TTTCTCATGG ----/GCTA TTAAATTGAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GCTA 0 1 220199 CASAVA_Build 4 152207484 4I CTTCACCCTT ----/AGTC AGTGGCAATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AGTC 0 1 220200 CASAVA_Build 4 152218680 3D GTATGAATGC TTA/--- TTTTCTTTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TTA 1 0 220201 CASAVA_Build 4 152221256 1I CAAAAAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 het 38 hom 13 1 12 0 C 0 1 220202 CASAVA_Build 4 152230262 1I AAAATAACTG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 7 8 220203 CASAVA_Build 4 152243079 2D TCACTGTAGA TG/-- TGTTCATACC 3070 hom 129 het 49 0 44 7 TG 2 1 220204 CASAVA_Build 4 152244111 2I GCCAGTACTC --/TG TAAATGATAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TG 0 1 220205 CASAVA_Build 4 152244724 5I AAGGAAATGG -----/CTTAT CTTATATCTG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 CTTAT 1 2 220206 CASAVA_Build 4 152245729 2D TCCCTTGTAT AC/-- TAGTATACAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 AC 1 0 220207 CASAVA_Build 4 152247972 1D GTCTGGAACT C/- CTGGCCTCAA 3070 hom 135 het 49 0 45 5 C 2 1 220208 CASAVA_Build 4 152249247 5D TTTTTAAAAA TAACT/----- TAAAGCATTG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TAACT 1 0 220209 CASAVA_Build 4 152249336 1D GTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 17 4 T 12 11 220210 CASAVA_Build 4 152262038 4D TTCTTTAGAC TAAG/---- TAAGATACAT 3070 hom 126 het 49 0 43 9 TAAG 2 1 220211 CASAVA_Build 4 152266540 1I CATTTAATAC -/A AAAAAGATGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 5 6 220212 CASAVA_Build 4 152271901 1D ACTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 49 het 33 1 29 3 T 10 9 220213 CASAVA_Build 4 152277185 3I AGTGCCTTCT ---/TGA TGAATTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TGA 1 2 220214 CASAVA_Build 4 152288857 16D GTCCTGTCTT ACACACACACACACAC/---------------- ACACACACAC 3070 hom 83 het 36 0 26 14 AC 17 9 220215 CASAVA_Build 4 152294202 1I GTAATTGTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 T 8 9 220216 CASAVA_Build 4 152294555 4I ACATAATAAT ----/ACTA ACTATTTCTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 ACTA 1 2 220217 CASAVA_Build 4 152308778 21D GGTTTATTAG AAGGTGAGAAGTATATTGAAA/--------------------- AAGGTGAGAA 3070 hom 63 het 34 0 22 18 AAGGTGAGAAGTATATTGAAA 2 1 220218 CASAVA_Build 4 152309004 2I AGCATTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 35 1 29 5 TC 0 1 220219 CASAVA_Build 4 152320132 1D TAATATCCTT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 8 7 220220 CASAVA_Build 4 152325197 11D CTTCCTCTCT CTGCTAGGGCC/----------- CTGTTTCACC 3070 hom 116 het 41 0 38 5 CTGCTAGGGCC 1 0 220221 CASAVA_Build 4 152335348 3D GATGATTTCT TCA/--- TTTTTCGTCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TCA 1 0 220222 CASAVA_Build 4 152338358 2I AATAAAACTA --/CT ATAAGGGATA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 CT 0 1 220223 CASAVA_Build 4 152345166 5D ATCTCACTTT CAAAA/----- CAAAACATAT 3070 hom 93 het 37 0 32 10 CAAAA 2 1 220224 CASAVA_Build 4 152352180 1I TCTGTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1179 hom 37 5 23 9 A 15 16 220225 CASAVA_Build 4 152361947 1D TATTTTCTTC T/- TTCTGCTCTG 3070 hom 81 het 30 0 27 5 T 3 2 220226 CASAVA_Build 4 152369142 4I CTTACATTTT ----/AAAC AAAGTAATTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAAC 0 1 220227 CASAVA_Build 4 152369459 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 22 0 15 7 T 11 12 220228 CASAVA_Build 4 152372982 1I TAGGCCTCAG -/A AAAATTATAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 4 5 220229 CASAVA_Build 4 152378145 4I GTTTTGAGTT ----/CTTG CTTCACTACT 3070 hom 120 het 41 0 41 0 CTTG 0 1 220230 CASAVA_Build 4 152380713 1I CCAAAAGAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 9 220231 CASAVA_Build 4 152381724 2D TGATCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 13 11 220232 CASAVA_Build 4 152388717 4D AATGTTTTAC TTTT/---- TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 12 8 220233 CASAVA_Build 4 152391779 4D AACCCATTTG TTCT/---- TTCTTTTTCT 3070 hom 91 het 35 0 30 5 TTCT 2 1 220234 CASAVA_Build 4 152393023 1D TCCTCCTTGA T/- ACACTTTCTC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 1 0 220235 CASAVA_Build 4 152404393 18D GCTACAGTTT TTGTTGTTGTTGTTGTTG/------------------ TTGTTGTTGT 3070 hom 61 het 28 0 20 12 TTG 10 4 220236 CASAVA_Build 4 152421728 4D GGCTGTGCAG CAGC/---- CCAGATTAGA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 CAGC 1 0 220237 CASAVA_Build 4 152428655 1I ATGGAAAAAA -/C ATTTGACAAA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 C 0 1 220238 CASAVA_Build 4 152439060 2I TTACAGGCGT --/GA GAGCCACCGC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 GA 1 2 220239 CASAVA_Build 4 152456391 1D CCATTTCTAC A/- AAAAAAAAGG 1268 het 1268 ref 37 30 3 4 A 9 8 220240 CASAVA_Build 4 152465727 3D CTGAGAGTTA AAG/--- AAGCCGGTCC 1600 het 1061 hom 10 3 5 2 AAG 2 1 220241 CASAVA_Build 4 152581926 1D TCCTTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 1211 het 1211 ref 45 37 3 6 T 13 12 220242 CASAVA_Build 4 152623314 1D TATGTTATAC T/- TTTTTTTTTT 1044 het 1044 ref 41 32 3 6 T 12 11 220243 CASAVA_Build 4 152841526 1D TTTGAGAACG C/- AACATCCTGC 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 C 1 0 220244 CASAVA_Build 4 152946005 6I ACGGTTATGA ------/TTATGG TTATGGTTAT 3070 hom 88 het 43 0 30 13 TTATGG 2 3 220245 CASAVA_Build 4 152948462 1I GGTGGTTCCC -/A GGGGATAGGA 3070 hom 56 het 21 0 19 2 A 0 1 220246 CASAVA_Build 4 152952568 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2720 het 219 hom 15 1 9 6 T 14 13 220247 CASAVA_Build 4 152968166 1D ACAATTTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 277 hom 53 1 48 4 A 10 9 220248 CASAVA_Build 4 152982385 1D GCCAAGCCTT C/- CCACCAGCCA 3070 hom 52 het 22 0 16 6 C 3 2 220249 CASAVA_Build 4 152984479 8D CGTGCTCCAT AGGATCAG/-------- AGGATCAGAG 3070 het 3070 ref 45 18 16 19 AGGATCAG 3 2 220250 CASAVA_Build 4 152986017 1D CAAAAGGGAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 41 21 13 8 T 8 7 220251 CASAVA_Build 4 152988247 1D AAGTCAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 13 11 A 15 14 220252 CASAVA_Build 4 152996272 1D AAACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 2691 het 2691 ref 22 9 8 5 A 13 12 220253 CASAVA_Build 4 153006664 1D TTCTTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 38 1 19 18 A 15 14 220254 CASAVA_Build 4 153007036 5I GTCATTGAAG -----/GGAGA GATCGTGACC 3070 hom 138 het 53 0 45 8 GGAGA 0 1 220255 CASAVA_Build 4 153025629 1D AGGTGGTGTG T/- TAGGTACTGA 3070 het 3070 ref 38 19 11 10 T 2 1 220256 CASAVA_Build 4 153025881 1D TTTCTTGTAA C/- TTGGATGAGA 3070 het 3070 ref 44 19 16 10 C 1 0 220257 CASAVA_Build 4 153027351 3D ATATCATATG TTA/--- TTATAATATA 3070 hom 27 het 10 0 10 1 TTA 2 1 220258 CASAVA_Build 4 153033629 4I AAAAAAGAGA ----/AAGG AACAGGGTTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AAGG 0 1 220259 CASAVA_Build 4 153035546 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 18 3 A 11 10 220260 CASAVA_Build 4 153038400 1D TATTCTCTTT C/- CCGGGTGAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 8 C 3 2 220261 CASAVA_Build 4 153042918 2I TTTATTTATT --/TA TTTTTTTATC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TA 0 1 220262 CASAVA_Build 4 153043573 1D TTTTGCCATT A/- TTTTTTTGAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 1 0 220263 CASAVA_Build 4 153045217 1D CTCACTCCCC T/- GTTCAAGAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 0 220264 CASAVA_Build 4 153047582 7I ATAAAAAAAA -------/AAAAAAG AAAAAAGTAT 3070 hom 61 het 24 0 20 6 AAAAAAG 1 2 220265 CASAVA_Build 4 153048218 1D TCCATTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 34 1 30 3 A 11 10 220266 CASAVA_Build 4 153074195 1I GTTTGAGATA -/G GGTCTCACTC 3070 hom 102 het 35 0 34 1 G 2 3 220267 CASAVA_Build 4 153076285 1I TTGTTGAACA -/G GCAACATGCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 220268 CASAVA_Build 4 153080322 2D GAACAAACAC AT/-- GTTTGATTCA 3070 het 3070 ref 51 30 18 3 AT 1 0 220269 CASAVA_Build 4 153096056 2D CGGCTCATCG CA/-- ACCTCCGCCT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 CA 1 0 220270 CASAVA_Build 4 153097879 1I CCAGCCCCCC -/T GGGCTTTGTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 0 1 220271 CASAVA_Build 4 153105851 1I CTTCCCTTTG -/C CCCGCCAGGT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 C 3 4 220272 CASAVA_Build 4 153127847 4I CCAGGCTTGT ----/TAGA TAAGGCAGAT 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 TAGA 0 1 220273 CASAVA_Build 4 153145669 1I CAGTCTCTAC -/A ATGTGATTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 1 2 220274 CASAVA_Build 4 153145782 1D GAAAACAGCA G/- AGCCCCGACC 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 G 1 0 220275 CASAVA_Build 4 153155998 24I TTCCTCACTC ------------------------/GAGGATGCACACACAGTCAAACCT TAGGACCAAC 3070 het 3070 hom 44 15 24 7 GAGGATGCACACACAGTCAAACCT 0 1 220276 CASAVA_Build 4 153176389 3I TTTGCAAGTG ---/CCC CCCTGCATGG 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 C 3 6 220277 CASAVA_Build 4 153180989 3D TGTTTTCGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 2221 het 64 hom 28 2 11 15 T 19 16 220278 CASAVA_Build 4 153183913 2D TTTTTCAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 6 A 12 10 220279 CASAVA_Build 4 153184588 2D GATGCCCCAC TT/-- TGGGGACCTT 3070 hom 57 het 21 0 17 4 T 3 1 220280 CASAVA_Build 4 153194418 1D GAACTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 7 hom 36 1 27 8 T 10 9 220281 CASAVA_Build 4 153195263 1D GATAGCACAC T/- TTTTTATTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 6 5 220282 CASAVA_Build 4 153198367 1D ATTTATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 11 10 220283 CASAVA_Build 4 153200061 1D GTGAGGTGTC A/- GGGGGAAGGA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 1 0 220284 CASAVA_Build 4 153223226 4D GTGGGGTCCC GGGA/---- GGGAGTGGGA 3070 hom 112 het 43 0 35 12 GGGA 2 1 220285 CASAVA_Build 4 153229441 1I TTAACTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 10 11 220286 CASAVA_Build 4 153229742 1D ATATCAGAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 34 0 25 9 A 10 9 220287 CASAVA_Build 4 153233530 1D GTGAGTGCAT G/- AAATACTGCT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 G 1 0 220288 CASAVA_Build 4 153242530 1I TAAAATGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 27 2 18 7 A 14 15 220289 CASAVA_Build 4 153272130 1D CTCGAGTTGA T/- TTTTTCCTGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 6 5 220290 CASAVA_Build 4 153272715 1I TCTTGCCTGT -/C ATATAACAGT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 0 1 220291 CASAVA_Build 4 153298709 1D AAGGTGCAGC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 85 het 33 0 29 4 T 8 7 220292 CASAVA_Build 4 153309205 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2749 hom 24 8 11 6 A 11 10 220293 CASAVA_Build 4 153317344 3I TCTTTTCTTT ---/TCC TTTTTTCTTT 3070 het 93 hom 25 3 10 12 TCC 0 1 220294 CASAVA_Build 4 153330838 2D TACTTTATTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 35 0 22 16 TG 10 9 220295 CASAVA_Build 4 153361415 1I GAAGAAAATA -/G AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 G 0 1 220296 CASAVA_Build 4 153365428 1D GCTTAAAGTC T/- TTTCTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 T 4 3 220297 CASAVA_Build 4 153376067 1I GTGACAAACT -/A AAAAAAAAAT 1913 het 1913 ref 31 20 6 5 A 9 10 220298 CASAVA_Build 4 153379555 1D GGCTTGAAGT G/- GTCCCTTATG 3070 het 3070 ref 51 19 19 13 G 2 1 220299 CASAVA_Build 4 153384558 1D GACACTAGCC G/- TGTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 G 1 0 220300 CASAVA_Build 4 153452579 1D CTAGTATACT A/- TGTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 A 1 0 220301 CASAVA_Build 4 153488814 3D TACAGAAAAG TCT/--- TCTTATCTAC 3070 hom 54 het 22 0 19 4 TCT 2 1 220302 CASAVA_Build 4 153497016 4D TATTAGTTCT TTTC/---- TTTACCTTGC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 TTTC 1 0 220303 CASAVA_Build 4 153672175 1D GTTTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2012 het 2012 ref 40 26 7 7 A 15 14 220304 CASAVA_Build 4 153760032 15I CAAATCCCTT ---------------/ATTTGAGAAGAACAA ATCCCACTTG 3070 hom 138 het 48 0 47 2 ATTTGAGAAGAACAA 0 1 220305 CASAVA_Build 4 153761131 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 10 220306 CASAVA_Build 4 153765702 2D AGGCCTTTTT TC/-- AGAGATGGTG 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 TC 1 0 220307 CASAVA_Build 4 153785726 1D GTCTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 34 0 23 11 T 11 10 220308 CASAVA_Build 4 153787822 1I TGCTTCTAAC -/T TTCCCAGGGG 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 2 3 220309 CASAVA_Build 4 153792753 1D TATTGAAAAC A/- TTTGAAATAT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 1 0 220310 CASAVA_Build 4 153794642 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 10 11 220311 CASAVA_Build 4 153799420 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 15 9 A 12 11 220312 CASAVA_Build 4 153800789 15D TAAAATGATT CTGCTTGGAGAACTA/--------------- CTGCAGCCAG 3070 hom 72 het 24 0 25 3 CTGCTTGGAGAACTA 1 0 220313 CASAVA_Build 4 153803207 1I GCTCAAGGGA -/T TTTCCCCCAA 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 3 4 220314 CASAVA_Build 4 153814930 1D AGAAAAAAAA G/- TCACTGAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 0 220315 CASAVA_Build 4 153815896 1I AGGAATAAAT -/A AACACAAGGG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 2 3 220316 CASAVA_Build 4 153820139 1I GAAGCTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 9 10 220317 CASAVA_Build 4 153823720 1I GTCGTTTCAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 252 hom 27 1 22 4 A 8 9 220318 CASAVA_Build 4 153827340 22D GTGAAATCAG GGCAGGAGGAAGGAAATAAACA/---------------------- GGCAAATACA 3070 hom 120 het 38 0 39 10 GGCAGGAGGAAGGAAATAAACA 1 0 220319 CASAVA_Build 4 153829873 4D CCCGACTAAT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 66 het 33 0 21 12 TG 11 9 220320 CASAVA_Build 4 153835227 1D CCACTCCCCT G/- GCCCCATGTC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 2 1 220321 CASAVA_Build 4 153841468 1I CACAAGCCAC -/A AAAACCAGCA 1254 hom 12 het 7 0 5 2 A 4 5 220322 CASAVA_Build 4 153851827 1D TCAGGGGCTC T/- TTTTTGCTGT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 6 5 220323 CASAVA_Build 4 153856090 1I GGCCTCCCAG -/T TATGCTTCCT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 1 2 220324 CASAVA_Build 4 153864894 1D TTTTTTTTTT A/- TTTTTTTGAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 1 0 220325 CASAVA_Build 4 153865874 1I TTTGTGAACT -/C AGAGCGAGAA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 0 1 220326 CASAVA_Build 4 153866118 14D TTTCTTCTTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 24 2 14 8 T 25 11 220327 CASAVA_Build 4 153867637 1I ACCTGGCGAA -/T TTTTTTTTTG 1733 het 348 hom 12 3 6 3 T 9 10 220328 CASAVA_Build 4 153867854 1D AAATCTTTTT C/- TTTTTTCCCA 3070 het 1657 hom 30 6 20 6 C 1 0 220329 CASAVA_Build 4 153871724 14D TACATGTTAA CAAGATCACTCTGG/-------------- CAGATTTTTG 3070 het 3070 ref 45 29 14 7 CAAGATCACTCTGG 1 0 220330 CASAVA_Build 4 153889700 5I ATATGAACTT -----/TAAAG TAGTTTTTTC 1936 het 1936 ref 13 8 5 0 TAAAG 0 1 220331 CASAVA_Build 4 153917758 2I TCAGGTATAT --/AA AAGAGAGTGC 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 A 2 4 220332 CASAVA_Build 4 153933915 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1425 het 1076 hom 7 3 3 1 A 13 12 220333 CASAVA_Build 4 153938849 1D TGGGCGACAG A/- GCGAGACACC 3070 het 2466 hom 22 7 11 4 A 1 0 220334 CASAVA_Build 4 153939822 6D TAATGAATAG ATATAC/------ ATATGATTAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 7 ATATAC 1 0 220335 CASAVA_Build 4 153943225 2D TGTAAATGTG TT/-- TTAGAAAATA 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 T 4 2 220336 CASAVA_Build 4 153947403 2D TGTGCCTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 36 0 29 7 T 12 10 220337 CASAVA_Build 4 153952501 1D TAATTAATGG T/- TAGTAAATGA 3070 hom 99 het 40 0 37 3 T 2 1 220338 CASAVA_Build 4 153954700 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 25 1 18 7 T 18 17 220339 CASAVA_Build 4 153963929 1D AATCATACAA C/- CCCTCAAGCT 3070 het 3070 ref 34 18 12 7 C 4 3 220340 CASAVA_Build 4 153974529 3D GTAATTTATA AAG/--- AAGAATTTTG 3070 het 3070 ref 44 30 14 0 AAG 2 1 220341 CASAVA_Build 4 153987219 2D CATTTAACTC CA/-- AATTCATTTT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 CA 1 0 220342 CASAVA_Build 4 153987525 1D GAAATTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 34 2 22 10 T 12 11 220343 CASAVA_Build 4 153989256 3D ACCAGTCACA TGT/--- TGTAACTTAT 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 TGT 2 1 220344 CASAVA_Build 4 154012940 1D TGTGGGAACC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 7 6 220345 CASAVA_Build 4 154019640 1I TTCAGTTCAA -/C GTTTCTCTTG 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 C 0 1 220346 CASAVA_Build 4 154020953 1D CATCTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1147 hom 14 4 8 2 A 15 14 220347 CASAVA_Build 4 154034872 1D AAAAATACAC T/- AAAGGTTTGG 3070 het 3070 hom 27 9 12 7 T 1 0 220348 CASAVA_Build 4 154047959 4I CTTTTTTAAT ----/AAAC AAAAGAATGT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 AAAC 0 1 220349 CASAVA_Build 4 154056744 1D ATCACAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 A 10 9 220350 CASAVA_Build 4 154057173 3D TTTTCATAAT AAC/--- ATTAAAAAAA 2918 het 2918 ref 21 12 7 3 AAC 1 0 220351 CASAVA_Build 4 154058286 1D AGTGAGTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 10 9 220352 CASAVA_Build 4 154072824 1D TGTCTCTATT A/- AAAAAAAATT 2728 het 2728 ref 21 14 7 0 A 9 8 220353 CASAVA_Build 4 154073004 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2771 hom 27 8 12 7 A 13 14 220354 CASAVA_Build 4 154076433 2I GCGTGTGCGG --/GT GTGTGTGTGT 2787 het 15 hom 24 2 12 10 GT 8 9 220355 CASAVA_Build 4 154099103 1I AATCCATACA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 8 9 220356 CASAVA_Build 4 154100544 7I GCAATCTTAA -------/CATCGGT CGTCCCGTTG 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 CATCGGT 0 1 220357 CASAVA_Build 4 154101849 2I TCGTGGCCTC --/TG TTGGTGGCTG 3070 hom 95 het 37 0 24 13 TG 0 1 220358 CASAVA_Build 4 154114996 3D AGGATCGGAT AAA/--- AACTGTAGAC 3070 hom 100 het 38 0 33 5 A 5 2 220359 CASAVA_Build 4 154117583 2D GCACCCCACC CT/-- CCCCCAAAGC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 CT 1 0 220360 CASAVA_Build 4 154119161 1D TTGAAAACAT G/- GGACTTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 3 2 220361 CASAVA_Build 4 154123957 4D GGGCCAGGCA GGCC/---- GGCCGGCATC 3070 hom 80 het 31 0 21 10 GGCC 2 1 220362 CASAVA_Build 4 154146602 1D CTCTCCATGG T/- TTCCAGACAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 3 2 220363 CASAVA_Build 4 154203312 1D CCAGAACAGA C/- CCCCCCCTCC 2860 het 2833 hom 23 10 8 6 C 8 7 220364 CASAVA_Build 4 154206207 1D GTCTGGAGAT C/- CTGGTACCCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 2 1 220365 CASAVA_Build 4 154238155 2D CTTCAAAAAC AT/-- ATGTTTTTTG 3070 hom 93 het 38 0 32 7 AT 2 1 220366 CASAVA_Build 4 154260519 1I TCACAGGACT -/G GGGCTAATCA 3070 het 3070 ref 54 23 20 11 G 3 4 220367 CASAVA_Build 4 154263108 1D GTAAAGAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 26 0 19 7 T 11 10 220368 CASAVA_Build 4 154268924 4I TAAAAAGGTA ----/TGAC TTTCTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 TGAC 0 1 220369 CASAVA_Build 4 154272758 1I GCTATGTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 9 10 220370 CASAVA_Build 4 154275232 1I GAGTATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 10 11 220371 CASAVA_Build 4 154285181 4D CTTAAACTGC TGAA/---- TGAAGTATTT 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 TGAA 2 1 220372 CASAVA_Build 4 154286899 1D CCTGTATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 9 9 T 13 12 220373 CASAVA_Build 4 154290338 1I GCAGAGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 12 8 A 11 12 220374 CASAVA_Build 4 154312250 4D TGGAAAAAAA AGAT/---- AGTACGTCCT 3070 het 3070 hom 31 13 18 3 AGAT 1 0 220375 CASAVA_Build 4 154312744 1I ATGATAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1754 hom 24 5 13 6 T 13 14 220376 CASAVA_Build 4 154315615 6D TTTTGTTTTG TTTTGT/------ TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 TTTTGT 1 0 220377 CASAVA_Build 4 154317096 3D GCAAAATGTT AAC/--- AACAGGTAAA 3070 het 3070 ref 30 17 7 9 AAC 2 1 220378 CASAVA_Build 4 154359597 1D CTTGTCCTGA C/- CCCCCCCATT 3070 hom 86 het 31 0 29 2 C 8 7 220379 CASAVA_Build 4 154360885 1I AAGCTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1403 hom 42 3 30 9 A 10 11 220380 CASAVA_Build 4 154362411 4I CGAGGAAGGA ----/AGGG AGGGAGGGAG 3070 hom 48 het 27 0 17 10 AGGG 3 4 220381 CASAVA_Build 4 154377987 2I GCATACTAAT --/AA AAAAAGAGTC 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 5 7 220382 CASAVA_Build 4 154392536 6D CACGCCACTG CACTCC/------ CACTCCAGCT 2493 het 2493 ref 29 17 8 5 CACTCC 2 1 220383 CASAVA_Build 4 154405941 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 1994 hom 29 10 14 5 T 9 8 220384 CASAVA_Build 4 154408975 1I TATCAATTTT -/G TTTCAGAGTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 220385 CASAVA_Build 4 154417024 1D GTGTAATAAA T/- TTATGGATAC 3070 het 3070 hom 46 15 25 6 T 3 2 220386 CASAVA_Build 4 154419400 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1335 hom 24 5 11 8 A 17 18 220387 CASAVA_Build 4 154420069 11D ATTTAATCAA TAGAAAATAAT/----------- AGAAATAATA 1042 het 1042 ref 30 20 5 11 TAGAAAATAAT 1 0 220388 CASAVA_Build 4 154423557 1D ACCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 23 7 14 2 T 10 9 220389 CASAVA_Build 4 154434730 1I CTGAAGAGAC -/A AAAATCTCTT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 4 5 220390 CASAVA_Build 4 154452286 1D TTAATTGGTC T/- TCATTTCCTC 3070 het 2201 hom 20 6 11 3 T 2 1 220391 CASAVA_Build 4 154461445 1I ACCTTGGCCA -/C ACTGGTCTCG 3070 het 1247 hom 17 4 10 3 C 0 1 220392 CASAVA_Build 4 154468777 1I ATTCTTGAAA -/T TTAGCAATTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 220393 CASAVA_Build 4 154475874 1I ACAGACACTT -/A AAAAAACTAG 3070 hom 51 het 27 0 17 10 A 6 7 220394 CASAVA_Build 4 154480218 1D CTTACCAACC T/- TTTTTTTTTT 1363 het 1363 ref 40 26 4 11 T 16 15 220395 CASAVA_Build 4 154485027 1D AGATGTCCTT A/- AAAAAAAAAA 2950 het 2950 ref 30 13 7 10 A 12 11 220396 CASAVA_Build 4 154486561 4D CTTTTACCTA ATCT/---- ATCTCTCTAC 3070 het 1022 hom 27 3 21 3 ATCT 2 1 220397 CASAVA_Build 4 154492643 1I GAAACCTTTT -/A AAAAACACAG 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 5 6 220398 CASAVA_Build 4 154494747 1I TCTAGACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 10 11 220399 CASAVA_Build 4 154495766 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 34 0 23 11 A 10 9 220400 CASAVA_Build 4 154502444 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 1175 hom 16 7 8 1 A 10 8 220401 CASAVA_Build 4 154506572 2I AAAAATTTAT --/TC TCTCACAGCT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 TC 2 3 220402 CASAVA_Build 4 154509412 1I TGTAGCCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 A 9 10 220403 CASAVA_Build 4 154520572 2D TACAGTGATC TA/-- TGATTGTTCC 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 TA 1 0 220404 CASAVA_Build 4 154520683 3I AAATGGTCTG ---/TTA TGGTATCATT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TTA 0 1 220405 CASAVA_Build 4 154530633 1D GCCCTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 2023 het 2023 ref 32 10 7 15 T 15 14 220406 CASAVA_Build 4 154537514 1I TCTGTAACAT -/A ACAACGACAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 1 2 220407 CASAVA_Build 4 154538256 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2137 het 1907 hom 15 6 5 4 A 10 11 220408 CASAVA_Build 4 154538533 3D GACATAAAAT ATA/--- AGGTTAGAGA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 ATA 1 0 220409 CASAVA_Build 4 154541350 2I ATAAAATTCA --/TT TTATGTCTGG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 2 4 220410 CASAVA_Build 4 154546144 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2139 hom 18 8 9 1 A 12 11 220411 CASAVA_Build 4 154554888 2D ATTTAAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2474 hom 19 8 8 3 T 13 11 220412 CASAVA_Build 4 154556077 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 12 13 220413 CASAVA_Build 4 154559251 1D ACACAGGCTT A/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 A 1 0 220414 CASAVA_Build 4 154560992 1D CTTTTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 12 11 220415 CASAVA_Build 4 154562918 1I TCTTCTCCTC -/T TTAAAAAAAA 2526 het 2526 ref 32 14 10 8 T 2 3 220416 CASAVA_Build 4 154574903 1I CTAAACCAAA -/T TTATGGGTCT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 2 3 220417 CASAVA_Build 4 154586720 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1796 hom 25 5 10 10 A 15 16 220418 CASAVA_Build 4 154586777 3D ATAATATATA CTT/--- CTTCTTCAAA 3070 het 3070 hom 31 10 13 9 CTT 3 2 220419 CASAVA_Build 4 154589688 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 T 11 10 220420 CASAVA_Build 4 154600774 1I TTGATTGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 T 10 11 220421 CASAVA_Build 4 154605560 1D AAAGTGTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 44 0 34 11 T 11 10 220422 CASAVA_Build 4 154605666 2D AATGCAGACA GT/-- GTGTGAGACT 3070 hom 156 het 55 0 51 5 GT 3 2 220423 CASAVA_Build 4 154609068 2I AATAATATAC --/AT ATGTGTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 AT 1 2 220424 CASAVA_Build 4 154622926 1I TGTAAAGTAA -/T TTTTTTTGAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 220425 CASAVA_Build 4 154628603 4I GTGTATGTAT ----/GAGA GAGAGACAAG 3070 hom 143 het 53 0 44 9 GA 3 5 220426 CASAVA_Build 4 154632775 1D AGCTAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 13 12 220427 CASAVA_Build 4 154633365 1D AAATTTAGGT G/- TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 1 0 220428 CASAVA_Build 4 154637463 1D CTATGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1043 het 1043 ref 24 16 3 5 T 12 11 220429 CASAVA_Build 4 154640032 1D ATCTTTATGA T/- TTTTTTTTTT 1766 het 768 hom 17 4 4 9 T 17 16 220430 CASAVA_Build 4 154643576 1I CAGGGTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 36 1 29 6 T 10 11 220431 CASAVA_Build 4 154649800 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 2698 hom 22 10 8 4 A 8 7 220432 CASAVA_Build 4 154649968 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 5 A 12 11 220433 CASAVA_Build 4 154652693 3D TTTCCAACTC TTT/--- TGAAAGAGTT 3070 het 3070 hom 44 21 22 3 T 4 1 220434 CASAVA_Build 4 154658073 1D ATAGTGTGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 9 8 220435 CASAVA_Build 4 154659137 2I CACAAAATCA --/CC CTGGAGAGAA 3070 het 3070 hom 56 20 34 2 C 1 3 220436 CASAVA_Build 4 154662465 2D GTTTTCTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 44 3 24 17 T 16 14 220437 CASAVA_Build 4 154664734 2D TTCACTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 2207 het 742 hom 33 5 8 21 T 20 18 220438 CASAVA_Build 4 154667870 1D AAATCTTCAG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 8 7 220439 CASAVA_Build 4 154680734 1D29M1I ACAAAAAAAC AAAAAAAAAAACCCCAAAACAAAAAACATC-/-AAAAAAAAAACCCCAAAACAAAAAACATCT TGTCAGTTCA 3070 het 3070 ref 25 18 13 6 N/A 0 0 220440 CASAVA_Build 4 154683002 3I CAAGGGCCAC ---/GTT GTTGCAGAGA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 GTT 1 2 220441 CASAVA_Build 4 154688630 1I GTTTTTTTTT -/C TTCTTCTTCT 3070 het 2576 hom 25 9 11 5 C 0 1 220442 CASAVA_Build 4 154691962 2D GAACTTGGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2536 hom 31 11 12 8 T 16 14 220443 CASAVA_Build 4 154693547 1D TATTTTTTGT G/- TTTTTTTTTT 1746 het 1746 ref 31 14 8 9 G 1 0 220444 CASAVA_Build 4 154694060 1I TGCTGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 14 15 220445 CASAVA_Build 4 154697115 1D TTATGTACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 10 9 220446 CASAVA_Build 4 154697451 5I TAATACTGAT -----/AAATC AAGGGTGCAC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 AAATC 0 1 220447 CASAVA_Build 4 154731435 3I TGACATGTTC ---/TGT TGTTGTTTGA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 TGT 2 3 220448 CASAVA_Build 4 154734846 1D TTAAAAAAAA T/- CTTCTCTTAC 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 1 0 220449 CASAVA_Build 4 154736053 8D AATAAAAATG AATCAAAT/-------- AATCAAATAC 3070 het 3070 hom 38 12 22 5 AATCAAAT 2 1 220450 CASAVA_Build 4 154736327 4I AAAAAAAAAA ----/AAAC AAAAACACGA 3070 het 2630 hom 33 12 13 8 AAAC 0 1 220451 CASAVA_Build 4 154738658 3I TAGATACATG ---/TTA TTATTTATGG 2909 het 2909 ref 35 23 7 5 TTA 1 2 220452 CASAVA_Build 4 154738846 1D ATTTCTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 T 11 10 220453 CASAVA_Build 4 154739655 2I ATTTATGAAC --/AA AAGAGTTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 A 2 4 220454 CASAVA_Build 4 154743064 3D TTGTAGGAGT ATG/--- ATGTGTTGTC 3070 het 3070 hom 52 21 24 8 ATG 2 1 220455 CASAVA_Build 4 154752620 1I ATATTGGTGT -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 64 het 29 0 17 12 C 8 9 220456 CASAVA_Build 4 154755319 1D GATCATTCTC A/- ATGTTTTGGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 1 220457 CASAVA_Build 4 154764503 1I CCATATTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 12 13 220458 CASAVA_Build 4 154764731 1I TAATTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 19 1 11 7 T 10 11 220459 CASAVA_Build 4 154769251 1I GTTTTCAATT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 7 8 220460 CASAVA_Build 4 154773634 4D AACATGAAAT AAAA/---- GAAAGAAAGC 3070 het 3070 ref 34 14 14 8 A 4 0 220461 CASAVA_Build 4 154773817 4D GTATTTATTC GTTT/---- GTTTATTTAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 GTTT 2 1 220462 CASAVA_Build 4 154773993 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 981 het 917 hom 18 7 4 7 T 19 18 220463 CASAVA_Build 4 154776834 2D20M1D TATTCGCTGA TGTGTATTCACCTTTCTAAGGCT/--TGTATTCACCTTTCTAAGGC- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 15 22 7 N/A 0 0 220464 CASAVA_Build 4 154778343 2D TTGTAAGCTT GG/-- GGGGCTGCCC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 G 6 4 220465 CASAVA_Build 4 154783980 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 A 7 6 220466 CASAVA_Build 4 154784857 4D CTCAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 180 het 180 ref 29 19 3 9 AAAG 1 0 220467 CASAVA_Build 4 154791892 2D AGCAAGAGCC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 107 het 47 0 35 13 AG 7 6 220468 CASAVA_Build 4 154815690 1D CATGTTAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 86 het 35 0 30 5 T 10 9 220469 CASAVA_Build 4 154820257 9D TGTGCCCTGT TCCTGCTGA/--------- TCCTGCCCAT 3070 het 3070 ref 42 17 17 11 TCCTGCTGA 1 0 220470 CASAVA_Build 4 154821201 2I GTGGAAGACA --/GT GTGGTGATTC 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 GT 1 2 220471 CASAVA_Build 4 154828199 1I AACTTAGGAG -/T CTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 0 1 220472 CASAVA_Build 4 154837466 1D GCCCATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 11 10 220473 CASAVA_Build 4 154842373 1I CCATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 8 13 A 11 12 220474 CASAVA_Build 4 154856666 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1636 hom 15 6 9 2 A 23 10 220475 CASAVA_Build 4 154863167 2I TCTGCCTCCC --/AA AAGTAGCTGG 3070 het 3070 hom 19 10 8 1 A 2 4 220476 CASAVA_Build 4 154863370 1D TTAATAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 12 11 220477 CASAVA_Build 4 154870502 4I AAAAATCCAC ----/TCTT TAATCTTGCC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 TCTT 0 1 220478 CASAVA_Build 4 154871505 2I AATTTCTAGA --/AG AGATGTCAAA 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 AG 1 2 220479 CASAVA_Build 4 154872834 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2992 het 2676 hom 20 8 7 5 A 12 11 220480 CASAVA_Build 4 154874416 1D TTGTACCCAC A/- AATACAATAT 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 A 3 2 220481 CASAVA_Build 4 154875098 4D CCTTAGTAGG AATT/---- AATTAATTAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 AATT 3 2 220482 CASAVA_Build 4 154876350 1I AAGTATTTAT -/A TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 0 1 220483 CASAVA_Build 4 154878375 3D ATATATACTC TGT/--- TGTTGTTGGA 3070 het 3070 ref 50 27 19 5 TGT 3 2 220484 CASAVA_Build 4 154878953 1I ATCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2437 het 1337 hom 30 5 11 14 T 15 16 220485 CASAVA_Build 4 154880662 1D TTGCATCTCA T/- TTTGGGAAGT 3070 het 3070 ref 41 18 19 5 T 4 3 220486 CASAVA_Build 4 154880769 1I TCTGGTACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 19 0 9 10 T 10 11 220487 CASAVA_Build 4 154894145 2D TTTTATCTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 54 het 26 0 17 9 TC 9 8 220488 CASAVA_Build 4 154896272 1I CCACCCCCGC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 9 220489 CASAVA_Build 4 154906093 1D GTGTCCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 T 11 10 220490 CASAVA_Build 4 154911039 2D TTGGGTTGTC TT/-- TTCATTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 4 T 4 2 220491 CASAVA_Build 4 154912185 5D TTTTTAATGC TAGAG/----- TAGAGTTGTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 4 TAGAG 2 1 220492 CASAVA_Build 4 154918787 1I GGGATACATA -/T TGCCAGGATT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 T 1 2 220493 CASAVA_Build 4 154923521 2D GAGTTTAATC TA/-- TGTTTAAATT 3070 het 3070 hom 55 22 25 9 TA 1 0 220494 CASAVA_Build 4 154934237 2D AACAACAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 28 2 21 5 A 17 15 220495 CASAVA_Build 4 154948525 1I CCAGCACTTT -/G GGGGGGCTGA 2223 het 443 hom 7 1 5 1 G 6 7 220496 CASAVA_Build 4 154951473 7D AGAATAACAT AATTATG/------- AAAAATTAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 AATTATG 1 0 220497 CASAVA_Build 4 154951946 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 968 hom 37 5 20 12 A 13 14 220498 CASAVA_Build 4 154952935 1I TCTAATGTTC -/T TTAGATTGGC 3070 hom 148 het 57 0 50 7 T 2 3 220499 CASAVA_Build 4 154957214 1I CCCTTGCCTT -/C CCCTTTTGTA 3070 het 3070 hom 52 20 24 8 C 3 4 220500 CASAVA_Build 4 154958968 1I AGCAGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 A 11 12 220501 CASAVA_Build 4 154959051 1I ATCCAGGAGC -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 7 8 220502 CASAVA_Build 4 154961489 4I ATCCCATTAC ----/TGAG TATGTACCCA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 TGAG 0 1 220503 CASAVA_Build 4 154972257 1I TTTATCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 10 11 220504 CASAVA_Build 4 154972368 1I TTAAGGTGGG -/A AGAACAAAGA 3070 het 2470 hom 19 6 12 1 A 1 2 220505 CASAVA_Build 4 154972579 1D ATAATTTCTC T/- TTTATGCACT 3070 het 3070 hom 32 14 17 3 T 4 3 220506 CASAVA_Build 4 154976756 2D CCATACACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 36 3 15 19 T 14 12 220507 CASAVA_Build 4 154978984 1I TGAAGCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 795 hom 34 2 26 6 T 10 11 220508 CASAVA_Build 4 154981680 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1316 hom 25 3 11 11 T 13 14 220509 CASAVA_Build 4 154996946 1D CTGGTCCTGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 9 hom 14 1 10 5 T 9 8 220510 CASAVA_Build 4 155010266 1I AAAAGTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 684 hom 29 3 23 3 T 10 11 220511 CASAVA_Build 4 155010760 1I ACCATACTAT -/G TTTACATTTA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 G 0 1 220512 CASAVA_Build 4 155011568 1D14M2D TGATTCCTAA TTTTTTTTTTTGTTGTT/-TTTTTTTTTTGTTG-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 N/A 0 0 220513 CASAVA_Build 4 155017682 2I58M2I ACTATCTAAG --TTTTTTGAGCCATGACTTTCAAATGTACTTGACTTTTTTGCTTTTCACAAATACCCCA--/TTTTTTTTGAGCCATGACTTTCAAATGTACTTGACTTTTTTGCTTTTCACAAATACCCCATC TCTCTCTCTC 3070 hom 160 het 44 0 54 4 N/A 0 0 220514 CASAVA_Build 4 155017840 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2018 het 2018 ref 46 31 6 9 T 12 11 220515 CASAVA_Build 4 155027996 1D TCTGCTCTTT A/- ACCAACAGGC 3070 hom 148 het 57 0 50 7 A 2 1 220516 CASAVA_Build 4 155054015 5I TGTTTAAAGA -----/TTAGG TTAGTTTCTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TTAGG 0 1 220517 CASAVA_Build 4 155066098 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 2094 het 2094 ref 14 7 6 1 TA 5 6 220518 CASAVA_Build 4 155066508 3D TGTGACACAG TGA/--- TGATTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 23 10 4 TGA 2 1 220519 CASAVA_Build 4 155102143 13D CAGGACATGC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1773 hom 26 11 11 4 A 23 10 220520 CASAVA_Build 4 155103433 9I AGATGCTGGA ---------/GGAGAGGTG GGGAGTAGGT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 GGAGAGGTG 0 1 220521 CASAVA_Build 4 155106915 1D TAGTTACTTT A/- CAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 A 1 0 220522 CASAVA_Build 4 155107928 2I1M24D CCTGAAAGGT --CATTATTAGTAATTATTAGTAATTA/GGC------------------------ CAATCATTAT 3070 het 3070 ref 46 33 19 2 N/A 0 0 220523 CASAVA_Build 4 155110482 1I TTGCCTTTAT -/A ATATAAGGTA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 1 2 220524 CASAVA_Build 4 155114086 1D TCCCTTAAAT A/- ACTCATGATA 3070 het 3070 hom 27 9 14 6 A 2 1 220525 CASAVA_Build 4 155114276 8D CTCCCCTGTT TCTCCCTC/-------- TCTCTCCTGT 3070 het 3070 ref 40 17 19 6 TCTCCCTC 1 0 220526 CASAVA_Build 4 155127925 1I GAATTTAAAA -/G TCATATAATG 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 G 0 1 220527 CASAVA_Build 4 155138870 1D CTTGTTAGGA T/- TTTGTTGAGG 3070 het 3070 ref 62 29 24 9 T 4 3 220528 CASAVA_Build 4 155161153 7I2M1I AAAGTACCAT -------GT-/AAACTGGGTA ACTTCTAACA 3070 het 3070 hom 46 23 18 5 N/A 0 0 220529 CASAVA_Build 4 155173547 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2779 het 2779 ref 33 19 9 5 T 12 11 220530 CASAVA_Build 4 155175177 1D TTGGGCCAAA G/- CAAACCCATC 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 G 1 0 220531 CASAVA_Build 4 155180889 1I GTAATGGAGG -/A ACAGTTAATG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 1 2 220532 CASAVA_Build 4 155197705 1I GTAAGCAGCC -/T TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 T 6 7 220533 CASAVA_Build 4 155205177 3D TGCATCCCTG CTC/--- CTCTTTGGGA 3070 het 3070 ref 35 15 13 10 CTC 2 1 220534 CASAVA_Build 4 155252807 2I TCCTGGACAC --/AT AAACCCTCCC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AT 0 1 220535 CASAVA_Build 4 155269526 1I CATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 31 0 20 11 T 13 14 220536 CASAVA_Build 4 155280403 1D TATATTATAT A/- AAATATATAT 1835 het 1495 hom 7 3 4 0 A 4 3 220537 CASAVA_Build 4 155281815 3I TCCTTGGCTC ---/CTT CTCTCATCAT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 CTT 0 1 220538 CASAVA_Build 4 155283590 1I TTTGGGCTGG -/A TAAACCTCAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 0 1 220539 CASAVA_Build 4 155285186 1I CCTATTTTTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 220540 CASAVA_Build 4 155296861 4I TTTAAAATTA ----/GTTT GTTTGGTTTC 3070 hom 48 het 26 0 17 9 GTTT 1 2 220541 CASAVA_Build 4 155305557 1D TTGATAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 685 hom 42 2 28 13 T 13 12 220542 CASAVA_Build 4 155313298 3I TCAGAACCTG ---/TTA TTATTGGTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TTA 1 2 220543 CASAVA_Build 4 155314637 1I ATATAGTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 432 hom 31 2 26 3 T 9 10 220544 CASAVA_Build 4 155328604 2D GTATCATACT AC/-- AGTTTTCATC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AC 1 0 220545 CASAVA_Build 4 155345422 1I TAGTTCTTCT -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 7 8 220546 CASAVA_Build 4 155354292 1I GGTGGATAGT -/G GCTACCATAG 3070 hom 90 het 34 0 28 6 G 1 2 220547 CASAVA_Build 4 155355591 1I GGTAAAAAAT -/C CCCCCCCCCC 893 het 320 hom 10 1 5 4 C 10 11 220548 CASAVA_Build 4 155358100 9I GTCATGTACA ---------/TTTTTCTTT TTTTTCTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TTTTTCTTT 1 2 220549 CASAVA_Build 4 155360504 1I ACTGTTGAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 88 het 32 0 30 2 T 8 9 220550 CASAVA_Build 4 155371826 4I ACTTGTGTCC ----/TAAT TAATTATTCA 3070 hom 103 het 37 0 34 3 TAAT 1 2 220551 CASAVA_Build 4 155372279 2I TGAAAATAAC --/TT TAAAATTTAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 3 220552 CASAVA_Build 4 155378766 4D GACGGTGGGG GGGT/---- GGGGTGGGGA 5 het 5 ref 14 3 1 13 GGGT 1 0 220553 CASAVA_Build 4 155389268 1D CGGAGGCACC A/- TATTACCTGA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 1 0 220554 CASAVA_Build 4 155392010 4I TTATAAATCA ----/TGTC TGTCTATTAC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 TGTC 1 2 220555 CASAVA_Build 4 155393268 1D TTCTTTTTTT C/- TTTTAATGGC 3070 het 259 hom 46 1 40 5 C 1 0 220556 CASAVA_Build 4 155394464 1I CATATTATAA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 T 6 7 220557 CASAVA_Build 4 155406925 2D AGTTGCAGGG GT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 59 het 37 1 31 5 GT 1 0 220558 CASAVA_Build 4 155408313 2I CTTCTTCCCG --/AA AAGCCTAGCT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 2 4 220559 CASAVA_Build 4 155408842 1I TCCCCCCCCC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 7 8 220560 CASAVA_Build 4 155410378 1I AGGCTAGCTT -/A AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 6 7 220561 CASAVA_Build 4 155412875 1D CTGATCAAGG C/- CTAAATACCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 2 1 220562 CASAVA_Build 4 155414401 1I TGTGCTTCTT -/C ACTTAACTGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 220563 CASAVA_Build 4 155415647 2I CAAATTGTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 10 12 220564 CASAVA_Build 4 155418644 1D CTCCATCACA C/- ACACAAAAAA 3070 het 256 hom 18 1 16 5 C 1 0 220565 CASAVA_Build 4 155424059 1I AAGTTTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 A 14 15 220566 CASAVA_Build 4 155430592 1I ATTGGAAAGG -/A AAAAAGTCAA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 5 6 220567 CASAVA_Build 4 155431182 1I GTTCTGGCAT -/A AAAAACAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 5 6 220568 CASAVA_Build 4 155432374 3D AGAAATACAG AGA/--- AGAAGGATGG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AGA 2 1 220569 CASAVA_Build 4 155433807 1D AGGTATTCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2944 hom 36 10 16 10 T 11 10 220570 CASAVA_Build 4 155439354 3D TTGAAAAAGT AGC/--- AGCTCTTTGC 3070 het 3070 hom 48 17 27 5 AGC 2 1 220571 CASAVA_Build 4 155451645 1D TATCTGGTCC T/- TTAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 3 2 220572 CASAVA_Build 4 155460587 2I GTATGTGCAT --/AC ACCATTGAAG 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 AC 1 2 220573 CASAVA_Build 4 155476277 2D CCTCATACAT AC/-- ACACACACAC 1124 het 1124 ref 47 37 5 7 AC 8 7 220574 CASAVA_Build 4 155480718 1D AAGGAAACTT G/- TAAACTATAG 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 G 1 0 220575 CASAVA_Build 4 155482179 20D TATCGTAATG CATACATTCATATATATACA/-------------------- CATACATTCA 3070 het 3070 ref 29 13 12 13 CATACATTCATATATATACA 1 0 220576 CASAVA_Build 4 155484647 2D GCAGCCTGGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 GA 7 6 220577 CASAVA_Build 4 155486279 1I TTGTCCCCCT -/C CACAAGTTAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 2 220578 CASAVA_Build 4 155487113 3I TGCCTTTGGT ---/AAC AACATGTCCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAC 1 2 220579 CASAVA_Build 4 155495940 2I CTCCCATCAG --/CA CTATGACAGT 3070 het 3070 ref 39 26 11 2 CA 0 1 220580 CASAVA_Build 4 155496997 4D TAAGCTGAGG TTAA/---- TTTATTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 16 2 TTAA 1 0 220581 CASAVA_Build 4 155514271 1I AAACCTACTT -/C CAGGAGGGGT 3070 het 3070 hom 42 16 13 13 C 1 2 220582 CASAVA_Build 4 155517057 1I AGTTACTATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 8 9 220583 CASAVA_Build 4 155527091 1I CTGTCTCACC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 111 het 47 0 36 11 T 8 9 220584 CASAVA_Build 4 155528007 6D AACAGATCCT ACTAAA/------ ACTAAAAGTG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 ACTAAA 2 1 220585 CASAVA_Build 4 155531323 1I CATATGATCA -/T TTGTCATGTA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 2 3 220586 CASAVA_Build 4 155534298 3I CCACTCTTTC ---/GCT GCTGTTTCAG 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 GCT 1 2 220587 CASAVA_Build 4 155541074 1D CTGTAAGGGT G/- GTTGAGTTAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 2 1 220588 CASAVA_Build 4 155551848 4D AGGGATGGGT TATC/---- AGGTAGAAAT 3070 het 3070 ref 39 27 8 5 TATC 1 0 220589 CASAVA_Build 4 155567887 1I ATCTAACTGG -/A TGTATAAATA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 220590 CASAVA_Build 4 155569581 1I GGGTAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1282 hom 37 5 25 7 A 10 11 220591 CASAVA_Build 4 155572466 8D CCCAATAAGC CTAAGGCT/-------- TTGGTTCCAA 3070 hom 90 het 33 0 29 7 CTAAGGCT 1 0 220592 CASAVA_Build 4 155575126 7D AAATTTAGAA TTATAGC/------- TTATAGCTAT 3070 hom 51 het 20 0 18 5 TTATAGC 2 1 220593 CASAVA_Build 4 155580020 2I ATTTTTGGCA --/AT ATTTGCCAAA 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 AT 1 2 220594 CASAVA_Build 4 155581068 1D CAAAAGAGCC T/- TTTTTGGGCA 3070 het 3070 hom 39 20 18 1 T 6 5 220595 CASAVA_Build 4 155582170 1D TTCAGAAAAG T/- TTTTTCCTAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 T 6 5 220596 CASAVA_Build 4 155582337 1I TTATTAGGCT -/G TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 0 1 220597 CASAVA_Build 4 155589822 1I CCCAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 32 1 24 7 A 10 11 220598 CASAVA_Build 4 155593252 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 9 10 220599 CASAVA_Build 4 155609820 2I GAGTGCAAAC --/AA ATCTTCTCAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 1 3 220600 CASAVA_Build 4 155611090 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 20 1 16 3 A 14 15 220601 CASAVA_Build 4 155612640 1I CAACTTGCTA -/T TTAAAGTACA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 2 3 220602 CASAVA_Build 4 155614125 1I TTTTTGGTGC -/T GCCTTGCCCA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 0 1 220603 CASAVA_Build 4 155615305 1I CACTTACTAG -/C TGGAGAATTT 3070 hom 87 het 39 0 25 14 C 0 1 220604 CASAVA_Build 4 155617573 1I AAAGTTAGCT -/A GGGGAAGGGG 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 0 1 220605 CASAVA_Build 4 155619988 1I AATAGAGCAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 7 8 220606 CASAVA_Build 4 155624993 1D AAACCTCCCA T/- TATCTCCCAT 3070 het 3070 ref 43 23 11 11 T 2 1 220607 CASAVA_Build 4 155628817 1I AATCGGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 10 11 220608 CASAVA_Build 4 155629211 1D GTTAAAAAAA T/- ATATGAGACA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 1 0 220609 CASAVA_Build 4 155636965 1I AAATACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3009 hom 42 11 15 16 A 11 12 220610 CASAVA_Build 4 155643153 3D TAAAAAAATT AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 35 15 16 7 AAG 5 4 220611 CASAVA_Build 4 155652314 1I TCAGGAAAAT -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 59 het 32 0 27 5 A 7 8 220612 CASAVA_Build 4 155659899 1D GAAGATAAAA C/- ACAGACCAAA 3070 het 3070 ref 53 32 17 5 C 1 0 220613 CASAVA_Build 4 155663272 9D AAAAGAACAA CTTCAGAGG/--------- TTTCACACTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CTTCAGAGG 1 0 220614 CASAVA_Build 4 155664277 1D TCCCTCTGAC T/- TTTTTTTTTA 2682 hom 27 het 12 0 9 3 T 10 9 220615 CASAVA_Build 4 155666716 1D GTGGATGAAT A/- AAAAGGTGGT 3070 hom 79 het 30 0 27 3 A 5 4 220616 CASAVA_Build 4 155667129 5D TTTGGAAAGT ATAAG/----- ATATTACAGA 3070 hom 114 het 41 0 39 4 ATAAG 1 0 220617 CASAVA_Build 4 155674752 4D ATTTTCATTA TTTT/---- TTTTTTTTGC 3070 hom 60 het 23 0 21 3 T 12 8 220618 CASAVA_Build 4 155676495 1I CAGCTTTAGT -/C CCCATTATTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 3 4 220619 CASAVA_Build 4 155683410 1D GCGTGCTCTC T/- CTCATATACG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 1 0 220620 CASAVA_Build 4 155685956 3I AACTATAGAA ---/AAT AATTCAACAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AAT 1 2 220621 CASAVA_Build 4 155686118 1D AAAATTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 A 11 10 220622 CASAVA_Build 4 155717099 2D TAAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 974 hom 18 3 10 6 AT 8 7 220623 CASAVA_Build 4 155738343 4I CTCAGAAAGA ----/AAAG AAAGAAAGGG 2241 het 2241 ref 22 9 6 7 AAAG 2 3 220624 CASAVA_Build 4 155755323 2D AAATAGGAAA CT/-- CTTTTAATAG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 CT 2 1 220625 CASAVA_Build 4 155755956 1D GCTCTCTGAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 9 8 220626 CASAVA_Build 4 155756986 1I TTTTTTTTTT -/C TCTCTCTCTT 3070 het 690 hom 49 3 40 6 C 0 1 220627 CASAVA_Build 4 155775009 5I AGAAGCTAGA -----/TTCTT TTCTTTTCTT 2679 het 2679 ref 19 7 6 6 TTCTT 3 4 220628 CASAVA_Build 4 155775677 2I CTTATTTATA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 AC 6 7 220629 CASAVA_Build 4 155777621 1D TAAAGTAAAA T/- TTTTTTTTAA 2304 het 2087 hom 15 5 6 4 T 9 8 220630 CASAVA_Build 4 155784863 1I CATTTTCTTT -/G ATGACAAAGT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 0 1 220631 CASAVA_Build 4 155786658 1D GTTGGTTCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 16 19 9 T 10 9 220632 CASAVA_Build 4 155805142 1I TTGTTAGACA -/T TTAGATTGCT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 2 3 220633 CASAVA_Build 4 155810794 6D GGTGAATGTT AAAAGG/------ GAAAGGGTTA 3070 het 3070 ref 30 19 12 1 AAAAGG 1 0 220634 CASAVA_Build 4 155814809 1I TCAGTAATCC -/A GTTCTACATT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 0 1 220635 CASAVA_Build 4 155815392 1I AATCCATGTT -/C CTAATACGTA 3070 het 3070 ref 60 30 25 5 C 1 2 220636 CASAVA_Build 4 155822339 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 31 1 19 12 A 15 14 220637 CASAVA_Build 4 155827662 1D AAAAAGTTCA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 8 7 220638 CASAVA_Build 4 155827785 1D AAAAGCAACC A/- AAAAAAAAAA 2275 het 2275 ref 29 18 5 6 A 13 12 220639 CASAVA_Build 4 155835195 1D AGAATAAAGC A/- AAAAAAAAAA 2401 het 2401 ref 23 11 6 6 A 11 10 220640 CASAVA_Build 4 155846354 1D TTTCATTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 11 10 220641 CASAVA_Build 4 155848941 1D ATGCAGGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 T 10 9 220642 CASAVA_Build 4 155849150 1D AGAAAATGAA T/- TTTTTTTTTT 2543 het 1443 hom 15 4 6 5 T 13 12 220643 CASAVA_Build 4 155851978 3I CTCTTAAAAT ---/TTC TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 TTC 1 2 220644 CASAVA_Build 4 155862114 5D TTGGTTCCTA TATAT/----- TATATTTATT 3070 het 3070 hom 32 12 16 7 TATAT 2 1 220645 CASAVA_Build 4 155876760 1I ATTAAATCTC -/T TTCCTTTGTA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 2 3 220646 CASAVA_Build 4 155983974 1D TTCTGCTATT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 A 8 7 220647 CASAVA_Build 4 155985771 1D TGTAGATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 27 3 T 11 10 220648 CASAVA_Build 4 155990598 2I ATCAATATAT --/AA AAGTCCCCTT 3070 het 3070 hom 39 17 22 0 A 2 4 220649 CASAVA_Build 4 156012332 1I GCTAATTTGA -/T TTTTTTTACC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 7 8 220650 CASAVA_Build 4 156015086 2I CCCAGATTTC --/AT AGTGTTCAAA 3070 hom 78 het 28 0 25 3 AT 0 1 220651 CASAVA_Build 4 156022462 79D TAAGTAGAGG ACCCTAACTCTGTGGTTACTCTAGTCAGTCATACACAGTGCTAGCTGATAACTCCGTAGCCATTTCATTAAGCCCTGGA/------------------------------------------------------------------------------- CAAATTGGAG 3070 het 3070 ref 26 25 11 4 ACCCTAACTCTGTGGTTACTCTAGTCAGTCATACACAGTGCTAGCTGATAACTCCGTAGCCATTTCATTAAGCCCTGGA 1 0 220652 CASAVA_Build 4 156024639 3I GAAAACAGAA ---/GAT AACTTTCGCA 3070 hom 105 het 36 0 35 1 GAT 0 1 220653 CASAVA_Build 4 156037749 3I AACTGAAGAG ---/CTT CTGTACAGCA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 CTT 0 1 220654 CASAVA_Build 4 156039316 4I CCATTTTCTT ----/TGTC TGAATAATGA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 TGTC 0 1 220655 CASAVA_Build 4 156041552 1I ATATTAAGAC -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 7 8 220656 CASAVA_Build 4 156046458 1D TCTAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1020 hom 31 6 7 19 T 12 11 220657 CASAVA_Build 4 156046482 3D TTAGCCACTT GTG/--- GTGGTGTGTG 3070 het 2593 hom 32 7 11 15 GTG 3 2 220658 CASAVA_Build 4 156047998 26D GAGAAGGCAG CTGGGCCTGGGGGACCACTACCATCA/-------------------------- AGATGCAGAG 3070 het 3070 hom 24 11 11 5 CTGGGCCTGGGGGACCACTACCATCA 1 0 220659 CASAVA_Build 4 156051244 1I GTAGAGCCCT -/G GGGGGGGCAT 3063 het 3063 ref 29 16 9 4 G 7 8 220660 CASAVA_Build 4 156052308 1D AGACCTTCCC T/- TGTCAGGTCT 3070 het 3070 hom 48 22 19 7 T 2 1 220661 CASAVA_Build 4 156081532 1I TGAGGGTAGA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 T 6 7 220662 CASAVA_Build 4 156081581 1I TGTTTAAACC -/T TTTGTTTTTT 2268 het 2268 ref 39 21 9 9 T 3 4 220663 CASAVA_Build 4 156088872 1D CTTCCTGTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 T 9 8 220664 CASAVA_Build 4 156108153 1D CTGTGATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 12 11 220665 CASAVA_Build 4 156112715 3D GGGACTCATG ATA/--- ATGAGAGCTA 3070 het 3070 ref 37 18 18 2 ATA 1 0 220666 CASAVA_Build 4 156121906 4D AAAAATAAAA AAAG/---- AAAGAAAGCC 2016 het 2016 ref 25 17 6 2 AAAG 3 2 220667 CASAVA_Build 4 156127197 1D CTTATAACAT A/- ATGGGAGAGA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 2 1 220668 CASAVA_Build 4 156138378 2D TTTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2197 hom 26 7 10 9 T 13 11 220669 CASAVA_Build 4 156165349 4D ATTAAACATA TTTC/---- TTAAGTACCC 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 TTTC 1 0 220670 CASAVA_Build 4 156165744 1I TATACAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 10 11 220671 CASAVA_Build 4 156170076 1D TAGGTTTTGT G/- TGGCAGTTCT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 G 1 0 220672 CASAVA_Build 4 156172020 1I TTACACAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 9 10 220673 CASAVA_Build 4 156194353 1D CCAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 11 10 220674 CASAVA_Build 4 156202502 4I GTGTACAGGA ----/ATCT ATCTAGGCCC 3070 hom 141 het 53 0 47 6 ATCT 1 2 220675 CASAVA_Build 4 156218354 1I TCATGTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 717 hom 43 3 31 9 T 10 11 220676 CASAVA_Build 4 156229849 2D ATCTCTTAGC TT/-- TTTTTAATGT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 7 5 220677 CASAVA_Build 4 156235509 1I TCTGTTCTGG -/A AAACCTGCTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 3 4 220678 CASAVA_Build 4 156241434 2I CAGCTCTATC --/AG AGAGTCTTGG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 AG 2 3 220679 CASAVA_Build 4 156248262 1D ATATGATCAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 T 9 8 220680 CASAVA_Build 4 156259696 2I GTCTCTAAAA --/AG AGTGTTATTA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 AG 1 2 220681 CASAVA_Build 4 156265854 3I39M3I ATGACCATTA ---TTTAAAAAAAAAAAGTGTTGGAGAGAATGTGGAGAAATT---/TTTTTTTTAAAAAAAAAGTGTTGGAGAGAATGTGGAGAAATTGGA GGAAGCCTTG 3070 het 3070 ref 23 13 13 7 N/A 0 0 220682 CASAVA_Build 4 156284140 1D CATATTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1795 hom 34 6 15 14 A 15 14 220683 CASAVA_Build 4 156285625 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGT 2163 het 2163 ref 26 12 7 7 T 8 9 220684 CASAVA_Build 4 156287091 18I AGCATAGAAA ------------------/TATACATATATGTATATC TATACATATA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TATACATATATGTATATC 0 1 220685 CASAVA_Build 4 156290492 1D TGCCAAATTT A/- AAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 5 4 220686 CASAVA_Build 4 156295051 2I TTTGCATATG --/TA TATATATACA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 TA 4 5 220687 CASAVA_Build 4 156295548 4D CTAGAAAAAA TTAT/---- TTATAAGTAT 3070 het 3070 hom 30 15 13 4 TTAT 2 1 220688 CASAVA_Build 4 156299854 1I TTGATGCACT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 7 8 220689 CASAVA_Build 4 156310505 7I CCTCCCAAGG -------/TGGATTT TGTGATCTCA 3070 het 3070 hom 58 24 25 9 TGGATTT 0 1 220690 CASAVA_Build 4 156314283 1I CTTTTCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 10 14 10 T 11 12 220691 CASAVA_Build 4 156319859 1I TTATCTGACA -/T TTTCCTGGTT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 T 3 4 220692 CASAVA_Build 4 156320616 2D TTTTATTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 12 10 220693 CASAVA_Build 4 156324831 2I GCCTCAAACA --/AT ATTTCTCCTT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AT 1 2 220694 CASAVA_Build 4 156326376 4D ATGTGTGCCT GGTG/---- GGTGAATAAT 3070 het 3070 ref 43 26 13 6 GGTG 2 1 220695 CASAVA_Build 4 156326502 2I GTGAAATGTG --/TT TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 T 8 10 220696 CASAVA_Build 4 156327561 3D AAAAGTTCAG CTT/--- CTTTATTTTC 3070 het 3070 ref 37 23 14 1 CTT 2 1 220697 CASAVA_Build 4 156340980 1I GAAGCTGTGG -/A AAAATAGGAA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 A 4 5 220698 CASAVA_Build 4 156341294 1D AATGAAATCA T/- GTCCTTTGCA 1250 het 1250 ref 8 5 3 0 T 1 0 220699 CASAVA_Build 4 156347908 1I CAGATAAATA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 8 9 220700 CASAVA_Build 4 156350859 1I TGGCTGAAGG -/C GAGTAACCTG 3070 het 100 hom 48 1 36 11 C 0 1 220701 CASAVA_Build 4 156351582 1D CTCAGGACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 9 220702 CASAVA_Build 4 156365788 1D AAGTAAAATG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 9 8 220703 CASAVA_Build 4 156373045 1D CATTTTAGAG T/- TTTTTATATA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 6 5 220704 CASAVA_Build 4 156379509 8I CAAATATCAT --------/ACCACTTA ACATGTAGCA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 ACCACTTA 0 1 220705 CASAVA_Build 4 156394895 1D CTTTGTGGCA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 T 8 7 220706 CASAVA_Build 4 156400737 1I ATTTAAGTCT -/A ATCTTAATTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 220707 CASAVA_Build 4 156406461 1I CTGATAAATA -/T TAATTCATTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 1 2 220708 CASAVA_Build 4 156420287 6D TGAGGGCAGC CTCATT/------ ATATGTCATT 2309 het 2309 ref 19 11 6 7 CTCATT 1 0 220709 CASAVA_Build 4 156432170 1I TTTTCACTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 9 10 220710 CASAVA_Build 4 156435854 1D TCATAGGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 116 het 46 0 39 7 A 10 9 220711 CASAVA_Build 4 156438707 1I CTGTAAAATC -/A AAAACAACTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 4 5 220712 CASAVA_Build 4 156443653 1D TTAATAGCCC A/- AAAAAGTCAA 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 A 6 5 220713 CASAVA_Build 4 156445845 1I CATTTGAAGG -/A AAAATTAGGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 4 5 220714 CASAVA_Build 4 156450271 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 34 2 23 9 A 12 11 220715 CASAVA_Build 4 156451921 1I ATTTTTTGGC -/T TTTGAAAAAT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 3 4 220716 CASAVA_Build 4 156471656 1D GTAATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 24 8 A 15 14 220717 CASAVA_Build 4 156476116 1I TTCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 2502 het 2502 ref 27 15 7 5 T 9 10 220718 CASAVA_Build 4 156480320 4D GGCCATGCAC AGAA/---- AGAGTTGTGG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AGAA 1 0 220719 CASAVA_Build 4 156483807 3D ATATTATGTA CAT/--- CATTATATAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 CAT 2 1 220720 CASAVA_Build 4 156484306 2D TTACATGAAA AT/-- ATATGCTATC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AT 3 2 220721 CASAVA_Build 4 156489592 3I GACAGAAACA ---/AAC AAGAAAATAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AAC 0 1 220722 CASAVA_Build 4 156494057 3D TCTGATATTC ATT/--- ATACTTAGAA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 ATT 1 0 220723 CASAVA_Build 4 156496193 2D TAAAAGGAAA CT/-- CTTTCTCAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CT 2 1 220724 CASAVA_Build 4 156501117 2D TATCTATAAA CT/-- CTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 CT 2 1 220725 CASAVA_Build 4 156501191 1D AGTGATTTAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 8 220726 CASAVA_Build 4 156506961 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 682 hom 25 2 18 5 A 13 14 220727 CASAVA_Build 4 156509965 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1972 hom 27 7 17 3 A 10 9 220728 CASAVA_Build 4 156510057 1D22M5D TTATAATATT AAAAAAAAAATGTTAAAAATAAAAAAAC/-AAAAAAAAATGTTAAAAATAAA----- AAAACAAAAT 3070 het 3001 hom 32 13 18 11 N/A 0 0 220729 CASAVA_Build 4 156512126 2I TCCCAAAAAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 9 11 220730 CASAVA_Build 4 156514075 1I AATGGAAAAG -/A AAAAATGTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 5 6 220731 CASAVA_Build 4 156514191 1D TGTATTTTAT A/- AATAGACTTG 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 A 3 2 220732 CASAVA_Build 4 156514949 4I TCAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 1607 hom 21 het 29 0 8 21 AAAC 3 4 220733 CASAVA_Build 4 156531028 5I ATTAACCATT -----/TAATC TAATCCCTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TAATC 1 2 220734 CASAVA_Build 4 156531940 1D CCCAGTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 28 2 17 9 A 19 18 220735 CASAVA_Build 4 156533971 8I AAATATTTAC --------/AAAGAGAA ACTGGATTTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAAGAGAA 0 1 220736 CASAVA_Build 4 156535199 2D TTTCACTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 23 1 15 7 T 16 14 220737 CASAVA_Build 4 156542147 1I TCTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 27 1 24 2 A 10 11 220738 CASAVA_Build 4 156542975 1D GAGGGTAGAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 371 hom 50 1 44 5 A 9 8 220739 CASAVA_Build 4 156546194 1D CTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 43 2 34 7 T 12 11 220740 CASAVA_Build 4 156570526 2D ACTACCGGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 351 hom 37 5 12 21 TG 10 9 220741 CASAVA_Build 4 156572774 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 10 11 220742 CASAVA_Build 4 156577953 1D AATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 11 23 4 T 10 9 220743 CASAVA_Build 4 156629708 1D CTTCAGGATA T/- AATCAAGATA 3070 het 3070 hom 51 22 26 4 T 1 0 220744 CASAVA_Build 4 156640098 1D CCTTTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 2226 het 2226 ref 38 14 6 18 T 15 14 220745 CASAVA_Build 4 156643467 1I AATAAATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 10 11 220746 CASAVA_Build 4 156653943 12D CACACTCACA CACACTCACACT/------------ CACACTCACA 3070 het 519 hom 38 4 20 17 CACACT 3 1 220747 CASAVA_Build 4 156661458 12D TTCAGCATAT CCAAGTTACTAG/------------ CCAAGGGCAG 3070 hom 105 het 37 0 36 3 CCAAGTTACTAG 1 0 220748 CASAVA_Build 4 156669522 2I TTCCTTAATG --/AA AAGAGTGGTG 3070 het 3070 ref 59 27 25 7 A 2 4 220749 CASAVA_Build 4 156678397 2I CACCTTTCAC --/TA TATATATATA 2236 hom 15 het 7 0 6 1 TA 5 6 220750 CASAVA_Build 4 156684585 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2833 hom 28 13 10 5 A 13 14 220751 CASAVA_Build 4 156688268 1D TAAAACTACT A/- AAAATGAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 5 4 220752 CASAVA_Build 4 156692488 4I CATATAAGAA ----/TTTG TTTGTGATAA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 TTTG 1 2 220753 CASAVA_Build 4 156694615 1D AAAACTAAGC T/- TCATAAATAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 T 2 1 220754 CASAVA_Build 4 156698462 2I ACTATGGAAA --/AC AGTCTGGAGA 3070 het 3070 ref 48 25 14 9 AC 0 1 220755 CASAVA_Build 4 156704896 1D2M7I TCAAATCTTG TCA-------/-CATTAAGGT TTTCTGCAGG 3070 het 3070 hom 41 17 19 6 N/A 0 0 220756 CASAVA_Build 4 156712060 1I TATCCTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 934 hom 38 2 21 15 T 11 12 220757 CASAVA_Build 4 156716176 1I TAAAATAAGG -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 8 220758 CASAVA_Build 4 156718956 1I TCATCCGAAA -/G GGTTATCTAG 3070 hom 132 het 52 0 44 8 G 2 3 220759 CASAVA_Build 4 156723400 3I44M2I TAAAATTATT ---TTATTTTTCATAACCATTTATGTTGACACATAACACACATACAC--/TTGTTATTTTTCATAACCATTTATGTTGACACATAACACACATACACAT GATACATATA 3070 hom 132 het 32 0 45 4 N/A 0 0 220760 CASAVA_Build 4 156724110 1I AATTGAAGAG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 6 7 220761 CASAVA_Build 4 156726492 1D TAAGAATGGC T/- TTTTTTCAGG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 7 6 220762 CASAVA_Build 4 156734417 1D TTTGAAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 26 5 T 12 11 220763 CASAVA_Build 4 156737326 1I TCGAGGTTTT -/A AAAAAATTAC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 6 7 220764 CASAVA_Build 4 156742570 7I CATCTATTAT -------/TTTTTGA TTTTTTGATT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TTTTTGA 0 1 220765 CASAVA_Build 4 156756129 2I CCTGTTCTCT --/TC TCTCTCCCTA 1390 het 1390 ref 26 14 5 7 TC 3 4 220766 CASAVA_Build 4 156757006 1I GTTAGCAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 9 10 220767 CASAVA_Build 4 156766531 1I TCTTTTCCCC -/A ATCAGAAAGG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 1 2 220768 CASAVA_Build 4 156767108 1D ATTCTATAGG T/- TTTGCCTGAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 4 3 220769 CASAVA_Build 4 156772804 5D TCATGTGAAC TTTGT/----- TTTATCACTT 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 TTTGT 1 0 220770 CASAVA_Build 4 156774543 1I TTTTTGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 T 11 12 220771 CASAVA_Build 4 156806688 1I TTTAAATGTA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 7 8 220772 CASAVA_Build 4 156807273 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 22 2 15 5 T 13 12 220773 CASAVA_Build 4 156809487 3D GGGTCCGTGA TCT/--- TCTTCAAGGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TCT 2 1 220774 CASAVA_Build 4 156812621 1D CCCCCCTCCG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 130 hom 37 3 22 12 T 10 9 220775 CASAVA_Build 4 156814955 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 A 12 11 220776 CASAVA_Build 4 156824996 2I AATTTGCCAC --/AT GTCTTTTGCT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 AT 0 1 220777 CASAVA_Build 4 156838842 8I TTGAAAGATG --------/GATAAATT GATAAATTAG 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 GATAAATT 1 2 220778 CASAVA_Build 4 156849521 1D AGAAAAAATG T/- GGTACTCAGA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 1 0 220779 CASAVA_Build 4 156849801 4I AACGGTCGTC ----/CTAA CTGACACCTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 CTAA 0 1 220780 CASAVA_Build 4 156870986 4D ACATGACAAA ATGT/---- ATGTACTCAC 892 het 892 ref 36 25 3 8 ATGT 2 1 220781 CASAVA_Build 4 156871022 1D GCTCTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1900 het 1900 ref 36 15 6 15 A 14 13 220782 CASAVA_Build 4 156872614 1I ACTTACAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 8 9 220783 CASAVA_Build 4 156878659 1I CCTGGAAGAG -/A AAGAGTAAGG 3070 het 3070 ref 63 31 28 4 A 2 3 220784 CASAVA_Build 4 156888822 1I CCTCCCACCC -/T TCCATTTCCA 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 T 1 2 220785 CASAVA_Build 4 156893076 1I CACGTAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 9 10 220786 CASAVA_Build 4 156897524 1D AATACTTGTG A/- ATATATGTGA 3070 het 3070 ref 51 25 22 5 A 2 1 220787 CASAVA_Build 4 156901080 1D TTGAAGACTT A/- ACAGTTCTAG 1499 het 1499 ref 15 7 4 4 A 2 1 220788 CASAVA_Build 4 156904148 1I CCTTACCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 10 11 220789 CASAVA_Build 4 156904613 1D TCAGTCTAAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 T 8 7 220790 CASAVA_Build 4 156907217 1I TAGCAATTCC -/T TTTTGGAAGT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 T 4 5 220791 CASAVA_Build 4 156921345 1I GATCCTGTAA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 8 9 220792 CASAVA_Build 4 156926710 1I TTGCCTTATG -/C CCATCTGCTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 C 2 3 220793 CASAVA_Build 4 156926874 10D TTCAATTTCC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 2617 hom 26 10 9 7 T 20 10 220794 CASAVA_Build 4 156931722 1D ATTTCCAATC T/- TTTTTTTTTT 1510 het 1510 ref 17 8 4 5 T 13 12 220795 CASAVA_Build 4 156932345 1D AAAAAATAGA G/- AAAAAAAAAA 1810 het 1810 ref 25 15 6 4 G 1 0 220796 CASAVA_Build 4 156976015 1D TGAGTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 32 0 18 15 A 15 14 220797 CASAVA_Build 4 156977240 1I TTCAATAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 750 hom 31 2 24 5 A 9 10 220798 CASAVA_Build 4 156978911 1D GTGTGAAAGC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 42 21 13 9 A 8 7 220799 CASAVA_Build 4 156985218 2I CTTGTGGGGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 TG 7 8 220800 CASAVA_Build 4 156985958 1I TTTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 2834 het 2834 ref 28 12 9 7 T 10 11 220801 CASAVA_Build 4 156993074 1I TCAGTGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 T 12 13 220802 CASAVA_Build 4 156993309 1D AATCACATGA C/- CCTTTTACTC 3070 het 3070 ref 49 21 22 6 C 3 2 220803 CASAVA_Build 4 157006285 1D TTTAATAGAG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 220804 CASAVA_Build 4 157009700 1I AGGGACTTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 9 10 220805 CASAVA_Build 4 157026855 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 93 het 34 0 32 4 AAAC 5 4 220806 CASAVA_Build 4 157028049 1D GGGCATGTTG A/- ATGACATTGG 3070 hom 125 het 50 0 42 8 A 2 1 220807 CASAVA_Build 4 157030500 2I AAAAACAGAC --/TT ATTCCTAGTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 2 220808 CASAVA_Build 4 157043112 1I CTCATATTAC -/A AAGGTAGTCG 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 A 2 3 220809 CASAVA_Build 4 157043406 3D TTATTGGTTC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 39 17 13 11 TTG 7 6 220810 CASAVA_Build 4 157046220 1I GGGCAGTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 9 10 220811 CASAVA_Build 4 157049046 2D CATGGGACCC AT/-- ACAGATGGGA 3070 het 3070 hom 36 14 13 11 AT 1 0 220812 CASAVA_Build 4 157062814 3D ACCTAAAGTT AAC/--- AACACTTAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAC 2 1 220813 CASAVA_Build 4 157065802 1D AAAACTTGGT A/- AAGAGTAAGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 3 2 220814 CASAVA_Build 4 157066688 1D GGAAAAAAAA G/- GAATTATTAG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 2 1 220815 CASAVA_Build 4 157068804 1I TGCAAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 935 hom 20 2 16 2 T 10 11 220816 CASAVA_Build 4 157076883 1I AGGACCCTTG -/T TTGCAGACCG 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 2 3 220817 CASAVA_Build 4 157080998 1D GAGTTAGACC A/- AAAAAAAAAA 1305 het 1305 ref 52 41 3 8 A 11 10 220818 CASAVA_Build 4 157088668 2D TACCTTCACC TT/-- TTTTTTGTTG 1932 hom 39 het 46 0 12 34 T 8 6 220819 CASAVA_Build 4 157090609 1I AAAGCTTTTT -/A AAGGATACAC 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 A 2 3 220820 CASAVA_Build 4 157091109 2D GATTCATCAG AA/-- AAAGTCTGCT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 5 3 220821 CASAVA_Build 4 157091455 1D CCTCACCCCA C/- CCCCACACCC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 5 4 220822 CASAVA_Build 4 157109817 1D ATTCAGACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2257 hom 35 9 15 11 T 13 12 220823 CASAVA_Build 4 157113578 1I ATAATTATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 10 220824 CASAVA_Build 4 157121100 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 23 2 10 11 T 13 12 220825 CASAVA_Build 4 157127225 1D ATACTACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 T 13 12 220826 CASAVA_Build 4 157134175 1I AGTGAAAATC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 T 8 9 220827 CASAVA_Build 4 157139266 4I ATATTTATTG ----/AAAC AAACAAAGCA 3070 hom 97 het 39 0 33 6 AAAC 1 2 220828 CASAVA_Build 4 157143373 1D TCAAAGGGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 44 20 19 7 T 9 8 220829 CASAVA_Build 4 157143952 1I CAGATGACCA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 6 7 220830 CASAVA_Build 4 157147745 1I TAAGTTCTTT -/G ATCAGTTTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 0 1 220831 CASAVA_Build 4 157148854 1I ATACATAACT -/A TTTTTTCCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 0 1 220832 CASAVA_Build 4 157149314 4D TGACATGTAG TAAA/---- TATTCTTCAT 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 TAAA 1 0 220833 CASAVA_Build 4 157149778 48D CAATAAGCCA ATAGTGCAAAGGATTGGAAACTTATTTACTGTATTTGATAGTTTAAAT/------------------------------------------------ ATCTAATTTT 3070 hom 93 het 29 0 31 3 ATAGTGCAAAGGATTGGAAACTTATTTACTGTATTTGATAGTTTAAAT 1 0 220834 CASAVA_Build 4 157150331 3D TTATACACAT TAA/--- TAATATTATA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 TAA 2 1 220835 CASAVA_Build 4 157155967 4D TGTCCAATCA TATT/---- TCTCTACAAT 3070 het 3070 ref 47 25 17 7 TATT 1 0 220836 CASAVA_Build 4 157156114 1D TGTTAATTTG C/- CTTTTGGTAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 2 1 220837 CASAVA_Build 4 157156688 1D GTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 389 hom 28 1 23 4 A 10 9 220838 CASAVA_Build 4 157157256 1D AAAGCTTTTT C/- TTTGCATTCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 1 0 220839 CASAVA_Build 4 157160901 1D TTGTTCTTTG T/- CCTGCAACTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 0 220840 CASAVA_Build 4 157164588 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 20 0 11 10 A 15 14 220841 CASAVA_Build 4 157187941 2D ACCTAATAAC AT/-- AGTCTTTCAG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 AT 1 0 220842 CASAVA_Build 4 157190638 1I AGAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 1901 hom 18 het 10 0 7 3 A 13 14 220843 CASAVA_Build 4 157194473 1I GTATCCTGGG -/A AAAAAATTCC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 6 7 220844 CASAVA_Build 4 157197850 1D AGTTTTAAAG T/- TTTTCTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 5 4 220845 CASAVA_Build 4 157198874 1D CTAAAAACAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 47 het 27 0 24 3 A 8 7 220846 CASAVA_Build 4 157202169 1I TTCCCCACTT -/C TTTGATGAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 0 1 220847 CASAVA_Build 4 157203272 1D CCATTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 26 1 20 5 A 11 10 220848 CASAVA_Build 4 157205759 4D TATTTTTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 39 het 24 0 14 10 TG 11 9 220849 CASAVA_Build 4 157206045 3I GGGAGGCCGA ---/GGC GGCGGGCGGA 3070 het 52 hom 17 2 13 2 GGC 1 2 220850 CASAVA_Build 4 157206115 1I TGTCTCTACT -/A AAAAATACAA 2916 het 1728 hom 12 4 7 1 A 5 6 220851 CASAVA_Build 4 157216272 1I AGAGCTATTT -/G TTTTTTAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 0 1 220852 CASAVA_Build 4 157220550 1I GTCCAAATGC -/T CCAAATTTCC 3070 hom 126 het 43 0 43 0 T 0 1 220853 CASAVA_Build 4 157221136 1I GTTATTTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 12 24 3 T 9 10 220854 CASAVA_Build 4 157223234 4I AATATAATAA ----/ATAT ATATTGTGTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AT 2 4 220855 CASAVA_Build 4 157224834 8I3M3D TACAATCAAT --------ATTGCA/AAAAAATGATT--- ATAAAGTTGC 3070 hom 93 het 32 0 32 2 N/A 0 0 220856 CASAVA_Build 4 157225996 1D CCCAACTGAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 8 7 220857 CASAVA_Build 4 157231311 1I TAAATTCCTT -/A AATAATGGCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 2 3 220858 CASAVA_Build 4 157235470 1D TGGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 12 11 220859 CASAVA_Build 4 157253039 2I AAAAAATGAC --/TT TTTCCTGTAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 3 5 220860 CASAVA_Build 4 157253999 1D GAAATGACAG A/- AAAAAATGAC 3070 hom 132 het 50 0 45 6 A 7 6 220861 CASAVA_Build 4 157257569 2I43M4I GAGTATTTAT --TATGTCATAGCATATATTAAGTGCTGTTCCAAATATTGTATAC----/TATATGTCATAGCATATATTAAGTGCTGTTCCAAATATTGTATACATAA ATGAGTTATA 3070 hom 72 het 23 0 25 3 N/A 0 0 220862 CASAVA_Build 4 157262361 4D AATAAAAAAT AAAG/---- AAATAAAAAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AAAG 1 0 220863 CASAVA_Build 4 157263401 1D AATAGGACTA C/- TGTAGCTAAC 3070 hom 42 het 24 0 15 9 C 1 0 220864 CASAVA_Build 4 157263772 1I ATGAAAAGAC -/A AAGATTGAGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 2 3 220865 CASAVA_Build 4 157265657 1D AAACTAGAAG C/- TTTTCCACTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 1 0 220866 CASAVA_Build 4 157275434 1I TCTTTATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 26 1 20 5 A 13 14 220867 CASAVA_Build 4 157278028 1D CTTTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 36 0 25 11 T 13 12 220868 CASAVA_Build 4 157278292 1I CTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 58 het 35 1 30 4 T 8 9 220869 CASAVA_Build 4 157279581 1D CACGTGTCAG T/- TTTAACAAAG 3070 het 3070 ref 33 22 7 4 T 4 3 220870 CASAVA_Build 4 157280053 1I CTAGGTTAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 8 9 220871 CASAVA_Build 4 157286645 1D CAGGAGGAAT A/- AAAAAAAAAA 1375 het 1375 ref 30 21 3 7 A 12 11 220872 CASAVA_Build 4 157289505 2D TCATGAAATG GT/-- GTGTGTGTGT 997 het 997 ref 58 45 3 11 GT 8 7 220873 CASAVA_Build 4 157292647 6D AAAAAAAACT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 TG 13 10 220874 CASAVA_Build 4 157302405 2D ACATATATGT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 AC 5 4 220875 CASAVA_Build 4 157305000 8D AGAGACAGGA TATATATG/-------- TATATAAATC 3070 het 3070 ref 37 22 14 3 TATATATG 1 0 220876 CASAVA_Build 4 157305690 1I GATGTGGGTT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 479 hom 32 3 27 2 A 0 1 220877 CASAVA_Build 4 157306501 1D TAGAGTAATT A/- AAAAAAATAG 3044 het 3044 ref 29 15 7 8 A 8 7 220878 CASAVA_Build 4 157308820 1D GCTTGCTGTT A/- AAGCCCCATC 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 3 2 220879 CASAVA_Build 4 157312364 1I TAAGAATAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 7 8 220880 CASAVA_Build 4 157315420 1I TGAAGAGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 9 10 220881 CASAVA_Build 4 157319454 1D GCCATGAACA G/- GGGAGAGTTA 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 G 4 3 220882 CASAVA_Build 4 157327398 4D ATTTATGTGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 AT 9 7 220883 CASAVA_Build 4 157327950 2D ATACATACAG AC/-- ACACACACAC 945 het 945 ref 67 55 3 10 AC 7 6 220884 CASAVA_Build 4 157333703 1D TTGCTCTGTC T/- GCCTTTTAAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 1 0 220885 CASAVA_Build 4 157336870 4D AAACAAAATA AGAG/---- AGAGATATGT 3070 het 3070 hom 37 14 19 6 AG 4 2 220886 CASAVA_Build 4 157356569 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 11 10 220887 CASAVA_Build 4 157357306 1I CTTTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 12 12 12 A 13 14 220888 CASAVA_Build 4 157370379 4D TGCAAAAAAC AAAT/---- AAAGATAAGT 3070 het 3070 hom 46 18 24 5 AAAT 1 0 220889 CASAVA_Build 4 157372516 1D ATGCTTGTGA T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 T 7 6 220890 CASAVA_Build 4 157372998 1I CTACATATTT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 7 8 220891 CASAVA_Build 4 157374679 1D AATTCCTTAA G/- GATCTAGAAC 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 G 2 1 220892 CASAVA_Build 4 157374865 1D GCTATTATCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 9 8 220893 CASAVA_Build 4 157375713 10D ACTGTGGGTA ATACTGATAT/---------- TTTAACAATA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 ATACTGATAT 1 0 220894 CASAVA_Build 4 157378000 1D AAGTGAAGAT G/- GGGGCCGTCA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 G 5 4 220895 CASAVA_Build 4 157378826 1D ATGATGCAGA T/- TTTACAGTTA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 T 4 3 220896 CASAVA_Build 4 157386860 1D ATAAAGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 T 10 9 220897 CASAVA_Build 4 157389320 1D GCAAATTTTG T/- TTGTGACATG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 3 2 220898 CASAVA_Build 4 157391329 1I GGAGTGCAGT -/G GCACGATCTC 3070 hom 36 het 19 0 16 3 G 1 2 220899 CASAVA_Build 4 157391784 1D AGTACATGAC T/- TTCATTCTAT 3070 het 3070 hom 45 20 18 9 T 3 2 220900 CASAVA_Build 4 157416476 1D TTGAGGTAAG T/- TTTTTACAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 6 5 220901 CASAVA_Build 4 157435119 1I TGTGTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1671 hom 39 5 24 10 A 13 14 220902 CASAVA_Build 4 157439435 1D TGACTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 13 12 220903 CASAVA_Build 4 157451142 1D TAGAAAAAAA C/- ATCCTAAAAT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 C 1 0 220904 CASAVA_Build 4 157452524 2I AAATTCAGTG --/TC TCTAATTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TC 1 2 220905 CASAVA_Build 4 157455709 1D AAATGACAGG C/- CTTTGTGCTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 2 1 220906 CASAVA_Build 4 157464876 3I CCAGCCCAAG ---/ATA ATAATATATG 3070 hom 81 het 38 0 28 10 ATA 2 3 220907 CASAVA_Build 4 157468563 1I ATGTGTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 735 hom 41 3 28 10 A 12 13 220908 CASAVA_Build 4 157468674 1D ACAAGTGTTA T/- TTTTCTATTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 5 4 220909 CASAVA_Build 4 157468905 2D CCCAGCTAAC TT/-- TTGTATTTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 4 2 220910 CASAVA_Build 4 157471629 2D CTGGAAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 12 10 220911 CASAVA_Build 4 157478248 1D TCCAAGTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 38 0 37 2 A 10 9 220912 CASAVA_Build 4 157482835 2D TTGGTGAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 20 0 11 9 T 18 16 220913 CASAVA_Build 4 157492702 1D AGTGCACCTA C/- CCTTTCCTTT 3070 het 3070 hom 29 13 11 6 C 3 2 220914 CASAVA_Build 4 157495056 2D GCTCCACTGA GT/-- TTTCAGCAGA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 GT 1 0 220915 CASAVA_Build 4 157502739 1D CATTTTAAGG T/- TTTTTCTTGT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 6 5 220916 CASAVA_Build 4 157504875 3D TTGGCCTAAT ATA/--- ATATTAATTA 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 ATA 2 1 220917 CASAVA_Build 4 157505394 1D AAAACAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 600 hom 50 3 32 16 T 14 13 220918 CASAVA_Build 4 157509144 5I GCAATGGAAG -----/ATGAA ATGAATGAAA 2247 hom 12 het 5 0 5 0 ATGAA 1 2 220919 CASAVA_Build 4 157519194 1D TAATTCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 T 13 12 220920 CASAVA_Build 4 157521440 2D TGATACCAAC AA/-- AAAAAATCCA 3070 het 73 hom 42 1 26 16 A 8 6 220921 CASAVA_Build 4 157523713 1D TTTCTTACTA C/- ATGACTGTAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 1 0 220922 CASAVA_Build 4 157525008 1D CCAACTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 21 0 17 4 A 12 11 220923 CASAVA_Build 4 157576511 1D CCCGGCTAAA T/- TTTTTTTTTG 2627 het 2627 ref 25 9 8 8 T 10 9 220924 CASAVA_Build 4 157585619 3D TTCTTTTCTT TTC/--- TTTTTTTTTT 427 het 427 ref 15 4 2 9 TTC 1 0 220925 CASAVA_Build 4 157586265 2D TAATATAAAG TC/-- TCTATAGTCT 3070 het 2718 hom 14 7 7 0 TC 2 1 220926 CASAVA_Build 4 157591319 1D CTCATATCCC T/- TTTTTTTTTC 1400 het 1400 ref 31 21 4 6 T 10 9 220927 CASAVA_Build 4 157599512 2D AGATTATAGA CC/-- TATATCTGAT 3070 het 3070 ref 39 20 19 0 C 2 0 220928 CASAVA_Build 4 157603568 2I GAAGGGAGAC --/TT TTTATTACTG 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 3 5 220929 CASAVA_Build 4 157605271 1D TTTTTAAAAC T/- TCTTAAGTGG 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 2 1 220930 CASAVA_Build 4 157606109 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2494 hom 28 11 10 7 A 13 12 220931 CASAVA_Build 4 157611781 4D61M1D TGGCTAAAAT TCTATCTATCGGGCTACATTTAAAGCAACTGGATACATAAAAATTTGAATTTGGCACCCATGATGT/----TCTATCGGGCTACATTTAAAGCAACTGGATACATAAAAATTTGAATTTGGCACCCATGATG- TTTGAGCAAA 3070 het 3070 hom 33 20 23 4 N/A 0 0 220932 CASAVA_Build 4 157622409 2D TTAAGGTGCC AA/-- AGAATTAACA 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 A 3 1 220933 CASAVA_Build 4 157626362 76D TCTTCTTTTG TCAATTCATTAGGAACTAGGATAAGAGGGAATAGGTTTTATTTTCTCGTTTATGTGATTAGCCTTATCTGTGCTGC/---------------------------------------------------------------------------- ATCTGGGTCT 2272 het 2272 ref 31 36 6 12 TCAATTCATTAGGAACTAGGATAAGAGGGAATAGGTTTTATTTTCTCGTTTATGTGATTAGCCTTATCTGTGCTGC 1 0 220934 CASAVA_Build 4 157630287 1I ACTGTTAAAG -/T TGAGGGCATT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 1 2 220935 CASAVA_Build 4 157633015 4D CAATTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 TTTG 1 0 220936 CASAVA_Build 4 157635448 1D TGTGAATCCC A/- AAGTTGGCAA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 3 2 220937 CASAVA_Build 4 157637199 3I CAATACACAT ---/ATA GAACCATAGA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 ATA 0 1 220938 CASAVA_Build 4 157637850 1I CTATACAAGA -/T TTCTGAGTCA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 2 3 220939 CASAVA_Build 4 157645923 1D TGTCTGGGGT G/- GGGGGTGGGG 3070 het 2150 hom 29 9 12 8 G 6 5 220940 CASAVA_Build 4 157651708 5I CAGGCAGCCT -----/ACAGA ACAGGAGAAA 2870 het 2870 ref 21 12 7 2 ACAGA 0 1 220941 CASAVA_Build 4 157652606 1I AGTTAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 10 11 220942 CASAVA_Build 4 157658630 1I AGGGAAAAGC -/A AAAAAAAAGC 2188 het 2188 ref 14 8 5 1 A 8 9 220943 CASAVA_Build 4 157670741 1D TGAACTGACC T/- TGTTCTGCAG 3070 het 3070 ref 49 24 19 8 T 2 1 220944 CASAVA_Build 4 157686552 1D TTCTTGTCAG T/- CATGGTCAAA 3070 het 3070 ref 53 25 27 1 T 1 0 220945 CASAVA_Build 4 157706872 3I ATATAGAGTC ---/TTA TTATCATAAG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TTA 1 2 220946 CASAVA_Build 4 157707817 2I GCAGTAATAC --/AA AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 8 10 220947 CASAVA_Build 4 157717361 4I ATGAGATCTT ----/ACTA ACTAAGTGTG 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 ACTA 1 2 220948 CASAVA_Build 4 157720801 1I TGACACTTCC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 8 9 220949 CASAVA_Build 4 157721726 5D TCCTTTCCCT CTTTG/----- CCTGGCTGCT 3070 het 3070 ref 31 17 14 4 CTTTG 1 0 220950 CASAVA_Build 4 157723193 1I ATATTAAAAA -/G AATGATTTAT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 G 0 1 220951 CASAVA_Build 4 157726955 1D ATCCTGATTA T/- TTGTAATAAA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 3 2 220952 CASAVA_Build 4 157729657 1D GTGCCATTGT G/- TTGGGGGCGA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 G 1 0 220953 CASAVA_Build 4 157730756 2I TGTTGATTTT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 CA 7 8 220954 CASAVA_Build 4 157730901 1D TCTTCCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 29 9 T 11 10 220955 CASAVA_Build 4 157734165 1I AAAGATACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 9 10 220956 CASAVA_Build 4 157734885 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 34 hom 26 1 14 11 A 9 8 220957 CASAVA_Build 4 157736995 1D ACATGGGGGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 A 9 8 220958 CASAVA_Build 4 157747094 1D CTCAGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2845 hom 29 9 12 9 T 12 11 220959 CASAVA_Build 4 157753168 4I ATACAAGATA ----/GATT TGACTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 GATT 0 1 220960 CASAVA_Build 4 157753305 3I TAAGGTCTAC ---/TTG TTGTTCCCTG 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 TTG 1 2 220961 CASAVA_Build 4 157757111 1D AGATTTCAGA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 T 8 7 220962 CASAVA_Build 4 157763540 1I GAAAGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 32 0 15 17 T 10 11 220963 CASAVA_Build 4 157763676 1D CTAAAAAAAA T/- AAAATTTAAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 T 1 0 220964 CASAVA_Build 4 157766346 1D CAAATTCTGA C/- CAGCCTTTGT 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 C 2 1 220965 CASAVA_Build 4 157772540 1D GCTTACCTTC T/- TCAATAAATC 3070 het 3070 ref 39 19 10 11 T 2 1 220966 CASAVA_Build 4 157774490 1I GGGAGTACTA -/G GGAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 G 2 3 220967 CASAVA_Build 4 157775699 1I AAATAGAAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 8 9 220968 CASAVA_Build 4 157778378 1I AAGGCATCCC -/A ATATGCAATT 3070 het 3070 hom 59 27 28 4 A 1 2 220969 CASAVA_Build 4 157779974 1D GCAGAGATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 11 10 220970 CASAVA_Build 4 157790342 1D GATCAACTGA T/- TGCTCACAAG 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 T 2 1 220971 CASAVA_Build 4 157794317 1I TCAAACATAA -/T TTTTTAAAAG 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 T 5 6 220972 CASAVA_Build 4 157796593 1D TCTTCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1788 het 1788 ref 25 11 6 8 A 12 11 220973 CASAVA_Build 4 157796800 5I TTAAAAAGTT -----/AAGTG AGGTGCAATT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AAGTG 0 1 220974 CASAVA_Build 4 157797340 2D ATTCACTGAC TT/-- GTCCTGGAAT 3070 het 3070 ref 50 23 21 7 T 2 0 220975 CASAVA_Build 4 157798518 1I CTTATTGCTT -/G AAAAAGAAGC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 G 0 1 220976 CASAVA_Build 4 157802119 1I GCAGTTCTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 307 hom 49 1 41 7 T 9 10 220977 CASAVA_Build 4 157808481 1I TAGTTTTAAC -/T TTTCCTATGT 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 T 3 4 220978 CASAVA_Build 4 157813683 1I AGCTGCAGTG -/T TCTGCAGTAA 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 T 1 2 220979 CASAVA_Build 4 157817382 1D CACAAATTAC A/- AAGTCAAATG 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 A 3 2 220980 CASAVA_Build 4 157822512 1I AAAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2677 het 2677 ref 29 12 8 9 A 15 16 220981 CASAVA_Build 4 157830643 2I GTCAAGAAAC --/TG TTCACAAAAT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 TG 0 1 220982 CASAVA_Build 4 157832138 1D CGGTGGATTG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 8 7 220983 CASAVA_Build 4 158039242 1I GAAGCTTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 9 10 220984 CASAVA_Build 4 158054280 3D TGGTCTTTTG CTT/--- CTTCTTAGGT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 CTT 3 2 220985 CASAVA_Build 4 158055484 9I GACAGACTGG ---------/GGAAAGTCT CTTTACAATA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 GGAAAGTCT 0 1 220986 CASAVA_Build 4 158060105 1I TCCTATTTAT -/C TTCATCATCC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 0 1 220987 CASAVA_Build 4 158065599 1D GGGCTGGGCC T/- TGCAGGAGGC 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 T 2 1 220988 CASAVA_Build 4 158132219 2D ACATCATATT GA/-- AGAAGCAGTA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 GA 1 0 220989 CASAVA_Build 4 158132998 1I GAAGATTCTT -/G AAGGTCCCAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 0 1 220990 CASAVA_Build 4 158135235 1D GAGTTTTATT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 9 8 220991 CASAVA_Build 4 158139329 1D TTAACACAAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 T 8 7 220992 CASAVA_Build 4 158141269 1D ACAGGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1092 hom 29 3 20 7 T 15 14 220993 CASAVA_Build 4 158143391 6I ATAATAATAA ------/TAATAT TAATAATAAA 1457 het 1457 ref 19 15 4 0 TAATAT 0 1 220994 CASAVA_Build 4 158144575 5I ACAGGATAAA -----/ACCAG TCTAGATCTC 3070 hom 107 het 41 0 34 7 ACCAG 0 1 220995 CASAVA_Build 4 158146622 1D ATATTTTAAA T/- TTTTATTTAT 2975 het 1782 hom 13 4 7 2 T 5 4 220996 CASAVA_Build 4 158149246 1I GCTTTTAGAT -/A AAAAGTATTA 3070 hom 113 het 42 0 37 5 A 4 5 220997 CASAVA_Build 4 158149550 1I CTTTTCTTTA -/T TTTTTTCATG 3070 hom 84 het 33 0 26 7 T 6 7 220998 CASAVA_Build 4 158157478 1D CTCCCCCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 12 11 T 13 12 220999 CASAVA_Build 4 158168149 1D CTCAATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 964 hom 25 4 12 9 A 15 14 221000 CASAVA_Build 4 158169986 2D GGAAAGGGAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 21 het 20 0 15 6 AT 9 8 221001 CASAVA_Build 4 158172505 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 ATA 5 6 221002 CASAVA_Build 4 158174091 1D28M4I TCAGACCTCA TTTTTTTTTTCACGCAGTAGTCATGGTGC----/-TTTTTTTTTCACGCAGTAGTCATGGTGCTTGA TTGATAGTGG 2460 het 988 hom 6 2 5 1 N/A 0 0 221003 CASAVA_Build 4 158175828 11D CAGCTATGAA TTAAATAGGTT/----------- TTAGAAGTCT 3070 het 3070 hom 36 14 21 2 TTAAATAGGTT 1 0 221004 CASAVA_Build 4 158179278 2D TCAAAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 33 2 12 20 A 13 11 221005 CASAVA_Build 4 158180592 1D GGATTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 462 hom 31 2 21 8 A 15 14 221006 CASAVA_Build 4 158182640 1D AATTAACTAC A/- AAAAAGATTA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 6 5 221007 CASAVA_Build 4 158192849 3D AACATACTAA TCT/--- TCTGTATTGG 3070 het 3070 hom 41 12 20 10 TCT 2 1 221008 CASAVA_Build 4 158197027 2D CATCTTTCAC TT/-- TTATGTTACC 3070 hom 48 het 18 0 17 4 T 4 2 221009 CASAVA_Build 4 158199622 1D TAGCTGGGTG T/- GGTGGCATGT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 1 0 221010 CASAVA_Build 4 158199757 1I AGATTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 680 hom 23 3 16 5 A 15 16 221011 CASAVA_Build 4 158200746 1D CCACTATTAC A/- TTTAGCCGTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 0 221012 CASAVA_Build 4 158203006 1I TCTAGCTCTC -/T ATCCTTCTAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 221013 CASAVA_Build 4 158205935 1I TCCTTTCAGC -/A AAAGGTAATT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 3 4 221014 CASAVA_Build 4 158208259 1D GATAAGATTC A/- AAGCACAGGT 3070 hom 120 het 47 0 41 7 A 3 2 221015 CASAVA_Build 4 158209691 1D TTCTGGTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2428 hom 24 7 13 5 T 12 11 221016 CASAVA_Build 4 158210657 1I AGGAGAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 9 10 221017 CASAVA_Build 4 158215550 1I CTTTTTTAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 2456 hom 20 6 11 3 A 8 9 221018 CASAVA_Build 4 158215883 1D AATAACAATT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 40 15 20 6 A 8 7 221019 CASAVA_Build 4 158216142 4I CTACAGAAGG ----/GGAA GGATGACAAA 3070 het 3070 hom 53 20 27 6 GGAA 0 1 221020 CASAVA_Build 4 158217583 1I CTGGGGGGGG -/C GGGGGGAAGA 2638 het 23 hom 18 1 8 9 C 0 1 221021 CASAVA_Build 4 158224006 1I AAGAACTTTT -/G TTGAGTTCTG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 G 0 1 221022 CASAVA_Build 4 158228390 1I AAATGTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 10 11 221023 CASAVA_Build 4 158232674 2I TTCTAGCTGA --/CT CTGTTACTGA 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 CT 1 2 221024 CASAVA_Build 4 158233763 1I TAAAGTTTAT -/A TAAAGTTCTT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 A 0 1 221025 CASAVA_Build 4 158245131 1I TTTTGATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 10 11 221026 CASAVA_Build 4 158246198 1D GTTCTGTCCA T/- TACTGAAAGT 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 T 2 1 221027 CASAVA_Build 4 158249044 1I TTGATTATAA -/G CTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 G 0 1 221028 CASAVA_Build 4 158308718 1D CCAGTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2413 hom 24 6 9 9 T 13 12 221029 CASAVA_Build 4 158315159 8I AGGGCACATG --------/TGATAATT TGATACCTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 TGATAATT 0 1 221030 CASAVA_Build 4 158329072 1I CAGTCCCCAA -/C AAAACTTCAC 2165 het 2165 ref 24 16 6 2 C 0 1 221031 CASAVA_Build 4 158337501 1D AAGATGTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 10 9 221032 CASAVA_Build 4 158360473 1I GACTCTACAA -/C GGGAGGGATT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 0 1 221033 CASAVA_Build 4 158455980 1D GGTACATTCC A/- AAAAAAAAAA 2244 het 2244 ref 35 23 6 7 A 15 14 221034 CASAVA_Build 4 158473130 1I AGCAGGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 36 1 22 13 A 11 12 221035 CASAVA_Build 4 158494746 11D ATGTGCAAAG GAATGTCGAGA/----------- GAAATATTTT 3070 het 3070 ref 41 25 15 1 GAATGTCGAGA 1 0 221036 CASAVA_Build 4 158513633 1D GTAGGGCTGC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 2416 hom 30 9 16 6 T 8 7 221037 CASAVA_Build 4 158517847 1D GATTAGAAAT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 13 het 32 1 23 8 G 11 10 221038 CASAVA_Build 4 158522135 1I GGATCACCTG -/A TGTCAGGAGT 3070 hom 47 het 20 0 15 5 A 0 1 221039 CASAVA_Build 4 158522369 6D ATAAAAATGA AAAATG/------ AAAAAAAAAA 155 het 155 ref 25 22 2 3 AAAATG 1 0 221040 CASAVA_Build 4 158524207 8I CATATTTAAA --------/TGTGTGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 TG 5 9 221041 CASAVA_Build 4 158529177 4I TTTTTAAATG ----/TTCT TGCTTATTAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTCT 0 1 221042 CASAVA_Build 4 158535195 1D GGTTGACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 15 14 221043 CASAVA_Build 4 158540357 1D CTTCTTACTG C/- CCCTGTAACA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 C 4 3 221044 CASAVA_Build 4 158545484 1D GCTATAACAT A/- AAAGTTAACA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 4 3 221045 CASAVA_Build 4 158552349 1I GTCCTACTGA -/G GTTCACGGTC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 G 1 2 221046 CASAVA_Build 4 158554893 1D GAGCCTGGAG T/- TTCCTACTGG 3070 hom 88 het 36 0 28 8 T 3 2 221047 CASAVA_Build 4 158561396 1D ATAATCTTAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 9 8 221048 CASAVA_Build 4 158564436 1I TCATTATGTT -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 7 8 221049 CASAVA_Build 4 158578000 38D GTTATTCTCA GTTATATAAAGTGTATAACTTTATACACTTTATATTCG/-------------------------------------- GTTATATAAA 3070 het 3070 ref 33 23 12 11 GTTATATAAAGTGTATAACTTTATACACTTTATATTCG 1 0 221050 CASAVA_Build 4 158580234 7I AATGTGTCTG -------/CAAATTA TTATGACACA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 CAAATTA 0 1 221051 CASAVA_Build 4 158582853 4D TTTTTTTAAC CTCT/---- CTAACAAGAT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 CT 3 1 221052 CASAVA_Build 4 158586530 1I CAATTGCAAG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 148 het 57 0 50 7 T 7 8 221053 CASAVA_Build 4 158595071 1D ACTCACTTTC T/- TTTTTTTTTT 2909 het 2909 ref 30 13 11 6 T 13 12 221054 CASAVA_Build 4 158605161 1D GAGATTTAAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 8 7 221055 CASAVA_Build 4 158605302 1I CAGAAATAAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 7 8 221056 CASAVA_Build 4 158606588 1D CTTAAATTAT G/- CACATGTAAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 G 1 0 221057 CASAVA_Build 4 158610608 7D GAAGCCTTAG GAAAAAA/------- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 GAAAAAA 1 0 221058 CASAVA_Build 4 158615846 1I CCAAAAAAAC -/A GCTTGAAGGC 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 A 0 1 221059 CASAVA_Build 4 158616413 1I TCAGAGGGAG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 A 7 8 221060 CASAVA_Build 4 158616502 3I AAATCAAAAA ---/TAT TATTTTTTAG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 TAT 1 2 221061 CASAVA_Build 4 158632259 1I TATTAATATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 T 9 10 221062 CASAVA_Build 4 158634475 2D CCAAGCAAAT GA/-- GAGGGGAACA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 GA 2 1 221063 CASAVA_Build 4 158642446 3I GTTATAATAA ---/TAC TACTGTTGAG 3070 hom 135 het 47 0 46 1 TAC 1 2 221064 CASAVA_Build 4 158644433 1I TGGTCAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 9 10 221065 CASAVA_Build 4 158645946 2D TATTTTAGTG CC/-- CCCCCCCCGA 3070 het 372 hom 25 6 12 8 C 10 8 221066 CASAVA_Build 4 158646232 1I TTATGAAATG -/T TAAAAGCAGT 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 T 1 2 221067 CASAVA_Build 4 158657626 1I TTGTACTTTA -/C TTTAGTTAAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 221068 CASAVA_Build 4 158658653 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2574 het 393 hom 25 1 10 14 A 12 13 221069 CASAVA_Build 4 158658681 14I TTTGTATTAT --------------/GATTTTGATGTTAC GCTTTTTATG 3070 hom 36 het 24 0 13 11 GATTTTGATGTTAC 0 1 221070 CASAVA_Build 4 158659104 1I GGAGATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1207 hom 29 3 19 7 A 10 11 221071 CASAVA_Build 4 158660080 2I TGTGTATAAC --/AG TACATATATT 3070 hom 114 het 40 0 39 2 AG 0 1 221072 CASAVA_Build 4 158665054 1I TCCTCTCTTC -/T TTGAGGTCCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 221073 CASAVA_Build 4 158666579 4D ATTACTGGCC TCAG/---- TCAGGGTGGA 3070 hom 96 het 34 0 33 5 TCAG 2 1 221074 CASAVA_Build 4 158666750 1I TCCCTAAAAT -/G GGGTCCATGG 3070 hom 78 het 36 0 26 10 G 3 4 221075 CASAVA_Build 4 158667592 1I CTAACAAATC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 221076 CASAVA_Build 4 158670113 2D TCTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 14 12 221077 CASAVA_Build 4 158670196 7I AAAATGTCCC -------/TACCATT TAAATAACTC 3070 hom 78 het 27 0 26 1 TACCATT 0 1 221078 CASAVA_Build 4 158671682 3D GAGAATTTCT TTG/--- TTGTTATTTT 3070 hom 120 het 46 0 41 8 TTG 2 1 221079 CASAVA_Build 4 158672778 1D ATCACTGATT A/- AAAAATAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 6 5 221080 CASAVA_Build 4 158682661 3D GTTTTAAGAG TAT/--- TATTTGTGGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TAT 2 1 221081 CASAVA_Build 4 158686473 1I TCTGCTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 44 1 37 6 T 10 11 221082 CASAVA_Build 4 158689968 8D TTGGTTTGTG TGGTTTCT/-------- TGGTTTCTTG 3070 hom 85 het 35 0 28 9 TGGTTTCT 2 1 221083 CASAVA_Build 4 158692952 1D GAGTTCCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 10 9 221084 CASAVA_Build 4 158700763 3D TGAGTCAAAA CTC/--- AGTGATAGTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 CTC 1 0 221085 CASAVA_Build 4 158701160 1D CACTCAACTC T/- TTATGAGAAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 T 3 2 221086 CASAVA_Build 4 158718747 17D ATTCTTCATA TACTATACCTATGTTTT/----------------- TATAGCTATC 3070 hom 60 het 27 0 21 9 TACTATACCTATGTTTT 1 0 221087 CASAVA_Build 4 158752230 4I TTTAATAAAA ----/ACTT ACTTAGCTAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ACTT 1 2 221088 CASAVA_Build 4 158759712 1D AACTGTATAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 9 8 221089 CASAVA_Build 4 158766851 1D GCTCTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 28 1 22 5 A 15 14 221090 CASAVA_Build 4 158772055 3D TTGAGAGGCT AAA/--- CAACACTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 A 3 0 221091 CASAVA_Build 4 158775016 2I GGCTCAGAAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 105 hom 25 1 18 6 AG 6 7 221092 CASAVA_Build 4 158776291 6D ATACAAAACT TACTAA/------ TAGTAAGTAC 2766 het 2766 ref 22 15 7 3 TACTAA 1 0 221093 CASAVA_Build 4 158778965 4I4M1I3M4I ACCACAGAAC ----AACA-AGA----/AAATAACACAGACCAC AAACAAATAA 3070 het 3070 ref 41 21 20 2 N/A 0 0 221094 CASAVA_Build 4 158780526 9D CCTTATTAAC TAAAGATGA/--------- TAAAGATGAT 3070 het 3070 hom 33 14 17 5 TAAAGATGA 2 1 221095 CASAVA_Build 4 158782206 1D GCTTAAATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 10 9 221096 CASAVA_Build 4 158782411 2D ATAGACTTTC TT/-- TTTTTTTTTA 1559 het 162 hom 10 3 5 2 T 11 9 221097 CASAVA_Build 4 158783029 2D TAAATCTAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 T 12 10 221098 CASAVA_Build 4 158784940 1D TTGACTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 12 10 2 T 10 9 221099 CASAVA_Build 4 158785068 1D GACTACCTAG A/- AACAGGTTTT 2620 het 2620 ref 27 13 8 6 A 3 2 221100 CASAVA_Build 4 158786201 2D GGGAATAGTG CA/-- CAGTGAATAT 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 CA 2 1 221101 CASAVA_Build 4 158786956 2D ACTTAGGAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 6 A 12 10 221102 CASAVA_Build 4 158788086 2I ATCTAAATAT --/TC TCTAATCAGT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 TC 1 2 221103 CASAVA_Build 4 158794836 3D36M3D CAAATCATTA TTGTTCTCAAACATTTTACTGCTATTTTTCTTAGTTAAAATT/---TTCTCAAACATTTTACTGCTATTTTTCTTAGTTAAA--- ATTATGAGTT 3070 het 3070 hom 31 19 23 4 N/A 0 0 221104 CASAVA_Build 4 158795515 2I CCAAGCAAAA --/CT CTCATTCATC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 CT 1 2 221105 CASAVA_Build 4 158797280 1D CCTTTGATTT A/- AAAAATATAT 220 het 220 ref 21 10 2 9 A 6 5 221106 CASAVA_Build 4 158800079 1I AAATGTGGTA -/C CCGATACACC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 C 2 3 221107 CASAVA_Build 4 158811245 1I CCTCCAATAG -/C CCCCCATATG 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 C 5 6 221108 CASAVA_Build 4 158816764 1D AAAAGCCTAC T/- TTTATCATAG 3070 het 3070 ref 52 25 22 6 T 4 3 221109 CASAVA_Build 4 158820966 9D TCTTAATTAA AAACATTAG/--------- ATTGTTGATT 3070 het 3070 ref 39 19 17 6 AAACATTAG 1 0 221110 CASAVA_Build 4 158822618 1D AATAAAAAAA T/- AAATATCAGT 3070 het 3070 ref 39 21 12 7 T 1 0 221111 CASAVA_Build 4 158829654 2D CACACACACT CA/-- CACACACACA 3070 het 459 hom 50 6 27 18 CA 11 10 221112 CASAVA_Build 4 158830165 1I GACTACAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 10 11 221113 CASAVA_Build 4 158838023 2D AAAGTATAAT TA/-- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 TA 1 0 221114 CASAVA_Build 4 158840185 1D GAAATCAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 A 8 7 221115 CASAVA_Build 4 158841255 1D TGTTCTAAGG C/- CAAATGTGAG 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 C 2 1 221116 CASAVA_Build 4 158866425 1D TGAAAATGTC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 9 8 221117 CASAVA_Build 4 158883298 1D TAAGTAATGA T/- TTTTTTGTTC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 7 6 221118 CASAVA_Build 4 158885262 1D TCTTTCTCCA T/- TGTGTCTTCT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 1 221119 CASAVA_Build 4 158894200 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 26 1 19 6 A 13 14 221120 CASAVA_Build 4 158908780 1D AATTAAAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 T 9 8 221121 CASAVA_Build 4 158911889 2D GTATTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TG 9 8 221122 CASAVA_Build 4 158922918 1I GGCCAATCAC -/A TTCTTGTTCT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 0 1 221123 CASAVA_Build 4 158956867 3D TAACAAGGAG TGC/--- TCAGCAGGAA 3070 hom 126 het 45 0 42 5 TGC 1 0 221124 CASAVA_Build 4 158961465 1D ATACGGAACC A/- AAAAAAAAAG 2662 het 2662 ref 48 37 6 5 A 10 9 221125 CASAVA_Build 4 158964704 1I CCTTAGTATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 579 hom 35 2 30 3 T 9 10 221126 CASAVA_Build 4 158965660 1D AACACCCCCC A/- AAAAAATCAC 3070 hom 76 het 30 0 26 4 A 7 6 221127 CASAVA_Build 4 158970002 4I TAAACCCAAA ----/TACT TATAGCCAAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TACT 0 1 221128 CASAVA_Build 4 158970182 1I CCTGAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 34 2 29 3 A 11 12 221129 CASAVA_Build 4 158971108 12D6M1D ATGAATTAAT GAATTAATTTAGGTCATTA/------------GGCATT- GGCAGTGACC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 221130 CASAVA_Build 4 158972376 4D ACTTGCTAAA ATGT/---- ATTTGTAATT 3070 het 3070 ref 45 28 16 3 ATGT 1 0 221131 CASAVA_Build 4 158975134 1D TTCTCTTGAT A/- TTGGATCATA 3070 hom 93 het 34 0 31 4 A 1 0 221132 CASAVA_Build 4 158978535 4D TCACCTGCAA TTTT/---- TTTGTGTGTG 1100 hom 48 het 23 0 15 9 T 7 3 221133 CASAVA_Build 4 158983225 1D GATATTGGGG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 8 7 221134 CASAVA_Build 4 158983578 1D TATTTATTAA G/- GAGATAAAGG 3070 hom 99 het 43 0 34 9 G 2 1 221135 CASAVA_Build 4 158984339 18D2M2D TATAACCAAT ATGCAAGCACACTAAGAACAGG/------------------CA-- TATATCAGGA 3070 hom 84 het 29 0 28 2 N/A 0 0 221136 CASAVA_Build 4 158987973 1D ACTAGATCAC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 8 7 221137 CASAVA_Build 4 158993774 1D AATGTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 13 12 221138 CASAVA_Build 4 159002626 1D ACAAGGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 10 9 221139 CASAVA_Build 4 159002866 1I TAAACTAGTC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 7 8 221140 CASAVA_Build 4 159005465 2D GGGAGAAGAC AA/-- ACAATAAAGA 3070 het 3070 hom 38 11 18 10 A 3 1 221141 CASAVA_Build 4 159008569 2D TCTCACAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 46 19 17 12 AC 9 8 221142 CASAVA_Build 4 159010081 1I GGGAATAAAT -/G GGGTTGCTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 3 4 221143 CASAVA_Build 4 159017357 18D TTACATCTTC ATGATGAATTTTACCACT/------------------ ATGAAATGTC 3070 het 3070 ref 26 17 10 3 ATGATGAATTTTACCACT 1 0 221144 CASAVA_Build 4 159025635 1I ACTTGTTTTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 52 14 28 10 A 8 9 221145 CASAVA_Build 4 159026931 1D ACATTTCTAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 8 7 221146 CASAVA_Build 4 159030355 2I AACAAGAAAC --/TG TGACTATGAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TG 1 2 221147 CASAVA_Build 4 159035457 1I AAATCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2649 hom 27 8 16 3 A 10 11 221148 CASAVA_Build 4 159036338 1I GTTAATACAG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 T 7 8 221149 CASAVA_Build 4 159041523 1I ATAACACTAC -/T TTTTTATCCA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 5 6 221150 CASAVA_Build 4 159045050 1D TCCAAAGATG A/- AAAAAAAAAA 1106 het 1106 ref 31 13 6 12 A 15 14 221151 CASAVA_Build 4 159049583 6D GGAAAATAAC ATATGA/------ ATATGAATAT 3070 het 3070 hom 56 21 28 9 ATATGA 3 2 221152 CASAVA_Build 4 159051523 1D CTATTTGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1459 hom 34 7 15 12 A 12 11 221153 CASAVA_Build 4 159058383 1D TCTTACCCTC T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 7 6 221154 CASAVA_Build 4 159072586 3D TCTCTATTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 22 0 11 11 T 17 14 221155 CASAVA_Build 4 159074901 1D GTAATTGCTG T/- TTTTTACACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 6 5 221156 CASAVA_Build 4 159082428 1I TCTAGAGAAC -/A AGGTTGAAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 2 221157 CASAVA_Build 4 159082554 1D ATTAATGAAG A/- AAAACAGACA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 5 4 221158 CASAVA_Build 4 159088619 2D TAAAAAAATA AC/-- AGTCATTTCT 2828 het 2828 ref 15 9 6 0 AC 1 0 221159 CASAVA_Build 4 159115781 1I TATACTTGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 9 221160 CASAVA_Build 4 159117477 1I ATAGGTTGAC -/A ATTTGAAAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 1 2 221161 CASAVA_Build 4 159118821 1I TATCAGTTAC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 8 9 221162 CASAVA_Build 4 159119014 2D GGGAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 11 9 221163 CASAVA_Build 4 159119220 1I AAAAAGTAGA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 0 1 221164 CASAVA_Build 4 159121758 1I GTCTCTCAAG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 221165 CASAVA_Build 4 159121992 1I GTATAATTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 130 het 50 0 44 6 A 8 9 221166 CASAVA_Build 4 159143603 2I TGTTGTTGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 36 0 24 12 T 11 13 221167 CASAVA_Build 4 159146025 21I GAGCCAGATA ---------------------/TAACATATGGTATGGCCTCTT GGCCACCGTG 3070 hom 120 het 44 0 41 4 TAACATATGGTATGGCCTCTT 0 1 221168 CASAVA_Build 4 159149255 4I TTCTGGAAAG ----/AAAA AAAACAAAAC 3070 hom 97 het 35 0 33 2 A 4 8 221169 CASAVA_Build 4 159156222 1D AAAAAGAGAT A/- TTTTTAATAA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 1 0 221170 CASAVA_Build 4 159182113 1D CTCTTCATGA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 1 221171 CASAVA_Build 4 159195268 1I TTTTCTCTAA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 6 7 221172 CASAVA_Build 4 159208994 1I ATTTGCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 25 1 21 3 A 10 11 221173 CASAVA_Build 4 159216586 3D CAGTTTCTAC AAA/--- AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 30 0 28 4 A 11 8 221174 CASAVA_Build 4 159216927 1D AGTTATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 12 11 221175 CASAVA_Build 4 159238867 1D AACACCGCAT A/- ATTCTCACTC 3070 hom 90 het 32 0 27 5 A 2 1 221176 CASAVA_Build 4 159245825 2I CTACTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 57 het 25 0 20 6 TA 5 6 221177 CASAVA_Build 4 159266011 1D TAAAGATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 25 9 A 13 12 221178 CASAVA_Build 4 159286748 2D TAACTAGTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 11 9 221179 CASAVA_Build 4 159288213 1D ACTCTGTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 27 0 15 12 A 15 14 221180 CASAVA_Build 4 159290195 5D TTCCATTGTC CTAAT/----- CATTCTCAGG 3070 hom 172 het 59 0 58 4 CTAAT 1 0 221181 CASAVA_Build 4 159290968 1I GCAGCCCCTT -/A AGAGAATGGG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 1 2 221182 CASAVA_Build 4 159292282 1I TTTACACGCA -/C AAACTACAAA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 C 0 1 221183 CASAVA_Build 4 159346998 4I ATATTTTCTC ----/TTTG TTTATTTTCC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTTG 0 1 221184 CASAVA_Build 4 159349210 40D GTAATAATGT TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------------- TATATATATA 3070 hom 69 het 23 0 24 8 TA 26 6 221185 CASAVA_Build 4 159350449 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 34 1 28 5 A 12 11 221186 CASAVA_Build 4 159370563 1I GCTGCCCCTT -/C CCCCAAGGAG 3070 hom 90 het 33 0 27 6 C 4 5 221187 CASAVA_Build 4 159388657 1D TTTCTGTTTT A/- AAAAAATGAC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 7 6 221188 CASAVA_Build 4 159395710 4D CCTTCCCATC CAAA/---- CAATTATTAC 3070 hom 114 het 42 0 39 6 CAAA 1 0 221189 CASAVA_Build 4 159396860 1I GTATTTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 10 11 221190 CASAVA_Build 4 159401777 4D ACATCATCTT ACTC/---- ATGATGCTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 ACTC 1 0 221191 CASAVA_Build 4 159404613 1I TAAAACAGCT -/C AAAGACCATG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 221192 CASAVA_Build 4 159405675 4D TATACCACAG TTTA/---- TTTATCCACT 3070 hom 111 het 39 0 38 2 TTTA 2 1 221193 CASAVA_Build 4 159412725 1I AAGCAAGAGG -/A AAAAAACAAC 3070 hom 119 het 49 0 44 5 A 6 7 221194 CASAVA_Build 4 159421168 1D GCTTAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 36 0 27 10 A 11 10 221195 CASAVA_Build 4 159447041 1I AGTGTCTGTT -/A ATGTTCCTTG 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 A 1 2 221196 CASAVA_Build 4 159467385 2I TACTAGTTTC --/CT GGAGGACTTA 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 CT 0 1 221197 CASAVA_Build 4 159468994 1D ATGACGATAG C/- ATATACTTTG 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 C 1 0 221198 CASAVA_Build 4 159472128 5I ATTCTCCTGC -----/CTCAG CTCAGCCTCC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 CTCAG 1 2 221199 CASAVA_Build 4 159475743 1D ATTATCTGGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2620 hom 29 8 19 2 A 9 8 221200 CASAVA_Build 4 159478515 1I CAATACCAGC -/T TTCTTTATTA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 T 2 3 221201 CASAVA_Build 4 159483555 5I TCCCATTTTC -----/GCGCT TCATTAGTTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 GCGCT 0 1 221202 CASAVA_Build 4 159490046 1I CTTTTTTTTT -/G GAAAACTCAT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 G 1 2 221203 CASAVA_Build 4 159496142 3D AGAGATGAAC AAT/--- AATAACTAAT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 AAT 2 1 221204 CASAVA_Build 4 159511785 1D ATGTTTTTAG T/- TAATAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 2 1 221205 CASAVA_Build 4 159514265 1D ATTGAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 1695 het 1419 hom 31 10 9 12 T 19 18 221206 CASAVA_Build 4 159518538 3D GCAAGAATTC TTG/--- TTGTGACAAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 TTG 2 1 221207 CASAVA_Build 4 159518768 1I TTAAAGATAC -/T TTTTTTTTTT 2018 het 1723 hom 31 8 9 14 T 15 16 221208 CASAVA_Build 4 159552646 1I CAAATATGAG -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 6 7 221209 CASAVA_Build 4 159553649 8I CAGAAGGAGG --------/AACATATT AACATATTTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AACATATT 1 2 221210 CASAVA_Build 4 159567165 1I TGGTACATCA -/G ATCCTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 0 1 221211 CASAVA_Build 4 159568465 1D ATAATTTACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 10 9 221212 CASAVA_Build 4 159568960 3D CAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAAAA 742 het 742 ref 32 14 7 11 AAG 1 0 221213 CASAVA_Build 4 159569127 1I TGAAGAATTT -/A TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 A 0 1 221214 CASAVA_Build 4 159570031 1D TTAAAGTAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 10 9 221215 CASAVA_Build 4 159580860 1I TATGGATGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 9 10 221216 CASAVA_Build 4 159589148 4D GTGTGTATAT ACAC/---- ACACACACAC 1942 het 1942 ref 24 14 6 6 AC 9 7 221217 CASAVA_Build 4 159589793 3D TGTAATCCCA GTT/--- ACTTGGGAGG 2963 het 596 hom 11 3 7 1 GTT 1 0 221218 CASAVA_Build 4 159592861 1D AGTAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 11 10 221219 CASAVA_Build 4 159599771 27I CACTGTGGTC ---------------------------/AAGCACTGGTGCCTAAGGTGCAAGACA AAGTTCCCTT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 AAGCACTGGTGCCTAAGGTGCAAGACA 0 1 221220 CASAVA_Build 4 159619895 3D AATTAAAAAG TTA/--- ACAAATTCAA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 TTA 1 0 221221 CASAVA_Build 4 159621297 1D CCGAGGCGGG C/- AGATCACGAG 3070 het 2542 hom 17 6 9 2 C 1 0 221222 CASAVA_Build 4 159625723 12D CTATAATCTT CTCATAGATTAC/------------ CTACCACCCA 3070 het 3070 ref 37 19 17 3 CTCATAGATTAC 1 0 221223 CASAVA_Build 4 159626126 1D TTCCTATGGG A/- ATCAATGTGT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 2 1 221224 CASAVA_Build 4 159627422 2D TGCTAAGTAC TA/-- TAAAGATAAA 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 TA 2 1 221225 CASAVA_Build 4 159633808 2D GCTAATAGAC TG/-- AGAACTCACT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TG 1 0 221226 CASAVA_Build 4 159633945 1D GGAAGACACA C/- CTGAACTATA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 C 2 1 221227 CASAVA_Build 4 159637577 1D GAAACTAAAA G/- GCACGAATAA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 G 2 1 221228 CASAVA_Build 4 159644062 1D AAAACTGAGA G/- TAATAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 G 1 0 221229 CASAVA_Build 4 159645141 2D GCTAAAATAA CT/-- CTCTAGGAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 CT 3 2 221230 CASAVA_Build 4 159648738 4I AAAAAAAAGG ----/AAAC AAAGATCCAT 818 het 818 ref 33 10 5 19 AAAC 0 1 221231 CASAVA_Build 4 159648820 1D CAGCCATTAC A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 A 8 7 221232 CASAVA_Build 4 159649360 1D AAAAAAAAAA G/- GAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 2 1 221233 CASAVA_Build 4 159650087 1D GAATTGAGTA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 290 hom 52 1 31 20 T 7 6 221234 CASAVA_Build 4 159650557 2I AACTTCTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 10 19 11 A 12 14 221235 CASAVA_Build 4 159650809 1D ACCTAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 12 6 A 13 12 221236 CASAVA_Build 4 159652447 1D TGTGGTTTTC T/- TTTTTAGAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 6 5 221237 CASAVA_Build 4 159653325 1I CTGGACAGAA -/G GGAAAAAATG 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 G 2 3 221238 CASAVA_Build 4 159659093 10I GTTGTGAGGG ----------/AAGAGGAAGA AAGATGGCTG 3070 het 3070 hom 36 9 23 4 AAGAGGAAGA 0 1 221239 CASAVA_Build 4 159665447 4I AACAATTCTT ----/TTAC TTAATGTTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTAC 0 1 221240 CASAVA_Build 4 159667380 3I CCTTTTGGAA ---/ATC ATCAATGTTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 ATC 1 2 221241 CASAVA_Build 4 159674848 3D GATATTCTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 26 0 13 13 T 19 16 221242 CASAVA_Build 4 159675511 3I TTTATTACAT ---/ATA ATAATAAAAT 2545 hom 18 het 9 0 7 2 ATA 2 3 221243 CASAVA_Build 4 159685039 1D GACCTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 34 0 24 10 T 11 10 221244 CASAVA_Build 4 159696827 1D ACTTAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1533 hom 48 7 26 15 A 17 16 221245 CASAVA_Build 4 159706990 2I TTTTTTTGAG --/AC AGTTTCGCTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AC 0 1 221246 CASAVA_Build 4 159712363 1I TTTCTAACAG -/A AAGCAGCCTG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 2 3 221247 CASAVA_Build 4 159788617 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 965 hom 25 3 18 4 A 13 14 221248 CASAVA_Build 4 159789703 1D TGACAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 28 1 23 6 A 12 11 221249 CASAVA_Build 4 159790884 3D GGGAGATGAA ATC/--- ATTCTGGAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 ATC 1 0 221250 CASAVA_Build 4 159794319 3I ACAAAATGAA ---/AAC AGACCAAGTG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 AAC 0 1 221251 CASAVA_Build 4 159821646 4D AGAGTGTACT CTTA/---- CTTAATTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTTA 2 1 221252 CASAVA_Build 4 159831292 3I CTTAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 AAG 3 4 221253 CASAVA_Build 4 159842758 1I AAATCACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 12 13 221254 CASAVA_Build 4 159854380 17I ATGAGCTTAG -----------------/AACATCTTGTGCAAAAA AGCAAGCAAG 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 AACATCTTGTGCAAAAA 0 1 221255 CASAVA_Build 4 159855756 1D AACAAGCTGA G/- GGGAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 G 4 3 221256 CASAVA_Build 4 159860960 1D ATTTTAAATA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 6 5 221257 CASAVA_Build 4 159867674 7I TGGGTTGGGA -------/CCCGAAG CCTAACCATA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 CCCGAAG 0 1 221258 CASAVA_Build 4 159880759 40D TTTAGACTTG AATCCAAAGATATCTCATCATGTATATGCAAATATTCTGA/---------------------------------------- AATCCAAAGA 3070 hom 36 het 25 0 13 16 AATCCAAAGATATCTCATCATGTATATGCAAATATTCTGA 2 1 221259 CASAVA_Build 4 159889033 1D ACAGCAGCAC A/- AAATGGACTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 4 3 221260 CASAVA_Build 4 159893576 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 29 0 23 6 A 13 14 221261 CASAVA_Build 4 159894266 1I TTTTTTTTTC -/A TTTTTTTTTT 1470 het 1470 ref 22 11 5 6 A 0 1 221262 CASAVA_Build 4 159895706 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 A 9 10 221263 CASAVA_Build 4 159897183 1I TCCTATTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 11 12 221264 CASAVA_Build 4 159897312 8I GGGTGGGCCC --------/TATCAATA TATCAATATG 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 TATCAATA 1 2 221265 CASAVA_Build 4 159897543 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 78 hom 30 2 25 3 T 8 9 221266 CASAVA_Build 4 159899461 1D ATTTTCTCGC T/- TTTTTTTTTT 1302 het 1302 ref 30 21 5 4 T 15 14 221267 CASAVA_Build 4 159901327 1D GATTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 20 0 17 3 A 13 12 221268 CASAVA_Build 4 159902865 1I TGTGTGCCTG -/T TAGTCCCAGC 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 1 2 221269 CASAVA_Build 4 159910784 1I AGCAGTTTGA -/C CCACAGATTC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 C 2 3 221270 CASAVA_Build 4 159920174 1D TTGGTCGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 35 4 13 18 T 17 16 221271 CASAVA_Build 4 159930429 10I GTTGTGGTAG ----------/CCTATTAAGT CCTGGCAGTG 3070 hom 105 het 40 0 33 8 CCTATTAAGT 0 1 221272 CASAVA_Build 4 159931721 1D GCAATAAACG A/- GAAGGTGGAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 7 A 1 0 221273 CASAVA_Build 4 159931869 18D CTGAGGATCC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 2874 het 1976 hom 16 7 7 2 T 29 11 221274 CASAVA_Build 4 159934931 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTGT 2940 het 2436 hom 19 8 9 2 T 8 9 221275 CASAVA_Build 4 159937009 3D GTTCTAGAGC TTA/--- TTGTTCCCAA 3070 het 3070 hom 47 18 25 6 TTA 1 0 221276 CASAVA_Build 4 159952262 2I TTTGTTGATT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 AC 7 8 221277 CASAVA_Build 4 159960001 6D TTGTTTGTAA ATTAAT/------ ATTAATATCT 3070 het 3070 ref 44 21 18 7 ATTAAT 2 1 221278 CASAVA_Build 4 159961313 1D ACCCAGTGAT A/- ACTGTCTTTT 3070 hom 129 het 52 0 41 12 A 2 1 221279 CASAVA_Build 4 160004413 1D TGAAGTAGTT C/- CATATAGGTC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 C 2 1 221280 CASAVA_Build 4 160012009 1D CCAACAAGTA T/- TTTTTTTTTT 1240 het 1240 ref 63 49 3 11 T 11 10 221281 CASAVA_Build 4 160052183 2I CAAGTCCCCC --/CT GTTCCTAGCA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 CT 0 1 221282 CASAVA_Build 4 160061754 2I TTGTTAGAAA --/GT GTGTAGGCTG 2703 het 2703 ref 17 8 6 3 GT 2 3 221283 CASAVA_Build 4 160064155 1I ATACAATTGA -/T TTTTGTATCT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 4 5 221284 CASAVA_Build 4 160071262 3D CCCAGCTAAA TTT/--- TTTATTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 6 3 221285 CASAVA_Build 4 160071539 1D GTTAAACCTC T/- TGAATATATA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 1 221286 CASAVA_Build 4 160080441 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAACAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 5 6 221287 CASAVA_Build 4 160087015 1D CCACATTTCA G/- GGGGGGGGAC 3070 hom 78 het 31 0 25 6 G 9 8 221288 CASAVA_Build 4 160090166 13I TGTACTTCAT -------------/TAGCATATAGATA GTGCTTCATG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TAGCATATAGATA 0 1 221289 CASAVA_Build 4 160094961 3D GAAGTGCCTT CTC/--- CTCCTCCCAC 3070 hom 60 het 21 0 21 1 CTC 3 2 221290 CASAVA_Build 4 160100045 1D CACTAAGGTA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 221291 CASAVA_Build 4 160103889 1D GGTAGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 80 het 43 1 38 4 T 10 9 221292 CASAVA_Build 4 160104968 1I TCAGATGACT -/G TCACAGCCGT 3070 hom 99 het 36 0 31 5 G 0 1 221293 CASAVA_Build 4 160105209 1I AAAGGAATAT -/A AAAAAATTCT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 6 7 221294 CASAVA_Build 4 160105853 3D TACACCAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 23 1 20 2 T 14 11 221295 CASAVA_Build 4 160106320 1D TTGAATAAGC T/- GGGAGTGGAC 3070 hom 100 het 40 0 31 10 T 1 0 221296 CASAVA_Build 4 160111153 2D AAAAAGAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AC 1 0 221297 CASAVA_Build 4 160114833 1D AACAATGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 25 0 21 4 A 11 10 221298 CASAVA_Build 4 160115772 4I TTCTTGTGAC ----/TTTG TTTAAGTTCC 3070 hom 27 het 10 0 9 1 TTTG 0 1 221299 CASAVA_Build 4 160132457 1D TTTAAGCCAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 8 221300 CASAVA_Build 4 160139788 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2996 hom 30 11 13 6 A 9 10 221301 CASAVA_Build 4 160141376 1D GTGTGAGCCA C/- CGGTGCCTGG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 C 2 1 221302 CASAVA_Build 4 160149176 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 9 10 221303 CASAVA_Build 4 160153183 1D GTTGAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 42 0 32 10 T 12 11 221304 CASAVA_Build 4 160154943 1D TAGTCTCAGC T/- ACTCAGGAGG 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 1 0 221305 CASAVA_Build 4 160160467 1I GGGGGACAGT -/A AAATCAGTTC 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 3 4 221306 CASAVA_Build 4 160161749 2D TTCATCACAC AG/-- AAATGACTAG 3070 het 3070 hom 39 18 19 4 AG 1 0 221307 CASAVA_Build 4 160167218 1D TCTTTTTTTT C/- ATTACTGTGT 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 C 1 0 221308 CASAVA_Build 4 160185957 15I GGTATTTTTG ---------------/AGATGATGAAGTCAT AGATACATTA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 AGATGATGAAGTCAT 0 1 221309 CASAVA_Build 4 160187976 2I ACTTTTCTTG --/AT ATTAATTTTG 3070 het 3070 ref 32 15 16 1 AT 1 2 221310 CASAVA_Build 4 160189308 3D CAATGATAAC TAA/--- TAATTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 14 12 13 TAA 2 1 221311 CASAVA_Build 4 160194521 3D AACTTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 13 10 221312 CASAVA_Build 4 160199525 15I TGGCATGTAA ---------------/TACCTTTAATGTGCC TTCCTACTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TACCTTTAATGTGCC 0 1 221313 CASAVA_Build 4 160201687 3D ACCCTATCTC AAA/--- AAAAAAAATA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 11 8 221314 CASAVA_Build 4 160205166 3I CAAAAATGGT ---/CAA CAACAAGATT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 CAA 2 3 221315 CASAVA_Build 4 160207829 1I GAATCTATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 264 hom 31 1 23 7 A 9 10 221316 CASAVA_Build 4 160256156 1D AAGTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 30 1 21 8 T 12 11 221317 CASAVA_Build 4 160301587 1D GAAATTAAAG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 8 7 221318 CASAVA_Build 4 160315899 1D AAAATAATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 10 9 221319 CASAVA_Build 4 160392560 8D ACCGCGGAGG TCTGCAGC/-------- TTCCCTCCTG 2831 het 2831 ref 25 14 8 5 TCTGCAGC 1 0 221320 CASAVA_Build 4 160447542 1I CTATGGGATT -/C CAAAACTGTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 2 221321 CASAVA_Build 4 160475899 3D ACCCAGAGAC AAG/--- AAGGAGTAAG 3070 het 3070 ref 46 26 18 3 AAG 2 1 221322 CASAVA_Build 4 160499275 2I TCCTCCTTTT --/AA AAAAAAAAAA 1863 het 478 hom 51 1 9 41 A 12 14 221323 CASAVA_Build 4 160513825 1D TCTGTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 25 9 8 A 13 12 221324 CASAVA_Build 4 160531982 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1982 hom 30 15 8 7 A 16 15 221325 CASAVA_Build 4 160536466 1I CTAGTCTTAA -/G GGAAAGCACA 3070 het 3070 hom 56 21 28 7 G 2 3 221326 CASAVA_Build 4 160537571 2I AACTCCCCTT --/TA TATATATATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TA 7 8 221327 CASAVA_Build 4 160544619 4D TGCCCAACTC ATCA/---- ATTTATTGAT 3070 hom 161 het 58 0 52 9 ATCA 1 0 221328 CASAVA_Build 4 160554424 3I CGTTTGACAC ---/TTG TTGTTATGGG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 TTG 1 2 221329 CASAVA_Build 4 160557690 1I CTCTGTTTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 174 hom 41 1 35 5 A 9 10 221330 CASAVA_Build 4 160562397 1I GTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 332 hom 43 1 30 12 A 10 11 221331 CASAVA_Build 4 160565196 2I ACATATTATA --/TG TGTGTGTGTG 1979 hom 21 het 8 0 8 3 TG 5 6 221332 CASAVA_Build 4 160566778 1D GTGAGGGGTT G/- GGGGGGAGGT 3070 hom 158 het 62 0 53 9 G 7 6 221333 CASAVA_Build 4 160567211 4D TTATTAATGT TTTA/---- TTTATTTTTT 3070 hom 138 het 50 0 47 7 TTTA 2 1 221334 CASAVA_Build 4 160567600 1D CATTAGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 518 hom 62 4 36 22 T 15 14 221335 CASAVA_Build 4 160576025 1I TCAAGTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 63 21 27 15 T 10 11 221336 CASAVA_Build 4 160578479 1I GCCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 2474 hom 8 het 26 1 16 9 C 0 1 221337 CASAVA_Build 4 160579092 1I TGTCAGCTGG -/C GGTCCCTCTC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 C 0 1 221338 CASAVA_Build 4 160579788 2D CCCAATCAAG TT/-- TTTTTTTTTT 2136 het 48 hom 17 2 9 7 T 18 16 221339 CASAVA_Build 4 160587379 1D CTGGCTTTCT G/- GGACTGTCCT 3070 hom 129 het 45 0 44 2 G 3 2 221340 CASAVA_Build 4 160587806 5D CCTTTAAGTA TTATG/----- TTATTTGATT 3070 het 3070 ref 43 22 15 7 TTATG 1 0 221341 CASAVA_Build 4 160597751 1I TTTTGGGTAA -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 5 6 221342 CASAVA_Build 4 160598094 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAATAAA 2801 het 2801 ref 13 6 6 1 A 7 6 221343 CASAVA_Build 4 160599959 1I CCATTTTGCC -/T TCCGCTATGA 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 T 1 2 221344 CASAVA_Build 4 160600824 2I TGAAAATAAC --/AT GTCAGGATCT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 AT 0 1 221345 CASAVA_Build 4 160608075 1I GAGTGTGTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 8 9 221346 CASAVA_Build 4 160615190 1D AAATGTTCAA C/- ATACTAATCA 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 C 1 0 221347 CASAVA_Build 4 160615923 5D GTACCCCAAG AATCT/----- AATCTAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 15 7 AATCT 2 1 221348 CASAVA_Build 4 160617802 1I TATGTCAAAG -/T TTTAGTCACT 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 T 3 4 221349 CASAVA_Build 4 160622035 1I TACATTTATT -/A AATTTTAATC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 2 3 221350 CASAVA_Build 4 160635312 12D TTGGAGCATC CAGCCTCAGCCT/------------ CAGCCTCAGC 3070 het 3070 ref 37 20 13 8 CAGCCT 3 1 221351 CASAVA_Build 4 160647467 1I ATTCAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 10 11 221352 CASAVA_Build 4 160656347 1I ATATATTGTG -/T CTTTTCAACT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 0 1 221353 CASAVA_Build 4 160661186 1I GGGTTCAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 T 9 10 221354 CASAVA_Build 4 160678493 1I CATGTTCTCA -/T TTTAATAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 3 4 221355 CASAVA_Build 4 160684886 1I GGGCTTGGGA -/C GGGCCATGGG 3070 hom 78 het 35 0 28 8 C 0 1 221356 CASAVA_Build 4 160688316 1D CTTTTCATTT A/- AAAAAATGCA 3070 hom 132 het 51 0 45 8 A 7 6 221357 CASAVA_Build 4 160719283 1D TCTCTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 T 12 11 221358 CASAVA_Build 4 160732720 3I CAACACTGAT ---/GTG GTAAGAATTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 GTG 0 1 221359 CASAVA_Build 4 160737998 5I TGTTATAATT -----/AATAA AATAGGAAAG 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 AATAA 0 1 221360 CASAVA_Build 4 160739389 1D TGCTGGGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 A 14 13 221361 CASAVA_Build 4 160753134 1D ATTTTAGATC T/- TTTCCTGCTT 2931 het 2931 ref 15 8 6 1 T 4 3 221362 CASAVA_Build 4 160767175 5I TACTGTATCT -----/ATTTG ATTCTTCTCT 2691 het 2691 ref 20 12 6 2 ATTTG 0 1 221363 CASAVA_Build 4 160768470 1I CCTGGCACTG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 37 22 14 3 T 6 7 221364 CASAVA_Build 4 160769999 15I TCCTTTCTTT ---------------/CAGAGATGCCTTACC CAGAGATTAG 2486 het 2486 ref 16 7 6 3 CAGAGATGCCTTACC 0 1 221365 CASAVA_Build 4 160771108 4D TGGGCAAAAA GAGT/---- GAAATTTCTT 3051 het 1451 hom 15 5 7 3 GAGT 1 0 221366 CASAVA_Build 4 160771997 4D TACAGCAGAG GATT/---- GATTACCTAG 3070 het 3070 ref 45 22 18 7 GATT 2 1 221367 CASAVA_Build 4 160772100 1D TTCCATTTAT G/- CAAACTCTAG 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 G 1 0 221368 CASAVA_Build 4 160772550 1D TGGAGGTGCA C/- CAGAGGTAGC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 C 2 1 221369 CASAVA_Build 4 160773571 4D CTTTACTTCT TTAA/---- TTATTTTATC 3070 het 3070 ref 34 18 12 7 TTAA 1 0 221370 CASAVA_Build 4 160775003 4I GTTTGTATGT ----/GGCG GGGGGGGGGC 1776 het 1776 ref 31 14 11 6 GGCG 0 1 221371 CASAVA_Build 4 160776465 1I TCTTTTTATC -/A AAAAAGAATT 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 A 5 6 221372 CASAVA_Build 4 160777393 1D GTAATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 T 13 12 221373 CASAVA_Build 4 160810855 1D TGTATCAATC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 42 0 32 10 T 9 8 221374 CASAVA_Build 4 160815996 1D TCTTTAATGC T/- TTTTTTTTTT 1794 het 1794 ref 40 28 5 8 T 13 12 221375 CASAVA_Build 4 160816254 1I TGCAATGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 878 hom 43 3 33 7 A 12 13 221376 CASAVA_Build 4 160819013 1I TCTTACTGTC -/T TTTTTCTACT 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 T 5 6 221377 CASAVA_Build 4 160822400 1I TGATCTATGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 8 9 221378 CASAVA_Build 4 160829433 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 46 hom 35 2 18 15 A 9 8 221379 CASAVA_Build 4 160829524 1D AGTTTTTAAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 8 7 221380 CASAVA_Build 4 160830054 6D GATGAAAGAC ATAAAT/------ ATAAACATCT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 ATAAAT 1 0 221381 CASAVA_Build 4 160831857 15I AGAATGAACT ---------------/AAATCCAAATCTTGC AGAGTGAAAA 3070 hom 90 het 30 0 30 3 AAATCCAAATCTTGC 0 1 221382 CASAVA_Build 4 160834756 2I3M1D ACAATAGCTA --TATG/GCTAT- TGAGATCAAC 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 N/A 0 0 221383 CASAVA_Build 4 160836750 1D TTTTTTTTTT C/- CATTTATGAA 3070 hom 81 het 35 0 27 8 C 2 1 221384 CASAVA_Build 4 160839672 2D TCCATTTTTC TG/-- TGTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 TG 2 1 221385 CASAVA_Build 4 160839796 4D TTTTTTAAAT TTTC/---- TTTTTCACAT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 TTTC 1 0 221386 CASAVA_Build 4 160840227 1D TTTTTTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 11 10 221387 CASAVA_Build 4 160841271 1I ACACTCTTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 T 8 9 221388 CASAVA_Build 4 160841448 1I GCTTTGCATC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 8 9 221389 CASAVA_Build 4 160844728 2I GAATACATGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 9 11 221390 CASAVA_Build 4 160845994 1D ATGAGGACTC T/- TTTTTTTTTT 1191 het 58 hom 30 0 5 25 T 18 17 221391 CASAVA_Build 4 160858485 2D AATAATAATA AT/-- AAAAAAAGAA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 AT 1 0 221392 CASAVA_Build 4 160858848 1D TAAGAGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 12 12 A 13 12 221393 CASAVA_Build 4 160879950 1I GCAACAAATG -/T TAAGTGTTGG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 1 2 221394 CASAVA_Build 4 160881211 1I TGATTTCATG -/T TTTTTTGTGA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 6 7 221395 CASAVA_Build 4 160883753 5I AAGCCTTTTA -----/TTATC TTTTGTTTCA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 TTATC 0 1 221396 CASAVA_Build 4 160883897 1D TTCAGACTTC T/- TGATAAGGCT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 2 1 221397 CASAVA_Build 4 160885058 18D GTGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGTGTGG/------------------ GTGTGTATGT 3070 hom 84 het 42 1 39 8 GTGTGTGTGTGTGTGTGG 1 0 221398 CASAVA_Build 4 160885249 3D TCATATAGGA AAC/--- AACAAGGTGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AAC 2 1 221399 CASAVA_Build 4 160885383 3I AAAATGTCTA ---/CTT CTGCTTGATG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 CTT 0 1 221400 CASAVA_Build 4 160886443 1I CACATTACTA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 7 8 221401 CASAVA_Build 4 160889448 2I GATGTAATAC --/CA CTTGTGTATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CA 0 1 221402 CASAVA_Build 4 160890250 1I TTAAAGAGAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 385 hom 31 1 25 5 T 8 9 221403 CASAVA_Build 4 160894309 18I TACTAGGGCT ------------------/AAAAATGTTTTATGTGCC ACCCTACAGT 3070 hom 96 het 34 0 33 5 AAAAATGTTTTATGTGCC 0 1 221404 CASAVA_Build 4 160898021 1D TACCTTATTT A/- AAAAAAAAAC 1191 hom 29 het 37 0 10 27 A 10 9 221405 CASAVA_Build 4 160899673 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 11 10 221406 CASAVA_Build 4 160903291 1D ACTACTAATC T/- TTTTCTCTAT 3070 hom 144 het 53 0 47 6 T 5 4 221407 CASAVA_Build 4 160904138 1D TGAATCATAC T/- TTCATATCAA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 T 3 2 221408 CASAVA_Build 4 160904845 1D TTCTGGATGG T/- TTTTTTTTTT 1194 het 1194 ref 35 20 4 11 T 15 14 221409 CASAVA_Build 4 160907914 2I CTAATTTCCC --/AG AGAGTAAACT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AG 2 3 221410 CASAVA_Build 4 160912185 1D TATTTATCAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 111 het 45 0 38 9 T 8 7 221411 CASAVA_Build 4 160923436 1D TTCCTTCATG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 121 het 45 0 41 5 T 9 8 221412 CASAVA_Build 4 160930503 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 8 1 A 12 11 221413 CASAVA_Build 4 160931281 4I CAGGATCAAC ----/ACAT ACAAGTTTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 ACAT 0 1 221414 CASAVA_Build 4 160935582 1D ATGGAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 35 1 21 14 T 13 12 221415 CASAVA_Build 4 160965750 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 22 1 17 5 A 15 14 221416 CASAVA_Build 4 160968074 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1730 het 558 hom 21 2 7 12 A 17 16 221417 CASAVA_Build 4 160979434 2D TGATTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 13 11 221418 CASAVA_Build 4 160980735 2I CTTCTTATTT --/GG GGGGGGGGTG 1596 hom 30 het 20 0 9 11 G 8 10 221419 CASAVA_Build 4 160980775 1I TTTTACGCTT -/A AAAAAATAAC 3070 hom 35 het 18 0 12 6 A 6 7 221420 CASAVA_Build 4 160981488 10D TGTGTGTGTG TATATATATA/---------- TATATATATA 2678 hom 33 het 12 0 12 5 TA 13 8 221421 CASAVA_Build 4 161004841 2D AAAAATAAAC AG/-- AGATCTTGAA 3070 hom 132 het 47 0 44 3 AG 2 1 221422 CASAVA_Build 4 161007781 3D TTTGTTGATT AAG/--- AAGAATTCTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AAG 2 1 221423 CASAVA_Build 4 161010721 1D ATTCTAATGC A/- AGCATTTCAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 2 1 221424 CASAVA_Build 4 161012435 1D CTCTACAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 21 1 11 9 T 13 12 221425 CASAVA_Build 4 161013007 1D TGACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 26 1 21 4 T 15 14 221426 CASAVA_Build 4 161013347 1I CATTAACTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 8 9 221427 CASAVA_Build 4 161013853 1I CCACTTTTTG -/A ATGGGGTTGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 1 2 221428 CASAVA_Build 4 161023540 1D TATCACTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 10 9 221429 CASAVA_Build 4 161025291 4D GTTTTCTCAC AGTT/---- ATTTATTAAT 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 AGTT 1 0 221430 CASAVA_Build 4 161027307 2D TAAAGTAAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TA 7 6 221431 CASAVA_Build 4 161031897 2D TTCCAAAGTG GC/-- TGTGACATTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GC 1 0 221432 CASAVA_Build 4 161036710 1D TCTTCCTTAA T/- GTATAAATTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 0 221433 CASAVA_Build 4 161037879 1I GTCCCCACCC -/A AATCTCATTT 3070 hom 91 het 33 0 29 4 A 2 3 221434 CASAVA_Build 4 161043222 1I ACTGATTTGA -/T TAAAAACCCA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 1 2 221435 CASAVA_Build 4 161045691 10D GGTCTGTGGC TTTTGATTAG/---------- TTTTGCTAAA 3070 hom 123 het 45 0 38 8 TTTTGATTAG 1 0 221436 CASAVA_Build 4 161047808 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 14 1 11 2 A 11 10 221437 CASAVA_Build 4 161048403 2D ACATACTGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 45 0 34 11 A 13 11 221438 CASAVA_Build 4 161060500 2D TATATGTATG CA/-- CACACACACA 1590 het 1590 ref 40 25 6 9 CA 10 9 221439 CASAVA_Build 4 161099408 4D ATGTTAAAAC TTGA/---- TTGATCCCTA 3070 hom 93 het 37 0 30 8 TTGA 2 1 221440 CASAVA_Build 4 161099761 2I AAGAAGCCTC --/TT TTCTTTATAA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 T 2 4 221441 CASAVA_Build 4 161241969 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2304 hom 28 10 12 7 AT 7 6 221442 CASAVA_Build 4 161276361 1D TCACTATATT A/- AAAAAAAAAA 1635 het 1635 ref 33 25 4 4 A 12 11 221443 CASAVA_Build 4 161277900 2D GGAGAAAATC TG/-- TGTATAAGTG 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 TG 2 1 221444 CASAVA_Build 4 161281257 2D TACTGTGACC AA/-- AAAAAAAAAA 1058 het 1058 ref 32 24 3 8 A 13 11 221445 CASAVA_Build 4 161287562 9I GTCTGTCACT ---------/ATTACATCA ATTTAATTGG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 ATTACATCA 0 1 221446 CASAVA_Build 4 161299366 2D TTAAAATTTT AA/-- AAGTCTTTTC 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 4 2 221447 CASAVA_Build 4 161307133 1I AAGTTTTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 235 hom 34 2 25 7 A 11 12 221448 CASAVA_Build 4 161318232 1D TCGGGTAAAC A/- ATGAAATTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 2 1 221449 CASAVA_Build 4 161322033 1I ACAATAATAC -/A AAAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 4 5 221450 CASAVA_Build 4 161324067 1D AGAATCTTGT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 8 7 221451 CASAVA_Build 4 161330591 1I TTCCAGACTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 9 10 221452 CASAVA_Build 4 161357832 1I CCTGGAACTT -/A AAAAAATAAA 1669 het 1669 ref 16 9 4 3 A 6 7 221453 CASAVA_Build 4 161362118 1I GTGTTGAAGA -/C CCCCCACTAT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 C 5 6 221454 CASAVA_Build 4 161366091 1D GTGGTATGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2381 hom 34 8 19 8 A 10 9 221455 CASAVA_Build 4 161367098 3D CTCAATCATA TAC/--- TTTGGGATGA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 TAC 1 0 221456 CASAVA_Build 4 161367689 1D TAATACTGAC A/- AAATGATAGA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 4 3 221457 CASAVA_Build 4 161368143 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 2237 het 1016 hom 17 4 7 6 T 14 13 221458 CASAVA_Build 4 161368674 2D CATGGAAACA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 12 13 6 T 11 9 221459 CASAVA_Build 4 161385654 1D GTGTTACCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 11 8 9 T 10 9 221460 CASAVA_Build 4 161400118 4I TCTTTCTTTC ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 37 0 29 8 T 11 15 221461 CASAVA_Build 4 161404034 2I TATATATAGA --/TC TCTCTCTCTC 2210 hom 18 het 10 0 6 4 TC 7 8 221462 CASAVA_Build 4 161417937 1D CAGGCAGGTA C/- CCCCCCTGGG 3070 hom 80 het 31 0 27 5 C 7 6 221463 CASAVA_Build 4 161420497 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 25 1 17 7 A 11 10 221464 CASAVA_Build 4 161423311 5I CCTTTATTGT -----/GATGA GATAAGTTCC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 GATGA 0 1 221465 CASAVA_Build 4 161424887 4D GTTTGAAACA TTGT/---- TTGTATGGTA 3070 het 3070 hom 30 15 15 2 TTGT 2 1 221466 CASAVA_Build 4 161426423 2I GACTCTTATC --/TT TATGATCTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 1 3 221467 CASAVA_Build 4 161430307 4I AGCCCTTCCT ----/AAAC AAACAAATGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAAC 1 2 221468 CASAVA_Build 4 161441038 1I TTGTTTTAAT -/A TTTTTATTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 0 1 221469 CASAVA_Build 4 161442746 1D CTATAAAAAA G/- AACATGCCAT 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 G 1 0 221470 CASAVA_Build 4 161445722 1I TCCACAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 10 11 221471 CASAVA_Build 4 161449462 1D TTATCTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 T 12 11 221472 CASAVA_Build 4 161455311 2D CTTGGAAAAC AA/-- AAGTCACTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 4 2 221473 CASAVA_Build 4 161459771 10I TTATGTTTCT ----------/ATGTATTATG TTCAGTATTA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 ATGTATTATG 0 1 221474 CASAVA_Build 4 161464755 4D TATTTCATTA TTAT/---- TTATTTAATA 3070 hom 111 het 41 0 38 5 TTAT 2 1 221475 CASAVA_Build 4 161491154 2D TGTATATATG TA/-- TATATATATA 2959 het 2959 ref 20 9 9 2 TA 6 5 221476 CASAVA_Build 4 161520493 1D CAGTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 34 2 24 8 A 15 14 221477 CASAVA_Build 4 161523649 1D ACTGTTATCA T/- TGATAGCGAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 2 1 221478 CASAVA_Build 4 161529359 2D GATGAGATGA TT/-- TTTTTTTTTT 1601 het 131 hom 17 3 6 8 T 18 16 221479 CASAVA_Build 4 161532197 2D GTATAAGCAT GA/-- GAGCAGCTTT 3070 hom 156 het 60 0 52 9 GA 2 1 221480 CASAVA_Build 4 161533238 1D AACAGTGATT A/- AAAGCTTAAG 3070 hom 99 het 43 0 33 10 A 4 3 221481 CASAVA_Build 4 161539399 2D GAAGCATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1143 het 1143 ref 40 25 3 13 TG 8 7 221482 CASAVA_Build 4 161558444 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTATT 3070 het 38 hom 13 1 11 1 A 1 0 221483 CASAVA_Build 4 161592775 1I CTCTGTCTTT -/A AAAAAGAAAA 2667 het 2667 ref 25 11 9 5 A 5 6 221484 CASAVA_Build 4 161602024 3I TTGCTGTGAG ---/TGT TGTTTGTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TGT 1 2 221485 CASAVA_Build 4 161604937 3I TTTTTAAAAA ---/AAC AAGGACAGTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AAC 0 1 221486 CASAVA_Build 4 161606834 1I TTCTTGTATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 28 1 21 6 T 11 12 221487 CASAVA_Build 4 161613450 1D AGGAGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 19 17 12 A 13 12 221488 CASAVA_Build 4 161613902 4I TTACTTAAAT ----/TCTA TCTATCTACC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TCTA 2 3 221489 CASAVA_Build 4 161625017 1D TTTACAGAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 28 0 23 5 A 9 8 221490 CASAVA_Build 4 161626359 1I AAACATATTT -/A ATCCAAAGAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 1 2 221491 CASAVA_Build 4 161633080 1I GGCTCAGCTT -/A AAAAAAAAAA 1439 het 774 hom 24 4 7 13 A 16 17 221492 CASAVA_Build 4 161637616 5I AATAGAAGAC -----/AAAAT AAAAACAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAAAT 0 1 221493 CASAVA_Build 4 161645495 42D TGAGATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATACACACACACAC/------------------------------------------ ATATATATAG 3070 hom 39 het 14 0 14 1 ATATATATATATATATATATATATATATATACACACACACAC 1 0 221494 CASAVA_Build 4 161646670 1D ATAAGGCAAT G/- TTTTTCCCTC 3070 hom 105 het 39 0 35 5 G 1 0 221495 CASAVA_Build 4 161648441 1D AGACTTATTT C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 C 1 0 221496 CASAVA_Build 4 161651307 1D GTGGAAAGGC T/- TTGTGGACCT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 3 2 221497 CASAVA_Build 4 161660144 1D TAGGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 32 0 23 9 T 11 10 221498 CASAVA_Build 4 161666655 4D TCCTTCCTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 31 1 17 13 T 16 12 221499 CASAVA_Build 4 161667987 4D TTTTACTTTC CTCT/---- CTCTCCTTTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 CT 4 2 221500 CASAVA_Build 4 161675300 1D ATAATCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 32 1 23 9 T 13 12 221501 CASAVA_Build 4 161675946 1D TATTTAAGGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 8 221502 CASAVA_Build 4 161676779 2D TTCTATATCT AA/-- GTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 2 0 221503 CASAVA_Build 4 161678628 1D AAACGAGAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 9 8 221504 CASAVA_Build 4 161680046 3I GCCGTACATT ---/AAA AAAACAAGCT 3070 hom 144 het 58 0 48 10 A 4 7 221505 CASAVA_Build 4 161693454 1D ATTATCTCAC A/- AAAAATATAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 6 5 221506 CASAVA_Build 4 161697529 4D10M3I CTCACTAAAG AAGAAAGAAAGAAC---/----AAGAAAGAACTGT TGTTGTTCTT 3070 hom 154 het 48 0 52 2 N/A 0 0 221507 CASAVA_Build 4 161698014 22D TACTTACTAC TGGTTAACAATTATTGTACAAT/---------------------- TGGTTAACAA 3070 hom 75 het 27 0 25 7 TGGTTAACAATTATTGTACAAT 1 0 221508 CASAVA_Build 4 161701489 4D TAATTCCACG ATTT/---- ATTTCACGCA 3070 hom 138 het 51 0 47 7 ATTT 2 1 221509 CASAVA_Build 4 161705625 1I ATATAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 32 2 23 7 T 11 12 221510 CASAVA_Build 4 161708743 3D GGATCACAAA AGT/--- AGTAGTAACA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AGT 3 2 221511 CASAVA_Build 4 161713494 1I TGTACTTAAT -/A AAACCATGGA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 3 4 221512 CASAVA_Build 4 161721553 1I GTTTGGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 37 2 27 8 A 11 12 221513 CASAVA_Build 4 161733329 3I CTTCCTGCCA ---/CCT CCAGACTCGT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 CCT 0 1 221514 CASAVA_Build 4 161734159 1D CAGAAATAGC T/- TTTTTGAGAG 3070 hom 104 het 41 0 33 8 T 6 5 221515 CASAVA_Build 4 161737181 5I ATTTTGTATA -----/AATTT ATTTCTTAGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AATTT 0 1 221516 CASAVA_Build 4 161792666 2I ATTGTCTTTT --/AA AGACATAATG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 3 221517 CASAVA_Build 4 161819501 4I TTAACGTGCT ----/TGAG TATTATCTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TGAG 0 1 221518 CASAVA_Build 4 161825194 1D TTGAGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 24 1 19 5 A 11 10 221519 CASAVA_Build 4 161826806 1D AATAGCTCTG C/- CCCCCCTGCC 3070 hom 162 het 60 0 46 14 C 7 6 221520 CASAVA_Build 4 161838660 1I ATAGACTGCT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 9 221521 CASAVA_Build 4 161851725 1D CCCAAAGGAT G/- GGATATTCAT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 G 3 2 221522 CASAVA_Build 4 161852398 1I AATAAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 26 1 22 3 T 10 11 221523 CASAVA_Build 4 161854581 1D TTCTCACTCA T/- AAGCGGGAGT 3070 hom 75 het 27 0 23 5 T 1 0 221524 CASAVA_Build 4 161864372 1I ATATTTGAGC -/T TTTTTTACCT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 6 7 221525 CASAVA_Build 4 161864528 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 44 1 27 16 T 14 13 221526 CASAVA_Build 4 161868958 1D GCTTTTTGTT C/- CCCATAGAAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 4 3 221527 CASAVA_Build 4 161871593 2D GAGATAGAGA GG/-- GGCATGGGTG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 4 2 221528 CASAVA_Build 4 161871842 1I CCACTGTTAC -/A AAAAAAAAAA 1834 het 1834 ref 47 30 5 12 A 13 14 221529 CASAVA_Build 4 161872072 1D GTGAGAAACT C/- CCAGCACCCA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 C 3 2 221530 CASAVA_Build 4 161876616 2I TATAAAAGAC --/AT ATTTTCTCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 1 2 221531 CASAVA_Build 4 161876779 5D TCTAACAGTC TAGTA/----- TATAAATTCT 3070 hom 93 het 34 0 31 5 TAGTA 1 0 221532 CASAVA_Build 4 161880917 1I TGTTTTTTTT -/A ACCATCTAGA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 1 2 221533 CASAVA_Build 4 161902610 2D AACTCTATAT AG/-- AGTCTTTGCA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AG 2 1 221534 CASAVA_Build 4 161914577 1D GGAAACAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 422 hom 32 1 24 7 A 9 8 221535 CASAVA_Build 4 161924675 2D AGCAGCATAA CT/-- CACAACTGGG 3070 hom 81 het 33 0 26 8 CT 1 0 221536 CASAVA_Build 4 161932341 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 7 8 221537 CASAVA_Build 4 161934806 1D ACTATGACTG A/- AAAAAAAAAG 1799 het 1799 ref 50 37 4 9 A 10 9 221538 CASAVA_Build 4 161944887 4D TAATACACAT TTAA/---- TTAATATGTA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TTAA 2 1 221539 CASAVA_Build 4 161953429 2D GTGATATGAT AA/-- AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 31 0 25 8 A 10 8 221540 CASAVA_Build 4 161953788 1D AATGTAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 5 A 10 9 221541 CASAVA_Build 4 161953983 3D TCTCTTACTT TTC/--- TTGTCATTCT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TTC 1 0 221542 CASAVA_Build 4 161954539 1D63M1I TCTGTTTTGA TTTTTTTTGTTTTTTAGTTTATTTGATTTTGGCTTTTTAGAGGTTCTCGGATATGTGGGTTGGA-/-TTTTTTTGTTTTTTAGTTTATTTGATTTTGGCTTTTTAGAGGTTCTCGGATATGTGGGTTGGAT TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 39 1 50 5 N/A 0 0 221543 CASAVA_Build 4 161965805 1D ATGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 1062 het 1062 ref 30 19 3 8 T 10 9 221544 CASAVA_Build 4 162017014 1I TCACATCTTT -/G GAGCATATAT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 G 1 2 221545 CASAVA_Build 4 162020501 1D ATTTGTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 32 1 26 5 T 11 10 221546 CASAVA_Build 4 162025016 2I AAGTATAAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 AT 7 8 221547 CASAVA_Build 4 162035420 1D GAATATGGGG A/- AAAGAAACAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 4 3 221548 CASAVA_Build 4 162037688 1D CAATGTGGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 10 9 221549 CASAVA_Build 4 162053616 8D GCACTATATA TATATATG/-------- TATATATGTA 1888 het 603 hom 14 3 8 5 TATATATG 3 2 221550 CASAVA_Build 4 162056474 1I ATCTATTTTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 0 1 221551 CASAVA_Build 4 162057029 2D TATCTATCTA TC/-- TATCTATCTA 894 het 97 hom 22 1 3 18 TC 1 0 221552 CASAVA_Build 4 162062559 2D TTCAAAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 A 12 10 221553 CASAVA_Build 4 162063027 2D TCCTTTGCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2943 hom 31 10 16 5 T 13 11 221554 CASAVA_Build 4 162065629 4I TTTTGTCTAC ----/CTGT CTTTCTCATC 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 CTGT 0 1 221555 CASAVA_Build 4 162067485 1I ATTCAGAAGT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 7 8 221556 CASAVA_Build 4 162069431 3D AGATACTGCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 21 14 5 A 14 11 221557 CASAVA_Build 4 162072328 1D ATAATTTTAA T/- CCCTCAAGAT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 1 0 221558 CASAVA_Build 4 162075690 1I CATTTAAAGA -/C AAAGCATTTT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 C 0 1 221559 CASAVA_Build 4 162076215 4D TTTTGTTAAA AGTT/---- AGGTTAACCC 3070 het 3070 hom 24 9 15 3 AGTT 1 0 221560 CASAVA_Build 4 162084846 2D CATTAATCTA TC/-- TCTATATAAT 3070 het 3070 ref 30 12 11 9 TC 2 1 221561 CASAVA_Build 4 162085615 1I CATTATGAGA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 8 9 221562 CASAVA_Build 4 162087131 2I GCGTGTGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 45 14 26 5 AT 5 6 221563 CASAVA_Build 4 162087676 1I CATTATGAGA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 7 8 221564 CASAVA_Build 4 162108009 1D ATATTTTATT C/- TTTTTAATCT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 C 1 0 221565 CASAVA_Build 4 162108838 1D TTATCATGCT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 8 7 221566 CASAVA_Build 4 162109658 1D GTTATTTGGG A/- AAAAAACCTC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 7 6 221567 CASAVA_Build 4 162110849 1D TTCATTTCTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 9 8 221568 CASAVA_Build 4 162115285 1D AAATCAACTT A/- ACAAAAATCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 1 221569 CASAVA_Build 4 162115735 1I TAGAATAACC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 8 9 221570 CASAVA_Build 4 162117294 1D AACTATTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 9 9 A 12 11 221571 CASAVA_Build 4 162118207 8D ACAATAATCA GAGTGCAG/-------- ATTGTGAAGA 3070 het 3070 ref 57 37 16 7 GAGTGCAG 1 0 221572 CASAVA_Build 4 162135845 4D TCTTTATTCA ATCC/---- ATCCACCATT 3070 hom 117 het 42 0 40 4 ATCC 2 1 221573 CASAVA_Build 4 162140115 3I AAAGATAATC ---/ATT ATTCAAAATA 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 ATT 1 2 221574 CASAVA_Build 4 162148151 15I CTATCCCTGA ---------------/GACCAATATACCATT GACCAAAATA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 GACCAATATACCATT 0 1 221575 CASAVA_Build 4 162148863 1I TATCACAAAC -/T TTTTAAGAAG 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 T 4 5 221576 CASAVA_Build 4 162150014 4I TTTTCTTGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 TTTG 3 4 221577 CASAVA_Build 4 162152076 4D TGTTCATTTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 AAAC 5 4 221578 CASAVA_Build 4 162152519 33D ACCCCCCAAA ATTTGAATGGGGACTTTAAATTAATATTAAATT/--------------------------------- ATTGATGGAA 3070 het 3070 ref 27 16 13 3 ATTTGAATGGGGACTTTAAATTAATATTAAATT 1 0 221579 CASAVA_Build 4 162153109 1D TTTTTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 39 1 28 10 A 14 13 221580 CASAVA_Build 4 162153779 4D AATTTTTGGT GAGA/---- GAGTTTGTGT 3070 het 3070 hom 50 24 25 2 GA 3 1 221581 CASAVA_Build 4 162154851 1I ATAATCAAAA -/G TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 0 1 221582 CASAVA_Build 4 162155062 3D CTTGTATTAT AGG/--- TTATATTTTG 3070 het 3070 hom 36 17 16 4 AGG 1 0 221583 CASAVA_Build 4 162157676 1I AATTCCCATG -/T GTTATGGGAG 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 0 1 221584 CASAVA_Build 4 162164038 5D CTTAATTTAA AACAC/----- AACCGCTTTA 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 AACAC 1 0 221585 CASAVA_Build 4 162164236 1I TCAGCTTTAA -/T TATTATGGGA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 T 1 2 221586 CASAVA_Build 4 162166602 1I TGGGAAATCT -/G GGAAACTAGA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 G 2 3 221587 CASAVA_Build 4 162166767 4I TGCATAAAAG ----/AGAC AATAAAATAT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AGAC 0 1 221588 CASAVA_Build 4 162166886 1D AAAAATAAAA G/- CACTTTTGGT 3070 hom 96 het 38 0 31 7 G 1 0 221589 CASAVA_Build 4 162171570 1I AAGTATAATT -/A AAAAGAAAAA 3070 hom 17 het 27 1 23 3 A 4 5 221590 CASAVA_Build 4 162173477 4D ATTCTTTCTA TGAC/---- TGATTTATGT 3070 het 3070 ref 36 16 13 11 TGAC 1 0 221591 CASAVA_Build 4 162173942 1D38M2I CAAACACAAC TTTTTTGAAATAAGGTCATTCATGTAGCTTAATTCTACT--/-TTTTTGAAATAAGGTCATTCATGTAGCTTAATTCTACTAA AAGAGATTTA 3070 hom 96 het 33 0 33 10 N/A 0 0 221592 CASAVA_Build 4 162175086 1I TAATATGATT -/A TTTTTACTAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 0 1 221593 CASAVA_Build 4 162175186 1I30M1D GTTAATTGCT -GTATTTAAGAACATACATTATTCATAAATTA/GGTATTTAAGAACATACATTATTCATAAATT- TTGATGTGGC 3070 hom 129 het 45 0 44 10 N/A 0 0 221594 CASAVA_Build 4 162175477 2D TAAGGGAAAC TT/-- GATGTATTAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 0 221595 CASAVA_Build 4 162175601 2D AGTGATTCCT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 11 9 221596 CASAVA_Build 4 162176144 7D CCAAATATAC ATAGTAT/------- ATAGTATATA 3070 hom 90 het 37 0 31 10 ATAGTAT 2 1 221597 CASAVA_Build 4 162176666 16D20M1D ATGCACAGGT TTTTTTTCATTGTTTCTTTTTTTTCATTGTTTTTTTA/----------------TTTTTTTTCATTGTTTTTTT- TTCTTTGTTT 3070 hom 81 het 24 0 28 5 N/A 0 0 221598 CASAVA_Build 4 162182283 2D ACATATATTA TG/-- TGTCAATAAA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 TG 2 1 221599 CASAVA_Build 4 162185325 3D TCAGTTCACA TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 TTC 4 3 221600 CASAVA_Build 4 162192252 1I TTTGCAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 13 14 221601 CASAVA_Build 4 162196809 1I ATGTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2848 het 2702 hom 29 12 9 8 T 13 14 221602 CASAVA_Build 4 162197096 1D CCTGCCTCAG C/- CTCCCAAGTA 3070 het 3056 hom 20 7 10 3 C 2 1 221603 CASAVA_Build 4 162204288 4D TGGGTGAGTC AGTG/---- AGTGAGTGGT 2766 het 2766 ref 28 19 7 2 AGTG 3 2 221604 CASAVA_Build 4 162211026 1I TTCTCTAACA -/T TTAACCTCTG 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 T 2 3 221605 CASAVA_Build 4 162221746 4D GAATAGTAGC TAGT/---- TAGTTTCATT 3070 het 3070 ref 43 27 14 5 TAGT 2 1 221606 CASAVA_Build 4 162226213 1I AAATATATAT -/A AAAAAAATTG 1689 hom 10 het 5 0 4 1 A 7 8 221607 CASAVA_Build 4 162233109 10I CTGTGCTCTA ----------/TCAGATGAGT CACTGAAATC 3070 hom 132 het 48 0 44 4 TCAGATGAGT 0 1 221608 CASAVA_Build 4 162239036 4I AAAAAAAGGG ----/TGAA TGAATGAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 TGAA 2 3 221609 CASAVA_Build 4 162239910 2D GAATTAACTA TG/-- TGTGTGTATA 3070 het 3070 hom 35 12 21 4 TG 4 3 221610 CASAVA_Build 4 162240397 1I TCCCCAATGG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 A 7 8 221611 CASAVA_Build 4 162242160 6D TGTTCTATAG TTTTAC/------ TTTTAGTAAT 3070 het 3070 hom 40 18 21 2 TTTTAC 1 0 221612 CASAVA_Build 4 162242269 1D AGAGATTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 10 9 221613 CASAVA_Build 4 162244741 4I CCTTTCAGTC ----/TTTG TTTGTCTGAG 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 TTTG 1 2 221614 CASAVA_Build 4 162245115 1I ATTTCTTTCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 7 8 221615 CASAVA_Build 4 162247435 1D AGATAAACTG A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 A 7 6 221616 CASAVA_Build 4 162247900 2I AATATATGTG --/TA TATATATATG 3070 het 3070 hom 34 8 21 5 TA 4 5 221617 CASAVA_Build 4 162247994 1I ATGGTATTAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 T 7 8 221618 CASAVA_Build 4 162248193 3I TACCCTCCCT ---/ACA ACAACAACAC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 ACA 3 4 221619 CASAVA_Build 4 162248260 1I TAAAATGTAT -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 6 7 221620 CASAVA_Build 4 162251165 4D TGTAATTATG AATA/---- AATAGATTGT 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 AATA 2 1 221621 CASAVA_Build 4 162251593 2I GTTCTAATAT --/AA GTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 0 2 221622 CASAVA_Build 4 162259322 3D GGAATCTCTC CTT/--- CTTTTCTAAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 8 CTT 2 1 221623 CASAVA_Build 4 162261167 4I AAAAAAACTT ----/ACTC AAAAAGTTAC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 ACTC 0 1 221624 CASAVA_Build 4 162261261 1I AGAAAGAAAA -/T TAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 1 2 221625 CASAVA_Build 4 162261799 1I TTTAAAACTA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 7 8 221626 CASAVA_Build 4 162263181 1I AACCACAGTA -/C AAAGGATTGT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 C 0 1 221627 CASAVA_Build 4 162263785 1D TATTGGGATT A/- TTTTTATCAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 1 0 221628 CASAVA_Build 4 162271091 2D TTTTCAAAAT AA/-- AAAAGAATGA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 6 4 221629 CASAVA_Build 4 162273956 1I ATTTTTCATA -/T GTTTGTTGGC 1858 het 1858 ref 29 23 4 2 T 0 1 221630 CASAVA_Build 4 162281345 1D GGCCAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2711 hom 27 9 10 8 T 11 10 221631 CASAVA_Build 4 162282629 11I TTCATGACTC -----------/AGAAAATTAAT ATGGTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 AGAAAATTAAT 0 1 221632 CASAVA_Build 4 162285172 2D CATGGAGTCA AC/-- AGAGATTATT 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 AC 1 0 221633 CASAVA_Build 4 162287415 1D GCATACTGGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 T 9 8 221634 CASAVA_Build 4 162293011 5D TCATGTTCGC AAAGA/----- AAAGTGTAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 AAAGA 1 0 221635 CASAVA_Build 4 162293566 8D ATAAATAAAT AAATAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 2977 hom 14 7 8 2 AAATAAAC 1 0 221636 CASAVA_Build 4 162295147 1D TAAGAAGCAG T/- TGTTTATGGT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 2 1 221637 CASAVA_Build 4 162305490 1I TATTTTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 33 1 24 8 A 11 12 221638 CASAVA_Build 4 162311994 1I AGAAAGATAG -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 6 7 221639 CASAVA_Build 4 162317311 1D TGGGCATTTT G/- GGGAGTGTTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 G 4 3 221640 CASAVA_Build 4 162335354 1D CACATTTTTT A/- ATCCATTTGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 2 1 221641 CASAVA_Build 4 162350320 1D TCCATCCACT G/- GTAACTATCA 3070 hom 138 het 52 0 46 6 G 2 1 221642 CASAVA_Build 4 162399291 1D AGTCTATTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 9 8 221643 CASAVA_Build 4 162402977 1I ACCATAATTT -/A AATATTGTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 2 3 221644 CASAVA_Build 4 162412337 2I TGAAGTCCTA --/TT TTTTTTTTTT 2090 het 2090 ref 31 21 7 3 T 12 14 221645 CASAVA_Build 4 162416714 1I CCTCTCACCA -/C CCCCCCCCAA 2288 het 2288 ref 32 19 9 4 C 8 9 221646 CASAVA_Build 4 162423866 4I AGAACCAGTT ----/AAAA AAAACAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 4 8 221647 CASAVA_Build 4 162428576 5I AGGGAGAGAA -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 AAAAC 2 3 221648 CASAVA_Build 4 162441371 1I TTATATAAAT -/A AAACTAACTT 3070 het 3070 hom 36 8 27 1 A 3 4 221649 CASAVA_Build 4 162441939 4I AAAGAGTCTC ----/TGTT TGTGGATAAC 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 TGTT 0 1 221650 CASAVA_Build 4 162443148 1I GTGGGGTGAT -/A ACCTCGTTGT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 1 2 221651 CASAVA_Build 4 162455994 2I5M2D GGGCATGGTG --GCATGCA/GCGCATG-- CCTGTAATCC 3070 het 1028 hom 27 6 17 4 N/A 0 0 221652 CASAVA_Build 4 162461141 3D CATGCGACCC ATG/--- ATATTTACTG 3070 hom 96 het 37 0 33 6 ATG 1 0 221653 CASAVA_Build 4 162462923 3D GCTAAGCAGA ATT/--- ATTTTATAGC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 ATT 2 1 221654 CASAVA_Build 4 162472044 1I TGTGGGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 608 hom 36 3 25 8 T 13 14 221655 CASAVA_Build 4 162484783 3D ACTAATTTTT TTA/--- TTATTATTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TTA 3 2 221656 CASAVA_Build 4 162485400 1I TAGAATACTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 7 8 221657 CASAVA_Build 4 162491242 1I TTTTTTTAAA -/C AGTAAATCAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 0 1 221658 CASAVA_Build 4 162494811 1I AACCACAGCC -/T TTTTTTTTTT 1976 het 1976 ref 25 7 9 9 T 15 16 221659 CASAVA_Build 4 162495938 1D TTAATCACCA T/- TTTTAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 5 4 221660 CASAVA_Build 4 162497927 4D AAAATAACTA AAAG/---- AACATTCATA 3070 het 3070 hom 40 20 19 2 AAAG 1 0 221661 CASAVA_Build 4 162500388 1I TAGCTTATTT -/A ATGCATAAAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 1 2 221662 CASAVA_Build 4 162507821 1D ATAGCCACGT C/- CCCCTCCACC 3070 hom 102 het 39 0 33 6 C 5 4 221663 CASAVA_Build 4 162517817 1I AAACTAGAAG -/A GATCAAAATC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 1 221664 CASAVA_Build 4 162519364 1D TAGACTTAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 9 8 221665 CASAVA_Build 4 162532837 1I TTTTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 27 0 17 10 T 11 12 221666 CASAVA_Build 4 162536724 1I CATTGATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 914 hom 32 3 16 13 A 12 13 221667 CASAVA_Build 4 162537334 1D TGAAAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 27 1 18 8 A 11 10 221668 CASAVA_Build 4 162538257 2D ATATTGAAGA AG/-- AGACTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 6 AG 2 1 221669 CASAVA_Build 4 162562706 3I TTATTATGTA ---/TAT TATTATATAG 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 TAT 2 3 221670 CASAVA_Build 4 162563983 15D AAGTAACAAC TGACTGAGTCTTTAA/--------------- TGAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 8 TGACTGAGTCTTTAA 1 0 221671 CASAVA_Build 4 162565134 1D TCCTTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 30 1 23 6 A 12 11 221672 CASAVA_Build 4 162575326 1D ACTCTATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 10 9 221673 CASAVA_Build 4 162591812 6D ACTTTAAAAC TAAAAT/------ TATGGTTTCC 2888 het 2888 ref 24 13 8 5 TAAAAT 1 0 221674 CASAVA_Build 4 162599664 1I GAATGCCAAC -/T TTTTTTGCCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 6 7 221675 CASAVA_Build 4 162602537 1D AAGAAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 38 0 27 11 A 11 10 221676 CASAVA_Build 4 162608847 1D AGTGCCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1240 hom 46 4 28 14 T 17 16 221677 CASAVA_Build 4 162610243 1D TATTTATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 27 1 16 10 T 15 14 221678 CASAVA_Build 4 162611224 1I CTATTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 28 1 20 7 A 11 12 221679 CASAVA_Build 4 162613333 1D TATATGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 20 1 10 9 T 15 14 221680 CASAVA_Build 4 162616690 1I17M1I ACCTTGTGAC -TTTTTTTTTTTGAAGAC-/TTTTTTTTTTTTGAAGACT TAAGCATTCA 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 N/A 0 0 221681 CASAVA_Build 4 162623001 1I TTTCATTTGA -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 6 7 221682 CASAVA_Build 4 162630520 1I AAATGCAGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2864 hom 20 6 11 3 T 8 9 221683 CASAVA_Build 4 162631143 1D GGAATAAAAC T/- TTTTTTTTTC 1131 het 1131 ref 53 39 3 11 T 10 9 221684 CASAVA_Build 4 162631541 1I TTTTAAAAAA -/C ATCTTTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 0 1 221685 CASAVA_Build 4 162638223 5D AACTTTTTAA TATAG/----- TATAAGAATG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TATAG 1 0 221686 CASAVA_Build 4 162645081 2I TTCGTTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 22 18 13 T 10 12 221687 CASAVA_Build 4 162646774 1I AGAGCTCAGG -/C GATCCTCCCA 3070 hom 71 het 30 0 25 5 C 0 1 221688 CASAVA_Build 4 162646836 1D ACGCCCGGCA T/- TTTTTTTTTT 1686 het 1686 ref 14 6 4 4 T 12 11 221689 CASAVA_Build 4 162646929 1I CCCTCTTCGG -/C CCCCCCAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 C 6 7 221690 CASAVA_Build 4 162650302 3I ACCAGGAGTG ---/TAA TAATGATGGC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 TAA 1 2 221691 CASAVA_Build 4 162658219 3D AGTTGAATGA TGT/--- TATATAAGCA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 TGT 1 0 221692 CASAVA_Build 4 162673611 1D ACGCAGAAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 9 8 221693 CASAVA_Build 4 162673943 1D ATTAAGGGGG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 34 19 8 7 A 8 7 221694 CASAVA_Build 4 162683111 1I CATTTAAGAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 A 8 9 221695 CASAVA_Build 4 162684354 1D AAGCAAAATT G/- AATTCAAAAT 3070 het 3070 hom 45 21 23 2 G 1 0 221696 CASAVA_Build 4 162684872 1D GTATGTGGAG A/- AACTGGAACT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 3 2 221697 CASAVA_Build 4 162686058 1I GATCTGGCGC -/T GTTGCTACAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 221698 CASAVA_Build 4 162686984 1I GTGTAAGACA -/T TTAAATCAGT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 2 3 221699 CASAVA_Build 4 162700653 1I CTTGGTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 9 10 221700 CASAVA_Build 4 162701168 1D TTTTATAAGA T/- TTTTTTTCTG 3069 het 3069 ref 21 9 8 5 T 8 7 221701 CASAVA_Build 4 162703225 1D CCTAATATTG T/- TTTTTTGATT 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 T 7 6 221702 CASAVA_Build 4 162708410 2I GAATCTACAC --/AT GTCTTTGATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AT 0 1 221703 CASAVA_Build 4 162714156 1I TGACCAACAT -/G GAGAAACCCG 1980 hom 12 het 7 0 5 2 G 1 2 221704 CASAVA_Build 4 162718818 1D AAATAGGTTT A/- AAGATTTAAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 6 A 3 2 221705 CASAVA_Build 4 162724209 1D GATAGTTGAA T/- TTTGATAAAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 4 3 221706 CASAVA_Build 4 162735943 2D TTCTGAACCC CT/-- GTTACACCTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CT 1 0 221707 CASAVA_Build 4 162738250 4D ATGAAACAAA AAAT/---- AAATAAATAC 3070 het 1904 hom 17 6 9 3 AAAT 3 2 221708 CASAVA_Build 4 162751384 1D TCCTCTATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 8 221709 CASAVA_Build 4 162753543 1D ATTAGTGCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 T 10 9 221710 CASAVA_Build 4 162754051 1I TCTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2797 het 1506 hom 25 6 10 9 A 15 16 221711 CASAVA_Build 4 162775642 1D AATAAAGCTG A/- AAAAAAATCT 2948 het 2948 ref 27 17 7 3 A 8 7 221712 CASAVA_Build 4 162776094 2D GTTACAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 30 1 14 18 A 14 12 221713 CASAVA_Build 4 162777063 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1474 hom 11 het 6 0 4 2 T 14 13 221714 CASAVA_Build 4 162782044 1I AGCTGTTAAA -/G GAGCAGAATT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 1 2 221715 CASAVA_Build 4 162783409 1I AAGATAGAAT -/G GGGCATTTGT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 3 4 221716 CASAVA_Build 4 162784478 7D CCAGAAAAAT TGAACAA/------- TGCATAACTG 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 TGAACAA 1 0 221717 CASAVA_Build 4 162789279 1I GGTCCTCTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 86 hom 35 1 26 8 A 8 9 221718 CASAVA_Build 4 162791934 1D CCTTGAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1709 hom 32 7 15 10 A 15 14 221719 CASAVA_Build 4 162797494 1D CACTGCTGGC T/- TGCAGTAGAC 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 T 2 1 221720 CASAVA_Build 4 162806438 2D TAGATGAACA CT/-- CACAGATGCA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 CT 1 0 221721 CASAVA_Build 4 162816161 1I TTTTAAAAAA -/T CAGAGAATTA 3070 het 3070 ref 27 11 13 3 T 0 1 221722 CASAVA_Build 4 162821253 1I TTATTTTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 9 10 221723 CASAVA_Build 4 162823218 1I TCTTCCCACC -/T TCCATGTTCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 1 2 221724 CASAVA_Build 4 162858703 1I TATTTGTAAA -/T AATATAAATT 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 T 0 1 221725 CASAVA_Build 4 162860309 1I CCTTGGTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 T 8 9 221726 CASAVA_Build 4 162866833 1I CTTTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 222 hom 22 5 13 4 C 0 1 221727 CASAVA_Build 4 162867004 1D AATTTTTGCA T/- TTTTTAGTAG 1635 het 1388 hom 9 4 5 0 T 6 5 221728 CASAVA_Build 4 162867516 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1038 het 405 hom 11 2 4 6 T 1 0 221729 CASAVA_Build 4 162872685 1I TATACCGAAC -/T TTTGAGAAAC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 3 4 221730 CASAVA_Build 4 162876918 4D ATTAAGTCTT CTTG/---- CTTAAGAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 CTTG 1 0 221731 CASAVA_Build 4 162878401 1I AGAGATAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 A 9 10 221732 CASAVA_Build 4 162880455 1I CCACAGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 11 12 221733 CASAVA_Build 4 162881315 4D TGGAATTCAG TGAT/---- TGATTGTTGT 3070 het 3070 ref 48 28 18 3 TGAT 2 1 221734 CASAVA_Build 4 162889507 1D TACAAGTGGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 42 0 36 8 A 9 8 221735 CASAVA_Build 4 162892393 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 A 9 10 221736 CASAVA_Build 4 162904565 1I TCCTTTCTTC -/T TTTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 5 6 221737 CASAVA_Build 4 162905241 1I TATAACATTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 A 8 9 221738 CASAVA_Build 4 162906899 5I TTAGTACCAT -----/TTTAC TTCAAGTCCT 3070 hom 93 het 40 0 31 9 TTTAC 0 1 221739 CASAVA_Build 4 162924200 4D CTTTCCTTGC CTTT/---- CTTTCTTTCT 1589 het 1589 ref 25 9 5 11 CTTT 4 3 221740 CASAVA_Build 4 162931601 2I TTTGAAAGAT --/TG CTAGATCTAG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TG 0 1 221741 CASAVA_Build 4 162932008 2D AGATTGAAAC AA/-- AATTAATCTA 3070 het 3070 hom 35 17 17 2 A 4 2 221742 CASAVA_Build 4 162934216 1I CATGTTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 39 1 33 5 T 11 12 221743 CASAVA_Build 4 162947716 1D AGGTTGGTCA T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 T 7 6 221744 CASAVA_Build 4 162949229 1D AAAACAGACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 10 9 221745 CASAVA_Build 4 162986651 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 23 0 18 5 A 15 14 221746 CASAVA_Build 4 162992352 2D ATTTAGAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 12 10 221747 CASAVA_Build 4 162992783 4D TAGATATAAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AT 8 6 221748 CASAVA_Build 4 162995584 77D TTTGAGGATA TTTTGAGGATATGGTTGAGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTCTAGCCTTGTTACTATTAAGTTCTATTAAG/----------------------------------------------------------------------------- TTCTACAGTT 3070 hom 51 het 16 0 18 4 TTTTGAGGATATGGTTGAGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTCTAGCCTTGTTACTATTAAGTTCTATTAAG 1 0 221749 CASAVA_Build 4 162996178 2D AGTAGGTACC AT/-- ATTTGGTCCT 3070 hom 105 het 36 0 36 1 AT 2 1 221750 CASAVA_Build 4 163006393 1D GAATAGCAAT A/- AAAAAACTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 6 221751 CASAVA_Build 4 163013908 1D CACAATGATG A/- ATAACAGTAG 3070 hom 126 het 46 0 42 4 A 2 1 221752 CASAVA_Build 4 163018026 3I ACAGATAAAA ---/TAG TAGAAAAAAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TAG 1 2 221753 CASAVA_Build 4 163018599 1I ATTAAAAATC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 49 het 20 0 17 3 T 8 9 221754 CASAVA_Build 4 163024663 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 8 9 221755 CASAVA_Build 4 163026631 1D ATTATTTGTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 8 221756 CASAVA_Build 4 163028681 3I TTTATAAAAC ---/CAG TCTTGGGTAT 3070 hom 153 het 57 0 51 6 CAG 0 1 221757 CASAVA_Build 4 163031688 1I ACTTTTTATA -/T TCATTAACTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 221758 CASAVA_Build 4 163033094 1I AGTTCTTTGC -/A AAAAGACATT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 4 5 221759 CASAVA_Build 4 163041790 1I AATCTAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 12 10 14 A 13 14 221760 CASAVA_Build 4 163061265 1I CTGAAGAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 221761 CASAVA_Build 4 163066394 2D CAGCTCTTGT TA/-- TTATTATAAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TA 1 0 221762 CASAVA_Build 4 163067009 1D TTTTTTTTTT G/- TTTTGTTTTT 3070 het 1168 hom 38 6 20 13 G 1 0 221763 CASAVA_Build 4 163075218 1I ATTTTGTGGG -/C GTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 C 0 1 221764 CASAVA_Build 4 163082904 1D CAGAGAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 438 hom 25 1 22 2 A 10 9 221765 CASAVA_Build 4 163087856 4D TTTTTAAAGT TCTA/---- TCTATCTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TCTA 2 1 221766 CASAVA_Build 4 163088895 2D TAAAGAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 2459 hom 21 het 20 0 11 9 A 18 16 221767 CASAVA_Build 4 163095652 1D AATTGTACCC G/- CAGATTTTAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 1 0 221768 CASAVA_Build 4 163096878 4D AAATGTAAGT AAAG/---- AGATTGCCCA 3070 hom 63 het 24 0 22 4 AAAG 1 0 221769 CASAVA_Build 4 163102127 2D CTCTAGAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 21 0 17 5 AT 8 7 221770 CASAVA_Build 4 163111659 1I AAACAATAAT -/G GATTTCCTAC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 1 2 221771 CASAVA_Build 4 163134063 6D GTATGATATT TAACTA/------ TAATATAAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 7 TAACTA 1 0 221772 CASAVA_Build 4 163143352 1I TGTTACTGCA -/T TTTTTTAGCT 2820 het 2820 ref 27 11 6 10 T 6 7 221773 CASAVA_Build 4 163143853 5I CTTACATTTC -----/CATTA CATTACATTT 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 CATTA 1 2 221774 CASAVA_Build 4 163151544 2I TTATTTCTCT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 TA 5 6 221775 CASAVA_Build 4 163159147 4D TTATTTTAGA TTCT/---- TTCTTCCTTC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 TTCT 2 1 221776 CASAVA_Build 4 163159256 1D TTCTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 29 9 A 11 10 221777 CASAVA_Build 4 163165018 1D CCTAACACTG T/- TTCTAATATT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 3 2 221778 CASAVA_Build 4 163168480 1I CCTCATTTAA -/T TTTGAAAATT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 3 4 221779 CASAVA_Build 4 163170509 12D AATTATTTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 26 0 25 4 T 21 9 221780 CASAVA_Build 4 163199148 1D CCTGCTTCAG C/- CCTCCCGAGT 3070 hom 37 het 16 0 13 3 C 3 2 221781 CASAVA_Build 4 163210484 1D GATATACTAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 T 8 7 221782 CASAVA_Build 4 163220981 3D AGAGGGTTTT AAG/--- AAGGAGTGTT 3070 het 3070 hom 44 14 27 6 AAG 2 1 221783 CASAVA_Build 4 163223134 1D AAACAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 13 12 221784 CASAVA_Build 4 163223423 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 11 10 221785 CASAVA_Build 4 163226124 2D CATATGTGTG TA/-- TACATGTTTG 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 TA 2 1 221786 CASAVA_Build 4 163228678 1D AACTGCTAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 T 8 7 221787 CASAVA_Build 4 163228832 1D TAATATATAA T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 7 6 221788 CASAVA_Build 4 163232574 5D TACCTTATAG AATAT/----- ATTTTCTATA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 AATAT 1 0 221789 CASAVA_Build 4 163252849 1I TGGGAAACTT -/A AATCAATTGA 3070 het 3070 ref 40 22 10 8 A 2 3 221790 CASAVA_Build 4 163258871 1D CCAAAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 25 1 19 5 T 12 11 221791 CASAVA_Build 4 163264216 1I CTAGTGGTTT -/A AACCAAAACA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 2 3 221792 CASAVA_Build 4 163265949 1D TGTAACTAAA T/- TTTTTTATTT 2841 het 2841 ref 27 13 8 6 T 7 6 221793 CASAVA_Build 4 163268711 2D TAGAATTTAT AG/-- AGTCCAAAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AG 2 1 221794 CASAVA_Build 4 163270987 2D ACAAGAATGT TG/-- TGTTTCCTAC 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 TG 2 1 221795 CASAVA_Build 4 163301096 1D ACAGGAAATA T/- TTTTTTCTAG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 7 6 221796 CASAVA_Build 4 163305199 1I TGCCTGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 25 1 17 7 A 13 14 221797 CASAVA_Build 4 163305711 1D TCATCCAGAA G/- GGTGATTATT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 G 3 2 221798 CASAVA_Build 4 163307594 6D TATGTGTGCA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 208 hom 31 2 11 20 TG 12 9 221799 CASAVA_Build 4 163317662 2D GTTTAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2427 het 893 hom 23 4 6 13 T 20 18 221800 CASAVA_Build 4 163319517 1D CAGTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 37 3 30 5 A 15 14 221801 CASAVA_Build 4 163323330 4D AATTTTTCCC TCAG/---- TCAAAGAAAA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 TCAG 1 0 221802 CASAVA_Build 4 163324154 4D CTGCCTATTT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AC 11 9 221803 CASAVA_Build 4 163324348 1I CTTAATGGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 9 10 221804 CASAVA_Build 4 163330776 4D CTGTGTTCTT ACTA/---- TTTTATTCTA 3070 het 3070 ref 51 25 18 11 ACTA 1 0 221805 CASAVA_Build 4 163335193 5I TTAATTCACC -----/TTAAG TTAATTTTTG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTAAG 0 1 221806 CASAVA_Build 4 163347534 7I AATCTTTTTT -------/GAAGAGA GAAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 GAAGAGA 1 2 221807 CASAVA_Build 4 163357714 1I GATTATTAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 9 10 221808 CASAVA_Build 4 163376817 1D AGTAGTTGGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 9 8 221809 CASAVA_Build 4 163381461 4I TGCACAATTA ----/TTAT TTCTCAATTT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 TTAT 0 1 221810 CASAVA_Build 4 163382405 3D CATCTTCAAA TCC/--- TGAGGATTTA 3070 het 3070 ref 32 20 12 0 TCC 1 0 221811 CASAVA_Build 4 163382791 2D AGCAAAAGCT CA/-- GTTATCGTTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 CA 1 0 221812 CASAVA_Build 4 163384274 3D TGATGAAAAA TAG/--- TAGATGTCAA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 TAG 2 1 221813 CASAVA_Build 4 163386166 27D AATCTCCTTA CAAAAAAGCATTGAAGTGCAGTTTCCT/--------------------------- CAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 36 18 15 11 CAAAAAAGCATTGAAGTGCAGTTTCCT 2 1 221814 CASAVA_Build 4 163414108 2I GCTCTCACGC --/AG AGTTTCAGGT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AG 1 2 221815 CASAVA_Build 4 163420088 4I GTTTGTTTAT ----/TTTA TTTAATACCA 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 TTTA 1 2 221816 CASAVA_Build 4 163421551 1I GGCTCTGTGT -/C CCCCACCCAA 1984 het 1405 hom 14 3 8 3 C 4 5 221817 CASAVA_Build 4 163421712 4I CTTCCCTTCG ----/CTCT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 CT 6 8 221818 CASAVA_Build 4 163421950 5I TTATTTTTAT -----/ATAAG ATATTAGGTA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 ATAAG 0 1 221819 CASAVA_Build 4 163423926 1I ATACTTTCCC -/A AAAATGGCTG 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 4 5 221820 CASAVA_Build 4 163424304 3D AAGCATAAAA GTT/--- GTTTGGTTTT 2103 het 2103 ref 18 11 6 1 GTT 2 1 221821 CASAVA_Build 4 163424550 1I38M1I TTCTTTTTAT -AAAAAAAACTATTAAAAATGTTTGACAAATTTTGAGTT-/AAAAAAAAACTATTAAAAATGTTTGACAAATTTTGAGTTA AAAATTGTTA 3070 het 3070 ref 23 15 8 7 N/A 0 0 221822 CASAVA_Build 4 163424662 3I TGAAACAAAT ---/ACA ACATTTGTTT 3070 het 3070 ref 20 12 8 1 ACA 1 2 221823 CASAVA_Build 4 163425291 1I CTCTTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2589 het 2589 ref 26 15 6 5 A 11 12 221824 CASAVA_Build 4 163426739 1I AGCCCTGCCC -/A AAAGAGAGGC 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 3 4 221825 CASAVA_Build 4 163427603 2D AATAGCTAGC AA/-- AAAAAAAAAA 2301 het 2301 ref 24 13 6 5 A 12 10 221826 CASAVA_Build 4 163428607 1D TAAGGTAAAT G/- GGTGGAAAAA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 G 3 2 221827 CASAVA_Build 4 163430436 1I ATAAACAAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2784 hom 24 9 9 6 A 9 10 221828 CASAVA_Build 4 163446505 1I CTATGGTGAA -/G CCATAGAATG 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 G 0 1 221829 CASAVA_Build 4 163448877 1I ATGTTATTTA -/T CATTATTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 0 1 221830 CASAVA_Build 4 163451303 5I CAAAATGTGT -----/AGGGA AGGAAATATT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 AGGGA 0 1 221831 CASAVA_Build 4 163477024 4I TCTGTCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AAAC 3 4 221832 CASAVA_Build 4 163482297 4D AACATTTGTT TATC/---- TAAGCATAAA 3070 hom 129 het 47 0 43 7 TATC 1 0 221833 CASAVA_Build 4 163485759 4I TCTTGAAAGA ----/TAAG TAAAGAACAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TAAG 0 1 221834 CASAVA_Build 4 163487015 1I AGAATAGTGG -/C CCCCCCCAAA 3070 hom 86 het 32 0 29 3 C 7 8 221835 CASAVA_Build 4 163488731 1I43M1D CACAACACCA -CCTTGATATATATCATGCACTTTATTTTTAATAATCCTGTACTA/CCCTTGATATATAACATGCACTTTATTTTTAATAATCCTGTACT- TTTTTTGAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 10 N/A 0 0 221836 CASAVA_Build 4 163488931 5I AGAGATCCAT -----/TTTAA TTTGTCAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TTTAA 0 1 221837 CASAVA_Build 4 163489782 3D TTCATACAAT TTC/--- TTATTGAATC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 TTC 1 0 221838 CASAVA_Build 4 163492363 4D TCATATAATT TTTC/---- TTTCTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 9 10 9 TTTC 2 1 221839 CASAVA_Build 4 163495532 1I GAGATTCAAC -/A GGTAAGAGAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 0 1 221840 CASAVA_Build 4 163496240 1I CAATTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 33 1 24 8 T 10 11 221841 CASAVA_Build 4 163497814 1D CTCTAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 T 13 12 221842 CASAVA_Build 4 163498238 2I GGAACTTACA --/TT TTTTATATAT 2324 het 2324 ref 35 24 8 3 T 4 6 221843 CASAVA_Build 4 163503471 2I GTTTTGTGAT --/AA AAAATTGCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 4 6 221844 CASAVA_Build 4 163513685 5I TGCTGGAATA -----/AATAT AATATTTTAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AATAT 1 2 221845 CASAVA_Build 4 163518396 1I AAGTTTGTCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 7 8 221846 CASAVA_Build 4 163525526 1D TGGGGGTGTT G/- GGGGGAGGGA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 G 6 5 221847 CASAVA_Build 4 163526981 4I TCTCATAAAT ----/AGTA AGTAAGCAGT 3070 het 3070 hom 43 13 25 5 AGTA 1 2 221848 CASAVA_Build 4 163528360 6D TTTGTTTCCC GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 129 hom 40 4 18 19 GT 11 8 221849 CASAVA_Build 4 163531621 1D18M1D AAGAGAAAAT AAAAAAAGAAAGAAAAAAAG/-AAAAAAGAAAGAAAAAAA- AAAGAAAGGG 3070 het 3070 ref 28 15 17 8 N/A 0 0 221850 CASAVA_Build 4 163533637 1D ATCATAGTTG T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 58 26 28 4 T 7 6 221851 CASAVA_Build 4 163534847 1D TGCAAAAAAA T/- GAGCAAATCA 3070 het 3070 hom 36 11 24 2 T 1 0 221852 CASAVA_Build 4 163537743 1D CAAGAAAATT A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 29 16 10 5 A 7 6 221853 CASAVA_Build 4 163538762 2D GAAACTGGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 TA 6 5 221854 CASAVA_Build 4 163545408 2D AAATTCCTTC AT/-- AGTCAATTTT 3070 het 3070 ref 49 25 18 7 AT 1 0 221855 CASAVA_Build 4 163554472 4I ATAGAGAGAA ----/AAAG AGAGAGGGAG 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 AAAG 0 1 221856 CASAVA_Build 4 163557706 1D ATTCAGAATG C/- CAGTTCTTGT 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 C 2 1 221857 CASAVA_Build 4 163566105 1I CTTTTTTTTT -/C TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 C 0 1 221858 CASAVA_Build 4 163571790 10I TCTGTTTTAC ----------/TCTTTCATAT TCTTTCATTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TCTTTCATAT 0 1 221859 CASAVA_Build 4 163581962 15D TCCAAAATGA CTAAGTATTTTAGTC/--------------- ATTTTGTACT 3070 het 3070 ref 46 30 19 0 CTAAGTATTTTAGTC 1 0 221860 CASAVA_Build 4 163594168 2D ATATATATGC TA/-- TATATATATA 2195 het 2195 ref 17 10 5 2 TA 8 7 221861 CASAVA_Build 4 163598479 4I GATAACATAA ----/TTGT TTATCATCAT 3070 hom 157 het 58 0 53 5 TTGT 0 1 221862 CASAVA_Build 4 163622201 2D ATATGTGTAT AC/-- ACACACACAC 2748 het 2748 ref 34 10 11 13 AC 10 9 221863 CASAVA_Build 4 163627815 1I CAGGACCGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 43 2 28 13 A 13 14 221864 CASAVA_Build 4 163628517 4D TATCAGTGTT AGTG/---- AGTTTTTGAA 3070 het 2895 hom 20 7 13 0 AGTG 1 0 221865 CASAVA_Build 4 163633643 1I AGTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 24 hom 39 1 27 11 A 9 10 221866 CASAVA_Build 4 163635109 2D CTAAAAATCC AA/-- AAAAAAAAAA 2326 het 1707 hom 19 8 6 5 A 14 12 221867 CASAVA_Build 4 163636689 5D TAATTATTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 8 T 16 11 221868 CASAVA_Build 4 163646755 1I TTCAAAACTA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 7 8 221869 CASAVA_Build 4 163647999 14D AGAATCGCTT GAACCTGGGAGGCA/-------------- GAGTTTTCAA 3070 het 3070 hom 16 8 9 2 GAACCTGGGAGGCA 1 0 221870 CASAVA_Build 4 163658220 1I AACTCTCATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 9 10 221871 CASAVA_Build 4 163663745 2D AATAACACAC TT/-- AAAAAGATAC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 T 2 0 221872 CASAVA_Build 4 163668150 2D TCAGCTCCCT TA/-- TATAAGTGAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TA 3 2 221873 CASAVA_Build 4 163668352 1D GTAAGGGTTG T/- CTCAATTAAG 3070 hom 99 het 34 0 34 1 T 1 0 221874 CASAVA_Build 4 163670086 1D47M1D TTTGAGTATT AAAAAAAAAGGTTGATATAGAGGTGATCTTGGCCAGAACATGATGCAAC/-AAAAAAAAGGTTGATATAGAGGTGATCTTGGCCAGAACATGATGCAA- ATATGAAAAT 3070 hom 132 het 30 0 45 3 N/A 0 0 221875 CASAVA_Build 4 163671143 1I GTATGGATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 10 221876 CASAVA_Build 4 163671667 1I GCTAAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 26 1 18 7 A 10 11 221877 CASAVA_Build 4 163673519 5I GATGTTACTG -----/GAAAA GAAAAGAAAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 GAAAA 2 3 221878 CASAVA_Build 4 163674438 1D CTACGGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2808 hom 34 8 15 11 T 15 14 221879 CASAVA_Build 4 163684766 1I AGGTCTTAGA -/T TTTAAGTCAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 3 4 221880 CASAVA_Build 4 163686096 1D TTAGAATTGC T/- TTTGGTATCT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 4 3 221881 CASAVA_Build 4 163690389 2D ATATATATAT AG/-- AGAGAGAGAG 2287 hom 21 het 10 0 8 3 AG 11 10 221882 CASAVA_Build 4 163691524 2I GCATAAGCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 297 hom 30 1 17 12 TC 7 8 221883 CASAVA_Build 4 163692588 1I TTACACTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 812 hom 33 2 25 6 T 9 10 221884 CASAVA_Build 4 163692854 1D CTCTTAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 11 10 221885 CASAVA_Build 4 163705697 1I TATACTATCT -/G TCCCACATCG 3070 hom 63 het 30 0 21 9 G 0 1 221886 CASAVA_Build 4 163707435 1D CAGCTATTTC T/- TATGGGACAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 2 1 221887 CASAVA_Build 4 163709274 1I TTTCTGGTTG -/T TTGTGTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 2 3 221888 CASAVA_Build 4 163714627 2D AATAACCTAA CT/-- CTACAACAGC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 CT 2 1 221889 CASAVA_Build 4 163714807 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 24 3 18 3 A 10 11 221890 CASAVA_Build 4 163720464 1D ATGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 749 hom 43 3 35 5 A 11 10 221891 CASAVA_Build 4 163721705 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 932 hom 26 2 15 9 T 12 11 221892 CASAVA_Build 4 163723032 1I GCTCTTGCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 193 hom 46 1 33 12 T 8 9 221893 CASAVA_Build 4 163724151 5D TGTTTTTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 hom 23 het 12 0 8 4 TTTGT 5 4 221894 CASAVA_Build 4 163725906 1I ACATATAAAA -/T ATTTTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 0 1 221895 CASAVA_Build 4 163727389 1D ACAAAGACAC A/- AAACACACAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 4 3 221896 CASAVA_Build 4 163728917 4I36M1I AGAGGGGAAC ----TGTAGAGAAATAAACAGATATCTGGAGCCACTTTTT-/TGTATGTAGAGAAATAAACAGATATCTGGAGCCACTTTTTC CTCTTAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 9 N/A 0 0 221897 CASAVA_Build 4 163729039 1D AGATGAGAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 10 9 221898 CASAVA_Build 4 163735677 3I CCACCACCAC ---/CAT CCCCAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 22 4 CAT 0 1 221899 CASAVA_Build 4 163736802 1I GATCAAGAAA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 123 het 43 0 41 2 T 7 8 221900 CASAVA_Build 4 163739192 2I ATAGATTAAT --/AA GAGTAATGCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 2 221901 CASAVA_Build 4 163740104 2I TAATTTCCAC --/AT GTTGTGGAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AT 0 1 221902 CASAVA_Build 4 163740596 2I CTTAAAGACA --/GT GTGTCCGGAG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 GT 2 3 221903 CASAVA_Build 4 163749103 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1548 het 1548 ref 39 25 4 10 T 12 11 221904 CASAVA_Build 4 163784370 1I CCAGAGTATA -/C AGAAGAAGGT 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 C 0 1 221905 CASAVA_Build 4 163790786 1D GAAATATATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 8 7 221906 CASAVA_Build 4 163797818 4D TATATAGATA AGAT/---- AGATAGATAG 2538 het 1614 hom 11 5 6 0 AGAT 5 4 221907 CASAVA_Build 4 163799833 1I TAAAAAATTT -/A AAAAGGCAGA 3070 het 3070 hom 36 15 21 0 A 4 5 221908 CASAVA_Build 4 163809545 17D ATAAACTGCC TGAGACTGGGTAATTTA/----------------- TAAAGGAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 19 5 TGAGACTGGGTAATTTA 1 0 221909 CASAVA_Build 4 163812676 1I CAACAAAGAT -/A AAAAAAAAAT 1606 het 1606 ref 15 9 5 1 A 9 10 221910 CASAVA_Build 4 163820721 1D GAGCATACAT A/- ATCTATTCAA 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 A 2 1 221911 CASAVA_Build 4 163821095 2I TATTAAACAC --/TG TTCCTGGACA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TG 0 1 221912 CASAVA_Build 4 163821360 4I TAATGATAAT ----/TGAA TGTCTTAGCT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TGAA 0 1 221913 CASAVA_Build 4 163828369 1D ACATATAGCT A/- ACTTAAAATG 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 2 1 221914 CASAVA_Build 4 163831732 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 2909 hom 16 6 9 2 A 9 8 221915 CASAVA_Build 4 163839415 1D GTTTTCTGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 9 221916 CASAVA_Build 4 163842564 1D GACTACCCTG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 8 221917 CASAVA_Build 4 163876905 2D ATACTTAATA TT/-- AACTCCCCTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 T 2 0 221918 CASAVA_Build 4 163887694 4D TTTGTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 2647 hom 32 6 13 13 TTGT 5 4 221919 CASAVA_Build 4 163907064 1D AACATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 36 0 27 9 A 13 12 221920 CASAVA_Build 4 163909833 2D CAGAGAAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 26 8 11 8 CT 2 1 221921 CASAVA_Build 4 163910333 20D CAAGTGCTGC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------- AAAAAAAAAG 3070 het 2673 hom 44 11 23 12 A 29 9 221922 CASAVA_Build 4 163916105 1D TTTAGTTTAC T/- TTAGTTTGAC 3070 hom 111 het 43 0 38 6 T 3 2 221923 CASAVA_Build 4 163922011 5I CATTGTAAAG -----/TTATT TTATTTTATT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TTATT 2 3 221924 CASAVA_Build 4 163923931 1D GTTCCACCTC T/- TGTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 57 30 21 6 T 2 1 221925 CASAVA_Build 4 163929229 1D AAGACCTTCA T/- TAAATGTGTC 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 T 2 1 221926 CASAVA_Build 4 163929324 1D GTTTCTGTAG C/- ACATCATTTT 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 C 1 0 221927 CASAVA_Build 4 163929667 1D AATGATTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 10 9 221928 CASAVA_Build 4 163930236 1I AGGTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 10 11 221929 CASAVA_Build 4 163947377 1I ACACTACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 959 hom 39 5 27 7 A 13 14 221930 CASAVA_Build 4 163949208 2D AGTCATATGC TA/-- TATGAAAACT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TA 2 1 221931 CASAVA_Build 4 163972900 1D AGACGTAAAC T/- TTTTCAGATT 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 T 5 4 221932 CASAVA_Build 4 163979192 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 A 12 13 221933 CASAVA_Build 4 164020439 8D AAATAAAATA AGGCTCTG/-------- AGCCTATCTC 3070 hom 123 het 47 0 41 9 AGGCTCTG 1 0 221934 CASAVA_Build 4 164021961 1D TTCATTTCCC A/- AAAAAATCAT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 A 7 6 221935 CASAVA_Build 4 164023174 3D GGTGGTAAAT GTA/--- GTAGGTATAA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 GTA 2 1 221936 CASAVA_Build 4 164023535 1I CAACTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 244 hom 35 2 26 7 T 10 11 221937 CASAVA_Build 4 164023930 1I AAGAGGAATC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 41 0 33 8 A 9 10 221938 CASAVA_Build 4 164024391 1D ACTTCTTTAT G/- GGGAAAAAAA 3070 het 19 hom 31 1 25 5 G 4 3 221939 CASAVA_Build 4 164025896 4I CTCAAAAAAA ----/AACC AAACCAAAAC 3070 hom 114 het 42 0 37 5 AACC 0 1 221940 CASAVA_Build 4 164029621 1D AAACATTTGT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 221941 CASAVA_Build 4 164030781 2D TGTTGAAGGT GG/-- GGTCTGGTAG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 4 2 221942 CASAVA_Build 4 164040761 17D GAAGAACAGG AAAAAAATGTCCACTAT/----------------- AATTTTATTT 3070 hom 99 het 33 0 34 4 AAAAAAATGTCCACTAT 1 0 221943 CASAVA_Build 4 164042803 1D TGCCAAATTG T/- TTTTCAGAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 T 5 4 221944 CASAVA_Build 4 164057890 1D CTTTATGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 10 9 221945 CASAVA_Build 4 164069345 4I GATGGTCATA ----/CTGT CTATGAAGAT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 CTGT 0 1 221946 CASAVA_Build 4 164080000 1D AAAAAACTAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1372 hom 32 4 20 9 A 10 9 221947 CASAVA_Build 4 164081439 3D AGCAGTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 43 13 25 6 TTG 5 4 221948 CASAVA_Build 4 164087799 4I AGTGGCGCTT ----/CTCC CTCCAAACAC 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 CTCC 1 2 221949 CASAVA_Build 4 164099542 1D GCAGAAGAAA G/- GGGAATGAAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 G 4 3 221950 CASAVA_Build 4 164101994 1I AAGAGGCAAG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 7 8 221951 CASAVA_Build 4 164104966 1D AGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2937 het 2490 hom 27 10 11 6 T 11 10 221952 CASAVA_Build 4 164105069 7D TGCTGGGATT ACAGTAG/------- GCGTAAGCAA 3070 het 3070 hom 20 9 11 2 ACAGTAG 1 0 221953 CASAVA_Build 4 164111874 2D CTATTTGGAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 AT 7 6 221954 CASAVA_Build 4 164112254 2D AAAAACAAAC TA/-- TGAAATAAGA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 TA 1 0 221955 CASAVA_Build 4 164112325 2D TTTCAAAGAG GT/-- GTGTCTATAT 3044 het 3044 ref 20 11 7 2 GT 3 2 221956 CASAVA_Build 4 164112809 4D TTAAAAGGTT TTTA/---- TTTAATTGAT 3070 het 3070 hom 35 8 21 6 TTTA 2 1 221957 CASAVA_Build 4 164116821 1D TGTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 10 9 221958 CASAVA_Build 4 164152243 1I GTCTTGGCAA -/C CTAACATTTG 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 C 1 2 221959 CASAVA_Build 4 164153774 1I GGCAAGCTGA -/T TTTTTTTATG 3070 hom 97 het 40 0 33 7 T 7 8 221960 CASAVA_Build 4 164157858 5I CAGATGCAGA -----/GCTGT GCACATATGA 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 GCTGT 0 1 221961 CASAVA_Build 4 164163530 3I TTAAAGGCAG ---/CTA CTGTGAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 CTA 0 1 221962 CASAVA_Build 4 164163863 3D GAGGGAATAT AGA/--- AGAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 29 14 15 4 AGA 3 2 221963 CASAVA_Build 4 164171195 1I AAGTGCTGGG -/T ATTACAAGCG 3070 het 1700 hom 28 6 15 7 T 0 1 221964 CASAVA_Build 4 164177799 1I CCATAAGTGC -/A AAAAATTATA 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 A 5 6 221965 CASAVA_Build 4 164181931 1D GATGCATCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 9 221966 CASAVA_Build 4 164186515 1D TCACCATTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 15 17 5 T 10 9 221967 CASAVA_Build 4 164202577 1I GTAAATTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 10 11 221968 CASAVA_Build 4 164203456 1D AATTTTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 T 13 12 221969 CASAVA_Build 4 164203845 2D GCTGTAATGC AG/-- AGACACTTCA 3070 het 3070 hom 34 10 17 8 AG 2 1 221970 CASAVA_Build 4 164209390 1D AAAGGATTAT A/- ATCCTTCTCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 2 1 221971 CASAVA_Build 4 164217769 1D GATGACTAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 T 8 7 221972 CASAVA_Build 4 164240359 1I TGATTGGTAA -/G AGTTTTTATG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 221973 CASAVA_Build 4 164240701 2D GTGGAAAATT AC/-- AGTCAAAGGG 1469 het 718 hom 6 2 4 0 AC 1 0 221974 CASAVA_Build 4 164243729 1I TTGACTGAAG -/C CAATGGGGGC 3070 het 3070 ref 41 24 10 7 C 1 2 221975 CASAVA_Build 4 164247197 1I TCATTTTTTT -/C ATTTCTGTAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 0 1 221976 CASAVA_Build 4 164254210 2I GATATTTCTC --/TG TGTGTCTGTG 3070 het 3070 hom 47 14 24 9 TG 2 3 221977 CASAVA_Build 4 164265033 1D TAAGTGCAGA G/- CCCTCATGAC 3070 het 3070 hom 43 16 23 5 G 1 0 221978 CASAVA_Build 4 164299258 3I CAAAGTTCAT ---/AAG AATACTTTCA 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 AAG 0 1 221979 CASAVA_Build 4 164302704 1D CAAGGCTGTG T/- TAACAGACCA 3070 hom 200 het 74 0 64 10 T 2 1 221980 CASAVA_Build 4 164312750 1I AAAACTGACA -/T TTTTTTACTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 6 7 221981 CASAVA_Build 4 164313783 1D TAAATAGAAA G/- GGGATTTTGT 3070 het 3070 ref 61 33 22 7 G 4 3 221982 CASAVA_Build 4 164318013 1I GTCACCCAGA -/G GGGCCAAAGG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 3 4 221983 CASAVA_Build 4 164363433 1I CGGAGAATAC -/T TTTAAGGAAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 3 4 221984 CASAVA_Build 4 164389611 1D GATGAAATAT A/- AAAGACAATA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 4 3 221985 CASAVA_Build 4 164400255 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2420 hom 18 het 9 0 7 2 A 10 11 221986 CASAVA_Build 4 164404804 14D AGTCAATTTC CAGTACAAATATTG/-------------- CAGGCCATTC 3070 hom 39 het 18 0 13 5 CAGTACAAATATTG 1 0 221987 CASAVA_Build 4 164408440 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1739 hom 23 het 10 0 5 7 A 21 18 221988 CASAVA_Build 4 164415412 1D GTTGTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 33 1 26 7 T 11 10 221989 CASAVA_Build 4 164420855 4D TTCTTAAAGC TTTG/---- TTTATGTCTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TTTG 1 0 221990 CASAVA_Build 4 164423514 2D GTGTATACAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 28 0 16 13 TA 9 8 221991 CASAVA_Build 4 164433770 12D AAAAATACAA ATAATCATAATC/------------ ATAATCATAA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 ATAATC 5 3 221992 CASAVA_Build 4 164434908 1D AGATTCCGTC T/- CAAAAAAATA 3070 hom 60 het 22 0 21 3 T 1 0 221993 CASAVA_Build 4 164448079 1I ATTCCAATGA -/T TATTCTTGTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 1 2 221994 CASAVA_Build 4 164449553 1I CCAAAAAGCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 22 20 1 A 9 10 221995 CASAVA_Build 4 164449805 2D TAAGGTTCTC TA/-- TGATTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 24 16 5 TA 1 0 221996 CASAVA_Build 4 164451314 4I ATATAGAGTC ----/TGTT TGGCTAATTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 TGTT 0 1 221997 CASAVA_Build 4 164451605 1D ATACCACGCC T/- TTATATGTTT 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 T 3 2 221998 CASAVA_Build 4 164452846 3D TACATAGAAA TAT/--- TATTTGTAAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 TAT 2 1 221999 CASAVA_Build 4 164459430 1D GCTTGGTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 217 hom 37 1 28 8 T 12 11 222000 CASAVA_Build 4 164460153 1D TCAAACTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 117 het 44 0 38 6 T 10 9 222001 CASAVA_Build 4 164463210 1I CTATTATCAA -/C ATACTTAAAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 0 1 222002 CASAVA_Build 4 164470433 4D AAGAAGTAGG ATAA/---- ATAAGGGAGG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 ATAA 2 1 222003 CASAVA_Build 4 164470502 1I CTGTAGAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2930 hom 25 8 12 5 T 10 11 222004 CASAVA_Build 4 164473659 4D TGTGACGCTC AAAT/---- AACTCTCACG 3070 hom 72 het 27 0 24 5 AAAT 1 0 222005 CASAVA_Build 4 164474620 1I ACACACATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 40 0 32 8 T 10 11 222006 CASAVA_Build 4 164476903 1D TTAGACATTC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 A 8 7 222007 CASAVA_Build 4 164477595 1D GGAGAAAGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 10 9 222008 CASAVA_Build 4 164478779 4D GTGAGAGATG GCCC/---- ATGGGTGATG 3070 hom 129 het 45 0 42 4 GCCC 1 0 222009 CASAVA_Build 4 164482566 1D TAATTTCCTC A/- AAAAAACTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 6 222010 CASAVA_Build 4 164516016 1I CTTGCTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 345 hom 39 1 29 9 T 11 12 222011 CASAVA_Build 4 164517357 1I TTGAACTGAG -/A AAAATCCCAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 5 222012 CASAVA_Build 4 164522696 1I CAAACTATGA -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 7 8 222013 CASAVA_Build 4 164559314 2D TTCACTAAAA AC/-- ACAATACCAA 3070 hom 151 het 52 0 50 2 AC 2 1 222014 CASAVA_Build 4 164580811 2I ACTGTAATAA --/TT CTACCTAGAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 0 2 222015 CASAVA_Build 4 164589203 1D ATAGAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 11 10 222016 CASAVA_Build 4 164631151 1I TAAAAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 A 9 10 222017 CASAVA_Build 4 164635686 1I CACTACTTCC -/T TGGGGGAAAC 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 1 2 222018 CASAVA_Build 4 164652262 1D AAATAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1450 het 1450 ref 36 23 6 7 A 16 15 222019 CASAVA_Build 4 164658241 4D AGTTGGGCGT ACAA/---- ACAGTTGATC 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 ACAA 1 0 222020 CASAVA_Build 4 164658574 1D ATTTTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 16 11 T 12 11 222021 CASAVA_Build 4 164659912 1D CTCTGCACTC T/- TTTTTTTTTT 1286 het 1286 ref 44 33 3 8 T 12 11 222022 CASAVA_Build 4 164661158 1D ACAGTCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 15 14 222023 CASAVA_Build 4 164663927 1D GTTTTTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1037 hom 32 9 10 14 T 11 10 222024 CASAVA_Build 4 164666236 11I ATGTCTGGTT -----------/TATGGTATTGA TAATACTGAA 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 TATGGTATTGA 0 1 222025 CASAVA_Build 4 164668119 4D GCTATAGGCA GATT/---- GATTGTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 20 2 GATT 2 1 222026 CASAVA_Build 4 164668239 2I TAACTTTTGT --/GA GACTTTGAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 GA 1 2 222027 CASAVA_Build 4 164668453 2D TATTGATGAC AT/-- GTTGAAATAA 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 AT 1 0 222028 CASAVA_Build 4 164668928 3I AATATGTTAG ---/TTA TTATTTCCAG 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 TTA 1 2 222029 CASAVA_Build 4 164669706 1I GATTTGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 10 11 222030 CASAVA_Build 4 164675054 3D TAACTCTGAA CTT/--- CTTAATAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 CTT 2 1 222031 CASAVA_Build 4 164675401 5D ATGCTACTTG GATTT/----- GATTTATTTA 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 GATTT 2 1 222032 CASAVA_Build 4 164677752 1I GGATTGTATG -/T TGGAAAACTC 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 1 2 222033 CASAVA_Build 4 164678928 1D TAAAATTTAT A/- AATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 8 12 4 A 3 2 222034 CASAVA_Build 4 164679381 5D GCCTGTTCTG TTATT/----- TTCTTTGGTT 3070 het 3070 ref 39 22 16 3 TTATT 1 0 222035 CASAVA_Build 4 164685313 1I ACCTCCTCTC -/A TTTTTTTGTT 2775 het 2775 ref 30 14 9 7 A 0 1 222036 CASAVA_Build 4 164688989 3I AAAATTGGGA ---/CTT CTTCTATCTA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 CTT 1 2 222037 CASAVA_Build 4 164696703 1I CATTATTAGA -/T TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 8 9 222038 CASAVA_Build 4 164697155 1I ATTGAGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 11 11 T 11 12 222039 CASAVA_Build 4 164710189 3D GGGTACATAC TCT/--- TATTATCCCC 3070 hom 144 het 49 0 48 4 TCT 1 0 222040 CASAVA_Build 4 164712922 1D TCTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2224 het 379 hom 21 8 7 6 T 15 14 222041 CASAVA_Build 4 164716802 3D TCCTTTTAAC ACT/--- GCCTTTGCTG 3070 het 3070 hom 32 16 16 0 ACT 1 0 222042 CASAVA_Build 4 164717425 1I ATTTTTACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 9 10 222043 CASAVA_Build 4 164720280 1I AATAGAACGG -/A AATGAATATG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 2 3 222044 CASAVA_Build 4 164723371 1I TAAAAACTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 10 11 222045 CASAVA_Build 4 164724255 1D TTTTTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 41 3 12 26 T 14 13 222046 CASAVA_Build 4 164724419 1D GCCAGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 2618 het 2618 ref 30 17 8 5 T 12 11 222047 CASAVA_Build 4 164735959 1D AAAAATAAAA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 2667 hom 25 12 10 3 T 1 0 222048 CASAVA_Build 4 164736055 2D AGAGATTGCA GT/-- TGCAGTGAGC 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 GT 1 0 222049 CASAVA_Build 4 164739900 2I TCAAAAAAAT --/TA TATATATATA 2832 het 122 hom 11 1 8 2 TA 7 8 222050 CASAVA_Build 4 164740022 2D AAACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AC 8 7 222051 CASAVA_Build 4 164742004 2D AAAGTGTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 32 2 18 12 T 12 10 222052 CASAVA_Build 4 164743769 1D GGAAGTGTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 13 11 9 T 9 8 222053 CASAVA_Build 4 164743926 1D AATCTAAATG T/- TTTATGATAC 3070 het 3070 ref 41 22 15 6 T 4 3 222054 CASAVA_Build 4 164759540 3D AGCTTCCCAG AGA/--- AGGAGACGCC 3070 het 3070 hom 58 26 29 3 AGA 1 0 222055 CASAVA_Build 4 164768283 1I AGTCTATAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 9 10 222056 CASAVA_Build 4 164768443 1I AAGGAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 10 11 222057 CASAVA_Build 4 164770891 1I TATGCAAAAA -/C ATAGAAGAAT 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 C 0 1 222058 CASAVA_Build 4 164772211 6D GCATTTTGCC TAAGAA/------ TAAGTTTCAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 TAAGAA 1 0 222059 CASAVA_Build 4 164784649 1I CTCTTCAAAA -/T TTTTTTTTAA 2862 het 2862 ref 22 9 6 7 T 8 9 222060 CASAVA_Build 4 164786847 1I ACATGAAATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 8 9 222061 CASAVA_Build 4 164789056 1D TGACTGTTTC T/- TAAACATTTG 3070 het 3070 ref 35 23 8 4 T 2 1 222062 CASAVA_Build 4 164792400 1I CCATTTCCAC -/T TTTTTTTTTT 1455 het 1455 ref 37 21 4 12 T 13 14 222063 CASAVA_Build 4 164856339 5D CTCACTAGGG ATAAA/----- ATAAAATAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 4 ATAAA 3 2 222064 CASAVA_Build 4 164877152 1D AGGGTTGGGT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 G 10 9 222065 CASAVA_Build 4 164910688 5I TTTCTCTAGC -----/TTATT TTATTTTAAG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 TTATT 1 2 222066 CASAVA_Build 4 164911228 2I TACAGACTCT --/GA GAGAGTTTCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GA 2 3 222067 CASAVA_Build 4 164913372 25I CCCCCCTTTC -------------------------/TTTTAAAATCAATTGTCCCTTACTA TCATCTCAGC 3070 hom 144 het 51 0 48 7 TTTTAAAATCAATTGTCCCTTACTA 0 1 222068 CASAVA_Build 4 164918772 3D ATTTAGCAGT TGG/--- TGGACATTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 11 TGG 2 1 222069 CASAVA_Build 4 164921225 1I TTATGGCTTT -/G ATTTTACCAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 0 1 222070 CASAVA_Build 4 164922719 1D AACTGCCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 39 1 33 6 A 12 11 222071 CASAVA_Build 4 164922812 3D AATTGGATAG GAA/--- GAAGCACAAG 3070 hom 137 het 49 0 45 6 GAA 2 1 222072 CASAVA_Build 4 164925462 1D CTGATTCCCA C/- AAAAATATAT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 C 1 0 222073 CASAVA_Build 4 164942734 1I TTTCTCTAAA -/C TTTTCCTCTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 222074 CASAVA_Build 4 164945973 1I CACTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1679 hom 27 4 17 6 A 10 11 222075 CASAVA_Build 4 164948411 1I AAATCATAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 395 hom 36 1 35 0 T 9 10 222076 CASAVA_Build 4 164951847 20D TTTTAAGATT TTTAGTGGCACTAAACATTG/-------------------- TTTAGTGGCA 3070 hom 75 het 32 0 26 10 TTTAGTGGCACTAAACATTG 1 0 222077 CASAVA_Build 4 164956984 1D CCTTCTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 17 0 12 5 T 11 10 222078 CASAVA_Build 4 164962396 1D GAAAAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1697 hom 39 6 22 11 T 13 12 222079 CASAVA_Build 4 164964487 2D AAGTTATGTT AA/-- AGTTTCAATA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 3 1 222080 CASAVA_Build 4 164964682 1D ATGGAATCAC A/- AAAATAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 4 222081 CASAVA_Build 4 164967691 2I TTTTTAAAAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 41 0 32 9 A 9 11 222082 CASAVA_Build 4 164976475 1D AAATAGATTG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 7 6 222083 CASAVA_Build 4 164977362 3I ATACCAAGTG ---/CGC CGCCATTGGC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 CGC 1 2 222084 CASAVA_Build 4 164981580 1D GCAATTTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 120 het 43 0 41 4 A 8 7 222085 CASAVA_Build 4 164982066 4I TTAAAAAAAG ----/AATT AATACGAGCC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 AATT 0 1 222086 CASAVA_Build 4 164983583 2I AGTACAGGGT --/TA GCAATAGGTA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 TA 0 1 222087 CASAVA_Build 4 164989967 1I AGCCACCATC -/A ATTATTATCA 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 1 2 222088 CASAVA_Build 4 164998704 3D TCCGGGGGGT GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 hom 104 het 39 0 32 7 G 13 10 222089 CASAVA_Build 4 165002466 1D GTGGTGTTGG A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 8 7 222090 CASAVA_Build 4 165009618 1I TCTAACAGTC -/T TCTTTAAATT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 T 1 2 222091 CASAVA_Build 4 165015106 1I CCACACTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 9 10 222092 CASAVA_Build 4 165020301 1D AAGATTACTG A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 7 6 222093 CASAVA_Build 4 165022079 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 8 5 A 11 10 222094 CASAVA_Build 4 165022278 5D ATCAGGCTAC AGAAA/----- AGAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 43 24 15 7 AGAAA 3 2 222095 CASAVA_Build 4 165030079 1I GAGAGCAGGG -/A AAAATTTCAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 5 222096 CASAVA_Build 4 165030983 2I TCTCTCTCTC --/TT TGTTTTTTCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 3 222097 CASAVA_Build 4 165040952 1I TTTTTTTTTT -/A TTAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 0 1 222098 CASAVA_Build 4 165043839 2D TTCCTTCCCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 42 het 24 0 14 11 TG 9 8 222099 CASAVA_Build 4 165047325 1D TTAGACAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 A 9 8 222100 CASAVA_Build 4 165047436 1D ATACACCCCT C/- CCCCCCCACA 3070 hom 69 het 26 0 23 4 C 8 7 222101 CASAVA_Build 4 165052668 3D GAATGCAGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 33 3 14 17 T 15 12 222102 CASAVA_Build 4 165054597 1D ATCTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 28 7 T 12 11 222103 CASAVA_Build 4 165054694 2I AAAAATTGTG --/AT TTTTTTTCCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AT 0 1 222104 CASAVA_Build 4 165059364 4I CATTAACTGA ----/TAAT TAATTGGTAG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 TAAT 1 2 222105 CASAVA_Build 4 165061454 4D TTTCCAGAAC CTAA/---- CTATTTTAAG 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 CTAA 1 0 222106 CASAVA_Build 4 165061886 1I ATTTGGAGTT -/G TTTAATCGTG 3070 het 3070 ref 36 14 15 7 G 0 1 222107 CASAVA_Build 4 165061982 1I TCATCACTTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 8 9 222108 CASAVA_Build 4 165062220 1I TGGTTATATA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 7 8 222109 CASAVA_Build 4 165063772 1D TTGGGAATAC A/- TTTTGAAAGA 3070 het 3070 hom 45 22 20 4 A 1 0 222110 CASAVA_Build 4 165064369 1D ATAGAATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1560 hom 32 6 11 15 A 15 14 222111 CASAVA_Build 4 165065833 1D GATTAATAAG A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 A 7 6 222112 CASAVA_Build 4 165089286 5D AACAGGAGTA AAGAC/----- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 AAGAC 1 0 222113 CASAVA_Build 4 165095950 1D GCTTTGAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 20 15 12 A 10 9 222114 CASAVA_Build 4 165099933 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1877 hom 33 11 10 12 A 12 11 222115 CASAVA_Build 4 165111764 1D AGGAGTAAAC A/- AGAGTAGGCA 3070 hom 129 het 49 0 44 6 A 2 1 222116 CASAVA_Build 4 165138665 1D TTTCACAGAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 9 8 222117 CASAVA_Build 4 165141041 11D TTTTGGATGG AAAATTCAATA/----------- AAATATTCAG 3070 het 3070 ref 25 14 10 4 AAAATTCAATA 1 0 222118 CASAVA_Build 4 165151999 1D ACCATAATAT A/- ATGAAAAGCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 1 222119 CASAVA_Build 4 165154343 1D GTGCTGATGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 A 9 8 222120 CASAVA_Build 4 165162200 2D TCTCCTAAGT CC/-- TTCTTATAGA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 2 0 222121 CASAVA_Build 4 165162457 1D CCTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 2948 het 341 hom 12 1 7 4 A 12 11 222122 CASAVA_Build 4 165172036 1I TTTTTTTTTC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 7 8 222123 CASAVA_Build 4 165176236 1D TAAAGAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1893 hom 29 6 12 11 A 13 12 222124 CASAVA_Build 4 165180957 6I ATACTTAGTT ------/CTTATA CTTATTAAAT 1074 het 983 hom 7 2 3 2 CTTATA 0 1 222125 CASAVA_Build 4 165185184 1D TAATTAAAAT A/- AATCATTCAA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 A 3 2 222126 CASAVA_Build 4 165192746 1I4M1I AGTTTTTTTT -TTTG-/GTTTGT TTTTTTTTGT 3070 hom 30 het 15 0 11 6 N/A 0 0 222127 CASAVA_Build 4 165192864 8D GTGGCTCACG CCTGTAAT/-------- CCTGTAATCC 3070 hom 44 het 20 0 10 13 CCTGTAAT 2 1 222128 CASAVA_Build 4 165197123 2I CCTAATGAAT --/CA GTTTCACAGG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 CA 0 1 222129 CASAVA_Build 4 165206783 1D AACTTGCAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 10 9 222130 CASAVA_Build 4 165207642 1I TGACGAAGGC -/T TTTTAATAGT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 4 5 222131 CASAVA_Build 4 165208533 5D GACACTTCTC AAAAG/----- AAGACATATG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 AAAAG 1 0 222132 CASAVA_Build 4 165219140 1D AAATAAATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 9 8 222133 CASAVA_Build 4 165222959 1D AATTTACAGG C/- CCCATTATAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 C 4 3 222134 CASAVA_Build 4 165225331 1I GTAAGCAATG -/T TTTTTTCAGT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 6 7 222135 CASAVA_Build 4 165228410 1D TTTTTCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 39 2 33 4 T 12 11 222136 CASAVA_Build 4 165230947 4I TTACCCAATT ----/ACTC AGTCATTCTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 ACTC 0 1 222137 CASAVA_Build 4 165231587 2D ACAGGGCAAC CT/-- TGAGAATTAC 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 CT 1 0 222138 CASAVA_Build 4 165240832 1I AACGTGTACA -/T TTTGCATAAA 3070 hom 132 het 50 0 43 7 T 3 4 222139 CASAVA_Build 4 165248420 1D TCGATAATAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 9 8 222140 CASAVA_Build 4 165251317 1D ATGAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 12 11 222141 CASAVA_Build 4 165254516 1I ATTTTTATAT -/A AAAACGATAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 4 5 222142 CASAVA_Build 4 165256582 5D ATGAATACTT TAGAA/----- TAGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 TAGAA 1 0 222143 CASAVA_Build 4 165259549 1I AAATTGAATG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 7 8 222144 CASAVA_Build 4 165260675 1I36M1D ATTTAGTTAT -AAAAAATCATAAATAAAATATTATCAAATAGAACTTA/AAAAAAATCATAAATAAAATATTATCAAATAGAACTT- ACTCACACAA 3070 het 3070 ref 36 29 23 5 N/A 0 0 222145 CASAVA_Build 4 165262490 1I AAGACATATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 9 222146 CASAVA_Build 4 165265223 3D CCAGTCATTT ACA/--- ACAACATGGT 3070 het 3070 ref 52 24 20 10 ACA 3 2 222147 CASAVA_Build 4 165269145 1I ACTCATAATG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 8 9 222148 CASAVA_Build 4 165281358 4D ATACACACAC ACAT/---- ACATACATAC 3070 het 3070 ref 57 24 22 12 ACAT 4 3 222149 CASAVA_Build 4 165288287 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGAGGGA 1127 hom 7 het 3 0 3 0 G 6 5 222150 CASAVA_Build 4 165288446 3I TCAATAAAAA ---/AAT AAATAAATTC 1904 hom 10 het 14 0 4 10 AAT 0 1 222151 CASAVA_Build 4 165289413 1I TTCTGCCTTC -/A AACCACCCAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 3 222152 CASAVA_Build 4 165291742 11I CCACTTTGGG -----------/GTCCAGAACTC CTCCAGAACT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 GTCCAGAACTC 0 1 222153 CASAVA_Build 4 165293728 4D TCAACAGAGA ATAT/---- ATATATATAA 3070 het 47 hom 36 1 25 11 AT 6 4 222154 CASAVA_Build 4 165293858 1D CTACCTTAGA T/- TTTACAATTC 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 4 3 222155 CASAVA_Build 4 165294823 6D TAGGCCATTT AAAAGA/------ AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 12 11 AAAAGA 2 1 222156 CASAVA_Build 4 165295937 1I CTAAACTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 10 11 222157 CASAVA_Build 4 165297509 1I ATCTCACCCC -/T ATACTAGTTT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 0 1 222158 CASAVA_Build 4 165300651 1D ACAGACTCTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 T 8 7 222159 CASAVA_Build 4 165307509 1I AATAAAAAAA -/T CAATGAATAA 3070 het 2701 hom 17 6 10 1 T 0 1 222160 CASAVA_Build 4 165307812 4D CCTCAAAAAG CAAA/---- CAGTCTGTTA 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 CAAA 1 0 222161 CASAVA_Build 4 165308171 1D ATAGTATTGT A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 A 8 7 222162 CASAVA_Build 4 165311795 1D TTTATGAACA T/- CTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 41 19 15 9 T 1 0 222163 CASAVA_Build 4 165312196 1D GAATACATTA T/- TTTTTCCAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 6 5 222164 CASAVA_Build 4 165318119 1D TCAATATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 43 1 35 7 T 11 10 222165 CASAVA_Build 4 165320007 3I GTATGTAATA ---/AAG CTTGAACAAA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 AAG 0 1 222166 CASAVA_Build 4 165321126 1D AATATTTCAA G/- GCTGAAGTTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 G 2 1 222167 CASAVA_Build 4 165322901 3D CACTAAACTT GAC/--- TAATAAATAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 GAC 1 0 222168 CASAVA_Build 4 165327629 1I TGAAGCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 821 hom 42 2 30 10 T 13 14 222169 CASAVA_Build 4 165327875 1I GTCTGCCCCC -/T CTCCTGGAGA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 0 1 222170 CASAVA_Build 4 165329920 3D CCTTCTATGA AGG/--- AGAAGACTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 AGG 1 0 222171 CASAVA_Build 4 165330319 1I CCAAGAAGTC -/T CATATCTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 0 1 222172 CASAVA_Build 4 165331183 1I AGGGTGTGTG -/T TTCACCTTCA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 2 3 222173 CASAVA_Build 4 165332953 3D GAGAATTTAG TTT/--- TTAAAGCCAC 3070 het 3070 hom 42 21 20 3 T 5 2 222174 CASAVA_Build 4 165333234 2D TAAAAAACAC TT/-- CAGTCACTCT 1997 het 1997 ref 27 16 5 6 T 2 0 222175 CASAVA_Build 4 165334624 3I GGAAGAATGA ---/ACT ACTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 ACT 1 2 222176 CASAVA_Build 4 165336493 1D ATTGGGACTT A/- AAAAATGATA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 6 5 222177 CASAVA_Build 4 165346716 1D CCGAGTTATC T/- TTGTTAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 3 2 222178 CASAVA_Build 4 165359831 4I AATTAAATAT ----/TTAG TTATATAGTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TTAG 0 1 222179 CASAVA_Build 4 165360890 2D AATGGAATTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2232 hom 17 6 8 3 AT 6 5 222180 CASAVA_Build 4 165362592 1I GGTAGTGAAG -/A AAAAAATTGG 3070 hom 116 het 43 0 39 4 A 6 7 222181 CASAVA_Build 4 165364845 1D ATATTATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 27 1 23 4 T 11 10 222182 CASAVA_Build 4 165371127 4D TTATTTACCT TTTC/---- TTTGTGTTGA 3070 het 3070 hom 23 8 13 3 TTTC 1 0 222183 CASAVA_Build 4 165373844 1I TGTTTATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 10 11 222184 CASAVA_Build 4 165388213 2D18M1D GTATAATAAT AAAAAAAAAAAAGTTAAAAGA/--AAAAAAAAAAGTTAAAAG- AAAAAAGAAA 3070 hom 51 het 16 0 17 5 N/A 0 0 222185 CASAVA_Build 4 165392932 15D CACCATCAAA AAAACAAAACAAAAC/--------------- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 33 22 10 8 AAAAC 5 2 222186 CASAVA_Build 4 165395993 1D CAAGAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 14 5 A 15 14 222187 CASAVA_Build 4 165398101 4I TGTTTTATAT ----/TTAA TTAGGCTAAA 2716 het 2716 ref 22 10 7 5 TTAA 0 1 222188 CASAVA_Build 4 165404294 4D AAGGGAACGA ACAG/---- ACACTTTTCA 3070 het 3070 ref 33 22 9 6 ACAG 1 0 222189 CASAVA_Build 4 165414640 1D AAAATCACTA T/- TTTTTTTTTT 1896 het 439 hom 8 1 4 4 T 11 10 222190 CASAVA_Build 4 165420358 1I TGTAAAATGT -/A AAAAAAGTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 222191 CASAVA_Build 4 165427314 5I ACTATTATAT -----/ATATA ATATATTTTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 ATATA 1 2 222192 CASAVA_Build 4 165428821 1I AAGGATTGAG -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 6 7 222193 CASAVA_Build 4 165436050 4D ATACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 96 het 40 0 33 10 AC 10 8 222194 CASAVA_Build 4 165438280 4D GCCTGCAGTT TAAC/---- TAGTAGTAAT 3070 hom 81 het 35 0 28 9 TAAC 1 0 222195 CASAVA_Build 4 165441620 1I AGCATGTTTA -/G GTTGCCTAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 2 222196 CASAVA_Build 4 165444354 3I CATCGCCTCC ---/CCA CCAACACATA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 CCA 1 2 222197 CASAVA_Build 4 165449811 10I AAAAAAAAAG ----------/GAATCCTTCA GCATTATAAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 GAATCCTTCA 0 1 222198 CASAVA_Build 4 165450105 2D ATCCTCAGTC AG/-- GGGGCTGAGT 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 AG 1 0 222199 CASAVA_Build 4 165459115 1D AGCATCCTAC A/- AAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 A 3 2 222200 CASAVA_Build 4 165461311 1I TCCTTAAAAG -/A AATCCAGGTG 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 2 3 222201 CASAVA_Build 4 165462088 1D CACCAAGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 35 1 15 19 A 11 10 222202 CASAVA_Build 4 165470777 3D AAGGAAGGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 14 16 A 15 12 222203 CASAVA_Build 4 165481882 1I AAGCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 15 14 A 11 12 222204 CASAVA_Build 4 165487199 56D AACCTGTATG TATGTATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------------------------- TATATATATA 3070 het 1941 hom 20 8 16 4 TATGTATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 222205 CASAVA_Build 4 165489921 1D GTTAAATCTG A/- GAAAAGTTAC 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 1 0 222206 CASAVA_Build 4 165497722 1D TTTTTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2852 hom 29 9 18 2 A 11 10 222207 CASAVA_Build 4 165501573 1D GCAGAATTTT A/- AAATTACATA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 4 3 222208 CASAVA_Build 4 165507520 8I TACTAAGCAC --------/CAACCTCA CAACCTCACA 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 CAACCTCA 1 2 222209 CASAVA_Build 4 165508219 6D TAGGAATGAC TTAGAT/------ TTAAAGTTCT 2748 het 2748 ref 21 9 8 9 TTAGAT 1 0 222210 CASAVA_Build 4 165508322 3D TAAAAATTAG GTT/--- GTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 GTT 2 1 222211 CASAVA_Build 4 165508649 1I AAAAAGATTT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 7 8 222212 CASAVA_Build 4 165508799 1D ATCCTAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 9 4 A 11 10 222213 CASAVA_Build 4 165508937 5I AGAAAAACAT -----/AATAA AAATATAATT 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 AATAA 0 1 222214 CASAVA_Build 4 165509684 2I TATCAGCTCC --/CT CTCTCTCAGG 3070 hom 83 het 33 0 27 6 CT 3 4 222215 CASAVA_Build 4 165517785 8I TAATAGTTCA --------/ACATTAGT ATCCATCCGT 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 ACATTAGT 0 1 222216 CASAVA_Build 4 165520911 3D TCACTAATAT ATA/--- ATATTTGTCA 3070 het 3070 hom 47 20 24 4 ATA 2 1 222217 CASAVA_Build 4 165525986 1I ACTCACTATC -/A AGATAGGCTT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 1 2 222218 CASAVA_Build 4 165529245 1D CAAATTATCA T/- TTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 7 6 222219 CASAVA_Build 4 165530685 5I TTTTCCTCAG -----/TTTAT TTTAATTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 TTTAT 0 1 222220 CASAVA_Build 4 165531402 1I TCCTGGATTC -/A GGGGCAAATT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 0 1 222221 CASAVA_Build 4 165535944 2D GGGAAAAACA CT/-- GTTTACCTTG 3070 het 3070 ref 44 21 16 8 CT 1 0 222222 CASAVA_Build 4 165538845 1I GAAGAAACCT -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 1 2 222223 CASAVA_Build 4 165540583 1D ACTTGAAGAC A/- AAGATTACAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 3 2 222224 CASAVA_Build 4 165540863 2D ATACCATGAA AT/-- ATGTGGAAAT 3070 het 3070 hom 48 21 25 2 AT 2 1 222225 CASAVA_Build 4 165551515 1D AAGAACATGG A/- TTTTCACTGG 3070 het 3070 hom 35 8 21 7 A 1 0 222226 CASAVA_Build 4 165553808 1D CAAAAAAAAA G/- GGGGGGGGCT 2427 het 1886 hom 28 11 7 10 G 9 8 222227 CASAVA_Build 4 165561040 2D AAAGTTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 AT 7 6 222228 CASAVA_Build 4 165562570 1D AATGCAAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 15 3 A 10 9 222229 CASAVA_Build 4 165567104 1D TTCCTTTTGC T/- GGCAGCTCCC 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 T 1 0 222230 CASAVA_Build 4 165577844 3I TACTTGTCTC ---/CTT CAAATCTCAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 CTT 0 1 222231 CASAVA_Build 4 165580330 3D TGCTCAACTC TTT/--- TTATCATTTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 3 T 5 2 222232 CASAVA_Build 4 165590765 4I AAAGAGGATG ----/ACCC AAACTACAAC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 ACCC 0 1 222233 CASAVA_Build 4 165593664 1D CAGAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2209 hom 41 9 17 16 A 15 14 222234 CASAVA_Build 4 165597272 2D ACAGAAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 21 9 A 13 11 222235 CASAVA_Build 4 165605885 3I TTTAATACTT ---/AAC AACAACCCAG 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 AAC 2 3 222236 CASAVA_Build 4 165611920 1I TTTCTAACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 13 12 T 9 10 222237 CASAVA_Build 4 165619349 1I TTAGCCACTT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 A 7 8 222238 CASAVA_Build 4 165624325 1I TATTTGCTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 8 9 222239 CASAVA_Build 4 165625944 1D GGGAGTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 11 10 222240 CASAVA_Build 4 165631866 1D CCTTGTGGAT G/- AGAGGAATGA 3070 het 3070 hom 62 28 28 8 G 1 0 222241 CASAVA_Build 4 165644099 1D TATACTATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 10 9 222242 CASAVA_Build 4 165669721 1I TGAGATATAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 8 9 222243 CASAVA_Build 4 165674889 9I12M10D4M2I CATAATATTA ---------TTGACTATTCTATTTCTGTGGTTAAA--/CCCAGCTTCTTTCCTTTTCAA----------TAAACT AAAACACCTC 3070 het 3070 ref 40 36 9 4 N/A 0 0 222244 CASAVA_Build 4 165676641 6I TCTCTTTCTA ------/ACTTGG ACTTGGTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 ACTTGG 1 2 222245 CASAVA_Build 4 165677118 1D TCCCCTATGT G/- GTATTTACTA 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 G 2 1 222246 CASAVA_Build 4 165682271 1I TTCTCAATAA -/T TTCCTCATCT 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 T 2 3 222247 CASAVA_Build 4 165689832 1I GGTGGGGGGA -/G GGGGGGGATA 994 het 414 hom 10 3 3 4 G 7 8 222248 CASAVA_Build 4 165694093 2D GAATTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1598 hom 12 het 6 0 4 2 T 13 11 222249 CASAVA_Build 4 165715647 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAGAAC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 6 7 222250 CASAVA_Build 4 165715851 1I AGGGTGCCAA -/G GGTTGAAAAA 3070 hom 95 het 34 0 29 5 G 2 3 222251 CASAVA_Build 4 165721450 9D TTTTTCTTAT TGATTTGAG/--------- TTTGTTGCAG 3070 hom 63 het 24 0 22 4 TGATTTGAG 1 0 222252 CASAVA_Build 4 165722820 1D TGTCAAATGC T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 98 het 39 0 33 6 T 8 7 222253 CASAVA_Build 4 165735119 1I TAATGTTTGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 8 9 222254 CASAVA_Build 4 165746081 2I AAATCTCAAT --/AG AGTTTGGTAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AG 1 2 222255 CASAVA_Build 4 165749204 1I TTAGGTCCCC -/A AAATACCTAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 3 4 222256 CASAVA_Build 4 165749716 2D24M1I TTACAGATGC TTTTTTTTTTTTGGACTAGCTGCTCA-/--TTTTTTTTTTGGACTAGCTGCTCAT TTTCCAAATA 3070 hom 57 het 22 0 20 5 N/A 0 0 222257 CASAVA_Build 4 165750340 2I TCTAAGACTC --/AT ATACCTCATC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 1 2 222258 CASAVA_Build 4 165751183 12D AAGAGTAAGG TGTGTGTGTGCA/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 82 het 39 0 28 12 TGTGTGTGTGCA 2 1 222259 CASAVA_Build 4 165751905 1D TAAGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 13 12 222260 CASAVA_Build 4 165752287 2I CTCAAAGACA --/AC ACAGTCTCAA 3070 hom 157 het 57 0 53 4 AC 1 2 222261 CASAVA_Build 4 165754247 1I AAGTACACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 44 0 34 10 A 9 10 222262 CASAVA_Build 4 165778656 1I GCATTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 1977 het 1977 ref 36 12 11 13 A 16 17 222263 CASAVA_Build 4 165788774 1I AAAGTAAATG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 9 222264 CASAVA_Build 4 165798754 1D TTGCAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 12 11 222265 CASAVA_Build 4 165800284 1I GGAAACCACT -/A AAAAAATAGT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 6 7 222266 CASAVA_Build 4 165805796 1D TCTTCCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 39 1 30 10 T 12 11 222267 CASAVA_Build 4 165806394 2I GTGCACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 382 hom 51 1 40 10 AC 8 9 222268 CASAVA_Build 4 165810143 1D TAAATGGGCT A/- AATGCTCCAG 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 3 2 222269 CASAVA_Build 4 165840916 1I TGGTCAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 964 hom 44 5 26 13 A 12 13 222270 CASAVA_Build 4 165912876 1I ACACCCAGAT -/C TCATGAGAAC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 C 0 1 222271 CASAVA_Build 4 165914771 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2002 het 1044 hom 25 7 7 12 A 17 16 222272 CASAVA_Build 4 165918929 1I TAAACAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2254 hom 23 7 11 5 A 11 12 222273 CASAVA_Build 4 165920142 1D AAGTCAGCAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 9 8 222274 CASAVA_Build 4 165921732 14D ACATTTACAT ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 18 9 20 AC 15 8 222275 CASAVA_Build 4 165945340 1I AATCACACTT -/A AACAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 A 2 3 222276 CASAVA_Build 4 165966054 1I TTTATATTTT -/A AAAAAAATGA 2483 het 2483 ref 30 12 8 10 A 7 8 222277 CASAVA_Build 4 166012651 9D TTAGGTCAAG TTCCATAAA/--------- TTCCATAAAC 3070 hom 99 het 40 0 34 10 TTCCATAAA 2 1 222278 CASAVA_Build 4 166017193 2I ATGAAAATAA --/TC TCTGTTACTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TC 1 2 222279 CASAVA_Build 4 166022137 1I ATTTCCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 9 10 222280 CASAVA_Build 4 166022475 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 35 1 16 18 A 16 15 222281 CASAVA_Build 4 166026754 19I AGCCCCTAAA -------------------/GCTTAAGGTACAAACCTTT GCTTAATGTG 3070 hom 105 het 36 0 36 3 GCTTAAGGTACAAACCTTT 0 1 222282 CASAVA_Build 4 166028719 1I TCTACTCTCT -/C CCTGCTCTGT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 C 2 3 222283 CASAVA_Build 4 166045970 2I AAAATCACAC --/AT GTTAGTATAC 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 AT 0 1 222284 CASAVA_Build 4 166047969 1I AAAGCTTGAC -/G TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 G 0 1 222285 CASAVA_Build 4 166048446 2I ATGCAGAAGT --/AC ACAGACACAC 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 AC 1 2 222286 CASAVA_Build 4 166049128 3D TTGCTTCAGG TAT/--- TTAATTAGCA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 TAT 1 0 222287 CASAVA_Build 4 166051297 6I GTGTATGCCA ------/CCACAC CCACACCCAG 3070 het 2248 hom 17 5 10 2 CCACAC 1 2 222288 CASAVA_Build 4 166053293 1I ATTGAAAAAA -/G ATTTAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 G 0 1 222289 CASAVA_Build 4 166053487 2D TTAAAAAAAA AC/-- ACATCAATTT 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 AC 2 1 222290 CASAVA_Build 4 166054344 2D GCTTGTGCAG TC/-- CTAGGACACT 3070 het 3070 hom 31 15 16 3 TC 1 0 222291 CASAVA_Build 4 166063028 2D GGATGACATT GG/-- GGTGAAATGT 3070 het 3070 ref 44 20 18 8 G 4 2 222292 CASAVA_Build 4 166075182 1I AGAATACCTC -/T TTTGCCTCCA 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 T 3 4 222293 CASAVA_Build 4 166075460 5D CCTCCAGTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 36 14 13 13 TTTTG 4 3 222294 CASAVA_Build 4 166075583 1I TTTTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 12 13 222295 CASAVA_Build 4 166077813 3I GTTGCAGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 TTG 3 4 222296 CASAVA_Build 4 166077906 1D TTTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2810 hom 39 16 14 10 T 16 15 222297 CASAVA_Build 4 166080509 8D CACAGTGAGT GGTGACTG/-------- GGTCCTTCAT 2727 het 2727 ref 37 29 7 7 GGTGACTG 1 0 222298 CASAVA_Build 4 166087887 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2132 het 2132 ref 28 15 6 7 T 13 12 222299 CASAVA_Build 4 166105180 1D ATTTCAAATG C/- ATGCTCTTTC 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 C 1 0 222300 CASAVA_Build 4 166105890 1D CCTCCATCTC A/- AAAAAAGACA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 6 222301 CASAVA_Build 4 166108883 3D ATATAAGAAA TAC/--- AGAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 TAC 1 0 222302 CASAVA_Build 4 166111099 2D ATTACTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 29 10 7 A 13 11 222303 CASAVA_Build 4 166121218 5I AATAGTTGAG -----/GGACA GGACATAGTA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 GGACA 1 2 222304 CASAVA_Build 4 166134981 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTGA 3070 het 2509 hom 22 8 12 2 A 1 0 222305 CASAVA_Build 4 166141435 3D GGGAATGGGG AGA/--- AGAAGGAATC 3070 het 3070 ref 25 10 11 5 AGA 2 1 222306 CASAVA_Build 4 166141533 1I TCATACCTCA -/T TAGAATTTGG 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 1 2 222307 CASAVA_Build 4 166142187 22D TAATGAGTCT GAGCATCACTGGGACATGGTTA/---------------------- GAGCATCACT 2604 het 2604 ref 24 17 9 2 GAGCATCACTGGGACATGGTTA 2 1 222308 CASAVA_Build 4 166142324 3D TATTTAAATT TGG/--- TGCCAGGAAC 2425 het 2425 ref 20 13 5 4 TGG 1 0 222309 CASAVA_Build 4 166142567 2D TGGGGAAAAG AA/-- AGAGATCAGA 1476 het 1472 hom 12 6 4 2 A 3 1 222310 CASAVA_Build 4 166143592 9D ATATATTTTC TTTTCTTTT/--------- TTTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 26 11 13 4 TTTTCTTTT 2 1 222311 CASAVA_Build 4 166145309 3I ATGGGGACAA ---/GTT GTGTGGACCT 3070 het 2568 hom 18 6 11 1 GTT 0 1 222312 CASAVA_Build 4 166156671 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 629 hom 12 2 7 3 A 10 11 222313 CASAVA_Build 4 166158097 5D TGTTGAAGAA AAATT/----- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 AAATT 1 0 222314 CASAVA_Build 4 166196202 5I CATTTTACAA -----/AGGAG AGGAGAGGCG 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 AGGAG 1 2 222315 CASAVA_Build 4 166201790 3I ATACAGTGAC ---/TTA TTATGACACT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TTA 1 2 222316 CASAVA_Build 4 166202008 1I GTGTGCTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 A 9 10 222317 CASAVA_Build 4 166209369 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 618 hom 16 4 8 4 T 14 13 222318 CASAVA_Build 4 166214716 2I GAGGGGCAGA --/CC CCCCCCCTCA 3070 hom 53 het 22 0 16 6 C 7 9 222319 CASAVA_Build 4 166215848 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2089 het 2089 ref 23 8 7 8 T 13 14 222320 CASAVA_Build 4 166237564 1I AAGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 5 hom 43 1 39 3 T 9 10 222321 CASAVA_Build 4 166257718 1D CATTGGCAGG C/- CTCAAAAGCC 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 C 2 1 222322 CASAVA_Build 4 166261241 1D AATATAATGC A/- AAACCCAACT 3070 het 3070 ref 46 27 16 4 A 4 3 222323 CASAVA_Build 4 166263841 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 2371 het 484 hom 23 2 8 13 AT 10 9 222324 CASAVA_Build 4 166265423 2D AGTGTACTAC AG/-- AGTTACAGTG 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 AG 2 1 222325 CASAVA_Build 4 166272095 2I AGACAGCAGA --/CT CTGTCACCTT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 CT 1 2 222326 CASAVA_Build 4 166297141 1D TTGGTAATTC T/- TTTTTTTTTT 1680 het 1680 ref 30 16 4 11 T 15 14 222327 CASAVA_Build 4 166311933 3I ATTACATGCT ---/CAG CAGCAGATCT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 CAG 2 3 222328 CASAVA_Build 4 166331188 1D AATGACCTTC A/- TGAATTCTAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 1 0 222329 CASAVA_Build 4 166332739 1I TGCAATAGTT -/C ATTTTGCAGT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 C 0 1 222330 CASAVA_Build 4 166336592 9I TACATAGAAA ---------/TCAGAATTT TCAGAATTTC 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 TCAGAATTT 1 2 222331 CASAVA_Build 4 166355496 1D AGATCAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 T 12 11 222332 CASAVA_Build 4 166356326 1I AATGGTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 T 10 11 222333 CASAVA_Build 4 166359707 1I TTAATTTTAT -/G GTCCTAAGTC 2014 het 2014 ref 34 21 5 8 G 1 2 222334 CASAVA_Build 4 166364830 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 1894 het 1894 ref 41 25 6 10 A 13 14 222335 CASAVA_Build 4 166368464 1D GATATAATAA T/- TATGGTTGCT 1616 het 1616 ref 34 29 4 1 T 2 1 222336 CASAVA_Build 4 166368503 4D AACAAAATGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2607 het 2607 ref 28 17 7 4 T 15 11 222337 CASAVA_Build 4 166370268 1I AATGTGAACA -/T GCTTCCTGCC 2769 het 2769 ref 53 45 6 2 T 0 1 222338 CASAVA_Build 4 166374052 1D ATTTTTAGCC T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 8 7 222339 CASAVA_Build 4 166374932 4D TGGAATAAGA TTTG/---- TTTATTAAAC 1764 het 1764 ref 37 32 4 3 TTTG 1 0 222340 CASAVA_Build 4 166375015 2I ACACTTTTAT --/TC TTTTTTTCAG 1863 het 1863 ref 40 34 4 2 TC 0 1 222341 CASAVA_Build 4 166384660 1I ATTTCCAGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 12 7 5 T 9 10 222342 CASAVA_Build 4 166390135 1D TACCTTTCTA G/- TGATTTGAGT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 G 1 0 222343 CASAVA_Build 4 166391684 2D CTTTGTGAGT AA/-- AAAAGGGTTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 6 4 222344 CASAVA_Build 4 166392830 1D TCAAAGTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 10 9 222345 CASAVA_Build 4 166411768 1D CATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 T 10 9 222346 CASAVA_Build 4 166412234 1I CCAATTTGGA -/T TGCCCTTTAT 2760 het 2760 ref 21 11 6 4 T 1 2 222347 CASAVA_Build 4 166423320 4I TAAGAGACAG ----/ATTA ATTAATCTTG 2977 het 2977 ref 40 30 7 3 ATTA 1 2 222348 CASAVA_Build 4 166426391 5I ATCACATAAT -----/AAAAG AGAGGGAGGG 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 AAAAG 0 1 222349 CASAVA_Build 4 166426712 2D GTATCAGGCC AA/-- AGAGTGAAGC 1804 het 1804 ref 60 49 4 11 A 3 1 222350 CASAVA_Build 4 166428175 1I ACCTCCATGC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 8 9 222351 CASAVA_Build 4 166432944 1D AACTTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 9 8 222352 CASAVA_Build 4 166438582 1D CATGCTACAA C/- CCCAGCTAAT 1918 het 1918 ref 19 10 5 4 C 4 3 222353 CASAVA_Build 4 166438876 1D TCTTCTTTAC T/- GTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 T 1 0 222354 CASAVA_Build 4 166445928 1I CTGCGTGCTG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 T 7 8 222355 CASAVA_Build 4 166447311 1D ATCTTTCTCT C/- TGAATTGTCA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 C 1 0 222356 CASAVA_Build 4 166450576 1D ATTTAAGCTT G/- TAAATTGATA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 G 1 0 222357 CASAVA_Build 4 166453030 2I ATTATTATTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 9 10 6 T 9 11 222358 CASAVA_Build 4 166460743 1D AGTTTTTAAT G/- CAGACAAATG 3070 het 3070 hom 36 10 24 2 G 1 0 222359 CASAVA_Build 4 166467490 12D CCTGCGTCAA GCCCCCGCCCCC/------------ GCCCCCGCCC 3070 het 369 hom 19 1 14 4 GCCCCC 4 2 222360 CASAVA_Build 4 166468002 3D TGCAGGGCGA GGC/--- GGCCATCCGT 2414 het 777 hom 14 5 7 5 GGC 2 1 222361 CASAVA_Build 4 166472114 1D CACAGGATGG A/- ACACTATAGT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 2 1 222362 CASAVA_Build 4 166472744 2I TTTTTCCCTT --/TG TATCCATATG 1735 het 1735 ref 27 18 6 3 TG 0 1 222363 CASAVA_Build 4 166481642 1I CATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 10 11 222364 CASAVA_Build 4 166496939 1D TGAAACACAG C/- CATAAAGAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 C 2 1 222365 CASAVA_Build 4 166500449 1I CATCAGTAGG -/T TCTTGGAAAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 1 2 222366 CASAVA_Build 4 166507663 3D TTTAACATGG CTA/--- CTATTTAACA 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 CTA 2 1 222367 CASAVA_Build 4 166509129 1I AAAAATGCTG -/T TCCATCAAAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 1 2 222368 CASAVA_Build 4 166510705 1D ATATATACCC A/- AGAAGTGAGA 3070 het 3070 hom 55 23 28 4 A 2 1 222369 CASAVA_Build 4 166512326 1D TTGTTAGAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 10 9 222370 CASAVA_Build 4 166513967 2D TGTTGGGAGC AT/-- ATATATATTT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 AT 5 4 222371 CASAVA_Build 4 166514578 1I CATATAATTA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 7 8 222372 CASAVA_Build 4 166517088 4D AAAAAGCAGC TCTT/---- TCTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 37 22 12 6 TCTT 2 1 222373 CASAVA_Build 4 166518337 1D CTACATTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 11 10 222374 CASAVA_Build 4 166549022 1D GACTGTTATT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 A 8 7 222375 CASAVA_Build 4 166554154 1I GGCTTTATCA -/G GTACTACCTT 3070 het 3070 hom 57 25 28 4 G 1 2 222376 CASAVA_Build 4 166555190 1I TGGCTCCATC -/T TTAAAGTAGT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 2 3 222377 CASAVA_Build 4 166555299 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AC 7 5 222378 CASAVA_Build 4 166555767 1I TGATTGGTGG -/A AAAAACCTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 5 6 222379 CASAVA_Build 4 166556366 2D ACATATATAT TA/-- CATACATACA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TA 1 0 222380 CASAVA_Build 4 166556476 4I TAACATGGGA ----/GAAT GAATGTAAGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GAAT 1 2 222381 CASAVA_Build 4 166558160 2D ATTGGCAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 29 0 23 6 T 12 10 222382 CASAVA_Build 4 166558963 2D ATTTGGCCTT AA/-- AAGAGGCAGA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 A 4 2 222383 CASAVA_Build 4 166561172 1D ATTTTTTCTG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 222384 CASAVA_Build 4 166562264 4I TTATAGAATT ----/CTTA CTTAAAGTTT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 CTTA 1 2 222385 CASAVA_Build 4 166562891 3D TCAATTCATC GTT/--- GTTCTTTCAT 3070 hom 27 het 11 0 9 2 GTT 2 1 222386 CASAVA_Build 4 166562957 5I ATTTAAGGAA -----/TCTTT TCTTCTCTTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TCTTT 0 1 222387 CASAVA_Build 4 166564228 5D ATGTTGATTC ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 ATTTT 5 4 222388 CASAVA_Build 4 166565009 2D TATAAATGAC TT/-- ATATTGATTA 3070 hom 57 het 22 0 20 6 T 2 0 222389 CASAVA_Build 4 166565147 2I TATTTATTTA --/TT TTTTTTTGAG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 7 9 222390 CASAVA_Build 4 166565893 4I TTTTTGTATC ----/TAAT TAGAAGTTTT 3070 hom 30 het 18 0 11 7 TAAT 0 1 222391 CASAVA_Build 4 166566262 6D ATATTTCCTC AAAAAA/------ AAAAAAACAC 3070 hom 84 het 29 0 29 3 A 13 7 222392 CASAVA_Build 4 166567161 6I TTGACTTTAC ------/TTTCAG TTTCAGTGGC 3070 hom 108 het 46 0 37 11 TTTCAG 1 2 222393 CASAVA_Build 4 166567272 4I CTATTTCTGG ----/ATTT ATTAAAGAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 ATTT 0 1 222394 CASAVA_Build 4 166567792 1I CTTAGGCAAG -/C CCCCTTGTGC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 4 5 222395 CASAVA_Build 4 166567937 1D TACCTTTTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 93 het 40 0 31 10 T 9 8 222396 CASAVA_Build 4 166567988 1D TTGTCCAACC T/- TTTTTTAAAC 3070 hom 54 het 28 0 19 9 T 7 6 222397 CASAVA_Build 4 166568474 1I TTAGATGTAA -/T TTTCTTCTTG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 3 4 222398 CASAVA_Build 4 166568607 2D TGTATTTTCA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 52 hom 34 1 28 5 TC 8 7 222399 CASAVA_Build 4 166569038 1I GAAAAAAGAC -/T TTACTGTAAT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 2 3 222400 CASAVA_Build 4 166569253 1D AGGAGTTGTC A/- GGGCTGCTGT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 1 0 222401 CASAVA_Build 4 166570455 1D GTGCTTGTGC T/- TTTTGGGTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 5 4 222402 CASAVA_Build 4 166571255 2I ATGAAAGTAA --/TT TTTTTATTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 5 7 222403 CASAVA_Build 4 166574719 1I AGATCCATAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 76 het 30 0 26 4 T 8 9 222404 CASAVA_Build 4 166579899 1D AACTTTAAAA T/- TTTAGTAAGG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 4 3 222405 CASAVA_Build 4 166580162 1I CGGCTGAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 581 hom 31 2 22 7 T 12 13 222406 CASAVA_Build 4 166585103 1D ATCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 31 1 28 3 A 11 10 222407 CASAVA_Build 4 166585551 5D CTCTTTCTTC TTATT/----- TTATTTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 30 3 TTATT 2 1 222408 CASAVA_Build 4 166585891 1I CCTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 25 1 18 6 T 10 11 222409 CASAVA_Build 4 166590709 1D TATTTCTTCA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 7 6 222410 CASAVA_Build 4 166594579 2D AAAGCTAGAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 185 hom 38 3 18 17 T 11 9 222411 CASAVA_Build 4 166594962 1D GATGATGTTG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 A 8 7 222412 CASAVA_Build 4 166596258 1D GTCAAAGGTA T/- TTTTTTTTTT 2524 het 2524 ref 22 7 7 8 T 15 14 222413 CASAVA_Build 4 166597159 2D TCTCTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 2760 het 2760 ref 22 8 10 5 TC 9 8 222414 CASAVA_Build 4 166603086 1I CAACTTTTTC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 40 15 14 11 A 7 8 222415 CASAVA_Build 4 166613557 1D GGTTTGCAGC T/- TAGGACACTA 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 T 2 1 222416 CASAVA_Build 4 166613935 3D ACCAAAAATA CCT/--- CCTCTTTCTC 3070 hom 84 het 29 0 29 1 CCT 2 1 222417 CASAVA_Build 4 166614374 3I TTGGAGGAGA ---/GTT GTTCAGAGAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GTT 1 2 222418 CASAVA_Build 4 166617780 3I GCACTACCTT ---/CTC CTTCTCCAGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTC 0 1 222419 CASAVA_Build 4 166626811 1I GAAAAGGGGT -/G GGGGGGGTAG 2372 het 2372 ref 29 12 11 6 G 7 8 222420 CASAVA_Build 4 166629452 1D AGGCTGCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 11 10 222421 CASAVA_Build 4 166637162 1D ATCACGATCC A/- AAATAATCAG 3070 het 1326 hom 13 3 8 4 A 4 3 222422 CASAVA_Build 4 166640747 2D CTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 2891 het 1627 hom 20 6 7 9 T 11 9 222423 CASAVA_Build 4 166643137 3D GTTAAGTCAC ATT/--- GTTGTTTCAT 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 ATT 1 0 222424 CASAVA_Build 4 166646402 1I ATTAAAATCA -/T TTAAATAATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 3 222425 CASAVA_Build 4 166651771 1I GGTAGGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 T 11 12 222426 CASAVA_Build 4 166659699 1I GGAGTCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 T 11 12 222427 CASAVA_Build 4 166666660 1D ATTACCTGTG T/- TTTTTTTTTT 2330 het 2330 ref 18 10 5 3 T 11 10 222428 CASAVA_Build 4 166670987 2D CCGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 3 CT 2 1 222429 CASAVA_Build 4 166671420 4I TGGGGAACAC ----/ACAA ACATTTATTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ACAA 0 1 222430 CASAVA_Build 4 166679745 3I CTTGTGATTT ---/AAA AAAATATTTT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 4 7 222431 CASAVA_Build 4 166683560 3I TAAATTTCTC ---/CTT CTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 51 22 20 9 CTT 1 2 222432 CASAVA_Build 4 166692162 3D AACAACAACT ACA/--- ACAACAATAA 3070 hom 108 het 38 0 37 3 ACA 3 2 222433 CASAVA_Build 4 166721814 1D GATTGTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 11 10 222434 CASAVA_Build 4 166736340 1D AGGGCTAGTG C/- AGAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 C 1 0 222435 CASAVA_Build 4 166737121 1D CAAGATCTGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 7 6 222436 CASAVA_Build 4 166737850 1D CAGGAACCTG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 7 6 222437 CASAVA_Build 4 166739090 3D AAAAGTAATA AGT/--- AGTATTTATT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 AGT 2 1 222438 CASAVA_Build 4 166745982 1D CCTTCTTTTC T/- TTATTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 T 3 2 222439 CASAVA_Build 4 166748375 1I CTGATGATAG -/T TTTTTTTTTT 1771 het 1771 ref 22 10 6 6 T 11 12 222440 CASAVA_Build 4 166759339 1D AAAGAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 25 17 6 T 11 10 222441 CASAVA_Build 4 166760171 1I AGATTTCTTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 8 9 222442 CASAVA_Build 4 166761450 1I ATCCTTAGCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 T 8 9 222443 CASAVA_Build 4 166773840 1I AAAGAGGTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 A 9 10 222444 CASAVA_Build 4 166774528 2D CAATGTAGTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1879 hom 23 6 9 8 AT 8 7 222445 CASAVA_Build 4 166780576 1D GCTGCAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 10 9 222446 CASAVA_Build 4 166783103 1D TAATGCTCTT G/- GTTCCTTTAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 2 1 222447 CASAVA_Build 4 166783436 1I CAAGACTGAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 T 8 9 222448 CASAVA_Build 4 166787291 1I ATAAGGTATA -/T TTTTATAAGT 3070 het 3070 ref 36 25 11 0 T 4 5 222449 CASAVA_Build 4 166788386 1I CTACAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 A 10 11 222450 CASAVA_Build 4 166794332 1I CACTTTATTA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 6 7 222451 CASAVA_Build 4 166794673 3I TTATATGCTA ---/TTT GAATTCTGCA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 0 3 222452 CASAVA_Build 4 166796907 1I TCTTTGTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 9 10 222453 CASAVA_Build 4 166807058 1D ATCAATACTC T/- TTTGAATAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 4 3 222454 CASAVA_Build 4 166811079 6D ATAGGAAGTC ATTCTG/------ ATTAGATTAC 3070 het 3070 hom 32 14 18 1 ATTCTG 1 0 222455 CASAVA_Build 4 166816479 1D TTAAATCTTC T/- CACTGCCCAG 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 T 1 0 222456 CASAVA_Build 4 166818588 1D TTCACTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 30 1 26 3 T 11 10 222457 CASAVA_Build 4 166820879 2D TGAGGGAAAG AA/-- AATGATAATC 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 A 4 2 222458 CASAVA_Build 4 166826500 1I ATGTCTAGCT -/A AAAAATACAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 5 6 222459 CASAVA_Build 4 166834269 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 7 8 222460 CASAVA_Build 4 166840718 1D GAGAATGCTT A/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 A 1 0 222461 CASAVA_Build 4 166841995 1D TTCTTATTCA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 132 het 49 0 45 7 T 8 7 222462 CASAVA_Build 4 166846964 1D TGGGAGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 12 11 222463 CASAVA_Build 4 166870888 1D CCAACAGTGT A/- AAAAGCATTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 5 4 222464 CASAVA_Build 4 166878459 1D ATTCAAGCCT A/- ATTTTTCAAG 3070 hom 95 het 34 0 32 2 A 2 1 222465 CASAVA_Build 4 166883932 7D CTCAAAAAAA AAAAAAT/------- AAATAAAAAT 27 het 3 hom 4 0 1 3 AAAAAAT 1 0 222466 CASAVA_Build 4 166896161 12D TATATATATA TATATATATTTT/------------ TTTTTCTTTT 1591 hom 12 het 5 0 5 0 TATATATATTTT 1 0 222467 CASAVA_Build 4 166898082 1D CAAGGCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 242 hom 37 2 30 8 T 12 11 222468 CASAVA_Build 4 166902487 1I AAAGTTAAAA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 1348 hom 30 4 22 4 G 1 2 222469 CASAVA_Build 4 166904131 1D AAAAAACAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 10 9 222470 CASAVA_Build 4 166906532 1I CTCTTTTATT -/G TACAACATAT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 G 0 1 222471 CASAVA_Build 4 166917741 1D TGAATTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 10 6 T 12 11 222472 CASAVA_Build 4 166927511 3D TAAGCCTAGG AAT/--- TTGAGACTGG 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 AAT 1 0 222473 CASAVA_Build 4 166933809 1I TGGAATTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 T 9 10 222474 CASAVA_Build 4 166940679 6I TGGGACCCCA ------/TAATAT TAATTTATAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 TAATAT 0 1 222475 CASAVA_Build 4 166945970 4I TCAGGGACTC ----/AATT AAGCATTTAC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AATT 0 1 222476 CASAVA_Build 4 166951178 1I TTTAGCCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 9 10 222477 CASAVA_Build 4 166951450 2D ATACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 20 14 11 AC 10 9 222478 CASAVA_Build 4 166970295 1I TAAATCTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 A 9 10 222479 CASAVA_Build 4 166995825 1D TAAATATCCA T/- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 53 26 24 3 T 7 6 222480 CASAVA_Build 4 166998747 1D CACAGACAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 T 10 9 222481 CASAVA_Build 4 167007512 1I TGAGTTATAA -/T GCTGGAAGAT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 T 0 1 222482 CASAVA_Build 4 167007774 4D ACCCAACAAC GTAT/---- GTATTCAAGA 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 GTAT 2 1 222483 CASAVA_Build 4 167009370 1D GTAATGTTTA T/- TTTTTAGTTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 6 5 222484 CASAVA_Build 4 167009815 8I TTCTCTCCAG --------/CATCACTT CATCACTTTG 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 CATCACTT 1 2 222485 CASAVA_Build 4 167016941 1D AGCAAGAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1710 hom 26 5 13 9 A 11 10 222486 CASAVA_Build 4 167026651 1I ATTTTATGTA -/T TTTTTTTGAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 8 222487 CASAVA_Build 4 167031917 1I TTCAGCTGGA -/T TGAATTTCTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 2 222488 CASAVA_Build 4 167039739 4D TGGCTAGTGG TCTA/---- TCTATTTTGT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TCTA 2 1 222489 CASAVA_Build 4 167041270 1I GCCCTTAACA -/T TTTTTTTCCG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 8 222490 CASAVA_Build 4 167041607 1I ACCTCTGATA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 6 7 222491 CASAVA_Build 4 167042766 1D AGCCAGTGGA T/- TTTAGCTTGC 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 4 3 222492 CASAVA_Build 4 167044567 1I ATATTTCAGG -/A AAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 A 6 7 222493 CASAVA_Build 4 167054963 1D CATTAATAAC T/- TCTTGATTCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 T 2 1 222494 CASAVA_Build 4 167062557 1D TACAGAGAAA C/- CTGAATTATA 3070 hom 96 het 38 0 32 7 C 2 1 222495 CASAVA_Build 4 167094230 6D TTGCTCTGTC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 AT 10 7 222496 CASAVA_Build 4 167098074 1D AAATTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 11 10 222497 CASAVA_Build 4 167113588 4I CATGCTTACT ----/TCTC TGAGCCTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TC 0 2 222498 CASAVA_Build 4 167130266 1I ATTTTATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 39 2 29 8 T 15 16 222499 CASAVA_Build 4 167137202 4D CTCCATCTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 42 het 20 0 16 6 AAAT 3 2 222500 CASAVA_Build 4 167161826 1I GCCAAGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 28 1 24 3 A 10 11 222501 CASAVA_Build 4 167176231 2D AAAAGTTGTA TT/-- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 10 8 222502 CASAVA_Build 4 167184417 1D ATTTTTCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 T 12 11 222503 CASAVA_Build 4 167190224 1D ATGTTTGAAC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 T 8 7 222504 CASAVA_Build 4 167194804 1D AGGGAAAACC A/- CTGTTGATTC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 1 0 222505 CASAVA_Build 4 167197990 1D TCTGTCTTCC T/- CTTTCTTTCC 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 T 1 0 222506 CASAVA_Build 4 167230811 2D TTCTATAGAC TT/-- AAGTAGGAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 0 222507 CASAVA_Build 4 167231588 2I TTGATTTCAC --/AT CTTTCTTAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 0 1 222508 CASAVA_Build 4 167231692 1D GAGTGATTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 9 8 222509 CASAVA_Build 4 167232651 1I TAAGACAGTA -/T TATCAGTTAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 1 2 222510 CASAVA_Build 4 167233332 1I AGATTATGTA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 222511 CASAVA_Build 4 167246281 1I CGGTAATAGA -/G GTATAAGAGG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 1 2 222512 CASAVA_Build 4 167249578 1I CAGAATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 912 hom 40 6 26 8 A 12 13 222513 CASAVA_Build 4 167256079 2D ACAGCAAGTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 11 9 222514 CASAVA_Build 4 167259949 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1316 hom 31 4 16 11 A 14 15 222515 CASAVA_Build 4 167268071 2D CAAGTGTTGT AG/-- AGTCAGACAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AG 2 1 222516 CASAVA_Build 4 167272897 1I CTTCTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 870 hom 24 3 18 3 T 13 14 222517 CASAVA_Build 4 167275599 1I TTCTATTTTT -/A GTAGAGACGG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 0 1 222518 CASAVA_Build 4 167285794 1I TTTTTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1591 hom 20 5 12 3 T 10 11 222519 CASAVA_Build 4 167290040 1D GGAATTGGAA C/- TTACATTTAA 3070 het 3070 ref 40 25 15 0 C 1 0 222520 CASAVA_Build 4 167293901 1D GATGTTTGTA G/- GGGAGAAGAG 3070 het 3070 ref 41 18 19 5 G 4 3 222521 CASAVA_Build 4 167303408 1I AAGCTTTTTT -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 6 7 222522 CASAVA_Build 4 167304305 2D TCAAAAAAAA AT/-- AAAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AT 1 0 222523 CASAVA_Build 4 167306868 1D AAAATAATAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 8 7 222524 CASAVA_Build 4 167310646 1I TGTGATACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 8 17 4 A 9 10 222525 CASAVA_Build 4 167318338 2D CAGGTTTCGC TA/-- TGTTTCCTAG 3070 het 3070 ref 35 14 15 7 TA 1 0 222526 CASAVA_Build 4 167322055 1D TTTTTATTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 10 9 222527 CASAVA_Build 4 167333521 1D CATAGTAGAC A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 7 6 222528 CASAVA_Build 4 167334910 1D GTGACTGGGT G/- GGATAGGAAT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 G 3 2 222529 CASAVA_Build 4 167336014 1D GTCATTTTAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 7 222530 CASAVA_Build 4 167345550 1D TTTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 10 9 222531 CASAVA_Build 4 167345699 1I TGGGTTCCAC -/T TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 6 7 222532 CASAVA_Build 4 167350691 2D CCTCGTGATC CA/-- CCTGCCTCGG 3070 het 2216 hom 26 6 18 4 CA 1 0 222533 CASAVA_Build 4 167360378 1I AAATGACCTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 7 8 222534 CASAVA_Build 4 167365899 1I TGGGATCATT -/C CTTCCATTGT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 C 1 2 222535 CASAVA_Build 4 167379138 1I TTCAATTAGG -/A AAAAGAGGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 4 5 222536 CASAVA_Build 4 167391741 1D ACTTAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 12 11 222537 CASAVA_Build 4 167394578 1D TGGTGAAGTG A/- AAAAAATCTG 2944 hom 15 het 6 0 6 0 A 7 6 222538 CASAVA_Build 4 167396436 3D AATTCTATAA TAT/--- TATTGTAGCA 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 TAT 2 1 222539 CASAVA_Build 4 167398912 2D CAACGTAAAC AT/-- ATGCCGTATT 3070 het 3070 hom 48 19 21 9 AT 2 1 222540 CASAVA_Build 4 167399333 3D TTACTTTTCC CTT/--- CTTGTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 18 17 6 CTT 2 1 222541 CASAVA_Build 4 167399686 2D AAACCAATAA AC/-- ACACAATAAT 3070 het 3070 ref 59 30 24 5 AC 3 2 222542 CASAVA_Build 4 167402598 1D AAATGACTGG T/- TGAATTATAC 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 2 1 222543 CASAVA_Build 4 167403050 1D GGTTCAAATA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 23 7 2 T 9 8 222544 CASAVA_Build 4 167403152 1D TCCTGGACAT A/- AGTTGTAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 8 6 A 2 1 222545 CASAVA_Build 4 167405973 1I ATGAGATGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 8 9 222546 CASAVA_Build 4 167412665 1D CTGCTGGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 43 1 31 11 T 12 11 222547 CASAVA_Build 4 167412867 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 943 hom 31 2 21 8 T 9 10 222548 CASAVA_Build 4 167412951 1D CTCTGCCTCC T/- TGGGTTCATG 3070 hom 45 het 19 0 16 7 T 2 1 222549 CASAVA_Build 4 167417487 2I AACATAAAAC --/AG ATAACATGAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AG 0 1 222550 CASAVA_Build 4 167422841 2D TGTACGTACA CT/-- CTGTGATGTT 3070 hom 169 het 64 0 56 10 CT 2 1 222551 CASAVA_Build 4 167426514 1D TTTTTTGGGA T/- TTTTTTTTTA 2583 het 2583 ref 24 13 8 3 T 10 9 222552 CASAVA_Build 4 167426722 1I GTGGAAAATG -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 57 het 31 0 20 13 A 6 7 222553 CASAVA_Build 4 167427261 1I CATATAAAAT -/A AAAATCAACC 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 4 5 222554 CASAVA_Build 4 167429206 1D CCCAATAGTG T/- TTTTTTATAA 3070 hom 93 het 38 0 32 9 T 7 6 222555 CASAVA_Build 4 167431689 3D CTTTAAAAAA ATT/--- ATTGTTATTT 3070 hom 45 het 19 0 16 4 ATT 2 1 222556 CASAVA_Build 4 167434636 1I TACACAACTG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 9 222557 CASAVA_Build 4 167434779 2D AAAAGCAGAT AG/-- AGAATAGGGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AG 2 1 222558 CASAVA_Build 4 167434931 5D GAAATAACAA AACTC/----- AACAGCAAGG 3070 het 3070 hom 28 13 15 1 AACTC 1 0 222559 CASAVA_Build 4 167436074 3D AACCTATAGG TCC/--- TCCAAAAAAA 3070 het 966 hom 23 6 12 5 TCC 2 1 222560 CASAVA_Build 4 167436238 2D ATTGAAGAAC AT/-- ATATTGGAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 AT 3 2 222561 CASAVA_Build 4 167436351 2I GTAGAAATTA --/AT AAAGTAGAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AT 0 1 222562 CASAVA_Build 4 167436439 4D TAAATTTCAT AAAC/---- AAAAAGATTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAC 1 0 222563 CASAVA_Build 4 167436505 4I TGTTGTATAT ----/TATA TATATACATA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 TA 3 5 222564 CASAVA_Build 4 167436859 1D CTATAGTCTA G/- CCAAGTTGGC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 1 0 222565 CASAVA_Build 4 167437480 1I CTGGACCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 11 12 222566 CASAVA_Build 4 167439354 5I48M1D AATCAGAAAT -----TTAAATATTAGTGATTTTTTAGTATTCTGTCTTTTTTAATCTGAACATA/TTAACTTAAATATTAGTGATTTTTTAGTATTCTGTCTTTTTTAATCTGAACAT- AAAAAAGTTA 3070 hom 102 het 30 0 35 6 N/A 0 0 222567 CASAVA_Build 4 167442424 4I GGAAGCTCTC ----/AAAT AAAACTGGTA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 AAAT 0 1 222568 CASAVA_Build 4 167442472 1D GAGCAGTGTC T/- TGGGGGACAA 3070 hom 57 het 31 0 19 13 T 2 1 222569 CASAVA_Build 4 167443004 1D AAACTTATAG A/- ACTACAAAGT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 2 1 222570 CASAVA_Build 4 167444828 5D CAGAATATAC ATTCT/----- TTTCTTCAGT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 ATTCT 1 0 222571 CASAVA_Build 4 167445067 2I ATTTAAAAAC --/TT TTTGAGCTGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 3 5 222572 CASAVA_Build 4 167445268 1D33M3I AAAAGAAATT AAAAAAAAATCAGAGCAGAACTAAATGAAATCAA---/-AAAAAAAATCAGAGCAGAACTAAATGAAATCAAAAC AACAATAAAA 3070 hom 111 het 31 0 38 4 N/A 0 0 222573 CASAVA_Build 4 167446197 1I GCATTCCCCC -/T GAGAACTGGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 222574 CASAVA_Build 4 167448016 1I TTTGGAGATG -/T TAAGGGTAAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 1 2 222575 CASAVA_Build 4 167448174 4I TGAAATAAAT ----/AAAA AAAAAGAGGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 5 9 222576 CASAVA_Build 4 167448509 6D AGAAAATGAT AAAAAC/------ AAAATATAAG 3070 het 3070 hom 28 12 14 4 AAAAAC 1 0 222577 CASAVA_Build 4 167449092 2D TAACTTTTGA CT/-- CTCTGCTAAC 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 CT 3 2 222578 CASAVA_Build 4 167450243 12I AGAAATGCAC ------------/GGTGCTGTGTAA AGAGACTTCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 GGTGCTGTGTAA 0 1 222579 CASAVA_Build 4 167450544 2I TGCATGTAAC --/AT AAATTAATTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AT 0 1 222580 CASAVA_Build 4 167454604 3I ATATACGGTA ---/TCT CCTCCTTGAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TCT 0 1 222581 CASAVA_Build 4 167462843 2I GAATAGATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 AT 5 6 222582 CASAVA_Build 4 167474403 1I TTAAAAAAAA -/C AAAAACAAAA 3070 het 363 hom 25 3 18 4 C 0 1 222583 CASAVA_Build 4 167476766 2D ACTGAATCAC AG/-- TGAACATTTT 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 AG 1 0 222584 CASAVA_Build 4 167478877 20D GTTTGAGCAA ATGTATGTATGTATGTATGT/-------------------- ATGTATGTAT 3070 het 130 hom 44 6 39 2 ATGT 11 6 222585 CASAVA_Build 4 167480827 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 504 hom 27 2 14 11 T 14 15 222586 CASAVA_Build 4 167488074 1I CCAGCCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 11 12 222587 CASAVA_Build 4 167493788 1D CCATGCCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 19 0 13 6 T 12 11 222588 CASAVA_Build 4 167540729 2I TGTATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 40 0 29 11 TG 6 7 222589 CASAVA_Build 4 167542953 1I CTGGATAAAA -/G TATTTTTCTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 222590 CASAVA_Build 4 167551312 2D AGTTAAAATA AG/-- AGAGAATTAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AG 3 2 222591 CASAVA_Build 4 167561321 1I CTGGGTCTTG -/C CCATGGCCTA 3070 hom 105 het 43 0 33 10 C 2 3 222592 CASAVA_Build 4 167564937 1D GATACCATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 31 1 20 11 A 15 14 222593 CASAVA_Build 4 167567607 4I TTGTTAAATT ----/CTTA CTTTTAGAGA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTTA 0 1 222594 CASAVA_Build 4 167572999 1D TGTTTTGTGG T/- TTTTTTGGTC 3070 hom 129 het 46 0 43 3 T 7 6 222595 CASAVA_Build 4 167577423 1I AAAAGCACTG -/T TTTCTGTGAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 3 4 222596 CASAVA_Build 4 167580765 4D ATATTTTCCC GTTT/---- GTTTATGTCA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 GTTT 2 1 222597 CASAVA_Build 4 167585253 2D GATATGCAGA AT/-- ATGTCTATTT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 AT 2 1 222598 CASAVA_Build 4 167588442 3D TCTTTATCAG TCT/--- TCTTCTCATT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TCT 3 2 222599 CASAVA_Build 4 167590590 1I AGACTGCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 18 1 12 5 A 10 11 222600 CASAVA_Build 4 167590984 5I AAAATTTATA -----/TTAAT TTATCATTAT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 TTAAT 0 1 222601 CASAVA_Build 4 167591737 1D CTGTATTCCA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 9 8 222602 CASAVA_Build 4 167592395 7D48M4D TATTTTATAG ATATATAATATATATGTGTATTGTCAGGGATAATATGAGTCATTTCATAATGATAAATC/-------ATATATATGTGTATTGTCAGGGATAATATGAGTCATTTCATAATGATA---- AATCAATCTT 3070 hom 48 het 13 0 17 5 N/A 0 0 222603 CASAVA_Build 4 167593226 1D TCAACAGATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 9 8 222604 CASAVA_Build 4 167593828 3D TAAGAAATAA GTT/--- GTTAATTCTT 3070 het 3070 ref 52 28 22 5 GTT 2 1 222605 CASAVA_Build 4 167601612 1D TTCTAGTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 67 hom 42 1 35 6 T 10 9 222606 CASAVA_Build 4 167613170 1I GTTCCATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 10 11 222607 CASAVA_Build 4 167614113 2D GAATAATTTT GA/-- GAGAGTCTTG 3070 hom 86 het 34 0 27 8 GA 3 2 222608 CASAVA_Build 4 167620671 2I CAGTATAGAC --/AT AGATTAAAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 AT 0 1 222609 CASAVA_Build 4 167623164 2D ATAAAGGTGT TA/-- TATAAAGTCT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 TA 3 2 222610 CASAVA_Build 4 167624109 1I GGGTAATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 442 hom 26 1 20 5 T 9 10 222611 CASAVA_Build 4 167678526 1I ACAATGTGAT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 7 8 222612 CASAVA_Build 4 167723065 1I TTATGGTATC -/A TTTTTTTTCC 396 het 396 ref 24 19 4 1 A 0 1 222613 CASAVA_Build 4 167728895 4I TACAGATTTG ----/TTTA TTTATAGCTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 TTTA 1 2 222614 CASAVA_Build 4 167730382 1I GGTGACCAAA -/G GTTCCAAAAG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 1 2 222615 CASAVA_Build 4 167735786 2I AAAAAAAAAA --/AC AAACTTTCCA 3070 het 3070 hom 53 22 22 9 AC 0 1 222616 CASAVA_Build 4 167740233 1I GATAAATAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 A 8 9 222617 CASAVA_Build 4 167748475 1I TATTCATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 10 11 222618 CASAVA_Build 4 167761582 2I AAATCAGGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 31 2 21 8 A 12 14 222619 CASAVA_Build 4 167763569 4D ATGGCACCGG CATC/---- TTCTTCTGGT 3070 hom 98 het 38 0 32 8 CATC 1 0 222620 CASAVA_Build 4 167770711 1D ATAGGAAGAG A/- AAAATCACAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 5 4 222621 CASAVA_Build 4 167773065 1I TTGTGGTGTG -/T AATTTTTTAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 222622 CASAVA_Build 4 167775180 1D TTAGCCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 630 hom 42 3 25 14 T 14 13 222623 CASAVA_Build 4 167775825 1D TGGCAATACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 10 9 222624 CASAVA_Build 4 167871546 1D ATACTGTGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 385 hom 47 1 39 8 T 10 9 222625 CASAVA_Build 4 167881747 2D GGTGAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 11 19 10 A 11 9 222626 CASAVA_Build 4 167882874 1D CTGAACATTC T/- TCAGAGATAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 2 1 222627 CASAVA_Build 4 167890509 2D GAATTTTTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 1526 hom 25 7 14 5 AC 10 9 222628 CASAVA_Build 4 167890990 1I TTGAAATTCT -/A AAATTTCAGG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 3 4 222629 CASAVA_Build 4 167897431 1I ATTTTCTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1341 hom 29 3 19 7 T 11 12 222630 CASAVA_Build 4 167898065 1D GAACTAAGTA T/- TTTTTTATAC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 7 6 222631 CASAVA_Build 4 167902283 1I TGAAAATTCT -/A AAAAACCAGA 3070 het 2255 hom 14 5 9 0 A 5 6 222632 CASAVA_Build 4 167908274 5I AACCAGTAGG -----/GAAAA GAAGAATGAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 GAAAA 0 1 222633 CASAVA_Build 4 167910719 1I TTTGGGAGAA -/T TGCTACAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 222634 CASAVA_Build 4 167910895 1D TATAGACACC A/- AAAAATATGC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 6 5 222635 CASAVA_Build 4 167913536 1D ATTTTGATAG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 2749 hom 26 6 18 2 T 8 7 222636 CASAVA_Build 4 167930294 4D GAGAGGAAAA AAGT/---- AAGGGAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 AAGT 1 0 222637 CASAVA_Build 4 167936451 1I AATTCTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 11 12 222638 CASAVA_Build 4 167939150 4D GAAGAAAATA AAAC/---- AGAGGAGGAG 3070 het 3070 ref 31 14 12 9 AAAC 1 0 222639 CASAVA_Build 4 167946693 4D GATTTTTCTC TCTT/---- TATTAAAATG 3070 het 3070 ref 21 13 8 1 TCTT 1 0 222640 CASAVA_Build 4 167946793 4I ATGCCTGAAG ----/ACAA ACATTCTATA 2912 het 2912 ref 19 11 7 1 ACAA 0 1 222641 CASAVA_Build 4 167965035 1D CATAAAGCCT A/- AAAAAAAAAA 1013 het 1013 ref 44 23 6 15 A 15 14 222642 CASAVA_Build 4 167998812 1I CCCGCAGAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1581 hom 19 5 9 5 T 9 10 222643 CASAVA_Build 4 168014379 2D ATGTGCCTGT AG/-- ACCCAGCTAC 3070 het 2768 hom 16 6 9 2 AG 1 0 222644 CASAVA_Build 4 168029355 1D GAACATTTAG A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 7 6 222645 CASAVA_Build 4 168033711 4I AAGCAACAGG ----/AGCC AGCCCAGTGG 3070 hom 104 het 40 0 33 7 AGCC 1 2 222646 CASAVA_Build 4 168068977 4I TAGTGTGTAC ----/TATG TATGTATTTA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 TATG 1 2 222647 CASAVA_Build 4 168071792 1D GATACAAATT A/- AAAAAAAAAA 1759 het 1759 ref 45 35 4 6 A 12 11 222648 CASAVA_Build 4 168083403 1I CCAAGGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 11 12 222649 CASAVA_Build 4 168092589 1D GCAAAAGTGG T/- TGTGTTGCAC 3070 het 3070 ref 31 21 8 3 T 2 1 222650 CASAVA_Build 4 168103766 1D TTTGTAAAAA T/- ATATATTTAT 3070 het 3070 ref 35 19 11 6 T 1 0 222651 CASAVA_Build 4 168117346 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3025 hom 22 8 10 5 A 12 11 222652 CASAVA_Build 4 168135156 9D ATTATTAAGT AGGCAAGAA/--------- AGGCAAGAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AGGCAAGAA 2 1 222653 CASAVA_Build 4 168148126 1I TAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 9 10 222654 CASAVA_Build 4 168150457 1I TAATATCCAA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 6 7 222655 CASAVA_Build 4 168150543 1I TTTGCTGTAC -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 5 6 222656 CASAVA_Build 4 168160812 4I ATTATAGCTG ----/TTTT TTTCTTTACC 3070 hom 96 het 33 0 33 1 T 3 7 222657 CASAVA_Build 4 168163317 1D AGAAACCATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 32 0 24 9 A 10 9 222658 CASAVA_Build 4 168172003 1D CTTGAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 879 hom 29 2 19 8 T 13 12 222659 CASAVA_Build 4 168172016 1D TTTTTTTTTT G/- TCTATTTTAA 3070 het 949 hom 26 3 17 7 G 1 0 222660 CASAVA_Build 4 168197403 1D TTTACTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 27 0 18 10 A 13 12 222661 CASAVA_Build 4 168202167 4I ATTTTTACTC ----/TAAT TATTATTTTT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TAAT 0 1 222662 CASAVA_Build 4 168225821 3D AAATGCTAAA AAG/--- AATAATTATG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 AAG 1 0 222663 CASAVA_Build 4 168226025 2I ATTTACTCTG --/AT ATTTCAACTC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AT 1 2 222664 CASAVA_Build 4 168236801 1I TGGGCAAATG -/A AAAAAAAAAA 1372 het 1372 ref 21 14 3 4 A 11 12 222665 CASAVA_Build 4 168242513 1I AACCATCAAG -/A AATAATATTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 3 222666 CASAVA_Build 4 168247688 1D GTAGTCTGGG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 9 8 222667 CASAVA_Build 4 168263294 1D AGCAACCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 11 10 222668 CASAVA_Build 4 168264437 1D CAAAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2821 hom 27 9 12 6 T 12 11 222669 CASAVA_Build 4 168270569 1I AAAAGTGCTC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 63 hom 37 2 19 16 T 6 7 222670 CASAVA_Build 4 168274219 2D TACTTTTGTG TA/-- TATATATATA 2068 hom 15 het 6 0 5 1 TA 7 6 222671 CASAVA_Build 4 168274674 2D TGTGTATATG TA/-- TATATATATA 1427 het 566 hom 8 2 3 5 TA 6 5 222672 CASAVA_Build 4 168276870 1D GGGTGGGGGA G/- GGGGGGGAAC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 G 8 7 222673 CASAVA_Build 4 168278534 1I ATAAATAAAA -/G GATTCATTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 2 222674 CASAVA_Build 4 168282374 1D TTGCCTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 9 222675 CASAVA_Build 4 168284092 1D TGGCCAACTT G/- GCAAAACCCC 3070 het 563 hom 14 2 11 1 G 2 1 222676 CASAVA_Build 4 168307568 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TA 8 7 222677 CASAVA_Build 4 168311641 7I GGAAAAACTA -------/GAGCTAG GGCTTTAATC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 GAGCTAG 0 1 222678 CASAVA_Build 4 168362730 1I TCACCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1743 hom 20 5 9 6 T 11 12 222679 CASAVA_Build 4 168467625 1D CAATATTGAC T/- GTTTCCACAC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 1 0 222680 CASAVA_Build 4 168467992 1D GATTTATATA G/- GACACTTTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 2 1 222681 CASAVA_Build 4 168479161 1I ATCAGGAGCA -/G AGACTAGAGA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 0 1 222682 CASAVA_Build 4 168490765 1D AAGAGAGAAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 9 8 222683 CASAVA_Build 4 168500300 1I CAGTTCCATA -/G GCTAGACAGG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 G 1 2 222684 CASAVA_Build 4 168513833 1D TACTTTCAAA T/- TCTTCATATT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 2 1 222685 CASAVA_Build 4 168514860 1I TATAAACACA -/T TTATATATGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 2 3 222686 CASAVA_Build 4 168515449 4I TAATAATAAT ----/AGAG AGAAATAACT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 1 3 222687 CASAVA_Build 4 168515594 10D GAAATTGTTA AAAATAAACT/---------- AAAATAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 7 AAAATAAACT 1 0 222688 CASAVA_Build 4 168516644 1D CTGGAAGCTC T/- TAGCCAGAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 2 1 222689 CASAVA_Build 4 168516900 1D TTTTTGTCTG T/- TTTATTTACT 3070 hom 81 het 33 0 26 8 T 4 3 222690 CASAVA_Build 4 168517008 1I CACACAACTG -/A AAAAGTTTAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 4 5 222691 CASAVA_Build 4 168518000 8I AAAACATATG --------/CACCTACA CATAACTGTT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 CACCTACA 0 1 222692 CASAVA_Build 4 168519209 1I TAAAGTAGAA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 86 hom 26 3 18 5 T 3 4 222693 CASAVA_Build 4 168519458 2I TTTAGGGAAA --/TC TCTGTTATTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TC 1 2 222694 CASAVA_Build 4 168521991 4D TGCTTGAACA GACT/---- GACTTTTTTT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 GACT 2 1 222695 CASAVA_Build 4 168522082 5I TAAAAATAAT -----/TCATC TTAAATGATT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TCATC 0 1 222696 CASAVA_Build 4 168527884 1I ATTTTAAGTG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 9 222697 CASAVA_Build 4 168530944 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2403 hom 18 het 7 0 7 0 A 9 10 222698 CASAVA_Build 4 168532845 2D TATATACATT TA/-- TATATATATA 1814 hom 12 het 9 0 5 4 TA 10 9 222699 CASAVA_Build 4 168533991 1I AAATCAATGA -/T TTTTTTCTAC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 6 7 222700 CASAVA_Build 4 168548025 1I AAGTATCATC -/T TGAGGTGTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 1 2 222701 CASAVA_Build 4 168559564 1I ACATCATAGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 7 8 222702 CASAVA_Build 4 168561608 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 332 hom 18 2 14 3 A 9 8 222703 CASAVA_Build 4 168568006 4D TCTGAAAAAC AATT/---- AATAAGCCAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AATT 1 0 222704 CASAVA_Build 4 168589970 1D ATAATAAATG T/- TTTTTTTTTT 1762 het 1762 ref 31 20 4 7 T 15 14 222705 CASAVA_Build 4 168592284 1I TCTTGGGAAT -/G GGAATGGATA 3070 het 3070 hom 54 20 29 5 G 2 3 222706 CASAVA_Build 4 168600745 16D TTGTTTATTT GTTTATAAGATGCTAG/---------------- GTTTATAAGA 3070 het 3070 ref 48 28 17 14 GTTTATAAGATGCTAG 1 0 222707 CASAVA_Build 4 168608220 1I GGAACACGTG -/T GTGTTACTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 0 1 222708 CASAVA_Build 4 168621572 1I CTAAACTTAA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 6 7 222709 CASAVA_Build 4 168623494 2I ACAATAAGAC --/AG AGGGGGTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AG 1 2 222710 CASAVA_Build 4 168628304 1D CTTTCTTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 74 het 30 0 24 6 A 10 9 222711 CASAVA_Build 4 168630694 1D AATGAAAACC A/- AAAGAAATGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 4 3 222712 CASAVA_Build 4 168630820 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 9 8 222713 CASAVA_Build 4 168633104 1D CTCTGACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 30 2 19 9 A 13 12 222714 CASAVA_Build 4 168634064 1D CAATCCAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 10 9 222715 CASAVA_Build 4 168642653 1I TCTTCTCCCC -/T GATTCTTCCC 3070 hom 99 het 37 0 32 5 T 0 1 222716 CASAVA_Build 4 168644409 5D TTCAGTAAAT CTAAA/----- CTAATTATTT 3070 hom 123 het 45 0 42 8 CTAAA 1 0 222717 CASAVA_Build 4 168653403 3I CCCTGTCTCC ---/TGA TAAGATGTTA 2432 hom 15 het 8 0 5 3 TGA 0 1 222718 CASAVA_Build 4 168656698 1I21M4D12M3I ATTTAATTAC -TTTTTTTAGTTTAATTTTTTAGTTTAATTACTTTTTT---/TTTTTTTTAGTTTAATATTAAA----ATCTAGTTTTCTCAA TACTTTTTAT 3070 hom 72 het 19 0 25 5 N/A 0 0 222719 CASAVA_Build 4 168657397 1I AAAAATGATC -/T TTTTTTTATG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 222720 CASAVA_Build 4 168658897 1I CTCAAAAAAA -/T GTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 0 1 222721 CASAVA_Build 4 168664061 24I GCTTTTCGAG ------------------------/TTTTCAGCGTTCTTGCAGTAATTC TTTTTCATCT 3070 hom 75 het 27 0 26 3 TTTTCAGCGTTCTTGCAGTAATTC 0 1 222722 CASAVA_Build 4 168669636 1I ATTTATTTTC -/A ATATAACTGG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 2 222723 CASAVA_Build 4 168676145 1D TATAGTTAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 59 het 28 0 19 9 T 10 9 222724 CASAVA_Build 4 168682079 1D CCCAGTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 34 2 24 8 T 12 11 222725 CASAVA_Build 4 168696194 2D AGAAACTGTG AT/-- ATATATATAT 1622 hom 15 het 9 0 6 3 AT 9 8 222726 CASAVA_Build 4 168699356 1I CACACAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 43 4 26 13 A 13 14 222727 CASAVA_Build 4 168716199 4D TTTGAATTGC CTCA/---- ATCAATTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 CTCA 1 0 222728 CASAVA_Build 4 168716918 1I GTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 10 222729 CASAVA_Build 4 168720854 1D TTTTTGTAGT G/- GGGGGGGTAA 3070 hom 123 het 43 0 42 2 G 8 7 222730 CASAVA_Build 4 168724504 4D AAAAGAAACT ATCA/---- ATCATCAGAG 2928 het 2928 ref 22 13 6 4 ATCA 2 1 222731 CASAVA_Build 4 168732062 1I CAGATGGCAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 T 8 9 222732 CASAVA_Build 4 168736984 1D GCTTTCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 12 11 222733 CASAVA_Build 4 168743295 3I TTCTGATAAT ---/AAC ACAATGGTAC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 AAC 0 1 222734 CASAVA_Build 4 168751014 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 2685 het 1106 hom 13 4 7 2 A 10 9 222735 CASAVA_Build 4 168758385 1I CTGTCAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 11 10 A 13 14 222736 CASAVA_Build 4 168759615 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2376 hom 30 het 11 0 10 1 A 11 12 222737 CASAVA_Build 4 168760818 1D ATATTAACCA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 8 7 222738 CASAVA_Build 4 168765157 1I TCTCTACTCT -/G GGCCATTGGT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 2 3 222739 CASAVA_Build 4 168768694 1I GCCTTTAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 9 10 222740 CASAVA_Build 4 168769179 1D ACTATGAACA T/- TTTTATGCAG 3070 het 3070 ref 50 24 21 6 T 5 4 222741 CASAVA_Build 4 168773350 1D AGCCACACTA T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 32 15 13 5 T 7 6 222742 CASAVA_Build 4 168774522 1D GAATTATTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 T 10 9 222743 CASAVA_Build 4 168774640 1I AATTTCTGGG -/A AAAAAGATGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 5 6 222744 CASAVA_Build 4 168774701 5D TGGATAGTAT TTTTC/----- TTTTAACAAT 3070 hom 51 het 23 0 18 7 TTTTC 1 0 222745 CASAVA_Build 4 168776682 1I TCATTTGTTT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 7 8 222746 CASAVA_Build 4 168777524 1I CAGCAACCTG -/A GGGGTCCCAT 3070 hom 129 het 48 0 38 10 A 0 1 222747 CASAVA_Build 4 168778395 1D AAACAAATAT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 11 10 222748 CASAVA_Build 4 168778889 1I AAGGCAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 222749 CASAVA_Build 4 168781289 1I TTACAGCAAC -/G ACCACCAAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 0 1 222750 CASAVA_Build 4 168782051 1I AAAATCCTCA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 7 8 222751 CASAVA_Build 4 168783603 4D TCAGATTATG TGCC/---- TGCCACTGAA 3070 het 3070 hom 41 20 17 5 TGCC 2 1 222752 CASAVA_Build 4 168786295 1D ACTTACTTTT G/- TAAATTATAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 G 1 0 222753 CASAVA_Build 4 168786465 6D CTAAACCAAA AAAAAT/------ AAAAAAGAAG 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 AAAAAT 1 0 222754 CASAVA_Build 4 168787006 1D GTTAAATATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 A 10 9 222755 CASAVA_Build 4 168791038 1D ATAATAATTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2684 hom 21 6 14 1 A 9 8 222756 CASAVA_Build 4 168794503 5I TTACTTTCTC -----/TTCTT TCTCAAGTTT 3070 het 3070 ref 46 25 20 1 TTCTT 0 1 222757 CASAVA_Build 4 168795984 2D CTCTTACCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 T 12 10 222758 CASAVA_Build 4 168796327 1D CTCTCTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 24 10 9 7 A 8 7 222759 CASAVA_Build 4 168798206 1I CAAATCTCTG -/A AAATAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 A 3 4 222760 CASAVA_Build 4 168805005 3D CATGCTACTA GTT/--- GATTAGTTGG 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 GTT 1 0 222761 CASAVA_Build 4 168810233 11D ATGGCTGGCC CTTGGCAGGCA/----------- CGGGATCCAG 3070 het 3070 ref 35 19 9 8 CTTGGCAGGCA 1 0 222762 CASAVA_Build 4 168815554 5I TTTGGAATAG -----/TTTTC TTCTCTTCAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 TTTTC 0 1 222763 CASAVA_Build 4 168816088 3I TTTGATAGCT ---/TTC TTCTTTTCAA 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 TTC 1 2 222764 CASAVA_Build 4 168817159 1D GGGAAAAATT G/- GCCATAACAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 G 2 1 222765 CASAVA_Build 4 168820881 3D AGCTCTCAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2794 hom 36 13 14 10 A 19 16 222766 CASAVA_Build 4 168824498 5D TCAAGAACAA TAGAG/----- TAGATTCATG 3070 het 3070 hom 44 17 27 1 TAGAG 1 0 222767 CASAVA_Build 4 168825032 1D TTTCAGGCTG C/- CCCAAAACAT 3070 het 2836 hom 26 8 17 2 C 4 3 222768 CASAVA_Build 4 168825423 6D26M2D TATGTGCATG TGTGTATATATATATATATGTGTGTGTGTGTATG/------TATATATATGTATGTGCATGTGTGTA-- TGTATATATG 1127 het 1127 ref 37 25 6 14 N/A 0 0 222769 CASAVA_Build 4 168829000 1D ACCCCCTTAC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 8 7 222770 CASAVA_Build 4 168835697 1D7M1D CCATATTTTA TTATATTGA/-TATATTG- AAAATATAAT 3070 het 3070 ref 27 17 7 5 N/A 0 0 222771 CASAVA_Build 4 168837357 1D TGGGAAAAAA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 8 7 222772 CASAVA_Build 4 168838375 7I TGCTTATCTT -------/TTTCTTG TTGATTTGTA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 TTTCTTG 0 1 222773 CASAVA_Build 4 168852240 2I AAGTGAGAGT --/AA GAGGATACAT 3070 hom 135 het 50 0 44 6 A 0 2 222774 CASAVA_Build 4 168854451 1D TTGTTTAATA G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 31 1 25 5 G 2 1 222775 CASAVA_Build 4 168880950 11I GTGTGTGTGT -----------/GTGAGTGTGTA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 GTGAGTGTGTA 0 1 222776 CASAVA_Build 4 168885193 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTAC 3070 het 202 hom 24 2 14 8 A 1 0 222777 CASAVA_Build 4 168885389 1D GTTTTTCCTA T/- TAAAGGACTC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 2 1 222778 CASAVA_Build 4 168887535 1D TGATATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 11 10 222779 CASAVA_Build 4 168901430 3D AGGTGAAATG TGT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 TGT 1 0 222780 CASAVA_Build 4 168906844 1I TGGCCTGAAC -/A AAAAAAAAAA 1623 het 1623 ref 45 34 5 6 A 11 12 222781 CASAVA_Build 4 168917713 1D CATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2508 hom 29 9 17 3 A 13 12 222782 CASAVA_Build 4 168921537 1D GGTTTGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 12 11 222783 CASAVA_Build 4 168921958 1I AATCAATGTC -/A AAAAAAAAAA 2816 het 1570 hom 21 7 8 6 A 13 14 222784 CASAVA_Build 4 168929702 1I GCTTCTAGAT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 A 7 8 222785 CASAVA_Build 4 168934377 1D ATTCCTTGAA T/- TTCACTTCCT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 3 2 222786 CASAVA_Build 4 168938718 1D TGCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 13 12 222787 CASAVA_Build 4 168940506 4D CCTGATTTGG CTCT/---- CTGTCTATTA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 CT 3 1 222788 CASAVA_Build 4 168944262 1I CTTTCCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 10 11 222789 CASAVA_Build 4 168963465 1D TGAGTGTACA T/- TATTTTGGGG 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 T 2 1 222790 CASAVA_Build 4 168969004 1I CTGCTAAGAT -/A AGAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 1 2 222791 CASAVA_Build 4 168971536 2D GTCCCTAATA CT/-- CTGCTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 CT 2 1 222792 CASAVA_Build 4 168987254 2I AGATCACAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2326 hom 47 9 20 18 A 13 15 222793 CASAVA_Build 4 168996119 1I AAATAGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 22 0 16 6 A 13 14 222794 CASAVA_Build 4 168996268 1D CCCTGTTGGT G/- AACATTTGGG 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 G 1 0 222795 CASAVA_Build 4 169000960 2D TTCATCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 15 13 222796 CASAVA_Build 4 169006244 1I TTAAATCTTG -/C CTGTAACTTA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 C 1 2 222797 CASAVA_Build 4 169007038 4I TAGTTAACAG ----/GATT GATAGGCAGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 GATT 0 1 222798 CASAVA_Build 4 169012666 35D GTTGTACAAT ATAACAAAATTATTAAGTAATAGAGTTTTAACATG/----------------------------------- AACTGAAGAT 3070 het 3070 ref 33 23 18 1 ATAACAAAATTATTAAGTAATAGAGTTTTAACATG 1 0 222799 CASAVA_Build 4 169033435 1I AACACATTTC -/T TTCAGCTGCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 2 3 222800 CASAVA_Build 4 169042107 21I TATTTCCTAC ---------------------/ATTATTATTTAGTAAAGTTGT TTTCTTTCCA 3070 het 3070 ref 46 27 15 5 ATTATTATTTAGTAAAGTTGT 0 1 222801 CASAVA_Build 4 169048702 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 2024 hom 12 het 5 0 5 0 A 10 9 222802 CASAVA_Build 4 169049835 2D ATCTTATCAC AT/-- GCTATAAATA 3070 het 2745 hom 25 7 15 4 AT 1 0 222803 CASAVA_Build 4 169054734 1I ACAGAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 25 8 12 5 A 12 13 222804 CASAVA_Build 4 169056271 1D TCTAGTGGAG A/- ACATAGTCAA 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 A 2 1 222805 CASAVA_Build 4 169056641 7I AAAGAGAGAG -------/AGAAAGA AGAAAGAAGA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 AGAAAGA 1 2 222806 CASAVA_Build 4 169057046 2D TATTCCTCTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 370 hom 34 5 11 19 A 11 9 222807 CASAVA_Build 4 169059615 2I GGCAAAAAAC --/TA TGAGTGTTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TA 0 1 222808 CASAVA_Build 4 169063266 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 416 hom 17 3 12 2 TG 4 5 222809 CASAVA_Build 4 169070063 1I GGCACAAGAC -/A AGGATGCCCT 2879 het 1376 hom 9 3 6 0 A 1 2 222810 CASAVA_Build 4 169079374 1D ATGGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2594 hom 32 11 15 6 A 14 13 222811 CASAVA_Build 4 169107323 1D AAAGACAGGC A/- AAAGTAACCT 3070 het 3070 ref 40 21 12 8 A 4 3 222812 CASAVA_Build 4 169117575 1D ATGTTGAAAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 39 23 10 7 A 8 7 222813 CASAVA_Build 4 169124230 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2056 hom 35 11 14 10 T 15 14 222814 CASAVA_Build 4 169127919 2I AAGAGGAGGT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 43 16 18 9 AG 5 6 222815 CASAVA_Build 4 169136721 1I TGCCATATAC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 8 9 222816 CASAVA_Build 4 169139770 5I TTTTTTTTAC -----/TTTAT TTTAAGTTCT 2560 het 2560 ref 17 9 6 2 TTTAT 0 1 222817 CASAVA_Build 4 169140057 1D CTTCATCCAT A/- GTCCCTAAAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 1 0 222818 CASAVA_Build 4 169144574 1I TCACTGAGAG -/T TCCTCCTGGA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 1 2 222819 CASAVA_Build 4 169154392 1D GGTGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 A 13 12 222820 CASAVA_Build 4 169156687 23D AAATTACATG GGTTCAGACGCTGGCACACAACA/----------------------- GGTTCATGTT 3070 het 3070 ref 44 23 21 6 GGTTCAGACGCTGGCACACAACA 1 0 222821 CASAVA_Build 4 169157464 1D TTTTTTTGTC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 8 7 222822 CASAVA_Build 4 169158644 4D TCTTAGTATT TCTC/---- TCTCTCTGTC 584 het 584 ref 30 15 6 9 TC 5 3 222823 CASAVA_Build 4 169158922 26D AGATAAAAAG GTTGAAATCTAAGAGATTCAAGGCTC/-------------------------- GAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 17 8 5 GTTGAAATCTAAGAGATTCAAGGCTC 1 0 222824 CASAVA_Build 4 169159104 1D TAATCTCTAA T/- TTTCAGGGTC 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 T 4 3 222825 CASAVA_Build 4 169164149 4I AGGACCTGGG ----/TTGT TTGAGTGGAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TTGT 0 1 222826 CASAVA_Build 4 169166250 1D GCCTTATTCC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 9 8 222827 CASAVA_Build 4 169167373 3D AAAGAAATTG AAA/--- GAGTTTGCAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 3 0 222828 CASAVA_Build 4 169173475 1D GCCAGGAGCC T/- TTTTTTTTTT 1592 het 1592 ref 31 12 5 14 T 15 14 222829 CASAVA_Build 4 169176353 1D CCACCAAACA G/- GCTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 G 2 1 222830 CASAVA_Build 4 169177305 3I TCAGAGTCTC ---/ATT ATTACAAGCT 3070 het 3070 hom 46 14 29 3 ATT 1 2 222831 CASAVA_Build 4 169180923 1I GACACACCCT -/G GAGACATTTT 3070 het 3070 hom 46 17 16 13 G 1 2 222832 CASAVA_Build 4 169187796 1I TGAGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 2990 het 2311 hom 27 7 8 12 T 11 12 222833 CASAVA_Build 4 169191778 1D AAGCAGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 13 12 222834 CASAVA_Build 4 169201457 1D ACATAATAAA T/- GGCCAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 1 0 222835 CASAVA_Build 4 169203005 3D TAATAATTTG TTA/--- TTATTAAAAT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 TTA 3 2 222836 CASAVA_Build 4 169239922 1I ATCCACAATT -/A ATCTAAGGGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 2 222837 CASAVA_Build 4 169240171 1I CTCCCCCCAC -/G GAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 36 1 24 11 G 1 2 222838 CASAVA_Build 4 169245682 1D TCAATGGATA C/- CTACTGAATA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 2 1 222839 CASAVA_Build 4 169246089 1D AAAATATTTT A/- AAAAACTCAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 5 222840 CASAVA_Build 4 169260472 1D GTTTTTGAGT G/- CAGTTATGTT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 G 1 0 222841 CASAVA_Build 4 169275739 8I TGTGGGAGAA --------/TACAGGAG TACAGGAGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TACAGGAG 1 2 222842 CASAVA_Build 4 169279744 1D ACTTTTGGTA T/- TTTTCGTACA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 5 4 222843 CASAVA_Build 4 169281010 2I ATGGAAAAAC --/AA AAAAAAAACC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 8 10 222844 CASAVA_Build 4 169283846 1I AGGCCAGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 403 hom 26 2 22 2 A 9 10 222845 CASAVA_Build 4 169286011 1D CAGATTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 592 hom 40 3 23 14 A 14 13 222846 CASAVA_Build 4 169303652 1D GTTGAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 38 1 32 5 T 11 10 222847 CASAVA_Build 4 169314830 1D ATATAAATTT G/- AAAGTAGTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 G 1 0 222848 CASAVA_Build 4 169314995 1D ATTTCTTTAT A/- TTTTTTTTTC 2561 het 2561 ref 18 7 8 4 A 1 0 222849 CASAVA_Build 4 169321227 2D CTTTTAACAC AT/-- GTTACATGTC 3070 hom 66 het 31 0 23 11 AT 1 0 222850 CASAVA_Build 4 169357414 86D ATGTCTGGAA CACTGAAGGCAAAGGTTGAAAGTATATGCACATACACCTGCAGTCTGGCATGTGCCCCAGCTACTAACTACTTCAAGGACATAGCC/-------------------------------------------------------------------------------------- CAGCCACTCC 2992 hom 33 het 9 0 11 1 CACTGAAGGCAAAGGTTGAAAGTATATGCACATACACCTGCAGTCTGGCATGTGCCCCAGCTACTAACTACTTCAAGGACATAGCC 1 0 222851 CASAVA_Build 4 169384937 1D TGTGGGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 35 1 24 10 T 13 12 222852 CASAVA_Build 4 169401566 1I CAATAGCAAA -/G ACATGGAATC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 0 1 222853 CASAVA_Build 4 169408443 1D GTAGAGGCAG A/- GTTTCACCAT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 A 1 0 222854 CASAVA_Build 4 169415870 11I ATCCTGGTAT -----------/CTGCAACTTTC ACAAGAATGA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 CTGCAACTTTC 0 1 222855 CASAVA_Build 4 169416165 1D GCTCCATGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 10 9 222856 CASAVA_Build 4 169422271 4D GTTTTTGGTT GCTA/---- GCTAGAATGC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 GCTA 2 1 222857 CASAVA_Build 4 169426705 1D CCTATTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 33 2 22 11 A 13 12 222858 CASAVA_Build 4 169432489 4D CCACCATCAT AAGA/---- AAGATTCTGA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AAGA 2 1 222859 CASAVA_Build 4 169441570 1D CAGGTGCAAC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 A 8 7 222860 CASAVA_Build 4 169443696 12D AGGAAAGAAT GAAAGAAAGAAA/------------ GAAAGAAAGA 1758 hom 7 het 7 0 4 6 GAAA 8 5 222861 CASAVA_Build 4 169455468 8I CATTTCTAAT --------/AAAAATAC AAAAATTAGC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 AAAAATAC 0 1 222862 CASAVA_Build 4 169457880 7I AAAATCATTA -------/ATACCCT ATACAATACT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATACCCT 0 1 222863 CASAVA_Build 4 169467205 1I CAGCAGTCAT -/A AAAAATCTTG 3070 hom 56 het 26 0 19 7 A 5 6 222864 CASAVA_Build 4 169467546 1I ATTATTCTGG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 7 8 222865 CASAVA_Build 4 169485734 1D ATTTTTTTTG C/- TTTTTTTTTT 1164 het 1164 ref 35 18 5 12 C 1 0 222866 CASAVA_Build 4 169539313 1D AATTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 21 6 A 11 10 222867 CASAVA_Build 4 169544320 5D81M1D AAAAAGAACA AAGATAAGAAAAGTGAGCGCAGAGAACCTAAGTAACTTAGCCACAATCCAACAACTGAGAAGTAGCAGATTCAACTAATCCCTGATG/-----AAGAAAAGTGAGCGCAGAGAACCTAAGTAACTTAGCCACAATCCCACAACTGAGAAGTAGCAGATTCAACTAATCCCTGAT- TTTTTTTAAT 3070 het 1255 hom 31 9 23 27 N/A 0 0 222868 CASAVA_Build 4 169548366 1I TTATTGTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 10 11 222869 CASAVA_Build 4 169548697 1I AAACCTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 65 het 26 0 23 3 A 9 10 222870 CASAVA_Build 4 169552147 1D TCAGCATCAT A/- ATATGCACAA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 2 1 222871 CASAVA_Build 4 169557006 1I CTTCAGGGAG -/T CCAGACCTAG 3070 hom 91 het 34 0 23 11 T 0 1 222872 CASAVA_Build 4 169561858 1I AAAATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 26 2 21 3 A 13 14 222873 CASAVA_Build 4 169574179 2I ACATGGTAAT --/TA GTACACCTGT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TA 0 1 222874 CASAVA_Build 4 169595602 1I TTTGGGTTTT -/G TTTGGTTTTG 3070 het 481 hom 35 2 30 3 G 0 1 222875 CASAVA_Build 4 169607541 1I TAAAAAAAAA -/T AAAAAAAAAG 3070 het 992 hom 22 7 12 3 T 0 1 222876 CASAVA_Build 4 169608709 1D CTGAATTTTC T/- TGTCAACATC 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 T 2 1 222877 CASAVA_Build 4 169614739 1D GAGTTCAAGA C/- CAGCCTGGGT 3070 het 3070 ref 23 9 9 5 C 2 1 222878 CASAVA_Build 4 169619398 1I GAAATCAGGA -/C AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 C 0 1 222879 CASAVA_Build 4 169622881 1I CTTACTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 T 10 11 222880 CASAVA_Build 4 169626996 1D AATCATTTGA T/- TTTTTGATGA 3070 het 3070 hom 40 14 23 4 T 6 5 222881 CASAVA_Build 4 169628566 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1729 het 1729 ref 27 18 5 4 A 13 12 222882 CASAVA_Build 4 169630548 1I GTAATAAAAG -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 6 7 222883 CASAVA_Build 4 169633377 1I TATCATTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 11 12 222884 CASAVA_Build 4 169633923 4I TGCAATGAAA ----/AAAC AAACAAACAC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 AAAC 2 3 222885 CASAVA_Build 4 169634378 1D GATGGAAGTT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 100 het 38 0 32 7 A 8 7 222886 CASAVA_Build 4 169648914 1I TCTAGGTAAA -/C TTTTGTGTCA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 0 1 222887 CASAVA_Build 4 169657276 4I TTAAATATGA ----/AAAT AAATAAAACT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AAAT 1 2 222888 CASAVA_Build 4 169657632 2I TCATCGACTC --/TA AAAGTATTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TA 0 1 222889 CASAVA_Build 4 169658120 2D GTCAGGGTCT CA/-- CTCTTTTGCC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 CA 1 0 222890 CASAVA_Build 4 169659689 3I AAGAAAATGC ---/AGA AGATCAAACC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AGA 1 2 222891 CASAVA_Build 4 169660834 4I TGCTGTAACC ----/CAGA CAGTGTGCTA 3070 hom 97 het 34 0 32 2 CAGA 0 1 222892 CASAVA_Build 4 169661373 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 21 0 16 5 A 15 14 222893 CASAVA_Build 4 169666511 1D CCCCGAGTCT C/- CCCCTCTCCA 3070 het 3070 hom 28 10 18 0 C 5 4 222894 CASAVA_Build 4 169668839 1I TACATTAATC -/A AATTAGAGTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 2 3 222895 CASAVA_Build 4 169669042 2D TAAAGAAAAC TT/-- ATATTCATTC 3070 het 3070 ref 36 22 14 2 T 2 0 222896 CASAVA_Build 4 169670794 1D AGTTGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 62 23 32 7 A 12 11 222897 CASAVA_Build 4 169671845 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 11 10 222898 CASAVA_Build 4 169673599 3D GCTTAGATTA AAC/--- AACAGAGATT 3070 het 3070 ref 42 18 17 10 AAC 2 1 222899 CASAVA_Build 4 169675756 3I GAAAACTAAA ---/CTT CTGATTCTCC 3070 hom 153 het 55 0 51 4 CTT 0 1 222900 CASAVA_Build 4 169677245 1I TTTTAAAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 79 hom 38 1 31 6 T 9 10 222901 CASAVA_Build 4 169677631 2D ATTTTAAATC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 9 222902 CASAVA_Build 4 169686355 1D CAAACTATCC A/- AAGACATAAC 3070 hom 123 het 53 0 40 13 A 3 2 222903 CASAVA_Build 4 169690254 6I CCCAATTAAC ------/AATAGG AAAATACACC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AATAGG 0 1 222904 CASAVA_Build 4 169698533 1D AGGTGGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3028 het 3028 ref 38 19 9 10 A 14 13 222905 CASAVA_Build 4 169706072 1D CTAACTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1554 het 1554 ref 25 12 7 6 A 13 12 222906 CASAVA_Build 4 169706992 2D CACACTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 31 3 17 11 A 14 12 222907 CASAVA_Build 4 169708004 1I CAAAACTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 345 hom 43 1 35 7 T 9 10 222908 CASAVA_Build 4 169716921 1I TATTTCCCCC -/T GATGTATCTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 222909 CASAVA_Build 4 169730673 1D CTGGAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 18 4 T 11 10 222910 CASAVA_Build 4 169730783 1D TCATCTACCA C/- TCTTCTCCCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 0 222911 CASAVA_Build 4 169743311 1D AGAAAACAGA G/- GGGGGCCTGG 3070 het 1800 hom 35 9 13 13 G 6 5 222912 CASAVA_Build 4 169746138 1I ATACTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 10 11 222913 CASAVA_Build 4 169747263 62D CCACTCCCAC CAACCCCCACCACCAAAAACTATAGATCTACTGCTGAGTCAATTTCTTCACATTTGAAAGCT/-------------------------------------------------------------- CAAGAAGGGG 3070 het 3070 ref 27 27 14 1 CAACCCCCACCACCAAAAACTATAGATCTACTGCTGAGTCAATTTCTTCACATTTGAAAGCT 1 0 222914 CASAVA_Build 4 169750457 1D TTGAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 14 13 A 12 11 222915 CASAVA_Build 4 169753672 1D ATTGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 14 11 A 15 14 222916 CASAVA_Build 4 169757252 1I GTAACAGATG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 6 7 222917 CASAVA_Build 4 169757627 2D GTGTGTATAT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 CA 7 6 222918 CASAVA_Build 4 169758831 1I GCTCTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 A 11 12 222919 CASAVA_Build 4 169760660 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2718 hom 22 8 11 3 A 13 12 222920 CASAVA_Build 4 169762980 1D TTGGGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 11 10 222921 CASAVA_Build 4 169791344 4D AAAATCTCCC TTCA/---- TTTAAATGAA 3070 het 3070 hom 35 16 19 3 TTCA 1 0 222922 CASAVA_Build 4 169811719 1I AGATCAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 10 11 222923 CASAVA_Build 4 169812712 2D TATGGCTACT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 63 hom 39 1 23 15 TG 10 9 222924 CASAVA_Build 4 169818320 2D CAACAACAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 AC 8 7 222925 CASAVA_Build 4 169822001 3I AAACTGAGTG ---/ATA ATGATGAGTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATA 0 1 222926 CASAVA_Build 4 169822496 2D GAGGAGGAGG AA/-- AAAAAAAAAA 2375 het 1824 hom 35 9 8 18 A 18 16 222927 CASAVA_Build 4 169823705 1D GCCCCCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 36 1 30 5 A 12 11 222928 CASAVA_Build 4 169825086 1D TACATATTTC T/- TTAAAAATAA 3070 het 3070 ref 39 22 17 0 T 3 2 222929 CASAVA_Build 4 169828753 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 18 0 14 4 A 10 11 222930 CASAVA_Build 4 169834466 1I GCCCATCTAA -/T TTTTTTTTTT 1300 het 656 hom 6 3 3 0 T 13 14 222931 CASAVA_Build 4 169853766 1D TTTTGAGCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 A 10 9 222932 CASAVA_Build 4 169873643 4I GCCACTGCCC ----/TCCA TCCACCCTGG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 TCCA 1 2 222933 CASAVA_Build 4 169901934 1D TGTGGTGTAT A/- AAGTGTGAGA 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 A 3 2 222934 CASAVA_Build 4 169902224 7I AAAAACAGAA -------/CTCCAGT CTCATGGTCT 3070 het 3070 hom 51 17 24 10 CTCCAGT 0 1 222935 CASAVA_Build 4 169910531 4D TGACCACAAA ACTT/---- ACTTAAATTC 3070 het 3070 ref 23 13 10 1 ACTT 2 1 222936 CASAVA_Build 4 169913151 1D AAGCCGTGAG T/- GAACAGAAGC 3070 het 3070 ref 37 25 9 3 T 1 0 222937 CASAVA_Build 4 169917410 1I GTTCATTAGG -/A AAAAAGTGAC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 5 6 222938 CASAVA_Build 4 169918056 1D GGGTGCGGGG A/- GGCCTCAACA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 1 0 222939 CASAVA_Build 4 169919821 1I TCATACATAC -/A AATTCTGATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 3 222940 CASAVA_Build 4 169922317 1D CTTTTAGAGA T/- TTTTTTTTTC 1023 het 1023 ref 38 30 3 5 T 10 9 222941 CASAVA_Build 4 169928469 5D ACAAGCCAAT TAACA/----- CATTCCTAAG 3070 het 3070 ref 34 22 10 3 TAACA 1 0 222942 CASAVA_Build 4 169928798 2I CAAAAAAAAA --/AC AAAACAAAAA 206 het 206 ref 26 5 2 19 AC 0 1 222943 CASAVA_Build 4 169932791 4D ATCACAATTT ATTC/---- ATTCATTCAG 3070 het 3070 hom 45 17 24 7 ATTC 3 2 222944 CASAVA_Build 4 169934785 1D AGGGTCATTG A/- AAAATCAAGG 3070 het 3070 ref 51 27 15 9 A 5 4 222945 CASAVA_Build 4 169938567 1D GCACCTGCCA C/- CACACCTGGC 2839 het 461 hom 10 2 8 1 C 2 1 222946 CASAVA_Build 4 169945968 1D GAACTGGATC T/- TTCCTTAGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 2 222947 CASAVA_Build 4 169962883 1D AACTCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 A 11 10 222948 CASAVA_Build 4 169965719 1D GGTGTGAGCC A/- CTGTGCCTGG 2918 het 2918 ref 16 8 7 1 A 1 0 222949 CASAVA_Build 4 169970832 1I ACGTACTTTT -/G GGGGGGGGCG 3070 het 61 hom 22 1 14 7 G 8 9 222950 CASAVA_Build 4 169971584 2D TTGGAAAGGC TA/-- TTATAACCAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TA 1 0 222951 CASAVA_Build 4 169987016 2D AATAAGGCAG AC/-- ACACAGAGAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AC 3 2 222952 CASAVA_Build 4 169988256 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 26 1 19 6 A 12 11 222953 CASAVA_Build 4 169991461 1I TTTCTTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 T 10 11 222954 CASAVA_Build 4 170001098 5D TTTACCTAAT ACTCC/----- TTAAAAGGAG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 ACTCC 1 0 222955 CASAVA_Build 4 170002790 1D AGAAGCTGGA G/- GGGGGAGGGC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 G 6 5 222956 CASAVA_Build 4 170005939 3D CTGAGAGGAA CTC/--- CTCCACTGTC 3070 het 1519 hom 12 4 7 1 CTC 2 1 222957 CASAVA_Build 4 170006228 5D GAAGGCTTCT CACAC/----- CACCACTGAT 3070 het 3070 hom 49 17 28 8 CACAC 1 0 222958 CASAVA_Build 4 170016524 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 21 3 12 6 A 11 10 222959 CASAVA_Build 4 170020038 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 T 11 12 222960 CASAVA_Build 4 170023510 1D AATGAATTTA T/- TAGCATGGGC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 2 1 222961 CASAVA_Build 4 170029202 1D TCAAGCATTG A/- AAAAAAAAAG 850 het 850 ref 47 37 2 8 A 10 9 222962 CASAVA_Build 4 170032376 1I TAGCCACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 21 2 17 2 T 11 12 222963 CASAVA_Build 4 170040300 1I ACATCTCATC -/A TACCTATCTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 0 1 222964 CASAVA_Build 4 170040802 2I GTGACAGAGC --/AA AAAACTCTGT 1552 het 1552 ref 29 13 9 7 A 4 6 222965 CASAVA_Build 4 170045550 4I TGACTGAGGA ----/AGGG AGGGAGGGGA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AGGG 2 3 222966 CASAVA_Build 4 170053935 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2344 het 405 hom 18 1 9 8 A 16 17 222967 CASAVA_Build 4 170055692 1D AAAACAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2894 hom 26 8 10 9 T 11 10 222968 CASAVA_Build 4 170055851 11D CTTTTACCCT ACAGAAGGAAA/----------- TCAGCGTTCC 3070 het 3070 ref 27 15 14 4 ACAGAAGGAAA 1 0 222969 CASAVA_Build 4 170063517 2D CTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1136 het 442 hom 22 4 6 13 T 20 18 222970 CASAVA_Build 4 170074213 5I TACTATGATT -----/CTTTA CTTTAAATCT 3070 hom 36 het 28 0 13 15 CTTTA 1 2 222971 CASAVA_Build 4 170081313 1I TAAAGTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 31 1 25 5 T 10 11 222972 CASAVA_Build 4 170081655 3D TAACATAATC ACT/--- AGTAGTGAAG 3070 hom 99 het 37 0 33 5 ACT 1 0 222973 CASAVA_Build 4 170082935 2D ATTCATATTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 123 het 45 0 42 4 CT 6 5 222974 CASAVA_Build 4 170083691 1D GTGTTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 12 11 222975 CASAVA_Build 4 170084222 1D ATAAGAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 10 9 222976 CASAVA_Build 4 170086053 1D TTGTATTTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 38 0 18 20 A 10 9 222977 CASAVA_Build 4 170089701 1I ATCAAATTAG -/A AAGAGGTGAC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 2 3 222978 CASAVA_Build 4 170104336 2D ACTTTAAAAA AT/-- AGAGTCATTT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 AT 1 0 222979 CASAVA_Build 4 170115993 1D CCATCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2332 hom 24 6 15 4 A 13 12 222980 CASAVA_Build 4 170117291 1I CAATTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 1978 het 513 hom 29 2 22 5 C 0 1 222981 CASAVA_Build 4 170117601 1I AATTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 2780 het 649 hom 22 3 11 8 A 15 16 222982 CASAVA_Build 4 170125822 1D CAAAAGCCAG C/- CAAGTAATTT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 2 1 222983 CASAVA_Build 4 170128560 2I GTAGTCCATG --/AT ATATATATAT 975 het 975 ref 18 11 3 4 AT 8 9 222984 CASAVA_Build 4 170135656 7D TCTCACATGA GGTAATG/------- GGTACTACAA 3070 hom 108 het 38 0 37 4 GGTAATG 1 0 222985 CASAVA_Build 4 170137280 2D CTGCCATTGC GG/-- GGCTTCAGCG 3070 hom 63 het 25 0 17 8 G 4 2 222986 CASAVA_Build 4 170142217 1I3M5D CCAAAGCAAT -TTACAGAT/CCTA----- TCAATGCTAT 3070 het 3070 ref 37 24 11 5 N/A 0 0 222987 CASAVA_Build 4 170153339 1D CATATCATCC T/- TTCATTTCAT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 3 2 222988 CASAVA_Build 4 170154829 1D TCTACTCCCC T/- TTTTGCTAGG 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 5 4 222989 CASAVA_Build 4 170160467 2D AGATATTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 2100 het 2100 ref 32 13 7 13 T 18 16 222990 CASAVA_Build 4 170171330 1I TGTGGCCAGC -/G TAACTTCTCC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 0 1 222991 CASAVA_Build 4 170172948 1I TATGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 T 10 11 222992 CASAVA_Build 4 170177397 1D CATTTTCTTC T/- GTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 1 0 222993 CASAVA_Build 4 170180935 1I TTCTCTACAA -/T TTTTTTTTTT 934 het 934 ref 30 16 3 11 T 15 16 222994 CASAVA_Build 4 170186059 24I AGATGTCACC ------------------------/ACTGGGGGAAGATGGGCGACGAGT ACATGGAACT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ACTGGGGGAAGATGGGCGACGAGT 0 1 222995 CASAVA_Build 4 170190132 4I TTCCTCCCTT ----/CCTC CCTTTCTCCT 3070 hom 103 het 40 0 30 10 CCTC 0 1 222996 CASAVA_Build 4 170192200 2D CCACTCAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 1036 het 1036 ref 23 5 3 15 T 16 14 222997 CASAVA_Build 4 170202902 3D GGGAAGAGAG TCA/--- TCAAATAACT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 TCA 2 1 222998 CASAVA_Build 4 170203434 1I CCACTGCCTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 77 het 33 0 25 8 A 8 9 222999 CASAVA_Build 4 170219043 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1306 hom 23 4 14 5 T 12 13 223000 CASAVA_Build 4 170224257 1D GTCATCTTGA T/- TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 22 14 3 5 T 13 12 223001 CASAVA_Build 4 170240078 1I TCCACTTGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 369 hom 37 1 27 9 T 9 10 223002 CASAVA_Build 4 170241267 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 9 8 223003 CASAVA_Build 4 170252233 1I GAGGTACTTC -/A AATCACATAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 3 223004 CASAVA_Build 4 170252461 1I AAGTAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 11 223005 CASAVA_Build 4 170300665 1I ACCTAAATAT -/A AAAAGCAAGC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 4 5 223006 CASAVA_Build 4 170305749 1I TTTTTCTCAT -/A AAAAAGGCAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 6 223007 CASAVA_Build 4 170320829 1D AGAGGGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 33 1 26 7 A 11 10 223008 CASAVA_Build 4 170320964 1D AAACACCCAG A/- AAAAAAAAAA 879 het 879 ref 38 26 2 10 A 13 12 223009 CASAVA_Build 4 170325341 1D ACATGTGAGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 9 8 223010 CASAVA_Build 4 170331726 2I TTTCCTGAGT --/TA TATATATATA 3070 het 894 hom 24 2 16 6 TA 8 9 223011 CASAVA_Build 4 170333184 1D CTTCTTGACC A/- CTCCAGGCTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 0 223012 CASAVA_Build 4 170337986 1I TATAGAAAAG -/A AAAAGAAGAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 4 5 223013 CASAVA_Build 4 170356081 2D GTCTACAAAT AG/-- AGTGTTAAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AG 2 1 223014 CASAVA_Build 4 170360147 2I AGTGAGCCTC --/TG TGTGGATGAG 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TG 2 3 223015 CASAVA_Build 4 170362027 1I TAATTCAATG -/A AATTTCCAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 3 223016 CASAVA_Build 4 170366252 4D TAATAATAAA TAAT/---- TGTTTTCATT 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 TAAT 1 0 223017 CASAVA_Build 4 170385333 1D TGGGATCCCT G/- GGGTGTTCCA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 4 3 223018 CASAVA_Build 4 170386115 1I CAGCGCTGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 46 0 38 8 T 8 9 223019 CASAVA_Build 4 170396691 1D CTAATTTCCG C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 47 het 18 0 16 3 C 9 8 223020 CASAVA_Build 4 170399297 8I AGCACTCCTG --------/AACTCCAC AACTCCACCA 3070 hom 120 het 47 0 39 8 AACTCCAC 1 2 223021 CASAVA_Build 4 170402140 1I CTTCCCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 32 1 23 8 T 10 11 223022 CASAVA_Build 4 170405608 2I GCCAACAAAC --/AT ATGAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 1 2 223023 CASAVA_Build 4 170408045 1D TCTTGGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 12 11 223024 CASAVA_Build 4 170427095 2I GGAAAAAGTT --/CA CAAAGGAGCC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 CA 1 2 223025 CASAVA_Build 4 170433174 1D CTTCCCCCCC T/- GATCCCTCCC 3070 het 3070 ref 37 15 15 8 T 1 0 223026 CASAVA_Build 4 170434968 1I GCTGGACAGA -/T TTTTTAAAGG 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 T 5 6 223027 CASAVA_Build 4 170441331 10D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTG 3070 het 133 hom 17 1 14 2 T 19 9 223028 CASAVA_Build 4 170441891 1I CTATCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 9 10 223029 CASAVA_Build 4 170443641 1D TTGATCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 12 11 223030 CASAVA_Build 4 170445978 1I GGGGAAACTG -/C CCCCCCGATC 3070 het 1873 hom 19 7 10 2 C 6 7 223031 CASAVA_Build 4 170450363 6I CTTCCTTCTG ------/CATGCC CCTCCTAGGC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 CATGCC 0 1 223032 CASAVA_Build 4 170452215 1I AAGAAGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 10 11 223033 CASAVA_Build 4 170460570 3D CTGAGAAGTC CCT/--- CCTCTGTCAT 3070 het 3070 ref 57 32 23 5 CCT 2 1 223034 CASAVA_Build 4 170475365 1I CTGATGAACC -/T TTTTTTGCCA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 6 7 223035 CASAVA_Build 4 170489900 1D AAACTTTCTC T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 T 7 6 223036 CASAVA_Build 4 170497427 2D TTTAATGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 T 12 10 223037 CASAVA_Build 4 170517156 1D AAACATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 11 10 223038 CASAVA_Build 4 170526413 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3040 hom 29 10 12 8 A 10 9 223039 CASAVA_Build 4 170527853 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 17 12 T 12 11 223040 CASAVA_Build 4 170532431 1I AAAATTAACC -/T TTTTTAAATA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 5 6 223041 CASAVA_Build 4 170542900 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1514 het 1514 ref 28 12 6 10 T 17 16 223042 CASAVA_Build 4 170548319 1I CTCCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 A 10 11 223043 CASAVA_Build 4 170557307 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 2790 het 2790 ref 18 9 6 3 A 9 10 223044 CASAVA_Build 4 170561808 1I TGGAAGAAAG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 223045 CASAVA_Build 4 170562509 1I TGGAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 T 10 11 223046 CASAVA_Build 4 170569668 3D GGCTCCAGAT AAG/--- GAGGAGAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 16 5 AAG 1 0 223047 CASAVA_Build 4 170586812 1D GGGATGCAAA C/- CCGTGTACAC 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 C 3 2 223048 CASAVA_Build 4 170587340 1I TTGCCCTGCC -/T TTTTACTCAC 3070 het 3070 hom 53 17 29 7 T 4 5 223049 CASAVA_Build 4 170589253 5I TAGACAGACT -----/AATAG AATAGGAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AATAG 1 2 223050 CASAVA_Build 4 170594950 1D AAATAACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 11 10 223051 CASAVA_Build 4 170604725 4I ACGAGGAAGT ----/AGAG AGAGAGACCG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 AG 3 5 223052 CASAVA_Build 4 170619885 1I AAAATCTGAA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 T 7 8 223053 CASAVA_Build 4 170621910 1D CTTCGTAGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 9 8 223054 CASAVA_Build 4 170624194 2I AACAGAAGAC --/TT CTCATCACAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 0 2 223055 CASAVA_Build 4 170624588 1D TTTATAGCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 10 9 223056 CASAVA_Build 4 170630831 1D AACAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 15 2 A 12 11 223057 CASAVA_Build 4 170649337 4I AGAAATGCTT ----/AAGA AAGAGTTCTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AAGA 1 2 223058 CASAVA_Build 4 170662766 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 T 8 9 223059 CASAVA_Build 4 170664557 7D CAATCTCCCA AATAACT/------- TCCACATTGA 3070 het 3070 hom 26 11 14 3 AATAACT 1 0 223060 CASAVA_Build 4 170664662 1D GAAAAAACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 A 10 9 223061 CASAVA_Build 4 170669924 1D CTGTGAAACT A/- TTTTGCACAA 3070 het 3070 ref 55 27 24 5 A 1 0 223062 CASAVA_Build 4 170671106 4I TTTCCACTTG ----/CTCA CTGTCAATAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 CTCA 0 1 223063 CASAVA_Build 4 170673227 3D CAATAACTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 13 1 8 4 T 14 11 223064 CASAVA_Build 4 170679074 1I TGAGGCAATG -/C CTCGCCCTGC 1462 hom 10 het 4 0 4 0 C 1 2 223065 CASAVA_Build 4 170687028 1D ATTTAAAAAC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 8 7 223066 CASAVA_Build 4 170690519 1D AAAAAATATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 25 0 17 8 A 10 9 223067 CASAVA_Build 4 170692427 12I TACTGGCCTG ------------/GCAAAGCTTACA GCCAAAGCTT 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 GCAAAGCTTACA 0 1 223068 CASAVA_Build 4 170707960 2D GCTCTCTCTC TT/-- GTCTGCTGCA 3070 het 3070 hom 30 10 16 6 T 2 0 223069 CASAVA_Build 4 170713275 2I TACATGCTTT --/CA CAGAGTAATC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 CA 1 2 223070 CASAVA_Build 4 170714465 1D ACAAAACAGT A/- AAAAAAAAAA 2902 het 1868 hom 25 6 11 8 A 17 16 223071 CASAVA_Build 4 170715253 1I GGAAGCCTTT -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 7 8 223072 CASAVA_Build 4 170719719 1D TTCAATGAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 9 223073 CASAVA_Build 4 170720059 1I ACATTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 11 12 223074 CASAVA_Build 4 170737514 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1011 het 1011 ref 29 12 3 14 A 15 14 223075 CASAVA_Build 4 170750871 1D AGGAACTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2773 hom 29 9 11 9 A 15 14 223076 CASAVA_Build 4 170772692 2I CTATTCTACT --/AG AGATTTTTCA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AG 1 2 223077 CASAVA_Build 4 170772910 2I TGATTTTATT --/AA AAGACTATGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 4 223078 CASAVA_Build 4 170777117 1D AATATTCAAT G/- CTGCCCTAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 0 223079 CASAVA_Build 4 170787005 1I ATATACAGGA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 7 8 223080 CASAVA_Build 4 170791681 1D CGTGGAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 8 T 12 11 223081 CASAVA_Build 4 170794461 3I TCATTATTTG ---/GTT GTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 54 0 31 23 GTT 1 2 223082 CASAVA_Build 4 170796215 1I TTATCACAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 9 223083 CASAVA_Build 4 170815198 1I ATTTAAAGGC -/A AAAAAATTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 7 223084 CASAVA_Build 4 170815966 5D TTATATAGAT ATATA/----- TTATATATAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ATATA 1 0 223085 CASAVA_Build 4 170823330 1D ACAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 32 1 23 8 A 11 10 223086 CASAVA_Build 4 170825893 3D GTGAGAGGGG GTT/--- GTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 GTT 2 1 223087 CASAVA_Build 4 170834239 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 11 12 223088 CASAVA_Build 4 170844790 2D GACATGGTAT TA/-- TTATACACAG 3070 het 3070 ref 27 12 12 4 TA 1 0 223089 CASAVA_Build 4 170846437 5D AGTCTGTTAA TTAAG/----- TTATCGATTG 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 TTAAG 1 0 223090 CASAVA_Build 4 170851308 1D CCTACTTACA T/- TACTGCCCTT 3070 hom 114 het 44 0 39 7 T 2 1 223091 CASAVA_Build 4 170857979 4I TCTTTCAGTA ----/GTTT GTTTGTTCGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 GTTT 1 2 223092 CASAVA_Build 4 170867404 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1151 het 1151 ref 25 15 3 7 A 13 14 223093 CASAVA_Build 4 170873548 1I AGTGACTCAG -/A AAAAAACATT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 6 7 223094 CASAVA_Build 4 170875467 2D TGATTGGAAA CT/-- CTTTTAATTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CT 2 1 223095 CASAVA_Build 4 170883383 2D GGATTCTGTT AA/-- AGTTATTTTG 3070 hom 87 het 33 0 28 6 A 3 1 223096 CASAVA_Build 4 170887182 3D AAAACCAGGC AGA/--- AGAACCTTAT 3070 hom 90 het 32 0 30 3 AGA 2 1 223097 CASAVA_Build 4 170895520 1I AGCAGACATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 A 11 12 223098 CASAVA_Build 4 170900821 1I AGACTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2866 hom 25 11 9 5 A 11 12 223099 CASAVA_Build 4 170902687 10I ACTGTACAAT ----------/AAGAGCAAAA AAGAAAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAGAGCAAAA 0 1 223100 CASAVA_Build 4 170921223 4D CTTTGCTGAG ACTA/---- ACTGATATAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 ACTA 1 0 223101 CASAVA_Build 4 170929019 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 97 hom 21 3 14 5 T 14 13 223102 CASAVA_Build 4 170937964 4D TATACATATG TAAC/---- TAACCTGCAC 3021 hom 18 het 7 0 7 0 TAAC 2 1 223103 CASAVA_Build 4 170940899 1D GTAATATCCA G/- GGGAAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 G 4 3 223104 CASAVA_Build 4 170944615 1I AGTAATATCT -/C CCCCCCCATC 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 C 7 8 223105 CASAVA_Build 4 170950612 1D TCAAAAGTTA T/- TTAAAAAAAA 2128 het 947 hom 11 2 6 3 T 3 2 223106 CASAVA_Build 4 170950901 1D TCTAATTTAG A/- AAAAAAAAAA 3038 het 57 hom 10 1 7 2 A 11 10 223107 CASAVA_Build 4 170951436 1D TTGGGAAACC T/- TTTTTTTTTT 1618 het 1201 hom 30 6 6 18 T 17 16 223108 CASAVA_Build 4 170951779 1I TTATTTATCT -/G AATTACGGAA 3070 het 3070 ref 61 46 14 1 G 0 1 223109 CASAVA_Build 4 170979014 3I AGATGAAAAT ---/GAA GAAGATGATG 3070 het 3070 hom 59 28 23 8 GAA 1 2 223110 CASAVA_Build 4 170991623 1I ATTCTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2912 hom 28 9 14 5 T 10 11 223111 CASAVA_Build 4 171001754 2I TTACAGGCGT --/GA GCTACCGTGC 3070 hom 87 het 32 0 27 5 GA 0 1 223112 CASAVA_Build 4 171009022 1I ACATATCTTC -/A ATGCTTTAGA 3070 hom 135 het 52 0 45 7 A 1 2 223113 CASAVA_Build 4 171011105 1D CCTGGTGGGA G/- GTAATTGGAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 2 1 223114 CASAVA_Build 4 171013281 4D TGTCTAATGC TTCT/---- TTCTACCCGA 3070 het 3070 ref 26 17 8 4 TTCT 2 1 223115 CASAVA_Build 4 171017510 2D GTGATATCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2348 hom 31 10 13 8 T 14 12 223116 CASAVA_Build 4 171018678 2I AGAGAGACTC --/TG TGTCAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 TG 1 2 223117 CASAVA_Build 4 171023467 1I AGGTTTGTCA -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 6 7 223118 CASAVA_Build 4 171031606 1D ATCTCTCTAT G/- TTGCCCAGGC 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 G 1 0 223119 CASAVA_Build 4 171036325 4I ACTCTGTCTC ----/AGAA AAAAAAAAAA 1343 het 1035 hom 16 7 5 4 AGAA 0 1 223120 CASAVA_Build 4 171037159 1D64M1D TTTTTTTTTT AAATAACTTTTGAAACCCTGTTTGTGATTTCTAAAAAGAGCAGCAAATGTTTCAAGGAAAAAAGGA/-AATAACTTTTGAAACCCTGTTTGTGATTTCTAAAAAGAGCAGCAAATGTTTCAAGGAAAAAAGG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 25 13 16 N/A 0 0 223121 CASAVA_Build 4 171043793 3I TATAAAATTC ---/TCA TCATTTCCTG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 TCA 1 2 223122 CASAVA_Build 4 171045644 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1990 het 1990 ref 21 11 7 3 A 16 14 223123 CASAVA_Build 4 171049516 4D AACAATGAAA CTAT/---- CTTTTTTCTA 2397 het 2397 ref 15 9 6 1 CTAT 1 0 223124 CASAVA_Build 4 171054561 4I GCTGCCGGGC ----/TTAA TTAACCTTAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 TTAA 1 2 223125 CASAVA_Build 4 171057932 3I AAATAATAAT ---/AAC AATAATAATA 3070 het 2553 hom 35 8 26 1 AAC 0 1 223126 CASAVA_Build 4 171059062 2I AAAAAAAAAT --/TA TGTTAACCCA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 TA 0 1 223127 CASAVA_Build 4 171069435 1D GTGGCACACG C/- CTGTAATCCC 3070 het 909 hom 17 5 11 2 C 2 1 223128 CASAVA_Build 4 171070842 2D AATTTTTTTT AA/-- AAAAAAGCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 8 6 223129 CASAVA_Build 4 171071441 2D CTTCCTGAAG CT/-- CTCACATTAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CT 2 1 223130 CASAVA_Build 4 171071540 1D AATTTCATTC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 105 het 39 0 36 5 T 9 8 223131 CASAVA_Build 4 171074914 1D TTATAACAGC A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 7 6 223132 CASAVA_Build 4 171081068 1I GGATGAGCCA -/C CTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 1 2 223133 CASAVA_Build 4 171082733 1D TGAACCAGGG A/- AGGCGGAGCT 1354 het 1244 hom 6 3 3 0 A 2 1 223134 CASAVA_Build 4 171083383 4D AAGATCAAGT TAGA/---- TATATATATA 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 TAGA 1 0 223135 CASAVA_Build 4 171084939 2I ATTGTCACAG --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 A 8 10 223136 CASAVA_Build 4 171087522 3I GAAATCTCTC ---/CTT CATTGCTGTA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 CTT 0 1 223137 CASAVA_Build 4 171090908 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAACCAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 6 7 223138 CASAVA_Build 4 171112128 1D TGCTCCAGAG C/- CCTGCAGAGA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 C 3 2 223139 CASAVA_Build 4 171116413 1I TACCTATTCT -/G TCAGGTATCA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 G 0 1 223140 CASAVA_Build 4 171118752 1D TCTACAAGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 10 9 223141 CASAVA_Build 4 171123734 15D GTTCTTGAAG CAAAACAAAACAAAA/--------------- CAAAACAAAA 3070 het 1211 hom 43 7 27 13 CAAAA 6 3 223142 CASAVA_Build 4 171132675 1I TGTAATAAAG -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 223143 CASAVA_Build 4 171135613 2I AAAAACAAAC --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 9 11 223144 CASAVA_Build 4 171159891 3I TTTTCCATCT ---/AGG AGTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 61 36 16 9 AGG 0 1 223145 CASAVA_Build 4 171194155 1D GGATTACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 A 12 11 223146 CASAVA_Build 4 171208720 1I TGGGGTTTCA -/C CATGTTGGCC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 C 1 2 223147 CASAVA_Build 4 171246663 4D GCTCTCACCA TGGT/---- GACACAGAAG 3070 het 3070 hom 31 8 21 2 TGGT 1 0 223148 CASAVA_Build 4 171255358 11I ATCTGTTGAG -----------/CCTCTCTTGGC ACATATTTCA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 CCTCTCTTGGC 0 1 223149 CASAVA_Build 4 171257242 1I AATAGTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 A 10 11 223150 CASAVA_Build 4 171266156 1I TGATGTCATC -/T TTTTTGGGCG 3070 het 3070 hom 28 8 18 2 T 5 6 223151 CASAVA_Build 4 171267501 4D AGTGTCTGTC TGTT/---- CTTGTTTCAA 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 TGTT 1 0 223152 CASAVA_Build 4 171295246 14D CACTTAGCAC CCTCTACCTAGCAA/-------------- CCTACATCTA 3070 het 3070 hom 45 22 24 5 CCTCTACCTAGCAA 1 0 223153 CASAVA_Build 4 171300659 5D TACAAAGTAA TATAT/----- TATCACTGTA 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 TATAT 1 0 223154 CASAVA_Build 4 171308283 1I ATTTTGGTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 T 9 10 223155 CASAVA_Build 4 171311999 1I ACATGCAGTG -/T TTTTTTTTTT 1804 het 1804 ref 20 9 5 6 T 13 14 223156 CASAVA_Build 4 171319188 2I AGGTCAACAC --/AT GTTTTGTAAA 3070 het 3070 ref 42 22 20 0 AT 0 1 223157 CASAVA_Build 4 171337765 1I TGCTCTAATC -/T TTCACTTGGA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 2 3 223158 CASAVA_Build 4 171341782 1I ACAACATAAT -/G ACAACATATA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 G 0 1 223159 CASAVA_Build 4 171343415 1I ATTTATTTCA -/T TAAGGTTTTA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 1 2 223160 CASAVA_Build 4 171351736 1D TAGTGGACAT C/- ATTGAATAAC 3070 het 3070 hom 25 12 10 5 C 1 0 223161 CASAVA_Build 4 171382156 4I CATGAATCTA ----/CTTT CTAACTCTAT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 CTTT 0 1 223162 CASAVA_Build 4 171382243 9D83M1I AATTCCCATG ATTTGTCACATTTGTCACCTGCAAACTGGAGATCCAAGAGAGCTGGTGGTGTAATTTTGGCCTGAGTCTGAAGGCCTTATAACTGATGGTAT-/---------ATTTGTCACCTGCAAACTGGAGATCCAAGAGAGCTGGTGGTGTAATTTTGGCCTGAGTCTGAAGGCCTTAGAACTGATGGTATA ACTCCAAGTC 3070 het 251 hom 32 2 34 33 N/A 0 0 223163 CASAVA_Build 4 171387177 1D TTGATATTAC A/- AGTGTTACCC 3070 hom 126 het 50 0 43 8 A 2 1 223164 CASAVA_Build 4 171389943 6D ATAGTGCTGT TATAAA/------ TATTGTGTGA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 TATAAA 1 0 223165 CASAVA_Build 4 171391480 1I TGAAACATTC -/A CTTCAAAAGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 223166 CASAVA_Build 4 171391774 2D AAACACACCA TT/-- TTTTTTTATT 3070 hom 111 het 42 0 38 9 T 9 7 223167 CASAVA_Build 4 171392324 2D TATTAAAAAG TA/-- TATATATATG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TA 5 4 223168 CASAVA_Build 4 171393022 1D CAAACAGAGC G/- CTGAGATCAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 1 0 223169 CASAVA_Build 4 171393950 1I TAAAAAACCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 34 het 22 0 16 6 T 9 10 223170 CASAVA_Build 4 171409482 1I TGATATACCT -/G TGAAAACCAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 G 0 1 223171 CASAVA_Build 4 171411274 1I CTGAAACTTG -/T AGAAAACTGA 3070 het 3070 ref 60 28 21 11 T 0 1 223172 CASAVA_Build 4 171412292 2I TTTATTTATT --/TA TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 TA 0 1 223173 CASAVA_Build 4 171420656 5D TGTAATACTC TACTT/----- TTCTCTTAAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 TACTT 1 0 223174 CASAVA_Build 4 171438367 1I TGGGACTACA -/G GCACCTGCCA 3070 hom 45 het 19 0 11 8 G 1 2 223175 CASAVA_Build 4 171439439 1D AGTTAAAAAG A/- AAAAAACCTA 2927 het 2927 ref 23 13 7 3 A 7 6 223176 CASAVA_Build 4 171443179 1D GTGATGTGCC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 A 9 8 223177 CASAVA_Build 4 171447522 1D TAACGAATGC T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 30 22 3 5 T 11 10 223178 CASAVA_Build 4 171453971 5D GAAATAACTA AACTG/----- GAGGATAATA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 AACTG 1 0 223179 CASAVA_Build 4 171454497 1D TCACTGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 887 hom 31 5 17 9 T 13 12 223180 CASAVA_Build 4 171455969 4D GAAAAAAATC AAAT/---- AAATAACATA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 AAAT 2 1 223181 CASAVA_Build 4 171460894 1D ATAAGTGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 39 0 31 9 T 10 9 223182 CASAVA_Build 4 171466385 1D TGATCACTGT A/- AGCATGCCTT 3070 hom 186 het 69 0 61 8 A 2 1 223183 CASAVA_Build 4 171468490 4D TGACAAAGAG TGAT/---- TGTCGTTTTG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 TGAT 1 0 223184 CASAVA_Build 4 171470112 1D AGCCAGCCTT A/- ACCTGTCCAT 3070 hom 122 het 49 0 41 8 A 2 1 223185 CASAVA_Build 4 171472790 3D4M3D CATATGTTAT GACTGGTACC/---TGTT--- TGAATACCAG 3070 hom 84 het 29 0 29 1 N/A 0 0 223186 CASAVA_Build 4 171474890 1I CAGGCAGGTG -/C CCCTCCGGGA 1738 hom 12 het 15 0 5 10 C 3 4 223187 CASAVA_Build 4 171481222 2D AATTTTATAT AA/-- GTTACTTATT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 A 2 0 223188 CASAVA_Build 4 171483734 1D AATAGAAAAA T/- AAAATGAAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 1 0 223189 CASAVA_Build 4 171488900 2D TATAGCCAAA AG/-- AGTTTCAGTA 3070 het 3070 hom 59 23 32 7 AG 2 1 223190 CASAVA_Build 4 171495615 1D AAAAAAAAAA T/- CTTCGAAATA 3070 het 653 hom 35 2 29 5 T 1 0 223191 CASAVA_Build 4 171497293 3D ACCTCCCCTG TTC/--- TTTGTTCTTC 3070 het 3070 ref 23 12 9 6 TTC 1 0 223192 CASAVA_Build 4 171499620 3D TGCTTGTATG TCT/--- TCTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 TCT 2 1 223193 CASAVA_Build 4 171505205 2I TTGTATGAGG --/GT GAAGTTTGGC 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 GT 0 1 223194 CASAVA_Build 4 171524897 2D ATATATTCAT AG/-- AGTTGTACAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 AG 2 1 223195 CASAVA_Build 4 171529299 3D CATCTCAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 7 A 13 10 223196 CASAVA_Build 4 171531209 6D GTCTCAGGTA TGTCTT/------ TGTCTTTATC 3070 hom 123 het 41 0 42 0 TGTCTT 2 1 223197 CASAVA_Build 4 171531814 1I TGCCATTGCT -/C CCCCCTCCCT 3070 hom 134 het 51 0 40 11 C 5 6 223198 CASAVA_Build 4 171533929 1I CTAAGCTTCG -/T TAAAAAAAGG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 1 2 223199 CASAVA_Build 4 171534038 5I ACATAGAAAC -----/AAAAT AATGATACTG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 AAAAT 0 1 223200 CASAVA_Build 4 171534371 1D CAGCAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 15 11 A 11 10 223201 CASAVA_Build 4 171537607 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 11 12 223202 CASAVA_Build 4 171538321 1I TGGATCAAAT -/G GTAGTTCTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 1 2 223203 CASAVA_Build 4 171539493 2I ATTCATCAAT --/GA AGCCTTCAGG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 GA 0 1 223204 CASAVA_Build 4 171541461 4D CTACTTGAAT AAAC/---- AAACAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 5 AAAC 2 1 223205 CASAVA_Build 4 171543911 2I ATATTAAATA --/TT TTAAATAATT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 2 4 223206 CASAVA_Build 4 171545403 1D ATAGTCATTA G/- TATTATACTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 1 0 223207 CASAVA_Build 4 171548796 4I AAAATATTCC ----/TAAT TAGAGAATAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TAAT 0 1 223208 CASAVA_Build 4 171588635 1D AATTTTCAAG A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 A 8 7 223209 CASAVA_Build 4 171598330 2I16M2D TGGTTGATAT --CAAAATATTACAGGGACT/CACAAAATATTACAGGGA-- CTTTCTGTGT 3070 het 937 hom 21 3 9 15 N/A 0 0 223210 CASAVA_Build 4 171608297 14D ACTGACATTT GAAATTCTCATTTG/-------------- ATGCTGACAT 3070 het 3070 ref 34 16 14 7 GAAATTCTCATTTG 1 0 223211 CASAVA_Build 4 171609549 8D54M4I GAGGGGAATT TATATATATATATATATATATATATCTCCTATTCATTCTTCATTCTGTCCCTCTGGAGAACC----/--------TATATATATATATATATCTCCTATTCATTCTTCATTCTGTCCCTCTGGAGAACCCTGA CTAATACATT 3070 het 381 hom 18 3 11 13 N/A 0 0 223212 CASAVA_Build 4 171622195 2D TTTCACTAAT TC/-- TCTCTCATCT 3070 het 3070 hom 43 14 26 4 TC 4 3 223213 CASAVA_Build 4 171626926 1I ACCTCTGGAG -/T TTTTTTTTTT 1064 het 1064 ref 31 15 3 13 T 13 14 223214 CASAVA_Build 4 171636583 2D ATATATAGAG AT/-- ATATATATAT 2152 het 1602 hom 11 6 5 1 AT 8 7 223215 CASAVA_Build 4 171637964 5I ATGTTCTATC -----/TTTAA TTTATCAGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTTAA 0 1 223216 CASAVA_Build 4 171645640 1D CTAGATGTGA T/- TTTTTTATGC 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 7 6 223217 CASAVA_Build 4 171646465 5D TACAAAGAAC TGATT/----- TGATCTGGTT 3070 het 3070 ref 43 24 16 6 TGATT 1 0 223218 CASAVA_Build 4 171659972 2I TCATTTTAAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 27 14 9 TG 7 8 223219 CASAVA_Build 4 171662146 3I GCTTACAGTT ---/CGC CAGCAATCTG 1225 het 182 hom 30 2 6 22 CGC 0 1 223220 CASAVA_Build 4 171670633 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 A 12 11 223221 CASAVA_Build 4 171673796 4I ATTGGCTTTG ----/GGTT GGTTGCCCAC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 GGTT 1 2 223222 CASAVA_Build 4 171676305 2I CTTGTAAATG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 TC 7 8 223223 CASAVA_Build 4 171677924 1I AAGTGTGCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 8 9 223224 CASAVA_Build 4 171682447 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1687 hom 17 4 8 5 A 10 9 223225 CASAVA_Build 4 171682484 1I GAGTCAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2532 hom 31 8 11 12 A 10 11 223226 CASAVA_Build 4 171683221 1I CAAAATGACC -/T TATAGATTGA 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 1 2 223227 CASAVA_Build 4 171686386 1D TTGGTTCCCA C/- TATGCACTTT 3070 het 3070 ref 49 25 21 5 C 1 0 223228 CASAVA_Build 4 171693852 10D TATAAAATAT TGACTTTTGC/---------- AAATTTTAGA 3070 het 3070 ref 41 24 17 2 TGACTTTTGC 1 0 223229 CASAVA_Build 4 171701506 1D TTAAAAAAAA G/- AACTGTAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 G 1 0 223230 CASAVA_Build 4 171702041 2D GAGCCCTATC AG/-- GGGATTAAAG 3070 het 3070 ref 43 27 11 5 AG 1 0 223231 CASAVA_Build 4 171709109 1I TACAAAAAAA -/C ATTCATACCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 223232 CASAVA_Build 4 171710475 1D TTAACTACAG T/- TATTTTATTT 3070 het 3070 hom 41 18 22 2 T 2 1 223233 CASAVA_Build 4 171711765 1I CAACAACAAT -/A ACAACAACAA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 1 2 223234 CASAVA_Build 4 171713181 1I ATACATGAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 10 223235 CASAVA_Build 4 171721212 1I TCTTTAGTTT -/C CTTTTTTTTG 3070 het 68 hom 35 2 20 13 C 1 2 223236 CASAVA_Build 4 171721350 3I TATAAAATCC ---/TTA TTATTTGAAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TTA 1 2 223237 CASAVA_Build 4 171729152 3D GTTAATAACC TAA/--- TATTATTAAT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 TAA 1 0 223238 CASAVA_Build 4 171730745 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATAAAAT 3070 het 3070 ref 59 32 24 4 TGTA 1 0 223239 CASAVA_Build 4 171733731 1D AGATCATGTC T/- TTTACAGGGA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 4 3 223240 CASAVA_Build 4 171734639 1I AAAATGCTTC -/T TTTTTTGTCA 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 T 6 7 223241 CASAVA_Build 4 171744907 1I ATATGCAAAT -/A ATCTGAGAAA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 1 2 223242 CASAVA_Build 4 171747067 2I CCTTTTAAAA --/TG TGTGAAAGAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TG 2 3 223243 CASAVA_Build 4 171750653 1I TACAAGCTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 9 10 223244 CASAVA_Build 4 171751546 4D TTTTTAACTT AATC/---- TTACTAATTT 3070 hom 60 het 21 0 21 1 AATC 1 0 223245 CASAVA_Build 4 171755932 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 9 10 223246 CASAVA_Build 4 171758151 1I TCTGTTGTCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 367 hom 34 1 31 2 T 8 9 223247 CASAVA_Build 4 171758368 1I ATCCTTGCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 9 10 223248 CASAVA_Build 4 171763826 2D CACACACACA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 117 het 46 0 40 8 T 11 9 223249 CASAVA_Build 4 171764168 1I GCTCTTTGAT -/A GCATTTTATG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 0 1 223250 CASAVA_Build 4 171773247 1D TTCCAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2244 hom 31 8 13 10 T 12 11 223251 CASAVA_Build 4 171778035 2I TTACCTGAAA --/AT ATGTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 AT 1 2 223252 CASAVA_Build 4 171782619 1D CTGGACAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 14 13 223253 CASAVA_Build 4 171813523 3D AAAAGAACGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 13 10 223254 CASAVA_Build 4 171814809 1D CAATCATTAT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 49 24 23 6 A 8 7 223255 CASAVA_Build 4 171816472 3D ACGGGGTTTC TTT/--- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 15 10 5 T 11 8 223256 CASAVA_Build 4 171820459 1I AACTTTTTAG -/A AAAAAAAAAA 2407 het 2407 ref 27 19 7 1 A 10 11 223257 CASAVA_Build 4 171820569 2D AGATAGGAAG AC/-- AGTTTAGACA 3070 het 3070 ref 44 23 19 3 AC 1 0 223258 CASAVA_Build 4 171821009 1I ATTCAGAGTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 7 8 223259 CASAVA_Build 4 171827787 1D TGTTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 440 het 440 ref 54 41 3 10 T 12 11 223260 CASAVA_Build 4 171854096 4D AAAAACAGTG TGTA/---- TGTATACCTT 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 TGTA 2 1 223261 CASAVA_Build 4 171857809 1I TTACCTTCTT -/C CCATAGAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 C 2 3 223262 CASAVA_Build 4 171860482 2I AATCACACAC --/AT ATATATGTAT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 AT 3 4 223263 CASAVA_Build 4 171863961 7I2M2D AATGGACAGA -------GAGG/CTACCATAA-- GAAGGGCCCC 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 N/A 0 0 223264 CASAVA_Build 4 171867762 1D TAGTGGCACA G/- GTATGTATCC 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 G 2 1 223265 CASAVA_Build 4 171872090 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAACAAAC 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 A 6 5 223266 CASAVA_Build 4 171877486 1I TTAAACTGGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 A 8 9 223267 CASAVA_Build 4 171907132 1D ATCTTCACAT A/- AAAAAAAAAA 2131 het 2131 ref 28 20 6 2 A 13 12 223268 CASAVA_Build 4 171909166 1D TTGACAAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 10 9 223269 CASAVA_Build 4 171914260 1I GGGACCATTG -/C CTGAGAGCTG 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 C 1 2 223270 CASAVA_Build 4 171919538 2I ATAGTGTCTC --/AG GGAATAAATT 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 AG 0 1 223271 CASAVA_Build 4 171919998 1D TTGTAATGTC T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 T 8 7 223272 CASAVA_Build 4 171925475 1I AAAAATAACA -/T TTTTTTGACC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 6 7 223273 CASAVA_Build 4 171929535 1I CATCCTAAAT -/G TGTAGCTGTC 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 G 0 1 223274 CASAVA_Build 4 171934778 1I GCACTCCCCA -/G TGCCAACCTT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 G 0 1 223275 CASAVA_Build 4 171940676 1D ATCTTAAATG T/- TTTTTTTTTC 2267 het 2267 ref 14 7 6 1 T 10 9 223276 CASAVA_Build 4 171947769 4D TTATTTTTTT TCAA/---- TCAATCTATA 3070 het 3070 ref 41 20 17 6 TCAA 2 1 223277 CASAVA_Build 4 171948673 1I GGACCTGTGT -/C CCCACCCAAA 3070 hom 117 het 46 0 37 9 C 3 4 223278 CASAVA_Build 4 171955493 1I AGTATAGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 13 14 223279 CASAVA_Build 4 171957110 9I8M6I6M4D TTGTATAGTA ---------ATTTCAAG------TTTGAAATGT/ATTTCTCACATTTCAAGTTACTATTTGAA---- GACAATCAAA 3070 het 3070 ref 45 27 19 4 N/A 0 0 223280 CASAVA_Build 4 171965112 6I TTGGTGTTCC ------/AATCTG TCTCTAAACT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 AATCTG 0 1 223281 CASAVA_Build 4 171973912 1I GCACAGAAGA -/C AAAAACTGAG 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 C 0 1 223282 CASAVA_Build 4 171977076 3I TAATGGCTTC ---/ATT ATTAACACAA 3070 het 3070 ref 47 25 11 11 ATT 1 2 223283 CASAVA_Build 4 171977970 1D GAATTATAAC T/- TTTTCACACA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 5 4 223284 CASAVA_Build 4 171980506 1I ATTTTCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 T 12 13 223285 CASAVA_Build 4 171994504 2D GTACCAAGAC TA/-- TATATATATA 2256 het 2256 ref 19 7 7 5 TA 8 7 223286 CASAVA_Build 4 172011824 1I GCCACAAAGC -/A AGGTGTAACA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 A 1 2 223287 CASAVA_Build 4 172014545 4I TTTTTTTTTT ----/TTTA ACATCAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 TTTA 0 1 223288 CASAVA_Build 4 172031209 25I ATTAAGTCAT -------------------------/AAAAATATTTGTATTGTATTGATGA AAATAGGCCT 3070 hom 123 het 41 0 42 2 AAAAATATTTGTATTGTATTGATGA 0 1 223289 CASAVA_Build 4 172045691 2I TTAAAATAAT --/TA TATGTGTTCC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 TA 1 2 223290 CASAVA_Build 4 172045917 1I TTTCTCCAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 9 223291 CASAVA_Build 4 172053532 1D AGAAAATGAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 9 8 223292 CASAVA_Build 4 172056386 3I CAGCCATGGA ---/ATC ATCAAGTTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ATC 1 2 223293 CASAVA_Build 4 172073591 2I AATTGTTTTT --/TG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 TG 0 1 223294 CASAVA_Build 4 172074127 1D ACAGCAATAC T/- GATTAGGCAG 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 1 0 223295 CASAVA_Build 4 172078263 1D ATTTTAATCT C/- CTTGCAAAAC 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 C 2 1 223296 CASAVA_Build 4 172088392 1D GAAGCATATT A/- AAAATGATTC 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 A 5 4 223297 CASAVA_Build 4 172089202 5D AGTACTCACA TTCCT/----- TTCTGTCTAC 3070 het 3070 ref 40 22 16 4 TTCCT 1 0 223298 CASAVA_Build 4 172089534 3I ATTTTAAAAT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 2589 hom 21 7 9 5 TTA 5 6 223299 CASAVA_Build 4 172089658 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2519 hom 33 8 18 7 T 12 11 223300 CASAVA_Build 4 172090006 11I GGCTTTCAGG -----------/CTAAACTCTTT CTTCCAAGTC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 CTAAACTCTTT 0 1 223301 CASAVA_Build 4 172090094 1D CAAAAAGGAT C/- AGAAATTCAG 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 C 1 0 223302 CASAVA_Build 4 172090989 3D TTCTAGAATG TCA/--- TCATGTTTCA 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 TCA 2 1 223303 CASAVA_Build 4 172093146 3I CATAATTGGC ---/TTA TTATTCTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTA 1 2 223304 CASAVA_Build 4 172095108 3D TTTTTCCCAA TTC/--- TTCTTTGGGC 3070 het 3070 ref 36 16 15 7 TTC 2 1 223305 CASAVA_Build 4 172101952 4I AATATTATTT ----/ATTA TATATTCAAT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 ATTA 0 1 223306 CASAVA_Build 4 172106285 1D TACCGCACCT C/- CCCACCACTG 3070 hom 117 het 40 0 40 1 C 4 3 223307 CASAVA_Build 4 172107201 1I AGAGCATAGA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 1 2 223308 CASAVA_Build 4 172109051 1D GTGTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 185 hom 37 1 30 6 A 12 11 223309 CASAVA_Build 4 172120847 1D GAATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2902 het 2902 ref 23 12 6 5 T 11 10 223310 CASAVA_Build 4 172121419 8D CTCTTCCAAG ATTATTTT/-------- AATGTTACAT 3070 het 3070 ref 26 15 12 2 ATTATTTT 1 0 223311 CASAVA_Build 4 172122117 1D ATCATACCCA G/- GGCCATGAAT 3070 het 3070 hom 41 15 23 5 G 3 2 223312 CASAVA_Build 4 172124542 1I TATTTCACAT -/A ACATGCAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 7 6 A 1 2 223313 CASAVA_Build 4 172124964 1D TAATTAACAG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 T 8 7 223314 CASAVA_Build 4 172127485 2D AGAAAATAAA AG/-- AGAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 38 23 10 5 AG 4 3 223315 CASAVA_Build 4 172128683 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAG 2896 het 2699 hom 20 9 7 4 A 10 9 223316 CASAVA_Build 4 172132120 1I CCAACATCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 8 9 223317 CASAVA_Build 4 172133767 1D GCTGAATTTT A/- CTAGGCTTTC 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 A 1 0 223318 CASAVA_Build 4 172136248 4D TGCGTATTCC CAGA/---- CATTGTGATT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 CAGA 1 0 223319 CASAVA_Build 4 172139252 1D TTCAAGATAC A/- TTTTTCTTCA 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 A 1 0 223320 CASAVA_Build 4 172144452 1I GAGGTTATTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 T 8 9 223321 CASAVA_Build 4 172146490 1D ATCTAGCTGT G/- GGGGGGGGGG 2639 het 1128 hom 23 3 8 12 G 11 10 223322 CASAVA_Build 4 172151911 2I ATATATATAT --/AC ATCTGCACTC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 AC 0 1 223323 CASAVA_Build 4 172152047 2D GAAAAAAAAT TA/-- TGTCTTCTGC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 TA 1 0 223324 CASAVA_Build 4 172154082 1I CCATGAGGTA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 T 7 8 223325 CASAVA_Build 4 172154342 1I TCTTTCTGTC -/T TATGTCTTCC 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 T 1 2 223326 CASAVA_Build 4 172162725 1D ATGGTACTAA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 8 7 223327 CASAVA_Build 4 172164012 1D ATTCAACAAT A/- TTTTTTTCTG 3070 het 2385 hom 20 7 10 3 A 1 0 223328 CASAVA_Build 4 172164256 4I AGGCCCTAGG ----/ATTA ATTAATCAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATTA 1 2 223329 CASAVA_Build 4 172164601 1D ATTTTATTAG T/- TAATTGTTGT 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 T 2 1 223330 CASAVA_Build 4 172173560 1I GAGTTCAAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 9 10 223331 CASAVA_Build 4 172174169 2I AACTCCGTTA --/CT AAGACTCCAT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 CT 0 1 223332 CASAVA_Build 4 172175242 6D41M2D ATATAATGTG TGTGTATATATATATATATACACACACTATACATTATATACTATATATG/------TATATATATATATACACACACTATACATTATATACTATATA-- TGTGTGTGTG 2329 het 2118 hom 11 5 5 6 N/A 0 0 223333 CASAVA_Build 4 172177453 2D TTTTCAAATC TG/-- TCTTTTATAT 1932 het 712 hom 13 3 4 6 TG 1 0 223334 CASAVA_Build 4 172177533 1D TGAGTTCATG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 A 9 8 223335 CASAVA_Build 4 172179064 1I TTTTCAGCGA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 6 7 223336 CASAVA_Build 4 172180165 2I TGTGGGGTGC --/TA TGGGGGGGGA 3070 het 2934 hom 29 10 15 4 TA 0 1 223337 CASAVA_Build 4 172196530 5I GATTTTTGTC -----/TTTCT TTTGTCTTGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTTCT 0 1 223338 CASAVA_Build 4 172202670 4I CAGCCGAAAC ----/AGAG AGGCAATTAT 3070 hom 83 het 39 0 37 2 AG 1 3 223339 CASAVA_Build 4 172204517 1D TACATTCATC A/- AAAAAATTGG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 7 6 223340 CASAVA_Build 4 172206259 63D TGTCAAATAA TGTGCATTACAGGAAGACAGTAAGGGACTTTAAACTCTTCCTACTTAAATTATTTTAAAAACT/--------------------------------------------------------------- ACTTTAATTC 3070 het 3070 ref 39 29 15 8 TGTGCATTACAGGAAGACAGTAAGGGACTTTAAACTCTTCCTACTTAAATTATTTTAAAAACT 1 0 223341 CASAVA_Build 4 172207702 1I GGATAGGAAG -/A ATAACACTGT 3070 het 3070 ref 45 27 14 4 A 1 2 223342 CASAVA_Build 4 172235371 2D AACCAGTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 33 1 26 6 A 13 11 223343 CASAVA_Build 4 172242995 1D CTTTATCTAT A/- TTTTTTTATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 1 0 223344 CASAVA_Build 4 172244007 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAAGA 3070 het 19 hom 26 1 19 6 AAAG 1 2 223345 CASAVA_Build 4 172265382 5D AAATTAACTC AAAAT/----- AAATCAAATG 2715 het 2715 ref 30 19 9 2 AAAAT 1 0 223346 CASAVA_Build 4 172366917 1I GATGGGGTTG -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 6 7 223347 CASAVA_Build 4 172373297 1I AGGAGGGGGA -/C AAAAGTTGAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 C 0 1 223348 CASAVA_Build 4 172374193 1D GCCACCTTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 15 14 10 T 9 8 223349 CASAVA_Build 4 172374900 2I GGAAAAAAAA --/AC CAATAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 AC 0 1 223350 CASAVA_Build 4 172375087 1I GTTTTGTTTG -/T TTTTTTCCCG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 6 7 223351 CASAVA_Build 4 172384352 1I ATATTTCCAG -/T TTCCTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 2 3 223352 CASAVA_Build 4 172390820 4I AAAAAATAAA ----/AAAT TAAATAAATA 3070 het 433 hom 15 3 12 0 AAAT 0 1 223353 CASAVA_Build 4 172394532 2I CAGGTTTGAC --/AT CCTATGTGGA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 AT 0 1 223354 CASAVA_Build 4 172396810 1D ATTGTGATTT G/- GGGGGGTTAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 G 7 6 223355 CASAVA_Build 4 172396997 16D GTGAGTGTTA GAAAGAAACTTTTAAT/---------------- GAAAGAAGAA 2904 het 2904 ref 29 16 9 8 GAAAGAAACTTTTAAT 1 0 223356 CASAVA_Build 4 172412449 1I ATATAAATGT -/A AAAAAAAAAA 1135 het 1135 ref 19 10 3 6 A 13 14 223357 CASAVA_Build 4 172414076 1I GTCCTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 11 12 223358 CASAVA_Build 4 172419438 1D AGTGATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 15 7 A 13 12 223359 CASAVA_Build 4 172463899 3I TTATTACTTT ---/ACA ACATTTTGAT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 ACA 1 2 223360 CASAVA_Build 4 172468645 1I GATTGCAAAA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 6 7 223361 CASAVA_Build 4 172471730 1I CCATTTGCTT -/G GGTAGACTTC 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 G 2 3 223362 CASAVA_Build 4 172479250 1D TGTGAGGCAC A/- AAGCTTCAGG 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 3 2 223363 CASAVA_Build 4 172479580 2I TAAGAAGATA --/AC ACAATAAAAA 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 AC 1 2 223364 CASAVA_Build 4 172481253 4D AAAAAGATAT AATA/---- AATGTGTGAT 3070 het 3070 ref 44 24 19 2 AATA 1 0 223365 CASAVA_Build 4 172482118 1D ACAGAACTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 10 9 223366 CASAVA_Build 4 172483609 1D CCTGTTCCCC A/- AAAAATTCAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 A 6 5 223367 CASAVA_Build 4 172499732 1I ATACTGAAAA -/T CGTGGTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 223368 CASAVA_Build 4 172502800 1D CAAATACCTT A/- AAAATATAGT 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 A 5 4 223369 CASAVA_Build 4 172504155 2I GTAAAAGTTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 AT 6 7 223370 CASAVA_Build 4 172504656 5D CCTTAGGGCA AAGGG/----- AGGCCCCTTC 3070 het 3070 hom 54 23 28 5 AAGGG 1 0 223371 CASAVA_Build 4 172507027 2D TGGTAAAAAG AT/-- ATGTAAAACT 3070 het 3070 hom 35 16 17 5 AT 2 1 223372 CASAVA_Build 4 172509127 1I CCTTGCTCAA -/G GGAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 G 2 3 223373 CASAVA_Build 4 172516062 1I CGATGCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 10 11 223374 CASAVA_Build 4 172517931 1D ATAATAAGAA C/- CTTAAAATGA 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 C 2 1 223375 CASAVA_Build 4 172525551 1I AATTCAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 11 12 223376 CASAVA_Build 4 172535541 1D TCCAATTTAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 8 7 223377 CASAVA_Build 4 172535679 2D TTATCTGCCC CT/-- GTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 CT 1 0 223378 CASAVA_Build 4 172546793 3D GGGAAGGGAA CAT/--- CACACACTGG 2821 het 2821 ref 19 12 7 0 CAT 1 0 223379 CASAVA_Build 4 172547750 1D TTTGGTAAAT A/- AACTTGTGTA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 3 2 223380 CASAVA_Build 4 172562054 2D GCAAATGCAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 AT 6 5 223381 CASAVA_Build 4 172564235 1I TTCTTCAATA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 6 7 223382 CASAVA_Build 4 172568160 4D TAAAATAGAA AAAT/---- AAATAGACAA 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 AAAT 2 1 223383 CASAVA_Build 4 172572869 1D CACTTGTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 11 10 223384 CASAVA_Build 4 172576555 3D AAAACTCACA TGT/--- TGTTCTAAGG 3070 het 3070 ref 55 28 23 8 TGT 2 1 223385 CASAVA_Build 4 172579565 1I AATGTAGTTA -/T GGATAATAAA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 T 0 1 223386 CASAVA_Build 4 172586954 2D ATGAGTATAT AA/-- ATTCATATGT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 3 1 223387 CASAVA_Build 4 172588901 1D ATCTACAGTA T/- TTTTTCTACA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 6 5 223388 CASAVA_Build 4 172592307 4I ATACAAAGAA ----/AGAT AGACCATATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AGAT 0 1 223389 CASAVA_Build 4 172596518 1D CACAGCAACG A/- AAACACTTTG 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 A 4 3 223390 CASAVA_Build 4 172602610 1I GTATCTCTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 101 het 40 0 34 6 T 9 10 223391 CASAVA_Build 4 172605063 1I TGACAGCTTT -/C TTTCCACTCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 0 1 223392 CASAVA_Build 4 172605733 4I TTATTTTGAA ----/ATAG ATAAATTTAG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 ATAG 0 1 223393 CASAVA_Build 4 172608599 3D TGGATTTTAA AGT/--- AGCACTTCTA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 AGT 1 0 223394 CASAVA_Build 4 172616066 3I CCACTACACT ---/TAG TAGCCTGGAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TAG 1 2 223395 CASAVA_Build 4 172618969 1I14M3D GAATTCTCTT -TTTTTTTCTGGATTCAA/ATTTTTTTCTGGATT--- CAACAGCTTC 3070 hom 105 het 34 0 36 0 N/A 0 0 223396 CASAVA_Build 4 172620134 2D18M2I TAGTAATAAC TTATATTTTTTTATTAAGAC--/--ATATTTTTTTATTAAGACAT ATTAATAACT 3070 hom 132 het 35 0 45 5 N/A 0 0 223397 CASAVA_Build 4 172620491 2I12M1I GTCCCTGTCT --TATCACCACAGA-/TATATCACCACAGAT TTTTTTCATA 3070 hom 114 het 37 0 39 2 N/A 0 0 223398 CASAVA_Build 4 172621254 2D CTGTAATCTC TG/-- TCCCCAACGA 3070 het 3070 hom 32 17 13 2 TG 1 0 223399 CASAVA_Build 4 172622223 15I TGTTACAGCA ---------------/TGCATTAGGAGATCC TGCCTTTTTA 3070 hom 114 het 39 0 38 2 TGCATTAGGAGATCC 0 1 223400 CASAVA_Build 4 172632885 2D ACCCAGTGGG GA/-- AGGTAATTGA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 GA 1 0 223401 CASAVA_Build 4 172634005 2I GTCTTTGAAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 9 11 223402 CASAVA_Build 4 172640767 1D AGTGCTTTAG T/- TTTTTTTTTC 2850 het 2850 ref 22 10 8 4 T 10 9 223403 CASAVA_Build 4 172642340 1I AATATAAAAA -/T GTAACAAAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 0 1 223404 CASAVA_Build 4 172651389 4D TCTGCCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 AAAC 5 4 223405 CASAVA_Build 4 172661473 1D TAGTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 A 12 11 223406 CASAVA_Build 4 172662245 1I AACTGGATAT -/C CACAAGCAGA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 C 1 2 223407 CASAVA_Build 4 172666888 1I CTTACCATTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 A 9 10 223408 CASAVA_Build 4 172672723 2D ATTCAATAAC AT/-- GAGTGAATCT 3070 het 3070 ref 31 22 9 1 AT 1 0 223409 CASAVA_Build 4 172697314 5I2M1I CATTATTCCT -----AG-/TTAGCAGT GTGTGTCTTT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 N/A 0 0 223410 CASAVA_Build 4 172697544 1D TTCAGGACTT G/- GCCTCAGTAA 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 G 2 1 223411 CASAVA_Build 4 172699010 1D TTCTTTATTC T/- TTTTTTTTTA 2293 het 2293 ref 20 10 8 3 T 10 9 223412 CASAVA_Build 4 172721013 1D TTCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 2999 het 655 hom 17 2 10 5 T 13 12 223413 CASAVA_Build 4 172731544 1I TTATTGTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1277 hom 35 3 24 8 A 12 13 223414 CASAVA_Build 4 172735385 2I GCCTGGCTAA --/TT ATTTTTGTAT 2688 het 36 hom 11 1 6 4 T 0 2 223415 CASAVA_Build 4 172735865 1I CAGGGGTCAT -/G GGGGTGGTCC 3070 het 2776 hom 24 6 14 4 G 4 5 223416 CASAVA_Build 4 172736378 1I TTATTAGAAG -/A CATGGATCAA 3070 het 3070 hom 51 26 23 2 A 0 1 223417 CASAVA_Build 4 172737391 1D ATGCTCCAAG T/- TTTGTTCACA 3070 het 3070 ref 42 22 13 8 T 4 3 223418 CASAVA_Build 4 172740776 3I GCGATTTCTC ---/ATA TGTGAAGAGA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 ATA 0 1 223419 CASAVA_Build 4 172740818 1D AAGAAGGCTT A/- AAAAAAAAAA 2844 het 2844 ref 30 12 6 15 A 11 10 223420 CASAVA_Build 4 172754287 2D GACTATTCTG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 A 11 9 223421 CASAVA_Build 4 172756093 1I GTTCCTCTTG -/C CCCCCCAAGT 3070 het 3070 ref 37 18 10 9 C 6 7 223422 CASAVA_Build 4 172758315 2D AAAACTGTAT AG/-- AGTTTCCTCA 3070 het 3070 hom 46 21 22 7 AG 2 1 223423 CASAVA_Build 4 172760072 1D TAAAAACATT A/- ATCTGTACCA 3070 het 3070 hom 43 15 24 5 A 2 1 223424 CASAVA_Build 4 172762759 2D AAAACCAACT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 17 9 7 1 TA 7 6 223425 CASAVA_Build 4 172764125 2D CATTTTTTTA CT/-- CTCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 17 12 CT 3 2 223426 CASAVA_Build 4 172764529 1I ATGTCAGAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 T 8 9 223427 CASAVA_Build 4 172776079 1D ATATAACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 T 13 12 223428 CASAVA_Build 4 172781982 1D CAAACATATG A/- AAAAATATTC 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 A 6 5 223429 CASAVA_Build 4 172793324 1I ATGTATGTGT -/G TGTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 G 0 1 223430 CASAVA_Build 4 172810065 2D GAAGAAAGCC TA/-- TGTGTTATAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 TA 1 0 223431 CASAVA_Build 4 172871580 1I AAGATATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 10 11 223432 CASAVA_Build 4 172894664 4D ACCAGTTAGG AAGT/---- AAGTAATTGC 3070 hom 102 het 37 0 34 5 AAGT 2 1 223433 CASAVA_Build 4 172908517 1I TAATAATTTA -/T TTTTAAATAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 4 5 223434 CASAVA_Build 4 172908984 3I CATTCTTGCT ---/AAG AACAAACAGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAG 0 1 223435 CASAVA_Build 4 172913257 1I GATATGTTTT -/G GATTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 1 2 223436 CASAVA_Build 4 172919874 1D CCAGGAGCTG T/- TTTTTTTTTT 1383 het 28 hom 12 1 4 8 T 12 11 223437 CASAVA_Build 4 172923825 2D TCAAATGAAT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 AC 5 4 223438 CASAVA_Build 4 172925299 1D CTAAATCATT A/- GTTGAGAAAT 3070 het 3070 hom 50 24 25 2 A 1 0 223439 CASAVA_Build 4 172925769 1I ATTATTGGAT -/G GGCCTGTTGT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 G 2 3 223440 CASAVA_Build 4 172926087 1I ACAAGCCAAA -/G GGGGGTAGCT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 G 5 6 223441 CASAVA_Build 4 172955315 1D TTAGTCCGTA T/- TGTGCTGCTG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 2 1 223442 CASAVA_Build 4 172956156 1D AGTCCCAGAC A/- AAAAAAAAAA 2742 het 2492 hom 29 9 8 12 A 15 14 223443 CASAVA_Build 4 172965959 4I TAAATGTATG ----/GTTA GTTACATTAC 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 GTTA 1 2 223444 CASAVA_Build 4 172979367 14D GGCTTAACGG ATATATATATATAT/-------------- ATATATATAT 1805 het 760 hom 38 7 4 29 AT 13 6 223445 CASAVA_Build 4 172993794 1D CATAAAATAG T/- GCTAGTAATA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 1 0 223446 CASAVA_Build 4 172995269 1D AATGGTTCAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 9 8 223447 CASAVA_Build 4 172995468 3D TTCTGAAGTT TAA/--- GTTTAAGATT 2177 het 2177 ref 12 6 5 2 TAA 1 0 223448 CASAVA_Build 4 172998121 7I ATTAAAGAAA -------/CCGTGGG CCGTGGGCAC 3070 hom 110 het 44 0 36 8 CCGTGGG 1 2 223449 CASAVA_Build 4 173022873 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1290 het 1290 ref 28 17 3 8 A 12 11 223450 CASAVA_Build 4 173033928 2D CTGATGAATC AT/-- GTGCTATGGA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 AT 1 0 223451 CASAVA_Build 4 173044207 1D GTTTATGAGT A/- AAAAAGGATT 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 A 6 5 223452 CASAVA_Build 4 173045739 1D ATGTTTAGTC T/- TTTTGTTTAT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 5 4 223453 CASAVA_Build 4 173048767 1I CTTCTCCTAC -/T TCAGGCTTGC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 1 2 223454 CASAVA_Build 4 173054754 4D TATATTAAAT ATTA/---- ATTAACTGAA 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 ATTA 2 1 223455 CASAVA_Build 4 173058626 1I ATATCTTTCA -/G GAAACATGGA 3070 hom 83 het 34 0 28 6 G 1 2 223456 CASAVA_Build 4 173072507 2I TAAAAATGAT --/AA AAAAAAAAAA 2185 het 2185 ref 22 7 8 7 A 13 15 223457 CASAVA_Build 4 173080262 1D ATTGTGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 T 11 10 223458 CASAVA_Build 4 173094975 1D TGACATTGAA T/- TTTTAATAAG 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 T 5 4 223459 CASAVA_Build 4 173096820 1I TTTAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 10 11 223460 CASAVA_Build 4 173097918 1D ATTAACTGTG A/- AAAAAACTGG 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 A 7 6 223461 CASAVA_Build 4 173104639 1D TTACTAAGTT C/- CGGGGGGTAC 3070 hom 66 het 29 0 22 7 C 2 1 223462 CASAVA_Build 4 173105901 1D CAATTTTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 45 hom 35 1 31 3 A 10 9 223463 CASAVA_Build 4 173109338 10I AATTAAGCAC ----------/ATAAGAATAT TTTTAAAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ATAAGAATAT 0 1 223464 CASAVA_Build 4 173110595 1D TATATAAACC T/- TGAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 2 1 223465 CASAVA_Build 4 173113107 2D TATCTATCTA TC/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TC 1 0 223466 CASAVA_Build 4 173113860 1I TCCAGAGTAG -/C CGGGACTACA 1785 het 1785 ref 21 11 6 4 C 1 2 223467 CASAVA_Build 4 173121195 2I GAGTGTTATT --/AA TAAAGAGTGG 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 A 0 2 223468 CASAVA_Build 4 173127949 1D CATGGCCAGC A/- AATTTGAGAG 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 A 3 2 223469 CASAVA_Build 4 173132482 2I TGAGTTTGAG --/AT ATGTTACTTT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 AT 1 2 223470 CASAVA_Build 4 173133657 1D ACAAGCGGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 9 10 6 T 9 8 223471 CASAVA_Build 4 173137554 1D GCCAATATTA C/- CCCCAATCTG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 5 4 223472 CASAVA_Build 4 173137682 1I AGAGTGACAA -/G GCAAAGGAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 1 2 223473 CASAVA_Build 4 173144763 1I GGATGACAAG -/T TTTTTGGGGG 3070 hom 18 het 9 0 7 2 T 5 6 223474 CASAVA_Build 4 173150926 2I TCAGAATAAG --/TA TATATATAAG 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 TA 4 5 223475 CASAVA_Build 4 173152454 1I ACAAAATATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 223476 CASAVA_Build 4 173157486 1I CTCTGAAATT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 8 9 223477 CASAVA_Build 4 173162492 7I TCAGATGCCC -------/AATAAGA AATTACTGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AATAAGA 0 1 223478 CASAVA_Build 4 173168063 1I AAACACTACT -/G GGACTATAAA 3070 hom 120 het 44 0 42 2 G 2 3 223479 CASAVA_Build 4 173168326 1I AAATTTGGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 42 0 32 10 T 8 9 223480 CASAVA_Build 4 173170479 4D ATTATTGTTT TTTG/---- TTTGTTTCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TTTG 2 1 223481 CASAVA_Build 4 173171222 1D GATTTTATTC T/- TTTTTTAAGA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 7 6 223482 CASAVA_Build 4 173178102 1D AAAAGGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 11 10 223483 CASAVA_Build 4 173183952 1D GATTATAAAT G/- TAGGTATTTC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 1 0 223484 CASAVA_Build 4 173188947 2I ATCCACAGGT --/AA AGTTCCCTGT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 1 3 223485 CASAVA_Build 4 173196062 1D TATTTTTTTC T/- TCTCTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 15 13 3 T 2 1 223486 CASAVA_Build 4 173197891 1I52M2I AATGGAGACT -AAAAATAGCATATTAATAATCATTGCACTTTCTGGATCACGCTATGAAAGAC--/AAAAAATAGCATATTAATAATCATTGCACTTTCTGGATCACGCTATGAAAGACAT ATTTTGTGTA 3070 hom 126 het 33 0 43 8 N/A 0 0 223487 CASAVA_Build 4 173209999 2D GCCTCAAGGC AG/-- AGAGGATACA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AG 3 2 223488 CASAVA_Build 4 173215259 1D TACAAAAAGT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 7 6 223489 CASAVA_Build 4 173221202 1D TTTAAAGAAC T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 8 7 223490 CASAVA_Build 4 173222897 1D GTTGGGGGTT A/- GGGGGGATAG 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 1 0 223491 CASAVA_Build 4 173225767 3D CAACAGGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TTG 5 4 223492 CASAVA_Build 4 173232278 1I CTTTACAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 T 10 11 223493 CASAVA_Build 4 173236947 1D ATGTCATAGG T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 43 16 23 5 T 8 7 223494 CASAVA_Build 4 173239603 1I TATTTATTCC -/T TTTTTTTTTT 2413 het 2348 hom 25 8 8 9 T 13 14 223495 CASAVA_Build 4 173245489 1D CAAATAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 A 12 11 223496 CASAVA_Build 4 173252927 1I AAAGGCAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 8 9 223497 CASAVA_Build 4 173254265 2I CCCTTTTTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 10 12 223498 CASAVA_Build 4 173260307 9D TATTCAACAC CAGAGATGT/--------- CAGAGATGTC 3070 het 3070 ref 52 27 21 8 CAGAGATGT 2 1 223499 CASAVA_Build 4 173261676 1I TCTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 1029 het 1029 ref 19 6 5 8 T 13 14 223500 CASAVA_Build 4 173265555 1D AGTATAATTG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 A 8 7 223501 CASAVA_Build 4 173266986 1I ACCATTATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 9 223502 CASAVA_Build 4 173276697 1D AGATAAAGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 T 10 9 223503 CASAVA_Build 4 173281145 1I TATTAACTAC -/A GATAGCTTAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 0 1 223504 CASAVA_Build 4 173283586 1I TACTTCCTTC -/A TAAGTCCATA 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 A 0 1 223505 CASAVA_Build 4 173288538 5D CTCAAATAGA AATAT/----- AATATAATTA 3070 het 3070 hom 31 11 15 7 AATAT 2 1 223506 CASAVA_Build 4 173293134 6D CTTAGGAAAA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 AG 10 7 223507 CASAVA_Build 4 173293493 4D ATACAATAAT AATC/---- AATATATGAG 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 AATC 1 0 223508 CASAVA_Build 4 173297727 1D TTAAATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 11 10 223509 CASAVA_Build 4 173311774 1I GTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 T 11 12 223510 CASAVA_Build 4 173313844 1D CAGCGTCAAG T/- GAGGACGGGG 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 1 0 223511 CASAVA_Build 4 173315549 1I ATTTTAAATG -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 6 7 223512 CASAVA_Build 4 173318076 1I GGACTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 2008 het 2008 ref 53 38 5 10 A 11 12 223513 CASAVA_Build 4 173325529 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 1071 hom 7 het 3 0 3 0 A 7 6 223514 CASAVA_Build 4 173351283 2D GAAGGTAGAT AA/-- GTGGTGAATA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 2 0 223515 CASAVA_Build 4 173357471 3D GAAAGATTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 31 14 12 8 TTG 5 4 223516 CASAVA_Build 4 173367170 2D GTCTCTGGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 29 0 20 10 A 15 13 223517 CASAVA_Build 4 173370826 1I AGTTTCATCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 13 het 39 1 26 12 T 9 10 223518 CASAVA_Build 4 173372236 1D TCTGTTTTTA T/- TTCTTTTCCT 952 het 952 ref 19 7 9 3 T 3 2 223519 CASAVA_Build 4 173372801 2D ATTTTTACCT CA/-- GTCTTTCCCT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CA 1 0 223520 CASAVA_Build 4 173380077 1I AGTTATTTAA -/T AACAAGTGTT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 0 1 223521 CASAVA_Build 4 173388782 2D AAGATGTTCC CT/-- GTTTTCAGAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CT 1 0 223522 CASAVA_Build 4 173392884 1D ATATTGTTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 223523 CASAVA_Build 4 173394499 4I GATTCTATAG ----/ATAA ATTGCAAGTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 ATAA 0 1 223524 CASAVA_Build 4 173405794 4D AAAATGAAAT AGAC/---- AGTCCTCATA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AGAC 1 0 223525 CASAVA_Build 4 173453150 1I TCCATTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 18 1 16 1 A 11 12 223526 CASAVA_Build 4 173461805 1D ATATTCTGGG T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 8 7 223527 CASAVA_Build 4 173462152 2I AGTATATGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 10 12 223528 CASAVA_Build 4 173466805 2D ATGAAATTTG TT/-- TTTTTTTGTT 3070 hom 71 het 34 0 24 10 T 9 7 223529 CASAVA_Build 4 173467147 1I TTAAAAAGTG -/T TTTTTAAAAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 5 6 223530 CASAVA_Build 4 173467483 2D AAAAATAGTT CA/-- GTTTGGTAGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CA 1 0 223531 CASAVA_Build 4 173490250 1I TCCGATCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 11 12 223532 CASAVA_Build 4 173507572 1D TATATATATA T/- TTTTTTTAAA 1616 hom 10 het 10 0 4 6 T 8 7 223533 CASAVA_Build 4 173518045 3D AGAATGCTTT ATC/--- ATCACAGCTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ATC 2 1 223534 CASAVA_Build 4 173519040 1I AGGTCCTTTT -/C TCCTGAGAGA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 C 0 1 223535 CASAVA_Build 4 173520112 5D TTAAACAAAC TTAAT/----- TTATTTAATG 3070 hom 78 het 27 0 27 2 TTAAT 1 0 223536 CASAVA_Build 4 173540628 1D TAAAGGACTG T/- TTTTTCCCCA 3070 hom 90 het 38 0 31 8 T 6 5 223537 CASAVA_Build 4 173540988 1D GTTCTTTTCA T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 8 7 223538 CASAVA_Build 4 173550189 1D TTCTTATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 25 1 19 5 T 15 14 223539 CASAVA_Build 4 173554043 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 488 hom 30 2 21 7 T 14 13 223540 CASAVA_Build 4 173557231 1D TAGTAGCCAC T/- GAGTAGTATA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 1 0 223541 CASAVA_Build 4 173576672 4D TTTCTACGAG ATTT/---- ATCAAGCAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 4 ATTT 1 0 223542 CASAVA_Build 4 173579672 2D CTGTGTGAAA GT/-- GTGTTTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 GT 3 2 223543 CASAVA_Build 4 173580109 3D TATTATTTTT ATA/--- ATAACAGGTT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 ATA 2 1 223544 CASAVA_Build 4 173582637 4D AGAAAACTAT GCAA/---- GTTTGTCATC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 GCAA 1 0 223545 CASAVA_Build 4 173584066 3D TGTAGTCCAT AGC/--- AGAGTTTTTT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 AGC 1 0 223546 CASAVA_Build 4 173584643 4D TAAGGACTCT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 41 het 36 1 28 7 TA 10 8 223547 CASAVA_Build 4 173591237 1D GAAGATGATC A/- TCTTTCCCAT 3070 hom 77 het 31 0 23 8 A 1 0 223548 CASAVA_Build 4 173593740 2D CATCACACTC TT/-- TAACAGGGCA 3070 hom 123 het 44 0 38 7 T 3 1 223549 CASAVA_Build 4 173595684 1I TCCTCCTCCA -/T TTGTTAAAAG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 2 3 223550 CASAVA_Build 4 173597212 3D TCTTTGCTGG TTC/--- TTCTTCTCCC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TTC 3 2 223551 CASAVA_Build 4 173598509 4D ACTGCTTTAA AAAT/---- AAATAAAGTC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AAAT 2 1 223552 CASAVA_Build 4 173599628 1D TAAGAATTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 9 8 223553 CASAVA_Build 4 173637044 4D GTGTATACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 120 het 48 0 41 11 AC 8 6 223554 CASAVA_Build 4 173640733 2I TGAGTTTATG --/TA TATATATATA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TA 6 7 223555 CASAVA_Build 4 173648765 1D AAACAAAGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 86 het 33 0 28 5 A 10 9 223556 CASAVA_Build 4 173649081 1I AACAAACAAA -/C AACAAAAGGT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 0 1 223557 CASAVA_Build 4 173660215 1D TTTGGCTCAT C/- TATTTGATCC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 C 1 0 223558 CASAVA_Build 4 173676824 2I ATATGTATAT --/AC ACACACACAC 2643 het 1190 hom 19 5 8 6 AC 8 9 223559 CASAVA_Build 4 173688670 32D TCGCCGTGTG TTATAAGCAAGAATCACCTGAATGTAGATTTT/-------------------------------- ATAATGAAAA 3070 hom 63 het 17 0 22 3 TTATAAGCAAGAATCACCTGAATGTAGATTTT 1 0 223560 CASAVA_Build 4 173700827 1I ATCGCAAAAG -/A AAAAGGAACA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 4 5 223561 CASAVA_Build 4 173704222 1D ACACAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 A 12 11 223562 CASAVA_Build 4 173705902 1D TGTCAATGAA G/- GGTCAAAAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 3 2 223563 CASAVA_Build 4 173718065 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 25 0 21 4 A 10 9 223564 CASAVA_Build 4 173721091 1D CAACTGTCAA T/- CCCGCCTTCA 3070 het 3070 hom 44 19 18 8 T 1 0 223565 CASAVA_Build 4 173723484 1I TGGGAGGTTT -/A ATGGTTATTG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 1 2 223566 CASAVA_Build 4 173742836 1D CATGAACTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 39 0 32 9 A 10 9 223567 CASAVA_Build 4 173744202 1D GGGAATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 753 hom 43 4 24 16 A 16 15 223568 CASAVA_Build 4 173744865 1I AATTGTGTAG -/A AAAAAATGTA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 7 223569 CASAVA_Build 4 173749143 3I GAAACGCATA ---/ATT ATTAGTATTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 ATT 1 2 223570 CASAVA_Build 4 173760223 4I5M10I AAATTAGGTT ----TAAAT----------/ATGATAAATCAAAGATACA TATTTTAAAC 3070 hom 78 het 25 0 27 1 N/A 0 0 223571 CASAVA_Build 4 173763739 1D TGTATGTGGG C/- CCCCAGTCCA 3070 hom 87 het 34 0 27 7 C 5 4 223572 CASAVA_Build 4 173782525 1D TTACCAGGTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 7 223573 CASAVA_Build 4 173785665 1I TTATCCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 10 11 223574 CASAVA_Build 4 173814655 1I AAGGACATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 619 hom 46 2 33 11 T 10 11 223575 CASAVA_Build 4 173821117 5I TATTAAGTGT -----/ATAGC ATAGCATTAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 ATAGC 1 2 223576 CASAVA_Build 4 173821667 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 47 het 18 0 15 3 AAAG 3 4 223577 CASAVA_Build 4 173827486 4D GATTATTTCA TCAC/---- TCAGGTATGA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 TCAC 1 0 223578 CASAVA_Build 4 173828834 1D TGTTCTTTTT G/- ATTAGAATTG 3070 hom 24 het 23 0 16 7 G 1 0 223579 CASAVA_Build 4 173830381 1D GGGCTTTTTG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 98 het 40 0 32 8 T 9 8 223580 CASAVA_Build 4 173835756 2D AGCTTTATGT TA/-- TGTTTTGTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 TA 1 0 223581 CASAVA_Build 4 173836037 5D CAGTTTTTAG TCTTT/----- TCTTTTAAAG 3070 hom 35 het 20 0 11 9 TCTTT 2 1 223582 CASAVA_Build 4 173840656 4I TTATATTGTC ----/TCTG TCTGTTGATT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 TCTG 1 2 223583 CASAVA_Build 4 173845352 2D AGACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1667 het 42 hom 17 1 6 10 A 20 18 223584 CASAVA_Build 4 173846690 14I TCCCTACTCA --------------/GTGACATCATAATG GTAACCCAAA 3070 hom 129 het 43 0 43 5 GTGACATCATAATG 0 1 223585 CASAVA_Build 4 173849761 1I AAAAGCGGGA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 8 9 223586 CASAVA_Build 4 173851851 1D GCACTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 T 13 12 223587 CASAVA_Build 4 173859143 2D AATCTAAGAA AG/-- AGTATAGCAT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AG 2 1 223588 CASAVA_Build 4 173865535 1I TCTTGCCAAA -/C CTGTTTAACA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 C 1 2 223589 CASAVA_Build 4 173872719 1D CATTTACTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 308 hom 44 1 39 4 A 11 10 223590 CASAVA_Build 4 173873248 2I TAAGGAGGTG --/GT GTAGTATTGT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 GT 1 2 223591 CASAVA_Build 4 173873838 1D ACTCTAGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 10 9 223592 CASAVA_Build 4 173874232 2I AACTGTTTTA --/GT TCAAACATTC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 GT 0 1 223593 CASAVA_Build 4 173874850 1I TCTAAGTTAC -/A AAAAAATTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 7 223594 CASAVA_Build 4 173879899 1D AACTCTCTTA T/- GTTTTTATCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 0 223595 CASAVA_Build 4 173881514 2D CATTCACTTT AG/-- GTATCAAAGA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AG 1 0 223596 CASAVA_Build 4 173901870 1I CATTCAGAAG -/C TTGAATCTGC 3070 hom 151 het 56 0 51 5 C 0 1 223597 CASAVA_Build 4 173905564 1I ATTCAGCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1290 hom 43 4 28 11 A 13 14 223598 CASAVA_Build 4 173905736 1D AAACTGCAAC T/- TTTAAGTGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 4 3 223599 CASAVA_Build 4 173921685 1D ACAAGGTGTA T/- TTTTTTTTTT 2287 het 70 hom 24 2 7 15 T 17 16 223600 CASAVA_Build 4 173930311 4D TTCATTGGTC TGTT/---- TATCTATCCT 3070 hom 96 het 36 0 33 6 TGTT 1 0 223601 CASAVA_Build 4 173930458 1D TAGTGGCCCC A/- AAGATATTTA 3070 hom 81 het 34 0 25 10 A 3 2 223602 CASAVA_Build 4 173931327 1I21M1I TTCAGTGACC -AAAAAAAAAAACCCACTTCCA-/AAAAAAAAAAAACCCACTTCCAT TTTTTTGTGC 3070 hom 54 het 22 0 18 7 N/A 0 0 223603 CASAVA_Build 4 173931705 1D GACTTAAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 10 9 223604 CASAVA_Build 4 173936253 2D AGCCAGAATA AC/-- AGAGTCTCAC 3070 hom 144 het 53 0 49 5 AC 1 0 223605 CASAVA_Build 4 173945913 4D CTCTACAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 34 0 27 13 AAAC 4 3 223606 CASAVA_Build 4 173950073 2I ATATATACAC --/AT GTGTGTACTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AT 0 1 223607 CASAVA_Build 4 173958556 1D ATGTCATCGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 9 8 223608 CASAVA_Build 4 173960521 4D CGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 42 het 18 0 15 5 AAAC 5 4 223609 CASAVA_Build 4 173988164 6D TTTGTGTTAT ACTGCC/------ ACTGCCACCT 3070 hom 81 het 32 0 28 6 ACTGCC 2 1 223610 CASAVA_Build 4 173988796 1I GAGGCAAGAG -/A AAAGCTTGAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 3 4 223611 CASAVA_Build 4 174004968 1I AAGAGAACTC -/T TATCACGCTT 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 T 1 2 223612 CASAVA_Build 4 174009144 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 35 het 26 1 24 1 AC 6 5 223613 CASAVA_Build 4 174014375 4I TTCTACTCTT ----/CTAC CTGTCTGGCT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 CTAC 0 1 223614 CASAVA_Build 4 174016773 1I AGTGGTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 13 14 223615 CASAVA_Build 4 174029165 2D TTCAGATATG GC/-- TATACTGATC 3070 hom 60 het 24 0 19 5 GC 1 0 223616 CASAVA_Build 4 174053011 4I TCCATTTTTC ----/CTGT CTGTCTTTGT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 CTGT 1 2 223617 CASAVA_Build 4 174067086 1I TCATTTACAT -/A AAAATATTAT 3070 hom 42 het 22 0 15 7 A 4 5 223618 CASAVA_Build 4 174109746 1D TGACATTTTT G/- TTTTCCTGCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 1 0 223619 CASAVA_Build 4 174145473 1D GTTTAAAAGT G/- TGTAGCACCT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 G 1 0 223620 CASAVA_Build 4 174154577 1I CAGAAATGGA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 24 het 39 1 36 2 T 7 8 223621 CASAVA_Build 4 174162840 1I GGCCGGTATT -/A AAGCTAAGCC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 3 223622 CASAVA_Build 4 174163261 1I TTTAAAAAAA -/T ATATATTATT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 0 1 223623 CASAVA_Build 4 174192907 1D TGCCATGCTC T/- TTTTTTTTTT 926 het 926 ref 11 6 2 3 T 15 14 223624 CASAVA_Build 4 174197132 1D TGACTGCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 26 0 23 4 T 10 9 223625 CASAVA_Build 4 174203993 2I CCTAGGTGAC --/AG AGTGAGATCC 2961 hom 17 het 20 0 9 11 AG 1 2 223626 CASAVA_Build 4 174204010 1D TCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 383 het 130 hom 14 3 3 8 A 17 16 223627 CASAVA_Build 4 174225325 1I GCTGTTCAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 T 9 10 223628 CASAVA_Build 4 174235118 1D AAGAGTTTTG T/- TTTTACTATG 3070 het 3070 hom 37 13 20 6 T 5 4 223629 CASAVA_Build 4 174236250 1D CAAGATACAC T/- TTTCAAACTA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 T 4 3 223630 CASAVA_Build 4 174254476 5I TCAAATATAG -----/AAGAT AAGAAATAAA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 AAGAT 0 1 223631 CASAVA_Build 4 174270549 8D ACCACCCCGA GTAGCCGG/-------- GGTGGGACTA 2341 het 2341 ref 22 12 7 6 GTAGCCGG 1 0 223632 CASAVA_Build 4 174272783 1I CTTCGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2381 hom 24 8 12 4 A 13 14 223633 CASAVA_Build 4 174279448 2I GACTCAAGAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2838 hom 36 8 16 12 TG 7 8 223634 CASAVA_Build 4 174281737 1D TTTAGATTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 T 9 8 223635 CASAVA_Build 4 174284851 1I GCGAAAACAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 T 8 9 223636 CASAVA_Build 4 174286502 1D TTCTTAAGTT C/- CCCATGTTAA 3070 het 3070 ref 45 29 13 3 C 4 3 223637 CASAVA_Build 4 174290213 5D TGAACAATCT AGAAA/----- AGAAGAGAGT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 AGAAA 1 0 223638 CASAVA_Build 4 174292825 8D ACAAGATCTA TCCCATTT/-------- TCCCATTTAA 3070 hom 123 het 43 0 42 7 TCCCATTT 2 1 223639 CASAVA_Build 4 174300901 1I TTGATTACTG -/A TGTGGCTCAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 0 1 223640 CASAVA_Build 4 174305061 1I ACAATTTCTG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 7 8 223641 CASAVA_Build 4 174306088 1I GTGTGTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 11 12 223642 CASAVA_Build 4 174310657 1D TAATTATTCA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 19 15 11 T 8 7 223643 CASAVA_Build 4 174311280 1D TTTATCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 38 0 32 6 A 11 10 223644 CASAVA_Build 4 174313859 1I CTGATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 13 22 12 T 10 11 223645 CASAVA_Build 4 174318489 3I AACTGTTTAT ---/GTC GTCTCAAATG 3070 het 3070 ref 41 20 20 1 GTC 1 2 223646 CASAVA_Build 4 174325140 2D ACTAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 21 0 14 7 A 14 12 223647 CASAVA_Build 4 174342470 1D CTGATAATGT A/- AAAAAAAAAC 2881 het 2881 ref 23 14 7 4 A 10 9 223648 CASAVA_Build 4 174343140 1I AATGAATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2887 hom 40 9 15 16 A 14 15 223649 CASAVA_Build 4 174355792 1D GGATTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2611 hom 33 10 17 6 T 12 11 223650 CASAVA_Build 4 174370355 1D TTCAGTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 903 hom 48 7 14 27 T 13 12 223651 CASAVA_Build 4 174370461 2D ATTTTGACAC AT/-- GTCTATTGGA 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 AT 1 0 223652 CASAVA_Build 4 174370955 1I CCTTTCTAGT -/G TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 G 0 1 223653 CASAVA_Build 4 174372529 1D ATGACTTGGA T/- TTTTTTTTTT 2636 het 2636 ref 43 19 9 16 T 15 14 223654 CASAVA_Build 4 174376196 5D CAATATTTTG TTTCC/----- TTTGCTTTGG 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 TTTCC 1 0 223655 CASAVA_Build 4 174381205 6I AACTATTCAG ------/TAATAA TAATGTTACT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TAA 1 3 223656 CASAVA_Build 4 174388022 1I GCATATGTTA -/T TATATTCTTT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 1 2 223657 CASAVA_Build 4 174395486 1D TCCCTGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 A 15 14 223658 CASAVA_Build 4 174402942 2D CCATTAAGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 28 1 20 7 A 18 16 223659 CASAVA_Build 4 174406667 1D TAATTTTTTT C/- CCTCAGTACT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 C 3 2 223660 CASAVA_Build 4 174457578 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 881 het 881 ref 40 35 3 2 A 11 10 223661 CASAVA_Build 4 174473898 15D TTCCTCTCTG GCCTCACCTGCTACT/--------------- GCTCTCCCCA 3070 hom 98 het 35 0 33 7 GCCTCACCTGCTACT 1 0 223662 CASAVA_Build 4 174507143 1D TGAGTGGGGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 A 9 8 223663 CASAVA_Build 4 174508067 1D AGTTTATCAT A/- AAAACACTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 5 4 223664 CASAVA_Build 4 174520257 1D TAGAAATCAT A/- AAAAAGTGAC 3070 hom 88 het 32 0 30 2 A 6 5 223665 CASAVA_Build 4 174527395 1I AAGAACTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 24 1 18 5 A 10 11 223666 CASAVA_Build 4 174530505 4I ATCCTTACTG ----/CTAT CTATCTGTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 CTAT 1 2 223667 CASAVA_Build 4 174531566 1I TGGAAGTAAA -/T TTTTATTGTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 4 5 223668 CASAVA_Build 4 174532753 4I TTTATAGATT ----/TATA TATATATATA 2641 hom 15 het 8 0 6 2 TA 6 8 223669 CASAVA_Build 4 174537024 4D TTTATAAAAT ATGA/---- ATGAAGAGTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATGA 2 1 223670 CASAVA_Build 4 174538335 1I CTTTTTATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 97 het 40 0 33 7 T 9 10 223671 CASAVA_Build 4 174539732 1I TTTTTTTTTT -/C TTTAGTGTAT 3070 hom 89 het 44 0 35 9 C 0 1 223672 CASAVA_Build 4 174544934 2I ATTGGAACTC --/TT TTGAAAATCT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 2 4 223673 CASAVA_Build 4 174551431 1D AACCATTACT A/- AAAGTGGAGT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 4 3 223674 CASAVA_Build 4 174551504 2I ATATTTGTTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 TA 6 7 223675 CASAVA_Build 4 174552386 3D AAAAATTATA ATT/--- ATAAGTCTGT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 ATT 1 0 223676 CASAVA_Build 4 174560181 1D ATTTCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 37 1 24 12 A 13 12 223677 CASAVA_Build 4 174565100 1I AAAATACATT -/A AAAAAAAAAA 2921 het 1370 hom 11 3 8 0 A 11 12 223678 CASAVA_Build 4 174570126 3D TCCCTACCAT TTC/--- TTCTTCTGTT 3070 het 3070 hom 52 22 22 9 TTC 3 2 223679 CASAVA_Build 4 174579141 1I GTTTAGTTTG -/T TTGGGGGGGG 3070 hom 171 het 63 0 57 6 T 2 3 223680 CASAVA_Build 4 174587727 1D TGGCTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 11 10 223681 CASAVA_Build 4 174593821 1D TAAAAGGATG A/- AAAAAACTCC 3070 hom 111 het 42 0 36 6 A 7 6 223682 CASAVA_Build 4 174597240 1D GACCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 12 11 223683 CASAVA_Build 4 174609211 1D CTATACCAAG A/- AGATAGCACG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 2 1 223684 CASAVA_Build 4 174609963 3D CTTCATCTCA AAG/--- AAGAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 AAG 2 1 223685 CASAVA_Build 4 174614485 1D AAGGATTGAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 144 het 55 0 49 6 A 9 8 223686 CASAVA_Build 4 174624962 1I AGTCCATTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 106 hom 42 1 38 3 A 9 10 223687 CASAVA_Build 4 174627847 5D TCCCTCTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2719 het 516 hom 36 5 8 24 T 22 17 223688 CASAVA_Build 4 174630419 1I ACTTGAGGGA -/G GGTTTGGGTC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 2 3 223689 CASAVA_Build 4 174631081 11D CTCTTTTCTA TCTCTTTTCTC/----------- AATCTACGAA 3070 hom 93 het 33 0 32 7 TCTCTTTTCTC 1 0 223690 CASAVA_Build 4 174632650 2D TATTTTGAAA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TC 6 5 223691 CASAVA_Build 4 174647237 3D GCGTTTCTAA TTT/--- TTTTTTTTTG 1765 hom 33 het 33 0 11 23 T 12 9 223692 CASAVA_Build 4 174648944 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2575 het 459 hom 41 4 12 25 T 15 16 223693 CASAVA_Build 4 174677556 1I TTCTTCAAAA -/G TAACAGTCTT 3070 het 3070 hom 65 26 31 8 G 0 1 223694 CASAVA_Build 4 174697203 2I AGTAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 A 9 11 223695 CASAVA_Build 4 174703535 9I AATCGTGGCA ---------/CAGCTATAC CATGGAATAC 3070 het 3070 ref 57 29 21 7 CAGCTATAC 0 1 223696 CASAVA_Build 4 174710234 13I ATATTCCACG -------------/TTTTATTTCATTA TTTGGTGAGT 3070 het 3070 hom 48 19 26 4 TTTTATTTCATTA 0 1 223697 CASAVA_Build 4 174713435 1I TCTCCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 10 5 A 11 12 223698 CASAVA_Build 4 174744794 1I CTCAGTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 978 hom 28 3 23 3 C 0 1 223699 CASAVA_Build 4 174746130 1D TGTAACACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 13 12 223700 CASAVA_Build 4 174751198 2D TATGACAAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 40 het 28 1 25 2 TA 7 6 223701 CASAVA_Build 4 174772990 1I GCTCTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 2280 het 2280 ref 25 9 8 8 T 14 15 223702 CASAVA_Build 4 174775765 1I GCATCACAAA -/G TTCTCGTGCC 3070 het 3070 ref 26 18 7 1 G 0 1 223703 CASAVA_Build 4 174776736 1D CTAGCAGTGA G/- CAAGGCTCTG 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 G 1 0 223704 CASAVA_Build 4 174778068 1I CTTCTTTGTC -/T TTTTTTGATC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 6 7 223705 CASAVA_Build 4 174778127 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTTTG 2927 het 2690 hom 15 6 6 3 T 9 10 223706 CASAVA_Build 4 174783698 2I GAATGAGAAC --/TT TTCTGGGTGG 3070 het 3070 ref 46 36 10 0 T 2 4 223707 CASAVA_Build 4 174789360 1I TGAAGTGTAA -/T TTATCAATTT 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 T 2 3 223708 CASAVA_Build 4 174792318 1D CCTGGCTAAG T/- TTTTTTTTTT 1348 het 1348 ref 40 28 3 9 T 11 10 223709 CASAVA_Build 4 174823972 1D AAAAATAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 10 9 223710 CASAVA_Build 4 174847403 2I GCCTGAAAAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 9 11 223711 CASAVA_Build 4 174848778 1D TTGAGATTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 9 8 223712 CASAVA_Build 4 174859380 2D GATGAGAAAC TT/-- AATTCAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 2 0 223713 CASAVA_Build 4 174864301 1D AACAAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 24 7 A 12 11 223714 CASAVA_Build 4 174872784 2D ACATTCATAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 40 1 14 25 A 16 14 223715 CASAVA_Build 4 174878681 3D GAACTACAAG CCA/--- CCACTTTTCA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 CCA 2 1 223716 CASAVA_Build 4 174881381 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 T 7 6 223717 CASAVA_Build 4 174886274 2D AGAGCTGATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 89 het 44 0 29 16 TG 9 8 223718 CASAVA_Build 4 174887041 1D TAGAAACCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 377 hom 27 1 21 5 A 10 9 223719 CASAVA_Build 4 174890373 1I TAAATCCTGC -/T TTTTTTTTTT 1722 het 1722 ref 44 13 15 16 T 17 18 223720 CASAVA_Build 4 174906916 1D ATATGAACGT G/- AGTCATTGCC 3070 hom 132 het 50 0 44 7 G 1 0 223721 CASAVA_Build 4 174921883 1D CTATTGCTTA T/- TTTGCATGAT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 T 4 3 223722 CASAVA_Build 4 174936846 1I CAGAAACTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 T 9 10 223723 CASAVA_Build 4 174963290 4I CTACAAAAAG ----/ATAA ATAAAGATTT 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 ATAA 1 2 223724 CASAVA_Build 4 174977861 4D AGCTTCTTGC CTTT/---- CTGAGACAAT 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 CTTT 1 0 223725 CASAVA_Build 4 174978696 1D AACTGTAGTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 9 8 223726 CASAVA_Build 4 174981259 2I AGTTGTATCC --/TT TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 7 9 223727 CASAVA_Build 4 174981774 1D TTCTCTGAGG A/- TTCAATCAGC 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 A 1 0 223728 CASAVA_Build 4 174993439 1D TTTTGTGGGG A/- AAAAATCACA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 6 5 223729 CASAVA_Build 4 174994802 7I TTTTAATGAC -------/ATCCTTT ATTTCACTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 ATCCTTT 0 1 223730 CASAVA_Build 4 175001585 2D TTGGAGCTCC CA/-- CACAGAGTCC 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 CA 3 2 223731 CASAVA_Build 4 175003476 1I TGGATTGCAG -/A ATTGCCTCAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 1 2 223732 CASAVA_Build 4 175023094 1D ATATCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 11 10 223733 CASAVA_Build 4 175026016 9I ATTTATAATA ---------/CATCCTTAG GAATCGAATT 3070 hom 87 het 30 0 30 1 CATCCTTAG 0 1 223734 CASAVA_Build 4 175037517 2D CTCAGACAAA AC/-- AGTGTTGAAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 3 AC 1 0 223735 CASAVA_Build 4 175037582 1D TGCGGAGCCA T/- TTTTTTTTTT 1305 het 1305 ref 23 13 3 7 T 13 12 223736 CASAVA_Build 4 175040921 1D AAATTAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 13 12 223737 CASAVA_Build 4 175042482 1D AATTTGCTCA T/- TTAGACATCC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 3 2 223738 CASAVA_Build 4 175043665 1I GATGAGGTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 8 9 223739 CASAVA_Build 4 175044386 11D ATGGAACAGC ATTGAATCTAT/----------- AAATTACTTT 3070 het 3070 ref 23 14 7 5 ATTGAATCTAT 1 0 223740 CASAVA_Build 4 175049013 3I TTGTTATTTT ---/ATC ATCAATTGTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 ATC 1 2 223741 CASAVA_Build 4 175055542 1D TTTTGGGGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 T 9 8 223742 CASAVA_Build 4 175063848 1D CATTCAAATT A/- AAAAGATGAA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 5 4 223743 CASAVA_Build 4 175078309 1D GCCAAAATCT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 9 8 223744 CASAVA_Build 4 175080935 3D CTTGAAAAAT CTC/--- CTCTCTTCAA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 CTC 2 1 223745 CASAVA_Build 4 175085719 1I TCCTATCACT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 89 het 35 0 30 5 A 8 9 223746 CASAVA_Build 4 175095688 1D ATGTTCCCAC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 8 223747 CASAVA_Build 4 175096682 1I AAAAAAAAAA -/C AACCTGTAAA 3070 het 381 hom 34 1 28 5 C 0 1 223748 CASAVA_Build 4 175111397 5D3M1I GTAAGAGCAG CATTTGCA-/-----GTAG TTATGGAAGT 2307 het 2307 ref 24 19 5 1 N/A 0 0 223749 CASAVA_Build 4 175117029 1D56M2I AAAACATGTC TATATAGTCATAAAAATATTTTACCATAAAGGATCTGTTCAGATGGCATCTATGCCT--/-ATATAGTCATAAAAATATTTTACCATAAAGGATCTGTTCAGATGGCATCTATGCCTAA GTTTTGTTAT 3070 hom 148 het 30 0 50 2 N/A 0 0 223750 CASAVA_Build 4 175120685 3I TGTTATTATT ---/ATC ATTATACTTG 3070 hom 44 het 17 0 15 2 ATC 0 1 223751 CASAVA_Build 4 175123169 1I GATGCTGGCC -/T CATAAAATGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 0 1 223752 CASAVA_Build 4 175127848 1D TGGCCTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 10 9 223753 CASAVA_Build 4 175129658 4D TTGTATTTTG ATTA/---- ATTTATTCCA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 ATTA 1 0 223754 CASAVA_Build 4 175131163 2I CTCAGGCCCC --/CT GAGTTAATGC 3070 hom 144 het 54 0 47 7 CT 0 1 223755 CASAVA_Build 4 175131351 1I28M2I TCTGCTCCGC -TTTTTTTCACAAGGTGCAAATCCTCTGA--/TTTTTTTTCACAAGGTGCAAATCCTCTGAGG GGGGGGTCCC 3070 hom 90 het 32 0 31 6 N/A 0 0 223756 CASAVA_Build 4 175131885 1D TTATTTATTT A/- TTTATTTTGT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 0 223757 CASAVA_Build 4 175136553 1I CCCTGTGTTA -/G AATTTTTTCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 223758 CASAVA_Build 4 175137476 1I AGCCTTCCTC -/T TTTTTTGCCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 6 7 223759 CASAVA_Build 4 175138105 1I TTTAAAGTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 99 hom 40 1 30 9 A 9 10 223760 CASAVA_Build 4 175138243 1I TGAAAACACT -/A GCTGATTTGA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 223761 CASAVA_Build 4 175142546 1I ACATAACCTG -/A AAAAAATTCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 7 223762 CASAVA_Build 4 175144481 2I GCTCCATGAC --/AG GGGGACAGAT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 AG 0 1 223763 CASAVA_Build 4 175148075 1I ATTCTGAGTT -/C CCTTGACCCA 3070 hom 87 het 33 0 28 5 C 2 3 223764 CASAVA_Build 4 175153025 20D ATATACACAT ACACATATACACACATATAC/-------------------- ACACATATAC 3070 hom 114 het 51 0 39 20 ACACATATAC 3 1 223765 CASAVA_Build 4 175154576 4D GGTAGGTATT TAGG/---- TAGGTAGGTA 3070 hom 87 het 36 0 29 10 TAGG 3 2 223766 CASAVA_Build 4 175155827 1I TCATCAAGAC -/T CATGGCCCCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 1 223767 CASAVA_Build 4 175173934 3I GCAGTTGTTA ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TTG 2 3 223768 CASAVA_Build 4 175174687 1D ATAAATGAGA C/- GAGTGAAAAG 3070 hom 135 het 50 0 46 5 C 1 0 223769 CASAVA_Build 4 175193810 1D AATTCAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 10 9 223770 CASAVA_Build 4 175195975 1D TGCTATTTTC T/- TTGCATTTCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 3 2 223771 CASAVA_Build 4 175198779 1D ATTTCAGGTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 9 8 223772 CASAVA_Build 4 175210459 1I TAAGCATATG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 7 8 223773 CASAVA_Build 4 175211970 2I TCTGAAACTT --/TG TGAGCACCAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TG 1 2 223774 CASAVA_Build 4 175219405 2D ATTGGTACCA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 10 8 223775 CASAVA_Build 4 175251153 1I AAGATGCTAA -/T AAGGGAAACC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 223776 CASAVA_Build 4 175260806 1I AATAACAGTA -/T TTTTTTATCG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 7 223777 CASAVA_Build 4 175262293 4D ATACAAATTA TAAG/---- TAATAATGAA 2227 het 2227 ref 12 7 5 0 TAAG 1 0 223778 CASAVA_Build 4 175270130 2D AAAACATAAC AT/-- GTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 AT 1 0 223779 CASAVA_Build 4 175272985 1D AGGAAAGACT C/- CAACCTTAAT 3070 hom 102 het 37 0 33 4 C 2 1 223780 CASAVA_Build 4 175273118 1I TGAGATTTCT -/C CCTATATTAC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 2 3 223781 CASAVA_Build 4 175276699 1I TCTCCTAATG -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 6 7 223782 CASAVA_Build 4 175277426 1I AACTAAAAAT -/G TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 0 1 223783 CASAVA_Build 4 175290188 1D AAAACAAATT A/- TTTACTAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 0 223784 CASAVA_Build 4 175290330 4I TTTAAGTCTG ----/TTCT TTAAGTATCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTCT 0 1 223785 CASAVA_Build 4 175295774 1I CTACTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 32 0 20 12 T 13 14 223786 CASAVA_Build 4 175300401 4I AAATCAAGAA ----/ATAG ATAATTACCT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 ATAG 0 1 223787 CASAVA_Build 4 175302904 2I ACACACACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 62 hom 34 1 29 4 AC 5 6 223788 CASAVA_Build 4 175308978 2D CTCCCACGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 14 12 223789 CASAVA_Build 4 175309929 58D GGAGCAATCC ATAGTAGGCATTTAATATAGAAAAACTTTGGTAGTGTAAAGGATTAAGGAAAGGTCAG/---------------------------------------------------------- ACAGATTGCT 3070 hom 102 het 39 0 35 6 ATAGTAGGCATTTAATATAGAAAAACTTTGGTAGTGTAAAGGATTAAGGAAAGGTCAG 1 0 223790 CASAVA_Build 4 175326435 1D ATACAAAATA T/- TTTGGGGGGG 3070 het 9 hom 30 2 25 3 T 4 3 223791 CASAVA_Build 4 175341964 4I GTATAAGATG ----/TCTC TCTCATGAGA 3070 hom 120 het 48 0 39 9 TC 2 4 223792 CASAVA_Build 4 175386305 3D TAAATTTATC GTT/--- GTATCATAGG 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 GTT 1 0 223793 CASAVA_Build 4 175393432 2D ATTTATAATC AA/-- GTCAGGGTAG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 2 0 223794 CASAVA_Build 4 175398324 2I TCTGTGTAAA --/AC ACTGCTAAAT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 AC 1 2 223795 CASAVA_Build 4 175404320 1D AGAGAAAGTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 2644 hom 29 8 18 3 T 9 8 223796 CASAVA_Build 4 175405146 3I TGGCCACTAC ---/TTG TTTTCAGGTC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 TTG 0 1 223797 CASAVA_Build 4 175422522 1D TAAAATTCTT A/- AAAAAAAAAA 3017 het 2840 hom 24 10 8 6 A 13 12 223798 CASAVA_Build 4 175426338 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 1187 hom 9 het 4 0 3 1 T 6 5 223799 CASAVA_Build 4 175427048 1D AAATAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2468 hom 20 9 7 4 A 11 10 223800 CASAVA_Build 4 175431574 3D CAGTTTAAGA ATT/--- ATTATTATTA 744 het 744 ref 37 31 3 3 ATT 6 5 223801 CASAVA_Build 4 175447022 1D TTCCCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2700 hom 30 9 11 12 T 16 15 223802 CASAVA_Build 4 175465492 1D AATTTACAAG A/- AAAAAACAAC 3070 hom 86 het 35 0 29 6 A 7 6 223803 CASAVA_Build 4 175467830 1I TATAACAAAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 9 10 223804 CASAVA_Build 4 175471122 1D AAAAAAAAAA G/- GTGTGCTACC 3070 het 1936 hom 34 12 11 11 G 2 1 223805 CASAVA_Build 4 175476230 3D TTTTTAATAT TAC/--- TACTATATGA 3070 het 3070 ref 36 22 13 2 TAC 2 1 223806 CASAVA_Build 4 175477505 4D AAAGAGTCTT TATC/---- TAGACAACAT 3070 het 3070 hom 39 12 26 1 TATC 1 0 223807 CASAVA_Build 4 175484915 4D ATATATATTT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 18 8 9 2 AG 9 7 223808 CASAVA_Build 4 175486678 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 8 9 223809 CASAVA_Build 4 175490913 4D AATTAGGTGG TTAA/---- TTAGAGAGCG 3070 het 3070 hom 40 18 21 2 TTAA 1 0 223810 CASAVA_Build 4 175501601 5D CTGTAAGGCA TCTTT/----- TCTTATGCTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 4 TCTTT 1 0 223811 CASAVA_Build 4 175506136 1I GAGAATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 11 12 223812 CASAVA_Build 4 175508383 2I AAATGAAATT --/AG AGAGTTAAGC 2804 het 2804 ref 31 21 6 4 AG 2 3 223813 CASAVA_Build 4 175510030 4D TAAAGAAGTA TTTC/---- TTTCTGTCCT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 TTTC 2 1 223814 CASAVA_Build 4 175512892 2D GTTTAGAATC TG/-- TGTTCATAAA 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 TG 2 1 223815 CASAVA_Build 4 175514104 3I AAGTCTTCAG ---/GTC GTCATTTCTG 3070 hom 77 het 31 0 26 5 GTC 1 2 223816 CASAVA_Build 4 175515082 1D ACCCGGTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 7 A 11 10 223817 CASAVA_Build 4 175531502 1I GCCATAGGGC -/T CATAGCCCTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 0 1 223818 CASAVA_Build 4 175549348 1D GACTTGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 13 12 223819 CASAVA_Build 4 175568490 1D ACCAAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2517 hom 27 het 17 0 8 10 A 14 13 223820 CASAVA_Build 4 175581998 3D ATTTCTAGAT CTC/--- CTACATTGCA 3070 hom 81 het 35 0 28 8 CTC 1 0 223821 CASAVA_Build 4 175599858 1D CCCCAGAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 15 1 12 2 T 13 12 223822 CASAVA_Build 4 175616090 1I CTTTTTGGGC -/A TATTTTTTAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 223823 CASAVA_Build 4 175616572 1D CCGGCAACCA C/- CCATTCTACT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 C 3 2 223824 CASAVA_Build 4 175617346 1I TGCCTTTGCA -/T TTTGTTGATT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 3 4 223825 CASAVA_Build 4 175618894 1D GGATACATTT A/- AAAAAAACCA 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 8 7 223826 CASAVA_Build 4 175622269 2D TCCTTGACTC AT/-- GTGGATATGG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 AT 1 0 223827 CASAVA_Build 4 175624167 1D TAAATTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 10 9 223828 CASAVA_Build 4 175625081 22D AATCACTACT CTGTGTGTGAAATAATTTCACA/---------------------- CTGTGTGTGA 3070 hom 111 het 39 0 38 7 CTGTGTGTGAAATAATTTCACA 1 0 223829 CASAVA_Build 4 175629950 1D AGGGGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 1140 het 1140 ref 31 19 6 6 T 13 12 223830 CASAVA_Build 4 175633090 6D TGAAGCGTCG TGGAGA/------ TGGAGAAGGG 3070 hom 75 het 28 0 24 8 TGGAGA 2 1 223831 CASAVA_Build 4 175640000 4D TATTATCCAC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 TA 9 7 223832 CASAVA_Build 4 175644320 3I ATGCATAGGC ---/TGT TAGTTACATG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TGT 0 1 223833 CASAVA_Build 4 175644574 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 6 223834 CASAVA_Build 4 175647776 1D TTTTCTCAAT G/- TCTACGTATT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 G 1 0 223835 CASAVA_Build 4 175656442 1D TTAATTGAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 9 8 223836 CASAVA_Build 4 175665946 1D GATGTACGAG T/- TAAGGAATGT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 2 1 223837 CASAVA_Build 4 175667995 1D CATGTGTCAA T/- TTGACAGTAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 T 3 2 223838 CASAVA_Build 4 175668942 2D TGCATTTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 809 hom 26 2 12 12 A 14 12 223839 CASAVA_Build 4 175671187 1D AAAATGCATA T/- TTTTTTTTTT 1298 het 1298 ref 26 20 3 3 T 12 11 223840 CASAVA_Build 4 175674037 1I ACACACCCAT -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 71 het 45 1 37 7 A 6 7 223841 CASAVA_Build 4 175689038 1D TCTTAATATG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 8 7 223842 CASAVA_Build 4 175695537 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2007 het 2007 ref 32 12 8 12 T 12 13 223843 CASAVA_Build 4 175710528 1D TCTCAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 0 223844 CASAVA_Build 4 175711135 2D ACATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 266 hom 30 2 17 12 AT 8 7 223845 CASAVA_Build 4 175713707 1D GTTCTGAATC G/- AAAGTGTGGC 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 G 1 0 223846 CASAVA_Build 4 175716004 1D GGGTTGCACT A/- ATAAACTGCC 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 2 1 223847 CASAVA_Build 4 175720486 1I GGTACAGATA -/T TTTTTTCTCA 2276 het 2276 ref 22 11 5 6 T 6 7 223848 CASAVA_Build 4 175726665 1I GGTGAAACAC -/T TGTCACTACA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 1 2 223849 CASAVA_Build 4 175730990 5I GTGGTTTTCT -----/ATTAC ATTACATCTT 3070 hom 93 het 41 0 32 9 ATTAC 1 2 223850 CASAVA_Build 4 175733946 1I TTTTAAAGAA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 223851 CASAVA_Build 4 175759544 2D TCATTTTAAT AG/-- AGTCTTTTGA 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 AG 2 1 223852 CASAVA_Build 4 175764220 1D TGTACAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 33 0 24 9 T 12 11 223853 CASAVA_Build 4 175767747 1D TGGTTTGCCT A/- AAAAAAAAAA 1273 het 1273 ref 37 31 4 2 A 11 10 223854 CASAVA_Build 4 175785428 1D GGATATGTGC A/- ATATTAACAT 3070 hom 157 het 61 0 53 9 A 2 1 223855 CASAVA_Build 4 175785618 1I TTGGATACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 25 20 10 T 12 13 223856 CASAVA_Build 4 175789626 1D TAACACTGAA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 45 15 24 7 T 8 7 223857 CASAVA_Build 4 175795108 1I CACTCTATTT -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 C 8 9 223858 CASAVA_Build 4 175800060 1D TTGTTTTCTT A/- ATCTTTAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 2 1 223859 CASAVA_Build 4 175801118 42I AAACTATTGG ------------------------------------------/TTTTTATTATCTTTATAATTTCCCCCTTTTCCTTTCATAAAA TTTACTGTGC 3070 het 3070 hom 32 13 19 6 TTTTTATTATCTTTATAATTTCCCCCTTTTCCTTTCATAAAA 0 1 223860 CASAVA_Build 4 175802132 1D15M1I ATAAACTAGA TTTTTTTTTTTGCATT-/-TTTTTTTTTTGCATTA TTTTTTTAAA 3070 hom 52 het 29 0 20 18 N/A 0 0 223861 CASAVA_Build 4 175802589 1D AAATTTAAAT A/- AAAAATTATT 2995 het 2449 hom 14 7 7 0 A 6 5 223862 CASAVA_Build 4 175810308 1I TAAAACTGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 16 16 11 A 9 10 223863 CASAVA_Build 4 175812087 5D AAACATAAGC AAATA/----- AAATAAAGTT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 AAATA 2 1 223864 CASAVA_Build 4 175817372 1D TTTTGAAATA T/- TTTTTGACTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 6 5 223865 CASAVA_Build 4 175818221 1D TCCACAGTGC A/- TCATATCAGG 3070 het 3070 ref 46 20 21 6 A 1 0 223866 CASAVA_Build 4 175841923 1D AGCTATTGTA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 4 3 223867 CASAVA_Build 4 175851792 1D ACCTACCACA G/- GGGGCATTGA 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 G 5 4 223868 CASAVA_Build 4 175870716 2D AGTATATTAC AT/-- GTGAGTGTGT 3070 het 3070 hom 38 10 20 9 AT 1 0 223869 CASAVA_Build 4 175872122 5D CAAATTTTAA TTTAT/----- TTTATTTCCT 3070 het 3070 hom 25 10 14 3 TTTAT 2 1 223870 CASAVA_Build 4 175874940 1D CTTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1531 het 967 hom 8 3 4 1 A 14 13 223871 CASAVA_Build 4 175875091 4I GAAAGAAGGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 3070 het 2980 hom 32 9 16 7 AAGG 3 4 223872 CASAVA_Build 4 175877702 4D CAAGTAAACT TTAG/---- TTATTTTCAC 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 TTAG 1 0 223873 CASAVA_Build 4 175879220 4I ATATATAAAC ----/ACTT AAGTAATAAT 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 ACTT 0 1 223874 CASAVA_Build 4 175881775 2D TATATATATT TG/-- TGTGTGTGTG 2617 het 2617 ref 26 11 12 3 TG 7 6 223875 CASAVA_Build 4 175886449 1D TGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 11 10 223876 CASAVA_Build 4 175892897 1D TTTCAGCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 10 9 223877 CASAVA_Build 4 175895265 2I TTGTTGAGAC --/AG AGTCTCTCTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AG 1 2 223878 CASAVA_Build 4 175911690 1I AGGATACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 10 11 223879 CASAVA_Build 4 175915750 1I CCCTCTCTCT -/C TTTCCTGTAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 0 1 223880 CASAVA_Build 4 175917047 1D ATGAAGTGTT A/- AAAAATAACT 3070 het 3070 ref 34 17 17 0 A 6 5 223881 CASAVA_Build 4 175918253 1D TACACAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2889 hom 24 7 10 7 T 12 11 223882 CASAVA_Build 4 175922915 1I AAGTCTGGCT -/A AAATTGTTAA 3070 het 3070 ref 52 33 17 2 A 3 4 223883 CASAVA_Build 4 175923670 1D GGGAAACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 11 10 223884 CASAVA_Build 4 175928334 2D AACATAGGAA TG/-- TCTAGAACAC 3070 het 3070 hom 33 12 19 5 TG 1 0 223885 CASAVA_Build 4 175931040 2I CGTTTAGATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 11 12 T 12 14 223886 CASAVA_Build 4 175931194 4D GCAAGTAAGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 7 AAAC 3 2 223887 CASAVA_Build 4 175931424 1I AAAATCCAGA -/T TTTTAAATTA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 T 4 5 223888 CASAVA_Build 4 175931867 3D ACTTGTGTAA AAG/--- AAGAAGTAGC 3070 het 3070 hom 41 19 19 5 AAG 3 2 223889 CASAVA_Build 4 175932203 9I ATCAGGTAAT ---------/CAAAGTAAA CATAACCTGT 3070 het 3070 hom 48 22 25 1 CAAAGTAAA 0 1 223890 CASAVA_Build 4 175933622 3D ATGGAAAAAA AAT/--- AATAATTAGT 3070 het 3070 hom 36 13 21 4 AAT 3 2 223891 CASAVA_Build 4 175942208 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 A 10 11 223892 CASAVA_Build 4 175980978 1I TCAAAAAAAA -/C AATGTATTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 223893 CASAVA_Build 4 175984601 1D GGGAGCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 36 4 18 14 T 15 14 223894 CASAVA_Build 4 175994491 2D CCCAGAAATC TG/-- GTAGAAACAA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 TG 1 0 223895 CASAVA_Build 4 175995196 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAAGAAAGA 3070 hom 46 het 17 0 14 3 AAG 0 1 223896 CASAVA_Build 4 176001648 1D ACCTTAGGGA C/- CTAATTCAGC 3070 hom 99 het 35 0 34 4 C 2 1 223897 CASAVA_Build 4 176005619 19I AATTCAGCCT -------------------/GTTTTCCTAGTGAAGAATA TTTTTCATAT 3070 hom 81 het 27 0 28 2 GTTTTCCTAGTGAAGAATA 0 1 223898 CASAVA_Build 4 176006341 3D AATAACAGCT TTA/--- TTGAGATATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTA 1 0 223899 CASAVA_Build 4 176008667 3D GATTTCTACC TTT/--- TAAGTATTTC 3070 hom 93 het 32 0 32 2 T 4 1 223900 CASAVA_Build 4 176012215 4I CACTTCATGT ----/GTGA GTATCTTATA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GTGA 0 1 223901 CASAVA_Build 4 176012669 1D44M2D CTCTCTTCTT GGCTTGCATGGTTTCTGAAGGGAAGTCAGATGTAACTATTATCTCTG/-GCTTGCATGGTTTCTGAAGGGAAGTCAGATGTAACTATTATCTC-- TTCCTCTACA 3070 hom 84 het 26 0 29 8 N/A 0 0 223902 CASAVA_Build 4 176015096 2D29M2I TGTTGGGGGT GGGGGGGGGGTTGCACCGTAACTGGGTTCCC--/--GGGGGTGGTTGCACCGTAACTGGGTTCCCCT GTTTTTAACT 3070 hom 135 het 40 0 45 6 N/A 0 0 223903 CASAVA_Build 4 176016036 1D AAAATTAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 9 8 223904 CASAVA_Build 4 176018097 1I CCCCTTAGAC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 6 7 223905 CASAVA_Build 4 176020534 2D ACTTAGAAAG AA/-- TGATACATAA 3070 hom 96 het 35 0 33 4 A 2 0 223906 CASAVA_Build 4 176021034 1I GTATTGCCTG -/C CCCTGGCATT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 3 4 223907 CASAVA_Build 4 176021802 49I GATGGTGAAT -------------------------------------------------/TCTGTCACCTAAGTGTTAGATAGCGGGGAGGAAGTAAGGAACAGCACAA TCCTGCCTGT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TCTGTCACCTAAGTGTTAGATAGCGGGGAGGAAGTAAGGAACAGCACAA 0 1 223908 CASAVA_Build 4 176021834 34I GGAGGGTGAG ----------------------------------/TGGTGAGGAGTAAGATTGAAATAAACTACACAAA TGGTGTCTTG 3070 hom 39 het 11 0 14 0 TGGTGAGGAGTAAGATTGAAATAAACTACACAAA 0 1 223909 CASAVA_Build 4 176027698 1I AACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 24 1 21 2 A 13 14 223910 CASAVA_Build 4 176031828 2D ACCAGAATCA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 11 9 223911 CASAVA_Build 4 176037468 1I GAGCTGGAAG -/T TATTGAAAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 2 223912 CASAVA_Build 4 176038212 1D ATTTGAAATA G/- TACAGCATAA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 1 0 223913 CASAVA_Build 4 176038583 4I GACAAAGTAT ----/ACAG ACAAACATTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ACAG 0 1 223914 CASAVA_Build 4 176040072 1I AAAAGTTTAT -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 1 2 223915 CASAVA_Build 4 176040864 4I TTTTATAAAC ----/AATT AATTTTGTAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AATT 1 2 223916 CASAVA_Build 4 176054784 1I CTACGTAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 T 9 10 223917 CASAVA_Build 4 176055323 1D ATAACAGAGC T/- TTTTTTTTTT 2353 hom 13 het 14 0 7 7 T 12 11 223918 CASAVA_Build 4 176065301 4D TTTTTTTTTT TTTA/---- AATTTCTGAA 3070 hom 92 het 38 0 32 6 TTTA 1 0 223919 CASAVA_Build 4 176071227 6I ATCTAATATG ------/GGCTCA GTTTGTAGTG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 GGCTCA 0 1 223920 CASAVA_Build 4 176076474 1I CTCTAAATTT -/A AAAAAAAAGA 2816 het 2816 ref 27 13 10 4 A 8 9 223921 CASAVA_Build 4 176083076 2D ATACATGAAA CT/-- CTGTGCTATC 3070 hom 87 het 40 0 30 10 CT 2 1 223922 CASAVA_Build 4 176088728 2I GTACAAAACA --/TG TTCTCCCTGC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TG 0 1 223923 CASAVA_Build 4 176101555 1D AAAAAAAAAA G/- GAAGTCGTTC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 2 1 223924 CASAVA_Build 4 176103028 1D TCTTTTGAAA G/- GGTGTCTGCT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 G 3 2 223925 CASAVA_Build 4 176135319 3D TTTGTTTATT TTA/--- TTATGTTGTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 TTA 2 1 223926 CASAVA_Build 4 176157473 1I61M1D CTTTTTTATG -TTTTTTTCTTGTAAATTTATTTAAGTTCCTTATAGGTGCTGTATAGCAGACCTTCATCAGGT/TTTTTTTTCTTGTAAATTTATTTAAGTTCCTTATAGGTGCTGTATAGCAGACCTTCATCAGG- GCATAGTTTG 3070 hom 105 het 24 0 36 7 N/A 0 0 223927 CASAVA_Build 4 176159620 1D CTAATTTTTT A/- AAAAATTTGG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 6 5 223928 CASAVA_Build 4 176168727 1I TCTCAAAATA -/T TTTTAAATTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 4 5 223929 CASAVA_Build 4 176173257 1I TGTATCTTTG -/C CCCCAAACAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 4 5 223930 CASAVA_Build 4 176183473 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 22 1 20 1 A 11 10 223931 CASAVA_Build 4 176184387 1D TAGGTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 36 2 17 20 T 12 11 223932 CASAVA_Build 4 176190018 4I53M1D TGCCATCATC ----TTTTCTTGGTGACAAATTTTGTAATATGGTGTTAAGATGAGCTTTTTATCAGGA/TTAATTTTCTTGGTGACAAATTTTGTAATATGGTGTTAAGATGAGCTTTTTATCAGG- AACCTAGGTA 3070 het 3070 ref 43 33 12 12 N/A 0 0 223933 CASAVA_Build 4 176190337 1I ATATTGATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 9 10 223934 CASAVA_Build 4 176197719 4D TTCCGTATTT ATAA/---- ATAGAGTAAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 ATAA 1 0 223935 CASAVA_Build 4 176231595 1I GTGCTCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 13 14 223936 CASAVA_Build 4 176247885 1D TTATTTGAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 10 9 223937 CASAVA_Build 4 176254420 1I GATTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 24 0 21 3 A 10 11 223938 CASAVA_Build 4 176268070 1I AACTGAACAC -/A AGACACCACT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 1 2 223939 CASAVA_Build 4 176269168 1I ATCACCAGTA -/G GATCAGCCGT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 G 1 2 223940 CASAVA_Build 4 176271500 1I TCTTCAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1196 hom 28 3 19 6 A 10 11 223941 CASAVA_Build 4 176271855 1D AAGTCTAGAT A/- AAAAAAACAT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 A 8 7 223942 CASAVA_Build 4 176273666 1I AACTAAAAAC -/A AAAAACCACA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 5 6 223943 CASAVA_Build 4 176275879 1I AGCTCGAAAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 7 8 223944 CASAVA_Build 4 176283195 4D TAAAAATTAT AAGA/---- AAGTGAAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AAGA 1 0 223945 CASAVA_Build 4 176284084 1I ATGATCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 10 11 223946 CASAVA_Build 4 176284993 2D ATTCACATTG AT/-- ATTTGGCATC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AT 2 1 223947 CASAVA_Build 4 176287048 1I GACTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1264 hom 12 het 9 0 5 4 T 11 12 223948 CASAVA_Build 4 176290738 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 0 1 223949 CASAVA_Build 4 176300975 2I CTATATTGAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 10 12 223950 CASAVA_Build 4 176306179 2I AGAAATAAAA --/AT AGTTAGTTTA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 AT 0 1 223951 CASAVA_Build 4 176312525 3D ATGCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 27 0 16 11 A 18 15 223952 CASAVA_Build 4 176318893 1D CCTCCAGAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 26 0 18 9 T 10 9 223953 CASAVA_Build 4 176319042 1I TCAACTTTTG -/A AAAAAAGTCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 7 223954 CASAVA_Build 4 176322254 1I ATTTTGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 23 6 A 13 14 223955 CASAVA_Build 4 176329639 10I TTAAATTAAA ----------/ACGGTATGTT TTCATTTAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ACGGTATGTT 0 1 223956 CASAVA_Build 4 176330529 11I TGTATGTTGC -----------/CTTTTTTTTTT CTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 CTTTTTTTTTT 1 2 223957 CASAVA_Build 4 176340748 1D CAGTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1279 hom 44 6 18 20 T 15 14 223958 CASAVA_Build 4 176342882 4I TGCTTGTTGA ----/TTTG TTTAAGTCAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTG 0 1 223959 CASAVA_Build 4 176344689 1D ATTCTAGAAA G/- GGAAGTAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 3 2 223960 CASAVA_Build 4 176345063 2D TATATATATA TG/-- TGTGATTACA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TG 3 2 223961 CASAVA_Build 4 176358295 2D CTAATTTTTG TA/-- TGTTTTTGTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TA 1 0 223962 CASAVA_Build 4 176358842 2I AATAGCACAC --/AT ATGTTTAACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AT 1 2 223963 CASAVA_Build 4 176359200 1D CTTACTACCA T/- TTTTTAAAAG 3070 hom 98 het 41 0 32 9 T 6 5 223964 CASAVA_Build 4 176359419 1D TCTTTTTCCA G/- GTATGGGAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 2 1 223965 CASAVA_Build 4 176362227 1I ACAAAGCAAT -/A AAAAAGTTGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 5 6 223966 CASAVA_Build 4 176369308 3I GAGGGCAGAC ---/ACA AGTGTTTATC 3070 hom 165 het 64 0 55 9 ACA 0 1 223967 CASAVA_Build 4 176394332 2D CTTTCTGTTT AA/-- GTGTCTTGAA 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 A 2 0 223968 CASAVA_Build 4 176395074 1D AAAATTATTT C/- CCCCCCAAAG 3070 hom 99 het 34 0 33 2 C 7 6 223969 CASAVA_Build 4 176399615 1I ATGCTATAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 9 10 223970 CASAVA_Build 4 176402095 1I TGAATACACA -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 T 6 7 223971 CASAVA_Build 4 176402613 1I TATTTGTCAA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 7 8 223972 CASAVA_Build 4 176403301 1D GGATGTGCAA G/- AAGCATGACG 3070 hom 75 het 29 0 26 5 G 1 0 223973 CASAVA_Build 4 176403985 4D GCCCAGCTAA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TTTG 5 4 223974 CASAVA_Build 4 176410931 1I CTGCCGCCAT -/G GGGTCAGAGC 3070 hom 95 het 37 0 30 7 G 3 4 223975 CASAVA_Build 4 176425219 1D AACATGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 643 hom 48 6 23 22 A 17 16 223976 CASAVA_Build 4 176428057 1I TCAGGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 35 1 22 12 A 11 12 223977 CASAVA_Build 4 176437514 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 158 hom 39 1 32 7 A 11 10 223978 CASAVA_Build 4 176438311 1D TTAACCCTGA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 1512 hom 40 17 17 6 C 1 0 223979 CASAVA_Build 4 176438608 2D TTCTCTCAGC CT/-- CTCTTGCCCA 3070 het 3070 hom 48 19 25 5 CT 3 2 223980 CASAVA_Build 4 176441433 1I GGGTGAAGTT -/A GGGGTACATT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 A 0 1 223981 CASAVA_Build 4 176451392 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2268 het 102 hom 15 1 6 8 T 17 16 223982 CASAVA_Build 4 176454648 1D GTTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 10 9 223983 CASAVA_Build 4 176455971 1I AAGAGATCTT -/A AGAGTGTCTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 1 2 223984 CASAVA_Build 4 176468051 1D63M5I TTTCTTTTTG TTTTTTTTTTGCGAAAACATCAGAAGATATAACATCCACTTTTATCATGATTTCTTCTTTTATC-----/-TTTTTTTTTGCGAAAACATCAGAAGATATAACATCCACTTTTATCATGATTTCTTCTTTTATCTTAAT TTATTTTTGT 3070 het 345 hom 43 1 52 4 N/A 0 0 223985 CASAVA_Build 4 176471338 2D TCAAATCTGC TG/-- TGTTTGTAGA 3070 hom 120 het 45 0 39 7 TG 2 1 223986 CASAVA_Build 4 176482682 1D TTAGAGAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 10 9 223987 CASAVA_Build 4 176516167 1I CACTTCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1130 hom 32 4 19 9 T 14 15 223988 CASAVA_Build 4 176544032 4D AAGTATATAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TA 10 8 223989 CASAVA_Build 4 176547149 4I TCTACAAGAG ----/CTAA CTATCTTAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 CTAA 0 1 223990 CASAVA_Build 4 176547545 1I AGAAACTCAC -/T CCAAACCACA 3070 hom 77 het 29 0 26 3 T 0 1 223991 CASAVA_Build 4 176547905 1I CCAGGAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 906 hom 21 2 12 7 T 10 11 223992 CASAVA_Build 4 176553841 1I44M1I GTGAGCCATT -AAAAAATAAAGGTAGTTATCTGGTATTTGAGTGAAAGAAAAAAA-/AAAAAAATAAAGGTAGTTATCTGGTATTTGAGTGAAAGAAAAAAAT GGGTTCCAAA 3070 hom 137 het 36 0 46 10 N/A 0 0 223993 CASAVA_Build 4 176555183 3D CCATGTTATA TAG/--- TAGATCATCA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TAG 2 1 223994 CASAVA_Build 4 176558190 1I GACAATTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1055 hom 17 3 11 3 A 13 14 223995 CASAVA_Build 4 176567906 3D ACGCATGGGC ACA/--- ACAACATGCA 3070 hom 104 het 37 0 33 4 ACA 3 2 223996 CASAVA_Build 4 176570005 1D CCTCATATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 10 9 223997 CASAVA_Build 4 176577145 1I AGCCAATGAT -/A ACTATATTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 2 223998 CASAVA_Build 4 176577665 1I ACAGAGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 723 hom 48 2 38 8 T 10 11 223999 CASAVA_Build 4 176580253 3D TCATTTTAAG CTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 115 het 49 0 35 15 CTT 1 0 224000 CASAVA_Build 4 176586508 24D AGCGCTCTGT CAAAACGGACCAATCAGCACCCTG/------------------------ CAAAACGGAC 3070 hom 45 het 25 0 14 14 CAAAACGGACCAATCAGCACCCTG 1 0 224001 CASAVA_Build 4 176602103 1I TTTTAAGTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 8 9 224002 CASAVA_Build 4 176602485 1D GGTGCAAAGC A/- AAAGCAAGTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 4 3 224003 CASAVA_Build 4 176611854 1D TTCCTGGCTA G/- GGGGGGTCAC 3070 hom 87 het 34 0 28 7 G 7 6 224004 CASAVA_Build 4 176617359 3D TTTCTAATAT TAG/--- TAGCTTATCT 3070 hom 111 het 43 0 38 7 TAG 2 1 224005 CASAVA_Build 4 176637836 1D AAATTTCTGA T/- GTATAAAATG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 1 0 224006 CASAVA_Build 4 176656155 1D TTCTTACAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 10 9 224007 CASAVA_Build 4 176656229 2I TTTCAATTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 GT 7 8 224008 CASAVA_Build 4 176664360 1D AAAAGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3004 het 3004 ref 29 16 10 3 T 12 11 224009 CASAVA_Build 4 176666104 3D GTGAATAGTG CCA/--- CAATAAACAT 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 CCA 1 0 224010 CASAVA_Build 4 176675320 2I CATTTAATCC --/AT ATATATATAT 2150 het 2150 ref 25 12 6 7 AT 7 8 224011 CASAVA_Build 4 176690329 1D TAACTAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 29 1 24 4 A 11 10 224012 CASAVA_Build 4 176695701 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 11 224013 CASAVA_Build 4 176698395 6D ACTTTGAAAA GAAAAC/------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 7 GAAAAC 1 0 224014 CASAVA_Build 4 176703197 11D GGATTCTTTT CAGGGTCAATG/----------- CACTAGTTGA 3070 het 3070 hom 39 19 22 3 CAGGGTCAATG 1 0 224015 CASAVA_Build 4 176707550 1I GTCATAGTTC -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 7 224016 CASAVA_Build 4 176709341 3D TTGGAAATAA TAT/--- TATTACAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 20 6 TAT 2 1 224017 CASAVA_Build 4 176710337 2D GCCCTCGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 A 13 11 224018 CASAVA_Build 4 176714083 1I TTTTTAAGCT -/C CCCCCATGTG 3070 het 3070 ref 55 25 24 6 C 5 6 224019 CASAVA_Build 4 176716086 1I TCCCAGCTCA -/T TTTTTTGTAT 1208 het 1208 ref 14 7 3 4 T 6 7 224020 CASAVA_Build 4 176718523 4D ACAAAGAAAT AAAG/---- AGTGAGAAAG 3070 het 2013 hom 20 5 14 2 AAAG 1 0 224021 CASAVA_Build 4 176718648 5I AAGAAGAAAG -----/AAAGA AAAGAAAGAA 3070 hom 33 het 16 0 12 5 AAAGA 1 2 224022 CASAVA_Build 4 176724499 1D TGCTATCATA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 7 6 224023 CASAVA_Build 4 176725110 2D ACAAACAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 AC 6 5 224024 CASAVA_Build 4 176731354 14I TTATGACTTT --------------/GCTATTGTGAATAG TGCTATGATA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 GCTATTGTGAATAG 0 1 224025 CASAVA_Build 4 176739008 3D TTTTTGTTTT TTA/--- TTATTATACT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 TTA 3 2 224026 CASAVA_Build 4 176747552 1D TTTCTTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 28 0 20 8 T 10 9 224027 CASAVA_Build 4 176773864 1I AAAGTAAATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 9 10 224028 CASAVA_Build 4 176781011 1I CCCTTTTTTT -/C TTTTCTGGGA 3070 het 2615 hom 36 13 16 7 C 0 1 224029 CASAVA_Build 4 176782091 1I TTGTATTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 11 12 224030 CASAVA_Build 4 176784545 1I AATTTAGAAA -/G GGTGGGAGGA 3070 hom 96 het 36 0 30 6 G 2 3 224031 CASAVA_Build 4 176786458 1I TTTGAAAGGG -/A AAAAATGCTG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 5 6 224032 CASAVA_Build 4 176804775 1D GTTGAAAATG A/- AACCAACCCA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 A 3 2 224033 CASAVA_Build 4 176809508 2D TTATTTAGCG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 11 9 224034 CASAVA_Build 4 176816561 1I GCCAAGTGTA -/G GGGGGGGTGA 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 G 7 8 224035 CASAVA_Build 4 176847592 1I ATTTATAGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 T 11 12 224036 CASAVA_Build 4 176870063 1I ACAAGAACAG -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 T 6 7 224037 CASAVA_Build 4 176872735 2D TCTCCACAGC TA/-- TCATATGAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 TA 1 0 224038 CASAVA_Build 4 176874634 2I AAGAAGAAAC --/TG TTGTTGTGCA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 TG 0 1 224039 CASAVA_Build 4 176881033 2I CAAAGAAATT --/AA AAAAAAAAAA 2906 het 27 hom 19 1 10 8 A 12 14 224040 CASAVA_Build 4 176883441 1D TGGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 23 1 18 4 T 14 13 224041 CASAVA_Build 4 176884305 1D GACCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1896 hom 15 het 6 0 6 0 T 13 12 224042 CASAVA_Build 4 176890344 1D TCTCCTGACC T/- CGTGATCCGC 1987 het 329 hom 9 2 6 1 T 1 0 224043 CASAVA_Build 4 176892713 1D TTTACTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 12 0 A 12 11 224044 CASAVA_Build 4 176907357 1D CCAAAAAAAA G/- GTAATGGCAA 2451 het 2451 ref 20 10 6 5 G 2 1 224045 CASAVA_Build 4 176939276 1D GCACAGTAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 10 9 224046 CASAVA_Build 4 176941104 1D TAGAAATCTG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 8 7 224047 CASAVA_Build 4 176941913 1D GACAAAAAAA T/- AGAAAAATAA 3070 het 373 hom 30 1 29 0 T 1 0 224048 CASAVA_Build 4 176952991 1I GCCATATTAT -/A AAGGGCTTGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 2 3 224049 CASAVA_Build 4 176955130 3D ATGCCATTCT TTG/--- TTGTTTTTAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTG 2 1 224050 CASAVA_Build 4 176959514 3I TAGGTAATAA ---/TAT TATAGGTATA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TAT 1 2 224051 CASAVA_Build 4 176975014 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 27 0 17 10 T 10 9 224052 CASAVA_Build 4 176975787 1I GAAATTAGAT -/G GGGAAAAAAG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 3 4 224053 CASAVA_Build 4 176980807 2I TTTTTTTTTT --/TG GTTTTTTGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TG 0 1 224054 CASAVA_Build 4 176987627 1D AAAGTCAGTT A/- AACAGTGAAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 2 224055 CASAVA_Build 4 176987794 2D CATTTATGTA AT/-- ATATATATAT 2699 hom 18 het 8 0 6 2 AT 8 7 224056 CASAVA_Build 4 176990276 4I TCCCTGGCTC ----/TTTG TTTGGTTCTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 TTTG 1 2 224057 CASAVA_Build 4 176990670 1D GAAGTAAACG T/- TATCTACCCA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 2 1 224058 CASAVA_Build 4 176992297 1I TACTCAACTG -/T TTTATTTGCC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 3 4 224059 CASAVA_Build 4 177057917 1I AATCTACCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2859 hom 28 8 12 8 A 9 10 224060 CASAVA_Build 4 177058650 10D GGCAAAAAAA AAAGCATATG/---------- AAAAAGTGCT 86 het 86 ref 25 13 2 10 AAAGCATATG 1 0 224061 CASAVA_Build 4 177061431 1D TAATTCATTG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 8 224062 CASAVA_Build 4 177076001 2I AGCCTTATAA --/GT GTCAATGTGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GT 1 2 224063 CASAVA_Build 4 177079665 1D ATTCCCAAAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 8 7 224064 CASAVA_Build 4 177086097 1D TTCTACTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 39 0 32 8 T 9 8 224065 CASAVA_Build 4 177088586 2D GGGGTTTTTT TG/-- TTGTTGTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TG 1 0 224066 CASAVA_Build 4 177096883 2I AAGTAAAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 A 12 14 224067 CASAVA_Build 4 177098448 2I CACAGAAAAC --/TT TTACCTATAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 4 224068 CASAVA_Build 4 177105333 1D CAGAGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 13 12 224069 CASAVA_Build 4 177111171 1I CAAGACCCTG -/T TTTTTAAAAA 2339 het 345 hom 31 1 13 17 T 5 6 224070 CASAVA_Build 4 177134132 1D TGCTAGGAAT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 224071 CASAVA_Build 4 177156295 1I CTATTACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 T 11 12 224072 CASAVA_Build 4 177157054 22I CTACCTCCTA ----------------------/TCATGTAAATTCTAAATTCCTC TCATTGCTTT 3070 hom 108 het 42 0 36 8 TCATGTAAATTCTAAATTCCTC 0 1 224073 CASAVA_Build 4 177162107 1D ACCGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2552 het 2552 ref 33 10 10 13 A 15 14 224074 CASAVA_Build 4 177164914 1I GCAGAGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 33 2 26 5 A 10 11 224075 CASAVA_Build 4 177165523 2I TTTACAAGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 27 1 20 6 T 16 18 224076 CASAVA_Build 4 177166300 3I GCAATTTAAC ---/ATA ATAATTATAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 ATA 1 2 224077 CASAVA_Build 4 177174731 1D TTGGTTGCAT C/- CAAGTTTAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 1 224078 CASAVA_Build 4 177175477 5I GGCAAGATAT -----/TATGA TATATGATCA 3070 hom 132 het 53 0 45 9 TATGA 0 1 224079 CASAVA_Build 4 177183892 1D GCTACTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 13 12 224080 CASAVA_Build 4 177199066 3D CCTGGGCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTG 5 4 224081 CASAVA_Build 4 177201752 23D TTAGGGGGCC ACTGCTCAGCTCCCAATTCCTGG/----------------------- ACTGCATGCG 3070 hom 78 het 24 0 24 4 ACTGCTCAGCTCCCAATTCCTGG 1 0 224082 CASAVA_Build 4 177211843 2I GTCTCATAAG --/AA AAAAAAAAAA 1899 het 1899 ref 25 15 6 4 A 10 12 224083 CASAVA_Build 4 177212377 2I AACACACTGA --/CT CTGCCATTCC 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 CT 1 2 224084 CASAVA_Build 4 177217548 1I GTAAATAAAG -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 7 8 224085 CASAVA_Build 4 177218814 1I CAATTGAACT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 8 9 224086 CASAVA_Build 4 177248402 1D TGGTTGTTTT A/- AAAAAAAAAA 2575 het 2575 ref 44 21 8 15 A 17 16 224087 CASAVA_Build 4 177327654 4D ATAAATGTGA ATGT/---- ATGTATTTAT 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 ATGT 2 1 224088 CASAVA_Build 4 177329919 1I CAGAAAAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 9 10 224089 CASAVA_Build 4 177334965 4D ATCCACTCAC TCAT/---- TTACTCATCC 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 TCAT 1 0 224090 CASAVA_Build 4 177337510 1D AAATATTATG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 9 8 224091 CASAVA_Build 4 177339338 1D CCATTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 12 11 224092 CASAVA_Build 4 177343004 4D CACATGTATT TCTC/---- TATGTGAACT 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 TC 2 0 224093 CASAVA_Build 4 177347605 1I AGAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 14 9 A 10 11 224094 CASAVA_Build 4 177349242 1D TATGTATAGA T/- TTTTTTTTTT 2289 het 543 hom 14 2 7 5 T 17 16 224095 CASAVA_Build 4 177352315 1D GTGTGCAAAG T/- GCAAGAGCAG 3070 hom 144 het 55 0 49 9 T 1 0 224096 CASAVA_Build 4 177352527 5D AGCCACAGTG TGTGA/----- TAAGTGCTTA 3070 hom 120 het 41 0 39 3 TGTGA 1 0 224097 CASAVA_Build 4 177359954 1D ATACTCCTAG C/- CTCAAGCCAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 2 1 224098 CASAVA_Build 4 177368861 4I GGAACTTTCC ----/TTCT TTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 46 19 16 11 TTCT 4 5 224099 CASAVA_Build 4 177380896 1D TAAACACTCG T/- TTTGTAGAAC 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 4 3 224100 CASAVA_Build 4 177381090 1I GCCGGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2275 het 1147 hom 11 4 5 2 T 7 8 224101 CASAVA_Build 4 177382680 1I GTGCCCAGCT -/A ATTTTTTTTT 2324 het 143 hom 12 2 6 4 A 1 2 224102 CASAVA_Build 4 177382849 1D CAGAAGCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 36 1 30 5 A 11 10 224103 CASAVA_Build 4 177383737 1I CCTTTTTAAA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 66 het 33 0 29 4 T 6 7 224104 CASAVA_Build 4 177387822 1D TGGGGACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 11 10 224105 CASAVA_Build 4 177389579 1D TCCTAACTTA T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 7 6 224106 CASAVA_Build 4 177401421 4D ATCAATTAGG TCTA/---- TCTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 20 14 1 TCTA 1 0 224107 CASAVA_Build 4 177404191 1D TAAAGTATAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 9 8 224108 CASAVA_Build 4 177408210 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1990 het 994 hom 19 8 7 4 A 17 13 224109 CASAVA_Build 4 177412683 1D AAGCAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 A 13 12 224110 CASAVA_Build 4 177421518 2D TTTGACAGAG TC/-- TTTTCTAAAC 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 TC 1 0 224111 CASAVA_Build 4 177427790 1I TTACTGATTT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 7 8 224112 CASAVA_Build 4 177437201 1D CATTTGGGGG A/- AAAAACCCTC 3070 het 3070 hom 38 11 20 8 A 6 5 224113 CASAVA_Build 4 177441537 1D AACCCAGATC T/- TTTATAGTGG 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 T 4 3 224114 CASAVA_Build 4 177446879 1D TAGGTTTAAG A/- AACTAGTATT 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 A 3 2 224115 CASAVA_Build 4 177531101 1D GATGCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 12 11 224116 CASAVA_Build 4 177531178 1D CACTGTAACC T/- CTGGCTCCCA 1869 het 1869 ref 15 10 5 0 T 1 0 224117 CASAVA_Build 4 177532869 1I TGAACAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 8 10 T 11 12 224118 CASAVA_Build 4 177534773 1I TAGGCTCTTG -/A GCAGGTGTGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 0 1 224119 CASAVA_Build 4 177537819 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2297 het 15 hom 17 1 9 7 A 17 16 224120 CASAVA_Build 4 177540601 1D TTTTGTTGTT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 8 7 224121 CASAVA_Build 4 177541125 1D TCATAATGTA T/- TGGAGTCAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 2 1 224122 CASAVA_Build 4 177543556 1D AAACACAGGG C/- CCAGGACAGG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 3 2 224123 CASAVA_Build 4 177547553 1D CTAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 11 10 224124 CASAVA_Build 4 177555149 1I CGGGGTTTCA -/C CCATGTTGGC 3070 hom 38 het 19 0 12 7 C 2 3 224125 CASAVA_Build 4 177556911 6D CATGCTGGCC AGGCTG/------ AGGCTGGTCT 3070 hom 37 het 15 0 10 5 AGGCTG 2 1 224126 CASAVA_Build 4 177559313 5D TTTTTAAAAA TTAAG/----- TTATGTACAT 3070 hom 87 het 36 0 29 8 TTAAG 1 0 224127 CASAVA_Build 4 177571824 1D CTTATCACTC T/- TATCCAGCGT 3070 hom 148 het 52 0 50 3 T 2 1 224128 CASAVA_Build 4 177579643 1D AGTCAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1201 hom 38 6 17 15 T 13 12 224129 CASAVA_Build 4 177581214 1D CTACACCCAC T/- TTTTAATATG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 5 4 224130 CASAVA_Build 4 177592860 16D CTTTCATTCC TTCCTTCCTTCTTTCA/---------------- TTCCTTCCTT 3070 hom 37 het 20 0 11 9 TTCCTTCCTTCTTTCA 1 0 224131 CASAVA_Build 4 177593013 1I CTTCCTTCCA -/T TTTTTTTTAA 1542 het 1542 ref 23 7 6 10 T 8 9 224132 CASAVA_Build 4 177604267 1D ATTAAGAGGT G/- GGGGGGTCTT 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 G 7 6 224133 CASAVA_Build 4 177604414 1I GGACTTTATG -/T TTTTTAATTA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 5 6 224134 CASAVA_Build 4 177614791 1I AACTTAAACT -/A AAAAAGCTTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 5 6 224135 CASAVA_Build 4 177615266 1D ATCCCAAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 A 9 8 224136 CASAVA_Build 4 177619434 1I TCATATGCAG -/A AGAATGAAAT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 A 1 2 224137 CASAVA_Build 4 177621367 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2473 het 1147 hom 14 6 6 3 T 11 10 224138 CASAVA_Build 4 177624612 3I TGCCAGCTGC ---/ATG ATATTTCATA 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 ATG 0 1 224139 CASAVA_Build 4 177627432 4D AAGTATAATA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 2710 hom 22 6 15 2 AAAT 4 3 224140 CASAVA_Build 4 177629242 1D TTAATCTATC T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 T 7 6 224141 CASAVA_Build 4 177637241 2I TAACTAAAAC --/TG AGATTTTCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TG 0 1 224142 CASAVA_Build 4 177638321 1I AAAATGCGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 8 9 224143 CASAVA_Build 4 177641525 1D TTCAGTATTT A/- GATGGTAACA 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 A 1 0 224144 CASAVA_Build 4 177643708 9D ACGTAGAGAG ATTCGTCAA/--------- ATGCTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 30 20 9 ATTCGTCAA 1 0 224145 CASAVA_Build 4 177646753 3D TAATGATTTG AAT/--- AGACATTTTT 3070 het 3070 hom 46 14 26 6 AAT 1 0 224146 CASAVA_Build 4 177654974 2D CTGTAAAGAC AT/-- ATATGCACAC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 AT 3 2 224147 CASAVA_Build 4 177658161 2D GACTAATCTC TT/-- ATAATTTTGA 3070 het 3070 hom 30 12 17 2 T 2 0 224148 CASAVA_Build 4 177660161 1D TTATTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 11 10 224149 CASAVA_Build 4 177664656 4D AGAAGACAGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2843 het 342 hom 29 3 7 20 TTTG 5 4 224150 CASAVA_Build 4 177669727 2I AGAGTGTGCG --/TA TATATATATA 3070 hom 42 het 23 0 15 8 TA 5 6 224151 CASAVA_Build 4 177670607 10I AAAGGATACG ----------/GAAGAACAGC TAGAGGGAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 GAAGAACAGC 0 1 224152 CASAVA_Build 4 177671347 2D CAAATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 29 0 25 8 TG 7 6 224153 CASAVA_Build 4 177674637 1D GAACAAGTTA C/- TCAACAACAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 1 0 224154 CASAVA_Build 4 177675965 1I GTACATAAAC -/T TTTTGAGAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 4 5 224155 CASAVA_Build 4 177680460 1I TTGCATCTAG -/A AATATATAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 2 3 224156 CASAVA_Build 4 177686536 1I AATGTGTAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 8 9 224157 CASAVA_Build 4 177694566 1D GGCTATCGTT C/- TTTTTAGAAT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 C 1 0 224158 CASAVA_Build 4 177695581 1I TTTAGAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 31 0 24 7 T 10 11 224159 CASAVA_Build 4 177700407 1I TACGAATTAC -/G GTTGCGCATT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 G 1 2 224160 CASAVA_Build 4 177718781 1D TCTTACTGGC A/- CTAATCTGTA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 1 0 224161 CASAVA_Build 4 177719414 2D ATACATATCC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 T 11 9 224162 CASAVA_Build 4 177726418 8D CACTTATATA TACAAATG/-------- TACATCCATT 2189 het 2189 ref 19 11 7 4 TACAAATG 1 0 224163 CASAVA_Build 4 177750811 1I ACTCCAGCCT -/G GGTGACAGAG 3070 hom 165 het 59 0 55 4 G 2 3 224164 CASAVA_Build 4 177753202 4D TATTCATATT TATC/---- TATCTACCTA 2651 het 352 hom 14 3 9 5 TATC 2 1 224165 CASAVA_Build 4 177761116 3D TTTATCTTTT TTC/--- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 23 8 8 7 TTC 1 0 224166 CASAVA_Build 4 177763019 2D ATTCTTTTCC AA/-- GAGATGATAT 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 A 2 0 224167 CASAVA_Build 4 177766886 4D AAGCTAAGCC CTGA/---- CTAAGTGGAA 3070 het 3070 hom 45 18 22 8 CTGA 1 0 224168 CASAVA_Build 4 177770913 1I TGTGATAATT -/A AATGATAGAA 3070 hom 55 het 33 1 32 0 A 2 3 224169 CASAVA_Build 4 177773849 2D TGTCAGGTTA TT/-- TTTGATGGTG 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 T 5 3 224170 CASAVA_Build 4 177777786 1D TCAATGAACT G/- GGGGGGAGTT 3070 hom 120 het 47 0 38 9 G 7 6 224171 CASAVA_Build 4 177780988 2D ATGTTTCCAA TG/-- TGTGTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 15 24 7 TG 3 2 224172 CASAVA_Build 4 177790627 1D TTTTAAGACC T/- TTTTTTTTTT 1798 het 1798 ref 33 19 4 11 T 13 12 224173 CASAVA_Build 4 177790665 1I12M1I GATTGGAGGA -TTTTTTTTTTCG-/TTTTTTTTTTTCGT TTTTTTTTTG 2049 het 2049 ref 26 15 5 7 N/A 0 0 224174 CASAVA_Build 4 177814052 1D GAATAATGCA T/- TTGATTCTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 3 2 224175 CASAVA_Build 4 177818081 1D CTGAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 2251 het 1627 hom 27 9 8 10 T 13 12 224176 CASAVA_Build 4 177822915 5I TTCCAATTAA -----/TCAGT TCAGTAGATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TCAGT 1 2 224177 CASAVA_Build 4 177824239 1D CCATCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1998 hom 21 7 9 5 A 13 12 224178 CASAVA_Build 4 177828501 5I GAAGATCAAT -----/AACTC AAAATGCCAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AACTC 0 1 224179 CASAVA_Build 4 177829459 2I CATGGAATAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 36 9 15 12 AC 7 8 224180 CASAVA_Build 4 177831021 54D8M6D CAGCTTTAAT ATTAGTGGTCATTCAAAATTGAAACATTGTAAAACAAAAATGTGTACACAAAAAATTATGTGCTAACT/------------------------------------------------------ATTATGTG------ GCCTGAAACA 3070 het 3070 hom 26 9 13 16 N/A 0 0 224181 CASAVA_Build 4 177832115 1I AAATGTGTAC -/G GAAGTAGTCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 1 2 224182 CASAVA_Build 4 177832896 13D AAATTCAAAT TTTATTTTCAAAG/------------- TTTATTTTCA 3070 het 3070 ref 24 13 9 5 TTTATTTTCAAAG 1 0 224183 CASAVA_Build 4 177835406 1I GTCTTGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 A 10 11 224184 CASAVA_Build 4 177836312 1D GGTGATATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 283 hom 29 2 12 15 A 11 10 224185 CASAVA_Build 4 177836822 1D ATTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 A 10 9 224186 CASAVA_Build 4 177840775 3D GGCAAAATCT TTG/--- TTTTAGTAAA 3070 het 3070 hom 24 9 9 7 TTG 1 0 224187 CASAVA_Build 4 177840838 2I CCAGCACTTT --/GG GAGGCCGACG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 1 3 224188 CASAVA_Build 4 177841083 1I CTATCTGAAG -/A AAAAAAAAAA 2419 het 1965 hom 29 8 11 10 A 15 16 224189 CASAVA_Build 4 177842076 3D CAATCTTAGC TCA/--- TCATTTGTGG 3070 hom 123 het 50 0 42 10 TCA 2 1 224190 CASAVA_Build 4 177848774 3D AAACAGTATC ATT/--- GTTTTTAAAA 3070 hom 148 het 50 0 50 2 ATT 1 0 224191 CASAVA_Build 4 177860477 1D GATTTATCCA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 7 224192 CASAVA_Build 4 177863126 1D TGTGGTCTAA C/- CACCTTATTA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 C 2 1 224193 CASAVA_Build 4 177864443 4I CTCCCTAATC ----/AATT AAAGATTTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AATT 0 1 224194 CASAVA_Build 4 177877459 1D CTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 9 8 224195 CASAVA_Build 4 177884565 1I CACCTTTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 9 224196 CASAVA_Build 4 177885807 2I AAGAAAATAT --/AA GAGACCCTGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 0 2 224197 CASAVA_Build 4 177887609 1I CACTGAAATT -/A AAAGAACCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 4 224198 CASAVA_Build 4 177894621 1D ATTAGTTCTA C/- TATAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 C 1 0 224199 CASAVA_Build 4 177900015 3D TTGTTTTTTT CTC/--- CTCCTCCTTC 3070 het 3070 ref 39 18 16 8 CTC 3 2 224200 CASAVA_Build 4 177915752 1D GAACATCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 35 1 25 9 A 12 11 224201 CASAVA_Build 4 177917887 1I TTTAAAAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 9 10 224202 CASAVA_Build 4 177921520 3I AACTATAGTT ---/ATA AACATGAATG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 ATA 0 1 224203 CASAVA_Build 4 177924751 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAGGAAAAGA 3070 het 153 hom 34 6 22 6 AC 1 0 224204 CASAVA_Build 4 177925114 1I GAAAAACAAG -/A AAAAAATCAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 6 7 224205 CASAVA_Build 4 177932285 5I ATTGCTAGGA -----/AAAAT AAAATAACAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAAAT 1 2 224206 CASAVA_Build 4 177932417 3D ATGAAACTGC ATA/--- ATAAATAAAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 ATA 2 1 224207 CASAVA_Build 4 177932959 2D AAGTATAATA AT/-- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 25 3 19 3 AT 1 0 224208 CASAVA_Build 4 177936543 1D CATATTTAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 44 0 35 10 A 10 9 224209 CASAVA_Build 4 177937830 1I48M1I TGCACATTTT -CCTATTGCACATAGGAAGGGAACTGCTAATGTCAGTGCGAAAGCAAAG-/CCCTATTGCACATAGGAAGGGAACTGCTAATGTCAGTGCGAAAGCAAAGC CCCCCAGATA 3070 het 15 hom 34 1 39 11 N/A 0 0 224210 CASAVA_Build 4 177942011 1I TTGTCAGTAA -/G TTTATAATTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 224211 CASAVA_Build 4 177942214 5I ACATGCTGTT -----/TTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 33 1 23 9 TTTTG 0 1 224212 CASAVA_Build 4 177943785 1I TCTCCTTCTC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 117 het 46 0 40 7 T 8 9 224213 CASAVA_Build 4 177944137 3D GTCAAAAGTA ATC/--- ACCACTATCA 3070 hom 119 het 49 0 38 14 ATC 1 0 224214 CASAVA_Build 4 177949676 1D45M4D CATGACCAGA TTTTAGGAATGAAGAGCTTATAAAGTTGAAACAAGCCTTGCATTGCTTGA/-TTTAGGAATGAAGAGCTTATAAAGTTGAAACAAGCCTTGCATTGC---- TTGTGATCTA 3070 hom 111 het 32 0 37 8 N/A 0 0 224215 CASAVA_Build 4 177960491 1D GATATTGACA T/- TTTTACCTTT 3070 hom 126 het 46 0 43 4 T 5 4 224216 CASAVA_Build 4 177961468 3I GTTTGGCCAA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 11 14 224217 CASAVA_Build 4 177972589 14I TTACTTTTAA --------------/TGGCTTGATAAAAT TGGCTTGATA 3070 hom 111 het 42 0 36 7 TGGCTTGATAAAAT 0 1 224218 CASAVA_Build 4 177975889 10D CATATGTGCA TGATAGGAGC/---------- TGATAGGAGC 3070 hom 112 het 51 1 49 5 TGATAGGAGC 2 1 224219 CASAVA_Build 4 177977268 1D ATGTCCCAAT A/- AAAAGTATTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 5 4 224220 CASAVA_Build 4 177992427 2I GACAAGACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 13 15 224221 CASAVA_Build 4 177995030 13I AACTTTCCAT -------------/GGGAAAAAAATAC GGGAAAAAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 GGGAAAAAAATAC 1 2 224222 CASAVA_Build 4 178008961 1I TCCTTCCAGA -/G TGCAGTGCAG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 G 0 1 224223 CASAVA_Build 4 178009276 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 451 hom 32 2 26 4 A 8 9 224224 CASAVA_Build 4 178017568 1I AATAGTTCCA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 7 8 224225 CASAVA_Build 4 178025180 2D TATCATTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 26 2 21 3 T 19 17 224226 CASAVA_Build 4 178035800 6I TGCATGTGTG ------/TGTGTA TGTGTATGTG 3070 hom 99 het 48 0 34 14 TGTGTA 2 3 224227 CASAVA_Build 4 178039232 1I TCTTCGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 36 1 28 7 T 11 12 224228 CASAVA_Build 4 178039416 1D AAAAAGTAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 10 9 224229 CASAVA_Build 4 178039975 1D ATTTTACCAA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 9 8 224230 CASAVA_Build 4 178040343 5D TAATACAAGA AATAG/----- AATAGCATAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AATAG 2 1 224231 CASAVA_Build 4 178047242 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 461 hom 21 1 14 6 TA 6 5 224232 CASAVA_Build 4 178054794 1D GACTCTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 22 3 T 11 10 224233 CASAVA_Build 4 178055278 1I TTACAAATAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 224234 CASAVA_Build 4 178057903 1D TTTATATTAG T/- TTTTTTAGAG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 7 6 224235 CASAVA_Build 4 178060059 4D TCTCTCTCTC TCTA/---- TATATATATA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TCTA 1 0 224236 CASAVA_Build 4 178060518 3D AATTTATTAT TAC/--- TATTATTATA 2468 hom 21 het 9 0 8 1 TAC 1 0 224237 CASAVA_Build 4 178063391 1D TATACACACA T/- TTTTTTCACA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 7 6 224238 CASAVA_Build 4 178064560 1D CCATGTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 28 5 T 12 11 224239 CASAVA_Build 4 178076098 3D GTCTTTTTAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 648 hom 21 3 8 13 A 14 11 224240 CASAVA_Build 4 178083198 1I TTTGCTCTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 24 1 21 2 A 0 1 224241 CASAVA_Build 4 178086897 6D TAGTTTCTTA TATTTT/------ TATTTTTTTT 3070 hom 58 het 31 0 21 12 TATTTT 2 1 224242 CASAVA_Build 4 178087216 1I60M1D CTTTCCATAC -TTTTTTTTTATGTATAGAAATAAGACCTGGAATTTTTTTTAGCTATCTTCTACCAGCGTGT/TTTTTTTTTTATGTATAGAAATAAGACCTAGAATTTTTTTCAGCTATCTTCTACCAGCGTG- TGATGTTGTC 3070 het 230 hom 12 1 10 10 N/A 0 0 224243 CASAVA_Build 4 178087715 3I ATTTAATTCA ---/TTT TTTAAGTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 3 6 224244 CASAVA_Build 4 178089709 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 hom 14 het 19 1 16 2 G 0 1 224245 CASAVA_Build 4 178093140 4D GTTTGTTTGT TTTA/---- TTTATTTATT 2722 hom 24 het 12 0 9 4 TTTA 4 3 224246 CASAVA_Build 4 178099404 4D GTGTGCATAA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 60 het 29 0 19 12 GT 11 9 224247 CASAVA_Build 4 178099638 3I TGATTTGGCC ---/CTT CTTGAATTGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CTT 1 2 224248 CASAVA_Build 4 178101062 1D TTCTTTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 473 hom 31 2 23 7 T 11 10 224249 CASAVA_Build 4 178101870 1I CTTGAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 245 hom 37 1 31 5 A 11 12 224250 CASAVA_Build 4 178105300 2D CTTTCTCTCC CT/-- CTCTTTCTCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CT 3 2 224251 CASAVA_Build 4 178114357 1D TCTGAGCCCT C/- CAAATGGTTC 3070 het 3070 ref 27 12 9 8 C 2 1 224252 CASAVA_Build 4 178121406 1D CTTCTTATCC T/- TTGTTCCTAA 3070 het 3070 hom 51 16 30 5 T 3 2 224253 CASAVA_Build 4 178127620 2I ATGATGGGAA --/GG GGTAAATAGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 2 4 224254 CASAVA_Build 4 178127687 1I AAAGCAGTGA -/T TTTTTTAGAT 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 T 6 7 224255 CASAVA_Build 4 178170904 4I GATTCTCTCT ----/GACC TTTTGAAAAT 3070 het 3070 hom 47 14 23 10 GACC 0 1 224256 CASAVA_Build 4 178184103 1I TCCGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 1872 het 987 hom 22 4 7 11 A 15 16 224257 CASAVA_Build 4 178193530 1D GAGAACTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2523 hom 25 7 13 5 A 12 11 224258 CASAVA_Build 4 178205663 1I GCAAGGGCTG -/T TGAGAGGGAT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 1 2 224259 CASAVA_Build 4 178207739 3I ATAGAAAGCA ---/TTT TTTAAAAAAA 3070 het 999 hom 39 4 14 21 T 3 6 224260 CASAVA_Build 4 178208189 1D TGTTCACCAA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 462 hom 32 2 14 16 T 2 1 224261 CASAVA_Build 4 178208305 1I AACCCATCCA -/T TTTCCATCCT 3070 hom 92 het 32 0 30 2 T 3 4 224262 CASAVA_Build 4 178209756 2I GGATGAGCAC --/AT AGTGTATAGA 3070 hom 102 het 42 0 33 9 AT 0 1 224263 CASAVA_Build 4 178209844 2D AACAAGAGAC TT/-- TGTGCCAACA 3070 het 3070 ref 50 25 18 9 T 3 1 224264 CASAVA_Build 4 178210208 1D GAAAACTTTC A/- AAAAAGGGAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 6 5 224265 CASAVA_Build 4 178215804 1I TTTGGCATAG -/A GAAATACAAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 0 1 224266 CASAVA_Build 4 178217035 1D CAAAAAATTA G/- CCGGGCGTGG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 1 0 224267 CASAVA_Build 4 178217214 2I TACACCAATG --/AA ACAGGATAGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 1 3 224268 CASAVA_Build 4 178220365 1I AAAACAACAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 9 224269 CASAVA_Build 4 178222410 1I AAGATGAACA -/G GGATAAGGAA 3070 hom 30 het 38 1 32 5 G 2 3 224270 CASAVA_Build 4 178235936 1D ATGATTCCTG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 9 8 224271 CASAVA_Build 4 178239448 2D ATTCTCCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 16 6 A 16 14 224272 CASAVA_Build 4 178278755 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 23 1 14 9 A 16 15 224273 CASAVA_Build 4 178282325 1D TGTCTACCCC T/- CTCCCTCTCT 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 T 1 0 224274 CASAVA_Build 4 178283277 1I CAGTTTTGAA -/C CCCCCACCTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 5 6 224275 CASAVA_Build 4 178294811 1I TTTGTGAGGT -/A AAACTCCTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 3 4 224276 CASAVA_Build 4 178321783 2I CACAGCCATT --/AA GAACATGAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 2 224277 CASAVA_Build 4 178341635 1D ATAGATGAAT A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 42 28 12 2 A 7 6 224278 CASAVA_Build 4 178342167 1I TTTTAGAAGT -/A AGGTTTTATC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 2 224279 CASAVA_Build 4 178343168 2D AGAAAGAAAG AA/-- AGAAAGAAAG 3070 hom 42 het 23 0 14 9 A 3 1 224280 CASAVA_Build 4 178345525 1I AAAAAGGATC -/T TTTTTAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 5 6 224281 CASAVA_Build 4 178346143 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 21 8 A 12 11 224282 CASAVA_Build 4 178349814 2I TTATTAGGCC --/CA GAGAGACATT 3070 hom 147 het 55 0 49 6 CA 0 1 224283 CASAVA_Build 4 178359691 2D ATTTGTGTAT CA/-- CACTTTTGTT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 CA 2 1 224284 CASAVA_Build 4 178363976 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 8 224285 CASAVA_Build 4 178380640 1I TTATATATAT -/A AAAAACTTTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 5 6 224286 CASAVA_Build 4 178381806 2I GAACTACAGC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 11 224287 CASAVA_Build 4 178382030 2I AAAGTCTCTC --/TT GAGTACTAAA 3070 hom 83 het 34 0 28 6 T 0 2 224288 CASAVA_Build 4 178382431 3I ACAAAAGACC ---/ACT AAGGCTCAGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ACT 0 1 224289 CASAVA_Build 4 178383864 4D TTATGAGAAG CTAT/---- CTGTCTGAGT 3070 hom 107 het 42 0 34 11 CTAT 1 0 224290 CASAVA_Build 4 178384710 1D AGAAAGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 14 0 10 4 A 11 10 224291 CASAVA_Build 4 178386195 1D GGCGCTGAGA G/- CAAGTGAGGG 2734 hom 21 het 8 0 7 1 G 1 0 224292 CASAVA_Build 4 178394242 2D TATTTAAAAC AA/-- ATTTTTAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 3 1 224293 CASAVA_Build 4 178408826 1D TCTATCATAT A/- ATTATGTATT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 A 2 1 224294 CASAVA_Build 4 178411196 4I TGTTTATTCA ----/TATT TATTTATTTA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 TATT 4 5 224295 CASAVA_Build 4 178423083 1I TCCTTTCCTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 A 8 9 224296 CASAVA_Build 4 178430723 1D GTTCTGTAAC A/- GGACTAGCTG 3070 het 3070 ref 35 21 10 6 A 1 0 224297 CASAVA_Build 4 178430791 1I AGAAGTGCCT -/G GGAAACTGTA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 G 2 3 224298 CASAVA_Build 4 178430857 1I TGGGCACAGT -/G GCTCACACCT 2558 het 2558 ref 24 10 6 8 G 1 2 224299 CASAVA_Build 4 178439090 1I GCATGTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 10 11 224300 CASAVA_Build 4 178439993 1D TTCCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1935 het 1357 hom 29 11 7 12 T 18 17 224301 CASAVA_Build 4 178455537 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 9 10 224302 CASAVA_Build 4 178456712 1D TTTTAAAAAT A/- AAAAAAATTT 2132 het 1049 hom 10 4 6 0 A 8 7 224303 CASAVA_Build 4 178458427 1I ACACAACAGA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 T 6 7 224304 CASAVA_Build 4 178473082 8I AAAATTAGCT --------/GGGCGTGG TGGTGGACGC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 GGGCGTGG 0 1 224305 CASAVA_Build 4 178478615 17D GACTGCTGTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 24 11 T 29 12 224306 CASAVA_Build 4 178493754 1D CTTATAATCC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 10 9 224307 CASAVA_Build 4 178501948 1D ACATTCATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 9 8 224308 CASAVA_Build 4 178503613 1D AAACCAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 25 1 20 5 T 12 11 224309 CASAVA_Build 4 178510990 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGATGTTAA 3070 het 2814 hom 25 10 14 3 AG 1 0 224310 CASAVA_Build 4 178519281 2I TCCTACTTAA --/CC CCACACTTGA 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 C 2 4 224311 CASAVA_Build 4 178525359 1I TGACAGGTGA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 48 16 22 10 T 7 8 224312 CASAVA_Build 4 178535978 1I ACTGAGAGTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 8 9 224313 CASAVA_Build 4 178547137 1D GGCACATGAC T/- GTGGTCCCAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 1 0 224314 CASAVA_Build 4 178551597 1D GCAGAAGGCA G/- GGAGACCAGG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 G 3 2 224315 CASAVA_Build 4 178553475 4I ACCATTAGTT ----/AGAG AGAATGTTTT 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 AG 1 3 224316 CASAVA_Build 4 178556683 2D TCCTATGTCA AC/-- ACACTATTTT 3070 het 3070 ref 39 17 20 3 AC 3 2 224317 CASAVA_Build 4 178556924 1I CATTTGCACC -/A GGGTATAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 0 1 224318 CASAVA_Build 4 178558760 1D CTCTTTTAAA C/- AACCAGACCC 3070 het 3070 hom 40 15 21 6 C 1 0 224319 CASAVA_Build 4 178582619 5I TAGAATTTCA -----/ACTTG ACTTGTGTAA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 ACTTG 1 2 224320 CASAVA_Build 4 178584048 1D CTTATACCTC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 T 8 7 224321 CASAVA_Build 4 178593225 2D ATTTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 13 11 224322 CASAVA_Build 4 178598012 1D AAAATTAAGG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 8 7 224323 CASAVA_Build 4 178599305 12I GGTTGGTAAA ------------/CACTTCAAGCAT CACTACAGCA 3070 hom 87 het 33 0 29 5 CACTTCAAGCAT 0 1 224324 CASAVA_Build 4 178602380 4D CATGGATATT TGTA/---- TGTATGTATG 3070 hom 102 het 47 0 35 13 TGTA 6 5 224325 CASAVA_Build 4 178604266 1I TGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2632 hom 21 7 13 1 A 10 11 224326 CASAVA_Build 4 178609015 4D TTTATATGAT AGTC/---- AGTAGCAATT 3070 het 3070 ref 40 23 15 5 AGTC 1 0 224327 CASAVA_Build 4 178609458 3D TGATCCTCCT ATC/--- ATCTTTATAA 3070 het 3070 ref 41 14 17 11 ATC 2 1 224328 CASAVA_Build 4 178610780 2D GAATAAATTC AG/-- AGTCTAAACC 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 AG 2 1 224329 CASAVA_Build 4 178620706 4D TTCATTTCAT CTAA/---- CTATTTCCTT 3070 het 3070 ref 47 27 16 7 CTAA 1 0 224330 CASAVA_Build 4 178622818 1I TTCCACTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 34 0 28 6 A 10 11 224331 CASAVA_Build 4 178636224 1I CATTTAGAAG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 7 8 224332 CASAVA_Build 4 178651484 15D TATTGACACT GCTACAATGACAATG/--------------- GCTACAATGA 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 GCTACAATGACAATG 2 1 224333 CASAVA_Build 4 178652223 1I TCAGGATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 13 12 T 12 13 224334 CASAVA_Build 4 178652698 1I TCTGGTGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 12 13 224335 CASAVA_Build 4 178653397 4I TTTTTAAGAT ----/TTAG ATTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 TTAG 0 1 224336 CASAVA_Build 4 178661204 4D TGTGTTGCTC TCTA/---- TCTCATTTCT 2655 het 2655 ref 13 7 6 1 TCTA 1 0 224337 CASAVA_Build 4 178662566 1I TTTTTTATTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 9 10 224338 CASAVA_Build 4 178663540 2D TCAGACTCTC TT/-- TGGGCAGGTC 1698 het 1698 ref 20 7 6 8 T 3 1 224339 CASAVA_Build 4 178665420 1D TTAAATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 11 10 224340 CASAVA_Build 4 178670342 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2669 het 2157 hom 24 10 7 7 T 15 14 224341 CASAVA_Build 4 178692535 1I TTTCACTGTT -/A ACAACAGGAT 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 A 1 2 224342 CASAVA_Build 4 178694574 1I TTTGCACTGG -/T TTTTTCCTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 5 6 224343 CASAVA_Build 4 178698635 1I TACAGCTCTT -/A AAAGGTGGCA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 3 4 224344 CASAVA_Build 4 178702548 1D TATTTCTTTG T/- TCCTTTTTGT 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 T 2 1 224345 CASAVA_Build 4 178704506 7D CCTCGCATGC ATTAGGT/------- ATTAGGTATT 2519 hom 18 het 9 0 7 2 ATTAGGT 2 1 224346 CASAVA_Build 4 178705933 2D CTTTAGTAAC AT/-- AGTTGCTTTG 3070 hom 120 het 41 0 41 0 AT 1 0 224347 CASAVA_Build 4 178707221 5D ACTGTGCTTA ACTGT/----- ACATATTATT 3070 het 3070 ref 38 20 18 2 ACTGT 1 0 224348 CASAVA_Build 4 178712084 1D GCACCACTAC T/- TTTTCTGTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 5 4 224349 CASAVA_Build 4 178716208 1D GAGTGAAACT C/- CCCTCTCAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 C 4 3 224350 CASAVA_Build 4 178716660 3D TCACTGCATT AAA/--- AAAAAAAATC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 11 8 224351 CASAVA_Build 4 178718753 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2667 hom 15 7 8 0 A 11 12 224352 CASAVA_Build 4 178719300 1I GAGACTGTCT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 6 7 224353 CASAVA_Build 4 178720679 2I GTACTCCTAC --/AT ATATATGTGT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 AT 3 4 224354 CASAVA_Build 4 178727093 1D CATGACCTTT A/- AGAACAGCAG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 2 1 224355 CASAVA_Build 4 178727652 2D AATGAACATT TC/-- TCCTTTGCAG 3070 het 3070 hom 33 7 23 4 TC 2 1 224356 CASAVA_Build 4 178727761 5D TTTGCAAAAA CATTG/----- CATTGTTGGA 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 CATTG 2 1 224357 CASAVA_Build 4 178731163 4D GTTTATAAAA TAAT/---- TAAATTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 TAAT 1 0 224358 CASAVA_Build 4 178733295 2D ATAACACAAA CT/-- CTCAAGGACA 3070 het 3070 ref 52 32 17 4 CT 2 1 224359 CASAVA_Build 4 178734229 1D TATTGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2506 hom 25 10 10 5 T 11 10 224360 CASAVA_Build 4 178740166 1D GAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 111 het 42 0 38 7 A 9 8 224361 CASAVA_Build 4 178742816 3D TCACTGTCTT CTC/--- CTGTGACTTG 3070 het 3070 ref 50 23 23 5 CTC 1 0 224362 CASAVA_Build 4 178745164 1D ATCTGAATAA C/- TAAATTTAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 0 224363 CASAVA_Build 4 178749486 7I CTGTTTCATA -------/TTTATAT TCCATGCACT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 TTTATAT 0 1 224364 CASAVA_Build 4 178761722 2D CATAATCAAC AT/-- GTCTGATCTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 AT 1 0 224365 CASAVA_Build 4 178789111 1D TCTCTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 1058 het 1058 ref 33 28 3 2 T 10 9 224366 CASAVA_Build 4 178789561 10D TTACAAAGAA TTCTTTTTTT/---------- TTCTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 6 TTCTTTTTTT 2 1 224367 CASAVA_Build 4 178797266 1D AACAGGGGAA G/- TGGCAGGAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 G 1 0 224368 CASAVA_Build 4 178815419 1D TGCAGTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 36 1 25 11 T 12 11 224369 CASAVA_Build 4 178821624 1D GTAAGATAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 10 9 224370 CASAVA_Build 4 178826310 11I ATATACTTAG -----------/GAAAGATATCA GAATAAGAAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 GAAAGATATCA 0 1 224371 CASAVA_Build 4 178832108 1D AAGAGGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 11 10 224372 CASAVA_Build 4 178833207 9D TTGTTGTTTG TTTGTTTGT/--------- TTGTTTGTTT 3070 het 2843 hom 21 9 11 2 TTTGTTTGT 1 0 224373 CASAVA_Build 4 178838159 3I GTAGTAGGAT ---/AAA AAAGCAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 3 6 224374 CASAVA_Build 4 178841362 1I CATCGCGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2856 hom 28 7 14 7 A 10 11 224375 CASAVA_Build 4 178842816 4D TAATCAAATA AGGC/---- AGGCAGTGCC 3070 hom 123 het 42 0 42 0 AGGC 2 1 224376 CASAVA_Build 4 178848551 4D AGGGTTACTT ACTC/---- ACATATTTTC 3070 hom 48 het 26 0 16 12 ACTC 1 0 224377 CASAVA_Build 4 178848602 2D AGGACCATAC AA/-- AAATGCTCAA 3070 hom 51 het 22 0 18 5 A 5 3 224378 CASAVA_Build 4 178850900 16D28M2I AGTTAAAGAA AAAATAACAAGGAGATAAAATAACAAGGAGATTTTAACATTCTC--/----------------AAAATAACAAGGAGATTTTAACATTCTCCT CTCACTCATG 3070 hom 96 het 27 0 33 10 N/A 0 0 224379 CASAVA_Build 4 178872593 1D ACATATATAT A/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 1 0 224380 CASAVA_Build 4 178879254 1D TGAAAAAATG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 8 7 224381 CASAVA_Build 4 178886478 1D ACTCCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3009 hom 33 13 11 9 T 15 14 224382 CASAVA_Build 4 178891501 1I TTTTCAAATG -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 6 7 224383 CASAVA_Build 4 178892203 1I ATTGGGCTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 33 0 27 7 T 8 9 224384 CASAVA_Build 4 178893282 1D CTCCATTACT G/- CATACATAGA 3070 hom 126 het 49 0 43 7 G 1 0 224385 CASAVA_Build 4 178893939 1D GATCTGGTGG T/- TTTTTTGAGG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 7 6 224386 CASAVA_Build 4 178896831 6I CCACTGTATC ------/CTTTAT TTGTGACCAA 3070 hom 126 het 46 0 43 4 CTTTAT 0 1 224387 CASAVA_Build 4 178897457 2I AAAAAAAAAA --/AT AAAAAACAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AT 0 1 224388 CASAVA_Build 4 178898709 1D GAAGGGAGTA G/- GGGGATAACC 3070 het 3070 hom 39 18 18 5 G 5 4 224389 CASAVA_Build 4 178902729 1I CCATTGGATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 8 9 224390 CASAVA_Build 4 178913450 1I GCTTTTGTAA -/T TGGAAATGGA 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 1 2 224391 CASAVA_Build 4 178913555 1D AACCTTGATG T/- TTTTTTTTTT 3062 het 374 hom 41 6 11 24 T 15 14 224392 CASAVA_Build 4 178917267 1I GAGCAGTGGT -/C CCCAGCCTTT 3070 hom 123 het 50 0 40 10 C 3 4 224393 CASAVA_Build 4 178920747 3I TGTACCCAAC ---/TGA TGATCTTATG 3070 hom 175 het 66 0 59 7 TGA 1 2 224394 CASAVA_Build 4 178942466 1I AACTGCATCT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 7 8 224395 CASAVA_Build 4 178946004 1D TAGTTGCAGC T/- TTGAGACTTG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 3 2 224396 CASAVA_Build 4 178948410 12D TACCTTAGGG AAATGTCTTTCA/------------ AAAGCTGTCT 3070 het 3070 ref 40 30 8 5 AAATGTCTTTCA 1 0 224397 CASAVA_Build 4 178949634 3D CTAGGTCTTA TAT/--- TTTTTCCTGA 3070 het 3070 ref 51 23 20 10 TAT 1 0 224398 CASAVA_Build 4 178952439 1D TAGAGCCCCC T/- GGTAATAGTC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 1 0 224399 CASAVA_Build 4 178953883 1D TGGTGGGGGC G/- GGAGGAAGGT 3070 het 2313 hom 23 7 10 7 G 3 2 224400 CASAVA_Build 4 178956552 4I TTATTATGAG ----/CTGT CTATTTCATC 3070 hom 138 het 48 0 47 1 CTGT 0 1 224401 CASAVA_Build 4 178957619 3D CACAAGAAGA GGT/--- GGTGGTGGTA 3070 hom 120 het 42 0 39 3 GGT 4 3 224402 CASAVA_Build 4 178961397 4D GTCTGTCAAA TAAT/---- TAGTGCACTG 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 TAAT 1 0 224403 CASAVA_Build 4 178969653 1I GTATGACTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 8 9 224404 CASAVA_Build 4 178969815 6I TCTCCCTTTC ------/TCTTTG TCTAATAGCT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TCTTTG 0 1 224405 CASAVA_Build 4 178970758 5I TAAGTATCTC -----/CCAGA CCACTCTGCA 3070 hom 155 het 61 0 48 13 CCAGA 0 1 224406 CASAVA_Build 4 178972385 1I TGCTGTCGCC -/T GCAAACTCAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 0 1 224407 CASAVA_Build 4 178972618 1I TCCTTGTCAT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 7 8 224408 CASAVA_Build 4 178974539 1I TCAGAATACC -/T TTTTTTAAGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 6 7 224409 CASAVA_Build 4 178976618 4I16M1D CATTTTTGAT ----ATTAATATTTCTTTTCT/ATTAATTAATATTTCTTTTC- TTTTTTTCTT 3070 hom 45 het 15 0 16 1 N/A 0 0 224410 CASAVA_Build 4 178978207 2D TCACAAATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 12 10 224411 CASAVA_Build 4 178982774 1I TCAAAAAACG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 172 hom 31 1 23 7 T 9 10 224412 CASAVA_Build 4 178983559 5D AATATGAAAT TAGAA/----- TAGATAAAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 TAGAA 1 0 224413 CASAVA_Build 4 178985090 1I AAGAAGCCAC -/T TGACCATGGA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 1 2 224414 CASAVA_Build 4 178986531 1I AAAAAAAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 9 10 224415 CASAVA_Build 4 178988152 1D ACCAGATGAT C/- CCACATCTGT 3070 hom 93 het 36 0 32 6 C 3 2 224416 CASAVA_Build 4 178991831 1D TTAGGTATTT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 7 6 224417 CASAVA_Build 4 178994786 1D17M1D GGCACTTATC ATTGCCTGAACACAGATAT/-TTGCCTGAACACAGATA- GCTATTCAGT 3070 hom 96 het 31 0 33 3 N/A 0 0 224418 CASAVA_Build 4 178997733 1I ACAAAGAAAC -/A AAAAAACCCA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 6 7 224419 CASAVA_Build 4 178999439 1I GTCAGTAAAA -/T TTTTTTGAGT 3070 hom 75 het 32 0 26 7 T 6 7 224420 CASAVA_Build 4 179017083 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 T 10 11 224421 CASAVA_Build 4 179025960 1I TTGGGGAATT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 7 8 224422 CASAVA_Build 4 179032885 3I GATTATGTAA ---/TAT TGTCATTATG 3070 het 3070 hom 68 28 31 9 TAT 0 1 224423 CASAVA_Build 4 179033074 1I TTAACAATTG -/T TATTTTATGT 3070 het 3070 ref 50 22 22 6 T 1 2 224424 CASAVA_Build 4 179034454 1D CCTGTCAATT C/- CCATTGTGCT 3070 het 3070 hom 39 18 14 7 C 3 2 224425 CASAVA_Build 4 179038590 1I GCCTTTATTA -/T TTTTTTTTTA 2486 het 2486 ref 23 12 9 2 T 9 10 224426 CASAVA_Build 4 179038769 1I TCAAACTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 10 11 224427 CASAVA_Build 4 179042660 1D TTTCCAGTGA T/- TTTCCTAATC 3070 hom 112 het 42 0 38 4 T 4 3 224428 CASAVA_Build 4 179043323 2I TCAACTTGAC --/TG TGCTAAGAGA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TG 1 2 224429 CASAVA_Build 4 179046980 1D ATGATGTGAG A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 35 22 11 3 A 7 6 224430 CASAVA_Build 4 179048118 1D AATAATACAT A/- AAAAAAAAAA 2252 hom 18 het 8 0 7 1 A 13 12 224431 CASAVA_Build 4 179051040 1D ATCCATGGTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 T 7 6 224432 CASAVA_Build 4 179058769 1I GTTATCTGGA -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 C 7 8 224433 CASAVA_Build 4 179067199 1I GTCTTTAGTT -/C TTAATATGTT 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 C 0 1 224434 CASAVA_Build 4 179067360 1D AAACTTCATA T/- TATCATATTG 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 2 1 224435 CASAVA_Build 4 179068440 1D CATTATTCCA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 8 7 224436 CASAVA_Build 4 179068997 4D TATAGAGAAT CTAA/---- CTAACTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 4 CTAA 2 1 224437 CASAVA_Build 4 179069112 3D TTTAAAAGTT AAG/--- AAGAAACATA 3070 het 3070 ref 32 16 12 6 AAG 2 1 224438 CASAVA_Build 4 179073647 1I TTGAAATCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 T 8 9 224439 CASAVA_Build 4 179078030 1D TTGAAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 2559 het 2559 ref 41 22 9 10 T 17 16 224440 CASAVA_Build 4 179079140 1I GGTTGTTTTG -/C CCCCCCCCCC 1949 het 906 hom 15 3 6 6 C 10 11 224441 CASAVA_Build 4 179084252 1I ATTTAAAGGG -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 224442 CASAVA_Build 4 179089845 4D CTTTTAGTTT CTGA/---- CTATTTTTTA 2991 het 2991 ref 27 16 7 6 CTGA 1 0 224443 CASAVA_Build 4 179090219 4D GAATAAACAA AAAT/---- AAATTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 AAAT 2 1 224444 CASAVA_Build 4 179093803 1I CAATTTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1776 hom 53 5 40 8 T 10 11 224445 CASAVA_Build 4 179095234 1D CAGTGTCATC A/- GGGGCCTGTG 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 1 0 224446 CASAVA_Build 4 179096240 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 171 hom 26 1 20 5 TG 8 7 224447 CASAVA_Build 4 179101918 2D TATTTAACTC TT/-- GATCATATAA 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 T 2 0 224448 CASAVA_Build 4 179105752 1I AGCTAGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 10 11 224449 CASAVA_Build 4 179106160 1I CAAATAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 32 2 23 7 A 11 12 224450 CASAVA_Build 4 179106455 1D TCACTTCGTT C/- TGTGATGTAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 C 1 0 224451 CASAVA_Build 4 179108334 1D TTTCCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 17 14 T 13 12 224452 CASAVA_Build 4 179109054 1I TGAGTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 45 2 34 9 A 13 14 224453 CASAVA_Build 4 179109560 3D AAGATAAAAG TAT/--- TATTATACAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TAT 3 2 224454 CASAVA_Build 4 179109848 4I AGTCTCTAAA ----/TCTT TCTTTATGAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 TCTT 1 2 224455 CASAVA_Build 4 179110771 1D TTATCTTTAC A/- AAAAATTAAG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 6 5 224456 CASAVA_Build 4 179115581 1D ATATTAAGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 42 19 21 3 A 9 8 224457 CASAVA_Build 4 179119192 1D TTTGTTCAAG A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 35 15 20 0 A 8 7 224458 CASAVA_Build 4 179119310 1I TTATTTTGGG -/A AAAAATATTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 5 6 224459 CASAVA_Build 4 179119663 1I AATGGATGCA -/T TTTTTTGCCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 7 224460 CASAVA_Build 4 179120273 9D TCATTTGTTT GCTTGTTTG/--------- GCTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 36 25 9 6 GCTTGTTTG 2 1 224461 CASAVA_Build 4 179121669 4D TTCATCTGGG TTCT/---- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 TTCT 2 1 224462 CASAVA_Build 4 179121855 1D AACAAATGTA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 T 8 7 224463 CASAVA_Build 4 179124806 4I TCTTTCTTTC ----/TTTT TTTCTTTTTT 3070 het 51 hom 40 2 31 7 T 3 7 224464 CASAVA_Build 4 179126025 1I TTCTATTCTG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 7 8 224465 CASAVA_Build 4 179126295 1I ATTTAAGCCA -/T TTTTTCATAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 5 6 224466 CASAVA_Build 4 179132228 1D CTACAGTAAA G/- AATAGATGTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 1 0 224467 CASAVA_Build 4 179134531 4I TGACTAAAAT ----/ACAA ACAAACAGGC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 ACAA 1 2 224468 CASAVA_Build 4 179134815 1I AATGTTAATC -/T TTTCAACCAA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 3 4 224469 CASAVA_Build 4 179142332 1D TCAGGTCTTG T/- TTTTTTTTTT 2841 het 2841 ref 24 9 9 6 T 13 12 224470 CASAVA_Build 4 179144368 2D CTAATTTGCT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 15 14 11 AC 9 8 224471 CASAVA_Build 4 179145138 11I TTTCTTTTTT -----------/CTTTTTTTTTA CTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 CTTTTTTTTTA 0 1 224472 CASAVA_Build 4 179150259 8I TCATCAAATG --------/AGTTTTAT AGTTTTATAT 1940 het 1492 hom 12 3 4 5 AGTTTTAT 1 2 224473 CASAVA_Build 4 179150809 1D TCAAAGCTGT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 42 17 16 10 A 9 8 224474 CASAVA_Build 4 179164762 1D CCTTCTTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 14 10 A 13 12 224475 CASAVA_Build 4 179182926 1I TTCTCAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1211 hom 32 4 26 2 A 13 14 224476 CASAVA_Build 4 179188938 8I ACATATACAC --------/ACACACTT ACACACACAT 1473 het 322 hom 6 1 4 1 ACACACTT 0 1 224477 CASAVA_Build 4 179198354 4D AGTGAATTGC CTTA/---- CTTAACTAAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 CTTA 2 1 224478 CASAVA_Build 4 179200427 1D33M2D TCTAAAAATG AAAAAAATTCTTATTATATACTTTGTTATAATAATT/-AAAAAATTCTTATTATATACTTTGTTATAATAA-- TTTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 26 23 10 4 N/A 0 0 224479 CASAVA_Build 4 179210060 2I TATTGAGAGA --/CT CTGATGCATT 3070 het 3070 ref 39 26 10 3 CT 1 2 224480 CASAVA_Build 4 179218185 11I GTGGTGATCG -----------/AATAGACTGAA AAGATTTTTA 3070 het 2563 hom 18 6 11 2 AATAGACTGAA 0 1 224481 CASAVA_Build 4 179219391 1I GTTGAGACAC -/G TATTTCCCTG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 G 0 1 224482 CASAVA_Build 4 179221137 4D TCCTCACTAA TTTT/---- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 29 17 8 5 T 11 7 224483 CASAVA_Build 4 179223468 4I CTAATAAATC ----/TAAT TAATTATCCT 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 TAAT 1 2 224484 CASAVA_Build 4 179242426 8I ATCAGCATAC --------/AACCGAAT AACCGAATAC 3070 hom 84 het 36 0 28 8 AACCGAAT 1 2 224485 CASAVA_Build 4 179254153 2D AAAGCACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 12 17 11 AC 7 6 224486 CASAVA_Build 4 179254628 2I AAAAAAAAAA --/AC CACAATCCCT 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 AC 0 1 224487 CASAVA_Build 4 179256169 4I AGTTGTGTTT ----/TTTA TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 TTTA 0 1 224488 CASAVA_Build 4 179257034 1D TTGACGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 25 0 16 9 T 12 11 224489 CASAVA_Build 4 179257936 5I TCACAACTAA -----/AATCC AAACTAAGCC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 AATCC 0 1 224490 CASAVA_Build 4 179258106 1D TGACTTATTT A/- TCACTGCTGG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 1 0 224491 CASAVA_Build 4 179260295 1I TAACATATTG -/A AAATTAATTA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 3 4 224492 CASAVA_Build 4 179260683 1D TCAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2825 het 1856 hom 18 6 7 6 A 12 11 224493 CASAVA_Build 4 179262141 5D TTGGTCTGAT AATTG/----- AATTAGTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 10 5 AATTG 1 0 224494 CASAVA_Build 4 179264407 1I AATGCCATGC -/T GTTTTAGTTA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 0 1 224495 CASAVA_Build 4 179265821 3I ATGACTTTTT ---/TTG TTTACTTTGA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 TTG 0 1 224496 CASAVA_Build 4 179265912 6D TATTTATCAA TTGTAT/------ TTATCTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 18 4 TTGTAT 1 0 224497 CASAVA_Build 4 179271030 1I TCAACTTGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 411 hom 33 1 31 1 A 9 10 224498 CASAVA_Build 4 179278635 1I CTGTCCAAGG -/T TTTTTTCCGT 3070 het 3070 hom 43 20 17 6 T 6 7 224499 CASAVA_Build 4 179279015 1D ATAATTTTAG A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 7 6 224500 CASAVA_Build 4 179282189 1I GGCAACAGCT -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 7 8 224501 CASAVA_Build 4 179283732 1I GAAGTGATGT -/A TTTTCTCTAC 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 A 0 1 224502 CASAVA_Build 4 179285428 1I AACCAAGATG -/A AGAGTGCAGT 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 A 1 2 224503 CASAVA_Build 4 179299778 1D GTATTTTGCC T/- GAGGGGTGTG 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 T 1 0 224504 CASAVA_Build 4 179302961 1I ACCCCCCCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 9 10 224505 CASAVA_Build 4 179306973 4I TAAACTTCAT ----/TCTC TATTAATAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 TC 0 2 224506 CASAVA_Build 4 179308268 2I AATATTTTAT --/AA AGCCATTAGA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 1 3 224507 CASAVA_Build 4 179318207 1I CTTGAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 9 10 224508 CASAVA_Build 4 179322623 2D GCTACTTTAC AT/-- ATATATATAT 1055 het 1055 ref 49 36 3 10 AT 7 6 224509 CASAVA_Build 4 179334401 1D TTGGCCATAA G/- GGAGCTCTCT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 G 3 2 224510 CASAVA_Build 4 179339322 2D GACTTTGGAA AT/-- ATGTGTTTAT 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 AT 2 1 224511 CASAVA_Build 4 179340778 2D AACAGATGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 25 0 22 5 T 12 10 224512 CASAVA_Build 4 179342334 1D TGTGGAAAAC A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 7 6 224513 CASAVA_Build 4 179351202 1I AAATTAAAGT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 8 9 224514 CASAVA_Build 4 179391552 1D CAAGTTTTTC T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 8 7 224515 CASAVA_Build 4 179399675 4D GCTGCAGTTG CCAC/---- CTGGGCACCC 3070 het 2520 hom 29 13 11 6 CCAC 1 0 224516 CASAVA_Build 4 179407003 8D ATTCAGCTAT TTTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 3070 het 353 hom 16 3 10 5 TTTCTCTC 1 0 224517 CASAVA_Build 4 179411560 1D TTGTATTCTG A/- GCGTGCAATA 3070 het 3070 ref 56 25 25 7 A 1 0 224518 CASAVA_Build 4 179412046 1D TCCTTTCAAA T/- TTGTATTGTG 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 T 3 2 224519 CASAVA_Build 4 179415225 1I ATCTGGTAGA -/T TTTTGTCTAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 4 5 224520 CASAVA_Build 4 179431809 1D ATGTCTGAGT A/- TATACTGTCA 3070 het 3070 ref 52 29 18 6 A 1 0 224521 CASAVA_Build 4 179440761 2D ATTAGGTAAC TA/-- TATATATACA 2962 het 2112 hom 19 5 9 5 TA 5 4 224522 CASAVA_Build 4 179441060 1D TCCTAATACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 10 9 224523 CASAVA_Build 4 179441448 3D ATATATATAT ATA/--- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 31 2 17 13 ATA 1 0 224524 CASAVA_Build 4 179442176 4D AGGCACCTTC TATT/---- TATTTTCATG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 TATT 2 1 224525 CASAVA_Build 4 179454584 2D GATACTGTCT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 56 26 17 14 AC 9 8 224526 CASAVA_Build 4 179456226 1I GGTGTGGGGC -/G GGGGGGGCAG 1071 het 1071 ref 21 10 6 5 G 7 8 224527 CASAVA_Build 4 179457393 3I GTGAAACAAA ---/TTG TGAGTAAATG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTG 0 1 224528 CASAVA_Build 4 179458240 1I ATGGAAGATC -/A ATGAGGACAA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 A 1 2 224529 CASAVA_Build 4 179459859 1D TGACAGTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 9 224530 CASAVA_Build 4 179468937 2I30M1D AAGGGTAATC --TAATCATTAATTAACAAATCATTAATTAAAC/TTTAATCATTAATTAACAAATCATTAATTAAA- AAAATAATAT 3070 hom 90 het 24 0 31 2 N/A 0 0 224531 CASAVA_Build 4 179469610 1D AAATCCAAAA G/- GCATGTTAAG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 G 2 1 224532 CASAVA_Build 4 179476558 1I TTTACCTTGC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 T 7 8 224533 CASAVA_Build 4 179516568 1D TTAAAAAAAA T/- GTGACACTCT 3070 het 3070 ref 47 20 20 8 T 1 0 224534 CASAVA_Build 4 179518563 1D TCCGTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 24 2 17 6 A 15 14 224535 CASAVA_Build 4 179521148 4D AAAAAATAAG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 TA 8 6 224536 CASAVA_Build 4 179522618 5I TGTTATATAG -----/TTATA TTATTATTAT 1939 het 1939 ref 14 9 4 1 TTATA 0 1 224537 CASAVA_Build 4 179527693 2I CATTTATTGA --/AG AGATTCTCAT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 AG 1 2 224538 CASAVA_Build 4 179537717 1D CAAGTGGGTT C/- CCCCCAGTGA 3070 het 3070 hom 34 13 12 10 C 6 5 224539 CASAVA_Build 4 179545651 1I AGTAATCAAA -/G CATTTTCAAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 0 1 224540 CASAVA_Build 4 179549649 1I ATATTATTCC -/T TTTTTTTTTT 2844 het 2844 ref 20 11 7 2 T 10 11 224541 CASAVA_Build 4 179550035 3D GAAAATAATA AAT/--- AATAATAATT 3070 het 2789 hom 25 8 12 7 AAT 4 3 224542 CASAVA_Build 4 179550603 1D ATGATTTATT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3035 hom 28 8 13 8 A 9 8 224543 CASAVA_Build 4 179553011 1I CTATTCAGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 T 9 10 224544 CASAVA_Build 4 179554500 1D CTGGTAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 A 10 9 224545 CASAVA_Build 4 179563995 1D TCAGTAGGTA T/- AAAGGCTACT 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 T 1 0 224546 CASAVA_Build 4 179572492 1I AGACGATAAG -/A AAAGTTCTGA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 3 4 224547 CASAVA_Build 4 179580011 1D GAAAATAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 10 9 224548 CASAVA_Build 4 179594851 1I ATCACTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 11 12 224549 CASAVA_Build 4 179598900 2D GATTTGTATC TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TA 8 7 224550 CASAVA_Build 4 179600623 6I GATTTCTGTT ------/ATTGGA ATTGGAATAT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 ATTGGA 1 2 224551 CASAVA_Build 4 179603789 1I GATCAAACAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 8 9 224552 CASAVA_Build 4 179613866 1D GTTATCTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 9 224553 CASAVA_Build 4 179616135 1D ACCTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2273 het 2273 ref 34 21 6 7 T 12 11 224554 CASAVA_Build 4 179616863 1D GGCATGACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 34 0 25 11 A 10 9 224555 CASAVA_Build 4 179619908 1I CTTTCATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 10 11 224556 CASAVA_Build 4 179628947 1D CAACATGGTG A/- AACCCTGTCT 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 A 3 2 224557 CASAVA_Build 4 179634128 2D TCTTAGACTC AG/-- AGACTGGGAC 3070 het 3070 hom 46 19 23 6 AG 2 1 224558 CASAVA_Build 4 179638263 18D TTTTAAATTG AAATTTAAATTTAAAAAA/------------------ AAGTAATACT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AAATTTAAATTTAAAAAA 1 0 224559 CASAVA_Build 4 179639672 2D ATGGCCTCTC TG/-- TGTAGCCACC 3070 het 3070 ref 38 21 13 6 TG 2 1 224560 CASAVA_Build 4 179639999 1D TTGTCATCAG T/- TTTTCCTCAG 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 T 5 4 224561 CASAVA_Build 4 179642419 1I TCCTGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 1635 het 1635 ref 38 19 5 14 T 13 14 224562 CASAVA_Build 4 179643583 1D GGTAATTATG T/- TTATACATGT 3070 het 3070 hom 49 24 23 3 T 3 2 224563 CASAVA_Build 4 179647277 1I CGTGGAGATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 32 hom 34 1 27 6 T 9 10 224564 CASAVA_Build 4 179650032 1D TGAATAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 279 hom 33 1 27 5 A 10 9 224565 CASAVA_Build 4 179652319 1I ACATTTATCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 9 10 224566 CASAVA_Build 4 179654631 1I TAAAAGAGAC -/A AAAAAACCTA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 A 6 7 224567 CASAVA_Build 4 179656665 4I GATTAAAATA ----/TAAG ATTTTCATGT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TAAG 0 1 224568 CASAVA_Build 4 179657208 6D5M5D GGAGGTAATG TTTTTCCTTAAGTGTG/------ACTAA----- TATTCCTTTT 3070 het 3070 ref 39 29 17 2 N/A 0 0 224569 CASAVA_Build 4 179658184 3D TTTTACTTAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 10 T 15 12 224570 CASAVA_Build 4 179658537 1D GCTCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 27 1 12 14 A 11 10 224571 CASAVA_Build 4 179662451 1I TTTATTTGGT -/A AAAAAAAAAA 1547 het 1547 ref 30 10 11 9 A 15 16 224572 CASAVA_Build 4 179662468 1I AAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1433 het 1433 ref 33 13 8 12 A 10 11 224573 CASAVA_Build 4 179664589 1D CCAATTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 10 9 224574 CASAVA_Build 4 179666090 1I ATAAGATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 A 10 11 224575 CASAVA_Build 4 179687526 3I TTTTGTTATG ---/ATT ATTATTCCTG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ATT 2 3 224576 CASAVA_Build 4 179696293 3D GAACACATAT GAG/--- CAGAAGGGAA 3070 hom 129 het 50 0 44 9 GAG 1 0 224577 CASAVA_Build 4 179698156 1I GCAAAGACTT -/C CCTTGCAAGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 2 3 224578 CASAVA_Build 4 179698712 3D TGAGTGAAAA GAG/--- GAGAAGGCGG 3070 hom 93 het 36 0 32 7 GAG 2 1 224579 CASAVA_Build 4 179703434 1D AGTTCCAAAC A/- AAAAAGTATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 5 224580 CASAVA_Build 4 179706918 4I AAATTTTAAC ----/TTAA TTGTTAATAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTAA 0 1 224581 CASAVA_Build 4 179711924 1I TGTGGCATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 419 hom 33 1 28 4 T 9 10 224582 CASAVA_Build 4 179714679 1D TTCGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 32 0 15 17 T 15 14 224583 CASAVA_Build 4 179719287 1I AAGCAAGCCC -/T TTTAATTAAA 3070 het 2557 hom 22 7 9 6 T 3 4 224584 CASAVA_Build 4 179724972 1D AAGGAGTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2176 hom 29 9 13 8 A 15 14 224585 CASAVA_Build 4 179726052 1I TGTGTTATAA -/C ATCCATGCTG 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 C 0 1 224586 CASAVA_Build 4 179729872 1I TTTTGGAGGG -/C CCCCCCCTTC 3070 hom 84 het 32 0 25 7 C 7 8 224587 CASAVA_Build 4 179735241 1D GGGTGATTGT T/- TTTTATGACA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 6 5 224588 CASAVA_Build 4 179738468 1I TCTTCAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 12 13 224589 CASAVA_Build 4 179747110 1I AGAAATTGTA -/G GGTGATCAAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 2 3 224590 CASAVA_Build 4 179751289 9I TAGTCTGCTC ---------/ATGCTCCCT GTTGCCCACG 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 ATGCTCCCT 0 1 224591 CASAVA_Build 4 179754607 1I CATCAAATAG -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 A 7 8 224592 CASAVA_Build 4 179755027 1D GTATTGTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 A 11 10 224593 CASAVA_Build 4 179755975 1D63M1I TAGTACTGCC TTTTTTTCATGCATAACTTAACTTATTTTCATATCTCAACACTATACCAGTAATTTTATAAAAT-/-TTTTTTCATGCATAACTTAACTTATTTTCATATCTCAACACTATACCAGTAATTTTATAAAATA AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 32 25 13 9 N/A 0 0 224594 CASAVA_Build 4 179756413 2I10M3D ATTCAAATAT --TGTTAATTTCAAA/TGTGTTAATTTC--- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 N/A 0 0 224595 CASAVA_Build 4 179757014 1I ATTGTGAAGT -/C CTGTCGTCCA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 1 2 224596 CASAVA_Build 4 179763685 1D ATGTCAATGT A/- ACTAAGTTGC 3070 hom 105 het 43 0 36 8 A 2 1 224597 CASAVA_Build 4 179777892 1D AAAACTAAGT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 9 8 224598 CASAVA_Build 4 179778553 3I AAAGGCACTT ---/ATC ATGACCCAGG 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 ATC 0 1 224599 CASAVA_Build 4 179788030 1D AACAAAAAAA T/- ATTTAAAATG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 1 0 224600 CASAVA_Build 4 179793565 1I GTAGTGTCAT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 7 8 224601 CASAVA_Build 4 179794043 1D TAAATTAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 10 9 224602 CASAVA_Build 4 179800443 1D ACCTAATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 35 1 30 5 T 12 11 224603 CASAVA_Build 4 179800571 1I CTGTAAATGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 420 hom 32 1 28 3 A 8 9 224604 CASAVA_Build 4 179814168 2D ATTTTTCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 15 het 47 2 32 13 TC 10 9 224605 CASAVA_Build 4 179830490 1D CTATTTCATC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 8 224606 CASAVA_Build 4 179834748 1I GATAAATAGC -/A CAACATCAAA 3070 hom 103 het 41 0 35 6 A 0 1 224607 CASAVA_Build 4 179844624 1I AATCAGGTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 T 8 9 224608 CASAVA_Build 4 179854253 1I TTATCACGCA -/C TGTGGCTGTA 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 C 0 1 224609 CASAVA_Build 4 179859167 1I GTAAAATATA -/T TTTATAGAGC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 3 4 224610 CASAVA_Build 4 179863639 5D TTCTTTAAGC TAAGG/----- TAACTAGAGA 3070 hom 99 het 34 0 34 3 TAAGG 1 0 224611 CASAVA_Build 4 179863741 1D TTGTTTCTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 25 8 11 7 A 8 7 224612 CASAVA_Build 4 179881741 1D TATTTTTTAA T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 7 6 224613 CASAVA_Build 4 179882700 1D GATATTAGAT C/- TTTGCCAGAT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 C 1 0 224614 CASAVA_Build 4 179889808 1D CTACCCAGTT A/- ATAGAACTGG 3070 hom 80 het 38 0 34 5 A 2 1 224615 CASAVA_Build 4 179902461 2D AGGAGGCAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 31 2 17 12 T 12 10 224616 CASAVA_Build 4 179907032 1I AGTAAATTGT -/A AAAAAAAAAA 1496 het 1496 ref 32 17 6 9 A 15 16 224617 CASAVA_Build 4 179916167 1D TCTGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1353 hom 25 5 12 9 A 15 14 224618 CASAVA_Build 4 179917755 1I TAAATGAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 9 10 224619 CASAVA_Build 4 179918101 1I AATTTATTGC -/A ATAATGTTGT 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 A 1 2 224620 CASAVA_Build 4 179920801 13D CACTTGCTTG TGCCTGTAATTCC/------------- AGCTACTCAG 3070 het 3070 hom 41 16 25 1 TGCCTGTAATTCC 1 0 224621 CASAVA_Build 4 179922939 1D ATTGAGAAGC A/- AGGCCATTAT 3070 het 3070 hom 44 20 19 7 A 2 1 224622 CASAVA_Build 4 179928280 1D TTAATTACTG T/- TGAAACAGTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 2 1 224623 CASAVA_Build 4 179933068 1D CAAGGTATGG C/- AAGGCAGTCC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 1 0 224624 CASAVA_Build 4 179943123 1D TGTTTGTTTG T/- TTTGTCTATT 3070 hom 123 het 49 0 40 10 T 4 3 224625 CASAVA_Build 4 179947790 1D AGCTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 1424 het 1424 ref 25 13 5 7 A 12 11 224626 CASAVA_Build 4 179948226 1I AAATCCTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 T 9 10 224627 CASAVA_Build 4 179949179 1I TGTCCTCCCC -/A CCAACACACA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 0 1 224628 CASAVA_Build 4 179951627 1I AGGTTAAGGA -/C CACTCCCATG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 C 1 2 224629 CASAVA_Build 4 179962595 1D GCCAAAATGC T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 7 6 224630 CASAVA_Build 4 179967289 1I CATTTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 10 11 224631 CASAVA_Build 4 179971039 1I GCATTCAGAC -/A AAGGGGAGCG 2306 het 2306 ref 28 17 6 5 A 2 3 224632 CASAVA_Build 4 179973321 4D ACAAACAAAC AAAT/---- AAATAAACAT 3070 het 3070 hom 28 10 14 5 AAAT 2 1 224633 CASAVA_Build 4 179979005 1D TATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 10 9 224634 CASAVA_Build 4 179986318 1D GTGACTATGA T/- AGGGCATCAC 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 T 1 0 224635 CASAVA_Build 4 179991308 1I CTGAAACCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 9 10 224636 CASAVA_Build 4 180000903 1D TTTTTCTGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 T 9 8 224637 CASAVA_Build 4 180007804 1I TTTGCATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 15 16 224638 CASAVA_Build 4 180011316 4D CCTTCTTACA TATC/---- TAAACATTGG 3070 het 3070 hom 35 15 19 3 TATC 1 0 224639 CASAVA_Build 4 180020636 1I GGTCTTGACT -/C TTTATCCAAT 1065 het 1065 ref 24 19 3 2 C 0 1 224640 CASAVA_Build 4 180022599 1D CAGCAGTGTT A/- AAAAAAACAA 2305 het 2305 ref 30 17 6 8 A 8 7 224641 CASAVA_Build 4 180022900 1D AATTTGACTG T/- TTTTTTGATT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 7 6 224642 CASAVA_Build 4 180025777 1I TAAAAAATTT -/A AAAATGTATA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 4 5 224643 CASAVA_Build 4 180026839 5D TTTTACTTGA AATAT/----- AATTAATTAG 3070 het 3070 ref 27 18 8 2 AATAT 1 0 224644 CASAVA_Build 4 180030415 1I AATACAAAAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 7 8 224645 CASAVA_Build 4 180043138 1D CAAAAATTCC A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 A 7 6 224646 CASAVA_Build 4 180046419 1D AAGCATTTGT A/- TACACCAATA 2417 het 2417 ref 21 16 5 0 A 1 0 224647 CASAVA_Build 4 180060610 2I AATCTGACTC --/AT GTGTATTTGC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 AT 0 1 224648 CASAVA_Build 4 180069794 1D GCAGAAAACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 8 224649 CASAVA_Build 4 180074272 6I CAGAAAATAT ------/AATATA AATCAGTAGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 AATATA 0 1 224650 CASAVA_Build 4 180075493 1I ACCCCTTTAT -/G ATAAACCACT 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 G 0 1 224651 CASAVA_Build 4 180076811 5D GACTTTGTAT TTATA/----- TTATAATTGT 3070 het 3070 hom 34 17 16 3 TTATA 2 1 224652 CASAVA_Build 4 180081461 1D ATCACATATC A/- GCGGGCCAAG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 A 1 0 224653 CASAVA_Build 4 180081894 1D TAAAACCTTT A/- AAAAAGTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 6 5 224654 CASAVA_Build 4 180084620 1I GTTGATTAAC -/T TATTTTTGTG 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 1 2 224655 CASAVA_Build 4 180085956 2D CTTTGTAGAA TT/-- TTTTTTTCCC 2452 het 2452 ref 23 14 6 4 T 9 7 224656 CASAVA_Build 4 180087734 1D TTTCACTGCC A/- AAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 A 6 5 224657 CASAVA_Build 4 180088890 1I ACATAATAAG -/A AAAAATATTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 A 5 6 224658 CASAVA_Build 4 180089074 4D CAGATACACC CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 46 15 19 13 CA 10 8 224659 CASAVA_Build 4 180094105 2I CTAAATTATA --/CT CTTTTATGAG 3070 het 3070 hom 55 22 26 7 CT 1 2 224660 CASAVA_Build 4 180095234 19D GAGGCTGAGG CAGGAGAATCGCTTGCACC/------------------- CAGGAGGCGG 2629 het 2629 ref 14 8 8 1 CAGGAGAATCGCTTGCACC 1 0 224661 CASAVA_Build 4 180104305 1I ACTGGATTGG -/T TTGTAGAAGA 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 T 2 3 224662 CASAVA_Build 4 180112044 1I ACCTTCACCG -/C TGCCGCCACC 3070 hom 71 het 32 0 18 14 C 0 1 224663 CASAVA_Build 4 180112311 6D ACACCACCAT CACCAC/------ CACCACCGTC 318 het 318 ref 39 25 2 15 CAC 4 2 224664 CASAVA_Build 4 180115984 1D TTGTTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2014 hom 40 9 21 10 T 15 14 224665 CASAVA_Build 4 180127884 1D ACAGTATCAT C/- AGCAGGATAT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 C 1 0 224666 CASAVA_Build 4 180139909 1I GTGAGGGGGT -/G GGGGGGGTTA 3070 hom 70 het 29 0 23 6 G 7 8 224667 CASAVA_Build 4 180151939 3D TTTTCCACAT GTG/--- GCTTCAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 6 GTG 1 0 224668 CASAVA_Build 4 180160418 6I TAAAGGAGTC ------/ACAAAA CTAAAGGATA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 ACAAAA 0 1 224669 CASAVA_Build 4 180163029 1I TGATCTATAT -/C CCTTTTGAAG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 2 3 224670 CASAVA_Build 4 180164016 2D AGGGGAAAAG AC/-- AGAAAAAAAA 3070 hom 64 het 31 0 25 8 AC 1 0 224671 CASAVA_Build 4 180167497 2I TGAAGAATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AT 5 6 224672 CASAVA_Build 4 180175779 3D GTTGGTGAGA AGC/--- AGCTTGACTT 3070 hom 90 het 34 0 30 6 AGC 2 1 224673 CASAVA_Build 4 180187767 1I TTGATATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 126 het 49 0 40 9 T 10 11 224674 CASAVA_Build 4 180219685 3I TTGAGATAAC ---/AAT AACATTAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAT 0 1 224675 CASAVA_Build 4 180221643 2I GGAAACTAAC --/AG AGATACCAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AG 1 2 224676 CASAVA_Build 4 180222502 1D ATTCAGACTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 9 8 224677 CASAVA_Build 4 180223941 1I CCTTATAATT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 7 8 224678 CASAVA_Build 4 180225251 1D GAGAAAACTT C/- CAAGAAGTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 2 1 224679 CASAVA_Build 4 180229668 1D TTTCAAAATT A/- AAAGTCTGAT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 4 3 224680 CASAVA_Build 4 180230075 1I TGTAGAAAAA -/T TTTGGGTTTT 3070 het 169 hom 37 1 29 7 T 3 4 224681 CASAVA_Build 4 180232618 2D ATTAGAAAAA GG/-- GGGGGGGGTA 3070 hom 36 het 29 0 15 14 G 10 8 224682 CASAVA_Build 4 180239082 1I GTGCAAATAT -/A AAAACTTTAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 4 5 224683 CASAVA_Build 4 180261266 1I AATCTGCAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 9 10 224684 CASAVA_Build 4 180265507 2I CACTTCTCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 TC 8 9 224685 CASAVA_Build 4 180267764 1D TTACTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 11 10 224686 CASAVA_Build 4 180272325 3I GTAGGCAGTC ---/TCT TCTTCTTGCC 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 TCT 2 3 224687 CASAVA_Build 4 180287865 4I TTCCCTTTTG ----/TCCT TCTTTCCTTC 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 TCCT 0 1 224688 CASAVA_Build 4 180298155 3D GCTCTAACAG TTC/--- TTCTACCCCA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 TTC 2 1 224689 CASAVA_Build 4 180302092 5D TCAACATTAA CAGAT/----- CAAAGAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 6 CAGAT 1 0 224690 CASAVA_Build 4 180302976 1D ACACCGCCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 10 9 224691 CASAVA_Build 4 180306228 1D TGTTAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 T 11 10 224692 CASAVA_Build 4 180306872 1I GAAATAAAAA -/T GTATATGTGA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 0 1 224693 CASAVA_Build 4 180310861 2I CTGCTTTTTG --/GT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 GT 0 1 224694 CASAVA_Build 4 180315866 1I ATGAATTTTT -/A AAAGATTTTC 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 A 3 4 224695 CASAVA_Build 4 180320901 1I TCCTTAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 11 12 224696 CASAVA_Build 4 180329150 2I GTTCATGAGG --/TC TCAGGAGATC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 TC 1 2 224697 CASAVA_Build 4 180329414 3D AAAGAAAAAA AAG/--- AATAAAAGAA 3070 het 3028 hom 20 11 7 2 AAG 1 0 224698 CASAVA_Build 4 180331370 1D GTTCAAACGG T/- TTTTGTGTGA 3070 het 3070 hom 33 12 20 2 T 5 4 224699 CASAVA_Build 4 180334111 1I AAAGTATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 10 11 224700 CASAVA_Build 4 180337643 1D TTGATTTGAT G/- GGGTTTTTTT 3070 hom 45 het 30 0 16 14 G 4 3 224701 CASAVA_Build 4 180338798 5I CTTTTATGGC -----/AAAGA AAAGAAAAGT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 AAAGA 1 2 224702 CASAVA_Build 4 180346342 1I TTTTGATAAG -/T TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 5 6 224703 CASAVA_Build 4 180354487 14I TCTGACGGGA --------------/TACCACATGGACAT ATATGTTCAG 3070 hom 78 het 30 0 27 5 TACCACATGGACAT 0 1 224704 CASAVA_Build 4 180355808 1I TTTTAAAAAG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 7 8 224705 CASAVA_Build 4 180357865 1I AGTTCACCAA -/C TGAGATAGTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 0 1 224706 CASAVA_Build 4 180359139 1D AATACAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 30 1 23 6 A 12 11 224707 CASAVA_Build 4 180362966 2I TGCGTGTGTG --/TA TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TA 0 1 224708 CASAVA_Build 4 180371701 2D TTTGGAGGGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 AG 6 5 224709 CASAVA_Build 4 180375975 1I TTTTATTTCC -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 1 2 224710 CASAVA_Build 4 180376352 4D AGCCACTAGC TTTG/---- TTTGAGTTGA 3070 het 3070 ref 43 29 13 2 TTTG 2 1 224711 CASAVA_Build 4 180376780 1D TATATTCTGG A/- AAAAAAAAAT 2411 het 2411 ref 19 12 5 2 A 10 9 224712 CASAVA_Build 4 180378053 1I AAGGGGGGCA -/G GGAGGTGCCG 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 G 2 3 224713 CASAVA_Build 4 180380398 2I ATGGATGTAT --/AA AGCATATATT 3070 het 3070 ref 53 33 16 4 A 1 3 224714 CASAVA_Build 4 180397992 1I CATTTTATTT -/C GAAAATTTGG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 C 0 1 224715 CASAVA_Build 4 180398439 3I CATTGTCAAA ---/AGT AGAACAGAAA 3070 het 3070 hom 31 13 10 8 AGT 0 1 224716 CASAVA_Build 4 180398690 5D GGGAGGTTTC CTACG/----- CTGTTCTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 17 3 CTACG 1 0 224717 CASAVA_Build 4 180400086 25I CTATCCTGGG -------------------------/ACCTCTATTTCATTCCTATCTTCAT TGAGGGCATT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 ACCTCTATTTCATTCCTATCTTCAT 0 1 224718 CASAVA_Build 4 180401787 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 T 6 5 224719 CASAVA_Build 4 180401906 6D ACAGGAGGGA GCCACC/------ GCACCCAGCC 3070 het 3070 ref 26 14 11 2 GCCACC 1 0 224720 CASAVA_Build 4 180403107 1I TTTTAAAATG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 7 8 224721 CASAVA_Build 4 180404046 5D CTCACACTAA TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 TTTTC 3 2 224722 CASAVA_Build 4 180404752 1I CAAAATACTT -/G AAATAAGACT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 G 0 1 224723 CASAVA_Build 4 180408979 1D TTTATCCTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 9 8 224724 CASAVA_Build 4 180409574 4I AGCACATTAG ----/TTAC TTGCTTTGAC 3070 het 2776 hom 19 7 11 1 TTAC 0 1 224725 CASAVA_Build 4 180411448 2I CACAAAAGTA --/AC ACAGAAATGA 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 AC 1 2 224726 CASAVA_Build 4 180411908 1I TCAATATACA -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 5 6 224727 CASAVA_Build 4 180412483 2D GAGTGCAATG GC/-- GCACAATCTT 3070 het 3070 hom 30 8 13 11 GC 2 1 224728 CASAVA_Build 4 180414869 1I TCAGGGAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 8 9 224729 CASAVA_Build 4 180416973 3D ATTTAGTCTT CTG/--- CTAATTTAGT 3070 het 3070 ref 38 24 9 7 CTG 1 0 224730 CASAVA_Build 4 180419006 1D TTAATAAACT C/- CCTTTTATAT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 C 3 2 224731 CASAVA_Build 4 180421980 1D AATCAATAGC A/- GGAGGAAAAT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 1 0 224732 CASAVA_Build 4 180422413 3I AAATAATAAA ---/ATT ATAAATGAAA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 ATT 0 1 224733 CASAVA_Build 4 180454801 2I ATATATTTAC --/TA TGTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 TA 0 1 224734 CASAVA_Build 4 180459292 1I CCAGGAGCTG -/T TTTTTTTTTT 2030 het 2030 ref 18 9 6 3 T 11 12 224735 CASAVA_Build 4 180472000 2D AAAAAAATAA AT/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AT 1 0 224736 CASAVA_Build 4 180480791 1I AATTGATAAC -/A TTTTTTTATT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 0 1 224737 CASAVA_Build 4 180486101 5I CATCTTTACT -----/TATAA TATACTTGTC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TATAA 0 1 224738 CASAVA_Build 4 180486243 39D AACAAATAGA AAGTAGATTCCCCCTCAACTTCTTTTTGAATTTAAGATT/--------------------------------------- AATAATCAGT 2793 het 2793 ref 20 22 7 3 AAGTAGATTCCCCCTCAACTTCTTTTTGAATTTAAGATT 1 0 224739 CASAVA_Build 4 180488482 2D TTTATTTATT TA/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 TA 1 0 224740 CASAVA_Build 4 180490779 1I ATGTCATTTG -/A AAAAAAAAAT 2689 het 2689 ref 23 11 6 6 A 9 10 224741 CASAVA_Build 4 180491226 2D AAAATTGAAA AC/-- ACAGAAATAA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 AC 2 1 224742 CASAVA_Build 4 180491506 1I AATACCTCAA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 46 23 12 11 T 6 7 224743 CASAVA_Build 4 180496613 1D TTATCCCACA T/- CTTACTGCCA 1445 het 1445 ref 10 6 3 1 T 1 0 224744 CASAVA_Build 4 180496717 1D CACAAATGTT C/- CCCGCTTTCT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 C 4 3 224745 CASAVA_Build 4 180497047 1I ACACACAGGT -/A TTTTGAGACC 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 A 0 1 224746 CASAVA_Build 4 180499914 8D ACACACACAC ACACACAA/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 33 11 19 5 ACACACAA 1 0 224747 CASAVA_Build 4 180500999 1D GATATCTTTT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 7 6 224748 CASAVA_Build 4 180503436 1D AGAAATCATG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 8 7 224749 CASAVA_Build 4 180505572 1D CAACGACAAC A/- AAAAACACAG 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 6 5 224750 CASAVA_Build 4 180512624 1D AATTTCAGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 132 het 45 0 45 0 A 10 9 224751 CASAVA_Build 4 180514293 8D AACTTTACCT ATATTAAA/-------- ACATCCTTAT 3070 hom 120 het 44 0 41 7 ATATTAAA 1 0 224752 CASAVA_Build 4 180524750 2D ATCCCCCCGC TG/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 TG 1 0 224753 CASAVA_Build 4 180525176 1I AAAAATACAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 8 9 224754 CASAVA_Build 4 180526865 1D GTATGTGATT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 9 8 224755 CASAVA_Build 4 180528814 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1140 het 99 hom 11 1 4 6 A 15 16 224756 CASAVA_Build 4 180534698 5I TCTTGTATAG -----/TTTTC TTTACATTTA 3070 hom 65 het 25 0 22 3 TTTTC 0 1 224757 CASAVA_Build 4 180536281 2D CCATAGATAT AA/-- AAACCATCGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 5 3 224758 CASAVA_Build 4 180536439 2I ATTTTTCAAT --/AA ACTGAATAGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 1 3 224759 CASAVA_Build 4 180538155 1D GTTCAAAAAA T/- AAAATTCTGA 3070 het 76 hom 29 1 25 4 T 1 0 224760 CASAVA_Build 4 180547514 1D TACTACACTG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 43 16 20 8 A 8 7 224761 CASAVA_Build 4 180553173 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAGA 2725 het 2541 hom 15 7 7 1 A 8 9 224762 CASAVA_Build 4 180556438 4D TCACTCCATC TTGG/---- TTGTAAGCAG 3070 hom 93 het 36 0 32 6 TTGG 1 0 224763 CASAVA_Build 4 180556533 1D TATATTAGTA C/- TGTATTTATT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 1 0 224764 CASAVA_Build 4 180558511 1D TAAACTGGTG T/- TGGTGGCTTA 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 2 1 224765 CASAVA_Build 4 180563334 1I TAGACCCAGA -/G GGGCCAGAAG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 3 4 224766 CASAVA_Build 4 180570744 6D GACTGTCATA ATGTAT/------ TTACAGACCA 2970 het 2970 ref 41 23 7 14 ATGTAT 1 0 224767 CASAVA_Build 4 180594242 1D TGAGCCCCCT C/- CCCCCACTCT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 C 6 5 224768 CASAVA_Build 4 180605953 1I GCATAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 11 12 224769 CASAVA_Build 4 180608917 8I CAGGGAGAGA --------/CATTTGTC TTTACAGTCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CATTTGTC 0 1 224770 CASAVA_Build 4 180617879 5D GCAGAAGGGA CTTGC/----- CTTGTCTCAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 5 CTTGC 1 0 224771 CASAVA_Build 4 180619070 1D AACAAAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 10 9 224772 CASAVA_Build 4 180626763 1D GGCAGGGGTA G/- GGGGAGAAGT 3070 hom 81 het 35 0 28 8 G 5 4 224773 CASAVA_Build 4 180630269 1D TGTTTTCCTC T/- TTTAAAATTA 3070 het 2708 hom 32 9 17 6 T 4 3 224774 CASAVA_Build 4 180632501 1I TAAGCAAACT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 6 7 224775 CASAVA_Build 4 180632685 1D CTTATTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 27 2 15 10 T 19 18 224776 CASAVA_Build 4 180633559 1I AAAAAAAAAA -/T TTTAAAAACA 3070 het 1391 hom 29 4 21 4 T 3 4 224777 CASAVA_Build 4 180633956 1I TTCCTATAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 224778 CASAVA_Build 4 180638232 1I CTTTCCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 13 14 224779 CASAVA_Build 4 180641105 1I GTGGGATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 25 1 18 6 A 11 12 224780 CASAVA_Build 4 180660242 1D TTATTGTTTG T/- CTTTTGGATC 3070 het 3070 hom 49 19 22 9 T 1 0 224781 CASAVA_Build 4 180662212 1I AAACTCATTA -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 6 7 224782 CASAVA_Build 4 180665448 1I CAAGACTCGG -/A AAAAAAAAAA 2780 het 2780 ref 26 10 8 8 A 13 14 224783 CASAVA_Build 4 180667227 1D TGGCACCATG T/- ACAAGTCTGT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 1 0 224784 CASAVA_Build 4 180670607 3D GTAAGTAAAT AGG/--- AGAACTAATC 3070 het 3070 hom 60 24 30 6 AGG 1 0 224785 CASAVA_Build 4 180686931 1I AACAAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 38 2 31 5 T 11 12 224786 CASAVA_Build 4 180688535 1D TTTAGAAAAA C/- AATGTAAATA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 C 1 0 224787 CASAVA_Build 4 180693077 1I TTTAAATTCC -/A CATGGCTGAG 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 A 0 1 224788 CASAVA_Build 4 180700427 2D AATCAGGAAA CT/-- CTCATATAAT 3070 het 3070 ref 32 19 13 0 CT 2 1 224789 CASAVA_Build 4 180700693 9D GCCTTAAAAT GATATGTTC/--------- GATATGTTCA 3070 het 3070 ref 54 27 26 3 GATATGTTC 2 1 224790 CASAVA_Build 4 180704469 1I CAGGAAAGAG -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 C 7 8 224791 CASAVA_Build 4 180705996 1I CAGAAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 49 het 24 0 19 5 A 9 10 224792 CASAVA_Build 4 180706649 1D CATGGATAGG A/- AGAATCAATA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 2 1 224793 CASAVA_Build 4 180707221 1D CTAAAACGCC A/- AAAACAATGG 3070 het 3070 ref 25 17 7 1 A 5 4 224794 CASAVA_Build 4 180707874 12I AATGACAGAC ------------/TTGATAAAGAAA ATATGGCACA 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 TTGATAAAGAAA 0 1 224795 CASAVA_Build 4 180708698 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 3 het 49 1 28 20 TG 10 9 224796 CASAVA_Build 4 180709238 1D GAGGGCCAGA G/- GGGGAAACAG 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 G 5 4 224797 CASAVA_Build 4 180711787 3D CCCAGGGACG AGC/--- AGCAGGAGAC 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 AGC 2 1 224798 CASAVA_Build 4 180713198 2I TGTATGCAGG --/GA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 GA 0 1 224799 CASAVA_Build 4 180721240 1D CCTCAAACAC A/- CACACACAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 1 0 224800 CASAVA_Build 4 180722926 1D GTGGCCATTT A/- TTTTATGGAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 1 0 224801 CASAVA_Build 4 180723266 1I39M1I CTTTTTTCTC -TTTCTTCCTCACCCTCCTCTTTCCTCTCTACTTCCTTTT-/TTTTCTTCCTCACCCTCCTCTTTCCTCTCTACTTCCTTTTC CTCCTGTTCT 3070 hom 93 het 27 0 32 4 N/A 0 0 224802 CASAVA_Build 4 180723984 14I TGTTACCAAT --------------/GACTATTTCTGAAA GAGAAGAGAG 3070 hom 90 het 38 0 31 8 GACTATTTCTGAAA 0 1 224803 CASAVA_Build 4 180725941 1I TAGTTGGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1296 hom 43 3 32 8 T 11 12 224804 CASAVA_Build 4 180726294 4I AGTAAAGAGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 41 het 46 2 38 6 AAAC 3 4 224805 CASAVA_Build 4 180728038 4I AGTCTCTGAG ----/ACTA ACTACCCTGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ACTA 1 2 224806 CASAVA_Build 4 180728560 3D TAGTAGTCTA CTG/--- CTAACCAGAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 CTG 1 0 224807 CASAVA_Build 4 180729454 1D ATCCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 12 11 224808 CASAVA_Build 4 180730947 4I AGTAAATCTT ----/GATA GATATAGTCA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 GATA 1 2 224809 CASAVA_Build 4 180731292 1D GTCCAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 33 4 26 3 A 12 11 224810 CASAVA_Build 4 180733222 1D CCTGCTTTAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 8 224811 CASAVA_Build 4 180733724 1I AACAATTAAT -/A AAAATGGCAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 4 5 224812 CASAVA_Build 4 180739178 1I CATTTTCTTG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 24 11 7 6 A 8 9 224813 CASAVA_Build 4 180741688 1D AGGAAATTAT A/- AAATACAATA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 A 4 3 224814 CASAVA_Build 4 180744397 1D AGGACTCACT A/- AAAAAAATCA 3070 het 1619 hom 25 4 12 9 A 8 7 224815 CASAVA_Build 4 180744453 2D CCAGAACTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 32 1 12 19 A 14 12 224816 CASAVA_Build 4 180744987 1I ATTGCTATGT -/A AAATATTGTG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 3 4 224817 CASAVA_Build 4 180748708 1I GTGCATGCTA -/T TTTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 5 6 224818 CASAVA_Build 4 180752266 1D AAAGACCATA C/- TATTTTTAGA 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 C 1 0 224819 CASAVA_Build 4 180756205 5I AAAGGTTAAG -----/TAAAA TAAAATTCCT 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 TAAAA 1 2 224820 CASAVA_Build 4 180762025 1I TCAAACCACG -/A AAATGTTTGG 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 3 4 224821 CASAVA_Build 4 180762556 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1515 het 577 hom 15 3 5 7 T 14 15 224822 CASAVA_Build 4 180769246 2D ACATATATTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 43 het 19 0 15 4 AT 8 7 224823 CASAVA_Build 4 180776367 2I AAATGTGTGC --/TT TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 6 8 224824 CASAVA_Build 4 180786444 1D CTCACTCTTC T/- GCAAAACCAC 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 T 1 0 224825 CASAVA_Build 4 180791149 26I CAATCCATGA --------------------------/ACATAACATTTCTTTCCATTTATTTG TATCTTCTTC 3070 hom 75 het 24 0 26 0 ACATAACATTTCTTTCCATTTATTTG 0 1 224826 CASAVA_Build 4 180801465 1I AGATTAAAAC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 7 8 224827 CASAVA_Build 4 180803595 1I ACTTCATACC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 7 8 224828 CASAVA_Build 4 180808636 1D GTGAGTGTGG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 8 7 224829 CASAVA_Build 4 180814115 1I TTCTTAACAG -/C TTTTGCATGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 0 1 224830 CASAVA_Build 4 180834414 1I GCAATACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 808 hom 33 3 24 6 A 10 11 224831 CASAVA_Build 4 180837711 1D ACTAAAGTTA C/- ATAACTCAGT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 1 0 224832 CASAVA_Build 4 180848378 1I TGATCCTGTT -/A ACAAACATCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 1 2 224833 CASAVA_Build 4 180848680 5I TTATTCCTTA -----/AAAGT AAAGGGGCCA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAGT 0 1 224834 CASAVA_Build 4 180852857 1I AAGTGATGAG -/A AAAAAATAGG 3070 hom 72 het 32 0 28 4 A 6 7 224835 CASAVA_Build 4 180858038 1D CTTAATACTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 9 8 224836 CASAVA_Build 4 180862183 1D ATACAGTAAG A/- AAAAAATCAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 6 224837 CASAVA_Build 4 180868826 3D TGGGGCAAAA GTT/--- GTTATATTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 5 GTT 2 1 224838 CASAVA_Build 4 180869249 8D TGGTCAAGAT TGAAAATG/-------- AACTATTTAG 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 TGAAAATG 1 0 224839 CASAVA_Build 4 180887618 2D GAGTTGTGTA CT/-- CTTTCTCAGA 3070 het 3070 ref 56 28 22 7 CT 2 1 224840 CASAVA_Build 4 180890988 1D TCTTTCAAGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 8 7 224841 CASAVA_Build 4 180895364 1D AGTTATGCAC T/- AAATGACAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 1 0 224842 CASAVA_Build 4 180907665 1I AAACAAACTG -/A AAAAAAAACG 3014 het 3014 ref 32 14 11 7 A 8 9 224843 CASAVA_Build 4 180908160 1I ACTTTAGAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 9 10 224844 CASAVA_Build 4 180909832 1I TCTCTAAAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 8 9 224845 CASAVA_Build 4 180919391 1D TTCTTTTTTT C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 9 8 224846 CASAVA_Build 4 180919713 2I ATAAAAAAAT --/CA CACATTAGTG 3070 het 3070 ref 48 23 23 2 CA 2 3 224847 CASAVA_Build 4 180921947 8D CTGGCTGTTT TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 2839 het 13 hom 20 1 9 11 TG 11 7 224848 CASAVA_Build 4 180929978 1I TTCTCTGACA -/T TTTTTCTAAT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 5 6 224849 CASAVA_Build 4 180933664 1I GTTTCTTTGT -/A AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 6 7 224850 CASAVA_Build 4 180934436 1D GGTTTGACAT C/- AATAATGCAC 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 C 1 0 224851 CASAVA_Build 4 180934994 11D AAGCTATTTT TAAGCTATTTC/----------- TAAGCTATTT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 TAAGCTATTTC 2 1 224852 CASAVA_Build 4 180936694 1I ATTCCTTTAC -/T TTTTCTAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 4 5 224853 CASAVA_Build 4 180944354 1I TTGTGTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 419 hom 32 1 28 3 T 9 10 224854 CASAVA_Build 4 180944682 2I TGCTTTTTTT --/TG TTTGTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TG 0 1 224855 CASAVA_Build 4 180948443 3I CATAAAATAA ---/TGT TGTCTTAGTT 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 TGT 1 2 224856 CASAVA_Build 4 180954471 1D TATTAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 32 2 27 3 A 11 10 224857 CASAVA_Build 4 180954697 3I TATACACCTA ---/TAT TATTATTATT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 TAT 5 6 224858 CASAVA_Build 4 180959269 5D GTGTTAGTGT TTAAC/----- ACAAGCTGTT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TTAAC 1 0 224859 CASAVA_Build 4 180960615 1I GTTATTGGAT -/C TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 0 1 224860 CASAVA_Build 4 180972079 4I TCAAGCAGAC ----/TCTA TCTAAGTTGC 3070 hom 84 het 35 0 28 7 TCTA 1 2 224861 CASAVA_Build 4 180979589 1D TAGAATAGTG A/- AAACAATATC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 4 3 224862 CASAVA_Build 4 180984906 3D TTTAATATGC ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 36 het 18 0 13 6 ATT 7 6 224863 CASAVA_Build 4 180995219 1I ATTTTTGGAG -/A AAAAAAAAAC 2775 het 2775 ref 29 16 8 5 A 9 10 224864 CASAVA_Build 4 180997150 3I TCTTGGAGAT ---/ATC ATGTTTGTTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ATC 0 1 224865 CASAVA_Build 4 181000899 1D GCATGTCCAT A/- AGCAATCTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 1 224866 CASAVA_Build 4 181002139 1I AAGAGATGGG -/A AATAAATCTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 3 224867 CASAVA_Build 4 181012895 1D ATATAATACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 333 hom 60 1 51 9 A 10 9 224868 CASAVA_Build 4 181016895 1I CTCCTTTTTT -/G TCCCTACAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 224869 CASAVA_Build 4 181018285 1D ATAAAAACAG A/- GGTAATAAAC 3070 het 252 hom 33 5 12 16 A 1 0 224870 CASAVA_Build 4 181020293 1D AGCCAGTACC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 A 9 8 224871 CASAVA_Build 4 181021152 1I GAATTAAAAA -/T AAAAGAAGTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 0 1 224872 CASAVA_Build 4 181023596 1I TAGTTTATAC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 7 8 224873 CASAVA_Build 4 181029084 3I TGTAGATTTC ---/AAT AATATCTTTT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AAT 1 2 224874 CASAVA_Build 4 181033766 1D GAAGAGAAAA C/- CAAATACCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 2 1 224875 CASAVA_Build 4 181036276 1I TATGCCGTTC -/A AAAAGCTTAA 3070 hom 68 het 27 0 23 4 A 4 5 224876 CASAVA_Build 4 181039760 1D TCTAAAGCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3001 hom 24 8 11 6 A 10 9 224877 CASAVA_Build 4 181044944 1D ATTTCTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 22 1 15 6 A 12 11 224878 CASAVA_Build 4 181048861 2D CATTTCTAAC TT/-- ATTATAAACT 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 2 0 224879 CASAVA_Build 4 181049955 2D TAATTTGCTA AT/-- ATATATTTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AT 4 3 224880 CASAVA_Build 4 181053329 1D AATACAGGCG T/- TGAGCCACCA 3070 hom 33 het 17 0 12 6 T 2 1 224881 CASAVA_Build 4 181060064 2D AAATATACTC TT/-- TTATTTTGCT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 4 2 224882 CASAVA_Build 4 181063387 1D TCTCTCAACC A/- AAAAAAATAT 3070 het 1897 hom 28 5 15 8 A 8 7 224883 CASAVA_Build 4 181076682 1D TTCTTTAGAA G/- AAATAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 G 1 0 224884 CASAVA_Build 4 181080370 1I ATATTGTAAT -/G AGAATTTCAG 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 G 0 1 224885 CASAVA_Build 4 181092992 1D CTGATTAACC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 A 8 7 224886 CASAVA_Build 4 181104919 1I AAAACTAACA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 8 9 224887 CASAVA_Build 4 181107298 1I TCTGAATCTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 8 9 224888 CASAVA_Build 4 181109052 1D ATAAATAACC T/- TTTGAATTCT 3070 het 3070 ref 45 23 17 6 T 4 3 224889 CASAVA_Build 4 181110896 1D TTATTATTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 T 9 8 224890 CASAVA_Build 4 181111899 2I TTTTTGATAG --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 9 11 224891 CASAVA_Build 4 181113121 1D GTTCTCCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 26 10 T 13 12 224892 CASAVA_Build 4 181114699 4D GCAAAAGTAT GGCC/---- TGCACTTCGT 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 GGCC 1 0 224893 CASAVA_Build 4 181118180 1D11M6I TTTTCTTTTC TTTTTTTCAGAG------/-TTTTTTCAGAGGTCAAT GTCAAAGTTT 3070 het 3070 ref 46 25 23 5 N/A 0 0 224894 CASAVA_Build 4 181123660 1I CCCCGGCAGG -/C CCCTGTGTGT 2889 hom 21 het 8 0 7 1 C 3 4 224895 CASAVA_Build 4 181124275 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 1362 hom 7 het 3 0 3 0 A 6 5 224896 CASAVA_Build 4 181127142 4I GACTAGCCTG ----/GTAA GTAATTTTCA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 GTAA 1 2 224897 CASAVA_Build 4 181127418 1D CAGTATTTCT A/- AAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 4 3 224898 CASAVA_Build 4 181130713 1I TTTTTATCAG -/A AATATAATTT 3070 hom 72 het 31 0 25 8 A 2 3 224899 CASAVA_Build 4 181132067 1I AAACAACAAC -/A AACAAAAAAC 2356 het 2350 hom 20 9 8 3 A 2 3 224900 CASAVA_Build 4 181134348 9D GCAGTCATCT CAAGTCTTG/--------- AATGGGGGGT 3070 het 3070 ref 51 29 21 8 CAAGTCTTG 1 0 224901 CASAVA_Build 4 181137423 1I GCTATGCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 26 1 20 5 T 11 12 224902 CASAVA_Build 4 181147532 1D AAATGACTAA C/- CCTATTTATT 3070 het 3070 ref 39 24 12 5 C 3 2 224903 CASAVA_Build 4 181149924 17I GAACACATGG -----------------/ACATACAGAGAGGAACA ACACATACTG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 ACATACAGAGAGGAACA 0 1 224904 CASAVA_Build 4 181155534 3D GTTATCTTAC CTT/--- CTTCTGTGAT 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 CTT 2 1 224905 CASAVA_Build 4 181155639 2I TAATTTTGAT --/AA AGTCAGTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 3 224906 CASAVA_Build 4 181156528 1I TTTTTAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 T 10 11 224907 CASAVA_Build 4 181157017 4D AAAAAATAAG AGTT/---- AGAATTATTC 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 AGTT 1 0 224908 CASAVA_Build 4 181157259 4D AAAAAATAAT AGTC/---- AGTCATTACT 3070 het 3070 ref 38 21 13 7 AGTC 2 1 224909 CASAVA_Build 4 181160463 2I ATAAGAATAA --/AG AGTGTCTCAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AG 1 2 224910 CASAVA_Build 4 181168395 2D CAAACAGATA AC/-- ACACATCTTC 3070 het 3070 hom 47 13 28 6 AC 3 2 224911 CASAVA_Build 4 181169645 1D CTTCTGAATA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 9 8 224912 CASAVA_Build 4 181185115 1I GAGGGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 644 hom 43 6 27 10 A 13 14 224913 CASAVA_Build 4 181193469 1D GTTTCCAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 9 8 224914 CASAVA_Build 4 181198842 1I AGTGCAGAAG -/A AAAAAACATT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 A 6 7 224915 CASAVA_Build 4 181208982 2D TTTAAATGAC AT/-- GTGTTAAATC 3070 hom 90 het 34 0 31 5 AT 1 0 224916 CASAVA_Build 4 181210157 1D GTTTATACCT A/- AAAAAACTGA 3070 hom 78 het 27 0 26 2 A 7 6 224917 CASAVA_Build 4 181213418 1D TTTTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 2888 het 566 hom 17 2 9 7 T 13 12 224918 CASAVA_Build 4 181214820 4D TGGGGAATAC GTGT/---- GTGTATGTGT 3070 hom 111 het 42 0 37 9 GT 4 2 224919 CASAVA_Build 4 181233419 2D AGCTAAAAAC AT/-- AAAAAGTGTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AT 1 0 224920 CASAVA_Build 4 181238171 3D CTGTAGTCTG TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 TAT 5 4 224921 CASAVA_Build 4 181240473 1D AACAGTAGTT C/- CAAAGAAGAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 2 1 224922 CASAVA_Build 4 181241492 1I AGATTTTTTT -/A TAAAAAAACT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 1 224923 CASAVA_Build 4 181247278 1D TTCTTTGAAA T/- TTGCATTTGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 3 2 224924 CASAVA_Build 4 181260168 1I TGGGGAGCCT -/C CCCCCTGAGT 3070 hom 79 het 35 0 24 11 C 5 6 224925 CASAVA_Build 4 181279161 2I37M14D TAACTAACTG --ATATATATATGTTTTTGTTTTAATAAGCCCAAATCAATCAAGGTGTTTAAC/ATATATATATATGTTTTTGTTTTAATAAGCCCAAATCAA-------------- TCACTTATAT 3070 hom 126 het 35 0 43 5 N/A 0 0 224926 CASAVA_Build 4 181282472 1I TTTTCTGGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 8 9 224927 CASAVA_Build 4 181282709 2D TGATGCTCTG AA/-- AAAATTTGTC 3070 het 3070 hom 49 16 30 4 A 6 4 224928 CASAVA_Build 4 181286466 1D GAAAATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 12 11 224929 CASAVA_Build 4 181288012 1D AAAAGGTACG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 278 hom 32 1 20 11 T 10 9 224930 CASAVA_Build 4 181289121 20D GCTTTTTCAG AAAAAAACAAAAACAAGAAC/-------------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 23 0 22 4 AAAAAAACAAAAACAAGAAC 1 0 224931 CASAVA_Build 4 181292789 11I GAATGCTCAC -----------/CATGGTACATA CTTGCTGACA 3070 hom 151 het 51 0 51 2 CATGGTACATA 0 1 224932 CASAVA_Build 4 181294602 2D TTTTTACTTT TC/-- TAAAGTTGAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TC 1 0 224933 CASAVA_Build 4 181299547 4I AAAGAAAAAG ----/AAAA AAAAAAACCA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 7 11 224934 CASAVA_Build 4 181300931 4D TGGAAGCCAT TAGA/---- TGGATTTTGC 3070 hom 102 het 40 0 33 8 TAGA 1 0 224935 CASAVA_Build 4 181304661 2I AACACTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 29 0 19 11 T 12 14 224936 CASAVA_Build 4 181306614 1I TGGTGGAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 8 9 224937 CASAVA_Build 4 181308559 1D TCGCGATATA G/- CTGAATAAGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 0 224938 CASAVA_Build 4 181309826 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 31 3 T 10 11 224939 CASAVA_Build 4 181314151 4I GAGCAGAAAC ----/AGAT TAGATAAGGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AGAT 0 1 224940 CASAVA_Build 4 181316395 1D GAAGCTGGGA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 8 7 224941 CASAVA_Build 4 181319759 2I GAAATGGAGG --/GC GAGAGAGAGA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GC 0 1 224942 CASAVA_Build 4 181321973 5I GTAACTTTTT -----/TATTA TATTAATTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TATTA 1 2 224943 CASAVA_Build 4 181324083 1D CTAATTTTGA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 8 7 224944 CASAVA_Build 4 181333455 2I GGTAGGTGAC --/AG AGAGGGAACA 3070 hom 129 het 50 0 42 8 AG 2 3 224945 CASAVA_Build 4 181334549 1D CATTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 3070 hom 38 16 13 9 G 11 10 224946 CASAVA_Build 4 181336939 1D AATTAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 30 8 T 11 10 224947 CASAVA_Build 4 181336950 1D TTTTTTTTTT G/- TATATGAAGA 3070 het 8 hom 34 2 25 8 G 1 0 224948 CASAVA_Build 4 181337531 3I AAAGTATAAT ---/AAG GAGTTGGTGT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAG 0 1 224949 CASAVA_Build 4 181350148 1D AAAAGCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 389 hom 32 2 25 5 T 10 9 224950 CASAVA_Build 4 181356747 1I TTCAGCAGAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 7 8 224951 CASAVA_Build 4 181364864 1D CAACCAGGCA T/- TTTTTTATAC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 7 6 224952 CASAVA_Build 4 181365039 6D ATACATGGAG ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 24 het 15 0 9 7 AT 12 9 224953 CASAVA_Build 4 181366797 1D GGTGATATAT A/- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 1 0 224954 CASAVA_Build 4 181378092 1I TTATTTCCAT -/A AGATTATTGG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 1 2 224955 CASAVA_Build 4 181378916 1D TTTGATAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 20 0 14 6 T 10 9 224956 CASAVA_Build 4 181387705 1D ATGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 6 A 10 9 224957 CASAVA_Build 4 181387852 1D GGCATTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1533 hom 33 6 15 12 T 17 16 224958 CASAVA_Build 4 181390250 2I AACTAACACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 A 10 12 224959 CASAVA_Build 4 181398301 2I TAATGCAGGC --/AT ATGTTTTAGA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 AT 1 2 224960 CASAVA_Build 4 181411602 1D CCTTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2633 hom 29 8 15 7 A 12 11 224961 CASAVA_Build 4 181417011 1D GGAGAGAGAG A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 8 7 224962 CASAVA_Build 4 181419230 1D GACAGAGAGA G/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 G 1 0 224963 CASAVA_Build 4 181423124 2D GCATCCTCAC CA/-- CACAAGAACA 3070 het 1531 hom 23 6 12 5 CA 3 2 224964 CASAVA_Build 4 181437106 1I AACTGGGCCG -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 50 22 17 11 A 6 7 224965 CASAVA_Build 4 181444072 2D GTGTGTTTAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 19 9 13 GT 9 8 224966 CASAVA_Build 4 181445110 3D CTCTTTGTTC TGA/--- TGATCTCCCT 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 TGA 2 1 224967 CASAVA_Build 4 181453078 1D TGATCTGCCC A/- CCTTGGCCTC 1764 het 1464 hom 9 3 4 2 A 1 0 224968 CASAVA_Build 4 181460659 1I CATTTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1407 het 1407 ref 15 5 4 6 A 11 12 224969 CASAVA_Build 4 181461260 2I CTGGCCTTTG --/AA AAAAATGCCG 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 A 5 7 224970 CASAVA_Build 4 181462037 3D TTGAATTTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 6 A 15 12 224971 CASAVA_Build 4 181462902 1I AACTATTTTT -/A TGGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 A 0 1 224972 CASAVA_Build 4 181463374 1D ATTTTGCTGA T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 96 het 38 0 33 7 T 7 6 224973 CASAVA_Build 4 181467224 1D GAAGGTTTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 A 10 9 224974 CASAVA_Build 4 181470090 2D GGGAATGGCC CA/-- CACAGGATGG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 CA 3 2 224975 CASAVA_Build 4 181487758 2D TATACACACG TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TA 6 5 224976 CASAVA_Build 4 181489396 8I ATCTGTGTGC --------/ATAAATAT ATAAACAGGC 3070 hom 114 het 40 0 39 2 ATAAATAT 0 1 224977 CASAVA_Build 4 181498052 2I ACATATTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 TG 8 9 224978 CASAVA_Build 4 181501870 4D TATAAATAAA AATT/---- AATCCCATGT 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 AATT 1 0 224979 CASAVA_Build 4 181502681 1D ATTTCTAATA T/- TTTCTCCTAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 4 3 224980 CASAVA_Build 4 181506869 9I ACAAATAGTT ---------/TTTAATGAA TAATGATTCT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TTTAATGAA 0 1 224981 CASAVA_Build 4 181510610 4I ACACACTCTT ----/AAAC AACCAGATTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAAC 0 1 224982 CASAVA_Build 4 181516532 6I AAATTTTCTA ------/TTATAC TTAAAGTTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTATAC 0 1 224983 CASAVA_Build 4 181523998 6D TATATGTATT TATATA/------ TACATACATA 2983 het 2291 hom 19 7 9 7 TA 4 1 224984 CASAVA_Build 4 181526109 1I ACAAAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 A 10 11 224985 CASAVA_Build 4 181531183 3I TATCACACTT ---/AAA GATGTAAGGG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 3 224986 CASAVA_Build 4 181531721 4D AGTTCCAGAC ATTA/---- ATTAAGGTTT 3070 het 3070 ref 46 30 14 3 ATTA 2 1 224987 CASAVA_Build 4 181535541 16D CAATGTCTGG CAGCAGACATTGTGAT/---------------- CACCACCGTT 3070 het 3070 ref 42 26 15 6 CAGCAGACATTGTGAT 1 0 224988 CASAVA_Build 4 181539590 1D CTGGAGAATT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1151 hom 25 5 14 6 C 11 10 224989 CASAVA_Build 4 181540313 4D TTTTTCTTCA CTGT/---- CTGACCTTTG 3070 het 3070 ref 39 22 15 5 CTGT 1 0 224990 CASAVA_Build 4 181550142 4I TTCATCCTCA ----/CGAC CGATCTAAAT 3070 hom 181 het 63 0 59 4 CGAC 0 1 224991 CASAVA_Build 4 181553744 2D ATTACATATC AT/-- ATATGTCTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AT 3 2 224992 CASAVA_Build 4 181553960 4D ATTCACAAAA AATC/---- AATATTCAAT 3070 hom 51 het 22 0 18 6 AATC 1 0 224993 CASAVA_Build 4 181555369 3I ACGTTTTTGG ---/TTT GTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 0 3 224994 CASAVA_Build 4 181564168 1I TTCCAGAAAA -/T TGTATATGAA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 1 2 224995 CASAVA_Build 4 181565288 1I TGGCCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 760 hom 44 3 35 6 T 11 12 224996 CASAVA_Build 4 181569973 5D CTGTATTAAG AACTT/----- AACTTAAACA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AACTT 2 1 224997 CASAVA_Build 4 181580483 1D GAATTAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 11 10 224998 CASAVA_Build 4 181582809 1I AGTTTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 A 10 11 224999 CASAVA_Build 4 181583063 4I ATTTCAAAAG ----/ATAA ATAAATTTAG 3070 hom 66 het 30 0 22 8 ATAA 1 2 225000 CASAVA_Build 4 181588691 4D17M2D TGCGTGAGTG AGGAAGGAAGGATTTTAAACATT/----AGGAAGGATTTTAAACA-- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 37 0 35 8 N/A 0 0 225001 CASAVA_Build 4 181594172 6I ACAATAAACA ------/ATAACT ATATTATTAG 2767 het 2767 ref 21 9 8 4 ATAACT 0 1 225002 CASAVA_Build 4 181594370 1D TAGATTTAAG A/- ATATCCTTAG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 2 1 225003 CASAVA_Build 4 181595539 1I CCAGTTCACA -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 59 22 26 11 T 7 8 225004 CASAVA_Build 4 181603861 1D TTCTATCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 17 12 T 13 12 225005 CASAVA_Build 4 181604985 26D TGAGACCAGC CTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCT/-------------------------- CTGGCCAACA 3070 het 3070 ref 29 15 9 16 CTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCT 2 1 225006 CASAVA_Build 4 181605614 1I GTCTAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 2355 het 1848 hom 28 8 6 14 T 13 14 225007 CASAVA_Build 4 181611051 1D GTCTCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1184 het 1184 ref 42 29 3 10 T 12 11 225008 CASAVA_Build 4 181614434 1I AACATAACCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 7 8 225009 CASAVA_Build 4 181620172 1I TCCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 C 0 1 225010 CASAVA_Build 4 181635865 1I TAGTAGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 11 12 225011 CASAVA_Build 4 181655867 1I CTTTGTCCCC -/T GTTCCTCTCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 0 1 225012 CASAVA_Build 4 181669590 2D TTCTTGTCTT TC/-- TGTTTTCTTC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TC 1 0 225013 CASAVA_Build 4 181669639 9I TTCCTTCCCT ---------/CCTCCCTTC CCTCCCTTCC 3070 hom 24 het 14 0 9 5 CCTCCCTTC 1 2 225014 CASAVA_Build 4 181674138 2I GATATATTGC --/AA AAAAAAAAAA 2974 hom 42 het 22 0 13 9 A 14 16 225015 CASAVA_Build 4 181675987 8D ATTATTATTA TTATTATT/-------- TTGAGATGGA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TTATTATT 1 0 225016 CASAVA_Build 4 181678490 3I TCAAACATAT ---/TTA TTAACTGGTT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TTA 1 2 225017 CASAVA_Build 4 181679168 1I TCTCCCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 31 0 16 15 A 10 11 225018 CASAVA_Build 4 181679178 2I AAAAAAAAAA --/AG GGGGGGGAAG 3070 hom 69 het 31 0 21 10 AG 0 1 225019 CASAVA_Build 4 181681812 1D TAGTTCCCCC T/- CCATGCACAT 3070 het 3070 hom 49 17 24 8 T 1 0 225020 CASAVA_Build 4 181682842 1D TATGCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 12 11 225021 CASAVA_Build 4 181686079 1I AAGCTTATGC -/T TTTTCAAACA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 4 5 225022 CASAVA_Build 4 181691871 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1290 het 96 hom 16 2 7 8 A 16 15 225023 CASAVA_Build 4 181695831 1I ATTAAGCAGA -/G GTCAGAATTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 1 2 225024 CASAVA_Build 4 181701149 1I CATTTGTTGA -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 6 7 225025 CASAVA_Build 4 181708182 2D AGACAGGACA CT/-- CTGAAAGACG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 CT 2 1 225026 CASAVA_Build 4 181708305 1D TCTTAAGTCT C/- CATCTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 15 1 C 2 1 225027 CASAVA_Build 4 181709734 1D TGCGTCTCCT C/- CCTTAGCCTG 3070 het 3070 hom 50 15 31 5 C 3 2 225028 CASAVA_Build 4 181712039 3D GTCCTAACAA CTC/--- CTTGAACAAA 3070 het 3070 hom 48 19 24 7 CTC 1 0 225029 CASAVA_Build 4 181714127 1I ACCTTTTTTT -/A TTTAAAACTG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 0 1 225030 CASAVA_Build 4 181715615 1D ATGCCATGTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 9 8 225031 CASAVA_Build 4 181716047 1D AGTAACCCTA G/- GAATCACAAA 3070 het 3070 ref 39 21 17 2 G 2 1 225032 CASAVA_Build 4 181719817 8I ATTATATATT --------/TACACACA TACACACATA 3070 het 3070 hom 36 9 17 10 TACACACA 1 2 225033 CASAVA_Build 4 181724283 4D GAGTGTGAGG GTGA/---- GTGTGGGTGA 3070 het 3070 hom 44 19 18 8 GTGA 1 0 225034 CASAVA_Build 4 181724486 10D TGAGTGTGGG TGAGGGTCAC/---------- TGAGTGTAGG 3070 het 3070 ref 53 26 15 16 TGAGGGTCAC 1 0 225035 CASAVA_Build 4 181724593 2D GTGAGGGTGA GT/-- GTGAGGGTGT 3070 het 3070 ref 51 22 14 19 GT 2 1 225036 CASAVA_Build 4 181724800 2I TGAGTGTGAC --/TG AGAGTAAATG 3070 het 3070 hom 56 21 28 7 TG 0 1 225037 CASAVA_Build 4 181724911 8D GGGTGAAAGT GAGTGTGA/-------- GTGAGGGTGA 518 het 518 ref 43 17 6 23 GAGTGTGA 1 0 225038 CASAVA_Build 4 181725021 2I GTGTGTGGGT --/GA GAGTGAGCAT 3070 het 3070 ref 50 21 12 17 GA 1 2 225039 CASAVA_Build 4 181725707 1I TGTTTATATG -/A AAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 A 4 5 225040 CASAVA_Build 4 181727720 1D AAAAATAAAT A/- AAAAAAAAAG 1519 het 1519 ref 25 10 5 10 A 10 9 225041 CASAVA_Build 4 181756385 1D GACCTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 116 het 47 0 37 11 A 12 11 225042 CASAVA_Build 4 181760351 4I AATAAAAACT ----/TTCA TTAAGTTGAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTCA 0 1 225043 CASAVA_Build 4 181763965 2D GTTCTTAGAC AG/-- AAAATCATAT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 AG 1 0 225044 CASAVA_Build 4 181764601 1I AACTTGAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 A 9 10 225045 CASAVA_Build 4 181771599 1D TTATTTTTTT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 35 het 35 0 12 23 A 8 7 225046 CASAVA_Build 4 181774617 1D TGTGGGAGCT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 9 8 225047 CASAVA_Build 4 181785382 9D GAAGAATATT AATAAGGAA/--------- AATTTTTGTG 3070 hom 105 het 39 0 36 7 AATAAGGAA 1 0 225048 CASAVA_Build 4 181785787 1D TGTTAAAAAT G/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 G 1 0 225049 CASAVA_Build 4 181787364 1D TGAGATGTGA T/- TTCACAGGGA 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 3 2 225050 CASAVA_Build 4 181789412 1I CTATGTCTTA -/T TGTCTTATGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 1 2 225051 CASAVA_Build 4 181791177 1D ATCCTCTAAT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 A 7 6 225052 CASAVA_Build 4 181792143 1D AAATAAAATT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 A 8 7 225053 CASAVA_Build 4 181798245 5I TTCTTTTTCT -----/TTTTC TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 29 1 20 8 TTTTC 0 1 225054 CASAVA_Build 4 181798976 2D GTATATATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TA 7 6 225055 CASAVA_Build 4 181799145 1I ATTCTAATTT -/C CTTCACCTGA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 C 1 2 225056 CASAVA_Build 4 181801424 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 16 0 11 6 A 10 9 225057 CASAVA_Build 4 181805242 1D CTTTGAAGTA T/- TTTTTTTTTC 1393 het 1393 ref 41 29 3 9 T 10 9 225058 CASAVA_Build 4 181808125 2I51M2D TATATATGCG --CATATATATACACATATGAAAGTATATATATACTTTCAGAGTATATATATATG/TATATATATATACACATATGAAAGTATATATATACTTTCAGAGTATATATATA-- CGCATATATA 2738 het 567 hom 14 2 9 12 N/A 0 0 225059 CASAVA_Build 4 181809471 9D TGGTTGGTTT GAAACCAAC/--------- ATTTAGTAAA 3070 het 3070 hom 41 20 21 1 GAAACCAAC 1 0 225060 CASAVA_Build 4 181811665 2D AACTTCAAAT AA/-- AAGTTACTGT 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 A 4 2 225061 CASAVA_Build 4 181813025 1D AAGGTGGAAT C/- TTTTGCAATA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 0 225062 CASAVA_Build 4 181813225 2I TTTTTCCACC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 41 0 29 12 T 12 14 225063 CASAVA_Build 4 181815812 2I GGGCGGAGAC --/AG GGGTGAGGTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 0 1 225064 CASAVA_Build 4 181831886 1D AGAAGTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 6 T 12 11 225065 CASAVA_Build 4 181834062 2D TTTCTGCTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 24 0 10 15 T 13 11 225066 CASAVA_Build 4 181841740 1I TTGCCTTTTA -/C TTTAATTAAC 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 C 0 1 225067 CASAVA_Build 4 181857945 1D71M1I TTTGAACCCT CCCACCTGTTTCCCATACTCACAGTGAGGCCTAGAACAGTAAATCTGAAAAAAAGGAGCAGCTAATTTGCTC-/-CCACCTGTTTCCCATACTCACAGTGAGGCCTGGAACAGTAAATCTGAAAAAAAGGAGCAGCTAATTTGCTCA AAAAAAAATT 3070 het 441 hom 35 3 30 27 N/A 0 0 225068 CASAVA_Build 4 181865153 2D GCAATGTATC TT/-- TTTTTTTCTG 3070 hom 113 het 43 0 37 6 T 9 7 225069 CASAVA_Build 4 181873646 1I ATCTTGAAAA -/T TAGAATATTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 225070 CASAVA_Build 4 181878606 1D GGGAGGCTGA G/- GGGGGGCGGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 7 6 225071 CASAVA_Build 4 181894501 5D TCATTTATCT GTTGA/----- GTTGTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 GTTGA 1 0 225072 CASAVA_Build 4 181897452 3D TTTATCCTAC TTA/--- TTAATTATAT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TTA 2 1 225073 CASAVA_Build 4 181907876 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 2847 het 130 hom 15 1 11 3 TG 8 9 225074 CASAVA_Build 4 181910757 2I ACAATTGGGG --/TA TAGGCATTGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TA 1 2 225075 CASAVA_Build 4 181916917 1D AATTAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 30 1 20 9 A 14 13 225076 CASAVA_Build 4 181918932 1I TTCATTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 48 0 35 13 T 10 11 225077 CASAVA_Build 4 181921488 3I GATGCCACAA ---/AAC AACACCAATT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 AAC 1 2 225078 CASAVA_Build 4 181923798 2D CATACTGCCG AT/-- ATATATAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 AT 4 3 225079 CASAVA_Build 4 181927260 1D GTCCACTTTG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 68 het 31 0 23 10 A 8 7 225080 CASAVA_Build 4 181930959 6I CATCTGAAGC ------/TTTTTT TTTTTTGGAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 6 12 225081 CASAVA_Build 4 181937611 1D TATTATTATT A/- TTTTTTGCAT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 1 0 225082 CASAVA_Build 4 181965055 1D GATTCCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 28 0 21 7 A 12 11 225083 CASAVA_Build 4 181969250 2D GAAAAGACTC AG/-- AGCCTGAGTA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 AG 2 1 225084 CASAVA_Build 4 181970262 2D TGAACATTCA CT/-- GTTTTCAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 CT 1 0 225085 CASAVA_Build 4 181970641 1I AGTTATAATT -/A AAAAAAAAAA 2607 het 2607 ref 36 16 9 11 A 13 14 225086 CASAVA_Build 4 181973496 2D AAGAATGAAG TC/-- TAACAGCAAG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 TC 1 0 225087 CASAVA_Build 4 181977257 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 21 2 17 2 T 11 12 225088 CASAVA_Build 4 181981523 1D TTGCTTCCAG T/- TAATTTTTAT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 T 2 1 225089 CASAVA_Build 4 181982987 1D CTGGAAGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 32 0 25 7 T 11 10 225090 CASAVA_Build 4 181990271 1I AAAAGTGTTG -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 6 7 225091 CASAVA_Build 4 181990389 2I ATGTCTTGCC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 T 9 11 225092 CASAVA_Build 4 181991478 4I31M2D TTTGTTAGGT ----TTACAGAAAAATTGAACAGAATATAGATAATTC/TCAATTACAGAAAAATTGAACAGAATATAGATAAT-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 39 27 21 3 N/A 0 0 225093 CASAVA_Build 4 181995407 4I TGTAATGGAA ----/TTTC TTTGAGTGGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TTTC 0 1 225094 CASAVA_Build 4 181997615 1I TAATGGCTAT -/G GCACTATGTG 3070 hom 75 het 29 0 27 2 G 1 2 225095 CASAVA_Build 4 181998016 20D ATATGTACGC GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/-------------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 75 het 32 0 26 11 GT 16 6 225096 CASAVA_Build 4 181998223 4I TCTTGCTTAG ----/GGAA GGAAGTTCAG 3070 hom 107 het 40 0 35 5 GGAA 1 2 225097 CASAVA_Build 4 181998986 5I CTCTAAAACT -----/CAAAA CAAAACAGGA 3070 hom 104 het 39 0 35 4 CAAAA 1 2 225098 CASAVA_Build 4 182000044 2I GAATTTTGTC --/TT TCTTTTTAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 1 3 225099 CASAVA_Build 4 182000349 1D ATTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 13 12 225100 CASAVA_Build 4 182004418 1I ACATCTACCT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 9 225101 CASAVA_Build 4 182005176 1D GTGACCCTTC T/- TTTATAGAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 3 T 4 3 225102 CASAVA_Build 4 182005827 2I AACTAATTAA --/TG TGTCTCCAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TG 1 2 225103 CASAVA_Build 4 182007759 5I GATCCAGATT -----/AACTG AACTGTAGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AACTG 1 2 225104 CASAVA_Build 4 182011268 1I25M1I TTACCGAACC -CCCCCCCCAAAAAAAGAAGACTGTT-/GCCCCCCCCAAAAAAAGAAGACTGTTA AAACAAAATA 3070 hom 39 het 15 0 14 8 N/A 0 0 225105 CASAVA_Build 4 182011964 1I TATTTTCTAA -/T TCTTCAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 2 225106 CASAVA_Build 4 182012197 1I CATTATTGGG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 6 7 225107 CASAVA_Build 4 182012348 5D TTTATGAAAA TAAAC/----- TAAAACCACG 3070 het 3070 ref 27 14 13 3 TAAAC 1 0 225108 CASAVA_Build 4 182013893 1I CTTCTCTTAC -/T TGTGGGTAGG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 1 2 225109 CASAVA_Build 4 182014201 1D GTGTGTGATG T/- TTTCCCTCCC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 4 3 225110 CASAVA_Build 4 182015663 4D TGTTTTTCTA TTTG/---- TTTGTGTTCT 3070 het 3070 ref 38 23 12 4 TTTG 2 1 225111 CASAVA_Build 4 182018993 1D TTTGTGCTTG A/- AACCCAGGGC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 3 2 225112 CASAVA_Build 4 182021692 7I TCTCAAAAAA -------/ACAAAAC AAAAAAAAAA 3070 het 771 hom 15 3 8 4 ACAAAAC 0 1 225113 CASAVA_Build 4 182031606 2D TGTTGGGTGC AT/-- ATATGTTTAG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 AT 3 2 225114 CASAVA_Build 4 182038171 2D ACATCCTCTG TT/-- TTTAATCCCC 3070 hom 138 het 50 0 47 5 T 5 3 225115 CASAVA_Build 4 182043409 1D AATGACTCTC T/- TTTTCCAAGT 3070 hom 132 het 47 0 44 5 T 5 4 225116 CASAVA_Build 4 182048003 6D TTATTTATTG TTTTTA/------ TTTTTGTTTT 3070 hom 53 het 20 0 18 4 TTTTTA 1 0 225117 CASAVA_Build 4 182055066 1D TTATACCATC T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 1 225118 CASAVA_Build 4 182056614 2I AATTCTGGTG --/TT TTTTTTTTCT 3070 hom 132 het 47 0 44 3 T 8 10 225119 CASAVA_Build 4 182057677 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAAACTCT 3070 het 599 hom 20 2 14 4 C 1 0 225120 CASAVA_Build 4 182061158 1I AAATGATGGG -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 225121 CASAVA_Build 4 182062569 1I AGTTATTATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 39 2 29 8 T 12 13 225122 CASAVA_Build 4 182063137 1I TACTTTCTTC -/T TTTTTTTATA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 7 8 225123 CASAVA_Build 4 182065154 2I TACATATTTC --/TA TGTTTGTTAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TA 0 1 225124 CASAVA_Build 4 182073159 1D TTCTTCTTTC A/- AACATTTGTA 3070 hom 114 het 43 0 39 6 A 3 2 225125 CASAVA_Build 4 182074800 3D ACAGAGACAT GAA/--- GAAAAGAGGG 3070 hom 99 het 35 0 33 3 GAA 2 1 225126 CASAVA_Build 4 182080955 1D CAAAGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 30 0 22 8 T 13 12 225127 CASAVA_Build 4 182087308 1D AGAAAGGAGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 119 het 49 0 42 7 A 9 8 225128 CASAVA_Build 4 182101588 1I GCCAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 2101 het 2101 ref 36 18 5 13 T 13 14 225129 CASAVA_Build 4 182106486 1I AGGCTGTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 417 hom 37 1 28 8 T 9 10 225130 CASAVA_Build 4 182117388 4D AACCACTGTC TTCG/---- TTCCTTTGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 TTCG 1 0 225131 CASAVA_Build 4 182123402 2D TGGAACTTTT AA/-- AGAGTGACAC 3070 hom 102 het 39 0 34 7 A 3 1 225132 CASAVA_Build 4 182133845 1D TATTATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 11 10 225133 CASAVA_Build 4 182137071 20D TCTAAGTGAC TCCCTCATTTCCAGATGTGA/-------------------- TCCCTCATTT 3070 hom 63 het 36 0 20 21 TCCCTCATTTCCAGATGTGA 2 1 225134 CASAVA_Build 4 182150291 1D ACACTGAAAG C/- CCCCCCACTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 7 6 225135 CASAVA_Build 4 182152718 1I TTCTTCCCCT -/A ATTTCTTATA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 225136 CASAVA_Build 4 182160433 2D AATTTCATAC AT/-- GTTTTCATAC 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 AT 1 0 225137 CASAVA_Build 4 182160639 3D TGTTTTGTCA GAT/--- GATGATATGG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 GAT 3 2 225138 CASAVA_Build 4 182162996 2I CCACTTTTCA --/CT CTCTATACCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CT 2 3 225139 CASAVA_Build 4 182167948 1I TATGTTCTGT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 7 8 225140 CASAVA_Build 4 182171360 1I TCCTTGAAGG -/A AAAAAAAAAA 2237 het 2237 ref 23 9 6 8 A 10 11 225141 CASAVA_Build 4 182171595 2I GAAAGGAATC --/AA AGAGAGAAAG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 1 3 225142 CASAVA_Build 4 182174319 2I AAGCAAGGAA --/CT CTCAGACCCC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 CT 1 2 225143 CASAVA_Build 4 182174571 1D TGTATATTAA G/- TATAATCATT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 G 1 0 225144 CASAVA_Build 4 182177952 1I TTAAACTGTT -/A GGGGGGGGGG 3070 het 2352 hom 28 8 16 4 A 0 1 225145 CASAVA_Build 4 182178368 2D CGGGCATTAC AG/-- AGAGTTAGGA 3070 het 3070 ref 51 23 23 7 AG 3 2 225146 CASAVA_Build 4 182193861 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 997 het 997 ref 19 9 3 7 A 17 16 225147 CASAVA_Build 4 182195218 4I ATAAGTAGTA ----/TTAT TTAATGCCTG 3070 hom 82 het 32 0 28 4 TTAT 0 1 225148 CASAVA_Build 4 182215107 4D TATCTTCAAA AAAT/---- AAATCCAGCA 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 AAAT 2 1 225149 CASAVA_Build 4 182218270 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 8 9 225150 CASAVA_Build 4 182228469 4I AAATAATAAT ----/AATA AATAAAAATT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 AATA 1 2 225151 CASAVA_Build 4 182229008 5I ATTTTAAAGT -----/TGTAA TGTAATATGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TGTAA 1 2 225152 CASAVA_Build 4 182234192 1D TTGTGCAGTG T/- TTGCTAATGG 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 T 3 2 225153 CASAVA_Build 4 182236973 2D TTACCATCAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 41 0 38 4 T 11 9 225154 CASAVA_Build 4 182238805 36D TACAAAAAGT ACCAGCAGAATAAAATGTTAGGTAGAAAATTACCAA/------------------------------------ ACTCCATCGT 3070 hom 102 het 34 0 35 9 ACCAGCAGAATAAAATGTTAGGTAGAAAATTACCAA 1 0 225155 CASAVA_Build 4 182242724 1I TTCTGCCTAT -/A AAAATGCTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 4 5 225156 CASAVA_Build 4 182243262 4D GGGGCTGCTA GAGT/---- GAGTATGTGG 3070 hom 87 het 32 0 30 4 GAGT 2 1 225157 CASAVA_Build 4 182250765 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 7 8 225158 CASAVA_Build 4 182255770 6I GGGACTAGGG ------/ATACTC CCAGTCCTCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATACTC 0 1 225159 CASAVA_Build 4 182265612 1D AGAGGAAAGC T/- TTTTCAGAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 5 4 225160 CASAVA_Build 4 182278278 1D GGTTGGACTT A/- ACAGTGTCTA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 2 1 225161 CASAVA_Build 4 182279227 5D GGATAAAAAT AAATC/----- AAAGATATCT 3070 hom 151 het 51 0 51 3 AAATC 1 0 225162 CASAVA_Build 4 182290524 2D TACATTTTCT CA/-- GAGTTGAGAA 3070 hom 102 het 41 0 34 8 CA 1 0 225163 CASAVA_Build 4 182299331 4D GCAATACTTT GATA/---- GATAGTGATT 3070 hom 108 het 47 0 36 12 GATA 2 1 225164 CASAVA_Build 4 182302023 1I AACGGTGAAT -/A AAAAAATGTA 3070 hom 120 het 52 0 41 11 A 6 7 225165 CASAVA_Build 4 182302691 1I ATGACAAGAA -/T CGAATGGACA 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 T 0 1 225166 CASAVA_Build 4 182303234 1D TGCTAGCCCT C/- CCCCCGCCAC 1327 het 942 hom 8 3 4 1 C 6 5 225167 CASAVA_Build 4 182309190 6D TCCTTATATA AGAAGT/------ AGGAGTGGAA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 AGAAGT 1 0 225168 CASAVA_Build 4 182315551 2D10M1I TACAGTGAGA CTCTTTCAAAAA-/--CTTTCAAAAAG AAAAAAAAGG 3070 hom 45 het 19 0 16 7 N/A 0 0 225169 CASAVA_Build 4 182316195 1D CAAAAAGCAT C/- CCGTCCCTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 3 2 225170 CASAVA_Build 4 182321506 2D TGTACACACG CA/-- CACACACACA 3070 hom 102 het 42 0 35 8 CA 7 6 225171 CASAVA_Build 4 182323873 1D GGTAGGACTG T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 6 225172 CASAVA_Build 4 182326423 1I CATAAATAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 9 225173 CASAVA_Build 4 182327713 1I TTTTTCTGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 10 225174 CASAVA_Build 4 182327819 1I CTCAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 637 hom 33 4 21 8 A 13 14 225175 CASAVA_Build 4 182333406 1D GGCGTGGATG A/- AAAAAGTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 6 5 225176 CASAVA_Build 4 182358194 1D CTCTCTATCC T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 T 7 6 225177 CASAVA_Build 4 182358358 1I GATCTCAGTG -/C TTGTCACGTA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 C 0 1 225178 CASAVA_Build 4 182360465 2I CAGGGGAGTT --/AC ACAGCTGGGT 3070 het 3070 hom 61 27 30 4 AC 1 2 225179 CASAVA_Build 4 182367567 5D TTTGTGACTT TAAAC/----- TAATTAAGCA 3070 het 3070 ref 40 20 18 7 TAAAC 1 0 225180 CASAVA_Build 4 182379768 1D AATTTTTTTG T/- ATTTTTTAGT 2327 het 486 hom 7 1 6 0 T 1 0 225181 CASAVA_Build 4 182382775 4D TTGGAAAGTA AGAG/---- AGAGAGAATG 3070 het 3070 ref 41 19 15 8 AG 5 3 225182 CASAVA_Build 4 182384579 3I TAAAAACAAA ---/AAC AACAAAAAAA 3070 het 10 hom 29 1 17 11 AAC 1 2 225183 CASAVA_Build 4 182386548 5I TCAAAACATG -----/TAATA TAATATAACA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TAATA 1 2 225184 CASAVA_Build 4 182392301 4D TTTCAGAAAT AGTA/---- AGTATTTGGA 3070 het 3070 ref 43 22 15 9 AGTA 2 1 225185 CASAVA_Build 4 182396235 1I CTATATTTCA -/G CCCCCGTTGA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 G 0 1 225186 CASAVA_Build 4 182403415 2I ATATGGAAAC --/AT ATTATATATA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AT 1 2 225187 CASAVA_Build 4 182407480 1D TTGAGATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 21 11 A 13 12 225188 CASAVA_Build 4 182411846 4D TATGTATATA TATG/---- TGTGTGTATA 3070 hom 57 het 25 0 19 7 TATG 1 0 225189 CASAVA_Build 4 182419859 2I GATTAAATAC --/AA AAGAGTTCCT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 2 4 225190 CASAVA_Build 4 182423939 1I CATAAGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 10 11 225191 CASAVA_Build 4 182433173 1I TCCTATAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 9 10 225192 CASAVA_Build 4 182435397 1I AGAAGTTAGT -/A ACTGGGTACA 3070 hom 135 het 54 0 46 8 A 1 2 225193 CASAVA_Build 4 182435835 1D TTTATAATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 10 9 225194 CASAVA_Build 4 182436765 4I GCCCTCTTTA ----/ATTT ATTTATTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 ATTT 2 3 225195 CASAVA_Build 4 182438213 1D TCACTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 11 10 225196 CASAVA_Build 4 182440074 1I TTTTACTAAG -/A AATGGTGCTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 A 2 3 225197 CASAVA_Build 4 182440888 5D AAATGAGCAT TAAAG/----- TAATCTTCTG 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 TAAAG 1 0 225198 CASAVA_Build 4 182441854 10I GAAAGAAGAT ----------/AGAGAGACAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AGAGAGACAG 0 1 225199 CASAVA_Build 4 182442123 1D GTGTAAACTT C/- CTACACCTTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 C 2 1 225200 CASAVA_Build 4 182449326 1I GCCCAGTACC -/T TTACACATAA 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 T 2 3 225201 CASAVA_Build 4 182453915 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 TG 6 7 225202 CASAVA_Build 4 182459471 3I TGCCGCAATA ---/AGG AGAACATTTA 3054 het 3054 ref 27 9 9 9 AGG 0 1 225203 CASAVA_Build 4 182470982 1D CTGTCTCTGG C/- CCCCCGGCTA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 C 6 5 225204 CASAVA_Build 4 182477568 1D GATGGCTCTT A/- AAAAAATAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 7 6 225205 CASAVA_Build 4 182487937 1I GGATCTGTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 T 9 10 225206 CASAVA_Build 4 182490122 33D AATTATTACT GGATTAGGTCAATAAATTTGGAAAGATGGGAAA/--------------------------------- GGATTACAGA 3070 het 3070 ref 39 45 9 1 GGATTAGGTCAATAAATTTGGAAAGATGGGAAA 1 0 225207 CASAVA_Build 4 182494324 1I AAAAAGAAAA -/G ACATCAGTCA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 0 1 225208 CASAVA_Build 4 182510269 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 99 het 37 0 33 5 T 8 7 225209 CASAVA_Build 4 182513654 1D GGATTTCTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 53 het 25 0 19 6 T 9 8 225210 CASAVA_Build 4 182513900 1I TTTTTTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 988 hom 34 3 24 7 A 11 12 225211 CASAVA_Build 4 182514170 2D GAATACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 18 21 11 AC 10 9 225212 CASAVA_Build 4 182514846 2I CCCATGTTCT --/CA CAGAGTGGGA 3070 hom 151 het 56 0 51 5 CA 1 2 225213 CASAVA_Build 4 182517248 3D TTTCAGAGTT ATC/--- ATACAGTGGT 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 ATC 1 0 225214 CASAVA_Build 4 182518652 1D AAAGCTCAAC T/- TTTTTTTTTT 1809 het 1809 ref 34 21 4 9 T 13 12 225215 CASAVA_Build 4 182527315 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 A 9 10 225216 CASAVA_Build 4 182528850 11D GATTGTGAAT AAAGAATCAAA/----------- AAAGTAAACT 3070 het 3070 ref 28 21 9 6 AAAGAATCAAA 1 0 225217 CASAVA_Build 4 182529644 1I TTATGTTGGC -/A AAAAAGATGA 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 A 5 6 225218 CASAVA_Build 4 182529790 1I TTAGCAACTC -/T TAAGACTTGT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 T 1 2 225219 CASAVA_Build 4 182530615 1D TGAATCTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 28 12 6 A 12 11 225220 CASAVA_Build 4 182542178 1D TGGCCACCAC G/- TTTTGTAAAT 3070 hom 67 het 29 0 22 8 G 1 0 225221 CASAVA_Build 4 182544720 3D TTCAAATGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 30 1 19 12 A 14 11 225222 CASAVA_Build 4 182545061 1D ACAATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 A 11 10 225223 CASAVA_Build 4 182546950 1I AATTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 11 12 225224 CASAVA_Build 4 182547822 1I TGAGTTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3006 het 2757 hom 17 8 7 2 A 11 12 225225 CASAVA_Build 4 182559090 1D TTAAATGGAT A/- AAAAATTTCT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 6 5 225226 CASAVA_Build 4 182562819 1I4M10I CTGCCCTAGC -GGAG----------/AGCAGTCTTCTGCCT GGATATCCAG 193 het 193 ref 16 10 1 6 N/A 0 0 225227 CASAVA_Build 4 182563938 20D GAGAGAGAGA GAGAGAGAGAGAGAGAGAGG/-------------------- GAGAGAGGGA 3070 het 1502 hom 27 8 14 8 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGG 1 0 225228 CASAVA_Build 4 182574088 2D TCTACATAAC TG/-- TAAGAAAGTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 TG 1 0 225229 CASAVA_Build 4 182587371 4I CTGCAATAAT ----/TGTG TGTGTAGTTC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 TG 2 4 225230 CASAVA_Build 4 182588236 1D ATGTGTTTTT A/- AAAAACATAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 6 5 225231 CASAVA_Build 4 182588339 1D AATTGCACTC T/- TTTTTTTTTT 1908 het 1908 ref 50 33 5 12 T 13 12 225232 CASAVA_Build 4 182596060 1I CGTAAATAAT -/A TATAAGTGGC 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 0 1 225233 CASAVA_Build 4 182611709 1I AGTTGATAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 63 21 27 15 A 9 10 225234 CASAVA_Build 4 182615021 4D AATACAAAAT TTAA/---- TTAAGAACTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 5 TTAA 2 1 225235 CASAVA_Build 4 182615868 1D AATTACAAAG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 51 22 25 5 A 7 6 225236 CASAVA_Build 4 182618751 1D ACCTTTTTTT C/- TGCATTAATT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 C 1 0 225237 CASAVA_Build 4 182623428 2D AAGACAACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2087 hom 30 7 16 7 A 13 11 225238 CASAVA_Build 4 182623482 1D AAGATATATA T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 24 8 9 7 T 7 6 225239 CASAVA_Build 4 182627830 2I AGAAAATTGT --/TG TGAGTAGTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TG 1 2 225240 CASAVA_Build 4 182629133 1I GTTTGTGGTG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 113 het 40 0 39 1 T 7 8 225241 CASAVA_Build 4 182631983 2I ATGTATACTG --/TA TATATATATA 3070 hom 33 het 16 0 11 5 TA 6 7 225242 CASAVA_Build 4 182638312 1I AAGGATCCTA -/C CCACATTTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 2 3 225243 CASAVA_Build 4 182640621 2D GCGATGGTTC AG/-- AGTTACAAAT 3070 het 3070 hom 51 22 27 4 AG 2 1 225244 CASAVA_Build 4 182643629 2I TAGAAGAAGA --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 10 225245 CASAVA_Build 4 182644165 1I AACTTGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 29 1 24 4 A 10 11 225246 CASAVA_Build 4 182652726 1D AGCCACCGCA C/- CCGGCTCAGC 3070 het 1383 hom 20 4 13 3 C 3 2 225247 CASAVA_Build 4 182658198 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACTC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 AG 2 1 225248 CASAVA_Build 4 182658482 1I GGCCTTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1953 hom 21 6 11 4 A 14 15 225249 CASAVA_Build 4 182668709 1I TAACCACACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 8 9 225250 CASAVA_Build 4 182674925 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 A 12 11 225251 CASAVA_Build 4 182675299 1D GAAATAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 A 12 11 225252 CASAVA_Build 4 182676186 1I TCATCAAGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 A 8 9 225253 CASAVA_Build 4 182703421 1D TTAATGTGGA T/- TTTTTCCCCT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 6 5 225254 CASAVA_Build 4 182704004 6I AAGAAAGAAA ------/TATAAG TATATGTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 TATAAG 0 1 225255 CASAVA_Build 4 182704993 4I AGCTTCTTTT ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 TTTG 1 2 225256 CASAVA_Build 4 182724248 1I TTTGGCGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 833 hom 35 4 27 4 A 9 10 225257 CASAVA_Build 4 182736382 4I TTTCCTTTTC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 46 22 19 5 TTTG 2 3 225258 CASAVA_Build 4 182740817 1D AAAACAAATC A/- AAAAAAAAAA 2963 het 536 hom 17 2 11 4 A 17 16 225259 CASAVA_Build 4 182741559 1I AGGGTGACCA -/C ACTTTCCATT 3070 het 3070 ref 51 26 17 8 C 0 1 225260 CASAVA_Build 4 182750106 1D AAAAAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 A 11 10 225261 CASAVA_Build 4 182772167 1D AGCATAGTTA T/- TTTTTTACCA 2992 het 2992 ref 18 9 7 2 T 7 6 225262 CASAVA_Build 4 182772247 1I CATACATAAA -/T TTTTTTCATT 2296 het 2296 ref 21 14 6 1 T 6 7 225263 CASAVA_Build 4 182795373 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 8 7 225264 CASAVA_Build 4 182822635 2I AAAAAAAACA --/AC AAACAAAAAA 2558 het 2558 ref 36 19 10 7 AC 0 1 225265 CASAVA_Build 4 182828072 1D GGTGTAGAAA G/- AATGTAAAAG 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 G 1 0 225266 CASAVA_Build 4 182833969 5D GTTGAACTTC TTCAA/----- TTCAATTAGT 3070 het 3070 ref 29 12 12 6 TTCAA 2 1 225267 CASAVA_Build 4 182834225 1D GCTGCGGGAA G/- GGGGGGTGCA 2118 het 2118 ref 24 15 6 3 G 7 6 225268 CASAVA_Build 4 182836991 1I TTTTAAACAA -/C AAAAAAAAAA 2262 het 2262 ref 26 14 5 7 C 0 1 225269 CASAVA_Build 4 182839431 1D TCCATTTCAG T/- TTTTTTTCGT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 8 7 225270 CASAVA_Build 4 182848798 1D GAAAGGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3048 het 3048 ref 34 23 9 2 A 11 10 225271 CASAVA_Build 4 182849077 1D AACAAGCAAA T/- ACCTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 1 0 225272 CASAVA_Build 4 182849383 4D AATATGATCT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 42 15 17 11 TG 10 8 225273 CASAVA_Build 4 182853147 4D ATTTTGTTGG ATTA/---- ATTTCATTTT 3070 het 3070 ref 54 26 25 4 ATTA 1 0 225274 CASAVA_Build 4 182858378 2D TTTCAGGGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2876 hom 32 10 17 5 T 12 10 225275 CASAVA_Build 4 182863199 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 A 13 11 225276 CASAVA_Build 4 182866722 1I ACTGAAGGAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 155 hom 38 1 27 10 A 0 1 225277 CASAVA_Build 4 182876219 9D TTTTCCTTAA TAAAAGAAC/--------- TAAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 30 13 19 1 TAAAAGAAC 1 0 225278 CASAVA_Build 4 182898835 1D TCAGCACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 26 6 A 11 10 225279 CASAVA_Build 4 182921066 1I CAGTGGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 13 11 A 10 11 225280 CASAVA_Build 4 182922401 2D AAACAGGAGA AG/-- AGAGAGATTT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 AG 4 3 225281 CASAVA_Build 4 182926104 1D TAACTGATTG C/- AAAATTTAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 C 1 0 225282 CASAVA_Build 4 182957866 3D AATGCCTGGG ATA/--- ATAATAGATG 3070 hom 114 het 40 0 39 2 ATA 3 2 225283 CASAVA_Build 4 182959381 7D TCATTTTTTC TGTTTTT/------- TGTTTGTTTG 3070 hom 116 het 44 0 38 7 TGTTTTT 1 0 225284 CASAVA_Build 4 182962272 4D AGGGAGGGAA AGGG/---- AGGGAGGGAG 883 het 33 hom 13 1 4 8 AGGG 5 4 225285 CASAVA_Build 4 182982416 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1453 het 1453 ref 23 9 6 8 T 15 14 225286 CASAVA_Build 4 182995140 2I TCTTAAGAAC --/TG TAAATTGTTG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 TG 0 1 225287 CASAVA_Build 4 182996286 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 628 het 219 hom 24 1 5 19 A 13 12 225288 CASAVA_Build 4 183000209 3I AGTTGAAGAC ---/TGT TGATTATATG 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 TGT 0 1 225289 CASAVA_Build 4 183009169 1D AAAGGATGAA T/- TGCATTTTCA 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 T 2 1 225290 CASAVA_Build 4 183029342 3D CCCAATTTTA TTC/--- TTCTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 20 19 3 TTC 2 1 225291 CASAVA_Build 4 183034033 1D CATCCCACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 A 10 9 225292 CASAVA_Build 4 183048666 1D AGGAATTATG C/- TACTATTAAA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 C 1 0 225293 CASAVA_Build 4 183051231 1D ATAAATGACA T/- TAAGAGTGTC 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 T 2 1 225294 CASAVA_Build 4 183060335 1D TAAAAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 632 hom 24 5 8 11 A 13 12 225295 CASAVA_Build 4 183063682 1D TGAGCTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 867 hom 38 7 22 10 T 16 15 225296 CASAVA_Build 4 183063803 8I ATATGATACA --------/CTATTTAT CTATTTATTT 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 CTATTTAT 1 2 225297 CASAVA_Build 4 183099459 2I TTGTTTGATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 T 12 14 225298 CASAVA_Build 4 183103274 1I TTGAGAAAGG -/A AATGTGAATG 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 A 2 3 225299 CASAVA_Build 4 183122739 1I ATGTTGCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 17 7 A 12 13 225300 CASAVA_Build 4 183130170 1D ACTGCATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 T 12 11 225301 CASAVA_Build 4 183136793 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1466 het 1430 hom 20 6 5 9 A 14 13 225302 CASAVA_Build 4 183137125 1D TGCTTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2551 hom 19 6 10 3 A 13 12 225303 CASAVA_Build 4 183172754 10I TCAGCGGCAC ----------/ATTAGACTAA ATTAGATTTA 3070 hom 85 het 31 0 28 4 ATTAGACTAA 0 1 225304 CASAVA_Build 4 183185719 1I AAGGCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 776 hom 40 2 26 12 T 10 11 225305 CASAVA_Build 4 183187652 1I TTATGTATGT -/G GGGTCATCCA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 3 4 225306 CASAVA_Build 4 183191166 1I TTTTTGAAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 334 hom 33 1 23 9 T 9 10 225307 CASAVA_Build 4 183201140 1D GAAGGTCGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 247 hom 51 3 37 11 T 11 10 225308 CASAVA_Build 4 183208149 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 9 10 225309 CASAVA_Build 4 183208955 4D CACCTGAAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 856 hom 24 het 37 0 9 32 AAAC 1 0 225310 CASAVA_Build 4 183216312 1I TATTTGGGGT -/G GGGGGGGGGC 3070 het 262 hom 25 2 15 8 G 9 10 225311 CASAVA_Build 4 183216724 1I CTTTTGCAAC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 6 7 225312 CASAVA_Build 4 183223183 2D AATTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1684 het 93 hom 26 2 5 19 T 16 14 225313 CASAVA_Build 4 183224748 3D AAAAAAAAAA TAT/--- ATATATATAT 425 het 425 ref 8 3 1 4 TAT 1 0 225314 CASAVA_Build 4 183229252 4D AAGAACAAAA ACTT/---- ACTTCACAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 ACTT 2 1 225315 CASAVA_Build 4 183233272 2D TGCCAGAGAC TG/-- TGATTTTTCT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 TG 2 1 225316 CASAVA_Build 4 183253089 1I AATAGAAGGT -/A AAAAAAAAAA 1949 het 7 hom 30 0 8 22 A 15 16 225317 CASAVA_Build 4 183254042 2D AAGAGATCAA TC/-- AATATTGAAG 3070 het 3070 hom 22 10 10 3 TC 1 0 225318 CASAVA_Build 4 183262037 1D GATATGCAAA T/- TGTCCTTTAT 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 T 2 1 225319 CASAVA_Build 4 183267282 3D TTGATCCAGA TGT/--- TGTGATTATA 2417 het 2087 hom 13 5 5 3 TGT 2 1 225320 CASAVA_Build 4 183268261 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1988 het 606 hom 17 5 5 8 A 17 16 225321 CASAVA_Build 4 183276755 1D TTTTTGTAGA T/- TTTTTAAGAA 3070 hom 28 het 15 0 10 5 T 6 5 225322 CASAVA_Build 4 183283916 1D TTTCCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 13 5 T 15 14 225323 CASAVA_Build 4 183285306 2D ATTTATCCAC AT/-- GAGCTGCCTT 3070 het 3070 ref 39 22 17 1 AT 1 0 225324 CASAVA_Build 4 183287086 1D TTCTCTCATA T/- TTTTCATACT 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 T 5 4 225325 CASAVA_Build 4 183288838 1I CTGTATGCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 T 10 11 225326 CASAVA_Build 4 183290181 1D AAAACAGTGA T/- TTTTACTTTA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 5 4 225327 CASAVA_Build 4 183295480 1D CTCTGCCACC T/- CCCCCCCCCC 2428 het 1711 hom 19 10 8 2 T 1 0 225328 CASAVA_Build 4 183299647 2D TGTGAGAGAC AG/-- AGAGAGACCC 3070 het 3070 hom 40 14 18 9 AG 4 3 225329 CASAVA_Build 4 183302350 8D CACACTCCCG CACACACA/-------- CACACACACA 1466 het 56 hom 13 1 6 7 CA 12 8 225330 CASAVA_Build 4 183319062 1D ATACATGTGG A/- TTGAGAAATT 3070 het 3070 ref 28 14 14 0 A 1 0 225331 CASAVA_Build 4 183326287 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1815 het 1815 ref 36 26 5 5 T 12 11 225332 CASAVA_Build 4 183328773 1I CAGGTTTTGG -/T TTAATGGTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 3 225333 CASAVA_Build 4 183330064 1I GTATCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 10 11 225334 CASAVA_Build 4 183330254 4I CCATTATAAA ----/TATT TATTTAGCTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TATT 1 2 225335 CASAVA_Build 4 183333098 5I CAACTGAAAT -----/ATTTA ATTTGTTACA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATTTA 0 1 225336 CASAVA_Build 4 183334303 3I AAAGACACAA ---/CAC TGAGTGTAGG 3070 hom 117 het 46 0 39 7 CAC 0 1 225337 CASAVA_Build 4 183334479 1D TGGCAGATTA C/- CTCCTCTGTG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 C 2 1 225338 CASAVA_Build 4 183335762 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 1879 het 1309 hom 19 4 4 11 T 14 13 225339 CASAVA_Build 4 183338278 5D AATCGAAGAG TTTTT/----- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 T 12 7 225340 CASAVA_Build 4 183364200 1D CTGTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 38 0 32 7 A 12 11 225341 CASAVA_Build 4 183378701 1D GTCCAAATGT G/- GGGGGCACTG 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 G 6 5 225342 CASAVA_Build 4 183386625 1D AAAATAGGTA T/- TTTCCCTTCA 3070 het 3070 hom 47 15 27 6 T 4 3 225343 CASAVA_Build 4 183387864 1D GAAGATCAAA C/- CCCAACTACA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 C 4 3 225344 CASAVA_Build 4 183397940 1D AAATAATCGC A/- AAAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 7 6 225345 CASAVA_Build 4 183401765 1I AGGAGACTGG -/A AAAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 48 23 20 5 A 6 7 225346 CASAVA_Build 4 183417922 3I AATATTGAAA ---/TTC TTCTTTTGTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTC 1 2 225347 CASAVA_Build 4 183425863 1I AAGCCAATTT -/A AAAAAAAAAA 1971 het 1971 ref 32 13 7 12 A 15 16 225348 CASAVA_Build 4 183478259 1D AACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 30 1 23 6 A 13 12 225349 CASAVA_Build 4 183488214 1I CTACTGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 10 11 225350 CASAVA_Build 4 183494497 3D GGAAGAAGCC AAA/--- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 A 11 8 225351 CASAVA_Build 4 183498058 1D TTTTTGATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 10 9 225352 CASAVA_Build 4 183502236 1D TTTTAAGTGA T/- TTTTTTCATT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 T 7 6 225353 CASAVA_Build 4 183505782 1D TTATTGGGAC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 9 8 225354 CASAVA_Build 4 183512735 1D TCTGTTTATT A/- ACATTACATA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 2 1 225355 CASAVA_Build 4 183530533 1D CACTGACATC T/- TTACAAATTA 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 T 3 2 225356 CASAVA_Build 4 183536243 3D ATTGGGAGTA GCT/--- GCTCCCTTTC 3070 het 3070 hom 55 26 25 4 GCT 2 1 225357 CASAVA_Build 4 183537086 2D TCCCTTGAGA CT/-- CTACAAATAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 CT 2 1 225358 CASAVA_Build 4 183538439 1I AAGCAAAAAC -/A AAAAACAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 5 6 225359 CASAVA_Build 4 183540508 1D CCATTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 41 1 31 9 T 12 11 225360 CASAVA_Build 4 183595642 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 8 7 225361 CASAVA_Build 4 183607615 1D ATTAGATGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 10 9 225362 CASAVA_Build 4 183611174 2D TTTATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2331 hom 29 8 13 9 TA 8 7 225363 CASAVA_Build 4 183615630 1I TATGGAAACT -/A AAGTCATAGA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 2 3 225364 CASAVA_Build 4 183620216 1D TCCTCTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2867 hom 30 10 13 7 T 15 14 225365 CASAVA_Build 4 183621034 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 10 9 225366 CASAVA_Build 4 183624701 1I GCTGGTCTTG -/A ACTCCTGGGC 3070 het 2801 hom 24 6 13 5 A 1 2 225367 CASAVA_Build 4 183624972 1D ACAAGAAGGT A/- AAAAAATGCT 3070 hom 4 het 42 1 28 13 A 7 6 225368 CASAVA_Build 4 183626972 30D CCTGTGTGCT TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/------------------------------ TGTGTGTGTG 2852 het 2852 ref 23 9 7 12 TG 23 8 225369 CASAVA_Build 4 183630875 1I TATATCACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 T 9 10 225370 CASAVA_Build 4 183632552 1D TAGGGCACTA T/- TTAGCATTGT 3070 het 3070 ref 55 27 24 4 T 3 2 225371 CASAVA_Build 4 183633555 1D AACTGATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 T 11 10 225372 CASAVA_Build 4 183637277 1D AACAATATAG T/- TAAGTGTTCA 3070 hom 63 het 25 0 22 5 T 2 1 225373 CASAVA_Build 4 183639620 1I TACGTTGAGA -/T TTTTTTTAAA 2291 het 2291 ref 24 13 8 3 T 7 8 225374 CASAVA_Build 4 183641225 3D TACGGAGCAT ATC/--- ATCACCACAA 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 ATC 2 1 225375 CASAVA_Build 4 183643808 2I ATGATTTATC --/TT TGTGGGTTTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 1 3 225376 CASAVA_Build 4 183647409 1D AGGGAAAATG T/- GTCCTCTCAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 T 1 0 225377 CASAVA_Build 4 183648874 19I ATGGTACCTT -------------------/TGGGTACATGTGGTACAAA ATGAAGGGAC 3070 het 3070 hom 64 25 31 9 TGGGTACATGTGGTACAAA 0 1 225378 CASAVA_Build 4 183651038 1D CATGTCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 16 8 T 13 12 225379 CASAVA_Build 4 183654684 2I ATAAGAAAAC --/AG GGATTGTTCT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AG 0 1 225380 CASAVA_Build 4 183655995 24D CTAAAAATAC ATATATATATATATATATATATAT/------------------------ ATATATATAT 3070 het 79 hom 23 1 17 7 AT 18 6 225381 CASAVA_Build 4 183658788 1I AAATAATTAG -/A AAAACGTGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 4 5 225382 CASAVA_Build 4 183662604 2D AGTCCTCTGT AA/-- AAGTGTTGGA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 4 2 225383 CASAVA_Build 4 183665296 1I ATCACTAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 9 10 225384 CASAVA_Build 4 183673804 18D CCTTAAGCAG AAGGATGAGGTTTAATGT/------------------ AAGGAGAGGA 3070 het 3070 ref 41 21 19 6 AAGGATGAGGTTTAATGT 1 0 225385 CASAVA_Build 4 183676452 1I TGTATGAATC -/T GTGACTGTGA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 0 1 225386 CASAVA_Build 4 183677314 1D CTTTAGTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 A 11 10 225387 CASAVA_Build 4 183681978 2D3M1I ATAATTATTA TTTCG-/--TCGT GAGAGACAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 N/A 0 0 225388 CASAVA_Build 4 183682988 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 498 hom 26 2 13 11 A 15 14 225389 CASAVA_Build 4 183685640 1D CTGTTGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 13 12 225390 CASAVA_Build 4 183685880 1I GTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3062 hom 26 10 12 4 T 8 9 225391 CASAVA_Build 4 183711690 1D AATAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 11 10 225392 CASAVA_Build 4 183719765 1I TTTTAATGGG -/A AAGACTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 3 225393 CASAVA_Build 4 183725892 1D CCCTACTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 74 het 29 0 24 6 T 10 9 225394 CASAVA_Build 4 183725990 1D AATGTAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 603 hom 37 2 31 4 A 17 16 225395 CASAVA_Build 4 183736607 23D TTTGTTTTTA GCTGTGATAGGTGCTTGATAGGT/----------------------- GCTGTGATAG 3070 hom 50 het 19 0 16 10 GCTGTGATAGGTGCTTGATAGGT 1 0 225396 CASAVA_Build 4 183747594 2D AGGTTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 28 1 17 10 T 19 17 225397 CASAVA_Build 4 183748903 1D TCGGGGGGCA G/- GAGAATCACT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 2 1 225398 CASAVA_Build 4 183750860 1D AGACTGTGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 9 225399 CASAVA_Build 4 183769058 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 20 2 12 6 T 15 14 225400 CASAVA_Build 4 183769476 4I GGATGAACTA ----/AAAT AAACAATTTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AAAT 0 1 225401 CASAVA_Build 4 183779327 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 258 hom 16 1 11 4 A 11 12 225402 CASAVA_Build 4 183779671 1D GCACTTTGGG A/- GGCCAAGGCA 3070 hom 41 het 16 0 15 1 A 1 0 225403 CASAVA_Build 4 183785778 37I AAGTGTCACT -------------------------------------/TACTGAATATGGTGTATATTCAGTATACAGTCCTGTA TACTGAATAT 3070 hom 84 het 27 0 29 6 TACTGAATATGGTGTATATTCAGTATACAGTCCTGTA 0 1 225404 CASAVA_Build 4 183796177 1D GTGTTAGGGG A/- AAAATTTTTT 1404 het 1404 ref 29 18 8 3 A 5 4 225405 CASAVA_Build 4 183809053 20D ATATATATAT ATATATATATATATATATAA/-------------------- AACAAAGCTG 2850 hom 24 het 9 0 8 4 ATATATATATATATATATAA 1 0 225406 CASAVA_Build 4 183809971 4D ATTTTTGGTA TCTT/---- TCTTACTATA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TCTT 2 1 225407 CASAVA_Build 4 183838587 1I GAAAGAAAGG -/C GGGGGGGAGA 3070 het 101 hom 29 3 16 10 C 0 1 225408 CASAVA_Build 4 183855117 1I ATTACTTAAG -/C CCCCCTGTGC 3070 het 3070 hom 40 20 16 4 C 5 6 225409 CASAVA_Build 4 183865379 1D TAGAGGGAAG A/- AAAAGGAAGA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 5 4 225410 CASAVA_Build 4 183875207 3I CCCGGAACTA ---/AAG AAGAAGTATC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AAG 2 3 225411 CASAVA_Build 4 183884524 24I GCGCAGCTTA ------------------------/TGGCAAAAACCTTAAAGGTTTTTG TGTCTGTGTC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TGGCAAAAACCTTAAAGGTTTTTG 0 1 225412 CASAVA_Build 4 183887021 1D ACTTGATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 35 1 21 14 A 13 12 225413 CASAVA_Build 4 183890326 6D ACTGTAGCTT AAACTC/------ AATCACTAAT 2071 het 2071 ref 23 17 6 2 AAACTC 1 0 225414 CASAVA_Build 4 183897188 1D AGTATCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 11 10 225415 CASAVA_Build 4 183903965 1I CTCCCTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 41 1 35 5 A 11 12 225416 CASAVA_Build 4 183910281 4I AATGCTGAGT ----/CTAA CTAACTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 CTAA 1 2 225417 CASAVA_Build 4 183910449 4D AGAATGAAGC AACT/---- AACTACTCTA 3070 het 3070 hom 34 12 20 4 AACT 2 1 225418 CASAVA_Build 4 183910679 1D TAACAGGGCT A/- AAAAAATTCT 3070 hom 84 het 34 0 28 7 A 7 6 225419 CASAVA_Build 4 183919573 3D TCCCAAAAAA AAG/--- AAGAAGAATT 3070 het 3070 ref 29 16 12 4 AAG 3 2 225420 CASAVA_Build 4 183920591 3I TTAAAACGAT ---/TGA TGATAATAAA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 TGA 1 2 225421 CASAVA_Build 4 183921144 1D TCAAGAGAGA C/- CCCCCACAAC 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 C 6 5 225422 CASAVA_Build 4 183923282 1I GCATGTGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 A 9 10 225423 CASAVA_Build 4 183929646 1D TCTCTGAAAT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 2317 hom 30 9 17 4 G 11 10 225424 CASAVA_Build 4 183936003 2D TATATGCTGT TA/-- TATATATATA 746 het 746 ref 9 6 3 2 TA 9 8 225425 CASAVA_Build 4 183937094 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 32 4 16 12 T 11 10 225426 CASAVA_Build 4 183978479 3D CAGGGTCCAT CCA/--- CCACCACCAT 3070 het 1218 hom 25 7 16 2 CCA 4 3 225427 CASAVA_Build 4 184008456 1I GGGTACATCT -/G GCAAGCTAAG 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 G 1 2 225428 CASAVA_Build 4 184018793 4D ACTAATGAAG GAAT/---- GAATGAATGA 2710 het 2710 ref 26 13 7 6 GAAT 4 3 225429 CASAVA_Build 4 184024078 2I GCCTGGCTAA --/TT TTTTTTTTTG 1571 het 1379 hom 10 3 5 2 T 9 11 225430 CASAVA_Build 4 184034702 3I GTAGCTTTCT ---/AAG AAGAGACCAG 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 AAG 1 2 225431 CASAVA_Build 4 184036114 1I AATATCTCCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 T 8 9 225432 CASAVA_Build 4 184036471 4D CGTTTGTCCT CAAA/---- CAGAGTCTGT 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 CAAA 1 0 225433 CASAVA_Build 4 184037860 4D CCATCTCAGA AAAC/---- AAACAAACTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 AAAC 3 2 225434 CASAVA_Build 4 184041826 1I AGACATTTTC -/T TTGAAAATGA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 T 2 3 225435 CASAVA_Build 4 184050775 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 23 1 16 6 A 10 11 225436 CASAVA_Build 4 184058154 3D AGTGTCATGC TGG/--- TGTGCAAAAG 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 TGG 1 0 225437 CASAVA_Build 4 184058746 1D TCTAAATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 A 11 10 225438 CASAVA_Build 4 184059006 1D TATGCTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 636 hom 34 2 20 12 T 14 13 225439 CASAVA_Build 4 184060879 2D ACAGGGCTGG GT/-- GTGTGGGCTG 3070 het 3070 hom 30 13 12 6 GT 3 2 225440 CASAVA_Build 4 184062910 10D ACCCTGCTTC CTCCACCGGA/---------- ATGGTGCAAC 3070 het 3070 ref 30 16 15 1 CTCCACCGGA 1 0 225441 CASAVA_Build 4 184087291 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 11 12 225442 CASAVA_Build 4 184088268 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1790 hom 25 4 19 2 T 11 10 225443 CASAVA_Build 4 184096792 4D ATTAATTTAG TTAA/---- TTAATTAATT 2727 het 2727 ref 21 8 6 7 TTAA 3 2 225444 CASAVA_Build 4 184100906 4D GCAGGAATAG TTTC/---- TTTATGTGTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TTTC 1 0 225445 CASAVA_Build 4 184105517 4I GGAAAAAGTT ----/AGAC AGGCGTCTCC 3070 hom 101 het 35 0 34 1 AGAC 0 1 225446 CASAVA_Build 4 184106692 1D GGTAAGAGGC T/- TTTTTTTTTT 2338 het 2338 ref 28 16 9 3 T 12 11 225447 CASAVA_Build 4 184107103 1I ATTAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2315 hom 25 9 10 6 A 11 12 225448 CASAVA_Build 4 184118577 8I24M2D CACACTCTCT --------CACACTCACACACACTCACACTCTCA/CACACTCACACACTCACACACACTCACACTCT-- CACACTCTCA 3070 het 3070 ref 65 39 19 19 N/A 0 0 225449 CASAVA_Build 4 184119545 2D TTTCCTCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 13 11 225450 CASAVA_Build 4 184138860 2D AATCCTAAAC AT/-- ATATGCACCT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AT 3 2 225451 CASAVA_Build 4 184139600 1D ACAAAAATAT A/- AAAAGATAAA 3070 hom 71 het 28 0 25 3 A 5 4 225452 CASAVA_Build 4 184142068 1I AAAAAGAACT -/A AAAAAACACA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 6 7 225453 CASAVA_Build 4 184148953 1I ACACTGGTGG -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 225454 CASAVA_Build 4 184149689 1I TTAAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 2488 het 782 hom 23 2 14 7 T 15 16 225455 CASAVA_Build 4 184155347 5I CCCTATCTAA -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 hom 84 het 34 0 27 8 AAAAC 3 4 225456 CASAVA_Build 4 184162550 4D CAACTGCAAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 66 het 48 1 35 12 AC 11 9 225457 CASAVA_Build 4 184167280 1D GTTTTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 28 1 19 8 A 15 14 225458 CASAVA_Build 4 184168594 1D CTCTCTTCCC T/- TTAGTTTCTG 3070 het 3070 hom 57 23 25 9 T 3 2 225459 CASAVA_Build 4 184182394 1D GACATCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1968 hom 31 10 12 10 A 15 14 225460 CASAVA_Build 4 184191136 1I GCTAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 A 13 14 225461 CASAVA_Build 4 184224677 1D AAAATTAGCT G/- GGCGTGGTGG 2250 het 417 hom 6 1 5 0 G 3 2 225462 CASAVA_Build 4 184268580 1D TGTAGAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1855 hom 35 11 17 7 T 19 18 225463 CASAVA_Build 4 184313277 4D GTTAGAACTT GGTA/---- GGGCTGTCAT 3070 hom 78 het 29 0 26 5 GGTA 1 0 225464 CASAVA_Build 4 184314175 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 28 hom 29 1 25 3 T 10 9 225465 CASAVA_Build 4 184316534 1I GTCTGAGACC -/A GGGTGTAGGC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 0 1 225466 CASAVA_Build 4 184320334 2I6M1D CAAACTACCC --GATTAGT/CTGATTAG- TTTTTTTTAC 3070 hom 105 het 37 0 36 3 N/A 0 0 225467 CASAVA_Build 4 184327585 1D TTTAAAATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 225468 CASAVA_Build 4 184328994 3D AGCTAATTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 30 0 20 11 T 17 14 225469 CASAVA_Build 4 184329806 1I ACACTCAAAT -/A GGTTCCCAAA 3070 hom 93 het 32 0 31 1 A 0 1 225470 CASAVA_Build 4 184338765 3I TAAGCAAAAT ---/GTG GTATCTGTGG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GTG 0 1 225471 CASAVA_Build 4 184340806 2I CTGTTATGTC --/TT TGTCACTTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 3 225472 CASAVA_Build 4 184341499 1I17M1D CCCCACCTGG -AATCAACATTTTAATGGT/AAATCAACATTTTAATGG- TTTTTTTAAC 3070 hom 128 het 42 0 42 5 N/A 0 0 225473 CASAVA_Build 4 184349883 1D ATCATTTTAG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 9 8 225474 CASAVA_Build 4 184358377 4D TCATTTAAGT GTCA/---- GTCAGTGTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 7 GTCA 2 1 225475 CASAVA_Build 4 184359418 4D CTAGCATACA GTTT/---- GTTTGTTTTT 3070 hom 108 het 43 0 35 8 GTTT 3 2 225476 CASAVA_Build 4 184361854 1D TCTAATTTTG T/- TTTTACAATA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 T 5 4 225477 CASAVA_Build 4 184365339 1D TTGGTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 12 11 225478 CASAVA_Build 4 184427350 1I ATAGCACTTA -/C GATTGGGTGG 3070 hom 146 het 53 0 46 7 C 0 1 225479 CASAVA_Build 4 184431379 3I TTAGTATATC ---/TTT TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 11 225480 CASAVA_Build 4 184433301 4I CACAGTTGAT ----/TTTG TTTATCTTGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TTTG 0 1 225481 CASAVA_Build 4 184439302 1D TTTCTGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 T 11 10 225482 CASAVA_Build 4 184450180 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 29 1 20 8 A 14 15 225483 CASAVA_Build 4 184452908 1D TTCCTGAGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 50 0 39 11 T 10 9 225484 CASAVA_Build 4 184453226 1D TTTCCAGCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 10 9 225485 CASAVA_Build 4 184458663 1I CTGCATTCAA -/C AAAATCTTAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 C 0 1 225486 CASAVA_Build 4 184459601 1D AGGGGGCAGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 9 8 225487 CASAVA_Build 4 184460720 1I AAGCACTGCT -/G GTTAGCTTAG 3070 het 3070 hom 57 22 24 11 G 1 2 225488 CASAVA_Build 4 184463661 1D AGAAGCCAGA G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 G 5 4 225489 CASAVA_Build 4 184474188 1I CAGTACCCCA -/C CATGTGTACT 3070 het 3070 hom 57 24 25 8 C 1 2 225490 CASAVA_Build 4 184485955 4I TTGTCATATC ----/ATTT ATAAGTTTAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 ATTT 0 1 225491 CASAVA_Build 4 184490145 4I CCCCAAAGAG ----/GATA GATACTATTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 GATA 1 2 225492 CASAVA_Build 4 184492834 1I TTTGAAACTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 8 9 225493 CASAVA_Build 4 184493464 5I AAAATTTTGA -----/AAATT AAATTAAAAG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 AAATT 1 2 225494 CASAVA_Build 4 184494210 5D GACATAGTAA AAAAG/----- AAAATTTGCT 3070 het 3070 ref 33 19 11 5 AAAAG 1 0 225495 CASAVA_Build 4 184499683 1I CACAGCAGCC -/G GGGGGCCTGA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 G 5 6 225496 CASAVA_Build 4 184500073 2I CTATATATAG --/TT TTTTTTTTTT 2465 het 1978 hom 21 4 10 7 T 10 12 225497 CASAVA_Build 4 184502475 1I CTCAAACTTC -/T GGGCTCAAGC 2404 het 1305 hom 22 5 6 11 T 0 1 225498 CASAVA_Build 4 184507430 1D AACTATAAGT G/- TAATCAGTGG 3070 hom 42 het 24 0 22 2 G 1 0 225499 CASAVA_Build 4 184508904 1D GCAGCACTCC A/- AGCCACTTTC 3070 hom 75 het 41 0 29 12 A 2 1 225500 CASAVA_Build 4 184514951 1D ATAGGGTTTC A/- GTCTGAAGAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 1 0 225501 CASAVA_Build 4 184517662 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 35 1 32 2 A 15 14 225502 CASAVA_Build 4 184520940 1I CCGACTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2799 hom 18 het 13 0 9 4 A 13 14 225503 CASAVA_Build 4 184524108 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1927 hom 22 7 14 1 A 11 10 225504 CASAVA_Build 4 184532215 1I TTCACCGGTG -/A AAATAATATA 2896 het 2896 ref 25 13 6 6 A 3 4 225505 CASAVA_Build 4 184532829 5D CTAAAAATAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 840 het 216 hom 9 2 4 3 A 21 16 225506 CASAVA_Build 4 184533012 1D AAAAAAAAAA T/- AATAAATTGT 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 1 0 225507 CASAVA_Build 4 184533648 1D TGTTAATGAA C/- TCACATACTG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 C 1 0 225508 CASAVA_Build 4 184535984 1I GCAGACAAAA -/C CCCTCAGACA 3070 het 3070 hom 27 14 10 3 C 3 4 225509 CASAVA_Build 4 184541004 1I GCGCCCGGCC -/T AACATAGCAC 1423 hom 10 het 5 0 4 1 T 0 1 225510 CASAVA_Build 4 184541103 1I TACAACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 10 11 225511 CASAVA_Build 4 184544166 2I AAATGATGAA --/AC CCCCCCCCGC 940 het 940 ref 11 7 4 1 AC 0 1 225512 CASAVA_Build 4 184546399 10D TATCTTTTGG CCTGGCCTGA/---------- CCTGGCCTGA 3070 het 3070 ref 29 12 12 8 CCTGGCCTGA 2 1 225513 CASAVA_Build 4 184555629 2D TGTTGTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1141 hom 35 7 19 10 T 12 10 225514 CASAVA_Build 4 184562361 8I GAGCTTTCCC --------/CCACCCCA TCTGTGTCCC 3070 hom 62 het 28 0 19 9 CCACCCCA 0 1 225515 CASAVA_Build 4 184565197 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 10 0 9 1 A 11 10 225516 CASAVA_Build 4 184572902 14D ATATATATAT ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 646 hom 7 het 3 0 3 0 AC 17 10 225517 CASAVA_Build 4 184575378 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 8 T 10 9 225518 CASAVA_Build 4 184578939 1D CTCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 23 1 11 11 A 13 12 225519 CASAVA_Build 4 184583467 3I TTGTTATTTT ---/TTG TTATTTCAGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TTG 0 1 225520 CASAVA_Build 4 184589605 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 33 1 20 12 T 13 12 225521 CASAVA_Build 4 184592898 2I ACATCCCCCA --/CT CTCTTCATTC 3070 hom 90 het 37 0 31 7 CT 2 3 225522 CASAVA_Build 4 184595361 6I AAAAAAAAAA ------/GAAAAG AAAAGAAAAG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 GAAAAG 0 1 225523 CASAVA_Build 4 184595901 1D AGAAGCACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 10 9 225524 CASAVA_Build 4 184599226 4I GATATGGAGT ----/CTTC CTTCATCACT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 CTTC 1 2 225525 CASAVA_Build 4 184599853 1I TGAGGCTTGG -/T TTATCATCCT 3070 hom 74 het 29 0 24 5 T 2 3 225526 CASAVA_Build 4 184600051 1D GACAAGCTGA C/- CACCCCTAGC 3070 hom 105 het 40 0 35 7 C 2 1 225527 CASAVA_Build 4 184600219 4I ATATATATAT ----/ATAC ACACACGTGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 ATAC 0 1 225528 CASAVA_Build 4 184601401 2D GTAATTTCTC CA/-- CCTTTTAAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 CA 1 0 225529 CASAVA_Build 4 184601623 2D40M4D CACATAAATT ACACAGTTAACCTTATCTGATCTTACCTAAAGTGACCTTTTTTTGC/--ACAGTTAACCTTATCTGATCTTACCTAAAGTGACCTTTTT---- TTGCTTATTC 3070 hom 81 het 29 0 26 20 N/A 0 0 225530 CASAVA_Build 4 184603624 5I CCTGTTTTTT -----/GCACA GCACAAGTAG 3070 hom 79 het 32 0 24 8 GCACA 1 2 225531 CASAVA_Build 4 184604553 3D AAACACGGTT CTG/--- CATCATTTGT 3070 hom 120 het 52 0 40 17 CTG 1 0 225532 CASAVA_Build 4 184609521 1I ACTCCGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 20 5 13 2 A 15 16 225533 CASAVA_Build 4 184611608 1D TATTGTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 29 1 16 12 T 14 13 225534 CASAVA_Build 4 184616299 3D AGAAAAGAGA AAG/--- AAGGTAGGTA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 AAG 2 1 225535 CASAVA_Build 4 184617741 2D ACCAAATAGC AG/-- AGAGTTAACA 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 AG 3 2 225536 CASAVA_Build 4 184619607 5D CTCCCATATC TTATT/----- TTAATTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 TTATT 1 0 225537 CASAVA_Build 4 184623088 2D ATTCTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 A 13 11 225538 CASAVA_Build 4 184624915 1D ATGCAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 4 A 11 10 225539 CASAVA_Build 4 184631009 1I TTTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 T 9 10 225540 CASAVA_Build 4 184631166 5D CTGGCCTCTT TTCTC/----- TTCCTCAGAC 3070 het 3070 hom 45 19 22 5 TTCTC 1 0 225541 CASAVA_Build 4 184674452 1D TGGAAAACAC T/- TTTAACAAAA 3070 hom 156 het 58 0 52 6 T 4 3 225542 CASAVA_Build 4 184674713 1I TGCATCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2100 het 1552 hom 22 6 7 9 T 15 16 225543 CASAVA_Build 4 184681149 8I CCCCCTCCCT --------/CCTCCCCC TGCCTTGGCC 3070 hom 116 het 42 0 34 8 CCTCCCCC 0 1 225544 CASAVA_Build 4 184683951 1D AAATGCTTGT C/- CCTTGTCTCA 3070 het 3070 ref 53 26 17 11 C 3 2 225545 CASAVA_Build 4 184705257 2D ATGAGTGCAC AT/-- GTCTATTTTT 3070 het 3070 ref 61 33 26 2 AT 1 0 225546 CASAVA_Build 4 184705893 1I41M1D TTTTCAGTTA -ATTGTCTTTCACTTTCCTAATCTCTAAAGTGGTCATCAGTCT/GATTGTCTTTCACTTTCCTAATCTCTAAAGTGGTTATCAGTC- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 22 8 N/A 0 0 225547 CASAVA_Build 4 184707381 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1721 het 1721 ref 31 17 5 10 T 14 13 225548 CASAVA_Build 4 184708500 1I CTCTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3008 het 2907 hom 25 9 9 7 A 11 12 225549 CASAVA_Build 4 184712597 1D GGTGTGTGTG T/- GGGGGGGTGA 2945 het 2945 ref 38 20 10 8 T 1 0 225550 CASAVA_Build 4 184715603 4D CCTCCCTTCT CAGA/---- CCCTTGGACT 3070 het 3070 ref 31 20 8 4 CAGA 1 0 225551 CASAVA_Build 4 184716092 4D GCAACTGACA TTTT/---- TGTACCTGTT 3070 hom 87 het 42 0 30 13 T 5 1 225552 CASAVA_Build 4 184738410 2I CATCTCTACC --/AA AAAAAAAAAA 2444 hom 36 het 18 0 14 4 A 16 18 225553 CASAVA_Build 4 184739964 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 24 1 11 13 T 15 14 225554 CASAVA_Build 4 184743638 1D TGGGGATGAG A/- AAACGTTCTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 4 3 225555 CASAVA_Build 4 184749507 4I TCAGATGCCC ----/TCTT TCTAACTGCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TCTT 0 1 225556 CASAVA_Build 4 184772458 4D GGATACTAAT AGTC/---- AGAGAAACAC 3070 hom 131 het 48 0 43 8 AGTC 1 0 225557 CASAVA_Build 4 184772983 1D TATATTGTTT A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 7 6 225558 CASAVA_Build 4 184779589 8I AATGGGAAGT --------/TGTTTCTA ACCATGGAAT 2251 het 2251 ref 15 9 5 1 TGTTTCTA 0 1 225559 CASAVA_Build 4 184780308 2I AAGTATGCAC --/TG TGTAGTGTTC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 TG 1 2 225560 CASAVA_Build 4 184782297 4I TTTTTTGGAG ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 TTTA 2 3 225561 CASAVA_Build 4 184782374 12I GCAACCTCTA ------------/CCTCCCAGGTTC CCTCCCAGGT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 CCTCCCAGGTTC 1 2 225562 CASAVA_Build 4 184785899 2I TCTTGAACTC --/CT GACCTCAGGT 1535 het 1535 ref 14 9 4 3 CT 0 1 225563 CASAVA_Build 4 184792193 1I ATTTATGCAA -/T TTTTTTCCAC 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 T 6 7 225564 CASAVA_Build 4 184795050 1D AAATCTGCAT C/- CCCCCCTCCA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 7 6 225565 CASAVA_Build 4 184797428 2I CATCCAGAAC --/CA CAGTTCCAAG 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 CA 1 2 225566 CASAVA_Build 4 184802243 2D GATCAGATTC TT/-- TTTCTTCTCA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 5 3 225567 CASAVA_Build 4 184806335 7I AGGTTGCAGT -------/GAGCCGA GATCGCGCCA 1730 het 1730 ref 14 6 5 3 GAGCCGA 0 1 225568 CASAVA_Build 4 184807718 1D ATCGATGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 11 10 225569 CASAVA_Build 4 184808901 2D GTGGGCATGT TA/-- TATATATTCT 3070 het 3070 hom 42 16 25 1 TA 4 3 225570 CASAVA_Build 4 184810649 1D TGGCAAAAGT A/- AAAAAAAATA 2065 het 1677 hom 18 6 6 6 A 9 8 225571 CASAVA_Build 4 184815181 3D TCAAAAATAG CAA/--- CAACAACAGC 3070 het 3070 hom 27 11 16 3 CAA 3 2 225572 CASAVA_Build 4 184818075 1I GGTTTTGGGG -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 T 7 8 225573 CASAVA_Build 4 184839926 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 62 het 22 0 21 1 A 9 10 225574 CASAVA_Build 4 184845447 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TA 7 6 225575 CASAVA_Build 4 184847939 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 17 0 10 7 T 10 11 225576 CASAVA_Build 4 184848374 1I AAACCATAAG -/A AAAAAAAAAA 3033 het 3033 ref 28 14 8 6 A 10 11 225577 CASAVA_Build 4 184869819 90D CTGAACAACC ACAGCAGCAGCAAACTGAAAGCAGGAGTGCTGTCTTCACTGCCTCGGGAATGCCTCAGAATCTTTCTGCTTAAAGCATAGCAAATCACTT/------------------------------------------------------------------------------------------ TTGATTGTGA 3070 het 3070 ref 34 35 14 4 ACAGCAGCAGCAAACTGAAAGCAGGAGTGCTGTCTTCACTGCCTCGGGAATGCCTCAGAATCTTTCTGCTTAAAGCATAGCAAATCACTT 1 0 225578 CASAVA_Build 4 184874489 1I GTTTTTCATG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 8 9 225579 CASAVA_Build 4 184882574 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 28 hom 17 1 15 1 A 9 8 225580 CASAVA_Build 4 184889816 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 35 het 18 0 12 6 AGG 0 1 225581 CASAVA_Build 4 184890321 4D CAACAAAAAA AAAG/---- AAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 27 13 13 5 AAAG 1 0 225582 CASAVA_Build 4 184891515 1I GCCTGCCTCT -/C CTCTGCCCTC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 C 1 2 225583 CASAVA_Build 4 184896486 2I ACTAATAATA --/CT CTCTCACAAT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 CT 2 3 225584 CASAVA_Build 4 184897671 1I GAATAGGCCA -/G GCACGGTGGC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 G 1 2 225585 CASAVA_Build 4 184899186 1D ATTTTCTATG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 8 7 225586 CASAVA_Build 4 184900249 4D TGTCTAATTA TATT/---- TATTTCTCTT 3070 het 3070 ref 33 21 9 5 TATT 2 1 225587 CASAVA_Build 4 184900332 1D TCTCTCAATA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 22 9 12 2 T 9 8 225588 CASAVA_Build 4 184900715 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 249 het 249 ref 20 6 4 10 T 14 12 225589 CASAVA_Build 4 184901071 1I GGATAAATAA -/G GCTCATCAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 1 2 225590 CASAVA_Build 4 184901642 3I TTATGAAGTG ---/TTA TTATTAATAA 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 TTA 2 3 225591 CASAVA_Build 4 184909612 3I TCCTTTAAGC ---/AAA TGTGTTAGTT 3070 het 3070 hom 53 20 24 9 A 0 3 225592 CASAVA_Build 4 184918288 1D CTCCGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 493 het 493 ref 23 18 2 3 A 15 14 225593 CASAVA_Build 4 184920046 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2520 het 117 hom 18 1 11 7 A 12 11 225594 CASAVA_Build 4 184920057 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAA 1448 het 299 hom 19 5 7 7 AG 1 0 225595 CASAVA_Build 4 184929706 2D CCCTGTCTCT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 38 0 35 5 A 11 9 225596 CASAVA_Build 4 184945625 2I GTTGTCTGAT --/AC ATGATTGTTG 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 AC 0 1 225597 CASAVA_Build 4 184950756 2D AGATCCTCTA AG/-- ATAGCCCCTC 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 AG 1 0 225598 CASAVA_Build 4 184952216 2D AGACAAAGAC CT/-- CTGTATCAAG 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 CT 2 1 225599 CASAVA_Build 4 184957038 5D7M9D4M5I GTACTTTGGG TTTTATACTTTGAGTTTTTGTACTA-----/-----TCCGGTG---------GCTAAAAGC TTACATAGTA 3070 het 3070 ref 38 21 18 4 N/A 0 0 225600 CASAVA_Build 4 184957815 1I CTACCCGTAC -/T TTTTTTGAAA 3070 hom 70 het 28 0 20 8 T 6 7 225601 CASAVA_Build 4 184958341 1D GGCTTCCTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 21 0 19 3 T 9 8 225602 CASAVA_Build 4 184962955 4I1M2D ATTTAGAATG ----AAC/CTTTA-- TTCTGAGATT 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 N/A 0 0 225603 CASAVA_Build 4 184965128 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 16 het 19 0 13 6 T 10 9 225604 CASAVA_Build 4 184965528 1D AGTCCCCAGG C/- CCTTCTGGTG 3070 hom 66 het 24 0 21 3 C 3 2 225605 CASAVA_Build 4 184967409 1D TAAAATAAAG T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 8 7 225606 CASAVA_Build 4 184970116 2I GGTCTCACTC --/TG TCACCCAGGC 854 het 854 ref 16 6 3 7 TG 0 1 225607 CASAVA_Build 4 184970480 6D GAATAAACTA TAACTT/------ TAAATTTACT 3070 het 3070 ref 29 18 11 2 TAACTT 1 0 225608 CASAVA_Build 4 184970771 1D CTACTTGTGA G/- GACTGACTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 G 2 1 225609 CASAVA_Build 4 184986024 1D ATCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 513 hom 27 3 15 9 A 17 16 225610 CASAVA_Build 4 185014430 1D CCTATGAACT A/- AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 9 A 7 6 225611 CASAVA_Build 4 185019456 1I CCGTTACCTT -/G GGGGGGGTCC 3070 hom 67 het 27 0 20 7 G 7 8 225612 CASAVA_Build 4 185021714 4I CGAATGTTAA ----/TTAC TTTGCCCTTT 3070 hom 174 het 64 0 58 6 TTAC 0 1 225613 CASAVA_Build 4 185032778 2I ATGCAGAGAC --/TA TATATATATA 2375 het 366 hom 8 1 6 1 TA 6 7 225614 CASAVA_Build 4 185039396 1D ACACCTATAA T/- TCCAGCACTT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 T 2 1 225615 CASAVA_Build 4 185042007 1D ATTTTATTTT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 113 hom 28 1 22 5 A 1 0 225616 CASAVA_Build 4 185042394 1I GTATATTAAA -/G AAACTTGTCA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 G 0 1 225617 CASAVA_Build 4 185042451 1D TTGTCTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 759 hom 27 2 20 5 T 15 14 225618 CASAVA_Build 4 185044496 1D ACAACAGAAA G/- GGGGGGGAAT 3070 het 3070 hom 55 22 23 10 G 8 7 225619 CASAVA_Build 4 185045416 1I CGCCTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3064 het 1777 hom 19 6 9 4 A 11 12 225620 CASAVA_Build 4 185050977 14D TACCTACCAA TTAGTAGGTAACAG/-------------- TTAGCATGTA 3070 hom 95 het 34 0 32 6 TTAGTAGGTAACAG 1 0 225621 CASAVA_Build 4 185067908 4I TCTATAATAG ----/CTTT CAAATGAGAC 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 CTTT 0 1 225622 CASAVA_Build 4 185069311 2D TAGACAAAAC TT/-- CTCTGCCCTC 3070 hom 162 het 58 0 54 5 T 2 0 225623 CASAVA_Build 4 185086366 2D GGGAGCCCTC GG/-- GGGGGGGCAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 8 G 9 7 225624 CASAVA_Build 4 185089160 1I ATCTAGAAAC -/T TGTCATGTTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 1 2 225625 CASAVA_Build 4 185090884 1I ATGGCTGCTC -/T TGTTGAAGCA 3070 hom 114 het 46 0 37 9 T 1 2 225626 CASAVA_Build 4 185094565 1D ATTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 10 9 14 T 12 11 225627 CASAVA_Build 4 185100727 1D TCCTTTTCTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 9 8 225628 CASAVA_Build 4 185104775 1D ATAGTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1182 hom 43 11 24 8 T 16 15 225629 CASAVA_Build 4 185105232 2D CTGGTGGGGG GT/-- GGGGCAAGGG 2239 hom 5 het 18 0 7 13 GT 1 0 225630 CASAVA_Build 4 185106644 4I CTTTCTCTAA ----/TGAC TATGCAGCCT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 TGAC 0 1 225631 CASAVA_Build 4 185108833 1I GGCCGGGGAG -/C CCACAGAACT 3070 hom 117 het 42 0 36 6 C 2 3 225632 CASAVA_Build 4 185138847 1D TTATTCATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 18 11 T 12 11 225633 CASAVA_Build 4 185141019 2D TTGCCTCAGT AA/-- TTATCTTTTC 3070 het 3070 ref 59 27 26 6 A 2 0 225634 CASAVA_Build 4 185146241 2D CCCCTCGCCA CC/-- CCGCGCCTGG 2953 het 2953 ref 24 11 10 3 C 4 2 225635 CASAVA_Build 4 185158909 3D AGCACCCAGG TGT/--- TGTTCTGTTC 3070 hom 68 het 26 0 22 4 TGT 2 1 225636 CASAVA_Build 4 185160101 1I TAAAATACTT -/A ACTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 1 2 225637 CASAVA_Build 4 185162096 2D CTTCCTTTGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3060 hom 37 11 19 7 T 11 9 225638 CASAVA_Build 4 185163531 1I ACTTGAACCC -/G GGAGGTGGAG 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 G 2 3 225639 CASAVA_Build 4 185172258 10D AGCCCCAACC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 26 2 14 13 A 24 14 225640 CASAVA_Build 4 185174612 1I AATGAATGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 417 hom 23 1 16 6 A 9 10 225641 CASAVA_Build 4 185176612 3I TATACATGTG ---/CCC CCCATGTAAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 3 6 225642 CASAVA_Build 4 185178830 1D ACATATGAAA G/- GGGGGGGGGT 3070 het 80 hom 29 3 17 9 G 10 9 225643 CASAVA_Build 4 185181787 1D2M1D AATATTATTA GAGC/-AG- TTCTGAGTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 N/A 0 0 225644 CASAVA_Build 4 185197818 1D ACGTGGGAAC G/- TGGAGGGGAC 2453 het 2453 ref 24 10 8 6 G 1 0 225645 CASAVA_Build 4 185205977 1D TGTTTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2743 hom 21 6 12 3 A 11 10 225646 CASAVA_Build 4 185219946 1I TGTGTGGGGC -/G AGGGGGGAAA 1755 het 1755 ref 25 10 10 5 G 0 1 225647 CASAVA_Build 4 185221038 3D AATTAACCAT AAA/--- ATTAAAGTAG 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 A 4 1 225648 CASAVA_Build 4 185221750 3I GTCTGTCAAG ---/CTC CTCCGCCTGT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 CTC 1 2 225649 CASAVA_Build 4 185225936 1I GTGAGAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 12 13 225650 CASAVA_Build 4 185234564 1D TTTCTAGCCC T/- TTTTTGGTTA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 6 5 225651 CASAVA_Build 4 185240321 1D CCAATGAAGC T/- CCGTGGGAAG 3070 hom 80 het 33 0 25 8 T 1 0 225652 CASAVA_Build 4 185245900 1D GGTACTGGTA C/- CAAAACAGAT 3070 het 2753 hom 17 7 10 0 C 2 1 225653 CASAVA_Build 4 185246327 1D49M1I GGCAACCTAC AGAATGGAAGAAAATTTCTACAATCTACCTATCTGACAAAGGTCTAATAT-/-TAATGGGAGAAAATTTTTGCAGTCTACCTATCTGACAAAGGTCTAATATC CAGAATCTAC 1864 het 1864 ref 25 33 4 0 N/A 0 0 225654 CASAVA_Build 4 185247608 1D TAGTGCAAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 1088 hom 35 5 22 8 T 9 8 225655 CASAVA_Build 4 185247630 1D TCTATTTTTT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 53 het 30 0 25 5 G 8 7 225656 CASAVA_Build 4 185256067 1D AGCTGGAGAC T/- TGAGTCCAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 T 2 1 225657 CASAVA_Build 4 185266876 1I CTGCAGAGTC -/A ATTAAAAGAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 1 2 225658 CASAVA_Build 4 185267378 8D CAACAACAAC AACAAAAA/-------- AAAACAAAAC 3070 het 2508 hom 17 6 11 1 AACAAAAA 1 0 225659 CASAVA_Build 4 185267995 2D TCAGACAAAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 42 18 11 16 GT 9 8 225660 CASAVA_Build 4 185272916 1D CTTTCTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 570 hom 41 2 26 13 A 12 11 225661 CASAVA_Build 4 185288078 1D TTTGGCAGAC T/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 T 7 6 225662 CASAVA_Build 4 185288871 1D CCTAACTGAC A/- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 2 1 225663 CASAVA_Build 4 185290545 1D TTGAGTTGAC T/- TTTTCCTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 T 5 4 225664 CASAVA_Build 4 185292837 1D CAAATGTGGC T/- TTGTCAGTTT 2076 het 2076 ref 36 23 8 6 T 3 2 225665 CASAVA_Build 4 185293843 10D GTGAATAATT CATAAGGGTA/---------- CTGTTCAGTG 3070 het 3070 ref 36 21 13 4 CATAAGGGTA 1 0 225666 CASAVA_Build 4 185294327 10D TGGAAATATT AGTCTATTAA/---------- AGTCTATTAG 3070 het 1369 hom 15 4 8 4 AGTCTATTAA 1 0 225667 CASAVA_Build 4 185304589 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAGAA 2711 het 2711 ref 17 10 7 1 G 1 0 225668 CASAVA_Build 4 185312028 1I AAAAATCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 9 10 225669 CASAVA_Build 4 185313645 2I AGCTGAGCAA --/AT ATGTGCAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AT 1 2 225670 CASAVA_Build 4 185315577 2D TCTTTCTTTC CT/-- TTTCTTTCTT 620 het 620 ref 43 25 4 14 CT 1 0 225671 CASAVA_Build 4 185318847 4D TCAGCTGGAG CTCT/---- CTCTCTCTTG 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 CT 6 4 225672 CASAVA_Build 4 185319815 2I AGAAAATGTG --/GT GTATATATAT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 GT 1 2 225673 CASAVA_Build 4 185323793 1I CCTCTAAGGA -/G GGAATATTCT 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 G 2 3 225674 CASAVA_Build 4 185329935 1I AACACATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 11 12 225675 CASAVA_Build 4 185334884 1D TAATCATGAG A/- AATTAGCACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 3 2 225676 CASAVA_Build 4 185337838 1D ACAGCACAAT C/- AAATTAGAAC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 1 0 225677 CASAVA_Build 4 185338082 3D ATCTCAAGTT AAC/--- AACCTAACAT 3070 hom 45 het 17 0 16 3 AAC 2 1 225678 CASAVA_Build 4 185338245 5D TTTTTTGACA AAATT/----- AATAAAATAG 3070 hom 54 het 20 0 18 3 AAATT 1 0 225679 CASAVA_Build 4 185338701 1D GAGATACAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 A 8 7 225680 CASAVA_Build 4 185341648 2D ATGCATGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 AC 9 8 225681 CASAVA_Build 4 185353170 1I CAGAGTCAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 40 het 18 0 14 4 T 8 9 225682 CASAVA_Build 4 185363875 1D GGAGGCTCCA G/- GCAGTCAGGG 3070 hom 64 het 25 0 19 7 G 2 1 225683 CASAVA_Build 4 185378000 6I GGGAAAGGGA ------/AAGGGG AAGGGGAAGG 2472 het 2472 ref 27 11 8 8 AAGGGG 1 2 225684 CASAVA_Build 4 185381419 5I2M1D AAATGACAAT -----ATA/GAGAGAT- CTGATGAGAG 3070 het 3070 ref 24 16 7 3 N/A 0 0 225685 CASAVA_Build 4 185399685 1I ATAAAAATTT -/G GGGGGGGGGG 2043 hom 27 het 15 0 6 9 G 10 11 225686 CASAVA_Build 4 185406078 1D GTAAGTGGTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 A 9 8 225687 CASAVA_Build 4 185409191 1D GCCAAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 30 1 28 1 A 12 11 225688 CASAVA_Build 4 185410203 2D CTTTAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 12 10 225689 CASAVA_Build 4 185412379 1D CCCACCAATT C/- CGGACACACC 3070 het 3070 hom 31 11 12 9 C 2 1 225690 CASAVA_Build 4 185412542 4I TCTGTGAATC ----/TATG TATTTGTAGC 3070 het 3070 ref 44 28 11 5 TATG 0 1 225691 CASAVA_Build 4 185414726 2I GAGCAAAGTG --/TA TATTCAGTCA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TA 1 2 225692 CASAVA_Build 4 185415027 1I TTTGTTGTTA -/C CGTAAGTGAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 1 2 225693 CASAVA_Build 4 185415180 1I CCTGGCACAC -/A AAAGGTGTTA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 3 4 225694 CASAVA_Build 4 185416955 3D7M2D ATGCAGTATA TATTATTGTCTT/---TATTGTC-- ATGCATATAT 3070 het 3070 ref 37 24 16 5 N/A 0 0 225695 CASAVA_Build 4 185417140 10D AGTATGTGTG TGTGAATATA/---------- TGTGAATATA 3070 het 3070 hom 41 18 17 10 TGTGAATATA 2 1 225696 CASAVA_Build 4 185437711 1I ATTTATATTA -/T TTCATTTTTT 3070 hom 138 het 48 0 46 2 T 2 3 225697 CASAVA_Build 4 185441154 1D TCTAAAAATG A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 8 7 225698 CASAVA_Build 4 185442508 5I ACAGACATCC -----/TTCCT TAAGTCCAGT 3070 hom 68 het 24 0 19 5 TTCCT 0 1 225699 CASAVA_Build 4 185442998 1I TGCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 785 hom 39 2 34 3 A 9 10 225700 CASAVA_Build 4 185456191 5D AACTGGGAAA TGACT/----- TGACTAAATA 3070 hom 141 het 50 0 47 4 TGACT 2 1 225701 CASAVA_Build 4 185456284 5D TGAAACTGCT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 41 2 24 15 A 19 14 225702 CASAVA_Build 4 185456837 1D GAACTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1075 hom 42 4 28 11 T 15 14 225703 CASAVA_Build 4 185466050 2I TATGATAGCA --/AT TCCTTCTTCT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 AT 0 1 225704 CASAVA_Build 4 185477528 1D CCATAAAATT A/- TTTTTTTAAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 1 0 225705 CASAVA_Build 4 185497553 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 6 7 225706 CASAVA_Build 4 185509133 1I TAAACTGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 35 1 24 10 T 11 12 225707 CASAVA_Build 4 185524084 1D GATATATAAT G/- GGCTGCTCAA 3070 hom 123 het 43 0 41 5 G 3 2 225708 CASAVA_Build 4 185545970 1D TTACAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2989 het 2989 ref 26 13 7 6 A 11 10 225709 CASAVA_Build 4 185552815 3D GAGTCCTTCA GAT/--- GATGTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 19 12 7 GAT 2 1 225710 CASAVA_Build 4 185564124 1D CAATACAGCC A/- AGAATAAAGT 3070 hom 81 het 32 0 27 7 A 2 1 225711 CASAVA_Build 4 185582212 2D ACACACAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 108 het 47 0 37 11 AC 10 9 225712 CASAVA_Build 4 185589746 3I TAAATCCAGA ---/GCG GCGGTCAAGA 3070 het 3070 ref 44 29 10 5 GCG 1 2 225713 CASAVA_Build 4 185589941 1D GTGGAAGTGG C/- CCTGCCTCCA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 C 3 2 225714 CASAVA_Build 4 185590012 1D CAGTTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 38 1 27 10 A 15 14 225715 CASAVA_Build 4 185592905 5D CATGAAGTTG ACAGT/----- ACTATCCATG 3070 het 3070 ref 63 34 19 15 ACAGT 1 0 225716 CASAVA_Build 4 185595513 1I CTAATTTTTT -/A AAAATATTTT 3060 het 1834 hom 19 6 8 5 A 4 5 225717 CASAVA_Build 4 185615998 1I AAAACCTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2686 hom 33 14 16 3 A 10 11 225718 CASAVA_Build 4 185623330 1D CAAAAAGCCA C/- CAATCTAAGT 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 C 2 1 225719 CASAVA_Build 4 185623638 1I TTCAAGAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 9 10 225720 CASAVA_Build 4 185624216 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 641 hom 24 4 14 6 T 10 9 225721 CASAVA_Build 4 185626643 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2838 het 2838 ref 20 10 8 2 A 9 10 225722 CASAVA_Build 4 185629145 2I TTTATATAAA --/AC AGTTATTCCA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AC 0 1 225723 CASAVA_Build 4 185641751 1I AAAACAATTC -/A AGTCTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 1 2 225724 CASAVA_Build 4 185647045 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 10 9 225725 CASAVA_Build 4 185650974 2D TATGATTTGA CT/-- CTGTGTCCCC 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 CT 2 1 225726 CASAVA_Build 4 185658888 1D CTGCTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 34 1 23 10 T 12 11 225727 CASAVA_Build 4 185659536 2D TCAGGGCTCC CT/-- GTTTCCTAGT 3070 het 3070 ref 36 17 16 5 CT 1 0 225728 CASAVA_Build 4 185661064 2D AGAAAAAGAC AT/-- GTGTGAGGTT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 AT 1 0 225729 CASAVA_Build 4 185666606 1D TGAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1226 het 1226 ref 20 12 3 6 A 13 12 225730 CASAVA_Build 4 185689802 2I CGTCTCTGAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 AT 5 6 225731 CASAVA_Build 4 185693758 1D TTGTTTCAGA T/- TTTTAACATC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 5 4 225732 CASAVA_Build 4 185694631 3D TTGGCTAGGC TAT/--- TATTAATTAT 3070 het 3070 ref 22 12 8 5 TAT 2 1 225733 CASAVA_Build 4 185696088 2I AATGGTAAGG --/AA AAAAGTCTGT 3070 het 3070 ref 56 29 22 5 A 4 6 225734 CASAVA_Build 4 185706912 1I TTTTCCTGGC -/A ATTTGCCTTC 3070 het 3070 hom 43 13 16 14 A 1 2 225735 CASAVA_Build 4 185707579 1I TGATTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 20 13 8 T 11 12 225736 CASAVA_Build 4 185710041 1D CACTGTACTC T/- TTTTCCACCA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 5 4 225737 CASAVA_Build 4 185710459 1D TTATCTTTTT C/- TTTTGTTGCC 3070 het 2891 hom 23 10 13 1 C 1 0 225738 CASAVA_Build 4 185725000 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1123 het 1123 ref 20 5 5 10 T 15 16 225739 CASAVA_Build 4 185726053 1D AGCCCCCCAA C/- CTTCCCACCC 1943 het 1751 hom 12 6 6 0 C 2 1 225740 CASAVA_Build 4 185731882 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 29 2 22 5 A 10 11 225741 CASAVA_Build 4 185732334 1I GAAAGCAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1586 hom 21 7 11 3 T 9 10 225742 CASAVA_Build 4 185734512 2I CATCAAAAAG --/AC ACAGAGATCC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AC 1 2 225743 CASAVA_Build 4 185735395 4I AGTGTGTACA ----/TACT TATTTATTAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TACT 0 1 225744 CASAVA_Build 4 185740559 1D AATAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2215 hom 30 6 16 8 T 12 11 225745 CASAVA_Build 4 185740881 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1694 hom 18 6 9 3 T 14 13 225746 CASAVA_Build 4 185742083 1D TTTGGGGAGC T/- TTTTTTTTTT 2416 het 1657 hom 39 9 11 19 T 15 14 225747 CASAVA_Build 4 185745662 1D TATTTCCCAT C/- CCCCCCCCGA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 C 9 8 225748 CASAVA_Build 4 185746369 4I CAGGAAGAAT ----/AGAG AGAAAAGCAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AG 1 3 225749 CASAVA_Build 4 185773210 5D AGGCGACTCT GTTAA/----- GTTAAGTCAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 GTTAA 2 1 225750 CASAVA_Build 4 185778507 1I CAGAAAGACT -/A AATGTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 2 3 225751 CASAVA_Build 4 185783158 1D CACATGCGCT A/- TCCATGGCAG 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 A 1 0 225752 CASAVA_Build 4 185808640 1I ATGCGGACTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 7 8 225753 CASAVA_Build 4 185810555 1D GAGGAACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 A 11 10 225754 CASAVA_Build 4 185816231 3D TTTTTTTTTT TTG/--- GGGCACTGTG 3070 het 1387 hom 15 4 8 4 TTG 1 0 225755 CASAVA_Build 4 185820087 4I TATTTCTATC ----/TATT CATCTCTTCA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TATT 0 1 225756 CASAVA_Build 4 185821962 1D TACATTGAAA T/- TAATTTCATT 3070 het 3070 hom 44 19 24 2 T 2 1 225757 CASAVA_Build 4 185823631 1D TAAAACCATT A/- AAAAAAATGA 1510 het 1510 ref 19 10 5 4 A 8 7 225758 CASAVA_Build 4 185825468 2I AAAGTGAGAC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3 hom 29 1 24 4 T 9 11 225759 CASAVA_Build 4 185829129 6D AGTTCTACAG ATTAAA/------ ATTAAATTTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 4 ATTAAA 2 1 225760 CASAVA_Build 4 185835679 8D ATAGGCACGA CACTGTCT/-------- AATATAGTTT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 CACTGTCT 1 0 225761 CASAVA_Build 4 185836977 18D CGCCCAGCCA GTTCTTACAGTTCTAAGT/------------------ TAACTTTTCT 3070 het 3070 ref 17 10 9 0 GTTCTTACAGTTCTAAGT 1 0 225762 CASAVA_Build 4 185838346 1D CTAAATATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 27 0 13 17 T 10 9 225763 CASAVA_Build 4 185838986 1I GCAGTAGTAG -/T ATCCGGGATT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 0 1 225764 CASAVA_Build 4 185840033 1I ATTTTTATTG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 T 6 7 225765 CASAVA_Build 4 185841035 1I CTATCTCTAC -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 6 7 225766 CASAVA_Build 4 185842160 2I TTTATTTTCT --/TC TGTCTTATAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 TC 0 1 225767 CASAVA_Build 4 185842595 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAG 3070 het 1295 hom 18 4 10 4 CT 2 1 225768 CASAVA_Build 4 185851911 3I GCATTATTTT ---/TGA TGATGACTCT 3070 het 3070 hom 49 14 25 10 TGA 2 3 225769 CASAVA_Build 4 185853119 4D AAATCGCCTT ATTA/---- ATTAATCAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 ATTA 2 1 225770 CASAVA_Build 4 185855148 3D GCCACCTCAG CCT/--- CCTGAGTAGC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 CCT 2 1 225771 CASAVA_Build 4 185855684 2D AGGTGGACTC TG/-- TAATTCTGTA 3070 het 3070 hom 40 19 19 5 TG 1 0 225772 CASAVA_Build 4 185857817 4I GCAGTCTCTC ----/TCTT TTTTTTTTTT 1812 het 1812 ref 20 9 6 5 TCTT 0 1 225773 CASAVA_Build 4 185858443 3I CTTCGACAAT ---/AAC AACATAAACA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 AAC 1 2 225774 CASAVA_Build 4 185860706 1D TTTTTATTTT A/- AAAATATCTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 5 4 225775 CASAVA_Build 4 185862118 1D ATGCTGGTGT A/- AACAAACCTA 3070 het 3070 ref 41 19 15 8 A 3 2 225776 CASAVA_Build 4 185862235 2D ATACTTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 19 15 15 T 12 10 225777 CASAVA_Build 4 185862732 2I AATGTGTATA --/CC CATGACTGAA 3070 het 3070 hom 58 23 28 7 C 1 3 225778 CASAVA_Build 4 185863728 1I ACATTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 10 11 225779 CASAVA_Build 4 185864299 1I GCCCCACTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2612 hom 19 7 9 3 A 8 9 225780 CASAVA_Build 4 185866371 13D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAG 3070 het 1710 hom 14 7 9 4 A 22 9 225781 CASAVA_Build 4 185866683 3D AAGAATATCA AAG/--- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 11 17 6 AAG 1 0 225782 CASAVA_Build 4 185868816 1I CTTACTAGTC -/A TAAGATCTCA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 0 1 225783 CASAVA_Build 4 185871166 1D AGTTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 11 10 225784 CASAVA_Build 4 185873054 4D AAAACAAAAC AGTA/---- AGTAAGGAGA 3070 het 3070 hom 42 18 20 7 AGTA 2 1 225785 CASAVA_Build 4 185873546 1I TCCAACCTCC -/A ACCTCCCGGG 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 1 2 225786 CASAVA_Build 4 185874086 3D TTTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 570 hom 21 4 12 5 T 13 10 225787 CASAVA_Build 4 185878321 4D CAAATAACTT TAAC/---- AAAGAATTGA 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 TAAC 1 0 225788 CASAVA_Build 4 185879769 6D TCAGACAAAC TAGATT/------ TTAAGACAGA 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 TAGATT 1 0 225789 CASAVA_Build 4 185880864 3D AAAACAAAAC AAA/--- AAAAAACTGT 1612 het 1612 ref 36 21 6 9 A 9 6 225790 CASAVA_Build 4 185881656 2I AGTAGAGCAC --/AT GTTTTCCAAA 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 AT 0 1 225791 CASAVA_Build 4 185882539 3I GCTGCTCTAG ---/ATA ATAATTTTAA 3070 het 2988 hom 31 8 19 4 ATA 1 2 225792 CASAVA_Build 4 185884520 1I GGTCAAAGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 20 22 2 A 9 10 225793 CASAVA_Build 4 185884902 2D ATGAGTAGAT AA/-- AAATAAAATG 2516 het 2516 ref 21 14 6 1 A 5 3 225794 CASAVA_Build 4 185888750 1D ATGAAATCAT A/- AAACAATTCT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 4 3 225795 CASAVA_Build 4 185890397 1I AATCACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 A 11 12 225796 CASAVA_Build 4 185890767 1I GTCCTTTCTT -/G GGGGGGGAAA 3070 het 366 hom 36 4 18 14 G 7 8 225797 CASAVA_Build 4 185900044 1I ATCAACACTC -/T TATGTCTAGC 3070 hom 60 het 26 0 19 7 T 1 2 225798 CASAVA_Build 4 185903447 1I TGGGAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 10 11 225799 CASAVA_Build 4 185910346 3D TTTTGAGACA TGT/--- TGTTGTTCCG 3070 het 3070 hom 38 16 15 8 TGT 3 2 225800 CASAVA_Build 4 185913741 1I AAGATGCCTC -/A ACTCACCTGA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 1 2 225801 CASAVA_Build 4 185917152 1I GCAGTGTTTG -/T TTTTTTGTCC 1976 hom 12 het 6 0 5 1 T 6 7 225802 CASAVA_Build 4 185929987 1D AACACAGCAG C/- CCCAGAAGCA 3070 het 3070 hom 49 19 26 5 C 4 3 225803 CASAVA_Build 4 185935930 2I AGAGAAAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 AG 7 8 225804 CASAVA_Build 4 185940479 1D TGGATGACTG A/- AAAAAAAAAA 2165 het 2165 ref 37 26 5 7 A 13 12 225805 CASAVA_Build 4 185948997 3I TCCAACAAAT ---/AGC AGCCTGAAAT 3070 het 3070 ref 52 27 16 9 AGC 1 2 225806 CASAVA_Build 4 185950590 1I TAATGAATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 9 10 225807 CASAVA_Build 4 185952352 2I CTTTTTGTAA --/AC AGACACAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 18 11 AC 0 1 225808 CASAVA_Build 4 185953071 4I CCCACTATCC ----/CAAT CAGAGGATTT 3070 het 2886 hom 24 8 14 2 CAAT 0 1 225809 CASAVA_Build 4 185953263 1I CCCGTAGAAA -/T TTTACATGCC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 3 4 225810 CASAVA_Build 4 185955309 6D CAACAGCTCC CGCTCA/------ CAGCGGGCCC 2487 het 2487 ref 30 14 8 14 CGCTCA 1 0 225811 CASAVA_Build 4 185973638 1I ACCCAGGCCT -/G GGGGGGGGAA 2187 het 2055 hom 28 7 10 11 G 8 9 225812 CASAVA_Build 4 185985282 1I AACTGACCGT -/G GGTTCGCTCC 3070 het 3070 hom 55 23 22 10 G 2 3 225813 CASAVA_Build 4 185986591 1I40M2D CCTCAGGCTA -TAAGGGGGCTTGGCTAAATAATCTCTTAGGTCTCTTTCAGCA/TTAAGGGGGCTTGGCTAAATAATCTCTTAGGTCTCTTTCAG-- CACACACTTA 3070 het 3070 hom 27 17 19 2 N/A 0 0 225814 CASAVA_Build 4 185987737 1I TTCTACTGTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 T 8 9 225815 CASAVA_Build 4 185988240 1I AGACCACATC -/A AAAAAAAAAA 2838 het 1166 hom 20 5 8 7 A 12 13 225816 CASAVA_Build 4 186001983 1I TTAACAAGAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 A 8 9 225817 CASAVA_Build 4 186003371 1D CCCATGGAAA G/- GGGGGGTCTC 2992 het 2342 hom 27 9 12 6 G 7 6 225818 CASAVA_Build 4 186004021 1D GAAAACCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 10 9 225819 CASAVA_Build 4 186007103 4D AATCAGGCAT TAAA/---- TAATAATATA 3070 het 184 hom 31 1 14 18 TAAA 1 0 225820 CASAVA_Build 4 186007119 1D ATAATATAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 hom 57 het 30 0 20 10 T 3 2 225821 CASAVA_Build 4 186007972 4D AAATGAAATT AAGA/---- AAGTAATTTC 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 AAGA 1 0 225822 CASAVA_Build 4 186011012 1I GGAACCTCTT -/C CTGTTACCTG 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 C 1 2 225823 CASAVA_Build 4 186011148 3D CATTCTCCGA TCT/--- TCTCTCTTTA 3070 het 3070 hom 43 17 20 9 TCT 2 1 225824 CASAVA_Build 4 186011534 5D GCAGGTTTAA CGGTG/----- GTTCCCAGTC 3070 hom 126 het 46 0 43 7 CGGTG 1 0 225825 CASAVA_Build 4 186012155 1I TTTTCTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 het 47 hom 14 1 9 4 C 0 1 225826 CASAVA_Build 4 186015443 1D TTTAATGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2096 hom 25 9 11 5 T 10 9 225827 CASAVA_Build 4 186021595 4I TTTTGTTTTT ----/TTTG TTTTTTCCTA 3070 het 1017 hom 28 7 15 6 TTTG 0 1 225828 CASAVA_Build 4 186027260 1I TAACAATAAT -/A AAAAATAGAG 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 5 6 225829 CASAVA_Build 4 186029306 4I AATCAAAAGT ----/TGCA TGCAATGAAT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 TGCA 1 2 225830 CASAVA_Build 4 186030134 1D TTGGTCTAAT A/- AGAGGCCTGA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 2 1 225831 CASAVA_Build 4 186033777 1I TTAATCATTC -/A AAAAAAAAAA 2901 het 2901 ref 24 13 7 4 A 13 14 225832 CASAVA_Build 4 186060103 1D TGGACTGGAG A/- AGAAAGAGAT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 2 1 225833 CASAVA_Build 4 186066914 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 10 11 225834 CASAVA_Build 4 186071222 1D ACACTCTGGA G/- GACATTATGC 3070 het 3070 hom 45 17 21 8 G 2 1 225835 CASAVA_Build 4 186075861 1D GGAGGCTGGT C/- TGGCTGATCT 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 C 1 0 225836 CASAVA_Build 4 186083943 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 50 23 19 8 A 9 8 225837 CASAVA_Build 4 186084899 2I55M1D ACGGTTATTA --TTTTTTTTAAGCAAATATATTTTAATAAAATTTTGAAAACTAGAAAAAACTTTTTA/TTTTTTTTTTAAGCAAATATATTTTAATAAAATTTTGAAAACTAGAAAAAACTTTTT- TGATTACCTA 3070 hom 93 het 29 0 32 6 N/A 0 0 225838 CASAVA_Build 4 186110156 1I GTATGGGGAT -/G GGGGGGACAT 3070 hom 57 het 21 0 17 4 G 6 7 225839 CASAVA_Build 4 186132260 1D CACCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 29 1 17 11 T 12 11 225840 CASAVA_Build 4 186136229 2D TCACAAAGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 TA 6 5 225841 CASAVA_Build 4 186141365 7D AGACTTCCTT GCCTCCA/------- GCCTCCAGCC 3070 het 3070 ref 40 20 10 12 GCCTCCA 3 2 225842 CASAVA_Build 4 186143999 1I TTCCTTTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 53 22 22 9 T 9 10 225843 CASAVA_Build 4 186144152 4I ATAGCGCTGG ----/ATGA ATATTTTTCT 3070 hom 126 het 47 0 41 6 ATGA 0 1 225844 CASAVA_Build 4 186145653 6I ATGTGAGTGT ------/GTGTGC GTGTGAGTGT 3070 het 3070 ref 64 32 23 9 GTGTGC 0 1 225845 CASAVA_Build 4 186145676 8D TGTGCGTGTG AGTGTGGA/-------- TGTGTGAGTG 3070 het 3070 ref 63 32 18 18 AGTGTGGA 1 0 225846 CASAVA_Build 4 186145804 2I10M4I AGTGTGCGTG --AGTGTGTGCA----/TAAGTGTGTGCATTTG TGTGTGGAGT 3070 het 3070 ref 89 62 27 6 N/A 0 0 225847 CASAVA_Build 4 186145859 2I21M2D AGTGTGTGCA --TGTGTGTGAGCGTGAGTGTGCAT/TGTGTGTGTGAGCGTGAGTGTGC-- GTGTGATAGT 3070 het 3070 ref 90 60 16 33 N/A 0 0 225848 CASAVA_Build 4 186145933 2I44M2D GAGTGTGCAC --GTGTGTGCCCGTGAGTGTGTGCATGCCTGTGTGAGTGTGCATGTGA/GTGTGTGTGCCCATGAGTGTGTGCATGCCTGTGTGAGTGTGCATGT-- GTGTGCGTGC 3070 het 3070 ref 65 63 15 30 N/A 0 0 225849 CASAVA_Build 4 186146675 1D GATGAGAACA T/- TCCCAGTCCA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 2 1 225850 CASAVA_Build 4 186148942 4D CTTGCAACTT AATC/---- AATTGCCTTT 3070 het 3070 ref 41 25 13 4 AATC 1 0 225851 CASAVA_Build 4 186168454 6D CGTGTGTGCA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 435 hom 53 6 22 27 TG 12 9 225852 CASAVA_Build 4 186172442 3I GCTGCCAGCC ---/CAA CAACAGGATA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 CAA 1 2 225853 CASAVA_Build 4 186185971 4I CATGGGAGAT ----/GGGG GGGAAGTTAT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 G 3 7 225854 CASAVA_Build 4 186213534 1I ATGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 20 20 10 A 10 11 225855 CASAVA_Build 4 186246673 1D TACTCTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 12 11 225856 CASAVA_Build 4 186247792 2I ACATATTTTA --/TC TGACTTCCTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TC 0 1 225857 CASAVA_Build 4 186249776 1D TGGCTTAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 10 9 225858 CASAVA_Build 4 186256775 6D AATCTTTGAA CTACAG/------ CCTGCTTCAA 3070 hom 114 het 42 0 38 6 CTACAG 1 0 225859 CASAVA_Build 4 186257912 4D CTGAAGCAAT TTTC/---- TTTCAATCAC 3070 hom 114 het 46 0 39 9 TTTC 2 1 225860 CASAVA_Build 4 186269193 1D CTGTCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 2113 het 52 hom 18 1 8 9 A 15 14 225861 CASAVA_Build 4 186300269 1I AAAAGTTTAT -/A AAAACAATGA 2839 het 2839 ref 25 10 9 6 A 4 5 225862 CASAVA_Build 4 186300560 3I AAGGACTGGA ---/TCT TCTCCGGAAG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 TCT 1 2 225863 CASAVA_Build 4 186302839 1I AGTGCAAACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 9 10 225864 CASAVA_Build 4 186310878 1I GGCCAACACT -/G GCAGATCACT 2919 het 2919 ref 23 9 8 6 G 1 2 225865 CASAVA_Build 4 186312131 6I TCTCTCTCTA ------/TTTTAT TTTTATTTTT 3070 het 3042 hom 23 9 10 4 TTTTAT 2 3 225866 CASAVA_Build 4 186317529 3I CAACAACAAC ---/AAG AAGCCCATTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AAG 1 2 225867 CASAVA_Build 4 186318244 1D ATTACACTAC A/- TTTTTAAGCA 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 A 1 0 225868 CASAVA_Build 4 186318517 1D AGTACAAGTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 10 9 225869 CASAVA_Build 4 186318573 1I CATGTCCTTG -/A AAATGAGAAG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 3 4 225870 CASAVA_Build 4 186318815 2D TGAACCTCCC CT/-- TTCAAAGTAG 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 CT 1 0 225871 CASAVA_Build 4 186320615 2I AATTGAAAAC --/TA TATAGTGACC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TA 2 3 225872 CASAVA_Build 4 186321191 1I CTCGACTAGG -/A ATGCACTTCA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 1 2 225873 CASAVA_Build 4 186322422 1I ACTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2613 het 2613 ref 24 10 6 8 T 11 12 225874 CASAVA_Build 4 186323519 1D AACATGGTAA T/- TTTTTTTACA 3070 het 2183 hom 22 7 12 3 T 8 7 225875 CASAVA_Build 4 186325124 1I CATTATGAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2397 hom 35 6 19 10 T 9 10 225876 CASAVA_Build 4 186325989 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 1231 hom 14 4 9 1 A 9 8 225877 CASAVA_Build 4 186346471 2I ACCTGGCTTC --/AT ATATATATAT 2144 het 2144 ref 26 11 9 6 AT 6 7 225878 CASAVA_Build 4 186346853 1I ATTGATTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 9 10 225879 CASAVA_Build 4 186349364 1I AATATATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 A 9 10 225880 CASAVA_Build 4 186350769 1D TAAAAAATGG T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 T 8 7 225881 CASAVA_Build 4 186357981 1I39M1I CTGCTCAGAC -AAAAAATTCAAAATATTACTGCTCATTGACAATGTACCT-/AAAAAAATTCAAAATATTACTGCTCATTGACAATGTACCTG GGTCACCCAA 3070 het 3070 ref 41 32 8 16 N/A 0 0 225882 CASAVA_Build 4 186360187 3D TTTTGTTTTT CCC/--- CCCATCCCCT 3070 het 3070 ref 48 27 16 9 C 6 3 225883 CASAVA_Build 4 186364641 1I ACCCCATCTC -/T ACTAAAAATA 2572 het 1745 hom 13 5 7 1 T 0 1 225884 CASAVA_Build 4 186371429 1D CCTGTTGAGC A/- TCTCCTATGT 3070 het 3070 hom 56 25 25 6 A 1 0 225885 CASAVA_Build 4 186375404 1I GTGTCTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 10 11 225886 CASAVA_Build 4 186377041 1D AATTTTAAAG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 T 8 7 225887 CASAVA_Build 4 186378417 1D CTCTTGTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 1461 hom 35 5 17 13 T 9 8 225888 CASAVA_Build 4 186381890 2D GATCGTGCCG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1874 hom 22 10 10 2 A 14 12 225889 CASAVA_Build 4 186385044 1I TTTTATTTTT -/A AACAATAAGG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 2 3 225890 CASAVA_Build 4 186386661 1D GAACTATGAT A/- ACGTGTAGAG 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 A 2 1 225891 CASAVA_Build 4 186391432 1D GACTTAGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 A 13 12 225892 CASAVA_Build 4 186392005 3I AACTTAAGTG ---/TTA TTATTATTAT 2741 het 2741 ref 24 15 7 2 TTA 5 6 225893 CASAVA_Build 4 186394518 1I CTGACTGAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 8 9 225894 CASAVA_Build 4 186394688 1I ATTTAAATAG -/A AAAAAAAAGA 1609 het 1609 ref 19 9 4 6 A 8 9 225895 CASAVA_Build 4 186394974 2I ACTATTGTTA --/TC TCTATTTTAC 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 TC 1 2 225896 CASAVA_Build 4 186395299 1I TTGACTAAGA -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 G 3 4 225897 CASAVA_Build 4 186397412 2D GGCAGATCAC TT/-- GAGGTCAGGA 1385 het 1316 hom 6 3 3 0 T 2 0 225898 CASAVA_Build 4 186400226 1D TGAAAGAAAT A/- AGAGTATGTA 3070 het 3070 ref 39 22 12 6 A 2 1 225899 CASAVA_Build 4 186403397 1I GTGATCAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 9 10 225900 CASAVA_Build 4 186407832 1I AGTTCACCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 8 9 225901 CASAVA_Build 4 186411222 3D ATAGGAAAAA GAC/--- GACTTCTAAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 2 GAC 2 1 225902 CASAVA_Build 4 186411606 3D AGACTTTTTT TTC/--- TTTTCTTTTC 1032 het 1032 ref 19 5 7 7 TTC 1 0 225903 CASAVA_Build 4 186423715 2D AGGACATGAC TG/-- TGCACCACTG 3070 het 3070 ref 50 30 15 6 TG 2 1 225904 CASAVA_Build 4 186425003 2D AGATATTCCC CT/-- GTTTGACTAC 3070 het 3070 ref 39 19 20 1 CT 1 0 225905 CASAVA_Build 4 186427356 16D ATAAAAGTGA AAGAGCTCAGTGGTAG/---------------- AACACCCTTG 3070 het 3070 ref 44 22 22 7 AAGAGCTCAGTGGTAG 1 0 225906 CASAVA_Build 4 186428775 5D ATGTAATTTC AGAAT/----- ATTTTCATCA 3070 het 3070 ref 30 16 11 5 AGAAT 1 0 225907 CASAVA_Build 4 186436647 4D ATGACGCATG GAAT/---- GAATGAATGA 3070 hom 105 het 50 0 36 15 GAAT 6 5 225908 CASAVA_Build 4 186445970 1I GGCCTCAGAA -/G TGACTAGCGC 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 G 0 1 225909 CASAVA_Build 4 186449315 1D CATTCCTTAG A/- AAAAAAGATT 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 A 7 6 225910 CASAVA_Build 4 186455238 2D TCTATTCAGC TT/-- TTAAATGTTG 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 T 4 2 225911 CASAVA_Build 4 186468581 11D TGTCAGTGGT ATATTTAGAAA/----------- TTATATTTAG 139 het 139 ref 36 26 1 12 ATATTTAGAAA 1 0 225912 CASAVA_Build 4 186543887 4I CGTCTCTACT ----/AACA AACAATACAA 2589 het 2471 hom 18 8 6 4 AACA 1 2 225913 CASAVA_Build 4 186544060 1I GGGAGGGGGG -/T GGGGGAGATA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 0 1 225914 CASAVA_Build 4 186546612 7D11M1D TACCTACCTA ACCTGCCTAACCTACCTAG/-------TCATCTACCTA- CCTGCCTACC 3070 het 3070 ref 43 31 12 12 N/A 0 0 225915 CASAVA_Build 4 186546961 5D CATCCTACTC AAATT/----- AATCTTTGTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AAATT 1 0 225916 CASAVA_Build 4 186547769 1D GACCTTCACT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 9 8 225917 CASAVA_Build 4 186551317 1I GGCCACAAGT -/G GATCTGCCTG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 1 2 225918 CASAVA_Build 4 186551678 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 24 1 15 8 T 13 12 225919 CASAVA_Build 4 186553239 1I GAGATACAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 126 het 53 0 42 11 T 8 9 225920 CASAVA_Build 4 186555918 2D CTACATTACC AA/-- AAGTCTCCCT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 4 2 225921 CASAVA_Build 4 186557661 1D TGTAAGATAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 99 het 45 0 34 11 A 9 8 225922 CASAVA_Build 4 186578332 1D TCACGGTTGG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 35 0 31 4 T 9 8 225923 CASAVA_Build 4 186581052 1I CTGTCACACA -/G GCTGGAGTGC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 G 1 2 225924 CASAVA_Build 4 186581712 1D TAGATTGGTT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 8 7 225925 CASAVA_Build 4 186586705 2D GGGACTGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 277 het 32 hom 22 1 2 19 A 14 12 225926 CASAVA_Build 4 186586732 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 22 0 13 9 A 10 9 225927 CASAVA_Build 4 186592530 1I AAAAATGTGA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 7 8 225928 CASAVA_Build 4 186592837 1I4M1I TAAGAAACCC -TATA-/TTATAC AGACACTTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 N/A 0 0 225929 CASAVA_Build 4 186594029 5D ATTAAAAACA TATCT/----- TATGTCAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 3 TATCT 1 0 225930 CASAVA_Build 4 186597962 2I TATACATATA --/CT CTCATATATG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 CT 1 2 225931 CASAVA_Build 4 186599105 1D GAATTTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 22 9 T 12 11 225932 CASAVA_Build 4 186602718 15D TCCATCATTG ACTGGCATTTAGTAA/--------------- ACTCATGTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 7 ACTGGCATTTAGTAA 1 0 225933 CASAVA_Build 4 186604870 3D TCTATAGCCC ACA/--- ACATTTTTTG 3070 hom 129 het 48 0 44 5 ACA 2 1 225934 CASAVA_Build 4 186605335 1D ATATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 28 1 21 6 T 13 12 225935 CASAVA_Build 4 186607671 1I ACCCGGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 377 hom 37 2 25 10 A 12 13 225936 CASAVA_Build 4 186614299 7I TAAAAAAGAT -------/TATAGAG TATGTTCTCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TATAGAG 0 1 225937 CASAVA_Build 4 186614531 1D43M1D CACCAGACGA CCCAAAGGAATGAAATTACTAAATAGGAACAGAAATCAATGGAAG/-CCAAAGGAATGAAATTACTAAATAGGAACAGAAATCAATGGAA- AAAAAAACAA 3070 hom 102 het 32 0 35 4 N/A 0 0 225938 CASAVA_Build 4 186624894 1I AGAGAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 1083 het 1083 ref 44 30 3 11 T 13 14 225939 CASAVA_Build 4 186645683 1D AAGAACCAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 10 9 225940 CASAVA_Build 4 186652089 2D AACGTGTGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 44 21 16 8 AT 8 7 225941 CASAVA_Build 4 186657107 1D CTTATATATT A/- AAAAAACAAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 7 6 225942 CASAVA_Build 4 186661398 2D AACAACAAAA AC/-- AAAACAAAAC 1460 het 1460 ref 29 7 6 26 AC 1 0 225943 CASAVA_Build 4 186662205 3I AGTAACATCC ---/TCA TGTTGCCTGT 3070 hom 87 het 44 0 29 15 TCA 0 1 225944 CASAVA_Build 4 186663775 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 26 0 24 3 A 13 12 225945 CASAVA_Build 4 186668067 1D TGGGTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 61 1 49 11 T 13 12 225946 CASAVA_Build 4 186678584 3D TCTCAACCTT TAA/--- AAAAAAAACA 3070 hom 41 het 20 0 12 8 TAA 1 0 225947 CASAVA_Build 4 186681260 2D AAGTGGACTC TG/-- TAGATTTAGC 3070 hom 81 het 31 0 28 6 TG 1 0 225948 CASAVA_Build 4 186689442 5I ACACGGTGTT -----/TGAAA TAACAACTCC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TGAAA 0 1 225949 CASAVA_Build 4 186696179 1I TGGGGGATTA -/G GGAGTGGTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 2 3 225950 CASAVA_Build 4 186701858 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 57 hom 19 1 15 3 A 15 14 225951 CASAVA_Build 4 186705533 1D TTTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 120 het 44 0 40 6 A 10 9 225952 CASAVA_Build 4 186715287 1D AGTTTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 13 12 225953 CASAVA_Build 4 186721157 1D ACCCCGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 18 9 A 11 10 225954 CASAVA_Build 4 186730955 1D TATCTCTATA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 9 8 225955 CASAVA_Build 4 186732961 1D GTTTTATAAC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 7 6 225956 CASAVA_Build 4 186733264 1D TATTTTGAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 97 het 41 0 33 8 T 10 9 225957 CASAVA_Build 4 186737284 1D TGGCTGATTT A/- TTTTTATTTT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 1 0 225958 CASAVA_Build 4 186739393 1D ATTCCGGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 10 9 225959 CASAVA_Build 4 186740451 1I TGAGACGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 653 hom 27 2 23 2 A 11 12 225960 CASAVA_Build 4 186742522 4D TTTCACCATA TTAG/---- TTAGGCTGGC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 TTAG 2 1 225961 CASAVA_Build 4 186744224 4I TCTCAACAAC ----/TAAA TAGTCTGTAC 3070 hom 90 het 33 0 29 4 TAAA 0 1 225962 CASAVA_Build 4 186744293 2D GAAAAGATCA AT/-- ATCACTGTCC 3070 hom 75 het 33 0 26 10 AT 2 1 225963 CASAVA_Build 4 186757032 1D GGCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 18 16 4 A 10 9 225964 CASAVA_Build 4 186760897 2D TCAGATTGGC AG/-- AGTTTGTAAC 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 AG 2 1 225965 CASAVA_Build 4 186763039 12D AACTATAGTC AGCGTGTCACAA/------------ AGCTGGGGAA 3070 hom 68 het 26 0 19 11 AGCGTGTCACAA 1 0 225966 CASAVA_Build 4 186766658 1D3M2D TGAAGTAAAA TATACT/-ATA-- TACTTCTACA 3070 het 3070 hom 35 13 20 5 N/A 0 0 225967 CASAVA_Build 4 186767147 1I TTTATTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 11 12 225968 CASAVA_Build 4 186768575 2I TTCTGGAAAA --/CT CTATAACCAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 CT 1 2 225969 CASAVA_Build 4 186771654 3D AAATTAGCCG GGT/--- GTGGTGGCGG 2663 het 984 hom 8 2 6 0 GGT 1 0 225970 CASAVA_Build 4 186775674 2D TTTTGGTTAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 11 22 1 TA 7 6 225971 CASAVA_Build 4 186779782 1I AAGATAAACG -/T TAAGTGTATA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 1 2 225972 CASAVA_Build 4 186779893 1D GAATTATGTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 T 9 8 225973 CASAVA_Build 4 186782723 1D GCATGTCAGT A/- AAGCATCAGA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 A 3 2 225974 CASAVA_Build 4 186786026 2D7M1D CTGATCTTTC CACACGGCCT/--CACGGCC- CCACAGTTTC 3070 het 3070 ref 47 27 17 4 N/A 0 0 225975 CASAVA_Build 4 186791872 1I GAGAGATATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 9 10 225976 CASAVA_Build 4 186791938 1I TGCACTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 T 10 11 225977 CASAVA_Build 4 186793995 5D TCTTTTTGAA TTATT/----- TTATTTTATT 3070 het 2420 hom 28 6 16 7 TTATT 5 4 225978 CASAVA_Build 4 186804593 2D ATACACACAC AT/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 AT 1 0 225979 CASAVA_Build 4 186812956 1I TCACTATGCC -/A GTTTTTTCTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 225980 CASAVA_Build 4 186814589 1D TTACCACGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2286 hom 37 9 12 17 T 15 14 225981 CASAVA_Build 4 186816563 1D CAGGAATTTT A/- AAAAAATCAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 6 225982 CASAVA_Build 4 186819252 2D GTGAAACCCC CT/-- GTCTGTACTA 1185 het 1185 ref 11 4 4 3 CT 1 0 225983 CASAVA_Build 4 186834898 1D CATCTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 11 10 225984 CASAVA_Build 4 186841375 1D AGTGTGAAAT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 G 1 0 225985 CASAVA_Build 4 186849055 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 31 0 23 9 T 11 10 225986 CASAVA_Build 4 186856641 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAATGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 225987 CASAVA_Build 4 186860808 1D GTTACATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 41 1 29 11 T 13 12 225988 CASAVA_Build 4 186864208 1I ATTTTGTTTG -/A AGTCTGAAGT 3070 hom 119 het 47 0 41 6 A 1 2 225989 CASAVA_Build 4 186865662 1D AACATCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 30 1 21 8 T 12 11 225990 CASAVA_Build 4 186869293 1D AATCTTTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 10 9 225991 CASAVA_Build 4 186872602 1D TAGTTTAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 36 1 31 4 T 10 9 225992 CASAVA_Build 4 186874747 1I TATAAATGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 T 8 9 225993 CASAVA_Build 4 186878489 4I ATAGTTCCAT ----/TAAG TTTATATTTA 3070 hom 68 het 28 0 23 5 TAAG 0 1 225994 CASAVA_Build 4 186882480 1D CCAGAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 36 0 26 10 A 13 12 225995 CASAVA_Build 4 186888433 1I TTCTAATTTT -/G TTTTTTTTAA 3070 hom 41 het 28 0 15 13 G 0 1 225996 CASAVA_Build 4 186893660 4D ACTCACACAC ACAA/---- ACAAACACAC 3070 het 2905 hom 40 13 23 4 ACAA 2 1 225997 CASAVA_Build 4 186914404 2D GAACACGTAA CT/-- CTGTAAAATT 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 CT 2 1 225998 CASAVA_Build 4 186917764 1D ATTGAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2013 hom 40 6 28 6 T 12 11 225999 CASAVA_Build 4 186923530 3I ACCTGTGGTT ---/TTA TTAAGTATTT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TTA 1 2 226000 CASAVA_Build 4 186924664 8D TGTATATTCA CATATTTT/-------- TGTAATTCAC 3070 hom 141 het 53 0 48 9 CATATTTT 1 0 226001 CASAVA_Build 4 186926348 5I CTGCCTGTGG -----/CACGA CACGGCTCCT 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 CACGA 0 1 226002 CASAVA_Build 4 186927232 1I AGTACCAGGG -/A AAAAAAAAAA 965 het 965 ref 37 6 7 24 A 10 11 226003 CASAVA_Build 4 186927259 1I CTTAGCATGA -/C AGGTGTAAGT 3070 hom 74 het 41 0 28 13 C 0 1 226004 CASAVA_Build 4 186928114 1I TGTTTGGAGT -/A AAAGGGCACT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 3 4 226005 CASAVA_Build 4 186928844 1D ACACTGATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 10 9 226006 CASAVA_Build 4 186931726 2I TGCAGAGGAC --/AG GGGGCAGACT 3070 hom 118 het 44 0 39 5 AG 0 1 226007 CASAVA_Build 4 186932855 1I AAAAACAAAA -/C CCCCCAGATT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 C 5 6 226008 CASAVA_Build 4 186935935 1I GTCTTTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 10 11 226009 CASAVA_Build 4 186936999 1I TACAATTGTT -/A AGAACTGGTG 3070 het 3070 ref 49 24 16 9 A 1 2 226010 CASAVA_Build 4 186937343 2I ACTTAAGAGT --/AG AGAGTCTGGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 AG 2 3 226011 CASAVA_Build 4 186943368 1D TTGAGCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 A 11 10 226012 CASAVA_Build 4 186952980 1I AGTCCTGCCT -/A ATGTGAGGAA 3070 het 3070 hom 55 17 28 10 A 1 2 226013 CASAVA_Build 4 186963018 1I GCTTCTATGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 8 9 226014 CASAVA_Build 4 186963378 2D CCAGGAAGAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TA 7 6 226015 CASAVA_Build 4 186974409 3D TCTAGTCACA TCT/--- TCTGCTGCAG 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 TCT 2 1 226016 CASAVA_Build 4 186983361 1I CTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 33 1 22 10 T 11 12 226017 CASAVA_Build 4 186983430 1I ATGTAATTTA -/T TTAGCAGATT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 2 3 226018 CASAVA_Build 4 186989252 1D GCCATTTGAA C/- TTTTGATCGT 3070 hom 120 het 45 0 41 5 C 1 0 226019 CASAVA_Build 4 186998149 4D TACCCTGTGG AAGA/---- AAGAAGTGGA 3070 hom 135 het 48 0 44 5 AAGA 2 1 226020 CASAVA_Build 4 187012934 4D GAAATAGAGA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 38 het 30 0 22 8 AG 16 14 226021 CASAVA_Build 4 187036090 2D ACTCTTTACC CA/-- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 27 18 7 4 CA 1 0 226022 CASAVA_Build 4 187037916 4D CTCTGATGGC TTTG/---- TTTTTCTCAT 3070 het 3070 ref 26 17 9 4 TTTG 1 0 226023 CASAVA_Build 4 187051136 1I TATAGCCTTG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 7 8 226024 CASAVA_Build 4 187052413 3I AAATGTTGGC ---/AGG AGGTGTTGGG 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 AGG 1 2 226025 CASAVA_Build 4 187055041 1D ACACATGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 14 11 A 16 15 226026 CASAVA_Build 4 187056024 1I GTCTCCACTC -/A AAAAAAAAAA 1884 het 1884 ref 17 7 6 4 A 11 12 226027 CASAVA_Build 4 187060837 2D GTTTTTACTT AA/-- AAAAAAAAAA 1267 het 129 hom 37 2 4 31 A 16 14 226028 CASAVA_Build 4 187066426 26D ATGCAAAGGC TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 2142 het 318 hom 13 2 5 7 TA 22 9 226029 CASAVA_Build 4 187071167 2I CATGGAAAAT --/AG AGTTTTCATT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AG 1 2 226030 CASAVA_Build 4 187080441 1D TCTGTCCCAG C/- CCCTCATTGG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 C 4 3 226031 CASAVA_Build 4 187083558 1I AAATAGCACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 T 8 9 226032 CASAVA_Build 4 187084701 3D AGTTGTGGTT TTG/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TTG 1 0 226033 CASAVA_Build 4 187089193 3I TTAAAGTGAT ---/AAA GATATCTTCA 3070 het 3070 hom 52 24 23 5 A 0 3 226034 CASAVA_Build 4 187094010 1I GGTATGTTTT -/C CTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 1 2 226035 CASAVA_Build 4 187100506 1D TTATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 7 T 11 10 226036 CASAVA_Build 4 187103052 1D TCAAACCCTG T/- TACAAAACCA 3070 het 3070 hom 45 20 21 5 T 2 1 226037 CASAVA_Build 4 187106074 1D GAGATTTTTT A/- AAGGAAGTTC 3070 het 3070 ref 21 8 8 5 A 3 2 226038 CASAVA_Build 4 187115331 1D GTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 9 8 226039 CASAVA_Build 4 187129891 2D GCTCTGGGTG GA/-- GAGCCCATTG 3070 hom 78 het 27 0 26 1 GA 2 1 226040 CASAVA_Build 4 187133578 1I ATCTTAAAAG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 7 8 226041 CASAVA_Build 4 187135195 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 16 1 12 3 A 13 14 226042 CASAVA_Build 4 187141690 1D GTGCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1260 hom 39 6 18 15 T 17 16 226043 CASAVA_Build 4 187150978 2D GTTTAGGGCA CC/-- ACAGTGAGAA 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 C 2 0 226044 CASAVA_Build 4 187154855 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2588 hom 32 8 14 10 A 11 10 226045 CASAVA_Build 4 187169230 3D TCTTGCAGAG TCC/--- TCATAAAAAA 2488 het 2488 ref 35 16 12 7 TCC 1 0 226046 CASAVA_Build 4 187169611 5D AAAATGTAAA TAAAG/----- TGAATAACAA 3070 het 3070 ref 49 30 17 2 TAAAG 1 0 226047 CASAVA_Build 4 187188778 1I CTCTCAGACA -/T TTTTTTAATG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 6 7 226048 CASAVA_Build 4 187193787 1D TTACAGGGTT A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 8 7 226049 CASAVA_Build 4 187207606 1I AGGCAGGAGT -/G GGGGGTCACA 3070 hom 48 het 19 0 15 4 G 5 6 226050 CASAVA_Build 4 187220490 1I GAAATGCTAC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 8 9 226051 CASAVA_Build 4 187225539 1D TAAAAAGGGG A/- AAAATGAGGT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 A 5 4 226052 CASAVA_Build 4 187235981 1D AGAGCACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 41 0 32 9 A 11 10 226053 CASAVA_Build 4 187251083 13D GGCCATGGGA GTAGGGTGCCGGG/------------- GTTGGCAGCA 3070 hom 90 het 31 0 29 6 GTAGGGTGCCGGG 1 0 226054 CASAVA_Build 4 187251223 1D CCTATGAGCC A/- TGAGGAGCTG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 1 0 226055 CASAVA_Build 4 187252025 1D CTCAATGCGT A/- CCAGCATATT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 A 1 0 226056 CASAVA_Build 4 187252307 2I TTTGCACCCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 36 2 23 11 T 12 14 226057 CASAVA_Build 4 187253541 1I TGTTTGTGTG -/T TTTTTTCCAA 3070 hom 72 het 26 0 23 3 T 6 7 226058 CASAVA_Build 4 187257409 1I TGCCCGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 18 0 11 7 T 10 11 226059 CASAVA_Build 4 187259358 1D AACAACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 7 9 T 11 10 226060 CASAVA_Build 4 187262048 2D AGGCCCGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 2632 het 1228 hom 27 8 8 12 T 14 12 226061 CASAVA_Build 4 187266705 2I AAGAATTCCG --/TT TAAGTGAAAG 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 T 1 3 226062 CASAVA_Build 4 187268542 1D CGTTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 13 7 T 13 12 226063 CASAVA_Build 4 187274756 1D TTTTTTTTTT A/- ATTTGAGACA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 2 1 226064 CASAVA_Build 4 187275256 2I TGTAAGGATT --/AA AAGAGATCAT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 2 4 226065 CASAVA_Build 4 187282221 10D GGTCATCCAC TAGAGGTACA/---------- TCCCCAAAGA 3070 hom 51 het 20 0 15 5 TAGAGGTACA 1 0 226066 CASAVA_Build 4 187286001 1I TCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2608 het 2608 ref 17 9 6 2 T 7 8 226067 CASAVA_Build 4 187301547 2I GATAGATATG --/GA TATACACATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 GA 0 1 226068 CASAVA_Build 4 187304146 1I TGTGAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 1707 het 1707 ref 48 34 5 9 A 11 12 226069 CASAVA_Build 4 187308876 1D CTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2151 het 172 hom 8 1 7 0 T 12 11 226070 CASAVA_Build 4 187315070 17I TTGAAAGTGA -----------------/GCTATGATCGTGCCGCT GCACTCCATC 3070 het 3070 ref 36 20 16 2 GCTATGATCGTGCCGCT 0 1 226071 CASAVA_Build 4 187315307 6I TAATCCTCTT ------/ACTTCA ACATACAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 18 8 ACTTCA 0 1 226072 CASAVA_Build 4 187324881 1D TTTCTTAAGG T/- TTTTTTTATC 3070 hom 56 het 25 0 20 5 T 8 7 226073 CASAVA_Build 4 187325660 3D GGCCTCACTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2417 het 1015 hom 35 14 8 13 A 21 18 226074 CASAVA_Build 4 187334186 3D AATATGAAAT AAG/--- AAGCCACTGG 3070 hom 54 het 23 0 17 6 AAG 2 1 226075 CASAVA_Build 4 187336940 5D TACGTGGGAA AATAG/----- AAAAGAATAC 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 AATAG 1 0 226076 CASAVA_Build 4 187337266 1I CTTTGAAAAA -/C ATCACATCAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 C 0 1 226077 CASAVA_Build 4 187337685 1I AGGACATTAC -/A AAAAAAAAAA 1748 het 1748 ref 27 12 5 10 A 11 12 226078 CASAVA_Build 4 187338280 1I AAAAATGTGA -/T TTTAACAACA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 3 4 226079 CASAVA_Build 4 187345545 2D TGCATAAAAC AT/-- TAACTATAAT 3070 het 3070 hom 50 16 24 10 AT 1 0 226080 CASAVA_Build 4 187348408 21D TTGTTTACTT TTATAGCTGTAATTAACCTTA/--------------------- TTATAGCTCA 3070 het 3070 ref 31 19 11 7 TTATAGCTGTAATTAACCTTA 1 0 226081 CASAVA_Build 4 187351064 3D GGCTGAGCAT TAA/--- CTAACTCCAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 TAA 1 0 226082 CASAVA_Build 4 187351280 2D ATATGAAAAT CA/-- CACTGGTAAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 CA 2 1 226083 CASAVA_Build 4 187353760 1D CAGCAACCTG A/- AGGCCTCAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 2 1 226084 CASAVA_Build 4 187357931 3D ATCTTTGTGT TAA/--- TAATGTGTTT 3070 het 3070 ref 41 24 15 3 TAA 2 1 226085 CASAVA_Build 4 187360813 2D CATACACATG CA/-- CAGACACATG 3070 het 3070 hom 70 28 36 6 CA 2 1 226086 CASAVA_Build 4 187361167 4D62M4D TGTACACACC TACATACACACATGCGCATATACACATACATAGATGCACATATATACACACATGCACACATAAATGCACA/----TACACACATGCGCATATACACATACATAGATGCACATATATACACACATGCACACATAAATG---- CAGCTATGTA 3070 het 3070 ref 73 64 47 15 N/A 0 0 226087 CASAVA_Build 4 187362184 1D TCCAGATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 10 11 T 12 11 226088 CASAVA_Build 4 187362945 1D CTCTACCCCC T/- GGTGCCCGTC 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 T 1 0 226089 CASAVA_Build 4 187363545 1D CAGGAAGGCT C/- CCCCACGGGA 3070 het 3070 hom 50 16 20 14 C 5 4 226090 CASAVA_Build 4 187365732 4D AAATAATTAA TAAT/---- TAATACTTTG 2132 het 2132 ref 14 7 7 3 TAAT 2 1 226091 CASAVA_Build 4 187366665 3I GATCCACGTG ---/TTC TTCTTTGATG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 TTC 1 2 226092 CASAVA_Build 4 187379006 1D CCTCCTTTTC A/- ATTATTTGAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 2 1 226093 CASAVA_Build 4 187383624 7D CCAGGCTGGA GTGCAGT/------- GTGCAGTGGC 2173 het 1469 hom 14 5 5 5 GTGCAGT 2 1 226094 CASAVA_Build 4 187384393 1I TTTTTAGCTC -/T TTGTCATGCA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 2 3 226095 CASAVA_Build 4 187393499 17I TTAATGTTTT -----------------/TTTCTAACTTCATCACC TTAAAGTGAA 3070 het 3070 hom 48 20 26 5 TTTCTAACTTCATCACC 0 1 226096 CASAVA_Build 4 187394244 2D CCTGGGCGAC AG/-- AGCGAGACTC 546 het 16 hom 6 0 3 3 AG 2 1 226097 CASAVA_Build 4 187400465 2D GCCCAGAGGC CT/-- GACATTCCTG 2940 het 2940 ref 15 7 6 2 CT 1 0 226098 CASAVA_Build 4 187402393 12D GCTTTTGTGA GTTTATATAATG/------------ GTTTAGTCAG 2746 het 2746 ref 26 19 6 4 GTTTATATAATG 1 0 226099 CASAVA_Build 4 187411792 1I ATCTCCATCA -/T TTTTTCTAGA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 5 6 226100 CASAVA_Build 4 187415782 3I ATTAGACTTC ---/TTT ATCATTGGGA 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 T 0 3 226101 CASAVA_Build 4 187418736 1I TTTAAAAGGG -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 6 7 226102 CASAVA_Build 4 187420038 2D CTTAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 1279 hom 10 het 5 0 3 2 A 12 10 226103 CASAVA_Build 4 187423813 1I AAGTAAGAAT -/A AAAAAAAAAA 1839 het 1839 ref 29 17 6 6 A 13 14 226104 CASAVA_Build 4 187425136 2I ATTGGGAAAG --/AT AAAATTCAAC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 AT 0 1 226105 CASAVA_Build 4 187455094 6D TTACTATAGT TAATAA/------ TAATAATATC 3070 het 3070 ref 44 27 14 11 TAA 4 2 226106 CASAVA_Build 4 187468040 3D AAAAAAAAAA CTT/--- AGGCCAGGCG 928 het 350 hom 33 4 6 24 CTT 1 0 226107 CASAVA_Build 4 187468500 3D GTTTGTCCTC TTA/--- TTATTTAGTT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 TTA 2 1 226108 CASAVA_Build 4 187468612 2D TCCTCCAGCA GT/-- GTCTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 GT 2 1 226109 CASAVA_Build 4 187477183 1I GAGGATCGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 10 11 226110 CASAVA_Build 4 187480535 1D TGCACAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 10 9 226111 CASAVA_Build 4 187488683 1I GTCGTGTGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1307 hom 22 4 11 7 T 9 10 226112 CASAVA_Build 4 187489078 1D TAATGTTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 9 226113 CASAVA_Build 4 187491537 1D CTCTTCCCTA T/- TTCTCCTCTC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 3 2 226114 CASAVA_Build 4 187491843 5I ATACCTCTAT -----/TTTAA TTTATTTCAA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TTTAA 0 1 226115 CASAVA_Build 4 187492704 1D ACTTTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 28 1 12 15 T 11 10 226116 CASAVA_Build 4 187498975 1D GATGTGGGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 9 8 226117 CASAVA_Build 4 187509026 1I ACATTTTTTT -/C TTTTTTGAGA 3070 hom 91 het 38 0 36 2 C 0 1 226118 CASAVA_Build 4 187510356 1D AAAAAAACAT A/- AAAAATGCTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 5 226119 CASAVA_Build 4 187531168 2D TGTTTAGAGC AG/-- AGTTTCCTGC 3070 hom 108 het 43 0 37 7 AG 2 1 226120 CASAVA_Build 4 187537378 2I TCAGACTGCA --/AC ACACACACAC 3070 het 331 hom 34 1 24 9 AC 7 8 226121 CASAVA_Build 4 187539315 1I TGCAGCTCCC -/G TCAGGGCAGC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 G 0 1 226122 CASAVA_Build 4 187559073 1I AGGCCATGGG -/A ATTAGAACAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 2 226123 CASAVA_Build 4 187562551 1I AAAGATAAAA -/T GTCTAACTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 226124 CASAVA_Build 4 187564369 2I CACACACACC --/CA CACGCACACC 3070 hom 152 het 60 0 43 17 CA 1 2 226125 CASAVA_Build 4 187564474 4D CCCACATGCT CACA/---- CACACACGCC 3070 hom 127 het 46 0 36 12 CA 5 3 226126 CASAVA_Build 4 187566585 1I AATTTATTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 116 het 44 0 39 5 T 9 10 226127 CASAVA_Build 4 187574095 3I CAAGCAGCCT ---/ATA ATAATAATAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 ATA 3 4 226128 CASAVA_Build 4 187577520 2I ATTTATTAAG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 352 hom 34 2 28 4 T 9 11 226129 CASAVA_Build 4 187583590 1D TGATTCACAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 80 het 39 0 30 11 A 9 8 226130 CASAVA_Build 4 187587505 1D TCTCAAATTT C/- CAAAAAAAAA 3070 het 706 hom 39 3 25 11 C 2 1 226131 CASAVA_Build 4 187588211 1D CTTTATGGGA T/- TTTTTTTTTT 1534 het 15 hom 8 0 4 4 T 12 11 226132 CASAVA_Build 4 187598803 1I TTACCAATGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 8 9 226133 CASAVA_Build 4 187599486 3D AAAATAAAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 13 10 226134 CASAVA_Build 4 187602513 1I ATTTTACACT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 49 15 27 7 A 8 9 226135 CASAVA_Build 4 187605716 1I ACTCCTCCTC -/A AAACTACCGT 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 3 4 226136 CASAVA_Build 4 187607422 21I TATATCTGGA ---------------------/TATATTTGGTAAAGGAGAGAG AGAGACACGA 3070 het 3070 ref 51 26 24 3 TATATTTGGTAAAGGAGAGAG 0 1 226137 CASAVA_Build 4 187608397 3D AATTTTTCTA TTT/--- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 T 10 7 226138 CASAVA_Build 4 187609077 18D GGTGGATCAC GAGGTCAGGGTGGATCAA/------------------ GAGGTCAGGA 1051 het 1051 ref 12 8 4 3 GAGGTCAGGGTGGATCAA 1 0 226139 CASAVA_Build 4 187614779 2D TCTCAAAAAC AT/-- AATATTCAAT 3070 het 3070 hom 27 13 13 2 AT 1 0 226140 CASAVA_Build 4 187615179 1D CTCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 13 12 226141 CASAVA_Build 4 187617332 16D CTTCTTTCTT TCTCTCTCTCTCTCTC/---------------- TCTCTCTCTC 2703 het 1167 hom 29 9 8 14 TC 17 9 226142 CASAVA_Build 4 187626155 6D CAACCAGGTG TTCTTA/------ TTCTCATGGT 3070 het 3070 ref 55 29 23 3 TTCTTA 1 0 226143 CASAVA_Build 4 187626303 1D TGTCTTATAT A/- AATAAATGTT 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 A 3 2 226144 CASAVA_Build 4 187628587 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 885 het 223 hom 24 3 6 15 T 14 12 226145 CASAVA_Build 4 187632101 1I ACCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1488 het 1170 hom 17 6 5 6 A 13 14 226146 CASAVA_Build 4 187651085 5I CGTTGCCATA -----/GAGGC CACTGAAGTG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 GAGGC 0 1 226147 CASAVA_Build 4 187654150 2D AGGGAATAAC AT/-- ATACAAATTA 3070 het 3070 hom 44 19 20 7 AT 2 1 226148 CASAVA_Build 4 187676229 1I CCATGTATTT -/G CATGCTTTTG 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 G 0 1 226149 CASAVA_Build 4 187677824 3D TCTGTCACCC AGG/--- ATGGAGTGCA 2021 hom 15 het 6 0 6 0 AGG 1 0 226150 CASAVA_Build 4 187681529 1I TATTATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 35 1 22 12 T 10 11 226151 CASAVA_Build 4 187685971 1I ATTACAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1028 hom 38 3 30 5 A 10 11 226152 CASAVA_Build 4 187690085 1I TCTGGTTTCA -/G TTATTTACTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 0 1 226153 CASAVA_Build 4 187692859 1D TTTCCCAGGA G/- GGCCAGTCCA 3070 hom 59 het 25 0 16 9 G 3 2 226154 CASAVA_Build 4 187707372 11I TTCCAAGAAC -----------/ATAAGAGTTTT ATATTCCTAA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 ATAAGAGTTTT 0 1 226155 CASAVA_Build 4 187715919 1I AGAGTGGGTT -/G TTAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 G 0 1 226156 CASAVA_Build 4 187716062 1I AGAGCTAAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 8 9 226157 CASAVA_Build 4 187722761 1D GTACTTTTAA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 70 het 28 0 23 5 T 7 6 226158 CASAVA_Build 4 187728001 1I ATCAAGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 10 11 226159 CASAVA_Build 4 187730944 1D GGGTTGGGGG A/- AAACAGTAAC 3070 hom 93 het 38 0 31 8 A 4 3 226160 CASAVA_Build 4 187731409 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAACTT 3070 hom 45 het 23 0 14 9 A 7 8 226161 CASAVA_Build 4 187740855 4I CTTTGTACTG ----/TCTC TCTCTATTTC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 TC 2 4 226162 CASAVA_Build 4 187746278 1D TGGTTATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 20 5 A 13 12 226163 CASAVA_Build 4 187748299 1I TTTGGAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 12 13 226164 CASAVA_Build 4 187750618 1D GATCTCATGT A/- AATCACTATG 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 3 2 226165 CASAVA_Build 4 187786130 1I GCTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2187 hom 34 8 18 8 A 13 14 226166 CASAVA_Build 4 187793459 1I AGGAAACAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 10 226167 CASAVA_Build 4 187795182 1D GCACGATGAC A/- ACATACACAG 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 A 2 1 226168 CASAVA_Build 4 187796257 2I TAATGGAGAC --/AA ACTATCTTTA 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 A 1 3 226169 CASAVA_Build 4 187802672 1I CAATGAGCAG -/T TTACCAGTTC 3070 het 3070 ref 49 24 24 1 T 2 3 226170 CASAVA_Build 4 187802822 3I CAGATCAGCT ---/ATA ATGTTTCAAT 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 ATA 0 1 226171 CASAVA_Build 4 187807269 3D AAATGCAACA AAG/--- AAGTGGCCGG 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 AAG 2 1 226172 CASAVA_Build 4 187808606 2D AAGACAGAAC AG/-- ACTCTTTGAT 3070 het 3070 ref 39 22 12 6 AG 1 0 226173 CASAVA_Build 4 187809295 3I ATTTATTTAT ---/TAA TAATAATAAA 2134 het 1128 hom 8 3 5 0 TAA 3 4 226174 CASAVA_Build 4 187820155 1D AGGAAATCCT C/- CCCCCCGCCC 2602 het 884 hom 21 5 10 6 C 7 6 226175 CASAVA_Build 4 187842044 1I TCAGAGGGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 9 10 226176 CASAVA_Build 4 187842819 3D GATAAGAGGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 13 10 226177 CASAVA_Build 4 187845554 5I ACAAAAAAAA -----/AGAAC AGAACAGCTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 AGAAC 1 2 226178 CASAVA_Build 4 187846799 3D AGTACCCCCC CCG/--- CCCCCCCCCA 2923 het 1439 hom 20 5 12 3 CCG 1 0 226179 CASAVA_Build 4 187857839 1D TGGTCTGCTG T/- TTGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 T 3 2 226180 CASAVA_Build 4 187870511 1D TCTACTGTGG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 42 15 17 11 T 9 8 226181 CASAVA_Build 4 187878531 1I CTACCTAGAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 89 het 36 0 30 6 A 8 9 226182 CASAVA_Build 4 187914562 1D GCTCCGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 24 1 19 4 T 11 10 226183 CASAVA_Build 4 187928223 1I AAGTACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 11 12 226184 CASAVA_Build 4 187929582 2D CTGAGCAATG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 37 het 39 1 25 15 C 13 11 226185 CASAVA_Build 4 187932161 2D CCCGAAACAC TG/-- TGTAGAGTAG 3070 het 3070 ref 58 32 18 9 TG 2 1 226186 CASAVA_Build 4 187948411 14I AAACTATAGC --------------/CTGGAGGTTAAGCT CTGGGTGCTT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 CTGGAGGTTAAGCT 0 1 226187 CASAVA_Build 4 187950767 1I TACACTGGAG -/T TATTGAGCTA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 T 1 2 226188 CASAVA_Build 4 187959335 8I ACAGGGGTGA --------/GCCACTGT GCCTGGCCTG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 GCCACTGT 0 1 226189 CASAVA_Build 4 187960281 1I AAAGGGGGGT -/G GGGGGGAAGA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 G 6 7 226190 CASAVA_Build 4 187968942 5D CAGCCTCCTG CGCAA/----- CCTCAACATT 412 het 412 ref 53 33 3 20 CGCAA 1 0 226191 CASAVA_Build 4 187971472 3I CTGAGCCCAG ---/AAA GTGGCATGTC 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 0 3 226192 CASAVA_Build 4 187977199 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 T 6 7 226193 CASAVA_Build 4 187977373 1D TAGTTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1541 hom 23 5 14 4 T 12 11 226194 CASAVA_Build 4 187982004 2D TGATATAAAA AT/-- AGTTATACAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AT 1 0 226195 CASAVA_Build 4 187982715 5D ATCAAAATTG AAATT/----- AAATTAACTT 3070 hom 111 het 41 0 38 5 AAATT 2 1 226196 CASAVA_Build 4 187996389 1I CGAAAATACA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 8 9 226197 CASAVA_Build 4 188001539 1D AGAAAAAGAA T/- TTTTTTCCTT 2583 het 2583 ref 27 16 6 6 T 7 6 226198 CASAVA_Build 4 188002026 11D TTTCAATGTC TTGGTTATTTT/----------- TTGGTTATTT 3070 het 3070 ref 22 12 8 4 TTGGTTATTTT 2 1 226199 CASAVA_Build 4 188003961 4I TTTCATGTGT ----/TATA TATACCTCAT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 TA 2 4 226200 CASAVA_Build 4 188004140 1I CTTTTGTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 30 2 16 12 T 10 11 226201 CASAVA_Build 4 188007042 5D AATAAATATG TACTT/----- TACTTAATTA 2351 het 2351 ref 16 10 5 1 TACTT 2 1 226202 CASAVA_Build 4 188007953 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 2328 hom 16 6 8 2 A 8 9 226203 CASAVA_Build 4 188012464 5I CATCAGGAGT -----/CTAGA AGACAGTCTG 3070 het 3070 ref 62 31 25 6 CTAGA 0 1 226204 CASAVA_Build 4 188013197 2I CAGAAGAGAA --/AG AGTGATTTCA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 AG 1 2 226205 CASAVA_Build 4 188017039 1D ATAGTGTAAA T/- TACACTACTA 3070 het 3070 ref 49 25 22 3 T 2 1 226206 CASAVA_Build 4 188023172 1D AGATGGAACA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 9 8 226207 CASAVA_Build 4 188023279 1I CTAAGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3066 het 3066 ref 33 15 10 8 T 11 12 226208 CASAVA_Build 4 188024825 4D TGTTTGAAAA TAAT/---- TAATGTATTT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 TAAT 2 1 226209 CASAVA_Build 4 188030982 2I CAAACATATA --/TG TGTGTGTGTG 2880 het 650 hom 27 7 8 12 TG 6 7 226210 CASAVA_Build 4 188030994 6D TGTGTGTGTG TATATA/------ TATATATATA 3070 het 510 hom 24 2 12 12 TA 9 6 226211 CASAVA_Build 4 188035447 2D TATGTTTGTG TA/-- TATATATATG 3070 hom 95 het 52 0 32 21 TA 5 4 226212 CASAVA_Build 4 188035493 6I TATGTATGTA ------/TGTGTG TATGTGTGTG 3070 het 239 hom 54 4 19 31 TG 0 3 226213 CASAVA_Build 4 188035641 2I26M2D TGTGTATATG --TATATGTGTGTGCTTGTGTACATGTGTA/TATATATGTGTGTGCTTGTGTACATGTG-- TATATGTGTG 3070 het 17 hom 57 2 54 14 N/A 0 0 226214 CASAVA_Build 4 188036112 3D CCATTGTGAT TTC/--- TTAATTATAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 3 TTC 1 0 226215 CASAVA_Build 4 188050280 1I GCTTTTCTTG -/C GGGGGGGGGG 2037 het 471 hom 28 4 11 13 C 0 1 226216 CASAVA_Build 4 188051232 1D AGACACTGTT A/- AGTTAGAAGC 3070 hom 124 het 47 0 39 8 A 2 1 226217 CASAVA_Build 4 188057936 5I CTGTCTCAGA -----/AAAAG AAAAGAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 AAAAG 1 2 226218 CASAVA_Build 4 188059025 1D GAGCCAATAA T/- TTTTTTACAG 3070 hom 95 het 33 0 32 1 T 7 6 226219 CASAVA_Build 4 188062300 1I CTACAACGGA -/T TTTTTTCACT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 6 7 226220 CASAVA_Build 4 188062579 1D AAATATTCCC A/- AGGAGCATGA 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 A 2 1 226221 CASAVA_Build 4 188065988 4I TACAGCTGGC ----/TTAG TTAGACCTTT 3070 het 3070 hom 45 19 16 10 TTAG 1 2 226222 CASAVA_Build 4 188066369 1D ATACTGTCTC T/- TTAAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 3 2 226223 CASAVA_Build 4 188069766 1I TGTTGGTTTA -/T TGTTTTTTTT 1223 het 1058 hom 16 9 3 5 T 1 2 226224 CASAVA_Build 4 188072598 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 637 hom 33 3 26 4 A 13 12 226225 CASAVA_Build 4 188079734 3I ATTTTAGGGT ---/TAA AGGGAATAAA 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 TAA 0 1 226226 CASAVA_Build 4 188080676 4I GCTAGACAGC ----/TTTT TTCCCCCAAG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 2 6 226227 CASAVA_Build 4 188084612 1D GAAGATGGAA T/- TTTTTTTTTT 2530 het 2059 hom 12 5 6 1 T 12 11 226228 CASAVA_Build 4 188084773 1I GCCCAGATAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 6 7 226229 CASAVA_Build 4 188086174 2D CCCGTTTTTC AG/-- AGTTAATTAT 3070 het 3070 hom 21 9 10 3 AG 2 1 226230 CASAVA_Build 4 188086883 4I CCCTGTCTGA ----/CTGT CTGAGCCCTC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 CTGT 0 1 226231 CASAVA_Build 4 188095177 1D TCAACTATCA T/- TGTCATTTAA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 2 1 226232 CASAVA_Build 4 188100562 1I TCACTGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 900 hom 44 3 33 8 T 10 11 226233 CASAVA_Build 4 188108048 2D ATATCTAAAC AT/-- AGAAAAGGTA 3070 hom 184 het 65 0 62 7 AT 1 0 226234 CASAVA_Build 4 188108783 4I CCAGCTTCTT ----/GTAA GTGTCATTCC 3070 het 3070 ref 40 19 9 12 GTAA 0 1 226235 CASAVA_Build 4 188110408 1I TCTCATCATT -/C TGCCACTTAC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 C 0 1 226236 CASAVA_Build 4 188111144 2D GTTGTTTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 38 1 26 12 T 13 11 226237 CASAVA_Build 4 188113844 1I CACAAGACAG -/C CCCCAACATT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 4 5 226238 CASAVA_Build 4 188116952 1I CCATTTTAGA -/C TTTTTCCAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 0 1 226239 CASAVA_Build 4 188131796 1I GGTTATTTCC -/T TTACGTCATT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 2 3 226240 CASAVA_Build 4 188132653 4D AGGTTGAATA AAAT/---- AAAGGCATTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAAT 1 0 226241 CASAVA_Build 4 188133219 1D AAACCAACTG A/- AAGATAGACG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 2 226242 CASAVA_Build 4 188133749 2D TAAAAAATAC AA/-- AAAGTTAGCC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 5 3 226243 CASAVA_Build 4 188139248 1I TATTGTCTGT -/G TTCTCTAGTT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 G 0 1 226244 CASAVA_Build 4 188170930 4I GAAAGATAAG ----/CAAA CAAAGATTTG 3070 hom 135 het 54 0 45 9 CAAA 1 2 226245 CASAVA_Build 4 188214801 1I AATAATAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 2931 hom 15 6 8 1 A 0 1 226246 CASAVA_Build 4 188215371 1I CCTCAGCCCC -/A CCAAGTGTCT 1949 het 1949 ref 11 5 6 0 A 0 1 226247 CASAVA_Build 4 188218087 1I TTGGAAAGCC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 8 9 226248 CASAVA_Build 4 188220989 1D GCCCTTGTTT A/- AAGACTGTGC 3070 het 3070 ref 29 9 8 13 A 3 2 226249 CASAVA_Build 4 188226286 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 1427 het 183 hom 14 1 9 5 TTC 1 0 226250 CASAVA_Build 4 188245987 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 579 hom 29 4 9 17 A 10 9 226251 CASAVA_Build 4 188247885 2D AGATATTGTT TG/-- TGTTTCTCAA 3070 het 2977 hom 18 8 7 4 TG 2 1 226252 CASAVA_Build 4 188248147 4D AGTCTATTGT CTGA/---- CTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 CTGA 1 0 226253 CASAVA_Build 4 188249908 3I ACAAAACTTC ---/AAT AATGTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AAT 1 2 226254 CASAVA_Build 4 188250030 1D GAAAAAAATA G/- TAAGAAACAT 3070 het 3070 hom 22 10 11 2 G 1 0 226255 CASAVA_Build 4 188264307 1D TGTCTTAGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 95 het 38 0 32 6 T 10 9 226256 CASAVA_Build 4 188284935 4D CTTTCTTTCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 1497 het 1018 hom 25 10 9 7 TTCC 4 3 226257 CASAVA_Build 4 188287057 2D GATAAAATTC TA/-- TCTCTGCATC 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TA 1 0 226258 CASAVA_Build 4 188294717 4I ACTCCCAGAT ----/TCCA TCCAGACCCA 3070 hom 84 het 33 0 26 7 TCCA 1 2 226259 CASAVA_Build 4 188313339 1D TTTCTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 44 4 18 22 T 17 16 226260 CASAVA_Build 4 188315035 1D TTCTAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 31 0 21 10 T 13 12 226261 CASAVA_Build 4 188330939 1D CCATTGTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 17 11 T 12 11 226262 CASAVA_Build 4 188351236 1D CACATAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 33 2 23 9 T 13 12 226263 CASAVA_Build 4 188355227 4D TTTCTTTCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 1721 hom 23 het 14 0 8 6 CCTT 5 4 226264 CASAVA_Build 4 188356905 1D TCCATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 28 3 14 11 T 16 15 226265 CASAVA_Build 4 188361608 2I ACAAAAAGAC --/AG AGAGACAGAG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AG 2 3 226266 CASAVA_Build 4 188363608 1I TGATCATTTA -/C ATAGAAAATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 0 1 226267 CASAVA_Build 4 188367305 4I TCCTTCCTTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 41 het 19 0 13 6 TC 7 9 226268 CASAVA_Build 4 188377940 5D TTTAACAAAT GACTG/----- TATCTAGGCA 3070 het 3070 hom 31 14 15 5 GACTG 1 0 226269 CASAVA_Build 4 188379403 1D AAAAAAAAAA C/- GGTGAAGATA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 1 0 226270 CASAVA_Build 4 188384873 1D ATAGAAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 9 8 226271 CASAVA_Build 4 188408328 3I TTGCTGAAAT ---/AAC AACAACAATA 3070 hom 111 het 43 0 36 7 AAC 2 3 226272 CASAVA_Build 4 188414298 1D AGCAATAGAG A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 90 het 43 0 30 13 A 8 7 226273 CASAVA_Build 4 188415620 1I ATTGCATTGA -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 7 8 226274 CASAVA_Build 4 188424558 14D8M9D GGGAAATTCT CTTGAATTGTAATCCCCATAATTCCCACGTG/--------------CCCATGAT--------- TCAATTACCT 3070 hom 69 het 24 0 23 4 N/A 0 0 226275 CASAVA_Build 4 188424861 1I ATTTTTACTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 303 hom 40 2 36 2 A 7 8 226276 CASAVA_Build 4 188425256 7D TGTTTGTTTG TTTTTTT/------- TTTTTGGGGT 892 het 414 hom 45 6 6 37 T 12 5 226277 CASAVA_Build 4 188428647 1D AGAAAAATAA G/- GCATAACAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 2 1 226278 CASAVA_Build 4 188450131 2D AATAATTTTG AC/-- ATATAGAAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AC 1 0 226279 CASAVA_Build 4 188450699 1I CTTTTTGCTA -/C CCATCATTCT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 2 3 226280 CASAVA_Build 4 188452754 1I TGTTAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 35 3 26 6 A 10 11 226281 CASAVA_Build 4 188453297 2I TTATTACAAA --/TT TGGCCTCTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 1 3 226282 CASAVA_Build 4 188455712 1D GAAAGACCCA C/- CCCCATGATT 3070 hom 64 het 35 0 28 8 C 5 4 226283 CASAVA_Build 4 188461861 1D ATCAGATGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 T 10 9 226284 CASAVA_Build 4 188471420 1I ATTCATTCAT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 A 6 7 226285 CASAVA_Build 4 188475283 1I TATTTTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 10 11 226286 CASAVA_Build 4 188492899 1D TCTCTCAATC T/- CTCTCTCTCT 3019 hom 18 het 10 0 7 3 T 1 0 226287 CASAVA_Build 4 188494599 9D7M1I AAGTCGCACT GGGTAGTTATATACAG-/---------TTTATAGT CGACAGTGAC 3070 het 3070 ref 33 19 14 5 N/A 0 0 226288 CASAVA_Build 4 188499706 1I TACCCAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 A 9 10 226289 CASAVA_Build 4 188501119 3D GACATGCAAC TCT/--- TCTTCTCACG 3070 het 3070 ref 47 25 13 10 TCT 3 2 226290 CASAVA_Build 4 188514883 1D ATTCACTGTT A/- AGAGTTAAAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 1 226291 CASAVA_Build 4 188527707 1D ATCAGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 39 3 28 8 T 13 12 226292 CASAVA_Build 4 188539698 1D GGTGAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 12 0 9 3 T 11 10 226293 CASAVA_Build 4 188549027 1I GATTCTGCAG -/A AACTTTCTTT 3070 hom 138 het 54 0 46 8 A 2 3 226294 CASAVA_Build 4 188582753 1I TCTCTACAGT -/G AATTGCACAT 3070 het 3070 ref 63 27 27 9 G 0 1 226295 CASAVA_Build 4 188584921 2D GTATTTTTTG TC/-- TCTGTACTTC 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 TC 2 1 226296 CASAVA_Build 4 188587649 1I GAGCAGGCTA -/C AAAATCCCTT 3070 hom 117 het 45 0 38 7 C 0 1 226297 CASAVA_Build 4 188589381 3I AAATGTAGTC ---/ATT ACGTTTACAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 ATT 0 1 226298 CASAVA_Build 4 188594099 2D GGGTATGGCA TT/-- TTTTTTGTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 6 226299 CASAVA_Build 4 188596505 2I CCTATTAGGC --/TT TAGAAGCAAG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 1 3 226300 CASAVA_Build 4 188599346 1I GCATCTATAA -/T TATGATTATA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 1 2 226301 CASAVA_Build 4 188600670 2D GCTTTTGCTT AA/-- GAGTTGCTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 0 226302 CASAVA_Build 4 188610291 1I ATGTCCTCAC -/T CAGATGCTGC 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 0 1 226303 CASAVA_Build 4 188617023 5D CATTTATTTA TTTAT/----- TTAATTTATT 3070 het 3070 ref 30 16 14 2 TTTAT 1 0 226304 CASAVA_Build 4 188627726 7D CCTTTCTCTG TATCTGT/------- TATCTGTCTC 3070 het 3070 ref 44 23 21 6 TATCTGT 2 1 226305 CASAVA_Build 4 188627819 4I AGAGAGAGAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 hom 108 het 45 0 33 12 AGAA 2 3 226306 CASAVA_Build 4 188631169 13I GAGAAATATA -------------/CTTTTTGTATATT CTAAGTCTCC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 CTTTTTGTATATT 0 1 226307 CASAVA_Build 4 188636149 2D AGGAAGATAC AT/-- GTGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AT 1 0 226308 CASAVA_Build 4 188640984 1D AAAGAGAATT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 A 7 6 226309 CASAVA_Build 4 188641754 2D TGAAATATCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 25 3 10 13 T 13 11 226310 CASAVA_Build 4 188643585 1I CTAGCTGAAG -/A AAAAAAAAAT 2698 het 2698 ref 30 17 7 6 A 9 10 226311 CASAVA_Build 4 188649019 1I TCAAAAAACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 11 12 226312 CASAVA_Build 4 188651993 1D CCTGTGCCCT G/- GTAGGCAATT 3070 het 3070 ref 53 26 26 2 G 2 1 226313 CASAVA_Build 4 188653175 4D GCCGAATTGT TTGA/---- TTGGTTGTGA 3070 het 3070 hom 46 16 24 10 TTGA 1 0 226314 CASAVA_Build 4 188657710 2I AAAGCCCAAA --/AG AGTTTTTCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AG 1 2 226315 CASAVA_Build 4 188662227 2D CCCTCTCCTC CT/-- CTCTCTTCTT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 CT 4 3 226316 CASAVA_Build 4 188668214 1D GAAGCTATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 T 10 9 226317 CASAVA_Build 4 188682189 2D GAGAAGAATC AA/-- ATAGACACAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 4 A 3 1 226318 CASAVA_Build 4 188687769 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 9 10 226319 CASAVA_Build 4 188690390 1I ATTCAGAGGG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 7 8 226320 CASAVA_Build 4 188691396 1I AATGAAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 9 10 226321 CASAVA_Build 4 188692390 1I GAAAAAGATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 345 hom 40 2 28 10 A 9 10 226322 CASAVA_Build 4 188700864 1D AAGCAATGGG A/- AAAGGGCTCC 3070 hom 55 het 24 0 17 7 A 4 3 226323 CASAVA_Build 4 188701831 1D ATGGAGTTGG A/- AGCAGTATCC 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 2 1 226324 CASAVA_Build 4 188704836 2D TTTGAATTGA TC/-- TCTCTCTCTC 1029 het 1029 ref 36 30 3 3 TC 9 8 226325 CASAVA_Build 4 188722448 1I GAGATAGAGG -/T TCGTATCTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 1 2 226326 CASAVA_Build 4 188726003 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 10 9 226327 CASAVA_Build 4 188730317 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 1234 hom 10 het 4 0 4 0 A 6 5 226328 CASAVA_Build 4 188737383 2I TGTTTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 282 hom 30 2 21 7 TA 6 7 226329 CASAVA_Build 4 188741616 3I GTCTCCTTCT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 44 het 21 0 13 8 TTC 5 6 226330 CASAVA_Build 4 188742752 1I TAGAAAAGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 298 hom 38 2 32 4 A 9 10 226331 CASAVA_Build 4 188745633 9I AAATAGAAAC ---------/CAAAAAAAA CAAAAATTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 CAAAAAAAA 0 1 226332 CASAVA_Build 4 188750486 1D ACTTTCTTTT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 A 8 7 226333 CASAVA_Build 4 188751107 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAGTTA 2722 het 32 hom 34 1 18 15 A 6 7 226334 CASAVA_Build 4 188753684 22D AGCACTTTGA GAGGATTACTTGAGCCCAGGAG/---------------------- GAGGATTACT 2419 hom 18 het 13 0 6 12 GAGGATTACTTGAGCCCAGGAG 2 1 226335 CASAVA_Build 4 188755072 2I GTTTATACAC --/TT ATTGATTTGT 3070 hom 148 het 50 0 50 0 T 0 2 226336 CASAVA_Build 4 188762757 3I GTATTTCTTC ---/AGA AGAAGTTACG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AGA 1 2 226337 CASAVA_Build 4 188779484 1D GTTATCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 954 hom 41 3 31 7 T 12 11 226338 CASAVA_Build 4 188792762 2D TTCTTAAATT CA/-- CAGTCACCCA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 CA 2 1 226339 CASAVA_Build 4 188803102 1D AAGAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 38 0 30 8 A 11 10 226340 CASAVA_Build 4 188810681 1D TTTTTTACTG A/- AAGCAAGTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 3 2 226341 CASAVA_Build 4 188811471 4D TGATAAAATC ATAA/---- ATAATTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 9 ATAA 2 1 226342 CASAVA_Build 4 188825705 2D TCCTGGCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 581 hom 28 3 17 9 T 17 15 226343 CASAVA_Build 4 188827908 1D TTCTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 36 0 24 12 T 11 10 226344 CASAVA_Build 4 188829441 1I ATCAGTGTGA -/T TTTTGGGGGG 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 4 5 226345 CASAVA_Build 4 188831111 1I TTTCTACACA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 7 8 226346 CASAVA_Build 4 188832797 1I ACATGAGCCA -/C CCGTGCCCCG 3070 hom 57 het 24 0 18 6 C 2 3 226347 CASAVA_Build 4 188835291 1D GTTATCGTTA T/- TTCTACAGAT 3070 hom 105 het 41 0 36 8 T 3 2 226348 CASAVA_Build 4 188835982 1D TCAGATACCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 10 9 226349 CASAVA_Build 4 188836084 1I TTTTATTTTA -/T TTTTATTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 4 5 226350 CASAVA_Build 4 188839161 1I TCCTTCCCTC -/T CCACTGCCTA 3070 hom 126 het 50 0 39 11 T 0 1 226351 CASAVA_Build 4 188846643 1D TTCTATATTG T/- AAATATCAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 0 226352 CASAVA_Build 4 188847935 4D TCTTTCTAAC TATT/---- AATTAATTAT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 TATT 1 0 226353 CASAVA_Build 4 188850868 1I AAAGGAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 980 hom 32 3 25 4 T 12 13 226354 CASAVA_Build 4 188864588 1D ACTAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 27 1 18 8 T 13 12 226355 CASAVA_Build 4 188872903 2D AATTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 13 11 226356 CASAVA_Build 4 188875089 1I TCCGTCTTGG -/A AAAAAAAAAA 2452 het 122 hom 9 1 6 2 A 11 12 226357 CASAVA_Build 4 188876722 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 41 het 31 0 12 19 T 9 10 226358 CASAVA_Build 4 188877417 1I GTTTGTTTTG -/T TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 4 5 226359 CASAVA_Build 4 188878301 5D AATTTGAGAA GAGAT/----- GTTTAAGAAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 GAGAT 1 0 226360 CASAVA_Build 4 188878703 1D ACTATATCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 10 9 226361 CASAVA_Build 4 188884555 1I CGCCTATCTT -/A AAAAAAAAAA 2993 het 2993 ref 27 15 9 3 A 10 11 226362 CASAVA_Build 4 188892828 1I TCCCAAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 10 11 226363 CASAVA_Build 4 188902906 2D CTCCGTCTCA AG/-- AAAAAAAAAA 1467 het 1467 ref 18 9 4 6 AG 1 0 226364 CASAVA_Build 4 188905597 1D ACAGTGACAA T/- TGGCACCCAG 3070 het 3070 ref 64 30 29 6 T 2 1 226365 CASAVA_Build 4 188914657 1I AATAAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 8 6 T 12 13 226366 CASAVA_Build 4 188914713 1I AGTCCATGGA -/T TTTTTTTTTT 2729 het 2729 ref 31 15 8 8 T 11 12 226367 CASAVA_Build 4 188924043 1D AGGACCCCCC A/- CCCGGGTAAC 2476 het 2476 ref 29 14 12 3 A 1 0 226368 CASAVA_Build 4 188924602 16D TTACATAGAT AGATACAGATTACATA/---------------- GATAGATACA 1007 het 1007 ref 40 21 3 20 AGATACAGATTACATA 1 0 226369 CASAVA_Build 4 188925743 2I TTAGGCAAAC --/AG AGAGGGAAGG 3070 het 3070 hom 56 21 23 12 AG 2 3 226370 CASAVA_Build 4 188940358 1I CTGTCTCAAC -/A AAAAAAAAAA 2363 het 719 hom 23 4 11 8 A 17 18 226371 CASAVA_Build 4 188941103 4D TTAGGCAAAC AGAG/---- AGGGAAGGCA 3070 hom 99 het 34 0 34 1 AG 3 1 226372 CASAVA_Build 4 188945959 1I TCTGGAATTA -/T TTTTTGTGTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 6 226373 CASAVA_Build 4 188949344 3I ATCCTTTTAC ---/TAG TAGTAGTAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAG 3 4 226374 CASAVA_Build 4 188949740 1D GAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 11 10 226375 CASAVA_Build 4 188951578 2D TTTCATACAA CT/-- CTAATTATCA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 CT 2 1 226376 CASAVA_Build 4 188966956 1I TAAGGAAAAA -/G AGAGAGAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 0 1 226377 CASAVA_Build 4 188978430 1I GCTATTCTTA -/T GTTCTCTTAT 3070 hom 144 het 51 0 48 3 T 0 1 226378 CASAVA_Build 4 188978758 1I AAATAAAAAA -/G GCATGTTTGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 1 2 226379 CASAVA_Build 4 188985847 1D ACTTTTAGAC T/- TTTTTTACTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 7 6 226380 CASAVA_Build 4 188997679 1D TTTTGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 333 hom 31 1 24 8 T 11 10 226381 CASAVA_Build 4 189011614 1D CACAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 11 10 226382 CASAVA_Build 4 189012602 2D TCTGGATAAC AT/-- AATAATAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 5 AT 1 0 226383 CASAVA_Build 4 189014765 3I CAGGGGCGTG ---/CCT GGCCTGTCAG 3070 hom 80 het 29 0 24 5 CCT 0 1 226384 CASAVA_Build 4 189021139 5D CATTGTTCTA GTGCT/----- GTTTAGGAAA 3070 hom 114 het 39 0 39 1 GTGCT 1 0 226385 CASAVA_Build 4 189021974 3I GAGCTTAACG ---/ACA ACAACAACAA 3070 hom 112 het 48 0 36 12 ACA 4 5 226386 CASAVA_Build 4 189023849 1I TTCATAAAAC -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 7 8 226387 CASAVA_Build 4 189121611 1D GATATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 11 10 226388 CASAVA_Build 4 189149185 4I GTCAGCAGAT ----/AAAC AAGTGAACAA 1973 hom 10 het 4 0 4 0 AAAC 0 1 226389 CASAVA_Build 4 189154323 1D TCTGGCTAAG T/- CTTTTCTATA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 1 0 226390 CASAVA_Build 4 189156485 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 10 9 226391 CASAVA_Build 4 189162171 3I GTGATAAATT ---/GAC TTCAAAAGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GAC 0 1 226392 CASAVA_Build 4 189165279 1D AACACAAGAT A/- ACCTGAACAC 3070 hom 129 het 48 0 43 6 A 2 1 226393 CASAVA_Build 4 189181303 11D GGTGCTTTGT TAAGCTCTGGG/----------- AATGCAACCT 3070 het 3070 ref 47 23 18 7 TAAGCTCTGGG 1 0 226394 CASAVA_Build 4 189182119 2D GATGGCAGAG TC/-- TCTGCTGCAT 3070 het 3070 ref 51 30 15 6 TC 2 1 226395 CASAVA_Build 4 189185148 1I CAAAAGCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 9 10 226396 CASAVA_Build 4 189186057 1I ATCATGAGTA -/T TTTTTTTTTT 1748 het 590 hom 17 3 7 7 T 13 14 226397 CASAVA_Build 4 189187610 14D TGTGTGTGCC TGTGTGTGTGCCTG/-------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 57 het 60 1 34 32 TGTGTGTGTGCCTG 1 0 226398 CASAVA_Build 4 189189760 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 810 hom 27 2 15 10 A 10 11 226399 CASAVA_Build 4 189196361 122D ATTAATACTA TCAAATTGCCTTTTTGTTTTGCTAATATTTAATACTCATGATAAAAAGATTTTAGACTGTAGCAGGTTTTTCTTTTTAACCCTGGTTATATTATTTGGCATGATTCAGATGTTGAAGTAGCC/-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TCAATTTTAA 2173 het 2173 ref 18 26 5 8 TCAAATTGCCTTTTTGTTTTGCTAATATTTAATACTCATGATAAAAAGATTTTAGACTGTAGCAGGTTTTTCTTTTTAACCCTGGTTATATTATTTGGCATGATTCAGATGTTGAAGTAGCC 1 0 226400 CASAVA_Build 4 189197353 2I AAACTGTCTC --/AG AACTCTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 AG 0 1 226401 CASAVA_Build 4 189216056 1D AATTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1199 hom 30 7 12 11 T 13 12 226402 CASAVA_Build 4 189220539 3D GTTTTCAATG TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 TTA 4 3 226403 CASAVA_Build 4 189225959 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2846 het 2846 ref 31 14 7 10 A 12 13 226404 CASAVA_Build 4 189267309 2I TACACACACA --/CG CACACATAGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CG 0 1 226405 CASAVA_Build 4 189268549 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 23 0 13 10 T 15 14 226406 CASAVA_Build 4 189268928 1I TATTCCTGTG -/C CCCCCTCCCC 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 C 5 6 226407 CASAVA_Build 4 189276483 23I CACACAGATT -----------------------/CACCTTTGCTCTGTTTTTGCTCG CAGTGCCCAC 3070 hom 111 het 42 0 35 8 CACCTTTGCTCTGTTTTTGCTCG 0 1 226408 CASAVA_Build 4 189284105 1I TAAGTACACA -/T TTTTTTAGAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 6 7 226409 CASAVA_Build 4 189284918 1I TGAAATTTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 44 het 21 0 15 6 T 7 8 226410 CASAVA_Build 4 189288436 1I TTGTTTGAAC -/T TGCTTTTCAA 3070 hom 62 het 22 0 21 1 T 1 2 226411 CASAVA_Build 4 189290294 6D ATGACAGGCC TTCCTT/------ TTCAAGACTG 3070 hom 57 het 21 0 20 2 TTCCTT 1 0 226412 CASAVA_Build 4 189292928 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 10 11 226413 CASAVA_Build 4 189294515 1I ACAATGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 11 12 226414 CASAVA_Build 4 189296924 1D AGTGGGATAG C/- CTCTTGAGGC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 C 2 1 226415 CASAVA_Build 4 189300264 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 19 2 12 5 A 17 16 226416 CASAVA_Build 4 189300909 1I GCTTTGTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 32 het 15 0 11 4 T 9 10 226417 CASAVA_Build 4 189300985 1D AGACCTGATG A/- AGATAAGTAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 2 1 226418 CASAVA_Build 4 189304342 3D ATATGATGCG AAC/--- AACCAAGGGT 3070 het 3070 hom 45 20 21 5 AAC 2 1 226419 CASAVA_Build 4 189306500 1I AAATTAGCTG -/T GGCATGATGG 3070 het 1129 hom 15 3 8 4 T 0 1 226420 CASAVA_Build 4 189307652 1D TCTGTGAAAT A/- AAGAGGGTTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 5 A 3 2 226421 CASAVA_Build 4 189334821 1D AAAGCGCCTC T/- TTTTTTTTTT 1398 het 135 hom 22 2 4 16 T 17 16 226422 CASAVA_Build 4 189339744 4D AAAGAAAGAC AAAT/---- AAAAGCCAGT 3070 hom 48 het 37 0 16 22 AAAT 1 0 226423 CASAVA_Build 4 189345577 1D CAATTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 38 0 10 28 T 15 14 226424 CASAVA_Build 4 189345849 4D CTGAGATTAC AGGT/---- ATGAGCCACC 3070 het 2699 hom 21 8 12 3 AGGT 1 0 226425 CASAVA_Build 4 189349832 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2097 het 884 hom 21 5 7 9 A 15 16 226426 CASAVA_Build 4 189372175 1I CCAAGACAGT -/G GGCTATGGTT 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 G 2 3 226427 CASAVA_Build 4 189372765 1D TTTTCTTTGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 9 8 226428 CASAVA_Build 4 189374256 12D CCCTCCTCCC TCCTTCCTTCCT/------------ TCCCCCCTTC 1123 het 922 hom 19 6 4 11 TCCT 3 0 226429 CASAVA_Build 4 189382228 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2269 het 251 hom 10 2 6 2 A 17 16 226430 CASAVA_Build 4 189382915 4D TCATAGTAAT AAAC/---- AGACAGCCTG 3070 het 3070 ref 35 20 10 7 AAAC 1 0 226431 CASAVA_Build 4 189387277 1I CTTTTTTTTT -/C TGAGATGGAG 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 C 0 1 226432 CASAVA_Build 4 189387850 1I CCTTCTCTTT -/G GGAAAGTAAG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 G 2 3 226433 CASAVA_Build 4 189390006 24D ACACTCACAT ACATATACTCACATACACACACTC/------------------------ ACACTCACAT 854 het 854 ref 59 41 6 18 ACATATACTCACATACACACACTC 1 0 226434 CASAVA_Build 4 189390725 1I TAGTTACAAG -/T TATGTCGCCT 3070 het 2712 hom 27 7 11 9 T 1 2 226435 CASAVA_Build 4 189401027 1I CAATTAATAC -/T TTTTTTTTTT 2604 het 1164 hom 18 5 9 4 T 13 14 226436 CASAVA_Build 4 189401894 2D CAAATGTTAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 7 het 46 1 32 13 AT 7 6 226437 CASAVA_Build 4 189402590 2I TTTTTTCTTT --/TC CTTTTTTTTT 2423 hom 39 het 15 0 13 2 TC 0 1 226438 CASAVA_Build 4 189410541 1I GCTAATCCAT -/G GCCTTACACT 3070 het 3070 ref 54 37 14 3 G 1 2 226439 CASAVA_Build 4 189411899 22D TTACATGAAC GTGCTATACATTCATACAGAAT/---------------------- GTATGACAGA 2494 het 2494 ref 16 11 7 2 GTGCTATACATTCATACAGAAT 1 0 226440 CASAVA_Build 4 189413648 1I AAAACATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 692 hom 25 2 14 9 T 14 15 226441 CASAVA_Build 4 189417282 1D TCAATCAATA T/- TTTTTAGCTA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 T 6 5 226442 CASAVA_Build 4 189419298 2D TCTATACCTG TT/-- TTTTGTGTGT 3070 het 2204 hom 30 8 16 8 T 6 4 226443 CASAVA_Build 4 189421979 1I21M1D CAGCTCTCAG -AAAAAAAATGTAATCCTAATAT/AAAAAAAAATGTAATCCTAATA- TTCCTTCAAT 3070 het 3070 hom 20 9 12 3 N/A 0 0 226444 CASAVA_Build 4 189428830 1I GAACGTGGCG -/A AGAGATGAAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 1 2 226445 CASAVA_Build 4 189437020 2D TGAGGAATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 61 het 56 1 39 17 AC 10 9 226446 CASAVA_Build 4 189437981 1D TTCAAGAGCA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 7 226447 CASAVA_Build 4 189447888 1D AAATGGCAAC A/- ATGACAACAG 3070 het 3070 hom 47 19 24 7 A 2 1 226448 CASAVA_Build 4 189448186 2I TATTTCTTCT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 34 1 19 14 TC 0 1 226449 CASAVA_Build 4 189451470 1I TTGAGCAGTG -/C CGTATATACC 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 C 1 2 226450 CASAVA_Build 4 189454376 1I ATGGGTGATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 10 226451 CASAVA_Build 4 189455098 2D GCCTAAGTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 A 14 12 226452 CASAVA_Build 4 189458134 1I TAACTATGCC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 8 9 226453 CASAVA_Build 4 189462143 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 704 hom 25 2 23 0 A 11 12 226454 CASAVA_Build 4 189483449 6I TTAATATAAA ------/TTTATG TTTAATTCTG 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TTTATG 0 1 226455 CASAVA_Build 4 189485403 1D TACCTGTCTT C/- CCGCTTCGCA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 C 3 2 226456 CASAVA_Build 4 189494857 1D TCAAGTCATT C/- CCCTTCTCCC 2937 het 2937 ref 22 10 9 3 C 4 3 226457 CASAVA_Build 4 189496250 3D ACTCCGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 177 het 121 hom 18 1 2 17 A 15 12 226458 CASAVA_Build 4 189501242 1D CTGAGGTGGG C/- GGATCATGAG 2688 het 644 hom 13 3 6 4 C 1 0 226459 CASAVA_Build 4 189502251 2D AGTTTCTGAG GC/-- AATTTGGACT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 GC 1 0 226460 CASAVA_Build 4 189504106 10I GTATTACCAC ----------/AGCAATGAAT AGTATTTACA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 AGCAATGAAT 0 1 226461 CASAVA_Build 4 189509800 1D GCCCAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1708 hom 15 4 10 3 T 11 10 226462 CASAVA_Build 4 189516265 1I ACTTTTTCGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 628 hom 43 2 32 9 T 10 11 226463 CASAVA_Build 4 189517332 3I TTAAAACAGG ---/ATA ATAACAAAAT 2939 het 2939 ref 18 10 6 2 ATA 1 2 226464 CASAVA_Build 4 189517966 1D GATCTTCTTC T/- TGGACTAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 2 1 226465 CASAVA_Build 4 189533521 1D GATTGACGCT G/- GGAAATGAAG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 G 3 2 226466 CASAVA_Build 4 189537214 40D ACCTCTCTAA ATCTGATGGAAGGAGAAAGACTGAAGTCAGAGAGGCTTGT/---------------------------------------- ATCTGATGGA 2695 het 2695 ref 36 20 6 18 ATCTGATGGAAGGAGAAAGACTGAAGTCAGAGAGGCTTGT 1 0 226467 CASAVA_Build 4 189542660 1D GCGAAAACCC G/- GGGGGGGGGA 1963 het 1299 hom 13 4 9 1 G 10 9 226468 CASAVA_Build 4 189543588 15D CTAGAGGAAA AGTTTTTCCCCATTC/--------------- AGTATGCTGT 3070 het 3070 hom 48 22 27 1 AGTTTTTCCCCATTC 1 0 226469 CASAVA_Build 4 189545581 1D ACTGGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 T 11 10 226470 CASAVA_Build 4 189558053 1D GAGGCTTTGA T/- TAGCACTTAC 3070 het 3070 hom 45 15 24 8 T 2 1 226471 CASAVA_Build 4 189561739 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 9 10 226472 CASAVA_Build 4 189564091 3I TCTAATACTA ---/CTT CTCCCATTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CTT 0 1 226473 CASAVA_Build 4 189566799 1D CTTAAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 A 10 9 226474 CASAVA_Build 4 189571244 2D GAAGCCCTTA TG/-- TGTGTGTCCA 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 TG 4 3 226475 CASAVA_Build 4 189579506 1I GTTTGATATT -/G AACAAAAGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 226476 CASAVA_Build 4 189595269 1I2M2I TGCCATTGTT -TA--/ATAAG TTATAATTTT 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 N/A 0 0 226477 CASAVA_Build 4 189597169 2I ATTTAGATCT --/CA CAGTCAACTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CA 1 2 226478 CASAVA_Build 4 189597763 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 22 1 19 2 A 10 11 226479 CASAVA_Build 4 189598074 4D TGCCTTCTGA CTGG/---- TATTTAATAA 3070 hom 66 het 30 0 23 8 CTGG 1 0 226480 CASAVA_Build 4 189599550 4I TATCCTCACC ----/ATAT ATATATATAT 1812 hom 21 het 10 0 8 2 AT 6 8 226481 CASAVA_Build 4 189599623 2D76M2I CATATATATA GCGTGTGTGTATATATGTATTTGGTATATCTATGGTGCATATATTTGGTATATATATGGTGTGTGTATATACACATAT--/--ATGTGTGTATATATGTATTTGGTATATCTATGGTGCATATATTTGGTATATATATGGTGTGTGTATATATACATATAC ACATACCATA 3070 het 678 hom 18 4 18 13 N/A 0 0 226482 CASAVA_Build 4 189599762 1I AAAAATACTC -/T TTTTTTGGTG 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 6 7 226483 CASAVA_Build 4 189600656 1D TACATGTAAT G/- CAACACGTGG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 G 1 0 226484 CASAVA_Build 4 189607396 6D TTTTAAGTGT TGATGA/------ TGATGATGAT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TGA 5 3 226485 CASAVA_Build 4 189637935 1I TTAAAGAGAC -/A ACCTCAATTC 3070 het 201 hom 36 1 30 5 A 1 2 226486 CASAVA_Build 4 189643945 1I AAGGAAGAAG -/C CTATACGACT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 C 1 2 226487 CASAVA_Build 4 189649354 1D AAAGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 12 11 226488 CASAVA_Build 4 189649634 1D CATAAGTAAT A/- AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 7 6 226489 CASAVA_Build 4 189653113 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 14 1 A 12 11 226490 CASAVA_Build 4 189656362 3I TAGAAGTACC ---/AAA AAAAAAAAAA 2617 het 2617 ref 32 14 11 7 A 13 16 226491 CASAVA_Build 4 189661652 1D AACAGCGTAA G/- GTCCTGGAAG 3070 het 3070 ref 63 37 22 5 G 2 1 226492 CASAVA_Build 4 189666763 11D ACCTGATTTC TAAATAGGAGG/----------- TAATACTATA 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 TAAATAGGAGG 1 0 226493 CASAVA_Build 4 189668332 1I AAATGTTTAG -/T TTTTTTTTTT 1903 het 1903 ref 21 7 7 7 T 13 14 226494 CASAVA_Build 4 189670910 1D TACAGATATG T/- TACAAGAAGA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 2 1 226495 CASAVA_Build 4 189671097 1I CATTGTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2554 hom 38 9 21 8 A 11 12 226496 CASAVA_Build 4 189675439 1D GACAAAAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 7 15 5 A 10 9 226497 CASAVA_Build 4 189679813 1I ACTAGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 564 hom 25 3 14 8 A 17 18 226498 CASAVA_Build 4 189682879 1I TTTTTCCAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 9 226499 CASAVA_Build 4 189684514 1I TTCTTTTACT -/G GCCAATACGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 2 226500 CASAVA_Build 4 189701013 1I GATTTTCTGA -/T TTTTTCATTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 5 6 226501 CASAVA_Build 4 189701766 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 26 0 20 7 A 10 9 226502 CASAVA_Build 4 189706002 3I AAAATGAATA ---/AAT AATCTTGATA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAT 1 2 226503 CASAVA_Build 4 189706111 1D TCATTTTTTC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 9 8 226504 CASAVA_Build 4 189707989 2D TTTAAGAAAA CT/-- CTATAAAAAC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 CT 2 1 226505 CASAVA_Build 4 189710195 1I CCATCTCAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 9 10 226506 CASAVA_Build 4 189710664 2I TAGATATAAC --/TT AGCTGCATAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 0 2 226507 CASAVA_Build 4 189711458 3I ATTTTATAGA ---/ATG ATAAGTTAGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ATG 0 1 226508 CASAVA_Build 4 189712117 1I TGACCTTAGC -/T GCTTAAACTT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 T 0 1 226509 CASAVA_Build 4 189734871 1I CCTTTAATAC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 8 226510 CASAVA_Build 4 189736804 3I TTAGCCAGTA ---/CTT CTTCTTTCTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CTT 2 3 226511 CASAVA_Build 4 189742272 1I GCTATAGTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 9 226512 CASAVA_Build 4 189744281 3D GGGACATGAG CTT/--- CTTGAATATC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CTT 2 1 226513 CASAVA_Build 4 189744801 1D GGGTATGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 34 0 27 7 T 11 10 226514 CASAVA_Build 4 189745508 4D2M2I AGGTGATACA TTTTAA--/----AACG GTAGAAACGG 3070 hom 114 het 39 0 39 1 N/A 0 0 226515 CASAVA_Build 4 189753162 15D CCGTGTCTCC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 20 0 16 11 A 24 9 226516 CASAVA_Build 4 189757669 1I TTTGAAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 141 het 57 0 47 10 T 10 11 226517 CASAVA_Build 4 189759871 2D AATACTCAGC TG/-- TGTTAAGAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 7 TG 2 1 226518 CASAVA_Build 4 189760516 2I AAGAGTGAAA --/CT CTGTCTAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 CT 1 2 226519 CASAVA_Build 4 189760720 2I TACTCAAATC --/AA AACTCATTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 4 226520 CASAVA_Build 4 189760815 1I TGTATAGTCA -/C CATTATAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 2 226521 CASAVA_Build 4 189762953 4D TTAAGGCTGG GAGA/---- GAGAGTTTGA 3070 hom 90 het 36 0 29 9 GA 4 2 226522 CASAVA_Build 4 189763568 7I AGAAATGGGG -------/GTTTTAA GTTTTAAGCA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 GTTTTAA 1 2 226523 CASAVA_Build 4 189765321 5D CAGAAATCTT ATCTA/----- ATCTGTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 20 5 ATCTA 1 0 226524 CASAVA_Build 4 189769462 4I TTCCCTTAGG ----/CACA CTTCGCATGC 3070 hom 145 het 53 0 48 5 CA 0 2 226525 CASAVA_Build 4 189779474 1I TGCTTTAAGC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 8 226526 CASAVA_Build 4 189780805 2I GTGTTATATT --/AG AGATATACAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AG 1 2 226527 CASAVA_Build 4 189781312 2I AAATATATAA --/AT ATATATATAT 2209 hom 21 het 11 0 8 3 AT 8 9 226528 CASAVA_Build 4 189781717 1D AAATAGGAAA C/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 38 20 17 2 C 1 0 226529 CASAVA_Build 4 189781914 1D CATGGTCATG A/- AAAAAAACGT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 7 226530 CASAVA_Build 4 189783314 2I TATATGTGAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 AT 6 7 226531 CASAVA_Build 4 189787388 4D ACATGTCAAA AAGG/---- ACAATTACAT 3070 het 3070 hom 33 11 19 4 AAGG 1 0 226532 CASAVA_Build 4 189788795 4D ACAGACAAGG GGGA/---- GGGAGTTGAG 3070 hom 84 het 32 0 28 6 GGGA 2 1 226533 CASAVA_Build 4 189790256 2I AGGACTGCCC --/CT CTATATTGGA 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 CT 1 2 226534 CASAVA_Build 4 189797488 1I AGTGTATCTA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 19 9 7 3 T 6 7 226535 CASAVA_Build 4 189804432 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1459 hom 31 9 19 3 T 11 12 226536 CASAVA_Build 4 189808267 2D CAGAACAAAA TC/-- TCTCTTAGTT 3070 het 2470 hom 15 6 8 1 TC 3 2 226537 CASAVA_Build 4 189810475 4I AAAATAAGAA ----/TAAC TAAGAGGAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 TAAC 0 1 226538 CASAVA_Build 4 189813678 1D AAAAGCATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2827 hom 18 8 8 2 A 10 9 226539 CASAVA_Build 4 189813887 1D GCATGCTCTC G/- GCTCACTGCT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 G 2 1 226540 CASAVA_Build 4 189819351 1I GTTTTTCTGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 8 9 226541 CASAVA_Build 4 189822744 5D TGTTCGGTAT AGATG/----- ATAGAAGTGA 3070 het 3070 ref 31 20 9 6 AGATG 1 0 226542 CASAVA_Build 4 189823746 1D GGAGAAAGCA G/- CTTCCCGTGC 2801 het 2801 ref 32 20 8 4 G 1 0 226543 CASAVA_Build 4 189824822 1I TAAAAGTAAG -/A AACAAATAGA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 2 3 226544 CASAVA_Build 4 189826854 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 T 7 8 226545 CASAVA_Build 4 189828259 1D CTAATTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 G 1 0 226546 CASAVA_Build 4 189830213 1D CCAACACTCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 8 7 226547 CASAVA_Build 4 189837533 4I GCAGATTTGC ----/TCTG TCTTTTATCT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 TCTG 0 1 226548 CASAVA_Build 4 189840455 3D TGGCAGTTGA GGG/--- GATCTGGATG 3070 het 3070 ref 49 25 14 11 G 4 1 226549 CASAVA_Build 4 189847204 2I GACTCCTTCT --/AA GTCTGTCTAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 0 2 226550 CASAVA_Build 4 189849720 1I GACTCTCATA -/C AGTCAGATCA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 0 1 226551 CASAVA_Build 4 189870168 1I CTCTGCAAAT -/A CCTGTCCAGC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 0 1 226552 CASAVA_Build 4 189875445 1D CCATTAAAGA C/- CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 C 8 7 226553 CASAVA_Build 4 189876938 1D AATACCACTA C/- TTGAAGGGGA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 C 1 0 226554 CASAVA_Build 4 189890427 1I AATTTACAGC -/T TTCTCAAAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 3 226555 CASAVA_Build 4 189894706 1I TGCCTCTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 11 12 226556 CASAVA_Build 4 189895833 1D ATTTGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 42 0 38 4 A 12 11 226557 CASAVA_Build 4 189908382 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2892 het 2754 hom 23 9 7 7 T 13 12 226558 CASAVA_Build 4 189919000 1D TTCTAACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1558 hom 38 7 17 14 T 15 14 226559 CASAVA_Build 4 189925163 1D TGAAAATAAA T/- TGTACCCCAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 2 1 226560 CASAVA_Build 4 189927222 1D TTATCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 A 13 12 226561 CASAVA_Build 4 189942026 1I TCAATTCCCT -/G ACATATGTCT 3070 hom 135 het 56 0 45 11 G 0 1 226562 CASAVA_Build 4 189945704 1I CTACTTAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 59 het 26 0 20 6 A 8 9 226563 CASAVA_Build 4 189955547 2D TTTTTAAAAC AT/-- GTGCTCACTT 3070 het 3070 hom 31 15 15 2 AT 1 0 226564 CASAVA_Build 4 189980541 6I AACTTTTATG ------/AATGAA AAATCTGAAA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 AATGAA 0 1 226565 CASAVA_Build 4 189981518 14D GGACACACAA AGGGACGCACACAC/-------------- AGGGACGCAC 3070 het 3070 hom 68 23 26 23 AGGGACGCACACAC 2 1 226566 CASAVA_Build 4 189991294 5D GCTCATGTGA TCGCT/----- TAGATTATCG 3070 hom 66 het 28 0 23 6 TCGCT 1 0 226567 CASAVA_Build 4 189995475 2I ATTATTTTAC --/AA ATTCTCATGT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 1 3 226568 CASAVA_Build 4 189997295 1D TAAAAATGAT A/- AAAAGTGGTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 5 4 226569 CASAVA_Build 4 189997653 2I ATGGTACACA --/CT CTTGTGTTGT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 CT 1 2 226570 CASAVA_Build 4 189999932 1D AGCCGACAGG A/- AGTTTCCAGT 3070 hom 132 het 47 0 43 5 A 2 1 226571 CASAVA_Build 4 190004127 2I GAAGACTGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 18 10 A 12 14 226572 CASAVA_Build 4 190004407 6D ACAAAAACTT ATACTC/------ AGAGAAGGCC 3070 hom 84 het 30 0 28 4 ATACTC 1 0 226573 CASAVA_Build 4 190004695 5I GTATGCATGT -----/GCTGA GCTGAAGTAG 3070 hom 127 het 46 0 43 3 GCTGA 1 2 226574 CASAVA_Build 4 190007412 2I CTCACAAGCA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 68 het 29 0 23 6 T 9 11 226575 CASAVA_Build 4 190008071 1D CATTTGTCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 55 30 20 5 T 9 8 226576 CASAVA_Build 4 190008477 5D CTTTGTAGTA TATTT/----- TAAAGTCAAG 3070 hom 105 het 37 0 36 6 TATTT 1 0 226577 CASAVA_Build 4 190025961 32D CTTTTTCCTT CCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTC/-------------------------------- CCTCCCTTCC 3070 hom 56 het 27 0 16 11 CCTC 9 1 226578 CASAVA_Build 4 190026038 7I TCCTTCCTTC -------/CTTCTTT CTTCTTTCCT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 CTTCTTT 1 2 226579 CASAVA_Build 4 190027260 4I TTCTTTTTTT ----/TTGA GACAGAGTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTGA 0 1 226580 CASAVA_Build 4 190031398 1D TGTCCTTGAG A/- AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 43 20 16 7 A 7 6 226581 CASAVA_Build 4 190040377 2D TTCAAATGTG TC/-- TAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 TC 1 0 226582 CASAVA_Build 4 190052021 1I GTCGTAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 T 13 14 226583 CASAVA_Build 4 190059448 1I AATGCTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 36 0 29 7 T 10 11 226584 CASAVA_Build 4 190061336 3D TCAATTTTTC TTA/--- TGTTTCTGAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 TTA 1 0 226585 CASAVA_Build 4 190062508 1D TAGGACTGTG C/- AGTCAAAATT 3070 het 3070 hom 43 18 24 1 C 1 0 226586 CASAVA_Build 4 190070848 2D TTTTTTTTTT TA/-- ATTGAGACAG 2863 het 1173 hom 23 5 11 7 TA 1 0 226587 CASAVA_Build 4 190078345 1I GAATTTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 10 11 226588 CASAVA_Build 4 190078736 1I AATCCACCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 9 10 226589 CASAVA_Build 4 190078906 1D CTGGACTCAG A/- AGTTCTGGCT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 A 2 1 226590 CASAVA_Build 4 190085287 5D ATAAACACAT AAAAC/----- AAATAAAGAC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 AAAAC 1 0 226591 CASAVA_Build 4 190085524 1D TCTTCTTCAC T/- TTCCCCTGGA 3070 hom 96 het 48 0 44 4 T 3 2 226592 CASAVA_Build 4 190090070 1I AAGGGCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 T 10 11 226593 CASAVA_Build 4 190095044 2D GAACTGTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 16 14 4 T 12 10 226594 CASAVA_Build 4 190097361 2D AGAAATCTCA CT/-- CTCTGCTTTA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 CT 3 2 226595 CASAVA_Build 4 190098576 1I ATGTGGCTAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 2952 hom 21 8 7 6 A 8 9 226596 CASAVA_Build 4 190106495 1I GAAGCTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 A 8 9 226597 CASAVA_Build 4 190106580 1D TCTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2017 het 107 hom 11 1 7 3 T 11 10 226598 CASAVA_Build 4 190110508 1I CAAAAAAGCC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 8 9 226599 CASAVA_Build 4 190111359 3I TTTTCAAAAC ---/TTA TTATAGTGTA 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 TTA 1 2 226600 CASAVA_Build 4 190113409 5D GAATCATGGT GGACA/----- GGAAGGGGAA 3070 het 3070 hom 42 20 19 4 GGACA 1 0 226601 CASAVA_Build 4 190118430 1D TCCTCCTTCC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 T 8 7 226602 CASAVA_Build 4 190119049 2D CTGGTTCAGG AC/-- ACAGAGTTCC 3070 het 3070 hom 49 19 24 8 AC 2 1 226603 CASAVA_Build 4 190119843 3I CTAAAAATAC ---/AAA AAATTAGCCT 3070 hom 63 het 24 0 19 5 A 3 6 226604 CASAVA_Build 4 190120962 1I TTATCTAGGC -/A AAGAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 2 3 226605 CASAVA_Build 4 190123092 4D GATGGGCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 TTTG 4 3 226606 CASAVA_Build 4 190125166 4D AAGCGCTTTG TAGA/---- TAGATAGCGT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TAGA 2 1 226607 CASAVA_Build 4 190157546 2I ATTCCAACCC --/CT GTTTTTTGTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CT 0 1 226608 CASAVA_Build 4 190167284 4D TTCCTCTGGG TAGA/---- TAGATACCCA 3070 hom 66 het 23 0 23 2 TAGA 2 1 226609 CASAVA_Build 4 190173190 9I TAACATACAG ---------/AAGTACTTT ATTTGATATT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 AAGTACTTT 0 1 226610 CASAVA_Build 4 190185199 2D ACTAAACTAT AA/-- ACTCAAAATA 3070 hom 114 het 39 0 38 1 A 3 1 226611 CASAVA_Build 4 190185744 2I ACTTCTTTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 33 1 21 11 T 10 12 226612 CASAVA_Build 4 190186460 1D CGGCACTACG C/- CCCGGCTAAT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 C 4 3 226613 CASAVA_Build 4 190187579 4I TTTAAAAGTC ----/CTAT CTGTTTTTAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTAT 0 1 226614 CASAVA_Build 4 190191343 1D ACCCACCTCA G/- CCTCCCAAAC 3070 hom 75 het 26 0 26 2 G 1 0 226615 CASAVA_Build 4 190192050 1D CAGTTATTTA T/- TGTTCTTGTT 3070 hom 111 het 40 0 35 5 T 2 1 226616 CASAVA_Build 4 190192534 1I CACTCGGTAC -/A ATCGCTGAGG 3070 hom 111 het 41 0 29 12 A 1 2 226617 CASAVA_Build 4 190201763 1I TGGAATTACA -/T TTTCATTCTT 3070 het 3070 ref 48 22 22 4 T 3 4 226618 CASAVA_Build 4 190206252 1D CACAAGGCTG T/- TTAATAAAGA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 3 2 226619 CASAVA_Build 4 190207214 2I CCATAGGTAT --/AG AGTCTGTGCA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 AG 1 2 226620 CASAVA_Build 4 190211717 1I GTACACATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 9 10 226621 CASAVA_Build 4 190222723 1D CACAAATATA T/- TGGAAATTAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 2 1 226622 CASAVA_Build 4 190224551 1D TTCTGAATTT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 8 7 226623 CASAVA_Build 4 190228320 1I GCTTTTTTTT -/A TTCTTTTTTT 3070 hom 7 het 25 1 18 6 A 0 1 226624 CASAVA_Build 4 190234424 4I TTTTAAAAAG ----/GAAA GAAAGAAGAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GAAA 1 2 226625 CASAVA_Build 4 190242402 1D ATGTAAGATG A/- AAATTTGGGG 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 4 3 226626 CASAVA_Build 4 190246007 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 12 13 226627 CASAVA_Build 4 190247056 9I GGTGTCTGGG ---------/TTATCAGAT CTGGCACACA 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 TTATCAGAT 0 1 226628 CASAVA_Build 4 190248990 1D ACAATTCATT A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 7 6 226629 CASAVA_Build 4 190251631 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 321 hom 22 2 14 6 A 13 14 226630 CASAVA_Build 4 190252734 1D ATGGTCTGAA G/- GAAATCCTGC 3070 het 3070 hom 48 20 23 7 G 2 1 226631 CASAVA_Build 4 190253668 1I TTTGGGCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 833 hom 32 2 29 1 A 9 10 226632 CASAVA_Build 4 190256270 1D TTCCTTACCC T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 T 7 6 226633 CASAVA_Build 4 190268930 1I ACATTCAACC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 8 9 226634 CASAVA_Build 4 190269789 10I TGCCTTCAGC ----------/TTTCTGCTGA ATTGTCTGCT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 TTTCTGCTGA 0 1 226635 CASAVA_Build 4 190273954 2D AATACATCTC CA/-- AAGACCAAGC 3070 hom 62 het 23 0 20 5 CA 1 0 226636 CASAVA_Build 4 190274118 5D CACTTGTAGT TCCAG/----- CCATTCAAGA 3070 het 3070 ref 49 27 21 2 TCCAG 1 0 226637 CASAVA_Build 4 190280728 1D GCCATTATAC A/- AAAAAAGGTA 3070 het 3070 hom 25 11 9 6 A 7 6 226638 CASAVA_Build 4 190281059 1D ACGGTGGGAG A/- GGGGTGAGGG 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 1 0 226639 CASAVA_Build 4 190281582 1D TGCTTTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 6 A 11 10 226640 CASAVA_Build 4 190285829 1I GAAATAGAAC -/T TCCTTTATGT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 1 2 226641 CASAVA_Build 4 190286903 1D TATAGACTTT G/- CAAAACTAGT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 G 1 0 226642 CASAVA_Build 4 190287173 1I GTTTGTGCAA -/C CCAAATATTT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 C 2 3 226643 CASAVA_Build 4 190290421 2I GAGGCTTTGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 10 12 226644 CASAVA_Build 4 190293370 3I CTTATTCTTG ---/TCA TCATTTTTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TCA 1 2 226645 CASAVA_Build 4 190293534 1I TTATTGGTTC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 7 8 226646 CASAVA_Build 4 190301240 1D AGAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1082 hom 10 het 4 0 4 0 A 13 12 226647 CASAVA_Build 4 190307356 4D TCAGATGGTT TTTC/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 28 0 26 5 TTTC 1 0 226648 CASAVA_Build 4 190310207 6D ATGAGAACGT TTTAAA/------ TTTAATCGAA 3070 hom 117 het 41 0 40 9 TTTAAA 1 0 226649 CASAVA_Build 4 190312215 1D CTCCATTAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 146 hom 34 1 31 3 T 3 2 226650 CASAVA_Build 4 190312550 1D TTATCTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 38 0 35 3 A 11 10 226651 CASAVA_Build 4 190316659 6D TCTTGGGCTT CATCTA/------ CATAGATTAG 3070 hom 117 het 43 0 40 6 CATCTA 1 0 226652 CASAVA_Build 4 190319365 2D TTCTTTAAAC TT/-- TGGGAGAATT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 3 1 226653 CASAVA_Build 4 190332211 1I CTGTCTTCTC -/A AATCAGTGAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 2 3 226654 CASAVA_Build 4 190332322 1I TAATTAAATA -/C TTTCATAATG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 0 1 226655 CASAVA_Build 4 190333055 1D TGTGGCTTTA C/- CGTACTGTCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 2 1 226656 CASAVA_Build 4 190335277 1D TAAATGACTA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 8 7 226657 CASAVA_Build 4 190337290 3D AGACAGTGGT GAG/--- GAGAACCTCT 3070 hom 129 het 45 0 44 2 GAG 2 1 226658 CASAVA_Build 4 190337524 4D CTGATGCCAC GCAG/---- GCCGCTTTCG 3070 hom 129 het 46 0 43 3 GCAG 1 0 226659 CASAVA_Build 4 190341627 2D TTCCTATGAA AC/-- AGTTTGCAGC 3070 hom 165 het 63 0 55 10 AC 1 0 226660 CASAVA_Build 4 190347562 1D GCTGCACGTA T/- TGTCTTGAGA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 T 2 1 226661 CASAVA_Build 4 190354457 1I CTATTCAGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 10 226662 CASAVA_Build 4 190355749 1D CATTCATAGT A/- GTCTCTGAGA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 1 0 226663 CASAVA_Build 4 190364091 2D CTCAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 543 het 26 hom 13 1 3 9 AT 1 0 226664 CASAVA_Build 4 190368225 1I TAGTACAGAA -/T GTGTAGCTGA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 0 1 226665 CASAVA_Build 4 190370112 2D TATTAAGAAA AG/-- AGGCTTATTT 3070 hom 157 het 55 0 53 3 AG 2 1 226666 CASAVA_Build 4 190376499 1D GTGACGTTTT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 8 7 226667 CASAVA_Build 4 190382625 12D GGAGGTGAGT CTTACAGTTATA/------------ TTTATAGAGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTTACAGTTATA 1 0 226668 CASAVA_Build 4 190383571 1D ATTTTCAATG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 7 226669 CASAVA_Build 4 190395643 2D TCACGGGGCC CT/-- GTCTGCTGAG 2481 het 2481 ref 26 16 7 3 CT 1 0 226670 CASAVA_Build 4 190406139 4I TTTTGGATTG ----/TCTC TCTATTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TC 1 3 226671 CASAVA_Build 4 190410335 1I AGGTACTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 812 hom 32 3 23 6 A 14 15 226672 CASAVA_Build 4 190417575 1D TTGTTGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 11 10 226673 CASAVA_Build 4 190431014 1D CTGGCCACAG T/- TGAGGGATCC 3070 hom 121 het 78 1 49 31 T 2 1 226674 CASAVA_Build 4 190431243 3I AGTCACTCAT ---/AAC ACACACACTG 1692 hom 71 het 96 0 14 82 AAC 0 1 226675 CASAVA_Build 4 190431803 1D31M2I AAACTATTTA CCAGAGTAAACTAATGAGAGTCTTACTGAGGT--/-CAGAATAAACTAATGAGATTCTTCCTGAGGTAA CAAGACTTTT 3070 hom 11 het 42 0 11 36 N/A 0 0 226676 CASAVA_Build 4 190432115 3I AGCTGCCATC ---/ATT ATTAATAACA 3070 het 605 hom 73 9 47 22 ATT 1 2 226677 CASAVA_Build 4 190433496 1D AGAGGCTTCT G/- GAGGTCTCTG 3070 het 184 hom 31 2 25 4 G 2 1 226678 CASAVA_Build 4 190434649 1I AGACAAGGGA -/T TATTTGACTT 3070 het 2102 hom 100 23 72 5 T 1 2 226679 CASAVA_Build 4 190437281 1D GTCACAATAC A/- AATTGACATC 2944 hom 63 het 27 0 22 6 A 3 2 226680 CASAVA_Build 4 190437381 2I ATAAGTGCTT --/AG GGGCATGAGA 3070 het 103 hom 50 4 40 6 AG 0 1 226681 CASAVA_Build 4 190437440 2D2M2D9M3I GCCGATGCAA AGCTACTGCCCCCAT---/--CT--TGAACAAATGGG TTGTTTAGCA 2006 het 1818 hom 54 17 7 33 N/A 0 0 226682 CASAVA_Build 4 190440007 2I GAATATATAT --/AG GTTTATTGTA 2233 het 2233 ref 53 41 6 6 AG 0 1 226683 CASAVA_Build 4 190447103 6D ACTCCTTCTT AGAAAA/------ AGACTCCATC 3070 hom 147 het 50 0 49 5 AGAAAA 1 0 226684 CASAVA_Build 4 190448588 5D CATGTTTCAC GTATT/----- GTATTCACGG 3070 hom 111 het 41 0 36 7 GTATT 2 1 226685 CASAVA_Build 4 190449106 12D CAAAAGCAAA ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 108 het 44 0 36 9 AC 15 9 226686 CASAVA_Build 4 190458228 1D ATTTATTCTT C/- CTTCATGGCA 3070 hom 99 het 35 0 33 3 C 2 1 226687 CASAVA_Build 4 190461162 4I ATCTGAGGTC ----/AACG AACGACAAGC 3070 hom 138 het 51 0 46 5 AACG 1 2 226688 CASAVA_Build 4 190462897 2I AGCATGCCTC --/GA GAGTCCCTCA 3070 hom 158 het 61 0 51 10 GA 1 2 226689 CASAVA_Build 4 190468590 1I ATCAGATAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 509 hom 36 2 26 8 T 9 10 226690 CASAVA_Build 4 190471152 3I GGGAAAAGTC ---/TTT TTAACTAACG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 5 226691 CASAVA_Build 4 190471481 5I GAGTGAGAGC -----/TCACT TCTTACCATG 3070 hom 148 het 52 0 50 2 TCACT 0 1 226692 CASAVA_Build 4 190472437 2D GCAGCCTGAG CT/-- CTGTACGTGA 2169 hom 29 het 15 0 9 7 CT 2 1 226693 CASAVA_Build 4 190476704 4I CTCTTCCCAG ----/TATC TATCTGGTAA 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 TATC 1 2 226694 CASAVA_Build 4 190477536 1I TGATGTGAAA -/C CGTTTGTTCA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 C 1 2 226695 CASAVA_Build 4 190478986 2I TTTCTTTTCT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 112 hom 26 2 20 4 TC 0 1 226696 CASAVA_Build 4 190480220 1I TGTGCAGCCT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 104 het 44 0 34 10 A 8 9 226697 CASAVA_Build 4 190484840 1I TCTCTAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1168 hom 43 5 25 13 T 11 12 226698 CASAVA_Build 4 190491304 3D TAAAAAAAAT AAC/--- AGATGCTGGT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AAC 1 0 226699 CASAVA_Build 4 190494012 1D TGCCTATTCC A/- ATGTAGTTGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 2 1 226700 CASAVA_Build 4 190494200 2D AAAATACTTT CA/-- GTTTTTTCCC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 CA 1 0 226701 CASAVA_Build 4 190495233 1I CAAAGGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 24 0 17 7 T 10 11 226702 CASAVA_Build 4 190500051 2I GAAAAGTAAC --/AT AAGAATAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 0 1 226703 CASAVA_Build 4 190501813 2I TCTTAGTCCT --/AA TAGTTGGAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 0 2 226704 CASAVA_Build 4 190503180 4I ATGAATTCTC ----/TTTG TTTGTGTCTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTTG 1 2 226705 CASAVA_Build 4 190506879 1D TCAGTATAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 11 0 10 3 T 10 9 226706 CASAVA_Build 4 190508680 4I TTTGGCTCTC ----/TGTT TGTCTGCTAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TGTT 0 1 226707 CASAVA_Build 4 190511121 2D CCATGCTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 14 12 226708 CASAVA_Build 4 190511583 1D TATTTCTGTA T/- TTTTTTTTTA 3046 hom 24 het 16 0 8 8 T 10 9 226709 CASAVA_Build 4 190512169 1I TTTCTGTTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 10 226710 CASAVA_Build 4 190517269 1I TTAAAAATAC -/A AAAATCTAGA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 4 5 226711 CASAVA_Build 4 190520778 2D ACACACACAG TC/-- TCACACACAC 3070 hom 187 het 69 0 62 8 TC 2 1 226712 CASAVA_Build 4 190524507 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 8 226713 CASAVA_Build 4 190525828 1I TGGAGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3053 het 682 hom 36 4 17 15 A 17 18 226714 CASAVA_Build 4 190529320 8D GGGTTAAAAT TTTTTGTA/-------- TTCTTTCTGC 3070 hom 90 het 33 0 28 5 TTTTTGTA 1 0 226715 CASAVA_Build 4 190529949 1D TTCACTCAGC A/- AATGAGAAAG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 3 2 226716 CASAVA_Build 4 190536103 1D TCAAAGTACT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 36 0 31 6 A 9 8 226717 CASAVA_Build 4 190537852 3I CTTAGTACTT ---/GAA GAACTTAATA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 GAA 1 2 226718 CASAVA_Build 4 190538949 2I CACCTGCAAG --/CA CACACACAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 CA 4 5 226719 CASAVA_Build 4 190540298 1I TGACTCAGAG -/T GAGATTAGGT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 0 1 226720 CASAVA_Build 4 190540724 1I TAAGCTTTCT -/G GGGCCCCGTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 3 4 226721 CASAVA_Build 4 190541621 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 15 4 A 17 14 226722 CASAVA_Build 4 190545205 33D TAGGACACTC TAAAATTTGTCAGTTCTAAAGCATTGTACAATA/--------------------------------- GTAGTCGTTA 3070 het 3070 ref 50 39 24 3 TAAAATTTGTCAGTTCTAAAGCATTGTACAATA 1 0 226723 CASAVA_Build 4 190545771 1D GGTCATCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 76 het 37 0 35 2 A 10 9 226724 CASAVA_Build 4 190548335 1I ATTACCAGCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 7 8 226725 CASAVA_Build 4 190550610 1I CACAACACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 20 0 16 4 T 11 12 226726 CASAVA_Build 4 190555280 1D CTCTCCACCT G/- TTTGTACTAC 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 G 1 0 226727 CASAVA_Build 4 190555456 1D CCCCACGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1066 hom 41 3 34 4 T 13 12 226728 CASAVA_Build 4 190565793 3D CACCAATTCA ATG/--- ATAAGTGTTT 3070 hom 163 het 59 0 55 6 ATG 1 0 226729 CASAVA_Build 4 190566903 1D TAATTACAGA G/- CACACAAATT 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 G 1 0 226730 CASAVA_Build 4 190577922 1D ATGTGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 11 10 226731 CASAVA_Build 4 190586889 2D TATGTAGAGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 2257 hom 25 6 11 8 T 11 9 226732 CASAVA_Build 4 190587477 1D CAAGCGGACA C/- AGGGTTCTCA 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 C 1 0 226733 CASAVA_Build 4 190587711 2I ACATGGGAAG --/AA AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 7 9 226734 CASAVA_Build 4 190637779 2I GAGTCAGAAA --/AG AGAGTCAGCG 3070 het 2449 hom 18 7 10 1 AG 2 3 226735 CASAVA_Build 4 190644308 1I AGTCAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 10 11 226736 CASAVA_Build 4 190652377 4I GCTGTTCTTC ----/CTCA CTCACAGCAG 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 CTCA 1 2 226737 CASAVA_Build 4 190659181 1I AACTGATAAA -/C CCCACGTTCA 643 het 643 ref 38 28 3 7 C 3 4 226738 CASAVA_Build 4 190659515 4D ATTACATATT ACTC/---- ACAAAGGCAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 ACTC 1 0 226739 CASAVA_Build 4 190663621 2D39M2D ACACACGCTT ACACACACACAGACACATATATAATCACACTCTCACACTGTCA/--ACACACACAGACACATATATAATCACACTCTCACACTGT-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 80 59 34 17 N/A 0 0 226740 CASAVA_Build 4 190665938 2I TGAAATATTT --/TA TGTTTTTTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TA 0 1 226741 CASAVA_Build 4 190685261 3I GTTTCATTGA ---/TCT TCTCTATTTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TCT 1 2 226742 CASAVA_Build 4 190691724 1D CATCTAGGTT G/- TTTTCTGATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 1 0 226743 CASAVA_Build 4 190694740 1D GTATAAATGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 45 het 24 0 12 12 G 10 9 226744 CASAVA_Build 4 190696829 1I GGTGGCTTTG -/C CTTCGGTGAC 3070 hom 108 het 42 0 34 8 C 1 2 226745 CASAVA_Build 4 190699402 1D ACAGAATGAG A/- AAAAAACTAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 7 6 226746 CASAVA_Build 4 190710652 1D76M2I AGCTGGGTGG CCAGGTGTTTTCACACAAAAAGGCCTTCCCTGCTCGGGCCATGGGATAAGCCTTTGAGTGGAGACCTAGGAAGGAGC--/-CAGGTGTTTTCACACACAAAGGCCTTCCTTGCTCGGGCCATGGGATAAGCCTTTGAGTGGAGACCTAGCAAGGAGCTT TGAAGTCTGC 3070 het 3070 hom 103 61 79 49 N/A 0 0 226747 CASAVA_Build 4 190711979 27D CACCTGTCCA CGAGTCTGGCCGCAGCGCACCTGTCCC/--------------------------- CGAGTCCGGC 3070 het 2579 hom 78 15 59 20 CGAGTCTGGCCGCAGCGCACCTGTCCC 1 0 226748 CASAVA_Build 4 190714767 1D CAAATTGCTC A/- ATTAAAATAA 2480 het 2480 ref 99 81 7 15 A 2 1 226749 CASAVA_Build 4 190720265 5D61M2I CTGTGAGGTA TTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGTACTTGAAATTGGGTTTTACTTTCTACAGTTTTTAA--/-----TTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGTACTTGAAATTGGGTTTTACTTTCTACAGTTTTTAATT ATTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 98 64 31 64 N/A 0 0 226750 CASAVA_Build 4 190720491 1D TTTTTAGCTG C/- TTTTTAAGGT 3070 het 3070 hom 98 24 66 10 C 1 0 226751 CASAVA_Build 4 190723878 8D TTTCACCAAA TCATGAGG/-------- TCCAGGAAAT 3070 het 3070 hom 100 33 64 11 TCATGAGG 1 0 226752 CASAVA_Build 4 190728183 1I CCTGCTATCA -/T TTTTGTTTAT 3070 het 3070 hom 100 30 49 21 T 4 5 226753 CASAVA_Build 4 190736068 7D AGCTTGGTAC CTGCATG/------- TTGGAAGTAC 3070 het 3070 ref 98 56 33 15 CTGCATG 1 0 226754 CASAVA_Build 4 190736936 8I19M1I GTCTATACTT --------ATAAATAAATATATATATA-/ATAAATAAATAAATAAATATATATATAT TTACATAAAT 3070 het 573 hom 42 6 23 22 N/A 0 0 226755 CASAVA_Build 4 190737287 1I33M1I TCATTTCCAA -TTTTCTCCATTACAAATAGGACCACCATGAGCA-/TTTTTCTCCATTACAAATAGCACCACCATGAGCAC CCTTACATGA 3070 het 3070 ref 102 56 44 41 N/A 0 0 226756 CASAVA_Build 4 190740455 11D TGGGATCAGA TTTTTTTAATT/----------- TATTTATTCA 3070 het 3070 ref 93 31 24 43 TTTTTTTAATT 1 0 226757 CASAVA_Build 4 190747090 2D TTACAGAGTC AA/-- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 93 27 25 44 A 10 8 226758 CASAVA_Build 4 190750404 1D TTAAGAAATT A/- GTCATCTAAA 3070 het 3070 hom 65 22 37 6 A 1 0 226759 CASAVA_Build 4 190760422 2I AGAAGAAAAA --/AG AATTGAGGAC 3070 het 3070 hom 104 31 67 6 AG 0 1 226760 CASAVA_Build 4 190760628 1D AAATTTCCAA T/- CAGCTTTGTA 3070 het 3070 hom 102 29 64 9 T 1 0 226761 CASAVA_Build 4 190763708 3D41M1D GGCATACTCT TTATTTCATTTCTCAGATTTTTAATCAGAATTCTAAAGTATAATT/---ATTTCATTTCTCAGATTTTTAATCAGAATTCTAAAGTATAA- TTTTTCTGAA 3070 het 3070 hom 74 37 42 36 N/A 0 0 226762 CASAVA_Build 4 190765134 5D CTGGTCCCCA CCTCC/----- CCCCCCCAGC 3070 het 3070 hom 71 22 16 35 CCTCC 1 0 226763 CASAVA_Build 4 190765361 1D CTTGGCATCT G/- GGGCCTTGCT 3070 het 3070 ref 86 62 15 9 G 4 3 226764 CASAVA_Build 4 190770427 9I42M3D TTTCTTCCTC ---------TCTGCTCTCTTTCCTGTTTCTCTATCTCCTCCTTTCTTCTTCTTT/TCTTCCTTTTCTTCTCTCTTTCCTGTTTCTCTATCTCCTTCTTTCTTCTTC--- TTCTCCCATG 3070 het 3070 hom 104 38 65 29 N/A 0 0 226765 CASAVA_Build 4 190770737 1I CAGGACAGAA -/G GGCCCAGGAC 3070 het 3070 ref 75 35 34 7 G 2 3 226766 CASAVA_Build 4 190771578 3I AATTCCGTCA ---/TCC TCTTCCTTCA 3070 het 3070 hom 102 39 51 13 TCC 0 1 226767 CASAVA_Build 4 190772222 2I AGGCTATTTA --/TC TCTATATATT 1522 het 1522 ref 45 26 6 13 TC 1 2 226768 CASAVA_Build 4 190776481 1D TGACTTTATT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 123 het 101 0 39 63 A 8 7 226769 CASAVA_Build 4 190776495 3I AAAACTACTC ---/CTT AAACTCTAAG 1519 het 801 hom 84 3 5 77 CTT 0 1 226770 CASAVA_Build 4 190780352 1D CATGAATGCA T/- TTTCTCTAAC 3070 het 3070 ref 99 43 44 13 T 4 3 226771 CASAVA_Build 4 190781288 6I TCCTCTCCCC ------/CTCACA CTCCCTCTCC 3070 het 3070 hom 66 20 34 12 CTCACA 0 1 226772 CASAVA_Build 4 190782949 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCTCCCC 1411 het 1411 ref 15 7 4 4 C 6 5 226773 CASAVA_Build 4 190783306 2D GTTTAATGAC TT/-- AATGCAAATA 3070 het 3070 ref 89 69 10 12 T 2 0 226774 CASAVA_Build 4 190783376 2D ATATTTGTTT TA/-- TAACATTTTA 3070 het 3070 hom 81 29 40 14 TA 2 1 226775 CASAVA_Build 4 190786873 2D TTTGCTAGTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 99 40 20 39 TG 1 0 226776 CASAVA_Build 4 190786918 35D TCGCCCAGGT TGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTACAAC/----------------------------------- CTCTGTCTCC 1405 het 1405 ref 77 73 6 40 TGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTACAAC 1 0 226777 CASAVA_Build 4 190787624 2I CGAGTCACAT --/AA AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 70 21 28 21 A 7 9 226778 CASAVA_Build 4 190787992 8D AAAGAAAGAC AAAGAAAG/-------- AAAGAGAGAG 154 het 154 ref 34 17 6 15 AAAG 3 1 226779 CASAVA_Build 4 190788061 1D GAAAAAAAAG A/- GAAAGATCGC 3070 het 3070 hom 66 23 33 12 A 1 0 226780 CASAVA_Build 4 190788606 1I AAAATGACAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 93 29 57 7 A 7 8 226781 CASAVA_Build 4 190788722 3D TCCCCCCGCC AAA/--- AAAAAAAACT 780 het 467 hom 80 6 8 71 A 11 8 226782 CASAVA_Build 4 190790365 5D ACTCCATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 64 16 42 28 A 15 10 226783 CASAVA_Build 4 190798922 4D ATCAATATAA ATAC/---- ATATGTGTAT 3070 het 3070 hom 100 40 56 11 ATAC 1 0 226784 CASAVA_Build 4 190799796 1D AAAATATATA T/- ATAATTGTTA 1099 het 1099 ref 32 22 5 6 T 1 0 226785 CASAVA_Build 4 190800750 1I GAGAGCTCCC -/T TTTCAGTTTT 3070 het 3070 hom 94 21 66 7 T 3 4 226786 CASAVA_Build 4 190805354 3I TACATTTAGT ---/ACA ACATGTGTGG 3070 het 3070 hom 56 24 26 6 ACA 1 2 226787 CASAVA_Build 4 190807826 1D ACGAGAAAAC A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 93 20 58 16 A 7 6 226788 CASAVA_Build 4 190808934 1D CAGACTTCCA C/- AAAAATGTTT 3070 het 3070 ref 103 82 15 8 C 1 0 226789 CASAVA_Build 4 190814977 4I22M1I TCTCTCTAGT ----GAGAGAGAGAGGGTTTCCCAAA-/GAGAGAGAGAGAGAGAGTTTCCCAAAG GGAAGACCAG 3070 het 589 hom 84 3 69 48 N/A 0 0 226790 CASAVA_Build 4 190818863 1I GCACTGTGCA -/G GGGGCACACA 3070 het 3070 hom 92 33 52 7 G 4 5 226791 CASAVA_Build 4 190819420 1I GTATCCTTAA -/G GCTTTGAGGC 3070 het 3070 hom 84 29 47 8 G 1 2 226792 CASAVA_Build 4 190821513 3D TGTCTCAAAA AAT/--- AAACAAATAA 3070 het 3070 hom 52 24 27 4 AAT 1 0 226793 CASAVA_Build 4 190823188 18D AGTGCGGGAG TGCGGGGGCCTGCCAAGC/------------------ CCACGCCCAC 3070 het 3070 hom 37 15 21 7 TGCGGGGGCCTGCCAAGC 1 0 226794 CASAVA_Build 4 190823431 1I15M2I50M1I CGCTAGGGCT -CCAGCACATTGTCAC--CTCATGTTTAACACAAATTTTCCTATATGCTCTAAGGCTACAGTTTTGTC-/GCCAGCACATTGTCACCTCTCATCTTTAATACAAATTTTGCTATATGCTCTAAGGCTACAATTTTGTCT TGTTACTCTG 3070 het 3070 ref 49 48 26 27 N/A 0 0 226795 CASAVA_Build 4 190831451 2D AATAAGAACA CT/-- GTTTAGTGGT 3070 het 3070 ref 73 33 19 23 CT 1 0 226796 CASAVA_Build 4 190836330 4I TTAAGACATA ----/CTGT CTTTGTCCAT 3070 het 3070 hom 100 33 57 19 CTGT 0 1 226797 CASAVA_Build 4 190836515 1D CACATGGCAA G/- GGGGCCGAGA 3070 het 3070 hom 76 31 42 6 G 5 4 226798 CASAVA_Build 4 190837294 1D CCCACATCCT A/- CTCATTGGCT 3070 het 3070 ref 58 43 9 7 A 1 0 226799 CASAVA_Build 4 190837949 2D ATACAAATAC TT/-- TTTTGTCTTA 3070 het 3070 ref 89 69 11 12 T 6 4 226800 CASAVA_Build 4 190841434 2I80M1D TACCTTCACT --CACAGAGTTTCCTAGGGCTGCAGGAACAAAGCGCCATAAGCTCGGTGGCTCAAAACATTTGGAAATGGTTCTCTCACAGAG/CACACAGAGTTTCCTAGGGCTGCAGGAACAAAGCGCCATAAGCTCGGTGGCTCAAAACATTCGGAAATGGTTCTCTCACAGA- TCACAGCCAC 3070 het 3070 ref 91 119 58 12 N/A 0 0 226801 CASAVA_Build 4 190841981 1I AACACTGCCC -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 69 20 39 10 T 6 7 226802 CASAVA_Build 4 190842424 2D ATGTCCAAAC TT/-- ATCAAATTGT 3070 het 3070 hom 100 34 53 13 T 2 0 226803 CASAVA_Build 4 190843064 5I ATGTTAATTA -----/GTTAT GTTATGTAAC 3070 het 3070 hom 79 29 42 10 GTTAT 1 2 226804 CASAVA_Build 4 190843540 3I GGAAACACAG ---/TCC TACTATCTGT 3070 het 3070 ref 99 50 14 35 TCC 0 1 226805 CASAVA_Build 4 190844997 4D ACTTAGTCCT TCTA/---- TCTGTTACTA 3070 het 3070 ref 57 40 13 5 TCTA 1 0 226806 CASAVA_Build 4 190847244 6I AAGGAAACAC ------/ACAGTT AGACCTTCTA 854 het 854 ref 53 36 4 13 ACAGTT 0 1 226807 CASAVA_Build 4 190851574 1I TTCTGGAATA -/G ATCCTACTGA 3070 hom 210 het 80 0 70 14 G 0 1 226808 CASAVA_Build 4 190851769 10I CAGATGAGAC ----------/CACCAGATGA CTCCTTGTTC 3070 het 3070 hom 103 27 34 42 CACCAGATGA 0 1 226809 CASAVA_Build 4 190857203 3I CGGCCAGTAA ---/TAT TTTTACTCTG 3070 het 3070 hom 79 27 47 14 TAT 0 1 226810 CASAVA_Build 4 190859688 3D AGGTGAACCT AGA/--- AGAAGTAGAG 3070 het 3070 ref 103 63 35 8 AGA 2 1 226811 CASAVA_Build 4 190859877 1D GTATGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 98 19 10 69 A 11 10 226812 CASAVA_Build 4 190865038 1D AAAAAGAAAA G/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 80 23 44 14 G 1 0 226813 CASAVA_Build 4 190866670 8I AAATACAAAA --------/ATACAAAC TAAAAGTTAC 3070 het 3070 hom 94 34 51 9 ATACAAAC 0 1 226814 CASAVA_Build 4 190866898 11I TGTTCAACAC -----------/CAAAAGCATGT CAGCGAGAAG 3070 het 3070 hom 93 17 46 30 CAAAAGCATGT 0 1 226815 CASAVA_Build 4 190867989 1I43M2I ACATGGACTT -AATGCATGGTTGTTCTTCCAAGAGGGTAAGGAAACCCCCGGGG--/AAATGCCTAGTTGTGCTTCCAGGAGGATAAGGAAACCCCCGGGGGA AAATGGCAAA 3070 het 3070 ref 74 46 26 40 N/A 0 0 226816 CASAVA_Build 4 190868191 1D AAGACAAGGC T/- TTTAGGTCAC 3070 het 3070 hom 94 27 54 25 T 4 3 226817 CASAVA_Build 4 190868945 1D TGAGGCCAAG A/- GTTCAAGGCC 3070 het 3070 hom 101 35 55 39 A 1 0 226818 CASAVA_Build 4 190871726 2D ATAAGGACTC TG/-- TCTTCTGTTA 3070 het 3070 hom 99 32 61 8 TG 1 0 226819 CASAVA_Build 4 190872781 4D ACATGCACAC AAAT/---- ACACACACAC 42 het 42 ref 100 83 5 16 AAAT 1 0 226820 CASAVA_Build 4 190877692 1D ATACAAAATT A/- GGTGTCTAAA 3070 het 3070 hom 99 35 50 14 A 1 0 226821 CASAVA_Build 4 190878543 2I ATATTATGAA --/AT ATAAATCTAA 3070 het 3070 hom 103 19 76 8 AT 1 2 226822 CASAVA_Build 4 190881331 1D AGTAAATTTC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 99 16 52 32 A 9 8 226823 CASAVA_Build 4 190882107 1I TTAGCCAGGC -/G TGGTGGCAGG 3070 het 3070 hom 36 14 18 7 G 0 1 226824 CASAVA_Build 4 190885485 6I ACACTATATA ------/TATATG TATATCACAC 3070 het 3070 hom 66 28 35 3 TATATG 0 1 226825 CASAVA_Build 4 190891422 5D CTCCCGCAGA CATTT/----- CTTCAGAAGC 3070 het 3070 hom 80 18 29 36 CATTT 1 0 226826 CASAVA_Build 4 190898320 2I TTTTTTTTTT --/AA ATAAAGATGA 3070 het 3070 ref 85 27 19 39 A 1 3 226827 CASAVA_Build 4 190899123 1I CACCAGCTGC -/T ACTCCACACC 3070 het 3070 ref 56 20 22 14 T 0 1 226828 CASAVA_Build 4 190899871 12D TCTGTTCCAA GAACCAGTGTAG/------------ GGACATACTA 3070 het 3070 ref 70 42 26 6 GAACCAGTGTAG 1 0 226829 CASAVA_Build 4 190900898 1D TCCTGGCTGG A/- GGCCAACCAA 3070 het 3070 hom 94 33 47 14 A 1 0 226830 CASAVA_Build 4 190901830 1D CTGAAAAAAA G/- AGACAAAGAA 3070 het 3070 ref 104 82 9 14 G 1 0 226831 CASAVA_Build 4 190904297 1I GGAGATGTTA -/C AACTAATACC 3070 het 3070 hom 99 29 57 13 C 0 1 226832 CASAVA_Build 4 190905398 1D ATATACCCAA C/- CAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 98 29 59 17 C 2 1 226833 CASAVA_Build 4 190909525 1D CTATGTATAA T/- TTTCAGATTA 3070 het 3070 ref 59 32 22 5 T 4 3 226834 CASAVA_Build 4 190910304 4D CAATAAATTA TACT/---- TACTTATAAA 3070 het 3070 hom 94 24 60 16 TACT 2 1 226835 CASAVA_Build 4 190910935 1I TAGTAAAGAC -/T TTTTAAATGG 3070 het 3070 hom 77 31 36 11 T 4 5 226836 CASAVA_Build 4 190911647 1I CTCTGCCTAG -/T TTTTCAGAAG 3070 het 3070 ref 80 38 35 9 T 4 5 226837 CASAVA_Build 4 190913586 2I56M1I GAGGAGGCTT --CACACCCCCATGTAGAGACATGATTGGGCTCCTATAATTAACTAACTTCTCTCCTC-/CACACACCCCCATGTAGAGACATGATTGGTCTCCTATAATTAACTAACTTCTTTCCTCT TCATATGTCT 3070 het 3070 hom 98 45 106 17 N/A 0 0 226838 CASAVA_Build 4 190928696 2D TGTTTCAGGA CT/-- CTTCTAGGAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CT 2 1 226839 CASAVA_Build 4 190936506 1D GAACCTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 33 0 25 8 A 13 12 226840 CASAVA_Build 4 190941663 3D AATTGAAAAT TTC/--- TTGAAAAGTA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TTC 1 0 226841 CASAVA_Build 4 190945605 2D AAACACACAC AT/-- GCTCGCACGT 3070 hom 142 het 53 0 44 12 AT 1 0 226842 CASAVA_Build 4 190946803 1D AAAGGCGGGG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 91 het 33 0 29 6 T 9 8 226843 CASAVA_Build 4 190955569 1D AAATTACCTT G/- GGCAGTATGG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 3 2 226844 CASAVA_Build 4 190957439 5I AAAAATAAAT -----/AAATA AAATAAAATT 1570 hom 10 het 4 0 4 0 AAATA 1 2 226845 CASAVA_Build 4 190957565 1I GGTGTCAGAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 19 0 14 5 A 8 9 226846 CASAVA_Build 4 190962741 15I TCTGATATTG ---------------/GAAACATGTCTAAAA GCCTAAAAGC 3070 hom 98 het 33 0 31 5 GAAACATGTCTAAAA 0 1 226847 CASAVA_Build 4 190966311 4I CACACACACA ----/TACG AGCGCATGCG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TACG 0 1 226848 CASAVA_Build 4 190966700 1D GAAAAAAAAA T/- ATCAACTCAG 3070 hom 75 het 28 0 26 4 T 1 0 226849 CASAVA_Build 4 190967284 4D GAAAGGGACA ATTT/---- ATTTAGGGAA 3070 hom 120 het 46 0 40 7 ATTT 2 1 226850 CASAVA_Build 4 190968388 1I GTAAGCTCAG -/A GGAGGGTAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 0 1 226851 CASAVA_Build 4 190972949 1I GTGCTTTTTT -/A TAAAAAAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 226852 CASAVA_Build 4 190973800 1D ATTTCATGCA T/- TTTTAATGCA 3070 hom 117 het 45 0 40 10 T 5 4 226853 CASAVA_Build 4 190974227 3I GATCTAATAA ---/TGT TGTTGGCATA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TGT 1 2 226854 CASAVA_Build 4 190981620 2D TGCCTATATT TA/-- TATATATATA 936 het 936 ref 38 29 3 7 TA 6 5 226855 CASAVA_Build 4 190986695 1D CTTTGCAGCA G/- GGGTCACACC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 G 4 3 226856 CASAVA_Build 4 190989511 1I GTGGTTATTG -/C CTGTCAGACA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 2 226857 CASAVA_Build 4 191001113 1D AAATTGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 30 0 19 12 T 12 11 226858 CASAVA_Build 4 191018056 3I TAGCTAAGAA ---/AAT AATGACTTAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AAT 1 2 226859 CASAVA_Build 4 191021601 1I TTGATGTGTA -/T TTTGAAATAA 3070 hom 83 het 32 0 27 5 T 3 4 226860 CASAVA_Build 4 191024391 2D TTGAAATAAC AA/-- AGAGATAATT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 3 1 226861 CASAVA_Build 4 191026951 2D GCATTTACAC AT/-- GTTCTTATGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 1 0 226862 CASAVA_Build 4 191027436 2D ATCTTACTCA CC/-- CTTGTAGTCG 3070 het 1305 hom 51 6 33 16 C 3 1 226863 CASAVA_Build 4 191034849 1I AGCTTACAGC -/G TGGAGGGGCG 3070 het 3070 ref 95 34 24 41 G 0 1 226864 CASAVA_Build 4 191035268 2D GTTTGGGAGA CT/-- CACAGCTTTC 3070 het 3070 ref 99 78 11 11 CT 1 0 226865 CASAVA_Build 4 191035372 1I CTTTTTGAAC -/A GGAGGAGAAA 3070 het 3070 hom 83 23 48 15 A 0 1 226866 CASAVA_Build 4 191035527 6D TTCAATAAAT AATAAG/------ AATATTTTCT 656 het 656 ref 44 29 3 21 AATAAG 1 0 226867 CASAVA_Build 4 191035561 1D TTTTGATAAC G/- TGTTGTTTTA 3070 het 3070 ref 71 24 27 21 G 1 0 226868 CASAVA_Build 4 191037139 1I GGAGGGGGGA -/G GGATAGCATT 3048 hom 18 het 7 0 7 0 G 2 3 226869 CASAVA_Build 4 191040207 3I AGCTGTACAC ---/CAG CAAGACTGAC 3070 het 3070 ref 75 31 40 4 CAG 0 1 226870 CASAVA_Build 4 191040653 1I GGGCAACCAT -/G GGCAGAATGT 3070 het 3070 ref 64 34 16 15 G 2 3 226871 CASAVA_Build 4 191042395 1D CAAATAATAA T/- TTTAGAGAGC 3070 het 3070 hom 103 30 55 20 T 4 3 226872 CASAVA_Build 4 191042985 1I TGTCAGTGCA -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 78 30 37 13 T 6 7 226873 CASAVA_Build 4 191043082 1D GCAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 43 0 27 17 A 13 12 226874 CASAVA_Build 4 191043175 1I TCATCCCTCT -/C TACAACATGG 3070 het 3070 ref 101 46 48 8 C 0 1 226875 CASAVA_Build 4 191043523 2D AAAATTAATT AA/-- AAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 58 22 9 27 A 8 6 226876 CASAVA_Build 4 191044374 2I6M2I CATAGAAAAC --ATATAG--/TTATATAGAT AAGGTCTCAC 2078 het 2078 ref 36 27 5 9 N/A 0 0 226877 CASAVA_Build 4 191045560 2D TTAATTGACT CA/-- CAGTTTGGCA 3070 het 3070 ref 92 76 12 4 CA 2 1 226878 CASAVA_Build 4 191046092 1D GAGAAATTGG C/- CCAAAATGAA 3070 het 3070 ref 82 39 30 16 C 3 2 226879 CASAVA_Build 4 191046241 5D1M4I CTTGGGCAAC AGGGGT----/-----TCCAC GCCTGTTGAT 3070 hom 99 het 35 0 31 7 N/A 0 0 226880 CASAVA_Build 4 191047405 1I ATACCCAAGC -/T TGGGTAATTT 3070 het 3070 ref 51 21 20 10 T 1 2 226881 CASAVA_Build 4 191048196 3I TGAATATCAC ---/AGA AGAAGTGAAA 3070 het 3070 hom 69 28 36 10 AGA 1 2 226882 CASAVA_Build 4 191049196 3I ATCAAATTAT ---/AGA AGAATTTCAA 3070 het 3070 hom 90 32 53 5 AGA 1 2 226883 CASAVA_Build 4 191052285 1I CCCATCTATT -/A AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 25 8 5 12 A 11 12 226884 CASAVA_Build 4 191052933 21D16M1D TGGGTGTGCA GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/---------------------ATGTGTGTGTGTGTGT- TTTTAATGTC 2529 het 2529 ref 31 29 7 14 N/A 0 0 226885 CASAVA_Build 4 191053071 1D AAATAAAACC T/- ATCGAAGAGT 3070 het 3070 ref 82 62 9 13 T 1 0 226886 CASAVA_Build 4 191053441 2I CCAACACTTT --/TA GTTTGCTTGT 3070 het 3070 ref 66 34 22 11 TA 0 1 226887 CASAVA_Build 4 191053539 1I CAACAAAATA -/T TTTACAAGTA 3070 het 3070 hom 66 12 49 5 T 3 4 226888 CASAVA_Build 4 191053829 2I AACAACAACA --/AC AAAAAACACC 3070 het 3070 ref 99 31 32 36 AC 0 1 226889 CASAVA_Build 4 191055359 2D1M3I23M1D11M3I60M2D TGTGTAGGCA CGG---GCGTCCAATCTTTTGGCTTCCCTGGGCTGCACTGG---AAGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATATACTAACATTAACAATAGCTGATGAGCTAA/--GTCTGTGTCCAATCTTTTGGCTTCCCT-GGCTGCATTCGAATAAGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATATACTAACATTAACAATAGAGGATGAGCT-- AAAAAAAAAC 2036 het 2036 ref 82 56 8 99 N/A 0 0 226890 CASAVA_Build 4 191055880 3D GGAAGGGAGA AGG/--- AGAAGGAAGG 3070 het 3070 ref 43 27 8 8 AGG 1 0 226891 CASAVA_Build 4 191056643 1D CTTCAGAGCT G/- TGAGAAGATA 3070 het 3070 ref 104 64 30 11 G 1 0 226892 CASAVA_Build 4 191056906 1D AGATAGAAGA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 59 35 12 12 T 7 6 226893 CASAVA_Build 4 191057180 2D GATACAGTCA CT/-- CTGTGAATTC 1607 het 1607 ref 67 57 4 6 CT 2 1 226894 CASAVA_Build 4 191062021 1I GGCTTGCTTT -/C TAAATTCTTT 3070 het 3070 hom 81 26 41 14 C 0 1 226895 CASAVA_Build 4 191062154 1D122M1D GCTGATTTCA TTTTTCCATCATCTATAAAGCACATAAGGTAATTTCTAAACCAGCAGTAAAATCTATTTATAAAGAATGCTGATTTGTTTTCTGCACTTTCCAACACAGAGCTTCAATTTATTTCCTTACCATA/-TTTTCCATCATCTATAAAGCACATAAGGTAATTTCTAAACCAGCAGTAAAATCTATTTATAAAGAGTGCTGATTTGTTTTCTGCACTTTCCAACACAGAGCTTCAATTTATTTCCTTACCAT- AAAAAACCAT 3070 het 3070 ref 83 85 33 104 N/A 0 0 226896 CASAVA_Build 4 191062416 3I44M9I AGTATGCTGA ---CTGATTTCACTGTGCTTCAAAGCAGACGATTTCACAGTCATTCG---------/TTGATGATTTCACTGTGCTTCAAAGCAGATGATTTCACAGTCATTGGATATATAAT GTAATGAGTT 3070 het 3070 hom 66 18 56 27 N/A 0 0 226897 CASAVA_Build 4 191062820 14I13M1D GGCCGGGTGC --------------TTAATCCCAGCACT/AGTGGTTCAGGTCTGTAATCCCAGCAC- TTTGGGAGAC 3070 het 3070 ref 58 31 25 9 N/A 0 0 226898 CASAVA_Build 4 191062922 1D TTACCAAAAA T/- TTGAAAAATT 3070 het 3070 hom 100 47 37 19 T 3 2 226899 CASAVA_Build 4 191063255 15I AGCATAATGA ---------------/AACCCCCATTTCTAC AATAATAATA 2938 het 2938 ref 36 22 8 11 AACCCCCATTTCTAC 0 1 226900 CASAVA_Build 4 191063553 1I ATTTGGGTGG -/A AAAAATAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 5 6 226901 CASAVA_Build 4 191063989 1D AAAGGAGAAC G/- AAGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 74 25 41 16 G 1 0 226902 CASAVA_Build 4 191064329 1I TCAATCATTT -/C CCCATGTCCC 3070 het 3070 ref 84 52 17 17 C 3 4 226903 CASAVA_Build 4 191064508 1I41M4D TTTGATATTT -TATACTTTTTGAAATGATCACCACAATCAAGCAAATTAGCATATT/CTATACTTTTTGAAATGATCACCACAATCAAGCAAATTAGAA---- TATTATCTCT 3070 het 3070 ref 65 57 18 22 N/A 0 0 226904 CASAVA_Build 4 191064576 2I TATTTACCAT --/TG TGTGTGTGTT 998 het 998 ref 69 30 4 35 TG 4 5 226905 CASAVA_Build 4 191065285 5D GCTAATTTTA AATTT/----- TTTCAGAGAT 3070 het 3070 ref 77 33 19 26 AATTT 1 0 226906 CASAVA_Build 4 191065770 1D ATATGGTTTA C/- AAACTTTTTC 3070 het 3070 ref 97 61 9 28 C 1 0 226907 CASAVA_Build 4 191066911 16D AAGACTGACT GTATTATTTCTAACCA/---------------- ATTATTTCTA 3070 het 3070 ref 46 34 9 17 GTATTATTTCTAACCA 1 0 226908 CASAVA_Build 4 191067634 1D CTTTGTTGGG A/- AATTTTTTAT 3070 het 3070 ref 78 52 21 5 A 3 2 226909 CASAVA_Build 4 191068952 1D91M1D ATTTAAAGTC ATTGTTGATAGGTAAGGAGTAACTTGCATTTTGTTAATTGTTTTTCATATGTTTTGCAGTTCTTTTTTTTTTCCTCTCTTGCTGTCTTCTTAT/-TTGTTGATAGGTAAGGAGTAACTTGAATTTTGTTAATTGTTTTTCATATGTTTTGCAGTTCTTTTTTTTCCCCTCTCTTGCTGTCTTCTTA- GTTTGGTTAT 3070 het 3070 ref 96 121 12 58 N/A 0 0 226910 CASAVA_Build 4 191069357 1I GTATTTCAAG -/T TATTTCATCT 265 het 265 ref 50 38 1 11 T 1 2 226911 CASAVA_Build 4 191071174 4D TGACAATAAC AAAT/---- AAATTCTAGA 3070 het 3070 ref 53 36 15 6 AAAT 2 1 226912 CASAVA_Build 4 191072335 2D TGGAGATGGT AA/-- AAAAAGTACA 3070 het 3070 hom 101 43 54 5 A 7 5 226913 CASAVA_Build 4 191072402 1D AATCTGTAAA T/- TAAAATATTT 3070 het 3070 ref 58 39 11 9 T 2 1 226914 CASAVA_Build 4 191073179 1D ACAGAAGAAA T/- TGTTCTAAAA 3070 het 3070 hom 64 23 39 2 T 2 1 226915 CASAVA_Build 4 191074367 1I CCCTCCCAGG -/T TGCCTTGCAA 3070 het 3070 hom 85 35 37 13 T 1 2 226916 CASAVA_Build 4 191076208 1D ACAGGACTAA C/- AAAGGAAATT 3070 het 3070 hom 72 28 36 9 C 1 0 226917 CASAVA_Build 4 191077639 1D21M10I TCAGACTAGG TTCTGGCCTCTCTCCCCTGTTG----------/-TCTGGACTCTCTCCAGTATTGCAATAGCTTT AATAATATCT 3070 het 3070 hom 87 32 53 8 N/A 0 0 226918 CASAVA_Build 4 191078863 1I GACTTGTTCT -/C CCCCCACAGC 3070 het 3070 hom 83 30 47 6 C 5 6 226919 CASAVA_Build 4 191080721 1D ACAATGGAAA T/- CAAAAGAATG 3070 het 3070 ref 64 38 12 18 T 1 0 226920 CASAVA_Build 4 191082342 5I AACAGCAAAT -----/AAAAG AAAACTCCAG 3070 hom 117 het 42 0 40 8 AAAAG 0 1 226921 CASAVA_Build 4 191083978 1I24M1D CAAATAAGAC -ATAAAAATCACCAACAGGTATATGA/AAAAAAAATCACCAACAGGTATACG- AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 81 49 16 25 N/A 0 0 226922 CASAVA_Build 4 191090676 1D ACTTGGCCAT A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 hom 73 35 36 4 A 7 6 226923 CASAVA_Build 4 191090989 5I TTGAAGAGAT -----/AGAAG AGAAGGTGAA 3070 het 3070 hom 103 30 39 35 AGAAG 1 2 226924 CASAVA_Build 4 191091338 1I TAGAAAATGA -/T TTCTCCAGGT 3070 het 3070 hom 102 36 57 13 T 2 3 226925 CASAVA_Build 4 191091458 2I GTGTCTTCAA --/TG GAAATCTCAG 3070 het 3070 ref 63 40 18 5 TG 0 1 226926 CASAVA_Build 4 191092260 2D CACGGATTCA AT/-- GAGTGGAGTT 3070 het 3070 ref 82 47 22 13 AT 1 0 226927 CASAVA_Build 4 191093396 1D ATTTTGGGGG T/- GGTTCTTATT 3070 het 3070 ref 86 46 34 6 T 1 0 226928 CASAVA_Build 4 191094066 4D GACTGGAATA AAAC/---- AAAATTAATC 1777 het 1777 ref 95 76 9 13 AAAC 1 0 226929 CASAVA_Build 4 191094354 1D CACTCTCAAA T/- TTTTTTAATT 2823 het 2823 ref 65 22 10 34 T 7 6 226930 CASAVA_Build 4 191094402 4D42M2I TTATTTATTC ATTAATTAATTTATTTTGAAAATAATTTTAACTTGTATTTTACATT--/----ATTTATTTATTTTGAAAATAATTTTAACTTGTATTTTACATTTA CAGGGGTACA 2511 het 2511 ref 83 144 7 47 N/A 0 0 226931 CASAVA_Build 4 191095515 1D AATCTCTTTT C/- CTTATAAATT 1616 het 1616 ref 73 63 5 7 C 2 1 226932 CASAVA_Build 4 191095570 3D GAATGGCCTA ATC/--- ATACTGTGTA 3070 het 3070 ref 64 52 8 4 ATC 1 0 226933 CASAVA_Build 4 191096559 1D CATCTTTAAC T/- GTAAATATGA 3070 het 3070 ref 89 60 19 11 T 1 0 226934 CASAVA_Build 4 191097000 3D GTGTTTGTTC CCT/--- CCTCCTCTAC 331 het 331 ref 102 76 4 28 CCT 3 2 226935 CASAVA_Build 4 191097056 4I AAACCATCAA ----/CACC TGGGAAGAGC 3070 het 3070 ref 60 35 15 10 CACC 0 1 226936 CASAVA_Build 4 191097508 1D7M6I GCTTTGATTT CTATAATT------/-TATAATTTTACTC TAACTCTGTT 3070 het 3070 ref 50 32 11 20 N/A 0 0 226937 CASAVA_Build 4 191097831 2I ACGAGGAAAC --/TG AGATTTTCAT 3070 het 3070 ref 86 39 32 15 TG 0 1 226938 CASAVA_Build 4 191098546 2D TAACACGGGC TA/-- CCATAACTCT 3070 het 3070 ref 90 53 26 13 TA 1 0 226939 CASAVA_Build 4 191099788 2I ATCAAATATC --/TT TGAACCTCCG 1702 het 1702 ref 39 28 4 8 T 1 3 226940 CASAVA_Build 4 191099820 1I TACTTTCAGA -/C CGTTTTTTAT 692 het 692 ref 39 25 3 11 C 1 2 226941 CASAVA_Build 4 191099936 1I CTTTTTAGGA -/G AAAAATACCT 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 G 0 1 226942 CASAVA_Build 4 191099993 7I TTTGCCCGAG -------/GTTGACT GTACATACAA 3070 het 3070 hom 63 24 34 7 GTTGACT 0 1 226943 CASAVA_Build 4 191101017 5D AGCCTTAAGA GTTAG/----- GTTAAGTTAC 181 het 181 ref 95 34 3 59 GTTAG 1 0 226944 CASAVA_Build 4 191101863 1D TACAACATCA G/- GGTAGCCTGT 967 het 967 ref 43 38 3 2 G 3 2 226945 CASAVA_Build 4 191102009 4I ATGGTAACTT ----/AAAA AATATATAAA 3070 het 3070 ref 67 31 27 10 A 2 6 226946 CASAVA_Build 4 191102763 1D CAAGATTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 11 10 226947 CASAVA_Build 4 191103566 14D62M1I CAAAATGAGG ACATTCCTTTTAAAACTTTGTTTCTTGGGAGTTTTTATCATAACGATGTTTAATGCTGTCAGATGCCTCTTTCTGT-/--------------ACTTTGTTTCTTGGGAGTTTTTATCATAACGATGTTTAATGCTGTCCAGTGCCTCTTTCTGTA ATCTGTTGAG 1697 het 1697 ref 90 87 4 60 N/A 0 0 226948 CASAVA_Build 4 191104082 1I GGAAAATTAA -/G AATTTTTTAA 3070 het 3070 ref 60 41 9 10 G 0 1 226949 CASAVA_Build 4 191105474 5I TGAAGCCGTC -----/ATAAG ATGTGTACAC 3070 het 3070 ref 41 25 9 7 ATAAG 0 1 226950 CASAVA_Build 4 191105544 1I CATTTTAACC -/T TTATTTCTGT 3070 het 3070 ref 64 30 29 5 T 2 3 226951 CASAVA_Build 4 191106334 2D GAAGGGAAAG AA/-- AAAAAACCTT 2945 het 2945 ref 96 27 9 63 A 8 6 226952 CASAVA_Build 4 191107366 1I CTTCAGTGCC -/G CGTGTTCATA 3070 het 3070 ref 94 40 40 22 G 0 1 226953 CASAVA_Build 4 191107624 1I GACAATATTA -/T AAGTAACGTT 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 T 0 1 226954 CASAVA_Build 4 191107931 1D ATCTAAATTG C/- TTATTAGTTT 3070 het 3070 hom 57 24 30 3 C 1 0 226955 CASAVA_Build 4 191108142 1D GTTTCCGTTT C/- TCCACATCCT 3070 het 3070 ref 83 66 11 6 C 1 0 226956 CASAVA_Build 4 191108221 1D TGATAATAGC T/- ATTCTAATGG 3070 het 3070 ref 59 26 19 15 T 1 0 226957 CASAVA_Build 4 191108508 1D ATGCACAAAA G/- TTTTTAATTC 3070 het 3070 ref 68 42 18 14 G 1 0 226958 CASAVA_Build 4 191108599 1I GCCAAATTCA -/T TGTCGTGAAG 3070 het 3070 hom 84 26 57 1 T 1 2 226959 CASAVA_Build 4 191110249 1D TTATAATAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 44 22 10 12 A 8 7 226960 CASAVA_Build 4 191110563 1D GACTCTTCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 96 48 21 27 T 9 8 226961 CASAVA_Build 4 191111142 1D AATAGCCACA T/- TTTTTAAAAC 3070 het 3070 ref 91 69 12 11 T 6 5 226962 CASAVA_Build 4 191111365 2D TTAAGCCCAC AG/-- GGTAATTTTG 2783 het 2783 ref 41 27 9 19 AG 1 0 226963 CASAVA_Build 4 191111474 4I AAAAAAAATA ----/TGTG AGTTAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 14 16 17 TG 0 2 226964 CASAVA_Build 4 191111613 1I CAGGAAGACT -/A AAAAAAAGGA 1436 het 1436 ref 79 66 4 9 A 7 8 226965 CASAVA_Build 4 191111899 5D GTAAGGTAAA AGATT/----- AGAAATCATA 3070 het 3070 ref 79 31 31 19 AGATT 1 0 226966 CASAVA_Build 4 191112309 1I TAGGATACTG -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 46 31 8 7 T 6 7 226967 CASAVA_Build 4 191112549 2D ATTTATAATA AG/-- AGAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 AG 2 1 226968 CASAVA_Build 4 191113354 1D AGAAAGTCTG T/- TAACAGTCAA 3070 het 3070 ref 54 33 20 2 T 2 1 226969 CASAVA_Build 4 191113401 1D AGGATGCAAT A/- GTGTAATACA 1376 het 1376 ref 87 69 4 14 A 1 0 226970 CASAVA_Build 4 191113605 3I TTCCTAAGTA ---/TCT TCTTTGTAGC 3070 het 3070 hom 99 25 66 13 TCT 1 2 226971 CASAVA_Build 4 191114253 4I CCCAGCACAC ----/ACAT ATGTATAACT 3070 het 3070 hom 91 31 48 17 ACAT 0 1 226972 CASAVA_Build 4 191114520 1D TCATAAGGCC T/- TAGATGATGA 3070 het 3070 ref 50 33 9 8 T 2 1 226973 CASAVA_Build 4 191115002 4I TCTTTAAAGT ----/TTTG TTTAATAGAA 3070 het 3070 ref 69 34 25 12 TTTG 0 1 226974 CASAVA_Build 4 191116255 7I ATGTAGAAAG -------/TTTTCTC TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 86 28 15 43 TTTTCTC 1 2 226975 CASAVA_Build 4 191116664 1D TAAAACATGA T/- TTTTATTTTA 1521 het 1521 ref 77 61 6 12 T 5 4 226976 CASAVA_Build 4 191116931 1I TAAGGCTTAA -/T TTTTTTAGAC 3070 het 3070 ref 93 67 9 17 T 6 7 226977 CASAVA_Build 4 191118600 4D CAAAATTAAA TTAG/---- TTAATGATCG 3070 het 3070 hom 96 20 62 25 TTAG 1 0 226978 CASAVA_Build 4 191118686 1I TCTGACACAA -/G TGCTGTGGAG 3070 het 3070 hom 60 24 33 3 G 0 1 226979 CASAVA_Build 4 191118760 4I24M4D TAGCCAGAAC ----CTTTTTCTGAATATAGTTGCTCAGTTAA/CTGTCTTTTTCTGAATATAGTTGCTCAG---- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 102 33 22 65 N/A 0 0 226980 CASAVA_Build 4 191120021 1D AGTAAAGAAG A/- CAGTAAAATT 1263 het 1263 ref 88 69 3 16 A 1 0 226981 CASAVA_Build 4 191120087 4D GACAGGTAGC TATT/---- TATTTACTTA 3070 het 3070 ref 68 39 16 15 TATT 2 1 226982 CASAVA_Build 4 191120169 1D ATTACTGTAG T/- TTTTCACATT 3070 het 3070 hom 76 31 41 8 T 5 4 226983 CASAVA_Build 4 191120342 3I TAAATTTATC ---/ATT ATCTTTTTAT 3070 het 3070 ref 45 24 9 12 ATT 0 1 226984 CASAVA_Build 4 191120371 4I AACCAGAGTT ----/AGAA AGAAGCAGTT 939 het 939 ref 42 25 3 14 AGAA 1 2 226985 CASAVA_Build 4 191120604 4I ATAGAAAAAC ----/AGGT AGAGACGTTT 3070 het 3070 hom 81 30 45 6 AGGT 0 1 226986 CASAVA_Build 4 191121134 5I GTGTTGTGGT -----/AATAC AATAACCAAA 3070 het 3070 hom 103 29 68 6 AATAC 0 1 226987 CASAVA_Build 4 191121220 3I TAGATTAATT ---/TTC TTATTTTTCT 3070 het 3070 hom 56 10 42 4 TTC 0 1 226988 CASAVA_Build 4 191121312 1I TCTTTCTGTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 66 34 9 24 T 7 8 226989 CASAVA_Build 4 191128970 1I CTGAGGAACA -/C CGCCTTCAAG 3070 het 3070 ref 74 52 8 15 C 1 2 226990 CASAVA_Build 4 191129035 1I CTGCCTGCTG -/A CTGGCTTTCC 3070 het 3070 ref 75 53 19 4 A 0 1 226991 CASAVA_Build 4 191129354 1I TCTAAATATT -/G TAATTTGGCC 3070 het 3070 ref 81 42 18 23 G 0 1 226992 CASAVA_Build 4 191131436 2D ACTGTTCTAT AG/-- AGCTGAAAGG 3070 het 3070 hom 71 22 34 15 AG 2 1 226993 CASAVA_Build 4 191132055 13D13M3D ATTTGGCTAC AGAAAAAAAAAGATGACACTAATAATAAA/-------------TGACATTAATAAT--- AATAAATAAT 3070 het 3070 ref 77 37 40 16 N/A 0 0 226994 CASAVA_Build 4 191133642 5I8M1D8M3I CCACAAATAA -----GAAGTTTCAAAAAGTAA---/GAATGGAAGTTTC-AAAAGTAAGTT GTTTAAAAGA 2418 het 2418 ref 50 28 6 18 N/A 0 0 226995 CASAVA_Build 4 191134116 1I GCAAAATTTT -/A AAAAATGATA 1577 het 1577 ref 39 26 5 8 A 5 6 226996 CASAVA_Build 4 191134856 1D17M2D ATAAAGAAGG AAAAAAGCCTCATGTGATCA/-AAAAACTCTCATGTGAT-- CATTTTAATC 3070 het 3070 ref 89 34 27 47 N/A 0 0 226997 CASAVA_Build 4 191135111 6I AGTTAAAACA ------/ATAAGG TGAGTAAAAG 3070 het 3070 hom 76 28 38 17 ATAAGG 0 1 226998 CASAVA_Build 4 191135680 12D15M4I TGGTTTCAAA CTTACTGCAATGCTTCAGTACCCAAAA----/------------CTTCAGTACCCAAAATAAT CTTGTACCAG 3070 het 3070 ref 81 58 54 10 N/A 0 0 226999 CASAVA_Build 4 191136201 1D GGCCAGGCTT A/- GATGTTTACA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 1 0 227000 CASAVA_Build 4 191138643 2D GCTGTACCAC TA/-- TGAGAGGGAG 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 TA 1 0 227001 CASAVA_Build 4 191143241 1I GTGTCCTTGC -/T GTGGTCCCTT 2356 het 2356 ref 32 15 10 7 T 0 1 227002 CASAVA_Build 4 191143482 5I TCCACATGTT -----/AACTC AACAGGACTT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 AACTC 0 1 227003 CASAVA_Build 4 191143583 5I GAGTCTTCTT -----/TAGAG TAGGATTAGC 3070 het 3070 hom 92 18 67 8 TAGAG 0 1 227004 CASAVA_Build 4 191143896 1I20M3I GGTTCCTTAA -TTTTGGACAGGTTTAACTGG---/TTTTTGGACAGGTTTACCTGGAGA AGGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 63 34 11 24 N/A 0 0 227005 CASAVA_Build 4 191144268 3I GGCCTTGGCT ---/GTG GCAGCTACAA 3070 het 3070 hom 85 13 48 24 GTG 0 1 227006 CASAVA_Build 4 191144406 1I AAAAGCCCTT -/G GGGGTCAGGA 3070 het 3070 hom 100 30 60 11 G 4 5 227007 CASAVA_Build 4 191144505 1I TAAATCCTTT -/G CCAACTGCAG 3070 het 3070 ref 55 26 17 13 G 0 1 227008 CASAVA_Build 4 191145168 1I CCAAAGTGCT -/G GGATTACAGC 3070 het 3070 ref 61 30 22 10 G 2 3 227009 CASAVA_Build 4 191146137 16D CGTATATCTG CAACTTCCCAGGAAAC/---------------- TTACCAACTT 1083 het 1083 ref 69 43 4 38 CAACTTCCCAGGAAAC 1 0 227010 CASAVA_Build 4 191146176 2D AGTATTATTA TT/-- TGAGTCTTCT 3070 het 3070 ref 54 26 24 19 T 3 1 227011 CASAVA_Build 4 191147376 1I GTGAGGGCCA -/G GGGTTAACGG 3070 het 3070 hom 103 37 52 14 G 3 4 227012 CASAVA_Build 4 191147842 2D AGATTCTAGT TC/-- TCTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 96 73 16 7 TC 2 1 227013 CASAVA_Build 4 191147978 3I CTTTTTTTTT ---/TTA TAATTATACT 3070 het 2086 hom 17 7 8 2 TTA 0 1 227014 CASAVA_Build 4 191150688 1I CCAGATCGTA -/C AACAAGGTTA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 0 1 227015 CASAVA_Build 4 191151285 1D ATTAAGCTGC A/- AAAAAAGGAG 3070 het 3070 hom 69 22 40 9 A 7 6 227016 CASAVA_Build 4 191151330 7D AGGCTGTAAC TTGTATA/------- TTGTAATGTA 1669 het 1669 ref 96 59 4 38 TTGTATA 1 0 227017 CASAVA_Build 4 191151702 1D AGACATCTCT C/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 91 27 26 40 C 1 0 227018 CASAVA_Build 4 191152558 1D TTATCCTTAC A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 102 43 39 21 A 8 7 227019 CASAVA_Build 4 191156212 1I TTTGATTTTT -/G TATGTGGCAA 3070 het 3070 hom 92 32 52 8 G 0 1 227020 CASAVA_Build 4 191156720 4I GTAGCTGGGA ----/TTAC AGGCACCCGC 242 het 242 ref 28 22 2 6 TTAC 0 1 227021 CASAVA_Build 4 191157220 2D CTTCTAATAG TT/-- TTTTTGGTGG 3070 het 3070 ref 61 29 16 19 T 7 5 227022 CASAVA_Build 4 191157610 1D ATAAGATTTT G/- GTGGGAACAC 1420 het 1420 ref 94 41 4 49 G 2 1 227023 CASAVA_Build 4 191157643 1I TATCATTTTG -/C CCCTGGCCAT 3070 het 3070 hom 96 33 50 13 C 3 4 227024 CASAVA_Build 4 191158413 1D AAGCTACCAA G/- GCTTATGGCT 3070 het 3070 hom 93 30 54 10 G 2 1 227025 CASAVA_Build 4 191159049 1I TTCTAATTTT -/C ATCTGAGACC 3070 het 3070 ref 62 37 19 7 C 0 1 227026 CASAVA_Build 4 191159161 3D TTTTCTGTCT TCC/--- TCTGAATCCT 3070 het 3070 hom 71 28 40 5 TCC 1 0 227027 CASAVA_Build 4 191165052 1D GAAATCTTTG C/- CTAAGCCAAT 1209 het 1209 ref 33 30 3 0 C 2 1 227028 CASAVA_Build 4 191166758 4D AGCACGTAAA TGTT/---- TGTTGCAGCA 2212 het 2212 ref 56 41 5 13 TGTT 2 1 227029 CASAVA_Build 4 191168923 1D TGTGTTTTAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3009 hom 29 8 13 8 T 9 8 227030 CASAVA_Build 4 191170229 1D ACAGTGGACT G/- GGGTGGGGAG 2626 het 2626 ref 56 42 8 6 G 4 3 227031 CASAVA_Build 4 191170605 1I GCCATACCCA -/G GTACTACATC 3070 het 3070 ref 77 38 30 9 G 1 2 227032 CASAVA_Build 4 191171874 5I8M4D CATAGCTGTA -----TTAAAAAAAAAC/TTTTTTTAAAAAA---- TGAAAGAAAT 1352 het 1352 ref 54 41 3 14 N/A 0 0 227033 CASAVA_Build 4 191172058 15D25M4D ATCAAGCAGA AGAAATAGTGAGCTTGAAGACAGGCTATTTGAAAATACGTAGTC/---------------GAAGACAGGCTCTTTGAAAATACAT---- AGAAGAGACA 3070 het 3070 ref 72 72 9 22 N/A 0 0 227034 CASAVA_Build 4 191172601 4I ACTTTTCCAG ----/ACAA ACAAAAGCTG 3070 het 3070 hom 99 31 49 19 ACAA 1 2 227035 CASAVA_Build 4 191172843 3I AGTAATAGCT ---/ACA ACAACATTTC 3070 het 3070 hom 87 18 58 12 ACA 2 3 227036 CASAVA_Build 4 191174169 1D CCTGCTCAAA G/- GGGGCCTGTC 2184 het 2184 ref 85 47 10 29 G 5 4 227037 CASAVA_Build 4 191178323 1I AGCCTGTTTG -/A AAACTGGAAA 3070 het 3070 hom 89 21 38 30 A 3 4 227038 CASAVA_Build 4 191178438 3D TTCGGGGGGC GGG/--- GGCAGAGACT 990 het 990 ref 64 23 3 40 G 5 2 227039 CASAVA_Build 4 191179177 3D AGCCACGGAA AGG/--- AGAACTGGCC 1628 het 1628 ref 63 35 8 24 AGG 1 0 227040 CASAVA_Build 4 191179253 1D TGAAGAACGC T/- GGGGAAAAAG 2556 het 2556 ref 64 46 9 13 T 1 0 227041 CASAVA_Build 4 191181253 1I CCGTGATAGT -/C TCACACACGC 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 C 0 1 227042 CASAVA_Build 4 191182150 1I TGTGTTAACA -/T TTTTTTAGCA 2353 het 2353 ref 17 10 5 2 T 6 7 227043 CASAVA_Build 4 191191567 1D TAATTGTCCT A/- AAAAACCCTA 3070 het 3070 ref 89 67 14 12 A 6 5 227044 CASAVA_Build 4 191192245 1D AGCACCCAAC T/- CCCCAGGGTG 3070 het 3070 hom 63 26 34 5 T 1 0 227045 CASAVA_Build 4 191193034 1D14M10D AAGAAAGAAA GGAAGAAAGAAAGAAAGACAGACAG/-GAAGAAACTTAGAA---------- ACTTGAGAGG 1113 het 1113 ref 40 34 5 15 N/A 0 0 227046 CASAVA_Build 4 191193654 2D AGAAAAAAAA CC/-- CACTAAAATT 2941 het 2941 ref 40 24 12 4 C 3 1 227047 CASAVA_Build 4 191194365 2D ATTAAAAAAA AG/-- AAAGACACTG 2677 het 2677 ref 74 54 9 14 AG 1 0 227048 CASAVA_Build 4 191194581 2I CTACAACCTC --/TA TGGAAAACAG 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 TA 0 1 227049 CASAVA_Build 4 191195622 5D TTTGATGAAT TAGAG/----- TAGTTAGTAC 3070 het 3070 ref 47 35 11 1 TAGAG 1 0 227050 CASAVA_Build 4 191195845 1I CATTAAAAAG -/T TTGGCTAATT 2508 het 2508 ref 53 40 7 6 T 2 3 227051 CASAVA_Build 4 191198290 6I CACAGTAATT ------/AAAAAC AAAATCACAA 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 AAAAAC 0 1 227052 CASAVA_Build 4 191199938 3D AAGTGTAGAC AAG/--- AGGGTCATCT 1330 het 1330 ref 27 24 3 0 AAG 1 0 227053 CASAVA_Build 4 191200378 1D CACAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 55 29 16 10 A 11 10 227054 CASAVA_Build 4 191202037 2D AGATAAAAAA TG/-- TGTTGAGACA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 TG 2 1 227055 CASAVA_Build 4 191203418 1D AAAGAGGGCT A/- GTAAAGTGAA 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 A 1 0 227056 CASAVA_Build 4 191203862 4I ATTTTCTTGA ----/CTAC CTATTCTGAT 2536 het 2536 ref 23 16 6 1 CTAC 0 1 227057 CASAVA_Build 4 191204060 1D AACCAGTGGG C/- AAGATGTTGG 1810 het 1810 ref 54 39 5 10 C 1 0 227058 CASAVA_Build 4 191204575 1D ATTTTGCATT A/- AAATGGTGAA 2133 het 2133 ref 68 52 5 11 A 4 3 227059 CASAVA_Build 4 191205459 1I AGAATCCTGC -/A AATGACAGAA 2678 het 2678 ref 79 65 6 10 A 2 3 227060 CASAVA_Build 4 191205606 1I CGTCCTAGCT -/A CCCCCAGCGG 3070 het 3070 hom 77 14 42 23 A 0 1 227061 CASAVA_Build 4 191205893 1I27M1I ACAAAACAAA -AATTTTGTAAACAGAAAACCTGACCAG-/CATTTTTGTAAACAGAAAACCTGACCAGA AAAATAAATT 3070 het 3070 ref 72 55 11 10 N/A 0 0 227062 CASAVA_Build 4 191207157 1I GCCCTTGTCA -/G CCCCTGCAGA 3070 het 3070 ref 60 48 9 3 G 0 1 227063 CASAVA_Build 4 191207264 1I TGCGGCACAA -/C TGACAGTGTC 3070 het 1116 hom 50 3 21 27 C 0 1 227064 CASAVA_Build 4 191208060 1D TTGCAGTGCT C/- GCAGCCCTGT 3070 hom 142 het 60 0 42 18 C 1 0 227065 CASAVA_Build 4 191209120 5I TCGGATTTTC -----/TGTTT TGTTTTTTTT 2914 het 2914 ref 87 41 10 36 TGTTT 1 2 227066 CASAVA_Build 4 191210080 1D GACCTACAGA T/- TCACAGGGCA 3070 hom 39 het 18 0 12 6 T 2 1 227067 CASAVA_Build 4 191212045 1I TATATATCTG -/T TTTGGTACCA 3070 hom 99 het 34 0 34 1 T 3 4 227068 CASAVA_Build 4 191212382 1D CCCATCCCTG A/- AGCCCCTCTC 3070 hom 102 het 48 0 34 14 A 2 1 227069 CASAVA_Build 4 191213059 5D TAGCTCACAC CTGTA/----- ATGTAAACAA 3045 het 3045 ref 48 40 7 5 CTGTA 1 0 227070 CASAVA_Build 4 191213753 1I AATAGTAACT -/A AACCCAATCC 3070 het 3070 ref 87 32 48 7 A 2 3 227071 CASAVA_Build 4 191214800 1D AAATGAAGAT G/- TGATGGTTTA 3070 het 1397 hom 13 3 9 1 G 1 0 227072 CASAVA_Build 4 191216517 1I AAGCAAGCCC -/A AGCAGCTCAG 3070 het 3070 hom 82 20 42 20 A 1 2 227073 CASAVA_Build 4 191218476 1D GAGATATCTC T/- TTTTGTTACT 3070 hom 102 het 50 0 34 16 T 5 4 227074 CASAVA_Build 4 191221820 1I TTTTTTCTAA -/T TTTTGAAATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 4 5 227075 CASAVA_Build 4 191222331 1D TCAGATATGC A/- AAAAATCTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 6 5 227076 CASAVA_Build 4 191251605 7I CACATAATTG -------/CTTGCTT CTTGCTTACC 1349 het 1349 ref 50 38 3 9 CTTGCTT 1 2 227077 CASAVA_Build 4 191255775 4D TAGATAGTAA ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 45 22 18 8 ATAG 3 2 227078 CASAVA_Build 4 191258444 1D GAAGGTGAGG C/- AAAAGCTTCC 3070 het 1330 hom 33 7 18 8 C 1 0 227079 CASAVA_Build 15 18260098 1D37M1D AGAGTGTTTC AAAACGTGCTCTCTCAAAACGAAAGTTCAACTCTGTGAG/-AAACGTGCTTTCTCAAAATGAAAGTTCAAGTCTGTGA- TTGAATGCAC 3070 het 3070 ref 63 69 8 2 N/A 0 0 227080 CASAVA_Build 15 18261148 1I CAAAAGAAAT -/G TTCAAATCTT 3070 het 3070 ref 41 24 12 6 G 0 1 227081 CASAVA_Build 15 18261348 1D GGCAAACATC A/- CAAAGAAGTT 3070 het 3070 ref 41 26 9 6 A 1 0 227082 CASAVA_Build 15 18266940 3I AAGGTTCAAC ---/TCT GTTAGATGAA 3070 het 3070 ref 51 33 11 7 TCT 0 1 227083 CASAVA_Build 15 18268080 1I TGTCCACTTG -/C AGATTCTACG 1857 het 1857 ref 42 26 6 10 C 0 1 227084 CASAVA_Build 15 18271956 1D ATATGACGAT A/- TTTCCTTTTC 1691 het 1691 ref 42 34 4 4 A 1 0 227085 CASAVA_Build 15 18274512 2I TTCTGTCTAG --/GT TTTTTGTGAA 3070 het 3070 ref 60 35 13 12 GT 0 1 227086 CASAVA_Build 15 18280573 3D CAGTATTCTT CTG/--- TCTAGTTTTT 3070 het 3070 ref 67 47 13 7 CTG 1 0 227087 CASAVA_Build 15 18280665 1I ACAGAGTTTC -/A AAAATGCTCA 3070 het 3070 ref 85 51 28 6 A 4 5 227088 CASAVA_Build 15 18286541 2I CAGATTCCAC --/AA AAAGAGTTTT 2519 het 2519 ref 47 37 6 4 A 3 5 227089 CASAVA_Build 15 18286895 1D AGAGTCTTTC A/- AAACTGCTCA 3070 het 3070 ref 50 31 16 3 A 4 3 227090 CASAVA_Build 15 18293187 2I CAGATTCTAC --/AA AAAGAGTGTT 1624 het 1624 ref 60 49 4 7 A 3 5 227091 CASAVA_Build 15 18295491 3D CAAAAAACCA AAC/--- AACATGTGTT 2767 het 2767 ref 36 25 6 5 AAC 2 1 227092 CASAVA_Build 15 18298625 1I TATGAAGATA -/T TTCCTTTTCC 3070 het 3070 ref 85 50 14 21 T 2 3 227093 CASAVA_Build 15 18298851 1D CAGAATCTAC A/- AAAAGAGTGT 1900 het 1900 ref 54 45 5 5 A 5 4 227094 CASAVA_Build 15 18299238 1D ATGTTCAACT C/- TCTGAGATGA 3070 het 3070 ref 64 54 7 5 C 1 0 227095 CASAVA_Build 15 18299498 4D CCACCATAGG CTTC/---- AAAGCCCTCC 3070 het 3070 ref 47 29 11 10 CTTC 1 0 227096 CASAVA_Build 15 18303104 1D TGTAGTTTTT A/- TGTGAAGATG 2467 het 2467 ref 56 34 6 16 A 1 0 227097 CASAVA_Build 15 18307593 1D AAAATTCCCA C/- AGCACTTTAG 3070 het 3070 ref 45 32 11 2 C 1 0 227098 CASAVA_Build 15 18307693 1I TCTTTCTTTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 46 32 11 3 T 8 9 227099 CASAVA_Build 15 18308118 3D CTAGAATGAA AAT/--- AAGTATATAT 3070 het 3070 ref 55 44 8 5 AAT 1 0 227100 CASAVA_Build 15 18308801 3D TGGTATTAAT CTA/--- CTACATCATT 3070 het 3070 ref 41 26 14 4 CTA 2 1 227101 CASAVA_Build 15 18309109 3I TTAGATTTTC ---/TTG TTGTTAAATT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TTG 1 2 227102 CASAVA_Build 15 18309267 1I TACAAGTCAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 T 8 9 227103 CASAVA_Build 15 18309604 4D TACATTATGA ACTG/---- ACTGTTAATT 2573 het 2573 ref 66 55 6 7 ACTG 2 1 227104 CASAVA_Build 15 18315179 1I CATTAATAAC -/A GAAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 A 0 1 227105 CASAVA_Build 15 18315235 9I CATAAATGGA ---------/TAAGACTTT TAAGACTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 TAAGACTTT 1 2 227106 CASAVA_Build 15 18318422 1D CTTAGAAAAG A/- AAGGTTAATG 3070 het 3070 hom 68 29 29 10 A 3 2 227107 CASAVA_Build 15 18320556 2I CAAAGAATTT --/AA TACAAAAGAC 3070 het 3070 ref 50 30 16 4 A 0 2 227108 CASAVA_Build 15 18321204 4I22M2D ATATTCCATT ----CTTACTCAAGAGAAATGAAAACAT/CTTACTTACTCAAGAGAAATGAAAAC-- GTGCATACAA 3070 het 3070 ref 51 44 9 12 N/A 0 0 227109 CASAVA_Build 15 18323187 4I TTTTCCTGTT ----/TGAC TGACTCAAGC 3070 het 3070 ref 59 47 9 3 TGAC 1 2 227110 CASAVA_Build 15 18324384 2I TTGGCAATGG --/TA TATAGAGTGC 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 TA 2 3 227111 CASAVA_Build 15 18327191 1D AAGGTGCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 68 25 23 22 A 11 10 227112 CASAVA_Build 15 18329596 1I AATATTGTCA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 61 36 11 14 T 6 7 227113 CASAVA_Build 15 18329644 1I AAACTTGTTC -/T TTTTTGTCTC 3070 het 3070 ref 58 36 11 11 T 5 6 227114 CASAVA_Build 15 18330036 1I ACGAGGTCTA -/G ATATCGAGAC 3070 het 3070 ref 43 29 8 6 G 0 1 227115 CASAVA_Build 15 18330243 1I ATTCCATCTC -/A AAAAATAAAA 2136 het 2136 ref 43 32 5 6 A 5 6 227116 CASAVA_Build 15 18330611 3I CGCTGCTGCA ---/CTT TTTTTTTTTT 3059 het 3059 ref 29 13 10 6 CTT 0 1 227117 CASAVA_Build 15 18336245 5D AGTGTTATTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 13 8 T 17 12 227118 CASAVA_Build 15 18337054 1I AGCTGAGTAG -/C AGGACTCTCT 3070 het 3070 ref 51 40 10 1 C 0 1 227119 CASAVA_Build 15 18338578 5I TATATAATAT -----/GATGC GATGTGTGTA 3070 het 3070 ref 53 33 15 5 GATGC 0 1 227120 CASAVA_Build 15 18341061 2D AAATATTACC CT/-- CTTACCAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 CT 2 1 227121 CASAVA_Build 15 18341462 3D AAGAAGAATT TTG/--- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 50 27 15 10 TTG 1 0 227122 CASAVA_Build 15 18343593 1D CAAGCCCAAG T/- TGAACGGAAT 3070 het 3070 ref 63 46 8 10 T 2 1 227123 CASAVA_Build 15 18344203 1I TTATGCTCTT -/A TATGGTGAGA 3070 het 3070 ref 58 30 24 4 A 0 1 227124 CASAVA_Build 15 18347151 1D TACTCAGGAC A/- AATATTATTC 3070 het 3070 ref 41 28 10 4 A 3 2 227125 CASAVA_Build 15 18348437 1D TTTGAGTGAC T/- TTTTTCTATT 3070 het 3070 ref 70 45 16 9 T 6 5 227126 CASAVA_Build 15 18348958 1D GATGACATAG A/- AATCCGTAAA 3070 het 3070 ref 35 23 12 2 A 3 2 227127 CASAVA_Build 15 18349918 1D TGAGTCTAAG A/- GAAGTAACTT 1332 het 1332 ref 36 30 3 5 A 1 0 227128 CASAVA_Build 15 18350958 1I30M4D AACATATAAA -TGTTTATTTGTTAAATAAAAAAATAATTTATTTT/GTGTTTATTTGTTAAATAAAAAAATAAATTA---- TTTGTTTGTT 2301 het 2301 ref 34 26 5 8 N/A 0 0 227129 CASAVA_Build 15 18351397 3I TGGAAGTGAA ---/TTG TTATACATAA 3070 het 3070 ref 45 31 12 2 TTG 0 1 227130 CASAVA_Build 15 18353573 1I ACACTTTCCC -/T TCCCTTGTCC 2007 het 2007 ref 28 19 6 3 T 1 2 227131 CASAVA_Build 15 18360294 1D82M12I ATCACCAGGG CGATTTAAGAGTATATTTGCACACACAGAAGAAGTCATGAGCTTGAAGATAAGATAATGGAAAATATTGACTCTGAGAAACAG------------/-GGTTTAAGAGTATATTTGCACACACAGAAGAAGTCATGAACTTGAAGATAAGAAAATGGAAAATACTGACTCTGAGAAACAGAAAGAATAACAA ATAAAAAATG 3070 het 3070 ref 67 80 7 4 N/A 0 0 227132 CASAVA_Build 15 18360696 3I CCCTTTAGTT ---/CTC TTTTGAGATT 2501 het 2501 ref 34 19 9 7 CTC 0 1 227133 CASAVA_Build 15 18362701 2D52M1I TTCTTGTGTG CAAAAAAAAAGACGTATTGAGATAAGACAAGTCTTTCCTTGCAAGGATACCTCT-/--TAAAAAAAGACGTATTGAGATAAGACAAGTCTTTCCTTGCAAGGATACCCCTA ATGCTCATAC 3070 het 3070 ref 72 53 13 28 N/A 0 0 227134 CASAVA_Build 15 18365579 1D ACCAAAAGAT C/- CCCCTGGAAA 3070 het 3070 ref 52 32 9 15 C 5 4 227135 CASAVA_Build 15 18367088 16D ATTCCTACTC ATTAGATGCTAGCTGG/---------------- AGAGCTCCTA 2022 het 2022 ref 85 57 10 31 ATTAGATGCTAGCTGG 1 0 227136 CASAVA_Build 15 18367384 4D AGAAAGAGAC GAGA/---- AACTGTTGGC 3070 het 3070 ref 40 22 11 8 GA 2 0 227137 CASAVA_Build 15 18368135 18D CAATGAAAGA TGAAATGATGAGATGAAG/------------------ TGAAATGATG 655 het 655 ref 95 66 2 36 TGAAATGATGAGATGAAG 1 0 227138 CASAVA_Build 15 18368511 5D AAGTGAAATG ATGAA/----- ATGAAATGAC 3070 het 3070 ref 86 43 16 32 ATGAA 2 1 227139 CASAVA_Build 15 18369607 2D GACATATAAC AT/-- ATTAAATATG 3070 het 3070 ref 55 31 12 16 AT 2 1 227140 CASAVA_Build 15 18370753 6I26M1I TTTGTGGTTA ------GATGTGATTGTTCTTAGAATTTAGAT-/AAACCTAATGTGATTGTTCTTAGAATTTAGATA AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 99 70 32 52 N/A 0 0 227141 CASAVA_Build 15 18371218 2D GCCTAATAAA CT/-- CAACCCCTTG 3070 het 3070 ref 61 43 10 9 CT 1 0 227142 CASAVA_Build 15 18373014 3D35M4I AGTCATCACA TCTTCTTAATAACTTAAAACTTTTATCACACTGGTTAG----/---TCTTAATAACTTAAAACTTTTATCACACTGGTTAGACTA ACTTATTTTA 3070 het 3070 ref 78 56 23 33 N/A 0 0 227143 CASAVA_Build 15 18374221 1I GTGCTCATTG -/A AAATATTTTT 2640 het 2640 ref 69 50 8 11 A 3 4 227144 CASAVA_Build 15 18374738 6D CTGTTTGTAC TCTTTT/------ TCTATTTTCC 1183 het 1183 ref 59 49 3 14 TCTTTT 1 0 227145 CASAVA_Build 15 18375061 1D AGTCATTTTT A/- TTTGCCATTT 3062 het 3062 ref 98 83 8 7 A 1 0 227146 CASAVA_Build 15 18375339 3D29M1I TATATTTTAC TTTTTTTTTTTGTGAACATATCACTGCTTCAA-/---TTTTTTGTGTGAACATACTAATGCTTCAAT CTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 85 34 26 32 N/A 0 0 227147 CASAVA_Build 15 18376205 2D AATTTTAATT AA/-- AGTCTGTGTA 1368 het 1368 ref 40 32 3 8 A 3 1 227148 CASAVA_Build 15 18376709 1I AATATATGTG -/A AAAAATCGTC 3070 het 3070 ref 85 64 15 6 A 5 6 227149 CASAVA_Build 15 18377033 4D AATGAACATA TTTG/---- TTTGGGTATT 3070 het 3070 ref 91 72 8 12 TTTG 2 1 227150 CASAVA_Build 15 18378487 1D TCGTTTGAGT G/- ATTATATAAA 3070 het 3070 hom 89 32 49 9 G 1 0 227151 CASAVA_Build 15 18378559 4I GAGGATTTAA ----/TTAC TTATTCATGT 3070 het 3070 hom 91 24 54 13 TTAC 0 1 227152 CASAVA_Build 15 18378755 2D94M4D ACATATACCC TATGTCTATTTTATGTATAAGCATATATGATTAAAAATATAGTTAAGAATTTTTAAACCTAGTATTATAAAGTAAAAATTAGTTAACTTCTGATGATTAT/--TGTCTATTTTATGTATAATCATATATGATTAAAAATATAGTTAAGAATTTTTAAACCTAGTATTATCAAGTAAAAATTAGTTAACTTCTGATGA---- TTGTTAATTA 3070 het 3070 ref 67 107 10 42 N/A 0 0 227153 CASAVA_Build 15 18380176 1D TGTTATTTTA T/- TTTTTGTCAT 3070 het 3070 hom 55 12 32 12 T 6 5 227154 CASAVA_Build 15 18380247 1D20M2I CAAAAGTGGT CCCATGAGATTATAATACATA--/-CCATGAGATTATAATACATATT TTTACATACT 3070 het 3070 ref 79 32 19 39 N/A 0 0 227155 CASAVA_Build 15 18382361 5D ATTAAGAAAA CACTT/----- CAATTTAAAA 2056 het 2056 ref 74 61 5 11 CACTT 1 0 227156 CASAVA_Build 15 18384120 3I GTAAAGACTT ---/GAG GAAGTTGAAT 3070 het 3070 hom 97 38 55 4 GAG 0 1 227157 CASAVA_Build 15 18386150 2D AGTGGTTAAC AG/-- GGTACATTTT 2829 het 2829 ref 20 9 7 5 AG 1 0 227158 CASAVA_Build 15 18386874 1I AAATTTATAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 90 41 15 34 A 7 8 227159 CASAVA_Build 15 18390423 5I AAAAACAAAG -----/AAAAA TATTTGTTTT 2427 het 2427 ref 37 16 8 13 A 0 5 227160 CASAVA_Build 15 18392802 4I TGTTATATGG ----/GATA GATATAGATT 3070 het 3070 ref 60 31 18 11 GATA 1 2 227161 CASAVA_Build 15 18398380 2D TCTTAATTTT TC/-- TTGAAATAAT 1410 het 1410 ref 37 18 3 16 TC 1 0 227162 CASAVA_Build 15 18401101 1D TTTTTAAGGT A/- AAAATCACAT 3070 het 3070 ref 49 32 10 7 A 5 4 227163 CASAVA_Build 15 18401129 2I AATTAATAAC --/TT AGCCATTTTA 1845 het 1845 ref 43 32 4 7 T 0 2 227164 CASAVA_Build 15 18401512 2I ATTCATGCAC --/AT GTTTATTTTT 1962 het 1962 ref 41 29 6 6 AT 0 1 227165 CASAVA_Build 15 18404697 1D AAACAACTCT C/- TTCATTATAC 2996 het 2996 ref 69 57 7 5 C 1 0 227166 CASAVA_Build 15 18405009 1D TATTCTAGAA G/- GATAAATTAT 2763 het 2763 ref 42 32 6 4 G 2 1 227167 CASAVA_Build 15 18407617 1I CACCACAGGA -/G GGATTTCACA 3070 het 3070 ref 62 33 22 7 G 2 3 227168 CASAVA_Build 15 18407834 1D ATGTGGTATT A/- GAGATGGTTA 1240 het 1240 ref 43 35 3 5 A 1 0 227169 CASAVA_Build 15 18410552 3I TGGTGGACAC ---/AGA AGAACAGACT 2879 het 2879 ref 58 46 7 5 AGA 1 2 227170 CASAVA_Build 15 18412522 4I TATACTTATC ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 60 46 8 6 ATCT 2 3 227171 CASAVA_Build 15 18417158 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 9 1 8 0 A 11 10 227172 CASAVA_Build 15 18425504 4I TTACAAACTA ----/ACTC ACAGAAACAC 3070 het 3070 ref 51 33 10 8 ACTC 0 1 227173 CASAVA_Build 15 18429334 9D TGGGAATGTT TGTATCAGC/--------- TTTATTGATA 2861 het 2861 ref 33 26 6 3 TGTATCAGC 1 0 227174 CASAVA_Build 15 18432880 2D ACCATAGTGA GG/-- GGGCAGGAGC 3070 het 3070 ref 76 42 20 15 G 5 3 227175 CASAVA_Build 15 18435045 1D TTCCTCCATC A/- TTCTACTCCC 1242 het 1242 ref 34 27 3 5 A 1 0 227176 CASAVA_Build 15 18437916 4I TGTTTCTATT ----/ACTC ACATTCCTCA 1725 het 1725 ref 47 37 4 6 ACTC 0 1 227177 CASAVA_Build 15 18440415 1I ATAAGAGTAT -/G GGGGGTGGGG 1566 het 1566 ref 31 26 4 1 G 5 6 227178 CASAVA_Build 15 18445288 1I GTCTAGAGGA -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 7 8 227179 CASAVA_Build 15 18451284 1I TAGACTGGGT -/A AAGAAAATGT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 2 3 227180 CASAVA_Build 15 18462825 2D TATATGCTTA TG/-- TGTCATCTGC 2883 het 2883 ref 20 12 6 2 TG 2 1 227181 CASAVA_Build 15 18467881 1I TTCATAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 22 9 9 A 9 10 227182 CASAVA_Build 15 18467944 5D TTATAAAAAA TAAAT/----- TCTAATTTGG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 TAAAT 1 0 227183 CASAVA_Build 15 18515129 1D CACAGGGAGC A/- GAAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 39 28 9 3 A 1 0 227184 CASAVA_Build 15 18551589 2I ATGCATGCGT --/GC GTGTGTGTGT 3070 het 2198 hom 28 13 12 3 GC 0 1 227185 CASAVA_Build 15 18579220 1I CACCCCAGGC -/A GGGGGGGGAC 3070 het 3070 ref 73 30 21 22 A 0 1 227186 CASAVA_Build 15 18582841 1D CCATGAAAAA G/- GATGAGTTCA 2102 het 2102 ref 38 22 5 11 G 2 1 227187 CASAVA_Build 15 18582942 1I ATGTTCTCAC -/T CATAAGAGGG 3070 het 3070 ref 75 57 9 9 T 0 1 227188 CASAVA_Build 15 18585819 4D AATCAACCAA CAAG/---- CAAGCAAGCA 3070 het 3070 ref 93 45 31 19 CAAG 4 3 227189 CASAVA_Build 15 18618807 1I GAGATTGGGA -/T TTTTGACATG 1164 het 1164 ref 58 49 3 6 T 4 5 227190 CASAVA_Build 15 18619873 3D GATGTGGAAT ATG/--- ATGAAGGAGA 1408 het 1408 ref 17 12 3 2 ATG 2 1 227191 CASAVA_Build 15 18635279 2I GGACAGCGGC --/AG AGAGTCCTAG 2002 het 2002 ref 19 13 5 1 AG 2 3 227192 CASAVA_Build 15 18642322 3D CCTGAAGATT TTC/--- TTCTTTTTTT 1062 het 1062 ref 22 18 4 0 TTC 2 1 227193 CASAVA_Build 15 18652360 7D AAGAAAGACT ACTTGCC/------- ACTGGCTTAT 2873 het 2873 ref 56 45 9 5 ACTTGCC 1 0 227194 CASAVA_Build 15 18654791 2D TATGCAAATA AC/-- ACAAAATAAA 3070 het 3070 ref 73 55 10 9 AC 2 1 227195 CASAVA_Build 15 18658289 1I GGTGCCTAGC -/A AATCTTCTAA 3070 het 3070 ref 87 63 15 9 A 2 3 227196 CASAVA_Build 15 18661032 1I TTTGATGGGG -/T TTTTTTTTTC 1803 het 1803 ref 40 30 4 6 T 9 10 227197 CASAVA_Build 15 18662433 1I AATCATGTGG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 47 36 9 2 T 7 8 227198 CASAVA_Build 15 18663027 1I CCCTTTATCA -/T TTTTTATTGC 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 T 5 6 227199 CASAVA_Build 15 18668563 1D ATCTTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 74 37 22 15 T 11 10 227200 CASAVA_Build 15 18669082 2D CCTCCCAGAC AG/-- GGCGGCAGCT 1453 het 1453 ref 22 8 7 7 AG 1 0 227201 CASAVA_Build 15 18673083 1I GGGCCCAGCA -/G CTGTCCCCTC 3070 het 3070 ref 52 33 9 10 G 0 1 227202 CASAVA_Build 15 18674227 3I CTGGCATATC ---/ATA AGTACTTGAT 3070 het 3070 ref 57 46 9 2 ATA 0 1 227203 CASAVA_Build 15 18675372 1I TTATTACATT -/A TTTCCATGGG 3070 het 3070 ref 66 40 21 5 A 0 1 227204 CASAVA_Build 15 18677456 1D TTTTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 62 28 24 10 T 11 10 227205 CASAVA_Build 15 18678335 1D ATATGATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 9 11 A 12 11 227206 CASAVA_Build 15 18680823 2D GATGTTCCAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 68 36 20 13 AT 6 5 227207 CASAVA_Build 15 18684232 5I GAGGTAGGTA -----/GATAT GATATTTTAT 3070 het 3070 ref 50 31 13 6 GATAT 1 2 227208 CASAVA_Build 15 18695303 1I CCTCTGTCTC -/A AAAAAAAGGG 2478 het 2478 ref 28 9 10 9 A 7 8 227209 CASAVA_Build 15 18698848 1D CTGTCACTAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 A 9 8 227210 CASAVA_Build 15 18699077 1I ACCACACCCA -/G GGTTTCACCA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 G 2 3 227211 CASAVA_Build 15 18703765 1D ACCATTAGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 62 47 9 8 T 10 9 227212 CASAVA_Build 15 18704313 1D AAAAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 1712 het 1712 ref 26 8 4 15 A 11 10 227213 CASAVA_Build 15 18708545 1I CCAGGGGGGG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 66 19 35 12 A 6 7 227214 CASAVA_Build 15 18709689 8D GGCTGATTCT ACACGAGA/-------- ACAAATAGCA 1269 het 1269 ref 66 63 3 4 ACACGAGA 1 0 227215 CASAVA_Build 15 18711953 1I GTGATATGGT -/C CTTTGTGAGC 3070 het 3070 hom 50 12 31 7 C 1 2 227216 CASAVA_Build 15 18714228 1I ACCCTCAAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 90 62 15 13 T 9 10 227217 CASAVA_Build 15 18714992 18D TGTCATGCCT GGCCTGCACCCCTCTGCA/------------------ GGCCTGCACC 3070 het 539 hom 45 5 12 35 GGCCTGCACCCCTCTGCA 2 1 227218 CASAVA_Build 15 18715660 1I TGGCCAGGCA -/C CCGTGGCTCA 3025 het 3025 ref 70 57 7 6 C 2 3 227219 CASAVA_Build 15 18715779 1I ACAAAAAAAA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 35 25 9 1 T 7 8 227220 CASAVA_Build 15 18718936 1I TTACTATAAT -/A AAAAAACTGG 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 A 6 7 227221 CASAVA_Build 15 18720590 2I TTCTTGAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2382 hom 38 7 23 8 A 10 12 227222 CASAVA_Build 15 18722808 3D ATTATTATTA TTT/--- TATTTATTTA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 4 1 227223 CASAVA_Build 15 18723279 1I ACCTGCCTAA -/T TTTTTTTTTT 1737 het 1737 ref 44 22 7 15 T 11 12 227224 CASAVA_Build 15 18736729 1D ATTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTG 1451 het 1451 ref 88 63 4 21 T 10 9 227225 CASAVA_Build 15 18737312 1D TCTTATTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 72 19 45 11 T 9 8 227226 CASAVA_Build 15 18737754 2D CTCCTCTGCT CC/-- CCTCAGCGGG 3070 het 3070 ref 72 42 16 14 C 4 2 227227 CASAVA_Build 15 18738416 28D CTGAGTTTTC CCATGAGGGAGGGAAATAACCTCATGCA/---------------------------- CCATGAGGGA 3070 hom 114 het 72 0 29 52 CCATGAGGGAGGGAAATAACCTCATGCA 2 1 227228 CASAVA_Build 15 18740908 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 86 17 42 27 A 11 12 227229 CASAVA_Build 15 18741417 1I TCTTCATTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 66 39 17 10 T 9 10 227230 CASAVA_Build 15 18741832 1D ACTCAACCCC A/- AACCTGATGG 3070 het 3070 ref 68 42 11 16 A 3 2 227231 CASAVA_Build 15 18743678 1D AAATCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 70 18 30 22 T 14 13 227232 CASAVA_Build 15 18744335 3D TTTGAAAAAT AAG/--- AACAGAGTTG 3070 het 3070 ref 37 16 13 10 AAG 1 0 227233 CASAVA_Build 15 18744904 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 386 hom 36 2 29 5 A 9 8 227234 CASAVA_Build 15 18745065 2D CCTGGGTGAC AG/-- AGCGAGACTC 2171 het 660 hom 28 3 10 17 AG 2 1 227235 CASAVA_Build 15 18750564 1D CAAAGGCATG T/- TTTACAACAG 3070 het 3070 ref 79 44 29 7 T 4 3 227236 CASAVA_Build 15 18751125 1I TGCTCTTCAT -/A AGGTGGGGTG 2505 het 2505 ref 69 41 9 19 A 1 2 227237 CASAVA_Build 15 18752162 4D TATATATATA TATG/---- TGTTTTGGAT 3070 het 303 hom 20 5 13 3 TATG 1 0 227238 CASAVA_Build 15 18753975 1I GCTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 1273 het 54 hom 17 1 4 12 T 17 18 227239 CASAVA_Build 15 18755056 1I CAGCCCCTGG -/C CCCCTGATTG 3070 hom 109 het 44 0 31 13 C 4 5 227240 CASAVA_Build 15 18755216 1D GGGAAGGTAG A/- GGGGGGCAAC 3070 het 3070 ref 64 36 20 8 A 1 0 227241 CASAVA_Build 15 18761215 4D TTTGGAACTT AAAC/---- AAGCTCCCAA 926 het 926 ref 86 74 3 12 AAAC 1 0 227242 CASAVA_Build 15 18769341 17D CTGACAGCCC TGGCCCTGGCCCTGTCT/----------------- TGGCCCTGGC 2240 het 2240 ref 42 19 8 36 TGGCCCTGGCCCTGTCT 1 0 227243 CASAVA_Build 15 18771173 1I TCTGGCACTT -/C CTGTCATGCC 3070 hom 39 het 14 0 13 1 C 1 2 227244 CASAVA_Build 15 18773911 5D AAATTGAAAG GAGAT/----- GAGATGAGAT 3070 het 3070 ref 84 50 22 13 GAGAT 3 2 227245 CASAVA_Build 15 18773933 20D GATGAAATGA GATGAAATGATGAGATGATG/-------------------- GATGAAATGA 3070 het 3070 ref 93 51 11 47 GATGAAATGATGAGATGATG 1 0 227246 CASAVA_Build 15 18774057 3I GAAATGAGAT ---/GAG GAGATGATAT 3070 het 3070 hom 94 19 66 9 GAG 1 2 227247 CASAVA_Build 15 18774660 3D ATGAGATGAA ATG/--- ATGAGATGAA 3070 het 3070 ref 94 47 31 17 ATG 2 1 227248 CASAVA_Build 15 18774724 5I GAAATGAAAT -----/AAATG AAATGATGAA 3070 hom 184 het 76 0 62 14 AAATG 1 2 227249 CASAVA_Build 15 18775053 5I AGATGAACTG -----/ATGAA ATGAAATGAA 3070 het 202 hom 59 2 25 32 ATGAA 2 3 227250 CASAVA_Build 15 18775632 1I AGATGAAATG -/A ATGAGATGAA 2865 het 2865 ref 47 12 6 29 A 1 2 227251 CASAVA_Build 15 18776427 4D AGTGCCAGAC AGTG/---- GGTGCAGGTC 1685 het 1685 ref 27 21 4 2 AGTG 1 0 227252 CASAVA_Build 15 18782447 3I GAGAAGAAAT ---/GAC GAGATGAAAT 3070 het 3070 hom 54 14 33 7 GAC 0 1 227253 CASAVA_Build 15 18782497 10D33M5I AGATGAAATG ATGAGATGAAATGAGATGAAAAATTATGAGATGAAAATATGAG-----/----------ATGAGATGAAAAATTATGAGATGAAAATATGAGATGAA ATGAAATGAG 3070 het 2305 hom 41 6 15 45 N/A 0 0 227254 CASAVA_Build 15 18783530 6I TTTCAATCTA ------/TAAACT TAAACTTGGA 2991 het 2991 ref 40 21 8 11 TAAACT 1 2 227255 CASAVA_Build 15 18784870 1I AAGAGCAATA -/T TCCAAGAAAA 3070 het 3070 ref 60 43 12 5 T 1 2 227256 CASAVA_Build 15 18787143 2D GAATTATCCC CT/-- GTTCATTGGG 3070 het 3070 ref 47 21 10 16 CT 1 0 227257 CASAVA_Build 15 18787384 3D TATCCATATT ATC/--- ACTACCAAGT 3070 het 3070 ref 76 59 14 4 ATC 1 0 227258 CASAVA_Build 15 18788378 2I AAGGTTAAAC --/AT GTAATATATA 2790 het 2328 hom 12 5 6 1 AT 0 1 227259 CASAVA_Build 15 18789944 1D GCCTTTTGAA C/- TTTGCAATTT 3070 het 3070 hom 60 21 33 7 C 1 0 227260 CASAVA_Build 15 18790139 1I CTTACATAGG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 36 8 18 10 T 6 7 227261 CASAVA_Build 15 18796386 1D AGTAATTTAA T/- TTTTGTTGCG 3070 het 3070 hom 62 19 39 4 T 5 4 227262 CASAVA_Build 15 18796513 1I TGGTGGCTTA -/T TTTCCTTTCT 3070 het 3070 hom 59 18 29 12 T 3 4 227263 CASAVA_Build 15 18798041 4I GAATGGATAT ----/TAAG TGTGTGGCAC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TAAG 0 1 227264 CASAVA_Build 15 18798277 8I TGGTTGGCTG --------/TTTGCTTA TTTGTTTGGT 3070 het 3070 ref 72 40 16 16 TTTGCTTA 0 1 227265 CASAVA_Build 15 18799783 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3059 hom 18 9 8 1 T 9 10 227266 CASAVA_Build 15 18800325 5I AAAGTTAGTT -----/TTTTC TTTTCTTTTT 3070 het 484 hom 56 8 7 41 TTTTC 1 2 227267 CASAVA_Build 15 18802180 5I TTAATGAATT -----/AACAC AAGAACAGAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 AACAC 0 1 227268 CASAVA_Build 15 18803985 4D CAAAATCTTT CTCA/---- CTCCTTCTGC 3070 het 3070 ref 55 31 10 15 CTCA 1 0 227269 CASAVA_Build 15 18805308 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 het 3070 ref 91 48 33 12 AG 2 1 227270 CASAVA_Build 15 18811104 12D GGGGAGAGAT GGAGCAGGAGCA/------------ GGAGCAGGAG 3070 het 722 hom 54 9 19 34 GGAGCA 4 2 227271 CASAVA_Build 15 18818503 1I GTCTCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 43 0 27 17 A 10 11 227272 CASAVA_Build 15 18818835 2D TTAATGTAAC TT/-- TTCAAATAAA 3070 het 3070 ref 63 48 14 1 T 4 2 227273 CASAVA_Build 15 18819123 2D TCACATTCCC CT/-- GATTGTTTGC 2853 het 2853 ref 51 29 9 14 CT 1 0 227274 CASAVA_Build 15 18819239 1D GCGCCGCCCC T/- GACCCCCACT 3070 het 3070 hom 56 25 23 9 T 1 0 227275 CASAVA_Build 15 18819735 5D AGAAATAATT ATGTC/----- ATGAGAGGTG 3070 het 3070 ref 97 76 14 11 ATGTC 1 0 227276 CASAVA_Build 15 18820400 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 136 het 52 0 44 10 A 9 8 227277 CASAVA_Build 15 18823422 10D CCTCCCAGAG CCTCTCCCTT/---------- CCTCTCCCTT 1820 het 1820 ref 41 23 5 19 CCTCTCCCTT 2 1 227278 CASAVA_Build 15 18824189 4I ATACGCGTGA ----/GGAG GGATTGCGGC 3070 hom 133 het 52 0 40 12 GGAG 0 1 227279 CASAVA_Build 15 18832856 2I AGCAGTTTCT --/GG TAATCTAGTG 3070 hom 205 het 81 0 76 5 G 0 2 227280 CASAVA_Build 15 18832977 4I AGATCACTGA ----/GGAC GGACCTTGAT 3070 het 3070 ref 84 69 9 6 GGAC 1 2 227281 CASAVA_Build 15 18833213 5D CCCCAGAACT TAAAA/----- TAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 70 55 12 8 TAAAA 2 1 227282 CASAVA_Build 15 18833636 2I TTTTATGTTT --/TA TATATATATA 1651 het 1651 ref 60 41 5 14 TA 6 7 227283 CASAVA_Build 15 18833875 2D AAAGAAAAAC TG/-- AAAGAAAAGT 3070 het 3070 ref 72 21 11 40 TG 1 0 227284 CASAVA_Build 15 18833889 1D AGAAAAGTGG A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 75 13 46 17 A 8 7 227285 CASAVA_Build 15 18834566 6D AAAAGGGCTA ATATAG/------ ATATAAACCC 2170 het 2170 ref 59 50 5 6 ATATAG 1 0 227286 CASAVA_Build 15 18835400 2I TAGCTTATGA --/CT CTGTAATTTA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CT 1 2 227287 CASAVA_Build 15 18835805 1I ATTTTTTAAT -/G GAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 78 63 12 3 G 1 2 227288 CASAVA_Build 15 18836351 1D TAGCCAAGTT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 160 het 61 0 54 7 A 9 8 227289 CASAVA_Build 15 18838002 3D GAGGTAATTG TCT/--- TCATCTCATG 3070 het 3070 ref 92 50 36 11 TCT 1 0 227290 CASAVA_Build 15 18838731 1D TGACAGAGCG A/- AAAAAAAAAA 2504 het 332 hom 37 6 12 19 A 17 16 227291 CASAVA_Build 15 18839197 6D AGCTGTAAAA AAACTT/------ AAACTCTCAA 3070 het 3070 ref 71 58 10 7 AAACTT 1 0 227292 CASAVA_Build 15 18842410 1D TGATCTCATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 51 23 13 16 A 10 9 227293 CASAVA_Build 15 18854798 3D TTCAAGATTA AGG/--- AGGTTTTATC 2367 het 2367 ref 72 55 6 11 AGG 2 1 227294 CASAVA_Build 15 18855632 1I GGTTGACAAT -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 90 47 37 6 A 6 7 227295 CASAVA_Build 15 18856181 3D TTCTATATTA TGT/--- TATTATAAAA 2672 het 2672 ref 50 42 7 2 TGT 1 0 227296 CASAVA_Build 15 18858396 2I GCTAATTAAC --/AT GTCTATCACC 3070 hom 169 het 65 0 57 8 AT 0 1 227297 CASAVA_Build 15 18860757 5D TCTCTTGTGG TCGTT/----- TCATTTCTAT 3070 het 3070 hom 66 15 31 22 TCGTT 1 0 227298 CASAVA_Build 15 18860909 1D TTCCCTACTA T/- TAGCTATAAT 3070 het 3070 ref 65 41 14 11 T 2 1 227299 CASAVA_Build 15 18861142 1I GGTGTCCTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 613 hom 68 2 57 9 T 8 9 227300 CASAVA_Build 15 18861403 4D CACTCTTAAT TTTC/---- TTTCTAAGTT 2564 het 2564 ref 77 69 6 4 TTTC 2 1 227301 CASAVA_Build 15 18861530 2D AAGTGCCACA TG/-- TGTTTGCAAA 3070 het 3070 ref 94 68 15 14 TG 2 1 227302 CASAVA_Build 15 18862765 1I TTTACATGTG -/A AAAAAATAGG 3070 het 3070 ref 66 38 17 11 A 6 7 227303 CASAVA_Build 15 18866426 2D GATAACAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1661 hom 64 12 13 39 T 14 12 227304 CASAVA_Build 15 18867758 1D TCCAATGTGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 84 57 18 11 T 9 8 227305 CASAVA_Build 15 18868277 4I TAAAAGTATC ----/TGTT TGAGTCCCTG 3070 hom 208 het 78 0 70 8 TGTT 0 1 227306 CASAVA_Build 15 18871633 4I CATTGTGCAG ----/GTTA GTTACATATG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 GTTA 1 2 227307 CASAVA_Build 15 18871888 3I ATCCATGTCC ---/CTA CTACAAAGGA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 CTA 1 2 227308 CASAVA_Build 15 18871911 1D GAACTCATCA T/- TTTTTATGGC 2167 hom 21 het 8 0 8 0 T 6 5 227309 CASAVA_Build 15 18872151 3D ATGATCAATC TTG/--- TTATTTTATC 3070 het 3070 ref 83 60 15 12 TTG 1 0 227310 CASAVA_Build 15 18872682 1I ACTAGTAGGA -/C CCCATGGGTT 3070 hom 184 het 69 0 61 8 C 3 4 227311 CASAVA_Build 15 18872992 1D TCCACCGCCC A/- AATCTCCCTT 3070 hom 189 het 71 0 59 14 A 3 2 227312 CASAVA_Build 15 18874051 1I TTATTTGGTA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 80 55 18 7 T 7 8 227313 CASAVA_Build 15 18886443 32D CTACTACCAC ACTTGATCATATAATTTTATTCTCCTGCTTTA/-------------------------------- ACTTGATGCT 3070 het 3070 ref 71 61 13 11 ACTTGATCATATAATTTTATTCTCCTGCTTTA 1 0 227314 CASAVA_Build 15 18888063 1D AAACCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 13 12 227315 CASAVA_Build 15 18891351 1D TTGTAAGATA C/- CTGCTGAGAG 3070 het 3070 ref 71 53 11 7 C 2 1 227316 CASAVA_Build 15 18892010 1D AAACCATTGC T/- GGGGAGCTAG 3070 het 2897 hom 19 7 9 3 T 1 0 227317 CASAVA_Build 15 18893985 6D ACAGCAGCAT AATTTA/------ AATTTGAGTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AATTTA 1 0 227318 CASAVA_Build 15 18906902 4D ACACGTATGC ACAA/---- ACAGATGCAA 1034 hom 10 het 9 0 4 6 ACAA 1 0 227319 CASAVA_Build 15 18912761 1D CCGGGGGGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 27 het 11 0 10 2 T 9 8 227320 CASAVA_Build 15 18913936 6D AATTAATAAC AAAAGG/------ AAAAGTGGAA 1521 het 715 hom 10 2 4 6 AAAAGG 1 0 227321 CASAVA_Build 15 18926412 1D CTTACAGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 13 12 227322 CASAVA_Build 15 18928449 1I AGAATGCTTT -/A AAAAAAAAGT 1435 het 1435 ref 7 4 3 0 A 8 9 227323 CASAVA_Build 15 18930838 1D TGTGACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 11 10 227324 CASAVA_Build 15 18932776 1D ATTTCAAAAG C/- CACTAAACAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 2 1 227325 CASAVA_Build 15 18943215 4D GAGAAGAGAG AACT/---- AACCTTAACC 3070 het 3070 ref 63 44 18 6 AACT 1 0 227326 CASAVA_Build 15 18943276 1I CTAAATGTCT -/A AACAACATAA 3070 het 3070 ref 66 46 16 4 A 2 3 227327 CASAVA_Build 15 19018666 1D TAAAAGAGAC A/- AAAAACAATC 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 6 5 227328 CASAVA_Build 15 19038608 2D AGTACTGACA TT/-- TAGAGTTGTT 2383 het 2383 ref 28 21 5 3 T 3 1 227329 CASAVA_Build 15 19044836 1D AACCTACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 13 12 227330 CASAVA_Build 15 19053072 1I AGAATGTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 9 10 227331 CASAVA_Build 15 19053500 1I TCAATGGAAA -/C TCCCCCTGCG 2952 hom 18 het 8 0 7 1 C 0 1 227332 CASAVA_Build 15 19106316 1I TCTCAAAGCA -/C CCCCCCCCAC 305 het 305 ref 35 23 2 10 C 8 9 227333 CASAVA_Build 15 19107660 1D GCAGGGGCGG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 81 42 31 8 A 8 7 227334 CASAVA_Build 15 19110170 4D TCACAAAAAT ATAA/---- ATAAATAGGA 3070 het 3070 ref 77 57 16 4 ATAA 2 1 227335 CASAVA_Build 15 19110511 2D TGGTATTAAC TT/-- AGGGCAGATG 3070 het 3070 ref 75 48 17 11 T 2 0 227336 CASAVA_Build 15 19110575 2D TTAAATAAAA AT/-- AGTTTAGATG 3070 het 3070 ref 83 46 27 10 AT 1 0 227337 CASAVA_Build 15 19111334 2D TCCTGGGGAC TG/-- TGAGGCTTCT 3070 het 3070 hom 76 29 36 11 TG 2 1 227338 CASAVA_Build 15 19112506 3D CTTGCTTAAT ATA/--- ATGAGAGGAG 3070 het 3070 hom 92 42 46 8 ATA 1 0 227339 CASAVA_Build 15 19114576 3D ACGTCTAATG TTC/--- TTTATTTCTT 3070 het 3070 ref 73 52 14 8 TTC 1 0 227340 CASAVA_Build 15 19115619 3I TAATGAATAA ---/CTT CTTGTTATAG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 CTT 1 2 227341 CASAVA_Build 15 19116054 4I TTGCCTTAAA ----/GTTT ATTTTTATAT 2835 het 2835 ref 45 34 7 4 GTTT 0 1 227342 CASAVA_Build 15 19116478 1I CAGACAGCAT -/A TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 83 59 15 9 A 0 1 227343 CASAVA_Build 15 19118009 1I GTCCAATATT -/A AAGATCATGA 3070 het 3070 ref 64 41 18 5 A 2 3 227344 CASAVA_Build 15 19118224 1D GACTGGTCTT A/- AGATATGTCA 3070 het 3070 ref 59 41 14 4 A 2 1 227345 CASAVA_Build 15 19118833 1D TTTGATGGCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 66 45 12 9 T 9 8 227346 CASAVA_Build 15 19120107 1D TTCTAACAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 65 49 14 2 T 10 9 227347 CASAVA_Build 15 19120467 3I ATATGTGTAA ---/AAG AAGGGACAAG 3070 het 3070 ref 84 43 33 8 AAG 1 2 227348 CASAVA_Build 15 19120684 3I TTTTTATTTA ---/TTG TTATTATACT 2221 het 2221 ref 24 13 7 4 TTG 0 1 227349 CASAVA_Build 15 19121517 4I TTTGATGGGG ----/TTAT TTGTTTTAGA 3070 het 3070 hom 59 22 35 2 TTAT 0 1 227350 CASAVA_Build 15 19121696 1D GCAGCTGATA C/- CCATATTCTG 3070 het 3070 ref 78 48 17 13 C 3 2 227351 CASAVA_Build 15 19121873 1D CTGAGTTTTC G/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 53 36 12 5 G 1 0 227352 CASAVA_Build 15 19122088 1I ATATATATAT -/G ATATATATAT 1057 het 902 hom 12 2 3 7 G 0 1 227353 CASAVA_Build 15 19122315 1I AGCAAGCACC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 67 51 13 3 A 8 9 227354 CASAVA_Build 15 19123434 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 62 45 14 4 T 8 7 227355 CASAVA_Build 15 19124132 3I TCTAGAATAT ---/AAG AAGGTTCTTT 1836 het 1836 ref 52 43 4 5 AAG 1 2 227356 CASAVA_Build 15 19125628 2I CTAATAAGCC --/TA TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 95 61 22 12 TA 0 1 227357 CASAVA_Build 15 19126903 1I TCACCAACTG -/A AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 70 34 31 5 A 8 9 227358 CASAVA_Build 15 19127286 3D ATAGTAATAC TAA/--- TATTATAATC 3070 het 3070 ref 65 48 12 5 TAA 1 0 227359 CASAVA_Build 15 19127639 4D AAGAAAATAA GAGT/---- AAGTTTAATG 3070 het 3070 ref 48 38 9 2 GAGT 1 0 227360 CASAVA_Build 15 19127896 6D TTACCTCAAA ATTTAT/------ ATTTATTTTC 3070 het 3070 ref 52 39 11 3 ATTTAT 2 1 227361 CASAVA_Build 15 19130203 1D CTATTTATGT A/- AAATATAGAA 3070 het 3070 ref 49 34 12 3 A 4 3 227362 CASAVA_Build 15 19130774 1I AGCGTTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 59 33 13 13 A 10 11 227363 CASAVA_Build 15 19134053 1D TAAACAAATC A/- AAGATGGAGG 3070 het 3070 ref 47 23 21 5 A 3 2 227364 CASAVA_Build 15 19137065 3D CGTATCCCTG GAT/--- GATATATTAT 3070 hom 151 het 57 0 51 6 GAT 2 1 227365 CASAVA_Build 15 19137927 4D TGATTGCAAA TAAC/---- TAACAACAAT 3070 het 3070 ref 86 46 34 9 TAAC 2 1 227366 CASAVA_Build 15 19138406 1I TTACTAAGAA -/G GGGGCATTTA 3070 hom 63 het 52 0 22 30 G 4 5 227367 CASAVA_Build 15 19138916 4D AGATCCTGTT TATA/---- GATAAACATA 3070 het 3070 hom 59 27 28 8 TA 2 0 227368 CASAVA_Build 15 19139362 2D TATTGTTAGT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 188 hom 42 6 19 19 A 11 9 227369 CASAVA_Build 15 19140759 3D ATCAGGCACC CTT/--- CTTCTATAGC 3070 het 3070 hom 54 24 26 5 CTT 2 1 227370 CASAVA_Build 15 19140963 4I CTTTGTTACA ----/TTAG TTAGTATATT 3070 het 3070 hom 70 29 30 11 TTAG 1 2 227371 CASAVA_Build 15 19141209 1I CTAAGTGGCA -/G TTAACCAGTA 3070 het 3070 ref 49 29 13 7 G 0 1 227372 CASAVA_Build 15 19143140 1D ATTTTTTTTG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 55 29 23 3 A 7 6 227373 CASAVA_Build 15 19143662 1D AAAAGGAATG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 190 het 81 0 64 17 A 8 7 227374 CASAVA_Build 15 19145831 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 7 hom 54 1 49 4 A 10 9 227375 CASAVA_Build 15 19146203 5I AGAAAAACTT -----/AAGAG AAATGATACT 3070 hom 208 het 72 0 69 3 AAGAG 0 1 227376 CASAVA_Build 15 19146623 1I ACAGTGCTCC -/A ATTTCAGTAT 3070 hom 157 het 57 0 53 4 A 1 2 227377 CASAVA_Build 15 19147185 2D62M2I AAAGGCAGAC AAAGAGGCGTCAAAGATTTAGCACTTGGTATGTCTTTGGAATGAATGAAGAAACAAAATAGAAA--/--AGAGGCGTCAAAGATTTAGCACTTGGTATGTCTTTGGAATGAATGAAGAAACAAAATAGAAAAT GACTGCATTG 3070 hom 268 het 62 0 90 11 N/A 0 0 227378 CASAVA_Build 15 19147554 4D ACAAGTAATT CAGA/---- CAATTTGGTA 3070 het 3070 ref 52 41 8 4 CAGA 1 0 227379 CASAVA_Build 15 19147905 2D ATATCAATGA TT/-- TTTTTTTTAC 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 10 8 227380 CASAVA_Build 15 19149290 2I AGCTTAATTT --/AA GTTAGAAAAT 3070 hom 199 het 70 0 67 3 A 0 2 227381 CASAVA_Build 15 19149621 2D ACTAATGTAG AT/-- ATAACTCATG 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 AT 2 1 227382 CASAVA_Build 15 19150004 1I AGTAAGGGGG -/A AAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 A 5 6 227383 CASAVA_Build 15 19150159 2I TTCCTAAATA --/AG AGTGATCATA 3070 hom 163 het 65 0 55 10 AG 1 2 227384 CASAVA_Build 15 19150735 2I TTTTTAATTT --/TG GAGGTTGTGT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 TG 0 1 227385 CASAVA_Build 15 19151288 2D CAAAATCATT TG/-- TGACAGGCTC 3070 het 3070 ref 63 34 24 6 TG 2 1 227386 CASAVA_Build 15 19151468 2D TATAAATACT AA/-- GTTATTATAC 3070 het 3070 ref 67 39 24 8 A 2 0 227387 CASAVA_Build 15 19151533 1D TCCATTAGTT A/- ATTATATTCT 3070 het 3070 ref 49 33 12 4 A 2 1 227388 CASAVA_Build 15 19151705 1I CTGAATTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 14 14 17 A 13 14 227389 CASAVA_Build 15 19152000 1I TATGATGACC -/G GGGTTACTGC 3070 het 3070 hom 96 43 45 8 G 3 4 227390 CASAVA_Build 15 19153036 1D CGTGCATGCT G/- TTATCTTACC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 G 1 0 227391 CASAVA_Build 15 19153416 5D AAAGTTTATA AAGAG/----- AAAAGAGTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 4 AAGAG 1 0 227392 CASAVA_Build 15 19154084 2I ATCCATATAT --/AG AGAGATTGAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AG 2 3 227393 CASAVA_Build 15 19154778 3I GACTCTGCAG ---/AGA AGATCTCCTC 1507 het 1507 ref 39 29 4 6 AGA 1 2 227394 CASAVA_Build 15 19155725 3I CCTCATCTCT ---/TAA TATTATTCTG 3070 het 3070 ref 48 28 11 9 TAA 0 1 227395 CASAVA_Build 15 19156446 4I CATAAAAAAT ----/TAAA TATATCAATA 3070 het 3070 hom 72 29 37 6 TAAA 0 1 227396 CASAVA_Build 15 19157186 4D GAGATTGCAG GAGA/---- AAGGGGGAGA 2959 het 873 hom 60 10 10 41 GA 2 0 227397 CASAVA_Build 15 19159293 1I TGGATGAGAG -/A AAAAAACCTC 3070 het 3070 ref 78 56 12 10 A 6 7 227398 CASAVA_Build 15 19160088 4D TTTTAGGTGA TGAT/---- TAGGTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 23 7 3 TGAT 1 0 227399 CASAVA_Build 15 19161159 1D TGAGGGTGAT G/- GAAATAGTCT 3070 het 3070 hom 71 28 36 9 G 2 1 227400 CASAVA_Build 15 19162923 3I GATTATATAT ---/TAA TAATATGTGC 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 TAA 1 2 227401 CASAVA_Build 15 19163236 1D GTCCTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 20 9 A 11 10 227402 CASAVA_Build 15 19163394 1I CTTGTCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 T 11 12 227403 CASAVA_Build 15 19170944 1I CTAGGCAAAA -/G CTCTTGGTGG 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 G 0 1 227404 CASAVA_Build 15 19171840 2D TTTATTTACT CA/-- CAGTTCCAGA 3070 het 3070 ref 96 44 34 22 CA 2 1 227405 CASAVA_Build 15 19171946 3I CTGTTCCTGA ---/CCT CTTCCGGTGT 3070 hom 96 het 55 0 32 23 CCT 0 1 227406 CASAVA_Build 15 19172989 1D TATAGTCTTA T/- TTTGCCATTT 3070 het 3070 ref 62 33 24 5 T 4 3 227407 CASAVA_Build 15 19174509 3D16M2D36M4D ACCACAACTA AGCAGGGACCTTATTTATTAAGGGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGCATTAG/---AGGGACCTTATTTATT--GAGTACATTCTTGCATATTTCTGCTTTAACATAGCA---- TTAGTTCAGT 3070 het 2829 hom 68 10 65 34 N/A 0 0 227408 CASAVA_Build 15 19177112 3I5M4D ATTAAGAAGT ---GATTAAGAT/CGGTATTA---- AGGTATTAAG 1205 het 1205 ref 86 85 3 5 N/A 0 0 227409 CASAVA_Build 15 19177337 1D GAGAAAGTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 68 29 29 10 T 9 8 227410 CASAVA_Build 15 19178680 1D CTGCCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 13 14 20 A 15 14 227411 CASAVA_Build 15 19179331 3D GCAGGGAGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2707 het 57 hom 37 2 10 26 T 17 14 227412 CASAVA_Build 15 19179461 1D ATAGGAGTCT G/- GGTTCACAGC 3070 het 3070 hom 57 26 24 8 G 3 2 227413 CASAVA_Build 15 19180160 5D ACAAATAGTA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 48 2 13 35 T 19 14 227414 CASAVA_Build 15 19180945 1D TAAAGAGGAG A/- AAAAATTATT 3070 het 3070 ref 42 24 13 7 A 6 5 227415 CASAVA_Build 15 19181433 2D GAGAGGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 79 het 49 0 29 22 AG 6 5 227416 CASAVA_Build 15 19182331 3D CCCTGTCTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 38 1 31 7 A 13 10 227417 CASAVA_Build 15 19182948 1I TTGATAAAAC -/A AAGCCAGTCA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 2 3 227418 CASAVA_Build 15 19184381 1D TCTAGGCATG A/- ATTTTCATGA 3070 het 3070 ref 72 36 32 5 A 2 1 227419 CASAVA_Build 15 19185589 4D TAAAAAATAT ATAA/---- ATAGTCTAAA 3070 het 3070 hom 42 17 24 2 ATAA 1 0 227420 CASAVA_Build 15 19185662 1D TCATTTTGTC A/- TATATAAGGC 3070 het 3070 ref 59 33 20 6 A 1 0 227421 CASAVA_Build 15 19187442 1I9M1D ATCAAAAAAA -ATAAATAAAT/TAAAAATAAA- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 28 0 30 1 N/A 0 0 227422 CASAVA_Build 15 19188594 5D TACCTATTTG AAAAC/----- AAAACAAAAG 3070 hom 132 het 48 0 45 5 AAAAC 2 1 227423 CASAVA_Build 15 19189459 1D TCTATTACAC T/- TACCTAGGCA 3070 hom 120 het 47 0 40 8 T 2 1 227424 CASAVA_Build 15 19190078 9D CCAAACATCG ATTTAAGAA/--------- ATCCCGAAAT 3070 het 3070 ref 87 48 35 14 ATTTAAGAA 1 0 227425 CASAVA_Build 15 19193808 19I CAGTTTAAAG -------------------/TTACTTTGTTTATCAGTAA TTACTTTATC 3070 hom 129 het 48 0 44 5 TTACTTTGTTTATCAGTAA 0 1 227426 CASAVA_Build 15 19194291 2D GTATTCATGA TT/-- TTTATCTGCT 3070 hom 172 het 61 0 58 4 T 5 3 227427 CASAVA_Build 15 19194906 1D CACCTCCATC A/- CAGGGCAATC 3070 hom 167 het 81 1 68 13 A 1 0 227428 CASAVA_Build 15 19198175 1I AATATGGTGC -/A AATACATTGA 3070 het 3070 ref 94 52 29 13 A 2 3 227429 CASAVA_Build 15 19198618 1D TGTATCTTTC A/- AAAAAAATTC 3070 hom 126 het 50 0 43 8 A 8 7 227430 CASAVA_Build 15 19198821 2I TTTTTCTCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 161 het 69 0 54 15 T 10 12 227431 CASAVA_Build 15 19199462 3D5M3D ATAACTGTGG AGAAATAGACA/---AATTG--- ACTATTTCTC 3070 hom 187 het 60 0 63 3 N/A 0 0 227432 CASAVA_Build 15 19199622 3I TTCATCCCTG ---/ATA ATATTCTCTT 3070 hom 196 het 72 0 66 6 ATA 1 2 227433 CASAVA_Build 15 19199808 1I GACAATCTCT -/A CCTTTTAATT 3070 hom 184 het 66 0 62 4 A 0 1 227434 CASAVA_Build 15 19200951 4I CTCAAATTTA ----/TAAG TAAGAGTTTT 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TAAG 1 2 227435 CASAVA_Build 15 19202956 1D ACCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 67 23 27 17 A 10 9 227436 CASAVA_Build 15 19203369 2I TTATACCTCT --/TA TATATATAAA 3070 het 3070 ref 61 27 25 9 TA 4 5 227437 CASAVA_Build 15 19203673 26D CACTAGTATT CACTTGTATTCACATATGAATACATA/-------------------------- CACTTGTATT 3070 het 3070 ref 82 49 29 20 CACTTGTATTCACATATGAATACATA 1 0 227438 CASAVA_Build 15 19204155 4D TATTACAGTA GTCT/---- GTATTATTTC 3070 het 3070 ref 80 41 33 6 GTCT 1 0 227439 CASAVA_Build 15 19214422 9D TCACTAGCAA GAATATATG/--------- GAATTGAATA 3070 het 3070 ref 59 44 12 7 GAATATATG 1 0 227440 CASAVA_Build 15 19216277 2D GTCTCAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 126 het 45 0 42 10 AT 7 6 227441 CASAVA_Build 15 19216648 7D CATTGCACAA GTACTAT/------- GTCCCTAAAC 3070 het 3070 ref 72 58 12 4 GTACTAT 1 0 227442 CASAVA_Build 15 19216920 4I AAAAAGAAAG ----/AAAA GTTTCCCAAA 3070 hom 157 het 61 0 53 8 A 0 4 227443 CASAVA_Build 15 19218728 1I TTCACTTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 41 15 5 A 10 11 227444 CASAVA_Build 15 19220761 4D CCTTCCCACC TAAT/---- TATTACCAGG 1323 het 1323 ref 33 22 5 7 TAAT 1 0 227445 CASAVA_Build 15 19221941 12D TACAATTTCT TTTTTTCGTTTC/------------ TTTTTTTTTT 157 het 157 ref 45 29 2 17 TTTTTTCGTTTC 1 0 227446 CASAVA_Build 15 19224193 2I GGTCTCACTC --/TG TTGCCCAGGC 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 TG 0 1 227447 CASAVA_Build 15 19225422 1I AAAATGGCCT -/G GGGGGATAAT 3070 het 3070 ref 47 32 10 5 G 5 6 227448 CASAVA_Build 15 19228755 14D GCTTTTCCCC TGCAGATGGCCTGG/-------------- TGCCCACACT 3070 het 3070 ref 40 21 18 5 TGCAGATGGCCTGG 1 0 227449 CASAVA_Build 15 19230528 1D ATGTGAGGTC T/- TTGTCCTGAT 3070 het 3070 ref 63 39 10 15 T 3 2 227450 CASAVA_Build 15 19231751 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 73 54 12 7 A 0 1 227451 CASAVA_Build 15 19232175 8D TACATTTGAA AGCATTGT/-------- AGCTGAAGTC 3070 het 3070 ref 52 32 19 6 AGCATTGT 1 0 227452 CASAVA_Build 15 19233728 1D TGTTTTATAC T/- AATAAGTCCA 3070 het 3070 ref 85 46 32 7 T 1 0 227453 CASAVA_Build 15 19234347 1I GCCAAGATCT -/C CCCATTGCAC 3070 het 3070 hom 49 13 27 9 C 3 4 227454 CASAVA_Build 15 19236960 1D TAAAGAAGGA T/- TTTTAATAAC 3070 het 3070 ref 62 43 11 9 T 5 4 227455 CASAVA_Build 15 19237353 1I CACTCACGAC -/G GGGGGGCCTC 1970 het 1970 ref 53 36 6 11 G 6 7 227456 CASAVA_Build 15 19243697 2D AAAATGAAAC AA/-- AATTTATTTT 3054 het 3054 ref 50 40 7 6 A 4 2 227457 CASAVA_Build 15 19247832 1D AATCCTGTCT A/- AAAATTTTAT 3070 het 3070 hom 44 11 26 9 A 5 4 227458 CASAVA_Build 15 19252093 1D TACCTGCCGC T/- TTTCTTATAA 3070 het 3070 ref 73 53 15 6 T 4 3 227459 CASAVA_Build 15 19252992 2I CCATCCTCAT --/AC ACAGACTTCC 3070 het 3070 ref 57 37 17 3 AC 1 2 227460 CASAVA_Build 15 19253481 1I AGCCTGATTT -/C CCCTGCCTTC 3070 het 3070 ref 52 26 13 13 C 3 4 227461 CASAVA_Build 15 19256022 3I CTAAAAAAAA ---/TGT TGTTTATCAA 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 TGT 1 2 227462 CASAVA_Build 15 19259374 1I TGAAGACAAT -/A AGAGCAAATT 3070 hom 109 het 47 0 40 7 A 1 2 227463 CASAVA_Build 15 19267752 14D CTTTTTCTTA TCTTTTTTTCTTTT/-------------- TCTTTTTTTC 221 het 221 ref 36 11 4 22 TCTTTTTTTCTTTT 1 0 227464 CASAVA_Build 15 19273142 1D AGTAGGAACA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 151 het 54 0 51 4 T 9 8 227465 CASAVA_Build 15 19276682 1D TAACCTGGTT A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 58 36 17 5 A 8 7 227466 CASAVA_Build 15 19277372 1D AAAGGTAGTT G/- GGGGGGGGAT 3070 hom 64 het 43 0 29 15 G 9 8 227467 CASAVA_Build 15 19277581 10I CAAGATGTGC ----------/TGAAATAAGG TTATTTCACC 3070 het 3070 ref 55 39 7 9 TGAAATAAGG 0 1 227468 CASAVA_Build 15 19277885 2I TGAAATTATC --/TG TGATAGAAAA 581 het 581 ref 63 55 3 5 TG 1 2 227469 CASAVA_Build 15 19278677 1I CTGAGCCCAC -/A CGCTGTCCTC 2276 het 2276 ref 73 48 10 15 A 0 1 227470 CASAVA_Build 15 19279041 1D GGATCCGAAG C/- CGTGGAATCT 1727 het 1727 ref 65 54 4 8 C 2 1 227471 CASAVA_Build 15 19281062 1D ACGCCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 10 A 11 10 227472 CASAVA_Build 15 19283729 30D GTATTGAGCT TCACACACACACACACACACACACACACAC/------------------------------ ACACACACAC 1421 het 1421 ref 61 33 4 34 TCACACACACACACACACACACACACACAC 1 0 227473 CASAVA_Build 15 19284317 1I ATGTTGTTTT -/A TTTTTTCCTC 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 0 1 227474 CASAVA_Build 15 19284384 2D28M2I ACTGAATTTT GCGAGAAATGTATACATATTGTATATATAC--/--GAGAAACATATACATATTGTGTATATACAT TTTTTTTCAG 1501 het 1501 ref 58 66 4 15 N/A 0 0 227475 CASAVA_Build 15 19285107 2I TCAAACATTC --/TG TATCATGCCA 3070 het 3070 ref 44 36 8 1 TG 0 1 227476 CASAVA_Build 15 19286162 1D AAACTCTGGG A/- AAAAATGGAG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 6 5 227477 CASAVA_Build 15 19291944 1D CTTTCCATAC G/- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 63 27 27 10 G 1 0 227478 CASAVA_Build 15 19293153 1D AACTAATGGG A/- AAAAATAAAC 3070 het 3070 ref 61 32 26 3 A 6 5 227479 CASAVA_Build 15 19300219 1D TAAAGTATAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 1984 hom 38 9 26 3 T 3 2 227480 CASAVA_Build 15 19300529 1D CTAACTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1507 hom 53 6 22 26 T 15 14 227481 CASAVA_Build 15 19301140 6I GTTGGTATCA ------/AGCAAT AGCAATAATG 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 AGCAAT 1 2 227482 CASAVA_Build 15 19302676 3D TGCCCACACA TAC/--- TACAATAATT 3070 het 3070 ref 53 32 9 16 TAC 2 1 227483 CASAVA_Build 15 19303028 2D GTTCTTGCAC AG/-- AGTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 62 42 10 11 AG 2 1 227484 CASAVA_Build 15 19303143 1D TTGATTGTGG T/- GTAAGGTGGA 3070 het 3070 ref 66 41 15 12 T 1 0 227485 CASAVA_Build 15 19310185 1D CGAAACTATT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 105 het 42 0 34 9 G 9 8 227486 CASAVA_Build 15 19311071 1D GCCACCCTAA T/- TTTTTTTTAA 2078 het 2078 ref 31 15 7 9 T 9 8 227487 CASAVA_Build 15 19313353 4D37M1I TGGACTAGAA AGGCAGGAGGAAAAGCCTGAGGGAGTGAGGTCCTGAAAGCC-/----AGGAGGAAAAGCCTGAGGGAGTGAGGTCCTGAAAGCCA AGTGAAGATG 3070 het 3070 ref 48 20 9 35 N/A 0 0 227488 CASAVA_Build 15 19315743 13I GTTATCTCCT -------------/ATTAAATGTTGCC ATAGGCTTAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ATTAAATGTTGCC 0 1 227489 CASAVA_Build 15 19316127 2I AAATTTTTGT --/AA AGTTTGCTTG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 1 3 227490 CASAVA_Build 15 19317149 2I AAAATTTAAC --/TG TTAAAATAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TG 0 1 227491 CASAVA_Build 15 19319395 1D TTCATTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1231 hom 31 6 20 5 T 10 9 227492 CASAVA_Build 15 19323386 1D CTTACTTTTA T/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 77 50 13 14 T 7 6 227493 CASAVA_Build 15 19324323 1I CAACTCTGCA -/T TAAGTCCTAG 3070 het 3070 ref 72 30 27 15 T 1 2 227494 CASAVA_Build 15 19324924 1I TCTACTTTTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 8 9 227495 CASAVA_Build 15 19328000 2I ATCTAGAACA --/AC ACACACAGAT 3070 het 3070 ref 57 26 23 8 AC 3 4 227496 CASAVA_Build 15 19330683 1I GGAAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2076 hom 43 8 14 21 A 11 12 227497 CASAVA_Build 15 19334020 14D TTCCTTTATA TTTATTTATTTATT/-------------- TTTATTTATT 2022 het 2022 ref 19 10 6 3 TTTATTTATTTATT 2 1 227498 CASAVA_Build 15 19337944 4D TCTGTCAAAA AAAG/---- AAAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 55 38 12 11 AAAG 2 1 227499 CASAVA_Build 15 19339925 1I AGAATGAGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 68 42 13 13 A 9 10 227500 CASAVA_Build 15 19340980 2I CTTGTCTACT --/TA TATTATTTCA 3070 het 303 hom 52 3 43 6 TA 1 2 227501 CASAVA_Build 15 19342398 8I44M2I TACAGTGACG --------ATTCCTTCAAGACATCTAGAAATTAAATAGATGTGCGTGAACAC--/AAGTGATTATTCTCTCACAGCATCTAGAAATTAAATAGATGTGTATGAACACTT TTTAAAAAAT 585 het 585 ref 92 111 2 9 N/A 0 0 227502 CASAVA_Build 15 19342833 1D TTCATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 45 3 26 16 T 12 11 227503 CASAVA_Build 15 19344110 1D ATCACCTTCA T/- TTACCCTAAA 2178 het 2178 ref 65 53 5 8 T 3 2 227504 CASAVA_Build 15 19345069 1D ACAAAGGAGG C/- AAAGTGTGAA 3070 het 3070 ref 55 38 12 5 C 1 0 227505 CASAVA_Build 15 19345774 1D ATTAATGAAT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 65 12 33 20 A 8 7 227506 CASAVA_Build 15 19349617 2I AAAATAAAAC --/AG AGGTTGGGCG 3070 het 3070 hom 73 15 43 15 AG 1 2 227507 CASAVA_Build 15 19350691 6I GTCATCATTG ------/TTTCTA TTTGTATTTG 3070 het 3070 hom 92 17 68 7 TTTCTA 0 1 227508 CASAVA_Build 15 19354811 1D ATTTCATTTT A/- AAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 78 29 40 10 A 7 6 227509 CASAVA_Build 15 19355980 4I AGACTTTTCC ----/TAGT TATAGTATTC 3070 het 3070 hom 67 14 47 6 TAGT 0 1 227510 CASAVA_Build 15 19356197 2I TATGAGTAAC --/TT TGTGTTTATC 3070 het 3070 hom 66 12 49 5 T 1 3 227511 CASAVA_Build 15 19359856 11D ATATATAATT AGTTAGATTAA/----------- AGGAATAAGT 3070 het 3070 ref 70 50 16 11 AGTTAGATTAA 1 0 227512 CASAVA_Build 15 19360920 5D TTCTTTGTGT TATAA/----- TATAATAATG 3070 het 3070 ref 82 59 17 11 TATAA 2 1 227513 CASAVA_Build 15 19365156 3D TATCAAAAAT AAG/--- AAAGAAATTA 3070 het 3070 ref 94 59 28 11 AAG 1 0 227514 CASAVA_Build 15 19365456 1I TCAGTTTTTA -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 81 61 18 2 T 6 7 227515 CASAVA_Build 15 19368052 2I AAGTGTAGAA --/AC AGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 25 22 14 AC 0 1 227516 CASAVA_Build 15 19369876 2D AGTTATGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 16 33 6 T 13 11 227517 CASAVA_Build 15 19370004 1D AAATATTTTA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 T 8 7 227518 CASAVA_Build 15 19371863 2I ATAAATTATA --/AC ATTCTTTTTG 3070 het 3070 hom 52 16 26 10 AC 0 1 227519 CASAVA_Build 15 19372799 2D CTCACAGATT CA/-- AGAGACCACT 3070 het 3070 ref 76 37 32 12 CA 1 0 227520 CASAVA_Build 15 19373227 1I GAAGAGCACC -/A AGTGGGCTCT 3070 het 3070 ref 68 30 30 8 A 1 2 227521 CASAVA_Build 15 19374213 1D AAGACACAGA G/- TGGCTAAATG 3070 het 3070 ref 79 57 13 9 G 1 0 227522 CASAVA_Build 15 19376337 1D TTGACACTTT A/- AAAAAAAAAA 3028 het 3028 ref 64 47 8 9 A 13 12 227523 CASAVA_Build 15 19384491 6D CTATGTCTGA AAGTAT/------ AAGTATTTTT 3070 het 3070 ref 91 54 26 17 AAGTAT 2 1 227524 CASAVA_Build 15 19385179 1I ATTCTGCCAG -/C CATTTCTCGT 3070 het 3070 hom 71 11 47 13 C 1 2 227525 CASAVA_Build 15 19385811 2I TCCAAAAGAA --/AC AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 78 16 52 10 AC 0 1 227526 CASAVA_Build 15 19387127 1I TTTGCCCATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 56 38 11 7 T 9 10 227527 CASAVA_Build 15 19388140 1I CAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 52 20 22 15 T 9 10 227528 CASAVA_Build 15 19388846 1D TATTTACTTA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 52 36 11 5 T 8 7 227529 CASAVA_Build 15 19390843 1D TTTGGACTCA T/- TTTTCCTTTG 3070 het 3070 ref 73 47 24 2 T 5 4 227530 CASAVA_Build 15 19390994 4D AATTTTTAAG TATT/---- TTTTCTTTTT 3070 het 2237 hom 46 15 16 15 TATT 1 0 227531 CASAVA_Build 15 19394455 1I CCTATTGAGG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 80 39 32 9 A 8 9 227532 CASAVA_Build 15 19394896 2I TAAAGAACAC --/TT AATGTAACAT 3070 hom 157 het 57 0 53 4 T 0 2 227533 CASAVA_Build 15 19401842 1D CACAGTTTCG T/- TTTTATTTGA 3070 het 3070 ref 79 57 13 9 T 5 4 227534 CASAVA_Build 15 19403570 1I GATACAGGGG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 74 45 10 19 T 7 8 227535 CASAVA_Build 15 19403818 1I AGTATGACAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 59 42 11 6 A 7 8 227536 CASAVA_Build 15 19406200 1I CTAAAAACAT -/A AAAAAAACAA 1063 het 1063 ref 30 18 4 8 A 7 8 227537 CASAVA_Build 15 19407241 4D AAAATTTTAA AGAG/---- AGACAGAAAA 3070 het 3070 ref 67 50 11 10 AG 3 1 227538 CASAVA_Build 15 19407491 1I TTAAAACTAA -/T AAGCAAAAGT 3070 hom 178 het 67 0 60 7 T 0 1 227539 CASAVA_Build 15 19408097 4D CATCCTCCTC CTAA/---- CTCTTTGAAA 3070 het 3070 ref 76 55 16 8 CTAA 1 0 227540 CASAVA_Build 15 19410387 1D GCCTGCACAA C/- CCCCCAGTAT 3070 het 3070 ref 79 56 16 10 C 6 5 227541 CASAVA_Build 15 19411525 1I GGGGGCTGGG -/T TTGGTGTGCT 3070 hom 55 het 25 0 14 11 T 2 3 227542 CASAVA_Build 15 19412625 3D GTTCCATGCC AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 het 3070 ref 74 46 19 10 AGG 4 3 227543 CASAVA_Build 15 19412969 1D GTACCACAGG C/- CTCGGTGGAA 2839 het 2839 ref 57 33 8 16 C 2 1 227544 CASAVA_Build 15 19414871 3D AAGCAAAAGT TAA/--- TAATTTTTCT 3070 het 3070 ref 66 46 12 13 TAA 2 1 227545 CASAVA_Build 15 19419793 3D CTTCTGGAAA TTC/--- TTTGAGGATT 3070 het 3070 ref 72 57 11 6 TTC 1 0 227546 CASAVA_Build 15 19421364 4D TGTCATTAAT TCTC/---- TCTTTTAATC 3070 het 3070 ref 83 64 16 7 TC 3 1 227547 CASAVA_Build 15 19421729 4D AATGCTCTTA AGTT/---- AGTTCATGGT 3070 het 3070 hom 81 32 27 23 AGTT 2 1 227548 CASAVA_Build 15 19421780 3I ATAACTAAAT ---/AGC AGGCAAACTG 3070 hom 147 het 66 0 49 17 AGC 0 1 227549 CASAVA_Build 15 19422321 3D ATTAAAAAAT AAC/--- GATAGCAACA 3070 het 3070 ref 70 55 10 9 AAC 1 0 227550 CASAVA_Build 15 19422741 4D ATATCTTTAT TTCA/---- TGTGGTCACT 3070 het 3070 ref 88 63 17 12 TTCA 1 0 227551 CASAVA_Build 15 19423999 4I TACTATTCAA ----/TATT TATTTATTTT 3070 het 3070 ref 78 54 16 8 TATT 2 3 227552 CASAVA_Build 15 19424153 1I ATACTAAAGT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 89 65 11 13 A 7 8 227553 CASAVA_Build 15 19424669 3I GTTTTTTTTT ---/TCC CCCTCTTTAT 2872 het 294 hom 52 4 13 35 TCC 0 1 227554 CASAVA_Build 15 19425362 1D TGCTTAAAAT A/- TTTGGAGTTG 3070 het 3070 ref 86 56 23 7 A 1 0 227555 CASAVA_Build 15 19427236 1D GCATGAGCCA G/- CATGCTGGGC 3070 het 3070 ref 58 40 16 3 G 1 0 227556 CASAVA_Build 15 19427565 5D ACACAATTGA TATCT/----- TAACTTCTGG 3070 het 3070 ref 81 60 19 5 TATCT 1 0 227557 CASAVA_Build 15 19429010 2I GAATTAAGAA --/TT ATTTTGTCAA 3070 hom 223 het 79 0 75 4 T 0 2 227558 CASAVA_Build 15 19429773 1D ATTCTTCTAC T/- TAATACATCT 3070 het 3070 ref 68 49 11 10 T 2 1 227559 CASAVA_Build 15 19429825 4D ACTAGTTAGA CTGG/---- CTGGCAGCAA 3070 het 3070 ref 86 62 15 13 CTGG 2 1 227560 CASAVA_Build 15 19430560 2D GAAAATAAAC AT/-- ATATCTATTC 3070 het 3070 ref 93 47 36 13 AT 3 2 227561 CASAVA_Build 15 19432428 1D AGTTGTTTCA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 76 19 45 13 T 8 7 227562 CASAVA_Build 15 19432468 2D70M2D GTATTGCAAC TATACAAATAGTTTTCCACTGATCCTTCAAATTACCAGATTAAAACACACACACACATACACACCCCCAAAACT/--TAAAAATAGTTTTCCACTGATCCTTCAAATTACCAGATTAAAACACACACACACATACACACCTCCAAAA-- CTCAACAATT 3070 het 3070 ref 75 72 10 40 N/A 0 0 227563 CASAVA_Build 15 19432778 1I TACTAAGCAC -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 78 56 13 10 T 6 7 227564 CASAVA_Build 15 19432870 3I AGCAATTTAT ---/TAA TAATTTGCAG 3070 het 3070 ref 73 53 8 12 TAA 1 2 227565 CASAVA_Build 15 19437570 1I TTCATAGAAT -/G GTGACTATAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 G 1 2 227566 CASAVA_Build 15 19438737 1D AATTAAAAAA C/- ATTCTTGTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 C 1 0 227567 CASAVA_Build 15 19445946 5I TATTTATTTC -----/CTTTT CTTTTTCTTT 1896 het 1896 ref 22 9 4 9 CTTTT 1 2 227568 CASAVA_Build 15 19445977 2D TGTAGTATTT TA/-- TTTTTTTGGT 3070 hom 30 het 17 0 11 6 TA 1 0 227569 CASAVA_Build 15 19446069 1D TTTAATCACA T/- AAAAAATTCT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 1 0 227570 CASAVA_Build 15 19446917 3D TTCTAATTGT TTC/--- TTCTTGTAAA 3018 het 3018 ref 31 22 7 7 TTC 2 1 227571 CASAVA_Build 15 19456776 2I AACAAGTACT --/CA TTTCCTTAGA 3070 het 2607 hom 41 9 25 7 CA 0 1 227572 CASAVA_Build 15 19461879 3D AGGAGGCCTG AGA/--- AGAAGGTCCT 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 AGA 2 1 227573 CASAVA_Build 15 19462528 1D TCAGGAAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 10 9 227574 CASAVA_Build 15 19464764 6I TCCACCAACT ------/CTTTTC CTGTCTCTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 CTTTTC 0 1 227575 CASAVA_Build 15 19488081 1D GTTTTCCTCT G/- GGTTAATGGG 2957 hom 18 het 7 0 7 0 G 3 2 227576 CASAVA_Build 15 19515709 1I TAAACTCTGA -/T TTTTTTTTTT 2707 hom 15 het 6 0 6 0 T 10 11 227577 CASAVA_Build 15 19589864 1I TCTCAAAAAA -/C AAAAAAAGAA 3070 het 1311 hom 24 6 16 2 C 0 1 227578 CASAVA_Build 15 19592506 2I TATTTGATTT --/TC TGTTTCTGGC 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 TC 0 1 227579 CASAVA_Build 15 19593838 1I CCACAGTTGG -/T TTTTTTCAAC 2046 het 2046 ref 33 21 5 7 T 6 7 227580 CASAVA_Build 15 19594105 1D CCATGAAAAA G/- GATGAGTTCA 1387 het 1387 ref 16 12 3 1 G 2 1 227581 CASAVA_Build 15 19613926 3D GCATCTCATC TCA/--- TCATCTCCAT 1907 het 1907 ref 34 28 5 1 TCA 2 1 227582 CASAVA_Build 15 19633500 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTGAGAT 2259 het 18 hom 8 1 6 1 T 6 5 227583 CASAVA_Build 15 19636975 1I TGCCCATTCG -/C CTTGTGTCTT 3070 het 3070 ref 54 24 18 12 C 1 2 227584 CASAVA_Build 15 19649338 1D TCTGTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 12 11 227585 CASAVA_Build 15 19663239 3D ATAGAGCACT CAA/--- AAAAAAAGAA 727 het 727 ref 78 70 2 6 CAA 1 0 227586 CASAVA_Build 15 19763751 3I TGTTTTTAGG ---/TTC TTCTGAATTT 1735 het 1735 ref 17 9 4 4 TTC 1 2 227587 CASAVA_Build 15 19765905 4I TGCACAACAC ----/TAAA TCTCACTGCA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TAAA 0 1 227588 CASAVA_Build 15 19767746 1I TCATCTTTTT -/G GTGATAGCCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 1 2 227589 CASAVA_Build 15 19769100 1D AATTAAAAAA C/- ATTCTTGTTT 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 C 1 0 227590 CASAVA_Build 15 19776220 4D TTTTATTTTT TCTG/---- TCTGTGTTAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 TCTG 2 1 227591 CASAVA_Build 15 19777236 1D CCCCTAGTGA T/- TTTTTTTATT 1446 het 1446 ref 12 6 3 3 T 8 7 227592 CASAVA_Build 15 19777747 1I TCAAGTGATT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 8 9 227593 CASAVA_Build 15 19788861 1I AAAGTGTTTC -/T TTAACTGAGA 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 T 2 3 227594 CASAVA_Build 15 19789960 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCTGAAGC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 C 4 5 227595 CASAVA_Build 15 19794957 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 1656 hom 16 5 11 0 A 9 8 227596 CASAVA_Build 15 19801434 2D GTTACTGTGC AT/-- ATATGTTGGA 3070 hom 178 het 64 0 60 4 AT 3 2 227597 CASAVA_Build 15 19809242 1D TGTTACAAAC A/- ATGCAATTAT 3070 het 3070 ref 47 28 16 4 A 2 1 227598 CASAVA_Build 15 19809658 1I GGTTGCTTCC -/A AATCATGACT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 A 2 3 227599 CASAVA_Build 15 19810022 3D CATTTATGTG TCT/--- TCTTCTGAGC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 TCT 3 2 227600 CASAVA_Build 15 19810166 2I ATTTTATGAT --/TG TCTTTTCAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TG 0 1 227601 CASAVA_Build 15 19811594 1I GTTTTAGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 59 34 14 11 T 9 10 227602 CASAVA_Build 15 19812444 1I GTGACAGCTA -/T TTTTGATATT 3070 het 3070 hom 41 9 28 4 T 4 5 227603 CASAVA_Build 15 19812981 2D AAATTATCTA CC/-- CTTATATTAT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 C 3 1 227604 CASAVA_Build 15 19819853 1D TCTTAGTGGA T/- AATGATTGGA 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 T 1 0 227605 CASAVA_Build 15 19820189 1D AATAAAGTTA C/- ATTTGATAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 C 1 0 227606 CASAVA_Build 15 19823722 2I ACCCCTTATC --/AG ATGTATAATT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 AG 0 1 227607 CASAVA_Build 15 19825300 4D TCCTTTCTTT TTAC/---- TTACTTACTT 3070 hom 63 het 35 0 21 15 TTAC 3 2 227608 CASAVA_Build 15 19825861 1D TGGCTTTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 9 8 227609 CASAVA_Build 15 19826009 1D ATTTTTATCC T/- TTTGGGTTAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 4 3 227610 CASAVA_Build 15 19828235 1I ATTCAGCCAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 A 8 9 227611 CASAVA_Build 15 19832552 1I GATTCTAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 27 13 8 A 9 10 227612 CASAVA_Build 15 19832691 1I GTGTAGAGCA -/G GGGAAAATGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 3 4 227613 CASAVA_Build 15 19833679 4D ATCTATCTAT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 2531 hom 47 9 32 8 ATAG 3 2 227614 CASAVA_Build 15 19833783 1I GATGAAAAAA -/G AACAAGATTC 2186 het 2186 ref 75 66 5 4 G 0 1 227615 CASAVA_Build 15 19834956 3D CTGGCCACAA ATG/--- ATAACAAGCA 3070 het 1900 hom 35 6 23 6 ATG 1 0 227616 CASAVA_Build 15 19836293 6I TATTTTTAGT ------/AGAGAC AGGGTCTCTC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AGAGAC 0 1 227617 CASAVA_Build 15 19837905 1D TTTTTTTACT A/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 1 0 227618 CASAVA_Build 15 19839290 1D GATGAAGGGT G/- GGGGGATGGG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 6 5 227619 CASAVA_Build 15 19841961 4D GCATTGTCTT AGAG/---- AGATCAAGTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 AG 3 1 227620 CASAVA_Build 15 19842291 5D CAAAAAGATC TTGGG/----- TCCTAGACTA 3070 hom 36 het 15 0 13 3 TTGGG 1 0 227621 CASAVA_Build 15 19843812 2I TTAAATGAGC --/TA TATATGTAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TA 2 3 227622 CASAVA_Build 15 19849340 4D AAAGAACAAT AAAC/---- AAAATTAATA 3070 het 1442 hom 27 5 9 16 AAAC 1 0 227623 CASAVA_Build 15 19849366 4D GCATTAAAAG AAAT/---- AAAACAAGTA 3070 het 1828 hom 33 5 20 10 AAAT 1 0 227624 CASAVA_Build 15 19851781 2D GAGAAGTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1575 hom 40 16 8 16 T 13 11 227625 CASAVA_Build 15 19853673 4I TACATTCCTA ----/TAAT TAATTTGTTG 3070 hom 107 het 38 0 34 4 TAAT 1 2 227626 CASAVA_Build 15 19855061 3I AGTTCTCTAT ---/TAA TATTGCATTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TAA 0 1 227627 CASAVA_Build 15 19856026 1D TCAACTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1972 het 1972 ref 34 18 7 9 T 10 9 227628 CASAVA_Build 15 19865417 3D ATTATTAAAT ATA/--- ATAATATATT 3070 het 1474 hom 15 4 10 2 ATA 3 2 227629 CASAVA_Build 15 19866338 1D TTGCTTTGGG T/- TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 46 11 27 9 T 7 6 227630 CASAVA_Build 15 19869074 1I TTTTGTGCTA -/C TTAGTGGTGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 0 1 227631 CASAVA_Build 15 19871215 1I AATAAGACAT -/G GAGACGTGTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 2 227632 CASAVA_Build 15 19871986 1I ATAGGTTATG -/T TTTTTACTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 5 6 227633 CASAVA_Build 15 19874325 3D ATATGCCAAC ATT/--- ACTACTCTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 ATT 1 0 227634 CASAVA_Build 15 19874805 4I TTTTTTTCCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 90 het 50 0 29 21 TTTC 3 4 227635 CASAVA_Build 15 19874820 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTA 3070 het 2103 hom 43 12 14 17 C 0 1 227636 CASAVA_Build 15 19882174 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAGAAGAA 3070 hom 24 het 37 1 32 4 AG 1 0 227637 CASAVA_Build 15 19884847 1D TTTTTCACTG A/- GTACCTCCCA 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 A 1 0 227638 CASAVA_Build 15 19887892 7I TTCAGCAAGG -------/CAGCTGT CATACGAACA 3070 hom 108 het 44 0 36 8 CAGCTGT 0 1 227639 CASAVA_Build 15 19891861 2D TTTGATGTAG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 100 hom 48 4 16 28 T 11 9 227640 CASAVA_Build 15 19893453 1D TGGGGGCCTA T/- TTTTAGTATT 3070 het 3070 ref 48 29 15 5 T 5 4 227641 CASAVA_Build 15 19894724 1D AAGGAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 35 0 24 11 A 11 10 227642 CASAVA_Build 15 19896255 1D TCAGAATTAG A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 A 8 7 227643 CASAVA_Build 15 19899043 2I GAGACTACAG --/GC GCCCACCACC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 GC 1 2 227644 CASAVA_Build 15 19905571 1D AGTTTCCATG C/- AGTTGTGCAG 1136 het 1136 ref 29 26 3 0 C 1 0 227645 CASAVA_Build 15 19907365 1D GGTGTTCTGG T/- TTTTGGAATT 3070 het 3070 ref 59 38 16 6 T 5 4 227646 CASAVA_Build 15 19912513 12D GTGTTTGTAT GTGTGTGCATAC/------------ GTGTGTGTTC 3070 het 3070 ref 45 34 9 7 GTGTGTGCATAC 1 0 227647 CASAVA_Build 15 19922816 1D CTAATAAGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 A 10 9 227648 CASAVA_Build 15 19939639 1D GCTATAAGAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 9 8 227649 CASAVA_Build 15 19943949 1D CTCCCAAAGC A/- ACACAATATT 3070 het 3070 ref 67 37 24 6 A 2 1 227650 CASAVA_Build 15 19950848 1D CTTGGGCTGC A/- AGTCTGTGCT 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 A 2 1 227651 CASAVA_Build 15 19952247 2D AAGAATGCAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 22 7 9 7 AT 8 7 227652 CASAVA_Build 15 19953587 1I AATGGCACAC -/A GTTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 56 19 31 6 A 0 1 227653 CASAVA_Build 15 19959254 1D TAGAAGAATA C/- AGTTATAATA 1789 het 1789 ref 60 50 4 6 C 1 0 227654 CASAVA_Build 15 19964735 1D GGTTACAATG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 49 27 16 6 A 7 6 227655 CASAVA_Build 15 19965420 3D TGAACTGCTA AGT/--- ACTTTTTTTT 1321 het 1321 ref 60 48 3 9 AGT 1 0 227656 CASAVA_Build 15 19965605 6I ATCCTCTATA ------/TGTTGT TGTTTACTTG 1317 het 1317 ref 61 49 3 9 TGT 1 3 227657 CASAVA_Build 15 19966445 1D CATCTTTTTA C/- AGAAGTATTC 3070 het 3070 ref 40 27 9 4 C 1 0 227658 CASAVA_Build 15 19967057 1I CTACATGCAC -/A AAATGAGTTT 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 A 3 4 227659 CASAVA_Build 15 19970174 14I TACAGGGACA --------------/CCAGGCTTCCAAAT GCCCCTCTTC 3070 het 3070 ref 57 39 10 8 CCAGGCTTCCAAAT 0 1 227660 CASAVA_Build 15 19971075 2D AGTAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 1078 het 1078 ref 38 15 5 20 AT 1 0 227661 CASAVA_Build 15 19971124 1I ATTGTTTAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 18 8 10 A 9 10 227662 CASAVA_Build 15 19971959 2I CAAGTTGCTG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 27 12 9 A 9 11 227663 CASAVA_Build 15 19972209 1I TTCTCTTCTG -/T TTTTTTCCCT 2918 het 2918 ref 58 39 8 11 T 6 7 227664 CASAVA_Build 15 19973914 4D CTTGAAATAT TTTA/---- TTTGTCAAGA 1159 het 1159 ref 51 44 3 5 TTTA 1 0 227665 CASAVA_Build 15 19975323 4D TATTTTTAGT AGAG/---- ATAAGGTTTC 1728 het 1728 ref 19 13 5 1 AG 2 0 227666 CASAVA_Build 15 19975744 4D AACCCTGGTC CTGA/---- CTGACAGGTC 3070 het 3070 ref 55 31 19 7 CTGA 2 1 227667 CASAVA_Build 15 19977448 4I CTGCTAAAAT ----/AGTC ATTCATAATC 3070 hom 69 het 35 0 24 11 AGTC 0 1 227668 CASAVA_Build 15 19984004 3D ACAGAATAAA TGT/--- TGTATGAAAA 3070 het 3070 ref 34 25 8 1 TGT 2 1 227669 CASAVA_Build 15 19986377 1I CCTAGGCTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 8 19 7 T 9 10 227670 CASAVA_Build 15 19987035 1D CCAGCACCTG T/- TGTTTCCTGA 2999 het 1837 hom 15 6 7 2 T 2 1 227671 CASAVA_Build 15 19987747 1I TTCTCCTCAG -/A ATAGAGTCTG 3070 het 3070 hom 53 18 28 7 A 1 2 227672 CASAVA_Build 15 19988174 20I TTCACCCAAA --------------------/GAACCTGGAGGTTCCAGGAG GAAATATAAA 3070 hom 141 het 51 0 48 6 GAACCTGGAGGTTCCAGGAG 0 1 227673 CASAVA_Build 15 19988921 1D AGGCCTGCCC A/- CCAAGAAGTC 31 het 31 ref 81 56 1 25 A 1 0 227674 CASAVA_Build 15 19989271 1I CAACAGATTC -/T TTTTTCTCTA 3070 het 3070 ref 97 59 29 9 T 5 6 227675 CASAVA_Build 15 19990414 1D37M1I GCAGCAGTAA CTCCAGGATGTCAATTCACAGGTTTATGAAGTGAAAAT-/-TCCAGGATATCAGTTCATAGGTTTATGAAGTGAAAATG GGATGGGTTA 3070 het 3070 ref 89 82 25 18 N/A 0 0 227676 CASAVA_Build 15 19990571 1D GCAAAAGTAA T/- TTTTTTATAA 3070 het 3070 ref 90 61 23 6 T 7 6 227677 CASAVA_Build 15 19990768 1I ACACTACTGG -/T GGGGAAGGTG 3070 het 3070 ref 96 72 13 11 T 0 1 227678 CASAVA_Build 15 19991952 1I ATTCACTGGT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 80 44 21 15 A 8 9 227679 CASAVA_Build 15 19992078 2D TCCTGGTGAG TC/-- ACACAACGAG 3070 het 3070 hom 69 21 27 22 TC 1 0 227680 CASAVA_Build 15 19992095 1D ACGAGCTCAC T/- TGTCCCCATC 3070 het 3070 ref 67 30 12 27 T 2 1 227681 CASAVA_Build 15 19995765 3I TCTGCTTTCT ---/CTA CTTTCTTATT 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 CTA 0 1 227682 CASAVA_Build 15 19995831 2D CATGCACGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 123 het 52 0 42 10 CA 9 8 227683 CASAVA_Build 15 19996240 9I CTGCTGATTA ---------/TCTCTTGGC TCTGTGAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 TCTCTTGGC 0 1 227684 CASAVA_Build 15 20010855 1I GCGAGGCGGG -/C GGATCACGAG 3070 hom 53 het 21 0 15 6 C 0 1 227685 CASAVA_Build 15 20012983 4I CACACACAAG ----/CACA CACACACACG 2098 het 735 hom 28 5 10 13 CA 4 6 227686 CASAVA_Build 15 20013320 4I CACACACAAG ----/CACA CACACACACG 1134 het 1134 ref 23 12 4 7 CA 4 6 227687 CASAVA_Build 15 20014957 1I CCCAGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 T 11 12 227688 CASAVA_Build 15 20018145 7I TTCCAAAGGC -------/TTTCAGA TGTGTCCTTT 3070 het 3070 hom 52 13 35 5 TTTCAGA 0 1 227689 CASAVA_Build 15 20020761 6D AGAGGCTTCC TTCTGG/------ TTCTGGCCCT 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 TTCTGG 2 1 227690 CASAVA_Build 15 20031593 1D TTAATCTGAG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 9 8 227691 CASAVA_Build 15 20032091 1D TCAAAATGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 10 9 227692 CASAVA_Build 15 20037020 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2701 hom 31 8 15 9 A 12 11 227693 CASAVA_Build 15 20038582 1D CGGTCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1252 hom 37 5 15 17 A 15 14 227694 CASAVA_Build 15 20039262 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 27 1 21 5 A 12 13 227695 CASAVA_Build 15 20040989 2D ACACACATAC CA/-- CACAGATACA 3070 het 3070 hom 94 24 29 44 CA 3 2 227696 CASAVA_Build 15 20041088 20D ACATGCCACA CACATATACACCCCACATAG/-------------------- CACATGTGTG 3070 het 3070 ref 94 23 22 67 CACATATACACCCCACATAG 1 0 227697 CASAVA_Build 15 20044170 1D GCCGACTTCT G/- GGGGGAAATG 1874 het 1874 ref 18 12 5 1 G 6 5 227698 CASAVA_Build 15 20044343 1D CTGTTCCCCC T/- GGAGGCTCTA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 1 0 227699 CASAVA_Build 15 20045722 1I TGGAGAGACT -/G GGGGGGGAGG 1975 het 1743 hom 19 5 5 9 G 7 8 227700 CASAVA_Build 15 20045992 1I AGCTGCCCCC -/G GGGCGCTTGG 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 G 3 4 227701 CASAVA_Build 15 20060150 4D TTCATTTGTA TTTC/---- TTTTATACTT 3070 het 3070 ref 58 31 21 8 TTTC 1 0 227702 CASAVA_Build 15 20061204 4D ACAAATAGAT ACTC/---- ACAGAACTTG 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 ACTC 1 0 227703 CASAVA_Build 15 20066006 1I TGGGGTTTCA -/C CCGTGTTAGC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 C 2 3 227704 CASAVA_Build 15 20067610 5D CAGGTAGAAA TATTT/----- TATTTTATGT 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 TATTT 2 1 227705 CASAVA_Build 15 20071678 5D ATCTTTGCGT ATTTA/----- ATTTATTTCC 3070 het 3070 ref 38 28 10 6 ATTTA 2 1 227706 CASAVA_Build 15 20073730 1D TATATTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 35 0 18 17 A 13 12 227707 CASAVA_Build 15 20081779 1I TGGAGCACTT -/G GGTACATTAT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 G 2 3 227708 CASAVA_Build 15 20084435 1I TTTGCTGTGC -/T TGCTTATACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 227709 CASAVA_Build 15 20084824 1I ATAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 41 1 32 8 T 10 11 227710 CASAVA_Build 15 20086152 4D AATATCTGAA AAAG/---- AAAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 48 29 13 8 AAAG 2 1 227711 CASAVA_Build 15 20086403 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 48 27 18 3 A 8 7 227712 CASAVA_Build 15 20086835 1I TCTTGAAAAA -/G GTATTTGGAT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 1 2 227713 CASAVA_Build 15 20087213 4D TGGGCACATG ATTT/---- ATTTATTTTC 1926 het 1926 ref 21 13 4 6 ATTT 3 2 227714 CASAVA_Build 15 20089428 5I TGTAAAATTT -----/CATTA CATGTATTTC 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 CATTA 0 1 227715 CASAVA_Build 15 20092799 4D GGCTGGCACT CAAA/---- CAGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 66 40 15 11 CAAA 1 0 227716 CASAVA_Build 15 20095505 5D AAAAAAAGAG AAGAT/----- AAGTATAGTC 3070 het 3070 ref 66 49 10 10 AAGAT 1 0 227717 CASAVA_Build 15 20199816 4D AATTAACATA TTAC/---- TTGTTATTAG 2636 het 1268 hom 21 4 6 13 TTAC 1 0 227718 CASAVA_Build 15 20199844 5I ATTTTAAACA -----/GTTAT GTTAAGTATA 2728 hom 15 het 12 0 6 6 GTTAT 0 1 227719 CASAVA_Build 15 20210584 3D TATATAATAT ATA/--- ATATCTATTA 2337 het 1865 hom 14 5 6 3 ATA 2 1 227720 CASAVA_Build 15 20220441 1D TTCAACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1160 hom 51 12 12 27 T 17 16 227721 CASAVA_Build 15 20224017 12D TTCACGGCAG CTCTTTCCATCA/------------ CAGGCTCAAA 3070 het 3070 ref 24 17 8 1 CTCTTTCCATCA 1 0 227722 CASAVA_Build 15 20224780 1I TAGATACACT -/G GGGGGTACCC 1412 het 1412 ref 49 42 5 2 G 5 6 227723 CASAVA_Build 15 20225974 1I TAGGCAGGGA -/G GGGGGAAGAA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 G 5 6 227724 CASAVA_Build 15 20228793 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 28 1 12 15 T 13 14 227725 CASAVA_Build 15 20232376 3I AGAGCAAATG ---/ATA ATATTTTTCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 ATA 1 2 227726 CASAVA_Build 15 20236434 1D TATTGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2523 hom 51 11 21 20 T 15 14 227727 CASAVA_Build 15 20242624 1D GGTTGCTTCA T/- CTAGGAGAAG 1319 het 1319 ref 55 48 3 6 T 1 0 227728 CASAVA_Build 15 20242868 1D ACAAAATGGG T/- TTCCTGTCTC 3070 het 3070 ref 84 49 21 16 T 3 2 227729 CASAVA_Build 15 20243363 1I TTTGTACAGG -/T ACAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 44 23 11 10 T 0 1 227730 CASAVA_Build 15 20246343 4I AAACCCAGTC ----/ATAT ATATATATTT 2640 het 2640 ref 24 10 7 7 AT 4 6 227731 CASAVA_Build 15 20246447 3D TTGGGTGGTT CTC/--- CTGCCAAAGC 2158 het 2158 ref 37 28 5 4 CTC 1 0 227732 CASAVA_Build 15 20247171 1I TTTTCTTTTT -/C TTTTTTCTTT 3070 het 532 hom 39 10 9 20 C 0 1 227733 CASAVA_Build 15 20247660 4D GAATTTGGAC GGCA/---- AGCGCGGCGG 3063 het 3063 ref 37 19 9 12 GGCA 1 0 227734 CASAVA_Build 15 20269241 2D CTAGTTCTGT AA/-- AGTTTCCTTA 1420 het 1420 ref 14 9 3 3 A 3 1 227735 CASAVA_Build 15 20292020 2D CTCTGGGCCC CT/-- GTTAGCCAGC 2293 het 2293 ref 68 53 5 11 CT 1 0 227736 CASAVA_Build 15 20308215 2I ACCATAGAGC --/AT ATATATATAT 2642 het 2642 ref 23 11 8 4 AT 7 8 227737 CASAVA_Build 15 20319584 1I AGGAATTTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 8 9 227738 CASAVA_Build 15 20323182 1D ACCTCTCCAG C/- CTCCTCACCC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 2 1 227739 CASAVA_Build 15 20332050 8D AAGGGAGGGA GGTGTAGG/-------- GGTGTAGGGT 3070 hom 96 het 34 0 32 5 GGTGTAGG 2 1 227740 CASAVA_Build 15 20339668 1D GATTGTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 22 1 10 11 T 15 14 227741 CASAVA_Build 15 20345568 1I CTCCGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 2619 hom 30 het 12 0 9 3 A 12 13 227742 CASAVA_Build 15 20401160 1D GGGTAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 1521 het 1521 ref 38 22 6 10 T 15 14 227743 CASAVA_Build 15 20435032 2D CCAAGTTAAC AG/-- GGGGTGGGTT 3070 het 3070 hom 41 16 17 9 AG 1 0 227744 CASAVA_Build 15 20458114 3I GTGTCCTAAT ---/CTC CTTGTCTTTT 1987 het 1987 ref 24 14 6 4 CTC 0 1 227745 CASAVA_Build 15 20458312 1I TAATTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1040 het 1040 ref 12 8 4 0 T 11 12 227746 CASAVA_Build 15 20460337 1I CCAGAAAGGG -/A AAAAAAAAAA 1308 het 1308 ref 30 12 8 10 A 15 16 227747 CASAVA_Build 15 20468616 8I3M1I CACTGTTCTT --------TGT-/TTGAATCATGTG TTTGAAGCAT 3070 het 3070 hom 42 20 20 4 N/A 0 0 227748 CASAVA_Build 15 20471146 4D GGCAGTTAGA GACG/---- GAGCAAAGTA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 GACG 1 0 227749 CASAVA_Build 15 20473993 3D GCTATGGCAT TTC/--- TTCTTCCAGC 3070 het 3070 hom 46 16 25 6 TTC 3 2 227750 CASAVA_Build 15 20475611 1D TTTTTCAATC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 26 12 8 7 T 7 6 227751 CASAVA_Build 15 20489632 1I TACTGATGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 9 10 227752 CASAVA_Build 15 20506749 1D CCCGCCTGCA C/- CCTCTCCCTG 1621 het 1621 ref 19 7 5 8 C 3 2 227753 CASAVA_Build 15 20524947 2I GGCAGCAGAC --/AA GAGAGAGAGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 2 227754 CASAVA_Build 15 20527714 2D AGAAAAATCA CT/-- CTGTACAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 CT 2 1 227755 CASAVA_Build 15 20533389 1I TTAGGGGTTA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 8 9 227756 CASAVA_Build 15 20540379 1D TTGGCTGTGT C/- CCCCACCCAA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 C 5 4 227757 CASAVA_Build 15 20546895 1I TCCAGGGTGG -/C CCCTGCTCTA 2624 het 2624 ref 30 17 7 6 C 3 4 227758 CASAVA_Build 15 20548611 4I ACATTTTCTT ----/TATA TATATATATA 3070 het 2747 hom 26 8 13 5 TA 6 8 227759 CASAVA_Build 15 20551382 1D ACAGCCACCT G/- GCTGCCCGGC 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 G 2 1 227760 CASAVA_Build 15 20554171 1I CCTATCTTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 18 10 9 A 9 10 227761 CASAVA_Build 15 20555565 4D TCTGAAAATC CTAA/---- CTAACTGAAT 3070 het 3070 hom 40 14 24 3 CTAA 2 1 227762 CASAVA_Build 15 20556654 4I ACTTCTTCAT ----/AAAC AAACAAACAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 AAAC 2 3 227763 CASAVA_Build 15 20556822 1I ATGAGCTAAA -/C TTTAAGAAAC 3070 het 3070 hom 40 11 22 7 C 0 1 227764 CASAVA_Build 15 20557657 4D TTAATTACAC CTTT/---- CTTAAAAAGC 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 CTTT 1 0 227765 CASAVA_Build 15 20567701 2D CCCTTTGCTC CA/-- CATTCTCCCT 3070 het 3070 ref 30 14 14 6 CA 2 1 227766 CASAVA_Build 15 20569250 1D AATTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2262 het 2166 hom 18 6 6 6 T 11 10 227767 CASAVA_Build 15 20588892 3I3M4I AACCTAACGA ---ACA----/GTGACAACCT AATTTGCTTG 3070 het 3070 ref 31 14 11 7 N/A 0 0 227768 CASAVA_Build 15 20591007 1I ATGGTGCCCG -/A AAACTTCATT 3070 het 3070 hom 14 7 7 0 A 3 4 227769 CASAVA_Build 15 20598212 2I ACCATCCATT --/AA GAGAGGATTT 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 A 0 2 227770 CASAVA_Build 15 20599834 2D TAACACAACT AC/-- AGACACATTC 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 AC 1 0 227771 CASAVA_Build 15 20601361 3D TGGGCCGATC AGG/--- AGATCAATAC 2658 het 1410 hom 12 4 6 2 AGG 1 0 227772 CASAVA_Build 15 20623419 1D ATACTGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1125 hom 32 7 12 13 T 13 12 227773 CASAVA_Build 15 20623553 1D ACCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1968 het 117 hom 13 2 8 3 T 12 11 227774 CASAVA_Build 15 20626694 4I GAATGTGACT ----/AGAA AGAAATATAT 1663 het 1663 ref 13 6 5 2 AGAA 1 2 227775 CASAVA_Build 15 20639050 2D GTCGCCCAGG CT/-- GGAGTGCAAT 3012 het 1435 hom 17 4 8 5 CT 1 0 227776 CASAVA_Build 15 20639538 1I AGAGGTGGGA -/G GGATGGCTTG 3070 het 2683 hom 28 10 14 4 G 2 3 227777 CASAVA_Build 15 20639994 2D GACTCCGTCT CA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 3 CA 1 0 227778 CASAVA_Build 15 20641881 1D CATACAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1564 hom 23 7 12 4 T 12 11 227779 CASAVA_Build 15 20642618 1D19M2I TACCATTTCA TGTTATATTTGTTTTATGAG--/-GTTATATTTGTTTTATGAGAC ACAGTTTCAT 1497 het 1497 ref 39 40 4 1 N/A 0 0 227780 CASAVA_Build 15 20642756 1D CTGAGATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 25 9 8 A 11 10 227781 CASAVA_Build 15 20645122 1D TACATAAGAT A/- AGGTAAACAT 3070 het 3070 ref 58 28 17 15 A 2 1 227782 CASAVA_Build 15 20647495 5I AAGGAATGAA -----/AATTG AATTGAATTG 1636 het 1636 ref 25 11 5 9 AATTG 2 3 227783 CASAVA_Build 15 20650010 4I AAGGGGCACA ----/GCAC AGGGGGAGGT 3070 het 3070 ref 41 25 11 5 GCAC 0 1 227784 CASAVA_Build 15 20650093 4D TGAGTCCTAC TTCT/---- CTCTCCATCT 3070 het 3070 ref 45 26 14 9 TTCT 1 0 227785 CASAVA_Build 15 20650321 1D GAGTATCAGA G/- GGTTCTGTTT 3070 het 3059 hom 21 9 10 2 G 3 2 227786 CASAVA_Build 15 20652040 1I CTTTCAAAAA -/G TCAACAAAGG 3070 het 389 hom 25 1 21 3 G 0 1 227787 CASAVA_Build 15 20652351 2I CTCTGGGCCC --/CT GTTAGCCAGC 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 CT 0 1 227788 CASAVA_Build 15 20658133 1I ATATGGAACA -/T TTTATCATCC 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 T 3 4 227789 CASAVA_Build 15 20659051 5D AGAGGCAGTA GAGAG/----- AAGATGAGAA 3070 het 3070 ref 44 28 11 9 GAGAG 1 0 227790 CASAVA_Build 15 20660077 1I AATATTTAAA -/T TTTTTTTAAT 2111 het 2111 ref 19 12 6 1 T 7 8 227791 CASAVA_Build 15 20669953 1I TCTACCATAC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 9 227792 CASAVA_Build 15 20670288 1I TATCCCATAT -/A TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 A 0 1 227793 CASAVA_Build 15 20678705 2D AAATAACTGT TC/-- TGTCTGGTTT 2346 het 2346 ref 40 33 7 1 TC 1 0 227794 CASAVA_Build 15 20688521 4I CTTGCCTTAT ----/TTGA TTAAGGCACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TTGA 0 1 227795 CASAVA_Build 15 20688852 1D TTTCTAAAAT A/- AAAAAGGTAC 3070 hom 38 het 19 0 13 6 A 6 5 227796 CASAVA_Build 15 20691097 1D TTAAAGCTCA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 9 8 227797 CASAVA_Build 15 20692098 4D TAAAAAAAAA AAGG/---- AAGAATACAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AAGG 1 0 227798 CASAVA_Build 15 20692675 2I AATAAAAGGT --/GA GAGAGGTCAG 3070 het 804 hom 29 2 21 6 GA 2 3 227799 CASAVA_Build 15 20692817 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 33 1 27 6 A 12 11 227800 CASAVA_Build 15 20698059 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1959 het 701 hom 18 4 6 8 A 17 16 227801 CASAVA_Build 15 20698644 2D AAGGAAACAT TA/-- AAATAAATTC 2357 het 2357 ref 39 32 5 3 TA 1 0 227802 CASAVA_Build 15 20699535 2D ACACAAATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AC 9 8 227803 CASAVA_Build 15 20709066 1D AGCAGGTGCC T/- TCCCAACCTC 3070 hom 68 het 27 0 22 6 T 2 1 227804 CASAVA_Build 15 20710474 1D TTCAAGAAGC T/- TTTTTCCAAA 3070 hom 58 het 28 0 21 7 T 6 5 227805 CASAVA_Build 15 20710805 3D TCGCAACCTA CTC/--- ATCTCACAAA 3070 hom 63 het 23 0 20 3 CTC 1 0 227806 CASAVA_Build 15 20715942 1I GAGATAATGG -/C TTTTGGAGTG 1369 het 1369 ref 27 22 3 2 C 0 1 227807 CASAVA_Build 15 20722691 1I TTAACTTAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 48 het 43 1 37 5 T 7 8 227808 CASAVA_Build 15 20729789 4D CATTGTCTTA TTTC/---- TTTCTTCACA 3070 hom 51 het 20 0 17 4 TTTC 2 1 227809 CASAVA_Build 15 20733182 1D TTTGGATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 11 10 227810 CASAVA_Build 15 20740118 1I TTAATGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 9 10 227811 CASAVA_Build 15 20754666 2I AGATATATTT --/TA TATATATATA 2283 hom 15 het 7 0 6 2 TA 6 7 227812 CASAVA_Build 15 20754751 2I ATATACATAT --/AC ATATATACGT 1671 hom 10 het 4 0 4 0 AC 0 1 227813 CASAVA_Build 15 20759040 5D CTAATGCGGT TATTC/----- TAAACTGATG 1090 het 1090 ref 41 35 3 6 TATTC 1 0 227814 CASAVA_Build 15 20760305 1I AATATGAATG -/A AAAAAAAAAA 1924 het 34 hom 6 1 4 1 A 10 11 227815 CASAVA_Build 15 20760510 1I CGGTCCAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 933 hom 23 2 15 6 A 10 11 227816 CASAVA_Build 15 20760907 1D GCTCTTCGCC A/- AAAAATAACG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 5 227817 CASAVA_Build 15 20762164 1I AAGATAATAA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 47 het 32 0 16 16 T 7 8 227818 CASAVA_Build 15 20768861 4I TATGCATGTG ----/TGTT TGTACAGATG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TGTT 0 1 227819 CASAVA_Build 15 20771371 4D TAATAATAAA TAAC/---- TAACATTTAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TAAC 2 1 227820 CASAVA_Build 15 20772438 4D4M2I CTTTTCACAG TGCCTTGG--/----GTAGTA ATTCAAGGGC 1539 hom 15 het 6 0 6 0 N/A 0 0 227821 CASAVA_Build 15 20774099 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 20 1 14 5 A 11 12 227822 CASAVA_Build 15 20778347 2I AGTCTCCAAC --/AG AGTTTCTTTC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AG 1 2 227823 CASAVA_Build 15 20779851 2I ATATATACAC --/AT GTGTATGTGT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 0 1 227824 CASAVA_Build 15 20780528 3D TGCTCTTTAC ATT/--- ATTAGGGTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 ATT 2 1 227825 CASAVA_Build 15 20780845 26D AAATTTAAAC ATTTTCCAATTGACAATTGGTTTAGT/-------------------------- ATTTTCCAAT 3070 hom 25 het 11 0 9 4 ATTTTCCAATTGACAATTGGTTTAGT 2 1 227826 CASAVA_Build 15 20791161 1D TTTTAGTGTA T/- TTTTTCAGGT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 6 5 227827 CASAVA_Build 15 20793674 1I GAATTTAGGG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 T 7 8 227828 CASAVA_Build 15 20796371 2I AGGAAGTGAC --/AA GAGAGAAAGC 3049 het 3049 ref 28 15 9 4 A 0 2 227829 CASAVA_Build 15 20796687 1I ACACAGGAAA -/G AAAACATGAC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 G 0 1 227830 CASAVA_Build 15 20800159 1D ATTTTGTGTA T/- TTTTTAGTAG 1356 het 1356 ref 10 6 3 1 T 6 5 227831 CASAVA_Build 15 20801454 1I TATTTAAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 23 9 8 6 T 9 10 227832 CASAVA_Build 15 20804960 1I GTAGGTTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 9 10 227833 CASAVA_Build 15 20809706 4D TAATGATTGT TCTC/---- TCTACCTCTC 3070 het 2622 hom 19 7 10 2 TC 3 1 227834 CASAVA_Build 15 20816777 1I GGCAGGAAGA -/G GGGGGCTCCC 1191 het 1191 ref 10 6 3 1 G 5 6 227835 CASAVA_Build 15 20817602 1D ATGGGAGTGA T/- AACCTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 30 8 2 T 1 0 227836 CASAVA_Build 15 20840082 6D TATGCACCAA TTTAAT/------ TTCTGTCACT 3070 het 2290 hom 29 5 23 5 TTTAAT 1 0 227837 CASAVA_Build 15 20854315 3I TTGCTCAGCG ---/TCT TCTTTTGATC 1407 het 1407 ref 21 16 3 2 TCT 1 2 227838 CASAVA_Build 15 20860710 4D TACTAGAGAA TGCC/---- AGCCAGCTGA 1155 het 1155 ref 44 36 3 7 TGCC 1 0 227839 CASAVA_Build 15 20865739 4D ACACGTATGC ACAA/---- ACAGATGCAA 3070 het 3070 ref 44 30 13 1 ACAA 1 0 227840 CASAVA_Build 15 20866014 2D AGGCACTCAT AC/-- ACATTTACAC 3070 het 3070 ref 47 29 15 4 AC 2 1 227841 CASAVA_Build 15 20890315 2D TCGGAGAGCT AC/-- ACAGAGGAGG 1793 het 1424 hom 7 3 4 0 AC 2 1 227842 CASAVA_Build 15 20968199 1D GAAAAAAAAA T/- GAATGATTTG 3070 het 3070 ref 93 76 9 9 T 1 0 227843 CASAVA_Build 15 20975964 2I ATTATTATTA --/TT TTTTTTTTTG 2472 het 2472 ref 25 10 6 9 T 9 11 227844 CASAVA_Build 15 20977232 2I CAGAAAAAAC --/AT ATCTCTCCAA 2314 het 2314 ref 23 15 5 3 AT 1 2 227845 CASAVA_Build 15 20984525 1I AATTTTTGTT -/A AAAAAAAATT 2582 het 2582 ref 99 88 6 5 A 8 9 227846 CASAVA_Build 15 20997187 1D ACGTGGTGGG A/- GTTCAAACAC 1808 het 1808 ref 23 18 4 1 A 1 0 227847 CASAVA_Build 15 21001529 2I CTATGCATAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 82 46 22 14 AT 4 5 227848 CASAVA_Build 15 21065074 1I GCAGCCTCTA -/T TTTTTTTTTA 1896 het 1426 hom 15 4 8 3 T 9 10 227849 CASAVA_Build 15 21065232 3I TCCAAGTGTC ---/TCG TCAATGAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 TCG 0 1 227850 CASAVA_Build 15 21146197 7D ACTCCGTGGC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1432 het 1432 ref 16 11 5 4 A 18 11 227851 CASAVA_Build 15 21146272 1I AAGTATACAC -/A AGGCCTTTCA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 1 2 227852 CASAVA_Build 15 21154578 2I TCATGTTTCC --/AG ATGAAGTAGT 2088 het 2088 ref 24 16 5 3 AG 0 1 227853 CASAVA_Build 15 21159993 1D TCCTGGGAGC G/- GGGGGCCACC 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 G 6 5 227854 CASAVA_Build 15 21172258 1I ACTTAGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 454 hom 31 1 23 7 A 11 12 227855 CASAVA_Build 15 21175301 1D CAGCGCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 26 2 18 6 A 14 13 227856 CASAVA_Build 15 21189768 2D CAGCCCCTGA GT/-- GTGTGTGTGT 2713 hom 15 het 8 0 6 2 GT 7 6 227857 CASAVA_Build 15 21229661 1I TGGGTAAGAG -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 60 48 9 3 T 7 8 227858 CASAVA_Build 15 21236446 3I CCTTCTCTCG ---/CAT CATCTCCTCC 2750 hom 47 het 21 0 11 10 CAT 1 2 227859 CASAVA_Build 15 21238912 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 28 0 22 6 T 11 10 227860 CASAVA_Build 15 21241509 5I GACCTCCCCT -----/TGTGC TGTGCCCCTT 2335 hom 21 het 10 0 7 3 TGTGC 1 2 227861 CASAVA_Build 15 21242449 2D GAAAACTGTT AA/-- AGTCTCTCTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 3 1 227862 CASAVA_Build 15 21243886 2D AGTTTTTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 23 0 15 8 A 12 10 227863 CASAVA_Build 15 21245378 1I TCTTGTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 27 1 20 6 T 12 13 227864 CASAVA_Build 15 21245548 1D7M1I CCGGCTAATT GTTTTGTA-/-TATTATAG TTTTTGGTAG 863 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 227865 CASAVA_Build 15 21248008 1D CAGTGTAATG T/- TTTTCAACTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 5 4 227866 CASAVA_Build 15 21250408 1D CATTTTTAGT G/- AGAGATGGGG 3051 hom 21 het 9 0 7 2 G 1 0 227867 CASAVA_Build 15 21250829 4I TCTATGTTGG ----/TTGT TTAATTACTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTGT 0 1 227868 CASAVA_Build 15 21258759 1D CACCATTCTC T/- TGCCTCAGCC 1901 het 468 hom 7 1 5 1 T 2 1 227869 CASAVA_Build 15 21260750 1I AGGTAATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 34 1 27 6 T 10 11 227870 CASAVA_Build 15 21263514 4D AAGATCAATT AGAC/---- AGTTTGGTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 AGAC 1 0 227871 CASAVA_Build 15 21271521 2I GTGTGTGTTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 114 hom 47 1 37 9 TG 6 7 227872 CASAVA_Build 15 21272733 1D GAAACATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 12 11 227873 CASAVA_Build 15 21273830 1D CCTTCATAGT C/- GGGGGGAGCC 3070 hom 48 het 20 0 15 5 C 1 0 227874 CASAVA_Build 15 21275127 1D CTGGGTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 26 7 T 11 10 227875 CASAVA_Build 15 21277738 1D GCTTTTTTTT G/- AACTACGTAT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 G 1 0 227876 CASAVA_Build 15 21285773 2I GAAAAAAAAA --/AC AAACAGACAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AC 0 1 227877 CASAVA_Build 15 21289081 1D CTTATGCATA C/- ACACATGTGC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 C 1 0 227878 CASAVA_Build 15 21289192 3I TCCTTTCAAA ---/CTT CTTATTAGAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CTT 1 2 227879 CASAVA_Build 15 21289522 1D ACCTCGTGAT C/- CCGCCCGCCT 2366 hom 4 het 15 0 9 6 C 3 2 227880 CASAVA_Build 15 21298076 1D GCAATGAGCC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 99 het 37 0 33 6 A 6 5 227881 CASAVA_Build 15 21325071 2I GAGACATAAC --/AG AATTATATGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AG 0 1 227882 CASAVA_Build 15 21326084 11D CAGTAGTCTC AAGTACATATT/----------- AAGTACATAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 11 AAGTACATATT 2 1 227883 CASAVA_Build 15 21326595 1D CAACACAAAT A/- TATAAATACA 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 A 1 0 227884 CASAVA_Build 15 21326729 3I GCAGTTTTTT ---/TTG TTTGTTTGTT 1775 het 1775 ref 15 8 4 3 TTG 0 1 227885 CASAVA_Build 15 21334499 1I TACAAGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 21 0 18 3 A 10 11 227886 CASAVA_Build 15 21340636 1D ACTGGAAGCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 T 9 8 227887 CASAVA_Build 15 21341564 8I TGTGTATATA --------/TATATATC TATATATATA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 TATATATC 0 1 227888 CASAVA_Build 15 21347046 4I TTACACTTTC ----/TTGT TTAAGTTTAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TTGT 0 1 227889 CASAVA_Build 15 21351975 1D AGCCATACCA T/- TTCTGGCCAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 T 3 2 227890 CASAVA_Build 15 21357540 3D ATCTGTAGAC AGA/--- AGATTTCTTG 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 AGA 2 1 227891 CASAVA_Build 15 21364922 1D CAGGTGCTGT G/- GACTCTCTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 G 2 1 227892 CASAVA_Build 15 21366433 4I GAAACATAGG ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 31 0 19 12 T 12 16 227893 CASAVA_Build 15 21367109 2D ACACATGCAA AT/-- ATACTAAGAG 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 AT 2 1 227894 CASAVA_Build 15 21370833 1I TAGCACAGGT -/A AAAAGAGAGC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 4 5 227895 CASAVA_Build 15 21373343 4I AATTCACAAC ----/AGAT ATTCTATTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AGAT 0 1 227896 CASAVA_Build 15 21373670 2D ACACACACAA AC/-- ACACATTCAC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AC 3 2 227897 CASAVA_Build 15 21374558 1D CCAGGCCTCT G/- GAAGTTCTGA 3070 hom 84 het 30 0 27 3 G 2 1 227898 CASAVA_Build 15 21375110 1D TGTGTGTGTG T/- TTTGTGTTTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 3 227899 CASAVA_Build 15 21375202 2I TTGATCTGTT --/GG GGGGGGGGCA 3070 hom 36 het 16 0 11 5 G 8 10 227900 CASAVA_Build 15 21375910 1I ATCAAACTAT -/A AAAAAAGTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 7 227901 CASAVA_Build 15 21376625 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 380 hom 32 1 22 9 A 10 9 227902 CASAVA_Build 15 21377308 1D GGTGACAGAG C/- CAAGACCCTG 3070 hom 51 het 23 0 18 6 C 2 1 227903 CASAVA_Build 15 21378980 4D AGAAACTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TTTG 3 2 227904 CASAVA_Build 15 21387216 1I ACCATGGGTA -/T TTCTTTCAAT 3070 hom 128 het 48 0 41 7 T 2 3 227905 CASAVA_Build 15 21392106 1I AGATAATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 5 hom 32 2 27 3 T 9 10 227906 CASAVA_Build 15 21421610 1D AGATTCAATT C/- CAGGAATTTA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 C 2 1 227907 CASAVA_Build 15 21428543 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 10 11 227908 CASAVA_Build 15 21448059 3I TACAATAAGG ---/TGT TGTTGTCGCA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 TGT 2 3 227909 CASAVA_Build 15 21448282 1D ATGAGGTTTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 A 9 8 227910 CASAVA_Build 15 21470871 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1139 hom 30 8 11 12 A 16 14 227911 CASAVA_Build 15 21535162 1D CCTCCCGCCT C/- CCCCCACCCC 1387 hom 7 het 3 0 3 0 C 6 5 227912 CASAVA_Build 15 21536620 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 499 hom 24 2 12 10 A 16 15 227913 CASAVA_Build 15 21543814 1I GTATGTCTTC -/T TTTTGAGAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 4 5 227914 CASAVA_Build 15 21546317 1D GTGAGCCACC G/- CGCCCAGCTG 3070 hom 106 het 41 0 35 6 G 1 0 227915 CASAVA_Build 15 21547545 1I ATATTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 37 1 30 6 T 10 11 227916 CASAVA_Build 15 21564816 2D ACATAGTATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 TA 6 5 227917 CASAVA_Build 15 21568635 2I GTGTGTGTGT --/GC GCGCGCTTGT 3070 het 404 hom 26 1 22 3 GC 3 4 227918 CASAVA_Build 15 21573654 1D AGAAGATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 43 0 33 10 T 13 12 227919 CASAVA_Build 15 21573908 1D TAGCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 12 11 227920 CASAVA_Build 15 21579708 1I AATGGGCTTC -/T TTCCAGAGCC 3070 hom 65 het 25 0 21 4 T 2 3 227921 CASAVA_Build 15 21583620 1D TGTTCTCCAC T/- TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 43 32 3 9 T 12 11 227922 CASAVA_Build 15 21586263 1D TTTTAAAGTG T/- TTAAGACATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 3 2 227923 CASAVA_Build 15 21586789 4D ATTCATATTT AAAG/---- AATTGACTAC 3070 hom 120 het 42 0 41 3 AAAG 1 0 227924 CASAVA_Build 15 21588251 1D ACAACGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 32 0 20 13 T 12 11 227925 CASAVA_Build 15 21591525 2D CCCAAGGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 2017 het 387 hom 31 7 10 15 A 20 18 227926 CASAVA_Build 15 21592948 1I TTAGTGAGGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 8 9 227927 CASAVA_Build 15 21595048 1D GTGGTGGCAT C/- CCACAACTGG 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 C 3 2 227928 CASAVA_Build 15 21595370 1D GGCACTGGCC A/- AAAAAACAGA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 7 6 227929 CASAVA_Build 15 21598512 1I GAAATACCTG -/A GACTGGGTAA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 0 1 227930 CASAVA_Build 15 21604041 2I TCCAGATGGC --/TG TGTGTGGACA 3070 het 3070 ref 51 27 16 8 TG 3 4 227931 CASAVA_Build 15 21604491 1D TCCTATTGTC T/- TGAGCTCAGG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 2 1 227932 CASAVA_Build 15 21606361 2I GTTACATAAA --/AT AGTGGTGCAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 AT 0 1 227933 CASAVA_Build 15 21608920 2D TTAAAAAAAA AT/-- AAAAGAAGAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 AT 1 0 227934 CASAVA_Build 15 21614502 1I TATCTTTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1583 hom 30 5 22 3 A 12 13 227935 CASAVA_Build 15 21624185 4I TTCCATAGAT ----/TGTC TTTTCATCCT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TGTC 0 1 227936 CASAVA_Build 15 21627207 1I ATGTCAATAC -/T TTTTTTTTTT 2072 het 2072 ref 20 9 7 4 T 11 12 227937 CASAVA_Build 15 21637318 2D AAAAACAAAA AC/-- AAAAACATGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AC 1 0 227938 CASAVA_Build 15 21665542 1D AAGCAACGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 38 0 30 10 A 10 9 227939 CASAVA_Build 15 21666098 2D AGGGAGTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 37 0 28 9 T 12 10 227940 CASAVA_Build 15 21675141 3D TGTCTTGTAG ACA/--- ACAACACATA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 ACA 3 2 227941 CASAVA_Build 15 21676833 1D CAGGATCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 35 0 25 13 T 12 11 227942 CASAVA_Build 15 21677021 1I TTAGTGGAAA -/G GGGGGGTCTC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 G 6 7 227943 CASAVA_Build 15 21677255 1D TGGGGATGGA C/- CCAGCCTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 3 2 227944 CASAVA_Build 15 21680145 2I TTTTATATTT --/GA GTTTTTTTAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 GA 0 1 227945 CASAVA_Build 15 21683090 1I AAAGTCAAGA -/C TTTTGCTTTT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 C 0 1 227946 CASAVA_Build 15 21683683 1I CAAAGTCCCT -/A AACTCTCTGA 3070 hom 157 het 56 0 53 3 A 2 3 227947 CASAVA_Build 15 21685877 4I GCTTTTTGAA ----/TGAG TAAGTTAAAT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 TGAG 0 1 227948 CASAVA_Build 15 21686329 1I ACTACATCTC -/A AAAAAAAAAA 2471 het 314 hom 19 1 8 10 A 14 15 227949 CASAVA_Build 15 21695328 1D TTTTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 2870 het 2870 ref 23 12 8 3 T 12 11 227950 CASAVA_Build 15 21695413 1D CTCATGTTGA T/- TTCGACTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 3 2 227951 CASAVA_Build 15 21699320 1D CACCCCCCTT A/- TCCCCCTCCA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 1 0 227952 CASAVA_Build 15 21703831 1D GGAGGACTGT C/- CCCCTCATCC 3070 hom 101 het 41 0 32 10 C 5 4 227953 CASAVA_Build 15 21705117 5D2M1D ATACTAATGT ATATCTAT/-----TA- TAGATTGAAT 3070 het 3070 hom 35 13 21 5 N/A 0 0 227954 CASAVA_Build 15 21715767 8I TATAAGCCAA --------/GAGATCAG GATATTTGGG 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 GAGATCAG 0 1 227955 CASAVA_Build 15 21716634 24D ATATTACACA TTTATCCCTCACTAATATCCACAG/------------------------ TTTATTCAGA 3070 het 3070 ref 34 22 12 5 TTTATCCCTCACTAATATCCACAG 1 0 227956 CASAVA_Build 15 21724854 2I ATGATCTCAG --/TT TTTTTTTTTT 1286 het 1286 ref 25 8 8 10 T 14 16 227957 CASAVA_Build 15 21727644 1D TCATCTACAA C/- CCAAATGTGT 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 C 3 2 227958 CASAVA_Build 15 21728349 1D GTTGAAACTT A/- ATGTTTATTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 2 1 227959 CASAVA_Build 15 21731075 1I TTTTTCTTAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 9 14 10 T 7 8 227960 CASAVA_Build 15 21734867 3D CATTCCCCCT TCC/--- TCCTCCCATT 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 TCC 3 2 227961 CASAVA_Build 15 21736466 1D CTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 10 9 227962 CASAVA_Build 15 21736956 21I TTTACTATGC ---------------------/ATACTTTATTGTTCTTTGCCA AGATTAATTT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 ATACTTTATTGTTCTTTGCCA 0 1 227963 CASAVA_Build 15 21739824 1I GTTAAACCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3009 hom 23 8 12 3 T 9 10 227964 CASAVA_Build 15 21740845 1D GTCTCAAAAA T/- AAATAAATAA 3026 het 387 hom 8 1 7 0 T 1 0 227965 CASAVA_Build 15 21742092 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2468 hom 26 6 13 7 T 9 8 227966 CASAVA_Build 15 21743578 1I CTGAGCATCT -/G GGACTACAGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 2 3 227967 CASAVA_Build 15 21755228 4I TTTAATGGGG ----/TTAT TTGTTTGTTT 3070 hom 79 het 34 0 26 8 TTAT 0 1 227968 CASAVA_Build 15 21755651 1D GGAGTCTTTT C/- CCCATTGCTT 3070 het 3070 ref 42 17 20 5 C 4 3 227969 CASAVA_Build 15 21755775 1D CAATGCTCTC T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 T 8 7 227970 CASAVA_Build 15 21756750 4I TTTTGTGTGA ----/TTTC TCATGATGAC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TTTC 0 1 227971 CASAVA_Build 15 21756977 1D CTAATGATTA T/- TTTTCTTAAG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 5 4 227972 CASAVA_Build 15 21757643 1I TCTTTTTTTT -/A AAAAAGAATA 1429 het 1429 ref 20 9 7 4 A 5 6 227973 CASAVA_Build 15 21759179 2D GGTTCCCGGC TG/-- TGAAGTCAGC 3070 hom 105 het 40 0 35 6 TG 2 1 227974 CASAVA_Build 15 21760425 1D15M4D CATCTTTGTG AAAATATCGTATTGTCTTAG/-AAATATCGTATTGTC---- TTAGTGAGAG 3070 het 3070 ref 17 13 7 0 N/A 0 0 227975 CASAVA_Build 15 21762147 3D TGGCCCTTTA TTC/--- TTACTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 18 20 1 TTC 1 0 227976 CASAVA_Build 15 21762924 1I CCTTGTGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 9 10 227977 CASAVA_Build 15 21763099 1I TAGAAAAATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 8 9 227978 CASAVA_Build 15 21763892 3I AATTTGTCTA ---/TTC TTCTTAATTT 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 TTC 1 2 227979 CASAVA_Build 15 21764881 1I AGCATCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 35 4 20 11 T 15 16 227980 CASAVA_Build 15 21765836 14D CCTCAGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2806 hom 19 11 8 5 A 26 12 227981 CASAVA_Build 15 21766602 1D TTTGATAGTA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 T 8 7 227982 CASAVA_Build 15 21767277 1I ATTATTTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 A 9 10 227983 CASAVA_Build 15 21768520 2I TTTAGCAATA --/TG TTTTTTTTTA 3070 hom 95 het 40 0 34 6 TG 0 1 227984 CASAVA_Build 15 21773853 1I AGTCTTGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 11 12 227985 CASAVA_Build 15 21774152 1D CCATGTTAAA T/- GAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 T 1 0 227986 CASAVA_Build 15 21775920 1I TTCACTCGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 9 10 227987 CASAVA_Build 15 21775977 14D GTGGTGGGAT CTTGGCTCACTGCA/-------------- CTTCCGCCTC 2255 het 2255 ref 17 10 7 2 CTTGGCTCACTGCA 1 0 227988 CASAVA_Build 15 21776179 8I GGGATTACAG --------/GCGTGAGC CACCGCGCCC 3070 hom 54 het 19 0 19 1 GCGTGAGC 0 1 227989 CASAVA_Build 15 21778894 5I TCTGTTACTT -----/AAAAC AAATACCTGG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AAAAC 0 1 227990 CASAVA_Build 15 21779348 1I TCTATAGTTC -/A AAGGCTTAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 3 227991 CASAVA_Build 15 21781318 12I GAACTTTGTT ------------/CCATAAGGAATC TTAGATTAGA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CCATAAGGAATC 0 1 227992 CASAVA_Build 15 21782216 1I ACTGGCGTGA -/G GCCACCACAC 3070 hom 72 het 34 0 25 9 G 1 2 227993 CASAVA_Build 15 21782686 1D CACTCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1307 hom 25 4 13 9 T 16 15 227994 CASAVA_Build 15 21783718 2D TTGTTCAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 12 10 227995 CASAVA_Build 15 21784868 3I24M1I CTTTTATAAA ---TCTATAAGTTGCTTAAACCTTCAG-/TCTTCTATAAGTTGCTTAAACCTTCAGT GTTTTCCTTT 2115 het 2115 ref 23 22 5 2 N/A 0 0 227996 CASAVA_Build 15 21784987 2I TTTTACCAAA --/AC ACATATAATT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 AC 1 2 227997 CASAVA_Build 15 21785378 2D TCTATAAAAC TG/-- TCTTTATTAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 TG 1 0 227998 CASAVA_Build 15 21785709 1I AAAATGTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 T 13 14 227999 CASAVA_Build 15 21787161 1I GAGGTTAGGA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 7 8 228000 CASAVA_Build 15 21795437 7I GGGGGTGCAT -------/AGTAGAG AGTAGAGTCA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 AGTAGAG 1 2 228001 CASAVA_Build 15 21796244 2D CATTTCACTC AT/-- GTGTGATGAA 3070 het 3070 hom 41 17 21 6 AT 1 0 228002 CASAVA_Build 15 21796352 1I CTCTCTGGAC -/T TTTGAACCTT 3070 het 3070 ref 42 25 14 3 T 3 4 228003 CASAVA_Build 15 21796854 2D ACATAAGGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 13 6 T 14 12 228004 CASAVA_Build 15 21799566 12I18M4I GACTGTGGTT ------------TTCATTCTACAGAGAAAG----/CTCATTATAAGCTTCATTCTACAGAGAAAGCAGT CAGGAGGTTA 3070 het 3070 ref 29 17 12 5 N/A 0 0 228005 CASAVA_Build 15 21799951 2D CCAACTCTTA AT/-- ATCCTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 AT 2 1 228006 CASAVA_Build 15 21800920 1I ATTCATGGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 19 17 0 A 8 9 228007 CASAVA_Build 15 21805014 1I GGGAAAGAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 8 9 228008 CASAVA_Build 15 21806032 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 T 9 8 228009 CASAVA_Build 15 21812416 1I ATCATCCCTA -/C CCCACAAACA 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 C 3 4 228010 CASAVA_Build 15 21812627 1I TATAATGGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 T 8 9 228011 CASAVA_Build 15 21813117 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 A 12 11 228012 CASAVA_Build 15 21815767 2I AAGGATCTAA --/AT GAATTGTAAT 3070 het 3070 hom 56 24 29 3 AT 0 1 228013 CASAVA_Build 15 21816869 2D AATCTCAAAG CT/-- CTAGCAGAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CT 2 1 228014 CASAVA_Build 15 21817121 2D ATACTGTAAC TG/-- TAATCTCTAC 3070 het 3070 hom 35 15 16 6 TG 1 0 228015 CASAVA_Build 15 21817357 1I AATCTATTCC -/A AAAAAGTGAA 3070 het 1207 hom 18 4 10 4 A 5 6 228016 CASAVA_Build 15 21819951 1D14M1I ATAAGAGGTA TTTTTATGTAAATAG-/-TTTTATGTAAATAGA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 18 23 4 N/A 0 0 228017 CASAVA_Build 15 21821687 3I AGAAAAATCA ---/TAT TATTCTCATA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 TAT 1 2 228018 CASAVA_Build 15 21822159 3D TGAAGCCCCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 27 3 13 11 T 16 13 228019 CASAVA_Build 15 21823341 1I TTAGAAACTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 7 8 228020 CASAVA_Build 15 21824082 2D GGAATGAGAA AG/-- AGAGTGTATG 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 AG 3 2 228021 CASAVA_Build 15 21854383 6I GGTTAGTTAT ------/TCATCA TCTGTGGTAG 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 TCA 0 2 228022 CASAVA_Build 15 21854608 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2403 het 2403 ref 15 8 6 1 T 12 11 228023 CASAVA_Build 15 21864318 3D CCTCCCAAAA TAG/--- TAGTGCTATC 3070 het 3070 ref 31 15 12 7 TAG 2 1 228024 CASAVA_Build 15 21864422 3D ACTTGGCCCC GTG/--- GTGGCATACG 3070 het 3070 hom 34 15 15 6 GTG 2 1 228025 CASAVA_Build 15 21865312 2D GGAGTGGAAG TT/-- TTTTTTTTTT 2864 het 2416 hom 26 10 9 8 T 16 14 228026 CASAVA_Build 15 21873781 1I CTTTTTAAAA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 2150 hom 22 6 12 4 T 8 9 228027 CASAVA_Build 15 21875247 1I ATCTTGATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 10 11 228028 CASAVA_Build 15 21876983 1D TAATCATCAC G/- TATAGAGAAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 G 1 0 228029 CASAVA_Build 15 21883076 1I CAATGGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 10 11 228030 CASAVA_Build 15 21884694 1D TTATCAACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1871 hom 18 7 7 4 T 12 11 228031 CASAVA_Build 15 21893062 2I GCGTGGACAC --/AA AGGCAGAGTG 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 A 1 3 228032 CASAVA_Build 15 21895973 1I CACTAGATAA -/G GTTTACCTCC 1379 het 1379 ref 18 12 3 3 G 1 2 228033 CASAVA_Build 15 21896816 1D CTTCTTCAGT A/- AAAAAAAAAA 1974 het 1974 ref 23 11 6 6 A 13 12 228034 CASAVA_Build 15 21900023 2D ATATATACAC AT/-- ATATATATGA 3011 het 3011 ref 22 11 7 4 AT 5 4 228035 CASAVA_Build 15 21902003 1I GATCTCATTC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 T 7 8 228036 CASAVA_Build 15 21903489 1D CTAAGTCCCA T/- TTATTTGTTT 2923 het 2923 ref 24 15 6 3 T 3 2 228037 CASAVA_Build 15 21911578 1D TGGAGATATA G/- GGAGACTATG 2621 het 2621 ref 26 17 7 2 G 3 2 228038 CASAVA_Build 15 21923841 1D GGTTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 T 13 12 228039 CASAVA_Build 15 21930278 3I AAGACTTATT ---/AAC AATTCCTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AAC 0 1 228040 CASAVA_Build 15 21932399 2I CTCAAAGGTC --/TT ATACACTCAC 2587 het 2587 ref 47 36 6 5 T 0 2 228041 CASAVA_Build 15 21937065 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 A 10 11 228042 CASAVA_Build 15 21941133 3D TAGAGATTTT TTG/--- TTGTTTTGTT 3070 het 1986 hom 21 6 12 4 TTG 2 1 228043 CASAVA_Build 15 21942302 1D TGCTGTAGCG T/- TGGTGGCTCA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 T 2 1 228044 CASAVA_Build 15 21945636 5D AGTTCTCATT TTTTA/----- AAGACATATC 3070 het 3070 hom 28 12 14 5 TTTTA 1 0 228045 CASAVA_Build 15 21950099 3D AGAGAGAGAG TTA/--- TTATTGGGCT 3070 het 3070 hom 34 16 16 6 TTA 2 1 228046 CASAVA_Build 15 21950410 8I TCGGCAGTAA --------/CCACCTCT CCACCTCTCA 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 CCACCTCT 1 2 228047 CASAVA_Build 15 21963754 1I AAAGTGTTAA -/G AACTGAATAG 2209 het 2209 ref 21 13 5 3 G 0 1 228048 CASAVA_Build 15 21969112 1I AGCATATCTC -/T TATTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 12 8 12 T 1 2 228049 CASAVA_Build 15 21970226 1D TGCAACCAAC A/- CAGAGTTTCC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 1 0 228050 CASAVA_Build 15 21976990 6I ACAGAACAGT ------/TGTAAA TGTAGTACAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TGTAAA 0 1 228051 CASAVA_Build 15 21978216 1I TCGGCTGCTA -/T TTTTTTTTTT 2527 het 2527 ref 23 13 8 2 T 10 11 228052 CASAVA_Build 15 21978752 2I AGTGAAATTC --/CT CTCTTTGATA 2937 het 2937 ref 27 13 10 4 CT 2 3 228053 CASAVA_Build 15 21984317 2D GACAAAAGAC AA/-- GAGAAATATC 3070 het 3070 hom 23 12 11 0 A 2 0 228054 CASAVA_Build 15 21985710 1D TGTAGATGAT C/- CTGTGAACAG 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 C 2 1 228055 CASAVA_Build 15 21993837 4D TCTTACATTC ATTT/---- GAGACATTTG 3070 hom 36 het 14 0 13 2 ATTT 1 0 228056 CASAVA_Build 15 22007659 1D CTTTCAAACT G/- GGTGATGGGC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 G 3 2 228057 CASAVA_Build 15 22008842 5I CCAACCAACC -----/AAACT GTTAGGGCCC 1762 het 1762 ref 48 35 4 9 AAACT 0 1 228058 CASAVA_Build 15 22008933 2D GATCCAACTT TA/-- TGTTTCCTCC 2212 het 2212 ref 34 26 5 4 TA 1 0 228059 CASAVA_Build 15 22009163 24I TCTGCATTGC ------------------------/ATTCCTCGGCAACTGCCTCAGGGG AGTCCATTAC 3070 hom 30 het 14 0 11 3 ATTCCTCGGCAACTGCCTCAGGGG 0 1 228060 CASAVA_Build 15 22016449 3I TTTCAGTTTT ---/CTC CTATCATTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CTC 0 1 228061 CASAVA_Build 15 22016502 1D TTCCTTTACC T/- TTTTTTTTTT 2464 het 2049 hom 24 6 6 12 T 12 11 228062 CASAVA_Build 15 22016675 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 8 9 228063 CASAVA_Build 15 22023840 1D ATTATATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 31 4 19 8 T 15 14 228064 CASAVA_Build 15 22041683 1I AGAACATGGA -/G GCATTTGGTT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 G 1 2 228065 CASAVA_Build 15 22055190 1D CTTGGTTTTT G/- GTTTTGTGTA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 G 2 1 228066 CASAVA_Build 15 22057627 3I TTATGTACAT ---/AAC AATTGTTACT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 AAC 0 1 228067 CASAVA_Build 15 22064822 1I GAAAAAAAAA -/T AAAATGTCCC 3070 hom 54 het 27 0 17 10 T 0 1 228068 CASAVA_Build 15 22067233 4I CTGCATGTGG ----/CTAT CTTATTTCCC 1364 het 1364 ref 33 26 3 4 CTAT 0 1 228069 CASAVA_Build 15 22081855 1D GTCACATTGA G/- GTTTTGATTT 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 G 2 1 228070 CASAVA_Build 15 22095165 1I CATGACTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 9 10 228071 CASAVA_Build 15 22099467 1I TCTGTTACTT -/A ACAACAGAAT 3070 het 2846 hom 20 7 10 3 A 1 2 228072 CASAVA_Build 15 22111250 2I GATCCAACTT --/TA TGTTTCCTCC 1857 het 1846 hom 10 6 4 0 TA 0 1 228073 CASAVA_Build 15 22112291 1D ATAGATAGAT G/- GGGGGGGCAT 3070 hom 33 het 18 0 12 6 G 8 7 228074 CASAVA_Build 15 22123219 1D GACAGAAGTA C/- CCCCGGAAGT 3070 het 3070 ref 38 24 8 6 C 5 4 228075 CASAVA_Build 15 22125846 4I TGAGGACTTC ----/TCTG TCTGTAATTC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TCTG 1 2 228076 CASAVA_Build 15 22128946 3D ACATAATGAT ATC/--- ATCCAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 ATC 2 1 228077 CASAVA_Build 15 22135763 3I TTGAACTCCT ---/GGG GGGGTCAAGC 1266 het 1266 ref 44 36 3 5 G 4 7 228078 CASAVA_Build 15 22138001 1I TGTTGACTTG -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 T 6 7 228079 CASAVA_Build 15 22149019 12D CTCCGTCTCC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAGA 2331 het 612 hom 12 2 5 5 A 20 8 228080 CASAVA_Build 15 22156777 3I CGTTTTAAGA ---/TGT TGTAATATAT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 TGT 1 2 228081 CASAVA_Build 15 22165432 4D TTTGTATGTG TGCA/---- TGTATATGTA 1927 het 1927 ref 17 9 6 2 TGCA 1 0 228082 CASAVA_Build 15 22165910 1D GTTAGTTTGC T/- TAAGGATAAT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 T 2 1 228083 CASAVA_Build 15 22165967 1D GATTTCATTC T/- TTTTTTCCAG 2274 het 2274 ref 24 15 6 3 T 7 6 228084 CASAVA_Build 15 22172588 1I ATCAAGACTC -/A AAAAAAAAAT 1414 het 1414 ref 37 29 4 4 A 9 10 228085 CASAVA_Build 15 22180764 1D GCCCCAGGGG C/- CTTTCAGAGG 2748 het 2748 ref 31 20 7 5 C 2 1 228086 CASAVA_Build 15 22194577 2I TAGTGATAGT --/AA AGAGTTCAGT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 1 3 228087 CASAVA_Build 15 22202279 2I TTCTTTGGCT --/TA GTTTGCTGTA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 TA 0 1 228088 CASAVA_Build 15 22204180 2D TGTGTGTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 TG 10 9 228089 CASAVA_Build 15 22210837 1I GTCATATATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 9 10 228090 CASAVA_Build 15 22213782 2I TAATTGACTC --/AT ATAGTTCTGC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 AT 1 2 228091 CASAVA_Build 15 22214373 1I ACAAATTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 9 10 228092 CASAVA_Build 15 22228563 1D ACTCCAGCCT G/- GGCAACAGAG 1695 hom 15 het 6 0 5 1 G 3 2 228093 CASAVA_Build 15 22273233 2D TCCAGGAGAC AG/-- GGGAGGGAAA 1365 het 1365 ref 24 17 4 4 AG 1 0 228094 CASAVA_Build 15 22284441 2I GAGTCTGTAC --/AT GGAGAGAGGG 2732 het 2732 ref 23 11 7 5 AT 0 1 228095 CASAVA_Build 15 22284667 1I AGCAGCAGTA -/C CCCAGCTCCC 2395 het 2395 ref 23 16 6 1 C 3 4 228096 CASAVA_Build 15 22300807 1D GCTGTATCAG T/- TTTTTTTTTT 1484 het 1484 ref 25 12 5 9 T 17 16 228097 CASAVA_Build 15 22327739 1I GGCGAAACTC -/T TGCACAGAAC 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 T 1 2 228098 CASAVA_Build 15 22327879 2I ATCTGTGATC --/TG TGCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 TG 1 2 228099 CASAVA_Build 15 22330742 1I GACAGAAGTA -/C CCCCGGAAGT 1548 het 1548 ref 35 26 4 5 C 4 5 228100 CASAVA_Build 15 22330899 1D AAAGGAGTTT A/- AAAAAGACAC 1429 het 1429 ref 26 17 4 6 A 6 5 228101 CASAVA_Build 15 22368976 2D AGTATTATAT TC/-- TCTACTCCAT 1848 het 1848 ref 33 26 4 3 TC 2 1 228102 CASAVA_Build 15 22378139 20D ATTTATTCCC ATATATATGTATATATGGGA/-------------------- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 33 16 14 7 ATATATATGTATATATGGGA 1 0 228103 CASAVA_Build 15 22400512 2I GAATAACATT --/TC TCTCATAGGC 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 TC 2 3 228104 CASAVA_Build 15 22407412 5D GTTAAGGTGA TAAAG/----- TAAAGTATTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 8 TAAAG 2 1 228105 CASAVA_Build 15 22413677 1D CTTCAGTGGG C/- CTACCATTTC 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 C 2 1 228106 CASAVA_Build 15 22415999 3D TTTTTTAGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2255 hom 24 7 12 5 T 13 10 228107 CASAVA_Build 15 22422041 1D GACATTCTTT A/- AGAGTACTGA 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 A 2 1 228108 CASAVA_Build 15 22428338 1D CTGTCTTCAC T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 64 24 30 10 T 8 7 228109 CASAVA_Build 15 22439711 1I CTTAATGGAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 A 8 9 228110 CASAVA_Build 15 22439858 1I AGATTTCAAG -/A AAAAAAAAAC 2136 het 2136 ref 25 12 5 8 A 9 10 228111 CASAVA_Build 15 22440770 5D AATGCTTAAG GGAAT/----- GGATAGCCTA 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 GGAAT 1 0 228112 CASAVA_Build 15 22442540 5I AAGCTAAACA -----/TTACT TTAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 TTACT 0 1 228113 CASAVA_Build 15 22443814 2D GAAATTAAAC AT/-- ATGTTTATAT 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 AT 2 1 228114 CASAVA_Build 15 22445574 1I CGGGAGCCAC -/A ACTCTTTTAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 1 2 228115 CASAVA_Build 15 22448440 1D ATCTTGCCAG A/- AGATGAAAGC 3070 het 3070 ref 42 24 15 4 A 2 1 228116 CASAVA_Build 15 22448597 4D ATATTTATTC AGAG/---- AGACAAATTG 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 AG 3 1 228117 CASAVA_Build 15 22450141 1I ACCTTATTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 8 9 228118 CASAVA_Build 15 22455642 2D ACATATAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 14 12 228119 CASAVA_Build 15 22459380 1I CTCAGGGGTG -/C TAATCGTCAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 C 0 1 228120 CASAVA_Build 15 22459679 1I TAAACAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 8 8 7 A 10 11 228121 CASAVA_Build 15 22467407 4I CAGGAGAATC ----/ACTT GAATCCAGGA 3070 het 848 hom 16 3 10 3 ACTT 0 1 228122 CASAVA_Build 15 22475846 5D CCCTTGTGTA TCCAC/----- CTACCAACAA 3070 het 3070 ref 36 25 11 2 TCCAC 1 0 228123 CASAVA_Build 15 22519691 1D TTTGTTGAGG T/- TTTTTTTTTC 2205 het 2205 ref 50 39 6 8 T 10 9 228124 CASAVA_Build 15 22523940 1I GTCCTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 494 hom 40 2 28 10 A 11 12 228125 CASAVA_Build 15 22534483 1I TTGGTTTACT -/G TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 0 1 228126 CASAVA_Build 15 22580935 5D CAGCTGGCAG AAGTT/----- AAGTCCTTGA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 AAGTT 1 0 228127 CASAVA_Build 15 22587203 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2120 het 1403 hom 19 5 9 5 A 15 16 228128 CASAVA_Build 15 22590660 4I CAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 58 het 30 0 20 10 AAAC 2 3 228129 CASAVA_Build 15 22590708 1D ATCCAATCAG A/- AAAGACAGTA 3070 het 2548 hom 28 7 9 13 A 4 3 228130 CASAVA_Build 15 22591487 1I TTTATCTTTA -/C TTTCGTTTTC 3070 het 1969 hom 15 4 8 3 C 0 1 228131 CASAVA_Build 15 22596603 1D AAAAATAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 T 12 11 228132 CASAVA_Build 15 22597520 2I ACATGTTTTT --/TC TGTCACTTTT 3070 hom 96 het 43 0 33 10 TC 0 1 228133 CASAVA_Build 15 22604562 1D TCTTTACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 12 11 228134 CASAVA_Build 15 22604728 2D CACTCTTCTG AT/-- ATAATTTGTA 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 AT 2 1 228135 CASAVA_Build 15 22614166 1I AAGATTCTGT -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 39 het 19 0 12 7 C 9 10 228136 CASAVA_Build 15 22628292 1D AATTCTATTG T/- TTTTTTTTTT 1388 het 1388 ref 39 29 4 6 T 11 10 228137 CASAVA_Build 15 22632659 1I TGCAAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 10 11 228138 CASAVA_Build 15 22642325 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2881 het 2644 hom 22 8 9 5 A 14 15 228139 CASAVA_Build 15 22647381 1I TGGTGGGGGG -/A AAGTTTTAGA 3070 hom 80 het 35 0 26 9 A 2 3 228140 CASAVA_Build 15 22650322 3D CTAGTTTATT TTG/--- TTGTTCAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TTG 2 1 228141 CASAVA_Build 15 22653450 1D ATTCTAAATG T/- AGAGACAGTC 3070 het 3070 hom 45 18 21 7 T 1 0 228142 CASAVA_Build 15 22653828 1I TATTTGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 10 11 228143 CASAVA_Build 15 22656571 2I TGATACAAAC --/TG TGGTATTTAT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 TG 1 2 228144 CASAVA_Build 15 22658377 1I CTAGGCTAAC -/A GCTATTGTAA 3070 hom 84 het 38 0 27 11 A 0 1 228145 CASAVA_Build 15 22662471 2I TCAGTTAATA --/TG TGTCTCCATT 3070 hom 115 het 42 0 39 3 TG 1 2 228146 CASAVA_Build 15 22667096 1D CTACAAATAA T/- TTTTTTTTTT 1460 het 1460 ref 16 6 5 5 T 12 11 228147 CASAVA_Build 15 22669112 15D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 1795 hom 10 het 3 0 4 1 A 25 10 228148 CASAVA_Build 15 22669696 1D TTTTGTCTCT C/- TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 1 0 228149 CASAVA_Build 15 22674629 2D GACAGTTGGG GA/-- GAACGGCAGC 2292 het 2292 ref 37 23 7 7 GA 2 1 228150 CASAVA_Build 15 22675680 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 10 11 228151 CASAVA_Build 15 22679064 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1361 hom 13 3 9 1 A 11 12 228152 CASAVA_Build 15 22682908 1D ATTTTCTTCA G/- GGAGAGACCC 3070 hom 69 het 41 1 28 12 G 3 2 228153 CASAVA_Build 15 22685131 1I TTCTGTGAAA -/T TTTATGCATC 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 3 4 228154 CASAVA_Build 15 22687442 1I TGTAATGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 9 10 228155 CASAVA_Build 15 22698637 1I GTAGTAACTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 A 7 8 228156 CASAVA_Build 15 22700899 5D CCTCTTGGGA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AAAAG 4 3 228157 CASAVA_Build 15 22704839 5D GTTCCTGGAA AGAAC/----- AGAACAAGGT 3070 het 3070 hom 54 23 28 4 AGAAC 2 1 228158 CASAVA_Build 15 22706418 1I GTCTTAATAG -/T TTTTTTGGAG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 6 7 228159 CASAVA_Build 15 22716149 1D GTATCTCCCC T/- TTTCATGGAA 3070 het 3070 ref 52 31 19 2 T 4 3 228160 CASAVA_Build 15 22722860 1I TGGATTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1851 hom 24 7 12 5 T 10 11 228161 CASAVA_Build 15 22745727 1D AGGTCTCTAC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 7 6 228162 CASAVA_Build 15 22759246 1D CTACCAACTT A/- ACTGGCCTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 2 1 228163 CASAVA_Build 15 22760335 1I AGGGTAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 10 11 228164 CASAVA_Build 15 22762112 1D69M2I ATTATATATA TTTTTTTTTACTGAAACACTTTTTAGACCTTTATGAATAATAATCAGAAACTTAGTTGTCATTTGTAAAC--/-TTTTTTTTACTGAAACACTTTTTAGACCTTTATGAATAATAATCAGAAACTTAGTTGTCATTTGTAAACAA AGAGGTTAGA 3070 het 3070 hom 30 17 36 4 N/A 0 0 228165 CASAVA_Build 15 22762525 2D TACTTACTAG TT/-- TTTTTTATAA 3070 het 3070 ref 50 24 18 9 T 8 6 228166 CASAVA_Build 15 22764049 2D CCCTGTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 1332 het 1332 ref 33 14 4 15 A 20 18 228167 CASAVA_Build 15 22765629 1I TTGGCCTCTC -/A AAAGTGCTGG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 3 4 228168 CASAVA_Build 15 22769038 1D ATGAGCTGCA T/- TAACAATTCC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 2 1 228169 CASAVA_Build 15 22770513 1D TAAAACATGG T/- AGATTGCAGT 3070 het 3070 ref 53 23 20 10 T 1 0 228170 CASAVA_Build 15 22822941 1D7M11I TAGGATGAAG ATCACTGG-----------/-TCATTAGGTAGTATTTAT ATGATATAAA 3070 het 3070 ref 37 25 11 5 N/A 0 0 228171 CASAVA_Build 15 22830970 1D CTTGAATATG A/- AAAAAAAAAA 1339 het 1339 ref 49 33 3 13 A 13 12 228172 CASAVA_Build 15 22831025 11D GTCTGAGAAA ACTTAGAGTAG/----------- ATATGATGAC 3070 het 3070 ref 44 23 17 7 ACTTAGAGTAG 1 0 228173 CASAVA_Build 15 22841664 4D TTAGATTTAA TAGT/---- TAATTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 12 16 7 TAGT 1 0 228174 CASAVA_Build 15 22863939 2D GCTCTGGGTT CC/-- CCCCAGGATG 3070 het 3070 ref 43 24 13 7 C 6 4 228175 CASAVA_Build 15 22865873 1D TGCCAGGCTT G/- GTGGCTGTTA 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 G 2 1 228176 CASAVA_Build 15 22916263 4D CTACAGCCTC ACAG/---- ACAATGGATT 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 ACAG 1 0 228177 CASAVA_Build 15 22925119 1I TTGTCCAATC -/A AAAAAAAAAA 2723 het 2723 ref 32 17 6 9 A 11 12 228178 CASAVA_Build 15 22939566 4I GGGGTATGAT ----/AAAG AAACAGCGAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AAAG 0 1 228179 CASAVA_Build 15 22963809 1I CTTAATAACG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 9 10 228180 CASAVA_Build 15 23016560 3D TGGTGAGACC GAA/--- GAAGACTTGC 3070 het 3070 hom 39 17 17 7 GAA 2 1 228181 CASAVA_Build 15 23072185 1D GATTGGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 11 10 228182 CASAVA_Build 15 23080869 1D GACCCTATGT A/- AAAAAAAAAA 1857 het 1857 ref 32 23 4 6 A 13 12 228183 CASAVA_Build 15 23083195 4D TACACATCAT AGTC/---- AGCGTGTCAA 3070 het 3070 ref 45 21 19 7 AGTC 1 0 228184 CASAVA_Build 15 23085407 1D TCAGAGGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 10 9 228185 CASAVA_Build 15 23096825 2D TAAAAACGTA AC/-- ACAATCTCCA 3070 het 3070 hom 30 9 17 5 AC 2 1 228186 CASAVA_Build 15 23099047 1I CTTACCAATA -/C TTGTTATTTT 3070 het 3070 hom 24 7 13 4 C 0 1 228187 CASAVA_Build 15 23100362 14D AATTTTCAGT ATAATGTATGATAG/-------------- AAGTTGTTCA 3070 het 3070 ref 27 16 15 1 ATAATGTATGATAG 1 0 228188 CASAVA_Build 15 23101046 1I TATTAATTTC -/T TTTTTTTTCT 2012 het 2012 ref 27 11 6 10 T 8 9 228189 CASAVA_Build 15 23113894 2D AGTGTGAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 40 2 14 24 T 12 10 228190 CASAVA_Build 15 23116261 4I AACAAACTTC ----/TTTG TTTCTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 TTTG 0 1 228191 CASAVA_Build 15 23116664 3I TCCAGCCTTG ---/ACA ACAATAGCAA 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 ACA 1 2 228192 CASAVA_Build 15 23130041 1D TTAATTCAAT A/- TACAAAAGTC 3068 het 3068 ref 28 18 8 2 A 1 0 228193 CASAVA_Build 15 23130137 1D CAGCCCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1949 hom 36 11 15 10 T 13 12 228194 CASAVA_Build 15 23130846 2D GATTTTGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 1400 het 973 hom 40 3 5 33 A 16 14 228195 CASAVA_Build 15 23137315 1I GCTAAATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1472 hom 29 5 12 12 T 13 14 228196 CASAVA_Build 15 23137491 1D CTGTACGTTT A/- AGTAGAGGCA 3063 hom 27 het 11 0 8 3 A 2 1 228197 CASAVA_Build 15 23138881 1I AGGGGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 10 11 228198 CASAVA_Build 15 23142685 2D TAAAAAGTAC AG/-- AGTCTCCTGA 3070 het 3070 hom 36 10 19 8 AG 2 1 228199 CASAVA_Build 15 23157070 4I TGGACTACAC ----/AGTT AGGACATGGA 3070 het 3070 ref 52 24 17 11 AGTT 0 1 228200 CASAVA_Build 15 23157367 1D GTCCTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 30 4 12 14 T 17 16 228201 CASAVA_Build 15 23159500 3D GTAAAATAAC CAT/--- AATAATATAG 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 CAT 1 0 228202 CASAVA_Build 15 23161809 1I TAACACGGTG -/A AACCCCATCT 988 het 908 hom 5 2 3 0 A 2 3 228203 CASAVA_Build 15 23172069 3D AGCTCAACAT ATC/--- ATCAAGGCAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 ATC 2 1 228204 CASAVA_Build 15 23183046 1I GTGTTGAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 A 9 10 228205 CASAVA_Build 15 23185502 1I ATCCACATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1607 hom 47 4 33 10 A 11 12 228206 CASAVA_Build 15 23189303 1D TTTAAGCAGG T/- TAAGTGACTG 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 T 2 1 228207 CASAVA_Build 15 23193452 1D CTAGAAACTT A/- AAACAGCTCT 3070 hom 123 het 46 0 39 8 A 4 3 228208 CASAVA_Build 15 23201789 1I TCCATATTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 A 9 10 228209 CASAVA_Build 15 23204151 1I ATAAGTTACC -/A AAAGTCCCGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 3 4 228210 CASAVA_Build 15 23222271 1D TTCTTTGAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 13 11 T 10 9 228211 CASAVA_Build 15 23223068 1I CTGGTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1947 hom 32 10 13 9 T 13 14 228212 CASAVA_Build 15 23234091 1I ACACTGAAAA -/G GGGGGGGGAA 2585 het 2585 ref 41 21 8 12 G 8 9 228213 CASAVA_Build 15 23236322 7D CTTAGAAATG GTGTCTT/------- GCTATGTTAG 2351 het 2351 ref 23 13 5 10 GTGTCTT 1 0 228214 CASAVA_Build 15 23238213 2I GAAATAAGTC --/AA GAGCATGGAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 2 228215 CASAVA_Build 15 23243128 1I ATATTGCTTC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 7 8 228216 CASAVA_Build 15 23244873 4I TGTGGCATTT ----/CTCA CTATGTGTGC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CTCA 0 1 228217 CASAVA_Build 15 23254407 4I GTATAAGGAT ----/GTCA GTCAAACACC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 GTCA 1 2 228218 CASAVA_Build 15 23255514 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTAAT 1562 hom 12 het 10 0 5 5 T 8 7 228219 CASAVA_Build 15 23258797 3D ATTTTAATAG AAT/--- AATATCTCAG 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 AAT 2 1 228220 CASAVA_Build 15 23260262 4D ATGAGACGGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 46 20 15 12 GA 8 6 228221 CASAVA_Build 15 23260941 1D TAACAGACTC G/- AGCTCAAGAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 G 1 0 228222 CASAVA_Build 15 23272195 1D AAGGCTTGTA G/- TTTCCAGGAG 3070 het 3070 ref 43 26 17 0 G 1 0 228223 CASAVA_Build 15 23273056 1D AATGATATGC A/- AAAACTAGGA 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 A 5 4 228224 CASAVA_Build 15 23275325 1I TTACAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 1793 het 584 hom 34 6 15 13 T 17 18 228225 CASAVA_Build 15 23277685 1D AGGCACATAC A/- ACCCCTGCAG 3070 hom 119 het 42 0 39 3 A 2 1 228226 CASAVA_Build 15 23284783 1D TTTTGGCCAA G/- CCAGAGAATA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 G 1 0 228227 CASAVA_Build 15 23288180 1D GCCTTTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 10 9 228228 CASAVA_Build 15 23292728 1D TTTATCCCAG T/- TATGCAAAGC 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 T 2 1 228229 CASAVA_Build 15 23294327 1I CAGATTAAAA -/C AACAATGAGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 0 1 228230 CASAVA_Build 15 23294868 2I GGATTTGGGG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 GA 5 6 228231 CASAVA_Build 15 23301141 1D GACTTAATCA C/- CCCCCCAAAG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 C 7 6 228232 CASAVA_Build 15 23310350 1I TTTGGTTCCT -/A AGGGTACTGC 3070 hom 168 het 62 0 55 7 A 1 2 228233 CASAVA_Build 15 23312550 5D60M1D AAGTCTTCCT TTCTGTTTTAAAAAGTGTCAGAATAACTTCTCTTTTACATGGCCTAGGGCCTAACACTCTAGAAGC/-----GTTTAAAAAGTGTCAGAATAACTTCTCTTTTACATGGCCTAGGGCCTAACACTCTAGAAG- CCCATTAGTG 3070 het 3070 hom 46 30 36 5 N/A 0 0 228234 CASAVA_Build 15 23320742 1I GCTGTGCATG -/T GTTGGGGCAG 3070 hom 93 het 38 0 30 8 T 0 1 228235 CASAVA_Build 15 23325303 1I TTTGAATATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 9 10 228236 CASAVA_Build 15 23346068 2D TTTTTGAAAC AG/-- AAAGAAAATG 3070 het 3070 ref 38 20 18 0 AG 1 0 228237 CASAVA_Build 15 23350099 1D ACCTTATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 11 10 228238 CASAVA_Build 15 23351827 1I GCTAGGCTCT -/G GTTGACCCTG 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 G 1 2 228239 CASAVA_Build 15 23362623 1I TGGTCTCCAG -/C GAGAGTCTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 8 C 0 1 228240 CASAVA_Build 15 23364174 1D GCTGGAGCCC T/- TGACCGTCCC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 2 1 228241 CASAVA_Build 15 23367446 4D TGGTGGACAG GTTA/---- ATTAGCTTGA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 GTTA 1 0 228242 CASAVA_Build 15 23375882 14I GTCTCAGTCT --------------/AAAGGTTAAAGAGC ACAGGTTGAG 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 AAAGGTTAAAGAGC 0 1 228243 CASAVA_Build 15 23378229 1I GCTAAAGAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 8 9 228244 CASAVA_Build 15 23378563 1D TGTCTACGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 11 10 228245 CASAVA_Build 15 23394131 1I GAAAGTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1147 hom 33 5 15 13 T 13 14 228246 CASAVA_Build 15 23397338 1I CTGTTTTTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 17 9 11 A 8 9 228247 CASAVA_Build 15 23404777 3D GGCCACACTC AGA/--- AGGATACCCC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 AGA 1 0 228248 CASAVA_Build 15 23405979 15I ATGATTATAC ---------------/TGTAGGACTGTATAT CTAGGACTGT 3070 hom 160 het 56 0 54 5 TGTAGGACTGTATAT 0 1 228249 CASAVA_Build 15 23421657 9I AGGGCCAGCC ---------/GCGAGGTGT GCGAGGTGTG 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 GCGAGGTGT 1 2 228250 CASAVA_Build 15 23424324 1D TTTGGGTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 10 9 228251 CASAVA_Build 15 23425784 1I6M1I GCCTATCTTA -TTATTT-/TTTATTTA TTTTTTTTTT 3070 het 1089 hom 16 3 12 2 N/A 0 0 228252 CASAVA_Build 15 23430984 4I AGACAAGAGT ----/CTGG CTTTTTTCGC 3070 hom 39 het 16 0 13 3 CTGG 0 1 228253 CASAVA_Build 15 23431373 1D TGAGTTTCCT G/- GGGCTATTGT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 G 4 3 228254 CASAVA_Build 15 23455500 1D AACAAAAAAA C/- AAAAGAAAAG 3070 hom 44 het 20 0 18 3 C 1 0 228255 CASAVA_Build 15 23459362 8I TATTTCACTG --------/AGCATTCT GTCCTCAAGG 3070 het 3070 hom 59 22 30 7 AGCATTCT 0 1 228256 CASAVA_Build 15 23459644 1I TGTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 G 0 1 228257 CASAVA_Build 15 23459772 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2894 hom 29 12 11 6 T 12 11 228258 CASAVA_Build 15 23467888 1I CTCTTGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 10 11 228259 CASAVA_Build 15 23469728 14D ACTACTCTAA TGTGTCCTCACATG/-------------- TGTGGCCACA 3070 het 3070 ref 45 29 15 5 TGTGTCCTCACATG 1 0 228260 CASAVA_Build 15 23469981 1D CAACAAACTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 T 9 8 228261 CASAVA_Build 15 23470675 3D TAATAAATGA CGT/--- CTGGTTAACT 3070 hom 104 het 36 0 34 4 CGT 1 0 228262 CASAVA_Build 15 23477419 3I CAACAACAAT ---/AAC AACAACAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 AAC 2 3 228263 CASAVA_Build 15 23479941 3D TCCCTTAAGA AAG/--- AAGAACTGGC 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 AAG 2 1 228264 CASAVA_Build 15 23484826 1I ATGTCTTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 9 10 228265 CASAVA_Build 15 23489791 1D GCTCCCAGGG A/- AGGACGCTGA 3070 hom 90 het 33 0 29 4 A 2 1 228266 CASAVA_Build 15 23494759 4I ACTATTTGTT ----/AACA ATCAGTAAGG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 AACA 0 1 228267 CASAVA_Build 15 23497170 1D GAGGTCACTT A/- AAAAAAAAAA 1091 het 1091 ref 21 16 3 2 A 12 11 228268 CASAVA_Build 15 23498994 1I CTGCCTCAGA -/T TTTTTTTTTT 1144 het 1144 ref 37 10 7 20 T 17 18 228269 CASAVA_Build 15 23504714 6I TCTCATCAAT ------/ATGCAA ATGTTTGACT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 ATGCAA 0 1 228270 CASAVA_Build 15 23507264 4I ACTGAGGCAC ----/AGAA AGAGTGAGTG 3070 het 2816 hom 45 10 23 12 AGAA 0 1 228271 CASAVA_Build 15 23508770 4I CTGTGGAATA ----/AGAC AGAGAGATTT 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 AGAC 0 1 228272 CASAVA_Build 15 23513982 1I GCTCACTTCT -/G CGCCTCTCCG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 228273 CASAVA_Build 15 23516917 1I AGTACTGTCA -/C TGATTATCTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 0 1 228274 CASAVA_Build 15 23519606 1D AGAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 37 het 24 0 19 5 A 10 9 228275 CASAVA_Build 15 23526550 23D TCAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAG/----------------------- AAAGAAAGAA 983 hom 4 het 6 0 5 4 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAG 1 0 228276 CASAVA_Build 15 23528880 1D ACTGCAAGCT C/- CGCCTCCCGG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 C 2 1 228277 CASAVA_Build 15 23534384 1I AGGCAACACA -/G CAACACTCCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 228278 CASAVA_Build 15 23538398 6I ATGTGACGGA ------/CTCTGT GAGTGCTGCG 3070 het 2466 hom 33 9 19 5 CTCTGT 0 1 228279 CASAVA_Build 15 23538529 1I AGGTGGCTTC -/T TGGGAGGCTC 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 T 1 2 228280 CASAVA_Build 15 23543528 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2926 het 119 hom 27 3 14 10 A 19 17 228281 CASAVA_Build 15 23544660 1D CAACTCAACT G/- AAGCAGAATA 3070 het 3070 ref 22 14 7 2 G 1 0 228282 CASAVA_Build 15 23570280 1I TAAATTCCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 T 11 12 228283 CASAVA_Build 15 23579718 2I ATTTGAGGGA --/CC CCCCCCCCTG 1654 het 1654 ref 28 13 5 10 C 8 10 228284 CASAVA_Build 15 23582731 1D CGACAGAACT G/- TTCTTCAGAA 3070 het 3070 hom 46 15 24 8 G 1 0 228285 CASAVA_Build 15 23587502 4D GACATCTACT TTTC/---- TTTTAATGTG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TTTC 1 0 228286 CASAVA_Build 15 23592645 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 9 8 228287 CASAVA_Build 15 23595159 1I GCTTGAGTGG -/T TTTACTCTGT 3070 hom 48 het 23 0 14 9 T 3 4 228288 CASAVA_Build 15 23604646 1D TTTTTGAGAT A/- AGAGTTTTGC 3070 hom 144 het 49 0 48 2 A 2 1 228289 CASAVA_Build 15 23605952 1D GGGCTGGGAA G/- GCAGGAAGAC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 2 1 228290 CASAVA_Build 15 23610091 1I TGAAACAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 27 1 22 4 T 10 11 228291 CASAVA_Build 15 23612480 1I TTTTGCTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 T 8 9 228292 CASAVA_Build 15 23620389 1I TATTAAAGAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 8 9 228293 CASAVA_Build 15 23620714 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 19 1 15 3 A 13 14 228294 CASAVA_Build 15 23620798 5D TTTTTGTGTG TGTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 3 TGTTT 1 0 228295 CASAVA_Build 15 23637520 1D AGGTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 833 hom 34 3 19 12 T 13 12 228296 CASAVA_Build 15 23643466 3I GAGCAGCACG ---/CGC CGCAGGCACT 3070 hom 81 het 34 0 25 9 CGC 1 2 228297 CASAVA_Build 15 23644232 3D AGCTGTAGTT AAG/--- AAGGTGGTTT 3070 hom 105 het 37 0 34 4 AAG 2 1 228298 CASAVA_Build 15 23644368 1D CTAAAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 281 hom 29 1 22 6 T 12 11 228299 CASAVA_Build 15 23648808 1D CTCCGAAGTT C/- CCTTCTCTCC 3070 hom 97 het 38 0 33 6 C 3 2 228300 CASAVA_Build 15 23657404 1I GGTGTTTCTG -/A AAAGTGTGGG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 3 4 228301 CASAVA_Build 15 23663719 1I ATATTTTTAA -/T TTTTTGGCTG 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 5 6 228302 CASAVA_Build 15 23664593 1D AAAAAAAAAA T/- ATATTCTAGA 3070 het 166 hom 30 1 25 4 T 1 0 228303 CASAVA_Build 15 23665868 1I GTAACACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 712 hom 46 2 32 12 A 9 10 228304 CASAVA_Build 15 23667291 3D AATTGTAGCA AAC/--- AACAGCAGGA 3070 hom 135 het 46 0 46 2 AAC 2 1 228305 CASAVA_Build 15 23670191 7D TTTTATTTTC TGTTTTT/------- TGTTTTTTGT 2157 hom 60 het 42 0 18 24 TGTTTTT 3 2 228306 CASAVA_Build 15 23670216 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 1218 hom 12 het 28 0 6 22 T 13 12 228307 CASAVA_Build 15 23677806 2D GAGAACAGAA AG/-- AGAATGAGTC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 AG 2 1 228308 CASAVA_Build 15 23678384 1I CACTGATAGC -/A AAAAAAGTGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 7 228309 CASAVA_Build 15 23679243 1I CATGGCAACA -/C CCAGAAGTTA 3070 het 3070 hom 69 25 35 9 C 2 3 228310 CASAVA_Build 15 23681267 1I AATTTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 2848 het 2848 ref 44 25 10 9 T 13 14 228311 CASAVA_Build 15 23682017 5D CCAGCTACTA TTTCT/----- TTTCTTTTTT 2097 het 889 hom 28 6 14 8 TTTCT 2 1 228312 CASAVA_Build 15 23682751 1D GAGAAATGCC T/- TTTCATCATG 3070 het 3070 hom 31 9 18 5 T 4 3 228313 CASAVA_Build 15 23684695 1I TCCTTTCCAG -/A GTTTTCATAA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 A 0 1 228314 CASAVA_Build 15 23684894 1I TTTTTGCAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 8 9 228315 CASAVA_Build 15 23685089 1D TTTAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2761 hom 33 11 11 11 T 12 11 228316 CASAVA_Build 15 23701896 1I AAAAATTAAC -/T GGGCGTGGTG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 0 1 228317 CASAVA_Build 15 23702150 1D ATGTAAAAAC G/- TTTTTCGCCA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 G 1 0 228318 CASAVA_Build 15 23703755 2I CTGTATGAAT --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 TG 4 5 228319 CASAVA_Build 15 23704039 1D AGTGCTCTAG T/- AATATGAAAT 976 het 976 ref 15 6 3 8 T 1 0 228320 CASAVA_Build 15 23704103 2I AACTGTAAAT --/TG TGTTTTTCCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TG 1 2 228321 CASAVA_Build 15 23704824 2D TTTTAATGTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 11 9 228322 CASAVA_Build 15 23706759 1I ACTCAGACTC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 7 8 228323 CASAVA_Build 15 23711466 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 890 hom 39 3 30 6 A 9 10 228324 CASAVA_Build 15 23717946 3I CTCCTCCCAC ---/CCA CCACCCTCCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CCA 1 2 228325 CASAVA_Build 15 23718481 19I TTTTTAATTG -------------------/TAGCCATTCTGACTGGTGT TAGATGGTAT 3070 hom 69 het 24 0 23 3 TAGCCATTCTGACTGGTGT 0 1 228326 CASAVA_Build 15 23721528 1D TTATCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2745 hom 33 12 9 12 A 13 12 228327 CASAVA_Build 15 23722378 3D TCTCAAAATC ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 2000 hom 21 5 13 5 ATA 7 6 228328 CASAVA_Build 15 23724337 1I TCTTTCTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 643 hom 37 2 26 9 T 10 11 228329 CASAVA_Build 15 23733790 3D AGATTTTGCT TCC/--- TCCCAGGCTG 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 TCC 2 1 228330 CASAVA_Build 15 23735889 1D GGGTGGGGGT G/- GGGGCTGTGC 1951 hom 15 het 7 0 6 1 G 5 4 228331 CASAVA_Build 15 23737649 2I GTGCGTGGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 51 22 15 14 TG 6 7 228332 CASAVA_Build 15 23739558 1D CCCTTAAGAG A/- GACTGCAGTG 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 A 1 0 228333 CASAVA_Build 15 23739724 7D TATCCCACCT CCACACA/------- AGAGACCACA 3070 het 3070 hom 35 16 18 3 CCACACA 1 0 228334 CASAVA_Build 15 23743981 2I TCTCTCTGCA --/TT TTTTTCCCCT 2741 het 2741 ref 31 19 6 6 T 5 7 228335 CASAVA_Build 15 23746472 3I CAGCACTCAC ---/ATT ATGAAATCCA 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 ATT 0 1 228336 CASAVA_Build 15 23747437 2D AAACATTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TG 7 6 228337 CASAVA_Build 15 23749166 1D CTTGTTACAT A/- ATTCTGGTTT 3070 het 3070 hom 37 19 18 0 A 2 1 228338 CASAVA_Build 15 23754322 1D AATTGCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 39 1 22 17 A 12 11 228339 CASAVA_Build 15 23757791 1D GCCAATTCAT G/- CCTTGTGGCC 3070 het 3070 ref 48 25 19 5 G 1 0 228340 CASAVA_Build 15 23761922 1I AGATCTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 37 1 23 13 A 11 12 228341 CASAVA_Build 15 23769005 1I TCAGCCGTGA -/C AGCTGGCAGT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 C 0 1 228342 CASAVA_Build 15 23770201 2I ACCTATACCC --/GT GGCTGCGTGG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 GT 0 1 228343 CASAVA_Build 15 23770345 1D TAGCAAAGGG T/- GGGGCACATG 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 1 0 228344 CASAVA_Build 15 23776928 1I AGGGTGAGCA -/T TGGTATATTG 3070 hom 151 het 54 0 51 3 T 1 2 228345 CASAVA_Build 15 23778970 1I5M9D TGCTGATGCT -ACCTGATGTAACAT/AACCTG--------- GTAACCATGT 3070 hom 105 het 37 0 36 4 N/A 0 0 228346 CASAVA_Build 15 23781307 1D GAATCATTCC T/- TACTGATGAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 1 228347 CASAVA_Build 15 23782138 1I TTATAGAGAT -/G GGGGTCTCAC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 4 5 228348 CASAVA_Build 15 23788047 1I CTTTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 743 hom 34 9 16 9 C 0 1 228349 CASAVA_Build 15 23795267 2D CCTCTTCTCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 1577 hom 34 7 20 7 TC 10 9 228350 CASAVA_Build 15 23818040 6D TCTGGTTCCA AGTTCT/------ AGACGTATTT 3070 het 3070 ref 59 31 21 12 AGTTCT 1 0 228351 CASAVA_Build 15 23822420 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 3041 het 1066 hom 10 3 7 0 T 8 7 228352 CASAVA_Build 15 23824033 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 21 0 15 6 T 14 12 228353 CASAVA_Build 15 23827911 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 28 1 18 9 A 11 12 228354 CASAVA_Build 15 23836097 1D16M1I TTTGCTTTTT AAAAAAAAAATTATAAA-/-AAAAAAAAATTATAAAT TTTTTTTTAA 3070 hom 42 het 17 0 15 6 N/A 0 0 228355 CASAVA_Build 15 23836601 1I CAGGATCTCA -/T TTTTTTATGG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 6 7 228356 CASAVA_Build 15 23845507 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 157 hom 18 2 10 6 T 13 14 228357 CASAVA_Build 15 23878441 1D AAATTTACGA G/- TTTCACTGTG 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 G 1 0 228358 CASAVA_Build 15 23882882 1D ATGCAACTAC T/- TTTTTTTTTT 1558 het 1558 ref 41 28 4 9 T 13 12 228359 CASAVA_Build 15 23917757 5D CTTCTTCTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1280 hom 31 8 12 11 T 19 14 228360 CASAVA_Build 15 23936222 10D TTATATTTCA TGCTCAGGGG/---------- TGCCTTTAAG 3070 het 3070 ref 40 22 18 5 TGCTCAGGGG 1 0 228361 CASAVA_Build 15 23942801 1I TCATCACTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 10 11 228362 CASAVA_Build 15 23942884 2I GTGGGTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2343 hom 30 9 12 9 T 12 14 228363 CASAVA_Build 15 23948897 1D GGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 27 1 20 6 T 11 10 228364 CASAVA_Build 15 23965581 8D TCTTCCTATT CATAGATA/-------- CAAGTATTTA 3070 het 3070 hom 44 20 22 9 CATAGATA 1 0 228365 CASAVA_Build 15 23972109 1D GGCTGCTTCA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 8 7 228366 CASAVA_Build 15 23978506 2D TAAAAAAAAA AT/-- TAAAAAAAAA 2027 het 2027 ref 21 11 8 3 AT 1 0 228367 CASAVA_Build 15 23981771 1D TTGGGAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 T 12 11 228368 CASAVA_Build 15 23987246 2D GGACAATAAC TG/-- TGTCTCATGC 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 TG 2 1 228369 CASAVA_Build 15 23989698 1I TTAGATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 11 12 228370 CASAVA_Build 15 24001598 7I ACAAACAAAC -------/AAACAAA AAACAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 33 6 AAACAAA 2 3 228371 CASAVA_Build 15 24004050 1I GGATTATGTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 8 9 228372 CASAVA_Build 15 24004662 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2904 hom 31 11 14 6 A 12 11 228373 CASAVA_Build 15 24005691 1I TTCTCTGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 13 11 T 12 13 228374 CASAVA_Build 15 24021187 1I AACTCCAGAG -/C CCCCGAGTCA 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 C 4 5 228375 CASAVA_Build 15 24047210 1I CGCACTCCAG -/C CTGGGTGACA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 1 2 228376 CASAVA_Build 15 24056862 1I TCCCTGAAAC -/A ACGCAACTTC 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 A 1 2 228377 CASAVA_Build 15 24082670 1D CTCGTAATTA T/- TTTTATATTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 5 4 228378 CASAVA_Build 15 24083186 3D ATTACAAAGC CAG/--- CAGCACTACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CAG 2 1 228379 CASAVA_Build 15 24083322 2D ATTTGCTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 12 10 228380 CASAVA_Build 15 24084624 1I CATTTTAGAT -/A ATGTAGCAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 2 228381 CASAVA_Build 15 24124161 1I CCCCAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 9 11 A 13 14 228382 CASAVA_Build 15 24130799 1D AAAGCATTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 15 13 14 T 10 9 228383 CASAVA_Build 15 24159865 1I CATCTATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 12 13 228384 CASAVA_Build 15 24175776 6I CCATAAAATT ------/AGTAGC TTAAAACACC 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 AGTAGC 0 1 228385 CASAVA_Build 15 24195067 20I TTCATATGCT --------------------/TATTTGCCATCTTTTCATCA TATTTGGTGA 3070 het 3070 hom 39 17 20 5 TATTTGCCATCTTTTCATCA 0 1 228386 CASAVA_Build 15 24197030 6D TTGAAGTCTC TAACTA/------ TAATTATAGA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 TAACTA 1 0 228387 CASAVA_Build 15 24203785 11D TACCTTGAGC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 24 19 10 A 22 11 228388 CASAVA_Build 15 24205609 3D CCCCATTTTA CAG/--- ATAACTGAGT 3070 het 3070 ref 28 12 12 5 CAG 1 0 228389 CASAVA_Build 15 24240820 2I ATCACACAAT --/AG AGAGAGAGAC 3070 het 3070 ref 58 27 20 11 AG 4 5 228390 CASAVA_Build 15 24243115 1D CTTCCATTCC T/- TTTTTTTTTT 1461 het 1461 ref 47 37 5 5 T 12 11 228391 CASAVA_Build 15 24263212 1I ACACTTGAGA -/C CCTGGAGGCA 3070 het 3070 hom 32 9 22 1 C 2 3 228392 CASAVA_Build 15 24268787 2D TATAATCCCC CT/-- GTGTTTGACA 3070 het 3070 ref 42 23 15 6 CT 1 0 228393 CASAVA_Build 15 24268915 1I TGTTCTGCAG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 A 0 1 228394 CASAVA_Build 15 24269959 2I CCTATGTCTC --/TT TGCATGTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 1 3 228395 CASAVA_Build 15 24279752 4I AAGTGTTGTG ----/AATT AAATAATAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AATT 0 1 228396 CASAVA_Build 15 24281043 4D AGTAGTAGAT AAAC/---- AACATTATGC 3070 het 3070 ref 36 21 12 6 AAAC 1 0 228397 CASAVA_Build 15 24281140 1I ATAACATCTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 8 9 228398 CASAVA_Build 15 24282031 1I GCAGGTATTT -/C CCCATCAAGA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 3 4 228399 CASAVA_Build 15 24285984 1D AGCAGAAATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 9 8 228400 CASAVA_Build 15 24295409 4I TTGCCAAAAC ----/AAAT AAATCAGCAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAAT 1 2 228401 CASAVA_Build 15 24295939 1D CCTTTATACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 T 13 12 228402 CASAVA_Build 15 24296553 4D GTCCCTGGTG ACTT/---- ACTTAGTTCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ACTT 2 1 228403 CASAVA_Build 15 24298744 2I TGACTTTGTG --/AC ACAATTATGT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AC 1 2 228404 CASAVA_Build 15 24299460 1D TTCTACTTTC T/- TTTTATTCTA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 5 4 228405 CASAVA_Build 15 24301904 1D TTCTCAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 T 15 14 228406 CASAVA_Build 15 24304619 1I ATATCTTACC -/A GGGGCAAGAT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 0 1 228407 CASAVA_Build 15 24305396 1D GACAAAAAAA C/- ATGATTATTT 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 C 1 0 228408 CASAVA_Build 15 24310733 1D TAAAAAAAAA G/- GGGGGGGGGT 1931 het 1931 ref 28 8 7 14 G 10 9 228409 CASAVA_Build 15 24320735 1I ATGAGTGTAA -/T CATATACTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 228410 CASAVA_Build 15 24325417 1D CCATTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 303 hom 23 2 11 10 A 15 14 228411 CASAVA_Build 15 24330881 3D AGAAGAGAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 13 10 228412 CASAVA_Build 15 24336789 1D GCTAACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 37 0 30 8 A 11 10 228413 CASAVA_Build 15 24346944 1D GCACAGTTAA C/- CCCAGAGCCT 3070 hom 69 het 29 0 22 7 C 4 3 228414 CASAVA_Build 15 24352931 4D TTAAGCATTC ATGA/---- ATCAATTATT 3070 hom 163 het 58 0 53 9 ATGA 1 0 228415 CASAVA_Build 15 24364741 4D TTTTCCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 30 7 T 15 11 228416 CASAVA_Build 15 24367467 2I CATGGAACAG --/TC TCTGCATCAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TC 1 2 228417 CASAVA_Build 15 24378190 6I CGTGCCTACA ------/TAGAGT TAATGTCCAG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TAGAGT 0 1 228418 CASAVA_Build 15 24386446 1I CGAAGACCAC -/A ATGAAATGCC 3070 hom 99 het 41 0 32 9 A 1 2 228419 CASAVA_Build 15 24400978 1D ACTTGACCCC T/- ATCTCGCACC 3070 hom 96 het 34 0 29 6 T 1 0 228420 CASAVA_Build 15 24402946 3I AAGAACAAGT ---/AAG AAGAAGTAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAG 2 3 228421 CASAVA_Build 15 24412844 1I ACTACACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 14 12 A 13 14 228422 CASAVA_Build 15 24417027 3D CCTGGTTTCC TGA/--- TTTGAGTGAT 3070 hom 75 het 27 0 24 5 TGA 1 0 228423 CASAVA_Build 15 24417406 1I GGTTATGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 721 hom 51 2 41 8 T 9 10 228424 CASAVA_Build 15 24443955 2I TGGCAGATGT --/TC TCTCAAGAGA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 TC 2 3 228425 CASAVA_Build 15 24474288 1I AAATCCAAAG -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 6 7 228426 CASAVA_Build 15 24480272 2I AAGAAGTTTT --/GA GAGTGAGATT 3070 het 3070 hom 38 9 17 12 GA 1 2 228427 CASAVA_Build 15 24491671 5I CATGAAAACA -----/TAGAG TAGAGTAACA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TAGAG 1 2 228428 CASAVA_Build 15 24491771 2I ATAGTTTCTC --/AG ACAAACAGAA 3070 het 3070 ref 35 24 8 3 AG 0 1 228429 CASAVA_Build 15 24492624 3D ATAATTACTG TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 42 13 26 5 TTA 4 3 228430 CASAVA_Build 15 24502678 1I AAATTGAGGG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 0 1 228431 CASAVA_Build 15 24507705 1D CTGCTCCGCT C/- GGCCTCATAT 3070 het 3070 ref 42 17 16 10 C 1 0 228432 CASAVA_Build 15 24508419 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 240 hom 43 7 14 22 T 13 12 228433 CASAVA_Build 15 24517145 1D GAAAAGTGTT A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 7 6 228434 CASAVA_Build 15 24522372 4I TTGGGGATAC ----/TGAA TGAACTGTAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TGAA 1 2 228435 CASAVA_Build 15 24528133 3I CTGGGTACTG ---/ATT ATGTTTATTT 3070 hom 160 het 61 0 54 7 ATT 0 1 228436 CASAVA_Build 15 24529244 2D TCTCTAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 2558 het 418 hom 19 1 6 12 A 12 10 228437 CASAVA_Build 15 24532033 6D CACAAAAAAG TAAAAA/------ TAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 24 14 8 3 TAAAAA 2 1 228438 CASAVA_Build 15 24540668 1D ACAATAACAG A/- AAACTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 4 3 228439 CASAVA_Build 15 24541050 3D TCAAGTTATA TCC/--- TCAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TCC 1 0 228440 CASAVA_Build 15 24542823 1D CCGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2288 het 2288 ref 38 20 6 12 T 15 14 228441 CASAVA_Build 15 24543236 4D CAAAATAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 1726 het 1726 ref 19 9 8 4 AAAC 5 4 228442 CASAVA_Build 15 24546796 3D TGCTCAGTTA AAT/--- AATAAGAATC 3070 het 3070 hom 35 14 21 2 AAT 2 1 228443 CASAVA_Build 15 24552959 1D AAAAACCCAT G/- GGGTGTACAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 4 3 228444 CASAVA_Build 15 24554632 1D GATGTTGGAG A/- AGAGAATTTT 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 A 2 1 228445 CASAVA_Build 15 24557733 2D TCATCCAAAC AG/-- AATTTCATTT 2481 het 2481 ref 15 7 6 3 AG 1 0 228446 CASAVA_Build 15 24564259 1D ACACCTACAC A/- TTAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 1 0 228447 CASAVA_Build 15 24566224 3I ACTGTTCTCA ---/AAC AACATTGACT 3070 hom 132 het 47 0 44 3 AAC 1 2 228448 CASAVA_Build 15 24572437 4I TCAGTCACTC ----/TTCT TTCTTTTAGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTCT 1 2 228449 CASAVA_Build 15 24573571 1D CGATTTGAGA G/- GGTTTTTTTT 2283 het 992 hom 36 7 18 13 G 3 2 228450 CASAVA_Build 15 24573593 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 2697 het 1102 hom 29 8 13 10 T 9 10 228451 CASAVA_Build 15 24573935 1I TATGTAATGT -/A AATGTTTTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 2 3 228452 CASAVA_Build 15 24576349 2I ATATACACAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 111 hom 33 4 16 13 GT 5 6 228453 CASAVA_Build 15 24576975 3D TAATGCAGTG AGA/--- AGATTATATC 3070 hom 54 het 21 0 19 5 AGA 2 1 228454 CASAVA_Build 15 24578431 10I TCACCTCTCA ----------/CCATCAAAGT CCAGAAAAGA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 CCATCAAAGT 0 1 228455 CASAVA_Build 15 24579797 2I CTAGATTCTA --/TT TTGTTATGTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 4 228456 CASAVA_Build 15 24580186 2I TGTACGATTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 TG 0 1 228457 CASAVA_Build 15 24580676 5D ATTTAATAGA AATGT/----- AATGTAAGCC 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 AATGT 2 1 228458 CASAVA_Build 15 24581403 1I CCTCAAATCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 14 10 T 11 12 228459 CASAVA_Build 15 24581907 3I TAGTAGTCCC ---/TTG TTATTTCATA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTG 0 1 228460 CASAVA_Build 15 24583067 4D TTTGGATGCC CTTT/---- CTTTCTCTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 3 CTTT 2 1 228461 CASAVA_Build 15 24583367 3D CGCTGTTATT ATA/--- ATGAGTGTTT 3070 het 2933 hom 30 9 13 10 ATA 1 0 228462 CASAVA_Build 15 24584831 3D GGTTCCCTTT TTC/--- TTCTTCTCCT 3070 het 3070 hom 42 16 25 2 TTC 3 2 228463 CASAVA_Build 15 24585148 1D TTAGCTTGAG A/- AGAAACACCC 3070 het 3070 hom 39 18 17 6 A 2 1 228464 CASAVA_Build 15 24585511 3D72M2I TAACATTCTA TATTATACAGCAATAAATTGTGAAACTTAAAATAATGTACTCTACAGTCCACGTCTTCAACACATGTACTGTAAC--/---TATACAGCAATAAATTGTGAAACTTAAAATAATGTACTCTACAGTCCACGTCTTCAACACATGTACTGTAACTT ATATTAATAT 3070 hom 178 het 39 0 60 12 N/A 0 0 228465 CASAVA_Build 15 24586229 1I TTTTTTTTTT -/C TCTTCTGGTG 3070 het 248 hom 26 2 18 6 C 0 1 228466 CASAVA_Build 15 24592651 1D TAACCTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 28 0 19 9 T 15 14 228467 CASAVA_Build 15 24592991 4D TTTAGAAAAC ATTT/---- ATTTGGGTAT 3070 het 3070 ref 35 16 17 3 ATTT 2 1 228468 CASAVA_Build 15 24593231 3D ACATTATTTT TTA/--- TTATTATAAA 3070 het 3070 ref 25 10 13 2 TTA 3 2 228469 CASAVA_Build 15 24598745 2I ATATGTACAT --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 39 26 11 2 AC 4 5 228470 CASAVA_Build 15 24601543 1D TGATAATCAC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 46 13 29 4 T 9 8 228471 CASAVA_Build 15 24602761 2D ATGAGAGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 42 2 18 22 T 13 11 228472 CASAVA_Build 15 24603006 1D TCCACTTCTG C/- ACCCCTGATG 3070 hom 86 het 32 0 27 6 C 1 0 228473 CASAVA_Build 15 24603836 2D ATAAAAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 37 2 18 18 A 13 11 228474 CASAVA_Build 15 24605446 1I AGAAGTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 A 13 14 228475 CASAVA_Build 15 24613195 1D CAAAAATTAG C/- TGGGTTTTGT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 C 1 0 228476 CASAVA_Build 15 24624535 1I ATCTCAGGTG -/T TTTTTTTTTT 2998 het 2998 ref 44 12 13 19 T 15 16 228477 CASAVA_Build 15 24624909 2I CTCCATAGAC --/AG AGTCGGGCAT 2083 het 2083 ref 28 21 6 1 AG 1 2 228478 CASAVA_Build 15 24625446 2I AAGGACTGAC --/AA AGTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 A 1 3 228479 CASAVA_Build 15 24629957 1D TACCTGTAGA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 T 7 6 228480 CASAVA_Build 15 24630193 2D CCAAATTCCC CT/-- CTCTCCCACT 3070 het 3070 ref 45 25 14 7 CT 3 2 228481 CASAVA_Build 15 24630959 1I CAATTTAGCT -/A TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 0 1 228482 CASAVA_Build 15 24631255 1D CATGGATTGA T/- TTCTGGACTC 3070 het 3070 ref 56 28 26 2 T 3 2 228483 CASAVA_Build 15 24634210 1I TTCACTGAAT -/A CACAATAGGG 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 A 0 1 228484 CASAVA_Build 15 24634383 1I TGAAAATAAT -/G GCAAAAACTG 3070 hom 59 het 24 0 19 5 G 1 2 228485 CASAVA_Build 15 24635748 2D AAACAGACAC AT/-- ATGTGAAAGC 3070 het 3070 ref 42 19 19 5 AT 2 1 228486 CASAVA_Build 15 24638069 1D TACTCACTCG C/- CCACCACCGC 3070 het 3070 hom 41 14 17 11 C 3 2 228487 CASAVA_Build 15 24657219 1D TTGAAATACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 A 11 10 228488 CASAVA_Build 15 24660296 1D TTCTGAGGTG T/- TCAGCTTGAT 3070 het 3070 hom 54 23 26 5 T 2 1 228489 CASAVA_Build 15 24660756 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 46 15 19 12 CA 10 9 228490 CASAVA_Build 15 24671020 1D ATTTTAAAAT A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 79 het 32 0 27 5 A 8 7 228491 CASAVA_Build 15 24733176 1I GGTTGACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 10 11 228492 CASAVA_Build 15 24737965 1D GAAATAAATG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 51 16 29 6 T 9 8 228493 CASAVA_Build 15 24738492 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1201 hom 30 4 16 11 A 16 15 228494 CASAVA_Build 15 24739066 6I TGAGGTTTAG ------/AATTCT AATTCTAAGG 3070 hom 71 het 29 0 24 5 AATTCT 1 2 228495 CASAVA_Build 15 24747043 1I CTCAAGAAAC -/A AAAACACACA 3070 hom 109 het 42 0 35 7 A 4 5 228496 CASAVA_Build 15 24747247 1I TGCTTCATTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 46 0 36 10 T 8 9 228497 CASAVA_Build 15 24750581 1D TCCATTTTGA T/- TTATTTATAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 3 2 228498 CASAVA_Build 15 24751405 1D CCTTAAAGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 8 228499 CASAVA_Build 15 24752052 1D AATACAAGGC T/- TTTTTTTTTT 2593 het 1594 hom 35 14 8 13 T 17 16 228500 CASAVA_Build 15 24754595 2I TATGCCACTC --/TT TGTATATGAA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 1 3 228501 CASAVA_Build 15 24756933 18D TTGGGGGGGA CACAGTTATTTAGTCTAT/------------------ CACATTCTTC 3070 hom 83 het 37 0 27 14 CACAGTTATTTAGTCTAT 1 0 228502 CASAVA_Build 15 24762552 1I GATGGGGGTT -/A TTTTCCCCGA 3070 hom 132 het 47 0 43 4 A 0 1 228503 CASAVA_Build 15 24774341 1D TTTTTTTTTT G/- CTACATTTCA 3070 het 129 hom 31 4 21 6 G 1 0 228504 CASAVA_Build 15 24774683 1I TTTTATATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 32 1 25 6 A 10 11 228505 CASAVA_Build 15 24777812 3D ATTATAAATA ATG/--- ATGATATTTG 3070 hom 54 het 24 0 19 6 ATG 2 1 228506 CASAVA_Build 15 24777870 1D AATCCCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 26 2 14 10 A 13 12 228507 CASAVA_Build 15 24811046 1D TTCTCATGAC T/- TTTTTTTTTT 2701 het 2701 ref 28 11 6 11 T 13 12 228508 CASAVA_Build 15 24812582 1I ACCTTTTAAG -/A AAAATCACGA 3070 hom 123 het 48 0 42 7 A 4 5 228509 CASAVA_Build 15 24823435 1I GTTTAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 8 13 11 T 11 12 228510 CASAVA_Build 15 24834072 1D ACATTCCTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 28 0 22 7 T 10 9 228511 CASAVA_Build 15 24834743 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 23 13 9 3 T 8 9 228512 CASAVA_Build 15 24836529 1I TGCTGGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 16 7 T 10 11 228513 CASAVA_Build 15 24848472 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1963 hom 12 het 5 0 5 0 T 12 11 228514 CASAVA_Build 15 24854867 2D TGAAAATGGT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 11 9 228515 CASAVA_Build 15 24857172 1D TAGCAAGTGC T/- TTCCTCTGCA 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 3 2 228516 CASAVA_Build 15 24857331 2D GTTTAAAATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 60 23 21 16 CA 9 8 228517 CASAVA_Build 15 24858590 4I ATGTTCTGAC ----/ACTT ACTCTGTGCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 ACTT 0 1 228518 CASAVA_Build 15 24860894 1I ACAGCCCTTC -/T TTTTTAAGCC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 5 6 228519 CASAVA_Build 15 24866088 1D AAGTCTAAGA C/- TGGGAAGTCC 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 C 1 0 228520 CASAVA_Build 15 24868938 1I TTTACTGAAA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 7 8 228521 CASAVA_Build 15 24872293 1I GGTATTGACT -/A AAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 4 5 228522 CASAVA_Build 15 24886520 1I GTGAAAGTAC -/T TTTTTTTTTT 2178 het 2178 ref 44 23 7 14 T 13 14 228523 CASAVA_Build 15 24939847 2D ATGTTTTACA AC/-- AGTTACACTC 3070 het 3070 hom 49 16 21 14 AC 1 0 228524 CASAVA_Build 15 24948492 1D AGCAATTATC A/- AGGTCTAATT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 2 1 228525 CASAVA_Build 15 24954036 3I CATAAAACCA ---/GTG GTGAGTAGCA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 GTG 1 2 228526 CASAVA_Build 15 24960874 1D TGTTCTATAA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 8 7 228527 CASAVA_Build 15 24965571 1D CTTATCTCTG T/- TTTCAAACAC 3070 het 3070 hom 45 20 20 7 T 4 3 228528 CASAVA_Build 15 24999401 2I CATGTCTAAC --/AT ATATATATAT 2308 het 2308 ref 27 14 7 6 AT 8 9 228529 CASAVA_Build 15 25014966 1D TTAAGTCTTT A/- ATCCATCTTG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 2 1 228530 CASAVA_Build 15 25023000 13D TTCTGAGCTT TTTCATTTAGGAA/------------- TTTCTTTCAG 3070 hom 138 het 44 0 47 1 TTTCATTTAGGAA 1 0 228531 CASAVA_Build 15 25032464 1I TAATTCTGTG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 7 8 228532 CASAVA_Build 15 25042429 1I TCTTGTTATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 8 9 228533 CASAVA_Build 15 25085815 6I TCTCAAAGTG ------/TTGGGA TTATAGACGT 3070 het 2944 hom 28 9 17 2 TTGGGA 0 1 228534 CASAVA_Build 15 25091843 5D AAAAAGAAAA AAAAG/----- AAAAGTGCTG 887 het 887 ref 22 11 6 7 AAAAG 2 1 228535 CASAVA_Build 15 25092509 2D AAACCAGCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 14 12 228536 CASAVA_Build 15 25094177 1I ATTGGAATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 9 10 228537 CASAVA_Build 15 25094694 1D GTAAATGGTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 T 7 6 228538 CASAVA_Build 15 25096393 1I ATTTTCTCAA -/T TTTTTTTATT 2877 het 2877 ref 32 18 9 5 T 7 8 228539 CASAVA_Build 15 25096648 1I CTGTGCAGTT -/C TGCCTTCTAA 3070 het 3070 ref 45 25 11 9 C 0 1 228540 CASAVA_Build 15 25099487 4D TGCAACCTAG AGTC/---- AGTCAGTCAG 3070 het 3070 ref 40 20 10 13 AGTC 4 3 228541 CASAVA_Build 15 25121412 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 9 228542 CASAVA_Build 15 25124742 1D CTCCTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 2598 het 155 hom 19 1 10 8 T 14 13 228543 CASAVA_Build 15 25125481 4I AGCAACAGGC ----/TATA TATACCACAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TA 2 4 228544 CASAVA_Build 15 25125874 5D ATTTTTTTAA TAAAT/----- TAAAAATCAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TAAAT 1 0 228545 CASAVA_Build 15 25128391 1I ACCCCATCTC -/T TACTAAAAAT 3070 hom 65 het 24 0 22 2 T 1 2 228546 CASAVA_Build 15 25145788 9I TTAAATCTGC ---------/CACTGTTAA CACATCCTCA 3070 het 3070 hom 58 26 24 8 CACTGTTAA 0 1 228547 CASAVA_Build 15 25305995 1D GTAATTCACG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 44 0 34 10 T 11 10 228548 CASAVA_Build 15 25320590 1I GATAACAATA -/T TTTTTAAAGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 5 6 228549 CASAVA_Build 15 25332144 1I GATATTAGAG -/A AGGATTTACA 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 A 1 2 228550 CASAVA_Build 15 25334619 1D GATCTTCACA G/- GTAGCTACTC 3070 het 3070 ref 56 30 18 9 G 2 1 228551 CASAVA_Build 15 25344589 3D CTTTTCTAAA TCT/--- TCTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 44 21 20 5 TCT 3 2 228552 CASAVA_Build 15 25366862 1I ACCAAACACG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 8 9 228553 CASAVA_Build 15 25367576 1D GAAGTTATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 A 10 9 228554 CASAVA_Build 15 25374116 6I GGGTGGTTCG ------/TGAGTT TGTATGGGGT 3070 het 3070 hom 64 21 33 10 TGAGTT 0 1 228555 CASAVA_Build 15 25384101 1D AAGGTCTCTG C/- GTGACTAACC 3070 het 3070 ref 35 19 11 6 C 1 0 228556 CASAVA_Build 15 25385209 4D AAAGCAGAAC TTAT/---- TTCTTATTGC 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 TTAT 1 0 228557 CASAVA_Build 15 25388986 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 T 11 12 228558 CASAVA_Build 15 25389654 2D CTGTTTTTTT TG/-- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 TG 1 0 228559 CASAVA_Build 15 25392836 1D AGCCACACCA C/- CCACCACATG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 3 2 228560 CASAVA_Build 15 25401214 2I GCTTGCTAAA --/TG TGATTGACAT 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 TG 1 2 228561 CASAVA_Build 15 25401394 3I TTTCCAAGAA ---/GAC TAAAGCATTT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 GAC 0 1 228562 CASAVA_Build 15 25411688 1D ATAGTTGTAT A/- AAAATCTTCT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 5 4 228563 CASAVA_Build 15 25418223 2D AGGATTAGGC TT/-- GCATTTGTTT 3070 het 3070 hom 33 15 16 4 T 2 0 228564 CASAVA_Build 15 25428097 7D TGATTCTGGC TGATATT/------- TGAGCCTCTT 3070 het 3070 ref 39 19 19 4 TGATATT 1 0 228565 CASAVA_Build 15 25431029 1D TTAGAGTAGT A/- AAATGTGGTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 4 3 228566 CASAVA_Build 15 25435867 3I ACTAGTGCCG ---/CCT CCTCTATCAT 3070 het 3070 hom 54 18 24 12 CCT 1 2 228567 CASAVA_Build 15 25439625 1D TTTCTCTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 10 9 228568 CASAVA_Build 15 25443930 1D GAAAAAAAAA C/- AAAGCCAATA 3070 het 3070 ref 49 21 22 7 C 1 0 228569 CASAVA_Build 15 25444536 1I ATTCTTTTTT -/A TGGCTGCATA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 0 1 228570 CASAVA_Build 15 25444699 5I TTAAAAAAGT -----/AAATA AAATAAAATA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 AAATA 2 3 228571 CASAVA_Build 15 25447448 2D GACTATTGAC AA/-- TATTGTCACT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 2 0 228572 CASAVA_Build 15 25448191 1D ATGTTTCAAG C/- CCCCCCATAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 C 7 6 228573 CASAVA_Build 15 25448573 1D CCAAAAGAAG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 8 7 228574 CASAVA_Build 15 25466895 2D TAATCCCGAA AT/-- TCAGCAGTCT 3070 het 3070 ref 52 22 19 11 AT 1 0 228575 CASAVA_Build 15 25468111 1I CGGGAGGCAC -/G GGGGGGAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 G 6 7 228576 CASAVA_Build 15 25471553 2D CAAGATGTGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 61 24 25 12 TA 6 5 228577 CASAVA_Build 15 25475337 1D TTCAGACAAG A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 36 16 19 2 A 7 6 228578 CASAVA_Build 15 25475948 1I CAATTTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 9 10 228579 CASAVA_Build 15 25477501 1I TCAAAGTGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 T 9 10 228580 CASAVA_Build 15 25479090 1I TTTTCTTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 9 10 228581 CASAVA_Build 15 25484893 1D TACCTGACAT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 8 7 228582 CASAVA_Build 15 25490577 3I TTTTTTTCTT ---/AAG AAGGTCTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 AAG 1 2 228583 CASAVA_Build 15 25493593 1D CCGCGGAGCG C/- CTCAGATCTC 2108 het 2108 ref 23 9 7 7 C 2 1 228584 CASAVA_Build 15 25497338 1I ACAGAAATGG -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 6 7 228585 CASAVA_Build 15 25502177 12I AGGAAGTATG ------------/TACAAAAACTTA TACAGCTGAT 3070 het 3070 hom 49 23 21 5 TACAAAAACTTA 0 1 228586 CASAVA_Build 15 25507301 5D AATGCTTTAA TAAAT/----- TATAGTCACA 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 TAAAT 1 0 228587 CASAVA_Build 15 25508691 2I68M2I ACACTCAGAA --ACACACTCTGCTCACACACATCACACACACTAATACACACTCCACTCACACACATTCACACTCACATG--/ACACACACTCCGCTCACACACATCACACACACTAATACACACTCCACTCACACACATTCACACTCACATGCT CTCATAGAAA 3070 het 3070 ref 78 65 32 37 N/A 0 0 228588 CASAVA_Build 15 25511269 1I TTGGACAGCT -/C CCATTCACGC 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 C 2 3 228589 CASAVA_Build 15 25512692 13D GTCTGATAAT AGCAAATTATCCA/------------- TAGCAATGGA 3070 het 3070 ref 48 25 21 6 AGCAAATTATCCA 1 0 228590 CASAVA_Build 15 25517247 3I GCCATACAAG ---/CTC CTCCTCCTGA 3070 het 3070 ref 54 28 22 4 CTC 2 3 228591 CASAVA_Build 15 25519039 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 535 hom 45 3 32 11 A 11 10 228592 CASAVA_Build 15 25521013 1I AAATTTTTTT -/G ATATTGGACT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 0 1 228593 CASAVA_Build 15 25525345 3D TTGTTCAGTG CAT/--- CATTACCCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CAT 2 1 228594 CASAVA_Build 15 25527069 10I TACCTGTGTC ----------/CTTTCAAAAT CTTTCAAAGA 3070 hom 105 het 39 0 34 6 CTTTCAAAAT 0 1 228595 CASAVA_Build 15 25527181 6D ATCAGGGTGT CATCAC/------ CCTGCATACC 3070 hom 80 het 29 0 25 6 CATCAC 1 0 228596 CASAVA_Build 15 25527613 1I TGCTGGCTGC -/A GGTGGCCAGC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 1 228597 CASAVA_Build 15 25529893 4I GCCATAACTA ----/TAAC AATCTAAATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TAAC 0 1 228598 CASAVA_Build 15 25535045 6D TCCTCAAATA ATATAT/------ ATATATATAG 2103 hom 20 het 13 0 7 7 AT 7 4 228599 CASAVA_Build 15 25536234 2I TTATGAACTC --/AT GTTTTGCTTA 3070 hom 178 het 63 0 60 3 AT 0 1 228600 CASAVA_Build 15 25538554 4D ACAACTAAAA TAGT/---- TGGTTGCTCT 3070 hom 105 het 41 0 34 8 TAGT 1 0 228601 CASAVA_Build 15 25539556 1D AAAAAAAAAA C/- CCCGATTAAT 3070 hom 41 het 34 1 28 6 C 4 3 228602 CASAVA_Build 15 25542653 13I TTAATCACCT -------------/CTATCTTGCAAGA GCACAGAACA 3070 hom 63 het 23 0 22 3 CTATCTTGCAAGA 0 1 228603 CASAVA_Build 15 25546345 1I GAAGTTGAAG -/A AAAAAAGAGC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 228604 CASAVA_Build 15 25547011 1I AAATTATAGG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 6 7 228605 CASAVA_Build 15 25555330 1I TCTCTATCTA -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 32 het 29 0 14 15 C 9 10 228606 CASAVA_Build 15 25561792 1D CTTTCATGTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 21 10 6 A 9 8 228607 CASAVA_Build 15 25564167 1D ATTGTTGGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 23 10 9 T 9 8 228608 CASAVA_Build 15 25569985 3I ATAGCTGAAA ---/TAT TATGATTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 TAT 1 2 228609 CASAVA_Build 15 25572163 4I TACATTGTCA ----/TATT TAGTTACCAC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 TATT 0 1 228610 CASAVA_Build 15 25572679 8D TTGGATAGTA TGAACATT/-------- TTAACAATGT 3070 het 3070 ref 36 19 17 1 TGAACATT 1 0 228611 CASAVA_Build 15 25572964 1I GTTCTAATAG -/T TTTTTGGTGG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 5 6 228612 CASAVA_Build 15 25573333 1D TAATCATGTG T/- TTTTTGTTCT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 6 5 228613 CASAVA_Build 15 25573924 1I AACTGGAAAA -/C ATTATGCTAA 3070 het 3070 hom 41 16 23 5 C 0 1 228614 CASAVA_Build 15 25574580 2I ACTGGCTTCA --/TC GACCTTCTGC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 TC 0 1 228615 CASAVA_Build 15 25591847 1D ACCTGTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 681 hom 39 5 27 8 A 17 16 228616 CASAVA_Build 15 25612539 2D TAAGAAGAAG AA/-- AAAAAAGACC 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 A 8 6 228617 CASAVA_Build 15 25620069 1D ATTATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 12 11 228618 CASAVA_Build 15 25632363 1I TGATAAACAA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 7 8 228619 CASAVA_Build 15 25643556 1I TGAGAGACGC -/T TTTTTTTTTT 2190 het 2190 ref 26 9 7 10 T 12 13 228620 CASAVA_Build 15 25655066 4D TTTTGTTGAG AACA/---- AACAGATTAC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 AACA 2 1 228621 CASAVA_Build 15 25657462 3I ACTCGGTCTC ---/AAA AGAAAAAAAA 2235 hom 22 het 13 0 8 5 A 1 4 228622 CASAVA_Build 15 25657734 1D CTCTACAGGT G/- GGACCCTGAG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 3 2 228623 CASAVA_Build 15 25660735 3D GATTTAAACA TCC/--- TCCTCTTGAC 3070 hom 129 het 50 0 44 8 TCC 2 1 228624 CASAVA_Build 15 25663685 2I CCCTTTGTAG --/CT CAGTAAGAGA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 CT 0 1 228625 CASAVA_Build 15 25666491 1D AATATCTATT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 8 7 228626 CASAVA_Build 15 25717865 2D CTTTCTTTGC AA/-- TCGTCAGGCA 3070 hom 120 het 43 0 40 4 A 2 0 228627 CASAVA_Build 15 25718493 2I CTAAAAAAAA --/AG AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AG 0 1 228628 CASAVA_Build 15 25719665 2D CCAAGACTGC AT/-- CACTGTACTC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AT 1 0 228629 CASAVA_Build 15 25721935 3D AGTTTAAACC ACG/--- ACGAGACAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 4 ACG 2 1 228630 CASAVA_Build 15 25725835 4D GTCACCCCCG GCCC/---- GCCCACCTCT 3070 hom 69 het 26 0 23 7 GCCC 2 1 228631 CASAVA_Build 15 25729350 3I GGAGAAAATA ---/TTT TTTGCAAACT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 3 6 228632 CASAVA_Build 15 25729805 1I AAAAGACACC -/T GTACATGCAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 0 1 228633 CASAVA_Build 15 25729932 1I ACTTAGCCGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 750 hom 35 2 25 8 A 10 11 228634 CASAVA_Build 15 25738458 2I TGTATATAAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 142 het 61 0 49 12 TG 6 7 228635 CASAVA_Build 15 25738871 2D GAGTCCAAAC TG/-- ATATAAATGA 3070 hom 126 het 46 0 43 4 TG 1 0 228636 CASAVA_Build 15 25740395 2D GTGCACACAG AC/-- ACAGGCTCAC 3070 hom 183 het 71 0 59 15 AC 2 1 228637 CASAVA_Build 15 25742138 9D GTCATATGCC GATTATAGT/--------- GATTATGTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 GATTATAGT 1 0 228638 CASAVA_Build 15 25758428 1D AGATTCAAGG A/- AGAAATAAAG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 2 1 228639 CASAVA_Build 15 25777130 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1251 het 1251 ref 24 12 4 8 A 17 16 228640 CASAVA_Build 15 25789530 8D AAAGAAAGAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AAAG 6 4 228641 CASAVA_Build 15 25827148 2D TTACATTAGG TA/-- TATATATCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TA 4 3 228642 CASAVA_Build 15 25832106 1D CTTGTTTTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 10 9 228643 CASAVA_Build 15 25843138 1D ATTGTATGTC T/- TTTTTTTATC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 7 228644 CASAVA_Build 15 25845204 1I CCATTGACCC -/T ACAAGTTTAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 0 1 228645 CASAVA_Build 15 25849966 1D ATTTGAGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 8 228646 CASAVA_Build 15 25850398 1I TTTAAAAAAA -/T AAAACAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 0 1 228647 CASAVA_Build 15 25851719 1D CAAGGCATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 10 9 228648 CASAVA_Build 15 25878126 1I GAAGTGAAGG -/A AAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 6 7 228649 CASAVA_Build 15 25889036 1D CCAACAAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1425 hom 28 8 13 7 A 10 9 228650 CASAVA_Build 15 25895677 1I TATTTGATTC -/T TTCTATAGAT 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 T 2 3 228651 CASAVA_Build 15 25908059 1I GGATAGTCCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 8 9 228652 CASAVA_Build 15 25910396 1I GAACTCTAAA -/T CTGGTAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 228653 CASAVA_Build 15 25910847 1D TTTAGGACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 25 0 11 14 T 13 12 228654 CASAVA_Build 15 25915337 1I ACCTACCAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 520 hom 29 2 22 5 A 9 10 228655 CASAVA_Build 15 25915840 11D23M18D AGAAAGAAAG GAAGAAAGAAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGAAGGAAGGAAGAGAGAGAG/-----------AGAAAGAAAGAAAGGAAGAAAGA------------------ AAAGAAAGAA 2211 het 410 hom 15 4 6 13 N/A 0 0 228656 CASAVA_Build 15 25938098 1D AAGGACGGCG C/- CCTTAACTGA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 C 3 2 228657 CASAVA_Build 15 25941129 10I AAAATTCGAG ----------/TGGGTGAGAA TGGTAATGGC 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 TGGGTGAGAA 0 1 228658 CASAVA_Build 15 25951371 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAAAAAA 907 hom 10 het 6 0 4 2 A 14 16 228659 CASAVA_Build 15 25954632 1D CATAATTCTA T/- TAATTCAGAG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 2 1 228660 CASAVA_Build 15 25956832 2D TTCTCCTCTC TT/-- TCTCTCTCCC 3070 het 3070 ref 41 18 12 12 T 3 1 228661 CASAVA_Build 15 25960003 2I AAAAAAAAAC --/AT GTGAGCATCT 2935 het 2935 ref 28 14 8 6 AT 0 1 228662 CASAVA_Build 15 25971985 1D GGTGTGTATC T/- CCAGGCAGCA 3070 het 3070 hom 47 20 16 11 T 1 0 228663 CASAVA_Build 15 25972674 1D TCCCCCACCC T/- GGCTCACCCC 3070 het 3070 hom 36 18 18 3 T 1 0 228664 CASAVA_Build 15 25972958 4I TGTGTATGTA ----/TGTG TGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 70 34 28 8 TG 2 4 228665 CASAVA_Build 15 25973489 1D ATGCTGCTAT A/- AAAAAACTGC 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 A 7 6 228666 CASAVA_Build 15 25974074 19D CTGATCTCAC ACTTGCATTTTTCCCCAAA/------------------- ACTTTTATCT 3070 het 3070 ref 47 25 20 10 ACTTGCATTTTTCCCCAAA 1 0 228667 CASAVA_Build 15 25976553 2I TCACAAAGAC --/AG GGGTGGGATT 3070 het 3070 ref 66 31 27 8 AG 0 1 228668 CASAVA_Build 15 25978450 1I ATTTTATTGA -/C CCCAAAAAGG 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 C 3 4 228669 CASAVA_Build 15 25983444 1D TTTGTCCTTC T/- TTTTCCTTTA 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 T 5 4 228670 CASAVA_Build 15 25983597 1D TGTCTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 2560 het 2560 ref 26 10 10 6 T 11 10 228671 CASAVA_Build 15 25998041 2D AAGATTACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3020 het 3020 ref 44 20 8 17 T 13 11 228672 CASAVA_Build 15 26019629 1D TGCATGGTGA C/- CCCCATCCTT 3070 hom 86 het 45 0 24 21 C 5 4 228673 CASAVA_Build 15 26020410 1D TATAGAATTA T/- ACTTTTTTGG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 0 228674 CASAVA_Build 15 26023738 4I TCTGTGTGGG ----/GTGT GTGTGTGCAT 3070 het 3070 hom 50 19 19 12 GT 3 5 228675 CASAVA_Build 15 26024894 4I TGTGTGCGCA ----/TGTG TGTGTGTGGG 3070 hom 99 het 46 0 29 17 TG 4 6 228676 CASAVA_Build 15 26029565 1D AGATGGGGCT G/- GGGAGGAAGT 3070 hom 66 het 26 0 20 7 G 4 3 228677 CASAVA_Build 15 26030153 1I AAGGAGAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 8 9 228678 CASAVA_Build 15 26034484 1I TAAAAGCCTC -/T TAACTCTTCA 3070 hom 144 het 59 0 47 12 T 1 2 228679 CASAVA_Build 15 26034964 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 30 1 16 13 T 17 16 228680 CASAVA_Build 15 26040859 1D CGGGGAGGGG A/- AACAAGGTCC 3070 hom 61 het 29 0 20 9 A 3 2 228681 CASAVA_Build 15 26043307 1D CATGAACATT C/- AAGGTTCTTT 3070 hom 102 het 38 0 32 6 C 1 0 228682 CASAVA_Build 15 26050792 2I CTGGGGGCCC --/CT GACTGCGGTG 3070 hom 81 het 28 0 23 5 CT 0 1 228683 CASAVA_Build 15 26053445 1D TTTTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 1470 hom 40 het 21 0 12 9 T 17 16 228684 CASAVA_Build 15 26054860 1I ACCACAAGGG -/A AAAAAACACC 3070 het 177 hom 15 1 12 2 A 6 7 228685 CASAVA_Build 15 26055076 1I TGACATAATA -/G TAAGGAAGCC 3070 hom 39 het 16 0 12 4 G 0 1 228686 CASAVA_Build 15 26066385 2D TTCTGAATCT CA/-- CACCTCATTC 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 CA 2 1 228687 CASAVA_Build 15 26070511 1I TAATAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 A 11 12 228688 CASAVA_Build 15 26083278 1D TGTACCTACC A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 12 14 11 A 1 0 228689 CASAVA_Build 15 26092119 3D AGATACTATT CAA/--- CAATTTAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 16 11 CAA 2 1 228690 CASAVA_Build 15 26092971 1D CATTCCAGCA T/- GTATAAATCG 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 1 0 228691 CASAVA_Build 15 26093093 1D AGGTTGCTGT A/- AACCTACAGA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 A 3 2 228692 CASAVA_Build 15 26111672 1I TGGGTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2843 het 2843 ref 40 18 14 8 T 11 12 228693 CASAVA_Build 15 26124027 27I CCAGCATGAC ---------------------------/TGCAGGGAGCACGTGCACCGCCCCACG TGCTCTCAAG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 TGCAGGGAGCACGTGCACCGCCCCACG 0 1 228694 CASAVA_Build 15 26125888 1I ATTCTTTCTC -/T TTTTCTTGAG 1741 het 1617 hom 13 4 6 3 T 4 5 228695 CASAVA_Build 15 26135845 2D9M1I TCGCACACTT ACACACTTGTG-/--ACACTTGTGC CTGCCACCCA 1943 het 1943 ref 56 53 7 6 N/A 0 0 228696 CASAVA_Build 15 26145134 1I CAAAACAGGG -/C GGTACCTGCA 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 C 0 1 228697 CASAVA_Build 15 26146198 1D GCCTTCATCC A/- AAAAAAAAAA 1135 het 1135 ref 25 12 4 9 A 11 10 228698 CASAVA_Build 15 26153609 2D CAGGGTAGGC TA/-- TGTATTCCTA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 TA 1 0 228699 CASAVA_Build 15 26158796 1D TATTGTAGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 28 11 4 T 9 8 228700 CASAVA_Build 15 26171921 4I TTACACAACA ----/CTGT CTGACCGTTT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 CTGT 0 1 228701 CASAVA_Build 15 26176197 1I ATTTCACTAG -/C CCCATCTCAT 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 C 3 4 228702 CASAVA_Build 15 26177373 1D TATCTATTAC A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 8 7 228703 CASAVA_Build 15 26181411 13I CACAGAAAGT -------------/GGCAGTGTTTGTA CAACTCAACA 3070 het 3070 ref 41 21 19 2 GGCAGTGTTTGTA 0 1 228704 CASAVA_Build 15 26182344 2I TCCCAACTGC --/AT ATATCAGCAT 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 AT 2 3 228705 CASAVA_Build 15 26208149 3I CCTTATAACA ---/TAG TTCTCAAATA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 TAG 0 1 228706 CASAVA_Build 15 26212659 4D57M1I GAGAAGAGAG AACTAACCTTAACCTTGAAGTGTAAACACGTTCCATCACAGAAGGCTGTGACTAAATGTCT-/----AACCTTAACCTTGAAGTGTAAACACACTCCATCACAGAAGGCTGTGACTAAATGTCTA AACAACATAA 1236 het 1236 ref 53 71 3 13 N/A 0 0 228707 CASAVA_Build 15 26214825 1I AATGTCAAAA -/T TATCTCCCTA 2835 het 2835 ref 27 16 7 4 T 1 2 228708 CASAVA_Build 15 26237364 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3004 hom 18 het 8 0 7 1 A 13 12 228709 CASAVA_Build 15 26240514 2D TCCAAGAAGT AC/-- ACACACATAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 AC 4 3 228710 CASAVA_Build 15 26255390 1I TTACTTTTTT -/G TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 G 0 1 228711 CASAVA_Build 15 26259475 3D AGGTGATGTC GAG/--- TGGTGGTGGT 1119 het 1119 ref 94 69 4 25 GAG 1 0 228712 CASAVA_Build 15 26261592 1D AGGAAACGTG T/- TTTTATGGCA 1795 het 1795 ref 24 17 5 2 T 5 4 228713 CASAVA_Build 15 26318127 2D CCCTAAAAAA AT/-- ATATATATAT 2398 hom 21 het 10 0 8 2 AT 8 7 228714 CASAVA_Build 15 26323840 2I GAAAAAAAAA --/AC ACCTCAGAGA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 AC 1 2 228715 CASAVA_Build 15 26330299 5D TCTCTGTTTC TTTAT/----- TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 TTTAT 1 0 228716 CASAVA_Build 15 26337818 1D GGCCCAGCTA T/- TTTTTTTGTA 1550 hom 10 het 4 0 4 0 T 8 7 228717 CASAVA_Build 15 26346409 1I TTTCTGTTAT -/A TTTTTTCCAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 0 1 228718 CASAVA_Build 15 26347052 1I GCATTGGGTA -/C CCCCCAGTGT 1181 het 1181 ref 11 8 3 0 C 5 6 228719 CASAVA_Build 15 26533209 1I TAAATACACT -/G GGGGGTACCC 2654 het 2654 ref 20 12 6 2 G 5 6 228720 CASAVA_Build 15 26536904 1D GACTCCGTCT C/- AAAAAAAAAA 2198 het 2198 ref 28 14 8 7 C 1 0 228721 CASAVA_Build 15 26540344 1I CTTGCTCCTT -/C CCCCACTGAG 1455 het 1455 ref 24 16 5 3 C 4 5 228722 CASAVA_Build 15 26541498 1D AGGAGTATTT G/- GGCTGATGGT 1789 het 1789 ref 84 65 5 14 G 3 2 228723 CASAVA_Build 15 26544602 3I GGAAAGAGGA ---/AAG GAGAAGGAAG 3070 het 7 hom 21 0 9 12 AAG 0 1 228724 CASAVA_Build 15 26551055 1D GGTTGCTTCA T/- CTAGGAGAAG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 1 0 228725 CASAVA_Build 15 26557583 1D TTTTTTTGGC G/- GGGGGGGGTA 2153 het 945 hom 22 8 6 8 G 9 8 228726 CASAVA_Build 15 26577410 1D AAAAGCTTTT A/- AAAATATATA 1237 het 1237 ref 45 35 3 7 A 5 4 228727 CASAVA_Build 15 26586552 1I TTTTTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 2816 het 2068 hom 14 6 8 0 T 11 12 228728 CASAVA_Build 15 26588259 1D ACTATGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1686 het 91 hom 7 2 5 0 A 15 14 228729 CASAVA_Build 15 26595274 4D GTCATTTCAC TTTA/---- TTTATTTATT 1439 het 1439 ref 23 18 4 1 TTTA 3 2 228730 CASAVA_Build 15 26609515 1D GCTACCTCCT C/- CCCATGCCAT 1140 het 1140 ref 16 11 4 1 C 4 3 228731 CASAVA_Build 15 26633939 3I TTTTGAGTAA ---/TTT TTTGTTTCAC 3070 het 3070 ref 39 22 8 9 T 3 6 228732 CASAVA_Build 15 26649149 1D ACAGAAACAG A/- AAAAAAAAAA 1216 het 1216 ref 41 35 4 4 A 12 11 228733 CASAVA_Build 15 26655972 4I CCCAAAGTGC ----/TGTT TGGGATGACA 2250 het 2250 ref 17 9 6 2 TGTT 0 1 228734 CASAVA_Build 15 26682397 1D GATTATATCC T/- TTTTTTTTTT 1986 het 1180 hom 20 9 5 6 T 17 16 228735 CASAVA_Build 15 26709053 1D TTTTTCCCCC T/- GCCTTGCTCT 1927 het 1927 ref 23 15 5 3 T 1 0 228736 CASAVA_Build 15 26775235 1D TTGATGAGGC T/- TTTATTTGAT 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 T 4 3 228737 CASAVA_Build 15 26780900 1D GAAGAGTTAA T/- TTAACAAGGA 3070 het 3070 ref 53 31 12 10 T 3 2 228738 CASAVA_Build 15 26781633 1I ACAGCTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 9 11 T 11 12 228739 CASAVA_Build 15 26788716 1D AGTTTTTTTT C/- CCCCCCACTT 3070 het 3070 ref 40 24 11 6 C 7 6 228740 CASAVA_Build 15 26789097 1D GTGATAATCT A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 32 19 8 6 A 7 6 228741 CASAVA_Build 15 26792603 1I TCTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 464 hom 19 2 13 4 A 11 12 228742 CASAVA_Build 15 26795538 2D ATTTATACAC AT/-- AGATTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 AT 1 0 228743 CASAVA_Build 15 26799201 3D AAAAAATAAC ATT/--- ATTTCTGGTA 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 ATT 2 1 228744 CASAVA_Build 15 26801670 1D GTTATTGTTT A/- CTTTTAAGAG 1434 het 1434 ref 11 7 3 2 A 1 0 228745 CASAVA_Build 15 26803204 1I ACTATTTTTG -/A AAAAAAGAAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 6 7 228746 CASAVA_Build 15 26804928 3I TTATTTTTAT ---/TTA TTATTTATTT 3070 het 269 hom 15 1 12 2 TTA 1 2 228747 CASAVA_Build 15 26805858 3I AATTATTTGC ---/TTA TTATTTTTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTA 1 2 228748 CASAVA_Build 15 26807683 21D AGCTGGCAGG CCCCTCCATGGATCACCGGCA/--------------------- CCAAGGCGCT 1339 het 1339 ref 11 9 3 2 CCCCTCCATGGATCACCGGCA 1 0 228749 CASAVA_Build 15 26808092 1I ATAGGACTTA -/C GACACCCTTG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 0 1 228750 CASAVA_Build 15 26808396 4I TGTTTTCAGT ----/TTTG TTTCTCTGTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTTG 0 1 228751 CASAVA_Build 15 26809856 3D GATGTAAAAG ATA/--- AATGTGAGAT 3070 het 3070 ref 32 22 9 1 ATA 1 0 228752 CASAVA_Build 15 26811786 1D TTAAAAACTG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 T 8 7 228753 CASAVA_Build 15 26819585 3D CGGAGCTTGC AGT/--- AGTGAGCGGA 2762 het 2490 hom 19 7 9 4 AGT 2 1 228754 CASAVA_Build 15 26821099 1I TTTTTCACCA -/T TTTTTTTTTT 2621 het 2621 ref 37 28 7 2 T 10 11 228755 CASAVA_Build 15 26823174 1D ATTCTGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 12 8 T 11 10 228756 CASAVA_Build 15 26833953 1I GGGAACGCAA -/G GGGGCGTCCC 3070 het 2703 hom 26 9 15 2 G 4 5 228757 CASAVA_Build 15 26841297 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTG 3070 het 1968 hom 18 6 9 3 T 8 7 228758 CASAVA_Build 15 26842274 1I TCTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 T 11 12 228759 CASAVA_Build 15 26843069 1D AGCCTTTTCC A/- GCCATTTCTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 A 1 0 228760 CASAVA_Build 15 26846124 11I TTTATGTGTG -----------/TGTATATATAT TGTATATATA 1983 het 1983 ref 15 7 5 3 TGTATATATAT 1 2 228761 CASAVA_Build 15 26850896 1I GTATTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 26 2 20 4 T 11 12 228762 CASAVA_Build 15 26854139 1D TTCTGGTACC T/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 T 6 5 228763 CASAVA_Build 15 26864477 2D AAAACCAGAC AG/-- AACAGTTATT 2869 het 2869 ref 37 23 7 8 AG 1 0 228764 CASAVA_Build 15 26864568 2I TTGAAAGAGG --/AT ATATCACATG 2810 het 2810 ref 27 19 6 2 AT 2 3 228765 CASAVA_Build 15 26868801 2D ATGTTTTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 TA 8 7 228766 CASAVA_Build 15 26877375 1I TCTCTGTCTC -/T TTTTTTTTTT 2525 het 2525 ref 22 9 8 5 T 10 11 228767 CASAVA_Build 15 26882099 1D TGAGATTTAT G/- TGCTGTTCTG 3070 het 3070 ref 43 29 9 5 G 1 0 228768 CASAVA_Build 15 26883507 3D TGTTATCCCT TCA/--- TCAGTGGGCA 1322 het 1322 ref 55 46 3 10 TCA 2 1 228769 CASAVA_Build 15 26886097 1D ACAAAAAAAA C/- AATAGAAACA 1421 het 1421 ref 18 8 6 4 C 1 0 228770 CASAVA_Build 15 27006840 6D TTTTGTTTTT TTTTTG/------ TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 TTTTTG 1 0 228771 CASAVA_Build 15 27020528 1I AGTCCATGAG -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 7 8 228772 CASAVA_Build 15 27021937 4I GGGAATAGTT ----/TGTC TGATGATTCC 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 TGTC 0 1 228773 CASAVA_Build 15 27031075 1I TCTCCCATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 9 10 228774 CASAVA_Build 15 27042199 1D GAGCCACCAT G/- GCCCAGCCTA 3070 hom 66 het 26 0 22 5 G 2 1 228775 CASAVA_Build 15 27054735 2I AATTCAAATC --/TG TATATTTTCA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 TG 0 1 228776 CASAVA_Build 15 27066599 2D AGGTTTTAAC AT/-- GTGAATTTGG 3070 het 3070 hom 56 19 31 7 AT 1 0 228777 CASAVA_Build 15 27089145 1D AATGTTTGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 9 8 228778 CASAVA_Build 15 27090968 1D AGCTTGCTTA C/- CCCGTAGTCA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 C 4 3 228779 CASAVA_Build 15 27099778 1D GTTTTAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 11 8 T 12 11 228780 CASAVA_Build 15 27100147 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 1947 hom 12 het 6 0 5 1 A 9 8 228781 CASAVA_Build 15 27101972 15D TTAGTCCCCT TGAAATTTATTTTTG/--------------- TGAATAGCGT 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 TGAAATTTATTTTTG 1 0 228782 CASAVA_Build 15 27102378 1D ATGTAGTGTA T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 7 6 228783 CASAVA_Build 15 27103218 1D CCCAAAGTGC T/- GGGATTATAG 3070 het 1705 hom 19 5 13 1 T 1 0 228784 CASAVA_Build 15 27104628 3I TGGTTGTCTC ---/ATT ATTAGCAACT 3070 het 3070 hom 46 16 28 2 ATT 1 2 228785 CASAVA_Build 15 27110223 2D CCCATGTGAG TA/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2919 hom 28 11 13 5 TA 1 0 228786 CASAVA_Build 15 27114908 1I ATCTCAGGTA -/G GGGCTCTGGT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 G 3 4 228787 CASAVA_Build 15 27115747 1D TAAAAAACTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 8 7 228788 CASAVA_Build 15 27120536 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAATAGG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 7 6 228789 CASAVA_Build 15 27120761 1I GAGCCAGGAG -/T TTTAAGATCG 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 3 4 228790 CASAVA_Build 15 27140283 1D AACGTATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 10 9 228791 CASAVA_Build 15 27174931 2D ATCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 6 A 11 9 228792 CASAVA_Build 15 27180713 1D TTGGAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 2675 hom 38 het 22 0 13 10 T 14 13 228793 CASAVA_Build 15 27182255 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 13 1 12 0 A 15 14 228794 CASAVA_Build 15 27182445 10I CTTCCTAAGA ----------/ACTTGGGTCC ACTTGGGTCC 3070 hom 65 het 30 0 20 10 ACTTGGGTCC 1 2 228795 CASAVA_Build 15 27194193 2D12M2I TGGGAAATGA GTGTGTGCGTGCAC--/--GTGCGCGTGCACAT GTGGGTGTAT 3070 hom 125 het 46 0 36 12 N/A 0 0 228796 CASAVA_Build 15 27194388 2D GTGGCTGTGG GT/-- GTGTGTGAGC 3070 hom 119 het 48 0 34 14 GT 4 3 228797 CASAVA_Build 15 27198298 4I CTCTGCCAGC ----/ACTT ACTTACCTTT 3070 hom 109 het 46 0 31 15 ACTT 1 2 228798 CASAVA_Build 15 27211435 5I AGAATGGCAT -----/CTGAC CTGACCTAAG 2447 het 95 hom 22 2 7 13 CTGAC 1 2 228799 CASAVA_Build 15 27231423 1D CCAGAATGAG C/- CGAGGTCGAT 3070 hom 135 het 50 0 44 6 C 2 1 228800 CASAVA_Build 15 27232641 1D TAATGTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 51 1 38 14 T 12 11 228801 CASAVA_Build 15 27234622 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGT 1090 hom 7 het 3 0 3 0 A 6 5 228802 CASAVA_Build 15 27239196 2D AGCTAGATAC AG/-- AGTGTCGATT 3070 het 2210 hom 26 7 19 1 AG 2 1 228803 CASAVA_Build 15 27264643 1D ATACCTTCCA G/- GATATTGTCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 G 2 1 228804 CASAVA_Build 15 27286952 1D GTTGGGGGGC G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 54 het 23 0 15 8 G 8 7 228805 CASAVA_Build 15 27301160 4I TCTGAGGCTC ----/TTCT TTCTGTTAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TTCT 1 2 228806 CASAVA_Build 15 27321354 1I TACAGTGAGA -/C CCCCCCCCCA 1606 het 1606 ref 23 8 6 9 C 9 10 228807 CASAVA_Build 15 27326372 1I TGAAAATGTC -/A CCAGGCTACA 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 A 0 1 228808 CASAVA_Build 15 27327235 1I GTATGTCTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 50 14 20 16 A 9 10 228809 CASAVA_Build 15 27335497 2D AGTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1546 het 1080 hom 23 11 4 8 A 18 16 228810 CASAVA_Build 15 27337994 1I CTGTTTATTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 9 10 228811 CASAVA_Build 15 27340248 2I CTACTTTCAC --/AT GTTTGAAATT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 AT 0 1 228812 CASAVA_Build 15 27343716 1I AAATGATGTT -/G GGGGCATGTT 2800 het 2800 ref 20 9 7 4 G 4 5 228813 CASAVA_Build 15 27350150 1D AGCTTTGAGG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 8 7 228814 CASAVA_Build 15 27351971 4D TTACACTATA TTTG/---- TTCTACTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 5 TTTG 1 0 228815 CASAVA_Build 15 27353943 1D GGTGTCCTTG A/- AAAAGTAAGG 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 A 5 4 228816 CASAVA_Build 15 27377672 4D AAGAAGAAAT AATC/---- AATATTAGAA 3070 het 3070 hom 37 18 17 3 AATC 1 0 228817 CASAVA_Build 15 27386786 2D CAGCTAACAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 14 8 A 12 10 228818 CASAVA_Build 15 27387868 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 8 7 228819 CASAVA_Build 15 27389155 1I GTGTGGTGCT -/G GGCATCTGTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 G 2 3 228820 CASAVA_Build 15 27393062 5D CATGGTTTAC TTAAT/----- ATTTCAAGCC 3070 het 3070 ref 34 18 14 5 TTAAT 1 0 228821 CASAVA_Build 15 27397811 1D GTATGTACAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 10 9 228822 CASAVA_Build 15 27413918 1D TTCAAGGCAG T/- TAAGAATTTC 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 2 1 228823 CASAVA_Build 15 27414077 4D GGTTGAACTT TGAC/---- TGAGCGTATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TGAC 1 0 228824 CASAVA_Build 15 27416139 1D AGAAAACAGT G/- TACTAACAGT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 G 1 0 228825 CASAVA_Build 15 27418396 2I AAATAATACT --/CC CCCCACTCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 4 6 228826 CASAVA_Build 15 27423075 8D AGGCGCTCTC TCTCTCTT/-------- TCTCTCTCTT 158 het 158 ref 28 4 2 23 TCTCTCTT 1 0 228827 CASAVA_Build 15 27423966 3D CTCTCACCCT CAG/--- AAGAAGGGGC 3070 hom 149 het 56 0 50 8 CAG 1 0 228828 CASAVA_Build 15 27429821 2D CTGAAATCTC TT/-- GTTTATATTA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 2 0 228829 CASAVA_Build 15 27473246 1D ATTTTTTTTT A/- AATTAACAAA 3070 hom 51 het 29 0 23 7 A 3 2 228830 CASAVA_Build 15 27474575 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCACC 842 hom 7 het 3 0 2 3 G 4 3 228831 CASAVA_Build 15 27475031 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 24 0 15 9 T 13 12 228832 CASAVA_Build 15 27478301 4I CCAAGGTCCC ----/CACT CACTCCCTGG 3070 het 3070 hom 29 8 17 4 CACT 1 2 228833 CASAVA_Build 15 27487925 1I AAGGAGGAAC -/G GCCCTGGTGG 3070 hom 102 het 40 0 33 7 G 1 2 228834 CASAVA_Build 15 27489129 1D CCTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 20 4 T 13 12 228835 CASAVA_Build 15 27494670 1I CATCCTGATA -/C CAAAGTCTGG 1413 het 1350 hom 6 3 3 0 C 1 2 228836 CASAVA_Build 15 27543033 2D ATGCACAGAT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 102 het 44 0 35 10 GA 6 5 228837 CASAVA_Build 15 27543771 1I AAAGAATAAA -/G GAAAAGAAGG 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 G 1 2 228838 CASAVA_Build 15 27549275 1I AATAAATTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 8 9 228839 CASAVA_Build 15 27556914 1D CAAAAAGTGC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 9 8 228840 CASAVA_Build 15 27565674 2I AAAATGGGAG --/AC ACACACACAC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AC 6 7 228841 CASAVA_Build 15 27568647 4I AAAACATGGG ----/AAAA AAAAACTGGC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 5 9 228842 CASAVA_Build 15 27568997 8I ACTTTGATTC --------/TTTGATTT TGTATGTGCG 3070 het 3070 ref 51 26 14 11 TTTGATTT 0 1 228843 CASAVA_Build 15 27571561 1D GTTGGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 2185 het 2185 ref 30 17 5 8 T 13 12 228844 CASAVA_Build 15 27573093 1I AGCCAGTGTG -/A CAGAGTAAGA 3070 het 2904 hom 34 7 17 10 A 0 1 228845 CASAVA_Build 15 27573700 1I AGACTATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 A 11 12 228846 CASAVA_Build 15 27578802 5D TTTCTGTATC TACTA/----- TATGTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 29 13 6 TACTA 1 0 228847 CASAVA_Build 15 27580769 1D GCAAACATTC T/- CAACAAAACA 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 T 1 0 228848 CASAVA_Build 15 27590306 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1404 het 947 hom 14 5 4 6 A 15 14 228849 CASAVA_Build 15 27618688 1I ATCCTGAGTC -/T TCCCAATCCT 3070 hom 33 het 15 0 11 4 T 1 2 228850 CASAVA_Build 15 27622645 5D GAGACTGTCT ACATG/----- ACATGTTAGT 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 ACATG 2 1 228851 CASAVA_Build 15 27623039 1I CATTTTGGGA -/G GCTGAGGTAG 3070 het 3063 hom 20 8 9 3 G 1 2 228852 CASAVA_Build 15 27623929 1I ATGGCTGCAC -/G AGCCATGTGA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 G 0 1 228853 CASAVA_Build 15 27626749 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2200 het 2200 ref 17 7 5 5 T 11 10 228854 CASAVA_Build 15 27634113 2I AGTGAAAAAG --/AC AAATTTCAGA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 AC 0 1 228855 CASAVA_Build 15 27634269 1D TGCTGTGGGG T/- TTTGCAAACG 2723 het 2723 ref 21 14 6 1 T 4 3 228856 CASAVA_Build 15 27643697 2D TCTCCAGGTA CC/-- CACTTGTTTC 3070 het 3070 hom 57 21 29 8 C 3 1 228857 CASAVA_Build 15 27645457 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 14 2 8 4 A 11 12 228858 CASAVA_Build 15 27646240 1D GGCATGAGCC A/- ACCATGCCCA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 2 1 228859 CASAVA_Build 15 27648207 14D CTCTTAAGGC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 31 1 28 6 A 25 11 228860 CASAVA_Build 15 27648949 6D ATAGCAAACA TTAGTT/------ TTAAAGGATT 3070 hom 69 het 25 0 21 5 TTAGTT 1 0 228861 CASAVA_Build 15 27659017 1D GGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2948 het 72 hom 21 1 8 13 T 17 16 228862 CASAVA_Build 15 27660564 2D TTGTAATGAC TT/-- TATTAGTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 3 1 228863 CASAVA_Build 15 27663689 2D TACAGTAAAC AT/-- GTATTTGTAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AT 1 0 228864 CASAVA_Build 15 27675921 1I TTAATCCCAG -/T TATACGTGTA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 1 2 228865 CASAVA_Build 15 27676583 4D TCACTCATAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 15 11 228866 CASAVA_Build 15 27677619 1D CCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 280 hom 35 1 31 3 A 10 9 228867 CASAVA_Build 15 27678192 8D TTTTTCTTTC TTTCTTTT/-------- TTTCTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 5 TTTCTTTT 2 1 228868 CASAVA_Build 15 27679442 1D TGTCTCTATG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 121 het 46 0 40 6 T 8 7 228869 CASAVA_Build 15 27685198 1I TGGGCATGAT -/G GGGGGGGTGC 3070 hom 45 het 19 0 16 7 G 7 8 228870 CASAVA_Build 15 27685735 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 2027 hom 3 het 21 1 8 12 T 15 14 228871 CASAVA_Build 15 27686801 1D TCTTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 567 hom 33 3 19 11 T 15 14 228872 CASAVA_Build 15 27717431 1I GAAGATGGTC -/T GGAGTTATTG 3070 het 3070 ref 51 26 17 8 T 0 1 228873 CASAVA_Build 15 27719356 18D CCTCTACCTC CCAGGTTCAAGCGATTCT/------------------ CCTGCCTCAG 3070 hom 18 het 9 0 7 2 CCAGGTTCAAGCGATTCT 1 0 228874 CASAVA_Build 15 27729336 1D2M3I TGGAGCAAGG ATG---/-TGTAA GCCTCTTGCT 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 N/A 0 0 228875 CASAVA_Build 15 27734598 1I TCTAAAGTGA -/C TCTGAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 23 3 C 0 1 228876 CASAVA_Build 15 27740556 1D AATTACAGCA T/- TTTTTTGCTG 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 7 6 228877 CASAVA_Build 15 27745668 1I GTCTTTTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 10 11 228878 CASAVA_Build 15 27746689 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1464 het 1464 ref 21 6 7 8 T 13 14 228879 CASAVA_Build 15 27757082 2D GCTGGGAAAC AT/-- AGAGGATGGA 3070 het 3070 hom 34 16 14 5 AT 1 0 228880 CASAVA_Build 15 27762228 1D CTTGCTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 31 1 22 8 T 13 12 228881 CASAVA_Build 15 27763431 1I TATTTATCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 9 10 228882 CASAVA_Build 15 27764490 1I TGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 11 12 228883 CASAVA_Build 15 27770159 4D CCCTGGCACC CACA/---- CACAGCCTGG 3070 hom 118 het 47 0 33 17 CA 4 2 228884 CASAVA_Build 15 27772639 1D TTGATGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 12 11 228885 CASAVA_Build 15 27772995 1D TAGGTATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 22 1 14 7 A 15 14 228886 CASAVA_Build 15 27774388 1D CAACCAACTT G/- ACTTCTCCTC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 G 1 0 228887 CASAVA_Build 15 27774818 6I CTGAACCCAA ------/AGCAAG AGCAAGTAGA 3070 hom 76 het 29 0 26 3 AGCAAG 1 2 228888 CASAVA_Build 15 27775583 2I AAAATATGCT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 9 11 228889 CASAVA_Build 15 27776890 1I AGCCAAGGTA -/C AAACACGCTA 3070 hom 98 het 35 0 32 3 C 0 1 228890 CASAVA_Build 15 27797028 1I TAAGCTACTT -/A GCCCCTCTCA 3070 hom 120 het 45 0 39 6 A 0 1 228891 CASAVA_Build 15 27807682 1I CATACTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 T 11 12 228892 CASAVA_Build 15 27813985 1I ATATCACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 25 0 15 10 T 13 14 228893 CASAVA_Build 15 27820127 1D GACCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1459 het 1459 ref 31 22 4 6 A 11 10 228894 CASAVA_Build 15 27821747 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1246 het 1246 ref 26 17 3 6 A 11 12 228895 CASAVA_Build 15 27826950 1I AGTAAATTAT -/C CCTGCATTGT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 2 3 228896 CASAVA_Build 15 27850175 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 7 6 A 12 10 228897 CASAVA_Build 15 27854822 1D TTTAATACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 41 2 29 10 A 15 14 228898 CASAVA_Build 15 27857213 1D AAATGTACTA T/- TCTTTTGACA 3070 hom 144 het 54 0 49 7 T 2 1 228899 CASAVA_Build 15 27862347 1D AAAAAAACAA C/- CCCCATTAGA 3070 hom 37 het 22 0 15 7 C 5 4 228900 CASAVA_Build 15 27869462 1I CCAGACAAAC -/T TGAGTAAGAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 1 2 228901 CASAVA_Build 15 27869947 1I GATCCACATC -/A ATACATTTTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 2 228902 CASAVA_Build 15 27875901 1D ATATTGAAAT G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 G 1 0 228903 CASAVA_Build 15 27876460 1D CATCTGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 456 hom 19 1 16 2 A 12 11 228904 CASAVA_Build 15 27898865 2D ATCGTATCTC TG/-- TGTTTCAATT 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 TG 2 1 228905 CASAVA_Build 15 27905652 3D TTTTTTTAAA AAG/--- AAGACATAAA 3070 het 3070 hom 33 12 19 3 AAG 2 1 228906 CASAVA_Build 15 27908231 1D GAATTGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 23 1 13 9 T 16 15 228907 CASAVA_Build 15 27909133 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 340 hom 31 2 24 6 A 15 14 228908 CASAVA_Build 15 27909852 7D TATAATGTAT TGTCTAA/------- TATATGATGT 2124 het 2124 ref 16 10 5 3 TGTCTAA 1 0 228909 CASAVA_Build 15 27918108 4D TCTGTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 1457 het 765 hom 38 7 3 31 TG 11 9 228910 CASAVA_Build 15 27921942 1D AGTATGCCAT C/- CCCCACCGCA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 C 5 4 228911 CASAVA_Build 15 27922677 12D TTCTTTTTTC TTTTCTTTTTTT/------------ TTTTCTTTTT 2067 het 2067 ref 17 6 7 4 TTTTCTTTTTTT 2 1 228912 CASAVA_Build 15 27963076 1D GTACGTGTCC T/- TTTTTTTTTC 1310 het 1310 ref 48 36 3 10 T 10 9 228913 CASAVA_Build 15 27970297 1I ATCTACTGTT -/A AAAAAAAAAA 2040 het 2040 ref 35 15 6 14 A 13 14 228914 CASAVA_Build 15 27995284 4D TTTGAATGCA AAGT/---- ATGTAGCTAC 2303 het 2303 ref 18 9 6 5 AAGT 1 0 228915 CASAVA_Build 15 27999397 1D CCTTCCCAGT G/- GGGGAGATGA 3070 hom 71 het 34 0 23 11 G 5 4 228916 CASAVA_Build 15 28017917 3D TCAAAGCATA ATT/--- ATGAAATCGT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 ATT 1 0 228917 CASAVA_Build 15 28023298 1I ACAAAAATTA -/G CTGGGTATGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 0 1 228918 CASAVA_Build 15 28038265 1I TCATTCCCCC -/T TCTTTCCCAG 3070 hom 114 het 46 0 37 9 T 1 2 228919 CASAVA_Build 15 28038409 1D GCAAACTTGC T/- TTTTTAGTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 5 228920 CASAVA_Build 15 28042692 1D ACGTCCCAAC A/- GGAGGACCTC 2536 het 2536 ref 25 18 7 1 A 1 0 228921 CASAVA_Build 15 28046162 1I ATCCGTTGCA -/G GGGTTTTACA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 G 3 4 228922 CASAVA_Build 15 28050387 1D TCCTGGGCTC A/- AGCGATCCTC 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 2 1 228923 CASAVA_Build 15 28057063 1D AAAAAAAAAA G/- GGAAAATTAA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 G 3 2 228924 CASAVA_Build 15 28058957 2D AGAATTAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 2766 het 1898 hom 25 8 10 7 T 16 14 228925 CASAVA_Build 15 28061702 1I AACTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 11 12 228926 CASAVA_Build 15 28063031 1D TAGCTGATAA T/- TTTTTTTTTT 2681 het 985 hom 17 3 8 6 T 17 16 228927 CASAVA_Build 15 28076275 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2493 het 755 hom 22 8 7 7 A 18 16 228928 CASAVA_Build 15 28083765 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 12 11 228929 CASAVA_Build 15 28119138 6D CCTTCTCCTC CTCCTT/------ CTCCTTCTCC 3070 hom 63 het 28 0 17 14 CTCCTT 3 2 228930 CASAVA_Build 15 28121481 1I GGCAGGGCTC -/G GGCATCAGTG 3070 hom 150 het 56 0 50 6 G 2 3 228931 CASAVA_Build 15 28122472 1I AACATTCTTT -/G CATGTAAGAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 0 1 228932 CASAVA_Build 15 28126714 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 9 8 228933 CASAVA_Build 15 28131140 1D CATGGTTTCA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 45 18 22 7 T 8 7 228934 CASAVA_Build 15 28133889 1I ATACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 703 hom 33 3 20 10 A 12 13 228935 CASAVA_Build 15 28142141 1I AATTTCATCC -/A AAAAAAAAAA 2311 het 2311 ref 29 18 8 3 A 13 14 228936 CASAVA_Build 15 28142756 1I GGTGCTGTTC -/T TTTATCCTCA 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 T 3 4 228937 CASAVA_Build 15 28252181 1I GTGGTGTGGG -/T TTAGGGGTGG 1705 het 1705 ref 35 24 7 4 T 2 3 228938 CASAVA_Build 15 28255143 1I AAATAACCCC -/T TAGCATGTTT 2841 het 2841 ref 42 31 6 5 T 1 2 228939 CASAVA_Build 15 28269212 3D ACACAGCTTG TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAT 4 3 228940 CASAVA_Build 15 28311878 4I TCTCTTTTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 2355 het 2355 ref 19 10 6 3 TTTC 4 5 228941 CASAVA_Build 15 28337520 1I AGTTCTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 T 12 13 228942 CASAVA_Build 15 28338554 4I GTCTGTCGAT ----/TTTG TTTGTTTGTT 1961 het 1961 ref 30 8 5 17 TTTG 3 4 228943 CASAVA_Build 15 28348714 1I CTCAGTATAA -/T TTTTTTTTTA 2107 het 2107 ref 11 5 5 1 T 9 10 228944 CASAVA_Build 15 28371690 4D GCTTTTTCAT GGAG/---- GGTATTCAGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 GGAG 1 0 228945 CASAVA_Build 15 28375209 1I GGAAGGAACC -/G GGCGAGAAGT 1907 hom 12 het 5 0 5 0 G 2 3 228946 CASAVA_Build 15 28382542 1I GCTTTTCTGG -/T TTTTTTTTGG 3024 het 2486 hom 16 5 8 3 T 8 9 228947 CASAVA_Build 15 28383384 1D CATGCCTCCT G/- GGGGGGTCTT 3070 hom 53 het 20 0 15 5 G 7 6 228948 CASAVA_Build 15 28397522 1D TTGTTAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 67 37 17 14 A 11 10 228949 CASAVA_Build 15 28398187 9D GCTTGGCATG GTAGGTCCT/--------- GTTTATAATT 1786 het 1786 ref 30 22 5 6 GTAGGTCCT 1 0 228950 CASAVA_Build 15 28439970 4D CCTCACACTT ACAC/---- ACACACACAC 2122 hom 21 het 8 0 8 0 AC 8 6 228951 CASAVA_Build 15 28450690 3I CTAAAACATA ---/AAC AACACACAGC 3070 het 3070 hom 43 13 26 4 AAC 1 2 228952 CASAVA_Build 15 28451029 1D TATGCAGTCA G/- GAGACCTGAT 1751 het 1751 ref 79 70 4 5 G 2 1 228953 CASAVA_Build 15 28452573 2D ACCCAAACTT CA/-- GTTTGCAGTG 3070 hom 54 het 21 0 19 3 CA 1 0 228954 CASAVA_Build 15 28455690 4I TGTGAGTGGC ----/TGTG TGTGAGTGGT 3070 hom 141 het 67 0 44 23 TG 2 4 228955 CASAVA_Build 15 28487461 3I AACGCATATC ---/TTG CTGCTTCTCT 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 TTG 0 1 228956 CASAVA_Build 15 28524440 2D ACTCCGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 2694 het 1625 hom 30 5 10 15 A 16 14 228957 CASAVA_Build 15 28524736 4I CATTTTATTG ----/AATT AATAAAATGA 2380 hom 12 het 6 0 5 1 AATT 0 1 228958 CASAVA_Build 15 28558385 1D TAATAAAAAA G/- TTAATAAAAC 1783 het 1783 ref 32 24 5 3 G 1 0 228959 CASAVA_Build 15 28601299 1I GCTATCTCCT -/C CCCATGCCAT 3070 het 3070 ref 47 29 10 8 C 3 4 228960 CASAVA_Build 15 28603571 1D ACAGATGGCA G/- GGGGGGCCCA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 G 7 6 228961 CASAVA_Build 15 28692703 1I GAGCCTGACT -/C CCCCCTGCAC 1797 hom 18 het 7 0 6 1 C 5 6 228962 CASAVA_Build 15 28715794 4D GTGACATGGA TTAG/---- TTAGTTAGGA 2702 het 2702 ref 38 25 6 13 TTAG 3 2 228963 CASAVA_Build 15 28717605 1D GTGAGCCACT G/- GCACCTGGCC 3070 hom 59 het 22 0 17 5 G 2 1 228964 CASAVA_Build 15 28742480 1D CGGGTGTAAT C/- CCCAGTACTT 3070 hom 32 het 13 0 10 3 C 4 3 228965 CASAVA_Build 15 28759123 5I AAGCAGAACC -----/AAAAA AAAAAAAACT 735 het 735 ref 26 19 3 4 A 8 13 228966 CASAVA_Build 15 28765194 2I TATATGTGTC --/AT ATATATTGAA 1779 het 1779 ref 31 20 4 7 AT 3 4 228967 CASAVA_Build 15 28769764 1D ACTAAAAGGA G/- GGGGGAAGGG 3070 hom 157 het 63 0 50 14 G 6 5 228968 CASAVA_Build 15 28769993 3I TGGGAAGCTA ---/TTG TTGGGTTTCA 3070 het 3070 ref 65 39 17 9 TTG 1 2 228969 CASAVA_Build 15 28770534 4I CTTCACAAGC ----/TTAT TTATTAGCTT 3070 het 3070 ref 50 31 12 7 TTAT 1 2 228970 CASAVA_Build 15 28770653 1D CATGAATTAT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 25 9 6 A 8 7 228971 CASAVA_Build 15 28771225 1I ATTTTTGTAA -/T TTTAGACATT 3070 het 3070 ref 52 34 13 5 T 3 4 228972 CASAVA_Build 15 28781232 1D AATTTGGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 T 10 9 228973 CASAVA_Build 15 28911208 1I CAAGCGAGCT -/G CCTGCCTAGG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 0 1 228974 CASAVA_Build 15 28912127 1D GTGGTCAGTC T/- TGAGATGCTT 3070 hom 51 het 22 0 17 6 T 2 1 228975 CASAVA_Build 15 28918369 1D TGTCACAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 10 9 228976 CASAVA_Build 15 28922018 1I ATTAGTATTT -/C TCCCCTCCTC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 C 0 1 228977 CASAVA_Build 15 28925172 1I ACTGCAGCCT -/C GGGTGACACA 3070 hom 31 het 31 1 29 1 C 0 1 228978 CASAVA_Build 15 28928567 17I TGAATAGTGC -----------------/TGCAATATACATACGTG TGCATGTGTC 1470 hom 7 het 3 0 3 0 TGCAATATACATACGTG 0 1 228979 CASAVA_Build 15 28934361 3I AAAAATGCAT ---/TGA TGATGATGAT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 TGA 5 6 228980 CASAVA_Build 15 28948953 14D CACATCCCCA TTCAACTTACTTAC/-------------- TTGGCCTGTG 3070 hom 47 het 20 0 14 7 TTCAACTTACTTAC 1 0 228981 CASAVA_Build 15 28951516 2D CTCTCTCTCC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 97 het 38 0 30 9 AT 6 5 228982 CASAVA_Build 15 28971241 1D TTTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2025 hom 18 het 12 0 6 6 T 17 16 228983 CASAVA_Build 15 28972403 1D CTATAAAGGA C/- CCAACTCTAC 3070 hom 87 het 31 0 30 2 C 3 2 228984 CASAVA_Build 15 28975351 6I CCGTCTGTAC ------/CAAAAA CAAAAACAAC 3070 hom 50 het 27 0 19 8 CAAAAA 1 2 228985 CASAVA_Build 15 28977175 1I TATTGAAAAA -/C ATCTTATTTG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 0 1 228986 CASAVA_Build 15 28983128 2D GAGGAGTCTC AG/-- AGTGCACAGT 3070 hom 61 het 27 0 15 12 AG 2 1 228987 CASAVA_Build 15 28988187 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGGT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 4 5 228988 CASAVA_Build 15 28993818 1I CTACAAAAAC -/T TTCTCTGGTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 3 228989 CASAVA_Build 15 29015107 1I TATCAGGGAC -/T TTGAGCATCC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 2 3 228990 CASAVA_Build 15 29015620 2D TTTTTATTGC TG/-- TGTCTTCAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 4 TG 2 1 228991 CASAVA_Build 15 29016154 1D GAAAATATTG T/- TAAGTTGAAA 3070 hom 129 het 50 0 44 8 T 2 1 228992 CASAVA_Build 15 29019151 5I CTACAAGAGT -----/TAAAA TAAAATAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TAAAA 1 2 228993 CASAVA_Build 15 29025045 4I CAGGCTCACA ----/CTGT CTGTGTGCGC 3070 hom 97 het 36 0 26 10 CTGT 1 2 228994 CASAVA_Build 15 29029555 5I GTAAATTTTT -----/AACTA AACAAACTGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AACTA 0 1 228995 CASAVA_Build 15 29030166 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 502 hom 22 2 17 3 A 13 14 228996 CASAVA_Build 15 29031009 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 9 228997 CASAVA_Build 15 29035497 1D CCTGCTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 517 hom 29 2 20 7 T 11 10 228998 CASAVA_Build 15 29038626 1D GCTGGAGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 414 hom 23 1 18 5 A 10 9 228999 CASAVA_Build 15 29039777 1D AGAGACACAG C/- CCAGCCAGCC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 3 2 229000 CASAVA_Build 15 29058394 2I AGATGACCAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AT 7 8 229001 CASAVA_Build 15 29094657 1I AATCCCAGCA -/C TTTGGGAGGC 3070 hom 42 het 20 0 15 5 C 0 1 229002 CASAVA_Build 15 29109857 1I CTGTCCTGGT -/G AAATAGTGTA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 G 0 1 229003 CASAVA_Build 15 29122202 1I GGGGCTAGAG -/A AAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 19 13 A 4 5 229004 CASAVA_Build 15 29137681 2D AAAAATACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 12 10 229005 CASAVA_Build 15 29147046 1D CTTTGTGCCT C/- AGTTTCCTGT 3070 het 3070 hom 59 20 32 7 C 1 0 229006 CASAVA_Build 15 29164172 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 18 2 8 8 T 15 14 229007 CASAVA_Build 15 29165530 1I AAAGCAAAGG -/A AAAACTGGGC 2503 het 2503 ref 27 15 8 4 A 4 5 229008 CASAVA_Build 15 29168370 1D TGACATTTGG C/- CCCCCCGAGC 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 C 7 6 229009 CASAVA_Build 15 29183559 2D TGTAAGGTCT GA/-- GAATCATTAT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 GA 2 1 229010 CASAVA_Build 15 29192928 4D GCTCTGACAG TTTT/---- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 12 8 229011 CASAVA_Build 15 29203402 3D ACAGCTTTAT TCA/--- TCATAATTGC 3070 hom 123 het 44 0 40 4 TCA 2 1 229012 CASAVA_Build 15 29212907 1I TACCAAAAGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 8 9 229013 CASAVA_Build 15 29236426 1I CTTACATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 25 2 18 5 T 13 14 229014 CASAVA_Build 15 29242024 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 15 3 9 3 A 15 12 229015 CASAVA_Build 15 29248258 2D GTTTTTTATT TA/-- TTTTTATTTA 3070 het 3070 ref 18 9 9 0 TA 1 0 229016 CASAVA_Build 15 29251044 1I TCACCCAGGC -/T TGGAGTGCAG 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 1 2 229017 CASAVA_Build 15 29266637 1I GATTTTTACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 T 8 9 229018 CASAVA_Build 15 29297819 2I TCTGATAAGC --/AA AAAAAAAAAG 2805 het 2805 ref 33 21 8 4 A 9 11 229019 CASAVA_Build 15 29299124 2D CATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 101 hom 47 3 22 22 TG 9 8 229020 CASAVA_Build 15 29301337 3I TTAACATGCC ---/ATT ATTATTATTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 ATT 3 4 229021 CASAVA_Build 15 29320604 2I TGCACAGCCC --/CT GCCATGGCTC 2864 het 3 hom 14 0 9 5 CT 0 1 229022 CASAVA_Build 15 29322153 2D TTTTTGTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3035 het 362 hom 23 4 11 8 T 18 16 229023 CASAVA_Build 15 29322641 1D AATTTTTGTA C/- TTTTTGGAGA 1483 het 1483 ref 15 10 4 1 C 1 0 229024 CASAVA_Build 15 29332632 2I CTTTTTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 6 T 14 16 229025 CASAVA_Build 15 29362017 1D TATTTGGGAG T/- TTTTTTTTTT 1022 het 1022 ref 35 23 3 9 T 11 10 229026 CASAVA_Build 15 29364478 1I AATATTTTAG -/A AAAAAACATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 229027 CASAVA_Build 15 29386807 1D CCCAGAGTTT C/- CCCTGGCCCT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 C 4 3 229028 CASAVA_Build 15 29431289 1D GGCAGATCTT G/- AGGTCAGGAG 3070 het 2681 hom 18 7 9 3 G 1 0 229029 CASAVA_Build 15 29443598 2D48M1D CTTACGAAAC TGTGTTGAATCCTGGTGGTCTCGTTTCCCCCACGTCATTGTTTTGCAGGAT/--TGTTGAATCCTGGTGGTCTCGTTTCCCCCACGTCATTGTTTTGCAGGA- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 38 25 28 8 N/A 0 0 229030 CASAVA_Build 15 29445469 1I ACGCTGTGTT -/C CCTGATAAGA 3070 hom 36 het 16 0 12 4 C 2 3 229031 CASAVA_Build 15 29455801 4I ACAGGGCTAC ----/CTGA CTATTTTGAC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 CTGA 0 1 229032 CASAVA_Build 15 29473620 1D AAGTTAAAGG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 8 7 229033 CASAVA_Build 15 29477207 3D ATTTTGTAAC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 26 10 11 6 ATT 4 3 229034 CASAVA_Build 15 29482370 1I AAAAAAAAAC -/A AACTTTTAAG 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 2 3 229035 CASAVA_Build 15 29492190 3I AGCTCGTGAT ---/TTC TTCTTAAAAA 3070 hom 132 het 52 0 48 4 TTC 1 2 229036 CASAVA_Build 15 29498192 2I AATCAGTAAG --/CA AAAATTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CA 0 1 229037 CASAVA_Build 15 29498777 4I AAAAATGGCC ----/CAAT CAAAGGAACA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CAAT 0 1 229038 CASAVA_Build 15 29499548 1I GTGCTGGAAG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 7 8 229039 CASAVA_Build 15 29500668 1D TTTGGTTATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 9 8 229040 CASAVA_Build 15 29501631 4I AACAAACAAA ----/AAAC AAAAAAAAAA 2503 hom 18 het 9 0 7 2 AAAC 0 1 229041 CASAVA_Build 15 29502018 1I ACCTCCACCT -/G ACCCTGCCCT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 G 0 1 229042 CASAVA_Build 15 29511648 1I ACTTACAAAA -/C CTTTCAGGTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 1 2 229043 CASAVA_Build 15 29511962 1D TTTTTTTTTT A/- AAATAAGGTC 1375 het 1375 ref 16 8 4 4 A 4 3 229044 CASAVA_Build 15 29519558 6D CTATAATACG TTGTTA/------ TTAACTATAG 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 TTGTTA 1 0 229045 CASAVA_Build 15 29524788 1I TGCTTTCTGA -/T TTTTTTTTTT 1254 het 1254 ref 37 13 3 21 T 17 18 229046 CASAVA_Build 15 29526447 1I CTTTGCCCCT -/G GCTTCTTCCA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 G 1 2 229047 CASAVA_Build 15 29535494 1D TGTTAGTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 106 het 41 0 34 7 T 9 8 229048 CASAVA_Build 15 29536226 1I TCTGGAACAG -/T TTGTCCCCAT 3070 hom 120 het 46 0 38 8 T 2 3 229049 CASAVA_Build 15 29542081 3I GAGATGGGGT ---/TTC TCCTCCATGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TTC 0 1 229050 CASAVA_Build 15 29546806 4D CATATTGTAG ACTC/---- ACAGCAGTGC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 ACTC 1 0 229051 CASAVA_Build 15 29547276 11D CGGCAACCAG CAGAGCCCCCA/----------- CAGAGCCCCC 3070 hom 75 het 26 0 24 4 CAGAGCCCCCA 2 1 229052 CASAVA_Build 15 29550342 3D GATACACAAA AAC/--- AACAGATTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AAC 2 1 229053 CASAVA_Build 15 29551380 1I GCTGGACCCC -/A TTCATAAAGG 3070 hom 120 het 46 0 38 8 A 0 1 229054 CASAVA_Build 15 29552357 1D TTCAGTTCCA G/- GGGGGCCTGC 3070 hom 163 het 56 0 54 2 G 6 5 229055 CASAVA_Build 15 29552437 8D CATGTACGTT CATACATG/-------- CATACATGCA 3070 hom 129 het 45 0 44 5 CATACATG 2 1 229056 CASAVA_Build 15 29554240 1I ATTAAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 27 1 20 6 T 10 11 229057 CASAVA_Build 15 29554519 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 A 16 14 229058 CASAVA_Build 15 29557844 2I ACAAATTATG --/TA TATATATATA 3070 het 921 hom 36 2 28 6 TA 5 6 229059 CASAVA_Build 15 29561042 1D CAGGAAAAGT A/- AAACTTTCAA 3070 hom 92 het 32 0 30 2 A 4 3 229060 CASAVA_Build 15 29562419 1D AGGGTAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 22 1 17 4 A 12 11 229061 CASAVA_Build 15 29566103 1D GGGCAGCCCC G/- GACCCTCTGG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 2 1 229062 CASAVA_Build 15 29572654 4D GAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAAGAATC 3070 hom 42 het 16 0 15 2 AAAG 1 0 229063 CASAVA_Build 15 29573342 3I GTATGGTGTA ---/GTT GTTACAGCAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 GTT 1 2 229064 CASAVA_Build 15 29576750 1D TATATGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 18 5 T 13 12 229065 CASAVA_Build 15 29584187 15I AGAATTAGCT ---------------/GAGGGAGTCTGTGAC GACGGCAGCA 3070 hom 93 het 33 0 30 3 GAGGGAGTCTGTGAC 0 1 229066 CASAVA_Build 15 29584393 1I TCAATTTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 11 12 229067 CASAVA_Build 15 29587132 5D TGCTGGCTGG GGGGC/----- GGGGGTGGCA 3070 hom 107 het 38 0 34 6 GGGGC 1 0 229068 CASAVA_Build 15 29587612 1I AAGGGAGCTA -/G TAACAGAATA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 G 0 1 229069 CASAVA_Build 15 29587906 1D TGCAGTGGCG C/- CGATCTCCGC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 2 1 229070 CASAVA_Build 15 29612029 1I AATTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 1887 het 1887 ref 25 11 6 8 A 11 12 229071 CASAVA_Build 15 29627563 2D CTGTACGTAC CA/-- TATACTCCTA 3070 het 3070 ref 49 31 13 5 CA 1 0 229072 CASAVA_Build 15 29627688 29D TGGGCCTCCC GGGCCACCCCCATCATCTGTGGGCGCCCT/----------------------------- GGGCCACCCC 3070 het 3070 ref 29 15 14 3 GGGCCACCCCCATCATCTGTGGGCGCCCT 1 0 229073 CASAVA_Build 15 29636442 2I TGAATTGTTT --/TA TGTTTGTTGA 3070 hom 126 het 46 0 41 5 TA 0 1 229074 CASAVA_Build 15 29643419 1I GCTCCAGCAC -/A AGTGAAGATG 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 1 2 229075 CASAVA_Build 15 29643606 1D ACTTGGGATT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 31 10 17 5 A 8 7 229076 CASAVA_Build 15 29671876 1I ATCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 1662 het 1662 ref 19 9 4 6 A 10 11 229077 CASAVA_Build 15 29693249 6I CTTAAAGAAC ------/TAGAAG TAGAACTACC 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 TAGAAG 0 1 229078 CASAVA_Build 15 29716136 16D AAGATGGGCC AAAAGCTAGGCCTCTT/---------------- ACACTAAACA 3070 het 3070 ref 24 18 8 4 AAAAGCTAGGCCTCTT 1 0 229079 CASAVA_Build 15 29731496 1D ATAGAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2220 hom 37 7 15 15 A 17 16 229080 CASAVA_Build 15 29761948 1I GAAAAAAGTT -/A AGAGGACTCG 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 A 1 2 229081 CASAVA_Build 15 29766603 1D ATTTAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 25 0 16 9 A 13 12 229082 CASAVA_Build 15 29783894 1I TTTGAGGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 171 hom 16 1 12 3 T 11 12 229083 CASAVA_Build 15 29784264 5D CAAGATGCAC TCTTT/----- TCTTCTGGAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TCTTT 1 0 229084 CASAVA_Build 15 29790566 1I CCTGACTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 219 hom 33 1 27 5 A 10 11 229085 CASAVA_Build 15 29794513 1D CACCTGTAGT C/- CCTGCTACCT 3070 hom 35 het 15 0 11 4 C 3 2 229086 CASAVA_Build 15 29794686 3D GCTTGAAACC CAA/--- CAATAGCTTC 1756 het 1756 ref 25 21 4 0 CAA 2 1 229087 CASAVA_Build 15 29798401 1D AGTGATTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 19 0 12 7 A 13 12 229088 CASAVA_Build 15 29805843 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 330 hom 32 1 21 11 CA 10 9 229089 CASAVA_Build 15 29806915 1I TCCACCCTCC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 82 het 36 0 25 11 T 7 8 229090 CASAVA_Build 15 29814554 3I ACAAGAAAAA ---/AAC AACCCCACTA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AAC 1 2 229091 CASAVA_Build 15 29815029 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2301 het 236 hom 16 1 12 3 A 15 16 229092 CASAVA_Build 15 29818546 1D TGAAAGCACA C/- ATTTCTGGGG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 1 0 229093 CASAVA_Build 15 29854473 3I AAAGATAGTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 30 9 A 11 14 229094 CASAVA_Build 15 29857027 2I AAAATGGAGG --/GA GGTCCTCCTT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 GA 0 1 229095 CASAVA_Build 15 29863933 2D TTACTAAAAC AT/-- AAAACAATGC 3070 het 3070 ref 40 24 14 3 AT 1 0 229096 CASAVA_Build 15 29891741 1I TGTTCAGGGA -/G GCCCAACCAG 3070 hom 92 het 37 0 28 9 G 1 2 229097 CASAVA_Build 15 29894766 1I TTTTAGCAGA -/G GAAAGCAACA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 G 1 2 229098 CASAVA_Build 15 29896041 1D AAAAAAAAAA T/- AGCCTGGCAC 2616 hom 30 het 11 0 11 0 T 1 0 229099 CASAVA_Build 15 29907350 1I TGAACTTGGA -/G GGGGCGGGGG 3070 hom 45 het 21 0 16 5 G 4 5 229100 CASAVA_Build 15 29915457 1D ATCCAAAATA C/- CCCCAATGAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 5 4 229101 CASAVA_Build 15 29919449 1I TTAAAAAAAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 411 hom 36 1 30 5 T 8 9 229102 CASAVA_Build 15 29922118 2D GCTATTTAAC AA/-- TATCACAAAC 3070 hom 126 het 46 0 43 4 A 2 0 229103 CASAVA_Build 15 29964689 1D GTAAATTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 22 5 T 12 11 229104 CASAVA_Build 15 29966015 1I TCTACTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 743 hom 29 2 25 2 T 11 12 229105 CASAVA_Build 15 29990968 1I TTGAGATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 810 hom 28 3 20 5 A 14 15 229106 CASAVA_Build 15 29999971 1I TATTTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 T 10 11 229107 CASAVA_Build 15 30003953 1I GTAAAATTTC -/T GTCAGTTCTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 1 229108 CASAVA_Build 15 30019613 4I TTTGATGGGG ----/TTGT TTGTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TTGT 1 2 229109 CASAVA_Build 15 30020817 1D AATAAAAAAA T/- AAAACATTTG 3070 het 3047 hom 17 8 8 1 T 1 0 229110 CASAVA_Build 15 30022684 1I AGAATATTTT -/A GTATATTTAA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 0 1 229111 CASAVA_Build 15 30025250 9D CAGGGGCCTG GAGGAAGAA/--------- GAGATGCTTA 3070 het 3070 ref 29 19 9 5 GAGGAAGAA 1 0 229112 CASAVA_Build 15 30027111 1I TGCATTGTAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 9 17 10 A 8 9 229113 CASAVA_Build 15 30027259 1D AATTTAAATG A/- AAGTTATATT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 3 2 229114 CASAVA_Build 15 30030396 1D AATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 12 11 229115 CASAVA_Build 15 30059560 1D GCCTTTGGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 2955 hom 32 8 19 6 T 9 8 229116 CASAVA_Build 15 30065713 1I ATGGAGGTTT -/G GGGGAGAAGC 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 G 4 5 229117 CASAVA_Build 15 30074174 1D AGTGTGCCTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 39 19 19 2 T 8 7 229118 CASAVA_Build 15 30080194 2I AATCATAAAA --/AT ATATGAGGTA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 AT 2 3 229119 CASAVA_Build 15 30081399 9D AATGGGAGAC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 1267 hom 23 8 13 5 A 20 11 229120 CASAVA_Build 15 30087688 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 12 5 A 15 14 229121 CASAVA_Build 15 30090817 1D ACACCAAGTT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 8 7 229122 CASAVA_Build 15 30101050 1D GAGACTCACT A/- AAAAGTAAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 4 229123 CASAVA_Build 15 30116270 1D TTTCAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2125 hom 45 6 25 16 T 15 14 229124 CASAVA_Build 15 30119237 1I ATAAAATAGT -/A CTATAGATGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 229125 CASAVA_Build 15 30121620 2D GTAAATTAAT AA/-- GTTACTAATG 3070 hom 114 het 42 0 38 5 A 2 0 229126 CASAVA_Build 15 30122746 1I AAACCATTTT -/A AAAAATGTGT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 5 6 229127 CASAVA_Build 15 30123260 1I TATATTTACC -/T TTTTTTGTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 7 229128 CASAVA_Build 15 30138500 1D CTTCTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 11 10 229129 CASAVA_Build 15 30145780 1D CATTATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 35 1 18 16 T 15 14 229130 CASAVA_Build 15 30151323 1D AATAAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 22 1 15 6 T 13 12 229131 CASAVA_Build 15 30159278 1D ACAAAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 22 1 15 6 A 11 10 229132 CASAVA_Build 15 30161835 1I21M2I GATTATTAGA -TTTTTTTTGTAGTCCCATAAG--/TTTTTTTTTGTAGTCCCATAAGTC TCTGACTTTT 3070 hom 99 het 34 0 34 4 N/A 0 0 229133 CASAVA_Build 15 30162945 2D TTCATGATAT TC/-- TGTTACAGCA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 TC 1 0 229134 CASAVA_Build 15 30169065 4I TTTCTGAGAG ----/TTTC TTTCTGCTGA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TTTC 1 2 229135 CASAVA_Build 15 30170154 1D ATTTCATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 11 10 229136 CASAVA_Build 15 30171462 1I CTCCTGTTTT -/G CTAGGACCAG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 0 1 229137 CASAVA_Build 15 30177704 4I TCCTCTGTGC ----/AGAA AGAAGCCTGT 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 AGAA 1 2 229138 CASAVA_Build 15 30182068 3D TTGTTATTGG TAT/--- TATAATTCAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 5 TAT 2 1 229139 CASAVA_Build 15 30183012 3D AGAACCTAAC ATT/--- AGTCAGGTGA 3070 het 3070 hom 40 18 17 6 ATT 1 0 229140 CASAVA_Build 15 30183366 2I TCTCGCACAC --/CT CACCTCTGAT 3070 hom 132 het 53 0 43 10 CT 0 1 229141 CASAVA_Build 15 30193359 3I AACAATAACG ---/ACA ACAACAACAA 3070 het 2505 hom 25 8 10 7 ACA 4 5 229142 CASAVA_Build 15 30202875 7D CCAGACCACT AGAGATA/------- AAATAAGGGA 3070 het 3070 ref 53 29 20 8 AGAGATA 1 0 229143 CASAVA_Build 15 30204182 1D AGAAATGTTA G/- GGACTGAATG 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 G 3 2 229144 CASAVA_Build 15 30205034 1I CTGCAGTCTT -/C CTGGGGTCAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 C 1 2 229145 CASAVA_Build 15 30205504 1D AGCTGATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 20 24 10 A 12 11 229146 CASAVA_Build 15 30213452 1D CATGCTCTGC A/- GATGGTGATT 3070 het 3070 ref 62 44 13 7 A 1 0 229147 CASAVA_Build 15 30216829 1D GTTTACAACA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 25 het 31 0 18 15 C 10 9 229148 CASAVA_Build 15 30219075 1I GGTGTCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 20 18 12 T 13 14 229149 CASAVA_Build 15 30238711 1D AATCAGGTCT C/- CTGACTGCAT 2367 het 2367 ref 16 8 5 3 C 2 1 229150 CASAVA_Build 15 30248526 1D TTTCTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2197 hom 40 11 15 14 A 16 15 229151 CASAVA_Build 15 30259239 1D CCATATTAAA C/- CCCCGCCAGC 3070 het 3070 ref 56 28 19 10 C 5 4 229152 CASAVA_Build 15 30273209 1D CCCACCTGGG A/- AAGGTGGCTC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 3 2 229153 CASAVA_Build 15 30275409 4D GCAGGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 886 hom 14 4 10 0 TTTG 5 4 229154 CASAVA_Build 15 30291366 9D CAAATTATAA ACAGGACCT/--------- ACCATGCCAA 3070 het 3070 ref 37 27 11 1 ACAGGACCT 1 0 229155 CASAVA_Build 15 30296028 1D TTGCCAGTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 65 33 28 4 A 9 8 229156 CASAVA_Build 15 30308723 1I GGCTTCCAAA -/G GAAAAAAAAA 1303 hom 7 het 3 0 3 0 G 1 2 229157 CASAVA_Build 15 30319160 4I TTTTACAGTT ----/AAAC AATAAGAAAG 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 AAAC 0 1 229158 CASAVA_Build 15 30342169 2D AAAATTATTA TT/-- TTTTTTTTTG 2475 het 1334 hom 18 4 6 9 T 11 9 229159 CASAVA_Build 15 30344623 1I CTCTCCCTTG -/A AAAACATTAC 1440 het 1440 ref 13 8 3 2 A 4 5 229160 CASAVA_Build 15 30348919 1I TACACCTGGT -/A AAAAAAAAAT 2380 het 2380 ref 15 8 5 2 A 9 10 229161 CASAVA_Build 15 30383854 1D ATTAAAAGTC A/- AAAAATAACA 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 A 6 5 229162 CASAVA_Build 15 30401349 1D TGGATTACTC T/- GCAGTCACAT 1424 het 1424 ref 17 10 3 4 T 1 0 229163 CASAVA_Build 15 30438889 1I AGGGTCTAAT -/A AGGAGCCACC 1957 het 1957 ref 31 20 6 5 A 1 2 229164 CASAVA_Build 15 30481143 1D TCATGGCTAG A/- AAAAAAAAAA 1862 het 1862 ref 27 19 5 3 A 12 11 229165 CASAVA_Build 15 30494759 1I AGCCTGCCTA -/T CTGATCTTCA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 T 0 1 229166 CASAVA_Build 15 30579367 1D CGTGTCCTTT G/- TTTCGCACCT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 1 0 229167 CASAVA_Build 15 30592281 3D GCAGAGCTTA CTG/--- CTTTCATTTT 1927 het 1927 ref 20 13 4 3 CTG 1 0 229168 CASAVA_Build 15 30594282 4I CATCTCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 AAAC 2 3 229169 CASAVA_Build 15 30594849 5D CTATGCTCTG TGCTC/----- TGTTGGCTCC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TGCTC 1 0 229170 CASAVA_Build 15 30596905 5D GAAAAATACT TTTTA/----- TTTTGTCATT 3070 het 3070 hom 24 11 11 4 TTTTA 1 0 229171 CASAVA_Build 15 30598394 1I CAAGGACCTG -/A AAAAAAAAAA 2238 het 1877 hom 16 6 6 4 A 12 13 229172 CASAVA_Build 15 30600245 2I ACTACCAAGA --/GT GTGTATTAAT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 GT 2 3 229173 CASAVA_Build 15 30611656 1D TCATCTGGCA G/- GGGGCATGAG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 G 5 4 229174 CASAVA_Build 15 30634377 1D TTACTAAGGA T/- TTTTTTTTTT 2656 het 1527 hom 12 4 6 2 T 13 12 229175 CASAVA_Build 15 30648887 1I TTTTTTTTTT -/C CCAGGTTTTT 2533 het 1239 hom 26 12 7 7 C 2 3 229176 CASAVA_Build 15 30649238 1I ACAAAACTTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 A 8 9 229177 CASAVA_Build 15 30655701 1I AAATAGTTCC -/T TAGAAAAGTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 1 2 229178 CASAVA_Build 15 30687826 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 8 7 229179 CASAVA_Build 15 30697775 1I AGACTTAAGG -/A AAAAAAACAC 1476 het 1476 ref 16 9 4 3 A 7 8 229180 CASAVA_Build 15 30699242 2I TTAAAGCAAC --/CT CTATAGTATT 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 CT 1 2 229181 CASAVA_Build 15 30700623 7I GTTTGTGAAA -------/ATGTATT ATGTATCACT 2414 het 2414 ref 14 8 5 1 ATGTATT 0 1 229182 CASAVA_Build 15 30701238 3I GAATGGCATG ---/AAC CCAGGAGGCG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 AAC 0 1 229183 CASAVA_Build 15 30720902 2D AACAAAAAAC AT/-- ATTCTAGAAG 3070 het 3070 hom 46 20 25 1 AT 2 1 229184 CASAVA_Build 15 30736673 4D TGGTCCTTAA TTCT/---- TTCTTTCATC 1664 hom 12 het 5 0 5 0 TTCT 2 1 229185 CASAVA_Build 15 30742332 2D CGATTTGATG TC/-- TCTGGTGCAG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 TC 2 1 229186 CASAVA_Build 15 30746605 5I ATTAAAAATT -----/ATTAA ATTTAATTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATTAA 0 1 229187 CASAVA_Build 15 30746849 1I AAGTTTGGTG -/T TTTTTATGAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 5 6 229188 CASAVA_Build 15 30752119 2D TTCTACTAAC TG/-- TGGCTGTGGA 3070 het 2933 hom 28 7 16 5 TG 2 1 229189 CASAVA_Build 15 30757131 1I CATGCACACC -/A AGGCACCTTT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 A 1 2 229190 CASAVA_Build 15 30758687 1D TCCCATGCTC T/- TTTTTTTTTT 2264 het 2264 ref 30 10 11 9 T 11 10 229191 CASAVA_Build 15 30770300 1D GTTGTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 1330 het 1330 ref 38 31 4 3 T 12 11 229192 CASAVA_Build 15 30774505 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 29 2 15 12 T 15 14 229193 CASAVA_Build 15 30781048 11I AGACCAGATG -----------/GCCTGCTCCCA CGTGGGACGG 3070 het 3070 hom 46 20 23 4 GCCTGCTCCCA 0 1 229194 CASAVA_Build 15 30788725 1I ATCATTACGA -/T TTTTTTTTTT 2901 het 2901 ref 32 15 9 8 T 11 12 229195 CASAVA_Build 15 30790953 4D ATGTATGTAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 43 20 12 12 AC 9 7 229196 CASAVA_Build 15 30795701 1I CTTCTTTGTA -/T TTTGATTTGG 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 3 4 229197 CASAVA_Build 15 30799033 1D GGGTTAAAAT C/- CCCCTCTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 C 5 4 229198 CASAVA_Build 15 30803120 1D ACTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 36 1 25 11 A 15 14 229199 CASAVA_Build 15 30808684 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2393 hom 15 het 7 0 6 3 T 7 8 229200 CASAVA_Build 15 30808875 4D AATCTTTTTA GTCT/---- GTCTGAGGCT 3070 hom 66 het 23 0 22 3 GTCT 2 1 229201 CASAVA_Build 15 30809348 2I TGGTACAAAG --/AA TGATACATTG 3070 hom 168 het 59 0 56 3 A 0 2 229202 CASAVA_Build 15 30817829 1D ATCTGAAAAT A/- AAATTAAGAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 4 3 229203 CASAVA_Build 15 30823258 1D GGGGGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 10 13 T 11 10 229204 CASAVA_Build 15 30828002 1I GGGGGCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 10 11 229205 CASAVA_Build 15 30834725 2D AAAACCTCTC TT/-- ATGTGCTTAT 3070 hom 108 het 37 0 37 1 T 2 0 229206 CASAVA_Build 15 30843344 4I ATAACTAATA ----/TAGT TATTTTCTCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TAGT 0 1 229207 CASAVA_Build 15 30844569 6I GCTTAAAGTG ------/TTTTGA TTTTATGTTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TTTTGA 0 1 229208 CASAVA_Build 15 30845130 4I AAAATATAAT ----/TCTA TCTCTTAAAA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 TCTA 0 1 229209 CASAVA_Build 15 30846024 1D AGAATAAGAA C/- CCCCCCCCCA 2844 hom 29 het 14 0 10 4 C 10 9 229210 CASAVA_Build 15 30848505 3I GTTATCACCA ---/GAG TAGTTAGGAG 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 GAG 0 1 229211 CASAVA_Build 15 30849156 3I GAAATATATC ---/CAA CAAGTTATTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 CAA 1 2 229212 CASAVA_Build 15 30849903 2D TGCAAACATC AT/-- AGAGAAAATG 3070 het 3070 ref 53 29 17 9 AT 1 0 229213 CASAVA_Build 15 30850328 4D TTTCAGAAAA TCTT/---- TATAATTCCT 3070 het 3070 hom 28 10 15 5 TCTT 1 0 229214 CASAVA_Build 15 30850582 1I GGCCTGATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2839 hom 30 8 19 3 T 10 11 229215 CASAVA_Build 15 30858773 1D ATGTGTATGG A/- ATTGTACACT 3070 het 3070 ref 49 28 20 1 A 2 1 229216 CASAVA_Build 15 30862497 1D TGGGGAGAGT G/- GGGAAGACAG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 G 4 3 229217 CASAVA_Build 15 30867551 1I ATCACTTGTA -/G TACCCAAACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 0 1 229218 CASAVA_Build 15 30869539 2I TAAGTGACAC --/AT GATTCTACGT 3070 hom 157 het 61 0 53 8 AT 0 1 229219 CASAVA_Build 15 30870861 2D GCAATAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 2324 het 562 hom 34 2 5 27 T 12 10 229220 CASAVA_Build 15 30873665 1D GCTGGGTAAT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 72 het 31 0 23 9 A 8 7 229221 CASAVA_Build 15 30880809 1D GAGAAACACT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 8 7 229222 CASAVA_Build 15 30888395 1I AACTTTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 8 10 T 13 14 229223 CASAVA_Build 15 30892487 1D ACATTTGGGG A/- AAAAATGGAT 3070 hom 111 het 48 0 38 11 A 6 5 229224 CASAVA_Build 15 30898714 1D CAACCCCCTT C/- CCCCCAACCA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 C 6 5 229225 CASAVA_Build 15 30902646 15D GTTTCTACTG TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 1027 het 1027 ref 14 5 3 6 T 27 12 229226 CASAVA_Build 15 30917972 1I AGGCGCAGTG -/A AATGCTCAAG 3070 hom 95 het 38 0 28 10 A 2 3 229227 CASAVA_Build 15 30922629 1D TCAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 548 hom 27 2 17 9 A 13 12 229228 CASAVA_Build 15 30923641 3D GCAAATTCTC ATT/--- ATTCTCCCAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 ATT 2 1 229229 CASAVA_Build 15 30925454 1D TACAGACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 11 10 229230 CASAVA_Build 15 30927852 1I TGCACACGTG -/T TGTGTGTATT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 1 2 229231 CASAVA_Build 15 30928644 1I GCTCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1984 het 292 hom 10 2 7 1 T 14 15 229232 CASAVA_Build 15 30929086 1D AATTTCTGGG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 8 7 229233 CASAVA_Build 15 30939640 2D AGAAAGAAAA AG/-- AGGAAGGAAG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 AG 2 1 229234 CASAVA_Build 15 30939677 4D AAGAAAAGGG AGGA/---- AGGAAGGAAG 1575 het 1575 ref 40 17 6 18 AGGA 5 4 229235 CASAVA_Build 15 30965299 1D GTTAATACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 14 14 T 15 14 229236 CASAVA_Build 15 30969218 2D TGTTTCTCCC CT/-- GTTCTCCAAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 CT 1 0 229237 CASAVA_Build 15 30974343 4I CAGGTTATTC ----/TGTG TGTGTATTTA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 TG 2 4 229238 CASAVA_Build 15 30975256 2I GTTAATTCTC --/AA GAGTTCATTG 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 0 2 229239 CASAVA_Build 15 30978640 4D ATAATGGCTA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 AAAC 2 1 229240 CASAVA_Build 15 30987242 29D CAGGCAAAAG AGGCCCTCTGAACCTGTGTCAGAGGACAC/----------------------------- AGGTCCTCTG 3070 het 3070 ref 38 30 11 12 AGGCCCTCTGAACCTGTGTCAGAGGACAC 1 0 229241 CASAVA_Build 15 30988097 2D AAACAAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 1716 het 671 hom 32 5 13 14 A 20 18 229242 CASAVA_Build 15 30990845 2I AACCCTACCT --/CC CCCTTCCCTG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 C 3 5 229243 CASAVA_Build 15 30999984 6D ACATCAAACA CTATCT/------ TGGGTAGAAA 3070 het 3070 hom 51 23 24 7 CTATCT 1 0 229244 CASAVA_Build 15 31003451 5I AGACCACTGT -----/CAAGA CAAGACCGTT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 CAAGA 1 2 229245 CASAVA_Build 15 31005882 3I CTGCATGCAC ---/TCT TCTTTAAATA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 TCT 1 2 229246 CASAVA_Build 15 31009259 1I CAAGATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 T 13 14 229247 CASAVA_Build 15 31013205 3D AAATAGTGTC CTT/--- CTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 5 CTT 2 1 229248 CASAVA_Build 15 31020520 1I CAAAAGCCCC -/T GGCCCACAGG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 0 1 229249 CASAVA_Build 15 31028561 2D AGCTACATCC TA/-- TGAGTCTTAT 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 TA 1 0 229250 CASAVA_Build 15 31034094 1D CACCAAAGCT G/- GGCACTTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 G 3 2 229251 CASAVA_Build 15 31034263 1I CTTTGGGAGG -/T TCAAGGTGGG 3070 het 1608 hom 25 5 13 7 T 1 2 229252 CASAVA_Build 15 31035304 2D GTGCGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 GT 8 7 229253 CASAVA_Build 15 31035854 1D CTAACCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 12 11 229254 CASAVA_Build 15 31043008 1I AGAAGAAGAA -/G AAAAAAAAGA 3070 het 1638 hom 20 4 11 5 G 0 1 229255 CASAVA_Build 15 31050285 1I GTCTGGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 37 2 29 6 A 12 13 229256 CASAVA_Build 15 31054294 1I ACTTTCACTT -/A AGGTCATTTC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 1 2 229257 CASAVA_Build 15 31059246 1I ACCCAGGACC -/A TACCATCAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 0 1 229258 CASAVA_Build 15 31065236 1I ACAGACATGG -/T AAGTTTGTTT 3070 hom 154 het 60 0 52 8 T 0 1 229259 CASAVA_Build 15 31068277 5I TATTGAGAAA -----/GAAAG GTTGAGAACC 3070 hom 163 het 58 0 54 4 GAAAG 0 1 229260 CASAVA_Build 15 31068637 3I CACTATAGGG ---/GAA GAAGAAAGGA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 GAA 2 3 229261 CASAVA_Build 15 31073720 10D CTCTCTCTCT CTCTCTCACA/---------- CACACACACA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 CTCTCTCACA 1 0 229262 CASAVA_Build 15 31074259 1I TAAAGCATTA -/T TTTTAAGGTG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 4 5 229263 CASAVA_Build 15 31090502 3I CCTTCAAAAT ---/TTC TTGAGTTTTG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TTC 0 1 229264 CASAVA_Build 15 31092981 1D GATGAACCAA G/- TTGGGTTGTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 1 0 229265 CASAVA_Build 15 31096920 2I GAGGGAACTC --/TG TACTTTCCGC 3070 het 3070 hom 61 27 25 9 TG 0 1 229266 CASAVA_Build 15 31097305 1D CGCCCGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 2351 hom 21 6 10 5 C 3 2 229267 CASAVA_Build 15 31100742 1I GTTGACCTTT -/A ACACCTATGC 3070 het 3070 ref 49 21 18 10 A 1 2 229268 CASAVA_Build 15 31100853 5D GTTTTCAGTC AAGTT/----- AACAATTTAG 3070 het 3070 ref 40 20 18 5 AAGTT 1 0 229269 CASAVA_Build 15 31108008 6D CTACAGAGGA AAAAAT/------ AAAAATAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 2 AAAAAT 4 3 229270 CASAVA_Build 15 31108757 1I ACACACAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 11 9 A 10 11 229271 CASAVA_Build 15 31111468 4D GTTGTCTAAA AATC/---- AATAAATGTA 3070 hom 129 het 47 0 44 5 AATC 1 0 229272 CASAVA_Build 15 31113161 1D GCTACCTCAT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 990 hom 33 6 13 15 G 2 1 229273 CASAVA_Build 15 31114169 1D CAGAATCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 94 het 35 0 32 5 T 10 9 229274 CASAVA_Build 15 31118844 2D TTAGAAAGTA TG/-- TGTGGCTCAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 TG 3 2 229275 CASAVA_Build 15 31121529 1D ATGTCTACCT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 8 7 229276 CASAVA_Build 15 31126242 2I AGACTTCTGG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TC 5 6 229277 CASAVA_Build 15 31126341 2I GAGGCTAGTC --/TT AAGCTGTAGC 3070 hom 103 het 41 0 31 10 T 0 2 229278 CASAVA_Build 15 31130995 3I AGTGCCGCTC ---/TAA TAATAATTGG 3070 hom 108 het 42 0 32 10 TAA 2 3 229279 CASAVA_Build 15 31132491 1D GTGGGATCAT C/- CCCCACTCCC 3070 hom 36 het 30 0 22 8 C 5 4 229280 CASAVA_Build 15 31139659 4I AGGGGTCTAT ----/GAAA GAAAGATAGT 3070 hom 175 het 66 0 58 8 GAAA 1 2 229281 CASAVA_Build 15 31148124 4I CCCTTGAAGC ----/TTTT TTTTTTTAAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 11 229282 CASAVA_Build 15 31154514 17D ATTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1408 hom 17 7 8 5 A 27 10 229283 CASAVA_Build 15 31158877 1D CACGCAGGAA G/- GCTGAGGGAG 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 G 2 1 229284 CASAVA_Build 15 31165811 1I70M1I TTTTATGTTT -AAAAAAAATCTCTCATTGAAAAACAAACCATACTTAGTGAAAAAATACAAAAAAAAATTTATCAAATTGT-/AAAAAAAAATCTCTCATTGAAAAACAAACCATACTTAGTGAAAAAATACAAAAAAAAATTTATCAAATTGTA ACAGTCGTCT 3070 hom 50 het 19 0 15 27 N/A 0 0 229285 CASAVA_Build 15 31166089 4D CACAGAAGAA AAAG/---- AAAGTAGCTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAAG 2 1 229286 CASAVA_Build 15 31172758 10I3M2I TGCCCAAGGC ----------ACT--/CATTCATCATACTTG ACATAAAATA 3070 het 3070 hom 45 13 27 8 N/A 0 0 229287 CASAVA_Build 15 31173560 5D TGCCAGTCTC CAGAT/----- GAGAATATTG 3070 het 3070 hom 45 22 21 4 CAGAT 1 0 229288 CASAVA_Build 15 31176810 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAGAG 2316 het 480 hom 22 5 9 8 AG 8 9 229289 CASAVA_Build 15 31185768 2D AACCAGAATC CA/-- CACACACACA 3070 het 35 hom 35 1 24 10 CA 10 9 229290 CASAVA_Build 15 31189334 2I AATGAAAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 34 0 20 14 A 12 14 229291 CASAVA_Build 15 31191788 2I TGCATAAAAC --/AT AAAATATTTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AT 0 1 229292 CASAVA_Build 15 31192742 1I TCAGTGGGCT -/C CCTTGACATG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 C 2 3 229293 CASAVA_Build 15 31192907 3D CAGCCTTTCT TTC/--- TTTACAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 TTC 1 0 229294 CASAVA_Build 15 31194418 1D CCAGCCAGCT A/- ACTGAAAAGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 1 229295 CASAVA_Build 15 31194985 1D CATCCTTAAG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 C 12 11 229296 CASAVA_Build 15 31196248 1D TAGATATGGC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 T 8 7 229297 CASAVA_Build 15 31196433 4D CAATAAATGC TTAT/---- TATTACTATT 3070 het 3070 ref 35 18 16 3 TTAT 1 0 229298 CASAVA_Build 15 31197199 1D TTACTAGAGA T/- TAACTATTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 229299 CASAVA_Build 15 31200115 4I GTTCGGCAGC ----/TTGT TTTTGTTGTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TTGT 0 1 229300 CASAVA_Build 15 31200622 1I CAATACCCCA -/T TCTATGATTT 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 T 1 2 229301 CASAVA_Build 15 31204046 2I AGCCAGGGTT --/GA GAGTCATCGG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 GA 1 2 229302 CASAVA_Build 15 31204342 1D TTTTTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1905 hom 29 7 17 6 T 11 10 229303 CASAVA_Build 15 31204934 3D CAATATGTGT AGA/--- AGATTATTTA 3070 het 3070 hom 43 20 18 7 AGA 2 1 229304 CASAVA_Build 15 31205198 1D CAGGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2632 het 1884 hom 18 6 6 6 A 15 14 229305 CASAVA_Build 15 31206664 3D CTCAAACAGA GAG/--- GAGGTCAGGC 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 GAG 2 1 229306 CASAVA_Build 15 31207133 2D TCCAATCAAA CT/-- CAGCACCATT 3070 het 3070 ref 55 29 18 11 CT 1 0 229307 CASAVA_Build 15 31207423 3I GGAAATAGAA ---/GAG GAAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 45 21 12 12 GAG 0 1 229308 CASAVA_Build 15 31218451 3I CTAATCTCTT ---/ATC CTGGTGAATG 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 ATC 0 1 229309 CASAVA_Build 15 31219856 1I AATTTTAGTG -/A GTACATCAAA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 0 1 229310 CASAVA_Build 15 31237487 7D CCTGTCTTTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 30 1 24 9 A 17 10 229311 CASAVA_Build 15 31241425 1D AACAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 533 hom 20 2 13 6 A 13 12 229312 CASAVA_Build 15 31243591 1D CCTTGACAAG A/- AGGAGGATGG 3070 het 3070 ref 60 32 24 4 A 2 1 229313 CASAVA_Build 15 31265983 1D AATGTTCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 11 10 229314 CASAVA_Build 15 31297800 1I CGGGACCTAC -/A AAAAAATGCT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 6 7 229315 CASAVA_Build 15 31307635 1D TTCAGCATCC A/- AACCTTAGAT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 A 3 2 229316 CASAVA_Build 15 31319221 3I ATAAAATATC ---/ATT ATTATTGAGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 ATT 2 3 229317 CASAVA_Build 15 31331911 1I AAATGGAAAG -/T TTTGCACTCT 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 T 3 4 229318 CASAVA_Build 15 31333235 1D AATTTATAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 10 9 229319 CASAVA_Build 15 31333565 3D AGATCCAGTT GTA/--- GTGATACAGC 3070 het 3070 ref 52 29 18 7 GTA 1 0 229320 CASAVA_Build 15 31344790 1I GGGGAAATTT -/A TTTCCTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 1 229321 CASAVA_Build 15 31346200 3I TTTTAGTCAC ---/GTT GTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 GTT 1 2 229322 CASAVA_Build 15 31349269 1I43M2D ATATTTTTCC -TTTTTTTTTGGTATTCTTTTCAGTATTTTATAGTTTTCTTTATAG/TTTTTTTTTTGGTATTCTTTTCAGTATTTTATAGTTTTCTTTAT-- AGAGATCTTT 3070 het 1661 hom 35 4 15 33 N/A 0 0 229323 CASAVA_Build 15 31354190 2D AGTCTCCCTC TG/-- TGTCCTGAGC 3070 het 3070 ref 50 23 17 10 TG 2 1 229324 CASAVA_Build 15 31357282 1D AGATGATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 34 0 34 1 T 10 9 229325 CASAVA_Build 15 31361161 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 14 0 11 3 T 11 10 229326 CASAVA_Build 15 31370414 1D ATGTATAATT A/- AAAAATATAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 6 5 229327 CASAVA_Build 15 31372356 1I GAGGATACAC -/A AGGCTTTATC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 2 229328 CASAVA_Build 15 31382751 11D CAGCCACCTG GAACTGTAAGT/----------- CCATTAAACC 3070 het 3070 ref 29 14 10 8 GAACTGTAAGT 1 0 229329 CASAVA_Build 15 31391871 1D GGTCTTATTT G/- GGGGGGGTAT 3070 het 3070 hom 34 18 12 5 G 8 7 229330 CASAVA_Build 15 31394434 2D AAAAAAAAAA CC/-- AAAAAAAAAC 590 het 590 ref 32 18 2 15 C 2 0 229331 CASAVA_Build 15 31398810 1I CATCATATCG -/A ACCAGAAGCC 3070 het 3070 ref 60 30 24 6 A 1 2 229332 CASAVA_Build 15 31416602 1D GGAGACTGAT A/- AAAAAAGAGA 2364 het 2364 ref 18 9 5 5 A 7 6 229333 CASAVA_Build 15 31417058 1I CCAAGTGCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 9 10 229334 CASAVA_Build 15 31421341 1D AGAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 11 10 229335 CASAVA_Build 15 31422103 4D ATAATCAATC TTGT/---- TTGTTATAAT 3070 het 3070 ref 26 15 10 3 TTGT 2 1 229336 CASAVA_Build 15 31429087 1I TTTCTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 1536 het 1536 ref 20 9 5 6 T 12 13 229337 CASAVA_Build 15 31432523 1I TGAAACCTTC -/T TCTGACATTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 1 2 229338 CASAVA_Build 15 31439783 1D CCCACTCCCA G/- CCCCAGGCCG 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 G 1 0 229339 CASAVA_Build 15 31464173 1D ATACTTACCA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 6 229340 CASAVA_Build 15 31467156 1I ATGACCTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 A 10 11 229341 CASAVA_Build 15 31471119 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2166 het 69 hom 14 1 7 7 A 17 16 229342 CASAVA_Build 15 31474445 1I ATGCTGATGC -/A AAAAAAAAAC 2763 het 2763 ref 28 11 6 11 A 9 10 229343 CASAVA_Build 15 31487505 1D TAAACTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 12 11 229344 CASAVA_Build 15 31505131 13D AGACTCACAA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTG 2231 het 826 hom 14 3 6 5 T 22 9 229345 CASAVA_Build 15 31508219 1D AGTTAGAGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 27 9 14 5 T 9 8 229346 CASAVA_Build 15 31516161 1D GCCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 2518 het 328 hom 10 1 7 2 T 10 9 229347 CASAVA_Build 15 31518294 1D AACCTAATAA C/- TAAAAGAATG 3070 het 3070 hom 43 15 22 8 C 1 0 229348 CASAVA_Build 15 31522752 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 37 1 27 10 A 16 15 229349 CASAVA_Build 15 31525040 3D TTTAGTAAAT ATC/--- ATTAAATTCT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 ATC 1 0 229350 CASAVA_Build 15 31532205 1I GTGAGAGGTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 7 8 229351 CASAVA_Build 15 31534827 1D AGATAAGATG T/- TTAGGAGTTA 3070 het 3070 ref 38 21 17 0 T 3 2 229352 CASAVA_Build 15 31535001 1D TACGTGCCTT A/- AAGGCCAAAA 3070 het 3070 hom 51 23 25 5 A 3 2 229353 CASAVA_Build 15 31551088 2D ATGCCTTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 2205 het 2144 hom 22 11 6 6 A 18 16 229354 CASAVA_Build 15 31558597 3I TGCAGAATGA ---/CGG TGGAATAGTG 3070 het 3070 ref 42 16 18 8 CGG 0 1 229355 CASAVA_Build 15 31558920 2D TATAAAACTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TA 1 0 229356 CASAVA_Build 15 31560972 1D TTTTGAATAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 8 19 5 T 10 9 229357 CASAVA_Build 15 31563782 5D CTAGGAAGAG AAGAA/----- AAGGGCCCTA 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 AAGAA 1 0 229358 CASAVA_Build 15 31564128 2I TATGGGTAAC --/AG AATTCATGGA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 AG 0 1 229359 CASAVA_Build 15 31565532 4I GAGTAGAGGA ----/GTTT CATAGAAACA 3070 het 3070 ref 54 24 25 5 GTTT 0 1 229360 CASAVA_Build 15 31569101 1I CAATCTGCCA -/T TGGTGAGCAT 3070 het 3070 ref 55 25 22 8 T 1 2 229361 CASAVA_Build 15 31569430 4D CCATTCATTC CTTA/---- AAGTTTCATT 3070 het 3070 ref 52 29 19 6 CTTA 1 0 229362 CASAVA_Build 15 31572658 2I CCCATCTCTC --/TG TGTTTCTGCC 2822 het 2822 ref 55 31 9 15 TG 1 2 229363 CASAVA_Build 15 31573596 1D ATTGTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 7 7 T 11 10 229364 CASAVA_Build 15 31574153 1I CCCACCTCCC -/A AGAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 1 2 229365 CASAVA_Build 15 31589991 4I TGAATAAATG ----/TATT TATTCTCTTT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 TATT 1 2 229366 CASAVA_Build 15 31591152 22D GAAATTAGAG GTGGCTGCACACATAGAAATTC/---------------------- GTCGCCAGGC 2812 het 2812 ref 27 18 10 9 GTGGCTGCACACATAGAAATTC 1 0 229367 CASAVA_Build 15 31594497 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2466 hom 15 6 8 1 A 11 10 229368 CASAVA_Build 15 31599119 1D TTTTATGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2841 hom 40 8 23 9 T 12 11 229369 CASAVA_Build 15 31600057 1I TCAGATTCTT -/A AATCTATTAG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 2 3 229370 CASAVA_Build 15 31600236 1D GCCATTTTGG C/- TCACTGTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 C 1 0 229371 CASAVA_Build 15 31601091 1I AAAAATCAAA -/G GGAGTGCCTT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 G 2 3 229372 CASAVA_Build 15 31602139 3D5M6D CAATTAGCCA GTTGAGGATTTAAC/---GAGTA------ TATCTGATCC 3070 het 3070 ref 43 29 8 12 N/A 0 0 229373 CASAVA_Build 15 31606136 2D TCTCTATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 T 12 10 229374 CASAVA_Build 15 31610782 2D ATGTAACTTG AA/-- AAAATTGCTA 1774 het 1774 ref 16 10 5 1 A 6 4 229375 CASAVA_Build 15 31616131 1I13M1D CTTCGGTGGT -CTCAGAGAACATTA/CCTCAGAGAACATT- AAGATGCATA 3070 het 3070 hom 48 21 26 7 N/A 0 0 229376 CASAVA_Build 15 31617032 1I TATTGGAAAT -/A TTTTTTTCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 229377 CASAVA_Build 15 31622476 1I ACTCCATGAC -/T TATTGAGATT 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 T 1 2 229378 CASAVA_Build 15 31628563 2D TATGCACACG TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 17 19 13 T 10 8 229379 CASAVA_Build 15 31630232 1D TTTGTTAAAC A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 8 7 229380 CASAVA_Build 15 31631243 1D CTTTGCTATC A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 A 1 0 229381 CASAVA_Build 15 31633088 7D CACATAGAAT AAGGAGC/------- AAGGAGCAGG 3070 hom 115 het 42 0 36 7 AAGGAGC 2 1 229382 CASAVA_Build 15 31635533 1I AGACACGTGG -/A AAATAGTGGG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 3 4 229383 CASAVA_Build 15 31636683 3I CCTCAGTGTT ---/ATC ATCTATAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 ATC 1 2 229384 CASAVA_Build 15 31641215 3D CAAAACACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 71 het 28 0 23 5 AAC 5 4 229385 CASAVA_Build 15 31642069 1D AACAGAAGAG A/- AGAGCTTACT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 2 1 229386 CASAVA_Build 15 31644616 1I CTTAGGAACT -/G GGCTGCTGAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 2 3 229387 CASAVA_Build 15 31647969 1I TTATTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 T 10 11 229388 CASAVA_Build 15 31650330 6D CTACTACAAA TATAAT/------ TATTTTTTTG 3070 het 3070 ref 19 10 9 4 TATAAT 1 0 229389 CASAVA_Build 15 31652617 2D TACTGAGCTC TT/-- TATTCAGCTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 3 1 229390 CASAVA_Build 15 31655324 2I CAGGAGCTGG --/TT TTTTAAAAAA 2657 het 2657 ref 25 11 8 6 T 4 6 229391 CASAVA_Build 15 31656284 4D AGAAAGAAAT AAAG/---- GGTATTCACA 3070 het 3070 hom 30 9 21 5 AAAG 1 0 229392 CASAVA_Build 15 31658261 5I18M1I CTTAGAATAA -----AAAAAAAAAAACAACAAC-/AAAAGAAAAAACAAAACAACAACA AAAAAAAAAC 3070 hom 25 het 25 0 17 14 N/A 0 0 229393 CASAVA_Build 15 31658952 3D AATCAATGCC AAG/--- AAGGTGTGAT 3070 het 3070 hom 41 19 17 6 AAG 2 1 229394 CASAVA_Build 15 31663511 2I CACCACTGTA --/CT CTCCAGCCTG 3070 het 1318 hom 11 3 8 0 CT 1 2 229395 CASAVA_Build 15 31666524 1D TGGGGGGACT G/- CGTATTTGAG 3070 het 3070 hom 51 13 25 14 G 1 0 229396 CASAVA_Build 15 31668308 2D AGTATTCCAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TG 7 6 229397 CASAVA_Build 15 31669776 7D CATATACGTG CAGGTCT/------- CAGGGGATAC 2959 het 2959 ref 20 9 8 6 CAGGTCT 1 0 229398 CASAVA_Build 15 31670926 4D GGCAAGCATT CATA/---- CATGTTTGTT 3070 het 3070 hom 46 18 25 5 CATA 1 0 229399 CASAVA_Build 15 31675569 1I TTTTCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 10 11 229400 CASAVA_Build 15 31675989 1D TTCTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 11 10 229401 CASAVA_Build 15 31677325 1I CTGTACACAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 7 8 229402 CASAVA_Build 15 31677402 1D CCTCCCCCAC T/- TTTTTTTTTT 2079 het 2079 ref 18 9 5 4 T 11 10 229403 CASAVA_Build 15 31677679 1D TTTTAATTAC A/- AAAAAAAAAA 2369 het 2369 ref 27 14 6 7 A 13 12 229404 CASAVA_Build 15 31678051 2D TTTGCAAGAC AG/-- AATCCCAAAC 3070 het 3070 ref 35 23 11 3 AG 1 0 229405 CASAVA_Build 15 31678549 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2685 het 2685 ref 22 10 8 4 A 10 11 229406 CASAVA_Build 15 31678675 1I TAAGCCATAA -/G GTTAGCTCAT 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 G 1 2 229407 CASAVA_Build 15 31696740 1I ACCCCGTCTC -/T ACTAAAAATA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 0 1 229408 CASAVA_Build 15 31700633 1I ATCCAGCAGA -/T TTTTAAAACC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 4 5 229409 CASAVA_Build 15 31704731 1D AGGACAGCAA G/- GGGGGAAGGC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 6 5 229410 CASAVA_Build 15 31708218 1D AGAAGTGTCT C/- CCCTTTCTTA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 C 4 3 229411 CASAVA_Build 15 31718366 2D TAGTCCTGAC AG/-- GGGATGTAAC 3070 hom 144 het 52 0 48 5 AG 1 0 229412 CASAVA_Build 15 31721490 1D TCTCATCCCA T/- TTTTGTCACT 3070 het 3070 ref 57 29 16 12 T 5 4 229413 CASAVA_Build 15 31734004 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 121 hom 32 1 24 7 A 13 12 229414 CASAVA_Build 15 31742555 4D CTTGGCATAG TGAC/---- TGACCAAGAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 8 TGAC 2 1 229415 CASAVA_Build 15 31746123 1I AGTGATATCC -/T TTCTACAACC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 2 3 229416 CASAVA_Build 15 31748722 1D CACTTTTACC A/- AAAAAAAAAA 2251 het 2251 ref 27 22 5 0 A 13 12 229417 CASAVA_Build 15 31749733 1D GAAATCAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 10 9 229418 CASAVA_Build 15 31755474 1D AGGATAATTG C/- CCCCCAAAGA 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 C 6 5 229419 CASAVA_Build 15 31755735 1I TCTAGAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 735 hom 34 4 20 10 A 14 15 229420 CASAVA_Build 15 31762495 1D TCATGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2307 het 2307 ref 23 8 7 8 T 11 10 229421 CASAVA_Build 15 31763946 1I CATCAACATT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 A 8 9 229422 CASAVA_Build 15 31768721 1I GTTGTGGGGT -/G GGGGGAGGGG 1022 hom 7 het 3 0 3 0 G 5 6 229423 CASAVA_Build 15 31769280 4D ATTTCCTAAT TGTC/---- TGAGACAACA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 TGTC 1 0 229424 CASAVA_Build 15 31770651 8D AATCTGAAAC CATATTAA/-------- CTAGATGTCT 3070 het 3070 ref 35 20 17 3 CATATTAA 1 0 229425 CASAVA_Build 15 31773652 1I AATATCATGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 8 9 229426 CASAVA_Build 15 31773905 1D GCCCGGTTAA T/- TTTTTGTATT 1150 het 1150 ref 13 7 4 2 T 6 5 229427 CASAVA_Build 15 31793022 1D TGAGGGTTGT G/- GTGAGGATAA 3070 het 3070 hom 74 33 34 8 G 2 1 229428 CASAVA_Build 15 31796368 1D TGAATGAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 701 hom 39 4 10 25 A 10 9 229429 CASAVA_Build 15 31810751 1I TTTTTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 919 hom 34 2 27 5 T 10 11 229430 CASAVA_Build 15 31814527 1D GAGCTCACAG C/- CCCTATTACT 3070 hom 117 het 43 0 40 4 C 4 3 229431 CASAVA_Build 15 31819008 1D TTTATAGTCA C/- CTTCTGGCCT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 C 2 1 229432 CASAVA_Build 15 31820982 3I CATGCAATAT ---/AAG AAGACTGTGC 3070 hom 151 het 56 0 51 5 AAG 1 2 229433 CASAVA_Build 15 31822297 1I AATGCAGATT -/G GGAAAAAAAA 3070 het 341 hom 36 1 28 7 G 2 3 229434 CASAVA_Build 15 31844071 1D AACCATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 670 hom 29 3 19 7 A 15 14 229435 CASAVA_Build 15 31846812 1I CCCGTCTCTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 9 hom 37 1 28 8 A 9 10 229436 CASAVA_Build 15 31847026 1I TTATTGAAAA -/C CATTTAAAGG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 1 2 229437 CASAVA_Build 15 31849030 2D GAAGGAAATG CA/-- CAGAGATCTG 3070 hom 90 het 32 0 29 3 CA 2 1 229438 CASAVA_Build 15 31852951 1I TGCTCATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 45 0 30 15 T 10 11 229439 CASAVA_Build 15 31854831 1D GGGAGTGGAG A/- AGGATGTGTG 3070 hom 150 het 56 0 50 6 A 2 1 229440 CASAVA_Build 15 31859332 1D17M2D CGTCTCTACT AAAAAAAAAAATAGAAAAAG/-AAAAAAAAAATAGAAAA-- AAATTAACCG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 229441 CASAVA_Build 15 31863415 1D TTCAGGGTTC T/- TTGGCTTTCA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 3 2 229442 CASAVA_Build 15 31867268 1D TCTGTAAAAT A/- ACCAGAAAGC 3070 hom 123 het 46 0 41 7 A 2 1 229443 CASAVA_Build 15 31877578 4I CTGTCTGTCT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 TTTA 3 4 229444 CASAVA_Build 15 31879428 4I GTGGGGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TTTG 3 4 229445 CASAVA_Build 15 31881111 2D ACCAAGAGTC TA/-- TTTTGTCTTA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 TA 1 0 229446 CASAVA_Build 15 31882013 2I TGTTTGAAAA --/AG GGCATATCGG 3070 hom 144 het 56 0 49 7 AG 0 1 229447 CASAVA_Build 15 31889106 2D CCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2271 het 31 hom 33 1 9 26 T 18 16 229448 CASAVA_Build 15 31900747 1D TTCCCTGTGA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 51 24 23 4 T 8 7 229449 CASAVA_Build 15 31904760 4D AGATTATTCC TTCT/---- TTATTTGGAA 3070 hom 105 het 38 0 36 6 TTCT 1 0 229450 CASAVA_Build 15 31906287 2I CACAGCACTC --/AG GGGCAAAACT 3070 hom 163 het 60 0 55 5 AG 0 1 229451 CASAVA_Build 15 31910116 1I CGTCTGGCAC -/T TTACAATATT 3070 hom 135 het 54 0 45 9 T 2 3 229452 CASAVA_Build 15 31914811 3I CAACCTACCC ---/TTT TTATTATTGC 3070 hom 84 het 35 0 25 10 T 2 5 229453 CASAVA_Build 15 31915653 1D29M1I TTTCTTTTGC TTTTTTTTTATTATTATTTCTTTTCTTTCC-/-TTTTTTTTATTATTATTTCTTTTCTTTCCT TTTTTTTTGT 3070 het 205 hom 13 1 17 6 N/A 0 0 229454 CASAVA_Build 15 31931557 19I AGAGGCGGCA -------------------/TTTGCTGAGGTTATTCTTC TGAGAGGTCA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 TTTGCTGAGGTTATTCTTC 0 1 229455 CASAVA_Build 15 31935092 33D ACTCCCCAGG TATTTCTGATATCTGCATCCAATTAAGAGCCAA/--------------------------------- TATTTCTGAT 3070 hom 36 het 19 0 12 12 TATTTCTGATATCTGCATCCAATTAAGAGCCAA 2 1 229456 CASAVA_Build 15 31936745 7D TGCTGGCAGC ACCAGCA/------- CCTGGTCTCC 3070 hom 48 het 19 0 13 6 ACCAGCA 1 0 229457 CASAVA_Build 15 31940974 1I ATAAATATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 690 hom 28 3 19 6 T 12 13 229458 CASAVA_Build 15 31941869 1D CACCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 11 10 229459 CASAVA_Build 15 31945131 4D TAGGGTCTGA ACTC/---- ACTCCAAAAG 3070 hom 123 het 42 0 42 2 ACTC 2 1 229460 CASAVA_Build 15 31955500 1I TAGGAATAGG -/A AAAAAAAAAA 1386 het 1386 ref 53 41 5 7 A 13 14 229461 CASAVA_Build 15 31959054 1D ATAATAAAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 8 7 229462 CASAVA_Build 15 31962055 2I CAAAAATGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 12 14 229463 CASAVA_Build 15 31969089 1D GTTTCTGCAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 9 8 229464 CASAVA_Build 15 31972230 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 12 1 11 0 T 11 10 229465 CASAVA_Build 15 31974783 1D GATACTTTTT G/- AACAACTCAG 3070 hom 59 het 26 0 19 7 G 1 0 229466 CASAVA_Build 15 31980315 1I AACTATTAAC -/T TGCCAACGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 2 229467 CASAVA_Build 15 31981372 10D CACTGAGTTC TAACAGTTCT/---------- TAAAATTTCT 3070 hom 127 het 47 0 43 4 TAACAGTTCT 1 0 229468 CASAVA_Build 15 31981652 3I TTATTTCAAC ---/AAT GTTTTATTGT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AAT 0 1 229469 CASAVA_Build 15 31982339 4D ATTCTGTAGC TTAA/---- TTAAACTAAT 3070 hom 87 het 30 0 30 2 TTAA 2 1 229470 CASAVA_Build 15 31983256 4I ATTGTATATG ----/TGTA TGTATATACA 3070 hom 135 het 53 0 46 7 TGTA 1 2 229471 CASAVA_Build 15 31984713 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 7 8 229472 CASAVA_Build 15 31996990 2I ACATATATAT --/AC ACACACGGAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 AC 3 4 229473 CASAVA_Build 15 32000930 2I GGAGGAGAGT --/GA GAGAGAGAGT 3070 hom 106 het 47 0 40 7 GA 4 5 229474 CASAVA_Build 15 32001239 4D CAAGAATCAT ACTC/---- AAAATGTAAG 3070 hom 160 het 56 0 54 5 ACTC 1 0 229475 CASAVA_Build 15 32001935 2I CACTTTTTTT --/TA TCTCTTATTT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 TA 0 1 229476 CASAVA_Build 15 32002631 2I GGATAAGCTA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AG 7 8 229477 CASAVA_Build 15 32003468 3I ATTCTACATT ---/ATG ATGAGTTGTA 3070 hom 27 het 14 0 10 8 ATG 1 2 229478 CASAVA_Build 15 32003854 2I CAGAGCGAGA --/CT CTGTCTCAAA 2473 het 105 hom 15 1 9 5 CT 1 2 229479 CASAVA_Build 15 32012509 1I TGTGGGAGAA -/G GGGTAGCAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 3 4 229480 CASAVA_Build 15 32017026 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 13 0 9 5 A 12 11 229481 CASAVA_Build 15 32020042 1I GTGAAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2728 hom 21 7 11 3 T 11 12 229482 CASAVA_Build 15 32037217 1D ATATTGTATG A/- AAAAAAAAAA 1009 het 1009 ref 42 35 4 4 A 12 11 229483 CASAVA_Build 15 32042173 4I ATAATATCTG ----/TCTA TCTGTCTATA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TCTA 0 1 229484 CASAVA_Build 15 32043600 1I GTCCTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 36 0 27 9 A 13 14 229485 CASAVA_Build 15 32045424 1D GCTTTTTATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 105 het 45 0 35 10 A 9 8 229486 CASAVA_Build 15 32046158 5I AAGATGAGAT -----/GAGAC AAGAGTGAGA 3070 hom 104 het 43 0 34 9 GAGAC 0 1 229487 CASAVA_Build 15 32047431 1D CATACATTTA G/- GAAAAAAAAA 1258 het 1258 ref 28 17 7 4 G 2 1 229488 CASAVA_Build 15 32055964 4I ACACAGCTTT ----/AACA AATATAAATT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 AACA 0 1 229489 CASAVA_Build 15 32058432 1I CAGGCAAAAG -/T TAAGGAGTAG 3070 hom 114 het 39 0 38 1 T 1 2 229490 CASAVA_Build 15 32059781 1D TAATAACATC T/- TTTTGTCAGC 3070 hom 153 het 57 0 51 6 T 5 4 229491 CASAVA_Build 15 32060115 4I GGTAGTCATG ----/CACC CACATAAGAA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 CACC 0 1 229492 CASAVA_Build 15 32060582 1I CCAAGACTCC -/T CCAGTTTTGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 0 1 229493 CASAVA_Build 15 32060929 3I CACCAAACTA ---/AAC AACATAACCA 3070 hom 120 het 44 0 39 5 AAC 1 2 229494 CASAVA_Build 15 32065593 5D AAATTTTTTT TTTTG/----- TTTTTTGTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TTTTG 1 0 229495 CASAVA_Build 15 32068554 1D ATAAATCCTG T/- TTTTTCTTAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 6 5 229496 CASAVA_Build 15 32072162 1D AAGAAGAGGG A/- AAAAAATGAG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 7 6 229497 CASAVA_Build 15 32073334 1D AAAAATAGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 8 229498 CASAVA_Build 15 32075517 2I ACACCAGGAG --/AT TATATCCCAC 3070 hom 87 het 31 0 27 4 AT 0 1 229499 CASAVA_Build 15 32081209 5I CGGTAATGAC -----/AAGCT GAATCCTGTG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AAGCT 0 1 229500 CASAVA_Build 15 32082023 3D GGGTTTTTCA CTT/--- TATTGACAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CTT 1 0 229501 CASAVA_Build 15 32090080 1D AACATTCACA C/- CATTTTTCAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 2 1 229502 CASAVA_Build 15 32096623 1D TCTGTCTCAA G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 117 het 42 0 39 4 G 5 4 229503 CASAVA_Build 15 32099804 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 30 0 27 4 A 10 9 229504 CASAVA_Build 15 32110613 1D TACATATGAG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 9 8 229505 CASAVA_Build 15 32113940 1I TTTCTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 2596 het 1511 hom 24 4 14 6 A 15 16 229506 CASAVA_Build 15 32115286 8D TTATTCATTT AGTTAGTA/-------- AGTTAGTTAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AGTTAGTA 1 0 229507 CASAVA_Build 15 32118905 1I GAACTCTCGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 88 hom 30 1 25 4 A 9 10 229508 CASAVA_Build 15 32120392 1D GAGACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 28 0 21 8 A 14 13 229509 CASAVA_Build 15 32124070 2D CTTGGCACAC AT/-- AGAAAATGGT 3070 hom 123 het 44 0 37 7 AT 1 0 229510 CASAVA_Build 15 32125236 1I CCTAACCTCA -/C CTTAGGAAAA 3070 hom 69 het 31 0 22 9 C 1 2 229511 CASAVA_Build 15 32127267 2I TTTTGGAGAT --/AG AGTCTCACTT 3070 hom 95 het 33 0 31 2 AG 1 2 229512 CASAVA_Build 15 32130798 1I TGAAACAAAG -/A GACAAAGTAC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 0 1 229513 CASAVA_Build 15 32140896 1I TGTACTGATA -/C AAAAGCTGTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 0 1 229514 CASAVA_Build 15 32158428 2I AAAATTATCT --/AA AAGAGGTACA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 2 4 229515 CASAVA_Build 15 32159169 1D AACAGTTTTT A/- AACAAAAGAT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 3 2 229516 CASAVA_Build 15 32160242 6D AAAAGAAATA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 18 het 7 0 7 1 AT 9 6 229517 CASAVA_Build 15 32173735 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAATAAA 2098 hom 15 het 6 0 6 0 A 7 6 229518 CASAVA_Build 15 32178603 4D TAATGTGGTT TTTG/---- TTTAAGTCCT 3070 hom 69 het 27 0 24 6 TTTG 1 0 229519 CASAVA_Build 15 32191623 1I TGGTGGGGGA -/G ATGGTATCTC 3070 hom 21 het 10 0 8 2 G 0 1 229520 CASAVA_Build 15 32192093 1I ATTTGACTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 30 1 25 4 T 10 11 229521 CASAVA_Build 15 32196482 3I TTTGTTTTGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TTG 3 4 229522 CASAVA_Build 15 32199265 1D CACAATCTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 9 8 229523 CASAVA_Build 15 32199435 5D AATTATACTC TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TTTGT 3 2 229524 CASAVA_Build 15 32200134 2D CTGGACACTT AA/-- GTTGCTTCCA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 A 2 0 229525 CASAVA_Build 15 32202008 1I CATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 11 12 229526 CASAVA_Build 15 32212961 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 371 hom 40 1 36 7 A 10 9 229527 CASAVA_Build 15 32214435 1D TTTGAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 27 1 21 5 T 11 10 229528 CASAVA_Build 15 32218132 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTAGTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 T 6 5 229529 CASAVA_Build 15 32221334 1D TTAATATTGA T/- TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 7 6 229530 CASAVA_Build 15 32225147 1D GAGAGAAATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 9 8 229531 CASAVA_Build 15 32235035 1I TACTCCTGAG -/C TTTTTTGCTA 3070 het 3070 hom 53 22 22 9 C 0 1 229532 CASAVA_Build 15 32238641 4I AAAAGTTAAT ----/TTTC TTTTTCTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTTC 0 1 229533 CASAVA_Build 15 32244811 1I CAATGTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 T 10 11 229534 CASAVA_Build 15 32246967 1I ATGTTTGATT -/G GTGTACCTGA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 1 2 229535 CASAVA_Build 15 32256534 3D GAAACTGGCA ATT/--- ATCATTGCCT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ATT 1 0 229536 CASAVA_Build 15 32259993 2D CCAGCAGCTC CT/-- CTCTCTACTG 3070 het 3070 ref 48 21 20 8 CT 4 3 229537 CASAVA_Build 15 32260660 4I GCTGTATGGT ----/TACA GTTCAAGTAC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 TACA 0 1 229538 CASAVA_Build 15 32262486 1D GCACACAGCT A/- TCCATGGCTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 A 1 0 229539 CASAVA_Build 15 32271682 1I TGGATCACCA -/G GGTCAGGAGA 3070 het 1337 hom 19 3 11 5 G 2 3 229540 CASAVA_Build 15 32274656 1D TATTGCAGCA C/- CAATTTATAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 2 1 229541 CASAVA_Build 15 32279322 16D TATTGTGAAG ACGGAAAGAACAAAGT/---------------- ACGGAAAGAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 ACGGAAAGAACAAAGT 2 1 229542 CASAVA_Build 15 32279916 2D CAGCTAATTG TT/-- TTTTTTTTTT 1816 het 1816 ref 18 6 6 6 T 12 10 229543 CASAVA_Build 15 32281959 3I TCTTAAACCT ---/TTC TTATGTTCCA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 TTC 0 1 229544 CASAVA_Build 15 32282863 2D TCCTTTAGAC TA/-- TATAATAGCT 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 TA 3 2 229545 CASAVA_Build 15 32287127 1D GCCACACCAG T/- TCTGTGGCTG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 T 2 1 229546 CASAVA_Build 15 32299372 1I TTTCTAACTA -/C AAAAGTAGTA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 0 1 229547 CASAVA_Build 15 32301714 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 8 A 12 11 229548 CASAVA_Build 15 32303722 2D26M3I CGGAGTGAAA CCCTGTCTCAAAAAACAAACCCAAAACA---/--CTGTCTCAAAAAACAAACCCAAAACAAAC AACAACAACA 3070 hom 127 het 39 0 39 9 N/A 0 0 229549 CASAVA_Build 15 32306527 2D TCCCAAACAT AA/-- GAGATTTTCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 2 0 229550 CASAVA_Build 15 32309401 2D AACCAAAAGA CT/-- CTTTTCTCCA 3070 hom 104 het 40 0 33 8 CT 2 1 229551 CASAVA_Build 15 32310228 4D GAGACTTTGG AGAC/---- AGACAACGTA 3070 hom 132 het 47 0 45 3 AGAC 2 1 229552 CASAVA_Build 15 32310856 1I ACTACGTCTC -/G GGAAAAAAAA 3070 hom 11 het 14 0 11 3 G 2 3 229553 CASAVA_Build 15 32311410 2D TTAAGCTATA TT/-- GAAGGGTTTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 2 0 229554 CASAVA_Build 15 32318767 1I ATAATACTAT -/A ATCATCTACA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 1 2 229555 CASAVA_Build 15 32319250 17I ACTCCACCCT -----------------/CTTGGTGGGAAAAGGAA GGGAATAATG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 CTTGGTGGGAAAAGGAA 0 1 229556 CASAVA_Build 15 32328054 2D CATATATACA CC/-- CCCACCCACA 1392 het 107 hom 27 2 13 12 C 5 3 229557 CASAVA_Build 15 32329331 1I TATATTCACT -/A GAAAATACTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 0 1 229558 CASAVA_Build 15 32330591 1I CAGCAGTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 30 1 23 6 A 10 11 229559 CASAVA_Build 15 32335050 1I GTAAAAGGTG -/A AAAGTGTTAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 3 4 229560 CASAVA_Build 15 32337499 4I TTAACTTTAC ----/AAAG AAAGGTTCCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAAG 1 2 229561 CASAVA_Build 15 32344896 1D AACAGCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 37 2 25 10 A 13 12 229562 CASAVA_Build 15 32346731 2I GTCTCTTTTT --/AA AAAAAAAAAA 1374 het 640 hom 34 4 9 21 A 14 16 229563 CASAVA_Build 15 32350868 1D TGGCCTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 20 1 18 1 T 14 13 229564 CASAVA_Build 15 32358411 1I TAGATTTTTA -/T TTTTCATTTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 4 5 229565 CASAVA_Build 15 32362874 4I GATAATTAAT ----/AATC AAGATAATTT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 AATC 0 1 229566 CASAVA_Build 15 32374057 1D CCTAAATACC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 8 7 229567 CASAVA_Build 15 32377691 1I AGGAAAGAAC -/A AAAAATAGGC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 5 6 229568 CASAVA_Build 15 32380287 10D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 24 2 14 10 A 22 12 229569 CASAVA_Build 15 32400295 8I CTGTAGTTCC --------/AGCTATTG AGAAGGCTGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AGCTATTG 0 1 229570 CASAVA_Build 15 32400416 10D AAATAAATAC AATAAAATAA/---------- AATAAAATAA 3070 hom 78 het 24 0 27 0 AATAA 5 3 229571 CASAVA_Build 15 32404108 1I CCCATTTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 9 10 229572 CASAVA_Build 15 32407609 1D22M4I TTTTAAAAAG AAAAAAAAAAAGACTAAAATTAG----/-AAAAAAAAAAGACTAAAATTAGAAGT AAGACCTGTC 3070 hom 78 het 23 0 27 6 N/A 0 0 229573 CASAVA_Build 15 32410003 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 10 9 229574 CASAVA_Build 15 32410529 1I AGTGAGACTC -/T TGTCTCAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 1 2 229575 CASAVA_Build 15 32417984 4D AGGCGGGCGT GATC/---- GATCACCTGA 3070 hom 39 het 16 0 13 4 GATC 2 1 229576 CASAVA_Build 15 32419570 4D ACAGGCTAAG AAAT/---- AAAATTCCTT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 AAAT 1 0 229577 CASAVA_Build 15 32419682 1I GTTGAGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 35 2 27 6 T 10 11 229578 CASAVA_Build 15 32420448 4I TCTCAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AAAG 2 3 229579 CASAVA_Build 15 32420978 1D11M2D AGAAATTACG TTAAGTGACAACAG/-TAAGTGACAAC-- AGGTATTTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 7 N/A 0 0 229580 CASAVA_Build 15 32421811 14I CGGGAGGATG --------------/GCTTGAGGTCAGAA GTTTGAGACC 3070 hom 24 het 8 0 9 0 GCTTGAGGTCAGAA 0 1 229581 CASAVA_Build 15 32424510 1I GACTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 13 0 10 3 A 11 12 229582 CASAVA_Build 15 32430887 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAAGAAAAG 77 het 77 ref 25 14 2 9 AAG 1 0 229583 CASAVA_Build 15 32451733 1I TAATATTGTA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 229584 CASAVA_Build 15 32485395 3I TAAAATCAGA ---/AAT AACGACAAAG 1796 het 1796 ref 37 27 6 4 AAT 0 1 229585 CASAVA_Build 15 32496828 1I ACCCCATCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 9 10 229586 CASAVA_Build 15 32498079 1D GCAGAGACCA G/- ATGTGGGAGG 3070 het 3070 hom 32 11 10 11 G 1 0 229587 CASAVA_Build 15 32502817 1I CAGTCCCAAG -/T CCCCGAGCAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 0 1 229588 CASAVA_Build 15 32504882 2D GGAATCCTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1009 hom 33 9 10 14 A 13 11 229589 CASAVA_Build 15 32505899 1D CCACAGACAG A/- AAAAGAAAAC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 5 4 229590 CASAVA_Build 15 32506233 1D GAAGGCAAAA T/- TTTTTTAAAA 1648 het 1648 ref 27 15 4 9 T 7 6 229591 CASAVA_Build 15 32507031 1I CACCTACTGC -/T TCTGCAAAAG 3070 het 3070 ref 67 40 21 7 T 1 2 229592 CASAVA_Build 15 32507155 1D TGCCAGCCAT C/- GGACTCCCAG 3070 het 3070 ref 66 46 14 7 C 1 0 229593 CASAVA_Build 15 32507272 4D ACAAGTGCAC ATAA/---- ATAAGCCAGG 3070 het 3070 ref 76 56 12 9 ATAA 2 1 229594 CASAVA_Build 15 32510487 2D TTATTACACC AA/-- AAGACTGAGA 3070 het 3070 ref 60 44 11 8 A 4 2 229595 CASAVA_Build 15 32510785 30D GAAAAAAAAT TATATATATATATATATATACATATATATA/------------------------------ TATATATATA 2361 hom 15 het 8 0 6 7 TATATATATATATATATATACATATATATA 1 0 229596 CASAVA_Build 15 32513157 2D GTGCTGCAAG GA/-- GACTACTGCT 2164 het 2164 ref 56 42 6 9 GA 2 1 229597 CASAVA_Build 15 32514415 8I AGAGCTCTCT --------/CCACTCTC CCGTTTCTCT 2419 het 2419 ref 54 33 9 12 CCACTCTC 0 1 229598 CASAVA_Build 15 32515856 2D GCCCAAAAAC AA/-- AGTGCCAGAC 1329 het 1329 ref 29 24 3 2 A 3 1 229599 CASAVA_Build 15 32517439 1I ATGACAAAAT -/A TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 0 1 229600 CASAVA_Build 15 32518819 6I AACTGGCCTA ------/ACAGAG ACAAAAGGTA 2792 het 2792 ref 24 16 7 1 ACAGAG 0 1 229601 CASAVA_Build 15 32521308 1D TATCTCTTCA T/- TTTTTCTTAG 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 T 6 5 229602 CASAVA_Build 15 32521707 2D AAATATTTTA AT/-- ATATTTTAAC 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 AT 3 2 229603 CASAVA_Build 15 32521834 6D TATCATGTAC TGTGTG/------ TGTATATATA 83 het 83 ref 19 3 2 15 TG 4 1 229604 CASAVA_Build 15 32528931 1D ATCTGAAATG T/- TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 T 4 3 229605 CASAVA_Build 15 32535640 2I CAAATTAATT --/AC AGTTATTTCC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 AC 0 1 229606 CASAVA_Build 15 32537839 18I GGTTTGGAAT ------------------/TTTTCAAAGCCTATAGCA TTTTGAAGTC 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 TTTTCAAAGCCTATAGCA 0 1 229607 CASAVA_Build 15 32541901 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1885 het 1885 ref 17 10 5 2 A 11 12 229608 CASAVA_Build 15 32544443 1I TCTTAACTTC -/T TTTTGCTACC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 4 5 229609 CASAVA_Build 15 32544623 1D TTACCCCGTA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 T 8 7 229610 CASAVA_Build 15 32548042 2I CATACATTTA --/TC TGATTTAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 TC 0 1 229611 CASAVA_Build 15 32548448 2I GGCTTCACAT --/AG AGAGTTAGCA 3070 het 3070 hom 39 12 25 2 AG 2 3 229612 CASAVA_Build 15 32550703 3I TATGTAAAAA ---/TCT TCTAGTTTTA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 TCT 1 2 229613 CASAVA_Build 15 32550808 1D GGAAGAGATA G/- GCATTTCAGG 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 G 2 1 229614 CASAVA_Build 15 32551826 1I ATTTCTTGTC -/T CTTTTTAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 1 229615 CASAVA_Build 15 32560973 1D TTATTCAAAT A/- ATACATATGT 1601 het 1601 ref 43 36 4 4 A 2 1 229616 CASAVA_Build 15 32589312 1D CCTCAATATA T/- TTTTAAGAAT 3070 het 2599 hom 21 7 10 4 T 5 4 229617 CASAVA_Build 15 32598051 1D ATACTATTAA G/- GGGAAAAAAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 G 4 3 229618 CASAVA_Build 15 32624761 1I AGGAGCTATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 A 9 10 229619 CASAVA_Build 15 32631734 1D TCATTTTTTT G/- AGGGCCATGT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 G 1 0 229620 CASAVA_Build 15 32632400 1D GTGGAGGGGG C/- TGGTGAAGGA 2136 het 1584 hom 13 7 5 2 C 1 0 229621 CASAVA_Build 15 32650882 3D AAAATGAAAA AAG/--- AAGAGGAATG 3070 het 3070 ref 39 27 7 7 AAG 2 1 229622 CASAVA_Build 15 32651454 3I ACCTAGAAAT ---/CAA CAACAAGGAA 1731 het 1731 ref 35 31 4 0 CAA 2 3 229623 CASAVA_Build 15 32651629 1I CTGAATGAAA -/C CACAAAGACT 3070 het 3070 ref 60 30 24 7 C 1 2 229624 CASAVA_Build 15 32655645 2D CAACACATAC AA/-- GGAGTTAGGC 2228 het 2228 ref 27 11 7 10 A 2 0 229625 CASAVA_Build 15 32656694 2D TTATTACACC AA/-- AAGACTGAGA 1346 het 1346 ref 62 48 4 11 A 4 2 229626 CASAVA_Build 15 32659256 2D GTGCTGCAAG GA/-- GACTACTGCT 3070 het 3070 ref 61 42 9 12 GA 2 1 229627 CASAVA_Build 15 32659983 2I CGCAGGGTTC --/CA CAGAGAGAGC 3070 hom 60 het 22 0 18 4 CA 1 2 229628 CASAVA_Build 15 32661067 10D6M5I TAACATTTTG ATTTTTTTTTTTTTAA-----/----------TTGGAAAAAAG AGGTTAGAGC 2328 het 2328 ref 33 17 5 16 N/A 0 0 229629 CASAVA_Build 15 32666384 1I CTTAAAGCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 A 11 12 229630 CASAVA_Build 15 32667543 1D CAGACTACAT A/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 28 8 18 2 A 1 0 229631 CASAVA_Build 15 32669647 4D12M1I ATAGTATAAT TTTATTTGAGATTGTC-/----TTTGAGATTGTCT TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 21 11 11 4 N/A 0 0 229632 CASAVA_Build 15 32670167 2D GCACGGATTC CA/-- CATTCTCTTG 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 CA 2 1 229633 CASAVA_Build 15 32676215 3D TATGTATATA TTG/--- TTGTTGTTGT 1478 het 1478 ref 22 15 4 3 TTG 5 4 229634 CASAVA_Build 15 32688276 4I TTAGAAAAAT ----/AGAG AGAAAGGCAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AG 1 3 229635 CASAVA_Build 15 32689955 3I GAAAATGAAA ---/TGT TGTATTGATT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 TGT 1 2 229636 CASAVA_Build 15 32692203 1I ACTAAGAACA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 7 8 229637 CASAVA_Build 15 32694036 1D TCCTGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 8 T 11 10 229638 CASAVA_Build 15 32701581 1D ATAATTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 12 11 229639 CASAVA_Build 15 32709739 1I GGAAGTTCTT -/C CTTGCAATAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 2 229640 CASAVA_Build 15 32709879 4D TTTGATAAGG GGCA/---- GGCATCATTA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 GGCA 2 1 229641 CASAVA_Build 15 32713614 1D CTGCACATTC T/- GCACGTGTAC 1348 het 452 hom 5 1 3 1 T 1 0 229642 CASAVA_Build 15 32723108 1D TAAGTAGAAA T/- TACCAAATGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 2 1 229643 CASAVA_Build 15 32733372 1I TTTCTATCAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 7 8 229644 CASAVA_Build 15 32735631 1D TGTGAAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 10 9 229645 CASAVA_Build 15 32738050 1D TGCAAGAGCT G/- GGACTTAAAA 3070 hom 44 het 39 1 29 9 G 3 2 229646 CASAVA_Build 15 32738775 1I CTAAAAAAGA -/C AAGTTCTTGA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 0 1 229647 CASAVA_Build 15 32738871 1D GGAGGAAGCA T/- TGTGCACAGG 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 T 2 1 229648 CASAVA_Build 15 32747780 7D AAACATCTCT ACAAACA/------- ACCAACAACC 3070 hom 89 het 34 0 31 4 ACAAACA 1 0 229649 CASAVA_Build 15 32758094 2D TCTCAGCAAT GA/-- GTCTTCTTGG 3070 het 3070 hom 46 17 22 10 GA 1 0 229650 CASAVA_Build 15 32769832 3D ATGTTGCTCC ACT/--- GTTTTCTCAC 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 ACT 1 0 229651 CASAVA_Build 15 32771210 1I AGAACTTTCT -/G TTTTTATGCT 3070 het 3070 ref 43 20 21 2 G 0 1 229652 CASAVA_Build 15 32772163 5I GACCCCTACC -----/TTTCT TTTCTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 TTTCT 1 2 229653 CASAVA_Build 15 32774727 1I GTTAAAATAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 8 9 229654 CASAVA_Build 15 32783733 1I ACAATTGGGG -/A AAAGATAACC 3070 het 3070 ref 51 22 20 9 A 3 4 229655 CASAVA_Build 15 32784021 1D ACAGGCGTTT A/- AAAAATATGC 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 A 6 5 229656 CASAVA_Build 15 32784267 6I CTCCTTGGCT ------/AACCAC GTAATCTCTG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 AACCAC 0 1 229657 CASAVA_Build 15 32793892 1I TTTACCTTCA -/C AGAGGCTGGT 3070 het 3070 ref 35 20 8 7 C 0 1 229658 CASAVA_Build 15 32810221 1I TGTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 T 9 10 229659 CASAVA_Build 15 32820899 1D ACCATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1092 het 1092 ref 38 14 3 21 T 15 14 229660 CASAVA_Build 15 32822237 1I ATCGAGATCC -/T TTTTTTTTTT 1197 het 1197 ref 31 14 6 11 T 17 18 229661 CASAVA_Build 15 32824918 1I GATACTGTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1833 hom 42 6 26 10 A 12 13 229662 CASAVA_Build 15 32827527 8I7M1I AGACCCAATT --------TGGGTCT-/TCTACCCATTGGTCTG GTGTTCCATC 3070 hom 108 het 34 0 37 2 N/A 0 0 229663 CASAVA_Build 15 32833363 2I TATTGAACTC --/AT ATATATATAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 5 6 229664 CASAVA_Build 15 32839237 1I ATGTGCCCTT -/C CTGCTCTTCT 3070 hom 33 het 35 1 29 6 C 1 2 229665 CASAVA_Build 15 32848063 1I GGTAGTAAAA -/G CTTCCTACTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 0 1 229666 CASAVA_Build 15 32852142 16I CACTAGATTT ----------------/TGTTGAGAAACCCAAG TGTAGAATAT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 TGTTGAGAAACCCAAG 0 1 229667 CASAVA_Build 15 32860986 2D TATGTGTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 2648 het 434 hom 36 8 7 21 T 16 14 229668 CASAVA_Build 15 32862534 1D ATATGGACAG C/- TTCCCCGCAC 3070 hom 140 het 52 0 46 7 C 1 0 229669 CASAVA_Build 15 32879281 1I AGATCAGACC -/A GGGGGGAGGA 2648 het 2648 ref 29 16 6 7 A 0 1 229670 CASAVA_Build 15 32887441 5I ATTAAGAGAT -----/TAAAG TAAAGACAGG 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 TAAAG 1 2 229671 CASAVA_Build 15 32902298 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 19 1 12 6 A 17 16 229672 CASAVA_Build 15 32903282 1D CTTAGAGGTA G/- GGTGCATGTT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 G 3 2 229673 CASAVA_Build 15 32910129 1I AGCCTCCTGA -/G TAACTGGGAC 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 G 0 1 229674 CASAVA_Build 15 32913776 3I AGATCAATAA ---/AAC AAAAAGCTGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 AAC 0 1 229675 CASAVA_Build 15 32926638 3D GTACTCAAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 AAC 7 6 229676 CASAVA_Build 15 32932062 1I CTATCTTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 9 10 229677 CASAVA_Build 15 32935024 2D AAACATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1371 het 1371 ref 32 15 7 10 T 18 16 229678 CASAVA_Build 15 32949679 1D CATAATTTCC A/- AAAAAGGTGA 3070 hom 71 het 30 0 25 5 A 6 5 229679 CASAVA_Build 15 32983368 3D CCTTTCCTAC TAA/--- TGAGTAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TAA 1 0 229680 CASAVA_Build 15 32985249 1I AGTGTTTCTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 229681 CASAVA_Build 15 32991399 8I TTCTTCTCGG --------/AGTTTCAT AGTTTCATGG 3070 hom 72 het 32 0 24 8 AGTTTCAT 1 2 229682 CASAVA_Build 15 32991844 2D TAAACTCTCT CA/-- GTTTTTGTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CA 1 0 229683 CASAVA_Build 15 32995936 1D CCATACTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 11 10 229684 CASAVA_Build 15 33007157 13D AGAGTGACTG AGATAATATCCCT/------------- AGTCTTCCTT 3070 hom 132 het 42 0 44 4 AGATAATATCCCT 1 0 229685 CASAVA_Build 15 33012953 1D GTATGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 13 12 229686 CASAVA_Build 15 33016758 1I GACCTCGTGA -/T TCCACCCACC 3070 hom 90 het 34 0 30 6 T 1 2 229687 CASAVA_Build 15 33018227 4I AAAAAGAAGA ----/TAGT TACCAGAAAG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TAGT 0 1 229688 CASAVA_Build 15 33030085 5D TCTTTCTCAC ATATT/----- ATATTTCTTC 3070 hom 84 het 30 0 28 3 ATATT 2 1 229689 CASAVA_Build 15 33036475 1I TTCATTAAGA -/T TAAGCCTGCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 1 2 229690 CASAVA_Build 15 33036651 1D GTCATTTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 43 het 18 0 15 3 T 10 9 229691 CASAVA_Build 15 33043155 1D ACACGTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 11 10 229692 CASAVA_Build 15 33043368 1I GTGTTGGTCA -/G GATGGTCTCG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 1 2 229693 CASAVA_Build 15 33044203 1D TGAATGCTTT C/- CTAAAATAAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 2 1 229694 CASAVA_Build 15 33047749 1D AAGGAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 2155 het 388 hom 16 1 11 4 T 15 14 229695 CASAVA_Build 15 33047907 1D CACCATGCCC G/- GCTAATTTTT 2850 hom 21 het 10 0 8 2 G 2 1 229696 CASAVA_Build 15 33049944 1I GGCGCGGTAG -/C TCACGCCTGT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 0 1 229697 CASAVA_Build 15 33107483 4D TCCTTTCTTC TTCT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TTCT 1 0 229698 CASAVA_Build 15 33129121 2D ATTTTTCCTC TT/-- GTCTTCTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 0 229699 CASAVA_Build 15 33149001 1I ATTTGAGGAC -/A GGGGCACTTC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 0 1 229700 CASAVA_Build 15 33158700 1I AAATCTGTGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 T 8 9 229701 CASAVA_Build 15 33163183 1D TCACGCCTGT A/- AATCCCAGCT 988 het 140 hom 8 1 5 2 A 3 2 229702 CASAVA_Build 15 33166982 1I ATGTTAAGTT -/A AACTCCCATT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 A 2 3 229703 CASAVA_Build 15 33182180 6D TAACATGAAA AAGTTT/------ AAGATTATGG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AAGTTT 1 0 229704 CASAVA_Build 15 33182876 1D CCATCCTTTA C/- TCAACAAGTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 0 229705 CASAVA_Build 15 33200528 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 1 0 229706 CASAVA_Build 15 33201752 1D CAGATATTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 21 0 15 7 T 10 9 229707 CASAVA_Build 15 33233819 4D ATTAAAAATA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AAAT 4 3 229708 CASAVA_Build 15 33237713 1I GCAGAAATGA -/G GGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 G 4 5 229709 CASAVA_Build 15 33241189 2D AGTGTGCTCG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 98 het 42 0 33 10 CT 9 8 229710 CASAVA_Build 15 33246931 1D ACTTTCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 10 9 229711 CASAVA_Build 15 33247066 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 581 hom 27 4 13 10 A 16 15 229712 CASAVA_Build 15 33253046 1I TGTATCTGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 9 10 229713 CASAVA_Build 15 33256922 6I TAATAATAAT ------/AAAAAA AATAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 2 8 229714 CASAVA_Build 15 33257258 1D CATGGAGAAA C/- CCCCATCTCT 1332 het 247 hom 6 1 3 2 C 5 4 229715 CASAVA_Build 15 33257436 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2872 het 2872 ref 29 19 6 4 A 10 11 229716 CASAVA_Build 15 33260956 1I18M1D GTTATAAAAA -AAAACTCTGCTTTTTAGTA/CAAAACTCTGCTTTTTAGT- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 2 N/A 0 0 229717 CASAVA_Build 15 33261444 3D46M3I CAATGTTGTA AAGAAGATTAGTAAAATGATTGTCTTTCTAAATAAAGATGTATGTAATT---/---AAGATTAGTAAAATGATTGTCTTTCTAAATAAAGATGTATGTATTTGTG ACTAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 12 17 25 N/A 0 0 229718 CASAVA_Build 15 33265393 2D GCCCGGCTAA TT/-- TTTTTTGTGT 721 het 707 hom 5 2 3 0 T 8 6 229719 CASAVA_Build 15 33296035 1I AAGAGATTAA -/T TGAGTTCTTA 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 T 1 2 229720 CASAVA_Build 15 33308822 4I ATTAAAAGAC ----/TCGG TCGGATGTAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TCGG 1 2 229721 CASAVA_Build 15 33312449 4D ATATTCATCA ACAG/---- ACAATTAGCA 3070 hom 111 het 40 0 37 4 ACAG 1 0 229722 CASAVA_Build 15 33315477 2D ATGCCACCAC AT/-- GTTTAGTTTA 3070 het 3070 hom 46 20 25 2 AT 1 0 229723 CASAVA_Build 15 33317761 1I TTTTACTGCC -/A AAAAAAAAAA 1160 het 1160 ref 16 10 4 2 A 13 14 229724 CASAVA_Build 15 33329501 1I CTAAAAATAT -/A AAAAAAAAAT 1519 het 1519 ref 11 6 4 1 A 9 10 229725 CASAVA_Build 15 33341036 1I AAGTTAGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 9 10 229726 CASAVA_Build 15 33341326 1I ACCCTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 29 1 20 8 A 13 14 229727 CASAVA_Build 15 33343590 1D TTAAGCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 44 1 29 15 T 11 10 229728 CASAVA_Build 15 33344024 1I TTTGAAAAAC -/A AAAAGGCTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 5 229729 CASAVA_Build 15 33348019 1D TTGCAGCTCT A/- AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 39 31 4 7 A 11 10 229730 CASAVA_Build 15 33355207 1D ACCTTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 2110 het 2110 ref 29 18 5 6 A 15 14 229731 CASAVA_Build 15 33384875 4I CCACATACTC ----/ACAG ACACTGTGAA 3070 hom 123 het 50 0 42 8 ACAG 0 1 229732 CASAVA_Build 15 33404017 1I AGCAGTTCGC -/T TTACGACTTC 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 T 2 3 229733 CASAVA_Build 15 33492493 6I GATTATGATG ------/TGTCAT TGTCATTGTA 3070 het 3070 ref 55 26 17 12 TGTCAT 1 2 229734 CASAVA_Build 15 33521303 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 8 9 229735 CASAVA_Build 15 33524386 1I GACCATTACT -/A AAAAATGCCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 5 6 229736 CASAVA_Build 15 33525723 2D TTTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 853 het 179 hom 20 3 8 9 T 18 16 229737 CASAVA_Build 15 33529155 4I8M1I CATGAGAGCT ----GCTCAGCA-/TTCATCTTTGCAC ACCTTTTCTC 3070 hom 120 het 38 0 41 5 N/A 0 0 229738 CASAVA_Build 15 33531658 4D TCCATCCTAC CACT/---- CACTGCTGCC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CACT 2 1 229739 CASAVA_Build 15 33533302 2I AAAATGAAAC --/TT AAGTGTTCAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 2 229740 CASAVA_Build 15 33542870 1I6M4I TGTGCACAAG -TTATAT----/TTTATATGTAA AAATATTTAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 N/A 0 0 229741 CASAVA_Build 15 33560472 1D GGTATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 12 11 229742 CASAVA_Build 15 33571217 2D TATGTAGATG TA/-- TATATCTAGA 3070 hom 60 het 21 0 21 1 TA 3 2 229743 CASAVA_Build 15 33586450 1D AGTGTCAGAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 63 het 27 0 20 7 A 9 8 229744 CASAVA_Build 15 33603653 2D TAACATTTTT AA/-- AAGATACAAA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 A 4 2 229745 CASAVA_Build 15 33615130 2D AGGAAATAAT AC/-- AGTTATCCAT 3070 hom 72 het 28 0 25 5 AC 1 0 229746 CASAVA_Build 15 33620996 2D TTCAGCTAAA TT/-- TACAGAATGC 3070 het 3070 ref 30 12 11 8 T 3 1 229747 CASAVA_Build 15 33627676 8D TGTGGGGATG GCCATGTT/-------- GCCAGACACA 3070 hom 72 het 27 0 23 4 GCCATGTT 1 0 229748 CASAVA_Build 15 33634694 1I ACAGATCATC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 9 229749 CASAVA_Build 15 33642777 1I CTGGGAACTA -/T CCCACAGTGT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 0 1 229750 CASAVA_Build 15 33645783 1I TAATTTGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 108 hom 40 2 32 6 A 9 10 229751 CASAVA_Build 15 33658012 1I ATTTTTAGAC -/T CTTCATCTAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 0 1 229752 CASAVA_Build 15 33658518 2I ACACATATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AC 7 8 229753 CASAVA_Build 15 33709675 1I ATCAAAAGTG -/C CCCCCCCCCA 2782 het 2720 hom 21 10 8 3 C 9 10 229754 CASAVA_Build 15 33738658 1I ATTACTTATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 9 11 7 A 9 10 229755 CASAVA_Build 15 33745606 4I ATCCTGCGAT ----/AGAC AGGCCTTCTG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AGAC 0 1 229756 CASAVA_Build 15 33749592 4I AATTACATAT ----/TAAG TATCTATATT 3070 het 3070 ref 52 34 15 3 TAAG 0 1 229757 CASAVA_Build 15 33756161 1I CCCTCGGCCT -/C CCCAAAGTGC 1429 het 340 hom 17 1 5 11 C 3 4 229758 CASAVA_Build 15 33765228 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TG 6 5 229759 CASAVA_Build 15 33779563 1D GCTGATTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 T 11 10 229760 CASAVA_Build 15 33797002 20D GGAGATCTGT GGGGCTGGAGGGAGATCTGC/-------------------- GGAGCCAGCT 3069 het 3069 ref 22 17 9 3 GGGGCTGGAGGGAGATCTGC 1 0 229761 CASAVA_Build 15 33802680 2I GCTGATCTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 10 12 229762 CASAVA_Build 15 33826348 1D CATCTCGGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 A 10 9 229763 CASAVA_Build 15 33829064 1I TTTTCGATAT -/A AAAAAACAGT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 6 7 229764 CASAVA_Build 15 33862290 1D TGTAAGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 806 hom 37 3 28 6 T 12 11 229765 CASAVA_Build 15 33863659 1I GCAGAGGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 10 11 229766 CASAVA_Build 15 33865837 1I CCACCTACTC -/T TTTTTTTTTT 2928 het 398 hom 30 4 16 10 T 15 16 229767 CASAVA_Build 15 33870007 1I TCTTTTTTGC -/T TGTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 2 229768 CASAVA_Build 15 33878513 1D ACACCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 27 1 20 6 T 13 12 229769 CASAVA_Build 15 33885631 8I ATAAATAACT --------/TTATTTTG TTATTTTGTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TTATTTTG 1 2 229770 CASAVA_Build 15 33902836 1I TTTAATGAAC -/T TGTTGAGCAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 1 2 229771 CASAVA_Build 15 33907537 1D TTTTATAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 17 2 13 2 A 13 12 229772 CASAVA_Build 15 33910254 4D CATCAAACTC CATA/---- CATAACTGGA 3070 hom 111 het 42 0 38 6 CATA 2 1 229773 CASAVA_Build 15 33911564 1I13M1D TGTCTCTACT -AAAAAAAAAACACA/AAAAAAAAAAACAC- AAAAATTAGC 1263 hom 26 het 12 0 7 6 N/A 0 0 229774 CASAVA_Build 15 33912593 3I CTGTGACATC ---/TCT TCTTCTCCCA 3070 hom 111 het 46 0 38 9 TCT 2 3 229775 CASAVA_Build 15 33923449 1D CTAACATAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 5 het 25 1 18 6 A 10 9 229776 CASAVA_Build 15 33924731 4I TAATTTTATA ----/TATT TATTTAATAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TATT 1 2 229777 CASAVA_Build 15 33931245 2D TGCAGGAAAT AC/-- AGTTTCACAG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 AC 1 0 229778 CASAVA_Build 15 33932138 5I ATATACAAAT -----/ATATC ATTATATATG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 ATATC 0 1 229779 CASAVA_Build 15 33932311 4I TAATAATAAC ----/AATT AATCTAAAGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AATT 0 1 229780 CASAVA_Build 15 33932783 1I GAGCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 29 2 19 8 A 11 12 229781 CASAVA_Build 15 33933466 2D CCATAATCAT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 37 1 31 6 TG 1 0 229782 CASAVA_Build 15 33935253 1D TCATAACCTG A/- AACCCCTACC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 3 2 229783 CASAVA_Build 15 33941456 1D AACCCCCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 13 12 229784 CASAVA_Build 15 33941516 2D TTGAAAAGAC TG/-- TCTTTTCTCC 3070 hom 57 het 29 0 21 9 TG 1 0 229785 CASAVA_Build 15 33942591 2D TCCAAGTTTT TA/-- TATGTTTTAT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 TA 2 1 229786 CASAVA_Build 15 33961690 2D AAAATTAAGT GA/-- GTCACACTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 GA 1 0 229787 CASAVA_Build 15 33966220 1D GAAAAAAAAA G/- AAACATTTTT 3070 het 295 hom 30 1 27 2 G 1 0 229788 CASAVA_Build 15 33974257 1I GAAAGAAATC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 8 9 229789 CASAVA_Build 15 33975591 1I TGGTCTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 618 hom 29 2 21 6 T 11 12 229790 CASAVA_Build 15 33980138 1I AATTTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 627 hom 36 2 25 9 T 13 14 229791 CASAVA_Build 15 33993645 1D ATTCTGTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 43 1 39 5 T 11 10 229792 CASAVA_Build 15 33994759 4I TGTCTGTCTA ----/TCTC TCTATCTGGC 3070 hom 111 het 48 0 38 10 TC 1 3 229793 CASAVA_Build 15 34019373 1I TTAACAATAC -/G TGGTTTACTT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 G 0 1 229794 CASAVA_Build 15 34019855 4I TCTACATGGC ----/AAAA AAAAGGGACT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 4 8 229795 CASAVA_Build 15 34023896 1I GATACGGTAA -/G ATTTGTTCTC 3070 het 3070 ref 56 31 20 5 G 0 1 229796 CASAVA_Build 15 34029357 1I CTTGGGAGGG -/T GAGGCAGGAG 1709 het 808 hom 10 4 4 2 T 0 1 229797 CASAVA_Build 15 34050311 1D AAGTAAGCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 17 22 7 A 10 9 229798 CASAVA_Build 15 34066922 1I TGCTTTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 735 hom 34 2 24 8 A 13 14 229799 CASAVA_Build 15 34068145 1I ATTTTTAATG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 7 8 229800 CASAVA_Build 15 34069450 1D ACCAGTAATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 999 hom 50 5 25 20 A 10 9 229801 CASAVA_Build 15 34079252 1I CTGAAAAGGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 T 8 9 229802 CASAVA_Build 15 34081472 1I CACACAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 T 11 12 229803 CASAVA_Build 15 34093618 1D TGCCCAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 18 10 T 12 11 229804 CASAVA_Build 15 34094363 1I ACATATTTGG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 51 17 28 6 A 7 8 229805 CASAVA_Build 15 34099181 9I AGAAATAAGC ---------/AGTTGTAAG TCAACTGAGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 AGTTGTAAG 0 1 229806 CASAVA_Build 15 34099368 4D TTTAGGGTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 496 het 496 ref 31 20 2 9 TTTG 1 0 229807 CASAVA_Build 15 34099511 2I CCCTAAAAAC --/AA GAGTAAAACT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 0 2 229808 CASAVA_Build 15 34100212 3D TTATTTTTTG ATA/--- ATTATTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 ATA 1 0 229809 CASAVA_Build 15 34101335 3I15M3I TTCCACTTTC ---AAGATTTTATCTAAT---/AAGAAGATTTTATCTAATAAA GAAGGAAAAC 3070 het 3070 hom 44 23 23 6 N/A 0 0 229810 CASAVA_Build 15 34101532 1I CTGAATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 34 1 28 5 T 11 12 229811 CASAVA_Build 15 34101866 3D TGCTCTTGGA CTT/--- CTTCTGTCTG 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 CTT 2 1 229812 CASAVA_Build 15 34104633 3I TGTCAGTCAA ---/ATG ATGATGATAT 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 ATG 2 3 229813 CASAVA_Build 15 34108011 1D ATTCTTAGAA G/- TTTTTTTTAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 1 0 229814 CASAVA_Build 15 34108474 5I AACTCATGAT -----/CAGAA GCATACAAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CAGAA 0 1 229815 CASAVA_Build 15 34110592 2D14M5I GTGTATATAT AGAGAGTGCACATGTA-----/--AGAGTGCACATGTATACTC TATTCTCATT 3070 hom 39 het 13 0 14 3 N/A 0 0 229816 CASAVA_Build 15 34112644 2D ATTTCTCAAA AC/-- ACATCCAATT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 AC 2 1 229817 CASAVA_Build 15 34130229 8D CATTTTCTCA TTTTCTCC/-------- TTTTCTCACC 3070 hom 84 het 31 0 29 5 TTTTCTCC 1 0 229818 CASAVA_Build 15 34137234 2I ACACATACCA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 AC 7 8 229819 CASAVA_Build 15 34148082 1I GGATAAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 40 1 31 8 A 10 11 229820 CASAVA_Build 15 34148524 1D GCAAAGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 10 9 229821 CASAVA_Build 15 34154584 1D TTACCCCTTT A/- CTCTCTCCTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 A 1 0 229822 CASAVA_Build 15 34155733 1I GATTTTTAGG -/A GAAAAAAAAA 2985 het 2985 ref 23 13 9 1 A 0 1 229823 CASAVA_Build 15 34157599 1D GTTGAATCTC T/- TATTATTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 T 2 1 229824 CASAVA_Build 15 34159393 1D AAGGTGGGGA G/- GATATTCCAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 G 2 1 229825 CASAVA_Build 15 34170783 4D ATAAATGATG AATC/---- AATCCATTAT 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 AATC 2 1 229826 CASAVA_Build 15 34171585 1I TTCCTCATGA -/T TTTTCCCTTC 3070 het 3070 ref 61 31 24 6 T 4 5 229827 CASAVA_Build 15 34174112 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 21 2 12 7 T 16 15 229828 CASAVA_Build 15 34174638 3I ACATATACTA ---/CTT TAAGAAAACA 3070 het 3070 hom 36 11 12 13 CTT 0 1 229829 CASAVA_Build 15 34174671 1D AAAATTAAGC T/- GAAGTAAGAA 3070 het 2483 hom 33 6 15 12 T 1 0 229830 CASAVA_Build 15 34176153 1D CATAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 6 A 11 10 229831 CASAVA_Build 15 34176916 4D GCTGTTTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 AAAC 4 3 229832 CASAVA_Build 15 34177566 1I TTTCTTTCCT -/C CAAAGCAAAT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 C 1 2 229833 CASAVA_Build 15 34182913 1I TTAGAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 8 9 T 12 13 229834 CASAVA_Build 15 34185818 1D ACAGGACAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 8 229835 CASAVA_Build 15 34187362 2D AAAAAAAAAA AC/-- CCAGTAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AC 1 0 229836 CASAVA_Build 15 34187466 1I CATGATGTAG -/A AAAGGGAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 4 229837 CASAVA_Build 15 34187634 1D TTTAGATTTT A/- AAAAAAACCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 7 229838 CASAVA_Build 15 34202014 5I TTCTCCTCTT -----/ATTTA TTTTTCCCCA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 ATTTA 0 1 229839 CASAVA_Build 15 34202991 1I CCGGACAATA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 7 8 229840 CASAVA_Build 15 34206934 1D CAGACGAAGA G/- AACAGGTGTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 G 1 0 229841 CASAVA_Build 15 34220991 1I CGTTCAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1150 hom 39 4 25 10 T 15 16 229842 CASAVA_Build 15 34221102 6D AGTTGACCAC ATAAGT/------ ATGGGTATAT 3070 hom 78 het 29 0 27 4 ATAAGT 1 0 229843 CASAVA_Build 15 34236737 1D AGTTGGAATC A/- AAGTGTATGA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 3 2 229844 CASAVA_Build 15 34283547 1D AAACTACTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 10 9 229845 CASAVA_Build 15 34323112 2D CAACTTCATC AA/-- AGTCTCAGGA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 3 1 229846 CASAVA_Build 15 34325233 1D ATGTACTGCT A/- AATGTAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 3 2 229847 CASAVA_Build 15 34326874 1D GGTAAACCCT A/- AAAATGCAGC 3070 het 3070 hom 30 13 16 3 A 5 4 229848 CASAVA_Build 15 34343578 3D ACTCATGGGG TTT/--- TTTTACTGGC 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 T 7 4 229849 CASAVA_Build 15 34344399 1I TTTTTAAAAA -/T AATGATGATA 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 T 0 1 229850 CASAVA_Build 15 34355136 2D2M4D AACCTAACGT TAATTGCC/--AT---- ACATCTTTGG 3070 het 3070 hom 37 14 22 5 N/A 0 0 229851 CASAVA_Build 15 34357416 3I ATATATGACA ---/TAT GTTATATCAC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TAT 0 1 229852 CASAVA_Build 15 34360376 1I AGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 12 13 229853 CASAVA_Build 15 34362371 1I TAAATAGCCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 8 9 229854 CASAVA_Build 15 34370867 1I CTACCAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 T 13 14 229855 CASAVA_Build 15 34371402 10D AACCGTCAGA ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AT 14 9 229856 CASAVA_Build 15 34379218 1I AAACCAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 9 10 229857 CASAVA_Build 15 34382758 1D AAATCCTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 10 9 229858 CASAVA_Build 15 34386246 48D TGAATGAATA TATATATATATATACATATATATATATATATGTATATATATATATATG/------------------------------------------------ TATATATATA 956 het 635 hom 8 2 2 7 TATATATATATATACATATATATATATATATGTATATATATATATATG 1 0 229859 CASAVA_Build 15 34386334 3I GATGTGGAAA ---/AAT ATATATATAT 747 het 747 ref 7 2 3 2 AAT 0 1 229860 CASAVA_Build 15 34405366 1I TGTTGTCTGC -/T TTAATAACAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 3 229861 CASAVA_Build 15 34413038 1D GGCAATAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 41 3 A 11 10 229862 CASAVA_Build 15 34416953 4I TAAAATCAGG ----/TTGT TTGTTTACTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TTGT 1 2 229863 CASAVA_Build 15 34421092 3D CAATAATAAT AAC/--- AACAACAACA 1941 het 1941 ref 36 25 7 5 AAC 5 4 229864 CASAVA_Build 15 34432793 1I ACACAAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 9 10 229865 CASAVA_Build 15 34434733 1D GACTTAAAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3025 hom 33 9 20 4 T 10 9 229866 CASAVA_Build 15 34435278 1I CCTTTTTTTG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 T 7 8 229867 CASAVA_Build 15 34446593 1D CCCTACTTCC T/- TTTTTTTTTT 2613 het 1729 hom 30 9 11 10 T 17 16 229868 CASAVA_Build 15 34447973 6D TTACATACAT ATATAC/------ ATATACATAT 1892 het 1892 ref 23 11 4 9 ATATAC 4 3 229869 CASAVA_Build 15 34449305 1D AATGAACAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 T 9 8 229870 CASAVA_Build 15 34458783 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 21 16 10 T 13 12 229871 CASAVA_Build 15 34458858 1D TTTAGAATTG T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 35 21 10 5 T 7 6 229872 CASAVA_Build 15 34458993 1I TATCTTTCCA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 7 8 229873 CASAVA_Build 15 34470800 1D GAAATAATGA T/- TAAAATTTAG 3070 het 3070 ref 35 23 10 3 T 2 1 229874 CASAVA_Build 15 34471987 4D TGAATTAATT AATA/---- AATATTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 AATA 2 1 229875 CASAVA_Build 15 34479624 1D TCAGATAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 429 hom 30 1 25 4 A 10 9 229876 CASAVA_Build 15 34479944 8I GTTGGAATAG --------/AGAGCATA AGAGCATAAT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 AGAGCATA 1 2 229877 CASAVA_Build 15 34482738 1I AGGTTAGGTA -/T TCTTTTTATA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 1 2 229878 CASAVA_Build 15 34486903 6I GTTGTTGTTC ------/TGTTGT TAAAACCACT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 TGT 0 2 229879 CASAVA_Build 15 34486984 1D ATCATGCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 28 1 23 4 A 12 11 229880 CASAVA_Build 15 34488924 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2965 het 2965 ref 30 13 8 9 A 11 12 229881 CASAVA_Build 15 34507250 9D CAAGTAGATT TTTAGCACC/--------- TTGGGTTACC 3070 het 3070 ref 47 21 20 11 TTTAGCACC 1 0 229882 CASAVA_Build 15 34513265 2I AAGGATATAC --/AG AGATTTTCTG 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 AG 1 2 229883 CASAVA_Build 15 34528767 1I AAGTTGGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 A 10 11 229884 CASAVA_Build 15 34529907 1D GTTGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 T 13 12 229885 CASAVA_Build 15 34535129 3D CCCCCCCCCC TCT/--- CTCTCTCTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TCT 1 0 229886 CASAVA_Build 15 34544300 1I CTTCTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 28 2 14 12 T 11 12 229887 CASAVA_Build 15 34544479 1I TGGTTTTTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 72 hom 27 1 20 6 T 8 9 229888 CASAVA_Build 15 34546474 1I TCATTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 876 hom 38 2 29 7 A 12 13 229889 CASAVA_Build 15 34547104 1I TTTTGGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 37 3 26 8 T 13 14 229890 CASAVA_Build 15 34557373 2I TATGTGTATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 104 het 44 0 35 9 TG 7 8 229891 CASAVA_Build 15 34559393 2I TTTCTGAGAC --/AG AGTGTCACTC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 AG 1 2 229892 CASAVA_Build 15 34568972 1I GATGTATAGA -/T AATAGATAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 229893 CASAVA_Build 15 34576596 1D TTTATTTTTT G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 54 het 26 0 22 4 G 9 8 229894 CASAVA_Build 15 34593834 1I CCATAGAAAG -/A AAAAAAAACG 3070 het 2892 hom 33 8 19 6 A 8 9 229895 CASAVA_Build 15 34595008 1D AATTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 18 1 10 7 T 11 10 229896 CASAVA_Build 15 34597756 1I AGAGAAAGGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 7 8 229897 CASAVA_Build 15 34600351 1I TCTCCCCGGG -/A AAAAAAAAAG 2960 het 2960 ref 29 14 8 7 A 9 10 229898 CASAVA_Build 15 34601149 12D GAAAAGAAAG AGAAAGAAAGAA/------------ AGAAAGAAAG 1626 het 1626 ref 31 17 8 8 AGAA 10 7 229899 CASAVA_Build 15 34608143 1I CTCAAAATAA -/G GCTTTAATTT 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 G 1 2 229900 CASAVA_Build 15 34612080 1D TTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1882 hom 31 8 11 12 T 13 12 229901 CASAVA_Build 15 34636792 1D TTGCCATCTT A/- AACAATATTA 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 3 2 229902 CASAVA_Build 15 34639881 3I TGGATCAATG ---/AAT GGTTTTGGAG 3070 hom 117 het 40 0 39 1 AAT 0 1 229903 CASAVA_Build 15 34656121 1I AGCAAGCTGG -/A AGGAGGCTAA 3070 hom 114 het 46 0 38 8 A 1 2 229904 CASAVA_Build 15 34656631 1I GTTTTAGAAG -/A AAAAAAAAAA 1191 het 1191 ref 25 15 3 7 A 12 13 229905 CASAVA_Build 15 34666887 1I TTCTTGAAAT -/C CTCACCTCTC 3070 hom 151 het 52 0 51 1 C 1 2 229906 CASAVA_Build 15 34667768 1D TTTTTAAGAA T/- TGAGGGAGCA 3070 hom 111 het 45 0 38 8 T 2 1 229907 CASAVA_Build 15 34669005 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 33 1 20 12 T 12 11 229908 CASAVA_Build 15 34671572 1D CTAGATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 36 1 27 8 T 11 10 229909 CASAVA_Build 15 34673980 5D TCATGAAAAA TATTT/----- TATTCATGTG 3070 hom 120 het 43 0 41 6 TATTT 1 0 229910 CASAVA_Build 15 34674312 1I GCACTTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 32 1 25 6 T 12 13 229911 CASAVA_Build 15 34675683 1D AAAAAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 27 5 T 12 11 229912 CASAVA_Build 15 34677865 1D CATTGGAAAC A/- AAAGGTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 4 3 229913 CASAVA_Build 15 34682709 1I TCTCTGTGCT -/C CCCCAAATGT 3070 hom 97 het 38 0 33 5 C 4 5 229914 CASAVA_Build 15 34683768 1D GCCACCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 27 0 16 11 T 12 11 229915 CASAVA_Build 15 34700276 1I AAATATTATT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 0 1 229916 CASAVA_Build 15 34713818 6I AGCTATTTGG ------/GAGGCT GAGGCAGGAG 3070 hom 63 het 23 0 20 3 GAGGCT 0 1 229917 CASAVA_Build 15 34716649 1I TTTAACCTCC -/T CAGAGGCACC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 0 1 229918 CASAVA_Build 15 34718873 1I CCAAGGTGGG -/C GGATCACTTG 3070 hom 42 het 15 0 13 2 C 0 1 229919 CASAVA_Build 15 34725463 1I AAAATAGCTC -/T TGTTTTTTTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 2 229920 CASAVA_Build 15 34725997 3D GTTTGATGAT TTA/--- TTCAAAAGTC 3070 hom 120 het 42 0 40 3 TTA 1 0 229921 CASAVA_Build 15 34726160 1D TTTACATGCC A/- AAAAATACAT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 A 6 5 229922 CASAVA_Build 15 34727272 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 7 8 229923 CASAVA_Build 15 34732950 1I AAATTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 699 hom 33 5 21 7 A 14 15 229924 CASAVA_Build 15 34734820 2D TTTTTTTTGC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 71 het 28 0 24 5 T 11 9 229925 CASAVA_Build 15 34749066 1D CACTAAGAAA C/- CCTCACTGGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 3 2 229926 CASAVA_Build 15 34752289 1I TTACTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 33 0 26 7 A 11 12 229927 CASAVA_Build 15 34758610 1I CTAGTTCTTT -/C TCAAGCCCAC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 C 0 1 229928 CASAVA_Build 15 34774065 2I CATTGTGCTT --/TC TCTCTTTTTT 3070 hom 157 het 58 0 53 5 TC 2 3 229929 CASAVA_Build 15 34787047 2I GGGATTTTTA --/TG TGTGCATTTG 3070 hom 126 het 51 0 43 8 TG 2 3 229930 CASAVA_Build 15 34797521 3I AGTTGCTTTC ---/TTA TTATTGAGTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTA 1 2 229931 CASAVA_Build 15 34799560 1I TTTTTATTTG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 7 8 229932 CASAVA_Build 15 34799747 4D TTATTATTTA TTAT/---- TTATTTATTT 1706 hom 12 het 5 0 5 0 TTAT 6 5 229933 CASAVA_Build 15 34800592 1I TCTGTTCATA -/T TCCTTTGCCC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 1 2 229934 CASAVA_Build 15 34802720 7I ACCATTACCA -------/CCACCTC CCATTTTAAA 3070 hom 90 het 33 0 28 5 CCACCTC 0 1 229935 CASAVA_Build 15 34813893 1I ACTTTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 34 1 25 8 T 11 12 229936 CASAVA_Build 15 34815180 5I GACTGTAAGA -----/TAAGT TAAGTGAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAAGT 1 2 229937 CASAVA_Build 15 34823472 1D ATTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3056 hom 30 het 17 0 10 7 T 15 14 229938 CASAVA_Build 15 34827888 1D AGATGTCTCA C/- TTTTCAGTGT 3070 hom 144 het 56 0 49 8 C 1 0 229939 CASAVA_Build 15 34833113 2D CTTTTTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 14 12 229940 CASAVA_Build 15 34833421 3D ATTGGAAGAA GAG/--- GAGGAGCAGG 3070 hom 107 het 43 0 36 8 GAG 3 2 229941 CASAVA_Build 15 34841667 3I GGCTGCCCTT ---/GTG GTGAGCACTC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 GTG 1 2 229942 CASAVA_Build 15 34846669 2I CCCAGCAGTT --/AA AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 28 0 19 9 A 8 10 229943 CASAVA_Build 15 34848043 3D CAAGCCAGAA AAG/--- AAGAAGTTTC 3070 hom 78 het 28 0 25 4 AAG 3 2 229944 CASAVA_Build 15 34855209 1D ACACAGGGAC A/- ATATGCAAGA 3070 hom 129 het 45 0 44 2 A 2 1 229945 CASAVA_Build 15 34862842 1D TTGGAGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 920 hom 27 2 21 4 T 12 11 229946 CASAVA_Build 15 34868205 2I CATTTAAACA --/CT CTGAATAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CT 1 2 229947 CASAVA_Build 15 34878726 4D TTTTAGTACT TAAG/---- TAAGTAAGTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TAAG 3 2 229948 CASAVA_Build 15 34928615 2I TTATGGTTGG --/AC ACAAGGCAGG 3070 hom 84 het 37 0 29 8 AC 1 2 229949 CASAVA_Build 15 34960412 1I TTTGCATTGA -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 6 7 229950 CASAVA_Build 15 34963730 1I TAATGCATGA -/T TTTTTTTTTT 1277 het 1277 ref 36 17 6 13 T 11 12 229951 CASAVA_Build 15 34967672 1D TGTTGGGGCT G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 34 het 28 1 20 7 G 8 7 229952 CASAVA_Build 15 34970567 1D ACTTAACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 35 0 27 9 T 11 10 229953 CASAVA_Build 15 34970902 1D CATTAATAAC T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 68 het 32 0 23 9 T 8 7 229954 CASAVA_Build 15 34974490 1I CAAAGAGGAA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 6 7 229955 CASAVA_Build 15 34987423 1I GCCAATGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 9 10 229956 CASAVA_Build 15 34991670 1I GAGGAATGCC -/A AAAAACAAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 5 6 229957 CASAVA_Build 15 35004985 1D TATTTTTTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 47 14 17 16 T 9 8 229958 CASAVA_Build 15 35010152 2I AGTCATAAGC --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 8 10 229959 CASAVA_Build 15 35015781 1D TCCGCCTCCC G/- GGGTTCACGC 3070 hom 45 het 16 0 15 1 G 4 3 229960 CASAVA_Build 15 35019040 1D GAGGTCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 12 11 229961 CASAVA_Build 15 35046384 1D GCCAGCTAGG A/- AGGCAGGATG 3070 hom 107 het 40 0 36 5 A 2 1 229962 CASAVA_Build 15 35048377 1D GCCTAGCTCA G/- AACTGTATAG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 G 1 0 229963 CASAVA_Build 15 35067956 2I AACCCTTCAG --/AC ACAGCAAAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AC 1 2 229964 CASAVA_Build 15 35070135 1D GTGGGCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 10 9 229965 CASAVA_Build 15 35070749 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 40 1 30 9 T 12 11 229966 CASAVA_Build 15 35070953 1I ACCTACATTA -/T TTGTAGGTGG 3070 hom 110 het 41 0 37 4 T 2 3 229967 CASAVA_Build 15 35071560 1D GATTACAGGC G/- GTGAGCCACC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 2 1 229968 CASAVA_Build 15 35075105 1I TTCATTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 13 3 T 11 12 229969 CASAVA_Build 15 35076983 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3045 hom 38 het 17 0 13 4 T 15 14 229970 CASAVA_Build 15 35077140 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 2498 het 544 hom 12 2 7 3 T 8 9 229971 CASAVA_Build 15 35094339 1D GGTCTAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 668 hom 36 2 19 15 T 15 14 229972 CASAVA_Build 15 35094979 4I ACACACACAA ----/ACAC ACACACTTCT 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 AC 3 5 229973 CASAVA_Build 15 35095827 1D ATTTGCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 678 hom 35 2 27 6 T 12 11 229974 CASAVA_Build 15 35098594 4D ACCTTGTTCA AGAG/---- AGATAGACTG 3070 het 3070 hom 51 17 32 3 AG 3 1 229975 CASAVA_Build 15 35112035 4D AGTTTTTGTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 1364 het 1364 ref 41 33 3 7 TGTT 4 3 229976 CASAVA_Build 15 35117033 1I CATTATCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 17 17 13 A 11 12 229977 CASAVA_Build 15 35126330 4D CGTTTAAAAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 352 hom 18 2 10 7 AT 10 8 229978 CASAVA_Build 15 35128965 6D GGTTTTGTTT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 2591 het 657 hom 18 8 8 5 TTTTTG 4 3 229979 CASAVA_Build 15 35131472 1I TCCAAGTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 928 hom 31 2 24 5 A 10 11 229980 CASAVA_Build 15 35138436 1D TTACAAATAG A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 7 6 229981 CASAVA_Build 15 35139420 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2494 hom 29 het 12 0 10 2 A 11 10 229982 CASAVA_Build 15 35147090 1I ATCAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 9 13 A 15 16 229983 CASAVA_Build 15 35158022 1D CCAGAGTTTT A/- AAAAAATCTA 3070 hom 65 het 27 0 22 6 A 7 6 229984 CASAVA_Build 15 35159038 1I CTTTGGTGGG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 7 8 229985 CASAVA_Build 15 35167093 1D CTTGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 A 11 10 229986 CASAVA_Build 15 35173587 1I ACGTTTGTGA -/T TTTTATAAGC 3070 het 3070 ref 53 28 21 4 T 4 5 229987 CASAVA_Build 15 35195041 5I CTAAGTATAA -----/TTTAC TTTACCATGG 3070 het 3070 ref 56 27 19 10 TTTAC 1 2 229988 CASAVA_Build 15 35198435 1D TCTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 12 11 229989 CASAVA_Build 15 35200037 1I CTTTTTTTTT -/C CCCCCCACAC 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 C 6 7 229990 CASAVA_Build 15 35210006 1D GGTGGTGACT G/- GGGCTGCCGG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 G 4 3 229991 CASAVA_Build 15 35218709 1D GGTCTTAACC A/- AAGCTACAGA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 3 2 229992 CASAVA_Build 15 35234667 3D AAGAGAGAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 868 hom 52 6 23 23 T 13 10 229993 CASAVA_Build 15 35236934 1I TGTATGAAAG -/T TATTCATTTC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 1 2 229994 CASAVA_Build 15 35240326 1D ATGCTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 21 6 A 14 13 229995 CASAVA_Build 15 35252117 1I CTTTTGAAAC -/T TAACATTATA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 T 1 2 229996 CASAVA_Build 15 35257986 5D TTTTTATTTC ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 het 3070 hom 44 18 21 7 ATTTT 3 2 229997 CASAVA_Build 15 35258387 1D ATTGGAAAAA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 7 229998 CASAVA_Build 15 35259701 1I TTTTCTAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 A 8 9 229999 CASAVA_Build 15 35269484 1D GTCAAAGGTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 9 8 230000 CASAVA_Build 15 35271116 3D TTATTCTCTC TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 17 9 TTG 3 2 230001 CASAVA_Build 15 35273870 1I TTAAAAAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 372 hom 39 1 33 5 T 9 10 230002 CASAVA_Build 15 35286039 1D TAAAAAAAAA C/- ATCCATATGT 3070 het 3070 ref 23 9 9 5 C 1 0 230003 CASAVA_Build 15 35295835 2I ATAGCTGATT --/CA CAGTTCCTAT 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 CA 1 2 230004 CASAVA_Build 15 35295967 1I TTCCTGGAAG -/C CTGCAACAAT 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 C 1 2 230005 CASAVA_Build 15 35296758 1I ATCTCTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 T 10 11 230006 CASAVA_Build 15 35312389 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 13 14 230007 CASAVA_Build 15 35312464 1D TTCAAGAAAG A/- TATTCCTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 1 0 230008 CASAVA_Build 15 35321627 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2987 het 691 hom 29 6 10 14 A 13 11 230009 CASAVA_Build 15 35332026 61D AGCTTGTGAG TTTTATAAAAAATCTCTTTTCTTTTCCTTTCTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------------------------------------------------- TTTTTTTTGG 2042 het 2042 ref 18 18 5 4 TTTTATAAAAAATCTCTTTTCTTTTCCTTTCTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 1 0 230010 CASAVA_Build 15 35333767 3I AAATTGATTC ---/TAT TATTATACTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TAT 2 3 230011 CASAVA_Build 15 35342836 1I TATTACATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 9 10 230012 CASAVA_Build 15 35345278 1I CCAAAAATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 9 10 230013 CASAVA_Build 15 35352424 5I CTAAATTCTC -----/ATAAG ATAATATTCT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 ATAAG 0 1 230014 CASAVA_Build 15 35353571 2I GTTACTGGCC --/GG GCGCGGTGGC 2859 het 2770 hom 20 9 7 5 G 1 3 230015 CASAVA_Build 15 35354578 2D CAACATCTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 TG 10 9 230016 CASAVA_Build 15 35355067 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 A 1 0 230017 CASAVA_Build 15 35355675 1D TCACATCAGC A/- AAAGACTGAA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 A 4 3 230018 CASAVA_Build 15 35373269 1I TTAGGCTATT -/A AACAGAATCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 2 3 230019 CASAVA_Build 15 35381789 6D TATTACAGTT AAAAAA/------ AAAAAGGTTA 3070 het 2917 hom 39 15 17 8 A 11 5 230020 CASAVA_Build 15 35382771 5D TTTTGACTTG TTTAC/----- TTTATTATTA 3070 het 1713 hom 22 6 11 5 TTTAC 1 0 230021 CASAVA_Build 15 35391096 1I CTGGGGCAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 A 8 9 230022 CASAVA_Build 15 35405365 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 1067 het 1067 ref 9 4 4 1 A 9 8 230023 CASAVA_Build 15 35405523 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2606 het 707 hom 14 3 7 5 A 17 16 230024 CASAVA_Build 15 35419389 1D CTCGTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 12 11 230025 CASAVA_Build 15 35458038 2I ATTATGACAC --/TT TAAGTTCTAG 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 1 3 230026 CASAVA_Build 15 35467834 1I CTTTTCGGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 A 12 13 230027 CASAVA_Build 15 35477072 3I GCAGTGTTGA ---/GAT GATGGGTTTA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 GAT 1 2 230028 CASAVA_Build 15 35478061 1I ACGTGGTAGG -/T TATGAGGGCT 3070 het 3070 hom 62 26 26 10 T 1 2 230029 CASAVA_Build 15 35486973 4D GTAATTTATC TTGT/---- TTGTCTTGTC 3070 het 3070 ref 24 11 12 2 TTGT 2 1 230030 CASAVA_Build 15 35502359 3I GAATGAATGC ---/TTG TTAAGTTAGT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 TTG 0 1 230031 CASAVA_Build 15 35502719 3D TTCTGATAAT GAG/--- GAGAACATAC 3070 het 3070 ref 66 36 23 8 GAG 2 1 230032 CASAVA_Build 15 35503317 1D TCTTATAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 11 10 230033 CASAVA_Build 15 35505780 4D ATTTTAAATT AATA/---- AATAAATAAT 3070 het 3070 hom 23 9 10 5 AATA 3 2 230034 CASAVA_Build 15 35515209 4I TGCTAGGTAA ----/TAAT TTAATAATTC 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 TAAT 0 1 230035 CASAVA_Build 15 35518316 2I GAGGCAGGAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 AC 7 8 230036 CASAVA_Build 15 35519631 6D AAATGATTAT TTAAAG/------ TTAAATTATT 3070 het 3070 ref 32 13 15 7 TTAAAG 1 0 230037 CASAVA_Build 15 35520135 1D AAGCTGCAAG A/- AAAAGTTTGT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 5 4 230038 CASAVA_Build 15 35520251 2D CTTTAAGTTT TA/-- GAATTGGGCT 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 TA 1 0 230039 CASAVA_Build 15 35525454 1D ATTTTGGGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 T 9 8 230040 CASAVA_Build 15 35533464 1I ATAAATGCCA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 7 8 230041 CASAVA_Build 15 35539095 1I CTGTGTATAA -/T TATCAGTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 1 2 230042 CASAVA_Build 15 35546315 5D TATTTCTGCC TTCAT/----- TTCGTTATGT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 TTCAT 1 0 230043 CASAVA_Build 15 35568484 1D CTTGGTTTTC T/- TTCTCATGTT 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 T 3 2 230044 CASAVA_Build 15 35569312 1I AAAAAAAAAA -/T AAAAAAAAGA 3070 het 178 hom 34 5 16 13 T 0 1 230045 CASAVA_Build 15 35573168 5D GTTTTCCATG TTTCT/----- TTTAATAATC 3070 het 3070 ref 33 20 12 2 TTTCT 1 0 230046 CASAVA_Build 15 35589916 3D GGTTGGTAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 139 hom 33 2 15 16 T 19 16 230047 CASAVA_Build 15 35591179 2D TACTTGATTC AT/-- ATGATTGCTG 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 AT 2 1 230048 CASAVA_Build 15 35593253 1I CTGATTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 10 11 230049 CASAVA_Build 15 35605929 2D TACATATAAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3035 hom 24 9 11 4 TA 7 6 230050 CASAVA_Build 15 35609007 1D AACATATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 27 1 20 6 T 12 11 230051 CASAVA_Build 15 35622105 3I AATCAATATC ---/AAG AAGATTTCTC 3070 het 3070 hom 60 26 28 6 AAG 1 2 230052 CASAVA_Build 15 35622845 1D AAAAAATTCT A/- AAACTTATAT 3070 het 3070 ref 47 28 13 6 A 4 3 230053 CASAVA_Build 15 35626130 3I GAGGTATCAC ---/ATT ATCCAACTTT 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 ATT 0 1 230054 CASAVA_Build 15 35633840 5I TATGTGACTT -----/AAAAA AGAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 42 26 9 7 A 1 6 230055 CASAVA_Build 15 35635351 1D TTCCAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2803 hom 30 9 15 6 A 11 10 230056 CASAVA_Build 15 35640168 1D ACACCCCATT G/- GACAGTATTA 3070 het 3070 hom 49 23 23 4 G 2 1 230057 CASAVA_Build 15 35640871 1I AGATGCAAAT -/A AACAATCAGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 A 2 3 230058 CASAVA_Build 15 35641998 1D AATGAAAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 A 9 8 230059 CASAVA_Build 15 35670703 2D TCCCTACTTC CT/-- CTCTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 13 22 6 CT 3 2 230060 CASAVA_Build 15 35670799 4D TTTTTCTCTC TCCT/---- TGTGTTCATA 3070 het 3070 ref 51 24 22 7 TCCT 1 0 230061 CASAVA_Build 15 35674639 1D GCCCCACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 11 10 230062 CASAVA_Build 15 35675154 1D ACTGCTTTAG T/- TTATAAACAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 3 2 230063 CASAVA_Build 15 35676564 1D GTCAAAGTTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 65 het 32 0 21 11 A 9 8 230064 CASAVA_Build 15 35676830 1I GGACAGAGTG -/T TTTTAGCCTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 4 5 230065 CASAVA_Build 15 35679116 7D22M1D TTCTCTTCTT CTTTTTCTTTCTTCCTTCTTTTTTTATTCT/-------TTTCTTTCTTCTTTTTTTATTC- TTTTTTTGGT 3070 hom 111 het 31 0 38 5 N/A 0 0 230066 CASAVA_Build 15 35680300 1D ATTTCCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 36 1 29 6 T 11 10 230067 CASAVA_Build 15 35685177 1D TTTTTCAAAT A/- AAAAATATTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 6 5 230068 CASAVA_Build 15 35686437 1I ATAGAACCCT -/C CCCCCAAAAA 2616 het 2616 ref 23 14 8 1 C 5 6 230069 CASAVA_Build 15 35703421 1D TTTCTTTTCA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 8 7 230070 CASAVA_Build 15 35703930 1D GACAGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 16 12 4 A 11 10 230071 CASAVA_Build 15 35714528 1I AACATTTTTC -/A AATGGCTAGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 3 230072 CASAVA_Build 15 35723345 9D CTTTGTTCAG TGAGTTTTC/--------- TTTAAGAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 4 TGAGTTTTC 1 0 230073 CASAVA_Build 15 35730160 1I AGACCCCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 A 12 13 230074 CASAVA_Build 15 35731026 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 3070 het 3070 ref 16 7 7 2 A 5 6 230075 CASAVA_Build 15 35731179 1D TTTAAAACCT C/- CCAAAACTTG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 C 3 2 230076 CASAVA_Build 15 35734741 5D AATGAAAAAA ATAAG/----- AGAGAGCGAG 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 ATAAG 1 0 230077 CASAVA_Build 15 35736082 1D ATACAAATAG A/- AAAAAAAAAT 2022 het 2022 ref 24 14 5 5 A 10 9 230078 CASAVA_Build 15 35738622 1I TAGAAAAACG -/T TAAGTGTAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 1 2 230079 CASAVA_Build 15 35747752 1D TGGGAAATGG A/- AAAAAATTTG 3070 het 3070 hom 44 12 28 4 A 7 6 230080 CASAVA_Build 15 35755855 1I CATCTCTTCC -/A AAAAAAAAAG 2456 het 2456 ref 31 19 9 3 A 9 10 230081 CASAVA_Build 15 35764674 1D ACCTTGATAC T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 8 7 230082 CASAVA_Build 15 35769003 1I AACAACAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 9 10 230083 CASAVA_Build 15 35773017 4I TGTGAATCAG ----/GAAT GAATGAATAC 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 GAAT 2 3 230084 CASAVA_Build 15 35773298 4I TTCTAGAGTC ----/CTCT TAGTCCATAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 CT 0 2 230085 CASAVA_Build 15 35773860 2I CAAAAGAGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 T 10 12 230086 CASAVA_Build 15 35791526 1I TTGTTTTATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 10 11 230087 CASAVA_Build 15 35795476 2D CCAGGATGAC AT/-- ATGTTTTAGT 3070 het 3070 hom 49 20 26 3 AT 2 1 230088 CASAVA_Build 15 35803281 1D TCATAGCTAC A/- AGTGTTACAA 3070 hom 84 het 30 0 29 3 A 2 1 230089 CASAVA_Build 15 35816133 1D CTAAGCCCAG A/- AAAAAAAAAA 1561 het 1561 ref 26 12 9 5 A 15 14 230090 CASAVA_Build 15 35819914 11D TCTCATTAAG TCTACTAAGAT/----------- TCTACTAAGA 3070 hom 105 het 39 0 35 7 TCTACTAAGAT 2 1 230091 CASAVA_Build 15 35823211 2D GTTGCATGGG AA/-- AAAAAAAAAA 2453 hom 18 het 11 0 7 4 A 13 11 230092 CASAVA_Build 15 35845571 4D GTGTGCGCGC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 62 het 30 0 14 17 GT 7 5 230093 CASAVA_Build 15 35849447 19D TTTTAACTGC TGCATAGAATATCACAGTA/------------------- TGCATGTACT 3070 het 3070 ref 34 25 11 1 TGCATAGAATATCACAGTA 1 0 230094 CASAVA_Build 15 35850548 5D AAACACTGGC ACCTT/----- ACTTGGGGCA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 ACCTT 1 0 230095 CASAVA_Build 15 35852454 2I AGAATTATGA --/CT CTGCTTACCG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 CT 1 2 230096 CASAVA_Build 15 35853087 4I TCTATGATAA ----/TACT TCACTTTTAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TACT 0 1 230097 CASAVA_Build 15 35857146 2D CTACAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 20 1 11 8 A 16 14 230098 CASAVA_Build 15 35859269 2I TTATTTTAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 10 12 230099 CASAVA_Build 15 35861632 1I TTACCAATGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 7 8 230100 CASAVA_Build 15 35865894 1I TACATTTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 9 10 230101 CASAVA_Build 15 35868592 1D TTGTTTTCTC T/- TTTTATTACT 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 T 5 4 230102 CASAVA_Build 15 35881706 2I TTTCCTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 24 0 16 8 T 14 16 230103 CASAVA_Build 15 35892074 79D TCACCATGGA CTCTTCAGGCCAAAATGGGGTTGCTGTCTCATTTGTAAGGCAGGCAACAACGGTGATCTTAGGTAGACCGGGGAAAAAT/------------------------------------------------------------------------------- GGAAAATCCA 3070 hom 63 het 17 0 21 1 CTCTTCAGGCCAAAATGGGGTTGCTGTCTCATTTGTAAGGCAGGCAACAACGGTGATCTTAGGTAGACCGGGGAAAAAT 1 0 230104 CASAVA_Build 15 35905121 1I ACAGTACAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 9 10 230105 CASAVA_Build 15 35909312 1I CAAAATGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 7 7 A 11 12 230106 CASAVA_Build 15 35910615 4D TTTTTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 45 13 19 14 TTTG 3 2 230107 CASAVA_Build 15 35913069 2I CAAGAATGTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 11 12 A 10 12 230108 CASAVA_Build 15 35920657 1D ATGTAAACGT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 7 6 230109 CASAVA_Build 15 35921501 1I CACTTAATAG -/A CTTTATATTT 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 A 0 1 230110 CASAVA_Build 15 35925020 1I CAGACAATAC -/T TGATATCTTT 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 T 1 2 230111 CASAVA_Build 15 35925205 2D GGACTTATAG TA/-- TATTTATATA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 TA 2 1 230112 CASAVA_Build 15 35925546 1I AGAACTATCA -/C CACTATAAAC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 C 1 2 230113 CASAVA_Build 15 35925773 15D67M7D CTGAAAAGCA AAACTGAGGTTTCCTGGAGAACTTCTGCCTAAAAACTGCAATGTCCACTCCTGTCAAGTTGCTAACCTACCAGCTTGTCCTACAAACTT/---------------GAAGAACTTCTGCTTACAAACTGCAATGTCCACTCCTGTCAAGTTGCTAACCTACCAGCTTGTCCTA------- CAAACTTGCA 3070 het 3070 ref 48 44 25 9 N/A 0 0 230114 CASAVA_Build 15 35926275 1I AATTTCTTCA -/T TTGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 T 2 3 230115 CASAVA_Build 15 35927208 1D CACCTACTGT C/- CCCACTCTAG 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 C 4 3 230116 CASAVA_Build 15 35927940 10D GCATTCTGAT TATAACTCAA/---------- TCCCACAGTT 3070 het 3070 hom 44 23 23 5 TATAACTCAA 1 0 230117 CASAVA_Build 15 35933512 1D GATTTAGTGG A/- AATGTATTGG 3070 het 3070 ref 56 28 21 7 A 3 2 230118 CASAVA_Build 15 35935814 1I CACTTCCTGG -/T TTTTTGTTAT 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 T 5 6 230119 CASAVA_Build 15 35935930 2I TTTGGATACT --/CA CAGAGACCCC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 CA 1 2 230120 CASAVA_Build 15 35945161 6I CAGATATAAC ------/CTTAAG CAGAGTATCT 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 CTTAAG 0 1 230121 CASAVA_Build 15 35948778 6D GAAAGACTGT AGAAAA/------ AAAGTATTTT 3070 het 3070 hom 48 20 22 8 AGAAAA 1 0 230122 CASAVA_Build 15 35949271 1D AGCATTTATC A/- GTGGCCATCT 3070 het 3070 ref 49 24 19 7 A 1 0 230123 CASAVA_Build 15 35949393 5D GTGCCAACTT AACAC/----- AAATGTCTTC 3070 het 3070 hom 45 21 22 3 AACAC 1 0 230124 CASAVA_Build 15 35951052 5D TTAGTACTTA TTTTT/----- ATTTTGCTAC 3070 het 3070 hom 42 18 21 8 T 5 0 230125 CASAVA_Build 15 35951457 1D ATATTTGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 A 10 9 230126 CASAVA_Build 15 36003796 2I TGTGGAAGAC --/AG TGTGGTGATT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AG 0 1 230127 CASAVA_Build 15 36017858 1D TTGAACCACT G/- GAGTGCTGAA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 G 2 1 230128 CASAVA_Build 15 36029763 6D TAATAGAAAA TATAAG/------ TATATTTCAG 3070 hom 72 het 27 0 25 5 TATAAG 1 0 230129 CASAVA_Build 15 36036106 1I CATACCAACC -/A AAAAAAGTCC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 6 7 230130 CASAVA_Build 15 36036948 2I TAATAGACAA --/AC AGAGAGCCAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AC 0 1 230131 CASAVA_Build 15 36045780 1I TGCTTAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 T 11 12 230132 CASAVA_Build 15 36055483 1D CGCCTGTAAT C/- CCCAGCACTT 3070 hom 68 het 25 0 22 4 C 4 3 230133 CASAVA_Build 15 36072867 1I CTAATTTGGG -/T TTTTTTTTTT 1059 het 1059 ref 40 27 3 10 T 11 12 230134 CASAVA_Build 15 36081702 1D GGATAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 1310 het 1310 ref 31 24 3 4 T 12 11 230135 CASAVA_Build 15 36092017 2D AGGAGTAGTC GT/-- GTGTGTGTGT 1958 het 1958 ref 51 26 5 22 GT 10 9 230136 CASAVA_Build 15 36092847 1D AGAAGTCCCT C/- CCCCCCTCTA 3070 hom 114 het 42 0 37 6 C 7 6 230137 CASAVA_Build 15 36098265 2D AGTAATGTTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 11 9 230138 CASAVA_Build 15 36100959 1D GGGTGCATGT G/- GGGGGATTTT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 G 6 5 230139 CASAVA_Build 15 36119268 2I GTTCTTAATG --/TT TTGCATAACA 3070 hom 160 het 59 0 53 6 T 2 4 230140 CASAVA_Build 15 36121498 1I CAGAATATCC -/T TTTTAAAAAA 1359 hom 34 het 42 0 11 31 T 4 5 230141 CASAVA_Build 15 36133585 1D ATTAAAATAA G/- TGATATTTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 1 0 230142 CASAVA_Build 15 36136181 2D TCTCTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 1164 het 1164 ref 43 29 4 10 TC 8 7 230143 CASAVA_Build 15 36136379 1I GCCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 9 10 230144 CASAVA_Build 15 36145274 4I CTCATAATGC ----/CAGG CAGGCTTCAC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 CAGG 1 2 230145 CASAVA_Build 15 36145478 4I CTGAGGACAT ----/GGAC GGACGTACAT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 GGAC 1 2 230146 CASAVA_Build 15 36147599 4D TAGATGATGA TGAT/---- TGATTGATTG 3070 hom 93 het 38 0 32 9 TGAT 4 3 230147 CASAVA_Build 15 36156284 1I ATAATGATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 A 12 13 230148 CASAVA_Build 15 36175270 29D CTTTGCATCC TTCAATTCAATCAAGTTGTTATTACCCAT/----------------------------- TTCAATTCAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 10 TTCAATTCAATCAAGTTGTTATTACCCAT 2 1 230149 CASAVA_Build 15 36187592 1D TCCATTTTTT G/- GGGAAAAAAA 3070 het 1739 hom 32 8 14 10 G 4 3 230150 CASAVA_Build 15 36188633 10D TCAATAAAAA AGGTAATTAT/---------- AGGCATAAGG 3070 het 2647 hom 20 6 14 2 AGGTAATTAT 1 0 230151 CASAVA_Build 15 36197304 1D TCAAATGAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 10 het 48 2 37 9 T 10 9 230152 CASAVA_Build 15 36208920 1I AAATAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 T 10 11 230153 CASAVA_Build 15 36214956 1I AATACTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 11 230154 CASAVA_Build 15 36226696 1D TAACCTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 53 2 32 19 T 13 12 230155 CASAVA_Build 15 36233419 1D TCCACTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 29 2 16 11 T 15 14 230156 CASAVA_Build 15 36234323 1I TTGTAATCCC -/G TCATGTTAAG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 G 0 1 230157 CASAVA_Build 15 36248585 2I TCTTTTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 31 1 21 9 TC 0 1 230158 CASAVA_Build 15 36259320 1D CCAGAATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 36 1 30 5 T 13 12 230159 CASAVA_Build 15 36260630 1I ATGTGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 11 12 230160 CASAVA_Build 15 36265678 1D GGGCTCTGCC T/- TTGCAGCAGC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 3 2 230161 CASAVA_Build 15 36266575 3D ACCTGTACAA AGG/--- AGGATCAGAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AGG 2 1 230162 CASAVA_Build 15 36273662 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 513 hom 13 2 10 1 A 13 12 230163 CASAVA_Build 15 36277987 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 8 9 230164 CASAVA_Build 15 36279296 3I CATCACTACT ---/TTG CCAAGCCCCA 3070 het 3070 hom 61 25 32 4 TTG 0 1 230165 CASAVA_Build 15 36285321 2I TCATGTGCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 AC 8 9 230166 CASAVA_Build 15 36296202 1I TACTTTCTAG -/A AATTCTATTT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 A 2 3 230167 CASAVA_Build 15 36303171 1D GAGGAAAAAA G/- GTGTTGAGGG 3070 het 3070 ref 32 15 12 7 G 2 1 230168 CASAVA_Build 15 36316352 1D TTTTTTCTTC T/- ATTATTATCC 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 1 0 230169 CASAVA_Build 15 36320917 2I TTTTTTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2806 hom 26 9 11 6 T 10 12 230170 CASAVA_Build 15 36335295 1I CCCTTTTCTC -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 T 6 7 230171 CASAVA_Build 15 36335492 1I AGTACATGCT -/C TATTATTTGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 0 1 230172 CASAVA_Build 15 36336724 4D AATATTGTGA TTAT/---- TTACTTATTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 TTAT 1 0 230173 CASAVA_Build 15 36339203 2D TACTAGGTCA CT/-- TATACAAATC 3070 het 3070 ref 47 23 18 8 CT 1 0 230174 CASAVA_Build 15 36344057 1I TGCTAAAATG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 T 8 9 230175 CASAVA_Build 15 36346137 12D CTGTCTCAAA AAACAAACAAAC/------------ AAACAAACAA 3070 het 1344 hom 25 6 12 11 AAAC 8 5 230176 CASAVA_Build 15 36346331 4D AGCCAAAAAG AAAA/---- AAAAAAAATT 3070 het 342 hom 45 4 25 18 A 12 8 230177 CASAVA_Build 15 36346738 1I CATTTTAGTA -/C CTGTAATATT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 1 2 230178 CASAVA_Build 15 36350971 4D AAATAGAGAC AGCT/---- AACATTTATT 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 AGCT 1 0 230179 CASAVA_Build 15 36357402 1D CATGTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 11 10 230180 CASAVA_Build 15 36357500 6I AGGATGTATT ------/AATGGC AATGGCAAGT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 AATGGC 1 2 230181 CASAVA_Build 15 36358261 2D GAAGAATGAC AA/-- AGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 3 1 230182 CASAVA_Build 15 36360022 1I AAATCCATTG -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 T 6 7 230183 CASAVA_Build 15 36366036 2I TACTTATGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 11 13 230184 CASAVA_Build 15 36367359 1D CGAGGAACAA C/- TGTAGCCTAC 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 C 1 0 230185 CASAVA_Build 15 36368723 2I TTTGAAATGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 10 12 230186 CASAVA_Build 15 36368903 1D AGGAAGTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 14 9 T 12 11 230187 CASAVA_Build 15 36375417 3D TCTGCCTTCT TGG/--- TGGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 TGG 2 1 230188 CASAVA_Build 15 36377185 4I TTCCCAGATC ----/CTAT CTGATTTTGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTAT 0 1 230189 CASAVA_Build 15 36381368 2D AGTTTCTTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 T 11 9 230190 CASAVA_Build 15 36382678 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 A 11 12 230191 CASAVA_Build 15 36395105 3D ACCCTGGAAC TTT/--- TTTCAGATGA 3070 het 3070 ref 24 12 7 8 T 6 3 230192 CASAVA_Build 15 36397295 2I TTCTGCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 15 12 T 13 15 230193 CASAVA_Build 15 36398586 3D TAATTTGGTG TTA/--- TTATTATATA 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 TTA 3 2 230194 CASAVA_Build 15 36399981 1I AAAGTTGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 T 9 10 230195 CASAVA_Build 15 36403122 1D TAAGAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 11 10 230196 CASAVA_Build 15 36414385 1D AAAGTACGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 30 14 7 T 12 11 230197 CASAVA_Build 15 36415052 2I GTATAGTATG --/TC TCTCAGTTAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 TC 2 3 230198 CASAVA_Build 15 36418664 4I AAGTGTCTTT ----/AGTG AGTGTCATTT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 AGTG 1 2 230199 CASAVA_Build 15 36429069 7I TTAATAGATA -------/AATTAGT GGTAAAGTTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AATTAGT 0 1 230200 CASAVA_Build 15 36432814 4D GTATATAACA CTAT/---- CTGTCTGTAA 3070 het 3070 ref 45 26 18 1 CTAT 1 0 230201 CASAVA_Build 15 36437962 5D CAAGACTATT ATCTC/----- AACAATAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 22 0 ATCTC 1 0 230202 CASAVA_Build 15 36441872 4D ATCTTTGAAG GACT/---- GACTGTGTGG 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 GACT 2 1 230203 CASAVA_Build 15 36451476 7I TGCTCAAACT -------/AGCTGAC GTAGAGAGTC 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 AGCTGAC 0 1 230204 CASAVA_Build 15 36459457 2D TAGATGCTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 36 1 27 8 T 15 13 230205 CASAVA_Build 15 36461943 1D GAGAAATTAA G/- CTTTATAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 G 1 0 230206 CASAVA_Build 15 36475658 1I AAAAAAACAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 8 9 230207 CASAVA_Build 15 36476536 2D TGTCACTCTT TG/-- GGCTGGGAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TG 1 0 230208 CASAVA_Build 15 36478496 3D AGGTTCAAAA GTC/--- GTTGTCAAAG 3070 hom 84 het 30 0 29 2 GTC 1 0 230209 CASAVA_Build 15 36478717 2I AATTTTTCTC --/CT TTTTTTTTGG 3070 hom 62 het 22 0 21 1 CT 0 1 230210 CASAVA_Build 15 36485459 1D AAGCATTGAT A/- AAAATTTAAC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 5 4 230211 CASAVA_Build 15 36492963 1D TGACCGGGTT A/- AAAAAATGTG 3070 hom 95 het 37 0 32 5 A 7 6 230212 CASAVA_Build 15 36494208 1D AAATAAATTT A/- AAAAAAAAAA 1327 het 1327 ref 33 25 3 5 A 11 10 230213 CASAVA_Build 15 36497236 6D TGTGTATGTG TGTGTA/------ TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 47 23 18 9 TGTGTA 1 0 230214 CASAVA_Build 15 36497439 9D GTTGTTCTTC TTTTTTCTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 1336 hom 32 7 17 9 TTTTTTCTT 1 0 230215 CASAVA_Build 15 36500587 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2781 het 2564 hom 29 9 12 8 T 15 14 230216 CASAVA_Build 15 36501832 1D GAAATCCAGT A/- AAAAAACTTC 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 A 7 6 230217 CASAVA_Build 15 36503506 1I AGCATGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 A 10 11 230218 CASAVA_Build 15 36509452 2D AATATGTATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 39 13 17 12 CA 6 5 230219 CASAVA_Build 15 36518685 2D57M2D TTGGTTGGTA TTTTTTTTTTTCTTTAAGGAGGCTAAAAATAGGCCCCAGTTTTTTTCTGGCTTGCAGGGTT/--TTTTTTTTTCTTTAAGGAGGCTAAAAATAGGCCCCAGTTTTTTTCTGGCTTGCAGGG-- ACTGCTGAGA 3070 het 3070 ref 30 30 11 6 N/A 0 0 230220 CASAVA_Build 15 36528903 1D AGGTTGAAGT G/- GAAGATCTGG 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 G 2 1 230221 CASAVA_Build 15 36532386 8D GTGTGTGGCA CCTCCCTG/-------- CCTCCCTGCA 1420 het 1420 ref 20 10 7 6 CCTCCCTG 2 1 230222 CASAVA_Build 15 36539876 3D CTGCAAGAGG AGA/--- AGGAGTGATG 3070 het 3070 hom 46 19 22 7 AGA 1 0 230223 CASAVA_Build 15 36540674 2D TCTTCAAGAG TT/-- TATGAGTATT 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 T 3 1 230224 CASAVA_Build 15 36549267 1D TGTAGTGCCC T/- TTTTTTTTTT 1632 het 1632 ref 40 26 4 10 T 11 10 230225 CASAVA_Build 15 36560073 1I CTATGCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 10 11 230226 CASAVA_Build 15 36569223 1I CTTCATAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 788 hom 42 2 32 8 T 10 11 230227 CASAVA_Build 15 36583486 1I ACATACCTAT -/A ACAGCAGGTT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 A 1 2 230228 CASAVA_Build 15 36585622 5I TTTTGGACAT -----/ATCTC AGGATGCCCT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 ATCTC 0 1 230229 CASAVA_Build 15 36586831 5I TGTTTGTTTT -----/TTAAA TTAAATTACT 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 TTAAA 1 2 230230 CASAVA_Build 15 36599333 1I TTCGAAGAGG -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 6 7 230231 CASAVA_Build 15 36607160 6I GTATTGCTCT ------/TTAAAG TTATATTAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTAAAG 0 1 230232 CASAVA_Build 15 36607899 1D AAATCTTTTA T/- TTTTCAAAGT 3070 hom 157 het 54 0 53 1 T 5 4 230233 CASAVA_Build 15 36716998 1I ACAGTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 T 12 13 230234 CASAVA_Build 15 36725188 2D TGTTATAAAA AC/-- ACAAAAATAT 2958 het 2958 ref 31 17 9 6 AC 2 1 230235 CASAVA_Build 15 36726152 7I GTTGGCACTG -------/AGCACAC AGGATGTGAA 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 AGCACAC 0 1 230236 CASAVA_Build 15 36736238 2D ATTAGAAGAC AG/-- GGCCTTTTAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 AG 1 0 230237 CASAVA_Build 15 36751829 1I ATTCACTCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 21 15 10 T 9 10 230238 CASAVA_Build 15 36755254 1D AGATATTTAC A/- AGATAAAAAA 2891 het 2891 ref 29 18 6 5 A 2 1 230239 CASAVA_Build 15 36756812 1D CTGCCCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 12 16 T 14 13 230240 CASAVA_Build 15 36770118 1I ACCAAAAAGC -/T TTTTCCTCTC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 4 5 230241 CASAVA_Build 15 36778607 1I TCTGCATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 15 26 9 A 11 12 230242 CASAVA_Build 15 36785414 1I AGTTGGGATA -/C GCATCAGTCA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 C 0 1 230243 CASAVA_Build 15 36787397 7I ACATGCACAC -------/TTTTATA TTTTAGGTAT 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 TTTTATA 0 1 230244 CASAVA_Build 15 36787562 1I GTGCAGGTGG -/T TTTTCAGAGA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 4 5 230245 CASAVA_Build 15 36790146 1I AACTTAAAAT -/G TAGATAAGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 230246 CASAVA_Build 15 36800230 1I AACGCTATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 A 9 10 230247 CASAVA_Build 15 36806626 1D GATTTGTCCC T/- TTTGTTTGCT 3070 hom 92 het 36 0 30 6 T 4 3 230248 CASAVA_Build 15 36808914 1I GAGTTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 19 0 15 4 T 15 16 230249 CASAVA_Build 15 36815186 2D CTTATATAAA AG/-- AGTTAGCTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AG 2 1 230250 CASAVA_Build 15 36818793 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 7 6 230251 CASAVA_Build 15 36820181 1D TTTTTATTTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 80 het 33 0 25 8 A 9 8 230252 CASAVA_Build 15 36820797 1D AGCATCATGA T/- TTATAAGCAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 3 2 230253 CASAVA_Build 15 36823100 1D AGTGACCAAC T/- TTTTAGATTT 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 T 5 4 230254 CASAVA_Build 15 36825014 1D TGGTATAGTT A/- AAAATCTTGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 5 4 230255 CASAVA_Build 15 36825590 1I AGGGTTCTAA -/T TTTCCATCCT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 3 4 230256 CASAVA_Build 15 36827730 2D TCTTTCCTTC TA/-- TAACCCACAG 3070 hom 144 het 54 0 49 7 TA 2 1 230257 CASAVA_Build 15 36836030 1I CAGCACTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 13 14 230258 CASAVA_Build 15 36836383 2I AAACAGAAAC --/TT TTACGGATTA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 T 2 4 230259 CASAVA_Build 15 36848358 3D ATTAGCCTCC TAA/--- TAATGAGACC 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 TAA 2 1 230260 CASAVA_Build 15 36873526 1I AGAAGTGGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 A 9 10 230261 CASAVA_Build 15 36879778 1D TCTGATGGTA G/- TTTGTATTTC 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 G 1 0 230262 CASAVA_Build 15 36883450 1D AATTTTAACA T/- TTTATTTTAT 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 T 4 3 230263 CASAVA_Build 15 36886101 1I ATAAAAAGAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 T 7 8 230264 CASAVA_Build 15 36891157 1I TTCGATTCAG -/A AGAGGGAGGC 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 A 1 2 230265 CASAVA_Build 15 36894267 1I GTATGTATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 13 14 230266 CASAVA_Build 15 36904065 1D GTATTTATCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 A 10 9 230267 CASAVA_Build 15 36921019 3I ACACAAAAAC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 1737 hom 21 6 12 3 T 11 14 230268 CASAVA_Build 15 36939128 6D CTTTGGAAGA CTATCT/------ CTATCTGTTT 3070 het 3070 ref 47 26 20 1 CTATCT 2 1 230269 CASAVA_Build 15 36944225 6D TTAAGTGAAT AAAGCC/------ ACCCAGGTGG 3070 het 3070 ref 35 23 12 1 AAAGCC 1 0 230270 CASAVA_Build 15 36944793 1D ACATAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 11 10 230271 CASAVA_Build 15 36950882 1I CCTTCCCCTT -/C CCCCACACTC 1714 het 1714 ref 21 11 5 5 C 4 5 230272 CASAVA_Build 15 36953910 2D TGACTAAAAC AG/-- GGGAAAGTTT 3070 het 3070 ref 43 22 19 4 AG 1 0 230273 CASAVA_Build 15 36970788 1D CAGGCATTCC T/- TTTTTTTTTT 1859 het 1859 ref 38 22 5 11 T 11 10 230274 CASAVA_Build 15 36978762 1D AGTGATTGAA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 7 6 230275 CASAVA_Build 15 36985590 1D ATAAAAGCCA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 8 7 230276 CASAVA_Build 15 36988314 1D CTACTTTTTT G/- ACATAGATAT 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 G 1 0 230277 CASAVA_Build 15 36991064 1I GGATGGTAGT -/C CTTCCTGCTT 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 C 1 2 230278 CASAVA_Build 15 36991835 1D TCCTTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1437 hom 26 7 11 8 T 15 14 230279 CASAVA_Build 15 36998803 1I GATCAGGTAA -/T TTTTTTTTTT 1692 het 1175 hom 9 4 4 1 T 10 11 230280 CASAVA_Build 15 37006118 1D ATGCCTTTCT C/- CTGCCTCAGC 1715 het 346 hom 7 2 4 2 C 2 1 230281 CASAVA_Build 15 37006828 1I AATTGTTTGC -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 6 7 230282 CASAVA_Build 15 37008239 2D TATAATGAAT CA/-- CATTTATTGG 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 CA 2 1 230283 CASAVA_Build 15 37008840 4I GGATCTTCTC ----/TCTT TATTAGTCAG 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 TCTT 0 1 230284 CASAVA_Build 15 37013463 4I TTACAGATGT ----/TATA TAATCAAATA 3070 het 3070 hom 34 17 16 2 TA 1 3 230285 CASAVA_Build 15 37014705 1I TTTGTAAGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 9 18 8 T 9 10 230286 CASAVA_Build 15 37022771 2I CAATTTAATC --/AT ATGAATAATG 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 AT 1 2 230287 CASAVA_Build 15 37033991 4D TCACAATAAT AAAG/---- AAATAATACG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AAAG 1 0 230288 CASAVA_Build 15 37034646 4I CCTAGTTCAG ----/GAGA GAGAAACTTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GA 2 4 230289 CASAVA_Build 15 37035935 5I TTCACAGGTG -----/TATAA TATGTCAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TATAA 0 1 230290 CASAVA_Build 15 37037873 2D TTCAAAATTG AC/-- ACAAAAAGAA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 AC 2 1 230291 CASAVA_Build 15 37044529 2D TTAGGATTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 37 0 27 10 TG 10 9 230292 CASAVA_Build 15 37048489 2D AATAAATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 29 2 23 4 A 13 11 230293 CASAVA_Build 15 37048920 1I GACAGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1519 hom 41 5 28 8 T 11 12 230294 CASAVA_Build 15 37050135 1D AGGAATTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 29 1 27 1 A 11 10 230295 CASAVA_Build 15 37051459 2D CCCCATAGCT GG/-- GGGGAGGCCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 6 4 230296 CASAVA_Build 15 37052463 1D TCCAAATAGC A/- AAAACTACAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 5 4 230297 CASAVA_Build 15 37052704 5I TAATCAAGTT -----/TTAAG TTAAGTTATC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTAAG 1 2 230298 CASAVA_Build 15 37054111 4D GTCCATGTGT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 CA 7 5 230299 CASAVA_Build 15 37055084 1I CCAGGATTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 357 hom 41 2 31 8 T 9 10 230300 CASAVA_Build 15 37057908 1D GGATTGTTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 64 het 25 0 21 4 T 9 8 230301 CASAVA_Build 15 37059706 1I TGGGTTTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 8 9 230302 CASAVA_Build 15 37059838 1I ATGTTTTATG -/T GCATAGAAAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 0 1 230303 CASAVA_Build 15 37059936 6D TGGATTTTTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 hom 75 het 32 0 26 8 TTG 5 3 230304 CASAVA_Build 15 37062051 4I GAGTCCATTA ----/TCGC TTGCTTGGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TCGC 0 1 230305 CASAVA_Build 15 37077230 3I AATCCAACTC ---/ATT ATGAGGGCAT 3070 hom 117 het 49 0 40 9 ATT 0 1 230306 CASAVA_Build 15 37077481 1D CTTTTATCAT C/- CTGGAGATTT 3070 hom 120 het 46 0 41 6 C 2 1 230307 CASAVA_Build 15 37101940 3I GTAAGATAAG ---/TAT TATTCTTCCC 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 TAT 1 2 230308 CASAVA_Build 15 37105751 1D GCTTATTGGC A/- ACAGAATCTT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 2 1 230309 CASAVA_Build 15 37115472 1I TATATCTCCT -/A ATGCTATCCC 1253 hom 7 het 3 0 3 0 A 1 2 230310 CASAVA_Build 15 37121928 1I AATCAAGGAG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 6 7 230311 CASAVA_Build 15 37125372 1D AGTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 14 0 11 4 A 10 9 230312 CASAVA_Build 15 37127357 6I ATTCTCTTAT ------/AATAAA AATAAAATGC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AATAAA 1 2 230313 CASAVA_Build 15 37129996 9D CTGCCTACAA GAAACTCAC/--------- GAAACTCACT 3070 hom 81 het 30 0 28 6 GAAACTCAC 2 1 230314 CASAVA_Build 15 37141697 4I AAATCTGTAC ----/TAAA TAAATAAATA 3070 hom 72 het 39 0 33 6 TAAA 3 4 230315 CASAVA_Build 15 37143434 1D AATTTTTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 9 230316 CASAVA_Build 15 37144985 1D TGTACCTTTA C/- CATTTATATT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 2 1 230317 CASAVA_Build 15 37148322 1I AGTCTGAATA -/T TTTTCTAAGT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 4 5 230318 CASAVA_Build 15 37148656 3D ATATACAGAT GTA/--- ATAATCAGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 GTA 1 0 230319 CASAVA_Build 15 37150617 1I CCTTCCTTGC -/T ATTGGTCATT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 0 1 230320 CASAVA_Build 15 37151503 1D GCTTCTCCCA T/- TAAAAAAAGC 3070 hom 114 het 47 0 38 10 T 2 1 230321 CASAVA_Build 15 37152001 1D AGGCCTTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 10 9 230322 CASAVA_Build 15 37153277 1D TGATTTCTGA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 82 het 29 0 28 2 T 8 7 230323 CASAVA_Build 15 37154334 1I CTAAGGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 37 2 27 8 A 11 12 230324 CASAVA_Build 15 37155620 1D TGCCTTCCCC G/- ACTGCTTCCC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 1 0 230325 CASAVA_Build 15 37159475 2D GGTTTTCTTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 7 A 11 9 230326 CASAVA_Build 15 37164450 1I AGTTAGTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 900 hom 35 2 28 5 A 10 11 230327 CASAVA_Build 15 37166394 1D GAATGGTGCT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 135 het 50 0 45 6 A 9 8 230328 CASAVA_Build 15 37167486 7D ACTAAGCATG TACTTAT/------- TACTTATAAG 3070 hom 89 het 37 0 30 8 TACTTAT 2 1 230329 CASAVA_Build 15 37268602 5D GTCTGACTCA TTCTT/----- TTCTAAGCCC 3070 het 3070 hom 41 15 24 5 TTCTT 1 0 230330 CASAVA_Build 15 37279851 2D CCAAAGCAGT AG/-- AGTTTGATTC 3070 het 3070 ref 35 16 15 6 AG 2 1 230331 CASAVA_Build 15 37283436 1D CATAAGAACA T/- AAACTTATTT 3070 het 3070 ref 50 26 19 5 T 1 0 230332 CASAVA_Build 15 37284373 1D AAAAAAAAAA C/- CTGGAAGTCA 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 C 2 1 230333 CASAVA_Build 15 37289027 2D TATCCTTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2949 hom 29 10 10 9 TG 11 10 230334 CASAVA_Build 15 37290397 1I ATGACAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 T 10 11 230335 CASAVA_Build 15 37291092 1D GCATTGCATC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 52 21 26 6 A 9 8 230336 CASAVA_Build 15 37291875 32I TTAAGAATAC --------------------------------/AAAATAAATAAAATAAAAGAAATAAAATAATA AGTAAATAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 AAAATAAATAAAATAAAAGAAATAAAATAATA 0 1 230337 CASAVA_Build 15 37292260 1D GAGGCAGGAG A/- AATCGCTTGA 3070 het 3070 ref 18 9 9 0 A 3 2 230338 CASAVA_Build 15 37294743 1D CGGAGTCCAG C/- CCTTACTTTA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 C 3 2 230339 CASAVA_Build 15 37317570 5D TAGTTATACT AATAA/----- AATAATTATT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AATAA 2 1 230340 CASAVA_Build 15 37319179 1I ATATGGGTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 36 1 25 10 T 9 10 230341 CASAVA_Build 15 37327725 3D TCCTTGTCTC CTT/--- CATCTTCCTT 3070 het 3070 hom 47 20 22 6 CTT 1 0 230342 CASAVA_Build 15 37329742 1D GTAATGCAAT A/- AGAATGAAAA 3070 het 3070 hom 49 21 25 5 A 2 1 230343 CASAVA_Build 15 37334918 2I AGGGACTGAT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 356 hom 41 1 33 7 TC 7 8 230344 CASAVA_Build 15 37340914 1I CAAAGGAAAA -/G CTAATGAATT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 0 1 230345 CASAVA_Build 15 37343395 2I AGAATTTAAG --/TA TATATATATA 1776 het 130 hom 16 1 10 5 TA 6 7 230346 CASAVA_Build 15 37346159 2D TGACAGTAAC AT/-- AAAGAATTTG 3070 het 3070 ref 56 32 19 6 AT 1 0 230347 CASAVA_Build 15 37356378 1I AATAAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 12 13 230348 CASAVA_Build 15 37356696 1I AAAATGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 11 12 230349 CASAVA_Build 15 37356924 1D GTACAATAAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 15 18 0 A 9 8 230350 CASAVA_Build 15 37358826 1I ATGCTCAACA -/C TGTGAGTAAT 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 C 0 1 230351 CASAVA_Build 15 37371352 2I GTCATGGATG --/TT TGTTTTACAG 3070 hom 126 het 48 0 40 8 T 1 3 230352 CASAVA_Build 15 37377144 1I GTTTTTGACC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 8 9 230353 CASAVA_Build 15 37379008 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAAAACT 2486 het 1392 hom 27 9 13 5 AG 0 1 230354 CASAVA_Build 15 37383615 1D GGTGCCACTC T/- TGAGTGCAGA 3070 hom 148 het 51 0 50 1 T 2 1 230355 CASAVA_Build 15 37392239 1D AAGCAGCCAT A/- AAAAAAGGAT 2714 het 2714 ref 19 13 6 0 A 7 6 230356 CASAVA_Build 15 37393483 4I GGATAAGGAG ----/CTGA CTGACAGCTA 3070 het 3070 hom 57 23 30 4 CTGA 1 2 230357 CASAVA_Build 15 37394290 2I ATTTTCTACC --/CT CTGTCTATGT 3070 het 3070 hom 37 9 25 3 CT 1 2 230358 CASAVA_Build 15 37395385 7D CAAAAATACA TGATGGT/------- TGATGGTTCG 3070 het 3070 hom 43 17 22 8 TGATGGT 2 1 230359 CASAVA_Build 15 37395756 9D AGTAATTTGT ATGAAGTGA/--------- ATGATTGTCC 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 ATGAAGTGA 1 0 230360 CASAVA_Build 15 37401769 2D AATGTGCCTG CA/-- CAGTGACAGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 8 CA 2 1 230361 CASAVA_Build 15 37407118 1I CTATATCTTC -/T TTTTCAAGTG 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 4 5 230362 CASAVA_Build 15 37409108 1I TAATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 A 10 11 230363 CASAVA_Build 15 37413885 4D CTTGCCTAAC TAAG/---- TAAGCATGCC 3070 hom 94 het 37 0 32 5 TAAG 2 1 230364 CASAVA_Build 15 37419287 4D AGAGGAGACA AGAG/---- AAAGAAAGTA 3070 hom 174 het 63 0 56 10 AG 2 0 230365 CASAVA_Build 15 37422491 1D TTTCTCTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 9 8 230366 CASAVA_Build 15 37423065 1D AAGCTAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 36 1 29 6 T 12 11 230367 CASAVA_Build 15 37432715 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 1584 hom 30 6 17 7 A 7 8 230368 CASAVA_Build 15 37445430 1D TGAGTTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 10 9 230369 CASAVA_Build 15 37445987 1I GGATATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 A 12 13 230370 CASAVA_Build 15 37447865 1D ACAATATGGC A/- AAACCCAGTC 3070 het 1882 hom 19 5 9 5 A 4 3 230371 CASAVA_Build 15 37465071 1I TGAACTTTCG -/T TAAGTTACCT 3070 hom 122 het 48 0 41 7 T 1 2 230372 CASAVA_Build 15 37485062 1D GGAATCCCTG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 7 230373 CASAVA_Build 15 37489976 1D AAAACACAGT A/- CCCCATCTGG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 1 0 230374 CASAVA_Build 15 37492448 5D TGGTTGTGTA GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 hom 148 het 53 0 50 6 GTTTT 4 3 230375 CASAVA_Build 15 37495920 1I TATGATGGAG -/C CAAGATGGGG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 1 2 230376 CASAVA_Build 15 37508477 1D ATCCTAGAGG A/- AAAAAAAAAA 981 het 981 ref 49 39 3 7 A 11 10 230377 CASAVA_Build 15 37510916 5D ACTTCTACAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 720 het 534 hom 38 3 8 27 AAAAG 1 0 230378 CASAVA_Build 15 37511113 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 het 49 hom 29 1 22 6 G 0 1 230379 CASAVA_Build 15 37519232 4I TATATAACTA ----/TAAC TAAAAAAATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAC 0 1 230380 CASAVA_Build 15 37520105 14D CTCTGTCTTT AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 1075 hom 12 het 13 0 6 13 A 30 16 230381 CASAVA_Build 15 37520468 4I AGAAAATAAA ----/ACAC AATACCTCCT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AC 0 2 230382 CASAVA_Build 15 37536247 1I GTGGGAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 27 1 21 5 T 11 12 230383 CASAVA_Build 15 37538940 2D TGGTAGTTTG AT/-- ATAGGAAGAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AT 2 1 230384 CASAVA_Build 15 37546598 6D TGCCTCCTTC CCTGGG/------ CCTGGGCCTG 3070 hom 60 het 24 0 19 5 CCTGGG 3 2 230385 CASAVA_Build 15 37562790 1I GATAAAACGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 35 0 27 8 A 12 13 230386 CASAVA_Build 15 37563525 1I GACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 931 hom 31 2 24 5 A 10 11 230387 CASAVA_Build 15 37564806 3D ACTTGAAGAT GAC/--- TACCTGAATA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 GAC 1 0 230388 CASAVA_Build 15 37571748 1I TTTTCTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 9 10 230389 CASAVA_Build 15 37578936 1D TCTTGTTTGG T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 8 7 230390 CASAVA_Build 15 37581387 1I ACCTGGGGAG -/T TTTTTAATTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 5 6 230391 CASAVA_Build 15 37583468 1D TTGTCAAAAT G/- GAAGTTTAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 2 1 230392 CASAVA_Build 15 37603626 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 21 1 20 0 A 11 12 230393 CASAVA_Build 15 37612745 1I ATAAAAAAGA -/T AAAAAAATTA 2677 hom 21 het 9 0 8 1 T 0 1 230394 CASAVA_Build 15 37661013 1I GTACTTCCCC -/G TGCCCTCCCT 2832 het 2625 hom 17 8 8 1 G 0 1 230395 CASAVA_Build 15 37663355 2I GTATACACAC --/AT GTGCGCATAC 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 AT 0 1 230396 CASAVA_Build 15 37664037 1I TAACAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 10 11 230397 CASAVA_Build 15 37664236 1I GGAACATTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 T 9 10 230398 CASAVA_Build 15 37692908 1I TAAAGAAACA -/G AAAATCTGAA 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 G 0 1 230399 CASAVA_Build 15 37693146 1I ATACCACAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 9 10 230400 CASAVA_Build 15 37693705 1D CAGAAGTGAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 9 8 230401 CASAVA_Build 15 37695466 1I AAAAAAATGG -/T TAAGTGAGGT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 1 2 230402 CASAVA_Build 15 37697987 1I CCAATTCCTT -/A ACTGGGAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 A 1 2 230403 CASAVA_Build 15 37706289 9I TATAAATTAC ---------/CCATCTCAG GTAGTATTTT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 CCATCTCAG 0 1 230404 CASAVA_Build 15 37706467 1D ATCTGGACCC T/- TCCCCCCTCA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 2 1 230405 CASAVA_Build 15 37714533 1D TGCCTTTAGT A/- AAAAAAGCAT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 A 7 6 230406 CASAVA_Build 15 37718310 4I TGTGGGTGCA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 TG 5 7 230407 CASAVA_Build 15 37721165 7D ATGAACTATG AGTCATA/------- GCTTCAAGTC 3070 het 3070 ref 39 23 17 0 AGTCATA 1 0 230408 CASAVA_Build 15 37726557 1D GGTTGTTACC A/- GGGGTGATAG 3070 het 3070 hom 47 19 24 5 A 1 0 230409 CASAVA_Build 15 37727059 1I ACTTGTGCTA -/C CCCTTTCCAC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 C 3 4 230410 CASAVA_Build 15 37727194 1D ATTATCACTT A/- ATAGAATGAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 2 1 230411 CASAVA_Build 15 37727662 2D42M1D AAAGTATAAT AAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAATCTAGTATAAAATTGCTACCA/--AAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAATCTAGTATAAAATTGCTACC- AAAAAAAAAA 2471 het 851 hom 7 4 6 5 N/A 0 0 230412 CASAVA_Build 15 37736955 6D ATTTCTATTG TCTTAA/------ TCTTAAGCAA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 TCTTAA 2 1 230413 CASAVA_Build 15 37742213 1D TAAGTCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2657 hom 30 6 20 4 A 13 12 230414 CASAVA_Build 15 37754286 1D AGTATTTTTT A/- AAGACACAAA 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 3 2 230415 CASAVA_Build 15 37758554 2D ATTCTTCAGC AG/-- AGTTTACTAA 3070 het 3070 hom 29 8 16 6 AG 2 1 230416 CASAVA_Build 15 37771552 1D TACAAAGTCG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 10 9 230417 CASAVA_Build 15 37777685 2I ATATTAATTG --/TA TATATATATA 1996 het 1996 ref 18 11 5 2 TA 6 7 230418 CASAVA_Build 15 37783327 4D AATTATATTG ATCT/---- ATGTAGTCAA 3070 het 2698 hom 21 7 11 5 ATCT 1 0 230419 CASAVA_Build 15 37796764 1I CCATCAATAG -/A AGTATGATAA 3070 hom 81 het 28 0 26 2 A 1 2 230420 CASAVA_Build 15 37797987 1I CAGACAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1796 hom 26 8 14 4 T 15 16 230421 CASAVA_Build 15 37802429 1D TCTCTTGAAG A/- AAAAAAAAAA 1104 het 1104 ref 32 19 3 10 A 12 11 230422 CASAVA_Build 15 37809598 1D GCCTTACCAG A/- AAAAAAAAAA 2583 het 2583 ref 24 11 6 7 A 12 11 230423 CASAVA_Build 15 37812113 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1408 het 715 hom 27 7 6 14 A 22 18 230424 CASAVA_Build 15 37817750 1D ACAGTTCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 A 10 9 230425 CASAVA_Build 15 37826329 1I GGGGGAAGAA -/G GGGGGAACTG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 G 5 6 230426 CASAVA_Build 15 37828917 2D ATAAAATATT AC/-- ACCAAACCAA 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 AC 2 1 230427 CASAVA_Build 15 37832924 1I CCTGTGTGTG -/C CACACACAAA 3070 het 3070 hom 43 10 27 6 C 1 2 230428 CASAVA_Build 15 37833441 10D TATATAAGAC CTATGCATAG/---------- CTAACAGATG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 CTATGCATAG 1 0 230429 CASAVA_Build 15 37854987 1D TATTTTAAGG A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 40 17 15 10 A 8 7 230430 CASAVA_Build 15 37866189 1D TTGTCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2212 hom 36 9 16 11 A 11 10 230431 CASAVA_Build 15 37896173 3I GGAAAGAGTT ---/TTC TTCTAAAATG 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 TTC 1 2 230432 CASAVA_Build 15 37899797 2D GTGATGGATC AT/-- CGAAGGTCAC 3070 hom 160 het 56 0 54 3 AT 1 0 230433 CASAVA_Build 15 37909083 16I CTACTTTCTC ----------------/TGTTATAAAACACTTA TGTTATAAAC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TGTTATAAAACACTTA 0 1 230434 CASAVA_Build 15 37915009 1I AGGAGCTCTG -/C CCCCAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 4 5 230435 CASAVA_Build 15 37923088 3I AGTGTAAGAG ---/ATT ATTACACAGG 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 ATT 1 2 230436 CASAVA_Build 15 37926734 1I AACAGAAAAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 6 7 230437 CASAVA_Build 15 37927192 1I ACCGAGATCA -/C CACCACTGCA 1917 het 909 hom 9 2 5 2 C 1 2 230438 CASAVA_Build 15 37929474 1D CTGAATACTG A/- AAGGCAATTG 3070 hom 87 het 39 0 31 8 A 3 2 230439 CASAVA_Build 15 37937465 1D CTCCTTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1493 het 973 hom 17 6 4 7 A 15 14 230440 CASAVA_Build 15 37939487 1D GGCTTAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 A 12 11 230441 CASAVA_Build 15 37942343 4I AGTGTATCTC ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AT 6 8 230442 CASAVA_Build 15 37946819 1I GGGACCACAG -/A AAAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 52 29 16 7 A 4 5 230443 CASAVA_Build 15 37948498 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2763 het 1437 hom 26 6 8 12 A 15 14 230444 CASAVA_Build 15 37951680 2D AAGTTGTATA AT/-- AGAGAGATAA 3070 het 3070 ref 50 26 22 4 AT 1 0 230445 CASAVA_Build 15 37955414 2I TGTTTAACTC --/AT ATATATATAT 1519 het 1289 hom 11 3 6 2 AT 6 7 230446 CASAVA_Build 15 37959978 1D GCTACCACTC A/- ATTTTGATGA 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 2 1 230447 CASAVA_Build 15 37972589 1D TCTAACTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 10 9 230448 CASAVA_Build 15 38002618 1I TTCCTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 10 11 230449 CASAVA_Build 15 38030244 2D GTTCACACAC AT/-- GTGAGATACG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AT 1 0 230450 CASAVA_Build 15 38045995 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1616 hom 27 6 13 8 A 13 14 230451 CASAVA_Build 15 38051843 1D ACCCTATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 9 13 A 15 14 230452 CASAVA_Build 15 38054740 14I TTGCCTGAGA --------------/TGACACACCTCTAC TAAGGGAGAT 3070 hom 157 het 55 0 53 2 TGACACACCTCTAC 0 1 230453 CASAVA_Build 15 38054822 4D ATACAAAAAA AGAT/---- AATCTGAAAC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AGAT 1 0 230454 CASAVA_Build 15 38056395 1I CCTTTCTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 64 het 30 0 20 10 T 9 10 230455 CASAVA_Build 15 38080329 3D AAGCAGAAAA AAT/--- AATGACCTAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAT 2 1 230456 CASAVA_Build 15 38090123 1I ACAGCACCAG -/A AAGTCTATGG 3070 hom 160 het 66 0 54 12 A 2 3 230457 CASAVA_Build 15 38092156 1D TCAGAACATC T/- TTTTTTTTTT 1301 het 1301 ref 37 27 4 6 T 13 12 230458 CASAVA_Build 15 38100215 1D TGAGTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 1665 het 1665 ref 20 9 5 6 T 16 15 230459 CASAVA_Build 15 38107573 1I TTGCAACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 13 14 230460 CASAVA_Build 15 38115086 3D TTTCATATAC CTG/--- CTGCTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 CTG 2 1 230461 CASAVA_Build 15 38117196 7I CAAGATAACT -------/TGTCGTG CAAGACTTCC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TGTCGTG 0 1 230462 CASAVA_Build 15 38118840 2D CCTGGGTCGT CA/-- CATGCGAGAA 2381 het 2381 ref 26 12 7 8 CA 2 1 230463 CASAVA_Build 15 38120697 3I TTTAAAAAAA ---/TTT TTTTATCTCA 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 T 4 7 230464 CASAVA_Build 15 38129225 2D CCCAACCCTC TT/-- TTCCACTGAA 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 4 2 230465 CASAVA_Build 15 38140797 4D CCATCCATCC GTCT/---- GTCCGTCCGT 3070 het 3070 hom 59 28 22 12 GTCT 1 0 230466 CASAVA_Build 15 38140897 44D CCATCTATCC ATGCATGCATCCATTGTGAGGAAGAAAGGTAGCAGCGGGCATAG/-------------------------------------------- ATGCAGGCAC 2873 het 2873 ref 45 35 9 12 ATGCATGCATCCATTGTGAGGAAGAAAGGTAGCAGCGGGCATAG 1 0 230467 CASAVA_Build 15 38147990 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 9 10 230468 CASAVA_Build 15 38153739 7D GCGGTGAGTG TTATAGC/------- TTATAGCTCA 2342 het 2342 ref 19 11 9 0 TTATAGC 2 1 230469 CASAVA_Build 15 38154724 1I ACAGTGCAGT -/G GGGGGCTGAA 1357 het 960 hom 6 3 3 0 G 5 6 230470 CASAVA_Build 15 38158768 1I AAAATTGCTC -/A AGTAGTACAA 3070 het 3070 hom 47 22 23 2 A 1 2 230471 CASAVA_Build 15 38159513 4D TATGTGTATG TATA/---- TATATATATA 2190 het 1683 hom 11 4 7 1 TA 8 6 230472 CASAVA_Build 15 38159932 1D GTGCTATTGG A/- ACAAGGGGCC 3070 het 3070 ref 62 30 25 8 A 2 1 230473 CASAVA_Build 15 38160696 4D GAAAAAAAAA AAAG/---- AAGAAGAAGA 3070 het 2035 hom 33 11 16 7 AAAG 1 0 230474 CASAVA_Build 15 38160913 1I TGAAAAATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 T 9 10 230475 CASAVA_Build 15 38165238 1I TTGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2488 hom 11 het 24 0 8 16 T 11 12 230476 CASAVA_Build 15 38172773 4I CGGAATGCCC ----/CCGT CCGTCCATCA 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 CCGT 1 2 230477 CASAVA_Build 15 38177957 2I AGGGAGAGGG --/TT AGGGGGTTCG 809 het 809 ref 39 26 3 10 T 0 2 230478 CASAVA_Build 15 38188415 1I TGAGGCCCCG -/C CCCCCCTGCG 552 het 552 ref 7 4 3 0 C 6 7 230479 CASAVA_Build 15 38196624 2D ACTGTCTCTT CA/-- CACAGAGATC 3070 het 3070 hom 42 13 24 6 CA 3 2 230480 CASAVA_Build 15 38201317 1D GTCACCCAAA T/- CCTTTAATTA 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 T 1 0 230481 CASAVA_Build 15 38203467 1I ATGAGACCGT -/G GGCCGGTGTG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 2 3 230482 CASAVA_Build 15 38204286 2I CCCTCTAAGA --/CT CTTGGTGGAG 2087 het 2087 ref 62 52 7 3 CT 1 2 230483 CASAVA_Build 15 38208964 1D GGCGTGTTCA C/- CCCCCGCGAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 C 6 5 230484 CASAVA_Build 15 38210986 1D TCTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 36 2 21 13 T 13 12 230485 CASAVA_Build 15 38217971 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTCTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 13 T 6 7 230486 CASAVA_Build 15 38234659 1D AAGTGCCAGG T/- TGATAAGTAC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 T 2 1 230487 CASAVA_Build 15 38245451 1D TTTTAAGTGA T/- TCTCCCACCT 3070 het 3070 ref 39 17 13 10 T 2 1 230488 CASAVA_Build 15 38246671 1D TTTCTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 1707 het 1707 ref 32 22 6 4 T 13 12 230489 CASAVA_Build 15 38260994 1D TTTAAAATGA T/- TTTTTATACC 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 T 6 5 230490 CASAVA_Build 15 38266624 1I ACAAAACAAA -/T TTTTTTTTTT 1731 hom 20 het 11 0 7 4 T 13 14 230491 CASAVA_Build 15 38283934 1D TTCATTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1074 hom 31 5 13 13 T 13 12 230492 CASAVA_Build 15 38287374 1D TAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 15 1 14 1 A 12 11 230493 CASAVA_Build 15 38299222 1I CAAAAAAAAC -/T TAAGTATCTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 2 230494 CASAVA_Build 15 38305697 1I TAAGTGTTCG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 6 7 230495 CASAVA_Build 15 38306705 3D TTTTTAAAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 25 1 11 13 T 15 12 230496 CASAVA_Build 15 38311058 3D ATATAGGTAA TGT/--- TGTTGGGAAG 3070 hom 116 het 46 0 36 13 TGT 2 1 230497 CASAVA_Build 15 38321536 5D GGTCAGAGGG GCGGA/----- GGCTGTCGAG 2661 het 2661 ref 24 10 8 6 GCGGA 1 0 230498 CASAVA_Build 15 38340389 1I AAAAATTTCA -/T TTTTTTTTTT 2907 het 2248 hom 19 6 8 5 T 11 12 230499 CASAVA_Build 15 38342376 3D AATCTCTCCA AAT/--- TATTAGTGGG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AAT 1 0 230500 CASAVA_Build 15 38346695 1D TGGCATGGGT A/- ATGGAGCCTC 2712 het 2712 ref 32 13 8 11 A 2 1 230501 CASAVA_Build 15 38358059 4D TGGAAAAGCA AAAT/---- ATTTAGAAAA 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 AAAT 1 0 230502 CASAVA_Build 15 38380267 1I TGCATTCCTT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 C 8 9 230503 CASAVA_Build 15 38382166 3D TGTGGCTCTC TCT/--- GGCCCTCCCC 1799 het 1799 ref 40 22 9 9 TCT 1 0 230504 CASAVA_Build 15 38384278 12D TGAATGAGCA AATGAATGAATG/------------ AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 39 23 10 12 AATG 6 3 230505 CASAVA_Build 15 38388884 1I GACCAAGCCT -/C CTGGAAATGG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 C 1 2 230506 CASAVA_Build 15 38397024 1D GAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 42 0 36 7 A 10 9 230507 CASAVA_Build 15 38428039 1D CCCGTCTCCT C/- TTCCAGATCC 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 C 1 0 230508 CASAVA_Build 15 38433436 1D GGGGCGTGAC A/- GGGGCAGAGG 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 A 1 0 230509 CASAVA_Build 15 38433813 1D AAGCTGCTTC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 8 7 230510 CASAVA_Build 15 38434667 2I TTAAAAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 10 12 230511 CASAVA_Build 15 38479493 1I CTAATTCCAG -/C CCACTCTCAA 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 C 2 3 230512 CASAVA_Build 15 38487299 2I GCTCACACAG --/TT TTCTGGTAAA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 2 4 230513 CASAVA_Build 15 38499641 1D TGAGTCCGCA G/- GGGGGGCAGA 3070 het 1818 hom 21 4 12 5 G 7 6 230514 CASAVA_Build 15 38500783 1D AATTAAAAGC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 42 9 25 9 A 8 7 230515 CASAVA_Build 15 38510222 4I CTGCCAGTGC ----/CTTT ACCCCACAGT 3070 het 3070 ref 50 32 16 2 CTTT 0 1 230516 CASAVA_Build 15 38529933 1D TGGTCCATGT A/- ATGTCCTGGT 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 A 2 1 230517 CASAVA_Build 15 38555134 2D ATGCCTGGAC TG/-- TGTCTTCTGG 3070 hom 58 het 23 0 15 8 TG 2 1 230518 CASAVA_Build 15 38559028 3D ATCCAAGCAC CAT/--- CATGGCCAGA 3070 hom 60 het 22 0 19 3 CAT 2 1 230519 CASAVA_Build 15 38581760 3D CTGCTACAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 33 2 15 16 T 19 16 230520 CASAVA_Build 15 38610022 4I CTGGCACCTC ----/CTCT CTCTCTCTCT 3070 hom 80 het 36 0 26 10 CT 7 9 230521 CASAVA_Build 15 38622482 1D GACTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2847 het 255 hom 17 2 8 7 A 15 14 230522 CASAVA_Build 15 38624224 1D CCGGCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 11 10 230523 CASAVA_Build 15 38624964 5I AAAAGAAAAC -----/CTTTA CTTTAGAGCA 3070 hom 108 het 42 0 34 8 CTTTA 1 2 230524 CASAVA_Build 15 38626200 1I TGTTTTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 15 8 T 13 14 230525 CASAVA_Build 15 38633954 2D CACTCAAAAC AG/-- GAGAGGAGAG 3070 hom 96 het 38 0 33 7 AG 1 0 230526 CASAVA_Build 15 38636487 2I TCAAGAACAT --/AA GAGAGACTGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 0 2 230527 CASAVA_Build 15 38637313 6D CTCATGAGAA AGAATT/------ AGAGAAAATG 3070 hom 99 het 35 0 34 4 AGAATT 1 0 230528 CASAVA_Build 15 38638298 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 279 hom 35 2 25 8 T 11 12 230529 CASAVA_Build 15 38643318 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 17 1 11 5 T 12 11 230530 CASAVA_Build 15 38655023 2D CTAACATATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 12 10 230531 CASAVA_Build 15 38655823 2I TCCTACAAAC --/AG TGCACAAGGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AG 0 1 230532 CASAVA_Build 15 38658658 1I ATGAATGGCT -/G GCCCCTGCCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 2 230533 CASAVA_Build 15 38661039 2D AAAAAGCAGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 133 het 61 0 43 20 GT 10 9 230534 CASAVA_Build 15 38663639 1D ATTTTAGGTG T/- TTGCAGTTTT 3070 hom 66 het 28 0 22 8 T 3 2 230535 CASAVA_Build 15 38665744 1I TGGGACCGCA -/G GCACACACCA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 G 1 2 230536 CASAVA_Build 15 38666384 2D GGCCAGGCGC TT/-- GGTGGCTCAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 2 0 230537 CASAVA_Build 15 38683684 52D GATACTATCT CCTATCTCTTCAATTTAAGGATGAGAAAATTGAGAACCAGGAAAATTGAGAA/---------------------------------------------------- CCTATCTCTT 3070 hom 30 het 16 0 11 11 CCTATCTCTTCAATTTAAGGATGAGAAAATTGAGAACCAGGAAAATTGAGAA 1 0 230538 CASAVA_Build 15 38694991 1I CAGGCACGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 45 het 19 0 15 5 G 1 2 230539 CASAVA_Build 15 38716666 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 234 hom 26 2 14 10 T 13 14 230540 CASAVA_Build 15 38727933 1D AATTTAAATA T/- ATTCTCCGAG 3070 hom 75 het 32 0 26 7 T 1 0 230541 CASAVA_Build 15 38729616 1D TCTTTCACAG A/- AAAAAAAAAA 1343 het 1343 ref 37 24 5 8 A 15 14 230542 CASAVA_Build 15 38733363 1D CCGAACGCTG T/- TTTCCCCCAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 4 3 230543 CASAVA_Build 15 38755106 1D ACTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 31 0 23 8 A 15 14 230544 CASAVA_Build 15 38760784 1D TTTCTTCCTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 T 9 8 230545 CASAVA_Build 15 38872668 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGTGCCC 3070 hom 48 het 19 0 15 4 C 1 2 230546 CASAVA_Build 15 38903487 1D CATCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 1775 het 1775 ref 36 18 9 9 A 17 16 230547 CASAVA_Build 15 38907069 1I AATTATAACT -/C CATTTAAAGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 1 2 230548 CASAVA_Build 15 38911189 2D AAGAGCGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CT 2 1 230549 CASAVA_Build 15 38929348 1D GGTCAATAAA C/- TTTTTCTGTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 1 0 230550 CASAVA_Build 15 38937667 1I TCCCGGTGCC -/A AAAAAAAAAA 1688 het 1306 hom 36 10 10 16 A 15 16 230551 CASAVA_Build 15 38939750 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 10 9 230552 CASAVA_Build 15 38942135 2D ATTTTCTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 1847 het 421 hom 30 5 8 18 T 20 18 230553 CASAVA_Build 15 38950336 4D ACACACAGAC ACAG/---- ACAGAGACAG 3070 hom 113 het 43 0 38 5 ACAG 2 1 230554 CASAVA_Build 15 38959036 2I CCCCCACCGC --/AA AAAAAAAGGC 3070 hom 47 het 22 0 15 7 A 7 9 230555 CASAVA_Build 15 38963744 13D GTTTCGAGCT TCTGACCTCGTGA/------------- TCCTCCCGCC 3070 hom 48 het 17 0 16 5 TCTGACCTCGTGA 1 0 230556 CASAVA_Build 15 38993829 8D GACTGTGTGT GTGTGTGA/-------- GAGTGTGTGT 3070 hom 157 het 63 0 51 15 GTGTGTGA 1 0 230557 CASAVA_Build 15 39020826 1I AGCCAGGGTT -/C CCTCTCCTGC 3070 hom 65 het 24 0 18 6 C 2 3 230558 CASAVA_Build 15 39022006 34D GCCCAGGGCC GCTAACTATCTAGCTGCTTATCCTTAACCTCCCT/---------------------------------- GCTAACTATC 3070 hom 73 het 41 0 24 22 GCTAACTATCTAGCTGCTTATCCTTAACCTCCCT 1 0 230559 CASAVA_Build 15 39026439 1D AGCTACTTGA T/- TTCCATGAGA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 3 2 230560 CASAVA_Build 15 39026617 4D AGAAACAAGA AAGT/---- AACTCACATA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AAGT 1 0 230561 CASAVA_Build 15 39026750 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 36 het 19 0 13 7 AC 10 8 230562 CASAVA_Build 15 39031492 1D TTGCTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 29 0 20 10 T 12 11 230563 CASAVA_Build 15 39033530 2I ACCACTGACA --/TC TGTCAGTGTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TC 0 1 230564 CASAVA_Build 15 39034066 1D TTGTCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 57 2 39 16 T 12 11 230565 CASAVA_Build 15 39036941 1I AAAGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 961 het 961 ref 33 24 3 6 A 13 14 230566 CASAVA_Build 15 39043013 1D GAGCACAGTT C/- CGGGGCCCTA 3070 hom 101 het 38 0 31 7 C 2 1 230567 CASAVA_Build 15 39044860 3I GTTGGTGGTG ---/GTT GTGGTTGTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 GTT 0 1 230568 CASAVA_Build 15 39045121 1D CATGTTCCTG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 111 het 40 0 36 4 T 7 6 230569 CASAVA_Build 15 39046438 1I TTTTATGCCC -/T TTTTGTATGT 3070 hom 95 het 37 0 31 6 T 4 5 230570 CASAVA_Build 15 39047971 3I TAAGGACTTG ---/GAA GAAGAACAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 GAA 2 3 230571 CASAVA_Build 15 39050407 2I CTCAGGAGTT --/GA GACCAGCCTG 3070 hom 84 het 31 0 27 4 GA 1 2 230572 CASAVA_Build 15 39054472 1I TGATCTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 570 hom 40 2 30 8 T 13 14 230573 CASAVA_Build 15 39054783 4D TTAAGATCAG TGTT/---- TGGGGGAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 TGTT 1 0 230574 CASAVA_Build 15 39059633 1D GATGCTGCAC G/- GGGCAAGCCA 3070 hom 129 het 47 0 41 6 G 4 3 230575 CASAVA_Build 15 39060666 11D CTCTCCTCAT CCACAGTGGAA/----------- CCACGGGTAC 3070 hom 114 het 39 0 39 6 CCACAGTGGAA 1 0 230576 CASAVA_Build 15 39068505 1D CCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2190 hom 26 het 15 0 8 7 A 15 14 230577 CASAVA_Build 15 39083793 2D GAGGACACTC TA/-- TGTTGAATTG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 TA 1 0 230578 CASAVA_Build 15 39085004 1D CCTGGCATTT A/- AAAAAAAAAA 2380 het 2380 ref 41 28 6 7 A 15 14 230579 CASAVA_Build 15 39100131 1I TATTTCTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 37 0 31 6 T 11 12 230580 CASAVA_Build 15 39102884 2I TTAAAAAGTA --/AT AGTCTAGACT 3070 hom 60 het 30 0 20 10 AT 0 1 230581 CASAVA_Build 15 39124187 1I ACAGTATTGT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 91 het 36 0 31 5 A 8 9 230582 CASAVA_Build 15 39125394 1D TCATCTCGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 25 0 11 14 A 12 11 230583 CASAVA_Build 15 39156709 1D GTTTGCTTTA T/- TTTTTTTTTT 1352 het 1352 ref 25 18 3 4 T 13 12 230584 CASAVA_Build 15 39185874 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2393 het 956 hom 29 6 7 16 A 18 17 230585 CASAVA_Build 15 39204420 15D AATGGAACAT TTAAAATTGCAAACA/--------------- CTGTTTGCAA 3070 hom 60 het 20 0 21 0 TTAAAATTGCAAACA 1 0 230586 CASAVA_Build 15 39243359 4D CAATTAACTC AGTT/---- AGAAAGAACA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AGTT 1 0 230587 CASAVA_Build 15 39246868 1D ATAAAAAAAA T/- AAAAAATAAA 1486 het 1486 ref 22 9 4 10 T 1 0 230588 CASAVA_Build 15 39247700 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 27 1 20 6 A 14 12 230589 CASAVA_Build 15 39254546 11D AAGGATTGGT ATTTTTTGGTA/----------- ATTTTTTGTA 3070 hom 51 het 21 0 18 7 ATTTTTTGGTA 1 0 230590 CASAVA_Build 15 39264754 1I CATATACATA -/T TTTTTTCATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 6 7 230591 CASAVA_Build 15 39270924 1I GACATCCTTT -/A ACACCCACCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 2 230592 CASAVA_Build 15 39289269 1I CTTCTGATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 9 10 230593 CASAVA_Build 15 39297020 1D AGGGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1196 het 932 hom 32 12 5 15 T 19 18 230594 CASAVA_Build 15 39364454 4D TTGTTGTAAC CTTA/---- CCCTCATCCG 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 CTTA 1 0 230595 CASAVA_Build 15 39365007 1I GGGCAGGGGT -/G GGGGGTCACA 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 G 5 6 230596 CASAVA_Build 15 39370900 1I CGCAGAAGTC -/A ACTCACTGTC 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 1 2 230597 CASAVA_Build 15 39372378 1I TCCACATAAA -/T TTTTTTTTTT 2784 het 1513 hom 20 6 7 7 T 13 14 230598 CASAVA_Build 15 39374202 5I TTTGTTGTTG -----/TTTGT TTTGAGACAG 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 TTTGT 0 1 230599 CASAVA_Build 15 39376826 2I TGCCAGCTAC --/TT TTGGGAGGCT 2915 het 1932 hom 13 4 6 3 T 2 4 230600 CASAVA_Build 15 39377591 1I TTACTTTCCC -/T GTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 0 1 230601 CASAVA_Build 15 39378607 4D ATGTTTGATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 32 11 15 9 TTTA 5 4 230602 CASAVA_Build 15 39395628 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2865 het 2865 ref 29 20 8 1 A 11 10 230603 CASAVA_Build 15 39403202 4I CTCAAGCAAT ----/CCTC CCTCCCACTT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 CCTC 1 2 230604 CASAVA_Build 15 39414195 2D TCTGCCTGGC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 76 het 34 0 26 8 TG 8 7 230605 CASAVA_Build 15 39414763 4I GTATATACTA ----/TATT TATATATTAT 2196 het 2196 ref 11 5 5 1 TATT 0 1 230606 CASAVA_Build 15 39417422 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1472 het 501 hom 16 3 8 5 T 19 18 230607 CASAVA_Build 15 39437215 1D ATTACAGGTG T/- TGAGCCACCA 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 T 2 1 230608 CASAVA_Build 15 39469282 4D TTTAATGAAC ATAA/---- ATAAAAATGA 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 ATAA 2 1 230609 CASAVA_Build 15 39482722 1D TCGCCCCACA C/- GGTCGCCAGT 1944 het 1944 ref 23 8 7 8 C 1 0 230610 CASAVA_Build 15 39514115 1D TACTAATGTC T/- TTTTTTTTTT 2848 het 1100 hom 36 7 11 18 T 15 14 230611 CASAVA_Build 15 39514469 1D TTTTTTTTTT G/- AGATGGAGTC 979 het 472 hom 15 2 7 6 G 1 0 230612 CASAVA_Build 15 39526060 5I AAAAAAAAAA -----/TTACT TTATTTTCAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 TTACT 0 1 230613 CASAVA_Build 15 39537389 1D TCGTCGTTGT C/- CCCCCCCCGC 3070 het 2245 hom 34 10 11 13 C 9 8 230614 CASAVA_Build 15 39539608 4D TGTTTTTGTT TTTG/---- TTTTTTTTTT 2637 het 2061 hom 19 8 7 5 TTTG 1 0 230615 CASAVA_Build 15 39562383 1D ATTCTGATCC A/- CCATGTAGAT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 A 1 0 230616 CASAVA_Build 15 39569622 4D CAGCCTGGCC CATT/---- AATGTAGTGA 1663 het 1663 ref 15 8 5 2 CATT 1 0 230617 CASAVA_Build 15 39589986 2D AATTTCCCTC TT/-- GTCGCCCAGG 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 T 2 0 230618 CASAVA_Build 15 39594535 6D TGGTAAAGTC TGAGTA/------ TAATTCAAGG 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 TGAGTA 1 0 230619 CASAVA_Build 15 39600968 9I ACTCAGTAGC ---------/GGATGGCTA GGATGGCTAT 3070 het 3070 hom 51 16 27 8 GGATGGCTA 1 2 230620 CASAVA_Build 15 39618020 2I AAGAAAAAAC --/AT AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 0 1 230621 CASAVA_Build 15 39618385 3D AAAAGAAAGA AAG/--- AAGCTAGCCA 3070 het 3070 hom 50 24 24 3 AAG 2 1 230622 CASAVA_Build 15 39619795 1I GTTACTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 681 hom 30 3 22 5 T 14 15 230623 CASAVA_Build 15 39634331 1D GCTGGCCCTT C/- CTCTCACTCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 2 1 230624 CASAVA_Build 15 39637154 1D TATGCCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 A 13 12 230625 CASAVA_Build 15 39656323 1D TGCTTATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 T 11 10 230626 CASAVA_Build 15 39661395 1I TTTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2187 het 2134 hom 20 7 5 8 A 11 12 230627 CASAVA_Build 15 39699002 8D GCAAACAAAC AAACAAAA/-------- AAACAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 17 5 AAACAAAA 3 2 230628 CASAVA_Build 15 39712274 1D GGAGATAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 36 1 25 10 A 12 11 230629 CASAVA_Build 15 39727245 1I AAGGTTCACC -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 6 7 230630 CASAVA_Build 15 39733569 3I GCTAATATCC ---/TCT TCTTCTGTAT 3070 hom 101 het 41 0 31 10 TCT 2 3 230631 CASAVA_Build 15 39742303 12D GTGAAGGATC ATATTAAGGAAT/------------ ATACTAACAT 3070 het 3070 ref 35 22 12 4 ATATTAAGGAAT 1 0 230632 CASAVA_Build 15 39744419 2I ACATTTTATC --/TG TCTTTTAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TG 0 1 230633 CASAVA_Build 15 39752357 6D CATGCGTGTG CACACA/------ CACACACACA 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 CA 12 9 230634 CASAVA_Build 15 39768221 1D CTCTTTGTAA T/- TTTTTTAGTG 3070 hom 80 het 31 0 21 10 T 7 6 230635 CASAVA_Build 15 39778684 1D TTTTGTTTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 T 7 6 230636 CASAVA_Build 15 39778984 2I CTTTTGTTTA --/TG TGTGTGTGTG 3004 het 1880 hom 26 7 10 9 TG 8 9 230637 CASAVA_Build 15 39781813 1D ACATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 23 0 16 7 A 16 15 230638 CASAVA_Build 15 39782428 1D AGAATACCTA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 95 het 37 0 31 6 T 8 7 230639 CASAVA_Build 15 39786076 1I TTTTTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 859 hom 28 2 17 9 T 13 14 230640 CASAVA_Build 15 39796642 5I TTTCTGCCTT -----/GTAAG GTACAATTTC 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 GTAAG 0 1 230641 CASAVA_Build 15 39797741 4D CTCACTATAT ATAG/---- ATAGATATCT 1940 het 1940 ref 12 6 5 2 ATAG 2 1 230642 CASAVA_Build 15 39805288 2D3M6D26M29D TCCCGCCACT GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAATAA/--ACT------TGGGCAACAGAGTGAGACTTGTACTC----------------------------- ATAAATAAAT 1716 hom 10 het 3 0 4 1 N/A 0 0 230643 CASAVA_Build 15 39825262 1I ACCTGGTTAA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 1991 hom 23 9 10 4 T 7 8 230644 CASAVA_Build 15 39840226 1D GAAAGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 28 5 T 13 12 230645 CASAVA_Build 15 39848380 3I GGTGGAAGAA ---/CTT CTTCTGAAAA 3070 hom 132 het 50 0 43 7 CTT 1 2 230646 CASAVA_Build 15 39852563 2D AATCGTATTT TC/-- TGTTTCATAA 3070 het 3070 hom 51 22 26 5 TC 1 0 230647 CASAVA_Build 15 39860557 1D TTTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 822 hom 31 2 23 6 T 12 11 230648 CASAVA_Build 15 39868783 1D ACTTTAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 34 1 29 4 A 11 10 230649 CASAVA_Build 15 39870745 2D CAACAAAAAC AG/-- ATCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 24 10 8 AG 1 0 230650 CASAVA_Build 15 39917616 1I GGACCTCTTT -/G GCCCAGGACC 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 G 1 2 230651 CASAVA_Build 15 39924329 1D TGGCTTTGGC T/- TTTCCCAGGG 3023 het 1123 hom 17 4 8 6 T 4 3 230652 CASAVA_Build 15 39926683 1D GTGTGGAGAG T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 64 het 26 0 19 7 T 7 6 230653 CASAVA_Build 15 39930438 2I GCCTGGCACC --/CA CACAGTCACA 2310 het 2310 ref 18 9 7 2 CA 2 3 230654 CASAVA_Build 15 39938679 2D GACAGAGTCT CA/-- CTCTGTCACC 3070 het 1939 hom 19 5 13 1 CA 1 0 230655 CASAVA_Build 15 39943850 3D TCTGTTGCAC TGT/--- TGTTGTAGTG 3070 het 3030 hom 34 11 16 8 TGT 3 2 230656 CASAVA_Build 15 39971040 1D TCACCGTGAT G/- GGGGGTATTA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 6 5 230657 CASAVA_Build 15 39978557 1I CAGGTGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 10 11 230658 CASAVA_Build 15 39993953 10I AGGGCAGCTG ----------/ACGTGTTCCC ACTTGAGCAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 ACGTGTTCCC 0 1 230659 CASAVA_Build 15 40021073 1I TTTTTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 1831 het 1831 ref 26 14 8 4 T 11 12 230660 CASAVA_Build 15 40021738 4D CGGTTTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1070 hom 26 6 16 5 T 17 13 230661 CASAVA_Build 15 40021908 1I CTAATTTTTG -/T TATTTTTAGT 3070 het 1369 hom 17 4 11 3 T 1 2 230662 CASAVA_Build 15 40022308 13I ACCTCCCATT -------------/GTTTACCCCACTC GTTTACCCCA 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 GTTTACCCCACTC 1 2 230663 CASAVA_Build 15 40027509 1D CACTTTGGGA G/- GCCAAGGCAG 3070 het 1689 hom 18 4 11 3 G 2 1 230664 CASAVA_Build 15 40035808 3D AAGCCTGGCC AGG/--- AGGAGGCCCT 2771 het 2771 ref 36 20 8 9 AGG 3 2 230665 CASAVA_Build 15 40037598 8I AATAACAACA --------/GGATTGTT ATTCAAAGGA 3070 het 3070 hom 47 17 25 6 GGATTGTT 0 1 230666 CASAVA_Build 15 40038886 19D ACTTTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAG 3070 het 630 hom 15 2 13 4 A 28 9 230667 CASAVA_Build 15 40049035 2I AAACTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 A 12 14 230668 CASAVA_Build 15 40073794 1I TCTGCCCCCC -/G GGGGGGGTGT 3070 hom 64 het 27 0 19 8 G 7 8 230669 CASAVA_Build 15 40083353 4D CGGGGGTTGC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 74 het 33 0 20 14 CTTT 4 3 230670 CASAVA_Build 15 40083909 4I GAAGGAAGGA ----/AGGC AGGCAGGCAG 3070 hom 58 het 23 0 19 4 AGGC 3 4 230671 CASAVA_Build 15 40093145 3I CCGGTAAGCA ---/GAG GAGAAGGAGA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 GAG 1 2 230672 CASAVA_Build 15 40106463 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 525 hom 29 2 21 6 A 13 14 230673 CASAVA_Build 15 40120811 1I GGGTAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 9 10 230674 CASAVA_Build 15 40121550 2I TATCAATGAC --/AT ATTTTCTAGG 3070 het 3070 hom 65 26 32 7 AT 1 2 230675 CASAVA_Build 15 40121876 4D TTATTTTCTC TATT/---- ACATTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 14 12 3 TATT 1 0 230676 CASAVA_Build 15 40122148 1I TAGCTTGAGG -/A TGGGGTCAGG 3070 het 1656 hom 21 6 14 1 A 0 1 230677 CASAVA_Build 15 40124275 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 883 hom 18 2 11 5 A 10 11 230678 CASAVA_Build 15 40125443 1I CCCCAACCAA -/T TTCTATCCTA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 2 3 230679 CASAVA_Build 15 40133932 1D AGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 83 hom 39 2 29 8 T 10 9 230680 CASAVA_Build 15 40135315 1D TAACAAATAC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 A 7 6 230681 CASAVA_Build 15 40138247 1D AAAAGAAAAT A/- AATATGTATA 3070 het 3070 ref 21 11 10 0 A 3 2 230682 CASAVA_Build 15 40141145 1I GACCCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2608 hom 33 8 14 11 A 11 12 230683 CASAVA_Build 15 40145923 16D GTCTCAGTAA GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 34 14 10 12 GT 16 8 230684 CASAVA_Build 15 40171086 1I CCCTTTCCCC -/G GGGGGAGTTA 3070 het 941 hom 32 5 13 14 G 5 6 230685 CASAVA_Build 15 40200978 3I ACAATCAGCA ---/GTG GTGTCAGTAG 3070 het 3070 ref 68 32 24 12 GTG 1 2 230686 CASAVA_Build 15 40201689 1I CACAAGATGC -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 0 1 230687 CASAVA_Build 15 40201757 1D TGTTGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1565 hom 24 7 9 8 A 15 14 230688 CASAVA_Build 15 40204870 1D TTTTTTTTTT G/- CATGTGGATG 3070 het 1221 hom 43 10 19 15 G 1 0 230689 CASAVA_Build 15 40211754 1D GTAGACACCT C/- CCCCCAGGCC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 C 6 5 230690 CASAVA_Build 15 40214253 1I GATTTTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 10 11 9 T 9 10 230691 CASAVA_Build 15 40234550 1D ACTGTCATGT A/- TACAGACACA 3070 het 3070 ref 85 47 32 6 A 1 0 230692 CASAVA_Build 15 40300125 2I CAGGTAATTT --/AA AATTTCAGTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 2 4 230693 CASAVA_Build 15 40304792 1I AATGCAAATG -/A GGGGGGGGGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 0 1 230694 CASAVA_Build 15 40310634 1I AAACCCATCT -/C CAAGGGGAGA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 C 1 2 230695 CASAVA_Build 15 40317185 1I CAATATATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 515 hom 26 2 14 10 T 15 16 230696 CASAVA_Build 15 40322013 1I GAGGGGGAGA -/G GGGACAGGGA 3070 hom 92 het 40 0 31 9 G 3 4 230697 CASAVA_Build 15 40326547 1D ATGATGAGCA T/- TTTTTTCATG 3070 hom 32 het 12 0 11 1 T 7 6 230698 CASAVA_Build 15 40339502 4I TTCTGGAATT ----/AGAC AGCGATTGGT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AGAC 0 1 230699 CASAVA_Build 15 40340511 1D ATTAAAAAAA T/- AATAATAATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 0 230700 CASAVA_Build 15 40355072 1I GCCGGTGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 9 10 230701 CASAVA_Build 15 40360927 1D TAATCCCAGC A/- CTTTGGGAGG 3070 hom 78 het 32 0 25 7 A 1 0 230702 CASAVA_Build 15 40371868 1I TTACTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 35 1 24 10 T 11 12 230703 CASAVA_Build 15 40377327 8D TCATTCATTT ATTCATTC/-------- ATTCATTCAT 3070 hom 114 het 38 0 39 1 ATTC 6 4 230704 CASAVA_Build 15 40384539 1I CATAAGAAAT -/G GGAAAAGACT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 G 2 3 230705 CASAVA_Build 15 40392739 5I37M2D ACAAAAAAAT -----AAAATGGTTCAACTATATAAGAGCTAAAACCATAAGACT/AACTCAAAATGGTTCAACTATATAAGAGCTAAAACCATAAGA-- CTCAGAAGAA 3070 hom 105 het 30 0 36 11 N/A 0 0 230706 CASAVA_Build 15 40394749 4D TAGAAATGGA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 87 het 37 0 30 9 AAAT 4 3 230707 CASAVA_Build 15 40396794 4I AAATGAAATA ----/GGAC AGACACGAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GGAC 0 1 230708 CASAVA_Build 15 40397161 6I TAAAGCTGTT ------/AAAAAC AAAAGTATTG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 AAAAAC 0 1 230709 CASAVA_Build 15 40398835 5I GATGAGCCTC -----/TTAAG TTTTTTGTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTAAG 0 1 230710 CASAVA_Build 15 40399006 4D GCTAATTCTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 36 het 13 0 13 2 TTTA 3 2 230711 CASAVA_Build 15 40399698 1D AATTAATTTT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 8 7 230712 CASAVA_Build 15 40403010 1I ATTTTTTTTT -/G GGGGACAGAG 3070 hom 46 het 17 0 15 2 G 4 5 230713 CASAVA_Build 15 40413656 1D GAATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 26 0 17 9 T 14 13 230714 CASAVA_Build 15 40414247 1I TGGTTTTCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 10 230715 CASAVA_Build 15 40470281 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1523 het 1523 ref 26 17 4 5 T 17 16 230716 CASAVA_Build 15 40490502 1D TAAGTGGGAG A/- GGGGGGCTGC 3070 hom 90 het 38 0 26 12 A 1 0 230717 CASAVA_Build 15 40495112 1D GTGCACTAAC A/- GGGGCGAAGA 3070 hom 72 het 28 0 24 5 A 1 0 230718 CASAVA_Build 15 40520136 1I CCATAAATAT -/A ATACACCTAC 3070 hom 44 het 25 0 22 3 A 1 2 230719 CASAVA_Build 15 40524066 15I AGGGAGAACA ---------------/CCCCTTTCTTGCTGT CCCTTGTGGG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CCCCTTTCTTGCTGT 0 1 230720 CASAVA_Build 15 40564229 4I CTCTGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AAAC 2 3 230721 CASAVA_Build 15 40566279 2I GAGGACTTGT --/TA TATATATATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TA 6 7 230722 CASAVA_Build 15 40579633 1D ATCAGCTGCC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 T 9 8 230723 CASAVA_Build 15 40598234 6I TAAAAAACTC ------/TGAAAG CTAAAGTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TGAAAG 0 1 230724 CASAVA_Build 15 40615648 5D CACAGATCAC CATAA/----- CATATCATAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CATAA 1 0 230725 CASAVA_Build 15 40632970 1I TACTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 42 1 37 4 T 11 12 230726 CASAVA_Build 15 40637299 1I AAGGCGAAAA -/G TATTTGATTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 0 1 230727 CASAVA_Build 15 40650169 4D TTTTTCTTAT TTTC/---- TTTCTTTCTC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TTTC 3 2 230728 CASAVA_Build 15 40651115 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 17 1 12 4 A 13 12 230729 CASAVA_Build 15 40651260 2I TTATGAAAAC --/AT ACAGACTGTA 3070 hom 47 het 21 0 15 6 AT 0 1 230730 CASAVA_Build 15 40658116 1D TATAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 18 12 10 T 15 14 230731 CASAVA_Build 15 40683357 1D ATCTTTGGTT C/- AAAGAACCAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 C 1 0 230732 CASAVA_Build 15 40686121 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2618 het 2512 hom 24 8 8 9 T 15 16 230733 CASAVA_Build 15 40778513 1I CTTGTTTATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 230734 CASAVA_Build 15 40852525 1D CAACTTGCTA T/- CCCTGAAATA 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 T 1 0 230735 CASAVA_Build 15 40864606 4D CACTTGCAGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1809 het 52 hom 22 2 7 14 T 22 18 230736 CASAVA_Build 15 40865624 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 5 A 13 12 230737 CASAVA_Build 15 40868794 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 687 hom 33 2 24 7 TA 7 8 230738 CASAVA_Build 15 40954467 2I CAGTGTGAGA --/CT CTGCCTCAAA 3070 hom 59 het 25 0 20 5 CT 1 2 230739 CASAVA_Build 15 40998774 1D TTCTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 11 10 230740 CASAVA_Build 15 41025098 1D7M10D AAAAGGGATA TTTTCCCTTCACCATTGA/-TTTCCCT---------- TCACTAAGAA 3070 hom 146 het 48 0 48 6 N/A 0 0 230741 CASAVA_Build 15 41029091 1I GAATTCCAGA -/C CCAGCCTGGC 2194 hom 17 het 8 0 6 2 C 2 3 230742 CASAVA_Build 15 41041624 1I AATTATTTTT -/C CTTCTCTTAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 1 2 230743 CASAVA_Build 15 41047875 1D CCTTAACAGA T/- TTTTTTTTTT 1432 het 1432 ref 28 18 6 4 T 17 16 230744 CASAVA_Build 15 41050217 1D GGTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1844 het 1844 ref 33 18 4 12 T 13 12 230745 CASAVA_Build 15 41053107 4I TTAAATTGGG ----/TTGT TTGTTTTCTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TTGT 1 2 230746 CASAVA_Build 15 41054934 1I ATTGTTTCTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 140 het 52 0 47 5 T 8 9 230747 CASAVA_Build 15 41056080 4I TAAAAAACAG ----/ATAA ATAATCATTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATAA 1 2 230748 CASAVA_Build 15 41143209 1D AATGCCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 17 0 11 7 T 12 11 230749 CASAVA_Build 15 41148772 1D GTGTTCAGTA T/- TTTTTTTTTT 1755 het 1755 ref 24 14 5 5 T 15 14 230750 CASAVA_Build 15 41162867 1I AGGATTATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 9 10 230751 CASAVA_Build 15 41165928 1D CCAGTATCTG A/- AAAAAAAAAA 3035 het 1546 hom 39 9 11 20 A 19 18 230752 CASAVA_Build 15 41175665 1D AATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1432 het 1432 ref 44 27 4 13 T 15 14 230753 CASAVA_Build 15 41178823 1D CCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 A 11 10 230754 CASAVA_Build 15 41186933 1I GAAATAGGTC -/A GGGGCAGTGG 2787 hom 30 het 15 0 10 5 A 0 1 230755 CASAVA_Build 15 41191236 4I GGTTCAAGAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAC 2 3 230756 CASAVA_Build 15 41228997 1I ACAAATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 200 hom 24 2 12 10 T 15 16 230757 CASAVA_Build 15 41244737 1D TGCTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 11 10 230758 CASAVA_Build 15 41250827 1D CTCTGTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 27 0 16 12 A 15 14 230759 CASAVA_Build 15 41297029 1I ACAATGCTGG -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 7 8 230760 CASAVA_Build 15 41321589 1I GTATCCTTAA -/G ACAACTCTAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 0 1 230761 CASAVA_Build 15 41350794 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 8 7 230762 CASAVA_Build 15 41404557 1I AGCACTGGCC -/T TTGAAGAGCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 3 230763 CASAVA_Build 15 41465082 1I TAAGCCACTC -/T TTATTTCCAC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 2 3 230764 CASAVA_Build 15 41474248 10D GCACCTCCCC CTTGCTCTCT/---------- CTTGCTCCTA 3070 het 3070 ref 34 16 12 11 CTTGCTCTCT 1 0 230765 CASAVA_Build 15 41483461 1I AAGCAGGTAA -/T TACTGTGCCA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 T 1 2 230766 CASAVA_Build 15 41503148 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 587 het 587 ref 15 12 2 1 A 15 14 230767 CASAVA_Build 15 41509935 3D AAAATATATC ATT/--- GTCTTGAACA 3070 het 3070 hom 34 11 21 3 ATT 1 0 230768 CASAVA_Build 15 41548037 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1242 het 1242 ref 30 15 5 10 A 17 16 230769 CASAVA_Build 15 41566821 1D AGTAAGGATG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 66 het 27 0 23 6 A 8 7 230770 CASAVA_Build 15 41631468 1D TGATTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 1564 het 1564 ref 28 17 4 7 T 14 13 230771 CASAVA_Build 15 41716325 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 11 12 230772 CASAVA_Build 15 41809888 2D CACTGCACTC CA/-- CAGCCTGGTG 3070 hom 41 het 15 0 13 2 CA 2 1 230773 CASAVA_Build 15 41824826 2D ACTAAGACTC AG/-- GGTTTTTTGA 3070 hom 87 het 30 0 29 2 AG 1 0 230774 CASAVA_Build 15 41827064 2I TTTTTTTATT --/TG TGTGTGTGTG 2350 het 2350 ref 20 9 5 6 TG 7 8 230775 CASAVA_Build 15 41827793 1D CATGGAGAAA C/- CCCCGTCTCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 5 4 230776 CASAVA_Build 15 41838449 2I CCTGGGTGAC --/AG AGTGAGACCC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AG 1 2 230777 CASAVA_Build 15 41866495 1D CGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 24 2 11 11 T 13 12 230778 CASAVA_Build 15 41897995 1D AAAAACTACC A/- AAAAAAAAAA 2007 het 502 hom 18 2 9 7 A 13 12 230779 CASAVA_Build 15 41908396 2D AATTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1285 het 489 hom 34 8 4 22 T 14 12 230780 CASAVA_Build 15 41911923 1D TTCATCTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 22 7 T 10 9 230781 CASAVA_Build 15 41912797 5D GTTATTTTTC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 1970 het 1925 hom 24 8 10 6 TTTCT 3 2 230782 CASAVA_Build 15 41914986 3I CTCAAAACAG ---/CAA CAACAACAAG 3070 hom 55 het 25 0 17 8 CAA 3 4 230783 CASAVA_Build 15 41925771 1D GGATAGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 242 hom 36 3 17 16 T 14 13 230784 CASAVA_Build 15 41984188 2I TTCTATATCC --/CT TTTTTCCTCA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 CT 0 1 230785 CASAVA_Build 15 42003852 1I TCAGTGTAAC -/T TTTTTTTTTT 2784 het 2784 ref 36 18 8 10 T 13 14 230786 CASAVA_Build 15 42035304 1D ACTTCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1367 het 1367 ref 34 24 3 7 T 13 12 230787 CASAVA_Build 15 42055606 1D TCCATATATT A/- AAAAAAAAAA 2823 het 2823 ref 30 9 8 13 A 13 12 230788 CASAVA_Build 15 42062453 1D TGGAATCTCA C/- TCTGTCACCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 1 0 230789 CASAVA_Build 15 42066209 1I GTACTTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1218 hom 47 4 31 12 T 12 13 230790 CASAVA_Build 15 42071834 1D TTGTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 25 2 15 9 T 15 14 230791 CASAVA_Build 15 42076575 4D AAGAAAGAAA AGAG/---- AGAAAGTTTG 3070 het 3070 ref 48 30 16 4 AG 3 1 230792 CASAVA_Build 15 42077145 5I ATTTCTATTC -----/TTAAG TTTTTATATT 3070 hom 106 het 39 0 34 5 TTAAG 0 1 230793 CASAVA_Build 15 42096330 1I GTTCACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 35 1 25 9 T 13 14 230794 CASAVA_Build 15 42108813 1I TGCTTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 978 hom 29 3 24 2 A 11 12 230795 CASAVA_Build 15 42130147 1D CACACTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 14 8 T 12 11 230796 CASAVA_Build 15 42131471 1D AAGTTAACTC T/- TTTTTTTTTT 1856 het 1856 ref 42 29 5 9 T 11 10 230797 CASAVA_Build 15 42199220 3D TGTCTACTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 35 1 21 13 T 18 15 230798 CASAVA_Build 15 42199386 1D AGTGAGTGGT A/- AAAAAATACT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 7 6 230799 CASAVA_Build 15 42200646 1D TAATTATGTT G/- ATTTTGAGGA 3070 hom 81 het 33 0 26 8 G 1 0 230800 CASAVA_Build 15 42200773 1D GGGGGGTGGG A/- GGGGGAGTCA 3070 hom 36 het 19 0 13 6 A 1 0 230801 CASAVA_Build 15 42202381 1D ACTCTGTATC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 8 7 230802 CASAVA_Build 15 42210885 1D GGCAATTCCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 10 9 230803 CASAVA_Build 15 42213661 1I CAGGCTGGAG -/A AGTGCAGTGG 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 1 2 230804 CASAVA_Build 15 42220489 1I CTTACATACC -/A GTAATAACCA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 0 1 230805 CASAVA_Build 15 42232370 1I AATATTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 10 11 230806 CASAVA_Build 15 42241865 4I TGGATGGGAC ----/TACA TACAGGTCCA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 TACA 1 2 230807 CASAVA_Build 15 42275390 3I CCTTTGCCTC ---/CTT CTTTTTATTT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CTT 1 2 230808 CASAVA_Build 15 42276690 1D GACTCGGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1099 hom 25 5 12 8 A 13 12 230809 CASAVA_Build 15 42287963 4D AGGCCAAGGC AGGA/---- AGGAGGATTG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AGGA 2 1 230810 CASAVA_Build 15 42289517 1I ATCTAAGAGC -/A AACCACAGGG 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 2 3 230811 CASAVA_Build 15 42313389 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 19 0 13 7 A 15 14 230812 CASAVA_Build 15 42313658 1D CTTTCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 2036 het 2036 ref 31 16 5 10 T 15 14 230813 CASAVA_Build 15 42320240 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 31 1 23 9 T 12 11 230814 CASAVA_Build 15 42326089 1D GGCTTTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 11 10 230815 CASAVA_Build 15 42331002 1I ACGATATGCA -/T TTTTGTGAGT 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 T 4 5 230816 CASAVA_Build 15 42338237 1D CCCATTTTAC A/- AACTGATAAG 3070 hom 108 het 41 0 35 7 A 3 2 230817 CASAVA_Build 15 42341064 1I ACATGGATGT -/C TGCTTTGTGG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 0 1 230818 CASAVA_Build 15 42342796 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 17 0 13 4 T 13 12 230819 CASAVA_Build 15 42354915 1D CTGAGGAATG A/- AAAAAAAAAA 1736 het 1736 ref 36 21 4 11 A 13 12 230820 CASAVA_Build 15 42407083 1D TATAGGCCCC T/- GTTTTCATTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 1 0 230821 CASAVA_Build 15 42499165 1I AGGGAAACTC -/T TGTCTCAAAA 3070 het 106 hom 22 1 17 4 T 1 2 230822 CASAVA_Build 15 42499647 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1269 het 1154 hom 23 10 3 10 T 15 14 230823 CASAVA_Build 15 42549939 1D TTACATTGGC T/- TTTTTTTTTT 1041 het 1041 ref 28 20 4 4 T 11 10 230824 CASAVA_Build 15 42550105 2D TCCCAGCTAA TT/-- TTTATATTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 5 3 230825 CASAVA_Build 15 42557329 1D ACGTAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2132 het 2132 ref 32 21 5 6 A 13 12 230826 CASAVA_Build 15 42573924 2I AACAAGATAC --/TT TTTTTTGTCT 3070 het 3054 hom 24 8 10 6 T 6 8 230827 CASAVA_Build 15 42596355 2I TGTTTGAAAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 AG 1 2 230828 CASAVA_Build 15 42667785 1I AGGAATCTGC -/A AAAAAAAAAA 1159 het 1159 ref 26 19 3 4 A 11 12 230829 CASAVA_Build 15 42717991 1D AACCACAAAA C/- CCCCCCCCCC 1589 het 1589 ref 16 7 7 2 C 11 10 230830 CASAVA_Build 15 42753238 1D CTCAGAGCTC T/- TAATTCCTTC 3070 hom 114 het 41 0 36 5 T 2 1 230831 CASAVA_Build 15 42777577 6I CTTTAAATTT ------/TTTTAA TTTTAATTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTTTAA 2 3 230832 CASAVA_Build 15 42801640 1D TGGTGCTAGT A/- AAGTTTTGAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 2 230833 CASAVA_Build 15 42812349 4D CAAGATTTTC TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 39 het 24 0 14 11 TATT 6 5 230834 CASAVA_Build 15 42813027 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 4 5 230835 CASAVA_Build 15 42814202 3D TTCAGTGCTC TGG/--- TGGTGAGAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TGG 2 1 230836 CASAVA_Build 15 42814335 1D AGCCAACAAC A/- AAAACAATCA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 5 4 230837 CASAVA_Build 15 42815072 1D TGGGTTTGGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 53 het 21 0 14 8 G 10 9 230838 CASAVA_Build 15 42816212 1I TGAGTGACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 18 1 12 5 T 11 12 230839 CASAVA_Build 15 42825538 5I AAACTCTATG -----/TAAGA TAAGTTAACA 3070 hom 27 het 25 0 10 15 TAAGA 0 1 230840 CASAVA_Build 15 42836253 2D TATCTATGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 44 0 34 13 A 12 10 230841 CASAVA_Build 15 42845150 3D AGGCTGAAGC AGG/--- AGAATTGCTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AGG 1 0 230842 CASAVA_Build 15 42873352 6D TGTCTCAAAA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 het 3070 ref 21 11 9 4 AAC 6 4 230843 CASAVA_Build 15 42895332 1D GCAACTGAGG T/- TATCCAAGTT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 T 2 1 230844 CASAVA_Build 15 42957942 1D AGGATCAAAA G/- ACAATAATTG 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 G 1 0 230845 CASAVA_Build 15 43140234 1I TGGAGATAGA -/G GGGTGGCTTG 3070 hom 78 het 28 0 25 3 G 3 4 230846 CASAVA_Build 15 43151999 1D CTCAGCCTCT G/- GGCCCATGAG 3070 hom 44 het 17 0 13 4 G 3 2 230847 CASAVA_Build 15 43212399 1I AAGTCTTGAA -/C CCTTAGCTGG 3070 hom 101 het 44 0 41 3 C 2 3 230848 CASAVA_Build 15 43233377 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 21 0 19 3 A 14 13 230849 CASAVA_Build 15 43243684 12D AAACTCGGGG CTACCCTCACCA/------------ CTACCCTCAC 3070 hom 111 het 39 0 35 7 CTACCCTCACCA 2 1 230850 CASAVA_Build 15 43243956 1D CACTGCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1050 het 1050 ref 33 15 4 14 T 15 14 230851 CASAVA_Build 15 43245634 1D AGTGCGCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 T 11 10 230852 CASAVA_Build 15 43258978 1D CCACACAAGT G/- GGCTCACGGC 3070 hom 73 het 31 0 21 10 G 3 2 230853 CASAVA_Build 15 43262823 2D GGTCTAACAC AT/-- GTCAGCTGCT 3070 hom 106 het 40 0 36 5 AT 1 0 230854 CASAVA_Build 15 43269239 1I AGTTCAAAGC -/G GGGGGGTGTA 3070 hom 45 het 20 0 13 7 G 6 7 230855 CASAVA_Build 15 43277318 2D TCACCTCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 2589 het 47 hom 30 1 15 15 A 18 16 230856 CASAVA_Build 15 43293975 1I GATATCTTTC -/T GTTCTTGATT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 0 1 230857 CASAVA_Build 15 43298247 2D GTTCAAGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 31 1 29 2 T 13 11 230858 CASAVA_Build 15 43298916 6D GTTTCTCTCA TTATGT/------ TTATGTTTTC 3070 hom 57 het 21 0 20 2 TTATGT 2 1 230859 CASAVA_Build 15 43299781 1I ACTCTGGTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 42 0 27 15 A 11 12 230860 CASAVA_Build 15 43301014 2I CTAAAATCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 31 0 22 9 T 12 14 230861 CASAVA_Build 15 43303069 1I TCTTATCATG -/A AACCCTTAGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 3 230862 CASAVA_Build 15 43309598 1I CTATTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2673 hom 20 het 8 0 7 1 A 10 11 230863 CASAVA_Build 15 43328322 1D TAGGAGAGTT A/- ACAACCTTTA 3070 hom 107 het 38 0 36 2 A 2 1 230864 CASAVA_Build 15 43328848 1I ATTTGTGTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 51 het 22 0 17 5 A 8 9 230865 CASAVA_Build 15 43332671 1D TCAGGCTTGG C/- CCTGAATTTG 3070 hom 92 het 35 0 30 5 C 3 2 230866 CASAVA_Build 15 43333728 2I AAAGCTGAGA --/AG AGAGGACATT 3070 hom 120 het 43 0 39 4 AG 2 3 230867 CASAVA_Build 15 43340836 2I TTATTTAACT --/TC TCTGTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TC 1 2 230868 CASAVA_Build 15 43356027 4D CCAAAAAATA AAAT/---- AAATAAAATA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 AAAT 2 1 230869 CASAVA_Build 15 43356474 1I TCAGTGGGAA -/G GGGGCCAATT 3070 hom 147 het 56 0 48 8 G 4 5 230870 CASAVA_Build 15 43364480 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1707 het 22 hom 22 1 8 13 T 16 14 230871 CASAVA_Build 15 43369547 32I AGTCCCAGCT --------------------------------/ACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA ACCTGGTAGG 3070 hom 27 het 10 0 10 1 ACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGA 0 1 230872 CASAVA_Build 15 43379425 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 2187 hom 11 het 14 0 8 6 T 12 13 230873 CASAVA_Build 15 43403994 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 2609 het 71 hom 12 1 8 3 T 10 9 230874 CASAVA_Build 15 43500185 1I ATATATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 9 10 5 A 10 11 230875 CASAVA_Build 15 43549479 1D TTCAGTTACA C/- CCACTTTACC 3070 het 3070 hom 37 17 19 2 C 3 2 230876 CASAVA_Build 15 43554676 1D TGTTTAACTT A/- AAAAAAAAAA 1772 het 1772 ref 40 31 4 5 A 12 11 230877 CASAVA_Build 15 43559331 2D AATACAGCAC AT/-- ATATATATAT 1076 het 1076 ref 23 12 3 8 AT 10 9 230878 CASAVA_Build 15 43566516 1I ATAAACTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 10 11 230879 CASAVA_Build 15 43620915 1D GGAAGAGGCA T/- TTGGCGGGTT 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 T 3 2 230880 CASAVA_Build 15 43632762 1I GGAGTACAGT -/G GTGCCCATCT 3070 hom 48 het 25 0 15 10 G 1 2 230881 CASAVA_Build 15 43637085 4D AAGAAATCTT AAAG/---- AAACAATATG 3070 het 3070 ref 47 20 16 12 AAAG 1 0 230882 CASAVA_Build 15 43659637 2D CCTTGGAGTC TG/-- TGAATGCTAG 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 TG 2 1 230883 CASAVA_Build 15 43665131 1D ACCCACCCCC G/- GGACTAACCC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 3 2 230884 CASAVA_Build 15 43702624 1D TCAATAAACT A/- GGTATTAATG 3070 het 2828 hom 16 7 7 2 A 1 0 230885 CASAVA_Build 15 43736371 1I CTCAGCTTAC -/T TGCAACCTCT 3070 hom 42 het 16 0 15 10 T 1 2 230886 CASAVA_Build 15 43736598 1I ACGCCTGGTC -/A TATATATTGT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 0 1 230887 CASAVA_Build 15 43745028 1D TTAGTCAACA T/- TTCTTTAGCA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 3 2 230888 CASAVA_Build 15 43752441 2I GCCTGCTCCC --/AG AGTTTCTGAT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 AG 1 2 230889 CASAVA_Build 15 43757505 4D CCTCAGGCTC TGTT/---- TGTTAGACTG 3070 het 3070 hom 27 10 13 9 TGTT 2 1 230890 CASAVA_Build 15 43763569 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTATT 1554 het 1294 hom 9 3 5 1 T 8 7 230891 CASAVA_Build 15 43764083 2D TAAGGGGTGT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 354 hom 40 4 16 21 TC 10 9 230892 CASAVA_Build 15 43779600 2D ACTGCGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 13 11 230893 CASAVA_Build 15 43788806 1I ACCACCGGGG -/C GGGGGAAAGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 0 1 230894 CASAVA_Build 15 43792077 2I GAAACTCCCT --/GG TCAGGCTGGC 3070 het 3070 ref 40 21 19 0 G 0 2 230895 CASAVA_Build 15 43795201 1I CTCCTTTTAC -/T TTGTGACCAG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 2 3 230896 CASAVA_Build 15 43799084 1D AAACACATAC G/- GGATAGTGTA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 3 2 230897 CASAVA_Build 15 43803607 4D CAAATGTGTG TGTT/---- TGTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 54 20 28 7 TGTT 2 1 230898 CASAVA_Build 15 43827846 1I TCATGCTAGG -/C TTTTTGGGAA 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 C 0 1 230899 CASAVA_Build 15 43846465 1I ACACAAATGC -/A AATTGTTAAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 2 3 230900 CASAVA_Build 15 43848292 17D GGAGCCAAGT TCCATAATAGCCTCTCC/----------------- TCCATAATAG 3070 het 3070 ref 34 14 11 13 TCCATAATAGCCTCTCC 2 1 230901 CASAVA_Build 15 43849367 1I TCACTGCAAG -/C TCCGCCTCCC 3070 het 2623 hom 22 10 8 4 C 0 1 230902 CASAVA_Build 15 43850592 1D GGTTTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 10 T 13 12 230903 CASAVA_Build 15 43876089 2D TATATAACAC GT/-- GTGTGTGTGT 1797 het 1797 ref 48 31 5 14 GT 6 5 230904 CASAVA_Build 15 43876395 6I GAGGTGGAGG ------/TGTTAT TGTTATTCTC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 TGTTAT 1 2 230905 CASAVA_Build 15 43877487 1D TTTTGAATGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 T 9 8 230906 CASAVA_Build 15 43885184 2D AGGACACAGT GA/-- GAGAGCTGTA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 GA 3 2 230907 CASAVA_Build 15 43893555 1D TGCGTGTGTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 8 het 21 0 12 9 T 9 8 230908 CASAVA_Build 15 43906916 1D CTTTACAGAG T/- GAGATGGGTT 3070 het 3070 hom 49 17 23 11 T 1 0 230909 CASAVA_Build 15 43908926 5D CCTGGCCTGA AAGTG/----- GGGCCTTACT 1513 het 1513 ref 30 18 7 6 AAGTG 1 0 230910 CASAVA_Build 15 43911785 2I TCAGCCCAAT --/AG AGGGGTTGCT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 AG 1 2 230911 CASAVA_Build 15 43914521 2D TCCAGATGAG CC/-- AACTCCTCCC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 C 2 0 230912 CASAVA_Build 15 44000046 1D GGTCACACTC A/- AACCATTCCC 3070 het 3070 ref 34 24 8 2 A 3 2 230913 CASAVA_Build 15 44005435 11D GTAGATATTA TGTGTTCTCAC/----------- TGTAGAGTCC 3070 het 3070 ref 48 29 18 7 TGTGTTCTCAC 1 0 230914 CASAVA_Build 15 44006491 20D GCCGTACCTT CCTTTCAGGCCTGGGTGCTA/-------------------- CCTGCACCCC 3070 het 3070 ref 38 22 15 6 CCTTTCAGGCCTGGGTGCTA 1 0 230915 CASAVA_Build 15 44032389 1I TATCTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 42 29 3 10 T 11 12 230916 CASAVA_Build 15 44032860 1D GAAAGACATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 52 23 20 9 A 10 9 230917 CASAVA_Build 15 44038312 1I TTTAATTTCC -/T TTCTAATAGA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 T 2 3 230918 CASAVA_Build 15 44042286 17D3M6D ATGAGAACAT ACTAATGTTCTCATTACTAGAATACT/-----------------TAG------ AGAACTGGAG 3070 het 3070 ref 34 19 19 3 N/A 0 0 230919 CASAVA_Build 15 44049300 2D TAGCTTGGAC AG/-- AGAGAGTCAC 3070 het 2959 hom 25 8 9 8 AG 4 3 230920 CASAVA_Build 15 44051671 2D TCAGTCCAAC AG/-- ATTGAAACTC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 AG 1 0 230921 CASAVA_Build 15 44055120 3D AATGATGAAG TCT/--- TCTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 50 24 24 3 TCT 2 1 230922 CASAVA_Build 15 44056625 4I ATGTTTGAGG ----/GTTT GTTTATTATG 3070 het 3070 hom 39 11 23 5 GTTT 1 2 230923 CASAVA_Build 15 44056825 1D TTTTAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 13 11 T 12 11 230924 CASAVA_Build 15 44057272 1I ATTTCTTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 1465 hom 34 7 16 11 A 0 1 230925 CASAVA_Build 15 44058974 2D CTTCTATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 14 17 T 12 10 230926 CASAVA_Build 15 44068600 7D TTTGGGAGGC AGCACTT/------- TGAGCTGGGC 3070 hom 48 het 18 0 15 4 AGCACTT 1 0 230927 CASAVA_Build 15 44068946 1I TTGAATTTTT -/G GTTCCAGTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 1 2 230928 CASAVA_Build 15 44076297 2D CTGAATAAAC CA/-- CAGTCATCTC 3070 het 3070 ref 44 21 18 8 CA 2 1 230929 CASAVA_Build 15 44078815 1I GCTCTGTTGA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 8 9 230930 CASAVA_Build 15 44079431 1D GACAATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 T 12 11 230931 CASAVA_Build 15 44082192 1D TTTGTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 2629 het 2629 ref 25 10 9 6 T 11 10 230932 CASAVA_Build 15 44095889 2I TGTGTTTATA --/TG TGTGTGTATA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 TG 3 4 230933 CASAVA_Build 15 44150508 1D CATTTTGTAT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 236 hom 32 1 20 12 G 10 9 230934 CASAVA_Build 15 44163208 2D TTGCCTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 10 A 12 10 230935 CASAVA_Build 15 44201693 4I TGAGAGAACC ----/CTGA CTAATATGCA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 CTGA 0 1 230936 CASAVA_Build 15 44202447 1I TCCTTCTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 T 9 10 230937 CASAVA_Build 15 44222329 1I TTAATGATTG -/C CATTCTAACT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 C 1 2 230938 CASAVA_Build 15 44274338 10D CATCCTAGAG ATTGTGGTAC/---------- ATTATTATTT 3070 het 3070 ref 37 24 12 5 ATTGTGGTAC 1 0 230939 CASAVA_Build 15 44285645 1D CATACAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2312 hom 34 7 16 12 T 15 14 230940 CASAVA_Build 15 44295008 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 0 1 230941 CASAVA_Build 15 44301745 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2420 hom 33 12 10 11 T 13 12 230942 CASAVA_Build 15 44320808 4D ATGGTTGAAT GTTA/---- GTTCAGTCTC 3070 het 3070 ref 52 28 22 4 GTTA 1 0 230943 CASAVA_Build 15 44322729 6D TTTCCTCCCA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 51 20 20 16 TG 11 8 230944 CASAVA_Build 15 44323291 1I ATTAAACCCC -/T TCCAACAAAA 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 T 1 2 230945 CASAVA_Build 15 44335316 5I TGCAAAAAAA -----/AAAAG AAAAGAATTC 2494 het 2494 ref 21 9 7 5 AAAAG 1 2 230946 CASAVA_Build 15 44335775 2D AGCTTTATTA TT/-- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 T 9 7 230947 CASAVA_Build 15 44345104 1D GTGAAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 973 het 973 ref 36 29 3 4 T 11 10 230948 CASAVA_Build 15 44346904 2D AGGCCTGGGT GG/-- GGGGTGTCGC 2900 het 2900 ref 28 11 7 10 G 6 4 230949 CASAVA_Build 15 44348073 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2332 hom 34 8 17 9 T 15 16 230950 CASAVA_Build 15 44359967 7D CATAAATTCA TGGATGG/------- TGGATGGCAG 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 TGGATGG 2 1 230951 CASAVA_Build 15 44361588 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2665 het 2665 ref 38 12 13 13 T 12 13 230952 CASAVA_Build 15 44362908 1D TCCTGTTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 10 9 230953 CASAVA_Build 15 44366216 5I AATTTTTCTT -----/TTAAA TAGTTTCAGT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 TTAAA 0 1 230954 CASAVA_Build 15 44376858 9I TGGCAATAAG ---------/GACACCCAA GACTCCTTAG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 GACACCCAA 0 1 230955 CASAVA_Build 15 44377507 1I TGATGAAAGG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 7 8 230956 CASAVA_Build 15 44380794 1I CAGTGTTACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 A 10 11 230957 CASAVA_Build 15 44383491 1D CTGTAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 53 hom 21 2 8 12 A 13 12 230958 CASAVA_Build 15 44393470 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 20 0 16 5 T 12 11 230959 CASAVA_Build 15 44413859 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 8 9 230960 CASAVA_Build 15 44415607 1D AAACAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 12 11 230961 CASAVA_Build 15 44422272 1D TACAGCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 20 8 T 13 12 230962 CASAVA_Build 15 44447424 1D GAAGCTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 26 7 T 11 10 230963 CASAVA_Build 15 44455501 3I TCTTGCTTTG ---/TAT TATTATTATT 3070 hom 72 het 26 0 24 9 TAT 5 6 230964 CASAVA_Build 15 44458987 5I CAACATTCTT -----/AAAGA AAAGAATTTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AAAGA 1 2 230965 CASAVA_Build 15 44463432 1D TGACAAATAC A/- CTACTACTAG 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 1 0 230966 CASAVA_Build 15 44465296 15I GTTAGTTTAC ---------------/TTTTCATGGAGCATA TTTTCATGGA 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 TTTTCATGGAGCATA 1 2 230967 CASAVA_Build 15 44465370 1D AGGGGACCAA T/- GGAGAAATTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 5 T 1 0 230968 CASAVA_Build 15 44465922 4I TATTATTACT ----/ATTA ATTATTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 ATTA 1 2 230969 CASAVA_Build 15 44467499 1D ATAAAAAAGG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 T 7 6 230970 CASAVA_Build 15 44467585 4I GCTATAGAGA ----/AATT AATTAGGAAT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AATT 1 2 230971 CASAVA_Build 15 44477057 2I TATATAAAAG --/TA AAACTATTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TA 0 1 230972 CASAVA_Build 15 44478262 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 9 230973 CASAVA_Build 15 44485376 1I TGCCCCCCAA -/C CCCCCGAGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 5 6 230974 CASAVA_Build 15 44502571 1I CCCATGTTTA -/T ATGGCAAATT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 T 0 1 230975 CASAVA_Build 15 44514262 1D ATATTGTGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 9 8 230976 CASAVA_Build 15 44514529 2D CCACTTTCCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 TC 10 9 230977 CASAVA_Build 15 44516962 1D ATGGCATGAG T/- TTTTTTTTTT 1869 hom 21 het 14 0 6 8 T 11 10 230978 CASAVA_Build 15 44517856 1D ACAAATACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 10 9 230979 CASAVA_Build 15 44520932 1D ATTGACTCAT A/- AAAAAATTAC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 A 7 6 230980 CASAVA_Build 15 44538214 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 12 11 230981 CASAVA_Build 15 44546089 1D ATACTTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1174 hom 41 5 30 6 A 15 14 230982 CASAVA_Build 15 44554873 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2259 hom 34 6 24 4 A 15 14 230983 CASAVA_Build 15 44555241 1D AATTCAGGCC A/- AAAAAAAAAG 788 het 788 ref 45 33 3 9 A 10 9 230984 CASAVA_Build 15 44556473 1D AGCCTTTTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 9 8 230985 CASAVA_Build 15 44557945 1I CATTCATTTA -/T GGTTTACAAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 0 1 230986 CASAVA_Build 15 44562608 5D CCAACAAATG CTTAA/----- CTTAAGACCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CTTAA 2 1 230987 CASAVA_Build 15 44565552 1D GATCTGTATC A/- GGGGGCCCAT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 A 1 0 230988 CASAVA_Build 15 44572473 1D ATCAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 11 10 230989 CASAVA_Build 15 44622721 1I TCTTACAGGA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 T 7 8 230990 CASAVA_Build 15 44624228 4I TAGGAGAAAG ----/GACA GTCAGGAGCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 GACA 0 1 230991 CASAVA_Build 15 44624519 2I TTGGGATTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 28 8 T 12 14 230992 CASAVA_Build 15 44625367 1D CATGAAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 12 11 230993 CASAVA_Build 15 44627455 1I TCTTCAGATA -/T TTTTTGTCTC 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 T 5 6 230994 CASAVA_Build 15 44631225 2I AATGACAAAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 27 10 9 8 TA 5 6 230995 CASAVA_Build 15 44631910 1I CCAGCACAGC -/T TACCCTGATC 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 T 1 2 230996 CASAVA_Build 15 44633640 1I ATCAAAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 T 10 11 230997 CASAVA_Build 15 44636326 2I CAGATGGCAT --/AA AAAAAAATGA 3070 hom 105 het 40 0 34 6 A 7 9 230998 CASAVA_Build 15 44637082 1I TAGGTATCAA -/T TTTTTTTTTT 1610 het 65 hom 34 1 7 26 T 11 12 230999 CASAVA_Build 15 44638111 3D GTGGGTACAT AGC/--- AGGCATATAT 3070 hom 99 het 34 0 33 2 AGC 1 0 231000 CASAVA_Build 15 44642570 1I GCAGGGAATA -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 6 7 231001 CASAVA_Build 15 44647825 1I TCAAACATTA -/T TTGTGCTGTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 3 231002 CASAVA_Build 15 44654707 1D TGGGGTTCGG T/- TAAGAAAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 2 1 231003 CASAVA_Build 15 44666713 1D ATATCTTGAA T/- TGTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 2 1 231004 CASAVA_Build 15 44667150 1I TTGGTCAGGC -/T TTCCTGAGGA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 2 3 231005 CASAVA_Build 15 44668936 1I ATTTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3013 het 2412 hom 19 5 8 6 T 10 11 231006 CASAVA_Build 15 44672718 1D TATTTTTTTA C/- CTTTATGTAT 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 C 2 1 231007 CASAVA_Build 15 44684603 1I CTTGTTTAAT -/G GTACATCCTT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 G 1 2 231008 CASAVA_Build 15 44687021 1I14M2I5M6I CAAATGTACC -TTTAGAGGCCAAAC--AATAT------/TTTTAGAGGCCAAACTTATTATTCCCAA GAGGTACAAC 3070 het 3070 ref 46 31 21 4 N/A 0 0 231009 CASAVA_Build 15 44691354 5I ATGTGAAATA -----/TAGTG TAAAGCATGT 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 TAGTG 0 1 231010 CASAVA_Build 15 44695855 1I GCTTGAATCC -/T TGAGTTTTCT 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 T 1 2 231011 CASAVA_Build 15 44706412 2D AGCAGAGCAT AA/-- AAGTTCAGAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 4 2 231012 CASAVA_Build 15 44755784 1I AGGAGAATGG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 106 het 43 0 35 8 A 8 9 231013 CASAVA_Build 15 44817895 5D TTTGCATTTA TTTAT/----- TTTAATGACA 3070 het 3070 hom 36 13 21 3 TTTAT 1 0 231014 CASAVA_Build 15 44914538 1I AAACACACAG -/A AAAAATATTA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 5 6 231015 CASAVA_Build 15 44951923 1I TTTTGAGTTT -/A AAAAAAAAAA 1232 het 1232 ref 29 9 5 15 A 15 16 231016 CASAVA_Build 15 44964735 20I ATGCATATGT --------------------/ATGCATATGCATACATATGC ATGCATAGAT 3070 hom 197 het 76 0 66 11 ATGCATATGCATACATATGC 0 1 231017 CASAVA_Build 15 44964754 4D TATACGTATG TATA/---- TATGTGTATA 3070 het 3070 ref 75 33 23 22 TA 3 1 231018 CASAVA_Build 15 44967957 1I AAACTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 24 0 21 3 A 10 11 231019 CASAVA_Build 15 45000280 14D TAAATAACTT TTTTTTAAATTAAA/-------------- TAACATGTTT 3070 het 3070 ref 36 20 17 5 TTTTTTAAATTAAA 1 0 231020 CASAVA_Build 15 45008744 1I TCCTTCCTTC -/T TTCCTTCCTC 3070 hom 49 het 24 0 15 9 T 2 3 231021 CASAVA_Build 15 45010609 1I GTATTCGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 11 12 231022 CASAVA_Build 15 45013928 5D TCCCATAAAT TTTCC/----- TTTATTGACT 3070 het 3070 hom 37 19 18 0 TTTCC 1 0 231023 CASAVA_Build 15 45038327 2D TGAGACGGAG TC/-- TCTCGCTCTG 2501 het 2501 ref 19 10 7 2 TC 3 2 231024 CASAVA_Build 15 45042165 2I ATCTAGAAAC --/TG TATCCAACAT 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 TG 0 1 231025 CASAVA_Build 15 45048351 1D AGAGTGTGCA T/- AACGATTGTT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 T 1 0 231026 CASAVA_Build 15 45103432 1D TTAAGATCAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 8 7 231027 CASAVA_Build 15 45113302 1I GAAATGTAAA -/T TTTAAACGAG 3070 het 3070 ref 55 28 22 5 T 3 4 231028 CASAVA_Build 15 45116492 1I CAGGGTATTT -/G GGGTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 G 3 4 231029 CASAVA_Build 15 45118661 1I CAGTATAAGC -/A AAAAGTGACC 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 A 4 5 231030 CASAVA_Build 15 45119929 2I TTGGTACTAT --/AA AAAGAGTAGG 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 3 5 231031 CASAVA_Build 15 45133302 4I GTGCTTAAAT ----/AATA ATTAAGTCCA 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 AATA 0 1 231032 CASAVA_Build 15 45135748 4D41M1I TAAAAAAATA AGAGAGAGAGAGAGAGAGATGCAGAGGAACAAAGACATCAACCAC-/----AGAGAGAAAGAGAGATGCAGAGGAACAAAGACACCAACCACA GGAAGCCATA 3070 het 3070 ref 38 38 9 8 N/A 0 0 231033 CASAVA_Build 15 45142438 3I CGAAAAAAAT ---/AAA ATAAAATGTA 2314 het 2314 ref 39 28 5 6 A 1 4 231034 CASAVA_Build 15 45149328 1I ACATCACCCC -/A AAAAATCTAG 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 5 6 231035 CASAVA_Build 15 45152080 3D29M1I TTATTTGTTT TTAAAAAAAGGATGAATTTTAAAAATTGCCTA-/---AAAAAAAGATGAATTTTTAAAATTGCCTAT TGAATACTAT 3070 het 3070 ref 51 55 8 6 N/A 0 0 231036 CASAVA_Build 15 45153615 1I TTAACATTGG -/T TGTTTCTGAA 3070 het 3070 ref 50 24 15 11 T 1 2 231037 CASAVA_Build 15 45153754 4I114M2D TGAAGATAAC ----AGAGGAATCACTGCTTACATAGCCATTTATTTAGTGCTTACCATCTACTATGCATTATTCAGTGTGTATTACATTTTGTTTTTCATCATCACAATAATTTTTCAAGATATATACAT/AAAGAGAGGAATCACTGCTTACATAGCCATTTATTTAGTGCTTCCCATCTACTATGCATTATTCAGTGCGTATTACATTTTGTTTTTCATTATCACAATAATTTTGCAAGATATATAC-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 38 52 15 18 N/A 0 0 231038 CASAVA_Build 15 45154825 1I AAAATTGTCT -/C TTATCAGGGA 3070 het 3070 ref 64 45 9 10 C 0 1 231039 CASAVA_Build 15 45154916 1I GCAACAGCTA -/C CAATAGTCAG 2413 het 2413 ref 58 38 6 14 C 1 2 231040 CASAVA_Build 15 45155479 1I ATTTTCTTAC -/T TTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 T 6 7 231041 CASAVA_Build 15 45157122 1D ATTATAACTT A/- ACATGTAATT 3058 het 3058 ref 44 30 7 7 A 2 1 231042 CASAVA_Build 15 45158203 4I ATAAATACAA ----/TATT TATTCATAAA 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 TATT 1 2 231043 CASAVA_Build 15 45161633 4D AATGAGGGAA AAAC/---- AAACAATTAC 1845 het 1845 ref 48 40 4 5 AAAC 2 1 231044 CASAVA_Build 15 45161777 1I31M1I GTTTTTATGA -TTTTTTTATCCCAGGGAAACATTGAAAAAAA-/TTTTTTTTATCCCAGGAAAACATTGAAAAAAAG TTTAGAGATG 3070 het 3070 ref 77 44 34 7 N/A 0 0 231045 CASAVA_Build 15 45163077 1I GTACTTTATA -/C CCTACTCTTT 2813 het 2813 ref 43 28 6 12 C 2 3 231046 CASAVA_Build 15 45163214 2D CTATCTGATT TA/-- TAGTTTGGTT 3070 het 3070 ref 56 35 10 11 TA 2 1 231047 CASAVA_Build 15 45166794 2D TATACCCATG AT/-- ACAAGGTAAG 3070 het 3070 ref 57 42 15 1 AT 1 0 231048 CASAVA_Build 15 45166902 2I AAACAAAATT --/AA AATTTTTAAA 3070 het 3070 ref 44 34 7 4 A 2 4 231049 CASAVA_Build 15 45167303 1I CAATTAAACC -/T TTTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 50 25 21 8 T 5 6 231050 CASAVA_Build 15 45167966 3I GCTCACACTT ---/CTC CACCATGTTT 1417 het 1417 ref 39 30 4 6 CTC 0 1 231051 CASAVA_Build 15 45170526 1D CATCTAAACC G/- GCAGGTAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 G 2 1 231052 CASAVA_Build 15 45171978 2D ACTGAAAAAA GT/-- AGAACTAAGC 3070 het 3070 ref 68 33 24 13 GT 1 0 231053 CASAVA_Build 15 45172027 1D71M1I TAAAGATTAA TGCAAATAAAGGATATTTTCACACACATATTTTCATTATAACCAGAAAGTGGAACCAATGCAAGTGAATAGA-/-GCAAATAAAGGATATTTTCACACACATATTTTCATTATAACCAGAAAGTAGAACCAATGCAAGTGAATAGAT TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 54 17 51 N/A 0 0 231054 CASAVA_Build 15 45174161 3D AGCTGTAAAA CTC/--- CTACAAGAAA 3070 het 3070 ref 61 45 12 7 CTC 1 0 231055 CASAVA_Build 15 45174628 1I GAAGTTGTGG -/A GAAATTGAAT 3070 het 3070 ref 57 32 17 8 A 0 1 231056 CASAVA_Build 15 45175848 3I TACTGTAATA ---/TTC TTATGCGAGA 1214 het 1214 ref 55 41 3 11 TTC 0 1 231057 CASAVA_Build 15 45176186 4D AAACACATCT ACAG/---- ACAGAGTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 9 10 ACAG 2 1 231058 CASAVA_Build 15 45178157 2D TGATACTGGG CT/-- TAAAGCAGCA 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 CT 1 0 231059 CASAVA_Build 15 45180849 4I CTCTCTGTGA ----/TTCC TTCTGTTTGC 3070 het 3070 ref 57 37 15 5 TTCC 0 1 231060 CASAVA_Build 15 45181910 3I CTTTCATTCT ---/CTG CTTTCGCTAA 3070 het 3070 ref 63 37 24 18 CTG 0 1 231061 CASAVA_Build 15 45181991 2D46M1I TTATAAACAC TGTATTTCTATTTATTCAAGGCTTGAATTGAGCTAGCTGCTAATAACA-/--TCTTTCTATTTATTCAAAGCTTGAATTGAGCTAGCTGCTAATAACAT TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 72 52 44 13 N/A 0 0 231062 CASAVA_Build 15 45182601 1I TGGAGAAAAG -/A AATTAAGTGT 2413 het 2413 ref 43 24 7 12 A 2 3 231063 CASAVA_Build 15 45182642 2I TTGCAGCCAC --/AT TTTGTCAAGG 1745 het 1745 ref 64 48 6 12 AT 0 1 231064 CASAVA_Build 15 45182723 5D TTCCAACTCA TTAAT/----- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 45 33 9 4 TTAAT 1 0 231065 CASAVA_Build 15 45195631 4D TGGTAATTTT GTAA/---- GTGTTTGAGA 3070 het 3070 hom 25 8 16 2 GTAA 1 0 231066 CASAVA_Build 15 45210123 2I AGAAATTGGC --/AG AGAGTCCCCT 3070 hom 95 het 40 0 29 11 AG 2 3 231067 CASAVA_Build 15 45224017 1I CTTAGCTCAC -/T TTTAAGGACA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 4 231068 CASAVA_Build 15 45235534 2D AAATATATGC AA/-- AATTATATTT 2904 het 2904 ref 21 13 8 1 A 4 2 231069 CASAVA_Build 15 45266019 1D TTCGTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 32 1 20 11 T 12 11 231070 CASAVA_Build 15 45269662 1D GGGCAGAGAA T/- TTGTCTTCAA 3070 het 3070 hom 39 18 21 1 T 3 2 231071 CASAVA_Build 15 45274222 4D TTAAAATGGT AGTC/---- AGTCAACTGG 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 AGTC 2 1 231072 CASAVA_Build 15 45275432 1I GAAAGCAAGG -/A CCCCCCAGGC 3070 hom 63 het 34 0 28 6 A 0 1 231073 CASAVA_Build 15 45275523 1I GATTTTTTTT -/G TTTTTGGAGA 3070 het 36 hom 37 2 21 14 G 0 1 231074 CASAVA_Build 15 45285421 5I CAACATTTAT -----/TTATC TTATTTTGCC 3070 hom 123 het 45 0 42 4 TTATC 0 1 231075 CASAVA_Build 15 45292556 1D TTCTGAAGTG T/- TGGCAATGTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 1 231076 CASAVA_Build 15 45295410 1I AGCTGTGGTC -/A AAAGACATAT 3070 hom 66 het 32 0 23 9 A 3 4 231077 CASAVA_Build 15 45303067 11I AGCTTGCGTG -----------/TTGTCATCTTA TGTCAGCTGG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 TTGTCATCTTA 0 1 231078 CASAVA_Build 15 45303655 1D ATAATAAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 134 hom 12 1 10 2 A 9 8 231079 CASAVA_Build 15 45307961 4I CCTTGGTAAA ----/TGTT TGTTTGTTTA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 TGTT 2 3 231080 CASAVA_Build 15 45312245 2D GTTCAAACTC TT/-- TGCACGTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 3 1 231081 CASAVA_Build 15 45322916 1I GCAGAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 A 11 12 231082 CASAVA_Build 15 45342505 1D TAAAACTGGA C/- CCCCTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 5 4 231083 CASAVA_Build 15 45343831 1I ATTTAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 31 2 24 5 T 12 13 231084 CASAVA_Build 15 45374411 1D AGTCTGGAAC A/- AAATCTGAAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 4 3 231085 CASAVA_Build 15 45379419 3I TCCATTAGTT ---/TTC ATCTTAAGAA 3070 hom 78 het 35 0 26 9 TTC 0 1 231086 CASAVA_Build 15 45380896 9D TGTTGGGGCA TCTGGGGCT/--------- TAACACCAGG 3070 hom 144 het 49 0 43 11 TCTGGGGCT 1 0 231087 CASAVA_Build 15 45396097 1I TATTGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 877 hom 28 2 19 7 T 14 15 231088 CASAVA_Build 15 45401769 1I TCACTAGTTA -/T TTTTTTTTTT 2053 het 1735 hom 22 7 8 7 T 15 16 231089 CASAVA_Build 15 45411132 1D ACAAAATAAC A/- GTATCTTTGG 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 A 1 0 231090 CASAVA_Build 15 45421424 3I CACTTTTGAG ---/CTA CTACTCCAAC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 CTA 1 2 231091 CASAVA_Build 15 45423679 1D CTCACTTGGA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 8 7 231092 CASAVA_Build 15 45428602 1D GAGGCTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 16 10 T 12 11 231093 CASAVA_Build 15 45433987 2I AGAACTAAGT --/TA TATATATATA 1773 hom 18 het 11 0 7 4 TA 6 7 231094 CASAVA_Build 15 45434010 2I GGATATTATT --/TA TATATATATA 1566 het 308 hom 9 1 6 2 TA 6 7 231095 CASAVA_Build 15 45434637 5I GAGAAAAGAG -----/GGAGA GGAGAGGCTA 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 GGAGA 1 2 231096 CASAVA_Build 15 45437836 3D TCATAATTTG TTC/--- TTCTTTTCAC 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 TTC 2 1 231097 CASAVA_Build 15 45447456 1D TTAATGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 12 11 231098 CASAVA_Build 15 45461609 1D AGTGTCGCCA T/- ATTAACATGG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 1 0 231099 CASAVA_Build 15 45462432 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAATAGA 3070 het 3070 hom 27 7 14 6 T 4 5 231100 CASAVA_Build 15 45463128 7D AGTTTTAACT CATAAGG/------- CATAAGGACC 3070 het 3070 ref 35 19 17 4 CATAAGG 2 1 231101 CASAVA_Build 15 45465168 1D CAATAAAGAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 8 7 231102 CASAVA_Build 15 45466525 2I GCCCTGCTGC --/GT GTGTGGCTCC 3070 hom 101 het 36 0 32 4 GT 2 3 231103 CASAVA_Build 15 45468297 1I GATAAACATG -/A ATGGCATAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 1 2 231104 CASAVA_Build 15 45468498 4D TTTGGTGCAA AAGT/---- AAGTAATGTT 3070 het 3070 hom 48 23 22 4 AAGT 2 1 231105 CASAVA_Build 15 45468918 1I AACTCTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 10 11 231106 CASAVA_Build 15 45470062 4I CACCGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 TTTG 3 4 231107 CASAVA_Build 15 45470889 1I AGTCTTCCAG -/C CTTCCTGCTG 3070 hom 129 het 51 0 43 8 C 1 2 231108 CASAVA_Build 15 45471149 1D CAACTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 306 hom 36 5 16 15 T 15 14 231109 CASAVA_Build 15 45472004 7D AAGACGGAGG AAGGTGA/------- AAGATTGCCA 3070 hom 102 het 35 0 34 2 AAGGTGA 1 0 231110 CASAVA_Build 15 45476901 1I CCTTTGACTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 T 9 10 231111 CASAVA_Build 15 45477038 3I TTCTGAACTC ---/CTT CTAATTTGGA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 CTT 0 1 231112 CASAVA_Build 15 45497057 3I CAATTACTGC ---/TAA GATTAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 TAA 0 1 231113 CASAVA_Build 15 45501583 1I CCATTGTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 9 10 231114 CASAVA_Build 15 45511987 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAA 3070 hom 90 het 39 0 30 12 AC 5 4 231115 CASAVA_Build 15 45519806 5I CCAAACAAAA -----/TGACG TGACAGTGGG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 TGACG 0 1 231116 CASAVA_Build 15 45523367 4D CTTGGCATAT CTAA/---- CTAAGAACAG 3070 hom 132 het 47 0 45 6 CTAA 2 1 231117 CASAVA_Build 15 45525247 2I CTTAAAAAAC --/AG ATGGTATTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AG 0 1 231118 CASAVA_Build 15 45545384 6D AATTCTGCAA TAATAT/------ TACCTATTGG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TAATAT 1 0 231119 CASAVA_Build 15 45549508 1D AAATGCAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 10 9 231120 CASAVA_Build 15 45557374 1D AGTTCAGCTC T/- TTTCTATGTA 3070 hom 129 het 44 0 44 1 T 4 3 231121 CASAVA_Build 15 45563932 1D GGTACTTTCG A/- AACACCTCCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 3 2 231122 CASAVA_Build 15 45564262 1D TTTCAATTCT G/- TTTCTCATTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 0 231123 CASAVA_Build 15 45576637 4D TCTGCCTGTG AGAA/---- AGAAACATTC 3070 hom 111 het 42 0 38 6 AGAA 2 1 231124 CASAVA_Build 15 45579801 1D TATAAATGGG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 8 7 231125 CASAVA_Build 15 45618897 1I CCTGGCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 19 0 11 8 T 11 12 231126 CASAVA_Build 15 45619534 2I TATATTTAGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 416 hom 43 2 32 9 TG 8 9 231127 CASAVA_Build 15 45621358 1D TTCTCTGTGC T/- GTTGCTGAAT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 1 0 231128 CASAVA_Build 15 45639701 1D ATTCAGAGAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 A 9 8 231129 CASAVA_Build 15 45641233 3D AATTTTAAAA TAT/--- TATGTAAGAT 2190 het 2190 ref 14 9 5 0 TAT 2 1 231130 CASAVA_Build 15 45655283 1I TGATCTCTTT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 A 6 7 231131 CASAVA_Build 15 45657366 1D TGTAAAAAAA T/- GTCTTACTGA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 T 1 0 231132 CASAVA_Build 15 45661399 1I CATGGGAATA -/G GATATACACA 3070 hom 104 het 39 0 34 5 G 1 2 231133 CASAVA_Build 15 45667282 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 12 11 231134 CASAVA_Build 15 45670009 1I CCTAGAACTT -/A AAAGTATAAT 2396 het 2396 ref 16 7 5 4 A 3 4 231135 CASAVA_Build 15 45670149 3I GCATCCTTGT ---/AAG AAGAGGAAGG 3070 het 3070 ref 50 25 24 1 AAG 1 2 231136 CASAVA_Build 15 45674162 2D CCCAGTCTAA TG/-- AGGGAGGTGG 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 TG 1 0 231137 CASAVA_Build 15 45678387 2D TTATTATGTA CT/-- CTGAGATGAG 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 CT 2 1 231138 CASAVA_Build 15 45678939 1I TGCCTTACGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 T 11 12 231139 CASAVA_Build 15 45685057 1D ATGGGGTGTC T/- TAGGCTACCT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 2 1 231140 CASAVA_Build 15 45686594 4D GGACTTGATC AGAT/---- AGATACCTTT 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 AGAT 2 1 231141 CASAVA_Build 15 45688388 2D TTATACAAAA AT/-- AAGCATTAAT 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 AT 1 0 231142 CASAVA_Build 15 45698396 3D TGTGAAATAT GTA/--- GTAGTCAGAT 3070 het 3070 ref 52 27 23 4 GTA 2 1 231143 CASAVA_Build 15 45699423 3D AGCTTAGATT TTA/--- TTATTTTAAT 3070 het 3070 hom 36 11 22 4 TTA 2 1 231144 CASAVA_Build 15 45700251 1I TGAGTGTGGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2243 hom 19 6 11 2 T 8 9 231145 CASAVA_Build 15 45700871 1D CCAGGACAGA T/- TTTTTTTTTT 1445 het 1445 ref 41 30 4 7 T 11 10 231146 CASAVA_Build 15 45711910 103D CCAGCTATAA TTGTGCATTTGTTTATTTCTCCTTTCAGCTTTCAGTGGTTGGCTCATGTGGTGTTTTATATGTACACATTTATAATCATTATGTCTTCCTGAAGAATTAATCT/------------------------------------------------------------------------------------------------------- CTCTTTGTCT 2548 het 2548 ref 20 34 7 2 TTGTGCATTTGTTTATTTCTCCTTTCAGCTTTCAGTGGTTGGCTCATGTGGTGTTTTATATGTACACATTTATAATCATTATGTCTTCCTGAAGAATTAATCT 1 0 231147 CASAVA_Build 15 45717799 1D AGTAAGATGA G/- GCAGGATGTG 3070 het 3070 hom 51 16 28 7 G 2 1 231148 CASAVA_Build 15 45720738 3D GTCTAGAAAT ATC/--- ATGGCTTTAA 3070 het 3070 hom 42 14 23 6 ATC 1 0 231149 CASAVA_Build 15 45721930 2I GAAACAGATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 53 24 18 11 CA 8 9 231150 CASAVA_Build 15 45739685 1D TCAACATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 A 12 11 231151 CASAVA_Build 15 45770290 1D TTTTTAACAC T/- TCATTTTGTA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 2 1 231152 CASAVA_Build 15 45771339 1D AAAAGACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3064 hom 28 8 18 2 A 12 11 231153 CASAVA_Build 15 45772427 1D GAAATCTTAC A/- AAAAGGAGTA 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 A 5 4 231154 CASAVA_Build 15 45773644 2D CTATTGAAAC AG/-- AAACTCTTGG 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 AG 1 0 231155 CASAVA_Build 15 45779621 1I AAATCAAAAA -/G GGAACTAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 G 2 3 231156 CASAVA_Build 15 45786309 1D TCACCATAAG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 8 7 231157 CASAVA_Build 15 45797136 1D CGTGGCAAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 T 10 9 231158 CASAVA_Build 15 45799718 3I CCTGGCCTTA ---/TTC TTCCTCGTAG 1974 het 1974 ref 25 10 5 10 TTC 1 2 231159 CASAVA_Build 15 45828522 3D GAAGAACATG AAA/--- AAAAATAGCA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 8 5 231160 CASAVA_Build 15 45839621 5I ATTTTGAGTT -----/AAAAG AAAAAGACCA 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 AAAAG 0 1 231161 CASAVA_Build 15 45840154 1D GCAGCAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2753 hom 32 8 18 6 A 11 10 231162 CASAVA_Build 15 45846430 1D ATTTATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 12 11 231163 CASAVA_Build 15 45847433 7I TAGGTTCTGC -------/TAACTCT TTGGAAGAAA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 TAACTCT 0 1 231164 CASAVA_Build 15 45856327 5I38M1I AGGTAATGAC -----CATTCAAATGGTGAATCAACTAGAATTCATATATAAAG-/TTGGTCATTCAAATGGTGAATCAACTAGAATTCATATATAAAGA AAAAATAGCA 3070 het 3070 ref 39 31 15 4 N/A 0 0 231165 CASAVA_Build 15 45870075 1I GCACAGGACT -/G GGGCTCAGGA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 G 3 4 231166 CASAVA_Build 15 45873108 1I ATTTTCATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 10 11 231167 CASAVA_Build 15 45879919 3D GTAGTCCCAG CTA/--- CTCGGGAGGC 3070 hom 27 het 13 0 10 4 CTA 1 0 231168 CASAVA_Build 15 45898726 1D GGAGCACTCA T/- TTTTGGGAGA 3070 hom 110 het 38 0 34 4 T 5 4 231169 CASAVA_Build 15 45912550 1I GAACATTCAA -/C AAAATGACTA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 0 1 231170 CASAVA_Build 15 45922443 13I AAGCTCCCCA -------------/GTCTATGATATTC TATTATGGCA 3070 hom 120 het 41 0 40 1 GTCTATGATATTC 0 1 231171 CASAVA_Build 15 45927594 1D15M5D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAGATAAAAG/-AAAAAAAAAAAAGAT----- AAAATTTGCA 2053 het 2053 ref 16 12 6 4 N/A 0 0 231172 CASAVA_Build 15 45930267 1D AGAGAAAGAA C/- TTTTTAGGTG 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 C 1 0 231173 CASAVA_Build 15 45935887 2D GGCACTTGCC TA/-- TGTAGTCCCA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TA 1 0 231174 CASAVA_Build 15 45941076 2D TCACAACAAC CA/-- CACATACTCT 3070 het 3070 ref 45 27 14 5 CA 3 2 231175 CASAVA_Build 15 45970591 1D CCTTGCATGG C/- CCACTAATGA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 C 3 2 231176 CASAVA_Build 15 46017184 1I TTGGAGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 19 0 14 5 T 10 11 231177 CASAVA_Build 15 46017194 1I TTTTTTTTTT -/A AAATACATAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 3 4 231178 CASAVA_Build 15 46044961 1D CACTCTCACA T/- TTTAAAGCCT 3070 hom 72 het 30 0 24 7 T 4 3 231179 CASAVA_Build 15 46064046 1D GTTTTATTTG T/- TTTTTTTTTT 1674 het 194 hom 16 1 7 8 T 14 13 231180 CASAVA_Build 15 46073020 1I TATAATGATA -/C CCCAAATTGC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 3 4 231181 CASAVA_Build 15 46079347 2D CTGAATATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 316 hom 22 1 9 13 TA 9 8 231182 CASAVA_Build 15 46116635 1I CCTGGCATCT -/C TAGATTCACC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 231183 CASAVA_Build 15 46120269 1D TGCTTACTAT G/- TGCCAGGTAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 1 0 231184 CASAVA_Build 15 46126539 1D GCCAAGGCGA T/- TTGCTTCCTT 3070 hom 120 het 42 0 39 3 T 3 2 231185 CASAVA_Build 15 46138925 3I TTATCATCAC ---/CAT CATCATCATC 3070 hom 78 het 35 0 27 8 CAT 3 4 231186 CASAVA_Build 15 46191298 1D GGTTAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 721 het 721 ref 51 30 5 16 A 15 14 231187 CASAVA_Build 15 46207058 11D CTGTAATCCC AGTGCTTTGGG/----------- AGTCCAAGGT 3070 hom 75 het 24 0 26 7 AGTGCTTTGGG 1 0 231188 CASAVA_Build 15 46240174 4I GGCTAAGATG ----/AAGT AAGTGTAAAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AAGT 1 2 231189 CASAVA_Build 15 46240369 1D ATTACAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 34 0 26 9 A 10 9 231190 CASAVA_Build 15 46251000 1D AATTTCTTCA T/- TTTTCCCCCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 5 4 231191 CASAVA_Build 15 46253881 1D TTGGCAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 712 hom 41 2 28 11 T 14 13 231192 CASAVA_Build 15 46267715 1D TAAGGTGATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 8 231193 CASAVA_Build 15 46272889 5D AATTTTGTGG TATAA/----- TATATTTCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TATAA 1 0 231194 CASAVA_Build 15 46276504 1I CATTGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 984 hom 42 3 25 14 T 14 15 231195 CASAVA_Build 15 46297463 1D ACGCAGGTAA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 8 7 231196 CASAVA_Build 15 46308149 12I TGGATAATAC ------------/ATCACACTCTAT AGATATCTTA 1648 het 1648 ref 17 13 4 1 ATCACACTCTAT 0 1 231197 CASAVA_Build 15 46314835 1I CTGTAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 10 11 231198 CASAVA_Build 15 46328827 1I ACTTTTTGTA -/G GTAGAGGTCT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 G 1 2 231199 CASAVA_Build 15 46345935 1I AAGCCTGGGC -/T TTTTTTTTTT 1684 het 1684 ref 34 14 7 13 T 14 15 231200 CASAVA_Build 15 46351013 9I TTATCATTAT ---------/ATTGAGCAG ATTTATGCAA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 ATTGAGCAG 0 1 231201 CASAVA_Build 15 46386185 1I GCTCCTGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 20 0 A 9 10 231202 CASAVA_Build 15 46401822 1D CACCAGAACA C/- CTGTATCATC 3070 het 3070 ref 43 22 17 6 C 2 1 231203 CASAVA_Build 15 46406247 2I TTATGAAATC --/AA AAGTCTACAT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 2 4 231204 CASAVA_Build 15 46409899 45D TCATTACATC TTAGTACAAGCAAGGAATCAAATAGTATGTCTCTCATGTGAACAT/--------------------------------------------- TTTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 38 29 17 9 TTAGTACAAGCAAGGAATCAAATAGTATGTCTCTCATGTGAACAT 1 0 231205 CASAVA_Build 15 46423583 1I ACCCGGAATG -/T TTTCCATCTG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 3 4 231206 CASAVA_Build 15 46427234 2D AATAGGATGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 8 13 14 AT 10 9 231207 CASAVA_Build 15 46427880 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2821 het 2821 ref 21 12 8 1 T 12 11 231208 CASAVA_Build 15 46431598 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 1915 hom 17 4 11 2 T 8 7 231209 CASAVA_Build 15 46444482 3D CCTGTCATCT TCA/--- TCAACACCAA 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 TCA 2 1 231210 CASAVA_Build 15 46446673 1I TGTGTAAGGC -/A ACTAGCACCC 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 1 2 231211 CASAVA_Build 15 46461199 1D AAAGGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2884 hom 29 8 13 9 A 12 11 231212 CASAVA_Build 15 46471257 16D39M2D ATATATATAT ACACATACACATACACACACACACACACATAACATTTTAATATACATATATTATGTA/----------------ACACACACACACATAACATTTTAATATACATATATTATG-- TATATATATA 1507 hom 12 het 11 0 5 20 N/A 0 0 231213 CASAVA_Build 15 46478367 2D CTAAGCTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 2973 het 2973 ref 41 15 11 16 T 14 12 231214 CASAVA_Build 15 46485045 4I AGAGATTTAC ----/CCCA TGAGGGGCGA 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 CCCA 0 1 231215 CASAVA_Build 15 46499992 1D TCAATTATAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 T 8 7 231216 CASAVA_Build 15 46524419 2I GTGAGTATAT --/AA AGATTTTAAG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 1 3 231217 CASAVA_Build 15 46541841 1D CAATTTAGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 10 9 231218 CASAVA_Build 15 46542061 1I CAAGTGTGTA -/G GAATTCCCGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 1 2 231219 CASAVA_Build 15 46571143 1I CCCGGCCCAC -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 33 12 8 13 T 6 7 231220 CASAVA_Build 15 46576529 1I TTTAAGGAGC -/A AAATCATTTC 3070 het 3070 ref 53 25 16 12 A 3 4 231221 CASAVA_Build 15 46577575 1D CTGAGGAGGG A/- ATCTCATAGT 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 A 2 1 231222 CASAVA_Build 15 46577666 1D TAGGGTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 11 10 231223 CASAVA_Build 15 46589103 1D ATAACATGTA T/- TTTTACATTA 1999 het 1999 ref 17 8 5 4 T 5 4 231224 CASAVA_Build 15 46603200 3D AAGGGTGGCT GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 het 297 hom 21 4 14 4 G 13 10 231225 CASAVA_Build 15 46604580 2D GTCAAATCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1039 hom 25 4 9 14 T 14 12 231226 CASAVA_Build 15 46609219 2D TTGATTGTAC AA/-- ACTCAACCCA 3070 het 3070 ref 44 20 17 8 A 3 1 231227 CASAVA_Build 15 46610595 2I GCATGAACTC --/TG TTTCCTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 TG 0 1 231228 CASAVA_Build 15 46613720 1D AGACAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 12 11 231229 CASAVA_Build 15 46641401 1D GCTTATTGGT A/- AAAAGCCCAA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 5 4 231230 CASAVA_Build 15 46643997 1D GATTCAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 11 10 231231 CASAVA_Build 15 46651833 1D ATGTATTATT A/- AATCTCTACC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 3 2 231232 CASAVA_Build 15 46682860 2I CATGGGAAAC --/TT TGTATTCGTT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 1 3 231233 CASAVA_Build 15 46695242 3D TTAAAGTTGT GAA/--- GAAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 GAA 3 2 231234 CASAVA_Build 15 46699365 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1941 hom 26 8 14 5 A 13 12 231235 CASAVA_Build 15 46707126 1D ATGATCTTCT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 A 8 7 231236 CASAVA_Build 15 46718107 1D ACATCAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 528 hom 38 3 19 17 T 17 16 231237 CASAVA_Build 15 46735834 1D ACCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 40 1 32 7 A 11 10 231238 CASAVA_Build 15 46739893 4I AGGGAGAGAT ----/GGAG GAAGGGGTAA 3070 hom 86 het 33 0 28 5 GGAG 0 1 231239 CASAVA_Build 15 46743959 1D GCCCTAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 766 hom 28 3 13 12 A 15 14 231240 CASAVA_Build 15 46746587 4D TTTTATATAC AGAT/---- ATTCATAGCA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AGAT 1 0 231241 CASAVA_Build 15 46750016 2D CAGTGAGAAC AG/-- AGACAGGGAC 3070 hom 132 het 47 0 43 6 AG 2 1 231242 CASAVA_Build 15 46750123 1D AATGGAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 33 5 20 9 A 16 15 231243 CASAVA_Build 15 46756093 4D CTGGGGTGTG TTTC/---- TTTTTTATTT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TTTC 1 0 231244 CASAVA_Build 15 46766972 3D AAAAAAAGAC AGA/--- AGAACCTAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 AGA 2 1 231245 CASAVA_Build 15 46780070 11I AGATACAACA -----------/TATATGCTAGC TATATGCTAG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TATATGCTAGC 1 2 231246 CASAVA_Build 15 46786432 1I AGTTGCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1851 hom 20 5 9 6 T 10 11 231247 CASAVA_Build 15 46789220 1I TTTTGAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 26 0 21 5 T 10 11 231248 CASAVA_Build 15 46789531 1D CATATTGTTT A/- ATTTCTATGT 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 A 2 1 231249 CASAVA_Build 15 46791092 1D TCCAAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 19 8 T 14 13 231250 CASAVA_Build 15 46792579 2I AATTTTTGTA --/TT TTTTTTTTGT 3070 hom 50 het 39 1 34 4 T 8 10 231251 CASAVA_Build 15 46795967 1D AAAACACAGG A/- AATCTACCCT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 3 2 231252 CASAVA_Build 15 46799638 3I AGAAGGAAGG ---/AGA AGGAGAAGAG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 AGA 0 1 231253 CASAVA_Build 15 46855412 1D ATAAAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 135 het 48 0 45 3 A 11 10 231254 CASAVA_Build 15 46858439 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1742 het 1742 ref 24 10 11 3 A 15 16 231255 CASAVA_Build 15 46865875 1I AAAATCAGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 141 het 55 0 47 8 A 9 10 231256 CASAVA_Build 15 46878030 1D TTAAATGCTC T/- GATAATGTAG 3070 het 3070 ref 43 24 13 7 T 1 0 231257 CASAVA_Build 15 46878406 3D AAAACCCAAT ATA/--- ATAATATTAC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 ATA 3 2 231258 CASAVA_Build 15 46885026 1I TAGTGTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 17 7 C 0 1 231259 CASAVA_Build 15 46887394 5I GTTTTGTTTT -----/TAAAG TAAAGAGAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TAAAG 1 2 231260 CASAVA_Build 15 46892769 3D AAGGAAGAAG AGA/--- AGGAGAGAGC 3070 het 3070 hom 47 22 23 6 AGA 1 0 231261 CASAVA_Build 15 46893484 1I GATTGTGGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 65 27 26 12 A 9 10 231262 CASAVA_Build 15 46898164 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1522 het 1522 ref 18 6 5 7 TA 9 8 231263 CASAVA_Build 15 46899378 2I AGGCACACAC --/CA CCATGCCTGG 3070 het 2306 hom 17 6 11 0 CA 0 1 231264 CASAVA_Build 15 46904418 1I ATTCAATATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 9 10 231265 CASAVA_Build 15 46907040 11I TTTGTATTTC -----------/TTCTGCCTCCA TTCTGCCTCA 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 TTCTGCCTCCA 0 1 231266 CASAVA_Build 15 46918204 1D TAGAAAAAAC A/- TAATAAAGAT 3070 het 3070 hom 28 13 15 1 A 1 0 231267 CASAVA_Build 15 46920535 5D ATTTCATATT ATTGA/----- ATTGCCTATG 3070 het 3070 ref 41 18 20 4 ATTGA 1 0 231268 CASAVA_Build 15 46939647 1I AAATAAATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 8 8 T 9 10 231269 CASAVA_Build 15 46941686 1I GGTTTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3003 hom 27 9 9 9 T 13 14 231270 CASAVA_Build 15 46942970 4I ATGAATACTA ----/AATT AATTTTGTCT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 AATT 1 2 231271 CASAVA_Build 15 46952616 1I TGTAATATTC -/A AATGGTGGCA 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 A 2 3 231272 CASAVA_Build 15 46953974 4D GCTCACATTA CTGT/---- CTGAGTTCTG 3070 het 3070 ref 41 21 13 10 CTGT 1 0 231273 CASAVA_Build 15 46954682 4D TAGCAAGTGG CTAT/---- CTAACAAAGC 3070 het 3070 ref 60 32 23 8 CTAT 1 0 231274 CASAVA_Build 15 46957128 1D CACTATAACT A/- AAAAAAAAAA 2123 het 2123 ref 38 28 7 4 A 13 12 231275 CASAVA_Build 15 46992547 3I TGATGCTCTA ---/TTT TTGGGCTGGT 1815 het 1815 ref 15 7 6 2 T 2 5 231276 CASAVA_Build 15 46997279 1I TCCTCTGCTC -/T TATCTGAGTA 3070 hom 93 het 39 0 30 9 T 1 2 231277 CASAVA_Build 15 46998069 1D TTTCTTTAAA T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 hom 39 19 18 3 T 7 6 231278 CASAVA_Build 15 46998586 1I TTCAAGACCT -/C CCCTGGATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 3 4 231279 CASAVA_Build 15 47002361 2I TGGAAAGTAG --/TC TAGATACCAT 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 TC 0 1 231280 CASAVA_Build 15 47007658 3I TACAGGCCAG ---/AAC AACAACGTCT 3070 het 3070 ref 39 15 17 7 AAC 2 3 231281 CASAVA_Build 15 47018191 1I ACAGCAGATG -/C CCCCAGCCAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 4 5 231282 CASAVA_Build 15 47020023 1D TCAAACTTTC T/- TCTACTCCAT 3070 het 3070 hom 49 19 26 5 T 2 1 231283 CASAVA_Build 15 47024841 1D GAATTCCAAT C/- AGTATCCACT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 C 1 0 231284 CASAVA_Build 15 47025219 3I AGAGGGAGTG ---/GCT GCTAATGGTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 GCT 1 2 231285 CASAVA_Build 15 47050435 1I TTGAACAAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 9 10 231286 CASAVA_Build 15 47054854 1D CCTATACGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 11 10 231287 CASAVA_Build 15 47068619 1I GACAAGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 T 12 13 231288 CASAVA_Build 15 47076173 2I TCAGGGTCAG --/AC ACACTTTCAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 AC 2 3 231289 CASAVA_Build 15 47078820 1I CAGCTCCTAT -/A GATAAAGATC 3070 het 3070 hom 53 24 23 6 A 0 1 231290 CASAVA_Build 15 47081520 2D TGAGGAATCG AC/-- ACACTGTCTT 3070 het 3070 hom 40 19 18 5 AC 3 2 231291 CASAVA_Build 15 47084819 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 20 8 8 4 A 9 7 231292 CASAVA_Build 15 47091623 1D TAGAGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 21 15 7 A 11 10 231293 CASAVA_Build 15 47094294 4D AACTGCTAAA TGTT/---- TGTTTATGTA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 TGTT 2 1 231294 CASAVA_Build 15 47102517 1I AGAAGCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 10 11 231295 CASAVA_Build 15 47109537 1D AAGACAGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1640 hom 35 7 17 11 A 12 11 231296 CASAVA_Build 15 47113532 1I TTTCCAACAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 9 10 231297 CASAVA_Build 15 47113910 1D CATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1935 het 1935 ref 36 20 5 11 T 13 12 231298 CASAVA_Build 15 47123098 1D AAAATGCAAG T/- TTTTTTTTTT 2960 het 81 hom 25 1 8 18 T 15 14 231299 CASAVA_Build 15 47157718 1I TATTATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 10 11 231300 CASAVA_Build 15 47160467 1D TTTAAAAATG T/- TTTTTTTTTT 2730 het 2730 ref 25 12 8 5 T 11 10 231301 CASAVA_Build 15 47163910 1D AAAAGAGCTG C/- CTTTGTCAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 C 2 1 231302 CASAVA_Build 15 47186109 2D ATATAAAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 32 1 20 12 A 15 13 231303 CASAVA_Build 15 47193582 1D GTCTCCCAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 10 9 231304 CASAVA_Build 15 47202192 1D GTAACTAATG T/- TAACACAGTA 3070 het 3070 ref 44 22 20 4 T 2 1 231305 CASAVA_Build 15 47208854 3D TTAAAAAATG TAT/--- TATTATAATA 2868 het 2868 ref 23 13 7 3 TAT 3 2 231306 CASAVA_Build 15 47213049 3I AGGAAAACTA ---/AGT AGTAGATACT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AGT 1 2 231307 CASAVA_Build 15 47217816 4D TCAGAAAACA CTCT/---- CTATTTATGC 3070 het 3070 ref 42 22 15 9 CT 3 1 231308 CASAVA_Build 15 47232809 2D CACATACATG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 A 11 9 231309 CASAVA_Build 15 47238320 4I CAATATTTGG ----/TTGT TTGTTTATAT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 TTGT 1 2 231310 CASAVA_Build 15 47248208 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 2141 het 2141 ref 21 6 10 5 A 15 16 231311 CASAVA_Build 15 47248269 1D ACATTTTACA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 34 het 18 0 14 4 T 9 8 231312 CASAVA_Build 15 47250176 3D CCACACTGAA CTC/--- CTCTCTTTGT 3070 het 2936 hom 26 7 15 5 CTC 2 1 231313 CASAVA_Build 15 47251266 1D GTTTAGTCTT A/- TTTTTTTTTT 2973 het 2973 ref 29 11 14 4 A 1 0 231314 CASAVA_Build 15 47259142 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1867 hom 42 10 16 16 T 18 17 231315 CASAVA_Build 15 47271352 1D ATTTTCTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 9 231316 CASAVA_Build 15 47277354 1I TGTACTTATA -/T TTTTAAAACA 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 4 5 231317 CASAVA_Build 15 47284670 1D ATTGTGCCAC T/- ATAAACATGC 3070 het 3070 ref 38 25 11 2 T 1 0 231318 CASAVA_Build 15 47291961 1I ATTTCATTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 15 7 6 T 9 10 231319 CASAVA_Build 15 47294426 2D ACCCCTCAGC TG/-- TGTTTGTCTG 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 TG 2 1 231320 CASAVA_Build 15 47303694 4D TTTTTGCTTG TTTA/---- TTTGTTTACA 3070 het 3070 ref 60 30 23 8 TTTA 1 0 231321 CASAVA_Build 15 47320345 1I TTTAGGAAGA -/G GGTAAGGTGA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 G 2 3 231322 CASAVA_Build 15 47321376 1D AGCAAATACA T/- TTTTTTATCG 3070 het 3070 ref 45 18 15 13 T 7 6 231323 CASAVA_Build 15 47355798 6D TTTCAGGTTG TGTGTT/------ TGTGTTTGTG 3070 het 3070 ref 54 28 20 11 TGTGTT 2 1 231324 CASAVA_Build 15 47367449 4I TCTGTCTCTT ----/TCTC TCTCTCCATC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TC 3 5 231325 CASAVA_Build 15 47376094 1D TGTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 17 8 T 13 12 231326 CASAVA_Build 15 47377418 1D AATTTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 11 10 231327 CASAVA_Build 15 47395825 1I TGTGGAGGGG -/A AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 A 5 6 231328 CASAVA_Build 15 47400714 15D GGAGGTGAAT AAATGAGAACAGCAA/--------------- ATGCATAGGC 3070 het 3070 hom 44 20 23 4 AAATGAGAACAGCAA 1 0 231329 CASAVA_Build 15 47408264 1D AGACTAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1305 hom 35 3 20 12 T 15 14 231330 CASAVA_Build 15 47408507 2D TTTCTTATCA CT/-- CTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 CT 2 1 231331 CASAVA_Build 15 47409296 1D GGATCAGTGT A/- AAAAAAAAAA 2795 het 2066 hom 26 8 9 9 A 17 16 231332 CASAVA_Build 15 47431250 1D CTGACCCTAT A/- AGGGAGGTCT 3070 het 3070 ref 54 27 20 8 A 2 1 231333 CASAVA_Build 15 47433104 1D AAAATAAGGG T/- TTTTTTTTTT 1537 het 1537 ref 34 17 5 12 T 15 14 231334 CASAVA_Build 15 47440057 6D GCTTATAAAA ACATAG/------ ACAAAGTATG 3070 het 3070 ref 34 18 12 7 ACATAG 1 0 231335 CASAVA_Build 15 47448615 3I GCCTGGCTAA ---/TTT TTTTTTTATT 3060 het 2967 hom 16 7 7 2 T 7 10 231336 CASAVA_Build 15 47454994 1I AGCATTTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 9 10 231337 CASAVA_Build 15 47457982 2D TATTTCATCA GT/-- GTTTTATAGT 3070 het 3070 ref 39 29 10 1 GT 2 1 231338 CASAVA_Build 15 47465089 1D TAACACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 A 13 12 231339 CASAVA_Build 15 47470614 12D TTTAGATTAT ATGAATTAAGAC/------------ ATGAGGAGAT 3070 het 3070 hom 41 18 24 0 ATGAATTAAGAC 1 0 231340 CASAVA_Build 15 47498289 1D GAAAAAAAAA G/- AAATATGTGT 3070 het 1643 hom 17 5 10 2 G 1 0 231341 CASAVA_Build 15 47518324 4I CTAAGCAACT ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 GA 5 7 231342 CASAVA_Build 15 47523414 1D CCCTGAGAGT C/- AGTTGTTAAA 3070 het 3070 hom 39 12 21 7 C 1 0 231343 CASAVA_Build 15 47528592 4D GATAGGAATT CAAA/---- CAGAGACTTG 3070 het 3070 ref 44 22 17 7 CAAA 1 0 231344 CASAVA_Build 15 47529296 4I ATAGTCAATT ----/ATAA ATAAAGATAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 ATAA 1 2 231345 CASAVA_Build 15 47537367 1D TAAATGAATC T/- AATCATTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 1 0 231346 CASAVA_Build 15 47543422 4I TTGTTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 47 15 19 13 TTTG 3 4 231347 CASAVA_Build 15 47545081 4D CAAAACCAAA AAAG/---- AGAGACCTAT 3070 het 3070 ref 26 16 8 5 AAAG 1 0 231348 CASAVA_Build 15 47550759 1I TGGATCACCT -/G AGGTCAGGAG 3070 hom 47 het 20 0 14 6 G 0 1 231349 CASAVA_Build 15 47554488 4D AAACTATAAA AGAT/---- AGAATAAACT 2425 het 2425 ref 22 14 5 4 AGAT 1 0 231350 CASAVA_Build 15 47555104 1I AATTTATTAA -/T TTTTTTCATA 3070 het 2150 hom 16 8 7 1 T 6 7 231351 CASAVA_Build 15 47555720 1D TTTTGTTTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 645 hom 27 4 19 4 G 2 1 231352 CASAVA_Build 15 47558733 2I ATGAGCTGAT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 TC 5 6 231353 CASAVA_Build 15 47563481 1D ATGTGGGAAT A/- AGTAATATGA 1417 het 1417 ref 52 42 4 6 A 2 1 231354 CASAVA_Build 15 47564963 1D TGTTATTTAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 10 9 231355 CASAVA_Build 15 47566910 3D CATAATATAA ATT/--- ATAATATAAA 3070 het 2860 hom 16 7 8 2 ATT 1 0 231356 CASAVA_Build 15 47571224 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATGC 3070 het 3070 hom 55 23 28 5 AT 5 4 231357 CASAVA_Build 15 47577184 1D AAGATTATAG A/- AAAAATACCT 3070 het 3070 hom 35 14 13 10 A 6 5 231358 CASAVA_Build 15 47583915 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 1685 hom 12 het 7 0 5 2 A 9 10 231359 CASAVA_Build 15 47601048 1I GTGTTCAGTT -/A ACACCTCCCT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 1 2 231360 CASAVA_Build 15 47602514 4D ACTCAGACTC TCTT/---- TCTTTTACTC 3070 het 3070 ref 30 20 10 3 TCTT 2 1 231361 CASAVA_Build 15 47605283 1I CAACAATGGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2625 hom 16 7 9 0 A 9 10 231362 CASAVA_Build 15 47606539 3D AAACCAGTAT CAC/--- CCAGTACCAA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 CAC 1 0 231363 CASAVA_Build 15 47609790 1D CCTATGGGTC T/- TTCAAAGCAT 3070 hom 146 het 54 0 48 6 T 3 2 231364 CASAVA_Build 15 47610588 4D TTTAAACTAA TAAT/---- TAAATTATAA 3070 het 3070 hom 26 12 13 4 TAAT 1 0 231365 CASAVA_Build 15 47614059 2I TTAAGAAGAC --/AG AAGATTAATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AG 0 1 231366 CASAVA_Build 15 47618418 1D TATCAGGAAA T/- TGTTGAGTAT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 T 2 1 231367 CASAVA_Build 15 47621787 1D GATGAAATTA T/- TTGGGTTGGA 3070 het 3070 ref 30 17 10 5 T 3 2 231368 CASAVA_Build 15 47624625 2D ATCCTCAAAC TT/-- TTTTTTGGCA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 8 6 231369 CASAVA_Build 15 47626244 4I AAAAAGAAAT ----/AAAC AAAGCCTCCA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AAAC 0 1 231370 CASAVA_Build 15 47631876 4D TGTTTCTTTC TTTT/---- ATCTTGCTGC 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 T 4 0 231371 CASAVA_Build 15 47635727 1I TTTCTTTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2595 hom 32 7 17 8 T 9 10 231372 CASAVA_Build 15 47636162 1I CTGACAGACA -/G GGGGGCACTC 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 G 5 6 231373 CASAVA_Build 15 47637614 1D TAATGCCTAA T/- GCCCCAACTT 3070 het 3070 ref 44 25 13 8 T 1 0 231374 CASAVA_Build 15 47645758 1I GCCATGAGCA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 7 8 231375 CASAVA_Build 15 47647839 1D TGTCAGGCTT A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 7 6 231376 CASAVA_Build 15 47648750 1I GTCTTCCCTA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 6 7 231377 CASAVA_Build 15 47651318 1D AGACTATTCA G/- GGATCTTCTG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 G 3 2 231378 CASAVA_Build 15 47652733 2I TTTCTAGATA --/TC TGTTATTATT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TC 0 1 231379 CASAVA_Build 15 47662687 4D AACTCCCGTA TTTG/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 TTTG 1 0 231380 CASAVA_Build 15 47675430 10D TTTTTAAAAA TGAACAAAGC/---------- CTCCAAGGAG 3070 het 3070 ref 25 19 9 4 TGAACAAAGC 1 0 231381 CASAVA_Build 15 47680153 1I CAAAAAAAAA -/G AAAAAAATCC 3070 het 2385 hom 22 10 10 2 G 0 1 231382 CASAVA_Build 15 47682991 1I GCTTACTGAA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 7 8 231383 CASAVA_Build 15 47683840 1I TTGTTGGCAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 T 9 10 231384 CASAVA_Build 15 47687285 1D TTAATTCTTT G/- TGGCTGTATT 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 G 1 0 231385 CASAVA_Build 15 47697117 1I GCAAGATACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 9 10 231386 CASAVA_Build 15 47703540 1I TTACAATCTT -/A AAAAAAAAAA 2532 het 2532 ref 19 8 8 3 A 11 12 231387 CASAVA_Build 15 47720188 4I GATAATTACA ----/TTGT TTGTTTATTT 3070 hom 121 het 45 0 41 4 TTGT 1 2 231388 CASAVA_Build 15 47739654 1D TGTTTTAAAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 111 het 45 0 38 8 T 8 7 231389 CASAVA_Build 15 47745956 3D CTGTATATGT ACC/--- ACATTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 ACC 1 0 231390 CASAVA_Build 15 47749120 1I TTGAAATCTT -/A ACAGGGAGTT 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 A 1 2 231391 CASAVA_Build 15 47749342 5I TTATAGATTT -----/TAAAA TAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 TAAAA 1 2 231392 CASAVA_Build 15 47765348 1D ATTCTGATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2923 hom 30 11 12 7 A 13 12 231393 CASAVA_Build 15 47784304 1I TTTCATTTAA -/T TTTTTATGCT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 5 6 231394 CASAVA_Build 15 47791352 1I4M1I TTATAGCTCT -TTAT-/GGTATC AGCTGCAGAG 3070 hom 87 het 32 0 29 6 N/A 0 0 231395 CASAVA_Build 15 47793250 4I TTTGATGGGG ----/TTTT TTGTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 6 231396 CASAVA_Build 15 47798789 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2018 hom 21 5 11 5 T 10 11 231397 CASAVA_Build 15 47814449 1I CATTGCTGGT -/C CACCAGGCAA 3070 hom 100 het 39 0 32 7 C 1 2 231398 CASAVA_Build 15 47818747 1I ACAAACTTCA -/T TTTATCACAG 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 3 4 231399 CASAVA_Build 15 47824001 1D ACTGATACTG A/- AAAAATAATT 3070 het 3070 hom 58 24 33 3 A 6 5 231400 CASAVA_Build 15 47826151 2I GAAAATGTGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 TA 5 6 231401 CASAVA_Build 15 47835044 1I TTTATGGATT -/A ACTGAAAGGA 3070 hom 64 het 33 0 29 4 A 1 2 231402 CASAVA_Build 15 47839035 5I ATAATACACT -----/TATAA TATAATACAC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TATAA 1 2 231403 CASAVA_Build 15 47847440 1I TGTAAATCCA -/G GGGGTGCCCC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 G 4 5 231404 CASAVA_Build 15 47854271 1I ATCATATTCC -/T TTTTCTGATC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 4 5 231405 CASAVA_Build 15 47867501 2D CTCTAATACA TG/-- TGTTTAGTGC 3070 het 3070 ref 45 26 16 5 TG 2 1 231406 CASAVA_Build 15 47877279 2I64M5D TGCCTGTTCA --CTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGTCCAATGGATTGTTGTATGAATGCATTAAAAATTGTAAA/CTCTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGTCCAATGGATTGTTGTATGAATGCATTAAAAATT----- GTACCATGCT 3070 het 3070 ref 23 29 12 8 N/A 0 0 231407 CASAVA_Build 15 47878581 1D GCTTCACTTA T/- TTTTTTTTTT 2429 het 2429 ref 19 9 7 5 T 12 11 231408 CASAVA_Build 15 47878641 1D ACATTTTACC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 8 7 231409 CASAVA_Build 15 47881574 2I TTCTCTATTG --/CC CCAGAATTTA 3033 het 3033 ref 30 21 7 2 C 2 4 231410 CASAVA_Build 15 47887151 1I GAAAAAAAAA -/T AAAAAGATTT 3070 hom 94 het 36 0 31 5 T 0 1 231411 CASAVA_Build 15 47893698 1D CTTTAGGGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 13 15 14 T 10 9 231412 CASAVA_Build 15 47897497 1D GGGGAACAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 9 8 231413 CASAVA_Build 15 47897918 1I CAAAGCTAGC -/G AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 G 0 1 231414 CASAVA_Build 15 47900632 4D ATTGAACATG CATA/---- CAAACACAAA 3070 het 3070 ref 52 23 25 5 CATA 1 0 231415 CASAVA_Build 15 47904307 4D TTCCTTGTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2375 hom 39 7 24 9 AAAC 5 4 231416 CASAVA_Build 15 47907795 1D GATGAGACTA T/- TAAGCCCAGC 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 T 2 1 231417 CASAVA_Build 15 47921203 1D ATACTATTCC T/- CTTGCAAAAC 3070 het 3070 ref 41 25 15 1 T 1 0 231418 CASAVA_Build 15 47925220 1I TGTATTATGA -/G GAAAGCAAGA 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 G 1 2 231419 CASAVA_Build 15 47928821 1D TACTATAGTT A/- TATATAACAT 3070 het 1486 hom 11 3 7 1 A 1 0 231420 CASAVA_Build 15 47931486 1D AGTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 13 12 231421 CASAVA_Build 15 47939424 2D AGGTTGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 A 14 12 231422 CASAVA_Build 15 47948753 1D TGAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 10 9 231423 CASAVA_Build 15 47952270 12D ATTCAATGTG GGATCCTGGATT/------------ GGATCCTGGA 3070 het 3070 ref 48 21 15 19 GGATCCTGGATT 2 1 231424 CASAVA_Build 15 47960602 4D CTCCGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2846 hom 30 9 9 14 AAAC 5 4 231425 CASAVA_Build 15 47965224 14D CCATCACATC CACCCCAGCATCCA/-------------- AATCAGAAAT 3070 het 3070 hom 36 21 18 4 CACCCCAGCATCCA 1 0 231426 CASAVA_Build 15 47967919 1D AGAATTGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 10 9 231427 CASAVA_Build 15 47983384 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 20 4 10 7 A 15 14 231428 CASAVA_Build 15 47984963 1I TTTGAGCAAT -/A AGCTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 23 25 2 A 1 2 231429 CASAVA_Build 15 48027085 1I TTCAATGGTA -/T TTTTTTTACA 3070 het 43 hom 24 1 19 4 T 7 8 231430 CASAVA_Build 15 48033564 1D TTATTATGGC T/- TTTTTTATGG 3070 hom 66 het 29 0 23 8 T 7 6 231431 CASAVA_Build 15 48057556 1D TTGGTCTCTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 9 8 231432 CASAVA_Build 15 48067314 1D CTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 8 231433 CASAVA_Build 15 48099458 1D GCCAAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 49 1 37 12 T 12 11 231434 CASAVA_Build 15 48101646 2I TATTTGCCAC --/AA AAAAAAATGC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 7 9 231435 CASAVA_Build 15 48111058 1D GATCTTTGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 9 8 231436 CASAVA_Build 15 48140680 1I TATATTGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 10 11 231437 CASAVA_Build 15 48144341 14D GCAGGAGCAA AAGGGAGAGGGAGG/-------------- AGGTGCTACA 3070 het 3070 ref 44 33 9 7 AAGGGAGAGGGAGG 1 0 231438 CASAVA_Build 15 48151698 3D CCAAAGTTTG CCC/--- CTGGGACTCT 3070 het 3070 hom 31 11 18 4 C 4 1 231439 CASAVA_Build 15 48162844 1I TATCTATAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 438 hom 26 1 22 3 A 8 9 231440 CASAVA_Build 15 48175243 1I CCCTGTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 A 11 12 231441 CASAVA_Build 15 48185420 1D ATTTTACAGG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 8 7 231442 CASAVA_Build 15 48190398 1I CCATAAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 11 12 231443 CASAVA_Build 15 48202015 4D GGTTTTGTTG TGTT/---- TGTCTGTTTG 3070 het 3070 hom 36 14 20 6 TGTT 1 0 231444 CASAVA_Build 15 48210525 6I AAGGCAGCAG ------/GAAGGA GAAGGAGAAG 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 GAAGGA 1 2 231445 CASAVA_Build 15 48211542 2D TTATAGTACT CA/-- CACACACACT 3070 hom 66 het 30 0 23 8 CA 5 4 231446 CASAVA_Build 15 48212485 1I GCATTAGGAG -/A AATACCTAAT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 2 3 231447 CASAVA_Build 15 48214433 8D CTCAACAGTC ACTCTGTG/-------- ACTCATCAGA 3070 het 3070 hom 52 19 26 9 ACTCTGTG 1 0 231448 CASAVA_Build 15 48219491 1I TATGATGGAC -/T TTTAGAGATT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 3 4 231449 CASAVA_Build 15 48220156 1I ACAAAGAATG -/A AATAACACAC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 2 3 231450 CASAVA_Build 15 48223078 2D TTGACTATAC AG/-- AGTCAGCCGT 3070 het 3070 ref 46 25 16 6 AG 2 1 231451 CASAVA_Build 15 48224241 1I ATTACCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 19 24 13 T 11 12 231452 CASAVA_Build 15 48233135 3I CTAGACACAC ---/CTT CTTAAGGGGA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 CTT 1 2 231453 CASAVA_Build 15 48245267 1I ACACAGAAAG -/A AAAAAAGCAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 6 7 231454 CASAVA_Build 15 48247063 1D CAAAAACACA T/- TTTTTCAAAT 3070 hom 87 het 32 0 29 4 T 6 5 231455 CASAVA_Build 15 48264164 1D CGTCTCGACT A/- AAAAAAAAAA 1182 het 1182 ref 17 12 3 2 A 13 12 231456 CASAVA_Build 15 48276658 1D AATCCTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 10 9 231457 CASAVA_Build 15 48278520 1I AATGTCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 11 12 231458 CASAVA_Build 15 48282867 2D CTCCATCAGA AT/-- ACTTGGCTTG 3070 hom 99 het 37 0 32 6 AT 1 0 231459 CASAVA_Build 15 48286087 2D TGCCCCTCAC TG/-- TCCAGCTTGT 3070 hom 102 het 36 0 33 5 TG 1 0 231460 CASAVA_Build 15 48308558 1I ATCTGTACCT -/A AACCCATAGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 2 3 231461 CASAVA_Build 15 48338495 1I TAAAAATACC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 7 8 231462 CASAVA_Build 15 48339513 2D AGATTCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 467 hom 38 2 25 11 T 16 14 231463 CASAVA_Build 15 48356253 2D CCAGCACCAC AT/-- GTCAGGGTAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AT 1 0 231464 CASAVA_Build 15 48358292 1I AAGAAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 20 0 10 10 T 10 11 231465 CASAVA_Build 15 48358970 1D ATCAATGATT A/- AATTATATAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 3 2 231466 CASAVA_Build 15 48360868 1D GCTCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 13 het 9 0 8 2 T 6 5 231467 CASAVA_Build 15 48368927 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 29 1 21 7 A 12 13 231468 CASAVA_Build 15 48370812 2D ATCCATTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 36 0 27 10 T 14 12 231469 CASAVA_Build 15 48372482 1I GTCTACATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 A 10 11 231470 CASAVA_Build 15 48372625 2D AATAAAACCA CT/-- CTCTACTAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 CT 3 2 231471 CASAVA_Build 15 48374019 1D AATAAATAAA T/- AAAATAAAAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 0 231472 CASAVA_Build 15 48375354 3D CACTGACAAC CTG/--- CTGTTATATT 3070 het 3070 ref 46 28 16 4 CTG 2 1 231473 CASAVA_Build 15 48384770 4D GTCCTATCTC TCTA/---- TCTATCTATC 3070 hom 55 het 37 0 26 12 TCTA 4 3 231474 CASAVA_Build 15 48387191 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2718 hom 28 het 19 0 8 11 A 15 16 231475 CASAVA_Build 15 48390465 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 24 4 13 7 A 17 16 231476 CASAVA_Build 15 48391144 1I ATCGGAAACA -/C TTATGGACCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 231477 CASAVA_Build 15 48396105 2I ACACACACCC --/AA AGTCTTTAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 3 231478 CASAVA_Build 15 48401873 1D TGAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2612 hom 18 het 10 0 7 3 A 13 12 231479 CASAVA_Build 15 48403693 1D ACCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 254 hom 28 2 23 3 A 14 13 231480 CASAVA_Build 15 48404794 2D ATGTTATGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 21 0 16 6 A 18 16 231481 CASAVA_Build 15 48405564 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTGTATTT 3070 hom 36 het 13 0 13 1 T 4 5 231482 CASAVA_Build 15 48411369 5D GTTTTTTGTT TTTTG/----- TTTTTTTTGA 2677 het 1241 hom 16 4 10 3 TTTTG 1 0 231483 CASAVA_Build 15 48420246 6I GTTTGTTGGC ------/CACTAT CACTATGTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CACTAT 1 2 231484 CASAVA_Build 15 48421814 1D GATTGATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 12 11 231485 CASAVA_Build 15 48425200 1D TGTCTGTACA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 9 8 231486 CASAVA_Build 15 48433543 2D AAGTGGGAAG AC/-- ACACACAAAG 3070 het 3070 ref 53 24 22 8 AC 4 3 231487 CASAVA_Build 15 48435661 2D CTTGGGAATA TG/-- TGAGACAGCG 3070 het 3070 hom 41 13 22 9 TG 2 1 231488 CASAVA_Build 15 48435843 1I CCTAAAATAG -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 7 8 231489 CASAVA_Build 15 48439806 1I CACCATCCTC -/A AAAGGTGTTA 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 3 4 231490 CASAVA_Build 15 48442017 1D CAGTGAACTT A/- TAAAAAAAAA 3070 het 537 hom 29 5 14 11 A 1 0 231491 CASAVA_Build 15 48443718 1D CTCCCTGCTC G/- TGAGTTCTAG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 G 1 0 231492 CASAVA_Build 15 48444094 10D TCTTTCTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1693 het 1693 ref 27 10 7 10 T 24 14 231493 CASAVA_Build 15 48447176 1I CATTCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 29 0 11 18 A 12 13 231494 CASAVA_Build 15 48451722 2D CCTTCCTGTC TA/-- TGTGTTATGC 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 TA 1 0 231495 CASAVA_Build 15 48457182 1I AGACAATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 10 11 231496 CASAVA_Build 15 48459023 5D GCAAAGAAAG AATAA/----- AATAAAATAA 3070 hom 41 het 21 0 15 7 AATAA 5 4 231497 CASAVA_Build 15 48465436 1D TGGGATTACA G/- GCATGAGCCA 2989 het 1930 hom 12 5 7 0 G 2 1 231498 CASAVA_Build 15 48475305 2D TCCGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2985 hom 31 11 11 9 T 12 10 231499 CASAVA_Build 15 48485807 1D AGTTAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 33 1 21 11 T 15 14 231500 CASAVA_Build 15 48495366 1D TGAACTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 34 0 18 16 T 16 15 231501 CASAVA_Build 15 48496353 1I TGCTTTGGCT -/A AAAAAAAAAA 901 het 901 ref 31 25 4 2 A 11 12 231502 CASAVA_Build 15 48501321 4D GTATATGGGT TATA/---- TATATATATA 3070 het 127 hom 17 2 9 7 TA 10 8 231503 CASAVA_Build 15 48504316 1I TTGCTTCCGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2930 hom 39 10 11 18 T 13 14 231504 CASAVA_Build 15 48506450 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2829 het 2829 ref 37 18 10 9 T 13 14 231505 CASAVA_Build 15 48508081 3D ACAAGAGATT AAC/--- AACAATAACT 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 AAC 2 1 231506 CASAVA_Build 15 48516494 1D AAATCAATAT G/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 G 1 0 231507 CASAVA_Build 15 48525346 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2776 het 981 hom 17 5 7 5 A 17 16 231508 CASAVA_Build 15 48525885 1I TGTTTAAATA -/G GTTTAAGCTG 3070 het 3070 hom 49 23 26 0 G 1 2 231509 CASAVA_Build 15 48527239 1D TTTACGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 16 1 11 4 T 11 10 231510 CASAVA_Build 15 48528151 1D TGGGATTACA G/- GCACATACCA 3045 het 3045 ref 19 9 8 2 G 2 1 231511 CASAVA_Build 15 48564398 22D GAATGATTCC ATTTCTATGAGGTTTGTAAAGT/---------------------- AGGCAAATGT 3070 het 3070 ref 30 24 12 1 ATTTCTATGAGGTTTGTAAAGT 1 0 231512 CASAVA_Build 15 48569116 5D TACTTTGAGA AAAAG/----- ATAATTTTTT 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 AAAAG 1 0 231513 CASAVA_Build 15 48574972 3D TAGTAGAGAT TGG/--- AGGGGGGGGT 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 TGG 1 0 231514 CASAVA_Build 15 48578878 1D TATTGTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 T 10 9 231515 CASAVA_Build 15 48579096 1D CTATTTTGAG T/- TAACTTCAGT 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 T 2 1 231516 CASAVA_Build 15 48584314 1D TAAAAAAAAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 10 16 6 A 8 7 231517 CASAVA_Build 15 48592283 4D TCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAAACA 3070 het 2537 hom 28 7 17 5 AAAC 2 1 231518 CASAVA_Build 15 48595142 4D TATATATGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 TA 10 8 231519 CASAVA_Build 15 48596962 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2753 hom 27 11 13 3 A 13 12 231520 CASAVA_Build 15 48597717 1I TCTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 15 0 9 6 T 11 12 231521 CASAVA_Build 15 48598132 1I TCACCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 28 1 22 5 A 11 12 231522 CASAVA_Build 15 48605296 3D TTAAAAATAA TAT/--- TAATGAGTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TAT 1 0 231523 CASAVA_Build 15 48607743 2I TTATATAAAC --/AT ATATATTTCC 3070 hom 48 het 24 0 16 8 AT 3 4 231524 CASAVA_Build 15 48609508 2I TTAAAAGTAA --/TT TTTCTTGACT 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 T 3 5 231525 CASAVA_Build 15 48611003 3D GAAATCAGAT CAA/--- CAATTTCTAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 CAA 2 1 231526 CASAVA_Build 15 48615013 4I GAATTAAACT ----/AGAA AGAAATAACA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 AGAA 1 2 231527 CASAVA_Build 15 48629315 1I CCCAGATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 8 9 A 10 11 231528 CASAVA_Build 15 48633426 1I TCATTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 14 15 T 15 16 231529 CASAVA_Build 15 48635718 1D AAGAGACTTT A/- AAAACAAGCA 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 A 5 4 231530 CASAVA_Build 15 48636848 3D TACTCAATCC AGT/--- GAAGTCTTGA 3070 het 3070 ref 28 13 10 8 AGT 1 0 231531 CASAVA_Build 15 48638220 1D AATAAAAAAA T/- ATATATATAA 2889 het 2462 hom 14 7 7 0 T 1 0 231532 CASAVA_Build 15 48638851 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1904 het 1904 ref 16 10 5 1 T 11 12 231533 CASAVA_Build 15 48640525 1D GGTTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 11 10 231534 CASAVA_Build 15 48641322 1D CACAACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 12 11 231535 CASAVA_Build 15 48648532 1D ACATGTGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1611 hom 28 5 16 7 T 10 9 231536 CASAVA_Build 15 48651069 1D AAAAAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 12 12 A 11 10 231537 CASAVA_Build 15 48651216 5D11M1I TTCTTTATAT ATTGCTACATTGTTTA-/-----TGTAATCTTTAT ACTTGTAATC 3070 het 3070 ref 49 27 19 9 N/A 0 0 231538 CASAVA_Build 15 48663073 2I AGTTTTGTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 15 2 11 2 TG 0 1 231539 CASAVA_Build 15 48665496 2D GAAAATTTTC AG/-- AGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 AG 2 1 231540 CASAVA_Build 15 48667587 1I TATGATAGGT -/C CCGCTGAACC 3070 het 3070 hom 46 15 25 6 C 2 3 231541 CASAVA_Build 15 48667887 5D AGATATTAAA TTAAG/----- TTAATTGATT 3070 het 3070 ref 29 16 12 4 TTAAG 1 0 231542 CASAVA_Build 15 48670976 1I CTACTTCTGA -/T TTTTTTTTTT 2682 het 2682 ref 40 21 8 11 T 15 16 231543 CASAVA_Build 15 48682804 1D AGAAGACTGA T/- TTTTTTTTTT 2692 het 1242 hom 12 3 6 3 T 11 10 231544 CASAVA_Build 15 48687843 27D TCCTCTCATC TGTCTTTTATTTATTTCTAGACTTTTA/--------------------------- TGTCTTGTCT 3070 het 3070 ref 33 20 17 8 TGTCTTTTATTTATTTCTAGACTTTTA 1 0 231545 CASAVA_Build 15 48689222 1D TCCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 A 13 12 231546 CASAVA_Build 15 48696174 2D AAATGTATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 34 1 15 18 T 13 11 231547 CASAVA_Build 15 48698965 1D CCAGCCTCAA C/- CTGCCGAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 C 2 1 231548 CASAVA_Build 15 48699158 1D ATTTAAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 9 5 T 10 9 231549 CASAVA_Build 15 48699800 1I TTTTTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 2683 het 2177 hom 24 7 9 8 T 13 14 231550 CASAVA_Build 15 48700424 1D TCCATCCCCC A/- AAAAAGTAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 6 5 231551 CASAVA_Build 15 48701501 2D CCTGGATGAC AA/-- GAGCAAAACT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 A 2 0 231552 CASAVA_Build 15 48703287 1D GTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3060 het 51 hom 24 1 10 13 A 11 10 231553 CASAVA_Build 15 48703868 6D AGTCCTTAGG ATTTAC/------ ATTTAATTTG 3070 het 3070 ref 35 18 14 7 ATTTAC 1 0 231554 CASAVA_Build 15 48704226 4D AATTCTACTC AGAA/---- AGAAACTATC 3070 het 3070 hom 51 26 23 5 AGAA 2 1 231555 CASAVA_Build 15 48705411 6D ACTATTTTAC TTAAGA/------ TTATTTCCTT 3070 het 3070 ref 43 25 17 5 TTAAGA 1 0 231556 CASAVA_Build 15 48706288 2D TCCCATGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 13 11 231557 CASAVA_Build 15 48706618 2D TGTAACAAAA CT/-- TTAAGTGATT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 CT 1 0 231558 CASAVA_Build 15 48708614 2D AAATAGGATG AT/-- ATTCTAGAAG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 AT 2 1 231559 CASAVA_Build 15 48709731 2D19M6D TTGTGATCTC TTGATACCATGATTCCAGATGATATAA/--GATACCATGATTCCAGATG------ ATATATTTTA 2141 het 2141 ref 22 14 6 10 N/A 0 0 231560 CASAVA_Build 15 48710007 2D AAGAGGATCA GT/-- GTGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 46 18 25 5 GT 5 4 231561 CASAVA_Build 15 48711783 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 22 7 A 11 10 231562 CASAVA_Build 15 48715585 6D AAAATTAGTG AAGAAT/------ ATGAATTTTT 2168 het 2168 ref 15 10 6 2 AAGAAT 1 0 231563 CASAVA_Build 15 48716784 1I AACCACTGTT -/G GGTTGTTTCA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 G 2 3 231564 CASAVA_Build 15 48720730 3D AAGGCCTCAT GCG/--- ATGAACTGCC 3070 het 3070 hom 52 17 28 9 GCG 1 0 231565 CASAVA_Build 15 48723433 1D AAAAGGAATT A/- GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 A 1 0 231566 CASAVA_Build 15 48727642 1D CCAAATACTA T/- TGATAATCTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 2 1 231567 CASAVA_Build 15 48730193 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 A 9 10 231568 CASAVA_Build 15 48732146 2D AAAAAAATCG TT/-- TAAGTGGGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 1 231569 CASAVA_Build 15 48734323 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAACC 2840 hom 25 het 10 0 8 2 A 8 9 231570 CASAVA_Build 15 48734561 4I GTAGAAATAA ----/GAGT GAGTGAACCT 3070 hom 20 het 10 0 7 3 GAGT 1 2 231571 CASAVA_Build 15 48735499 1D AGAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 138 hom 29 1 23 5 A 12 11 231572 CASAVA_Build 15 48735663 1D AATGCTAAAT A/- AAAGAAACTC 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 4 3 231573 CASAVA_Build 15 48739165 1I CTATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2765 hom 27 9 15 3 T 10 11 231574 CASAVA_Build 15 48744883 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3028 het 888 hom 18 4 8 6 A 17 16 231575 CASAVA_Build 15 48751135 2I CTGTCGCTAC --/AA AAAAGTTTTT 3070 hom 88 het 34 0 29 5 A 4 6 231576 CASAVA_Build 15 48751464 4D TAATAATAAA TGAC/---- TATGTTACTG 3070 het 3070 hom 42 17 20 6 TGAC 1 0 231577 CASAVA_Build 15 48757565 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAATAC 3070 het 1205 hom 18 4 11 3 A 7 8 231578 CASAVA_Build 15 48758363 1D TTGCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 11 10 231579 CASAVA_Build 15 48759495 1I GGCCAAGGTG -/T GGTGGATCAC 2654 het 284 hom 12 1 7 4 T 0 1 231580 CASAVA_Build 15 48762723 1D GCAGTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 34 1 26 7 A 12 11 231581 CASAVA_Build 15 48771679 1I ATCCACATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 A 10 11 231582 CASAVA_Build 15 48776832 10D CCTGGGCACT CCAGCCTGGG/---------- CAACAAAGCA 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 CCAGCCTGGG 1 0 231583 CASAVA_Build 15 48780897 1I TAAATATGAG -/A AAAAAAAAAA 2280 het 2280 ref 23 10 7 6 A 12 13 231584 CASAVA_Build 15 48780966 4D CTTTCTCCCT AAAA/---- AAAAAAGCCA 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 A 10 6 231585 CASAVA_Build 15 48786296 1D AGCTACATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 10 9 231586 CASAVA_Build 15 48787022 1D GGTCAAGGCA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 9 8 231587 CASAVA_Build 15 48788750 1D TTAAATTTCA G/- TATTGCGATG 3070 het 3070 hom 42 13 26 3 G 1 0 231588 CASAVA_Build 15 48794223 1I CCTGAGGTCA -/C GAAGTTCAGG 2874 het 2874 ref 23 14 8 1 C 0 1 231589 CASAVA_Build 15 48799212 1D TCCTCTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 11 10 231590 CASAVA_Build 15 48799393 5D AAATTAAGCC ATAAG/----- ATAACTTGGT 3070 hom 122 het 43 0 40 4 ATAAG 1 0 231591 CASAVA_Build 15 48799877 4D TTAAAGATGT TAAA/---- TAGTTTCATA 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 TAAA 1 0 231592 CASAVA_Build 15 48801097 1D ACAAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 2906 het 424 hom 14 2 10 2 T 16 15 231593 CASAVA_Build 15 48804067 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 A 13 12 231594 CASAVA_Build 15 48811823 1I TAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 10 231595 CASAVA_Build 15 48817681 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 15 9 12 A 9 10 231596 CASAVA_Build 15 48820123 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AG 2 1 231597 CASAVA_Build 15 48821086 2D ATATCTATTC AT/-- AGTCATTAAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 4 AT 1 0 231598 CASAVA_Build 15 48824897 1I GCCTCAGCCT -/C CCAAAGAGCT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 C 2 3 231599 CASAVA_Build 15 48838256 1D CAATCAACTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 5 A 8 7 231600 CASAVA_Build 15 48839748 2D CTCTGATGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1500 het 362 hom 22 2 4 16 T 13 11 231601 CASAVA_Build 15 48840492 2D TTTTTTCATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 45 het 27 0 16 14 TG 10 9 231602 CASAVA_Build 15 48840674 1I AATTTTTTAA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 6 7 231603 CASAVA_Build 15 48844403 1D CCCCCCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 20 10 A 12 11 231604 CASAVA_Build 15 48860205 14D AATCTCGGCT CACTGCAACCTCCA/-------------- CCTCCCGGAT 3070 het 3070 ref 18 11 7 0 CACTGCAACCTCCA 1 0 231605 CASAVA_Build 15 48861140 1I TAAGAAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 A 11 12 231606 CASAVA_Build 15 48865457 1D CAACCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 25 1 13 11 T 15 14 231607 CASAVA_Build 15 48877697 1D CCAAGTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 A 13 12 231608 CASAVA_Build 15 48879218 1I AACTCTGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 9 10 231609 CASAVA_Build 15 48884901 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 755 het 755 ref 15 6 3 6 T 11 10 231610 CASAVA_Build 15 48888853 1I TTTAAAAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2262 hom 25 9 13 3 T 9 10 231611 CASAVA_Build 15 48893597 2I CTCAGCAAAA --/CT CTAATGTTCT 3070 hom 48 het 26 0 15 11 CT 1 2 231612 CASAVA_Build 15 48904411 2I TATATACATG --/TA TATATATATA 3070 het 474 hom 16 1 10 5 TA 7 8 231613 CASAVA_Build 15 48906871 3I TCCTGATTTT ---/TTA AAATCAGAAC 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 TTA 0 1 231614 CASAVA_Build 15 48913993 1I CAGAGTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 11 12 231615 CASAVA_Build 15 48928168 1D TTTCTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 11 10 231616 CASAVA_Build 15 48928978 1I CCCAGCTAAC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 7 8 231617 CASAVA_Build 15 48931688 1D TCATTCACTT A/- ACATCTTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 10 7 A 2 1 231618 CASAVA_Build 15 48933189 1D TTACAAACCT A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 A 7 6 231619 CASAVA_Build 15 48933761 1I GCTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 2416 het 177 hom 26 4 11 11 C 0 1 231620 CASAVA_Build 15 48943532 2D AGTGGAACAC TG/-- TAAAATTAAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 TG 1 0 231621 CASAVA_Build 15 48946777 1D TGAAGACCTA G/- GATCAGTGGA 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 G 2 1 231622 CASAVA_Build 15 48956322 1I AGAGTAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 329 hom 21 1 17 3 A 10 11 231623 CASAVA_Build 15 48967019 1D TCTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 13 12 231624 CASAVA_Build 15 48967299 1I ACAGGCGTGA -/G CCACTGCGCC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 G 0 1 231625 CASAVA_Build 15 48970683 3D AGACGCTAAC ATT/--- ATCCTGATAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATT 1 0 231626 CASAVA_Build 15 48974866 1D AGACTCTATC A/- AAAAAAAAAA 1960 het 6 hom 13 0 6 7 A 17 16 231627 CASAVA_Build 15 48978421 2D TAACAGGTTC TA/-- TCTTTGTGAC 3070 hom 75 het 31 0 26 7 TA 1 0 231628 CASAVA_Build 15 48981350 1D GACCTCAAGT G/- ATCTGTCTGC 3070 hom 48 het 19 0 16 4 G 1 0 231629 CASAVA_Build 15 48984233 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 20 0 19 1 T 12 11 231630 CASAVA_Build 15 48985558 1I AGTGCTAGAA -/T TATAGGCATA 2672 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 2 231631 CASAVA_Build 15 49000606 1I TGCCTTATTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 8 9 231632 CASAVA_Build 15 49005286 1D GCCCGACTAA T/- TTTTTTTTTT 1648 het 24 hom 7 1 5 1 T 17 16 231633 CASAVA_Build 15 49008204 2D GTTTTTCATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 13 11 231634 CASAVA_Build 15 49010814 1I ATCCCAGCAC -/T TTGGGAGGCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 2 3 231635 CASAVA_Build 15 49024076 1D TAAAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 12 11 231636 CASAVA_Build 15 49032255 1I TACTGTTAAC -/T TATAGAATGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 1 2 231637 CASAVA_Build 15 49039978 1D CTGAACAAAT A/- ATATGAAAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 2 1 231638 CASAVA_Build 15 49049002 5I TTATTTTTAA -----/ATTTT ATTTTCTTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 ATTTT 1 2 231639 CASAVA_Build 15 49050417 1D GGTATTTTAC A/- TATGCTTTGT 3070 het 3070 ref 45 26 19 1 A 1 0 231640 CASAVA_Build 15 49051688 4D CTTCATGTAG TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 96 het 41 0 32 11 TTTC 5 4 231641 CASAVA_Build 15 49055042 2D TTGAGAAGAC TG/-- TCCTTTCTCT 3070 hom 93 het 33 0 31 3 TG 1 0 231642 CASAVA_Build 15 49055587 1I GAGCCACCAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 65 het 30 0 25 5 A 8 9 231643 CASAVA_Build 15 49062183 3D TTAGCCCATC ATT/--- ATTATTTTTT 3070 hom 120 het 41 0 41 1 ATT 3 2 231644 CASAVA_Build 15 49067893 1D3M2D AACCTCTGCC TTCTGG/-TCT-- GCTCAGGCAA 3070 hom 42 het 15 0 15 3 N/A 0 0 231645 CASAVA_Build 15 49077683 3D TGGATGTCCT TGG/--- TGGATTTATA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TGG 2 1 231646 CASAVA_Build 15 49078128 1D CAAAAAAAAA G/- AATCATCTGT 3070 het 3070 hom 23 7 11 6 G 1 0 231647 CASAVA_Build 15 49080457 1I TTGAAATTTG -/T TTGTTTAGAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 3 231648 CASAVA_Build 15 49088822 1D ATGGGGTTTC A/- CCATATTGGT 1938 hom 12 het 5 0 4 1 A 1 0 231649 CASAVA_Build 15 49091846 1I TACTGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 21 1 15 5 T 10 11 231650 CASAVA_Build 15 49098347 1D TATTTGTGGG T/- TTTTTTTTTA 1094 het 1094 ref 48 39 3 8 T 10 9 231651 CASAVA_Build 15 49102595 2D ATTTCATAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 20 7 T 15 13 231652 CASAVA_Build 15 49108424 1D TCTAGGATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 10 9 231653 CASAVA_Build 15 49111096 1I GCTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 34 0 20 14 T 11 12 231654 CASAVA_Build 15 49127994 1D CCCACATTGG T/- TTTTTTTTTT 2292 het 624 hom 35 7 8 20 T 15 14 231655 CASAVA_Build 15 49137948 1D GTAAAAAAAA T/- ATATATAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 1 0 231656 CASAVA_Build 15 49148150 3D ACCCCTCCTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 31 7 19 5 T 22 19 231657 CASAVA_Build 15 49183415 1I AGAGGAATGA -/G GAGTTACTGG 3070 hom 160 het 63 0 54 9 G 1 2 231658 CASAVA_Build 15 49194388 2I TGTCACCATG --/TA TATTGTTCCT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 TA 1 2 231659 CASAVA_Build 15 49199572 1I GAAGACAAAG -/T TTTGTTTGTT 3070 het 1657 hom 29 7 17 5 T 3 4 231660 CASAVA_Build 15 49226143 8D TCCTGGCACA TACTATGC/-------- TACTATGCTA 3070 hom 120 het 49 0 39 12 TACTATGC 2 1 231661 CASAVA_Build 15 49232515 1D ACAACTATTT A/- GTTAGAATTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 1 0 231662 CASAVA_Build 15 49236410 1I AATCAATTGT -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 C 7 8 231663 CASAVA_Build 15 49239568 3I TATGTGATCA ---/AAT AATAATATGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AAT 2 3 231664 CASAVA_Build 15 49260526 1I CCATGTGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 22 11 15 T 13 14 231665 CASAVA_Build 15 49278320 2I GTTCATCAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 10 12 231666 CASAVA_Build 15 49300465 1I CATGCACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 12 13 231667 CASAVA_Build 15 49319576 1I CTTCTCCGCA -/G GAATGACCCT 1555 hom 18 het 10 0 6 4 G 1 2 231668 CASAVA_Build 15 49330290 1I ACAGCAGTCA -/T TTTTTCTAAG 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 T 5 6 231669 CASAVA_Build 15 49333750 1I AAATAATTTT -/A AAAATTTTTC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 4 5 231670 CASAVA_Build 15 49338124 1I GGAGTCCAGG -/C CCCCTGCTCC 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 C 4 5 231671 CASAVA_Build 15 49343993 3D GGAAAGAGTA ACG/--- ACGGTCAAGG 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 ACG 2 1 231672 CASAVA_Build 15 49357238 1D AACAGATAGA T/- TGTTCCCCTC 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 T 2 1 231673 CASAVA_Build 15 49362648 3D47M4D GACGAGTGTA AAGAACTAATTTCAGATTCTGAATGTGAGGAACAGAAACCGGAGGAAATTAAAG/---AACTAATTTCAGATTCTGAATGTGAGGAACAGAAACCGGAGGAAATT---- AAAGGGAAAC 3070 het 3070 ref 33 27 11 14 N/A 0 0 231674 CASAVA_Build 15 49378397 10D AAATGAGCAA AGCAGGCCTG/---------- AGCTCATTGC 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 AGCAGGCCTG 1 0 231675 CASAVA_Build 15 49401439 1D TGTTTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 1579 het 1579 ref 30 20 4 6 A 13 12 231676 CASAVA_Build 15 49411409 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 2319 het 2319 ref 40 30 6 4 TA 8 7 231677 CASAVA_Build 15 49454226 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1591 hom 8 het 25 0 7 18 T 19 18 231678 CASAVA_Build 15 49475251 1I TTATATATTT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 7 8 231679 CASAVA_Build 15 49476836 4I TCCCTCCCTC ----/CCTT CCTCCCTCCC 2195 het 836 hom 18 3 8 7 CCTT 0 1 231680 CASAVA_Build 15 49483521 4I GTGATTATTC ----/TCTT TGACACCACA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 TCTT 0 1 231681 CASAVA_Build 15 49485777 2D TCTTTAAACA TC/-- TTTCAGCCCA 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 TC 1 0 231682 CASAVA_Build 15 49488581 1I GTTCTTATGG -/C CTTATCTAGG 2416 hom 12 het 12 0 6 6 C 1 2 231683 CASAVA_Build 15 49504360 1I CTTCCATGAT -/A GCCCCTGGGC 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 0 1 231684 CASAVA_Build 15 49505087 2I TAATGAAATA --/TC TGTTATTTAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TC 0 1 231685 CASAVA_Build 15 49526766 4D TTTTGTCGTC TTCT/---- TTCTTTTAGT 3070 het 3070 ref 50 24 20 7 TTCT 2 1 231686 CASAVA_Build 15 49530429 2D ATTAAAAGAC TG/-- AGAATCTTTC 3070 het 3070 hom 46 23 22 4 TG 1 0 231687 CASAVA_Build 15 49532901 2D AAAAACACTC TG/-- AAATAAGAAT 1231 het 1231 ref 23 17 5 1 TG 1 0 231688 CASAVA_Build 15 49540062 4I CTTATAAATA ----/TATC TATAACTTCA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 TATC 0 1 231689 CASAVA_Build 15 49545638 1D AAGAAAAGCC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 23 0 15 8 A 10 9 231690 CASAVA_Build 15 49552484 2I TCCTACAACA --/CT CTCCCTCTTC 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 CT 1 2 231691 CASAVA_Build 15 49557749 1D TTTTGGGTGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 21 het 44 1 40 3 T 9 8 231692 CASAVA_Build 15 49558412 1I CCATATAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 A 9 10 231693 CASAVA_Build 15 49575333 1I TATTTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 1577 het 1577 ref 36 26 4 6 A 11 12 231694 CASAVA_Build 15 49594314 1D GCTTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 2433 het 2433 ref 29 9 8 12 A 17 16 231695 CASAVA_Build 15 49603153 13I CATGAGAAGA -------------/CAGAGGCAGACTG CAGTGATGCA 3070 het 3070 hom 56 26 26 4 CAGAGGCAGACTG 0 1 231696 CASAVA_Build 15 49633279 1D TGCAGGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 A 13 12 231697 CASAVA_Build 15 49636539 1I CACTGCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 10 11 231698 CASAVA_Build 15 49640483 1D TTTGTAATTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 1524 hom 13 4 8 1 A 8 7 231699 CASAVA_Build 15 49641024 1I CAGCATACAA -/G GACGCCAGTA 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 G 1 2 231700 CASAVA_Build 15 49643483 1D TTTTGGTTAG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 A 7 6 231701 CASAVA_Build 15 49649743 1I AAAAAGAGTG -/A AAACAAATGA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 3 4 231702 CASAVA_Build 15 49653927 1D AAGGCCTGCC A/- AAAATATCCC 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 5 4 231703 CASAVA_Build 15 49662178 4I AGGTTTCCTT ----/ATTA AATACGTTCC 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 ATTA 0 1 231704 CASAVA_Build 15 49666074 1I TAATGTTACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 A 9 10 231705 CASAVA_Build 15 49683764 2I GGGCATCTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 A 10 12 231706 CASAVA_Build 15 49684531 1I TTCATATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 10 11 231707 CASAVA_Build 15 49688252 1D AAAAAGAATG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 9 8 231708 CASAVA_Build 15 49688583 5D ATAAGTGAAA TAAGT/----- TAAGAATGCA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 TAAGT 1 0 231709 CASAVA_Build 15 49689430 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAACTA 3070 het 2291 hom 37 13 15 9 AC 0 1 231710 CASAVA_Build 15 49690257 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1945 het 1611 hom 15 6 7 2 A 15 14 231711 CASAVA_Build 15 49700588 5D CTATCCCCAA AAACC/----- AAGATTCTCC 3070 het 3070 ref 47 29 17 4 AAACC 1 0 231712 CASAVA_Build 15 49701236 1I TTACTATATT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 8 9 231713 CASAVA_Build 15 49707528 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1779 het 339 hom 8 3 4 1 A 13 12 231714 CASAVA_Build 15 49717078 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1758 het 331 hom 11 2 5 4 A 17 16 231715 CASAVA_Build 15 49724216 5I AAAAATCAAG -----/CTTTT TGCCCATGGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 CTTTT 0 1 231716 CASAVA_Build 15 49729826 1D GTTTAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2891 het 2891 ref 32 16 8 8 A 13 12 231717 CASAVA_Build 15 49740893 4D TTTATACCTT AGAG/---- ATGCTTACTG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AG 2 0 231718 CASAVA_Build 15 49746646 1D GCCCCTACCG T/- TTTTTTGTTT 1837 het 1837 ref 21 14 6 1 T 7 6 231719 CASAVA_Build 15 49756207 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 1910 hom 22 6 13 3 T 7 6 231720 CASAVA_Build 15 49770142 1D TAGATTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 11 10 231721 CASAVA_Build 15 49772369 2D TTTCTTTTAT TC/-- TTTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 21 19 3 TC 1 0 231722 CASAVA_Build 15 49774520 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1456 het 1456 ref 15 7 4 4 A 15 14 231723 CASAVA_Build 15 49797038 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 375 hom 36 1 30 5 A 9 10 231724 CASAVA_Build 15 49862969 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 19 1 17 1 A 12 11 231725 CASAVA_Build 15 49907352 1I AGATTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 A 13 14 231726 CASAVA_Build 15 49923383 1I AGATTGCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 26 2 19 5 T 12 13 231727 CASAVA_Build 15 49991930 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 27 1 20 6 T 13 12 231728 CASAVA_Build 15 50055028 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 917 het 917 ref 22 17 2 3 A 11 10 231729 CASAVA_Build 15 50094193 1D GAGATTTTCT A/- AAAAAAAAAA 2139 het 2139 ref 33 17 7 9 A 16 15 231730 CASAVA_Build 15 50095420 1I GGTGGCGCGC -/G CCTGTAATCC 2470 hom 15 het 6 0 6 0 G 0 1 231731 CASAVA_Build 15 50117646 1I CTCAAGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 702 hom 39 3 20 16 A 15 16 231732 CASAVA_Build 15 50130931 1D AGTCTATTTA C/- ATAAGAAAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 1 0 231733 CASAVA_Build 15 50132064 1D TTTCCTCTTT C/- CCCCAGCCCC 3070 hom 39 het 28 1 22 5 C 5 4 231734 CASAVA_Build 15 50137048 1D CCTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 48 1 35 13 A 13 12 231735 CASAVA_Build 15 50142993 48D TGAGTTTTCC AGCAAACCTCCTCCTCTTCTAGTTGCCCTTACTGTAGAGTAAACATTT/------------------------------------------------ AGCAAACCTC 2633 hom 30 het 37 0 9 33 AGCAAACCTCCTCCTCTTCTAGTTGCCCTTACTGTAGAGTAAACATTT 2 1 231736 CASAVA_Build 15 50145232 5D TTTGCAAATA TACTT/----- TACTTTTTCC 3070 hom 42 het 17 0 15 4 TACTT 2 1 231737 CASAVA_Build 15 50170772 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 11 10 231738 CASAVA_Build 15 50172724 5D TGGAGGTAGG AACAC/----- AACAGAGAAT 3070 het 3070 ref 48 29 18 4 AACAC 1 0 231739 CASAVA_Build 15 50175285 1I TAACAACAAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 70 32 25 13 A 7 8 231740 CASAVA_Build 15 50176623 1D GACAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 11 10 231741 CASAVA_Build 15 50177024 1I GCTGATGGGA -/C CCCCCCCCCA 2829 het 2829 ref 39 20 10 9 C 9 10 231742 CASAVA_Build 15 50177802 1D GGAAGAACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 T 10 9 231743 CASAVA_Build 15 50184486 1D CATGTAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 26 0 14 12 T 15 14 231744 CASAVA_Build 15 50201008 4I TAATATCGTT ----/TTTC TTTCTATGTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TTTC 1 2 231745 CASAVA_Build 15 50208444 1D TTGTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1165 het 474 hom 29 10 5 14 T 19 18 231746 CASAVA_Build 15 50270675 3D TCTACGGATT AAC/--- AACAACAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAC 3 2 231747 CASAVA_Build 15 50272354 5D ATTAAAAAAT AAAAA/----- AATTATGGTG 3070 hom 75 het 28 0 26 4 A 7 2 231748 CASAVA_Build 15 50272804 3D CCGGAGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1329 hom 28 het 15 0 6 11 A 21 18 231749 CASAVA_Build 15 50282418 2I TTTTTTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 23 1 17 5 T 10 12 231750 CASAVA_Build 15 50313979 1D GTTAGGGGGG A/- AAAAAGCCAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 6 5 231751 CASAVA_Build 15 50316510 4D GCTGCCCAGC CAGA/---- CAAAGGCAAG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 CAGA 1 0 231752 CASAVA_Build 15 50321237 2I GTGTGTGTGT --/GA GTGTGAGAGA 3070 het 117 hom 35 2 32 4 GA 0 1 231753 CASAVA_Build 15 50334500 1I ATTCTGGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 23 3 12 8 A 13 14 231754 CASAVA_Build 15 50345703 5I AGTAATCATC -----/CTTAA CTTAGTGAGC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 CTTAA 0 1 231755 CASAVA_Build 15 50349184 1D CTGGCCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 21 0 13 8 T 15 14 231756 CASAVA_Build 15 50363699 1D AATGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 24 2 18 4 A 12 11 231757 CASAVA_Build 15 50370357 1I GTATTTAGGT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 95 het 40 0 31 9 A 8 9 231758 CASAVA_Build 15 50380933 2D AGCACAGTGG TA/-- TGATCATAGC 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 TA 1 0 231759 CASAVA_Build 15 50381040 1I CCTAGATAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 8 9 231760 CASAVA_Build 15 50383157 1D GGCTATACCA G/- TCTAGAGTGG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 1 0 231761 CASAVA_Build 15 50391429 9I TTTAATAAGA ---------/TTTGTCATT TTTATAGACC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTTGTCATT 0 1 231762 CASAVA_Build 15 50402324 1D TAAAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1399 hom 17 4 9 4 T 12 11 231763 CASAVA_Build 15 50409395 12D GCCTGGGTAA TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 1919 het 1919 ref 39 17 7 15 T 26 14 231764 CASAVA_Build 15 50421231 4I TAATGATGAG ----/AACA AACAAAGCAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AACA 1 2 231765 CASAVA_Build 15 50421524 1I CATGCATTTC -/A ATCTTGCTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 1 2 231766 CASAVA_Build 15 50427798 1D TAGAGAAACA G/- GGATATGGTA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 G 3 2 231767 CASAVA_Build 15 50428283 1I AGTATTTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 31 1 20 10 A 13 14 231768 CASAVA_Build 15 50428413 2I TATAACAGAT --/AA AAAAGCTAAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 4 6 231769 CASAVA_Build 15 50454372 1D ACTAACATAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 284 hom 29 1 24 4 T 9 8 231770 CASAVA_Build 15 50456533 5D GGTATTCATA TTGAG/----- TTATGTTTCT 3070 het 3070 ref 36 22 13 4 TTGAG 1 0 231771 CASAVA_Build 15 50460675 1I TTCTCAGGTG -/T TCTGTTGGTG 3070 hom 122 het 48 0 38 10 T 1 2 231772 CASAVA_Build 15 50465109 1D AGGCTGCAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 65 het 24 0 22 2 A 9 8 231773 CASAVA_Build 15 50468936 1D AGATCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 26 18 7 T 12 11 231774 CASAVA_Build 15 50479581 2D TTTAATTATT TC/-- TATCTTATTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 TC 1 0 231775 CASAVA_Build 15 50487047 5D AAAAAATTAA AAATT/----- AAATAAAATT 3070 het 2156 hom 16 5 10 2 AAATT 1 0 231776 CASAVA_Build 15 50487939 1D ACTAAAATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 10 9 231777 CASAVA_Build 15 50489337 1D GCATCAACTG T/- TTTTTTGATA 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 T 7 6 231778 CASAVA_Build 15 50509195 1D AACAAAAAAA C/- AAAACAAAAC 161 het 161 ref 20 10 1 11 C 1 0 231779 CASAVA_Build 15 50517706 1D GCCGCAAAGC A/- AATACACATG 3070 het 3070 hom 42 12 21 10 A 3 2 231780 CASAVA_Build 15 50524085 3D GTTGTATAAG GAA/--- GAATAAGAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 GAA 2 1 231781 CASAVA_Build 15 50530488 1D TAAATGCCAA T/- TTTTTCCCAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 6 5 231782 CASAVA_Build 15 50535262 1D CCTTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 13 12 231783 CASAVA_Build 15 50567696 1D GAGAAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 A 13 12 231784 CASAVA_Build 15 50575583 1D AAGAGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 31 1 26 4 A 11 10 231785 CASAVA_Build 15 50575898 1D CTGGAAACGT C/- CCAGGAAATG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 3 2 231786 CASAVA_Build 15 50582955 1D TGCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2937 hom 26 10 14 2 A 11 10 231787 CASAVA_Build 15 50583092 1I TGCACACCAG -/C CCTGGGTGAC 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 C 2 3 231788 CASAVA_Build 15 50589604 3D AACCATTCAC AGA/--- AGCAGTTCCA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AGA 1 0 231789 CASAVA_Build 15 50597325 3D CAAAAGACTT AAC/--- AAAGTAAATC 3070 hom 45 het 19 0 16 4 AAC 1 0 231790 CASAVA_Build 15 50602936 1D TTCATTCAAC A/- AATATTCAAT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 A 3 2 231791 CASAVA_Build 15 50610156 2D GTATACTGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 3 A 13 11 231792 CASAVA_Build 15 50610527 9D GCTCAGCTAA TTTTTGTAT/--------- TTTTAGTAGA 3070 het 2389 hom 19 5 11 3 TTTTTGTAT 1 0 231793 CASAVA_Build 15 50615502 1D ATCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 11 10 231794 CASAVA_Build 15 50616265 3D AGATATTGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 1260 het 65 hom 14 2 4 8 T 19 16 231795 CASAVA_Build 15 50620751 1D TTCGGTATTC T/- TTTTTTTTTT 2523 hom 15 het 8 0 6 2 T 12 11 231796 CASAVA_Build 15 50633201 2D GGAAGAAAAC AG/-- ATAATATTTA 3070 hom 166 het 59 0 56 4 AG 1 0 231797 CASAVA_Build 15 50633942 5I AGAAGTGAAC -----/TAAAT TAATGTTTAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TAAAT 0 1 231798 CASAVA_Build 15 50634913 2D ATAACTAAAA AC/-- ACAGTTGTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AC 2 1 231799 CASAVA_Build 15 50654142 5I CCTTTCTTTC -----/TTTTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 17 19 5 T 9 14 231800 CASAVA_Build 15 50655717 2D TTTACATTTT TG/-- TGTGTGTTCT 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 TG 4 3 231801 CASAVA_Build 15 50669033 1I CAATTTATTT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 40 20 9 11 A 7 8 231802 CASAVA_Build 15 50683096 4I TAGATGAATG ----/AATA AAGAAAATGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AATA 0 1 231803 CASAVA_Build 15 50697537 1I CAATTTTTCC -/T TTTTTTTTTG 2986 het 2721 hom 22 9 9 4 T 9 10 231804 CASAVA_Build 15 50705191 1I GTGCCATCTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 53 25 22 6 A 8 9 231805 CASAVA_Build 15 50707172 1D TGCTTATGCA T/- TTTTTTTTTT 1566 het 1566 ref 41 31 4 6 T 11 10 231806 CASAVA_Build 15 50714094 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 21 0 12 10 T 15 14 231807 CASAVA_Build 15 50722972 4D GCGACAGCAT CTCA/---- CTATGTTGCC 2583 het 2583 ref 22 11 6 8 CTCA 1 0 231808 CASAVA_Build 15 50726414 2D CAGCAATCAT TC/-- TGTTTCTACA 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 TC 1 0 231809 CASAVA_Build 15 50726731 2D TAGTTTATGT AA/-- AAAAAAAAAA 2019 het 2019 ref 26 12 6 9 A 13 11 231810 CASAVA_Build 15 50733633 5I AAGGGTAGTG -----/ATATC ATATATCTAT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 ATATC 0 1 231811 CASAVA_Build 15 50738062 1I TAATGGGAAT -/A AAATTTTCAT 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 A 3 4 231812 CASAVA_Build 15 50743095 5D ACATATTACA TTAAT/----- TTAACTATTT 3070 het 3070 ref 41 22 17 5 TTAAT 1 0 231813 CASAVA_Build 15 50744440 1D TGTTGGGGGT G/- GGGGGGTGCA 3070 het 2072 hom 23 6 12 5 G 7 6 231814 CASAVA_Build 15 50751991 1D TTCATTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 13 12 231815 CASAVA_Build 15 50760374 13I TCTACAAGCA -------------/CTTTGCAATTAAC CTTGGTAATG 3070 het 3070 hom 40 18 20 4 CTTTGCAATTAAC 0 1 231816 CASAVA_Build 15 50764919 1D TTTTTTTTTG T/- TTTGTTTTGT 3070 het 273 hom 26 1 20 5 T 4 3 231817 CASAVA_Build 15 50771345 6D ATAAATAAAT AAGAAA/------ AAGAAAAAGA 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 AAGAAA 3 2 231818 CASAVA_Build 15 50772314 1I GCACAGGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2618 hom 28 8 15 5 T 10 11 231819 CASAVA_Build 15 50785025 1D GAAAGAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2499 hom 14 6 8 0 A 10 9 231820 CASAVA_Build 15 50799617 1D TCATAATGGC A/- ATGATCACAG 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 2 1 231821 CASAVA_Build 15 50800477 13D AGTAGTACAT CGTCAGTAGACAA/------------- CGATGTACTA 568 het 568 ref 35 21 3 11 CGTCAGTAGACAA 1 0 231822 CASAVA_Build 15 50801269 2D AACTCAAGTA TG/-- TGTAGGCAAG 3070 hom 126 het 44 0 43 2 TG 2 1 231823 CASAVA_Build 15 50803165 10D ATAATTTTCT AAATTGTTTA/---------- AAAATCATTC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 AAATTGTTTA 1 0 231824 CASAVA_Build 15 50805675 1D TTGTCAGGAG T/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 47 24 15 9 T 7 6 231825 CASAVA_Build 15 50814903 2D CTAGGGGAAA GC/-- GTAGGGGATA 3070 het 3069 hom 26 9 12 5 GC 1 0 231826 CASAVA_Build 15 50832088 2D CCCAAATCAA AG/-- AGGGGGGGGG 3070 het 259 hom 30 4 12 16 AG 2 1 231827 CASAVA_Build 15 50840471 18I GGTGGCTCTC ------------------/AGGTGAGGTCCATTCTTG GAATTGCCCT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 AGGTGAGGTCCATTCTTG 0 1 231828 CASAVA_Build 15 50842648 1D ATTGTTGGTG A/- AAGGTAGTAC 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 A 3 2 231829 CASAVA_Build 15 50845067 1I TAAAACGCAG -/T TGGGGGTAGG 3070 het 3070 ref 55 31 22 2 T 1 2 231830 CASAVA_Build 15 50851087 1I53M1D GTAATGTCTG -TTTTTTTTTACAATGAGCATGTATTAACAGATGTAATTTTGATAATCACTAAAT/TTTTTTTTTTACAATGAGCATGTATTAACAGATGTAATTTTGATAATCACTAAA- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 27 17 9 N/A 0 0 231831 CASAVA_Build 15 50855877 1D TCTCCACCAT G/- TCTACTCGAC 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 G 1 0 231832 CASAVA_Build 15 50872959 1D AACTTAGGAT G/- TTTATTTTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 0 231833 CASAVA_Build 15 50873337 1I CAGGGATCCA -/G GGGGGAGGCT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 G 5 6 231834 CASAVA_Build 15 50885088 4I TTTGGGGCGC ----/CTAT CTTTTACCCC 1488 hom 18 het 8 0 5 3 CTAT 0 1 231835 CASAVA_Build 15 50885188 1I GGAGGCCCAC -/G TGGGTTCCGG 1371 hom 25 het 10 0 4 6 G 0 1 231836 CASAVA_Build 15 50933515 3D TGGAAATTTA CCC/--- CCCCAGTCTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 7 4 231837 CASAVA_Build 15 50934464 3D GGGAGAACTT CTG/--- CTATGCTAGG 3070 het 3070 hom 47 17 26 5 CTG 1 0 231838 CASAVA_Build 15 50944238 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 72 het 28 0 24 5 A 9 8 231839 CASAVA_Build 15 50949225 2D GTATGAATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 10 A 12 10 231840 CASAVA_Build 15 50951855 2D AAAAGTAAAC AG/-- AGGGAGAATA 3070 hom 84 het 31 0 28 5 AG 2 1 231841 CASAVA_Build 15 50957555 14D GGCTGCTCTG AGGCCTTAATGACT/-------------- GGTCATCCAG 3070 het 3070 hom 36 17 22 2 AGGCCTTAATGACT 1 0 231842 CASAVA_Build 15 50958723 1I CATAAAAAAA -/T ATCATAAACG 3070 het 3070 hom 38 10 21 7 T 0 1 231843 CASAVA_Build 15 50989295 4D TCTCTTTTTA TTTC/---- TTTTATCAGT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 TTTC 1 0 231844 CASAVA_Build 15 51031570 9D CTGTAGTAGG AACTTAGTA/--------- AACTTAGTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AACTTAGTA 2 1 231845 CASAVA_Build 15 51038477 1I GTTTTTCTGT -/G TTATAACTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 231846 CASAVA_Build 15 51041249 1D GGTTTGCATA T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 8 7 231847 CASAVA_Build 15 51055446 2D GATTTTAGGT AA/-- AAAACACTGA 3070 hom 96 het 36 0 29 8 A 6 4 231848 CASAVA_Build 15 51067724 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 TA 8 7 231849 CASAVA_Build 15 51095804 18I ATGGCCTTCA ------------------/CCTGCCACCATGTTGCTG CAAAGAACAT 1327 het 1327 ref 55 45 3 7 CCTGCCACCATGTTGCTG 0 1 231850 CASAVA_Build 15 51148062 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTTGTTTTTG 3070 hom 132 het 56 0 49 7 TG 1 0 231851 CASAVA_Build 15 51151323 1D CCATTATCTG C/- CCCCCTATGT 3070 hom 89 het 32 0 29 4 C 6 5 231852 CASAVA_Build 15 51163403 2D AATACGAGTC TG/-- TTATTTAACT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TG 1 0 231853 CASAVA_Build 15 51164169 4D AGTAACATAA TAGC/---- TAGCTAGCTA 3070 hom 90 het 37 0 31 8 TAGC 4 3 231854 CASAVA_Build 15 51166911 1I CTATTTCTCA -/G GGGGAAGGAT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 G 4 5 231855 CASAVA_Build 15 51169218 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 40 1 32 7 T 13 12 231856 CASAVA_Build 15 51169418 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 12 12 12 A 13 14 231857 CASAVA_Build 15 51184426 1D CACATACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 29 1 19 9 T 15 14 231858 CASAVA_Build 15 51186985 2I TGGTTTATGT --/TA TACATGCAGC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 TA 1 2 231859 CASAVA_Build 15 51190277 1D CTTATTATTA T/- TTTTATCACT 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 T 5 4 231860 CASAVA_Build 15 51199040 4D AGTAAAGTAG ATAA/---- ATAAAGTATA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 ATAA 2 1 231861 CASAVA_Build 15 51213250 1I AAGACTCTTT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 7 8 231862 CASAVA_Build 15 51213799 2I AGAGAGAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 AG 6 7 231863 CASAVA_Build 15 51225591 3I TTGCCTGAGG ---/TCT TCTTACATGC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 TCT 1 2 231864 CASAVA_Build 15 51240292 1I GCCACATAAT -/G ATGGACCACA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 G 0 1 231865 CASAVA_Build 15 51243337 5I ATTAAAAAAG -----/TTAAT TTAGTTTATT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TTAAT 0 1 231866 CASAVA_Build 15 51248194 1D CTAGAGTTCC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 T 8 7 231867 CASAVA_Build 15 51251835 1D CTTTATTTTG T/- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 4 3 231868 CASAVA_Build 15 51275437 1D TAAGGCTGCC T/- TTAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 3 2 231869 CASAVA_Build 15 51281573 1D TTTCTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 36 1 25 10 T 13 12 231870 CASAVA_Build 15 51284288 2D ATATTTAAGC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 44 0 41 4 A 11 9 231871 CASAVA_Build 15 51290160 1I GAAATGACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1339 hom 29 4 17 8 T 10 11 231872 CASAVA_Build 15 51294011 4I TAAGCTTGTT ----/AGAA AGAAAGCTAT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 AGAA 1 2 231873 CASAVA_Build 15 51300740 1D32M19D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGGGCATGTGTTTGCCTGCGTGAGGTAGGC/-AAAAAAAAGAAAAAAAAAAGTGGGGCATGTGT------------------- TCCTTTTCCA 3070 het 82 hom 17 1 17 6 N/A 0 0 231874 CASAVA_Build 15 51302573 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 24 2 14 8 A 15 14 231875 CASAVA_Build 15 51302920 1I TATGCTTTTC -/T TTTTATTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 4 5 231876 CASAVA_Build 15 51305730 1D TGTTATAGAC T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 7 6 231877 CASAVA_Build 15 51315696 4D8M18D8M10D GGAACTCAGC ATTTAAGGCAGGTTTTCTATGAAGTATCTTAAACCTTTCCTGTTTTGC/----AAAACAGG------------------AAAGGTTT---------- AAGTTATCGA 3070 het 3070 ref 43 30 20 7 N/A 0 0 231878 CASAVA_Build 15 51316557 1I AGTGGAAGGA -/G GGGGAGGATC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 4 5 231879 CASAVA_Build 15 51332196 1D GATACATATC A/- CTTTATTCTT 3070 het 3070 hom 55 18 35 2 A 1 0 231880 CASAVA_Build 15 51336425 4I TGACTAAGAA ----/ATTT ATTTACTGAC 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 ATTT 1 2 231881 CASAVA_Build 15 51339856 1I TAGTCCTTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 9 10 231882 CASAVA_Build 15 51341046 1I AAACACATCA -/G GGGTTCATAA 3070 het 3070 hom 70 28 32 10 G 3 4 231883 CASAVA_Build 15 51353030 1D CAGTTGCTAA G/- CATCCACAAC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 G 1 0 231884 CASAVA_Build 15 51353123 1I TTTTGTGGGT -/A AAAATCCCAA 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 A 4 5 231885 CASAVA_Build 15 51355430 2I TTTTGTAAAC --/TG TGTTTCGTAA 3070 hom 3 het 17 1 15 1 TG 1 2 231886 CASAVA_Build 15 51360617 1D TCAAGAATTT C/- TTTTTTTTTT 2894 het 2279 hom 34 11 20 3 C 1 0 231887 CASAVA_Build 15 51362018 2D TGTAGAAGAG AT/-- AACTTTTGAG 3070 het 3070 hom 38 16 15 9 AT 1 0 231888 CASAVA_Build 15 51370772 1D AATGCAAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 A 10 9 231889 CASAVA_Build 15 51379779 1I TTCATATTTT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 6 7 231890 CASAVA_Build 15 51380857 1I AGAAATTCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 T 9 10 231891 CASAVA_Build 15 51396879 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1229 het 331 hom 12 1 6 5 A 12 13 231892 CASAVA_Build 15 51399158 1I CGTTCTACCT -/G GGGGGTGGAG 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 G 5 6 231893 CASAVA_Build 15 51410456 1D56M1D AACTCGACTT GGAGGATGAAAGGAGGTATCTTCAAGTGAGATCCCAAAGCCAGACAGATTTATAGACT/-GAGGATGAAAGGAGGTATCTTCAAGTGAGATCCCAAAGCCAGACAGATTTATAGAC- TTTTAAACAG 3070 het 3070 hom 40 12 17 38 N/A 0 0 231894 CASAVA_Build 15 51421081 2I ATGTATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 AC 6 7 231895 CASAVA_Build 15 51425909 1D AAGGGGAAAA G/- GATTTTGTGT 3070 het 3070 ref 62 31 27 4 G 2 1 231896 CASAVA_Build 15 51430334 12D TCTCCATCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAGAAAAA 3070 het 1547 hom 27 7 18 4 A 16 4 231897 CASAVA_Build 15 51431732 4I ATATGTAAAT ----/AGAG AGAGAGAGAG 1541 hom 27 het 16 0 9 7 AG 5 7 231898 CASAVA_Build 15 51440824 3I CTAAAGTTTG ---/ATA ATGAGATGAA 3070 hom 166 het 59 0 56 3 ATA 0 1 231899 CASAVA_Build 15 51450814 1D TTTCACTCTA T/- TTTCTAATTT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 T 4 3 231900 CASAVA_Build 15 51455326 1D ATCAGCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 7 T 13 12 231901 CASAVA_Build 15 51456523 2D TTTTTTTTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2270 het 1731 hom 27 10 7 10 A 13 11 231902 CASAVA_Build 15 51459044 1I TCTCAGGTGT -/A AAATTTAAGG 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 A 3 4 231903 CASAVA_Build 15 51499200 10D GCTGGGGATG AAGGACTCTA/---------- AAGTCCATAT 2883 het 2883 ref 34 20 10 7 AAGGACTCTA 1 0 231904 CASAVA_Build 15 51499370 4D CTTAATTTTG TATA/---- TTCATTTTCA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 TA 2 0 231905 CASAVA_Build 15 51533040 1D TTGTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 2670 het 2670 ref 63 44 7 12 A 12 11 231906 CASAVA_Build 15 51535779 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2098 hom 25 8 12 5 TA 9 8 231907 CASAVA_Build 15 51548311 1D AAATGAGAGG A/- AAGCAAAGGC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 3 2 231908 CASAVA_Build 15 51549779 26D ACACTGGAAC AACAGTGAATAAGGTTACTTATAAGG/-------------------------- AACAGATGAA 3070 het 3070 ref 38 20 20 3 AACAGTGAATAAGGTTACTTATAAGG 1 0 231909 CASAVA_Build 15 51564113 15D CTCCATCTCG AAAAAAAAAAAGAGT/--------------- AAAAAAAAAA 2493 het 111 hom 14 2 8 8 AAAAAAAAAAAGAGT 1 0 231910 CASAVA_Build 15 51566850 5D GCTTAGACAC CACCA/----- CACCATGTTC 3070 het 3070 ref 47 23 19 7 CACCA 2 1 231911 CASAVA_Build 15 51570742 2I TCTACTTTTC --/AG AGAGGGAAAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 2 3 231912 CASAVA_Build 15 51571700 1I GGCGTATCTG -/C CCCCCATAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 5 6 231913 CASAVA_Build 15 51574263 1I GATATCTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 314 hom 18 2 13 3 T 8 9 231914 CASAVA_Build 15 51578240 1D GAATGAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 44 1 35 9 T 12 11 231915 CASAVA_Build 15 51578928 1I TTGCTATATA -/T TTCTAAGTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 3 231916 CASAVA_Build 15 51581254 2D TTCCTAAGTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 19 11 5 T 11 9 231917 CASAVA_Build 15 51587973 1D TTTCATGCTG T/- TAAAACCAAA 3070 hom 90 het 31 0 29 2 T 2 1 231918 CASAVA_Build 15 51609577 1I GTGAGTAGAT -/G GAGCAGACAC 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 G 1 2 231919 CASAVA_Build 15 51611274 1D AAACAAAAGG T/- TAAGAGATGA 3070 hom 96 het 35 0 32 4 T 2 1 231920 CASAVA_Build 15 51612091 6D ATTGAACTCT TAGAGA/------ TAGAGAGTAG 3070 het 3070 ref 52 25 18 12 TAGAGA 2 1 231921 CASAVA_Build 15 51612874 4I CCCATTAAGA ----/TGAT TATACCCTCC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TGAT 0 1 231922 CASAVA_Build 15 51627427 5D GGACAGCAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 43 18 23 6 AAAAG 3 2 231923 CASAVA_Build 15 51638662 1D TTTTTTTTTT C/- ATTTTAGGAT 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 C 1 0 231924 CASAVA_Build 15 51645257 1I ACGTTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 55 20 22 13 A 10 11 231925 CASAVA_Build 15 51647562 1D TTTTGTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 26 0 16 10 T 13 12 231926 CASAVA_Build 15 51648580 1I TTTTCTTTCC -/T TTTCACAGGA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 3 4 231927 CASAVA_Build 15 51649752 1D TCATATACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 33 1 26 8 T 13 12 231928 CASAVA_Build 15 51651913 1D TATTTTTTTG C/- CCTACCTATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 3 2 231929 CASAVA_Build 15 51660446 4I AAGATAGTTA ----/TAAT TAATTATTTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAT 1 2 231930 CASAVA_Build 15 51660558 1I ATTGACTGAC -/T TTATGCTCTC 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 T 2 3 231931 CASAVA_Build 15 51662926 1I GTTCATTTGG -/A AAAACTTGAA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 4 5 231932 CASAVA_Build 15 51663458 2D TTTAAATGAC AG/-- AGAGATAATA 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 AG 3 2 231933 CASAVA_Build 15 51668764 20D TCTCAGATAA CACGAATTTCAGTTTGTATT/-------------------- CACGAATTTC 3070 het 3070 ref 32 19 11 11 CACGAATTTCAGTTTGTATT 2 1 231934 CASAVA_Build 15 51684100 1D CCAGAGTCTA C/- AAAGAACTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 0 231935 CASAVA_Build 15 51702969 2D AGCATTATAT TA/-- TATATATATA 1287 het 1287 ref 30 20 3 8 TA 8 7 231936 CASAVA_Build 15 51705288 1D CTGTTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 1859 het 1859 ref 31 20 4 8 A 13 12 231937 CASAVA_Build 15 51737061 1I ACAAATGGAG -/T TATTTAATCC 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 T 1 2 231938 CASAVA_Build 15 51739192 2D AGGCAGTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 9 5 A 12 10 231939 CASAVA_Build 15 51746922 1I ATAAATTAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 8 9 231940 CASAVA_Build 15 51748286 13D TCACAGCTAC TTGGGGGGCTGAG/------------- GTGGGAGGAT 3070 het 3070 hom 25 11 15 2 TTGGGGGGCTGAG 1 0 231941 CASAVA_Build 15 51751470 4I GAAGGGGAAA ----/GAGG GAGGGAGGGA 3070 het 3070 hom 47 21 16 10 GAGG 2 3 231942 CASAVA_Build 15 51759434 1I TATCTGCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 11 12 231943 CASAVA_Build 15 51772881 1I TCTGAAAAAC -/T GTGTCTTGCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 0 1 231944 CASAVA_Build 15 51792009 1D GCTTGAACCT G/- GGGGGTGGAG 2932 het 2932 ref 30 15 10 5 G 6 5 231945 CASAVA_Build 15 51792643 1D CTGAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2611 hom 25 10 8 7 A 13 12 231946 CASAVA_Build 15 51792682 1I GTATTTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1279 hom 24 4 13 7 A 13 14 231947 CASAVA_Build 15 51814310 1D AAAAAAAAAA T/- AATAATATTA 2291 het 17 hom 9 1 7 1 T 1 0 231948 CASAVA_Build 15 51815429 1I CATAATCGTT -/A AAAATATAAC 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 4 5 231949 CASAVA_Build 15 51823281 1I CTGGCTAACA -/C GGTGAAACCC 1357 hom 10 het 4 0 4 0 C 0 1 231950 CASAVA_Build 15 51824524 1I ACTTTATTGT -/A AAAAAAAAAA 2805 het 2318 hom 22 7 8 7 A 13 14 231951 CASAVA_Build 15 51824647 1D TATAAAATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 10 9 231952 CASAVA_Build 15 51827472 1I AGTGAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 15 11 T 13 14 231953 CASAVA_Build 15 51837145 1I ATTAAAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 8 9 231954 CASAVA_Build 15 51841327 14I AAACAAAAAC --------------/AATCAAACAAAAAA CCAAAGCAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AATCAAACAAAAAA 0 1 231955 CASAVA_Build 15 51850738 1D TAAAATGAAA C/- AGAAATTTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 2 C 1 0 231956 CASAVA_Build 15 51852201 1D AGCAAAAAAA T/- GTACATTATT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 1 0 231957 CASAVA_Build 15 51867865 1D CCAAAAGATG A/- GAAAGAGTCA 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 A 1 0 231958 CASAVA_Build 15 51870192 1I TAATAAACAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 A 8 9 231959 CASAVA_Build 15 51873150 1D ACAGTTAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 A 10 9 231960 CASAVA_Build 15 51887492 1D TTAAAAAAAC A/- ACAACAGAGA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 2 1 231961 CASAVA_Build 15 51887821 3D AAAAATAAAA AAC/--- AAAAAACCTG 3070 het 3070 hom 43 11 26 6 AAC 1 0 231962 CASAVA_Build 15 51887867 1I TATTTAAACA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 35 8 15 12 T 7 8 231963 CASAVA_Build 15 51887948 2D AAACATCGCC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 22 5 A 11 9 231964 CASAVA_Build 15 51888394 1D ACTGGCTTCC T/- TTTAGCCCTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 4 3 231965 CASAVA_Build 15 51888497 1D AAACAACTAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 9 8 231966 CASAVA_Build 15 51889525 4I GATGCCCCTC ----/AATT AAATACAACA 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 AATT 0 1 231967 CASAVA_Build 15 51894527 1I GGTTATTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 T 10 11 231968 CASAVA_Build 15 51896299 1D TGACAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 147 hom 46 1 38 8 A 10 9 231969 CASAVA_Build 15 51912953 1I TAAATCTAGT -/A CTGCTTCAGT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 A 0 1 231970 CASAVA_Build 15 51918597 2I TTTCTAAAAC --/AT GTGTAAAATG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AT 0 1 231971 CASAVA_Build 15 51927012 1I TGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 959 het 959 ref 16 4 6 6 T 15 16 231972 CASAVA_Build 15 51927596 2D TCTCTCTCTC TT/-- ATTGATCAGT 3070 het 3070 hom 44 21 19 6 T 2 0 231973 CASAVA_Build 15 51937918 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2755 hom 33 10 19 4 T 10 11 231974 CASAVA_Build 15 51938455 4I TAAAAATTAT ----/TGTA TGTGTTTAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TGTA 0 1 231975 CASAVA_Build 15 51939752 3D GATAACTCAC ATG/--- ATATCATTTT 3070 het 3070 ref 46 22 21 4 ATG 1 0 231976 CASAVA_Build 15 51940951 4D GTTCATTGGA TTTC/---- TTTCTATCAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 TTTC 2 1 231977 CASAVA_Build 15 51948097 7D CCACAAAAAG TCATAGA/------- TCTCTCCCTG 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TCATAGA 1 0 231978 CASAVA_Build 15 51948921 2D GCCAATAAAA AG/-- GGTAATTCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 AG 1 0 231979 CASAVA_Build 15 51951838 1D CATTCATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 214 hom 38 1 31 6 T 11 10 231980 CASAVA_Build 15 51958369 1D TATGCAGATA G/- AAGCCATTTG 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 G 1 0 231981 CASAVA_Build 15 51960626 2I AGTTGGGGAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 TG 7 8 231982 CASAVA_Build 15 51963612 1D TAACAAAAGA G/- GAGTCACAGA 3070 hom 138 het 53 0 46 8 G 2 1 231983 CASAVA_Build 15 51967147 4I TGTGGTTTGC ----/TACA TACACCCTTC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 TACA 1 2 231984 CASAVA_Build 15 51977901 2D CCAGACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 AC 9 8 231985 CASAVA_Build 15 51983325 8D AATTTCTGAC AGCTACAT/-------- AGCTACATTG 3070 hom 111 het 43 0 37 10 AGCTACAT 2 1 231986 CASAVA_Build 15 51986473 1I AATCCAACCA -/C CCCCCCTCTC 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 C 6 7 231987 CASAVA_Build 15 51993595 28D GTGTATGTAT CAGGCCTGTGTGCCCAAAGCTTATATGC/---------------------------- CAGGCCTGTG 3070 het 3070 ref 36 20 13 9 CAGGCCTGTGTGCCCAAAGCTTATATGC 1 0 231988 CASAVA_Build 15 51997836 1I TTGTTTATTT -/C CCTACTCAGA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 2 3 231989 CASAVA_Build 15 51999586 4D ATAATGTTCA TAAT/---- TAATCATTTC 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 TAAT 2 1 231990 CASAVA_Build 15 52003736 2D AAACAAAAAA AG/-- AGATAGCACG 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 AG 2 1 231991 CASAVA_Build 15 52006236 1I GAAGAAGATA -/C CCAATCTTTA 3070 hom 160 het 60 0 54 6 C 2 3 231992 CASAVA_Build 15 52007605 2I GGAATTAAAG --/AC ACACACACAC 3070 het 737 hom 25 3 18 4 AC 5 6 231993 CASAVA_Build 15 52011804 3D CAAAAATCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 181 hom 35 4 31 2 AAC 9 8 231994 CASAVA_Build 15 52014646 1I CCTCCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 577 hom 26 2 10 14 A 11 12 231995 CASAVA_Build 15 52016763 1I CATGCAGAGG -/A AAAGAATATC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 3 4 231996 CASAVA_Build 15 52017277 1I CAAAGTTAGC -/A TTCATAAGTG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 0 1 231997 CASAVA_Build 15 52017694 1I TGGAAAGCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 9 10 231998 CASAVA_Build 15 52020549 1D AAACTATACT A/- CAAGGCTACA 3070 het 3070 ref 29 20 9 1 A 1 0 231999 CASAVA_Build 15 52022844 4D CAAATTGACC ACTT/---- ACTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 45 15 24 9 ACTT 2 1 232000 CASAVA_Build 15 52025941 1D CTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2658 hom 36 het 28 0 13 15 T 15 14 232001 CASAVA_Build 15 52051416 4D TAGGTAACAC TCTT/---- TATTTTCCTT 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 TCTT 1 0 232002 CASAVA_Build 15 52053075 1I CAACAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3009 het 3009 ref 35 22 11 2 A 11 12 232003 CASAVA_Build 15 52054228 3D TCAAAAGCAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 763 hom 37 5 18 15 T 14 11 232004 CASAVA_Build 15 52058624 1I CATTGCTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 A 7 8 232005 CASAVA_Build 15 52067021 3D GACAGGCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 36 12 19 7 TTG 7 6 232006 CASAVA_Build 15 52076322 3I TCCTGATGGG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 11 14 232007 CASAVA_Build 15 52098058 1I TTCCCCATGA -/G GTCAAATTCT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 G 1 2 232008 CASAVA_Build 15 52102960 3D AAGAGATAGT ATC/--- ATATTTTTAG 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 ATC 1 0 232009 CASAVA_Build 15 52104428 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAATGC 3070 het 1604 hom 16 4 12 0 A 7 8 232010 CASAVA_Build 15 52117404 4D TTTACCAAAA AGTG/---- AGAAGTGTAA 3070 het 3070 hom 21 9 12 1 AGTG 1 0 232011 CASAVA_Build 15 52122344 12D TCTGTCTCAG AAAAGAAAAAGA/------------ AAAAGAAAAA 2440 het 2440 ref 22 16 7 8 AAAAGA 4 2 232012 CASAVA_Build 15 52140613 2D TAATAATAAT AA/-- AAAAAAAAGG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 10 8 232013 CASAVA_Build 15 52152373 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 8 232014 CASAVA_Build 15 52153627 1I AAAAGAGAAT -/C CTTTCCCCAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 232015 CASAVA_Build 15 52154402 1D CAATACTATG T/- TGAATAGAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 1 232016 CASAVA_Build 15 52155324 3I ATCTTCAGAT ---/ATA ATAATGCCAG 3070 hom 120 het 51 0 41 10 ATA 1 2 232017 CASAVA_Build 15 52156118 3I GTTGCTGGCA ---/GAG GAGTGATAGT 3070 hom 129 het 46 0 42 4 GAG 1 2 232018 CASAVA_Build 15 52161098 1D CAATCCCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 10 9 232019 CASAVA_Build 15 52161858 8D GTTTTCCAAG TTGCCTAC/-------- TTTTTCTTCT 3070 hom 117 het 41 0 40 2 TTGCCTAC 1 0 232020 CASAVA_Build 15 52169150 1D TTCCAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1283 hom 38 5 18 15 T 17 16 232021 CASAVA_Build 15 52169790 1D TATAGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 38 1 29 8 A 11 10 232022 CASAVA_Build 15 52171254 1I CAATTGATAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 8 9 232023 CASAVA_Build 15 52172682 1D TGTAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 36 1 30 5 A 12 11 232024 CASAVA_Build 15 52173466 35D AGCACCAACT GGTGTGCATTGAAACCTTTACTTCATTTCCAAGAA/----------------------------------- GGTGTGCATT 3070 hom 102 het 33 0 32 6 GGTGTGCATTGAAACCTTTACTTCATTTCCAAGAA 2 1 232025 CASAVA_Build 15 52175829 2I CTCTATTTGG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 9 11 232026 CASAVA_Build 15 52185144 2I TTTCTACTAC --/TG GGTGATGAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TG 0 1 232027 CASAVA_Build 15 52187683 1D TAAATAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 33 0 22 11 T 11 10 232028 CASAVA_Build 15 52192576 2I TTAGGCGAGA --/TT TTTTTTTTTT 1181 het 104 hom 38 2 8 28 T 10 12 232029 CASAVA_Build 15 52195467 1D CATTGGGTTA T/- TTTTATAGTC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 5 4 232030 CASAVA_Build 15 52198536 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 989 het 989 ref 34 28 3 3 T 11 10 232031 CASAVA_Build 15 52198823 1D AATATTTTAA T/- TTTTTTCATG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 7 6 232032 CASAVA_Build 15 52209407 1I TTATAATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 816 hom 31 2 24 5 T 10 11 232033 CASAVA_Build 15 52213927 2D GTGTGTGTGT GC/-- GTTTGTGTGT 3070 hom 65 het 27 0 20 7 GC 1 0 232034 CASAVA_Build 15 52216335 1D TGTGTATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 22 0 11 11 T 12 11 232035 CASAVA_Build 15 52223396 2D TTATATATAT AA/-- GTCAAAATCA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 2 0 232036 CASAVA_Build 15 52223821 1D TGCATCGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 11 10 232037 CASAVA_Build 15 52230758 1D GGCTGACCAT A/- AAAAAGTTAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 6 5 232038 CASAVA_Build 15 52235078 4I TTACTTCCAC ----/TTAA TTATTTGTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTAA 0 1 232039 CASAVA_Build 15 52245951 4D TTTCTGAACT ATTC/---- ATTTTCTGTA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 ATTC 1 0 232040 CASAVA_Build 15 52246990 8D CACTCGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 19 11 232041 CASAVA_Build 15 52247730 12D CTTTAAAAAG TTGCTGGCTACT/------------ TTCGCTGGTT 3070 hom 117 het 40 0 40 2 TTGCTGGCTACT 1 0 232042 CASAVA_Build 15 52253829 3D ACAAATTACA TCT/--- TCTTCAGGAA 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 TCT 2 1 232043 CASAVA_Build 15 52266922 13D TTAATAAAAA GGCCTGACCCTTC/------------- TCAATAACTC 3070 het 3070 ref 35 17 16 5 GGCCTGACCCTTC 1 0 232044 CASAVA_Build 15 52304574 5I TTATCTTTTC -----/AATAA AATAGCTTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 7 AATAA 0 1 232045 CASAVA_Build 15 52304660 1I GTTCTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 10 10 11 T 11 12 232046 CASAVA_Build 15 52307237 1D GCACCACAGC T/- TAGGTGAGTA 3070 hom 126 het 47 0 41 7 T 2 1 232047 CASAVA_Build 15 52309593 32I TATTTTTTCA --------------------------------/ACATATTGATTTCATTTTATGTGAATATACAC CTGTTGGTAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ACATATTGATTTCATTTTATGTGAATATACAC 0 1 232048 CASAVA_Build 15 52309959 4D GTGAAAATAA TAAT/---- TAATCTCTAC 3070 hom 102 het 41 0 35 9 TAAT 2 1 232049 CASAVA_Build 15 52310988 2I TGAAGGATTC --/TA TGTCTTCATT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TA 0 1 232050 CASAVA_Build 15 52315509 1I ATTAGATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 28 2 17 9 A 13 14 232051 CASAVA_Build 15 52323091 1I CCAACAGTGT -/A AAAGCATTCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 4 232052 CASAVA_Build 15 52328726 1D TGGTGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 11 10 232053 CASAVA_Build 15 52339995 2I CTGAAGTTAT --/TA TATATACATA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 TA 3 4 232054 CASAVA_Build 15 52393937 1I AAATAAAGAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 9 232055 CASAVA_Build 15 52402499 1D TTTTGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2523 hom 39 9 17 14 T 13 12 232056 CASAVA_Build 15 52407797 1D TGAATTATTT A/- AAAATTACCA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 5 4 232057 CASAVA_Build 15 52415533 1D ATAATATTGA G/- AATTTTGGAG 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 G 1 0 232058 CASAVA_Build 15 52415869 1D60M1D5M1I TTGAATACAA TTTTTTGTCAGATATGTGATTTGCTATTATTTTTGCCTTGTTTGTGCCTTGTCTTTTAATTAATCTT-/-TTTTTGTCAGATATGTGATTTGCTATTATTTTTGCCTTGTTTGTGCCTTGTCTTTTAATT-GTCTTA AAAATATCTC 3070 het 3070 ref 39 36 23 5 N/A 0 0 232059 CASAVA_Build 15 52417845 4I TGTCTGTCTT ----/TGTC TGTCAGGTTC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 TGTC 1 2 232060 CASAVA_Build 15 52419131 14D TTATGTGGAG ATATATATATATAT/-------------- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 20 8 10 8 AT 12 5 232061 CASAVA_Build 15 52421099 1I TCAGGAATAC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 A 7 8 232062 CASAVA_Build 15 52422056 1D ATCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2659 hom 29 8 14 7 A 12 11 232063 CASAVA_Build 15 52434662 2I AAATAAATGT --/GG ATTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 42 27 14 1 G 0 2 232064 CASAVA_Build 15 52438092 6I ACATTCTTGA ------/TTTATT TTTGAGATAG 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 TTTATT 0 1 232065 CASAVA_Build 15 52441502 1D CTGGGTTTGT A/- AAAAAATATG 3070 hom 105 het 41 0 34 10 A 7 6 232066 CASAVA_Build 15 52443787 2D CAAAAAATGA CC/-- CCCCCCCAAG 3070 het 23 hom 26 1 10 15 C 9 7 232067 CASAVA_Build 15 52451208 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 28 8 11 13 AC 10 9 232068 CASAVA_Build 15 52460123 1I TTATCTTTTG -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 56 25 20 11 T 7 8 232069 CASAVA_Build 15 52473096 3D ATGTGCATAT TGA/--- TTTAACAAAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 6 TGA 1 0 232070 CASAVA_Build 15 52481555 1D GTTGAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2300 hom 39 9 15 15 A 17 16 232071 CASAVA_Build 15 52485485 1D AGAGAAGTGT G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 G 8 7 232072 CASAVA_Build 15 52491107 6D TTCACTGACA TACTGT/------ TACACATTGT 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 TACTGT 1 0 232073 CASAVA_Build 15 52563573 1I GGCTTCCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1180 hom 49 3 33 13 A 11 12 232074 CASAVA_Build 15 52582534 2D ATATTAGAAT CA/-- CACTCAGGAA 3070 het 3070 ref 46 25 16 6 CA 2 1 232075 CASAVA_Build 15 52585139 2D ACTTTGCACA CT/-- CTCATTCAAG 3070 het 3070 hom 52 23 26 5 CT 2 1 232076 CASAVA_Build 15 52586136 3D AATTAAACAT CTC/--- TTCTTCAGCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 5 CTC 1 0 232077 CASAVA_Build 15 52593294 1D TTTCTAAATA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 T 8 7 232078 CASAVA_Build 15 52594189 1I GAGGCAGCTG -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 6 7 232079 CASAVA_Build 15 52607809 1D GGTTTGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 38 0 30 9 T 15 14 232080 CASAVA_Build 15 52636239 1D ATGCTAGTAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 A 8 7 232081 CASAVA_Build 15 52672835 2D TGTATTTGCA TC/-- TGTCCAGGTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 3 TC 1 0 232082 CASAVA_Build 15 52681569 2D CATAGACTGA AC/-- AGGCAAATAT 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 AC 1 0 232083 CASAVA_Build 15 52683880 4D CTTAAACCAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 48 21 20 10 GAAA 4 3 232084 CASAVA_Build 15 52684441 6I CTGCAACTTA ------/AAAAAT AAAAATAAAG 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 AAAAAT 1 2 232085 CASAVA_Build 15 52691545 21D AACCAGAATT TTATAAAACACCATCTGTCAC/--------------------- ATATATTTTG 3070 het 3070 ref 41 25 16 7 TTATAAAACACCATCTGTCAC 1 0 232086 CASAVA_Build 15 52691781 4I TGCTAGATAC ----/CTTA CTTAAAGGTG 3070 het 3070 ref 43 29 11 3 CTTA 1 2 232087 CASAVA_Build 15 52698061 6I ATATCCTGTG ------/TTCAAC TTCAAAGTGC 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 TTCAAC 0 1 232088 CASAVA_Build 15 52703891 4D AGACAAAGTG AAAT/---- AAATAGCTAG 3070 het 3070 hom 57 19 31 8 AAAT 2 1 232089 CASAVA_Build 15 52704779 2D CCCTACTGAG AT/-- ATAGTCCCAA 3070 hom 117 het 42 0 39 3 AT 2 1 232090 CASAVA_Build 15 52705654 6I CATATCACCA ------/CTTGGC CTTGGCCTTC 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 CTTGGC 1 2 232091 CASAVA_Build 15 52705794 4D TGATTTACTC TGGA/---- TGGAGATTTG 3070 het 3070 ref 55 28 24 6 TGGA 2 1 232092 CASAVA_Build 15 52707903 5I CTAATACGTT -----/AAGTA AAGTACAGAA 3070 het 3070 hom 56 21 27 8 AAGTA 1 2 232093 CASAVA_Build 15 52709095 1D CAACATGGTT A/- AAAATCTCAC 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 5 4 232094 CASAVA_Build 15 52709240 4I AGTAAAAGGC ----/AGTT AGTTAGGATT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 AGTT 1 2 232095 CASAVA_Build 15 52715345 1D ACAATGAAGT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 9 8 232096 CASAVA_Build 15 52719890 1D ATAACCCAGG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 8 7 232097 CASAVA_Build 15 52723038 1D ACACAGCAAA G/- GAAAAAATAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 2 1 232098 CASAVA_Build 15 52736529 1I TTAACTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 10 11 232099 CASAVA_Build 15 52738960 2D ACCCTACCCT CA/-- CACAGAGATG 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 CA 3 2 232100 CASAVA_Build 15 52739570 2D CCTGCTATAC AT/-- ATAATATATC 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 AT 2 1 232101 CASAVA_Build 15 52740384 2I AGACATTCAT --/GA GAGAGAAGAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 GA 3 4 232102 CASAVA_Build 15 52741303 1I CTGAAAAAAA -/T AAAAAACACA 3070 het 2196 hom 26 5 20 1 T 0 1 232103 CASAVA_Build 15 52741602 1I TAAAAGTTTG -/A AAAGCTTTGT 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 A 3 4 232104 CASAVA_Build 15 52742791 1D TTTATAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 11 10 232105 CASAVA_Build 15 52757227 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 2768 het 2768 ref 16 9 7 0 A 10 9 232106 CASAVA_Build 15 52763037 1D ATTCCGAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 8 232107 CASAVA_Build 15 52764791 1D ATATGTAAGT A/- AAAATCTATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 5 4 232108 CASAVA_Build 15 52765665 1D AAAGGATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 46 1 31 15 A 24 23 232109 CASAVA_Build 15 52766776 24D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG/------------------------ GACGACAGCA 3070 het 154 hom 34 2 26 8 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 1 0 232110 CASAVA_Build 15 52766864 1D AACAAGTAAC A/- AAAAAATAGA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 7 6 232111 CASAVA_Build 15 52767315 1D ATCATGACTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 9 8 232112 CASAVA_Build 15 52767918 2D CTCCTTAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 12 10 232113 CASAVA_Build 15 52771745 2D ACAGAAAAAC TT/-- ATCAAAATTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 0 232114 CASAVA_Build 15 52771891 1D ATGAAAGGGC A/- AAAATTCAAA 3068 hom 33 het 27 0 11 17 A 5 4 232115 CASAVA_Build 15 52776656 2D AAGTGCCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 35 2 14 19 A 12 10 232116 CASAVA_Build 15 52784469 1D TAAAATTTTT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 9 8 232117 CASAVA_Build 15 52786813 1D TTTAATAGAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 9 8 232118 CASAVA_Build 15 52789225 2I TATTTTTAAG --/TA TAAGGTCCCA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TA 1 2 232119 CASAVA_Build 15 52790406 2D ATAACAGTCC TG/-- TGTTTCCCTG 3070 het 3070 ref 54 24 18 14 TG 2 1 232120 CASAVA_Build 15 52798744 2I CATTTTCTAA --/TT TTTTTTTTAC 3070 het 1517 hom 20 5 12 3 T 8 10 232121 CASAVA_Build 15 52808890 2I AAATAAAAAT --/AA AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 7 9 232122 CASAVA_Build 15 52809367 1D AGCAGTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2827 hom 29 8 10 11 T 17 16 232123 CASAVA_Build 15 52817428 1D ACCATATGGA G/- GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 G 2 1 232124 CASAVA_Build 15 52820152 1I CGTTAACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 10 11 232125 CASAVA_Build 15 52841466 1I TCACAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 863 hom 32 2 27 3 A 11 12 232126 CASAVA_Build 15 52843424 1D GTGCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 12 11 232127 CASAVA_Build 15 52846492 1I CACAGAAATG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 7 8 232128 CASAVA_Build 15 52852236 1I CTCTGACTAT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 8 9 232129 CASAVA_Build 15 52854868 1I CCAGGGCCCG -/A AAAAAAAAAA 1957 het 1954 ref 31 9 12 10 A 15 16 232130 CASAVA_Build 15 52859043 1I AAAGCAAAAC -/A AAAAATAATC 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 5 6 232131 CASAVA_Build 15 52865583 1D TATATGTTCC A/- AACCATAATC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 3 2 232132 CASAVA_Build 15 52869967 4D TACCATTCTT TGAG/---- TGAGTCAAAC 3070 het 3070 hom 49 25 22 4 TGAG 2 1 232133 CASAVA_Build 15 52873326 2I AGTGCAGTGG --/CA CGATCTTGGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 CA 0 1 232134 CASAVA_Build 15 52902808 3D CATTTATCAT TTC/--- TTCGTGGTGA 3070 het 3070 ref 53 32 20 1 TTC 2 1 232135 CASAVA_Build 15 52903893 1I TTTAGATGTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 8 9 232136 CASAVA_Build 15 52904552 1D CGACCAGCAG C/- CGGACTTTCC 3070 het 3070 hom 28 12 8 8 C 2 1 232137 CASAVA_Build 15 52904714 42D CAGATTTTTA TGGGTAAAGGATAGGGGGCATGGTGGGCCAAAAGGCAACTTT/------------------------------------------ TGGGGCATGA 3070 het 3070 ref 28 23 8 4 TGGGTAAAGGATAGGGGGCATGGTGGGCCAAAAGGCAACTTT 1 0 232138 CASAVA_Build 15 52908504 5I TGATCTTACC -----/AAAGT AATTACACAG 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 AAAGT 0 1 232139 CASAVA_Build 15 52908682 1D GAACAATGCA T/- GAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 54 22 20 12 T 1 0 232140 CASAVA_Build 15 52909743 1D TCAATATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 13 12 232141 CASAVA_Build 15 52910227 1I CTTGCTGTGA -/C CCCCCCCAGT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 C 7 8 232142 CASAVA_Build 15 52926255 4I107M1D AGCTTTTATT ----TTTATTTATTTTTTTTTTTTGGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCAGTGCAACCTCTGCCTTCCGGGTTCAAGCGA/TTTATTTATTTATTTTTTTTTTTTGGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCAGTGCAACCTCTGCCTTCCGGGTTCAAGCG- TTTTTCTGCC 3070 hom 36 het 13 0 13 7 N/A 0 0 232143 CASAVA_Build 15 52927064 1D GTTTAACAAC A/- AAAAAAGATG 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 7 6 232144 CASAVA_Build 15 52927769 2I AAATTTCTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 12 232145 CASAVA_Build 15 52929710 1D ATAAGCTTCC A/- AAAAAACCTA 3070 hom 90 het 35 0 30 6 A 7 6 232146 CASAVA_Build 15 52929922 3I GAATTGAGAT ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 9 12 232147 CASAVA_Build 15 52932845 1D AATGGAAAGC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 8 7 232148 CASAVA_Build 15 52936218 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 8 7 232149 CASAVA_Build 15 52937385 1D TAAAATGACC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 7 6 232150 CASAVA_Build 15 52938033 1D CCTACACCTA G/- CTGCATTTCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 0 232151 CASAVA_Build 15 52941018 2I TTAAGTATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 25 0 21 4 A 11 13 232152 CASAVA_Build 15 52941924 1D AGAGAAATCC A/- AAAAGATCAC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 5 4 232153 CASAVA_Build 15 52942826 4D GCTGAATGTC TGTT/---- TGAGGGAGAA 3070 hom 38 het 17 0 14 7 TGTT 1 0 232154 CASAVA_Build 15 52943231 1I GCACTGAGAA -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 6 7 232155 CASAVA_Build 15 52958077 1D TGTTAACATA G/- GGAAAGATAT 3070 hom 96 het 37 0 33 6 G 3 2 232156 CASAVA_Build 15 52959406 1D ATCAACAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 30 0 22 8 A 16 15 232157 CASAVA_Build 15 52964945 10D GGACACATAA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 hom 88 het 35 0 30 9 TG 12 7 232158 CASAVA_Build 15 52965098 4D TTATACTCTT TTAG/---- TTATTTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 TTAG 1 0 232159 CASAVA_Build 15 53019326 1D TTAACTTTAT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 8 7 232160 CASAVA_Build 15 53033907 1I GGAGTTTTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 643 hom 30 2 20 8 T 9 10 232161 CASAVA_Build 15 53046039 3D ATTTCCTAGG AAA/--- AAAAAAAGTA 3070 hom 39 het 24 0 14 12 A 10 7 232162 CASAVA_Build 15 53050873 21D AAATATTTAT GAAGAGGATGAGAAATAATCA/--------------------- GAAGAGGATG 3070 het 3070 ref 43 22 15 11 GAAGAGGATGAGAAATAATCA 2 1 232163 CASAVA_Build 15 53050979 1I AAGGCAAGAC -/A AAAAAAAAAA 2998 het 2998 ref 39 22 10 7 A 10 11 232164 CASAVA_Build 15 53051268 2I TTGGTAAAAG --/AC ACAAAATTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AC 1 2 232165 CASAVA_Build 15 53072028 25I AAATGCTGAG -------------------------/GGAATTCATCAGCACTGGGCCTGAC TTACAAGAGC 3070 hom 72 het 23 0 24 1 GGAATTCATCAGCACTGGGCCTGAC 0 1 232166 CASAVA_Build 15 53073477 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 9 10 232167 CASAVA_Build 15 53078804 13I GAATGAGTTC -------------/AAACAATGAGTTT TGCAAGGAGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AAACAATGAGTTT 0 1 232168 CASAVA_Build 15 53086814 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 975 het 647 hom 11 5 5 1 A 15 14 232169 CASAVA_Build 15 53093279 4I CACAATGGAG ----/TCTC TCTCTGCTTC 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 TC 2 4 232170 CASAVA_Build 15 53097799 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 6 7 232171 CASAVA_Build 15 53102679 22D GGGGAAAAAT ACACACACACACACACACACAC/---------------------- ACACACACAC 3070 hom 69 het 28 0 23 11 AC 19 8 232172 CASAVA_Build 15 53104906 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 9 10 232173 CASAVA_Build 15 53112078 7D GTTTGTCTAT CCACAGG/------- CCATGGACTT 3070 hom 126 het 48 0 40 11 CCACAGG 1 0 232174 CASAVA_Build 15 53123375 6I CAGGAGTCTA ------/TGATGG TAATATGGAG 3070 het 3070 hom 51 20 22 9 TGATGG 0 1 232175 CASAVA_Build 15 53129756 4D TTGTTGAGAT ACTC/---- ACAAGCACCA 3070 het 3070 ref 41 21 18 4 ACTC 1 0 232176 CASAVA_Build 15 53131201 1D ATTTTTCAAA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 T 8 7 232177 CASAVA_Build 15 53135289 1D TAGAACTGTG A/- AAAAAAAAAA 1461 het 1461 ref 36 19 4 14 A 13 12 232178 CASAVA_Build 15 53183582 1D TATTGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 115 hom 39 1 26 12 A 12 11 232179 CASAVA_Build 15 53186976 1I AATTGTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 17 1 12 4 T 13 14 232180 CASAVA_Build 15 53188437 1D TTTTTTTTTT G/- TTTTTTTTTG 3070 hom 59 het 23 0 19 5 G 1 0 232181 CASAVA_Build 15 53191230 1D GGTACGTACC T/- TGTAGTCCCA 3070 hom 56 het 24 0 19 5 T 2 1 232182 CASAVA_Build 15 53198513 7D GTGATTACCA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 16 1 12 3 T 18 11 232183 CASAVA_Build 15 53205270 1I TTTATCCCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 T 9 10 232184 CASAVA_Build 15 53207194 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 24 0 17 7 A 14 13 232185 CASAVA_Build 15 53221445 1D AAAGTACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 30 0 22 8 A 11 10 232186 CASAVA_Build 15 53234760 3D GGGGCAAAAA TAT/--- TATAGGAACA 3070 het 3070 hom 51 19 27 8 TAT 2 1 232187 CASAVA_Build 15 53242215 1I AAAACATAAT -/A AAAAAAAAAA 2930 het 879 hom 9 2 6 1 A 11 12 232188 CASAVA_Build 15 53245251 3D CATGTAACAT ACA/--- ACTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 54 25 25 6 ACA 1 0 232189 CASAVA_Build 15 53255029 4I TTGATAACAT ----/AAAG AAATACAGTG 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 AAAG 0 1 232190 CASAVA_Build 15 53258322 6D AGCTTCAGTT GATTAA/------ GATTAAAACG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 GATTAA 2 1 232191 CASAVA_Build 15 53261218 4D CTGACACTGC CATA/---- CAAATTGTTA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CATA 1 0 232192 CASAVA_Build 15 53266291 2I GTGGTTATGT --/GA GAGAATGCTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GA 2 3 232193 CASAVA_Build 15 53267432 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 9 10 232194 CASAVA_Build 15 53278308 4I2M3I TAATGGACTC ----TT---/ACAGTTCCA TATGGCTGGG 3070 hom 39 het 16 0 14 4 N/A 0 0 232195 CASAVA_Build 15 53283075 3I CAGCCCATTT ---/TTA TTTTTTTTTT 1370 het 182 hom 5 2 3 0 TTA 0 1 232196 CASAVA_Build 15 53286699 1D ATAAACTGTT A/- ATAACTACTT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 2 1 232197 CASAVA_Build 15 53288137 23D AGAGAGGAAA TCTTTCCCACAAGTCCCTGGAAG/----------------------- ACTTTCCCTC 3070 hom 114 het 38 0 38 8 TCTTTCCCACAAGTCCCTGGAAG 1 0 232198 CASAVA_Build 15 53289150 2I ATCTTTTGGG --/AT ATATATATAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AT 6 7 232199 CASAVA_Build 15 53296988 1D CGTCTTTACT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 7 232200 CASAVA_Build 15 53297154 21D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/--------------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 3 A 32 11 232201 CASAVA_Build 15 53300773 1I TGCCTTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 8 9 232202 CASAVA_Build 15 53305365 2D AAAATGTAAC AG/-- GGGTTAAAAG 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 AG 1 0 232203 CASAVA_Build 15 53306818 1D TAAAATAGTT G/- ATTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 21 9 G 1 0 232204 CASAVA_Build 15 53325911 3D AGATATCGGC TTT/--- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 47 13 27 8 T 10 7 232205 CASAVA_Build 15 53332942 1I GTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1307 het 1307 ref 20 10 6 4 A 11 12 232206 CASAVA_Build 15 53433006 1I CCTAAGGCAA -/T TTATAAACAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 2 3 232207 CASAVA_Build 15 53436731 2I CTATCCAACA --/AC AGATGACCCA 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 AC 0 1 232208 CASAVA_Build 15 53437523 2D GTTATCCTAC CA/-- CAGTGTTTGT 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 CA 2 1 232209 CASAVA_Build 15 53440609 2I CATATGCAAG --/AA AAAACGCAGA 3070 het 3070 hom 26 14 12 0 A 4 6 232210 CASAVA_Build 15 53442355 1I CATAGTGAGA -/C CCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 C 4 5 232211 CASAVA_Build 15 53442854 1D AAAAACAAAC A/- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 15 2 A 4 3 232212 CASAVA_Build 15 53445795 1I AGGAAAAATG -/A AAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 4 5 232213 CASAVA_Build 15 53447113 2D TGTAGGGTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 45 5 20 21 A 14 12 232214 CASAVA_Build 15 53449498 2D ATAAAGGTAA AT/-- ATATATTTCA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AT 4 3 232215 CASAVA_Build 15 53455002 4D CTCCATAAAT AAAG/---- ATACTATGAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 AAAG 1 0 232216 CASAVA_Build 15 53457402 4I TCAGATCAGT ----/ACAA ACAGACTAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACAA 0 1 232217 CASAVA_Build 15 53459591 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2694 het 1894 hom 15 7 7 1 A 15 16 232218 CASAVA_Build 15 53461298 1I5M4I8M7I CATGTGAAGT -ATACA----TAATACAG-------/AATACAGATGCAATACAGTAGTCAA ATTCCATTTT 3070 het 1108 hom 40 4 22 18 N/A 0 0 232219 CASAVA_Build 15 53466229 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 628 het 258 hom 7 2 2 3 A 10 11 232220 CASAVA_Build 15 53468257 1D CTGTCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 A 13 12 232221 CASAVA_Build 15 53470259 1D GAGAGGATAC A/- AAAAGGTTGG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 5 4 232222 CASAVA_Build 15 53471036 2D ATGCAATGAC AG/-- AAATACACAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 3 AG 1 0 232223 CASAVA_Build 15 53474786 1D CAATCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 A 12 11 232224 CASAVA_Build 15 53476714 1I AAAAAAAAAC -/A AAACAAAAAA 236 het 236 ref 9 3 1 6 A 3 4 232225 CASAVA_Build 15 53476923 3D AGGCAGAAGC AAG/--- AAGTTCATTT 3070 het 3070 hom 41 20 21 2 AAG 2 1 232226 CASAVA_Build 15 53477477 3I AAGAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AAG 3 4 232227 CASAVA_Build 15 53480059 2I14M1I AAACAAAAAC --AAAACAAAACAAAC-/AAAAAACAAAACAAACA AAAAAAAATT 3070 het 550 hom 32 3 13 23 N/A 0 0 232228 CASAVA_Build 15 53482896 2I ATAAGTACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 13 15 232229 CASAVA_Build 15 53483717 3D CAACCTGAAA AAC/--- AACGTGTTAC 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 AAC 2 1 232230 CASAVA_Build 15 53485247 3I TTATTTTCTT ---/GAA CGAGTCCAAC 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 GAA 0 1 232231 CASAVA_Build 15 53486835 18D TGATAAATAT CCCCTGAGACGTGTGGGA/------------------ CCCAATATGA 3070 het 3070 ref 28 17 13 6 CCCCTGAGACGTGTGGGA 1 0 232232 CASAVA_Build 15 53491414 1I TCCTTCTCAC -/A AAAAAAAAAT 2063 het 2063 ref 17 9 5 3 A 9 10 232233 CASAVA_Build 15 53495587 2I TAAACATTGT --/TA TATATATATA 2865 het 2785 hom 28 10 14 4 TA 5 6 232234 CASAVA_Build 15 53496538 1D TCATTACTCA C/- ATGGACTACT 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 C 1 0 232235 CASAVA_Build 15 53499834 2I TGATTCTACT --/GC ACACACAGAT 3070 het 2770 hom 25 7 11 7 GC 0 1 232236 CASAVA_Build 15 53499905 1D ATCTTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 12 11 232237 CASAVA_Build 15 53502659 1I GAGCCAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 26 3 11 12 T 13 14 232238 CASAVA_Build 15 53505072 1D AGTAAAAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 107 het 41 0 36 7 T 10 9 232239 CASAVA_Build 15 53509966 4D AAATAGATTC TTAT/---- TTAGATTTAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 TTAT 1 0 232240 CASAVA_Build 15 53512274 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 2227 het 2227 ref 19 12 5 2 A 9 10 232241 CASAVA_Build 15 53514779 1D TAAGCCAGTA G/- GGCATATTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 3 2 232242 CASAVA_Build 15 53531110 1I GAATAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3014 hom 29 9 11 9 T 13 14 232243 CASAVA_Build 15 53540212 2D TGGAACATTC AT/-- TCCAAGATAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AT 1 0 232244 CASAVA_Build 15 53543163 4I ATCAAGAACT ----/CAAC CAACCTCTTT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 CAAC 1 2 232245 CASAVA_Build 15 53547240 12D AAGTCTTAAT CCTGCTGCAAAA/------------ CCTATGTTTG 3070 het 3070 ref 29 18 13 5 CCTGCTGCAAAA 1 0 232246 CASAVA_Build 15 53548820 1I GGCTCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1459 hom 22 5 11 6 A 10 11 232247 CASAVA_Build 15 53556662 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1156 hom 17 5 10 2 A 10 11 232248 CASAVA_Build 15 53556970 1D ATAGACCAAA G/- GGAGGAGTAG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 G 3 2 232249 CASAVA_Build 15 53557151 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1643 hom 26 7 12 7 TA 7 6 232250 CASAVA_Build 15 53567611 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 891 hom 26 7 14 5 T 13 12 232251 CASAVA_Build 15 53568800 1D TACAATAAAG A/- AAAGATGGAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 A 4 3 232252 CASAVA_Build 15 53571705 3I GACTACGATC ---/GTT AATGGGTAAA 3070 hom 120 het 44 0 38 6 GTT 0 1 232253 CASAVA_Build 15 53577086 1D CAAGACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 12 11 232254 CASAVA_Build 15 53578402 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 984 hom 25 4 13 8 A 13 11 232255 CASAVA_Build 15 53592883 1D GCCTTTTCAG T/- TTCGTGTTGG 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 3 2 232256 CASAVA_Build 15 53598931 1I TAATGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 2013 het 1406 hom 24 6 12 6 A 15 16 232257 CASAVA_Build 15 53600695 2D CTCACCAGCA TC/-- TGTTATTTTT 2657 het 2657 ref 24 17 6 2 TC 1 0 232258 CASAVA_Build 15 53603912 3D CCTCCCAAAG TGC/--- TGCTGGGATC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TGC 2 1 232259 CASAVA_Build 15 53604219 1I GTTGGTATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 9 10 232260 CASAVA_Build 15 53608754 2I TCTTGTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 1791 hom 39 8 21 10 TG 0 1 232261 CASAVA_Build 15 53611073 2I TCATGCATTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 9 11 232262 CASAVA_Build 15 53613586 12D AGAGTTTACC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2218 het 930 hom 22 7 6 11 T 24 12 232263 CASAVA_Build 15 53615668 11D GTATTTTTCT TTTTCCTATTA/----------- TTTTCCTATT 3070 hom 45 het 15 0 16 3 TTTTCCTATTA 3 2 232264 CASAVA_Build 15 53636178 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 8 4 A 11 12 232265 CASAVA_Build 15 53636286 1I ATCAGAAATG -/A AAAGGGGGAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 3 4 232266 CASAVA_Build 15 53644072 17D GGGTTCTGGT GGCCATGCCTGTCCCAG/----------------- GGCCATGCAA 3070 het 3070 hom 34 12 13 12 GGCCATGCCTGTCCCAG 1 0 232267 CASAVA_Build 15 53645879 1D ATATTGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 7 A 12 11 232268 CASAVA_Build 15 53648542 1D TATAGCTTTC T/- TTTTTTTTTC 1836 het 1836 ref 43 33 5 5 T 10 9 232269 CASAVA_Build 15 53648836 1I TTTGTTCTTG -/A TTTTTCTAGT 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 0 1 232270 CASAVA_Build 15 53654992 1I AAATACAAAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 46 28 15 3 A 7 8 232271 CASAVA_Build 15 53657069 20D CAATGAAATC TAAAACTAGGTTTTTGTTTT/-------------------- TAAAACTAGG 2361 het 2361 ref 24 16 7 10 TAAAACTAGGTTTTTGTTTT 2 1 232272 CASAVA_Build 15 53661316 1I TGAAACCAAT -/G AGAGGGTTAC 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 G 0 1 232273 CASAVA_Build 15 53662993 1I TTTTACCACA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 7 8 232274 CASAVA_Build 15 53674970 1D TAGCAAAGCT C/- TGTAAGGGAC 3070 het 3070 hom 43 22 20 2 C 1 0 232275 CASAVA_Build 15 53676844 1D CTGCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2568 hom 28 10 9 9 A 12 11 232276 CASAVA_Build 15 53688034 2D CTGTCTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1260 hom 24 7 12 5 T 16 14 232277 CASAVA_Build 15 53689437 1I AGTTATCTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 T 8 9 232278 CASAVA_Build 15 53690051 1I TCTATATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 18 1 13 4 T 11 12 232279 CASAVA_Build 15 53691510 1D AAGAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 A 11 10 232280 CASAVA_Build 15 53692188 30D TTAAAAGCCA ATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------ ATATATATAT 3070 het 647 hom 16 6 8 5 AT 26 11 232281 CASAVA_Build 15 53696714 1D TATTTTTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 12 11 232282 CASAVA_Build 15 53705198 1I ACTGCAAGCT -/C CCCCCTCCCG 1501 het 1501 ref 13 6 4 3 C 5 6 232283 CASAVA_Build 15 53728579 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1899 het 1432 hom 25 8 7 10 A 11 12 232284 CASAVA_Build 15 53728918 1I AATTTAATTC -/A CATGAAGTGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 0 1 232285 CASAVA_Build 15 53743030 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1034 het 1034 ref 36 20 4 12 T 13 14 232286 CASAVA_Build 15 53746698 1D ATAATTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 15 14 232287 CASAVA_Build 15 53749738 1I ACAACCCAAG -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 56 het 23 0 19 4 T 7 8 232288 CASAVA_Build 15 53764195 1I TGGTGGCAGT -/G GGAATGGGGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 2 3 232289 CASAVA_Build 15 53767892 2I TTTTGGTGAT --/TA TATATCCTCT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 TA 2 3 232290 CASAVA_Build 15 53781025 5D CTCCATCTCA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 AAAAC 5 4 232291 CASAVA_Build 15 53787639 17D GTAAGCTGGT AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 2566 het 2566 ref 34 20 10 5 A 29 12 232292 CASAVA_Build 15 53792628 6D AACTTGGTGT TTATAA/------ TTATAAGAAC 3070 het 3070 ref 26 11 11 6 TTATAA 2 1 232293 CASAVA_Build 15 53793224 1I TGAATTGCTA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 7 8 232294 CASAVA_Build 15 53801898 6D GGGGAAATGA ATAACT/------ ATGACAGTAA 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 ATAACT 1 0 232295 CASAVA_Build 15 53802276 1I AACAAAATTT -/G GACAAGGTCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 1 2 232296 CASAVA_Build 15 53808020 1I ATACAAAAAA -/G GGCATTTGAA 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 G 2 3 232297 CASAVA_Build 15 53808257 1I TAGTCTAAAA -/G AAAAAAAAGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 0 1 232298 CASAVA_Build 15 53810606 4I TAATGATGTA ----/CTTT CTTTGTCTCT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 CTTT 1 2 232299 CASAVA_Build 15 53814239 1D ACCAGAGGTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 9 8 232300 CASAVA_Build 15 53817389 5I TTGTACCCTG -----/CTGCT CTGCTATCAA 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 CTGCT 1 2 232301 CASAVA_Build 15 53827588 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2096 het 55 hom 10 2 6 2 A 13 12 232302 CASAVA_Build 15 53834530 4I GAACACCACA ----/CTCT CTCCACTTTC 3070 het 3070 ref 57 29 20 8 CT 1 3 232303 CASAVA_Build 15 53846854 3D AGGACTCTGT ATA/--- ATAATACTTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 7 ATA 3 2 232304 CASAVA_Build 15 53848974 1I CTGTTCTTAC -/T TTTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 3 4 232305 CASAVA_Build 15 53849800 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1457 hom 23 6 8 9 A 13 12 232306 CASAVA_Build 15 53864310 3I AGCAGTTTGG ---/CCT GAGGGTGAGG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 CCT 0 1 232307 CASAVA_Build 15 53869428 1D ACTAATACTG C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 30 het 14 0 11 3 C 9 8 232308 CASAVA_Build 15 53870402 1D AAGGTTCCTG C/- CCCCCCATGG 3070 hom 77 het 28 0 26 2 C 7 6 232309 CASAVA_Build 15 53872790 3D ATTTAGGTTT GGG/--- GGGGTGTGTT 3070 hom 80 het 30 0 28 4 G 7 4 232310 CASAVA_Build 15 53876401 1D CCCCACCCCC A/- AACTTAACAC 3070 hom 28 het 12 0 10 2 A 3 2 232311 CASAVA_Build 15 53880189 8D ATGCACACGT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 36 het 20 0 12 9 AC 12 8 232312 CASAVA_Build 15 53883238 1D ACTCCTCATT C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 C 1 0 232313 CASAVA_Build 15 53884023 4D TCTCTCAGAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 122 het 50 0 40 14 AAAC 4 3 232314 CASAVA_Build 15 53893563 1I CCTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 11 232315 CASAVA_Build 15 53895586 1I GTGATACCAT -/A CAGAATGGAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 0 1 232316 CASAVA_Build 15 53905676 3I GGAGGCTAGT ---/GTA GTGATAGGCT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 GTA 0 1 232317 CASAVA_Build 15 53920517 1I TCCGCCTCCC -/A AGGTTCAAGT 2956 het 2323 hom 16 7 7 2 A 1 2 232318 CASAVA_Build 15 53923887 1I CTGGTCAGTT -/A AAAGACCCCT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 3 4 232319 CASAVA_Build 15 53927353 2D CATTTTTAGT AG/-- AGACAGGGTT 3070 het 2420 hom 16 5 10 2 AG 2 1 232320 CASAVA_Build 15 53930865 1I CAATGCAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 10 11 232321 CASAVA_Build 15 53936074 1D TCTTACTTCC T/- TAAGTCCATT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 T 2 1 232322 CASAVA_Build 15 53937802 1D TGGTTTATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 10 9 232323 CASAVA_Build 15 53943877 1D TATTATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 11 10 232324 CASAVA_Build 15 53945036 1I7M1I AACTACTAAA -TAACATT-/TTAACATTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 27 8 N/A 0 0 232325 CASAVA_Build 15 53953191 1D TCAAACTAAT C/- TTTTTTACAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 C 1 0 232326 CASAVA_Build 15 53954469 1D GCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 18 15 4 A 11 10 232327 CASAVA_Build 15 53966248 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 585 hom 20 4 10 6 A 17 16 232328 CASAVA_Build 15 53979559 1I ATGACTCCAC -/T TTTTTTTTTT 2732 het 2732 ref 39 14 12 13 T 13 14 232329 CASAVA_Build 15 53980892 3I GGACTTTCTG ---/GCT GCTAATTATT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 GCT 1 2 232330 CASAVA_Build 15 53984583 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 697 het 697 ref 11 7 2 2 A 14 13 232331 CASAVA_Build 15 53989501 7I CTGAATTTCC -------/ATTTCAG TTTTCACTCA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 ATTTCAG 0 1 232332 CASAVA_Build 15 53990431 1D CCAACTACTT A/- ACTATCAGCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 1 232333 CASAVA_Build 15 53990572 1I ATTTACAGTG -/T GAGATTCTTT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 T 0 1 232334 CASAVA_Build 15 53996492 2D ACCAGATATC AT/-- AGAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 16 8 AT 1 0 232335 CASAVA_Build 15 53996955 1D GGACTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2230 hom 22 6 13 3 T 12 11 232336 CASAVA_Build 15 53998076 1D ATACTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 29 0 20 10 A 12 11 232337 CASAVA_Build 15 54000365 1D GCAACAAATC A/- AGAGGACTAG 3070 het 3070 ref 66 39 22 6 A 2 1 232338 CASAVA_Build 15 54000439 1D AACCGAGTTT C/- TCAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 C 1 0 232339 CASAVA_Build 15 54003321 1I AAAAACAGAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2557 hom 31 8 18 5 T 8 9 232340 CASAVA_Build 15 54006110 7I ACAAAAATTA -------/GCTGGGC GCTGGGCATC 3070 het 2817 hom 22 7 8 7 GCTGGGC 1 2 232341 CASAVA_Build 15 54021554 1I ATATTTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 T 10 11 232342 CASAVA_Build 15 54031085 1D GATCACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 31 2 20 9 A 17 16 232343 CASAVA_Build 15 54037624 3D AAAGATGACT GTC/--- TTCTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 15 22 5 GTC 1 0 232344 CASAVA_Build 15 54040159 9D TTCATATATA TATCTATCC/--------- TATTAGTTCT 3070 het 3070 ref 29 23 8 3 TATCTATCC 1 0 232345 CASAVA_Build 15 54043673 2D TCAAAAAATA TT/-- GTGCCTTCTT 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 T 2 0 232346 CASAVA_Build 15 54046566 1I TAGTAGAGAC -/A AGGGTTTCAC 3070 het 1231 hom 11 3 8 0 A 1 2 232347 CASAVA_Build 15 54047128 3I ATTATAAAAC ---/ATT ATGTATATTT 3070 het 2385 hom 16 7 9 0 ATT 0 1 232348 CASAVA_Build 15 54047204 1I TATAAAAAAA -/C CTTCATAGAT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 C 1 2 232349 CASAVA_Build 15 54049378 2D AGGGAAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 21 18 7 A 13 11 232350 CASAVA_Build 15 54051060 1D GGCTGCAGTC A/- GCAGAGATTG 1835 het 1835 ref 22 14 4 4 A 1 0 232351 CASAVA_Build 15 54052591 3D AACAAAGAAA TGT/--- TGGACTTAAT 3070 het 3070 ref 57 30 25 4 TGT 1 0 232352 CASAVA_Build 15 54056286 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1252 het 7 hom 10 0 5 5 T 11 10 232353 CASAVA_Build 15 54057001 1D TACTAATTCT A/- AAAATCCATA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 A 5 4 232354 CASAVA_Build 15 54057228 1D TTTAATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 11 10 232355 CASAVA_Build 15 54058559 2I ATTTTTAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 AT 6 7 232356 CASAVA_Build 15 54059408 1I TAATTATTAC -/T TTTTTTTTTT 2732 het 2732 ref 18 7 6 5 T 11 12 232357 CASAVA_Build 15 54059921 1D GATCCAAGGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 44 12 20 14 A 9 8 232358 CASAVA_Build 15 54062794 4I GTGTGTGCGT ----/GCGC GCGCGCGCGT 3070 hom 99 het 41 0 31 10 GC 4 6 232359 CASAVA_Build 15 54080090 1I GTAACACTGA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 6 7 232360 CASAVA_Build 15 54080513 1I ACCCTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 852 hom 25 4 14 7 T 14 15 232361 CASAVA_Build 15 54085339 2D AACCAGCCAT TG/-- AGGATCTAAA 3070 het 3070 ref 51 31 16 5 TG 1 0 232362 CASAVA_Build 15 54087225 1D GGTATTTGTC T/- TTTTTATAAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 T 6 5 232363 CASAVA_Build 15 54091289 1I ATTCTGCAAT -/A AAAAACTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 5 6 232364 CASAVA_Build 15 54096369 1D TCCCTCAAGG A/- CACAAATTAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 A 1 0 232365 CASAVA_Build 15 54106061 1I TGGATTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 12 13 232366 CASAVA_Build 15 54114307 1I CATTTGCCCC -/T TGTGATCTTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 1 2 232367 CASAVA_Build 15 54122072 2D TGTGTGTCAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 112 het 59 0 37 23 TG 10 9 232368 CASAVA_Build 15 54122442 2I TGCCCCTGGG --/TC TCGTGGGGTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TC 1 2 232369 CASAVA_Build 15 54126433 1D GAATATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 43 1 36 6 T 11 10 232370 CASAVA_Build 15 54130363 1I CTCTTGATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 10 11 232371 CASAVA_Build 15 54145459 1I TATTCATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 26 0 15 11 A 12 13 232372 CASAVA_Build 15 54152562 15D22M2D AAAATGCTTT TTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTTAGACAG/---------------TTATTATTATTATTTTTTAGAC-- AGTCTCACTT 3070 het 1276 hom 20 6 15 3 N/A 0 0 232373 CASAVA_Build 15 54152713 2D GTAGCTGGGA TT/-- TTACAGACAC 1636 het 1636 ref 16 11 4 2 T 4 2 232374 CASAVA_Build 15 54152933 1I TTTAAAAAAA -/T GATCTGTTTT 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 T 0 1 232375 CASAVA_Build 15 54153055 2D TTAAATTCAC AA/-- AAACTTTTAT 3070 het 3070 ref 67 37 27 5 A 5 3 232376 CASAVA_Build 15 54153337 1I CCACAGTAGT -/C TTGATGACCA 3070 het 3070 ref 56 32 16 8 C 0 1 232377 CASAVA_Build 15 54153434 2D AGGAACACTC TT/-- TTGCTTTATT 3070 het 3070 ref 66 40 17 9 T 4 2 232378 CASAVA_Build 15 54160060 1D GCCTGGGCAA C/- AAAGTGAGAC 3070 hom 31 het 14 0 9 5 C 1 0 232379 CASAVA_Build 15 54161696 3I AGATTGCTAA ---/TCT TCTTTGTATA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 TCT 1 2 232380 CASAVA_Build 15 54169212 4I TGGGATTAGT ----/TTCA TTTTCTTCAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TTCA 0 1 232381 CASAVA_Build 15 54184295 2D CCCTGGGGTT AA/-- AAGATGGGAA 3070 hom 108 het 44 0 33 11 A 4 2 232382 CASAVA_Build 15 54193161 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 115 hom 21 1 18 2 A 13 14 232383 CASAVA_Build 15 54202241 2I ACCACAAGAC --/AA AGTCCTTCCC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 1 3 232384 CASAVA_Build 15 54207041 1D TTTGAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 2125 het 12 hom 17 0 8 9 T 15 14 232385 CASAVA_Build 15 54222845 2D ATATATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AC 10 9 232386 CASAVA_Build 15 54256430 1D CCAGGGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 159 hom 29 2 22 5 A 13 12 232387 CASAVA_Build 15 54256443 1D AAAAAAAAAA C/- AGATTGCACT 3070 het 183 hom 32 3 20 9 C 1 0 232388 CASAVA_Build 15 54261316 1I TTTTAAAGCA -/G GGGTCCCCAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 3 4 232389 CASAVA_Build 15 54263320 1I ATAATTTGCA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 8 232390 CASAVA_Build 15 54319597 2D ACTAGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 19 7 T 13 11 232391 CASAVA_Build 15 54321211 2D TGCTTTCTGT CA/-- CACACACACA 3070 hom 41 het 31 1 26 4 CA 9 8 232392 CASAVA_Build 15 54351634 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 24 1 14 9 A 13 14 232393 CASAVA_Build 15 54356507 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 67 het 26 0 23 3 T 10 9 232394 CASAVA_Build 15 54358294 1I GAGATCCACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 29 1 24 4 T 11 12 232395 CASAVA_Build 15 54366378 1I TGGCATATTT -/A TAACTATTTC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 0 1 232396 CASAVA_Build 15 54368133 1D AATTTGTTTC T/- TTTCTCTTGC 3070 hom 96 het 35 0 32 5 T 4 3 232397 CASAVA_Build 15 54368321 1D CTCTCTACAC T/- TTTGTCTCTC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 4 3 232398 CASAVA_Build 15 54398858 5D CAACTGTGTC AACAA/----- AACAAGACAT 3070 hom 99 het 40 0 34 7 AACAA 2 1 232399 CASAVA_Build 15 54399979 2D ATAGAGGGAA AG/-- AGAGAGATAG 3070 hom 122 het 51 0 44 8 AG 4 3 232400 CASAVA_Build 15 54402338 2I ACAGTAAAAA --/AG AATATCACAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AG 0 1 232401 CASAVA_Build 15 54403090 1I CTGATGCAGC -/A AAAAAAACGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 7 8 232402 CASAVA_Build 15 54403197 33D AAGAAGGAGG AGGAGGAGAAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGA/--------------------------------- AGGAGGAGAA 3070 hom 35 het 29 0 22 13 AGGAGGAGAAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGA 1 0 232403 CASAVA_Build 15 54403672 1I CTGTAATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 35 1 25 9 A 11 12 232404 CASAVA_Build 15 54405771 1D ATGCATTCCA T/- TTTTTCTTGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 6 5 232405 CASAVA_Build 15 54412968 2I CCTTCATGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 34 0 25 9 A 12 14 232406 CASAVA_Build 15 54418061 3I ATTTGAAATG ---/GTT GTTATTATTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GTT 1 2 232407 CASAVA_Build 15 54428422 1I CCATTTTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 59 hom 27 1 24 2 T 8 9 232408 CASAVA_Build 15 54469186 1D TACAACTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 22 0 21 3 T 10 9 232409 CASAVA_Build 15 54472138 2D TAATAATTAT TG/-- TGTTACTAAT 3070 hom 78 het 30 0 26 6 TG 2 1 232410 CASAVA_Build 15 54477824 4D TAATTTTACC TGTT/---- TGTTTTACCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TGTT 2 1 232411 CASAVA_Build 15 54488133 1I71M4I GCAAACCTGC -TCTCTTCCTTCTCCCTGTCTTAGTAAAAGGCATCACCCAATTGTTCAGTCTAAAATTGAAGAGTCATCTTG----/TTCTCTTCCTTCTCCCTGTCTTAGTAAAAGGCATCACCCAATTGTTCAGTCTAAAATTGAAGAGTCATCTTGATCT ATCTGTTTTC 3070 hom 102 het 35 0 34 28 N/A 0 0 232412 CASAVA_Build 15 54506129 4D ACACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 893 hom 20 het 10 0 8 2 AC 8 6 232413 CASAVA_Build 15 54506783 2I CGTTTTTAAA --/AT ATGTTTTCAA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 AT 1 2 232414 CASAVA_Build 15 54512907 5I TCCTGGAACT -----/TAAAA TAAAAATATT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TAAAA 1 2 232415 CASAVA_Build 15 54518937 1D TAGAATAGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 A 10 9 232416 CASAVA_Build 15 54531220 1I AATTCATGAT -/G GGGATGCATC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 3 4 232417 CASAVA_Build 15 54533590 2I AGGCATACTC --/TA TGTGAAAGAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TA 0 1 232418 CASAVA_Build 15 54533863 5I ATTATACTCT -----/TTTAG TTATTTTTAA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TTTAG 0 1 232419 CASAVA_Build 15 54538051 11I TGTATCTACC -----------/ATAATAGTGTT GTACACAATC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 ATAATAGTGTT 0 1 232420 CASAVA_Build 15 54550181 3D AATAAAAGAT ATC/--- ATGTTAACAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 ATC 1 0 232421 CASAVA_Build 15 54555327 1D TTTAATATAC T/- TTTAAGTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 4 3 232422 CASAVA_Build 15 54567546 4D CATAGTGGTG CTCT/---- GTAGAGGTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 4 CT 2 0 232423 CASAVA_Build 15 54576091 1D ATTTTATATA T/- ATAGCATATT 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 T 1 0 232424 CASAVA_Build 15 54580935 1I ATGCTGGAAT -/A AAAAAATCTG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 6 7 232425 CASAVA_Build 15 54598138 5I TATACAAAAA -----/TTAAC TTAAGATGAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTAAC 0 1 232426 CASAVA_Build 15 54600086 1D AACAAACAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 9 8 232427 CASAVA_Build 15 54600158 1D AAAGGACAAA G/- AAAGGCATTA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 G 1 0 232428 CASAVA_Build 15 54612663 1D GAGCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 T 12 11 232429 CASAVA_Build 15 54618774 2D CCAACAGGGT GC/-- ACTGTAGTGT 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 GC 1 0 232430 CASAVA_Build 15 54623242 1D TCTAGGTAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 T 9 8 232431 CASAVA_Build 15 54625560 3I ATTATTCCAG ---/CTC CTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 20 12 12 CTC 0 1 232432 CASAVA_Build 15 54627513 1I AGGGACAAAT -/A GGGGTATTAT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 A 0 1 232433 CASAVA_Build 15 54629104 4D TATTTCTTTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 75 het 32 0 26 8 AT 11 9 232434 CASAVA_Build 15 54631953 12I AAATTTTATG ------------/TTATATGTATTT TAACACAATT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TTATATGTATTT 0 1 232435 CASAVA_Build 15 54645535 1D GCAGAATTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 10 9 232436 CASAVA_Build 15 54660990 2I TGAGTACTCT --/TA TCTTTATGGA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TA 0 1 232437 CASAVA_Build 15 54663207 1I CCTCAAAAAC -/A AAAAACAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 5 6 232438 CASAVA_Build 15 54663574 1D AATAAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 32 0 15 17 T 17 16 232439 CASAVA_Build 15 54669176 1I GTAGATAAAT -/A AAAAAATGGT 3070 hom 86 het 31 0 29 2 A 6 7 232440 CASAVA_Build 15 54677454 3I TAAAATACTC ---/AAT AATATAAATA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 AAT 1 2 232441 CASAVA_Build 15 54677899 3I TAATCAAGTT ---/ATC ATATTTTTAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ATC 0 1 232442 CASAVA_Build 15 54680917 1I AGAACTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 10 11 232443 CASAVA_Build 15 54698255 1D CATCCTTAAC T/- TTTTTCCTCA 3070 het 3070 hom 37 15 19 5 T 6 5 232444 CASAVA_Build 15 54703983 1I ACGACAAACG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 8 232445 CASAVA_Build 15 54704275 2D TTACCTACAA AT/-- ACTTAAGTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 1 0 232446 CASAVA_Build 15 54704772 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAAATAG 2357 het 2357 ref 18 10 5 3 A 7 8 232447 CASAVA_Build 15 54708964 1D AATTCAGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 43 0 35 11 T 10 9 232448 CASAVA_Build 15 54713356 1I AATATAAATC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 7 8 232449 CASAVA_Build 15 54713782 1I GAAAAAATTA -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 6 7 232450 CASAVA_Build 15 54716841 1D GTTAAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 35 2 20 13 T 12 11 232451 CASAVA_Build 15 54731554 1I ACAACTAGTA -/T TATCACTAAG 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 1 2 232452 CASAVA_Build 15 54734940 1D TTGTGATCAG C/- CCCACCTCGG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 4 3 232453 CASAVA_Build 15 54742749 1I ACTCCAGCCT -/G GGGTTGGAGT 1959 het 1959 ref 28 8 9 11 G 3 4 232454 CASAVA_Build 15 54751368 1I AATAGTTCTC -/A ACTGCAGAGA 2925 het 2925 ref 22 14 6 2 A 1 2 232455 CASAVA_Build 15 54757498 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1315 het 1315 ref 31 12 4 15 T 17 16 232456 CASAVA_Build 15 54766326 1D GAGAAAAAAT A/- ATCTTAAAGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 A 2 1 232457 CASAVA_Build 15 54778550 1I TTAAGCTGTG -/T TAAGTTTGTG 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 1 2 232458 CASAVA_Build 15 54785255 2D CTCAAACTGC TA/-- TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 56 27 23 6 TA 1 0 232459 CASAVA_Build 15 54797607 1D TTATTTCAGT A/- AAAAAAAAAA 1320 het 1320 ref 41 33 3 5 A 11 10 232460 CASAVA_Build 15 54803346 1I GAAAATATCG -/T TAAGTTGAAA 3070 het 3070 ref 57 34 21 2 T 1 2 232461 CASAVA_Build 15 54805703 1I ACAACAGGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2819 hom 28 9 15 4 A 11 12 232462 CASAVA_Build 15 54806722 10I CACTTTGGGA ----------/GGCCGAGGTG GGTGGGTCAC 3070 hom 30 het 10 0 10 1 GGCCGAGGTG 0 1 232463 CASAVA_Build 15 54816542 1D ATTCTCCCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 T 10 9 232464 CASAVA_Build 15 54827298 1D ATTTTTTCTC A/- TGAGATCTTT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 1 0 232465 CASAVA_Build 15 54835147 1I AAGAATAGTC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 T 5 6 232466 CASAVA_Build 15 54850384 7D TATTCATTTT GTTTACC/------- GTTTACCAAA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 GTTTACC 2 1 232467 CASAVA_Build 15 54862638 20I GATCAAAAGG --------------------/GTTTATGATAAGTACTAGCA GTTTATACAA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 GTTTATGATAAGTACTAGCA 0 1 232468 CASAVA_Build 15 54866719 3D GTGCTATCAC TTA/--- TTATGCTCTT 3070 hom 108 het 40 0 36 5 TTA 2 1 232469 CASAVA_Build 15 54870651 1I TCTACTTAGG -/A AATAGATTTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 2 3 232470 CASAVA_Build 15 54886682 15D AGTTTTGGAA AATGAAAAAAGTTTT/--------------- AAGGATGAAA 3070 het 2327 hom 33 8 11 16 AATGAAAAAAGTTTT 1 0 232471 CASAVA_Build 15 54909216 1I TAAGACAACT -/C GGCTATGTAC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 C 0 1 232472 CASAVA_Build 15 54912911 1I18M3D ACTCCATCTC -AAAAAAAACAGAAAGAAAAAG/AAAAAAAAACAGAAAGAAA--- AAGAACAAGG 3070 het 3070 hom 29 15 21 8 N/A 0 0 232473 CASAVA_Build 15 54921322 4D TAATAAAGAT AAAC/---- AAACAGAATG 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 AAAC 2 1 232474 CASAVA_Build 15 54925295 3D GAAGTTGATT GTA/--- ACCTCTGTGG 1936 het 1787 hom 9 4 4 2 GTA 1 0 232475 CASAVA_Build 15 54929682 1I GGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 1615 het 1615 ref 12 5 5 2 A 14 15 232476 CASAVA_Build 15 54975074 5I AATGTACACT -----/TGAAA TGAGTGAATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TGAAA 0 1 232477 CASAVA_Build 15 55005314 1D ATCTAAATTG T/- TTGTGTTTAG 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 3 2 232478 CASAVA_Build 15 55010194 1D TATCAGCTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 T 10 9 232479 CASAVA_Build 15 55022142 2I TATGTGTAAC --/AT AGAACTATTT 3070 hom 114 het 41 0 37 4 AT 0 1 232480 CASAVA_Build 15 55031680 2D TTGTGTATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 876 hom 36 10 18 9 AC 9 8 232481 CASAVA_Build 15 55078905 2I GCAACCAAAC --/AG GGGATATCAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AG 0 1 232482 CASAVA_Build 15 55079646 1D TTTTGTAATC T/- ACTTCATCTC 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 T 1 0 232483 CASAVA_Build 15 55086253 1I CCAAAAATAC -/A AAAAATGAGC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 5 6 232484 CASAVA_Build 15 55087140 1D TTTCCAGTGA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 33 9 22 3 T 7 6 232485 CASAVA_Build 15 55095200 1I ACAAGGACTT -/A AGAGACTCAG 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 1 2 232486 CASAVA_Build 15 55127490 1D ACATAGAAAA G/- GTACAATAAA 3070 hom 125 het 47 0 42 6 G 2 1 232487 CASAVA_Build 15 55150743 1D CAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 1789 het 93 hom 26 2 7 17 A 13 12 232488 CASAVA_Build 15 55154522 3I ATGCTTTAAC ---/CTT CTTCTTATAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTT 2 3 232489 CASAVA_Build 15 55161903 4I TGTATGCAAC ----/TTTA TTTATAGAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTTA 1 2 232490 CASAVA_Build 15 55185821 1D TACGTAAGAT G/- GTAGGGGAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 G 2 1 232491 CASAVA_Build 15 55189810 1I TAGTTGGGGG -/A AAAAATGATG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 5 6 232492 CASAVA_Build 15 55201563 3D ACTTTTCCTG CTT/--- CTTATCTCCT 3070 het 3070 ref 34 12 12 11 CTT 2 1 232493 CASAVA_Build 15 55201674 1I TCTTGCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 27 8 T 11 12 232494 CASAVA_Build 15 55203003 1D ACCACTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2935 hom 30 10 16 4 T 11 10 232495 CASAVA_Build 15 55204379 9I CACCGTGTCA ---------/GCCAGGATG GTCTTGATCT 2426 hom 15 het 7 0 6 1 GCCAGGATG 0 1 232496 CASAVA_Build 15 55206475 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2928 het 410 hom 14 3 8 3 T 13 12 232497 CASAVA_Build 15 55217534 1I AAAAAAAAAA -/T AAATAAAGTA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 0 1 232498 CASAVA_Build 15 55218039 1D TATCTAACCG A/- AAGGAAAAGT 3070 hom 94 het 38 0 32 7 A 3 2 232499 CASAVA_Build 15 55219098 14D CCTAGCCATC ACCTTTATTTGCAA/-------------- ACACTAAAAA 3070 het 3070 ref 32 20 13 4 ACCTTTATTTGCAA 1 0 232500 CASAVA_Build 15 55221956 32I AAGGATGTGC --------------------------------/TCAAAGAATGATGATGAATTGTTAGAAGGTTA CAAAAGCCAG 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 TCAAAGAATGATGATGAATTGTTAGAAGGTTA 0 1 232501 CASAVA_Build 15 55230864 1D ACTTCAGAAG A/- AAAAAAATCA 2849 het 2849 ref 24 14 7 3 A 8 7 232502 CASAVA_Build 15 55231260 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 582 hom 25 2 19 4 A 13 12 232503 CASAVA_Build 15 55232033 1D TGGTAGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 36 8 A 11 10 232504 CASAVA_Build 15 55239206 7I ACCAGTCTAA -------/TACGAAC TACTTAAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TACGAAC 0 1 232505 CASAVA_Build 15 55240343 1I CCCAGCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 9 10 7 T 11 12 232506 CASAVA_Build 15 55245030 1D ACTGTATTAA T/- TTTTTTTTTT 1473 het 1473 ref 27 19 4 4 T 15 14 232507 CASAVA_Build 15 55249180 1I CTAAACTTGA -/G GGGGGGAGAA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 G 6 7 232508 CASAVA_Build 15 55258527 1D GGAAGTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2863 hom 27 9 10 9 A 11 10 232509 CASAVA_Build 15 55260145 5I TTCTGTAGAA -----/TTCTT TAATAACACA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 TTCTT 0 1 232510 CASAVA_Build 15 55260935 2D GATTCTGAAT CG/-- CCTCCTAGCT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 CG 1 0 232511 CASAVA_Build 15 55261042 1D AGTTCCCATT A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 7 6 232512 CASAVA_Build 15 55263172 1D ATGGGGAAAG A/- AAAAAATGAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 7 6 232513 CASAVA_Build 15 55269321 1D GGAAACAACT A/- AAATGTCCAT 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 A 4 3 232514 CASAVA_Build 15 55273751 1D TCTCTTCCAT G/- CCAGGGGCAT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 G 1 0 232515 CASAVA_Build 15 55273869 1D TGGCCAAGGC T/- TGAGTTGGGA 3070 hom 119 het 42 0 39 3 T 2 1 232516 CASAVA_Build 15 55275656 1D CCACAGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2985 hom 27 8 13 7 A 13 12 232517 CASAVA_Build 15 55278252 1I TTGGCAGTAC -/T TTAACCCATG 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 2 3 232518 CASAVA_Build 15 55284251 1D AAACTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 11 12 11 T 11 10 232519 CASAVA_Build 15 55291457 27D CACACACACG CACACACACACACCACACACACACACA/--------------------------- CACACACACA 3070 het 2320 hom 27 12 15 10 CACACACACACACCACACACACACACA 1 0 232520 CASAVA_Build 15 55305348 1D TATTTATTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1961 hom 19 6 8 5 T 10 9 232521 CASAVA_Build 15 55306415 1D GATAGCTACT G/- TATTGTACAG 3070 het 3070 hom 40 14 21 7 G 1 0 232522 CASAVA_Build 15 55308996 1D CAGTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 13 13 A 12 11 232523 CASAVA_Build 15 55310445 1I TAACCAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3024 het 3024 ref 37 19 8 10 A 12 13 232524 CASAVA_Build 15 55310856 1D TATTTAGGCA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 T 8 7 232525 CASAVA_Build 15 55321412 2D AACCTTGTAG GT/-- GGAGGTTGCA 3070 het 489 hom 14 2 10 2 GT 1 0 232526 CASAVA_Build 15 55321551 1D CTGTCCCAAT A/- ATCTGGCTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 2 1 232527 CASAVA_Build 15 55325512 1I TGTCAAAGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 9 10 232528 CASAVA_Build 15 55326033 1I ATGCAGACAT -/A ATCTCCAGTA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 1 2 232529 CASAVA_Build 15 55326656 3D CCACCACCAC CAT/--- ATCCTTGGTC 2468 het 2468 ref 36 16 10 12 CAT 1 0 232530 CASAVA_Build 15 55328905 1D GCTCATAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 28 3 12 13 A 13 12 232531 CASAVA_Build 15 55341256 22I CAGATTGATT ----------------------/ATATAGGATTATTAATAGACCC TATAATACGT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 ATATAGGATTATTAATAGACCC 0 1 232532 CASAVA_Build 15 55348324 1D TGTTTACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 33 1 25 7 T 12 11 232533 CASAVA_Build 15 55353719 1D AGCCTCAGCA T/- TAGATTACAG 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 2 1 232534 CASAVA_Build 15 55358027 1D CAATCACTGT A/- AAAAAAAAAA 2524 hom 33 het 18 0 12 6 A 11 10 232535 CASAVA_Build 15 55358433 1D CCTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 16 2 11 3 T 12 11 232536 CASAVA_Build 15 55358712 1D TAAAATTCTT A/- ACCTCAGCAG 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 A 2 1 232537 CASAVA_Build 15 55359724 4D CGAACTCTTA TTTG/---- TTAGAGGTGC 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 TTTG 1 0 232538 CASAVA_Build 15 55361400 1D TTCCCCCCAG C/- CCCCCGCACC 1767 het 1767 ref 13 6 6 1 C 6 5 232539 CASAVA_Build 15 55368490 1D TTTTAACCAC A/- AAAAAAAGCG 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 A 8 7 232540 CASAVA_Build 15 55375209 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 941 hom 35 3 28 4 A 10 11 232541 CASAVA_Build 15 55380736 1D AAAATAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 24 2 9 13 A 11 10 232542 CASAVA_Build 15 55390891 1D TCACCCCCCC T/- GAGTAGCTGG 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 T 1 0 232543 CASAVA_Build 15 55395578 2I TTGAGTTGTA --/AG AGTTCTCTGT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AG 1 2 232544 CASAVA_Build 15 55399765 2I TGCACACACG --/AC ACACATGCAC 3070 hom 51 het 32 0 17 15 AC 2 3 232545 CASAVA_Build 15 55399804 2I CACTTGCACG --/CA CACACGTACA 3070 hom 48 het 32 0 16 16 CA 2 3 232546 CASAVA_Build 15 55419569 1I GTTTTTTTTT -/G TTTTGTTTTA 3070 hom 51 het 32 0 23 9 G 0 1 232547 CASAVA_Build 15 55430740 1I CTGTCTCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 32 0 30 3 A 10 11 232548 CASAVA_Build 15 55434369 12I GCAAACCAGT ------------/GCCTGCCACATA GGGGCAGGCT 3070 hom 69 het 30 0 21 9 GCCTGCCACATA 0 1 232549 CASAVA_Build 15 55434619 4I ACCCCCACTG ----/CAAT CAATCCTTCA 3070 hom 118 het 43 0 35 8 CAAT 1 2 232550 CASAVA_Build 15 55454242 4I AGTTGGAAAA ----/TTCT TTCTTTCCTG 1781 het 1781 ref 28 17 5 6 TTCT 1 2 232551 CASAVA_Build 15 55464164 4D TAAACTTTAT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 TTTC 2 1 232552 CASAVA_Build 15 55469389 1D ACTGCAACCT C/- CCACCTCCTG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 C 3 2 232553 CASAVA_Build 15 55495692 1I TCAGTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 46 2 35 9 G 0 1 232554 CASAVA_Build 15 55497098 1I GAAATAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 30 3 18 9 T 14 15 232555 CASAVA_Build 15 55502938 1D CCTTTTTTTT A/- ACGTTAATTT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 2 1 232556 CASAVA_Build 15 55507257 1D GAATTCCACA C/- CCCCCCATGC 3070 hom 84 het 31 0 26 5 C 7 6 232557 CASAVA_Build 15 55511224 1I TTTTTTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 26 1 24 1 T 10 11 232558 CASAVA_Build 15 55519600 1I ATAAAATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 44 1 25 18 A 15 16 232559 CASAVA_Build 15 55530510 1I ATTAAAATAG -/A AAAAAATGAC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 6 7 232560 CASAVA_Build 15 55543564 1D ACTTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 36 3 23 10 T 11 10 232561 CASAVA_Build 15 55549201 1I AAACTTTTCT -/C CCCCCTTCAC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 5 6 232562 CASAVA_Build 15 55566857 1I ATACAGAGTC -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 7 8 232563 CASAVA_Build 15 55572190 1I GTCCATAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 94 hom 32 1 24 7 A 10 11 232564 CASAVA_Build 15 55580147 1I AGACTTTGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 8 9 232565 CASAVA_Build 15 55593642 4D TTCCCCATTG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 TTTA 3 2 232566 CASAVA_Build 15 55597417 2D TTTATAAAAC TG/-- TGTGTGTGGG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 TG 5 4 232567 CASAVA_Build 15 55606747 1D GCCCAGTGCT C/- CTGTCAGCCT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 C 2 1 232568 CASAVA_Build 15 55647854 1D CCTCACCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3008 hom 31 10 15 6 A 13 12 232569 CASAVA_Build 15 55648620 1I AACGTATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 T 9 10 232570 CASAVA_Build 15 55660867 1D CTACAGATTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2035 hom 30 6 19 5 A 9 8 232571 CASAVA_Build 15 55662061 1D GAAGAGGAAA G/- TCTGAGATGA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 G 1 0 232572 CASAVA_Build 15 55666474 1I AGATTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 9 9 9 T 10 11 232573 CASAVA_Build 15 55667522 9D GCCCAAGCAG CTTCCCTCC/--------- TGCCTACCAT 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 CTTCCCTCC 1 0 232574 CASAVA_Build 15 55670358 9I TGGGCTTTGA ---------/AGGACCAGT AGACAGAGAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 AGGACCAGT 0 1 232575 CASAVA_Build 15 55682802 1I CAGGGACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 20 20 11 T 10 11 232576 CASAVA_Build 15 55686214 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 2374 het 2374 ref 14 6 5 3 ATA 4 5 232577 CASAVA_Build 15 55695447 5I TGAAACGAAG -----/CAAAA CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 11 14 CAAAA 3 4 232578 CASAVA_Build 15 55703223 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1178 hom 18 3 12 3 A 12 13 232579 CASAVA_Build 15 55710671 1I ATTTAAGTAA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 7 8 232580 CASAVA_Build 15 55718705 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 2866 het 2061 hom 21 5 10 6 T 12 13 232581 CASAVA_Build 15 55727607 1I GGTATTATTC -/A CTTATTTATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 1 232582 CASAVA_Build 15 55728275 1D CTTGTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1633 het 1633 ref 33 18 6 10 T 17 16 232583 CASAVA_Build 15 55752013 1I TACTCCTCTC -/T ACTGCAAGTG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 0 1 232584 CASAVA_Build 15 55754578 1D AATTTCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 11 10 232585 CASAVA_Build 15 55763622 1D CCATTCATGA G/- GGCTCCACCC 3070 hom 51 het 24 0 18 7 G 3 2 232586 CASAVA_Build 15 55768977 5I AATATATACA -----/TATAT TATATATACG 2897 hom 18 het 8 0 7 1 TATAT 1 2 232587 CASAVA_Build 15 55775846 8D CTCTGGGATG GGCCGTCT/-------- GTTCATCCTG 3070 het 3070 hom 36 16 16 9 GGCCGTCT 1 0 232588 CASAVA_Build 15 55792922 1D CTTTAAATTG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 T 9 8 232589 CASAVA_Build 15 55796687 1D GCCTTCTGGG T/- TTTTTCTACA 2642 het 2642 ref 51 43 6 2 T 6 5 232590 CASAVA_Build 15 55797521 3D GCAACCTCCG CCT/--- CCTCTGTTCA 2302 het 2302 ref 27 16 7 4 CCT 2 1 232591 CASAVA_Build 15 55797660 1I GTCTTGATCT -/C CTGACCTCAT 3070 het 2614 hom 16 6 10 0 C 1 2 232592 CASAVA_Build 15 55797839 1D CATTCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 883 het 883 ref 23 15 3 6 T 15 14 232593 CASAVA_Build 15 55808993 3D GGCTTCACAT GCA/--- GCAGCAGACC 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 GCA 3 2 232594 CASAVA_Build 15 55818488 1D AGCACTGATA T/- TTTTTTACAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 6 232595 CASAVA_Build 15 55822723 21I TGCTTTCCAT ---------------------/GGGCCCAAGACTCCTGACCCC GGGAGAGAAT 3070 hom 82 het 27 0 24 6 GGGCCCAAGACTCCTGACCCC 0 1 232596 CASAVA_Build 15 55826445 5D AATGTTTAAG TGGCC/----- TGGCCTGGAG 3070 hom 90 het 36 0 28 8 TGGCC 2 1 232597 CASAVA_Build 15 55846931 1I TGGGCACAAA -/C CTGTACAATC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 1 2 232598 CASAVA_Build 15 55848773 1D CTGGGCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 11 10 232599 CASAVA_Build 15 55864568 1D CCGCTGTGGT A/- AAAAATCACA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 6 5 232600 CASAVA_Build 15 55880545 1I TTTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 11 14 11 T 13 14 232601 CASAVA_Build 15 55881740 1D TTAAACCTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 A 8 7 232602 CASAVA_Build 15 55882880 1D AAAAGGGGGT A/- CTACTATTAA 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 A 1 0 232603 CASAVA_Build 15 55884816 1I CCTCAGCCTT -/C CGAGTAGCTG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 1 2 232604 CASAVA_Build 15 55903389 12D TGGGGCGGTA TGAGGGGTGGGT/------------ ATGGCCTCCA 3070 het 1702 hom 24 6 16 6 TGAGGGGTGGGT 1 0 232605 CASAVA_Build 15 55916592 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2342 hom 25 7 11 7 A 11 10 232606 CASAVA_Build 15 55943993 1D ACACATAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 45 1 27 17 T 13 12 232607 CASAVA_Build 15 55964811 2D AGGCCTGAAA AG/-- AGAGAGAAAC 3070 het 3070 hom 44 16 23 6 AG 4 3 232608 CASAVA_Build 15 55968983 1I AGTTAAAATT -/G TAAGCTGGAT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 G 0 1 232609 CASAVA_Build 15 55969318 1D GTGACAGCCG T/- AATATATATC 3070 het 3070 hom 38 12 23 4 T 1 0 232610 CASAVA_Build 15 55970484 6D AGCTTCTTAA TTTGTC/------ TTTGTCTTGC 3070 het 3070 hom 48 23 22 6 TTTGTC 2 1 232611 CASAVA_Build 15 55973200 3D AATCCAGAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2601 hom 43 13 20 10 T 18 15 232612 CASAVA_Build 15 55975156 1D AAGGACTGGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 37 10 16 11 A 9 8 232613 CASAVA_Build 15 55994905 1D TTCTCTCTCT C/- CCCCCCCCCC 1384 het 131 hom 12 1 3 8 C 12 11 232614 CASAVA_Build 15 56029143 1D CTAGAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 25 1 20 5 A 19 18 232615 CASAVA_Build 15 56035243 1I TGCTTTCCTC -/T CCCCAAGACG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 0 1 232616 CASAVA_Build 15 56048492 3D ACTCGGTAAA CAC/--- CACAAGGCAA 3070 hom 117 het 43 0 40 5 CAC 2 1 232617 CASAVA_Build 15 56051639 5D ATTGGAAAAA AAGAC/----- AAGACAAGAC 3070 hom 87 het 31 0 29 7 AAGAC 3 2 232618 CASAVA_Build 15 56053923 7D ACTCCATCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 10 3 A 21 14 232619 CASAVA_Build 15 56054709 4D AGAGAAAAGG ACAT/---- ACATGTCCAT 3070 hom 87 het 34 0 27 8 ACAT 2 1 232620 CASAVA_Build 15 56056587 1D CTTTTCGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 15 1 11 3 T 13 12 232621 CASAVA_Build 15 56068372 4I CCTGATATTG ----/TGAC TTATGTGCCG 3070 hom 96 het 35 0 32 4 TGAC 0 1 232622 CASAVA_Build 15 56068501 1D TACTTAAGAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 8 7 232623 CASAVA_Build 15 56069160 23D ATATGGAAAT GCATCATGTAATGTTATATTCAG/----------------------- GCATCATGTA 3070 hom 51 het 27 0 18 13 GCATCATGTAATGTTATATTCAG 2 1 232624 CASAVA_Build 15 56084888 1I GCCTTTGTAA -/C CCCAATGCCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 3 4 232625 CASAVA_Build 15 56085514 1D AAAGCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 240 hom 36 1 24 11 T 13 12 232626 CASAVA_Build 15 56086196 2I AATTATGGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 32 0 17 15 T 13 15 232627 CASAVA_Build 15 56103659 5D CACAAAGGAG GAAGA/----- GAAAAGACTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 GAAGA 1 0 232628 CASAVA_Build 15 56112794 4D GGACTTGATG CTTT/---- CTATTTGACA 3070 hom 157 het 58 0 53 7 CTTT 1 0 232629 CASAVA_Build 15 56114947 2D TGTGCTATAA TT/-- TTTGTTATTT 3070 hom 87 het 32 0 29 4 T 5 3 232630 CASAVA_Build 15 56129687 1D TGCTAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 11 10 232631 CASAVA_Build 15 56130850 4D ATTTTCTCTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TTTA 3 2 232632 CASAVA_Build 15 56135393 4I AAAAAAAAGG ----/TCTT TCTTTTAGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TCTT 1 2 232633 CASAVA_Build 15 56142183 1D AACACCATCT A/- GTTTTAAAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 1 0 232634 CASAVA_Build 15 56143467 1D AGCTTCCAAA T/- TAAATTCTGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 1 232635 CASAVA_Build 15 56162383 1D TTTGATCATC A/- ATGGTCAGTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 1 232636 CASAVA_Build 15 56187518 1D ATGTGTTAGA T/- TTTTGTGTGA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 5 4 232637 CASAVA_Build 15 56228740 2D CCTATTAGCA AT/-- ATAGGTCTTG 3070 hom 126 het 50 0 43 8 AT 2 1 232638 CASAVA_Build 15 56234087 4I CCCATCATAC ----/TCAG TCATTCACCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TCAG 0 1 232639 CASAVA_Build 15 56239748 1D TGCTTGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 32 3 17 12 T 11 10 232640 CASAVA_Build 15 56240129 2I AATTAACCTG --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 8 10 232641 CASAVA_Build 15 56242930 1I TGATACATTA -/G AACATCCACA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 G 0 1 232642 CASAVA_Build 15 56255228 5D GGACTTATAC AGTGG/----- AGCAGATCAG 3070 hom 135 het 48 0 46 6 AGTGG 1 0 232643 CASAVA_Build 15 56263385 1I CAAGTGAGTG -/A AAAAACTAGA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 5 6 232644 CASAVA_Build 15 56267596 5I AAGTATCAAT -----/TAAAA TAAATCGTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TAAAA 0 1 232645 CASAVA_Build 15 56267766 1I CTCTAGCGCG -/C CCCCCCTGTG 3070 hom 53 het 24 0 19 5 C 6 7 232646 CASAVA_Build 15 56283861 1D TTTCTCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 14 13 232647 CASAVA_Build 15 56287237 4I ATTACTGACA ----/ATTT ATTTATGCAC 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 ATTT 1 2 232648 CASAVA_Build 15 56290964 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 638 hom 23 3 9 11 AT 8 7 232649 CASAVA_Build 15 56321973 1I ATGAAATGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 2899 hom 27 8 12 7 A 8 9 232650 CASAVA_Build 15 56322338 1I TAAATCGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 41 0 29 12 T 12 13 232651 CASAVA_Build 15 56329687 37D ACACAGGTTA AAACACTGTGTGAGCTGGGAAGCGTTATATGTTTAAG/------------------------------------- AAACAGGCTC 1458 het 1458 ref 28 28 4 4 AAACACTGTGTGAGCTGGGAAGCGTTATATGTTTAAG 1 0 232652 CASAVA_Build 15 56334125 3I TGTCTTAAAT ---/CTC CTTCTCCTTT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 CTC 0 1 232653 CASAVA_Build 15 56336014 1I ACAAAGTGAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 A 7 8 232654 CASAVA_Build 15 56349857 21I TTACACCTTG ---------------------/GTGTGGCTGTACCCAGAAGGT TGTTTCCTGT 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 GTGTGGCTGTACCCAGAAGGT 0 1 232655 CASAVA_Build 15 56358172 1D GCCAGAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 8 A 11 10 232656 CASAVA_Build 15 56369772 2D ATGGGGTGAC TT/-- ATCACACACT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 2 0 232657 CASAVA_Build 15 56376990 1I AAGCTCTGGA -/C TTCAACTCTG 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 0 1 232658 CASAVA_Build 15 56379718 2I ACTATAGGGA --/TT TTACAATTTG 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 2 4 232659 CASAVA_Build 15 56387094 1I AGATTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2589 hom 35 11 12 12 A 13 14 232660 CASAVA_Build 15 56387107 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 1189 het 1189 ref 38 19 5 14 G 1 0 232661 CASAVA_Build 15 56388390 1I TGTACATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 T 10 11 232662 CASAVA_Build 15 56402901 1D TCTCCACAGC T/- TTTGCTAACA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 4 3 232663 CASAVA_Build 15 56408257 1D AAAGTATATG A/- CAAAATGCTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 A 1 0 232664 CASAVA_Build 15 56410257 2D CTCCAAAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 20 2 9 9 T 13 11 232665 CASAVA_Build 15 56411409 3D TCAGCATCTC CCT/--- CCTAATTCCC 3070 het 3070 hom 33 16 14 7 CCT 2 1 232666 CASAVA_Build 15 56416343 1D CGTCTCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2063 hom 22 6 8 8 A 15 14 232667 CASAVA_Build 15 56420384 1I GTGTAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 10 11 232668 CASAVA_Build 15 56423413 1D TGCTGAGAAC A/- AAAAAACTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 6 232669 CASAVA_Build 15 56440143 1D TTGCCTTATA G/- GATGCATCTC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 2 1 232670 CASAVA_Build 15 56468826 1I TGCGTTTGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 47 het 20 0 15 5 T 9 10 232671 CASAVA_Build 15 56477662 1I CCAGGCAGGT -/A AAAAAATTCC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 6 7 232672 CASAVA_Build 15 56487135 1I AAGCAACTCT -/C CCCCCTCTGG 3070 het 3070 ref 47 18 18 11 C 5 6 232673 CASAVA_Build 15 56492951 1I CACATTCACA -/C CTAAACTCCG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 1 2 232674 CASAVA_Build 15 56501683 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 18 2 11 5 T 13 12 232675 CASAVA_Build 15 56504763 1I TTATCAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 40 1 27 12 T 11 12 232676 CASAVA_Build 15 56505822 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3049 hom 22 10 11 2 A 10 11 232677 CASAVA_Build 15 56507052 1D GGCTGGACTC T/- TTTTTTTTTT 1969 het 951 hom 23 7 12 4 T 13 12 232678 CASAVA_Build 15 56509366 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 26 0 16 10 A 12 11 232679 CASAVA_Build 15 56509883 1I TCTCACTGGG -/C CCACTGTAAT 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 C 2 3 232680 CASAVA_Build 15 56537664 1D ATTGCTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 A 12 11 232681 CASAVA_Build 15 56546439 2D AGTTTTCAAG AC/-- ACTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 AC 2 1 232682 CASAVA_Build 15 56561910 1D TGGAGTGGTG A/- AAAAGAGTTC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 5 4 232683 CASAVA_Build 15 56564195 19D ACTCCAGGGC CCACACTCCTACCGTCGGG/------------------- CCACACTGCC 3070 hom 107 het 48 0 35 20 CCACACTCCTACCGTCGGG 1 0 232684 CASAVA_Build 15 56585403 5D ACCATACAGC CAGTA/----- CCCGCGAGCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CAGTA 1 0 232685 CASAVA_Build 15 56588224 2D AGTTTTTTTT TG/-- GACACCTTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 TG 1 0 232686 CASAVA_Build 15 56617013 1I GAGCATGAAG -/C CCAGACTCTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 2 3 232687 CASAVA_Build 15 56627124 6D TTGGAGAGTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 45 0 41 7 A 16 10 232688 CASAVA_Build 15 56630523 8D AGACGGGGTT TCGCCACG/-------- TTGGCCAGGC 2711 hom 30 het 12 0 11 1 TCGCCACG 1 0 232689 CASAVA_Build 15 56637563 2D AGCTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 30 1 18 11 T 13 11 232690 CASAVA_Build 15 56637753 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCACC 2933 het 1810 hom 12 4 8 0 G 4 3 232691 CASAVA_Build 15 56638122 30I ATTGTGAACT ------------------------------/GCACATGCTAGAGATCTAGGTTGCATGCTC ATTATGAGAA 3070 hom 102 het 35 0 34 1 GCACATGCTAGAGATCTAGGTTGCATGCTC 0 1 232692 CASAVA_Build 15 56640142 20D CATTACAAAC ACAATATAAGTCCTGAATAG/-------------------- ACATTTAGGA 3070 hom 120 het 41 0 40 5 ACAATATAAGTCCTGAATAG 1 0 232693 CASAVA_Build 15 56640505 2D TAGGGTGATG AC/-- ACACTTATTT 3070 hom 75 het 29 0 26 5 AC 3 2 232694 CASAVA_Build 15 56640929 1I TGTCGGGATT -/A AGATAAGGGG 3070 hom 66 het 29 0 23 7 A 1 2 232695 CASAVA_Build 15 56643985 1I TTGGGAGGCC -/T TTGGCGGGCG 3070 hom 36 het 13 0 11 2 T 2 3 232696 CASAVA_Build 15 56647240 1I TTCTGGTAAC -/A AGGAAAAATT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 1 2 232697 CASAVA_Build 15 56665738 1D TAATTAGGTA T/- TGTACTTTAA 3070 het 3070 hom 50 23 23 5 T 2 1 232698 CASAVA_Build 15 56675591 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2392 het 2386 hom 23 11 9 3 A 11 10 232699 CASAVA_Build 15 56679242 1D TTTTCCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 26 1 20 5 A 12 11 232700 CASAVA_Build 15 56679614 2D CCCCTTACTC TT/-- TTTTCTCCCT 3070 het 3070 hom 38 10 25 3 T 6 4 232701 CASAVA_Build 15 56684948 1D TTTCCTTTTT A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 38 15 17 8 A 7 6 232702 CASAVA_Build 15 56693782 11D GTCTCAAAAT AAAAAGAAAGA/----------- AAAAAGAAAG 3070 hom 34 het 27 1 24 4 AAAAAGAAAGA 2 1 232703 CASAVA_Build 15 56697736 4I TTGATTTTCG ----/ACAA AGGTGATTTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 ACAA 0 1 232704 CASAVA_Build 15 56715283 1D TTTATCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 13 12 232705 CASAVA_Build 15 56718571 1I AAAATGGCAG -/A AAAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 3 4 232706 CASAVA_Build 15 56725348 1D CATTGTCTTA C/- CCCTCTCTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 C 4 3 232707 CASAVA_Build 15 56732307 1D CCTTTTGTAA T/- TATGGACATT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 2 1 232708 CASAVA_Build 15 56751562 4I AAAACAAAAT ----/CATG AAAAGATAGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CATG 0 1 232709 CASAVA_Build 15 56767152 1D CATACTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 10 9 232710 CASAVA_Build 15 56767938 1I ACAAACTATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 8 9 232711 CASAVA_Build 15 56775167 1I GAGCAAGACT -/C TGTCTAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 0 1 232712 CASAVA_Build 15 56775791 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 9 10 232713 CASAVA_Build 15 56779038 14D TCACTTGAGG CCAGGAGTTTGAGA/-------------- CCAGGAGTTT 3070 het 3070 ref 28 16 10 7 CCAGGAGTTTGAGA 2 1 232714 CASAVA_Build 15 56786581 1I TTGGGGGGGG -/A GAAAAAAGCT 2501 het 1930 hom 16 6 6 4 A 0 1 232715 CASAVA_Build 15 56786874 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2448 het 2448 ref 26 14 8 6 A 13 12 232716 CASAVA_Build 15 56797964 1D GTATTGGGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 10 9 232717 CASAVA_Build 15 56810953 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 15 11 11 A 8 9 232718 CASAVA_Build 15 56829946 4I TGTCCTCTTT ----/TCTC TCTCTCTGTC 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 TC 3 5 232719 CASAVA_Build 15 56845157 1I TCTCTATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 682 hom 32 2 24 6 A 11 12 232720 CASAVA_Build 15 56852627 1I GTTTCCTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1920 hom 26 8 11 7 A 9 10 232721 CASAVA_Build 15 56856351 1I CCATCTCTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2840 hom 21 7 12 2 A 9 10 232722 CASAVA_Build 15 56858302 2D TCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1328 het 539 hom 17 6 8 3 T 20 18 232723 CASAVA_Build 15 56870077 1D AATAGACCTT A/- GTGGGGGGTA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 1 0 232724 CASAVA_Build 15 56881597 1I TAAAAAGTTC -/A AAAGCACTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 3 4 232725 CASAVA_Build 15 56881787 1D TTTACAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 T 13 12 232726 CASAVA_Build 15 56882802 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 2703 hom 27 6 20 1 A 8 9 232727 CASAVA_Build 15 56888902 1I GATTTCTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 T 8 9 232728 CASAVA_Build 15 56894107 7I TGGGCTCAAA -------/TGATCCT CCCTCCTCAG 2955 het 2955 ref 29 16 7 6 TGATCCT 0 1 232729 CASAVA_Build 15 56898297 9D CGCCTGGCTA ATTTTTTGT/--------- ATTTTTTGTA 2497 het 2497 ref 15 7 6 5 ATTTTTTGT 2 1 232730 CASAVA_Build 15 56914134 1D CTACATCATC T/- TTTTTTAGCC 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 7 6 232731 CASAVA_Build 15 56923495 1I TGCATTAAAA -/C CCTATTCTAT 2852 het 34 hom 21 1 7 13 C 2 3 232732 CASAVA_Build 15 56927569 1D ACAGATGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 34 2 13 20 T 16 15 232733 CASAVA_Build 15 56947948 15D TTTTTTGTTT TTTTGTTTTGTTTTG/--------------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 35 14 11 13 TTTTG 6 3 232734 CASAVA_Build 15 56959675 1I CACTGTTCTT -/G GGTACTTTAT 3070 het 3070 ref 51 24 25 2 G 2 3 232735 CASAVA_Build 15 56963806 3D TTTAATACTT TTG/--- TTGTTGTTGT 1411 het 1411 ref 20 10 5 5 TTG 4 3 232736 CASAVA_Build 15 56978098 4I CCAGTTTACA ----/AAGT AAGTAAACAG 3070 hom 91 het 36 0 30 6 AAGT 1 2 232737 CASAVA_Build 15 56983207 1I ATTAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 1997 het 1997 ref 16 8 5 3 A 11 12 232738 CASAVA_Build 15 57010204 2D CTATTAAAAA AT/-- ATATATATAT 1973 het 233 hom 9 1 6 2 AT 7 6 232739 CASAVA_Build 15 57011540 2D CAAGGTAGAC AT/-- GTGTTAAACT 3070 het 3070 ref 43 21 19 5 AT 1 0 232740 CASAVA_Build 15 57023493 1I ATAAGATGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 47 11 25 11 T 9 10 232741 CASAVA_Build 15 57027744 16D3M12D3M1D TAATAAAAAA GGTCAAAATGGAAAGCATAGGCTTTGGGGCCATAT/----------------ATA------------ATA- AATCATGAAT 2545 het 2545 ref 16 19 6 2 N/A 0 0 232742 CASAVA_Build 15 57031539 1D TGTAAACAAT A/- TGAATTTGTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 6 A 1 0 232743 CASAVA_Build 15 57039595 1D GGGCGGGGTG C/- CAGTGGCTCA 2808 hom 24 het 11 0 8 3 C 2 1 232744 CASAVA_Build 15 57051076 3I TTTCTTTTCT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TTC 3 4 232745 CASAVA_Build 15 57055091 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 14 13 232746 CASAVA_Build 15 57056851 1D TGTGTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1743 hom 20 5 9 6 A 12 11 232747 CASAVA_Build 15 57056999 1I ATATAGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 8 8 T 10 11 232748 CASAVA_Build 15 57059389 1D ATGGTGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 T 12 11 232749 CASAVA_Build 15 57063452 3I CAATAAATAT ---/TTA TTGAGTGCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTA 0 1 232750 CASAVA_Build 15 57103954 7I AGATCTTTTC -------/AGTTAGT AGCAAGTACT 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 AGTTAGT 0 1 232751 CASAVA_Build 15 57159147 1D TAAGACAAAC T/- TTTTTTTTTT 2044 het 2044 ref 42 29 6 7 T 15 14 232752 CASAVA_Build 15 57212975 18D CTTCTTGTTA GAAAGGGTGCTCAGAGTG/------------------ GAAAGGTATG 3070 het 3070 ref 34 18 15 7 GAAAGGGTGCTCAGAGTG 1 0 232753 CASAVA_Build 15 57219397 1D TATCAATCAG T/- TATTACTCCT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 2 1 232754 CASAVA_Build 15 57239333 4I GAGAAATGGC ----/TAAT TAATTAATTA 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 TAAT 4 5 232755 CASAVA_Build 15 57246044 1I AGGAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 T 12 13 232756 CASAVA_Build 15 57251868 1D GGACAGACAT G/- GTCAATGTGA 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 G 2 1 232757 CASAVA_Build 15 57252935 4I TATTTAAAAG ----/ACAA ACAAACAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 ACAA 2 3 232758 CASAVA_Build 15 57256774 4I TGTGTGCCGC ----/TTAT TTATTTAATA 3070 het 3070 ref 39 16 18 5 TTAT 1 2 232759 CASAVA_Build 15 57262657 1D CTTAGACGGG A/- AAAAAGAGTG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 6 5 232760 CASAVA_Build 15 57285481 7D CTCATGCTCA GATACTC/------- TGTTTAACAA 3070 het 3070 ref 49 28 20 5 GATACTC 1 0 232761 CASAVA_Build 15 57289813 2D TCATATCCAC AT/-- GTTCATATTT 3070 het 3070 ref 62 36 20 6 AT 1 0 232762 CASAVA_Build 15 57290377 1I ATCCAGTTAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 2468 hom 20 7 13 0 A 7 8 232763 CASAVA_Build 15 57292446 3D CCTCTATCCT GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 GAG 5 4 232764 CASAVA_Build 15 57300359 1D GGCGGGAGGA T/- GACTTAAGGC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 1 0 232765 CASAVA_Build 15 57302807 1D AGTTACAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 39 3 21 15 A 16 15 232766 CASAVA_Build 15 57303776 2D GAAAAGAAAT AA/-- GAGAAAAGAC 3070 hom 116 het 44 0 37 7 A 2 0 232767 CASAVA_Build 15 57309187 4D GAAAAGATTT GTAA/---- GTGTTAAATA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 GTAA 1 0 232768 CASAVA_Build 15 57312597 4D CTTCATTAAC TCTT/---- TCTATCTTTT 3070 hom 123 het 42 0 42 2 TCTT 1 0 232769 CASAVA_Build 15 57316287 1D CAGAAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 11 10 232770 CASAVA_Build 15 57323310 1D ATAAGACAAA G/- TAATTCTGCG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 0 232771 CASAVA_Build 15 57334168 1D CAATAAAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 10 9 232772 CASAVA_Build 15 57346710 1D AGAGACGGGG T/- TTTCACCATG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 4 3 232773 CASAVA_Build 15 57353551 2I AATGGTTTAC --/TT TTTTTTTTCG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 8 10 232774 CASAVA_Build 15 57368265 1D AATGTGAGTC A/- ATTTGAATAT 3070 hom 81 het 36 0 26 11 A 2 1 232775 CASAVA_Build 15 57402497 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2682 het 342 hom 14 2 10 2 A 15 14 232776 CASAVA_Build 15 57404155 1D CCATCCCAAG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 50 het 35 1 26 8 C 10 9 232777 CASAVA_Build 15 57406817 1D TACATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2056 hom 24 8 12 4 T 13 12 232778 CASAVA_Build 15 57413969 1D TGTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 324 hom 40 2 28 10 A 15 14 232779 CASAVA_Build 15 57416518 2D TCCTAGTTTT AA/-- AAAAAAAAAT 2832 het 2832 ref 25 8 7 11 A 11 9 232780 CASAVA_Build 15 57417652 1D GTTCAAGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 11 10 232781 CASAVA_Build 15 57419870 1D CACATTAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 22 23 2 T 11 10 232782 CASAVA_Build 15 57431233 1I TCACAGGACG -/T TTGGAAATGG 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 T 2 3 232783 CASAVA_Build 15 57435215 1D TGCCTATTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 65 het 35 0 23 13 T 10 9 232784 CASAVA_Build 15 57437085 6D CTGGCTATTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 hom 58 het 25 0 19 7 TTG 8 6 232785 CASAVA_Build 15 57438772 2D TTTTACATAC AT/-- ATATATATAT 569 het 360 hom 6 2 4 0 AT 7 6 232786 CASAVA_Build 15 57445788 2D TTCTTTTTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TC 6 5 232787 CASAVA_Build 15 57453603 5D AAAAAAAAAA AGAAG/----- GAAAGAAAGA 3070 het 244 hom 21 1 19 3 AGAAG 1 0 232788 CASAVA_Build 15 57459298 1I TTCTCCTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 T 11 12 232789 CASAVA_Build 15 57459359 4I TTATTTATTC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 het 2033 hom 34 10 8 16 ATTT 3 4 232790 CASAVA_Build 15 57469779 1I TCAAACCTTG -/T TTACGACGTA 3070 het 2944 hom 27 10 11 6 T 2 3 232791 CASAVA_Build 15 57481262 1I CTTTTCAGCA -/T TTTTTTTTTT 1609 het 14 hom 16 0 7 9 T 15 16 232792 CASAVA_Build 15 57482539 9I ATATAGGTTC ---------/TAGTTCATT TAGTTCATTT 3070 het 3070 ref 39 19 9 11 TAGTTCATT 1 2 232793 CASAVA_Build 15 57483254 5D AGGTAATTGA TTTCT/----- TTTCAGTTAA 3070 het 3070 ref 41 20 20 2 TTTCT 1 0 232794 CASAVA_Build 15 57485141 1D CAAAAAAAAA G/- AATAATGATA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 G 1 0 232795 CASAVA_Build 15 57490037 1I GGACTACGAG -/A AAAAAAACCA 3070 hom 101 het 42 0 33 9 A 7 8 232796 CASAVA_Build 15 57498286 1I ATTATCTGAG -/C CCCCAGTTTC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 C 4 5 232797 CASAVA_Build 15 57499072 1I GAATTCTATT -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 A 6 7 232798 CASAVA_Build 15 57519169 1D AAGCTTCTGC A/- AGCTTGTTTA 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 A 2 1 232799 CASAVA_Build 15 57531297 1D GCTGTGTATA C/- CATCCTCCTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 C 2 1 232800 CASAVA_Build 15 57543247 1D GCCATCTTAA T/- TACTGTGTCT 3070 het 1961 hom 15 5 9 2 T 2 1 232801 CASAVA_Build 15 57558249 2D TTCTGTTGAC AG/-- AGGTTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 21 21 4 AG 2 1 232802 CASAVA_Build 15 57582862 1D AGTTTATTAT A/- TACAATGGTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 1 0 232803 CASAVA_Build 15 57599591 1I TTTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 24 1 19 4 T 11 12 232804 CASAVA_Build 15 57627714 2I CCCTGGTGGA --/GT GGCTGGGTGA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 GT 0 1 232805 CASAVA_Build 15 57637852 1D CTCAGTTTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 2 A 12 11 232806 CASAVA_Build 15 57653943 2D ATTTAAAAAG AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 10 8 232807 CASAVA_Build 15 57686103 1I TTACTATTTA -/G TAGTTTCCTC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 G 0 1 232808 CASAVA_Build 15 57687042 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1797 hom 35 13 14 8 A 15 16 232809 CASAVA_Build 15 57710406 6I GAAGTAGCAC ------/TTTTTT TTTTTTAATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 12 232810 CASAVA_Build 15 57717932 3D TATCTTGTAC ATG/--- ATAAAATGTA 3070 het 3070 hom 49 21 25 5 ATG 1 0 232811 CASAVA_Build 15 57720335 24D AATTTAAAAA AGACCCAAATATTGTTCCTTGCTG/------------------------ TAATGACAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AGACCCAAATATTGTTCCTTGCTG 1 0 232812 CASAVA_Build 15 57723279 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 3 4 232813 CASAVA_Build 15 57733104 2D ACATACTTTA CT/-- CTCTTAGTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 7 CT 3 2 232814 CASAVA_Build 15 57740275 8I GTGAAATATG --------/AAAAAACA AAAAAACAAA 3070 hom 96 het 43 0 33 10 AAAAAACA 1 2 232815 CASAVA_Build 15 57752614 1D AAGTGGGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 504 hom 24 2 14 8 T 15 14 232816 CASAVA_Build 15 57761483 1I CCGAAGAAAC -/T TTTACTTCCT 3070 hom 20 het 23 1 22 0 T 3 4 232817 CASAVA_Build 15 57762718 1I TCACGTGAGT -/G CCAATATCCT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 G 0 1 232818 CASAVA_Build 15 57769611 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAGAAAA 3070 hom 73 het 27 0 25 2 G 0 1 232819 CASAVA_Build 15 57770614 2D AGTCCGTCTC TT/-- TGATAAAATG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 3 1 232820 CASAVA_Build 15 57771164 2D CCTTTCAGAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TA 8 7 232821 CASAVA_Build 15 57790355 1I ATCCTAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 9 10 232822 CASAVA_Build 15 57796593 1I CCTCTAAACC -/T TTTTTTTTTT 2461 het 310 hom 34 4 18 12 T 16 17 232823 CASAVA_Build 15 57798170 1D TTTTTTAGCT A/- AACTGACCCA 3070 hom 66 het 25 0 17 8 A 3 2 232824 CASAVA_Build 15 57803254 1I GTACTTGTAA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 6 7 232825 CASAVA_Build 15 57808358 1D GTAGCAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 9 8 232826 CASAVA_Build 15 57829803 4D TTGTTTTGCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3024 hom 26 7 13 7 TTTA 5 4 232827 CASAVA_Build 15 57833602 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2968 het 1043 hom 22 5 7 10 A 16 15 232828 CASAVA_Build 15 57851967 1D TTTTCTCTTC T/- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 T 4 3 232829 CASAVA_Build 15 57875170 1I TTTTATATTT -/A AAAAACCTCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 5 6 232830 CASAVA_Build 15 57878484 1D TTCAAGACCA T/- TCCTGGGCCA 3070 hom 30 het 14 0 8 6 T 2 1 232831 CASAVA_Build 15 57883400 1D CTCCACCTCT G/- GGGGCAGGGC 1928 het 1928 ref 20 13 4 3 G 5 4 232832 CASAVA_Build 15 57891993 6I GACAGCCAGG ------/AGCACC GGCCCGCGCA 3070 het 3070 hom 49 21 20 8 AGCACC 0 1 232833 CASAVA_Build 15 57892392 1D AAAAGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 15 13 T 12 11 232834 CASAVA_Build 15 57902792 2D CTCATCTCTC TT/-- GTCTTCTCTT 3070 het 3070 ref 43 26 11 6 T 2 0 232835 CASAVA_Build 15 57905357 3D AACTTAAAGT AAA/--- ATAATAATAA 3070 het 1963 hom 13 4 8 2 A 4 1 232836 CASAVA_Build 15 57915967 1I TTTTTATGTG -/T ATGTGCGTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 0 1 232837 CASAVA_Build 15 57928583 8D GATTCAGGGG GTTTATCA/-------- GTAAGGTAGG 3070 het 3070 hom 47 22 23 5 GTTTATCA 1 0 232838 CASAVA_Build 15 57929161 6I TGTGTGACTG ------/TGTGTA TGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 55 21 17 17 TGTGTA 1 2 232839 CASAVA_Build 15 57933495 5I ATGAACAGGC -----/ACAGA ACAGAAGGAC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 ACAGA 1 2 232840 CASAVA_Build 15 57933923 12D TTCTTTCCTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2264 het 2264 ref 28 11 9 8 T 24 12 232841 CASAVA_Build 15 57935990 2I ATATAAATTG --/AT ATATATATAA 2195 het 988 hom 9 2 5 2 AT 4 5 232842 CASAVA_Build 15 57938200 1I TTTTTGGCAG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 8 9 232843 CASAVA_Build 15 57940821 1D TAGCGATGCA T/- TTTTTATGGA 3070 hom 117 het 41 0 40 2 T 6 5 232844 CASAVA_Build 15 57944266 1D GCTGTTAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 10 9 232845 CASAVA_Build 15 57945252 1I AAGAATTCCA -/T AGTCTGGGCA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 0 1 232846 CASAVA_Build 15 57945880 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 36 1 34 5 A 10 9 232847 CASAVA_Build 15 57949453 1I CATTTTTGAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 232848 CASAVA_Build 15 57950043 1I CAATTTTGGT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 G 1 2 232849 CASAVA_Build 15 57950949 1D TTCAAGGGGG A/- AAAAATTCAT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 6 5 232850 CASAVA_Build 15 57957046 3I CTCCTATCAC ---/CTT CTAGCTGCAA 3070 hom 116 het 42 0 37 5 CTT 0 1 232851 CASAVA_Build 15 57957280 1I TGGAGTCCAG -/C CACTGTACAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 2 232852 CASAVA_Build 15 57962300 4I CTTGGGAGGC ----/TGAG TGAGGCAGGA 3070 het 864 hom 19 5 10 4 TGAG 1 2 232853 CASAVA_Build 15 57975066 1D GACTTGGCTA C/- ATGGCGAAGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 1 0 232854 CASAVA_Build 15 58000806 3I CGACAGTGAG ---/ACT CCGTCTCAAG 3070 hom 72 het 29 0 23 6 ACT 0 1 232855 CASAVA_Build 15 58013476 1D CTTCTTTTGA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 76 het 33 0 26 8 T 8 7 232856 CASAVA_Build 15 58013749 1I TACTAAAGAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 8 9 232857 CASAVA_Build 15 58017590 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 21 7 A 10 11 232858 CASAVA_Build 15 58027934 19D ACTTTTTCTC TTCTAGAGAAAAAGACTCT/------------------- TTCTAGAGAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 TTCTAGAGAAAAAGACTCT 1 0 232859 CASAVA_Build 15 58029622 1D TATTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 43 1 36 6 A 11 10 232860 CASAVA_Build 15 58032253 1I CTGCTCTAAC -/A AAAATACCTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 4 5 232861 CASAVA_Build 15 58033847 2D TATTGACTTC TA/-- TATATATATA 2154 het 1741 hom 16 6 9 1 TA 6 5 232862 CASAVA_Build 15 58034814 1I ATTTAAACAT -/A ACACTATTTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 1 2 232863 CASAVA_Build 15 58045769 1I TTTTTGTATG -/A TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 0 1 232864 CASAVA_Build 15 58047034 1D ACTGCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 11 10 232865 CASAVA_Build 15 58053293 1D TTAATTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 17 0 9 10 A 13 12 232866 CASAVA_Build 15 58056643 3D TTTCAACAAG TAA/--- TAACATAAAG 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 TAA 2 1 232867 CASAVA_Build 15 58063721 2I TAAAAACAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 AC 0 1 232868 CASAVA_Build 15 58066806 2D AAACAAAAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 114 het 48 0 39 10 AG 10 9 232869 CASAVA_Build 15 58068895 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 33 3 17 13 A 13 14 232870 CASAVA_Build 15 58069170 5D AATATAAACT CATAA/----- CATGTTAATG 3070 hom 66 het 27 0 23 6 CATAA 1 0 232871 CASAVA_Build 15 58071856 1D AAAAAAAAAA G/- AAGAAGGAGA 3070 het 537 hom 33 2 25 6 G 1 0 232872 CASAVA_Build 15 58076192 1I GGTGTGCCAG -/T GATGCGCTGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 0 1 232873 CASAVA_Build 15 58077309 1D TCTGCAGTTG C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 28 het 26 1 23 2 C 9 8 232874 CASAVA_Build 15 58080697 1D GGATGTGCCT C/- CCCCCCCACC 3070 hom 56 het 21 0 19 3 C 8 7 232875 CASAVA_Build 15 58088179 1D ATCATATACA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 7 6 232876 CASAVA_Build 15 58088616 1D TGAGTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 11 10 232877 CASAVA_Build 15 58089335 2D GGAGGGAGGA AG/-- AGTCCAAGCC 3070 hom 82 het 32 0 27 6 AG 2 1 232878 CASAVA_Build 15 58092103 1D GGTGAACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 45 2 34 11 A 12 11 232879 CASAVA_Build 15 58094692 1D AAATATGCAC T/- TTTTTTATTA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 7 6 232880 CASAVA_Build 15 58095127 1I TTATAGTTAG -/A AAGAAAATTA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 A 2 3 232881 CASAVA_Build 15 58105736 2I CTCATAACCA --/CT CTACTCTGCA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 CT 1 2 232882 CASAVA_Build 15 58106338 1D ACAAAAAAAT A/- AAAAAACATT 3070 hom 71 het 27 0 24 3 A 7 6 232883 CASAVA_Build 15 58111535 1D ATTACCTCTA T/- ATATGCATGC 3070 het 3070 hom 48 23 23 3 T 1 0 232884 CASAVA_Build 15 58112521 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 726 hom 29 2 24 3 A 11 12 232885 CASAVA_Build 15 58127060 1D ATGAGAAGGT A/- CTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 0 232886 CASAVA_Build 15 58127653 1D TAATTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 11 10 232887 CASAVA_Build 15 58129086 4I CATTCACACC ----/AACT GTCTCATGAT 3070 hom 126 het 49 0 42 7 AACT 0 1 232888 CASAVA_Build 15 58129273 3D AATGCTTTTT TTG/--- TTGTTGTTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 7 TTG 3 2 232889 CASAVA_Build 15 58131159 1D ATTAGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 141 hom 24 2 20 2 T 12 11 232890 CASAVA_Build 15 58134774 1D CTTTAACATA T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 7 6 232891 CASAVA_Build 15 58136045 3I GTCGTTGTTC ---/TTG TTGTTAAGCC 3070 het 3055 hom 37 10 25 2 TTG 1 2 232892 CASAVA_Build 15 58137573 2D ATATGTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 14 12 232893 CASAVA_Build 15 58158104 1I ACAATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 33 2 26 6 T 13 14 232894 CASAVA_Build 15 58160607 1D TGCCTGCCTC G/- GCCTCCCAAA 3070 hom 59 het 27 0 18 9 G 2 1 232895 CASAVA_Build 15 58163770 1D TATATATACA T/- TTGAGTTCTT 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 T 3 2 232896 CASAVA_Build 15 58170549 1D CTGTGAAATA G/- CCAAATGGAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 G 1 0 232897 CASAVA_Build 15 58175394 1I TGTACAGATG -/C CTGGGTTCTA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 1 2 232898 CASAVA_Build 15 58179458 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 2768 het 2768 ref 24 12 8 4 A 9 10 232899 CASAVA_Build 15 58180182 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 22 2 10 10 A 17 16 232900 CASAVA_Build 15 58183451 1I GCAAAGTGCT -/G GGGAGTTGTG 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 G 3 4 232901 CASAVA_Build 15 58216277 1D CTTGGGAGAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 2981 hom 19 6 9 5 A 7 6 232902 CASAVA_Build 15 58253588 3I GTATAATAAA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AAT 3 4 232903 CASAVA_Build 15 58257607 1D AAAAAGAGAG A/- CCAGAAGACA 3070 hom 99 het 38 0 33 7 A 1 0 232904 CASAVA_Build 15 58259791 1D CTTCAGCCAC T/- TTTTTTTTTT 2688 het 2021 hom 46 14 9 24 T 18 17 232905 CASAVA_Build 15 58260503 1D AAAATAATAC T/- CTTTATAATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 1 0 232906 CASAVA_Build 15 58262103 5I AATTAAAAAA -----/AAAAG AAAACTGCTG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 AAAAG 0 1 232907 CASAVA_Build 15 58265911 1D TAATAGGAGC A/- ATTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 2 1 232908 CASAVA_Build 15 58268145 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGGAGGG 126 het 6 hom 4 0 2 2 G 7 6 232909 CASAVA_Build 15 58268283 2I AAAGTATAAT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 1955 hom 15 5 10 0 A 9 11 232910 CASAVA_Build 15 58277571 1D AAACTAGATT G/- GCCAGTGGAA 3070 het 3070 ref 65 34 21 10 G 2 1 232911 CASAVA_Build 15 58279007 1D TGGAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1782 het 1782 ref 19 8 6 5 A 12 11 232912 CASAVA_Build 15 58290302 2I TAGCAAGACT --/CA CAGAAGCAGA 3070 hom 144 het 56 0 48 8 CA 1 2 232913 CASAVA_Build 15 58291793 1D ATCTGACCCC A/- AAAGCTCACA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 A 4 3 232914 CASAVA_Build 15 58294129 1D ACAAAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 29 0 24 6 A 11 10 232915 CASAVA_Build 15 58296546 5I CAACTCAATC -----/AACTT AACAAAATCG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AACTT 0 1 232916 CASAVA_Build 15 58297696 1D TTTTACAGAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 56 het 27 0 19 8 T 9 8 232917 CASAVA_Build 15 58304653 1D TGCTTTTTTT C/- CTCTGGCAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 3 C 2 1 232918 CASAVA_Build 15 58309626 1I TCCTATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 25 1 20 4 A 10 11 232919 CASAVA_Build 15 58310413 1D CCATTTGGCT G/- CCCCTGAGTC 3070 hom 41 het 19 0 13 6 G 1 0 232920 CASAVA_Build 15 58348097 4D TCTAGGTAAA CAAT/---- CAATCAGTGA 3070 het 3070 hom 35 12 17 10 CAAT 2 1 232921 CASAVA_Build 15 58349455 1D TTTCCATGAA T/- TTTCATGGTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 4 3 232922 CASAVA_Build 15 58350222 3D TACCTTGGTG TGT/--- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 52 30 15 11 TGT 1 0 232923 CASAVA_Build 15 58380373 1D TGTCAGAAAA G/- GGGGGGATGG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 G 7 6 232924 CASAVA_Build 15 58395690 1D CCCATGATTC A/- AATTTTCTCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 3 2 232925 CASAVA_Build 15 58397362 1D AAAAGACTGG C/- CCCCATGATT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 C 5 4 232926 CASAVA_Build 15 58399736 1D GGAGGACCCA T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 T 7 6 232927 CASAVA_Build 15 58402876 1D6M3I CTAGGTGCAT CCTGAAT---/-CTGAATTTC TTTTCACTAG 3070 hom 57 het 23 0 19 5 N/A 0 0 232928 CASAVA_Build 15 58405319 28D TAAGTAAAAA AAAATCTTGTTACATCCTTAACATTTTT/---------------------------- AAATCTTGTT 3070 het 235 hom 23 1 17 6 AAAATCTTGTTACATCCTTAACATTTTT 1 0 232929 CASAVA_Build 15 58409600 1D CAAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 31 1 23 7 A 13 12 232930 CASAVA_Build 15 58412023 24I CTCAGCAAAT ------------------------/GTAAAAGAACAGAAATTATAACAA ACTGTCTCTC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 GTAAAAGAACAGAAATTATAACAA 0 1 232931 CASAVA_Build 15 58430268 2I GAAGATAATC --/AT ATAAGCCTCA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 AT 1 2 232932 CASAVA_Build 15 58436872 1D AATCTATACT C/- CTACCCCTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 2 1 232933 CASAVA_Build 15 58448057 1D ACTGTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 1470 het 1470 ref 31 18 5 9 A 13 12 232934 CASAVA_Build 15 58461543 8D AAGAAGGGAG GGGAGGGA/-------- GGGAGGGAGG 2665 het 28 hom 12 1 8 5 GGGA 5 3 232935 CASAVA_Build 15 58468407 1D TTTTTTTTTT C/- CAGTAGAGAT 2094 het 1713 hom 17 8 7 2 C 2 1 232936 CASAVA_Build 15 58471389 3D CTCCAACAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3000 hom 36 11 15 13 A 15 12 232937 CASAVA_Build 15 58471898 1D TGTCCTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 10 10 A 13 12 232938 CASAVA_Build 15 58472009 6D TCCCAAAAAG AAGAGT/------ AAAAGTTTAC 3070 het 3070 ref 32 16 14 5 AAGAGT 1 0 232939 CASAVA_Build 15 58474206 6D AAAAAAAAAG AAAAAA/------ AAAAACAGCT 3070 hom 90 het 31 0 27 8 A 11 5 232940 CASAVA_Build 15 58474485 1D TTCTCATGTG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 35 11 20 5 A 8 7 232941 CASAVA_Build 15 58479348 2I TGGAAGGTTA --/GG GGGGAACACA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 G 4 6 232942 CASAVA_Build 15 58480548 4I AGCTTCATTC ----/ATTT GTCTGGCGCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATTT 0 1 232943 CASAVA_Build 15 58481926 1I GTAGGTGATG -/A AAAAAAGCCA 3070 hom 67 het 24 0 23 1 A 6 7 232944 CASAVA_Build 15 58483320 2I CCCTATCAGC --/CT CTATTGTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 CT 1 2 232945 CASAVA_Build 15 58484492 1D ACTTACAGCC A/- AAAAAAAAAA 2788 het 2788 ref 35 16 7 13 A 12 11 232946 CASAVA_Build 15 58494676 1D TTCCATTGTT C/- CCTGACCCAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 3 2 232947 CASAVA_Build 15 58499225 5D AGAACAAAAC AAAAT/----- ACTACTATAT 3070 het 3070 hom 50 18 29 7 AAAAT 1 0 232948 CASAVA_Build 15 58499643 1I AGAAATGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 260 hom 40 1 28 11 A 11 12 232949 CASAVA_Build 15 58500449 2D AAATATGCCC CT/-- GTCCTTGCAG 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 CT 1 0 232950 CASAVA_Build 15 58500695 1D AGTCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 643 hom 36 4 24 10 A 16 15 232951 CASAVA_Build 15 58501497 1I GCTATTCTTT -/A ACACAGAATA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 1 2 232952 CASAVA_Build 15 58502172 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 1339 het 1339 ref 15 9 5 1 A 9 10 232953 CASAVA_Build 15 58503912 28I ATACAGAGGA ----------------------------/TGGGCAAAGGGGAAGAGGGGGATTAGAG TGGGGGAAGG 3070 hom 54 het 17 0 19 2 TGGGCAAAGGGGAAGAGGGGGATTAGAG 0 1 232954 CASAVA_Build 15 58509941 10I TTTATAATCT ----------/TAATTTGTGG TAATTTGTTA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 TAATTTGTGG 0 1 232955 CASAVA_Build 15 58511610 1I TACAAAAAAT -/A CTGAAACTTA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 0 1 232956 CASAVA_Build 15 58515091 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 17 3 13 3 A 17 16 232957 CASAVA_Build 15 58515941 3D CTAAAATATT TGC/--- TGAATATATG 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 TGC 1 0 232958 CASAVA_Build 15 58522996 1I TTATCAACAG -/T TAAGTGCTGT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 1 2 232959 CASAVA_Build 15 58530899 1D CTATGTTCAG A/- AGGAAATAAA 3070 het 3070 hom 39 18 20 3 A 2 1 232960 CASAVA_Build 15 58535728 6I GCTTAAAATT ------/TAAATA TAATGTCTAT 3070 hom 45 het 16 0 16 1 TAAATA 0 1 232961 CASAVA_Build 15 58543845 1D AAAACAGCAC T/- TACAAAAAGG 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 T 2 1 232962 CASAVA_Build 15 58545189 2I TCTACTACAA --/AT ATATGTGTGT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AT 2 3 232963 CASAVA_Build 15 58549668 1I CCATCTCCAA -/T CTCCAGGACA 3070 het 3070 hom 60 25 32 3 T 0 1 232964 CASAVA_Build 15 58558731 1I CAGCGAAGTG -/C CGAGACTGGG 3070 hom 62 het 24 0 18 6 C 1 2 232965 CASAVA_Build 15 58571516 3I TAAAAATGTC ---/AAT AACGTGTGTG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 AAT 0 1 232966 CASAVA_Build 15 58573674 1I TGAACACTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 A 8 9 232967 CASAVA_Build 15 58574069 1D GAGCTCCATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 45 11 28 6 T 8 7 232968 CASAVA_Build 15 58575350 2D AGGGATCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 A 13 11 232969 CASAVA_Build 15 58580603 60D TTTGATTATT GTCTTAGGAGAAAAACCTAGGTCTTAGGTTTTCCTAAGGTTCTCCTAAGTCCAATAGAAG/------------------------------------------------------------ GTCTTAGGAG 3070 het 3070 ref 29 24 15 8 GTCTTAGGAGAAAAACCTAGGTCTTAGGTTTTCCTAAGGTTCTCCTAAGTCCAATAGAAG 1 0 232970 CASAVA_Build 15 58593183 2D TGTAGTGGTG CA/-- CAGAGTGCCT 3070 het 3070 ref 46 22 18 9 CA 2 1 232971 CASAVA_Build 15 58596602 1I TCATCTGTGC -/T TTTTTTTTTT 2443 het 2443 ref 28 11 11 6 T 13 14 232972 CASAVA_Build 15 58611824 3I TTACATATGA ---/TGG TAAGAATTCC 3070 hom 132 het 52 0 45 7 TGG 0 1 232973 CASAVA_Build 15 58617981 1D TGTCCTATTA C/- CCATATCCAG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 C 3 2 232974 CASAVA_Build 15 58621342 1D AGTAAGAACA C/- AACAGCCATG 3070 het 3070 ref 57 31 19 7 C 1 0 232975 CASAVA_Build 15 58627117 1D ATGACTGGCC T/- TTTTTTTTTT 2369 het 1539 hom 24 8 8 8 T 16 15 232976 CASAVA_Build 15 58648436 1D GTTTTGCGCT A/- AAAAAAAAAA 1726 het 91 hom 37 1 10 26 A 19 18 232977 CASAVA_Build 15 58658955 1D CTTCCTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 A 11 10 232978 CASAVA_Build 15 58665947 2D TATTAGAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 1468 het 1468 ref 72 41 5 26 GT 8 7 232979 CASAVA_Build 15 58679083 1I GTAAAAGTAC -/A GAGACAGAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 0 1 232980 CASAVA_Build 15 58740245 1D ACACTGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 52 23 25 5 A 10 9 232981 CASAVA_Build 15 58742142 1I GAAAAAAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 80 hom 47 1 38 8 T 9 10 232982 CASAVA_Build 15 58759096 1D AACCTTGAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 9 8 232983 CASAVA_Build 15 58762803 4D TGCCCAGCCA ACAT/---- GATTTCTTAA 3070 hom 84 het 33 0 28 7 ACAT 1 0 232984 CASAVA_Build 15 58764413 2D GCTTGGGCAA AT/-- ATAGCTTAAC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AT 2 1 232985 CASAVA_Build 15 58774648 1D AAGCCTCTGC T/- TAGTGACCCA 3070 hom 154 het 58 0 52 6 T 2 1 232986 CASAVA_Build 15 58791490 1D TGTGATACGT A/- GTCTAATAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 0 232987 CASAVA_Build 15 58793550 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 929 het 929 ref 32 23 5 4 T 12 11 232988 CASAVA_Build 15 58802869 1I CAAAACCATT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 1772 hom 23 7 11 5 C 9 10 232989 CASAVA_Build 15 58807682 1I AGATGCTTCC -/T TTTTTGCTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 5 6 232990 CASAVA_Build 15 58846163 1D CAGACTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2361 hom 34 11 13 10 T 13 12 232991 CASAVA_Build 15 58850683 8I AACTCCCCCT --------/ATCCTCCC ACCCTCCATT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 ATCCTCCC 0 1 232992 CASAVA_Build 15 58851899 2I AAACTACCTC --/AT GTGATTGCCT 3070 het 3070 hom 30 7 19 4 AT 0 1 232993 CASAVA_Build 15 58865467 2D TGGTACTCAG TA/-- TAACTATTTG 3070 hom 138 het 52 0 47 6 TA 2 1 232994 CASAVA_Build 15 58873037 1D TGCCAGTTTC T/- TAAGTCATCT 3070 het 3070 hom 47 18 25 5 T 2 1 232995 CASAVA_Build 15 58876003 1I ACCCCCCGCC -/A AAAAAAAAAA 3055 het 2588 hom 32 12 10 10 A 11 12 232996 CASAVA_Build 15 58880904 8D AACACAGACT TTAGTGGC/-------- TTAGATATTT 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 TTAGTGGC 1 0 232997 CASAVA_Build 15 58888660 1I AAACCCATTG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 6 7 232998 CASAVA_Build 15 58889281 1I TAATATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 10 11 232999 CASAVA_Build 15 58890211 1D TTCCCTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 23 1 17 5 T 12 11 233000 CASAVA_Build 15 58901504 1D TCACAGAAGC A/- CGGAATTTTA 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 A 1 0 233001 CASAVA_Build 15 58903939 2D TTCCCTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 A 13 11 233002 CASAVA_Build 15 58906143 1I CTGAGTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 33 0 27 6 T 12 13 233003 CASAVA_Build 15 58913103 1D GTTCACCAAA C/- CCACCAAGCC 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 C 3 2 233004 CASAVA_Build 15 58931269 1I GAGAGAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 41 2 26 13 T 12 13 233005 CASAVA_Build 15 58935246 4I TGAGTAGCTG ----/CGAT CACAGGCGCC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 CGAT 0 1 233006 CASAVA_Build 15 58943299 3D TGTCAGAATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 24 1 12 11 T 17 14 233007 CASAVA_Build 15 58961106 2D AAAAACAAGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 92 het 38 0 30 10 AG 9 8 233008 CASAVA_Build 15 58975076 1I TTCAATAGCT -/C CGGCATCTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 1 2 233009 CASAVA_Build 15 58981158 1I TAAATAATCG -/T TAAGTGCTTA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 T 1 2 233010 CASAVA_Build 15 58981784 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 0 1 233011 CASAVA_Build 15 58990367 1D GCTCTGGCTG T/- TTTTTTTTTG 1288 het 1288 ref 28 13 4 11 T 10 9 233012 CASAVA_Build 15 58992246 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 2123 hom 15 het 9 0 6 3 AAAC 5 4 233013 CASAVA_Build 15 58994779 1D GGACTTCTTT C/- CCCAATAAGT 3070 het 3070 ref 56 30 18 8 C 4 3 233014 CASAVA_Build 15 58996105 2D AATTGCCTGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 AT 6 5 233015 CASAVA_Build 15 59018233 1I CTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 8 9 233016 CASAVA_Build 15 59021396 1I CAAGAAATAG -/T TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 5 6 233017 CASAVA_Build 15 59037450 1D TTTCAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 36 1 28 7 T 11 10 233018 CASAVA_Build 15 59061326 1D TGTTGATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 32 0 25 7 T 11 10 233019 CASAVA_Build 15 59071055 1D GATGAAAAAA G/- TTTAAAAGTA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 1 0 233020 CASAVA_Build 15 59072174 1D CTGACACCGT G/- GATGTTTTCA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 G 2 1 233021 CASAVA_Build 15 59083490 1I TTCATGGCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2041 hom 38 8 16 14 A 11 12 233022 CASAVA_Build 15 59085065 4D CTGAAAGCTT TCTC/---- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 39 18 16 7 TC 6 4 233023 CASAVA_Build 15 59085447 10D TTTTTGTTTG TTTGTTTTGT/---------- TTTGTTTTGT 3070 het 2935 hom 23 7 10 6 TTTGT 5 3 233024 CASAVA_Build 15 59092149 1I AAGTTATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 T 10 11 233025 CASAVA_Build 15 59094966 1I TGAAATACAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 A 9 10 233026 CASAVA_Build 15 59113209 1D GATGTGCTGT A/- AAGTGCATAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 3 2 233027 CASAVA_Build 15 59113393 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 30 8 A 11 10 233028 CASAVA_Build 15 59147793 11D GGATTAGCTC TAACCAATGCT/----------- TAACGGTGTG 3070 het 3070 ref 52 30 21 6 TAACCAATGCT 1 0 233029 CASAVA_Build 15 59156428 1I TGTTCAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 16 13 16 A 13 14 233030 CASAVA_Build 15 59201317 1D CTGCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1564 hom 31 9 14 9 A 12 11 233031 CASAVA_Build 15 59212546 1I TTCAAAAGGT -/A AACTCTCTAA 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 2 3 233032 CASAVA_Build 15 59217056 1I TTGCAGCAGC -/A AGTCACAGAG 3070 hom 120 het 53 0 40 13 A 1 2 233033 CASAVA_Build 15 59221399 1D AGGTTCAGGA G/- GGGGAAAGAG 3070 het 3070 ref 47 26 12 10 G 5 4 233034 CASAVA_Build 15 59221639 2D ATTTATAAAG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 11 9 233035 CASAVA_Build 15 59222044 1I ACAAAAATAA -/C CCAGAAAGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 2 3 233036 CASAVA_Build 15 59228961 2D GGTTAAGAAG AC/-- ACTATTCTCT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 AC 2 1 233037 CASAVA_Build 15 59230572 20D GAGCAGACAT CACCAATAGATCATGAATAG/-------------------- CACTCTTTTA 3070 het 3070 hom 47 24 25 5 CACCAATAGATCATGAATAG 1 0 233038 CASAVA_Build 15 59231963 4D ATTTAAATGT TACA/---- TAATCATATA 2456 het 988 hom 9 2 6 1 TACA 1 0 233039 CASAVA_Build 15 59233262 4D1M2I3M3D GTTTCATGCA CAATT--GCTAAG/----TGGGCT--- AACCCTTCAA 3070 het 3070 hom 45 21 22 8 N/A 0 0 233040 CASAVA_Build 15 59234515 1D GTGGAGTTCT A/- ATATACAGTA 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 A 2 1 233041 CASAVA_Build 15 59248607 7D GCAGGGCTGG CCTGACT/------- CCTCTGACTG 3070 het 3070 hom 48 19 20 10 CCTGACT 1 0 233042 CASAVA_Build 15 59249268 1D ACGGCCTCAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 8 A 8 7 233043 CASAVA_Build 15 59264882 7I AGGATCTCTA -------/GTGACAC TACGGCTACT 3070 hom 120 het 44 0 39 5 GTGACAC 0 1 233044 CASAVA_Build 15 59269671 2D TTTGGTCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 37 1 28 8 A 12 10 233045 CASAVA_Build 15 59270857 1D TCCTTGTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 32 0 13 19 A 16 15 233046 CASAVA_Build 15 59272567 5I TTCTCTCTCC -----/TATCT TATATCTTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TATCT 0 1 233047 CASAVA_Build 15 59274460 1I GCACCAGAAC -/A AAAAAAAAAA 2059 het 1515 hom 22 6 8 8 A 10 11 233048 CASAVA_Build 15 59274483 3D CTTTAGTTGC TGT/--- TGTTGTTAAT 3070 hom 13 het 21 0 10 13 TGT 3 2 233049 CASAVA_Build 15 59277388 1D GATCCCTCCC A/- GGGGGTTCAA 3070 hom 72 het 31 0 22 10 A 1 0 233050 CASAVA_Build 15 59278122 1D GAAATAATTA T/- TTATTTGAGT 3070 hom 47 het 34 0 23 11 T 3 2 233051 CASAVA_Build 15 59285665 4D ATGCAGATAA TACT/---- TTATTTAATC 3070 hom 144 het 53 0 49 5 TACT 1 0 233052 CASAVA_Build 15 59286574 2I TACGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 TA 6 7 233053 CASAVA_Build 15 59288760 1D GTTGAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 34 1 27 6 A 15 14 233054 CASAVA_Build 15 59290784 2I GCAAAAAAAA --/AT AAAAAAAAAA 3070 het 860 hom 22 7 11 4 AT 0 1 233055 CASAVA_Build 15 59291750 1I TGTTTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 541 hom 36 2 23 11 A 10 11 233056 CASAVA_Build 15 59295988 2D TCCGATGTGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 82 het 36 0 28 10 T 11 9 233057 CASAVA_Build 15 59299073 1D CTCAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 A 13 12 233058 CASAVA_Build 15 59303015 4D TTTAACAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 41 23 12 9 AAAG 3 2 233059 CASAVA_Build 15 59303497 1I ATTAGATATC -/A AAAAAAAAAA 2824 het 2824 ref 29 11 10 8 A 13 14 233060 CASAVA_Build 15 59314043 1D AAAAAAAAAA G/- ATATTAGCAT 3070 het 633 hom 40 5 17 18 G 1 0 233061 CASAVA_Build 15 59331195 1D ATTCTAAGTG T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 6 233062 CASAVA_Build 15 59332312 2I GTATTGTAAT --/AA AAAGTCTCAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 5 233063 CASAVA_Build 15 59332508 1D CAACCACTAA T/- CTAGTTCTTA 3070 hom 114 het 42 0 37 7 T 1 0 233064 CASAVA_Build 15 59333202 2D GTGGTACAGG TA/-- TACACCATGG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TA 2 1 233065 CASAVA_Build 15 59340665 1D TAATAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 9 8 233066 CASAVA_Build 15 59341095 1D TTTGTTTCTA T/- TTTGGTAAAT 3070 hom 116 het 48 0 39 9 T 4 3 233067 CASAVA_Build 15 59351843 4D ATTTAAAGAC ATAA/---- ATAAAACTTA 3070 hom 117 het 41 0 40 4 ATAA 2 1 233068 CASAVA_Build 15 59361032 1D TTAGAGGCCA T/- TAACCTTAGC 3070 hom 91 het 33 0 30 3 T 2 1 233069 CASAVA_Build 15 59361662 2D38M1D CCATCTCTAC AAAAAAAAAAAAAAAGAGCTTTCATTCATAAAATTTTATCT/--AAAAAAAAAAAAAGAGCTTTCATTCATAAAATTTTATC- TTTAATTTTC 3070 het 31 hom 16 1 26 8 N/A 0 0 233070 CASAVA_Build 15 59381128 1D TGAAAACAAC T/- TTTTTTCAAA 3070 hom 120 het 46 0 40 7 T 7 6 233071 CASAVA_Build 15 59393892 1D CAAAAGTTTC T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 7 6 233072 CASAVA_Build 15 59400210 5D GGGCACACTG TTTGT/----- TTTGTCAGTT 3070 hom 84 het 36 0 28 13 TTTGT 2 1 233073 CASAVA_Build 15 59400500 1I GAAAAATTAC -/T CTATGCAAAG 3070 hom 159 het 59 0 55 4 T 0 1 233074 CASAVA_Build 15 59402161 1D CGTGCTTGCC T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 141 het 55 0 48 8 T 7 6 233075 CASAVA_Build 15 59404298 1D AAGGCTAAAA G/- TGTCTTCATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 0 233076 CASAVA_Build 15 59409672 3I7M14D TGTTATCCGG ---GGTTTCACCGTGTTATCCGGG/GATGGTCTCA-------------- ATCTCCTGAC 2902 hom 24 het 8 0 8 2 N/A 0 0 233077 CASAVA_Build 15 59421249 1D TCTGGAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 29 1 24 4 A 13 12 233078 CASAVA_Build 15 59432865 4D TACCGAATCT GCTG/---- GCACCTTGAT 3070 hom 114 het 41 0 38 5 GCTG 1 0 233079 CASAVA_Build 15 59446387 1I AGAATTGCTA -/G GGGGTGTCCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 4 5 233080 CASAVA_Build 15 59450189 1I TCATGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 32 1 26 5 T 12 13 233081 CASAVA_Build 15 59451866 1I GTATTACATT -/G GGGCAAGCCA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 G 3 4 233082 CASAVA_Build 15 59461026 2D TCATTACTTG AT/-- TTTTCTCTTC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 AT 1 0 233083 CASAVA_Build 15 59463822 1I CAGCCTCCCG -/A AGTAGCTGGG 2651 hom 27 het 10 0 8 4 A 1 2 233084 CASAVA_Build 15 59480339 1I TCACCATGGA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 79 het 33 0 27 6 T 7 8 233085 CASAVA_Build 15 59485370 4D TACATGTCTT AAAC/---- AATATATAGA 3070 hom 66 het 23 0 22 3 AAAC 1 0 233086 CASAVA_Build 15 59486303 5D TCTAAAGCTT ATCTC/----- ATCTCTTATG 3070 hom 46 het 18 0 16 3 ATCTC 2 1 233087 CASAVA_Build 15 59492499 2D ACATGGAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 197 het 72 0 65 8 AC 9 8 233088 CASAVA_Build 15 59497536 1D TTTTCTCTAT A/- AATCTGTTGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 3 2 233089 CASAVA_Build 15 59498744 2I GAAGAGCACG --/TC TCTGCAGCCA 3070 hom 70 het 31 0 24 7 TC 1 2 233090 CASAVA_Build 15 59507901 4I CGTCTCAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 2814 hom 15 het 7 0 6 1 AAAT 3 4 233091 CASAVA_Build 15 59508317 2D TAATTTTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 8 T 12 10 233092 CASAVA_Build 15 59511639 14D TATTAATCTC ATAGGTTTTGTTTT/-------------- ATAGGTTACC 3070 hom 83 het 33 0 28 11 ATAGGTTTTGTTTT 1 0 233093 CASAVA_Build 15 59516858 1I AAATTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 39 0 33 6 T 10 11 233094 CASAVA_Build 15 59529321 1D ATCATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 11 10 233095 CASAVA_Build 15 59548466 1I TTTTCTCCAA -/T CCCTCAAATA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 0 1 233096 CASAVA_Build 15 59558901 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 1414 het 1414 ref 44 30 4 12 AC 9 8 233097 CASAVA_Build 15 59578266 1I AATCAATGAT -/A AAATTTGTAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 3 4 233098 CASAVA_Build 15 59608430 1I CCAGAAAAGT -/G ACCCTAGGAC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 G 0 1 233099 CASAVA_Build 15 59610377 2D GTAAATGCCA CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 458 hom 29 8 14 8 C 12 10 233100 CASAVA_Build 15 59633058 1D TAGGAAAATG A/- AAAAAAAAAA 2137 het 2137 ref 39 21 5 13 A 15 14 233101 CASAVA_Build 15 59634477 29I ATTTAGGTGG -----------------------------/CCTGGGGAGCGTTAGCCACCCCAGGGTTC CCTCACTGAA 3070 het 3070 ref 39 25 13 1 CCTGGGGAGCGTTAGCCACCCCAGGGTTC 0 1 233102 CASAVA_Build 15 59635537 2I CAGCAAAGGT --/AC AGTCTATGGA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 AC 0 1 233103 CASAVA_Build 15 59639285 2D CTTCTATCTC TT/-- TTCCACCTCT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 4 2 233104 CASAVA_Build 15 59640235 2D CTAATGCAAT AA/-- AATAGTGCCT 3070 het 3070 ref 63 28 25 10 A 4 2 233105 CASAVA_Build 15 59651558 4I GATTCTTCTC ----/TCTT TTTTTCTTTA 1112 het 1112 ref 8 5 3 0 TCTT 0 1 233106 CASAVA_Build 15 59654780 1D TTTAAAGGGT A/- GGGGCAATGT 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 A 1 0 233107 CASAVA_Build 15 59655851 1D TGGAGAGATA C/- GTCCTCCCCA 3070 het 2992 hom 27 9 11 7 C 1 0 233108 CASAVA_Build 15 59656287 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAGAACA 3070 het 1616 hom 20 5 13 2 A 5 6 233109 CASAVA_Build 15 59665990 3D AGCTGGAAAC CAT/--- CATTCTCAGC 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 CAT 2 1 233110 CASAVA_Build 15 59666473 1D TGCAGCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 11 10 233111 CASAVA_Build 15 59674257 6D CCAATCTCTT TGTTTG/------ TCTGTTTCTT 3070 het 3070 hom 47 20 26 4 TGTTTG 1 0 233112 CASAVA_Build 15 59684619 1I CTCCCAGCAT -/G GCAGTTGGCA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 G 1 2 233113 CASAVA_Build 15 59687040 1I TACTTACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 22 20 10 T 11 12 233114 CASAVA_Build 15 59701052 1I CTTGAGCCTT -/C CACCTAGGAC 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 C 1 2 233115 CASAVA_Build 15 59705130 1I CCAAAAAGAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 6 7 233116 CASAVA_Build 15 59721135 9I TGTATCCCCT ---------/GGGCTTAGG GGGCTTAGGA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 GGGCTTAGG 1 2 233117 CASAVA_Build 15 59726348 1D TTGTGCAGAT G/- GGGGAAACGG 3070 hom 57 het 20 0 19 2 G 5 4 233118 CASAVA_Build 15 59757698 1I CCTTTTTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 8 9 233119 CASAVA_Build 15 59764750 1I TTGACGGGAT -/G TCTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 G 0 1 233120 CASAVA_Build 15 59864764 1I TACAAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2195 hom 33 10 13 10 A 16 17 233121 CASAVA_Build 15 59889837 1D ATAGCCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 12 11 233122 CASAVA_Build 15 59890614 1I TAGGTGGAAG -/C TCCCCCCATT 3070 het 2157 hom 26 7 10 9 C 0 1 233123 CASAVA_Build 15 59892735 13I CAGTCAACAA -------------/TAAAACTGTCTTT TAAAACTCCC 3070 hom 114 het 45 0 38 8 TAAAACTGTCTTT 0 1 233124 CASAVA_Build 15 59905399 1I AAATGATACC -/T GTCTTGTGAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 0 1 233125 CASAVA_Build 15 59906185 1I CACATTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 9 10 233126 CASAVA_Build 15 59906392 1I CAAATGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 13 14 233127 CASAVA_Build 15 59910777 3I GGAGACTGAG ---/GAA GAAGAAGGCC 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 GAA 2 3 233128 CASAVA_Build 15 59916070 1D GATTCTGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 791 hom 32 9 11 12 A 15 14 233129 CASAVA_Build 15 59921937 2I GTTCCCCTCC --/CT GTGTCCATGT 3070 het 2326 hom 25 7 17 1 CT 0 1 233130 CASAVA_Build 15 59927576 1I TATTTTTGCC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 50 het 37 1 31 5 A 8 9 233131 CASAVA_Build 15 59928121 1I TCATGCCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 45 1 33 11 T 11 12 233132 CASAVA_Build 15 59929704 1D GCTTATGTTT C/- CATATTTGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 2 1 233133 CASAVA_Build 15 59936023 1D AACTGGCACT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 10 9 233134 CASAVA_Build 15 59945284 2D TGTATATATA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 hom 69 het 30 0 23 7 TG 5 4 233135 CASAVA_Build 15 59948608 8D TTCTTTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 260 het 260 ref 22 5 4 15 T 19 11 233136 CASAVA_Build 15 59951061 1D TTTTCAAGAC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 9 8 233137 CASAVA_Build 15 59957481 1D TTTTCATTGA T/- TTTGTTGTAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 4 3 233138 CASAVA_Build 15 59981835 1D CCAACTCTTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 10 9 233139 CASAVA_Build 15 59982376 1D TCCAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 33 1 23 9 A 14 13 233140 CASAVA_Build 15 59988626 1D TCTATTGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 43 1 33 9 A 11 10 233141 CASAVA_Build 15 59992032 1I CAAATTCAGG -/T TTTTGCTCTG 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 T 4 5 233142 CASAVA_Build 15 59992132 1D AGCCAACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 13 12 233143 CASAVA_Build 15 60004004 1I CTCAAAAACG -/T TTTTTTGAAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 6 7 233144 CASAVA_Build 15 60017758 1I ACTTTGCTGT -/G GGGGTGGGGG 3070 hom 79 het 30 0 24 6 G 4 5 233145 CASAVA_Build 15 60023406 1D CAGAATCTAT A/- AAAAAAAAAA 1409 het 1409 ref 24 17 3 4 A 12 11 233146 CASAVA_Build 15 60052312 1I AACTGCATGA -/T AACACTCAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 1 233147 CASAVA_Build 15 60063760 1D TACTGTAAAA G/- TTCTGATCAC 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 G 1 0 233148 CASAVA_Build 15 60115733 1D GTGAATAATT A/- AAGTCACTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 3 2 233149 CASAVA_Build 15 60117200 1I TTTCAAAAGT -/A AAAGAATAAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 3 4 233150 CASAVA_Build 15 60124769 3I TTGCCATTAC ---/TTT TTTTAATGGC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 4 7 233151 CASAVA_Build 15 60138421 2D AAGACAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 39 2 31 6 A 12 10 233152 CASAVA_Build 15 60142775 1I AAAAAAAAAA -/C AACTTCACAC 3070 het 720 hom 37 3 24 10 C 0 1 233153 CASAVA_Build 15 60152251 2I TAGTTCAATC --/TT TGTAGAATTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 3 233154 CASAVA_Build 15 60153025 4D CTTCATTCTC TCTT/---- TCTTTTCCTC 3070 hom 111 het 39 0 38 3 TCTT 2 1 233155 CASAVA_Build 15 60158111 1D ACTTTCCCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 10 9 233156 CASAVA_Build 15 60159724 2I AGCTAAAATC --/TG GGTTGGGAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TG 0 1 233157 CASAVA_Build 15 60164111 1I GGACACATTC -/T CCTTCTCAGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 0 1 233158 CASAVA_Build 15 60178477 1D TGGACATATA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 8 7 233159 CASAVA_Build 15 60182704 4D AAAGGAAAGA CTAT/---- CTTTTTATCC 3070 het 3070 hom 30 12 17 3 CTAT 1 0 233160 CASAVA_Build 15 60188890 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 AT 9 8 233161 CASAVA_Build 15 60193595 3D GTTCATCTGA TAG/--- TTCCAGTGCC 3070 het 3070 ref 42 20 18 5 TAG 1 0 233162 CASAVA_Build 15 60195739 5D TATATATATA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 405 het 4 hom 10 0 2 8 T 18 13 233163 CASAVA_Build 15 60199217 1D TTTTATGGTG T/- TTTTCCCTTG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 5 4 233164 CASAVA_Build 15 60200764 1I CAAAAAAGAA -/T TGGGGGCGAG 3070 hom 90 het 33 0 28 5 T 1 2 233165 CASAVA_Build 15 60216601 1D GTTACCCTTT G/- CACTGGGGAC 3070 het 3070 hom 45 20 20 6 G 1 0 233166 CASAVA_Build 15 60221788 9I AGTTCAGCCT ---------/GAGTTTGGA GTAGGCTGAA 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 GAGTTTGGA 0 1 233167 CASAVA_Build 15 60222278 11I GCATATTGTT -----------/TATATGCAATA TAATCTGCAG 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 TATATGCAATA 0 1 233168 CASAVA_Build 15 60222764 4D GCAGAAACAC AGTT/---- GGTTAAGAAA 3070 het 3070 hom 38 15 21 4 AGTT 1 0 233169 CASAVA_Build 15 60226055 1I GGTGAAGACA -/G GGGGTTCCTT 3070 het 3070 hom 43 11 21 11 G 4 5 233170 CASAVA_Build 15 60231700 1D GAGGCCCTCT C/- CCTCACATTC 3070 hom 98 het 35 0 26 11 C 3 2 233171 CASAVA_Build 15 60234675 11I CTGTGTCTTT -----------/TAGCAGTTCTG TAGCAGTTCT 3070 het 3070 hom 36 18 15 3 TAGCAGTTCTG 1 2 233172 CASAVA_Build 15 60235170 1D ATAGTGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 25 1 21 3 A 12 11 233173 CASAVA_Build 15 60236111 15D ATCTGAGCTA CGAGCTGTCAATAGC/--------------- CAAACCTCTC 3070 het 3070 ref 31 16 13 6 CGAGCTGTCAATAGC 1 0 233174 CASAVA_Build 15 60237996 1I CCATTGAGAC -/A AAAAATCAAC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 5 6 233175 CASAVA_Build 15 60254653 1I CTTTAAGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 652 hom 28 2 22 4 A 10 11 233176 CASAVA_Build 15 60257774 20D TATATGTGTG TGTATATATATATATATATA/-------------------- TATATATGTA 3070 hom 48 het 22 0 16 8 TGTATATATATATATATATA 1 0 233177 CASAVA_Build 15 60262772 4I CCTCCCTCTC ----/TTCT TTCTCTTTCT 3070 hom 74 het 31 0 21 10 TTCT 1 2 233178 CASAVA_Build 15 60263184 11D TGGCCTTTTA CACAATTTTCT/----------- CAAATTTTCT 3070 het 3070 ref 27 15 10 6 CACAATTTTCT 1 0 233179 CASAVA_Build 15 60265159 11I1M2D TCTCTCCCTG -----------CTT/TCCAGCAGGGAC-- AACTACACCA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 N/A 0 0 233180 CASAVA_Build 15 60275382 1D ATAGTAACAC A/- AAATATAATA 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 A 4 3 233181 CASAVA_Build 15 60280110 1D CGCCACTACC T/- TAATATACCT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 2 1 233182 CASAVA_Build 15 60303115 1D TTCCCGTGAC A/- AGAGTTTTCA 3070 hom 69 het 27 0 22 6 A 2 1 233183 CASAVA_Build 15 60321788 1D TGAGTGGGAA T/- GGGTGGTAGG 3070 het 3070 ref 22 11 9 4 T 1 0 233184 CASAVA_Build 15 60326446 2I CCACCTCTCT --/GG GGCATTCTAA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 G 2 4 233185 CASAVA_Build 15 60333753 3I CCAGCAGCCT ---/CTC CTCCTGCTCC 2773 het 2773 ref 39 16 15 8 CTC 1 2 233186 CASAVA_Build 15 60341864 14I TGGCCCAGAG --------------/GGTCACTGCACCTT GGCCCAGGCC 3070 het 2469 hom 36 9 18 10 GGTCACTGCACCTT 0 1 233187 CASAVA_Build 15 60350481 1I TTTAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 A 10 11 233188 CASAVA_Build 15 60371400 1I GTTCTGCTCT -/G ATCTTAGTTA 2549 het 2549 ref 21 12 6 3 G 0 1 233189 CASAVA_Build 15 60384139 2I CTTGTCTGTC --/TT TTTCATTACT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 T 3 5 233190 CASAVA_Build 15 60385899 3I TACACATAGA ---/TCT TCTTAGAATC 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 TCT 1 2 233191 CASAVA_Build 15 60386077 1D CAAAAATCAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 157 het 61 0 53 9 T 9 8 233192 CASAVA_Build 15 60397305 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1454 het 1454 ref 21 10 5 6 A 13 14 233193 CASAVA_Build 15 60397771 2D ATGTATATAT AA/-- GTTATATATA 2146 het 2146 ref 20 14 6 0 A 2 0 233194 CASAVA_Build 15 60407104 2D ATATTTAGGG CC/-- TTGGGTGAGC 1816 het 1816 ref 18 12 5 3 C 2 0 233195 CASAVA_Build 15 60417959 18D CAGTATCCCA TACAGTCTAAATAACCTT/------------------ TACCATTGTC 3070 het 3070 ref 50 29 21 5 TACAGTCTAAATAACCTT 1 0 233196 CASAVA_Build 15 60422396 1D ACCTTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 795 het 795 ref 23 12 3 8 A 17 16 233197 CASAVA_Build 15 60436099 1D CATAATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 535 hom 26 2 21 3 T 12 11 233198 CASAVA_Build 15 60447073 2I AAAAAAAAAA --/GG AAAAAAGGAA 158 het 158 ref 12 4 2 6 G 0 2 233199 CASAVA_Build 15 60450768 1I TGTGTGAAGG -/T TTTCCCCCCA 3070 hom 113 het 44 0 37 7 T 3 4 233200 CASAVA_Build 15 60452967 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 1771 het 51 hom 11 1 8 2 A 14 16 233201 CASAVA_Build 15 60462396 2I AAACTAAAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 38 0 27 11 T 10 12 233202 CASAVA_Build 15 60463763 8D CTGTAATTCC AGCACTTT/-------- AGCACTTTGG 3070 het 21 hom 25 1 21 3 AGCACTTT 2 1 233203 CASAVA_Build 15 60468889 1D TCGTCTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 33 0 30 3 T 10 9 233204 CASAVA_Build 15 60475558 1I ACTTCTGACC -/T CAAGTGATCC 3070 hom 62 het 25 0 19 6 T 0 1 233205 CASAVA_Build 15 60484198 1I GATCTTCCAA -/G GGGGGGCGTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 6 7 233206 CASAVA_Build 15 60514593 1D GATCTTGTTC T/- TTTTTATGGC 3070 het 2378 hom 31 10 13 8 T 6 5 233207 CASAVA_Build 15 60517807 1D CACTTCTCCC T/- TGTGGAAATA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 2 1 233208 CASAVA_Build 15 60525478 1I CTCTGTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 22 2 17 3 T 10 11 233209 CASAVA_Build 15 60532750 1D TGTCAACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 35 2 20 13 T 16 15 233210 CASAVA_Build 15 60534686 1I ATACAGAGGC -/A AGTGAGTCCC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 1 2 233211 CASAVA_Build 15 60536205 4D GCTTGTCACA TAGT/---- TAGTATGTTT 3070 het 3070 ref 43 24 15 6 TAGT 2 1 233212 CASAVA_Build 15 60547176 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 10 9 233213 CASAVA_Build 15 60549459 2I GAGAGAGAGC --/GA GAGAGAGAGA 3040 het 3040 ref 44 20 14 10 GA 5 6 233214 CASAVA_Build 15 60551377 1I CAGCAGGAGG -/A ATGGGGGGCA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 1 2 233215 CASAVA_Build 15 60562223 1D CAAAAGAGTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 12 17 11 A 9 8 233216 CASAVA_Build 15 60565507 1D GAAAAGTTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 A 10 9 233217 CASAVA_Build 15 60575857 4I AAAAGAAATT ----/ACAC ACACGGAACC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 AC 2 4 233218 CASAVA_Build 15 60576022 3I TTCCCGTCTT ---/CTG GGAGCTTATC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 CTG 0 1 233219 CASAVA_Build 15 60578227 1D CTTAGGAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2704 hom 25 7 13 5 T 10 9 233220 CASAVA_Build 15 60582002 1D CTGCAGGCAT G/- GGGGTTTATT 3070 hom 128 het 51 0 40 11 G 5 4 233221 CASAVA_Build 15 60585757 1D CATTATCTAG T/- GGCTGCTGGT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 1 0 233222 CASAVA_Build 15 60588776 1D GTTTGTTTTG T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 T 8 7 233223 CASAVA_Build 15 60595228 1I ACACATCTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 8 9 233224 CASAVA_Build 15 60597536 2D CTAGCAGCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 T 13 11 233225 CASAVA_Build 15 60598289 4D GAGTTTCACC GTGT/---- TGGCCTGGCT 2068 het 2068 ref 21 12 5 5 GT 2 0 233226 CASAVA_Build 15 60601781 1I ACCAAGAAAT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 34 9 16 9 A 7 8 233227 CASAVA_Build 15 60607892 2I GAGGAAGGAG --/AC ACGGAGTAGG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 AC 1 2 233228 CASAVA_Build 15 60616516 1D CATTGTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1137 hom 25 8 10 7 T 13 12 233229 CASAVA_Build 15 60621850 1I ACCTGGCTGA -/T TTTTGTATTT 3070 hom 32 het 12 0 10 2 T 4 5 233230 CASAVA_Build 15 60635426 1D TTTTTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 31 2 12 17 T 17 16 233231 CASAVA_Build 15 60641231 1I GGTCTTCAGA -/T CCCCACCCTG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 0 1 233232 CASAVA_Build 15 60647136 4D GACCAGTGTG ACAA/---- ACATAGCAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 ACAA 1 0 233233 CASAVA_Build 15 60652288 1D ACCCTGGGTC T/- GGAGGCAGGA 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 T 1 0 233234 CASAVA_Build 15 60655755 3D ACCCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 A 13 10 233235 CASAVA_Build 15 60697454 1I CAGGCAATTC -/T TTTTTTTTTT 1438 het 1438 ref 25 9 4 12 T 17 18 233236 CASAVA_Build 15 60704122 4I TTTCCTCTGC ----/TTCT TTGTCAGGTT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 TTCT 0 1 233237 CASAVA_Build 15 60705803 5D TTGAACAAAC AAAAT/----- AAAAACCAAA 3070 het 3070 hom 45 19 25 5 AAAAT 1 0 233238 CASAVA_Build 15 60707335 4I GCAATTTTGG ----/GCTT GCTCGTTTTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 GCTT 0 1 233239 CASAVA_Build 15 60709634 2I TTGGAAAAAC --/TG TGGAAATATG 3070 hom 117 het 49 0 39 10 TG 1 2 233240 CASAVA_Build 15 60712430 5D GTTGAATTTA TTTAT/----- TTTAATTCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 4 TTTAT 1 0 233241 CASAVA_Build 15 60718722 6D TAGGTTATAG ATCTAT/------ ATCTATATCT 3070 hom 66 het 26 0 22 9 ATCTAT 5 4 233242 CASAVA_Build 15 60721157 1D GCCCTTACCT A/- AGCCTTTTCT 3070 hom 57 het 21 0 17 4 A 2 1 233243 CASAVA_Build 15 60722075 4I TCAGTGGATG ----/TAGT TAAATTTCTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TAGT 0 1 233244 CASAVA_Build 15 60725661 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 34 1 25 8 T 11 10 233245 CASAVA_Build 15 60735076 12D17M31D8M65D3M1D ATTCATTGTA GCACATGTCACCGTGGGTTGGCTGGCACTGTCCCCTGCTCCACAGAGGGTGTACTGGGCCATGGGAATGCGTCAGTGGAGAGAACGTGTCACTCCCCGAAGCCTCTGATGCTTTTCCTTCCTCTTGTGTTTCAGGCA/------------GTGCTTTAGCTATAACT-------------------------------TTAGGAAT-----------------------------------------------------------------GGC- TGGGAATTTT 3070 hom 44 het 20 0 15 8 N/A 0 0 233246 CASAVA_Build 15 60736645 1I CTGAAAAGGT -/G GGGGGGGGGA 3070 het 333 hom 35 1 24 10 G 9 10 233247 CASAVA_Build 15 60736776 2D AGTTCTTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1494 het 1494 ref 50 37 4 10 TG 7 6 233248 CASAVA_Build 15 60737677 2I AAAAAAAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 16 6 A 10 12 233249 CASAVA_Build 15 60743721 1D ATTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 10 9 233250 CASAVA_Build 15 60744496 4I TCTCCTTGGT ----/GGTA GGTAGGTATA 3070 hom 123 het 47 0 42 6 GGTA 2 3 233251 CASAVA_Build 15 60745192 10D TTCCCCCACA AACTCAAGAT/---------- AATTCTACTG 3070 hom 84 het 29 0 28 2 AACTCAAGAT 1 0 233252 CASAVA_Build 15 60753057 2D TCTTGTGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 27 0 18 11 T 14 12 233253 CASAVA_Build 15 60758522 1D ATACCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 23 2 16 5 T 17 16 233254 CASAVA_Build 15 60758931 4D CCATAAAAAG GAAT/---- GAAGTACCGA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 GAAT 1 0 233255 CASAVA_Build 15 60773097 1I AGTTTTCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 39 1 32 6 T 10 11 233256 CASAVA_Build 15 60785714 1D TCAAATAAAC T/- ACTTTCAGTA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 1 0 233257 CASAVA_Build 15 60792055 1I GTTAAGAGTT -/A CCTTTATGCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 0 1 233258 CASAVA_Build 15 60805611 1I TCTATACCCC -/A AGGGAGTGCA 3070 hom 90 het 31 0 30 1 A 1 2 233259 CASAVA_Build 15 60809553 3I TGGAGTCTCA ---/TGC TGCTGTTGTC 3070 hom 22 het 16 0 7 12 TGC 1 2 233260 CASAVA_Build 15 60809627 13D TCAAGCAATT CTCCTGCCTCAGC/------------- CTCCTGCCTC 1739 het 1739 ref 14 5 7 2 CTCCTGCCTCAGC 2 1 233261 CASAVA_Build 15 60810901 1D CTGAATTATG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 76 het 31 0 26 5 T 8 7 233262 CASAVA_Build 15 60825646 1I AGCAACAAGG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 6 7 233263 CASAVA_Build 15 60838446 2I TCCATGAATC --/TT TGACTTTGTG 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 1 3 233264 CASAVA_Build 15 60838922 4D ACAAAAGCCC CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 CAAA 6 5 233265 CASAVA_Build 15 60844808 1D CCCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1309 het 1309 ref 37 27 3 7 T 11 10 233266 CASAVA_Build 15 60847459 2I CACTTGACTT --/AG ACAAATTTAC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AG 0 1 233267 CASAVA_Build 15 60856783 1I CGAAACTCTC -/A AAAAAAAAAA 1959 het 1959 ref 23 9 9 5 A 15 16 233268 CASAVA_Build 15 60858627 4D TAAGAAAATT AAAC/---- AAAAACAAAC 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 AAAC 1 0 233269 CASAVA_Build 15 60879199 1I AGCACCTCAT -/A AGCCAGAGAG 3070 het 3070 hom 53 21 18 14 A 1 2 233270 CASAVA_Build 15 60884485 1I GAGTGTATGG -/A AACTGCCAAA 3070 hom 150 het 59 0 48 12 A 2 3 233271 CASAVA_Build 15 60903955 2D AAGTAATATC AT/-- AGCCTAATTG 3070 het 3070 ref 52 25 20 10 AT 1 0 233272 CASAVA_Build 15 60905969 1D TTGCAACAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 A 10 9 233273 CASAVA_Build 15 60906327 5I TCCCTCAAAG -----/TAAGT TAAGTTTTCA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 TAAGT 1 2 233274 CASAVA_Build 15 60907624 5I GGGGAAGGGG -----/GAAAA GAAAAGAACA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 GAAAA 1 2 233275 CASAVA_Build 15 60908416 5D ATATATAATA TATAT/----- TATATTATAT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TATAT 3 2 233276 CASAVA_Build 15 60909820 1I TGGAACTGAT -/G GGGGCACCTG 3070 het 3070 hom 57 24 26 7 G 4 5 233277 CASAVA_Build 15 60910295 1I GCTTGTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 16 8 A 14 15 233278 CASAVA_Build 15 60911699 1D AATCTGACCA C/- CCCCCGGCAA 3070 hom 120 het 45 0 39 6 C 6 5 233279 CASAVA_Build 15 60913426 7D AAAAGTATAG TGTTTTT/------- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 18 5 TGTTTTT 2 1 233280 CASAVA_Build 15 60914047 1D TCCTATGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 14 19 10 A 10 9 233281 CASAVA_Build 15 60915918 8I CAATCAAGTC --------/CTTCTCAG CTTCTCAGAG 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 CTTCTCAG 1 2 233282 CASAVA_Build 15 60916225 4I CCATTTTTAA ----/TGAT TGATTGCATG 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 TGAT 1 2 233283 CASAVA_Build 15 60918291 2I GGGTTATAAC --/AG AGAGACAAAA 3070 het 3070 hom 51 17 30 4 AG 2 3 233284 CASAVA_Build 15 60922360 2D ACACCTAATA AG/-- AGAGTGGTGT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 AG 3 2 233285 CASAVA_Build 15 60925314 1I GTTCCAAGGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 A 8 9 233286 CASAVA_Build 15 60933118 1D GCATGTTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 10 9 233287 CASAVA_Build 15 60933810 8I ATCTGCCTGG --------/TGTCCTCA TTCCCACCTG 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 TGTCCTCA 0 1 233288 CASAVA_Build 15 60944187 1I GTGCAGCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 A 11 12 233289 CASAVA_Build 15 60951172 1D CTTAATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2563 hom 23 9 10 5 T 13 12 233290 CASAVA_Build 15 60952106 1I AATTACATAT -/G ATTTCAAGGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 G 0 1 233291 CASAVA_Build 15 60952274 2I AGTGAAACCC --/TA TATCTCTACT 3070 het 2490 hom 16 6 7 3 TA 1 2 233292 CASAVA_Build 15 60956929 4D TCTGTCCTTC ATGG/---- AGGCGAGGAC 3070 het 3070 ref 42 20 15 8 ATGG 1 0 233293 CASAVA_Build 15 60958473 4D AATGCATGTC TTTT/---- TAATATTCTG 3070 het 3070 ref 48 26 19 6 T 5 1 233294 CASAVA_Build 15 60970191 2D TGTGCTCTGG GT/-- GCTTTCTGCT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 GT 1 0 233295 CASAVA_Build 15 60970357 1D TGGAAGGCAT G/- GGGGGGTGGT 3070 het 3070 ref 43 23 11 9 G 7 6 233296 CASAVA_Build 15 60972480 1I GTTAGAGTAG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 T 8 9 233297 CASAVA_Build 15 61006336 3I TCCAAGATGG ---/AGT ACTACAGTAG 3008 het 3008 ref 24 14 7 3 AGT 0 1 233298 CASAVA_Build 15 61006842 1D CACAAAGTTT A/- AAAAAAAAAC 2756 het 2756 ref 33 24 7 2 A 10 9 233299 CASAVA_Build 15 61007781 1D ACTGGGTTAA T/- TTGCCCCAGG 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 T 3 2 233300 CASAVA_Build 15 61008627 4D CACCATGCAT ACAA/---- ACAAACATAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 ACAA 2 1 233301 CASAVA_Build 15 61009370 1D TTGTGTATGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 19 13 12 T 10 9 233302 CASAVA_Build 15 61011042 5I TTCTAATCCT -----/TATTC TATTTCCTCT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 TATTC 0 1 233303 CASAVA_Build 15 61018525 1I AGATAACGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 A 11 12 233304 CASAVA_Build 15 61023793 5I TGCTAGTCTA -----/GCTAT GCTATGCTAT 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 GCTAT 2 3 233305 CASAVA_Build 15 61024884 1I AACAGCACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 14 22 8 A 9 10 233306 CASAVA_Build 15 61031423 1I GTCAGATGGC -/T TCTGCCCTAG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 2 233307 CASAVA_Build 15 61033599 2D AACAAACGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 41 1 31 9 T 13 11 233308 CASAVA_Build 15 61034420 3D GCCAATCAAA GGG/--- GGGGGGAAGC 3070 hom 51 het 25 0 19 6 G 9 6 233309 CASAVA_Build 15 61034864 1I GGGTGTTGTG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 7 8 233310 CASAVA_Build 15 61035543 4D AGACTGTCTG AAAA/---- AAAAAAAAAA 1830 het 119 hom 21 3 9 11 A 22 18 233311 CASAVA_Build 15 61039916 1D ATTGCTTGAA C/- CTGGGAGATG 3070 het 938 hom 12 3 8 1 C 2 1 233312 CASAVA_Build 15 61045193 3D TGTAAAAAGA AGG/--- AGAAGGAGGA 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 AGG 1 0 233313 CASAVA_Build 15 61067788 2I TTTTTTTTTT --/TG TTGTTGTTGT 3070 het 253 hom 33 3 22 8 TG 0 1 233314 CASAVA_Build 15 61077502 1D CTGGGCAGGT G/- GGGGCAGGGT 3070 het 3070 ref 43 25 13 6 G 5 4 233315 CASAVA_Build 15 61081057 7D TGTGTAACCT TACAACA/------- CAACTTCGAA 3070 hom 105 het 36 0 33 5 TACAACA 1 0 233316 CASAVA_Build 15 61081675 1D TCAAATAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 33 0 23 11 T 14 13 233317 CASAVA_Build 15 61081689 1D TTTTTTTTTT G/- AAACGGAGTT 3070 hom 14 het 29 1 20 8 G 1 0 233318 CASAVA_Build 15 61084907 4D CACTCTCACC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 82 het 40 0 28 12 AAAT 5 4 233319 CASAVA_Build 15 61086245 1I TCAAAGTAGT -/C CCAGCAAAGA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 2 3 233320 CASAVA_Build 15 61099439 3D TTCCTTAATC CTT/--- CTTCTCTACC 3070 het 3070 ref 38 22 15 4 CTT 2 1 233321 CASAVA_Build 15 61100110 1I GGGAAGGCAT -/C ACAGAGGAAC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 C 0 1 233322 CASAVA_Build 15 61102841 2I TTCTTGTTGG --/AA AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 6 8 233323 CASAVA_Build 15 61104175 23D GTTTTGATGC TTAAATGTCCCTGGCTTCACAGT/----------------------- AGACCTGCCC 3070 het 3070 ref 45 29 22 2 TTAAATGTCCCTGGCTTCACAGT 1 0 233324 CASAVA_Build 15 61114016 3I TGGATGGATG ---/ATC GGCTGATGTC 3070 het 3070 ref 55 29 19 7 ATC 0 1 233325 CASAVA_Build 15 61117240 1D CTCCTATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 11 10 233326 CASAVA_Build 15 61120188 1I TATAAGTGAG -/A AAAAAAGGCT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 6 7 233327 CASAVA_Build 15 61122380 3I TAGTCTAACT ---/TTG TAGTCTGGTC 2252 het 2252 ref 14 8 5 1 TTG 0 1 233328 CASAVA_Build 15 61124599 1D TCAAGCTTCC T/- GGAAAGGGGA 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 T 1 0 233329 CASAVA_Build 15 61131386 4I TGAGTAGTTC ----/ATTA ATTGTTAGAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATTA 0 1 233330 CASAVA_Build 15 61131783 3D TCAAAGAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AAG 5 4 233331 CASAVA_Build 15 61134280 1I TAATAGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 25 1 20 4 A 11 12 233332 CASAVA_Build 15 61146147 1D TGAAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 11 10 233333 CASAVA_Build 15 61148248 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 1302 het 381 hom 9 1 4 4 A 8 7 233334 CASAVA_Build 15 61167661 1D CCACTTTATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 A 9 8 233335 CASAVA_Build 15 61176859 1I TTCTCATGCT -/G GGATCTGCAG 3070 hom 60 het 26 0 18 8 G 2 3 233336 CASAVA_Build 15 61179028 1D AATGATCAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 9 11 6 A 10 9 233337 CASAVA_Build 15 61180686 1D TAGGGTTCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 9 8 233338 CASAVA_Build 15 61182192 1I AAAATATACG -/A AAAAAAAAAA 2781 hom 21 het 8 0 8 0 A 10 11 233339 CASAVA_Build 15 61182897 2D GCAAGCCTCT GA/-- GAGACTGCCC 3070 het 3070 hom 31 11 15 6 GA 3 2 233340 CASAVA_Build 15 61183694 1I TCTCTACCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 9 10 233341 CASAVA_Build 15 61183958 1D CTCTCCCCGC T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 63 het 32 0 20 12 T 8 7 233342 CASAVA_Build 15 61184113 2D AAATTTCTAT TC/-- TTTAAGCCAC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TC 1 0 233343 CASAVA_Build 15 61188775 1D TGAGAATCAG T/- TTTTAAAAAA 3070 het 419 hom 29 3 20 6 T 5 4 233344 CASAVA_Build 15 61191770 1D ATTAGGAAAG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 T 8 7 233345 CASAVA_Build 15 61192322 1D AAACAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 36 2 29 5 A 11 10 233346 CASAVA_Build 15 61197347 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 16 0 8 8 T 11 10 233347 CASAVA_Build 15 61203554 2D ACAAACTAAT AA/-- GATTAATGAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 2 0 233348 CASAVA_Build 15 61204214 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 71 het 27 0 23 4 A 9 8 233349 CASAVA_Build 15 61218930 1I AAATATACAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 7 8 233350 CASAVA_Build 15 61224329 2I ACACACACAC --/AT GTAATTTAGA 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 AT 0 1 233351 CASAVA_Build 15 61224593 1D ATATCTGGCC T/- TCTGTGTCTT 3070 het 3070 ref 36 18 9 10 T 2 1 233352 CASAVA_Build 15 61226657 1I ACACAAACTA -/T TTTTTTTTTT 1515 het 1084 hom 30 4 7 19 T 13 14 233353 CASAVA_Build 15 61227611 4D GGCTACAAAT AAAG/---- AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 32 13 12 8 AAAG 1 0 233354 CASAVA_Build 15 61227655 2I CAAGATAAAG --/AT AACATAGAGT 3070 het 3070 hom 37 10 23 4 AT 0 1 233355 CASAVA_Build 15 61231922 1I TAATTTTGCA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 1999 hom 15 6 9 0 T 5 6 233356 CASAVA_Build 15 61233253 6D GAGACAACAC AAAATT/------ AAAATTCAGG 3070 het 3070 hom 33 12 20 2 AAAATT 2 1 233357 CASAVA_Build 15 61250144 1D CATTATGTCT A/- AATGAGAACT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 A 3 2 233358 CASAVA_Build 15 61267321 1D CACGGTTTTT C/- CCCCCCCCCC 1356 het 1356 ref 36 15 5 16 C 11 10 233359 CASAVA_Build 15 61281542 1I AAAGAAAAAA -/G GAAAAAAAAG 3070 het 175 hom 15 1 13 1 G 1 2 233360 CASAVA_Build 15 61287222 1D TTTGCCATGT C/- CTTCTAAGTG 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 C 2 1 233361 CASAVA_Build 15 61293338 1I GTCTCAGGGG -/A AAAAAAAAAA 2468 het 2275 hom 17 9 7 1 A 10 11 233362 CASAVA_Build 15 61299703 1I ACAGACCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 11 12 233363 CASAVA_Build 15 61302373 3I TTATTTTTTG ---/TTT TTATTTTTTG 3070 het 2528 hom 15 7 7 1 T 2 5 233364 CASAVA_Build 15 61306685 8D GTTTTTCGTG TTAGTAAC/-------- TTAGGGTTAC 3070 het 3070 ref 52 26 23 6 TTAGTAAC 1 0 233365 CASAVA_Build 15 61309311 1I AAAATGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 10 11 233366 CASAVA_Build 15 61310751 2D GCGTGTTTTT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 37 1 31 5 TG 1 0 233367 CASAVA_Build 15 61314405 1D ATAAAATGTA C/- CCCTAGAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 C 4 3 233368 CASAVA_Build 15 61331842 1I GGTAGAGCTA -/G GGGCAGTTAT 3070 het 3070 ref 46 28 14 4 G 3 4 233369 CASAVA_Build 15 61342656 17D ATACTCTAGT GAATACACATTTCACTA/----------------- GAATACACAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 8 GAATACACATTTCACTA 1 0 233370 CASAVA_Build 15 61358333 1I CTCAAGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 13 10 T 13 14 233371 CASAVA_Build 15 61360787 2D TCTAATTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2202 hom 30 11 9 11 A 17 15 233372 CASAVA_Build 15 61362650 2I CCCAGCTAAC --/TG TTGTATTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 TG 0 1 233373 CASAVA_Build 15 61363835 1D CCACAAACAC G/- GGGGGTGATG 3070 hom 114 het 46 0 38 8 G 6 5 233374 CASAVA_Build 15 61369260 1D GTTTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 11 13 A 12 11 233375 CASAVA_Build 15 61371825 2D ATTTTTTGTG GA/-- GATGGGGGTC 3070 het 3070 hom 24 10 14 1 GA 2 1 233376 CASAVA_Build 15 61373362 1I TTCACAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 11 12 233377 CASAVA_Build 15 61378697 1D TGCTCTGTCA C/- CCAGGCTGGA 3070 het 847 hom 16 3 11 2 C 3 2 233378 CASAVA_Build 15 61379754 1D TTTCTGACAC A/- AAAACTTTAA 3070 het 3070 hom 26 9 16 2 A 5 4 233379 CASAVA_Build 15 61382598 2D TCAACAGAGT CA/-- CACAACGTTT 3070 het 3070 ref 46 26 17 5 CA 3 2 233380 CASAVA_Build 15 61394949 1D CCTGGCTAAT A/- ACGGTGAAAG 2379 het 2079 hom 14 6 6 2 A 2 1 233381 CASAVA_Build 15 61415975 1D AACCAAGGCC T/- GAAGAAGGGA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 1 0 233382 CASAVA_Build 15 61418519 1I TCCTTAACCT -/C CCACAGAGAC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 2 3 233383 CASAVA_Build 15 61435769 1D ACCATATAAT A/- CCAGCAATTC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 1 0 233384 CASAVA_Build 15 61435845 1I GCGTGATCTC -/A GCTCACTGCA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 A 0 1 233385 CASAVA_Build 15 61436910 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 9 233386 CASAVA_Build 15 61446316 1I TGAGACTACC -/G GCACATGCCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 1 2 233387 CASAVA_Build 15 61448204 8D GAACCAGAGA ATTTGCCT/-------- ATTTGCCTGC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 ATTTGCCT 2 1 233388 CASAVA_Build 15 61451090 1I CACACTAGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 8 9 233389 CASAVA_Build 15 61461542 4D TTTTCGTTCC TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2672 hom 32 9 16 7 TTTG 4 3 233390 CASAVA_Build 15 61462895 2D TCCTTCATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 14 12 233391 CASAVA_Build 15 61463046 5D AGATGAACTG AGAAT/----- AGGAGAACAG 3070 het 3070 ref 38 23 13 4 AGAAT 1 0 233392 CASAVA_Build 15 61466300 15D CCTTCTTTTC TTTTCTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1620 hom 23 8 15 3 TTTTCTTTTTTTTTT 1 0 233393 CASAVA_Build 15 61467801 1I GTTAGACTGT -/A AATAGCTTAA 3070 het 3070 hom 57 26 25 6 A 2 3 233394 CASAVA_Build 15 61470736 1D CTTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 29 0 24 6 A 10 9 233395 CASAVA_Build 15 61471488 2D CTCTCTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1457 hom 44 12 17 15 T 14 12 233396 CASAVA_Build 15 61476269 1I CCTTACAACC -/T TGCCAGAGTT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 1 2 233397 CASAVA_Build 15 61485903 1D GTTTGTTGTC T/- GGGGAGGGTC 3070 hom 69 het 27 0 19 8 T 1 0 233398 CASAVA_Build 15 61487160 1D TGGTGGATCG T/- TTTTTCCTTC 3070 hom 89 het 37 0 28 10 T 6 5 233399 CASAVA_Build 15 61489526 3I GTTCAAGTGA ---/TTC TTCTGCCTCA 3070 hom 27 het 11 0 9 2 TTC 1 2 233400 CASAVA_Build 15 61526532 3I CATAATGTGC ---/TCA TTATTATACA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TCA 0 1 233401 CASAVA_Build 15 61532873 1D CTCTTGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 51 1 34 17 T 12 11 233402 CASAVA_Build 15 61534905 4D GAAGTGTTGG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 9 7 233403 CASAVA_Build 15 61538760 2I CAGCTGGGCT --/TC TGAGTCTAGT 3070 hom 58 het 22 0 20 2 TC 0 1 233404 CASAVA_Build 15 61541077 1D TTCTAGTCAT A/- AAAAAACATG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 7 6 233405 CASAVA_Build 15 61546447 1I CTCTCCTTAC -/T CCAGCACCCA 3070 hom 93 het 35 0 28 7 T 0 1 233406 CASAVA_Build 15 61562700 3D ACTATGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 17 0 12 5 A 17 14 233407 CASAVA_Build 15 61563686 9D GTGGTGGTGC ATGCCTGTA/--------- ATCCCAGCTA 3070 hom 63 het 23 0 21 4 ATGCCTGTA 1 0 233408 CASAVA_Build 15 61579477 1I TATCATATAA -/T TTATTGCTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 3 233409 CASAVA_Build 15 61579812 1I8M1D AATACTTCTG -TAACAGTTA/TTAACAGTT- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 29 0 22 10 N/A 0 0 233410 CASAVA_Build 15 61581414 5D ACTCACCCGT TCATG/----- TCATGTATTC 3070 hom 108 het 41 0 34 8 TCATG 2 1 233411 CASAVA_Build 15 61581684 1D GGAGACACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 26 0 21 6 T 11 10 233412 CASAVA_Build 15 61601928 1I TTGCTAAAAC -/A AAAGTTAGAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 3 4 233413 CASAVA_Build 15 61610615 1I ACAAAACTGG -/T TTAATATCCT 3070 hom 166 het 57 0 56 1 T 2 3 233414 CASAVA_Build 15 61612377 1I CATGGCAATC -/T TTTTTTCACC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 6 7 233415 CASAVA_Build 15 61650933 2D GGTATATGTC TT/-- TATGATTTTA 3070 hom 98 het 37 0 33 5 T 3 1 233416 CASAVA_Build 15 61657181 2D ACCCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 28 3 14 12 A 18 16 233417 CASAVA_Build 15 61665053 1I GTGTCTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1906 hom 28 5 15 8 T 16 17 233418 CASAVA_Build 15 61685981 2I GGAAATAACA --/CT GTTTCTGGCA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 CT 0 1 233419 CASAVA_Build 15 61695503 4I AGGAGCCTGC ----/TCTA TCTATTAGAA 3070 hom 83 het 30 0 26 4 TCTA 1 2 233420 CASAVA_Build 15 61700864 4I TCCATTCTCC ----/CAGT CACTTTCAGG 2855 het 317 hom 10 1 7 2 CAGT 0 1 233421 CASAVA_Build 15 61719238 1I ATGGAGGCCT -/G GCCATCAGAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 2 233422 CASAVA_Build 15 61728960 1I CAGCTAGACG -/T TAAGTGCAGT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 1 2 233423 CASAVA_Build 15 61734781 1D TTATCTATGG T/- TAACTCAAAT 3070 hom 96 het 34 0 32 4 T 2 1 233424 CASAVA_Build 15 61738489 1I CATGAAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 10 233425 CASAVA_Build 15 61742095 1D GTAACCTCAT A/- ACTTTAAATC 3070 hom 96 het 33 0 32 1 A 2 1 233426 CASAVA_Build 15 61752881 1I AGATAAAACA -/G GAGCTTTTCT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 1 2 233427 CASAVA_Build 15 61774278 1I CTATATTTCA -/G TATATAAAGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 0 1 233428 CASAVA_Build 15 61790567 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 8 7 233429 CASAVA_Build 15 61800290 1D TTATATCTAG T/- TTTTTTTTTA 1312 het 1312 ref 37 32 3 2 T 10 9 233430 CASAVA_Build 15 61806812 1I TAGGATAGAT -/A AGACTCCAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 233431 CASAVA_Build 15 61815865 1D TCACACTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 37 1 26 10 T 13 12 233432 CASAVA_Build 15 61818234 1D AGTCAGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 340 hom 41 2 27 12 T 12 11 233433 CASAVA_Build 15 61823239 9I AACTGTATCT ---------/GCTTTAGTA ACGTTGTGGT 3070 hom 42 het 19 0 14 5 GCTTTAGTA 0 1 233434 CASAVA_Build 15 61839363 1D CTGGGGGCAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 33 0 22 12 A 9 8 233435 CASAVA_Build 15 61840839 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 30 2 15 13 A 17 16 233436 CASAVA_Build 15 61845503 2D CTAATTTATT TA/-- TGTTATATTA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 1 0 233437 CASAVA_Build 15 61863317 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 760 hom 34 4 22 8 A 15 16 233438 CASAVA_Build 15 61863858 1D ATCATGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 13 12 233439 CASAVA_Build 15 61881409 2D CAGGTCTCCC CA/-- CTCCTGCCAC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 CA 1 0 233440 CASAVA_Build 15 61885200 1D ATCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 23 1 13 9 A 13 12 233441 CASAVA_Build 15 61887377 1I TCTAGTTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1267 hom 29 4 17 8 A 13 14 233442 CASAVA_Build 15 61889042 2D TTAGAATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 19 8 A 16 14 233443 CASAVA_Build 15 61895349 1I CAAACCATAT -/C ACCTAACATT 3070 hom 89 het 38 0 30 8 C 0 1 233444 CASAVA_Build 15 61903786 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 16 17 233445 CASAVA_Build 15 61908716 2D GTGTGTGCAC AT/-- ATATGTTTAT 100 hom 3 het 6 0 1 5 AT 3 2 233446 CASAVA_Build 15 61908778 2I ATAAATAATA --/TG TGTGTGCACA 83 het 3 hom 5 0 1 4 TG 3 4 233447 CASAVA_Build 15 61914677 3D CATACTCAAA AAC/--- AACAAGCAAA 3070 hom 118 het 44 0 39 5 AAC 2 1 233448 CASAVA_Build 15 61919932 17D TTAAAGGTTG AGTGGTTAAATTTGGAT/----------------- AGTGGGAATA 3070 hom 108 het 36 0 33 8 AGTGGTTAAATTTGGAT 1 0 233449 CASAVA_Build 15 61930357 1D CAGAATAACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 95 het 45 0 39 6 T 10 9 233450 CASAVA_Build 15 61934380 3D CTAACCTGCC TTT/--- TATAAGGACC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 4 1 233451 CASAVA_Build 15 61944842 1D TGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 8 233452 CASAVA_Build 15 61954151 2I GGGTCATAGC --/AT GACTGGCTGT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 AT 0 1 233453 CASAVA_Build 15 61955049 2D TCTACTAGGG TT/-- TTTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 8 6 233454 CASAVA_Build 15 61961758 12D TCCTTCCTTT CTTCCTTCCTCC/------------ CTTCCTTCCT 3070 het 665 hom 23 3 11 11 CTTCCTTCCTCC 2 1 233455 CASAVA_Build 15 61968620 2I GAGGAACATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 29 0 21 8 A 13 15 233456 CASAVA_Build 15 61974433 2D CAGCTCTGAT AA/-- AGTCTCACGA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 3 1 233457 CASAVA_Build 15 62006996 1D TGGGATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 811 hom 41 3 22 18 T 15 14 233458 CASAVA_Build 15 62011803 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTAG 3070 hom 60 het 23 0 19 5 A 1 0 233459 CASAVA_Build 15 62020919 1I TCCTTTTGCA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 233460 CASAVA_Build 15 62022963 1I CGACTCTACT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 8 9 233461 CASAVA_Build 15 62024302 1I ATCTTTTTCT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 7 8 233462 CASAVA_Build 15 62026323 1D CCCCACCTCC T/- ACTCCCTGCC 3070 hom 89 het 36 0 29 7 T 1 0 233463 CASAVA_Build 15 62026585 7I CACTATACTA -------/AAACCCC AAACCCCATA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AAACCCC 1 2 233464 CASAVA_Build 15 62031897 1I CCATGATCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 421 hom 40 1 26 14 T 9 10 233465 CASAVA_Build 15 62056361 1I AAAAAGAGAA -/G GGGGAAGGGG 3070 hom 107 het 53 0 34 19 G 4 5 233466 CASAVA_Build 15 62056774 3D GAGTGAAAAA AAT/--- AATGCTTTCA 3070 hom 108 het 43 0 36 10 AAT 2 1 233467 CASAVA_Build 15 62060051 2I ACCTTTAAGA --/CG CGTGATTGGG 3070 hom 48 het 21 0 15 6 CG 1 2 233468 CASAVA_Build 15 62060342 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 13 10 A 16 14 233469 CASAVA_Build 15 62064454 1D GGGCAGAGAA G/- GCTTTGTGGA 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 G 2 1 233470 CASAVA_Build 15 62066108 10I GCAGCCAGGG ----------/CTGAGAACCA CTGACTTACA 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 CTGAGAACCA 0 1 233471 CASAVA_Build 15 62067760 1D CAGCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1179 het 1179 ref 33 15 5 13 T 15 14 233472 CASAVA_Build 15 62069502 1I CCAACAGGAC -/A AAAACCCCAT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 4 5 233473 CASAVA_Build 15 62069679 11I GACTCCATCT -----------/AGAAAAAAAAA AGAAAAAGAA 3070 hom 67 het 27 0 23 5 AGAAAAAAAAA 0 1 233474 CASAVA_Build 15 62072703 1I TCTTGCCCAA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 T 7 8 233475 CASAVA_Build 15 62087461 2I ATAAATTATA --/TC TCTGTTTTTT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TC 1 2 233476 CASAVA_Build 15 62113463 1I GGCTATTGAA -/C CCAGCCTGGG 3070 hom 41 het 31 0 23 8 C 2 3 233477 CASAVA_Build 15 62113912 4D CTGTTTGTTC GTTT/---- GTTTGTTTAA 3070 hom 109 het 42 0 35 8 GTTT 3 2 233478 CASAVA_Build 15 62114420 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 964 het 964 ref 16 9 4 3 A 13 14 233479 CASAVA_Build 15 62133820 8D ACTCCGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 19 11 233480 CASAVA_Build 15 62145555 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 16 4 A 12 11 233481 CASAVA_Build 15 62147209 1I GCCCTGCTAA -/T TTTTTTGATT 3070 hom 72 het 31 0 23 8 T 6 7 233482 CASAVA_Build 15 62168705 5I AGGCAGAGGT -----/TGCGG TGAGAGCGGA 3070 hom 64 het 27 0 24 3 TGCGG 0 1 233483 CASAVA_Build 15 62170416 1D CTTTAATTTG C/- TCCTGGGCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 1 0 233484 CASAVA_Build 15 62176389 4I GGTCTGTGGC ----/TAAT TAAAGGCCGA 3070 hom 78 het 29 0 24 5 TAAT 0 1 233485 CASAVA_Build 15 62181634 1D AAACATTTAT C/- TTTTTGTTGA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 C 1 0 233486 CASAVA_Build 15 62184471 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3010 het 11 hom 19 1 13 5 A 15 16 233487 CASAVA_Build 15 62186998 1I TGCGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 32 2 26 4 A 12 13 233488 CASAVA_Build 15 62192012 1D AGTCAAAACC A/- AAAAAAAAAA 2044 het 2044 ref 42 31 6 6 A 13 12 233489 CASAVA_Build 15 62193078 4D ATCTCAAAAT AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAAG 4 3 233490 CASAVA_Build 15 62215174 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 36 0 32 4 A 11 10 233491 CASAVA_Build 15 62217578 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1181 hom 36 5 15 16 T 16 17 233492 CASAVA_Build 15 62232735 1D GGTGGAGGGG C/- TTTTTTTTGG 3070 hom 35 het 16 0 10 6 C 1 0 233493 CASAVA_Build 15 62234763 8D TGTCTCTACC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 2652 het 118 hom 27 3 13 12 A 24 16 233494 CASAVA_Build 15 62268003 1I AGGGAGGGGG -/A AAAAAACACA 3070 hom 85 het 36 0 28 8 A 6 7 233495 CASAVA_Build 15 62273770 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2094 het 1105 hom 18 5 5 8 T 17 16 233496 CASAVA_Build 15 62315249 1D ACAAAATTAG C/- CTGGGTGTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 2 1 233497 CASAVA_Build 15 62333606 1D GCCATTGAAC T/- TTTTTTTTTT 1428 het 1158 hom 26 8 4 14 T 17 16 233498 CASAVA_Build 15 62344915 1I CAATAGCTTT -/A AAAAAAAAAA 2094 het 2094 ref 27 12 5 10 A 15 16 233499 CASAVA_Build 15 62365726 1D TCCTTTAATC A/- AAAAACACTT 1276 het 1276 ref 26 19 3 4 A 6 5 233500 CASAVA_Build 15 62380621 1D AAAATAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 469 hom 31 4 18 9 A 16 15 233501 CASAVA_Build 15 62387694 4I TTCATTATTA ----/AAGT AAGGGAGCCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAGT 0 1 233502 CASAVA_Build 15 62389207 1I ACAAACAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 11 12 233503 CASAVA_Build 15 62389805 1D GTGTCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 22 0 14 9 A 15 14 233504 CASAVA_Build 15 62393123 1I GGTATATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1139 hom 27 3 16 8 A 12 13 233505 CASAVA_Build 15 62415508 2D CTAGATTCGA TC/-- TCTCTCATTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TC 4 3 233506 CASAVA_Build 15 62438463 2I AAGAAAATCA --/AT AGTTATGATT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AT 0 1 233507 CASAVA_Build 15 62440558 1D TTGAAGATTC T/- AAGTACAGTA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 1 0 233508 CASAVA_Build 15 62443372 10I TAAGTACTTG ----------/GGATTTTAGA AACTCAGCTC 3070 hom 63 het 25 0 22 5 GGATTTTAGA 0 1 233509 CASAVA_Build 15 62447153 1D CAAAAACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 11 10 233510 CASAVA_Build 15 62459207 1I AAACAAAAAC -/A AAAAACATTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 5 6 233511 CASAVA_Build 15 62474358 1I TCGGCCTCTC -/A AAAGTGCTGG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 3 4 233512 CASAVA_Build 15 62475165 2D GCTAATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2070 hom 18 het 18 0 7 11 T 14 12 233513 CASAVA_Build 15 62478192 12D TCTTTTTTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2302 hom 5 het 21 1 8 12 T 28 16 233514 CASAVA_Build 15 62480208 4D GGGGGTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 2870 het 1174 hom 40 5 14 21 TTTG 1 0 233515 CASAVA_Build 15 62486256 1D TCTGTTTAGG A/- GATAGATTTA 3070 het 3070 ref 41 28 13 3 A 1 0 233516 CASAVA_Build 15 62487792 1D ATTACAGGTG T/- TGAGCCACTG 3070 hom 30 het 12 0 11 2 T 2 1 233517 CASAVA_Build 15 62491205 1I AGTGCTGGGA -/T TACAGGCGTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 1 2 233518 CASAVA_Build 15 62491810 1D AAGCCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 28 2 21 5 A 15 14 233519 CASAVA_Build 15 62491898 5I CTAACAAACA -----/TATAT TATATTGAAT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TATAT 1 2 233520 CASAVA_Build 15 62496720 1I TTAATTTTTT -/A AAAAAAGATA 3070 hom 47 het 19 0 14 5 A 6 7 233521 CASAVA_Build 15 62499782 1I TTCTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 22 3 13 6 T 12 13 233522 CASAVA_Build 15 62511689 4I AGCTTGGTGA ----/AACC CCATCTCTAC 3070 hom 90 het 31 0 30 1 AACC 0 1 233523 CASAVA_Build 15 62513170 1D TTGTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 11 10 233524 CASAVA_Build 15 62514610 1I CATCTCTGCT -/A AAAAAAAATA 2191 het 2191 ref 14 7 5 2 A 8 9 233525 CASAVA_Build 15 62514778 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 23 2 14 7 A 17 16 233526 CASAVA_Build 15 62516516 1I ACTAAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 35 1 30 4 A 10 11 233527 CASAVA_Build 15 62519712 1I TGTGGTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 30 2 20 8 T 13 14 233528 CASAVA_Build 15 62521451 1D GATCTGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 27 8 A 14 13 233529 CASAVA_Build 15 62523260 2I AATAAAGAAG --/TT TTTAACTATT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 3 5 233530 CASAVA_Build 15 62528465 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 12 11 233531 CASAVA_Build 15 62531206 1D TGCCCGGCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 602 hom 12 2 9 1 A 15 14 233532 CASAVA_Build 15 62534874 1D CACTGGCAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 T 10 9 233533 CASAVA_Build 15 62535214 4I TAGTGAAACA ----/CTGT CTGAGGCTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTGT 0 1 233534 CASAVA_Build 15 62543940 1I TGTGACAGAC -/A AAAATGAAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 4 5 233535 CASAVA_Build 15 62555543 1I AAAATAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 28 2 17 9 A 12 13 233536 CASAVA_Build 15 62574356 1D TGCTTACTAG A/- AAAAAATCCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 7 6 233537 CASAVA_Build 15 62577153 1D GCTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 254 hom 20 1 12 7 A 12 11 233538 CASAVA_Build 15 62584583 1D TGCAGGTAAG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 8 7 233539 CASAVA_Build 15 62588122 1I AATTTTTAAA -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 8 233540 CASAVA_Build 15 62615976 1D TAAAATTCCA C/- CCCCCCCCCC 1887 het 155 hom 16 1 10 5 C 11 10 233541 CASAVA_Build 15 62619055 21D TACCTGCCTA ATTTTTGTATTTTTAGTAGTG/--------------------- ACAGGGTTTC 3070 het 3070 ref 19 9 9 2 ATTTTTGTATTTTTAGTAGTG 1 0 233542 CASAVA_Build 15 62633910 1I ACCTTGCCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 A 9 10 233543 CASAVA_Build 15 62635409 1D ACCTGGCCAA T/- TTTTTTTTTT 2758 het 112 hom 18 1 9 9 T 13 12 233544 CASAVA_Build 15 62637534 13D ACCCCTACCC CCACCTCCTACCT/------------- GGGTTCCAAT 3070 het 3070 ref 39 25 11 7 CCACCTCCTACCT 1 0 233545 CASAVA_Build 15 62639619 1D TTTTAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 11 10 233546 CASAVA_Build 15 62642591 1D AGTCCCAGCT C/- CCTCGGGAGG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 C 3 2 233547 CASAVA_Build 15 62658964 1I AAACAAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 35 4 23 8 C 0 1 233548 CASAVA_Build 15 62666639 4D CACAGTACCT ATTA/---- ATTAGTAGTA 3070 hom 99 het 40 0 34 9 ATTA 2 1 233549 CASAVA_Build 15 62667514 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1075 het 271 hom 6 1 4 1 A 12 11 233550 CASAVA_Build 15 62669928 2I ATATACATGC --/AT ATATATATAT 3070 het 746 hom 29 3 24 2 AT 6 7 233551 CASAVA_Build 15 62701020 2D TGCTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 T 16 14 233552 CASAVA_Build 15 62715134 2I CTGACTACTC --/TA TGAAACAAGG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 TA 0 1 233553 CASAVA_Build 15 62726389 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2614 het 2614 ref 29 12 8 9 A 13 14 233554 CASAVA_Build 15 62739088 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2655 het 1154 hom 21 6 8 7 T 17 16 233555 CASAVA_Build 15 62746965 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1276 hom 24 4 10 10 A 10 11 233556 CASAVA_Build 15 62765606 4D TCTTGGGAAA AAGT/---- AAGGGACTGA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 AAGT 1 0 233557 CASAVA_Build 15 62776486 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2976 het 30 hom 23 1 10 12 A 19 18 233558 CASAVA_Build 15 62790010 1D CAGGCTGGTC T/- TGAATTCCTG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 2 1 233559 CASAVA_Build 15 62805377 3I CCCATCTTCC ---/CCA CCAACACTCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 CCA 1 2 233560 CASAVA_Build 15 62813723 3I CAGGTGGATC ---/ACT TGAGGTCAGG 3070 hom 104 het 37 0 31 6 ACT 0 1 233561 CASAVA_Build 15 62821322 1D AGGCTGAGGC A/- AGGAGAATCG 3070 hom 36 het 13 0 13 1 A 2 1 233562 CASAVA_Build 15 62822898 1I GCCCAGGGGG -/A GGGGGGGCTC 3070 hom 33 het 17 0 11 6 A 0 1 233563 CASAVA_Build 15 62823811 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1101 hom 10 het 7 0 4 3 A 15 16 233564 CASAVA_Build 15 62827255 1D TCAGATGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 26 1 16 9 A 12 11 233565 CASAVA_Build 15 62841616 1I9M1I GGGGATGGGT -GCTGGAGCA-/GGCTGGAGCAG GGCCCAGCCA 3070 hom 81 het 28 0 23 9 N/A 0 0 233566 CASAVA_Build 15 62853888 4D TCTTCCAAAC TAAT/---- TAAATTGTGG 3070 hom 60 het 21 0 19 4 TAAT 1 0 233567 CASAVA_Build 15 62861980 1I TCCTTCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 37 1 29 7 A 12 13 233568 CASAVA_Build 15 62862792 1I CTCTATAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 412 hom 23 1 16 7 A 9 10 233569 CASAVA_Build 15 62866415 5I ACCCTGGTTG -----/AGCCC AGCCCTCTTC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 AGCCC 1 2 233570 CASAVA_Build 15 62867439 3D AAGATAAACA TTT/--- TTTTTTTTAT 3070 hom 52 het 22 0 18 5 T 11 8 233571 CASAVA_Build 15 62873556 1I ATTAAAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 8 9 233572 CASAVA_Build 15 62873802 1D TGTCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 491 hom 29 2 18 9 T 13 12 233573 CASAVA_Build 15 62884264 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 467 hom 15 3 10 2 T 14 13 233574 CASAVA_Build 15 62884738 1I CCACGCCCGG -/C TAATTTTTGT 1994 hom 15 het 6 0 6 0 C 0 1 233575 CASAVA_Build 15 62900023 2I TCCCAGCACT --/CA CAGAGCAACC 3070 hom 102 het 39 0 33 6 CA 1 2 233576 CASAVA_Build 15 62902506 1D TCGCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 15 9 T 12 11 233577 CASAVA_Build 15 62904069 2I CCCTCTAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 15 5 A 10 12 233578 CASAVA_Build 15 62908953 1D TTGTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 12 11 233579 CASAVA_Build 15 62919384 4D TTTTTCTTTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 2755 het 94 hom 16 2 11 3 CTTT 3 2 233580 CASAVA_Build 15 62928326 5D CGCCTGGTTC AAGCA/----- AAGCAATTCC 3070 hom 42 het 17 0 15 4 AAGCA 2 1 233581 CASAVA_Build 15 62936201 1I CGCCTTTTTT -/C CCCCTCTAAT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 C 4 5 233582 CASAVA_Build 15 62944139 1I CATATACCAT -/C CCCCCCCACC 2431 het 2431 ref 30 9 12 9 C 7 8 233583 CASAVA_Build 15 62947585 1I CAGGAGCCCG -/T TTTTTTTTTG 2367 hom 13 het 12 0 9 3 T 9 10 233584 CASAVA_Build 15 62948109 2I GGGTGGATCA --/CC TGAGGTCAGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 0 2 233585 CASAVA_Build 15 62951515 2D TCGGGAGTCA CT/-- GTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 CT 1 0 233586 CASAVA_Build 15 62952809 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 9 8 233587 CASAVA_Build 15 62957678 4D GAGCCTTTTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 16 het 38 1 20 17 CTTT 5 4 233588 CASAVA_Build 15 62962363 1D AAAAAAAAAA C/- GAAAATGCCC 1242 het 414 hom 17 4 7 7 C 1 0 233589 CASAVA_Build 15 62966184 4D TTCTCTTCTC TCTT/---- TCAGCCACTT 1706 het 1706 ref 12 7 5 1 TCTT 1 0 233590 CASAVA_Build 15 62966858 1D GCCTGGCCAG A/- AAATAACTAT 3070 het 3070 hom 44 21 20 4 A 4 3 233591 CASAVA_Build 15 62968446 1D CCTGCCAGGT G/- GCCTGGGGTT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 G 2 1 233592 CASAVA_Build 15 62988185 1D AGGTTATGGG T/- TTAGGGTACT 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 T 3 2 233593 CASAVA_Build 15 62993246 1D TTCTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 293 hom 32 4 12 16 T 13 12 233594 CASAVA_Build 15 62994065 2I CAGAGACTAA --/CC TGCAGTCTGA 2918 het 2918 ref 30 15 8 7 C 0 2 233595 CASAVA_Build 15 63007799 1I AGTGTTTTCA -/T TTTTCAGTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 4 5 233596 CASAVA_Build 15 63022915 1D CCCCCTCCCT C/- CCTCCTTCTC 3070 hom 105 het 39 0 33 6 C 3 2 233597 CASAVA_Build 15 63030687 6D9M3D8M3D25M3D TTCTTCTTCC TCTTTTTTTTTTCTTTTCTTCCTCTTTTCTTCTTTTTTTTCTTTCTTCTTCCCTTTC/------TTTTTTCTT---TTCCTCTT---TTCTTTTTTTTCTTTCTTCTTCCCT--- TTCTTTTCTT 3070 hom 33 het 12 0 12 10 N/A 0 0 233598 CASAVA_Build 15 63030940 5I TCCTTATTCT -----/TCTTC TCTTCTTTTC 113 hom 8 het 13 0 2 11 TCTTC 1 2 233599 CASAVA_Build 15 63031065 3D TTCTTTCCTT TTC/--- TTCTTTCCTC 1969 hom 12 het 7 0 5 2 TTC 2 1 233600 CASAVA_Build 15 63031220 1D50M1D TTTCTTCTTT CCTTCTTTCTTTTTCTTTTCTCTTCGTCCTCTTGTTCTTTCCTCTTCTTCCT/-CTTCTTTCCTTTTCTTTTCTCTTCGTCCTCTTGTTCTTTCCTCTTCTTCC- TTCTTCTCTT 891 het 145 hom 11 2 2 19 N/A 0 0 233601 CASAVA_Build 15 63032111 3I CTTTCCTCTT ---/CTC CTCCTCCTCC 3070 hom 56 het 33 0 21 12 CTC 3 4 233602 CASAVA_Build 15 63032263 3D CTCCTTCCTT CTC/--- TTCTTCTCCT 1938 hom 48 het 29 0 15 15 CTC 1 0 233603 CASAVA_Build 15 63032575 3I CTTTCTTCTC ---/CTT CTTTCTTGTT 2182 hom 24 het 17 0 9 8 CTT 1 2 233604 CASAVA_Build 15 63032841 3I CTTCCTTCTC ---/CTT CTTCTTTAGT 19 hom 4 het 20 0 1 20 CTT 2 3 233605 CASAVA_Build 15 63033035 1I TCTTCTTCTT -/C CTTCTTTCTC 3070 hom 50 het 23 0 14 9 C 1 2 233606 CASAVA_Build 15 63033144 6I CTTCTCCTTG ------/TTCTTC TTCTTCTCCT 3070 hom 44 het 20 0 14 6 TTC 2 4 233607 CASAVA_Build 15 63033375 3D CTTCTATTGT TTC/--- TTTTTTCTTC 3070 hom 58 het 22 0 20 2 TTC 1 0 233608 CASAVA_Build 15 63034015 13D CTTCTTCCTT TTCTTCTTCTTCC/------------- TTCTTCTTCT 2567 het 26 hom 28 1 15 14 TTCTTCTTCTTCC 1 0 233609 CASAVA_Build 15 63034055 3D TCTTCTTGTC TCT/--- TCTTCTTCTC 954 hom 4 het 14 0 3 11 TCT 4 3 233610 CASAVA_Build 15 63034132 4D7M3D TTCCTTCTCC TTCTTTCTTCTTTC/----TTCTTCT--- TTTTTGTTCT 3070 hom 39 het 14 0 14 2 N/A 0 0 233611 CASAVA_Build 15 63034437 5D CTTCTTCTTC TTTCT/----- TTCTTTCTTC 1222 het 129 hom 17 1 7 10 TTTCT 1 0 233612 CASAVA_Build 15 63036855 3D CCAAAATTCT ATC/--- ATCTTTAAAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ATC 2 1 233613 CASAVA_Build 15 63041054 1I ATAAATGCAG -/A AGGAATGATA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 1 2 233614 CASAVA_Build 15 63048057 4D2M7D TGCACTTAAA AATGGTTAAAATG/----GT------- GCATATTTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 5 N/A 0 0 233615 CASAVA_Build 15 63052271 1D AACTAAAAAA T/- ATCAGAGTGC 3070 hom 48 het 19 0 17 3 T 1 0 233616 CASAVA_Build 15 63053385 3D CTGTTTACAC ATA/--- ATAATAAGTG 3070 hom 66 het 26 0 23 5 ATA 3 2 233617 CASAVA_Build 15 63070199 4I TACTTACCTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 TTTC 3 4 233618 CASAVA_Build 15 63085770 1D TTATAAGATC T/- TTTTTTTTTT 751 het 751 ref 31 14 2 15 T 17 16 233619 CASAVA_Build 15 63089094 1D TCCAGGCTGG A/- AGTGCAGTGG 3070 hom 48 het 19 0 15 4 A 2 1 233620 CASAVA_Build 15 63089763 1I GAAAAAACGC -/A CATCCATTAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 0 1 233621 CASAVA_Build 15 63096483 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1132 hom 29 4 17 8 A 15 14 233622 CASAVA_Build 15 63102265 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 7 8 233623 CASAVA_Build 15 63103903 1D AAGCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 11 10 233624 CASAVA_Build 15 63104421 4I TAGGCCTGGC ----/CTAA CTTTTATTGA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 CTAA 0 1 233625 CASAVA_Build 15 63111708 1D AGCAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 23 0 18 5 T 13 12 233626 CASAVA_Build 15 63117373 1I CCACTATTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 41 het 30 0 20 10 T 9 10 233627 CASAVA_Build 15 63125488 1D GTCAGGAGTT C/- CGAGACCAGC 3012 hom 18 het 8 0 7 1 C 2 1 233628 CASAVA_Build 15 63127577 11D GTCTCAAAAG AAAAAAAAAGA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 26 7 AAAAAAAAAGA 1 0 233629 CASAVA_Build 15 63142600 2D TCTGAATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 12 10 233630 CASAVA_Build 15 63143114 1D TCTGGAAGAA G/- GGATTCTGCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 3 2 233631 CASAVA_Build 15 63170679 1D TAATGTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 T 12 11 233632 CASAVA_Build 15 63171782 4I GATCACAGAT ----/AGTC AGAGCAGAAG 3070 hom 51 het 20 0 14 6 AGTC 0 1 233633 CASAVA_Build 15 63179636 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1166 hom 24 3 17 4 A 11 12 233634 CASAVA_Build 15 63185712 1I AATGGCCTCA -/C CTGCTCTCCT 3070 hom 113 het 44 0 35 9 C 1 2 233635 CASAVA_Build 15 63196390 2D TGTGGAGCTC TA/-- TGAGGGTAAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TA 1 0 233636 CASAVA_Build 15 63259938 3D ATGCCCTATA TTC/--- TTATTATTTC 3070 het 3070 hom 30 11 16 5 TTC 1 0 233637 CASAVA_Build 15 63268290 1D ACTCTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3000 het 110 hom 24 2 10 12 A 19 18 233638 CASAVA_Build 15 63270597 1I ACGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 40 1 27 12 A 14 15 233639 CASAVA_Build 15 63271363 1D GTGAGCCACA G/- GCGCCTGGCC 3070 hom 32 het 14 0 11 3 G 2 1 233640 CASAVA_Build 15 63302784 17I AGCCTCCTCT -----------------/GTTTCTCAGCCTCCTCC GCTTCTCAGC 3070 hom 53 het 23 0 18 5 GTTTCTCAGCCTCCTCC 0 1 233641 CASAVA_Build 15 63321788 1D TGTTTACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 24 0 19 5 A 11 10 233642 CASAVA_Build 15 63353969 1D TGTCTCGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 635 hom 31 3 21 7 A 14 13 233643 CASAVA_Build 15 63364602 3D AATCTCGGCT CAC/--- CACAACGTCC 2431 hom 15 het 6 0 6 0 CAC 2 1 233644 CASAVA_Build 15 63370563 1I GAACTCCTGG -/C CCTCAAGTGG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 2 3 233645 CASAVA_Build 15 63375732 6I TCTGTGTATA ------/TTCACT TATGTTCCAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 TTCACT 0 1 233646 CASAVA_Build 15 63377463 2I TTCTTATAAC --/TG TGGGCCCTGG 3070 hom 99 het 36 0 32 4 TG 1 2 233647 CASAVA_Build 15 63377824 22D CTCCATCTAA ACACACACACACACACACACAC/---------------------- ACACACACAC 2958 hom 35 het 9 0 10 7 AC 20 9 233648 CASAVA_Build 15 63379981 1I ACAGCAAAAG -/A AAAAAAAGCC 3070 het 219 hom 37 1 30 6 A 7 8 233649 CASAVA_Build 15 63380398 1I GGCTTCGTCC -/A AGTGGATCCT 3061 hom 40 het 17 0 10 7 A 1 2 233650 CASAVA_Build 15 63384220 1D GACTTCATTT A/- GGGTGTTTCT 3070 hom 114 het 39 0 38 1 A 1 0 233651 CASAVA_Build 15 63390414 2D GAACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 24 0 12 12 A 16 14 233652 CASAVA_Build 15 63397174 4D ACTCCATCTC ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 ATAA 5 4 233653 CASAVA_Build 15 63401655 1I ATCAGTCCCC -/T AAGTCCCCTC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 0 1 233654 CASAVA_Build 15 63410178 4I CAGTGGAAGC ----/TCTA TCTATCTTTC 3070 hom 61 het 23 0 21 2 TCTA 1 2 233655 CASAVA_Build 15 63412410 1I GTATTGACGG -/C ACCCGGAGGG 3070 hom 79 het 33 0 20 13 C 0 1 233656 CASAVA_Build 15 63417989 1D AGGTGCAAGA G/- GGAGGGTGTG 3070 hom 118 het 43 0 36 7 G 3 2 233657 CASAVA_Build 15 63435977 12D TGCAGATGGA CAAGCCGATGGT/------------ CACACTATGT 3070 het 3070 hom 26 14 10 4 CAAGCCGATGGT 1 0 233658 CASAVA_Build 15 63437496 1D CCAAGACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1307 hom 23 7 10 7 T 17 16 233659 CASAVA_Build 15 63438060 5D TGTCTTTATG TTTTA/----- TTTTATTTTA 2370 het 2370 ref 22 13 5 8 TTTTA 3 2 233660 CASAVA_Build 15 63441020 16I CACAGCAGCC ----------------/CCGCTGTGTCACTACA TAGAAGAGTA 2444 het 2444 ref 26 16 8 2 CCGCTGTGTCACTACA 0 1 233661 CASAVA_Build 15 63444111 1I AATCTCTACC -/A AAAATACAAA 3070 het 3070 hom 37 20 17 0 A 4 5 233662 CASAVA_Build 15 63445064 1I GTCTCTCTCC -/T TTAGTCTCTG 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 2 3 233663 CASAVA_Build 15 63446237 15I GAGTCCAGGT ---------------/GCCCCTCCTCAGGGA GCCCACAGAA 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 GCCCCTCCTCAGGGA 0 1 233664 CASAVA_Build 15 63460967 1D TTGTAAGGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 10 9 233665 CASAVA_Build 15 63481348 1I GAGGGACGAA -/C CCCCCAGTGC 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 C 5 6 233666 CASAVA_Build 15 63484958 2D CCTGACCCTC TT/-- ATTGTGTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 19 4 T 2 0 233667 CASAVA_Build 15 63503412 4D CCTGTCTGTT GTCA/---- GTTAACCCTC 3070 het 3070 hom 56 24 27 6 GTCA 1 0 233668 CASAVA_Build 15 63506602 1I TAACAAGAGC -/T TAAACTCTGT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 T 1 2 233669 CASAVA_Build 15 63522885 2I AACAAGTAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 A 12 14 233670 CASAVA_Build 15 63525096 1I ACCTAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 9 9 10 A 11 12 233671 CASAVA_Build 15 63526620 1D CAATGGTTTG T/- TCTCTAAGTG 3070 het 3070 hom 54 22 29 3 T 2 1 233672 CASAVA_Build 15 63535500 2I AACACATACA --/CT CTCTCACTCA 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 CT 2 3 233673 CASAVA_Build 15 63550905 1D AACCAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 1035 het 1035 ref 28 11 4 13 T 18 17 233674 CASAVA_Build 15 63565026 1D TTTGCCAGAT C/- AATTCTCTTT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 C 1 0 233675 CASAVA_Build 15 63566027 6D AACATGGAAT TCAACA/------ ACTATTCAAC 3070 het 3070 ref 23 12 10 3 TCAACA 1 0 233676 CASAVA_Build 15 63569505 1I AGATTTAGAA -/T CTGTGCACTT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 0 1 233677 CASAVA_Build 15 63591137 1I ACAAATAAAT -/A AAACACATAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 4 233678 CASAVA_Build 15 63592610 1I TGACTCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 13 14 233679 CASAVA_Build 15 63593131 3D TCTCATCTGC TAA/--- TGTTTATTCT 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 TAA 1 0 233680 CASAVA_Build 15 63599834 1I CCTGGCTGAC -/T TTTTTTTTTT 2594 het 2594 ref 30 17 10 3 T 13 14 233681 CASAVA_Build 15 63610951 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 9 8 233682 CASAVA_Build 15 63619221 4D ATATAATATC AAAT/---- AAAAAGCAAG 3070 het 3070 ref 41 21 20 2 AAAT 1 0 233683 CASAVA_Build 15 63624763 1I TGGCATGGGC -/T TAATAAATAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 1 2 233684 CASAVA_Build 15 63625618 5D AATAGTTGTT TTAAG/----- TTAAGTTTTA 3070 het 3070 ref 45 24 18 4 TTAAG 2 1 233685 CASAVA_Build 15 63659896 1D TGGGCTTCAG T/- TTAGGGAGGG 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 3 2 233686 CASAVA_Build 15 63668063 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 13 12 233687 CASAVA_Build 15 63680046 1D CTGGCCCCGC A/- AAAAAAAAAA 2066 het 1174 hom 14 6 7 2 A 12 11 233688 CASAVA_Build 15 63683008 1D AGCTACAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 13 12 233689 CASAVA_Build 15 63704670 1D GTGAAGCCAA C/- CCCCAGCCAT 3070 hom 99 het 40 0 30 12 C 5 4 233690 CASAVA_Build 15 63706176 1I CATTCCAAAA -/T TTTTTTGGGT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 6 7 233691 CASAVA_Build 15 63714133 1D CAAAAGCACC A/- AAAAAAAAAA 2877 het 1466 hom 31 6 12 13 A 18 17 233692 CASAVA_Build 15 63718963 7I CAGGGGCCCA -------/CTGAGGC CTGTGCGGCT 3070 het 3070 ref 49 25 15 9 CTGAGGC 0 1 233693 CASAVA_Build 15 63723587 1D GACTTACCCT A/- AGGTCACAGC 3070 het 3070 ref 58 31 22 5 A 2 1 233694 CASAVA_Build 15 63727282 1D TTGGGGAAGT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 25 12 11 4 A 8 7 233695 CASAVA_Build 15 63728945 1D ACCACGTGGA C/- CATGGGCAAG 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 C 2 1 233696 CASAVA_Build 15 63755534 2D ATAAGGAAAA AT/-- ATATATATAT 2829 het 1201 hom 12 5 7 0 AT 12 11 233697 CASAVA_Build 15 63765301 2D ATGCTAGCAG CA/-- CAGTCTTGAT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 CA 2 1 233698 CASAVA_Build 15 63785823 5D CCTTTTGAAT AAGAA/----- AAGGGGAAAA 1905 het 1905 ref 20 11 6 3 AAGAA 1 0 233699 CASAVA_Build 15 63788052 2I ACACCCACAG --/CA CAGGATAAAA 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 CA 1 2 233700 CASAVA_Build 15 63803774 1D TTTTGAATCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2047 hom 24 8 9 7 T 15 14 233701 CASAVA_Build 15 63803789 1D TTTTTTTTTT A/- TTTCAAAAGC 3070 het 2234 hom 26 11 11 4 A 1 0 233702 CASAVA_Build 15 63848511 5D GGATATAAAC TATTA/----- TGAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 TATTA 1 0 233703 CASAVA_Build 15 63868902 1D GTATTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 A 14 13 233704 CASAVA_Build 15 63876365 1D AGAATAAACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 A 10 9 233705 CASAVA_Build 15 63878712 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 34 2 22 11 T 16 15 233706 CASAVA_Build 15 63885112 1D TCCTTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 1781 het 1781 ref 36 17 6 13 T 15 14 233707 CASAVA_Build 15 63892771 1D ACCTCAAACT C/- CCGAGTAGCT 2665 het 2665 ref 17 9 7 1 C 3 2 233708 CASAVA_Build 15 63895189 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 658 het 334 hom 17 4 3 10 A 20 18 233709 CASAVA_Build 15 63905076 1I ATATTGTTTT -/A ATACTCAGAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 1 2 233710 CASAVA_Build 15 63911693 6D ACTCTGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 15 0 13 2 A 20 14 233711 CASAVA_Build 15 63920361 1I CTCAAAACAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 9 10 233712 CASAVA_Build 15 63943317 1D ACTCCAGCCT G/- GGGTGACAGA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 4 3 233713 CASAVA_Build 15 63953112 1D TGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1104 het 1104 ref 23 15 3 5 T 13 12 233714 CASAVA_Build 15 64028463 6D GAAGAATGAA ACAATT/------ AGAAAAGAAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ACAATT 1 0 233715 CASAVA_Build 15 64044291 1I GCCCATTCCC -/A AGCTCATACC 3070 hom 69 het 27 0 21 6 A 1 2 233716 CASAVA_Build 15 64054246 1I AAAAACTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 9 10 233717 CASAVA_Build 15 64069975 4D GGGAAGAAAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 GAAA 4 3 233718 CASAVA_Build 15 64075875 1D TCTAGCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 36 1 23 13 T 16 15 233719 CASAVA_Build 15 64082382 3D CTTTTCTTTC TTT/--- TTTCTTTTTT 132 het 132 ref 30 6 3 22 T 6 3 233720 CASAVA_Build 15 64082867 3I GGTGGGGAGG ---/AGA AGATGGCCTA 3070 hom 106 het 44 0 33 11 AGA 1 2 233721 CASAVA_Build 15 64083819 5D TTTTGTAATA TTTTC/----- TTTTCTTAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 4 TTTTC 2 1 233722 CASAVA_Build 15 64090308 3I AGTGGGAAGC ---/CAT CATTGGGTGT 3070 hom 124 het 46 0 38 8 CAT 1 2 233723 CASAVA_Build 15 64091458 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 25 1 18 6 A 13 12 233724 CASAVA_Build 15 64094359 1D GCTCTAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 11 10 233725 CASAVA_Build 15 64098069 8I GGGTGTCTGC --------/GTGTGCAA GTGTGCAAGT 3070 hom 131 het 53 0 42 11 GTGTGCAA 1 2 233726 CASAVA_Build 15 64113791 1D GGAATGCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 32 0 20 12 T 13 12 233727 CASAVA_Build 15 64120306 1I AGGAAGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 45 3 26 16 T 13 14 233728 CASAVA_Build 15 64129684 2I ACGTGGAATA --/TT GACTGTCCAA 3070 hom 123 het 45 0 39 6 T 0 2 233729 CASAVA_Build 15 64144092 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 T 9 10 233730 CASAVA_Build 15 64148576 1D TAGAGACCAC A/- AGGGCAAATA 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 A 2 1 233731 CASAVA_Build 15 64158930 1D TTCATTCACA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1450 hom 29 10 14 5 C 11 10 233732 CASAVA_Build 15 64168048 1D CTTCATTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 793 hom 34 4 22 8 A 13 12 233733 CASAVA_Build 15 64171519 1D TCAGTAGAAG C/- TAAAAGGTAG 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 C 1 0 233734 CASAVA_Build 15 64175935 2D CAGGCTGTAT CC/-- AGCCTCCCCC 3070 hom 71 het 27 0 20 7 C 2 0 233735 CASAVA_Build 15 64179471 1I GTTGCGCTTT -/G GGGGGGGAAA 3070 het 2436 hom 23 9 11 3 G 7 8 233736 CASAVA_Build 15 64192059 3D46M4D ACAAACAAAT AAAAACCCCCAGAAACTCCACACCCAGACACATCCTAGGGAAACTGCAGGGCA/---AACCCCCAGAAACTCCACACCCAGACACATCCTAGGGAAACTGCAG---- GGCAGTGCAA 3070 het 3070 ref 30 27 12 18 N/A 0 0 233737 CASAVA_Build 15 64232978 2D AAAGAAAAAG AA/-- AAAGAAAGAA 118 het 118 ref 16 8 1 9 A 5 3 233738 CASAVA_Build 15 64233691 4I CCCAACCTCG ----/CGCT CGCTCGCCCA 3070 hom 86 het 36 0 25 11 CGCT 1 2 233739 CASAVA_Build 15 64236499 3I ACAGGTTTTA ---/GAG GAGAATAAAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 GAG 1 2 233740 CASAVA_Build 15 64249407 1D CCGTCTGCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2994 hom 32 10 14 8 A 13 12 233741 CASAVA_Build 15 64251804 1D ACAGCATCAA C/- CGGCAGCCTT 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 C 2 1 233742 CASAVA_Build 15 64258478 1I AATCTGTCAG -/C CCCGGGAAGC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 3 4 233743 CASAVA_Build 15 64260920 12I TTCTACTATA ------------/ACTTCTACTATC ACTTCTACTA 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 ACTTCTACTATC 1 2 233744 CASAVA_Build 15 64261809 3I TAGAACTGTC ---/ATT AAGCCAACAG 3070 hom 147 het 55 0 48 7 ATT 0 1 233745 CASAVA_Build 15 64267090 2I AAATGCCAAA --/AG ATTGGCCAGG 3070 hom 114 het 41 0 36 5 AG 0 1 233746 CASAVA_Build 15 64269242 1I ATTAAATCCC -/T ACTCGAAAGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 1 233747 CASAVA_Build 15 64270381 2I CAGGGGAGAC --/TT TATTACAACA 2916 het 2916 ref 24 15 7 2 T 1 3 233748 CASAVA_Build 15 64270751 1D GCTTCTATAC A/- GGGGTTTCAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 1 0 233749 CASAVA_Build 15 64271706 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 7 6 233750 CASAVA_Build 15 64278045 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 1484 hom 17 4 12 1 T 7 6 233751 CASAVA_Build 15 64281607 12D CCATATATGT AGACAATATGTG/------------ CATATACAAC 3070 het 3070 ref 40 28 8 10 AGACAATATGTG 1 0 233752 CASAVA_Build 15 64283481 1D TTAAAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 11 10 233753 CASAVA_Build 15 64292106 1D CAGGGCCCAT C/- CCCCAGAGGC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 5 4 233754 CASAVA_Build 15 64292187 1D GCCAGGGACT C/- CCCCCCAGCC 3070 hom 54 het 19 0 19 2 C 7 6 233755 CASAVA_Build 15 64299102 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 9 10 233756 CASAVA_Build 15 64300071 1I CTGGGACTAC -/A AGGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 1 2 233757 CASAVA_Build 15 64301282 1D ATAAAAGCTG C/- CCCTGCTAAC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 C 4 3 233758 CASAVA_Build 15 64305683 1D CTGTCACCCA G/- GGGTGGAGTG 3070 hom 48 het 20 0 15 5 G 4 3 233759 CASAVA_Build 15 64314273 1D AGCCTCCAGT G/- GGGGAGTCCC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 G 5 4 233760 CASAVA_Build 15 64314908 1D AAAAAAAAAA G/- GTCAAAATCT 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 G 2 1 233761 CASAVA_Build 15 64316718 1I CCAACTCACT -/C CCCCCCAACA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 C 6 7 233762 CASAVA_Build 15 64324864 1I GTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 36 1 24 11 A 11 12 233763 CASAVA_Build 15 64330273 4I TACTCCAGCC ----/TGAG TGAGAAAGTG 2399 het 2399 ref 16 9 6 1 TGAG 1 2 233764 CASAVA_Build 15 64357367 1D TGGCATGGGG A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 A 7 6 233765 CASAVA_Build 15 64396580 1D CAACTTCACA T/- TTTTTTTTTT 1819 het 1819 ref 27 19 4 5 T 12 11 233766 CASAVA_Build 15 64396738 8D TATTTGTGGG AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAG 3070 het 1962 hom 30 10 15 7 A 17 9 233767 CASAVA_Build 15 64413203 2D CTATGGAAAC AG/-- AGTTTTCAGT 3070 hom 70 het 27 0 24 5 AG 2 1 233768 CASAVA_Build 15 64417173 1D AAAATAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 19 1 18 0 A 11 10 233769 CASAVA_Build 15 64430487 2I TAAAGTGATT --/CA CAGTTACTAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CA 1 2 233770 CASAVA_Build 15 64431318 1I GGCGTGAGCT -/A ACCACGCCCA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 1 2 233771 CASAVA_Build 15 64437826 1D TCTCTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 1158 het 1158 ref 37 27 3 7 T 13 12 233772 CASAVA_Build 15 64439873 4I TTTTGTTAAC ----/TAAT TGTTTGTTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TAAT 0 1 233773 CASAVA_Build 15 64440456 1D TCTGGGAGGC G/- GGAGGTTGCA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 3 2 233774 CASAVA_Build 15 64440965 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAACAG 3070 het 90 hom 25 1 20 4 C 0 1 233775 CASAVA_Build 15 64443269 1D AGCTACTCGG A/- GAGGCTGAGG 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 1 0 233776 CASAVA_Build 15 64461455 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 29 1 22 6 A 11 12 233777 CASAVA_Build 15 64493017 1D ATTGTAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 326 hom 41 2 32 7 T 11 10 233778 CASAVA_Build 15 64499292 1I TGACATAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 190 hom 30 1 19 10 A 9 10 233779 CASAVA_Build 15 64500363 4D45M2I ATATACACAC ACATACATACACACACATACATACATATATACACGTGCATATATATACT--/----ACATACACACACATACATACATATATACACGTGCATATATATACTTA TATAATTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 13 N/A 0 0 233780 CASAVA_Build 15 64503457 1I GTCTTGTGCA -/T TTTTTTTTTT 2369 het 86 hom 10 1 8 1 T 10 11 233781 CASAVA_Build 15 64505753 1I TCAAGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 27 1 19 7 A 14 15 233782 CASAVA_Build 15 64522980 2I CTTGAAAAAC --/AG GGGCCAGGCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AG 0 1 233783 CASAVA_Build 15 64527556 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 326 het 163 hom 11 4 3 4 G 0 1 233784 CASAVA_Build 15 64536508 3D AAAATTCAAT TTA/--- TTATTATTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTA 3 2 233785 CASAVA_Build 15 64541996 1D GATTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 11 10 233786 CASAVA_Build 15 64542905 1D CGGAGTCTCA C/- CTCTTGTTGC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 2 1 233787 CASAVA_Build 15 64551051 1D ATAAAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 10 233788 CASAVA_Build 15 64551696 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 174 hom 35 3 20 12 A 15 14 233789 CASAVA_Build 15 64572082 1D GGTGTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 1263 het 1263 ref 31 24 4 4 T 12 11 233790 CASAVA_Build 15 64573223 1D GGCTACTTAT A/- AATTTATTTA 3070 hom 84 het 31 0 28 4 A 3 2 233791 CASAVA_Build 15 64596648 2D CCCCTTTTCC TT/-- TTTCTCTCTC 3070 hom 64 het 25 0 22 3 T 5 3 233792 CASAVA_Build 15 64657360 1D GCGTTAGCTA T/- TTTTCCTGAT 3070 hom 99 het 38 0 30 10 T 5 4 233793 CASAVA_Build 15 64663164 10D TAAACTTAGG TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 35 1 28 6 T 21 11 233794 CASAVA_Build 15 64685038 1I TCCTTCTCAG -/T TTTGCAAACT 3070 hom 104 het 49 0 32 17 T 3 4 233795 CASAVA_Build 15 64706754 2I TTTGTGAAGT --/AA AAGAGTTACG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 2 4 233796 CASAVA_Build 15 64708342 1I ATTGTTTGGA -/T TTTTTTACAA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 6 7 233797 CASAVA_Build 15 64712951 1I CTGGCTCGTA -/C CCCCCCCAGC 3070 hom 44 het 18 0 14 4 C 7 8 233798 CASAVA_Build 15 64724878 7D GTTGGGAAGA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2639 hom 24 het 23 0 11 12 T 23 16 233799 CASAVA_Build 15 64725700 1I GACCCCAGGA -/C CCCCACAGCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 4 5 233800 CASAVA_Build 15 64728233 4I AGGAGTTCTC ----/AGAA AGAATAAGGC 3070 hom 99 het 41 0 33 8 AGAA 1 2 233801 CASAVA_Build 15 64729763 2D GTGAATTTGT GG/-- AATGAATGAG 3070 hom 150 het 55 0 49 6 G 2 0 233802 CASAVA_Build 15 64731276 1I TAGCGATTTT -/A TTCCAGTAGT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 0 1 233803 CASAVA_Build 15 64732445 17I AGGTGGTCTC -----------------/TGAGCAGAGTCTGCAGA TGACTAGACA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TGAGCAGAGTCTGCAGA 0 1 233804 CASAVA_Build 15 64732493 8I TGAGGATGAT --------/GGGGAACC GGGGAACCAG 3070 hom 63 het 33 0 22 11 GGGGAACC 1 2 233805 CASAVA_Build 15 64738352 2D ATGTGTTAGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 71 29 33 11 GT 8 7 233806 CASAVA_Build 15 64748757 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 11 T 9 8 233807 CASAVA_Build 15 64751651 9D ACTCCGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAG 3070 hom 46 het 19 0 15 7 A 18 9 233808 CASAVA_Build 15 64753034 1I GCCCAGCAGA -/C AGAGCAGGAG 2657 hom 24 het 10 0 8 2 C 0 1 233809 CASAVA_Build 15 64755215 1D AATGTATTTG C/- AAAGCAGAAT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 C 1 0 233810 CASAVA_Build 15 64756639 1D AAATTTTTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 8 7 233811 CASAVA_Build 15 64758013 1I GATGGTCAGC -/A GTTTGAAAGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 233812 CASAVA_Build 15 64760954 1I GAAAGGCTCT -/A ACCAGCCATT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 1 2 233813 CASAVA_Build 15 64771085 1I CCCTGTTGGT -/G GGGGGGGTGG 3070 het 3000 hom 22 9 10 3 G 7 8 233814 CASAVA_Build 15 64784898 2I CTCTGCCAAC --/TA TGACTCCCCA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 TA 0 1 233815 CASAVA_Build 15 64786670 1I GCTTCCCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2429 hom 28 6 15 7 T 11 12 233816 CASAVA_Build 15 64790179 5I TTAGGCAAAT -----/GAAAG GAAACCCAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 GAAAG 0 1 233817 CASAVA_Build 15 64801908 1D CCAGCCTAGA G/- GCAGTGGACA 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 G 2 1 233818 CASAVA_Build 15 64809366 1D GAAAACACTC G/- CCAGACAAAC 2130 het 2130 ref 16 7 7 3 G 1 0 233819 CASAVA_Build 15 64820714 13D AGGTGGTTTG CCTCAAACCCCAC/------------- CCTCAAATCC 3070 het 3070 hom 32 13 19 4 CCTCAAACCCCAC 1 0 233820 CASAVA_Build 15 64821750 4D TTCACCCCTA ACAG/---- ACAGGCCTCT 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 ACAG 2 1 233821 CASAVA_Build 15 64822809 1D CTGAAAAAGC T/- TTTGTGAGTG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 4 3 233822 CASAVA_Build 15 64822969 1D TCCTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 11 10 233823 CASAVA_Build 15 64836070 8I CAGTGGAGAT --------/TGGACTGG TGGGGCCAGA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 TGGACTGG 0 1 233824 CASAVA_Build 15 64838126 1I TCTCCAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 23 2 16 5 A 12 13 233825 CASAVA_Build 15 64842408 1D CCCCTTCTGA G/- GCTGCTTCCT 3070 hom 144 het 51 0 48 3 G 2 1 233826 CASAVA_Build 15 64857478 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1999 het 1931 hom 32 9 11 12 T 15 16 233827 CASAVA_Build 15 64861624 3I GGTGGGGAAA ---/AGG AGAATACACT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 AGG 0 1 233828 CASAVA_Build 15 64874955 1I TAAATTTTAT -/A AAAATATCCT 2915 het 2866 hom 17 7 8 2 A 4 5 233829 CASAVA_Build 15 64901770 1D GAGTGATGGT G/- GGGGTGGAGG 3070 het 3070 hom 49 19 18 12 G 5 4 233830 CASAVA_Build 15 64903009 1D GTGGATAATG A/- GAGCTGACTC 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 1 0 233831 CASAVA_Build 15 64913336 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2720 hom 22 9 10 4 A 13 12 233832 CASAVA_Build 15 64930198 3I CTTCTCTGGT ---/CTC CTGCAGGGCT 3070 het 2851 hom 33 9 17 7 CTC 0 1 233833 CASAVA_Build 15 64935299 1D CTGCCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2399 het 2104 hom 28 9 8 11 A 15 14 233834 CASAVA_Build 15 64935653 1D CATCTCAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 10 9 233835 CASAVA_Build 15 64958734 1D ACCATAGTTT A/- AAAAAGAACA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 6 5 233836 CASAVA_Build 15 64984620 2D CACACCTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2120 het 250 hom 29 4 11 14 T 18 16 233837 CASAVA_Build 15 64991282 1I GCTGCTGTGA -/G GGATTAAATG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 3 233838 CASAVA_Build 15 64992758 1D TATCTACCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 8 233839 CASAVA_Build 15 65000642 1D TCCAGAACTG T/- GAGAGAGTAC 3070 hom 111 het 45 0 36 9 T 1 0 233840 CASAVA_Build 15 65002754 1D AGATCTCATG C/- CCTCTCCTCA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 3 2 233841 CASAVA_Build 15 65009302 1D AGACTCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 16 15 233842 CASAVA_Build 15 65029020 1D CCCGGCTAAA T/- TTTTTTTTGT 1315 het 976 hom 6 2 3 3 T 9 8 233843 CASAVA_Build 15 65039783 1I ATGATTGTAC -/A AGTAACACCG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 1 2 233844 CASAVA_Build 15 65045283 1I CATGAGGCTC -/T CGATATCTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 233845 CASAVA_Build 15 65058804 1D TTGTAATGTT A/- AAAAAAAAAA 2768 het 2768 ref 31 17 7 8 A 11 10 233846 CASAVA_Build 15 65066409 1I GGCCATTGAG -/A ATTTAAAAGA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 1 2 233847 CASAVA_Build 15 65080099 1I AACATAGCTT -/A AAAAAAAAGG 2772 het 2772 ref 30 16 6 8 A 8 9 233848 CASAVA_Build 15 65086098 1D CAGGGTTCCC T/- TTTGCAGCAG 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 T 4 3 233849 CASAVA_Build 15 65086386 2D AGAGAAGAAG AC/-- ACAGATTTAG 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 AC 2 1 233850 CASAVA_Build 15 65105344 18D GAAGCCCTGG GCCTGGACATGAGCACTA/------------------ GCTCTCTCAC 3070 het 3070 ref 42 21 20 8 GCCTGGACATGAGCACTA 1 0 233851 CASAVA_Build 15 65106685 1I ACTATGTCTC -/A AAAAAAAACA 2747 het 2747 ref 20 10 7 4 A 8 9 233852 CASAVA_Build 15 65113673 1I TGACTCCCGG -/T CTCAGATTCC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 0 1 233853 CASAVA_Build 15 65152291 1D GAACCGAGAC A/- ATTCCAAGAG 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 A 2 1 233854 CASAVA_Build 15 65152521 4I TTTTTGGTGC ----/CAAA CAAACCACAT 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 CAAA 1 2 233855 CASAVA_Build 15 65153057 5D TCATACAAGC ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 het 2682 hom 27 6 13 9 ATTTT 5 4 233856 CASAVA_Build 15 65155307 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2618 hom 29 7 11 11 A 14 15 233857 CASAVA_Build 15 65161523 1I GCTTGCAGTC -/G AGGTGGAGAG 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 G 0 1 233858 CASAVA_Build 15 65174208 1D GTTTGGAGTC A/- AGAGTTGCAC 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 A 2 1 233859 CASAVA_Build 15 65174484 4D AGCTGGTAAA TGGT/---- TGGTTGGTCC 3070 het 3070 ref 55 26 19 13 TGGT 3 2 233860 CASAVA_Build 15 65174944 1D CTTGAAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 27 20 11 T 11 10 233861 CASAVA_Build 15 65178449 1D CTTTCTGTGG T/- TGCCGCCCTG 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 2 1 233862 CASAVA_Build 15 65194644 1D TAGGAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 59 25 25 10 T 11 10 233863 CASAVA_Build 15 65203843 1I CAGTCTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 33 0 20 13 A 11 12 233864 CASAVA_Build 15 65219349 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 9 10 233865 CASAVA_Build 15 65219515 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 650 hom 33 3 27 4 A 11 12 233866 CASAVA_Build 15 65231759 1D GGAAACAGAG A/- AGACTCTAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 1 233867 CASAVA_Build 15 65235379 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 31 2 16 13 A 15 14 233868 CASAVA_Build 15 65236097 3D TCATGCTTCT GTG/--- GTGGCTTACC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 GTG 2 1 233869 CASAVA_Build 15 65239058 14D TCCAATCCCT ACTCCCTCCCTGTA/-------------- ACTCCCTCTG 3070 hom 93 het 32 0 32 7 ACTCCCTCCCTGTA 1 0 233870 CASAVA_Build 15 65249260 1I ATGTGAGTTC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 10 het 31 1 25 5 T 7 8 233871 CASAVA_Build 15 65257126 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 32 1 27 4 T 11 10 233872 CASAVA_Build 15 65262819 1I TCTTACTGAC -/A ATGATACAGT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 1 2 233873 CASAVA_Build 15 65265700 1D GAGGAAGCTC A/- GTGACGCTCT 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 A 1 0 233874 CASAVA_Build 15 65272988 3D GACAAGCCTA GAG/--- GAGTCAGGAG 3070 hom 123 het 44 0 40 6 GAG 2 1 233875 CASAVA_Build 15 65276477 6I CTTAAAACCA ------/TCCTTC TCCTCTGGCC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 TCCTTC 0 1 233876 CASAVA_Build 15 65287249 3D ACATAATTTT TTC/--- TTCTTCTTCA 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 TTC 4 3 233877 CASAVA_Build 15 65293588 5D TATATAGTTC TCTTT/----- TGTCAGTAAT 3070 het 3070 ref 44 21 20 6 TCTTT 1 0 233878 CASAVA_Build 15 65337924 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 15 1 11 3 A 14 15 233879 CASAVA_Build 15 65343089 1I TTTTCACACT -/A TTTAGATCAC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 0 1 233880 CASAVA_Build 15 65343712 3D AGTAGTTTAG AAC/--- AACAAATACT 3070 het 3070 hom 56 24 28 7 AAC 2 1 233881 CASAVA_Build 15 65344288 2I CTACCATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 TA 6 7 233882 CASAVA_Build 15 65348340 3I AATAAAACAT ---/AAC AACAAACTGG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AAC 1 2 233883 CASAVA_Build 15 65349092 1D53M5I TGAGATCCAC TTTTTTTTTTTTAGCTCCCACATGTGAGAACGTGAGATATATTTGTCTTTCTGT-----/-TTTTTTTTTTTAGCTCCCACATGTGAGAACGTGAGATATATTTGTCTTTCTGTACTTG ACTTATTTCA 3070 het 641 hom 27 3 30 15 N/A 0 0 233884 CASAVA_Build 15 65359723 6I TTCTCTCAAT ------/TTTGTA TCTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 TTTGTA 0 1 233885 CASAVA_Build 15 65360703 1D GATTGATTAA T/- TAGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 T 2 1 233886 CASAVA_Build 15 65370340 1I CTGGCCTTTA -/G TGGGCCAGGA 3070 het 3070 ref 60 29 24 7 G 0 1 233887 CASAVA_Build 15 65377701 1I GACTCGGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 13 14 233888 CASAVA_Build 15 65378471 1D ATATTCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 27 1 15 12 A 15 14 233889 CASAVA_Build 15 65389519 3I TTTCAAATTG ---/TTA GAGAACTCCA 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 TTA 0 1 233890 CASAVA_Build 15 65397205 1D TGACAGGGCA G/- GGAGGGTCTG 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 G 3 2 233891 CASAVA_Build 15 65399886 4D TCTCTAGTAA TTAC/---- TTTTCCAGAT 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 TTAC 1 0 233892 CASAVA_Build 15 65402197 2I TCCCCACCAC --/CA CAGTTGGGTG 3070 hom 84 het 38 0 27 11 CA 1 2 233893 CASAVA_Build 15 65407553 1D TTGTTTTTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 T 10 9 233894 CASAVA_Build 15 65408691 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2382 het 2382 ref 16 7 7 2 A 15 16 233895 CASAVA_Build 15 65409460 3D TGTGATCTCC GGT/--- GGCTACTCGG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 GGT 1 0 233896 CASAVA_Build 15 65437243 3I ATTCTGTATT ---/ATC ATCATTATTA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 ATC 1 2 233897 CASAVA_Build 15 65461372 1D ATACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 25 2 12 12 A 13 12 233898 CASAVA_Build 15 65477174 2I AGACTCAAAC --/AG AAAAATGATA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AG 0 1 233899 CASAVA_Build 15 65478861 3I CTTGAGGAAA ---/TGT TGTTTCAAAT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 TGT 1 2 233900 CASAVA_Build 15 65480942 4D CACAAGTGAT AGAG/---- AGGGAGGGGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 3 1 233901 CASAVA_Build 15 65539384 1D AAAAGGAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 9 8 233902 CASAVA_Build 15 65548520 1I ATATTTTGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 452 hom 43 2 36 5 T 9 10 233903 CASAVA_Build 15 65550642 1D45M4D AAGGACATAA CCCATAAAAATTAAAATTTTTAATTTCAATAGATATTTCCAAATCATTAT/-CCATAAAAATTAAAATTTTTAATTTCAATAGATATTTCCAAATCA---- TTCTTTTTTG 3070 hom 108 het 30 0 37 3 N/A 0 0 233904 CASAVA_Build 15 65550915 2I AAGCAAAGTT --/AA AAGTGAGCTG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 2 4 233905 CASAVA_Build 15 65561619 1I ACATTTCCCA -/C CCAAAGGATA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 2 3 233906 CASAVA_Build 15 65568912 25I TGGCCTCCTG -------------------------/GGTGAGGTCAGGAGTTCAAGATCTT GGCTCACTGC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 GGTGAGGTCAGGAGTTCAAGATCTT 0 1 233907 CASAVA_Build 15 65569495 6D AATAAGCTAA GGAAAT/------ AGACAATCAC 3070 hom 63 het 24 0 22 4 GGAAAT 1 0 233908 CASAVA_Build 15 65583196 1I CTGTCCCTGT -/G GGGAAGGTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 3 4 233909 CASAVA_Build 15 65585670 2I TACAAGAAAG --/TT TATTCTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 16 7 T 1 3 233910 CASAVA_Build 15 65599991 1I CACAAAGCTC -/G GATAAGAGGC 3070 het 3070 hom 44 14 24 6 G 1 2 233911 CASAVA_Build 15 65609955 3D AAAAAAAAAA GGT/--- GGCCGGTCGT 1448 het 978 hom 21 6 7 9 GGT 1 0 233912 CASAVA_Build 15 65615770 1I GAAGGGCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 989 hom 22 3 14 5 T 13 14 233913 CASAVA_Build 15 65619866 1D ATCGCTTGAA C/- CTGGGAGGTG 3070 hom 66 het 24 0 22 3 C 2 1 233914 CASAVA_Build 15 65621928 7D CCACGCGCCA CGCGCCG/------- CGCGCCGCGC 1399 hom 33 het 13 0 11 2 CGCGCCG 3 2 233915 CASAVA_Build 15 65628306 1D TTTATTTTTG A/- AAAAAAAAAA 1800 het 1800 ref 28 20 4 4 A 13 12 233916 CASAVA_Build 15 65630170 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 22 1 14 7 T 12 11 233917 CASAVA_Build 15 65635947 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 15 14 233918 CASAVA_Build 15 65652099 2D ATTATTATTA TT/-- TTTTTTTTTG 1406 het 219 hom 16 3 3 10 T 11 9 233919 CASAVA_Build 15 65659924 6D ATCAACACTT TTACTC/------ TTAAAGATAA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TTACTC 1 0 233920 CASAVA_Build 15 65675369 1D TTATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 26 2 18 6 T 13 12 233921 CASAVA_Build 15 65679387 2D ACATGCAAAC TT/-- ATATATAAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 T 2 0 233922 CASAVA_Build 15 65692390 5D GCTGATAGTT AAAAG/----- AGGAGTTATT 3070 hom 129 het 48 0 44 6 AAAAG 1 0 233923 CASAVA_Build 15 65695579 2I AATGTCACAC --/AA AGAGCAAAGA 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 1 3 233924 CASAVA_Build 15 65699155 1D CCTTGTTCTA C/- AAAAAATAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 C 1 0 233925 CASAVA_Build 15 65700455 1I GGAGAAAATT -/C TAAAATACCA 3070 hom 81 het 30 0 25 5 C 0 1 233926 CASAVA_Build 15 65701923 1I TGCATGTGGA -/T TTTTTTTTTT 1393 het 1393 ref 39 32 4 3 T 11 12 233927 CASAVA_Build 15 65702991 1I ACTATCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 116 hom 40 2 25 13 T 14 15 233928 CASAVA_Build 15 65704189 1D GCCTGGTTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 6 5 233929 CASAVA_Build 15 65706411 3D TGCAGCCTGA CCT/--- CCTGGACTCA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 CCT 2 1 233930 CASAVA_Build 15 65708788 1I CTAATGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 22 1 18 3 T 11 12 233931 CASAVA_Build 15 65709087 4D CTATCCTAAC ACTT/---- ACCAGATGAG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 ACTT 1 0 233932 CASAVA_Build 15 65714581 1I GATATTTATC -/T TTTTTTTTTT 2788 het 480 hom 23 2 14 7 T 15 16 233933 CASAVA_Build 15 65727970 1D TTTTCAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 25 1 17 7 T 13 12 233934 CASAVA_Build 15 65728038 12D GATCTCGGCT CACTGCAACCTC/------------ CACTGCAACC 1700 hom 12 het 6 0 5 2 CACTGCAACCTC 2 1 233935 CASAVA_Build 15 65732680 1D GTTTAAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 15 14 233936 CASAVA_Build 15 65734924 2I TCATGTTCAA --/AT ATGTCATTCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AT 1 2 233937 CASAVA_Build 15 65738283 1D ACTTCTTCTG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 9 8 233938 CASAVA_Build 15 65739578 1D AGAAGAAATG T/- TTTTTAATAA 3070 hom 120 het 41 0 41 0 T 6 5 233939 CASAVA_Build 15 65740264 1I ACAGAATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 31 1 23 7 A 12 13 233940 CASAVA_Build 15 65740436 1D AATAATCTGG C/- CATGCAAGGC 3070 hom 63 het 24 0 21 4 C 2 1 233941 CASAVA_Build 15 65749188 1I AGATAACAAC -/A AAAAAACCTG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 7 233942 CASAVA_Build 15 65763144 2D ATGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 93 het 36 0 31 6 CT 2 1 233943 CASAVA_Build 15 65765996 21D CTGTGTCTCA AATAATAATAATAATAATAAT/--------------------- AATAATAATA 3070 hom 48 het 16 0 17 3 AAT 13 6 233944 CASAVA_Build 15 65804629 1I TCAGCCATCC -/T TTTTTTACCT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 6 7 233945 CASAVA_Build 15 65832290 1D ACAATCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 875 hom 29 4 20 5 A 13 12 233946 CASAVA_Build 15 65838961 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 9 het 9 ref 31 13 1 19 AAAG 1 0 233947 CASAVA_Build 15 65840636 1D TTTTTCATTT C/- CTCTTCTTCC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 2 1 233948 CASAVA_Build 15 65843041 1D GTTTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 1210 het 1210 ref 37 31 3 3 T 11 10 233949 CASAVA_Build 15 65850513 56D AATTCTTAAA ACACATGGTAATGTGTACCATGTGTTTTACACATGGTAATGTGTACCATGTGTTTT/-------------------------------------------------------- ACACATGGTA 3070 hom 33 het 20 0 12 16 ACACATGGTAATGTGTACCATGTGTTTT 3 1 233950 CASAVA_Build 15 65865232 1I AGAAGCAACC -/T TGGGAAACTG 3070 hom 138 het 51 0 46 5 T 1 2 233951 CASAVA_Build 15 65865411 1I TGTTAGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 46 3 32 11 T 13 14 233952 CASAVA_Build 15 65868364 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 34 0 15 21 A 18 16 233953 CASAVA_Build 15 65884988 2D CTGGAGGGAG GA/-- GAGAGCTGGG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 GA 3 2 233954 CASAVA_Build 15 65887381 5D CCACTGCCCA GCTGG/----- GCTTCCATCT 3070 hom 87 het 35 0 22 15 GCTGG 1 0 233955 CASAVA_Build 15 65888347 1I CCTGGGGTTA -/G GATGGTCACA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 1 2 233956 CASAVA_Build 15 65892930 3D AGCCCACAGG CTA/--- CTGTCTCCCT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 CTA 1 0 233957 CASAVA_Build 15 65899648 1D TTCAACTAGT A/- AAAGATATGT 3070 hom 69 het 25 0 22 4 A 4 3 233958 CASAVA_Build 15 65918901 1D AAGTGGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1296 hom 29 3 19 7 T 15 14 233959 CASAVA_Build 15 65928277 1I TTGCAGATTA -/T TTTAATATGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 4 233960 CASAVA_Build 15 65931050 1D CGCCCAAGCT G/- GGAGTGCAGT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 G 3 2 233961 CASAVA_Build 15 65937777 3D GGTCCCTCAT TAA/--- TAATGAGTTA 3070 hom 123 het 49 0 42 9 TAA 2 1 233962 CASAVA_Build 15 65938847 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 25 1 16 8 A 18 16 233963 CASAVA_Build 15 65942377 2I CACAAAATTT --/CA CAGTTGGGTG 3070 hom 151 het 54 0 51 3 CA 1 2 233964 CASAVA_Build 15 65946491 1I AGACTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 13 14 233965 CASAVA_Build 15 65974668 1D TAGAATCAAA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 7 233966 CASAVA_Build 15 65974979 1I TTTTATGTTC -/T TTCCCCCCCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 3 233967 CASAVA_Build 15 65978806 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1689 het 1689 ref 45 29 4 12 A 13 14 233968 CASAVA_Build 15 65979551 1I TTATTTATTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 447 hom 24 1 19 4 T 8 9 233969 CASAVA_Build 15 65981310 3I TATTAAAAGA ---/TCT TCTTTTTTCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TCT 1 2 233970 CASAVA_Build 15 65982916 3D ACCCTATGAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1631 hom 30 8 13 9 T 16 13 233971 CASAVA_Build 15 65984919 1D TTCATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 21 0 19 2 T 12 11 233972 CASAVA_Build 15 65985189 1D AGTGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 29 4 19 6 T 15 14 233973 CASAVA_Build 15 65989581 2D TCCTGAGTTC TG/-- TGAGTTGTTC 3070 het 2391 hom 35 9 16 12 TG 2 1 233974 CASAVA_Build 15 65989613 1D TCCAACATGA G/- GGGGTCATAG 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 G 5 4 233975 CASAVA_Build 15 65991282 1I AGGTCATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 17 11 T 13 14 233976 CASAVA_Build 15 65993840 1I TTGTAGAGTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 8 9 233977 CASAVA_Build 15 65995536 2D GTCCTTTCTT AC/-- AGTTTGTTCC 3070 het 3070 ref 47 25 16 8 AC 1 0 233978 CASAVA_Build 15 65995869 4D TTATTTAATT AATC/---- CATCTATTTG 3070 het 3070 ref 40 24 14 4 AATC 1 0 233979 CASAVA_Build 15 65999030 1D CATTGTGCCT G/- GCCCCCAAGA 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 G 2 1 233980 CASAVA_Build 15 65999246 1D TATTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 31 3 17 11 T 15 14 233981 CASAVA_Build 15 66002051 1D CTTTTTAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 22 1 12 9 T 15 14 233982 CASAVA_Build 15 66005313 2D TCTGGCTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 25 1 15 9 T 14 12 233983 CASAVA_Build 15 66017206 3I TGATCAAATT ---/AGA AGGAGAGAGT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 AGA 0 1 233984 CASAVA_Build 15 66018754 1I GAACTCATCC -/T TTTTTTATGG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 6 7 233985 CASAVA_Build 15 66021685 1I GACTAGAAGT -/G GGGCCTCTCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 3 4 233986 CASAVA_Build 15 66023699 6D TAGGCTACTT TATTGC/------ CAAGTTTTCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TATTGC 1 0 233987 CASAVA_Build 15 66026514 1I TTTTGTCTTG -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 6 7 233988 CASAVA_Build 15 66058603 4D GAATAAAATA CTTT/---- CTTATCTCTC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 CTTT 1 0 233989 CASAVA_Build 15 66061037 4D GTGTCCTCAA TTAG/---- TTCTAAACTC 3070 het 3070 hom 46 19 22 7 TTAG 1 0 233990 CASAVA_Build 15 66071060 1D TTTCACCATG T/- TTGGCCAAGC 3070 hom 39 het 15 0 13 3 T 3 2 233991 CASAVA_Build 15 66079680 1D ATATGATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 15 0 12 3 A 13 12 233992 CASAVA_Build 15 66093700 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1621 hom 33 5 16 12 T 16 17 233993 CASAVA_Build 15 66095865 1I GGATCATGGT -/G GGGGGGGGGC 1771 het 1113 hom 15 3 6 6 G 9 10 233994 CASAVA_Build 15 66097247 3I AAAAAAAAAG ---/GAA GAAGAAAAAG 3070 hom 67 het 24 0 20 4 GAA 2 3 233995 CASAVA_Build 15 66104710 1I TGGTCTCTAT -/A AAAAAAAAAA 724 het 724 ref 26 16 3 7 A 10 11 233996 CASAVA_Build 15 66116078 2D CTGGGGAACC CT/-- GAGGACAAAC 3070 het 3070 hom 47 14 24 10 CT 1 0 233997 CASAVA_Build 15 66124604 1D AGTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 26 0 22 4 T 11 10 233998 CASAVA_Build 15 66142426 1D TGGTTTTTTT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 7 6 233999 CASAVA_Build 15 66143303 1I ACTTGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 11 12 234000 CASAVA_Build 15 66146188 1I AAAGACCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 9 10 234001 CASAVA_Build 15 66146826 1D TAGTTGGTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 29 0 25 4 T 9 8 234002 CASAVA_Build 15 66150086 5D AATGGAAAAT ATCTC/----- ATTAATGATT 3070 het 3070 ref 37 22 13 5 ATCTC 1 0 234003 CASAVA_Build 15 66162539 3I TTATTTTGTT ---/GTA GTGCTAACAA 3070 hom 117 het 48 0 39 9 GTA 0 1 234004 CASAVA_Build 15 66179491 2D TTTCTTCGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 41 6 20 16 A 16 14 234005 CASAVA_Build 15 66179506 2D AAAAAAAAAA AC/-- ACCTTTTGAT 3070 het 609 hom 45 10 20 16 AC 2 1 234006 CASAVA_Build 15 66180293 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 37 1 23 13 T 13 12 234007 CASAVA_Build 15 66182666 1I TAAAATGATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 9 10 234008 CASAVA_Build 15 66182725 1D ATTATTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 34 0 23 11 T 13 12 234009 CASAVA_Build 15 66192249 2I AGTATGTCTC --/AG GGAAATAACA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 AG 0 1 234010 CASAVA_Build 15 66197713 2D TGTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2064 het 1247 hom 14 5 6 3 A 16 14 234011 CASAVA_Build 15 66198513 1D TGGGCAGGCC G/- GGGCATGGTG 3070 hom 69 het 24 0 23 1 G 4 3 234012 CASAVA_Build 15 66200656 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2655 hom 27 10 11 6 T 12 11 234013 CASAVA_Build 15 66206959 1D GTTTCTACAC T/- TTTTGTTGCC 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 5 4 234014 CASAVA_Build 15 66210873 1I AGATCTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 36 0 28 8 A 10 11 234015 CASAVA_Build 15 66227298 1I TCTAACATTC -/T TTTTTTGGGA 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 T 6 7 234016 CASAVA_Build 15 66235897 1I GTCAGGAGTT -/C CAGACCAGCC 2592 het 2592 ref 17 10 7 0 C 1 2 234017 CASAVA_Build 15 66241286 1I CTCACCACTG -/C ACTCCAGCCT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 C 0 1 234018 CASAVA_Build 15 66259860 1I AGTAAATTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 9 10 234019 CASAVA_Build 15 66260009 4I TGTTTCACTA ----/CATT CATTAGATTC 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 CATT 1 2 234020 CASAVA_Build 15 66261689 2D AATATTAGTC AT/-- ATAATCTAAG 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 AT 2 1 234021 CASAVA_Build 15 66265365 4I CTCAAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 2729 het 2729 ref 25 16 7 2 AAAC 2 3 234022 CASAVA_Build 15 66269069 4D CAAGTGTGTT TGAG/---- TAACAAGTGA 3070 het 3070 ref 35 14 16 6 TGAG 1 0 234023 CASAVA_Build 15 66270029 2D TGTACAGTAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 14 het 53 2 42 10 TG 8 7 234024 CASAVA_Build 15 66276372 2I CAGCAACTGC --/AG AGACTGCTGT 3070 hom 92 het 36 0 29 7 AG 1 2 234025 CASAVA_Build 15 66276540 2D GCTTGAACAC AG/-- GGGGAGACCA 3070 het 3070 hom 35 17 15 4 AG 1 0 234026 CASAVA_Build 15 66278128 23D TTTTCTAGCA ATAGTTTTTCTAAAAACTATTGC/----------------------- ATAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 18 13 5 ATAGTTTTTCTAAAAACTATTGC 1 0 234027 CASAVA_Build 15 66282494 1D GGCATGAGCC A/- ACTGCACCTG 2240 het 2240 ref 20 12 6 4 A 2 1 234028 CASAVA_Build 15 66294379 9I TGCAACTCTT ---------/CCTTCCCCA CCTTCCCAGA 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 CCTTCCCCA 0 1 234029 CASAVA_Build 15 66294660 2I GCAATCTCAG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 TC 8 9 234030 CASAVA_Build 15 66323815 1D GTGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 16 7 A 10 9 234031 CASAVA_Build 15 66324984 2I AACAAAAAAC --/AG AACAACCAGA 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 AG 0 1 234032 CASAVA_Build 15 66329019 6D AGTGAATCTC ATGAAG/------ ATAGAGAGTA 3070 het 3070 ref 47 30 12 7 ATGAAG 1 0 234033 CASAVA_Build 15 66333207 4I CTATAAATCT ----/CAAA CAAGTAAACT 3070 het 3070 ref 28 19 9 0 CAAA 0 1 234034 CASAVA_Build 15 66333263 1I TAAAACTACA -/T TTTTTTTTTT 2902 het 619 hom 24 3 10 11 T 15 16 234035 CASAVA_Build 15 66334700 1D TTGGACCTGA C/- CCCCCCCAAT 3070 hom 122 het 46 0 39 9 C 8 7 234036 CASAVA_Build 15 66335900 5D CCGTTATTAC CAATA/----- CAATACTTGT 3070 hom 63 het 23 0 21 4 CAATA 2 1 234037 CASAVA_Build 15 66337946 5D14M2D ATATCTCACA TATATTATATACATATATGTA/-----TATATACATATATG-- TATCATATAT 3070 hom 21 het 13 0 8 6 N/A 0 0 234038 CASAVA_Build 15 66338078 2I GATATATATG --/AT ATATATATAT 2513 hom 18 het 15 0 7 8 AT 7 8 234039 CASAVA_Build 15 66339015 1D CGGCCCCCAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 42 het 29 0 24 7 A 9 8 234040 CASAVA_Build 15 66343424 1I GAACCTTTCC -/A AAAAAAAAAA 1119 het 828 hom 28 4 10 14 A 16 17 234041 CASAVA_Build 15 66349309 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 18 1 15 2 A 15 14 234042 CASAVA_Build 15 66365084 1D TTGTTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1468 het 1468 ref 32 22 4 6 T 13 12 234043 CASAVA_Build 15 66407149 12I GACTCCTGGG ------------/TCTGCCTCTTCC TCTGCATCCA 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 TCTGCCTCTTCC 0 1 234044 CASAVA_Build 15 66417135 1D ACATGAAAAA G/- CTCAAACGTC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 G 1 0 234045 CASAVA_Build 15 66428417 1D TCTCTTTCGA G/- GGGGGGCTCT 3070 hom 64 het 28 0 17 12 G 7 6 234046 CASAVA_Build 15 66435161 1I ACTTTGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 31 0 26 5 T 10 11 234047 CASAVA_Build 15 66442315 15D GAATGGGTGG ATGGATGATGGATGA/--------------- ATGGATGATG 3070 hom 132 het 61 0 43 26 ATGGATGATGGATGA 3 2 234048 CASAVA_Build 15 66444403 4D TCAGAGAGGC CAAA/---- CAACCTGCCC 3070 hom 99 het 37 0 33 6 CAAA 1 0 234049 CASAVA_Build 15 66445091 7D TTCTTTTCTC TTTTCTT/------- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 32 11 19 4 TTTTCTT 1 0 234050 CASAVA_Build 15 66453773 1I GGCCTCGAGA -/C CATCAGAGCT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 C 1 2 234051 CASAVA_Build 15 66455621 1I TTCTCCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 32 1 22 9 T 10 11 234052 CASAVA_Build 15 66456866 1I GGTTTCACCA -/T TTTGGCCAGG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 3 4 234053 CASAVA_Build 15 66457665 8I ACAGTGTTAT --------/ACTTTTTA ACCGTTCTCC 3070 hom 66 het 27 0 21 6 ACTTTTTA 0 1 234054 CASAVA_Build 15 66465326 1D TAAAGGCCAA C/- CCCCACCCAC 3070 hom 59 het 27 0 19 8 C 5 4 234055 CASAVA_Build 15 66478226 2I TAAAATATAA --/AT ATATTTTATA 2667 hom 15 het 8 0 6 2 AT 2 3 234056 CASAVA_Build 15 66483006 4D ATAAACCTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 TTTC 5 4 234057 CASAVA_Build 15 66523424 1I CCAGGAGATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 9 10 234058 CASAVA_Build 15 66534446 2I ATTGAATCTT --/TA TCTCATACTA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 TA 0 1 234059 CASAVA_Build 15 66555997 1D ATCTAGGGCT A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 28 17 9 3 A 8 7 234060 CASAVA_Build 15 66569120 1I ACAGGAAATG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 51 17 30 4 T 6 7 234061 CASAVA_Build 15 66608096 1I TTTTTTTTTT -/C TTTGAATTGG 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 C 0 1 234062 CASAVA_Build 15 66609002 2D CTCATGCTCA CT/-- CTCTCTTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 19 9 CT 4 3 234063 CASAVA_Build 15 66618164 3I CTACTGGGAG ---/AGA AGAAGAGGAT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AGA 2 3 234064 CASAVA_Build 15 66620628 1I ACCCTGTCTC -/A AAATAAAAAA 3070 het 569 hom 25 2 19 4 A 3 4 234065 CASAVA_Build 15 66628768 1D TTGTTTGGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 T 9 8 234066 CASAVA_Build 15 66631871 2I GCGGGGGGGT --/TG GGGGGGGGCA 1211 het 496 hom 11 3 3 5 TG 0 1 234067 CASAVA_Build 15 66632744 1I TAGTCCTAAA -/T GTAATCACAA 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 T 0 1 234068 CASAVA_Build 15 66639690 1D TCTTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 2829 het 1646 hom 14 4 7 3 T 11 10 234069 CASAVA_Build 15 66654838 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 het 682 hom 13 3 10 0 CTC 0 1 234070 CASAVA_Build 15 66668250 1I AACTCCTGAA -/G AAATTGCTGG 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 G 0 1 234071 CASAVA_Build 15 66709206 1I TTGGGCTCTT -/A AACCAGCATG 3070 hom 114 het 46 0 38 8 A 2 3 234072 CASAVA_Build 15 66717138 2D CTCCTGGGCT CC/-- CCCCACATTA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 C 6 4 234073 CASAVA_Build 15 66723425 4D CCCATCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 AAAC 3 2 234074 CASAVA_Build 15 66727094 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 291 het 291 ref 11 4 2 6 AAG 1 0 234075 CASAVA_Build 15 66733254 1D CTCCCCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 22 1 15 7 A 13 12 234076 CASAVA_Build 15 66736571 2D TTCACAGAAT AA/-- AGTTTTTAAG 3070 het 2802 hom 22 6 15 1 A 3 1 234077 CASAVA_Build 15 66740370 1D GTAATGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1381 hom 39 8 14 17 T 12 11 234078 CASAVA_Build 15 66744405 5I AGTTTACCAG -----/TCTTT TCTTTTATGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TCTTT 1 2 234079 CASAVA_Build 15 66747675 1I GGGCTGGGGA -/G GGGGGGCGCT 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 G 6 7 234080 CASAVA_Build 15 66747808 1D GTTAAGATTA C/- ATCAGACAGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 C 1 0 234081 CASAVA_Build 15 66752754 1I CCCTGTCTCT -/A CAAATGAAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 0 1 234082 CASAVA_Build 15 66760521 1D CAGGAGAATC G/- CTTGAACCCA 3070 het 2076 hom 21 5 13 3 G 1 0 234083 CASAVA_Build 15 66760620 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 68 het 32 0 24 8 T 9 8 234084 CASAVA_Build 15 66760795 1D CAGTGAGGAG C/- CCCCTGATTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 C 5 4 234085 CASAVA_Build 15 66763393 1D ACCCATTGAA G/- ATTTTGGAGC 3070 het 3070 hom 61 28 25 9 G 1 0 234086 CASAVA_Build 15 66765163 4I TGTTTGATTG ----/ATTA ATTAAACACT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 ATTA 1 2 234087 CASAVA_Build 15 66765617 1I TTGGTAGAGA -/G GGGGGTTCTG 2481 het 2481 ref 16 6 8 2 G 5 6 234088 CASAVA_Build 15 66768514 2D TGTCCCAGCA CC/-- AAGAAGGGCT 3070 hom 68 het 24 0 22 3 C 2 0 234089 CASAVA_Build 15 66770315 4D CCCAAAGTGC CAAG/---- TGGGATTACA 1751 het 1751 ref 16 9 4 3 CAAG 1 0 234090 CASAVA_Build 15 66780197 2D AGCAGCCGCG GA/-- GAGAGAGAGA 2837 hom 35 het 15 0 11 4 GA 6 5 234091 CASAVA_Build 15 66789281 1I GTTCCCCCCA -/C CCTACCACCT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 2 3 234092 CASAVA_Build 15 66797082 3D GCTAAGTAGC AGA/--- AGAAGAACTC 3070 hom 120 het 45 0 40 7 AGA 3 2 234093 CASAVA_Build 15 66800579 1D CTGGCCCACT A/- ATCACTATTA 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 A 2 1 234094 CASAVA_Build 15 66801138 4I TGTTTTCTTG ----/TATT TATTTATTTA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 TATT 3 4 234095 CASAVA_Build 15 66808320 1D ACGAGTGATT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 50 21 22 7 A 8 7 234096 CASAVA_Build 15 66812739 1I GCACTGACTA -/T TTATTTATTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 3 234097 CASAVA_Build 15 66813122 2I TTACAATTCA --/GT GTGTTGAGTA 3070 hom 144 het 52 0 47 5 GT 2 3 234098 CASAVA_Build 15 66820508 2I CTAGCTGGGG --/GT GGGGGGGTGT 1564 het 126 hom 17 2 9 6 GT 0 1 234099 CASAVA_Build 15 66822232 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2749 het 2125 hom 23 7 11 6 A 12 11 234100 CASAVA_Build 15 66822801 2D CTGAACTGAG AA/-- AAATGAAGCA 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 A 5 3 234101 CASAVA_Build 15 66823420 1D TGTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 2935 het 885 hom 26 8 10 8 T 16 15 234102 CASAVA_Build 15 66830583 3I CCATGAAATG ---/AGA AGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 AGA 0 1 234103 CASAVA_Build 15 66834792 1D TTGAGCTCAG C/- CAGTTCAAGA 2391 het 2391 ref 22 10 7 5 C 2 1 234104 CASAVA_Build 15 66836570 3D CATTTTTTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 2915 het 2777 hom 30 11 11 8 A 17 14 234105 CASAVA_Build 15 66843068 1I AAATAAATTA -/G CTGGGTGTGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 0 1 234106 CASAVA_Build 15 66848252 1D ATTTTTAAGT G/- TCAGAAGCCT 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 G 1 0 234107 CASAVA_Build 15 66879469 1D CACAAGGCTG T/- TAAGTGACCG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 2 1 234108 CASAVA_Build 15 66880394 1I TGGAAGGGAA -/G GAAAGGAGGT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 G 1 2 234109 CASAVA_Build 15 66880614 2I AAGAAGAAGA --/AG AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 AG 0 1 234110 CASAVA_Build 15 66891297 1I ACCCGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 25 2 20 3 T 11 12 234111 CASAVA_Build 15 66891430 2I CCCTAAGTTG --/GT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 15 8 GT 0 1 234112 CASAVA_Build 15 66903563 20D TCGGCCGTAG TACTCTCTTACCTACATCAT/-------------------- GGTTCTGCTG 3070 hom 72 het 24 0 24 1 TACTCTCTTACCTACATCAT 1 0 234113 CASAVA_Build 15 66907987 4D TGGTCACAGG CTAA/---- CTAAGAGTTC 3070 hom 129 het 46 0 44 7 CTAA 2 1 234114 CASAVA_Build 15 66910356 2I TTGGGGAAAC --/AG AGATTGCTAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AG 1 2 234115 CASAVA_Build 15 66912480 4D TGTAATACTG TTTA/---- TTTAACTTCA 3070 het 3070 hom 39 18 21 2 TTTA 2 1 234116 CASAVA_Build 15 66916015 1I5M1I CCAGCACTTT -GGAGG-/GGGAGGA CGAAACGGGT 2906 hom 35 het 13 0 10 3 N/A 0 0 234117 CASAVA_Build 15 66917922 1D CAATACACAT A/- AGTTAGGTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 1 234118 CASAVA_Build 15 66921597 1D TTTATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 13 12 234119 CASAVA_Build 15 66958195 1D TAAAGGGGGG A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 76 het 28 0 26 2 A 8 7 234120 CASAVA_Build 15 66958568 3I TGTGCATCAG ---/CAA CAACAATAAT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CAA 2 3 234121 CASAVA_Build 15 66968030 5D GTCTATTCCA CACTC/----- GGTCTTTATT 2898 het 2898 ref 20 11 7 3 CACTC 1 0 234122 CASAVA_Build 15 66968687 1I AAAATGATTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 T 8 9 234123 CASAVA_Build 15 66969041 4D19M2D CATTTTAAAT AAACAGAGTATAATTTTTATAACTT/----AGAGTATAATTTGTATAAC-- TATTTTCCCA 3070 het 3070 ref 30 23 10 3 N/A 0 0 234124 CASAVA_Build 15 66969159 1D GTTGCATGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 10 9 234125 CASAVA_Build 15 66970912 6D ATCTAGTTGA TTGTTG/------ TTAAGTTCAA 3070 het 3070 ref 56 28 25 6 TTG 2 0 234126 CASAVA_Build 15 66973074 5D TTGAATATTC TGTTT/----- TATTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 20 7 TGTTT 1 0 234127 CASAVA_Build 15 66975244 6D CACACACACA CACACG/------ CACACGCACA 3070 het 41 hom 31 3 27 4 CACACG 2 1 234128 CASAVA_Build 15 66978812 3I GTCTGTCTCA ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTC 0 1 234129 CASAVA_Build 15 66980867 1D GGGCTGGGCG T/- TGGTGGTGCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 1 234130 CASAVA_Build 15 66990318 3I GTCCCTAGCA ---/ACC ACAATTCTGC 3070 hom 60 het 28 0 21 7 ACC 0 1 234131 CASAVA_Build 15 67022321 6I CAATGCATTT ------/TATAAG TATGAGTTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TATAAG 0 1 234132 CASAVA_Build 15 67028891 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 28 2 21 5 A 13 12 234133 CASAVA_Build 15 67053597 1I TGAGGTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2990 hom 44 8 25 11 T 14 15 234134 CASAVA_Build 15 67075039 1D ATCTGTACAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 13 het 41 1 32 8 A 10 9 234135 CASAVA_Build 15 67101918 1D TGTATTATCT G/- GGAGATGTTC 3070 hom 144 het 53 0 48 6 G 3 2 234136 CASAVA_Build 15 67121463 1I TCCCTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 490 hom 44 4 26 14 A 15 16 234137 CASAVA_Build 15 67139259 1I GAGAAGGAGC -/A AAGGCCAGTT 3070 hom 109 het 49 0 42 7 A 2 3 234138 CASAVA_Build 15 67150279 1I CAGGCTGGAT -/A AGCATGACAC 3070 hom 59 het 27 0 20 7 A 1 2 234139 CASAVA_Build 15 67156461 4I CTTCTGAAAT ----/ATAA ATTATGTTTT 3070 hom 78 het 33 0 24 9 ATAA 0 1 234140 CASAVA_Build 15 67158571 1D ACTCTGACCT A/- CCAAAATGCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 0 234141 CASAVA_Build 15 67162036 2I GTTAAAAATA --/TG TGTGATCAAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TG 2 3 234142 CASAVA_Build 15 67162743 1D CTTCTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 25 0 12 13 T 13 12 234143 CASAVA_Build 15 67171053 1D TTGCTCCTGA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 T 9 8 234144 CASAVA_Build 15 67185476 1I GGAGTGCTTG -/C CCCTTCCTTA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 C 3 4 234145 CASAVA_Build 15 67186268 4I CAGCTACTCA ----/GGAG GCTGAGGCAG 1324 het 1324 ref 11 6 3 2 GGAG 0 1 234146 CASAVA_Build 15 67187844 1D CAGGCTGATT C/- CTCTGACCTA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 C 2 1 234147 CASAVA_Build 15 67197439 1I CCAGCAGCAT -/C TGCATGACTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 0 1 234148 CASAVA_Build 15 67204162 1I AGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 2751 het 2751 ref 18 9 6 3 A 10 11 234149 CASAVA_Build 15 67206643 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 31 7 13 11 A 19 17 234150 CASAVA_Build 15 67207452 1I GCAATAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 9 7 5 T 10 11 234151 CASAVA_Build 15 67275803 1I TTTATATTTA -/T TTTAGACTAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 3 4 234152 CASAVA_Build 15 67288828 1I AGTTAGAGTC -/A ACACTGCAAA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 1 2 234153 CASAVA_Build 15 67322964 1D CCCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1081 het 1081 ref 18 11 5 3 A 13 12 234154 CASAVA_Build 15 67346439 3D ACGTATATTT TTG/--- TTGTTCTTAT 3070 hom 84 het 29 0 29 2 TTG 2 1 234155 CASAVA_Build 15 67371754 1D ACAATATTAT A/- ACACCACCAC 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 A 2 1 234156 CASAVA_Build 15 67385126 1D GGTGGAGTGT G/- GGTGTTGTTA 3070 hom 102 het 44 0 34 11 G 3 2 234157 CASAVA_Build 15 67386492 1D ATACATCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 35 0 27 14 T 14 13 234158 CASAVA_Build 15 67389452 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAACAA 543 het 543 ref 27 15 6 7 A 8 7 234159 CASAVA_Build 15 67395970 1D AAGGAAGGAG A/- AATACATTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 2 234160 CASAVA_Build 15 67405830 1D GCTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1335 hom 27 5 12 10 T 17 16 234161 CASAVA_Build 15 67406226 2I CCCCACCCCC --/CT GTTATTAACA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CT 0 1 234162 CASAVA_Build 15 67414176 1D AAGGGAATGT A/- ATTTTGTCTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 2 1 234163 CASAVA_Build 15 67417140 1I CCAAGTAGAG -/T TAAGACTAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 1 2 234164 CASAVA_Build 15 67436871 2D TGCCCAGGTT GG/-- TCTCAAACTC 3070 hom 28 het 15 0 9 6 G 2 0 234165 CASAVA_Build 15 67444037 2D ATATGGTTGC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 50 het 22 0 18 5 TG 9 8 234166 CASAVA_Build 15 67447456 1I GGCTTTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1138 hom 41 4 24 13 T 10 11 234167 CASAVA_Build 15 67447580 1I CTATATAGCT -/G GGATTACGGG 3070 hom 66 het 24 0 23 5 G 2 3 234168 CASAVA_Build 15 67448134 3I TTAAATTTCA ---/ATT ATTATTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATT 2 3 234169 CASAVA_Build 15 67452669 8D CTTTGCTGTG TAACCTAA/-------- TAACCTAATA 3070 hom 84 het 35 0 29 8 TAACCTAA 2 1 234170 CASAVA_Build 15 67457133 1D TCTCAAGGCC A/- CATGGCACCT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 1 0 234171 CASAVA_Build 15 67467303 1I CCTGGATATA -/C CCCCCACCAT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 C 5 6 234172 CASAVA_Build 15 67471536 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 40 het 17 0 14 4 T 9 8 234173 CASAVA_Build 15 67472573 7I AGAGTGGGCA -------/TTCCAGC TGTGGCCCTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 TTCCAGC 0 1 234174 CASAVA_Build 15 67472827 28D CTTGCTGTAT GGCCTCAGGGCAGTCACTGTCCACTCTG/---------------------------- GGCCTCAGGG 3070 hom 56 het 22 0 21 5 GGCCTCAGGGCAGTCACTGTCCACTCTG 1 0 234175 CASAVA_Build 15 67473615 3D AGGACAGCTT AGA/--- GGCAGTTGCT 3070 hom 90 het 34 0 30 7 AGA 1 0 234176 CASAVA_Build 15 67498694 2I CAGAGCAGAC --/AG AGTGATCTTT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AG 1 2 234177 CASAVA_Build 15 67509409 3I CTGTCTCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 AAC 5 6 234178 CASAVA_Build 15 67511615 1I GGAGTGAGAG -/T AGAAAAGGAG 3070 hom 83 het 37 0 28 9 T 0 1 234179 CASAVA_Build 15 67521096 1I CACATCCAAG -/A AAAATCAACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 5 234180 CASAVA_Build 15 67523360 5D TATATTTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 hom 39 het 17 0 14 4 TTTGT 4 3 234181 CASAVA_Build 15 67524944 1I AGATAAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 589 hom 28 2 20 6 A 13 14 234182 CASAVA_Build 15 67528152 1D GAGGCTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 806 hom 33 3 21 9 T 13 12 234183 CASAVA_Build 15 67531221 1I AAAGAAGGTG -/C CCCCCCCCCC 2448 het 338 hom 21 1 10 10 C 10 11 234184 CASAVA_Build 15 67540977 14D CCTGAGGTCG GGAGTTCGAGACCA/-------------- GCCTGGCCAA 3070 hom 37 het 14 0 10 4 GGAGTTCGAGACCA 1 0 234185 CASAVA_Build 15 67543067 27D CTCCTCCTCT CCCTCCTCCTCCCCTACCCCTCCTTTC/--------------------------- CCCTCCTCCT 3070 hom 37 het 18 0 11 9 CCCTCCTCCTCCCCTACCCCTCCTTTC 1 0 234186 CASAVA_Build 15 67544959 4I CATATAAAAC ----/ACTT AGCATAGTTA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 ACTT 0 1 234187 CASAVA_Build 15 67579407 6D GAGCTCAGTG CCCCAC/------ TGAGCTCACT 3070 het 3070 ref 36 20 12 6 CCCCAC 1 0 234188 CASAVA_Build 15 67588891 1I AATAAGTGAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 A 8 9 234189 CASAVA_Build 15 67590128 1D TGTGATGGTC A/- ATATTTTGTG 3070 het 3070 ref 49 22 16 11 A 2 1 234190 CASAVA_Build 15 67596363 1I TTTTGAGTGT -/G GCTATCCAAC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 234191 CASAVA_Build 15 67596886 1I TTTTTTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 36 1 27 8 T 10 11 234192 CASAVA_Build 15 67616463 1I AGAAGGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 10 11 234193 CASAVA_Build 15 67639701 2D CAAAAAAAAA AT/-- ATATATATAG 3070 hom 73 het 28 0 24 5 AT 5 4 234194 CASAVA_Build 15 67646046 1D TCTCGGTCTC A/- ACTGACTTCA 3070 het 16 hom 32 1 28 3 A 2 1 234195 CASAVA_Build 15 67646136 1D TCTTCCTGGT G/- GGCTCGTGGT 3070 het 3070 ref 16 8 8 0 G 3 2 234196 CASAVA_Build 15 67649091 3I GTGCTGGGCC ---/TTA TAGAACTCAG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 TTA 0 1 234197 CASAVA_Build 15 67649926 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1980 het 4 hom 15 0 6 9 A 15 14 234198 CASAVA_Build 15 67654251 1D TGTTTCAGAG A/- AAACAATCCT 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 A 4 3 234199 CASAVA_Build 15 67671592 1D GCACACTGCT G/- GTTATTATTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 2 1 234200 CASAVA_Build 15 67671947 1D TCTCTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 2130 het 1543 hom 44 10 9 26 T 19 18 234201 CASAVA_Build 15 67681807 2D CACAGCACTC TA/-- TAGATCTTCC 3070 het 3070 hom 45 17 22 7 TA 2 1 234202 CASAVA_Build 15 67684523 1I CTCCGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 2601 het 781 hom 15 3 8 4 A 10 11 234203 CASAVA_Build 15 67686262 1I TATAGAGAGA -/T TCCCCAGTTA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 1 2 234204 CASAVA_Build 15 67691533 1D CATCACCCAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 79 het 31 0 27 6 T 9 8 234205 CASAVA_Build 15 67694808 2D GGCCCTTATA AG/-- GGTCAGCCTC 3070 hom 66 het 23 0 21 4 AG 1 0 234206 CASAVA_Build 15 67710667 14I CATGTGTGCA --------------/TGCATGTGTGTGCG TGCATGTGTG 3070 hom 115 het 60 0 38 22 TGCATGTGTGTGCG 0 1 234207 CASAVA_Build 15 67712485 5D ATTTTTTGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 34 11 15 13 TTTTG 4 3 234208 CASAVA_Build 15 67714273 1D TTAAACTTTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 A 8 7 234209 CASAVA_Build 15 67717148 3D CTCTGGGTTG GCT/--- GCTGCTGCTG 3070 hom 137 het 54 0 41 15 GCT 7 6 234210 CASAVA_Build 15 67721425 3I TCCTTTGAGA ---/CTT CTTCTTTGAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTT 2 3 234211 CASAVA_Build 15 67721806 4I TTCTTTTAGT ----/TTTG TTTGTTCTGT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TTTG 1 2 234212 CASAVA_Build 15 67722826 1I CCACAGGCTC -/T ACAGGAAGCG 3070 hom 27 het 14 0 9 5 T 0 1 234213 CASAVA_Build 15 67725733 5D TCATCTGCTC TTTTA/----- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 TTTTA 1 0 234214 CASAVA_Build 15 67734185 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 8 7 234215 CASAVA_Build 15 67751093 1D TGTTTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 T 11 10 234216 CASAVA_Build 15 67752151 5I GTCAATATAA -----/AATAT AATATATCTT 2457 het 2457 ref 21 12 6 3 AATAT 1 2 234217 CASAVA_Build 15 67755126 4D TGCACCAGGC TGAG/---- TGAGGGAGTG 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 TGAG 2 1 234218 CASAVA_Build 15 67759779 1I AGGGGAGATT -/A AGAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 1 2 234219 CASAVA_Build 15 67791297 2D ACACCTTAGG TT/-- TTGCAGAAGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 5 T 4 2 234220 CASAVA_Build 15 67793978 5D GGGAAGAGGG GCTTC/----- TTGCGGTTGC 3070 het 3070 ref 53 26 19 12 GCTTC 1 0 234221 CASAVA_Build 15 67809081 1D ATTATAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2751 hom 24 12 9 3 T 13 12 234222 CASAVA_Build 15 67840334 1D TTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2078 hom 32 8 12 12 A 15 14 234223 CASAVA_Build 15 67879992 2I ACATACATAT --/AC ACACACACAT 1454 het 801 hom 22 6 11 5 AC 4 5 234224 CASAVA_Build 15 67887022 1D TTTTCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 23 2 11 11 A 16 15 234225 CASAVA_Build 15 67893069 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 9 10 234226 CASAVA_Build 15 67895663 3D GGTATCCCTT CTC/--- CTCACTCTAA 3070 het 3070 ref 43 18 16 11 CTC 2 1 234227 CASAVA_Build 15 67897483 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 8 12 12 A 10 11 234228 CASAVA_Build 15 67914241 1D GGGTTTTTGA C/- ATGGGCCTTC 2247 het 2247 ref 23 12 7 4 C 1 0 234229 CASAVA_Build 15 67918106 4I ATCCCCATTG ----/ACAA ACAAAACAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ACAA 1 2 234230 CASAVA_Build 15 67918839 4I TTTTTTTTTC ----/TTCT TTCTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTCT 1 2 234231 CASAVA_Build 15 67919436 1D TGGGGAGGGT G/- GGGGGTGGGG 2235 het 1547 hom 18 6 8 4 G 6 5 234232 CASAVA_Build 15 67927553 1I TGCCAAAATG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 6 7 234233 CASAVA_Build 15 67933615 1D AAAATCCAGG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 9 8 234234 CASAVA_Build 15 67948883 1I TCAAAAGGGC -/A AAAAACAGGT 3070 hom 95 het 38 0 30 8 A 5 6 234235 CASAVA_Build 15 67965033 1D GTAGGGGCGT C/- CCCGGGGAGG 1738 het 1738 ref 24 17 4 3 C 4 3 234236 CASAVA_Build 15 67978251 6D GAACCATTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2108 het 497 hom 25 5 7 14 T 22 16 234237 CASAVA_Build 15 67978443 1I TAGTAGAGAC -/G GGAGGGGAAC 2112 het 2112 ref 24 12 7 5 G 2 3 234238 CASAVA_Build 15 67978971 7D TCTTTTTTCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 18 4 10 4 T 18 11 234239 CASAVA_Build 15 67986912 2D AAGCTGCTTT AA/-- AAAAAAAAAC 2482 het 2482 ref 22 10 9 4 A 11 9 234240 CASAVA_Build 15 67995981 5I TGTGGATGTC -----/CATCT CTCCTGCCTG 3070 hom 84 het 32 0 27 5 CATCT 0 1 234241 CASAVA_Build 15 67997364 2I AATTTCATTT --/TG TGTTGTGTAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TG 1 2 234242 CASAVA_Build 15 68011518 2D ATTCACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 91 het 39 0 29 12 AC 6 5 234243 CASAVA_Build 15 68062878 1I GAGAGGACCT -/G GGCAGGTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 2 3 234244 CASAVA_Build 15 68102875 2I CTCTATTGTG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 15 18 15 AC 7 8 234245 CASAVA_Build 15 68121511 1D CCACATTAAA G/- GATTCCCCTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 2 1 234246 CASAVA_Build 15 68126090 7D GAGACGCAGC AGGAGGA/------- AGGAGGAAGC 3070 hom 80 het 34 0 26 11 AGGAGGA 2 1 234247 CASAVA_Build 15 68126986 1D TCCCGCCCAG C/- CCCCCGACTC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 6 5 234248 CASAVA_Build 15 68128043 1D GACCAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1537 hom 28 8 16 4 A 10 9 234249 CASAVA_Build 15 68129769 1D AAGAGGAGGT G/- GGGGAGGCTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 G 5 4 234250 CASAVA_Build 15 68134871 1I GAGGTAGACA -/G TGATTAACAG 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 G 0 1 234251 CASAVA_Build 15 68157802 1D AAAAATAAAC A/- AAAAAAACCA 3070 hom 147 het 55 0 49 6 A 8 7 234252 CASAVA_Build 15 68159457 1D CCAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 34 1 16 17 A 17 16 234253 CASAVA_Build 15 68162660 1D TTAGGACTCT A/- AAGAGTTTCA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 3 2 234254 CASAVA_Build 15 68199148 2D TCCAACCCCC CA/-- CCCCACTTCC 3070 het 2154 hom 25 9 13 3 CA 1 0 234255 CASAVA_Build 15 68222709 1D TCCTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1738 het 1200 hom 19 8 6 5 T 15 14 234256 CASAVA_Build 15 68272216 1D CTAAGAGCCA G/- GGGGATGCGG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 G 5 4 234257 CASAVA_Build 15 68276399 8I CCCGTCTGTA --------/GGAAGCAG GGCCCCAGCA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 GGAAGCAG 0 1 234258 CASAVA_Build 15 68292180 2D AGATTAAGGG GA/-- GATTACAGGA 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 GA 2 1 234259 CASAVA_Build 15 68303387 1I TGCAAAATGT -/C CCCTGGGGGG 3070 hom 114 het 44 0 36 8 C 3 4 234260 CASAVA_Build 15 68311246 1D TTATGAGCCC T/- CTGATTTCTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 T 1 0 234261 CASAVA_Build 15 68315321 1D CTATTTTGCC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 7 T 7 6 234262 CASAVA_Build 15 68328464 1I GGTTCCTGTG -/C CCTGGGCTGG 3070 hom 115 het 47 0 36 11 C 2 3 234263 CASAVA_Build 15 68362335 12D GGATGAATAA ATGGATGGATGG/------------ ATGGATGGAT 3070 het 1091 hom 36 12 13 15 ATGG 6 3 234264 CASAVA_Build 15 68366348 1D AGCAATGGGC G/- GGGGGGGGGG 1394 het 19 hom 15 1 4 11 G 11 10 234265 CASAVA_Build 15 68366412 1I TAATGACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 10 11 234266 CASAVA_Build 15 68367367 2I AAAAATATAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 AG 7 8 234267 CASAVA_Build 15 68367554 1D AATTTCTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 75 het 29 0 25 5 A 8 7 234268 CASAVA_Build 15 68368114 3D GTAAAATGGG AAT/--- AATAACAGCT 3070 het 3070 ref 48 25 17 7 AAT 2 1 234269 CASAVA_Build 15 68368581 5D CTTCAAGCCA CCCCC/----- CCCCCCCCAT 3070 hom 28 het 23 0 17 9 C 13 8 234270 CASAVA_Build 15 68368629 2D GGGGAATGTC TT/-- CGCCTTGCTA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 2 0 234271 CASAVA_Build 15 68368755 11D CATTGGCAGA GGTTAGCAAAC/----------- GGTCAGCCTG 3070 het 3070 ref 40 26 13 6 GGTTAGCAAAC 1 0 234272 CASAVA_Build 15 68369527 3D AAGGGAAGTA GAG/--- GAGGAGAAGA 3070 het 3070 ref 43 17 15 13 GAG 3 2 234273 CASAVA_Build 15 68372243 1I GCAGACCTGT -/G GGATTCACAC 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 G 2 3 234274 CASAVA_Build 15 68372831 1D CAAAACTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 A 12 11 234275 CASAVA_Build 15 68376349 2D TCTTTTTTTT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 352 hom 31 5 12 15 GA 9 8 234276 CASAVA_Build 15 68376952 1D TGAATATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 796 hom 28 7 14 7 T 12 11 234277 CASAVA_Build 15 68382050 4D GGGCAGATGA ATGG/---- ATGGATGGAT 3070 het 3070 ref 60 22 18 21 ATGG 4 3 234278 CASAVA_Build 15 68382921 8I TGGAGGGGTA --------/GATAAGTG GATGAATGGA 3070 het 3070 ref 52 25 16 11 GATAAGTG 0 1 234279 CASAVA_Build 15 68387212 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 8 7 234280 CASAVA_Build 15 68389091 13I CCCAGCTGGA -------------/CTTTTCCCTTTAG CTTAGTGATT 3070 hom 48 het 19 0 14 5 CTTTTCCCTTTAG 0 1 234281 CASAVA_Build 15 68390265 1D GTTTTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 2400 het 296 hom 18 3 5 10 A 11 10 234282 CASAVA_Build 15 68396625 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 35 1 27 7 A 12 11 234283 CASAVA_Build 15 68399754 1D GGTGACCAAC A/- TGTGCTAATT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 A 1 0 234284 CASAVA_Build 15 68404868 1D CACCTCCTGG C/- CCTTAATTAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 C 3 2 234285 CASAVA_Build 15 68408374 2D GCTTTCTAGC CT/-- CTGTTTCCTC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 CT 2 1 234286 CASAVA_Build 15 68428051 2I ACTGTGGACC --/CT CTTTCTTGGG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 CT 1 2 234287 CASAVA_Build 15 68431335 2I TCCTGACCTG --/AC AGGGGTTTGC 3070 het 3070 hom 49 19 19 11 AC 0 1 234288 CASAVA_Build 15 68446221 1D TAATCATTAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 9 8 234289 CASAVA_Build 15 68461429 1I TACCATTGAA -/G AAAATGCTAC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 G 0 1 234290 CASAVA_Build 15 68462853 1D CCAGCCACCG T/- TTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 5 4 234291 CASAVA_Build 15 68468346 1D AAATATGGAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 8 7 234292 CASAVA_Build 15 68475402 1D TGATAAAAGC A/- AAGATCTGAA 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 A 3 2 234293 CASAVA_Build 15 68480872 1D TCTCTTGCTT C/- CCCACTCACT 3070 het 3070 ref 32 20 9 4 C 4 3 234294 CASAVA_Build 15 68486401 1I GACTGAGGGG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 A 8 9 234295 CASAVA_Build 15 68491627 1D TGTGTTAGCT G/- GGGTGTCTGC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 G 4 3 234296 CASAVA_Build 15 68496274 1D CATGTTAGCA C/- CCCCCACACG 3070 het 3070 hom 54 26 24 4 C 6 5 234297 CASAVA_Build 15 68508575 2D TACGCAGGAC TA/-- TGTGACTAGC 3070 het 3070 ref 47 28 17 2 TA 1 0 234298 CASAVA_Build 15 68525130 1I CAAAATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 10 11 234299 CASAVA_Build 15 68526399 1D GACTGTTATC A/- TGATCATCAT 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 A 1 0 234300 CASAVA_Build 15 68529209 8D GATGGTTGGG TGGAGGGA/-------- TGGAGGGATG 2659 het 1488 hom 31 8 10 14 TGGAGGGA 3 2 234301 CASAVA_Build 15 68529610 16D TGGATGGAGA GATAAAGGGATGGGTG/---------------- GATAAAGGGA 2751 het 2751 ref 42 20 10 17 GATAAAGGGATGGGTG 1 0 234302 CASAVA_Build 15 68532275 1D GAGACGGGGT C/- CCCCTGTGCT 780 het 524 hom 9 3 3 3 C 5 4 234303 CASAVA_Build 15 68533051 4D TTTCTTCTTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 45 het 20 0 15 6 CTTT 4 3 234304 CASAVA_Build 15 68539970 6D TTAGCAAGAG TGCAGA/------ TGCAGAGCCA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TGCAGA 2 1 234305 CASAVA_Build 15 68543722 1D TTAATTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 7 T 10 9 234306 CASAVA_Build 15 68559289 1D TTTGAGCCAT C/- CGAGTGAATC 3070 hom 51 het 20 0 14 6 C 2 1 234307 CASAVA_Build 15 68560096 8D CACAAATGCA GTGAGTGG/-------- GTGAGTGGGC 3070 hom 64 het 28 0 18 15 GTGAGTGG 2 1 234308 CASAVA_Build 15 68561528 1I TTCTCCCCCC -/T CAGCCTCCCG 2642 hom 21 het 8 0 7 1 T 0 1 234309 CASAVA_Build 15 68563842 4D GAGACCCTGC GTAA/---- GTGTCAGCTC 3070 hom 93 het 33 0 29 4 GTAA 1 0 234310 CASAVA_Build 15 68564872 6I AGAAGAGGTA ------/CAGAAT CAACCCAAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CAGAAT 0 1 234311 CASAVA_Build 15 68565737 2I AGCTGGAGTC --/TT TACCTCCCTG 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 1 3 234312 CASAVA_Build 15 68567350 1D AGCCACCTAA C/- CCAATTCCTT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 C 3 2 234313 CASAVA_Build 15 68570544 5I TGAAAGGTGC -----/GGAGG GGAGGGGAGG 3070 hom 116 het 46 0 35 11 GGAGG 2 3 234314 CASAVA_Build 15 68572019 1I GAACCAAGCT -/G GGGCTCGGGC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 G 3 4 234315 CASAVA_Build 15 68595301 1I AATACAAAAA -/T TTTTTTAAAA 2733 het 2733 ref 24 11 8 5 T 6 7 234316 CASAVA_Build 15 68604604 4D GACACATAAA TTAG/---- TTACTTAGTT 3070 het 3070 hom 44 13 27 7 TTAG 1 0 234317 CASAVA_Build 15 68617076 3I CTGCTTAGAG ---/AAC AACAATAGGA 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 AAC 1 2 234318 CASAVA_Build 15 68629846 1D GGCTGTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 33 1 19 13 T 15 14 234319 CASAVA_Build 15 68636232 1D CCAGACAGAC A/- AGAGACAAAC 3070 hom 73 het 31 0 21 11 A 2 1 234320 CASAVA_Build 15 68636552 3D GGTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 35 0 22 15 T 15 12 234321 CASAVA_Build 15 68642158 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2854 het 441 hom 29 2 12 15 A 14 13 234322 CASAVA_Build 15 68645452 1I TTTTGCATGT -/A AGATAGTGAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 2 234323 CASAVA_Build 15 68653183 1D GGAGAGAAAA G/- GGAAAGAGTT 3070 hom 126 het 46 0 40 7 G 3 2 234324 CASAVA_Build 15 68662414 2I CATCCAGCCC --/AG GGGGGGGGGG 1357 hom 45 het 23 0 10 13 AG 0 1 234325 CASAVA_Build 15 68667188 3D TTAAAAACGG AGA/--- AGATCTGCTT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 AGA 2 1 234326 CASAVA_Build 15 68686953 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 7 8 234327 CASAVA_Build 15 68688707 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2680 het 436 hom 12 1 10 1 A 15 14 234328 CASAVA_Build 15 68712572 16I CTTCCCAGGA ----------------/CGCCATCCGGGGAGGC CAGGTGTTTA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 CGCCATCCGGGGAGGC 0 1 234329 CASAVA_Build 15 68714188 1I TCTCTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 29 0 26 4 A 13 14 234330 CASAVA_Build 15 68750411 1D TTTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 11 10 234331 CASAVA_Build 15 68751656 1D TGCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAG 1097 het 1097 ref 48 39 3 6 A 10 9 234332 CASAVA_Build 15 68759428 1D AACTCAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 15 14 234333 CASAVA_Build 15 68819570 4D TTAAATACAT AAGA/---- AATACTGTGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAGA 1 0 234334 CASAVA_Build 15 68819845 1D TGTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 15 14 234335 CASAVA_Build 15 68825217 1D TACAACCATC T/- GACCTTTGAC 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 1 0 234336 CASAVA_Build 15 68841645 2I AAAGGCATAA --/CT CTGAATTAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 1 2 234337 CASAVA_Build 15 68877447 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1364 het 1364 ref 15 7 3 5 A 12 11 234338 CASAVA_Build 15 68895262 1I TTTAAACAAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 T 8 9 234339 CASAVA_Build 15 68899479 1I ATTTTCTCTT -/A TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 0 1 234340 CASAVA_Build 15 68902424 1D GTTCAATTAA T/- TTTACCAGCA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 T 4 3 234341 CASAVA_Build 15 68944761 2I CTAAAGAGAA --/CT AGACATTCAC 3070 het 3070 ref 26 13 13 0 CT 0 1 234342 CASAVA_Build 15 68946461 1D GATGGCCAAG T/- TGCCCAAGGC 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 T 2 1 234343 CASAVA_Build 15 68947457 1D GGGAAAGGGA G/- GGGGGTGCTA 3070 hom 98 het 38 0 33 5 G 6 5 234344 CASAVA_Build 15 68949779 1D TGGTTACCAC T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 T 7 6 234345 CASAVA_Build 15 68972908 2D TGTTTGTACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2751 hom 29 9 13 8 T 12 10 234346 CASAVA_Build 15 68980243 2I AATTCTCCAA --/AT ATATAAGATG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 AT 2 3 234347 CASAVA_Build 15 69025033 1D ATTAAAGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 T 11 10 234348 CASAVA_Build 15 69034123 4I GATGCATGCT ----/CTAA CTAACCCTGT 3070 hom 78 het 29 0 25 5 CTAA 1 2 234349 CASAVA_Build 15 69055190 1D TTTGCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1388 het 1388 ref 49 35 5 9 A 11 10 234350 CASAVA_Build 15 69060989 1D TGCTTTTCTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 8 7 234351 CASAVA_Build 15 69078166 1D TTCTTTCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 10 9 234352 CASAVA_Build 15 69129622 1D TCCTGGGAAT C/- ACTATGGGCA 3070 het 3070 hom 42 18 20 6 C 1 0 234353 CASAVA_Build 15 69130238 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 926 het 926 ref 16 7 2 7 T 13 12 234354 CASAVA_Build 15 69137344 2D ATAAATCAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 1711 hom 20 4 10 6 TA 10 9 234355 CASAVA_Build 15 69138012 1I AACAGGCACA -/C ACCACCATGT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 0 1 234356 CASAVA_Build 15 69143743 1I CACTCTGTTG -/C CCAAACTGGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 2 3 234357 CASAVA_Build 15 69176056 6I TAGATGGAAG ------/AGTTCT AGCTGCTGTA 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 AGTTCT 0 1 234358 CASAVA_Build 15 69193317 1D GTTGCGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 11 10 234359 CASAVA_Build 15 69224950 1D AAATACAACC A/- AAAGGGTTGA 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 A 4 3 234360 CASAVA_Build 15 69227909 1D ATAGAATGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 T 10 9 234361 CASAVA_Build 15 69244745 2I TCCTCCCGAC --/AA GTTTGCACAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 0 2 234362 CASAVA_Build 15 69259536 1D AGAGTATAAT A/- AAAAAAAAAC 501 hom 5 het 7 0 2 5 A 10 9 234363 CASAVA_Build 15 69263117 15I TACTTTCCTT ---------------/CTATTGTCATGGGTA CTATCTACCC 3070 hom 111 het 39 0 38 3 CTATTGTCATGGGTA 0 1 234364 CASAVA_Build 15 69264995 4D ATGTAGAATC TTTG/---- TTTGAGAATA 3070 het 3070 hom 44 19 21 7 TTTG 2 1 234365 CASAVA_Build 15 69269063 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 13 14 234366 CASAVA_Build 15 69271298 6D CTTCTTCTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 910 hom 20 6 8 6 T 16 10 234367 CASAVA_Build 15 69273110 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 62 het 25 0 21 4 T 9 8 234368 CASAVA_Build 15 69282894 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2592 hom 25 10 10 5 A 9 10 234369 CASAVA_Build 15 69285263 1D GGAGATTCTC T/- TTTTTTTTTT 1194 het 1194 ref 39 18 3 18 T 17 16 234370 CASAVA_Build 15 69295430 1D TAAGAAGCAT A/- AATATGCCAA 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 A 3 2 234371 CASAVA_Build 15 69295622 1I ACAAAAAGTG -/T TAAGATGTGC 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 1 2 234372 CASAVA_Build 15 69299484 1D ACGTGAGTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 12 20 11 A 10 9 234373 CASAVA_Build 15 69304537 3D CCAGAAAAAT GAA/--- GAAGAGGAAA 3070 het 3070 ref 44 19 20 7 GAA 2 1 234374 CASAVA_Build 15 69342043 2I GCTGAACTAA --/AG AGAGTGGCAA 3070 hom 122 het 45 0 40 5 AG 2 3 234375 CASAVA_Build 15 69350213 13I AGTGGTCAGG -------------/TGGTCAGTGAGTA TAGCCATCTC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TGGTCAGTGAGTA 0 1 234376 CASAVA_Build 15 69359178 1D TTTCCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 33 0 29 5 A 12 11 234377 CASAVA_Build 15 69361811 4I65M1D AGGAAGAAAT ----AGGAAAAAAGAAGACAAGGAGATGTGTTACTTGTTTGTAAATGTGAGGTTGATCCTGTAGCTGTCA/AGAAAGGAAAAAAGAAGACAAGGAGATGTGTTACTTGTTTGTAAATCTGAGGTTGATCCTGTAGCTGTC- ACAGTCCTGT 3070 het 3070 hom 37 17 17 32 N/A 0 0 234378 CASAVA_Build 15 69369819 1D GTCATTTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 10 9 234379 CASAVA_Build 15 69377940 1D CTCTTCTAGT C/- CCCCCCTTAG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 7 6 234380 CASAVA_Build 15 69387884 4I TTTATTTTGT ----/TTTC TTTCTTTATT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 TTTC 1 2 234381 CASAVA_Build 15 69389559 4D TTTTACCTAC CTAT/---- CTGTCTTTTA 3070 hom 135 het 49 0 46 4 CTAT 1 0 234382 CASAVA_Build 15 69421530 6D GCTTCTTCAT AAAAAA/------ AAAAGGTGGG 3070 het 3070 hom 30 10 17 5 A 10 4 234383 CASAVA_Build 15 69425191 1D TGGGTGTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 2742 hom 26 9 15 2 G 1 0 234384 CASAVA_Build 15 69425520 2I GTCGCATCTC --/TT TGGTCTCCTT 3070 het 3070 ref 54 26 21 7 T 1 3 234385 CASAVA_Build 15 69432757 4D ATTAGCAAAC ACTT/---- AATCTGATTG 3070 het 3070 ref 48 25 20 4 ACTT 1 0 234386 CASAVA_Build 15 69439243 1D ACAAGCAAAC A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 40 18 17 7 A 8 7 234387 CASAVA_Build 15 69464977 9D TGGAGTTCGC TAAAGCGAA/--------- TAAATTTGAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TAAAGCGAA 1 0 234388 CASAVA_Build 15 69468859 1I GAATTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1327 hom 33 4 14 15 T 14 15 234389 CASAVA_Build 15 69473472 3I ATACACAATA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 15 11 T 13 16 234390 CASAVA_Build 15 69483238 2I TGACACATAC --/TA TAATGCTCAT 3070 hom 117 het 43 0 37 6 TA 1 2 234391 CASAVA_Build 15 69484292 4D TTTCTTTGCT TTTC/---- TTTTTTGACA 2653 het 112 hom 14 1 10 4 TTTC 1 0 234392 CASAVA_Build 15 69485307 1I GTAAATTGAA -/T TTCTTTTTCA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 T 2 3 234393 CASAVA_Build 15 69487561 1D ACTTAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 A 11 10 234394 CASAVA_Build 15 69488549 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCCCCCTC 3070 het 665 hom 33 8 17 8 C 9 8 234395 CASAVA_Build 15 69498608 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 9 8 234396 CASAVA_Build 15 69516515 1D GTGGAAGGTG A/- AGTGGGAGCA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 A 2 1 234397 CASAVA_Build 15 69517720 4D CTTATGAAAT TTTG/---- TTTATTTTTG 3070 het 3070 ref 30 16 13 3 TTTG 1 0 234398 CASAVA_Build 15 69523088 2I AAATTTCCAC --/AT GTTGCGCTTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AT 0 1 234399 CASAVA_Build 15 69529044 1D GATGATAATC G/- GTTGTCCCCA 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 G 2 1 234400 CASAVA_Build 15 69534815 3I GTGTGTGATT ---/GAA GGAGAGTGTT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 GAA 0 1 234401 CASAVA_Build 15 69557359 1D CCCCAAGGAT G/- GGGAGGTGGT 3070 hom 112 het 42 0 36 6 G 4 3 234402 CASAVA_Build 15 69561087 4I ATAAGAAAAA ----/AAAG GAAGGACAAG 3070 hom 91 het 35 0 31 4 AAAG 0 1 234403 CASAVA_Build 15 69567917 15I GGAAATCTTA ---------------/AATGAAACCAGCCAG ATCTCATACT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 AATGAAACCAGCCAG 0 1 234404 CASAVA_Build 15 69569219 2D ATTTTAAACA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 11 9 234405 CASAVA_Build 15 69571097 1I ACTCCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 A 10 11 234406 CASAVA_Build 15 69576912 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2875 hom 20 6 11 3 A 9 10 234407 CASAVA_Build 15 69578894 1D TTATTATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2311 hom 29 10 10 10 A 13 12 234408 CASAVA_Build 15 69586812 14I CTCATAAACT --------------/GCACTATTTTTAGG GCACTATTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GCACTATTTTTAGG 0 1 234409 CASAVA_Build 15 69592138 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 8 7 234410 CASAVA_Build 15 69592509 5D ATCTCATGGG AGACC/----- AGACATCCAC 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 AGACC 1 0 234411 CASAVA_Build 15 69609550 3I CCTGTTAGAA ---/ATT ATTATTATTG 3070 het 3070 hom 38 9 18 11 ATT 3 4 234412 CASAVA_Build 15 69609993 1I ACATCTATTT -/A AATATGGTAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 2 3 234413 CASAVA_Build 15 69610198 1I CAAGCCCCCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 10 11 234414 CASAVA_Build 15 69611474 4D CATGCTGAGG AGTA/---- AGTAAGGTTA 3070 het 3070 ref 55 24 21 14 AGTA 2 1 234415 CASAVA_Build 15 69611870 2D TGCCCAGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 2503 het 2444 hom 19 10 7 2 T 12 10 234416 CASAVA_Build 15 69617789 1D7M1I CACACGAAAT CCCTCTAC-/-CATGTGCA ATGTTTAGTC 3070 het 3070 hom 38 17 17 9 N/A 0 0 234417 CASAVA_Build 15 69627172 1I GCTGTAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 11 12 234418 CASAVA_Build 15 69635777 3I CCTAGGTTCC ---/TTG TTATTTTTAT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 TTG 0 1 234419 CASAVA_Build 15 69638959 1I CTTTTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 2667 het 2667 ref 31 16 9 6 T 11 12 234420 CASAVA_Build 15 69643006 4D ACACTGAAGT AGAC/---- AGACAGTAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 6 AGAC 2 1 234421 CASAVA_Build 15 69645035 1I GGTAGAGACC -/T TTATCCCTCT 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 T 2 3 234422 CASAVA_Build 15 69645550 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 31 1 13 17 T 13 12 234423 CASAVA_Build 15 69649807 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 48 1 41 7 T 11 10 234424 CASAVA_Build 15 69654494 2D CATTTTACTG CA/-- CCATGGGAGA 3070 het 3070 ref 62 38 19 8 CA 1 0 234425 CASAVA_Build 15 69655500 1D TTTTTTGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 13 12 234426 CASAVA_Build 15 69658215 1D AATTTGACTT G/- GGGGACTCTG 2669 het 2489 hom 16 6 8 2 G 5 4 234427 CASAVA_Build 15 69662968 2D TTTTGCTGCG TC/-- TCTTATAAGT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 TC 2 1 234428 CASAVA_Build 15 69663867 1D TTGCCACATT G/- GCCAGGCTGG 3070 het 2497 hom 17 6 7 4 G 2 1 234429 CASAVA_Build 15 69669739 3I TGGACTAGGT ---/TGA TGATAGGAAT 3070 hom 65 het 27 0 20 7 TGA 1 2 234430 CASAVA_Build 15 69671190 1D ACTGAGAAAC A/- AAAAAGTGGG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 6 5 234431 CASAVA_Build 15 69673306 1I CCCCTTCCCA -/C CCCCCCCGGC 1808 het 1700 hom 13 6 5 2 C 7 8 234432 CASAVA_Build 15 69675010 1I TGTTCAGAAC -/T TTGGAAGCTC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 2 3 234433 CASAVA_Build 15 69679616 3D AAGTCTTGCT CTC/--- CTCCTGGAGT 3070 het 3070 ref 57 26 21 14 CTC 2 1 234434 CASAVA_Build 15 69684222 2I AAACAAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 2894 het 2894 ref 38 20 10 8 A 10 12 234435 CASAVA_Build 15 69691276 1I ATGAGGATGT -/A AATGGTGGGG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 2 3 234436 CASAVA_Build 15 69704029 1D ACCTGCCCTC T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 47 20 16 12 T 8 7 234437 CASAVA_Build 15 69706897 1D ATGAGAAGTA G/- GTTTAGCTTT 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 G 2 1 234438 CASAVA_Build 15 69713581 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2916 het 358 hom 16 4 7 5 A 16 15 234439 CASAVA_Build 15 69719244 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAGAAAAG 3070 het 50 hom 28 3 18 7 G 1 0 234440 CASAVA_Build 15 69731041 1D TTCACCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 T 11 10 234441 CASAVA_Build 15 69733326 16I CTGCACAGGA ----------------/CTCTGCCCATCTCCCT CTCGACATTT 3070 het 3070 ref 40 16 16 9 CTCTGCCCATCTCCCT 0 1 234442 CASAVA_Build 15 69740792 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTTTTTTTTT 380 het 380 ref 32 10 4 18 TTA 1 0 234443 CASAVA_Build 15 69741657 1D GTGGTTTTAC G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 47 het 36 1 25 11 G 8 7 234444 CASAVA_Build 15 69742645 1I ACACTATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 11 8 A 10 11 234445 CASAVA_Build 15 69743853 1D CAGACTTGTA T/- TTATTAATGC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 3 2 234446 CASAVA_Build 15 69744741 1D AATGGGGTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 27 0 27 1 T 9 8 234447 CASAVA_Build 15 69761966 1D TGTATCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 15 14 234448 CASAVA_Build 15 69763911 1D TCTTGTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 13 12 234449 CASAVA_Build 15 69764596 1I TCCTCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 10 11 234450 CASAVA_Build 15 69767163 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AAACAAACCA 3050 het 61 hom 27 1 12 14 AAC 0 1 234451 CASAVA_Build 15 69768080 1I GTTGTTGAGG -/T TTTTTTTTTG 2491 het 2491 ref 20 7 8 5 T 9 10 234452 CASAVA_Build 15 69772374 3I TCCTAAACAG ---/ATA ATGAGAGTGA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 ATA 0 1 234453 CASAVA_Build 15 69777312 1I GAAATAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3025 hom 37 8 17 12 T 11 12 234454 CASAVA_Build 15 69791067 2I AAAGGTAATG --/AT ATATATATAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AT 4 5 234455 CASAVA_Build 15 69793452 1I GGACAAAGTA -/T CAGGTTGGTG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 0 1 234456 CASAVA_Build 15 69794997 2I TGTATGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 TG 5 6 234457 CASAVA_Build 15 69795169 3D AGGCTCTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 836 hom 24 6 7 11 T 14 11 234458 CASAVA_Build 15 69795933 4D AGCACTTTCC TGTT/---- TGTTTTATAG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TGTT 2 1 234459 CASAVA_Build 15 69795984 1I TTGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 534 hom 22 4 10 8 T 11 12 234460 CASAVA_Build 15 69796993 3D TTAGCATAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1471 hom 27 10 8 9 A 15 12 234461 CASAVA_Build 15 69797542 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 21 0 14 7 A 17 16 234462 CASAVA_Build 15 69801063 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 9 234463 CASAVA_Build 15 69803978 1D ACGCCCAGTC T/- TTTTTGCCTA 3070 hom 48 het 21 0 17 10 T 6 5 234464 CASAVA_Build 15 69807163 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2284 hom 18 het 8 0 7 1 A 10 11 234465 CASAVA_Build 15 69815743 8D TGACTCTCTG TCTTGCTC/-------- TCTTGCTCTC 3070 het 3070 ref 67 37 21 13 TCTTGCTC 2 1 234466 CASAVA_Build 15 69819195 1D TTTGGGGTGG T/- TTTTTTTTTT 2761 het 1283 hom 33 10 11 12 T 12 11 234467 CASAVA_Build 15 69819224 1D TTTGCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 840 het 840 ref 31 11 3 17 T 11 10 234468 CASAVA_Build 15 69822448 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 8 7 234469 CASAVA_Build 15 69834222 1I AGAAGCAGTT -/A AGACTTGAGG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 1 2 234470 CASAVA_Build 15 69869230 6I CATGCACACT ------/CATACA CATACACACA 3070 hom 189 het 71 0 58 13 CATACA 1 2 234471 CASAVA_Build 15 69882689 1I ACAACAACAA -/C AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 C 0 1 234472 CASAVA_Build 15 69883555 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1296 hom 31 4 19 8 A 14 15 234473 CASAVA_Build 15 69887036 1D TACACCCACC T/- TCCACCTCTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 2 1 234474 CASAVA_Build 15 69888906 1D GAGCAGCGCA G/- GGGGCTGGTG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 G 5 4 234475 CASAVA_Build 15 69892983 1D TGGCGGTGGA C/- CCCCACGGAG 3070 hom 59 het 26 0 18 10 C 5 4 234476 CASAVA_Build 15 69895985 1D AACAATAAAT A/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 1 0 234477 CASAVA_Build 15 69904844 4I TATTTAATAC ----/TGAT TGATAGTCTG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 TGAT 1 2 234478 CASAVA_Build 15 69906794 1D ACCTCACAGT G/- GGGGCACAAT 3070 het 3070 ref 31 16 15 1 G 5 4 234479 CASAVA_Build 15 69922311 2I TGTGTATGCA --/TG TGTGTGTGTG 2588 het 2014 hom 18 7 7 4 TG 7 8 234480 CASAVA_Build 15 69926154 1D AGCCTTCCAT C/- CCCCCCATTC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 C 7 6 234481 CASAVA_Build 15 69929086 24D ATACTGAAGT ATTAAGACCAAAGGATTCAGAGCC/------------------------ ATTAAGACCA 3070 het 3070 ref 26 23 8 4 ATTAAGACCAAAGGATTCAGAGCC 1 0 234482 CASAVA_Build 15 69930018 1D AAATTAGCCA G/- GGTGTGGTGG 3070 hom 56 het 20 0 19 1 G 3 2 234483 CASAVA_Build 15 69939279 1D TTAGACCTAC G/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 G 1 0 234484 CASAVA_Build 15 69940530 3D TTTCAGACTC ATT/--- ATAATTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 ATT 1 0 234485 CASAVA_Build 15 69948467 1D TGGAATTTTT A/- AAAAATCACT 3070 het 3070 ref 29 13 12 5 A 6 5 234486 CASAVA_Build 15 69963332 5D ACTTCTCTGG GTTTT/----- GTTATTTCTA 3070 het 3070 hom 28 13 14 3 GTTTT 1 0 234487 CASAVA_Build 15 69970261 1I GTTTGTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 11 12 A 10 11 234488 CASAVA_Build 15 69975336 3D ATTAATAGAC ATT/--- AAAGAATATT 3070 het 3070 hom 46 22 19 6 ATT 1 0 234489 CASAVA_Build 15 69991654 1I AAGAGAAAAG -/T TTTTTTTTTT 2517 het 1080 hom 18 4 7 7 T 14 15 234490 CASAVA_Build 15 69993279 3D CTCATGTAAT AAA/--- AGGTCGTTTC 3070 het 3070 hom 52 23 23 7 A 4 1 234491 CASAVA_Build 15 70001996 1D TCCCTTTCCC T/- TTCCCACCCT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 T 3 2 234492 CASAVA_Build 15 70003460 1D TTTCTTTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 9 8 234493 CASAVA_Build 15 70004581 2D11M4D6M8D16M4D CATATATACA TGTGTATATATACACATATATACATGTGTATATATACACATATATACACAT/--CGTATATATAC----ATATAC--------GTATACACATATATAC---- ATATATACAT 3070 het 3059 hom 16 11 14 2 N/A 0 0 234494 CASAVA_Build 15 70016333 1I CTGGCTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3033 hom 39 14 14 11 A 12 13 234495 CASAVA_Build 15 70017748 3I AAAAAACAAA ---/GAG ATTTTATGAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 GAG 0 1 234496 CASAVA_Build 15 70025122 1D GTACAATTTC T/- TTTTGTTGCC 3070 het 3070 hom 70 31 37 2 T 5 4 234497 CASAVA_Build 15 70028348 1D TTTTTTTGTG A/- GGGGGGGGGA 3070 het 2046 hom 28 8 11 9 A 1 0 234498 CASAVA_Build 15 70030836 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 T 11 10 234499 CASAVA_Build 15 70036138 9D TACACATATG TAGCATATA/--------- TAGCATATAT 3070 het 3070 ref 24 15 7 4 TAGCATATA 2 1 234500 CASAVA_Build 15 70039244 1I GTAGAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 818 hom 34 4 17 13 A 15 16 234501 CASAVA_Build 15 70039770 2I TCTCCATCTC --/TT GTTCCCTCTC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 T 0 2 234502 CASAVA_Build 15 70058173 1I TCTTTAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 25 1 20 4 T 13 14 234503 CASAVA_Build 15 70069485 1I ATATAAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 924 hom 35 2 17 16 T 15 16 234504 CASAVA_Build 15 70090410 1D AGATATGTTA T/- TTTTTTTTTT 1220 het 1220 ref 30 19 3 8 T 12 11 234505 CASAVA_Build 15 70090993 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 A 10 9 234506 CASAVA_Build 15 70108116 1I TTCTAGGCTA -/C TATACCACTA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 C 0 1 234507 CASAVA_Build 15 70114764 1D TGAAAATAAC G/- AAATGTCCAC 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 G 1 0 234508 CASAVA_Build 15 70116438 1I CTCATCCTAC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 0 1 234509 CASAVA_Build 15 70121411 1I CACTGACAGT -/A AAAAAAAAAA 3036 het 3036 ref 31 9 12 10 A 14 15 234510 CASAVA_Build 15 70123329 2D TTCCCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 608 hom 40 7 19 15 T 18 16 234511 CASAVA_Build 15 70127792 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3033 hom 23 10 12 1 A 14 13 234512 CASAVA_Build 15 70132804 1I CCGTCTCAAA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 2856 hom 27 11 12 4 G 1 2 234513 CASAVA_Build 15 70146496 3D ATTACATAAT ATA/--- ATCTTATATG 2411 het 1972 hom 11 4 5 2 ATA 1 0 234514 CASAVA_Build 15 70156422 1I AACTACATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 A 13 14 234515 CASAVA_Build 15 70160895 4I ATTCTGTAGA ----/CTGT CTGTTTACTC 3070 hom 85 het 31 0 29 2 CTGT 1 2 234516 CASAVA_Build 15 70173295 1I AAAATTAAAT -/A AAAAAAAACC 3025 hom 18 het 8 0 7 1 A 8 9 234517 CASAVA_Build 15 70173762 5I CAGATAGTGA -----/TTTTT TTTTTTAACA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 6 11 234518 CASAVA_Build 15 70185661 1D CTGCTTGAGG C/- CAGGAGTTCA 3070 het 3070 ref 23 10 11 3 C 2 1 234519 CASAVA_Build 15 70189293 1D TCTGTCTCAC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 7 6 234520 CASAVA_Build 15 70200961 1D GTGTCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 839 hom 20 3 14 3 A 13 12 234521 CASAVA_Build 15 70206027 1I CTCAAAAAAT -/A AGGAAAATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 234522 CASAVA_Build 15 70224683 1I CTAAGGCTAA -/T CCCTCCATCT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 0 1 234523 CASAVA_Build 15 70227697 1I CCCGGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 T 11 12 234524 CASAVA_Build 15 70251231 1I GGCTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3026 het 3026 ref 23 11 8 4 T 12 13 234525 CASAVA_Build 15 70277790 3D GCAGAGGCAC GTG/--- CGCTCAGTGT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 GTG 1 0 234526 CASAVA_Build 15 70278250 1I CAACCTGTAA -/C CCCTAAGATA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 C 3 4 234527 CASAVA_Build 15 70285765 2D GAACTTCTGA CT/-- CTGAGGAAGA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 CT 2 1 234528 CASAVA_Build 15 70294596 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 11 10 234529 CASAVA_Build 15 70300961 1I AGGATTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 11 12 234530 CASAVA_Build 15 70303330 1D AAAAAAAAAA T/- CTTGGCTCTT 3070 het 1443 hom 27 8 12 7 T 1 0 234531 CASAVA_Build 15 70304728 1D CCTCCATCTT A/- AACTTTTTTT 2368 het 2368 ref 23 12 8 5 A 3 2 234532 CASAVA_Build 15 70305759 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 A 6 7 234533 CASAVA_Build 15 70309315 11D TTAAAAAAAA AAAAAAGAAAG/----------- AAAAAAGAAA 1438 het 406 hom 9 1 7 3 AAAAAAGAAAG 2 1 234534 CASAVA_Build 15 70330897 1D ACAATGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 27 2 17 8 A 11 10 234535 CASAVA_Build 15 70345891 4I AAAAGTCAGA ----/AAAT AAATAATTAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 AAAT 1 2 234536 CASAVA_Build 15 70346298 2D ATGGTGAGGA AC/-- AGATTCCCAC 3070 het 3070 hom 51 19 32 0 AC 1 0 234537 CASAVA_Build 15 70349664 1I GGCACACACA -/T TAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 T 1 2 234538 CASAVA_Build 15 70356288 1I CTTTTTTTTT -/G TTTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 G 0 1 234539 CASAVA_Build 15 70363198 4D CTAAAGGACA AGAT/---- AGATAGATAT 3070 hom 117 het 41 0 40 4 AGAT 3 2 234540 CASAVA_Build 15 70373356 1D CCCACAGTGC T/- TGGGATTTCA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 2 1 234541 CASAVA_Build 15 70389942 1I CAGAGTAATC -/T TTTTTTTTTT 1908 het 721 hom 25 4 12 9 T 16 17 234542 CASAVA_Build 15 70400703 1D AGAGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 28 1 22 5 T 13 12 234543 CASAVA_Build 15 70400872 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 17 0 11 6 T 13 12 234544 CASAVA_Build 15 70402268 1I ATAATTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 T 13 14 234545 CASAVA_Build 15 70411734 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 688 hom 29 2 17 10 T 13 12 234546 CASAVA_Build 15 70415053 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 10 hom 21 1 20 0 AC 8 7 234547 CASAVA_Build 15 70415167 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 0 1 234548 CASAVA_Build 15 70418159 1I TCTCAAAGAA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 29 0 24 5 G 1 2 234549 CASAVA_Build 15 70447386 2D TATCACACTC TG/-- TCTGTATCCC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TG 1 0 234550 CASAVA_Build 15 70450987 1D TCTCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 29 2 19 9 A 22 21 234551 CASAVA_Build 15 70453499 4D TCACTGTGTA CCTC/---- CCTCTGTTTC 3070 hom 62 het 24 0 21 5 CCTC 2 1 234552 CASAVA_Build 15 70453617 1I GTTAGACGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 580 hom 34 2 27 5 T 9 10 234553 CASAVA_Build 15 70453943 3I ATCATATAAA ---/ATG ATATTACTAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 ATG 0 1 234554 CASAVA_Build 15 70465634 2D TGTGTGTATG TA/-- TATATATATA 3070 het 84 hom 30 2 19 11 TA 10 9 234555 CASAVA_Build 15 70471881 1D TATTAAAACT A/- AAAAAAAAAA 1334 het 1334 ref 42 35 3 5 A 11 10 234556 CASAVA_Build 15 70500985 4I AGCCAAACTT ----/TGTC TGATCTGCAG 3070 hom 129 het 50 0 42 8 TGTC 0 1 234557 CASAVA_Build 15 70505746 4I CCAGAATTTC ----/TATT TAGTTTGTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TATT 0 1 234558 CASAVA_Build 15 70529335 2I CTGAAAAATA --/TC AATTATTATT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TC 0 1 234559 CASAVA_Build 15 70538397 1D TTTGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 27 0 14 13 T 17 16 234560 CASAVA_Build 15 70542670 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 20 0 13 7 T 17 16 234561 CASAVA_Build 15 70544155 1D ACAAAAAGAC A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 6 234562 CASAVA_Build 15 70547179 1D TGAAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1309 hom 24 3 18 3 A 15 14 234563 CASAVA_Build 15 70573290 4I TTTTATTGTT ----/TGAC TGTGCATACA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TGAC 0 1 234564 CASAVA_Build 15 70576855 1D TTTCTGGCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 10 9 234565 CASAVA_Build 15 70577639 1D AACCAAAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 307 hom 31 1 26 4 T 10 9 234566 CASAVA_Build 15 70579496 1D CATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 43 1 29 13 T 12 11 234567 CASAVA_Build 15 70595823 1D GAGTTCTTTT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 8 234568 CASAVA_Build 15 70597768 1I GTTTGGGGGT -/G GTGCTTCAGT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 1 2 234569 CASAVA_Build 15 70602121 2I GCTACAGACT --/GG GAGAAGATAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 1 3 234570 CASAVA_Build 15 70602912 1I AACAGCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 757 hom 41 4 28 9 T 14 15 234571 CASAVA_Build 15 70625315 2I AAGATGTCTA --/AG AGATAACTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AG 1 2 234572 CASAVA_Build 15 70635605 1I AATAAAAGGT -/A GAAACTGACT 3070 hom 78 het 33 0 25 8 A 0 1 234573 CASAVA_Build 15 70640223 15I TCTCAGTGGG ---------------/AATTCTTTTTCTTGT AATACACTCA 3070 hom 150 het 51 0 50 3 AATTCTTTTTCTTGT 0 1 234574 CASAVA_Build 15 70646102 1I TATTGATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 4 het 38 1 31 6 T 9 10 234575 CASAVA_Build 15 70656376 1D TACTGTGTGC T/- TTTTTTTTTT 1784 het 1784 ref 37 28 4 5 T 12 11 234576 CASAVA_Build 15 70666708 3I CTTAACTATA ---/TTG TTGTACTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TTG 1 2 234577 CASAVA_Build 15 70669976 1I AAGATTACTA -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 105 het 39 0 35 5 T 7 8 234578 CASAVA_Build 15 70676564 1I ATGCCCTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 10 234579 CASAVA_Build 15 70679359 2I GATATTTCCC --/AA AGTGTTGGCT 3070 hom 156 het 58 0 52 6 A 1 3 234580 CASAVA_Build 15 70694959 8I TCCTACTGTG --------/GCTGAGCT GCTATCCAAG 3070 hom 85 het 32 0 24 8 GCTGAGCT 0 1 234581 CASAVA_Build 15 70729078 1D AAAAAGTCAC T/- GTTTTGGGGT 2267 hom 29 het 16 0 13 3 T 1 0 234582 CASAVA_Build 15 70757165 1I TCTAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 2520 het 2024 hom 14 6 6 2 A 9 10 234583 CASAVA_Build 15 70758423 4D AGAAAAAGAA AAGG/---- AAGGAAGGAA 1312 het 1312 ref 21 9 6 7 AAGG 4 3 234584 CASAVA_Build 15 70758760 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 19 1 14 4 A 14 15 234585 CASAVA_Build 15 70766998 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAG 2719 het 2719 ref 16 9 6 1 A 9 10 234586 CASAVA_Build 15 70769115 6I TTTGTCTGAA ------/AAAAAC AAAAACAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 AAAAAC 1 2 234587 CASAVA_Build 15 70780974 2I TGTACAAACG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 CA 6 7 234588 CASAVA_Build 15 70795468 2D CTAGGCTATC TA/-- TGATGTCTGG 3070 het 3070 ref 49 24 21 5 TA 1 0 234589 CASAVA_Build 15 70797256 1D TGTGTGGTGC G/- GGGGGGTACA 3070 hom 81 het 34 0 24 10 G 7 6 234590 CASAVA_Build 15 70805818 1I GTGTTGTTAC -/T TTTTAAATGG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 4 5 234591 CASAVA_Build 15 70806860 4D GGTATAGCTC TTTG/---- TTTAAGTGGA 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 TTTG 1 0 234592 CASAVA_Build 15 70808642 3D GGCCAGACTG TTT/--- TTTTTTTTTT 2671 het 6 hom 21 1 11 9 T 19 16 234593 CASAVA_Build 15 70809969 4I CTGGGTGACA ----/GAGT GAGACCCTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GAGT 0 1 234594 CASAVA_Build 15 70812749 2I ACACAGGCAC --/AT GTGTGTCATG 2278 het 2278 ref 31 19 7 5 AT 0 1 234595 CASAVA_Build 15 70819052 3I GCCCACAAAA ---/AAG AAGCATATGA 3070 hom 62 het 26 0 21 5 AAG 1 2 234596 CASAVA_Build 15 70820965 1I TGGTACTGGT -/A ATAAAATCAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 1 2 234597 CASAVA_Build 15 70823541 1D AGTTATCCCA G/- GGACCCTAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 2 G 3 2 234598 CASAVA_Build 15 70825114 5I AAGACAGTTT -----/GGGAG GGCAGCTTCT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 GGGAG 0 1 234599 CASAVA_Build 15 70827531 1I ACTTGTATCC -/A AAACATTTTG 3070 hom 63 het 46 1 40 5 A 3 4 234600 CASAVA_Build 15 70829583 1D ACTCACCCTT C/- ACCAGGCATC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 C 1 0 234601 CASAVA_Build 15 70836596 2D TCTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3061 het 1637 hom 28 7 9 12 T 18 16 234602 CASAVA_Build 15 70839092 2D CAATGTGTTG AA/-- TCAGAAACTC 3070 het 3070 ref 44 28 14 2 A 2 0 234603 CASAVA_Build 15 70846778 1I TCAAATAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 19 13 A 13 14 234604 CASAVA_Build 15 70855280 1I TTGAGATCAG -/A AGTGTTTCCG 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 A 1 2 234605 CASAVA_Build 15 70870573 1I TCTCTTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2188 hom 31 11 15 5 T 11 12 234606 CASAVA_Build 15 70873196 1D TGCCCAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 11 10 234607 CASAVA_Build 15 70875727 2D ACCAAGCGGT AG/-- AGAGTTAGAC 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 AG 3 2 234608 CASAVA_Build 15 70882001 4I AAGATGAAAA ----/AGAT AGGTATTTTT 3070 hom 157 het 56 0 53 3 AGAT 0 1 234609 CASAVA_Build 15 70899262 2D GAGCACTCGA CT/-- CTCTCAGGTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 CT 3 2 234610 CASAVA_Build 15 70924788 1I CCGGGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 1249 het 706 hom 13 4 4 5 T 15 16 234611 CASAVA_Build 15 70924967 1D TTTTAATAAT A/- AAAAAAACCT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 8 7 234612 CASAVA_Build 15 70929073 1D CCACCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 50 2 39 9 A 10 9 234613 CASAVA_Build 15 70932316 1D CTACTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2283 het 890 hom 20 4 8 8 T 13 12 234614 CASAVA_Build 15 70952394 12D ACCTGTCCTA ATATGTTAGGTC/------------ ATATGGTAGA 597 het 597 ref 37 16 5 19 ATATGTTAGGTC 1 0 234615 CASAVA_Build 15 70961168 1I GTATAGTACA -/C CATTTTTAAT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 C 1 2 234616 CASAVA_Build 15 70962213 4D ACTAATGCTT TGTC/---- TGTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 TGTC 1 0 234617 CASAVA_Build 15 70972872 1D ATGTTATCTC G/- GGTTCTTCCT 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 G 3 2 234618 CASAVA_Build 15 70976519 1I AATCAATATA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 7 8 234619 CASAVA_Build 15 70978974 1I TTTTAGGAGG -/T TTTTTTTTTT 2828 het 2828 ref 39 16 9 14 T 11 12 234620 CASAVA_Build 15 70988399 1I AAGTACTCAG -/A AAACCATCTG 3070 het 3070 hom 53 27 25 1 A 3 4 234621 CASAVA_Build 15 70989151 1I AATCTTTTGA -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 T 6 7 234622 CASAVA_Build 15 70996014 1I ATCATATTCA -/C AATTCAGTTT 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 C 0 1 234623 CASAVA_Build 15 71002006 1I AATAGTCTCT -/C CCATTAACTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 2 3 234624 CASAVA_Build 15 71009687 1D GGAGGGGGAG T/- TTTTTTTTTT 1216 het 1216 ref 35 28 3 4 T 12 11 234625 CASAVA_Build 15 71018649 12I CAGGTGACAA ------------/AAGAAAATCAAG AACTCAAAGG 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 AAGAAAATCAAG 0 1 234626 CASAVA_Build 15 71042317 2D GGAATTAAAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 1793 hom 26 7 15 4 AC 6 5 234627 CASAVA_Build 15 71045400 1D AAAGTTTCTA T/- AAGGTCATGT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 1 0 234628 CASAVA_Build 15 71050257 2D TATTTCTCTC TT/-- TGACTGCAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 3 1 234629 CASAVA_Build 15 71060371 4D CACCATCAGT TAAA/---- TAAGCAAAAA 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 TAAA 1 0 234630 CASAVA_Build 15 71065497 4I AATGATATAG ----/TAGA TATTTTGTAA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 TAGA 0 1 234631 CASAVA_Build 15 71070872 1I TTAAAGAACT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 8 9 234632 CASAVA_Build 15 71071556 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2996 het 399 hom 15 2 8 5 A 15 14 234633 CASAVA_Build 15 71072474 1D TTTTTAAAAG T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 T 8 7 234634 CASAVA_Build 15 71077609 1D TCTTTCAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 39 11 17 11 T 11 10 234635 CASAVA_Build 15 71080482 1D GTACCTGTGT G/- GGTAGATCTG 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 G 3 2 234636 CASAVA_Build 15 71082765 2D CCCAGTTTTG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 GT 1 0 234637 CASAVA_Build 15 71097220 1I TTTCCTGTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 21 23 7 T 9 10 234638 CASAVA_Build 15 71109994 1D ATGATATCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 54 26 20 9 T 9 8 234639 CASAVA_Build 15 71127723 1I ACCTAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1496 het 1496 ref 25 8 5 12 T 15 16 234640 CASAVA_Build 15 71140220 1I TTTTTGGGTA -/T TTTTTGTACA 3070 het 3070 hom 36 9 17 10 T 5 6 234641 CASAVA_Build 15 71145637 6I GCCAGGATGG ------/TCTCGA TCTCCTGACC 3070 hom 45 het 16 0 14 2 TCTCGA 0 1 234642 CASAVA_Build 15 71160977 1I AAGTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1569 het 1569 ref 49 33 4 12 T 11 12 234643 CASAVA_Build 15 71162063 2I ATAGACTAAC --/AG AGTTTTATCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AG 1 2 234644 CASAVA_Build 15 71166202 1D GCACATGCCA C/- CCATGCCTGG 3070 het 2673 hom 19 8 10 1 C 3 2 234645 CASAVA_Build 15 71196267 1I TTTTAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 11 12 234646 CASAVA_Build 15 71200026 1I TTTTAAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1867 hom 22 6 12 4 T 13 14 234647 CASAVA_Build 15 71201526 4I TAGCAATGAA ----/TATG TAAAGACTAG 2795 hom 18 het 7 0 6 1 TATG 0 1 234648 CASAVA_Build 15 71223445 5D GGCACCAGAA TGATT/----- TGATTTGATT 3070 het 3070 ref 46 22 14 11 TGATT 3 2 234649 CASAVA_Build 15 71237254 1D CATCAATACT A/- ATACTGTTTC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 2 1 234650 CASAVA_Build 15 71261373 4I GCAATTTACA ----/AAAG AAAGAGATTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 AAAG 1 2 234651 CASAVA_Build 15 71265565 1I TTTTTGCCAG -/A AAAAAAAAAA 1019 het 1019 ref 34 24 5 5 A 13 14 234652 CASAVA_Build 15 71286230 4D TGTGTGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGCG 1870 het 1870 ref 31 16 11 5 TG 6 4 234653 CASAVA_Build 15 71292427 1I GTCATCAAAA -/G GGGAACCATA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 G 3 4 234654 CASAVA_Build 15 71303002 12D CTACCCCTGC TCGCTTTTGGTG/------------ TCCATTTGCA 1920 het 1920 ref 15 13 4 4 TCGCTTTTGGTG 1 0 234655 CASAVA_Build 15 71303978 4I TTCTTTCTTC ----/TACT TACTTGTTCG 2923 het 2923 ref 18 11 6 1 TACT 1 2 234656 CASAVA_Build 15 71322618 1D AAAGTAACTT A/- AAAGAACTAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 4 3 234657 CASAVA_Build 15 71326648 11D GAACCAGCCC TTGGAAAATAT/----------- TTTACATATT 3070 het 3070 hom 49 21 23 6 TTGGAAAATAT 1 0 234658 CASAVA_Build 15 71343013 12D TTTGAAACAC TTGTTTCTAAAA/------------ TTAAAATCTG 3070 het 3070 hom 19 9 12 3 TTGTTTCTAAAA 1 0 234659 CASAVA_Build 15 71360656 1I CTTCAGGAGA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 6 7 234660 CASAVA_Build 15 71363557 1D AAATAGATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 10 9 234661 CASAVA_Build 15 71367273 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1647 hom 18 6 8 4 A 12 11 234662 CASAVA_Build 15 71384637 1D CTTTGTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3033 het 3033 ref 26 13 9 5 A 12 11 234663 CASAVA_Build 15 71390360 1I ATTGATTGGA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 8 234664 CASAVA_Build 15 71390496 3I TCGGGGTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 TTG 3 4 234665 CASAVA_Build 15 71393316 2D AAAAAAAGGA AT/-- ATATATATAT 2317 het 1136 hom 15 3 7 5 AT 10 9 234666 CASAVA_Build 15 71401173 1D CCTGTGGGCC A/- AGGCGGGTTG 3070 het 3070 ref 38 14 17 8 A 2 1 234667 CASAVA_Build 15 71401756 2D TGTTTTTCTG GT/-- GTGTGTGGTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 GT 4 3 234668 CASAVA_Build 15 71434796 1I TGCAGAGGCT -/A AAAGAGGTCA 3070 het 3070 hom 44 14 26 4 A 3 4 234669 CASAVA_Build 15 71547287 1D CTCAAGAATC T/- TTTTTTTTTT 1368 het 1368 ref 52 31 6 15 T 13 12 234670 CASAVA_Build 15 71581551 1I CTTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1246 hom 28 3 20 5 A 13 14 234671 CASAVA_Build 15 71610142 1I TTATCATGGA -/T TTTTTTTTTT 2750 het 2750 ref 20 10 6 4 T 11 12 234672 CASAVA_Build 15 71621186 1I AAAAGTTATA -/C CATGCTGTAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 1 2 234673 CASAVA_Build 15 71669212 2I AGAAGCAGTC --/AA AGTGTCTTCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 3 234674 CASAVA_Build 15 71681574 1D TCCAGGGCAA C/- CCACAGAACA 3070 hom 126 het 49 0 41 8 C 3 2 234675 CASAVA_Build 15 71693714 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 13 9 A 10 11 234676 CASAVA_Build 15 71718197 2I AAAATGTATG --/TA TATATATATA 2938 het 2938 ref 27 14 8 5 TA 5 6 234677 CASAVA_Build 15 71718496 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3047 het 2789 hom 35 8 11 16 T 13 14 234678 CASAVA_Build 15 71719895 8I7M2D TGCTTAAGAG --------TTAGCCAGG/CTAACTCTTAAGCTA-- CTGTCAGGCG 3070 het 3070 ref 42 24 13 9 N/A 0 0 234679 CASAVA_Build 15 71726581 1I ATCTTTGTCA -/T TTGCAGGTTT 2415 het 2415 ref 31 13 9 9 T 2 3 234680 CASAVA_Build 15 71758066 1D TCTCCAGGAG A/- AGAGGGGGAG 3070 hom 135 het 50 0 44 7 A 2 1 234681 CASAVA_Build 15 71776962 1D TGGGCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1309 het 1309 ref 32 20 4 8 T 19 18 234682 CASAVA_Build 15 71803098 3I TGCTGTGTGC ---/CAT CTTTATATCC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 CAT 0 1 234683 CASAVA_Build 15 71805384 3I GACCATGCTT ---/CAA CAACCTGATC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 CAA 1 2 234684 CASAVA_Build 15 71809316 1D AGTGGCCTGT G/- CCTGCCTTCA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 G 1 0 234685 CASAVA_Build 15 71810617 4D GGAGGGCAAA ATAG/---- ATAGTGCCGA 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 ATAG 2 1 234686 CASAVA_Build 15 71814748 2D GTTGTGTATA CC/-- TATGTGTGCA 3070 het 3070 hom 37 11 21 7 C 2 0 234687 CASAVA_Build 15 71814968 2D GCATGTTCAC AT/-- GTTTCCTCAC 3070 het 3070 ref 35 16 12 9 AT 1 0 234688 CASAVA_Build 15 71816289 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAACA 3070 het 2510 hom 24 7 10 7 A 9 8 234689 CASAVA_Build 15 71836080 2I AGGGGGGGGG --/TA ATGTATTTCA 2217 het 2217 ref 24 12 10 2 TA 0 1 234690 CASAVA_Build 15 71841697 1I TGCTGCTTCT -/A TCACCTAGCT 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 A 0 1 234691 CASAVA_Build 15 71842444 1I TCAGCTCCAT -/A ATAGAATCTG 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 1 2 234692 CASAVA_Build 15 71872580 2D CTCAGACTAC TT/-- TTTCTACACT 3070 het 3070 hom 35 15 14 8 T 5 3 234693 CASAVA_Build 15 71872981 1D TTAATTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 10 17 15 T 13 12 234694 CASAVA_Build 15 71874624 2D ACACACGTGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 44 13 20 12 AC 8 7 234695 CASAVA_Build 15 71886976 1D CCCTCAAAGA T/- TGAGAAAGGG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 2 1 234696 CASAVA_Build 15 71901972 1D ACGATTGGTA G/- GGGGCATGGA 3070 hom 116 het 44 0 36 8 G 5 4 234697 CASAVA_Build 15 71902800 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2774 hom 27 8 14 5 T 11 12 234698 CASAVA_Build 15 71910232 11D TTTCTGCTGC CAGAACTCCCT/----------- CAGTAAATCC 3070 het 3070 ref 40 23 15 5 CAGAACTCCCT 1 0 234699 CASAVA_Build 15 71913374 1D TATCTATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 18 17 234700 CASAVA_Build 15 71923335 4D TCCTGAAGAC TTGT/---- TTATTTCTTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 TTGT 1 0 234701 CASAVA_Build 15 71927469 10D GAGGCCTCAG TCTTTGGAAA/---------- TCTTCAGAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 TCTTTGGAAA 1 0 234702 CASAVA_Build 15 71943273 1I CTTGGTGCGG -/A AAAAAAAACT 2483 het 2483 ref 22 9 7 6 A 8 9 234703 CASAVA_Build 15 71954121 1D ATCTTCTGAA C/- CAATAAACTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 C 2 1 234704 CASAVA_Build 15 71955377 14D GCAGGTAGGT GGTGTGCATGTAGA/-------------- GAGAGGGCTT 3070 hom 93 het 33 0 32 4 GGTGTGCATGTAGA 1 0 234705 CASAVA_Build 15 71963507 1D TCAGAAGGGG A/- AAAGCCACCT 3070 hom 122 het 45 0 36 9 A 4 3 234706 CASAVA_Build 15 71988765 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 9 10 234707 CASAVA_Build 15 71991865 1I CATGAGGCAA -/G GAAGAGAACG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 1 2 234708 CASAVA_Build 15 72008264 1D CACCCCGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 21 2 11 8 A 15 14 234709 CASAVA_Build 15 72010554 8D CCCCGCCTGA CTCACCGG/-------- CTCTGGCAAT 3070 hom 59 het 22 0 19 6 CTCACCGG 1 0 234710 CASAVA_Build 15 72010674 3I CCCTGACTTC ---/TAT ACATGGCCAA 3070 hom 75 het 26 0 24 3 TAT 0 1 234711 CASAVA_Build 15 72023033 1D TTGCTTCTAA T/- TTATAAGCAG 3070 hom 120 het 44 0 39 5 T 3 2 234712 CASAVA_Build 15 72047436 1I TCCAAAAAAA -/G CAAAACAAAA 3070 hom 83 het 35 0 27 8 G 0 1 234713 CASAVA_Build 15 72081784 2I TTCTAGTGCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 51 het 24 0 17 7 TG 7 8 234714 CASAVA_Build 15 72084854 1I GTTGCTTTGC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 6 7 234715 CASAVA_Build 15 72084988 1I CCCAGCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 38 2 25 11 T 11 12 234716 CASAVA_Build 15 72091542 1D AAGATTAAGA G/- AAAAAAACCC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 1 0 234717 CASAVA_Build 15 72092222 1D CAAAAAGCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 10 9 234718 CASAVA_Build 15 72128849 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 21 1 18 2 A 15 14 234719 CASAVA_Build 15 72136723 2I GACTTGAACC --/TG TGTTTTCTGG 1988 het 1988 ref 43 32 5 6 TG 1 2 234720 CASAVA_Build 15 72140977 5I TCAAATAAAC -----/AACTT AACAATGCAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AACTT 0 1 234721 CASAVA_Build 15 72166949 1D CCCAGAAAAC T/- CCAAAACAGT 2213 het 2213 ref 42 14 12 16 T 1 0 234722 CASAVA_Build 15 72166963 1D AAACAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 2552 het 775 hom 41 9 9 24 T 15 14 234723 CASAVA_Build 15 72167582 11I CTGTGACCAT -----------/CGAGACACCAC TGAGGCTTGG 3070 het 3070 ref 90 76 9 5 CGAGACACCAC 0 1 234724 CASAVA_Build 15 72221351 1I CAAAATAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 19 2 14 3 T 11 12 234725 CASAVA_Build 15 72233957 1I ACTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 41 2 33 6 A 11 12 234726 CASAVA_Build 15 72282609 2D AAACCCTTTT TG/-- TTCCTACAAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 TG 1 0 234727 CASAVA_Build 15 72301804 1D GGGTGCACTG C/- TCCTCCCTCC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 1 0 234728 CASAVA_Build 15 72301929 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 28 0 19 9 T 11 10 234729 CASAVA_Build 15 72319224 1D TGAGAGTTAC G/- GGGGGGGTAC 3070 hom 131 het 49 0 41 8 G 8 7 234730 CASAVA_Build 15 72323454 3D GTCTCCCTCT AAG/--- AAGGAGACCA 3070 hom 55 het 21 0 17 5 AAG 2 1 234731 CASAVA_Build 15 72326766 8D ATATATATAT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 72 het 26 0 25 3 AC 13 9 234732 CASAVA_Build 15 72327659 1D CTAAATTTTA T/- TTTTTATTTG 3070 hom 33 het 12 0 12 1 T 6 5 234733 CASAVA_Build 15 72334526 1I GGATCCAGCC -/T CTCTCCTGAG 3070 hom 76 het 32 0 22 10 T 0 1 234734 CASAVA_Build 15 72341459 1D CCTCCCACCG A/- AACAGAACCT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 3 2 234735 CASAVA_Build 15 72346391 1D TCATCTCTGT A/- AAAACAGCTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 4 234736 CASAVA_Build 15 72364595 1I TAGGCTCTTT -/C CCATGAGCCT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 C 2 3 234737 CASAVA_Build 15 72367191 4I TAAAAACAGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 78 het 30 0 26 5 AAAC 2 3 234738 CASAVA_Build 15 72369181 4D AACCTTTGTC TATT/---- TATTTTTTTA 3070 hom 136 het 50 0 45 6 TATT 2 1 234739 CASAVA_Build 15 72369577 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 28 1 13 14 T 13 14 234740 CASAVA_Build 15 72373836 2D AATTTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 18 0 14 4 A 12 10 234741 CASAVA_Build 15 72381324 1D TTCCCTCCCT C/- CTTCTGCCTT 3070 hom 81 het 32 0 27 6 C 2 1 234742 CASAVA_Build 15 72382820 2I AGACAGAGAC --/AA AGAGAGCAGA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 1 3 234743 CASAVA_Build 15 72387132 1I CCAAACCCCA -/G GTAATCAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 1 2 234744 CASAVA_Build 15 72402926 1D TTTTTAATTA T/- TTTTTTTATT 2221 het 2100 hom 14 7 6 1 T 8 7 234745 CASAVA_Build 15 72404648 1D TCCTGAGATT G/- GCCACACCCC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 2 1 234746 CASAVA_Build 15 72434553 1D CAAACTTCCA C/- CCCTCCATTC 3070 hom 68 het 27 0 24 3 C 4 3 234747 CASAVA_Build 15 72447506 20D ATCCTTAGGC TATTTTATTTTATTTTATTT/-------------------- TATTTTATTT 3070 het 699 hom 23 5 10 12 TATTT 8 4 234748 CASAVA_Build 15 72454961 1D CTGATCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 22 1 11 10 A 11 10 234749 CASAVA_Build 15 72457266 6I AAAATGTATT ------/TAACTC TAAGGTTATA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 TAACTC 0 1 234750 CASAVA_Build 15 72466129 1I GCCGGGACCC -/T CCCACCCGGC 3070 hom 53 het 23 0 15 8 T 0 1 234751 CASAVA_Build 15 72475120 1D GACCTTGGGT G/- GGAGGGCAGC 3070 hom 42 het 18 0 14 4 G 3 2 234752 CASAVA_Build 15 72479443 1D CAGCTTCAGG C/- CCCCCGTGGG 3070 hom 51 het 36 0 18 18 C 6 5 234753 CASAVA_Build 15 72514835 15I CTAAGCCTGT ---------------/GGCCCTGAAGCCAGC GGCCCTGAAG 3070 het 2629 hom 40 8 17 15 GGCCCTGAAGCCAGC 1 2 234754 CASAVA_Build 15 72518322 1I GAGCCGAGTC -/T TTAGCAAAGA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 2 3 234755 CASAVA_Build 15 72536949 2D AAAAAAAGAA AT/-- ATATATATAT 2142 het 1275 hom 12 5 6 3 AT 7 6 234756 CASAVA_Build 15 72542478 1D TTTTTGACTC T/- TATTCTGTGC 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 2 1 234757 CASAVA_Build 15 72546743 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2285 het 2040 hom 18 6 7 5 T 13 14 234758 CASAVA_Build 15 72550197 1D ATGCTCCTGT A/- AGAACCTAAT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 2 1 234759 CASAVA_Build 15 72557934 1I TACAAACAGG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 2015 hom 20 8 10 2 T 8 9 234760 CASAVA_Build 15 72576046 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2473 hom 32 12 12 8 A 15 14 234761 CASAVA_Build 15 72597012 1D TTCAATAAAA C/- GTTACTTAAA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 C 1 0 234762 CASAVA_Build 15 72606502 2D TAAGTACCAC AT/-- GTTATTTTGC 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 AT 1 0 234763 CASAVA_Build 15 72614006 1D TTGTAATCCC A/- AACACTTTGG 2445 het 2445 ref 20 12 6 2 A 3 2 234764 CASAVA_Build 15 72625503 2I GGTTTTCACT --/CA CATCACCCAG 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 CA 1 2 234765 CASAVA_Build 15 72628851 1D TCCCAACTAC T/- TCGGCAGGCT 3070 hom 45 het 18 0 14 4 T 2 1 234766 CASAVA_Build 15 72663212 1I TTAATGCACT -/A ATACCATATG 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 A 1 2 234767 CASAVA_Build 15 72672994 8D ACAGGCAAAG GAACCCCA/-------- GTATAGGAGA 3070 het 3070 ref 42 20 15 11 GAACCCCA 1 0 234768 CASAVA_Build 15 72676190 1D CTGACTTTTG T/- TTTTTTTTTA 2479 het 2479 ref 19 9 6 4 T 10 9 234769 CASAVA_Build 15 72679611 10D GCCTAAGGCC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1086 het 664 hom 12 3 3 6 T 26 16 234770 CASAVA_Build 15 72707709 1D TTCTAGATAA G/- GGGCACAGAT 3070 het 3070 ref 47 20 21 6 G 4 3 234771 CASAVA_Build 15 72729255 1D GGGAAAAAAA G/- GGGGGGGGGG 1302 het 1302 ref 32 13 7 12 G 11 10 234772 CASAVA_Build 15 72739809 2D GTCTCCAAAA AT/-- ATATATATAT 2785 hom 19 het 10 0 7 3 AT 10 9 234773 CASAVA_Build 15 72746971 1D CCTAAGTACT A/- AAAAAAAAAA 1689 het 1689 ref 23 13 5 5 A 15 14 234774 CASAVA_Build 15 72752952 1D GGTCTTGGCT G/- GGGCATGGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 4 3 234775 CASAVA_Build 15 72756464 1I TGCATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2628 het 2628 ref 37 16 9 12 T 11 12 234776 CASAVA_Build 15 72764016 1D CAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 A 11 10 234777 CASAVA_Build 15 72769798 1I CTAAGGCAGC -/T GCCCAAATGA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 0 1 234778 CASAVA_Build 15 72798223 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1340 het 916 hom 11 3 4 6 A 11 10 234779 CASAVA_Build 15 72844799 1D GGCAAACTAC A/- ATTTTTTTTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 2 1 234780 CASAVA_Build 15 72917069 1D TACACCAGCA G/- GGGGGGACGA 3070 hom 87 het 32 0 23 9 G 7 6 234781 CASAVA_Build 15 72929239 2D TTTGGGAAAC AG/-- GGGACACCAG 3070 hom 36 het 18 0 12 6 AG 1 0 234782 CASAVA_Build 15 72963151 1I TTGTTTCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 40 1 31 8 T 10 11 234783 CASAVA_Build 15 72964079 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 10 9 234784 CASAVA_Build 15 72973558 6D GCTCACTGCA GCCTCT/------ GCCTCCCGGG 2108 hom 15 het 6 0 6 0 GCCTCT 1 0 234785 CASAVA_Build 15 72983066 4D ACTTCCTCTT ACAC/---- ACAATCTTTG 3070 hom 54 het 20 0 18 6 AC 3 1 234786 CASAVA_Build 15 72987588 1I GCTATTCAGG -/A GGCTGAGGCA 1776 hom 12 het 5 0 5 0 A 0 1 234787 CASAVA_Build 15 72988655 7D CTCTCATTTG ACTTTAC/------- ACTCCCCAAG 3070 hom 84 het 30 0 29 7 ACTTTAC 1 0 234788 CASAVA_Build 15 72989259 1I CTTTGAGAGG -/C CCAAGACAAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 2 3 234789 CASAVA_Build 15 72996611 5D GCTGGGTGTG GTAGC/----- ATGCATCTGT 3070 hom 24 het 10 0 9 2 GTAGC 1 0 234790 CASAVA_Build 15 72998196 2I TACCTGCTTC --/CA CAGTTTCGGC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 CA 1 2 234791 CASAVA_Build 15 73002059 1D AAGTTGAGTC T/- TTTTTTTTTT 1341 het 1251 hom 25 8 3 14 T 19 18 234792 CASAVA_Build 15 73005894 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 27 0 22 5 A 12 11 234793 CASAVA_Build 15 73023381 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 2512 het 54 hom 15 1 9 5 CT 2 1 234794 CASAVA_Build 15 73041621 4I GAGATTGCGC ----/CACT CACTGCACTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 CACT 1 2 234795 CASAVA_Build 15 73042800 1D TCATTATCAA T/- TACAGCTGAC 3070 hom 75 het 46 1 41 5 T 2 1 234796 CASAVA_Build 15 73048416 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 247 hom 21 1 12 8 T 14 15 234797 CASAVA_Build 15 73050627 1I TGGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 4 5 234798 CASAVA_Build 15 73052122 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 759 hom 25 2 19 4 A 12 13 234799 CASAVA_Build 15 73053846 1D CTTCTCACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 25 0 19 7 T 10 9 234800 CASAVA_Build 15 73059247 1I ACTTTAAGTG -/A AGGATGCCGC 3070 hom 123 het 46 0 40 6 A 1 2 234801 CASAVA_Build 15 73063064 1D AAACTTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 11 10 234802 CASAVA_Build 15 73063420 1I TGGTGATGAC -/A AAACCTCTGT 3070 hom 116 het 47 0 39 8 A 3 4 234803 CASAVA_Build 15 73063850 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 30 0 21 9 A 13 12 234804 CASAVA_Build 15 73082135 1D TCTGCTTGCC T/- TTTTTTTTTC 1345 het 1345 ref 43 34 3 7 T 10 9 234805 CASAVA_Build 15 73087484 1D ACTTGGGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 T 10 9 234806 CASAVA_Build 15 73104305 1D AGCTACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 25 1 19 5 T 12 11 234807 CASAVA_Build 15 73135959 4D CACAATATCC AACA/---- AACAAACAAA 3070 hom 96 het 47 0 33 17 AACA 4 3 234808 CASAVA_Build 15 73142348 2I GCTGGCTCTC --/AG GGGGACAAGT 3070 hom 114 het 48 0 38 10 AG 0 1 234809 CASAVA_Build 15 73157470 4D GGCTTCCCTC TTTA/---- TTTGTTTCTC 1182 het 1182 ref 31 23 4 5 TTTA 1 0 234810 CASAVA_Build 15 73166490 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 142 hom 25 2 19 5 A 15 14 234811 CASAVA_Build 15 73166727 1I AATAAAAAAG -/A ACGAACTAGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 2 234812 CASAVA_Build 15 73191208 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CT 1 2 234813 CASAVA_Build 15 73191378 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 17 0 10 7 A 13 12 234814 CASAVA_Build 15 73192928 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 112 hom 24 2 12 10 T 17 16 234815 CASAVA_Build 15 73198108 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCCCCAT 3070 het 430 hom 11 1 10 0 C 8 9 234816 CASAVA_Build 15 73200912 1D ATACAATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 10 9 234817 CASAVA_Build 15 73201950 1D TTTACAATTC T/- TTTTTTTTTT 2626 het 2545 hom 29 9 6 14 T 17 16 234818 CASAVA_Build 15 73203561 1D GGTCGCATTA T/- TTAAGGGGAC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 3 2 234819 CASAVA_Build 15 73210075 2I TGTTTTTTTT --/TG TTTTGTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 TG 0 1 234820 CASAVA_Build 15 73212749 3I ATTTAGAAAT ---/AAC AACAATAGGC 3070 hom 32 het 17 0 11 6 AAC 1 2 234821 CASAVA_Build 15 73220442 2D4M6D GATCAGCGCT TGAGATATTTTG/--AGAT------ CAGACCCTGC 3070 hom 84 het 31 0 28 6 N/A 0 0 234822 CASAVA_Build 15 73223262 4D AAAAAGAAAA AAGT/---- AAGAAAGAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 2 AAGT 1 0 234823 CASAVA_Build 15 73226248 1I TGAAATTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 29 1 22 6 T 11 12 234824 CASAVA_Build 15 73226382 3I TGGCCTCATG ---/TTT TCTTCATTGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 1 4 234825 CASAVA_Build 15 73230373 1I CAGGACTAAC -/A AATTAGCTAC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 2 3 234826 CASAVA_Build 15 73232911 1I TAAAGTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 699 hom 33 3 22 8 T 11 12 234827 CASAVA_Build 15 73246652 3D AGCCACTATT CTC/--- CTCATCTTGA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 CTC 2 1 234828 CASAVA_Build 15 73255232 3I AAAAGTAGTG ---/GGA GGACTCAACC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GGA 1 2 234829 CASAVA_Build 15 73265944 1D CTTATCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 11 10 234830 CASAVA_Build 15 73272901 1I CTGCATAGCA -/G GCTGAGCAGT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 1 2 234831 CASAVA_Build 15 73274448 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 48 het 17 0 16 2 A 7 6 234832 CASAVA_Build 15 73277611 2D TGGAGGTAGT GG/-- GGGGGGGGCT 3070 hom 63 het 26 0 19 8 G 10 8 234833 CASAVA_Build 15 73334524 1D AAATTGCATT C/- TTTTTGTAAT 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 C 1 0 234834 CASAVA_Build 15 73353242 2I GGGGCTGGAG --/TC TCTGCCGCCA 3070 hom 137 het 51 0 42 9 TC 1 2 234835 CASAVA_Build 15 73385467 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAATAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 8 7 234836 CASAVA_Build 15 73395436 1I TGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 501 hom 20 2 14 4 T 11 12 234837 CASAVA_Build 15 73396555 2I TTTTTTTTTT --/TG TTTGTTTTTG 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TG 0 1 234838 CASAVA_Build 15 73396768 5D TAGTAATTCT TTTTG/----- TTTTATTTTG 3070 hom 58 het 21 0 18 3 TTTTG 1 0 234839 CASAVA_Build 15 73397666 3I AATAGTGTGG ---/GAC GACTCTGTTC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 GAC 1 2 234840 CASAVA_Build 15 73402876 2D TTGATTACTA TT/-- TTTTCACTAT 3015 hom 27 het 10 0 9 1 T 6 4 234841 CASAVA_Build 15 73405203 1D GAGCTGTTCT A/- ATAGATCTGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 2 1 234842 CASAVA_Build 15 73417184 1I CCCAGCACTT -/A AGAGTGGGAG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 A 1 2 234843 CASAVA_Build 15 73442819 1I CCCACCATTG -/T TGACACCAAC 3070 hom 120 het 43 0 39 4 T 1 2 234844 CASAVA_Build 15 73444708 1I TGAAACAGTG -/T TCAATCTATA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 234845 CASAVA_Build 15 73456089 1D CCTTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 16 15 234846 CASAVA_Build 15 73484163 1D GAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 10 9 234847 CASAVA_Build 15 73516572 1D CCCAGAACCC T/- TTTTTTTTTT 1706 het 1706 ref 44 28 4 12 T 13 12 234848 CASAVA_Build 15 73517777 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 10 9 234849 CASAVA_Build 15 73549571 4I GGTTGGTTAA ----/TTGT TTGGAAAAGG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 TTGT 0 1 234850 CASAVA_Build 15 73552174 1I CACCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 1935 het 878 hom 19 2 8 9 A 15 16 234851 CASAVA_Build 15 73575894 1I GTATTATTAA -/T CTTTTTTTTT 2807 het 2338 hom 27 8 15 4 T 0 1 234852 CASAVA_Build 15 73604174 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 26 3 A 24 13 234853 CASAVA_Build 15 73619236 1I CCAGGCTAAC -/T TTTGTATTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 3 4 234854 CASAVA_Build 15 73639536 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 27 1 18 8 A 17 16 234855 CASAVA_Build 15 73648071 1I ATCTCTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 997 hom 20 3 11 6 A 13 14 234856 CASAVA_Build 15 73669477 1I CTCAAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 672 hom 21 2 12 7 A 12 13 234857 CASAVA_Build 15 73681282 1I TTCCTCCCCC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 64 het 31 0 21 10 T 8 9 234858 CASAVA_Build 15 73684199 3D AAGTTCTTTT GTG/--- GTGATTTCTG 3070 hom 117 het 41 0 39 4 GTG 2 1 234859 CASAVA_Build 15 73702721 1D TGTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 1601 hom 10 het 5 0 4 1 T 6 5 234860 CASAVA_Build 15 73705354 1I ATGACTTGAC -/A CAGGCCGAGG 3070 hom 75 het 27 0 23 4 A 0 1 234861 CASAVA_Build 15 73720621 1D CAACCTAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 18 0 11 7 A 11 10 234862 CASAVA_Build 15 73720831 2I TCTCAAAAAG --/AT ATATATATAT 2331 hom 15 het 11 0 6 5 AT 8 9 234863 CASAVA_Build 15 73723012 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 582 hom 18 2 14 2 A 12 11 234864 CASAVA_Build 15 73724607 1D TGAGAGTTAC A/- AAAAAACCCG 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 7 6 234865 CASAVA_Build 15 73724851 1I AAGTAGATGC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 25 het 36 1 24 11 T 8 9 234866 CASAVA_Build 15 73725355 1D TCACAGGGAA G/- GGGGGGGTCC 3070 hom 108 het 41 0 36 6 G 8 7 234867 CASAVA_Build 15 73743877 4I TGAGAAGAAC ----/TCAG TCAGGAGCCT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 TCAG 1 2 234868 CASAVA_Build 15 73765795 1D GCCCCACCCC T/- CCTGGAGGCA 1073 het 1073 ref 23 12 3 8 T 1 0 234869 CASAVA_Build 15 73845974 2D CTGGTTGAGA CT/-- CACAAAGAGA 2359 het 2359 ref 28 16 10 3 CT 1 0 234870 CASAVA_Build 15 73846051 1D GCTGGACAAG A/- ATCTCTGAAG 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 2 1 234871 CASAVA_Build 15 73854654 2I ACTGACACAC --/AT ATATATATAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 AT 4 5 234872 CASAVA_Build 15 73865060 1I ATGCTCTTGG -/T TTTCCCACCT 2108 het 2108 ref 28 18 6 4 T 3 4 234873 CASAVA_Build 15 73884242 1D ACCCTGTCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1501 hom 21 6 9 6 A 13 12 234874 CASAVA_Build 15 73885983 1D GCGGAGTCTT G/- GCTCTTTACA 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 G 2 1 234875 CASAVA_Build 15 73893338 7I TAACTGGAAA -------/TACTGGC TACAATGTAG 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 TACTGGC 0 1 234876 CASAVA_Build 15 73911387 1I GTTCTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1579 hom 29 6 14 9 T 14 15 234877 CASAVA_Build 15 73917941 2D CTTCTTCTTC AA/-- AAAAAAATAC 187 het 187 ref 16 8 2 7 A 9 7 234878 CASAVA_Build 15 73918979 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 11 10 234879 CASAVA_Build 15 73945200 1D ATATCTGGTT G/- TTTTTTTTTT 1815 het 1815 ref 39 16 15 8 G 1 0 234880 CASAVA_Build 15 73951721 1I CTGCTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 2993 het 2993 ref 35 18 10 7 A 11 12 234881 CASAVA_Build 15 73952274 3D CTTTTTTGTA TTG/--- TTTTTCATTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 6 TTG 1 0 234882 CASAVA_Build 15 73954692 1I GGAAACTTGA -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 5 6 234883 CASAVA_Build 15 73956876 1D GTTTATATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 11 10 234884 CASAVA_Build 15 73963236 12D ATTTATACAT ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AC 13 7 234885 CASAVA_Build 15 73964103 1I TTGCTCAGGC -/T TGGAGTGCAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 234886 CASAVA_Build 15 73965398 2D TTCTCTTGCT GA/-- CACCACCAGT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 GA 1 0 234887 CASAVA_Build 15 73965522 1D TGTGTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 36 1 28 7 T 12 11 234888 CASAVA_Build 15 73969467 11D CTGTAACATG GTAGAGAAAGT/----------- TTCAGATGTA 3070 het 3070 ref 38 18 18 5 GTAGAGAAAGT 1 0 234889 CASAVA_Build 15 73979969 3I CACTTTTAAC ---/AAG AAATCCAGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AAG 0 1 234890 CASAVA_Build 15 73981328 5D CTATTAAGAC AAATT/----- AAATATTTGC 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 AAATT 1 0 234891 CASAVA_Build 15 73982654 2D ACACACTAAG AC/-- AATTTTTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 AC 1 0 234892 CASAVA_Build 15 73984127 3I TAAAGGAACA ---/TCT TCTCGTTCCG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TCT 1 2 234893 CASAVA_Build 15 73996259 2D TAGGGTAAAC TT/-- TTAAAAATTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 2 234894 CASAVA_Build 15 74001038 1D GCCTGGGCGA C/- AGCGAGACTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 0 234895 CASAVA_Build 15 74004855 1I CAAGAGGGGT -/A AAAATAGAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 4 5 234896 CASAVA_Build 15 74008706 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 27 1 18 8 A 13 14 234897 CASAVA_Build 15 74016750 1I CTGAAAGTAC -/A ACAAAATTAG 3045 hom 18 het 7 0 7 0 A 1 2 234898 CASAVA_Build 15 74017043 1D ACTTTTTAGT G/- GCTCTTGCCC 3070 het 3070 hom 37 17 13 7 G 2 1 234899 CASAVA_Build 15 74019521 1D AAAAAAAAAA T/- AACTGTTAAT 3070 het 325 hom 38 2 34 3 T 1 0 234900 CASAVA_Build 15 74020180 4D AACCACATGG CTAA/---- CTAACAAAGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CTAA 2 1 234901 CASAVA_Build 15 74023718 2I CCTGGCACAC --/AT AGGCATGTGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 0 1 234902 CASAVA_Build 15 74024152 2D AAAAGGCTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 41 0 31 11 TG 7 6 234903 CASAVA_Build 15 74024352 2I TTTTTAATAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 18 17 12 T 10 12 234904 CASAVA_Build 15 74024670 1D TTTTTATTTT A/- TTTTTTTTGT 3070 hom 39 het 18 0 13 5 A 1 0 234905 CASAVA_Build 15 74027986 3D TGAGTCACTG CGC/--- CGCCCGGCCC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 CGC 2 1 234906 CASAVA_Build 15 74029834 2D GCAGTCGAGC CT/-- CTCTACAGAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 5 CT 3 2 234907 CASAVA_Build 15 74031957 1D TTCATGTGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 9 8 234908 CASAVA_Build 15 74035189 1D GTACCTGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2121 hom 42 13 10 19 A 17 16 234909 CASAVA_Build 15 74035483 1D AGAAAGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 157 hom 45 1 35 9 T 12 11 234910 CASAVA_Build 15 74035914 3D GATTTATGTT ATG/--- ATAGATTTTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ATG 1 0 234911 CASAVA_Build 15 74036959 2I ACAATTTCAC --/TA TGTTGCACCC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TA 0 1 234912 CASAVA_Build 15 74045532 1D TCCCAAACAC A/- GAAGCTACGT 3070 het 3070 hom 58 25 27 6 A 1 0 234913 CASAVA_Build 15 74065212 4D AAAAAATAAA ACTT/---- AATTATGGCC 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 ACTT 1 0 234914 CASAVA_Build 15 74084845 1D CTTTGGGAAG C/- CCGAGGTGGG 3070 hom 50 het 21 0 15 6 C 3 2 234915 CASAVA_Build 15 74102676 28D AGGTACCTAT AGTGATTGGAAGCCCAGAAGGTACCTAC/---------------------------- AGTGATTGGA 2512 het 2512 ref 28 22 6 11 AGTGATTGGAAGCCCAGAAGGTACCTAC 1 0 234916 CASAVA_Build 15 74131672 1I CATATCAATG -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 5 6 234917 CASAVA_Build 15 74136612 1I9M1I AGAATCACCT -GGGGCAGTT-/GGGGGCAGTTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 6 N/A 0 0 234918 CASAVA_Build 15 74160344 1D ATGAGGTCTC A/- TTATGTTGCC 3070 het 2886 hom 26 7 12 7 A 1 0 234919 CASAVA_Build 15 74162034 4D GGCACATGGT GAAA/---- GAAGGAGCAA 2829 het 2809 hom 20 9 8 4 GAAA 1 0 234920 CASAVA_Build 15 74163995 2I TTTTTTTTGG --/GT TTTTTTTTTT 3070 het 2752 hom 35 13 21 2 GT 0 1 234921 CASAVA_Build 15 74165450 1I ATTTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2517 het 2517 ref 29 8 9 12 A 13 14 234922 CASAVA_Build 15 74182737 1D CATCTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2300 hom 28 8 15 5 A 11 10 234923 CASAVA_Build 15 74195674 1D CTCCGCAGTC T/- TTGTAGTTTG 3070 het 3070 hom 42 10 25 7 T 3 2 234924 CASAVA_Build 15 74232090 18D CTCACATGTC GCTTTCTCACTGAGGCCT/------------------ GCTCTGACCA 3070 het 3070 ref 37 24 12 8 GCTTTCTCACTGAGGCCT 1 0 234925 CASAVA_Build 15 74284384 4I AGGTTTTCCT ----/TTGA TTGATTGCTA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TTGA 1 2 234926 CASAVA_Build 15 74305402 5I TTTTAACTTC -----/CCTTA CAATATATTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CCTTA 0 1 234927 CASAVA_Build 15 74311398 2D ACGTACACAT AC/-- ACACACACAC 1081 het 1081 ref 35 21 3 11 AC 9 8 234928 CASAVA_Build 15 74323220 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAACAA 3070 hom 40 het 16 0 13 3 C 0 1 234929 CASAVA_Build 15 74329619 1I AGATGGATTG -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 7 8 234930 CASAVA_Build 15 74353124 1I TGAAATATAT -/A AAAAAACATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 6 7 234931 CASAVA_Build 15 74371742 1I TTGGCTACAT -/A AAACAGTCTG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 3 4 234932 CASAVA_Build 15 74377442 1D AGATTAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1671 het 1671 ref 27 13 4 10 T 15 14 234933 CASAVA_Build 15 74381780 1I TTACTTAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 831 hom 40 2 28 10 A 10 11 234934 CASAVA_Build 15 74386886 1D CATCTTAACC T/- TTTTTTTTTT 2037 het 2037 ref 43 22 6 15 T 15 14 234935 CASAVA_Build 15 74415695 1I GTGGGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 30 1 20 9 T 13 14 234936 CASAVA_Build 15 74416627 1I GGGATGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2340 hom 30 7 18 5 T 13 14 234937 CASAVA_Build 15 74429055 1I CATCATCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 38 1 31 6 A 10 11 234938 CASAVA_Build 15 74431883 1D TTGTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2056 het 592 hom 24 3 7 14 T 15 14 234939 CASAVA_Build 15 74434943 1D AGAAGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 35 0 27 8 T 11 10 234940 CASAVA_Build 15 74452437 4I TTCCTTTTTC ----/TTTA TTTCTTTCTT 2611 het 11 hom 12 1 8 3 TTTA 0 1 234941 CASAVA_Build 15 74453505 1I AAATTAGAAA -/G GCTGGGGGCA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 1 2 234942 CASAVA_Build 15 74456789 1D CAGCTCAGCC T/- TTATTTAATT 3070 hom 123 het 50 0 42 9 T 3 2 234943 CASAVA_Build 15 74462482 2D GTGTGTATAG GT/-- GTGTGTGTGT 521 het 330 hom 30 4 5 21 GT 8 7 234944 CASAVA_Build 15 74471965 2I GAGCTCGTCT --/AC ACACACACAC 3070 hom 24 het 48 1 38 9 AC 8 9 234945 CASAVA_Build 15 74479401 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1901 het 211 hom 14 2 7 5 A 17 16 234946 CASAVA_Build 15 74490273 1I TTCACATCTC -/T TTGTCTTCTT 3070 hom 147 het 56 0 49 7 T 2 3 234947 CASAVA_Build 15 74491637 2D TAGATGGGGT TA/-- TATGATACTG 3070 het 3070 ref 41 20 16 7 TA 2 1 234948 CASAVA_Build 15 74495888 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 904 hom 24 3 18 4 A 12 11 234949 CASAVA_Build 15 74496606 2I18M1I AAAGATAGTC --TGTGTGTGTTAAAAAAAC-/TGTGTGTGTGTTAAAAAAACA AAAAAAACAA 3070 hom 60 het 23 0 21 6 N/A 0 0 234950 CASAVA_Build 15 74509112 1D AATTTTAAAA G/- GGAAACAGCA 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 G 3 2 234951 CASAVA_Build 15 74520602 4I CAGGTGTGAG ----/CCAC CCACCGTGCC 3070 het 1529 hom 17 5 9 3 CCAC 1 2 234952 CASAVA_Build 15 74548695 1D CATGAAGTTA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 111 het 43 0 38 7 T 8 7 234953 CASAVA_Build 15 74549335 1D TAATGCCTTA T/- TTTTTTAGAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 6 234954 CASAVA_Build 15 74550495 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 977 het 480 hom 26 4 4 20 T 14 12 234955 CASAVA_Build 15 74551559 1I ACAAGCCAGA -/G AAGATCCGTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 0 1 234956 CASAVA_Build 15 74554730 1I TAGCCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 11 12 234957 CASAVA_Build 15 74556313 4I TTTCAATGTT ----/ATAA ATAAAGTTGT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 ATAA 1 2 234958 CASAVA_Build 15 74557615 3D TTTTTGTTAA TTG/--- TTCTAGTTTG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 TTG 1 0 234959 CASAVA_Build 15 74562152 1D AATTAGCACC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 90 het 34 0 31 5 A 8 7 234960 CASAVA_Build 15 74562692 1D ATTCACATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 539 hom 33 4 22 7 A 16 15 234961 CASAVA_Build 15 74564270 1I35M3I TGTTAAAAAC -CTCAATAAACTAGGTATTGAAGAAACATACCCCAA---/TCTCAATAAACTAGGTATTGAAGAAACATACCCCAAAAT AATAATAAGA 3070 hom 117 het 32 0 40 2 N/A 0 0 234962 CASAVA_Build 15 74565910 1D AATTTATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 354 hom 42 1 34 8 A 10 9 234963 CASAVA_Build 15 74575624 1I ATTAACAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 25 8 T 11 12 234964 CASAVA_Build 15 74600788 1I CTAAGGTCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 31 het 43 1 33 9 A 9 10 234965 CASAVA_Build 15 74618120 1D AATAATAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 10 9 234966 CASAVA_Build 15 74620623 1I TTATTAAAAA -/T ATATATATCT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 0 1 234967 CASAVA_Build 15 74627518 1I TCCCGTTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 411 hom 35 1 31 3 A 9 10 234968 CASAVA_Build 15 74629146 2I GTGTAAAAAC --/AA AAAAAAAAGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 10 234969 CASAVA_Build 15 74630505 13D CACTGTTGGC AGGAACATAAATT/------------- AGTAGAGCCA 3070 hom 75 het 25 0 26 0 AGGAACATAAATT 1 0 234970 CASAVA_Build 15 74639844 2I ATTTAATAGC --/CA CACACAATTC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 CA 3 4 234971 CASAVA_Build 15 74640418 1I ATTTCTCTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 9 10 234972 CASAVA_Build 15 74641224 1D CTAGTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 24 2 15 8 T 17 16 234973 CASAVA_Build 15 74649943 6D CACTATTGCT AAGTCC/------ AAGTCCATTC 3070 hom 117 het 41 0 39 5 AAGTCC 2 1 234974 CASAVA_Build 15 74658499 1I TGCCTTGACT -/G AAAAATACAA 2603 hom 15 het 9 0 6 3 G 0 1 234975 CASAVA_Build 15 74700876 2I ATGAGACAGT --/TC TCTTTGTGAG 3070 hom 81 het 35 0 27 8 TC 1 2 234976 CASAVA_Build 15 74706648 3I ATTTTACAAA ---/TCT TCTCAGAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TCT 1 2 234977 CASAVA_Build 15 74727586 1D ATGAAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 39 1 30 9 A 11 10 234978 CASAVA_Build 15 74728505 5D TGCAGGAGAG AGAGC/----- TGTTCTCCTT 3070 hom 81 het 31 0 27 5 AGAGC 1 0 234979 CASAVA_Build 15 74747358 1I GACTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 31 1 25 5 A 10 11 234980 CASAVA_Build 15 74757810 1D GAAAAATCCA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 74 het 30 0 24 6 T 8 7 234981 CASAVA_Build 15 74758114 1I CAGATAAAAG -/A AGGGAAAAAT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 1 2 234982 CASAVA_Build 15 74769088 1D CCTTGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1636 het 1636 ref 39 28 5 7 A 11 10 234983 CASAVA_Build 15 74769364 6I TGAATAAATA ------/AATAAG AATATGGGCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AATAAG 0 1 234984 CASAVA_Build 15 74773281 2D TGTTCAAGAT AA/-- AAAGAGTTCT 3070 het 3070 ref 48 25 20 4 A 5 3 234985 CASAVA_Build 15 74780492 1I TGCCATACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 41 1 26 14 A 14 15 234986 CASAVA_Build 15 74781574 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 A 8 9 234987 CASAVA_Build 15 74804814 2I TGTATACATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 11 13 234988 CASAVA_Build 15 74805347 1I TGAATATGAC -/A AAAAAAAAAG 2491 het 2491 ref 23 11 6 6 A 9 10 234989 CASAVA_Build 15 74814939 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 10 9 234990 CASAVA_Build 15 74821781 1D TTTAACTGAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 234991 CASAVA_Build 15 74834101 1D ATTTTAATTG T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 6 234992 CASAVA_Build 15 74836411 4D TAATTAGTGC CCCA/---- CCCACTTACC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 CCCA 2 1 234993 CASAVA_Build 15 74838355 5D ACTGAATTCA TATAT/----- TATTTCTCAA 3070 hom 60 het 34 0 21 14 TATAT 1 0 234994 CASAVA_Build 15 74842947 1D TTATTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 31 1 27 3 A 11 10 234995 CASAVA_Build 15 74848222 1D GTATTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 35 2 29 4 A 15 14 234996 CASAVA_Build 15 74851445 3D TATTAACTAT GAA/--- GAAGAAGAGG 3070 hom 102 het 40 0 34 7 GAA 3 2 234997 CASAVA_Build 15 74856946 1I AAAAAATTAG -/C CAGACATGGT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 C 1 2 234998 CASAVA_Build 15 74869627 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 21 4 A 15 14 234999 CASAVA_Build 15 74886935 1D TATTTTTTAC T/- TTTTTTATTA 2354 het 568 hom 10 2 7 1 T 7 6 235000 CASAVA_Build 15 74892296 1I ATACTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 625 hom 37 2 30 5 A 11 12 235001 CASAVA_Build 15 74894321 3D AACAGGAAAC AAA/--- TAACAGATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 3 0 235002 CASAVA_Build 15 74894448 1I CAAATTAAAA -/C CAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 37 1 29 7 C 1 2 235003 CASAVA_Build 15 74907788 1I ACCCAAAAGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 A 7 8 235004 CASAVA_Build 15 74941645 11D AACAATAAGG CTTTTATAAAA/----------- CCATGTGTGT 3070 hom 75 het 28 0 25 5 CTTTTATAAAA 1 0 235005 CASAVA_Build 15 74973648 1I ATTTCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 24 3 20 1 A 11 12 235006 CASAVA_Build 15 74974905 1I CTTGACTAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 34 0 24 10 A 8 9 235007 CASAVA_Build 15 74988027 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1352 hom 17 het 8 0 4 4 A 15 14 235008 CASAVA_Build 15 75000452 1D TGGGGCCACT C/- CCCACTCCAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 4 3 235009 CASAVA_Build 15 75031423 1I AAAAATAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1155 hom 43 5 31 7 T 13 14 235010 CASAVA_Build 15 75033881 1D TTTATTTGGC G/- GGGGGGGGGG 1562 hom 23 het 22 0 10 12 G 12 11 235011 CASAVA_Build 15 75060774 1D AGACACGTCA C/- CCACACCTAG 3070 hom 30 het 11 0 11 1 C 3 2 235012 CASAVA_Build 15 75062556 1I ATGGGAAGCC -/T TTTCGGGAGG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 3 4 235013 CASAVA_Build 15 75113217 1I CTTAGAGAGG -/A GCACACACAC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 0 1 235014 CASAVA_Build 15 75113597 1D AAAAGAGGTG T/- GGGGGCACGC 3070 hom 63 het 28 0 22 7 T 1 0 235015 CASAVA_Build 15 75115164 1I GTGTCCCCAG -/A AAGGGGAGGG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 2 3 235016 CASAVA_Build 15 75122159 1D GTCGGGGAAT G/- GGGGAAGAGT 3070 hom 108 het 44 0 35 9 G 5 4 235017 CASAVA_Build 15 75162146 4I AGAGCATCCA ----/CTCC CTCCCTCCCT 2489 het 2489 ref 29 16 7 6 CTCC 3 4 235018 CASAVA_Build 15 75166256 3D GTGTCTTTTT TTA/--- TTATTTTTTT 1796 het 1796 ref 15 10 5 1 TTA 2 1 235019 CASAVA_Build 15 75180143 2D CTAATTAAAC TG/-- AGAGAAGCCA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TG 1 0 235020 CASAVA_Build 15 75185739 1I TGTGCATTCA -/T TCTAAAGACA 3070 het 2988 hom 27 8 14 5 T 1 2 235021 CASAVA_Build 15 75185757 4D CATAAGTGAC TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 972 hom 33 3 13 17 TATT 5 4 235022 CASAVA_Build 15 75205315 3I CCAGGAGAAG ---/AGC AGCAGTCCAG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 AGC 1 2 235023 CASAVA_Build 15 75219705 3I AACTAGAGAC ---/TAA TGTCTTTTAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TAA 0 1 235024 CASAVA_Build 15 75242010 1I ATCTCCTAAC -/A AAATGTTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 3 4 235025 CASAVA_Build 15 75243208 2D GCAGGTACAC AT/-- GTCTCTAGTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 AT 1 0 235026 CASAVA_Build 15 75255659 1I16M1D TAATAAGAAG -AAAAAAAAAAGAAAAGA/AAAAAAAAAAAGAAAAG- AAAAAAAAAA 1428 het 732 hom 18 6 10 7 N/A 0 0 235027 CASAVA_Build 15 75255720 1I TACATTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 10 11 235028 CASAVA_Build 15 75256890 1D CTAGCATTTT G/- CTAGGAAAAG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 G 1 0 235029 CASAVA_Build 15 75263753 2I ATTGAAACTC --/AT ATATATTGCT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 AT 3 4 235030 CASAVA_Build 15 75264277 15I ACAGTCTAAG ---------------/ACTCTGCCTCGAAAA ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 29 19 10 0 ACTCTGCCTCGAAAA 0 1 235031 CASAVA_Build 15 75266034 4I AAAAAACAAA ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 AAAC 1 2 235032 CASAVA_Build 15 75276415 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1259 het 1259 ref 23 8 4 11 T 17 18 235033 CASAVA_Build 15 75294734 1D GTGGATTGCC T/- TTTTAATTGT 3070 het 3070 ref 47 30 16 1 T 5 4 235034 CASAVA_Build 15 75295304 6D TGAGATATAT TTTATA/------ TTTATATTTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTTATA 3 2 235035 CASAVA_Build 15 75305451 1D GATATATATA T/- ATATATATAT 1466 hom 10 het 4 0 4 0 T 1 0 235036 CASAVA_Build 15 75309034 5D TAGCTGTTTC TTTCT/----- TTTCTTTCTT 3070 het 3013 hom 32 11 16 7 TTTCT 2 1 235037 CASAVA_Build 15 75309603 1D GAGATAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 38 0 32 8 T 12 11 235038 CASAVA_Build 15 75336081 1D CAGAACATAG C/- CAGTTCATTT 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 C 2 1 235039 CASAVA_Build 15 75359962 1D AATGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 2845 het 2845 ref 27 10 8 9 T 15 14 235040 CASAVA_Build 15 75374231 1I AAACTAACTG -/T AACTGATATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 1 235041 CASAVA_Build 15 75409885 1D AAGTGCTTAC A/- AAAGGTCCTA 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 4 3 235042 CASAVA_Build 15 75418032 1D AAAAATCTTT A/- AAAAAAAAAA 2180 het 409 hom 19 2 6 11 A 11 10 235043 CASAVA_Build 15 75424484 14D AATATAAGTG GTGAGAGCAGGCAT/-------------- CCTTGCCTTG 3070 het 3070 hom 42 20 23 2 GTGAGAGCAGGCAT 1 0 235044 CASAVA_Build 15 75425827 1D TGACAGTGAT C/- AGTCCCTTGG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 C 1 0 235045 CASAVA_Build 15 75427847 4D AAGAAAAAAT AATA/---- AATAATAGGT 3070 het 3070 ref 39 23 15 3 AATA 2 1 235046 CASAVA_Build 15 75451410 5D AGAGAAAATG TTTTC/----- TCTGCTCTCC 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 TTTTC 1 0 235047 CASAVA_Build 15 75456507 6D AGGGGCTGGG GGCAGT/------ GGCTCATGCC 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 GGCAGT 1 0 235048 CASAVA_Build 15 75476879 1I AAATAGAAAC -/A AAAAAAAATC 1839 het 1839 ref 21 12 5 4 A 8 9 235049 CASAVA_Build 15 75488620 1D TAAATGTACT G/- GGAAAATTAA 3070 hom 93 het 39 0 32 8 G 3 2 235050 CASAVA_Build 15 75493177 1D TTATGTAGGA T/- GTTAACATTA 3070 het 3070 hom 49 21 23 6 T 1 0 235051 CASAVA_Build 15 75505004 1I AAAAAGTAAA -/T TTGTTACTAA 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 T 2 3 235052 CASAVA_Build 15 75508806 1I TCATATCTCC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 7 8 235053 CASAVA_Build 15 75515217 1I TAGGTGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1436 hom 47 5 30 12 T 12 13 235054 CASAVA_Build 15 75551283 1D TGCTATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 T 13 12 235055 CASAVA_Build 15 75552740 1D TATTAGCAGA C/- ATTTGTATAA 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 C 1 0 235056 CASAVA_Build 15 75553188 1D TAAACCAAAC A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 8 7 235057 CASAVA_Build 15 75573559 1D CAGGGTCTTC T/- TTTGTTGCCC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 4 3 235058 CASAVA_Build 15 75585561 4D TTTTTTAATA TAAG/---- TAAGTATGTC 3070 het 3070 ref 20 11 8 3 TAAG 2 1 235059 CASAVA_Build 15 75591847 2D AAAATTAAAG AA/-- AAAAAAGGAC 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 A 8 6 235060 CASAVA_Build 15 75597407 1D AGCAGATGTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 45 0 37 9 A 9 8 235061 CASAVA_Build 15 75599966 2D TTGGTGGTTT TA/-- TTTTTTTTTG 3070 het 1529 hom 22 7 12 3 TA 1 0 235062 CASAVA_Build 15 75602561 2I GATATATGAC --/TT ATATATATAG 2974 het 2974 ref 20 11 8 1 T 0 2 235063 CASAVA_Build 15 75603357 1I ATCCTGGACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 10 235064 CASAVA_Build 15 75606380 2I GGCCAGGACT --/AG ACGCCCACGT 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 AG 0 1 235065 CASAVA_Build 15 75611702 1D TGGTGGGAGC T/- GTCCCCAGCC 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 T 1 0 235066 CASAVA_Build 15 75619200 1D GGAAGGGAAT G/- GGGGCGGCTT 3070 hom 65 het 29 0 19 11 G 5 4 235067 CASAVA_Build 15 75620774 1D GAGAGGGGCT G/- GGGAGTGCCC 3070 hom 85 het 36 0 28 8 G 4 3 235068 CASAVA_Build 15 75635145 1D CACGAAGCCC T/- TTGACCTCCA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 3 2 235069 CASAVA_Build 15 75652267 4I CTTGAGTATT ----/AGTC AGTGAATGTG 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 AGTC 0 1 235070 CASAVA_Build 15 75665261 2D AAGGAGAAAA AG/-- AGGTCGGGAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 7 AG 2 1 235071 CASAVA_Build 15 75696767 1D GAGCTGCTCC A/- GGGGTGGATC 2437 het 2437 ref 26 12 7 7 A 1 0 235072 CASAVA_Build 15 75750570 2D GACTGTGGAG CC/-- CTACCCAGGA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 C 3 1 235073 CASAVA_Build 15 75752845 3I CCTGTGACCT ---/CCC CGTTACCGAG 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 1 4 235074 CASAVA_Build 15 75763234 1D CTTTTATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 541 hom 40 4 25 11 A 16 15 235075 CASAVA_Build 15 75791281 1I TCTCCTCTGA -/G GGGGGGGGCA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 8 9 235076 CASAVA_Build 15 75799199 2I ACACACACAC --/AT GCACACTCAC 3070 het 3070 hom 81 33 38 10 AT 0 1 235077 CASAVA_Build 15 75799278 4I7M2I CATGCATACA ----CACACAT--/CACTCACACATAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 60 27 26 10 N/A 0 0 235078 CASAVA_Build 15 75801579 3I10M11I TGTTGTCAGC ---TTTTAAATGG-----------/GCTTTTTAAATGGCTTGTTAATGC CCCGGTAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 10 N/A 0 0 235079 CASAVA_Build 15 75807124 1D ATTTTATATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 10 9 235080 CASAVA_Build 15 75809917 1D CCAGCGCCTG C/- CCCGTACCCG 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 C 4 3 235081 CASAVA_Build 15 75827859 4D CCAGCACAGA GCCT/---- GGCTCAGGGC 3052 het 2487 hom 24 10 9 5 GCCT 1 0 235082 CASAVA_Build 15 75846343 4I GAAAGAGGAG ----/AAGA AAGATTTTTT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 AAGA 1 2 235083 CASAVA_Build 15 75847674 1I CAGGGTCCCC -/T GGGCAGACAG 2636 hom 27 het 19 0 8 11 T 0 1 235084 CASAVA_Build 15 75852085 1D AAAAGGTCCA T/- TAACACATTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 2 1 235085 CASAVA_Build 15 75856662 1D TTATCATGGT G/- GGGGGGTCCA 3070 het 3070 hom 40 11 17 12 G 7 6 235086 CASAVA_Build 15 75856766 12D GCATACACAT ATACACACACAA/------------ ATACACACAC 3070 het 3070 ref 45 21 13 13 ATACACACACAA 1 0 235087 CASAVA_Build 15 75856859 1I CATATACACA -/T CACGCACACA 2569 het 2569 ref 29 13 6 10 T 0 1 235088 CASAVA_Build 15 75868516 2D TGTGAAAATC AT/-- AGCTCTAGTC 3070 het 3070 ref 51 28 17 7 AT 1 0 235089 CASAVA_Build 15 75870792 1D GCGGGGGGTC A/- AGGGAAGACA 3070 hom 101 het 36 0 32 4 A 2 1 235090 CASAVA_Build 15 75878331 6I ACTGATCAGA ------/AAGCAG AAGCAGGGCC 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 AAGCAG 1 2 235091 CASAVA_Build 15 75880991 2I AGTTAATGGG --/TT TTTTTTTTTT 2461 het 2461 ref 23 7 10 6 T 12 14 235092 CASAVA_Build 15 75892073 10D GCTGACCCTC GCCAACAATG/---------- GCCAGGCTCA 3070 het 3070 hom 25 13 13 1 GCCAACAATG 1 0 235093 CASAVA_Build 15 75896372 4D70M1D AAGAGGAGCT GAGAGAGAGAGAGAGAAGAAAAAAACAATGGCAAAGAAAGGCCATGATCAGCCAGAGCCAACAAGGGAGGAGCAG/----GAGAGAGAGAGAAGAAAAAAACAATGGCAAAGAAAGGCCATGATCAGCCAGAGCCAACAAGGGAGGAGCA- GGAGAGGCAG 3070 hom 78 het 26 0 26 14 N/A 0 0 235094 CASAVA_Build 15 75914574 3D GCATCTCGCT CTG/--- TTATCCAGGC 3070 het 975 hom 14 3 9 2 CTG 1 0 235095 CASAVA_Build 15 75921357 1D CATCTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 63 24 25 14 A 12 11 235096 CASAVA_Build 15 75927041 1D AAAGTTGGTT C/- TTTGAAAAGA 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 C 1 0 235097 CASAVA_Build 15 75927145 1D TATCAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 A 11 10 235098 CASAVA_Build 15 75927457 19I CGCTTGAACC -------------------/TGGGAGGCAGAGGTTGCAG TGAGGTGAGA 2589 het 1846 hom 13 4 7 2 TGGGAGGCAGAGGTTGCAG 0 1 235099 CASAVA_Build 15 75934848 1I AATGAAATTG -/A AAAAAAAAAA 1837 het 1837 ref 53 35 6 12 A 12 13 235100 CASAVA_Build 15 75935740 12D TGTCTCCAAC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAGG 3070 het 1625 hom 21 7 9 8 A 20 8 235101 CASAVA_Build 15 75940551 1D TGTTTTTTTG C/- TTTTTTTTGT 3070 het 150 hom 20 3 12 5 C 1 0 235102 CASAVA_Build 15 75946312 4D GACTGAGCGT GGGA/---- GGTTTGGGGT 3070 het 2973 hom 30 12 10 8 GGGA 1 0 235103 CASAVA_Build 15 75949639 3D ATGGTTGGGT GGA/--- GGAGGAGGAG 3070 het 3070 hom 38 16 14 9 GGA 4 3 235104 CASAVA_Build 15 75955544 1I TCCTTCACCA -/C CCCCGGCCCT 2444 het 2444 ref 40 20 8 12 C 4 5 235105 CASAVA_Build 15 75964380 12I CGTATGTGTG ------------/CACACACACACT CACACACACA 3070 het 3070 ref 48 21 15 12 CACACACACACT 1 2 235106 CASAVA_Build 15 75965133 2D GTGCACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 62 30 20 14 AC 7 6 235107 CASAVA_Build 15 75965212 2I GACACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 62 30 21 11 CA 5 6 235108 CASAVA_Build 15 75966994 1I CTTGGGGAGA -/C CCCTGGCCCT 3070 hom 65 het 27 0 21 6 C 3 4 235109 CASAVA_Build 15 75972086 9I TGGAGTGCAG ---------/CTGGGGTCA CTCGGGTCAC 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 CTGGGGTCA 0 1 235110 CASAVA_Build 15 75975468 1D CCAAGTGCTG C/- CCCCCATCTC 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 C 6 5 235111 CASAVA_Build 15 75987201 1D AGTATGACTT G/- TTGGGGCTCA 1236 het 1236 ref 20 17 3 0 G 1 0 235112 CASAVA_Build 15 75989333 1D TTGACAGTGG C/- TCCCCCAGCC 2330 het 737 hom 14 4 6 4 C 1 0 235113 CASAVA_Build 15 76003066 1D AATTACTTTT A/- AACTTTTAGG 3070 het 3070 ref 27 16 9 4 A 3 2 235114 CASAVA_Build 15 76003325 1I CATTGGAGTA -/G TTAAGGTTGG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 G 0 1 235115 CASAVA_Build 15 76012933 2I ATACAGACAC --/AT GAGTCTTCCC 3070 het 2671 hom 32 10 16 6 AT 0 1 235116 CASAVA_Build 15 76022652 2D CCAGCCCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 1307 het 468 hom 21 5 5 11 T 18 16 235117 CASAVA_Build 15 76022802 1I TGAGACTACA -/G GGCATGTGCC 3070 het 1184 hom 15 3 9 3 G 2 3 235118 CASAVA_Build 15 76026533 1D CCCAATATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 24 0 17 8 T 9 8 235119 CASAVA_Build 15 76028354 3D CCAGATGTGG TGC/--- TGCGCTCTGA 1707 het 1707 ref 41 30 5 6 TGC 2 1 235120 CASAVA_Build 15 76034742 1D TGCTGAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 28 1 19 8 A 13 12 235121 CASAVA_Build 15 76036005 2I ATGTATGTAC --/AT AGTTACTTTA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AT 0 1 235122 CASAVA_Build 15 76036962 4D ATCTAGTAAG TATT/---- TCTTGATCTG 3070 het 3070 ref 44 30 12 5 TATT 1 0 235123 CASAVA_Build 15 76038527 2I GTATCCTAGC --/TG TGTGTAATCA 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 TG 2 3 235124 CASAVA_Build 15 76041691 2D AATTATAGGA CT/-- CTCTGGTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 CT 3 2 235125 CASAVA_Build 15 76045011 2I AAAAAAAAAA --/AT AAAAATACGC 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 AT 0 1 235126 CASAVA_Build 15 76047406 1D TTGTCCCCTC A/- CCTTTCATCC 3070 het 3070 ref 42 27 14 1 A 1 0 235127 CASAVA_Build 15 76050669 4I CTGGGGTGGG ----/GGGT GGGATTGGAA 3070 hom 54 het 20 0 17 3 GGGT 0 1 235128 CASAVA_Build 15 76058447 3D CTCAGAGGGC TGG/--- TGGGGGTGTG 3000 hom 26 het 16 0 10 6 TGG 2 1 235129 CASAVA_Build 15 76060091 3I AAATGGAGGA ---/AAG AAGAGCTTGT 2611 het 2611 ref 47 39 6 2 AAG 1 2 235130 CASAVA_Build 15 76061910 2D TCAGTCTCCC CT/-- CTCTCTGTCT 2767 het 2767 ref 18 10 7 1 CT 4 3 235131 CASAVA_Build 15 76062176 4I AATCTGAGAT ----/ACAG ACATTTCAGC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 ACAG 0 1 235132 CASAVA_Build 15 76068983 19D3M8D GGCTGTGAAA CTGTCTCCTGCCCTCCTGCCCATGGGCTGC/-------------------CCA-------- GGCAGGTCCT 2320 het 231 hom 18 1 15 7 N/A 0 0 235133 CASAVA_Build 15 76069320 7I GCACAGGGCA -------/CAGGGCG CAGGGACGGC 3070 hom 4 het 19 0 12 7 CAGGGCG 0 1 235134 CASAVA_Build 15 76074731 3I ATATACCGTA ---/GTT GTTGAAACCA 1300 het 1300 ref 42 29 4 9 GTT 1 2 235135 CASAVA_Build 15 76075826 1D GCTGAGGGGT G/- GGGGGGGTTC 3070 hom 47 het 19 0 16 3 G 8 7 235136 CASAVA_Build 15 76097362 1D ATCCTGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2158 hom 27 6 17 4 A 12 11 235137 CASAVA_Build 15 76101947 1D ACAAAGCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 29 0 20 9 T 10 9 235138 CASAVA_Build 15 76105549 1D GTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2539 hom 39 9 15 15 T 13 12 235139 CASAVA_Build 15 76108457 1I GTGGTTATAA -/T TTTTTTTTTT 2106 het 1225 hom 16 3 6 7 T 15 16 235140 CASAVA_Build 15 76121838 4D GTCACTTTAC CTCT/---- CTAAGCCTCA 3070 het 3070 ref 35 15 15 7 CT 3 1 235141 CASAVA_Build 15 76124956 1D AAAAAATAAA G/- TTTGCACATC 3070 het 3070 hom 40 18 17 7 G 1 0 235142 CASAVA_Build 15 76134641 2I CATGGTTCTG --/GT GGTAAAGTCA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 GT 0 1 235143 CASAVA_Build 15 76134709 1D GAATATCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 28 0 18 10 A 10 9 235144 CASAVA_Build 15 76144153 1I GCACCAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 11 235145 CASAVA_Build 15 76148400 1D CTACAATGGT G/- GGGGTCTTTT 3070 hom 81 het 32 0 26 6 G 5 4 235146 CASAVA_Build 15 76155248 16D ATCTCCAGGG AGCAGCTCCAGCTGTT/---------------- AGCAGCTCTG 3070 hom 92 het 38 0 30 9 AGCAGCTCCAGCTGTT 1 0 235147 CASAVA_Build 15 76155980 1D CCGTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2069 het 116 hom 14 1 8 5 A 15 14 235148 CASAVA_Build 15 76184405 1D CTTTTCCCTC T/- TTGGGGGGGT 3070 hom 37 het 15 0 11 4 T 3 2 235149 CASAVA_Build 15 76187599 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1080 hom 24 3 13 8 A 18 17 235150 CASAVA_Build 15 76188596 2I TGTTCCCCCA --/CC CCGCATATTC 3070 het 1103 hom 17 5 10 2 C 2 4 235151 CASAVA_Build 15 76192934 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 17 8 T 12 11 235152 CASAVA_Build 15 76205546 1I TGCCCCCCCC -/G CCTTTTTTTT 1625 het 88 hom 17 2 6 9 G 0 1 235153 CASAVA_Build 15 76213880 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1199 het 1199 ref 28 21 4 3 A 15 14 235154 CASAVA_Build 15 76214408 7D TTCTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2857 het 1391 hom 30 9 10 11 T 21 14 235155 CASAVA_Build 15 76215005 1I3M1I CCAGAGAAGC -CTT-/ACTTG GTAGCATTTA 3070 hom 45 het 18 0 16 4 N/A 0 0 235156 CASAVA_Build 15 76224429 1I AAATAAAAAT -/A AATTTTTTTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 2 3 235157 CASAVA_Build 15 76230963 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 12 11 235158 CASAVA_Build 15 76255471 1D GATTTAATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 9 8 235159 CASAVA_Build 15 76260465 1I GCACGCAAGG -/T GTGGCACATA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 0 1 235160 CASAVA_Build 15 76269634 1D AGCAAGACTC T/- TGTCTCTACA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 2 1 235161 CASAVA_Build 15 76269968 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1702 hom 20 6 12 2 A 12 11 235162 CASAVA_Build 15 76288476 4I CCAGGGAGCC ----/CTGT CTGTCTGTCA 3070 het 2179 hom 27 9 12 6 CTGT 2 3 235163 CASAVA_Build 15 76291836 1D CAGCAGAATG A/- AAAAAACCCT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 7 6 235164 CASAVA_Build 15 76294732 2D GCTCTGGATG CA/-- CAGTGTCCAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 CA 2 1 235165 CASAVA_Build 15 76296964 1D TTTGGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1799 het 523 hom 19 3 8 8 T 17 16 235166 CASAVA_Build 15 76299093 1D AAAATTCAAG A/- AGACCTGGCC 3070 hom 53 het 21 0 18 3 A 2 1 235167 CASAVA_Build 15 76303647 10D ACTGAAACAT CATGAGAAAC/---------- CCTGAGCCAG 3070 het 3070 ref 38 22 19 5 CATGAGAAAC 1 0 235168 CASAVA_Build 15 76304389 2D GGGGATCTAC AA/-- AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 8 6 235169 CASAVA_Build 15 76308472 2D TTATATTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 473 hom 38 2 17 20 T 13 11 235170 CASAVA_Build 15 76317503 1D AATTGTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 35 3 16 16 T 11 10 235171 CASAVA_Build 15 76320188 1D GAGAGATTGA G/- GGGGGGGTCT 3029 het 2234 hom 23 8 8 7 G 8 7 235172 CASAVA_Build 15 76323316 1I ACAAACTTCT -/A AAGGCCAGGA 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 A 2 3 235173 CASAVA_Build 15 76324294 9I AAAGAGACAC ---------/GGGGTGCGG AAAGCCCTTT 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 GGGGTGCGG 0 1 235174 CASAVA_Build 15 76326114 1I GAAGTTACTA -/G GAACTCCAGC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 G 1 2 235175 CASAVA_Build 15 76329851 4D CCGTCTCATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 21 0 18 4 A 17 13 235176 CASAVA_Build 15 76337851 1I TTTTATAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 9 10 235177 CASAVA_Build 15 76339288 1I AGTGAGGGGC -/A AAGGCCTCTC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 2 3 235178 CASAVA_Build 15 76341082 1D TCATCCTCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 9 8 235179 CASAVA_Build 15 76342848 1I TGAGCAGTGA -/C CCCCCCTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 C 6 7 235180 CASAVA_Build 15 76358379 1I ACTGTATTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 9 10 235181 CASAVA_Build 15 76358676 2D AACATTTCTT TC/-- TGTCTTTGTC 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 TC 1 0 235182 CASAVA_Build 15 76366729 2I AGTTACAGTT --/CC AAAAACTGCA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 C 0 2 235183 CASAVA_Build 15 76371454 1I TACTTAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 60 30 21 9 A 8 9 235184 CASAVA_Build 15 76374799 1D TATTCTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2078 hom 45 11 12 22 T 17 16 235185 CASAVA_Build 15 76375979 1I ACAATCATGG -/C TCAATGCAGC 3070 hom 63 het 26 0 20 6 C 0 1 235186 CASAVA_Build 15 76392382 3I ATTCGGCCAA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 12 15 235187 CASAVA_Build 15 76397251 1I TCATATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 34 1 27 6 A 11 12 235188 CASAVA_Build 15 76398151 1I CCATTCATAG -/T TTTCTCTCTC 1772 het 1772 ref 21 11 5 5 T 3 4 235189 CASAVA_Build 15 76403725 1I GGAGGAGCCA -/C GGTGTGCCTG 3070 hom 107 het 41 0 32 9 C 0 1 235190 CASAVA_Build 15 76436665 1I CAGGGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 11 12 235191 CASAVA_Build 15 76437444 1I ACGCAACAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 55 19 25 11 A 8 9 235192 CASAVA_Build 15 76440124 2D ATGTCTGGAG CC/-- CAGCCTTGGA 3070 het 3070 hom 36 12 19 7 C 3 1 235193 CASAVA_Build 15 76445963 1D GGTATCAAGA G/- ATCCTCCCAC 3070 het 3070 hom 25 9 16 0 G 1 0 235194 CASAVA_Build 15 76461943 1D ATTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2285 hom 25 8 11 6 A 12 11 235195 CASAVA_Build 15 76462542 1D AGCCGGGGGA T/- TGAGGAGGAT 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 T 2 1 235196 CASAVA_Build 15 76502272 1D TTTAAATGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 9 9 A 10 9 235197 CASAVA_Build 15 76514161 1I TAAAACTGTT -/A AAAAAAAAAA 2827 het 2827 ref 32 10 12 10 A 15 16 235198 CASAVA_Build 15 76521644 4D TAAGTAATAA TTAC/---- TTAAGTAATT 3070 het 3070 ref 33 18 15 1 TTAC 1 0 235199 CASAVA_Build 15 76526289 3I CATGCTTACC ---/AGT AGTGAATGAG 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 AGT 1 2 235200 CASAVA_Build 15 76529200 1I GACCTCAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 T 9 10 235201 CASAVA_Build 15 76534972 6D TATTGAAAAA AAAAAG/------ AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 48 25 16 10 AAAAAG 1 0 235202 CASAVA_Build 15 76538738 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTGGTTTT 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 T 4 5 235203 CASAVA_Build 15 76545958 1I AATTTATTCT -/C CTTCCCACCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 1 2 235204 CASAVA_Build 15 76563265 1D ACTGCAACCT C/- CCCCCTCCCG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 6 5 235205 CASAVA_Build 15 76564818 1I GAAGAAAGAG -/A AAAAAATGGT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 6 7 235206 CASAVA_Build 15 76566590 4D TGCCCAATTA CAAT/---- CAATGCCTCT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 CAAT 2 1 235207 CASAVA_Build 15 76570888 12D TTTATTTATG TATGTATTTATT/------------ TATGTATTTA 2547 het 2547 ref 23 13 8 4 TATGTATTTATT 2 1 235208 CASAVA_Build 15 76572600 4D TTATTGCATC AGAT/---- AGAGCACAAG 3070 het 3070 ref 69 33 30 11 AGAT 1 0 235209 CASAVA_Build 15 76577791 1D CTGTAAGTAT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 271 hom 33 1 22 10 G 10 9 235210 CASAVA_Build 15 76582499 1D ATTTTAAGCA T/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 T 7 6 235211 CASAVA_Build 15 76584870 1D ACAAAGTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 11 10 235212 CASAVA_Build 15 76586116 2D CAGAGGCACA CT/-- CTCTTACAGA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 CT 3 2 235213 CASAVA_Build 15 76591127 1D TGAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 9 12 A 13 12 235214 CASAVA_Build 15 76596200 1D GAGGATCACT C/- TAAGGCCAGG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 C 1 0 235215 CASAVA_Build 15 76622970 2I AATCTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 1741 het 207 hom 19 4 7 8 TG 0 1 235216 CASAVA_Build 15 76623687 3D ATAGCATAAC TGA/--- TGATACAGAA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 TGA 2 1 235217 CASAVA_Build 15 76629891 1I CTAAACAGTG -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 124 het 48 0 40 8 T 7 8 235218 CASAVA_Build 15 76656019 4D TCTCTACAAA AAAT/---- AAATAAATTA 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 AAAT 3 2 235219 CASAVA_Build 15 76656196 1D ACCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2238 het 2196 hom 38 12 10 17 A 15 14 235220 CASAVA_Build 15 76657358 7D TTTATTAATA CTTTTAT/------- CTTTTAACCC 2424 het 2424 ref 18 9 7 2 CTTTTAT 1 0 235221 CASAVA_Build 15 76659890 1D AGCATATTCC A/- ATAGTCAGTC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 2 1 235222 CASAVA_Build 15 76665358 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 12 11 235223 CASAVA_Build 15 76666870 1I AGGTTTCTGA -/G GCTGGTGTGT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 G 1 2 235224 CASAVA_Build 15 76667063 1D ATGAAATGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 8 T 9 8 235225 CASAVA_Build 15 76668282 1I GTTTTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 34 1 23 10 T 13 14 235226 CASAVA_Build 15 76674765 4I ATTCAAACAG ----/TCTC TCTCTGTGAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 TC 2 4 235227 CASAVA_Build 15 76675290 4I CTAGAAGGCA ----/CCCC CCCTTTGAGG 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 C 3 7 235228 CASAVA_Build 15 76675838 1D ACTCTTGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 17 9 T 11 10 235229 CASAVA_Build 15 76676591 8I TGGGAGGCTG --------/AGGCAGGC AGATCACCTG 3070 het 3070 ref 38 24 9 6 AGGC 0 2 235230 CASAVA_Build 15 76677796 1I ATTTTATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1937 hom 26 8 14 4 T 14 15 235231 CASAVA_Build 15 76684408 4I AGATTCTGTC ----/TCAG TCAGTCAATC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TCAG 1 2 235232 CASAVA_Build 15 76694931 1I GATCAGGGAT -/C CCCCAAAGCA 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 C 4 5 235233 CASAVA_Build 15 76695053 1I GGTATAGAGA -/T TTTTTTGGAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 6 7 235234 CASAVA_Build 15 76697654 1I GAAAAAAAAC -/T TGAGTTTTTA 2876 het 2876 ref 39 21 7 11 T 1 2 235235 CASAVA_Build 15 76701014 5D GACTTCATCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3015 het 2777 hom 18 8 8 4 CAAAA 5 4 235236 CASAVA_Build 15 76702426 1D TCTTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 2627 het 2627 ref 24 13 7 4 T 12 11 235237 CASAVA_Build 15 76729405 1I ATCAATTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 1750 hom 37 6 22 9 T 8 9 235238 CASAVA_Build 15 76729441 3D GAGTGTGCCC AGG/--- AGGAGGATGG 3070 het 2356 hom 32 6 14 14 AGG 3 2 235239 CASAVA_Build 15 76733036 1D AGCATCTTCA G/- GCTTTACCTC 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 G 2 1 235240 CASAVA_Build 15 76737253 3D CTGGCTGAGG CAT/--- CATAATTTAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 CAT 2 1 235241 CASAVA_Build 15 76745620 1I GCCATGATTG -/T AAGTTTCCTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 1 235242 CASAVA_Build 15 76745856 1I CTTGGGTGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 8 9 235243 CASAVA_Build 15 76748341 2D AAACAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 225 hom 13 1 8 4 AT 8 7 235244 CASAVA_Build 15 76748513 1D CACTTCCCCT C/- CCCCAGAGAT 3070 hom 50 het 19 0 17 2 C 5 4 235245 CASAVA_Build 15 76753223 1I CAGGGACTTG -/T TTTCCCATTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 3 4 235246 CASAVA_Build 15 76757841 1I GCCTGGCTCA -/T TTTTTTTTGT 2109 het 2109 ref 18 8 6 4 T 8 9 235247 CASAVA_Build 15 76770277 1D ACAAAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 8 A 12 11 235248 CASAVA_Build 15 76773193 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 20 1 17 2 T 11 10 235249 CASAVA_Build 15 76809488 11D TCCAATGGGG TAGTGCTCCCC/----------- CATTGGACAA 3070 het 3070 ref 21 14 7 1 TAGTGCTCCCC 1 0 235250 CASAVA_Build 15 76816260 5I ATACGGAAAC -----/ACTGT TGCCTAAAGT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 ACTGT 0 1 235251 CASAVA_Build 15 76830244 2I CGCTATTTTT --/AG AGTCTTTTAC 3070 hom 30 het 14 0 9 5 AG 1 2 235252 CASAVA_Build 15 76839491 1D CTGAGTCACA G/- GGTCCCATCT 1564 het 1564 ref 23 12 6 5 G 3 2 235253 CASAVA_Build 15 76843582 1D GGAAAGGCAT C/- CAGGCCCACG 1563 hom 21 het 12 0 6 6 C 2 1 235254 CASAVA_Build 15 76862398 1I ACGAGCAAAA -/G TCTACACATT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 G 0 1 235255 CASAVA_Build 15 76863302 1D CTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 10 9 235256 CASAVA_Build 15 76871319 92D AAGGTGAGGG GAAATGGCTGGGGAAAGCCATCTGCTCTTTTAAAACTCCCTCAGAACAAAAAAGAGGCCAGCCCATGACTGGGGACAGCTGGCAGGTTCCCA/-------------------------------------------------------------------------------------------- GAGGGCAGGG 3070 het 3070 ref 26 28 10 3 GAAATGGCTGGGGAAAGCCATCTGCTCTTTTAAAACTCCCTCAGAACAAAAAAGAGGCCAGCCCATGACTGGGGACAGCTGGCAGGTTCCCA 1 0 235257 CASAVA_Build 15 76884054 1D CTGAGAGCAT C/- TCCCTCTGCT 3070 hom 62 het 25 0 11 15 C 1 0 235258 CASAVA_Build 15 76887094 3D AAGTGCTTAT AAC/--- AACAGCTGGC 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 AAC 2 1 235259 CASAVA_Build 15 76887271 1D TATTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2659 hom 25 8 8 9 T 12 11 235260 CASAVA_Build 15 76888042 4D CCTAGTTGAC CTCA/---- CTCAGTAGAG 3070 hom 75 het 28 0 26 4 CTCA 2 1 235261 CASAVA_Build 15 76894662 3D TTCGGTTTTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TTG 5 4 235262 CASAVA_Build 15 76896216 1I GGCTGAGAAA -/C CCTGCTCTAG 3070 hom 87 het 36 0 29 7 C 2 3 235263 CASAVA_Build 15 76899611 1D GATCTTCTTT C/- TTTTTTTAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 1 0 235264 CASAVA_Build 15 76910617 1I GTGGGCAACG -/T GCTGGTGCTA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 T 0 1 235265 CASAVA_Build 15 76913759 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 9 8 235266 CASAVA_Build 15 76931417 1D AGTAGAGATA G/- GGGTTTCACC 3070 hom 57 het 21 0 19 4 G 4 3 235267 CASAVA_Build 15 76931743 2D TTTATGTCTC TA/-- TTCACGAATT 3070 hom 75 het 28 0 25 4 TA 1 0 235268 CASAVA_Build 15 76934070 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1344 het 1344 ref 48 25 7 17 A 13 12 235269 CASAVA_Build 15 76936936 1D TGAGTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1579 hom 44 6 25 13 T 15 14 235270 CASAVA_Build 15 76937919 9I AACCCGGGAG ---------/GCAGAGATT GCAGAGATTG 3070 het 2632 hom 20 6 11 3 GCAGAGATT 1 2 235271 CASAVA_Build 15 76951512 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 685 hom 20 3 12 5 A 13 14 235272 CASAVA_Build 15 76951787 1D GGTTGCTAAA C/- AACGAAGCTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 C 1 0 235273 CASAVA_Build 15 76955183 2D ACTCCATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 2595 hom 30 het 14 0 9 5 A 14 12 235274 CASAVA_Build 15 76960895 2D CCGGCCTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 TG 8 7 235275 CASAVA_Build 15 76962227 1D TTAGCTTCTT A/- GGGAGGCTGA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 1 0 235276 CASAVA_Build 15 76962609 1D GAGACTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 26 3 14 9 A 15 14 235277 CASAVA_Build 15 76966352 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2573 hom 30 het 16 0 9 7 A 17 16 235278 CASAVA_Build 15 76969370 3I CGCCTGTAAT ---/AGC AGCATTTTGG 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 AGC 1 2 235279 CASAVA_Build 15 76969781 1D CTTTGACACC T/- TTTTTTTTTG 1342 het 1342 ref 30 22 3 5 T 10 9 235280 CASAVA_Build 15 76973838 4I GACAGACAGT ----/CTCA CTCTGTTGCC 2732 het 2325 hom 17 7 7 3 CTCA 0 1 235281 CASAVA_Build 15 76980275 1D AATACATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2468 hom 35 13 10 12 T 15 14 235282 CASAVA_Build 15 77017015 10D AGGGACCTGT GGCCAGAATG/---------- AAGACCATGC 3070 het 3070 ref 38 21 19 4 GGCCAGAATG 1 0 235283 CASAVA_Build 15 77017766 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2701 het 2701 ref 23 10 9 4 A 13 14 235284 CASAVA_Build 15 77018236 1D CTCCATACTG T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 33 14 13 7 T 8 7 235285 CASAVA_Build 15 77019581 1D AGGCCAGCCA T/- TTGTTTTTGG 2653 het 2389 hom 26 10 9 7 T 3 2 235286 CASAVA_Build 15 77021193 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1870 het 200 hom 14 1 7 6 A 17 18 235287 CASAVA_Build 15 77022649 4D AGTATTCCCC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 TGTT 5 4 235288 CASAVA_Build 15 77025667 1I TGTCCCTGTG -/T TGTCTCCACC 2832 het 2832 ref 26 13 10 3 T 1 2 235289 CASAVA_Build 15 77027941 6I TAGAAGCTGG ------/AAATAA CCGTAGTGAC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 AAATAA 0 1 235290 CASAVA_Build 15 77028757 13D GAGTGGGATT TGAACCCCTGCTA/------------- TGAACCCCTG 3070 hom 76 het 29 0 26 6 TGAACCCCTGCTA 1 0 235291 CASAVA_Build 15 77030786 4D CCACCTCTCC TCTT/---- TCTTAGCCAC 3070 hom 81 het 31 0 26 6 TCTT 2 1 235292 CASAVA_Build 15 77032076 2I AGTTTTCCTC --/TT GTTTTGTTGA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 0 2 235293 CASAVA_Build 15 77032693 13D CTGTTTTTGT TTTTGAGACAGGG/------------- TTTTGAGACA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 TTTTGAGACAGGG 1 0 235294 CASAVA_Build 15 77035119 1D AATAATACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 476 hom 33 2 19 12 T 12 11 235295 CASAVA_Build 15 77057618 12D TTTTCTTTTG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 24 1 13 14 T 24 12 235296 CASAVA_Build 15 77076120 2D GAGTGGCGGC TG/-- TGTGTGTGTG 2761 hom 52 het 31 0 13 19 TG 7 6 235297 CASAVA_Build 15 77114078 1I TAAGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 10 11 235298 CASAVA_Build 15 77127374 2D CCAAGAGCTA TC/-- TCTGAAGATA 3070 het 3070 hom 38 16 15 9 TC 2 1 235299 CASAVA_Build 15 77130862 2I ACGCAAGCGT --/AC ACACACACAC 3070 het 496 hom 51 2 33 16 AC 7 8 235300 CASAVA_Build 15 77151644 1D GGGGGTTTCT G/- GGAGTTCTTG 2480 het 2188 hom 20 8 7 5 G 3 2 235301 CASAVA_Build 15 77157577 1D TGTGCACTTG C/- CCTGGCCCAG 2549 het 2549 ref 24 7 7 10 C 3 2 235302 CASAVA_Build 15 77159524 4I CATGAGGCAA ----/TGAC TGACTATCTC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 TGAC 1 2 235303 CASAVA_Build 15 77163402 1D CAGAGTTGAA G/- GGCATTTAGT 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 G 3 2 235304 CASAVA_Build 15 77178553 2D TCCAAGTTGA TT/-- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 T 9 7 235305 CASAVA_Build 15 77186455 1I CTTCCACCCA -/C CCCCCCAGGG 3070 het 3070 ref 45 19 14 12 C 6 7 235306 CASAVA_Build 15 77205436 1I TAAAATGTTC -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 T 6 7 235307 CASAVA_Build 15 77211425 5I TTTTCTTTTC -----/TCTTT TCTTTTCTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TCTTT 2 3 235308 CASAVA_Build 15 77216817 1I AAGACTTAGG -/T TTTTTTTTTT 2284 het 2284 ref 20 7 6 7 T 11 12 235309 CASAVA_Build 15 77217915 1D AGATGTAAGA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 G 1 0 235310 CASAVA_Build 15 77218367 1I TTTATTAGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 T 8 9 235311 CASAVA_Build 15 77221310 1I ATCAGCTCTC -/A TGAGAACTCC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 0 1 235312 CASAVA_Build 15 77223870 1I GCACACAGCA -/G GGGGGCCCTA 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 G 5 6 235313 CASAVA_Build 15 77231459 4D TATATGTATG TGTA/---- TATATATATA 430 hom 10 het 6 0 4 2 TGTA 1 0 235314 CASAVA_Build 15 77237738 1D ATCTTGCCTA T/- TTGGCTTTCA 3070 het 3070 ref 37 15 11 11 T 3 2 235315 CASAVA_Build 15 77239174 1I AGTTTTTTTT -/A AAATTTTATT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 3 4 235316 CASAVA_Build 15 77244981 18I TGCTATAAAG ------------------/AACTACCTGAGACTGGGT AATTTATGAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 AACTACCTGAGACTGGGT 0 1 235317 CASAVA_Build 15 77251906 1I CTGTCACACC -/T AGACTGCTGC 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 T 0 1 235318 CASAVA_Build 15 77267526 1I CTGGAGTGCA -/G GTGGTTGGAT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 G 1 2 235319 CASAVA_Build 15 77271114 1D TGCACCAGAG C/- CCCCCGAGCA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 C 6 5 235320 CASAVA_Build 15 77279223 1D ACAGCAACCT C/- CCAACCCCCC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 3 2 235321 CASAVA_Build 15 77285081 5I CTGCCTCCTT -----/GACCA TGACTGTCCT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 GACCA 0 1 235322 CASAVA_Build 15 77287418 2D AGCTGGACTC TT/-- TGAACATCAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 9 T 3 1 235323 CASAVA_Build 15 77292070 1D AGCTCTGGAT G/- GGGATTCAGA 3070 het 3070 ref 44 23 18 5 G 4 3 235324 CASAVA_Build 15 77295264 1D ATAGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1872 het 1731 hom 22 7 6 9 T 15 14 235325 CASAVA_Build 15 77305415 2I CTCCTAAGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 44 0 32 12 T 11 13 235326 CASAVA_Build 15 77311976 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2467 hom 30 10 13 8 A 13 12 235327 CASAVA_Build 15 77323239 4D TAAGGAGGAC TCTA/---- TCTACCCTGG 2855 het 2855 ref 29 15 7 7 TCTA 2 1 235328 CASAVA_Build 15 77332014 2D ACATATGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 15 9 T 13 11 235329 CASAVA_Build 15 77336959 3D GGGAATAGGC ATG/--- ATGATCAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 ATG 2 1 235330 CASAVA_Build 15 77338836 35D GTCTGCCCAT GAGAATATTGTTAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAA/----------------------------------- GAGAATATTG 3070 het 2539 hom 32 12 16 12 GAGAATATTGTTAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAA 1 0 235331 CASAVA_Build 15 77340815 1I TTCCTAGAAT -/A AAAGCCTTTT 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 A 3 4 235332 CASAVA_Build 15 77343634 1D CACTTTACTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 A 8 7 235333 CASAVA_Build 15 77343745 1I TTGATTTTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 8 9 235334 CASAVA_Build 15 77358199 3I TAGGGACACA ---/CCG CCTCCTCCTC 3070 het 3070 ref 55 22 23 10 CCG 0 1 235335 CASAVA_Build 15 77377370 1I TTTCCAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 10 11 235336 CASAVA_Build 15 77385420 1I TGGGGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 921 hom 33 3 25 5 T 13 14 235337 CASAVA_Build 15 77397008 2I TGAATACATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 185 het 69 0 62 7 TG 5 6 235338 CASAVA_Build 15 77397611 1D TCTTTCTCCT G/- GGGTGTTCCT 3070 hom 143 het 50 0 43 7 G 4 3 235339 CASAVA_Build 15 77404834 1D TGACTTTAGT G/- GGGAGGTGAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 G 4 3 235340 CASAVA_Build 15 77407762 1I CCCATTTTCC -/T TTTAATTTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 4 235341 CASAVA_Build 15 77409784 3D14M4D ATATATACAA ACTACAACCTAGCTGAAAAAG/---ACAACCTAGCTGAA---- AAGTCAAGAA 3070 het 3070 ref 28 15 13 5 N/A 0 0 235342 CASAVA_Build 15 77410811 1I CACTCAAAAT -/G GATCAAAGAC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 1 2 235343 CASAVA_Build 15 77411464 1I ATAAATAAAT -/A ACATAAATAA 3070 het 2341 hom 18 7 9 2 A 1 2 235344 CASAVA_Build 15 77414261 2D ATAATACAAC AA/-- AAGAGATGAA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 A 4 2 235345 CASAVA_Build 15 77414696 4I TGGGAAAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AAAC 2 3 235346 CASAVA_Build 15 77415382 2D ACTGAGACAC AG/-- AGAATTTAAT 3070 het 3070 ref 48 25 17 10 AG 2 1 235347 CASAVA_Build 15 77418262 1I AGCGGTAGCG -/T TAAGTGTCAA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 1 2 235348 CASAVA_Build 15 77419273 9D GATGATGGTA GTGGTGATG/--------- GTGGTGATGG 3070 het 3070 ref 72 29 22 24 GTGGTGATG 2 1 235349 CASAVA_Build 15 77421881 1I CATTACAAAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 7 8 235350 CASAVA_Build 15 77432864 1D AAAATTTAAT G/- GGGGAAAAAA 625 het 625 ref 12 5 2 5 G 5 4 235351 CASAVA_Build 15 77433161 1I TTGTGTTATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 8 9 235352 CASAVA_Build 15 77435472 4D ACATTCTGAT TGTC/---- TGTTTGCCCA 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 TGTC 1 0 235353 CASAVA_Build 15 77436439 2D ATATACACAT AA/-- ACACAGTTAT 3070 het 3070 ref 44 22 20 4 A 3 1 235354 CASAVA_Build 15 77441121 2I TTAAAAAAAA --/AT AAAAATATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 0 1 235355 CASAVA_Build 15 77448491 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2977 het 1591 hom 31 9 12 10 A 17 16 235356 CASAVA_Build 15 77452933 12D AAAGCAAGAG ACAGCCTCAAGA/------------ CAGACAGCCT 3070 het 3070 ref 39 28 12 3 ACAGCCTCAAGA 1 0 235357 CASAVA_Build 15 77455716 4D TTGGGTAACT TAAA/---- TAAGAGTAGA 3070 het 3070 ref 24 12 11 4 TAAA 1 0 235358 CASAVA_Build 15 77468336 1D TGATGAGATT G/- TTTTTTTTCT 2016 het 2016 ref 24 13 6 5 G 1 0 235359 CASAVA_Build 15 77471085 1I AGTATTGAAG -/C CCCCCACTAT 3070 hom 53 het 21 0 18 3 C 5 6 235360 CASAVA_Build 15 77473385 1D TGAGACACAG T/- GCCCGGCCCA 2764 het 2486 hom 14 6 6 2 T 1 0 235361 CASAVA_Build 15 77483943 1I CATATTCTTT -/G GTGGGCATTC 3070 hom 129 het 49 0 41 8 G 1 2 235362 CASAVA_Build 15 77501291 1D GCCTGGTGGT G/- GGAACTTGCC 3070 het 3070 ref 44 17 15 13 G 3 2 235363 CASAVA_Build 15 77502628 5D12M3D TAAATACTGT TAGAGTAATCTCTAAAATAT/-----TAATCTCTAAAA--- TATGTTGATG 3070 het 3070 hom 31 16 17 4 N/A 0 0 235364 CASAVA_Build 15 77516508 4D CTAACTAAGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 144 het 57 0 48 13 AAAC 3 2 235365 CASAVA_Build 15 77516812 4D GTGGGTGGAT AGTG/---- AGTGGGTGGG 3070 hom 80 het 31 0 21 10 AGTG 2 1 235366 CASAVA_Build 15 77530173 2D TGTACAGAAT AG/-- AGTCATTTTT 3070 hom 53 het 21 0 18 4 AG 2 1 235367 CASAVA_Build 15 77531034 3D TGCTCACCGG CTC/--- CTCCTCCTGC 2251 hom 39 het 18 0 10 8 CTC 3 2 235368 CASAVA_Build 15 77531931 10D GACTGGGTGA GTGTGTGGGT/---------- GTGTGTGGGT 3070 hom 197 het 70 0 62 11 GTGTGTGGGT 2 1 235369 CASAVA_Build 15 77532023 4I GTCTGGATGA ----/GTCT GTCTGTGTGT 3070 hom 144 het 51 0 43 8 GTCT 1 2 235370 CASAVA_Build 15 77532257 2D TGGGTGAGTC TG/-- TGTGAGTGTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 TG 3 2 235371 CASAVA_Build 15 77532458 2I TGCCTTGCTC --/TT TGACCAGATC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 1 3 235372 CASAVA_Build 15 77532824 2D CTGAGTTCCT CA/-- GTTTCCTTAT 3070 het 3070 ref 50 21 19 12 CA 1 0 235373 CASAVA_Build 15 77534135 1D GATGGGAAAT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 9 8 235374 CASAVA_Build 15 77534320 5I ATTTTACATT -----/AAAAG AAAATCTGTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAAAG 0 1 235375 CASAVA_Build 15 77538420 1I CTAAAAATGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 8 9 235376 CASAVA_Build 15 77538567 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTCAAG 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 CT 1 2 235377 CASAVA_Build 15 77540683 4I GTCTCTTAAC ----/CTCT CTGAGTTTCC 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 CT 1 3 235378 CASAVA_Build 15 77544264 27D GACAGGGATT TGATTCTCCCTCCGGTGGAATATTTCA/--------------------------- TGATTCTCCC 2198 het 2198 ref 38 16 6 20 TGATTCTCCCTCCGGTGGAATATTTCA 2 1 235379 CASAVA_Build 15 77551549 3I GATAAATGTT ---/ATG ATGTTATATA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 ATG 1 2 235380 CASAVA_Build 15 77552037 6D TTTGTGAGAG ATGTTC/------ ATGTTATGTG 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 ATGTTC 1 0 235381 CASAVA_Build 15 77553848 2D CAGATGTTGA AG/-- AAAGAGTGTG 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 AG 1 0 235382 CASAVA_Build 15 77554460 1D ATTATTGAGA C/- TTTTCTGTAC 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 C 1 0 235383 CASAVA_Build 15 77561634 1I TTGTCCTGAA -/C CAAGTCTCCA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 C 1 2 235384 CASAVA_Build 15 77562689 1D TACCTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 2344 het 1398 hom 30 5 12 13 T 19 18 235385 CASAVA_Build 15 77564230 1D AATAATTAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2434 hom 17 5 11 1 A 9 8 235386 CASAVA_Build 15 77570983 1I TTCTTTGACT -/A AGGAAAGGGA 1366 het 1366 ref 13 9 4 0 A 1 2 235387 CASAVA_Build 15 77576973 2D TCTTCACTAT CA/-- CATAGTCAAG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 CA 2 1 235388 CASAVA_Build 15 77579382 1D TGATAGACAC A/- AGTGACCAGA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 2 1 235389 CASAVA_Build 15 77579623 3D ATGAGATCCG GTT/--- GTTAGAAAGT 3070 hom 114 het 41 0 37 5 GTT 2 1 235390 CASAVA_Build 15 77581542 1D GCAGCCACAG T/- TAAGACCTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 1 235391 CASAVA_Build 15 77582830 6I GTGACTGAAC ------/TTGAGA TTGAGAATGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TTGAGA 1 2 235392 CASAVA_Build 15 77588072 1I AACTCCTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 399 hom 33 1 25 7 A 9 10 235393 CASAVA_Build 15 77588314 1I ATAATGTTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 71 het 36 0 27 9 T 9 10 235394 CASAVA_Build 15 77589256 2I CCCCTGACTT --/CA GAGAGGAAGG 3070 hom 126 het 48 0 41 7 CA 0 1 235395 CASAVA_Build 15 77589521 1I CTGGCCCTTG -/C CCCACTTATC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 3 4 235396 CASAVA_Build 15 77590192 1D TTATCCCCCC T/- GAGGTGAAAT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 1 0 235397 CASAVA_Build 15 77590874 1I AAAAAAAAAA -/T AAAACCAGAG 3070 het 198 hom 30 1 24 5 T 0 1 235398 CASAVA_Build 15 77593944 1D TTATGGGAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 33 het 22 0 14 9 A 9 8 235399 CASAVA_Build 15 77596020 1I TCTGTCCCCC -/G CATAGTCTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 235400 CASAVA_Build 15 77615669 1D TTCTCCTGCC T/- CAGCCTCCCG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 1 0 235401 CASAVA_Build 15 77632894 3I AGAATAGATA ---/TTC TTTACACATC 3070 hom 46 het 34 0 16 18 TTC 0 1 235402 CASAVA_Build 15 77648849 2I CTCTGCCAAC --/AA AAGAGATTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 4 235403 CASAVA_Build 15 77651996 1I ACAAATTAAT -/A AAGCATAGTT 3070 het 3070 hom 54 19 31 4 A 2 3 235404 CASAVA_Build 15 77656819 1D TTTTAACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 8 15 6 T 11 10 235405 CASAVA_Build 15 77659497 1I AGAAAATTTC -/A TTGAACTTCT 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 A 0 1 235406 CASAVA_Build 15 77662378 1D TCCCTTTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 A 10 9 235407 CASAVA_Build 15 77665142 1I ACCTAAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 11 12 235408 CASAVA_Build 15 77680263 2D TGAAAACCTG CC/-- CCCCCCCCAA 3070 het 1517 hom 30 6 15 9 C 10 8 235409 CASAVA_Build 15 77681194 1D TCAACATCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 9 8 235410 CASAVA_Build 15 77682991 2D8M1D CATTATCATG TTCAAACTTGC/--GGAACTAG- CTATAGCTAG 3070 het 3070 hom 35 14 19 5 N/A 0 0 235411 CASAVA_Build 15 77684647 11I GACTTAACTG -----------/TGGTTTAACTA TCTAACTTTG 3070 het 3070 hom 56 23 28 5 TGGTTTAACTA 0 1 235412 CASAVA_Build 15 77691510 1D GAACGTCTGG C/- CCCCCAGGCA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 C 6 5 235413 CASAVA_Build 15 77699495 3D TGTATAGGAA TGC/--- TGCTGATTTT 3070 het 3070 ref 45 24 15 10 TGC 2 1 235414 CASAVA_Build 15 77736863 1D ACTACAAAGG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 44 21 23 3 A 8 7 235415 CASAVA_Build 15 77758922 2I GAATGAGACC --/CT GTCTCAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CT 0 1 235416 CASAVA_Build 15 77762601 4I TATTTGACTC ----/TTGT TTAATTATTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTGT 0 1 235417 CASAVA_Build 15 77763480 1D AACATCTATT A/- AAAAAAGAGT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 7 6 235418 CASAVA_Build 15 77764768 1I36M1I TGGAATCCCT -CCTGAAGGATCTGCCTAAGGCTGTTTTACATTTAAC-/CCCTGAAGGATCTGCCTAAGGCTGTTTTACATTTAACT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 9 16 24 N/A 0 0 235419 CASAVA_Build 15 77765863 1I AAAACTACCA -/T TTTTTTATGA 3070 hom 76 het 33 0 26 7 T 6 7 235420 CASAVA_Build 15 77766823 1I GCCTTTAAAC -/T TTGCAAAGGG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 2 3 235421 CASAVA_Build 15 77767798 1I TATTTTATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 9 10 235422 CASAVA_Build 15 77769293 1I GAATTGATGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 59 25 26 8 A 8 9 235423 CASAVA_Build 15 77775636 1D TTCTGATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1809 hom 37 9 21 8 T 15 14 235424 CASAVA_Build 15 77776321 4I CTCAGAAAAA ----/AGAG AGAGAAATTG 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 AG 2 4 235425 CASAVA_Build 15 77787835 1I GATTGGGAGA -/C TTTTATTACT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 0 1 235426 CASAVA_Build 15 77788141 1I ATTTCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 10 11 235427 CASAVA_Build 15 77796544 1I AGTTAAAATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 9 10 235428 CASAVA_Build 15 77808917 1I GGCTAGTTAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 99 het 43 0 33 10 T 8 9 235429 CASAVA_Build 15 77809033 7I CTGGGTGACC -------/TGGGTGA CTGGGAGAGA 3070 het 3070 hom 48 24 25 0 TGGGTGA 0 1 235430 CASAVA_Build 15 77809434 1D AAGTAGGAAC G/- GGGATGCTAA 3070 hom 104 het 41 0 34 7 G 4 3 235431 CASAVA_Build 15 77810358 1I TCCGTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1519 hom 34 7 17 10 A 15 16 235432 CASAVA_Build 15 77811133 4D AGGAAGGAAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 het 2613 hom 35 11 19 5 GGAA 4 3 235433 CASAVA_Build 15 77813420 4D TCCATGGAAC AGCT/---- AGCTAGATGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AGCT 2 1 235434 CASAVA_Build 15 77816267 10D AACAGATTTA CTCCCAGAGC/---------- CTCCCAGAGC 3070 het 3070 hom 45 18 18 12 CTCCCAGAGC 2 1 235435 CASAVA_Build 15 77817897 3I GATAATTTGG ---/ATA ACAGTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 ATA 0 1 235436 CASAVA_Build 15 77821749 1I TTCTGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 2709 het 2147 hom 28 6 11 11 T 16 17 235437 CASAVA_Build 15 77833831 1D TGGAGTTATC G/- AAAGAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 18 13 5 G 1 0 235438 CASAVA_Build 15 77836909 1I TATAGACTTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 A 7 8 235439 CASAVA_Build 15 77837842 3D AGAGGACACA CAC/--- CACAGCAGGT 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 CAC 2 1 235440 CASAVA_Build 15 77840702 3D GTTGTTGTTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 56 19 21 17 TTG 5 4 235441 CASAVA_Build 15 77840848 1I TTGTTATTAT -/A ATAACACAGA 3070 het 3070 ref 53 28 22 3 A 1 2 235442 CASAVA_Build 15 77863061 1I TTACCACTGA -/C CCACAGAAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 2 3 235443 CASAVA_Build 15 77864709 2D TGAAACCAAA AG/-- AAAAGCCCAA 1879 het 1879 ref 34 28 4 2 AG 1 0 235444 CASAVA_Build 15 77872981 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 16 2 7 7 A 15 14 235445 CASAVA_Build 15 77875541 1D CTGCCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1780 het 1622 hom 22 8 8 6 A 13 12 235446 CASAVA_Build 15 77883631 1D TGGCCACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 15 10 A 13 12 235447 CASAVA_Build 15 77909856 1D9M2D AAATGGTATG AAAAAAATGCTT/-AAAAAATGC-- TTTTACAAGT 3070 het 3070 ref 22 14 9 4 N/A 0 0 235448 CASAVA_Build 15 77918014 1D CATCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 2059 het 1246 hom 13 4 7 2 A 11 10 235449 CASAVA_Build 15 77918104 1I AGAATTGCGT -/G AACCCGGGAA 2198 het 1016 hom 14 3 8 3 G 0 1 235450 CASAVA_Build 15 77918183 12D GACTCCATCT CAAAAACAAAAA/------------ CAAAAACAAA 2944 het 2368 hom 14 8 7 5 CAAAAA 4 2 235451 CASAVA_Build 15 77919176 1I AATCTACCTT -/A AAAAAAAAAA 2276 het 2276 ref 31 19 8 4 A 12 13 235452 CASAVA_Build 15 77932854 3I CCAATTTCTT ---/CTC CTTCAGATAA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 CTC 0 1 235453 CASAVA_Build 15 77940074 1D AATTTAAGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 62 het 38 1 33 4 T 10 9 235454 CASAVA_Build 15 77945444 1D ATTTTATAAG T/- TTTTTTTTTT 2054 het 492 hom 21 3 5 13 T 15 14 235455 CASAVA_Build 15 77946388 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 27 1 23 3 A 11 12 235456 CASAVA_Build 15 77946888 1I GATATTTTTC -/T TGTAATCCAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 2 235457 CASAVA_Build 15 77954055 1D GAGGCTGACC A/- AAAAACTTAA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 6 5 235458 CASAVA_Build 15 77954672 1I CAAAAGCGAC -/A AAAAAAAAAA 1728 het 1728 ref 17 6 7 4 A 15 16 235459 CASAVA_Build 15 77955377 4D CCAGGCCAAA AAAT/---- AAATAAGCAC 2149 het 2149 ref 25 17 6 5 AAAT 2 1 235460 CASAVA_Build 15 77957266 1D TGCTGAAAGG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 8 7 235461 CASAVA_Build 15 77958259 1I GCTTATTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 128 hom 36 3 25 8 T 11 12 235462 CASAVA_Build 15 77958889 3D CATGCCCAGC TAA/--- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 24 11 12 2 TAA 1 0 235463 CASAVA_Build 15 77960198 4I CAAAAAAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 973 hom 27 7 12 8 AAAC 2 3 235464 CASAVA_Build 15 77963090 8D TACATATATC ACCTTACT/-------- ACCTTACTTT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 ACCTTACT 2 1 235465 CASAVA_Build 15 77967887 12D ACATGGAGAG AAAGAACAGTTA/------------ AAAGGCCTTT 3070 hom 120 het 40 0 40 1 AAAGAACAGTTA 1 0 235466 CASAVA_Build 15 77976816 1D GGGCAAGGCA G/- GACATGTAGC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 2 1 235467 CASAVA_Build 15 77980938 2D AAAATATTTG TA/-- TGTCACACCA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 TA 1 0 235468 CASAVA_Build 15 77982992 3D ATAATAAATT ATC/--- ATGTCATATA 1010 het 1010 ref 10 5 4 1 ATC 1 0 235469 CASAVA_Build 15 77995242 3I CAATGTGTTC ---/TAA TAATACATAA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 TAA 1 2 235470 CASAVA_Build 15 78000353 2I GATGCAATTT --/CA CATTTATATG 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 CA 1 2 235471 CASAVA_Build 15 78002032 3D TAAAGGGGAG TGC/--- TGATCCACAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 TGC 1 0 235472 CASAVA_Build 15 78005094 4D TAAAAATTAT TTTG/---- TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 TTTG 2 1 235473 CASAVA_Build 15 78010514 2I TGTGTGTGTG --/TC TGTCTGTCTG 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 TC 0 1 235474 CASAVA_Build 15 78025215 1D TTTCCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 34 1 23 11 A 13 12 235475 CASAVA_Build 15 78038686 1D AAAAGCAGTT G/- GGGGGGGGGT 1722 het 1711 hom 16 6 5 5 G 10 9 235476 CASAVA_Build 15 78046215 8D AGGCAGGAAA GCAGGAAG/-------- GCAGGAAGGC 3070 het 3070 ref 46 22 15 17 GCAGGAAG 3 2 235477 CASAVA_Build 15 78047011 4D TGATAAAGCT GTAA/---- GTGCCTTCTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GTAA 1 0 235478 CASAVA_Build 15 78051606 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 735 het 735 ref 23 15 2 6 A 11 12 235479 CASAVA_Build 15 78052191 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2459 het 1508 hom 16 6 7 3 A 14 13 235480 CASAVA_Build 15 78060192 2I CCACAATATA --/AC ACACAATATA 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 AC 2 3 235481 CASAVA_Build 15 78074692 1I TTTTCTAAGC -/A CAGATTGCTT 3070 hom 117 het 49 0 40 9 A 0 1 235482 CASAVA_Build 15 78081852 1D GGAGACATGC A/- AAAAAAATGC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 8 7 235483 CASAVA_Build 15 78092798 1D ACAGACAACA C/- CAAATGCTGG 3070 het 3070 hom 45 18 22 6 C 2 1 235484 CASAVA_Build 15 78132084 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 955 het 955 ref 40 26 3 11 T 13 14 235485 CASAVA_Build 15 78133104 1D GACTTCGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1930 hom 23 5 14 5 A 12 11 235486 CASAVA_Build 15 78138132 1D AAATTAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 10 9 235487 CASAVA_Build 15 78171045 1I AAAAAAAAAC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 2295 hom 27 7 17 3 T 7 8 235488 CASAVA_Build 15 78188133 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 T 8 9 235489 CASAVA_Build 15 78197238 1I GCTTCATCTA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 7 8 235490 CASAVA_Build 15 78197738 1I GCCAGGATGG -/T CTCTAGCTCC 3070 het 1951 hom 17 4 11 2 T 0 1 235491 CASAVA_Build 15 78198498 1I CCCGTTAGTA -/C CTTCTGTCAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 C 1 2 235492 CASAVA_Build 15 78198983 1I ATGCTTTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 9 10 235493 CASAVA_Build 15 78204064 1I CTTCAAAAGG -/T TGGTCCTGAT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 1 2 235494 CASAVA_Build 15 78214208 1I GAGAAAAAGC -/A GTGCAAGAAA 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 A 0 1 235495 CASAVA_Build 15 78219698 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAATA 2903 het 1743 hom 12 4 7 1 A 8 9 235496 CASAVA_Build 15 78228137 3I AAAAACAAAC ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 CAA 5 6 235497 CASAVA_Build 15 78233773 6D GGGGAATCGA ATTAAT/------ ATCCGTTAGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 6 ATTAAT 1 0 235498 CASAVA_Build 15 78238625 1D ACAGAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 18 1 13 5 A 11 10 235499 CASAVA_Build 15 78246455 1I TGTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 10 11 235500 CASAVA_Build 15 78251848 2I CAATTTTCTC --/AT GAGTGGCTAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 AT 0 1 235501 CASAVA_Build 15 78252304 1D ATCTTTGTGG A/- GATGGCAGTG 3070 hom 135 het 52 0 45 8 A 1 0 235502 CASAVA_Build 15 78254235 1D ACAGTATGAT C/- CCCCCTACTG 3070 hom 70 het 27 0 22 5 C 6 5 235503 CASAVA_Build 15 78261254 2D GCGATTCTCC TG/-- TGCCTTAGCC 3070 hom 140 het 52 0 46 8 TG 2 1 235504 CASAVA_Build 15 78265655 1D CCCCTTTCAA C/- CCTGTGACTG 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 C 3 2 235505 CASAVA_Build 15 78266710 1D TGCAGAGCCC A/- TCCGTCAGAT 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 A 1 0 235506 CASAVA_Build 15 78271206 1D GCCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 425 hom 34 1 18 16 A 11 10 235507 CASAVA_Build 15 78281606 1D CCTTGTAGGT A/- AACCAGAGTC 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 A 3 2 235508 CASAVA_Build 15 78283601 8D ATATATACAC AAACACAT/-------- ACACACATGC 1258 hom 7 het 3 0 3 1 AAACACAT 1 0 235509 CASAVA_Build 15 78286689 1I TTTTTTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 29 15 6 T 10 11 235510 CASAVA_Build 15 78292443 1I CTTCCTTCTG -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 7 8 235511 CASAVA_Build 15 78293367 1I TGAAGGGAGG -/A AAAGGCATAT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 A 3 4 235512 CASAVA_Build 15 78304753 1I TTTTCATTTG -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 T 6 7 235513 CASAVA_Build 15 78304832 1I CCCCTTTTTT -/C CCCCACCATT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 C 4 5 235514 CASAVA_Build 15 78306925 3D TCGGTTCTAG ACC/--- ACCACAATTA 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 ACC 2 1 235515 CASAVA_Build 15 78308338 1I AATCTGAAAC -/T TTTTTTGAGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 6 7 235516 CASAVA_Build 15 78314400 1D TATGACTCTG C/- CCCCCTGGTG 3070 hom 108 het 39 0 34 5 C 6 5 235517 CASAVA_Build 15 78326038 1I TGTGGACTTT -/G GGGGATTTGG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 G 4 5 235518 CASAVA_Build 15 78327230 1I CATTTTAACT -/G GGGCCCAGGG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 G 3 4 235519 CASAVA_Build 15 78331819 1D CTTTACAGTT A/- AAAAAAAAAA 1155 het 1155 ref 21 16 3 2 A 11 10 235520 CASAVA_Build 15 78346708 24D TCCTTGTGTG TGGGTCAGGACGGGTGCCTCTGCC/------------------------ TGCCTGAAGC 3070 het 3070 hom 43 19 21 9 TGGGTCAGGACGGGTGCCTCTGCC 1 0 235521 CASAVA_Build 15 78409102 1D AAAATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 15 14 235522 CASAVA_Build 15 78418562 1I TTTCTAAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 9 10 235523 CASAVA_Build 15 78419047 1D GGACAGTTGG A/- AAAACCCCAG 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 5 4 235524 CASAVA_Build 15 78425800 1I TTGACAGCTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 T 8 9 235525 CASAVA_Build 15 78432733 1I ATTGATGCAG -/A AAAAAAGCAT 3070 het 3070 hom 41 12 25 4 A 6 7 235526 CASAVA_Build 15 78436037 2I AGACAGAGAG --/AA AAATATAGCT 3070 het 3070 ref 52 21 21 10 A 3 5 235527 CASAVA_Build 15 78436233 1D ATTCTATCCA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 T 7 6 235528 CASAVA_Build 15 78447514 1I CTGAGACTTT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 31 11 8 12 A 8 9 235529 CASAVA_Build 15 78451063 4D ACGAGTGGAT TGTC/---- TGTCTTTGTG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 TGTC 2 1 235530 CASAVA_Build 15 78455779 1I CAGTTCCCCG -/C CCCCCCCGCC 3038 het 3038 ref 25 14 8 3 C 7 8 235531 CASAVA_Build 15 78455970 1I ACTCATCCCA -/G GGGGGCTGTC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 G 5 6 235532 CASAVA_Build 15 78458039 1I TTTCCATACT -/G GCCACAATAA 3070 hom 132 het 54 0 44 10 G 1 2 235533 CASAVA_Build 15 78463629 1I ACACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 2097 het 2097 ref 23 11 9 3 A 15 16 235534 CASAVA_Build 15 78473710 1D TTTCTAGCTC T/- TTTTTTTTTT 1271 het 1271 ref 35 14 3 18 T 17 16 235535 CASAVA_Build 15 78480167 1D GAGGTCAGAA G/- ATCAAGACCA 3070 het 1654 hom 17 5 9 3 G 1 0 235536 CASAVA_Build 15 78487107 2D TTTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 959 het 959 ref 51 32 4 16 TG 10 9 235537 CASAVA_Build 15 78487380 21D GAGTATTTGC AGAGTAATTAATAAGGCTCAT/--------------------- ATGTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 21 9 5 AGAGTAATTAATAAGGCTCAT 1 0 235538 CASAVA_Build 15 78496024 4D CTCAGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 46 21 17 9 TTTG 4 3 235539 CASAVA_Build 15 78496514 1D TATCTCTAAT A/- AAAGTCAATA 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 A 4 3 235540 CASAVA_Build 15 78496740 5I TAATTTATGA -----/TTTCT TTTAAGTTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TTTCT 0 1 235541 CASAVA_Build 15 78496952 2I TTCCTTCTCC --/TT TTTCTTTTCT 2478 het 2478 ref 21 10 7 4 T 3 5 235542 CASAVA_Build 15 78497031 1I CTCCTGCTCC -/T TTTTTTCCTT 2647 het 2647 ref 24 15 8 1 T 6 7 235543 CASAVA_Build 15 78499626 5D GGGTTTCACT TAAGA/----- TTTTTGACTT 3070 het 3070 hom 36 17 19 3 TAAGA 1 0 235544 CASAVA_Build 15 78502162 4D TCTAGAGTAA TAAT/---- TAAGGCATAT 3070 het 3070 hom 38 17 20 3 TAAT 1 0 235545 CASAVA_Build 15 78510949 1I ATTCCCGGAT -/G GGCCGTAGTA 3070 hom 66 het 27 0 18 9 G 2 3 235546 CASAVA_Build 15 78512595 1I TATGCCCACA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 8 9 235547 CASAVA_Build 15 78515278 1D AGATATGGGC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 154 het 54 0 51 3 A 8 7 235548 CASAVA_Build 15 78526147 1D AAACACAGTC A/- GTACCCAACA 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 A 1 0 235549 CASAVA_Build 15 78535674 1D TTAACTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 11 10 235550 CASAVA_Build 15 78541608 1I GATTGATACA -/T TTTTCTAGGG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 4 5 235551 CASAVA_Build 15 78549582 1D TCTCTTTTTT C/- CCCCTCTCCT 3070 hom 120 het 47 0 39 9 C 5 4 235552 CASAVA_Build 15 78551514 1D GGGGGGCATT G/- GGGTGGGGAG 3070 hom 58 het 25 0 19 6 G 4 3 235553 CASAVA_Build 15 78562708 1D TGATTGTGCT G/- GGGGCTGCTT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 G 5 4 235554 CASAVA_Build 15 78580666 1I AAATAATATT -/A AAAAGAGCCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 4 5 235555 CASAVA_Build 15 78583923 1I CCAGCACTTT -/G GGAGGCCGAG 3070 hom 77 het 30 0 24 6 G 2 3 235556 CASAVA_Build 15 78595132 1D TTCCTAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 8 11 A 15 14 235557 CASAVA_Build 15 78641476 1I TTCTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 12 14 T 13 14 235558 CASAVA_Build 15 78643924 1D ATGACCTGGA T/- TTTTTTTTTT 2042 het 2042 ref 15 8 5 2 T 11 10 235559 CASAVA_Build 15 78644061 1D TGATTTTTCA C/- CCCTTCCCTC 1331 het 1331 ref 14 6 7 1 C 4 3 235560 CASAVA_Build 15 78644321 1D CTTCTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 41 1 31 9 T 13 12 235561 CASAVA_Build 15 78645271 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 6 7 235562 CASAVA_Build 15 78655679 1D CTCTCATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 12 11 235563 CASAVA_Build 15 78694965 2D GGGGAGTGTG TA/-- TGGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 39 18 16 8 TA 1 0 235564 CASAVA_Build 15 78723993 1D AAGACAGGTC T/- TTTGGGCTGG 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 4 3 235565 CASAVA_Build 15 78736482 1I AAAACTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 333 hom 43 1 35 7 T 10 11 235566 CASAVA_Build 15 78738739 1D GATGAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 700 het 700 ref 42 34 3 5 A 11 10 235567 CASAVA_Build 15 78758707 1D TGCTGTGTGA G/- GGGGTGGATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 5 4 235568 CASAVA_Build 15 78768221 1D ATGTTATCAA T/- TTTTTTTTTT 2658 het 969 hom 30 5 9 17 T 17 16 235569 CASAVA_Build 15 78770767 3I TAGGGGAAAC ---/AAT GATGAACAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 AAT 0 1 235570 CASAVA_Build 15 78773695 4D TTAAAGCAGT ATAA/---- GAATCGTTCA 3070 het 3070 hom 45 22 21 6 ATAA 1 0 235571 CASAVA_Build 15 78780333 2D AAACTGTTAA AC/-- ACACATTTAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 5 AC 3 2 235572 CASAVA_Build 15 78800610 1I ATTTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2540 hom 31 10 15 6 T 13 14 235573 CASAVA_Build 15 78803965 1I TCTCATAAGG -/A AAAAACATAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 5 6 235574 CASAVA_Build 15 78804886 3I ACCTGGTGTC ---/ATT ATTTTTATAA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 ATT 1 2 235575 CASAVA_Build 15 78810999 26D AAAAGAACAC GTATATTTTTCCACCAGATATGTAAA/-------------------------- AGTATTAGTG 3070 hom 72 het 24 0 25 5 GTATATTTTTCCACCAGATATGTAAA 1 0 235576 CASAVA_Build 15 78815261 1D TTCATTATTT C/- CCCCAAAGAC 3070 het 3070 hom 39 10 23 7 C 5 4 235577 CASAVA_Build 15 78823539 5I ATCTGAGAAC -----/TAAAA TAAAGGGGCC 3070 het 3070 ref 43 23 19 1 TAAAA 0 1 235578 CASAVA_Build 15 78824788 1D CCTAACAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 13 12 235579 CASAVA_Build 15 78830602 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATTAGA 3070 het 1292 hom 18 6 10 2 T 0 1 235580 CASAVA_Build 15 78838247 1I CATTTAAGTT -/A AAAAAAACCA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 7 8 235581 CASAVA_Build 15 78842047 7I AGAGCAAGTC -------/ACATCAT ACATCGTTGG 3070 hom 72 het 25 0 24 1 ACATCAT 0 1 235582 CASAVA_Build 15 78848456 1I AAGGAGAGGA -/G GGAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 G 2 3 235583 CASAVA_Build 15 78854425 1D TTTTACTATA T/- AAAATTTACC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 0 235584 CASAVA_Build 15 78856331 2I TCAGCAGGTG --/GA GAGTGTGGAG 3070 het 3070 ref 47 27 14 6 GA 1 2 235585 CASAVA_Build 15 78861421 1D GATCACAATG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 9 8 235586 CASAVA_Build 15 78868293 1I CACTAGAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 11 12 235587 CASAVA_Build 15 78885734 1D GTTGATCTAG A/- AGAAAGGCTT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 2 1 235588 CASAVA_Build 15 78888183 1D TGGGGAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 27 2 19 6 A 13 12 235589 CASAVA_Build 15 78892830 2D ACTGCAACCC CT/-- GTCTCCTGGG 3070 het 2900 hom 23 7 8 8 CT 1 0 235590 CASAVA_Build 15 78894956 4D TTCCTACCTC CCTT/---- CTTTCTTTCC 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 CCTT 1 0 235591 CASAVA_Build 15 78915420 1D GTTTGCTCAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 39 het 22 0 14 8 A 9 8 235592 CASAVA_Build 15 78915470 3D ACGGAAGTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2241 het 210 hom 20 1 7 13 T 17 14 235593 CASAVA_Build 15 78946183 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 25 2 14 9 A 14 15 235594 CASAVA_Build 15 78953866 1I ATAGGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 499 hom 46 2 33 11 A 11 12 235595 CASAVA_Build 15 78969983 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2000 hom 27 7 11 9 A 11 10 235596 CASAVA_Build 15 78972778 1D TCATTTTTCA G/- GTTAGAAAAA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 G 2 1 235597 CASAVA_Build 15 78979723 1D ACAGAATGCA G/- GGGGGCAGCT 3070 hom 55 het 20 0 18 3 G 6 5 235598 CASAVA_Build 15 78986409 1D GTGTGCAGCT C/- CCCCCCCACC 3070 hom 131 het 48 0 44 4 C 8 7 235599 CASAVA_Build 15 78993491 5I GGAAGGCTCT -----/ATGGC ACAGTATCTG 3070 hom 167 het 61 0 53 8 ATGGC 0 1 235600 CASAVA_Build 15 78994242 1D GAGACCGGAG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 86 het 31 0 29 2 T 8 7 235601 CASAVA_Build 15 78995244 2D CATTAAGACA CT/-- CTGTAAAACA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CT 2 1 235602 CASAVA_Build 15 78996185 2D CTGAGTAACT TG/-- TGTCTTCTAC 3070 hom 100 het 40 0 32 8 TG 2 1 235603 CASAVA_Build 15 78999211 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 606 hom 19 2 14 3 A 13 12 235604 CASAVA_Build 15 79078000 1I TCTAAAGAGT -/G GGGGGCCTCA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 G 5 6 235605 CASAVA_Build 15 79083185 1D TTTGTATGTC T/- TTTTTTTTTT 994 het 994 ref 42 32 3 8 T 12 11 235606 CASAVA_Build 15 79126300 3D CTGCTGGGTG GAA/--- GCTGAGTGAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 GAA 1 0 235607 CASAVA_Build 15 79130979 1D AGCTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 23 0 19 4 T 13 12 235608 CASAVA_Build 15 79131824 4I AATATTGGCT ----/GTGA GTTTGTCGTA 3070 hom 120 het 42 0 40 2 GTGA 0 1 235609 CASAVA_Build 15 79136203 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 10 9 235610 CASAVA_Build 15 79138285 1D AATGACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1237 hom 35 3 27 5 T 13 12 235611 CASAVA_Build 15 79138468 1D CAGTCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 18 6 T 13 12 235612 CASAVA_Build 15 79138843 1I ATAGTTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 27 1 22 4 T 10 11 235613 CASAVA_Build 15 79142363 2I2M19I GCAGTATGGG --AG-------------------/TCAGATCATGCCATGCCTGGCTC CCATCTCATC 3070 hom 110 het 39 0 36 4 N/A 0 0 235614 CASAVA_Build 15 79145317 2D ACTTTAACTC TT/-- TTCAATTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 T 4 2 235615 CASAVA_Build 15 79146202 2I57M4I GAATTTATCT --TTTTATGTGATTTTTTCATTGCATTTATTCATAAAATGTTCCTTTTTGTTTTTATAT----/TCTTTTATGTGATTTTTTCATTGCATTTATTCATAAAATGTTCCTTTTTGTTTTTATATTAAA TATTTACTTA 3070 hom 60 het 19 0 21 13 N/A 0 0 235616 CASAVA_Build 15 79148313 2I CTCTATACTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 925 hom 34 2 24 8 A 12 14 235617 CASAVA_Build 15 79177339 1D AATTTTCTCC A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 8 7 235618 CASAVA_Build 15 79178005 1D CCCATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 1194 het 1031 hom 32 9 5 18 A 19 18 235619 CASAVA_Build 15 79183372 3I TTATTGTGGT ---/ATA GGTATGAGAG 3070 het 3070 ref 48 23 15 10 ATA 0 1 235620 CASAVA_Build 15 79196618 2D GAGATTATAC AT/-- ATATATATAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 AT 5 4 235621 CASAVA_Build 15 79198275 3D ACGTTACCAA ATT/--- ATTATAAACT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 ATT 2 1 235622 CASAVA_Build 15 79200910 2D7M2D TTCATCAAAA ACACATCTGAC/--AAATTTG-- TTTTTTGGTA 2769 het 2769 ref 16 10 7 1 N/A 0 0 235623 CASAVA_Build 15 79203869 1D TGAAGTTTTC T/- TTTTTTTGTT 2091 het 2091 ref 22 11 6 6 T 8 7 235624 CASAVA_Build 15 79204509 2D AGTAAAAAAG AA/-- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 28 11 13 6 A 9 7 235625 CASAVA_Build 15 79207042 3D ACCAAAAGAA GAG/--- GAGGGGCTCA 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 GAG 2 1 235626 CASAVA_Build 15 79217343 1I ATAAATTATC -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 54 18 29 7 A 6 7 235627 CASAVA_Build 15 79239421 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2408 het 65 hom 17 1 7 9 T 19 18 235628 CASAVA_Build 15 79344136 1I TTCAAACAGA -/G ATGTGCAGAA 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 G 0 1 235629 CASAVA_Build 15 79348568 11D TTGAACATAG TCTCAGGGCGT/----------- TCTTGGTAGC 3070 het 3070 ref 40 20 16 8 TCTCAGGGCGT 1 0 235630 CASAVA_Build 15 79367657 4D TCCAGTCTGC TGCT/---- TGCTTATGGT 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 TGCT 2 1 235631 CASAVA_Build 15 79382582 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 20 20 10 T 12 11 235632 CASAVA_Build 15 79390453 8D TGGGTAGGAA TCAGCAAG/-------- AAGATCCTAA 3070 het 3070 ref 50 27 21 7 TCAGCAAG 1 0 235633 CASAVA_Build 15 79401005 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2311 het 2311 ref 29 16 7 6 A 14 15 235634 CASAVA_Build 15 79403233 1I AGGCCCAATC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 8 9 235635 CASAVA_Build 15 79432601 2D AAAGAAAAAC TG/-- TTTTTGTACA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 TG 1 0 235636 CASAVA_Build 15 79441813 1I CTTTAATTAT -/G GATTATGGCT 3070 het 3070 ref 55 32 18 5 G 1 2 235637 CASAVA_Build 15 79443554 1D AGGTGGGGGT A/- AAAAAATCTC 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 A 7 6 235638 CASAVA_Build 15 79446691 1D AGCAACATGG A/- AAAAATAATA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 6 5 235639 CASAVA_Build 15 79447868 9I2M1I ATGGAGTTAC ---------AC-/TACTACTCTACT AAATACTTCA 3070 het 3070 ref 39 20 15 6 N/A 0 0 235640 CASAVA_Build 15 79448313 1D TGGACTAAAT A/- TAATTGGGAT 3070 het 3070 hom 53 21 28 4 A 1 0 235641 CASAVA_Build 15 79451506 1D CTATAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 11 10 235642 CASAVA_Build 15 79459411 1D TGCCTCTACA T/- TTTTTTGATT 3070 het 3070 ref 29 14 11 6 T 7 6 235643 CASAVA_Build 15 79461041 1I TCCACTTACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 8 9 235644 CASAVA_Build 15 79477433 2D GTGCGCGCGC GT/-- GTGTGTGTGT 1273 het 1273 ref 47 33 3 11 GT 6 5 235645 CASAVA_Build 15 79479929 1D AGAAGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 11 10 235646 CASAVA_Build 15 79504418 1I CAGATATTCT -/C CATGAGACCT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 C 1 2 235647 CASAVA_Build 15 79504861 5D GTTTATGGGC TCTCT/----- TCTCTTTAGC 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 TCTCT 2 1 235648 CASAVA_Build 15 79510691 1D AGGCTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 632 hom 30 7 13 10 T 17 16 235649 CASAVA_Build 15 79511193 3D GGGTTTACTC TTT/--- TTGTTGGACA 3070 het 3070 ref 40 20 15 8 T 5 2 235650 CASAVA_Build 15 79514624 1D TAGATAAAGC T/- TTTTTTTTTT 1727 het 1727 ref 61 42 6 13 T 12 11 235651 CASAVA_Build 15 79517419 4I AACTGTATCT ----/TAAC AGCATTATGT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 TAAC 0 1 235652 CASAVA_Build 15 79522854 3D TTTGAAAGGC TGT/--- TGTTTGGTAT 3070 het 3070 ref 49 27 16 7 TGT 2 1 235653 CASAVA_Build 15 79524326 4I TAAAGATAAT ----/AAAC AAGCTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 12 8 9 AAAC 0 1 235654 CASAVA_Build 15 79530158 1I TCCCAATAAC -/G TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 G 0 1 235655 CASAVA_Build 15 79532546 1I GGGTTAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 T 10 11 235656 CASAVA_Build 15 79542868 1D GTCTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 11 10 235657 CASAVA_Build 15 79547586 1D GAAATAAAGG A/- AAAAAAAATT 2279 het 2279 ref 21 8 7 6 A 9 8 235658 CASAVA_Build 15 79554313 1I ACACACATTT -/A TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 A 0 1 235659 CASAVA_Build 15 79555244 1D ATATTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 A 11 10 235660 CASAVA_Build 15 79588281 3D TGTATACTGC TTG/--- TTAATTATTT 3070 het 3070 ref 40 20 15 6 TTG 1 0 235661 CASAVA_Build 15 79593141 4I CTCAAGAGAA ----/AAAC AAAGAAATGA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AAAC 0 1 235662 CASAVA_Build 15 79596639 5I AAAGCCAACA -----/TACCT TTAATTACCA 3070 het 3070 hom 42 15 26 1 TACCT 0 1 235663 CASAVA_Build 15 79605939 1I CCTGGAATTA -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 6 7 235664 CASAVA_Build 15 79609682 8D3M5I TTCAATGTGA TTCTGGGTAGA-----/--------AAAGCTAT GCTCTGTGTG 3070 hom 123 het 45 0 42 8 N/A 0 0 235665 CASAVA_Build 15 79611342 1I AGGAGATGGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 8 9 235666 CASAVA_Build 15 79616403 1I AAAAAAGAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 8 9 235667 CASAVA_Build 15 79618924 1D CCACAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2767 het 2767 ref 42 31 6 7 A 11 10 235668 CASAVA_Build 15 79622516 1D TTGTGAGGAA T/- GAAGCAATCC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 1 0 235669 CASAVA_Build 15 79681164 1D TGTTGGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 34 1 25 10 A 14 13 235670 CASAVA_Build 15 79682567 6D AAGCCTGATG ATCAAA/------ ATCATGACAA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 ATCAAA 1 0 235671 CASAVA_Build 15 79713850 1D AAGCTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 T 11 10 235672 CASAVA_Build 15 79726518 1I GTTAGTAGAG -/T TTCAATAGTT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 2 3 235673 CASAVA_Build 15 79727925 3D CCTTTATAAC TTT/--- TTTATTTTCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 6 3 235674 CASAVA_Build 15 79747210 4D CATCTTTTAC TGAT/---- TGATTATGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 5 TGAT 2 1 235675 CASAVA_Build 15 79754456 1D AAGGGCTGAG C/- CAGTGCCCTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 C 2 1 235676 CASAVA_Build 15 79757267 1D GGCCAGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 11 9 T 11 10 235677 CASAVA_Build 15 79759359 4I GCCACATGAC ----/ACTT AATCTAAAAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 ACTT 0 1 235678 CASAVA_Build 15 79765544 1D TTTATTCAAG A/- ATTGTCAAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 2 1 235679 CASAVA_Build 15 79789737 4I ACATAATGGT ----/ATTA ATTATTAATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATTA 1 2 235680 CASAVA_Build 15 79797407 1D ATTCATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 11 10 235681 CASAVA_Build 15 79798719 3I GATATTTAAA ---/TAT TATGAGAGTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TAT 1 2 235682 CASAVA_Build 15 79803774 1D TGGTTACCCC T/- GTCTCCCTAA 3070 hom 93 het 40 0 31 9 T 1 0 235683 CASAVA_Build 15 79820744 4I ATATAACTTC ----/TTTG TTTATTACAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTTG 0 1 235684 CASAVA_Build 15 79821897 1D TTCTATTAAA C/- AGGTATTACT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 235685 CASAVA_Build 15 79828676 6I20M1I GTGTTTTTTT ------TTTGTTTGTTTTGTGGGGGG-/TGTTTGTTTGTTTGTTTTGTGGGGGGA GGGGGTTGTT 3070 hom 60 het 28 0 25 6 N/A 0 0 235686 CASAVA_Build 15 79831652 1D TATTATTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 34 0 24 11 A 14 13 235687 CASAVA_Build 15 79831824 1I GTTTGGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 870 hom 33 2 25 6 T 12 13 235688 CASAVA_Build 15 79832386 1I AAGCTATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 45 1 39 5 T 10 11 235689 CASAVA_Build 15 79833287 1D TTAACCCTTC A/- ACTAAAACAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 2 1 235690 CASAVA_Build 15 79835180 1D TGAAATTTAC T/- GAGATAAGAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 1 0 235691 CASAVA_Build 15 79845942 5I AAAAACTATA -----/TGAGT TAAGTATGAT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TGAGT 0 1 235692 CASAVA_Build 15 79847148 2D CATGGTGAAA CT/-- CTGTCTGTAC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 CT 2 1 235693 CASAVA_Build 15 79852667 1D AACCAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1147 hom 35 4 21 10 T 15 14 235694 CASAVA_Build 15 79883344 8I CTTAAAATAT --------/AATAAAAA AATAAAAAAA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AATAAAAA 1 2 235695 CASAVA_Build 15 79883497 1D CAGGTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 31 0 19 12 A 12 11 235696 CASAVA_Build 15 79893396 1D AAACTCAACC T/- TGTCTCCTGG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 2 1 235697 CASAVA_Build 15 79894080 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 32 2 17 13 T 14 13 235698 CASAVA_Build 15 79899043 6D GCTGCTGTTT CTTCTC/------ CTTCTCCTTC 3070 hom 116 het 49 0 37 12 CTTCTC 3 2 235699 CASAVA_Build 15 79901037 6D GTTTTAACTT AAAAAC/------ AAAACAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 AAAAAC 1 0 235700 CASAVA_Build 15 79906092 1I TAGTGACAAG -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 91 het 34 0 31 3 A 7 8 235701 CASAVA_Build 15 79956237 1D AGGTTGTATG A/- AGGCAAGTCT 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 A 2 1 235702 CASAVA_Build 15 79965570 3I AAGAAAAACA ---/TAG TAGAGAATGG 3070 het 3070 hom 55 23 24 8 TAG 1 2 235703 CASAVA_Build 15 79966040 3I TGACGTGTAC ---/AAG AAGGACAACT 3070 het 3070 ref 55 24 22 9 AAG 1 2 235704 CASAVA_Build 15 79975103 4D CTAAATATAC AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 hom 38 17 16 7 AACA 3 2 235705 CASAVA_Build 15 79978324 1D AAAAAAAAAA G/- TAGCCATTCC 2461 het 355 hom 25 2 12 11 G 1 0 235706 CASAVA_Build 15 79986709 2I ACTCCTTTTC --/AA AAAAAAAAAA 3063 hom 23 het 21 0 14 7 A 15 17 235707 CASAVA_Build 15 79991448 4D TGTGCTCTTG CTCT/---- CTCTCTCTCT 2793 hom 45 het 28 0 16 14 CT 9 7 235708 CASAVA_Build 15 80002925 1I ACTGTCACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 14 0 11 3 A 10 11 235709 CASAVA_Build 15 80013650 1I GTGAGACTCC -/T TTTCAAAAAA 2674 het 13 hom 10 0 7 3 T 3 4 235710 CASAVA_Build 15 80020499 1D ACATGCCTAT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 1931 hom 24 6 14 4 G 1 0 235711 CASAVA_Build 15 80025701 12D AAGTAAAAGC CAAAGGTCACCT/------------ CAAAGTTAGG 2780 het 2780 ref 29 15 7 9 CAAAGGTCACCT 1 0 235712 CASAVA_Build 15 80025761 4D ATGCCATGAT AAAG/---- AAAGTCCCTG 3070 hom 78 het 31 0 27 8 AAAG 2 1 235713 CASAVA_Build 15 80028062 4I AATAGATAAC ----/CAGT AGTTATATAG 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 CAGT 0 1 235714 CASAVA_Build 15 80033079 1I AACCAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 24 0 14 10 T 14 15 235715 CASAVA_Build 15 80034006 12D AAACATCATG GCACTGTAAAAA/------------ GGCGGCCAGG 3070 het 3070 ref 38 21 17 6 GCACTGTAAAAA 1 0 235716 CASAVA_Build 15 80056631 1D GAATAGCATC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 40 13 24 4 A 8 7 235717 CASAVA_Build 15 80074560 1D ATAAAATGTC G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 14 het 16 0 10 6 G 8 7 235718 CASAVA_Build 15 80089581 1I TAGAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 T 10 11 235719 CASAVA_Build 15 80095851 1I ATTTAAAAAA -/G CTCTTTCTCC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 G 0 1 235720 CASAVA_Build 15 80111244 1D CAAGATTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 A 11 10 235721 CASAVA_Build 15 80130099 1I TGTTCTCCTG -/T TGTCTTTGTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 1 2 235722 CASAVA_Build 15 80131825 1D GTTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 12 11 235723 CASAVA_Build 15 80136191 1D GGATGATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 846 hom 25 3 16 7 A 15 14 235724 CASAVA_Build 15 80137796 1D TTGCCGAGTT G/- TGGGAAGACA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 0 235725 CASAVA_Build 15 80145302 1D CTAACAAACC T/- TTTTTTTTTT 2679 het 2224 hom 29 8 10 11 T 15 14 235726 CASAVA_Build 15 80149030 1I AAAAGCAGTT -/G GGTTCTGCAG 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 G 2 3 235727 CASAVA_Build 15 80153416 2D TTAGAAAAAC AT/-- GTAGTTATCA 3070 het 3070 ref 43 28 15 1 AT 1 0 235728 CASAVA_Build 15 80167206 1D CCTGCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 1295 het 1295 ref 32 25 3 6 A 12 11 235729 CASAVA_Build 15 80167457 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2257 het 2257 ref 14 8 5 1 A 9 8 235730 CASAVA_Build 15 80175573 1D TGAGAGGTTG T/- GGGGGGATCC 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 1 0 235731 CASAVA_Build 15 80175730 4D CAATAATTTG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 TGTT 4 3 235732 CASAVA_Build 15 80185244 3D TAGAGCACAG AAC/--- CTATGTCAGA 3070 het 3070 ref 26 13 12 3 AAC 1 0 235733 CASAVA_Build 15 80200935 1D GGGAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 1381 het 239 hom 28 2 7 19 A 17 16 235734 CASAVA_Build 15 80201654 2D ATATTTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 1849 het 1849 ref 27 15 5 7 A 13 11 235735 CASAVA_Build 15 80203457 17D ACTCCTTCTC AAACAAAACAAAAACAA/----------------- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 24 13 13 9 AAACAAAACAAAAACAA 2 1 235736 CASAVA_Build 15 80209611 2D CTTGGAAAAC AT/-- GTTCTCTAAC 3070 het 3070 hom 37 15 20 5 AT 1 0 235737 CASAVA_Build 15 80211944 1I GAGCAGCCAG -/C GGGGCACAGA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 C 0 1 235738 CASAVA_Build 15 80223658 1I TCTCCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2852 het 2852 ref 35 12 11 12 A 12 13 235739 CASAVA_Build 15 80225241 1I TCAAAAAACC -/A AAAAAAAAAA 2733 het 1936 hom 18 6 9 3 A 14 15 235740 CASAVA_Build 15 80226007 1D TCAATTCGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 11 11 A 17 16 235741 CASAVA_Build 15 80228368 1D TAACCTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 T 11 10 235742 CASAVA_Build 15 80290259 1D ACTCCATTAC A/- AAAAAAAAAA 2141 het 1131 hom 25 8 8 9 A 17 16 235743 CASAVA_Build 15 80302661 1D AACTTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 11 10 235744 CASAVA_Build 15 80311083 1I ATATCCCCAG -/T TTTTTTCCAC 3070 het 3070 hom 48 15 28 5 T 6 7 235745 CASAVA_Build 15 80323105 2D TATTGGAGTT AC/-- AGACCTTTTA 3046 het 3046 ref 17 9 7 1 AC 1 0 235746 CASAVA_Build 15 80345542 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 10 11 235747 CASAVA_Build 15 80350909 1I AGTAAAAAAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 8 9 235748 CASAVA_Build 15 80355738 2D TTTTGCAGAA TT/-- AGAGAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 16 17 4 T 2 0 235749 CASAVA_Build 15 80369551 1D ACAAACTATG A/- AAAAAAAAAA 1117 het 1117 ref 9 3 4 2 A 12 11 235750 CASAVA_Build 15 80452387 2I ATTTGTGCTA --/TT TTTTTTTTCC 1990 hom 12 het 5 0 5 0 T 8 10 235751 CASAVA_Build 15 80467996 1I TCTCTGACCT -/C CCCCCCAAAG 1469 hom 7 het 4 0 3 1 C 6 7 235752 CASAVA_Build 15 80478479 1D TAGTTGGGAC A/- AGTACAGTGA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 2 1 235753 CASAVA_Build 15 80691812 2D GTCAAAAATA AT/-- AGAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 43 25 17 1 AT 1 0 235754 CASAVA_Build 15 80790331 2D CAAAATGTAT CA/-- GGGGGAAAAG 1350 het 1350 ref 21 16 3 2 CA 1 0 235755 CASAVA_Build 15 80840999 1I GAGCTACCAT -/A ACAGCTCATG 1307 het 1307 ref 9 4 3 2 A 1 2 235756 CASAVA_Build 15 80864944 4I TGTCACTGAT ----/AGTG AGAGACCATC 3070 het 3070 ref 17 7 7 3 AGTG 0 1 235757 CASAVA_Build 15 80953827 2D ACCAGGTAAC TA/-- TGTGCACAGA 1388 het 1388 ref 11 8 3 1 TA 1 0 235758 CASAVA_Build 15 81011820 1I TGTCTGTCCC -/T GGTCTGACCT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 0 1 235759 CASAVA_Build 15 81011923 1D GGCATAACAA T/- TTTTTTTTTT 1529 het 1529 ref 40 29 4 7 T 12 11 235760 CASAVA_Build 15 81016730 1I TAAGGTGATG -/A GGAGGGAATG 3070 het 3070 ref 51 21 20 10 A 0 1 235761 CASAVA_Build 15 81039199 1D CCCCTACCCC T/- GACTACTCCC 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 T 1 0 235762 CASAVA_Build 15 81045305 1D ATAACATTTA G/- ATTGCCTTAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 G 1 0 235763 CASAVA_Build 15 81053925 1D TGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 10 9 T 10 9 235764 CASAVA_Build 15 81056016 9D TCCCTTTGAC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 8 A 30 21 235765 CASAVA_Build 15 81060668 1I GAGGCCCAAG -/A AAAGTGGGAG 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 3 4 235766 CASAVA_Build 15 81064045 18D CTTTGGGAGG CTGAGGTGGGTGGATCAC/------------------ CTGAGGTGGG 2738 het 2738 ref 26 15 7 7 CTGAGGTGGGTGGATCAC 2 1 235767 CASAVA_Build 15 81067605 4D GTATCGAGAG ATCA/---- ATCTACAAAG 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 ATCA 1 0 235768 CASAVA_Build 15 81069349 5I GAAAGAAAGC -----/ATTAG ATTAGAAGGC 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 ATTAG 1 2 235769 CASAVA_Build 15 81072968 5I GGCAGGTGTA -----/TATCT TATCTTATCA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 TATCT 1 2 235770 CASAVA_Build 15 81074569 5I CTGATCATTG -----/ATTTT ATTTTATTTT 3070 het 3070 ref 45 23 13 9 ATTTT 2 3 235771 CASAVA_Build 15 81082344 1D TCTTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 2224 het 1597 hom 38 11 7 20 T 19 18 235772 CASAVA_Build 15 81086137 3D AGGCTGAGGG AGA/--- AGAATCCCTT 2448 het 2448 ref 20 11 8 2 AGA 2 1 235773 CASAVA_Build 15 81087427 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 742 hom 36 5 15 16 A 16 17 235774 CASAVA_Build 15 81090640 1D AGTGTCATAC T/- TTTTTTTTTT 2533 het 2533 ref 40 13 9 18 T 13 12 235775 CASAVA_Build 15 81099991 1I ATATAACTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 13 17 13 T 13 14 235776 CASAVA_Build 15 81100571 4I ACATTTAGAC ----/TTTG TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 TTTG 0 1 235777 CASAVA_Build 15 81105294 1D TGGGTCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1128 het 1128 ref 35 27 3 7 T 11 10 235778 CASAVA_Build 15 81109464 1D GAAATATAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 10 9 235779 CASAVA_Build 15 81121799 1D ACTACCCCAT C/- CCTTGTCACT 3070 hom 125 het 48 0 36 13 C 3 2 235780 CASAVA_Build 15 81140406 1D TCTCCTACTT G/- GCTGTGAGTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 G 2 1 235781 CASAVA_Build 15 81145551 1I GGATCTTAAT -/C TGGGTGGGGT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 C 0 1 235782 CASAVA_Build 15 81152533 1I CTGAAATCAA -/T TTTTTTTTTT 1511 het 1511 ref 27 11 8 8 T 14 15 235783 CASAVA_Build 15 81163618 2D ACACCTTCTA CT/-- CTTCCAGGGT 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 CT 2 1 235784 CASAVA_Build 15 81218707 1D AGACCAGCCT G/- GGGCAACAGG 3070 hom 59 het 22 0 20 2 G 4 3 235785 CASAVA_Build 15 81225767 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 5 6 235786 CASAVA_Build 15 81226399 2I TGCCAGAAGC --/TA TATGAGTCGT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 TA 1 2 235787 CASAVA_Build 15 81229482 2I CTCTGGTCTC --/TT TGTTTCCCAT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 T 1 3 235788 CASAVA_Build 15 81254148 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1571 het 1571 ref 29 10 7 12 A 15 14 235789 CASAVA_Build 15 81254784 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2129 het 1467 hom 21 7 10 4 A 15 14 235790 CASAVA_Build 15 81282275 1D TGAAAGTGGG T/- TTTTTTTTCG 1199 het 1199 ref 37 30 3 4 T 9 8 235791 CASAVA_Build 15 81304904 1I GACTCTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2484 hom 29 9 15 5 A 10 11 235792 CASAVA_Build 15 81306616 1D GAAAAAAATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 359 hom 22 1 18 4 A 9 8 235793 CASAVA_Build 15 81307337 5D AGTAAAAAAA ATTTG/----- ATATATATAT 3070 hom 48 het 26 0 17 10 ATTTG 1 0 235794 CASAVA_Build 15 81310104 2D AAATTACCCT AA/-- GTCAATATTC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 2 0 235795 CASAVA_Build 15 81311165 1I GTTTAAAGCC -/A AACTAGAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 2 3 235796 CASAVA_Build 15 81312426 6D GGGCGTGTCA CTTTCT/------ CTGTCTCTAC 3070 het 3070 hom 41 17 20 7 CTTTCT 1 0 235797 CASAVA_Build 15 81319064 12D CTCTTCCTCC ACTCCCCCCGCA/------------ CTGCTGCTGG 3070 het 3070 ref 44 21 20 7 ACTCCCCCCGCA 1 0 235798 CASAVA_Build 15 81325111 1I CAAGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 34 1 29 4 T 10 11 235799 CASAVA_Build 15 81334656 2D TGCGCTCAGC TA/-- TATATATATA 3070 het 712 hom 21 2 14 9 TA 9 8 235800 CASAVA_Build 15 81343671 1I CGTGGAAAAT -/G GGAGATCTAA 3070 hom 156 het 61 0 48 13 G 2 3 235801 CASAVA_Build 15 81348052 10I TGGCAGTGAC ----------/CCTGCCCCTG CCTGCTGTCC 3070 hom 82 het 33 0 19 14 CCTGCCCCTG 0 1 235802 CASAVA_Build 15 81360239 1I TATTCACTGG -/A AAAACTCTAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 4 5 235803 CASAVA_Build 15 81400652 1D ACCCTGTTCC A/- AAAAAAAAAA 1972 het 1972 ref 45 30 5 10 A 13 12 235804 CASAVA_Build 15 81417036 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1626 het 1626 ref 34 21 4 9 A 15 14 235805 CASAVA_Build 15 81434161 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1508 het 1508 ref 26 14 6 6 A 15 14 235806 CASAVA_Build 15 81464484 1D TAAAAGATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 38 0 32 7 A 10 9 235807 CASAVA_Build 15 81475449 1I TTTTAATTTC -/T TTTGCCTGTG 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 T 3 4 235808 CASAVA_Build 15 81475623 3I TTCTCCCACA ---/TTC TTCAACCTCC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 TTC 1 2 235809 CASAVA_Build 15 81483376 4D TCCTGGGCTC AAGT/---- AAGTGATCCT 3070 het 3070 hom 46 17 24 6 AAGT 2 1 235810 CASAVA_Build 15 81486726 12D GGGGAAATAC GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGTGT 2628 het 2628 ref 28 17 10 3 GT 12 6 235811 CASAVA_Build 15 81495255 1D TGAGTCAAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 32 12 12 9 A 9 8 235812 CASAVA_Build 15 81506413 2D ATCTGACAGC TA/-- CCCTAACAGG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 TA 1 0 235813 CASAVA_Build 15 81536034 5I TTAGAAAAAC -----/ATAAA ATAAAGTAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 ATAAA 1 2 235814 CASAVA_Build 15 81546173 1D ATTTGGATGC T/- TTTTTTTTTT 3045 het 2891 hom 26 13 8 5 T 12 11 235815 CASAVA_Build 15 81546572 1D ACTCCACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 19 10 A 12 11 235816 CASAVA_Build 15 81552133 1I GGCATTTGAG -/A AAACAGCAGA 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 A 3 4 235817 CASAVA_Build 15 81560473 1D TGGGATTACA G/- GGTGTGTGCC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 3 2 235818 CASAVA_Build 15 81588587 1D CACTAAGTCC T/- TTTTTTTTTC 1360 het 1360 ref 41 31 3 7 T 10 9 235819 CASAVA_Build 15 81588924 1D CTCCAACCCA T/- TTTTTTTTTC 934 het 934 ref 40 32 3 5 T 10 9 235820 CASAVA_Build 15 81679128 1I CATCCCCTGT -/G AAAGGCAATT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 0 1 235821 CASAVA_Build 15 81756365 3D TTTTTTAAAA AAT/--- ACTTCATACG 3070 het 3070 hom 39 10 25 4 AAT 1 0 235822 CASAVA_Build 15 81758501 1D CTGATAAACT A/- AAAAAAAAAA 873 het 873 ref 27 23 2 2 A 11 10 235823 CASAVA_Build 15 81780528 4D AATGGCACAA AGAC/---- AGAGCACTGA 3070 het 3070 ref 52 28 19 7 AGAC 1 0 235824 CASAVA_Build 15 81804597 2I AGATTTTTCA --/CT CTGTGTTCCT 2137 het 2137 ref 25 16 5 4 CT 1 2 235825 CASAVA_Build 15 81865101 1I CATAAGATTC -/T TTTTTTTTTT 904 het 904 ref 20 11 4 5 T 15 16 235826 CASAVA_Build 15 81865738 1I GGCCCTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 27 1 18 8 T 12 13 235827 CASAVA_Build 15 81868764 1I TCTACCAACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 38 1 28 9 T 10 11 235828 CASAVA_Build 15 81969848 1D TTAAGGATTC T/- TTTTTTTTTT 2240 het 2240 ref 36 21 7 8 T 12 11 235829 CASAVA_Build 15 81971835 1D CAGAAGGTAA G/- GGGGGCCTTG 3070 hom 90 het 40 0 29 11 G 6 5 235830 CASAVA_Build 15 81994860 1D GTAAAAAAAA G/- GCAAACACTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 2 1 235831 CASAVA_Build 15 82015939 1D CACGTCTATC T/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 41 21 17 5 T 7 6 235832 CASAVA_Build 15 82038414 1D CTTCTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1646 hom 27 7 13 7 T 15 14 235833 CASAVA_Build 15 82051230 1I TCCTTAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 29 1 23 5 T 11 12 235834 CASAVA_Build 15 82052266 2I GACCCATGTC --/AT ATGGTCAAAG 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 AT 1 2 235835 CASAVA_Build 15 82052694 1D AAGAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 10 9 235836 CASAVA_Build 15 82053575 1D TTTTCATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 12 11 235837 CASAVA_Build 15 82055375 2D TTACTCCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1112 hom 39 10 17 13 T 15 13 235838 CASAVA_Build 15 82059799 1D GGATTGTTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 8 7 235839 CASAVA_Build 15 82071770 1I GTTGTTGACC -/A AAAAAAAAAA 2996 het 2996 ref 29 11 11 7 A 14 15 235840 CASAVA_Build 15 82078239 3I CATGAAAATA ---/TTG TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 TTG 0 1 235841 CASAVA_Build 15 82097526 1I ATCTCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2173 het 2173 ref 30 15 8 7 T 11 12 235842 CASAVA_Build 15 82102240 1D CTCTTATCTG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 38 0 26 12 T 9 8 235843 CASAVA_Build 15 82102436 1D GATGATTGCT A/- AAAATCCACA 3070 het 3070 hom 42 17 18 8 A 5 4 235844 CASAVA_Build 15 82116979 1I AGGCACAGTG -/T TTCATTTTGC 3070 het 3070 ref 58 30 15 13 T 2 3 235845 CASAVA_Build 15 82135147 1D ATGATTTATC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 7 6 235846 CASAVA_Build 15 82138179 1D GCTAAGAGTT C/- CCCTCTCTTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 C 4 3 235847 CASAVA_Build 15 82145774 1I CCTCCTCCTT -/C CTCCTGGTCT 3070 het 3070 ref 37 15 18 4 C 1 2 235848 CASAVA_Build 15 82147646 1I CCAACACCAG -/T TTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 6 7 235849 CASAVA_Build 15 82152045 1D CCCCCAAGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 10 9 235850 CASAVA_Build 15 82164324 2I GTCAGGAAAC --/AG TGTCTCTAAA 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 AG 0 1 235851 CASAVA_Build 15 82176365 2I TTTATTTCTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 32 17 10 5 TG 8 9 235852 CASAVA_Build 15 82190379 1I AGAATCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 11 12 235853 CASAVA_Build 15 82205914 3I CCAAGGAAGA ---/AAG AAGGAGAGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AAG 1 2 235854 CASAVA_Build 15 82231619 1I GCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2922 het 2922 ref 29 14 10 5 T 10 11 235855 CASAVA_Build 15 82236705 1I TGAGCAGAAT -/G GGCAGTCCCC 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 G 2 3 235856 CASAVA_Build 15 82239826 5I GACAAGAAAT -----/AACTC AAATCAGAGC 3070 het 2636 hom 28 9 16 3 AACTC 0 1 235857 CASAVA_Build 15 82240180 1D AAAAAAAAAA C/- AAACTTCTCA 1898 het 1898 ref 35 18 9 8 C 1 0 235858 CASAVA_Build 15 82242669 2D ATGGATAGCG TA/-- TATATATATA 2626 hom 21 het 11 0 8 3 TA 8 7 235859 CASAVA_Build 15 82263899 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 A 10 9 235860 CASAVA_Build 15 82265896 31I CTTTCCATCC -------------------------------/CTGAGGCTCAACTATCATTCTTACATGCTCA CACAGATGAC 3070 het 3070 ref 52 28 16 8 CTGAGGCTCAACTATCATTCTTACATGCTCA 0 1 235861 CASAVA_Build 15 82303008 1D CCTTTTTTTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 A 8 7 235862 CASAVA_Build 15 82309858 1I GGAAGATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 12 25 8 A 10 11 235863 CASAVA_Build 15 82315849 1D ACCAGTTTTC A/- AAAACGATGA 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 A 5 4 235864 CASAVA_Build 15 82338370 2D ACGCCATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2771 hom 21 8 10 3 A 12 10 235865 CASAVA_Build 15 82338549 9D GGAATGCCTT TTTCAGGTC/--------- TTGACATTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 TTTCAGGTC 1 0 235866 CASAVA_Build 15 82350772 5D ATATCACTAA TATAT/----- TAAGAGAGTA 3070 het 3070 hom 36 12 22 7 TATAT 1 0 235867 CASAVA_Build 15 82355530 2D CACTCAATAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2744 hom 36 8 22 9 TA 7 6 235868 CASAVA_Build 15 82359177 1D ACTGTATCAT G/- TGATCATTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 G 1 0 235869 CASAVA_Build 15 82361593 2D TGAGGCACTT GA/-- GAGAGAGAGT 3070 het 3070 hom 58 25 24 9 GA 5 4 235870 CASAVA_Build 15 82363382 1D AATTAGAAAA G/- GGGGATATCA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 G 5 4 235871 CASAVA_Build 15 82375258 1D TTCCTCTTTT G/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 G 1 0 235872 CASAVA_Build 15 82376543 5I CTTTAGAAAA -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 48 25 20 5 AAAAT 2 3 235873 CASAVA_Build 15 82381615 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2639 hom 19 6 10 3 T 10 9 235874 CASAVA_Build 15 82386370 1D CACTAACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 26 0 12 14 T 17 16 235875 CASAVA_Build 15 82387729 1D GGCTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 12 11 235876 CASAVA_Build 15 82395304 2I AATCCCAAAC --/AG GGGAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AG 0 1 235877 CASAVA_Build 15 82408543 1D CTTCTTTTAC T/- CATTTTTATT 3070 het 2402 hom 18 6 11 1 T 1 0 235878 CASAVA_Build 15 82413155 2D GTGTAAACAA AC/-- ACACAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 20 8 AC 3 2 235879 CASAVA_Build 15 82459538 1D TTAATCGGGA T/- TTTTTTTAAG 2966 het 2966 ref 32 17 8 7 T 8 7 235880 CASAVA_Build 15 82459816 1D CCCTTTGGCC A/- AAAAAAAAAA 2264 het 2264 ref 43 34 5 4 A 12 11 235881 CASAVA_Build 15 82474710 1D GTGTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 12 11 235882 CASAVA_Build 15 82489400 8D AACCCATTTT CTGAGGAG/-------- CTGAGGAGAA 3070 hom 78 het 31 0 26 7 CTGAGGAG 2 1 235883 CASAVA_Build 15 82505948 1D TTGGTGATGC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 8 7 235884 CASAVA_Build 15 82516479 1I ACTCAGACTC -/A ACGTTCCCCA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 1 2 235885 CASAVA_Build 15 82520409 3I AGTTTTTAGA ---/AAG AAGTTCCTCC 3070 het 3070 ref 38 18 19 1 AAG 1 2 235886 CASAVA_Build 15 82538287 1D66M1D TAATAATAAT AAAAAAAAAAACCTTCAAAGGAATAAAAAAAAAGAATAGTATGCTCAGAATATTCTCCTTTTTTGTTA/-AAAAAAAAAACCTTCAAAGGAATAAAAAAAAAGAATAGTATGCTCAGAATATTCTCCTTTTTTGTT- AAAAAAAAAA 3070 het 588 hom 21 3 22 14 N/A 0 0 235887 CASAVA_Build 15 82543418 1I CGTTTCAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 133 het 52 0 45 7 A 9 10 235888 CASAVA_Build 15 82568136 1D ATAGAACTAG A/- AATGATGCAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 3 2 235889 CASAVA_Build 15 82585706 1D CAGTTAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 944 hom 40 3 30 7 T 13 12 235890 CASAVA_Build 15 82596359 1I CAGAAAATGT -/A AAAGTATATG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 3 4 235891 CASAVA_Build 15 82598109 1I TATTTTGTTT -/A AAAAAAAAAT 2831 het 2831 ref 37 24 9 4 A 9 10 235892 CASAVA_Build 15 82599730 1I ACACTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2707 het 2707 ref 22 9 7 6 A 11 12 235893 CASAVA_Build 15 82613105 4I GTGTATTCAC ----/ACAA ACATACAGTC 3070 het 3070 ref 54 29 17 8 ACAA 0 1 235894 CASAVA_Build 15 82623812 3D3M4I GTCTCAGTGG GGAAAA----/---ACATCTC GCCTTGGACA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 N/A 0 0 235895 CASAVA_Build 15 82649143 1I GGGGAGCTGG -/T TGCAGAGGCC 2885 het 2885 ref 67 46 8 13 T 1 2 235896 CASAVA_Build 15 82658407 3D CCAGCAAGAT GAA/--- GGACTAGATT 3070 het 3070 ref 52 33 13 8 GAA 1 0 235897 CASAVA_Build 15 82677024 4I ACCCAAAAAT ----/AGAG AGAAGAGACA 2461 hom 12 het 5 0 5 0 AG 1 3 235898 CASAVA_Build 15 82712495 5D ATCATGCATT GTTCA/----- GTTCAGTTCA 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 GTTCA 3 2 235899 CASAVA_Build 15 82730406 2D CTTTCTTTCC CT/-- CTCTTTCTTC 3070 het 1949 hom 20 6 12 2 CT 3 2 235900 CASAVA_Build 15 82738886 5I ACACTCTCTT -----/TAAAC AAAACAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 TAAAC 0 1 235901 CASAVA_Build 15 82758660 1D ACTAAATGGC A/- AAGATGACCA 3070 hom 24 het 9 0 8 1 A 3 2 235902 CASAVA_Build 15 82765556 1D CCTGTCACCT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 9 8 235903 CASAVA_Build 15 82839761 1I GATCTAAAAT -/G GTTATCTGTA 1377 het 1377 ref 30 27 3 0 G 1 2 235904 CASAVA_Build 15 82862773 3D CCAGCCTGAT CTC/--- CTACAAAACC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 CTC 1 0 235905 CASAVA_Build 15 82874272 1I ACAATAGTTT -/A AAAAATGTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 5 6 235906 CASAVA_Build 15 82877904 1I TTTACATTTG -/A AAAAATCTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 5 6 235907 CASAVA_Build 15 82908288 4D TTTGGGGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 28 14 7 7 TTTG 5 4 235908 CASAVA_Build 15 82918839 1D ATATTAAGTG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 8 7 235909 CASAVA_Build 15 82944513 2D GTATAAATAA AT/-- ATATATATAT 2457 hom 21 het 8 0 8 0 AT 8 7 235910 CASAVA_Build 15 82957914 2D GTAATCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 29 0 17 12 T 14 12 235911 CASAVA_Build 15 82974732 1I TGGTAAGTGA -/G GGGGGGGAGG 3070 het 3070 ref 52 23 18 11 G 7 8 235912 CASAVA_Build 15 82975549 9I TGGTAGAAAA ---------/GTCCCACCT GTCATCAATG 3070 hom 54 het 21 0 16 5 GTCCCACCT 0 1 235913 CASAVA_Build 15 82980837 6D CTAAAAATAC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1774 het 511 hom 15 3 6 6 A 20 14 235914 CASAVA_Build 15 82994590 6D ACCCGGCTAA TTTTCT/------ TTTTCTTTTT 1798 het 1798 ref 19 11 4 4 TTTTCT 3 2 235915 CASAVA_Build 15 83002688 1I ACCGGGCACC -/G GGCCAAACAG 838 het 838 ref 17 4 3 10 G 2 3 235916 CASAVA_Build 15 83009380 1I GTATCTTTAT -/G GAACAAGAGA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 G 1 2 235917 CASAVA_Build 15 83013705 1I TATATCCCCC -/A AGGGGTACTA 2893 het 2893 ref 29 13 10 6 A 1 2 235918 CASAVA_Build 15 83028050 1I CTGAGCCACC -/G GCACCTGATC 3070 het 3070 hom 39 16 22 1 G 1 2 235919 CASAVA_Build 15 83030033 7D AATAAATTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1145 hom 27 8 11 8 T 23 16 235920 CASAVA_Build 15 83033265 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2454 het 800 hom 20 6 7 7 A 16 14 235921 CASAVA_Build 15 83033845 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 30 1 15 14 T 17 16 235922 CASAVA_Build 15 83034853 1D CCCCATCTTT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 26 9 14 4 A 8 7 235923 CASAVA_Build 15 83037699 1I TTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 20 3 14 3 T 12 13 235924 CASAVA_Build 15 83041285 1I AAAAATTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 10 11 235925 CASAVA_Build 15 83044480 1I GACCTATAAT -/G GAGAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 1 2 235926 CASAVA_Build 15 83045401 1D AGCAAATAGG A/- AAAAAAAAAA 2124 het 1640 hom 28 8 8 12 A 17 16 235927 CASAVA_Build 15 83049156 1I TTCTGGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 615 hom 28 3 19 6 T 11 12 235928 CASAVA_Build 15 83056477 1D ACCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 13 12 235929 CASAVA_Build 15 83056685 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2547 het 611 hom 28 4 9 15 T 16 15 235930 CASAVA_Build 15 83063767 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 983 het 983 ref 39 28 3 10 A 11 10 235931 CASAVA_Build 15 83064288 5D5M3D CCTAGACCAC TGAAGCCTAGATT/-----CCCAG--- GCTCAAGCAA 3070 het 3070 ref 22 14 9 2 N/A 0 0 235932 CASAVA_Build 15 83065471 3D CACTGGAGAT GTG/--- GCTCTTCCCT 3070 het 3070 hom 33 12 16 7 GTG 1 0 235933 CASAVA_Build 15 83067878 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 30 1 23 6 T 11 12 235934 CASAVA_Build 15 83071727 1D ATGATCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 46 1 29 16 T 16 15 235935 CASAVA_Build 15 83076641 1I TCAGCCTCCC -/A AAGTAGCTGG 3070 het 2229 hom 15 5 9 1 A 2 3 235936 CASAVA_Build 15 83080508 1D AGTTAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 913 hom 36 3 23 10 T 13 12 235937 CASAVA_Build 15 83082805 1D AGAGGAACGA G/- TGAGGTAGGG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 1 0 235938 CASAVA_Build 15 83104198 5D TTCCCCCCCC CCCCA/----- CCCTGCCATT 3070 hom 3 het 25 1 11 17 CCCCA 1 0 235939 CASAVA_Build 15 83104365 1I ATAAGTGGTT -/G AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 G 0 1 235940 CASAVA_Build 15 83105203 1D CAGGAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 1081 het 1081 ref 39 28 3 8 T 13 12 235941 CASAVA_Build 15 83112089 1D TTGTATTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 9 8 235942 CASAVA_Build 15 83130101 1I AGATTCATTT -/A AAAAAAAAAA 2126 het 2126 ref 28 10 8 10 A 15 16 235943 CASAVA_Build 15 83149966 4D AGTTTCTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 TTTG 3 2 235944 CASAVA_Build 15 83158048 1D AGCCACTGTG C/- CTGGCCTGTA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 C 2 1 235945 CASAVA_Build 15 83158862 1I GATTTAACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 9 10 235946 CASAVA_Build 15 83165212 1I14M1I TGAATTCCAA -CCCACCTCCAACCC-/CCCCACCTCCAACCCT TTTTTTTTTC 3070 het 23 hom 22 1 19 7 N/A 0 0 235947 CASAVA_Build 15 83174503 1I TTATCTGAAC -/T TGCTAGGCTT 3070 het 3070 hom 38 17 21 0 T 1 2 235948 CASAVA_Build 15 83186286 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 T 6 7 235949 CASAVA_Build 15 83186730 2I AGGGGTAGGG --/AC ACAGAGGACA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AC 1 2 235950 CASAVA_Build 15 83194322 1D TGACAGGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 22 1 16 7 A 12 11 235951 CASAVA_Build 15 83206025 5D CGAGTTGGTG CCCTA/----- CCCTACCGTT 3070 hom 63 het 25 0 21 5 CCCTA 2 1 235952 CASAVA_Build 15 83217069 2I AGTGTTAAAA --/TT TAAGTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 T 1 3 235953 CASAVA_Build 15 83220480 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2135 het 2135 ref 20 10 5 5 A 13 14 235954 CASAVA_Build 15 83227460 1I ATGTCATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 11 12 235955 CASAVA_Build 15 83234363 1D AGCCACCGCG C/- CCCCCCACCG 3070 hom 48 het 22 0 16 6 C 7 6 235956 CASAVA_Build 15 83237806 1I GGGGGTCACC -/A GGGGGGGCTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 0 1 235957 CASAVA_Build 15 83239990 1I AAAATTCGCT -/G GGGGGAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 G 5 6 235958 CASAVA_Build 15 83241857 4D TAAATATTTG TCTT/---- TCTTTATGTT 3070 hom 93 het 32 0 32 1 TCTT 2 1 235959 CASAVA_Build 15 83245744 1D25M1D ACTCCATCTC AAAAAAACAAAAAACAAACAAACAAAC/-AAAAAACAAAAAACAAACAAACAAA- AAAAAACAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 7 N/A 0 0 235960 CASAVA_Build 15 83246715 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 36 2 24 10 A 13 14 235961 CASAVA_Build 15 83248999 34D CAGCAAGCAC AATTCTGATGTGTACTAAATTCTGATGTGTACTA/---------------------------------- AATTCTGATG 3070 hom 63 het 29 0 22 10 AATTCTGATGTGTACTA 3 1 235962 CASAVA_Build 15 83250178 1I21M1D AAAAAAAAAA -CCCAAATCTGCAAATGATTTAC/CCCCAAATCTGCAAATGATTTA- TTCTGTGTGT 3070 hom 50 het 20 0 16 5 N/A 0 0 235963 CASAVA_Build 15 83253272 1D TTTCTGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 1 T 11 10 235964 CASAVA_Build 15 83258089 4I GCAAGGTTGA ----/ATTC ATTCTGTTGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 ATTC 1 2 235965 CASAVA_Build 15 83271379 1D TGAGGCCTAG A/- AAAGGGCTCA 3070 hom 101 het 39 0 33 6 A 4 3 235966 CASAVA_Build 15 83272150 1D TATTGGGGGA G/- GGGGATGCCA 3070 hom 66 het 26 0 22 6 G 5 4 235967 CASAVA_Build 15 83276239 1I TCTGTCTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 46 het 22 0 16 6 A 9 10 235968 CASAVA_Build 15 83282556 1D CTTCCTGTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 30 0 25 5 T 9 8 235969 CASAVA_Build 15 83286049 1I AGAAGTTTTC -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 8 235970 CASAVA_Build 15 83288965 1D GGGGGCCCTG C/- CCCACCCACC 3070 hom 69 het 27 0 18 9 C 4 3 235971 CASAVA_Build 15 83290035 1I CTGTTTAGAC -/T TTTTGTTTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 5 235972 CASAVA_Build 15 83294122 1I GTGGGAAGGA -/C CTTATCTACA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 1 2 235973 CASAVA_Build 15 83305567 1D TGAGAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 1503 het 1503 ref 33 15 5 13 T 17 16 235974 CASAVA_Build 15 83313765 1I GAGCACCCTG -/C CCCCCCGACT 3070 hom 83 het 36 0 26 10 C 6 7 235975 CASAVA_Build 15 83330851 1D TAGTCAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 948 hom 35 3 21 11 T 15 14 235976 CASAVA_Build 15 83339553 1D AGTATGTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1152 hom 28 4 14 10 T 13 12 235977 CASAVA_Build 15 83347268 1I ATGTCATGAA -/T TTTTTTTTTT 1344 het 1344 ref 49 34 3 12 T 11 12 235978 CASAVA_Build 15 83355123 1I TGTTTCCCCC -/T AGTCGTGTTC 3070 hom 150 het 57 0 50 7 T 0 1 235979 CASAVA_Build 15 83359480 1I TGCATAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 35 1 29 5 T 11 12 235980 CASAVA_Build 15 83360620 1I TTCAGTTTAA -/T TCTTTTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 1 2 235981 CASAVA_Build 15 83361698 2D GCATTGGATA GT/-- ATCTTTAATA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 GT 1 0 235982 CASAVA_Build 15 83366662 3D ATTGGAAGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 1642 het 657 hom 28 10 4 14 T 17 14 235983 CASAVA_Build 15 83366776 3D ATATGCAAAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 26 1 19 6 T 17 14 235984 CASAVA_Build 15 83367841 1I6M1D TAGGTTCAAG -ATTGCTA/TATTGCT- GCAGCATAGG 3070 hom 126 het 47 0 42 9 N/A 0 0 235985 CASAVA_Build 15 83368254 3I TCAGATTTCC ---/AAA AAAAAAAAGT 3070 hom 141 het 58 0 46 12 A 8 11 235986 CASAVA_Build 15 83373652 1I CTCACGGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 14 15 235987 CASAVA_Build 15 83379942 1D AGTTTTTGAT G/- GAAGTTCTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 2 1 235988 CASAVA_Build 15 83387331 3I ACAAGGCTCT ---/CTG CTGTCTGAAT 3070 hom 199 het 75 0 65 10 CTG 1 2 235989 CASAVA_Build 15 83388599 2I TAGGGGGAGG --/AA AAAGAGACTA 3070 hom 134 het 47 0 45 2 A 3 5 235990 CASAVA_Build 15 83389646 5D AGATCACAGG AATTA/----- AATTCAGACA 3070 het 3070 hom 59 25 25 11 AATTA 1 0 235991 CASAVA_Build 15 83391807 2D TTTTAAAATG AT/-- ATTGCTAAAA 352 het 352 ref 30 13 2 16 AT 2 1 235992 CASAVA_Build 15 83436564 1I TTTGTTGTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 T 9 10 235993 CASAVA_Build 15 83473910 1D TTTGGTTTTG T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 6 235994 CASAVA_Build 15 83477074 4D GTTCCTGGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 118 het 45 0 37 9 TG 11 9 235995 CASAVA_Build 15 83478782 3I TTCCCCACTC ---/CTT CTCTTACCAA 3070 hom 103 het 43 0 34 9 CTT 0 1 235996 CASAVA_Build 15 83483867 2I GAGAACTGAC --/AG AGGGCTCTCA 3070 hom 89 het 35 0 28 7 AG 1 2 235997 CASAVA_Build 15 83490116 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 678 hom 41 3 31 7 A 13 14 235998 CASAVA_Build 15 83493686 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 245 hom 26 1 17 8 T 9 10 235999 CASAVA_Build 15 83507212 18I CCTTGGGAGG ------------------/CTGAGGCAGGTGGATCAC CTGAGGTCAG 3070 hom 51 het 17 0 16 3 CTGAGGCAGGTGGATCAC 0 1 236000 CASAVA_Build 15 83521569 6I ACTGGCACCC ------/AGAGAA AGAGAGAACC 3070 hom 48 het 20 0 14 6 AGAGAA 0 1 236001 CASAVA_Build 15 83523897 1I TTCTATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 10 11 236002 CASAVA_Build 15 83528152 3D48M2D GGATTAAGAT GTAGTAAAATTTTCACTGCTTCATCATAGACATTCTTTTTATTTTTGAGACAG/---GTAAATTTTTCACTGCTTCATCATAGACATTGTTTTTATTTTTGAGAC-- GGCCTTGTTC 3070 het 3070 ref 27 29 9 3 N/A 0 0 236003 CASAVA_Build 15 83555823 5D AACAACAGAA TATTC/----- TATTATAAAA 2511 het 2511 ref 41 34 6 4 TATTC 1 0 236004 CASAVA_Build 15 83583393 1D AGAGCTCTAG A/- AAAAAAGCTT 1926 het 1926 ref 17 13 4 0 A 7 6 236005 CASAVA_Build 15 83596452 1D CCAGAGCTGG T/- TGAGGCAAGT 3062 het 3062 ref 27 13 8 6 T 2 1 236006 CASAVA_Build 15 83615848 1D ACCCCCTGCG C/- CCCCCCCATT 1895 het 1503 hom 15 8 5 2 C 8 7 236007 CASAVA_Build 15 83617759 3D GTCTCAAAAA TCT/--- TCTTCTTCTT 2190 het 2190 ref 20 11 5 5 TCT 4 3 236008 CASAVA_Build 15 83620534 3D CATGCTCTAC CAA/--- AAATTTTGTA 2822 het 2822 ref 23 13 7 4 CAA 1 0 236009 CASAVA_Build 15 83621576 1D TCTAAAAAAA T/- GGTACTCAAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 1 0 236010 CASAVA_Build 15 83644600 2I AAGTTATAGA --/TT TTTTTTTTTT 2247 het 2247 ref 26 17 6 3 T 10 12 236011 CASAVA_Build 15 83648451 1I GAATTAGAAA -/T TATTATTCAC 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 1 2 236012 CASAVA_Build 15 83650366 1D AGGTTAAAAA C/- AAAACAAAAC 1267 het 1267 ref 23 15 5 4 C 1 0 236013 CASAVA_Build 15 83652813 4D AAAAAAACAC AGTT/---- AGGCTGGACA 2046 het 2046 ref 30 16 7 7 AGTT 1 0 236014 CASAVA_Build 15 83667877 1D TCATTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 35 4 14 17 T 17 16 236015 CASAVA_Build 15 83683581 3I GGACTGGGCA ---/TGG TGGCTCACGC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 TGG 1 2 236016 CASAVA_Build 15 83686746 3D GTGGTTGTAC TGA/--- TGATGATGGT 3070 het 3070 hom 53 20 24 10 TGA 3 2 236017 CASAVA_Build 15 83695370 1D TCTCTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 A 11 10 236018 CASAVA_Build 15 83698308 1I TTTCATTTCA -/T TTTTTTTTTT 2864 het 2864 ref 31 14 9 8 T 10 11 236019 CASAVA_Build 15 83700370 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1890 het 31 hom 18 1 11 6 A 19 18 236020 CASAVA_Build 15 83701488 6D ATAAATAAAT AAATAA/------ AAATAAAAAT 2492 het 831 hom 9 3 6 1 AAATAA 4 3 236021 CASAVA_Build 15 83704402 3I TAGACCGGTA ---/AAG AAGGAGGGTG 3070 hom 102 het 38 0 32 6 AAG 1 2 236022 CASAVA_Build 15 83713788 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2038 het 50 hom 13 1 8 4 A 17 16 236023 CASAVA_Build 15 83722689 1D TGTGCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 2721 het 909 hom 29 8 9 12 T 17 16 236024 CASAVA_Build 15 83729555 1I TGGACAGAGT -/A AAAATTAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 4 5 236025 CASAVA_Build 15 83731901 4D GCTGGAAATC AGTT/---- AGGGGGCAAT 3070 het 3070 hom 24 9 13 4 AGTT 1 0 236026 CASAVA_Build 15 83732275 1D TTTCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1577 hom 26 7 13 7 T 13 12 236027 CASAVA_Build 15 83732790 2D TTAGTTTGCT GA/-- GAGTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 GA 2 1 236028 CASAVA_Build 15 83734812 1I GCATGACAAG -/A GTTGATTTAG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 0 1 236029 CASAVA_Build 15 83745110 5D TATATATATA TTTTT/----- TTTTTTTAAA 703 hom 10 het 9 0 4 5 T 12 7 236030 CASAVA_Build 15 83745544 1I TATTGAACTG -/T TTAGTTTCGT 3070 hom 126 het 51 0 42 9 T 2 3 236031 CASAVA_Build 15 83750632 1I TAGAAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 32 1 26 5 T 11 12 236032 CASAVA_Build 15 83756347 1D ATGTTACAGC A/- AAAATCATGC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 5 4 236033 CASAVA_Build 15 83759170 1I ATATGCAATT -/G GGTGCTTTAG 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 G 2 3 236034 CASAVA_Build 15 83759951 1D ATACCGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 12 14 T 15 14 236035 CASAVA_Build 15 83767034 1I TAATATGATA -/T TTTTCTGGTT 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 T 4 5 236036 CASAVA_Build 15 83771606 1I AATTTTGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 9 10 236037 CASAVA_Build 15 83776334 1I TTCTCATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 50 20 27 3 T 9 10 236038 CASAVA_Build 15 83784212 1D TAATAAAAAA T/- AATAATAATA 1730 hom 10 het 6 0 4 2 T 1 0 236039 CASAVA_Build 15 83785477 4I GTGTATTGAT ----/AATG AATGACCAAT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 AATG 1 2 236040 CASAVA_Build 15 83786003 1D CTCTTAAAAG T/- TTTTTTTTTC 1359 het 1359 ref 43 35 3 5 T 10 9 236041 CASAVA_Build 15 83796455 1D TCCCTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2842 hom 45 13 19 14 T 15 14 236042 CASAVA_Build 15 83805186 1I GGAACAGAGT -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 11 12 236043 CASAVA_Build 15 83811542 4D ACTCAATAAA TGTT/---- TGAGTGATTG 3070 het 3070 ref 52 26 25 2 TGTT 1 0 236044 CASAVA_Build 15 83816577 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1382 het 1382 ref 28 13 5 11 A 15 14 236045 CASAVA_Build 15 83822590 1I AACTTTCAAA -/G TAAACTCTAA 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 G 0 1 236046 CASAVA_Build 15 83823083 3I CTTAACATCA ---/TTG TTTCCCGAAG 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 TTG 0 1 236047 CASAVA_Build 15 83828522 1D TTGTTCTTCT A/- AAAATGTTGG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 5 4 236048 CASAVA_Build 15 83831965 4D CATGCCTGGC TATT/---- TATTTATGTA 3070 het 3070 ref 59 29 19 11 TATT 2 1 236049 CASAVA_Build 15 83841179 6D AGAAACTTGC TTTGAA/------ TTTGAAGTTA 3070 het 3070 ref 31 16 15 1 TTTGAA 2 1 236050 CASAVA_Build 15 83842826 16I GTTGATACTA ----------------/TCTTTGATCTGGTCAT TTGAAGCTTG 3070 hom 144 het 53 0 49 4 TCTTTGATCTGGTCAT 0 1 236051 CASAVA_Build 15 83850774 5I TAATATATAA -----/TGTAT TGTATTAAAT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 TGTAT 1 2 236052 CASAVA_Build 15 83851261 4D TTACTTTCTC TGGG/---- TAGCCTTTGT 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 TGGG 1 0 236053 CASAVA_Build 15 83865875 1D TTCGATGTTT A/- TGAGTATAGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 1 0 236054 CASAVA_Build 15 83868729 1I TTTATTATTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 2542 hom 18 6 11 1 T 7 8 236055 CASAVA_Build 15 83870678 2I TGGCTGGCAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 11 15 16 GT 7 8 236056 CASAVA_Build 15 83878837 1D GCCTAGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 20 1 12 7 T 15 14 236057 CASAVA_Build 15 83879119 1D GTACCTGGAG T/- TCAATAAGTA 3070 het 3070 ref 41 23 18 0 T 2 1 236058 CASAVA_Build 15 83881410 1I GGTACAGTAA -/G GGGAGAGAAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 3 4 236059 CASAVA_Build 15 83881500 1I AGTTGCACAT -/C AAATACTTTT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 C 0 1 236060 CASAVA_Build 15 83883628 1D GCTGAGAATT C/- CTGCATCATG 2832 het 2832 ref 33 24 6 3 C 2 1 236061 CASAVA_Build 15 83891781 1D TACTCAGGAC A/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 1 0 236062 CASAVA_Build 15 83904034 3I CACTTACTTC ---/CTA CTACTGTGTG 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 CTA 1 2 236063 CASAVA_Build 15 83904907 4I TTATTATGAG ----/TATT TAAATTATTC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TATT 0 1 236064 CASAVA_Build 15 83915504 2I ACTTATGTAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 T 9 11 236065 CASAVA_Build 15 83918027 1I AGAAAAATAG -/A AAAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 6 7 236066 CASAVA_Build 15 83921564 5D GGTAATGAAT GAATG/----- GCGAGCAAAC 3070 het 3070 hom 33 12 20 3 GAATG 1 0 236067 CASAVA_Build 15 83935466 1D AATAATTTTT C/- CCATTATACT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 3 2 236068 CASAVA_Build 15 83935865 11D TTGAATACTT AAGTTCAGAAA/----------- AAGTTCAGAA 3070 het 3070 ref 39 23 15 3 AAGTTCAGAAA 2 1 236069 CASAVA_Build 15 83938032 1D CTCATTTCTC T/- TTTGTTCATT 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 T 4 3 236070 CASAVA_Build 15 83949022 3D TAGGTTCATC AGA/--- ATGAGAGTTA 3070 het 3070 ref 32 20 10 4 AGA 1 0 236071 CASAVA_Build 15 83949360 1D GCGCTTTGCA G/- GGCTTCTGAG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 G 3 2 236072 CASAVA_Build 15 83951936 1I TCCACTCTTT -/A AAACATATTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 3 4 236073 CASAVA_Build 15 83952379 3I TATTCTTTTT ---/GCA TTGAAGAGAA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 GCA 0 1 236074 CASAVA_Build 15 83959670 1I TGGAGACGAT -/G CCTTTGCAGC 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 G 0 1 236075 CASAVA_Build 15 83968725 5D TCCGCATTGC AACAA/----- AACAAAAGAC 3070 het 3070 hom 40 16 23 4 AACAA 2 1 236076 CASAVA_Build 15 83970703 1I TGAATTTGAC -/A TGCTCTAGGT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 0 1 236077 CASAVA_Build 15 83977107 1D AGAAATAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 12 12 T 13 12 236078 CASAVA_Build 15 83978458 4I ATTTTATTGT ----/CAAA CAGTTATAAT 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 CAAA 0 1 236079 CASAVA_Build 15 83983001 1D TCTGAGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1894 hom 29 5 15 9 T 12 11 236080 CASAVA_Build 15 83983861 1I TGTAATTACC -/T GAATTTTGTT 3070 het 3070 ref 57 27 24 6 T 0 1 236081 CASAVA_Build 15 84001401 3D ATAATAGTAG TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 TAA 4 3 236082 CASAVA_Build 15 84003852 1I CTTTGGAGAT -/A ACGTTTGTCT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 1 2 236083 CASAVA_Build 15 84003969 1I GTATACATGG -/A AGTGTCATCA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 1 2 236084 CASAVA_Build 15 84005938 2D CCTGGGCAAC AA/-- GAGTGAAACT 3070 het 3006 hom 19 8 9 3 A 2 0 236085 CASAVA_Build 15 84018088 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 2814 het 1136 hom 15 5 7 3 T 10 9 236086 CASAVA_Build 15 84019099 2I ATATATGTGA --/AT ATATATATAT 2823 het 2823 ref 27 13 8 6 AT 7 8 236087 CASAVA_Build 15 84027186 19I ACAGGCGTGA -------------------/GCCACCGCACCTGGCCACG AATTGATTCT 2181 het 2181 ref 22 14 5 3 GCCACCGCACCTGGCCACG 0 1 236088 CASAVA_Build 15 84045909 1I GAACTCCTGA -/C CTCAGGTGAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 1 2 236089 CASAVA_Build 15 84046059 1I CTAATATGCA -/C CTAAGTTTCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 1 2 236090 CASAVA_Build 15 84055246 1D CTTGTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 T 12 11 236091 CASAVA_Build 15 84063134 1I AACCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 10 11 236092 CASAVA_Build 15 84064462 2D32M24D GCGAGAGAGT GAGAGACCCCAGCTCAACATTTAAAAACAAACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/--GAGACCCCAGCTCAACATTTAAAAACAAACTC------------------------ TGTGTGTTGG 3070 het 3070 hom 27 16 18 9 N/A 0 0 236093 CASAVA_Build 15 84068753 1D GGACTCTCAC G/- TGAGAGAGCA 3070 het 3070 ref 49 21 21 8 G 1 0 236094 CASAVA_Build 15 84076693 5D ATTATATAAC ATAAT/----- ATAACATTAT 2561 het 1625 hom 13 5 8 0 ATAAT 1 0 236095 CASAVA_Build 15 84106668 25D CAGGCTCCTG TGTTCCCTCTCAGGCTGGGTCCCTT/------------------------- TGTTCCCTCT 3070 het 3070 ref 28 16 11 11 TGTTCCCTCTCAGGCTGGGTCCCTT 2 1 236096 CASAVA_Build 15 84129800 1D AGCAAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 2916 het 2755 hom 22 9 8 5 T 13 12 236097 CASAVA_Build 15 84133623 1D TTGAGATCCC T/- TTTTTTTTTT 2369 het 1569 hom 24 8 8 8 T 13 12 236098 CASAVA_Build 15 84159678 1I CTTGAGCCCA -/G GAGTTTGAGG 1855 het 1855 ref 20 8 7 5 G 1 2 236099 CASAVA_Build 15 84170888 1D ATATTATAAC A/- GTATAATGGA 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 1 0 236100 CASAVA_Build 15 84171308 1D GTGATCTAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 T 9 8 236101 CASAVA_Build 15 84174497 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2486 het 1194 hom 26 4 11 11 A 16 17 236102 CASAVA_Build 15 84190288 1D CTGCACAAAC G/- CAAAGAAAAC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 G 1 0 236103 CASAVA_Build 15 84204578 1D CTTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 2967 het 2967 ref 28 17 8 3 T 13 12 236104 CASAVA_Build 15 84212253 3I GTCGAGATAG ---/GGT CCTGCCACAT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 GGT 0 1 236105 CASAVA_Build 15 84235900 1I GTGTTTCTCA -/C CCCCCCCCTT 3070 het 3070 hom 46 17 17 12 C 8 9 236106 CASAVA_Build 15 84241561 2I ATCTCTGTCC --/CT CTCTCTCTGT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 CT 4 5 236107 CASAVA_Build 15 84254649 32I TCTTCAGAGT --------------------------------/ACTGCTCAGCATTACGTGGAGGAACAGCTGAA TCTTTTGGCA 3070 het 3070 ref 38 25 15 2 ACTGCTCAGCATTACGTGGAGGAACAGCTGAA 0 1 236108 CASAVA_Build 15 84255481 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1642 het 914 hom 19 5 8 7 T 13 14 236109 CASAVA_Build 15 84260907 2I GATTGATCAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 10 12 236110 CASAVA_Build 15 84261550 1D CAGAGGTGCA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 41 15 18 9 T 8 7 236111 CASAVA_Build 15 84268324 8I TCTGCATGCG --------/TGTATATA TGTATATGTG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 TGTATATA 0 1 236112 CASAVA_Build 15 84283811 6D TCTCAAAGAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 2514 het 2514 ref 22 16 6 4 AAAAAC 3 2 236113 CASAVA_Build 15 84309010 2I TTGTTTTTCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 TG 6 7 236114 CASAVA_Build 15 84335060 1I CAAGCTCCAC -/T CTTCTACCTT 3070 het 3070 hom 54 23 21 10 T 0 1 236115 CASAVA_Build 15 84363666 2I ATTAGGGGGG --/AA AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 A 7 9 236116 CASAVA_Build 15 84367619 2D ATTTCCATGC AA/-- AGTTATTCTG 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 3 1 236117 CASAVA_Build 15 84390175 1D GTACAGAAGA G/- TTGGAAAGAG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 G 1 0 236118 CASAVA_Build 15 84390552 3I AGAGAGGCCT ---/GAA GAAGAATTTG 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 GAA 2 3 236119 CASAVA_Build 15 84391874 2D AGAAGAAAAC AT/-- ATGGGAAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 19 4 AT 2 1 236120 CASAVA_Build 15 84394201 1I CTCAATGAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 133 hom 37 1 30 6 T 9 10 236121 CASAVA_Build 15 84399835 5D CCTTGTGTAG AACCT/----- AACTTGGATG 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 AACCT 1 0 236122 CASAVA_Build 15 84402625 1I AAAATGGAGC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 8 9 236123 CASAVA_Build 15 84420920 2I GGCAACACAG --/TA TATAAGCTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TA 2 3 236124 CASAVA_Build 15 84423719 1I TGGGTTTCTA -/T TGCCCTGAAC 1241 het 1241 ref 17 8 4 5 T 1 2 236125 CASAVA_Build 15 84445640 1D AATCCAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 22 0 16 6 T 11 10 236126 CASAVA_Build 15 84524294 4D AGACATAAAT AGAG/---- AGATAACTAG 3070 hom 120 het 42 0 41 4 AG 3 1 236127 CASAVA_Build 15 84528669 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 46 27 4 15 T 15 14 236128 CASAVA_Build 15 84579925 1D TATACAATCT C/- ATTTAATCTT 3070 het 3070 hom 55 22 29 4 C 1 0 236129 CASAVA_Build 15 84588761 1I GTAGGGTCGC -/G GGGGGAAGGA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 G 5 6 236130 CASAVA_Build 15 84591138 1I GACAACCTCC -/T GGGTCCACTG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 0 1 236131 CASAVA_Build 15 84617391 1I AATTCCAGTT -/G GAGGATGCTC 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 G 1 2 236132 CASAVA_Build 15 84621383 2I TATAATAAGA --/TT TTTTTTTTTT 2531 het 2531 ref 44 18 10 16 T 16 18 236133 CASAVA_Build 15 84622720 10I TAAAAAAACA ----------/GATTTTCTAT GATTTTCTAT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 GATTTTCTAT 1 2 236134 CASAVA_Build 15 84628427 1D AAATTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 13 12 236135 CASAVA_Build 15 84630649 2D3M4D GTTATTCCTC TTGTCTAAT/--GTC---- TGAAATTTTG 3070 het 3070 hom 46 21 23 6 N/A 0 0 236136 CASAVA_Build 15 84634579 3D CTTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 35 1 25 9 T 17 14 236137 CASAVA_Build 15 84635610 21D CACACACACA GAGACACATACACACACACAC/--------------------- CACACAGAGA 1361 het 1361 ref 58 19 9 46 GAGACACATACACACACACAC 1 0 236138 CASAVA_Build 15 84640451 1D TTAGGTAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 585 hom 41 4 18 19 A 14 13 236139 CASAVA_Build 15 84675018 2D GAAATCAATC AG/-- AGTTTCTGGA 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 AG 2 1 236140 CASAVA_Build 15 84675650 1D CTAATCTTAC T/- TAGAGAGGTA 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 T 2 1 236141 CASAVA_Build 15 84678884 1I ACATAACTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 9 10 236142 CASAVA_Build 15 84682765 1I AAGGGATAAA -/G GTGACCCCCG 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 G 1 2 236143 CASAVA_Build 15 84684530 1D GCCTCCACTG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 C 10 9 236144 CASAVA_Build 15 84685623 3I GCAAAACAAG ---/AAC AACAACCAAC 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 AAC 2 3 236145 CASAVA_Build 15 84687544 13D CTCCTTGGCT ATGAATCCCTCCC/------------- CTTAAGAGTC 3070 het 3070 hom 56 23 29 8 ATGAATCCCTCCC 1 0 236146 CASAVA_Build 15 84704097 1I AGATACTTTG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 1437 hom 23 3 16 4 T 7 8 236147 CASAVA_Build 15 84704555 1I GGTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1560 het 1560 ref 41 15 9 17 T 15 16 236148 CASAVA_Build 15 84709913 1I AAACCATTGA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 7 8 236149 CASAVA_Build 15 84723487 2D TGACTACCTG AA/-- AAAACCCTTG 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 A 6 4 236150 CASAVA_Build 15 84726427 1D CTGTGCAGGG T/- TGACACATCT 1935 het 1935 ref 14 8 5 1 T 2 1 236151 CASAVA_Build 15 84728806 5D CCCAGCATAT TATAA/----- TATAACAATT 3070 het 3070 hom 29 10 17 4 TATAA 2 1 236152 CASAVA_Build 15 84749593 1I AAAAAATACC -/A AAAAAAAAAT 1731 het 1731 ref 17 11 5 1 A 9 10 236153 CASAVA_Build 15 84770205 2I AAAATAACAC --/AA ACAGATAATT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 A 1 3 236154 CASAVA_Build 15 84776307 1D CAGGATCAGG T/- TTTTAACTCT 3070 hom 110 het 46 0 37 10 T 5 4 236155 CASAVA_Build 15 84788106 3D CTTGGGTTGA CTC/--- CTCTATATCT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 CTC 2 1 236156 CASAVA_Build 15 84792945 1I CAGGGAGAGG -/C CTGAGGCCAG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 C 1 2 236157 CASAVA_Build 15 84794182 1I CTGGCGTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 31 7 A 9 10 236158 CASAVA_Build 15 84831804 1D GCCCCCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 40 0 30 10 T 12 11 236159 CASAVA_Build 15 84835071 1D AGCCACATCT C/- CCACCACTTA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 C 3 2 236160 CASAVA_Build 15 84839181 1I TGCTTCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 28 1 22 5 T 10 11 236161 CASAVA_Build 15 84839635 2I TCTTTTTTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 17 0 14 3 A 10 12 236162 CASAVA_Build 15 84844764 1D80M1D TCATATACCA TTGCTATTCAGTTATTTCAAGTGGGTAAAGTGGTTTTTAACATATTCACAAATTGGTACAACCACTAGCTCATTCCAGTACA/-TGCTATTCAGTTATTTCAAGTGGGTAAAGTGGTTTTTAACATATTCACAAATTGGTACAACCACTAGCTCATTCCAGTAC- ATTTTCATCT 3070 hom 223 het 48 0 74 8 N/A 0 0 236163 CASAVA_Build 15 84849562 1D CAGCCATTAC T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 8 7 236164 CASAVA_Build 15 84852796 1D TAAAACAGGA T/- TTTTTTCGAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 7 6 236165 CASAVA_Build 15 84853909 1I TTATGAATTT -/G GGTTTCAAAA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 G 2 3 236166 CASAVA_Build 15 84854587 7I TTCCTTCATG -------/TAAGTTT GCCTGCAAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TAAGTTT 0 1 236167 CASAVA_Build 15 84867942 3I AACTAATACT ---/TAC TATATTCCAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TAC 0 1 236168 CASAVA_Build 15 84871238 1I TTACAAAGTT -/A AAAACAAGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 4 5 236169 CASAVA_Build 15 84883325 7I AATCCAATCC -------/ATACCAT ATACCTTCCT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 ATACCAT 0 1 236170 CASAVA_Build 15 84895059 3D CATAGATCTT ATA/--- ATAGGCTATT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 ATA 2 1 236171 CASAVA_Build 15 84898102 1D TATTTCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 34 1 29 4 T 12 11 236172 CASAVA_Build 15 84910348 1I TTTGGCTCAC -/G CTCGTTGGGC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 0 1 236173 CASAVA_Build 15 84910950 2D CAGGATACAG AC/-- ACACACACAC 933 het 933 ref 49 36 4 10 AC 7 6 236174 CASAVA_Build 15 84913246 1I ACATAAACTG -/T TTTTTTTTTT 1288 het 1288 ref 35 24 4 7 T 11 12 236175 CASAVA_Build 15 84913503 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 7 236176 CASAVA_Build 15 84922071 1D AAGTCAAGAA C/- TGGGGGTTTG 3070 hom 48 het 19 0 15 4 C 1 0 236177 CASAVA_Build 15 84924174 1D TGTAAGAAGG A/- AAACTGTCTT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 4 3 236178 CASAVA_Build 15 84937532 1I GAACCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 612 hom 32 2 22 8 T 15 16 236179 CASAVA_Build 15 84942102 1D ATGTGATTGG T/- TTGGGGAGGA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 3 2 236180 CASAVA_Build 15 84943570 1D GATGTTTCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 73 het 34 0 25 9 T 10 9 236181 CASAVA_Build 15 84951217 12I TTCCTTCTTT ------------/CCCTTTCCCAAA CCCTTGGTGG 3070 hom 129 het 55 0 44 11 CCCTTTCCCAAA 0 1 236182 CASAVA_Build 15 84955943 1I TTCTGTGGGA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 6 7 236183 CASAVA_Build 15 84960167 1D AACAGGAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 35 1 31 3 A 10 9 236184 CASAVA_Build 15 84977037 10I CCAGCGTAGT ----------/TTTGTTTTGG TTTGTTTTTG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TTTGTTTTGG 0 1 236185 CASAVA_Build 15 84980730 1D ATCAAGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 22 2 15 5 T 12 11 236186 CASAVA_Build 15 84985205 1D CTGAGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 11 10 236187 CASAVA_Build 15 84986832 3D ATAGGGATAA TAT/--- TTTCTAAAAT 1213 hom 10 het 9 0 4 5 TAT 1 0 236188 CASAVA_Build 15 84997402 1I CAAATGCAAA -/C CCAAAATGAG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 2 3 236189 CASAVA_Build 15 85009575 1I19M3I CACTTCCAAA -TTTCCTTGGAAAGACTGCA---/TTTTCCTTGGAAAGACTGCAGTG GTCTATCATT 3070 hom 111 het 35 0 38 2 N/A 0 0 236190 CASAVA_Build 15 85016978 1D TTGACTTAAG A/- AAAAAACAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 6 236191 CASAVA_Build 15 85020807 1D AATCCTAGAA C/- TTTTGTTAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 0 236192 CASAVA_Build 15 85041739 1D TCTTGTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 13 12 236193 CASAVA_Build 15 85050205 1D CATCTTTTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 18 18 6 A 10 9 236194 CASAVA_Build 15 85053022 1D GACAATATCA C/- CCTAGGCCAG 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 C 3 2 236195 CASAVA_Build 15 85053576 1I TTAGGAGGAA -/T TTTTTCAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 5 6 236196 CASAVA_Build 15 85054414 1I CTGAACTTAG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 A 7 8 236197 CASAVA_Build 15 85060301 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 487 hom 17 3 10 5 A 17 16 236198 CASAVA_Build 15 85061934 4D TTCAGGGATC TTTG/---- TTTTTTGCCC 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 TTTG 1 0 236199 CASAVA_Build 15 85070224 1I CAGTATGGTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 55 19 26 10 A 8 9 236200 CASAVA_Build 15 85082138 5D ACAAAATGCT ATCAA/----- ATCAAATCAA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 ATCAA 3 2 236201 CASAVA_Build 15 85082656 1I TCCAAATTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 A 9 10 236202 CASAVA_Build 15 85086008 1D CTAGCAGACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 T 10 9 236203 CASAVA_Build 15 85095053 2D AGGCCCCAGC GT/-- GTGTGTTGTT 3013 het 3013 ref 34 21 8 5 GT 4 3 236204 CASAVA_Build 15 85120768 1I TATTGATTTG -/T TAGAAGTTCA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 1 2 236205 CASAVA_Build 15 85121662 1D CTTCCATCTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 2455 hom 22 6 9 7 T 9 8 236206 CASAVA_Build 15 85124170 2I ACACACACAC --/AT ACACACACCC 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 AT 0 1 236207 CASAVA_Build 15 85124436 1I CCATTGACAT -/C CAGTTGGCAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 1 2 236208 CASAVA_Build 15 85128083 1D CCAGGCTGGT C/- TCGAATTCCT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 1 0 236209 CASAVA_Build 15 85146515 1D GAGGTTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 236210 CASAVA_Build 15 85151074 1D TTAATAACTA T/- TTTATCTTTT 2136 het 2136 ref 18 12 5 1 T 4 3 236211 CASAVA_Build 15 85157439 1I TTTGAGGGTT -/G GGGGGGGCCT 3070 het 405 hom 41 1 29 11 G 7 8 236212 CASAVA_Build 15 85159978 1D CCAACCCCAG C/- TCTAAGTAAC 2760 het 2760 ref 36 23 9 4 C 1 0 236213 CASAVA_Build 15 85168794 2D TCCCAGGAAG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 5 het 27 1 15 12 T 11 9 236214 CASAVA_Build 15 85170272 1I AACTTCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1350 hom 39 3 32 4 A 10 11 236215 CASAVA_Build 15 85187751 1D CAAGACCCCG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 36 1 29 6 T 9 8 236216 CASAVA_Build 15 85194471 1I CAAGATGTCA -/C CATTCTTGCT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 1 2 236217 CASAVA_Build 15 85195066 4D AAAACAAAAC AAAA/---- CAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 A 4 0 236218 CASAVA_Build 15 85197291 1D CCAAAAAAAA T/- CTCAAAGCCC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 1 0 236219 CASAVA_Build 15 85213822 1D CCCTGTAGAT C/- CGATATGTGG 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 C 2 1 236220 CASAVA_Build 15 85214567 4D GGTCAAATAA TGAG/---- TAAGTGGCAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 TGAG 1 0 236221 CASAVA_Build 15 85229363 4I AACTTTACAT ----/ACAC ACATATACTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AC 1 3 236222 CASAVA_Build 15 85232598 1D TCTTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2094 het 2094 ref 32 19 6 7 A 13 12 236223 CASAVA_Build 15 85239405 1I CTTCTTTCTC -/T TTTCCCCCCT 3070 het 120 hom 34 2 16 16 T 3 4 236224 CASAVA_Build 15 85262102 1I CCTGACTCAT -/A AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 A 6 7 236225 CASAVA_Build 15 85262780 1I CTCAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 222 hom 26 1 18 7 A 11 12 236226 CASAVA_Build 15 85273111 6I ATTTTAATAA ------/TTTAAC TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 TTTAAC 0 1 236227 CASAVA_Build 15 85278770 1I TATATAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 11 12 236228 CASAVA_Build 15 85278937 1I AGTACTTCAA -/G CAGTATCTGG 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 G 0 1 236229 CASAVA_Build 15 85282305 1I GACACACTAC -/T TTTTTTGGGG 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 T 6 7 236230 CASAVA_Build 15 85284112 1D ACGCTGTTTC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 7 6 236231 CASAVA_Build 15 85320169 1I TGACAGCAGA -/G GCAGTTTAAC 2846 het 2846 ref 26 16 7 3 G 1 2 236232 CASAVA_Build 15 85323891 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTTT 1284 het 831 hom 8 3 3 2 T 6 7 236233 CASAVA_Build 15 85324370 3D29M2I GCCCTCCTAG AGCAGCAACTCAACTCAGTAATCAGATCCTAG--/---AGCAACTCAACTCAGTAATCAGATCCTAGTT TTTTAAATCA 3070 het 3070 hom 36 18 30 7 N/A 0 0 236234 CASAVA_Build 15 85326627 5I TACATTCTTA -----/TTTTC TTTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 TTTTC 1 2 236235 CASAVA_Build 15 85326760 2I AAGATGAAAC --/AG AGTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 AG 1 2 236236 CASAVA_Build 15 85328597 3D TTTTTTTCTC TCT/--- TTTTTTTTTT 2184 hom 16 het 16 0 8 8 TCT 1 0 236237 CASAVA_Build 15 85329860 1I TTTGTTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 43 1 37 5 T 10 11 236238 CASAVA_Build 15 85330158 11D GATAGCAATC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTGA 3070 het 71 hom 30 2 27 3 T 19 8 236239 CASAVA_Build 15 85330785 3D AATAGCAAAA AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 hom 40 het 44 1 35 10 AGG 6 5 236240 CASAVA_Build 15 85335599 2I CTGCTTACAC --/AT GTTTGCCCAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AT 0 1 236241 CASAVA_Build 15 85358046 4D AACAAAATGG AGTT/---- AGTTATGCTG 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AGTT 2 1 236242 CASAVA_Build 15 85358514 4D AGCTAACGCA AAAG/---- AAAGAGAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 28 2 AAAG 2 1 236243 CASAVA_Build 15 85360499 2I TCCCAGGTGA --/TT TTTATGTTCA 3070 hom 119 het 46 0 40 6 T 3 5 236244 CASAVA_Build 15 85362286 3I ATCTTTCTAA ---/AAT AATAGGCAGA 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 AAT 1 2 236245 CASAVA_Build 15 85363629 3D GCAAAAGCAA TGT/--- TATAACTGAA 3070 het 3070 ref 45 26 17 4 TGT 1 0 236246 CASAVA_Build 15 85364297 1D CTGAACCAGG A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 A 7 6 236247 CASAVA_Build 15 85365740 5D GGAATCTAAT TAAAC/----- TAAAGAGCTT 3070 het 3070 ref 38 21 16 4 TAAAC 1 0 236248 CASAVA_Build 15 85372272 5I ACACTGAACT -----/TAAAA TAAAAGTGGA 2520 het 2520 ref 19 10 6 3 TAAAA 1 2 236249 CASAVA_Build 15 85373742 3I TAACAACAAC ---/AAT GACAGCAACA 3070 het 3070 hom 56 23 29 4 AAT 0 1 236250 CASAVA_Build 15 85376572 1I AAGAAGTTAA -/T TAAGGTATGA 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 T 1 2 236251 CASAVA_Build 15 85397721 5I ACCAGCATGT -----/TAAAA TAATAACATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAAAA 0 1 236252 CASAVA_Build 15 85407518 1D TATAAAATTT A/- ACAAATACAC 3070 het 3070 hom 23 9 11 4 A 2 1 236253 CASAVA_Build 15 85407964 1I AATTCAGATG -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 57 22 31 4 A 6 7 236254 CASAVA_Build 15 85413566 1I ATTGCAGAGC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 T 6 7 236255 CASAVA_Build 15 85415749 4I AAATGTTCAT ----/TGTC TGTTGGAAGC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 TGTC 0 1 236256 CASAVA_Build 15 85437570 1I TCTTCATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 10 11 236257 CASAVA_Build 15 85458050 1I CTGTAAAACT -/A AAGGCAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 A 2 3 236258 CASAVA_Build 15 85462445 1I GGTAGTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 487 hom 32 2 25 5 T 10 11 236259 CASAVA_Build 15 85470576 1I ATGAATAATT -/G GGGGGGGGGG 3070 het 3070 ref 35 12 9 14 G 10 11 236260 CASAVA_Build 15 85471212 8D ACACTGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 860 hom 28 7 13 10 A 19 11 236261 CASAVA_Build 15 85476117 1D TTTTAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 A 11 10 236262 CASAVA_Build 15 85481889 2D TAAAATAAAC TT/-- AAATCAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 2 0 236263 CASAVA_Build 15 85489709 1D ATATTTCTTT A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 A 7 6 236264 CASAVA_Build 15 85498051 1I ACCCAGCAGT -/G GGATTGCTGG 3070 hom 78 het 27 0 27 2 G 2 3 236265 CASAVA_Build 15 85511501 1I CTGCAAACTG -/C CTTAGATAGG 3070 hom 168 het 62 0 55 7 C 1 2 236266 CASAVA_Build 15 85515383 1I TGTTATTATT -/G TAATTATGAC 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 G 0 1 236267 CASAVA_Build 15 85519322 1I AGCCTCCACC -/A AAAAAACTGC 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 6 7 236268 CASAVA_Build 15 85527450 4D TAAAATACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 AC 9 7 236269 CASAVA_Build 15 85530921 1D CTACAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 670 hom 27 5 12 10 A 17 16 236270 CASAVA_Build 15 85541238 3I CATCAGTCTT ---/ATG ATATTAGCCC 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 ATG 0 1 236271 CASAVA_Build 15 85545981 1I TATTTATTTG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 26 13 13 0 T 6 7 236272 CASAVA_Build 15 85553402 1I TTCCAGACAA -/T ATGCTAAGAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 0 1 236273 CASAVA_Build 15 85563277 1D AAAGCCTTAC T/- TTACTTTTAG 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 3 2 236274 CASAVA_Build 15 85567504 1I TTTTTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 12 13 236275 CASAVA_Build 15 85571864 1I TCTGAACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 T 11 12 236276 CASAVA_Build 15 85580131 2I GGTTCCACCC --/CT GTTTTATTTT 2363 het 2363 ref 19 10 5 4 CT 0 1 236277 CASAVA_Build 15 85595499 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTTTTT 1223 het 418 hom 6 1 5 0 T 13 12 236278 CASAVA_Build 15 85609601 2D AAATGGAATC TG/-- TTTCTGAAAG 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 TG 1 0 236279 CASAVA_Build 15 85615992 1D TCCTGTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 A 11 10 236280 CASAVA_Build 15 85623218 1D AAGGACTTGC T/- TTATGAATCT 3070 het 2994 hom 19 8 8 3 T 3 2 236281 CASAVA_Build 15 85626972 1D AGAGTGGGTT A/- AAAAAAAAAA 1842 het 1842 ref 41 20 5 16 A 17 16 236282 CASAVA_Build 15 85629075 1D AAACCGTTTT G/- GCTGGGCGCA 3070 het 2440 hom 25 7 15 3 G 2 1 236283 CASAVA_Build 15 85632110 1D TGATTACCCT A/- ATGAGCACTT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 2 1 236284 CASAVA_Build 15 85634088 1I ACAAAAAATT -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 6 7 236285 CASAVA_Build 15 85636777 1D AAACTGAGCC A/- GAAACTGAAA 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 1 0 236286 CASAVA_Build 15 85641657 5D GTGGCTAAAA TATGG/----- TACATGCACA 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 TATGG 1 0 236287 CASAVA_Build 15 85645451 1D CTCTGGGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2606 hom 24 8 13 3 T 11 10 236288 CASAVA_Build 15 85647948 3D TTATTAAAAC ATT/--- ATTTTCTGTA 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 ATT 2 1 236289 CASAVA_Build 15 85648858 4I ACAAAGAAAT ----/AAAC AAAACTAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAAC 0 1 236290 CASAVA_Build 15 85650715 1D AGTGAGATGC T/- GTCTCAAAAA 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 T 1 0 236291 CASAVA_Build 15 85655737 8D TTTAAAATTA AAATTTTT/-------- AAAGCTTAAT 2440 het 2440 ref 19 10 6 5 AAATTTTT 1 0 236292 CASAVA_Build 15 85658015 2D AAGTCACAGG AT/-- ATAGCCTAGA 3070 het 3070 ref 47 30 15 3 AT 2 1 236293 CASAVA_Build 15 85658854 1D AAAAGTCACA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 8 7 236294 CASAVA_Build 15 85659479 4D AAACAGATAA ATAG/---- ATAGACAGAT 3070 hom 117 het 55 0 39 19 ATAG 2 1 236295 CASAVA_Build 15 85659521 12D AGATAGATAG ATACATACATAC/------------ ATACATACAT 3070 hom 52 het 43 0 18 27 ATAC 8 5 236296 CASAVA_Build 15 85664630 1D GTTAATGACA C/- CATCATCTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 C 2 1 236297 CASAVA_Build 15 85667513 1I TCTTGGGCAG -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 A 6 7 236298 CASAVA_Build 15 85684072 4D AAAACATAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 AAAC 4 3 236299 CASAVA_Build 15 85686353 1I AATATGATTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 8 9 236300 CASAVA_Build 15 85687735 1I AAGCCATGCC -/A ATAAATAGCT 3070 het 3070 hom 61 25 28 8 A 1 2 236301 CASAVA_Build 15 85728749 1D TCATCAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1247 hom 27 5 14 9 T 15 14 236302 CASAVA_Build 15 85742190 1D GGGGCTTGTG A/- GAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 A 1 0 236303 CASAVA_Build 15 85744962 1I TGTAGTTCAA -/G GGGGGGAATA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 G 6 7 236304 CASAVA_Build 15 85762831 2D AAATATTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 A 12 10 236305 CASAVA_Build 15 85765242 1I AATCCCTTAC -/T TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 6 7 236306 CASAVA_Build 15 85766947 4D TCATTTTTTG GAAA/---- CTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 41 21 17 7 GAAA 1 0 236307 CASAVA_Build 15 85768479 1I GTGATTTCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 7 8 236308 CASAVA_Build 15 85773706 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 9 8 236309 CASAVA_Build 15 85792127 1I TTTTTGACTT -/A ACAATGCTAT 3070 het 3070 hom 57 21 28 8 A 1 2 236310 CASAVA_Build 15 85794296 1I ACATGACTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 9 10 236311 CASAVA_Build 15 85794841 1I AGAACAACAT -/A AAAAGGGCTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 4 5 236312 CASAVA_Build 15 85795973 1I GGCTTTCTAT -/A AAACACTCAT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 3 4 236313 CASAVA_Build 15 85802620 2D TTAAATACTC TT/-- TTCATTGCTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 4 2 236314 CASAVA_Build 15 85807883 1D TATTTATCCC A/- GCAGTGTTAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 1 0 236315 CASAVA_Build 15 85813987 1D TAAAAAAAAA C/- AAAGAGACAA 3070 het 2973 hom 22 8 12 3 C 1 0 236316 CASAVA_Build 15 85815689 1D TTCAAAGATT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 G 1 0 236317 CASAVA_Build 15 85818537 2D ATAGCTTATT TA/-- TAACTAGTCC 3070 hom 78 het 31 0 27 8 TA 2 1 236318 CASAVA_Build 15 85822411 3D GGTGCAAAAC CTT/--- CTCACACCTC 3070 het 3070 hom 48 22 23 4 CTT 1 0 236319 CASAVA_Build 15 85827172 10D ACCTAATTCT TGTGTTTTTG/---------- TGTGTTTAAT 3070 het 3070 ref 40 18 18 5 TGTGTTTTTG 1 0 236320 CASAVA_Build 15 85830368 1D AGTTTATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 12 11 236321 CASAVA_Build 15 85832475 1D TAATCTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 12 11 236322 CASAVA_Build 15 85838793 1I GCCAGGCGCT -/A AAGCTGTCTG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 2 3 236323 CASAVA_Build 15 85848281 3I CATTTCCAGT ---/AAC AACTCAACAA 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 AAC 1 2 236324 CASAVA_Build 15 85851551 1I TGGCAGCAGG -/C CTAAAGAGCC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 C 1 2 236325 CASAVA_Build 15 85861360 2D TTGGGTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2494 hom 21 7 11 4 A 12 10 236326 CASAVA_Build 15 85865333 1I AAGAGAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 25 16 9 T 10 11 236327 CASAVA_Build 15 85866441 1I GGCAGGCCAG -/A AAAAAAGGGT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 A 6 7 236328 CASAVA_Build 15 85869458 1D TCAGCTAGGT G/- GGGGTGTCTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 5 4 236329 CASAVA_Build 15 85872932 1D GATGAAGACC T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 7 236330 CASAVA_Build 15 85876433 2D ACAGTCCCCT AA/-- AGTCTTAACT 1941 het 1941 ref 13 8 5 0 A 3 1 236331 CASAVA_Build 15 85882506 1I ATCAATTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 8 9 236332 CASAVA_Build 15 85894221 4D TAGAATGTAG TTTC/---- TTTATCTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 TTTC 1 0 236333 CASAVA_Build 15 85914218 2D TTTTGAATAT AA/-- AAGAGGACCA 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 A 4 2 236334 CASAVA_Build 15 85949749 1D AATGGGTTTT A/- AAAATTTACA 3070 hom 132 het 46 0 44 2 A 5 4 236335 CASAVA_Build 15 85954843 1D GCTCCAACGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 8 7 236336 CASAVA_Build 15 85954895 1I TGCTACGACC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 T 8 9 236337 CASAVA_Build 15 85957205 2D TTTTAAAAAA CT/-- CTAATTCTAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 CT 2 1 236338 CASAVA_Build 15 85963530 2D AATGAAGACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2655 hom 30 9 13 9 A 13 11 236339 CASAVA_Build 15 85968436 1D GATTATGTCT A/- CAAGTCTTAG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 1 0 236340 CASAVA_Build 15 85977321 4D TTTTAATTCC TCTT/---- TCTATTCCTA 2226 het 2226 ref 27 22 5 1 TCTT 1 0 236341 CASAVA_Build 15 85978203 1D CTGATGGGGA C/- CTGAGGTAGG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 C 2 1 236342 CASAVA_Build 15 86002357 1I AATGTAACTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 A 8 9 236343 CASAVA_Build 15 86002615 1I TTCAACAAGT -/A AAAACCTTTC 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 4 5 236344 CASAVA_Build 15 86012737 1D GTTCGTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 12 11 236345 CASAVA_Build 15 86081001 1D GTCCAGGATG T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 52 22 22 9 T 7 6 236346 CASAVA_Build 15 86098045 1I CTTCCAGCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 18 12 7 T 9 10 236347 CASAVA_Build 15 86114838 2I GAACCCAGGA --/GG GGCGGAGCTT 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 G 2 4 236348 CASAVA_Build 15 86124427 1D TTGCTGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1635 hom 30 6 12 12 T 13 12 236349 CASAVA_Build 15 86130181 1I CTTGGTGTCA -/T ATTCAGATTT 3070 het 3070 ref 57 28 24 5 T 0 1 236350 CASAVA_Build 15 86139658 6D ACAAAAACAA AAACAG/------ AAACAGAAAC 3070 het 2710 hom 23 6 13 5 AAACAG 4 3 236351 CASAVA_Build 15 86139680 2D AAACAGAAAC AG/-- AAACAAACAA 1080 het 1080 ref 29 18 4 7 AG 1 0 236352 CASAVA_Build 15 86151385 1D GATGGAATTG T/- TTTTTTTTTT 2252 het 2252 ref 28 13 7 9 T 15 14 236353 CASAVA_Build 15 86153417 1I TCTGCTATAC -/T TTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 T 6 7 236354 CASAVA_Build 15 86156626 4I AAAAAAAGAA ----/AATT AATTAATTAA 3070 het 1831 hom 20 4 11 5 AATT 2 3 236355 CASAVA_Build 15 86162107 1I AACTATATGA -/C CTTAAATGTT 3070 hom 135 het 53 0 44 9 C 1 2 236356 CASAVA_Build 15 86168709 1D TAAATTCCTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 16 13 9 T 9 8 236357 CASAVA_Build 15 86204714 1D CAAGTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 13 22 12 T 15 14 236358 CASAVA_Build 15 86208796 1D AGGCTTTAAC A/- GTACTGTGAA 3070 het 3070 hom 48 19 28 1 A 1 0 236359 CASAVA_Build 15 86262233 2D TTTTTTTGTG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 10 8 236360 CASAVA_Build 15 86263353 1I AAAGCCTCAC -/A ACAGTGTAGA 3070 hom 97 het 42 0 37 5 A 1 2 236361 CASAVA_Build 15 86272399 2D ATTTTTTAGT AC/-- AGACAGGGTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 AC 1 0 236362 CASAVA_Build 15 86291493 1D GTTACGTAAC T/- TGCCCAAGAT 3070 het 3070 hom 44 20 18 7 T 2 1 236363 CASAVA_Build 15 86291589 1D ATCATGACAG C/- CCCCTTCAAC 3070 het 3070 hom 36 14 14 9 C 5 4 236364 CASAVA_Build 15 86301419 4D AATAATACTA GAGC/---- GAGCCTGCCT 3070 hom 138 het 49 0 46 4 GAGC 2 1 236365 CASAVA_Build 15 86301876 3I AGGAAACAAA ---/TGT TGTGCACTGT 3070 het 3070 hom 41 12 24 5 TGT 1 2 236366 CASAVA_Build 15 86305267 17D GTCCTCATTC AACACAGGTGAAGTTTA/----------------- AATCCTTCAC 3070 het 3070 ref 36 26 10 7 AACACAGGTGAAGTTTA 1 0 236367 CASAVA_Build 15 86321219 2I GCCTTGGCTG --/CT CTCAGACAAC 3070 het 3070 hom 48 19 27 2 CT 1 2 236368 CASAVA_Build 15 86324595 4I CATGTGTACA ----/TGTG TGTGTTTCCA 3070 het 3070 hom 60 26 29 5 TG 2 4 236369 CASAVA_Build 15 86333710 1D GACACAGGAA G/- GGGAACATCA 2845 het 944 hom 9 2 7 0 G 4 3 236370 CASAVA_Build 15 86346926 2D GAAGCTATGC AA/-- AAAAAAAAAA 2612 het 1484 hom 17 5 7 8 A 16 14 236371 CASAVA_Build 15 86365823 1D ACCATGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 15 13 T 11 10 236372 CASAVA_Build 15 86380658 1D ATCTACACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 10 7 A 14 13 236373 CASAVA_Build 15 86456772 2I CTGCCACTGC --/CA CAGTCTCTCT 3070 het 3070 ref 54 29 17 8 CA 1 2 236374 CASAVA_Build 15 86465332 1I ATGTATGTAT -/A TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 0 1 236375 CASAVA_Build 15 86475137 3D GACCAATGTT AAC/--- AACCTGGTTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 AAC 2 1 236376 CASAVA_Build 15 86490087 1D CAATCATGTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 60 28 25 7 T 8 7 236377 CASAVA_Build 15 86512973 1D CTCCTGGGGG A/- AGACTTGGGG 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 A 2 1 236378 CASAVA_Build 15 86533654 1D TTGCAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 13 25 9 T 12 11 236379 CASAVA_Build 15 86548633 1I CTGTCTATAA -/C AAAAATCACA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 C 0 1 236380 CASAVA_Build 15 86551965 5D TAAGCCAAGG CCCCT/----- CCTGGCTTCC 3070 het 3070 ref 40 16 16 14 CCCCT 1 0 236381 CASAVA_Build 15 86553122 13I TCCTTAGGGG -------------/ATCCTAGTGTGCA ATCAAGTTAG 3070 hom 86 het 32 0 27 5 ATCCTAGTGTGCA 0 1 236382 CASAVA_Build 15 86558321 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 89 het 33 0 29 5 A 10 9 236383 CASAVA_Build 15 86558897 1D AATAAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 872 het 477 hom 24 3 5 16 A 15 14 236384 CASAVA_Build 15 86562000 4I TGTAGCACAA ----/TTTT TTTTTTTTTT 1985 hom 37 het 25 0 13 12 T 12 16 236385 CASAVA_Build 15 86580902 1I GGAAGGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 292 hom 29 1 19 9 A 12 13 236386 CASAVA_Build 15 86672988 2I TGTCTCAAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 9 11 236387 CASAVA_Build 15 86687667 22D ATATGATGCC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 45 0 35 14 T 34 12 236388 CASAVA_Build 15 86689776 1I CAGGCTGCTA -/T TAACAAAACA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 1 2 236389 CASAVA_Build 15 86717425 3I TAGAGCTCAT ---/AGA AGAAGAAGGC 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 AGA 2 3 236390 CASAVA_Build 15 86717536 1D ACAAGCAAGA G/- AAAGGAAGAG 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 G 1 0 236391 CASAVA_Build 15 86717768 1D GGAAATTACC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 9 8 236392 CASAVA_Build 15 86766360 1D CGTCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2141 hom 29 9 10 10 A 19 18 236393 CASAVA_Build 15 86805778 4D AAATAAAGTT AAAC/---- AACAACATAT 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 AAAC 1 0 236394 CASAVA_Build 15 86832882 4I TCACTTCGCT ----/CAGA CAGAGGCAGA 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 CAGA 1 2 236395 CASAVA_Build 15 86845315 1D CTGACCTTGG T/- CCCTGTTGCT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 1 0 236396 CASAVA_Build 15 86850807 1D CAGAGAACCG T/- TTATGCTGAT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 3 2 236397 CASAVA_Build 15 86852943 2D GGGTGGAGAC AG/-- AGACTTCTTT 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 AG 2 1 236398 CASAVA_Build 15 86876537 4D GACTCTATCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 84 het 33 0 28 6 CAAA 4 3 236399 CASAVA_Build 15 86883330 2D TGGCAGACCG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 117 hom 28 2 22 4 CT 11 10 236400 CASAVA_Build 15 86889900 9I TCTTAAGACT ---------/CAATATAAC CCCCTTGTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 CAATATAAC 0 1 236401 CASAVA_Build 15 86912400 4D GAGGCAAGAT TTTC/---- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 TTTC 2 1 236402 CASAVA_Build 15 86913528 4D AATTGAAAAC AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 AATA 4 3 236403 CASAVA_Build 15 86923939 2D TCTATTTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1722 hom 17 6 9 4 A 13 11 236404 CASAVA_Build 15 86944425 3D GTTCTAATCT GAA/--- GAAGAATTGT 3070 het 3070 hom 32 12 19 2 GAA 3 2 236405 CASAVA_Build 15 86950782 6I GGGAAAGGAC ------/AGGACT TTGGCACTAG 3070 het 3070 ref 49 27 12 10 AGGACT 0 1 236406 CASAVA_Build 15 86951202 1I TTAAAATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 9 10 236407 CASAVA_Build 15 86960334 1I GCGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 9 10 236408 CASAVA_Build 15 86962075 1I GATCAGCTGG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 93 het 40 0 29 11 A 7 8 236409 CASAVA_Build 15 86962492 3I TTTTTTCTTC ---/CTA TTCAGCTTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CTA 0 1 236410 CASAVA_Build 15 86964830 1I GTATTTTTGG -/C AGAGATGGGG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 0 1 236411 CASAVA_Build 15 86965234 1I GTGTACTCAG -/T TAAGTCATTC 3070 hom 87 het 31 0 28 3 T 1 2 236412 CASAVA_Build 15 86965983 3D TTTAGTTGTT GTC/--- GTTGTTCCGT 3070 het 3070 ref 17 8 9 0 GTC 1 0 236413 CASAVA_Build 15 86969119 7I ACTCCGCCTC -------/AAAAAAA AAAAAATGCC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 6 13 236414 CASAVA_Build 15 86988790 1D AAAGAAAAGA C/- AAAAAAAAAA 1692 het 37 hom 21 1 14 6 C 1 0 236415 CASAVA_Build 15 87003090 1I CCAAGGACAG -/A AAAATCAACT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 4 5 236416 CASAVA_Build 15 87005904 1I TAGAGCCTGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 8 9 236417 CASAVA_Build 15 87010960 1D AGTGTCTATT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 8 7 236418 CASAVA_Build 15 87012427 4D AGAGGAATAT TTAA/---- TTATAGCTGT 2655 het 2655 ref 27 20 6 1 TTAA 1 0 236419 CASAVA_Build 15 87015767 3D GACAGGTAAT AAC/--- AAATGCTGGC 3070 het 3070 ref 30 21 8 1 AAC 1 0 236420 CASAVA_Build 15 87018804 1I TAGGAGTGTA -/T TTTTTCCCTA 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 5 6 236421 CASAVA_Build 15 87019417 1D TTTAATGTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 9 8 236422 CASAVA_Build 15 87021733 1I CTGCATTCAC -/T TCTGCTCTCA 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 T 1 2 236423 CASAVA_Build 15 87025230 1D CCCACCCTGA G/- GGGGATGGGG 3070 hom 64 het 24 0 21 4 G 5 4 236424 CASAVA_Build 15 87028637 1I CCCAAAGTGC -/T GGGATGACAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 0 1 236425 CASAVA_Build 15 87060408 1D CACATGTCAC T/- ACAGTTTTGA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 1 0 236426 CASAVA_Build 15 87063633 2D TCCTGCCTCG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 13 7 A 14 12 236427 CASAVA_Build 15 87068164 1I TTAAACTTGT -/A AAAAAAAAAA 2533 het 2497 hom 23 9 9 5 A 13 14 236428 CASAVA_Build 15 87081571 1D ATAAAAAAAA C/- AAAATGAAGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 C 1 0 236429 CASAVA_Build 15 87090014 1I TATAGTAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 A 10 11 236430 CASAVA_Build 15 87097696 1I GCTGTAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 8 9 236431 CASAVA_Build 15 87103766 2I TCTGTAGAAT --/GG GCACATGGCA 3070 het 2376 hom 27 6 14 7 G 1 3 236432 CASAVA_Build 15 87107724 3I CATCTGCAGT ---/AGA AGAAGTACTT 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 AGA 1 2 236433 CASAVA_Build 15 87109733 5I ATGGTAAGGC -----/ATGTT ATGTTGGTAA 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 ATGTT 1 2 236434 CASAVA_Build 15 87129411 1D CCCCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 562 het 562 ref 24 18 2 4 A 17 16 236435 CASAVA_Build 15 87142158 1D TCTCAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 11 10 236436 CASAVA_Build 15 87153130 1D TAAATGAAAA G/- GAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 G 2 1 236437 CASAVA_Build 15 87170013 1D CCTAAACCCC A/- GCCTGCTCCT 3070 het 3070 ref 46 22 18 10 A 1 0 236438 CASAVA_Build 15 87170712 1D AGGGGACCCC T/- GGAGACACAG 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 1 0 236439 CASAVA_Build 15 87185738 1D TAGAAAAAAA T/- ATGTGAGCCC 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 T 1 0 236440 CASAVA_Build 15 87187548 1D AGCAGGGGGA G/- GGGGGAGAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 G 6 5 236441 CASAVA_Build 15 87198081 1I CCCAGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 2662 het 2662 ref 32 11 10 11 T 14 15 236442 CASAVA_Build 15 87235120 3I TTTTTGCATC ---/TTT TTTTTTTTTT 1997 het 1997 ref 32 18 7 7 T 11 14 236443 CASAVA_Build 15 87245126 4D CTCCGCCCTG CTGT/---- CTGTCCATAG 3070 het 3070 ref 45 24 20 1 CTGT 2 1 236444 CASAVA_Build 15 87245481 4D22M4D30M2D CACACATTCA CACGCACGCATTCACACGCACGCATTCACACACACTCACATTCACACACATTCACACACTCA/----CACGCATTCACACGCACGCATT----CACACTCACATTCACACACATTCACACACT-- CACACACACA 804 het 804 ref 46 61 3 16 N/A 0 0 236445 CASAVA_Build 15 87255975 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2109 het 725 hom 17 7 7 4 A 13 12 236446 CASAVA_Build 15 87261260 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 163 het 163 ref 13 2 2 9 A 12 11 236447 CASAVA_Build 15 87261287 5I AGAAATACAA -----/GAGCT GTACGTTGAA 1805 het 1195 hom 17 4 5 8 GAGCT 0 1 236448 CASAVA_Build 15 87267560 1I TTGTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2620 het 2620 ref 31 12 10 9 A 11 12 236449 CASAVA_Build 15 87267622 1I ACCTATGTGT -/C CATGGTTAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 1 2 236450 CASAVA_Build 15 87277645 5D GGGGCCTTTT TTTTC/----- TTTTTCTTTT 877 het 463 hom 18 5 6 7 TTTTC 1 0 236451 CASAVA_Build 15 87282277 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTTGAAAC 3070 hom 129 het 46 0 43 3 CT 1 2 236452 CASAVA_Build 15 87282694 2D TTTTTTTTTT TC/-- GAGATGGAGT 2920 het 33 hom 12 1 9 2 TC 1 0 236453 CASAVA_Build 15 87288793 12D TGTAATCCCA GCTACTTGGGAG/------------ GCTGAGGCAG 3070 het 909 hom 13 3 8 4 GCTACTTGGGAG 1 0 236454 CASAVA_Build 15 87289043 2D GTTATTGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 13 11 236455 CASAVA_Build 15 87289188 6D CTTTCTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 24 18 236456 CASAVA_Build 15 87295909 1I ATCATGTAGC -/A AGGATGAGCT 2597 het 2597 ref 23 10 7 6 A 1 2 236457 CASAVA_Build 15 87297930 1D CCAAGTAGCT G/- GGATTACAGG 1863 het 1440 hom 9 3 4 2 G 3 2 236458 CASAVA_Build 15 87307236 1D AGTTAGATTG T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 T 8 7 236459 CASAVA_Build 15 87307340 22I CTGCAGGATA ----------------------/TCCTTTCACTCTGCTGATTGTT TCCTTTGCTG 3070 het 3070 ref 44 30 10 6 TCCTTTCACTCTGCTGATTGTT 0 1 236460 CASAVA_Build 15 87308488 6D GCTTTGGTTA GTATGG/------ TCATTTTAAC 3070 het 3070 ref 33 18 13 5 GTATGG 1 0 236461 CASAVA_Build 15 87312249 1D TAGTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 618 hom 26 3 20 3 T 12 11 236462 CASAVA_Build 15 87313385 1I TATGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 C 2 3 236463 CASAVA_Build 15 87313704 2I CAGGATTTTG --/CT CTGTCACCCA 2743 hom 18 het 10 0 7 3 CT 1 2 236464 CASAVA_Build 15 87317271 10D GGGAGGGGTG TAGGGAGAGT/---------- AGCCTTTGAC 3070 het 3014 hom 19 9 8 4 TAGGGAGAGT 1 0 236465 CASAVA_Build 15 87322996 1D GTCCTCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 7 6 T 12 11 236466 CASAVA_Build 15 87338430 2I GCCAACTTTA --/AG AGCTGTAACA 3070 het 3070 hom 40 10 21 9 AG 1 2 236467 CASAVA_Build 15 87350650 1I AATAGCAAAT -/C TTTTAATTAC 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 C 0 1 236468 CASAVA_Build 15 87369110 3I AAAAATTTAA ---/AAG AAGTAAAATG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 AAG 1 2 236469 CASAVA_Build 15 87370948 1I TAAAGATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 11 12 236470 CASAVA_Build 15 87372772 1D AGGATATACA T/- TTTTTGTGTG 3070 het 2780 hom 21 7 9 5 T 6 5 236471 CASAVA_Build 15 87373924 1I AAATTAAGGA -/T TTTTTTTTTT 1910 het 495 hom 23 2 7 14 T 15 16 236472 CASAVA_Build 15 87380363 3D CCCCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2948 het 1150 hom 35 14 9 13 A 21 18 236473 CASAVA_Build 15 87405546 1D CCAGCTACTC G/- GGAGGCTGAG 3070 het 464 hom 10 1 8 1 G 3 2 236474 CASAVA_Build 15 87417225 1I AAATAATTTT -/A ATAAGTATAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 1 2 236475 CASAVA_Build 15 87417772 1D CCTCAGGTGA T/- CCACCCTCCT 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 T 1 0 236476 CASAVA_Build 15 87422961 1I CAATGTAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 526 hom 29 3 16 11 T 11 12 236477 CASAVA_Build 15 87425237 1D ATTTCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 43 1 30 12 T 13 12 236478 CASAVA_Build 15 87477503 1I CGTATTCCAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 7 8 236479 CASAVA_Build 15 87479381 3I ACTTTTTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 1306 hom 10 het 26 0 10 16 TTC 0 1 236480 CASAVA_Build 15 87480792 1I CTCTCACTTG -/T CCCCAGTGCT 3070 het 3070 hom 51 19 29 3 T 0 1 236481 CASAVA_Build 15 87483100 2D TTTTTTTTTT TC/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 19 2 TC 1 0 236482 CASAVA_Build 15 87485208 1D TTAGTTTCAC T/- TTTTTTTTTT 2568 het 2568 ref 26 13 6 7 T 12 11 236483 CASAVA_Build 15 87487924 1D ATCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 22 1 15 6 A 13 12 236484 CASAVA_Build 15 87508710 4D CGAGAAAGCT GAGA/---- AAGACTGTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 5 GA 2 0 236485 CASAVA_Build 15 87514730 1I TACAAACACC -/A AAAATGCTGC 3070 hom 113 het 43 0 38 5 A 4 5 236486 CASAVA_Build 15 87516268 1I GCTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 A 0 1 236487 CASAVA_Build 15 87535952 1D AATCTCCACC T/- TCCCAGGTTC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 2 1 236488 CASAVA_Build 15 87536165 1I CCCAGCTGAG -/C ATGTCTGTTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 C 0 1 236489 CASAVA_Build 15 87536745 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1104 het 1104 ref 33 22 3 8 T 15 16 236490 CASAVA_Build 15 87543532 1D GAGCTGAAGT A/- AAAGATCACT 3070 hom 166 het 61 0 56 6 A 4 3 236491 CASAVA_Build 15 87550239 2D AAAAAAAAAA AG/-- GGGGGGGGGG 1400 hom 3 het 15 0 7 8 AG 1 0 236492 CASAVA_Build 15 87557512 1I TCAATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 2465 het 2465 ref 27 11 7 9 A 13 14 236493 CASAVA_Build 15 87558734 1I TTTGTAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2322 hom 17 5 11 1 T 10 11 236494 CASAVA_Build 15 87558862 6D ATTGCGTACA CAATTT/------ TGCGAGCACA 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 CAATTT 1 0 236495 CASAVA_Build 15 87584546 3I ACACGTCTCA ---/AAC AACAACAACG 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 AAC 3 4 236496 CASAVA_Build 15 87592759 1I TGCTCTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 9 10 236497 CASAVA_Build 15 87598150 5I AAGAGAAAAA -----/TAAAT TAAAATAAAA 2720 het 2720 ref 20 11 7 2 TAAAT 0 1 236498 CASAVA_Build 15 87604275 4I TATGTTTAAC ----/TGTT TGAGAAACCG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 TGTT 0 1 236499 CASAVA_Build 15 87606194 2I AATTTATGTC --/TG TGGAGGTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 TG 1 2 236500 CASAVA_Build 15 87612887 1D GGAGGATCTC T/- TTTTTTTTTT 1220 het 1220 ref 41 25 3 13 T 13 12 236501 CASAVA_Build 15 87617987 3D AGCCCCAGTT GGA/--- GGAAGGGACA 3070 het 3070 ref 52 29 16 8 GGA 2 1 236502 CASAVA_Build 15 87621551 4D AAAATAAAAC AAAA/---- AAAGAATCAT 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 A 7 3 236503 CASAVA_Build 15 87629968 1I GACTAAGTCC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 8 9 236504 CASAVA_Build 15 87630222 1I CCAAACTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2900 hom 33 15 11 7 T 11 12 236505 CASAVA_Build 15 87638876 4I GGACAAAAAA ----/AACC AAACCTAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 AACC 0 1 236506 CASAVA_Build 15 87658209 6D GATATATAAT CACACA/------ CACACACACA 3070 het 3070 ref 47 30 8 9 CA 15 12 236507 CASAVA_Build 15 87658415 2D AGGGGGAAAG AC/-- ACACACACAC 1025 het 1025 ref 52 38 3 12 AC 8 7 236508 CASAVA_Build 15 87658716 6I ATTACTGGTA ------/TACAAG TACAACTGCA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 TACAAG 0 1 236509 CASAVA_Build 15 87660937 1I GGAGCCTGCA -/C CCACCCCGAT 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 C 2 3 236510 CASAVA_Build 15 87661995 1I CTCAACATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 13 14 236511 CASAVA_Build 15 87665321 4I TGTCAATATG ----/CTAC CTGAGGGGCT 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 CTAC 0 1 236512 CASAVA_Build 15 87670773 1I TGTGCCAGAA -/C CCCAGACCAG 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 C 3 4 236513 CASAVA_Build 15 87674988 3D AAATGACAAA TGC/--- TGCTGCACAC 2567 het 2567 ref 25 10 10 6 TGC 3 2 236514 CASAVA_Build 15 87675387 1D AAGGGAAAAA G/- GGAGTATCTG 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 G 3 2 236515 CASAVA_Build 15 87726833 4I GTGCTGGAGT ----/GTGA GTATTTACAC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 GTGA 0 1 236516 CASAVA_Build 15 87741281 1D GGTTAATTGG T/- TTGTTGGAGT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 3 2 236517 CASAVA_Build 15 87768316 2D CTGTGCCAGA AG/-- AGAGAGGACA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 AG 4 3 236518 CASAVA_Build 15 87768813 42I CCTTTTCTGG ------------------------------------------/AATTAGAAAGGTTGCTTCTGCCACCCAGTCACTTCCCAAAGT TCGGTGGCAG 3005 het 3005 ref 27 14 9 4 AATTAGAAAGGTTGCTTCTGCCACCCAGTCACTTCCCAAAGT 0 1 236519 CASAVA_Build 15 87783540 1I TGGTAAACAC -/A CCCAGCCTTT 3070 hom 76 het 30 0 23 7 A 0 1 236520 CASAVA_Build 15 87795021 10D CCACAGAGAC AGAGAGAGAG/---------- AGAGAGAGAG 3070 hom 45 het 28 0 18 11 AG 14 9 236521 CASAVA_Build 15 87802777 1I GTAGCAATGG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 81 het 32 0 26 6 A 7 8 236522 CASAVA_Build 15 87805664 1I CTTCTCATCT -/C CCCATCCCTT 3070 hom 60 het 26 0 17 9 C 3 4 236523 CASAVA_Build 15 87806674 1D CTTCACTTTA C/- CAGGAGGAGC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 C 2 1 236524 CASAVA_Build 15 87810583 1I TAGAGAGGGA -/T TCTGAGGGGT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 1 2 236525 CASAVA_Build 15 87828324 1D TGGGGTGGGT G/- GGGGGTCTGT 3070 hom 69 het 32 0 22 10 G 6 5 236526 CASAVA_Build 15 87832525 2I GAGGCTACAC --/TG TTAAATATGG 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 TG 0 1 236527 CASAVA_Build 15 87833009 1D CTGGGAGAAT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 677 hom 25 5 12 8 G 11 10 236528 CASAVA_Build 15 87836319 1I AGGGTCAACA -/G AAGTTGACCC 3070 hom 102 het 36 0 32 4 G 0 1 236529 CASAVA_Build 15 87841811 2D CTTTAAAAAT AC/-- AGAGATAATT 3070 hom 75 het 33 0 26 8 AC 1 0 236530 CASAVA_Build 15 87860826 1D TTTTACTTAA T/- GAAGGTAACA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 1 0 236531 CASAVA_Build 15 87877065 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1059 het 25 hom 5 1 4 0 A 16 14 236532 CASAVA_Build 15 87890778 7D AATCTTCTCT TTCAAAA/------- TCTTTCCCAG 3070 het 3070 ref 30 15 12 5 TTCAAAA 1 0 236533 CASAVA_Build 15 87894732 1I AAAGACACAC -/A ATGCATATGT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 A 1 2 236534 CASAVA_Build 15 87895541 2D GAAGACATGC AG/-- AGAGGGAAGA 2688 het 2688 ref 27 16 6 6 AG 3 2 236535 CASAVA_Build 15 87896646 1D GAAAGAAAGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 8 7 236536 CASAVA_Build 15 87898411 3D TAGGATTCAG AGA/--- AGGTGTTCGA 3070 hom 79 het 33 0 22 11 AGA 1 0 236537 CASAVA_Build 15 87900066 6I TCCCCCAGAG ------/CCAGGT ACCACCAGGT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 CCAGGT 0 1 236538 CASAVA_Build 15 87905827 1I AGCAAGTGGT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 7 8 236539 CASAVA_Build 15 87909354 2D CATAACAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 AG 9 8 236540 CASAVA_Build 15 87909892 4I TATTTGATTG ----/CATT CATTTAGCTC 3070 het 2560 hom 19 7 11 1 CATT 1 2 236541 CASAVA_Build 15 87912269 1I GGAGAATTTT -/G AACATGTACA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 G 0 1 236542 CASAVA_Build 15 87913812 1I CTTAGGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 9 12 14 T 14 15 236543 CASAVA_Build 15 87921483 12D GACTAAATGA GTACATTCTTGC/------------ GTACATTCTT 3070 hom 78 het 32 0 26 9 GTACATTCTTGC 2 1 236544 CASAVA_Build 15 87922895 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 2891 het 2891 ref 24 9 8 7 C 0 1 236545 CASAVA_Build 15 87925462 1I CACATAGCAA -/T TTATAATTTA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 2 3 236546 CASAVA_Build 15 87928070 1I TAAAGGCATG -/A AGCCACCACA 3070 het 1620 hom 20 5 10 5 A 1 2 236547 CASAVA_Build 15 87949945 4D AAGAGTTATT AATC/---- AATATAAGTA 3070 het 3070 ref 23 15 7 2 AATC 1 0 236548 CASAVA_Build 15 87964889 2I GGATTTTCCC --/CT GAGTTGCTCT 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 CT 0 1 236549 CASAVA_Build 15 87974739 2I CTGCAGAGAC --/AG GGGCACGCGT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 AG 0 1 236550 CASAVA_Build 15 87975248 2D GTATCTAAAC AT/-- AGAAAACGCA 3070 het 3070 hom 56 23 25 11 AT 1 0 236551 CASAVA_Build 15 87984542 6D ATAAATTAAA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 hom 33 het 12 0 12 1 AAT 5 3 236552 CASAVA_Build 15 87985060 1D GTCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 1337 hom 22 het 14 0 6 8 A 17 16 236553 CASAVA_Build 15 87987317 2I AACCCCAAAC --/AT GTGGGGTTTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AT 0 1 236554 CASAVA_Build 15 88012179 1D TTTTATTGAG T/- TGGTAATCTA 3070 hom 62 het 28 0 23 6 T 2 1 236555 CASAVA_Build 15 88020288 1I AAGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 9 10 236556 CASAVA_Build 15 88031083 2D AGTGAGAAAC TG/-- TACAAAATCT 3070 het 3070 ref 48 24 15 11 TG 1 0 236557 CASAVA_Build 15 88033473 1D AGTTCTGCCA T/- TGTAGTACCT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 2 1 236558 CASAVA_Build 15 88037150 1I GCCTCATCTG -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 6 7 236559 CASAVA_Build 15 88039393 1I TAATTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 10 11 236560 CASAVA_Build 15 88043657 3D TGGGATGCCT TTC/--- TTCTTCTGGC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTC 3 2 236561 CASAVA_Build 15 88043858 3D CACACCTCAG TTC/--- TTCTCTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TTC 2 1 236562 CASAVA_Build 15 88046783 1I TTTTTTGGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 9 10 236563 CASAVA_Build 15 88056595 1I TAACTACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 800 hom 25 2 18 5 T 10 11 236564 CASAVA_Build 15 88057716 1D TTTTATTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 438 hom 30 1 21 8 T 10 9 236565 CASAVA_Build 15 88065193 1I TTCTTCTTTC -/A ACTCTTACGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 236566 CASAVA_Build 15 88066003 2I GGGACTACAA --/GT GTGTGTCACC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 GT 3 4 236567 CASAVA_Build 15 88067086 2D AGTTACGATT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 21 het 36 1 21 14 A 11 9 236568 CASAVA_Build 15 88068411 2I CCATCTCCAC --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 17 7 A 9 11 236569 CASAVA_Build 15 88075644 1I TGCAGAGTCT -/G GGGGGAACCG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 G 5 6 236570 CASAVA_Build 15 88097109 1I AACCCCGTCT -/C TATTAAAAAT 1683 het 1683 ref 16 8 5 3 C 0 1 236571 CASAVA_Build 15 88098653 1D CTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 1729 het 1729 ref 19 8 6 7 A 10 9 236572 CASAVA_Build 15 88099160 1I GGCCTCCAAG -/C ATCTCTGGAA 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 C 0 1 236573 CASAVA_Build 15 88111890 1D AAGGGGAAGG A/- AAGGAGAGGA 3070 het 1464 hom 23 4 10 10 A 3 2 236574 CASAVA_Build 15 88112585 2D GTCCAACCCC CT/-- GTTTTACAGA 3070 het 3070 ref 42 20 15 8 CT 1 0 236575 CASAVA_Build 15 88113796 1I CATGGCCCCA -/C TTGGTGATAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 C 0 1 236576 CASAVA_Build 15 88115392 2D CAACATGGTG AA/-- ACCCTGTCTC 2566 het 1426 hom 15 3 8 4 A 3 1 236577 CASAVA_Build 15 88116396 2I GCCCAGAGTT --/GA ATTCAACACC 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 GA 0 1 236578 CASAVA_Build 15 88117112 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1186 hom 19 5 9 5 T 11 10 236579 CASAVA_Build 15 88117429 2I AAGGATACAC --/AT GTTTATGTTA 3070 het 3070 ref 50 29 18 3 AT 0 1 236580 CASAVA_Build 15 88127224 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 531 hom 17 3 13 1 A 10 9 236581 CASAVA_Build 15 88129779 2I TGGGTCCCTA --/AC ACAGCCTTGA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 AC 1 2 236582 CASAVA_Build 15 88134377 2I AATTACATGA --/TG TCAGTGATTT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 TG 0 1 236583 CASAVA_Build 15 88138890 1I CCCCTCACCA -/C CCCCATGAGA 2164 het 2134 hom 17 6 7 4 C 4 5 236584 CASAVA_Build 15 88140720 1D ATAATTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2670 hom 29 9 15 5 T 11 10 236585 CASAVA_Build 15 88156911 1D GACACATGGT A/- AGGTGAAACT 3070 hom 84 het 43 0 34 10 A 2 1 236586 CASAVA_Build 15 88162028 2I TGTCTCTACC --/AA AAAAAAAAAA 2729 het 2144 hom 23 8 13 2 A 12 14 236587 CASAVA_Build 15 88162796 1D CTTTTGTTCT C/- TTGAATCTTG 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 C 1 0 236588 CASAVA_Build 15 88167477 1I CATTTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 2865 het 2358 hom 19 6 8 5 A 12 13 236589 CASAVA_Build 15 88171162 1I AGAGGCAGGA -/T TCAAACCAAG 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 T 1 2 236590 CASAVA_Build 15 88194066 1D CTTCTCCTAG C/- CCCCTACCCC 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 C 5 4 236591 CASAVA_Build 15 88195268 1D TAATCTCTAA C/- AATGTCTATT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 C 1 0 236592 CASAVA_Build 15 88195580 1I ATTCATCTTC -/T TTTTTTTTTT 1124 het 1124 ref 21 10 4 7 T 13 14 236593 CASAVA_Build 15 88196039 2D CGTGAAATCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 11 10 T 14 12 236594 CASAVA_Build 15 88201654 1I ACACTCTCAG -/T ACATCAGTAC 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 0 1 236595 CASAVA_Build 15 88203401 4I AGCCCAAGTG ----/TCCT TCCTTCCTTC 2272 het 2272 ref 32 14 7 11 TCCT 4 5 236596 CASAVA_Build 15 88216353 1D AGAGTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2591 het 2026 hom 25 10 8 7 A 13 12 236597 CASAVA_Build 15 88224910 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1735 het 12 hom 9 0 6 3 A 13 14 236598 CASAVA_Build 15 88225857 1D CTGGACAAGT G/- GTTCAATTAT 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 G 2 1 236599 CASAVA_Build 15 88233680 9D ACTCTCATAC AAAGTCAGA/--------- GAATAACTGG 3070 het 3070 ref 33 18 13 5 AAAGTCAGA 1 0 236600 CASAVA_Build 15 88245131 1D GATTTACTCA T/- TCATAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 T 2 1 236601 CASAVA_Build 15 88262715 1D TTTAGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 21 1 13 7 T 17 16 236602 CASAVA_Build 15 88266528 1D CAGTTGGTCC A/- AAGTGTATCA 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 A 3 2 236603 CASAVA_Build 15 88269092 1D TCTTAGAGAT G/- GGGTTTCAAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 4 3 236604 CASAVA_Build 15 88270877 13D AATAACTATT GCAAATAACTATC/------------- GCCAATAACT 3070 hom 45 het 16 0 16 3 GCAAATAACTATC 1 0 236605 CASAVA_Build 15 88275752 1D TCTCTTTAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 9 8 236606 CASAVA_Build 15 88284677 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 A 11 10 236607 CASAVA_Build 15 88362407 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1121 het 254 hom 32 5 4 23 T 16 14 236608 CASAVA_Build 15 88363124 4D CTAGTGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TTTG 4 3 236609 CASAVA_Build 15 88363237 1I CTTTTATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 27 het 15 0 10 5 T 9 10 236610 CASAVA_Build 15 88364723 2D ACTGCCTCCC CG/-- CCCCCGGGGA 2888 hom 30 het 13 0 10 3 CG 1 0 236611 CASAVA_Build 15 88365255 1I ACCCCCCCCC -/A CCTTAGCAGC 3070 het 866 hom 32 4 20 8 A 0 1 236612 CASAVA_Build 15 88365329 1I GAGTCAAACG -/T TTTCTCCAGT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 T 3 4 236613 CASAVA_Build 15 88369251 8D CGTGCACGGA TGTGTTGC/-------- TGTGGTTGGA 3070 hom 102 het 38 0 34 7 TGTGTTGC 1 0 236614 CASAVA_Build 15 88384196 1D GCAGTTCTCT A/- AGTCTTTTGG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 2 1 236615 CASAVA_Build 15 88425526 1D CAGGGCAGTG A/- AATAGCACAT 3070 hom 39 het 15 0 13 3 A 3 2 236616 CASAVA_Build 15 88435292 2D CCCATGAACG CA/-- CACACAGTGT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 CA 4 3 236617 CASAVA_Build 15 88435689 1D CCAGGACAAC G/- GGGGGGTCCT 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 G 7 6 236618 CASAVA_Build 15 88436654 4I TTTCTCTCTC ----/TCTT TCTTTCTTGG 2903 het 2903 ref 33 15 12 6 TCTT 2 3 236619 CASAVA_Build 15 88438141 3D CAGGCGTGAG CCA/--- CCACGCCTGG 3070 het 2784 hom 27 7 15 5 CCA 2 1 236620 CASAVA_Build 15 88441917 1D GAAGTGGGGA G/- GTATTGTTTC 3070 het 3070 hom 33 11 20 3 G 2 1 236621 CASAVA_Build 15 88442903 2D GCCTCAGCCC CT/-- GAGTAGCTGG 3070 het 2930 hom 22 8 10 5 CT 1 0 236622 CASAVA_Build 15 88447739 4I TGTGGGAGAA ----/AGTT AGAGTAATAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AGTT 0 1 236623 CASAVA_Build 15 88448001 4D TAAAAGATGG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 39 17 12 13 GTTT 4 3 236624 CASAVA_Build 15 88450552 8D CCAGGTTGGA GTGCAGTG/-------- GTGCAGTGGT 2414 het 2414 ref 34 17 6 12 GTGCAGTG 3 2 236625 CASAVA_Build 15 88451572 2D TTTGTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 1891 het 57 hom 19 2 7 11 T 18 16 236626 CASAVA_Build 15 88454574 3I TGTCTCAAAA ---/AAG AAGAAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 AAG 1 2 236627 CASAVA_Build 15 88455945 1I GGAAGACATC -/A AAAAAAAAAA 2426 het 1619 hom 9 4 5 0 A 11 12 236628 CASAVA_Build 15 88456293 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 32 13 10 10 AAAC 4 3 236629 CASAVA_Build 15 88457724 1D TTTAAATAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 T 10 9 236630 CASAVA_Build 15 88463725 4D AAAAAAAGAA AAAG/---- AAAGAGAGAG 3070 het 1712 hom 23 10 10 4 AAAG 2 1 236631 CASAVA_Build 15 88465848 1I TAATAGAGAC -/A GGGTTTTGCC 3070 het 1724 hom 13 4 8 1 A 0 1 236632 CASAVA_Build 15 88474964 20I AATAAATAAA --------------------/AAAATAAATAAGTAAGTAAG TAAATAAATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAAATAAATAAGTAAGTAAG 0 1 236633 CASAVA_Build 15 88476624 1D TTTTTTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 32 0 23 9 T 11 10 236634 CASAVA_Build 15 88480035 1I CTAATCACCC -/T TACCTTGCTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 1 2 236635 CASAVA_Build 15 88484583 1I TCTCAAAAAC -/A AAACAACAAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 3 4 236636 CASAVA_Build 15 88486944 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 26 1 15 11 A 15 14 236637 CASAVA_Build 15 88490155 1D CAGTGGCTCT C/- CACCTGTAAT 3070 hom 108 het 39 0 34 5 C 2 1 236638 CASAVA_Build 15 88539282 1I GCTCCATGGC -/T TTTTTTTTTT 1153 het 1153 ref 35 23 3 9 T 13 14 236639 CASAVA_Build 15 88551224 1D TTTGGCTCAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 90 het 39 0 30 9 A 8 7 236640 CASAVA_Build 15 88551570 2D GGTAGGAGAC AG/-- AAGCCATCAT 3070 hom 89 het 36 0 26 10 AG 1 0 236641 CASAVA_Build 15 88553625 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 7 8 236642 CASAVA_Build 15 88554069 2D GACCGGAGAT GA/-- GAGAATTGGG 3070 hom 143 het 51 0 46 6 GA 3 2 236643 CASAVA_Build 15 88556363 19D ATTCCCACAT CACTTCCTACTCAGAACCC/------------------- CACTTCCTAC 3070 hom 39 het 20 0 12 10 CACTTCCTACTCAGAACCC 2 1 236644 CASAVA_Build 15 88563956 1I GGGTGTGGAA -/G GGGGGGGCTC 3070 hom 43 het 22 0 13 9 G 7 8 236645 CASAVA_Build 15 88566098 1D TTCCCATCCC G/- CCAAGGAGTA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 G 1 0 236646 CASAVA_Build 15 88567112 3D ACCCCAGCAC AAG/--- AAGGAGTCAC 3070 hom 34 het 14 0 10 4 AAG 2 1 236647 CASAVA_Build 15 88571165 1I TGCACTGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 10 236648 CASAVA_Build 15 88574152 5D GTAGGGACAC AAGGG/----- AAGGGATGGG 3070 hom 88 het 34 0 28 8 AAGGG 2 1 236649 CASAVA_Build 15 88575452 4D ATCAAAGTCT AGAG/---- AGCAGACACA 3070 hom 93 het 37 0 29 8 AG 3 1 236650 CASAVA_Build 15 88590860 1I CCCCATCTCT -/A CTGAAAATAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 0 1 236651 CASAVA_Build 15 88675925 1D CACCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 1728 hom 13 4 9 0 C 3 2 236652 CASAVA_Build 15 88715427 4D AACTAATGAA AATC/---- AAAGGATTTA 2507 het 2507 ref 19 11 6 4 AATC 1 0 236653 CASAVA_Build 15 88718396 1D CCTTTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 38 3 25 10 A 15 14 236654 CASAVA_Build 15 88777816 22D GTTATTTGCT GAATGCCACCGATGTTTTCTAA/---------------------- GAATGCCACC 3070 hom 96 het 41 0 33 10 GAATGCCACCGATGTTTTCTAA 2 1 236655 CASAVA_Build 15 88806239 4I AAAAAAAGAA ----/AAAG AAAAAAAAAA 1981 hom 26 het 10 0 9 1 AAAG 0 1 236656 CASAVA_Build 15 88842593 1D TACTTCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 37 2 26 10 A 13 12 236657 CASAVA_Build 15 88845392 1I CTGCAGTGTT -/G CAGGGAGATA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 G 0 1 236658 CASAVA_Build 15 88847262 2D AAATACAAAC AT/-- GTACATAAGC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 1 0 236659 CASAVA_Build 15 88848218 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 12 0 9 4 A 11 10 236660 CASAVA_Build 15 88850858 1D TCTAACACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 37 2 25 10 T 14 13 236661 CASAVA_Build 15 88851321 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 11 10 236662 CASAVA_Build 15 88855376 1I ACACTCTGTT -/A TCTAGCTACT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 0 1 236663 CASAVA_Build 15 88858806 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTG 1724 hom 10 het 4 0 4 0 A 7 8 236664 CASAVA_Build 15 88864576 1I TCAGCCCCCG -/A AGTAGCTGGC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 1 2 236665 CASAVA_Build 15 88867707 2D TTATTAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 33 3 15 15 T 18 16 236666 CASAVA_Build 15 88868237 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 28 1 20 7 A 15 14 236667 CASAVA_Build 15 88872467 1I AACCAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 9 10 236668 CASAVA_Build 15 88879398 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 21 1 18 2 A 19 18 236669 CASAVA_Build 15 88879911 1I ATGATAAGAC -/A ATAGATATGT 3070 hom 144 het 56 0 49 7 A 1 2 236670 CASAVA_Build 15 88880727 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 26 1 16 9 A 15 17 236671 CASAVA_Build 15 88881477 3I ATAATATCTT ---/AAG AAGTTGACCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAG 1 2 236672 CASAVA_Build 15 88882570 2I ATGGAAAAAA --/CT CACCATGTCG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 CT 0 1 236673 CASAVA_Build 15 88883660 1I ATGTATATTA -/G TAAACTCTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 0 1 236674 CASAVA_Build 15 88892402 1D TAGGATTACA G/- GTGTGAGCCA 2113 het 2113 ref 23 9 7 7 G 2 1 236675 CASAVA_Build 15 88895578 2I TTTTTCTGTG --/CT CTTCTTACTG 3070 hom 135 het 48 0 45 3 CT 1 2 236676 CASAVA_Build 15 88896788 1D CTTTCGTACT C/- CCTAGGATGA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 C 3 2 236677 CASAVA_Build 15 88912865 1I GGGATTACAG -/A ACCTATTGAC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 1 2 236678 CASAVA_Build 15 88913229 1I ATAACGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 32 0 24 8 T 15 16 236679 CASAVA_Build 15 88913553 3D AAACAAAACC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 16 0 9 7 T 17 14 236680 CASAVA_Build 15 88917790 1D AGGGTTCCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 T 10 9 236681 CASAVA_Build 15 88921091 14D GAGGTCTGTG GGAGTTGAGGAAGT/-------------- GGAGTTGAGG 3070 het 3070 ref 35 17 16 5 GGAGTTGAGGAAGT 1 0 236682 CASAVA_Build 15 88929698 1D TTCCTTAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 11 10 236683 CASAVA_Build 15 88932843 1I78M1I GCCAGTCAAC -TTTTTTTAGCCATTCATCCCAGGCTGCAGCTGGGTGACGTCAGAGGTGACTTGGAATGGCAACAGATGGTGCCTGAGC-/TTTTTTTTAGCCATTCATCCCAGGCTGCAGCTGGGTGACGTCAGAGGTGACTTGGAATGGCAACAGATGGTGCCTGAGCT TGTAGGACCG 3070 het 631 hom 43 3 35 30 N/A 0 0 236684 CASAVA_Build 15 88944660 3I AGCCTCCATC ---/CTT CTTCCCAGAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 CTT 1 2 236685 CASAVA_Build 15 88949847 2D TTGAATCTGT AA/-- AAAGAGGCTG 3070 hom 105 het 37 0 36 3 A 5 3 236686 CASAVA_Build 15 88951267 16D ACCTAGTGCA GCCACAGGCTAAACTG/---------------- GCCACAGCCA 3070 hom 77 het 31 0 26 6 GCCACAGGCTAAACTG 1 0 236687 CASAVA_Build 15 88965400 6D GGAAATTTGG AAACAA/------ AAACAAAAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAACAA 4 3 236688 CASAVA_Build 15 88978354 1I CAACAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 33 1 27 5 T 12 13 236689 CASAVA_Build 15 88989640 1I AATCTCACCG -/C CTCCTGCACG 3070 hom 75 het 29 0 24 5 C 1 2 236690 CASAVA_Build 15 89079830 1I TGGACTCTTT -/A ATAAATAGTG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 1 2 236691 CASAVA_Build 15 89088994 1I CATTAAAAAG -/A ATCAGGGAGG 2406 hom 12 het 11 0 6 5 A 1 2 236692 CASAVA_Build 15 89113900 4I TCACCTGTGG ----/CGCT CGCTTTAACG 1574 het 1574 ref 20 12 5 3 CGCT 1 2 236693 CASAVA_Build 15 89133277 2D TACAATGGAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 17 0 11 6 AT 10 9 236694 CASAVA_Build 15 89145383 18D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAGTTGTA/------------------ AAAAAAAAAA 2972 het 2125 hom 16 8 7 7 AAAAAAAAAAAAGTTGTA 1 0 236695 CASAVA_Build 15 89145681 1I ACATCTCACA -/T TGTGGGAAGG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 1 2 236696 CASAVA_Build 15 89147635 1I TGTCTGTGCC -/A GGGGTTTGTG 3070 het 3070 ref 49 20 17 12 A 0 1 236697 CASAVA_Build 15 89149492 9D AATGGTACCC TATGTATGT/--------- TATATATGGT 2150 het 2150 ref 18 12 6 2 TATGTATGT 1 0 236698 CASAVA_Build 15 89154308 1I ACCTAGTCGC -/T TTTTTTTTTT 2644 het 2644 ref 41 11 10 20 T 13 14 236699 CASAVA_Build 15 89158794 10D CATCTGCAGC CTTCCTGGGG/---------- CTTCCTGGGG 3070 het 3070 ref 29 15 10 8 CTTCCTGGGG 2 1 236700 CASAVA_Build 15 89159276 3I AGGTTGAGAG ---/GAA GAAGGTCATT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 GAA 1 2 236701 CASAVA_Build 15 89160535 3D ATTGTGGTGG CCT/--- CGTTTTTCAG 2702 het 2702 ref 35 15 10 10 CCT 1 0 236702 CASAVA_Build 15 89162528 1D CACCTGTTCG A/- AACTCCCAGC 3070 het 3070 ref 42 19 17 7 A 3 2 236703 CASAVA_Build 15 89179131 2I CTTTGCAGTC --/CT CTCAGCATGT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 CT 1 2 236704 CASAVA_Build 15 89189270 2D CCTGGCCAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 26 0 14 12 T 16 14 236705 CASAVA_Build 15 89194011 1I ACCTTATAGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 8 9 236706 CASAVA_Build 15 89207991 1I TGAATATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2933 hom 27 8 16 3 A 10 11 236707 CASAVA_Build 15 89232812 10I TCAGGTCCTG ----------/GGGCTGTTTT GAAGGTGAAG 3070 hom 42 het 23 0 14 9 GGGCTGTTTT 0 1 236708 CASAVA_Build 15 89234956 1D CTTCAGGAGC G/- GGTTGGGGGC 3070 hom 46 het 21 0 12 9 G 3 2 236709 CASAVA_Build 15 89248771 1I AGGAAGGAAG -/A AAAAAATGTC 3070 hom 31 het 14 0 11 3 A 6 7 236710 CASAVA_Build 15 89267200 1I AAAAAACAAA -/C AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 C 0 1 236711 CASAVA_Build 15 89272684 2D GATGCTGTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 29 9 A 13 11 236712 CASAVA_Build 15 89290159 1I CAGGCATGAG -/C GACCGCGTCC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 C 0 1 236713 CASAVA_Build 15 89292211 2I GGCCTCCTCC --/CT GTCCTGCTCT 2311 het 2311 ref 20 10 7 3 CT 0 1 236714 CASAVA_Build 15 89295245 1D TATATTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 11 10 236715 CASAVA_Build 15 89303529 1I AGCACTTCAT -/A AAAGCAGCTA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 3 4 236716 CASAVA_Build 15 89309350 1I TGTCTGTACC -/A AAAAATACAA 3070 het 2965 hom 22 7 14 1 A 5 6 236717 CASAVA_Build 15 89309584 1D GAGTGAGAAA G/- GGGTGGGAAG 2942 het 2942 ref 21 13 7 3 G 4 3 236718 CASAVA_Build 15 89310145 1D AGTGAGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 A 11 10 236719 CASAVA_Build 15 89314837 3D AATGACTATG GGA/--- GGAGGCAGTC 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 GGA 2 1 236720 CASAVA_Build 15 89319805 2I GCCCACAGGA --/CT CTCTCTCTCA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 CT 4 5 236721 CASAVA_Build 15 89321365 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1381 hom 25 9 11 9 C 0 1 236722 CASAVA_Build 15 89329799 1D TTTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2170 het 1568 hom 11 5 5 1 T 12 11 236723 CASAVA_Build 15 89331128 1I AAGAGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2087 hom 21 6 11 4 A 10 11 236724 CASAVA_Build 15 89336943 1D CAAGTCTGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 19 11 7 T 10 9 236725 CASAVA_Build 15 89338156 1D CCACAAAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2843 hom 20 7 11 2 A 9 8 236726 CASAVA_Build 15 89347092 1I TGAAATGTTT -/A AATTCTCAGC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 2 3 236727 CASAVA_Build 15 89358679 2D TATGAGAGAG AA/-- AGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 A 3 1 236728 CASAVA_Build 15 89364044 1I TGTAATATAA -/T TTTTTTTTTT 3010 het 3010 ref 29 14 7 8 T 13 14 236729 CASAVA_Build 15 89364774 1I TCTTCAGACA -/T TTGTTGCAAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 2 3 236730 CASAVA_Build 15 89370060 1I ATCACATGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 9 10 236731 CASAVA_Build 15 89371149 1D ATTTTTTTTT C/- CATTTCCGGA 3070 het 419 hom 16 1 14 2 C 2 1 236732 CASAVA_Build 15 89371670 1D TTATAGAGAT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 8 7 236733 CASAVA_Build 15 89376853 1D TCTATTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 10 9 236734 CASAVA_Build 15 89390112 8D AGGTGCTTTA TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 2785 het 2785 ref 27 14 7 8 TTTG 5 3 236735 CASAVA_Build 15 89392088 3D GTCCTCCCTA CTC/--- CTCCTCCTTC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 CTC 3 2 236736 CASAVA_Build 15 89395589 1D GGGAGCATAG A/- GTCTTGTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 A 1 0 236737 CASAVA_Build 15 89403497 1D TTGATAAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 10 9 236738 CASAVA_Build 15 89404168 1I TTATGAGCTG -/A AACTTATGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 3 236739 CASAVA_Build 15 89405082 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 2439 het 2037 hom 16 8 6 3 A 13 12 236740 CASAVA_Build 15 89407530 1D TCCCCCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 11 10 236741 CASAVA_Build 15 89408699 5D CGATGGAGAG GGGAA/----- GGGAACTGGA 3070 het 3070 ref 44 26 17 5 GGGAA 2 1 236742 CASAVA_Build 15 89411820 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTGTATTT 2853 het 2853 ref 22 13 9 0 T 4 5 236743 CASAVA_Build 15 89412993 1I GTTTGCCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 9 10 236744 CASAVA_Build 15 89417777 1I TTTGTTTTTG -/T GTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 T 0 1 236745 CASAVA_Build 15 89419940 1I TCTCTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 A 10 11 236746 CASAVA_Build 15 89425788 1I TTATAGGCAT -/G GGCCACTGTG 3070 hom 65 het 24 0 22 2 G 2 3 236747 CASAVA_Build 15 89429487 1D ATATTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1616 hom 40 6 16 18 T 13 12 236748 CASAVA_Build 15 89432988 1D ATTTTCTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 T 9 8 236749 CASAVA_Build 15 89439135 1D CAAATGAAAG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 7 6 236750 CASAVA_Build 15 89465366 1I ACTCGTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 10 236751 CASAVA_Build 15 89475886 1D AAAAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 11 10 236752 CASAVA_Build 15 89488650 1I ACATTCATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 9 10 236753 CASAVA_Build 15 89489131 1D AAGAGAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 35 2 25 10 T 15 14 236754 CASAVA_Build 15 89498039 6D AATTATGTGA GGGCAG/------ GGGCAGGGGC 3070 hom 78 het 36 0 22 15 GGGCAG 4 3 236755 CASAVA_Build 15 89514523 1I ATTTGTTGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 9 236756 CASAVA_Build 15 89517182 1I TTTCTGGTGG -/A AAAAGTCCAG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 4 5 236757 CASAVA_Build 15 89518717 1D GTTTAGGGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 9 236758 CASAVA_Build 15 89519937 2D ATGTAAATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 7 het 21 1 15 6 AT 8 7 236759 CASAVA_Build 15 89565125 2D GAGACAGGGG TC/-- TCTCTCTTTC 3070 het 1021 hom 13 3 7 4 TC 4 3 236760 CASAVA_Build 15 89577926 1I ATCCTCTCTG -/C CCCCCATTCA 3070 het 3070 hom 48 19 28 1 C 5 6 236761 CASAVA_Build 15 89579685 1I TAGAAATAAG -/T TTTTCTACAG 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 T 4 5 236762 CASAVA_Build 15 89586252 1D AAACCTGCTC T/- TGTCTAGATC 3070 het 3070 hom 55 16 32 8 T 2 1 236763 CASAVA_Build 15 89605497 2I ACTGTGTCTG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 9 11 236764 CASAVA_Build 15 89621150 1I CTGCCTCCCA -/G GTTCAAGTGA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 1 2 236765 CASAVA_Build 15 89638744 2D AGTACTAACA TT/-- TATTGCTCTG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 T 3 1 236766 CASAVA_Build 15 89681182 2D GGTGCTTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TG 8 7 236767 CASAVA_Build 15 89682217 1D TGCCTGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2214 hom 23 10 9 4 T 11 10 236768 CASAVA_Build 15 89685978 3D ACTAAATGAT AAG/--- GAGAAACATT 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 AAG 1 0 236769 CASAVA_Build 15 89707459 1I AAGTACACTT -/A AAAAAGACAC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 A 5 6 236770 CASAVA_Build 15 89715183 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 28 2 20 6 T 15 14 236771 CASAVA_Build 15 89718515 1D AGTTTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 47 0 38 9 A 11 10 236772 CASAVA_Build 15 89721075 3D TGTCCCCAAA TAT/--- TATTATTCTT 3070 het 3070 ref 38 21 14 5 TAT 3 2 236773 CASAVA_Build 15 89723285 2D TTGCTCATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 2454 hom 16 5 10 1 TA 6 5 236774 CASAVA_Build 15 89725484 4I CTGGCTCTTT ----/TCTC TCTCTCTGCA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 TC 3 5 236775 CASAVA_Build 15 89737531 1D CCTTGTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 11 10 236776 CASAVA_Build 15 89738284 1D GCTACTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 T 15 14 236777 CASAVA_Build 15 89740485 2D GTCTGTTCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2073 hom 30 9 17 4 T 19 17 236778 CASAVA_Build 15 89750179 2D GGGGTTTCAC TA/-- TGTTGGCCAG 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 TA 1 0 236779 CASAVA_Build 15 89751084 2D ACTCCTTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1889 het 186 hom 16 3 7 6 A 20 18 236780 CASAVA_Build 15 89760200 13D TTTTTTTCCA TTTTTGTGTTCTC/------------- TTTAATTTCT 3070 het 3070 ref 19 11 9 3 TTTTTGTGTTCTC 1 0 236781 CASAVA_Build 15 89762333 1I CTTGTGCTCC -/T TTTTGGTTTC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 4 5 236782 CASAVA_Build 15 89763679 1I TCTGACTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 10 11 236783 CASAVA_Build 15 89766599 4D CTTTGATAAA TTGT/---- TTGTATCTCT 3070 het 3070 hom 48 18 26 7 TTGT 2 1 236784 CASAVA_Build 15 89767499 1D TCCATATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 18 22 14 T 12 11 236785 CASAVA_Build 15 89784680 1I AGGTATAGCT -/A AAAAAAAAAA 3032 het 3032 ref 32 13 7 12 A 11 12 236786 CASAVA_Build 15 89808015 4D GTATACATGT TTGA/---- TTATTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 TTGA 1 0 236787 CASAVA_Build 15 89815520 4D TCTTAGAGAC AGAA/---- AGTAGAATGA 3070 het 3070 ref 42 22 16 7 AGAA 1 0 236788 CASAVA_Build 15 89827423 1I AGCATGGTTA -/T TTTTTCATGA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 5 6 236789 CASAVA_Build 15 89829084 11I TGTCTGATTT -----------/ACATAGGGCTC ACAGATTGGT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 ACATAGGGCTC 0 1 236790 CASAVA_Build 15 89829235 1D GGAGCCCCCA T/- TTTGAAAATG 3070 het 2645 hom 27 9 15 3 T 4 3 236791 CASAVA_Build 15 89841154 1I TCCATTATCT -/C CCCCAGAAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 C 4 5 236792 CASAVA_Build 15 89842667 1D ACATGTCAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 36 0 29 8 T 10 9 236793 CASAVA_Build 15 89856054 2D ACAATACAAC AT/-- ATAATTGCAG 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 AT 2 1 236794 CASAVA_Build 15 89862013 8D AATCTCTCTG TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 TC 11 7 236795 CASAVA_Build 15 89862071 2I TCTCTCTGTC --/TA TATATATATA 2390 het 2390 ref 24 12 9 3 TA 7 8 236796 CASAVA_Build 15 89863936 5I ATAGAAAAAG -----/TACTT TATAAAATTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TACTT 0 1 236797 CASAVA_Build 15 89864584 1D TATCAGAAAT G/- TTAGTCTTTC 3070 het 3070 ref 50 23 22 6 G 1 0 236798 CASAVA_Build 15 89887541 1D TGTTTGTTTG T/- TTGTTTTTGT 2478 het 2478 ref 43 22 7 14 T 3 2 236799 CASAVA_Build 15 89889266 1D TCCCGTAGCT C/- CCAGAAATGA 2893 het 2893 ref 28 15 9 4 C 3 2 236800 CASAVA_Build 15 89893121 2D AGCAACTGTA GT/-- GTAATGGTGG 3070 het 3070 ref 58 29 23 7 GT 2 1 236801 CASAVA_Build 15 89905007 6D TATACACAGA TGTACT/------ TAGACAGACT 3070 het 3070 ref 39 23 14 5 TGTACT 1 0 236802 CASAVA_Build 15 89917736 4I AGAGAGAGAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 AGAA 3 4 236803 CASAVA_Build 15 89918101 3D CGGAGAATGT CAC/--- CACAATACTC 3070 het 3070 ref 50 22 23 7 CAC 2 1 236804 CASAVA_Build 15 89933692 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 10 15 A 13 12 236805 CASAVA_Build 15 89933904 1D TTTGACTCAG A/- AATTTCACTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 3 2 236806 CASAVA_Build 15 89940178 1I AAGTGGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 A 11 12 236807 CASAVA_Build 15 89946952 4D GTCAGAGTTT GAGG/---- GAGGGAGAGA 3070 het 3070 hom 45 17 19 11 GAGG 2 1 236808 CASAVA_Build 15 89953531 4D CCATGAAGAT AAAG/---- AAAGAAACCC 3070 het 3070 ref 53 23 23 12 AAAG 2 1 236809 CASAVA_Build 15 89955665 2I AGTCCCAGAC --/AT GTGGGAGGAG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 AT 0 1 236810 CASAVA_Build 15 89962281 1I GTGGTTTTAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 8 9 236811 CASAVA_Build 15 89974380 1I GTATAGGCAA -/G TATATAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 G 0 1 236812 CASAVA_Build 15 89985415 1D CCAAACAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 18 7 A 11 10 236813 CASAVA_Build 15 89994625 1I TCTTCCACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 9 10 236814 CASAVA_Build 15 90009514 2I GCAGCAGCAC --/CA CCCCCCACCG 3070 het 2388 hom 31 10 17 4 CA 0 1 236815 CASAVA_Build 15 90027160 8D ATCTTGCAGT CCTAGAGA/-------- CTAGAAGTTC 3070 het 3070 ref 41 24 14 5 CCTAGAGA 1 0 236816 CASAVA_Build 15 90038143 2D TGTTTGAAAT TC/-- TCTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TC 2 1 236817 CASAVA_Build 15 90057333 1I TATTTGTGGA -/T TTTTTGATTG 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 5 6 236818 CASAVA_Build 15 90079420 1D TTGTAGATTC T/- CCCTTTCCCA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 T 1 0 236819 CASAVA_Build 15 90103206 1D CCTCCACCGT G/- GGGGGGTCCC 3070 het 3070 hom 35 13 16 7 G 7 6 236820 CASAVA_Build 15 90105487 1D GTGAGGAGCA G/- GGGGTTGCTA 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 G 5 4 236821 CASAVA_Build 15 90110627 6D TCATCCACAA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 2789 hom 27 11 15 3 AC 12 9 236822 CASAVA_Build 15 90115708 1I TCCAAGCCTG -/T TTTTTTTTTT 2345 het 2345 ref 29 11 7 11 T 14 15 236823 CASAVA_Build 15 90117195 6I TCTACCTAGT ------/AAGAAC AAGAACACAT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 AAGAAC 1 2 236824 CASAVA_Build 15 90117346 1I CCAGCAGGCG -/A AAATTAACAG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 3 4 236825 CASAVA_Build 15 90132145 1D CTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1777 het 1777 ref 30 14 6 11 T 17 16 236826 CASAVA_Build 15 90212697 1D TAGATAACAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 9 8 236827 CASAVA_Build 15 90213757 1I GTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 21 3 15 3 A 13 14 236828 CASAVA_Build 15 90214949 1D CTTGAATCCC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 8 7 236829 CASAVA_Build 15 90215107 1D ATCTACAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 56 20 26 10 T 10 9 236830 CASAVA_Build 15 90224864 1D TTTGAGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 17 22 12 T 11 10 236831 CASAVA_Build 15 90225809 4D CTGTTGACCT AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AAAG 4 3 236832 CASAVA_Build 15 90227141 1D AGGTATCACC T/- TGGTGTCCCA 3070 hom 126 het 51 0 43 9 T 2 1 236833 CASAVA_Build 15 90250090 1I CTTATCGTTA -/C TTTTTAGGGC 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 C 0 1 236834 CASAVA_Build 15 90257828 1I GGCTATAGCA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 105 het 45 0 35 10 T 7 8 236835 CASAVA_Build 15 90262324 4I GAACCCTCTT ----/CTGG CTGGAAGTGT 3070 hom 104 het 41 0 33 8 CTGG 1 2 236836 CASAVA_Build 15 90275041 2D AAAACAACCC CT/-- GAGTTAGTTT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 CT 1 0 236837 CASAVA_Build 15 90288472 1D ATTACCATAT C/- CCTGTGCAAG 3070 hom 148 het 52 0 50 3 C 3 2 236838 CASAVA_Build 15 90289576 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 485 hom 24 2 16 6 A 16 17 236839 CASAVA_Build 15 90299590 2D TTTTTGAAAC AG/-- AGTCTCGCTC 3070 het 1476 hom 25 6 15 4 AG 2 1 236840 CASAVA_Build 15 90308531 1I TCATCTGTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 10 236841 CASAVA_Build 15 90313545 1I ATATATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 37 1 27 9 T 13 14 236842 CASAVA_Build 15 90316039 18D TTTCCCCTAG CAGCAGTGGCTCCGTATT/------------------ CAGCAGTGGC 3070 hom 78 het 37 0 24 18 CAGCAGTGGCTCCGTATT 2 1 236843 CASAVA_Build 15 90319513 1I GAATTTGAAT -/G CCTTTGCCTG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 0 1 236844 CASAVA_Build 15 90324659 1D CTGAGAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 35 1 24 11 A 12 11 236845 CASAVA_Build 15 90330705 1D CTAGTAGCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 9 8 236846 CASAVA_Build 15 90332777 1I AAAAAGGAAA -/T CGTGCAGATC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 0 1 236847 CASAVA_Build 15 90334885 1D CAGCCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 45 4 31 10 A 13 12 236848 CASAVA_Build 15 90336352 1I TCCATACTTC -/A AAGGTTAGCT 3070 hom 113 het 44 0 38 6 A 2 3 236849 CASAVA_Build 15 90348299 1D CACTGGTTAT A/- GGGGCAGATT 3070 hom 138 het 53 0 43 10 A 1 0 236850 CASAVA_Build 15 90363315 2D AGGGGCTGAT GC/-- GCGGTTCCTA 3070 hom 96 het 36 0 29 9 GC 2 1 236851 CASAVA_Build 15 90373902 1D CCTCCTTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 494 hom 36 2 26 8 T 10 9 236852 CASAVA_Build 15 90375219 15I TGTAGCTGCA ---------------/GCAGCCAACCATCTG GCATCTTGTC 1466 hom 7 het 4 0 3 1 GCAGCCAACCATCTG 0 1 236853 CASAVA_Build 15 90376879 1D AGAAAGCCCT G/- GGTGCGGTGA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 3 2 236854 CASAVA_Build 15 90380598 1I GTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 2012 het 933 hom 19 6 6 7 C 0 1 236855 CASAVA_Build 15 90397057 1D TACATTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 21 8 10 4 T 10 9 236856 CASAVA_Build 15 90397917 2D TTTGTTTTTT TG/-- TTTGTTTGTT 1789 het 1789 ref 42 18 11 13 TG 1 0 236857 CASAVA_Build 15 90400592 1D TTTCTGCTCC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 A 9 8 236858 CASAVA_Build 15 90406052 1I TATGGGTTTG -/T TTTGTGGATG 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 3 4 236859 CASAVA_Build 15 90408667 1D TGTGCAGAAG C/- TTTTTAGCTT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 C 1 0 236860 CASAVA_Build 15 90414877 8D CACTCTAGAC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 1745 hom 28 8 10 12 T 19 11 236861 CASAVA_Build 15 90419015 1D AGCAGGGCGG T/- GGGGGGTGGC 1643 het 1643 ref 31 18 6 8 T 1 0 236862 CASAVA_Build 15 90420608 1I TTCTGCTGAT -/G GCAGCCTATG 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 G 1 2 236863 CASAVA_Build 15 90424625 1D ATACATGGAG T/- TTTTTTTTTT 1480 het 1480 ref 30 15 4 11 T 15 14 236864 CASAVA_Build 15 90431751 1D TTATCTATTA T/- TTTTTTTTTT 2886 het 606 hom 27 5 11 11 T 19 18 236865 CASAVA_Build 15 90439337 1D CCTGCCTCTG T/- AGCTGGGGCT 2659 het 2659 ref 31 13 7 12 T 1 0 236866 CASAVA_Build 15 90443684 2D AATGAACTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 32 2 15 15 A 12 10 236867 CASAVA_Build 15 90444300 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 27 0 21 6 A 12 11 236868 CASAVA_Build 15 90444413 4D CTGGCTTCAT GACA/---- GATATTTCAT 3070 het 3070 ref 48 20 20 13 GACA 1 0 236869 CASAVA_Build 15 90446815 1D TGGGATTCGG C/- CCCCAAGTAC 3070 hom 157 het 58 0 52 6 C 5 4 236870 CASAVA_Build 15 90454954 1D CATGAAGGCA G/- GGACTGCAGT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 G 3 2 236871 CASAVA_Build 15 90455109 6I GACCAATCCA ------/TGGACG TAGACTTGGC 3070 hom 116 het 43 0 35 8 TGGACG 0 1 236872 CASAVA_Build 15 90459304 2I TCAAAGGAAA --/AT AGAAAGTCAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AT 0 1 236873 CASAVA_Build 15 90471606 1I ATATCCTACA -/G TCACACAGCC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 0 1 236874 CASAVA_Build 15 90476854 1I AATTGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 29 1 24 4 A 13 14 236875 CASAVA_Build 15 90489658 2I ATGCTTAGTT --/TC TCATCTACGT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 TC 1 2 236876 CASAVA_Build 15 90490197 1I CAGAAAACCC -/A TATCTCTGTG 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 0 1 236877 CASAVA_Build 15 90501179 2D ATTTCAACTA AG/-- AGAGTAAATT 3070 het 3070 hom 42 20 21 2 AG 3 2 236878 CASAVA_Build 15 90507789 1D ATAAAAAAAA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 2829 hom 29 9 13 7 T 2 1 236879 CASAVA_Build 15 90508841 2I TTAAGAAGTC --/TG TGTAGCATCT 3070 het 3070 hom 54 21 26 7 TG 1 2 236880 CASAVA_Build 15 90509202 4I AACTCAAAGG ----/TTGA TTGATTGGTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 TTGA 1 2 236881 CASAVA_Build 15 90517631 1I CCATAACTGA -/C CCACTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 C 2 3 236882 CASAVA_Build 15 90519214 1D TTGATATAAG T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 T 3 2 236883 CASAVA_Build 15 90553729 1I TTCAAGCTGT -/A AAGGCGAGGG 2334 het 2334 ref 29 18 6 5 A 2 3 236884 CASAVA_Build 15 90555302 2D TCATGGGGGC AT/-- AGTTTTCTCC 2819 het 2819 ref 20 10 8 3 AT 1 0 236885 CASAVA_Build 15 90556343 9D GGGAGTCCCA AGATCAGCC/--------- AGATCAGCCA 3070 het 3070 ref 38 24 14 1 AGATCAGCC 2 1 236886 CASAVA_Build 15 90586549 1D AAGTTAACTG T/- TTTTTTTTTT 2612 het 2612 ref 63 48 7 8 T 12 11 236887 CASAVA_Build 15 90590712 3I CCAATAAGGA ---/AGG AAAGCACAGC 3070 hom 141 het 52 0 47 5 AGG 0 1 236888 CASAVA_Build 15 90631138 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 2931 het 2119 hom 18 6 7 5 A 11 10 236889 CASAVA_Build 15 90640576 1I CTCTTTCACC -/T TCGTTCCTCT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 1 2 236890 CASAVA_Build 15 90652904 1I TTTTTTTTTT -/A TTTCTTTATT 2522 het 1956 hom 21 7 9 5 A 0 1 236891 CASAVA_Build 15 90662225 1I AAAATACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 10 11 236892 CASAVA_Build 15 90674175 7I GGATACAGCT -------/AGGAGGC AGGAGGCACC 3070 het 3013 hom 31 9 14 8 AGGAGGC 1 2 236893 CASAVA_Build 15 90679285 1I TTCTGAATGA -/G GGGGTGGTAG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 G 4 5 236894 CASAVA_Build 15 90713643 1I CAGAGAGAGA -/C TCTGTCTCAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 0 1 236895 CASAVA_Build 15 90720236 1I TAGAAAGAAA -/C TTAATTCCCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 0 1 236896 CASAVA_Build 15 90724675 6D TATATGAGAA GGTTCT/------ GGTCCATCCT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 GGTTCT 1 0 236897 CASAVA_Build 15 90724971 9D GAGGAGGAGA AGGAGAAGG/--------- AGGAGAAGGA 3070 hom 60 het 22 0 18 4 AGGAGAAGG 3 2 236898 CASAVA_Build 15 90728542 1I GGCAGTTATC -/T TTTTTTTTTT 2977 het 1378 hom 36 4 19 13 T 14 15 236899 CASAVA_Build 15 90728739 1D GATTTCCTCA C/- CCCAATGCAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 4 3 236900 CASAVA_Build 15 90733660 4D ACTCCCAGCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 87 het 36 0 28 8 AAAC 5 4 236901 CASAVA_Build 15 90735334 1D AACAAACTCA T/- TTTTGCAGAG 3070 hom 111 het 42 0 38 6 T 5 4 236902 CASAVA_Build 15 90753760 1I TTTGTTCTGC -/T TTTTTTCATT 3070 hom 109 het 43 0 36 7 T 6 7 236903 CASAVA_Build 15 90769311 16D TTTCTACAAT TTCAGCACTCTATAAA/---------------- TTATCTTTAG 3070 hom 69 het 23 0 24 7 TTCAGCACTCTATAAA 1 0 236904 CASAVA_Build 15 90779151 1D CAGAGGTCTG T/- TTAGCCAGAG 3070 hom 108 het 40 0 36 5 T 3 2 236905 CASAVA_Build 15 90780291 3D TGTGCTTCTA TCT/--- TCTTCTCTTC 3070 hom 69 het 30 0 23 8 TCT 3 2 236906 CASAVA_Build 15 90783449 1D TGCAAAACTC T/- TTGTAAGTGT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 3 2 236907 CASAVA_Build 15 90796580 1D ATGCACAGCG T/- TATGTTTGAG 3070 hom 135 het 53 0 44 11 T 2 1 236908 CASAVA_Build 15 90809999 1D ATTTAAGATT A/- AAAAAAAAAT 1861 het 1861 ref 28 19 5 4 A 10 9 236909 CASAVA_Build 15 90813833 2I ATGGAAGCAG --/AA AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 54 24 21 9 A 7 9 236910 CASAVA_Build 15 90833388 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 20 0 18 2 A 13 12 236911 CASAVA_Build 15 90849606 3I TATATTAAAT ---/ATA ATAATGAGAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 ATA 1 2 236912 CASAVA_Build 15 90863871 4I TTGGAGTGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 1961 hom 33 het 20 0 10 10 TTTG 2 3 236913 CASAVA_Build 15 90864575 1I GAGGCAGGAG -/A AATCACTTGA 3070 hom 28 het 12 0 9 4 A 2 3 236914 CASAVA_Build 15 90865563 4D CTGTTATAGT GATA/---- GTGAGTAAGT 3070 het 2072 hom 30 7 16 8 GATA 1 0 236915 CASAVA_Build 15 90866701 3I TACATACTCA ---/ACG AATGTTACTT 1620 hom 8 het 9 0 5 4 ACG 0 1 236916 CASAVA_Build 15 90906094 5D CTGCCTTTGG GTCAC/----- GTCACGTCAC 3070 hom 157 het 55 0 51 5 GTCAC 3 2 236917 CASAVA_Build 15 90908605 14I CCTCTACCAG --------------/AGAGGATGTGAATA AGATTTTGAA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 AGAGGATGTGAATA 0 1 236918 CASAVA_Build 15 90924427 10I GTGAAGCAGA ----------/GCCAGGGGCT GCCAGGGGCT 3070 hom 42 het 20 0 12 8 GCCAGGGGCT 1 2 236919 CASAVA_Build 15 90939701 2D TTCTGGAAAC TA/-- TAAGTGATTG 3070 het 3070 hom 39 15 22 4 TA 2 1 236920 CASAVA_Build 15 90944333 1D GGCTTATCCT G/- GGTTGGCCAC 3070 het 3070 ref 50 26 20 5 G 3 2 236921 CASAVA_Build 15 90951271 1I CCGGCCACCA -/C CCCGTCTGGG 970 hom 7 het 3 0 3 0 C 3 4 236922 CASAVA_Build 15 90955419 12D39M12I AGGAGAAGGA AGGAAGGGAGGGAGGGAGAGAGTGAGGGAGGGAAGTGGGGAAAGGGGAGAA------------/------------AGGGAGAGAGTGAGGGAGGGAAGTGGGGAAAGGGGAGAAGGAAGAAAGGAG GGGAGGAAGG 3070 hom 30 het 12 0 9 6 N/A 0 0 236923 CASAVA_Build 15 90960157 1I GGTGCCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 28 0 20 8 T 13 14 236924 CASAVA_Build 15 90962979 2D CACACACGTG CA/-- CACACACACA 2732 het 2732 ref 26 10 9 7 CA 10 9 236925 CASAVA_Build 15 90970213 1D AAAGCAAAAG A/- AGAGATAAAA 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 A 2 1 236926 CASAVA_Build 15 90972406 1D TTTCCCAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 11 10 236927 CASAVA_Build 15 90976068 1D TACATGCTTT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 57 het 24 0 16 8 A 9 8 236928 CASAVA_Build 15 90980863 4I CGCGGAGATA ----/GGCT GGCTGCATGG 2798 het 2798 ref 30 18 8 4 GGCT 1 2 236929 CASAVA_Build 15 90987371 1D ACTTTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 12 11 236930 CASAVA_Build 15 90996100 2D TCATTAAAAG AC/-- ACATTCTTTG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 AC 2 1 236931 CASAVA_Build 15 91000858 5D AGTTAAATAC ACATG/----- ACATGACAAG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 ACATG 2 1 236932 CASAVA_Build 15 91002440 3D CATCAAGAAT GTA/--- GAAAGCATAA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 GTA 1 0 236933 CASAVA_Build 15 91002923 1D ACACTATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 41 1 36 5 A 11 10 236934 CASAVA_Build 15 91015432 1D CTAATAATCT A/- AAAATATTAC 3070 hom 62 het 23 0 20 3 A 5 4 236935 CASAVA_Build 15 91017554 1D GGAGTTCGGG A/- AAAGCTCTTA 3070 het 3070 ref 34 18 8 8 A 4 3 236936 CASAVA_Build 15 91022212 1I TTCTTCCTTT -/C CAATCCTTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 236937 CASAVA_Build 15 91024664 1D TCCGTACCAT C/- CCCAGAATGG 3070 hom 135 het 55 0 48 8 C 4 3 236938 CASAVA_Build 15 91030076 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 2678 het 2678 ref 32 13 13 7 A 10 9 236939 CASAVA_Build 15 91030577 3I AGCAATGCGT ---/GAG GAGTAGGAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 GAG 1 2 236940 CASAVA_Build 15 91036845 1D TATCATGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1616 hom 26 5 14 7 A 14 13 236941 CASAVA_Build 15 91038681 1D ATTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 38 2 12 24 T 15 14 236942 CASAVA_Build 15 91039142 1D AAATATATAG T/- TTTTTTTTTT 2619 het 501 hom 19 5 7 8 T 13 12 236943 CASAVA_Build 15 91047623 2D GCACCCTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2490 hom 30 14 10 6 T 13 11 236944 CASAVA_Build 15 91049205 4I GACCAGTGTG ----/TCTT TCTTCTTTTC 3057 het 1846 hom 30 8 12 10 TCTT 1 2 236945 CASAVA_Build 15 91049244 1D ATTGTAGTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 8 11 A 10 9 236946 CASAVA_Build 15 91050588 1D CAGAAAACCA C/- TGTCTGAGCC 3070 het 3070 hom 63 27 29 8 C 1 0 236947 CASAVA_Build 15 91051899 1I GAGCTCCTCC -/T TGCCTCAGCC 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 T 1 2 236948 CASAVA_Build 15 91053591 1D ATCATCCTAC A/- AAGTTATCAC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 3 2 236949 CASAVA_Build 15 91054568 4I GGTCTCACTG ----/ACTT CAAGAATGAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 ACTT 0 1 236950 CASAVA_Build 15 91056856 4I TCCTAATAAC ----/TTTG TTACTGTGCT 2526 het 2526 ref 49 39 6 4 TTTG 0 1 236951 CASAVA_Build 15 91057429 1I TAAATGTTTA -/T TTTTTTTAAT 2178 het 2178 ref 16 11 5 0 T 7 8 236952 CASAVA_Build 15 91059280 2I TTTAGGTCTC --/TG TAGTAACATG 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 TG 0 1 236953 CASAVA_Build 15 91060194 1D CTCACTTCAC T/- TTAGAGTCTG 3070 het 3070 hom 26 9 15 3 T 3 2 236954 CASAVA_Build 15 91063566 1I ACAGATGCAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 A 7 8 236955 CASAVA_Build 15 91066190 1D GAGACCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 11 9 T 14 13 236956 CASAVA_Build 15 91068089 1D GGTGGTGCCA C/- TGCACTCCCG 2572 het 2111 hom 14 7 7 1 C 1 0 236957 CASAVA_Build 15 91068622 1D TTCAGTCTAT A/- AAAAAATCCC 3070 het 3070 ref 41 24 17 0 A 7 6 236958 CASAVA_Build 15 91069021 2I CAACTGAAAG --/AA AAGTCAAAAT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 2 4 236959 CASAVA_Build 15 91069890 5D TACTTTAACT AGAAA/----- AGAAAAGCCT 3070 het 3070 ref 32 19 12 2 AGAAA 2 1 236960 CASAVA_Build 15 91075665 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAATTAG 2244 het 1852 hom 17 7 7 3 A 6 8 236961 CASAVA_Build 15 91078094 1D GTGGATGTGA G/- GGGATCACGC 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 G 4 3 236962 CASAVA_Build 15 91080784 2I GGTTTGGTGG --/CA CACACACCTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CA 3 4 236963 CASAVA_Build 15 91084551 2D CTGGTCTATC TT/-- TTTTTTTTTT 2891 het 2849 hom 33 15 7 11 T 16 14 236964 CASAVA_Build 15 91086330 7D ATTCCACCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 827 het 827 ref 22 6 7 11 A 19 12 236965 CASAVA_Build 15 91086382 9I AAGCTCCAAA ---------/TAAATTCTG TAAATTCTGT 3070 het 3070 ref 32 12 9 11 TAAATTCTG 1 2 236966 CASAVA_Build 15 91088069 3I CTCTAGGATT ---/AAG AAGGAGAGGA 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 AAG 1 2 236967 CASAVA_Build 15 91090040 5I ACTCTGTCTC -----/AAAAA AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 8 13 236968 CASAVA_Build 15 91091066 5I CCTGGCCAAA -----/AGGGC AGGGCGAAAC 1560 het 1423 hom 9 3 4 2 AGGGC 1 2 236969 CASAVA_Build 15 91091952 1I AGTGGACAGC -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 T 7 8 236970 CASAVA_Build 15 91092040 2D AAAATCACTC AT/-- GTGTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 AT 1 0 236971 CASAVA_Build 15 91093144 32D AGGGCTTATT AAAAAGTACACAAACAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------------------- AAAAAGTACA 2686 het 2686 ref 28 12 7 9 AAAAAGTACACAAACAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 236972 CASAVA_Build 15 91093537 1I AACCTTGGAG -/C GTGCTTCTGG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 C 0 1 236973 CASAVA_Build 15 91107372 1I TAGAAATTAG -/A AAAAAAAAAG 2040 het 1952 hom 14 6 5 3 A 9 10 236974 CASAVA_Build 15 91108384 2D CCAAGCTTGT TA/-- TATAGCTAAT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 TA 3 2 236975 CASAVA_Build 15 91116158 1D12M69D TTTTGTTTTG TTTTTTCAAGACAGGGTCCTGCTCTGTCAATCAGGCTGGAATCCAGTGGTACAAACACGGCTCACTGCAGCCTTGACCTTCC/-TTTTTCAAAACA--------------------------------------------------------------------- AAGTCACTGC 1611 het 1611 ref 34 39 6 9 N/A 0 0 236976 CASAVA_Build 15 91124915 4D TTTTAAAAAG AGAA/---- AGAAAGGCCT 3070 het 3070 ref 32 18 13 3 AGAA 2 1 236977 CASAVA_Build 15 91129781 4D AAAGAGAGGC CACA/---- CACACACACA 2297 het 2297 ref 34 15 11 9 CA 7 5 236978 CASAVA_Build 15 91129929 1D AGGAGTTCAA T/- TATCAGCCTG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 2 1 236979 CASAVA_Build 15 91131695 1D GCTGGGAATC T/- TCTGAGACAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 2 1 236980 CASAVA_Build 15 91132676 1D GATCTGGTTG T/- TTGAAAGTGT 3070 het 3070 hom 46 18 19 10 T 3 2 236981 CASAVA_Build 15 91132854 3I CTTTTGGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 TTG 5 6 236982 CASAVA_Build 15 91150271 2I GCTGGTCTTG --/GA ACTCCTGAGC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GA 0 1 236983 CASAVA_Build 15 91156308 1I TCTCTATGTA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 7 8 236984 CASAVA_Build 15 91156407 1I TGCTTAATAC -/T ACGGAAACCT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 0 1 236985 CASAVA_Build 15 91156861 8D CCCGGCCTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 2597 het 2597 ref 23 11 7 8 TTTG 5 3 236986 CASAVA_Build 15 91169355 26D CAAATACCAA ACTTAAACAGAATTCCCTAATTACCC/-------------------------- ACTTAAACAG 3063 het 3063 ref 46 37 13 7 ACTTAAACAGAATTCCCTAATTACCC 1 0 236987 CASAVA_Build 15 91178543 1D TTATTTAAAA T/- TTTTTTTTTA 2994 het 2254 hom 18 6 9 3 T 10 9 236988 CASAVA_Build 15 91187857 3D ATCTAACGCC TGA/--- TGATGTGATC 2892 het 2892 ref 28 15 7 6 TGA 2 1 236989 CASAVA_Build 15 91206333 3I GAGTTGTTTT ---/TTG TTTTTGTTGT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 TTG 0 1 236990 CASAVA_Build 15 91215408 1D GGCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2828 hom 18 het 8 0 7 1 T 11 10 236991 CASAVA_Build 15 91217948 2D ATTTTGATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1471 hom 29 7 10 14 T 18 16 236992 CASAVA_Build 15 91231540 1I AAACTAAATG -/T TTTGACTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 3 4 236993 CASAVA_Build 15 91233717 19I TCTCAAAAAA -------------------/AAAGAAAAAAAAGAAAAAG AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AAAGAAAAAAAAGAAAAAG 0 1 236994 CASAVA_Build 15 91239163 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 32 3 14 15 A 18 16 236995 CASAVA_Build 15 91239808 1I GTAAGGTCAG -/T TTTGTAGGTC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 3 4 236996 CASAVA_Build 15 91240240 1I TTTTCTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 11 12 236997 CASAVA_Build 15 91253308 7I AGATGAACTG -------/ACACACC ACACACCACT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 ACACACC 1 2 236998 CASAVA_Build 15 91271222 6I TATTCAGCTG ------/TATGTT TATATTTTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TATGTT 0 1 236999 CASAVA_Build 15 91274256 5I CCTTACAGAA -----/AAGTC AAGTACTTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAGTC 0 1 237000 CASAVA_Build 15 91276678 1D CCTTCCCCCT C/- CCCCCCACCC 3070 hom 39 het 21 0 15 6 C 7 6 237001 CASAVA_Build 15 91277070 15I CAGCTCACTG ---------------/CAACCTCCGCCTCCT TGACTCAAGT 3070 hom 60 het 23 0 17 7 CAACCTCCGCCTCCT 0 1 237002 CASAVA_Build 15 91278659 2D ACAGTATCTA GG/-- GGGGACTCTG 3070 hom 141 het 51 0 48 4 G 6 4 237003 CASAVA_Build 15 91281510 1I GTAGTAAATG -/A AAAAAAGTAC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 6 7 237004 CASAVA_Build 15 91286883 1I TGTAAAAAGT -/G GGTTTACATT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 G 2 3 237005 CASAVA_Build 15 91305524 1I AAGTTTTCTA -/T TTCTTCTTGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 3 237006 CASAVA_Build 15 91308466 1D GAAAGAGATC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 7 6 237007 CASAVA_Build 15 91311144 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1637 het 604 hom 15 6 5 4 A 15 16 237008 CASAVA_Build 15 91312354 1D TATTTTAATC A/- ATTTATTTTT 3070 hom 85 het 32 0 28 4 A 2 1 237009 CASAVA_Build 15 91320088 4D TTGGGGCATT AATC/---- TATTCAGAGC 3070 hom 42 het 15 0 14 1 AATC 1 0 237010 CASAVA_Build 15 91331851 1D AAGAAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 223 hom 15 1 10 5 A 13 12 237011 CASAVA_Build 15 91337803 14I TATCTTTAAA --------------/AGATATATAGGTAT AGCAAGAGGT 3070 hom 75 het 30 0 26 6 AGATATATAGGTAT 0 1 237012 CASAVA_Build 15 91339726 4D GTGTGTGTGC GTGT/---- GTATTTTCCT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 GT 3 1 237013 CASAVA_Build 15 91342194 1I GCTCCTGGCA -/C GTTCAACAGT 3070 hom 150 het 54 0 50 4 C 0 1 237014 CASAVA_Build 15 91351955 4D TTCCCAGTTT TACC/---- TTTATGGAAT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 TACC 1 0 237015 CASAVA_Build 15 91357537 9D AATGGATAGT CCGGAAAGG/--------- CCCCAGGAGG 3070 hom 114 het 42 0 38 6 CCGGAAAGG 1 0 237016 CASAVA_Build 15 91368393 4I TTTCAAGTGT ----/GTAC GTACTTGTGT 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 GTAC 1 2 237017 CASAVA_Build 15 91369471 3I AGGACTTGAA ---/GGG GGGGAGCAGG 3070 het 2948 hom 29 9 9 11 G 4 7 237018 CASAVA_Build 15 91375765 3D GTGTCTTCCC CAG/--- GCATCCCACA 3070 hom 81 het 28 0 25 5 CAG 1 0 237019 CASAVA_Build 15 91386592 1I TACCACCCCC -/T TCCCTCCCCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 237020 CASAVA_Build 15 91391140 2I TGGGTGGCAC --/TG TGTTCTCCTG 3070 hom 84 het 32 0 27 5 TG 1 2 237021 CASAVA_Build 15 91398729 1D ATAAGTCTCA T/- GAGATCTGAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 1 0 237022 CASAVA_Build 15 91400633 1D CTAAGAAGCG C/- CTGAGACGAG 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 C 2 1 237023 CASAVA_Build 15 91401054 1I CCACCTTAAA -/G GGTCGCTGAG 3070 hom 104 het 41 0 31 10 G 2 3 237024 CASAVA_Build 15 91403256 2I CGCTACTGCC --/CT GATTAGAGGG 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 CT 0 1 237025 CASAVA_Build 15 91411518 1I TGGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 1613 het 1613 ref 27 13 8 6 A 9 10 237026 CASAVA_Build 15 91413340 1D TGCTGATGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 125 hom 25 2 14 9 T 10 9 237027 CASAVA_Build 15 91413785 1I AGCTGCAGTT -/G CAAAGTATAA 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 G 0 1 237028 CASAVA_Build 15 91419329 1D ACAGCAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2503 hom 35 7 18 10 T 15 14 237029 CASAVA_Build 15 91429440 1D CCCTGATCTT A/- AGAGTCCATG 3070 het 3070 ref 42 16 13 13 A 2 1 237030 CASAVA_Build 15 91466790 1I TTTGGGTGCA -/T TTTTTTTTTC 2455 het 2009 hom 18 6 6 6 T 9 10 237031 CASAVA_Build 15 91467621 25I GACCACACTG -------------------------/CAATAGCAATATCAATAGCAATAGC AGTATCAAGA 3070 het 3070 ref 41 22 18 4 CAATAGCAATATCAATAGCAATAGC 0 1 237032 CASAVA_Build 15 91468399 1I TACTACTGTG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 7 8 237033 CASAVA_Build 15 91474671 1D CAAATCTCAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 8 7 237034 CASAVA_Build 15 91479220 1I TTCCTCACAT -/C CCCCCACATT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 C 5 6 237035 CASAVA_Build 15 91484839 1D GGAAGGGCCT C/- CTAGACTTTA 3070 hom 114 het 46 0 37 9 C 2 1 237036 CASAVA_Build 15 91495788 1I TTTTTTATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 237037 CASAVA_Build 15 91497027 1I TAATGAGAGG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 237038 CASAVA_Build 15 91497865 3I TATATAAAAC ---/TTG TTTTTTTTTT 507 hom 3 het 10 0 5 5 TTG 0 1 237039 CASAVA_Build 15 91498167 4D AGCCTAAAAC TCTT/---- TCTATCTTAA 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TCTT 1 0 237040 CASAVA_Build 15 91504262 1D ACCCGCAGCA G/- AGTTGGTGGT 3070 hom 108 het 40 0 32 8 G 1 0 237041 CASAVA_Build 15 91506863 1D CAGCTGAGCT A/- GGGGGGTGAA 3070 hom 81 het 31 0 25 7 A 1 0 237042 CASAVA_Build 15 91510328 1I GTATAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 43 2 32 9 A 10 11 237043 CASAVA_Build 15 91519109 1D TTCCAGTAGA C/- AAGGAGGAGT 3070 het 3070 ref 43 24 13 7 C 1 0 237044 CASAVA_Build 15 91522541 1D AGTAGCCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 33 0 24 9 T 10 9 237045 CASAVA_Build 15 91532072 1I CTCCCACTTT -/G CAAGGGTGGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 0 1 237046 CASAVA_Build 15 91538976 1I CATGGTGGTC -/T TTTTGTACAC 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 4 5 237047 CASAVA_Build 15 91541546 4D ATATTAAGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 63 het 34 0 21 16 TG 11 9 237048 CASAVA_Build 15 91541690 4D GTCTTTATTA TTAT/---- TTATTTATAA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 TTAT 3 2 237049 CASAVA_Build 15 91552281 2D CCCTGTATCG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1139 hom 29 7 11 14 A 16 14 237050 CASAVA_Build 15 91561274 1I TGATATAAAG -/A AAAAAAAAAC 1289 het 1289 ref 46 37 3 6 A 9 10 237051 CASAVA_Build 15 91564087 3D GCATTTTAAG TTA/--- TTATTATTAT 2257 het 2257 ref 35 17 8 10 TTA 7 6 237052 CASAVA_Build 15 91582045 5I ATATTTTATT -----/TTTTA TTTTAAGTTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TTTTA 1 2 237053 CASAVA_Build 15 91583432 1D CCTCCCCAGA C/- CTACTGCGAC 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 C 2 1 237054 CASAVA_Build 15 91583477 1D AACTCTGTGA T/- TTTTAACGAG 3070 het 3070 hom 39 9 20 10 T 5 4 237055 CASAVA_Build 15 91592219 1I CTCTAGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 10 11 237056 CASAVA_Build 15 91595841 11I ACTGGTGTTA -----------/CCATAAGAAGC CCATGAGAAG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 CCATAAGAAGC 0 1 237057 CASAVA_Build 15 91604862 17D3M23D AGTTCTTAGT CTTGCCAGAGCCTGAGGTGCCAGAGGGCACGCGGTAGGGGGAA/-----------------TGC----------------------- CGCGGTGCAG 3070 hom 59 het 20 0 18 4 N/A 0 0 237058 CASAVA_Build 15 91611708 9D ACTCCATTTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 26 0 17 10 A 20 11 237059 CASAVA_Build 15 91612453 1D CTTTGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 A 11 10 237060 CASAVA_Build 15 91612691 1D TAGGAGGGAC A/- GGGGAGGTAG 2754 het 2754 ref 35 18 10 7 A 1 0 237061 CASAVA_Build 15 91613711 1I CAGTCTTGGT -/G GGAGTAGGGG 3070 hom 114 het 44 0 37 7 G 2 3 237062 CASAVA_Build 15 91614642 7I TCTGTGCTCC -------/TCCCCAT AGCGGGTTGG 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 TCCCCAT 0 1 237063 CASAVA_Build 15 91615142 1D TTTGGCTCTC G/- GGGTGTGGCT 3070 het 3070 hom 38 14 13 11 G 4 3 237064 CASAVA_Build 15 91615203 1I GCAGTGCCTG -/T TGAGTTGCTT 3070 het 3070 hom 41 10 24 7 T 1 2 237065 CASAVA_Build 15 91615945 1D TAATGTAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 35 2 18 16 A 16 15 237066 CASAVA_Build 15 91623227 4D TCTTTTTAAT AGAC/---- AGAAGAGGGA 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 AGAC 1 0 237067 CASAVA_Build 15 91626613 8D ATACCATGTA TAGTTCTT/-------- TCTCATTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TAGTTCTT 1 0 237068 CASAVA_Build 15 91626764 13D TATCATTTAA TAAGGATCCTTAT/------------- TAAGGATCAT 3070 hom 57 het 20 0 20 2 TAAGGATCCTTAT 1 0 237069 CASAVA_Build 15 91628198 7D GAAAGAGCCA CCAGCCT/------- CTGCTTCTCT 3070 hom 93 het 33 0 31 5 CCAGCCT 1 0 237070 CASAVA_Build 15 91628912 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 6 A 11 12 237071 CASAVA_Build 15 91634126 4D TTTGAAAGGG TAGT/---- TAAAGTAGAG 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 TAGT 1 0 237072 CASAVA_Build 15 91636879 1I CAGAGGTTGC -/T AGTGAGCCGA 1847 hom 8 het 5 0 4 1 T 0 1 237073 CASAVA_Build 15 91639830 4I ATTTAAAGGC ----/TATT TAATGACTTA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 TATT 0 1 237074 CASAVA_Build 15 91639945 21D ATTTTATTAA AAATATATAAAGCATAAAAAG/--------------------- AAATACAGGA 3070 het 3070 ref 35 21 17 1 AAATATATAAAGCATAAAAAG 1 0 237075 CASAVA_Build 15 91640622 1D GAACAAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 11 10 237076 CASAVA_Build 15 91640757 1D TAAACATAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 45 0 40 6 A 9 8 237077 CASAVA_Build 15 91642226 2D GCATGAGCCA CC/-- GTGCCCGGCC 3070 het 2031 hom 17 5 11 3 C 2 0 237078 CASAVA_Build 15 91642530 10I TGACACACTC ----------/TCCTATAGCA TCATTCTTTG 3070 het 3070 hom 55 25 26 4 TCCTATAGCA 0 1 237079 CASAVA_Build 15 91642962 4D TCTGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 2369 het 489 hom 6 1 5 0 AAAT 5 4 237080 CASAVA_Build 15 91654114 5I GGCCCTGTCT -----/CAAAA CAAAACAAAA 3070 hom 117 het 42 0 38 6 CAAAA 3 4 237081 CASAVA_Build 15 91661641 2I ATAATGAAAC --/AG GGAAACGTTT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 AG 0 1 237082 CASAVA_Build 15 91662695 1D GTCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 26 het 11 0 9 4 T 7 6 237083 CASAVA_Build 15 91664753 4I GCTACTCCAA ----/TTTC TTTCGGGAGA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 TTTC 1 2 237084 CASAVA_Build 15 91673690 1I CCTGGCAAAA -/T AAACTTTCTT 3070 hom 104 het 40 0 32 8 T 0 1 237085 CASAVA_Build 15 91675897 2D TAGGCATAAC TG/-- TTAGTACAGG 3070 het 3070 ref 51 24 14 13 TG 1 0 237086 CASAVA_Build 15 91679342 1D CTTATTTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 662 hom 35 2 20 13 A 13 12 237087 CASAVA_Build 15 91680911 6D CTAGGTTTTG ATCTCT/------ ATCTCTCAAA 3028 hom 27 het 14 0 10 5 ATCTCT 2 1 237088 CASAVA_Build 15 91681288 1D TCAAAAAAAA T/- GAAATAAAAT 1547 hom 10 het 5 0 4 1 T 1 0 237089 CASAVA_Build 15 91681433 2I AAAAATGTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 10 12 237090 CASAVA_Build 15 91689586 2I AGAGAGAGAG --/AA AAAAAAAAAG 2985 het 70 hom 21 1 15 5 A 9 11 237091 CASAVA_Build 15 91697002 5I GAAATCAAGA -----/TACTT TGCTTTGTTG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 TACTT 0 1 237092 CASAVA_Build 15 91697460 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 14 15 237093 CASAVA_Build 15 91699551 4I CGGGATTTGG ----/TTGA TTGTCTAGGA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TTGA 0 1 237094 CASAVA_Build 15 91714320 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 17 0 11 7 A 16 14 237095 CASAVA_Build 15 91723154 3I TAAAAGACAC ---/TAT TATTATGTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TAT 2 3 237096 CASAVA_Build 15 91723895 1D TGCCTATAAT C/- CCCAGCACTT 3070 hom 70 het 27 0 22 5 C 4 3 237097 CASAVA_Build 15 91726115 3I TGTACCTTTA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 29 0 24 5 T 12 15 237098 CASAVA_Build 15 91729828 1D CCAATGCTTC G/- TCAGACGCAG 3070 het 1323 hom 18 4 13 1 G 1 0 237099 CASAVA_Build 15 91733977 1D AGCAAGGAAG A/- AAAAAAAAGG 2601 het 1878 hom 15 6 6 3 A 9 8 237100 CASAVA_Build 15 91734050 2D GGAGAGAAAA GG/-- GATTTTATTT 205 het 205 ref 8 5 1 2 G 3 1 237101 CASAVA_Build 15 91736009 4I TTTGGTTCTC ----/TGTT TGTCTGTTAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TGTT 0 1 237102 CASAVA_Build 15 91740625 1I CAACTAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 237103 CASAVA_Build 15 91741674 1D GCTGCTTGGG A/- GGCTGAGGCA 3070 het 1212 hom 21 4 12 5 A 1 0 237104 CASAVA_Build 15 91743448 4I GTTATAGAAC ----/ATTT ATTTCCATCA 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 ATTT 1 2 237105 CASAVA_Build 15 91745238 3D AATCCAAATC TTT/--- TTTTTTTTTT 1583 het 822 hom 20 8 5 7 T 17 14 237106 CASAVA_Build 15 91747507 1D GGGTTTATCA G/- GGGTTTCTCC 3023 het 2049 hom 17 7 7 4 G 4 3 237107 CASAVA_Build 15 91754773 1I AACCCCAGTT -/A ATCTTTTTTT 2028 het 504 hom 26 6 12 8 A 1 2 237108 CASAVA_Build 15 91754830 2I CTTCTTGAAA --/CT CTCGCCTCCC 3070 het 3070 ref 33 17 7 9 CT 1 2 237109 CASAVA_Build 15 91754965 1D AAACTGAGCC G/- TGATTGGCCA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 G 1 0 237110 CASAVA_Build 15 91755592 1D AGACAGCTTG C/- TAAGGCTCAG 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 C 1 0 237111 CASAVA_Build 15 91756907 10I CAGAGATGTA ----------/GGAGCTGCTT GGGGCCAAAT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 GGAGCTGCTT 0 1 237112 CASAVA_Build 15 91760135 10D AGGAGGAAGG TAGAGGAAGA/---------- AAGCCATACG 3070 het 3070 hom 37 16 18 9 TAGAGGAAGA 1 0 237113 CASAVA_Build 15 91760741 2I ACACGCCTGT --/CC CCCCATTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 C 4 6 237114 CASAVA_Build 15 91764929 3D GGCATTTTGA GGG/--- GGGGGGTGTG 3070 het 336 hom 23 3 12 8 G 9 6 237115 CASAVA_Build 15 91768051 1I AATGATCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 T 10 11 237116 CASAVA_Build 15 91777082 4D ATACACTTCT TAAG/---- TATGTTTTTC 3070 het 2188 hom 24 8 13 4 TAAG 1 0 237117 CASAVA_Build 15 91784511 3D GTACAAACAA AAT/--- AACACACAAA 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 AAT 1 0 237118 CASAVA_Build 15 91785602 4D TCAATGATAT TCAG/---- TGAGAACTGA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TCAG 1 0 237119 CASAVA_Build 15 91786321 1I CCTTTTGGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 9 237120 CASAVA_Build 15 91788570 3I ATATGTACTT ---/AAC AATTTGAATT 3070 hom 126 het 44 0 42 2 AAC 0 1 237121 CASAVA_Build 15 91790077 1D TAGAAAAAAA C/- ATAGAAGATT 3070 hom 77 het 31 0 26 5 C 1 0 237122 CASAVA_Build 15 91791894 5D TTCCTTCAAC TTTTA/----- TTTTAAGTTC 3070 het 1111 hom 21 3 14 7 TTTTA 2 1 237123 CASAVA_Build 15 91801170 1I TTCCAGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 T 11 12 237124 CASAVA_Build 15 91803062 1D TGGAAAGAGA G/- ACATAATGAA 3070 hom 148 het 53 0 50 4 G 1 0 237125 CASAVA_Build 15 91806274 1D CCTACTGAGG A/- GACTCAGAAT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 A 1 0 237126 CASAVA_Build 15 91813198 1I TCCCTTTGCT -/C CACCTTTAGC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 1 2 237127 CASAVA_Build 15 91813305 2I ATGTAGTAAA --/AG AGTACAATGT 648 hom 7 het 13 0 3 10 AG 1 2 237128 CASAVA_Build 15 91816279 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAAAAAGG 3070 het 278 hom 26 4 15 7 G 1 0 237129 CASAVA_Build 15 91816621 4I TGTTTCTTTC ----/AGAT AGATACTTTT 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 AGAT 1 2 237130 CASAVA_Build 15 91817489 2I TGGGAATGTC --/TT TTAACATGCT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 2 4 237131 CASAVA_Build 15 91817916 2D TCTGGATCCC CA/-- CACACATCTT 3070 hom 81 het 33 0 28 7 CA 4 3 237132 CASAVA_Build 15 91819862 3D CTGATAAAGT AGG/--- AGGAACAAAT 3070 het 3070 hom 20 9 10 2 AGG 2 1 237133 CASAVA_Build 15 91869173 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 301 hom 17 1 16 0 A 8 9 237134 CASAVA_Build 15 91870911 7D TTTTCTTTTC TTTCTTT/------- TTTCTTTTTT 2770 het 2770 ref 26 11 8 8 TTTCTTT 3 2 237135 CASAVA_Build 15 91871502 2D TATGTGTGTG TC/-- TCTCTGTGTG 2182 het 1383 hom 33 13 17 3 TC 3 2 237136 CASAVA_Build 15 91875886 1I GTCATTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 27 0 18 9 T 14 15 237137 CASAVA_Build 15 91876879 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 17 1 13 3 A 14 13 237138 CASAVA_Build 15 91877372 1I CTTATATAGG -/A AAAATCATAG 3070 het 3070 hom 54 23 24 7 A 4 5 237139 CASAVA_Build 15 91877512 1D GTTGTATTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 9 8 237140 CASAVA_Build 15 91879366 14D CTTGGCTTTA CTGTAAATGGTTAC/-------------- CTGAGGTGCT 3070 het 3070 ref 40 27 17 6 CTGTAAATGGTTAC 1 0 237141 CASAVA_Build 15 91883363 2I TCTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 29 0 22 7 T 11 13 237142 CASAVA_Build 15 91888476 1I AATCATTCAC -/A AAAAGCAGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 4 5 237143 CASAVA_Build 15 91891248 1I ATTGATAAAA -/G TTAGAATAAT 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 G 0 1 237144 CASAVA_Build 15 91891695 4I AGATTTTTCA ----/TATT TATTTATGTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TATT 1 2 237145 CASAVA_Build 15 91892007 1I ACTGTGTTTT -/A TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 0 1 237146 CASAVA_Build 15 91892346 3D ATGTCCATGT GTG/--- GTAAAGCCAG 3070 het 3070 ref 24 11 10 6 GTG 1 0 237147 CASAVA_Build 15 91896575 2I AACAAATAAA --/AG AGTATAATTA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AG 1 2 237148 CASAVA_Build 15 91897248 1D AGACTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 1909 het 248 hom 16 4 5 7 A 19 18 237149 CASAVA_Build 15 91901355 8D CCAGAGTATA TAGGTAGG/-------- TAGGTAGGTA 3070 het 282 hom 33 3 12 22 TAGG 6 4 237150 CASAVA_Build 15 91922146 1D AAAGAGGGGG A/- AAAAAGAGGG 3070 hom 143 het 52 0 47 5 A 6 5 237151 CASAVA_Build 15 91927346 3I GGAGTCAAAC ---/GTT GTAAACACGT 3070 hom 104 het 37 0 30 7 GTT 0 1 237152 CASAVA_Build 15 91939024 1I CGGTGTTTGG -/T TTTTTTGTCC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 T 6 7 237153 CASAVA_Build 15 91953352 2D TGCCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 902 het 902 ref 34 10 5 19 T 16 14 237154 CASAVA_Build 15 91960775 1I TCTTCAGCTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 A 8 9 237155 CASAVA_Build 15 91964916 2I TATTTTTTGG --/AT ATGAGTCCTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 1 2 237156 CASAVA_Build 15 91966090 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 37 0 26 11 T 16 14 237157 CASAVA_Build 15 91967226 5D TTTTCTTGTA TATTT/----- TATATGTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 4 TATTT 1 0 237158 CASAVA_Build 15 91970519 2I AAAGTATAAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 9 11 237159 CASAVA_Build 15 91971069 3D CTAAAACAAC AAT/--- GTCAACTTCA 3070 hom 93 het 37 0 31 8 AAT 1 0 237160 CASAVA_Build 15 91975798 1I TATCTTGACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 9 237161 CASAVA_Build 15 91983433 2I GAAACCCTCA --/AG AATACCTGTG 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 AG 0 1 237162 CASAVA_Build 15 92001231 6I GTATAAATTA ------/TATAAG TATAAGTTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TATAAG 1 2 237163 CASAVA_Build 15 92012355 4D TATTAATTGA TATT/---- TATTTTATTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TATT 2 1 237164 CASAVA_Build 15 92012511 1D TCATTCTCCA T/- TTTTTTCCAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 6 237165 CASAVA_Build 15 92012627 1I TTTTGTGTTG -/A AAAACTTGAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 5 237166 CASAVA_Build 15 92018125 4D TTGTTTAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 7 AAAC 3 2 237167 CASAVA_Build 15 92018626 1D CCAGAATCAG T/- TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 8 7 237168 CASAVA_Build 15 92031669 5D ACTCAAAAGA AGAAG/----- AGAAGACATA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 AGAAG 2 1 237169 CASAVA_Build 15 92046869 3D TCACGAGGTC AGG/--- AGATCGAGAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AGG 1 0 237170 CASAVA_Build 15 92051619 1I AGTGAAAATT -/A ATTCTTATTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 2 237171 CASAVA_Build 15 92063562 1I TTCTAACCTC -/T TATCAGTATG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 1 2 237172 CASAVA_Build 15 92066564 1D ATGTCAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 559 hom 23 2 13 8 T 12 11 237173 CASAVA_Build 15 92069172 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2391 het 9 hom 13 1 11 1 A 13 14 237174 CASAVA_Build 15 92072397 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 15 13 237175 CASAVA_Build 15 92077270 5I TGATTGTGAT -----/TATAA TATGTTTGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TATAA 0 1 237176 CASAVA_Build 15 92084552 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 44 het 37 1 33 3 A 10 9 237177 CASAVA_Build 15 92089741 8D GGCTTCTTCC AATCTTCT/-------- AATCTTCTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 AATCTTCT 2 1 237178 CASAVA_Build 15 92090688 3D CAGAGTTTTG TTC/--- TTCTTGCCCA 3070 hom 65 het 29 0 19 11 TTC 2 1 237179 CASAVA_Build 15 92096115 1I AATAGGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 34 1 22 11 T 11 12 237180 CASAVA_Build 15 92102317 3D TACTAATGTA TAT/--- TATACTATAT 3070 hom 45 het 18 0 16 3 TAT 2 1 237181 CASAVA_Build 15 92112786 1I GGCTGAGGCA -/G GAGAATTGCT 3070 het 539 hom 13 2 10 1 G 1 2 237182 CASAVA_Build 15 92114807 1D AGGGTACAAC A/- ATGGTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 A 2 1 237183 CASAVA_Build 15 92118733 4D AAATATTTGT TAAA/---- TAAATGAGCC 3070 het 3070 hom 43 21 20 3 TAAA 2 1 237184 CASAVA_Build 15 92120443 11I CCATGAGATA -----------/CCATCTCACAC CAGTTAGAAT 3070 het 3070 hom 22 8 14 2 CCATCTCACAC 0 1 237185 CASAVA_Build 15 92121402 25D GAAGAAGCAT ATAAAAATTACCCACAATTTTAACC/------------------------- ATGTGGAGGT 3070 het 3070 ref 32 21 11 2 ATAAAAATTACCCACAATTTTAACC 1 0 237186 CASAVA_Build 15 92121661 8D CTTCATATTG TGTGTGTA/-------- TGTGTGTATG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TGTGTGTA 2 1 237187 CASAVA_Build 15 92122567 4I AAACAAGGTA ----/CATT CAGAGACATC 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 CATT 0 1 237188 CASAVA_Build 15 92124074 2I GTGGCTACAC --/AT GTTAATATTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 0 1 237189 CASAVA_Build 15 92127301 1D ATTGTGCTAC A/- AAAACTCACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 5 4 237190 CASAVA_Build 15 92131135 1I ACATACATAT -/A TTTTTTTTCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 0 1 237191 CASAVA_Build 15 92149370 1I AAAATGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 31 1 15 15 A 10 11 237192 CASAVA_Build 15 92149450 2D CTCTTTAGGG TA/-- TATATCCCTC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 TA 3 2 237193 CASAVA_Build 15 92149569 3D ATATATAATA ATT/--- GTGTGTGTAA 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 ATT 1 0 237194 CASAVA_Build 15 92153863 1D AAGCTCCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 35 0 30 6 A 12 11 237195 CASAVA_Build 15 92154130 2D ATAATCTCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 34 2 20 14 T 15 13 237196 CASAVA_Build 15 92154345 1I CTGTCTCAAA -/T TTTTTTGAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 7 237197 CASAVA_Build 15 92154630 2I ATCCTTCTAA --/AT AGTTAGATTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AT 0 1 237198 CASAVA_Build 15 92160046 1D TGACATTTGA C/- CAAATGGGCC 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 C 2 1 237199 CASAVA_Build 15 92160178 1D TCAGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 A 11 10 237200 CASAVA_Build 15 92160951 8I AGCTGAATTG --------/TACCAGAT TTGTAAAAGA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TACCAGAT 0 1 237201 CASAVA_Build 15 92167818 1I13M1I CGATCTCAGC -CACTGCAACCTCC-/TCACTGCAGCCTCCA ACCTCCTGGG 3070 hom 33 het 12 0 7 6 N/A 0 0 237202 CASAVA_Build 15 92168030 6D AAAGTTAAAG GAAAAA/------ AAAAAAACAA 3070 hom 48 het 18 0 17 3 GAAAAA 1 0 237203 CASAVA_Build 15 92191694 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 252 hom 19 1 16 2 A 9 10 237204 CASAVA_Build 15 92192676 1D TAAATACTAA T/- TTTTTTTTTT 1883 het 1883 ref 29 15 4 10 T 15 14 237205 CASAVA_Build 15 92196700 1D GACAAAACTC T/- TAGAAAATTG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 2 1 237206 CASAVA_Build 15 92210399 1I TTGATAGTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 423 hom 32 1 27 4 T 8 9 237207 CASAVA_Build 15 92215273 2I ACCATTTCTT --/TG TGTTAAGAAC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 TG 1 2 237208 CASAVA_Build 15 92217528 1D AACAGGATTA C/- TTTTTTTAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 1 0 237209 CASAVA_Build 15 92260317 2I GGATTAAATT --/AC ACAGTGATTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AC 1 2 237210 CASAVA_Build 15 92280428 4D AGAATTTCAC TTAT/---- TTATTAGTGA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 TTAT 2 1 237211 CASAVA_Build 15 92295957 4D GTATCTATCT TCTA/---- TCTATCTATC 3070 hom 84 het 33 0 29 6 TCTA 3 2 237212 CASAVA_Build 15 92298057 1D AGTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 27 1 18 8 A 14 13 237213 CASAVA_Build 15 92310315 9D TTGATAGTTT GGAAAAATC/--------- TTAGCTTTAT 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 GGAAAAATC 1 0 237214 CASAVA_Build 15 92316562 1I TTTCTTTTGC -/T TTTCATATCA 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 T 3 4 237215 CASAVA_Build 15 92323609 4D AAAAAGAGAA GAAG/---- GATGAAGAAA 3070 het 3070 hom 42 13 27 3 GAAG 1 0 237216 CASAVA_Build 15 92324484 1D AGGGTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 17 11 A 12 11 237217 CASAVA_Build 15 92326638 1I TGAGTTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 11 12 237218 CASAVA_Build 15 92328130 1I ACAGTCCTCT -/C CCCCTGTCAT 3070 het 3070 hom 52 21 22 9 C 4 5 237219 CASAVA_Build 15 92338921 1D TCAGTTGACA T/- TTTTCTACAC 3070 het 3070 ref 43 20 19 5 T 5 4 237220 CASAVA_Build 15 92342547 6I GCCAGTTGTG ------/AAGGAC AAGGTGTTAT 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 AAGGAC 0 1 237221 CASAVA_Build 15 92349584 1D GGTATAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 12 13 T 17 16 237222 CASAVA_Build 15 92355176 9I TTTACCTAAC ---------/ATTTAACAT ATTTAACATA 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 ATTTAACAT 1 2 237223 CASAVA_Build 15 92369173 1D TTTTTCACTA T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 8 7 237224 CASAVA_Build 15 92375305 3D TGAAAATCAC AGA/--- AGGAGAGCTG 3070 hom 98 het 35 0 33 2 AGA 1 0 237225 CASAVA_Build 15 92379427 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 7 8 237226 CASAVA_Build 15 92385702 1I ATATAATTAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 8 9 237227 CASAVA_Build 15 92386471 5D CCCTCCGTCT CTAAC/----- AATGGTTAGC 3070 het 3070 hom 44 17 22 8 CTAAC 1 0 237228 CASAVA_Build 15 92395674 2D ACACACTCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 136 het 52 0 44 11 AC 6 5 237229 CASAVA_Build 15 92396194 2I ACAGAAACAC --/CT ACACAACGCA 1745 het 1745 ref 38 25 7 6 CT 0 1 237230 CASAVA_Build 15 92401263 1I ACAGGTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 787 hom 52 2 40 10 T 11 12 237231 CASAVA_Build 15 92417954 1D AGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 T 11 10 237232 CASAVA_Build 15 92418934 1D CTAGCATACG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 106 het 44 0 39 5 A 10 9 237233 CASAVA_Build 15 92424181 4I AGACCAAAAC ----/ACTT ACAATATTCA 3070 het 3070 hom 58 19 32 7 ACTT 0 1 237234 CASAVA_Build 15 92426011 1I TGATGCAATG -/C CCATATGGGT 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 C 2 3 237235 CASAVA_Build 15 92429810 1D TTACCAAGAA T/- TGGGGGGGAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 2 1 237236 CASAVA_Build 15 92438572 1D TTAAAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2986 hom 28 11 14 4 T 11 10 237237 CASAVA_Build 15 92440941 2D GCCCAAGGTA TC/-- TCCAGCCACT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TC 2 1 237238 CASAVA_Build 15 92447952 1I TTTCTTTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 9 10 237239 CASAVA_Build 15 92450533 1I TCTTATTAGC -/A AAAAGTGACC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 4 5 237240 CASAVA_Build 15 92456518 1I CATTATCTTT -/A ACCATTTCCT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 A 1 2 237241 CASAVA_Build 15 92459015 1D AAACACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 13 14 16 A 13 12 237242 CASAVA_Build 15 92462496 1I GGATAGCATT -/G GGAGATATAC 1732 hom 10 het 6 0 4 2 G 2 3 237243 CASAVA_Build 15 92473503 1I CTCCATACTC -/T TTTTCCATTA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 4 5 237244 CASAVA_Build 15 92476271 1I ATGATACATA -/T TTTTTCCATC 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 T 5 6 237245 CASAVA_Build 15 92506103 10D TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA/---------- TTAAATACAT 3070 het 917 hom 36 10 16 14 TGTGTGTGTA 1 0 237246 CASAVA_Build 15 92507911 3I TAAATTTGGA ---/AAT AATAACTGTC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AAT 1 2 237247 CASAVA_Build 15 92510918 1I TCATATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 T 10 11 237248 CASAVA_Build 15 92529783 5I TAGTTCTGCA -----/GGTGT GGTGTTTGTC 3070 het 3070 ref 51 24 16 11 GGTGT 1 2 237249 CASAVA_Build 15 92530913 2D CTCACACACA CT/-- GTTTACGATA 3070 het 3070 ref 55 27 22 7 CT 1 0 237250 CASAVA_Build 15 92531151 2D AAACTCAGCT GA/-- TGCTCGCCCA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 GA 1 0 237251 CASAVA_Build 15 92537423 1I GGTCAGGAGA -/T TGAGACCATC 2275 het 535 hom 8 2 5 1 T 1 2 237252 CASAVA_Build 15 92546252 2D AAAATAAAAC AA/-- AGAGTATAGC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 3 1 237253 CASAVA_Build 15 92574899 2D TGTAACTCTC TT/-- GTATCTAATT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 T 2 0 237254 CASAVA_Build 15 92575103 1I AAAGCGGCGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 A 8 9 237255 CASAVA_Build 15 92584300 1D TCATTGGTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 10 9 237256 CASAVA_Build 15 92585368 3I CTCCTAGGGA ---/TCC TCCTTTAGTT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 TCC 1 2 237257 CASAVA_Build 15 92586918 1D ACACTGAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 46 22 16 9 T 9 8 237258 CASAVA_Build 15 92595597 1D ACGCATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 12 11 237259 CASAVA_Build 15 92596866 1D GGTTTACAGA T/- TTTTTTTTTT 2361 het 2361 ref 42 26 6 11 T 13 12 237260 CASAVA_Build 15 92599719 4I GCACTTATGA ----/CTAT CTGACATAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CTAT 0 1 237261 CASAVA_Build 15 92608851 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2839 hom 22 9 9 4 A 9 10 237262 CASAVA_Build 15 92610314 2I42M1D CGTGTGCGCG --CACACACACACACACGTGCTCTACAGTCTCAATATGCACACAC/CACACACACACACACACGTGCTCTACAGTCTCAATATGCACACA- TGGATGATCC 3070 het 3070 hom 42 26 30 22 N/A 0 0 237263 CASAVA_Build 15 92616964 1I TAACACCATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 9 10 237264 CASAVA_Build 15 92619794 4I CTCCACTGTC ----/TGTT TTTTTCTATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TGTT 0 1 237265 CASAVA_Build 15 92622937 1I TAACAGGTAG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 8 9 237266 CASAVA_Build 15 92629059 1I TGAGGTATAT -/G GAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 G 1 2 237267 CASAVA_Build 15 92629748 1I TCACAATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 T 9 10 237268 CASAVA_Build 15 92631474 1D TTAAGAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 33 2 14 17 T 11 10 237269 CASAVA_Build 15 92644743 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 28 1 18 9 A 15 16 237270 CASAVA_Build 15 92652948 1I GTTGATAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 9 10 237271 CASAVA_Build 15 92655540 3D GATTACAGGC ATG/--- AGCCACTACA 3070 het 1807 hom 19 4 14 1 ATG 1 0 237272 CASAVA_Build 15 92660485 7D TATGTGCATT ATGTATA/------- ATGTATAATG 3070 het 3070 hom 32 13 15 9 ATGTATA 2 1 237273 CASAVA_Build 15 92662168 3D TTCTCATTTC TAT/--- TATTATTATA 3070 het 3070 hom 36 17 17 4 TAT 4 3 237274 CASAVA_Build 15 92663271 1I TTGTTCTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 T 13 14 237275 CASAVA_Build 15 92666535 1I TGTTTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1591 hom 29 6 11 12 T 13 14 237276 CASAVA_Build 15 92669905 2D TGAATAAAGA CT/-- CTGTCGTGGA 3070 het 3070 hom 28 8 20 0 CT 2 1 237277 CASAVA_Build 15 92671249 2I CATGCATCAC --/TG TTGTTCATTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TG 0 1 237278 CASAVA_Build 15 92674746 1D TCCTTTCTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 T 9 8 237279 CASAVA_Build 15 92680973 2I TGTGCATATA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TG 4 5 237280 CASAVA_Build 15 92682473 3D GGTCTTTGTA TGC/--- TTATTCACTG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 TGC 1 0 237281 CASAVA_Build 15 92683738 4I GTCCTCTTAG ----/ACGT ACGTGAACTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 ACGT 1 2 237282 CASAVA_Build 15 92686847 5I ACATATATAT -----/TTATC TTATATATAC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 TTATC 0 1 237283 CASAVA_Build 15 92687170 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 TA 5 4 237284 CASAVA_Build 15 92688298 1D AGGAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 12 11 237285 CASAVA_Build 15 92698247 3D ATTTTTATAT ATA/--- ATAATAACAA 1921 het 1357 hom 15 6 7 4 ATA 3 2 237286 CASAVA_Build 15 92701792 1D TTTTTTTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 G 1 0 237287 CASAVA_Build 15 92705086 1D TTTTAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 10 8 T 12 11 237288 CASAVA_Build 15 92708301 1I AATTTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 11 12 237289 CASAVA_Build 15 92708421 1I TAAATAAAGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 T 8 9 237290 CASAVA_Build 15 92711413 1I TTCTCTTATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 9 10 237291 CASAVA_Build 15 92714195 1I TTTTTGGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 9 10 237292 CASAVA_Build 15 92719747 3D TTCCAGAATT CTC/--- CTGGGGATTT 3070 het 3070 hom 36 12 20 6 CTC 1 0 237293 CASAVA_Build 15 92728498 1D TATCCTTTCA T/- TTTTATAGAG 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 T 5 4 237294 CASAVA_Build 15 92734283 68D TGTTCAAGGC ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATGTAT/-------------------------------------------------------------------- ATATATATAT 2296 het 1038 hom 14 4 7 5 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATGTAT 1 0 237295 CASAVA_Build 15 92777317 9I ATACATAGGG ---------/GATTTGTTA GATTTGTTAG 3070 het 3070 ref 44 21 13 10 GATTTGTTA 1 2 237296 CASAVA_Build 15 92778613 2D TCCCAGCCTA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 14 18 12 T 11 9 237297 CASAVA_Build 15 92779103 1D17M4D TTTTTTTTTC TTTTTTTTTTGATGCAGTTTTG/-TTTTTTTTTGATGCAGT---- TTTGCTCCTT 3070 het 3070 ref 41 23 18 6 N/A 0 0 237298 CASAVA_Build 15 92781254 2D TTATAGGAAC AG/-- ATTATATATT 3070 het 3070 ref 26 14 11 2 AG 1 0 237299 CASAVA_Build 15 92798835 1D TCTTTTGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 15 7 A 12 11 237300 CASAVA_Build 15 92803263 1D GATTCATAGG T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 7 6 237301 CASAVA_Build 15 92811656 18I CTTTTATTAT ------------------/AAATATATCAATTATAAA AATAATCAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AAATATATCAATTATAAA 0 1 237302 CASAVA_Build 15 92812652 18D CAGTTTGCTT ATAAATCAATTTTCTTAA/------------------ ATAAATCAAT 3070 hom 45 het 23 0 16 10 ATAAATCAATTTTCTTAA 2 1 237303 CASAVA_Build 15 92815018 4D GTGAGCAAAC ACCT/---- ACCTGCATCA 3070 hom 126 het 43 0 43 2 ACCT 2 1 237304 CASAVA_Build 15 92818190 1D CTCCAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 955 het 955 ref 35 24 3 8 T 12 11 237305 CASAVA_Build 15 92839092 4D GCGTTTATGT TTGG/---- TTGGTTGGTT 3070 hom 54 het 25 0 19 7 TTGG 4 3 237306 CASAVA_Build 15 92865016 6D TTTTTGGAAA AAAGCT/------ ATGTGAACAT 3070 het 3070 hom 34 16 15 6 AAAGCT 1 0 237307 CASAVA_Build 15 92879880 5I GCCTTTCCTG -----/TGTGC TGTGCAACAC 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 TGTGC 1 2 237308 CASAVA_Build 15 92884000 4I ATTTGATTCT ----/TAAA TAATCTTCAT 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 TAAA 0 1 237309 CASAVA_Build 15 92884393 3D AAAATTCTCT ATA/--- ATATCATAAC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 ATA 2 1 237310 CASAVA_Build 15 92885413 1D GATGAGTGAG A/- AAAATGGGTA 3070 hom 138 het 53 0 47 7 A 5 4 237311 CASAVA_Build 15 92890448 8D GGAGTCCTGA GTTGACAT/-------- GTAGGAAGAT 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 GTTGACAT 1 0 237312 CASAVA_Build 15 92891988 1D TGAAATACAA T/- TTTTTTAATG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 7 6 237313 CASAVA_Build 15 92892504 1D TTGTCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 10 237314 CASAVA_Build 15 92900111 3D AAAACAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 AAC 7 6 237315 CASAVA_Build 15 92911831 1D AAATGTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 42 1 33 8 A 13 12 237316 CASAVA_Build 15 92916576 1D TGCTCTCCAG A/- CAGCAGACAG 3027 het 3027 ref 39 27 8 4 A 1 0 237317 CASAVA_Build 15 92919288 1D ATTCTTTCAC A/- AACAGCAACA 3070 het 3070 ref 45 26 15 5 A 3 2 237318 CASAVA_Build 15 92949074 1D TTTCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 43 2 26 15 T 15 14 237319 CASAVA_Build 15 92967836 1I TTTGTGTGGT -/G GGGGGTATGC 3070 het 3070 ref 63 26 28 9 G 5 6 237320 CASAVA_Build 15 92968759 1I AGACCCAGGT -/G GAGTCTGTGG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 1 2 237321 CASAVA_Build 15 92975393 1I TTGAGGGAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 417 hom 33 1 29 3 A 9 10 237322 CASAVA_Build 15 93009643 10D GGCTTCCTGG ATGCCCTCAA/---------- ATGCCTTTGT 3070 het 3070 ref 44 30 15 4 ATGCCCTCAA 1 0 237323 CASAVA_Build 15 93010574 4D TGAGCCAAGA AAGG/---- AAGGACAGGG 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 AAGG 2 1 237324 CASAVA_Build 15 93013536 3I AGAAAACCGG ---/GGT GGGGGGCCTT 3070 hom 34 het 17 0 10 7 GGT 0 1 237325 CASAVA_Build 15 93051056 3D AATTGAGATT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 TTG 4 3 237326 CASAVA_Build 15 93051188 3I ATCTTTCATT ---/TGA TGATAAGAGT 3070 het 3070 hom 29 12 14 5 TGA 1 2 237327 CASAVA_Build 15 93054571 1I CTTTTCCCAG -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 6 7 237328 CASAVA_Build 15 93058387 3D TGTGAACTTG ATC/--- ATTGCCATTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 4 ATC 1 0 237329 CASAVA_Build 15 93068319 1D TGGCATGGAT G/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 G 1 0 237330 CASAVA_Build 15 93073609 3I GCTCATGCAA ---/TCC TCCTACCTCA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 TCC 1 2 237331 CASAVA_Build 15 93073699 1I TGGGCTTTCA -/C TTTTTTGGCT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 C 0 1 237332 CASAVA_Build 15 93074263 2D ATTAGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 22 11 T 12 10 237333 CASAVA_Build 15 93074894 1D GATTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 12 11 237334 CASAVA_Build 15 93076990 1I GTGGGAGGGA -/G GGGGGGGAAG 3070 het 2618 hom 21 7 10 4 G 7 8 237335 CASAVA_Build 15 93077940 4I TGTATGTATG ----/TATA TATATATATA 2828 het 2828 ref 39 18 13 8 TA 7 9 237336 CASAVA_Build 15 93084430 2I CCACTTGTTT --/TA TATATATATA 3070 het 682 hom 34 2 29 4 TA 7 8 237337 CASAVA_Build 15 93089216 20D GAAGGAAAGG AGGGAGGGAAGAAGGAAGGA/-------------------- AGGGAGGGAA 3070 hom 29 het 11 0 10 3 AGGGAGGGAAGAAGGAAGGA 1 0 237338 CASAVA_Build 15 93118827 1D ATGAATAGCC A/- AAAAATTTTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 6 5 237339 CASAVA_Build 15 93119365 1D TTTAATCTCC T/- TTTACCACAG 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 4 3 237340 CASAVA_Build 15 93122813 1D AGAAAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 10 9 237341 CASAVA_Build 15 93130846 4I ACAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 59 het 31 0 21 10 AAAC 3 4 237342 CASAVA_Build 15 93132451 4D CCTTTCTTCA TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 48 het 33 0 17 18 TTCC 6 5 237343 CASAVA_Build 15 93135236 1I TCTTAATTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 43 0 31 12 T 9 10 237344 CASAVA_Build 15 93138624 1D11M1D GTATCCGCTA TATTCAGAAGTCT/-AATCAGAAGAC- AATTTCAAAA 3070 hom 108 het 36 0 37 3 N/A 0 0 237345 CASAVA_Build 15 93143047 1D CACTAAAAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 10 9 237346 CASAVA_Build 15 93146913 14D GTGCTGCAAC CTAGGAATTGGGAG/-------------- CTCACTCTCA 3070 hom 105 het 37 0 36 3 CTAGGAATTGGGAG 1 0 237347 CASAVA_Build 15 93165872 2I GCAAGTGACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 49 0 37 12 T 12 14 237348 CASAVA_Build 15 93182204 4D AAAGCTGTGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 27 5 A 15 11 237349 CASAVA_Build 15 93183082 1D CTGCCTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 607 hom 44 2 35 8 A 13 12 237350 CASAVA_Build 15 93183709 10D CTTTCTCATC TTCTTTTTCT/---------- TTCTTTTTCT 3070 hom 101 het 39 0 33 9 TTCTTTTTCT 2 1 237351 CASAVA_Build 15 93188055 1I GAGGTGGTGG -/T TGTTCGGTTA 3070 hom 105 het 36 0 35 1 T 1 2 237352 CASAVA_Build 15 93191433 1D CTCCTAAGTA G/- GCTGGGATTA 3070 hom 46 het 34 1 32 1 G 2 1 237353 CASAVA_Build 15 93194310 1D TTCAGAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 26 5 T 11 10 237354 CASAVA_Build 15 93199670 1D AGAAAAGGAA G/- CAGTAAGAAA 3070 hom 43 het 19 0 15 5 G 1 0 237355 CASAVA_Build 15 93202441 12D GAGACTCATC TTGAAAACGTGA/------------ AAAAGGACTC 3070 het 3070 hom 47 22 22 10 TTGAAAACGTGA 1 0 237356 CASAVA_Build 15 93203184 1D AAGCCTTGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 9 8 237357 CASAVA_Build 15 93212454 1I CACACTTCTT -/C TTTTTTTTTT 2981 het 1769 hom 27 10 11 6 C 0 1 237358 CASAVA_Build 15 93229701 2I GCATTCAGAC --/TT ATAATTTTTT 3070 het 1930 hom 16 5 9 2 T 0 2 237359 CASAVA_Build 15 93233881 1D AGTTTTTCTA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 7 6 237360 CASAVA_Build 15 93236930 2I GAATAATTAA --/AT ATTAATTTAT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 AT 1 2 237361 CASAVA_Build 15 93244967 4I TACCTTGCTC ----/TCTG TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TCTG 0 1 237362 CASAVA_Build 15 93247689 1I AAGCTGTAAT -/A CAGAAGTATA 3070 het 3070 ref 58 26 21 11 A 0 1 237363 CASAVA_Build 15 93251835 2D TTTTCATATA TT/-- TGTTGGCCAC 3070 het 3070 ref 30 15 11 6 T 3 1 237364 CASAVA_Build 15 93253105 1D CTTTTTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 12 11 237365 CASAVA_Build 15 93256124 2I ATTAAATTAT --/AA GTGTAGACAT 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 0 2 237366 CASAVA_Build 15 93256314 1D GCAAACTGTT A/- ATGGCATTTT 3070 het 3070 hom 45 12 24 10 A 2 1 237367 CASAVA_Build 15 93257580 1D38M1I ATTTGCATTT AAAAAATTGATATAGAGATATTCGAGTTTTAGATTTTTT-/-AAAAATTGATATAGAGATATTCGAGTTTTAGATTTTTTC CTGAATCAGT 3070 het 3070 ref 45 26 24 4 N/A 0 0 237368 CASAVA_Build 15 93257761 1D TTCTTTTATT C/- CTAGTATTGA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 C 2 1 237369 CASAVA_Build 15 93258260 2D CAGTTTGTTG CA/-- CAGAGTATGT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 CA 2 1 237370 CASAVA_Build 15 93263032 3D TGAGAAACTA GTT/--- GTTTATCCCT 3070 het 3070 ref 26 15 7 7 GTT 2 1 237371 CASAVA_Build 15 93263837 8I TGACCCATCA --------/ATTCAGAT ATGAGAACCT 3070 het 3070 hom 59 21 32 6 ATTCAGAT 0 1 237372 CASAVA_Build 15 93265421 3I CAAGGCATTT ---/CTC CTCATTGTGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTC 1 2 237373 CASAVA_Build 15 93297151 1I TAATAATTGC -/T TTCATGAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 2 3 237374 CASAVA_Build 15 93303377 1D TAGTCTAGTG T/- AACTACAAGA 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 T 1 0 237375 CASAVA_Build 15 93314222 2D TTATGCAAAC AT/-- GTGTGCATAT 3070 het 3070 ref 52 29 19 6 AT 1 0 237376 CASAVA_Build 15 93333892 4D TTTTGACTAT ATAG/---- ATAGATAGAG 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 ATAG 3 2 237377 CASAVA_Build 15 93348925 8I TTTAAAAGTA --------/TGTGAGTG TGTGAGTGTG 3070 het 3070 ref 43 21 10 12 TGTGAGTG 1 2 237378 CASAVA_Build 15 93414561 1D TTAACATTGC A/- TTTTATAAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 0 237379 CASAVA_Build 15 93416241 1I TTTCAAGATC -/T TTTAATTATA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 3 4 237380 CASAVA_Build 15 93425849 1D CTTATTTATC T/- TTTTTTTTTT 1555 het 1555 ref 45 26 4 15 T 13 12 237381 CASAVA_Build 15 93455160 1D CAACCCCCAA T/- TTTTTTTTTT 2179 het 2179 ref 35 16 8 11 T 15 14 237382 CASAVA_Build 15 93461004 1D GAAAAAAATC T/- TAAAATTTAT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 2 1 237383 CASAVA_Build 15 93463163 3I TACCTGCTGG ---/TTT TTTTTTTTTT 2984 het 2984 ref 37 17 9 11 T 10 13 237384 CASAVA_Build 15 93493806 1D ATACAAATTG A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 7 6 237385 CASAVA_Build 15 93513681 1D TAGTCCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2437 hom 23 9 9 5 A 13 12 237386 CASAVA_Build 15 93525615 1I TGTGAAGGTG -/T TTTTTTTTTT 2878 het 2878 ref 48 23 9 16 T 11 12 237387 CASAVA_Build 15 93533775 7D GGGATGATCA TATGGTT/------- TTTGCTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 20 6 TATGGTT 1 0 237388 CASAVA_Build 15 93533955 14I TTTGCCTGAA --------------/GTGTGTGTATGTGT GTGTGTGTCT 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 GTGTGTGTATGTGT 0 1 237389 CASAVA_Build 15 93543869 1I GGCATCTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 A 9 10 237390 CASAVA_Build 15 93555237 4D GAAAAAAAAA AAAG/---- AATAACGAGT 3070 het 3033 hom 28 7 18 5 AAAG 1 0 237391 CASAVA_Build 15 93572311 4D GGCAACTTAG ATCA/---- ATCACAAGGT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 ATCA 2 1 237392 CASAVA_Build 15 93572607 4I TAAAAAGCCT ----/CAGG CAGGGCATAG 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 CAGG 1 2 237393 CASAVA_Build 15 93573043 2I TGAAAAATTA --/TC TGAGTCTATG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 TC 0 1 237394 CASAVA_Build 15 93576211 10D CAAAGACAGA AAACAAAAAC/---------- AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 13 12 8 AAACAAAAAC 2 1 237395 CASAVA_Build 15 93581942 4D ATTCTGTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 2574 hom 18 6 9 3 AAAT 4 3 237396 CASAVA_Build 15 93583635 1D8M1D GAGAGAGGAA TGGAAGGAGA/-GGAAGGAG- AGCAGGAGGG 3070 hom 56 het 20 0 17 5 N/A 0 0 237397 CASAVA_Build 15 93584249 1I AAACACTAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2014 hom 19 6 12 1 T 8 9 237398 CASAVA_Build 15 93598989 1D GCATCAGTAG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 T 8 7 237399 CASAVA_Build 15 93605244 1D ATTTTCTGCC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 T 9 8 237400 CASAVA_Build 15 93606786 1D CTGATTTATT A/- AAATTTCATC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 4 3 237401 CASAVA_Build 15 93609235 4D TGTATCGCAT GACG/---- TTCACCTCCC 3070 het 3070 hom 70 32 33 9 GACG 1 0 237402 CASAVA_Build 15 93621179 20D CTCTTACTTG GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/-------------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 24 10 10 7 GT 19 9 237403 CASAVA_Build 15 93629982 1D TATAAGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2910 hom 24 9 12 4 A 13 12 237404 CASAVA_Build 15 93675987 1I ATAATAAAAG -/A AAAAAATAAA 2741 hom 15 het 7 0 6 1 A 6 7 237405 CASAVA_Build 15 93677822 1D TTTTAAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 38 0 32 6 T 13 12 237406 CASAVA_Build 15 93683250 1D GTTTTTCATA T/- TGTTGTCACT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 2 1 237407 CASAVA_Build 15 93685838 8I TCTTACAGAG --------/TTATGTTA TTATGTTATT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TTATGTTA 1 2 237408 CASAVA_Build 15 93686028 1I ATACACCTGA -/G GATTATACAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 G 1 2 237409 CASAVA_Build 15 93700812 1I CCATCACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 9 10 237410 CASAVA_Build 15 93702257 1I CCCCGTCTCT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 25 0 19 6 A 8 9 237411 CASAVA_Build 15 93712444 1I TGTTGGGGGG -/A AAAAAAACCC 3070 hom 92 het 37 0 31 6 A 7 8 237412 CASAVA_Build 15 93779751 1I GCATTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2087 het 2087 ref 19 9 5 5 A 12 13 237413 CASAVA_Build 15 93783624 1D TATTCCTCCA C/- CCCCCCACTC 3070 het 109 hom 25 2 17 6 C 7 6 237414 CASAVA_Build 15 93785600 1D GAAAGGGGCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 8 7 237415 CASAVA_Build 15 93785857 4D TCAGATAGTT TATA/---- TATATATATA 1119 het 1028 hom 9 3 3 3 TA 12 10 237416 CASAVA_Build 15 93787585 1D AGGACATCAG A/- CATAAGAAGT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 1 0 237417 CASAVA_Build 15 93788325 1D TGCCAAGGTA T/- TTTTTTTTTT 1160 het 1160 ref 31 25 3 5 T 11 10 237418 CASAVA_Build 15 93790298 1I ATTTTTGGTA -/T TTTTTTTAGT 2702 hom 15 het 7 0 6 1 T 7 8 237419 CASAVA_Build 15 93817060 2D TCTTATATAC AT/-- ACATATAGTA 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 AT 1 0 237420 CASAVA_Build 15 93850925 4I CAATCTATCA ----/ATCT ATCTGTCTAT 3070 het 366 hom 40 4 26 10 ATCT 1 2 237421 CASAVA_Build 15 93854635 1D TCGCCAGCCA T/- TTACCATTCA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 T 3 2 237422 CASAVA_Build 15 93879163 5D ATCTCAATGC TTTAT/----- TTTATTTTAT 3070 hom 84 het 40 0 29 11 TTTAT 5 4 237423 CASAVA_Build 15 93882352 3D CCTGGAACTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 30 9 A 14 11 237424 CASAVA_Build 15 93892909 2D CCTTTTGTTG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 11 9 237425 CASAVA_Build 15 93896815 1D TGTAATTTTT G/- GCATATCACT 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 G 2 1 237426 CASAVA_Build 15 93897147 2I TGTATATATG --/TA TATATGTGTG 2226 het 5 hom 17 1 12 4 TA 2 3 237427 CASAVA_Build 15 93898755 2D TCAATAAAAT TA/-- TATATATACT 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 TA 5 4 237428 CASAVA_Build 15 93902112 1D ACCTTGTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 A 10 9 237429 CASAVA_Build 15 93903537 1I AGAAATATTT -/A ACAATACAGT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 A 1 2 237430 CASAVA_Build 15 93905355 1D ACTAAATTCA C/- AGGGAAACTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 0 237431 CASAVA_Build 15 93905451 1D ATATATATGA G/- ATATATATGT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 1 0 237432 CASAVA_Build 15 93925778 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2911 hom 38 9 16 13 T 12 13 237433 CASAVA_Build 15 93929643 1D CTTGCAGACA C/- CCCCCCCACA 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 C 8 7 237434 CASAVA_Build 15 93931977 1D TTGATAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 17 9 T 11 10 237435 CASAVA_Build 15 93949577 4I7M1D CTTATGTCAT ----TTTAAGAT/TTTCTTTAAGA- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 28 15 7 N/A 0 0 237436 CASAVA_Build 15 93960541 1D TTTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 T 10 9 237437 CASAVA_Build 15 93961133 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 9 10 237438 CASAVA_Build 15 93968150 1I CACGTATACA -/T TTTTAGGCTG 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 4 5 237439 CASAVA_Build 15 93974607 1I CATTAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 T 10 11 237440 CASAVA_Build 15 93978544 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TA 7 6 237441 CASAVA_Build 15 93985434 1I TTAGCTATGG -/C CAGTGATGCT 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 C 1 2 237442 CASAVA_Build 15 93993328 2D AATAATATAA CT/-- CTTAATTTGA 3070 het 1606 hom 21 4 14 5 CT 2 1 237443 CASAVA_Build 15 93994821 6I TCTGAGAAGA ------/CAGTTC CAGTTCTAGT 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 CAGTTC 1 2 237444 CASAVA_Build 15 93996657 3I ATAAAAGAAA ---/AAG AAGCTCTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AAG 1 2 237445 CASAVA_Build 15 93997207 3I AGAATCATAT ---/TAA TAATAATAAA 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 TAA 3 4 237446 CASAVA_Build 15 94008731 1I AACTACCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 11 12 237447 CASAVA_Build 15 94021217 1I GAAAAACACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 9 13 12 T 9 10 237448 CASAVA_Build 15 94023550 3D TATGAAAAGA TGT/--- TGTTCATCAT 3070 het 3070 hom 55 27 26 3 TGT 2 1 237449 CASAVA_Build 15 94026484 3D CTGATATTTG AGA/--- AGGACTCTGG 3070 het 3070 hom 51 23 22 10 AGA 1 0 237450 CASAVA_Build 15 94029746 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2711 het 2395 hom 27 8 9 10 T 12 11 237451 CASAVA_Build 15 94032256 1D GGATGGTCTT A/- ACGTCAGAGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 2 1 237452 CASAVA_Build 15 94037341 1D ACCAATTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 12 13 A 13 12 237453 CASAVA_Build 15 94039013 1D TATAAACAAC A/- AAAAATTAGA 3070 het 3070 hom 36 10 24 2 A 6 5 237454 CASAVA_Build 15 94060141 3D CAAAAAAAAA TAT/--- ATATATATAT 2885 hom 18 het 8 0 7 1 TAT 1 0 237455 CASAVA_Build 15 94069313 1D ACTGAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 39 1 37 1 A 11 10 237456 CASAVA_Build 15 94069948 60I ACGGTTGCTC ------------------------------------------------------------/ATACTTACAACGAACAAATTAAATTAAAATTTGCCTTTAACAGAAAGGTGCTATGGGACT ATCTTTGAGT 3070 hom 30 het 12 0 11 3 ATACTTACAACGAACAAATTAAATTAAAATTTGCCTTTAACAGAAAGGTGCTATGGGACT 0 1 237457 CASAVA_Build 15 94078743 2D AGTGAACTCC CT/-- CTGAGCTGCA 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 CT 2 1 237458 CASAVA_Build 15 94098195 6D TTTTCTTTTC TTTTCT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 608 hom 32 8 13 14 TTTTCT 1 0 237459 CASAVA_Build 15 94100017 1D ACTAACATGA T/- TTTTTTTTTT 1921 het 1921 ref 38 16 7 17 T 16 15 237460 CASAVA_Build 15 94100611 4D ACTAAATGCT GTAA/---- GTAACATATC 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 GTAA 2 1 237461 CASAVA_Build 15 94104357 1I GAACTGAGGG -/A AATCTAAGAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 2 3 237462 CASAVA_Build 15 94107073 2D ACACATACAC AT/-- ATCTCTTTCC 1705 het 1705 ref 37 14 6 18 AT 2 1 237463 CASAVA_Build 15 94111144 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 30 1 18 11 A 14 12 237464 CASAVA_Build 15 94118169 1I ACTAAAAAAA -/T AATAATAACA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 0 1 237465 CASAVA_Build 15 94139924 1D AGGGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 15 11 A 12 11 237466 CASAVA_Build 15 94150319 1I TGACTCTACT -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 5 6 237467 CASAVA_Build 15 94152564 1D GGGAAAAACT A/- ATCTACTGTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 5 A 2 1 237468 CASAVA_Build 15 94173805 1I GGCTTTTACT -/A AAAAGGAGCT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 4 5 237469 CASAVA_Build 15 94175728 1D ACTGCAACCT C/- CCACCTCCTA 3070 hom 77 het 30 0 24 8 C 3 2 237470 CASAVA_Build 15 94187251 1D CTATGCTGAT G/- CCCAGCCAAA 3070 het 3070 ref 56 32 17 7 G 1 0 237471 CASAVA_Build 15 94223123 1D GCAGATGTAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 9 8 237472 CASAVA_Build 15 94236303 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 594 hom 34 7 22 5 A 15 14 237473 CASAVA_Build 15 94237972 2D CATATTTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 46 1 31 15 A 16 14 237474 CASAVA_Build 15 94304755 1I GACTCACACC -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 42 12 18 12 A 6 7 237475 CASAVA_Build 15 94311189 1D TTAATTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2164 hom 23 7 13 3 T 13 12 237476 CASAVA_Build 15 94313332 1I CCCACTTGAG -/C TGAGCAGTAG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 C 0 1 237477 CASAVA_Build 15 94318889 1D AAACACTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 12 11 237478 CASAVA_Build 15 94322668 1D GCATTATGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 54 21 25 8 T 10 9 237479 CASAVA_Build 15 94324011 2I AGGAACTGGT --/CA CAGGAATCGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CA 1 2 237480 CASAVA_Build 15 94328444 2D ATCTCATGAG CA/-- CACACACACA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 CA 10 9 237481 CASAVA_Build 15 94345866 1I ACTCAGAATG -/C CCCAGGTTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 3 4 237482 CASAVA_Build 15 94355844 1D71M2D TAAAAAAATG AAAAAAAAAAAGATATGGTAATGGAGTTCTACACTGTAGCCTGATAACTTAAATTCCACTTAACTGACTCTCTT/-AAAAAAAAAAGATATGGTAATGGAGTTCTACACTGTAGCCTGATAACTTAAATTCCACTTAACTGACTCTC-- TCTTATTTCC 3070 het 230 hom 30 1 26 22 N/A 0 0 237483 CASAVA_Build 15 94356254 1D GTCCCATAGA C/- CCCCTTGCCC 3070 het 3070 hom 41 16 23 4 C 5 4 237484 CASAVA_Build 15 94362703 1D AGGGTATTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 10 9 237485 CASAVA_Build 15 94366898 1D TTCAGGCTAC A/- AAATGAATTA 3070 hom 114 het 44 0 38 7 A 4 3 237486 CASAVA_Build 15 94381486 24D CGTGTGGGGC GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/------------------------ GTGTGTGTGT 3070 het 2492 hom 36 9 14 18 GT 17 5 237487 CASAVA_Build 15 94394394 1D TGTTTTTGTC A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 8 7 237488 CASAVA_Build 15 94398939 2I CTCCCATCCT --/GA GAGATAGCAG 2854 het 2175 hom 13 6 6 1 GA 2 3 237489 CASAVA_Build 15 94408364 16I GAAAGGATAC ----------------/AGATTAGAATCAGCAA AGAGAGGAGG 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 AGATTAGAATCAGCAA 0 1 237490 CASAVA_Build 15 94414173 1I GCCTTGGCCT -/C CCAAAGTGTT 2196 hom 12 het 5 0 5 0 C 2 3 237491 CASAVA_Build 15 94416101 6I ACCATGGTTC ------/ATATAA ATATAGTATA 3070 het 3070 ref 18 8 8 2 ATATAA 0 1 237492 CASAVA_Build 15 94418935 1D TTGGCCTCCC A/- AAAGTGCTGG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 4 3 237493 CASAVA_Build 15 94420095 2D CACCTAAATA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 72 het 34 0 25 10 AC 9 8 237494 CASAVA_Build 15 94420502 1D AATACAGTAC T/- TTTGATGACA 3070 het 3070 ref 45 24 17 6 T 4 3 237495 CASAVA_Build 15 94421879 3D CATCATCACT ATC/--- ATCATCATTT 3049 het 3049 ref 37 23 11 3 ATC 3 2 237496 CASAVA_Build 15 94428868 1D TTGAAATCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 88 het 38 0 30 8 T 10 9 237497 CASAVA_Build 15 94432269 1D ACCTTCCCCC T/- TCTCTAACCT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 T 2 1 237498 CASAVA_Build 15 94432499 1D CACACATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 11 10 237499 CASAVA_Build 15 94446852 1D AATTATAGAT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 232 hom 43 1 36 7 A 1 0 237500 CASAVA_Build 15 94447713 1I ATATGAGAAT -/G GGGGGGATAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 6 7 237501 CASAVA_Build 15 94456785 4I AATTTAGCTA ----/AATT AATAGTGACC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AATT 0 1 237502 CASAVA_Build 15 94460277 1I CTCCAAATCA -/T TTATGTGTAC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 2 3 237503 CASAVA_Build 15 94463793 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 1644 het 1644 ref 15 10 5 0 G 3 4 237504 CASAVA_Build 15 94472935 1D TCATATGATT A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 8 7 237505 CASAVA_Build 15 94479077 1D21M2D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAC/-AAAAAAAAAAACAAAAAAAAA-- CCAGTATTTT 3070 het 2899 hom 20 13 20 5 N/A 0 0 237506 CASAVA_Build 15 94479475 1I GCTGGGGATA -/T AACCCACAAT 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 T 0 1 237507 CASAVA_Build 15 94479641 1D AGTGAGTGTT A/- ACAGTTCTTA 571 het 571 ref 16 10 3 3 A 2 1 237508 CASAVA_Build 15 94482880 4D AAAACAAAAC AAAA/---- AAAACAGCAA 549 het 32 hom 20 1 4 17 A 8 4 237509 CASAVA_Build 15 94495957 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 39 het 19 0 14 8 A 8 7 237510 CASAVA_Build 15 94514690 1I CAGGTACTTG -/C GGGGGCGGTG 1314 hom 11 het 7 0 3 4 C 0 1 237511 CASAVA_Build 15 94519007 1D TTATTACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 67 hom 27 1 21 5 T 12 11 237512 CASAVA_Build 15 94529683 3D ACTTGTTTCT TGC/--- TGAAGGACGA 3070 het 3070 ref 73 36 31 9 TGC 1 0 237513 CASAVA_Build 15 94536166 1D ATATATTGCA T/- TTTTGTGTTT 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 T 5 4 237514 CASAVA_Build 15 94562962 2I GGACATGGAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 AT 5 6 237515 CASAVA_Build 15 94568931 2I CAGTAACCTA --/CT GAGTAACCTA 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 CT 0 1 237516 CASAVA_Build 15 94576310 6D TCCAAAAAAC AAAAAG/------ AAATAGACCA 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 AAAAAG 1 0 237517 CASAVA_Build 15 94579071 2D AGCTCTTCAT TC/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 TC 1 0 237518 CASAVA_Build 15 94591392 1I ATTTATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 10 12 T 11 12 237519 CASAVA_Build 15 94591532 1D CAATAGGTAG T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 T 8 7 237520 CASAVA_Build 15 94597103 1D AAACTTTAAG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 A 7 6 237521 CASAVA_Build 15 94597435 1I ACAGTAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 10 11 237522 CASAVA_Build 15 94598812 5D TTATAAGACA CACTG/----- CACTGCTAAT 3070 het 3070 hom 45 17 25 5 CACTG 2 1 237523 CASAVA_Build 15 94600165 1I ACCTTATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 14 12 14 A 13 14 237524 CASAVA_Build 15 94601513 1I CTTGCCCACA -/T TTTTAAAATT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 4 5 237525 CASAVA_Build 15 94602376 1D CCCTCTCCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 10 9 237526 CASAVA_Build 15 94619603 1D TCAACCCCCA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 C 8 7 237527 CASAVA_Build 15 94622075 1I CTCGATCTGC -/T TTTTTCGCCT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 5 6 237528 CASAVA_Build 15 94622981 11D TATTTCTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 27 0 24 5 T 22 11 237529 CASAVA_Build 15 94682269 4I TACCTCTAGC ----/AACA TGTTCTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 24 3 AACA 0 1 237530 CASAVA_Build 15 94697779 9I CTTCCCTCTT ---------/CCCCAGATC CCCCAGATCC 3070 het 2646 hom 24 8 10 6 CCCCAGATC 1 2 237531 CASAVA_Build 15 94703727 11D CTAGTCTCTT TCCCCCAAGAC/----------- TCCCCGAGGT 2822 het 2822 ref 29 13 8 12 TCCCCCAAGAC 1 0 237532 CASAVA_Build 15 94708481 1I TCAATAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 64 hom 38 1 34 3 A 9 10 237533 CASAVA_Build 15 94716009 11D CCAGGCACAG TGGCTCACACC/----------- TGTAATCCCA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TGGCTCACACC 1 0 237534 CASAVA_Build 15 94722397 1I GTAGTCAATG -/A AAAAATTCTT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 5 6 237535 CASAVA_Build 15 94725645 3D CTGGGCCTGG CTT/--- CTTCTTGGTA 3070 hom 83 het 31 0 24 8 CTT 3 2 237536 CASAVA_Build 15 94726265 1D TTATTTATGT C/- CTTCTACACC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 2 1 237537 CASAVA_Build 15 94726353 8D AATTATTAAA CATTCAAT/-------- CATTCAATCA 3070 hom 51 het 24 0 18 8 CATTCAAT 2 1 237538 CASAVA_Build 15 94728289 4D TTCACCCTCC CCTT/---- CCTTCCTTCC 1878 het 1878 ref 38 13 10 16 CCTT 6 5 237539 CASAVA_Build 15 94731506 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAGTAG 1738 het 1738 ref 14 9 4 1 A 7 6 237540 CASAVA_Build 15 94735423 2D CTCATCTATA TG/-- TTGTTAAATC 3070 het 3070 hom 55 21 32 2 TG 1 0 237541 CASAVA_Build 15 94737680 1I TTCATAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 8 9 237542 CASAVA_Build 15 94739556 1I TTTTTCTTTT -/C TCTTATTTAT 3070 het 559 hom 36 5 21 10 C 0 1 237543 CASAVA_Build 15 94739980 1D CTCTTCCTTC T/- TTTTTTCACT 3070 hom 77 het 31 0 21 11 T 7 6 237544 CASAVA_Build 15 94740899 13I CTCAAGTGAT -------------/CCTCCCGTGTTAG CCTCCCAAGT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 CCTCCCGTGTTAG 0 1 237545 CASAVA_Build 15 94742291 1D TTCCATAACA G/- GGGGTCGTCA 3070 hom 154 het 55 0 52 4 G 5 4 237546 CASAVA_Build 15 94757810 1I GAAGTGCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 11 12 237547 CASAVA_Build 15 94760099 3I AATAGTTGCA ---/AAT GAATACATTC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 AAT 0 1 237548 CASAVA_Build 15 94763338 1I GCTAGCAATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 8 9 237549 CASAVA_Build 15 94764198 10D CAGGGATACT AAGGCAGACC/---------- AAGCAAGGTG 3070 het 3070 ref 44 27 17 1 AAGGCAGACC 1 0 237550 CASAVA_Build 15 94855165 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2529 het 2529 ref 46 18 17 11 T 13 14 237551 CASAVA_Build 15 94860748 1D TCTTTGCCCC T/- GGACCTGCCT 3070 het 3070 ref 38 19 14 7 T 1 0 237552 CASAVA_Build 15 94860897 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1957 het 1631 hom 30 8 9 14 T 18 16 237553 CASAVA_Build 15 94880499 1D ATATCTCCCT G/- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 G 4 3 237554 CASAVA_Build 15 94881041 1D TGGCTGTTAG T/- TTTTTTCCTC 3070 het 1257 hom 23 9 12 2 T 7 6 237555 CASAVA_Build 15 94881058 1D CCTCTGCCCA C/- CCCCCTACCC 1660 het 384 hom 21 4 11 6 C 6 5 237556 CASAVA_Build 15 94881811 2I ATTTTCCTGC --/AA AAACTCCTCA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 3 5 237557 CASAVA_Build 15 94885157 2I CTCAGGGAAG --/GA AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 GA 0 1 237558 CASAVA_Build 15 94906959 1D GACATCTAAA G/- AAGGTTTGCA 3070 het 3070 ref 60 28 25 7 G 1 0 237559 CASAVA_Build 15 94910178 1I TGGATTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2838 het 2838 ref 29 16 8 5 T 11 12 237560 CASAVA_Build 15 94910458 1D TCAAAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 996 het 996 ref 39 27 3 9 A 13 12 237561 CASAVA_Build 15 94912124 1D TCATGAGTTA T/- TTTTTTTTTC 1248 het 1248 ref 34 26 3 5 T 10 9 237562 CASAVA_Build 15 94916417 1I TTTTGAGTAT -/A AAAATGCATC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 A 4 5 237563 CASAVA_Build 15 94916505 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 T 13 12 237564 CASAVA_Build 15 94927224 1I TATTTCAAAG -/A ATATTGATAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 1 2 237565 CASAVA_Build 15 94930669 1I GACTTTGATA -/C CCCCCCCTTT 3070 hom 49 het 25 0 18 7 C 7 8 237566 CASAVA_Build 15 94932629 1D GTCCAAAAAA T/- AAAAAAAAGA 3070 het 1400 hom 33 6 18 9 T 1 0 237567 CASAVA_Build 15 94935736 1D CACATTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 831 hom 51 4 28 19 T 15 14 237568 CASAVA_Build 15 94935751 1D TTTTTTTTTT A/- TGAAAGTCTG 3070 het 1016 hom 42 8 29 6 A 1 0 237569 CASAVA_Build 15 94937505 4D TATATCTATT TATC/---- TATATACCTT 3070 het 3070 ref 44 22 20 3 TATC 1 0 237570 CASAVA_Build 15 94952860 2D52M4I CAATTTTCAC ATGTTTATTTTTACTAGGAATTATTTTTTCAGAGATGGTTATATGAAGGGTCAT----/--GTTTATTTTTACTAGGAATTATTTTTTCAGAGATGGTTATATGAAGGGTCATTAGA TAGACAGGCT 3070 het 3070 ref 28 17 17 10 N/A 0 0 237571 CASAVA_Build 15 94959196 1D CAAAAAAATA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 8 7 237572 CASAVA_Build 15 94965522 1D TGAAATACAC T/- TTGGTGACCT 3070 het 3070 ref 53 24 24 6 T 3 2 237573 CASAVA_Build 15 95030194 1D CTGATCAAGG A/- AATGTAAATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 2 237574 CASAVA_Build 15 95030929 10D ATCTCTACTA ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3029 hom 18 het 8 0 7 1 AT 14 9 237575 CASAVA_Build 15 95040568 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1136 het 428 hom 30 2 7 22 T 12 10 237576 CASAVA_Build 15 95047308 1I GTGCCAGATG -/A AAAGATAGGG 3070 hom 148 het 52 0 50 2 A 3 4 237577 CASAVA_Build 15 95048832 2D GCCATTCAAT TA/-- TGTTTTCCAA 3070 hom 95 het 37 0 32 5 TA 1 0 237578 CASAVA_Build 15 95055500 4I ATTTGATAAA ----/TGAT TGAATTTTAG 3070 hom 129 het 53 0 44 9 TGAT 0 1 237579 CASAVA_Build 15 95079693 1D CTGAGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 T 11 10 237580 CASAVA_Build 15 95094076 1D GTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2033 het 666 hom 26 3 10 13 T 17 16 237581 CASAVA_Build 15 95095367 6I GTGAGATCAG ------/AGGTTA AGCTTATGGA 3070 hom 150 het 54 0 50 4 AGGTTA 0 1 237582 CASAVA_Build 15 95104234 1I CCTAAGGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 A 12 13 237583 CASAVA_Build 15 95109380 1I CAGCCTGAGT -/G CGGTCTCTGG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 G 0 1 237584 CASAVA_Build 15 95126804 1D ACCCAGCCAA C/- CCTGACTGGT 3070 hom 112 het 43 0 37 7 C 3 2 237585 CASAVA_Build 15 95152920 3I ATATTCTATC ---/ATT ATCATTATTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 ATT 0 1 237586 CASAVA_Build 15 95168898 1D AATAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 31 1 25 5 A 12 11 237587 CASAVA_Build 15 95169955 10D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAC/---------- ATTAACTACA 3070 het 37 hom 22 1 18 6 AAAAAAAAAC 1 0 237588 CASAVA_Build 15 95177965 1D GCCCTTCTTG T/- TTTTTTATCT 3070 hom 74 het 31 0 26 5 T 7 6 237589 CASAVA_Build 15 95178953 1D TATTTCTGCC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 9 8 237590 CASAVA_Build 15 95181579 1I CCTGAGCTCA -/G GAGTTCGAGA 3070 hom 72 het 30 0 22 9 G 1 2 237591 CASAVA_Build 15 95181682 1D CCAGCTACTC A/- GGGGGGCGCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 1 0 237592 CASAVA_Build 15 95182879 1D TGTGAAATAT A/- TATTTGGTCT 3070 hom 126 het 48 0 43 6 A 1 0 237593 CASAVA_Build 15 95186026 1I AGTCAATGCC -/T GGCTTTAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 0 1 237594 CASAVA_Build 15 95186264 2I TACTGCTCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 34 1 25 8 A 12 14 237595 CASAVA_Build 15 95186993 20I GACTGAATTG --------------------/TTACAATTGCATGATCAAAC TTGAGTGCAT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TTACAATTGCATGATCAAAC 0 1 237596 CASAVA_Build 15 95188860 1I CCTATTGACC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 7 8 237597 CASAVA_Build 15 95219779 6D AAATGTGTAT TGAGAA/------ TAAGACGGCC 2280 het 2280 ref 12 7 5 0 TGAGAA 1 0 237598 CASAVA_Build 15 95223712 1I ATTTCAGGAG -/A GTCCCTACCT 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 A 0 1 237599 CASAVA_Build 15 95225034 1I TCTAGATTAC -/A ACATGCTTTC 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 A 1 2 237600 CASAVA_Build 15 95234748 1D CAGCAATATC T/- TTTTTTTTTT 2655 het 2655 ref 36 14 6 16 T 15 14 237601 CASAVA_Build 15 95241918 1D GAACTCATCA T/- TTTTTTATGG 3070 het 979 hom 19 3 10 6 T 7 6 237602 CASAVA_Build 15 95260989 1I AGACTGAGGA -/T TTCATATATT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 2 3 237603 CASAVA_Build 15 95264367 2D TTTTGAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 8 A 12 10 237604 CASAVA_Build 15 95265700 2D ACCGTGCCTG TA/-- ATCTAACCTA 3070 hom 96 het 36 0 31 7 TA 1 0 237605 CASAVA_Build 15 95266149 1I ATCTTTTATC -/T GTTTTTTCAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 237606 CASAVA_Build 15 95267933 9I CTATCTTGAT ---------/CTCATTTCA CTCATTTCAT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 CTCATTTCA 1 2 237607 CASAVA_Build 15 95273500 1D GCTGTGGCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 40 1 28 11 T 10 9 237608 CASAVA_Build 15 95275308 1I TTACCAGCAG -/C CCCCCCACTG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 C 6 7 237609 CASAVA_Build 15 95276641 1D ATCTGATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 11 10 237610 CASAVA_Build 15 95277205 1I TCTTCATTAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 8 9 237611 CASAVA_Build 15 95279017 5D TGGGAAAGAG AAGAA/----- AATTGAATGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 AAGAA 1 0 237612 CASAVA_Build 15 95280957 1I AATAGAGGCT -/C TAATTAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 0 1 237613 CASAVA_Build 15 95281313 1D TAGCCTCAAG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 8 7 237614 CASAVA_Build 15 95283217 1D TATCTTTCAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 8 7 237615 CASAVA_Build 15 95285487 1I AGATCACTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 9 10 237616 CASAVA_Build 15 95285882 6D51M2I GAGCAACTGT TAGAAATAGACAAAAAATTAATAAGAATATACATTATTTGGATTATGATTTTCAGAC--/------TAGACAAAAAATTAATAAGAATATACATTATTTGGATTATGATTTTCAGACTT AACTTTATTT 3070 hom 99 het 18 0 34 3 N/A 0 0 237617 CASAVA_Build 15 95286048 5I GCCATAAAAT -----/AACTC AACAAATTTC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 AACTC 0 1 237618 CASAVA_Build 15 95287108 1I ACATTGAAGG -/A AAAAATAATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 5 6 237619 CASAVA_Build 15 95308658 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 753 hom 17 2 12 3 A 9 8 237620 CASAVA_Build 15 95319652 1I CTATTTACTA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 6 7 237621 CASAVA_Build 15 95325839 4I TCTGTTTATT ----/ACAA ACAAAATTAA 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 ACAA 1 2 237622 CASAVA_Build 15 95335176 14I ACTATTACCT --------------/ACTAAATCGCTTAG AAATGAGAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 ACTAAATCGCTTAG 0 1 237623 CASAVA_Build 15 95335816 1I TTTTTGGGCT -/G GGGGGGGGCT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 G 8 9 237624 CASAVA_Build 15 95353808 1I CCTCTCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 44 2 33 9 A 13 14 237625 CASAVA_Build 15 95356247 5I GTTCCGTCTT -----/TACTC TAAGATCATA 3070 hom 126 het 47 0 41 6 TACTC 0 1 237626 CASAVA_Build 15 95356668 2D CAACTCAATT AG/-- AGTCTCTATT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AG 2 1 237627 CASAVA_Build 15 95358792 1D TACCAATTAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 7 237628 CASAVA_Build 15 95359403 1D TTTTGAAGAG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 7 237629 CASAVA_Build 15 95360516 4D21M1D GTGAACAAAA AGATAGAACTCAATAGCAATACATTG/----AGAACTCAATAGCAATACATT- GAGGTAAAAT 3070 hom 63 het 19 0 22 4 N/A 0 0 237630 CASAVA_Build 15 95362131 3D TAGTATATTC TGA/--- GTCATTATCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TGA 1 0 237631 CASAVA_Build 15 95362978 4D ATGTAGGCTA TTAG/---- TTAGCTTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTAG 2 1 237632 CASAVA_Build 15 95365981 2I AAATCTCTCC --/CT CTGTCTCTCT 3070 hom 65 het 28 0 22 6 CT 1 2 237633 CASAVA_Build 15 95367789 1I GACTGAAAAC -/T TTTCACCCAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 3 4 237634 CASAVA_Build 15 95368204 4I GAAAGAAGAA ----/AAAT AAAACCAAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAAT 0 1 237635 CASAVA_Build 15 95379750 1D CATTATAAGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 9 8 237636 CASAVA_Build 15 95407138 1D TTTACTGCTA C/- TGTTGCAGCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 0 237637 CASAVA_Build 15 95410104 4I CGTGATGACT ----/GAAA GAAAGAGGAG 3070 hom 146 het 55 0 48 7 GAAA 1 2 237638 CASAVA_Build 15 95418868 1I AAAAAAACCC -/A AAAAAAACAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 8 237639 CASAVA_Build 15 95457925 4D CCTTTTAGTG TTTC/---- TTTATTTACT 3070 hom 48 het 22 0 17 6 TTTC 1 0 237640 CASAVA_Build 15 95463642 1D CACACCATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 10 9 237641 CASAVA_Build 15 95477161 1D CCTGGAATTC T/- TTTTTTTTTT 1232 het 1232 ref 42 28 4 10 T 13 12 237642 CASAVA_Build 15 95485700 3D ACCTACAAAG AGA/--- AGTACTTTTT 3070 het 3070 ref 50 27 21 3 AGA 1 0 237643 CASAVA_Build 15 95485908 1D TCTTTTTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 11 10 237644 CASAVA_Build 15 95491772 1D GTGGGCAGAC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 53 het 29 0 17 12 A 8 7 237645 CASAVA_Build 15 95495083 4I ATATTGGTGA ----/ATTT ATTCTAATTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATTT 0 1 237646 CASAVA_Build 15 95503849 3D TTAAGAAAAA AAT/--- AAATACAACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAT 1 0 237647 CASAVA_Build 15 95508735 1I TTATTTCTGG -/A AATTTGCTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 3 237648 CASAVA_Build 15 95522111 1I CAAGATGGTC -/A GTATATGGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 237649 CASAVA_Build 15 95523712 1D TTACCTGTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 10 9 237650 CASAVA_Build 15 95535015 3I TGTCAATTTA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 10 13 237651 CASAVA_Build 15 95542956 11D54M1I AGTAATTAAT GTTGCTGAAAATATATCGCATAACTTTTCAAATATTTTGTTTGGCAAAACCAAAGATGGGTTTTG-/-----------TATATCGCATAACTTTTCAAATATTTTGTTTGGCAAAACCAAAGATGGGTTTTGC CAAACACTAG 3070 hom 74 het 33 0 24 35 N/A 0 0 237652 CASAVA_Build 15 95550818 15D5M2D ATTAATTTTT CACTAAAAATAGAAGATTCACT/---------------AGTGA-- ATCTTCTATG 3070 hom 69 het 22 0 24 2 N/A 0 0 237653 CASAVA_Build 15 95557401 1I GGCTGTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 27 1 23 3 T 10 11 237654 CASAVA_Build 15 95571442 2I AAATTAGTGA --/AT GAAATCGAGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 0 1 237655 CASAVA_Build 15 95574627 1I TGTTGCAAAG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 7 8 237656 CASAVA_Build 15 95580296 1I TCCTTAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 836 hom 37 2 27 8 T 10 11 237657 CASAVA_Build 15 95582462 1I CTGTCTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 36 2 32 2 A 11 12 237658 CASAVA_Build 15 95583904 1D GATTTTTAAG A/- GCTTCCAAGA 3070 hom 111 het 46 0 37 9 A 1 0 237659 CASAVA_Build 15 95594553 14D CCCTACACAC CTTGTTTGTAAAAT/-------------- TGTCTCTCCA 3070 hom 51 het 20 0 18 5 CTTGTTTGTAAAAT 1 0 237660 CASAVA_Build 15 95598180 4D CTGGAAAATT TTTC/---- TGCATTTCTC 3070 het 3070 hom 39 19 18 5 TTTC 1 0 237661 CASAVA_Build 15 95600973 1D TTTGTTGCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 55 17 25 13 T 10 9 237662 CASAVA_Build 15 95605711 2I CAAGCAAAAG --/AT ATATTGAATC 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 AT 2 3 237663 CASAVA_Build 15 95607774 4D AGGAGAAGAA AGGG/---- AGGGAGGGAG 2530 het 1122 hom 20 5 7 9 AGGG 4 3 237664 CASAVA_Build 15 95616261 5D CAATTTTTTA TTTAC/----- TTTATTTCAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 7 TTTAC 1 0 237665 CASAVA_Build 15 95618288 2D GTCCAAAATC AG/-- TACCAGTGGG 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 AG 1 0 237666 CASAVA_Build 15 95625290 4I TGTTATGATA ----/TTAT TTGTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 TTAT 0 1 237667 CASAVA_Build 15 95625808 1I TTCCTTTATT -/A TTTTTTTCTG 3070 het 2747 hom 25 7 16 2 A 0 1 237668 CASAVA_Build 15 95632341 1I CTTTAAATTA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 7 8 237669 CASAVA_Build 15 95634461 1I TGCAGGTTAG -/T TACATATGTA 3070 het 2265 hom 16 6 8 2 T 1 2 237670 CASAVA_Build 15 95649028 2I TTTACTTTAG --/TT TTATGATCCA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 2 4 237671 CASAVA_Build 15 95663259 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 21 1 16 4 A 14 15 237672 CASAVA_Build 15 95681606 1I TGATATCAAA -/C CCCCCCCCCT 2354 het 2354 ref 31 13 15 3 C 9 10 237673 CASAVA_Build 15 95690826 2D TTAATTAAAC AT/-- ATATATTTGG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 AT 4 3 237674 CASAVA_Build 15 95693013 1I AGACAGATGG -/A AAAAACCAGT 3070 het 3070 hom 53 22 28 3 A 5 6 237675 CASAVA_Build 15 95697849 3D ATCTGCACTA AGT/--- TATTCATCAA 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 AGT 1 0 237676 CASAVA_Build 15 95722376 4D GAGTAATTAC CAAT/---- CAATCAGTAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 9 CAAT 2 1 237677 CASAVA_Build 15 95748968 4I GCCCAAAAGA ----/CTAT CTATCTGCTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 CTAT 1 2 237678 CASAVA_Build 15 95770962 2D ACTTTCATGC TT/-- TTTTTTTTTT 1488 het 1111 hom 30 9 5 17 T 18 16 237679 CASAVA_Build 15 95779536 1I AAGTTAACAA -/G GATACCCAGG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 1 2 237680 CASAVA_Build 15 95783199 1I ATACTATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 A 11 12 237681 CASAVA_Build 15 95788399 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- CTTGTGAAGA 3070 het 207 hom 34 4 18 13 AAAG 1 0 237682 CASAVA_Build 15 95792334 4I TTCTAAACAC ----/ATAA ATAAATAAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATAA 2 3 237683 CASAVA_Build 15 95802921 1D ATCAATTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 68 het 40 1 37 2 A 10 9 237684 CASAVA_Build 15 95804540 15D TATTAAAAGC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 2701 het 2153 hom 19 10 8 6 A 26 11 237685 CASAVA_Build 15 95811719 1I ATAGTTTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 10 11 237686 CASAVA_Build 15 95813752 1D AGCTTTTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 8 7 237687 CASAVA_Build 15 95839554 10I GGTTTGCAGA ----------/TGTATGACTC TGTCCCTTCT 3070 hom 157 het 60 0 53 7 TGTATGACTC 0 1 237688 CASAVA_Build 15 95869227 1I CACAGTGAAG -/A ATTCTTAGCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 237689 CASAVA_Build 15 95878459 1D TGTGTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3019 hom 32 10 14 8 T 13 12 237690 CASAVA_Build 15 95883052 1D GAGGAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 1066 het 1066 ref 25 16 3 6 A 11 10 237691 CASAVA_Build 15 95884633 2I AAACACATAC --/AT ATATATACAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AT 3 4 237692 CASAVA_Build 15 95938758 1I CCAGACACGG -/A TCTGGTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 0 1 237693 CASAVA_Build 15 95948932 1D AAAAAAGTTT G/- GGGGGGGGGC 1493 het 1493 ref 28 8 6 14 G 10 9 237694 CASAVA_Build 15 95963666 1I GTTTTTTTAG -/T TTTTTTTCTT 2082 het 2082 ref 35 18 10 7 T 7 8 237695 CASAVA_Build 15 95964520 5I TAGATATATT -----/AATAC AATAACCTGC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AATAC 0 1 237696 CASAVA_Build 15 95965783 1I TGGAGAAAAG -/T TTTTGTTAAT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 T 4 5 237697 CASAVA_Build 15 95968564 1I AGAAAAAAAA -/T CTAATAAGAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 237698 CASAVA_Build 15 95970665 1D TAACCCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 774 hom 30 4 19 8 A 15 14 237699 CASAVA_Build 15 95974782 1I CATGTACTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 T 9 10 237700 CASAVA_Build 15 95996698 1I TACCACGGGG -/A AAAAAAAAAT 1992 het 1992 ref 24 10 6 8 A 9 10 237701 CASAVA_Build 15 96004257 1I AACAGGCTGT -/G GGGCTTGTGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 G 3 4 237702 CASAVA_Build 15 96006754 1I GTCACATACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 9 10 237703 CASAVA_Build 15 96007716 8D GCTTTGTTCC TTTGCTCT/-------- TCACGATAAA 3070 het 3070 ref 32 21 8 5 TTTGCTCT 1 0 237704 CASAVA_Build 15 96010773 1I TCTGAATGCA -/C CCATCTGAAT 1292 het 1292 ref 50 26 5 19 C 2 3 237705 CASAVA_Build 15 96036616 1D ATTACTGTGG T/- TTTTCTGGGC 3070 hom 110 het 44 0 33 12 T 5 4 237706 CASAVA_Build 15 96038513 5I CTAGTTTTGT -----/TGTCG TGTCGTTGTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 TGTCG 1 2 237707 CASAVA_Build 15 96048807 1D CAACCAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 22 2 13 7 T 13 12 237708 CASAVA_Build 15 96055545 8I GTTCTCCTCC --------/TTGAAGAT GGCATATCTC 3070 hom 123 het 43 0 41 3 TTGAAGAT 0 1 237709 CASAVA_Build 15 96058652 1I TGAGAGCTTT -/A AAAACTTTTA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 A 4 5 237710 CASAVA_Build 15 96059504 1I TCTATTAATA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 6 7 237711 CASAVA_Build 15 96061536 1D TGAGATGCTT C/- CATCATGGTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 2 1 237712 CASAVA_Build 15 96080013 1I ACCTTATGGT -/A AAATCTAGAG 3070 hom 87 het 30 0 28 2 A 3 4 237713 CASAVA_Build 15 96086555 4D AAGTACTGGG ATTA/---- ATTATAGGCA 3070 hom 65 het 25 0 21 7 ATTA 2 1 237714 CASAVA_Build 15 96091892 6I TCTACTTTAA ------/TATTAT TATTATTATT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 TAT 3 5 237715 CASAVA_Build 15 96092173 1I AGGTTCAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 423 hom 23 1 18 4 A 8 9 237716 CASAVA_Build 15 96092874 1D AGTGGCCCCA C/- CCACTCCTAT 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 3 2 237717 CASAVA_Build 15 96097073 1D TTGTTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 33 0 29 4 A 12 11 237718 CASAVA_Build 15 96103007 3D AACAATTTTT AAC/--- AATAGTGCTT 3070 hom 54 het 21 0 18 5 AAC 1 0 237719 CASAVA_Build 15 96103524 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 18 1 11 7 A 15 14 237720 CASAVA_Build 15 96106993 1D CCGGCCATCT G/- GTCAGTGGTC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 G 2 1 237721 CASAVA_Build 15 96110547 1I CTCTGTTATC -/T TTTTTTGTTC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 6 7 237722 CASAVA_Build 15 96116054 2D TTTTAACATG TC/-- TCTTTTTAAA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 TC 2 1 237723 CASAVA_Build 15 96118327 7I CCTTTGCAGG -------/CATGTCC AACATCGTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CATGTCC 0 1 237724 CASAVA_Build 15 96120688 1D TTAGCAAATT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 9 8 237725 CASAVA_Build 15 96123525 1D GGTAGACTGG A/- AAAAAATGTG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 7 6 237726 CASAVA_Build 15 96123903 1D ACAAAAGTTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 8 237727 CASAVA_Build 15 96140018 1D CCTGACATTT A/- AACTGCCTTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 3 2 237728 CASAVA_Build 15 96148487 1I ACTAAGATGA -/C CCCCCCCCAC 3070 het 401 hom 38 1 31 6 C 8 9 237729 CASAVA_Build 15 96163364 1I TTGCACTCAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 42 17 16 9 A 7 8 237730 CASAVA_Build 15 96168352 1D ATCTGCACTC T/- TCACGTTCAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 1 237731 CASAVA_Build 15 96206641 2I GAAATGAAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 31 0 22 9 T 10 12 237732 CASAVA_Build 15 96208778 8D TATATTAAAC TATATATA/-------- TATATATATA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TA 12 8 237733 CASAVA_Build 15 96210621 2D GCAAAGAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 26 0 18 8 A 14 12 237734 CASAVA_Build 15 96220547 1D AAGCAGGCCA C/- CCCCGAGCCA 2433 het 2433 ref 23 13 9 1 C 5 4 237735 CASAVA_Build 15 96221388 3D TGCGACCTTC TTT/--- TTTATTCTCA 3070 het 3070 hom 51 20 24 8 T 6 3 237736 CASAVA_Build 15 96225457 2D TTTAGAAACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 13 11 237737 CASAVA_Build 15 96232823 1D TTGGAAACTC T/- TTTGCCATAA 3070 het 3070 ref 49 23 19 8 T 4 3 237738 CASAVA_Build 15 96238604 3D AGTCTGCAAA CAT/--- CATCATGTTT 3070 het 3070 hom 48 17 27 6 CAT 3 2 237739 CASAVA_Build 15 96260126 1I TTTAAAAATC -/A TATTGAACTA 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 A 0 1 237740 CASAVA_Build 15 96270692 1I TTTTTTCGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 T 10 11 237741 CASAVA_Build 15 96271932 14D ACCATATCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 7 A 20 6 237742 CASAVA_Build 15 96272559 1D TTATTATGAT A/- GTCATCAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 11 4 A 1 0 237743 CASAVA_Build 15 96273049 1D AGTGGGAAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 28 10 12 6 A 9 8 237744 CASAVA_Build 15 96291470 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2683 het 606 hom 14 2 7 5 A 12 11 237745 CASAVA_Build 15 96313627 1D AGCAAAGCTC T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 6 5 237746 CASAVA_Build 15 96315773 5I TTTCCCATGG -----/TGTTT TGAAGAGTGG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 TGTTT 0 1 237747 CASAVA_Build 15 96330146 7I GTACCCATGT -------/TATGTGA CTCCCTCTTG 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 TATGTGA 0 1 237748 CASAVA_Build 15 96337170 1I TCCCAATTTA -/C AGAAGATGAA 3070 het 3070 hom 52 20 26 6 C 0 1 237749 CASAVA_Build 15 96338034 5D CAGCTTTGTC ACTTT/----- TAGTGAGTCA 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 ACTTT 1 0 237750 CASAVA_Build 15 96338558 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 754 hom 26 3 21 2 A 15 14 237751 CASAVA_Build 15 96338987 1I GGCAAATCAT -/A AAAAAATCAT 3070 het 2469 hom 27 11 12 4 A 6 7 237752 CASAVA_Build 15 96341613 1I GAGCCTGGGG -/A AAAGATATGA 3070 het 3070 hom 50 14 30 6 A 3 4 237753 CASAVA_Build 15 96345093 11D GTATGTGATA TGTGTGTGCGT/----------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 60 33 18 11 TGTGTGTGCGT 1 0 237754 CASAVA_Build 15 96345305 5I GTGGAGGATG -----/GGTGT GGTGTGGTGT 3070 het 3070 hom 59 21 23 16 GGTGT 2 3 237755 CASAVA_Build 15 96368068 1D CTCTTTACAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 8 7 237756 CASAVA_Build 15 96369089 4I AGACAGCGTC ----/TCTG TCTGTGTCCA 550 het 550 ref 15 6 2 7 TCTG 1 2 237757 CASAVA_Build 15 96369222 3I GCCTGGCTAA ---/TAT TGGTATTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 TAT 0 1 237758 CASAVA_Build 15 96372687 4D GCAAGCAAGG ATGA/---- ATGAATGGAT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 ATGA 2 1 237759 CASAVA_Build 15 96374287 1I TTACTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 10 11 237760 CASAVA_Build 15 96374347 1I GTTTTTGGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 8 9 237761 CASAVA_Build 15 96376874 3I CTCCATTTAC ---/AGG AGTTCTTGAA 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 AGG 0 1 237762 CASAVA_Build 15 96376981 4I AGTGTGTCTT ----/TCTC TCCAGAATGA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 TC 1 3 237763 CASAVA_Build 15 96377023 1I43M7I GGTCATACTG -CCACTAAAAACCAAACACATTTAAATGAACTCCGCCACCACCC-------/CCCACTAAAAACCAAACACATTTAAATGAACTCCGCCACCACCCACCCTCT ACCCTCTCCC 3070 het 3070 ref 36 32 10 7 N/A 0 0 237764 CASAVA_Build 15 96379418 13I GCTGAAGTGT -------------/CTACCTCCCCCAG CTAGACTCTG 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 CTACCTCCCCCAG 0 1 237765 CASAVA_Build 15 96385593 2D TGCTCCACAG GC/-- ATCTTAAGAA 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 GC 1 0 237766 CASAVA_Build 15 96399891 1I TCAGAGATTT -/A AAAAAAAAAA 180 het 180 ref 47 28 3 16 A 15 16 237767 CASAVA_Build 15 96401197 1I ACTTTCAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 14 16 6 T 9 10 237768 CASAVA_Build 15 96411245 13D CTCATGATGG GAGCTGCCTCAGA/------------- GAGCTGCCTC 2346 het 2346 ref 41 26 8 11 GAGCTGCCTCAGA 1 0 237769 CASAVA_Build 15 96425392 4D TACTAAGGGG TAGT/---- TAGTTTTTGC 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 TAGT 2 1 237770 CASAVA_Build 15 96438532 4D ATTTTTTTTT AAGA/---- AAAAGATTTT 3070 het 3070 hom 51 23 24 6 AAGA 1 0 237771 CASAVA_Build 15 96439728 3D AAGAATTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1957 hom 32 12 10 13 T 17 14 237772 CASAVA_Build 15 96441889 4I AAATATTGAT ----/TGAA TGATGTTCCA 3070 het 3070 hom 50 17 26 7 TGAA 0 1 237773 CASAVA_Build 15 96442864 1I30M4D GCAAAAGATC -AAAAAAAAATGACAGAGTATTCCAGGCAGATAAT/AAAAAAAAAATGACAGAGTATTCCAGGCAGA---- TAATTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 27 19 6 N/A 0 0 237774 CASAVA_Build 15 96443517 1I GCTTACCAAC -/G GGCCAGGCCA 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 G 2 3 237775 CASAVA_Build 15 96444734 1D AAAGTGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 13 8 A 13 12 237776 CASAVA_Build 15 96478489 1I AACAATAATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 8 9 237777 CASAVA_Build 15 96482891 1D CACATAAACA G/- GCACTCTAGA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 G 2 1 237778 CASAVA_Build 15 96493118 2I GGTGAGGGCA --/TT TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 5 7 237779 CASAVA_Build 15 96494983 3D TGGGAAGGGC AGG/--- AGAAGTTCAG 3070 het 3070 hom 32 12 19 2 AGG 1 0 237780 CASAVA_Build 15 96496494 1D GCAAAAGAAC A/- AAAATGGATC 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 A 5 4 237781 CASAVA_Build 15 96498201 3I GGTAGGAAGA ---/TCT TCTGAGTCCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TCT 1 2 237782 CASAVA_Build 15 96499627 1I AGAAACAATC -/A AGTGTTTATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 237783 CASAVA_Build 15 96501177 5I TTTTTTAATT -----/TTAAC TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TTAAC 0 1 237784 CASAVA_Build 15 96520066 5D CACTGCATCT AAGTA/----- AAGTGTCAAG 3070 hom 138 het 51 0 47 7 AAGTA 1 0 237785 CASAVA_Build 15 96521904 1D AGAAAAATGT C/- AGTTTGATAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 1 0 237786 CASAVA_Build 15 96528817 1D ATTCTGAAGC T/- CCCCTCACCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 0 237787 CASAVA_Build 15 96540200 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 572 het 440 hom 20 6 3 11 T 19 17 237788 CASAVA_Build 15 96545725 1I AAATAGCTTT -/A AATTTAAAGA 3070 het 3070 ref 27 18 7 2 A 2 3 237789 CASAVA_Build 15 96546879 2D CAACAATCCA CG/-- TCTGAAAAAT 3070 het 3070 hom 68 30 32 8 CG 1 0 237790 CASAVA_Build 15 96547618 1I ATTTGGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 9 10 237791 CASAVA_Build 15 96569529 4D AAGAGTGTTT GGAC/---- GGACGCCTGT 3070 het 3070 ref 38 22 16 1 GGAC 2 1 237792 CASAVA_Build 15 96573978 2D GATGAAACTC TG/-- TCTCTACTAA 3070 het 2323 hom 19 9 9 1 TG 1 0 237793 CASAVA_Build 15 96576254 1I AACTGTGGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 9 10 237794 CASAVA_Build 15 96578807 3I ATTCCATCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 2361 het 2361 ref 27 11 9 7 A 12 15 237795 CASAVA_Build 15 96578846 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 9 12 A 10 11 237796 CASAVA_Build 15 96581649 1D ACCCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1412 het 158 hom 7 1 4 2 A 13 12 237797 CASAVA_Build 15 96582586 2I TATTACCTGG --/AA TGAGATACTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 0 2 237798 CASAVA_Build 15 96584746 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 A 11 10 237799 CASAVA_Build 15 96585790 2D GGAAATAAAC AT/-- ATTCATTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AT 2 1 237800 CASAVA_Build 15 96591370 1D TTCAGGAGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 740 hom 41 6 15 20 A 10 9 237801 CASAVA_Build 15 96599580 1I AAAGTCCTGA -/T TCTCATCGTT 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 T 1 2 237802 CASAVA_Build 15 96607705 17I CGCCTTAATT -----------------/TCATTCTTTACCAAAAG TCATTCATGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TCATTCTTTACCAAAAG 0 1 237803 CASAVA_Build 15 96610213 2D GTTTTTTTTT GG/-- GGGGGGGGGT 2979 hom 34 het 21 0 11 10 G 11 9 237804 CASAVA_Build 15 96610229 11D GGGGGTTGTT TTTTTGTTTTG/----------- TTTTGTTTTG 824 het 812 hom 20 2 5 14 TTTTTGTTTTG 1 0 237805 CASAVA_Build 15 96622641 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1732 hom 25 5 16 4 A 11 12 237806 CASAVA_Build 15 96625899 1I GAGGGGCAGA -/G GTGGCCCCAG 3070 het 2806 hom 30 8 12 10 G 1 2 237807 CASAVA_Build 15 96628189 1D ACCCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 29 2 24 4 A 12 11 237808 CASAVA_Build 15 96630422 1I ATCAAGCTAT -/A ACTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 1 2 237809 CASAVA_Build 15 96637782 1I TGACACTCTG -/T TTTTTGTCAG 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 T 5 6 237810 CASAVA_Build 15 96640264 8I GCATGACACC --------/TGCTCAGG TGCTCAGGTC 3070 het 3070 ref 60 28 20 12 TGCTCAGG 1 2 237811 CASAVA_Build 15 96640486 1D GGCAATGACT G/- GGGGGCTTAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 G 6 5 237812 CASAVA_Build 15 96640969 1D GTATTGAAAG C/- CTGGCAATTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 8 C 2 1 237813 CASAVA_Build 15 96654953 1I AATGTGGCCA -/C CCCCCGCATG 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 C 5 6 237814 CASAVA_Build 15 96658726 1I GCATTTACAC -/T TGAGGAATTA 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 T 1 2 237815 CASAVA_Build 15 96675451 4I GTTTCAAACC ----/AAGG AAGGCCTGGA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 AAGG 1 2 237816 CASAVA_Build 15 96675917 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 7 4 A 10 11 237817 CASAVA_Build 15 96684230 2I AAGTGGTCAC --/AG TAAACGAAAG 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 AG 0 1 237818 CASAVA_Build 15 96690843 1D TTACATCTTG T/- TCACTCCCAA 3070 het 3070 ref 56 28 21 7 T 2 1 237819 CASAVA_Build 15 96694457 2D TGGGGCAGAC AT/-- GTGTGCATGT 3070 het 3070 hom 43 21 18 5 AT 1 0 237820 CASAVA_Build 15 96695364 1D TGCTCTACTT A/- AACTTGGAAT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 3 2 237821 CASAVA_Build 15 96702750 1I GGAGGGGTCT -/G GGGGGGACCT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 G 6 7 237822 CASAVA_Build 15 96703731 1I TGATAATGCA -/G GGGCTGACAG 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 G 3 4 237823 CASAVA_Build 15 96711903 6D TTCCGAATTC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 570 hom 17 2 10 6 AT 10 7 237824 CASAVA_Build 15 96723176 1I33M1D TAAACTATTT -AAAAAAAAAAACTAACTAATTTTAGGCTTACAGA/AAAAAAAAAAAACTAACTAATTTTAGGCTTACAG- AAAAAGTACA 3070 het 3070 ref 24 18 13 4 N/A 0 0 237825 CASAVA_Build 15 96726930 1D CCTACCCACA C/- CCCACACACA 1211 het 1211 ref 38 16 7 15 C 4 3 237826 CASAVA_Build 15 96732687 1D TACCCAGTGT A/- AACATCCTGT 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 A 3 2 237827 CASAVA_Build 15 96740875 1D GCTACTGTTG A/- AAAAAATACA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 7 6 237828 CASAVA_Build 15 96741884 2D CCTCTGTAAA TG/-- TGTGTGTGTG 1234 het 1234 ref 37 22 8 7 TG 9 8 237829 CASAVA_Build 15 96743339 1I AAAGCACATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 422 hom 42 1 27 14 T 9 10 237830 CASAVA_Build 15 96743876 1I ACAAAATGGC -/A GCCCAACCGT 3070 hom 109 het 44 0 35 9 A 0 1 237831 CASAVA_Build 15 96747660 2D ATCAAAATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 193 hom 34 3 16 16 T 13 11 237832 CASAVA_Build 15 96751969 1D GATAAGGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 14 21 9 T 10 9 237833 CASAVA_Build 15 96762807 1D CAGGCAGCTA T/- ATGTTTAGTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 0 237834 CASAVA_Build 15 96763728 4D GTCCCCACCC CCCA/---- CCCCGTGTCT 3070 hom 67 het 26 0 20 9 CCCA 1 0 237835 CASAVA_Build 15 96767842 1D CAATCTTGAC T/- TATCTAGCAA 3070 hom 171 het 72 0 57 17 T 2 1 237836 CASAVA_Build 15 96770032 1D AATGAGGGTC G/- GGGGGAGTGT 3070 het 56 hom 29 1 21 8 G 6 5 237837 CASAVA_Build 15 96775876 1I TTCTGTCTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 9 10 237838 CASAVA_Build 15 96780176 14I CATAAGCTGG --------------/CAGCAAAGTGTGAC CAGCATGGGT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 CAGCAAAGTGTGAC 0 1 237839 CASAVA_Build 15 96780730 1I CTCTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3046 het 1009 hom 17 3 8 6 A 13 14 237840 CASAVA_Build 15 96790476 2I CACGTGGAAC --/TG TGAGTCCATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TG 1 2 237841 CASAVA_Build 15 96792599 1I CTTCTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 7 T 11 12 237842 CASAVA_Build 15 96793780 1I TTTTATTTTT -/A TTTTTTGAGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 0 1 237843 CASAVA_Build 15 96812576 1I ACAAGGGGGG -/T TTACCTTGGT 3070 hom 117 het 44 0 36 8 T 2 3 237844 CASAVA_Build 15 96866533 1D GTTTCAGCTG A/- ATGTTTGCCT 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 A 2 1 237845 CASAVA_Build 15 96879334 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2127 het 33 hom 11 1 6 4 T 11 12 237846 CASAVA_Build 15 96879986 4D CCGAGCTTTT AAAA/---- GTCTTTTTGG 3070 hom 102 het 36 0 33 4 A 4 0 237847 CASAVA_Build 15 96903494 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2961 het 2961 ref 26 14 8 5 A 11 10 237848 CASAVA_Build 15 96905868 3I CAGTTTTTGT ---/TGG TGTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 TGG 0 1 237849 CASAVA_Build 15 96908662 9I TGGGGCGCAC ---------/TCCAGCCTT AGAGAAGTTG 3070 hom 44 het 18 0 13 5 TCCAGCCTT 0 1 237850 CASAVA_Build 15 96913610 4D TCTCTCCAAC CTGA/---- CTAATTCAGC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 CTGA 1 0 237851 CASAVA_Build 15 96920010 1I CTTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1486 hom 21 4 12 5 T 10 11 237852 CASAVA_Build 15 96920817 1I GATACTGGAC -/A AACCTGGAAG 3070 het 3070 ref 36 19 9 8 A 2 3 237853 CASAVA_Build 15 96939416 4I TTCTTGTGAT ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 AGTG 1 2 237854 CASAVA_Build 15 96940693 2I CCTGGTCAAC --/AG AGCGAGACTC 1206 het 816 hom 9 3 4 2 AG 1 2 237855 CASAVA_Build 15 96943122 3I AGTCTCAAAA ---/AAT AATAATAATT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 AAT 3 4 237856 CASAVA_Build 15 96943670 3I ATATATTAAT ---/AAG AATAAAGTAC 3070 het 3070 ref 42 20 10 12 AAG 0 1 237857 CASAVA_Build 15 96949671 2D GTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 CA 7 6 237858 CASAVA_Build 15 96950453 1I ACTGTAGAGA -/G GCTAAATACA 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 G 1 2 237859 CASAVA_Build 15 96951429 2I ATTTTTTTTT --/TC CCTGAGACAG 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 TC 0 1 237860 CASAVA_Build 15 96955315 3I CTTTCTGATA ---/ATG ATGACACTAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 ATG 1 2 237861 CASAVA_Build 15 96961188 4D ACACACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 41 18 13 13 AC 9 7 237862 CASAVA_Build 15 96961490 5D AAACATATAA TATAT/----- TATTTAGTTC 3070 het 3070 hom 29 9 19 5 TATAT 1 0 237863 CASAVA_Build 15 96962580 1I GCTCAATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 10 11 237864 CASAVA_Build 15 96980613 4D CCTAAGAAAC AATT/---- AAATTATGGC 3070 het 3070 hom 27 12 15 1 AATT 1 0 237865 CASAVA_Build 15 96981272 1I TAAAAAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 497 hom 36 2 26 8 A 12 13 237866 CASAVA_Build 15 96983166 5I GTTTAAAAAT -----/ATAAA GTAATGAATA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 ATAAA 0 1 237867 CASAVA_Build 15 96985731 2I TTGATGTTAA --/GT GTGTGTGTGT 1559 het 1559 ref 30 9 9 12 GT 6 7 237868 CASAVA_Build 15 96990266 1D AAAAAAAAAA C/- CTAGAACAGT 3070 het 3070 ref 47 22 22 5 C 2 1 237869 CASAVA_Build 15 96992497 2I GAAAGAAATG --/AC ACAAACTCTG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AC 1 2 237870 CASAVA_Build 15 96993756 1D CTCTGAACCC T/- AGAAAGTGTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 1 0 237871 CASAVA_Build 15 96996770 1D TCACCGGGGG A/- ACCTCGTTAA 3070 hom 56 het 24 0 19 7 A 2 1 237872 CASAVA_Build 15 96997291 1D CCCGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2015 het 2015 ref 22 10 6 6 A 13 12 237873 CASAVA_Build 15 96998162 1D ATTTTAAAGA G/- ACAGGGTCTC 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 G 1 0 237874 CASAVA_Build 15 97000448 3I ATATAAATAA ---/AGG AGGAGAATAG 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 AGG 1 2 237875 CASAVA_Build 15 97007655 2D TCAGGTCCCT TC/-- TACCATCCTA 3070 hom 27 het 32 0 15 18 TC 1 0 237876 CASAVA_Build 15 97008668 1D GTAGTAGCCT G/- GGGGGGGGGT 904 hom 12 het 9 0 3 6 G 10 9 237877 CASAVA_Build 15 97015945 1I ACAAAGGATC -/T TTTAAAACAA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 3 4 237878 CASAVA_Build 15 97021833 17D ACTAGGCAGA GAGAGAGATGGAGATTT/----------------- GAGGGAGATG 3070 het 3070 hom 48 21 27 5 GAGAGAGATGGAGATTT 1 0 237879 CASAVA_Build 15 97026677 1I TTGAATGGTC -/T TTGCTAAGCG 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 T 2 3 237880 CASAVA_Build 15 97027931 2I AGGAGTCAAA --/CT CTCATGCCAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CT 1 2 237881 CASAVA_Build 15 97029561 4D ACCCTCCAGG GTCT/---- GTTTTGTAAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 GTCT 1 0 237882 CASAVA_Build 15 97034887 10D GGTTTCAGAC ATATTTTAAA/---------- ATACTACTAT 3070 het 3070 hom 55 21 29 8 ATATTTTAAA 1 0 237883 CASAVA_Build 15 97039249 1D GCTGACACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 38 2 25 11 A 15 14 237884 CASAVA_Build 15 97039674 4D TCTGATGCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1991 het 139 hom 36 5 10 21 T 20 16 237885 CASAVA_Build 15 97040444 5I CTTTTAATTG -----/TTATT TTAGAGTGTA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 TTATT 0 1 237886 CASAVA_Build 15 97045013 2I TGGCAGCCTC --/TA TGATAGATCT 2188 het 2188 ref 27 18 5 4 TA 0 1 237887 CASAVA_Build 15 97048641 1D GTTACTTAAC T/- TCCTTGCTGG 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 T 2 1 237888 CASAVA_Build 15 97049104 2I CACTTCCCCC --/CA CACACTCTCT 3070 hom 70 het 27 0 22 5 CA 2 3 237889 CASAVA_Build 15 97050205 1I TATTCAAATT -/C CTGACCTCAA 3070 hom 54 het 20 0 19 3 C 1 2 237890 CASAVA_Build 15 97050291 1D TTGCACTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 10 9 237891 CASAVA_Build 15 97051085 2I ACAGAGCAAG --/AC ACTATCCCAA 3070 het 3070 hom 53 20 30 3 AC 1 2 237892 CASAVA_Build 15 97056723 1D GTCTCTCCCC T/- GGCCCCTTAC 3070 het 3070 hom 42 12 22 8 T 1 0 237893 CASAVA_Build 15 97061005 2D CTAGGGAGAG TC/-- TGTCTCCACC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 TC 1 0 237894 CASAVA_Build 15 97062706 1I AGGTGAGGAA -/G GATGGGGTTT 3070 het 3070 hom 51 18 24 9 G 1 2 237895 CASAVA_Build 15 97064813 1I TAGTGTCCCC -/A AGGGGAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 1 2 237896 CASAVA_Build 15 97065798 4I GGATATACTC ----/AGAT GGATGTATAC 3070 hom 162 het 58 0 53 5 AGAT 0 1 237897 CASAVA_Build 15 97067697 2I TTTTTAATCT --/TC TGTTAGGTTA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TC 0 1 237898 CASAVA_Build 15 97077553 1I AGGCAGGGAA -/G GGTGACCATC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 2 3 237899 CASAVA_Build 15 97078088 1I GCTGCTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 10 11 237900 CASAVA_Build 15 97099739 4I AAACAACAGG ----/AAGT AAGAACAAAA 3070 hom 183 het 68 0 61 7 AAGT 0 1 237901 CASAVA_Build 15 97100374 1I GAAAAAAAAA -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 237902 CASAVA_Build 15 97101801 1D TAACATTTTA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 8 T 7 6 237903 CASAVA_Build 15 97109920 2D TAATAAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 40 0 33 7 T 14 12 237904 CASAVA_Build 15 97110640 2D ATTTTTAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 25 0 12 14 T 15 13 237905 CASAVA_Build 15 97113440 1I CGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 22 1 19 2 A 11 12 237906 CASAVA_Build 15 97132495 1I ATGAAAAGGG -/A AAAAAATTTA 3070 hom 138 het 53 0 45 8 A 6 7 237907 CASAVA_Build 15 97147130 1I AGGGAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 716 hom 33 2 21 10 T 12 13 237908 CASAVA_Build 15 97155892 4I GTGGGAAAAT ----/AAAG ATTGACTATT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 AAAG 0 1 237909 CASAVA_Build 15 97156929 2D GTGTGGGCAC TG/-- TGCTGGGGGA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 TG 2 1 237910 CASAVA_Build 15 97160120 1D CAGTAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 44 0 32 13 A 13 12 237911 CASAVA_Build 15 97160993 2D CGAGGGAGAC AG/-- TGCTTCATCC 3070 het 3070 ref 39 18 11 10 AG 1 0 237912 CASAVA_Build 15 97161748 2D AACACGAAGC AT/-- GTGTGTGCAT 3070 het 3070 hom 53 17 31 6 AT 1 0 237913 CASAVA_Build 15 97180955 2D TGCTATTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 26 0 19 9 AT 9 8 237914 CASAVA_Build 15 97182618 2D TGTATGTGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 56 16 28 13 CA 7 6 237915 CASAVA_Build 15 97187886 1I CCTTCCCCTG -/C CCCCCCAACT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 6 7 237916 CASAVA_Build 15 97222808 1I TGACAAACTC -/T TTTTTATTGC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 5 6 237917 CASAVA_Build 15 97230056 1I AAAAACAAAC -/A AACAACAACA 1417 het 1417 ref 31 19 6 6 A 2 3 237918 CASAVA_Build 15 97235969 1D GAAGAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 11 10 237919 CASAVA_Build 15 97248072 1D ACTTTGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 T 11 10 237920 CASAVA_Build 15 97248181 5I TTCAACGTTC -----/TTGAG TTATTACTAC 3070 het 3070 hom 50 17 28 5 TTGAG 0 1 237921 CASAVA_Build 15 97263341 2I GGCTTATTTT --/TG TGCTTTTAGT 3070 het 1223 hom 16 4 11 1 TG 1 2 237922 CASAVA_Build 15 97273477 1I ACTATGCTTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 7 8 237923 CASAVA_Build 15 97285748 2D ATTCAAAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 10 13 T 14 12 237924 CASAVA_Build 15 97287169 2I GTAATAATGA --/TG TGTATTCTTA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 TG 1 2 237925 CASAVA_Build 15 97296029 1I GCAAGGGCCA -/C CCTGACCCTC 3070 hom 106 het 42 0 36 6 C 2 3 237926 CASAVA_Build 15 97297367 1I TTGGGCTTAA -/T TTTTTTTTTT 1982 het 1982 ref 35 13 8 14 T 15 16 237927 CASAVA_Build 15 97319453 1D GTCTGTACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 10 9 237928 CASAVA_Build 15 97321045 2I TTTGTGTTGC --/TT TTTTTTTGTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 7 9 237929 CASAVA_Build 15 97326385 4I TGTCTCAAAA ----/AAAG AGGGTACTCA 3070 hom 96 het 35 0 30 5 AAAG 0 1 237930 CASAVA_Build 15 97327485 5I TTGTTTGTTT -----/TTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 TTTTG 0 1 237931 CASAVA_Build 15 97329328 1I TGGATGATGA -/C CTCTCAAGGC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 1 2 237932 CASAVA_Build 15 97329699 4I CCACAGCACC ----/TGCA TGCATCCCAG 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 TGCA 1 2 237933 CASAVA_Build 15 97331277 2D TTAACCTCAT CA/-- CATCTGGTCC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CA 2 1 237934 CASAVA_Build 15 97340095 1D AAAAAAAAAA C/- CAAAAAACAC 3070 hom 117 het 46 0 38 8 C 2 1 237935 CASAVA_Build 15 97341203 4D ATGAAATGAC TACA/---- TACATAAGTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TACA 2 1 237936 CASAVA_Build 15 97341692 1I CTGGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 32 2 25 5 A 13 14 237937 CASAVA_Build 15 97343922 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAAGAATC 3070 hom 92 het 38 0 29 9 AG 0 1 237938 CASAVA_Build 15 97349427 1D GGGTCCCTGA C/- CCCCCACGTA 3070 hom 57 het 22 0 18 4 C 6 5 237939 CASAVA_Build 15 97354589 1I CAATTACATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 264 hom 10 1 9 0 A 9 10 237940 CASAVA_Build 15 97357374 4D TATGCCTGCG TGTA/---- TGTGTGTTGT 3070 hom 205 het 70 0 69 5 TGTA 1 0 237941 CASAVA_Build 15 97362452 3I TTTCATTTAT ---/ATA ATATTTGTGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATA 1 2 237942 CASAVA_Build 15 97363956 1D TAGTGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 271 hom 22 1 14 7 A 14 13 237943 CASAVA_Build 15 97370083 1D ATTTTCATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 10 9 237944 CASAVA_Build 15 97381320 2I TGTGTAAGTG --/TC TCTGTAGGGG 3070 hom 108 het 46 0 37 9 TC 1 2 237945 CASAVA_Build 15 97383003 1I GATTATTTTT -/G GTGTGTGCAT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 G 1 2 237946 CASAVA_Build 15 97385886 12D ACAAACGATC TTGTGACCTTGG/------------ TGCCTGCCTT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 TTGTGACCTTGG 1 0 237947 CASAVA_Build 15 97394843 1I20M1D ATTGTAATGC -TTTTTTTTGTTCTTGTTTTGT/TTTTTTTTTGTTCTTGTTTTG- TTTTTTTTTC 3070 het 55 hom 31 1 28 6 N/A 0 0 237948 CASAVA_Build 15 97400872 2D GAGAGGCCAA GG/-- GGGGGGCAGA 3070 hom 35 het 14 0 11 5 G 8 6 237949 CASAVA_Build 15 97406738 1D AAACAAATAA T/- TTGATTGTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 3 2 237950 CASAVA_Build 15 97408708 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3055 hom 25 het 13 0 8 5 A 7 6 237951 CASAVA_Build 15 97411336 3D TGAAACAGAA CCC/--- CCCCCCCCCA 3070 het 30 hom 27 1 16 10 C 12 9 237952 CASAVA_Build 15 97418276 1I ATTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 733 hom 27 2 14 11 T 15 16 237953 CASAVA_Build 15 97422181 1I GGTATGCCCA -/T TTGTACATTG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 2 3 237954 CASAVA_Build 15 97432170 1D AACCCTGGGT G/- GGGGGGGCTT 3070 het 3070 hom 33 14 11 8 G 8 7 237955 CASAVA_Build 15 97434717 2D GAAGTCTCTC TT/-- ATAGCTTCCA 3070 het 3070 ref 50 29 18 5 T 2 0 237956 CASAVA_Build 15 97437112 1I TTGTTTTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 10 237957 CASAVA_Build 15 97439382 1I CTTTTGCTGT -/G CAGAAGCTCC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 G 0 1 237958 CASAVA_Build 15 97441350 1D ATTAATTCTT C/- CCATTCAAGG 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 C 3 2 237959 CASAVA_Build 15 97463631 1I GCAGGAGGCA -/G AGGCGCTGCG 1091 hom 24 het 9 0 5 4 G 0 1 237960 CASAVA_Build 15 97464496 2D TGATGTAAAC TA/-- TGCCCAGTCC 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 TA 1 0 237961 CASAVA_Build 15 97471749 5I TGGATCCTAG -----/GAACT GAACTGGAGA 3070 het 3070 hom 55 22 24 9 GAACT 1 2 237962 CASAVA_Build 15 97471824 2D AGGGCCAGGA TG/-- TGTTAGTGTG 3070 het 3070 ref 44 21 15 9 TG 2 1 237963 CASAVA_Build 15 97472506 1I CTTGGCATCA -/C CCCTCCTTTC 3070 hom 65 het 26 0 20 6 C 3 4 237964 CASAVA_Build 15 97479572 2D ATGCAGAAAC AG/-- TGTGCGTGAC 3070 het 3070 hom 52 25 23 6 AG 1 0 237965 CASAVA_Build 15 97491570 17I GAATGCCCTT -----------------/TTCTGTTATAGCCTAAG TTCTGGAGTG 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 TTCTGTTATAGCCTAAG 0 1 237966 CASAVA_Build 15 97493378 3I CCTTTAAACT ---/CTA CTAAGTAAAG 3070 het 3070 ref 55 26 24 5 CTA 1 2 237967 CASAVA_Build 15 97494484 3I GTGAGTAGTG ---/ACC ACATCTTACA 3070 hom 80 het 32 0 25 7 ACC 0 1 237968 CASAVA_Build 15 97497013 4D AAAGGGAATG AGAT/---- AGAGAAAGTG 3070 het 3070 ref 52 25 19 8 AGAT 1 0 237969 CASAVA_Build 15 97500269 2D TGACACTGTA AC/-- AGTTAGTTGA 3070 het 3070 ref 54 33 18 3 AC 1 0 237970 CASAVA_Build 15 97518893 4I TGGGCGATTG ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 TA 6 8 237971 CASAVA_Build 15 97523463 1I CTCATAGCTG -/A CCCATGCGAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 0 1 237972 CASAVA_Build 15 97524866 4D CCTGGCAATG GACA/---- TCCCAGTCTA 3070 het 3070 hom 50 23 23 5 GACA 1 0 237973 CASAVA_Build 15 97532494 1I GATTTACCGT -/A AAGCCCAGTA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 A 2 3 237974 CASAVA_Build 15 97546772 1D AATAAAAAAA T/- AATTTCAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 1 0 237975 CASAVA_Build 15 97566459 5I ACTTTAGTTT -----/TATAA TATATTTAAT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 TATAA 0 1 237976 CASAVA_Build 15 97569359 1I GATAATTATA -/G TTGCCCTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 G 0 1 237977 CASAVA_Build 15 97574892 1I TTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 11 12 237978 CASAVA_Build 15 97577746 1D ACATGTATTA G/- TGCCACCTGT 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 G 1 0 237979 CASAVA_Build 15 97587537 4D AGGCATTAGA TAGT/---- TAGAGTACTC 3070 het 3070 ref 58 31 21 6 TAGT 1 0 237980 CASAVA_Build 15 97603242 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2071 het 73 hom 10 1 6 3 A 16 15 237981 CASAVA_Build 15 97603889 5D GTGATAAAAG AAAAA/----- AAAAGATAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 9 4 237982 CASAVA_Build 15 97612266 1D GAAAACAGTC A/- AATCTTTAAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 3 2 237983 CASAVA_Build 15 97674444 3D GAAAACTCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 21 1 14 6 A 18 15 237984 CASAVA_Build 15 97728828 2I AGCAAGACTC --/TG TCTCAAAAAC 3070 hom 62 het 24 0 21 3 TG 0 1 237985 CASAVA_Build 15 97742896 3D CTCAACCTTC CTT/--- CTTCCTGCCC 3070 hom 138 het 47 0 42 5 CTT 2 1 237986 CASAVA_Build 15 97744206 5D TTCCTCTCCT CTCCC/----- CTCCCTTGCT 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 CTCCC 2 1 237987 CASAVA_Build 15 97752121 3I ATCTCTTAAA ---/AAC AACAAACTTC 3070 het 3070 ref 30 17 7 6 AAC 1 2 237988 CASAVA_Build 15 97761057 4I CAGGGAAAGA ----/AGTC AGACAATAAG 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 AGTC 0 1 237989 CASAVA_Build 15 97767995 3I ACTCTGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 1191 het 1191 ref 12 7 4 1 A 11 14 237990 CASAVA_Build 15 97792587 17D GGGCTCCCGA CCTCCTCTGTGCTCGTC/----------------- CCTGCGCCCT 3070 hom 57 het 19 0 18 3 CCTCCTCTGTGCTCGTC 1 0 237991 CASAVA_Build 15 97794967 4D AGGGTGGTGC TAAG/---- TGAGAGACAG 3070 hom 87 het 32 0 26 6 TAAG 1 0 237992 CASAVA_Build 15 97799489 1D AATGCTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 67 het 28 0 23 5 T 10 9 237993 CASAVA_Build 15 97844661 2D TACCATTGAA CT/-- CCATTTGTTG 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 CT 1 0 237994 CASAVA_Build 15 97853915 1I ATTATTTATG -/A AACGGCTGAG 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 A 2 3 237995 CASAVA_Build 15 97868319 5I GGAGTCCAAG -----/ACCAA CCTGGCCAAC 3023 het 3023 ref 27 13 8 6 ACCAA 0 1 237996 CASAVA_Build 15 97884177 1D AGTTTTGTTG A/- GCTTCCTCTA 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 A 1 0 237997 CASAVA_Build 15 97888977 1I CCTCCCCCCA -/C CCCACAACAA 2644 hom 18 het 7 0 7 0 C 3 4 237998 CASAVA_Build 15 97897561 1D AATATCGGCC G/- GGGCACGGTG 3070 hom 39 het 16 0 13 3 G 4 3 237999 CASAVA_Build 15 97900359 1I TCCATTGCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 12 11 A 14 15 238000 CASAVA_Build 15 97907032 1D TTTCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 26 10 6 10 T 19 18 238001 CASAVA_Build 15 97908593 1I TCACTCTGTC -/A CCCAGGCTAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 0 1 238002 CASAVA_Build 15 97909798 1I TTCTTAAGGG -/T TTTGGGCACA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 3 4 238003 CASAVA_Build 15 97911711 1D CCATTTTGTC T/- AAGCAAGGAG 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 T 1 0 238004 CASAVA_Build 15 97913262 1D ACTTTGGCTC T/- TAACTTAAAA 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 T 2 1 238005 CASAVA_Build 15 97914929 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 C 1 0 238006 CASAVA_Build 15 97918845 1D ACGTATTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 10 9 238007 CASAVA_Build 15 97919445 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 12 11 238008 CASAVA_Build 15 97929451 1D TTTTTCCCTC T/- TCCCCCAACC 3070 hom 126 het 43 0 43 0 T 2 1 238009 CASAVA_Build 15 97930257 4I CCATAAAGGC ----/AGAG AGAGGCCTTG 3070 het 3070 hom 62 23 32 7 AG 2 4 238010 CASAVA_Build 15 97935133 15I GCTAGGTGCT ---------------/GCGGAATACCAGTGA GCAAGGCTTG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 GCGGAATACCAGTGA 0 1 238011 CASAVA_Build 15 97939143 1D ATGAGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 12 12 T 12 11 238012 CASAVA_Build 15 97943428 4D ACATTACATG CTTA/---- CTTAATTCTC 3070 het 3070 ref 47 23 19 9 CTTA 2 1 238013 CASAVA_Build 15 97945673 3I CACTGCTTAG ---/GAC GACCTTCAGT 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 GAC 1 2 238014 CASAVA_Build 15 97948078 5D CCTATCTGTG TTAAT/----- TTAAAGTGAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 TTAAT 1 0 238015 CASAVA_Build 15 97952188 9D CCTTTCTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 1307 hom 35 9 12 18 T 21 12 238016 CASAVA_Build 15 97955229 8D ATTTCACCTC GGTCCTGT/-------- GGTCCTGTGG 2067 het 2064 ref 13 6 5 2 GGTCCTGT 3 2 238017 CASAVA_Build 15 97958483 8D TGCTGATCTA TATATCCT/-------- TATGACAGTG 3070 het 3070 hom 32 15 17 1 TATATCCT 1 0 238018 CASAVA_Build 15 97975004 1I TTTTTTTTTT -/G GTATGGTCTG 3070 het 360 hom 48 2 40 6 G 1 2 238019 CASAVA_Build 15 97988222 1I TGTTTTAAAC -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 30 16 7 7 T 6 7 238020 CASAVA_Build 15 98031587 1D ATATAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 11 10 238021 CASAVA_Build 15 98044649 1I TGTTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 T 10 11 238022 CASAVA_Build 15 98049691 1I CTTCCTGTAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 40 11 22 7 A 8 9 238023 CASAVA_Build 15 98052711 2D TTTTTGTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 37 1 28 8 T 12 10 238024 CASAVA_Build 15 98053588 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 5 A 14 12 238025 CASAVA_Build 15 98054529 1I TTCCAACTTA -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 7 8 238026 CASAVA_Build 15 98054783 1D TTCATCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 47 2 40 5 A 11 10 238027 CASAVA_Build 15 98058650 2D AAATAAGGGG AA/-- AAAGGGACAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 5 3 238028 CASAVA_Build 15 98061011 1D TCCAAATATG T/- TTTTTCTAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 6 5 238029 CASAVA_Build 15 98061383 1D TACTTGTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 10 9 238030 CASAVA_Build 15 98070645 4I GTGGGTGTGA ----/GTGT GTGTGTATGT 2640 het 2640 ref 32 19 8 5 GT 3 5 238031 CASAVA_Build 15 98072540 1D CCCCCCCCCA C/- CCCCCCCCCA 1968 hom 16 het 13 0 7 6 C 10 9 238032 CASAVA_Build 15 98075237 20I CAGGAGGTTT --------------------/CAGATTGGGGCTTAAAACAC CAGACGTTCC 3070 het 3070 hom 41 14 20 9 CAGATTGGGGCTTAAAACAC 0 1 238033 CASAVA_Build 15 98076161 2I TACCTTGAGA --/CT CTGCAGGGTT 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 CT 1 2 238034 CASAVA_Build 15 98078829 1I GGTTTACCTC -/G GGGGTGCTAG 3070 het 3070 hom 56 21 30 5 G 4 5 238035 CASAVA_Build 15 98082873 2D TGACGGTCTC TG/-- TTACTCAAAG 3070 het 3070 hom 42 20 19 5 TG 1 0 238036 CASAVA_Build 15 98088163 1I AAGCAGGGAG -/A AATGTAAGTC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 2 3 238037 CASAVA_Build 15 98088446 3I AAGAGCAAAT ---/TTA TTATTTACTT 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 TTA 1 2 238038 CASAVA_Build 15 98093058 4D GTCTAATCTC CTCT/---- CTCTCACTCA 3070 het 3070 ref 32 15 12 7 CT 4 2 238039 CASAVA_Build 15 98107539 3D GTAAAGCCTG AAA/--- TCCAGTACGT 3070 hom 144 het 52 0 49 5 A 3 0 238040 CASAVA_Build 15 98110264 1I TCACCCCCTT -/C AGAGAAGGAA 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 C 0 1 238041 CASAVA_Build 15 98113219 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 11 10 238042 CASAVA_Build 15 98123197 1I TCTTTTTTTT -/A TAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 0 1 238043 CASAVA_Build 15 98126951 1D TCAGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1773 hom 21 9 10 3 A 11 10 238044 CASAVA_Build 15 98132625 3D AGTATATATG TAT/--- TATTATATAT 2458 het 795 hom 8 3 5 1 TAT 3 2 238045 CASAVA_Build 15 98134609 1D AATATAACAA C/- AAAAAAATCG 3070 het 1159 hom 27 4 14 9 C 1 0 238046 CASAVA_Build 15 98134725 3D TAAGGTAAAT TTA/--- TTATTAAAGA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 TTA 3 2 238047 CASAVA_Build 15 98138673 1D ACTCTTTTGG A/- ACTAGGATTT 3070 het 3070 ref 54 32 18 4 A 2 1 238048 CASAVA_Build 15 98143518 4I ATTAAGTGTC ----/TGTT AAACTTCTTA 2911 hom 15 het 7 0 6 1 TGTT 0 1 238049 CASAVA_Build 15 98161858 3D TAAAAACAAT AAC/--- AACAGATCCA 3070 het 3070 ref 35 18 9 9 AAC 2 1 238050 CASAVA_Build 15 98162660 1D GGTCGGTGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 A 10 9 238051 CASAVA_Build 15 98163054 2D GATTAAGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 14 12 238052 CASAVA_Build 15 98171395 1D TTCTTTAGCC A/- AAAAAAAAAA 2174 het 2037 hom 27 9 5 13 A 15 14 238053 CASAVA_Build 15 98171657 8I ATACAACTTG --------/TTTTTTTC TTTTTTTCTT 3070 het 1975 hom 20 10 8 2 TTTTTTTC 1 2 238054 CASAVA_Build 15 98172286 5D AGTATCCCAT ATGCA/----- GTAACAAACC 3070 het 3070 ref 37 22 14 4 ATGCA 1 0 238055 CASAVA_Build 15 98178725 1I TCTTAATCCA -/T TTTCCCCCAC 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 T 3 4 238056 CASAVA_Build 15 98180790 1D ACATTTGTGG T/- TTTTTTTTAA 3010 het 3010 ref 25 15 7 5 T 9 8 238057 CASAVA_Build 15 98184268 1I GAGAAAACAC -/T TTTGCATGCA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 3 4 238058 CASAVA_Build 15 98191915 3I CTGAATAATG ---/AGA AGGTTTGGCT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AGA 0 1 238059 CASAVA_Build 15 98192241 1I TTTATAGTCT -/A AAAATCACAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 4 5 238060 CASAVA_Build 15 98192613 1I TATTATCGTT -/A ACATGTGATC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 1 2 238061 CASAVA_Build 15 98192802 1I CTTAATTATA -/T TGGAAAACCT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 1 2 238062 CASAVA_Build 15 98196257 1D TAAAGTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 558 hom 24 2 14 8 A 15 14 238063 CASAVA_Build 15 98200544 2D TGGAAGAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 17 1 13 3 A 18 16 238064 CASAVA_Build 15 98219266 1I CTACTTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2279 hom 28 9 14 5 A 11 12 238065 CASAVA_Build 15 98227839 3I25M1D GTGCATAAAC ---AATGTGTTTATTGATATGCTAAAACA/AATAATGTGTTTATTGATATGCTAAAAC- ATTGCTTGAC 3070 het 3070 ref 36 30 19 2 N/A 0 0 238066 CASAVA_Build 15 98228873 1D AAAATCAAGA G/- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 G 4 3 238067 CASAVA_Build 15 98232414 2I GAGCCATAGC --/AA AAAAAAAAAG 2110 het 2110 ref 30 15 5 10 A 9 11 238068 CASAVA_Build 15 98242263 1D TTAATAAGGC A/- AAAAGGGCAA 3070 het 3070 ref 34 15 8 12 A 5 4 238069 CASAVA_Build 15 98242491 7D GCCATTACCC TGTTTAG/------- TAAGGGCCCC 3070 het 3070 ref 36 19 15 6 TGTTTAG 1 0 238070 CASAVA_Build 15 98251458 1D TACATAGAAT A/- ACAATAATTA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 A 2 1 238071 CASAVA_Build 15 98252267 3D TGGGCATTTA AGG/--- AGATCAGAAT 3070 het 3070 hom 38 11 20 9 AGG 1 0 238072 CASAVA_Build 15 98268368 1I GAGGGCTTCA -/G GTATTTAAAG 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 G 1 2 238073 CASAVA_Build 15 98283399 2D GTGTGTGTGT GG/-- GGGTTGGTGT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 G 5 3 238074 CASAVA_Build 15 98305867 1D AGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 12 11 238075 CASAVA_Build 15 98306027 1I GTAATAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 162 hom 21 1 12 8 T 15 16 238076 CASAVA_Build 15 98316645 7I GGGGACTGTG -------/CCTGTCC TGCATTCATC 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 CCTGTCC 0 1 238077 CASAVA_Build 15 98321660 1D GGGATTGGAA G/- GGGGGATAAC 3070 hom 111 het 44 0 34 10 G 6 5 238078 CASAVA_Build 15 98322448 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 902 hom 19 3 15 1 A 11 12 238079 CASAVA_Build 15 98328219 4I TTTTTTTTCT ----/TAGA TAGATAGGGT 1527 het 1165 hom 16 6 5 5 TAGA 1 2 238080 CASAVA_Build 15 98330896 4D GGGGGAAGGA CCTT/---- CCTTCATCAT 3070 het 3070 ref 36 15 15 7 CCTT 2 1 238081 CASAVA_Build 15 98331111 6D ATCCTAGGCC TGGGCT/------ TGTGTCCTCA 3070 het 3070 ref 35 22 12 2 TGGGCT 1 0 238082 CASAVA_Build 15 98333608 1I AGGAATGGAA -/T TCCATCTCTG 3070 hom 108 het 40 0 33 7 T 1 2 238083 CASAVA_Build 15 98337323 1D GGACAGACTG A/- AAAAAGGGCA 3070 hom 140 het 53 0 45 8 A 6 5 238084 CASAVA_Build 15 98348355 1D GAAATTTGGC T/- TTTTTTTTTT 1486 het 1486 ref 31 15 4 12 T 15 14 238085 CASAVA_Build 15 98362346 4D ACTGTAATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1409 het 796 hom 18 5 4 9 T 22 18 238086 CASAVA_Build 15 98377728 3I TAAGATTTGG ---/AAA AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 29 0 21 8 A 8 11 238087 CASAVA_Build 15 98424111 1I ACGTCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 301 hom 37 1 27 9 T 11 12 238088 CASAVA_Build 15 98431504 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGGAGGG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 7 6 238089 CASAVA_Build 15 98431643 1I AAAGTATAAT -/A TAAAAAAAGG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 0 1 238090 CASAVA_Build 15 98432129 2D TATTAAAGAC AT/-- ATACATTATT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 AT 2 1 238091 CASAVA_Build 15 98435190 2D ACTCCCTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 21 2 9 11 A 16 14 238092 CASAVA_Build 15 98448591 1D AAAAAATTAG C/- CAGGTTTGGT 3070 hom 75 het 26 0 25 1 C 2 1 238093 CASAVA_Build 15 98454447 3I TATTTGTTCT ---/GGA GGAGGGAGAT 3070 hom 75 het 27 0 24 3 GGA 1 2 238094 CASAVA_Build 15 98457499 1D GGGATGGAAC G/- GGGGGAAAAG 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 G 6 5 238095 CASAVA_Build 15 98463731 1D AAGAAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 11 10 238096 CASAVA_Build 15 98482508 2D CGAAAGCGTG GA/-- GAGAAAGGTG 3070 hom 84 het 33 0 27 9 GA 3 2 238097 CASAVA_Build 15 98489095 1I TTAAAGTATG -/A AAAAAAAAAA 2030 het 333 hom 15 2 11 2 A 16 17 238098 CASAVA_Build 15 98491636 1I ACAATTTTTT -/A ATAGCATTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 238099 CASAVA_Build 15 98495868 2I ATCTGGAAGG --/GT GTGTTTACCA 3070 hom 72 het 29 0 23 6 GT 2 3 238100 CASAVA_Build 15 98498217 2D ACATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 118 hom 30 1 16 14 AT 10 9 238101 CASAVA_Build 15 98510686 1D4M10I7M30I ATGGCCAAAT GTGAA----------TCTTCGC------------------------------/-AGAATTATTATTTTTCTTAGCAAGGAACATCCCTGGGAAAGAGAATACGTG TCTGAAGGTA 3070 hom 36 het 13 0 11 3 N/A 0 0 238102 CASAVA_Build 15 98513718 2I TCCAGTTGCC --/CA CAGTTTGCTG 3070 het 3070 hom 58 23 30 5 CA 1 2 238103 CASAVA_Build 15 98516334 1I CTCCCTCCAG -/C CCCCTGGCAA 2490 het 2490 ref 27 11 8 8 C 4 5 238104 CASAVA_Build 15 98517793 2D GCCCCCCAGT AA/-- AGAGGGTCTC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 3 1 238105 CASAVA_Build 15 98522120 4D ATACTGAATG TCAT/---- TCATTCATTC 3070 hom 140 het 57 0 47 11 TCAT 4 3 238106 CASAVA_Build 15 98549628 2I GGCACCAGGA --/GG GGTTTGTGGC 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 G 2 4 238107 CASAVA_Build 15 98566495 1I AAGGAGAAGA -/T GGCCTTGGTT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 0 1 238108 CASAVA_Build 15 98572230 1D GGTAATTATG T/- TTTTTTAATT 2574 het 2574 ref 16 7 6 4 T 7 6 238109 CASAVA_Build 15 98574840 1I CTTTCTGATA -/G GGAAAAATAA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 G 2 3 238110 CASAVA_Build 15 98585062 8I CTTTCCCACC --------/ATGCAGGA CACATCAGAA 3070 hom 30 het 39 0 14 25 ATGCAGGA 0 1 238111 CASAVA_Build 15 98588547 20I TCGGAAACAT --------------------/ATCTTAGCAGGAGAAGCAAA GTCCACTGTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 ATCTTAGCAGGAGAAGCAAA 0 1 238112 CASAVA_Build 15 98612743 1D AAGGTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 31 2 22 7 A 11 10 238113 CASAVA_Build 15 98616681 1I TTGCCTCTGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 14 12 12 A 8 9 238114 CASAVA_Build 15 98625407 2D GCCCCCCTCC CT/-- GTCTCCCTTC 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 CT 1 0 238115 CASAVA_Build 15 98625863 1I TGAGTTGTTC -/T TTTTTTACAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 238116 CASAVA_Build 15 98626704 3D AATAATGCCA CAT/--- CATACCTACA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CAT 2 1 238117 CASAVA_Build 15 98629278 4D32M1D GTAAAAATGT CTACCTAAGTCCTTTCCCATTTTTTAAATTGAATTGT/----CTAAGTCCTTTCCCATTTTTTAAATTGAATTG- TTTTTTTTTT 3070 het 2892 hom 32 9 18 17 N/A 0 0 238118 CASAVA_Build 15 98629759 2I CCATATATAT --/GA GTGTTAATTG 3070 hom 69 het 35 0 24 11 GA 0 1 238119 CASAVA_Build 15 98632578 1D ATTCCCTTTT C/- ATTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 1 0 238120 CASAVA_Build 15 98678829 1I GTGTAAAATC -/A AAGATAAAGC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 2 3 238121 CASAVA_Build 15 98696367 3I CCGACTCTTG ---/CTC CTCATTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 CTC 1 2 238122 CASAVA_Build 15 98698506 1I GCGGCGTATA -/C CCCCACGCAA 2655 hom 21 het 12 0 8 4 C 4 5 238123 CASAVA_Build 15 98706340 1I TGTCACCATC -/T TGGTTTTGGT 3070 hom 144 het 52 0 47 5 T 1 2 238124 CASAVA_Build 15 98729022 1I ATAATAATAA -/T AAAATAAATA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 0 1 238125 CASAVA_Build 15 98734024 1D ACCTGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 11 10 238126 CASAVA_Build 15 98734703 1D GATCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 11 10 238127 CASAVA_Build 15 98735986 1D TCAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 17 1 14 2 A 12 11 238128 CASAVA_Build 15 98743891 2I AGATAAATCC --/AG AGTCTCATAA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 AG 1 2 238129 CASAVA_Build 15 98744575 2I CATGTGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 TG 6 7 238130 CASAVA_Build 15 98761608 5D AACAGGTCTC ATTTT/----- ATTTTATGAG 3070 het 3070 ref 23 12 10 3 ATTTT 2 1 238131 CASAVA_Build 15 98762971 1I TAAAAAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 het 144 hom 29 4 16 9 C 0 1 238132 CASAVA_Build 15 98767183 1I CTTAAAAAAA -/C GTGCAGCCCA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 C 0 1 238133 CASAVA_Build 15 98771603 3I ATAACCTCCC ---/AAA AAAATTGAAT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 4 7 238134 CASAVA_Build 15 98773531 4D GGCAGGGAGT GAGG/---- GAGGGGAGGG 3070 het 3070 ref 33 22 9 3 GAGG 2 1 238135 CASAVA_Build 15 98773684 4I ACTTGAAGTA ----/AAAC AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AAAC 1 2 238136 CASAVA_Build 15 98773860 4I AATTAGAAAA ----/AAGT ATTATAAAAT 3070 het 3070 ref 32 20 12 0 AAGT 0 1 238137 CASAVA_Build 15 98782751 2I CTTCCATATA --/GT GTTAAGCCTG 2593 het 2593 ref 21 11 7 3 GT 1 2 238138 CASAVA_Build 15 98783208 1I GATTTAATGA -/C CCCCCTGCTG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 C 5 6 238139 CASAVA_Build 15 98783626 8D GATTTACCCC TTGCTATT/-------- CTTGTGACAG 3070 het 3070 ref 37 22 13 4 TTGCTATT 1 0 238140 CASAVA_Build 15 98788459 2I ACATTCAGTC --/AG AGTTCAATTT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 AG 1 2 238141 CASAVA_Build 15 98789800 1D CCCTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 560 hom 42 2 26 14 T 11 10 238142 CASAVA_Build 15 98792660 2D AAGGGATGTC AG/-- AGTTTCTTGT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 AG 2 1 238143 CASAVA_Build 15 98796341 1I GAATTTGGTC -/T TAGGCTTTGG 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 T 1 2 238144 CASAVA_Build 15 98807817 1D AAAGAATTCA T/- TTGAATGAAA 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 3 2 238145 CASAVA_Build 15 98810834 1I TAAACTATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 A 11 12 238146 CASAVA_Build 15 98812524 1D TGAATGGGAG A/- AAATATTTGC 3070 het 3070 hom 24 11 12 2 A 4 3 238147 CASAVA_Build 15 98813600 1D TTAAGAGCAA T/- AATATTTGGA 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 T 1 0 238148 CASAVA_Build 15 98815743 5D TTTTAAGGTG TACAT/----- TAAAGATATT 3070 het 3070 ref 43 22 18 5 TACAT 1 0 238149 CASAVA_Build 15 98823211 1D CAGTACACTG T/- ACCTGAAAGA 3070 het 3070 ref 38 21 14 5 T 1 0 238150 CASAVA_Build 15 98824003 3D TATTTTGAGA CAT/--- CATGGGATAG 3070 het 3070 hom 51 24 25 3 CAT 2 1 238151 CASAVA_Build 15 98831870 1D GAGAGAAACG A/- GGAGTGACTG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 1 0 238152 CASAVA_Build 15 98840339 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAGGG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TA 1 0 238153 CASAVA_Build 15 98841490 9D CAGAAGGATC AATAATAAT/--------- AATAATTATT 701 hom 20 het 8 0 6 2 AAT 5 2 238154 CASAVA_Build 15 98849622 1D TATTGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 38 2 29 7 T 13 12 238155 CASAVA_Build 15 98865909 2I GTTTCTCCCC --/CT GTTTAGCCTC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 CT 0 1 238156 CASAVA_Build 15 98872518 1I GTGTGGGTAT -/A AAAAAAACTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 8 238157 CASAVA_Build 15 98873378 4D GGTCTTAGAA GAAT/---- GTAAATCTTA 3070 hom 78 het 33 0 27 8 GAAT 1 0 238158 CASAVA_Build 15 98875983 2I CAGAATGACT --/GA GAGACAGAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 GA 2 3 238159 CASAVA_Build 15 98877163 1D AAATGTTCTG A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 8 7 238160 CASAVA_Build 15 98880480 3D GTTTGGGATT ACA/--- ACACTTCAAG 3070 hom 181 het 65 0 60 7 ACA 2 1 238161 CASAVA_Build 15 98885617 5I TAAAGAACTT -----/TTCTC TTTATCCAGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TTCTC 0 1 238162 CASAVA_Build 15 98889807 1I AAAACACAGT -/A AAGCCGGATG 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 2 3 238163 CASAVA_Build 15 98891291 3D CCTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1914 hom 13 het 16 0 6 10 T 19 16 238164 CASAVA_Build 15 98892392 7D ACTCAAAAGA ATGCAAC/------- TCAAATTGCT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 ATGCAAC 1 0 238165 CASAVA_Build 15 98901262 2D CCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2333 het 435 hom 22 3 8 13 T 14 12 238166 CASAVA_Build 15 98901735 1I CTTTGTAGCC -/G GGGGGAAAGG 3070 hom 62 het 23 0 19 4 G 5 6 238167 CASAVA_Build 15 98903181 2I TTTTTAGTGC --/TT TTTTTTTTTC 1380 het 77 hom 13 1 3 9 T 9 11 238168 CASAVA_Build 15 98903495 3I GCCCAACCTC ---/TTT TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 7 10 238169 CASAVA_Build 15 98904948 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAACTAA 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 A 6 7 238170 CASAVA_Build 15 98922145 3D GACTCAGCAC AAG/--- AAGACAGCTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 AAG 2 1 238171 CASAVA_Build 15 98925706 1I AGAGATCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 A 9 10 238172 CASAVA_Build 15 98925869 4I11M2I ATAGGAAAAT ----TAGTGATTAAA--/TATGTAGTAATTAAATT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 19 9 4 N/A 0 0 238173 CASAVA_Build 15 98927896 2D ACAAAAATAA AC/-- AGTTTTACCA 3070 het 3070 hom 50 21 22 8 AC 1 0 238174 CASAVA_Build 15 98930281 1D AGGTAGTTTG A/- ACTACAATTT 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 A 2 1 238175 CASAVA_Build 15 98930845 2D CTGTCTTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 CT 9 8 238176 CASAVA_Build 15 98937130 1I CTTTAACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 22 1 19 2 T 10 11 238177 CASAVA_Build 15 98937420 1D CAGAGATAAG A/- GAAAAACTCA 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 A 1 0 238178 CASAVA_Build 15 98953067 1I ACTCAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 43 1 35 7 A 11 12 238179 CASAVA_Build 15 98954147 2D TATTAAACTC TT/-- GTCTTAGGAC 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 2 0 238180 CASAVA_Build 15 98963921 1I TGAAGGATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 20 19 12 T 10 11 238181 CASAVA_Build 15 98982632 1I ATTGGTGTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 A 9 10 238182 CASAVA_Build 15 98990590 1I AGTGCAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 634 hom 24 2 16 6 C 0 1 238183 CASAVA_Build 15 98998827 4D ACAGGGGAGG AATT/---- AATTTTCTAA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 AATT 2 1 238184 CASAVA_Build 15 99004748 3I AAGAATGACG ---/TTC TTCTTGTTAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TTC 1 2 238185 CASAVA_Build 15 99017159 1D CGGAGGTTGC A/- AGTGAGCCGA 3070 hom 52 het 22 0 18 4 A 2 1 238186 CASAVA_Build 15 99017395 1D TAGAGGGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 10 13 A 12 11 238187 CASAVA_Build 15 99021469 1I CACCCACCGG -/T TTTTTTGTGT 2409 het 2092 hom 26 7 13 6 T 6 7 238188 CASAVA_Build 15 99022894 2D GACTCTTATG TA/-- TATTCATTTT 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 TA 2 1 238189 CASAVA_Build 15 99037130 1I TGCCGTTTGC -/T AAGACCATTG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 0 1 238190 CASAVA_Build 15 99039731 4I AAAAGTCTGT ----/AAAC AAACACATCT 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 AAAC 1 2 238191 CASAVA_Build 15 99045599 3D AGCCAAAAAG AAA/--- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 A 11 8 238192 CASAVA_Build 15 99046351 5I CGTGCCCTGC -----/CCACT CTACTCCTTC 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 CCACT 0 1 238193 CASAVA_Build 15 99057883 1D TGTCTGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 12 11 238194 CASAVA_Build 15 99058148 1I ACTTGCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 21 5 T 13 14 238195 CASAVA_Build 15 99065909 1D AGATGATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 30 0 27 3 T 13 12 238196 CASAVA_Build 15 99067676 2I AGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 426 hom 57 2 40 15 TG 7 8 238197 CASAVA_Build 15 99067786 3D GAGGTGGTGT TGG/--- TGGTGGTGGT 3070 hom 124 het 56 0 40 20 TGG 6 5 238198 CASAVA_Build 15 99082082 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1704 het 1704 ref 26 14 5 7 A 13 12 238199 CASAVA_Build 15 99089008 1I GTGCAACCAC -/T TTTTTTTTTT 1714 het 604 hom 30 4 15 11 T 16 17 238200 CASAVA_Build 15 99093817 1I CACCATGCAT -/G GCTAATTTGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 1 2 238201 CASAVA_Build 15 99105181 1D GTCATTCAAA T/- TGTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 2 1 238202 CASAVA_Build 15 99107289 1D TTGGCAATGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 56 het 50 1 44 5 T 9 8 238203 CASAVA_Build 15 99111955 1D TAAGACTCTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 9 8 238204 CASAVA_Build 15 99113339 1D TACTTTTTTT G/- GTCATTGGGG 3070 hom 93 het 37 0 35 3 G 2 1 238205 CASAVA_Build 15 99120111 1D AGAGACAAAA G/- GTTTGCAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 G 2 1 238206 CASAVA_Build 15 99124306 1I CAGAGATGGT -/G GGGGGGTGGT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 G 6 7 238207 CASAVA_Build 15 99129881 1D AGCTTTTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 41 0 33 10 A 10 9 238208 CASAVA_Build 15 99143911 2D26M2I GTGTGTGTAC GTGTGTGTGAGTGTGTGAATTTGTATGA--/--GTGTGTGAGTGTGTGAATTTGTATGAGT GTGTGTCAAT 3070 het 593 hom 68 4 24 57 N/A 0 0 238209 CASAVA_Build 15 99148578 3D CATTATTTAC AAA/--- AAGATGAAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 5 2 238210 CASAVA_Build 15 99153494 4I TGACAGAATT ----/AAAG AAAGAATCAC 3070 hom 99 het 43 0 34 9 AAAG 1 2 238211 CASAVA_Build 15 99155614 1I AAATGTGAAC -/A AAAGAAATTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 3 4 238212 CASAVA_Build 15 99155705 5D TTTTATACTG ATAAA/----- ATAAACAATA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 ATAAA 2 1 238213 CASAVA_Build 15 99156472 1D CTATTTCATA C/- ACTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 38 18 19 2 C 1 0 238214 CASAVA_Build 15 99197603 1D AAAAAAATGC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 7 238215 CASAVA_Build 15 99214225 1I GCTTGACAGG -/A AAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 6 7 238216 CASAVA_Build 15 99223032 1I CCATCTTGGG -/A ACCAATGTGA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 1 2 238217 CASAVA_Build 15 99231069 1D TCCTGGGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 43 1 40 2 A 10 9 238218 CASAVA_Build 15 99310435 1I TGGTATCAAA -/T TGCTTGTCAG 3070 hom 150 het 55 0 50 5 T 1 2 238219 CASAVA_Build 15 99310600 1I TTCCTTATGC -/T TTTAAGCAAG 3070 hom 126 het 51 0 43 8 T 3 4 238220 CASAVA_Build 15 99312082 1D GTTATTTAGC T/- TTTTTTGCTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 238221 CASAVA_Build 15 99312747 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 65 het 48 1 42 5 T 9 8 238222 CASAVA_Build 15 99313447 1D TTTTACTAAT G/- TTTTTTTCTG 3070 het 391 hom 26 1 23 3 G 1 0 238223 CASAVA_Build 15 99322536 2D GCACACGCAT GC/-- GCGCACACAC 3070 hom 157 het 59 0 53 6 GC 3 2 238224 CASAVA_Build 15 99325269 24D2M2D AGGATTTTTC CTGGGAGCAGGATTTTCCAAAGGGAGCT/------------------------AG-- CTTTGGTGGC 3070 hom 108 het 36 0 37 4 N/A 0 0 238225 CASAVA_Build 15 99327624 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 10 11 238226 CASAVA_Build 15 99329062 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 23 0 16 7 A 15 14 238227 CASAVA_Build 15 99336606 1I AAAGGGAACA -/T TTTTTTAACA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 6 7 238228 CASAVA_Build 15 99338430 1D GCAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 126 het 52 0 43 11 A 10 9 238229 CASAVA_Build 15 99385851 1D CACAGGACTT A/- ACGTTCTGTA 3070 hom 154 het 57 0 51 6 A 2 1 238230 CASAVA_Build 15 99400055 1D TCTGTCAGTC T/- TTTTAAAGGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 5 4 238231 CASAVA_Build 15 99401161 26D TAACTTTGGT CCATGAGAACGTTCAGAGTAAGGCAG/-------------------------- CCTGTGTGTT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 CCATGAGAACGTTCAGAGTAAGGCAG 1 0 238232 CASAVA_Build 15 99405828 1D ATGGAGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 25 1 20 4 A 12 11 238233 CASAVA_Build 15 99409381 1D AGTGCTGCTC G/- GGGGGCCCTC 3070 hom 78 het 31 0 20 11 G 6 5 238234 CASAVA_Build 15 99418505 1I ATTTTGAGTG -/C CCCCCCCGCC 3070 het 1730 hom 28 6 10 12 C 7 8 238235 CASAVA_Build 15 99421397 7I TTGCCCATCT -------/ACAAAAC ACAAAACAGG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 ACAAAAC 1 2 238236 CASAVA_Build 15 99429110 4D CTGTGTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 994 het 77 hom 26 1 8 18 TTTG 1 0 238237 CASAVA_Build 15 99433456 1D TGGTGTCAAA C/- CCATATACTC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 C 3 2 238238 CASAVA_Build 15 99459027 3I AGGAAGGATG ---/GGA AGAGTCCTGG 3070 hom 69 het 24 0 21 3 GGA 0 1 238239 CASAVA_Build 15 99462466 1I ACTGGTGTGG -/C CCTTCCAGAA 3070 hom 80 het 31 0 25 6 C 2 3 238240 CASAVA_Build 15 99473227 1I AGTGTGCCTA -/C GCAGACGTGA 3070 hom 102 het 45 0 34 11 C 0 1 238241 CASAVA_Build 15 99479297 1I CATGCCATTT -/C CCTCGGGTGG 2550 hom 26 het 14 0 8 6 C 2 3 238242 CASAVA_Build 15 99482584 2D TGTCTCTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 2304 het 882 hom 33 5 12 16 A 19 17 238243 CASAVA_Build 15 99487417 1D GATATCTGTT A/- ACAGCAGCCG 3070 hom 111 het 41 0 38 5 A 2 1 238244 CASAVA_Build 15 99487750 1D GCTACTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 133 het 54 0 44 10 A 11 10 238245 CASAVA_Build 15 99497164 2I CTGTTCTAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 13 6 A 10 12 238246 CASAVA_Build 15 99518683 2I TGGCTATTAC --/AA GAGAACAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 2 238247 CASAVA_Build 15 99530774 4D TGGGGCCTGG CAGA/---- GCAGGCGCCC 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 CAGA 1 0 238248 CASAVA_Build 15 99533531 1I AAAATGGTTC -/T GAAAAGTACA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 0 1 238249 CASAVA_Build 15 99546324 3I TTTAGTGGTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 11 14 238250 CASAVA_Build 15 99550344 2D AGCATCCTTC AA/-- AGAGGATCAA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 A 3 1 238251 CASAVA_Build 15 99550426 19I GAAGGCAGGT -------------------/CTCACAGATTCTTTCCACA CTCACAGCAC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 CTCACAGATTCTTTCCACA 0 1 238252 CASAVA_Build 15 99551225 1D GAGCAAGCAT A/- AACGGCTGGG 3070 hom 81 het 33 0 24 10 A 3 2 238253 CASAVA_Build 15 99554137 3D TCAGAAGTGG GAA/--- GGTTTACGGC 3070 het 3070 ref 38 18 16 6 GAA 1 0 238254 CASAVA_Build 15 99566134 1D AAACAGTTAT A/- GGGGCATATC 3070 het 3070 ref 45 26 11 8 A 1 0 238255 CASAVA_Build 15 99604099 1D TTTTTTTTTT A/- ATCAAAACGT 3070 hom 59 het 23 0 17 7 A 2 1 238256 CASAVA_Build 15 99613759 1D GCTTCTGGTG T/- TAAGACTTAA 3070 hom 87 het 37 0 28 9 T 2 1 238257 CASAVA_Build 15 99638585 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2819 het 2773 hom 17 9 7 1 A 10 11 238258 CASAVA_Build 15 99649248 2D GATAGTTTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 15 6 T 14 12 238259 CASAVA_Build 15 99650319 3D AGTTGCAGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 A 14 11 238260 CASAVA_Build 15 99675248 1I TTCCTCTTTG -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 33 14 19 0 A 6 7 238261 CASAVA_Build 15 99689465 1I CAGGCAAGAG -/A AGACACACAA 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 A 1 2 238262 CASAVA_Build 15 99694536 4D GGGGCCAGGC ACTG/---- ACTGAGCTAA 3070 het 3070 ref 35 19 10 11 ACTG 2 1 238263 CASAVA_Build 15 99719064 56D CCATCACCCC TCCCACTAAATGTGGAATCAGAATCTCAGCAAATTTTTATTCCTCCCCATTCTCAT/-------------------------------------------------------- CCCCTGCCTT 3070 het 3070 ref 34 29 10 7 TCCCACTAAATGTGGAATCAGAATCTCAGCAAATTTTTATTCCTCCCCATTCTCAT 1 0 238264 CASAVA_Build 15 99727478 1D23M4I ATAGCCTCCC AAAAAACCATGTGCGAAGCTTTGG----/-AAAAACCATGTGCGAAGCTTTGGAATT AATTCCCAGC 2912 het 2912 ref 24 17 8 4 N/A 0 0 238265 CASAVA_Build 15 99732016 1I CCTCCTCCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 9 10 238266 CASAVA_Build 15 99733043 1I ATTTAACCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 9 10 238267 CASAVA_Build 15 99742912 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTACATT 3070 hom 68 het 25 0 23 2 T 6 5 238268 CASAVA_Build 15 99746249 1I AACTCAAGAG -/T ATTTCTTGAC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 0 1 238269 CASAVA_Build 15 99746435 1D ACGCCCATCA G/- GATGGCCTAA 3070 hom 84 het 31 0 28 5 G 2 1 238270 CASAVA_Build 15 99747156 2D AATCTAAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 37 0 17 22 T 12 10 238271 CASAVA_Build 15 99747915 1D ACCGCTAGCT G/- GGGGCTCTGC 3070 hom 86 het 53 0 39 14 G 5 4 238272 CASAVA_Build 15 99748083 1I GGGATTGTCG -/C CCCCATCATC 3070 hom 78 het 32 0 24 8 C 4 5 238273 CASAVA_Build 15 99749537 3I AACACCCCTC ---/CTA CTGTCAGAGC 3070 het 3070 hom 41 9 28 4 CTA 0 1 238274 CASAVA_Build 15 99763947 2D CCCACACACC CA/-- CACACACACA 3070 hom 107 het 41 0 35 7 CA 6 5 238275 CASAVA_Build 15 99771194 1I GGAAGGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 A 10 11 238276 CASAVA_Build 15 99777425 4D ACTCTCCTAA ACTG/---- ACTGTAATAA 3070 het 3070 ref 34 21 10 7 ACTG 2 1 238277 CASAVA_Build 15 99783362 2D GTTTATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 41 19 17 7 AT 7 6 238278 CASAVA_Build 15 99786962 1I TGCTGATGGA -/G GAAGGAAAGA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 G 1 2 238279 CASAVA_Build 15 99788017 1I TCACAGTGCT -/G TGAGGCCATC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 G 0 1 238280 CASAVA_Build 15 99792532 4I ATTCTCCCGG ----/CACC CACTGTGTCC 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 CACC 0 1 238281 CASAVA_Build 15 99795210 1I CACCCCCACC -/A ACCACCTCCC 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 1 2 238282 CASAVA_Build 15 99813968 1D7M11I CCCCTCCACG TGCTGATT-----------/-GCTGATTCACTAAGACTG CACGTAACAG 3070 het 3070 ref 51 27 21 9 N/A 0 0 238283 CASAVA_Build 15 99822685 1I AGGGGACAGA -/G GGCTACTCAG 3070 het 3047 hom 33 11 13 9 G 2 3 238284 CASAVA_Build 15 99823054 1D GATTCTACAG C/- CCTGATGTGC 3070 het 3070 ref 50 23 15 14 C 3 2 238285 CASAVA_Build 15 99823419 1I GGGGCCGTGA -/G GGGGGACATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 5 6 238286 CASAVA_Build 15 99824484 1D AAAGACCCTA T/- TATTACTGTA 3070 hom 123 het 43 0 42 2 T 2 1 238287 CASAVA_Build 15 99824833 2I CCATACAGGT --/AA AAAAAAAATT 2792 het 2792 ref 24 11 8 5 A 8 10 238288 CASAVA_Build 15 99825003 1D GCAACAATTC T/- TTTTTTTTTT 1886 hom 11 het 25 0 9 16 T 15 14 238289 CASAVA_Build 15 99825167 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 41 het 21 0 15 6 T 6 7 238290 CASAVA_Build 15 99829762 1I AAATTGTGAT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 8 9 238291 CASAVA_Build 15 99834253 1I AGGTAGGTCC -/A AAAAAAAAAA 2211 het 2211 ref 29 11 7 11 A 11 12 238292 CASAVA_Build 15 99854089 1I CTTCTGCACC -/T CCCTGCCCTG 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 0 1 238293 CASAVA_Build 15 99859941 1I GGGAGTGAGT -/C CCCCCTGGTG 3070 hom 43 het 18 0 13 5 C 5 6 238294 CASAVA_Build 15 99860216 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 296 hom 40 1 32 7 A 9 10 238295 CASAVA_Build 15 99863438 1I ATCCTCCCCT -/C CCCCAGCTCC 3070 hom 98 het 39 0 31 8 C 4 5 238296 CASAVA_Build 15 99865705 1D AAAATATATT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 31 20 9 4 A 7 6 238297 CASAVA_Build 15 99872476 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1735 het 1735 ref 30 13 5 12 T 15 16 238298 CASAVA_Build 15 99876802 1I TTATAGACGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 10 11 238299 CASAVA_Build 15 99882871 3D TTGCAATCTG TGC/--- TGTTTATTTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 TGC 1 0 238300 CASAVA_Build 15 99884782 3D TCAGGAAGGG AGA/--- AGAGACCCCG 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 AGA 2 1 238301 CASAVA_Build 15 99887859 1D CGGTGGGGGG T/- AGCAGGGCTG 3070 hom 79 het 30 0 23 7 T 1 0 238302 CASAVA_Build 15 99889707 15I TTCTTTCCTT ---------------/CTTTCCTTCCTTTTC CTTTCTTTCT 3070 hom 41 het 17 0 13 4 CTTTCCTTCCTTTTC 0 1 238303 CASAVA_Build 15 99890674 1I TGTTACGGTT -/C CCTCTGTCTG 3070 hom 74 het 26 0 23 3 C 2 3 238304 CASAVA_Build 15 99910747 1D TATGCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 38 2 29 7 T 13 12 238305 CASAVA_Build 15 99911159 6I TTTTTGTAGA ------/GACGGG TTTTTGCCAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 GACGGG 0 1 238306 CASAVA_Build 15 99922202 1I GGCCTGGAAC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 7 8 238307 CASAVA_Build 15 99925577 1I CCGTATCAAG -/A GTGACTGAGC 2287 het 2287 ref 16 10 5 1 A 0 1 238308 CASAVA_Build 15 99931255 1I TGCTCATGCA -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 7 8 238309 CASAVA_Build 15 99932607 1D TTTTTAAAAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 2343 hom 18 7 10 1 T 8 7 238310 CASAVA_Build 15 99941280 1I TTTCTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1537 het 1537 ref 29 13 7 9 T 14 15 238311 CASAVA_Build 15 99944497 1D TGCAAACAGG A/- AAAAATAGAG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 6 5 238312 CASAVA_Build 15 99946850 1D AATATTGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 10 9 238313 CASAVA_Build 15 99946973 2D AAATATATAA CT/-- CAGAAATAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 CT 1 0 238314 CASAVA_Build 15 99947098 2D AAAACTGGGG AC/-- ACACACAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 AC 4 3 238315 CASAVA_Build 15 99947903 4I33M1D AGGTGAATGG ----ATAAACTGTGGTACATCTACACAATGTAATATTA/ATAAATAAACTGTGGTACATCTACACAATGTAATATT- ACGCAGCATT 3070 het 3070 hom 32 19 23 2 N/A 0 0 238316 CASAVA_Build 15 99948453 4D AAACTTGTCG ATTA/---- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 ATTA 1 0 238317 CASAVA_Build 15 99948811 1D TGTTTATTTG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 7 6 238318 CASAVA_Build 15 99951427 2I CTTGAGTTGA --/TT TTTTTGTATA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 5 7 238319 CASAVA_Build 15 99951745 1D ATGCAGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 720 hom 31 4 19 8 T 12 11 238320 CASAVA_Build 15 99957133 1D CAAGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 958 hom 35 10 12 13 T 14 13 238321 CASAVA_Build 15 99957423 1I TTTTAAGTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 8 9 238322 CASAVA_Build 15 99957640 1D TAAGTTGAGA T/- TTTCCAGGTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 4 3 238323 CASAVA_Build 15 99960344 1I AAAACTTTAT -/A ATTCTTTTAC 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 1 2 238324 CASAVA_Build 15 99960673 3D GGATGCCCAC CCT/--- GTGTGGTGCG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 CCT 1 0 238325 CASAVA_Build 15 99963277 4D GTCTCTATAA TTTT/---- TTTTTTTTAA 3070 het 717 hom 33 6 13 14 T 12 8 238326 CASAVA_Build 15 99972987 1D GAAGGGGGCT C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 67 het 30 0 18 13 C 9 8 238327 CASAVA_Build 15 99997107 1D TTCCTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 47 1 33 14 T 11 10 238328 CASAVA_Build 15 100025304 1I TGGAGATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 27 0 20 7 T 10 11 238329 CASAVA_Build 15 100030318 16D CCATCATCAA GAAAGCTGACTCCTGG/---------------- GAAAGCTGAC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 GAAAGCTGACTCCTGG 2 1 238330 CASAVA_Build 15 100035228 1I GTTCTCCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 33 2 18 13 T 14 15 238331 CASAVA_Build 15 100071265 16I GCAGTGGCAA ----------------/TGGAGAGGGAGAGAAG TGGACAGATT 3070 hom 111 het 41 0 37 5 TGGAGAGGGAGAGAAG 0 1 238332 CASAVA_Build 15 100072332 8D ACTCCATCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 1877 hom 29 het 17 0 9 9 A 26 18 238333 CASAVA_Build 15 100086326 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1395 het 33 hom 19 1 9 9 A 17 16 238334 CASAVA_Build 15 100093284 1D ATCTGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 23 2 20 1 T 17 16 238335 CASAVA_Build 15 100093616 1I ATCTTTCATT -/C CCACTCAGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 2 3 238336 CASAVA_Build 15 100095977 1D TTACATGTGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 8 7 238337 CASAVA_Build 15 100101037 1D CGTCTTAAAA G/- AAAAGAAAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 G 1 0 238338 CASAVA_Build 15 100129764 1D AGTGGCCGGG A/- AATTTGCTGT 3070 hom 51 het 18 0 13 5 A 3 2 238339 CASAVA_Build 15 100129839 1D CTTCACCTGG A/- AGGGAGGGGT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 A 2 1 238340 CASAVA_Build 15 100133921 8D TTTCCTCATC CTCTGCTG/-------- CTCTGCTGCC 3070 hom 72 het 25 0 24 5 CTCTGCTG 2 1 238341 CASAVA_Build 15 100140646 1I CTGTTCAGGA -/G GCTGAGGCAG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 1 2 238342 CASAVA_Build 15 100142873 1I GAGATTTTTC -/T TAATATTTGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 1 2 238343 CASAVA_Build 15 100161907 1D ACAGTAATTT G/- GGGAGCATGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 4 3 238344 CASAVA_Build 15 100164859 1D GAAACTACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 32 0 25 8 T 10 9 238345 CASAVA_Build 15 100168659 2D ACAATACTAC AT/-- GTTTCACGAT 3070 hom 186 het 66 0 62 5 AT 1 0 238346 CASAVA_Build 15 100177229 4I ATTTATTTAT ----/TTAG TTAGTTAGTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 TTAG 3 4 238347 CASAVA_Build 15 100185893 1I AGAATTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 T 10 11 238348 CASAVA_Build 15 100213424 1I TCTTCATGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 690 hom 36 2 31 3 T 9 10 238349 CASAVA_Build 15 100218949 1I GATCCACAAA -/C GTTTTCGGTA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 C 0 1 238350 CASAVA_Build 15 100220663 1D GGTGCTCTGT G/- TCCCAGCTGC 3070 hom 52 het 24 0 18 7 G 1 0 238351 CASAVA_Build 15 100229219 1D AAGCAAGGGA G/- GTATTATTAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 2 1 238352 CASAVA_Build 15 100238212 2I CATGTGTTCT --/CA TTGTTCAACT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 CA 0 1 238353 CASAVA_Build 15 100238354 1I CTGCATAGTA -/T TCCATGGTGT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 2 238354 CASAVA_Build 15 100243431 1I CAGGATACAC -/G GGGGTCAGGG 2003 hom 12 het 5 0 5 0 G 4 5 238355 CASAVA_Build 15 100245944 1D GCTCCTAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 66 hom 31 2 21 9 A 9 8 238356 CASAVA_Build 15 100258910 1D ACAAGGAAAA T/- TTTTAAAAAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 5 4 238357 CASAVA_Build 15 100260605 1I AGACATCTAG -/T TTTTTTTATT 1760 het 1760 ref 36 25 4 7 T 7 8 238358 CASAVA_Build 15 100261021 5I TGATTATTCA -----/TCCTT TCCTTTCACT 3070 het 3070 ref 82 63 7 12 TCCTT 1 2 238359 CASAVA_Build 15 100261404 1I ATACCTAATG -/T TAAATGATGA 1443 het 1443 ref 12 7 3 2 T 1 2 238360 CASAVA_Build 15 100261594 4D CTTATAATTT AATA/---- AATATTTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 15 5 AATA 2 1 238361 CASAVA_Build 15 100263638 2D GAAAAACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 AC 7 6 238362 CASAVA_Build 15 100266743 4D AACTTTTTAC TTAG/---- TTATTGTACT 2045 het 2045 ref 79 69 5 7 TTAG 1 0 238363 CASAVA_Build 15 100283717 1I CTAGAGTCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 T 8 9 238364 CASAVA_Build 15 100286130 2D TATACAGATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 1458 hom 18 5 11 2 TG 8 7 238365 CASAVA_Build 15 100287099 1D ATTTTGAAAA C/- TAGGATTGAC 1121 het 1121 ref 9 6 3 0 C 1 0 238366 CASAVA_Build 15 100296456 4I TTAATTTATT ----/AATA AATCATGTGA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 AATA 0 1 238367 CASAVA_Build 15 100304501 1I TATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 T 10 11 238368 CASAVA_Build 15 100305911 1D GGCTTTTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 67 28 29 10 A 9 8 238369 CASAVA_Build 15 100305931 1I TATTCTAATC -/T TTTTTTTTTA 2129 het 2129 ref 60 37 5 18 T 9 10 238370 CASAVA_Build 15 100306646 1I AAGAATAGCA -/T ATTTGTTCTT 3070 het 3070 ref 44 29 12 3 T 0 1 238371 CASAVA_Build 15 100307795 1I CAGCTCTAGA -/T CCAGTAAAGA 3070 het 3070 ref 44 27 14 3 T 0 1 238372 CASAVA_Build 15 100309200 1I TGGGGGTTGT -/G GGGGGTCACC 1746 het 1274 hom 11 4 5 2 G 5 6 238373 CASAVA_Build 15 100315151 1D TTAAGTATAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 56 42 11 4 A 10 9 238374 CASAVA_Build 15 100316934 4I GTGTTGAAAT ----/AAAC CTTACAGATT 1480 het 1480 ref 30 7 4 19 AAAC 0 1 238375 CASAVA_Build 15 100321019 1D TGATAACGTT A/- TGATGATTAA 1696 het 1696 ref 56 40 4 12 A 1 0 238376 CASAVA_Build 15 100324453 5I CTAATATTCA -----/TATAG TATAAACCGT 1890 het 1890 ref 52 43 5 4 TATAG 0 1 238377 CASAVA_Build 15 100333053 1D CGCCACCAGA G/- GGTCCTCAGC 2558 het 1257 hom 28 6 8 14 G 3 2 238378 CASAVA_Build 15 100334731 1D GGAAGAAGGT G/- GGGGAGGTGA 3070 het 2770 hom 39 9 28 2 G 5 4 238379 CASAVA_Build 11 67382 1D CAGAGCCCAG C/- AAGCTAAGAT 1372 het 1372 ref 9 6 3 0 C 1 0 238380 CASAVA_Build 11 163461 1D GGAAAGGGAA T/- TTTTTTTTTA 1676 het 1676 ref 9 5 4 0 T 10 9 238381 CASAVA_Build 11 166184 1D CCCTTAACCC T/- TAACCCTAAC 378 het 378 ref 32 9 6 18 T 2 1 238382 CASAVA_Build 11 173692 1I AATAAATTAT -/A AAAAAAAAAA 2383 het 2383 ref 28 17 5 6 A 10 11 238383 CASAVA_Build 11 175510 1I AAAATTGTAA -/T TTTTTTCAGA 1904 het 1904 ref 27 20 4 3 T 6 7 238384 CASAVA_Build 11 178262 1I CTAGAACCAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 42 28 8 6 A 8 9 238385 CASAVA_Build 11 180325 2D GTCAGAGCGC CA/-- GTTATTAAGC 3070 het 3070 ref 95 55 27 15 CA 1 0 238386 CASAVA_Build 11 182354 34D CCTTCAACCT GGGGGGTTGAACCCCAGGATAGCAACCCCAAGCC/---------------------------------- CTCCTTGCTA 3070 het 3070 ref 81 48 32 17 GGGGGGTTGAACCCCAGGATAGCAACCCCAAGCC 1 0 238387 CASAVA_Build 11 186372 12D11M1I12M1I TGAGGGGACA TGGGGGGGACCTTGGTGAGGGGA-CCTGGTGAGGGG-/------------TGGTGAGGGGAGCATGGTGAGGGGA ACATGGGGGG 456 het 168 hom 8 1 2 8 N/A 0 0 238388 CASAVA_Build 11 187170 3I GATCCCCACT ---/GAG GATGCTGCAG 3070 hom 92 het 33 0 28 5 GAG 0 1 238389 CASAVA_Build 11 199895 3D CTGAAGGGAA CCC/--- CCCACCCACG 3070 het 3070 ref 50 22 18 12 C 6 3 238390 CASAVA_Build 11 209620 1D GGAACAAGGT A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 7 6 238391 CASAVA_Build 11 209701 1I CCTCCCACTG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 7 8 238392 CASAVA_Build 11 215098 1I TTAAGGAAGC -/A AAAAAAAAAA 2664 het 2405 hom 20 6 7 7 A 10 11 238393 CASAVA_Build 11 216084 1D CATTTTACCT A/- AGATAGAAGG 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 A 2 1 238394 CASAVA_Build 11 219275 3I CATGGTGAAA ---/CCC CTACTCTACT 350 het 350 ref 13 5 1 7 C 1 4 238395 CASAVA_Build 11 232127 1D TGCACTTCTG C/- CCCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 10 C 4 3 238396 CASAVA_Build 11 232569 1D GTTGAATGTC A/- AAAAAAATCT 3070 het 2680 hom 27 6 16 5 A 8 7 238397 CASAVA_Build 11 233126 1D TTTTTTACTT C/- CCTCTCCTTG 3070 het 2521 hom 19 7 11 2 C 3 2 238398 CASAVA_Build 11 238132 1D CCTTGTTTTG A/- AAACTGAAAT 3019 het 3019 ref 19 8 9 2 A 4 3 238399 CASAVA_Build 11 251114 10D GAAAGAAAAG AAAGAAAGAA/---------- AAAGAAAGAG 3070 het 2763 hom 18 9 9 2 AAAGAAAGAA 1 0 238400 CASAVA_Build 11 253869 10D CAAAGCATTC TTCTAAAAAA/---------- TTTGGGGGTG 3070 het 3070 ref 33 18 11 8 TTCTAAAAAA 1 0 238401 CASAVA_Build 11 256148 2I ACAATGAAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 11 13 238402 CASAVA_Build 11 258181 2I GCCTCAGCCC --/CT TTCTCATCTC 2123 het 2123 ref 27 13 6 8 CT 0 1 238403 CASAVA_Build 11 259755 1D CATTCGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 60 17 27 16 T 13 12 238404 CASAVA_Build 11 262562 4I CATCTCCTCT ----/CCTG GGCTCCTGGG 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 CCTG 0 1 238405 CASAVA_Build 11 273878 1D TTTATAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 12 11 238406 CASAVA_Build 11 283002 1I TGAGGGGTGA -/G GGCCATGGTG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 2 3 238407 CASAVA_Build 11 293493 1I GCTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 653 het 653 ref 20 7 3 10 A 10 11 238408 CASAVA_Build 11 297940 1I CTCCAGGACC -/T CCACACCACT 1640 het 1640 ref 26 15 5 6 T 0 1 238409 CASAVA_Build 11 298886 1I AGAGTCTGAG -/C CCGGGTGAGG 3070 het 1655 hom 24 8 10 6 C 2 3 238410 CASAVA_Build 11 312729 1I ACTCATTCCA -/T AAAACAAAGG 3070 het 43 hom 25 1 23 1 T 0 1 238411 CASAVA_Build 11 314096 1D CTGGTTTTTT G/- GGTTTTTTTT 3070 het 3041 hom 21 7 10 4 G 3 2 238412 CASAVA_Build 11 318566 1I TCAAAACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 T 11 12 238413 CASAVA_Build 11 319961 4I GTTTGTGGGT ----/TTTG TTTGTTTCTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TTTG 1 2 238414 CASAVA_Build 11 330902 4D GAAGGAGAAA GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 hom 36 het 18 0 9 10 GAAG 5 4 238415 CASAVA_Build 11 331013 1D17M4I GAAGGGAGGG AAGGGAAGGGAAGGGAAG----/-AGGGAAGGGAAGGGAAGGAAA GAAAGAAGAA 3070 hom 34 het 14 0 11 5 N/A 0 0 238416 CASAVA_Build 11 331193 3I ATGAGAAAGA ---/AAG AAGGAAGGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAG 1 2 238417 CASAVA_Build 11 331780 1D TTCTTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1490 het 1490 ref 26 11 6 9 T 12 11 238418 CASAVA_Build 11 339214 4D TTCCCAAAGA TTAT/---- TTAAGTCACA 3070 het 3070 ref 27 18 7 2 TTAT 1 0 238419 CASAVA_Build 11 340152 3I CACAACACAC ---/ACA ACACACACAC 3070 hom 45 het 23 0 16 7 ACA 1 2 238420 CASAVA_Build 11 340412 2D TCACAACTCT AA/-- GAGGGTCCAC 2463 het 2463 ref 17 10 6 1 A 2 0 238421 CASAVA_Build 11 346477 2D58M4I ATACACACCC CACACACACGTACCATGCACACACATATACACACACCACATATATACATGTCACACACAT----/--CACACACGTACCATGCACACACATATACACACACCACATATATACATGTCACACACATACAC ACCATGCACA 3070 het 3070 ref 30 33 11 19 N/A 0 0 238422 CASAVA_Build 11 346602 1I4M1D GACATACACA -CACAC/CCACA- CACACAAGCA 3070 het 113 hom 83 3 42 42 N/A 0 0 238423 CASAVA_Build 11 346942 4D CCACACACAT ACAC/---- ACAGCACACA 3070 het 3070 ref 97 48 41 10 AC 3 1 238424 CASAVA_Build 11 347339 4D44M2D CACACCACAC ACATACATACATCACACACATACACAGCACACATACATACACACACACAT/----ACATACATCACACACATACACAGCACACATACATACACACACAC-- GCACCATGCA 3070 het 1189 hom 71 9 39 52 N/A 0 0 238425 CASAVA_Build 11 347451 2I CCATGCATGT --/AC ACACACACCA 3070 hom 143 het 79 0 45 34 AC 4 5 238426 CASAVA_Build 11 347546 2D AAACATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 76 het 74 1 37 37 AC 6 5 238427 CASAVA_Build 11 347591 2D CATACCACAA AC/-- ACACAACATG 3070 het 3070 hom 85 30 30 27 AC 3 2 238428 CASAVA_Build 11 347711 6D ACACCACACA CAACAT/------ ACACACACCA 3070 het 3070 ref 93 47 36 13 CAACAT 1 0 238429 CASAVA_Build 11 348452 8I CCGGCGATGT --------/TAACCCGA TAGGATGGAT 3070 hom 66 het 25 0 21 4 TAACCCGA 0 1 238430 CASAVA_Build 11 356409 2D CCATAAAGAC TG/-- TACCAGCCAC 3070 hom 144 het 52 0 47 6 TG 1 0 238431 CASAVA_Build 11 415695 3D TGCTAGACTT CAC/--- CAATAGTTTT 2421 hom 18 het 9 0 7 4 CAC 1 0 238432 CASAVA_Build 11 415923 1D TAGTAGAGAT G/- GGGTTTCACC 3070 hom 38 het 16 0 13 3 G 4 3 238433 CASAVA_Build 11 455184 1D AAATGAGAAG C/- TATAAAACTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 1 0 238434 CASAVA_Build 11 464913 4D ACGTTCGTGT ACGG/---- ACATATTCAC 3070 het 3070 hom 67 28 27 18 ACGG 1 0 238435 CASAVA_Build 11 464983 27D TTCACGCGTT TGTGATACGGACATATTCACGAGTTTG/--------------------------- TGTGATACGG 3070 het 3070 ref 68 43 21 24 TGTGATACGGACATATTCACGAGTTTG 1 0 238436 CASAVA_Build 11 469241 1D GCCCACACAG C/- CCTCGAGTGA 3070 het 2745 hom 31 7 21 3 C 3 2 238437 CASAVA_Build 11 469730 1I ATTCTGCAAG -/A ACGAGCAGGG 3070 het 3070 ref 51 24 18 9 A 1 2 238438 CASAVA_Build 11 511915 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 A 10 11 238439 CASAVA_Build 11 513286 2I5M1I2M1I9M1I GCTTTGGTCT --CAAAG-GC-GGGATTACA-/CCCAAAGTGCTGGGATTACAG GCATGAGCCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 N/A 0 0 238440 CASAVA_Build 11 524404 12D CTCAGCCAGG CCCAGGCCCAGC/------------ CCCAGGCCCC 2484 het 2484 ref 26 10 10 10 CCCAGGCCCAGC 1 0 238441 CASAVA_Build 11 528793 11D AGAGGAGCAC GCAGGCCACGT/----------- GCAGGCCACG 2774 het 2774 ref 33 13 11 14 GCAGGCCACGT 2 1 238442 CASAVA_Build 11 536568 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2754 het 1957 hom 16 6 6 4 A 13 12 238443 CASAVA_Build 11 561167 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 9 10 238444 CASAVA_Build 11 561780 1I CACCATGCTT -/G GCGTCTGCAA 2538 het 2538 ref 21 8 7 6 G 1 2 238445 CASAVA_Build 11 564890 1D TAGCACCCCC T/- GTGCCCCTTC 1428 hom 10 het 5 0 4 3 T 1 0 238446 CASAVA_Build 11 579580 2I CACTCGGGGG --/GA GGCAGGAGGC 3018 het 2268 hom 33 10 11 12 GA 0 1 238447 CASAVA_Build 11 584895 5D CTTGGCAGAT AAAAC/----- AACGCAAGTA 3070 het 3070 ref 28 17 10 6 AAAAC 1 0 238448 CASAVA_Build 11 602823 1I ATCGGGCGTC -/T TGTCAGTGAC 3070 het 3041 hom 28 11 9 8 T 1 2 238449 CASAVA_Build 11 625242 4D ATTTTCAGAT AAAC/---- AACAGAAGTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAC 1 0 238450 CASAVA_Build 11 626088 1I CCGCAGCCCC -/G GTGACCTTGT 3070 hom 91 het 35 0 26 9 G 1 2 238451 CASAVA_Build 11 630743 1D GATGGGGAGT G/- GGGAAGAGGG 1456 het 949 hom 15 5 6 4 G 4 3 238452 CASAVA_Build 11 633779 4I TTCAGCCCTT ----/TCTC TCTCCTCCAC 2186 het 2186 ref 26 11 7 8 TC 2 4 238453 CASAVA_Build 11 635394 3D TCGGCTCACC ACG/--- ACCTCTGCCT 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 ACG 1 0 238454 CASAVA_Build 11 636987 2D CTATCTCTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 6 A 13 11 238455 CASAVA_Build 11 645542 3I ATCATCCGCA ---/GGC GCTGCGGGAG 2924 het 1274 hom 23 7 11 5 GGC 0 1 238456 CASAVA_Build 11 645829 6D CTTTATTTAT TTATTA/------ TTATTATTAT 1209 het 1209 ref 10 4 3 3 TTA 5 3 238457 CASAVA_Build 11 658253 1I AGAAAAGCTG -/A AAAGTACATC 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 A 3 4 238458 CASAVA_Build 11 660082 1D AAGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 A 13 12 238459 CASAVA_Build 11 665163 3D CCAGCCTGGG CAA/--- CAGAGTGAGA 3070 het 3070 ref 16 9 7 0 CAA 1 0 238460 CASAVA_Build 11 670003 9I ACAGGAGAAA ---------/ACCAGGATG ACCAGGATGG 3070 het 3070 hom 40 11 17 12 ACCAGGATG 1 2 238461 CASAVA_Build 11 674420 1I TTCGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3069 hom 22 9 12 1 A 11 12 238462 CASAVA_Build 11 690984 2D CTGAGATCAG AA/-- AAGCCCAGCC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 4 2 238463 CASAVA_Build 11 692924 1I CACCTTCCCT -/C CCCCTTTGCT 3070 hom 49 het 23 0 15 8 C 4 5 238464 CASAVA_Build 11 694605 1D CCAGGGAAGG A/- CCCCCTCCCT 3070 hom 69 het 27 0 22 6 A 1 0 238465 CASAVA_Build 11 723342 17I CACACAGTCA -----------------/TGGGGATGTCCTGGGTG AATCAGCAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 TGGGGATGTCCTGGGTG 0 1 238466 CASAVA_Build 11 735302 1D ATCTCACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2653 hom 24 8 9 7 A 13 12 238467 CASAVA_Build 11 738428 1I AGAAGGATTA -/T TTTATTAATA 3070 het 3070 hom 40 10 21 9 T 3 4 238468 CASAVA_Build 11 742725 1D TCCTCTGTGT C/- CTTTGTATAA 3070 het 3070 ref 41 25 11 6 C 2 1 238469 CASAVA_Build 11 748928 1D TCTAACCTGC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 27 12 14 1 T 7 6 238470 CASAVA_Build 11 757153 1I TAAACATATT -/G GACAACCCAC 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 G 1 2 238471 CASAVA_Build 11 770322 2I GCTTCGTGTC --/TG AAGTCCTGGC 3070 hom 95 het 36 0 29 7 TG 0 1 238472 CASAVA_Build 11 772111 1I TGCTGGCTCT -/G ATGTCTGCCC 2798 het 2548 hom 24 9 9 6 G 0 1 238473 CASAVA_Build 11 800010 9D CGTGAGACTT CTCCGCCGC/--------- CTCCGCCGCA 1596 hom 31 het 12 0 7 7 CTCCGCCGC 2 1 238474 CASAVA_Build 11 824682 3D AGGGCGCTCA GCT/--- GCTGTCTGCA 2656 het 2545 hom 23 10 7 7 GCT 2 1 238475 CASAVA_Build 11 826540 1D GTGCTCACCT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 264 hom 25 2 11 12 G 10 9 238476 CASAVA_Build 11 829768 2I CCTCAGCCCC --/CT GAGTGGCCGG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 CT 0 1 238477 CASAVA_Build 11 836745 1D GGGTGGGGTA G/- GGGTGCTTGT 3070 het 3070 ref 48 24 12 12 G 4 3 238478 CASAVA_Build 11 841982 1D AGGACCCCCA G/- GTGGACCTCT 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 G 2 1 238479 CASAVA_Build 11 842901 1I TCTGTCCTGA -/C CCCCCCGCTG 1708 hom 11 het 16 0 7 9 C 6 7 238480 CASAVA_Build 11 844731 1D GCCTGGTGGA G/- GGGGTGCAGT 3070 hom 54 het 21 0 16 5 G 5 4 238481 CASAVA_Build 11 854938 3I GAGCTAGAAC ---/ACA ACACTACTTT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 ACA 1 2 238482 CASAVA_Build 11 861827 3I CCACAGGACC ---/GGT GCACCTCGAG 3070 hom 99 het 36 0 31 5 GGT 0 1 238483 CASAVA_Build 11 891936 1D CACCACACTC A/- ACACTCACAC 3070 hom 163 het 57 0 48 11 A 2 1 238484 CASAVA_Build 11 892037 4D TCTCACACTT ACAC/---- ACTCACATTC 3070 het 3070 ref 51 23 20 9 AC 3 1 238485 CASAVA_Build 11 892669 5D CCCTGGCCCA GGGTT/----- GGCTCTGCAC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 GGGTT 1 0 238486 CASAVA_Build 11 896188 1I CCCACCTCGG -/C CCCCCCCAAA 2013 het 389 hom 11 1 5 5 C 7 8 238487 CASAVA_Build 11 902838 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 14 13 238488 CASAVA_Build 11 908501 1D CTAAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 10 3 A 11 10 238489 CASAVA_Build 11 911973 4I TGGGTGCTGC ----/AAAG AAAGGACCCA 3070 hom 65 het 27 0 20 7 AAAG 1 2 238490 CASAVA_Build 11 917251 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGGGTCTC 3070 hom 84 het 31 0 25 6 G 7 6 238491 CASAVA_Build 11 937800 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 83 het 36 0 29 7 A 9 8 238492 CASAVA_Build 11 938849 2I CCTGGGCAAC --/AA GAGCGAAACT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 0 2 238493 CASAVA_Build 11 941929 1D43M1D TACAGCGATG TCTGTCCTGGCTCACTGGAGTGTTGACTTCCTGGGCTCAGGTGAT/-CTGTCCTGGCTCACTGGAGTGTTGACTTCCTGGGCTCAGGTGA- TCCCCCCACC 3070 hom 75 het 20 0 26 6 N/A 0 0 238494 CASAVA_Build 11 943552 1I AGAGCCCCCC -/A CCCCCCATTG 3070 hom 47 het 19 0 14 5 A 0 1 238495 CASAVA_Build 11 944723 2I TGTGTATTTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 1706 hom 61 6 43 12 GT 8 9 238496 CASAVA_Build 11 951155 3D AGAAGCAGAT GGA/--- GATGTGGGTC 367 het 367 ref 67 47 3 21 GGA 1 0 238497 CASAVA_Build 11 958433 12D CGCCCCTGTT CCCATCCCCGTC/------------ TCCATCCCCG 3070 hom 72 het 27 0 20 9 CCCATCCCCGTC 1 0 238498 CASAVA_Build 11 1005225 1D CCGGGAAGAG A/- CCGTGGCCCA 3070 hom 80 het 31 0 26 7 A 1 0 238499 CASAVA_Build 11 1053850 2D ATATTTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 A 12 10 238500 CASAVA_Build 11 1055590 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1940 hom 18 6 8 4 A 15 16 238501 CASAVA_Build 11 1057339 1I GTAAACTGAC -/T TTTTTTTTTT 1790 het 1790 ref 24 16 4 4 T 10 11 238502 CASAVA_Build 11 1095000 2D TGGGCAGAGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 71 het 32 0 22 11 GT 10 9 238503 CASAVA_Build 11 1102062 1I GAGGGGCCTT -/G GGGGTGACTG 2368 hom 28 het 14 0 10 4 G 4 5 238504 CASAVA_Build 11 1106684 4I ATTTGGAGAA ----/AGAC AGAAGGAATG 3070 hom 42 het 16 0 13 3 AGAC 0 1 238505 CASAVA_Build 11 1106932 4D TCTTTTCCCT TCTA/---- TCTCTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 12 6 TCTA 1 0 238506 CASAVA_Build 11 1110805 1D ACTGCCCCCA C/- CCCCCCGCAC 3070 hom 32 het 32 0 21 12 C 7 6 238507 CASAVA_Build 11 1114107 1I GGGGGAGGGT -/C TGCCACTGGG 3070 hom 33 het 19 0 10 9 C 0 1 238508 CASAVA_Build 11 1119662 1I GTGTTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1986 hom 34 5 26 3 A 12 13 238509 CASAVA_Build 11 1126997 2D AATAAAAAAA AT/-- TAGAGAGATA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 AT 1 0 238510 CASAVA_Build 11 1131451 4D19M4I TTGCATGTGC GTGTGTTTGCAGGGTTCTGTGTG----/----GTTTGCAGGGTTCTGTGTGTGTT TGCACATCTG 3070 hom 193 het 50 0 63 5 N/A 0 0 238511 CASAVA_Build 11 1139403 20D TAGACTCATA CACTCACTCACTCATTGACT/-------------------- CACTCACTCA 2105 het 2105 ref 84 78 9 10 CACTCACTCACTCATTGACT 1 0 238512 CASAVA_Build 11 1145008 1D GAGGGGGCCC A/- AACACGCAGC 1352 hom 10 het 5 0 4 2 A 3 2 238513 CASAVA_Build 11 1171848 1D TGTTGGGAGG A/- AAGCCCCAGG 3070 hom 86 het 37 0 21 16 A 3 2 238514 CASAVA_Build 11 1172893 1I AGATGTCCGG -/C CTCTGGAACG 1217 het 91 hom 16 1 5 10 C 1 2 238515 CASAVA_Build 11 1192384 1D TTACACTGAC A/- ACCAAGGAGA 3070 het 3070 ref 36 23 9 6 A 2 1 238516 CASAVA_Build 11 1192608 1D ATGAAGCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 10 9 238517 CASAVA_Build 11 1261283 1D GCCTGGGCAT G/- GGGGCTGGGG 3070 hom 72 het 31 0 20 11 G 5 4 238518 CASAVA_Build 11 1319518 1I CTGTCCGCAT -/G GTTTAGGGTG 3070 het 556 hom 38 3 22 13 G 1 2 238519 CASAVA_Build 11 1329497 1D CTCCAACCTC T/- ATGCCTCACT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 1 0 238520 CASAVA_Build 11 1335586 2D TTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTGGT 3070 hom 74 het 28 0 25 6 T 9 7 238521 CASAVA_Build 11 1335815 10I TGAGCTGGTC ----------/TCCCAGGCGG ATGCCTGAGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TCCCAGGCGG 0 1 238522 CASAVA_Build 11 1349609 5I AAGAGTGCAT -----/GGATG GGGACCTCGT 3070 hom 39 het 14 0 12 2 GGATG 0 1 238523 CASAVA_Build 11 1357941 4D AAAGAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 702 het 702 ref 24 5 4 16 AAAG 1 0 238524 CASAVA_Build 11 1363567 1D GTCAATTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 425 hom 20 2 14 4 A 21 20 238525 CASAVA_Build 11 1366313 1I CCCACTCCCC -/T TCCCCAGCTG 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 1 2 238526 CASAVA_Build 11 1377715 3I GTTTTCACAT ---/GGG AGCAGAGGAG 3070 hom 64 het 23 0 19 4 G 0 3 238527 CASAVA_Build 11 1393578 18D GCCCACACGG TGGTCCCAGCAGAGGACT/------------------ TGGTCCCAGC 2273 het 2273 ref 25 9 10 9 TGGTCCCAGCAGAGGACT 2 1 238528 CASAVA_Build 11 1429052 1D CAGTGCCCCT G/- GGGGGGCTGT 3070 het 1786 hom 25 5 10 10 G 7 6 238529 CASAVA_Build 11 1435636 7D ACCTTGCTGC GGGCTGG/------- GGGCTGAGGT 2178 het 2178 ref 22 7 7 9 GGGCTGG 1 0 238530 CASAVA_Build 11 1445633 21D GAGGACAGCG CACAGCACAGTCCCCTCAGCC/--------------------- CAGGAGAGGG 2674 het 2674 ref 31 18 7 10 CACAGCACAGTCCCCTCAGCC 1 0 238531 CASAVA_Build 11 1446669 1D TAAGGGGGAT G/- GGGGGGGGGC 2790 hom 38 het 21 0 13 9 G 10 9 238532 CASAVA_Build 11 1451781 1D CAGACGTGTC G/- GAAGTCCACG 3070 hom 81 het 31 0 25 6 G 2 1 238533 CASAVA_Build 11 1453130 2I CCAATCACAC --/AT GTGTGCACAG 3070 hom 128 het 49 0 43 6 AT 0 1 238534 CASAVA_Build 11 1463105 2D CTGGCACAGG CA/-- CACACACACA 1369 het 1369 ref 41 28 4 9 CA 7 6 238535 CASAVA_Build 11 1472129 3D TCAGAAAACA GAG/--- GAGGAGGACC 3070 het 3070 hom 52 21 24 10 GAG 3 2 238536 CASAVA_Build 11 1482817 1I GCCTCGCATG -/A ACATTGGCGT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 A 1 2 238537 CASAVA_Build 11 1483201 2I TCAAGGCGAC --/AG GGAGCTATGG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 AG 0 1 238538 CASAVA_Build 11 1486106 2I GGTGGGGCGG --/TC TCCAGAGAAG 3070 hom 48 het 17 0 15 2 TC 1 2 238539 CASAVA_Build 11 1486924 1D CAGAGGGGTG C/- CAACAGCTGT 3070 hom 50 het 38 1 23 16 C 2 1 238540 CASAVA_Build 11 1488589 1D CAATCAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3063 hom 26 9 16 1 A 10 9 238541 CASAVA_Build 11 1494015 2I GCAGTGACCC --/CT GAGTGCTTCT 3070 hom 99 het 36 0 31 5 CT 0 1 238542 CASAVA_Build 11 1496499 5I ACCCACTGTT -----/AAATC AAGTTTCACC 3070 hom 95 het 34 0 31 3 AAATC 0 1 238543 CASAVA_Build 11 1500011 4D GCAAAAGTTG CTTT/---- CTTTTTTTTT 2520 het 1491 hom 18 5 8 6 CTTT 2 1 238544 CASAVA_Build 11 1500133 1D TCAGTCCCCC T/- GAGTAGCGGA 1831 het 1831 ref 12 5 5 2 T 1 0 238545 CASAVA_Build 11 1510660 1D CTCACGTTAG C/- CCCGGGACAT 2716 het 2716 ref 38 18 11 9 C 4 3 238546 CASAVA_Build 11 1516542 6I ATATTTTTTC ------/TCTTTT TCTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 TCTTTT 2 3 238547 CASAVA_Build 11 1540498 2I CATGCACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 64 35 24 5 CA 6 7 238548 CASAVA_Build 11 1548442 1I CCAGCCACAC -/T TCGTGCAGCC 3070 het 2179 hom 25 10 11 4 T 1 2 238549 CASAVA_Build 11 1549412 1D GGATTTTTGT C/- CCCCCCCCAT 2241 het 88 hom 12 1 8 3 C 9 8 238550 CASAVA_Build 11 1579345 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 A 10 9 238551 CASAVA_Build 11 1581584 4I ACCCTCATAC ----/ACAT ACATACATAC 3070 het 3070 hom 63 23 35 5 ACAT 3 4 238552 CASAVA_Build 11 1586242 2D TGAGAGGGAG GT/-- GTGCAGGTGT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 GT 2 1 238553 CASAVA_Build 11 1589167 1D TTTATTGTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 9 8 238554 CASAVA_Build 11 1591981 4D TGTGTCTATG TATC/---- TATCTATCAT 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TATC 3 2 238555 CASAVA_Build 11 1597032 2D TAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 12 10 238556 CASAVA_Build 11 1611661 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 11 10 238557 CASAVA_Build 11 1612153 1D GAGCAAACCA G/- GGGGTTATTA 3070 hom 88 het 32 0 29 4 G 5 4 238558 CASAVA_Build 11 1620772 1I GTTTCTGGGG -/A CAGCACATCA 3070 hom 57 het 23 0 15 8 A 0 1 238559 CASAVA_Build 11 1627539 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 10 238560 CASAVA_Build 11 1643576 2D GCCAGGTAAC TG/-- AGAACGGGGC 1714 het 410 hom 6 1 4 1 TG 1 0 238561 CASAVA_Build 11 1645480 4D TCAGGCCCCG TGGC/---- CGTCACCCCC 2467 het 2467 ref 23 14 6 5 TGGC 1 0 238562 CASAVA_Build 11 1650392 2D TGTCCAGCCG TC/-- ACCATGCTCT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 TC 1 0 238563 CASAVA_Build 11 1654936 1D ATATTGTTGG T/- GGGGGGGCGG 3070 het 3070 ref 31 11 13 7 T 1 0 238564 CASAVA_Build 11 1655394 1D AGTGTTCTAG T/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 7 6 238565 CASAVA_Build 11 1658544 1D ATCAAAAATA T/- TTTTTATTAG 2928 het 2928 ref 23 13 7 3 T 6 5 238566 CASAVA_Build 11 1660538 11D GATGGCCGTG GCAGTGGGACA/----------- GCTCTGTGTC 3070 het 3070 ref 49 24 17 13 GCAGTGGGACA 1 0 238567 CASAVA_Build 11 1664442 16D TCCTTCCTTC CTTCTTCCCTCCCTCA/---------------- CTTCCTTCCT 2322 het 1742 hom 21 7 7 7 CTTCTTCCCTCCCTCA 1 0 238568 CASAVA_Build 11 1667879 2I CCTGTGTTGT --/CA CACCTGGGCC 2706 het 2706 ref 43 20 10 13 CA 1 2 238569 CASAVA_Build 11 1668008 2D CTGCCCCACA GG/-- GCTGAGCCCT 3070 het 2921 hom 24 10 11 3 G 3 1 238570 CASAVA_Build 11 1669779 1D ACAGGCCTTA T/- TAGAGTTCAG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 T 2 1 238571 CASAVA_Build 11 1669943 11I TGAGAGACCG -----------/GGGGAGCAGCA GGGACCTTCA 3070 hom 84 het 31 0 24 7 GGGGAGCAGCA 0 1 238572 CASAVA_Build 11 1672709 1D TTGCTTTGGA C/- CCTGAAAATT 3070 het 2999 hom 24 10 10 4 C 3 2 238573 CASAVA_Build 11 1682998 1I AGAAGGGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 10 11 238574 CASAVA_Build 11 1683151 3I ACTTCCATGT ---/GGG GAAACTGGTG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 G 1 4 238575 CASAVA_Build 11 1688850 1D CACAGAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 10 9 238576 CASAVA_Build 11 1697473 1I CAATAAAGCG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 9 10 238577 CASAVA_Build 11 1697558 1I TGCCTATTAT -/A AAAAATATGT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 5 6 238578 CASAVA_Build 11 1706393 1I GAGATATTCT -/A TTCTATGCAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 1 238579 CASAVA_Build 11 1708467 3I ATGCTATGGG ---/AGC AGGAGGACCC 3070 hom 76 het 29 0 24 5 AGC 0 1 238580 CASAVA_Build 11 1708894 2D TACACACATG CA/-- CACAGTCACA 3070 hom 78 het 42 0 27 16 CA 3 2 238581 CASAVA_Build 11 1709171 2D80M2D TACACACATG AACAGTCACATACATGCACACATGTACACACAACACACACATGTGCAGTCACACACATGCACATATACATAATACACACATGCA/--CAGTCACATACATGCACACATGTACACACAACACACACATGTGCAGTCACACACATGCACATATACATAATACACACATG-- CACAGTCACA 3070 het 1706 hom 67 10 65 61 N/A 0 0 238582 CASAVA_Build 11 1709709 4I CACAACACAT ----/ACAC ACATGCACAC 3070 hom 216 het 82 0 71 11 AC 1 3 238583 CASAVA_Build 11 1723870 2D ATGTGCCATG CA/-- CACTCACGTG 3070 hom 144 het 55 0 46 10 CA 2 1 238584 CASAVA_Build 11 1723942 2D ACACATTGTG CA/-- CACACATTTA 3070 hom 171 het 65 0 53 14 CA 4 3 238585 CASAVA_Build 11 1724076 2I CCACGTAATT --/AC ACACACATGC 3070 hom 202 het 76 0 68 8 AC 3 4 238586 CASAVA_Build 11 1724215 2D ACATGCACAC AT/-- AGTTACACTC 3070 hom 174 het 61 0 57 5 AT 1 0 238587 CASAVA_Build 11 1732601 1D TTGCCCAGCT C/- CCACTACTCC 3070 hom 48 het 19 0 15 4 C 3 2 238588 CASAVA_Build 11 1769164 1I TTTAATTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 9 10 238589 CASAVA_Build 11 1769619 1I ATTATTGATA -/T GGTTGAATTG 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 0 1 238590 CASAVA_Build 11 1775801 1I GTTAAGCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2322 hom 38 10 13 15 T 15 16 238591 CASAVA_Build 11 1789758 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3030 hom 29 het 16 0 10 6 T 10 9 238592 CASAVA_Build 11 1790496 1D AATGCACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 11 10 238593 CASAVA_Build 11 1791709 11D CAAAAACAAA AAACAAAAAAC/----------- AAACAAACAA 3070 hom 51 het 18 0 17 2 AAACAAAAAAC 1 0 238594 CASAVA_Build 11 1804748 1I54M1D GGGTCTGCAG -CCCCCAGAGGTGTCACACCCCTACTGCCTGCCTCTGTCCCCCACTTCTCTGGCCT/CCCCCCAGAGGTGTCACACCCCTACTGCCTGCCTCTGTCCCCCACTTCTCTGGCC- TGGGACCCTG 3070 het 99 hom 25 1 17 19 N/A 0 0 238595 CASAVA_Build 11 1825512 1D GGAGAGAGAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 41 het 16 0 14 2 A 9 8 238596 CASAVA_Build 11 1840572 19D GGTAATCTCG CCTCCCCTGGGTGATCTCA/------------------- CCTCCCCTGG 3070 hom 58 het 27 0 16 12 CCTCCCCTGGGTGATCTCA 2 1 238597 CASAVA_Build 11 1847612 1I GGCGTGGGGG -/A GGGCTGGTTT 2070 hom 37 het 16 0 7 9 A 0 1 238598 CASAVA_Build 11 1861723 1D GGGATGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 11 10 238599 CASAVA_Build 11 1894311 1D TGACAGCACT C/- CCCTTGTTTC 3070 hom 100 het 38 0 28 11 C 4 3 238600 CASAVA_Build 11 1906639 2D GTGCCCTTAG CC/-- CCCCACCTTG 3070 hom 39 het 16 0 13 4 C 6 4 238601 CASAVA_Build 11 1909325 1D GCGCCCTAAC A/- GTCACTCGGG 3070 het 3070 hom 44 19 22 4 A 1 0 238602 CASAVA_Build 11 1910762 2D ACCCATTCAT AC/-- ACTCACCTAC 3070 het 2147 hom 46 15 17 15 AC 2 1 238603 CASAVA_Build 11 1917863 10D GACCCTGTCT CACACACACA/---------- CACACACACA 105 het 105 ref 102 49 2 56 CA 13 8 238604 CASAVA_Build 11 1921831 2D CTGCACACAC AT/-- GTTTGCAGAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 8 AT 1 0 238605 CASAVA_Build 11 1934956 18D GGAGAGCCAT GGCGGAGAGGTGCCGTCG/------------------ GGCGGAGAGG 2971 hom 52 het 23 0 15 8 GGCGGAGAGGTGCCGTCG 2 1 238606 CASAVA_Build 11 1937212 2I TGGGATGCTC --/AG GGGTTCAGCT 3070 hom 69 het 25 0 19 6 AG 0 1 238607 CASAVA_Build 11 1944720 1I GGGTGTCTCA -/C CCCCTTAAGG 3070 hom 66 het 26 0 20 6 C 4 5 238608 CASAVA_Build 11 1969861 1I GCTGAGACAC -/G AGCCACACAC 3070 hom 75 het 29 0 23 6 G 0 1 238609 CASAVA_Build 11 1970163 1D CGTGCACCGA G/- GGTCCAGCGT 1207 het 1207 ref 22 11 4 7 G 3 2 238610 CASAVA_Build 11 1971106 1I CATACACCCC -/T GGGCCCAGAG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 0 1 238611 CASAVA_Build 11 1981599 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1449 hom 18 5 10 3 A 13 12 238612 CASAVA_Build 11 1982553 1D GGGGACCTAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 9 8 238613 CASAVA_Build 11 2006725 1I ATACTTAGAC -/A CCCCCCCCAC 1956 het 869 hom 24 7 7 10 A 0 1 238614 CASAVA_Build 11 2011846 1I TGGGCAGGGA -/G GGCTGGCGTC 3070 hom 65 het 26 0 20 6 G 2 3 238615 CASAVA_Build 11 2014439 21D CAGGGCTGGG AGCTGTTGGTTCCCAGGCTGC/--------------------- AGCTGGAGTT 1239 het 1239 ref 18 9 4 10 AGCTGTTGGTTCCCAGGCTGC 1 0 238616 CASAVA_Build 11 2020626 1I TCATACTCCA -/T TCTCCATAAT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 1 2 238617 CASAVA_Build 11 2024820 1I CTATTCTCCA -/T TTTTTTCATT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 6 7 238618 CASAVA_Build 11 2035435 1I ATTCTCTACA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 29 9 10 10 T 6 7 238619 CASAVA_Build 11 2038214 1I TACTTTATTC -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 6 7 238620 CASAVA_Build 11 2039279 1I TTTGTTCTCC -/A TCCAACAACT 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 A 0 1 238621 CASAVA_Build 11 2052391 3D CTGGAATTAG ACA/--- ACATCTGTCC 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 ACA 2 1 238622 CASAVA_Build 11 2064668 4I GGCGTGGGGG ----/AGTC AGTCGGAGCT 1916 het 1916 ref 39 22 7 10 AGTC 1 2 238623 CASAVA_Build 11 2066227 1I TTCGGGAGCG -/C CCCCCCTCCC 3070 het 2320 hom 18 8 9 1 C 6 7 238624 CASAVA_Build 11 2110464 2D GGGTTGTTGT GG/-- GGGGGGGGGA 3070 hom 30 het 13 0 10 3 G 11 9 238625 CASAVA_Build 11 2120014 1I AATCAGTATT -/A AAAAAAAAAA 2149 het 2149 ref 22 9 5 8 A 13 14 238626 CASAVA_Build 11 2128036 1D AGCCACCAGT C/- CCCCCCTCCA 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 C 7 6 238627 CASAVA_Build 11 2156389 2I GTGTGTGCGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 603 hom 55 4 41 10 GT 6 7 238628 CASAVA_Build 11 2165025 7D CACACCACAT ACACACC/------- ACACACCACA 3070 het 3070 ref 52 20 16 23 ACACACC 3 2 238629 CASAVA_Build 11 2165723 2I ACACCACACA --/TG CATACACACC 1061 het 1061 ref 34 15 4 16 TG 0 1 238630 CASAVA_Build 11 2169300 1I TTTTGAGACA -/G GGTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 47 18 14 16 G 2 3 238631 CASAVA_Build 11 2170572 1I CCCGGTGTCT -/C TGAGCTGACT 3070 het 2539 hom 27 8 12 7 C 0 1 238632 CASAVA_Build 11 2174338 4D TCTCTCTGTT TCTG/---- TCTGTCTATC 3070 het 3070 ref 49 23 18 10 TCTG 2 1 238633 CASAVA_Build 11 2182286 1I GCCCTTTTAA -/C CACCGGGGTC 2438 het 1996 hom 21 7 6 8 C 1 2 238634 CASAVA_Build 11 2185447 8D TTATGATGTG GTCTGGGA/-------- GTTCCAGGGT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 GTCTGGGA 1 0 238635 CASAVA_Build 11 2186787 1D GGGCAGCAGA G/- GGGGCAGCAG 1916 het 542 hom 18 4 7 7 G 5 4 238636 CASAVA_Build 11 2199899 1I ATTGAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 1279 het 1279 ref 47 34 3 10 A 11 12 238637 CASAVA_Build 11 2202630 2I TACACATGTG --/TA TATATGTGTG 3070 hom 45 het 22 0 16 6 TA 2 3 238638 CASAVA_Build 11 2204151 5D AATCCTAGCA TGAGG/----- ATTTGGGAGG 3070 hom 42 het 18 0 15 4 TGAGG 1 0 238639 CASAVA_Build 11 2212395 2D GATTCTTAAC TG/-- TGGAATTTTG 2857 het 2857 ref 33 23 7 4 TG 2 1 238640 CASAVA_Build 11 2216093 1D GCACAGGAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 T 10 9 238641 CASAVA_Build 11 2217355 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 28 1 26 1 A 11 12 238642 CASAVA_Build 11 2217714 2D CCCATAACAC AT/-- GTTTACCTAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 AT 1 0 238643 CASAVA_Build 11 2220891 1D ATTACAATTC A/- AAATTAAATT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 4 3 238644 CASAVA_Build 11 2226988 1I TGCGGGGGGT -/G GGGGGTGGAG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 G 5 6 238645 CASAVA_Build 11 2228982 1D CACAAGACCC A/- AAGGACATAG 3070 het 3070 ref 22 11 8 4 A 3 2 238646 CASAVA_Build 11 2240117 1D TGAGGTCATT G/- GGGGGACCCT 2109 het 2109 ref 29 18 6 5 G 6 5 238647 CASAVA_Build 11 2243712 1I GGGGTCTTCA -/T TAACACGGCA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 1 2 238648 CASAVA_Build 11 2265349 2D GGTGGGGGAA AG/-- AGAGAAAGAC 3070 hom 68 het 25 0 21 4 AG 3 2 238649 CASAVA_Build 11 2267152 1D AGCCACCGCG C/- CCCTGCCGCC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 C 4 3 238650 CASAVA_Build 11 2277619 36D CACATATGCA TGCACACACATCCACGTCTGCACACGCATCCACGCC/------------------------------------ TGCACACGCA 2431 het 2431 ref 32 22 12 7 TGCACACACATCCACGTCTGCACACGCATCCACGCC 1 0 238651 CASAVA_Build 11 2282374 2D GGTCTGGTTC TA/-- TTGCCCAGCA 3070 hom 68 het 25 0 19 7 TA 1 0 238652 CASAVA_Build 11 2284358 4D GGGGAGAGAG AGAA/---- AGAGAGAAAG 3070 hom 35 het 16 0 11 5 AGAA 1 0 238653 CASAVA_Build 11 2284777 5D AGGAGGAGGA AAGAG/----- AAAAGAGGAA 2380 hom 21 het 14 0 8 6 AAGAG 1 0 238654 CASAVA_Build 11 2299011 1I AAGCAGGCCA -/C CCCCTGGCGT 3070 hom 112 het 43 0 34 9 C 4 5 238655 CASAVA_Build 11 2301957 1I GGAAGGTCTT -/C ATGGGCAGTG 3070 hom 96 het 35 0 31 4 C 0 1 238656 CASAVA_Build 11 2302088 5D GAGTACACTC TAAAT/----- AAAAAGTATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TAAAT 1 0 238657 CASAVA_Build 11 2302228 1I ACCAGCATTG -/C CACAAAACAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 1 2 238658 CASAVA_Build 11 2309247 1D GGGCAGGGGC G/- GGGGGGTTAC 3070 hom 30 het 13 0 10 3 G 7 6 238659 CASAVA_Build 11 2314638 1D TCTCACGGCA G/- GCAAGGCAAG 3070 hom 105 het 38 0 35 4 G 2 1 238660 CASAVA_Build 11 2320585 1D CTCCCTTCAC A/- GTGGAGATGC 3070 hom 119 het 46 0 37 11 A 1 0 238661 CASAVA_Build 11 2330327 1D CATTTCTCTC T/- TTCTTGCATT 3070 hom 96 het 33 0 32 4 T 3 2 238662 CASAVA_Build 11 2336990 13D TGGTTCTGCT CAGTATGCAGACA/------------- CTACCGGAAA 3070 hom 105 het 36 0 34 3 CAGTATGCAGACA 1 0 238663 CASAVA_Build 11 2347126 1I GGAACTATTT -/A CTGTCCTGAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 0 1 238664 CASAVA_Build 11 2363661 1I ACAAGAAACG -/T TGCTAGAACA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 1 2 238665 CASAVA_Build 11 2430342 2I AGCTGGAGAC --/AG GGGGCGGGAA 3070 hom 49 het 22 0 14 8 AG 0 1 238666 CASAVA_Build 11 2431215 1D AAACAGCCAA T/- TGCCAGGCTG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 T 2 1 238667 CASAVA_Build 11 2449373 4D CACATGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGCA 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 TG 6 4 238668 CASAVA_Build 11 2450464 3I AGATGTGAGT ---/AGG AGGTCTGTGG 2889 het 2889 ref 30 15 9 6 AGG 1 2 238669 CASAVA_Build 11 2454549 3I CTGGAGTGCA ---/GTG GTGGTGCAAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 GTG 2 3 238670 CASAVA_Build 11 2457946 2D AAGTTCCAGA CT/-- CTCCCACATT 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 CT 2 1 238671 CASAVA_Build 11 2458627 1I CACCCTTATT -/C CCTAAGAAAT 3070 het 3070 ref 38 23 15 0 C 2 3 238672 CASAVA_Build 11 2474681 18I GTAAGGCAAG ------------------/CCTGGTGGTGTCAAAATC CCTCAGCATT 2835 het 2835 ref 23 16 6 3 CCTGGTGGTGTCAAAATC 0 1 238673 CASAVA_Build 11 2478686 1I GTTGGGGGGT -/G GGGGGCAAGG 1273 hom 10 het 4 0 4 0 G 5 6 238674 CASAVA_Build 11 2479054 1I AAAAAGTTGG -/T TTTTTTTTTT 1640 het 1640 ref 27 15 6 6 T 10 11 238675 CASAVA_Build 11 2479139 1D AGTCAGAGAC A/- AAAAAAGGAG 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 A 7 6 238676 CASAVA_Build 11 2498836 7I CTATGAATGT -------/TGTTTGC TGTTTGCTTT 3070 hom 89 het 38 0 30 8 TGTTTGC 1 2 238677 CASAVA_Build 11 2500077 1D CACATGAGCT G/- GGGGGGGGTC 2204 het 831 hom 12 4 7 1 G 9 8 238678 CASAVA_Build 11 2562080 1I ATCTATGTGC -/T GTATATGTGT 3070 hom 196 het 73 0 65 8 T 0 1 238679 CASAVA_Build 11 2594770 1D TCTTGTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 12 11 238680 CASAVA_Build 11 2597770 1D TAAGCCTATC A/- CCCAGGTAGT 3070 hom 113 het 42 0 35 7 A 1 0 238681 CASAVA_Build 11 2618369 2D TGGGATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 16 14 238682 CASAVA_Build 11 2619201 1D GATGTTGGGC T/- TTTTTTTTTA 1322 het 1322 ref 40 34 3 3 T 10 9 238683 CASAVA_Build 11 2636386 3D TCCAGAGAGC CCT/--- GGCTCCCTGG 3070 hom 84 het 31 0 29 4 CCT 1 0 238684 CASAVA_Build 11 2648899 13D AGGAAGTCTG GCAGTTAGTCTGA/------------- GCAGTTAGTC 3070 het 3070 ref 40 21 13 12 GCAGTTAGTCTGA 1 0 238685 CASAVA_Build 11 2649476 1D GGCAGAGAGC A/- GGGGTGACTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 1 0 238686 CASAVA_Build 11 2655829 1I AAATCATTTG -/T TTTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 57 24 29 4 T 5 6 238687 CASAVA_Build 11 2658131 1I TCCCCACCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 14 11 A 9 10 238688 CASAVA_Build 11 2660935 1D CAACTCAGGA G/- GGTGTGGGGA 3070 het 3070 hom 40 15 23 3 G 3 2 238689 CASAVA_Build 11 2676251 1D CAGACTGAGA C/- CTGCATCTGA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 2 1 238690 CASAVA_Build 11 2687228 1D TGCAGGGCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1281 hom 21 3 10 8 T 10 9 238691 CASAVA_Build 11 2693696 4D CTTGGGTGAT TGAG/---- TGGGTAGAGG 2546 het 2546 ref 31 13 10 11 TGAG 1 0 238692 CASAVA_Build 11 2696979 2I TTGTCTCTCA --/AG TTGGGGGTAA 3070 hom 90 het 35 0 29 6 AG 0 1 238693 CASAVA_Build 11 2727767 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 14 0 11 3 A 13 12 238694 CASAVA_Build 11 2735771 1D AAACCTTTAG A/- AAAAACATAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 6 5 238695 CASAVA_Build 11 2736929 1D TTTTTTTTTT C/- CCAACTTCCT 3070 het 367 hom 38 3 27 9 C 3 2 238696 CASAVA_Build 11 2742005 1D AGTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 28 9 T 12 11 238697 CASAVA_Build 11 2755422 1I TGTAACGGAG -/A CAGCGGAATG 3070 hom 105 het 39 0 32 7 A 0 1 238698 CASAVA_Build 11 2763408 15D TTAAAAAATC ATTTAATACATTTAT/--------------- ATTTAATACA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 ATTTAATACATTTAT 2 1 238699 CASAVA_Build 11 2765664 1D34M5I GAATGAAGGA TCTATCTTTAAATTTTAATTTTAATTTATTAAAAT-----/-CTATCTTTAAATTTTAATTTTAATTTATTAAAATGAAAA GAAAATTCCA 3070 hom 96 het 27 0 32 5 N/A 0 0 238700 CASAVA_Build 11 2775939 12D CAGTGCCCCC ACTTGTGGCCCA/------------ GGCCCAAGCA 3070 hom 71 het 29 0 23 8 ACTTGTGGCCCA 1 0 238701 CASAVA_Build 11 2780961 3I CCCAGCCGGG ---/CAC CCCCCCCCCC 3070 hom 52 het 21 0 16 5 CAC 0 1 238702 CASAVA_Build 11 2789054 5D TGTCCGGCTT CCCTG/----- GCTCATTGTC 3070 het 3070 hom 34 16 15 6 CCCTG 1 0 238703 CASAVA_Build 11 2791224 1D AACCCGCCTG C/- CCGTCAGTGC 3070 hom 59 het 26 0 19 7 C 3 2 238704 CASAVA_Build 11 2811968 12D ATGGTGGGAG TGGTGTGGCACA/------------ TGGTGTGGCA 2909 het 2909 ref 36 12 12 16 TGGTGTGGCACA 2 1 238705 CASAVA_Build 11 2813204 12D AACCCTGACT CACACACACACA/------------ CACACACACA 3070 het 399 hom 28 6 10 14 CA 15 9 238706 CASAVA_Build 11 2816263 4D TTAGAGCCTA TGAC/---- TGACAGGGGT 3070 hom 77 het 28 0 24 4 TGAC 2 1 238707 CASAVA_Build 11 2817931 4D CCAATAACAT AAAC/---- AATCAATTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 5 AAAC 1 0 238708 CASAVA_Build 11 2850707 8D TTTTCTATTT TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 1703 hom 15 het 12 0 6 6 TTTA 6 4 238709 CASAVA_Build 11 2854993 4D ACTGGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTTTT 3070 het 2952 hom 22 9 10 3 TTTG 2 1 238710 CASAVA_Build 11 2866891 1I GACGCCCTCT -/A AAAAAAAAAA 1911 het 1911 ref 24 11 8 5 A 12 13 238711 CASAVA_Build 11 2884694 1I GAGAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2269 het 2269 ref 21 9 9 3 A 11 12 238712 CASAVA_Build 11 2891834 1D TTAGGGGCAG C/- CGGCAGCTGT 3070 hom 75 het 28 0 22 8 C 2 1 238713 CASAVA_Build 11 2896524 1D TTGAGGGCCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 71 het 29 0 20 9 T 10 9 238714 CASAVA_Build 11 2912057 1D ATTCTTTGGG A/- GCCCCAGGGA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 1 0 238715 CASAVA_Build 11 2912231 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 11 10 238716 CASAVA_Build 11 2912276 1I ATGTGCACTA -/T TAGTCCCAAC 1826 het 1330 hom 14 3 4 7 T 1 2 238717 CASAVA_Build 11 2917186 1I CTCTGTACTT -/A AAAAAAAAAA 2856 het 2856 ref 32 16 8 8 A 10 11 238718 CASAVA_Build 11 2920104 1I TCTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 11 12 238719 CASAVA_Build 11 2925425 1D ACACATGCCG A/- AAAAAAAAAA 1177 het 1177 ref 34 25 3 9 A 12 11 238720 CASAVA_Build 11 2925875 1I TGGCGTGGGA -/G GAGTGGGTGA 3070 hom 107 het 40 0 36 4 G 1 2 238721 CASAVA_Build 11 2930340 1D ACACCATGTA T/- TTGCTTAGAG 3070 het 3070 hom 60 20 32 8 T 3 2 238722 CASAVA_Build 11 2930765 2I AGTAAAACAC --/TT TTTATGCCAA 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 T 3 5 238723 CASAVA_Build 11 2938932 1I AACCATCAAC -/G GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 G 7 8 238724 CASAVA_Build 11 2940968 1I AAAAGAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 10 7 A 9 10 238725 CASAVA_Build 11 2941932 1D TTATTTGCGC T/- TTTTTTTTTA 879 het 879 ref 49 41 3 5 T 10 9 238726 CASAVA_Build 11 2947172 4I ATGTGTGTGT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 18 19 14 AC 7 9 238727 CASAVA_Build 11 2956775 1I CAGGGGTGTT -/A AAAGCATGGA 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 A 3 4 238728 CASAVA_Build 11 2962604 3D TAGTACATAA CAG/--- CAGGCCAGGT 3070 het 3070 ref 46 25 13 9 CAG 2 1 238729 CASAVA_Build 11 2964591 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 13 1 10 2 T 15 14 238730 CASAVA_Build 11 2964727 6I GAGCCACCGC ------/ACCCAG ACTCTAAGAT 3070 hom 77 het 28 0 25 3 ACCCAG 0 1 238731 CASAVA_Build 11 2971282 9D GGTTATAAAC CTCAGAGGT/--------- AAGCTGGGAG 3070 het 3070 ref 29 18 11 2 CTCAGAGGT 1 0 238732 CASAVA_Build 11 2977415 2D ATAGCTCCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 38 11 18 11 TC 7 6 238733 CASAVA_Build 11 2981011 2D CGGTTGCTTT GG/-- GAGGTTCTGG 2875 het 2875 ref 29 15 8 8 G 3 1 238734 CASAVA_Build 11 3010855 1I TCTAAAAAAA -/G AACTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 G 0 1 238735 CASAVA_Build 11 3044063 2I CAGGGTCTCA --/CT CTGTCACCTA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 CT 1 2 238736 CASAVA_Build 11 3045119 1D CTCCTGCCTC A/- GCCTCCTAAG 3070 het 1456 hom 15 4 11 0 A 1 0 238737 CASAVA_Build 11 3049339 2D AAATGAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 21 1 11 9 A 13 11 238738 CASAVA_Build 11 3051400 1D TTTTAGTAGA G/- GGGGGGTTTC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 G 7 6 238739 CASAVA_Build 11 3052080 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2016 het 1640 hom 17 4 7 6 A 13 12 238740 CASAVA_Build 11 3053131 2I TCACATCAGC --/CA TACACCTGCT 3070 het 3070 ref 33 17 8 8 CA 0 1 238741 CASAVA_Build 11 3057796 1I CGTCTCCATT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 7 8 238742 CASAVA_Build 11 3059514 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1107 het 789 hom 21 9 4 8 T 18 16 238743 CASAVA_Build 11 3060481 24I TAGTTTGCTA ------------------------/AGAATAATGGCCTCCAGTTCCATC CATGTTCCTA 3070 het 3070 ref 23 14 10 2 AGAATAATGGCCTCCAGTTCCATC 0 1 238744 CASAVA_Build 11 3062821 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2603 hom 33 11 12 10 A 12 13 238745 CASAVA_Build 11 3063474 1I CTGGACTCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 8 9 238746 CASAVA_Build 11 3064351 1D GGAGGTGCAG A/- AGGGAGGTGG 3070 hom 43 het 19 0 13 6 A 2 1 238747 CASAVA_Build 11 3079075 1D5M2I GCCACCATGC TTTGAC--/-TTGACCT TAAGTTTCAT 3070 hom 57 het 19 0 20 2 N/A 0 0 238748 CASAVA_Build 11 3080477 4I ATCCTTTCAC ----/CTCT CTGAGCCTCA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 CT 1 3 238749 CASAVA_Build 11 3086576 4D TAATAAGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TTTG 3 2 238750 CASAVA_Build 11 3089538 1I CAGCAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2825 hom 23 7 9 7 A 10 11 238751 CASAVA_Build 11 3091461 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 33 0 23 10 A 13 12 238752 CASAVA_Build 11 3117495 2D TTCCAGAGGG CA/-- CATCCAGCCT 1429 het 1429 ref 21 9 4 8 CA 2 1 238753 CASAVA_Build 11 3118914 3I TAACAACAGA ---/AAC AACAACGTCA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 AAC 2 3 238754 CASAVA_Build 11 3159891 1I ACTTATATGT -/G GGGGGGGGAA 3070 hom 34 het 28 0 16 12 G 8 9 238755 CASAVA_Build 11 3161017 1I AAAAAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 326 hom 27 1 17 9 T 11 12 238756 CASAVA_Build 11 3169269 1D TAACACGGTG A/- AAACCCCGTC 3070 hom 39 het 15 0 12 3 A 4 3 238757 CASAVA_Build 11 3169436 1I GGGTGACAGA -/G GGAGACGCCG 3070 hom 38 het 17 0 13 4 G 2 3 238758 CASAVA_Build 11 3177562 10D GAGGCGGCTG AGCTGGGCTC/---------- AGCTGGGCTC 1551 het 1324 hom 24 6 7 12 AGCTGGGCTC 2 1 238759 CASAVA_Build 11 3180594 1I TGTTTCTTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 8 9 238760 CASAVA_Build 11 3181028 7D TGCACTCCCC GGCAGAA/------- GGCAGAAGCT 913 het 913 ref 20 10 5 6 GGCAGAA 2 1 238761 CASAVA_Build 11 3181106 1I CACAGCGTCT -/C CCCTCCGACA 1636 het 1636 ref 21 7 4 10 C 3 4 238762 CASAVA_Build 11 3181319 1I CCGCTCCCCT -/C CCAGGCCGAC 1569 hom 23 het 12 0 7 5 C 2 3 238763 CASAVA_Build 11 3195637 17D CAGGGTAAGA GCTAGGTGGTGGGCGGG/----------------- GCTCCTCCTG 3070 het 2429 hom 19 6 10 5 GCTAGGTGGTGGGCGGG 1 0 238764 CASAVA_Build 11 3200582 1D GTGTCCACGT C/- CCCAGTCGCT 3070 hom 43 het 19 0 14 5 C 4 3 238765 CASAVA_Build 11 3202756 1D CAGGGGGGAT G/- GGGTGTGTTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 G 4 3 238766 CASAVA_Build 11 3207019 19D CAGAATGGGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 34 1 22 11 T 29 10 238767 CASAVA_Build 11 3214814 1D AAACTTTTGA T/- TTTTTTCGTC 3070 het 2996 hom 23 8 14 1 T 7 6 238768 CASAVA_Build 11 3215340 7I ACAGCGGTAT -------/CTTATGG CTTATGGCTA 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 CTTATGG 1 2 238769 CASAVA_Build 11 3215632 1I TAGCGTTACT -/G GGGTGTTTCG 3070 hom 78 het 32 0 25 7 G 3 4 238770 CASAVA_Build 11 3215817 4I AAATATGTAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 AC 7 9 238771 CASAVA_Build 11 3218467 4D GGTCTCGAGC AGGG/---- TCCTGACCTC 3070 hom 36 het 16 0 11 6 AGGG 1 0 238772 CASAVA_Build 11 3219520 1I GCATTTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 11 13 T 10 11 238773 CASAVA_Build 11 3234408 1I CGGCGCTGCT -/G GGCAAGGTCA 2813 hom 21 het 8 0 8 0 G 2 3 238774 CASAVA_Build 11 3319522 1D ACTTCCCTGA T/- TTTTTTTTTT 1220 het 1220 ref 41 31 4 6 T 12 11 238775 CASAVA_Build 11 3320507 9I GTGTGGGAAT ---------/TCTCTAAGA TTCTTGATAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TCTCTAAGA 0 1 238776 CASAVA_Build 11 3334457 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1488 het 1488 ref 22 11 6 5 T 13 12 238777 CASAVA_Build 11 3335334 7D GGGAGAACGC GTCCCTT/------- GTCCCACAGT 3070 het 3070 hom 41 15 22 6 GTCCCTT 1 0 238778 CASAVA_Build 11 3336572 52I12M1D GAACGTGTCC ----------------------------------------------------TTGCTTATTTTTC/GTGCTCTATTCCTTTCTCCTTCAAATCCTCCATTGTTTACTTAAATTGGATTTTGCTTATTTTT- CCATTTAGTG 3070 het 3070 ref 29 21 12 3 N/A 0 0 238779 CASAVA_Build 11 3344478 1I TGGCCACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 10 12 A 12 13 238780 CASAVA_Build 11 3344890 1I AAAAAAGCAT -/A AATTTTCTTA 3070 het 3070 hom 25 13 9 3 A 2 3 238781 CASAVA_Build 11 3356184 1I TTCTTAGGTT -/A AAAAAAAAAA 2157 het 2157 ref 25 14 8 3 A 11 12 238782 CASAVA_Build 11 3387849 1D TGTCCACGTT G/- GGGGGAACAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 6 5 238783 CASAVA_Build 11 3392348 1D AGAAGTGGTT G/- TTTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 50 29 10 11 G 1 0 238784 CASAVA_Build 11 3397048 1D TTCCCAAAGT C/- CTGGGATTAC 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 C 2 1 238785 CASAVA_Build 11 3407586 1D TTGTGGGTTT G/- GGGGTGACTC 1965 het 1965 ref 40 27 6 7 G 5 4 238786 CASAVA_Build 11 3418940 4I ATCCACAAGC ----/AAGT GAGATATTAC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 AAGT 0 1 238787 CASAVA_Build 11 3419944 1D ATTTCTAATG T/- TTGCAATGTT 3070 het 3070 ref 48 36 9 5 T 3 2 238788 CASAVA_Build 11 3423174 1D TGGTCCCCAA T/- TTTTTTTAGC 2098 het 2098 ref 28 20 5 4 T 8 7 238789 CASAVA_Build 11 3423261 6I TTGTGTACTT ------/CATTTC TATTGTTATG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 CATTTC 0 1 238790 CASAVA_Build 11 3423400 1D CAGATCATCA G/- GGCATTAGAT 2555 het 2555 ref 22 11 6 5 G 3 2 238791 CASAVA_Build 11 3424870 2D TTAGGGAAAC AT/-- ATGCTTAGAG 2186 het 2186 ref 38 29 5 4 AT 2 1 238792 CASAVA_Build 11 3425003 4D GCGGTGATCC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 45 27 15 5 AG 8 6 238793 CASAVA_Build 11 3427425 1I AATCACTAAC -/A TAGGCCGGAT 3070 het 2280 hom 38 7 28 3 A 0 1 238794 CASAVA_Build 11 3427637 1D GGCATGGTTT C/- CCTTTAGGCC 3070 het 3070 ref 49 28 12 11 C 3 2 238795 CASAVA_Build 11 3428422 1D CCATGTTTTA T/- TTTTGTTGTC 1860 het 1860 ref 22 10 4 8 T 5 4 238796 CASAVA_Build 11 3428595 1D TACTTTTTCC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 T 8 7 238797 CASAVA_Build 11 3428916 1I CATGTGTGAC -/G TTCCATTGCC 3070 het 3070 ref 47 31 12 4 G 0 1 238798 CASAVA_Build 11 3429760 1I CAATGTAAAA -/G TCTTAACTGT 3070 het 3070 ref 50 36 10 4 G 0 1 238799 CASAVA_Build 11 3430276 3D CACACAAAAT ATC/--- ATCAACATAA 2383 het 2383 ref 31 22 5 4 ATC 2 1 238800 CASAVA_Build 11 3430633 1I ATCTGCATGA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 T 6 7 238801 CASAVA_Build 11 3431330 3D AACCCTCCTG TTC/--- TTTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 56 43 11 3 TTC 1 0 238802 CASAVA_Build 11 3431524 1I TAAAATAAGG -/C CTACCATCCC 3070 het 3070 ref 63 38 16 11 C 1 2 238803 CASAVA_Build 11 3431592 1I TCCAGGGAGT -/A AAGAAATCAT 3070 het 3070 ref 57 34 13 10 A 2 3 238804 CASAVA_Build 11 3431701 1I TATTTACTGT -/G GGGGTTGTTG 1867 het 1867 ref 47 29 5 13 G 4 5 238805 CASAVA_Build 11 3431897 5D GCTCTTTTTT GTTTG/----- TTTGCTCTGT 2360 het 2360 ref 40 22 5 15 GTTTG 1 0 238806 CASAVA_Build 11 3433415 1I ATTTTACCTT -/C CCTAATTGCT 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 C 2 3 238807 CASAVA_Build 11 3433556 3I TAACTCCTCC ---/TCT TCTTAAGAGA 3070 het 2039 hom 34 5 24 7 TCT 1 2 238808 CASAVA_Build 11 3434910 2D TTTGAAGAGG AA/-- AGAGTCTTGC 3070 het 3070 ref 51 41 8 3 A 3 1 238809 CASAVA_Build 11 3435496 1I TTTGTCTTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 8 9 238810 CASAVA_Build 11 3436518 2D TTTTTAATGC TT/-- TTTTTTTTTG 1308 het 1308 ref 27 16 5 6 T 11 9 238811 CASAVA_Build 11 3437755 2I CCACCTCAGG --/GA GTTGCTATGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 GA 0 1 238812 CASAVA_Build 11 3438841 1I ATATCTGAAA -/C CGGCAGGGCC 2013 het 2013 ref 34 21 7 6 C 1 2 238813 CASAVA_Build 11 3438997 5I TCTCTGTCTC -----/TTCTT CTCTTCCCAT 3070 het 3070 ref 41 21 10 10 TTCTT 0 1 238814 CASAVA_Build 11 3439522 1I6M6I TTAACTTCAA -CCCTCT------/CCCCTCTGAGAGA GAGAGAGGCT 1218 het 1218 ref 30 24 3 4 N/A 0 0 238815 CASAVA_Build 11 3441124 1I TGAGCCTCGC -/A GATGAGAACC 2432 het 2432 ref 30 21 6 3 A 0 1 238816 CASAVA_Build 11 3442486 1I AAGGTCAAAA -/C AAATACATTT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 C 0 1 238817 CASAVA_Build 11 3442838 2I TAGCTGAGAC --/TA CGGGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 TA 0 1 238818 CASAVA_Build 11 3443370 1I AATATTTGTA -/T TCTTCTTAGC 3070 het 3070 ref 42 31 9 2 T 1 2 238819 CASAVA_Build 11 3443987 1I TCTCAAAAAA -/C AAAAAACCCA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 C 0 1 238820 CASAVA_Build 11 3445930 1I TTTCCTTTTT -/G TTTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 27 15 8 4 G 0 1 238821 CASAVA_Build 11 3446593 4D TTGCTGAATT TCTA/---- TCTACTAATT 2264 het 2264 ref 24 17 5 3 TCTA 2 1 238822 CASAVA_Build 11 3452896 1D ATAATTGAGG T/- TTTTAGGACC 3070 het 3070 ref 52 35 11 6 T 5 4 238823 CASAVA_Build 11 3456165 1D CGTTCCCTGT C/- CCCCCCCCCA 2246 hom 13 het 7 0 5 2 C 10 9 238824 CASAVA_Build 11 3469417 7D TCCTTCCTCC TGGTTTT/------- TGGTTTTTGT 3070 het 704 hom 28 4 8 16 TGGTTTT 2 1 238825 CASAVA_Build 11 3477518 2I TTATTTTTAT --/AC AGTTATTTAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AC 0 1 238826 CASAVA_Build 11 3477564 7I ATTTTTATTA -------/CTTTTAT TTTTTTTTGA 1935 het 1935 ref 26 10 4 12 CTTTTAT 0 1 238827 CASAVA_Build 11 3480655 8I ACATGACGGT --------/GTGTCCAG GTGTTCAGGT 2327 het 2307 hom 21 11 5 5 GTGTCCAG 0 1 238828 CASAVA_Build 11 3480905 1I TTTCATAGGA -/T TTTTGTGATG 2838 het 2838 ref 17 8 7 2 T 4 5 238829 CASAVA_Build 11 3481538 1I AGTTTGCCTC -/T GAAAGTTGTG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 0 1 238830 CASAVA_Build 11 3486210 3D GATCTGGAAT AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 12 9 238831 CASAVA_Build 11 3490177 1I AATACGTTTA -/T TCCTACTTTA 1483 het 1483 ref 43 34 5 4 T 1 2 238832 CASAVA_Build 11 3490559 1D TCTATTTGCC A/- GAAGCATTTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 1 0 238833 CASAVA_Build 11 3493112 1I21M2D TCTTGACATG -AAAACTTTCACAACTACTAACAA/CAAAACTTTCACAACTACTAAC-- GACAATAGAC 3070 het 3070 ref 33 31 7 3 N/A 0 0 238834 CASAVA_Build 11 3500120 4I CTTTGGCAAG ----/TTTC TTTATGTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 TTTC 0 1 238835 CASAVA_Build 11 3500237 1D AAAAATATAT A/- TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 1 0 238836 CASAVA_Build 11 3503952 1I AATCTTAGAC -/T TTTTTTTTTT 2401 het 2268 hom 23 6 8 9 T 13 14 238837 CASAVA_Build 11 3522819 4I AGATAGTGTA ----/AAAT AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 33 22 7 4 AAAT 0 1 238838 CASAVA_Build 11 3532937 4D GAAAAATATA ACCT/---- AATTGTGTTC 1154 het 1154 ref 39 33 3 4 ACCT 1 0 238839 CASAVA_Build 11 3534806 1D ATTTCACCCC T/- AGATCACTGT 3070 het 3070 ref 46 33 9 4 T 1 0 238840 CASAVA_Build 11 3539179 1D TCACATACAC T/- TTTTTTTTTT 2943 het 2392 hom 23 7 10 6 T 13 12 238841 CASAVA_Build 11 3542968 1D AGGAGACTGA G/- GCAGAGGCTT 3070 het 3070 ref 42 27 10 6 G 2 1 238842 CASAVA_Build 11 3543032 1D TCATTGTCAG C/- CCCCTTCCCC 2664 het 2664 ref 48 33 9 7 C 5 4 238843 CASAVA_Build 11 3545348 2I TCATGGTGAC --/CA CAGTCTTGAA 3070 het 3070 ref 79 41 25 13 CA 1 2 238844 CASAVA_Build 11 3546311 2D TGATCTCTAC AG/-- AGAGTCTTCC 3070 het 3070 ref 42 28 9 7 AG 3 2 238845 CASAVA_Build 11 3547225 2D GGGCTGTGAT GA/-- GGGGGTCCCC 829 het 829 ref 37 27 2 9 GA 1 0 238846 CASAVA_Build 11 3548092 1I GACTGGATGG -/A ATTTTGCACA 1766 het 1766 ref 26 18 4 4 A 1 2 238847 CASAVA_Build 11 3552146 2D GATTGTCTCA AG/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 34 7 5 AG 1 0 238848 CASAVA_Build 11 3564363 1D AGACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 12 10 A 11 10 238849 CASAVA_Build 11 3607083 2I TATTATATAT --/AC ACACACACGT 3070 het 104 hom 26 1 20 5 AC 4 5 238850 CASAVA_Build 11 3616214 4D TGGCCCCAAG AAGT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 16 0 13 3 AAGT 1 0 238851 CASAVA_Build 11 3618162 3I AGGGGCAGGA ---/TGG TGGGAACAGC 3070 hom 91 het 33 0 29 4 TGG 1 2 238852 CASAVA_Build 11 3619797 1D GGGTCCAGGA T/- TAGGGCCCCG 1007 hom 17 het 7 0 4 3 T 2 1 238853 CASAVA_Build 11 3621342 4D AAAAAAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 97 het 34 0 33 3 AAAG 4 3 238854 CASAVA_Build 11 3621498 1I ATCCTGCCTG -/C CCCACTCTCT 3070 hom 105 het 42 0 33 9 C 3 4 238855 CASAVA_Build 11 3629253 2I3M3I CAATCCCTTC --CAA---/TACAAAAC AACAACTCCT 2460 hom 15 het 7 0 6 1 N/A 0 0 238856 CASAVA_Build 11 3633132 4D GCGGCAAAGT CAGA/---- CAGAGAAGAG 3070 hom 72 het 28 0 25 5 CAGA 2 1 238857 CASAVA_Build 11 3636791 1I TCCTACAAGA -/C CCTGTTCACG 3070 hom 147 het 54 0 49 5 C 2 3 238858 CASAVA_Build 11 3655786 10D CTACTAAAAT ACACACACAC/---------- ACACACAAAG 1735 het 1646 hom 15 6 6 4 AC 8 3 238859 CASAVA_Build 11 3661352 1D ACTGCAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 27 0 18 9 T 12 11 238860 CASAVA_Build 11 3661520 1D AATTTTGTAA T/- TTTAGTAGAG 3070 hom 42 het 16 0 13 3 T 4 3 238861 CASAVA_Build 11 3687788 1I ATAATAATTT -/A AAAAAAAAAA 362 het 362 ref 10 5 3 2 A 11 12 238862 CASAVA_Build 11 3693597 1I CTACTTAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 T 9 10 238863 CASAVA_Build 11 3704217 8D AAGTTAGTTC TTTGAAGT/-------- TACCAGTAAT 1838 het 1838 ref 19 12 6 2 TTTGAAGT 1 0 238864 CASAVA_Build 11 3717691 2D TCTGCCACCC CT/-- GAGAGAGCAA 3070 het 3070 hom 47 20 25 3 CT 1 0 238865 CASAVA_Build 11 3718323 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1300 het 1300 ref 19 8 4 7 A 13 14 238866 CASAVA_Build 11 3719149 1I AAAAATCTGG -/C CAGGAGCGGT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 C 1 2 238867 CASAVA_Build 11 3726767 1D AAAAAAAAAA C/- AATTATATAA 2904 het 2030 hom 23 8 10 5 C 1 0 238868 CASAVA_Build 11 3734444 1I GGCCAGTCTA -/G TCTCGAACTC 3070 hom 60 het 22 0 19 3 G 0 1 238869 CASAVA_Build 11 3754608 1I CAAATAGAAA -/T TTCATACAGA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 2 3 238870 CASAVA_Build 11 3778942 1I GTCTGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 23 0 16 7 A 10 11 238871 CASAVA_Build 11 3781604 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTTT 1987 het 775 hom 16 3 7 6 T 11 12 238872 CASAVA_Build 11 3783784 1D AGCCACCACG C/- CCCCGCGAGA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 5 4 238873 CASAVA_Build 11 3806737 1I GTATTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2213 hom 20 7 10 3 T 10 11 238874 CASAVA_Build 11 3807055 2D CAATGGGGAA AT/-- TTTTTTTTTT 1347 het 719 hom 18 9 8 1 AT 1 0 238875 CASAVA_Build 11 3808479 4D AAAAAATAAA AAGT/---- AAGAGTTAAT 2739 het 2739 ref 21 9 11 4 AAGT 1 0 238876 CASAVA_Build 11 3815243 2D ATATGTATGT AC/-- AGACTACTCG 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 AC 1 0 238877 CASAVA_Build 11 3818346 1I CTCAACACCC -/A CCCCCACCAA 2965 het 2209 hom 19 8 9 2 A 0 1 238878 CASAVA_Build 11 3823837 2D TAGTTTCCCT GA/-- GAGAGGAGGG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 GA 3 2 238879 CASAVA_Build 11 3845999 2D TTTTGCTGAC AA/-- GAGCAAAGGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 0 238880 CASAVA_Build 11 3853943 4D TTATGAGGGT TAAG/---- TAAGATAATG 3070 het 3070 ref 47 25 22 2 TAAG 2 1 238881 CASAVA_Build 11 3854922 1D AGATAGTTTC T/- TTCATTTCCC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 3 2 238882 CASAVA_Build 11 3860824 2D CTAAGTTGTT TG/-- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 50 24 24 3 TG 1 0 238883 CASAVA_Build 11 3862588 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2537 het 2537 ref 35 15 9 12 A 13 12 238884 CASAVA_Build 11 3869104 2I ATTTTTCATG --/TT TTTTTTTTTT 2474 het 2017 hom 24 6 9 9 T 10 12 238885 CASAVA_Build 11 3874019 2D CGGAATAGTG CT/-- CTCTCTCTAC 2750 het 2750 ref 21 11 8 2 CT 5 4 238886 CASAVA_Build 11 3886418 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 20 6 A 13 14 238887 CASAVA_Build 11 3887602 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 26 1 21 4 A 12 13 238888 CASAVA_Build 11 3893842 1D CCAGCCTGGG C/- CCACAGGGTG 3070 hom 75 het 26 0 25 1 C 3 2 238889 CASAVA_Build 11 3897935 1D AAGTGTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 36 0 26 10 T 12 11 238890 CASAVA_Build 11 3958417 2D CCATCTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 1421 het 941 hom 32 8 6 19 A 18 16 238891 CASAVA_Build 11 3959974 2I CTGGGACTAC --/AT AGGTGCACGC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AT 0 1 238892 CASAVA_Build 11 3972891 2D AAAATCATGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 7 T 13 11 238893 CASAVA_Build 11 4022205 1I CTTTGGAATG -/A GAAAACAGAA 3070 hom 112 het 46 0 38 8 A 0 1 238894 CASAVA_Build 11 4048724 1I CTGGTCCTGA -/G GAAAAAAAAC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 G 1 2 238895 CASAVA_Build 11 4051726 1I CAATAGTTCC -/T TCCTCATCTT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 T 1 2 238896 CASAVA_Build 11 4058808 1D TATTTTTAGG T/- TTTTTTTTTC 829 het 829 ref 44 40 3 1 T 10 9 238897 CASAVA_Build 11 4071885 2I ATCGCTTTGG --/GT GTAGCCCAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 GT 1 2 238898 CASAVA_Build 11 4073191 27D AGATGAGGAA ACTGACGCTCAGAGCGAGGTGTCGCCG/--------------------------- ACTGACCCAA 3070 hom 84 het 27 0 28 4 ACTGACGCTCAGAGCGAGGTGTCGCCG 1 0 238899 CASAVA_Build 11 4077750 1I AAGTTGCTTT -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 105 het 43 0 34 9 C 8 9 238900 CASAVA_Build 11 4078475 1D CATACTGTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 8 238901 CASAVA_Build 11 4079371 1I CCACACCCCC -/A CCCCGCTCCC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 0 1 238902 CASAVA_Build 11 4090924 1D GTAATACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 42 0 31 12 A 11 10 238903 CASAVA_Build 11 4102725 1I TTATTTATTT -/A TATTTTTTTT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 A 0 1 238904 CASAVA_Build 11 4107418 1D AGACTATATG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 8 238905 CASAVA_Build 11 4116347 1D ATGATAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 82 het 29 0 27 2 T 10 9 238906 CASAVA_Build 11 4118720 2D ATTTCCAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 35 0 21 15 T 13 11 238907 CASAVA_Build 11 4120619 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 21 2 15 4 A 14 13 238908 CASAVA_Build 11 4126475 1D TCATCCTATA C/- AAAAATCAAG 3070 hom 63 het 29 0 22 8 C 1 0 238909 CASAVA_Build 11 4128727 6D TTAAAGTATC ATAGGT/------ ATACCTTTAA 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 ATAGGT 1 0 238910 CASAVA_Build 11 4134649 1I CCTCTCCTCA -/T TTCCCAACCC 3070 het 3070 ref 39 22 17 0 T 2 3 238911 CASAVA_Build 11 4135279 2I ACCTCACAGG --/AA AACCCAAGCC 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 2 4 238912 CASAVA_Build 11 4136366 2I GAGATTCTCT --/TG TGCTTCAGCC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TG 1 2 238913 CASAVA_Build 11 4137909 1I AAGAAAATCT -/A AAAAAAAAAA 2827 het 137 hom 20 1 9 10 A 10 11 238914 CASAVA_Build 11 4138582 12I ACCCAGATGT ------------/ACCCAACATCCC AGGACTGTTG 3070 het 3070 ref 45 27 15 4 ACCCAACATCCC 0 1 238915 CASAVA_Build 11 4141458 3D GGTAATTAAT CTA/--- CTCAGGTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 CTA 1 0 238916 CASAVA_Build 11 4156764 1I TGATCTCAGG -/C CCCTGGGAAA 2510 het 2510 ref 35 12 11 12 C 3 4 238917 CASAVA_Build 11 4167829 1I TTCCAGGGGG -/A TGGGACAGAA 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 A 0 1 238918 CASAVA_Build 11 4177215 2D AGTATTTCAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 21 0 17 5 TA 9 8 238919 CASAVA_Build 11 4177593 1I GTTTTTTTGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 18 7 4 T 7 8 238920 CASAVA_Build 11 4190267 2I AGATGAGGAT --/TC TCTGTGTATC 3070 hom 90 het 37 0 33 4 TC 1 2 238921 CASAVA_Build 11 4190862 4D TCAATCTCTA TATT/---- TAAGGAAATC 3070 het 3070 ref 30 14 14 6 TATT 1 0 238922 CASAVA_Build 11 4196627 2I AAATTAGAGA --/CT CTGTTCTCTG 2692 het 2692 ref 43 30 6 7 CT 1 2 238923 CASAVA_Build 11 4205733 1D TTTCCTCACT G/- GCTGCCAAGT 2193 het 2193 ref 40 30 7 4 G 2 1 238924 CASAVA_Build 11 4235057 1D TTTAGCAATA T/- TTATTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 T 3 2 238925 CASAVA_Build 11 4235273 1D ACTACTAATA T/- TTTTTGTTGA 2994 het 2994 ref 43 36 7 0 T 6 5 238926 CASAVA_Build 11 4236442 1D GGTAAAAAAA G/- GAGTACTAAT 3070 het 3070 ref 43 31 11 1 G 2 1 238927 CASAVA_Build 11 4240228 1I TTTAGCTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1389 hom 34 3 25 6 A 9 10 238928 CASAVA_Build 11 4247661 2D TACACAACAT GA/-- GATACCACTA 2555 hom 15 het 6 0 6 0 GA 2 1 238929 CASAVA_Build 11 4248106 2D CTGCGTATGT AA/-- AAAAAAAAAA 2065 het 2065 ref 30 19 5 6 A 12 10 238930 CASAVA_Build 11 4253548 1I TAAATTTTCA -/T TTTTTACAAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 5 6 238931 CASAVA_Build 11 4255467 2D GAGACTCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1906 hom 18 6 11 1 A 13 11 238932 CASAVA_Build 11 4257526 1I62M3I TGAGTGGTTT -TTTTTAATTTTTAAATTTTTTAAGTTAGTTGAGACCAGTGAAGTGTGGTATGTTAACTTAAA---/CTTTTTAATTTTTAAATTTTTTAAGTTAGTTGAGACCAGTGGAGTGTGGTATGTTAACTTAAATGT TGTTCTTCTT 2402 het 2402 ref 8 6 5 0 N/A 0 0 238933 CASAVA_Build 11 4264808 3D ATTAAAGAAG AAC/--- AACATTTAAG 3070 het 3070 ref 55 44 8 5 AAC 2 1 238934 CASAVA_Build 11 4274281 1I ATTCTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 31 12 7 T 12 13 238935 CASAVA_Build 11 4274389 1I TGATTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 32 5 9 18 T 11 12 238936 CASAVA_Build 11 4281213 1I GTCATAGAGC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 2647 hom 19 6 12 1 T 8 9 238937 CASAVA_Build 11 4283702 1D ACAGAAAATT A/- AAAAAAAATT 1730 het 1730 ref 18 12 4 2 A 9 8 238938 CASAVA_Build 11 4284735 1I8M1I GTGAAGAGAC -ACCCACAG-/AACCCACAGA ATGGTAGCAA 3070 het 3070 ref 37 20 18 0 N/A 0 0 238939 CASAVA_Build 11 4285365 1I TAATATTCAG -/C CATGCAAAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 1 2 238940 CASAVA_Build 11 4287860 1D TGGGTAAGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 10 9 238941 CASAVA_Build 11 4290284 1I AAATTCAACA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 7 8 238942 CASAVA_Build 11 4296191 1D TGTTTGAGAT C/- CAGACAGAAT 3070 het 3070 hom 37 11 25 1 C 2 1 238943 CASAVA_Build 11 4309032 1D AATTACACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 132 hom 26 2 15 9 A 14 13 238944 CASAVA_Build 11 4317406 4I TGGCCAAGAC ----/AATT AAGCTACCTG 3070 het 3070 ref 57 37 15 5 AATT 0 1 238945 CASAVA_Build 11 4321158 1I GCTTGAGCCT -/G GGGAGGTGGA 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 G 3 4 238946 CASAVA_Build 11 4325575 1I TGATTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 1560 het 1560 ref 24 9 5 10 T 13 14 238947 CASAVA_Build 11 4325921 2D TGTAGTGGTA TC/-- TCATGTTGTG 2303 het 2303 ref 44 39 5 1 TC 2 1 238948 CASAVA_Build 11 4326698 1D TGGGGCTATT A/- AGATGGAATG 3070 het 3070 ref 37 26 10 2 A 2 1 238949 CASAVA_Build 11 4334542 4I TTTGTACATT ----/TAAA TATTTTCCAA 3070 het 3070 ref 39 25 9 5 TAAA 0 1 238950 CASAVA_Build 11 4337841 5D AATGTGATAC ATTAA/----- ATTAACAGAA 3070 het 3070 ref 28 17 9 3 ATTAA 2 1 238951 CASAVA_Build 11 4340757 5I AAAGCTGTTT -----/AAAAG AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 21 7 11 3 AAAAG 2 3 238952 CASAVA_Build 11 4368819 1D ACATTGGACT G/- GGCAAAGATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 3 2 238953 CASAVA_Build 11 4377686 1D TTATAGCACT A/- AAATGCCCAC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 4 3 238954 CASAVA_Build 11 4385983 1D AAGATAAAGG A/- AAGACTTAAA 3070 het 2958 hom 19 7 11 1 A 3 2 238955 CASAVA_Build 11 4387102 5D TCCCAGAACT TAAAA/----- TAAAGTATAA 3070 het 3070 hom 24 12 12 0 TAAAA 1 0 238956 CASAVA_Build 11 4388704 2I ATTAAAAAAA --/AC AAACAAAAAC 3070 hom 99 het 40 0 34 7 AC 0 1 238957 CASAVA_Build 11 4393858 1D GGTTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 14 het 26 1 19 6 G 11 10 238958 CASAVA_Build 11 4405228 1I AAGTACCGTA -/C CATTATGTTT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 C 1 2 238959 CASAVA_Build 11 4410064 1I GTTCTGATGG -/C TATGGTTTAT 3070 hom 153 het 57 0 51 6 C 0 1 238960 CASAVA_Build 11 4420143 3D AAGAACTCCT ACA/--- ACAATACCCC 3070 hom 104 het 36 0 34 2 ACA 2 1 238961 CASAVA_Build 11 4429880 1D GTGTATCATA T/- TTTTCTTTAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 5 4 238962 CASAVA_Build 11 4430415 1I TCTCACCCCC -/A AGGCCATCAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 1 2 238963 CASAVA_Build 11 4437774 2D CTTTCTTGAA CT/-- CTGTCTCTGC 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 CT 2 1 238964 CASAVA_Build 11 4458716 1D AGCTAACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 13 12 238965 CASAVA_Build 11 4461431 1I AAGAGATGCC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 7 8 238966 CASAVA_Build 11 4468037 2D CCTCAAATTT TG/-- TGACCCCAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 TG 2 1 238967 CASAVA_Build 11 4470078 1D TTGAGCTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 A 12 11 238968 CASAVA_Build 11 4471463 2I ACTATTCTGA --/TT TTTTATGTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 4 6 238969 CASAVA_Build 11 4483703 26I TGCCTACCTG --------------------------/TAAATAATAAATCTGCTTCATGTAAA TTGTGTGAGT 3070 het 3070 ref 56 29 19 8 TAAATAATAAATCTGCTTCATGTAAA 0 1 238970 CASAVA_Build 11 4484176 2D GTACTTAGAG TT/-- TTTAACATGA 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 T 5 3 238971 CASAVA_Build 11 4484258 4I TGTCTTTAGT ----/TTTG TTTATGTGAT 3070 het 3070 ref 25 12 7 6 TTTG 0 1 238972 CASAVA_Build 11 4484310 2I CATTACCCTT --/GA AAACTGGCAC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 GA 0 1 238973 CASAVA_Build 11 4484394 1I CAAGAGAAAG -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 7 8 238974 CASAVA_Build 11 4485789 1I AGTTTACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 10 11 238975 CASAVA_Build 11 4485863 2I GCCAATAAAC --/AT ATGAAAACAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 AT 1 2 238976 CASAVA_Build 11 4486365 1D AATTAATGCA G/- GAACAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 G 2 1 238977 CASAVA_Build 11 4486438 3I TGGACACATA ---/GAG GAGAATACCA 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 GAG 1 2 238978 CASAVA_Build 11 4487174 1D CTCAAGTGGT A/- AGCTCAACAA 3070 het 3070 hom 47 21 26 0 A 2 1 238979 CASAVA_Build 11 4488430 2D ATATTTCCTG AA/-- AAAGAGATTA 3070 het 3070 hom 39 10 26 7 A 5 3 238980 CASAVA_Build 11 4488937 5D TACATCCAAT TCTTA/----- TCTTTTCAGT 3070 het 3070 hom 54 23 28 5 TCTTA 1 0 238981 CASAVA_Build 11 4490233 2D CATCTCTGTC TT/-- TGATTTCAGA 3070 het 3070 hom 43 16 20 9 T 3 1 238982 CASAVA_Build 11 4490466 4I ATTGTTGGGC ----/TTAT TTGTCTCATT 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 TTAT 0 1 238983 CASAVA_Build 11 4491864 1I ACCCCCTTCA -/C AATCCCATTA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 C 0 1 238984 CASAVA_Build 11 4491940 1D25M5I GCCAATCTCA GGGCCTCTGAAATGGAATCTTCTAAT-----/-GGCCTCTGAAATGGAATCTTCTAATGGCCG GCCCTTCTCT 3070 het 3070 ref 28 15 12 8 N/A 0 0 238985 CASAVA_Build 11 4493149 5D ACCCTTGTGT CACAC/----- CACATGCCAA 3070 het 3070 ref 56 32 16 12 CACAC 1 0 238986 CASAVA_Build 11 4495139 4I GACTGATATA ----/AGAC AGTCAGCAAG 3070 het 3070 hom 37 19 15 3 AGAC 0 1 238987 CASAVA_Build 11 4495555 4D16M4I ATTGTATCAA ATTGAAATGTGCATGGGCTT----/----ACAAGCCCATGCACATTTCA GTTTATCTAA 3070 het 3070 ref 38 21 18 2 N/A 0 0 238988 CASAVA_Build 11 4495794 2I CCTTTAGTGA --/CT CTAATTCTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CT 1 2 238989 CASAVA_Build 11 4496935 2I14M4D GGATACAGAC --AGTGCTATTTCATATGAC/AGAGTGCTATTTCATA---- TGACTATTTT 3070 het 3070 ref 37 17 19 1 N/A 0 0 238990 CASAVA_Build 11 4497372 2I TCTTAACAGT --/GC GCTCATCTCT 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 GC 1 2 238991 CASAVA_Build 11 4499910 5I ATGTTGTTTG -----/TATTC AAGTTTTGAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TATTC 0 1 238992 CASAVA_Build 11 4504409 16D GAGCAAATAT TAGAGCTAAAGAGATA/---------------- TAGGCCCCAA 3070 het 3070 ref 38 30 9 6 TAGAGCTAAAGAGATA 1 0 238993 CASAVA_Build 11 4506555 1I GCGAATGGGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 8 9 238994 CASAVA_Build 11 4507389 1D67M1I GTAATATTAT CTTTGTTATTTGATTATGCATATTTGGATCTCTTAATCTAGCTAAGGGTCCATTAGTTGTGTTTTCTT-/-TTTGTTATTTGATTATGCATATTTGGATCTCTTAATCTAGCTAAGGGTCCATTAGTTGTGTTTTCTTC CCCCCAAAGA 3070 het 3070 ref 45 42 17 15 N/A 0 0 238995 CASAVA_Build 11 4508793 1D AGCATGATGT C/- CCTCAAGTTC 3070 het 3070 hom 63 28 28 7 C 3 2 238996 CASAVA_Build 11 4509117 2I TTTCATTATG --/TA TATCAGAACA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 TA 1 2 238997 CASAVA_Build 11 4510574 1I82M4D TGAAAACCAT -GCAAGAGAACTACGTGATGCAGTCACAATTTCAGTAGCCAATTTGATCAAGTAGAAGAAAGGGTATCAGTGATTGAAGATCAAATG/GGCAAGAGAACTACGTGATGCAGTCACAACTTCAGTAGCCAATTTGATCAAGTAGAAGAAAGGGTATCAGTGATTGAAGATCA---- AATGAAATGA 3070 het 3070 ref 34 45 12 11 N/A 0 0 238998 CASAVA_Build 11 4511335 1I AATAACGGGC -/A AAATAACCAG 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 3 4 238999 CASAVA_Build 11 4511425 2D CCCAATTAAA AT/-- ACACAGAGTG 2794 het 2794 ref 35 24 7 4 AT 1 0 239000 CASAVA_Build 11 4512999 1I CAAGACTAAA -/C CAGGAAGAAG 2387 het 2387 ref 13 6 6 1 C 1 2 239001 CASAVA_Build 11 4514822 1D TTAAATATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 20 0 15 7 A 12 11 239002 CASAVA_Build 11 4515840 3I AGTAAGGAGG ---/AAC AATAAAAGGG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AAC 0 1 239003 CASAVA_Build 11 4516565 4D AGCCAACAAG TAGA/---- TAGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 59 28 27 6 TAGA 2 1 239004 CASAVA_Build 11 4517935 2I CAGAATAGAC --/TG AGATACTAAG 3070 het 3070 hom 58 27 23 8 TG 0 1 239005 CASAVA_Build 11 4519550 2D CTTTAAATTT TA/-- TTTTATTTTA 279 het 279 ref 31 19 3 9 TA 1 0 239006 CASAVA_Build 11 4524193 3D ATAACGACAA GCT/--- GCTAATATTT 3070 het 3070 hom 51 23 25 5 GCT 2 1 239007 CASAVA_Build 11 4524329 1I GCTGCCTAGC -/T TCCACATTTG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 1 2 239008 CASAVA_Build 11 4524692 2D CATATGAGGA CT/-- CTGTGGAAAT 3070 het 3070 ref 54 24 24 7 CT 2 1 239009 CASAVA_Build 11 4529932 1D AATGGCACCC A/- ATGGGTGGCA 3070 het 3070 hom 48 18 20 12 A 2 1 239010 CASAVA_Build 11 4531968 1D ATGCCCCCCT A/- ATCCTGTACC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 2 1 239011 CASAVA_Build 11 4532450 1D TCCTGCCCCT G/- GCATGCTGCT 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 G 2 1 239012 CASAVA_Build 11 4536630 3D TCCTCCCAAA GAT/--- GATACTTGGA 3070 het 3070 ref 47 25 17 9 GAT 2 1 239013 CASAVA_Build 11 4536750 4D GATATCTAAT TCTA/---- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 TCTA 1 0 239014 CASAVA_Build 11 4543807 2I GTGGATAGTT --/TC TGTGTGGAGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 TC 0 1 239015 CASAVA_Build 11 4544053 1D GCCTCAACAT A/- AGAAGTTTGA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 2 1 239016 CASAVA_Build 11 4545173 3D TCATGAAGAA TTC/--- TTCTTAGATC 3070 het 3070 ref 34 24 9 1 TTC 2 1 239017 CASAVA_Build 11 4545439 2D AGATGGGGTT TC/-- TCTGTTGGTC 3070 het 3070 ref 26 12 12 4 TC 2 1 239018 CASAVA_Build 11 4546570 2I AAGATTAAAC --/AA AGTCAGTTTA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 1 3 239019 CASAVA_Build 11 4549285 2I CGATCCATAC --/AG AGTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 AG 1 2 239020 CASAVA_Build 11 4549757 1I ACAAGAGACC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 7 8 239021 CASAVA_Build 11 4549871 2D CACCAAAAAG TC/-- TCTAGGAGAT 3070 het 3070 hom 46 16 23 8 TC 2 1 239022 CASAVA_Build 11 4550709 2I TTTTTCCAAC --/TT TTTGAGTTTA 3070 hom 125 het 46 0 40 6 T 3 5 239023 CASAVA_Build 11 4550806 4D AATTCTTGTG ATTT/---- ATTAGGTAGT 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 ATTT 1 0 239024 CASAVA_Build 11 4551557 1I GGCACTTAGA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 7 8 239025 CASAVA_Build 11 4552984 2D GAAAAAAGAC TT/-- TGTTAGGGGG 3070 hom 138 het 50 0 47 4 T 3 1 239026 CASAVA_Build 11 4553218 3D CAGTTCTTAA GAG/--- GAGATTGTGC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 GAG 2 1 239027 CASAVA_Build 11 4555181 1D AGTGCTTCAA G/- GGGGGGATCT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 G 7 6 239028 CASAVA_Build 11 4588458 2D GAAGTAGAAA AG/-- AGAGAACAAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AG 3 2 239029 CASAVA_Build 11 4588991 1D CTACTTTATG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 8 239030 CASAVA_Build 11 4596364 1D AGATTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 103 het 45 0 36 9 A 12 11 239031 CASAVA_Build 11 4603824 2D TTTAATGGGC GG/-- GGGGGGGGCA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 G 10 8 239032 CASAVA_Build 11 4605586 1I AGGCTTCCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 9 10 239033 CASAVA_Build 11 4610927 2I AAAATTTAAT --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 11 239034 CASAVA_Build 11 4616282 4D GGAGGGAGAG GTGT/---- GTGTGCCTGT 3070 het 3070 hom 57 23 31 3 GT 4 2 239035 CASAVA_Build 11 4622021 1D TGCTGAACAG A/- AAGCATGTGG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 3 2 239036 CASAVA_Build 11 4622926 4I GTCCTATCAC ----/TCTG TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 TCTG 0 1 239037 CASAVA_Build 11 4628748 1I GCAAATATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2750 hom 22 8 10 4 A 11 12 239038 CASAVA_Build 11 4635017 1D ATTGTTATTA T/- TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 7 6 239039 CASAVA_Build 11 4639956 6D AAGTTTTCCA GTATAT/------ GTACACTGTG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 GTATAT 1 0 239040 CASAVA_Build 11 4654979 1D ATAAATAAAT A/- AATAAAAGAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 3 2 239041 CASAVA_Build 11 4673583 1D TTCTGTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 19 8 T 11 10 239042 CASAVA_Build 11 4676224 1D AGTGATAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 11 10 239043 CASAVA_Build 11 4686600 1D AACTTGCTCA G/- GTAAATACTC 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 G 2 1 239044 CASAVA_Build 11 4690611 1I TATTTCTAAG -/T TTTTTTTTTC 2887 het 2887 ref 25 13 9 3 T 9 10 239045 CASAVA_Build 11 4710362 7D AAAAAAAAAA AAAAAAG/------- AAAATTTTCA 3070 het 1571 hom 25 8 11 11 AAAAAAG 1 0 239046 CASAVA_Build 11 4712717 1I GGTGATGGGT -/C CCCCAGTATT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 C 4 5 239047 CASAVA_Build 11 4722312 2D CCCCTGTACT TA/-- CATTCAGTGA 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 TA 1 0 239048 CASAVA_Build 11 4731903 1D AAAAGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 2702 het 2702 ref 35 20 6 9 T 17 16 239049 CASAVA_Build 11 4733047 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 8 7 239050 CASAVA_Build 11 4742686 2D TCCATCACAG AC/-- ACACACACAC 1297 het 1297 ref 24 14 4 8 AC 10 9 239051 CASAVA_Build 11 4744301 1D ACAGTATTTG A/- GGAGTTCTTT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 1 0 239052 CASAVA_Build 11 4744610 1D ATGACATTCA T/- TTTTTGCAGT 3070 het 918 hom 16 3 11 3 T 6 5 239053 CASAVA_Build 11 4786567 1D TCAGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 39 2 23 15 T 13 12 239054 CASAVA_Build 11 4787771 1D AAATTCAGCC T/- TTGGCAGAGA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 3 2 239055 CASAVA_Build 11 4788042 1D TATGCATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 40 1 38 2 T 11 10 239056 CASAVA_Build 11 4788112 5I AACTGCTGAT -----/ATGTC ATGTAAGTCG 3070 hom 95 het 43 0 32 11 ATGTC 0 1 239057 CASAVA_Build 11 4854552 2I GCCCATGTAT --/TA TTTTCTAGCC 3070 hom 162 het 60 0 49 11 TA 0 1 239058 CASAVA_Build 11 4861044 1D AGCTGAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 11 10 239059 CASAVA_Build 11 4873871 1I TTTGTTTTTT -/A ACCTCTAAGT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 1 2 239060 CASAVA_Build 11 4882571 1D GAGAAAAAAA G/- GGAGAAAGTG 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 G 3 2 239061 CASAVA_Build 11 4890074 8I AGATAAATAA --------/AATAATTT AATAATTTGT 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 AATAATTT 1 2 239062 CASAVA_Build 11 4894209 1I CTTTTACTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 9 10 239063 CASAVA_Build 11 4894958 1I GCCAAGAATG -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 7 8 239064 CASAVA_Build 11 4900183 6I TAGCAGAAAA ------/TACCTC TACCTACATG 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TACCTC 0 1 239065 CASAVA_Build 11 4903976 3D ATAAAATAAT AAC/--- AATTTAATAT 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 AAC 1 0 239066 CASAVA_Build 11 4905929 1D GACCTAGGAC A/- AATTACTTAA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 A 3 2 239067 CASAVA_Build 11 4911283 4D TGATTAAGAA AGAC/---- AGAAAGATTG 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AGAC 1 0 239068 CASAVA_Build 11 4911372 1D GTTTGTTTTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 8 7 239069 CASAVA_Build 11 4918875 1D ATGATTTTTT A/- ATATACATAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 2 1 239070 CASAVA_Build 11 4919554 1I13M4I TATAAAAAGG -AAAAAATAGAAAT----/AAAAAAATAGAAATAAAC AAGCAAACTG 3070 hom 45 het 23 0 16 8 N/A 0 0 239071 CASAVA_Build 11 4919591 1I CTGCAGGTTC -/T TTTTTTTTAA 782 het 3 hom 20 0 2 18 T 8 9 239072 CASAVA_Build 11 4923856 3D TAACTCTATG ACA/--- ACAACAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 ACA 3 2 239073 CASAVA_Build 11 4946336 4I TTCTCTTAAA ----/TAAT TAATTATTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 TAAT 1 2 239074 CASAVA_Build 11 4962983 4D CTTAAAACTT AGTC/---- AGATATAGAT 3070 het 3070 hom 42 21 21 3 AGTC 1 0 239075 CASAVA_Build 11 4969998 1I TTTACTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 132 het 51 0 42 9 T 10 11 239076 CASAVA_Build 11 4991510 4D TAGGCAGGTC TTTG/---- TTTGTTTTAA 3070 hom 92 het 36 0 30 10 TTTG 2 1 239077 CASAVA_Build 11 4995653 2I ATTATTGTGT --/GA GAGATTTTTC 3070 hom 139 het 52 0 46 6 GA 2 3 239078 CASAVA_Build 11 5010799 1I CCAAAAAAAA -/T AAAAATAAAT 3070 het 20 hom 25 1 14 10 T 0 1 239079 CASAVA_Build 11 5011504 10D AATGTCTTAA GATTAATTTT/---------- GATTAGATGT 3070 het 3070 hom 35 11 21 4 GATTAATTTT 1 0 239080 CASAVA_Build 11 5011804 2I ACACACACAA --/AC ACACACACAC 3000 het 3000 ref 32 19 8 5 AC 6 7 239081 CASAVA_Build 11 5013846 1D AGAGAACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1440 hom 33 9 14 10 A 15 14 239082 CASAVA_Build 11 5014703 12D65M3I CTGTGCTAGC AGCTGCTATGCTAGCTGCTATGCTATGCTAGCAACTGCTTCATCTGATCTTTCTCTTTCTCTCTCTCTTTCCCCCAA---/------------AGCTGCTATGCTATGCTAGCAACTGCTTCATCTGATCTTTCTCTTTCTCTCTCTCTTTCCCCCAAAAG AAGAAGGAGC 3070 het 3070 ref 43 38 21 21 N/A 0 0 239083 CASAVA_Build 11 5015846 1I CCTAATCCTT -/A CCTTATTCCT 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 A 0 1 239084 CASAVA_Build 11 5018088 3I TTATTTCTAC ---/AAT AACTCTTCAT 3070 het 3070 ref 24 10 12 2 AAT 0 1 239085 CASAVA_Build 11 5018304 4I TTCTTAATTC ----/ATCA TTCATTCAGT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 ATCA 0 1 239086 CASAVA_Build 11 5024020 14D CAACCAAGGG ACTAATAAAGGGTA/-------------- CAGGGCATCT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 ACTAATAAAGGGTA 1 0 239087 CASAVA_Build 11 5026721 4D CACATCTTTG TATT/---- TATTTGTTTC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 TATT 2 1 239088 CASAVA_Build 11 5029199 2I GTGTGAATTT --/AA AATTGGGCCG 3070 het 3070 ref 47 29 16 2 A 2 4 239089 CASAVA_Build 11 5029451 1D AACTGGGATG C/- ATCCTCAGAT 3070 het 3070 hom 59 24 26 9 C 1 0 239090 CASAVA_Build 11 5029545 2I TTGAAAAAAA --/AT AATTGATTCG 3070 het 3070 hom 50 16 26 8 AT 0 1 239091 CASAVA_Build 11 5029811 1I TTATTTTTTT -/A TTAAAAAAAA 2346 het 2346 ref 27 15 7 5 A 0 1 239092 CASAVA_Build 11 5035979 1I ATTACCCAGC -/A AAAAATGGGT 3070 het 3070 hom 36 18 15 3 A 5 6 239093 CASAVA_Build 11 5038316 4D AAGGAAAATA GAAG/---- GAAACAAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 GAAG 1 0 239094 CASAVA_Build 11 5039518 1I TTTAAGAGAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 8 9 239095 CASAVA_Build 11 5039827 4D CTCTATACTT ACTC/---- ACCTGTGCAC 3070 het 3070 ref 32 19 11 5 ACTC 1 0 239096 CASAVA_Build 11 5040464 1I AATAAAAGTT -/A AAAAATAAGC 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 A 5 6 239097 CASAVA_Build 11 5041006 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 960 het 960 ref 39 29 3 8 TA 6 5 239098 CASAVA_Build 11 5042265 1I TTCAAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 11 12 239099 CASAVA_Build 11 5046321 2I ATAGCAACAC --/TT AATATAGCAA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 0 2 239100 CASAVA_Build 11 5048153 1I TCATTCATGA -/C CCATAGGTTT 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 C 2 3 239101 CASAVA_Build 11 5050278 1D AAATTGCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 11 10 239102 CASAVA_Build 11 5057432 1I TCAAAAAAAA -/C ATATAAGAGA 3070 het 386 hom 33 1 25 7 C 0 1 239103 CASAVA_Build 11 5077625 5D ATATATATCA ATTAT/----- ATTATATATT 3032 het 2458 hom 17 7 8 2 ATTAT 2 1 239104 CASAVA_Build 11 5077916 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 9 10 239105 CASAVA_Build 11 5078392 1I TCTGCTTGAG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 7 8 239106 CASAVA_Build 11 5079062 1I GAAAGCATAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 59 33 22 4 T 8 9 239107 CASAVA_Build 11 5079424 2I ACACACACAC --/AT ATATGTATAT 3070 het 2355 hom 32 13 15 4 AT 2 3 239108 CASAVA_Build 11 5082752 1D CCGATTTCGC A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 56 29 18 9 A 8 7 239109 CASAVA_Build 11 5092715 5D TTGTTGTTGT TTTGG/----- TTTGGTTTGG 3070 het 3070 ref 29 17 7 5 TTTGG 3 2 239110 CASAVA_Build 11 5094816 7I TTCTACATCA -------/ATATATG ATATATGCTG 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 ATATATG 1 2 239111 CASAVA_Build 11 5096074 3D AGTAATGCCC ACA/--- ACAACACTAC 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 ACA 3 2 239112 CASAVA_Build 11 5097818 1D AGTAAAGCAT G/- GTGGTATAAG 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 2 1 239113 CASAVA_Build 11 5098216 2I CAGAACAAAC --/TT TTTATACTGC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 3 5 239114 CASAVA_Build 11 5100742 1I GCATCAATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 T 9 10 239115 CASAVA_Build 11 5102505 1I AATCACAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 10 11 239116 CASAVA_Build 11 5105766 5D AATATATTCA CTTAT/----- CTTTTTTTGC 2882 het 2064 hom 12 5 7 2 CTTAT 1 0 239117 CASAVA_Build 11 5129372 1I AGATGTGAGA -/C CCCAAACCTA 3070 het 3070 hom 53 19 23 11 C 3 4 239118 CASAVA_Build 11 5143686 3D TCAAAGGGGG GTT/--- GTTCTCTGGC 2240 hom 12 het 5 0 5 0 GTT 2 1 239119 CASAVA_Build 11 5148016 1I TATAAAACTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 8 9 239120 CASAVA_Build 11 5154359 6D CATATATATA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TG 10 7 239121 CASAVA_Build 11 5155917 6I CAATCTGGCA ------/ATGCCC ATGTGCTCAC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 ATGCCC 0 1 239122 CASAVA_Build 11 5156394 1D GGTATGCAAG C/- CTTCCAGCCC 3070 hom 105 het 44 0 34 10 C 2 1 239123 CASAVA_Build 11 5163445 1D TAGGAATAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 9 8 239124 CASAVA_Build 11 5163955 2I AGTCTAGTAT --/AC TCCATGGGTC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AC 0 1 239125 CASAVA_Build 11 5165644 3I ATGTTATATA ---/ATC ATATTATTGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 ATC 0 1 239126 CASAVA_Build 11 5165715 4D TCTATATGAT TATC/---- TAATATACCT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TATC 1 0 239127 CASAVA_Build 11 5166098 1D GAAAAAGATA C/- AATTAAATGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 1 0 239128 CASAVA_Build 11 5166440 5D CATTTTGTGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 29 2 17 10 T 15 10 239129 CASAVA_Build 11 5166588 1I TTTTCAAAGA -/T TTTTTCCCCT 3070 hom 96 het 33 0 32 1 T 5 6 239130 CASAVA_Build 11 5167476 3D TGGACGGCTC AGA/--- AGAAGACAGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AGA 3 2 239131 CASAVA_Build 11 5169510 4I GGTACTGTAT ----/AGTA AGTGAGTTCT 3070 hom 97 het 39 0 32 7 AGTA 0 1 239132 CASAVA_Build 11 5172643 1D GGACTGTTGT G/- GGGTGGGGGG 2656 hom 15 het 6 0 6 1 G 4 3 239133 CASAVA_Build 11 5173385 2I ACAGTGTCTC --/TG TGTGTACATC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TG 2 3 239134 CASAVA_Build 11 5174581 1I TCTACCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 11 12 239135 CASAVA_Build 11 5174729 3D GCTACCACAT CAA/--- CAACAGTTTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 CAA 2 1 239136 CASAVA_Build 11 5175385 2D CAGACATGTA AT/-- ATTGTTCAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 2 AT 2 1 239137 CASAVA_Build 11 5183156 3D TTTAATAACA TAT/--- TATTACATAT 2544 hom 15 het 6 0 6 0 TAT 2 1 239138 CASAVA_Build 11 5184385 1D TGGCAGCAAT A/- AAAAAGTAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 6 5 239139 CASAVA_Build 11 5186322 2D AGTGAGAACT GG/-- TTTCAAATCT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 G 2 0 239140 CASAVA_Build 11 5210039 7D ATATAAAAAT ATAAAAA/------- ATGGTGTGGG 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 ATAAAAA 1 0 239141 CASAVA_Build 11 5215680 2I CTAGATTTTG --/AC ACACAGTGAA 3070 het 3070 ref 55 31 16 8 AC 2 3 239142 CASAVA_Build 11 5218634 2D TAATCAGTTC TA/-- TATATATATA 1003 het 1003 ref 52 41 3 9 TA 7 6 239143 CASAVA_Build 11 5226920 4D GGAATCTAAT AAAG/---- AAAAGTCATT 3070 hom 27 het 10 0 10 1 AAAG 1 0 239144 CASAVA_Build 11 5227885 4I AGGATACTGC ----/TGCT TAATTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TGCT 0 1 239145 CASAVA_Build 11 5229130 1I AATTAAAAGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 7 8 239146 CASAVA_Build 11 5231029 1I TTATTATTTG -/T ATTGCTTGCA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 0 1 239147 CASAVA_Build 11 5234359 2D ATCTTTTGAA TC/-- TCTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 TC 3 2 239148 CASAVA_Build 11 5237416 1D GTCCAATTTT A/- AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 A 7 6 239149 CASAVA_Build 11 5248140 1I GTGGTGACAG -/T TGACAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 T 1 2 239150 CASAVA_Build 11 5249042 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 16 14 239151 CASAVA_Build 11 5249379 2D TACAATTTCC TG/-- TATGTTCAGG 3070 het 3070 ref 36 15 11 11 TG 1 0 239152 CASAVA_Build 11 5249809 1I TGTAAGTGCT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 45 19 14 12 A 7 8 239153 CASAVA_Build 11 5250711 1D GATAATATAA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 T 8 7 239154 CASAVA_Build 11 5266985 4D GCCTGGCTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 40 3 14 24 T 16 12 239155 CASAVA_Build 11 5267927 4D CATCTATCTG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 hom 102 het 41 0 35 8 TCTA 4 3 239156 CASAVA_Build 11 5271091 8I TGGGTTCTTG --------/GTTTCACT GTTTCACTGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 GTTTCACT 1 2 239157 CASAVA_Build 11 5274099 1I ATGGAGTATT -/A TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 0 1 239158 CASAVA_Build 11 5283012 1D CTGTATTTAC A/- AAAAAACAAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 7 6 239159 CASAVA_Build 11 5287664 1I AAAACAAAGC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 9 239160 CASAVA_Build 11 5292183 1D CTTGACTCTT C/- CTAAAATGGT 3070 hom 40 het 25 0 22 4 C 2 1 239161 CASAVA_Build 11 5293115 2I TAGTAGAAAT --/AG AGTTATACCT 3070 hom 105 het 43 0 35 8 AG 1 2 239162 CASAVA_Build 11 5296121 1D GTGTGATGTT C/- CCCTTCCTCT 924 hom 5 het 3 0 2 1 C 4 3 239163 CASAVA_Build 11 5299905 1I ATGGTCACAT -/A ATAAGGAACA 3070 hom 151 het 54 0 51 3 A 1 2 239164 CASAVA_Build 11 5300784 1D GATGATCAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 T 10 9 239165 CASAVA_Build 11 5300935 3D GTGCATTTGA AAG/--- AAGAATTTAA 3070 hom 117 het 42 0 40 5 AAG 2 1 239166 CASAVA_Build 11 5303662 5I TTTTAAAAAT -----/AAAAC AAAAAATTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAAAC 0 1 239167 CASAVA_Build 11 5309092 3I AGGAGATAGA ---/ACT ACTCCAAGGA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 ACT 1 2 239168 CASAVA_Build 11 5318264 3I TAGTAATTCT ---/ACC ACAACAAAAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 ACC 0 1 239169 CASAVA_Build 11 5321353 3I TAGAAGAAAT ---/GTC GTCTTTCTGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 GTC 1 2 239170 CASAVA_Build 11 5327211 1I CCTACTCCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 T 9 10 239171 CASAVA_Build 11 5328005 21D GAAGACAGAA ATCACTAGTAGTCTTTACAGG/--------------------- TTATGTAACC 3070 het 3070 ref 31 25 12 1 ATCACTAGTAGTCTTTACAGG 1 0 239172 CASAVA_Build 11 5329218 10D TGGTGAACAT CTTATGAACA/---------- GGTAGAATTC 3070 het 3070 ref 46 29 16 5 CTTATGAACA 1 0 239173 CASAVA_Build 11 5330648 7I TTATATATAC -------/TTAATAT TTAATATATA 3070 het 1925 hom 13 5 7 1 TTAATAT 1 2 239174 CASAVA_Build 11 5331276 9D AGTTGGTCAT ATGTGGAGA/--------- GTGGGGAGGA 3070 het 3070 hom 34 12 17 8 ATGTGGAGA 1 0 239175 CASAVA_Build 11 5331773 17I AACTTGGCTG -----------------/TGTGTCTGTCTGTAGTA TGTGTGAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 17 4 TGTGTCTGTCTGTAGTA 0 1 239176 CASAVA_Build 11 5333339 1I AAACACTAGC -/A ACCTGCTTCT 3070 het 3070 ref 48 19 19 10 A 1 2 239177 CASAVA_Build 11 5333568 3D CTTTAAAAAT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 35 5 15 16 TAA 1 0 239178 CASAVA_Build 11 5339554 2D10M1D CCCTAGCAGA GTGATCTAGTTAG/--GATCTAGTTA- GAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 30 14 18 1 N/A 0 0 239179 CASAVA_Build 11 5340416 10D GCCTGCTGGG GCAAAATGGA/---------- GCTCAAGGCC 3070 het 3070 ref 58 30 25 4 GCAAAATGGA 1 0 239180 CASAVA_Build 11 5340568 8D CACTTGTGAT ATCTATAA/-------- AGAGTATCTC 3070 het 3070 ref 34 19 13 6 ATCTATAA 1 0 239181 CASAVA_Build 11 5340775 2I GTATGGCATT --/AA AAAAAAAAAA 2596 het 1612 hom 22 5 9 8 A 12 14 239182 CASAVA_Build 11 5340833 3I GGTTGAAAAC ---/AAG AAGGAAAAGG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AAG 1 2 239183 CASAVA_Build 11 5341264 6D TACACACACA CTCTCT/------ CTCTCACACA 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 CT 5 2 239184 CASAVA_Build 11 5342396 18D GAAAAAATAA ACTAAGCGTGAGAGGTAT/------------------ TTATGTGTCT 3070 het 3070 ref 40 31 12 2 ACTAAGCGTGAGAGGTAT 1 0 239185 CASAVA_Build 11 5342766 1D AGAGAGAGGG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3036 hom 29 7 21 1 A 7 6 239186 CASAVA_Build 11 5343312 1I TTCCTGTCTA -/T TGCACAGGAT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 1 2 239187 CASAVA_Build 11 5343870 4I TGTTTGGGGG ----/CTAA CTGTTAATGG 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 CTAA 0 1 239188 CASAVA_Build 11 5346266 3I ATAGAAATCA ---/CTG TTGCTATTAT 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 CTG 0 1 239189 CASAVA_Build 11 5346435 1D ACATAAAGAC T/- TTGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 T 3 2 239190 CASAVA_Build 11 5347029 5D TGATTTTCTA GTACT/----- GTACTGAATG 3070 het 3070 hom 33 16 16 2 GTACT 2 1 239191 CASAVA_Build 11 5350154 1I ACTTCCATAC -/T GTTTTCTATA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 0 1 239192 CASAVA_Build 11 5357500 4I ATTAATAGAT ----/TTTC TTTATGTCCA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 TTTC 0 1 239193 CASAVA_Build 11 5357796 3I ACAAAACTTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 12 15 239194 CASAVA_Build 11 5357947 1I AATGAAAATG -/A AAAATCGGTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 4 5 239195 CASAVA_Build 11 5360899 1D TACAAGACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 13 12 T 11 10 239196 CASAVA_Build 11 5363310 2I ATGCAAAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 AT 5 6 239197 CASAVA_Build 11 5363751 2I AAGTATGTTC --/TA TATATATATA 2171 het 769 hom 10 2 6 2 TA 5 6 239198 CASAVA_Build 11 5364647 1D GTAGAGCATC A/- GCTCAAAAAT 3070 het 3070 ref 55 30 22 3 A 1 0 239199 CASAVA_Build 11 5365540 1I TTCCTTGAAT -/A GTTTTTCCCT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 0 1 239200 CASAVA_Build 11 5366522 2D TTATGTATAC GT/-- CTCTCTTGCT 3070 het 3070 hom 42 16 23 6 GT 1 0 239201 CASAVA_Build 11 5369582 1D CTATAATCCC A/- GCACTTTGGG 3070 hom 105 het 40 0 35 6 A 1 0 239202 CASAVA_Build 11 5369881 4D ATAAAAAGGA AAAC/---- AAACAAAATT 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 AAAC 2 1 239203 CASAVA_Build 11 5370724 1D14M1D TCTCAAAAAC AAAAAAAAAGAAAAAT/-AAAAAAAAGAAAAA- AAATAAATAT 3070 hom 63 het 21 0 22 2 N/A 0 0 239204 CASAVA_Build 11 5371189 1D AAATATTAAA T/- AAAAATAAGC 3070 het 72 hom 28 1 16 12 T 1 0 239205 CASAVA_Build 11 5375990 7D ACATGTACCC TAAAACT/------- TAAAAGTATA 3070 het 152 hom 12 1 8 4 TAAAACT 1 0 239206 CASAVA_Build 11 5376013 3D TATAACAAAA AAT/--- AAGTTAGAAA 3070 het 592 hom 18 3 12 3 AAT 1 0 239207 CASAVA_Build 11 5377572 2D AGAAGGATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 30 0 19 13 A 13 11 239208 CASAVA_Build 11 5379617 4I TAATCTTTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 36 het 23 0 13 10 TTTC 2 3 239209 CASAVA_Build 11 5379659 3D TCTTTTTCTT CTG/--- CTTTTTCTTT 2977 hom 36 het 27 0 12 16 CTG 1 0 239210 CASAVA_Build 11 5383336 2D TAGAAAGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 12 10 239211 CASAVA_Build 11 5385483 1D CTTCCATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 40 0 33 7 T 13 12 239212 CASAVA_Build 11 5385900 2D TCTTACATCA CT/-- CTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 CT 2 1 239213 CASAVA_Build 11 5387315 1D TTCTAGAACT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 8 239214 CASAVA_Build 11 5387720 3I AAAATGTCTC ---/ATT ATCTTTAAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 ATT 0 1 239215 CASAVA_Build 11 5388753 3I GATTTAGCTG ---/TAT TATTACAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TAT 1 2 239216 CASAVA_Build 11 5389288 2D GACACATGAC TG/-- TATTTCTAAT 3070 hom 120 het 41 0 40 2 TG 1 0 239217 CASAVA_Build 11 5395655 12I GTTCAACCAT ------------/TGTGGAAGTCAG TGTGGCGATT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TGTGGAAGTCAG 0 1 239218 CASAVA_Build 11 5397836 4D AAATGTTGCA TATT/---- TATTTTAGTT 3070 hom 66 het 26 0 23 5 TATT 2 1 239219 CASAVA_Build 11 5398459 2D TGCTATTTAC AA/-- AGTCTTCACA 3070 het 3070 hom 30 12 16 4 A 3 1 239220 CASAVA_Build 11 5402870 4I34M1I TCCTCATGTT ----TTATTTTTTCTCTGCTAGAGCCTAAAAGTTAGCA-/TCTATTATTTTTTCTCTGCTAGAGCCTAAAGGTTAGCAT TTTTTTAATA 2718 het 2718 ref 23 19 6 5 N/A 0 0 239221 CASAVA_Build 11 5404995 4D CCAACCTTTC TTTT/---- GAGTTTCATA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 4 0 239222 CASAVA_Build 11 5406377 16D GTTTTAGCTT TTTATATTAGAAAGTA/---------------- CATAAACAAA 3070 het 3070 ref 48 30 17 7 TTTATATTAGAAAGTA 1 0 239223 CASAVA_Build 11 5407030 2I AACCCCAGCC --/TT TTTGAGAGTT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 3 5 239224 CASAVA_Build 11 5413379 42I CTTAATAAAT ------------------------------------------/TTTATAAATTTATAATTTATAAATAATTTATAAATAAAATAA ATTTTAACTG 1392 het 1392 ref 29 22 3 4 TTTATAAATTTATAATTTATAAATAATTTATAAATAAAATAA 0 1 239225 CASAVA_Build 11 5414704 1D AGGCAGAGGA C/- CAGAACTCAC 3070 het 3070 hom 51 16 26 9 C 2 1 239226 CASAVA_Build 11 5416076 2D AGATACTGCC CT/-- CTCTCTCCAC 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 CT 4 3 239227 CASAVA_Build 11 5416162 1D CATAGCAACA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 9 8 239228 CASAVA_Build 11 5422055 1I ATGACTTCAG -/T TCATTTGGTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 1 2 239229 CASAVA_Build 11 5424111 1D GAGGTAACCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 10 9 239230 CASAVA_Build 11 5425592 1D GTACTAGTGG T/- TCAATTCCAG 3070 hom 95 het 39 0 32 8 T 2 1 239231 CASAVA_Build 11 5430398 11I GCGACTTTAC -----------/GAGATATGGAG GAGATATGGA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 GAGATATGGAG 1 2 239232 CASAVA_Build 11 5432008 2I TCAAAGCTCT --/CA CAACACATGT 3070 het 3070 ref 64 31 23 10 CA 1 2 239233 CASAVA_Build 11 5438290 2I CTTTCAACTC --/TT GAGTCATTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 0 2 239234 CASAVA_Build 11 5438420 1D AACCATTGCT G/- GGGGAGCTGG 3070 hom 84 het 35 0 28 8 G 5 4 239235 CASAVA_Build 11 5447375 1I TGGAAAGTTC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 8 9 239236 CASAVA_Build 11 5452312 3I TAATAAATTG ---/GTT TTTTTGGAGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 GTT 0 1 239237 CASAVA_Build 11 5453703 2D CTATTCAACC TA/-- TGTTTCTTTG 3070 het 3070 hom 47 17 29 1 TA 1 0 239238 CASAVA_Build 11 5463951 1I GTTTCTGTTA -/T TTAAACCTCT 3070 hom 102 het 41 0 35 8 T 2 3 239239 CASAVA_Build 11 5464052 5D TTTTTCTTTC TGTTT/----- TATTTTTTCA 3070 het 3070 ref 43 21 19 4 TGTTT 1 0 239240 CASAVA_Build 11 5464224 1I ATGGTATGTG -/C CCGCTAAATA 3070 hom 92 het 33 0 27 6 C 2 3 239241 CASAVA_Build 11 5465820 1D ACAAATGCAG A/- AAAAAAGTTA 3070 hom 135 het 50 0 46 6 A 7 6 239242 CASAVA_Build 11 5473493 2D AGGAGCTACA AC/-- ACAGTCAGAA 3070 het 3070 hom 39 16 22 2 AC 2 1 239243 CASAVA_Build 11 5474159 47I GTAATGATTT -----------------------------------------------/TTAAAGACCCCACAAAGAGACTTACTGCCTCATTTAAAACACAATTG GAATTGGCAA 3070 hom 78 het 26 0 26 7 TTAAAGACCCCACAAAGAGACTTACTGCCTCATTTAAAACACAATTG 0 1 239244 CASAVA_Build 11 5474849 8D ATCAATGTTT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 1068 het 11 hom 31 1 10 20 A 23 15 239245 CASAVA_Build 11 5479803 4D ACTCCCACCT GTGA/---- GTGAATTTCT 3070 het 2142 hom 24 6 13 8 GTGA 2 1 239246 CASAVA_Build 11 5480021 3I ATTCTCTGTG ---/TAA TAAGTTGAGA 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 TAA 1 2 239247 CASAVA_Build 11 5481223 1D GAAACTACAC T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 8 7 239248 CASAVA_Build 11 5484456 3D GTAATTATAT ATA/--- ATGTGAATTA 3070 het 3070 hom 30 9 17 5 ATA 1 0 239249 CASAVA_Build 11 5524594 7I CGGTTAACTC -------/TCAGGGT TCTCATTTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TCAGGGT 0 1 239250 CASAVA_Build 11 5525359 5D GCAAGCTATT TAAAC/----- TACATGATAT 3070 hom 51 het 20 0 18 4 TAAAC 1 0 239251 CASAVA_Build 11 5526078 1D TTTGATGCTT A/- ACTCAGTGGA 3070 hom 126 het 45 0 43 3 A 2 1 239252 CASAVA_Build 11 5526336 2I CACACCAACC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 46 0 37 9 A 9 11 239253 CASAVA_Build 11 5526702 15D TTAAAAGGTG GTCATATTAGTACCT/--------------- GTCTCTCAAG 3070 hom 93 het 29 0 32 1 GTCATATTAGTACCT 1 0 239254 CASAVA_Build 11 5528715 2I TACAAACATG --/AA AAAAAAATTG 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 7 9 239255 CASAVA_Build 11 5529413 1D AGGTTCAGTC T/- TTGACCTAAC 3070 hom 108 het 45 0 33 12 T 3 2 239256 CASAVA_Build 11 5530890 4D ATCCACCTCA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 15 11 239257 CASAVA_Build 11 5532776 4I AAATAAATAA ----/TACT TACTGAATTC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 TACT 1 2 239258 CASAVA_Build 11 5533020 5I GGAAAGCATT -----/TTATA TAGAAAGAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTATA 0 1 239259 CASAVA_Build 11 5533816 1D TGACTAAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 9 T 10 9 239260 CASAVA_Build 11 5535419 1D TCTTGGTTGC T/- TTGTCTATGA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 3 2 239261 CASAVA_Build 11 5543787 4I TTAAATAATT ----/AAAG AAAATAAATA 3070 het 2100 hom 16 5 9 2 AAAG 0 1 239262 CASAVA_Build 11 5544511 14I GAAAGAATAA --------------/AAGTATGACCTTGT TTCCAATCTG 3070 het 3070 ref 43 23 20 1 AAGTATGACCTTGT 0 1 239263 CASAVA_Build 11 5545417 1D AATTCAATGT G/- GCCATCGTGG 3070 het 3070 ref 54 29 23 2 G 2 1 239264 CASAVA_Build 11 5554530 2I CGTTACTCAG --/TT TTTTGAGGTG 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 T 4 6 239265 CASAVA_Build 11 5556634 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 2427 het 932 hom 9 2 7 0 A 10 9 239266 CASAVA_Build 11 5558123 1D TGAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2462 het 1740 hom 18 6 8 4 T 13 12 239267 CASAVA_Build 11 5562710 2D TTCCTGTATC TT/-- TACATGACTC 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 T 3 1 239268 CASAVA_Build 11 5563350 1I CCTAGGTTTC -/A AAATCCACCC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 3 4 239269 CASAVA_Build 11 5563819 1I ATATTAGCTA -/G GTAAATTCAT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 G 1 2 239270 CASAVA_Build 11 5566589 1D TGCCCACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 33 2 21 12 T 12 11 239271 CASAVA_Build 11 5569698 1D TGACCTTTAG C/- CCCGGGGGGC 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 C 4 3 239272 CASAVA_Build 11 5574208 22D CTCTATTCTA CAAGCTGAAGTATGTAGAGGAG/---------------------- GCAGCTCTGG 3070 hom 60 het 18 0 21 3 CAAGCTGAAGTATGTAGAGGAG 1 0 239273 CASAVA_Build 11 5578501 2I CCACACGGAC --/TA TGTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 35 14 16 5 TA 0 1 239274 CASAVA_Build 11 5580083 1D CATCTCTACT A/- AAAAATACAA 1186 het 1186 ref 9 6 3 0 A 6 5 239275 CASAVA_Build 11 5581974 10D CTAATTGTGT GTGTGTGTGC/---------- GTGTGTGTGT 2964 het 2964 ref 28 18 7 4 GTGTGTGTGC 1 0 239276 CASAVA_Build 11 5591712 3D GTGATATTTA CTT/--- CTTTATAAGT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 CTT 2 1 239277 CASAVA_Build 11 5593276 2D TGATGAACTG AC/-- ACCCCTTTCT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 AC 2 1 239278 CASAVA_Build 11 5594544 1D GAGAATAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 99 hom 36 1 22 13 T 15 14 239279 CASAVA_Build 11 5600288 7I ATTAGCTGGA -------/CGTGGTG CGTGGTGGCG 1775 het 1192 hom 15 5 7 3 CGTGGTG 1 2 239280 CASAVA_Build 11 5600445 1D ACAAACAAAT A/- AAAAAAACCG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 8 7 239281 CASAVA_Build 11 5606613 2I GCAAAGTTGA --/TT TTTTTTTTTT 1888 het 1888 ref 28 16 9 3 T 11 13 239282 CASAVA_Build 11 5614961 2D CCTGGGCGAC AG/-- AGCGAGACTC 1742 het 540 hom 7 2 4 1 AG 2 1 239283 CASAVA_Build 11 5616308 1D CATGAAAGAG T/- TAAAGCCAAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 6 T 2 1 239284 CASAVA_Build 11 5618747 3I ATACAGTTGC ---/TCA TCATTTTATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TCA 1 2 239285 CASAVA_Build 11 5620497 1D CTGGTTTATC T/- TTTTAATTCA 3070 hom 140 het 54 0 46 9 T 5 4 239286 CASAVA_Build 11 5631967 1D TTTCATAGAT A/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 1 0 239287 CASAVA_Build 11 5640259 2I TACTTTAATG --/AA AAGAGTCAGG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 2 4 239288 CASAVA_Build 11 5648151 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTC 2568 hom 11 het 8 0 7 1 T 9 10 239289 CASAVA_Build 11 5649111 1I CAGGGGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 11 239290 CASAVA_Build 11 5649632 1I GGAAAAATTG -/T TTACATTCTA 3070 het 130 hom 33 1 28 4 T 2 3 239291 CASAVA_Build 11 5653469 2D CTTGCATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 503 hom 24 3 11 10 T 15 13 239292 CASAVA_Build 11 5662227 1I ACTCCATTTA -/C CAGTGACAAT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 C 1 2 239293 CASAVA_Build 11 5666367 2I TTTTTTTTGG --/GT GTGTGTGTGT 3021 het 2294 hom 43 12 15 16 GT 6 7 239294 CASAVA_Build 11 5701869 3D TTCATAACTT GAA/--- GAAGGTCAGG 3070 hom 117 het 45 0 40 7 GAA 2 1 239295 CASAVA_Build 11 5703377 1I TTTCCTTGAG -/T CTTTTTTTGC 3070 hom 178 het 65 0 60 5 T 0 1 239296 CASAVA_Build 11 5704343 1D TTGACCCTTC T/- TGTCTTCTTC 3070 hom 169 het 67 0 54 13 T 2 1 239297 CASAVA_Build 11 5704852 4I CACGTACTGT ----/GAGC ACATGGCTGT 3070 hom 179 het 66 0 56 10 GAGC 0 1 239298 CASAVA_Build 11 5706477 4I AGTCCTGAGG ----/TAGA TAGAAAGCCA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 TAGA 1 2 239299 CASAVA_Build 11 5707996 2D GCAGTAACCA TT/-- TTTTTTTTTT 1690 het 483 hom 32 7 7 18 T 20 18 239300 CASAVA_Build 11 5716281 1I TTGTTTTCTT -/A AAACAACCTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 3 4 239301 CASAVA_Build 11 5716573 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 10 9 239302 CASAVA_Build 11 5716957 2D ATAAGACTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 12 10 239303 CASAVA_Build 11 5720969 5I GTGCAATGTT -----/AAAGA AATCAATTCA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 AAAGA 0 1 239304 CASAVA_Build 11 5722869 4I AGTAAAAGCC ----/ATAT ATATACATCA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 2 4 239305 CASAVA_Build 11 5726947 1D GGATTGTGAA T/- TTTTTTTGAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 8 7 239306 CASAVA_Build 11 5728492 2D GAAAAATATA AT/-- AGTGACTACA 3020 het 3020 ref 18 10 7 1 AT 1 0 239307 CASAVA_Build 11 5737016 4D GTAAAACTGG AAAT/---- AAATAAATAT 2125 hom 15 het 10 0 6 4 AAAT 3 2 239308 CASAVA_Build 11 5741123 4D ATATTTATTT ATTA/---- ATTTATTTTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 ATTA 1 0 239309 CASAVA_Build 11 5762415 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCA 1764 hom 18 het 8 0 6 2 A 4 5 239310 CASAVA_Build 11 5762817 2D AGAAAACATC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 18 het 10 0 7 3 AT 7 6 239311 CASAVA_Build 11 5763983 1I GTTGGTAATC -/T TATTAAAGTT 2717 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 2 239312 CASAVA_Build 11 5765197 4D GTTGCTACTG GATA/---- GATATACAGC 3070 hom 69 het 24 0 24 1 GATA 2 1 239313 CASAVA_Build 11 5766680 2D TGAGCAGGAA AT/-- AAAAAAAAGA 3070 het 206 hom 37 2 15 20 AT 1 0 239314 CASAVA_Build 11 5770451 1D TTTTATAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 10 9 239315 CASAVA_Build 11 5770871 1I TTAAATGTGT -/G GGTTTGCTTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 2 3 239316 CASAVA_Build 11 5771736 4D GATTAAACTT AGTA/---- AGAAAGGCAT 2784 het 2784 ref 25 16 7 3 AGTA 1 0 239317 CASAVA_Build 11 5774082 1D AACAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 A 11 10 239318 CASAVA_Build 11 5777050 4D TAAAAAGAAT GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 hom 63 het 26 0 22 7 GAAA 4 3 239319 CASAVA_Build 11 5777334 5I AAGCACACTT -----/ATATA AAAGAGTGAT 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 ATATA 0 1 239320 CASAVA_Build 11 5788330 3I TGTTATAAGT ---/ATA ATGAGATGTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 ATA 0 1 239321 CASAVA_Build 11 5789091 3D TGAAACTCTG AAT/--- AATACTGTTA 3070 het 3070 ref 39 26 11 2 AAT 2 1 239322 CASAVA_Build 11 5789972 5D CAAACCTGCA CATTC/----- TGCACACGTA 3070 het 3070 ref 25 15 10 1 CATTC 1 0 239323 CASAVA_Build 11 5792161 4I ATACGTTAAC ----/AACA AACAATCTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AACA 1 2 239324 CASAVA_Build 11 5793685 4D GTAGTATGTA TGTG/---- TATGTGTGTA 3070 het 3070 hom 40 12 24 5 TG 2 0 239325 CASAVA_Build 11 5796439 1I ACTGAAACAG -/T TTTTAAAAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 4 5 239326 CASAVA_Build 11 5797018 1I TATTCCGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 A 10 11 239327 CASAVA_Build 11 5801835 6D TAATAGCAAC AACAAT/------ AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 10 AACAAT 1 0 239328 CASAVA_Build 11 5806302 1I TGTACCAGAG -/C TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 C 0 1 239329 CASAVA_Build 11 5810965 7D AGCCTCCTGA GTAGCTG/------- GTAGCTGGGA 3070 het 3070 hom 33 12 18 5 GTAGCTG 2 1 239330 CASAVA_Build 11 5813293 3D45M2D CATAAGCCCA GAGGAGTTTATAAAGTCTTTATCACTGACTTTTGTTCCCCAGATTCTCTT/---GAGTTTATAAAGTCTTTATCACTGACTTTTGTTCCCCAGATTCTC-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 24 12 4 N/A 0 0 239331 CASAVA_Build 11 5817532 4D CACAAACTAT TAAA/---- TAAATATGCT 3070 het 3070 ref 40 20 15 8 TAAA 2 1 239332 CASAVA_Build 11 5825023 1D ATCCATTTTG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 A 8 7 239333 CASAVA_Build 11 5826385 2D CCCAAGGGGA GG/-- GGATGACACA 3070 het 3070 ref 39 18 14 8 G 4 2 239334 CASAVA_Build 11 5827415 2D TGGGAATAAC TG/-- AGCATTCTGT 3070 het 3070 hom 23 7 15 2 TG 1 0 239335 CASAVA_Build 11 5833667 1D TCTCCTGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 10 9 239336 CASAVA_Build 11 5834124 3D TAGAGTAAGC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 38 16 21 3 TAT 4 3 239337 CASAVA_Build 11 5837095 2D AAATTATTTC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 37 0 28 9 AG 10 9 239338 CASAVA_Build 11 5837544 3I GTGGGAAAAA ---/AAG AAGCACAGTG 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 AAG 1 2 239339 CASAVA_Build 11 5838097 3I TAATGTACAC ---/CTG CTGTTTTCTC 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 CTG 1 2 239340 CASAVA_Build 11 5838476 4D TATAATTATT ACTG/---- ACTATCTTCA 2958 het 2958 ref 20 11 7 3 ACTG 1 0 239341 CASAVA_Build 11 5838698 2D ATATATATAT AG/-- AGTCAGAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 AG 2 1 239342 CASAVA_Build 11 5840317 4D CAAGAGCAAT ACTC/---- AATCAGTTGT 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 ACTC 1 0 239343 CASAVA_Build 11 5843267 1D AGAACAGAAT A/- AAAAACACAG 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 A 6 5 239344 CASAVA_Build 11 5843972 1I GAGGCTGCAG -/A AAAAAGGGAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 5 6 239345 CASAVA_Build 11 5846880 1D GAATTTTGTC A/- AAGGCCTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 23 1 A 3 2 239346 CASAVA_Build 11 5852721 3I GGGAGAGAAT ---/TCA TTCAGGTTAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCA 0 1 239347 CASAVA_Build 11 5853612 1D CTTGTGGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 35 1 29 5 T 13 12 239348 CASAVA_Build 11 5858680 16I ACATGGGATT ----------------/GGAACAGACATCCATA GGTGAGGGCA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 GGAACAGACATCCATA 0 1 239349 CASAVA_Build 11 5866815 5I TTAGCTACTC -----/TAGAG TAGTGAGTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TAGAG 0 1 239350 CASAVA_Build 11 5867042 1I TACCTATTTC -/A AAAATAAACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 4 5 239351 CASAVA_Build 11 5867244 6I CCCTGGTAAG ------/GTGATA GTGTCTGTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GTGATA 0 1 239352 CASAVA_Build 11 5869017 2I TTGAAAACTT --/AC AGTTAGCACA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AC 0 1 239353 CASAVA_Build 11 5880323 1I TACCTTCGTG -/A AAAGAGACTT 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 A 3 4 239354 CASAVA_Build 11 5881300 2I AGCTCTAGAG --/TT TTTTTTTTTT 2682 het 2682 ref 30 11 9 10 T 14 16 239355 CASAVA_Build 11 5882631 2D TAGCTCCCAC AT/-- ATGAGTGAGA 3070 het 3070 ref 30 13 11 8 AT 2 1 239356 CASAVA_Build 11 5888203 1D GCAGCCAGGA G/- GTGGCATGTT 3070 het 3070 ref 35 20 15 1 G 2 1 239357 CASAVA_Build 11 5891414 1D TATGAAAGTA C/- AAAACAATGT 3070 het 3070 ref 49 26 17 7 C 1 0 239358 CASAVA_Build 11 5893608 1I GAATAAAAAG -/A AAAGAACAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 3 4 239359 CASAVA_Build 11 5899968 1I GAGAAATTTC -/A AGAAAGCTAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 1 2 239360 CASAVA_Build 11 5902289 2I AAGATAACAC --/AG AGAAGGAATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AG 1 2 239361 CASAVA_Build 11 5909505 1D TCTCTCGCAT C/- CCCCCCAACA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 C 7 6 239362 CASAVA_Build 11 5924867 1I TAGTTTCTCT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 A 8 9 239363 CASAVA_Build 11 5934959 4D TGCATCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 AAAT 5 4 239364 CASAVA_Build 11 5940309 1D TATAATTCAT C/- AGTGAAGCCA 2025 het 1879 hom 11 5 5 1 C 1 0 239365 CASAVA_Build 11 5942717 2I GAGGGGTAAC --/AT GTGTAAGGTA 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 AT 0 1 239366 CASAVA_Build 11 5947739 3I AAAGACAGTG ---/ATT AGACTAGTTG 3070 hom 120 het 44 0 39 5 ATT 0 1 239367 CASAVA_Build 11 5956891 1D GGTGGATTAG C/- TTTTTGATGT 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 C 1 0 239368 CASAVA_Build 11 5956926 1D TTAGCTAGTA T/- TTTTTTTTTT 1549 het 1549 ref 31 14 6 11 T 16 15 239369 CASAVA_Build 11 5958231 1D CTCTTTATCA T/- TATGTAATGC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 2 1 239370 CASAVA_Build 11 5961683 1I AAACACTCTC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 T 7 8 239371 CASAVA_Build 11 5966120 1I TAATGGTTTG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 8 239372 CASAVA_Build 11 5987870 1D GTCATAGGTG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 7 6 239373 CASAVA_Build 11 5989308 2I GCCTCAGTTC --/AA AAAACATGTC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 4 6 239374 CASAVA_Build 11 5994627 1I AGATATCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 12 11 A 10 11 239375 CASAVA_Build 11 5994919 1D GTGCTGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 11 10 239376 CASAVA_Build 11 5996571 1D AAAGATAAAC A/- AAATTGATAA 3070 het 3070 ref 25 12 12 2 A 4 3 239377 CASAVA_Build 11 6005745 1D TATGAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 18 10 A 11 10 239378 CASAVA_Build 11 6006734 2I AATATGGCAT --/AC ACACACAATG 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 AC 3 4 239379 CASAVA_Build 11 6008189 1D GGAAGAAACC A/- TGTGTGGTTT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 1 0 239380 CASAVA_Build 11 6008675 3D TTACATACTC CTT/--- CTTCCAATGC 3070 het 3070 ref 47 22 20 7 CTT 2 1 239381 CASAVA_Build 11 6034971 2I GCTGTGATAT --/AA GTGACACTAG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 0 2 239382 CASAVA_Build 11 6055599 1D CTTAATGTCA C/- CCCCTGATGA 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 C 5 4 239383 CASAVA_Build 11 6118422 1I ATAAGACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2483 hom 25 7 11 7 A 10 11 239384 CASAVA_Build 11 6140001 4I ACTTTTTGCA ----/TGTT TGTTTGTGCA 2751 het 2751 ref 31 21 7 3 TGTT 1 2 239385 CASAVA_Build 11 6142310 1I AATTGATGCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 A 9 10 239386 CASAVA_Build 11 6196316 1D CTTCCTCCCC T/- TCACCCCAGC 3070 het 3070 ref 31 18 9 5 T 2 1 239387 CASAVA_Build 11 6205521 3D GAATTATCCA AGG/--- AGAACAGCAG 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 AGG 1 0 239388 CASAVA_Build 11 6206638 1I GATGCACTGG -/A ACAAGTACTT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 1 2 239389 CASAVA_Build 11 6213887 1D TATTATTTTT G/- CAACTTTTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 1 0 239390 CASAVA_Build 11 6215361 1D AGAATCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 30 2 23 6 A 12 11 239391 CASAVA_Build 11 6243311 1I AGACATCCAG -/A GGCAGATGTA 3070 het 3070 hom 55 20 27 8 A 0 1 239392 CASAVA_Build 11 6245163 2D TTAACTTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 10 6 A 12 10 239393 CASAVA_Build 11 6246947 5D AGTAGAGAGT AAGTG/----- AAGTATTTTT 1950 het 23 hom 31 1 12 19 AAGTG 1 0 239394 CASAVA_Build 11 6252422 1D AGAAATTAAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 2432 hom 31 6 22 3 A 8 7 239395 CASAVA_Build 11 6260046 7D TTGTTTTGGG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 992 hom 24 7 12 6 T 36 29 239396 CASAVA_Build 11 6261254 1I CTGACAGAAA -/G TGGCAAACTG 3070 hom 108 het 42 0 33 9 G 0 1 239397 CASAVA_Build 11 6264675 1D GCTTAAAACG T/- TTTTTGCTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 5 239398 CASAVA_Build 11 6270210 2D TCCATGTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2867 het 882 hom 17 3 10 5 A 14 12 239399 CASAVA_Build 11 6277035 7D AGATGAAATC TTATGGA/------- GAAATTTCCT 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 TTATGGA 1 0 239400 CASAVA_Build 11 6277457 1I AAAACAACAA -/C CAACAACAAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 C 1 2 239401 CASAVA_Build 11 6283080 4D ACATCCCCGA TGTC/---- TGTCTACTAG 3070 het 3070 hom 56 23 30 7 TGTC 2 1 239402 CASAVA_Build 11 6287986 2I CATATATATG --/TA TATATATATA 2286 het 2286 ref 23 11 8 4 TA 5 6 239403 CASAVA_Build 11 6295598 2D CCCTACTGCA AG/-- AGAGTCACAA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 AG 3 2 239404 CASAVA_Build 11 6296509 4D21M6I CTAAAAAAAA AAACACACACACACACTCACACAAA------/----ACACACACACACTCACACAAAAACAAC AACAACAACA 3070 het 1804 hom 52 9 28 25 N/A 0 0 239405 CASAVA_Build 11 6299066 3I CACCTTCACC ---/TCT TCTTTTAAAA 3070 hom 122 het 45 0 39 6 TCT 1 2 239406 CASAVA_Build 11 6299486 1I TCGGGAGGGC -/T TGAGGCAGAA 3070 hom 78 het 32 0 27 8 T 1 2 239407 CASAVA_Build 11 6302682 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 32 2 16 14 A 15 14 239408 CASAVA_Build 11 6339684 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 6 7 239409 CASAVA_Build 11 6347290 1I TGAAGACAGC -/T TTAAAGACTG 3070 hom 56 het 21 0 19 2 T 2 3 239410 CASAVA_Build 11 6359522 1D GTTGCAGTGA G/- CCGAGATCGC 2457 hom 18 het 9 0 6 3 G 1 0 239411 CASAVA_Build 11 6367216 5D TACCCACTTC CCAGA/----- CGAGTTCAGA 3070 het 3070 ref 37 17 13 12 CCAGA 1 0 239412 CASAVA_Build 11 6384200 1D GGCTACTAGC T/- TTTTTTTTTT 1870 het 1870 ref 46 32 4 10 T 12 11 239413 CASAVA_Build 11 6459716 3D AGACTGCTTC CCT/--- CCTCACCCCA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 CCT 2 1 239414 CASAVA_Build 11 6470283 1D CAGCATCTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 9 8 239415 CASAVA_Build 11 6473646 4I GGTAGCAGGC ----/AACT AGTTATCAGC 3070 het 3070 hom 44 19 17 8 AACT 0 1 239416 CASAVA_Build 11 6483897 1D ATCTGCCAAA G/- AAGGAAACCC 3070 het 3070 ref 56 33 19 4 G 1 0 239417 CASAVA_Build 11 6498714 4I TCATTCAACT ----/TCTA TCTATCTGTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TCTA 1 2 239418 CASAVA_Build 11 6503835 3D TTTGTTCTCT TCC/--- CTTGCTTTGT 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 TCC 1 0 239419 CASAVA_Build 11 6504414 1I TTTCTGTATT -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 8 239420 CASAVA_Build 11 6507109 1D TGCTCACTGC A/- AAGGCCGGCC 3070 het 3070 hom 43 16 19 9 A 3 2 239421 CASAVA_Build 11 6508642 1D TTACTTCACT G/- CTGCTGAGAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 G 1 0 239422 CASAVA_Build 11 6508761 2I TAGAACCCTG --/TC TCTGTTTTTC 3070 hom 140 het 58 0 47 11 TC 1 2 239423 CASAVA_Build 11 6521325 1I CCATGGAGTT -/A ACGTGGATAC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 1 2 239424 CASAVA_Build 11 6524472 12I TTGAGGAGGC ------------/TGCCCTACTGCA TGCCCTACTG 3070 hom 97 het 40 0 30 10 TGCCCTACTGCA 0 1 239425 CASAVA_Build 11 6531769 1I TCTTAACAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 9 10 239426 CASAVA_Build 11 6556937 1D TCGAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2082 hom 26 5 18 3 T 11 10 239427 CASAVA_Build 11 6557103 10I GCCCAGCTAA ----------/TTTTTGTATT TTTTTGTATT 3070 het 445 hom 11 1 10 0 TTTTTGTATT 1 2 239428 CASAVA_Build 11 6561371 1D CAGACTATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 A 12 11 239429 CASAVA_Build 11 6564806 1I ACAGGTTCCT -/G GGCATAAGGG 3070 hom 41 het 16 0 12 4 G 2 3 239430 CASAVA_Build 11 6568096 5D GAACCATCCC TAGAA/----- TAAACACCAC 3070 het 3070 hom 33 13 20 2 TAGAA 1 0 239431 CASAVA_Build 11 6583320 1D TACAGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 35 1 25 10 T 12 11 239432 CASAVA_Build 11 6583332 1D TTTTTTTTTT A/- AGTTAAGGGG 3070 het 88 hom 34 2 24 8 A 2 1 239433 CASAVA_Build 11 6583456 1I TTCCTGATCC -/T CTCCCTCTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 239434 CASAVA_Build 11 6583608 3D TTAAGGCACT ATG/--- ATGAACACCT 3070 hom 93 het 34 0 32 4 ATG 2 1 239435 CASAVA_Build 11 6586605 1D AGGTCCATCT C/- CCCCATCCCC 3070 hom 135 het 48 0 43 6 C 5 4 239436 CASAVA_Build 11 6603576 1I ATGGCAATAA -/G GGGGGAACTC 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 G 5 6 239437 CASAVA_Build 11 6605834 5D TGTGTGCTTA TGTAT/----- TCCTGTGTGT 3070 hom 114 het 42 0 39 6 TGTAT 1 0 239438 CASAVA_Build 11 6611034 13D ACTGAGGTGA CATTCCTATGCCT/------------- CATGAAGCAG 3070 hom 107 het 38 0 36 4 CATTCCTATGCCT 1 0 239439 CASAVA_Build 11 6612586 1I TAAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1278 hom 42 4 30 8 A 10 11 239440 CASAVA_Build 11 6642648 1D TCTGGGGGGG C/- GTGGAATTCT 3070 hom 77 het 30 0 25 5 C 1 0 239441 CASAVA_Build 11 6644573 6D CCTCCTTCTT CTCCTC/------ CTCCTCTTCT 3070 het 2499 hom 26 8 12 6 CTC 4 2 239442 CASAVA_Build 11 6645999 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 21 8 T 12 11 239443 CASAVA_Build 11 6647487 4I AGAGGGAAAT ----/CATC CATCCAGTCT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 CATC 1 2 239444 CASAVA_Build 11 6652017 1D CTTCTGGGAT A/- AAAGGAGAAG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 A 4 3 239445 CASAVA_Build 11 6671544 1D TGAGACAGTG A/- AAAGAGATCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 A 4 3 239446 CASAVA_Build 11 6673243 1I GTCCAGGGTG -/A ATGGAGGGGC 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 A 1 2 239447 CASAVA_Build 11 6673501 1D AGCACTGTGC T/- TTTCTAAGTT 3070 het 3070 hom 28 9 16 4 T 4 3 239448 CASAVA_Build 11 6675859 1I ATAACACTGT -/G GGGCTGGCCA 3070 hom 99 het 35 0 32 3 G 3 4 239449 CASAVA_Build 11 6677362 2D CTCAACATCC AT/-- ATGTTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 13 17 9 AT 2 1 239450 CASAVA_Build 11 6678844 6D TCTAAGCAGC CCAGTA/------ CCTTTACTTT 3070 het 3070 ref 29 18 11 1 CCAGTA 1 0 239451 CASAVA_Build 11 6678937 1D51M1I GGAACTAATT AAAAAAAAACTTGCCCTGTTCTTGTCTTTAGAAGATGTATTTTAATAAAAAA-/-AAAAAAAACTTGCCCTGTTCTTGTCTTTAGAAGATGTATTTTAATAAAAAAT GTACTCTTTC 3070 hom 114 het 33 0 37 5 N/A 0 0 239452 CASAVA_Build 11 6679648 2D AACAGCACAC AT/-- GTTTGTTGGC 2402 het 2402 ref 30 21 5 5 AT 1 0 239453 CASAVA_Build 11 6680193 1D CTCCATATGG C/- AAAAAGGACT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 C 1 0 239454 CASAVA_Build 11 6706883 3D AGATACAGGG AGA/--- AGATTTCCTC 3070 hom 86 het 30 0 28 4 AGA 2 1 239455 CASAVA_Build 11 6715718 4I AAAGTTAGGA ----/AAAG AAAGAAGGGC 3070 hom 75 het 31 0 24 7 AAAG 1 2 239456 CASAVA_Build 11 6716774 4D ACCACTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 717 het 365 hom 33 3 8 22 TTTG 1 0 239457 CASAVA_Build 11 6733670 4D ATCTTTGTTG TTGT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 138 het 48 0 47 2 TTGT 1 0 239458 CASAVA_Build 11 6753247 1I TTTCCTCATT -/C CTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 17 0 13 4 C 1 2 239459 CASAVA_Build 11 6760510 1D AAACATAGAG C/- CTAGGAGCTT 3070 hom 114 het 44 0 38 7 C 2 1 239460 CASAVA_Build 11 6767462 4D CCATCTCAGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 AAAC 5 4 239461 CASAVA_Build 11 6773718 1I AAAATAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 532 hom 36 3 26 7 T 13 14 239462 CASAVA_Build 11 6779886 3I CCCGCCAGAG ---/AAC AACCCCCCTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AAC 1 2 239463 CASAVA_Build 11 6790526 3D GGTGGGACCT CAC/--- CACCTCCTTA 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 CAC 2 1 239464 CASAVA_Build 11 6794614 1I TGATATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 29 9 A 12 13 239465 CASAVA_Build 11 6796396 3D GGCTGCATAG ACA/--- TCAGTATGAC 3070 hom 73 het 28 0 22 6 ACA 1 0 239466 CASAVA_Build 11 6799222 5I TACCATAGCC -----/TGGGT CTGTAGTAGG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 TGGGT 0 1 239467 CASAVA_Build 11 6801532 1I GGGTAGAAAG -/A GAAAAAAATA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 0 1 239468 CASAVA_Build 11 6818778 2I TTTCACAGTC --/TT TTAATTTCCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 4 239469 CASAVA_Build 11 6828329 1D TGGTGCATTC T/- GAAAGTACAA 3070 hom 103 het 49 0 43 6 T 1 0 239470 CASAVA_Build 11 6830045 18D GGCTGGGCGC AGTGGCTCACACCTGTAA/------------------ TCCCAGCACT 2092 hom 18 het 8 0 7 2 AGTGGCTCACACCTGTAA 1 0 239471 CASAVA_Build 11 6830493 1I ATATATTGCA -/T GTGGTAATTG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 0 1 239472 CASAVA_Build 11 6832644 3D GTAAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 5 A 15 12 239473 CASAVA_Build 11 6832991 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 10 11 239474 CASAVA_Build 11 6834829 2I CTAAACACAC --/AT GTGGCAATCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AT 0 1 239475 CASAVA_Build 11 6838702 2D AATGAAATCA AG/-- ATTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AG 1 0 239476 CASAVA_Build 11 6839378 1D ATGCAGTCAT A/- AAAAAAGAAC 3070 hom 10 het 28 1 26 1 A 7 6 239477 CASAVA_Build 11 6843523 1I TAGCAGATTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 8 239478 CASAVA_Build 11 6850794 1I GCCCAACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 10 11 239479 CASAVA_Build 11 6852321 1D CCTCACCTGT G/- GGCTCAGATT 3070 hom 87 het 37 0 26 13 G 3 2 239480 CASAVA_Build 11 6857876 2I GTAGCCTCTC --/TT TATGATTTTA 3070 hom 147 het 57 0 48 9 T 1 3 239481 CASAVA_Build 11 6863294 40I TGAAAGAAAA ----------------------------------------/TACTGGCTGTATAAATTTTTGTATTGAACAAAACTGTCAT TCAAAACTAC 3070 hom 96 het 30 0 33 1 TACTGGCTGTATAAATTTTTGTATTGAACAAAACTGTCAT 0 1 239482 CASAVA_Build 11 6867151 1I ACTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 26 0 15 11 A 11 12 239483 CASAVA_Build 11 6874006 29D TAATTCAAAT TAATACACACACACAACACACAAACACAA/----------------------------- ATGCATATGT 3070 hom 108 het 34 0 37 7 TAATACACACACACAACACACAAACACAA 1 0 239484 CASAVA_Build 11 6875228 1I TAGAGTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 15 6 T 15 16 239485 CASAVA_Build 11 6879821 1D TAAATTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 30 1 19 10 A 13 12 239486 CASAVA_Build 11 6883078 3D GGGCAGACTG CCT/--- CCTCAAGTGG 3070 hom 45 het 20 0 15 5 CCT 2 1 239487 CASAVA_Build 11 6904204 19D GCGGCGTGGG CGGGGCCTGCAGAAAGGGA/------------------- CGGGGCCTGC 3070 hom 53 het 24 0 14 15 CGGGGCCTGCAGAAAGGGA 2 1 239488 CASAVA_Build 11 6932007 3D GGACCCACTT GAG/--- GAGGCAGTCT 3070 het 426 hom 9 1 8 0 GAG 2 1 239489 CASAVA_Build 11 6943286 3I GTTTCTAGAA ---/CTG CTATTTATAG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 CTG 0 1 239490 CASAVA_Build 11 6944307 1D AGTTGGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 A 10 9 239491 CASAVA_Build 11 6947394 1D GAAAATAGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 10 9 239492 CASAVA_Build 11 6950216 2D CCTAGGAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 2137 het 103 hom 21 2 5 15 T 14 12 239493 CASAVA_Build 11 6950719 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 8 9 239494 CASAVA_Build 11 6962666 1D AAAAATAGTT A/- AAAAGAGAAC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 5 4 239495 CASAVA_Build 11 6971997 6D TTTTATATAT ATTTTA/------ TATATTATAT 1153 het 842 hom 16 5 6 7 ATTTTA 1 0 239496 CASAVA_Build 11 6977376 1I AAATGCACAG -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 7 8 239497 CASAVA_Build 11 6982203 7D ATAGTGTACA ACTTCCC/------- ACTTCAGTAC 3070 hom 81 het 34 0 28 9 ACTTCCC 1 0 239498 CASAVA_Build 11 6985130 3I AAAATAATAA ---/AAT AATAATTATA 1929 hom 12 het 10 0 5 5 AAT 2 3 239499 CASAVA_Build 11 6985673 5D ATTAGTCCAT AAAAG/----- AAATCATGAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AAAAG 1 0 239500 CASAVA_Build 11 6985852 4D ATAACAATTC TTAA/---- TTGTTTTTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 3 TTAA 1 0 239501 CASAVA_Build 11 6986342 1D AAAAGACAAG A/- ATGCCCACTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 2 1 239502 CASAVA_Build 11 6987054 1D CAATGGAACA G/- AATATAGAGC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 1 0 239503 CASAVA_Build 11 6988445 1D ATCCCCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 25 2 18 5 A 15 14 239504 CASAVA_Build 11 6988770 1D ATAAAAAAAA T/- AAAATGGCAA 3070 hom 87 het 31 0 29 3 T 1 0 239505 CASAVA_Build 11 6990806 3D GGCTTGACTG AGA/--- AGAAGGATTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AGA 2 1 239506 CASAVA_Build 11 6993837 1I GACATCTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 10 25 5 A 12 13 239507 CASAVA_Build 11 6995546 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 29 1 19 9 A 13 14 239508 CASAVA_Build 11 7002589 4I AAAGTATGTA ----/TTTT TTTCTAATTA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 3 7 239509 CASAVA_Build 11 7003624 3D TGGAGCTAAA TAC/--- ATGCATAAAT 3070 hom 111 het 38 0 38 5 TAC 1 0 239510 CASAVA_Build 11 7016813 1D TGGTGGTCTT G/- TGCATGGGGA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 G 1 0 239511 CASAVA_Build 11 7017165 2D GCTTTAGAGT TA/-- TATATATATA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 TA 6 5 239512 CASAVA_Build 11 7025125 1D TACCCCTTTC G/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 26 1 23 2 G 1 0 239513 CASAVA_Build 11 7028272 1I AAGAAAGATC -/T TTATTTTTCA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 2 3 239514 CASAVA_Build 11 7031542 3D CATGCAATGC ATA/--- ATAATCACAT 3070 het 3070 ref 33 19 13 2 ATA 2 1 239515 CASAVA_Build 11 7047440 4D CTTATTTTAT TTTA/---- TTTTTTTTGA 303 het 287 hom 50 3 3 44 TTTA 1 0 239516 CASAVA_Build 11 7064844 5D GGTAGACCTC AGATA/----- AGAGGGAACT 3070 hom 111 het 41 0 36 6 AGATA 1 0 239517 CASAVA_Build 11 7066497 3I ATAATTTTAG ---/TAA TAATTTAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TAA 1 2 239518 CASAVA_Build 11 7070484 1D CAAGCCATAA T/- ATTGGAAGAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 1 0 239519 CASAVA_Build 11 7072044 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCCATAGG 3070 hom 95 het 34 0 31 3 C 5 6 239520 CASAVA_Build 11 7079247 1I GAAGGATTAG -/C AACAAAGCTA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 C 0 1 239521 CASAVA_Build 11 7080756 1D TTACTACCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 9 8 239522 CASAVA_Build 11 7081558 1D ATCGTAATGT C/- CCCCCCCAAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 8 7 239523 CASAVA_Build 11 7092162 2D TAAGACCCCC CT/-- CTCTCTAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 CT 4 3 239524 CASAVA_Build 11 7101789 1D TCACTCCTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 267 hom 32 1 29 2 T 10 9 239525 CASAVA_Build 11 7103307 2D ATTTTGAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 32 1 10 21 T 13 11 239526 CASAVA_Build 11 7115713 1D AAAAAACATG A/- AAAAAAAAAA 1225 het 1225 ref 40 25 3 12 A 13 12 239527 CASAVA_Build 11 7117912 1I TCTACAATCA -/C CCTTTTTCAT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 C 2 3 239528 CASAVA_Build 11 7160772 3I AGGAAACTAA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 AAT 5 6 239529 CASAVA_Build 11 7161142 3I ATTCAAAGGG ---/ATA ATAATAGAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATA 2 3 239530 CASAVA_Build 11 7162730 6I GAATGTGACC ------/AATAAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 AAT 4 6 239531 CASAVA_Build 11 7163294 1I ATGATAATTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 9 10 239532 CASAVA_Build 11 7170043 1D AATCAAACTG A/- ACATATCCAT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 2 1 239533 CASAVA_Build 11 7170430 1I GTACTCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 194 hom 30 1 20 9 T 11 12 239534 CASAVA_Build 11 7170602 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTC 1943 het 1943 ref 18 10 5 3 T 10 9 239535 CASAVA_Build 11 7174928 2D GATTAAAAAC AA/-- TATAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 2 A 2 0 239536 CASAVA_Build 11 7190049 3D CACCTGGGAG AAA/--- AAGAGTGCTG 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 A 5 2 239537 CASAVA_Build 11 7191124 3I AAAATCAAAG ---/AGA AGAATTATAT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 AGA 1 2 239538 CASAVA_Build 11 7199460 1D GCTTTATGGG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 9 8 239539 CASAVA_Build 11 7221751 1D GCAGAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 T 13 12 239540 CASAVA_Build 11 7228259 2D CCCCCCGCCA CC/-- CCCCCCCAGC 2769 het 2769 ref 29 15 10 4 C 9 7 239541 CASAVA_Build 11 7229116 2I AGAAAACTAA --/CC GGGACCCACG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 C 0 2 239542 CASAVA_Build 11 7231386 1D TACCAGAGGC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 T 8 7 239543 CASAVA_Build 11 7251137 1D AGGTTTTTTT C/- TTTTGTTAGT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 C 1 0 239544 CASAVA_Build 11 7254871 4D AAAAAACAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 21 9 12 0 AAAC 6 5 239545 CASAVA_Build 11 7258586 2I ATGTAAGTAA --/GG GATACTATAG 3070 het 3070 hom 36 17 19 0 G 1 3 239546 CASAVA_Build 11 7269499 1I TGCTCTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 16 13 14 A 13 14 239547 CASAVA_Build 11 7276465 2I ACAGGTCCAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 T 9 11 239548 CASAVA_Build 11 7293872 1D TTGGGGTTGT G/- GGGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 G 4 3 239549 CASAVA_Build 11 7297197 22D TGATTTTGCC ATTATAAAACTATCATTTCATT/---------------------- GTCTTCTGAC 3070 het 3070 ref 29 20 15 2 ATTATAAAACTATCATTTCATT 1 0 239550 CASAVA_Build 11 7299130 1D CCCAAAGGCC T/- GAGGCCACTC 3070 hom 120 het 41 0 40 1 T 1 0 239551 CASAVA_Build 11 7301695 1D CAAACTGTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 T 9 8 239552 CASAVA_Build 11 7303049 1I TCCTACCCAT -/G GAGCATGGAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 2 239553 CASAVA_Build 11 7305905 1D TAATAATAAT A/- ATTTTAAAAA 915 hom 10 het 4 0 4 0 A 2 1 239554 CASAVA_Build 11 7312046 5D CAAGAATAAT TAAGA/----- TTTTTAAGAC 3070 het 3070 ref 43 23 19 4 TAAGA 1 0 239555 CASAVA_Build 11 7331499 12D AGTTCGATCC TCTGTTATAGTA/------------ TTTATTTATA 3070 het 3070 hom 33 14 19 3 TCTGTTATAGTA 1 0 239556 CASAVA_Build 11 7335708 2D ATCTATAGAC AT/-- AATTTATTTC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 AT 1 0 239557 CASAVA_Build 11 7339950 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTA 2574 het 392 hom 12 4 7 1 T 10 9 239558 CASAVA_Build 11 7340832 23D CTTGGGACAG CTCCATTATACCTTTCTTTTGCT/----------------------- CTTCTCAAAC 3070 het 3070 ref 39 30 13 3 CTCCATTATACCTTTCTTTTGCT 1 0 239559 CASAVA_Build 11 7345583 7D AATTTCTGCA TTTGGAT/------- TTAGGCTTAG 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 TTTGGAT 1 0 239560 CASAVA_Build 11 7349113 7D ACATCTTTAC AACATGA/------- AATGTTTCCT 3070 het 3070 hom 21 10 10 2 AACATGA 1 0 239561 CASAVA_Build 11 7361473 1I CATAAAGACA -/T TTTTCTCATT 3070 het 3070 hom 55 23 29 3 T 4 5 239562 CASAVA_Build 11 7370390 1I ATTCAGGCTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 T 8 9 239563 CASAVA_Build 11 7371102 1D TTTGTTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1212 hom 30 4 19 8 T 15 14 239564 CASAVA_Build 11 7371768 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 17 1 11 5 T 13 12 239565 CASAVA_Build 11 7376220 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 27 0 14 13 T 15 14 239566 CASAVA_Build 11 7376766 1D TAGACACACC A/- AACAGCAGGT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 3 2 239567 CASAVA_Build 11 7381572 1D TGGTGCACCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 10 9 239568 CASAVA_Build 11 7391569 1I TGTTTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 8 9 T 12 13 239569 CASAVA_Build 11 7392920 1D GGAAATGGGG A/- GTCTTTAGAG 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 A 1 0 239570 CASAVA_Build 11 7394974 2D CCAGTGTTTT TG/-- TTTTTTTAAG 3070 hom 30 het 34 0 25 9 TG 1 0 239571 CASAVA_Build 11 7420661 1I ACATCCATTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 9 10 239572 CASAVA_Build 11 7424614 1D TCCTGCCCTG C/- CCTTTCTGTC 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 C 3 2 239573 CASAVA_Build 11 7433013 1I TTTCACTGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 23 8 10 5 A 9 10 239574 CASAVA_Build 11 7434733 1I CTTATTTGTT -/C TTCAATCCAA 3070 het 3070 hom 53 17 32 4 C 0 1 239575 CASAVA_Build 11 7439909 1I TAGTGGAGTT -/A ACCATTCAAA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 A 1 2 239576 CASAVA_Build 11 7440189 1D GACCCTTTCA T/- TTTTCCATGC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 5 4 239577 CASAVA_Build 11 7441264 1I TTGGTTGAGA -/T TTTTCTAGTC 3070 het 3070 hom 48 17 28 3 T 4 5 239578 CASAVA_Build 11 7443677 1D GATAAACCCA T/- CAGATCTCGT 3070 het 1155 hom 18 5 8 5 T 1 0 239579 CASAVA_Build 11 7446785 3D TGCAACTCTG CCT/--- CTGTTCTCTT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 CCT 1 0 239580 CASAVA_Build 11 7450673 1D ATTCCAATAA T/- TTATTCATTG 3070 het 3070 hom 31 8 21 3 T 3 2 239581 CASAVA_Build 11 7454834 3I AAGGAGGGAA ---/GAG GAGGAGGAGG 3070 het 2461 hom 35 9 12 14 GAG 5 6 239582 CASAVA_Build 11 7459167 1D AAGCTATTTC T/- TTTTCCCTAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 5 4 239583 CASAVA_Build 11 7459383 1D AGACTACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 36 1 21 14 T 15 14 239584 CASAVA_Build 11 7460748 1D AGGCAAAGAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 A 9 8 239585 CASAVA_Build 11 7461765 12D GCCAGTCCTG AGCCAACCTCTT/------------ TGGAGCCCAC 3070 het 3070 ref 34 15 17 7 AGCCAACCTCTT 1 0 239586 CASAVA_Build 11 7469519 2I ATCTTAAAAC --/AA TACACATTTA 3070 het 3070 hom 51 18 29 4 A 0 2 239587 CASAVA_Build 11 7480264 1I TAAGTAAGAA -/T AAAATCAGGG 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 0 1 239588 CASAVA_Build 11 7483646 1I TCACCTGTCT -/C TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 C 0 1 239589 CASAVA_Build 11 7485136 1D TAAGTGTCCA T/- CATACACAGG 3070 het 3070 ref 44 28 14 3 T 1 0 239590 CASAVA_Build 11 7485360 1D TATGTGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1579 hom 30 6 13 11 T 15 14 239591 CASAVA_Build 11 7495389 3D GACCAGGTTT GGG/--- GTGAAAAAGT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 G 4 1 239592 CASAVA_Build 11 7501937 2I GTGTCTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 GT 6 7 239593 CASAVA_Build 11 7508102 7I CATATTACCC -------/AAGGCAA AAGGCAAAAA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 AAGGCAA 1 2 239594 CASAVA_Build 11 7508632 1D GCTTGAGGCT G/- GGGGTATGGG 3070 het 3070 hom 33 17 12 6 G 5 4 239595 CASAVA_Build 11 7517830 1I AGAGCTTGTC -/A GGGGCACAGC 3070 het 334 hom 45 1 40 4 A 0 1 239596 CASAVA_Build 11 7547963 1I TGGCTTGGCT -/G GGTGGTTAGT 3070 hom 132 het 52 0 41 11 G 2 3 239597 CASAVA_Build 11 7567787 1D TGATAACCAC A/- AAGCTTATTA 3070 het 3070 ref 51 26 23 2 A 3 2 239598 CASAVA_Build 11 7568917 1D TTTCTTACTC T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 T 8 7 239599 CASAVA_Build 11 7572084 4I AGTGTTGTTG ----/TTGT GTTTTTTTTC 3070 het 2501 hom 24 7 17 0 TTGT 0 1 239600 CASAVA_Build 11 7573699 1I ATTTTTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 747 hom 35 5 18 12 T 15 16 239601 CASAVA_Build 11 7585156 3D CTGGAACTAC TTG/--- AGGCCCATGC 1171 het 1171 ref 16 7 4 5 TTG 1 0 239602 CASAVA_Build 11 7586452 4D TGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 AAAC 5 4 239603 CASAVA_Build 11 7589133 5D TGTGAGCACC TGGTA/----- TGTCTTCATC 3070 het 3070 hom 44 17 21 8 TGGTA 1 0 239604 CASAVA_Build 11 7595725 1I CTCTCCACAC -/G GGGGGTAACC 3070 het 3070 ref 26 17 9 0 G 5 6 239605 CASAVA_Build 11 7596693 1D CATCCAGAAG T/- TTTTTTTTTT 954 het 605 hom 30 6 3 21 T 19 18 239606 CASAVA_Build 11 7601021 2D TGCTTCAGGC CT/-- CTCAGTCTCT 3070 het 3070 ref 53 29 16 9 CT 2 1 239607 CASAVA_Build 11 7617832 2D GGTCCCACCT CC/-- CCAGAGGCTC 3070 hom 99 het 37 0 31 6 C 4 2 239608 CASAVA_Build 11 7643179 4I CACGTGGAGG ----/TGTT TGTTAGTAGG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 TGTT 1 2 239609 CASAVA_Build 11 7644025 2I TCAGTGCAGC --/GT GTGAGGTGCT 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 GT 1 2 239610 CASAVA_Build 11 7645141 1I ATGCTGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1403 hom 30 4 22 4 A 11 12 239611 CASAVA_Build 11 7648746 2I GAAATTAGTC --/AA GAGACAAGGA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 0 2 239612 CASAVA_Build 11 7668321 3D AATGATTGGC CAT/--- CAGGATTCAG 3070 hom 150 het 54 0 50 6 CAT 1 0 239613 CASAVA_Build 11 7675144 4D CCTTAACTCT TCTC/---- TCTCTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 8 15 3 TC 4 2 239614 CASAVA_Build 11 7677030 2I TCTGTGGAAA --/GG GAAGGGAAGG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 G 1 3 239615 CASAVA_Build 11 7678063 1I GTTTGCTGGA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 T 7 8 239616 CASAVA_Build 11 7679748 1D TGCACAATCG A/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 A 1 0 239617 CASAVA_Build 11 7691428 6I TGCTAAAAAA ------/AAAAAT AGTTCCTGGT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 AAAAAT 0 1 239618 CASAVA_Build 11 7707803 4D ACAGCAAGGA AGAG/---- AGAGAGAATG 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 AG 5 3 239619 CASAVA_Build 11 7712529 1D AACAAATTTT A/- AAAGATTGAT 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 A 4 3 239620 CASAVA_Build 11 7718594 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 2279 het 284 hom 10 1 7 2 A 12 11 239621 CASAVA_Build 11 7719214 13I ACCTGGGCTT -------------/CACTGGTGCATTC TACCAAATAT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 CACTGGTGCATTC 0 1 239622 CASAVA_Build 11 7723710 1D AAATGATCCA C/- CCCCCCTCAG 3070 hom 54 het 22 0 17 5 C 7 6 239623 CASAVA_Build 11 7731809 3D AGAAAATGCT TTG/--- TTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 49 22 19 9 TTG 2 1 239624 CASAVA_Build 11 7739171 2D ATATGCACAC AT/-- GTTTTCAAGC 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 AT 1 0 239625 CASAVA_Build 11 7756510 3I TGAAAATTAG ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 51 19 27 5 A 9 12 239626 CASAVA_Build 11 7759140 1D CAGCACAGCA C/- AACTGCTCTA 3070 het 3070 ref 42 26 15 1 C 1 0 239627 CASAVA_Build 11 7760168 1D TCTCCAAGAT A/- AAAATGAAAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 5 4 239628 CASAVA_Build 11 7762602 4D AAAAAGAAAT ACAA/---- ACAGCCATCA 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 ACAA 1 0 239629 CASAVA_Build 11 7764393 1D TTAGGGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 3 T 11 10 239630 CASAVA_Build 11 7765299 2D AAAAATGTGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 TA 7 6 239631 CASAVA_Build 11 7766438 1I ACTCAATAGC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 A 8 9 239632 CASAVA_Build 11 7766594 1I GACACATACA -/C CCCCCCCAAG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 7 8 239633 CASAVA_Build 11 7770148 4I TTTTTGTTTC ----/TTGT TTTATTTTTC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTGT 0 1 239634 CASAVA_Build 11 7770516 1D TGCTCCAACC A/- AGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 9 A 2 1 239635 CASAVA_Build 11 7770579 3I GTTACAGTTA ---/TAT TATTATGTAC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 TAT 2 3 239636 CASAVA_Build 11 7770826 1D GGATTTCCTT G/- GGTTTATCCT 3070 het 3070 hom 42 15 20 8 G 3 2 239637 CASAVA_Build 11 7772744 18I GGCCCCACTG ------------------/AAACCCAGGGAAGGGGGA AAACATAATT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 AAACCCAGGGAAGGGGGA 0 1 239638 CASAVA_Build 11 7772889 1D TTTTGCTTTT G/- TCTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 G 1 0 239639 CASAVA_Build 11 7773489 5D CAAGAAATAA TTAGG/----- TTAATACTTT 3070 het 3070 ref 51 31 16 5 TTAGG 1 0 239640 CASAVA_Build 11 7774960 21I AGATTACCAG ---------------------/ATATGGTTACCAGGTAGATGC ATAGGATGAT 3070 het 3070 hom 42 14 20 9 ATATGGTTACCAGGTAGATGC 0 1 239641 CASAVA_Build 11 7775462 2I TAATGAACAC --/TT AAATATTAGC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 0 2 239642 CASAVA_Build 11 7776066 4D CCTAGTATAA ATTG/---- ATTAATGACT 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 ATTG 1 0 239643 CASAVA_Build 11 7776675 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAG 1146 het 1146 ref 21 13 4 4 A 9 10 239644 CASAVA_Build 11 7780768 1I ATGCAGTTCT -/A AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 A 6 7 239645 CASAVA_Build 11 7780980 1I AGAGAAGCAG -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 7 8 239646 CASAVA_Build 11 7781840 1D GATAAATGTT A/- AAAGAAATTC 3070 het 3070 hom 39 13 21 6 A 4 3 239647 CASAVA_Build 11 7782481 1I ATAGGCCTTA -/T TGTTCAGAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 1 2 239648 CASAVA_Build 11 7786956 1I16M1I CCCAATGACA -TTTTTCACAGAATTAG-/TTTTTTCACAGAATTAGA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 21 15 6 N/A 0 0 239649 CASAVA_Build 11 7794204 1D GCATCAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 10 9 239650 CASAVA_Build 11 7794307 1D GTGCTGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 493 hom 37 2 26 10 A 14 13 239651 CASAVA_Build 11 7804322 1D CAGAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 13 12 239652 CASAVA_Build 11 7807514 1I TTTTATCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 11 12 239653 CASAVA_Build 11 7809267 5I TACAAAAAAA -----/TATAT AAATATAAAT 2459 het 602 hom 11 2 5 4 TATAT 0 1 239654 CASAVA_Build 11 7809294 1D AGTAAAATTA G/- CCAGGTGTCA 2345 het 715 hom 14 3 6 6 G 1 0 239655 CASAVA_Build 11 7809440 1I ACCTCAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 17 1 15 1 A 10 11 239656 CASAVA_Build 11 7810713 3I GTACAGCCTA ---/TTG TTGTTGTTTA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TTG 2 3 239657 CASAVA_Build 11 7811259 3D TGATGCCTGT ATC/--- ATCATTATAT 3070 het 3070 ref 53 26 23 5 ATC 2 1 239658 CASAVA_Build 11 7811502 1I ACATTTTACC -/T GTGGAATGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 0 1 239659 CASAVA_Build 11 7820350 4I ATTCTGTAGG ----/TTGT TTATTTACCT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 TTGT 0 1 239660 CASAVA_Build 11 7823469 1D TATAAAAATC A/- GTAGTTTTGC 3070 het 3070 hom 33 10 20 4 A 1 0 239661 CASAVA_Build 11 7825265 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2060 het 1524 hom 15 5 7 3 T 13 12 239662 CASAVA_Build 11 7825638 1I TTACATAGGT -/A AATGTGTGTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 3 239663 CASAVA_Build 11 7828857 3D TGGGGTTTTT TTG/--- TTTGTTTGCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTG 1 0 239664 CASAVA_Build 11 7831121 3D TAGATTTCAA CTT/--- CTTATTTCTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 CTT 2 1 239665 CASAVA_Build 11 7835069 3I TTTCACTCTC ---/ATT GTAATCAATA 3070 het 3070 ref 36 18 18 0 ATT 0 1 239666 CASAVA_Build 11 7835437 5D AATGCATCAA TTGAT/----- TTATTTATTG 3070 het 3070 ref 38 20 17 3 TTGAT 1 0 239667 CASAVA_Build 11 7835607 4D TTTTTACTGA TTCT/---- TTATTTATAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 TTCT 1 0 239668 CASAVA_Build 11 7857328 2I CTCACTATCC --/CT CGAGGACAGT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 CT 0 1 239669 CASAVA_Build 11 7857667 4I TCAACCTACT ----/GAAA GAGAGTTGAC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 GAAA 0 1 239670 CASAVA_Build 11 7867458 3D CTCATACTTC TTT/--- GAGTTCTTTG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 3 0 239671 CASAVA_Build 11 7886941 1D GCATATTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 A 9 8 239672 CASAVA_Build 11 7888184 4I TATGAAAAGG ----/GTAT GTATATAAGT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 GTAT 1 2 239673 CASAVA_Build 11 7889005 1D CTGAAAAAAA C/- AGCTGAAGAA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 C 1 0 239674 CASAVA_Build 11 7896063 4D GAAGCAAGAC AAAG/---- AAAATAATTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 AAAG 1 0 239675 CASAVA_Build 11 7898019 5D ATATTTAAAG TAAAT/----- TAAAATAAAT 2455 het 2455 ref 24 15 6 5 TAAAT 1 0 239676 CASAVA_Build 11 7903697 1D TTATAAAGAA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 T 8 7 239677 CASAVA_Build 11 7908113 6D ATATATATAT ATATAA/------ AATCCCTCAC 3070 hom 25 het 11 0 9 4 ATATAA 1 0 239678 CASAVA_Build 11 7908188 5D CACACACTGC CTACA/----- CTACAACCCT 3070 hom 45 het 16 0 16 1 CTACA 2 1 239679 CASAVA_Build 11 7921591 1I TGAGTCATGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 56 25 24 7 A 9 10 239680 CASAVA_Build 11 7925127 1I TAAGGGTCAG -/C ACAGGAGTGG 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 C 0 1 239681 CASAVA_Build 11 7925290 4D AATATAAATA TATC/---- TATCACTGCC 3070 het 3070 ref 30 17 12 3 TATC 2 1 239682 CASAVA_Build 11 7929399 2D TCTCAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2149 hom 24 12 9 5 A 12 10 239683 CASAVA_Build 11 7934574 2D AAAATATTGC TG/-- TGAGACATCA 3070 het 3070 hom 35 10 24 1 TG 2 1 239684 CASAVA_Build 11 7940112 1I CTGGTTGTTT -/A AAAGAGCCTG 3070 het 3070 hom 35 16 11 8 A 3 4 239685 CASAVA_Build 11 7941906 4I AATCTCTCAA ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 65 het 33 0 25 8 TC 7 9 239686 CASAVA_Build 11 7946086 4I AGCCAGCTGG ----/TAGT TAGGTATGAG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 TAGT 0 1 239687 CASAVA_Build 11 7950489 1I TTAAATTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 10 11 239688 CASAVA_Build 11 7951578 1D TGCTGGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 A 12 11 239689 CASAVA_Build 11 7964712 2D CGCTCAGTAC AA/-- AAAAAAAAAA 2911 het 1864 hom 40 10 8 22 A 18 16 239690 CASAVA_Build 11 7965242 1D CCGTCCCAAG T/- TTTACCCGGA 3070 hom 51 het 21 0 17 5 T 4 3 239691 CASAVA_Build 11 7968535 1D AAGCAGCCAT A/- AAAAAATTGG 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 A 7 6 239692 CASAVA_Build 11 7971956 2D CAAGATCCAG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 TA 7 6 239693 CASAVA_Build 11 7982916 2D ATATTTTTAT TG/-- TTATGAGTAA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 TG 1 0 239694 CASAVA_Build 11 7985707 3D TCCCCCCCCC CCA/--- GCCTCTCAAA 3070 het 404 hom 21 5 10 7 CCA 1 0 239695 CASAVA_Build 11 7987524 1D AGAAGACTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 10 9 239696 CASAVA_Build 11 7993236 1I CCTGTCTCTC -/A AGAACAGAAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 A 1 2 239697 CASAVA_Build 11 8000039 1D ACTCCAGCTC A/- AAAAAAAAAA 1592 het 385 hom 15 1 5 9 A 17 16 239698 CASAVA_Build 11 8004597 1D GAGATTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 314 hom 39 4 17 18 A 11 10 239699 CASAVA_Build 11 8006916 1D AGGATTGCTT G/- GAGTCTAGGA 3070 hom 93 het 34 0 29 5 G 2 1 239700 CASAVA_Build 11 8009379 1D TGCATTTGGT G/- GGGTCAAGAG 3070 het 3070 hom 31 11 14 8 G 4 3 239701 CASAVA_Build 11 8010810 9D TTGCACCTCC CGCACATCT/--------- GGCTCACGCC 3070 het 3070 ref 37 16 18 4 CGCACATCT 1 0 239702 CASAVA_Build 11 8035748 3D GGGTAATTAC CCT/--- CCTTATCTTG 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 CCT 2 1 239703 CASAVA_Build 11 8048550 3D TTTGCAAATG ATA/--- ATTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 ATA 1 0 239704 CASAVA_Build 11 8052027 2I3M12D AGAGCAGGTA --AAGAGCAGAACCGTA/TTACG------------ GTTCAGCATC 3070 hom 75 het 25 0 25 2 N/A 0 0 239705 CASAVA_Build 11 8053842 1D CTGCTGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 42 0 33 9 A 11 10 239706 CASAVA_Build 11 8078819 1I TGTATGTGGA -/G GGGGTACCAT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 G 4 5 239707 CASAVA_Build 11 8081037 1D CTGGCCTCCT G/- GGGGCCCATT 3070 hom 84 het 37 0 28 9 G 5 4 239708 CASAVA_Build 11 8084812 1D CTTAGGAATC T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 93 het 40 0 33 7 T 7 6 239709 CASAVA_Build 11 8092730 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 13 14 239710 CASAVA_Build 11 8095739 4D AGTTCAAGAG ATCT/---- ATTATACATT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 ATCT 1 0 239711 CASAVA_Build 11 8145764 6D AATGGAAAGT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 9 A 18 12 239712 CASAVA_Build 11 8149215 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 517 hom 21 2 14 5 A 9 10 239713 CASAVA_Build 11 8151271 2I GTGAAAACAC --/AA AGTTATAGTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 3 239714 CASAVA_Build 11 8157543 20D CCTAATTCCT CTCTTTTGTGTTTTTCATAA/-------------------- CTTGATTATG 3070 hom 114 het 40 0 38 6 CTCTTTTGTGTTTTTCATAA 1 0 239715 CASAVA_Build 11 8159831 1I ACTCACTTTA -/C AAAAAAATAC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 0 1 239716 CASAVA_Build 11 8159978 1I AATTTTGTGA -/T TTTTTTGTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 6 7 239717 CASAVA_Build 11 8161827 4I TTAATGTAAC ----/TTTA TTTATATCAA 3070 hom 148 het 55 0 49 6 TTTA 1 2 239718 CASAVA_Build 11 8163393 2D AAACTAACAC AT/-- GTTTCTTATA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 AT 1 0 239719 CASAVA_Build 11 8165355 1I ATTGTTTGGA -/T TTTTTTCATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 239720 CASAVA_Build 11 8168034 6D ATATATATAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 45 het 19 0 16 5 AT 9 6 239721 CASAVA_Build 11 8170675 2I AGAGGAACCC --/AA GAGAGAGAGA 3070 hom 114 het 40 0 35 5 A 0 2 239722 CASAVA_Build 11 8178405 3D TCTGTAATTT GGA/--- GGTTAAGTTA 3070 hom 138 het 56 0 47 9 GGA 1 0 239723 CASAVA_Build 11 8179755 13D AATGACCCAC TCAGGCAGCACTT/------------- TCACTGGAAT 3070 het 3070 ref 25 17 11 4 TCAGGCAGCACTT 1 0 239724 CASAVA_Build 11 8184964 1I GCACTTAGGG -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 5 6 239725 CASAVA_Build 11 8188671 1D TATTTCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 A 13 12 239726 CASAVA_Build 11 8197527 2I TTGCAGACTC --/TT ACCTCCTGGA 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 T 0 2 239727 CASAVA_Build 11 8213267 1I TTAACAGTCA -/C CCCCAGGATA 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 C 4 5 239728 CASAVA_Build 11 8214317 1I AGCCTTGGTA -/T TTTTTTTTTT 2957 het 1196 hom 44 8 16 20 T 15 16 239729 CASAVA_Build 11 8221357 2I GACCTGGATA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 AG 5 6 239730 CASAVA_Build 11 8229999 2I TGTGTGAGTG --/TA TGTGTGTGTA 3070 hom 69 het 55 1 37 17 TA 0 1 239731 CASAVA_Build 11 8237256 1I GCAAGACACC -/G GCCATCCAAG 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 G 1 2 239732 CASAVA_Build 11 8242361 2I CGATCCTACC --/CT GAGTCTTACA 3070 hom 92 het 37 0 26 11 CT 0 1 239733 CASAVA_Build 11 8244126 1D GTACCTAATT G/- GCAGCCACAT 3070 het 3070 ref 43 17 15 12 G 2 1 239734 CASAVA_Build 11 8256734 1I CCAACATGTC -/T TTCCCTTCCT 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 T 2 3 239735 CASAVA_Build 11 8271141 6D TCTCAAAAAA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 3070 hom 31 het 44 1 35 14 AG 9 6 239736 CASAVA_Build 11 8273263 2D AATTGTCTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 42 1 28 14 A 13 11 239737 CASAVA_Build 11 8274410 3I TAGAAGAGTT ---/ATA ATAAGAAATA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 ATA 1 2 239738 CASAVA_Build 11 8278414 1I CTGATCTAGG -/C CCATTTAAAG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 C 2 3 239739 CASAVA_Build 11 8281772 2I TTTTTTTTTT --/TA AAAAGAAACT 1673 het 46 hom 28 1 6 21 TA 0 1 239740 CASAVA_Build 11 8282124 2D CTATTTTCTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 16 7 TA 1 0 239741 CASAVA_Build 11 8283566 3D TATTTTGAAT TTA/--- TTATTATTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTA 3 2 239742 CASAVA_Build 11 8286527 1D AGCTTAGACC A/- AAAAAAAAAA 1741 het 1741 ref 47 32 5 10 A 13 12 239743 CASAVA_Build 11 8288766 2D TCTTAGAAGG CA/-- CAGAGCTAGA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 CA 2 1 239744 CASAVA_Build 11 8297757 1I TCCTCTCCTG -/C CCAGGCACCA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 C 2 3 239745 CASAVA_Build 11 8297925 10D CAACTTTATT CTGTCCTTGC/---------- CTGTCCTCCT 3070 het 3070 ref 33 14 14 9 CTGTCCTTGC 1 0 239746 CASAVA_Build 11 8299065 1I AGGCAGTCGG -/C GGAAACAAAG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 0 1 239747 CASAVA_Build 11 8319239 1I CCCGGGCCTC -/T CAAAGTGCTG 3070 hom 62 het 25 0 16 9 T 0 1 239748 CASAVA_Build 11 8325751 2D CTGGAAATGG CA/-- CAAGCCATTT 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 CA 2 1 239749 CASAVA_Build 11 8341028 4I TCTCTCTCTC ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 het 212 hom 32 5 10 17 CCTT 3 4 239750 CASAVA_Build 11 8343193 9D CTGGTTAGTC CCTTCTCCT/--------- CCTCCCAACC 3070 het 3070 hom 29 11 11 8 CCTTCTCCT 1 0 239751 CASAVA_Build 11 8349868 2D CCCTCCCTCC CT/-- CTCTCCCTCC 3070 hom 7 het 14 0 9 5 CT 3 2 239752 CASAVA_Build 11 8350395 10D TCTATGAACA CCAATCGGGC/---------- CCTTGTAAGG 3070 het 3070 ref 24 13 9 4 CCAATCGGGC 1 0 239753 CASAVA_Build 11 8362323 2I TTAGTATTAA --/TC TCTGTTTTAT 1961 het 1961 ref 19 10 6 3 TC 1 2 239754 CASAVA_Build 11 8364130 3I ATCTCTGACC ---/TCG TCGTGATCCA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 TCG 1 2 239755 CASAVA_Build 11 8366305 1I AAGGGGAGGT -/C CCTGAGAGTG 3070 hom 60 het 24 0 19 5 C 2 3 239756 CASAVA_Build 11 8375953 13D GCCTCAGTAG CCGATTCGATCAA/------------- CTGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 23 15 7 2 CCGATTCGATCAA 1 0 239757 CASAVA_Build 11 8380742 1I TTATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2486 hom 19 6 12 1 A 8 9 239758 CASAVA_Build 11 8383645 4I CCTGTCTGTG ----/GCTT GCTTATTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 GCTT 1 2 239759 CASAVA_Build 11 8385102 2D TAGTTTTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 12 10 239760 CASAVA_Build 11 8391549 1D ACAGATTTGC A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 49 22 23 5 A 8 7 239761 CASAVA_Build 11 8405262 3I GTAAGTACTT ---/CTA CTACCATGTG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 CTA 1 2 239762 CASAVA_Build 11 8412747 3I GCTCTGTGAG ---/CTA CTATTATGGT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 CTA 1 2 239763 CASAVA_Build 11 8415764 12D TTTTTACTAA TTTTCTTTATAT/------------ TTTTCTTTAT 3070 het 3070 ref 33 16 17 3 TTTTCTTTATAT 1 0 239764 CASAVA_Build 11 8421723 1D ACCGTATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 A 12 11 239765 CASAVA_Build 11 8424398 1I CTCTTTTTTC -/T TTATTAGTCT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 2 3 239766 CASAVA_Build 11 8428742 1D TTTCAATAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 A 9 8 239767 CASAVA_Build 11 8440751 2I AGACAGAGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 AG 8 9 239768 CASAVA_Build 11 8450380 2D TTGGTAAACT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 15 10 11 TG 7 6 239769 CASAVA_Build 11 8468574 1D ACAGCTCACC A/- AGGCCTGCTG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 2 1 239770 CASAVA_Build 11 8480203 1I AAATGTTCTC -/A AATTACATAG 3070 hom 57 het 29 0 20 9 A 2 3 239771 CASAVA_Build 11 8484741 1I ATAATCCAGC -/A AAAAAAATCC 3070 het 2909 hom 28 9 15 4 A 7 8 239772 CASAVA_Build 11 8490458 1D GTAGATATAC A/- AAAAAAATAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 239773 CASAVA_Build 11 8490747 1I TAAGCTTATA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 T 6 7 239774 CASAVA_Build 11 8498827 4D CCAATAACAG ACAA/---- ACAGACAGCC 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 ACAA 1 0 239775 CASAVA_Build 11 8506353 1I AGGCATTTTG -/C TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 C 0 1 239776 CASAVA_Build 11 8531375 2I GATATATATG --/AT ATATATATAT 1260 hom 7 het 4 0 3 1 AT 5 6 239777 CASAVA_Build 11 8533015 2I AAAAAATGTG --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 AT 4 5 239778 CASAVA_Build 11 8540633 1I AGTCTAAACA -/G GTGTATAACA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 1 2 239779 CASAVA_Build 11 8564177 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAACAAA 3070 het 2915 hom 19 7 12 0 A 6 7 239780 CASAVA_Build 11 8568557 4I AAAAATAAGG ----/ATCA ATAATAGTAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 ATCA 0 1 239781 CASAVA_Build 11 8568802 1D TTAGTAATTT C/- TTATGCACTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 C 1 0 239782 CASAVA_Build 11 8570122 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 943 hom 12 3 9 0 A 10 11 239783 CASAVA_Build 11 8580351 5I ATCCTTTGTT -----/TTTTG TTTTGTTTTA 2408 het 1832 hom 16 5 8 3 TTTTG 1 2 239784 CASAVA_Build 11 8581419 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2638 het 977 hom 19 6 7 6 A 14 13 239785 CASAVA_Build 11 8582722 1D TGAGAGAGTG C/- CTGGGTCCAC 3070 het 3070 hom 56 25 26 6 C 2 1 239786 CASAVA_Build 11 8583783 20D AAGACTCCGT CTCAAAACAAACAAACACAC/-------------------- CTCAAAACAA 3070 het 3070 ref 36 25 13 6 CTCAAAACAAACAAACACAC 2 1 239787 CASAVA_Build 11 8589326 1D ATGTCCTTGA C/- CCCCCCCAAA 3070 het 2694 hom 41 12 23 6 C 8 7 239788 CASAVA_Build 11 8601139 4D TATAGTCATT CATA/---- CATAGTGGTG 3070 het 3070 ref 58 34 20 7 CATA 2 1 239789 CASAVA_Build 11 8603468 10D GCTTCAGAGT CTGGTAGCTG/---------- CTGGTAGCTG 3070 het 3070 hom 40 16 19 11 CTGGTAGCTG 2 1 239790 CASAVA_Build 11 8603667 12D AGGCATGTAC ACACACACACAG/------------ ACACACACAC 3070 het 2501 hom 40 10 19 17 ACACACACACAG 2 1 239791 CASAVA_Build 11 8615445 4D CATTTAATGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 57 het 41 0 20 22 AT 10 8 239792 CASAVA_Build 11 8625065 5D AATGCATACT GCCTC/----- AGTAGTTTCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 GCCTC 1 0 239793 CASAVA_Build 11 8625569 2D TAACTGAAAG AA/-- TGGCAAGAAC 3070 hom 129 het 49 0 42 9 A 2 0 239794 CASAVA_Build 11 8646388 1I TAAAATCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 T 11 12 239795 CASAVA_Build 11 8646714 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 2997 het 314 hom 17 3 11 3 T 13 12 239796 CASAVA_Build 11 8658581 1I AATGAAGGCA -/G GGGCACTAAG 3070 hom 120 het 48 0 38 10 G 3 4 239797 CASAVA_Build 11 8659771 3D AGCGAAGACA TGC/--- TGCTATTAGC 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 TGC 2 1 239798 CASAVA_Build 11 8660550 1I AGGGCTGGCG -/C CATTTGGTGA 2416 het 2416 ref 24 9 9 6 C 1 2 239799 CASAVA_Build 11 8666534 2D AGCTACTAAC AG/-- TTCTAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 18 12 10 AG 1 0 239800 CASAVA_Build 11 8667529 3D ATTTCCTCTT AGG/--- AGGTTAGGGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AGG 2 1 239801 CASAVA_Build 11 8668866 2I GGCTGGTCTC --/AT AAACTCCTGA 3070 het 2578 hom 19 7 11 1 AT 0 1 239802 CASAVA_Build 11 8674074 1I GAAAAATTGT -/G GATGAGATGA 3070 het 3070 ref 52 22 24 6 G 1 2 239803 CASAVA_Build 11 8680922 1I AGCAACTGGA -/G GCTGCTTTCC 3070 hom 66 het 28 0 21 7 G 1 2 239804 CASAVA_Build 11 8691227 13I CCTAGCAGGA -------------/CTTGAGCCTTGTC CATGCTCCTA 3070 hom 113 het 44 0 34 11 CTTGAGCCTTGTC 0 1 239805 CASAVA_Build 11 8699442 1D TTTCACTCCT C/- CCCATAACTC 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 C 4 3 239806 CASAVA_Build 11 8699632 4D CCCAACAACC TCCG/---- TCCGGTTCCA 3070 hom 70 het 27 0 22 6 TCCG 2 1 239807 CASAVA_Build 11 8703493 3I CCTTATGAAA ---/TAT TATTACTTTT 3070 hom 47 het 21 0 15 6 TAT 1 2 239808 CASAVA_Build 11 8706717 1D GATGAACTCT C/- CCCCCCACTC 3070 hom 78 het 30 0 26 5 C 7 6 239809 CASAVA_Build 11 8710759 1D AATGATGAAG A/- GCAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 50 30 19 2 A 1 0 239810 CASAVA_Build 11 8714490 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 A 10 11 239811 CASAVA_Build 11 8730575 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2337 hom 20 7 9 4 A 10 11 239812 CASAVA_Build 11 8739147 1I CAACCCTCCT -/C CCTCAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 C 2 3 239813 CASAVA_Build 11 8742343 1D AATCAATCTC A/- AAAAAAAAAC 2990 het 2990 ref 22 11 8 4 A 10 9 239814 CASAVA_Build 11 8743815 1I TCTTGTATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 T 9 10 239815 CASAVA_Build 11 8745548 3D AGGCCAAAAT GAA/--- GAAGAAGTTT 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 GAA 3 2 239816 CASAVA_Build 11 8747363 1I AAGCAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3026 het 3026 ref 39 14 11 14 T 15 16 239817 CASAVA_Build 11 8765471 1D TTCTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 30 1 23 7 T 11 10 239818 CASAVA_Build 11 8767899 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 6 7 239819 CASAVA_Build 11 8770118 1D ACCTGAGGTC A/- AGGAGTTCAA 3070 hom 42 het 19 0 14 5 A 2 1 239820 CASAVA_Build 11 8770234 1D AGGCTGAGGC A/- GGAGAATTGC 3070 het 1121 hom 15 3 11 1 A 1 0 239821 CASAVA_Build 11 8782493 3D CATAAGACAT GGG/--- GAGCTGTCTG 3070 het 3070 ref 44 20 14 11 G 4 1 239822 CASAVA_Build 11 8787031 1D TTCTGCTATA C/- CAACAGAAGG 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 C 2 1 239823 CASAVA_Build 11 8788191 1I TTTTTTTTTT -/C CCATTACAGG 1401 het 608 hom 23 4 8 11 C 2 3 239824 CASAVA_Build 11 8791049 8D AAACAGTGCT CCCAAAAA/-------- AAAGGTCCTG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 CCCAAAAA 1 0 239825 CASAVA_Build 11 8794925 1D GTCTCCCTTA G/- GGGCCTTTGC 3070 hom 86 het 34 0 28 7 G 4 3 239826 CASAVA_Build 11 8799702 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 29 0 24 5 A 11 10 239827 CASAVA_Build 11 8801230 1I TTGGGGACTT -/A AAAAAGTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 A 5 6 239828 CASAVA_Build 11 8810709 5I CTCAGTGGAA -----/CTGCG CTAGCATTCC 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 CTGCG 0 1 239829 CASAVA_Build 11 8814093 1D TCACCTAGCT C/- TAACAGTCTC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 C 1 0 239830 CASAVA_Build 11 8821136 1D AGAGTTGCTC T/- TCTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 2 1 239831 CASAVA_Build 11 8822360 1D TCAGCTCCAC A/- AAAAAATCGA 3070 het 3070 ref 33 15 9 10 A 7 6 239832 CASAVA_Build 11 8824047 2D AATAAATTAC AG/-- AGTGTCTAGA 3070 het 3070 ref 54 32 21 4 AG 2 1 239833 CASAVA_Build 11 8829848 1I TAAATACATA -/G GGGGGGGACA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 G 7 8 239834 CASAVA_Build 11 8833175 1D GCTGAGGTGG A/- AAAGATCACT 3070 het 3070 hom 28 9 18 2 A 4 3 239835 CASAVA_Build 11 8838457 4I AGATTTGATA ----/AATG AATTCAGTAA 3070 het 3070 hom 47 23 23 1 AATG 0 1 239836 CASAVA_Build 11 8839160 5D AAATTAACTC GAGAT/----- GGATCAAAGA 3070 het 3070 ref 36 19 15 6 GAGAT 1 0 239837 CASAVA_Build 11 8843245 5I TATTTCTATC -----/ATATT ATATTTGCAT 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 ATATT 1 2 239838 CASAVA_Build 11 8846139 1I GTCATGAAAG -/A AAAAAACCAA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 A 6 7 239839 CASAVA_Build 11 8848057 1I TAATTCTGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 9 10 239840 CASAVA_Build 11 8848633 2D TGCGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 2186 het 1326 hom 39 15 8 16 TG 8 7 239841 CASAVA_Build 11 8850762 2D GTATTAACTC TT/-- TGTCTCCAAA 3070 het 3070 hom 39 14 23 3 T 3 1 239842 CASAVA_Build 11 8855002 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1618 hom 27 5 11 11 A 15 14 239843 CASAVA_Build 11 8855094 3D GAGTAAATGA GAG/--- GAGATGTCAG 3070 het 3070 hom 33 17 15 1 GAG 2 1 239844 CASAVA_Build 11 8862405 1D CTACTAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 951 hom 28 3 21 4 A 15 14 239845 CASAVA_Build 11 8875215 1I ACAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 2140 het 2140 ref 14 6 5 3 T 11 12 239846 CASAVA_Build 11 8885164 1D ACTGGACTTG T/- TTTTTCTCCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 6 5 239847 CASAVA_Build 11 8885614 12D GCACATATAA AAATATATTTAC/------------ AAATATATTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 8 AAATATATTTAC 2 1 239848 CASAVA_Build 11 8886776 5I CTAGGCCATC -----/CTTCA AGGCCTAGCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 CTTCA 0 1 239849 CASAVA_Build 11 8890230 1D TGAGGCAGGA G/- AATCGCTTGA 3070 hom 24 het 10 0 8 2 G 1 0 239850 CASAVA_Build 11 8900503 1I CTCTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 A 10 11 239851 CASAVA_Build 11 8906441 1D TGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 14 11 A 10 9 239852 CASAVA_Build 11 8918342 13I CAAAAGATCT -------------/TCCCACGTCAGCC TCCCACAGCA 3070 het 3070 hom 24 7 13 4 TCCCACGTCAGCC 0 1 239853 CASAVA_Build 11 8919681 1D AGGGAGGAGT G/- GCCAGGGTTA 3070 het 1016 hom 26 5 15 6 G 2 1 239854 CASAVA_Build 11 8921935 1I CCGAGTTTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 8 9 239855 CASAVA_Build 11 8922823 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1340 hom 10 het 4 0 4 0 T 12 11 239856 CASAVA_Build 11 8924156 4D AGTTCTTTGG TTTA/---- TTTAATCATT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TTTA 2 1 239857 CASAVA_Build 11 8925455 7D CATTCCAAAG AGGACAT/------- AGGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 6 AGGACAT 1 0 239858 CASAVA_Build 11 8928490 1D TCATCCCCTG A/- AGTCAAGGAC 3070 het 3070 ref 48 22 21 6 A 2 1 239859 CASAVA_Build 11 8931630 1D ATTATTTAAG A/- AAAAAAGAGG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 7 6 239860 CASAVA_Build 11 8932432 1D CTGGATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 T 13 12 239861 CASAVA_Build 11 8943417 2I GCAAGGACAC --/AG GGATCATCAC 3070 hom 57 het 25 0 19 6 AG 0 1 239862 CASAVA_Build 11 8948881 1D AAAATGGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 12 11 239863 CASAVA_Build 11 8963611 3I TTTTATCTGA ---/CCT CCACATTTGT 3070 het 2844 hom 22 7 11 4 CCT 0 1 239864 CASAVA_Build 11 8975404 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATCGCTT 2872 het 1622 hom 12 5 7 0 AGG 1 0 239865 CASAVA_Build 11 8975760 4D AAAGGAAATG AACA/---- CTATGGGAAG 3070 het 3070 hom 47 19 24 5 AACA 1 0 239866 CASAVA_Build 11 8978895 1I TCACTGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 11 12 A 11 12 239867 CASAVA_Build 11 8980652 15I GGAGGAGAAA ---------------/AATTATACTGTGTAT AATTTTTGTA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 AATTATACTGTGTAT 0 1 239868 CASAVA_Build 11 8983920 3I GAGGGTTCTC ---/AAT AAATACTAGT 3070 hom 153 het 55 0 51 4 AAT 0 1 239869 CASAVA_Build 11 8997637 1I TTTAATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 10 11 239870 CASAVA_Build 11 8999554 1I TCCTGTTTTC -/T TTTTTCCCAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 5 6 239871 CASAVA_Build 11 9006338 1D TTTTTCCTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 T 9 8 239872 CASAVA_Build 11 9009998 6D CCCCATAAGT TATAGA/------ TATGATGGCA 3070 het 3070 hom 39 17 16 8 TATAGA 1 0 239873 CASAVA_Build 11 9012946 4I TCTACTGAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 1956 hom 27 6 15 6 AAAC 3 4 239874 CASAVA_Build 11 9016246 2I ACAGCAGAGA --/AG AGAGACATGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AG 2 3 239875 CASAVA_Build 11 9018398 5D TAACAATAAT AATAA/----- AATAAAACAA 2598 het 2598 ref 34 25 6 6 AATAA 2 1 239876 CASAVA_Build 11 9039695 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2981 het 2392 hom 32 15 10 7 A 15 14 239877 CASAVA_Build 11 9054739 2D AGGCTGATAT AA/-- AAAATCAATT 2789 het 2789 ref 31 17 9 6 A 6 4 239878 CASAVA_Build 11 9057190 1D TACAGCATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 10 9 239879 CASAVA_Build 11 9059781 4D CACCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 28 het 37 1 31 5 AAAC 4 3 239880 CASAVA_Build 11 9059797 4D ACAAACAAAC AAAA/---- AAAAAAAACC 3070 hom 32 het 33 1 30 5 A 12 8 239881 CASAVA_Build 11 9062653 1I TGCAAAGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 9 10 239882 CASAVA_Build 11 9063951 3D ATCTCTTTAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 17 0 15 2 T 21 18 239883 CASAVA_Build 11 9093126 1D GAAAGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 888 hom 43 4 13 26 T 19 18 239884 CASAVA_Build 11 9094998 1D TCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 2176 het 1920 hom 12 5 7 2 A 12 11 239885 CASAVA_Build 11 9139471 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 503 hom 28 2 13 13 A 13 14 239886 CASAVA_Build 11 9140277 2I TCCACTGTTA --/CT GTTTTTAACC 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 CT 0 1 239887 CASAVA_Build 11 9142040 1D AATTGTATGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 9 8 239888 CASAVA_Build 11 9143571 1I ATATTAACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 10 11 239889 CASAVA_Build 11 9151106 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1480 het 1480 ref 18 9 6 3 T 15 14 239890 CASAVA_Build 11 9155609 1D TTGTCTCCAC A/- AAAAAAAAAA 1718 het 1718 ref 19 9 7 3 A 12 11 239891 CASAVA_Build 11 9161563 1D GGTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 1434 het 1434 ref 26 15 4 7 T 15 14 239892 CASAVA_Build 11 9186950 3I ATCTTCACTA ---/AAG AAGACTGGCA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 AAG 1 2 239893 CASAVA_Build 11 9193849 1I TGTTTTTGTG -/T TTTTAGTAAA 2694 het 1796 hom 16 4 7 5 T 4 5 239894 CASAVA_Build 11 9200426 2I AAAGACAGTA --/TC TCTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 TC 1 2 239895 CASAVA_Build 11 9214864 1I GAAAAAGATG -/A AAAAGGAAGA 3070 het 1714 hom 18 4 9 5 A 4 5 239896 CASAVA_Build 11 9216483 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 TA 6 7 239897 CASAVA_Build 11 9229369 1I CTCAGACCTC -/T TCAGCATTCC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 1 2 239898 CASAVA_Build 11 9230302 1I GCGCCTGTAG -/T TCCCAGCTAC 3070 het 1597 hom 16 5 10 1 T 1 2 239899 CASAVA_Build 11 9231142 7D CCAGGCTAAT TTTTCTA/------- TTTTCTGTAG 3059 het 3059 ref 31 19 10 7 TTTTCTA 1 0 239900 CASAVA_Build 11 9236730 1I CCTGGACTAG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 50 26 12 12 A 7 8 239901 CASAVA_Build 11 9239162 1D CTGTAGAGAT A/- AGAGTCTTGC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 2 1 239902 CASAVA_Build 11 9240864 1I ATCAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 16 5 T 12 13 239903 CASAVA_Build 11 9244552 1I ATATTACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1314 hom 40 5 28 7 T 10 11 239904 CASAVA_Build 11 9252046 1I CTGTTTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1822 hom 39 10 16 13 T 15 16 239905 CASAVA_Build 11 9262900 4I AGAGAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 80 het 30 0 28 3 AAAG 2 3 239906 CASAVA_Build 11 9264320 7I GGGACTGGAA -------/GTTATAG GTCCTGCTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 GTTATAG 0 1 239907 CASAVA_Build 11 9266239 1D CTACCCCCGA C/- CCCCCCAGTT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 7 6 239908 CASAVA_Build 11 9267273 16D ATCACGGACG TGTGTCACCACACCAA/---------------- TTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 39 21 16 4 TGTGTCACCACACCAA 1 0 239909 CASAVA_Build 11 9267444 1D TTAAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 31 2 21 8 T 15 14 239910 CASAVA_Build 11 9271579 5D GAGTGTACTC ATATT/----- ATCCCCTTCT 3070 het 3070 hom 30 14 15 4 ATATT 1 0 239911 CASAVA_Build 11 9280107 2D CAGTTGAGAT TC/-- TCTCTTATAT 1884 het 1884 ref 22 11 7 4 TC 3 2 239912 CASAVA_Build 11 9280297 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2983 hom 21 het 9 0 8 1 T 9 10 239913 CASAVA_Build 11 9284809 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1882 hom 24 6 11 7 A 11 12 239914 CASAVA_Build 11 9285572 1I AAATAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 13 14 239915 CASAVA_Build 11 9287370 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 4 hom 28 1 24 3 A 9 10 239916 CASAVA_Build 11 9288515 1I AAGATTAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3040 hom 26 8 13 5 A 9 10 239917 CASAVA_Build 11 9293727 2D ACTCCGTCCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 30 2 18 11 A 18 16 239918 CASAVA_Build 11 9296177 1D AGCCACCACG C/- CCCAGCCTCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 4 3 239919 CASAVA_Build 11 9320122 1I CAGTTATTCT -/G TGCCTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 G 0 1 239920 CASAVA_Build 11 9324987 1I ATTAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 1023 het 1023 ref 20 7 5 8 T 13 14 239921 CASAVA_Build 11 9338038 1I GCTGCTTTTA -/C CTTTTTGTGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 1 2 239922 CASAVA_Build 11 9342071 3D TACGCAATGC CAA/--- CAACAAGGTG 3070 hom 63 het 24 0 20 5 CAA 3 2 239923 CASAVA_Build 11 9349251 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 0 1 239924 CASAVA_Build 11 9351383 2I TGTAATAGCT --/AA AAAGAGTCTT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 3 5 239925 CASAVA_Build 11 9357079 4D ATCTCAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 352 het 352 ref 21 3 3 16 AAAG 1 0 239926 CASAVA_Build 11 9368890 17I CTGGGCAACA -----------------/TAGGGAGACCCAGTCAC TACAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 TAGGGAGACCCAGTCAC 0 1 239927 CASAVA_Build 11 9372524 1D GCAGGGAAGC T/- TGGCTGTATA 3070 hom 90 het 33 0 31 5 T 2 1 239928 CASAVA_Build 11 9390954 1D CACTTTCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 A 10 9 239929 CASAVA_Build 11 9423512 1D TTTTGGGGGT G/- GGGGGGGATG 2045 hom 18 het 9 0 7 2 G 8 7 239930 CASAVA_Build 11 9426902 2I TATAAGTTCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 48 0 37 11 TG 7 8 239931 CASAVA_Build 11 9445004 1I AATACTCTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 369 hom 11 1 9 1 T 9 10 239932 CASAVA_Build 11 9448623 7D GACTTGAAGA GGGTAGG/------- GAATGAATAA 3070 hom 129 het 50 0 43 8 GGGTAGG 1 0 239933 CASAVA_Build 11 9462729 1D AAGTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 20 1 12 7 T 13 12 239934 CASAVA_Build 11 9480731 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 18 2 12 4 A 15 14 239935 CASAVA_Build 11 9488858 1I GGGGGAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 747 hom 45 2 37 6 T 10 11 239936 CASAVA_Build 11 9496828 2D CAAAAAGAGT GA/-- GACTCCGTCT 3070 hom 49 het 25 0 17 8 GA 2 1 239937 CASAVA_Build 11 9529974 1D GGCAGGCGAT G/- GCAGTCAACA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 G 2 1 239938 CASAVA_Build 11 9538464 4D TAATTGTGTA AACT/---- AACTAATAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 AACT 2 1 239939 CASAVA_Build 11 9539052 1I CTTCAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 24 1 14 9 T 13 14 239940 CASAVA_Build 11 9539846 1D TAACTCTTAG A/- ATTTGCCCTT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 2 1 239941 CASAVA_Build 11 9545134 1D TTAAGTACCC T/- AGCATGGTCT 3070 het 3070 ref 30 19 11 0 T 1 0 239942 CASAVA_Build 11 9550434 1I CTCCGTGTCG -/A AAAAAAACCA 2066 het 2066 ref 15 7 6 2 A 7 8 239943 CASAVA_Build 11 9566099 1D TTATTTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 10 9 239944 CASAVA_Build 11 9567162 2I CTTATATTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 T 10 12 239945 CASAVA_Build 11 9567774 4D AAAAATTGTC TGTT/---- TGTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 TGTT 2 1 239946 CASAVA_Build 11 9574252 1I ATAAAGTAAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 55 het 22 0 19 3 A 8 9 239947 CASAVA_Build 11 9599842 10D TTCTATTTCT TTTGCCCTCA/---------- TTTGCCCTCA 3070 het 3070 ref 43 21 16 11 TTTGCCCTCA 2 1 239948 CASAVA_Build 11 9618749 4I GTCTCAAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AAAC 4 5 239949 CASAVA_Build 11 9626366 1D CGACTTGGCC T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 27 13 9 7 T 7 6 239950 CASAVA_Build 11 9627165 3D ACATTAGCAA TGT/--- TAAGCATTAG 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 TGT 1 0 239951 CASAVA_Build 11 9636801 4I CCTGGGTGAC ----/TGAG TGAGATCCTG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 TGAG 1 2 239952 CASAVA_Build 11 9653838 10D TTGATTTTTT TTCTCCTTCC/---------- TTCTCCTGCA 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 TTCTCCTTCC 1 0 239953 CASAVA_Build 11 9654055 1I TTGGATTGTT -/A AAATACAACT 3070 het 3070 hom 58 20 29 9 A 3 4 239954 CASAVA_Build 11 9667074 2I AGAATTTTCT --/GG GGTAATTTGC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 G 2 4 239955 CASAVA_Build 11 9680535 2D TTTTGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 11 9 239956 CASAVA_Build 11 9685543 1I TGTATTTGTC -/T TTTTTTGATT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 T 6 7 239957 CASAVA_Build 11 9687146 2D CTCCCACCTC AG/-- CCTCCTGACA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 AG 1 0 239958 CASAVA_Build 11 9687417 2I TCAGCTAATT --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 8 10 239959 CASAVA_Build 11 9690671 1I TTAAATTAAT -/A TAAACAATGT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 0 1 239960 CASAVA_Build 11 9692291 4D GGCTTCTGTG CTAT/---- CTAACTGTCC 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 CTAT 1 0 239961 CASAVA_Build 11 9692400 1D CCCACACTTT A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 8 7 239962 CASAVA_Build 11 9695972 1I GAATTAGAAA -/T TTAGTGAGTG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 2 3 239963 CASAVA_Build 11 9696507 13D TGTCTAGCTG CTGAATTACCCTC/------------- CTGAGGTTAA 3070 het 3070 hom 46 22 24 5 CTGAATTACCCTC 1 0 239964 CASAVA_Build 11 9696800 5I GTTTAACTTG -----/TTATC TTATCAGTAG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 TTATC 1 2 239965 CASAVA_Build 11 9696907 1I TTAAGAAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 T 9 10 239966 CASAVA_Build 11 9704009 6I3M10I CAAAATATTT ------TAT----------/TTAAAGTATCTTCCTGTCA TTTGGAAATT 3070 het 3070 hom 25 10 13 4 N/A 0 0 239967 CASAVA_Build 11 9704124 1D GGTAATGTTA T/- GCATGTGTGT 3070 het 3070 hom 27 13 14 1 T 1 0 239968 CASAVA_Build 11 9705318 1I TTGAGACCAT -/C CTGGCCAACA 3000 het 3000 ref 19 9 7 3 C 1 2 239969 CASAVA_Build 11 9706129 1D ATGTCAGCTC T/- TACAAATAAA 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 T 2 1 239970 CASAVA_Build 11 9707628 1I TCTGACTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2575 hom 28 8 13 7 T 10 11 239971 CASAVA_Build 11 9707784 1D CCAGCTAATG T/- TTTTGTAATT 3070 het 855 hom 13 3 8 2 T 5 4 239972 CASAVA_Build 11 9722481 2D GGTACATGAG AT/-- ATTTTGATAC 3070 het 2327 hom 22 7 14 1 AT 2 1 239973 CASAVA_Build 11 9726827 1I CAGCTAGTGA -/G GGAGAATTAT 3070 het 3070 hom 56 19 29 8 G 2 3 239974 CASAVA_Build 11 9733251 2D CACCTTTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1534 hom 30 10 13 7 T 16 14 239975 CASAVA_Build 11 9734234 1D CCTGATGCAT G/- GGACCAGGAC 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 G 3 2 239976 CASAVA_Build 11 9734276 1D GAAGACTGTT C/- CCCCCACAGG 3070 het 3070 ref 36 14 9 13 C 6 5 239977 CASAVA_Build 11 9739808 4D CTCAAGGTTC CTCT/---- CTTTCTCACA 3070 het 3070 ref 48 27 18 7 CT 3 1 239978 CASAVA_Build 11 9752712 1D TGATTGAGCA T/- GGTGGGGATC 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 T 1 0 239979 CASAVA_Build 11 9761197 4I30M7D GAAAAAACTG ----TATCTATCTTTCATGTTAAAGAAGTCCAGAAGACTGG/TATCTATCTATCTTTCATGTTAAAGAAGTCCAGA------- TAAGAATGCA 3070 het 3070 ref 28 21 14 5 N/A 0 0 239980 CASAVA_Build 11 9763998 1D ATGTTGATGG T/- TTTTTTTTTG 2877 hom 18 het 9 0 7 2 T 10 9 239981 CASAVA_Build 11 9770880 3D CATGTTTATG TGT/--- TGTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 TGT 3 2 239982 CASAVA_Build 11 9781344 1D TCTTTACTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 28 14 4 A 10 9 239983 CASAVA_Build 11 9783972 1I GTTTTGATCT -/C CTTACCTCGT 3070 het 2685 hom 17 7 9 1 C 1 2 239984 CASAVA_Build 11 9793590 1I CTTAAAAAAA -/T ATATAATAAT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 0 1 239985 CASAVA_Build 11 9800979 1D GTAAATATAT C/- TGCACTGATA 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 C 1 0 239986 CASAVA_Build 11 9804837 2D GTGTGGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 146 hom 30 3 17 11 TA 9 8 239987 CASAVA_Build 11 9815870 1I AGCAGAAAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 T 9 10 239988 CASAVA_Build 11 9819658 1D ACATAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 29 0 15 14 T 14 13 239989 CASAVA_Build 11 9821835 2D GAAGGTTATG AA/-- ACATGTTTGA 3070 het 3070 hom 26 12 12 4 A 3 1 239990 CASAVA_Build 11 9843687 9D GTGGCACATG CCTGTAATC/--------- CCCAGCTACT 1769 het 1769 ref 12 7 4 2 CCTGTAATC 1 0 239991 CASAVA_Build 11 9852183 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 11 10 239992 CASAVA_Build 11 9861414 1I TGCTGTGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 A 10 11 239993 CASAVA_Build 11 9862509 1D TCCTACTTTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 102 het 40 0 35 8 A 8 7 239994 CASAVA_Build 11 9864665 1I CCTGTAGTTC -/T TTTGGTTTTA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 3 4 239995 CASAVA_Build 11 9873586 1I ACAGAATTTT -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 6 7 239996 CASAVA_Build 11 9873732 1D AGAGGACAGA C/- AATATTCCAG 2452 het 2452 ref 23 14 6 4 C 1 0 239997 CASAVA_Build 11 9877179 1I AATAAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 10 11 239998 CASAVA_Build 11 9881083 1D ATAGGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 24 1 16 7 A 12 11 239999 CASAVA_Build 11 9886810 9I GTTCATAATC ---------/GTGTTGTTG TTGTTGTTGC 3070 het 2400 hom 25 7 16 2 GTGTTGTTG 0 1 240000 CASAVA_Build 11 9886975 1D GCATGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 27 9 7 11 T 17 16 240001 CASAVA_Build 11 9895189 1I ATTTTCATTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 8 9 240002 CASAVA_Build 11 9896180 1D ATCCACCCAA C/- AATATGTTTA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 C 1 0 240003 CASAVA_Build 11 9896313 4D CCTCTTACTA ACTT/---- ACTACCTTTG 3070 het 3070 hom 47 19 23 9 ACTT 1 0 240004 CASAVA_Build 11 9900697 1I AATTCAAAAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 8 9 240005 CASAVA_Build 11 9902014 1I AAATTAGAGA -/C CCAGATTTAT 3070 het 3070 hom 52 21 28 3 C 2 3 240006 CASAVA_Build 11 9904090 2I ACGTGATAAC --/AT GTTTTCCATG 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 AT 0 1 240007 CASAVA_Build 11 9906135 1I AGCATTTTTA -/G AAGAAAATGA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 0 1 240008 CASAVA_Build 11 9907505 10D GGATTTTATA TGACAACCAG/---------- TGACAACCAG 3070 het 3070 ref 33 19 9 12 TGACAACCAG 2 1 240009 CASAVA_Build 11 9911371 16D TACACAGATC AACGAGACAGAAGGTT/---------------- AACAAGGATA 1942 het 1942 ref 13 8 5 0 AACGAGACAGAAGGTT 1 0 240010 CASAVA_Build 11 9918513 2D GGGCAACACA GC/-- GAGACTCTGC 3070 het 702 hom 12 3 8 1 GC 1 0 240011 CASAVA_Build 11 9925145 17D TGGAATCTAG AATTAGTTATTTGATCT/----------------- AATTAGATTG 3070 het 3070 hom 30 14 16 4 AATTAGTTATTTGATCT 1 0 240012 CASAVA_Build 11 9925900 1I GGCTACTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 A 11 12 240013 CASAVA_Build 11 9928272 1D AGCAGGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 12 11 240014 CASAVA_Build 11 9931560 1I AGTGAGACTC -/A AAAAAAAACG 3070 het 2340 hom 19 5 12 2 A 8 9 240015 CASAVA_Build 11 9931870 1I TATAAAGAGG -/T TATACATTAG 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 T 1 2 240016 CASAVA_Build 11 9933995 1I CCTTAGTTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 7 8 240017 CASAVA_Build 11 9934694 1I TTAACTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 119 hom 33 2 22 9 C 0 1 240018 CASAVA_Build 11 9935590 1I CTTGTTTTTA -/C TTTTTTTTTT 3070 het 577 hom 15 2 12 1 C 0 1 240019 CASAVA_Build 11 9939093 1I GCCAAATAAT -/A ATAATCTTAA 3070 het 3070 hom 27 9 18 0 A 1 2 240020 CASAVA_Build 11 9940387 1I ATTATTAAGA -/C CAATTATAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 1 2 240021 CASAVA_Build 11 9947146 1D TTCACTTGGA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 6 5 240022 CASAVA_Build 11 9956756 14D GTTTGTTTGA TTGTTTTTGTTTGT/-------------- TTGTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 12 16 8 TTGTTTTTGTTTGT 1 0 240023 CASAVA_Build 11 9959842 1D GTCTTTGCAG A/- AGTTATTTGC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 2 1 240024 CASAVA_Build 11 9970947 2I TAAGATATTA --/TG TGAGTTCCAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TG 1 2 240025 CASAVA_Build 11 9971512 8I TAAGTATATG --------/TGTTCAGC TGTTCAGCTC 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TGTTCAGC 1 2 240026 CASAVA_Build 11 9973177 1D AAAAAAAAAA T/- AAAAATTACT 3070 het 180 hom 21 1 15 5 T 1 0 240027 CASAVA_Build 11 9979591 1D GCAAAAAAAA G/- GGGGGGGCCA 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 G 8 7 240028 CASAVA_Build 11 9986719 1I CAAATAATTG -/C CATTGGTATG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 1 2 240029 CASAVA_Build 11 9987990 3D TTTACACTCC CAA/--- CAAGAGTGTA 2424 het 2424 ref 20 14 5 4 CAA 2 1 240030 CASAVA_Build 11 9993935 1D CCCTCTTTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 10 9 240031 CASAVA_Build 11 9999571 1I CCAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 8 9 240032 CASAVA_Build 11 10002461 5I TTTTAAACTT -----/AAAAA AAAATAGTCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 4 9 240033 CASAVA_Build 11 10015760 1D AACTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 12 11 240034 CASAVA_Build 11 10019922 33D TCCCCCAAGT GATGATACTCTATACGTAGCAGAAACTACAGTA/--------------------------------- GATTATGCAA 3070 het 3070 ref 31 25 13 3 GATGATACTCTATACGTAGCAGAAACTACAGTA 1 0 240035 CASAVA_Build 11 10020107 1D ATACAATCTT A/- ACTTCCACCA 3070 hom 135 het 50 0 45 6 A 2 1 240036 CASAVA_Build 11 10021706 1D CAACACTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 86 het 34 0 29 5 T 10 9 240037 CASAVA_Build 11 10023295 1D ATTGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1864 het 57 hom 17 1 6 10 T 15 14 240038 CASAVA_Build 11 10030282 1D GGCAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 40 1 31 9 A 11 10 240039 CASAVA_Build 11 10047442 3D CCTCCCCCCA CCC/--- CCCAACAGGC 2590 het 749 hom 9 2 6 1 C 6 3 240040 CASAVA_Build 11 10058112 4I GGCTCATGCC ----/TGTA TGTAATCCCT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 TGTA 1 2 240041 CASAVA_Build 11 10064393 4D TTTTGGTGTG CAAT/---- CAGTGATTGA 3070 het 3070 ref 40 21 18 3 CAAT 1 0 240042 CASAVA_Build 11 10071145 1I TCCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 T 11 12 240043 CASAVA_Build 11 10071506 1D GGTCAGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3009 hom 29 11 14 5 A 14 13 240044 CASAVA_Build 11 10073675 1D AAGCTTTTTT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 7 240045 CASAVA_Build 11 10076597 1I TCAAGGAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 2 3 240046 CASAVA_Build 11 10082212 1D CCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 35 26 5 4 A 15 14 240047 CASAVA_Build 11 10082674 1D TCACGGGGCT G/- GGTGTGAGAG 3070 hom 144 het 52 0 47 6 G 3 2 240048 CASAVA_Build 11 10082901 1D AGATTTTCTT A/- AATAAGTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 21 9 A 3 2 240049 CASAVA_Build 11 10083302 1I TTAGCGCTGT -/A AAGGGTTCAA 3070 het 3070 hom 39 10 21 8 A 2 3 240050 CASAVA_Build 11 10089391 1I ACAGAAGAAA -/C ATTTCCAGCC 3070 het 2995 hom 18 7 7 4 C 0 1 240051 CASAVA_Build 11 10090967 4D ACAGAATGAA AAAT/---- AAATAGGAAA 3070 het 3070 hom 34 16 17 3 AAAT 2 1 240052 CASAVA_Build 11 10096640 1I ATATGGTCAG -/A AGGTATACAT 2169 het 2169 ref 23 10 6 7 A 1 2 240053 CASAVA_Build 11 10097036 1I AAAAAAAAAA -/C AACAAAACTA 3070 hom 82 het 34 0 28 6 C 0 1 240054 CASAVA_Build 11 10107471 1I AAGTGATCTG -/C CTGCCTTGGC 3070 hom 63 het 22 0 19 3 C 1 2 240055 CASAVA_Build 11 10107827 1I TGTCTCTAAA -/T TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 6 7 240056 CASAVA_Build 11 10109580 2D ATATATTCTC TT/-- GTTTTGCTCT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 T 2 0 240057 CASAVA_Build 11 10116649 2D TCTTTTCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 11 10 T 13 11 240058 CASAVA_Build 11 10118360 1D GATACATGGT G/- GCTAAAGTCT 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 G 2 1 240059 CASAVA_Build 11 10118969 1I GGTGTCAGAG -/A GTTGGAAATT 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 A 0 1 240060 CASAVA_Build 11 10126624 1I TAAATACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 14 13 T 10 11 240061 CASAVA_Build 11 10130499 1I CATGGAGAAA -/C CCCCTCTCTA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 4 5 240062 CASAVA_Build 11 10133528 1I ACAAACTCAT -/A AAGTATGAGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 2 3 240063 CASAVA_Build 11 10133667 1I TAGAACTTTA -/T TGTGTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 25 10 3 T 1 2 240064 CASAVA_Build 11 10138365 1D ATGTGTTGGT A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 A 8 7 240065 CASAVA_Build 11 10139441 4I CTCTACTCCT ----/AATG AATAGGGTAT 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 AATG 0 1 240066 CASAVA_Build 11 10142820 1I AAATGGAAAC -/A AACCAAACAG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 2 3 240067 CASAVA_Build 11 10142915 1D TATCTATACA C/- CCATACCACA 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 C 3 2 240068 CASAVA_Build 11 10145778 2I AAGCTATTTT --/AC ACCTAGATCA 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 AC 1 2 240069 CASAVA_Build 11 10148943 1I CCTCCTCAGT -/C TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 C 0 1 240070 CASAVA_Build 11 10149146 1I TGTTCATCAG -/T TTTTAATAGT 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 T 4 5 240071 CASAVA_Build 11 10157551 1D AAAAAAACTT A/- TTTTTGTCAC 1841 het 1841 ref 29 18 4 7 A 1 0 240072 CASAVA_Build 11 10160859 3D CTATGTCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 TTG 7 6 240073 CASAVA_Build 11 10165722 1I ATAAACTCAC -/T TTTTTTTTTT 2213 het 2213 ref 37 20 6 11 T 13 14 240074 CASAVA_Build 11 10166510 9I ACAATACACA ---------/GATGTAGTG GATGTAGTGG 3070 het 3070 hom 57 18 30 10 GATGTAGTG 1 2 240075 CASAVA_Build 11 10170048 1D ATGATTTCCC T/- TCTCCCTCTA 3070 het 3070 hom 61 24 30 8 T 2 1 240076 CASAVA_Build 11 10171365 1D CATTTTCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 12 10 2 A 10 9 240077 CASAVA_Build 11 10173001 2I ATTGAAATCT --/AG AGTCTCTACC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 AG 1 2 240078 CASAVA_Build 11 10177953 1I CCCTTGTGCA -/T TGTTGATGGC 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 T 1 2 240079 CASAVA_Build 11 10181927 1I GGTTGTTATA -/G TGATAGAAAC 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 G 0 1 240080 CASAVA_Build 11 10182663 19D TCAGGAGGCT GAGGCAGGAGAATGGCGTG/------------------- GAGGCAGGAG 905 het 905 ref 12 6 3 6 GAGGCAGGAGAATGGCGTG 2 1 240081 CASAVA_Build 11 10182781 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 20 6 A 13 12 240082 CASAVA_Build 11 10186325 1I CTCTAAACTT -/C CAGGCACGGT 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 C 1 2 240083 CASAVA_Build 11 10187431 2I TCCACAAATT --/TC TGTTTTTTTT 2497 het 2497 ref 36 13 14 9 TC 0 1 240084 CASAVA_Build 11 10188887 1D TGTAATCCCA G/- CACTTTGGGA 3070 het 1689 hom 28 5 14 9 G 1 0 240085 CASAVA_Build 11 10189241 1I TATTTGACAA -/G TGTAACACTG 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 G 0 1 240086 CASAVA_Build 11 10214737 1I TGTGCACCAC -/T TATACCCAGC 2664 het 2638 hom 13 6 6 1 T 1 2 240087 CASAVA_Build 11 10217684 7D5M4I GTGTCTGTAA CATCCTGCTGTA----/-------ATGGAAAAC AATTTTACTT 3070 het 3070 hom 39 19 22 2 N/A 0 0 240088 CASAVA_Build 11 10227359 1D GCTCTTTAAC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 8 7 240089 CASAVA_Build 11 10238544 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAATT 1236 het 1236 ref 6 3 3 0 A 8 9 240090 CASAVA_Build 11 10252874 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 14 0 11 3 A 18 16 240091 CASAVA_Build 11 10253468 1I AAAAGTCTTT -/A AGTGGCAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 1 2 240092 CASAVA_Build 11 10258281 17I TGCTCAAAAA -----------------/GTTTCAGATTTCAGAGT GTTTCAGATT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 GTTTCAGATTTCAGAGT 1 2 240093 CASAVA_Build 11 10260936 22D CAACAGACCC CACCATCTATAGAGTCAAGGCT/---------------------- CACCATCTAT 3070 hom 72 het 26 0 25 6 CACCATCTATAGAGTCAAGGCT 2 1 240094 CASAVA_Build 11 10263381 2D TTCAGTAAAC TG/-- TGATTGTGCG 3070 hom 60 het 21 0 21 2 TG 2 1 240095 CASAVA_Build 11 10271330 4I CAGAAATAAA ----/CGTG CGTGCATGAA 3070 hom 163 het 60 0 55 5 CGTG 1 2 240096 CASAVA_Build 11 10282751 1D CAAGCCGGCA G/- GGGGGCGCGG 2562 hom 30 het 12 0 10 2 G 6 5 240097 CASAVA_Build 11 10285324 1I ATATTGTCCT -/C CCCCTATTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 4 5 240098 CASAVA_Build 11 10301295 1D TCCAAAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 509 hom 36 3 22 11 A 18 17 240099 CASAVA_Build 11 10331250 1I AAATATAGAG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 7 8 240100 CASAVA_Build 11 10335338 1D GTTTTTGCTT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 23 19 3 G 2 1 240101 CASAVA_Build 11 10336757 1I GTTTTCGGGG -/T TGGGGGGGCA 3070 het 3070 hom 45 13 22 10 T 1 2 240102 CASAVA_Build 11 10339614 1I CTAAAAATGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 2581 hom 16 6 10 0 A 8 9 240103 CASAVA_Build 11 10339810 5D CAAAACAAAC AAACA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 573 hom 29 8 12 10 AAACA 1 0 240104 CASAVA_Build 11 10339899 2D ATTACATTAA GT/-- ATAAATGGTC 3070 het 3070 hom 31 11 18 4 GT 1 0 240105 CASAVA_Build 11 10340326 1D AGAAAAAGAT A/- AGACATCACA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 2 1 240106 CASAVA_Build 11 10341704 8D TGCCAGCATT ACGAATGA/-------- AAGAATGAAA 3070 het 3070 hom 42 17 25 5 ACGAATGA 1 0 240107 CASAVA_Build 11 10360829 2D GCACCTCCCA CT/-- CTCTGAGTCT 3070 hom 62 het 29 0 15 14 CT 3 2 240108 CASAVA_Build 11 10361335 1D TGGATGGATC A/- ACTTGAGGTC 3070 hom 60 het 22 0 19 3 A 2 1 240109 CASAVA_Build 11 10361823 1I6M1D TGTAATCCCA -CACTTTG/GCACTTT- GGGAGGCTGA 2047 hom 36 het 13 0 12 1 N/A 0 0 240110 CASAVA_Build 11 10377455 19D CATGATGTTT TAATGTACATATGTATGCA/------------------- TAATGTACAT 3070 het 3070 ref 50 20 14 20 TAATGTACATATGTATGCA 2 1 240111 CASAVA_Build 11 10377616 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 T 7 8 240112 CASAVA_Build 11 10378327 1D AAGGGTTCCC T/- TTTATCTACA 3070 hom 126 het 47 0 43 5 T 4 3 240113 CASAVA_Build 11 10389831 1D ACTCTTTTTC T/- TTTTTAACAA 3070 hom 44 het 40 1 27 12 T 6 5 240114 CASAVA_Build 11 10389861 1I ACTTTTACTT -/A TAGTGGGTGT 2365 het 2365 ref 37 8 6 23 A 0 1 240115 CASAVA_Build 11 10390813 1I TTTCCTGTTG -/C CCTTAAAATA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 C 2 3 240116 CASAVA_Build 11 10391013 6I CTCACCTGGC ------/TAATTT TAATTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TAATTT 1 2 240117 CASAVA_Build 11 10394368 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 A 10 9 240118 CASAVA_Build 11 10403223 1I GGTCAAACTC -/A ATTCTCCATC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 1 2 240119 CASAVA_Build 11 10407185 1D TGTGGGTACC A/- GGGGAATAAG 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 A 1 0 240120 CASAVA_Build 11 10421814 1D CTTTTGATAA T/- TTTTTACTGT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 6 5 240121 CASAVA_Build 11 10430304 3D GTTTTTTGTA GTT/--- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 GTT 2 1 240122 CASAVA_Build 11 10443521 1D ATTGATTTTT A/- AAAAATTAGG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 6 5 240123 CASAVA_Build 11 10460811 7D ATTAAAAAAA TATATAT/------- TATTATGTTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 TATATAT 1 0 240124 CASAVA_Build 11 10464125 2I GTGATGCCAG --/TC TCTCGAAAGT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 TC 2 3 240125 CASAVA_Build 11 10466590 9D GGGATGGTAT GAGAGAGTC/--------- GAGAGAGTCA 3070 het 3070 ref 36 15 17 6 GAGAGAGTC 2 1 240126 CASAVA_Build 11 10467809 1I TCTGTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1922 hom 23 6 13 4 T 12 13 240127 CASAVA_Build 11 10472633 1I TTATTAGAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 108 het 47 0 36 11 A 8 9 240128 CASAVA_Build 11 10481677 1D CTTTCAAAGA C/- CTGTTGTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 C 2 1 240129 CASAVA_Build 11 10483403 1D CTCGTCGGAT G/- ATGATGCAGC 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 G 1 0 240130 CASAVA_Build 11 10483499 3I35M1D GTCAGCTCTC ---AGGGGCTTCTTAATTAGAGTCTTACCTCCTTCCCCT/AGGAGGGACTTCTTAATTAGAGTCTTACCTCCTTCCCC- TTGCCTTTCC 3070 hom 114 het 39 0 38 15 N/A 0 0 240131 CASAVA_Build 11 10483629 1D CTGAGGATGA C/- TGAGGTTGTC 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 C 1 0 240132 CASAVA_Build 11 10488125 4D TTAGTATGGC TTAG/---- TTAAACTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 11 6 TTAG 1 0 240133 CASAVA_Build 11 10491811 1D TTTTCTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 10 9 240134 CASAVA_Build 11 10496590 4D GTAATTAGAC TGAA/---- TGAAAGAAGC 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 TGAA 2 1 240135 CASAVA_Build 11 10496988 2D TGTTAGGTGT AA/-- AAACAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 5 3 240136 CASAVA_Build 11 10498381 2D TTTTTGACTC TT/-- TTTGTAACAA 3070 het 976 hom 14 2 10 2 T 5 3 240137 CASAVA_Build 11 10501869 1D CTGTAACAAG A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 44 21 22 1 A 7 6 240138 CASAVA_Build 11 10503205 1I ACCAACTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 47 1 41 5 A 10 11 240139 CASAVA_Build 11 10505769 1D GAGAAGTCAC G/- GGGGGGGGTT 3070 het 3070 ref 45 19 10 16 G 9 8 240140 CASAVA_Build 11 10507175 1D AATAAAAGGT G/- TGGCAGAAAC 3070 het 3070 ref 36 16 17 4 G 1 0 240141 CASAVA_Build 11 10511665 2I TAAAAAAAAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 TA 6 7 240142 CASAVA_Build 11 10513481 1I ATTGTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 10 11 240143 CASAVA_Build 11 10531653 1I5M1D AAACTTGACC -TTATAT/TTTATA- ATAGACTATT 2657 het 2235 hom 32 14 17 1 N/A 0 0 240144 CASAVA_Build 11 10535080 1D GGGAGATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 24 0 16 8 T 12 11 240145 CASAVA_Build 11 10550017 2D AGTCCTGGCT TG/-- TGTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 41 20 18 5 TG 2 1 240146 CASAVA_Build 11 10553879 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTCTGAGA 3070 het 745 hom 29 4 21 4 G 0 1 240147 CASAVA_Build 11 10557742 1D GGGGTAGAGT A/- ACACCTCATC 3070 hom 135 het 50 0 45 8 A 2 1 240148 CASAVA_Build 11 10573280 1I ACTCCTGAGC -/T TTAAAGTATC 3070 het 1502 hom 24 6 10 8 T 2 3 240149 CASAVA_Build 11 10585784 1D GGCAACAGAG C/- ATGCCATCAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 C 1 0 240150 CASAVA_Build 11 10590073 3D CTTACTGATG AGA/--- AGAAGAGAGG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AGA 3 2 240151 CASAVA_Build 11 10595154 1D GGGGATAAAC T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 8 7 240152 CASAVA_Build 11 10598493 1D TAAAATACAG C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 70 het 26 0 23 3 C 8 7 240153 CASAVA_Build 11 10616635 2D AAACTCTGAC TG/-- TGCTTATAGC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 TG 2 1 240154 CASAVA_Build 11 10655702 8I GGTCACATTT --------/CCTCTTCA CCTCTTCACC 3070 hom 104 het 41 0 34 7 CCTCTTCA 1 2 240155 CASAVA_Build 11 10656175 1D GTCTATCCAT C/- CCACATTTTG 3070 hom 102 het 37 0 35 4 C 3 2 240156 CASAVA_Build 11 10663540 1I TTCCGTTCCC -/A AAAAAAAAAA 2884 het 313 hom 17 2 10 5 A 15 16 240157 CASAVA_Build 11 10665992 1I TTAGCTTTGC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 72 het 29 0 23 6 T 8 9 240158 CASAVA_Build 11 10669836 1D CATTCTGTGA G/- GGGGCATGTG 3070 hom 111 het 41 0 36 6 G 5 4 240159 CASAVA_Build 11 10670650 1D GTCCCTCGGT G/- GGGGCAATAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 5 4 240160 CASAVA_Build 11 10678924 2D TGGTTCTCAT TC/-- TCTGTTTGCC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 TC 2 1 240161 CASAVA_Build 11 10692322 1I AAAAAAAATC -/T TTTTTTTTTT 2563 hom 21 het 12 0 8 4 T 11 12 240162 CASAVA_Build 11 10696849 1I CTATTGCCGA -/C CTGGGCTTCC 3070 hom 125 het 46 0 39 7 C 1 2 240163 CASAVA_Build 11 10707818 1D GCGGGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 31 0 29 4 T 10 9 240164 CASAVA_Build 11 10713199 1I TTTTATTTTA -/T TTTTATTTCA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 4 5 240165 CASAVA_Build 11 10722904 2D ACCAAATATG TA/-- TATATATATA 1345 het 1345 ref 41 30 3 8 TA 7 6 240166 CASAVA_Build 11 10739497 4I5M7D GTTAGCAGGA ----TGTTACCAACCC/TGAGTGGTA------- AAATGGCTGT 3070 hom 117 het 40 0 37 8 N/A 0 0 240167 CASAVA_Build 11 10758815 4D GCCTCATCTA AATC/---- AAACCATTTC 3070 hom 95 het 34 0 31 5 AATC 1 0 240168 CASAVA_Build 11 10764391 1D GGAGGGAGAA T/- TGGGGGCACA 3070 hom 78 het 33 0 25 8 T 2 1 240169 CASAVA_Build 11 10766717 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 AAG 3 4 240170 CASAVA_Build 11 10767454 4I ACATTTTGGG ----/ACAA ACAGATTAAT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 ACAA 0 1 240171 CASAVA_Build 11 10775023 2D TCTTGAAGAG TC/-- TAAAAATTCC 3070 het 3070 hom 48 24 21 3 TC 1 0 240172 CASAVA_Build 11 10785067 1I CAAAAAGAAT -/A AAGCATCTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 2 3 240173 CASAVA_Build 11 10787917 2I TGTTTTTTTT --/TG TGTTTTTTGT 3070 hom 95 het 37 0 30 7 TG 1 2 240174 CASAVA_Build 11 10788275 4I AACCTTTGAT ----/TCCA GTGTCAAAAC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 TCCA 0 1 240175 CASAVA_Build 11 10788520 1I GAGATATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 35 0 20 15 A 15 16 240176 CASAVA_Build 11 10791027 4D AGAATTTAAT GTTA/---- GTTTCCATAT 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 GTTA 1 0 240177 CASAVA_Build 11 10793272 1D AAATAAGTCA G/- GGTGTGGTGG 3070 hom 84 het 33 0 23 10 G 3 2 240178 CASAVA_Build 11 10799012 1I CTTTTAAAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 9 10 240179 CASAVA_Build 11 10843679 2D GAAAAGATTC TT/-- GAGTTGTTTC 3070 het 3070 hom 39 11 23 8 T 2 0 240180 CASAVA_Build 11 10844514 1D CCATGTCTGG C/- TGATTTTTAT 3070 het 2273 hom 17 6 8 4 C 1 0 240181 CASAVA_Build 11 10853983 4I AGAATTTTTA ----/TGGT TTCAGATCTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TGGT 0 1 240182 CASAVA_Build 11 10861515 2I GTTTGATGTC --/TG TTGTTCTTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TG 0 1 240183 CASAVA_Build 11 10862264 3D AGAAATAAAG AGA/--- AGGAGTACAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 AGA 1 0 240184 CASAVA_Build 11 10884559 1D GGAAAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 36 1 30 6 T 11 10 240185 CASAVA_Build 11 10884699 1D AGCTGTCACT G/- GGGAGAAATG 3070 het 3070 hom 44 16 24 5 G 4 3 240186 CASAVA_Build 11 10887679 1I TGGGGGTACT -/G GGGGGGGGAT 726 het 726 ref 17 9 2 6 G 8 9 240187 CASAVA_Build 11 10888913 1I TGAAACGATG -/C TTTGTGGTAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 240188 CASAVA_Build 11 10898206 1I AATAACATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 10 11 240189 CASAVA_Build 11 10902539 3D CAATTAATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 35 2 18 15 T 15 12 240190 CASAVA_Build 11 10904413 1D TTTTTTTCTA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 65 het 25 0 21 4 T 7 6 240191 CASAVA_Build 11 10907374 1D CCTTTATAGA G/- ATATTAAATT 3070 het 3070 ref 47 24 16 8 G 1 0 240192 CASAVA_Build 11 10908602 2D CCCCGCTTCC GT/-- ATTACTATTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GT 1 0 240193 CASAVA_Build 11 10932156 1I GATCCTGTCT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 7 8 240194 CASAVA_Build 11 10957987 1I ATACGACCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 373 hom 25 1 23 1 T 9 10 240195 CASAVA_Build 11 10958428 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 423 hom 26 1 18 7 T 9 10 240196 CASAVA_Build 11 10969523 1I GAGGGTCCTC -/T TGATATTGAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 2 240197 CASAVA_Build 11 10970395 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 T 10 11 240198 CASAVA_Build 11 10975985 1I GTAATGATAA -/T AATAACTACA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 0 1 240199 CASAVA_Build 11 10989043 2D AAGACAGCTC CG/-- CAGGCAGCAC 3070 hom 129 het 46 0 41 6 CG 1 0 240200 CASAVA_Build 11 10990612 1I AGTTTTCAAG -/A AAAAAGAGAT 3070 hom 71 het 29 0 23 6 A 5 6 240201 CASAVA_Build 11 10991034 1D ACAAATATAT A/- TTTTTTTGTT 3070 het 2816 hom 19 7 8 5 A 1 0 240202 CASAVA_Build 11 10999863 2D AGTTTATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 TG 7 6 240203 CASAVA_Build 11 11001112 3D ATTTAATCCA GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 49 22 19 11 GTT 5 4 240204 CASAVA_Build 11 11004557 4D3M3D TTCTCTGGCA GTTGTCCCAT/----TCC--- TCAAACCAGT 3070 hom 147 het 52 0 49 7 N/A 0 0 240205 CASAVA_Build 11 11004844 1D GAATATGTGT A/- AGTGGTTATA 3070 het 3070 ref 51 23 23 6 A 2 1 240206 CASAVA_Build 11 11006972 1D GTGAAATTGG T/- TTTTGGGCTA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 5 4 240207 CASAVA_Build 11 11007838 1I AGTATTAATG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 8 9 240208 CASAVA_Build 11 11009313 24D CTCAAGCTCC TGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCT/------------------------ TGGCCTCCCA 3070 hom 30 het 8 0 11 0 TGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCT 1 0 240209 CASAVA_Build 11 11013978 1D GAATATTTCA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 8 7 240210 CASAVA_Build 11 11019682 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 300 hom 34 1 27 6 T 12 11 240211 CASAVA_Build 11 11024428 1D GTGCAGCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 21 11 T 13 12 240212 CASAVA_Build 11 11029504 1I TTTTATTTAG -/T TTTTTTAGTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 240213 CASAVA_Build 11 11031224 1D TATAAAAAAG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 7 240214 CASAVA_Build 11 11031648 1I CCATTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1618 het 610 hom 19 3 7 9 T 15 16 240215 CASAVA_Build 11 11033532 1D TGAGGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 40 2 23 15 T 13 12 240216 CASAVA_Build 11 11033712 1I TCTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 9 10 240217 CASAVA_Build 11 11049411 6I GTGGGTTTGC ------/CAATTT CAAAGGCCCT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 CAATTT 0 1 240218 CASAVA_Build 11 11050390 1D CCCTCCCACC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 106 het 39 0 34 5 T 8 7 240219 CASAVA_Build 11 11071430 1D TAGCAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 25 0 21 4 A 12 11 240220 CASAVA_Build 11 11079208 3I CCAAAAAACC ---/CAA CAACAACAAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 CAA 3 4 240221 CASAVA_Build 11 11079291 8I AGAGTACTCA --------/TGGTTTCT GAATTCTTGA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 TGGTTTCT 0 1 240222 CASAVA_Build 11 11083363 1I GATATTGAAC -/A GTGGAGCTTC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 0 1 240223 CASAVA_Build 11 11087991 1D CCCCTCTATG T/- TTTTTTTTTT 3045 het 3045 ref 32 18 9 5 T 13 12 240224 CASAVA_Build 11 11089022 1D AACACTGTAC T/- TTTCGGTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 T 4 3 240225 CASAVA_Build 11 11090327 2D AAGCTCACTG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 AC 10 9 240226 CASAVA_Build 11 11092153 1D GGAGATAAAG A/- AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 A 7 6 240227 CASAVA_Build 11 11092340 1D TCTTTACTTA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 8 7 240228 CASAVA_Build 11 11094058 3I TGCCATTGCC ---/TCT AGAAGTAGGG 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 TCT 0 1 240229 CASAVA_Build 11 11100335 1D TCGTTTATGC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 9 8 240230 CASAVA_Build 11 11102752 1I GAATTATGTG -/T TTTTTTTTTC 2169 het 2169 ref 29 19 7 3 T 9 10 240231 CASAVA_Build 11 11103595 3I TGTTCTGCAG ---/TTC TTCTCATAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTC 1 2 240232 CASAVA_Build 11 11104914 3I GCTCTAATTT ---/TTG TTATTTCTTT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 TTG 0 1 240233 CASAVA_Build 11 11105166 3D ATCATTCAGG AGC/--- AGATTATTTA 3070 het 3070 ref 34 21 12 2 AGC 1 0 240234 CASAVA_Build 11 11106875 9I ATTGACCTTC ---------/TGAGTTCCT TATAGGTTAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 TGAGTTCCT 0 1 240235 CASAVA_Build 11 11115563 5I TTTTAAACTC -----/AGAAG AAAGAGCCTC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AGAAG 0 1 240236 CASAVA_Build 11 11118551 5I GCCCCAGAAA -----/GCTAG GCTAGCTTGC 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 GCTAG 1 2 240237 CASAVA_Build 11 11120185 1D TCAACATACA G/- GGGAGCTGTG 3070 het 3070 hom 49 22 23 6 G 4 3 240238 CASAVA_Build 11 11122904 1D CCAGGGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 12 11 240239 CASAVA_Build 11 11137089 1D ATCGCGTGCA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 8 7 240240 CASAVA_Build 11 11138748 1D CAAATTGAAT G/- TTGCCTTTTC 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 G 1 0 240241 CASAVA_Build 11 11139166 1D GGCAGGGGGT A/- GGGGGGTCAT 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 A 1 0 240242 CASAVA_Build 11 11144182 12D GCACTTTCTC TTTCTCTTTTAT/------------ TTTCTCTTCT 3070 het 3070 ref 42 22 17 6 TTTCTCTTTTAT 1 0 240243 CASAVA_Build 11 11145673 2D ATTATCAAAT TG/-- TACAGTTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 6 TG 1 0 240244 CASAVA_Build 11 11148389 1D AGTGACCTTG A/- CTGAGTCTGT 3070 het 3070 ref 64 33 25 6 A 1 0 240245 CASAVA_Build 11 11157796 1D AAAAAGCAAG A/- AAAAAAGTGC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 7 6 240246 CASAVA_Build 11 11159429 1I TAAATATTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 8 9 240247 CASAVA_Build 11 11160500 3D CTCTTCCTTG GCT/--- GCTGCCCCTT 2870 het 2870 ref 38 17 10 11 GCT 2 1 240248 CASAVA_Build 11 11162309 1D TGTTGTTTAC A/- GATGCCATGA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 A 1 0 240249 CASAVA_Build 11 11164645 2D TGGTGGAAAC AT/-- AAATTTGTAC 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 AT 1 0 240250 CASAVA_Build 11 11167444 5D AGAGAGAAAA AAGAG/----- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 40 15 23 3 AAGAG 1 0 240251 CASAVA_Build 11 11169255 3D AAAAAGGAAA AAG/--- AAGGGCATTA 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 AAG 2 1 240252 CASAVA_Build 11 11171513 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2900 hom 28 het 13 0 9 4 A 15 14 240253 CASAVA_Build 11 11191859 1I CTTCTTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 10 11 240254 CASAVA_Build 11 11202459 1D AGGATGTCAG C/- CCAGGGTAGG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 C 3 2 240255 CASAVA_Build 11 11228144 2I GCATATATAT --/AC ACCTATATGT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 AC 1 2 240256 CASAVA_Build 11 11229798 2I GGGCAGAAAT --/TA TGTCATTTTG 3070 hom 157 het 58 0 53 5 TA 0 1 240257 CASAVA_Build 11 11230176 1I GAGCAACACA -/T TCCTGAGGGT 3070 hom 111 het 44 0 36 8 T 1 2 240258 CASAVA_Build 11 11231528 6D TAGGAAATGG GTGACT/------ GCTGTCTCAT 3070 het 3070 hom 39 14 21 6 GTGACT 1 0 240259 CASAVA_Build 11 11234556 2D AGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2637 hom 34 8 16 10 TG 8 7 240260 CASAVA_Build 11 11236621 4D TCAAATACTT ACTC/---- TATTTCAGGT 3070 het 3070 ref 34 18 15 3 ACTC 1 0 240261 CASAVA_Build 11 11238289 2I AAGGACATGC --/CT CTCTATCCTC 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 CT 2 3 240262 CASAVA_Build 11 11240823 2D AGCCCAGATT TC/-- TCTCTCTCTC 2133 het 2133 ref 46 25 8 13 TC 8 7 240263 CASAVA_Build 11 11240872 2I TACACGCACT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 44 23 9 12 CA 6 7 240264 CASAVA_Build 11 11242160 3D TGTCTCAGTC TCT/--- TCTTCTGTAA 3070 het 3070 hom 49 19 19 11 TCT 3 2 240265 CASAVA_Build 11 11251372 5D GGAAACAATC AAAGT/----- AAAGAGACAG 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 AAAGT 1 0 240266 CASAVA_Build 11 11251485 1I GCAAGAAGGC -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 A 6 7 240267 CASAVA_Build 11 11257723 6I AGCTATACTC ------/GATAAG GATAAATCTC 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 GATAAG 0 1 240268 CASAVA_Build 11 11259865 1I CCCTAGAGAC -/T TAGAAGTGCG 3070 het 3070 hom 37 14 12 11 T 1 2 240269 CASAVA_Build 11 11262957 2I AGATTAAGTC --/TT TTTTTTTGGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 9 240270 CASAVA_Build 11 11269598 2D TGCCTGACAC AT/-- AGTAAGTACT 3070 het 3070 hom 65 30 33 2 AT 1 0 240271 CASAVA_Build 11 11283307 1D TAGTTGGCCT G/- CAATATCTTG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 G 1 0 240272 CASAVA_Build 11 11284337 1D TGTGTGTGTC T/- GTGTGTGCAT 3070 hom 4 het 33 1 26 6 T 1 0 240273 CASAVA_Build 11 11284518 1I GTTAGCCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 57 25 19 13 A 9 10 240274 CASAVA_Build 11 11284962 1D CTCCCTTTAT C/- CGAGTCTGGG 3070 hom 135 het 52 0 44 10 C 2 1 240275 CASAVA_Build 11 11285871 1D GCATCCTTGA C/- CCCCCCAAGG 3070 hom 132 het 50 0 44 6 C 7 6 240276 CASAVA_Build 11 11290317 1I TCATGATCTG -/C CCACCTCGGC 2511 het 2511 ref 16 9 6 4 C 2 3 240277 CASAVA_Build 11 11292506 1D AAGCAGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 35 2 20 14 T 13 12 240278 CASAVA_Build 11 11295248 6I AACAAAATGG ------/TTATGT TTATGTTTAT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 TTATGT 1 2 240279 CASAVA_Build 11 11297339 1I CCTTCTTGCC -/T CTTCTTACAC 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 T 0 1 240280 CASAVA_Build 11 11301085 3I TGATGTCTGC ---/TCT TCTTATAAGG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 TCT 1 2 240281 CASAVA_Build 11 11302315 3D AGTTTATGTG GTT/--- TAAGGCCTGT 3070 het 3070 hom 47 21 22 5 GTT 1 0 240282 CASAVA_Build 11 11302777 1D TCCCTGATGA T/- TAGTGATGTA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 2 1 240283 CASAVA_Build 11 11307221 3I AATGTAACTC ---/CTT CTTGTTTGTT 3070 hom 115 het 44 0 36 8 CTT 1 2 240284 CASAVA_Build 11 11308079 5D CAAGTTTACA TAGCC/----- TAGCCATTAA 3070 hom 166 het 60 0 56 5 TAGCC 2 1 240285 CASAVA_Build 11 11311214 1I ATCCTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1019 hom 31 6 13 12 A 13 14 240286 CASAVA_Build 11 11318224 5I GCTGGCATCT -----/CTCAA CTCAGTAGTA 3070 hom 141 het 51 0 43 8 CTCAA 0 1 240287 CASAVA_Build 11 11318410 27I5M1I CTGTGAAGGT ---------------------------TAACT-/TAAACACTGTCTAAAAACTGCCCAGAATAACTC CCATCTCCTA 3070 hom 92 het 29 0 30 9 N/A 0 0 240288 CASAVA_Build 11 11322382 1D TCACATGGGT C/- TTTTTCCCCT 3070 hom 99 het 38 0 31 7 C 1 0 240289 CASAVA_Build 11 11322986 12D TCGGGCTATG TAACCTCTTGGC/------------ TAACAAACAC 3070 hom 88 het 34 0 28 13 TAACCTCTTGGC 1 0 240290 CASAVA_Build 11 11326212 2D TAAGAAAGAG AA/-- GAGAGGGCCG 3070 hom 69 het 27 0 22 6 A 2 0 240291 CASAVA_Build 11 11329885 3D AGCAATTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1668 het 5 hom 27 0 6 21 T 14 11 240292 CASAVA_Build 11 11339638 12D TCATAAAGTT TATCTATCTTTC/------------ TATCTATCTT 3070 hom 108 het 43 0 36 14 TATCTATCTTTC 2 1 240293 CASAVA_Build 11 11342683 1D AGAGGGGGGG A/- AAAAGAGATG 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 A 5 4 240294 CASAVA_Build 11 11343143 1D TTTTCCTTAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 8 240295 CASAVA_Build 11 11347761 4I ACAATTTCAA ----/TCCC TCCCTTGCCA 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 TCCC 1 2 240296 CASAVA_Build 11 11348200 1D TATCTTATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 A 10 9 240297 CASAVA_Build 11 11348712 1D GAGATGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 A 13 12 240298 CASAVA_Build 11 11349688 3I TCTCTCCAAG ---/CAT CATCGGCAAG 3070 het 3070 hom 52 11 27 14 CAT 1 2 240299 CASAVA_Build 11 11353898 3D GCAAATGTTT AAC/--- AACACAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 AAC 2 1 240300 CASAVA_Build 11 11355184 1D TTCCTTTCGA C/- CCTGCCCACC 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 C 3 2 240301 CASAVA_Build 11 11355794 1I TCTCCATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 36 1 25 10 A 12 13 240302 CASAVA_Build 11 11364557 4I AAACTAAGAC ----/AGTT AGTTGTACAT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 AGTT 1 2 240303 CASAVA_Build 11 11416951 1D CAACATGGAC A/- AATACGATCA 3070 hom 165 het 59 0 51 8 A 3 2 240304 CASAVA_Build 11 11441333 2D AGACAGACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 591 hom 43 4 17 26 AC 8 7 240305 CASAVA_Build 11 11441347 4D ACACACACAC ACAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 277 hom 45 8 23 17 ACAG 1 0 240306 CASAVA_Build 11 11450720 2I AAACAAAGAT --/AC AGACCAGACT 3070 hom 81 het 49 0 26 23 AC 0 1 240307 CASAVA_Build 11 11451792 1D TGTATGCACA C/- AGGGGGAGAG 3070 hom 87 het 31 0 29 3 C 1 0 240308 CASAVA_Build 11 11453276 1D ATTTTATCAC A/- ATAAAGTGAA 3070 het 3070 hom 26 8 10 9 A 2 1 240309 CASAVA_Build 11 11453324 2I TTTCTTATAA --/CT CTACTTCGTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CT 1 2 240310 CASAVA_Build 11 11458674 1D TAGTGTCTGG T/- TAGAAAGAGG 3070 hom 134 het 47 0 41 6 T 2 1 240311 CASAVA_Build 11 11459414 3D2M1I CCTGTGCTCC TCGCT-/---CTA GAGCATGAAT 3070 hom 119 het 45 0 39 7 N/A 0 0 240312 CASAVA_Build 11 11471873 2I GAAAGTCGTG --/CC TTTCTGCTCT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 0 2 240313 CASAVA_Build 11 11482563 1I TATTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 10 11 240314 CASAVA_Build 11 11483476 1D ACAGTGTGAG T/- TACCAGATTC 3070 het 3070 hom 59 24 29 7 T 2 1 240315 CASAVA_Build 11 11488614 1D TGTACCAGGC A/- CTGGGCATGC 3070 hom 102 het 49 0 34 15 A 1 0 240316 CASAVA_Build 11 11489240 1I AAGGCCTTCT -/C CTCCCGGGGG 3063 het 2287 hom 24 8 13 3 C 1 2 240317 CASAVA_Build 11 11492109 1D AGTGCTGGTT C/- CCCCCAAGGG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 C 6 5 240318 CASAVA_Build 11 11505744 1I TAAATATATA -/T TTATACATTT 3070 het 3070 hom 27 8 18 1 T 2 3 240319 CASAVA_Build 11 11507749 2D ATAATCTCCT TA/-- TATATATATA 3070 het 3035 hom 33 14 15 4 TA 7 6 240320 CASAVA_Build 11 11515345 1I ACAGTTAATC -/A GGGGTGGAGC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 0 1 240321 CASAVA_Build 11 11515489 1D CAAGTCAGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 9 8 240322 CASAVA_Build 11 11519909 3I CTACCCTCTC ---/CTT CTGGAACTTT 3070 hom 85 het 36 0 22 14 CTT 0 1 240323 CASAVA_Build 11 11537769 5I GATGGGATGC -----/GATGG GATGGGATGG 3070 hom 123 het 57 0 38 19 GATGG 2 3 240324 CASAVA_Build 11 11539477 5D AAATGAAGCA CTGTG/----- CTGTAGGGAA 3070 het 3070 hom 51 18 33 2 CTGTG 1 0 240325 CASAVA_Build 11 11547606 3I CCTCTGGGAA ---/TTC TTCTAAGAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TTC 1 2 240326 CASAVA_Build 11 11552898 1I TTAATATCTC -/T TCCCAGCAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 240327 CASAVA_Build 11 11571907 5D TAAAATAAAG TAAAA/----- TAAAATAAAA 3070 het 2056 hom 24 7 14 7 TAAAA 3 2 240328 CASAVA_Build 11 11590281 1D TAAGTCTTCA T/- TTTCTTACCT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 T 4 3 240329 CASAVA_Build 11 11633318 1I TAAGCACTGT -/A AAAAAAAAAA 1684 het 1684 ref 51 28 6 17 A 15 16 240330 CASAVA_Build 11 11662750 1D AAGTCTTATC A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 A 8 7 240331 CASAVA_Build 11 11674966 1D CTTCCTTACA C/- CCTTATACAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 3 2 240332 CASAVA_Build 11 11675638 1D AATTTATAAT C/- CTTTGGGTAT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 C 2 1 240333 CASAVA_Build 11 11699108 1D TACATACACA C/- CACATATATA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 2 1 240334 CASAVA_Build 11 11701905 1D ACCCAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 543 hom 28 3 18 7 A 15 14 240335 CASAVA_Build 11 11718303 3D CACCAGCCTC CTT/--- CTTACCTGGA 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 CTT 2 1 240336 CASAVA_Build 11 11728695 1D TAGACTGGAG T/- TTTTAAGAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 5 4 240337 CASAVA_Build 11 11731799 7D ATTTGAATAG TAGGAAT/------- TAGGAATGGC 3070 het 3070 ref 42 29 12 5 TAGGAAT 2 1 240338 CASAVA_Build 11 11742956 1D TAAACTTTTT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 8 7 240339 CASAVA_Build 11 11770938 1I ATCTTTAAAG -/C TTTTTCTCAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 C 0 1 240340 CASAVA_Build 11 11772146 1D ATTAACCTGC A/- AGCCCCTTTA 2341 het 2341 ref 23 14 6 3 A 2 1 240341 CASAVA_Build 11 11777127 2I CAGAAGCCAC --/CA CACCAGGGGG 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 CA 1 2 240342 CASAVA_Build 11 11780832 3D TACCCAGCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 789 het 789 ref 7 4 2 2 T 17 14 240343 CASAVA_Build 11 11789176 1D57M2D TATCTCAGTT CCCAGCTCAGCACCCCTTTCGCTGGAGGGCCTTATTAATTAACATCATCTAAATACTTTC/-CCAGCTCAGCACCCCTTTCGCTGGAGGGCCTTATTAATTAACATCATCTAAATACTT-- TGTGTATTTT 3070 het 3070 ref 34 36 13 11 N/A 0 0 240344 CASAVA_Build 11 11798232 4I CTCATTTCTT ----/AAAA AAAAAAAAAA 1490 het 1490 ref 23 11 7 5 A 12 16 240345 CASAVA_Build 11 11801559 4D48M4D ACATGCATGC ATGTATGTATGTATACACATACATAAATACACATATGCATACACATAGCTGCACAT/----ATGTATGTATACACATACATAAATACACATATGCATAAACATAGCTGC---- ACATATATAC 3070 het 3070 ref 70 56 28 14 N/A 0 0 240346 CASAVA_Build 11 11807974 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 A 11 10 240347 CASAVA_Build 11 11812498 1I TAATTTTTTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 7 8 240348 CASAVA_Build 11 11812651 2I TTTTTTTGAG --/AC AGTTTCACTC 2088 het 1730 hom 16 7 5 4 AC 0 1 240349 CASAVA_Build 11 11815071 1I CAAACTATGT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 7 8 240350 CASAVA_Build 11 11817396 1D AAATGTTCTG T/- TCAGGTCAAG 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 T 2 1 240351 CASAVA_Build 11 11828536 1I CCTTTTTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 A 9 10 240352 CASAVA_Build 11 11830735 1I AGGTGTCTTT -/G GCTTTCTTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 1 2 240353 CASAVA_Build 11 11835290 1I ACTCATCTCC -/A AAAAGATGCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 4 5 240354 CASAVA_Build 11 11838215 1I CAACAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 12 13 240355 CASAVA_Build 11 11840148 1D GTACAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 28 0 22 6 T 15 14 240356 CASAVA_Build 11 11840551 1I ACATTGTGGG -/T TTTTTTCATG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 6 7 240357 CASAVA_Build 11 11854387 2I CAGAGAACTC --/TT TTGACTAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 4 240358 CASAVA_Build 11 11855274 1D GCTATTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 32 0 30 2 A 11 10 240359 CASAVA_Build 11 11926016 2D ATTTATACTC AG/-- AGGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 AG 2 1 240360 CASAVA_Build 11 11960019 1I CTAGGCAGCT -/C CCCCCACCCC 1932 het 1932 ref 38 23 6 9 C 5 6 240361 CASAVA_Build 11 11962562 3I AAGTACTGCA ---/AAT AATATTGTGG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 AAT 1 2 240362 CASAVA_Build 11 11962779 1I AATTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 2401 het 2401 ref 32 14 7 11 A 17 18 240363 CASAVA_Build 11 12025694 1D AAGTGCTGCC A/- AAAAAGAACA 3070 het 3070 hom 31 13 15 5 A 6 5 240364 CASAVA_Build 11 12026193 1D GGTGGTAGCT C/- ATACCTATAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 1 0 240365 CASAVA_Build 11 12027582 1I CTAAGAAGAT -/C ACTCAGATCT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 C 0 1 240366 CASAVA_Build 11 12034206 1I GCAAATTACC -/T TATTGACAAT 2127 het 2127 ref 32 18 7 7 T 1 2 240367 CASAVA_Build 11 12039317 1I CAGAATCCCC -/A AACTGCCCTA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 2 3 240368 CASAVA_Build 11 12041593 1D TCATTAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 864 hom 28 5 13 10 A 18 17 240369 CASAVA_Build 11 12045396 1I GTTGCCTTAA -/G CTGTATTCAC 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 G 0 1 240370 CASAVA_Build 11 12049527 1D TACCAGCGCT G/- GGGGGGGCCC 2129 het 2129 ref 15 8 5 2 G 8 7 240371 CASAVA_Build 11 12052454 1D ACAACATAGC A/- AAGACCCTGT 3070 het 158 hom 24 2 15 7 A 3 2 240372 CASAVA_Build 11 12058033 1D GGCAGTTCCT G/- GTAATTGGCA 3070 het 3070 ref 25 16 8 2 G 2 1 240373 CASAVA_Build 11 12067943 1I GCCTGTGGCA -/G GGGCAGGGGG 3070 het 3070 hom 34 17 13 4 G 3 4 240374 CASAVA_Build 11 12068129 1I AATTAAAAAG -/A AAAAAGATCT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 5 6 240375 CASAVA_Build 11 12075843 1D AACATGTAAC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 106 het 41 0 36 5 T 8 7 240376 CASAVA_Build 11 12079436 1D16M1I TATCTTTTAT GGGGGGGGATGGCCTCC-/-GGAGGGGATGGCCTCCT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 20 18 7 N/A 0 0 240377 CASAVA_Build 11 12086495 1D ATAAAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 37 1 24 13 A 14 13 240378 CASAVA_Build 11 12094267 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 T 8 7 240379 CASAVA_Build 11 12101945 1D TTCTCTGTGG T/- TTTCCTCTGA 3070 het 3070 ref 63 30 25 10 T 4 3 240380 CASAVA_Build 11 12103993 1D TCTTATTCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 240381 CASAVA_Build 11 12108407 1D GAGGGACCCT G/- CAACTGAAGG 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 G 1 0 240382 CASAVA_Build 11 12112950 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2908 het 2908 ref 30 14 8 8 A 10 11 240383 CASAVA_Build 11 12115416 1I ACCAGGACTA -/C AATCAGAGTT 3070 hom 58 het 33 0 19 14 C 0 1 240384 CASAVA_Build 11 12123265 1I GCTGGGTTCA -/T TGTAGCACAT 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 T 1 2 240385 CASAVA_Build 11 12125339 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 2949 het 2949 ref 21 14 7 0 A 8 9 240386 CASAVA_Build 11 12126953 1I CAGGGAGGGC -/A AAATTATGCT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 3 4 240387 CASAVA_Build 11 12143301 1D AGAAAGAAAT A/- AAAAAATCAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 7 6 240388 CASAVA_Build 11 12145359 2D2M8I GGACTCTTGT CACC--------/--CCTGCTGGTG AGCAGGAATC 3070 hom 99 het 37 0 34 6 N/A 0 0 240389 CASAVA_Build 11 12147070 3D ATCCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 520 het 94 hom 18 2 7 9 A 17 14 240390 CASAVA_Build 11 12147357 1D TCTACACACA T/- TTTTTTCTAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 7 6 240391 CASAVA_Build 11 12147502 4D CACCATCTCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTTA 5 4 240392 CASAVA_Build 11 12158287 2D TACCTTGTAT TG/-- TCTACTTGGC 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 TG 1 0 240393 CASAVA_Build 11 12169909 2D AAAGAAAAAA AG/-- AGAGAGATGT 3070 hom 100 het 38 0 34 5 AG 4 3 240394 CASAVA_Build 11 12170296 1D CCCTTTATAG A/- AAAAAATGTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 7 6 240395 CASAVA_Build 11 12173712 1I TTACAATGGG -/A AAAATATAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 4 5 240396 CASAVA_Build 11 12180788 1D TTTATTTTAT A/- AGTTAGGTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 1 240397 CASAVA_Build 11 12186405 1D TATTTTACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 46 0 35 11 T 10 9 240398 CASAVA_Build 11 12190867 2D CACATGAATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 40 0 28 13 TG 7 6 240399 CASAVA_Build 11 12191202 2D TCTCACTGAC TT/-- TTAAAAGCCT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 4 2 240400 CASAVA_Build 11 12208838 2I ATTCTTCTTT --/CC CCCCCCCCAT 3070 het 3001 hom 33 11 14 8 C 8 10 240401 CASAVA_Build 11 12211076 4D CCCACTCCAT CCTG/---- CCTGGAATGT 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 CCTG 2 1 240402 CASAVA_Build 11 12212426 1I GGTAGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 A 12 13 240403 CASAVA_Build 11 12216223 1D GGATCTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 53 23 26 4 A 9 8 240404 CASAVA_Build 11 12216779 12I GGGATCCTGG ------------/ATTGAATCCTGA GACAGAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 ATTGAATCCTGA 0 1 240405 CASAVA_Build 11 12229345 31D AGCCACAGAT AGTTTGAGGAGCAGTGAGCTAAGCCACAGTG/------------------------------- AGTTTGAGGA 3070 het 3070 ref 36 23 15 8 AGTTTGAGGAGCAGTGAGCTAAGCCACAGTG 1 0 240406 CASAVA_Build 11 12273268 1D ATTTTGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 27 0 18 10 T 13 12 240407 CASAVA_Build 11 12295915 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1238 hom 25 6 15 4 A 14 15 240408 CASAVA_Build 11 12297571 1I TGGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 T 12 13 240409 CASAVA_Build 11 12299776 4I GTAAGGCTGT ----/GTGA GTGTTTATTA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 GTGA 0 1 240410 CASAVA_Build 11 12303171 1I TGAGTCCTGC -/T TGGCACCCAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 1 2 240411 CASAVA_Build 11 12307093 1D TTAATTTAGC A/- ACTAGATTTC 3070 het 3070 ref 52 28 23 1 A 2 1 240412 CASAVA_Build 11 12311483 1D AACTTTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 11 10 240413 CASAVA_Build 11 12314373 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTATTAT 3070 het 2473 hom 16 5 11 1 TGTT 1 0 240414 CASAVA_Build 11 12319591 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 A 9 8 240415 CASAVA_Build 11 12334079 1D TGAGAGAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 10 9 240416 CASAVA_Build 11 12336709 2I CCTGGAACTT --/AA GTTATACCTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 2 240417 CASAVA_Build 11 12338240 3I CCTTTTTTTT ---/AAA TTTAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 0 3 240418 CASAVA_Build 11 12338312 8D GAGGCACCTA CCTACCTG/-------- CCTACCTATG 3070 hom 57 het 24 0 19 6 CCTACCTG 1 0 240419 CASAVA_Build 11 12344631 1I TTCCACCTCT -/G GGGGCAGGGC 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 4 5 240420 CASAVA_Build 11 12349195 1D CAATGGCAAC A/- AAAGCCAAAA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 4 3 240421 CASAVA_Build 11 12350746 1D AATTCATAAT A/- TTTTTTTGAG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 1 0 240422 CASAVA_Build 11 12352243 3I AAGCTTCTGA ---/TTT TTATTGTTAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 5 240423 CASAVA_Build 11 12354240 6D TTTTTTTTTT TTTTAA/------ AAAAGGTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 TTTTAA 1 0 240424 CASAVA_Build 11 12357364 4I CTTTATGACC ----/TGTA TGTATCTTGT 3070 hom 124 het 43 0 42 1 TGTA 1 2 240425 CASAVA_Build 11 12357768 1I TGTGTGAAAT -/G TTTCATGTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 0 1 240426 CASAVA_Build 11 12382228 1D AATATAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 T 13 12 240427 CASAVA_Build 11 12384630 2D TGTATTTTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 11 9 240428 CASAVA_Build 11 12399222 2I GTCTTGGTGG --/AC TCGGAGCTTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AC 0 1 240429 CASAVA_Build 11 12400729 1I CTTATAGGGT -/A CATTTCCCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 1 240430 CASAVA_Build 11 12404133 3I CATTCAACAG ---/ATA ATGATTGAGT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 ATA 0 1 240431 CASAVA_Build 11 12404671 1D TGCTCCAAGC A/- ATAAATATAT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 2 1 240432 CASAVA_Build 11 12424164 3I CATTTACTTT ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 9 12 240433 CASAVA_Build 11 12435923 10I TCCTTCAGAT ----------/ATGCACACAG ATGCACAATT 3070 hom 123 het 56 0 46 10 ATGCACACAG 0 1 240434 CASAVA_Build 11 12436698 5I AAAAATATAC -----/TCTCT TAACTCCCCA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TCTCT 0 1 240435 CASAVA_Build 11 12449486 2I TATCCACTTA --/AT CTCTTTTAAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AT 0 1 240436 CASAVA_Build 11 12449720 2I TAGCAAACTA --/AC ACAGGAGCAG 3070 hom 114 het 46 0 39 8 AC 1 2 240437 CASAVA_Build 11 12455831 1I CATAGTGAGA -/C CCCCATCTCA 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 C 4 5 240438 CASAVA_Build 11 12465639 3I CCAGCTAGAT ---/ATC ATCAAGTGCT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 ATC 1 2 240439 CASAVA_Build 11 12468652 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 G 0 1 240440 CASAVA_Build 11 12471479 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 23 4 A 15 14 240441 CASAVA_Build 11 12471736 1I ACCAGACGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1030 hom 33 3 24 6 A 11 12 240442 CASAVA_Build 11 12473745 1I GAGTTTTTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2220 hom 30 5 17 8 T 8 9 240443 CASAVA_Build 11 12473780 1D GTCATTGCAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 1719 hom 30 4 9 17 A 9 8 240444 CASAVA_Build 11 12474512 1I AATAACTGAG -/T TAAGTGCATG 3070 het 3070 hom 48 20 27 1 T 1 2 240445 CASAVA_Build 11 12479230 1D AATCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 11 14 A 13 12 240446 CASAVA_Build 11 12480015 4D TATAAGAACA ACTT/---- ACTTGATCAC 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 ACTT 2 1 240447 CASAVA_Build 11 12480929 1D ACTATTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 23 7 T 12 11 240448 CASAVA_Build 11 12485182 1D AAATGATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 5 T 11 10 240449 CASAVA_Build 11 12488691 10D AAACTGGGAA TGAAAAATGG/---------- TGAAAAATGG 3070 het 3070 ref 37 20 19 4 TGAAAAATGG 2 1 240450 CASAVA_Build 11 12489868 3D GTTATCAGGC CAT/--- CATTGACCTT 3070 het 3070 hom 44 15 18 11 CAT 2 1 240451 CASAVA_Build 11 12492062 16D CGGAGCAGCC ACAGGCTCCTGCACTA/---------------- GTGCGAGTCC 3070 het 3070 ref 32 20 12 4 ACAGGCTCCTGCACTA 1 0 240452 CASAVA_Build 11 12504356 1D AAATAAAATC T/- TTTTTTTTAA 1870 het 1870 ref 19 12 6 1 T 9 8 240453 CASAVA_Build 11 12505425 20I CAGAGGAAAG --------------------/GAGGGAGGATGGGAGGATTA GAGGGAGGGA 3070 het 2724 hom 37 10 12 15 GAGGGAGGATGGGAGGATTA 0 1 240454 CASAVA_Build 11 12508851 4I GTTTTTTATC ----/ACTT ACTTAATGTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 ACTT 1 2 240455 CASAVA_Build 11 12528345 1I CCCTGTGTCT -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 A 6 7 240456 CASAVA_Build 11 12533401 4D ACAAATGGAT AAAG/---- AAAAAGTGGT 3070 het 3070 hom 50 21 24 6 AAAG 1 0 240457 CASAVA_Build 11 12533618 1D GCCAAAGGCT G/- GGGGGGTGGG 3070 hom 107 het 42 0 35 7 G 7 6 240458 CASAVA_Build 11 12534683 3D GTCACAGCCC ACT/--- GAGATTACTT 3070 het 3070 hom 50 25 22 6 ACT 1 0 240459 CASAVA_Build 11 12536680 1I TGGAGAAAGA -/C GTCTGAAACT 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 C 0 1 240460 CASAVA_Build 11 12540043 1D GGGGACATCA T/- TCCCATCACA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 2 1 240461 CASAVA_Build 11 12541106 3D AAAATTCTTC TTA/--- TTATTATTTG 3070 het 3070 ref 34 21 12 3 TTA 3 2 240462 CASAVA_Build 11 12542144 3I GAGAACTTTC ---/TTT ATGACCTTGG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 0 3 240463 CASAVA_Build 11 12543570 3I GGGAGGCACA ---/GTG GCTCATGCCT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 GTG 0 1 240464 CASAVA_Build 11 12543836 1I ATCCTGTCTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 A 8 9 240465 CASAVA_Build 11 12555208 1D GCTTTCAAGA T/- TTTTTTTTTT 2708 het 2708 ref 31 15 8 8 T 12 11 240466 CASAVA_Build 11 12561059 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2502 het 1334 hom 18 5 10 3 A 11 12 240467 CASAVA_Build 11 12562358 1I TAATTACGTT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 7 8 240468 CASAVA_Build 11 12566132 1I AGCATCCCCT -/C CCCGTGTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 C 3 4 240469 CASAVA_Build 11 12566471 2I TAGGCGCGCG --/CA CCACCACGCC 3070 het 1561 hom 16 5 9 2 CA 0 1 240470 CASAVA_Build 11 12569329 2I CATATTCATT --/TC TCTCTCTAAA 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 TC 3 4 240471 CASAVA_Build 11 12572498 1I ATTTATCATA -/T TAACCTAGTA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 1 2 240472 CASAVA_Build 11 12573228 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 21 het 10 0 8 3 A 9 10 240473 CASAVA_Build 11 12576382 1I CACAGGAAAT -/A AAAACATTTG 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 A 4 5 240474 CASAVA_Build 11 12580324 5D AAAACAGAAA TATCT/----- TATCTAAAGT 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 TATCT 2 1 240475 CASAVA_Build 11 12586584 1D CTGGTCATTA G/- AGAAATGCAA 3070 het 3028 hom 20 7 12 1 G 1 0 240476 CASAVA_Build 11 12595722 2I TTAACAAAAG --/TT TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 49 24 15 10 T 3 5 240477 CASAVA_Build 11 12597768 1D ACCTCTTAAA T/- TTTTTGATTG 3070 hom 91 het 38 0 31 7 T 6 5 240478 CASAVA_Build 11 12599510 2I CCCATACTCC --/CT GTTTGCAGAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CT 0 1 240479 CASAVA_Build 11 12601808 2I CAAAAGAGAC --/TT TAAGTTAAAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 1 3 240480 CASAVA_Build 11 12609882 2I TTATACACAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 166 het 66 0 55 11 AC 5 6 240481 CASAVA_Build 11 12613565 1D CTAAGTGTCA T/- TTTTTTCACG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 7 6 240482 CASAVA_Build 11 12614208 1D TGTCTTTTAC A/- AAAAAACTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 7 A 7 6 240483 CASAVA_Build 11 12629891 1I TCTTCTTCTA -/T TTTTTTTTTT 1806 het 1806 ref 33 10 8 15 T 17 18 240484 CASAVA_Build 11 12688145 1D CCAAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 13 12 240485 CASAVA_Build 11 12754123 1I AAGTTACGGC -/A AGGGTCACAG 2879 het 1481 hom 30 7 8 15 A 1 2 240486 CASAVA_Build 11 12771244 1D TATGAAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 12 11 240487 CASAVA_Build 11 12775218 2I CCTGGGAAAC --/AG AGCAAGACTC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 AG 1 2 240488 CASAVA_Build 11 12786370 1I AAATTATAGG -/T TCATAGTAGG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 1 2 240489 CASAVA_Build 11 12806802 1D AACTGAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 35 2 22 11 T 14 13 240490 CASAVA_Build 11 12812861 2D TTGGGATTAC AG/-- AGGTTCACAC 3070 hom 57 het 21 0 20 2 AG 2 1 240491 CASAVA_Build 11 12815425 4I TTTCTGCAAA ----/CACT CAAGAAAAGG 3070 hom 90 het 33 0 29 4 CACT 0 1 240492 CASAVA_Build 11 12830359 6D2M1I GCTTTAGGTA CCAGACTA-/------TAC AGGAGTTTGT 3070 hom 90 het 31 0 28 7 N/A 0 0 240493 CASAVA_Build 11 12842195 1D TTATAAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 36 1 27 8 A 15 14 240494 CASAVA_Build 11 12846975 4D AACTTTTCTG TTAT/---- TTTTCCAGTA 3070 het 3070 ref 46 24 21 1 TTAT 1 0 240495 CASAVA_Build 11 12856757 1I TGAGGGGTAG -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 6 7 240496 CASAVA_Build 11 12856935 1I TATATATATG -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 0 1 240497 CASAVA_Build 11 12864788 1D TCACAACTGA T/- TTTTTTTTTT 1626 het 1626 ref 33 18 5 10 T 15 14 240498 CASAVA_Build 11 12867528 1D CAGCCCCCCA C/- CAGGGCAGCA 3070 hom 67 het 28 0 20 8 C 2 1 240499 CASAVA_Build 11 12877428 4I TCTAGGTAAT ----/AAAG AAACAATGCC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 AAAG 0 1 240500 CASAVA_Build 11 12884665 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 15 2 10 3 A 17 16 240501 CASAVA_Build 11 12907116 1D ATTTTATATC A/- CTTGTGGCCT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 1 0 240502 CASAVA_Build 11 12907558 1D GTGGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 33 0 29 5 T 11 10 240503 CASAVA_Build 11 13022888 8D CAACTGTTGA AAGGAAGG/-------- AAGGAAGGAA 3070 hom 68 het 35 0 22 17 AAGG 7 5 240504 CASAVA_Build 11 13033277 2I ATGTAGGCCT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 33 9 13 11 AC 8 9 240505 CASAVA_Build 11 13057314 1D CCTTGTCCCC T/- TGTTAAATTT 3070 het 3070 ref 46 24 14 9 T 2 1 240506 CASAVA_Build 11 13070771 1D CAGGTGTGGA T/- TTTATTTTTC 1541 hom 15 het 6 0 6 0 T 4 3 240507 CASAVA_Build 11 13072565 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTGGTA 3070 hom 50 het 19 0 17 2 T 6 7 240508 CASAVA_Build 11 13073908 3D42M1I TACATGGAAT GAGGAGTCAAATGTTCTTGCTTCCTCAGCTATCATTATTTCTAGT-/---GAGTCAAATGTTCTTGCTTCCTCAGCTATCATTATTTCTAGTA AATTTTTAAC 3070 hom 108 het 30 0 37 4 N/A 0 0 240509 CASAVA_Build 11 13075215 1I GAGTAAGACT -/C TGTCTCTAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 5 C 0 1 240510 CASAVA_Build 11 13077395 2D ACAACTGATT AG/-- AGACCAAGGG 3070 hom 123 het 43 0 41 2 AG 2 1 240511 CASAVA_Build 11 13079712 1I TCAAAAATAA -/T AAAATAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 0 1 240512 CASAVA_Build 11 13080704 1I GAAAGGCTCT -/G CTAGTTAAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 G 0 1 240513 CASAVA_Build 11 13082223 4I GGAAGAGAGA ----/AAGG AAGGAAGAAA 3070 hom 35 het 17 0 12 5 AAGG 1 2 240514 CASAVA_Build 11 13088665 2I AAGATCACTT --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 27 0 12 15 A 9 11 240515 CASAVA_Build 11 13088713 2D AGAAAGTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 22 0 15 8 A 15 13 240516 CASAVA_Build 11 13091757 1I AACAGAAGGG -/A AAGGGAAGCG 3070 hom 78 het 31 0 24 7 A 2 3 240517 CASAVA_Build 11 13095913 2D CCTCCAAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 28 0 20 8 T 16 14 240518 CASAVA_Build 11 13096376 4D AGGACCTGTG GGCA/---- GGCAGAGCAG 3070 hom 114 het 41 0 39 5 GGCA 2 1 240519 CASAVA_Build 11 13101530 1D AAGGAAGTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 A 10 9 240520 CASAVA_Build 11 13111395 5D AACATTTGTT TACTG/----- TAGAGTAAGT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 TACTG 1 0 240521 CASAVA_Build 11 13111613 1D TTCAATTGCC T/- TTCAAAATCA 3070 het 3070 hom 50 16 26 8 T 3 2 240522 CASAVA_Build 11 13111852 4I ATGCAATTTT ----/AATA AATAAATACA 2403 het 2403 ref 25 14 7 4 AATA 2 3 240523 CASAVA_Build 11 13114408 2D TTCAAAGTAC AT/-- GTCTGGTCAG 3070 het 3070 ref 38 19 17 4 AT 1 0 240524 CASAVA_Build 11 13115951 10D TGTGATTCAG ACACTGTACA/---------- AGGCCCTGGG 3070 het 3070 ref 41 28 13 7 ACACTGTACA 1 0 240525 CASAVA_Build 11 13119078 1I CCATGCCCCC -/A AACCACAAAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 2 3 240526 CASAVA_Build 11 13119596 2D CACATTTTTC AG/-- AGTGAGGCCA 3070 het 3070 ref 55 26 22 8 AG 2 1 240527 CASAVA_Build 11 13119983 2I ACTAGCAAAC --/AG GGAATTACAG 3070 hom 111 het 38 0 34 4 AG 0 1 240528 CASAVA_Build 11 13122160 1I CTTGGTTCTT -/C CTCCATCCTT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 C 1 2 240529 CASAVA_Build 11 13156155 1D TATTATTCAT A/- ATAGAGAAAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 2 1 240530 CASAVA_Build 11 13182881 1D TCAAAATTTA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 8 7 240531 CASAVA_Build 11 13186338 1D GAATGAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 41 0 29 12 A 13 12 240532 CASAVA_Build 11 13186527 1I AAATCTTTTG -/A AAAATCTGTT 3070 het 3070 ref 60 32 21 7 A 4 5 240533 CASAVA_Build 11 13196358 1D AAAAATACAG A/- AATTAGCCTA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 A 3 2 240534 CASAVA_Build 11 13197417 1I AAATAAAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 787 hom 28 3 19 6 T 8 9 240535 CASAVA_Build 11 13211355 1I GTAAGGATGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 92 het 34 0 29 5 T 8 9 240536 CASAVA_Build 11 13214014 1D TAGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 8 A 11 10 240537 CASAVA_Build 11 13214274 1I CTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2238 hom 25 9 11 5 T 13 14 240538 CASAVA_Build 11 13221604 12D TAACCAGTGC ATAATACTATGG/------------ AGGCTTCTGC 3070 het 3070 ref 43 23 17 9 ATAATACTATGG 1 0 240539 CASAVA_Build 11 13233314 1D TCAGCTGCAC A/- TGCATCCAGC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 1 0 240540 CASAVA_Build 11 13235595 2D ACATTGTGAA TG/-- TACTTAATCC 3070 het 3070 hom 38 12 23 4 TG 1 0 240541 CASAVA_Build 11 13248400 6I CTTTTTTCTA ------/TATATT TATGGCTTAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TATATT 0 1 240542 CASAVA_Build 11 13252328 1D TAATGCCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 T 10 9 240543 CASAVA_Build 11 13254250 3D CTCCCTGCAA TCT/--- TCTTTTCGGT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 TCT 2 1 240544 CASAVA_Build 11 13270679 1I CAAAAAAAAA -/T AAAATAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 0 1 240545 CASAVA_Build 11 13272531 3I ATTTTTCAAC ---/AAT GAGTGTGAAT 3070 hom 129 het 45 0 43 2 AAT 0 1 240546 CASAVA_Build 11 13301613 10D4M1D CCCCATGTTA TGAGGTCCCCATCAT/----------CTCA- TTTTACCTGG 3070 het 3070 ref 39 24 18 6 N/A 0 0 240547 CASAVA_Build 11 13302261 2I CAGACCACTG --/CT CTCTACCCTC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CT 2 3 240548 CASAVA_Build 11 13302503 1D CTGCCGCATC T/- TTTCTTACTG 3070 het 3070 ref 37 22 11 5 T 4 3 240549 CASAVA_Build 11 13305360 1I CTTTTATGAA -/C AAAAAAAAAT 3070 het 2680 hom 22 7 12 3 C 0 1 240550 CASAVA_Build 11 13306017 28I TCCCTGAAGT ----------------------------/CCACCCAGGGATCCCAGTTAACAATTTC TGATCTGGAA 3070 hom 129 het 42 0 43 2 CCACCCAGGGATCCCAGTTAACAATTTC 0 1 240551 CASAVA_Build 11 13325807 1I TCCTCTCTAC -/A AAAAAATATA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 6 7 240552 CASAVA_Build 11 13341251 28D TCTTTATTTC ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 3070 het 156 hom 13 1 9 3 AT 20 6 240553 CASAVA_Build 11 13360420 4I ACTACAAAGT ----/AAGA AAGACCTGGG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 AAGA 1 2 240554 CASAVA_Build 11 13361819 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 A 8 9 240555 CASAVA_Build 11 13364490 2I TCCTTAGAGC --/TG TGTCTCTTCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TG 1 2 240556 CASAVA_Build 11 13367267 4D AGGATAACCT GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 GAAA 3 2 240557 CASAVA_Build 11 13369556 11D TACTTAACAG AACTAAACTGT/----------- AACTAAACTG 3070 het 3070 ref 59 25 19 17 AACTAAACTGT 2 1 240558 CASAVA_Build 11 13378820 2D TCCACCCCCC AG/-- AGGTAGTTCT 3070 hom 78 het 31 0 24 7 AG 2 1 240559 CASAVA_Build 11 13381666 1I TTCTGAAAGA -/T ACATCATCTA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 0 1 240560 CASAVA_Build 11 13384979 2I CTTAGCCATG --/TC TCTCTCTCCA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 TC 4 5 240561 CASAVA_Build 11 13385636 1D GGCATATAAT G/- GGAACTTAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 3 2 240562 CASAVA_Build 11 13393705 1I CTGCCCCTTC -/T TTTTTTTTTT 1779 het 1518 hom 22 6 7 9 T 11 12 240563 CASAVA_Build 11 13396308 1I CAAAGTTTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 9 10 240564 CASAVA_Build 11 13398441 1I GTAAGAAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 T 9 10 240565 CASAVA_Build 11 13399232 3I TTATAGTTAT ---/ATC ATGTGTTCAC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 ATC 0 1 240566 CASAVA_Build 11 13406102 1I TATGACATTG -/T TAACAGTACT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 1 2 240567 CASAVA_Build 11 13414914 1D GATTTCTCTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 9 8 240568 CASAVA_Build 11 13421356 4D CAGCCTGACA GAGT/---- GAGAACCCAT 3070 het 3070 ref 27 15 8 6 GAGT 1 0 240569 CASAVA_Build 11 13443849 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1191 het 1191 ref 29 17 3 10 A 13 12 240570 CASAVA_Build 11 13448258 1I ACAAACTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 30 1 25 4 A 10 11 240571 CASAVA_Build 11 13451229 1I CCCCCAATAT -/C CCTTGAAACC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 2 3 240572 CASAVA_Build 11 13451527 6D CAGATAGCTA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 37 2 19 19 T 20 14 240573 CASAVA_Build 11 13455118 2I AAATCTACAC --/AT AGATTTTATA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 AT 0 1 240574 CASAVA_Build 11 13479000 2D CCCTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 44 0 36 10 A 12 10 240575 CASAVA_Build 11 13479990 6I ACAATATTAC ------/TTGTTG TTGTTGTTTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 TTG 2 4 240576 CASAVA_Build 11 13492131 1D TACAGTTTTC T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 T 6 5 240577 CASAVA_Build 11 13497590 1I GTGCTAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1691 hom 33 5 23 5 A 13 14 240578 CASAVA_Build 11 13499488 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 29 1 27 1 T 11 12 240579 CASAVA_Build 11 13506509 27D ATACTAACTT TTTTGTGATGATTAACTGATATATATA/--------------------------- TCAGGTTTTT 3070 hom 75 het 21 0 26 3 TTTTGTGATGATTAACTGATATATATA 1 0 240580 CASAVA_Build 11 13507484 2D GTTTCGTGAC TT/-- TAACGATCGG 1469 hom 7 het 4 0 3 1 T 3 1 240581 CASAVA_Build 11 13517192 1D TCCCCTGCAT A/- AGCTCTGTCT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 2 1 240582 CASAVA_Build 11 13550350 3D AAACGAGACA AAG/--- AAGGCCATTA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AAG 2 1 240583 CASAVA_Build 11 13562371 4I AAACCTAGAA ----/AGGC AGGCAGGCCA 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 AGGC 2 3 240584 CASAVA_Build 11 13565078 1D TTCCTATACA C/- CAACAATACA 3070 het 3070 ref 33 14 13 7 C 2 1 240585 CASAVA_Build 11 13583688 2D TGCCAGCATT TC/-- TTATTGCCTG 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 TC 1 0 240586 CASAVA_Build 11 13587817 2I TTAACAGTAT --/AC ACAGCAACTT 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 AC 1 2 240587 CASAVA_Build 11 13589553 2D TGTGATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1686 het 1686 ref 24 10 6 8 T 13 11 240588 CASAVA_Build 11 13592412 1I CCAACTTTTA -/T TTTTAGGTTC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 4 5 240589 CASAVA_Build 11 13593069 1I TCTGTTTTTT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 G 1 2 240590 CASAVA_Build 11 13594028 1I TTGGCGGTAT -/G GCCATTTTAA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 G 1 2 240591 CASAVA_Build 11 13607632 3I TTTTCTGGTT ---/TTA TTATTATCAT 2380 het 2380 ref 34 19 9 6 TTA 2 3 240592 CASAVA_Build 11 13611793 1D AAGGAATGTA C/- AATCATGGTA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 C 1 0 240593 CASAVA_Build 11 13617692 8I AATACATTGG --------/TATTCATA TATTTGTATA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 TATTCATA 0 1 240594 CASAVA_Build 11 13619152 1I GATTTTGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 9 10 240595 CASAVA_Build 11 13624981 24D CAGACTTCCA AACAAGATGTTGTTTGGAAACAAC/------------------------ AACAAGATGT 3070 het 3070 ref 46 33 11 9 AACAAGATGTTGTTTGGAAACAAC 1 0 240596 CASAVA_Build 11 13635515 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 10 10 5 A 10 9 240597 CASAVA_Build 11 13638663 1D AATGATATAA T/- TTGGATCTGT 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 T 3 2 240598 CASAVA_Build 11 13648008 1D TCTTTATGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3062 hom 38 12 16 11 A 10 9 240599 CASAVA_Build 11 13656846 1I ATTTAGTGGG -/T TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 1 2 240600 CASAVA_Build 11 13657337 1I TATTGAAATA -/C TGTGTTTCAC 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 C 0 1 240601 CASAVA_Build 11 13664841 1D TTATCTGTTT A/- AAAAAAACTC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 8 7 240602 CASAVA_Build 11 13666375 1D GTTTTTTTTT C/- CCCTAGGAGG 3070 het 2560 hom 25 11 11 4 C 4 3 240603 CASAVA_Build 11 13671701 1D GTGAGCAATC T/- TTTAATTATC 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 T 4 3 240604 CASAVA_Build 11 13690415 1D CTTAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 1311 het 1311 ref 36 26 3 7 A 13 12 240605 CASAVA_Build 11 13690887 3D TTAAAATAAG TTA/--- TTATTTTTGG 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 TTA 2 1 240606 CASAVA_Build 11 13699411 6D GAGTTGGAAT TATAAA/------ TATAACACAG 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 TATAAA 1 0 240607 CASAVA_Build 11 13710249 1D TCTCTGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 12 11 240608 CASAVA_Build 11 13712688 1I AATTTAAGAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 2774 hom 21 7 11 3 A 8 9 240609 CASAVA_Build 11 13713241 3D CCAGCTACTT AGG/--- AGGCTGAGGC 3070 het 2310 hom 17 6 10 1 AGG 2 1 240610 CASAVA_Build 11 13717760 1D CAATTCCTAC T/- TACTTCTCCC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 2 1 240611 CASAVA_Build 11 13724182 13I CACGGTGGTG -------------/AGCTCAGGAGTCA GTATTGCCTG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 AGCTCAGGAGTCA 0 1 240612 CASAVA_Build 11 13725385 1D CAGCCCTGGT G/- GGGCTGCTTT 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 G 4 3 240613 CASAVA_Build 11 13727794 2I TCAAGGGAAC --/AT ATCCCATGGG 3070 hom 57 het 23 0 18 5 AT 1 2 240614 CASAVA_Build 11 13732134 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 8 240615 CASAVA_Build 11 13735389 5I TTCAGATATT -----/GAAAA GAAAAGGCAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 GAAAA 1 2 240616 CASAVA_Build 11 13736023 3D AATTTTGATT AAG/--- AAGGAGATTT 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 AAG 2 1 240617 CASAVA_Build 11 13737020 3D TGTTTTCAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 31 4 13 17 A 17 14 240618 CASAVA_Build 11 13737841 1D TACATTTCAA G/- GCAGTGCCTA 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 G 2 1 240619 CASAVA_Build 11 13741751 1I ATGCCAATAA -/G GTGAAGTAAA 3070 hom 147 het 55 0 47 8 G 1 2 240620 CASAVA_Build 11 13755247 1I CTTAGCATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 T 10 11 240621 CASAVA_Build 11 13756166 1D AATTGAGTTG T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 T 8 7 240622 CASAVA_Build 11 13759951 5I AAATATTTGT -----/AAAAC AAAACAAATG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAAAC 1 2 240623 CASAVA_Build 11 13765374 2D CTGGATGATG AA/-- GAGAGAAATT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 A 2 0 240624 CASAVA_Build 11 13769092 12I CACATGTATA ------------/TATATATGTGTG GGTATGTATT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 TATATATGTGTG 0 1 240625 CASAVA_Build 11 13778001 3I ATTGGTGAGG ---/ATA ATCTTTACTC 3070 het 3070 hom 45 13 29 3 ATA 0 1 240626 CASAVA_Build 11 13778684 1D GCGTAGGGGT A/- GGGGGGAGGG 1839 het 1839 ref 13 6 4 3 A 1 0 240627 CASAVA_Build 11 13781050 1I TTCAAATGTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 8 9 240628 CASAVA_Build 11 13782634 1I AAATATATAA -/C CCCCCCCGAC 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 C 7 8 240629 CASAVA_Build 11 13789845 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2930 hom 35 9 18 9 T 11 10 240630 CASAVA_Build 11 13793097 2I AACTGTACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 17 20 11 AC 8 9 240631 CASAVA_Build 11 13811386 1D TTTGTTTTTT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 1254 hom 31 7 16 8 C 10 9 240632 CASAVA_Build 11 13813051 1I TTTCTTTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 9 10 240633 CASAVA_Build 11 13836500 1D TCTCCTGATG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 82 het 32 0 26 6 T 8 7 240634 CASAVA_Build 11 13843097 1D ATATATATTA T/- TGATCCTCTC 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 T 2 1 240635 CASAVA_Build 11 13847597 1D GCATTTGTTG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 8 7 240636 CASAVA_Build 11 13853195 1I GAGAGTAGTC -/G GGTCCTGAGA 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 G 2 3 240637 CASAVA_Build 11 13854486 1D ATAGCTGGGA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 9 8 240638 CASAVA_Build 11 13856350 1I TCCTTTACTC -/A AAAAAAACAG 3070 hom 111 het 46 0 36 10 A 7 8 240639 CASAVA_Build 11 13861490 1D GAGGGGAGAG A/- AGGTGGTGCT 3070 hom 143 het 53 0 48 5 A 2 1 240640 CASAVA_Build 11 13868897 1I CTAGAAATTA -/T TGAACTCTTC 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 T 1 2 240641 CASAVA_Build 11 13869349 4I AATGAGAATT ----/AAAA AGAGAGAAAT 3070 het 3070 ref 51 27 13 11 A 1 5 240642 CASAVA_Build 11 13898754 1D TGTCGGACTT A/- AAACTAGAGA 3070 hom 77 het 37 0 25 13 A 4 3 240643 CASAVA_Build 11 13898862 1D GGACTACGGA T/- GGGGAGAGTT 3070 hom 93 het 39 0 32 8 T 1 0 240644 CASAVA_Build 11 13900092 1D TTCCTATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 39 0 29 10 A 11 10 240645 CASAVA_Build 11 13902407 3D GCCTGTGATA AAC/--- AACATTGAGA 3070 hom 107 het 42 0 34 10 AAC 2 1 240646 CASAVA_Build 11 13903644 2I GCTTCTGCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 34 0 21 13 A 14 16 240647 CASAVA_Build 11 13905670 1I GGTCAACCTA -/C CAACATTTTA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 1 2 240648 CASAVA_Build 11 13919364 2D AATGTCTTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AT 8 7 240649 CASAVA_Build 11 13923436 1I TGTAAGCTAT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 87 het 40 0 30 10 A 8 9 240650 CASAVA_Build 11 13923657 8D GAATCCTAGG TCTCTGAC/-------- TCACAAAAGG 3070 hom 87 het 34 0 30 7 TCTCTGAC 1 0 240651 CASAVA_Build 11 13933078 1I GCATGCTAGC -/A AAAATTACAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 4 5 240652 CASAVA_Build 11 13943107 1D TCCTAGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 170 hom 31 1 26 4 A 12 11 240653 CASAVA_Build 11 13945663 1D ACCCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 31 1 24 6 A 13 12 240654 CASAVA_Build 11 13953290 1I TGTTGCTATA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 6 7 240655 CASAVA_Build 11 13955848 1I GTGCTTTTTT -/A ATGCTCTATG 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 A 1 2 240656 CASAVA_Build 11 13983851 4I GTTGCTAAGT ----/ATTA ATTATTATAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 ATTA 1 2 240657 CASAVA_Build 11 14002129 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 610 hom 32 2 19 11 A 12 13 240658 CASAVA_Build 11 14009784 1D CAGTGGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 25 1 17 8 T 11 10 240659 CASAVA_Build 11 14015653 2I CCACATGTAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 11 13 240660 CASAVA_Build 11 14020518 1I AGTCCTGGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 A 11 12 240661 CASAVA_Build 11 14039070 1I CTAGTTTGGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 A 9 10 240662 CASAVA_Build 11 14057817 1I AAAAGCTCTC -/A TTTTTTTTTT 1734 hom 33 het 33 0 11 22 A 0 1 240663 CASAVA_Build 11 14058070 1I GACTGCTGTG -/C CTGCGGAACT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 C 1 2 240664 CASAVA_Build 11 14060309 1I GGAGGAGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 28 2 21 5 A 11 12 240665 CASAVA_Build 11 14075967 1D TGTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 10 9 240666 CASAVA_Build 11 14076775 2D TATGAAAGGC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 88 het 36 0 29 7 AG 7 6 240667 CASAVA_Build 11 14119152 4I TGCCCCCCCC ----/CCCA ATGCCCCACT 1255 het 1255 ref 29 13 7 9 CCCA 0 1 240668 CASAVA_Build 11 14121684 1D CCCTGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 2941 het 584 hom 19 3 10 7 A 13 12 240669 CASAVA_Build 11 14121815 1D GCAGGATTTC A/- GTCCTGTAGA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 1 0 240670 CASAVA_Build 11 14125023 1I AGCCATCTGG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 6 7 240671 CASAVA_Build 11 14125874 4I ATACTAAGAC ----/TTTT TTTTTTTTTT 546 het 546 ref 27 11 7 9 T 13 17 240672 CASAVA_Build 11 14126597 1I TAGTTGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 A 9 10 240673 CASAVA_Build 11 14128044 6I GAGGCATGAC ------/TGTATT TGGGAAATCA 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 TGTATT 0 1 240674 CASAVA_Build 11 14137115 2I TATCTCTTAC --/TA TTTGTTTCTA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 TA 0 1 240675 CASAVA_Build 11 14140319 1I AGGTTTTCTT -/A AAAATATAAA 3065 het 3065 ref 33 14 9 10 A 4 5 240676 CASAVA_Build 11 14145640 1D AACAAAACCA T/- TTTCATTATC 3070 hom 31 het 17 0 11 6 T 4 3 240677 CASAVA_Build 11 14156932 4D TGCTATTATG GTAA/---- GTGTCGGATT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 GTAA 1 0 240678 CASAVA_Build 11 14157174 1D ATACCTGAAA G/- GAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 63 31 28 4 G 2 1 240679 CASAVA_Build 11 14161909 1I GACTCTAAAG -/C ATATGGTCTT 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 0 1 240680 CASAVA_Build 11 14162009 3D ATAAAATATG ATA/--- ATAATATTCA 3070 het 3070 ref 51 23 19 11 ATA 3 2 240681 CASAVA_Build 11 14165905 1I CCCAGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1938 hom 18 5 9 4 T 10 11 240682 CASAVA_Build 11 14168358 1I TTCCCTCACT -/C CCAGGAGCCT 3070 het 3070 ref 57 31 22 4 C 2 3 240683 CASAVA_Build 11 14168767 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1942 het 124 hom 14 3 7 4 T 14 13 240684 CASAVA_Build 11 14170631 1I TCTGAAGCTG -/C CCCCGTCAAT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 C 4 5 240685 CASAVA_Build 11 14178262 1I CCCTATTCTC -/T TATGTTATAT 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 T 1 2 240686 CASAVA_Build 11 14199713 1I CACTCTAAGT -/G GACTCATCCG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 G 1 2 240687 CASAVA_Build 11 14210053 1I5M2I AGGATGGTGG -GATTA--/TCCTTACC TAGGGTCATT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 N/A 0 0 240688 CASAVA_Build 11 14234490 3I AATTGATTAC ---/TAA TAATATCTGC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 TAA 1 2 240689 CASAVA_Build 11 14260782 1I AATTGGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 10 11 240690 CASAVA_Build 11 14272495 1I GAGCACCGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 10 11 240691 CASAVA_Build 11 14276115 2I AACTAGCCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 27 0 17 10 A 14 16 240692 CASAVA_Build 11 14276901 1I TGCCTATCAT -/A AGAATCAAAA 3070 hom 154 het 59 0 52 7 A 1 2 240693 CASAVA_Build 11 14284199 1I AAAAAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 27 1 17 9 T 11 12 240694 CASAVA_Build 11 14285653 1I TGGGATAACA -/G GCGCCCACCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 1 2 240695 CASAVA_Build 11 14300399 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 14 15 240696 CASAVA_Build 11 14302103 1D CATTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 33 1 26 6 A 13 12 240697 CASAVA_Build 11 14305937 1I CTCAATAGAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 8 9 240698 CASAVA_Build 11 14308776 1I AGTTAACATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 8 9 240699 CASAVA_Build 11 14325992 1D ATTCCAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 11 10 240700 CASAVA_Build 11 14330798 1D AAAAAGGCGT G/- TCAAGTGGCA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 1 0 240701 CASAVA_Build 11 14338690 1D GATCAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 13 12 240702 CASAVA_Build 11 14349722 1I ATGAGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 49 1 36 12 T 11 12 240703 CASAVA_Build 11 14362675 1I ATACATAAAC -/A AGGATTTACA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 1 2 240704 CASAVA_Build 11 14389621 2D TCTATCCCCA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 121 het 63 1 48 15 AC 10 9 240705 CASAVA_Build 11 14394626 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 31 4 16 11 A 17 16 240706 CASAVA_Build 11 14395820 1I GGGGAGGAGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 80 het 35 0 27 8 T 7 8 240707 CASAVA_Build 11 14402636 10D TAGTACACAA TGTTTTGTTT/---------- TGTTTTGTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TGTTT 4 2 240708 CASAVA_Build 11 14406325 1I CTAGCTACTC -/A AGGAGGCTGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 1 2 240709 CASAVA_Build 11 14416714 2I TTTGTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 29 0 21 8 T 10 12 240710 CASAVA_Build 11 14424641 4D TATGGGACAC AAGG/---- AAGCAGAGAA 3070 hom 102 het 38 0 34 8 AAGG 1 0 240711 CASAVA_Build 11 14426163 1D TCACTATCTG C/- TTACAATTTG 3070 hom 108 het 46 0 34 14 C 1 0 240712 CASAVA_Build 11 14427792 1I CTGACTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 647 hom 28 2 20 6 T 13 14 240713 CASAVA_Build 11 14432465 1I CAGACCCCGT -/C CCCAAAAAAA 2049 het 22 hom 12 1 11 0 C 3 4 240714 CASAVA_Build 11 14437378 4D GTTTACTTAA CTTG/---- CTTGACTGCC 3070 hom 84 het 32 0 28 5 CTTG 2 1 240715 CASAVA_Build 11 14443974 1D CTTTACTAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 9 8 240716 CASAVA_Build 11 14445313 1D AAATTCAAAC A/- AAAAAAACCA 3070 hom 69 het 38 1 35 2 A 8 7 240717 CASAVA_Build 11 14451701 16I GGGTAACAGC ----------------/CAGTTGGTGGAGCAGT CGGAACACAC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 CAGTTGGTGGAGCAGT 0 1 240718 CASAVA_Build 11 14472574 1D GAATCAAAAA T/- TTTTTTAAAA 1646 het 1646 ref 34 21 8 6 T 7 6 240719 CASAVA_Build 11 14480755 1D AGAATATTTA T/- TTTTTTAGCT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 T 7 6 240720 CASAVA_Build 11 14487051 1D GCCAACACCT A/- ACTCATCTCC 3070 hom 96 het 40 0 33 8 A 2 1 240721 CASAVA_Build 11 14489638 1I ACTGAAAGTC -/A AGTGTAATTT 3070 hom 116 het 46 0 40 6 A 1 2 240722 CASAVA_Build 11 14510240 1D TTTTTCTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 817 hom 30 2 21 7 A 12 11 240723 CASAVA_Build 11 14512894 4D TAAAAAAATT AAAA/---- AAACAAACAA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 7 3 240724 CASAVA_Build 11 14513282 1I GAAGCTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 824 hom 34 4 22 8 T 12 13 240725 CASAVA_Build 11 14560583 3D GCAAAAACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 AAC 7 6 240726 CASAVA_Build 11 14562634 1I TTTTTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 1121 het 1121 ref 37 22 5 10 G 0 1 240727 CASAVA_Build 11 14576737 1I CCTCCTTCCC -/T TTATTTTGAG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 2 3 240728 CASAVA_Build 11 14588481 1D ACAGCCTCCG A/- AGATGTCTTA 3070 hom 76 het 36 0 29 8 A 2 1 240729 CASAVA_Build 11 14617385 2I TAAATCTAGG --/AA AAAAAGGGTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 5 7 240730 CASAVA_Build 11 14633092 1D AGGAAACCTA G/- GCGAACAGGA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 G 2 1 240731 CASAVA_Build 11 14647000 1I GTTTTGGAAG -/C CTGTTTGTCT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 C 1 2 240732 CASAVA_Build 11 14647671 1D GTGCCATGTT G/- GGTGTGCTGC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 3 2 240733 CASAVA_Build 11 14651040 1D AAAACTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 24 1 16 7 T 15 14 240734 CASAVA_Build 11 14658903 1I AAATGACTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 37 1 28 8 A 12 13 240735 CASAVA_Build 11 14705984 1I TACAAACCTT -/A ACAAGGCTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 2 240736 CASAVA_Build 11 14715885 1D GCTATCCCTT C/- CCCCCTCCCC 3070 hom 18 het 9 0 7 2 C 6 5 240737 CASAVA_Build 11 14717517 2D CATGATTTGG CT/-- CTCTGTTTGC 3070 hom 66 het 23 0 23 1 CT 3 2 240738 CASAVA_Build 11 14734924 3I TTAAGTGCTT ---/TTC ATTTTTTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTC 0 1 240739 CASAVA_Build 11 14740277 1D GATTTTATAC T/- TTTTTTTTTT 919 het 919 ref 27 17 3 8 T 13 12 240740 CASAVA_Build 11 14772442 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 901 hom 29 3 16 11 T 15 14 240741 CASAVA_Build 11 14786791 4I TATTATCACC ----/AATA AATAAGTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AATA 1 2 240742 CASAVA_Build 11 14788015 1I GACTAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 513 hom 30 2 22 6 T 12 13 240743 CASAVA_Build 11 14794549 1I TGGGTCTTTA -/T TTTTCAAATA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 4 5 240744 CASAVA_Build 11 14799770 1I TAGACTAATT -/G TTTTTCATTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 0 1 240745 CASAVA_Build 11 14804925 1D AAGGACTCCT C/- CCCCAACCCA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 C 5 4 240746 CASAVA_Build 11 14831237 2I GTTCTCCCTG --/AC CCCAGAGGGC 3070 hom 119 het 42 0 39 3 AC 0 1 240747 CASAVA_Build 11 14833036 1I AGAATAACTG -/A TCACAGGGAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 240748 CASAVA_Build 11 14836394 1I GCTGTAGAAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 240749 CASAVA_Build 11 14837938 4I GCCAAAGAAC ----/TCAT TCATATTCAC 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 TCAT 1 2 240750 CASAVA_Build 11 14839043 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 56 hom 31 1 25 5 AC 8 7 240751 CASAVA_Build 11 14850276 5D TGGCTTACTT AAGTC/----- ATCAGAAATT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 AAGTC 1 0 240752 CASAVA_Build 11 14874078 1D GGTGTGGGGG T/- TTCAGAAGAG 3070 hom 114 het 44 0 37 8 T 3 2 240753 CASAVA_Build 11 14884321 4D GGCGTACTCT GCGC/---- GCGCGCGGAG 3070 hom 58 het 24 0 18 7 GC 5 3 240754 CASAVA_Build 11 14886802 6D TCCTTCCCTT TCTAAG/------ GTGGAGAGTA 3070 hom 111 het 42 0 36 9 TCTAAG 1 0 240755 CASAVA_Build 11 14887615 13D TGTGAGAGAG ATTTAAGTTATAT/------------- ATTTAAGTCT 3070 het 3070 hom 28 13 12 7 ATTTAAGTTATAT 1 0 240756 CASAVA_Build 11 14888951 1D AAATTTAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 31 7 T 10 9 240757 CASAVA_Build 11 14917406 1I CCATGAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 10 12 T 12 13 240758 CASAVA_Build 11 14922690 4I AGAATTGCTC ----/TGTT TATTTTAATA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TGTT 0 1 240759 CASAVA_Build 11 14931180 2D GATAAGTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 6 T 12 10 240760 CASAVA_Build 11 14933491 1D ACTTCATAGT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 56 1 51 5 G 2 1 240761 CASAVA_Build 11 14943061 1D ATAATAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 10 9 240762 CASAVA_Build 11 14947671 1D GCAGATTAAC A/- AGGTGGATCC 3070 hom 135 het 49 0 46 4 A 2 1 240763 CASAVA_Build 11 14969447 1D CCCATATCGT G/- GGGGGGGTCC 3070 hom 42 het 20 0 10 11 G 8 7 240764 CASAVA_Build 11 14970078 2I TACACTCCCC --/TT GTAATATTGT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 0 2 240765 CASAVA_Build 11 14982461 4D AGAAGAATAA AATG/---- AATGAGTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AATG 2 1 240766 CASAVA_Build 11 14986821 1I TTTCAGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1001 hom 41 3 24 14 T 12 13 240767 CASAVA_Build 11 15001916 5I CTGACAAAAT -----/ATTTG ATTTAAGTAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATTTG 0 1 240768 CASAVA_Build 11 15005176 1I TGGGTAGGGG -/C TCATGAAGTG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 C 0 1 240769 CASAVA_Build 11 15007251 12D TATGTGTATG TATATATATATA/------------ TATATATATA 2089 het 406 hom 19 5 6 11 TA 15 9 240770 CASAVA_Build 11 15009060 1D TTCTTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 11 10 240771 CASAVA_Build 11 15022159 8D3M18D AATCTTTGGA TTATACATTAGTATAATTTGGATTATACA/--------TAG------------------ TTAATTAATC 3070 hom 66 het 21 0 23 4 N/A 0 0 240772 CASAVA_Build 11 15024063 1I TGGTGGACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 10 240773 CASAVA_Build 11 15029486 1I AGGCCAAGGC -/G GGGGGGATTA 2937 het 2596 hom 21 9 9 3 G 6 7 240774 CASAVA_Build 11 15043002 4D GACAGTTTGA TTGT/---- TTGTCCAAAT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 TTGT 2 1 240775 CASAVA_Build 11 15065531 1D ATTCCTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 11 10 240776 CASAVA_Build 11 15066449 1D GGTCCTGGGC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 8 7 240777 CASAVA_Build 11 15073804 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 9 8 240778 CASAVA_Build 11 15076446 9D CTGTATTTCC CATATTTTG/--------- CATATTTTGC 3070 hom 123 het 48 0 42 10 CATATTTTG 2 1 240779 CASAVA_Build 11 15083118 5D TCTCTATCAT CTCTG/----- CTCTGCTCTG 3070 het 3070 ref 42 19 17 7 CTCTG 3 2 240780 CASAVA_Build 11 15084382 1I AAGGTTTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 255 hom 36 1 25 10 T 9 10 240781 CASAVA_Build 11 15099189 1I ATGAATACAT -/A TGAAAATGTT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 0 1 240782 CASAVA_Build 11 15116296 1D CAATTTGTGA C/- CCCCCCAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 7 6 240783 CASAVA_Build 11 15126752 5I AGCAACCACT -----/ATGCC ATGCCGATAA 3070 hom 178 het 65 0 60 5 ATGCC 1 2 240784 CASAVA_Build 11 15132192 1I AGCCAAGCCT -/G GGGGTAGGCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 4 5 240785 CASAVA_Build 11 15132926 1I CTTTTGTCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 685 hom 53 2 43 8 T 9 10 240786 CASAVA_Build 11 15136983 3D TTGTTGGTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 2028 het 166 hom 33 5 12 18 T 21 18 240787 CASAVA_Build 11 15147323 1I AGGGAGGGTT -/C CCCGATGTAG 3070 hom 125 het 46 0 39 7 C 3 4 240788 CASAVA_Build 11 15162338 1D TTATTACAAA T/- TTCAGTAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 3 2 240789 CASAVA_Build 11 15164371 1I TTTCTGCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 28 5 T 11 12 240790 CASAVA_Build 11 15174605 1D AAACTCTGCT A/- ACAACAAATC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 2 1 240791 CASAVA_Build 11 15176131 5I GCTGCACTCG -----/GTTCT GTTCTTGAAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 GTTCT 1 2 240792 CASAVA_Build 11 15204938 1I TATCTAATGA -/C GGTTATTCCT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 C 0 1 240793 CASAVA_Build 11 15211817 4I TCCTAGTTTG ----/TCCT TCCTTCCTTC 3070 het 3070 hom 55 17 19 19 TCCT 4 5 240794 CASAVA_Build 11 15224637 2D AAATGGAATC AT/-- ATAAAATGTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 AT 2 1 240795 CASAVA_Build 11 15225856 4D AGAAATAAGG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 27 het 16 0 10 6 TA 11 9 240796 CASAVA_Build 11 15254018 1I TATTAAGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 9 10 240797 CASAVA_Build 11 15273123 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2419 hom 18 het 7 0 7 0 A 13 12 240798 CASAVA_Build 11 15275579 4D TATAGTGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 74 het 32 0 25 10 AAAC 4 3 240799 CASAVA_Build 11 15276436 1D AATATTAAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 8 7 240800 CASAVA_Build 11 15278189 4D AGCAGGCACA CACT/---- CTACCAAGTA 3070 hom 154 het 56 0 52 6 CACT 1 0 240801 CASAVA_Build 11 15287300 2I TGCACAAAGA --/CT CTAATGTAAT 3070 het 3070 ref 58 26 26 6 CT 1 2 240802 CASAVA_Build 11 15290659 1I CAGGGTGGGT -/G GGAGGAGGAC 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 G 2 3 240803 CASAVA_Build 11 15291621 1D TTCTTCTCTG T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 7 6 240804 CASAVA_Build 11 15291677 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTGAGG 3070 hom 92 het 40 0 31 9 T 7 6 240805 CASAVA_Build 11 15300128 1I TTATAGCACT -/C CCCCCCACCA 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 C 6 7 240806 CASAVA_Build 11 15307464 2I TCAAAGTAAC --/AT AGCTAGCAAA 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 AT 0 1 240807 CASAVA_Build 11 15309244 1D CATGGACCTA G/- GGAAAACTTC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 G 3 2 240808 CASAVA_Build 11 15315791 2I ATTACTAACA --/AC ACACTATGCA 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 AC 2 3 240809 CASAVA_Build 11 15318750 1D TTTCTCTTTG T/- TTTTTTTTTC 2861 het 2691 hom 17 7 6 4 T 10 9 240810 CASAVA_Build 11 15323029 2D GGAAAGACAA AG/-- AGAGAGACAG 3070 het 3070 hom 56 17 31 11 AG 4 3 240811 CASAVA_Build 11 15332544 1I AAAAGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 17 11 T 14 15 240812 CASAVA_Build 11 15333708 3D GAAATGAAGA AAG/--- AAGAAGTAAG 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 AAG 3 2 240813 CASAVA_Build 11 15338518 1D TAACTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 11 10 240814 CASAVA_Build 11 15347190 1I TAAAGTATCC -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 6 7 240815 CASAVA_Build 11 15347319 7D TGTGGATATA CCTTGAT/------- CTCTGGGCAG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 CCTTGAT 1 0 240816 CASAVA_Build 11 15353860 13D TTCTCTATTG TAAGACTCTGTGC/------------- TAAGAGAAGG 3070 het 3070 ref 45 22 22 4 TAAGACTCTGTGC 1 0 240817 CASAVA_Build 11 15354633 2I GGGAAAGGAG --/AC ACTGAGGAGA 3070 hom 118 het 45 0 35 10 AC 1 2 240818 CASAVA_Build 11 15358131 1I CATTGTAAAT -/C CATTATGTCT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 1 2 240819 CASAVA_Build 11 15367816 3D GCTAATTTGA CTT/--- CTTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 16 15 5 CTT 3 2 240820 CASAVA_Build 11 15367995 1D AGTTAGCTAT G/- GGTTTGTCAT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 G 3 2 240821 CASAVA_Build 11 15368353 1I GATATAAGGA -/G AAATGAATGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 0 1 240822 CASAVA_Build 11 15370969 2D AAACACACAC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 46 18 16 12 CA 10 9 240823 CASAVA_Build 11 15375839 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2329 het 1545 hom 17 8 5 4 T 14 13 240824 CASAVA_Build 11 15398980 1D CAGAATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 15 11 T 12 11 240825 CASAVA_Build 11 15400348 1D AGCAATATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 T 10 9 240826 CASAVA_Build 11 15405782 2I AGCAATGTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 157 hom 27 3 17 7 AC 7 8 240827 CASAVA_Build 11 15405798 2I ACACACACAG --/AC ACACACACAC 3070 hom 44 het 24 0 18 6 AC 8 9 240828 CASAVA_Build 11 15405861 6I ATTGCAACTT ------/TATATA TATATTTTAG 3070 hom 56 het 22 0 19 3 TA 2 5 240829 CASAVA_Build 11 15406431 1I TCATAGACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 405 hom 38 1 32 5 A 9 10 240830 CASAVA_Build 11 15406664 1D ACAAAACTTC A/- GCTCACAGAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 1 0 240831 CASAVA_Build 11 15414465 1D AAAAAAGTCA G/- GGGATGAAGA 2974 het 2974 ref 25 13 9 4 G 4 3 240832 CASAVA_Build 11 15418999 5D AAATTCGATA TTATC/----- TTTGCTTTCT 3070 het 3070 ref 36 21 14 4 TTATC 1 0 240833 CASAVA_Build 11 15456842 2D ACTTTAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 28 1 16 11 A 16 14 240834 CASAVA_Build 11 15459942 1I TTATTTTATT -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 C 8 9 240835 CASAVA_Build 11 15461462 1D ACTGTGGGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 9 8 240836 CASAVA_Build 11 15474829 1I CCACTGTTTG -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 240837 CASAVA_Build 11 15482441 1I CCCTATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 918 hom 39 2 29 8 T 11 12 240838 CASAVA_Build 11 15506054 2I GTCTAAAAAA --/AG AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 29 0 26 3 AG 0 1 240839 CASAVA_Build 11 15514400 1I AGTTCATGGG -/T TAAAAAAAGG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 2 240840 CASAVA_Build 11 15516966 1I ACCTTTTATT -/A GCCTCTTCCT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 0 1 240841 CASAVA_Build 11 15532480 1D TAAACTTTAA T/- TTTCTCTGTT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 4 3 240842 CASAVA_Build 11 15533187 1D TTTACAATTA G/- GTATTCATTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 G 2 1 240843 CASAVA_Build 11 15533645 1D TCTTCAAACA T/- TTTTTTTTTA 1419 het 1419 ref 35 26 4 5 T 10 9 240844 CASAVA_Build 11 15537097 4I GAAAGAAGAA ----/AGAG AGAGAGAGGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AG 4 6 240845 CASAVA_Build 11 15543049 2D ATTCAGGCAA AG/-- AGAATTGAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 5 AG 2 1 240846 CASAVA_Build 11 15552028 1D TTTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 35 0 29 7 A 11 10 240847 CASAVA_Build 11 15552257 1D ACTTAGCTGA C/- CTGATAAATG 3070 hom 96 het 38 0 29 9 C 2 1 240848 CASAVA_Build 11 15570119 1I GGCTGCCTCT -/C CCGGTAGGGC 3070 hom 89 het 34 0 27 7 C 2 3 240849 CASAVA_Build 11 15571230 2D GGAAAACAGA CT/-- CTGCTCACTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CT 2 1 240850 CASAVA_Build 11 15572243 1D GGCAAGCAGC A/- AATGCCTGGT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 3 2 240851 CASAVA_Build 11 15573394 1D TCCAGGCGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 12 11 240852 CASAVA_Build 11 15587435 2I GATCACAAAC --/CA CACACATTTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 CA 3 4 240853 CASAVA_Build 11 15613461 1I GGCCACTGTG -/T TTTCTCTTCC 3070 hom 119 het 47 0 39 8 T 3 4 240854 CASAVA_Build 11 15616077 2D ATCATTCGTT CA/-- TTTGTTCAGT 3070 het 3070 hom 53 23 25 8 CA 1 0 240855 CASAVA_Build 11 15656761 6I3M2D5M1I ACTAACTAGG ------AGATTTTACT-/AATAGAAGA--AAACTC CCTCAACAAT 3070 het 3070 ref 41 27 14 1 N/A 0 0 240856 CASAVA_Build 11 15673821 1D GTCCAGGGAA C/- AACTGTCCGG 3070 het 3070 hom 51 18 28 5 C 1 0 240857 CASAVA_Build 11 15675011 1I GATCTTTCAG -/A AAAAATAAGT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 5 6 240858 CASAVA_Build 11 15681171 1I CTTTTGCATT -/C CCCCACAAAG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 4 5 240859 CASAVA_Build 11 15685319 2I CATATAAGAC --/AT ACTCAGAAAT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 AT 0 1 240860 CASAVA_Build 11 15688525 1I AATTTTGAGT -/A GGTATTCAGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 0 1 240861 CASAVA_Build 11 15697421 2I CTTCAGTTGT --/AA AAGAGTCTTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 2 4 240862 CASAVA_Build 11 15708079 1I ATTCTGGGTC -/T TGGATGGCTT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 1 2 240863 CASAVA_Build 11 15726558 1I TTCATGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 30 1 21 8 T 13 14 240864 CASAVA_Build 11 15736785 1I AAGATGGAGA -/C CCCCCTCCCC 1429 hom 21 het 9 0 7 2 C 5 6 240865 CASAVA_Build 11 15763771 1D GTATAGGAGG A/- AGAAAGTTCA 3070 hom 97 het 37 0 27 10 A 2 1 240866 CASAVA_Build 11 15768968 2D CCTATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 32 0 27 6 TA 9 8 240867 CASAVA_Build 11 15774619 1D AATTTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 1020 het 1020 ref 39 30 4 5 T 12 11 240868 CASAVA_Build 11 15783131 1D AGACAATTGG C/- TTTTCCAAAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 0 240869 CASAVA_Build 11 15792921 3D TTAAATACCA TGT/--- TTTGCTCTCC 3070 hom 63 het 27 0 21 7 TGT 1 0 240870 CASAVA_Build 11 15796436 1I GACAACAGGA -/G GGGGCGTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 G 4 5 240871 CASAVA_Build 11 15824343 1D CTGGAGAGGG T/- TCCCGGTTAA 3070 hom 82 het 29 0 26 3 T 2 1 240872 CASAVA_Build 11 15824960 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 15 16 240873 CASAVA_Build 11 15825124 1D ACATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 26 5 A 13 12 240874 CASAVA_Build 11 15839660 1I TGAGGACATA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 6 7 240875 CASAVA_Build 11 15842509 1D TTCTAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 5 A 10 9 240876 CASAVA_Build 11 15849667 1D CGGCTTCACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3 hom 35 1 19 15 A 10 9 240877 CASAVA_Build 11 15852175 1D GATCTTATCC T/- GAGATTTTAA 3070 hom 126 het 44 0 43 2 T 1 0 240878 CASAVA_Build 11 15852406 1D TCTTCCAAAA T/- TTAGCATCCA 3070 hom 110 het 43 0 36 7 T 3 2 240879 CASAVA_Build 11 15855350 1I TTTTCAGGGC -/A AAAAACTTAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 5 6 240880 CASAVA_Build 11 15858684 1I CCTCACTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1207 hom 26 4 16 6 A 15 16 240881 CASAVA_Build 11 15863292 1D CAGAGAGAAA C/- AAGCCTGGCC 3070 hom 60 het 23 0 20 4 C 1 0 240882 CASAVA_Build 11 15865902 1D ATCAGAAAGA T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 101 het 39 0 34 6 T 7 6 240883 CASAVA_Build 11 15871990 1D AAATATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 42 1 35 8 A 14 13 240884 CASAVA_Build 11 15888268 3I GGCGGCTCAG ---/TGC TGACATTACC 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 TGC 0 1 240885 CASAVA_Build 11 15896166 2D TTTCAGGTGG AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 A 10 8 240886 CASAVA_Build 11 15901383 7D CCCACACTGC TTTTACT/------- TTTTACTTGT 3070 het 3070 ref 33 17 9 11 TTTTACT 2 1 240887 CASAVA_Build 11 15913926 1I TCCACACCAT -/C CCCCCCCTTC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 C 7 8 240888 CASAVA_Build 11 15921958 3I CAGCTCCAAT ---/ATC ATCATCTCCT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 ATC 2 3 240889 CASAVA_Build 11 15953954 1I ACACTATCAG -/A AAAAAACTTA 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 A 6 7 240890 CASAVA_Build 11 15956628 4I GGTCTTCTTC ----/CTAT CTAATTGGCT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 CTAT 0 1 240891 CASAVA_Build 11 15959614 4D TTCAAAGTGT ATAA/---- ATAAAGACAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 ATAA 2 1 240892 CASAVA_Build 11 15965844 1I ATTTAACTAG -/A AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 31 15 6 10 A 11 12 240893 CASAVA_Build 11 15971583 3I GAAAGCAGTT ---/AGA AGAAGCCTAG 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 AGA 1 2 240894 CASAVA_Build 11 15972581 1I AAGGGGAGTA -/C TAAGAGATGA 3070 het 2698 hom 43 11 10 22 C 0 1 240895 CASAVA_Build 11 15978717 1I AGTTTAATAT -/C CTTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 C 1 2 240896 CASAVA_Build 11 16006363 1D CTTTTTTTCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 T 8 7 240897 CASAVA_Build 11 16071023 1D ATATTTCTTC A/- GAAACAATCT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 A 1 0 240898 CASAVA_Build 11 16084466 2D ATAAGGAGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3018 hom 25 12 13 1 AT 7 6 240899 CASAVA_Build 11 16092967 2D AGCTCTTCAG AT/-- CATGAGACAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 AT 1 0 240900 CASAVA_Build 11 16147694 1I CCCCTTTAAC -/A AGATGGATTT 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 A 1 2 240901 CASAVA_Build 11 16148048 2D GTGTTTATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 13 11 240902 CASAVA_Build 11 16151735 1I AAAGTGTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 1783 hom 21 4 13 4 T 8 9 240903 CASAVA_Build 11 16161460 1D ATTCAGGAAC A/- AGTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 19 18 6 A 2 1 240904 CASAVA_Build 11 16163024 3I GAGAGCACTC ---/AGA AGGACTTTGT 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 AGA 0 1 240905 CASAVA_Build 11 16164777 1D TTTTTTTTTT C/- CATCTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 C 2 1 240906 CASAVA_Build 11 16167528 16D GCAAAGGTCA TGTGTGTGTGCATGTG/---------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 30 20 6 TGTGTGTGTGCATGTG 1 0 240907 CASAVA_Build 11 16167820 1D AATAGATTGG A/- AAGACATGAG 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 A 3 2 240908 CASAVA_Build 11 16181454 1I AAGGAAGGAG -/A AAAAAGTAAC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 5 6 240909 CASAVA_Build 11 16182703 3D AAAGAAAAAA AAC/--- AACTTTACTT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 AAC 2 1 240910 CASAVA_Build 11 16185716 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2185 het 2185 ref 22 9 7 6 A 15 14 240911 CASAVA_Build 11 16185959 1I ATAAACAACA -/G AGTATCAACA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 G 0 1 240912 CASAVA_Build 11 16189582 1I GAGTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 45 1 33 11 A 11 12 240913 CASAVA_Build 11 16204866 1D TCTTCACCCC T/- GTCTCTCATT 3070 hom 114 het 39 0 39 1 T 1 0 240914 CASAVA_Build 11 16206325 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 148 hom 31 1 26 4 A 12 13 240915 CASAVA_Build 11 16208453 1D TGGGTGGGAG T/- TGGGTAGCAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 2 1 240916 CASAVA_Build 11 16219127 1D AAGTAAGACA C/- TCTAATTCTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 1 0 240917 CASAVA_Build 11 16226418 1I CTACCATTTT -/G GGGTCTGGAG 3070 hom 67 het 26 0 18 8 G 3 4 240918 CASAVA_Build 11 16227219 1I GCTCTGTCTC -/G AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 29 1 22 6 G 0 1 240919 CASAVA_Build 11 16228410 1I ACGGCCTTGC -/T CTTTTTTAGA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 0 1 240920 CASAVA_Build 11 16229602 3I AGAATAGTAT ---/GAA GAAGATTATG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 GAA 1 2 240921 CASAVA_Build 11 16230114 1I ATTTTCTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 160 hom 30 1 24 5 A 9 10 240922 CASAVA_Build 11 16231472 1I ATTCCGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 10 11 240923 CASAVA_Build 11 16235976 3I CTCTTAAAAC ---/ACA ACAATAAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ACA 1 2 240924 CASAVA_Build 11 16236123 1D AAAAGAATTT A/- AAAAAATGAC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 7 6 240925 CASAVA_Build 11 16236272 2D TACAGGACAC TT/-- TGGCAGTTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 7 T 3 1 240926 CASAVA_Build 11 16236487 3D ACAATGAAAC ATT/--- ATTCTGCACT 3070 hom 78 het 28 0 27 6 ATT 2 1 240927 CASAVA_Build 11 16237115 2D ATTAAAAATT AA/-- GTTTATTAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 4 A 2 0 240928 CASAVA_Build 11 16241876 1I TCAAAATGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 85 hom 52 1 46 5 T 7 8 240929 CASAVA_Build 11 16242812 1I CCCTCCAAAA -/T TAGAATACCT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 2 240930 CASAVA_Build 11 16244039 1D CAGAAAATGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 9 8 240931 CASAVA_Build 11 16245130 1I GAATGAAACT -/G CACTCTTATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 0 1 240932 CASAVA_Build 11 16245329 1D CGTTAAAATT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 31 0 31 1 A 9 8 240933 CASAVA_Build 11 16247388 4I TTATTCTCCT ----/TGTC TGTTTATTCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TGTC 0 1 240934 CASAVA_Build 11 16258500 1D TTATTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 39 1 29 9 T 13 12 240935 CASAVA_Build 11 16291904 1D ATGTTCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 751 hom 33 4 19 10 T 15 14 240936 CASAVA_Build 11 16294231 1I AACTCATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 46 2 34 10 T 11 12 240937 CASAVA_Build 11 16297967 1D TATAAACGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 11 10 240938 CASAVA_Build 11 16318437 1D TCTAGATGCT A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 31 18 10 4 A 7 6 240939 CASAVA_Build 11 16324284 1I ACTCATTTCA -/G TCAGATAATT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 0 1 240940 CASAVA_Build 11 16327564 1I CAAGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 C 2 3 240941 CASAVA_Build 11 16344888 4I ATTTTCTATC ----/TGGT TGGTCCCTTC 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 TGGT 1 2 240942 CASAVA_Build 11 16359131 1I AACTTACAGT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 7 8 240943 CASAVA_Build 11 16362344 2I AACAAGAAAC --/TG TTTAGGAATC 3070 hom 105 het 45 0 36 9 TG 0 1 240944 CASAVA_Build 11 16371537 1D TCAAAAAAAA T/- ATCCCTCTAC 3070 het 3070 ref 34 17 14 5 T 1 0 240945 CASAVA_Build 11 16374162 7D TTCAAGCACA TAGAATT/------- TAGAGATCTC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 TAGAATT 1 0 240946 CASAVA_Build 11 16376941 1D AAGGCTATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 11 10 240947 CASAVA_Build 11 16387952 1I TCCTCGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 644 hom 44 2 34 8 A 10 11 240948 CASAVA_Build 11 16393450 1I ATGGATGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 A 11 12 240949 CASAVA_Build 11 16397659 1I TTTTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 9 10 240950 CASAVA_Build 11 16398631 1D CAATACAACT C/- CCCCAAATAC 3070 hom 153 het 55 0 51 4 C 5 4 240951 CASAVA_Build 11 16415225 2D ACAAGAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2571 het 1785 hom 29 10 9 10 A 16 14 240952 CASAVA_Build 11 16415394 1D CCTGTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2671 hom 28 10 12 6 T 12 11 240953 CASAVA_Build 11 16424924 2I AAAAGAAGAC --/AT ATACAAGGTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 AT 1 2 240954 CASAVA_Build 11 16425567 4I TCCTTCGATT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 82 het 29 0 28 1 TC 6 8 240955 CASAVA_Build 11 16436545 1I TAAAAATTTA -/T TTTTAAAGTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 4 5 240956 CASAVA_Build 11 16449573 4D TCCTTATCTC ACAG/---- ACAGACTTGC 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 ACAG 2 1 240957 CASAVA_Build 11 16458769 1D TTTTTAGTAA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 255 hom 23 4 12 8 C 10 9 240958 CASAVA_Build 11 16460249 4D ATAGGTAGTT AGAA/---- AGAGGCAGAA 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 AGAA 1 0 240959 CASAVA_Build 11 16460808 1I GTGTTCTTTG -/A AAAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 A 6 7 240960 CASAVA_Build 11 16460897 1D CTTATACATA C/- TTCACATTTC 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 C 1 0 240961 CASAVA_Build 11 16461796 1I ATTTGCAATG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 53 26 18 9 A 7 8 240962 CASAVA_Build 11 16480587 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 9 240963 CASAVA_Build 11 16482691 1I CCACTGATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 A 9 10 240964 CASAVA_Build 11 16485113 1D CTTGAGCCAA G/- AAGGCAGAGG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 1 0 240965 CASAVA_Build 11 16486746 1I CATGAGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 10 11 240966 CASAVA_Build 11 16501302 1D AGAATATACA T/- TTTTTTTCAG 2863 het 2304 hom 12 5 6 1 T 8 7 240967 CASAVA_Build 11 16523468 1D GTCCAAGCCC A/- AAAAAAAAAA 1143 het 1143 ref 40 22 5 13 A 15 14 240968 CASAVA_Build 11 16524235 2D AAGCAACAAC AA/-- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 33 15 12 8 A 9 7 240969 CASAVA_Build 11 16527502 1D ATGTTGGTCA G/- GCTGGTCTCA 3070 het 627 hom 17 2 14 1 G 2 1 240970 CASAVA_Build 11 16540019 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 585 hom 34 2 23 9 T 11 12 240971 CASAVA_Build 11 16548520 1I TTTTTCAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 10 11 240972 CASAVA_Build 11 16550275 1D GCTTATAATC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 9 8 240973 CASAVA_Build 11 16558562 1I TCAGAAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 9 10 240974 CASAVA_Build 11 16564389 1I CTGAAACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 A 9 10 240975 CASAVA_Build 11 16571645 1I CCACCTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 37 2 25 10 A 11 12 240976 CASAVA_Build 11 16576773 1D TATGCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1059 het 1059 ref 32 21 3 8 A 13 12 240977 CASAVA_Build 11 16584354 1D CTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 36 6 15 15 T 12 11 240978 CASAVA_Build 11 16601534 1I TTTTATGGGA -/T TTTTTTTTTC 1828 het 1828 ref 23 13 4 6 T 9 10 240979 CASAVA_Build 11 16612944 1D GTGGGAGGGA C/- CCAGTGAGGG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 C 3 2 240980 CASAVA_Build 11 16628688 1I AATTTAAAAA -/T TCTTTGAGCT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 1 2 240981 CASAVA_Build 11 16628925 1D ATTGAAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 9 240982 CASAVA_Build 11 16630886 1D ATAAATAGAT G/- GGACCTAATT 3070 het 3070 hom 28 9 17 3 G 3 2 240983 CASAVA_Build 11 16637620 1D CTTCAATAAT G/- TGTTAGCTAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 G 1 0 240984 CASAVA_Build 11 16648991 26D TGAACTACAG CCATCACTCAATGGGAAGAGGAGTCC/-------------------------- CCATCACTCA 3070 het 3070 ref 38 23 14 7 CCATCACTCAATGGGAAGAGGAGTCC 1 0 240985 CASAVA_Build 11 16653996 1I GATTATTTTT -/G GCTTTTAATA 3070 het 3070 ref 41 28 7 6 G 1 2 240986 CASAVA_Build 11 16683757 1D CTCTAGGGGG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 8 7 240987 CASAVA_Build 11 16684093 4I AAAATGGCAG ----/AAGT AAGTCCTTCC 3070 hom 75 het 31 0 24 7 AAGT 1 2 240988 CASAVA_Build 11 16688741 1I CAGTGTTGAA -/T CTACCTCTTT 3070 hom 144 het 50 0 49 1 T 0 1 240989 CASAVA_Build 11 16689530 2I3M9D GCCTATAGTC --CCAGCTACTGGG/CACCA--------- GGGTGGAGAT 3070 het 3070 ref 40 23 15 8 N/A 0 0 240990 CASAVA_Build 11 16691500 1D CTCTATTTTA C/- ATTACATAAA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 C 1 0 240991 CASAVA_Build 11 16694930 1I AGTTAGATAT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 A 7 8 240992 CASAVA_Build 11 16696077 1D CCTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2916 het 781 hom 31 5 10 16 T 15 14 240993 CASAVA_Build 11 16698823 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 1312 hom 17 3 11 3 A 8 7 240994 CASAVA_Build 11 16702608 1D TGTAGGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 A 13 12 240995 CASAVA_Build 11 16704310 4D GGCGGGAGGA TTAC/---- TTGAGGTTGG 2819 het 2500 hom 21 7 9 5 TTAC 1 0 240996 CASAVA_Build 11 16730470 1D TGCTTTAAAC T/- TTTAAGTTGC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 4 3 240997 CASAVA_Build 11 16732232 1D TCAGTTGTTT C/- CTAAGTGATC 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 C 2 1 240998 CASAVA_Build 11 16735246 2D TAGACAATAC AT/-- ATGACATTTA 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 AT 2 1 240999 CASAVA_Build 11 16748041 1I TCTCTAAGTG -/C CCCCCCAACC 2686 het 2686 ref 32 17 10 5 C 6 7 241000 CASAVA_Build 11 16748398 1I GAGAGCTCGC -/G GGGGGGTAGC 1362 het 1362 ref 24 11 7 6 G 6 7 241001 CASAVA_Build 11 16758104 1D AAAACGGGGA G/- GGGGGGGGGA 2901 het 2901 ref 39 20 10 11 G 10 9 241002 CASAVA_Build 11 16765530 3I ACAAGCTCTC ---/AAT AATGACTCCA 3070 het 3070 ref 46 23 22 1 AAT 1 2 241003 CASAVA_Build 11 16788095 4I TTAGGGAACT ----/CCTC CCTCACTGCA 3070 hom 116 het 43 0 37 6 CCTC 1 2 241004 CASAVA_Build 11 16794885 2I GCGCCCTCAT --/GA GATGACCCAG 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 GA 1 2 241005 CASAVA_Build 11 16796213 4I TGGTGCCTGA ----/CAGT CAGCCTCACC 3070 hom 113 het 45 0 36 9 CAGT 0 1 241006 CASAVA_Build 11 16796915 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 11 241007 CASAVA_Build 11 16803857 1D TCTATAAACA T/- TTTTTTGGAT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 T 7 6 241008 CASAVA_Build 11 16807132 3I AAATAAATTC ---/CTT CTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 CTT 2 3 241009 CASAVA_Build 11 16807970 7D ATATGACAGG TTTCTTT/------- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 TTTCTTT 3 2 241010 CASAVA_Build 11 16808276 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1975 hom 28 9 18 1 T 12 11 241011 CASAVA_Build 11 16810457 2D TACTCTTATC AT/-- TGACTGGGGT 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 AT 1 0 241012 CASAVA_Build 11 16812267 1I CTGAGTAGCT -/G GGGATTACAG 1380 het 1380 ref 11 4 3 4 G 3 4 241013 CASAVA_Build 11 16814927 2I GGCTTTTTTT --/TG TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 TG 0 1 241014 CASAVA_Build 11 16816638 1I TCTGTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 1399 het 1399 ref 23 11 6 6 A 17 18 241015 CASAVA_Build 11 16820055 1I AAAGTAAAAG -/C CCTGCAGCTG 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 C 2 3 241016 CASAVA_Build 11 16836358 3I AAAAAGGGTG ---/CTT TTTTGTTTAC 3070 het 3070 ref 47 25 13 9 CTT 0 1 241017 CASAVA_Build 11 16836616 1D CTTTAACAAA T/- TTTTTTTTTT 2205 het 1162 hom 23 5 7 11 T 17 16 241018 CASAVA_Build 11 16841087 1D GCTGCAGACA G/- CAAAGCATCA 3070 hom 148 het 53 0 47 6 G 1 0 241019 CASAVA_Build 11 16841999 1I GGCTTAGAAG -/A GGAGCAAAAT 3070 hom 110 het 45 0 36 9 A 0 1 241020 CASAVA_Build 11 16843717 18I TGTGATGGTG ------------------/GGCACCTGCTACTCGGGA GGCTGAGGCA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 GGCACCTGCTACTCGGGA 0 1 241021 CASAVA_Build 11 16850096 2D AAATGTAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 1841 het 52 hom 29 1 6 22 T 20 18 241022 CASAVA_Build 11 16850933 1D CCAAATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 23 9 T 11 10 241023 CASAVA_Build 11 16852552 1D6M1I ATCACCCGAG CCCAGGA-/-CCAGGAG GTCAAGGCTG 3070 hom 66 het 23 0 22 2 N/A 0 0 241024 CASAVA_Build 11 16853570 1I ATTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 9 10 241025 CASAVA_Build 11 16855355 1D ACTGCCCCCA G/- GCTTGTAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 G 2 1 241026 CASAVA_Build 11 16862765 16D TTAAAAAAAG AAAAGAAAAGAAAAGA/---------------- AAAAGAAAAA 3070 het 379 hom 11 2 9 4 AAAAGAAAAGAAAAGA 1 0 241027 CASAVA_Build 11 16867038 3I TAAAAAAAAA ---/AAG AAAGAAACCC 2178 hom 20 het 11 0 6 5 AAG 0 1 241028 CASAVA_Build 11 16899371 4D AGCCTAACAG TCAT/---- CTCTAGACCA 3070 het 3070 ref 41 27 10 4 TCAT 1 0 241029 CASAVA_Build 11 16900297 9I AGCACAAAAT ---------/ACATTCTTG ACATTCTTAT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 ACATTCTTG 0 1 241030 CASAVA_Build 11 16910402 1I TATTCATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 778 hom 34 5 18 11 T 15 16 241031 CASAVA_Build 11 16928624 1I GAGATAAGAC -/T TTTTTTTTTT 2381 het 2381 ref 38 12 10 16 T 15 16 241032 CASAVA_Build 11 16935026 1I AGTTACACTG -/C CCTTGAAGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 2 3 241033 CASAVA_Build 11 16936972 3D ACATACTGAA AAG/--- AAGAAGAAAG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AAG 3 2 241034 CASAVA_Build 11 16937350 7I CTGCTCCCCT -------/CCCCATG CTCTCCCCCT 3070 het 162 hom 39 2 24 13 CCCCATG 0 1 241035 CASAVA_Build 11 16943278 1I CAAAATATAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2593 hom 28 7 18 3 A 9 10 241036 CASAVA_Build 11 16943450 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 94 het 34 0 32 2 A 9 10 241037 CASAVA_Build 11 16952420 1D CAGAGAATTC T/- TTTTTTTTTT 1775 het 731 hom 18 5 6 7 T 15 14 241038 CASAVA_Build 11 16957547 4I AGGGTAAGAC ----/AGTT ATTCCCATTT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AGTT 0 1 241039 CASAVA_Build 11 16970199 1I GGTCCAGGGA -/C CCCCCCCCAG 3070 het 81 hom 28 1 15 12 C 8 9 241040 CASAVA_Build 11 16976824 4I CTAAAAAAAA ----/TAAT TATTCAAAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAAT 0 1 241041 CASAVA_Build 11 16984318 1D ACATGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 4 3 241042 CASAVA_Build 11 16988513 1I AGCTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 23 het 23 ref 19 1 1 17 A 11 12 241043 CASAVA_Build 11 16997500 4I CATTAAAGAC ----/CAAA CAAAGATCAT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 CAAA 1 2 241044 CASAVA_Build 11 17030390 1D TGCCTGACAT C/- GGTTTCACCT 3070 het 1426 hom 34 4 28 2 C 1 0 241045 CASAVA_Build 11 17033799 4D GTACTATCTT AGAG/---- AGATATAACT 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AG 3 1 241046 CASAVA_Build 11 17039763 4I TATGTGACAG ----/ACCC ACAGCTAATA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 ACCC 0 1 241047 CASAVA_Build 11 17044766 2I TGCTTAAAAA --/CT CTTAAAGCAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CT 1 2 241048 CASAVA_Build 11 17048748 1I GATGAAGTTA -/C CAGGAGTTGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 1 2 241049 CASAVA_Build 11 17064083 5I TGTGAAAATC -----/CCTAT CCTGTTTTGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CCTAT 0 1 241050 CASAVA_Build 11 17065942 2I TTTAATTAAC --/TT ATTAAATAGA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 0 2 241051 CASAVA_Build 11 17071771 1I CTTTTTTTTT -/G GGGGGGGGGG 1204 het 326 hom 14 1 7 6 G 11 12 241052 CASAVA_Build 11 17074383 1I GCTGGTCTTG -/T AACTCCTGAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 0 1 241053 CASAVA_Build 11 17081330 1D GGATAGAAGA T/- TTTTTGCTTT 3070 hom 98 het 36 0 34 4 T 6 5 241054 CASAVA_Build 11 17101903 1I AGCAATGGGC -/T CAAGTATGCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 0 1 241055 CASAVA_Build 11 17106358 1I TTTTTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 33 1 21 11 T 11 12 241056 CASAVA_Build 11 17119401 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1387 het 1387 ref 24 12 4 8 T 17 16 241057 CASAVA_Build 11 17120797 10D GATCTGTGAT CACACCACTG/---------- CACTCCAGCT 3070 hom 111 het 37 0 37 2 CACACCACTG 1 0 241058 CASAVA_Build 11 17159470 1I AATCATCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 27 2 21 4 T 11 12 241059 CASAVA_Build 11 17176236 1I AACTGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 26 1 16 9 T 14 15 241060 CASAVA_Build 11 17176493 1I TCAGCCTCCC -/A AAAGTGCTGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 3 4 241061 CASAVA_Build 11 17177245 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 28 1 18 9 A 14 13 241062 CASAVA_Build 11 17191057 28D TTTAGTGGCT GCCTACCACAGTAGGTTCCACAGAGGAG/---------------------------- GCAGTACATG 3070 hom 63 het 23 0 21 7 GCCTACCACAGTAGGTTCCACAGAGGAG 1 0 241063 CASAVA_Build 11 17193469 4D AAAAAAAAAA AAAT/---- TTTTTTTTTT 2581 hom 42 het 17 0 11 6 AAAT 1 0 241064 CASAVA_Build 11 17193635 3I41M1I AATAAATCTT ---AAAAAAAAAGTTGATGTCTATGTTTTCTCTTCTCGAAGCTT-/AAAAAAAAAAAAGTTGATGTCTATCTTTTCTCTTCTCGAAGCTTC CCCCACCCAG 3070 hom 62 het 20 0 21 9 N/A 0 0 241065 CASAVA_Build 11 17195194 1I TGCACTCCAG -/C CTGGGCGACA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 C 1 2 241066 CASAVA_Build 11 17196188 1I ATTCACATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1044 hom 30 4 19 7 T 16 17 241067 CASAVA_Build 11 17198101 5I AAAAAAAGAA -----/AAAAG AAATATCTGG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 AAAAG 0 1 241068 CASAVA_Build 11 17198795 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 14 7 A 18 14 241069 CASAVA_Build 11 17198943 1D GCAAATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 24 1 18 7 A 12 11 241070 CASAVA_Build 11 17200386 1I AGAGCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 27 0 21 6 T 10 11 241071 CASAVA_Build 11 17205715 2D ATCCCCTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 2120 het 91 hom 20 2 7 11 T 18 16 241072 CASAVA_Build 11 17211689 2D CCTAGGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 15 15 11 TG 10 9 241073 CASAVA_Build 11 17213828 1I CTTTAACAGT -/A AAGCTTCTCG 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 2 3 241074 CASAVA_Build 11 17219012 3I ACTTCTACTT ---/TTC TCTTTCTTTC 3070 het 117 hom 34 2 17 15 TTC 0 1 241075 CASAVA_Build 11 17231200 10D TTGTTGTTGC TGTTGTTGTT/---------- TTGTTTTTGT 3070 hom 36 het 11 0 13 0 TGTTGTTGTT 1 0 241076 CASAVA_Build 11 17238005 1I TGTCAGAACT -/C CCAACATTTT 3070 hom 135 het 47 0 44 3 C 2 3 241077 CASAVA_Build 11 17242958 1D CCTTCCCCCC A/- CCAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 1 0 241078 CASAVA_Build 11 17246796 1I CCCTCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 32 1 24 7 T 13 14 241079 CASAVA_Build 11 17262830 5I AAACAACCCA -----/GTTTT GTTTTTAAGA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 GTTTT 1 2 241080 CASAVA_Build 11 17265297 1D CAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1457 het 1457 ref 35 22 5 9 T 1 0 241081 CASAVA_Build 11 17288360 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 12 13 T 12 11 241082 CASAVA_Build 11 17294021 2D ATGTAAACAA TG/-- TATTGTCTCA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 TG 1 0 241083 CASAVA_Build 11 17298198 1I GATCTCGTTC -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 7 8 241084 CASAVA_Build 11 17304128 1D TTACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1359 het 1359 ref 32 23 3 7 T 12 11 241085 CASAVA_Build 11 17324590 1D3M3I AGTCTAATAA GCAT---/-CATCTA TTAGATGTCA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 N/A 0 0 241086 CASAVA_Build 11 17326771 1I CCTAGACAGA -/T TTTTTTGAAG 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 6 7 241087 CASAVA_Build 11 17353010 7D TAGGGAAGTC CTTTAAT/------- CTTTATGTAT 3070 het 3070 hom 47 18 27 2 CTTTAAT 1 0 241088 CASAVA_Build 11 17360152 15D ACTCCAGAGT TGGACCTGCCCAGAG/--------------- TGGAACTAGA 3070 het 3070 ref 49 25 19 9 TGGACCTGCCCAGAG 1 0 241089 CASAVA_Build 11 17387243 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2062 het 139 hom 15 3 7 5 T 17 16 241090 CASAVA_Build 11 17390597 1D AGTCTGCAAT G/- GGTCATTTGT 3070 het 3070 hom 58 26 20 12 G 3 2 241091 CASAVA_Build 11 17393189 7I GTGGTTTTTG -------/AAGAAAA AAGAAAAAAG 3046 het 3046 ref 27 11 7 9 AAGAAAA 2 3 241092 CASAVA_Build 11 17402350 3I GGGCTTAAAA ---/TCT AGATGACAGG 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 TCT 0 1 241093 CASAVA_Build 11 17416506 4I TGACCACATG ----/CACA GTCACTATTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 CA 0 2 241094 CASAVA_Build 11 17440923 2I TGCAGAAAAC --/AG TGCATAATAT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 AG 0 1 241095 CASAVA_Build 11 17446137 3I AGCCAGGCCC ---/TGG TGGTTAATGA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 TGG 1 2 241096 CASAVA_Build 11 17452668 1I CATGGTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 27 16 9 T 13 14 241097 CASAVA_Build 11 17466899 1I AGGTGTAAGT -/G GGGGGGGCAC 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 G 7 8 241098 CASAVA_Build 11 17471703 1I GAAAGAAGCT -/G GGGCACCCCA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 G 3 4 241099 CASAVA_Build 11 17472036 4I AAAATAAATC ----/TGTT TATTTTATTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TGTT 0 1 241100 CASAVA_Build 11 17489462 1D TAAGTTGGGT G/- GGGGGGGGTC 3070 het 2498 hom 30 11 11 8 G 9 8 241101 CASAVA_Build 11 17491960 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 53 29 12 12 A 10 9 241102 CASAVA_Build 11 17507257 1D CTTGCCACCT G/- TCAGAGCCCT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 G 1 0 241103 CASAVA_Build 11 17521540 1D ATACCACCCA C/- CCCCCCCAAG 3070 hom 75 het 28 0 22 6 C 8 7 241104 CASAVA_Build 11 17524632 3D CCACCACCAC CAT/--- CATCATCATC 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 CAT 4 3 241105 CASAVA_Build 11 17546054 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCCCGCTT 261 hom 3 het 15 0 1 14 AG 2 1 241106 CASAVA_Build 11 17546239 1D ACCGTGTCAG C/- CAGGATGGTC 1844 het 1844 ref 12 5 5 2 C 2 1 241107 CASAVA_Build 11 17553488 10D CTGTTGAGCC AAGTAAGGCA/---------- GAGTGAGAGC 3070 het 3070 ref 40 26 13 4 AAGTAAGGCA 1 0 241108 CASAVA_Build 11 17586289 1I CTTAGTGTGG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 2686 hom 25 7 11 7 T 6 7 241109 CASAVA_Build 11 17589938 2D TGTGAGAAAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 49 21 13 15 TG 10 9 241110 CASAVA_Build 11 17622892 1I CTTATGATTC -/A ACATCGTAAT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 A 1 2 241111 CASAVA_Build 11 17625330 1I GCCAAGATGG -/C ACCCTGCTGT 3070 het 3070 ref 57 33 18 6 C 0 1 241112 CASAVA_Build 11 17634943 2D AGAAAAACTG AA/-- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 9 7 241113 CASAVA_Build 11 17635131 8D ATTAAAAAAT GACCAAAG/-------- GACTGGAATA 3070 het 3070 ref 39 25 14 3 GACCAAAG 1 0 241114 CASAVA_Build 11 17642720 2I TGAAAATATG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 T 8 10 241115 CASAVA_Build 11 17646172 1I GATTGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 9 10 241116 CASAVA_Build 11 17659534 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 A 7 6 241117 CASAVA_Build 11 17659827 40D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATACACACACACAC/---------------------------------------- ACACACACAC 3070 hom 36 het 15 0 13 6 ATATATATATATATATATATATATATATACACACACACAC 1 0 241118 CASAVA_Build 11 17662206 4I ATCACCATAT ----/TGAG TGAGTGAGGA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 TGAG 2 3 241119 CASAVA_Build 11 17668829 1D AAATGGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 T 11 10 241120 CASAVA_Build 11 17674815 1D TCAGGCCTGC T/- CCCTAAGCCC 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 1 0 241121 CASAVA_Build 11 17684930 2D GGAGGGAAAC TT/-- ATATGTAAAA 3070 het 3070 hom 45 21 23 3 T 2 0 241122 CASAVA_Build 11 17691511 3I TTTTTTAAAA ---/AAG AAGAAGAAGT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAG 3 4 241123 CASAVA_Build 11 17716052 1D AAGTGCCCAT G/- GGCAAAGAAA 3070 het 3070 hom 25 9 13 4 G 3 2 241124 CASAVA_Build 11 17735337 3D ATCCATTTAG CCA/--- CACACAGTGA 3070 het 3070 hom 54 15 36 6 CCA 1 0 241125 CASAVA_Build 11 17749373 6I AGCAGGCTAG ------/GTCACT CTAAATGGGC 3070 hom 117 het 41 0 38 3 GTCACT 0 1 241126 CASAVA_Build 11 17768461 1D CATTCACATA T/- TTTTTTTTTT 1353 het 1353 ref 31 16 3 12 T 13 12 241127 CASAVA_Build 11 17782689 3I CAGTAGCTCC ---/ACT ACTATTACTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 ACT 1 2 241128 CASAVA_Build 11 17785460 1D CTCCCCCCCC A/- CAAAAAAAAT 3070 hom 64 het 27 0 21 6 A 1 0 241129 CASAVA_Build 11 17805065 19I CTTGCTTATA -------------------/AGGATCAGGTGACCAGCCC AGGATCACAC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 AGGATCAGGTGACCAGCCC 0 1 241130 CASAVA_Build 11 17850392 31D GCTGGAAATG TTCTATATCTTGCTCTGGATGGTGTTTTCTT/------------------------------- TTCTATATCT 3070 het 3070 ref 32 15 15 12 TTCTATATCTTGCTCTGGATGGTGTTTTCTT 2 1 241131 CASAVA_Build 11 17862042 7D GCCAGATTGT TCAAATC/------- TGAACATTCT 3070 hom 68 het 24 0 18 7 TCAAATC 1 0 241132 CASAVA_Build 11 17880321 9I TAGTCCACTT ---------/TGACTGGTA TGACAAACCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TGACTGGTA 0 1 241133 CASAVA_Build 11 17880577 1I TGTTCAAGAG -/A AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 6 7 241134 CASAVA_Build 11 17881423 2D CCTGGCAAAA AC/-- ACAGAGTTGA 3070 hom 91 het 33 0 29 5 AC 2 1 241135 CASAVA_Build 11 17887940 1D AGGAGCTCCT G/- GGGGGAAAGT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 6 5 241136 CASAVA_Build 11 17888917 1D AAGCCACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 36 1 27 8 A 11 10 241137 CASAVA_Build 11 17910181 1D GGTGTTTTGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 9 8 241138 CASAVA_Build 11 17911839 1D TAAATTAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 13 12 241139 CASAVA_Build 11 17920147 1I TATAGCAAAT -/C TTGAAGTCGG 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 C 0 1 241140 CASAVA_Build 11 17921223 5I CTGACTTCAT -----/AAAAC AAATTTGGAA 3070 het 3070 hom 32 14 18 0 AAAAC 0 1 241141 CASAVA_Build 11 17935862 1I TAGTGGTGGG -/A AAAAAAAAAA 1533 het 1362 hom 23 6 9 8 A 15 16 241142 CASAVA_Build 11 17956402 1I CTTGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 2805 het 2805 ref 40 17 10 13 A 13 14 241143 CASAVA_Build 11 17968896 1D GCTATTAATC T/- TTTTTTTTTT 2963 het 2541 hom 17 8 7 2 T 12 11 241144 CASAVA_Build 11 17978882 3D AATACCATAT CAC/--- AATACCATAT 3070 het 3070 hom 37 15 20 5 CAC 1 0 241145 CASAVA_Build 11 17985844 13D TATAATGGAG GGGGTGGGGGAAA/------------- GGGGTGGCCT 3070 het 3070 hom 38 16 15 13 GGGGTGGGGGAAA 1 0 241146 CASAVA_Build 11 18008369 1I CTGTCTGTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 8 9 241147 CASAVA_Build 11 18008546 1I CTCTATCTTG -/A AAAAAAAAAA 1437 het 1437 ref 49 36 5 8 A 13 14 241148 CASAVA_Build 11 18016284 1D ATCAATAGAT A/- ATTACCTATA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 2 1 241149 CASAVA_Build 11 18022897 2D ACAAAACAAA AC/-- AAAAAAACAC 937 het 937 ref 34 19 7 8 AC 1 0 241150 CASAVA_Build 11 18023597 1I TTAGAATTCC -/A ACCCCCCCCT 1852 het 1725 hom 22 9 10 3 A 1 2 241151 CASAVA_Build 11 18030461 1D CCCCATAGGC A/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 7 6 241152 CASAVA_Build 11 18052548 1I CAAGATTTTT -/G TCTGCTTTGT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 G 0 1 241153 CASAVA_Build 11 18055439 3D CCGTATCTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 1971 het 1971 ref 35 15 6 15 A 19 16 241154 CASAVA_Build 11 18057867 1D GAATATACTT A/- ACAGTGGATA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 2 1 241155 CASAVA_Build 11 18061321 1D GGCTCTCAGT A/- AAAAAGTCTT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 A 6 5 241156 CASAVA_Build 11 18063561 1D AAAGATACAA T/- TATCTAGGAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 2 1 241157 CASAVA_Build 11 18068269 1I ATTTAAAACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 T 8 9 241158 CASAVA_Build 11 18069377 5I TAATGCCCAA -----/CTATT CTAAAGTGGT 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 CTATT 0 1 241159 CASAVA_Build 11 18077203 2I ATTTGAACCC --/AT ATGAGTCTGA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 AT 1 2 241160 CASAVA_Build 11 18077845 8D AGAGGAGGTG ACATTGAA/-------- GCCGGGCCAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 10 ACATTGAA 1 0 241161 CASAVA_Build 11 18080295 1D GAGGCCGAGG A/- GGATGGATCA 3070 het 2040 hom 26 6 14 6 A 1 0 241162 CASAVA_Build 11 18096405 2D CACTACCCTC AA/-- AAAATTCACA 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 6 4 241163 CASAVA_Build 11 18120148 1D CCAGACACTT A/- AGGAGTCAAA 3070 het 2973 hom 16 7 7 3 A 2 1 241164 CASAVA_Build 11 18127621 1D AAATAAAAAA G/- GATAGTGACA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 G 2 1 241165 CASAVA_Build 11 18135422 1D TATGTGCCAC A/- TTTTCTTAAT 3070 het 978 hom 14 2 9 3 A 1 0 241166 CASAVA_Build 11 18135930 1D GTTCCAAGAT A/- GACGAATAGA 2720 het 2720 ref 22 11 8 3 A 1 0 241167 CASAVA_Build 11 18144582 1D CAGTAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 303 hom 16 4 10 3 A 12 11 241168 CASAVA_Build 11 18150341 1I GAACCAAAAA -/G GTTTACATTG 3070 hom 101 het 39 0 34 5 G 1 2 241169 CASAVA_Build 11 18159097 1D AGAACATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2330 hom 20 7 10 4 A 12 11 241170 CASAVA_Build 11 18161736 1D TATCTCAAAG A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 7 6 241171 CASAVA_Build 11 18165741 1I TTGTGTTCTG -/A AAAAATGCAG 2869 het 2869 ref 27 18 7 2 A 5 6 241172 CASAVA_Build 11 18167919 1I GTCTTTTTTT -/G GGGGGGTGGG 3049 het 3049 ref 26 11 9 6 G 6 7 241173 CASAVA_Build 11 18193274 5D ACCTTGCACT GGTGC/----- ACAGGTGCCA 3070 hom 110 het 41 0 33 10 GGTGC 1 0 241174 CASAVA_Build 11 18200995 1I TGTGTGGTGT -/G GGGGGGGGTG 3070 hom 22 het 31 1 23 7 G 8 9 241175 CASAVA_Build 11 18201174 4I GGTGTGTGTG ----/TGTA TGTGAGTGGT 3070 hom 66 het 29 0 19 10 TGTA 0 1 241176 CASAVA_Build 11 18209973 1I CTACTGATAC -/T TTGCGCTCTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 2 3 241177 CASAVA_Build 11 18213484 1I GCTCTTTTTA -/T TTTATGGATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 3 4 241178 CASAVA_Build 11 18215616 2D AATTTATACA AT/-- ATTAATGGCT 3070 hom 45 het 25 0 19 7 AT 2 1 241179 CASAVA_Build 11 18224245 1D GAGGGGAATG A/- AAGAAGGACA 3070 het 3070 ref 31 18 9 5 A 3 2 241180 CASAVA_Build 11 18230836 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1755 het 1755 ref 15 8 5 2 A 13 12 241181 CASAVA_Build 11 18232017 1I GGGGGAAAAA -/C CCCACACCTT 3070 hom 140 het 53 0 43 10 C 3 4 241182 CASAVA_Build 11 18238968 1D GGAATCTGCA T/- TTTTTTTTTT 2359 het 1928 hom 30 12 7 11 T 16 15 241183 CASAVA_Build 11 18244495 1I CATTTCCTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 1816 hom 13 5 8 0 A 8 9 241184 CASAVA_Build 11 18246940 54D TGGGCGACAG AGCAAGACTCTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATATA/------------------------------------------------------ AACTTTAGTA 1403 het 1403 ref 8 10 3 5 AGCAAGACTCTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATATA 1 0 241185 CASAVA_Build 11 18250081 5I ATACACACTC -----/AACTT AGATAACAGA 3070 hom 107 het 44 0 34 10 AACTT 0 1 241186 CASAVA_Build 11 18251884 1D AAGTAGGGAC T/- TTGTTGAGAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 T 3 2 241187 CASAVA_Build 11 18259065 1D AAATGAAAAA G/- TTCTAGAGAC 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 G 1 0 241188 CASAVA_Build 11 18259699 1D ATTTTTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 10 241189 CASAVA_Build 11 18265034 1I GCCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 A 11 12 241190 CASAVA_Build 11 18271156 2I GGATCAGAGC --/TT TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 7 9 241191 CASAVA_Build 11 18281400 1I CACTGCCCAT -/A GAAAAGGAGT 3070 het 3070 hom 67 28 31 8 A 0 1 241192 CASAVA_Build 11 18285853 1D TCTCAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 1330 het 1330 ref 38 30 3 6 A 11 10 241193 CASAVA_Build 11 18302176 1D TCAGCCGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 23 3 10 12 T 15 14 241194 CASAVA_Build 11 18304645 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 27 1 19 7 A 11 12 241195 CASAVA_Build 11 18307300 3I GGGTTGTGAC ---/ATT ATGGAATTTT 3070 het 3070 hom 41 13 26 2 ATT 0 1 241196 CASAVA_Build 11 18310217 1D CCCAAATTGC G/- GGGGGTTACA 3070 het 3070 hom 43 17 19 8 G 6 5 241197 CASAVA_Build 11 18316560 4D ATTATTATTA TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 12 9 TGTT 5 4 241198 CASAVA_Build 11 18328562 1D GAAAGTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 A 12 11 241199 CASAVA_Build 11 18340792 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1063 het 1027 hom 12 7 4 1 T 20 19 241200 CASAVA_Build 11 18357343 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2009 het 1111 hom 14 3 9 2 A 13 14 241201 CASAVA_Build 11 18368966 1D TTCTGAAATA G/- CTGAATAGTA 3070 het 2754 hom 18 6 10 2 G 1 0 241202 CASAVA_Build 11 18387760 2D TGGGCAAAAT AA/-- ATGTTCCAGG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 3 1 241203 CASAVA_Build 11 18388026 1D ATTCTTTAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2172 hom 20 7 11 2 T 10 9 241204 CASAVA_Build 11 18388610 4D TTGGGCAGGC ATGG/---- ATGAAGAGCC 3070 het 3070 hom 37 15 17 10 ATGG 1 0 241205 CASAVA_Build 11 18390736 1I TCTTTGGCTT -/C CCCCCCATCC 3070 het 3056 hom 24 10 9 5 C 6 7 241206 CASAVA_Build 11 18393050 1D TCTGAATGGC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 9 8 241207 CASAVA_Build 11 18402139 4D GAAGTGTGAT AGTA/---- AGTGTTTGTG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 AGTA 1 0 241208 CASAVA_Build 11 18407000 1D ACTATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 25 2 15 9 A 16 15 241209 CASAVA_Build 11 18418915 3D TTAGCCAGGC ATG/--- GTGGTATGTC 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 ATG 1 0 241210 CASAVA_Build 11 18425034 4D AGGGCAAGAA GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 48 18 24 7 GTTT 4 3 241211 CASAVA_Build 11 18428166 1I ACTGGGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1522 hom 27 6 14 7 T 13 14 241212 CASAVA_Build 11 18434689 2I CCTTCCACAC --/AG GGGCCCAGGA 3070 hom 101 het 39 0 31 8 AG 0 1 241213 CASAVA_Build 11 18435584 1I AAAATGTTTT -/A AGCCATCTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 2 241214 CASAVA_Build 11 18436909 2I AGATCCACTT --/TG TTTCTTTTAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TG 0 1 241215 CASAVA_Build 11 18438024 1D TTTGGTGGGG T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 8 7 241216 CASAVA_Build 11 18440958 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2213 hom 31 7 13 11 A 9 10 241217 CASAVA_Build 11 18441079 1D ATTTCTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 21 20 12 T 12 11 241218 CASAVA_Build 11 18443550 4D ATGACTTACG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 17 13 241219 CASAVA_Build 11 18444412 4I TTCCAGAATC ----/TCTT TCTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 TCTT 0 1 241220 CASAVA_Build 11 18454127 1I ATAACTGAAG -/A ATATAAGAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 2 241221 CASAVA_Build 11 18484515 1D CTCTTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 A 13 12 241222 CASAVA_Build 11 18486969 1D AAAATTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 456 hom 41 2 37 2 A 12 11 241223 CASAVA_Build 11 18489068 3I CAACAACAAC ---/AAT GACAACAAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AAT 0 1 241224 CASAVA_Build 11 18494480 1I CTCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 894 hom 40 2 29 9 T 10 11 241225 CASAVA_Build 11 18504261 1I TTAAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 10 11 241226 CASAVA_Build 11 18524247 1I AGTACAAACT -/A AACTCTTTGA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 2 3 241227 CASAVA_Build 11 18539132 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 A 13 12 241228 CASAVA_Build 11 18544811 6D ATACATTCTT TTAGAG/------ TTAGTCAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 5 TTAGAG 1 0 241229 CASAVA_Build 11 18547753 1D GGTAACCATT A/- AAAACCATGT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 5 4 241230 CASAVA_Build 11 18564996 1D TACTAAAAAT A/- CAAAAAAAAT 2633 het 2057 hom 17 7 8 2 A 1 0 241231 CASAVA_Build 11 18570135 1I AGATTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 811 hom 45 4 31 10 A 11 12 241232 CASAVA_Build 11 18574926 1D CTTTCTCTTC T/- TAGTTCCAGT 3070 het 3070 ref 54 26 21 7 T 2 1 241233 CASAVA_Build 11 18576075 2D ATGGAGAAAG CT/-- CTGTAGATTT 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 CT 2 1 241234 CASAVA_Build 11 18576718 9I ACTTAAGTGC ---------/ACCTTAGAA ACCTTAGAAT 3070 het 3070 ref 26 11 8 8 ACCTTAGAA 1 2 241235 CASAVA_Build 11 18583369 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 442 hom 24 1 19 4 A 11 10 241236 CASAVA_Build 11 18601597 1I TTTATATGTC -/A AATTGGACTA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 2 3 241237 CASAVA_Build 11 18603880 1D TGTAGAGATT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 49 hom 21 1 13 7 G 10 9 241238 CASAVA_Build 11 18604552 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 471 hom 35 2 19 15 A 12 11 241239 CASAVA_Build 11 18607449 1D CATGGTGAAA C/- CCCCATCTCT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 C 5 4 241240 CASAVA_Build 11 18609676 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 8 9 241241 CASAVA_Build 11 18611266 1I AATATAGACC -/T TTTTTCAGAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 5 6 241242 CASAVA_Build 11 18615889 4D CCTGGGTGAC AGTT/---- AGACTCTGGG 3070 hom 111 het 39 0 36 4 AGTT 1 0 241243 CASAVA_Build 11 18626725 1D ATGACAACAT A/- AAAAAATCTC 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 A 7 6 241244 CASAVA_Build 11 18630260 1I GTGAGGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 10 11 241245 CASAVA_Build 11 18633540 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTGT 1543 het 365 hom 8 1 4 3 T 8 9 241246 CASAVA_Build 11 18633992 1D CTAAAAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 25 0 18 7 A 11 10 241247 CASAVA_Build 11 18644729 10D CTGTCTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTGA 3070 hom 29 het 21 0 17 5 T 18 8 241248 CASAVA_Build 11 18644976 1D TGTATTTTTT G/- TAGAGACGGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 1 0 241249 CASAVA_Build 11 18654817 1D CATGGTGAAA C/- CCCCGTTTCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 5 4 241250 CASAVA_Build 11 18657995 1I CATCTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 16 0 10 6 A 13 14 241251 CASAVA_Build 11 18660667 5I AAATGAGGAA -----/AAAAG AAAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 AAAAG 1 2 241252 CASAVA_Build 11 18665868 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 12 0 12 1 A 10 9 241253 CASAVA_Build 11 18687331 4D TGGCACACAA TGAT/---- TGATTTAGTA 3070 het 3070 hom 57 22 29 8 TGAT 2 1 241254 CASAVA_Build 11 18689268 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 10 9 241255 CASAVA_Build 11 18693165 5D GGGATACATA CATAC/----- ATGTCATTGG 1056 hom 37 het 32 0 8 24 CATAC 1 0 241256 CASAVA_Build 11 18695549 1D GTCTGCGTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 9 8 241257 CASAVA_Build 11 18700430 1I TGAGTCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 674 hom 31 2 21 8 T 11 12 241258 CASAVA_Build 11 18700746 1I TTTGGAAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 8 9 241259 CASAVA_Build 11 18722676 1I CAGCAGCAGG -/A AAAAAAAAAA 2991 het 2991 ref 36 18 8 10 A 11 12 241260 CASAVA_Build 11 18724713 4D TGCTAACACA TAAT/---- TAATTCTTGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TAAT 2 1 241261 CASAVA_Build 11 18725276 4D CTTGGCTGCA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 38 1 23 15 T 16 12 241262 CASAVA_Build 11 18731695 3D CCCACACCTT CTC/--- CTAGTTTTCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CTC 1 0 241263 CASAVA_Build 11 18733038 1D AGGTGGCCCT C/- AGTGAACCCT 3070 hom 143 het 54 0 46 8 C 1 0 241264 CASAVA_Build 11 18733703 1D CTGGGAGGCT A/- ACTCAAGACT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 2 1 241265 CASAVA_Build 11 18735061 2I AAAAAAAAAC --/AA CAAAAAACAA 1347 het 329 hom 15 2 10 3 A 0 2 241266 CASAVA_Build 11 18736799 3D GAAGGATGAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 42 0 29 14 T 14 11 241267 CASAVA_Build 11 18763916 1I ACCTCACCAC -/A AAAAAAGGAG 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 A 6 7 241268 CASAVA_Build 11 18764325 1D GGGGAATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 14 7 T 15 14 241269 CASAVA_Build 11 18780194 1D AAAACTCTCA T/- TTTTTCCCTC 3070 hom 52 het 22 0 17 6 T 6 5 241270 CASAVA_Build 11 18794169 1D AATATGTTTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 T 7 6 241271 CASAVA_Build 11 18794243 1I TTTTCGTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2522 hom 21 9 11 1 T 8 9 241272 CASAVA_Build 11 18796335 10D TAATTGAGCA AGGCGATTGC/---------- AGGCTGTGCA 3070 het 3070 ref 38 24 12 8 AGGCGATTGC 1 0 241273 CASAVA_Build 11 18798625 2D ATTAAATCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 197 hom 29 4 13 12 T 14 12 241274 CASAVA_Build 11 18808905 8D TTATTGATTA TGCTTATT/-------- TGGATGTTCT 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 TGCTTATT 1 0 241275 CASAVA_Build 11 18811331 1I TATAATCCCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 8 9 241276 CASAVA_Build 11 18816434 1D16M2D CCCCCCAGCT GGGTGAAACCCCCCAACAG/-GGTGAAACCCCCCAAC-- GGGTTACCAA 3070 het 3070 ref 35 20 17 6 N/A 0 0 241277 CASAVA_Build 11 18817508 1I AGAAAGGCCA -/G GTCACTACAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 G 1 2 241278 CASAVA_Build 11 18819168 1D AAAATCCTTT A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 A 7 6 241279 CASAVA_Build 11 18819228 5D AGGCCACTAG CTAGA/----- CTAATGAAGA 3070 het 3070 ref 30 16 8 7 CTAGA 1 0 241280 CASAVA_Build 11 18820856 1I CAAAAACAAG -/C AACAGGGAAA 2655 het 2655 ref 23 11 7 5 C 0 1 241281 CASAVA_Build 11 18823252 1I AATAAAAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 9 10 241282 CASAVA_Build 11 18831792 1I AAAGGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 56 25 19 12 A 11 12 241283 CASAVA_Build 11 18840100 1I CATTGATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 24 9 8 T 11 12 241284 CASAVA_Build 11 18841476 7D AAGGATCTAA ACAGTGT/------- ACTTTCAAAT 3070 het 3070 ref 35 20 15 4 ACAGTGT 1 0 241285 CASAVA_Build 11 18844120 1D GTTTGGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 34 0 29 5 A 11 10 241286 CASAVA_Build 11 18849278 2I CCTTGGCACA --/CT ATTTTTTGGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CT 0 1 241287 CASAVA_Build 11 18852850 1I CATAGTTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 9 10 241288 CASAVA_Build 11 18854702 4I TAATGAAAAT ----/TAAA TAAGCTGGGA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 TAAA 0 1 241289 CASAVA_Build 11 18858374 1I GACCTTTTGC -/A GGCAAAAATA 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 A 0 1 241290 CASAVA_Build 11 18859981 4D60M1D GAACAGAGAA TGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGATATTGCTATAAAAAGTTTACTTAATGATACATTGAGGACTGT/----TGAGTGAGTGAGTGAGTGATATTGCTATAAAAAGTTTACTTAATGATACATTGAGGACTG- TAAGGTGGAT 3070 het 3070 hom 38 10 14 42 N/A 0 0 241291 CASAVA_Build 11 18860467 2I ATGTGTTTTT --/CC CCCCTGCCTG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 C 4 6 241292 CASAVA_Build 11 18882328 4D TCAATTAAAA AGTC/---- AGTATTACTG 3070 het 3070 hom 46 16 26 4 AGTC 1 0 241293 CASAVA_Build 11 18900735 1D TGTGAAAAGA C/- CAAACCTACA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 2 1 241294 CASAVA_Build 11 18901081 1I TTCAACAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2397 hom 27 8 11 8 A 12 13 241295 CASAVA_Build 11 18913789 1D GTACACAGTG T/- TTTGGGTAGG 1166 het 1166 ref 42 31 3 8 T 4 3 241296 CASAVA_Build 11 18918486 3I TAAAGACAAA ---/AAG AAGGCTAGCT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AAG 1 2 241297 CASAVA_Build 11 18920527 1D20M1D AGAAAATGTC GTGAAGATTTTCCTTTGGAGAG/-TGAAGGTTTTCCTTTGGAGA- TGAGAGGCAA 3070 het 3070 ref 19 14 11 0 N/A 0 0 241298 CASAVA_Build 11 18944692 3D CCCACGTGTT TTA/--- TTATTATTAT 1218 het 1218 ref 12 6 4 2 TTA 7 6 241299 CASAVA_Build 11 18956346 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1102 het 1102 ref 25 11 5 9 TA 9 8 241300 CASAVA_Build 11 18959475 2D GCGGCCTATC AT/-- ACGGTCTGTC 3070 het 3070 ref 49 26 21 4 AT 1 0 241301 CASAVA_Build 11 18959702 1D CTTAAGTCTA G/- TGGCAACTAT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 G 1 0 241302 CASAVA_Build 11 18966287 1I TTCCTGGACA -/C CCCTGATGTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 3 4 241303 CASAVA_Build 11 18974641 4D TTGGTTTGCT CTTG/---- CTTTTCTAGC 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 CTTG 1 0 241304 CASAVA_Build 11 18978939 1D GCATTTACAG A/- AGTTTAAAGT 3070 het 3070 ref 56 31 18 7 A 2 1 241305 CASAVA_Build 11 18987920 1I TGTCAAATGC -/T TTTTCTGCAT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 4 5 241306 CASAVA_Build 11 18988659 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTTATTG 2787 het 2787 ref 19 12 6 1 T 7 6 241307 CASAVA_Build 11 18994433 1D CAACTCACAC T/- TTTTTTTTTT 2773 het 2773 ref 33 9 10 14 T 15 14 241308 CASAVA_Build 11 19009395 1I GCTAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 2873 het 2873 ref 33 16 9 8 A 12 13 241309 CASAVA_Build 11 19009798 4I CAAGAAAATC ----/TTTT TTTTATTATT 1956 het 1956 ref 19 11 5 3 T 4 8 241310 CASAVA_Build 11 19019610 1D AAAGACCAAA C/- CTATGACTGA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 C 2 1 241311 CASAVA_Build 11 19022560 1D AGCTAACAAG A/- GAAGTGAAGG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 1 0 241312 CASAVA_Build 11 19027152 1D ACATAAATAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 45 15 21 11 A 9 8 241313 CASAVA_Build 11 19030850 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AG 0 1 241314 CASAVA_Build 11 19031035 6D CGCCTGTAAT CCCCGC/------ CCCAGCTACT 2237 het 2237 ref 18 11 6 2 CCCCGC 1 0 241315 CASAVA_Build 11 19031717 1D AGATAAATAC T/- TAATAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 T 2 1 241316 CASAVA_Build 11 19037836 1I AGAAATGGAC -/T TTTCCTATTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 4 241317 CASAVA_Build 11 19038692 4D GGACTAAGGT AAAA/---- ACCAAAACTG 3070 hom 87 het 33 0 30 6 A 5 1 241318 CASAVA_Build 11 19040209 6D TGACTGCCAG GGTTAC/------ TGTTGCGGCC 3070 hom 132 het 47 0 45 3 GGTTAC 1 0 241319 CASAVA_Build 11 19051376 1D CTCTAGGCTG A/- AAGCTCCCTG 3070 het 3070 hom 41 21 17 4 A 3 2 241320 CASAVA_Build 11 19053284 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 19 7 11 1 A 8 9 241321 CASAVA_Build 11 19063971 1I ACAAGGGGGG -/A AAAGAACTGT 3070 het 3070 ref 44 27 14 3 A 3 4 241322 CASAVA_Build 11 19074837 1D ACTGAGACAC A/- AAGGTGTTAA 3070 het 3070 ref 57 26 24 7 A 3 2 241323 CASAVA_Build 11 19078344 1D GTCATTTGAT C/- CTTACACTGT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 C 2 1 241324 CASAVA_Build 11 19080118 1I AATTAGTACA -/C CAGGCAGAAC 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 C 1 2 241325 CASAVA_Build 11 19080249 4D AATCTTATTC ATGG/---- ATGGATGGAT 3070 het 3070 ref 46 24 16 9 ATGG 3 2 241326 CASAVA_Build 11 19088108 1I TGCAACGATG -/A ACAGAAAGAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 241327 CASAVA_Build 11 19089000 1I ATCATATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 34 1 14 19 T 13 14 241328 CASAVA_Build 11 19092044 2I AGATATGGCT --/AC ACACAAAGAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 AC 2 3 241329 CASAVA_Build 11 19092337 1D GTACAGTCAA T/- TGCCCTCCCC 3070 hom 97 het 39 0 31 8 T 2 1 241330 CASAVA_Build 11 19092585 20I GTGCTGGAGC --------------------/TGGGATTCCAGGTCAGGCAG TGGGCTCCAG 3070 het 2539 hom 28 13 12 4 TGGGATTCCAGGTCAGGCAG 0 1 241331 CASAVA_Build 11 19104466 2I TTTCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 12 14 241332 CASAVA_Build 11 19126856 4D TTGGGAGGCC CAGG/---- CAGGCAGATC 3070 het 1589 hom 15 6 8 1 CAGG 2 1 241333 CASAVA_Build 11 19138502 3D GCTTGGATGA TAT/--- TATTATTATG 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 TAT 4 3 241334 CASAVA_Build 11 19161290 6I CAAGAATAAA ------/AATAAT AATAATAAAA 3070 hom 74 het 29 0 23 6 AAT 2 4 241335 CASAVA_Build 11 19176851 1D TGAAAACCAT G/- GGCTTTGGAA 3070 het 3070 ref 40 19 12 11 G 3 2 241336 CASAVA_Build 11 19200161 1D ATAGGACAAA C/- CTGGAAGACT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 C 2 1 241337 CASAVA_Build 11 19200968 2D GAACCTCCTC AG/-- AGACACAGCA 3070 het 3070 ref 29 14 10 7 AG 2 1 241338 CASAVA_Build 11 19204624 1D AGTATTCTAA G/- GAAACACTTT 3070 het 3070 hom 41 19 17 6 G 2 1 241339 CASAVA_Build 11 19225841 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1594 het 1119 hom 14 4 5 5 A 17 18 241340 CASAVA_Build 11 19230147 2D ATCACTTCGT AG/-- AGATTTCCAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AG 2 1 241341 CASAVA_Build 11 19235346 1D CACCTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 194 hom 30 1 27 3 T 12 11 241342 CASAVA_Build 11 19250271 2I CAACTTCAGC --/AA AGTCTCAGGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 1 3 241343 CASAVA_Build 11 19251779 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAGGATG 3070 hom 47 het 17 0 15 2 A 5 6 241344 CASAVA_Build 11 19262833 12D GAATTCACAT ATTCATTCATTC/------------ ATTCATTCAT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 ATTC 6 3 241345 CASAVA_Build 11 19265841 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 17 1 12 4 A 14 15 241346 CASAVA_Build 11 19266771 1D ATTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 42 1 27 16 A 14 13 241347 CASAVA_Build 11 19266839 2D TCTCTCTCTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 101 het 47 0 33 14 TG 9 8 241348 CASAVA_Build 11 19280643 1I GAAAGGAATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 411 hom 38 1 28 9 T 9 10 241349 CASAVA_Build 11 19286847 4D GAGCTATGCC CTTT/---- CTTTCTGAGT 3070 hom 126 het 44 0 43 2 CTTT 2 1 241350 CASAVA_Build 11 19289711 3D AAACTTCCAA TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 hom 75 het 30 0 26 7 TCT 4 3 241351 CASAVA_Build 11 19298689 1I TTTAGCGGGG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 6 7 241352 CASAVA_Build 11 19303681 1D CAAGCATATG A/- AAAAAAGCTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 6 241353 CASAVA_Build 11 19305401 1I GGTATTTCTC -/T TGACTGCACC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 1 2 241354 CASAVA_Build 11 19305898 1D TTTCAACAAG C/- CAGGTACAAG 3070 hom 75 het 30 0 24 7 C 2 1 241355 CASAVA_Build 11 19306052 10D CTAAGCACCT ACTGTGTGAC/---------- ACTGTGTGAC 3070 hom 78 het 30 0 27 5 ACTGTGTGAC 2 1 241356 CASAVA_Build 11 19310183 1D TTCTTTTTTT G/- TTTTGAGGTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 1 0 241357 CASAVA_Build 11 19329193 2I TATGGTGCTG --/GA ATTGCTAAGT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 GA 0 1 241358 CASAVA_Build 11 19363427 10D TAGTTTTGGA TAAATATGTT/---------- TATTCATTCA 3070 het 3070 ref 49 24 20 8 TAAATATGTT 1 0 241359 CASAVA_Build 11 19379083 1I ATTGGAGCTT -/C TTTAGCATTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 C 0 1 241360 CASAVA_Build 11 19382017 1I GTGACATTTG -/T GCAGAGCCCA 3070 hom 65 het 30 0 22 8 T 0 1 241361 CASAVA_Build 11 19382059 1I TACGTGGCTC -/T TTACGGGGAC 3070 hom 30 het 18 0 11 7 T 2 3 241362 CASAVA_Build 11 19382676 9D AGTTTCTGCA GCTTTAACC/--------- CTAGGTTCTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GCTTTAACC 1 0 241363 CASAVA_Build 11 19400722 2D CAGGAGAGGC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 101 het 38 0 29 9 CT 6 5 241364 CASAVA_Build 11 19404819 1D GTCCCATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2439 hom 29 9 15 5 T 12 11 241365 CASAVA_Build 11 19405177 1D GCAGCTGACC G/- GGACACTCTT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 G 3 2 241366 CASAVA_Build 11 19408836 6D TAAGAAGATA TGATGC/------ CAGTCTCCCC 3070 het 3070 ref 43 29 11 8 TGATGC 1 0 241367 CASAVA_Build 11 19412233 1D AAAATGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 42 0 28 14 A 12 11 241368 CASAVA_Build 11 19414908 1D TATTTTATGC T/- TTTCAGTATA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 4 3 241369 CASAVA_Build 11 19415832 1I TGCCACTCAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 21 21 1 A 8 9 241370 CASAVA_Build 11 19417019 1I AGTTTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 T 11 12 241371 CASAVA_Build 11 19433365 1D TTGGGTGATA T/- AATGTAATAT 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 T 1 0 241372 CASAVA_Build 11 19442527 1I AAGAAGTGAG -/A AGGGGATACA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 1 2 241373 CASAVA_Build 11 19463157 8D CCTGTGCACT AGAGGCCC/-------- AGAGGCCCAG 3070 hom 109 het 41 0 36 11 AGAGGCCC 2 1 241374 CASAVA_Build 11 19465981 7D TAAGAGACCC CAAAGTA/------- CAAAGTAGAG 3070 hom 131 het 48 0 42 7 CAAAGTA 2 1 241375 CASAVA_Build 11 19488879 5D ATCTAGGGAC ACTGG/----- ACTGGAAAGT 3070 hom 101 het 37 0 33 4 ACTGG 2 1 241376 CASAVA_Build 11 19492952 1D ATGGCTGCAG C/- CCAGGCAGGC 3070 hom 67 het 30 0 24 6 C 3 2 241377 CASAVA_Build 11 19516643 2D TTTGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 10 10 T 12 10 241378 CASAVA_Build 11 19516799 1D TATAACTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 10 9 241379 CASAVA_Build 11 19517015 2I AATGACATTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 10 12 10 TA 8 9 241380 CASAVA_Build 11 19520164 4D CGGAAAAGAC AGTT/---- AGAGTCTTAG 3070 het 3070 hom 54 23 28 9 AGTT 1 0 241381 CASAVA_Build 11 19523586 2D TGGGGCAGTG GT/-- GTCCCTTTGA 3070 het 3070 hom 40 11 17 12 GT 2 1 241382 CASAVA_Build 11 19523889 1I TTTTTGCAGG -/T TTTTTTTTTA 2433 het 2433 ref 21 12 7 2 T 9 10 241383 CASAVA_Build 11 19529864 1I GTGGTGGGGG -/A AAAAAATGGT 3070 hom 126 het 50 0 42 8 A 6 7 241384 CASAVA_Build 11 19571883 1I GTGACACCTT -/A TCATGGTCTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 0 1 241385 CASAVA_Build 11 19572614 1I GCACATAGAA -/G CAGGCTGCTG 3070 hom 33 het 16 0 11 5 G 0 1 241386 CASAVA_Build 11 19573845 1D AAGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 19 1 13 7 A 12 11 241387 CASAVA_Build 11 19580960 1I TCTCATCTAT -/G ACCATTAACT 3070 hom 75 het 34 0 25 9 G 0 1 241388 CASAVA_Build 11 19597392 1D TTGGGTATAT A/- ACCCAGTAAT 2982 hom 15 het 6 0 6 0 A 2 1 241389 CASAVA_Build 11 19628847 12D TTCACACAGT GGAATACTACCC/------------ GGCAATTAAA 3070 het 3070 hom 50 26 28 8 GGAATACTACCC 1 0 241390 CASAVA_Build 11 19639664 2D TAAGTGTTTG TA/-- AAGACCAGAC 3070 hom 90 het 33 0 29 4 TA 1 0 241391 CASAVA_Build 11 19654604 2D CCTCTCCCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 12 10 241392 CASAVA_Build 11 19664113 3D GTCCAGAATT CTC/--- AGCATGCTCA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 CTC 1 0 241393 CASAVA_Build 11 19665899 4D GCATGTGTGT ATGC/---- ATGCGTGTGT 3070 het 3070 hom 72 31 30 12 ATGC 2 1 241394 CASAVA_Build 11 19669390 1I AAAAAAAAAA -/G CAGATGACAT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 G 0 1 241395 CASAVA_Build 11 19673534 1I GCTCCCAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 10 11 241396 CASAVA_Build 11 19677564 3D ATCCTGGTAT CCC/--- CTTGATTTTA 3070 het 3070 ref 46 22 20 6 C 4 1 241397 CASAVA_Build 11 19694201 1I AGTCTCTTGG -/T TTATGGCATG 3070 het 3070 ref 53 32 15 6 T 2 3 241398 CASAVA_Build 11 19700445 1D GTAATTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 24 9 11 6 A 8 7 241399 CASAVA_Build 11 19701511 4D GGTATAGACA GTGT/---- GTGGCAGGAT 3070 hom 90 het 31 0 31 4 GT 3 1 241400 CASAVA_Build 11 19710384 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2689 het 1983 hom 19 8 8 3 A 13 14 241401 CASAVA_Build 11 19717140 1I CCATCACTAC -/A AAAAAATACA 3070 hom 72 het 31 0 25 8 A 6 7 241402 CASAVA_Build 11 19719620 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 23 1 15 7 T 16 15 241403 CASAVA_Build 11 19720141 1I ATCTTTTGAC -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 T 7 8 241404 CASAVA_Build 11 19724497 1D CGTTTGTATG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 T 9 8 241405 CASAVA_Build 11 19726865 2I TGTTAGGAAC --/AG GGGGCAGGGA 3070 het 3070 hom 40 10 25 5 AG 0 1 241406 CASAVA_Build 11 19733632 3D CTCTAGAGGC TGA/--- TGAAAGTCCA 3070 hom 159 het 58 0 53 6 TGA 2 1 241407 CASAVA_Build 11 19748384 1D TAAAAAAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 28 0 21 8 T 10 9 241408 CASAVA_Build 11 19759654 1D ATGATGAGGG A/- AATGTGCCCC 3070 hom 74 het 29 0 23 6 A 3 2 241409 CASAVA_Build 11 19759882 1D CTCCTTTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 12 11 241410 CASAVA_Build 11 19783538 1D ATTTTGAGAT G/- GGGGTTTGGC 3070 het 3070 hom 54 22 28 5 G 5 4 241411 CASAVA_Build 11 19787914 1I ATCGCTATTG -/C CCCCCCAATT 3070 het 3070 ref 53 28 17 8 C 6 7 241412 CASAVA_Build 11 19806787 1D ATTTTTTGTG T/- TTTTTGTAGG 3070 hom 77 het 28 0 22 7 T 6 5 241413 CASAVA_Build 11 19815798 1I ACATTCTATT -/A AAAAAAAAAA 345 het 345 ref 43 28 3 12 A 11 12 241414 CASAVA_Build 11 19830017 5D AAGCATTCTT ATAAG/----- ACAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 ATAAG 1 0 241415 CASAVA_Build 11 19830892 7I CACCTGGCAC -------/AGGCCTA AGGCCTAGGT 3070 het 3070 hom 50 22 20 8 AGGCCTA 1 2 241416 CASAVA_Build 11 19843993 1D3M1D GCTCTGATTC TTCTA/-TCT- GAGAAAGACA 3070 het 3070 hom 46 22 23 5 N/A 0 0 241417 CASAVA_Build 11 19845757 1I CAGATGAGGA -/C CCTTGAAGTG 3070 hom 126 het 43 0 43 0 C 2 3 241418 CASAVA_Build 11 19855088 4D CAATAAAAAA TATT/---- TATTTATTTA 1995 het 770 hom 11 3 6 2 TATT 3 2 241419 CASAVA_Build 11 19878401 1D3M5D4M18D AGGAATAAAC AAGAAGTTGTATCAAAGTCTCGGGGCCAGTG/-AGA-----TAAC------------------ TTCAGTTATC 3070 hom 166 het 47 0 54 5 N/A 0 0 241420 CASAVA_Build 11 19885237 1D TGAGATGAAA C/- CATACAGAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 2 1 241421 CASAVA_Build 11 19885650 1I CACTCATAGG -/A GGGAGGGGGA 3070 hom 111 het 40 0 36 4 A 0 1 241422 CASAVA_Build 11 19903870 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 620 hom 32 7 11 15 A 17 16 241423 CASAVA_Build 11 19904764 2D ACACTTAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 38 0 25 14 A 13 11 241424 CASAVA_Build 11 19906341 1I TTTTTTATTT -/C GTATTTTCCT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 0 1 241425 CASAVA_Build 11 19912951 1I GAGGGGCTGG -/T TCTAGAAGAA 3070 hom 129 het 51 0 42 9 T 1 2 241426 CASAVA_Build 11 19918034 1I ACTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 115 het 48 0 39 9 T 11 12 241427 CASAVA_Build 11 19929554 3I ATACACCTAT ---/TAC TACAACTGAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 TAC 1 2 241428 CASAVA_Build 11 19929705 4I ATCCTGTAAT ----/AAAG AGTTGATTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAAG 0 1 241429 CASAVA_Build 11 19933514 1I CTTGTCTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 302 hom 35 1 29 5 A 10 11 241430 CASAVA_Build 11 19954065 23D AAGAAAGTTT AGGAATTTCTGATTTCGATAATG/----------------------- GTCTGTAAAC 3070 het 3070 ref 35 25 13 4 AGGAATTTCTGATTTCGATAATG 1 0 241431 CASAVA_Build 11 19956108 1I GTTTTTTTTT -/G GTTTTTTTTG 1839 het 1839 ref 16 8 7 1 G 1 2 241432 CASAVA_Build 11 19963670 3I TGAGAAAAAA ---/TAC AAGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 TAC 0 1 241433 CASAVA_Build 11 19964068 1I TAATAACAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 9 10 241434 CASAVA_Build 11 19966560 1D TTCTAAAGAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 A 8 7 241435 CASAVA_Build 11 19966661 1I AAAGGAGAGA -/T TTTTTCTTTT 3070 het 455 hom 34 2 26 6 T 5 6 241436 CASAVA_Build 11 19976827 1D GACTGTGCTT C/- CCCCCCTCTC 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 C 7 6 241437 CASAVA_Build 11 19988396 1D AAGAAGGACT G/- GGGGGAAAAT 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 G 6 5 241438 CASAVA_Build 11 19990813 1I AAAAAAAAAA -/G AGAAGGGGGA 3070 hom 70 het 27 0 25 2 G 0 1 241439 CASAVA_Build 11 19991335 1I TACTGGGATA -/T TGTGAGTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 1 2 241440 CASAVA_Build 11 19991597 1D TTTGCCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 687 hom 28 2 20 6 T 13 12 241441 CASAVA_Build 11 19995144 5D ATAAAAATAG AAAAT/----- AAAATAAAAG 3070 hom 48 het 19 0 17 3 AAAAT 2 1 241442 CASAVA_Build 11 20005426 1D TCCGCTCGGG C/- CCCGGGGTTT 3070 het 2718 hom 28 8 11 9 C 4 3 241443 CASAVA_Build 11 20012370 4I AAAACAATAA ----/TACT TACCCTTTTC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 TACT 0 1 241444 CASAVA_Build 11 20016054 1D GAATTGCTCA C/- CCTGCATCTA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 C 3 2 241445 CASAVA_Build 11 20024336 1D TATGCACCTG T/- AGTCCCAGCT 3070 hom 57 het 24 0 18 6 T 1 0 241446 CASAVA_Build 11 20058693 1I ATCCAAAATA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 7 8 241447 CASAVA_Build 11 20063193 3D TTGCATACTT GTA/--- GTCCCAGCTA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 GTA 1 0 241448 CASAVA_Build 11 20084089 3D TAAAGAGCTC CCA/--- CCTCAAGGTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 CCA 1 0 241449 CASAVA_Build 11 20087224 1I GTCATTTCTG -/T GTAGGGCTGA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 0 1 241450 CASAVA_Build 11 20087421 1I TGAAAGCAGG -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 6 7 241451 CASAVA_Build 11 20093280 1D GCAGAGGAAG A/- GATTGCTAAG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 1 0 241452 CASAVA_Build 11 20096711 1I GACAGAGAGA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 41 1 33 7 G 0 1 241453 CASAVA_Build 11 20103849 1D CAAAAAAAAA G/- AAATTCCTTA 3070 het 229 hom 24 1 11 12 G 1 0 241454 CASAVA_Build 11 20116080 1I AGAGTAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 11 14 T 12 13 241455 CASAVA_Build 11 20129219 14D14M2D7M7D GTTGGTCAGG GATTTGAGAATAGCCTTGTGTGTGATCCATCTGCCTTAGCCAGA/--------------CTATTCTCAAATCC--CTGACCT------- TGTGATCCAT 1954 het 1954 ref 23 21 5 4 N/A 0 0 241456 CASAVA_Build 11 20131830 4I TGACAGGGTG ----/TCTT TCTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 TCTT 1 2 241457 CASAVA_Build 11 20142745 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 9 10 241458 CASAVA_Build 11 20143117 2I TCTTTTTTTT --/AA TAAAAAAAAG 3070 hom 21 het 15 0 8 7 A 0 2 241459 CASAVA_Build 11 20151215 1D TTAAGGAAAA G/- GGGGGGTGTA 3070 hom 91 het 41 0 32 12 G 7 6 241460 CASAVA_Build 11 20152886 4D CTCTCTCCTC TCAT/---- TCATCATGTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TCAT 2 1 241461 CASAVA_Build 11 20158770 1D TCTAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 13 13 T 12 11 241462 CASAVA_Build 11 20172977 1D TTTTTGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 12 11 241463 CASAVA_Build 11 20174001 1I TGCCAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 11 12 241464 CASAVA_Build 11 20174902 1I TCTTGTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 812 hom 32 5 13 14 T 14 15 241465 CASAVA_Build 11 20175420 4I TGTTCATCTT ----/TCTC TCTACAATTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TC 1 3 241466 CASAVA_Build 11 20176632 3I ATTTGATATC ---/TTA TTTTCTCTTG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TTA 0 1 241467 CASAVA_Build 11 20180012 5D CCAGAGACCA CGTGT/----- CGTGTCGAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 CGTGT 2 1 241468 CASAVA_Build 11 20183590 1I TCCCTGTATA -/G GGTTTCTGAC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 G 2 3 241469 CASAVA_Build 11 20185549 3D GGAGAAAGGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 40 19 14 9 TTG 4 3 241470 CASAVA_Build 11 20206590 1D TCTGTTGTGT G/- GGGAAAGTTC 3070 hom 120 het 42 0 40 2 G 4 3 241471 CASAVA_Build 11 20211874 2I GACTACATGC --/AT ATGTGCCACC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AT 1 2 241472 CASAVA_Build 11 20212394 2D AAAAACAACC TT/-- TTGTTTCACT 3070 het 3070 ref 32 17 14 2 T 4 2 241473 CASAVA_Build 11 20213182 3I AATTAGTATA ---/TCC TCCTGCTGAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TCC 1 2 241474 CASAVA_Build 11 20223352 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 74 het 32 0 25 7 A 9 8 241475 CASAVA_Build 11 20229494 1I AAAAAAAATA -/T AAATAAAGTT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 0 1 241476 CASAVA_Build 11 20258228 1D GAATGAGCAG C/- CCCCCCAAAC 3070 hom 54 het 23 0 19 5 C 7 6 241477 CASAVA_Build 11 20267256 3D TTTGTTTTTT TTC/--- TTTTTTGAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 7 TTC 1 0 241478 CASAVA_Build 11 20268226 1I TGGAAACAAC -/A AAAAAAACAT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 7 8 241479 CASAVA_Build 11 20270638 1I TGTCTGTAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 9 10 241480 CASAVA_Build 11 20274006 1I ATGTTTATAC -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 117 het 49 0 40 9 T 7 8 241481 CASAVA_Build 11 20276080 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1758 het 1595 hom 12 4 6 2 A 15 16 241482 CASAVA_Build 11 20281303 2D TTCAAAACTC TG/-- TGCTCTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 6 TG 2 1 241483 CASAVA_Build 11 20287733 6D GCAGAGAGAG ATAGAA/------ ATAGAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 24 12 7 ATAGAA 2 1 241484 CASAVA_Build 11 20291333 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 13 14 241485 CASAVA_Build 11 20291908 1I AGCTTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 A 13 14 241486 CASAVA_Build 11 20293584 2D TTCTTACCTA AT/-- ATGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 AT 2 1 241487 CASAVA_Build 11 20298738 1I AATAGAAGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 9 241488 CASAVA_Build 11 20299481 1I AATTTCCCTG -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 A 6 7 241489 CASAVA_Build 11 20309228 1I TTATACAGAG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 7 8 241490 CASAVA_Build 11 20316213 1I CGGCAATCTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 7 8 241491 CASAVA_Build 11 20317528 1I AGAAATGTGC -/T TACTCTTACC 3070 het 3070 hom 51 16 25 10 T 1 2 241492 CASAVA_Build 11 20320114 1I CTCTGCTCTC -/A AAGAGACTCG 3070 het 2674 hom 23 7 10 6 A 2 3 241493 CASAVA_Build 11 20333271 1I TGTTCATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 28 1 24 3 T 13 14 241494 CASAVA_Build 11 20335179 1D TGTTTTCTAA T/- TTTTTTTACC 3070 het 62 hom 35 2 16 17 T 8 7 241495 CASAVA_Build 11 20336174 1D GTTTCTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 219 hom 27 3 14 11 A 14 13 241496 CASAVA_Build 11 20341463 2I GTGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 GT 6 7 241497 CASAVA_Build 11 20349334 1I ATCTCTGTTG -/T TTTATTTGAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 4 241498 CASAVA_Build 11 20349729 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 2417 het 1318 hom 17 5 7 5 T 9 10 241499 CASAVA_Build 11 20354370 1I TTATTAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 38 1 34 3 A 10 11 241500 CASAVA_Build 11 20360964 9D TCTTCAAATA TAGACACCT/--------- TGGGGATTAG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TAGACACCT 1 0 241501 CASAVA_Build 11 20367776 4D CAGCAGAGTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 43 1 35 8 A 15 11 241502 CASAVA_Build 11 20369172 1D ACGCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 16 1 12 3 A 13 12 241503 CASAVA_Build 11 20370038 1D AATGTGGATC T/- TAATTTTCCA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 2 1 241504 CASAVA_Build 11 20379095 1D ATTTATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 21 1 18 2 T 12 11 241505 CASAVA_Build 11 20382284 1I TTATATTTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 10 241506 CASAVA_Build 11 20388623 4I CAAAATAAAT ----/GGTC AGGTAGTTGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GGTC 0 1 241507 CASAVA_Build 11 20390520 1D GTAGTCTGAA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 67 het 35 0 27 8 C 10 9 241508 CASAVA_Build 11 20390856 5D ATTGCTAACA TTAAT/----- TTAGTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 TTAAT 1 0 241509 CASAVA_Build 11 20391206 1I ACCTATGGAT -/A GTTTGAAAAG 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 0 1 241510 CASAVA_Build 11 20393807 1D TTCCACCATG T/- TGACCAGCCA 3070 hom 120 het 45 0 40 7 T 2 1 241511 CASAVA_Build 11 20402393 2I TTAAGGAGGT --/AC ACTATCAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AC 1 2 241512 CASAVA_Build 11 20405989 4D GGTAGATATA TTTT/---- CATAAAATTT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 T 4 0 241513 CASAVA_Build 11 20416468 2D GTATCCCAGA CT/-- CTGTGAGGCT 3070 hom 104 het 39 0 30 9 CT 2 1 241514 CASAVA_Build 11 20417441 1I GGGAGAAGTT -/C CTCCTGATTC 3070 het 3070 hom 61 24 27 10 C 1 2 241515 CASAVA_Build 11 20419119 1D CACCTCTCCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 70 het 34 0 27 7 T 9 8 241516 CASAVA_Build 11 20423203 9D AAATATAAAA ACATAGGTT/--------- AAAAGTGGAT 3070 hom 60 het 23 0 21 4 ACATAGGTT 1 0 241517 CASAVA_Build 11 20424478 1D TTGCATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 12 11 241518 CASAVA_Build 11 20426269 1D TGCTCATAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 T 10 9 241519 CASAVA_Build 11 20437136 1D ATATAGTAAA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 8 7 241520 CASAVA_Build 11 20441697 1D GTATGTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 243 hom 44 1 36 7 T 13 12 241521 CASAVA_Build 11 20442021 1D CTCTGGATCG A/- AATCTCCATA 3070 hom 157 het 56 0 53 3 A 3 2 241522 CASAVA_Build 11 20445750 1D CACTCTTCTT A/- AGAGACAGGC 3070 hom 135 het 51 0 46 6 A 2 1 241523 CASAVA_Build 11 20453695 1I GTTTTTACTT -/A AAAAACCTCT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 5 6 241524 CASAVA_Build 11 20454878 1I ATTTTTAGAG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 7 8 241525 CASAVA_Build 11 20454968 2D TTTGCTAATT CC/-- CCAAGTGATC 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 C 4 2 241526 CASAVA_Build 11 20455678 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 10 11 241527 CASAVA_Build 11 20460935 26D TCACTCCTCA TGGAAAGACAAGTCAAGTCAAAAATT/-------------------------- TGGAAAGACA 3070 hom 51 het 26 0 18 11 TGGAAAGACAAGTCAAGTCAAAAATT 2 1 241528 CASAVA_Build 11 20462556 5I CCTCACCCAA -----/ATCTC ATCTTGAATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATCTC 0 1 241529 CASAVA_Build 11 20465182 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 36 1 29 6 A 12 11 241530 CASAVA_Build 11 20468937 3I TTTTCTGTTC ---/TTG TTGTTGTTCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTG 2 3 241531 CASAVA_Build 11 20471254 1I ACTCCATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 196 hom 19 1 17 1 A 13 14 241532 CASAVA_Build 11 20475314 1I TACGAGAAAA -/T TATTGTTTGA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 1 2 241533 CASAVA_Build 11 20475635 4I AAAGGATCAT ----/GTAA GTAAGTGTTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 GTAA 1 2 241534 CASAVA_Build 11 20481201 1I ATTCAGACTT -/A AAAAAATACT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 6 7 241535 CASAVA_Build 11 20483988 1D TATTTTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 19 2 11 6 A 12 11 241536 CASAVA_Build 11 20485578 4D CTGTGGTATG TAGT/---- TAGTTCTCGC 3070 hom 114 het 41 0 39 4 TAGT 2 1 241537 CASAVA_Build 11 20485916 1D AAAATTAATG A/- AACATAATGC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 3 2 241538 CASAVA_Build 11 20487393 2D AAAATGTATC AA/-- CTTATAAAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 2 0 241539 CASAVA_Build 11 20487998 2D AGGCCACAAT GA/-- GATCACACCA 3070 hom 84 het 32 0 25 7 GA 2 1 241540 CASAVA_Build 11 20490931 1I TTAAGAACTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 T 8 9 241541 CASAVA_Build 11 20492014 1D GTCGTGGGGT G/- GGGGGTGGGG 876 het 876 ref 10 5 2 3 G 6 5 241542 CASAVA_Build 11 20498835 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 12 11 241543 CASAVA_Build 11 20505244 8I CTTAAAAAGA --------/AAAGAAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAAG 2 4 241544 CASAVA_Build 11 20508559 1D CTGGACAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 29 0 23 8 T 11 10 241545 CASAVA_Build 11 20511308 6I GCTGTGACTT ------/TTAAAC TTAAAGCTAA 3070 hom 101 het 41 0 33 8 TTAAAC 0 1 241546 CASAVA_Build 11 20521993 1I AGGGTTGGGG -/A AAAATGGGGA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 4 5 241547 CASAVA_Build 11 20522116 6I ACCATGAAGT ------/TTTTTA TGTACACTTA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 TTTTTA 0 1 241548 CASAVA_Build 11 20551633 1I TAAGAGTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 A 12 13 241549 CASAVA_Build 11 20553129 3I30M3I GGAGAAAGAT ---GAAGATGAAGATGAAGAAGATGATGAAGAT---/GAAGAAGATGAAGATGAAGAAGATGATGAAGATGAA GAAGAAGATG 3070 hom 80 het 22 0 26 6 N/A 0 0 241550 CASAVA_Build 11 20558441 1I TTCAAACGCT -/A ATATTAATAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 1 2 241551 CASAVA_Build 11 20560107 2I AGGTGCAAGA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 TC 7 8 241552 CASAVA_Build 11 20563189 2I CTTTTTTTTT --/TA AATTTTTTTT 3070 het 3012 hom 33 11 14 10 TA 0 1 241553 CASAVA_Build 11 20565622 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 10 12 T 12 13 241554 CASAVA_Build 11 20573668 1D GTTAGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 1323 het 1323 ref 26 19 4 3 T 13 12 241555 CASAVA_Build 11 20581384 1D GCCTGGAAAG C/- TTTGTGCAGT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 C 1 0 241556 CASAVA_Build 11 20589890 1D TATTTTGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 235 hom 29 2 20 7 A 15 14 241557 CASAVA_Build 11 20596249 1D AAGGGATGGT G/- GGGGGTACTC 3070 hom 102 het 42 0 32 11 G 6 5 241558 CASAVA_Build 11 20597752 1I CTTTAATTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 918 hom 37 2 28 7 T 9 10 241559 CASAVA_Build 11 20599270 3D CAAGAAGGAG TTA/--- TTAAGAATAG 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 TTA 2 1 241560 CASAVA_Build 11 20600910 4I TCCGTCACCT ----/CTTC CTTCCATCCT 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 CTTC 1 2 241561 CASAVA_Build 11 20602206 2D GTTGCTCTAA AT/-- ATATATATAA 3021 het 2001 hom 17 6 7 4 AT 5 4 241562 CASAVA_Build 11 20602607 1D AGCTCTAAAC T/- TTCCCAATTC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 3 2 241563 CASAVA_Build 11 20609781 2D TTATGATCTC AT/-- TCTCAATTCA 3070 het 3070 hom 54 24 27 3 AT 1 0 241564 CASAVA_Build 11 20621350 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 28 1 18 9 T 13 12 241565 CASAVA_Build 11 20633675 1I CTCAACTGTC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 7 8 241566 CASAVA_Build 11 20643691 2D TATGGGAGAG AT/-- AATGATGGGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 1 0 241567 CASAVA_Build 11 20648608 1D CGTGTGGGGA G/- GGGGGAGCAA 3070 hom 71 het 28 0 23 5 G 6 5 241568 CASAVA_Build 11 20648925 2D CCCCAGAATC TG/-- TGTGGTCATT 3070 het 3070 ref 25 13 11 5 TG 3 2 241569 CASAVA_Build 11 20649896 3I CAGATTGATG ---/GGT GGGGGGGTGG 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 GGT 0 1 241570 CASAVA_Build 11 20651523 11I GAGCTCTTGG -----------/AGCATCATTCT AGCATTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 AGCATCATTCT 0 1 241571 CASAVA_Build 11 20651965 2I AAACAATACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 14 16 12 T 12 14 241572 CASAVA_Build 11 20665719 1I CTAAACTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1574 hom 31 4 19 8 T 13 14 241573 CASAVA_Build 11 20666156 1D ACCATACAGA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 8 7 241574 CASAVA_Build 11 20666303 1D GAGAGAGAAC T/- TTTTTTTTAT 2891 hom 27 het 11 0 8 3 T 9 8 241575 CASAVA_Build 11 20667393 1D GCAGAAGCCC T/- TTTTTTATTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 7 6 241576 CASAVA_Build 11 20674030 1I TGGCCTGGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 570 hom 30 2 22 6 T 9 10 241577 CASAVA_Build 11 20678166 1I GACGTAGAAC -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 0 1 241578 CASAVA_Build 11 20678250 4D TTTTTAGAAA AAAC/---- AAAAACAAAA 86 het 86 ref 24 5 2 17 AAAC 1 0 241579 CASAVA_Build 11 20678623 1D GAAAAAAAAA T/- ATATATATTT 3070 hom 27 het 11 0 9 2 T 1 0 241580 CASAVA_Build 11 20685476 3D TCGTCTGAAG TCT/--- TCTTCCCTCA 3070 hom 41 het 16 0 14 2 TCT 2 1 241581 CASAVA_Build 11 20690429 1I GAAATTATAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 8 9 241582 CASAVA_Build 11 20692491 1D ACGCCCGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 17 1 11 5 T 11 10 241583 CASAVA_Build 11 20692653 1I TTATTTTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 9 10 241584 CASAVA_Build 11 20696586 2I ATTTATTCAT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TG 0 1 241585 CASAVA_Build 11 20697542 4D ACTATTAAAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 72 het 27 0 22 5 AC 16 14 241586 CASAVA_Build 11 20698028 1I CCAGACTGTT -/A AGTCACTTTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 1 2 241587 CASAVA_Build 11 20700140 3D TCTGAGTCTC TCT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 34 0 25 12 TCT 1 0 241588 CASAVA_Build 11 20707259 1D ATGCTACTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 35 0 30 6 T 9 8 241589 CASAVA_Build 11 20709212 3D GGATTCTATG ATA/--- ATTTCAGCTG 3070 hom 138 het 51 0 46 10 ATA 1 0 241590 CASAVA_Build 11 20716186 7D AACACCCAGA ATCATCT/------- ATCATCTATG 3070 hom 87 het 37 0 28 11 ATCATCT 2 1 241591 CASAVA_Build 11 20717535 1D ATGCTCAACA T/- TAAATGAATA 3070 hom 132 het 49 0 41 8 T 2 1 241592 CASAVA_Build 11 20719300 2D TCATTCTAAA GT/-- TCAAATAGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 GT 1 0 241593 CASAVA_Build 11 20729769 1D TGGCTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 25 2 18 6 A 18 17 241594 CASAVA_Build 11 20730290 3I ATATTTCATC ---/ATT AAGTCTGATG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 ATT 0 1 241595 CASAVA_Build 11 20731551 1D ATATGTCATA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 7 241596 CASAVA_Build 11 20733682 3D GTTTTTGTTT TTG/--- TTTTTTTTTT 461 hom 16 het 12 0 9 3 TTG 1 0 241597 CASAVA_Build 11 20734808 1D GATGGGGTCT A/- TCTTATGCTT 3070 hom 69 het 25 0 23 3 A 1 0 241598 CASAVA_Build 11 20742897 1D AAAAGGCTGA G/- GGGGAAGGAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 5 4 241599 CASAVA_Build 11 20752565 8I TGTTCCTCAG --------/GATAGACT GATAGACTAG 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 GATAGACT 1 2 241600 CASAVA_Build 11 20752669 1D TTCTTATATC T/- CTGAACTGAA 3070 het 3070 ref 26 18 8 1 T 1 0 241601 CASAVA_Build 11 20753608 1D TTCACCACTC T/- TTTTGCTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 5 4 241602 CASAVA_Build 11 20755944 1D CCTTGGTGCA T/- TTTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 48 28 18 5 T 6 5 241603 CASAVA_Build 11 20760163 2D CCCTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1648 hom 22 6 13 4 A 13 11 241604 CASAVA_Build 11 20762670 1I GTGGGCGATG -/A GGGCTGGTAT 3070 het 2730 hom 28 8 14 6 A 0 1 241605 CASAVA_Build 11 20764007 1I CTCTTTTGGA -/T TTTTTTTTTC 2380 het 2380 ref 22 11 6 5 T 9 10 241606 CASAVA_Build 11 20764473 3I ACCCCATCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 2194 het 538 hom 18 3 9 6 A 11 14 241607 CASAVA_Build 11 20766159 1I TTATGTCAGT -/A AGTTCACTTC 3070 het 3070 hom 51 16 30 5 A 1 2 241608 CASAVA_Build 11 20771971 1D AGATTTTTGA G/- TTGCAGAATT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 G 1 0 241609 CASAVA_Build 11 20774682 4I AAAATCTATC ----/TATA CTGCTTTTGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TA 0 2 241610 CASAVA_Build 11 20776637 2D TTTAAAAAAA CT/-- CTTCTTTGAC 3070 het 3070 ref 51 24 24 4 CT 2 1 241611 CASAVA_Build 11 20777093 47D GAGTCAGATG ATAAATACGGACAAAATTAAACCTAATGATAAACGTCATGGAAGAAA/----------------------------------------------- ATAAAACAGA 3070 het 3070 ref 23 19 9 6 ATAAATACGGACAAAATTAAACCTAATGATAAACGTCATGGAAGAAA 1 0 241612 CASAVA_Build 11 20777782 4D TATGTATGTG TGTA/---- TGTATGTATG 3070 het 562 hom 39 5 21 16 TGTA 6 5 241613 CASAVA_Build 11 20780531 1I AGAAATGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 11 12 241614 CASAVA_Build 11 20787654 1I CTCCTTGCTT -/C CTCCTTTTCC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 1 2 241615 CASAVA_Build 11 20791592 1D AGGACGTGAT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 9 8 241616 CASAVA_Build 11 20795957 1D GTTTTAAAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 40 0 31 10 T 10 9 241617 CASAVA_Build 11 20799020 2I TTGTCACCTA --/AC ACAATATATA 3070 hom 71 het 30 0 24 6 AC 1 2 241618 CASAVA_Build 11 20814744 1D CAGGTGAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 10 9 241619 CASAVA_Build 11 20814951 2D GGTGAAAAAC AG/-- AGGAATTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AG 2 1 241620 CASAVA_Build 11 20817182 1D AATTAGCTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 10 9 241621 CASAVA_Build 11 20820494 1I GACTCCGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2058 hom 27 7 13 7 A 15 16 241622 CASAVA_Build 11 20832831 1D GTGACAGTGG A/- CAGCCTGTGT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 1 0 241623 CASAVA_Build 11 20837930 1D3M7D GAGCACAGGA GGTAGGCGAAC/-GTA------- ATATTGAATT 3070 hom 135 het 48 0 46 5 N/A 0 0 241624 CASAVA_Build 11 20840412 1I TCAAGAGTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 304 hom 51 1 42 8 T 9 10 241625 CASAVA_Build 11 20842206 25D GCTGGGCATC AGAGGGAGACCGTGGAAAGAGAGGG/------------------------- AGAGGGAGAC 3070 hom 30 het 8 0 11 0 AGAGGGAGACCGTGGAAAGAGAGGG 1 0 241626 CASAVA_Build 11 20843680 1I GCCATCTGGA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 89 het 32 0 29 3 T 8 9 241627 CASAVA_Build 11 20848567 6I CTCTGGCAAC ------/TATCTT TAATTTATAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 TATCTT 0 1 241628 CASAVA_Build 11 20849765 2I TTTTTTTTTT --/TA ATTCATGTAG 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 TA 0 1 241629 CASAVA_Build 11 20861244 1D TTGGAACAGA T/- TTGGCAGGGC 2928 het 2928 ref 32 14 15 3 T 3 2 241630 CASAVA_Build 11 20862649 1D CGGGGTGAGG T/- TGGAAGCTCG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 2 1 241631 CASAVA_Build 11 20868576 3I AGTGCCTCTT ---/CTC CTCCAAATGA 1464 het 1464 ref 35 30 4 2 CTC 1 2 241632 CASAVA_Build 11 20872423 1D AAATTTGGAA C/- TTTTCTCATC 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 C 1 0 241633 CASAVA_Build 11 20878024 4I GACTTCAAAT ----/AAAC AACTATGGTA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 AAAC 0 1 241634 CASAVA_Build 11 20879684 1I CCCAAGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 35 0 26 9 T 13 14 241635 CASAVA_Build 11 20883125 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1099 het 1099 ref 16 8 4 4 T 17 16 241636 CASAVA_Build 11 20887727 1I CAATGAAGTT -/A ACTCTCTTGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 241637 CASAVA_Build 11 20891409 1I ATTTTAGCAT -/A ACAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 A 1 2 241638 CASAVA_Build 11 20898348 1I TATACTCTGC -/A AAAAGAAGAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 4 5 241639 CASAVA_Build 11 20910028 1I ACCAGGTAAA -/G GGTAGGGCTA 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 G 2 3 241640 CASAVA_Build 11 20915131 1D TACTTGCTTC T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 T 7 6 241641 CASAVA_Build 11 20918390 1D CTTGGGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 29 0 20 9 T 11 10 241642 CASAVA_Build 11 20921178 2D TCTTTTACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 9 T 14 12 241643 CASAVA_Build 11 20922458 1I CATAATTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 9 10 241644 CASAVA_Build 11 20930179 1I TTAAAGGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 12 13 241645 CASAVA_Build 11 21041117 2I GCCCAGCTAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 TG 7 8 241646 CASAVA_Build 11 21052800 1D TACACATGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 10 9 241647 CASAVA_Build 11 21053584 4D CAGATCAGTC TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 TTTG 4 3 241648 CASAVA_Build 11 21065510 1D ATCTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 11 10 241649 CASAVA_Build 11 21077064 1I GATCTCAGCA -/T TTTTTTAACC 3070 het 3070 ref 33 13 8 12 T 6 7 241650 CASAVA_Build 11 21078144 1I ATTTTAGCCC -/T TTTTTTTTTT 1164 het 1164 ref 42 23 3 16 T 11 12 241651 CASAVA_Build 11 21085449 1I AGGCCCAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 9 10 241652 CASAVA_Build 11 21109046 4I CAACAGGTAA ----/TAGT TAGACTGGTG 3070 het 3070 ref 61 32 20 9 TAGT 0 1 241653 CASAVA_Build 11 21109199 1D CTGATGTGGT G/- GGGGGAGATG 3070 hom 160 het 57 0 54 5 G 6 5 241654 CASAVA_Build 11 21124403 1D GACCAATGAT A/- AAGGGCCACT 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 A 3 2 241655 CASAVA_Build 11 21148809 2D17M2D ATATACTGTA GTTTATATATATACTGTATTA/--TTATATATATACTGTAT-- TATATATATA 940 het 940 ref 22 7 2 15 N/A 0 0 241656 CASAVA_Build 11 21150225 1D AGGGCGTTTT A/- AAAACTGCAC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 5 4 241657 CASAVA_Build 11 21162862 2I TCCTCTGTTT --/TA TTAACGAGGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TA 0 1 241658 CASAVA_Build 11 21166614 1D TGGCTTTTTT C/- TCTCACTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 0 241659 CASAVA_Build 11 21177918 1I ATCCCTCCCC -/T AGCCCCCCAC 3070 het 50 hom 17 1 14 2 T 0 1 241660 CASAVA_Build 11 21200987 6D AAAGTTCCTC TTGGTA/------ TTGATTTCTA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 TTGGTA 1 0 241661 CASAVA_Build 11 21208936 1I GTAAAACTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 10 241662 CASAVA_Build 11 21220239 4I AATGATGAAC ----/ACAT ACATGAGAAA 3070 het 3070 hom 54 19 26 9 ACAT 1 2 241663 CASAVA_Build 11 21226473 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 529 het 529 ref 37 25 4 9 AAAG 1 0 241664 CASAVA_Build 11 21240800 2D CTATTCTGAC TT/-- TTTATCTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 11 7 T 5 3 241665 CASAVA_Build 11 21244314 1I CATTTAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 21 20 12 T 10 11 241666 CASAVA_Build 11 21256171 1D GAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 9 241667 CASAVA_Build 11 21269520 15D AGAATAGATC AATAATAAGTTCTGA/--------------- AATTGAGATG 3070 hom 42 het 25 0 15 13 AATAATAAGTTCTGA 1 0 241668 CASAVA_Build 11 21274547 2I CTGCATTATA --/TG TGTATATATA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 TG 1 2 241669 CASAVA_Build 11 21290466 1I TTAGAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 604 hom 37 3 29 5 T 11 12 241670 CASAVA_Build 11 21304247 2D31M2D TTACACTAAT TCTCTTTTTGGCTTTATATCTACCATTTTGCTATT/--TCTTTTTGGCTTTATATCTACCATTTTGCTA-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 19 10 8 N/A 0 0 241671 CASAVA_Build 11 21308611 1D GATAGTTTTT C/- TGGGAATGAG 3070 het 3070 hom 49 20 25 5 C 1 0 241672 CASAVA_Build 11 21316821 1I AAACATTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 23 11 9 T 9 10 241673 CASAVA_Build 11 21323001 1D CTTCTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 30 1 25 4 A 11 10 241674 CASAVA_Build 11 21345549 27D AAGTTGCATT GCAAACCACACGATATTACAAAGGGCA/--------------------------- CTAAGTTAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 5 GCAAACCACACGATATTACAAAGGGCA 1 0 241675 CASAVA_Build 11 21354008 8I GTCTCTTGTC --------/AGTTTTTT AATGGAGTTA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 AGTTTTTT 0 1 241676 CASAVA_Build 11 21354275 1D GTTTTCTAGA T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 7 6 241677 CASAVA_Build 11 21356388 2D CATATATATG TA/-- TATATATATA 2755 het 1696 hom 16 4 7 5 TA 10 9 241678 CASAVA_Build 11 21361394 1D CAGTATTCGG T/- TTTTTTGGGC 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 T 7 6 241679 CASAVA_Build 11 21371117 1D TAAGTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 12 10 T 13 12 241680 CASAVA_Build 11 21377168 1I CTGAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 10 11 241681 CASAVA_Build 11 21381634 15I ATGAGTTTCA ---------------/TTAACAGCAAGCTCT TGCCCCATGG 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 TTAACAGCAAGCTCT 0 1 241682 CASAVA_Build 11 21381729 2D GTAGCTCTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 29 4 14 12 A 15 13 241683 CASAVA_Build 11 21381866 1D ATGTTATCAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 8 7 241684 CASAVA_Build 11 21383327 3D TAGGTTTTGT TGC/--- TGCTCCTTGG 3070 hom 133 het 46 0 43 4 TGC 2 1 241685 CASAVA_Build 11 21383519 1D AGGATTCCAA T/- TTTTTCTGTT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 6 5 241686 CASAVA_Build 11 21384538 3D AATAATTACC AGA/--- AGAAGTAGAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AGA 2 1 241687 CASAVA_Build 11 21392655 4D CAAATGGACT CTCC/---- CTCCGGTGTA 3070 het 3070 ref 41 26 13 3 CTCC 2 1 241688 CASAVA_Build 11 21392735 1D GTTCTTCTTG T/- TTTAATAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 4 3 241689 CASAVA_Build 11 21394077 1D AGAGGACGGA G/- GGAAGCTTCT 3070 het 3070 ref 41 19 20 2 G 3 2 241690 CASAVA_Build 11 21399780 1I CAGGAGATTT -/A AAAGAGCCAG 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 A 3 4 241691 CASAVA_Build 11 21400216 12D CATTTACACA TATGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 1656 hom 35 10 14 16 TATGTGTGTGTG 1 0 241692 CASAVA_Build 11 21403411 1I GTGAATAGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 18 18 10 A 9 10 241693 CASAVA_Build 11 21416382 2I TACATGACAG --/TT TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 7 9 241694 CASAVA_Build 11 21417191 4I ACTGCAGGTA ----/ATAG ATAGAGGTGT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 ATAG 1 2 241695 CASAVA_Build 11 21418429 1I AAAGTAAGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 G 0 1 241696 CASAVA_Build 11 21421163 1I GGTAATTTAC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 7 8 241697 CASAVA_Build 11 21421644 1I23M1I CATAAAATTG -AGGCTACTTTGTCTTTGCTTTTA-/AAGGCTACTTTGTCTTTGCTTTTAT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 21 14 4 N/A 0 0 241698 CASAVA_Build 11 21421990 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 10 11 241699 CASAVA_Build 11 21423497 4D TGCCCAGGCT GGAG/---- TGCAATAGCG 2703 het 2703 ref 17 8 6 3 GGAG 1 0 241700 CASAVA_Build 11 21430315 6I TAAAATCTCA ------/TTTGTC CCTCACAATA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TTTGTC 0 1 241701 CASAVA_Build 11 21432057 5D TTTATTATTA TACTT/----- TACTTTACTT 3061 het 2576 hom 23 6 8 9 TACTT 3 2 241702 CASAVA_Build 11 21433998 2D CTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 30 6 T 13 11 241703 CASAVA_Build 11 21434107 1I GCCTCCCAGG -/T TCCAGCATTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 1 2 241704 CASAVA_Build 11 21435025 1I TGTTTTTTTT -/C CTAAGATACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 241705 CASAVA_Build 11 21436143 4I GAAGATCAGG ----/TGAT TGATGGAGAC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TGAT 1 2 241706 CASAVA_Build 11 21437058 4I ATATTTAGAG ----/ACAC ATAATTTTGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AC 0 2 241707 CASAVA_Build 11 21456048 4I TAATAAAAAG ----/AATC AAGCAGAAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AATC 0 1 241708 CASAVA_Build 11 21456816 1D ACACCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 13 12 241709 CASAVA_Build 11 21458032 1D CAGTCTTGTC T/- TTTTTTCCTC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 T 7 6 241710 CASAVA_Build 11 21465600 3I GAAGCAAAAA ---/AAC AACATTTACC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAC 1 2 241711 CASAVA_Build 11 21465755 4I CAAAGAACAT ----/ACAA ACAACCAGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ACAA 1 2 241712 CASAVA_Build 11 21471650 1D TGTAGGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 34 0 29 6 A 13 12 241713 CASAVA_Build 11 21492779 1I AATATAGCTC -/T CCCTGTGCCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 0 1 241714 CASAVA_Build 11 21564630 1D TAGAAATACT A/- AAAAAAAAAC 1359 het 1359 ref 43 30 3 10 A 10 9 241715 CASAVA_Build 11 21613146 2I TTAGTATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TG 5 6 241716 CASAVA_Build 11 21613406 1I ATCTCCCTGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 12 hom 38 1 35 2 A 8 9 241717 CASAVA_Build 11 21614253 1I ATTTTAATTT -/G TTAATGAGTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 0 1 241718 CASAVA_Build 11 21625159 2I TATTAAAAAT --/AA AAACTTTTTT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 3 5 241719 CASAVA_Build 11 21626149 2I ACATAGTCTC --/AG AAATTTTGTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AG 0 1 241720 CASAVA_Build 11 21626915 1I CTCTTTGGAG -/A ACAATATTCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 2 241721 CASAVA_Build 11 21631475 6I GAATCTGTGA ------/TTTAAC TTTAGGTGTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TTTAAC 0 1 241722 CASAVA_Build 11 21631656 3I TGTGACTATC ---/CTT CTTTCAGGAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CTT 1 2 241723 CASAVA_Build 11 21632480 1I TATTGTTTCA -/T TTTTGCCCCT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 4 5 241724 CASAVA_Build 11 21632765 2D AATAATATTT AA/-- AAAAAATATA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 8 6 241725 CASAVA_Build 11 21637051 1I AAAAAAAAAA -/T ATCAAGAATG 3070 hom 27 het 45 1 38 6 T 0 1 241726 CASAVA_Build 11 21669502 3I TAATTTAAAA ---/AAT AATTTCTTAT 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AAT 1 2 241727 CASAVA_Build 11 21696814 2I TCTGTTAAGC --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 CT 6 7 241728 CASAVA_Build 11 21700370 1D TTCCTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 25 7 T 11 10 241729 CASAVA_Build 11 21702456 4I TAGAGTACTC ----/AAAT GAATCCAATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAAT 0 1 241730 CASAVA_Build 11 21703882 1D CACCCCAGCT C/- TTGGCAACCA 3070 hom 105 het 41 0 33 8 C 1 0 241731 CASAVA_Build 11 21706274 3D CTGATTTTGT CTA/--- CTATTTCTAA 3070 hom 51 het 19 0 18 3 CTA 2 1 241732 CASAVA_Build 11 21708229 15I14M7D GAACTATGAC ---------------TGGTGAGCTCACCACCTAGGT/CCTCTGCAGATCCAATTGTGGGCCCTTAA------- GCAGATCTGC 3070 het 63 hom 29 1 13 23 N/A 0 0 241733 CASAVA_Build 11 21708926 1D TTATTTTCCA G/- GGGGAAGAAA 3070 hom 141 het 54 0 46 8 G 5 4 241734 CASAVA_Build 11 21712334 1I ATATTCTTTC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 8 9 241735 CASAVA_Build 11 21712604 1I ACGTGATTAC -/T TTCCACTTAC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 2 3 241736 CASAVA_Build 11 21715463 4I AAAATTTTAG ----/ATTT ATTATTATTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATTT 0 1 241737 CASAVA_Build 11 21717855 29D AGGACAGTGG CCTCTTCTCACAGCTCCACTAGGCAGTTC/----------------------------- CCCAATGGGG 3070 hom 60 het 20 0 21 3 CCTCTTCTCACAGCTCCACTAGGCAGTTC 1 0 241738 CASAVA_Build 11 21718350 4I CTGGTAGAGG ----/TTCT TTCTGAGGGC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TTCT 1 2 241739 CASAVA_Build 11 21718993 1I TGCTTAGAAA -/T TTTGGCGAGG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 3 4 241740 CASAVA_Build 11 21721137 5I GCTTTATTTA -----/TTTTG TTTTATTTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TTTTG 0 1 241741 CASAVA_Build 11 21723633 4I CTATACTCCT ----/TTAA TTATTTATAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTAA 0 1 241742 CASAVA_Build 11 21726257 5D CGCCTAGCAA ATAAT/----- ATATTTTAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 5 ATAAT 1 0 241743 CASAVA_Build 11 21726882 1D AAATAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 38 1 35 2 T 11 10 241744 CASAVA_Build 11 21743275 3D ACAATCAAAC ATT/--- ATAATTAGTT 3070 het 3070 hom 31 16 15 2 ATT 1 0 241745 CASAVA_Build 11 21745449 1I CAGGATTGTT -/A GGCATCTCTC 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 A 0 1 241746 CASAVA_Build 11 21745869 2D ATATATATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 TA 8 7 241747 CASAVA_Build 11 21748177 1D ATTATTGGGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 57 het 25 0 20 6 T 9 8 241748 CASAVA_Build 11 21750145 1D TATGAACTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 53 28 15 10 T 10 9 241749 CASAVA_Build 11 21750873 1I CCTCTGTTGA -/T TGTTTCATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 2 241750 CASAVA_Build 11 21760427 9I GGATGATTCT ---------/GTGTTACCG GTGGAAGGTA 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 GTGTTACCG 0 1 241751 CASAVA_Build 11 21762723 1I CTGTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 1993 het 1993 ref 23 8 6 9 A 11 12 241752 CASAVA_Build 11 21778318 1I AACTTTTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 9 10 241753 CASAVA_Build 11 21780877 2I TACATTTGAA --/AT CTGTGCAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AT 0 1 241754 CASAVA_Build 11 21798956 2I ATAGATTTGA --/AT ATAGTTTAAT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 AT 1 2 241755 CASAVA_Build 11 21801202 1D ATCAACAAAA C/- TAAACATTAG 3070 het 3070 ref 60 32 19 10 C 1 0 241756 CASAVA_Build 11 21808844 1D GGAAGTCCTT A/- ACTCAGGAAC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 2 1 241757 CASAVA_Build 11 21811069 3D ATACTGCATA TCT/--- TCTATAGTCT 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 TCT 2 1 241758 CASAVA_Build 11 21811642 3D AAGCATATTT GAG/--- GAGGAAATCA 3070 het 3070 ref 36 24 10 3 GAG 2 1 241759 CASAVA_Build 11 21812016 1I AGCGACCCCT -/C ACAAATGAGC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 C 0 1 241760 CASAVA_Build 11 21812362 1D TACAAGTACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 T 9 8 241761 CASAVA_Build 11 21814262 1D TAGAAAAAAC A/- AATAGATGGA 3070 het 3070 hom 42 12 23 7 A 3 2 241762 CASAVA_Build 11 21815731 4D TGGAAGAAAA TGTT/---- TGACCAACTG 3070 het 3070 ref 35 24 11 1 TGTT 1 0 241763 CASAVA_Build 11 21831630 1D TGAAGTTCAC A/- GCAATTATTT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 1 0 241764 CASAVA_Build 11 21833478 2D CTCTCTAAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 GT 6 5 241765 CASAVA_Build 11 21846407 4D GTACACTTTC TTTA/---- TTTGTTTGAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TTTA 1 0 241766 CASAVA_Build 11 21870976 1I CAAATGCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 9 10 241767 CASAVA_Build 11 21879205 1I AATTAAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 9 241768 CASAVA_Build 11 21879503 2I TCTCAAAAAG --/AA AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 A 8 10 241769 CASAVA_Build 11 21881988 1I AAAGGTGAGA -/T TTTTTTGCTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 6 7 241770 CASAVA_Build 11 21884107 2I AATGATTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 T 11 13 241771 CASAVA_Build 11 21886880 1I GAGTCTTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 8 9 241772 CASAVA_Build 11 21892437 4D TAATATTAAT TTTG/---- TTTATTAGCT 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 TTTG 1 0 241773 CASAVA_Build 11 21895357 1I12M1I GCCTTAGAAA -TCTCAGGCACCC-/GGCTCAGGCACCCA AAAATGACTG 3070 hom 78 het 28 0 26 6 N/A 0 0 241774 CASAVA_Build 11 21897763 1I CATAAAGCCA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 126 het 49 0 42 7 T 7 8 241775 CASAVA_Build 11 21904024 3D CTAAAATATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 36 0 18 19 A 15 12 241776 CASAVA_Build 11 21904073 1I CTGTATTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 11 13 A 12 13 241777 CASAVA_Build 11 21904412 4D TGACAATCAG TATT/---- TATTAAGTAT 3070 hom 135 het 47 0 46 2 TATT 2 1 241778 CASAVA_Build 11 21910858 45D CTTGGGGTGT CACTGTCTCCCATCACCCCCATTTGGGACAATCTAGTTGCAGGGA/--------------------------------------------- AAAAAATTCC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CACTGTCTCCCATCACCCCCATTTGGGACAATCTAGTTGCAGGGA 1 0 241779 CASAVA_Build 11 21914534 1D CCCTGTTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 33 9 A 12 11 241780 CASAVA_Build 11 21916006 1D AAAAAAAAAA C/- CTTTTGATTG 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 C 2 1 241781 CASAVA_Build 11 21918142 1I TTTACTTAGC -/A AAATTCTCTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 3 4 241782 CASAVA_Build 11 21919827 1D GATTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1092 het 1092 ref 41 32 4 5 T 11 10 241783 CASAVA_Build 11 21925896 1D CTCCAGCCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 28 0 25 4 A 10 9 241784 CASAVA_Build 11 21928050 1D AGTAAATGAA G/- TCATACCTCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 0 241785 CASAVA_Build 11 21941561 2D ACACACACAC AT/-- ATATGTATAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AT 3 2 241786 CASAVA_Build 11 21941753 2I TAAGCTTTGC --/TG ACTATGTTAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TG 0 1 241787 CASAVA_Build 11 21942492 1D AATGGACAGT G/- GATGAGAAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 2 1 241788 CASAVA_Build 11 21942614 2I4M1I TTCAAGGCAG --TAAG-/CTTAAGC CTGCTGTTCA 3070 hom 144 het 50 0 49 3 N/A 0 0 241789 CASAVA_Build 11 21944250 1D CTACCTAATC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 90 het 36 0 27 9 T 8 7 241790 CASAVA_Build 11 21944700 2I ATGTTAAGAC --/TT TCTGTAACTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 3 241791 CASAVA_Build 11 21957172 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 17 18 241792 CASAVA_Build 11 21958873 1D CAGAACTGTG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 129 het 47 0 42 5 A 9 8 241793 CASAVA_Build 11 21966315 1I TGAGTTGCTA -/G TAGAAGTGAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 G 0 1 241794 CASAVA_Build 11 21980910 1D CTTCAGTGCC A/- TACTATCTGG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 1 0 241795 CASAVA_Build 11 21981150 1D TGCTAAATTA C/- CGCAATCCCC 3070 het 3070 hom 50 18 26 6 C 2 1 241796 CASAVA_Build 11 21985094 2D AAGAAATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TA 7 6 241797 CASAVA_Build 11 21985594 1I CTCTTGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 9 10 241798 CASAVA_Build 11 21986174 1D ATCTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 A 11 10 241799 CASAVA_Build 11 21988214 1I GCCTTAATTT -/C AACTTTAGTG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 C 0 1 241800 CASAVA_Build 11 21989571 1D TTTAAAACTG T/- TTCAATAACT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 T 3 2 241801 CASAVA_Build 11 21990393 1I GGTTGCATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 18 5 A 10 11 241802 CASAVA_Build 11 21992595 1D CACACACTTA T/- ATACCCCACA 3070 hom 117 het 47 0 40 8 T 1 0 241803 CASAVA_Build 11 21994125 1I ATTTTTTGAA -/T TTTTTTTTTA 2238 het 346 hom 11 1 6 4 T 9 10 241804 CASAVA_Build 11 22001031 1I AACAGGAGCT -/G CCTTGTAGAG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 G 0 1 241805 CASAVA_Build 11 22014105 1D TGTGAAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 41 0 34 9 A 10 9 241806 CASAVA_Build 11 22017508 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1968 hom 22 8 9 5 A 13 12 241807 CASAVA_Build 11 22018071 1I CATGATCTTC -/T TTGGGCACAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 2 3 241808 CASAVA_Build 11 22022796 9I TTTTATTTCC ---------/ATTGTTCTT ATTCTATTTC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 ATTGTTCTT 0 1 241809 CASAVA_Build 11 22027399 1D TTTTGTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 G 1 0 241810 CASAVA_Build 11 22037088 4I CATGCTCTGA ----/GCCT GCCATGCACC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 GCCT 0 1 241811 CASAVA_Build 11 22039409 1D TGTATTTTCA G/- TCTATGAGTC 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 G 1 0 241812 CASAVA_Build 11 22046105 1D AAGATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 A 11 10 241813 CASAVA_Build 11 22050413 4D GAACAGTGAA CTAT/---- CTGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 36 22 14 2 CTAT 1 0 241814 CASAVA_Build 11 22053969 3D TGTTTTTGGA AAG/--- AAGGTGATCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 7 AAG 2 1 241815 CASAVA_Build 11 22091490 1I TTAAAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 10 11 241816 CASAVA_Build 11 22130986 1D TCAAAATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 38 0 26 12 T 11 10 241817 CASAVA_Build 11 22132481 4I AAATCACATC ----/CAAA TCTGCTGCTG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 CAAA 0 1 241818 CASAVA_Build 11 22137486 1I AACTGTACCC -/A AATAAAATCA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 2 3 241819 CASAVA_Build 11 22141564 1D TCTTGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 1094 het 1094 ref 31 20 4 7 A 12 11 241820 CASAVA_Build 11 22149390 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2116 het 2116 ref 17 11 5 1 A 14 13 241821 CASAVA_Build 11 22149506 1I CTCAATGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 9 10 241822 CASAVA_Build 11 22155234 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 T 9 10 241823 CASAVA_Build 11 22156554 1I ATGGTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1443 hom 30 7 16 7 G 0 1 241824 CASAVA_Build 11 22157017 1D ACCCTGTCTC G/- GGTATGTCTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 G 3 2 241825 CASAVA_Build 11 22159496 1D AATTCGTTTT C/- CTCCTCTCCA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 C 2 1 241826 CASAVA_Build 11 22180584 1D ATTTTTTAAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 9 8 241827 CASAVA_Build 11 22184462 2D GGAAAGGGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AG 2 1 241828 CASAVA_Build 11 22187990 1D CTATGCTTCT G/- TAAGCAAAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 0 241829 CASAVA_Build 11 22190118 1D TTATTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 12 11 241830 CASAVA_Build 11 22196198 1D ATTTTTCTTC T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 T 7 6 241831 CASAVA_Build 11 22197675 1D AAGAGGACTA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 7 6 241832 CASAVA_Build 11 22198612 1I CAAATTTAAA -/C AAAGGATTGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 0 1 241833 CASAVA_Build 11 22211933 3D ATAAGCAGAA GTT/--- GTTGTTGTTC 3070 het 3070 ref 44 28 13 5 GTT 4 3 241834 CASAVA_Build 11 22218931 1D AAGCAGAAAC A/- TTTTTTTTTC 3070 het 300 hom 41 1 39 2 A 1 0 241835 CASAVA_Build 11 22230228 1I AAAATTTGTA -/G GTATGTTTGC 3070 hom 60 het 26 0 20 6 G 1 2 241836 CASAVA_Build 11 22235195 1D GCTGACAGCG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 10 9 241837 CASAVA_Build 11 22245757 5I TTTTTTAACT -----/GTTAA GTTCAGAGGT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 GTTAA 0 1 241838 CASAVA_Build 11 22252671 4D GATCTTCCTC TTTT/---- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 11 7 241839 CASAVA_Build 11 22254183 1D ACTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 39 0 27 12 T 12 11 241840 CASAVA_Build 11 22259644 1D TTCTTTCTTG A/- AAAAACAAGT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 6 5 241841 CASAVA_Build 11 22259777 4D TGATAAAAAT AAGA/---- AAGAGCATGG 3070 het 3070 hom 41 19 17 6 AAGA 2 1 241842 CASAVA_Build 11 22261360 1I TTCTTCCAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 T 9 10 241843 CASAVA_Build 11 22272050 1D CATAATGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 10 9 241844 CASAVA_Build 11 22276707 1D ACTATATATG A/- TTACAGCACA 2733 het 2733 ref 17 9 6 2 A 1 0 241845 CASAVA_Build 11 22277108 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 9 10 241846 CASAVA_Build 11 22277529 2I TAAAAAAAAA --/AT GTAATGAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 AT 0 1 241847 CASAVA_Build 11 22283587 2I TTTGAAAGAC --/TG TTTGAAATAA 3070 hom 110 het 43 0 37 6 TG 0 1 241848 CASAVA_Build 11 22285826 3D AAGTATGTTG ATC/--- ATCTTGTAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 ATC 2 1 241849 CASAVA_Build 11 22286678 1D TAGCTAAAAT A/- AAAAATAGTA 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 A 6 5 241850 CASAVA_Build 11 22289604 6D CATTCTTAAG CTTATA/------ TTTAAGGGCC 3070 het 3070 hom 39 18 21 4 CTTATA 1 0 241851 CASAVA_Build 11 22297697 3I AGCAGTAGTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 TTG 2 3 241852 CASAVA_Build 11 22303723 1I TTCATTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 18 20 15 A 12 13 241853 CASAVA_Build 11 22306009 1I ACATTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 10 11 241854 CASAVA_Build 11 22306650 1D TATGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 376 hom 33 1 31 1 A 11 10 241855 CASAVA_Build 11 22318031 1D GCAGGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 32 0 25 7 A 11 10 241856 CASAVA_Build 11 22323438 1I ACTCAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 1165 het 1165 ref 14 5 4 5 T 15 16 241857 CASAVA_Build 11 22325367 1D TTTGGGGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 10 22 4 A 10 9 241858 CASAVA_Build 11 22325629 1D AACTTTCGGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 9 8 241859 CASAVA_Build 11 22328581 2I AGGAAATCAC --/AA AAAAAAAAAC 2579 het 2579 ref 33 21 8 4 A 9 11 241860 CASAVA_Build 11 22329785 1D ACAGCTTCTT A/- AAAAAATCAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 7 6 241861 CASAVA_Build 11 22332213 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2525 hom 25 8 13 4 T 10 11 241862 CASAVA_Build 11 22337937 1D TTGTTAATGT G/- TCATGACAAG 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 G 1 0 241863 CASAVA_Build 11 22338233 1I TTAAGGCACT -/A AAAAAAAAAA 3014 het 3014 ref 36 12 11 13 A 13 14 241864 CASAVA_Build 11 22340150 1D GTCTAAGACC T/- TTTTTTTTTT 1095 het 1095 ref 37 28 3 6 T 11 10 241865 CASAVA_Build 11 22404701 14D ACCCAAATGA CAGGTATCTATTAC/-------------- CAAGATTATT 3070 het 3070 ref 34 22 11 4 CAGGTATCTATTAC 1 0 241866 CASAVA_Build 11 22420384 7I ATAACCATGC -------/CACAAAG CACATTGATC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 CACAAAG 0 1 241867 CASAVA_Build 11 22430149 2I AGCTCCAAAA --/AT ATGTTAACTC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 AT 1 2 241868 CASAVA_Build 11 22430618 1D ACTCAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 A 12 11 241869 CASAVA_Build 11 22456830 4I TAAACCCTGA ----/GATT GATTCTTCTG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 GATT 1 2 241870 CASAVA_Build 11 22463647 1D ATGTTTGGCT C/- TGGGAAATGG 3070 hom 66 het 30 0 23 7 C 1 0 241871 CASAVA_Build 11 22469575 3I ACAACAAACA ---/AAC AACAACAACA 2178 het 139 hom 39 3 11 25 AAC 5 6 241872 CASAVA_Build 11 22470614 2D TGGATTTATC CT/-- CTCTCATGAG 3070 het 3070 ref 41 25 16 1 CT 3 2 241873 CASAVA_Build 11 22474939 16D GGGCTTTCTA TGTGTGTGTGTGTGTG/---------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 7 het 43 1 28 16 TG 17 9 241874 CASAVA_Build 11 22478549 1I AAGAAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 781 hom 34 2 24 8 A 13 14 241875 CASAVA_Build 11 22480555 1D TCCTTTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 35 3 25 7 A 13 12 241876 CASAVA_Build 11 22482758 1I TGTGGCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 634 hom 32 2 23 7 T 12 13 241877 CASAVA_Build 11 22485174 4I TATTCCTAGC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TTTG 3 4 241878 CASAVA_Build 11 22486539 1I TCTAAGCATA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 7 8 241879 CASAVA_Build 11 22490779 1D AGGAGGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 709 hom 47 4 27 16 T 15 14 241880 CASAVA_Build 11 22493445 1I ACTAGATAAG -/T TTTTTTTACT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 7 8 241881 CASAVA_Build 11 22501055 1I ATATTTTTTC -/A AAAATCATAC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 4 5 241882 CASAVA_Build 11 22507791 1I ATGACAATTT -/C AAGCAGCATA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 C 0 1 241883 CASAVA_Build 11 22510453 4I TGAGATTAGC ----/GATG GATGGATTGG 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 GATG 1 2 241884 CASAVA_Build 11 22511003 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2003 het 1015 hom 25 7 9 9 A 11 10 241885 CASAVA_Build 11 22511083 4I GAAGAGGCTA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 36 15 18 3 TG 7 9 241886 CASAVA_Build 11 22515847 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2798 hom 18 8 9 1 A 10 9 241887 CASAVA_Build 11 22517126 2D GTGTGTGTGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 99 het 39 0 33 7 GA 8 7 241888 CASAVA_Build 11 22524203 1D AATATTACTA T/- TTTTAATTGG 3070 het 3070 hom 51 22 27 2 T 5 4 241889 CASAVA_Build 11 22531705 1D GTTACTGTTG T/- TACTTGTTTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 2 1 241890 CASAVA_Build 11 22533241 1D TTTCTCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 32 0 18 14 A 12 11 241891 CASAVA_Build 11 22548709 2I AACAAATCTG --/TC TCTCACTCCA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 TC 2 3 241892 CASAVA_Build 11 22557272 3I ATAAACTAAG ---/TCT TCTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 TCT 1 2 241893 CASAVA_Build 11 22559986 1D TTATTTCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 10 9 241894 CASAVA_Build 11 22561096 4D GAGTCGAAAA ATAG/---- ATAGAGTAAC 3070 het 3070 ref 28 19 8 2 ATAG 2 1 241895 CASAVA_Build 11 22576834 1D GGCCGAAGAA G/- TTGTATTATC 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 G 1 0 241896 CASAVA_Build 11 22579272 1D GAAACAAATG A/- AAAAAAGTCT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 7 6 241897 CASAVA_Build 11 22594687 1D GGTAAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 22 9 T 12 11 241898 CASAVA_Build 11 22595833 3I GTCCACCACC ---/ACT ATGACTGCAG 3070 hom 98 het 37 0 31 6 ACT 0 1 241899 CASAVA_Build 11 22598642 1D TCCTAGGTTA G/- GGGGGGTTCT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 G 7 6 241900 CASAVA_Build 11 22601470 1I CTAAATATCA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 7 8 241901 CASAVA_Build 11 22604258 5I ATCCTTAAGT -----/AGAAA AGAAATTTTC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 AGAAA 1 2 241902 CASAVA_Build 11 22607122 2D TTCCATGGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 32 het 16 0 11 7 TG 8 7 241903 CASAVA_Build 11 22622811 7D GGCATGATCT CAGCTAA/------- CTGCAACCCT 3070 hom 74 het 28 0 25 4 CAGCTAA 1 0 241904 CASAVA_Build 11 22631205 4D TCTCTCTCTC TCCT/---- TCCTTCCTTC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 TCCT 4 3 241905 CASAVA_Build 11 22634909 2D TTTGTCATGA TG/-- TGTGTGTGTG 1062 het 1062 ref 51 35 3 14 TG 9 8 241906 CASAVA_Build 11 22638009 12D GGAGGAAGGA AGGAAGGGAGGG/------------ AGGAAGGGAG 3070 hom 36 het 17 0 12 6 AGGAAGGGAGGG 3 2 241907 CASAVA_Build 11 22642452 1I CATAGGAGGG -/A AAAAATAACG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 5 6 241908 CASAVA_Build 11 22643127 1D AATTTAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 40 0 30 10 A 11 10 241909 CASAVA_Build 11 22647386 11D GTTAACAATA GTCATTAGACT/----------- GTCATTAGAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 6 GTCATTAGACT 2 1 241910 CASAVA_Build 11 22648423 2D CAGTTGAGTC TG/-- TGTGTGTAGA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 TG 4 3 241911 CASAVA_Build 11 22648517 1D TCATCATCTT A/- GGGGCAGCAT 3070 het 3070 hom 26 10 16 1 A 1 0 241912 CASAVA_Build 11 22650111 1D TTGAAATGTG A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 7 6 241913 CASAVA_Build 11 22652338 2D TATTTTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 40 6 14 20 T 12 10 241914 CASAVA_Build 11 22653806 3D GGATCATCAT ATA/--- TAGCAGCACT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 ATA 1 0 241915 CASAVA_Build 11 22654895 1I AAGCATTGGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 8 9 241916 CASAVA_Build 11 22656096 1D AATGAATGAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 9 8 241917 CASAVA_Build 11 22656422 6D AGATATTTTT CTTACA/------ CTTAGATACA 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 CTTACA 1 0 241918 CASAVA_Build 11 22656712 1D GGATTTGCTG T/- TGTGCAAATT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 T 2 1 241919 CASAVA_Build 11 22657955 2I ATAAATCATC --/TG AGATATATTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 TG 0 1 241920 CASAVA_Build 11 22659432 3I CAGGCAACTG ---/TTT AAATCCCACC 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 0 3 241921 CASAVA_Build 11 22659956 1I TTATATTATA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 7 8 241922 CASAVA_Build 11 22660418 1D ATGAAAGCCA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 T 7 6 241923 CASAVA_Build 11 22661788 1D AAATAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 13 12 241924 CASAVA_Build 11 22662635 1D ACACAAAAAA T/- TAAGGCAGGA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 2 1 241925 CASAVA_Build 11 22687343 1D AAAAAAAAAA C/- CACAGAAGAC 3070 hom 81 het 34 0 27 8 C 2 1 241926 CASAVA_Build 11 22688628 8D TGTGTGTCTG TGTGTGTC/-------- TGTGTGTATA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TGTGTGTC 1 0 241927 CASAVA_Build 11 22691187 1D AGACTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 16 15 241928 CASAVA_Build 11 22694766 1D TCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 592 hom 35 2 26 8 A 14 13 241929 CASAVA_Build 11 22695261 1D CATAACTAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 48 het 24 0 17 8 A 9 8 241930 CASAVA_Build 11 22695898 1I AATCAGCAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 37 het 27 0 22 5 A 9 10 241931 CASAVA_Build 11 22702641 1I TAATGTTTAT -/G AATACTTTAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 241932 CASAVA_Build 11 22719446 2I AAAAGTAAAA --/CT CTGTGTAAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CT 1 2 241933 CASAVA_Build 11 22736006 1D TAAAAAAGGC T/- CCTGTCTATG 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 T 1 0 241934 CASAVA_Build 11 22738260 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1690 hom 26 6 9 11 T 15 14 241935 CASAVA_Build 11 22745675 1D ATGTGAATGA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 T 8 7 241936 CASAVA_Build 11 22757836 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 28 2 A 11 10 241937 CASAVA_Build 11 22760889 7D GATTTTGTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1837 hom 31 13 10 10 T 18 11 241938 CASAVA_Build 11 22761351 1I TTGTTAGCCA -/C TTGTTTGTCT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 C 0 1 241939 CASAVA_Build 11 22765640 1D ACATTAAATA T/- TTGTTACTTT 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 T 3 2 241940 CASAVA_Build 11 22768713 3D TTCTTCTCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 1771 het 812 hom 32 11 7 14 T 19 16 241941 CASAVA_Build 11 22779573 1I CATGGGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 11 12 241942 CASAVA_Build 11 22788465 1D AGTTTCAGCT C/- CTTGATACTA 3070 het 3070 ref 44 27 13 5 C 2 1 241943 CASAVA_Build 11 22788932 1D GCTGGGAGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 65 het 29 0 21 8 A 10 9 241944 CASAVA_Build 11 22791558 1I TAAATCGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 10 11 241945 CASAVA_Build 11 22791694 2I AGTTTCTTTG --/TA TATAGTTAAT 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 TA 2 3 241946 CASAVA_Build 11 22804503 1D GTTTTGAGAG A/- AAAAAAACCA 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 8 7 241947 CASAVA_Build 11 22810015 4D AGATAAAAAC AATT/---- AACATGTGTG 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 AATT 1 0 241948 CASAVA_Build 11 22810784 4D TGTTTTATTA TTAG/---- TTGTTAATCT 3070 het 3070 hom 39 19 19 3 TTAG 1 0 241949 CASAVA_Build 11 22813778 1D AAGAATATGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 8 241950 CASAVA_Build 11 22814360 1D TCTAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 A 13 12 241951 CASAVA_Build 11 22814900 1I TTTGGGGGTT -/A AGGGGACCCC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 1 2 241952 CASAVA_Build 11 22815744 1D AAGAAGGGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 168 hom 28 1 17 10 A 13 12 241953 CASAVA_Build 11 22815873 1D TCAATTATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 10 9 241954 CASAVA_Build 11 22823949 1D TTGTGTTCAT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 680 hom 30 3 17 10 G 1 0 241955 CASAVA_Build 11 22828721 1I CCCTCTGGGT -/A AGATACCCAG 3070 het 2917 hom 20 8 9 3 A 1 2 241956 CASAVA_Build 11 22831775 1D GTACAATTGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 13 14 5 A 9 8 241957 CASAVA_Build 11 22836666 1I TAACAATAAC -/T TTTTTTATCC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 6 7 241958 CASAVA_Build 11 22841036 1D TGTCTGAGAC T/- TATTAGGAAG 3070 het 3070 hom 46 18 27 1 T 2 1 241959 CASAVA_Build 11 22849436 1D AAGTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 1642 het 459 hom 31 3 5 23 T 12 11 241960 CASAVA_Build 11 22850988 1D GAAATGATAT A/- AATCTAAAGA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 3 2 241961 CASAVA_Build 11 22854841 4I GCTTCATAAC ----/TTTG TTTAAGCTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 TTTG 0 1 241962 CASAVA_Build 11 22855553 1D AGGAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 A 12 11 241963 CASAVA_Build 11 22856018 1I ATCTACTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 11 12 241964 CASAVA_Build 11 22860080 1I TTCTGGTCTG -/A AAACCATAAT 3070 het 3070 ref 67 30 29 8 A 3 4 241965 CASAVA_Build 11 22860976 1D GTTATATATA T/- TATATATATA 464 hom 3 het 19 0 1 18 T 2 1 241966 CASAVA_Build 11 22864235 2D TAGGCAACAC AT/-- GTGTGTAAAT 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 AT 1 0 241967 CASAVA_Build 11 22867259 1I AATTGGACTG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 8 9 241968 CASAVA_Build 11 22871288 1I GGCTTAGGGA -/G GCATTTGGCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 1 2 241969 CASAVA_Build 11 22872999 5I CATACATTTT -----/AGACA AGACAAGAGT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 AGACA 1 2 241970 CASAVA_Build 11 22873368 3D GCCCGTGTTT TTC/--- TTATTCTGGT 3070 het 3070 ref 51 27 24 2 TTC 1 0 241971 CASAVA_Build 11 22875052 17D AAGAATACTT AATGGAAATGGAAATAC/----------------- TTAATAACAA 3070 het 3070 ref 45 21 21 11 AATGGAAATGGAAATAC 1 0 241972 CASAVA_Build 11 22898534 1D TGTTATTGCC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 8 7 241973 CASAVA_Build 11 22899664 1D TTATTCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 T 12 11 241974 CASAVA_Build 11 22900417 1D TTTGTATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 353 hom 39 1 29 10 T 11 10 241975 CASAVA_Build 11 22903212 1D TTTGATAGTT A/- AAACATTTTA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 4 3 241976 CASAVA_Build 11 22906513 2I GTGCACATGA --/GC GCGCGCACAC 1732 het 1732 ref 35 12 13 10 GC 3 4 241977 CASAVA_Build 11 22907784 2D TATATTATTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TA 6 5 241978 CASAVA_Build 11 22913642 1I GAGGCAGGAG -/A ATCACTTGAA 3070 het 1298 hom 13 3 8 2 A 1 2 241979 CASAVA_Build 11 22916717 4D CATATTCAAC ATTA/---- ATTATGTGAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 ATTA 2 1 241980 CASAVA_Build 11 22918622 1D AAAAGTACTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 9 8 241981 CASAVA_Build 11 22921943 8D ATGATTCAAT TACTTCCC/-------- TCTGGGTCTC 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 TACTTCCC 1 0 241982 CASAVA_Build 11 22926707 1D CTAGTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 2389 het 2389 ref 22 13 7 2 T 13 12 241983 CASAVA_Build 11 22927825 1I AAGGGGTGGA -/G GGGGCGATAT 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 G 4 5 241984 CASAVA_Build 11 22928492 1D GGAGCCAGCA C/- CACGGAAGAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 2 1 241985 CASAVA_Build 11 22928618 1D ATGCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1405 hom 23 9 11 3 T 13 12 241986 CASAVA_Build 11 22934781 2D CCAATCTCTT TC/-- TCTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 53 17 32 7 TC 2 1 241987 CASAVA_Build 11 22936422 1D AGGAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 A 11 10 241988 CASAVA_Build 11 22960476 9I TTAAAAAGTT ---------/CAAAAACAC CAAAAACAAT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 CAAAAACAC 0 1 241989 CASAVA_Build 11 22965520 1D TTGTTTTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 T 9 8 241990 CASAVA_Build 11 22968172 1D TTATTTGAAG C/- CCAGGCAATC 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 C 3 2 241991 CASAVA_Build 11 22969161 53D TAATAAGATG ATAAAGACAGAAAGAAATCTCATCCTTTTTATACTACCAACAATGTATAATCC/----------------------------------------------------- ATTATGTACA 3070 het 3070 ref 31 26 13 7 ATAAAGACAGAAAGAAATCTCATCCTTTTTATACTACCAACAATGTATAATCC 1 0 241992 CASAVA_Build 11 22969777 1I AACTATAATA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 6 7 241993 CASAVA_Build 11 22979577 1I TTTATAAGTA -/T TTAAACAAGA 3070 hom 80 het 41 0 27 14 T 2 3 241994 CASAVA_Build 11 22979919 1I TTATCAGTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 8 9 241995 CASAVA_Build 11 22990950 37I GAAGCATTCA -------------------------------------/GATATCCAGAAACCTGCCCACTTGAATGCGCTATTTT GATACTTCCT 3070 hom 81 het 24 0 28 3 GATATCCAGAAACCTGCCCACTTGAATGCGCTATTTT 0 1 241996 CASAVA_Build 11 22993207 2D ATATATCACT TA/-- TATGTCATAT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TA 2 1 241997 CASAVA_Build 11 23021438 2I AAATATCATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 12 14 241998 CASAVA_Build 11 23022789 1D GCTTATTCTG A/- AAAAAAAAAA 1337 het 1337 ref 45 37 3 6 A 11 10 241999 CASAVA_Build 11 23024111 1D TCAAAAAGCA T/- TTTTTGTAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 7 T 6 5 242000 CASAVA_Build 11 23028768 1D TATAAAAAAA T/- AATGAAAGAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 0 242001 CASAVA_Build 11 23029759 1I TGGCTCTTAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 242002 CASAVA_Build 11 23033039 1I TTCAAGTTAA -/G GGGGTACATG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 G 4 5 242003 CASAVA_Build 11 23035955 1D CTAGATACTA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 9 8 242004 CASAVA_Build 11 23038133 4D TTGATTTTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 24 1 17 17 T 16 12 242005 CASAVA_Build 11 23038380 2I TCATCCTCAT --/TC TCTCTCTCTC 1756 het 218 hom 30 1 12 17 TC 6 7 242006 CASAVA_Build 11 23039293 2D61M4I TGGAAGAGAC TGTGGGATTTTCTAGATATAGAATCATATTGTTTATGTGTGTGTGCAGTTTTGGTCTGTTTTG----/--TGGGATTTTCTAGATATAGAATCATATTGTTTATGTGTGTGTGCAGTTTTGGTCTGTTTTGTTAT TTATTATTTC 3070 hom 75 het 26 0 26 24 N/A 0 0 242007 CASAVA_Build 11 23040033 1I TATCTGGAGG -/T TTTTTTAAAT 3070 het 138 hom 41 1 37 3 T 6 7 242008 CASAVA_Build 11 23045407 1I ATTTTGTGTT -/A AAAAAAGTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 7 242009 CASAVA_Build 11 23047454 2D ATTGGCTGTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AT 8 7 242010 CASAVA_Build 11 23047949 8I ACTTGCAGCC --------/ATTATAGT ATTATAGTAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATTATAGT 1 2 242011 CASAVA_Build 11 23048541 1I TTCTCATTGC -/T TTTGTGTATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 3 4 242012 CASAVA_Build 11 23051015 1D ATCATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 32 1 16 15 T 17 16 242013 CASAVA_Build 11 23054415 1I AATGATGTTG -/A AAAATTAGCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 4 5 242014 CASAVA_Build 11 23055143 37D ATTTTGACAT AGATATGAAACATCTGTACACTGAATAGTATAAAACA/------------------------------------- AGATATGAAA 3070 hom 102 het 35 0 34 6 AGATATGAAACATCTGTACACTGAATAGTATAAAACA 1 0 242015 CASAVA_Build 11 23059077 4D CAGAAATAAT TAAG/---- TAAAGAAAGA 3070 hom 114 het 39 0 39 2 TAAG 1 0 242016 CASAVA_Build 11 23064382 1I TTTTTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 29 0 21 8 T 10 11 242017 CASAVA_Build 11 23066537 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 9 10 242018 CASAVA_Build 11 23069136 1I TTTACTTTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 9 10 242019 CASAVA_Build 11 23070379 1I AGTCCCATCT -/G GGGTAACGAG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 G 3 4 242020 CASAVA_Build 11 23071410 1I AAACATTTTG -/T TTAACAAGGC 2925 hom 18 het 8 0 7 1 T 2 3 242021 CASAVA_Build 11 23072570 2I TTTTGAATAA --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 24 0 13 11 TG 0 1 242022 CASAVA_Build 11 23073834 1D GCAAGTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 11 10 242023 CASAVA_Build 11 23077007 2I ACTATTTCTG --/TT TTTTTTTTTT 1702 het 838 hom 43 3 14 26 T 12 14 242024 CASAVA_Build 11 23080516 1D18M5I GACAATACTT AAAAAAATTTACAGGAAAA-----/-AAAAAATTTACAGGAAAATTTTT AAACCCTTTT 3070 het 3070 ref 25 16 14 4 N/A 0 0 242025 CASAVA_Build 11 23082882 1D TGTATATTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 9 8 242026 CASAVA_Build 11 23084407 1I TGGGCAACAG -/C CTGAAATCTG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 C 1 2 242027 CASAVA_Build 11 23085690 2I AGGGATGTAC --/GA TTTCCGTTCC 3070 het 3070 hom 49 16 24 9 GA 0 1 242028 CASAVA_Build 11 23086783 2I GGCAGAAGAG --/AC AGTGCAGTGT 3070 het 3070 hom 53 22 21 10 AC 0 1 242029 CASAVA_Build 11 23087935 3I ATAAACTTTC ---/TGT TGTTATGACA 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 TGT 1 2 242030 CASAVA_Build 11 23088462 4D TACCATTTGT TTGA/---- TTAATTTTTT 2810 het 2810 ref 41 21 8 12 TTGA 1 0 242031 CASAVA_Build 11 23088556 1D AAGGGATGAA T/- TTTTAACAAA 3070 het 3070 hom 37 17 15 6 T 5 4 242032 CASAVA_Build 11 23089007 1I GGCTGAAAGG -/A ACACCTAAGT 3070 hom 132 het 52 0 44 8 A 1 2 242033 CASAVA_Build 11 23093738 1D TAACAAAGAT A/- ATTCAATATG 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 2 1 242034 CASAVA_Build 11 23095817 1I GGGAAGTGAT -/A AATGTCCATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 2 3 242035 CASAVA_Build 11 23097546 4D TCTCTCAATA AACT/---- AACTAAGATG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 AACT 2 1 242036 CASAVA_Build 11 23098880 6D AAAAAGAAAA TAAACT/------ TAAATTTTCA 3070 het 1832 hom 28 7 18 4 TAAACT 1 0 242037 CASAVA_Build 11 23104254 6D CAAAAGGCTT TCACAA/------ TCAATCAGCA 3070 het 3070 ref 34 21 11 5 TCACAA 1 0 242038 CASAVA_Build 11 23107001 5I CTTTTTTAAC -----/TTTTA TTTTAAGTTC 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 TTTTA 1 2 242039 CASAVA_Build 11 23108504 6I AAATAACATT ------/TTCTAG TTCTGTGAAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTCTAG 0 1 242040 CASAVA_Build 11 23109550 2I ACCAGCTCTC --/TT TTGTACATCT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 2 4 242041 CASAVA_Build 11 23112665 1D CAATGGTAGT C/- AGTAGGGATC 3070 het 3070 hom 51 18 22 12 C 1 0 242042 CASAVA_Build 11 23116549 1D TGTACAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 22 9 A 12 11 242043 CASAVA_Build 11 23120968 1I AAACTCCATC -/T CAAAAAAAAA 2062 het 1097 hom 24 8 11 5 T 0 1 242044 CASAVA_Build 11 23121118 1D GAATAAGTCC T/- TTTTCCTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 5 4 242045 CASAVA_Build 11 23121917 1I AATAATTTTA -/T ATTCCTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 0 1 242046 CASAVA_Build 11 23122000 1I TTTTTCTGTA -/T TCTCCCTACC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 1 2 242047 CASAVA_Build 11 23125319 9I CTCAACAGTT ---------/CATGAAAAG TCACATTGGT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 CATGAAAAG 0 1 242048 CASAVA_Build 11 23128289 1I ACGATCCAAC -/T TAAGCTTTCT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 1 2 242049 CASAVA_Build 11 23130670 1D GGAAAAAAAC A/- AAAAAAACCC 2185 het 1068 hom 30 7 8 15 A 8 7 242050 CASAVA_Build 11 23130937 1D TTCTTAAGTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 8 7 242051 CASAVA_Build 11 23132907 1D GAATCCCAGG C/- CAATTTGTGT 3070 het 3070 hom 44 17 21 8 C 2 1 242052 CASAVA_Build 11 23133854 2D AAAAAAGAGA CT/-- CATGTAACTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 8 CT 1 0 242053 CASAVA_Build 11 23139132 1D TACTACGTTA G/- GAACTATTTA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 2 1 242054 CASAVA_Build 11 23146639 1D GAGAACTAGG T/- TTCCCCTGTC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 3 2 242055 CASAVA_Build 11 23147491 2D CTGAGCAAAC AG/-- AGGACAAATC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 AG 2 1 242056 CASAVA_Build 11 23148385 1I ATGTTCCTTG -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 A 7 8 242057 CASAVA_Build 11 23148744 2D GTTTAAAAAT GA/-- GAGATTTACT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 GA 3 2 242058 CASAVA_Build 11 23154284 6I TTCTTTTTTT ------/TTTTTC TTTTATTATT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTTTTC 0 1 242059 CASAVA_Build 11 23160028 1I AATTCCTTTG -/T ATTTTGGGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 242060 CASAVA_Build 11 23161031 1D CTGTAAGAAA T/- TTTGTGATCT 3070 het 3070 hom 46 20 23 4 T 4 3 242061 CASAVA_Build 11 23180398 3I GAAGTGCCTA ---/CTC CTCCTCCCTG 3070 hom 108 het 43 0 33 10 CTC 2 3 242062 CASAVA_Build 11 23187833 1D TTATTACTTG A/- TGAAACACAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 1 0 242063 CASAVA_Build 11 23191169 4I TGCTGTGCCT ----/CTTA CTTCCTCTTA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 CTTA 0 1 242064 CASAVA_Build 11 23192424 2I TCTATTTTTC --/AT ATATATGGTC 3070 het 3070 ref 39 16 18 5 AT 3 4 242065 CASAVA_Build 11 23195658 1D AGGCAGAAAT A/- AAAGTTGTTC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 4 3 242066 CASAVA_Build 11 23197818 7D TAGGCATGGG TGAGAAC/------- TTCTTGACTA 1912 het 1773 hom 9 5 4 1 TGAGAAC 1 0 242067 CASAVA_Build 11 23199857 1D GTAGTCTAAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 7 6 242068 CASAVA_Build 11 23200888 1D GGGTGGAGGA G/- GGGTAAACAG 3070 het 3070 hom 30 14 11 7 G 4 3 242069 CASAVA_Build 11 23212975 1D28M1D TTTTTTTGGA GGGGGGGTAGTTATTTATTCTACTACCAGC/-GGGGGGTAGTTATTTATTCTACTACCAG- CTCCATGTAT 3070 hom 144 het 44 0 48 4 N/A 0 0 242070 CASAVA_Build 11 23226239 1D ATATATAATG A/- ATTACTGTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 1 242071 CASAVA_Build 11 23231038 3D GCTCTATTAA TAT/--- TATTAGCCTT 3070 hom 96 het 36 0 33 6 TAT 2 1 242072 CASAVA_Build 11 23231155 1I GAAGTACCTA -/T CCTAGTGTGT 3070 hom 120 het 50 0 40 10 T 0 1 242073 CASAVA_Build 11 23233450 7I50M2I TGTTGGTTTG -------AAAAAATTAAAAAATTAAAAGTGGGCAAAAGATTTGAATAGACATTTCTC--/AAAAAATAAAAAATTAAAAAATTAAAAGTGGGCAAAAGATTTGAATAGACATTTCTCAA AAAAAACAGC 3070 hom 78 het 29 0 27 6 N/A 0 0 242074 CASAVA_Build 11 23234087 1I AGAGCTAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 64 hom 49 2 39 8 A 9 10 242075 CASAVA_Build 11 23234269 1D ATACTTTATT G/- TATATTTAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 1 0 242076 CASAVA_Build 11 23235307 1D ACTCTTAGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 9 8 242077 CASAVA_Build 11 23237365 4I TAGATAAGAC ----/AGAT AGAGATAGAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AGAT 0 1 242078 CASAVA_Build 11 23237717 1D ATGGCTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 23 11 T 11 10 242079 CASAVA_Build 11 23238121 1D AGTTCTAGGG T/- ACATGTGCAC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 1 0 242080 CASAVA_Build 11 23240225 2D TGCCACACAC AT/-- GAGACTATTG 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 AT 1 0 242081 CASAVA_Build 11 23240833 5D CTTTCTTTTT TTTTA/----- TTTTTATTTT 1321 het 1071 hom 35 7 10 18 TTTTA 1 0 242082 CASAVA_Build 11 23241018 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 81 het 30 0 27 5 T 7 6 242083 CASAVA_Build 11 23245538 1D GAACTAGCAC T/- CCATAATTAA 3070 het 3070 hom 48 20 26 3 T 1 0 242084 CASAVA_Build 11 23265206 1I AGTTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 127 hom 33 1 29 3 A 9 10 242085 CASAVA_Build 11 23267546 1D TCTACATAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 11 10 9 T 9 8 242086 CASAVA_Build 11 23270028 1D GCATTAGAAC A/- CCAGTGAAGG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 1 0 242087 CASAVA_Build 11 23270526 76D TGTTTGTGTC ATTTATAATTACTTACATCTGTGTTTTATAGTTCACATTGTACAGATCATCTTCTTGGTTAAGTACATTCTTAGAT/---------------------------------------------------------------------------- ATTTCATTGT 1467 het 1467 ref 16 31 4 3 ATTTATAATTACTTACATCTGTGTTTTATAGTTCACATTGTACAGATCATCTTCTTGGTTAAGTACATTCTTAGAT 1 0 242088 CASAVA_Build 11 23287231 1I TACTTAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 18 1 12 5 T 11 12 242089 CASAVA_Build 11 23306475 2D ATTGATCAAC AT/-- ATATATTTAT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 AT 4 3 242090 CASAVA_Build 11 23309595 2I GTGTAGTCTC --/TG TATGTTTTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TG 0 1 242091 CASAVA_Build 11 23324953 1D TTCAGTATGC A/- AAAAAGTTAG 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 A 6 5 242092 CASAVA_Build 11 23332206 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 20 1 18 1 T 12 11 242093 CASAVA_Build 11 23335555 1I AGTTAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1001 hom 36 3 27 6 T 10 11 242094 CASAVA_Build 11 23353323 1I AAAAAAAAAA -/T TCCAAAATTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 1 2 242095 CASAVA_Build 11 23357541 4D ATATACACAC ATAT/---- ATGTACATAC 3070 het 3070 hom 40 18 20 5 AT 3 1 242096 CASAVA_Build 11 23360702 1I TCACTTATAA -/G GTGGGAGCTG 3070 het 2816 hom 21 6 15 0 G 1 2 242097 CASAVA_Build 11 23369135 2D AAAGGCACTC TG/-- TATTTCTATT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 TG 1 0 242098 CASAVA_Build 11 23373823 2D AAGCAGACAC TA/-- TGTTTCAGAC 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 TA 1 0 242099 CASAVA_Build 11 23379562 1D TGATTTGTGC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 8 7 242100 CASAVA_Build 11 23381116 2I TCAATTGCAC --/CT CTCTCTGCTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 CT 3 4 242101 CASAVA_Build 11 23392537 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 29 hom 24 1 12 11 A 8 7 242102 CASAVA_Build 11 23396572 4D CATTCACATG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 81 het 46 0 28 20 CA 11 9 242103 CASAVA_Build 11 23398157 1I AAATAAGCTA -/T GAATAGACAG 3070 hom 39 het 32 0 14 18 T 0 1 242104 CASAVA_Build 11 23400109 1I TAAGATCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 12 12 A 11 12 242105 CASAVA_Build 11 23402486 1D TGGTTAGTTC T/- TTTTAGATAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 5 4 242106 CASAVA_Build 11 23406405 1D TCAAACTGGG T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 75 het 34 0 26 9 T 8 7 242107 CASAVA_Build 11 23407054 1D AAATTTTAAG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 242108 CASAVA_Build 11 23407782 3I AATTATCATA ---/TTG TTATCTTTCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTG 0 1 242109 CASAVA_Build 11 23408594 1I ATTTGATAAC -/T TTCTTCTTTT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 2 3 242110 CASAVA_Build 11 23409923 10D GAACATTCTT TTTTATTTTA/---------- TTTTATTTTA 3070 hom 21 het 13 0 8 5 TTTTA 6 4 242111 CASAVA_Build 11 23414679 1D AGGTGAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 T 11 10 242112 CASAVA_Build 11 23416304 1D CAATTCACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 T 10 9 242113 CASAVA_Build 11 23418060 2I GATTTGTAGG --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 15 14 11 A 8 10 242114 CASAVA_Build 11 23421225 3I AAGGGTGGGC ---/TTG TTGAGACGTT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 TTG 1 2 242115 CASAVA_Build 11 23421484 5I TGTTTCACTT -----/GAAAG GAAAGATGCT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 GAAAG 1 2 242116 CASAVA_Build 11 23422416 1D TGCTTTCCTC T/- TTTTTTTTTA 1442 het 1442 ref 16 9 4 3 T 10 9 242117 CASAVA_Build 11 23422538 1I AACATATCTA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 6 7 242118 CASAVA_Build 11 23422616 1D AGTTAAAATT C/- CTTTATTACT 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 C 2 1 242119 CASAVA_Build 11 23422900 4D26M1I TTAGCTACTT AGAAAGAGCAGAAGAAACACCAATTTAAGG-/----AGAGCAGAAGAAACACCAATTTAAGGA AAAAAAAAAT 2467 het 2467 ref 25 16 8 9 N/A 0 0 242120 CASAVA_Build 11 23422968 1D AAGTTACTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 A 9 8 242121 CASAVA_Build 11 23440933 4D TGGAACTTAT TCTA/---- TCTAACTGTA 3070 het 3070 hom 54 24 27 4 TCTA 2 1 242122 CASAVA_Build 11 23443322 1D ATTTGGTTCT G/- ATTTAAATGC 3070 het 3070 hom 35 14 18 6 G 1 0 242123 CASAVA_Build 11 23444788 1D ACCAGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 15 12 T 13 12 242124 CASAVA_Build 11 23450692 1D ACCAATACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 10 9 242125 CASAVA_Build 11 23465750 1I CATTCCTTCT -/G AAACTATTCC 2796 het 2796 ref 15 7 7 1 G 0 1 242126 CASAVA_Build 11 23467844 1D ACATGCACAT G/- GTATGTTTGT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 G 2 1 242127 CASAVA_Build 11 23470666 1D AAAGAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 22 9 T 11 10 242128 CASAVA_Build 11 23475278 1D TCTATCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 8 T 12 11 242129 CASAVA_Build 11 23476392 9D AGGTTCAGTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 T 17 8 242130 CASAVA_Build 11 23477038 2D CTTTTAAAAC AT/-- ATATTCAGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 AT 3 2 242131 CASAVA_Build 11 23478487 1D ATACATAGAT A/- ATATGATATG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 1 242132 CASAVA_Build 11 23478578 2D AAAAAAAGTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 842 hom 19 2 16 2 AT 7 6 242133 CASAVA_Build 11 23479524 1D TTACACAGAC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 8 7 242134 CASAVA_Build 11 23483080 1I TTTTTTTTTT -/C TGAGTGAGAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 242135 CASAVA_Build 11 23483308 1D47M1D GCTTCATTGA TTTTTTTTCTCTTTTGATTTCTATTTTAAAAAATTTATCGTTGTTACAT/-TTTTTTTCTCTTTTGATTTCTATTTTAAAAAATTTATCGTTGTTACA- TTTTTTCAGA 3070 hom 119 het 30 0 39 5 N/A 0 0 242136 CASAVA_Build 11 23483922 2D ATATACTTAC GT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 GT 1 0 242137 CASAVA_Build 11 23484949 4D TATTGTTCTT ATTA/---- ATTAATTAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ATTA 3 2 242138 CASAVA_Build 11 23486208 1D GGCTGGAGTG C/- AGTGGCACGA 2231 het 2231 ref 20 8 6 6 C 1 0 242139 CASAVA_Build 11 23486461 1I TTTGTAAAAC -/T TTTTTTTTAA 2773 het 2548 hom 14 7 6 1 T 8 9 242140 CASAVA_Build 11 23487571 3D TACTTGTTAC TTA/--- TTATCTTTTT 3070 hom 108 het 45 0 37 12 TTA 2 1 242141 CASAVA_Build 11 23487831 1I CCACCATTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 242142 CASAVA_Build 11 23489330 2I CTCTCTCTTT --/CA CACACACACA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 CA 7 8 242143 CASAVA_Build 11 23490009 11D TCAAATTTAA TAATCTTTAAC/----------- GTAAAACCCC 3070 hom 117 het 40 0 40 5 TAATCTTTAAC 1 0 242144 CASAVA_Build 11 23494189 1D GTAGCTGGGA T/- TACAGGTGCC 3070 het 2705 hom 23 8 12 3 T 2 1 242145 CASAVA_Build 11 23495522 1I ATTTTACATA -/T TTGTAACAAA 3070 het 3070 ref 52 22 20 10 T 2 3 242146 CASAVA_Build 11 23504153 13I CTTGTAAATT -------------/AAAAACAGAAACG AAACCAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 AAAAACAGAAACG 0 1 242147 CASAVA_Build 11 23504358 1I GCAGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 18 12 T 13 14 242148 CASAVA_Build 11 23511707 1D27M1D ATGTGAGGTC TCTGGAGAGTTTGAGGACTTTTCAGGGAT/-CTGGAGAGTTTGAGGACTTTTCAGGGA- TTGAGCCATA 3070 het 3070 ref 41 25 21 4 N/A 0 0 242149 CASAVA_Build 11 23514532 1I TGGCTATACA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 T 8 9 242150 CASAVA_Build 11 23517626 1I GTGTGGAAAT -/A CTGTTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 A 0 1 242151 CASAVA_Build 11 23523917 1D ATGAACTGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 T 10 9 242152 CASAVA_Build 11 23530063 1I ACAGCAGCGC -/A AAATGACAAA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 3 4 242153 CASAVA_Build 11 23531150 2D GTGAGGGGGT GG/-- GGGTGTGCGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 5 3 242154 CASAVA_Build 11 23547906 1I CTATCTTCAA -/C CCCCCTGGGA 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 C 5 6 242155 CASAVA_Build 11 23550437 1I ATATTGAGCA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 6 7 242156 CASAVA_Build 11 23557305 3D CCTATGCCCA GGT/--- GGTTCTAACC 3070 het 3070 hom 42 16 25 1 GGT 2 1 242157 CASAVA_Build 11 23558266 2I TTGTCTTGAC --/AA ACCTATACTT 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 A 1 3 242158 CASAVA_Build 11 23562813 2D ACGTGATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 129 hom 33 4 15 15 T 13 11 242159 CASAVA_Build 11 23568165 1D TATTTTATTT A/- AAAAAAACTT 2419 het 1453 hom 12 6 5 1 A 8 7 242160 CASAVA_Build 11 23583142 1I ATCTACCAAA -/C TGACCCTCTG 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 C 0 1 242161 CASAVA_Build 11 23659735 1D ACTTTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 11 10 242162 CASAVA_Build 11 23665051 1I ATTTCAAATC -/G GCCTAAAGAG 3070 hom 55 het 24 0 18 6 G 1 2 242163 CASAVA_Build 11 23676420 5I AGAATGTAAC -----/TTATA TTATGTTTAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTATA 0 1 242164 CASAVA_Build 11 23676592 3D AAAATGAAGA TGT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TGT 1 0 242165 CASAVA_Build 11 23681525 1I CACCTGTAAT -/C ACAGCACTTT 3070 hom 96 het 35 0 30 5 C 0 1 242166 CASAVA_Build 11 23684268 6I AGCAAGTATA ------/TATATG TATAACACTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TATATG 0 1 242167 CASAVA_Build 11 23690645 1D ATGTTTTCTG T/- TTTCATTTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 T 4 3 242168 CASAVA_Build 11 23692388 1I TACACAGTGA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 7 8 242169 CASAVA_Build 11 23692634 4I3M6D CTCACTATTA ----AATATGTTA/TTTCAAT------ TTTAAATATG 1719 het 1236 hom 26 5 7 17 N/A 0 0 242170 CASAVA_Build 11 23694556 1D ATTTTCTTTA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 8 7 242171 CASAVA_Build 11 23700315 1D AAAGAATGTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 8 242172 CASAVA_Build 11 23708402 1D TTTCTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 710 hom 41 2 24 16 T 13 12 242173 CASAVA_Build 11 23739704 1I ATATGTCCTT -/G GGCATTTTAT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 G 2 3 242174 CASAVA_Build 11 23741273 5I CCCTCAAGTT -----/ATATC ATATTAATTT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 ATATC 0 1 242175 CASAVA_Build 11 23744390 1D CAACTGAGGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 A 8 7 242176 CASAVA_Build 11 23745512 1D AAATTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 1750 het 1750 ref 29 17 5 7 A 12 11 242177 CASAVA_Build 11 23749802 1I TGCCATGGCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 51 17 25 9 T 8 9 242178 CASAVA_Build 11 23766040 1D GCTGCCTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 10 9 242179 CASAVA_Build 11 23772223 1D TCTAGAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 42 0 30 13 T 11 10 242180 CASAVA_Build 11 23778043 1D TAGTTGCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 10 9 242181 CASAVA_Build 11 23783760 5D GCATAACCTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 22 17 242182 CASAVA_Build 11 23784060 1I GACCCTGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 20 1 15 4 A 10 11 242183 CASAVA_Build 11 23787477 1I GTCTCAATGA -/T TTTTTTCACT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 6 7 242184 CASAVA_Build 11 23804834 1I TTTATGCTTG -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 6 7 242185 CASAVA_Build 11 23829945 1D CATCTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 1400 het 1400 ref 30 20 3 7 T 11 10 242186 CASAVA_Build 11 23834716 1D TTCATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1081 hom 35 3 23 9 T 12 11 242187 CASAVA_Build 11 23863485 1D ATTGTTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 13 12 242188 CASAVA_Build 11 23868252 3D AATGGTCAGG GAA/--- GCAGATAATT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 GAA 1 0 242189 CASAVA_Build 11 23874752 4I TCAAATTCAC ----/TCTT TCTCTAACTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TCTT 0 1 242190 CASAVA_Build 11 23892132 1D AAAACTTGTT C/- AGGAAAACTC 3070 het 3070 hom 38 15 13 12 C 1 0 242191 CASAVA_Build 11 23892634 1D AATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 59 hom 49 1 41 7 T 10 9 242192 CASAVA_Build 11 23893173 1I TTTTACTTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 7 8 242193 CASAVA_Build 11 23893740 2D GTTTTTAATT TC/-- TTTCCGTCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TC 1 0 242194 CASAVA_Build 11 23895662 1D TGGTCATTCA G/- GGGCATATTG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 G 4 3 242195 CASAVA_Build 11 23895852 11D AAGAAACATG TATTCTCCAGA/----------- TATTGTATGA 3070 het 3070 hom 33 16 18 4 TATTCTCCAGA 1 0 242196 CASAVA_Build 11 23896426 1D ATTATTTTTT C/- CTTGTTGTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 2 1 242197 CASAVA_Build 11 23900571 4I TCACTAATGA ----/AATT AATTAAGCAC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 AATT 1 2 242198 CASAVA_Build 11 23901586 1D TCTGAGTCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 10 9 242199 CASAVA_Build 11 23905578 2D AAGCTAAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 13 11 242200 CASAVA_Build 11 23915678 1D GGCTATCCCT A/- AAACCCTTGG 3070 hom 66 het 25 0 21 4 A 4 3 242201 CASAVA_Build 11 23921542 1D GAAACACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 35 0 30 5 T 12 11 242202 CASAVA_Build 11 23922571 3D TAAAAGCTGT AAG/--- AAGGATACCC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 AAG 2 1 242203 CASAVA_Build 11 23923032 4I TATTCTTTTC ----/TTCT TTCTTTAGTC 3070 hom 125 het 49 0 42 7 TTCT 1 2 242204 CASAVA_Build 11 23924722 14D6M5D4M5I5M14I TTTTAAATAG AGAAACAAGGTAAAAATACTAAAAATGCA-----AATAT--------------/--------------AATATT-----TGCATTTTTAGTATTTTTACCTTGTTTC TCTAAGTACA 3070 hom 90 het 26 0 31 1 N/A 0 0 242205 CASAVA_Build 11 23925141 1I AAATTTGATC -/T ATGACTTGTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 0 1 242206 CASAVA_Build 11 23925547 2I CCTTATGAAC --/TA TATGGTATTT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TA 1 2 242207 CASAVA_Build 11 23932962 4D ACAGTGTTAT TAAG/---- TATTGAATAC 3070 hom 117 het 43 0 40 5 TAAG 1 0 242208 CASAVA_Build 11 23939821 2I GGAAATTCCC --/CT GACTCAGCAT 3070 hom 104 het 40 0 30 10 CT 0 1 242209 CASAVA_Build 11 23940760 2I CTCAGGTAAA --/TG TGCCACAGGC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TG 1 2 242210 CASAVA_Build 11 23940887 18D TTTCCTATTT TCTCTCTCTCTCTCTCTC/------------------ TCTCTCTCTC 3070 hom 100 het 44 0 34 15 TC 17 8 242211 CASAVA_Build 11 23963529 5D TTTTTTTAAC TTTTA/----- TTTTAGGTTC 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TTTTA 2 1 242212 CASAVA_Build 11 23984394 1I AATTTACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 303 hom 33 1 28 4 A 10 11 242213 CASAVA_Build 11 23986443 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 40 1 30 10 A 11 10 242214 CASAVA_Build 11 23992313 1I CCCATATGCC -/T TGTCCCCACT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 T 1 2 242215 CASAVA_Build 11 23992908 1D AATGAAACTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 A 9 8 242216 CASAVA_Build 11 24025473 2D GAAGAGGATC AA/-- AAGTCTTCTC 3070 het 3070 ref 45 23 21 1 A 4 2 242217 CASAVA_Build 11 24031020 4I AGAGAGTGGG ----/AGAT AGATAGGGGT 3070 het 3070 hom 56 16 29 11 AGAT 1 2 242218 CASAVA_Build 11 24033966 1D TTTTTAGTAG A/- AGATGGGGTT 3070 hom 78 het 32 0 25 8 A 2 1 242219 CASAVA_Build 11 24039640 1I ACTCCACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2864 hom 27 9 12 6 A 14 15 242220 CASAVA_Build 11 24044969 3D CAAATCTAAC TCT/--- TCTTTTATTT 3070 het 3070 hom 37 11 21 8 TCT 2 1 242221 CASAVA_Build 11 24045064 3D TTCCTTCCAT TAA/--- TAATAACACA 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 TAA 3 2 242222 CASAVA_Build 11 24046383 1D TCTGGACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 39 1 20 18 A 15 14 242223 CASAVA_Build 11 24049785 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAAAGA 2941 hom 20 het 16 0 8 9 A 9 8 242224 CASAVA_Build 11 24068186 4D ATTTACCATC TAAA/---- TAAACTTAGG 3070 het 3070 hom 39 18 19 5 TAAA 2 1 242225 CASAVA_Build 11 24080425 1I ATAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 10 11 242226 CASAVA_Build 11 24090072 1I AGATATATTG -/A AAAAATGAGT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 5 6 242227 CASAVA_Build 11 24093774 3D GATTTTCTTC TTT/--- GATAAATATA 3070 het 3070 ref 52 28 23 2 T 3 0 242228 CASAVA_Build 11 24094336 1I AAGTCCAGAG -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 6 7 242229 CASAVA_Build 11 24094540 1I ATGAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 A 8 9 242230 CASAVA_Build 11 24095316 1I GTCAAACGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 17 20 10 A 12 13 242231 CASAVA_Build 11 24095966 1I AAAAATAAAG -/T TTAAAAAAAA 3070 het 103 hom 30 1 23 6 T 2 3 242232 CASAVA_Build 11 24099448 9D TCTCTCTATC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 1080 hom 30 8 12 10 T 19 10 242233 CASAVA_Build 11 24101085 4D TTAAGGAAAC ATTT/---- CTTTCCTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATTT 1 0 242234 CASAVA_Build 11 24106551 1I CCCCACCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2839 hom 32 10 12 10 A 14 15 242235 CASAVA_Build 11 24107545 1D AATTTCATTC T/- TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 7 6 242236 CASAVA_Build 11 24109092 1I TATTCTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 13 14 242237 CASAVA_Build 11 24110710 1D TATTGAAATT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 A 9 8 242238 CASAVA_Build 11 24113412 5D GTTTCTTCAG TTAAA/----- TTAAGACAAA 3070 het 3070 hom 46 21 23 4 TTAAA 1 0 242239 CASAVA_Build 11 24120689 2D AGTCTCAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 36 0 19 18 T 18 16 242240 CASAVA_Build 11 24123886 1I TAGTGATGGT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 C 0 1 242241 CASAVA_Build 11 24124638 1I TGAATTTTAG -/A ATGTGATTTT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 A 1 2 242242 CASAVA_Build 11 24124725 1I CTGTGTGACC -/G ATTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 G 0 1 242243 CASAVA_Build 11 24125841 1D TTGGCACCAT C/- CCCCTTGTTG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 C 5 4 242244 CASAVA_Build 11 24128021 21D CTAGCTATTT TGAGTTGCCAGAGTTCTTGCC/--------------------- TGAGTTGCCA 3070 het 3070 ref 40 24 16 8 TGAGTTGCCAGAGTTCTTGCC 1 0 242245 CASAVA_Build 11 24132528 2D GGGAAGAAAG AC/-- AAAGTGCAAA 3070 het 3070 ref 37 23 11 5 AC 1 0 242246 CASAVA_Build 11 24136989 2I TGAATCTGTA --/AT ATATATATAT 2991 het 2991 ref 23 13 8 2 AT 8 9 242247 CASAVA_Build 11 24142098 1D53M1D AGTAAATTTA TTTTTTTTCCTCCCTTCTCTTCATCAAAATATTTCAGATCTCCCCATTGCCAACA/-TTTTTTTCCTCCCTTCTCTTCATCAAAATATTTCAGATCTCCCCATTGCCAAC- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 16 16 29 N/A 0 0 242248 CASAVA_Build 11 24143369 1D GGGCAAAAAA G/- AATGTGTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 G 1 0 242249 CASAVA_Build 11 24145708 4I AAAAAGAAAC ----/CAAA CAACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 CAAA 0 1 242250 CASAVA_Build 11 24146119 3D GAAAAAAATG AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 AAC 3 2 242251 CASAVA_Build 11 24149245 2D TAAATTAATC AT/-- ATGTTTTCTC 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 AT 2 1 242252 CASAVA_Build 11 24150878 1I ACTACAAATA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 T 7 8 242253 CASAVA_Build 11 24163196 1I CTTATTATTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 2916 hom 18 7 7 4 A 7 8 242254 CASAVA_Build 11 24163373 4D AGAGAGAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAG 2851 het 1425 hom 12 5 6 3 AAAG 3 2 242255 CASAVA_Build 11 24167641 1D TTGAATTATT A/- AACTTGTTTC 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 A 3 2 242256 CASAVA_Build 11 24170863 2D53M1D TTAAAATTAA CTCTGATACTGTTTTATTTTGTTGCTGTCAATATTCTTCTTTATAGAGTTCTATTA/--CTGATACTGTTTTATTTTGTTGCTGTCAATATTCTTCTTTATAGAGTTCTATT- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 40 28 16 15 N/A 0 0 242257 CASAVA_Build 11 24171932 4I AATTTTATAT ----/TTAA TTGTGTTCAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TTAA 0 1 242258 CASAVA_Build 11 24172810 4D TCAGAAACAC CATA/---- AATAAAGAAG 3070 het 3070 hom 42 18 20 6 CATA 1 0 242259 CASAVA_Build 11 24177207 4D TACAGGGCTC TTAG/---- TTAGTCTTCA 3070 het 3070 hom 49 20 25 6 TTAG 2 1 242260 CASAVA_Build 11 24180936 2I ATTGAAAAAA --/CT CTTTTAGATA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 CT 1 2 242261 CASAVA_Build 11 24181160 4I AAAAAAAAAA ----/GAGC AAGAAATAAT 1558 het 1558 ref 34 16 7 11 GAGC 0 1 242262 CASAVA_Build 11 24182510 2I TTTAAAAAAG --/AC AATTCAAGGA 3070 het 1639 hom 18 4 12 2 AC 0 1 242263 CASAVA_Build 11 24183033 1D TTTATTGTAG T/- TTTTTTTTGG 2562 het 2562 ref 16 8 6 2 T 9 8 242264 CASAVA_Build 11 24184845 2D AAAAAAAAAA AT/-- ATATAGCATT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 AT 3 2 242265 CASAVA_Build 11 24190488 1D CCGCTCCATG A/- AAAACCACAC 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 A 5 4 242266 CASAVA_Build 11 24191576 2D AACAGAAAAC AA/-- AATAACAACA 3070 het 3070 hom 46 16 24 7 A 4 2 242267 CASAVA_Build 11 24198387 3D AGAGAGACAT AAA/--- AAACCGTTCA 1899 het 1899 ref 17 11 4 4 A 6 3 242268 CASAVA_Build 11 24202684 4D GTATATTCTC CTTT/---- CTAAGTGGGA 3070 het 3070 ref 26 12 8 9 CTTT 1 0 242269 CASAVA_Build 11 24204529 16D ACACACACAC ACACATATATATATAT/---------------- ATATATATAT 3070 het 1324 hom 21 6 14 2 ACACATATATATATAT 1 0 242270 CASAVA_Build 11 24205579 4D CACCGTGGCA AGAG/---- AGAGAATTAG 3070 het 3070 ref 40 26 13 3 AG 4 2 242271 CASAVA_Build 11 24206374 4I AGAGTAGAGC ----/TAAG TAAGTAAGTA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 TAAG 2 3 242272 CASAVA_Build 11 24209528 3I TATTTGAAGA ---/TAT TATGATTGTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 TAT 1 2 242273 CASAVA_Build 11 24215837 1D ATTTTTATAA T/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 7 6 242274 CASAVA_Build 11 24217141 2D CTAAACATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2455 het 1626 hom 52 19 10 24 T 20 18 242275 CASAVA_Build 11 24222467 8D TCTTTCTCTC TTTCTTTG/-------- TTTCTTTCTC 3068 het 3068 ref 22 11 9 2 TTTCTTTG 1 0 242276 CASAVA_Build 11 24225243 4D AGCTCATTGC ATTG/---- ATTGTCATTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 ATTG 2 1 242277 CASAVA_Build 11 24230406 1I ACTCCAGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 A 12 13 242278 CASAVA_Build 11 24238818 3I4M7I GTTTGGTAGC ---TTGA-------/TTTTTGAATAATTT CATACATTTT 3070 het 3070 hom 44 19 24 3 N/A 0 0 242279 CASAVA_Build 11 24245148 2I7M1D ACATTAATAT --TGAGTTGA/TCTGAGTTG- AAAAAAAAAA 3070 het 621 hom 35 3 29 6 N/A 0 0 242280 CASAVA_Build 11 24251908 1D CTGCTGGCTC G/- GCAGCCTGCT 2266 het 1908 hom 20 10 6 5 G 2 1 242281 CASAVA_Build 11 24270904 3I CATTCAATTG ---/CCT ATATTTCCAC 3070 het 3070 ref 41 19 20 2 CCT 0 1 242282 CASAVA_Build 11 24275252 1D ATGGTGTTTG T/- TATGCTTTAT 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 T 2 1 242283 CASAVA_Build 11 24285884 1I TCTGTGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 A 10 11 242284 CASAVA_Build 11 24296218 5D TATTTTATTC TCTTT/----- TCTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 37 14 20 6 TCTTT 2 1 242285 CASAVA_Build 11 24300093 2D AAATAAGTAC AA/-- AGTCAAGCTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 8 A 3 1 242286 CASAVA_Build 11 24304951 1I CTACTAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 367 hom 39 1 32 6 A 9 10 242287 CASAVA_Build 11 24305845 1D ATGGAACTCT A/- AAAAATGTTC 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 6 5 242288 CASAVA_Build 11 24312332 3D AGGATCAATA CAC/--- CAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 CAC 1 0 242289 CASAVA_Build 11 24313370 3D CTTTGAAGCA ACC/--- ACCACCACCA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 ACC 5 4 242290 CASAVA_Build 11 24319777 1I GGCAAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 18 0 12 6 T 11 12 242291 CASAVA_Build 11 24323466 1D ACACTCAGGG T/- TTGGTACAAT 3070 het 3070 ref 52 28 17 8 T 3 2 242292 CASAVA_Build 11 24329273 1D ATGGGAGCAA T/- AAAAAAAAGA 3070 het 152 hom 38 1 33 4 T 1 0 242293 CASAVA_Build 11 24330861 1D ACATCCATTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 50 27 16 8 T 8 7 242294 CASAVA_Build 11 24337928 5D CTGCATCATA TTATT/----- TTATATAATA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 TTATT 1 0 242295 CASAVA_Build 11 24338303 5D CATTTTATTG ATTAA/----- ATTATATTTA 3070 het 2844 hom 29 8 20 1 ATTAA 1 0 242296 CASAVA_Build 11 24345360 1D AGTAGGTCAG A/- AGATATTTAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 2 1 242297 CASAVA_Build 11 24346146 1I TTCATTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 749 hom 35 2 29 4 T 10 11 242298 CASAVA_Build 11 24346271 1I TTTATCAAGG -/A AAAAAACAGG 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 A 6 7 242299 CASAVA_Build 11 24348079 1D GTTTACAGCA C/- CTATCAACCC 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 C 2 1 242300 CASAVA_Build 11 24349954 1I ATCTCTTCAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 8 242301 CASAVA_Build 11 24350430 1D CACAGGATTG T/- TTTCCTTACT 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 T 4 3 242302 CASAVA_Build 11 24357271 1D TCTTAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 33 0 26 8 A 11 10 242303 CASAVA_Build 11 24363281 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 116 het 52 0 38 14 TA 6 5 242304 CASAVA_Build 11 24376401 1I ATATTGATCA -/T TTTTTAACCT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 5 6 242305 CASAVA_Build 11 24390739 2D ATTTTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 23 0 17 6 A 14 12 242306 CASAVA_Build 11 24401270 1I AGCCACCCTA -/T TTTTTTTATG 3070 hom 104 het 41 0 35 6 T 7 8 242307 CASAVA_Build 11 24415040 1D GGAGGACACT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 8 7 242308 CASAVA_Build 11 24426492 2D TAGAATAAAC AT/-- GTGAATGGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 AT 1 0 242309 CASAVA_Build 11 24432421 1D ATGACATTCC T/- TTTTTTTTTT 1333 het 1333 ref 27 15 5 7 T 13 12 242310 CASAVA_Build 11 24435055 1D ACATTGTGTT A/- AAACTTGGGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 4 3 242311 CASAVA_Build 11 24439519 1I TTGGGTATAA -/T TTTTTCAGGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 5 6 242312 CASAVA_Build 11 24445995 1D ATCTATTTTC T/- TTTGGATAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 5 T 4 3 242313 CASAVA_Build 11 24446212 4D CAGAAGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 72 het 33 0 25 10 TTTG 5 4 242314 CASAVA_Build 11 24452905 10D CCCATATCCA GGGCACACTG/---------- GGGCAAGGGG 3070 hom 75 het 27 0 26 2 GGGCACACTG 1 0 242315 CASAVA_Build 11 24453608 1I TCTAGCAAGT -/G ATTACTCCAC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 0 1 242316 CASAVA_Build 11 24454118 1D TCTTCTGAGA C/- CCCCCAAGCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 6 5 242317 CASAVA_Build 11 24458611 1I TGTCACTTTG -/C AAAAAGGATT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 0 1 242318 CASAVA_Build 11 24458740 1I TTTTCATCTG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 91 het 37 0 31 6 T 7 8 242319 CASAVA_Build 11 24460082 2I ATAGAGACAC --/AT ATATATATAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AT 4 5 242320 CASAVA_Build 11 24460652 1D ATGGCTAAAA G/- GGTCTCATGG 3070 hom 114 het 44 0 39 6 G 3 2 242321 CASAVA_Build 11 24461062 3D ATAATAAAGA CAG/--- AATCATTGCA 3070 hom 87 het 31 0 30 9 CAG 1 0 242322 CASAVA_Build 11 24461526 2D ACCCTTGAGA CT/-- CTGCACGTCA 3070 hom 108 het 48 0 37 11 CT 2 1 242323 CASAVA_Build 11 24463155 1I ATATTTTGAA -/T TTTTGTGGGT 3070 hom 93 het 37 0 32 8 T 4 5 242324 CASAVA_Build 11 24463318 1I TAAGTTATTT -/A AAAATGTACA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 4 5 242325 CASAVA_Build 11 24470978 1D TATTACTGTG T/- GAAGAATGAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 1 0 242326 CASAVA_Build 11 24490461 1I CAAACCTTCA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 7 8 242327 CASAVA_Build 11 24504388 1D ACTAGGGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 38 1 31 6 A 13 12 242328 CASAVA_Build 11 24504580 3D CTCTCTACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 35 8 T 14 11 242329 CASAVA_Build 11 24512355 1I TTCTGAGATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 8 9 242330 CASAVA_Build 11 24513260 1D TTCATTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 10 6 A 12 11 242331 CASAVA_Build 11 24513847 3I TTGGAATAAA ---/CTT CTCCCAAACT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CTT 0 1 242332 CASAVA_Build 11 24515777 2I GAAGCAAAAC --/AT GTGTTAAATT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 AT 0 1 242333 CASAVA_Build 11 24516142 1D CCACTTCTTT G/- AAGAGAAGGA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 G 1 0 242334 CASAVA_Build 11 24516791 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TA 7 6 242335 CASAVA_Build 11 24517054 2I TTAAAGAAAG --/AA AACAATTTGA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 2 4 242336 CASAVA_Build 11 24520859 1I ACTTTTATTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 8 9 242337 CASAVA_Build 11 24521048 1I ACACACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 12 13 242338 CASAVA_Build 11 24525330 1I AATTAGAAAA -/G AAAAAAACTA 3070 hom 56 het 29 0 20 9 G 0 1 242339 CASAVA_Build 11 24536502 1D ATCTTTTTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 9 8 242340 CASAVA_Build 11 24536587 1D AACATTTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 165 hom 36 1 29 6 A 10 9 242341 CASAVA_Build 11 24544746 4D GTATAGATAT ACAC/---- ACACACACAC 2409 het 621 hom 21 5 8 10 AC 11 9 242342 CASAVA_Build 11 24546485 1I CAGAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 2455 hom 36 13 18 5 C 0 1 242343 CASAVA_Build 11 24547215 2D TAAAAATAAA AC/-- AGTTAAATGT 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 AC 1 0 242344 CASAVA_Build 11 24547819 4I ATTCTATATC ----/CAAA CTATTAATTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 CAAA 0 1 242345 CASAVA_Build 11 24548374 1D AAGAGATGTG T/- TGATATTTCA 3070 het 3070 ref 45 20 20 7 T 2 1 242346 CASAVA_Build 11 24549388 32I GAGGCTGTCA --------------------------------/TTTATTAGGTATAAGAAAGTGACCTTCTTTAG TTTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 TTTATTAGGTATAAGAAAGTGACCTTCTTTAG 0 1 242347 CASAVA_Build 11 24551239 1I AGAGAAATTG -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 T 6 7 242348 CASAVA_Build 11 24551621 1D TACTGCAAAT G/- GGTCCTCAGC 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 G 3 2 242349 CASAVA_Build 11 24551986 1D TCTTGTTTTA T/- TTTTTTTATT 2027 het 2027 ref 16 10 5 1 T 8 7 242350 CASAVA_Build 11 24552517 2I CTTTCTTTCA --/TC TCTCTCTCTC 2210 het 1217 hom 12 3 5 4 TC 8 9 242351 CASAVA_Build 11 24554379 1I CTAAAGATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 1988 hom 15 5 10 0 A 7 8 242352 CASAVA_Build 11 24554699 1I TGAGATTTTC -/A TAAAGATTTG 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 A 0 1 242353 CASAVA_Build 11 24555269 1I TGTTTATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 9 10 242354 CASAVA_Build 11 24556684 2D GGGCTGGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2453 hom 31 8 16 7 A 13 11 242355 CASAVA_Build 11 24561623 5D CATTTGCTGT CATAA/----- CATAACTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 CATAA 2 1 242356 CASAVA_Build 11 24562002 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1427 het 385 hom 15 4 8 3 T 14 13 242357 CASAVA_Build 11 24566757 1I AAAGGAATAA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 6 7 242358 CASAVA_Build 11 24568059 1I TTGGGGTTTG -/A AAAAAACAGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 7 242359 CASAVA_Build 11 24570037 1D GGTATATTGT C/- CTTTAATTAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 2 1 242360 CASAVA_Build 11 24573960 1D CAAGAAGCTT A/- CATTCAACAT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 A 1 0 242361 CASAVA_Build 11 24631037 1I CAAAAATATC -/A AAAATTTAAG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 4 5 242362 CASAVA_Build 11 24656198 1D AAAGGAGAAA G/- GGGGGGGGGG 1376 het 1376 ref 19 7 3 9 G 12 11 242363 CASAVA_Build 11 24665372 1D GTGACAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 10 9 242364 CASAVA_Build 11 24678703 1D AGAAATTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 10 9 242365 CASAVA_Build 11 24681988 1I AAAAACGAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 10 242366 CASAVA_Build 11 24693287 1I TAAATGTTTG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 A 7 8 242367 CASAVA_Build 11 24696002 6I GTTAGTTTGC ------/TAAGGA TAATAGCCTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAGGA 0 1 242368 CASAVA_Build 11 24698368 1D CAGATAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 10 9 242369 CASAVA_Build 11 24699462 6D CTGATAATGT AAAAGA/------ AAAAGAAGAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 AAAAGA 2 1 242370 CASAVA_Build 11 24705178 1D AGAGAGATTT A/- AATTGGTTCT 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 A 3 2 242371 CASAVA_Build 11 24706438 2I TTAAACACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 AC 7 8 242372 CASAVA_Build 11 24708530 1D AAACGAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 A 12 11 242373 CASAVA_Build 11 24709493 1I TAGTTTTGAC -/T TTTAATGCCA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 3 4 242374 CASAVA_Build 11 24711158 2I TTCAAAGTTT --/AC ACACACAAGA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 AC 3 4 242375 CASAVA_Build 11 24712388 1I ATGAGGAGAC -/A GGCTTATGCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 1 242376 CASAVA_Build 11 24712494 1D AAAAATCAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 154 het 54 0 52 2 A 9 8 242377 CASAVA_Build 11 24722929 4D TTAGAGTGTC AGTT/---- TGTGCTCTTT 3070 het 3016 hom 16 7 8 2 AGTT 1 0 242378 CASAVA_Build 11 24730818 1I TTGAAACTCA -/C ATGCAGAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 C 0 1 242379 CASAVA_Build 11 24732461 7D ATTTAAAATT TTTCACC/------- TTTCTGGGAT 3070 hom 90 het 32 0 30 5 TTTCACC 1 0 242380 CASAVA_Build 11 24740218 4I ATTTTACGTA ----/TTAC TTCTTGTTCT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TTAC 0 1 242381 CASAVA_Build 11 24743736 1I AATTTTTTCC -/T TTTTTTTTCT 2479 hom 41 het 18 0 13 5 T 8 9 242382 CASAVA_Build 11 24744843 3I TCAAATGATT ---/ATG ATGTTTGAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATG 1 2 242383 CASAVA_Build 11 24746095 1D GTATCATTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 10 9 242384 CASAVA_Build 11 24746895 4D AAGGATGTGG AGAA/---- AGAACTGTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 5 AGAA 2 1 242385 CASAVA_Build 11 24747829 1I TTTTTTTTTT -/G GGGATTATAA 3070 het 158 hom 36 1 27 8 G 3 4 242386 CASAVA_Build 11 24749076 1I AGGCTCCAGC -/A ACCACACACC 3070 hom 114 het 48 0 36 12 A 1 2 242387 CASAVA_Build 11 24751204 2D AACAGTGTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 36 0 28 8 T 15 13 242388 CASAVA_Build 11 24755505 1D TAAATTCATG C/- GGGGGGATCC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 1 0 242389 CASAVA_Build 11 24756046 1I GAAAAAAGTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 7 8 242390 CASAVA_Build 11 24756535 1I AGATCCTTTC -/T AAAAAATGAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 0 1 242391 CASAVA_Build 11 24759710 7I AGCCACAGGT -------/AAGAGAA ACTTTCATTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 AAGAGAA 0 1 242392 CASAVA_Build 11 24770080 1I AGTGAGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 323 hom 36 1 24 11 T 13 14 242393 CASAVA_Build 11 24776947 1I GACTCAAGGT -/A TATTTCCTGT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 0 1 242394 CASAVA_Build 11 24777711 1I AGACTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 28 1 21 6 A 14 15 242395 CASAVA_Build 11 24778663 1I CATTTAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 28 2 23 3 A 13 14 242396 CASAVA_Build 11 24793114 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 18 0 17 1 A 15 12 242397 CASAVA_Build 11 24797891 1D AGGCTAGTTA T/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 7 6 242398 CASAVA_Build 11 24805048 3I AAATGAGGAG ---/CTC TTAATATGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTC 0 1 242399 CASAVA_Build 11 24805213 2D GAAATACATA GT/-- GTGGGTTTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 GT 2 1 242400 CASAVA_Build 11 24806153 2D TTTAGGAGAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 61 het 54 1 35 18 AC 9 8 242401 CASAVA_Build 11 24808232 1I TTTGTCAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 466 hom 39 2 36 1 A 9 10 242402 CASAVA_Build 11 24810693 1I AATATAACTT -/A AAAAATATGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 6 242403 CASAVA_Build 11 24812827 3D ATTTGCACTC CCA/--- CCAACAGTGC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CCA 2 1 242404 CASAVA_Build 11 24815191 1I GTTGGTAGAA -/T TTATGTCCTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 3 242405 CASAVA_Build 11 24816229 1I TAGAAGAAAG -/T TTAAATAATT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 2 3 242406 CASAVA_Build 11 24823118 1D GGGGCCACAG C/- CCCCCACACA 3070 hom 43 het 21 0 13 9 C 6 5 242407 CASAVA_Build 11 24827257 1I TTGATATATC -/T TTTTTTATTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 6 7 242408 CASAVA_Build 11 24835686 1I AAAATAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1565 hom 27 4 16 7 T 12 13 242409 CASAVA_Build 11 24835832 4I CAGAGGGTGA ----/ACTT ACTTTAATTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ACTT 1 2 242410 CASAVA_Build 11 24844304 2I TTTAATTGTC --/TT TAATATTCTT 3070 hom 30 het 21 0 11 10 T 1 3 242411 CASAVA_Build 11 24844651 1I AAAACAACAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 138 het 51 0 46 5 T 9 10 242412 CASAVA_Build 11 24846353 2I GTGTAAAGAC --/AG AGAGATAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AG 2 3 242413 CASAVA_Build 11 24851802 3D TCTCACACTC CTT/--- ATTATTTGGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CTT 1 0 242414 CASAVA_Build 11 24852109 1I ATAGAAAAAA -/G AAGATCAACC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 G 0 1 242415 CASAVA_Build 11 24855539 2D AGCTTTAAGA CT/-- CTCTTAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 CT 3 2 242416 CASAVA_Build 11 24858409 2I TCCCAAATTT --/AC AGACTCTCTC 3070 hom 87 het 34 0 29 6 AC 0 1 242417 CASAVA_Build 11 24858478 1I TTCAACACTG -/T TTTTCCTACT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 4 5 242418 CASAVA_Build 11 24860038 4D ATTTAATGTG TTTA/---- TTTGTTTTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TTTA 1 0 242419 CASAVA_Build 11 24860938 16I GGGAAGAAGG ----------------/GAGGAAGGGAGGAAGA GAGGGAGGGA 2190 hom 41 het 22 0 11 11 GAGGAAGGGAGGAAGA 0 1 242420 CASAVA_Build 11 24861074 4D GAAAGAAAGG AAGA/---- AAGAAAGAGA 125 het 125 ref 16 11 3 3 AAGA 3 2 242421 CASAVA_Build 11 24871460 1D TATAAACAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 49 het 36 1 31 5 A 10 9 242422 CASAVA_Build 11 24872819 2I ACACGACAAC --/AT GTGTCATTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AT 0 1 242423 CASAVA_Build 11 24876369 1I TGACAATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 11 12 242424 CASAVA_Build 11 24876751 1D TGTCAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 2372 het 1115 hom 17 3 8 6 A 13 12 242425 CASAVA_Build 11 24879523 1D TCACTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 746 hom 42 2 33 8 A 13 12 242426 CASAVA_Build 11 24893788 3D TAGATAGATA GAT/--- GATAGATAGA 26 het 26 ref 42 22 1 22 GAT 2 1 242427 CASAVA_Build 11 24896968 2I GGAATACATC --/TA TATATATATA 2936 hom 21 het 9 0 8 1 TA 5 6 242428 CASAVA_Build 11 24914663 1D AGTAAGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 11 10 242429 CASAVA_Build 11 24916698 1D GCTCTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 11 10 242430 CASAVA_Build 11 24922000 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 662 het 662 ref 14 6 4 4 A 20 18 242431 CASAVA_Build 11 24923640 1D AATTTGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 45 3 23 19 T 15 14 242432 CASAVA_Build 11 24928091 2D CTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 29 1 9 20 T 16 14 242433 CASAVA_Build 11 24945499 3I TTTAAAATTT ---/TTG TTATTAGTCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTG 0 1 242434 CASAVA_Build 11 24950964 1I ATTTTATTGA -/G GGTTTTTTCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 G 2 3 242435 CASAVA_Build 11 24951489 1I TTTATTAGTT -/G TTTTTTTTTT 309 het 176 hom 20 3 5 12 G 0 1 242436 CASAVA_Build 11 24952620 4I GCATTTTCTT ----/ACAC ACACATTAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AC 2 4 242437 CASAVA_Build 11 24952917 1D CTTTCGAGGT A/- AAAATAAGGC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 5 4 242438 CASAVA_Build 11 24958408 1I ACAAAATGCA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 48 15 26 7 T 6 7 242439 CASAVA_Build 11 24960071 4D AGGCAAAGGA CATG/---- CATGAACAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 CATG 2 1 242440 CASAVA_Build 11 24961939 2I TTAAATTAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 12 14 242441 CASAVA_Build 11 24962278 1I CTATGGATAC -/T CAGCCTGACT 3070 het 3070 hom 48 23 22 3 T 0 1 242442 CASAVA_Build 11 24967224 1D CTGTGCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 320 hom 33 1 20 13 A 15 14 242443 CASAVA_Build 11 24977745 1I ACCTCGGCCT -/C CCAAAGTGCT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 C 2 3 242444 CASAVA_Build 11 24979039 4I AATCTTTTGA ----/GAGT GAGTGTGTGG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 GAGT 1 2 242445 CASAVA_Build 11 24988808 2I CCATCTCTAC --/TA AAAATACAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 TA 0 1 242446 CASAVA_Build 11 24993000 1I GTTTTTATGG -/T TTTTAAGTCT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 4 5 242447 CASAVA_Build 11 24994762 4D TGTTTGTGTC TGTG/---- TGTACCACAT 3070 het 3070 ref 46 28 16 4 TG 3 1 242448 CASAVA_Build 11 24995058 1D GCCGACATCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 10 9 242449 CASAVA_Build 11 24995831 12D AGTTTGCTTA TTGTTGTTGTTG/------------ TTGTTGTTAT 3070 het 3070 ref 41 21 18 7 TTG 6 2 242450 CASAVA_Build 11 24998917 2I ATTTAATAAC --/TT TTAAAATTAT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 2 4 242451 CASAVA_Build 11 24999362 2D GCATTCTCTC AG/-- AGACTTATTA 3070 het 3070 ref 38 27 9 4 AG 2 1 242452 CASAVA_Build 11 24999906 2D AGGGGAATAT AG/-- AGAGTCTGTG 3070 het 3070 hom 56 22 26 8 AG 3 2 242453 CASAVA_Build 11 25004660 1D AAATGTGATT A/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 A 1 0 242454 CASAVA_Build 11 25006002 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAGGTGT 3070 het 569 hom 25 6 9 10 G 0 1 242455 CASAVA_Build 11 25006813 2D AATTTGCATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 12 10 242456 CASAVA_Build 11 25007929 1D TTTCTCTCAT A/- AAATTTGCTT 2924 het 2895 hom 15 6 6 3 A 4 3 242457 CASAVA_Build 11 25008053 4I AACTACCAAG ----/TAAT TAATTATTTT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 TAAT 1 2 242458 CASAVA_Build 11 25011544 1D TCAAAGGATT A/- AAAAAGTCAA 3070 het 3070 hom 48 16 23 9 A 6 5 242459 CASAVA_Build 11 25026101 1D CTACCACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 20 het 27 1 22 5 A 10 9 242460 CASAVA_Build 11 25033072 1I AATAATACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 27 het 19 0 10 9 T 9 10 242461 CASAVA_Build 11 25033663 1D GAGCTCTGAG T/- TAAAACTGTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 4 T 2 1 242462 CASAVA_Build 11 25041837 4I ATTAATCATT ----/AAAC AACCACCATT 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 AAAC 0 1 242463 CASAVA_Build 11 25045858 4I GGAGTGTAAA ----/TTAG TTCAATCATT 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 TTAG 0 1 242464 CASAVA_Build 11 25049251 1I GAGGTATGAT -/C AATGTGTTTT 3070 het 3070 ref 48 29 14 5 C 0 1 242465 CASAVA_Build 11 25049971 2D AAAAAAAGAT AA/-- AAAAAAATAA 2113 het 2113 ref 19 11 8 1 A 9 7 242466 CASAVA_Build 11 25051686 1I TTTAATTTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 2355 hom 22 8 11 3 T 7 8 242467 CASAVA_Build 11 25058606 1I CTACCCAAGG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 7 8 242468 CASAVA_Build 11 25059541 1D TCATTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 12 11 242469 CASAVA_Build 11 25060976 1I GGATTTTGTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 8 9 242470 CASAVA_Build 11 25062641 3D AAAAAAAGAG AGA/--- AGATGATTAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 AGA 2 1 242471 CASAVA_Build 11 25064201 1I TGCTGTGCAA -/G TGAACACACC 3070 hom 160 het 61 0 54 7 G 0 1 242472 CASAVA_Build 11 25064901 1I ATTTTATTTT -/C CCAGATAAAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 2 3 242473 CASAVA_Build 11 25072053 3D CTGAACCCTA TTC/--- TTCTGAAAAA 3070 het 3070 ref 49 22 22 6 TTC 2 1 242474 CASAVA_Build 11 25076088 2D TGCTGAGATG GA/-- GTTTCCCTGT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 GA 1 0 242475 CASAVA_Build 11 25079241 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2879 het 318 hom 28 3 8 17 A 13 12 242476 CASAVA_Build 11 25080064 3D TTATAAAAAT TAA/--- TAATCTACTA 3070 het 3070 hom 24 10 14 1 TAA 2 1 242477 CASAVA_Build 11 25082270 1D ATATTGTTAC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 7 6 242478 CASAVA_Build 11 25087499 1I30M2D TTTGGAGTAG -AATTATTTTCTAATTCAATGTTTATACTAGTT/AAATTATTTTCTAATTCAATGTTTATACTAG-- TTTTTTTTTA 3070 het 2713 hom 29 8 12 15 N/A 0 0 242479 CASAVA_Build 11 25088940 1I TTATAATCAA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 6 7 242480 CASAVA_Build 11 25091078 1I ATACTTGAAG -/A ATATGTGGTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 1 2 242481 CASAVA_Build 11 25092321 1I CTTATCTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 11 12 242482 CASAVA_Build 11 25097251 1I GAAGCATAAA -/T TTTTAAAATC 3070 het 3070 ref 51 30 17 4 T 4 5 242483 CASAVA_Build 11 25101835 3I AGAGCCCTTT ---/GCA GCATCTGACT 3070 het 3070 ref 57 30 22 5 GCA 1 2 242484 CASAVA_Build 11 25102942 2I GTTAAATACC --/AA AAAAAAAAAA 2306 het 2306 ref 24 9 9 6 A 12 14 242485 CASAVA_Build 11 25106760 1I AGTATTTTCA -/T TTTCCCTAAA 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 T 3 4 242486 CASAVA_Build 11 25108100 2I CCAACTTTGT --/TC TTCCTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 TC 0 1 242487 CASAVA_Build 11 25108523 1I AGGTCTATTC -/A AGATTGTCTA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 1 2 242488 CASAVA_Build 11 25111627 5I CTGCATTAAT -----/TAAAA TAAGCTTCCT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 TAAAA 0 1 242489 CASAVA_Build 11 25114570 1I CAGAAAAAAA -/T AGCCACAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 0 1 242490 CASAVA_Build 11 25115168 2D CTATTCACAA AC/-- ACATTTGTGT 3070 het 3070 ref 55 26 26 4 AC 2 1 242491 CASAVA_Build 11 25115401 2D TGTTCATGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 47 10 24 13 TA 8 7 242492 CASAVA_Build 11 25116716 3D TAAAGGGAGA TAT/--- TATGCCCAGA 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 TAT 2 1 242493 CASAVA_Build 11 25125184 1D ATGCCCCCCC A/- CCACCACCCC 3070 het 1385 hom 23 5 11 7 A 1 0 242494 CASAVA_Build 11 25131088 6D CTATCCCGTC CCAAAT/------ CCTTTAAACC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 CCAAAT 1 0 242495 CASAVA_Build 11 25132477 2D TCTTCTTCTC TT/-- ATTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 2 0 242496 CASAVA_Build 11 25132992 1I ACGTCACTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 238 hom 40 1 36 3 A 9 10 242497 CASAVA_Build 11 25139303 2I TCAGTGACAC --/TT TGTTAAAACC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 3 242498 CASAVA_Build 11 25139931 4I CTAAAAATAA ----/TTAT TTATATGCAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTAT 1 2 242499 CASAVA_Build 11 25140943 1D AAATAAAGAC A/- AAAAATGTAA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 A 6 5 242500 CASAVA_Build 11 25149257 6D ATGTTGTATA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 AT 10 7 242501 CASAVA_Build 11 25151321 1D ATCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 13 12 242502 CASAVA_Build 11 25175350 2I AATGGGAAAC --/AG AGAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 AG 2 3 242503 CASAVA_Build 11 25175555 3D GCATTTGTGG TTA/--- TTATTATAGG 3070 het 3070 ref 35 18 16 4 TTA 3 2 242504 CASAVA_Build 11 25176827 4I TACTAAACAT ----/AGTC AGGTCATTAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AGTC 0 1 242505 CASAVA_Build 11 25188069 1D AAATTACCAT A/- AAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 7 6 242506 CASAVA_Build 11 25191871 1I AAAATTATTC -/T TTTTTAAGTA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 5 6 242507 CASAVA_Build 11 25199714 2D CTTTTTTTTC TA/-- TGTGTTTGTG 3070 het 3070 hom 46 23 21 2 TA 1 0 242508 CASAVA_Build 11 25201243 1I TTGTTAAGAG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 8 242509 CASAVA_Build 11 25210081 1I TGTTTGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 40 1 30 9 T 11 12 242510 CASAVA_Build 11 25211040 1I TTTAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 11 12 242511 CASAVA_Build 11 25214616 1D CCTGACCATG C/- TTTTTTGATC 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 C 1 0 242512 CASAVA_Build 11 25216199 1D GCTCAATCAT A/- AAATATTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 4 3 242513 CASAVA_Build 11 25219088 13D TCATCTTCAA TAAGCATCTTCAG/------------- AATTGATTGA 3070 het 3070 ref 33 23 8 7 TAAGCATCTTCAG 1 0 242514 CASAVA_Build 11 25236548 1I ATTTTAAGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 8 9 242515 CASAVA_Build 11 25247101 2D CTTAATGCTC TT/-- GAGTGAAAGT 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 T 2 0 242516 CASAVA_Build 11 25248117 2D TCTAGGGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 37 0 19 18 T 20 18 242517 CASAVA_Build 11 25251282 1I GCTAGGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 38 1 33 4 T 10 11 242518 CASAVA_Build 11 25265523 4D CTGATCTAGG AATT/---- AATTAGTTGC 3070 het 3070 ref 46 25 17 8 AATT 2 1 242519 CASAVA_Build 11 25267422 1I GTCGAAAAAA -/T ATTTTTAGTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 0 1 242520 CASAVA_Build 11 25270015 1I TCAGTTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 24 2 15 7 A 12 13 242521 CASAVA_Build 11 25270380 2D ACTAAGAGTC AG/-- GGGAAATTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AG 1 0 242522 CASAVA_Build 11 25282155 1I TAACAAACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 10 11 242523 CASAVA_Build 11 25282806 2I CCATGTTTAT --/AG AGAGTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AG 2 3 242524 CASAVA_Build 11 25287163 8D GTATGTGGCA CCTTCCTT/-------- CCTCCTCTTG 3070 hom 120 het 40 0 40 3 CCTT 2 0 242525 CASAVA_Build 11 25292694 5I CAGTCATACC -----/ATGTT ATGTTATAAT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 ATGTT 1 2 242526 CASAVA_Build 11 25295669 1D GCCCACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 34 0 22 13 A 12 11 242527 CASAVA_Build 11 25298928 1I TTTATGGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2716 hom 28 8 11 9 T 13 14 242528 CASAVA_Build 11 25306218 16I GAGATATCCA ----------------/CTATGATGGTTTGGAT CTATGATGGT 3070 hom 90 het 40 0 30 11 CTATGATGGTTTGGAT 0 1 242529 CASAVA_Build 11 25312510 2I TGAAATAAAC --/AG ATAAAAAAAC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AG 0 1 242530 CASAVA_Build 11 25315143 1D TATTTACTAG T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 6 242531 CASAVA_Build 11 25324680 2I TTGTCAGATG --/TA TAGTTTGCAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TA 1 2 242532 CASAVA_Build 11 25330166 2D GTATAGATGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 50 het 43 1 32 10 AT 9 8 242533 CASAVA_Build 11 25336687 2D CATACATATA TG/-- TGTGTGTGTG 1741 het 1741 ref 51 34 5 16 TG 10 9 242534 CASAVA_Build 11 25345102 1I CATGGCCCAA -/G CTGTACCTTG 3070 hom 48 het 20 0 15 5 G 0 1 242535 CASAVA_Build 11 25353927 1D TATTAATTAA T/- TTACCTGTAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 3 2 242536 CASAVA_Build 11 25359096 1D AGACATGTTA T/- TTCTTTTTTG 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 3 2 242537 CASAVA_Build 11 25361506 3I ATTTCACTCA ---/CTT CTTCTCTAGG 3070 hom 126 het 48 0 42 6 CTT 1 2 242538 CASAVA_Build 11 25368078 6I ACATAAAAAT ------/AAAATA AAAATAAAAA 3070 hom 72 het 35 0 25 10 AAAATA 2 3 242539 CASAVA_Build 11 25368889 9I TGTACATTTC ---------/CAGGTTCTT CAGGTTCTTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 CAGGTTCTT 1 2 242540 CASAVA_Build 11 25374995 1I CTACTTCCTA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 8 9 242541 CASAVA_Build 11 25378947 4I TATTGATCCA ----/CTTT CTTATTCCAA 3070 hom 148 het 50 0 50 0 CTTT 0 1 242542 CASAVA_Build 11 25381804 4D ATAAATATAC ATAT/---- ATATATATAT 1285 hom 12 het 6 0 5 2 AT 11 9 242543 CASAVA_Build 11 25383044 3I GCATAATTAC ---/ATA ATAATTTCAC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 ATA 1 2 242544 CASAVA_Build 11 25385845 1D ATTTGGTTTC T/- TTTGGGGGCC 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 T 4 3 242545 CASAVA_Build 11 25390688 2I GTGTTATTCT --/GG GTTTTTTTCC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 1 3 242546 CASAVA_Build 11 25391316 4I TTCAATAAAT ----/AAAG AAAGTATTGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAAG 1 2 242547 CASAVA_Build 11 25391773 1I23M76D AAATGGAAAG -AAAATTCTTGGCCTATAGGATGCATATATATATATATATATACACACATACACATATATATATATATACACACACATATATATATATATACACACACAT/AAAAATTCTTGGCCTATAGGATGC---------------------------------------------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 45 het 14 0 16 2 N/A 0 0 242548 CASAVA_Build 11 25398176 1D CAGACTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 32 1 19 12 A 13 12 242549 CASAVA_Build 11 25400254 1I CTTAGAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 11 12 242550 CASAVA_Build 11 25401074 5I GTATATGTAT -----/TTTTA TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 25 1 16 8 TTTTA 0 1 242551 CASAVA_Build 11 25401341 16I ACAGACTTCT ----------------/AGTACTATATTCAATA AGAATGTGGG 3070 hom 48 het 18 0 16 3 AGTACTATATTCAATA 0 1 242552 CASAVA_Build 11 25409774 46D TTATATTATA TTATATTATATTATATTATTAGTATATTATATTATATTATATTATC/---------------------------------------------- TATCCATCTT 3070 hom 81 het 20 0 28 2 TTATATTATATTATATTATTAGTATATTATATTATATTATATTATC 1 0 242553 CASAVA_Build 11 25410237 5D ATACAAACAC TACTT/----- TAATAACAGT 3070 hom 93 het 33 0 31 3 TACTT 1 0 242554 CASAVA_Build 11 25428962 4D ATTTTAGGAT ATTA/---- ATTATAATAC 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 ATTA 2 1 242555 CASAVA_Build 11 25439134 1D ATGTGCTACA T/- TTTTTTTTTT 2415 het 2415 ref 36 18 7 11 T 11 10 242556 CASAVA_Build 11 25442151 1I TCAGAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 9 10 242557 CASAVA_Build 11 25443913 4D TGAATGTAAT AATC/---- AGATAGAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 AATC 1 0 242558 CASAVA_Build 11 25456326 2D AATGAAGGAA AT/-- ATGTCAAATG 3070 het 3070 hom 36 13 21 3 AT 2 1 242559 CASAVA_Build 11 25462010 4I GTGAAGGATA ----/AAAG AGTACACATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAG 0 1 242560 CASAVA_Build 11 25466903 1D AAGTGTGATC A/- GGGGGAGGAA 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 A 1 0 242561 CASAVA_Build 11 25469105 1D GTTGGTGTAT A/- GTAATATTAG 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 1 0 242562 CASAVA_Build 11 25470407 1D TACATTTAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2267 hom 22 7 10 5 T 10 9 242563 CASAVA_Build 11 25481208 3D TGTTTTGGTC ATT/--- ATTTGCATTA 3070 het 3070 hom 44 18 23 4 ATT 2 1 242564 CASAVA_Build 11 25492098 4D AAAAAGAAAG TGTC/---- TGTACTGAAC 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 TGTC 1 0 242565 CASAVA_Build 11 25493092 1I AATTTCAAAG -/T TTTCATTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 3 4 242566 CASAVA_Build 11 25493746 1I GGTGTGACTC -/A ATCTGTTTCG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 A 1 2 242567 CASAVA_Build 11 25496027 1D TAATTTAATT G/- TATCTGAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 G 1 0 242568 CASAVA_Build 11 25496212 6I TAATCTAGAC ------/TTACAT TTATAAGCAT 3070 hom 84 het 33 0 29 6 TTACAT 0 1 242569 CASAVA_Build 11 25496485 2I GAAAAAGAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 18 18 15 AC 8 9 242570 CASAVA_Build 11 25504709 3I AGAGTGACGT ---/AAC AGCAATGCTC 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 AAC 0 1 242571 CASAVA_Build 11 25505589 3D TTACCACCTG AGC/--- AGCTCCGCCT 3070 het 3070 hom 52 25 20 10 AGC 2 1 242572 CASAVA_Build 11 25507890 2D ATTGCTGGAG CC/-- CCCAGGAGGT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 C 5 3 242573 CASAVA_Build 11 25508080 1I ATGAAAAAAA -/G ATCCCTAGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 0 1 242574 CASAVA_Build 11 25510933 4I TACTGATATA ----/TTTG TTTATGACCA 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 TTTG 0 1 242575 CASAVA_Build 11 25511731 22I AAAAATACTT ----------------------/TTCCTAACTATAATATTTAAGG TGAAAATTCA 3070 hom 102 het 34 0 35 1 TTCCTAACTATAATATTTAAGG 0 1 242576 CASAVA_Build 11 25517579 4D ATTTCAATCT GAAA/---- GAAAGACAAT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 GAAA 2 1 242577 CASAVA_Build 11 25517966 3D TCTCTGCTTC TAT/--- TATTTATTTG 3070 hom 102 het 41 0 33 13 TAT 2 1 242578 CASAVA_Build 11 25519964 1I TCTCCTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 23 2 16 5 A 11 12 242579 CASAVA_Build 11 25522318 6D CCCCAGAACT TAAAAA/------ TAAAAATTAA 3070 hom 69 het 27 0 22 6 TAAAAA 2 1 242580 CASAVA_Build 11 25536783 1I CCCACATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 10 11 242581 CASAVA_Build 11 25561368 1I TTCTCAGCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 A 11 12 242582 CASAVA_Build 11 25564978 1I AAAATGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 20 20 10 T 10 11 242583 CASAVA_Build 11 25566378 1D AAACCATACA T/- TTTTTTAACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 7 6 242584 CASAVA_Build 11 25569731 1I TGATGGATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 10 11 242585 CASAVA_Build 11 25571310 6D AATAAAAACA TATACT/------ TATACAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 20 6 TATACT 1 0 242586 CASAVA_Build 11 25578845 1D TGATTTTTCT C/- CCCTGTGTTT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 C 4 3 242587 CASAVA_Build 11 25579037 1D ATGGAAAAGG T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 T 7 6 242588 CASAVA_Build 11 25583609 1D GATCAAATGG C/- AGATCTACTT 3070 het 3070 ref 44 26 13 6 C 1 0 242589 CASAVA_Build 11 25583909 1I GATTGTTTGG -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 T 6 7 242590 CASAVA_Build 11 25584996 2I ACAGTTTGAC --/TT CCTCTTTTAC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 0 2 242591 CASAVA_Build 11 25588274 4I ACCAACAGGG ----/CAGT CAAATATTAA 3070 het 3070 ref 34 15 9 10 CAGT 0 1 242592 CASAVA_Build 11 25589935 1D TTAGATTTTA T/- TTTCTGAGAC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 4 3 242593 CASAVA_Build 11 25596375 1D GAAGTGGCAG A/- AAACAATTTA 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 A 4 3 242594 CASAVA_Build 11 25597880 3D41M3D TTTTCCTTTT TACTTTTATTTCTGTGTACCTTTCTCATGCCTTTTGTCTTTTTCTCT/---TTTTATTTCTGTGTACCTTTCTCATGCCTTTTGTCTTTTTC--- TCTTCTTTAT 1890 het 1890 ref 16 17 4 6 N/A 0 0 242595 CASAVA_Build 11 25602278 1I CTTCTTGATG -/T TTGCAGATAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 2 3 242596 CASAVA_Build 11 25602799 1D CTAATCCGGC A/- AGGCGCCCAT 2656 het 2656 ref 31 18 7 6 A 2 1 242597 CASAVA_Build 11 25609531 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTC 2926 het 2845 hom 18 8 8 2 T 10 9 242598 CASAVA_Build 11 25609829 1I AAGAGATTAA -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 7 242599 CASAVA_Build 11 25615663 4D AATGCAAAAT AAAC/---- AAATTTATAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 6 AAAC 1 0 242600 CASAVA_Build 11 25620351 3I AATATTAAAA ---/TAT TATGATTGTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TAT 1 2 242601 CASAVA_Build 11 25628700 4D TGCCTATATG TATA/---- TATGTGTATG 3070 het 3070 ref 59 33 25 2 TA 3 1 242602 CASAVA_Build 11 25628785 4I GCATATACGC ----/ACAT ACATATACAT 3070 hom 160 het 57 0 54 3 ACAT 1 2 242603 CASAVA_Build 11 25628883 18D57M8D ATATACAGAT ATATGTATATATGTATGCATATGTATATATGTATGCATATGTATATGTGTGTATGCATACGTATATGTATGCATATGCATATG/------------------ATATGTATATATGTATGCATATGTATATGTGTGTATGCATACGTATATGTATGCATA-------- TGTGTTTGCA 3070 het 3070 ref 58 28 21 49 N/A 0 0 242604 CASAVA_Build 11 25629537 28D TATACATATT TATGTATATACATATGTATATACATACG/---------------------------- TATGTATATA 3070 hom 54 het 17 0 19 5 TATGTATATACATATGTATATACATACG 1 0 242605 CASAVA_Build 11 25631194 5D CATTCTATTC AACTT/----- AACTTAAACA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 AACTT 2 1 242606 CASAVA_Build 11 25635772 9D ATAACATCCC AGCACATAA/--------- CAGGTGGTTG 3070 hom 42 het 15 0 15 2 AGCACATAA 1 0 242607 CASAVA_Build 11 25635959 5I TTACATTAAT -----/TAAGG TAAAGATCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAAGG 0 1 242608 CASAVA_Build 11 25637996 1D GTCAGCTTTT A/- AAAAAATAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 7 6 242609 CASAVA_Build 11 25640710 1D GCACCAGTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 429 hom 30 1 25 5 T 10 9 242610 CASAVA_Build 11 25643653 2D TACCTACTGC AG/-- AGTCTACCAT 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 AG 2 1 242611 CASAVA_Build 11 25647128 7D GACCCTGTCC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2213 het 2213 ref 28 15 6 9 A 18 11 242612 CASAVA_Build 11 25651243 4D AATATTAAGG ATTA/---- ATTAAGAAAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 2 ATTA 2 1 242613 CASAVA_Build 11 25653274 1I GACACAGAAG -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 6 7 242614 CASAVA_Build 11 25654806 2I TGGAGAAAAA --/AC AGTTTCTTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AC 0 1 242615 CASAVA_Build 11 25661253 1D CAATGTACAG T/- TTTTGGTGGC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 5 4 242616 CASAVA_Build 11 25667443 1I TAGGTATTGA -/G GGGGGGCTGG 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 G 6 7 242617 CASAVA_Build 11 25674695 1I CTCCCAAAAA -/T TTGAGACAGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 3 242618 CASAVA_Build 11 25677335 1D AAGGACTCCT C/- CCTATGAACT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 3 2 242619 CASAVA_Build 11 25679907 1I TTCTCTGTAT -/G GATGTATAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 1 2 242620 CASAVA_Build 11 25680482 1I ACCGAGATAG -/A AAAAAATATT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 A 6 7 242621 CASAVA_Build 11 25681791 2I CATTGTGCCA --/AT ATGTTATATC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AT 1 2 242622 CASAVA_Build 11 25682169 14D ATTGGTTAAG AAAATGTGAACAGA/-------------- CATTAAATTT 3070 hom 117 het 42 0 40 5 AAAATGTGAACAGA 1 0 242623 CASAVA_Build 11 25684918 4I CATTTGACAA ----/CGAT TATTGGTTGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CGAT 0 1 242624 CASAVA_Build 11 25695892 4I11M8D TTTTGCTTAC ----TAAGTTTCTTAATTTCTGG/TGATTAAGTTTCTTA-------- ATATTAGACC 3070 hom 93 het 31 0 32 4 N/A 0 0 242625 CASAVA_Build 11 25707606 1I GACCTGGAAG -/T TTTTCCCTTT 3070 hom 127 het 52 0 42 10 T 4 5 242626 CASAVA_Build 11 25708971 4I CTTTCAGAAG ----/TAAA TAAAAACAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 TAAA 1 2 242627 CASAVA_Build 11 25709302 2I AGGTACAAAC --/AG GGGAAATGCC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 AG 0 1 242628 CASAVA_Build 11 25713218 1I TGAATGGTAT -/C CCTACAAAAT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 C 2 3 242629 CASAVA_Build 11 25713824 2I ATCAACTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 39 0 34 5 T 10 12 242630 CASAVA_Build 11 25713910 1D GACAAAGGAA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 7 242631 CASAVA_Build 11 25715668 5I TCAGCTCTTT -----/AAGAA AAGTGTGGGT 3070 hom 120 het 47 0 40 9 AAGAA 0 1 242632 CASAVA_Build 11 25721312 1I CATTATTAAG -/A AATTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 2 3 242633 CASAVA_Build 11 25725266 6D GTTAAAAATG TTAGTA/------ TTAGAGACAC 3070 hom 45 het 18 0 16 4 TTAGTA 1 0 242634 CASAVA_Build 11 25727946 1I AAATTTGTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 9 242635 CASAVA_Build 11 25729640 2D AGTATTTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 1977 hom 15 het 7 0 6 1 TC 6 5 242636 CASAVA_Build 11 25729856 1D CAAGATGACA C/- CTTTTATTGC 3070 hom 91 het 34 0 31 3 C 2 1 242637 CASAVA_Build 11 25730040 32I GAAACACATG --------------------------------/TAAGAGGGCACAAACCCTTATATAAACACAAA TAAGAGGGCA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TAAGAGGGCACAAACCCTTATATAAACACAAA 0 1 242638 CASAVA_Build 11 25731845 3D ATCTTATTTA CTT/--- CTTCACCATC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 CTT 2 1 242639 CASAVA_Build 11 25736624 4I CTGGCTCAGC ----/AGTT AGTTACCACC 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 AGTT 1 2 242640 CASAVA_Build 11 25736929 3D GGAGCTTATA GAT/--- GATAAAACTC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GAT 2 1 242641 CASAVA_Build 11 25741890 1I CAGTTAGAAT -/G GCAATCATTA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 G 1 2 242642 CASAVA_Build 11 25743889 1I GTTACCTGTG -/T TTTTTCATCT 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 T 5 6 242643 CASAVA_Build 11 25744383 4I CTGGAAAGAA ----/AGAC CACTTGGCTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AGAC 0 1 242644 CASAVA_Build 11 25748023 2D TTCAGGGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 24 4 10 10 T 16 14 242645 CASAVA_Build 11 25749670 36D TCAGTAGGTG AATAGATAGATAAAGTGTGGTAAATCTAGACAAGGA/------------------------------------ AATATTATTT 3070 het 3070 ref 28 20 10 10 AATAGATAGATAAAGTGTGGTAAATCTAGACAAGGA 1 0 242646 CASAVA_Build 11 25750110 1D CTATATTTGG C/- CTTCTGTATC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 C 2 1 242647 CASAVA_Build 11 25752468 1D ACAAAGAAAA G/- TTTTAGAATG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 G 1 0 242648 CASAVA_Build 11 25752683 1D TATAAAATTA T/- TTTTTCCAAT 3070 het 3070 hom 24 8 12 5 T 6 5 242649 CASAVA_Build 11 25752869 2I TTAAAAAAAA --/GG AGAAGAAAGT 3070 het 2802 hom 25 7 14 4 G 0 2 242650 CASAVA_Build 11 25752948 2D TTATTTCTCT TC/-- TGTTGTAGAT 2254 het 2254 ref 23 14 6 3 TC 1 0 242651 CASAVA_Build 11 25753625 3I TAGCACTGCA ---/GAT GATGATGGAG 3070 het 3070 hom 55 22 26 7 GAT 2 3 242652 CASAVA_Build 11 25756052 2D ACAATGAGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 31 1 18 13 A 15 13 242653 CASAVA_Build 11 25756271 2D ACATACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 AC 6 5 242654 CASAVA_Build 11 25756723 2D TTCTAGACTA AG/-- AGCACCAAGG 3070 het 3070 hom 37 17 16 7 AG 2 1 242655 CASAVA_Build 11 25758086 2I40M2I AATCCTATTA --TATATAATAAATAATAATCCTATTTTATATATATAATAAA--/TGTATATAATAAATAATAATCCTATTTTATATATATAATAAAAT ATATATATAT 2986 het 2218 hom 11 6 7 2 N/A 0 0 242656 CASAVA_Build 11 25759699 1D AGCACAACTG C/- CCCCACCCCA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 C 5 4 242657 CASAVA_Build 11 25760239 3D ATAACAAAGA AAC/--- AACATGAGAA 3070 het 3070 hom 42 19 18 6 AAC 2 1 242658 CASAVA_Build 11 25760449 5I CAATAAAATG -----/ATAAA ATACAAGAGC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 ATAAA 0 1 242659 CASAVA_Build 11 25761787 1D AGGGATTAAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 A 8 7 242660 CASAVA_Build 11 25762267 5I CTAACATCAC -----/AACTA GAGGATCTAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AACTA 0 1 242661 CASAVA_Build 11 25762777 3I CCCAAACATT ---/GAG GAGAAGGGTC 3070 het 3070 ref 64 34 22 8 GAG 1 2 242662 CASAVA_Build 11 25765555 1I CACTAAATAC -/A GAAATGTATT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 0 1 242663 CASAVA_Build 11 25767505 1D TTCAGTATAT A/- AATCCAATAC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 3 2 242664 CASAVA_Build 11 25769225 1D GGCTAGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 946 hom 41 3 16 22 T 13 12 242665 CASAVA_Build 11 25770004 1D ACCCACAGCC A/- ATATTATACC 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 A 2 1 242666 CASAVA_Build 11 25778226 1D AATATCTAAG A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 7 6 242667 CASAVA_Build 11 25778526 4I CTAAAGAAAT ----/AAAG AAGCCATTTG 3070 hom 181 het 68 0 61 7 AAAG 0 1 242668 CASAVA_Build 11 25782183 1D ACACACACAC A/- CACACACACA 3070 het 1926 hom 34 6 14 15 A 1 0 242669 CASAVA_Build 11 25783900 1I TAACCAGGAC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 7 8 242670 CASAVA_Build 11 25784858 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1664 hom 10 het 6 0 4 2 A 11 10 242671 CASAVA_Build 11 25790645 1I CTAATTTATC -/T GTTTTGCTGG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 0 1 242672 CASAVA_Build 11 25791548 1I TTACTTATAT -/A CTGACTTAAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 0 1 242673 CASAVA_Build 11 25792276 3I TATCTGCATG ---/ACT ACATTTTTGA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 ACT 0 1 242674 CASAVA_Build 11 25795050 2I AAATAATTGT --/TA TATGTGTCCC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TA 1 2 242675 CASAVA_Build 11 25797965 1D GATTTTCTTA T/- TGTCCTTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 T 2 1 242676 CASAVA_Build 11 25804914 1I GAAAGATGAT -/A GAGTTGAAAG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 0 1 242677 CASAVA_Build 11 25806550 1D AAAAATATTT A/- TAACAGCTGT 1599 het 1599 ref 36 21 6 9 A 1 0 242678 CASAVA_Build 11 25806584 2D ATTGAAAGAC TT/-- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 24 11 9 T 5 3 242679 CASAVA_Build 11 25808034 1D TAGAACCCAG C/- TTTATTCTAT 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 C 1 0 242680 CASAVA_Build 11 25808484 4I ATCACAGCTT ----/CTAA GTAGTTCCTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CTAA 0 1 242681 CASAVA_Build 11 25810636 1I CAAAGAAGAT -/A AAAACCTTGA 1417 hom 7 het 3 0 3 0 A 4 5 242682 CASAVA_Build 11 25815534 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 13 14 1 A 8 9 242683 CASAVA_Build 11 25817881 1D35M2I CTTAACTTTA TTTTTTTTTATTATCTCTAGCAGTCGTTTTTACAAC--/-TTTTTTTTATTATCTCTAGCAGTCGTTTTTACAACTA TGTCATTTGA 3070 het 405 hom 28 1 33 6 N/A 0 0 242684 CASAVA_Build 11 25822035 16D CCAAAGCCCA GTTTTGAGACTTGGCT/---------------- GGTTTTAACT 3070 het 3070 ref 28 21 10 5 GTTTTGAGACTTGGCT 1 0 242685 CASAVA_Build 11 25824914 1D TAAATTCAGT C/- CCCAATTCCC 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 C 4 3 242686 CASAVA_Build 11 25826275 1D GAAAGTACTT A/- AAACCACAAT 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 A 4 3 242687 CASAVA_Build 11 25827747 10D6M2D CCGAACAGAA TGCAATGAATGAAATGAA/----------GTTCTG-- AAACAGAATC 3070 het 2946 hom 31 9 12 16 N/A 0 0 242688 CASAVA_Build 11 25828018 1I TAAAAAAAAA -/T ATCTGAAATA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 0 1 242689 CASAVA_Build 11 25829579 1D ATGGCAAGAA G/- GTCACAAGTC 3070 het 3070 hom 39 10 20 9 G 2 1 242690 CASAVA_Build 11 25829611 1D TTAATGCTAT A/- AAAAATTTAT 3070 het 1531 hom 33 4 16 13 A 6 5 242691 CASAVA_Build 11 25832418 2I28M1D TTCTGAAGGG --TTTACAGGAATGAATTTTGCTTTTTTAAT/TTTTTACAGGAATGAATTTTGCTTTTTTAA- TTTTTTTTGG 3070 hom 72 het 22 0 25 2 N/A 0 0 242692 CASAVA_Build 11 25833153 5D TTTCTGACTT GAAGA/----- GAAGGCAACC 3070 het 3070 hom 45 22 20 4 GAAGA 1 0 242693 CASAVA_Build 11 25833503 1D AAAACTGAAT A/- AAAAAAAAAA 2125 het 2125 ref 37 25 6 6 A 13 12 242694 CASAVA_Build 11 25834043 1I ACATAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 9 10 242695 CASAVA_Build 11 25838720 2D CAATAAACTT TC/-- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 19 13 6 TC 2 1 242696 CASAVA_Build 11 25843835 1D TGAAATTGTA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 T 7 6 242697 CASAVA_Build 11 25863341 5D AAATAAAAGT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 32 0 26 7 A 22 17 242698 CASAVA_Build 11 25870224 1I CTTCCTTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 8 9 242699 CASAVA_Build 11 25883545 4I GATTGTGCTG ----/CTGT CTAAGAGGCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CTGT 0 1 242700 CASAVA_Build 11 25886425 2D AAAATTATAA CT/-- CTATGAATTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 CT 2 1 242701 CASAVA_Build 11 25890913 2I GGTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 49 0 35 14 TG 7 8 242702 CASAVA_Build 11 25909083 3I AAAAAAATAA ---/ATT ATATTATTAT 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 ATT 0 1 242703 CASAVA_Build 11 25910356 1I15M3D TACTTCTTAG -AAAAAGTCAGCCCATGAG/AAAAAAGTCAGCCCAT--- GAGTAGATCT 3070 het 3070 hom 41 20 22 7 N/A 0 0 242704 CASAVA_Build 11 25916803 1D CTCCTATGTA C/- CCTCCACACA 3070 het 3070 ref 57 30 23 5 C 3 2 242705 CASAVA_Build 11 25917362 16D CTCCTTTGGG ACAGAATTTGCACTAA/---------------- ATGCATTTGC 3070 hom 84 het 31 0 28 4 ACAGAATTTGCACTAA 1 0 242706 CASAVA_Build 11 25919336 2D CTTAATCATC AT/-- GTGTGTGTTT 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 AT 1 0 242707 CASAVA_Build 11 25919446 1I TTCATTAGGG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 52 het 37 0 17 20 A 7 8 242708 CASAVA_Build 11 25926324 4D ACAAAACAGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 39 17 11 12 AAAC 4 3 242709 CASAVA_Build 11 25926532 1I ACACACATAC -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 7 8 242710 CASAVA_Build 11 25932920 4D CTATAAATTA TATT/---- TATTATATAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 TATT 2 1 242711 CASAVA_Build 11 25938245 2I AAAACTTGGC --/TA TATATATATA 2972 het 973 hom 12 3 7 2 TA 5 6 242712 CASAVA_Build 11 25941744 1I TTTAAAAAAA -/C AATTTATATT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 C 0 1 242713 CASAVA_Build 11 25946785 3D ATTAAAAAAA AAT/--- AGTACATCCA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 AAT 1 0 242714 CASAVA_Build 11 25947405 4D AATGGTAAAC AAAT/---- AGAGATGTTT 3070 het 3070 ref 44 26 16 4 AAAT 1 0 242715 CASAVA_Build 11 25948180 3D AATATGAAAA ATT/--- ATTTAGAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 8 6 ATT 2 1 242716 CASAVA_Build 11 25950187 2D TCATTTTGTA CT/-- CTGTTTCCTG 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 CT 2 1 242717 CASAVA_Build 11 25956464 1I TTCAGAAATG -/A AAAAAAGAAA 1834 het 1834 ref 35 29 5 1 A 6 7 242718 CASAVA_Build 11 25957463 2I CTCTGAAAGC --/CT CTCTCTTCAG 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 CT 3 4 242719 CASAVA_Build 11 25960210 1D CTAGCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 19 12 T 13 12 242720 CASAVA_Build 11 25965489 1I ATTACAGACG -/T TGAGCCACCA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 T 1 2 242721 CASAVA_Build 11 25966505 4I AACTGGGGTT ----/GATC GATCACCTGC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 GATC 1 2 242722 CASAVA_Build 11 25966577 5D GTTTCTATCC TAACA/----- TGTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 32 22 9 2 TAACA 1 0 242723 CASAVA_Build 11 25967241 1D CCAAACTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 36 1 26 10 T 12 11 242724 CASAVA_Build 11 25967350 4D CATCGTTGAA AATC/---- AAAGCAATTT 3070 het 3070 hom 34 13 21 0 AATC 1 0 242725 CASAVA_Build 11 25977775 2D CAATTATATT CA/-- GTTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 CA 1 0 242726 CASAVA_Build 11 25978203 1D TACAACACAT G/- GGAATTATGG 3070 het 3070 ref 51 23 19 10 G 3 2 242727 CASAVA_Build 11 25982237 2I GGAAACTCAC --/GA GAGGACATAG 3070 het 3070 ref 43 27 10 6 GA 1 2 242728 CASAVA_Build 11 25985427 6D CTACTATTTA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 708 het 541 hom 22 3 6 13 GT 10 7 242729 CASAVA_Build 11 25989211 2D25M2D ACCAGATTTT TGTTTGAATAATTTTCTTTATTGCTTTTC/--TTTGAATAATTTTCTTTATTGCTTT-- TGTTTTCAAA 3070 het 2192 hom 28 6 14 12 N/A 0 0 242730 CASAVA_Build 11 25991095 5D GATCTCATTC ATTTT/----- AAGGACTGAA 3070 het 3070 ref 34 18 15 5 ATTTT 1 0 242731 CASAVA_Build 11 25993305 1D AATAGGTGGT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 8 7 242732 CASAVA_Build 11 25993499 1I TATTAAACTC -/A AAAGTGTTCC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 3 4 242733 CASAVA_Build 11 25994513 2D ATGTTGGAAG AT/-- ATATTTTTAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AT 3 2 242734 CASAVA_Build 11 25994721 1D TTAAAAGTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 40 het 18 0 14 4 T 10 9 242735 CASAVA_Build 11 25995829 8D TGTCATCTGC TGACCCAA/-------- TGTTATAAAT 3070 hom 129 het 46 0 44 3 TGACCCAA 1 0 242736 CASAVA_Build 11 25997054 1I ACCAAAAGTT -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 63 het 30 0 22 8 A 7 8 242737 CASAVA_Build 11 25997528 4I AGGCCAAAAA ----/ACAT AGTGCGTTGG 3070 hom 117 het 40 0 40 0 ACAT 0 1 242738 CASAVA_Build 11 25998795 3D ATTGATTGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 48 0 39 11 T 13 10 242739 CASAVA_Build 11 25999547 1D CAAGAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 8 T 11 10 242740 CASAVA_Build 11 26000336 1I TGTAATTTTT -/G GGGGGGGTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 7 8 242741 CASAVA_Build 11 26003038 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2495 het 758 hom 9 2 6 1 A 7 6 242742 CASAVA_Build 11 26014149 4D AATCTGTGGT CGTA/---- CAAGCTATGA 3070 hom 111 het 41 0 38 5 CGTA 1 0 242743 CASAVA_Build 11 26018578 4D CCTTCTGCAC CTAT/---- CTGATAGCAA 3070 hom 129 het 49 0 44 6 CTAT 1 0 242744 CASAVA_Build 11 26018678 2I CATCTGTCTC --/AT ATGATTTTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AT 1 2 242745 CASAVA_Build 11 26019295 4I GCCAAAATTC ----/TTTT TTTTTTATTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 6 10 242746 CASAVA_Build 11 26020933 2I ATGCAGTGAC --/AG AGTGTGAGGG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 AG 1 2 242747 CASAVA_Build 11 26021304 1D GATAAAAAAA T/- ATACTGTAAA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 T 1 0 242748 CASAVA_Build 11 26021637 6I TTCACAAATT ------/TATCTC TAATCTTCAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TATCTC 0 1 242749 CASAVA_Build 11 26023292 1I AGACTGGCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 32 0 29 3 A 9 10 242750 CASAVA_Build 11 26023639 1D GAGGTAGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 26 0 20 6 A 13 12 242751 CASAVA_Build 11 26023722 1D TTAGCTCTGT C/- GCACGAGCAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 1 0 242752 CASAVA_Build 11 26026452 3D GGGGTCGTTA AGC/--- AGGGAATGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 AGC 1 0 242753 CASAVA_Build 11 26028554 1D CTGGCCTGGG T/- GAAAAAGCAA 3070 hom 79 het 34 0 27 7 T 1 0 242754 CASAVA_Build 11 26028677 4I CCTCTTGCAC ----/CAAA CAGTTAGCAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 CAAA 0 1 242755 CASAVA_Build 11 26028808 3I TGGTCTACAT ---/AGA AGATTAAACC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 AGA 1 2 242756 CASAVA_Build 11 26031489 5D60M5I AAAATATACA TTGGTTTGGTCAGGAAAGGTGGGACATCTTGAGTAGTGGGGCTCCCAGCCAGGTCATGAGTGAAT-----/-----TTGGTCAGGAAAGGTGGGACATCTTGAGTAGTGGGGCTCCCAGCCAGGTCATGAGTGAATTAAAA TATTTTCTGA 3070 hom 75 het 27 0 26 12 N/A 0 0 242757 CASAVA_Build 11 26032383 1I ATGAGCAGCT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 9 10 242758 CASAVA_Build 11 26034108 5D73M1D TTACACAAAG ATATTGCAAAGTCAAATCTGAAAGAAAGTCATCTTCTCTCAAGTTTTAGCTACCATGTTCCAAGGTTGTCAGGCATTTA/-----GCAAAGTCAAATCTGAAAGAAAGTCACCTTCTCTCAAGTTTTAGCTACCATGTTCCAAGGTTGTCAGGCATTT- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 31 0 33 19 N/A 0 0 242759 CASAVA_Build 11 26056564 2D AGAAATTCGT GA/-- GAGCTTAGAC 3070 hom 81 het 30 0 27 6 GA 2 1 242760 CASAVA_Build 11 26102780 1D ATCTGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 891 het 891 ref 21 11 3 7 T 15 14 242761 CASAVA_Build 11 26116081 5D GGGGCAAAGG TTTCT/----- TTTCATTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 TTTCT 1 0 242762 CASAVA_Build 11 26130148 1D ATTATGATTG A/- AGACTGAATG 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 2 1 242763 CASAVA_Build 11 26147046 1I AATCTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1403 hom 35 6 18 11 A 12 13 242764 CASAVA_Build 11 26180405 24D TAATATATAT TATATATAATATAGATACATATTA/------------------------ TATATATCAT 2482 het 570 hom 7 2 5 3 TATATATAATATAGATACATATTA 1 0 242765 CASAVA_Build 11 26199834 4I6M3I ATCATGTCAG ----AAGGTG---/ATGTAAGATGTAC ATGCAAGAGC 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 N/A 0 0 242766 CASAVA_Build 11 26207224 1I AAAGAGGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 9 10 242767 CASAVA_Build 11 26213934 4I TATGTAATCA ----/TTTG TTTGTCTACA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 TTTG 1 2 242768 CASAVA_Build 11 26222240 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1344 het 1344 ref 30 18 5 7 A 15 14 242769 CASAVA_Build 11 26305667 1D ACCAATAAGG A/- AGAAAGCAAT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 2 1 242770 CASAVA_Build 11 26314867 1I GAGAAATAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 9 10 242771 CASAVA_Build 11 26333135 2I ATTGTAACTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 28 0 21 7 T 11 13 242772 CASAVA_Build 11 26343532 1D GTGCCCTAGT G/- GGGATTCTCT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 G 4 3 242773 CASAVA_Build 11 26355487 3D AGATAATAAA AAG/--- AAGGAATTTG 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 AAG 2 1 242774 CASAVA_Build 11 26357018 1I GGAGGCTAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 9 10 242775 CASAVA_Build 11 26357094 1I CAACTTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2548 hom 24 7 13 4 A 11 12 242776 CASAVA_Build 11 26357162 2I ATTATGAAAC --/AG AGTGAGTAGG 3070 hom 115 het 46 0 40 6 AG 1 2 242777 CASAVA_Build 11 26361621 65D TCACAGTAGT AGATTGACTGTCCTAGGAGATGACAGCAATATATATAATGGCTTACCCTATCCTAAATGACTTTA/----------------------------------------------------------------- GACTATTACA 3070 het 3070 ref 32 39 16 1 AGATTGACTGTCCTAGGAGATGACAGCAATATATATAATGGCTTACCCTATCCTAAATGACTTTA 1 0 242778 CASAVA_Build 11 26363899 4I ACTGCCTAAT ----/AGAC AGGAACTGGA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 AGAC 0 1 242779 CASAVA_Build 11 26365624 8D CTAAAGTTAC TTCGTGAA/-------- TTTCTCAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 TTCGTGAA 1 0 242780 CASAVA_Build 11 26366144 1D TCTTCTTTAA T/- TTTTTTATGG 3070 het 2975 hom 19 7 11 1 T 7 6 242781 CASAVA_Build 11 26370114 1D GTCGGAAAAC A/- ACAGCTCTCC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 2 1 242782 CASAVA_Build 11 26372362 4D TGCTAGACAT ACTC/---- ACAGGAGATG 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 ACTC 1 0 242783 CASAVA_Build 11 26373416 1D TTCAAGTAGC T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 7 6 242784 CASAVA_Build 11 26374739 2I ATGCATCCAT --/AA AAAAAGATGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 5 7 242785 CASAVA_Build 11 26375998 1I CACAGTAAGA -/T ATTTTTTTTG 3070 het 358 hom 37 2 33 2 T 0 1 242786 CASAVA_Build 11 26376135 1D AGGATGGGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 A 11 10 242787 CASAVA_Build 11 26378967 2I GCCTAGATGA --/AT ATATATATAT 3070 hom 10 het 22 1 15 6 AT 7 8 242788 CASAVA_Build 11 26387251 2D TAAGTACAAT AA/-- AAAAAAAAAA 1945 het 1945 ref 19 11 6 2 A 13 11 242789 CASAVA_Build 11 26387586 1D CATGAAATTG T/- TTTTTTCTAC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 7 6 242790 CASAVA_Build 11 26389852 1D AATCCATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 25 23 8 T 11 10 242791 CASAVA_Build 11 26392881 2D ACAGTAAAGT TA/-- AAAAAAAAAA 1602 het 1491 hom 36 7 12 17 TA 1 0 242792 CASAVA_Build 11 26402370 1D ACTAAAATCT C/- CCCCCCCACA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 8 7 242793 CASAVA_Build 11 26406851 4D TTGTAGAATT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 107 hom 39 4 27 9 TG 13 11 242794 CASAVA_Build 11 26415759 6I GGCACACTAG ------/CTGATT CTAATTGGCT 3070 hom 123 het 47 0 40 7 CTGATT 0 1 242795 CASAVA_Build 11 26415974 1D AAATCCTAAT A/- AAAATATTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 4 242796 CASAVA_Build 11 26416167 3D TGAACAAAAA AAT/--- AATAAACTGG 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 AAT 2 1 242797 CASAVA_Build 11 26417158 3D GAACCCATAA ATT/--- TGTGGATAAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 ATT 1 0 242798 CASAVA_Build 11 26426870 2D ATGACAGTCT CA/-- CAGTCACTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CA 2 1 242799 CASAVA_Build 11 26427877 2D TAGAATTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 27 0 20 7 T 12 10 242800 CASAVA_Build 11 26435362 1D17M1D AAAAAGAAAT AAAAAAAAAACCTGCACGT/-AAAAAAAAACCTGCACG- TTTTGCACAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 N/A 0 0 242801 CASAVA_Build 11 26438549 5D GAAAGGGGGG GGGGC/----- GGGCGGGTGG 1414 het 963 hom 8 3 3 3 GGGGC 1 0 242802 CASAVA_Build 11 26438837 1I AAAAGTAAAC -/A AGAAAAATCT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 1 2 242803 CASAVA_Build 11 26445533 1D TTTGTGCCCA T/- TTAATCATCC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 3 2 242804 CASAVA_Build 11 26448032 4I ATGTTTTTTG ----/AACC AAATTAGAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AACC 0 1 242805 CASAVA_Build 11 26451742 3I TAAAAAGTTA ---/GTT GTATTTTCCA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 GTT 0 1 242806 CASAVA_Build 11 26467343 1D CTGAAAGGGG C/- CAACGTAGAG 1960 het 1960 ref 17 8 7 2 C 2 1 242807 CASAVA_Build 11 26477643 1D AAATTAACTT A/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 1 0 242808 CASAVA_Build 11 26482395 1D GACCACATGA T/- TTTTTTTAGG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 8 7 242809 CASAVA_Build 11 26482638 4D AAACAAAAGA TAAT/---- TAATGAATAA 3070 het 2635 hom 25 6 15 5 TAAT 2 1 242810 CASAVA_Build 11 26482697 1D AGATGCTAAG A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 25 8 9 8 A 7 6 242811 CASAVA_Build 11 26486909 1I GAGAAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 A 9 10 242812 CASAVA_Build 11 26487229 2I TCTCTCTCTC --/TA TATATATATA 2217 het 2217 ref 28 11 7 10 TA 8 9 242813 CASAVA_Build 11 26487936 1D ACACATTAGG A/- AGTACTAAAC 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 A 2 1 242814 CASAVA_Build 11 26493467 1D TGCTTGGATA T/- TTTTTTAGCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 7 6 242815 CASAVA_Build 11 26493530 4I AACCAAAACT ----/TTAG TTAATCATGG 3070 hom 60 het 29 0 21 8 TTAG 0 1 242816 CASAVA_Build 11 26494800 1I TTCATTAAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 23 7 12 4 T 8 9 242817 CASAVA_Build 11 26496680 2I ACAACTTTTC --/AT AGACTCCACT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 AT 0 1 242818 CASAVA_Build 11 26498038 1D ATGGGAACAC A/- ATTCTATGGT 3070 hom 96 het 40 0 33 9 A 2 1 242819 CASAVA_Build 11 26499165 4I GATGTAACAT ----/TAAC TAACTCCTTA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TAAC 1 2 242820 CASAVA_Build 11 26505178 3D ACTACATAAT TAG/--- TAGGTTTTCT 3070 hom 105 het 37 0 36 3 TAG 2 1 242821 CASAVA_Build 11 26506001 1I ACAAAAAAGA -/C CTCCCTTATC 3070 het 3070 ref 57 27 25 5 C 1 2 242822 CASAVA_Build 11 26513113 1D TTATGTTTCA T/- TTATTTACTC 3070 het 3070 ref 56 33 20 3 T 3 2 242823 CASAVA_Build 11 26519765 2D GGTGAAGATA TT/-- GTGTTTATTA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 2 0 242824 CASAVA_Build 11 26520959 4I37M2I TTAGTTAACT ----ATATTTATAGAATGAAAGAAAAAGACCATTTATATTA--/ATAAATATTTATAGAAAGAAAGAAAAAGACCATTTATGTTAAT ATATATGTTA 2627 het 2627 ref 20 17 6 2 N/A 0 0 242825 CASAVA_Build 11 26521594 1I CTTTTTTTTT -/A AATTATATTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 2 3 242826 CASAVA_Build 11 26522715 3D ATTTTAAATG TTC/--- TTACCATAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 TTC 1 0 242827 CASAVA_Build 11 26522844 1D TTTTGTTGAC A/- AAAAATAAAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 6 5 242828 CASAVA_Build 11 26523837 3D CACAAATATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 A 14 11 242829 CASAVA_Build 11 26524026 3D GCACCAGCTC CTT/--- CTTCTCCTGA 3070 het 3070 ref 50 26 24 1 CTT 2 1 242830 CASAVA_Build 11 26525816 1D TTTGGCTTTT G/- TTTTTGGTAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 G 1 0 242831 CASAVA_Build 11 26526313 1I AAGATATGGA -/G ATGGTAGTGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 G 0 1 242832 CASAVA_Build 11 26527075 1D AATGAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 29 3 15 11 A 14 13 242833 CASAVA_Build 11 26529499 4D ATGATGGGAA CTCT/---- CTCTCCCTCT 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 CT 4 2 242834 CASAVA_Build 11 26530438 1I ACACGCATTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 8 9 242835 CASAVA_Build 11 26530862 1D AAGGTGCTGC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 93 het 56 1 45 11 A 8 7 242836 CASAVA_Build 11 26531127 28I CATTTATCAC ----------------------------/ACAAGTGTAAAAATGGCCTGTTATCATT ACAATTATCT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 ACAAGTGTAAAAATGGCCTGTTATCATT 0 1 242837 CASAVA_Build 11 26531359 1D TTTTGTTTTT G/- TTTTTTCTCA 3070 het 407 hom 35 7 15 13 G 1 0 242838 CASAVA_Build 11 26534498 27D AAACATGTAC TCAATACCCAGTATGAACCTCAGACTG/--------------------------- TATACTGATT 3070 het 3070 ref 32 19 11 10 TCAATACCCAGTATGAACCTCAGACTG 1 0 242839 CASAVA_Build 11 26534857 1D TCAGGTTTTA C/- CCTGCCCAAG 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 C 3 2 242840 CASAVA_Build 11 26542556 1I ACAAATTATT -/A AAAAAAATTT 3070 het 1312 hom 16 4 9 3 A 7 8 242841 CASAVA_Build 11 26544935 1I CTTCTGACAC -/A AAATAACTCA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 3 4 242842 CASAVA_Build 11 26546596 1I CCTACCATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 25 0 12 13 T 11 12 242843 CASAVA_Build 11 26555688 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 28 1 15 12 A 16 14 242844 CASAVA_Build 11 26564838 1I GTGTTAGCCA -/G GATGGTCTCG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 G 1 2 242845 CASAVA_Build 11 26566458 1I TTTCTGTATA -/C CCTTTTTCTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 2 3 242846 CASAVA_Build 11 26566848 1D ACACTACATT A/- AAAAACCTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 6 5 242847 CASAVA_Build 11 26574317 4I TCTCTTTCTT ----/TCTC CTTTGACTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TC 0 2 242848 CASAVA_Build 11 26579664 1D ATAAACATTG A/- AAAAAAATAC 3070 hom 99 het 37 0 34 5 A 8 7 242849 CASAVA_Build 11 26580874 1I ACCAAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 30 2 20 8 A 10 11 242850 CASAVA_Build 11 26589983 1I CATTATATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 T 9 10 242851 CASAVA_Build 11 26604387 1D TTGTGTCCTG T/- GGGAAGCAGA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 1 0 242852 CASAVA_Build 11 26604906 1D TATTCAATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 10 9 242853 CASAVA_Build 11 26608666 16D TACATGTAGC TTTTATTATCACACAG/---------------- TTTTATAAAA 3070 het 3070 hom 46 24 25 4 TTTTATTATCACACAG 1 0 242854 CASAVA_Build 11 26609100 1I TTACATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 308 hom 38 2 28 8 T 11 12 242855 CASAVA_Build 11 26615903 4I TCTTTGTGTC ----/TTAA TTATTTGTTC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 TTAA 0 1 242856 CASAVA_Build 11 26618138 1I AATTATATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 T 9 10 242857 CASAVA_Build 11 26618339 1D TAATATTTCC T/- TGACATCTCT 3070 het 3070 ref 25 12 8 6 T 2 1 242858 CASAVA_Build 11 26619334 2D GAAGCAGACT CA/-- CGGACACAGA 3070 het 3070 ref 56 30 23 3 CA 1 0 242859 CASAVA_Build 11 26620610 4I AAGTAGCTGG ----/AAGT GATTACAGGT 3070 het 1019 hom 13 3 10 0 AAGT 0 1 242860 CASAVA_Build 11 26620695 1I GGCTGGTCTC -/A AACTCCTGAC 2051 het 639 hom 9 2 5 2 A 2 3 242861 CASAVA_Build 11 26621850 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 11 10 242862 CASAVA_Build 11 26623180 1D TTCACCTGTT G/- TATTTATTGT 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 G 1 0 242863 CASAVA_Build 11 26626718 1D GATGTCCTCT G/- GGGGACAAAA 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 G 5 4 242864 CASAVA_Build 11 26628357 3I CAAGGTGGCG ---/GAA GAAGAAGATG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 GAA 2 3 242865 CASAVA_Build 11 26628583 1I GTCGATGCGA -/T TTTTTATACT 3070 hom 111 het 40 0 36 4 T 5 6 242866 CASAVA_Build 11 26635802 1I GTTTGTTTAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 8 9 242867 CASAVA_Build 11 26636059 1I TCTGTAGATG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 6 7 242868 CASAVA_Build 11 26636248 19I TCTTTAATCC -------------------/ATTTTGAGTTTATTTTTGA ATTTGGTAAG 982 het 982 ref 29 16 3 11 ATTTTGAGTTTATTTTTGA 0 1 242869 CASAVA_Build 11 26636525 99D TCACCTGAGG TCAGGAGTTCAAGAGCAAAGAGCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATAGCCGGGTGCAGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTAC/--------------------------------------------------------------------------------------------------- TCAGGAGGTT 1545 het 1545 ref 10 6 4 6 TCAGGAGTTCAAGAGCAAAGAGCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATAGCCGGGTGCAGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTAC 1 0 242870 CASAVA_Build 11 26637308 4I ATTCATTTAA ----/TACT TACTTATGCC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 TACT 1 2 242871 CASAVA_Build 11 26637487 1I TTATTCCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 T 11 12 242872 CASAVA_Build 11 26640438 1I TTCTCATGCT -/C CCCCCCCCTC 3070 het 3070 hom 41 11 16 14 C 8 9 242873 CASAVA_Build 11 26647186 2I ATGTGTACAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 AT 5 6 242874 CASAVA_Build 11 26648639 2D CAGCTAATGA CT/-- GGAATGACTG 3070 het 3070 hom 46 18 26 3 CT 1 0 242875 CASAVA_Build 11 26650412 1D AGAAATATTT G/- CCATGATATG 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 G 1 0 242876 CASAVA_Build 11 26653445 11D GATAGCAGAT GGTAAAGCAAA/----------- GTATAGGGCT 3070 het 3070 ref 51 32 20 2 GGTAAAGCAAA 1 0 242877 CASAVA_Build 11 26658378 4D GAGAGTGAAC ATTT/---- ATTAAAGTCA 2964 het 2227 hom 17 6 7 4 ATTT 1 0 242878 CASAVA_Build 11 26663747 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 83 het 31 0 28 3 A 7 8 242879 CASAVA_Build 11 26664424 3I AAAAGATAAG ---/TTC TTCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TTC 1 2 242880 CASAVA_Build 11 26669587 1I TATGTACATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 9 10 242881 CASAVA_Build 11 26684396 1I AAAGATTTTT -/A ACACCAGGCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 2 242882 CASAVA_Build 11 26692232 1I CAAAACGAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 852 hom 43 3 33 7 A 9 10 242883 CASAVA_Build 11 26693151 2I TAGAAAACAC --/TG TGAAATGTCT 3070 hom 196 het 72 0 66 6 TG 1 2 242884 CASAVA_Build 11 26693463 1I GGCAGATCAG -/A AAGGCTTGAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 2 3 242885 CASAVA_Build 11 26698935 5D TTCGTTAAAA TGTTT/----- TGTACTTTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TGTTT 1 0 242886 CASAVA_Build 11 26716302 2D AGGGGGTGTG GC/-- GCCTGAGCAA 3070 hom 90 het 38 0 29 10 GC 2 1 242887 CASAVA_Build 11 26718717 1D AAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 800 hom 42 4 31 8 T 12 11 242888 CASAVA_Build 11 26730583 1I CAACTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 A 14 15 242889 CASAVA_Build 11 26737646 1D TTGTATGTAG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 7 6 242890 CASAVA_Build 11 26742825 1I CAGGCCCCTG -/A AAAAAAAAAA 1537 het 1537 ref 24 9 5 10 A 13 14 242891 CASAVA_Build 11 26744517 1I TCATCAGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 9 10 242892 CASAVA_Build 11 26748627 1I ATTACAGGCG -/C CCCCCCACCA 1438 het 408 hom 8 3 4 1 C 6 7 242893 CASAVA_Build 11 26748855 2D AAGGAAATTG AT/-- AAGAAAATTT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 AT 1 0 242894 CASAVA_Build 11 26760300 2I GTGTGGGATA --/TC TCTCTCTTGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TC 3 4 242895 CASAVA_Build 11 26770335 4D CACAATTTGC ACAA/---- ACAGAGGTGG 3070 het 3070 ref 48 26 17 9 ACAA 1 0 242896 CASAVA_Build 11 26771862 4I ATGAGATAAG ----/TACA TACACAGATG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 TACA 1 2 242897 CASAVA_Build 11 26774093 13D CTTACAACAC AAATTTCTGCATA/------------- AATATCTGGC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AAATTTCTGCATA 1 0 242898 CASAVA_Build 11 26774314 1D CAATGGTATG A/- ATCTATGTGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 2 1 242899 CASAVA_Build 11 26779227 1D CTACAGTTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 136 het 57 0 45 13 A 10 9 242900 CASAVA_Build 11 26782537 4I TAAAATTACC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTAT 2 3 242901 CASAVA_Build 11 26790530 2I GGTCTCTCTC --/TT TGTTTTAAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 1 3 242902 CASAVA_Build 11 26799568 2I GAGGGAAAAG --/TT TTTTATAATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 4 6 242903 CASAVA_Build 11 26801264 1I GGAAAATCCA -/C CCCCCATGAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 5 6 242904 CASAVA_Build 11 26806844 1D GGACTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 210 hom 32 3 13 19 A 10 9 242905 CASAVA_Build 11 26807065 1D TAAGTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 12 11 242906 CASAVA_Build 11 26808842 1D AAATAAAAAA G/- AATTTTGCAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 7 G 1 0 242907 CASAVA_Build 11 26811221 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1631 hom 25 het 18 0 7 11 A 15 14 242908 CASAVA_Build 11 26819106 1I TTTGTATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 12 13 242909 CASAVA_Build 11 26821062 3D AAAAACTATT AAG/--- AAGAAGTATA 2621 het 2621 ref 21 15 6 2 AAG 3 2 242910 CASAVA_Build 11 26823060 4D TATCAATTAC TATT/---- TATTTATTCA 3070 het 3070 hom 48 20 26 7 TATT 3 2 242911 CASAVA_Build 11 26828487 1I GTGGTTGCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 11 12 242912 CASAVA_Build 11 26829017 1I TGACACTTAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 A 8 9 242913 CASAVA_Build 11 26830135 1D TAATCTAAAG T/- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 4 3 242914 CASAVA_Build 11 26841737 25D GCCAGGCTTG ATTGTTCTTTTCTATCTCACCAGAA/------------------------- ATTGTTCTTT 3070 hom 89 het 40 0 29 17 ATTGTTCTTTTCTATCTCACCAGAA 2 1 242915 CASAVA_Build 11 26847239 3D TAGCGTCCTT AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 AAC 3 2 242916 CASAVA_Build 11 26847437 16D TTTCTTTTTC TTTTTTTTTTTTTTGT/---------------- TTTTTTTTTT 2076 het 2076 ref 20 14 6 3 TTTTTTTTTTTTTTGT 1 0 242917 CASAVA_Build 11 26847861 1D AACAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 2896 het 2777 hom 22 9 8 5 A 15 14 242918 CASAVA_Build 11 26851882 1D ACTCAATCCC T/- TTTACAACAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 4 3 242919 CASAVA_Build 11 26861278 1I CAACATCAAC -/A AAAAAAAAAT 2751 het 2751 ref 19 11 6 2 A 9 10 242920 CASAVA_Build 11 26869145 1I ATGGAACAGG -/A TAGCAAATCC 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 0 1 242921 CASAVA_Build 11 26881739 35I AAGGTTGTCA -----------------------------------/CATACATGTGGCATAATAGTTATGGCTATGGCAAG CATAATAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 14 11 CATACATGTGGCATAATAGTTATGGCTATGGCAAG 0 1 242922 CASAVA_Build 11 26919018 4I ATTTCCCTTC ----/CTTA CTGTGCTAGC 3070 het 3070 ref 39 21 10 8 CTTA 0 1 242923 CASAVA_Build 11 26919250 1D CCATGGCTGG A/- GCATCTGGTA 3070 het 3070 hom 40 14 15 11 A 1 0 242924 CASAVA_Build 11 26922988 1I TTATTTTTAC -/A CTTATTACAT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 0 1 242925 CASAVA_Build 11 26939645 4D AAAGAAAAAG CAGA/---- CAAATGATAA 3070 het 3070 ref 42 27 13 3 CAGA 1 0 242926 CASAVA_Build 11 26963663 2D TCCACCTCCA TC/-- TGTTTGACAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 7 TC 1 0 242927 CASAVA_Build 11 26967715 3I CTTTTCTTCC ---/CTT CTTCTTGCTT 2968 het 2968 ref 31 14 8 9 CTT 2 3 242928 CASAVA_Build 11 26971420 1D AAAAAAAAAA C/- ATTGTTTTTC 3070 het 1116 hom 35 7 13 16 C 1 0 242929 CASAVA_Build 11 26978110 2D GTAATCTCAG CA/-- CTTTGGGAGG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 CA 1 0 242930 CASAVA_Build 11 26978202 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCC 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 A 5 4 242931 CASAVA_Build 11 26985075 16I TAATTTAAAT ----------------/CAGTAATGACGATACC CACTTTGAAG 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 CAGTAATGACGATACC 0 1 242932 CASAVA_Build 11 26986953 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAGAAAGAA 325 het 325 ref 15 7 2 6 AG 1 0 242933 CASAVA_Build 11 26992543 1I CATGCAGAAT -/A AAGAATTGCA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 A 2 3 242934 CASAVA_Build 11 26999035 1D CATGTGGAGC A/- GACATAAATC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 1 0 242935 CASAVA_Build 11 27004500 1D TCTAAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 845 hom 41 3 31 7 A 12 11 242936 CASAVA_Build 11 27005137 1D CACCCACCTC T/- TTTTTAAGGT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 6 5 242937 CASAVA_Build 11 27007200 1I AATTTAAACT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 242938 CASAVA_Build 11 27015484 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1148 hom 38 6 24 8 A 16 15 242939 CASAVA_Build 11 27019308 8D CTTTTCTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 34 0 28 9 T 18 10 242940 CASAVA_Build 11 27025042 2I TGATCTGCAA --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TG 0 1 242941 CASAVA_Build 11 27027259 1D TAAGTTATTT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 10 9 242942 CASAVA_Build 11 27035922 4I TGGGACAATT ----/TGTC TGTGTGTGTG 3070 hom 120 het 52 0 40 12 TGTC 0 1 242943 CASAVA_Build 11 27043940 4D TAAGAGGTAT ATTA/---- ATTATATTCT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 ATTA 2 1 242944 CASAVA_Build 11 27044670 5D ATTACACAGC GTTAG/----- GTTTGGAGTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 GTTAG 1 0 242945 CASAVA_Build 11 27055739 2D TCCACCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 2610 het 853 hom 33 6 9 18 A 18 16 242946 CASAVA_Build 11 27067329 5I TAAAATTAAA -----/TAAAG TAAACACTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TAAAG 0 1 242947 CASAVA_Build 11 27071797 1I TATTTATTTG -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 7 8 242948 CASAVA_Build 11 27075312 1I TACAGACTAG -/C GCCAAAATGC 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 C 0 1 242949 CASAVA_Build 11 27077004 4I CTCTACCAGT ----/CAAA CTAACCTTTG 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 CAAA 0 1 242950 CASAVA_Build 11 27080170 1D TACTAAGAAT G/- GACTTCAGAC 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 G 2 1 242951 CASAVA_Build 11 27084429 2I CAAATTGGAT --/AA AGAGTCAAGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 1 3 242952 CASAVA_Build 11 27092847 5D GACCCACAAC TCATA/----- TCATATGCAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 TCATA 2 1 242953 CASAVA_Build 11 27094596 1D AAAGTATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 28 1 23 5 A 12 11 242954 CASAVA_Build 11 27112156 2D CTATCAGTTT AA/-- AAAATAGACT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 6 4 242955 CASAVA_Build 11 27115887 1I GTCTCATAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 9 10 242956 CASAVA_Build 11 27116661 3I TTCCAAAAGT ---/ATG ATAACAATAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 ATG 0 1 242957 CASAVA_Build 11 27117703 1I ATTTACCACA -/G CTGTAATCAA 3070 hom 96 het 42 0 33 9 G 0 1 242958 CASAVA_Build 11 27120003 2D AGCAATGGAG AA/-- ACATATGTGA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 3 1 242959 CASAVA_Build 11 27121649 4I AAAAAAAAAT ----/AGAG AGAGAGAGAA 1347 hom 24 het 15 0 9 6 AG 4 6 242960 CASAVA_Build 11 27122248 5D GTCTCAAAAC AAAAG/----- AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 5 AAAAG 1 0 242961 CASAVA_Build 11 27123530 1I ATAAGAACCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 9 10 242962 CASAVA_Build 11 27126880 1D AGTGACTTAG A/- AAAACAGTTA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 5 4 242963 CASAVA_Build 11 27134044 1D TTTTATTTTA T/- TTTATTTACT 1514 het 772 hom 19 4 5 10 T 4 3 242964 CASAVA_Build 11 27146729 1I AAAAAGTCTA -/T CCCTCCCTTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 0 1 242965 CASAVA_Build 11 27148136 5D TTAATCCATC TTAAG/----- TTAATTTTTA 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 TTAAG 1 0 242966 CASAVA_Build 11 27151729 1I GAAAACCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1140 hom 28 3 20 5 A 11 12 242967 CASAVA_Build 11 27162060 1D AATTGGATAG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 8 7 242968 CASAVA_Build 11 27172528 4I AATCAAACTA ----/TTAT TTAACTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TTAT 0 1 242969 CASAVA_Build 11 27172624 1D AATTAATCTC T/- TTTTTTTTTG 1146 het 1146 ref 28 19 3 6 T 10 9 242970 CASAVA_Build 11 27179261 2I CTCCCCAAAC --/AG AATTCATTTT 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 AG 0 1 242971 CASAVA_Build 11 27192560 3I TACCGATGAA ---/AAG AAGAAGGCTC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 AAG 2 3 242972 CASAVA_Build 11 27206674 1D CACCAGTGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 35 0 25 10 T 10 9 242973 CASAVA_Build 11 27207984 1I TTAGTTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 30 3 21 6 A 11 12 242974 CASAVA_Build 11 27211355 4D TTTTTTTCTT TTTC/---- TTTTTCTTTT 3070 het 87 hom 28 2 15 11 TTTC 1 0 242975 CASAVA_Build 11 27212647 1D AAGGCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 27 0 23 4 A 11 10 242976 CASAVA_Build 11 27218469 1I AGTTATCTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 397 hom 47 1 38 8 T 9 10 242977 CASAVA_Build 11 27219785 12D AACTGCTTGA GAATGAATGAAT/------------ GAATGAATGA 3070 het 3070 ref 46 22 22 5 GAAT 8 5 242978 CASAVA_Build 11 27220730 1D ATGAAAATGG A/- AAAATTCCTC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 5 4 242979 CASAVA_Build 11 27222221 1I TCTCACTCTG -/T TGCCCAACCT 3070 het 3070 hom 29 9 19 1 T 1 2 242980 CASAVA_Build 11 27242117 1I51M3D TCTATTTCCT -AAAAAAAAAAAAAAATCCCGATTCCTATTTCTATGAGAAAGCAAGACGCCTTAG/AAAAAAAAAAAAAAAATCCAGATTCCTATTTCTATGAGAAAGCAAGACGCCT--- TAGAAAGTAC 3070 het 3070 ref 28 20 11 10 N/A 0 0 242981 CASAVA_Build 11 27243441 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 A 13 14 242982 CASAVA_Build 11 27243638 1I GCTCGGAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 A 11 12 242983 CASAVA_Build 11 27264980 1D CAAGTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 1829 hom 20 7 11 2 T 9 8 242984 CASAVA_Build 11 27267488 1I ATACCCTCAT -/A AAAAAAAAAA 2619 het 2619 ref 25 15 6 4 A 11 12 242985 CASAVA_Build 11 27277103 2D ATCCAACAAC AG/-- GAGCGGGAGG 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 AG 1 0 242986 CASAVA_Build 11 27280917 4D AATTAATAAT TAAA/---- TAATTTTCAA 3070 het 3070 hom 35 16 18 4 TAAA 1 0 242987 CASAVA_Build 11 27285847 11I CCATATTAGC -----------/TCCATGGTTCA CTGAACCATC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 TCCATGGTTCA 0 1 242988 CASAVA_Build 11 27294378 1I ATCTTGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 10 11 242989 CASAVA_Build 11 27294865 4I AATTAAAAAC ----/AAAA AAAACTCAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 4 8 242990 CASAVA_Build 11 27295289 2I TAATTGTACT --/AC TTTTTCCCAT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 AC 0 1 242991 CASAVA_Build 11 27299786 1I ACTATCTCTA -/T TAGACTCCAC 3070 het 3070 ref 31 15 16 0 T 1 2 242992 CASAVA_Build 11 27308167 1I AATAATAACC -/T ATTCTGACTG 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 0 1 242993 CASAVA_Build 11 27314951 7D TCCTAATAAA CTGTTCT/------- CTGCTTAGAA 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 CTGTTCT 1 0 242994 CASAVA_Build 11 27337091 1I ACCCCCCCCC -/A CCCACCGCCA 1379 het 160 hom 12 4 5 3 A 0 1 242995 CASAVA_Build 11 27337611 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 T 10 9 242996 CASAVA_Build 11 27338705 1D ATGAAAGGGC T/- GACTCAGGTT 3070 het 3070 ref 48 21 20 8 T 1 0 242997 CASAVA_Build 11 27341710 1I ACCAAAACCA -/C CCCCCTATAT 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 C 5 6 242998 CASAVA_Build 11 27342580 13D ATCAGTAACA TCGAAACGCACTG/------------- AGCTGCCTTA 3070 het 3070 ref 29 20 8 5 TCGAAACGCACTG 1 0 242999 CASAVA_Build 11 27350992 1D ATTCTCTCTC T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 T 8 7 243000 CASAVA_Build 11 27354045 1D TGCAATGTCT A/- AAATAATATT 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 A 4 3 243001 CASAVA_Build 11 27358026 3D ATCCTGCCTT AAA/--- TTAAACACTC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 A 3 0 243002 CASAVA_Build 11 27359830 1D ACAAACAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 21 8 A 11 10 243003 CASAVA_Build 11 27360558 1D CCTTTTCTTA C/- AATAATGAAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 C 1 0 243004 CASAVA_Build 11 27369813 4D GCCAGAAGAG AAAT/---- AGAGCTTTGA 3070 het 3070 ref 32 15 11 10 AAAT 1 0 243005 CASAVA_Build 11 27380539 1D ACTAGAAAGT A/- AGGAGATACC 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 A 2 1 243006 CASAVA_Build 11 27382919 1D AGGTGTATTT C/- CCCACTCTAT 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 C 4 3 243007 CASAVA_Build 11 27392883 5D AACAGGGGTC AGAAA/----- AGGCAGGCGC 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 AGAAA 1 0 243008 CASAVA_Build 11 27418769 2D TTTGTAACTT TG/-- TTCCCACAAA 3070 hom 96 het 35 0 32 4 TG 1 0 243009 CASAVA_Build 11 27427397 2D TTTAACAAAA AT/-- CTATTCAATC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AT 1 0 243010 CASAVA_Build 11 27432885 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2450 hom 27 9 11 7 A 16 15 243011 CASAVA_Build 11 27434441 2I CACACCATCA --/AC ACACACAGTG 3070 hom 171 het 63 0 56 7 AC 3 4 243012 CASAVA_Build 11 27446825 1D TTGTCACGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2340 hom 44 12 13 19 A 15 14 243013 CASAVA_Build 11 27452613 2D TCGAGAGAGA GT/-- GTGTTCTGCC 2149 het 2149 ref 29 19 6 4 GT 3 2 243014 CASAVA_Build 11 27458170 4D ACATATAAAT ACAC/---- ACACAAAGAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 AC 4 2 243015 CASAVA_Build 11 27470015 1D TAATTTTCTA G/- GGCTGGCATA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 G 3 2 243016 CASAVA_Build 11 27472104 1D AAAGCTCCAA T/- TTAAAAATTC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 3 2 243017 CASAVA_Build 11 27487387 1D GTTTGTGGAC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 105 het 41 0 34 7 T 9 8 243018 CASAVA_Build 11 27490237 2D TGCTGTAGTC TA/-- TGGATTTGCT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 TA 1 0 243019 CASAVA_Build 11 27512177 3I GCAAAGACTT ---/GAA GGAGGTGAGG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 GAA 0 1 243020 CASAVA_Build 11 27513219 1I ATTCATATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 9 18 9 T 9 10 243021 CASAVA_Build 11 27515214 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 26 1 19 6 T 15 14 243022 CASAVA_Build 11 27535956 1D AAATTACTCT A/- AGAGAAAATG 3070 hom 94 het 35 0 31 4 A 2 1 243023 CASAVA_Build 11 27536054 2D AGTAGCAGGG AC/-- ACACACACAC 1661 het 1661 ref 43 30 5 8 AC 10 9 243024 CASAVA_Build 11 27558557 1D CTTCATTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 10 9 243025 CASAVA_Build 11 27560221 1D AAACTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 12 11 243026 CASAVA_Build 11 27560448 1D AGTCTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 2886 het 2886 ref 23 11 7 5 T 13 12 243027 CASAVA_Build 11 27573735 1I TCCATTTTTT -/A AAAAATCAAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 5 6 243028 CASAVA_Build 11 27586222 1I CATGCATTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 9 10 243029 CASAVA_Build 11 27589305 1D CCCTATCCTG T/- CATTTGAAAA 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 T 1 0 243030 CASAVA_Build 11 27605681 1D GTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 48 1 37 10 T 11 10 243031 CASAVA_Build 11 27606652 1I TACTTGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2901 hom 42 8 26 8 T 11 12 243032 CASAVA_Build 11 27606758 5D TAATGTTTTC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 22 20 1 TTTCT 4 3 243033 CASAVA_Build 11 27614621 1I GGTAAGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 11 12 243034 CASAVA_Build 11 27614715 1I CTATGGGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 A 12 13 243035 CASAVA_Build 11 27615373 2D ACAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 2833 het 2833 ref 42 16 13 13 AG 7 6 243036 CASAVA_Build 11 27619762 3I AAAGACAAAT ---/GGG GGGCGAAAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 3 6 243037 CASAVA_Build 11 27621827 8D TGATTTACCT GATGCAGG/-------- GATGCAGGAT 3070 hom 78 het 33 0 25 12 GATGCAGG 2 1 243038 CASAVA_Build 11 27628030 1I CCACTCAGAA -/T TGACCTCTTT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 1 2 243039 CASAVA_Build 11 27628076 3D CTGAGGAAAT CTG/--- CTGCTGAATG 3070 het 2880 hom 39 7 17 15 CTG 3 2 243040 CASAVA_Build 11 27635587 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 8 7 243041 CASAVA_Build 11 27640121 5D CCCTTCTCAC TTGTT/----- TTGTTTTGTT 3070 hom 117 het 49 0 39 11 TTGTT 3 2 243042 CASAVA_Build 11 27672710 1D GTTCCATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 485 hom 40 4 13 24 T 19 18 243043 CASAVA_Build 11 27686718 1I AGATTTACTC -/T TTAATTAACT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 2 3 243044 CASAVA_Build 11 27699024 5I GAGGATTACC -----/CATTT CATTACCGGT 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 CATTT 0 1 243045 CASAVA_Build 11 27699986 1D GTACCCCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2975 hom 31 11 12 8 A 11 10 243046 CASAVA_Build 11 27711080 1I GTGTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 27 4 17 6 G 0 1 243047 CASAVA_Build 11 27714269 1D CTGGGCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 928 hom 37 3 11 23 T 15 14 243048 CASAVA_Build 11 27723078 1I ATGACAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 861 hom 37 2 28 7 T 11 12 243049 CASAVA_Build 11 27743570 7D CATTAAGCTA TTGTTGG/------- TTGGATTTTT 3070 het 3070 ref 42 28 13 3 TTGTTGG 1 0 243050 CASAVA_Build 11 27754835 1I GAAAAAAAAA -/T ACTGTAATAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 0 1 243051 CASAVA_Build 11 27755362 13I CCTAGCTGGA -------------/ATGCAGCCCTGTG AGTCACCCCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATGCAGCCCTGTG 0 1 243052 CASAVA_Build 11 27782605 1D AAGCATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 32 1 24 9 A 13 12 243053 CASAVA_Build 11 27785530 1D TTTTTATTTG T/- TTTTTGTTTG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 6 5 243054 CASAVA_Build 11 27795872 3I AAACAACAAC ---/AAT AACAAAAATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AAT 0 1 243055 CASAVA_Build 11 27803617 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 30 2 20 8 T 14 12 243056 CASAVA_Build 11 27806801 1I TAGAATGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 10 243057 CASAVA_Build 11 27810147 3D AATAGAAAGC ATT/--- ATATCATTAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 ATT 1 0 243058 CASAVA_Build 11 27811209 1I CAAAAATTAG -/C CCGGGCATGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 2 3 243059 CASAVA_Build 11 27811662 6D ACAGAACTTA AGATAC/------ AGCTGGAAAT 3070 het 3070 ref 53 30 20 4 AGATAC 1 0 243060 CASAVA_Build 11 27816596 8D CCCTCCCCCG CTTCCTTC/-------- CTTCCTTCCT 3070 hom 30 het 19 0 11 9 CTTC 7 5 243061 CASAVA_Build 11 27818825 1D TTAGCTTTTT G/- CTCCCTCTTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 1 0 243062 CASAVA_Build 11 27828739 1D AATTTATCTA T/- TTTTTTTTTT 1082 het 1082 ref 35 21 3 11 T 15 14 243063 CASAVA_Build 11 27844341 1D GCTGTTTTAC A/- GATGAGATAA 3070 hom 99 het 43 0 34 10 A 1 0 243064 CASAVA_Build 11 27858387 8I TGGTAAAAGG --------/ATAAGCTC GACCAACTCC 3070 hom 123 het 47 0 41 6 ATAAGCTC 0 1 243065 CASAVA_Build 11 27864569 1D TAGATAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 895 hom 41 3 30 8 T 15 14 243066 CASAVA_Build 11 27893321 1D GCAGGCTGTA C/- AGGAAGCATG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 1 0 243067 CASAVA_Build 11 27908486 1D CATTTTAAGC A/- AAAAAACCAA 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 7 6 243068 CASAVA_Build 11 27915551 1D GAAACATGCC A/- AAAATCTAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 5 4 243069 CASAVA_Build 11 27924520 1D CAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 19 2 16 1 A 13 12 243070 CASAVA_Build 11 27925117 1I TGCACGTAAT -/C CCCCAAGTGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 C 4 5 243071 CASAVA_Build 11 27946609 3D CTAATTAAAT AAC/--- AAATCATTTT 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 AAC 1 0 243072 CASAVA_Build 11 27954258 1I CAATTTAGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 8 9 243073 CASAVA_Build 11 27954726 1D CATTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 532 hom 20 2 15 3 A 13 12 243074 CASAVA_Build 11 27965957 1I TCTTAACCAA -/C CCAGGTAGAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 2 3 243075 CASAVA_Build 11 27970914 4D CGGACAACAT AGTG/---- AGTGAGCCCT 3070 hom 29 het 16 0 10 7 AGTG 2 1 243076 CASAVA_Build 11 27978558 1D TTCAGTCAAG A/- CTTTTAAACA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 1 0 243077 CASAVA_Build 11 27985310 1D CACTTGTGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 10 9 243078 CASAVA_Build 11 28002007 1D TAGTTAAGCA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 8 7 243079 CASAVA_Build 11 28021804 6D CAATTTTGAC AAAACA/------ AAAACAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 7 AAAACA 4 3 243080 CASAVA_Build 11 28022037 1D ATAAATGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 17 7 A 11 10 243081 CASAVA_Build 11 28031211 4D ACAAAAGTGG GAGA/---- GAGTGTCCAA 3070 hom 117 het 41 0 40 2 GA 3 1 243082 CASAVA_Build 11 28031778 1D CCCTCCCCCC T/- TTCCCCCACC 1925 hom 10 het 7 0 6 1 T 3 2 243083 CASAVA_Build 11 28032048 1D TGGTGAGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 942 hom 20 2 12 6 A 15 14 243084 CASAVA_Build 11 28055059 2D ACTCCTTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 1093 het 1093 ref 21 12 5 4 A 20 18 243085 CASAVA_Build 11 28057463 3I AAAATGAAAT ---/AAC AACAACAACT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 AAC 3 4 243086 CASAVA_Build 11 28057906 1I AAACTTGTTT -/A ATACAGGAAT 3070 hom 151 het 57 0 50 7 A 1 2 243087 CASAVA_Build 11 28074988 4D ATCTTGGGTA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 103 het 43 0 33 11 TC 9 7 243088 CASAVA_Build 11 28078685 1I TGTGAGTGAA -/G GGGGGGGGGT 3070 het 453 hom 26 1 11 14 G 9 10 243089 CASAVA_Build 11 28092491 1I TTTTGTTTAT -/C CCGTTAACCA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 C 2 3 243090 CASAVA_Build 11 28115173 1D TTATAGATAA T/- TTTTATCCAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 5 4 243091 CASAVA_Build 11 28118091 2D AGACTCTGTG GA/-- GACCCATGGC 3070 hom 90 het 34 0 29 5 GA 2 1 243092 CASAVA_Build 11 28128757 1I TGTGTGATAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 145 hom 37 1 31 5 A 8 9 243093 CASAVA_Build 11 28141278 1I GTGAAAAGTG -/A AAAAAAGTGT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 A 6 7 243094 CASAVA_Build 11 28143837 1D AGGGTTGTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 74 het 42 1 39 2 A 10 9 243095 CASAVA_Build 11 28159716 1D AAACTCATCA T/- TTTTTAAGGC 2958 hom 15 het 7 0 6 1 T 6 5 243096 CASAVA_Build 11 28181102 1I TGATTGGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 414 hom 35 1 30 4 A 9 10 243097 CASAVA_Build 11 28228690 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 113 het 45 0 38 9 A 11 10 243098 CASAVA_Build 11 28277423 1I GAATGAGAAG -/T TTTTCTAGAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 5 243099 CASAVA_Build 11 28283622 1D AACTGAAGTA T/- AAAAAGATTA 3070 het 3070 ref 53 23 20 10 T 1 0 243100 CASAVA_Build 11 28290689 1D TTCTTTGTTC T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 7 6 243101 CASAVA_Build 11 28321339 1D CAGGGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 1408 het 1408 ref 28 18 4 7 A 15 14 243102 CASAVA_Build 11 28327398 3I GTGTGGCCAA ---/TCT TCTGATAGTG 3070 hom 108 het 39 0 35 4 TCT 1 2 243103 CASAVA_Build 11 28329242 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 28 3 22 3 T 12 11 243104 CASAVA_Build 11 28344618 1D GAAGAAAAAA G/- TTCATTTTCT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 G 1 0 243105 CASAVA_Build 11 28345326 1I AGCCACTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 817 hom 37 3 28 6 A 13 14 243106 CASAVA_Build 11 28348428 8I AGTGAGAACA --------/TGCAATAT TGCAATATTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TGCAATAT 1 2 243107 CASAVA_Build 11 28358962 1D TAGATGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 43 1 33 9 T 12 11 243108 CASAVA_Build 11 28366172 1D ATAAATTACC T/- CAACATAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 0 243109 CASAVA_Build 11 28377786 1D GTTACATGCC T/- TTCTCCCTTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 3 2 243110 CASAVA_Build 11 28378357 1D AAATTTTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 10 9 243111 CASAVA_Build 11 28389762 3I TAAAATTCCT ---/AGA AGAAGACATA 3070 hom 87 het 41 0 30 11 AGA 2 3 243112 CASAVA_Build 11 28411053 1I TTTTTCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2365 hom 54 8 35 11 T 12 13 243113 CASAVA_Build 11 28416132 1D TTTACTGAAT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 8 7 243114 CASAVA_Build 11 28417147 1I TGAAGAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 23 2 18 3 A 11 12 243115 CASAVA_Build 11 28425183 1D GAGATTATTT A/- AAAAAACACC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 7 6 243116 CASAVA_Build 11 28426977 3D AAATAAATGT ATA/--- ATATTTATTA 3070 hom 64 het 28 0 22 6 ATA 2 1 243117 CASAVA_Build 11 28440140 2I TTGCCCGGGT --/GC GCCCTTGAGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 GC 1 2 243118 CASAVA_Build 11 28446195 1D ATCTCAGCCA T/- TTTTGTTCCA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 5 4 243119 CASAVA_Build 11 28447382 1I CTGATTGACC -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 5 6 243120 CASAVA_Build 11 28448166 1D GCAACAAAAG A/- AAAAAACCTC 3070 hom 117 het 46 0 39 7 A 7 6 243121 CASAVA_Build 11 28453504 1D TATTCTGAGA T/- TTTCCCTCCA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 4 3 243122 CASAVA_Build 11 28457042 1D CAACATGGCA C/- CTGCCAAGGG 3070 hom 108 het 44 0 37 8 C 2 1 243123 CASAVA_Build 11 28457353 2D ATGTCATGAC TA/-- TGTCAGATGC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TA 1 0 243124 CASAVA_Build 11 28462973 1D GGTTTCTAAA C/- AGTCTGGCCG 3070 het 3070 ref 46 28 15 3 C 1 0 243125 CASAVA_Build 11 28463359 5D TATTGAATGC AAGAA/----- AAGAAAAGAA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 AAGAA 5 4 243126 CASAVA_Build 11 28478132 1D GGAATTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 22 3 12 7 T 14 13 243127 CASAVA_Build 11 28491218 3I AGACACTGAA ---/ATG ATGATTACAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 ATG 1 2 243128 CASAVA_Build 11 28497678 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 23 0 12 11 A 13 12 243129 CASAVA_Build 11 28517290 1I TTCCCAGGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 62 het 25 0 21 4 T 9 10 243130 CASAVA_Build 11 28526402 6D AAGGCCATTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 hom 93 het 45 0 30 17 TTG 6 4 243131 CASAVA_Build 11 28665155 2D GTTATCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1932 hom 30 het 15 0 9 6 T 16 14 243132 CASAVA_Build 11 28665742 1D TCATGAATGC T/- TTTTTTTTTT 1212 het 1212 ref 47 37 4 6 T 13 12 243133 CASAVA_Build 11 28671172 6D CAAATGTCAA GATAAG/------ GAAAAGGCAT 3070 hom 111 het 39 0 38 3 GATAAG 1 0 243134 CASAVA_Build 11 28671948 1D AGAGGAATAG C/- CATCTTGCTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 2 1 243135 CASAVA_Build 11 28672260 1I TTGAGCTTCC -/T TTTTTTTTTT 1727 het 1497 hom 25 10 9 7 T 15 16 243136 CASAVA_Build 11 28675150 1I CCTAAAATTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 9 10 243137 CASAVA_Build 11 28676796 2I AATTTTTGTG --/TC TCTCTCTAAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TC 3 4 243138 CASAVA_Build 11 28677996 1I ACTGTTACAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 39 0 32 7 A 8 9 243139 CASAVA_Build 11 28685886 3D TACTTACAGT ATC/--- ATATCAATCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATC 1 0 243140 CASAVA_Build 11 28686666 1D CTGATCACTG T/- TGCTAGGTAA 3070 hom 93 het 34 0 31 4 T 2 1 243141 CASAVA_Build 11 28691314 6D ATTCTATTGA TATACT/------ TAATCAGTAT 3070 hom 135 het 51 0 46 8 TATACT 1 0 243142 CASAVA_Build 11 28711086 1I CATTTTATGC -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 7 8 243143 CASAVA_Build 11 28753411 1I AATTAGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 10 11 243144 CASAVA_Build 11 28754020 1D GACCCTATAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 10 9 243145 CASAVA_Build 11 28758482 4I TAGATACAAC ----/GGTG GTACAGGCAT 3070 hom 81 het 29 0 26 3 GGTG 0 1 243146 CASAVA_Build 11 28759849 16D CTATATATAT ATATATATATATATAC/---------------- ACATTTTTTT 3070 hom 56 het 23 0 18 6 ATATATATATATATAC 1 0 243147 CASAVA_Build 11 28764293 2D GGTCTGGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 2998 het 60 hom 21 1 8 12 T 18 16 243148 CASAVA_Build 11 28766977 1I TTTAAAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 582 hom 37 4 26 7 T 13 14 243149 CASAVA_Build 11 28788317 1I TTATAAAGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 8 9 243150 CASAVA_Build 11 28788562 1I TCCCCAGCTC -/A AAAGTCTCAA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 3 4 243151 CASAVA_Build 11 28797941 1I ATATTTGATT -/A AAATTGCTTG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 3 4 243152 CASAVA_Build 11 28813452 2I AAGTATATAT --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 30 0 21 9 A 9 11 243153 CASAVA_Build 11 28814315 3I TACCTGGTGA ---/TAC TACTAATTTT 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TAC 1 2 243154 CASAVA_Build 11 28814955 10D GTAAATTACA GAGAATAAGG/---------- GAGAGAATGC 3070 hom 111 het 37 0 38 5 GAGAATAAGG 1 0 243155 CASAVA_Build 11 28816621 1D GCTAAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 11 10 243156 CASAVA_Build 11 28821850 4D TTGAATATGA TTTG/---- TTTGTCTCCA 3070 hom 113 het 44 0 37 7 TTTG 2 1 243157 CASAVA_Build 11 28822128 1D CTGTGCCCCC T/- GTCTCTTACA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 1 0 243158 CASAVA_Build 11 28822675 1D TCCCTCTTTC T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 27 het 29 0 14 15 T 7 6 243159 CASAVA_Build 11 28833269 1I59M1I GCATGGCATT -AAAAAAATCTTAAAAATTTCTGTGTGACTGAGCTTACCTTCTCATGCCCCTGCTTTTTT-/AAAAAAAATCTTAAAAATTTCTGTGTGACTGAGCTTACCTTCTCATGCCCCTGCTTTTTTC CATGAGAATG 3070 hom 191 het 33 0 64 10 N/A 0 0 243160 CASAVA_Build 11 28845620 4D CAAAAAAAAT TAAA/---- TAAATAAAGT 3070 hom 102 het 38 0 35 12 TAAA 3 2 243161 CASAVA_Build 11 28847010 2I TCGCTTCCCT --/TC TCTGTAAAAC 3070 hom 97 het 40 0 32 8 TC 1 2 243162 CASAVA_Build 11 28849304 1I35M1D TTATAATATC -TCACATGGGGATTAGGGCTTCAACACATGAATTTCA/ATCACATGGGGATTAGGGCTTCAACACATGAATTTC- AGCATGTGTT 3070 hom 81 het 27 0 27 4 N/A 0 0 243163 CASAVA_Build 11 28850490 8D TACTTTTAAG TATATATA/-------- TATATATATA 3070 hom 52 het 25 0 18 7 TA 12 8 243164 CASAVA_Build 11 28850627 3D GCTATTTTAC TTG/--- TTATTATTAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TTG 1 0 243165 CASAVA_Build 11 28853023 1D TGTTTCAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 10 9 243166 CASAVA_Build 11 28853641 1D TACCCACATA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 6 243167 CASAVA_Build 11 28854462 1D GAATTATGTA T/- TCTTTTATTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 2 1 243168 CASAVA_Build 11 28854964 1D CCTTAATCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 9 243169 CASAVA_Build 11 28857235 1I TTGGTGGACA -/T TTGGGTTGGT 3070 hom 23 het 16 0 8 8 T 2 3 243170 CASAVA_Build 11 28874672 4D CACAACTTTT AATC/---- AATTTTGTAT 3070 hom 84 het 33 0 28 6 AATC 1 0 243171 CASAVA_Build 11 28878813 1D AGATTAATTA T/- TTTTTTGGCT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 7 6 243172 CASAVA_Build 11 28883697 1I TTTTTCTGCT -/A AAAAATGGCA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 5 6 243173 CASAVA_Build 11 28891497 1I GCTTTTGTTC -/A AATACATTCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 3 243174 CASAVA_Build 11 28894753 1D CAAATACAAG A/- AAAAAACAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 7 6 243175 CASAVA_Build 11 28906590 1D CAGTTAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 12 11 243176 CASAVA_Build 11 28924162 1I TCTATGAGAT -/G GGCACTATTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 2 3 243177 CASAVA_Build 11 28925164 2D CAAGGAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 26 0 18 8 A 16 14 243178 CASAVA_Build 11 28935472 1D CCTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 10 9 243179 CASAVA_Build 11 28963713 9D CCCAAATACT ATGGAAGCC/--------- GTAAATCTAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 ATGGAAGCC 1 0 243180 CASAVA_Build 11 28972332 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 7 8 243181 CASAVA_Build 11 28980144 38D GGTGCTTCAG ATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 AT 27 8 243182 CASAVA_Build 11 28984439 3D CAAAACAATT AAG/--- AAGGGCAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AAG 2 1 243183 CASAVA_Build 11 28988900 1I AATAACTTTC -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 6 7 243184 CASAVA_Build 11 28996067 4I AATAGTTGAT ----/AAAG AAGTATAAAG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AAAG 0 1 243185 CASAVA_Build 11 28998285 1D CTTTGCAGCC T/- TTTTTTACAA 3070 hom 92 het 37 0 30 7 T 7 6 243186 CASAVA_Build 11 29005173 3D ACGGCTTTAG GGT/--- GGTAGAACTT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 GGT 2 1 243187 CASAVA_Build 11 29010365 1D ATCTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 11 10 243188 CASAVA_Build 11 29016249 1D ATCTATCATA T/- TTTTTTAGGT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 7 6 243189 CASAVA_Build 11 29016520 1D TTCTGCTAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 10 9 243190 CASAVA_Build 11 29020835 1D CTTATTTTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 10 9 243191 CASAVA_Build 11 29022427 1I CAGACTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 169 hom 22 2 15 5 A 13 14 243192 CASAVA_Build 11 29030676 1D GCAAGAAAGA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 337 hom 42 1 35 7 C 1 0 243193 CASAVA_Build 11 29033383 4D AGTATAATTA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 54 het 29 0 19 10 AAAT 3 2 243194 CASAVA_Build 11 29039665 1D TATACACACA C/- CCCCCCCACA 3070 hom 75 het 35 0 25 10 C 8 7 243195 CASAVA_Build 11 29053569 1D TTTTAGAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 9 243196 CASAVA_Build 11 29080029 2I AGATAAATGT --/TA TATATATATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TA 6 7 243197 CASAVA_Build 11 29091352 1I CCTTGACAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 10 243198 CASAVA_Build 11 29172263 1D ATCAACATCT C/- CCACCATACC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 3 2 243199 CASAVA_Build 11 29177181 1I AAAGTAAAAT -/C AAAACAAAAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 0 1 243200 CASAVA_Build 11 29178311 2D ACTAATTGTC AT/-- AGAAAATCTG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 AT 1 0 243201 CASAVA_Build 11 29178512 6D TTGGATAATA TATTTC/------ TATTTCTATT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 TATTTC 2 1 243202 CASAVA_Build 11 29186079 1I AACCACTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 13 14 243203 CASAVA_Build 11 29189011 1D ATAAAGTTAT A/- ATATGCATAT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 2 1 243204 CASAVA_Build 11 29190930 1D CTAGTTTGTG A/- AAATGTGAGG 3070 hom 123 het 42 0 42 0 A 4 3 243205 CASAVA_Build 11 29200013 1I ATTTTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 10 11 243206 CASAVA_Build 11 29202409 1D ACTCCTGTGC A/- TGGAGATGTC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 1 0 243207 CASAVA_Build 11 29202632 1D GTGCTTTGTT G/- GGGGGAAACC 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 G 6 5 243208 CASAVA_Build 11 29203311 1D CCCTAGGGAC T/- TTCCCTGCCC 3070 hom 99 het 39 0 26 13 T 3 2 243209 CASAVA_Build 11 29206476 2D CCTGTGTATT TG/-- TGTGTGTATA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TG 4 3 243210 CASAVA_Build 11 29211658 11D CTCTGGCATA ATGGCCTACTG/----------- GATCTAACAC 3070 hom 141 het 46 0 48 4 ATGGCCTACTG 1 0 243211 CASAVA_Build 11 29212957 1D ATATACTCTA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 8 7 243212 CASAVA_Build 11 29217188 4I AAAATCTAAC ----/AGTT AGAATTTTAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AGTT 0 1 243213 CASAVA_Build 11 29223996 1D ACAGCTGAGG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 76 het 32 0 26 6 A 8 7 243214 CASAVA_Build 11 29224436 1D AGAGTGAAGT A/- AAAATATTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 5 4 243215 CASAVA_Build 11 29243763 1I TTTATAGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 41 1 35 5 A 10 11 243216 CASAVA_Build 11 29281411 1I AGATATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 10 11 243217 CASAVA_Build 11 29301967 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 54 het 29 0 16 14 AAAG 3 2 243218 CASAVA_Build 11 29304533 1D ATGTTTTCTT G/- GTTTTTCACA 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 G 2 1 243219 CASAVA_Build 11 29306755 1D TCACAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1442 hom 42 7 22 13 A 15 14 243220 CASAVA_Build 11 29306770 1D AAAAAAAAAA C/- CAACTTTTAC 3070 het 1709 hom 44 13 21 10 C 2 1 243221 CASAVA_Build 11 29313531 1I ATGAGCACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 9 10 243222 CASAVA_Build 11 29316047 2I ATATATATAT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 AG 7 8 243223 CASAVA_Build 11 29325840 1I AAATGATACT -/A AAAAAAAAAA 2811 het 2811 ref 33 15 10 8 A 10 11 243224 CASAVA_Build 11 29329206 3D TGACAAATAA ATC/--- ATCAGAGTAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 ATC 2 1 243225 CASAVA_Build 11 29331179 2I AGAAGGAAGT --/TG TGATAAATAG 3070 het 3070 hom 40 11 24 5 TG 1 2 243226 CASAVA_Build 11 29331586 1D GGTCAAGCAA C/- CTGAATTTTT 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 C 2 1 243227 CASAVA_Build 11 29336708 2D TTCTTCAGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 30 5 13 13 A 12 10 243228 CASAVA_Build 11 29338620 1D ATATGTGTCC T/- TTTTGTTTCC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 5 4 243229 CASAVA_Build 11 29343799 1D TGAAGACTAA G/- TCCAGTTAAC 3070 het 3070 hom 59 23 30 10 G 1 0 243230 CASAVA_Build 11 29360296 2I GTAAGTATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 1674 hom 35 5 20 10 AT 7 8 243231 CASAVA_Build 11 29366217 4I TGATTTTTAG ----/TTAA TTAGTTAATC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TTAA 0 1 243232 CASAVA_Build 11 29380992 4D AATTAGCAGC AACA/---- TTTGCATATA 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 AACA 1 0 243233 CASAVA_Build 11 29382171 1D ACTTATTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 286 hom 40 1 33 6 T 10 9 243234 CASAVA_Build 11 29383206 1I CTTTTTCCAG -/T GTAGTCTTGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 1 243235 CASAVA_Build 11 29383968 5I AATTACTGAA -----/TACTC TACTCTATAT 3070 hom 79 het 33 0 26 7 TACTC 1 2 243236 CASAVA_Build 11 29388775 4D TTTGAAATAC TAAG/---- TAAGTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TAAG 2 1 243237 CASAVA_Build 11 29394173 1I TATTTTTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 9 10 243238 CASAVA_Build 11 29406434 2D TTTATTTAAC CA/-- CAGTTGTGTG 589 het 589 ref 16 8 2 6 CA 2 1 243239 CASAVA_Build 11 29428765 2D AATATATTAC AT/-- ATATATATAT 2242 het 2242 ref 28 15 6 7 AT 7 6 243240 CASAVA_Build 11 29436476 1I ATGCTAACTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 A 8 9 243241 CASAVA_Build 11 29437119 1D CTAAGATGAA G/- GGAGGCATTG 3070 het 3070 hom 25 10 15 1 G 3 2 243242 CASAVA_Build 11 29438448 1D ATACATACAC G/- GGGGGGGGGA 3070 het 103 hom 24 2 12 10 G 10 9 243243 CASAVA_Build 11 29443366 5D ATTCATGTAA TGTAT/----- TATATCAATA 3070 het 3070 ref 41 18 21 4 TGTAT 1 0 243244 CASAVA_Build 11 29449027 2D GAGGGTAGAC AG/-- GGGGGGAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 7 AG 1 0 243245 CASAVA_Build 11 29449482 1I GCTGGGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 11 12 243246 CASAVA_Build 11 29452085 3D GGTGTCTGTC TGT/--- TGTTAGACAT 3070 het 3070 ref 46 21 18 8 TGT 2 1 243247 CASAVA_Build 11 29452835 1D TTCCCTGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 10 9 243248 CASAVA_Build 11 29455043 5D CTTTTTTATC TATCT/----- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 TATCT 1 0 243249 CASAVA_Build 11 29455575 1D CATCCAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 11 10 243250 CASAVA_Build 11 29456181 4I TTTATGAAAG ----/CTTA CTGTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 CTTA 0 1 243251 CASAVA_Build 11 29456607 1D AGCATTTCAC T/- TTTCTTAGAA 3070 het 3070 hom 52 22 26 5 T 4 3 243252 CASAVA_Build 11 29461876 2I TAATAAAGAA --/AT ATATATGTAT 2771 het 2771 ref 21 11 7 3 AT 3 4 243253 CASAVA_Build 11 29462783 3D GAAATTAAAC CTT/--- CTCTGTATAT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 CTT 1 0 243254 CASAVA_Build 11 29466892 2D TAATTAAAAC TT/-- ATATATTTTT 2962 het 746 hom 10 2 6 2 T 2 0 243255 CASAVA_Build 11 29470340 1D GCAATTCAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 A 9 8 243256 CASAVA_Build 11 29471952 1D TGAATCACCG T/- TAACATGCTT 3070 het 3070 ref 50 27 20 3 T 2 1 243257 CASAVA_Build 11 29474870 1I ATTCCACCCC -/T GATAAATGGT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 T 0 1 243258 CASAVA_Build 11 29476724 2D AATAACTCTC AT/-- GTGTGCATCT 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 AT 1 0 243259 CASAVA_Build 11 29477302 5D TTATAACAGA CAAAT/----- CAAATAATAG 3070 het 3070 ref 26 14 11 3 CAAAT 2 1 243260 CASAVA_Build 11 29479175 1I GAGTGCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2755 hom 24 9 11 4 A 13 14 243261 CASAVA_Build 11 29479949 1I AAGGAAGTCT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 6 7 243262 CASAVA_Build 11 29481158 6D TGACAGAGCG AGAGAA/------ AGAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 25 13 8 9 AGAGAA 2 1 243263 CASAVA_Build 11 29482271 1D ACTGCAACCT C/- CTCCTCCTAG 2339 het 2339 ref 22 15 6 1 C 2 1 243264 CASAVA_Build 11 29495091 1D CCCTAACTGC T/- TTCTTTTTCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 3 2 243265 CASAVA_Build 11 29566227 1D TGAGTAGGGT A/- AAAAAAAAAA 1267 het 1267 ref 42 32 3 8 A 12 11 243266 CASAVA_Build 11 29638322 1D TTTTTCAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 10 9 243267 CASAVA_Build 11 29707447 1I AAAAACCCTG -/A ACAAACTTTA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 1 2 243268 CASAVA_Build 11 29714592 1D TCTCGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 892 het 892 ref 16 8 4 4 A 13 12 243269 CASAVA_Build 11 29720621 1D TTTTGACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 11 10 T 12 11 243270 CASAVA_Build 11 29798848 1I TTTATGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3054 het 3054 ref 28 13 10 5 A 14 15 243271 CASAVA_Build 11 29828823 1D AAAAATGTCC T/- TCAAAATAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 2 1 243272 CASAVA_Build 11 29844846 4D AGGTAGCAGT GGAA/---- GGAACCTGGA 3070 hom 97 het 35 0 30 6 GGAA 2 1 243273 CASAVA_Build 11 29848601 3I ATCACTATTC ---/TAA TAATATTTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAA 1 2 243274 CASAVA_Build 11 29861023 9D AGTAAAAAGA TGAATAAAT/--------- TAAATGAATA 3070 het 3070 ref 29 14 14 3 TGAATAAAT 1 0 243275 CASAVA_Build 11 29863316 2D ATGTGTACAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 87 het 43 0 29 14 TA 6 5 243276 CASAVA_Build 11 29864093 1D CATTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 T 11 10 243277 CASAVA_Build 11 29872293 2D CGAGTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 511 hom 35 7 12 16 T 13 11 243278 CASAVA_Build 11 29873715 1I TTTGTATTGC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 7 8 243279 CASAVA_Build 11 29878103 1I CCAAACAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 37 1 26 10 A 11 12 243280 CASAVA_Build 11 29882208 1I AAGAGCTGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 242 hom 34 1 26 7 A 9 10 243281 CASAVA_Build 11 29884143 1I ATTCTGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1246 hom 32 4 18 10 A 11 12 243282 CASAVA_Build 11 29889691 3I GTGTGGATGA ---/CTT CTTATTTTCT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 CTT 1 2 243283 CASAVA_Build 11 29892259 1I TTAGGACACC -/A AAAACATTAA 3070 hom 108 het 47 0 37 10 A 4 5 243284 CASAVA_Build 11 29897725 1D ACCACTTCCC A/- AGGGCAAGTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 2 1 243285 CASAVA_Build 11 29900017 1D TCAAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2580 hom 32 9 13 10 A 15 14 243286 CASAVA_Build 11 29900098 2I TCTATAAAAC --/AG AAACAATGTC 3070 hom 111 het 44 0 36 8 AG 0 1 243287 CASAVA_Build 11 29924081 1I TTATAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 12 0 A 10 11 243288 CASAVA_Build 11 29933014 1D TCACTGTACT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 10 9 243289 CASAVA_Build 11 29934275 1I AGCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1373 hom 43 4 20 19 A 11 12 243290 CASAVA_Build 11 29935703 1I GGTGTCTCTG -/T CTCCCCCCTC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 0 1 243291 CASAVA_Build 11 29943429 4I TTGCAGAATT ----/AAAA AAAAAAAAAA 2002 het 2002 ref 25 14 7 4 A 12 16 243292 CASAVA_Build 11 29950611 1D CTGGCCTAGG C/- ACCACCCTCA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 C 1 0 243293 CASAVA_Build 11 29960039 1D GAAGACTGCT A/- AAACACCAGT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 4 3 243294 CASAVA_Build 11 29973641 1D AGAATAGTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 9 8 243295 CASAVA_Build 11 29996120 1D GGTTTCTTTT A/- CGGGCCTCTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 A 1 0 243296 CASAVA_Build 11 29998230 1I CCCAAGGAGA -/G GAGAGCACTG 3070 hom 132 het 48 0 44 4 G 1 2 243297 CASAVA_Build 11 30003494 2I AGAGTGATTC --/AA AAGTTAGTAA 3070 het 3070 ref 49 22 24 3 A 2 4 243298 CASAVA_Build 11 30003629 17I AATTCTAGGC -----------------/TCAGTCACTCTTCTCAG TGCGGGGAAA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 TCAGTCACTCTTCTCAG 0 1 243299 CASAVA_Build 11 30005621 1I ATTCAGAGAG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 7 8 243300 CASAVA_Build 11 30009477 1I ATTTTAATAG -/A AATTTTTGAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 3 243301 CASAVA_Build 11 30049199 2I CCATGGCTGG --/TA TGCCTATTGC 3070 hom 135 het 52 0 45 7 TA 0 1 243302 CASAVA_Build 11 30050417 1I GCTCCTTCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 351 hom 43 1 38 4 A 9 10 243303 CASAVA_Build 11 30055197 1D ATAACCATAG T/- TTTTTCCTTC 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 6 5 243304 CASAVA_Build 11 30063317 1I ACTCCAGCCT -/G GGGCTACAAA 3070 hom 39 het 16 0 12 4 G 3 4 243305 CASAVA_Build 11 30086319 2I AAGGCAACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 44 0 33 11 A 12 14 243306 CASAVA_Build 11 30087918 1I TACACCACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 208 hom 51 3 29 19 T 13 14 243307 CASAVA_Build 11 30099329 3D CTAGACAAGA TGT/--- TGTGCTGAGT 3070 hom 157 het 55 0 53 2 TGT 2 1 243308 CASAVA_Build 11 30171332 1D AAAACAAAGA T/- TTTTTTTTTT 2986 het 2922 hom 39 16 10 13 T 15 14 243309 CASAVA_Build 11 30177309 2I GCAGTAATTC --/TT TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 6 8 243310 CASAVA_Build 11 30195054 1I AGCACTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 11 12 243311 CASAVA_Build 11 30195349 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2841 het 1236 hom 20 5 10 5 T 13 12 243312 CASAVA_Build 11 30203036 8D CATATATAAA ATATATAT/-------- ATATATATAT 1471 hom 7 het 4 0 3 1 AT 11 7 243313 CASAVA_Build 11 30204736 3I TCATCTTTCA ---/AAG AAGAAGAACA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 AAG 2 3 243314 CASAVA_Build 11 30205058 1I GACCTTGTCT -/A AAAAAAAAAA 2944 het 2944 ref 40 22 9 9 A 11 12 243315 CASAVA_Build 11 30222051 2I AATTCTTTAA --/CT CTCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 CT 4 5 243316 CASAVA_Build 11 30228010 1I CATCTGAAAA -/G ACTACCAGAA 3070 het 3070 ref 53 27 22 4 G 0 1 243317 CASAVA_Build 11 30228835 1D CTGAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 7 A 11 10 243318 CASAVA_Build 11 30228950 5D AAAAAAATTG AAATT/----- AAATTGAGGT 3070 het 3070 hom 25 11 14 3 AAATT 2 1 243319 CASAVA_Build 11 30236092 12D GCCTGCAATA GTACTATGAAAG/------------ GTACTAAGAA 3070 het 3070 ref 43 24 18 9 GTACTATGAAAG 1 0 243320 CASAVA_Build 11 30237699 2D AATGCAGTAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 AT 6 5 243321 CASAVA_Build 11 30246166 1D ATTTGTCTAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 2810 hom 17 7 9 1 T 8 7 243322 CASAVA_Build 11 30257438 3I TGTAAGTATA ---/CTC CTCTTTTTGT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 CTC 1 2 243323 CASAVA_Build 11 30268998 1D ATTTATAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 9 8 243324 CASAVA_Build 11 30272520 1D2M40I ACAGTAAAAA GCT----------------------------------------/-CTACTGATACATACTGATACATGTATGTATGTACATACATAC ATAAACTACT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 N/A 0 0 243325 CASAVA_Build 11 30274416 1D GAGATAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 12 11 243326 CASAVA_Build 11 30279185 7I AGTTTGCAAG -------/TGGTACC TTTGCTGAAG 3070 het 3070 ref 35 21 13 2 TGGTACC 0 1 243327 CASAVA_Build 11 30280469 1I TTGTGCTTGT -/A TTTTTAATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 1 243328 CASAVA_Build 11 30304929 20D AACTACCTTG ACTCAGGTGTGTGCAGTTTT/-------------------- ACTCAGGTGT 3070 het 3070 ref 55 27 20 18 ACTCAGGTGTGTGCAGTTTT 2 1 243329 CASAVA_Build 11 30309050 2I AAAATAAAAC --/AG GGAAAATTTG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 AG 0 1 243330 CASAVA_Build 11 30314486 2D TGTCTCAACA CT/-- CTATAGAGTT 3045 het 3045 ref 33 20 9 5 CT 2 1 243331 CASAVA_Build 11 30314609 2D ATTTTATCTC CT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 CT 1 0 243332 CASAVA_Build 11 30315758 1I AGTGATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 14 16 11 A 12 13 243333 CASAVA_Build 11 30319526 1D CATAGTGAAA C/- CCCCGTCTCT 785 hom 5 het 4 0 2 2 C 5 4 243334 CASAVA_Build 11 30346388 1D GTCTGTGTCC A/- AAAAAACTTG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 7 6 243335 CASAVA_Build 11 30348280 25I AGTTTTGATT -------------------------/TTTTTCCTTAAACCATCCCAGATGG TTTTTACTTA 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 TTTTTCCTTAAACCATCCCAGATGG 0 1 243336 CASAVA_Build 11 30350276 5I ATATAAAAAT -----/TACTC CAACTGTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 TACTC 0 1 243337 CASAVA_Build 11 30350775 1D TGTTCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 18 11 T 12 11 243338 CASAVA_Build 11 30355545 1I TTCCTTGACT -/G GGCTGGCTCA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 G 2 3 243339 CASAVA_Build 11 30357749 1D AACTTTTCTG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 T 8 7 243340 CASAVA_Build 11 30358907 1I GTAATAGTAA -/T TAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 1 2 243341 CASAVA_Build 11 30362276 1I TGCTGATTAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 59 22 28 9 A 6 7 243342 CASAVA_Build 11 30377286 1D GATCCAATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 10 9 243343 CASAVA_Build 11 30378886 1I TCATCAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2445 hom 32 10 15 7 T 15 16 243344 CASAVA_Build 11 30388574 1D AGGGGAGAGG A/- AGTAAGAAGA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 2 1 243345 CASAVA_Build 11 30405768 6I TCATGAGAAA ------/ATGTGT ATTCCTTGAT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 ATGTGT 0 1 243346 CASAVA_Build 11 30412975 1D AAAGTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 57 22 30 5 T 11 10 243347 CASAVA_Build 11 30414446 3I AAACTTTAGA ---/GAG CATCAGTCAC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 GAG 0 1 243348 CASAVA_Build 11 30423324 1D GAGACTCCCC G/- GGCTGAGGAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 G 3 2 243349 CASAVA_Build 11 30432683 1D GACCTAGTTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 9 8 243350 CASAVA_Build 11 30437568 1D AACATCCCAG C/- CTAGAAAATA 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 C 2 1 243351 CASAVA_Build 11 30441974 2D ACTGTTATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 8 20 2 TA 8 7 243352 CASAVA_Build 11 30446135 1D TCCCCAGAGG C/- CCCCCGATGC 3070 het 2766 hom 35 8 20 7 C 6 5 243353 CASAVA_Build 11 30450136 1D AATCCCAGCT A/- CAGTGCACGC 3070 het 3070 ref 43 20 20 4 A 1 0 243354 CASAVA_Build 11 30457765 1D CCTCTAAAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 2592 hom 25 7 16 2 A 9 8 243355 CASAVA_Build 11 30467171 2D TTCTTCTTCT TC/-- TCCTTTTTTT 2695 het 958 hom 46 8 11 27 TC 2 1 243356 CASAVA_Build 11 30469015 1D ATTATAGCTA T/- TTTCCTAGTC 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 T 4 3 243357 CASAVA_Build 11 30470837 4D CGTACCTTAC TAAA/---- TAAAGCTAGG 3070 het 3070 ref 44 21 20 5 TAAA 2 1 243358 CASAVA_Build 11 30471788 1I ATTTTAAAGA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 1 2 243359 CASAVA_Build 11 30475003 1D ATGTTTTGTA T/- ATTACTGCCT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 1 0 243360 CASAVA_Build 11 30476671 1D AACTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2449 het 2061 hom 27 11 8 8 A 17 16 243361 CASAVA_Build 11 30496148 1I ATCCATGACA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 T 5 6 243362 CASAVA_Build 11 30506262 2I TATACACAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 46 23 10 13 AC 7 8 243363 CASAVA_Build 11 30525940 14D CTGACAGGTG TTTGCATATCTGTA/-------------- TTTGAGTCAA 3070 het 3070 ref 27 17 12 4 TTTGCATATCTGTA 1 0 243364 CASAVA_Build 11 30526342 1I AGTAACTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 10 11 243365 CASAVA_Build 11 30532728 4D ATTCTCGTGC CTCA/---- CTCAGCCTCC 3070 hom 75 het 29 0 25 5 CTCA 2 1 243366 CASAVA_Build 11 30558310 1D AATGCTTTTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 148 het 52 0 50 2 T 8 7 243367 CASAVA_Build 11 30573278 2I GACTCTATAC --/AT AAAGGCAACG 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 AT 0 1 243368 CASAVA_Build 11 30582003 1I TAAGATATGC -/A AAAAAAAAAA 2008 het 2008 ref 45 15 14 16 A 12 13 243369 CASAVA_Build 11 30590291 1I TACTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 T 10 11 243370 CASAVA_Build 11 30594325 1I CATGGCCGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 808 hom 34 4 21 9 T 13 14 243371 CASAVA_Build 11 30596356 5D GTGGACTTTA AGTAT/----- AGAAGTCATG 3070 hom 141 het 50 0 46 6 AGTAT 1 0 243372 CASAVA_Build 11 30599193 1D AATTAAATCA G/- AATGCCTCAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 0 243373 CASAVA_Build 11 30601688 2D TTATACATAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 AC 9 8 243374 CASAVA_Build 11 30610779 1D GACCAAAAAG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 8 7 243375 CASAVA_Build 11 30616866 7I TTTAAAGAAA -------/AGCTGGC TGTGAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 AGCTGGC 0 1 243376 CASAVA_Build 11 30619625 1D GCACCTGTGA G/- GTTACTTTTG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 G 2 1 243377 CASAVA_Build 11 30623872 1D TGCTTCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 22 10 A 11 10 243378 CASAVA_Build 11 30627561 4D ATGATCTTGG CTCA/---- CTGCAACATC 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 CTCA 1 0 243379 CASAVA_Build 11 30637962 1D GTTGTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3022 hom 21 7 8 6 T 11 10 243380 CASAVA_Build 11 30639379 1D CGGCACCCAA G/- GGTCCAGAGG 3070 hom 120 het 42 0 41 2 G 3 2 243381 CASAVA_Build 11 30700697 1I ACCTAAGATA -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 6 7 243382 CASAVA_Build 11 30706078 1D GAAAGCAACA C/- CCCTGATTTC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 4 3 243383 CASAVA_Build 11 30706669 10D TACTAAAAAT ACAAAACAAA/---------- ACAAAACAAA 3070 hom 42 het 14 0 15 0 ACAAA 6 4 243384 CASAVA_Build 11 30707964 1D ATATCCAGGG C/- CCACTTGTCC 3070 hom 129 het 47 0 44 5 C 3 2 243385 CASAVA_Build 11 30708102 2D GCAAAGACAC AT/-- GTGTGTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 AT 1 0 243386 CASAVA_Build 11 30711647 4D CAACATACAT AAAG/---- AAAGAACTAG 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 AAAG 2 1 243387 CASAVA_Build 11 30713710 4D AAATATAGAC AAAT/---- AAATTATAGC 3070 hom 88 het 35 0 30 6 AAAT 2 1 243388 CASAVA_Build 11 30715122 1D CATGATCTTT G/- GTTTCCATGG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 2 1 243389 CASAVA_Build 11 30723030 1I ATATTCTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 10 11 243390 CASAVA_Build 11 30723552 2I GGGTTTGGTC --/AA GAGGAAGGAC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 0 2 243391 CASAVA_Build 11 30733591 1I GGGCAAAGAG -/A AAAATGGCCA 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 A 4 5 243392 CASAVA_Build 11 30734367 1D AAAATAACAT C/- AATCATATCT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 C 1 0 243393 CASAVA_Build 11 30746154 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 23 1 15 7 A 14 13 243394 CASAVA_Build 11 30748179 1D GCTTGTGTGT G/- GTGTATATAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 1 243395 CASAVA_Build 11 30762806 2D AAGTCAAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 14 13 A 14 12 243396 CASAVA_Build 11 30763957 1D TCCATCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2647 het 1394 hom 22 7 8 9 A 12 11 243397 CASAVA_Build 11 30768334 4D GGAAGGAAGG AGAA/---- AGAAAGAGAA 2615 het 2615 ref 31 15 8 9 AGAA 2 1 243398 CASAVA_Build 11 30784881 1D GGTTTCTTTT G/- GCTATGCAGA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 G 2 1 243399 CASAVA_Build 11 30790434 1D TGGGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 A 11 10 243400 CASAVA_Build 11 30798032 18D CCATTATTTT CTTTGAGAGTAAGGGCTC/------------------ CTTCATTTTG 3070 het 3070 hom 41 23 21 4 CTTTGAGAGTAAGGGCTC 1 0 243401 CASAVA_Build 11 30802066 1I AATGTATCCA -/T TAACCATTAC 3070 het 3070 ref 59 31 21 7 T 1 2 243402 CASAVA_Build 11 30815817 2I GCATCTTCTC --/AT ATGTTTATGC 3070 het 3070 ref 49 21 23 5 AT 1 2 243403 CASAVA_Build 11 30816486 1I ATTTCTATTG -/T GATTTCCTCT 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 T 0 1 243404 CASAVA_Build 11 30826862 1I CCTAGACCCG -/C CCCCCCCCAG 2560 het 2560 ref 30 16 10 4 C 8 9 243405 CASAVA_Build 11 30842873 1I GTGTATATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 T 10 11 243406 CASAVA_Build 11 30858103 2I TACTGCACAC --/AT GTTTGCTCAC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 AT 0 1 243407 CASAVA_Build 11 30860572 1I TTTTTATATA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 7 8 243408 CASAVA_Build 11 30877540 12D TAAAACAATA TTTATATATTGT/------------ TTTATATAGT 3070 het 3070 ref 24 15 8 5 TTTATATATTGT 1 0 243409 CASAVA_Build 11 30886279 2D ATGGAAAACC CA/-- CACATTGCCT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 CA 3 2 243410 CASAVA_Build 11 30910338 1D ATCATTCTCG A/- AAAAATAGAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 6 5 243411 CASAVA_Build 11 30911115 1D ATTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 T 12 11 243412 CASAVA_Build 11 30917068 1D GTGTACTCAA C/- CCCCCTTATT 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 C 6 5 243413 CASAVA_Build 11 30943728 1I GTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1183 hom 23 4 13 6 T 9 10 243414 CASAVA_Build 11 30957281 1I CTGGGATTCA -/C CTCCTCCACA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 1 2 243415 CASAVA_Build 11 30971202 1I ACTCCACATG -/A AAAAAAAATT 3070 het 2841 hom 17 7 7 3 A 8 9 243416 CASAVA_Build 11 30974594 1D CCCAGTGCAA G/- AGTATTGGGA 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 G 1 0 243417 CASAVA_Build 11 30976661 1D ATTTTCCTTG C/- AAAAGAATTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 1 0 243418 CASAVA_Build 11 30978854 1D TACTATGTTT A/- AAAAAAAAAG 1100 het 1100 ref 29 21 3 5 A 10 9 243419 CASAVA_Build 11 31008263 1I ATACAAATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 9 10 243420 CASAVA_Build 11 31008984 1D CCAGGGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 11 10 243421 CASAVA_Build 11 31012421 1I TTCATAAAGT -/A AAAAAAGTTA 2206 het 2206 ref 31 18 6 7 A 6 7 243422 CASAVA_Build 11 31016196 5I GGGGCCTGTT -----/GTGGG GTTGGGGGAG 1439 het 1307 hom 18 7 3 8 GTGGG 0 1 243423 CASAVA_Build 11 31021947 1I TTTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2724 het 2724 ref 30 13 10 7 T 12 13 243424 CASAVA_Build 11 31056358 1D TTCTGCCTGC A/- AAAAAAGATC 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 7 6 243425 CASAVA_Build 11 31060720 6D ATAGATATAG ATATCT/------ ATATCTATAC 3070 het 3070 ref 43 25 18 3 ATATCT 2 1 243426 CASAVA_Build 11 31067736 1I TGCTCCGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 15 14 T 14 15 243427 CASAVA_Build 11 31079490 1D AGCTGGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 11 10 243428 CASAVA_Build 11 31089102 2D CTCGCTGGGG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 A 11 9 243429 CASAVA_Build 11 31094366 1I CAAAATTTAC -/T CTTATATCTA 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 0 1 243430 CASAVA_Build 11 31095504 1I TGATTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 15 11 A 13 14 243431 CASAVA_Build 11 31095829 1I ATGTTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 10 11 243432 CASAVA_Build 11 31107298 2I TATGACCTAA --/AT ATGTATTATC 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 AT 1 2 243433 CASAVA_Build 11 31116222 1D GCAACTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 44 18 25 1 A 9 8 243434 CASAVA_Build 11 31120612 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 TG 10 9 243435 CASAVA_Build 11 31128873 1D ATTGCTTTTT C/- CCTTATATCT 3070 het 3039 hom 23 8 11 4 C 3 2 243436 CASAVA_Build 11 31135586 2D ATGAATATAC AT/-- ATATATATAT 2849 het 1698 hom 11 4 7 1 AT 6 5 243437 CASAVA_Build 11 31136217 5I CAAAACATTG -----/TTTTA TTTTATTTTA 3070 het 2684 hom 19 7 9 3 TTTTA 3 4 243438 CASAVA_Build 11 31146913 2D GTAAATGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 GT 7 6 243439 CASAVA_Build 11 31191996 3D ATTAGAGAAA AAG/--- AAGTATTTAT 3070 het 3070 hom 38 15 20 6 AAG 2 1 243440 CASAVA_Build 11 31192241 1D TTGTAAAAAG T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 29 7 19 3 T 8 7 243441 CASAVA_Build 11 31209830 1I GAGGGAACAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 9 10 243442 CASAVA_Build 11 31214302 3D TTCAATATCA CTT/--- CTTATTTTAT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 CTT 2 1 243443 CASAVA_Build 11 31228426 1I AAAACAAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 9 10 243444 CASAVA_Build 11 31228882 1D ATCCCTAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1547 hom 26 6 9 11 T 15 14 243445 CASAVA_Build 11 31235657 1D GAAAGTAAAG T/- GGCTTGAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 11 3 T 1 0 243446 CASAVA_Build 11 31254278 1D TAACTGACAG A/- AAAATACATT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 5 4 243447 CASAVA_Build 11 31261489 1D TAAACCCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 11 10 243448 CASAVA_Build 11 31264330 1I GTGGGGCCTA -/G GAGTCTGATT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 G 1 2 243449 CASAVA_Build 11 31274976 1I AAAACAGCAT -/G GGGGGGGACC 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 G 7 8 243450 CASAVA_Build 11 31304496 1I GCTTTACCAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 8 9 243451 CASAVA_Build 11 31318350 1D CCCAGGATAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 9 8 243452 CASAVA_Build 11 31327160 1I ATTTTTTTTT -/A AAGTGGGGAG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 2 3 243453 CASAVA_Build 11 31329051 4I GAAATGCAAA ----/TATT TACATTTTTT 3070 het 3070 ref 27 18 9 0 TATT 0 1 243454 CASAVA_Build 11 31364577 1D AGGCCCCCCA T/- TCTAGGCTGT 3070 het 3070 hom 44 14 22 9 T 2 1 243455 CASAVA_Build 11 31381010 3D GTACTGTGAC ATT/--- ATAACAGCTA 3070 het 3070 ref 46 28 13 7 ATT 1 0 243456 CASAVA_Build 11 31388193 1I TTTTAGTAAA -/G ACTGGGTTTC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 0 1 243457 CASAVA_Build 11 31404485 1D24M1D GAAGGTTGGA TTTTTTTTTTCTCTTGACAACATTTA/-TTTTTTTTTCTCTTGACAACATTT- AAAAAAAAAG 2816 het 2816 ref 23 15 6 8 N/A 0 0 243458 CASAVA_Build 11 31428537 1D TTAATCTTAA C/- TAAGTTCAGT 3070 het 3070 ref 46 28 17 1 C 1 0 243459 CASAVA_Build 11 31436298 1I GAAAGTAGTA -/T TAAATAAACT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 1 2 243460 CASAVA_Build 11 31464692 2D ACATTTAATA TT/-- GTTACTGTCA 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 T 2 0 243461 CASAVA_Build 11 31467725 5D TCCTTAGTCT TCTTA/----- TCTTATCTCT 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 TCTTA 2 1 243462 CASAVA_Build 11 31474250 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAAAGC 3070 het 2338 hom 34 12 15 8 C 0 1 243463 CASAVA_Build 11 31475112 5D TGATAATCTT ATATC/----- ATATACTATA 2272 het 2272 ref 15 8 6 2 ATATC 1 0 243464 CASAVA_Build 11 31515526 1I TTGCTGTAGC -/T TTATAGTAAG 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 2 3 243465 CASAVA_Build 11 31534591 2D TATACACGTG CA/-- CACACAATTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 CA 4 3 243466 CASAVA_Build 11 31538110 1D TTTTCAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 A 9 8 243467 CASAVA_Build 11 31539560 7D GAAGAGCACA TTATTTT/------- TTATTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 TTATTTT 3 2 243468 CASAVA_Build 11 31545160 1D TCTTTATTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 10 9 243469 CASAVA_Build 11 31575720 1D CAGTAATGAA C/- CTAAACTCTA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 C 2 1 243470 CASAVA_Build 11 31578342 3D CTCTTTTCTT CAC/--- CATGTGATTT 3070 het 3070 hom 44 20 17 8 CAC 1 0 243471 CASAVA_Build 11 31586163 1D GAGTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 15 14 243472 CASAVA_Build 11 31587140 1D CCTTACCTTG C/- CAAGGTTTTG 3070 het 3070 hom 46 18 22 7 C 2 1 243473 CASAVA_Build 11 31588451 5D TCATTTTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 TTTGT 4 3 243474 CASAVA_Build 11 31601165 3D TAATATAAAA GTT/--- GTTGAAAATA 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 GTT 2 1 243475 CASAVA_Build 11 31601999 1D TGAAAACAAA T/- AACTCAATTA 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 T 1 0 243476 CASAVA_Build 11 31605378 1D CAAATTCTCT G/- GGGGGGGGGG 1856 het 112 hom 11 2 5 4 G 11 10 243477 CASAVA_Build 11 31612754 7D AGCCTATCTA GATAACT/------- GATTAAATAA 3070 het 3070 ref 39 23 14 4 GATAACT 1 0 243478 CASAVA_Build 11 31618020 1D TGTAGTTCCT A/- ATAATGGTAG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 2 1 243479 CASAVA_Build 11 31632373 1I CAAAAGACTT -/A ACACTGTAAA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 A 1 2 243480 CASAVA_Build 11 31633117 1D ATTCCTAGAT A/- ACACTGCAGC 3070 het 3070 ref 62 31 24 7 A 2 1 243481 CASAVA_Build 11 31633503 1D AAGAGATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 A 11 10 243482 CASAVA_Build 11 31636486 2D GATGTTATTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 10 9 8 TA 7 6 243483 CASAVA_Build 11 31639800 1D TGTGACCATT A/- AAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 7 6 243484 CASAVA_Build 11 31661264 1D TTGTATCCTG T/- TTTATTAACA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 4 3 243485 CASAVA_Build 11 31661942 2D CAAAATTGAT AA/-- GAGGTAGAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 A 2 0 243486 CASAVA_Build 11 31664055 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 2988 het 1552 hom 28 8 8 12 A 17 16 243487 CASAVA_Build 11 31664993 1I ACCCTGCTTC -/A AAAAAAAAAA 2861 het 2690 hom 32 9 11 12 A 13 14 243488 CASAVA_Build 11 31667569 1D ACCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2040 het 2040 ref 25 9 6 10 A 17 16 243489 CASAVA_Build 11 31676081 1D CAGAAAATGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 9 8 243490 CASAVA_Build 11 31683975 4D TTTTTTAAAT TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 TTTG 2 1 243491 CASAVA_Build 11 31688123 1I CCTTGCACTT -/A ATCACAGTCT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 1 2 243492 CASAVA_Build 11 31698663 1I TCTCTTTCAG -/T TGCTTAGCAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 2 243493 CASAVA_Build 11 31713284 1I ATCCATTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 19 17 16 A 14 15 243494 CASAVA_Build 11 31725050 4D AAAAAATAAA AAAT/---- AAAACAAATT 3070 het 461 hom 16 1 14 2 AAAT 1 0 243495 CASAVA_Build 11 31725158 4D AGACTAACAC TGTG/---- TGTGTGTGTG 2353 het 2353 ref 37 16 6 15 TG 10 8 243496 CASAVA_Build 11 31730411 1I TTTTAAAAAA -/G CAAATTTCCT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 G 0 1 243497 CASAVA_Build 11 31741218 1I TATAATGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 11 12 243498 CASAVA_Build 11 31764812 4I TAGTGATGAT ----/AAAA AGTAAGAAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 1 5 243499 CASAVA_Build 11 31765162 4I TAATAAACAA ----/AAAT AAATTATTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAAT 1 2 243500 CASAVA_Build 11 31768385 1D AAAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 25 7 A 10 9 243501 CASAVA_Build 11 31770307 1I GCCTTGAGGG -/C CCTGCCAGAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 C 2 3 243502 CASAVA_Build 11 31776540 1I CTTTTGGAGT -/A ATGGACTCTT 3070 hom 54 het 22 0 15 7 A 1 2 243503 CASAVA_Build 11 31781233 1I GCAGCCCAGT -/C CCAAGCAACC 3070 hom 119 het 46 0 37 9 C 2 3 243504 CASAVA_Build 11 31794829 1I AGCAGGGGGC -/G GCCACCGCTC 2900 hom 38 het 17 0 11 6 G 1 2 243505 CASAVA_Build 11 31797249 1I CTGGGCCGGA -/G GAGGGTCCTA 3070 hom 53 het 23 0 15 8 G 1 2 243506 CASAVA_Build 11 31820216 1I ACAGAAGGGA -/G GTTCCCTGCA 3070 hom 71 het 27 0 22 5 G 1 2 243507 CASAVA_Build 11 31824251 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2839 het 2839 ref 33 19 7 7 A 10 11 243508 CASAVA_Build 11 31832079 1D TTTCTAGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2816 hom 34 10 10 14 A 14 13 243509 CASAVA_Build 11 31838735 11D TTAGCCTGCT GTAGCCTGCTG/----------- TAGCCTGCTA 3070 het 3070 hom 40 13 27 4 GTAGCCTGCTG 1 0 243510 CASAVA_Build 11 31844094 1I TCTTGCTGAG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 7 8 243511 CASAVA_Build 11 31890049 1I TTTGAGACTA -/C AGGGTTTCTA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 C 0 1 243512 CASAVA_Build 11 31913061 1D GGGTTAAAAG C/- CCCCCCATGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 C 7 6 243513 CASAVA_Build 11 31942155 1D CCACATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 36 1 24 11 T 13 12 243514 CASAVA_Build 11 31944351 2D62M2I ATATAATATA TTATAATATAATTATATTATTATAATTATTTTATAATATAATCATAATTATAATATATACATAA--/--ATAATATAATTATATTATTATAATTATTTTATAATATAATCATAATTATAATATATACATAAAT ATGTTATATT 1931 hom 10 het 4 0 4 3 N/A 0 0 243515 CASAVA_Build 11 31945585 1D CAGTCTGGGT C/- CCCAGGTGAG 3070 hom 50 het 32 0 22 11 C 4 3 243516 CASAVA_Build 11 31952784 1I CAGTGCTGAG -/A AAAAAAAAAA 2270 het 2270 ref 44 29 6 9 A 13 14 243517 CASAVA_Build 11 31953910 1D CATGCACCCC T/- AATAGCAAAA 3070 hom 152 het 55 0 50 6 T 1 0 243518 CASAVA_Build 11 31955782 1I TGGCGAACCA -/C CTAAAGATGA 3070 hom 93 het 32 0 30 2 C 1 2 243519 CASAVA_Build 11 31958222 1D TAGAGGTGGT G/- GTTGAGCAGC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 G 2 1 243520 CASAVA_Build 11 31963473 1I ATGTTTAATG -/T TTTTTTTTTT 2115 het 2115 ref 34 15 8 11 T 11 12 243521 CASAVA_Build 11 32026422 1I CTCAATATTT -/A TTAGGATTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 243522 CASAVA_Build 11 32041030 1D TTCTTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 2957 het 1025 hom 19 5 9 5 A 17 16 243523 CASAVA_Build 11 32073369 1I TGTTTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 2720 het 2720 ref 32 13 12 7 T 15 16 243524 CASAVA_Build 11 32074737 1I AAAAAAAAAA -/C TCACTTATCT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 C 0 1 243525 CASAVA_Build 11 32079377 1D CCCAGCCCAA C/- CCCCCGCTAG 3070 het 1945 hom 22 6 12 4 C 6 5 243526 CASAVA_Build 11 32080393 1I AAAATGGGGG -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 A 7 8 243527 CASAVA_Build 11 32085181 1D AGCATATGGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 9 8 243528 CASAVA_Build 11 32091788 1I CTGAATGTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 8 9 243529 CASAVA_Build 11 32110097 44D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAC/-------------------------------------------- ACACACTGTG 2964 hom 21 het 6 0 8 1 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAC 1 0 243530 CASAVA_Build 11 32114215 1D TGGTTTTTTT C/- CCCCCCCCTC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 C 9 8 243531 CASAVA_Build 11 32116724 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 22 1 18 3 A 11 10 243532 CASAVA_Build 11 32123917 2D ATAAAGAAAA AG/-- AGGTTTAATG 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 AG 2 1 243533 CASAVA_Build 11 32134200 1I ATTTTTCTTG -/T TTACATTGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 3 243534 CASAVA_Build 11 32138176 1I AGATTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 1673 het 1673 ref 20 9 4 7 A 15 16 243535 CASAVA_Build 11 32187073 1D CAAGAAGGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 10 9 243536 CASAVA_Build 11 32200811 1D GTCTCTAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 A 8 7 243537 CASAVA_Build 11 32202643 2D CTCCTGCCTC CT/-- CTCTTATCTC 2344 het 2344 ref 31 18 9 4 CT 3 2 243538 CASAVA_Build 11 32205696 1I CCCAACAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 29 14 5 A 9 10 243539 CASAVA_Build 11 32208636 1D CTAAGACCTT G/- GTCATAAACT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 G 2 1 243540 CASAVA_Build 11 32221795 1D CATTTTTTTC T/- GACATAAACA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 T 1 0 243541 CASAVA_Build 11 32221938 1I AAAATCTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 11 12 243542 CASAVA_Build 11 32223783 8I GTAATAAGTA --------/TCCCCAGG TCCCCAGATA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 TCCCCAGG 0 1 243543 CASAVA_Build 11 32298471 4I CCTTCATTTC ----/TAAA TAGAGGGGTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 TAAA 0 1 243544 CASAVA_Build 11 32305437 2D TTGATCTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 13 12 T 14 12 243545 CASAVA_Build 11 32323648 1D TTGCTTGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 T 10 9 243546 CASAVA_Build 11 32338962 1I ATCCTTTTAA -/T TTTTTTATTG 3070 het 2038 hom 26 5 17 4 T 6 7 243547 CASAVA_Build 11 32384754 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 T 1 0 243548 CASAVA_Build 11 32433104 1D TACCATACCA T/- TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 32 22 4 6 T 11 10 243549 CASAVA_Build 11 32479934 4I TCGAAAACAT ----/TAAA TAAACATTAT 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 TAAA 1 2 243550 CASAVA_Build 11 32484095 1D TCATACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 12 11 243551 CASAVA_Build 11 32489858 1I AGATAAGAGT -/A AAAAAAAAAA 2570 het 2570 ref 40 21 10 9 A 14 15 243552 CASAVA_Build 11 32511318 3D CCCTCTTGGG AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 A 12 9 243553 CASAVA_Build 11 32520742 1D AGGAGGCCAA G/- GGGGGGGTGG 3051 het 872 hom 17 4 8 6 G 8 7 243554 CASAVA_Build 11 32524575 1D AATTTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 2265 het 2265 ref 21 11 6 4 T 13 12 243555 CASAVA_Build 11 32534787 1D CCTCAGTAAG T/- TTTCCACTAT 3070 het 3070 ref 56 28 25 3 T 4 3 243556 CASAVA_Build 11 32536433 7D ACGATAGATT AGCACTC/------- AGCACTCAGC 3070 hom 91 het 36 0 28 9 AGCACTC 2 1 243557 CASAVA_Build 11 32542917 1I TTAATAAATC -/T GCAAAATTTC 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 T 0 1 243558 CASAVA_Build 11 32552612 1D AGACAATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 A 13 12 243559 CASAVA_Build 11 32563965 2D TGGCTTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 2092 het 27 hom 16 1 5 11 T 12 10 243560 CASAVA_Build 11 32571929 1I CTTAAAAATA -/T TTTTAAATGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 4 5 243561 CASAVA_Build 11 32575466 1D TTTTCCCCCC T/- ACTATACTAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 1 0 243562 CASAVA_Build 11 32579624 5D AGCATTCTTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2956 het 850 hom 25 8 11 7 A 22 17 243563 CASAVA_Build 11 32583929 1D ATTTTAGTTC T/- AGCTGTTTTC 3070 het 3070 hom 36 9 17 11 T 1 0 243564 CASAVA_Build 11 32584136 1D ATTGGATATA T/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 1 0 243565 CASAVA_Build 11 32585771 1I GTTAAGACTT -/A AGATTTTCCA 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 A 1 2 243566 CASAVA_Build 11 32585934 1D TGGAGACTGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 183 hom 32 2 19 11 A 9 8 243567 CASAVA_Build 11 32587720 1D AGTTCCAAAG T/- TGCTTCCACA 2576 het 2576 ref 24 12 7 5 T 2 1 243568 CASAVA_Build 11 32597390 2D GGTGTTTGCT GA/-- GTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 GA 1 0 243569 CASAVA_Build 11 32597777 6D CCTGGGTGAC AGAGGG/------ AGACCCTGTT 3070 het 1784 hom 23 5 11 8 AGAGGG 1 0 243570 CASAVA_Build 11 32613304 1I CCAAATAAAA -/C CCCACAGACT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 C 3 4 243571 CASAVA_Build 11 32633146 1D14M1I6M11D6M2D10M17D7M4D TTTCACTAAA ACAAGGTACTTTCCT-GACAGTTTCAAAGTTCATCCTTAAGCCTATAATTATAATTTGTTATAATTCCCTTGCAAGTTC/-TATATCAAGATAATACTACTG-----------GTCCAT--TAAAGTGTAT-----------------TTTCCCT---- CCTTGCAAGA 3070 het 3070 ref 33 28 9 19 N/A 0 0 243572 CASAVA_Build 11 32634982 2I CTTTTGACTC --/TT TTGTAGAAGT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 2 4 243573 CASAVA_Build 11 32646666 1D AGTAAATGGC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 16 17 10 A 9 8 243574 CASAVA_Build 11 32652779 2I1M4D GCTTTTCTCA --GCCTA/TGG---- TTGTAGGCTG 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 N/A 0 0 243575 CASAVA_Build 11 32675319 1I ATACTTTTTG -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 T 6 7 243576 CASAVA_Build 11 32681862 1D GAATTTCTGG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 A 7 6 243577 CASAVA_Build 11 32685826 4D ACAAAGCACA TTAT/---- TTACGGTATG 3070 het 3070 hom 37 15 17 8 TTAT 1 0 243578 CASAVA_Build 11 32690703 1I AATAAAAAAT -/A AAGAGGCATG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 3 243579 CASAVA_Build 11 32690911 2I ATATATACAC --/TG TTCATTTTAT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 TG 0 1 243580 CASAVA_Build 11 32702704 1D TTACTTCCGA T/- TTTTTAGAAT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 6 5 243581 CASAVA_Build 11 32706827 7D GTTTTGTTTG TTTTGTT/------- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 TTTTGTT 1 0 243582 CASAVA_Build 11 32718263 4D TAGTTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 18 5 TTTC 2 1 243583 CASAVA_Build 11 32721654 3I ATTTAAAGCA ---/GTG GTGTATAGAG 3070 het 3070 hom 22 7 13 2 GTG 1 2 243584 CASAVA_Build 11 32726380 1D TCTCTGGTGG T/- ATTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 1 0 243585 CASAVA_Build 11 32728160 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTGTATT 1799 het 1071 hom 9 4 5 0 T 6 5 243586 CASAVA_Build 11 32736769 1D GTAATAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 10 9 243587 CASAVA_Build 11 32738406 1I GTCTTAACTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 8 9 243588 CASAVA_Build 11 32752386 1D GTCTTATTCC T/- TGCCTTACAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 T 2 1 243589 CASAVA_Build 11 32762452 1D AGTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 A 12 11 243590 CASAVA_Build 11 32763949 2I ATTAAAATTC --/TA TCTCCTCTTA 3070 het 3070 hom 50 20 27 3 TA 0 1 243591 CASAVA_Build 11 32768800 4D TTAAGAAACA GAGG/---- GAGGATTATA 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 GAGG 2 1 243592 CASAVA_Build 11 32771741 4D TTTATTTTAT TTTA/---- TTTTTTTAGA 768 het 768 ref 21 10 4 7 TTTA 1 0 243593 CASAVA_Build 11 32779843 1D GTAGGCAATC A/- ATAGCATCTG 3070 het 3070 hom 54 19 34 1 A 2 1 243594 CASAVA_Build 11 32786765 1I CGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 2733 het 2733 ref 22 11 9 2 A 11 12 243595 CASAVA_Build 11 32789199 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAAAA 272 het 272 ref 16 6 4 7 C 1 0 243596 CASAVA_Build 11 32821853 1D CGTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3042 hom 41 15 16 10 T 14 13 243597 CASAVA_Build 11 32823794 5D GGCTAGGAAT GTCAA/----- GTCAAGCAGG 3070 het 2652 hom 17 7 9 3 GTCAA 2 1 243598 CASAVA_Build 11 32832014 3D AAGGAGATGA AGG/--- AGGAGGAGGA 2886 het 1312 hom 27 8 11 8 AGG 5 4 243599 CASAVA_Build 11 32833514 1D TTTGCCAGGC T/- ATTACATTTT 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 T 1 0 243600 CASAVA_Build 11 32847276 1I GGAAGAAGGA -/G AGAAGCAGAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 0 1 243601 CASAVA_Build 11 32851863 1D AGAAGCCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 24 21 4 A 13 12 243602 CASAVA_Build 11 32855612 1I GATGGTGTGA -/C CCCAGGTGTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 3 4 243603 CASAVA_Build 11 32861289 1D TAATGAAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 27 14 3 T 10 9 243604 CASAVA_Build 11 32866474 1D CCGAGCCCTG C/- CCCCCGGGGG 2878 hom 24 het 10 0 8 2 C 6 5 243605 CASAVA_Build 11 32902365 1D TAATTCACAC T/- GAGCAAAAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 1 0 243606 CASAVA_Build 11 32906040 1I TACAAGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 13 14 243607 CASAVA_Build 11 32930522 2D TTTTCTATTA AC/-- ACAGTGTATT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AC 2 1 243608 CASAVA_Build 11 32966538 2I GTAGCAAGAC --/GA GAGCCACAGA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 GA 1 2 243609 CASAVA_Build 11 32982318 1I CCCTCCCCCC -/T CTTCCCCTCT 3070 hom 29 het 23 0 16 7 T 0 1 243610 CASAVA_Build 11 32982818 1D AATTTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 28 1 19 9 A 12 11 243611 CASAVA_Build 11 32992898 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 10 11 243612 CASAVA_Build 11 32999372 1I ACACCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2696 het 2696 ref 28 11 9 8 A 13 14 243613 CASAVA_Build 11 33002655 5D GCAAACATCA TAGAG/----- TATAGTTCCA 3070 het 3070 hom 49 21 26 7 TAGAG 1 0 243614 CASAVA_Build 11 33004896 10D GGCTAATTTT TTTTCTTTTC/---------- TTTTCTTTTC 3070 het 385 hom 35 4 13 18 TTTTC 4 2 243615 CASAVA_Build 11 33007145 1D ACATTAAGTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 24 14 2 A 9 8 243616 CASAVA_Build 11 33010108 5D TTCAGAAAAT TTCTC/----- TTATTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 TTCTC 1 0 243617 CASAVA_Build 11 33012289 4D ACTCCTTAAT ATCA/---- ATCAGGTTTG 3070 het 3070 ref 36 16 16 5 ATCA 2 1 243618 CASAVA_Build 11 33013389 9D GCCTCTCCTG CCTCTCCTT/--------- CCTCTCCTTC 3070 hom 49 het 28 0 14 18 CCTCTCCTT 2 1 243619 CASAVA_Build 11 33014234 1D GTCAGTAATG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 28 19 7 2 T 9 8 243620 CASAVA_Build 11 33014312 1D CTATAAAATA C/- CTATGATACC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 2 1 243621 CASAVA_Build 11 33016664 1D TGTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2115 het 202 hom 35 5 10 20 T 17 16 243622 CASAVA_Build 11 33016832 1D TTTTTTGTAG T/- TTTTTTTTGT 2485 het 2485 ref 30 14 11 5 T 9 8 243623 CASAVA_Build 11 33017138 1D CCGGACTAAC T/- TTTTTTTAAA 2704 het 1758 hom 18 7 8 4 T 8 7 243624 CASAVA_Build 11 33017335 1I GGGATGCGGC -/G GCGCGTTCCG 1959 hom 29 het 15 0 8 7 G 1 2 243625 CASAVA_Build 11 33018887 11D CTCCTTTTCA CCTCCTCTCCC/----------- CCTCCTCTCC 3070 het 3070 ref 30 13 11 8 CCTCCTCTCCC 2 1 243626 CASAVA_Build 11 33021357 1D AACTCCATCT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 2149 hom 24 8 13 5 G 2 1 243627 CASAVA_Build 11 33022434 4D AAAAAAAAAT GTGA/---- GTAAGTTCAC 3070 het 3070 ref 45 26 15 5 GTGA 1 0 243628 CASAVA_Build 11 33024633 4D TATATCAACA TTTG/---- TTTGTATATG 3070 het 3070 ref 45 25 17 8 TTTG 2 1 243629 CASAVA_Build 11 33025083 1I ATTGGCTCAT -/G GCCTATAAGC 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 G 1 2 243630 CASAVA_Build 11 33025339 1I TCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2475 het 2475 ref 31 17 6 8 A 13 14 243631 CASAVA_Build 11 33028190 1I CTTCAAGCAC -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 6 7 243632 CASAVA_Build 11 33028771 4D TTCAAAAAAC AAAT/---- AACAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 3 AAAT 1 0 243633 CASAVA_Build 11 33028943 1I TCTGTGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1549 hom 29 4 17 8 T 12 13 243634 CASAVA_Build 11 33031113 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2644 hom 30 8 11 11 A 9 10 243635 CASAVA_Build 11 33031587 1I AGTAAGAATT -/C CCCCTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 C 4 5 243636 CASAVA_Build 11 33042695 1D AACATGGGGG A/- GGCAGTCATG 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 1 0 243637 CASAVA_Build 11 33043612 1I CTTGAACTCC -/T TGACCTCAGG 3070 het 54 hom 21 1 12 8 T 1 2 243638 CASAVA_Build 11 33045097 1D TTATTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 11 10 243639 CASAVA_Build 11 33054581 2D TTGGGTACAC AT/-- AATCCTTTCA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AT 1 0 243640 CASAVA_Build 11 33062558 4D GCACCAAAAA AGAC/---- AGACCAGGAA 3070 hom 123 het 43 0 42 3 AGAC 2 1 243641 CASAVA_Build 11 33063485 7I CTGTGGATAC -------/TTTATAG TTTATTTCAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TTTATAG 0 1 243642 CASAVA_Build 11 33064269 2I TGGGTGAGAC --/AG AGCAGTCTCA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AG 1 2 243643 CASAVA_Build 11 33070487 1I AAGATTTTAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 7 8 243644 CASAVA_Build 11 33072964 4D TAATTGCATA TTTC/---- TTTCTTAAGC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 TTTC 2 1 243645 CASAVA_Build 11 33074087 4I TAGAGGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 TTTG 3 4 243646 CASAVA_Build 11 33075106 1D TATACCTATG C/- AAAAGAAAGT 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 C 1 0 243647 CASAVA_Build 11 33085757 3I AAAAAATTTG ---/ACA ACAAGTCTGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ACA 1 2 243648 CASAVA_Build 11 33093710 11D CTACTATGTG TGACAAATAAT/----------- TAAGGCCCTT 3070 hom 114 het 39 0 39 1 TGACAAATAAT 1 0 243649 CASAVA_Build 11 33096870 1D CCTCTGATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 42 0 40 2 A 12 11 243650 CASAVA_Build 11 33097181 1I GTCACATGAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 8 9 243651 CASAVA_Build 11 33112799 1D CACTGGTGGA C/- TTTTTAGTCA 3070 het 3070 ref 56 30 23 4 C 1 0 243652 CASAVA_Build 11 33120459 2D TATAATCTAG AT/-- ATGAGTTAAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 2 1 243653 CASAVA_Build 11 33124978 1D TTACTTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 9 9 A 13 12 243654 CASAVA_Build 11 33143987 2I TTTTTTAAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 AC 7 8 243655 CASAVA_Build 11 33144926 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 17 1 9 7 T 13 12 243656 CASAVA_Build 11 33152114 1D GGCAGGCCAG T/- TGTTTTACAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 2 1 243657 CASAVA_Build 11 33158017 2D GAAGGGGACT CC/-- CACTGGTTAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 C 3 1 243658 CASAVA_Build 11 33159536 1I CGACGACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 9 10 243659 CASAVA_Build 11 33160377 1D CAAAAAACTC A/- AAAAAAACCT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 8 7 243660 CASAVA_Build 11 33160618 13I CTCAGGATTT -------------/TCATGGTGGTCAA TCACATAAGC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TCATGGTGGTCAA 0 1 243661 CASAVA_Build 11 33177486 5D ACATTGAGCA TCTTT/----- TCTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 TCTTT 3 2 243662 CASAVA_Build 11 33177894 1I GTTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 21 1 13 7 T 11 12 243663 CASAVA_Build 11 33186418 1D TGTTCTGTAG C/- CTATTCTACC 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 C 2 1 243664 CASAVA_Build 11 33188230 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1603 hom 10 het 4 0 4 0 A 15 14 243665 CASAVA_Build 11 33199048 1I ATTGCACCAC -/G GGGTAATCAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 3 4 243666 CASAVA_Build 11 33233520 2D GACTTCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 27 0 20 7 A 13 11 243667 CASAVA_Build 11 33234496 4I CTTCCATTCC ----/AGAA AGAAAGGTGT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 AGAA 1 2 243668 CASAVA_Build 11 33234923 2I AGATGCTCTT --/GA AAAATTTCCA 3070 hom 111 het 43 0 36 7 GA 0 1 243669 CASAVA_Build 11 33239113 1I AGGTATTATT -/C CCCCCCCAAC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 7 8 243670 CASAVA_Build 11 33242601 2D TGGAAAAAAA AC/-- AGTTTAGATT 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 AC 1 0 243671 CASAVA_Build 11 33244441 1I CTTTATTAAA -/T ATGAAATATT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 0 1 243672 CASAVA_Build 11 33247880 1I CTCCCCTGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 9 243673 CASAVA_Build 11 33257369 1I CTGGGAAGGC -/G GGAGGTTGCA 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 G 2 3 243674 CASAVA_Build 11 33260803 1D AGACTGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 12 11 243675 CASAVA_Build 11 33261796 1I TTCAGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1519 het 1519 ref 42 26 4 12 T 13 14 243676 CASAVA_Build 11 33263456 1I TTTTCCAATA -/T TATTTGGAGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 1 2 243677 CASAVA_Build 11 33263698 5D TCAAAAAAAA AAAAT/----- ATATATATAT 3070 het 18 hom 12 1 8 3 AAAAT 1 0 243678 CASAVA_Build 11 33264514 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 28 1 13 14 T 17 16 243679 CASAVA_Build 11 33268750 1I CACTAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 2684 het 191 hom 24 1 13 10 A 10 11 243680 CASAVA_Build 11 33272282 1D TCTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 574 hom 27 2 21 4 A 13 12 243681 CASAVA_Build 11 33272414 1D10M1D TAGGCATACG AAAAAAGTTGTA/-AAAAAGTTGT- AAAAATAGTA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 N/A 0 0 243682 CASAVA_Build 11 33272727 1I GTTTAAACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 9 10 243683 CASAVA_Build 11 33283976 1I AATTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 10 11 243684 CASAVA_Build 11 33296334 1I AGTCCAATAG -/T TTTTTTTTCT 2948 het 2866 hom 18 7 7 4 T 8 9 243685 CASAVA_Build 11 33304167 1D CTTAAGTATT A/- TTTACAGCAG 3070 het 3070 hom 37 15 22 0 A 1 0 243686 CASAVA_Build 11 33312774 2D GATGAGCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 28 2 19 7 A 13 11 243687 CASAVA_Build 11 33317463 1D GAAATTTTGA T/- TTTCTTAGGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 4 3 243688 CASAVA_Build 11 33323741 1I AGTGAAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 42 1 36 5 T 10 11 243689 CASAVA_Build 11 33344811 1I CTGCAGTAAC -/A AATGATCCCC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 2 3 243690 CASAVA_Build 11 33345487 1I GGGGGCACAC -/G CCTGTAGTCC 3070 hom 81 het 31 0 25 6 G 0 1 243691 CASAVA_Build 11 33345909 6D ATTTGTTTTG TTATTA/------ TTATTATTAT 3070 hom 57 het 23 0 19 7 TTA 8 6 243692 CASAVA_Build 11 33347755 12D CCAATCTCTT GGAGGACTTTTC/------------ GGAGGACTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 GGAGGACTTTTC 2 1 243693 CASAVA_Build 11 33374769 1I ATTAACTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 9 10 243694 CASAVA_Build 11 33381603 7D AAACAGACAC ACATCAG/------- ACACACATAG 281 het 281 ref 96 65 5 30 ACATCAG 1 0 243695 CASAVA_Build 11 33412227 1D AAGAATATGG T/- ATTCTTAGAA 3070 hom 51 het 23 0 15 8 T 1 0 243696 CASAVA_Build 11 33418243 17D ATTTTGTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3033 hom 33 het 14 0 9 5 T 27 10 243697 CASAVA_Build 11 33421444 1D TTTTTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1008 het 1008 ref 34 23 3 8 T 12 11 243698 CASAVA_Build 11 33421852 1I TATGGAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 36 7 A 10 11 243699 CASAVA_Build 11 33428706 2D AACAACAACA AC/-- AACAAAAAAG 2813 het 807 hom 44 11 11 24 AC 1 0 243700 CASAVA_Build 11 33439334 1D AATAAAAAGG A/- AAAAATGATA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 6 5 243701 CASAVA_Build 11 33453818 1I TCGCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 2703 het 94 hom 19 2 9 8 A 15 16 243702 CASAVA_Build 11 33456394 2I CAGAACTCAC --/AG AGAGGCAAGT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 AG 2 3 243703 CASAVA_Build 11 33457213 1I TCTTCAGATA -/T TTTTTTCACC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 6 7 243704 CASAVA_Build 11 33501023 1I TCTCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 48 1 38 9 A 13 14 243705 CASAVA_Build 11 33502640 4I GAGGAATTTA ----/CTTT CTATTTCTAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CTTT 0 1 243706 CASAVA_Build 11 33512693 1I TGGCTTAGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 8 9 243707 CASAVA_Build 11 33529702 1I TTGAACATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 31 0 24 7 A 12 13 243708 CASAVA_Build 11 33533232 35D TTTTCTTACC TAATTTTTCTTACAATTTTTCTTACTAATTTTTCT/----------------------------------- TACAAAAAAT 3070 hom 51 het 14 0 17 4 TAATTTTTCTTACAATTTTTCTTACTAATTTTTCT 1 0 243709 CASAVA_Build 11 33564539 3I GCTTCTGCAG ---/GTA GTAGAATGGT 3070 hom 129 het 50 0 41 9 GTA 1 2 243710 CASAVA_Build 11 33572435 1D ACAACAACCA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 131 het 50 0 42 8 T 9 8 243711 CASAVA_Build 11 33574926 1I TCCTTTCCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 427 hom 31 1 19 11 T 9 10 243712 CASAVA_Build 11 33584250 1D TCAGAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 33 0 24 9 A 11 10 243713 CASAVA_Build 11 33608019 1I TTCTGCTCTG -/T TTTTTCCCCA 1470 hom 7 het 3 0 3 0 T 5 6 243714 CASAVA_Build 11 33612247 1I TCACTGCAAC -/T TTCTGCCTCC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 3 243715 CASAVA_Build 11 33612408 1I CAAGTGATCC -/A ACCCACCTCG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 1 2 243716 CASAVA_Build 11 33613798 24D CATTCTAGAT AAAACTGTTTCATTCATTTTAGAC/------------------------ AAAACTGTTT 3070 hom 50 het 30 0 17 19 AAAACTGTTTCATTCATTTTAGAC 2 1 243717 CASAVA_Build 11 33616527 60D CTATGTTATT TTATTCTCTAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAC/------------------------------------------------------------ TCATCTATGA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TTATTCTCTAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAATAC 1 0 243718 CASAVA_Build 11 33625913 1D AAAACCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 23 0 21 2 A 12 11 243719 CASAVA_Build 11 33638318 1I CTGGACTTTA -/G GCCCACTTGG 3070 hom 63 het 25 0 19 6 G 1 2 243720 CASAVA_Build 11 33642476 1I TGGCTCCCAG -/C CCAGGCGTCA 3070 hom 74 het 30 0 21 9 C 2 3 243721 CASAVA_Build 11 33643730 1I ATGGGTGGGA -/C CAGAAGAGGT 3070 hom 63 het 25 0 19 6 C 1 2 243722 CASAVA_Build 11 33654731 1D GGCCAGAATG C/- CCCAAGTTGC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 C 4 3 243723 CASAVA_Build 11 33696604 1D AACTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 A 15 14 243724 CASAVA_Build 11 33698867 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 2687 het 2687 ref 22 10 8 4 A 9 10 243725 CASAVA_Build 11 33714863 1I TCCCTTTTAC -/T TTTTTTTTTA 2745 het 2745 ref 20 8 9 3 T 9 10 243726 CASAVA_Build 11 33715253 1I GGTGGCCTCG -/C CCTCAGGGAC 3070 hom 79 het 31 0 24 7 C 2 3 243727 CASAVA_Build 11 33728288 1I ATTTATTAGA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 6 7 243728 CASAVA_Build 11 33737888 3D TTATTGGAGT TAG/--- TAAACATGGA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 TAG 1 0 243729 CASAVA_Build 11 33742678 1D TTATCTTTCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 20 17 8 A 10 9 243730 CASAVA_Build 11 33767379 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 223 hom 18 1 16 1 A 10 9 243731 CASAVA_Build 11 33778765 3I ATGAGCCGGT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 40 0 28 12 TTG 0 1 243732 CASAVA_Build 11 33780287 4I CTGGAGGTAA ----/TTAC GAAAGGCACT 3070 het 3070 hom 51 18 24 9 TTAC 0 1 243733 CASAVA_Build 11 33781682 1D AAACTCGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 46 0 40 7 A 11 10 243734 CASAVA_Build 11 33785837 2D GAAAGCCAAT CA/-- CTGACCCAAC 3070 het 3070 ref 41 23 16 3 CA 1 0 243735 CASAVA_Build 11 33789039 1I ATAGAAGGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 A 9 10 243736 CASAVA_Build 11 33796203 1I GGGTTTTTTT -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 33 0 28 5 G 1 2 243737 CASAVA_Build 11 33801576 1I GATTATTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 325 hom 25 1 23 1 T 9 10 243738 CASAVA_Build 11 33801958 1D ATCCAGCTTT C/- CCAGCATCAT 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 C 3 2 243739 CASAVA_Build 11 33806530 2I TTTTTTTTTT --/TA AAAGCTAAAA 3062 het 3062 ref 27 15 9 3 TA 0 1 243740 CASAVA_Build 11 33808021 1D TTTTATCCGG T/- TATTCTCTCA 3070 hom 115 het 42 0 37 5 T 2 1 243741 CASAVA_Build 11 33823580 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAGC 1263 het 1263 ref 24 12 4 8 A 9 8 243742 CASAVA_Build 11 33827701 2D AGCCTCCCCT CC/-- CCCCAGTCCC 2472 het 2472 ref 18 8 6 4 C 6 4 243743 CASAVA_Build 11 33828157 3D TCAAGCAATC CCT/--- CCACCTCAGC 3070 het 3070 hom 21 9 12 0 CCT 1 0 243744 CASAVA_Build 11 33830295 1D AAAAAAAATA C/- CTTTTTATTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 C 2 1 243745 CASAVA_Build 11 33833244 1D GGGAAGGGAA G/- GGGGGGAAGG 3070 hom 52 het 22 0 17 5 G 7 6 243746 CASAVA_Build 11 33835567 4D CAAAACAAAG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 5 AAAC 3 2 243747 CASAVA_Build 11 33836734 1I TGCAGAGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 9 10 243748 CASAVA_Build 11 33841070 1I TCCCAGACTG -/T TTTTTTTTTT 2746 het 2746 ref 20 9 8 3 T 10 11 243749 CASAVA_Build 11 33841353 1I TCTGTGACTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 8 9 243750 CASAVA_Build 11 33855994 1I ATCCTTTGGC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 9 10 243751 CASAVA_Build 11 33856289 8I ACCAAATTTC --------/CCATGCTT CCATTAAAGG 3070 hom 150 het 55 0 50 5 CCATGCTT 0 1 243752 CASAVA_Build 11 33864003 1D CTGGTACACC T/- TTTTTTTTTT 1637 het 1637 ref 21 7 5 9 T 12 11 243753 CASAVA_Build 11 33865007 1D AGATGTGTTA G/- GGGGATGGGA 3070 hom 96 het 36 0 31 6 G 5 4 243754 CASAVA_Build 11 33865664 4D GGAATGTGGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 42 2 17 23 T 22 18 243755 CASAVA_Build 11 33889437 1D ATTTTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 2232 het 2232 ref 59 43 6 10 T 13 12 243756 CASAVA_Build 11 33896791 1D AAAAACTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 11 10 243757 CASAVA_Build 11 33909693 9I TTTCACTCAA ---------/TGCTAGCAT TGCCCCAGAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 TGCTAGCAT 0 1 243758 CASAVA_Build 11 33914706 2D AAAAACAACA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3009 hom 41 11 23 8 AC 1 0 243759 CASAVA_Build 11 33916108 3D GTTGTTGTTG TTT/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 T 5 2 243760 CASAVA_Build 11 33958368 1D TTATGGCTGC A/- AAAAAAAAAT 1167 het 1167 ref 25 13 4 8 A 10 9 243761 CASAVA_Build 11 33962572 1I ATACACAGTA -/C CCCCACCCCC 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 C 4 5 243762 CASAVA_Build 11 33987147 2I AAAAAAAAAA --/AC AACAACAACT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 AC 0 1 243763 CASAVA_Build 11 33989038 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2752 hom 42 10 15 18 T 15 14 243764 CASAVA_Build 11 33990126 1D GGCAGTGAGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 8 7 243765 CASAVA_Build 11 33991624 1I GCTCCATTTT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 7 8 243766 CASAVA_Build 11 33993194 1D GCCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 26 2 18 7 A 15 14 243767 CASAVA_Build 11 33998780 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 646 hom 26 2 14 10 A 14 15 243768 CASAVA_Build 11 34000101 1D TAATCCTACT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 44 14 24 8 A 8 7 243769 CASAVA_Build 11 34027952 3D TTTGCACACC CTA/--- CTGTCTGTTG 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 CTA 1 0 243770 CASAVA_Build 11 34032356 1I TCTTTTTTTT -/C CCCAATCCTT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 C 3 4 243771 CASAVA_Build 11 34034419 5D GTAGTATTGC TTAAA/----- TTAAAACAGA 3070 het 3070 ref 35 20 11 5 TTAAA 2 1 243772 CASAVA_Build 11 34042374 1I TACTCCTATC -/T TTACCATTCT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 T 2 3 243773 CASAVA_Build 11 34047783 4I TAAAAAAAAA ----/AATT TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 AATT 0 1 243774 CASAVA_Build 11 34048243 1D CACTGTCCTC T/- TGACCTTTAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 1 243775 CASAVA_Build 11 34049926 1D AGATGTTATA T/- TTTTTATTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 T 6 5 243776 CASAVA_Build 11 34051229 2D AATGTGTGAC TA/-- TGTAAAGTTG 3070 het 3070 ref 49 28 17 7 TA 1 0 243777 CASAVA_Build 11 34052436 2I CTTGTAACAC --/TT TGGTATTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 T 1 3 243778 CASAVA_Build 11 34053060 1D CTAGTATTTT A/- AGGAGGCTGA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 2 1 243779 CASAVA_Build 11 34055787 1D AGTATCTGTA T/- TTATGCATTT 3070 het 3070 hom 35 17 15 4 T 3 2 243780 CASAVA_Build 11 34057153 2I TATTGTCTAA --/TG TGTGTAGTAG 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 TG 2 3 243781 CASAVA_Build 11 34057627 8D GTAATCTTTT TATGTGTA/-------- TATGTGTTTT 3070 het 3070 ref 36 23 15 0 TATGTGTA 1 0 243782 CASAVA_Build 11 34059330 1I AGTTGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1186 hom 19 3 9 7 T 14 15 243783 CASAVA_Build 11 34063582 1I TAAGAAAAAT -/A ACATTATTTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 1 2 243784 CASAVA_Build 11 34067615 1D CAGGGCCAGG T/- TAGGTGGCTC 2911 het 2911 ref 15 7 6 2 T 2 1 243785 CASAVA_Build 11 34071323 1D TTTTTTATAT A/- TATATTTTTT 3070 het 2683 hom 25 10 13 2 A 1 0 243786 CASAVA_Build 11 34072088 1D GCTTTTTCTA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 7 6 243787 CASAVA_Build 11 34073377 2I ATTGATAAAA --/AG TGATTCTAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 AG 0 1 243788 CASAVA_Build 11 34078306 4I AGGATTGGTA ----/CTAT CTATCTATCA 3070 het 3070 hom 46 23 22 2 CTAT 2 3 243789 CASAVA_Build 11 34080863 3I GATAGCCTCA ---/TCT TCTAATACAC 3070 het 3070 hom 61 23 32 6 TCT 1 2 243790 CASAVA_Build 11 34095296 1D AGCAGGGACC T/- GTTTAACTGA 1025 het 1025 ref 24 14 3 7 T 1 0 243791 CASAVA_Build 11 34110624 3D GTTGTGGCCC GGT/--- GGTGCAGTTT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 GGT 2 1 243792 CASAVA_Build 11 34114013 1I TTGAACCCCA -/G AGGTTGAGGC 3070 hom 70 het 27 0 23 4 G 0 1 243793 CASAVA_Build 11 34142501 3D GGGAAGCAAT GTG/--- GTCCTGAGTG 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 GTG 1 0 243794 CASAVA_Build 11 34163678 1D26M1D TTAGTCTGCA TTTTTACAAATGCAGAAACAGCCTTTGT/-TTTTACAAATGCAGAAACAGCCTTTG- AGAGGGTAGG 3070 het 2843 hom 51 8 27 27 N/A 0 0 243795 CASAVA_Build 11 34176574 4D CAAACAACAA CAAC/---- AAAAAAAAAC 177 het 177 ref 29 15 4 11 CAAC 1 0 243796 CASAVA_Build 11 34183726 1I ACCCACAAAC -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 G 0 1 243797 CASAVA_Build 11 34197177 4I TATACCAAGC ----/TTAG TTAGTGCTAG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 TTAG 1 2 243798 CASAVA_Build 11 34211342 4D AGGATTTTTC TTTT/---- TATTTTTTTG 3070 hom 103 het 41 0 35 6 T 5 1 243799 CASAVA_Build 11 34211457 1I TCACTGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1588 hom 22 5 11 6 T 13 14 243800 CASAVA_Build 11 34211777 1D CTGGCCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 12 11 243801 CASAVA_Build 11 34218905 1D TTAGTGGAGA G/- GGGGGTTTCA 2967 het 1503 hom 16 5 8 3 G 6 5 243802 CASAVA_Build 11 34223062 3I GCCCGGGAAG ---/TCA TCAAGGCTGG 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 TCA 1 2 243803 CASAVA_Build 11 34255729 1I14M1I6M1I24M1I CAATATGGTG -AACCCCATCTCTAC-AAAAAT-CAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGT-/AAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTG CACACCTGTA 3070 hom 21 het 3 0 8 2 N/A 0 0 243804 CASAVA_Build 11 34266663 16D AAAATTGTAA CAGAACAGACAGAGCC/---------------- CAGAACAGAC 3070 het 3070 ref 44 21 17 10 CAGAACAGACAGAGCC 1 0 243805 CASAVA_Build 11 34266876 5D GCAGAAATCA CTCCT/----- CTCCTGGGTG 3070 hom 139 het 52 0 44 13 CTCCT 2 1 243806 CASAVA_Build 11 34285106 6D CAGGAAACTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1700 het 1700 ref 34 17 8 10 A 22 16 243807 CASAVA_Build 11 34287783 1D TTATGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 22 5 A 11 10 243808 CASAVA_Build 11 34310393 1D GGAGCATTCA C/- CCTCTAACCT 3070 het 3070 hom 69 23 36 10 C 3 2 243809 CASAVA_Build 11 34321580 2D ACAGACAGAC AG/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 AG 1 0 243810 CASAVA_Build 11 34325898 4D GGAAACACAT TAAC/---- TAAGAATTAA 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 TAAC 1 0 243811 CASAVA_Build 11 34338324 1D AGAATAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 614 hom 35 2 24 10 T 13 12 243812 CASAVA_Build 11 34344104 1D TGTTGCCATA T/- TCCCAGACCT 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 T 2 1 243813 CASAVA_Build 11 34344211 1I CTATTTCAGC -/T TTTTAATATT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 4 5 243814 CASAVA_Build 11 34349722 1D GCTATGGCTG T/- TTTAGCAAAC 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 4 3 243815 CASAVA_Build 11 34349989 3D TTGTTGTCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 559 hom 31 6 14 14 T 17 14 243816 CASAVA_Build 11 34352799 4D TTTATCTGAG TCTC/---- TCTCTCTCTC 2478 het 2478 ref 22 12 7 4 TC 7 5 243817 CASAVA_Build 11 34355095 1D TGGTTGACAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 8 7 243818 CASAVA_Build 11 34361761 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2503 hom 19 7 10 3 A 15 14 243819 CASAVA_Build 11 34367137 1D AATGTGCATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 10 9 243820 CASAVA_Build 11 34380021 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 2758 het 739 hom 10 2 6 2 A 9 10 243821 CASAVA_Build 11 34383806 3I TCTCCACCCT ---/CCC ATCTCCTTAC 3070 hom 97 het 39 0 28 11 C 0 3 243822 CASAVA_Build 11 34384357 1D GAGAAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 38 1 33 4 A 11 10 243823 CASAVA_Build 11 34386709 2D TTTGTGTCAA TT/-- AAAAAAAAAG 1344 het 796 hom 31 4 7 20 T 2 0 243824 CASAVA_Build 11 34387037 4D CTGTGGGCTC TGTT/---- TGTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 50 22 23 9 TGTT 2 1 243825 CASAVA_Build 11 34388143 1I AAAAACAAAC -/A AACAACAACA 1652 het 1405 hom 48 10 9 29 A 2 3 243826 CASAVA_Build 11 34388814 1D TTCAAAAAAC T/- TTTGAATAGA 3070 het 1352 hom 16 4 11 1 T 4 3 243827 CASAVA_Build 11 34390651 2D7M2I TGGTGAAACC CTGTTTCTG--/--GTTTCTGAA AAAAAAAAAG 1407 het 1407 ref 16 7 8 3 N/A 0 0 243828 CASAVA_Build 11 34392080 4I TTGCATGATG ----/CTAT CTATGTTAAC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 CTAT 1 2 243829 CASAVA_Build 11 34393708 1I TAATCATGGG -/T TTCTTGTAGT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 2 3 243830 CASAVA_Build 11 34394391 23D CTTGGCTTTA TTTTGCATTTCCCCATGTGTTAG/----------------------- TTTTATTCTC 3070 het 3070 ref 22 15 9 2 TTTTGCATTTCCCCATGTGTTAG 1 0 243831 CASAVA_Build 11 34395156 1D AGCAAGTAAA G/- GGAACACATG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 G 3 2 243832 CASAVA_Build 11 34396164 1D TCAGGAAAAA G/- TTGCCCAATT 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 G 1 0 243833 CASAVA_Build 11 34401288 1I AAATATTTCA -/T TTCTTTCTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 3 243834 CASAVA_Build 11 34409281 1I TGAACCCGAG -/A AACGGAGGTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 2 3 243835 CASAVA_Build 11 34435164 4D GTAAGATCCC TACA/---- TATGTGAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 7 TACA 1 0 243836 CASAVA_Build 11 34455698 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 55 het 35 0 21 14 T 9 8 243837 CASAVA_Build 11 34457812 1I AACCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 25 2 19 4 A 13 14 243838 CASAVA_Build 11 34461992 5I ACTATTCTAT -----/TACTG TACTGTACTG 3070 hom 144 het 62 0 46 16 TACTG 2 3 243839 CASAVA_Build 11 34463303 2I GGATTGGAAG --/AA TCCAGAGAGC 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 0 2 243840 CASAVA_Build 11 34490381 3D AGAACCAATT TGC/--- TGACCTCTTG 3070 het 3070 ref 63 32 26 8 TGC 1 0 243841 CASAVA_Build 11 34490707 1D AAAATGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 494 hom 35 7 15 13 T 13 12 243842 CASAVA_Build 11 34492580 1D TCCCAGGTCA T/- CTATGAGACA 3070 hom 130 het 49 0 39 11 T 1 0 243843 CASAVA_Build 11 34494123 1D GGTGGAGGGA G/- GGGGCAGAAG 3070 hom 129 het 48 0 42 6 G 5 4 243844 CASAVA_Build 11 34499869 4D TGGCATATAT TAAA/---- TACTCAATAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 TAAA 1 0 243845 CASAVA_Build 11 34511380 2D GGTGGGTCGT TC/-- GAGGTCAGGA 1367 het 1367 ref 33 26 3 6 TC 1 0 243846 CASAVA_Build 11 34517647 34D ACTGCACTTA ACACACACACACACACACACACACACACACACAC/---------------------------------- ACACACACAC 3070 hom 126 het 41 0 42 12 AC 26 9 243847 CASAVA_Build 11 34524130 2D AAAACAAACC AA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 59 het 25 0 16 9 A 10 8 243848 CASAVA_Build 11 34532126 1I ATCATAAGTC -/A GACCATTTTA 3070 hom 129 het 44 0 43 1 A 0 1 243849 CASAVA_Build 11 34535215 1D TCCTACTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 11 10 243850 CASAVA_Build 11 34538247 10D TATATATATT TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TG 11 6 243851 CASAVA_Build 11 34541353 1D AAAAGAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 11 10 243852 CASAVA_Build 11 34546468 1D CCCTTGCCGT A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 A 7 6 243853 CASAVA_Build 11 34551471 1D AGTTCTGTGA T/- CTTGGAAACA 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 T 1 0 243854 CASAVA_Build 11 34567404 1D GCAGCGCCTC T/- TTTTTTTTTT 762 het 423 hom 17 4 2 11 T 17 16 243855 CASAVA_Build 11 34577014 1I CCTGCCTCGG -/C CTCCCAAAGT 3070 hom 69 het 26 0 17 16 C 1 2 243856 CASAVA_Build 11 34580168 1D TTTAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 312 hom 31 3 23 6 T 15 14 243857 CASAVA_Build 11 34580529 11D CAGGCAGTGT GTGGAGTGCAA/----------- GTCAGGACAC 3070 het 3070 ref 49 29 15 10 GTGGAGTGCAA 1 0 243858 CASAVA_Build 11 34582190 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 91 het 36 0 29 7 A 8 7 243859 CASAVA_Build 11 34590113 1I AAAAATGGTG -/C CCCAAACCAG 3070 hom 57 het 52 1 46 5 C 3 4 243860 CASAVA_Build 11 34594864 1I CTGGAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 10 243861 CASAVA_Build 11 34598001 1I TAAGCAGACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 912 hom 35 2 24 9 T 9 10 243862 CASAVA_Build 11 34599575 1D ATTTCCTGCA T/- TGTCTGGACT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 2 1 243863 CASAVA_Build 11 34603336 1I ACACCTGGAG -/T CCTTTATTAA 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 0 1 243864 CASAVA_Build 11 34607983 1D TTTCCCAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 18 het 47 1 41 6 T 10 9 243865 CASAVA_Build 11 34608810 4I GTCTTATTTA ----/TTTT TCAGTCAACT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 5 243866 CASAVA_Build 11 34626470 2D GCATTTACAA AT/-- ATATATATAT 1157 het 1157 ref 22 13 3 9 AT 9 8 243867 CASAVA_Build 11 34629266 1D ACATTTAAAT A/- AATTAATCCC 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 3 2 243868 CASAVA_Build 11 34629628 1D CTGGGGAAAA G/- AGATCGCTGA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 1 0 243869 CASAVA_Build 11 34634694 8I GGCCTTTGCA --------/CTTCTATG CTTCTATGTT 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 CTTCTATG 1 2 243870 CASAVA_Build 11 34635388 1I GGCAATTTCC -/A TCTCTCCCAG 3070 hom 105 het 45 0 34 11 A 0 1 243871 CASAVA_Build 11 34635749 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 7 6 243872 CASAVA_Build 11 34644432 3D AAGGCCTTTC TTT/--- TTTTGACTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 4 243873 CASAVA_Build 11 34644866 1D CATTTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 720 hom 27 5 15 7 T 13 12 243874 CASAVA_Build 11 34657058 2D TTTTTCCCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 15 14 7 TG 7 6 243875 CASAVA_Build 11 34657305 1D AAAACAAAAC A/- AACCAGAAAG 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 3 2 243876 CASAVA_Build 11 34659119 9I TGAAACATGT ---------/TATACGTTA TCTCCACCAC 3070 hom 138 het 49 0 45 5 TATACGTTA 0 1 243877 CASAVA_Build 11 34671812 18D ATTTTTCTAA TTATTACTTATTTATGAG/------------------ TAAACTACTA 3070 het 3070 ref 41 31 15 0 TTATTACTTATTTATGAG 1 0 243878 CASAVA_Build 11 34672605 1I GTGTAGTATA -/T TTTGAAGTCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 4 243879 CASAVA_Build 11 34674094 1D TTATCCTTTT A/- AAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 41 17 19 6 A 7 6 243880 CASAVA_Build 11 34674463 1D TATGCACATT G/- CTGCAAAGGG 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 G 1 0 243881 CASAVA_Build 11 34674746 1D CTTCCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 11 10 243882 CASAVA_Build 11 34681614 1D TATGATCTTT G/- TAATATATTA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 G 1 0 243883 CASAVA_Build 11 34683161 1I TTTTCTTGTA -/G GCAACAGATC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 1 2 243884 CASAVA_Build 11 34683805 28I TTAGTATTTC ----------------------------/TTGTAGGATAGGTCCAATGTTGATGAAA TCTCTCAGCT 3070 het 3070 hom 23 10 12 3 TTGTAGGATAGGTCCAATGTTGATGAAA 0 1 243885 CASAVA_Build 11 34684924 2I AGAAATGGAG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 45 het 30 0 14 16 TC 6 7 243886 CASAVA_Build 11 34687376 1I TTTACCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2503 hom 35 7 11 17 T 12 13 243887 CASAVA_Build 11 34693235 3I GCTTGGAGAA ---/AAC AATGTTTTCT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 AAC 0 1 243888 CASAVA_Build 11 34696275 2D GTGTCAAAAA AG/-- AGAGACTGAT 3070 het 3070 ref 51 25 22 5 AG 3 2 243889 CASAVA_Build 11 34701005 4D AACTTTGGAT AATA/---- AATAAATGTA 3070 het 3070 hom 26 10 11 7 AATA 2 1 243890 CASAVA_Build 11 34702322 1I AGGCATTTCT -/C AGCTTTGGCT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 0 1 243891 CASAVA_Build 11 34724365 1I GGATATACTG -/C CACCCCCCCT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 C 1 2 243892 CASAVA_Build 11 34728335 1I TGATAAGAAG -/A GGGGGGTCGG 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 A 0 1 243893 CASAVA_Build 11 34728889 1D AGAGAAGAAA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 8 7 243894 CASAVA_Build 11 34729414 2I GTCCTCATCT --/TA TATAAACAAC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 TA 2 3 243895 CASAVA_Build 11 34731944 1D TTTAGACGTA C/- AAGATGATGA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 C 1 0 243896 CASAVA_Build 11 34732700 2D AAATCCTCAG CT/-- CTGGCTGCCA 3070 het 3070 hom 54 20 29 5 CT 2 1 243897 CASAVA_Build 11 34733763 11D CATCTACACT AGAGAGAAGGA/----------- AAAACACACA 3070 het 3070 hom 46 21 25 7 AGAGAGAAGGA 1 0 243898 CASAVA_Build 11 34734206 4D TAGTGAGACC CTAT/---- CTATCTCTAA 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 CTAT 2 1 243899 CASAVA_Build 11 34737545 8I AAGAAGAAGG --------/AGAGAATT AGAGAATTGC 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 AGAGAATT 1 2 243900 CASAVA_Build 11 34756777 1I ACTGCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2320 het 1973 hom 26 8 7 11 A 15 16 243901 CASAVA_Build 11 34760520 1I GCTAGGACTT -/A ACAGTACTAT 3070 het 3070 hom 41 11 21 9 A 1 2 243902 CASAVA_Build 11 34762528 8I AGGGAAGATG --------/ACTCAATA ACTCAATAAC 3070 het 3070 hom 53 13 22 18 ACTCAATA 1 2 243903 CASAVA_Build 11 34773837 2D TAACAATGAC AT/-- AGAGTTTCAG 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 AT 1 0 243904 CASAVA_Build 11 34783317 1D CCTTTGTGTC T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 154 het 57 0 52 6 T 8 7 243905 CASAVA_Build 11 34785379 1D TAGGAAATGA C/- TTTTTCTATT 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 C 1 0 243906 CASAVA_Build 11 34788056 3D ACTAAAAAAG GTT/--- GTTGGGGACA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 GTT 2 1 243907 CASAVA_Build 11 34788317 4D CAGTGCAGTT AGGC/---- AGGAATAAGC 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 AGGC 1 0 243908 CASAVA_Build 11 34788921 2I AAGCTGCAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 11 13 243909 CASAVA_Build 11 34789315 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAT 2886 het 2157 hom 22 8 6 8 A 10 9 243910 CASAVA_Build 11 34792417 1D ATCAAAATGT G/- GGGGGGGATG 3070 hom 45 het 16 0 15 2 G 8 7 243911 CASAVA_Build 11 34794275 8I TCAACAAAAT --------/ACCAGCAG ACCAAATCCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 ACCAGCAG 0 1 243912 CASAVA_Build 11 34799596 5D TCAAACCATG ATATC/----- ATATCGTGCA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 ATATC 2 1 243913 CASAVA_Build 11 34808443 1D GGCAGAAGCT G/- GGGGGTGTAC 3070 het 3070 hom 40 11 22 7 G 6 5 243914 CASAVA_Build 11 34809369 1I TTCCCAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 10 11 243915 CASAVA_Build 11 34814836 1I TCACACTTGT -/A AATCCCAGCA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 A 2 3 243916 CASAVA_Build 11 34816805 1I GGGAATCATC -/T CCAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 0 1 243917 CASAVA_Build 11 34817464 4D GCACTCACAT ACAC/---- ACACACTTCA 3070 het 3070 hom 51 23 22 8 AC 5 3 243918 CASAVA_Build 11 34819172 1I TTTACAACTT -/A ATCACTAAAA 3070 hom 126 het 47 0 41 6 A 1 2 243919 CASAVA_Build 11 34821990 1I AACATAAAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 8 9 243920 CASAVA_Build 11 34832510 1D TGCAGAAGCA G/- CTGTTTTCAC 3070 het 3070 hom 58 22 31 5 G 1 0 243921 CASAVA_Build 11 34834297 1I CAATGAAGAC -/T TGGTGGGGAG 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 T 1 2 243922 CASAVA_Build 11 34836553 1D CGAAACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 10 27 6 T 11 10 243923 CASAVA_Build 11 34839171 1D TGTATTAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 10 9 243924 CASAVA_Build 11 34839267 6D CACTTTAAGG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2147 het 173 hom 23 4 9 10 T 20 14 243925 CASAVA_Build 11 34843955 1I TCATCTCTTG -/A AACTCTTTCC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 3 243926 CASAVA_Build 11 34850342 4I TGATAATGAT ----/TGAC TGACGGCTGG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TGAC 1 2 243927 CASAVA_Build 11 34854041 5D ACAGAAGATT AAAAG/----- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 AAAAG 1 0 243928 CASAVA_Build 11 34858679 1I TCATATTCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 9 10 243929 CASAVA_Build 11 34879118 3I AAGGACAAGT ---/TTA TTATTACACA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTA 2 3 243930 CASAVA_Build 11 34881086 28D GCCTCCAAAC TAATCCTGGGAAATGATTTAACTGTTTA/---------------------------- TAATCCTGGG 3070 hom 42 het 22 0 15 12 TAATCCTGGGAAATGATTTAACTGTTTA 2 1 243931 CASAVA_Build 11 34882584 2I CCATGGCCTT --/GC AACGAATAAG 843 het 843 ref 46 36 2 9 GC 0 1 243932 CASAVA_Build 11 34884297 1I TACTTTTTTT -/G TTTGTGGCTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 0 1 243933 CASAVA_Build 11 34887081 1I GTTTGAAACG -/T TAAGATATGT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 1 2 243934 CASAVA_Build 11 34893186 1D TGAGTGCAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 30 het 19 0 10 9 A 10 9 243935 CASAVA_Build 11 34893864 1I GGCAAGGAGC -/A AACTGCTCAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 2 3 243936 CASAVA_Build 11 34896565 2D GTCTCAGGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 33 0 18 16 A 14 12 243937 CASAVA_Build 11 34899568 4I GAATAGAGAA ----/ACTG ACTGACCCAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 ACTG 1 2 243938 CASAVA_Build 11 34901323 1D TGGGGTATAT G/- GGTGATTCAT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 G 3 2 243939 CASAVA_Build 11 34901759 1D TTCCAGTGTT C/- CATCAGGTAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 2 1 243940 CASAVA_Build 11 34904794 1D TTGTATTAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 T 10 9 243941 CASAVA_Build 11 34905138 1I CTGTTGATGT -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 7 8 243942 CASAVA_Build 11 34905350 1I GACTACAAAA -/G CGTTAAATTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 0 1 243943 CASAVA_Build 11 34907286 1I CCTGTTTTTC -/A ATATATAATG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 1 2 243944 CASAVA_Build 11 34909660 1I GGTTATTTTG -/T TTTTGTTTTT 3070 het 1142 hom 35 6 26 3 T 4 5 243945 CASAVA_Build 11 34913056 1D TTTGATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 12 11 243946 CASAVA_Build 11 34919198 4I GCTACTAGAC ----/TTAA TTTAAGAAGC 3070 hom 126 het 44 0 42 2 TTAA 0 1 243947 CASAVA_Build 11 34926697 2D CCTCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2045 het 1126 hom 30 8 9 14 T 16 14 243948 CASAVA_Build 11 34932893 1D TACTAGCTAT C/- AGACACTATT 3070 het 3070 hom 47 21 21 7 C 1 0 243949 CASAVA_Build 11 34935450 4D AAGAACAAAC TACT/---- TAATGCAGTC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 TACT 1 0 243950 CASAVA_Build 11 34935853 1D AGAGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 12 20 14 T 11 10 243951 CASAVA_Build 11 34936759 2I TTCCTAGTGC --/AA AGTGTTTCTG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 1 3 243952 CASAVA_Build 11 34952013 3I TGCTATTATA ---/CTT CTTCTACCCA 3070 het 3070 hom 53 25 25 3 CTT 1 2 243953 CASAVA_Build 11 34953315 1I TCAAGATTTT -/C TGCATTACCA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 C 0 1 243954 CASAVA_Build 11 34966682 1D GTTTTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 559 hom 36 3 25 8 A 16 15 243955 CASAVA_Build 11 34978214 1I CTCTAGGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 10 11 243956 CASAVA_Build 11 34986024 1D TTACTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 192 hom 30 2 22 8 T 15 14 243957 CASAVA_Build 11 34992519 1D ATCATATTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 53 18 29 6 T 8 7 243958 CASAVA_Build 11 34993300 1I CAAAGACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 10 11 243959 CASAVA_Build 11 34997996 2I GTTCATTCTT --/TC TGTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 TC 0 1 243960 CASAVA_Build 11 34998311 2D ATATGAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 2347 het 571 hom 24 6 10 8 T 18 16 243961 CASAVA_Build 11 35001031 1D TAACAAAGAG A/- AAGGAATAGC 2741 het 1329 hom 10 3 6 1 A 3 2 243962 CASAVA_Build 11 35016261 1I GGTTTTAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 13 14 A 11 12 243963 CASAVA_Build 11 35018652 5D CATTGGGGAA AACAC/----- ATAGTACCGA 3070 het 3070 hom 45 19 22 5 AACAC 1 0 243964 CASAVA_Build 11 35022809 1I TCATTTCAAC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 7 8 243965 CASAVA_Build 11 35024884 1I TGTGGGTAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 T 8 9 243966 CASAVA_Build 11 35040522 2I GTATTTTTAA --/TT CTTTGTATAT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 0 2 243967 CASAVA_Build 11 35048587 1D GCAAACAAAC A/- AAAAAACCTC 3070 het 3070 ref 37 17 18 3 A 7 6 243968 CASAVA_Build 11 35050780 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 12 11 243969 CASAVA_Build 11 35053546 6I GAACAGTAGC ------/CAGAGT CAATCAACAT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 CAGAGT 0 1 243970 CASAVA_Build 11 35053871 2D TACGGCAAAG TA/-- TATATATATA 1185 het 498 hom 7 2 3 2 TA 10 9 243971 CASAVA_Build 11 35064909 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2684 hom 21 8 10 3 A 11 12 243972 CASAVA_Build 11 35119142 1D TGACTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 1336 het 1336 ref 36 25 3 9 A 13 12 243973 CASAVA_Build 11 35128194 1I ATTGTACTTT -/A AAAAACATTG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 5 6 243974 CASAVA_Build 11 35150973 1D ATTTTGGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 41 0 30 12 A 11 10 243975 CASAVA_Build 11 35155307 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 42 het 17 0 14 4 T 8 7 243976 CASAVA_Build 11 35164178 1D AGAACAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 116 het 47 0 39 8 A 10 9 243977 CASAVA_Build 11 35184871 1I TGAATATGTC -/T AGTGAGTGGA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 T 0 1 243978 CASAVA_Build 11 35190526 1I ATATATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 11 12 243979 CASAVA_Build 11 35195239 1D TATCTCACAT C/- CATCTTCTGT 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 C 2 1 243980 CASAVA_Build 11 35197988 1D CCCCAACTAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 T 9 8 243981 CASAVA_Build 11 35198497 1D CCTGTCAGTC T/- CCCCCACTTC 3070 het 2559 hom 25 8 12 5 T 1 0 243982 CASAVA_Build 11 35200722 2D TTTATATATA AT/-- ATATATATAT 2317 het 189 hom 9 1 6 2 AT 9 8 243983 CASAVA_Build 11 35226103 1D AAACCCAGAA G/- GGGGGCCCTC 3070 hom 69 het 34 0 27 9 G 6 5 243984 CASAVA_Build 11 35243577 1D GGCTTTACGG T/- TTTTTTTTTT 1092 het 1092 ref 34 21 3 10 T 13 12 243985 CASAVA_Build 11 35255912 1I GGATGGACCC -/T AATTATCACA 3070 het 3070 hom 54 19 23 12 T 0 1 243986 CASAVA_Build 11 35260203 1D GGAAGATTAA G/- GCCCCTGGAG 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 G 2 1 243987 CASAVA_Build 11 35267425 1I GGGTTTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 T 11 12 243988 CASAVA_Build 11 35267567 1D TTAAAACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 T 11 10 243989 CASAVA_Build 11 35268851 1I TTTTTTTTTT -/C TCTCTTTTTC 2097 het 1077 hom 17 7 8 2 C 0 1 243990 CASAVA_Build 11 35277840 3I GGAGATAAAA ---/AAG AAGAACAGAT 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 AAG 1 2 243991 CASAVA_Build 11 35284418 1D CTATAAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 A 11 10 243992 CASAVA_Build 11 35285343 1D CCTTCTAGAG C/- CAGGCTCAGC 3070 het 3070 ref 40 15 11 14 C 2 1 243993 CASAVA_Build 11 35311543 1I CTGCCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 2612 het 2612 ref 35 15 8 12 A 13 14 243994 CASAVA_Build 11 35320668 6D TGTTGTTTGT TGTTTG/------ TTTTTTTTGC 584 het 584 ref 31 18 4 12 TGTTTG 1 0 243995 CASAVA_Build 11 35320925 1D AAATAAAATT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 7 6 243996 CASAVA_Build 11 35323185 1I CCCCAAGAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 9 10 243997 CASAVA_Build 11 35326560 2I GTAGCAGATA --/CT CTCAATAAAT 3070 het 3070 ref 49 29 15 5 CT 1 2 243998 CASAVA_Build 11 35331551 1I AAGTCTAACT -/C CCCTGTTGAT 3070 het 3070 ref 56 26 21 9 C 3 4 243999 CASAVA_Build 11 35339009 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTGA 2822 het 2822 ref 28 19 7 2 A 0 1 244000 CASAVA_Build 11 35343736 2I CTGTCTCTGC --/AA AGACTTCCCT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 1 3 244001 CASAVA_Build 11 35345680 4I AAAATGTCAG ----/AGGA AAGACTGTTT 3070 het 3070 hom 54 24 26 4 AGGA 0 1 244002 CASAVA_Build 11 35349234 1I AGGCCAGGTG -/T GCTACCCTCA 3070 het 3070 ref 57 30 18 9 T 0 1 244003 CASAVA_Build 11 35382254 2I TTTTGAAAAG --/AC AAATACCTGT 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 AC 0 1 244004 CASAVA_Build 11 35388283 1I TTCTAACAAA -/T AAAAATAGTA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 T 0 1 244005 CASAVA_Build 11 35389837 2D TTTCTTCTTT TC/-- TCTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 21 12 6 TC 2 1 244006 CASAVA_Build 11 35393886 1I TTTCCCCTGA -/C CCCTTGGCTC 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 C 3 4 244007 CASAVA_Build 11 35405314 1D ATCTACTGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 9 8 244008 CASAVA_Build 11 35410373 1D CCTGGCACAG C/- CCAAGTTCAC 3070 hom 161 het 59 0 52 8 C 3 2 244009 CASAVA_Build 11 35421305 1D GCAACTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 26 1 20 7 T 11 10 244010 CASAVA_Build 11 35423515 1I AATAGGAGTG -/A ATGAGAGAGG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 1 2 244011 CASAVA_Build 11 35423711 4I TGTGTCTATT ----/TAGA TAATCATGTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 TAGA 0 1 244012 CASAVA_Build 11 35435434 1I AATGCTTGAG -/T GGGGAATCCA 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 T 0 1 244013 CASAVA_Build 11 35435617 2I TTTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 44 13 26 5 TG 5 6 244014 CASAVA_Build 11 35439733 1I TTCCCCAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 T 2 3 244015 CASAVA_Build 11 35447927 1D TTTAATTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 11 10 244016 CASAVA_Build 11 35456679 3I GGAGGAGGGA ---/GCT GCGCTCCCTC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 GCT 0 1 244017 CASAVA_Build 11 35463924 1D GGTACTCAGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 212 hom 22 1 16 5 A 9 8 244018 CASAVA_Build 11 35466689 2D TTATTTACTC AT/-- ATAAACTATC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AT 2 1 244019 CASAVA_Build 11 35481408 1D TGTCTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 42 21 4 18 T 15 14 244020 CASAVA_Build 11 35484559 1D TTTTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 28 2 21 6 T 11 10 244021 CASAVA_Build 11 35496337 1D CTTACCACCA G/- CCATGTCCTC 3070 het 3070 hom 57 17 28 12 G 1 0 244022 CASAVA_Build 11 35497561 1I GCCACACTGG -/A AATAAATGGT 3070 hom 137 het 53 0 45 8 A 2 3 244023 CASAVA_Build 11 35503213 1D TATTCCTTTC T/- TTCTTTCCCT 3070 hom 137 het 49 0 45 4 T 3 2 244024 CASAVA_Build 11 35504598 5I AAGGATGTTT -----/TATAA CATAATAGGT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 TATAA 0 1 244025 CASAVA_Build 11 35511323 1D TGAGGTTAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 10 9 244026 CASAVA_Build 11 35526121 1D TTAGCTACTT A/- TCCTGATGCT 2657 het 2657 ref 17 7 7 3 A 1 0 244027 CASAVA_Build 11 35534486 1I CCATAGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 T 10 11 244028 CASAVA_Build 11 35542301 1D TCAAGATTCC A/- AAAAAACCAG 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 7 6 244029 CASAVA_Build 11 35574083 1D CAAACAGTGT A/- CAGTTTGACT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 A 1 0 244030 CASAVA_Build 11 35583875 1I GAAAAAAAAA -/C ACAAATCACA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 C 0 1 244031 CASAVA_Build 11 35586273 1I TGTTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 2574 het 2574 ref 37 17 8 12 A 11 12 244032 CASAVA_Build 11 35611047 1D TGGCAACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 32 1 24 8 T 12 11 244033 CASAVA_Build 11 35618660 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2085 hom 34 5 25 4 A 11 10 244034 CASAVA_Build 11 35622305 1I ACAGACGGGG -/T TTTCGCCATG 3070 het 684 hom 13 2 10 1 T 3 4 244035 CASAVA_Build 11 35627948 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 383 het 383 ref 19 11 3 5 A 16 15 244036 CASAVA_Build 11 35687107 1D TGTTGCCATG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 10 9 244037 CASAVA_Build 11 35704808 1D TTGTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 35 2 20 13 A 15 14 244038 CASAVA_Build 11 35721516 1D CAGGTTTCTT C/- CTCCAGTCAC 3070 het 3070 hom 47 21 23 4 C 2 1 244039 CASAVA_Build 11 35729096 1D AATTCCATTT A/- AAAAATATCA 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 A 6 5 244040 CASAVA_Build 11 35740886 1D TGGGTTTGAA T/- TTCCAGCTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 3 2 244041 CASAVA_Build 11 35769017 1D GTAGTAAACA G/- GGGAAGGAAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 4 3 244042 CASAVA_Build 11 35771308 1D AAAAAAAAAA G/- AAATCTAGCT 3070 het 321 hom 20 1 14 5 G 1 0 244043 CASAVA_Build 11 35774378 4D GTGTATCTGC CTCG/---- CTCGCTCGCT 3070 het 2563 hom 36 8 23 8 CTCG 3 2 244044 CASAVA_Build 11 35778195 1D TCTCGCTGAC T/- TTCAAGAATG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 3 2 244045 CASAVA_Build 11 35781399 1D TAGTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1969 hom 38 14 15 11 A 17 16 244046 CASAVA_Build 11 35790967 3D AGCAGTCAAA TCT/--- TCTGGCCTGA 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 TCT 2 1 244047 CASAVA_Build 11 35806435 1D GACCTTCCAG T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 105 het 39 0 35 5 T 8 7 244048 CASAVA_Build 11 35808613 1D ATAGCATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 32 7 T 11 10 244049 CASAVA_Build 11 35815393 1I TTTCAGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 683 hom 30 2 15 13 T 10 11 244050 CASAVA_Build 11 35819396 2D ACGCCTATAG TC/-- TCTGCTACTT 2896 het 2896 ref 25 16 8 2 TC 2 1 244051 CASAVA_Build 11 35820641 1D TTATGGTGGG A/- AAAAAAACGG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 7 244052 CASAVA_Build 11 35828850 1D AGGAGGCCAA G/- GTGGACATAT 3070 het 2937 hom 25 9 12 4 G 2 1 244053 CASAVA_Build 11 35841431 1D AAGTCAGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 71 het 32 0 24 8 T 10 9 244054 CASAVA_Build 11 35846140 5D ACTCTGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 835 hom 5 het 7 0 2 6 A 17 12 244055 CASAVA_Build 11 35858732 10I TTCTTTCAAT ----------/GTGTGGGCTG CTTACTGATT 3070 hom 66 het 22 0 23 2 GTGTGGGCTG 0 1 244056 CASAVA_Build 11 35867893 3D GATTTCCTCT TCA/--- TCAACAAGCA 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 TCA 2 1 244057 CASAVA_Build 11 35875872 1D ATGGAATGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 247 hom 29 2 24 3 A 10 9 244058 CASAVA_Build 11 35878143 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 127 hom 20 1 14 5 A 12 13 244059 CASAVA_Build 11 35878207 3D AGATATTTTA AAT/--- AATAAACTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 AAT 2 1 244060 CASAVA_Build 11 35884561 1I TCATAAATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 411 hom 36 1 31 4 A 9 10 244061 CASAVA_Build 11 35887038 12D TGTGTGTATA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TG 15 9 244062 CASAVA_Build 11 35895016 2D ACAGATTGCT GG/-- GGGCTCTATC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 5 3 244063 CASAVA_Build 11 35899202 1D GATTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 hom 86 het 35 0 29 6 G 1 0 244064 CASAVA_Build 11 35943115 1I GACTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2153 het 1174 hom 34 5 15 14 A 14 15 244065 CASAVA_Build 11 35989693 9I GTTCTGCTAC ---------/CTTTTAATA CTCAATAATA 3070 hom 108 het 45 0 37 9 CTTTTAATA 0 1 244066 CASAVA_Build 11 35991913 1D TGTGCCTGAG T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 7 6 244067 CASAVA_Build 11 36007371 8D CTCCATCTCA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 27 het 12 0 10 5 AAAC 6 4 244068 CASAVA_Build 11 36007532 6D GGGTGGCGCC AGGACT/------ CAGTGCTCAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 AGGACT 1 0 244069 CASAVA_Build 11 36013302 1D AGGACTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 34 1 23 11 T 15 14 244070 CASAVA_Build 11 36018303 2I TTCTTAAAAA --/AG AGAATTCTTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AG 1 2 244071 CASAVA_Build 11 36020004 2D TGTGTTTGGT TG/-- AGGGGGGTGT 2811 het 2811 ref 23 9 9 6 TG 1 0 244072 CASAVA_Build 11 36021136 1D TCCTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 2550 het 2550 ref 25 10 7 8 A 12 11 244073 CASAVA_Build 11 36038673 5D CATCCTTCCT TAGGG/----- TAGCCTTTGT 3070 het 3070 hom 37 14 21 6 TAGGG 1 0 244074 CASAVA_Build 11 36049559 3D AAGTGGGAAA AAT/--- AATATATGTA 3070 hom 171 het 59 0 56 7 AAT 2 1 244075 CASAVA_Build 11 36051147 1D TGAGACTTTG C/- CTTCCTGTAT 3070 hom 99 het 40 0 32 8 C 2 1 244076 CASAVA_Build 11 36053430 22I ATTTCATATG ----------------------/CCTTTTTCCTTGGCCTTTTTAT CCTTTCACTG 3070 hom 141 het 49 0 46 8 CCTTTTTCCTTGGCCTTTTTAT 0 1 244077 CASAVA_Build 11 36060748 5I ACCACCCTGA -----/TTTGT TTTGTTTTAC 3070 hom 141 het 57 0 48 9 TTTGT 1 2 244078 CASAVA_Build 11 36065842 1D GTATATATAA T/- TTTTTTTTTT 1202 het 1202 ref 28 24 3 1 T 11 10 244079 CASAVA_Build 11 36067558 2D TCCCAATACA TT/-- TTTTTTTTTT 2716 hom 12 het 19 0 10 9 T 15 13 244080 CASAVA_Build 11 36077126 1I TTTTTTTTTT -/C CCCATTTTTG 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 C 3 4 244081 CASAVA_Build 11 36077461 1I CAGTGATTAG -/A AAATACTAAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 3 4 244082 CASAVA_Build 11 36080626 2D GCCCCTCCTC CT/-- CTCTCTCCTT 3070 het 3070 hom 41 15 16 11 CT 4 3 244083 CASAVA_Build 11 36087882 1I CTTTATATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 A 9 10 244084 CASAVA_Build 11 36094971 2D TCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 17 9 T 15 13 244085 CASAVA_Build 11 36097634 1I CTCTGTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 14 11 T 11 12 244086 CASAVA_Build 11 36111481 25D TTTCTTTTCC TTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCT/------------------------- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 23 16 11 4 TTTCT 8 3 244087 CASAVA_Build 11 36139702 12D ATTCATTTTG GGATGGATGGAT/------------ GGATGGATGG 3070 het 3070 ref 48 24 19 9 GGAT 7 4 244088 CASAVA_Build 11 36145618 8D AGGAATTTTG GACACAGA/-------- GACACAGACT 3070 hom 126 het 48 0 43 10 GACACAGA 2 1 244089 CASAVA_Build 11 36151975 16D CTTCACAGAA TTGGAAAAAAACTACT/---------------- TTAAAGTTCA 1889 hom 10 het 4 0 4 2 TTGGAAAAAAACTACT 1 0 244090 CASAVA_Build 11 36158440 1I TCTTAGAACA -/C CCTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 C 2 3 244091 CASAVA_Build 11 36161452 1I TGATTACTTG -/C CTTTGTAAAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 C 1 2 244092 CASAVA_Build 11 36173416 8D TGCATTTTTC TAGAAGCA/-------- TAGAAGCATC 3070 het 3070 ref 47 23 21 10 TAGAAGCA 2 1 244093 CASAVA_Build 11 36174156 1I CCCAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2939 hom 45 11 18 16 A 14 15 244094 CASAVA_Build 11 36176405 1D TAATACCCCC T/- TTCACATTGC 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 3 2 244095 CASAVA_Build 11 36182141 1I CTTTTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 A 13 14 244096 CASAVA_Build 11 36182625 2D TCTCTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 16 16 18 T 14 12 244097 CASAVA_Build 11 36186115 1D TAGATCCTGG T/- TATAAATAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 2 1 244098 CASAVA_Build 11 36186899 1D AATAGGGGGG A/- AAAAACACCA 3070 het 3070 ref 38 18 15 7 A 6 5 244099 CASAVA_Build 11 36201882 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 9 244100 CASAVA_Build 11 36221096 2D TTCTCCCCAA CT/-- CTCTAGCAGT 3070 het 3070 hom 47 22 22 4 CT 3 2 244101 CASAVA_Build 11 36225422 3D ATAATTAGCA CTT/--- CTTTTTTGGA 3070 hom 85 het 34 0 29 5 CTT 2 1 244102 CASAVA_Build 11 36235375 1I GTTTTCTGTG -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 244103 CASAVA_Build 11 36243786 1D TTCTCAGACA C/- CTTCATGTAC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 2 1 244104 CASAVA_Build 11 36245725 3D TGGGGTATAC CCT/--- CCTCCTCCTC 3070 hom 94 het 42 0 31 14 CCT 4 3 244105 CASAVA_Build 11 36248383 3D CTCCCAACCA TCT/--- TCTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 10 14 TCT 3 2 244106 CASAVA_Build 11 36255856 1I TTCACAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 414 hom 34 1 30 3 A 9 10 244107 CASAVA_Build 11 36272669 1D ACTGGGTGGC T/- TTATCAACAA 3070 hom 99 het 41 0 33 9 T 3 2 244108 CASAVA_Build 11 36277318 2I GAAAATGCTC --/AA GTTTCATTAT 3070 het 3070 ref 61 34 25 2 A 0 2 244109 CASAVA_Build 11 36278701 5D CAGAAGGGGC CATAT/----- CATCTCACCT 3070 het 3070 hom 21 7 12 3 CATAT 1 0 244110 CASAVA_Build 11 36278776 1D TATTTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 10 9 244111 CASAVA_Build 11 36285004 1I TCATAGTGCT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 8 9 244112 CASAVA_Build 11 36297809 2D CTAAATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 37 1 24 14 T 16 14 244113 CASAVA_Build 11 36298537 1D ACGCAGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 9 8 244114 CASAVA_Build 11 36313532 2D TTGGGTGGCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 73 het 31 0 23 9 GT 8 7 244115 CASAVA_Build 11 36322032 1I TTTTATGTTG -/C TTTTTTTTTT 2648 het 2135 hom 31 11 13 7 C 0 1 244116 CASAVA_Build 11 36330483 1D TTTTCAGATG T/- TTAGATTGTG 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 T 3 2 244117 CASAVA_Build 11 36359714 1I CCTTTTATGC -/T TGCCATTTAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 1 2 244118 CASAVA_Build 11 36361822 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2504 het 244 hom 26 4 7 17 T 18 17 244119 CASAVA_Build 11 36366069 1I CTTTCTTGGG -/A AAAAATCAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 5 6 244120 CASAVA_Build 11 36367316 1I TACATTTGTT -/G GGTCAGAGGG 3070 hom 102 het 41 0 33 8 G 2 3 244121 CASAVA_Build 11 36369151 9D TCTGACTGCA GAAGCTTCC/--------- GAGGGTTGTG 3070 hom 135 het 47 0 45 10 GAAGCTTCC 1 0 244122 CASAVA_Build 11 36369690 1I GCACCAAAAC -/T TTTTAAGTTG 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 4 5 244123 CASAVA_Build 11 36394950 5I CTCCCTGATA -----/GGAGG GGAGGGGAGG 3070 hom 98 het 36 0 26 10 GGAGG 2 3 244124 CASAVA_Build 11 36395662 2D TGTTGACAGG GT/-- GGCCCTCCAT 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 GT 1 0 244125 CASAVA_Build 11 36399905 1D CTCCTCTTTT A/- TTTTCCTTTC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 1 0 244126 CASAVA_Build 11 36403945 1I GTCATAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 11 12 244127 CASAVA_Build 11 36408160 1D AAGGAATTGC T/- TTTTTTTTTC 1487 het 1487 ref 45 36 4 5 T 10 9 244128 CASAVA_Build 11 36409582 1I TAAATTTATC -/T TTTTTTTTTA 2903 het 2903 ref 25 13 7 5 T 9 10 244129 CASAVA_Build 11 36420472 1I TTTCTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3008 het 414 hom 13 2 8 3 T 13 14 244130 CASAVA_Build 11 36420787 1I TTTACCAGAT -/A ACTCTAAGTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 1 2 244131 CASAVA_Build 11 36430137 5I CAAATATCTC -----/TATAA TATAATACAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 TATAA 1 2 244132 CASAVA_Build 11 36439748 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 9 244133 CASAVA_Build 11 36441771 1D TGTATCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 31 0 26 6 A 11 10 244134 CASAVA_Build 11 36443401 1I AAATCAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2664 hom 51 6 38 7 T 12 13 244135 CASAVA_Build 11 36443500 4D ACTCCACAGT CAGA/---- CAGCAGCCTT 3070 hom 114 het 42 0 38 8 CAGA 1 0 244136 CASAVA_Build 11 36446053 3I GCCCTTCTTC ---/CAA CAACTCCTTG 3070 hom 92 het 37 0 30 8 CAA 1 2 244137 CASAVA_Build 11 36452714 1I TTATAGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 11 12 244138 CASAVA_Build 11 36462769 1I AAAACTGATT -/G GACCCATGGT 3070 hom 99 het 43 0 32 11 G 1 2 244139 CASAVA_Build 11 36463706 2D CTGAGAGAAG AA/-- AAGCAGCACC 3070 hom 126 het 45 0 40 7 A 4 2 244140 CASAVA_Build 11 36464213 1D CACCCAGGCT G/- GGGGTGCAGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 5 4 244141 CASAVA_Build 11 36469279 1I ATTAATACCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 8 9 244142 CASAVA_Build 11 36475401 1I TCCTATAATT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 7 8 244143 CASAVA_Build 11 36484263 1D TCAATATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 327 hom 34 2 24 8 A 12 11 244144 CASAVA_Build 11 36488723 3D CTCTCCAAGC AGG/--- AGAAAACCCC 3070 hom 65 het 23 0 22 2 AGG 1 0 244145 CASAVA_Build 11 36509187 1D AGATTAAGGG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 132 het 53 0 45 8 T 9 8 244146 CASAVA_Build 11 36514761 5I AAAAGACAAA -----/TAAAT TAAGAAGAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TAAAT 0 1 244147 CASAVA_Build 11 36541724 4D CTCCAGAAGC ACTA/---- ACTGTTCATA 3070 hom 102 het 36 0 35 3 ACTA 1 0 244148 CASAVA_Build 11 36563226 1D AATACACACA T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 121 het 47 0 41 6 T 8 7 244149 CASAVA_Build 11 36595487 1D CTTTTGTGAT G/- GCAGACTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 G 2 1 244150 CASAVA_Build 11 36598082 14I TTTAACTGAA --------------/GACATAGGCCATGG GACATAGGCC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 GACATAGGCCATGG 1 2 244151 CASAVA_Build 11 36616012 1D TATGTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 31 2 22 8 T 13 12 244152 CASAVA_Build 11 36661485 1D GTAGTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 909 het 148 hom 20 2 5 13 T 19 18 244153 CASAVA_Build 11 36668717 1D AACTTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 16 3 A 13 12 244154 CASAVA_Build 11 36679372 1D TAAGTGCCAG C/- TTGCCTCTAG 3070 hom 117 het 45 0 40 6 C 1 0 244155 CASAVA_Build 11 36687240 1D ATAATCTATT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 153 hom 47 1 37 9 G 10 9 244156 CASAVA_Build 11 36692328 1I ATTCTTCGAT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 7 8 244157 CASAVA_Build 11 36696822 9D CCTGCTGGCA TAATGTTTT/--------- TCCTTTTAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 TAATGTTTT 1 0 244158 CASAVA_Build 11 36698986 1D ATTTTTTCCC T/- GTTTTTTAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 5 T 1 0 244159 CASAVA_Build 11 36703959 1D TAAAAAGAGG T/- TTTAATGGAC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 4 3 244160 CASAVA_Build 11 36707672 1I TTACACATGA -/T TTTTTTGTTA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 6 7 244161 CASAVA_Build 11 36708065 1I TGAAAATCAT -/A AAAAAAACCA 3070 hom 123 het 48 0 40 8 A 7 8 244162 CASAVA_Build 11 36709241 1I AGAACATAAC -/T TTTTTGGCCT 3070 hom 88 het 35 0 27 8 T 5 6 244163 CASAVA_Build 11 36710264 1I GAAAAAAGAA -/T TTAGAAAATG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 2 3 244164 CASAVA_Build 11 36714718 1I AGCTCACTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 30 0 24 6 T 8 9 244165 CASAVA_Build 11 36716530 1I AAGAAGGTTT -/G GCTTTACATT 3070 hom 114 het 47 0 38 10 G 1 2 244166 CASAVA_Build 11 36722505 1I AGAAAGGAGA -/C CCCCCCCACC 3070 hom 73 het 32 0 26 6 C 7 8 244167 CASAVA_Build 11 36734521 7D GAGTTTGCAT CAAGGTG/------- CAAGGTGGAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 CAAGGTG 2 1 244168 CASAVA_Build 11 36734929 8I2M2I AGAGGGAAGG --------AA--/TTTTTGTTAATT GTAGGGGATG 3070 hom 93 het 33 0 29 5 N/A 0 0 244169 CASAVA_Build 11 36736801 1D AACGGGAATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 8 244170 CASAVA_Build 11 36746339 2I TAAAGAAGTA --/TG TGAGAGTGGG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 TG 1 2 244171 CASAVA_Build 11 36780821 1I TTTAATGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 29 2 20 7 T 13 14 244172 CASAVA_Build 11 36792869 1D TGGATGTCAG A/- AAGGAACTGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 2 244173 CASAVA_Build 11 36793257 1I AAAGCAAGTA -/C CTTGAAGGCC 3070 hom 156 het 57 0 51 6 C 1 2 244174 CASAVA_Build 11 36801692 1I CCTTTCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 41 2 33 6 T 11 12 244175 CASAVA_Build 11 36807783 1I TTGTTAAAAT -/G GTTTGTTCTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 2 244176 CASAVA_Build 11 36811475 1I CTAGTATTTT -/G TGGAGGATTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 G 0 1 244177 CASAVA_Build 11 36822764 2D GAAGCAGAAC AA/-- GAGAGGTAGA 3070 hom 107 het 42 0 34 9 A 2 0 244178 CASAVA_Build 11 36822925 1D ATAACTGGTC G/- CCCTAGGCAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 0 244179 CASAVA_Build 11 36829861 3D CACTCTCTTG CCA/--- CCACCACAGG 2481 het 2481 ref 25 15 7 3 CCA 3 2 244180 CASAVA_Build 11 36847178 1I TATGCAGTGA -/G CCAAGATTGC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 0 1 244181 CASAVA_Build 11 36855472 6I ATAGGAGTGG ------/CGTCTC TGTCTCTTTA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 CGTCTC 0 1 244182 CASAVA_Build 11 36857110 1I CTAAGTGCTA -/T TTCAAGAAAT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 2 3 244183 CASAVA_Build 11 36861372 1D ATTTAGCCAA C/- CCTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 C 3 2 244184 CASAVA_Build 11 36867030 1I TATTTTTTTT -/C CTTCACAGAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 C 1 2 244185 CASAVA_Build 11 36870722 12I TTCCACTGCT ------------/TTATGAGAAGTG AAGTCTTCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TTATGAGAAGTG 0 1 244186 CASAVA_Build 11 36871700 1I TCCCCTATCC -/T TTTTTTTTTT 2031 het 293 hom 16 2 10 4 T 11 12 244187 CASAVA_Build 11 36878845 1D TACAGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 19 14 5 T 15 14 244188 CASAVA_Build 11 36885767 1I ATGATCAGCA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 57 het 32 0 20 12 T 8 9 244189 CASAVA_Build 11 36886035 1D3M1D TTGAGCTTTT GAGAG/-AGA- TCCAACTGGG 2682 hom 18 het 20 0 7 13 N/A 0 0 244190 CASAVA_Build 11 36892481 15D ACTCCATTTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAGAAA 3070 het 1736 hom 26 9 13 8 A 21 6 244191 CASAVA_Build 11 36894223 1I TAAAAAGGGT -/A GAATATTGAG 3070 hom 77 het 31 0 24 7 A 0 1 244192 CASAVA_Build 11 36910262 1I TCCAATTAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 244193 CASAVA_Build 11 36914770 1I GTATCCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 10 11 244194 CASAVA_Build 11 36918060 1D TCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2219 het 960 hom 12 3 5 4 T 7 6 244195 CASAVA_Build 11 36918565 1I ATTTTGAAAA -/T TTATCTTTAA 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 2 3 244196 CASAVA_Build 11 36918799 1I TTTGGTTATA -/T TTTAATCACT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 3 4 244197 CASAVA_Build 11 36925070 1I GGGAGATGAT -/G ATGGGAGGTG 3070 hom 103 het 40 0 33 7 G 0 1 244198 CASAVA_Build 11 36932339 1D GAACTGGAGA T/- TTTCTGATTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 4 3 244199 CASAVA_Build 11 36934345 4D GGGGATATGC ATAA/---- ATATTTTAGT 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 ATAA 1 0 244200 CASAVA_Build 11 36935656 2I CAAACTTCAC --/AT GTTTTCATTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 0 1 244201 CASAVA_Build 11 36939113 1I TTGACAAACC -/T TTAGCTGAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 3 244202 CASAVA_Build 11 36941440 2D ACACTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 87 het 43 0 30 13 TC 9 8 244203 CASAVA_Build 11 36942484 2I TCTATCTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 9 11 3 A 10 12 244204 CASAVA_Build 11 36943351 1D TGCAATACAC A/- AATCTCTCCT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 3 2 244205 CASAVA_Build 11 36943452 1D ATAAGGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 T 11 10 244206 CASAVA_Build 11 36959244 1D GCGCATTGCT G/- GGGGGGCCTC 3070 hom 36 het 27 0 13 15 G 7 6 244207 CASAVA_Build 11 36963847 1I TCTAAGAACC -/T TTTCTTTTTA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 3 4 244208 CASAVA_Build 11 36966474 1I AATGAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 11 12 244209 CASAVA_Build 11 36970675 1I AGGATATAAA -/T TTGCCACATT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 2 3 244210 CASAVA_Build 11 36972653 1D CCTTGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 13 12 244211 CASAVA_Build 11 36980224 2I GGGAAATGTC --/TA TAACCTCTTG 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 TA 1 2 244212 CASAVA_Build 11 36994169 1D TAGCGATGAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 9 8 244213 CASAVA_Build 11 36994437 4D TGATGATTGA ATAG/---- ATAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 ATAG 1 0 244214 CASAVA_Build 11 37013914 1D TCCAATTTGT A/- AAAGCTCAAC 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 A 4 3 244215 CASAVA_Build 11 37043029 1I AACCGATCTG -/T GTGGTGGAAT 3070 het 3070 ref 52 23 20 9 T 0 1 244216 CASAVA_Build 11 37054101 1I ACTCTCTGGA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 G 1 2 244217 CASAVA_Build 11 37055007 1I TAAGCAAAGA -/T TAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 1 2 244218 CASAVA_Build 11 37055390 2I TAAGGCAGAA --/AC AGTTTTTCAC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 AC 0 1 244219 CASAVA_Build 11 37063012 2D ATGTAGTAAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3013 hom 41 9 17 15 AT 9 8 244220 CASAVA_Build 11 37064236 1I TCTTGTTTTG -/A AACAAAGGAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 2 3 244221 CASAVA_Build 11 37070309 5D GGACCTTTAC ATTTA/----- ATCCTTACAA 3070 het 3070 hom 43 19 22 8 ATTTA 1 0 244222 CASAVA_Build 11 37074528 4D GTTAATAGAC TGTT/---- TGTGCTATCA 3070 het 3070 ref 48 22 22 5 TGTT 1 0 244223 CASAVA_Build 11 37075708 2D TTATATCACC AT/-- GGAAATTGGC 2236 het 2236 ref 24 13 6 6 AT 1 0 244224 CASAVA_Build 11 37084775 1I CACTTTTTAC -/T TTTTTGGAAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 5 6 244225 CASAVA_Build 11 37087226 2I TGTAAGAAAC --/TG TGTTCTACCT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 TG 1 2 244226 CASAVA_Build 11 37088422 1D AACTTTTGGC T/- TGGTTAGATG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 244227 CASAVA_Build 11 37089484 1I ATGTTTTTTT -/C TTTTCTTTTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 0 1 244228 CASAVA_Build 11 37106163 1D CTCCAACCAC T/- TTACAGAGTG 3070 hom 111 het 42 0 36 6 T 3 2 244229 CASAVA_Build 11 37109995 1D TGAATTGTTC T/- ATAATTTATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 0 244230 CASAVA_Build 11 37110103 5D GTGGTAGAGT TTTAA/----- TTTATCTATT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTTAA 1 0 244231 CASAVA_Build 11 37112898 5D TACTATTCTT ATATC/----- AGATAAAACA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 ATATC 1 0 244232 CASAVA_Build 11 37118266 1D TGTAATTTAA T/- TTTTTTTTCG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 9 8 244233 CASAVA_Build 11 37118978 1D8M1D CTTACCTTGT AATACTGAGT/-ATACTGAG- TTTTTTCTCT 3070 hom 81 het 28 0 28 3 N/A 0 0 244234 CASAVA_Build 11 37121351 1I TATTGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 10 11 244235 CASAVA_Build 11 37126217 1I TATTTATCAA -/T TTTTTTTTTT 1884 het 443 hom 11 1 6 4 T 10 11 244236 CASAVA_Build 11 37131843 1D AAAAATATTG C/- CAATATATTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 2 1 244237 CASAVA_Build 11 37132591 1I CTCAAATCAA -/G GGACTGAATT 3070 hom 129 het 51 0 42 9 G 2 3 244238 CASAVA_Build 11 37133567 2D TTTTGTGTGT GA/-- GAGAGAGAGA 1048 het 1048 ref 38 29 3 6 GA 7 6 244239 CASAVA_Build 11 37139858 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 11 10 244240 CASAVA_Build 11 37142959 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 13 14 244241 CASAVA_Build 11 37156273 1I ATTAAATGGG -/C TTTTGAATTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 0 1 244242 CASAVA_Build 11 37161564 2D TGTTTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 46 het 26 0 16 10 TA 10 9 244243 CASAVA_Build 11 37182226 1D TGCAGATTCC T/- TTTTTTTTTT 1580 het 1580 ref 38 26 5 7 T 13 12 244244 CASAVA_Build 11 37204878 1I GTTGGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 10 11 244245 CASAVA_Build 11 37216364 1I TCATAACTCC -/T TTTTTTTTTA 2689 het 2689 ref 25 16 8 1 T 9 10 244246 CASAVA_Build 11 37229719 1I GAATTGGACG -/T TTTTTTTTTT 2790 het 2790 ref 41 17 11 13 T 10 11 244247 CASAVA_Build 11 37236238 1I ACAGTATAGT -/A AAGTTGTGTG 3070 het 3070 ref 56 27 21 8 A 2 3 244248 CASAVA_Build 11 37241276 1D TTTTAGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 T 11 10 244249 CASAVA_Build 11 37244056 2D TAATGCCATG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 11 9 244250 CASAVA_Build 11 37251676 1D AATAGATATA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 8 7 244251 CASAVA_Build 11 37253587 2D ATGACTGATG GC/-- CAGGGACTCT 3070 het 3070 hom 42 21 20 1 GC 1 0 244252 CASAVA_Build 11 37253865 3I TTAGGCTCTG ---/TGT TTTCACTCTA 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 TGT 0 1 244253 CASAVA_Build 11 37255648 1I TCTCAGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 T 10 11 244254 CASAVA_Build 11 37256156 4I TAAGGCATTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 17 18 8 TTTG 3 4 244255 CASAVA_Build 11 37260546 2D AGTAATAAAC TT/-- ATATAAAATA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 T 2 0 244256 CASAVA_Build 11 37267507 3I TTGAAAGGAA ---/TCT TCTTTTTCTT 3070 hom 124 het 48 0 42 6 TCT 1 2 244257 CASAVA_Build 11 37274876 1I TGATGTTAAC -/T GTAGACATTT 3070 het 3070 ref 39 22 7 10 T 0 1 244258 CASAVA_Build 11 37277011 1D ACAGATATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 10 9 244259 CASAVA_Build 11 37288840 1I ACAAGTTTCA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 7 8 244260 CASAVA_Build 11 37299619 1I TTTGCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 11 12 244261 CASAVA_Build 11 37305952 1I CACCTGCTCT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 8 9 244262 CASAVA_Build 11 37330314 3I TATATTATAC ---/ATA ATATTCATTT 1086 het 1086 ref 9 5 3 1 ATA 1 2 244263 CASAVA_Build 11 37344552 1D TAAAAAGAGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 A 9 8 244264 CASAVA_Build 11 37353637 2I TTATAAGAAT --/AG AGCACTCTAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AG 1 2 244265 CASAVA_Build 11 37354168 7I GATTGCATTG -------/AGTCTAC AGTCTACAGA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 AGTCTAC 1 2 244266 CASAVA_Build 11 37357009 1I CAAGCTTCTA -/T TTTTATTCTT 3070 het 3070 hom 44 23 19 2 T 4 5 244267 CASAVA_Build 11 37358652 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAGGACA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 5 6 244268 CASAVA_Build 11 37360272 2I CTTGCTCTTT --/TC TCTCTATTTT 2749 het 2749 ref 31 18 7 6 TC 2 3 244269 CASAVA_Build 11 37365970 5I AGACCCAGAC -----/ACTGT AGAGTCTCCT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 ACTGT 0 1 244270 CASAVA_Build 11 37371030 3I AGTTATGTTA ---/GTT GTCGGTATTT 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 GTT 0 1 244271 CASAVA_Build 11 37378641 3D ATTTTTTATA AAT/--- AATAATCTCG 1434 het 1434 ref 14 10 3 1 AAT 3 2 244272 CASAVA_Build 11 37384428 1D TGTTATGTTG T/- TTTTTGATTG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 6 5 244273 CASAVA_Build 11 37384990 1I GCATTTTTCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 8 9 244274 CASAVA_Build 11 37386019 4D TCTTTCTGTC TTCT/---- TTTTGTTTCC 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 TTCT 1 0 244275 CASAVA_Build 11 37398485 1I CAAACCTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 11 12 244276 CASAVA_Build 11 37405381 92D ATTGCACATT TAAAAATAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTGAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA/-------------------------------------------------------------------------------------------- TAAAAATAAC 2716 het 2716 ref 27 25 6 6 TAAAAATAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTGAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA 1 0 244277 CASAVA_Build 11 37406017 2D ATTGATTATA TT/-- TCTTTTTTTT 2847 het 2222 hom 19 8 9 2 T 3 1 244278 CASAVA_Build 11 37424536 2I AAAAAAAAAA --/GT CTTTGCATTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 GT 0 1 244279 CASAVA_Build 11 37427277 1D AATATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 12 11 244280 CASAVA_Build 11 37436503 1D AGTTTAAAGT A/- AACATCAAGT 3070 het 3070 hom 47 14 30 3 A 3 2 244281 CASAVA_Build 11 37442934 4D TTATGGAATT TTTA/---- TTTGATTCTT 3070 het 3070 ref 29 19 9 2 TTTA 1 0 244282 CASAVA_Build 11 37456144 1I TTTCAATACA -/C CTCACATTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 244283 CASAVA_Build 11 37468543 1D ATGTGTAATA T/- TTTTTTTAAT 2747 het 2747 ref 41 30 6 5 T 8 7 244284 CASAVA_Build 11 37495282 1I TGTAGTGTGT -/A AAATTACTCT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 3 4 244285 CASAVA_Build 11 37506005 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTCTTT 1251 het 1251 ref 32 16 8 8 T 7 6 244286 CASAVA_Build 11 37514177 39D3M20D CCCAAAGATG CTTACAATTCAATTCTATTTCTTTTCAGGTGTAGTTTCTATGGAATCAAAAAAGAAGCATTT/---------------------------------------ATG-------------------- ATTAATATTC 3070 het 3070 ref 32 33 10 3 N/A 0 0 244287 CASAVA_Build 11 37514493 1D TAGTACTTTT A/- TTTTTGCATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 1 0 244288 CASAVA_Build 11 37514861 1I TTTCTAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 544 hom 25 3 17 5 C 0 1 244289 CASAVA_Build 11 37517220 14I CAAATGCATG --------------/AAAAGACATATCCA TACAAAGACT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 AAAAGACATATCCA 0 1 244290 CASAVA_Build 11 37518757 1I GTGTGTATTC -/A AATGGAAATT 3070 hom 132 het 45 0 45 0 A 2 3 244291 CASAVA_Build 11 37520539 1D AAATGGTTGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 A 9 8 244292 CASAVA_Build 11 37527531 4I TGCATGTGTT ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 TG 6 8 244293 CASAVA_Build 11 37533267 1I AAAAAAAAAA -/T ATTGTATAAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 0 1 244294 CASAVA_Build 11 37542433 1I GTAAAATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 9 10 244295 CASAVA_Build 11 37553840 4I TCGTGGCAGC ----/CAAA CAATGTTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 CAAA 0 1 244296 CASAVA_Build 11 37554606 1D GTTTAATATT A/- AAAAAAGCAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 6 244297 CASAVA_Build 11 37555769 1D TCCATTAAAA C/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 C 1 0 244298 CASAVA_Build 11 37557917 1I GCCCTGTTGC -/A AAGAGCAGGG 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 A 2 3 244299 CASAVA_Build 11 37558006 24D CTGACAGAAG GGAAAAAATGACCACAGACCCTGT/------------------------ GGGAAAGGCC 3066 het 3066 ref 42 35 8 1 GGAAAAAATGACCACAGACCCTGT 1 0 244300 CASAVA_Build 11 37564955 1D TTCATTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 29 2 10 17 T 17 16 244301 CASAVA_Build 11 37565691 4D GTTTAGCTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1639 hom 31 7 13 11 T 17 13 244302 CASAVA_Build 11 37566098 2I ATTGTAAAAC --/AT GTGTGTTTGA 3070 het 3065 hom 19 7 10 2 AT 0 1 244303 CASAVA_Build 11 37566722 1D TGTTAGACCC T/- TATCAGTGGT 3035 het 3035 ref 28 19 7 2 T 2 1 244304 CASAVA_Build 11 37567334 1D TTATTTTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 11 10 244305 CASAVA_Build 11 37572262 1I ATTTTGAAAA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 3 4 244306 CASAVA_Build 11 37572952 3D CCACACTGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 17 10 A 15 12 244307 CASAVA_Build 11 37575663 1I TGCTCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2824 hom 24 9 12 3 A 12 13 244308 CASAVA_Build 11 37576496 1I CACTTATGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 9 10 244309 CASAVA_Build 11 37579612 1D GATTGACTTC A/- GTTGTTCTTA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 1 0 244310 CASAVA_Build 11 37584368 1I ATAGCCACAC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 7 8 244311 CASAVA_Build 11 37588257 2D TCTTAATAAC AG/-- AGAGAAATGC 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 AG 3 2 244312 CASAVA_Build 11 37591531 1D ACCTTCCCCC T/- AATCTGTGTC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 1 0 244313 CASAVA_Build 11 37591941 1I CAGGTGATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2426 hom 26 8 16 2 T 9 10 244314 CASAVA_Build 11 37593208 4D CTCTCAAAAC TTTG/---- TTTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 TTTG 1 0 244315 CASAVA_Build 11 37602440 1I GCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 T 10 11 244316 CASAVA_Build 11 37603168 1D GAAAAATTAG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 51 19 24 9 T 8 7 244317 CASAVA_Build 11 37607588 1D GTTCTAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 39 0 28 11 T 12 11 244318 CASAVA_Build 11 37610988 4I TTTGTTTATT ----/TTTC TTTCTAAGAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 TTTC 1 2 244319 CASAVA_Build 11 37615088 12D GAGCAGTATT AGTTTCACGCAA/------------ AACTGAGCTG 2298 het 2298 ref 23 16 6 3 AGTTTCACGCAA 1 0 244320 CASAVA_Build 11 37615558 22D CATGGCTTGA TTCATCATCTTTTTTAGCCCTG/---------------------- TTCTATATTC 3070 het 3070 hom 37 21 22 4 TTCATCATCTTTTTTAGCCCTG 1 0 244321 CASAVA_Build 11 37621031 1D GTATTAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 13 26 4 A 10 9 244322 CASAVA_Build 11 37624879 4I AAGCAAAAAA ----/CTTT CTTCATCTTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 CTTT 0 1 244323 CASAVA_Build 11 37625640 1D TTAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 1436 het 1436 ref 14 7 5 2 A 10 9 244324 CASAVA_Build 11 37627785 1I GAAAAAAAAA -/T ATGTAATCTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 244325 CASAVA_Build 11 37628885 2I GTTGTGGGGC --/TA TGATTTATAT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 TA 0 1 244326 CASAVA_Build 11 37630624 3I GAATTGATGG ---/ATC ATCATATGGT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 ATC 1 2 244327 CASAVA_Build 11 37646172 1D TGCCTTCGCT G/- GGCACTTATT 3070 het 3070 hom 45 19 20 7 G 3 2 244328 CASAVA_Build 11 37650178 12D ATAGGTAAAG ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 2376 het 279 hom 16 2 7 8 AT 21 15 244329 CASAVA_Build 11 37661969 1D AAAAAAGGAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 9 8 244330 CASAVA_Build 11 37667879 4D TTAGGAGAGA TAAT/---- TAATCAAATT 3070 het 3070 ref 40 20 18 5 TAAT 2 1 244331 CASAVA_Build 11 37669981 1I TTAATAAAGT -/A AGTAGCCATG 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 A 1 2 244332 CASAVA_Build 11 37670566 10D AAGAAAAGAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAG 2648 het 945 hom 16 5 7 4 AAAAG 5 3 244333 CASAVA_Build 11 37672963 1I TACCAGGAGT -/G GGGTGCTGCT 3067 het 3067 ref 25 17 7 1 G 3 4 244334 CASAVA_Build 11 37674677 18D GAGGAGATCC CTTGCACAAGTTGCCTCT/------------------ CTTGCCTGTT 3070 het 3070 ref 38 25 16 2 CTTGCACAAGTTGCCTCT 1 0 244335 CASAVA_Build 11 37676214 4I TCTATGTCAC ----/CAAA CAATCACAAA 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 CAAA 0 1 244336 CASAVA_Build 11 37681944 1I TGTTCCAGCA -/T TTTTTTTTTT 2969 het 2969 ref 36 18 9 9 T 13 14 244337 CASAVA_Build 11 37690751 1I TTTCTAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 18 15 14 T 11 12 244338 CASAVA_Build 11 37690870 1I CAAAAACATC -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 6 7 244339 CASAVA_Build 11 37726188 1I TGAAATCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 881 hom 24 2 17 5 T 13 14 244340 CASAVA_Build 11 37730937 1I9M1D7M1D TTTCTTTCTT -TCTTTCTTCTCTTTCTTC/CTCTTTCTTC-CTTTCTT- CTTTCTTCTT 3070 het 3037 hom 16 8 8 0 N/A 0 0 244341 CASAVA_Build 11 37744113 4I AATATATCAG ----/CTTA CTTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 CTTA 0 1 244342 CASAVA_Build 11 37751663 1I GCTATTGGGT -/A AAATACAGCT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 3 4 244343 CASAVA_Build 11 37760632 1I CTAGTTTCTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 8 9 244344 CASAVA_Build 11 37768260 1I AAGTATCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 14 14 T 11 12 244345 CASAVA_Build 11 37772638 1D AATTTGTTAG A/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 1 0 244346 CASAVA_Build 11 37774538 1D GAAATAATGC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 10 9 244347 CASAVA_Build 11 37777732 1D AAAAAGACTG A/- AAAAAATGGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 7 6 244348 CASAVA_Build 11 37781188 2D CAAAATCTAG AT/-- ATGTCATATA 3070 het 3070 hom 42 14 18 13 AT 2 1 244349 CASAVA_Build 11 37787259 3D AATATTATAA TTC/--- TTCTTTCATT 3070 het 2315 hom 20 6 12 2 TTC 2 1 244350 CASAVA_Build 11 37805864 2I CACACAGACG --/CA CACACACACA 3070 het 275 hom 35 1 27 7 CA 6 7 244351 CASAVA_Build 11 37808530 1I AGAAAAGTAT -/A TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 A 0 1 244352 CASAVA_Build 11 37814495 4I AAGGCTTCCC ----/TAAA TAAATTACTA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 TAAA 1 2 244353 CASAVA_Build 11 37818828 3D GTAGCTGGGA TTT/--- TTACAGGTGC 1632 het 1632 ref 14 8 5 2 T 5 2 244354 CASAVA_Build 11 37820432 1D CCTTGCTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 T 10 9 244355 CASAVA_Build 11 37822655 1I TATCCCAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 9 10 244356 CASAVA_Build 11 37827153 1I AATGAATAAA -/T TGCACTACTA 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 1 2 244357 CASAVA_Build 11 37832807 1D AATTTTAATG A/- AAAAAACCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 6 244358 CASAVA_Build 11 37838221 2D CTGCTGTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 33 1 26 6 T 15 13 244359 CASAVA_Build 11 37841839 1I GCTAATTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 376 hom 33 1 28 4 A 9 10 244360 CASAVA_Build 11 37844066 3D TTGCTGAATT AAC/--- AATTATTTGA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 AAC 1 0 244361 CASAVA_Build 11 37855528 1D AGATACGATC T/- TACACGCCAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 2 1 244362 CASAVA_Build 11 37858793 4D TTATCCCGAT ATAA/---- ATACTTTCAA 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 ATAA 1 0 244363 CASAVA_Build 11 37859603 3D AGGGCAGGTA TAC/--- TAGCAGTGTT 3070 hom 96 het 38 0 32 7 TAC 1 0 244364 CASAVA_Build 11 37859717 1I TGTTACAAGA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 113 het 44 0 38 6 T 8 9 244365 CASAVA_Build 11 37864186 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 10 11 244366 CASAVA_Build 11 37864676 1D GTATTGATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 9 8 244367 CASAVA_Build 11 37867456 1D TTTTATGGTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 7 244368 CASAVA_Build 11 37872532 5I AATTAATTGG -----/TTTAT TTTGTTTATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTTAT 0 1 244369 CASAVA_Build 11 37905708 1D TTAAGGTATC T/- TTTTTCAGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 6 5 244370 CASAVA_Build 11 37917317 3I TTGATGTGTT ---/ATC ATAAAATGCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATC 0 1 244371 CASAVA_Build 11 37921838 1D CCGGTCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 32 5 19 8 T 15 14 244372 CASAVA_Build 11 37922371 1D CTTGGCACTG T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 7 6 244373 CASAVA_Build 11 37930935 1D TGAAAAACTA T/- TTTTTAATAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 6 5 244374 CASAVA_Build 11 37933168 1D CTTAATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 20 1 14 5 T 13 12 244375 CASAVA_Build 11 37940918 1D TATCATTAGT A/- ATTCTACAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 1 244376 CASAVA_Build 11 37941410 1I TGTTATATGG -/T TTTTTGTGTG 1687 hom 10 het 5 0 4 1 T 5 6 244377 CASAVA_Build 11 37944230 18D ATCTACAAGA AGAACTACTGCTGAAAGG/------------------ AGAACTACTG 3070 hom 72 het 25 0 24 8 AGAACTACTGCTGAAAGG 1 0 244378 CASAVA_Build 11 37946129 3I TTTTGGGGGG ---/GGT GGGGGGTGCA 3070 hom 51 het 23 0 14 9 GGT 0 1 244379 CASAVA_Build 11 37946920 1D GTACAGTAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 171 hom 39 1 35 3 A 10 9 244380 CASAVA_Build 11 37991169 3D TCTTTCCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 TTG 7 6 244381 CASAVA_Build 11 38035165 1D GTTTATTCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 23 9 T 12 11 244382 CASAVA_Build 11 38040299 1D TTACATATAC A/- ATTTTCATAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 2 1 244383 CASAVA_Build 11 38084815 1I TTGACTCTTG -/T TTTTTTTTTT 1161 het 1161 ref 44 26 4 14 T 13 14 244384 CASAVA_Build 11 38118679 1D GTGCACTTTT A/- ATGTTCATTG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 2 1 244385 CASAVA_Build 11 38156268 1I CAATTAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 9 T 10 11 244386 CASAVA_Build 11 38156774 2D ACAAGCTGAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 78 het 32 0 26 8 AC 8 7 244387 CASAVA_Build 11 38157895 1D ACTTTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 33 1 28 4 A 12 11 244388 CASAVA_Build 11 38158215 1D AGAGTTGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 41 0 34 8 T 10 9 244389 CASAVA_Build 11 38159047 1D GGTTACGGGA C/- CCCCCCCAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 8 7 244390 CASAVA_Build 11 38160557 1D TCCAAAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 22 0 18 4 T 12 11 244391 CASAVA_Build 11 38169915 30D GTCTACAGCT CCCAGTGTGAGTGACGCAGAAGACGGGTGA/------------------------------ TTTCTACATT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 CCCAGTGTGAGTGACGCAGAAGACGGGTGA 1 0 244392 CASAVA_Build 11 38176010 5I ATAATAATAC -----/AATAA AATAAAATAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 AATAA 2 3 244393 CASAVA_Build 11 38180614 1I CAGCAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 10 11 244394 CASAVA_Build 11 38184112 1D AAAAAAAAAA T/- CATTAGAGAA 2904 het 2904 ref 24 13 8 3 T 1 0 244395 CASAVA_Build 11 38189034 4I ATAGAGACTT ----/TGTC TGTGCTGTTT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 TGTC 0 1 244396 CASAVA_Build 11 38214321 1I7M3D TAAAAAAAAT -AAATAAACTT/AAAATAAA--- CTTTTGTGTA 3070 hom 90 het 31 0 31 2 N/A 0 0 244397 CASAVA_Build 11 38214618 4D TAGCATCATC TCTT/---- TTTTTCTCTA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 TCTT 1 0 244398 CASAVA_Build 11 38215328 1I CTTTGTTCTT -/C TTTTTTTTTT 1126 hom 41 het 22 0 13 9 C 0 1 244399 CASAVA_Build 11 38225227 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTC 3070 hom 139 het 58 0 45 13 TG 5 4 244400 CASAVA_Build 11 38225571 2D GTATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 105 het 39 0 35 7 AC 6 5 244401 CASAVA_Build 11 38237303 1D CTGCTTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 11 10 244402 CASAVA_Build 11 38237645 1D ATTTTAAGGT G/- TTTTTTTTCC 3070 het 99 hom 31 1 26 4 G 1 0 244403 CASAVA_Build 11 38242118 1I ATTTTTTTTT -/A AAAATATGTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 4 5 244404 CASAVA_Build 11 38243516 1I GCATTAGGCG -/A AAGTTACCTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 3 244405 CASAVA_Build 11 38251986 1I TCAATTATAC -/T TTGTTCTTTA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 2 3 244406 CASAVA_Build 11 38263108 2D CTTCAAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 1407 het 442 hom 32 4 3 26 A 12 10 244407 CASAVA_Build 11 38266683 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2816 hom 30 9 15 6 T 12 11 244408 CASAVA_Build 11 38276850 1I CTTTAGGTTT -/G TCTTTCCCAG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 0 1 244409 CASAVA_Build 11 38284703 2D51M4I TCTTTCTTTC TTTCTTTCCCTTTCTTTCCCTTCCTTCCTTCCTCTCTCTCTTTTCTTCTTTCT----/--TCTTTCCCTTTCTTTCCCTTCCTTCCTTCCTCTCTCTCTTTTCTTCTTTCTTTTC TTTCTTTCTC 3070 hom 117 het 33 0 40 8 N/A 0 0 244410 CASAVA_Build 11 38291747 1I AATAAGTGAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 9 244411 CASAVA_Build 11 38291955 2D AGAAGACAGA AT/-- ATATAGCTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AT 3 2 244412 CASAVA_Build 11 38292048 3D GAAAAAAGTT AAG/--- GAGAATTGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAG 1 0 244413 CASAVA_Build 11 38296314 2I ATTAAAGATT --/AG AGTTTGTATT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AG 1 2 244414 CASAVA_Build 11 38300766 4I CCTGAGGCAA ----/AAAC AAACAAAATG 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AAAC 1 2 244415 CASAVA_Build 11 38302200 1D AAGGATTTTT G/- TTTTTTTCCC 3070 het 356 hom 32 1 25 6 G 1 0 244416 CASAVA_Build 11 38303458 1I GCTATGCAGG -/A AAAAAATTAC 3070 hom 132 het 52 0 44 8 A 6 7 244417 CASAVA_Build 11 38306813 1I TAATTGCATG -/A AAAAATGACA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 5 6 244418 CASAVA_Build 11 38308777 1D TCCATATAAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 111 het 47 0 38 9 A 9 8 244419 CASAVA_Build 11 38319581 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 10 9 244420 CASAVA_Build 11 38324932 1D AACAGAAAAA C/- TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 0 244421 CASAVA_Build 11 38328011 2D AAGCCCCCAA AT/-- AATTTCCTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 6 AT 1 0 244422 CASAVA_Build 11 38344393 1D CTGTCCCTGG T/- TTTTTATATG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 6 5 244423 CASAVA_Build 11 38345118 1I GAATGAGTGC -/T TTTAGTCTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 3 4 244424 CASAVA_Build 11 38348401 3I CAATCAACTT ---/ACA GACATAATTG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 ACA 0 1 244425 CASAVA_Build 11 38354140 1D CTGTAGATTT C/- TTTGAGCAGG 3070 hom 108 het 40 0 37 4 C 1 0 244426 CASAVA_Build 11 38359071 1I TTTATTAATC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 70 het 35 0 29 6 T 9 10 244427 CASAVA_Build 11 38360239 1I AGAAGTGCCA -/G GAACATAAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 2 244428 CASAVA_Build 11 38369337 1D TCCTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 2490 het 2490 ref 30 17 6 7 T 12 11 244429 CASAVA_Build 11 38377492 2D TATAAAAAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2080 hom 17 6 9 3 TA 7 6 244430 CASAVA_Build 11 38378337 2D CATGTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 726 het 726 ref 49 34 3 12 TG 7 6 244431 CASAVA_Build 11 38386884 4I TGATTATTTT ----/TTTC TTTTTCTTAT 3070 het 922 hom 16 4 12 0 TTTC 0 1 244432 CASAVA_Build 11 38389847 1I TTGGCTGAAA -/T CTTTCCTCTG 3070 het 3070 ref 49 33 15 2 T 0 1 244433 CASAVA_Build 11 38403377 1I TATGTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 11 12 244434 CASAVA_Build 11 38405407 2I TGGCTTTGGG --/TT TGTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 1 3 244435 CASAVA_Build 11 38407274 11D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAGAAAA 3070 het 2096 hom 16 7 10 4 A 16 5 244436 CASAVA_Build 11 38410323 6I TTGAGTGTTT ------/AATACA AAAGTGACCA 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 AATACA 0 1 244437 CASAVA_Build 11 38410385 6I ATCATCATTT ------/AGGAAA AGGAGGAGGA 2554 hom 30 het 13 0 7 6 AGGAAA 0 1 244438 CASAVA_Build 11 38412780 1D ATCCTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2767 hom 31 9 12 10 T 17 16 244439 CASAVA_Build 11 38415241 1I GTCATTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 10 11 244440 CASAVA_Build 11 38418301 2I AAAAGAAAAA --/AT ACTTTCTTGA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 AT 0 1 244441 CASAVA_Build 11 38419171 1D CCTGAACACA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 45 14 28 3 T 8 7 244442 CASAVA_Build 11 38421897 2D TGCATGCATA TG/-- TGTGTGTGTG 2340 het 2340 ref 49 31 6 13 TG 9 8 244443 CASAVA_Build 11 38422920 3D TAAAAATAGT TTG/--- TTATTTCCTT 3070 het 3070 ref 42 21 20 2 TTG 1 0 244444 CASAVA_Build 11 38425888 1I ATGGTCAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 8 9 244445 CASAVA_Build 11 38427037 1D TTCCATAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 19 24 8 T 10 9 244446 CASAVA_Build 11 38427682 1I ATAAATATAT -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 6 7 244447 CASAVA_Build 11 38430117 1D CACCTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 21 13 12 T 12 11 244448 CASAVA_Build 11 38431430 1D GGCTTCTTCG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 10 9 244449 CASAVA_Build 11 38432650 1D GGCTAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 28 3 14 11 A 13 12 244450 CASAVA_Build 11 38438300 3I TATTAAAAAG ---/ATA ATAAAATAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 ATA 1 2 244451 CASAVA_Build 11 38442387 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 A 11 10 244452 CASAVA_Build 11 38443927 1D ACATTGTTCT G/- GGAATTCCTA 3070 het 3070 ref 35 23 12 0 G 3 2 244453 CASAVA_Build 11 38444570 1D ATTTTAAAAA G/- GGGCTACTCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 4 3 244454 CASAVA_Build 11 38445895 1D TTAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 10 9 244455 CASAVA_Build 11 38448164 2I ATAACTCTAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 AT 7 8 244456 CASAVA_Build 11 38456936 4D CTAAGACAAA AAAT/---- AAATAAATAT 3070 het 3070 ref 25 11 9 9 AAAT 3 2 244457 CASAVA_Build 11 38458314 3D AATGAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 2870 het 2870 ref 32 12 8 14 A 17 14 244458 CASAVA_Build 11 38462989 3D TGCACATACG AGA/--- AGGAGTAGAG 3070 het 3070 ref 55 26 27 4 AGA 1 0 244459 CASAVA_Build 11 38466716 6D AAAGTTTTTA GTATTT/------ GTTTTTGTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 5 GTATTT 1 0 244460 CASAVA_Build 11 38480048 1I AATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 482 hom 32 2 24 6 T 9 10 244461 CASAVA_Build 11 38487328 1D AGAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1099 het 1099 ref 36 29 3 4 A 12 11 244462 CASAVA_Build 11 38492902 1I CTTACTGCTA -/G CCTTTGGTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 0 1 244463 CASAVA_Build 11 38500545 1I TATTTTTAAG -/A AAAAAACTAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 6 7 244464 CASAVA_Build 11 38508842 1I TCTTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 30 1 24 5 C 0 1 244465 CASAVA_Build 11 38517413 1I CACACTAGTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 59 het 25 0 18 7 T 8 9 244466 CASAVA_Build 11 38517581 1I CCTTCCCCCA -/C CCCCCAACAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 5 6 244467 CASAVA_Build 11 38526480 1I TCTCCTCGCC -/A AAAAAACAAG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 6 7 244468 CASAVA_Build 11 38529082 5D TAAGAATGAA ATAAG/----- ATAATTTATG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 ATAAG 1 0 244469 CASAVA_Build 11 38530983 1D TTTTTTTCAG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 7 244470 CASAVA_Build 11 38533726 3D TCATGACTAA TCT/--- TCTTTGCTCA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TCT 2 1 244471 CASAVA_Build 11 38534689 3I GTATTCTTTC ---/ATT ATTATTCTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATT 2 3 244472 CASAVA_Build 11 38535913 2D CTCAGCATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 AC 10 9 244473 CASAVA_Build 11 38536360 1I AACTCTAGTA -/T TTAACCAGCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 3 244474 CASAVA_Build 11 38566078 5I17M1I AAACCTTAAT -----TTTTTTTTTCGAATTTT-/TTAACTTTTTTTTTCGAATTTTG TAAGAAGATA 3070 hom 105 het 32 0 36 3 N/A 0 0 244475 CASAVA_Build 11 38566363 2D AAAAAATACA CT/-- CAGTGTTTTC 3070 het 3070 ref 45 27 18 0 CT 1 0 244476 CASAVA_Build 11 38577791 1D ACCTATGGTC T/- TTTTTTTTTT 1075 het 1075 ref 34 28 3 3 T 13 12 244477 CASAVA_Build 11 38578162 2D CAAACAATAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 14 22 5 AC 6 5 244478 CASAVA_Build 11 38581966 1D GCATAAGAAC G/- GTTGTTTATG 3070 het 3070 hom 28 14 13 2 G 2 1 244479 CASAVA_Build 11 38583089 1I AAATGGGATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2141 hom 26 8 13 5 A 9 10 244480 CASAVA_Build 11 38587951 1D GGTTGACAGC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 8 7 244481 CASAVA_Build 11 38589507 9I CCTTCCAAAA ---------/ATGATTTCG ATGACAATAG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 ATGATTTCG 0 1 244482 CASAVA_Build 11 38590042 1I TCGCAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 10 11 244483 CASAVA_Build 11 38604357 1D CATGTAGTGG A/- AGGTCAGACA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 2 1 244484 CASAVA_Build 11 38628648 1D ACTGTAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1968 hom 36 7 16 13 T 17 16 244485 CASAVA_Build 11 38628924 1D GCCAGCCATA T/- TTCCAGTTAA 3070 het 3070 ref 53 26 24 4 T 3 2 244486 CASAVA_Build 11 38631534 3I ATCTATTATC ---/GCT TCTTCTTCTT 3070 hom 89 het 40 0 29 11 GCT 0 1 244487 CASAVA_Build 11 38631697 2D TATACACATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 16 het 37 1 25 11 TA 6 5 244488 CASAVA_Build 11 38631709 2D TATATATATA TG/-- TATATTTCTT 3070 het 123 hom 31 4 21 8 TG 1 0 244489 CASAVA_Build 11 38635840 1D CAATCCTTAG C/- ACCTGTATTT 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 C 1 0 244490 CASAVA_Build 11 38638201 1I TAGTCACGAC -/A AAAAATTAAG 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 A 5 6 244491 CASAVA_Build 11 38642086 3D TAAAAGAAGT GAG/--- GAGGAAGAAG 3070 hom 120 het 44 0 41 5 GAG 2 1 244492 CASAVA_Build 11 38642788 3I CTAATGTATA ---/TTG TTATATAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 TTG 0 1 244493 CASAVA_Build 11 38644411 1D TTTTACCCTT A/- AAAGTATGCA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 4 3 244494 CASAVA_Build 11 38653990 25D TTTTTAAAGA GAAGGATAACATTGGAGGGAAATGT/------------------------- GAAGGATAAC 3070 hom 51 het 19 0 18 6 GAAGGATAACATTGGAGGGAAATGT 2 1 244495 CASAVA_Build 11 38658267 1D TCTCTGTCTC A/- TTTGTTTTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 1 0 244496 CASAVA_Build 11 38663904 2I ATATATTGTA --/AT ATATATATAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AT 5 6 244497 CASAVA_Build 11 38675307 8D TCGTGATCCA CCCCCCAC/-------- CCCCCCGGCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CCCCCCAC 1 0 244498 CASAVA_Build 11 38684172 1D TTCTTTTGTC T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 7 244499 CASAVA_Build 11 38701891 1I CTATCCACAT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 7 8 244500 CASAVA_Build 11 38702222 2I AATAAACACT --/AA GAAATAAAGA 3070 hom 85 het 34 0 29 5 A 0 2 244501 CASAVA_Build 11 38704649 1I ATAGTGCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 10 11 244502 CASAVA_Build 11 38705213 1D ACTCTGATGA T/- AGTTTCTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 1 0 244503 CASAVA_Build 11 38715202 5I CGCAAAGATA -----/TTTAT TGTCCTAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TTTAT 0 1 244504 CASAVA_Build 11 38715708 1D TCCTCCCAGG T/- ATTTCTGTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 0 244505 CASAVA_Build 11 38721201 1D CACAGCATAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 9 8 244506 CASAVA_Build 11 38722993 1I AAAATTATAA -/T AGAAGTGTTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 244507 CASAVA_Build 11 38724354 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 10 9 244508 CASAVA_Build 11 38725563 1D TTATTGTTGA T/- GTAATTTTTC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 1 0 244509 CASAVA_Build 11 38727853 11I ATTTGTATTT -----------/TATAAATGCTA TATGTAGTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TATAAATGCTA 0 1 244510 CASAVA_Build 11 38736613 1D TCAGGGAACT A/- AAATCTATTA 3070 hom 123 het 45 0 38 7 A 4 3 244511 CASAVA_Build 11 38737645 1I TGAAAGTCAG -/A AAAAAACTTC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 7 244512 CASAVA_Build 11 38741966 1D CATATTTAAA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 T 9 8 244513 CASAVA_Build 11 38747790 2I AGGATAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 11 13 244514 CASAVA_Build 11 38747961 9I TGAGGTGGCT ---------/GAAATGACA GAAATAGAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GAAATGACA 0 1 244515 CASAVA_Build 11 38758745 3D77M1D TTTAGTTTGA TGTTGTCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTGCTGCCTATGCTTTTGTTGTCATATCGAAAAAATCATTGCAAAACCAAAGTC/---TGTCCCATTTGTCTATTTTTGCTTTTGCTGCCTATGCTTTTGTTGTCATATCGAAAAAATCATTGCAAAACCAAAGT- CTTGGAAGAC 3070 het 3070 hom 31 15 17 24 N/A 0 0 244516 CASAVA_Build 11 38761014 1I ATATAGGAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 10 244517 CASAVA_Build 11 38761363 5I GTCATGTAGC -----/TATAA TATATTATAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TATAA 0 1 244518 CASAVA_Build 11 38763513 4I TTTCTATGGA ----/TTGT TTGTTTGTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TTGT 2 3 244519 CASAVA_Build 11 38763858 1I AAGTTTGTGA -/C CCCCCCTGGA 1590 het 1590 ref 17 13 4 0 C 6 7 244520 CASAVA_Build 11 38766854 1D TTCAGTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 35 2 24 10 A 14 13 244521 CASAVA_Build 11 38766868 1D AAAAAAAAAA C/- AGTATTTCTT 3070 het 1024 hom 34 5 23 7 C 1 0 244522 CASAVA_Build 11 38774177 1I CAGTTCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 31 1 25 5 T 10 11 244523 CASAVA_Build 11 38775331 26D GGCTGTGCTT CACTCTGTATATCTCACCATCCAGCC/-------------------------- CACTCTGTAT 3070 hom 93 het 42 0 32 14 CACTCTGTATATCTCACCATCCAGCC 1 0 244524 CASAVA_Build 11 38776128 1D AATGGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 34 2 26 6 A 12 11 244525 CASAVA_Build 11 38777434 1I ATTTTCAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 23 4 T 9 10 244526 CASAVA_Build 11 38778099 2D ACAAATTAAA AC/-- TGAAAAATAG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 AC 1 0 244527 CASAVA_Build 11 38780336 2I GCAAACCCCC --/AA AGAATGCAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 3 244528 CASAVA_Build 11 38781636 1I CCATAACGTT -/G GAGCAGTCTG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 1 2 244529 CASAVA_Build 11 38781953 1D CAACAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 2453 het 320 hom 23 1 10 12 A 12 11 244530 CASAVA_Build 11 38783065 1D CTCCATTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 67 het 28 0 22 7 A 8 7 244531 CASAVA_Build 11 38784892 1D GGAGATTATA G/- TACCCTTCCT 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 G 1 0 244532 CASAVA_Build 11 38794448 14I AAATTCACTG --------------/CATACACACACACA CATACACACA 3070 hom 104 het 42 0 34 9 CATACACACACACA 1 2 244533 CASAVA_Build 11 38795143 1D57M4I GTTGAAACTT AAAAAAAAAAAGTACAGTAAACACGTGGTTCTAGATCATAGGGATAAATTATATGAGG----/-AAAAAAAAAAGTACAGTAAACACGTGGTTCTAGATCATAGGGATAAATTATATGAGGCTTT CTTTCTGCAT 3070 hom 114 het 28 0 38 10 N/A 0 0 244534 CASAVA_Build 11 38799373 1D CTTGGAGTAG T/- TTGATCATCT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 3 2 244535 CASAVA_Build 11 38802934 1I CCACCAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 13 14 244536 CASAVA_Build 11 38803569 1D GTGAGACAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 8 7 244537 CASAVA_Build 11 38806738 1D ACAAAATTAG A/- AAAAAACAAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 7 6 244538 CASAVA_Build 11 38807350 1I AATCAGCATG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 9 10 244539 CASAVA_Build 11 38810753 1I TCATATACTT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 7 8 244540 CASAVA_Build 11 38824311 2D AACTTACACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 34 0 26 9 T 12 10 244541 CASAVA_Build 11 38825644 1D GGTTATATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 24 0 20 5 A 10 9 244542 CASAVA_Build 11 38827124 2I TTACTGAAGT --/TA TATGTACAAG 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 TA 1 2 244543 CASAVA_Build 11 38830349 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 24 2 17 5 A 13 14 244544 CASAVA_Build 11 38832691 10D TCAGTTTTCC ATTTTATGGA/---------- ATTAGACATT 3070 het 3070 hom 41 21 21 2 ATTTTATGGA 1 0 244545 CASAVA_Build 11 38853977 1I TAGCTTCAAT -/A AAATTCTGAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 3 4 244546 CASAVA_Build 11 38859767 1D CATGTCTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 26 5 A 10 9 244547 CASAVA_Build 11 38875299 1I GATTGTTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 80 het 42 1 38 3 T 9 10 244548 CASAVA_Build 11 38881484 3I ATACATAAAA ---/TTG TTGTTGTTAT 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 TTG 2 3 244549 CASAVA_Build 11 38882466 1D AAATTAAAGG A/- GAAGACCTAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 5 A 1 0 244550 CASAVA_Build 11 38884950 6I AGGTAGAGAC ------/ACGAAA ACGAAAAACC 2232 het 2198 hom 19 6 6 7 ACGAAA 1 2 244551 CASAVA_Build 11 38886393 1D AGAGAATTGG A/- AAAAAACTAC 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 7 6 244552 CASAVA_Build 11 38889193 4I TGTGCCAAAC ----/AGTT AGCCAATTCG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AGTT 0 1 244553 CASAVA_Build 11 38892755 1I TTTAATTAGA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 6 7 244554 CASAVA_Build 11 38898754 1D TGCTGGGGGT C/- CACTCCAGAC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 C 2 1 244555 CASAVA_Build 11 38901378 1D AACTATAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2939 hom 17 7 7 3 A 11 10 244556 CASAVA_Build 11 38901910 1I CTACTTGTTC -/A AATATAGTTA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 A 2 3 244557 CASAVA_Build 11 38903921 1I TTGCAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 621 hom 24 2 18 4 A 10 11 244558 CASAVA_Build 11 38905130 1I ACTGCCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1922 hom 31 10 11 10 T 14 15 244559 CASAVA_Build 11 38907973 1D GGGGGGAAAA T/- CAACTAATTG 3070 het 3005 hom 25 7 16 2 T 1 0 244560 CASAVA_Build 11 38911851 1I ATTTTAGTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 8 9 244561 CASAVA_Build 11 38914116 1I TCTTTTTTTT -/C CTCCATCTCC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 1 2 244562 CASAVA_Build 11 38917375 2I TTATAATAAC --/AT ATTAATATTT 3070 het 2420 hom 16 6 8 2 AT 1 2 244563 CASAVA_Build 11 38917648 1D ATTCATGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 A 12 11 244564 CASAVA_Build 11 38926432 1D TAAGATGTAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 9 8 244565 CASAVA_Build 11 38931391 1I TTGTATCCGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 9 10 244566 CASAVA_Build 11 38935774 2D ACACAGCAAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 78 het 35 0 27 8 AC 10 9 244567 CASAVA_Build 11 38936529 1D TCATAATACG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 T 13 12 244568 CASAVA_Build 11 38937010 1I CATGACCTTG -/C CCCATTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 C 3 4 244569 CASAVA_Build 11 38941798 1D18M1I TGGGTGTGTA TTTTTTTTTTGTTGGTTTG-/-TTTTTTTTTGTTGGTTTGT TTTTTTTTTA 3070 het 1189 hom 35 8 22 11 N/A 0 0 244570 CASAVA_Build 11 38943391 1I AAAACAAAAG -/A AACACAGAGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 2 3 244571 CASAVA_Build 11 38943623 3I TAAATACAAA ---/TTT TTTTAATAGT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 4 7 244572 CASAVA_Build 11 38944715 1D TGAAGCCTGA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 T 8 7 244573 CASAVA_Build 11 38946388 1I CCTTAGACCC -/A ATTAGGCTGA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 1 2 244574 CASAVA_Build 11 38948540 1I GAAGATCTAT -/C CCCTCTCTCG 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 C 3 4 244575 CASAVA_Build 11 38950786 1D ACAATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 11 10 244576 CASAVA_Build 11 38956467 2I CAAAAAAATC --/AG AGCTTAGTCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AG 1 2 244577 CASAVA_Build 11 38959602 1I TTAAATGAAT -/A AAAAAAACCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 7 8 244578 CASAVA_Build 11 38961372 1I GAAGAATTCT -/C TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 244579 CASAVA_Build 11 38966506 2D GCAAAAATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 40 1 34 5 T 13 11 244580 CASAVA_Build 11 38968476 1I AGAATGAGCC -/T GTTAAAACTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 0 1 244581 CASAVA_Build 11 38970966 1D TGTAATCCCA G/- TACTTTGGGA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 1 0 244582 CASAVA_Build 11 38975579 1D AGTTGGTGCA T/- TGATGCTTTG 3070 hom 105 het 37 0 34 3 T 2 1 244583 CASAVA_Build 11 38977434 2D ACACAAAAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TA 7 6 244584 CASAVA_Build 11 38977813 1D CCTGAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 11 10 244585 CASAVA_Build 11 38980836 1D ACAAACTTTT A/- CTCCTCAAGT 3070 hom 119 het 41 0 39 3 A 1 0 244586 CASAVA_Build 11 38981911 4D GTAATTTAAG TAAC/---- TAAATAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 TAAC 1 0 244587 CASAVA_Build 11 38990467 1I AGTTTCACTC -/T TGTTGACCAG 3070 het 31 hom 33 1 29 4 T 1 2 244588 CASAVA_Build 11 38991443 1D AACCCATAGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 9 8 244589 CASAVA_Build 11 38996828 1D GTTTATTCTC T/- TACTGAGTTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 1 244590 CASAVA_Build 11 39003099 1D CATCAAAGCA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 7 244591 CASAVA_Build 11 39012812 6I ATGTACCCTA ------/AAACTT AAAGTATAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AAACTT 0 1 244592 CASAVA_Build 11 39013298 1I GGATCTACCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 918 hom 43 4 27 12 A 13 14 244593 CASAVA_Build 11 39017006 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 94 het 35 0 32 3 T 10 9 244594 CASAVA_Build 11 39023591 3I TGTTATTGAT ---/GTA GTCAGATTTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 GTA 0 1 244595 CASAVA_Build 11 39027268 1I AGAGACACCA -/C CCAGGAAGAG 3070 hom 101 het 39 0 33 6 C 2 3 244596 CASAVA_Build 11 39033056 5I TAAAGTAGGA -----/AAGAT GTGCTTTCAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 AAGAT 0 1 244597 CASAVA_Build 11 39044765 1I TTGGAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 302 hom 35 2 27 6 A 11 12 244598 CASAVA_Build 11 39063644 2I TGTGTGTATG --/TA TATATATATA 3070 hom 12 het 28 1 26 1 TA 6 7 244599 CASAVA_Build 11 39064827 1D TACCAAGATA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 51 1 40 10 T 8 7 244600 CASAVA_Build 11 39065645 3I TATGTTAGGA ---/CAC CATGAGAAGG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 CAC 0 1 244601 CASAVA_Build 11 39069354 1D ATAGCCATGA T/- TTTTTTTTTT 1353 het 1353 ref 42 35 3 5 T 11 10 244602 CASAVA_Build 11 39073121 1I CTCGGGACCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 18 0 11 7 T 9 10 244603 CASAVA_Build 11 39083966 5D TACATGAAAT AAATC/----- AAGTCAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 4 AAATC 1 0 244604 CASAVA_Build 11 39087722 1I AATCACAGTT -/A AAAAACAGAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 5 6 244605 CASAVA_Build 11 39094035 1D TCACACTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 855 hom 38 2 24 13 A 13 12 244606 CASAVA_Build 11 39095212 1D TAAATCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 13 12 244607 CASAVA_Build 11 39099080 3I AAATTGATTC ---/AGG AGATTTTCTT 3070 hom 62 het 22 0 20 2 AGG 0 1 244608 CASAVA_Build 11 39116118 8I CCCTCTGTCT --------/GTCTCTCA GCCTCTCCCC 3070 hom 109 het 44 0 35 9 GTCTCTCA 0 1 244609 CASAVA_Build 11 39116771 1I GTGCTTCAGA -/C TTTGCTTATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 0 1 244610 CASAVA_Build 11 39118309 1D AGCGACATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 10 9 244611 CASAVA_Build 11 39119370 4I AAAAATCACT ----/TAGA TACTCTATTT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TAGA 0 1 244612 CASAVA_Build 11 39120635 2D GTTGACTTTT AA/-- GTCTTTAATT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 2 0 244613 CASAVA_Build 11 39122412 4I CACGCCTTAC ----/AGTA AGTTCAGAAG 3070 hom 91 het 36 0 29 7 AGTA 0 1 244614 CASAVA_Build 11 39131524 1I TCAGGCAAGA -/C GAAAGAAATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 0 1 244615 CASAVA_Build 11 39132236 4D ATTTAATGTA TAGT/---- TATTTTTATT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 TAGT 1 0 244616 CASAVA_Build 11 39132580 9I TGCAAGCTCT ---------/AATATTATA AATATATTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AATATTATA 0 1 244617 CASAVA_Build 11 39133633 16D TATACACACG CACACAAACACACACA/---------------- CACACACAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 4 CACACAAACACACACA 1 0 244618 CASAVA_Build 11 39133969 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3053 hom 27 het 12 0 10 2 T 9 10 244619 CASAVA_Build 11 39137615 3D GACCTTCCTC CTT/--- GTTACAGAAA 3070 hom 129 het 48 0 43 6 CTT 1 0 244620 CASAVA_Build 11 39139399 2D TTAGGTTATC TA/-- TGTTTTTAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TA 1 0 244621 CASAVA_Build 11 39143554 13D AATTACAAAC AATTTCTGGAGTA/------------- AAAAATCCAT 498 het 498 ref 24 25 2 7 AATTTCTGGAGTA 1 0 244622 CASAVA_Build 11 39159165 1D CTTTGTTCCC T/- TTTTTTTTTT 2269 het 1832 hom 30 12 7 12 T 17 16 244623 CASAVA_Build 11 39166049 1I ATTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1222 het 1222 ref 28 16 4 8 A 15 16 244624 CASAVA_Build 11 39166299 2D ATGAACACAC AT/-- ATGTGTGTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 2 1 244625 CASAVA_Build 11 39171455 1I TTTCTTATCA -/G TAAAATGGTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 0 1 244626 CASAVA_Build 11 39173568 1I CTAAGTATTA -/G GAGTGGTTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 2 244627 CASAVA_Build 11 39182044 1D CAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 0 244628 CASAVA_Build 11 39182707 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 896 hom 29 3 18 8 A 15 14 244629 CASAVA_Build 11 39202195 1I ATTTTGATGA -/G CTATTTGTAG 3070 hom 123 het 43 0 41 2 G 0 1 244630 CASAVA_Build 11 39232419 1I TTGGATTATC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 9 10 244631 CASAVA_Build 11 39235150 1I CTGCCAGTCT -/G TAGGCTAGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 244632 CASAVA_Build 11 39239449 1I GATTTTGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 10 11 244633 CASAVA_Build 11 39239843 1I CAGTTATAGT -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 6 7 244634 CASAVA_Build 11 39243584 1D TCTGCAAAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 10 9 244635 CASAVA_Build 11 39245411 1I AAAATAATAG -/T TTTTTTGTTA 3070 hom 100 het 39 0 34 5 T 6 7 244636 CASAVA_Build 11 39247867 1D AAACCCTGTC T/- CTACAATAAA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 1 0 244637 CASAVA_Build 11 39248047 1D ACCCTACCTC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 83 het 36 0 28 8 A 9 8 244638 CASAVA_Build 11 39250787 4D TTTATTTTAA AAAG/---- AAAGGCTTCT 3070 hom 90 het 32 0 31 7 AAAG 2 1 244639 CASAVA_Build 11 39252455 9I ATATCCAAGG ---------/AAAATAAAT AAAATAAATG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AAAATAAAT 1 2 244640 CASAVA_Build 11 39262064 1I AAGTCACACA -/C CCCCTACACT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 C 4 5 244641 CASAVA_Build 11 39263598 1I TGATGCAAGA -/G GGGGTCTCCC 3070 hom 92 het 34 0 29 5 G 4 5 244642 CASAVA_Build 11 39264050 1I CTGAGGTCTA -/C CAATGGCCCC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 C 1 2 244643 CASAVA_Build 11 39266939 1D CATTGATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 31 1 25 5 A 11 10 244644 CASAVA_Build 11 39275943 1D TATTACTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 23 2 17 4 A 15 14 244645 CASAVA_Build 11 39276546 4D CTCCACCAAT AAAG/---- AAACTTATGA 3070 hom 129 het 48 0 44 8 AAAG 1 0 244646 CASAVA_Build 11 39289111 1I GATTCATTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 10 244647 CASAVA_Build 11 39301064 1I CTACTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2083 hom 28 8 16 4 A 15 16 244648 CASAVA_Build 11 39304831 4D AGTAGGAGAG AGAA/---- AGAGAGAGAA 3070 hom 106 het 39 0 34 6 AGAA 1 0 244649 CASAVA_Build 11 39324077 4I GAAAAAAAAA ----/TAAT TACAGGGGAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TAAT 0 1 244650 CASAVA_Build 11 39342665 4I TGTATACAAA ----/TAGT TAGTCGACCG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 TAGT 1 2 244651 CASAVA_Build 11 39344431 1D ATCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 43 0 22 22 T 15 14 244652 CASAVA_Build 11 39348072 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 87 het 34 0 30 10 A 8 7 244653 CASAVA_Build 11 39348180 1D ATCTTCTCTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 8 244654 CASAVA_Build 11 39348732 1I GTGTTAGCCA -/G AATGGTCTCG 3070 hom 18 het 9 0 7 2 G 0 1 244655 CASAVA_Build 11 39352167 1D CTTCTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 48 1 38 9 A 11 10 244656 CASAVA_Build 11 39360663 8D TTAGATCTTC TTTGTCTT/-------- TTTGTCTTTT 3070 hom 120 het 42 0 41 4 TTTGTCTT 2 1 244657 CASAVA_Build 11 39376278 1D GATCTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 2561 het 2561 ref 27 12 9 6 T 11 10 244658 CASAVA_Build 11 39381113 1D TGAGAAGGCC T/- AAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 T 1 0 244659 CASAVA_Build 11 39381474 1I TTCCAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 10 11 244660 CASAVA_Build 11 39384483 1D CAGAAAAAAA T/- AATTCATTCT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 1 0 244661 CASAVA_Build 11 39385538 1I AATAGCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 A 10 11 244662 CASAVA_Build 11 39385752 3I AACATTACTG ---/ATT ATTAGAGAAA 3070 het 3070 ref 41 20 20 6 ATT 1 2 244663 CASAVA_Build 11 39386378 1I GTGATGAAAT -/A AATCTGTACA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 2 3 244664 CASAVA_Build 11 39387079 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1369 hom 19 4 10 6 A 13 12 244665 CASAVA_Build 11 39389101 2I AACATTTCCA --/AC ACACACACAC 3070 het 1953 hom 35 6 21 8 AC 6 7 244666 CASAVA_Build 11 39393815 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 11 12 244667 CASAVA_Build 11 39396186 1I ATGTAGAGCT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 6 7 244668 CASAVA_Build 11 39396638 2D TGTTACTCAT AA/-- AAATATGAAT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 5 3 244669 CASAVA_Build 11 39398156 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 A 11 10 244670 CASAVA_Build 11 39399908 3I CCATCTTCGC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 34 0 24 10 T 14 17 244671 CASAVA_Build 11 39400103 1D GGGAGGCCAA G/- GCAGGCAGAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 2 1 244672 CASAVA_Build 11 39401921 1D TTGCCATGCT A/- AATCTCTGCC 3070 hom 126 het 45 0 43 3 A 3 2 244673 CASAVA_Build 11 39402303 32D GGAAAAGGCT CATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------- TATATATATA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 CATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 244674 CASAVA_Build 11 39407314 1D GAGCAGACTC T/- TAACAATGGA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 2 1 244675 CASAVA_Build 11 39409763 2I TGCATACATT --/TG TTTCTTGCTG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TG 0 1 244676 CASAVA_Build 11 39411078 1I GTCAGCTAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 29 1 23 5 T 9 10 244677 CASAVA_Build 11 39414329 4I TGTCTCATTT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AAAC 2 3 244678 CASAVA_Build 11 39415309 1I TTGTTTTTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 8 9 244679 CASAVA_Build 11 39416658 1I TTTTTTTTTT -/C TGAAGCTAGG 2190 het 3 hom 16 0 9 7 C 0 1 244680 CASAVA_Build 11 39437109 1I ATAAAGGTAT -/A AAAAAATTAT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 6 7 244681 CASAVA_Build 11 39438308 35D GTACTTCCTG TGCTTTTTGCTTGCAGTGCTCATTTATAAGATCTT/----------------------------------- TACAAATTAA 1937 het 1937 ref 24 24 5 4 TGCTTTTTGCTTGCAGTGCTCATTTATAAGATCTT 1 0 244682 CASAVA_Build 11 39445810 1D AGTCACCTAA T/- AGATTACAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 6 T 1 0 244683 CASAVA_Build 11 39446081 14D TCTCCATCTG TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTGA 3070 het 1827 hom 22 8 12 2 T 22 8 244684 CASAVA_Build 11 39450305 3D ATCATAATTG TCA/--- TCATCATCAT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 TCA 5 4 244685 CASAVA_Build 11 39450437 1D ATTATATGTG T/- TTTAATTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 4 3 244686 CASAVA_Build 11 39450660 1D AAAGTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 11 10 244687 CASAVA_Build 11 39453706 1I ATAGGAGAGA -/T TTTTTTTTTT 1855 het 1567 hom 18 9 6 3 T 13 14 244688 CASAVA_Build 11 39461080 2I TAAGCCTATG --/TT TTCATTTTGT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 T 2 4 244689 CASAVA_Build 11 39466202 1I AGTGATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 10 11 244690 CASAVA_Build 11 39473538 23D AAATAATTGG GATTATGACATTGAAAAGGAACA/----------------------- GATTATGACA 3070 het 3070 ref 38 19 13 10 GATTATGACATTGAAAAGGAACA 1 0 244691 CASAVA_Build 11 39475959 1D TTTGGACAAC T/- TTTTTTTTTT 1288 het 1288 ref 33 21 5 7 T 13 12 244692 CASAVA_Build 11 39478660 4D TCCATAATGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 AT 7 5 244693 CASAVA_Build 11 39485137 1D TTTTCCCAGC T/- TTTTTTTTTG 1274 het 1274 ref 46 36 3 8 T 10 9 244694 CASAVA_Build 11 39505842 1D TATTTGAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 10 9 244695 CASAVA_Build 11 39507294 1I TGCCATGCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 501 hom 36 2 25 9 A 9 10 244696 CASAVA_Build 11 39507451 1I TTGTTGAGAG -/T TTTTTTTTTT 2840 het 45 hom 46 1 13 32 T 11 12 244697 CASAVA_Build 11 39508208 1I ATCTTTTGTA -/T TTTTTTGTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 7 244698 CASAVA_Build 11 39515154 1D TTACTCAAAA G/- CCTGTGCTCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 1 0 244699 CASAVA_Build 11 39515827 4D AATTCCTATG TGTT/---- TGTTTAATTT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 TGTT 2 1 244700 CASAVA_Build 11 39524745 6I14M6D AATAAAGCCT ------TTTTTTAGAAAAAATATAAG/CTTATATTTTTTCTAAAAAA------ ACTCTTTAGT 3070 hom 93 het 29 0 32 3 N/A 0 0 244701 CASAVA_Build 11 39525301 4I TAAAAGCCAT ----/CTGA CTGACAGGGT 3070 hom 116 het 43 0 39 4 CTGA 1 2 244702 CASAVA_Build 11 39525542 4D GCCACCATGT AAGA/---- AAGATATACC 3070 hom 87 het 31 0 27 5 AAGA 2 1 244703 CASAVA_Build 11 39525891 4D ATACTGATAA TAAT/---- TAATATGAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 6 TAAT 2 1 244704 CASAVA_Build 11 39526471 2D TTAAAATATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 12 10 244705 CASAVA_Build 11 39526975 1I TCAGGAATGG -/A AAAATCAAAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 4 5 244706 CASAVA_Build 11 39529402 1I TAATTGATAA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 244707 CASAVA_Build 11 39538855 1D CAACCTGCTT G/- GGTCCCCTTC 3070 hom 74 het 31 0 24 8 G 3 2 244708 CASAVA_Build 11 39548975 1D TGTGAAATTA G/- TGCTTGAAAG 3070 hom 60 het 27 0 21 7 G 1 0 244709 CASAVA_Build 11 39551952 1D CCCACAACAT A/- AAAAACTCAG 3070 het 3070 hom 54 18 30 6 A 6 5 244710 CASAVA_Build 11 39553035 4D CCAAAGGGAG ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AT 11 9 244711 CASAVA_Build 11 39553377 4D CAATTTTTAT GTCA/---- GTCTGATCAA 3070 hom 82 het 32 0 27 7 GTCA 1 0 244712 CASAVA_Build 11 39554124 2D TCTAATTTTC TA/-- TGTTTGTTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TA 1 0 244713 CASAVA_Build 11 39555559 5D GAATCATTAG GGTCT/----- GGCCTGGCCT 3070 hom 75 het 28 0 23 6 GGTCT 1 0 244714 CASAVA_Build 11 39556898 1I CCAAAAAAAC -/T TTTTTTCTCA 3070 het 282 hom 40 1 35 4 T 6 7 244715 CASAVA_Build 11 39558137 1D ATTATCCTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 97 het 41 0 33 8 T 9 8 244716 CASAVA_Build 11 39560170 1I ATAATGTGTT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 7 8 244717 CASAVA_Build 11 39561468 2D ACAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 28 0 24 5 AG 1 0 244718 CASAVA_Build 11 39561879 5D ACTCAACTAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1146 het 302 hom 33 3 4 28 T 21 16 244719 CASAVA_Build 11 39563072 1D GTGTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 29 2 13 14 T 13 12 244720 CASAVA_Build 11 39563737 4I ACATTTTTCT ----/TATA TATATATATG 2281 hom 15 het 8 0 6 2 TA 4 6 244721 CASAVA_Build 11 39563798 5D ATAATATTAT ATATA/----- ATATAATATA 1732 hom 10 het 5 0 4 1 ATATA 3 2 244722 CASAVA_Build 11 39566420 5D TCTCAATGTA TAGTT/----- TAATTTTCAG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TAGTT 1 0 244723 CASAVA_Build 11 39574674 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 21 9 A 14 13 244724 CASAVA_Build 11 39578016 1I GCTAAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 27 1 22 4 A 10 11 244725 CASAVA_Build 11 39578689 2D ACACATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 68 het 38 0 23 15 AC 9 8 244726 CASAVA_Build 11 39578863 1I AGTAAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 31 2 20 9 A 13 14 244727 CASAVA_Build 11 39579367 1D TCATAAGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 18 7 A 11 10 244728 CASAVA_Build 11 39595640 1D GATTGCTTAT A/- AAAAAATAGA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 7 6 244729 CASAVA_Build 11 39600499 5D TAGTTGTAAG AGTTT/----- AGTTTAGTTG 3070 hom 128 het 48 0 41 8 AGTTT 2 1 244730 CASAVA_Build 11 39605068 1I TAATTGAGAT -/G ATTTAAATTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 0 1 244731 CASAVA_Build 11 39607917 2D GTAAACACTC TT/-- TTATCCCTGT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 4 2 244732 CASAVA_Build 11 39609610 5D CAGATTTATC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 24 1 17 7 A 16 11 244733 CASAVA_Build 11 39617949 1I ATTTTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 29 1 22 6 T 13 14 244734 CASAVA_Build 11 39618859 1D AAACAACAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 10 9 244735 CASAVA_Build 11 39628676 1I ATGAAATAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 178 hom 38 1 26 11 A 9 10 244736 CASAVA_Build 11 39631258 1D AAGCTGCTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2987 hom 24 9 12 4 A 10 9 244737 CASAVA_Build 11 39643710 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTTGT 2691 hom 27 het 12 0 8 4 T 9 8 244738 CASAVA_Build 11 39652398 4I GCAGGAAGAG ----/ACAC ACACTCAGAG 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 AC 2 4 244739 CASAVA_Build 11 39672971 2D AAAGCTTAAA AT/-- ATATGTTTTA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 AT 3 2 244740 CASAVA_Build 11 39677980 1D GGGAGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 7 A 11 10 244741 CASAVA_Build 11 39679285 2D CATTTATGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 TA 6 5 244742 CASAVA_Build 11 39680567 1I ATTATTTTGA -/T GCTCAAAGTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 0 1 244743 CASAVA_Build 11 39681089 1D CTATCCACAT C/- CCCCCACCCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 6 5 244744 CASAVA_Build 11 39683978 1D TTCAAACCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2498 hom 38 14 12 13 T 12 11 244745 CASAVA_Build 11 39688725 7D TTTATATTGG TAAAGTA/------- CTGTCAACGT 3070 het 3070 ref 28 17 11 1 TAAAGTA 1 0 244746 CASAVA_Build 11 39689783 1D TAATTATTTT A/- AATGTCCTCT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 3 2 244747 CASAVA_Build 11 39698026 13D CAAAACACAA GATTTTGAGGCAT/------------- GACAGGAGTG 3070 het 3070 hom 35 13 22 4 GATTTTGAGGCAT 1 0 244748 CASAVA_Build 11 39698649 2D GTGTTAAATA AT/-- ATGTTATTGA 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 AT 2 1 244749 CASAVA_Build 11 39700187 1D AAGGGAATGG T/- TTTTTTTTTC 2572 het 2572 ref 28 16 7 5 T 10 9 244750 CASAVA_Build 11 39700408 1I TTCTCTAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 T 9 10 244751 CASAVA_Build 11 39720007 2I TCTAAAAATC --/AA AAGAGTTGAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 2 4 244752 CASAVA_Build 11 39725575 1D TTTTGTTTTC T/- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 T 4 3 244753 CASAVA_Build 11 39727114 6D TCTGTCTCGA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 8 9 AAAAAC 4 3 244754 CASAVA_Build 11 39729190 3D GTTTAGTTGG ACA/--- ACAAGAGTGG 3070 het 3070 hom 45 18 23 6 ACA 2 1 244755 CASAVA_Build 11 39731062 1D GAAAAGAACC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 T 8 7 244756 CASAVA_Build 11 39732053 4I AAAAAATGCT ----/AACA ATCACCTGAG 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 AACA 0 1 244757 CASAVA_Build 11 39732935 1I TTTGAAAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 9 10 244758 CASAVA_Build 11 39740865 2I63M1I GTATAATAAT --AAAAAAAAATGGCCCAAAATAAATGCAATTCATATTTACACAGGATCTTTTTGAAGTTTCTGT-/AAAAAAAAAAATGGCCAAAAATAAATGCAATTCATATTTACACAGGATCTTTTTGAAGTTTCTGTG AACATATTAG 3070 het 3070 ref 22 19 18 8 N/A 0 0 244759 CASAVA_Build 11 39743662 2D TTTATCTGAA AG/-- AGTGTTTTTT 3070 het 453 hom 14 2 8 4 AG 2 1 244760 CASAVA_Build 11 39744191 2I ATTTTATCGA --/AT AGTGAAAGTG 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 AT 0 1 244761 CASAVA_Build 11 39745361 5D TGCAATTATC TTAAT/----- TTTAGTTGAG 3070 het 3070 ref 46 26 17 4 TTAAT 1 0 244762 CASAVA_Build 11 39750764 1D CTGGCAGAAA C/- AAGGACACAG 3070 het 3070 ref 53 23 19 11 C 1 0 244763 CASAVA_Build 11 39751769 1I ATTCGCTTTC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 7 8 244764 CASAVA_Build 11 39754024 1D ATTTGATGAG T/- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 24 11 10 4 T 2 1 244765 CASAVA_Build 11 39759104 5D TGTAGGGATC AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 12 18 4 AAAGA 3 2 244766 CASAVA_Build 11 39762354 4I GTAATTCAAA ----/CTTT CTTTCTATTT 3070 het 451 hom 19 4 12 3 CTTT 1 2 244767 CASAVA_Build 11 39783610 1I ATTAAATTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 8 9 244768 CASAVA_Build 11 39785020 1D TAGGAATAAG C/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 57 27 23 8 C 1 0 244769 CASAVA_Build 11 39800710 1D AAATAGTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 T 10 9 244770 CASAVA_Build 11 39803084 1D ACACAGGGGG C/- CAACAACTAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 C 2 1 244771 CASAVA_Build 11 39803263 5I GGAATGAAAA -----/TTAGT TTAGTCACTG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TTAGT 1 2 244772 CASAVA_Build 11 39807063 1I AGTAAACTAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 8 9 244773 CASAVA_Build 11 39812261 4D ATTGGGGTCT TAGA/---- TAGCTCCTAA 3070 het 3070 ref 32 17 14 5 TAGA 1 0 244774 CASAVA_Build 11 39822634 2I TTCTTGATTA --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 2742 hom 32 8 19 5 T 8 10 244775 CASAVA_Build 11 39835515 1D TGAAAGACTC A/- AAATTGTAAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 4 3 244776 CASAVA_Build 11 39850830 2D TTGATCTGAC CT/-- CTGTTATTTC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 CT 2 1 244777 CASAVA_Build 11 39851918 1I CCCTACCAGT -/G GATCCTGACT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 244778 CASAVA_Build 11 39855410 1I GAGATACAAC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 A 7 8 244779 CASAVA_Build 11 39855501 1I ACAGCACATC -/A AAAAGCTTAC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 4 5 244780 CASAVA_Build 11 39865156 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 406 hom 10 1 8 1 ATA 5 4 244781 CASAVA_Build 11 39865344 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 8 9 244782 CASAVA_Build 11 39866421 2I GGGAAAAAAC --/AG AGCAGAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AG 1 2 244783 CASAVA_Build 11 39870415 1I ACCATAAAAA -/C CCTAAAAGAA 3070 het 11 hom 20 1 18 1 C 2 3 244784 CASAVA_Build 11 39881875 4D TTTAAGTAGG CAAA/---- CAGAGACACT 3070 het 3070 ref 28 14 13 3 CAAA 1 0 244785 CASAVA_Build 11 39882346 1I AGTGGCAAGG -/A AAAAATATGG 3070 hom 94 het 35 0 31 4 A 5 6 244786 CASAVA_Build 11 39889926 1I TCCTTTTCAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 39 13 24 2 A 7 8 244787 CASAVA_Build 11 39892885 1D AAGGGTAGTG C/- CAAAGTTTCT 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 C 2 1 244788 CASAVA_Build 11 39894143 1I TGGTCTGCAG -/T TACAATTAAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 244789 CASAVA_Build 11 39894596 1D TGGGTCTTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 871 hom 31 2 25 5 A 10 9 244790 CASAVA_Build 11 39897910 1I CTGATTTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 29 1 25 3 A 11 12 244791 CASAVA_Build 11 39899796 7D TGTATCTCTG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1845 het 1845 ref 22 11 7 5 A 21 14 244792 CASAVA_Build 11 39900505 1D CCACCATCCT C/- CAGACTCCAG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 C 2 1 244793 CASAVA_Build 11 39902783 2D TTTTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2710 het 327 hom 9 1 7 1 T 12 10 244794 CASAVA_Build 11 39905152 1D TAAAAATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 32 het 13 0 11 2 T 10 9 244795 CASAVA_Build 11 39905354 1D CCTCCAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2080 hom 28 6 13 9 A 13 12 244796 CASAVA_Build 11 39905483 2I TGCATTTTAT --/AC AGTTTTATTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 AC 0 1 244797 CASAVA_Build 11 39905976 1I TTGTGACCTT -/A AAAATTTGTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 4 5 244798 CASAVA_Build 11 39906572 1D TAGAAAATCA C/- CCTTTCATTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 3 2 244799 CASAVA_Build 11 39908230 1I AGTAAGAATA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 6 7 244800 CASAVA_Build 11 39908383 1I TATATATCAG -/T TAACAAGTAA 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 1 2 244801 CASAVA_Build 11 39908741 1D AAATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 2793 het 2793 ref 30 16 10 4 T 13 12 244802 CASAVA_Build 11 39909088 1I CTAGTATGTC -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 6 7 244803 CASAVA_Build 11 39916044 2I TTAATAGGTT --/TG TCTCACTTGC 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 TG 0 1 244804 CASAVA_Build 11 39921386 1I TTTATCACCC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 8 9 244805 CASAVA_Build 11 39925281 4I AGATAAGCCC ----/ACAA ACAAAGATGA 3070 het 2354 hom 20 7 10 3 ACAA 1 2 244806 CASAVA_Build 11 39928433 32D GTTTGTGAAG TATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------- TATATATATA 2749 het 228 hom 11 1 6 8 TA 24 8 244807 CASAVA_Build 11 39934701 7D CAGACACTTT CTTTTAA/------- TAATATTTAT 3070 het 3070 hom 25 12 11 4 CTTTTAA 1 0 244808 CASAVA_Build 11 39943017 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1742 het 1742 ref 19 9 5 6 A 14 13 244809 CASAVA_Build 11 39946312 7I AGAACAGCCA -------/GGCTCCT GAATAAACCC 3070 het 3070 hom 27 10 9 8 GGCTCCT 0 1 244810 CASAVA_Build 11 39953531 1D TACAGATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 6 A 12 11 244811 CASAVA_Build 11 39961330 1I TATAATGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 11 12 244812 CASAVA_Build 11 39971769 2D TGGGCTGTCC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 11 9 244813 CASAVA_Build 11 39972506 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 11 hom 29 1 25 3 A 10 9 244814 CASAVA_Build 11 39993330 4I TGATTTAGTT ----/TTTG TTTGTAAGCC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 TTTG 1 2 244815 CASAVA_Build 11 39998940 1D TTGTCACTAG T/- TAGGAATGGG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 2 1 244816 CASAVA_Build 11 39999042 1D GCAAGAAGAA G/- AAGAAAAAAA 1460 het 1460 ref 36 19 8 10 G 1 0 244817 CASAVA_Build 11 40013194 10D TCATGGTTCC TGATGGGTCA/---------- TAAAGTAATC 3070 het 3070 ref 31 19 14 2 TGATGGGTCA 1 0 244818 CASAVA_Build 11 40014642 1D CAATTTATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 23 19 7 A 11 10 244819 CASAVA_Build 11 40022407 3I GTTTTCACAG ---/CTT CTTCTTCTGT 3070 het 3070 ref 19 9 7 3 CTT 2 3 244820 CASAVA_Build 11 40030114 5D ATATAGTAAG AATAT/----- AATATATTTT 3070 het 3070 ref 36 19 16 4 AATAT 2 1 244821 CASAVA_Build 11 40033599 5I TGTTTATTTA -----/TTTTT GTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 0 5 244822 CASAVA_Build 11 40036833 2I GGAATTGAAT --/AC ACACACACCT 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 AC 4 5 244823 CASAVA_Build 11 40043572 2I AGGTGGATCC --/AA AAAAAAAAAA 2824 het 2824 ref 34 13 12 9 A 14 16 244824 CASAVA_Build 11 40043885 2I AAAATATCCC --/CT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 CT 0 1 244825 CASAVA_Build 11 40060146 1I TTTAGGGGCC -/A GGGGCAGAAG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 0 1 244826 CASAVA_Build 11 40065328 2I CCCTCCACTT --/TC TCTTTCTCCA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 TC 1 2 244827 CASAVA_Build 11 40065469 4I TAGATCACAG ----/CTCT ATATTTTTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CT 0 2 244828 CASAVA_Build 11 40076878 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 1032 het 58 hom 17 1 3 14 T 12 11 244829 CASAVA_Build 11 40118982 1D TTGCCAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 303 hom 31 1 20 10 A 16 15 244830 CASAVA_Build 11 40131713 1D TAGATAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 11 10 244831 CASAVA_Build 11 40157137 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 36 1 24 11 T 13 12 244832 CASAVA_Build 11 40166946 1D GACATGAAAT G/- AAAAGGATGC 3070 het 3070 hom 42 14 27 1 G 1 0 244833 CASAVA_Build 11 40167379 1D CTTTTTAATG T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 T 6 5 244834 CASAVA_Build 11 40173221 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1472 het 1081 hom 12 4 4 4 A 11 10 244835 CASAVA_Build 11 40173870 1D GGTGATTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 10 11 A 13 12 244836 CASAVA_Build 11 40209601 4I TATAATAAAC ----/TATA TAGTCAATAT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 TA 1 3 244837 CASAVA_Build 11 40220911 1I TGTATCATCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 10 244838 CASAVA_Build 11 40225782 1I TTACTCTCTG -/T CTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 0 1 244839 CASAVA_Build 11 40235392 1D AAGACTAAAC A/- AAACAAAATA 3070 het 3070 ref 39 17 15 9 A 4 3 244840 CASAVA_Build 11 40256924 1D AGATATTAGT G/- GGTTTTGTCT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 G 3 2 244841 CASAVA_Build 11 40270780 1D CCTTTTTTTT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 2469 hom 28 11 10 9 G 10 9 244842 CASAVA_Build 11 40283736 1D TGTCAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2602 hom 42 11 14 17 A 14 13 244843 CASAVA_Build 11 40285068 1D GGTTATCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1306 hom 31 3 16 12 T 12 11 244844 CASAVA_Build 11 40285131 10I TATCTATGTA ----------/TCTATCTATC TCTATCTATC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 TCTATCTATC 1 2 244845 CASAVA_Build 11 40291900 1I TGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 9 10 244846 CASAVA_Build 11 40295067 1I CTAATATGCT -/A AAAAAAGATG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 6 7 244847 CASAVA_Build 11 40305447 1I AGAGAGGCCA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 7 8 244848 CASAVA_Build 11 40321469 4D TAAAACTTAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 46 16 24 7 AT 7 5 244849 CASAVA_Build 11 40324012 1I AAAAGTGGGC -/A AAATATATGA 3070 het 3070 hom 44 21 22 1 A 3 4 244850 CASAVA_Build 11 40326353 2I TTGGAAAAAC --/AG TGCTAGACTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AG 0 1 244851 CASAVA_Build 11 40326399 1I TCAATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2267 hom 30 7 10 13 A 11 12 244852 CASAVA_Build 11 40327529 1I CAGAATCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 T 10 11 244853 CASAVA_Build 11 40329889 2I ATTTGACCTC --/TT TGTCACTATA 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 T 1 3 244854 CASAVA_Build 11 40330777 4I ATTCTGTGTT ----/TGTC TGTGAACTTA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 TGTC 0 1 244855 CASAVA_Build 11 40330920 1D TCAGCTCTTG T/- TTGCCTGAGA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 3 2 244856 CASAVA_Build 11 40342802 3D TTCAAAATTT AAC/--- AAGGTTTGTA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 AAC 1 0 244857 CASAVA_Build 11 40361362 5D GTATATTTAT ATATC/----- ATATTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 20 21 2 ATATC 1 0 244858 CASAVA_Build 11 40367604 3I TCAAAAAAAA ---/AAC AAATAATCAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AAC 0 1 244859 CASAVA_Build 11 40379294 1I CTTAATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 10 11 244860 CASAVA_Build 11 40396173 1I AGACAGCTGT -/A AAACTTCCTA 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 A 3 4 244861 CASAVA_Build 11 40400819 1I CTCATTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 11 12 244862 CASAVA_Build 11 40403254 1D CTTTGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2021 hom 24 8 12 5 A 11 10 244863 CASAVA_Build 11 40404504 1I ATCCAGCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 10 11 244864 CASAVA_Build 11 40410316 1D GTGCCATGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 10 8 T 10 9 244865 CASAVA_Build 11 40422444 1I TGCCTTAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 431 hom 13 1 9 3 T 8 9 244866 CASAVA_Build 11 40431308 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 2301 hom 20 6 13 1 A 7 8 244867 CASAVA_Build 11 40435044 1D AAGAAAGGAA G/- GGGAAAAAAA 2875 het 2875 ref 24 14 8 2 G 4 3 244868 CASAVA_Build 11 40437548 2D CATCTCAGTC AG/-- AGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 AG 2 1 244869 CASAVA_Build 11 40441109 1I GATCATCCGT -/A AATATGAAGT 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 A 2 3 244870 CASAVA_Build 11 40452218 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAGAGT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 6 7 244871 CASAVA_Build 11 40461898 10D GCAAGAAATG TGTATATATA/---------- TGTATATATA 3070 hom 54 het 25 0 19 9 TGTATATATA 3 2 244872 CASAVA_Build 11 40474393 1D ATAATCTCTA T/- TAGTTGTCTT 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 T 2 1 244873 CASAVA_Build 11 40479265 1D ACTGGTGCAA G/- GGGGTGGGTT 3070 hom 56 het 36 0 23 13 G 5 4 244874 CASAVA_Build 11 40484029 1D CTGAAAATGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 8 7 244875 CASAVA_Build 11 40501721 22D TATATAATAT GTAATCTATTATATATAATAGA/---------------------- GTATTCTATT 2007 het 2007 ref 7 8 5 2 GTAATCTATTATATATAATAGA 1 0 244876 CASAVA_Build 11 40503183 1I GCATAGCAAG -/A AAGAAGAATA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 2 3 244877 CASAVA_Build 11 40511608 1D GATTGAGTGT G/- GGGGAGAATT 3070 hom 101 het 42 0 32 11 G 5 4 244878 CASAVA_Build 11 40528935 1I TTTTGGGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 17 11 A 11 12 244879 CASAVA_Build 11 40529477 1I TTTCAAGGAA -/T TTTTTCCTGT 3070 het 3070 hom 44 12 26 6 T 5 6 244880 CASAVA_Build 11 40531410 4I AAACAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 AAAC 2 3 244881 CASAVA_Build 11 40538410 2D ATGCTGATGT AC/-- ACAGCACCAG 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 AC 2 1 244882 CASAVA_Build 11 40540658 2I ATGAGGAAAC --/AG ACTCCCATAA 3070 het 3070 hom 50 13 32 5 AG 0 1 244883 CASAVA_Build 11 40553518 1D TAATTTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 11 10 244884 CASAVA_Build 11 40555959 5D TTCTTTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 811 het 811 ref 21 7 5 10 T 21 16 244885 CASAVA_Build 11 40557450 1D AGACTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 2 A 12 11 244886 CASAVA_Build 11 40557886 1I ACAACAACAA -/C AAAACAGTGT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 C 0 1 244887 CASAVA_Build 11 40560950 1I GCCTGTTCAA -/T TTTTTTTTTA 2666 het 2653 hom 18 8 6 4 T 9 10 244888 CASAVA_Build 11 40563603 1I TTGTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1655 hom 22 7 12 3 T 11 12 244889 CASAVA_Build 11 40575755 1D CCACTGCCCA G/- GTTCAATTAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 2 1 244890 CASAVA_Build 11 40579009 1D ATATCCCCAT A/- AATATGAGGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 2 244891 CASAVA_Build 11 40580161 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 17 4 A 10 11 244892 CASAVA_Build 11 40588690 1D GCGTTCAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 9 8 244893 CASAVA_Build 11 40592566 26I AGTGGGTGTT --------------------------/GCTCTGGATTAAGCTTTGGCTTAAGA GAATGTTGTG 3070 hom 75 het 25 0 25 2 GCTCTGGATTAAGCTTTGGCTTAAGA 0 1 244894 CASAVA_Build 11 40592694 1D CTTCAACGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 9 244895 CASAVA_Build 11 40596394 1I CAGCACCCAG -/T GAAAGACAGC 3070 hom 131 het 48 0 44 4 T 0 1 244896 CASAVA_Build 11 40596582 1I CTCCAGATCT -/A TGAAATAAAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 0 1 244897 CASAVA_Build 11 40598048 3D TTGTTGGTGG TTA/--- TTATTCATTG 3070 hom 105 het 41 0 36 8 TTA 2 1 244898 CASAVA_Build 11 40599667 1I GGCAAGTTGC -/T TTTTTTTGCC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 7 8 244899 CASAVA_Build 11 40600491 1I TTTATACCAA -/G GGATTCTACA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 2 3 244900 CASAVA_Build 11 40624158 2D TTCCTCAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 T 14 12 244901 CASAVA_Build 11 40626665 1D CTAAATAAAA G/- TTTATTGATT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 G 1 0 244902 CASAVA_Build 11 40634346 1D ACTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 10 8 T 11 10 244903 CASAVA_Build 11 40642671 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 9 10 244904 CASAVA_Build 11 40651161 1D ATCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 37 28 3 6 A 11 10 244905 CASAVA_Build 11 40666115 1D CTTTACAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 11 10 244906 CASAVA_Build 11 40690258 4D AGTTACTGAC TTAA/---- TTAAAGTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 TTAA 2 1 244907 CASAVA_Build 11 40694176 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 10 het 23 0 10 13 A 10 9 244908 CASAVA_Build 11 40698063 1D TCCTTTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 10 9 244909 CASAVA_Build 11 40699902 9I TGGTGAAACC ---------/CTGTCTCTA CTAAAAATAC 3070 het 2522 hom 15 6 8 1 CTGTCTCTA 0 1 244910 CASAVA_Build 11 40702852 4D TAACAAGAAG TAAA/---- TAAATAAACA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TAAA 3 2 244911 CASAVA_Build 11 40704291 2D CCTATCAACC AA/-- AAAAAAAAAA 2042 het 2042 ref 34 12 7 15 A 16 14 244912 CASAVA_Build 11 40708886 4D TGTGGACAAT TGAG/---- TGTTACCTTC 3070 het 3070 ref 36 22 14 2 TGAG 1 0 244913 CASAVA_Build 11 40710185 3D AAAAAAAAAC CAA/--- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 CAA 1 0 244914 CASAVA_Build 11 40715703 1I CACCAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 9 10 244915 CASAVA_Build 11 40717619 4I TTAATATATA ----/CAGT CATAGACAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CAGT 0 1 244916 CASAVA_Build 11 40728935 1D TAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 13 12 244917 CASAVA_Build 11 40742860 1D CAGCTCAAGG A/- GAGAGAAATT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 A 1 0 244918 CASAVA_Build 11 40744210 1D AAGCAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 21 1 13 7 A 13 12 244919 CASAVA_Build 11 40744834 1D GTGGTCATCA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 7 6 244920 CASAVA_Build 11 40745162 1D CTGGATGGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 77 het 31 0 26 5 A 10 9 244921 CASAVA_Build 11 40753540 2D ACTCTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 14 12 244922 CASAVA_Build 11 40754401 1D GATTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 11 13 T 11 10 244923 CASAVA_Build 11 40760572 1D AATTGCATAC T/- TTTTTTTTTT 1890 het 1890 ref 45 28 5 12 T 13 12 244924 CASAVA_Build 11 40764032 1D ATATTGTTGG A/- AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 A 9 8 244925 CASAVA_Build 11 40765388 1I ATTGCCAACT -/G GGGGGGGGTA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 G 8 9 244926 CASAVA_Build 11 40780635 1I TAGAATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 10 11 244927 CASAVA_Build 11 40790435 1D CTTAGGCCTC T/- GACTGATACA 3070 het 3070 hom 50 15 30 5 T 1 0 244928 CASAVA_Build 11 40800466 1I TGATTCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 14 12 T 13 14 244929 CASAVA_Build 11 40804077 1D GGGGGGGGGG C/- GTCTCACATA 3070 hom 53 het 22 0 19 3 C 1 0 244930 CASAVA_Build 11 40811911 2I TTTAGAAATA --/AT ATTTTTGAAT 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 AT 1 2 244931 CASAVA_Build 11 40816743 4D AAATACACAT AGAA/---- AGAATTATTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AGAA 2 1 244932 CASAVA_Build 11 40822371 2I TAATAAAAAA --/AT AAAAAATACA 1671 het 1671 ref 25 14 6 5 AT 0 1 244933 CASAVA_Build 11 40825257 1I TATTTGAATA -/C CCTTTCTTTC 3070 hom 42 het 15 0 14 1 C 2 3 244934 CASAVA_Build 11 40826198 4D TGGCTAGTGG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 TCTA 3 2 244935 CASAVA_Build 11 40847209 1I ATTATTTCCA -/T TTTAGAAGTA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 3 4 244936 CASAVA_Build 11 40847990 1D TGCTCTGAAG C/- TTTTTAATAA 3070 het 3070 hom 42 12 24 6 C 1 0 244937 CASAVA_Build 11 40850444 1I GCTGAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 13 14 244938 CASAVA_Build 11 40855276 1D GGCTAGCCAG A/- ATCTCTCTGT 3070 hom 46 het 29 0 21 9 A 2 1 244939 CASAVA_Build 11 40856048 4I TCAGCTATTA ----/CAAT CAATGAACCT 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 CAAT 1 2 244940 CASAVA_Build 11 40857335 1D AAAACTCAAG C/- TTTTGAATAT 3070 het 3070 ref 39 25 11 5 C 1 0 244941 CASAVA_Build 11 40859786 1D AGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2674 hom 30 10 12 9 T 12 11 244942 CASAVA_Build 11 40865335 1I TAATACACAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 8 9 244943 CASAVA_Build 11 40873476 1D CCTCACTAAA T/- TTTTATCTAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 T 5 4 244944 CASAVA_Build 11 40874667 1I AATTAGAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 11 12 244945 CASAVA_Build 11 40877225 1I GGTCATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 11 12 244946 CASAVA_Build 11 40882530 1D TGGCAAAATA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 T 9 8 244947 CASAVA_Build 11 40899051 1I ATAATCAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 652 hom 47 3 28 16 T 14 15 244948 CASAVA_Build 11 40902147 1D TAAAGGAAAT A/- AAGTCATTCC 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 A 3 2 244949 CASAVA_Build 11 40904802 1D TATAGTATAC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 7 T 7 6 244950 CASAVA_Build 11 40919052 1D TTACAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 38 1 23 14 T 16 15 244951 CASAVA_Build 11 40923350 10I TAGAGACGGG ----------/GTTTCACTCT GTTAACCTGG 1702 hom 10 het 4 0 4 0 GTTTCACTCT 0 1 244952 CASAVA_Build 11 40936091 1D ATTAGGAGGT G/- GGGTCTTTGG 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 G 4 3 244953 CASAVA_Build 11 40947412 4D TTTCTTATGG ATAA/---- ATAAATAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 ATAA 3 2 244954 CASAVA_Build 11 40972950 2D ACTTTTTTTT TA/-- ACTACTTCAT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 TA 1 0 244955 CASAVA_Build 11 40976388 8D CCCAGAACTT AAAAAAAA/-------- AAAAAGGACA 3070 het 3070 hom 23 11 12 1 A 13 5 244956 CASAVA_Build 11 40981318 1D TACAGTTCTG A/- AAAAATGTTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 6 5 244957 CASAVA_Build 11 40981663 3D TCAACCGACA ATT/--- ATGCTGAGGG 3070 het 3070 ref 47 21 19 8 ATT 1 0 244958 CASAVA_Build 11 40982879 24D AGGGGGCACA TGTTCTCAGGACCTCCTGAGGCTG/------------------------ TGTCACAGAA 3070 het 3070 ref 32 18 15 3 TGTTCTCAGGACCTCCTGAGGCTG 1 0 244959 CASAVA_Build 11 40994831 2D GAGTGAACAC AG/-- AGAGGTTTTC 3070 het 3070 ref 47 24 20 5 AG 3 2 244960 CASAVA_Build 11 40996198 1D TCCATGGACC A/- GGGGCAATAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 A 1 0 244961 CASAVA_Build 11 40998902 3D TCTCACTCTG TTC/--- TTCTTTTAGT 3070 het 3070 hom 59 23 31 6 TTC 2 1 244962 CASAVA_Build 11 40999420 2D TCCAAGAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 12 10 244963 CASAVA_Build 11 41000437 1I ATCTTTAAAA -/G AAAGTGAACT 3070 het 1980 hom 22 5 10 7 G 0 1 244964 CASAVA_Build 11 41003656 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 10 A 11 10 244965 CASAVA_Build 11 41004922 1D ATTTTTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 10 12 A 12 11 244966 CASAVA_Build 11 41006149 1D GAAGAAAACT C/- CTAGCCACTG 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 C 2 1 244967 CASAVA_Build 11 41023328 1D GTAAGAGACC T/- TAAAAGTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 2 1 244968 CASAVA_Build 11 41043210 13I AAAGGGGGCT -------------/GAGCCAGGGAGCC GAGCCAGGGA 3070 hom 66 het 28 0 18 10 GAGCCAGGGAGCC 1 2 244969 CASAVA_Build 11 41051460 1I AAGTGAGGGG -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 7 8 244970 CASAVA_Build 11 41054106 1I ACATTCATTG -/T TCTATTTCAA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 1 2 244971 CASAVA_Build 11 41065015 1D GATATGAGTC T/- TTTTTTTTTT 882 het 882 ref 42 28 3 11 T 13 12 244972 CASAVA_Build 11 41066589 1D TAACCTGGCT C/- TTTTCCATAG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 C 1 0 244973 CASAVA_Build 11 41068142 1D ATTGATATTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 7 hom 29 1 14 14 A 9 8 244974 CASAVA_Build 11 41073321 2D ATGGAGGCTG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 42 16 15 14 GA 6 5 244975 CASAVA_Build 11 41095158 1I CCAGTAGAAT -/G GTCTAACAGT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 G 1 2 244976 CASAVA_Build 11 41100059 1I TTAGCAGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 10 11 244977 CASAVA_Build 11 41101804 1I GTTCACTCAA -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 T 6 7 244978 CASAVA_Build 11 41103409 4I GAAATGAAAA ----/TAAT TAACATTTAA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 TAAT 0 1 244979 CASAVA_Build 11 41105866 1I CTATTCAACA -/T AAACATTGCT 3070 het 215 hom 47 1 38 8 T 0 1 244980 CASAVA_Build 11 41106393 1I TCATACCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2889 hom 28 6 14 8 A 11 12 244981 CASAVA_Build 11 41117835 2D TACTTTTCAA TT/-- TTTTTTTAAA 3070 hom 111 het 46 0 38 11 T 9 7 244982 CASAVA_Build 11 41158015 1I GCAGGTTTTC -/T TTCCACCTAG 3070 hom 95 het 35 0 31 4 T 2 3 244983 CASAVA_Build 11 41160975 1D TGGGCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 176 hom 38 1 22 15 A 15 14 244984 CASAVA_Build 11 41166184 4D CAAAGAGACT GTCA/---- ATCAGTCTCA 3070 hom 159 het 56 0 53 3 GTCA 1 0 244985 CASAVA_Build 11 41176752 1D AGGGGAGAGG A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 A 8 7 244986 CASAVA_Build 11 41225964 1D ATTCCAATTT A/- AATCAACTTG 3070 het 3070 ref 46 20 21 5 A 3 2 244987 CASAVA_Build 11 41228128 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2822 het 890 hom 20 2 10 8 A 11 12 244988 CASAVA_Build 11 41233859 1D CATATTATGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 55 18 30 7 A 9 8 244989 CASAVA_Build 11 41240534 1I ACAGTTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 28 2 17 9 A 14 15 244990 CASAVA_Build 11 41242222 1I TTTTTATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 16 10 T 15 16 244991 CASAVA_Build 11 41244005 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 20 0 16 4 A 10 11 244992 CASAVA_Build 11 41247408 1I CCTTTTATTA -/T TTATTTATTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 3 244993 CASAVA_Build 11 41256951 1I TTGTTTTGTG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 7 8 244994 CASAVA_Build 11 41267048 1D TGAACCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 33 3 11 19 T 12 11 244995 CASAVA_Build 11 41274442 1D TATGCTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 T 12 11 244996 CASAVA_Build 11 41315545 6I AGCAAACCTG ------/ACAAAA ACAAAAACAA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 ACAAAA 1 2 244997 CASAVA_Build 11 41322708 1D TAGTGCCTGT G/- GTTGGTTTTG 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 G 2 1 244998 CASAVA_Build 11 41323102 1D TTATTAACTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 9 8 244999 CASAVA_Build 11 41324099 1I TATACATATG -/T TTTTTCCAGA 3070 hom 129 het 53 0 44 9 T 5 6 245000 CASAVA_Build 11 41328111 4D GCTTAATAAA AGAC/---- AGCCAGATCC 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 AGAC 1 0 245001 CASAVA_Build 11 41329614 4D CAGGAAACTC AAAG/---- AACCCCTGTG 3070 het 3070 ref 54 28 23 3 AAAG 1 0 245002 CASAVA_Build 11 41337571 1D ATATGAGGAC A/- GGGGGTACAT 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 A 1 0 245003 CASAVA_Build 11 41349288 1D TTTCAAGCCC T/- GAAATTGGGG 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 T 1 0 245004 CASAVA_Build 11 41353438 15D GGAAATCAGA AAGTGTGACATACGT/--------------- AAGTACAATT 3070 het 3070 ref 29 20 12 3 AAGTGTGACATACGT 1 0 245005 CASAVA_Build 11 41360049 2D TATGTGTTTG TA/-- TATATATATG 3070 hom 84 het 35 0 29 7 TA 5 4 245006 CASAVA_Build 11 41365331 1D AGATGATAAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 8 7 245007 CASAVA_Build 11 41370689 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 42 1 31 10 A 11 12 245008 CASAVA_Build 11 41370862 2D GAAGAAAGAC AT/-- GTGATAATGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AT 1 0 245009 CASAVA_Build 11 41375804 1I AACAAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1096 hom 28 4 14 10 A 13 14 245010 CASAVA_Build 11 41378710 1I ATAGGAGATA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 7 8 245011 CASAVA_Build 11 41379601 1D CATAACTAAA G/- CAAGGTCCTG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 G 1 0 245012 CASAVA_Build 11 41384222 4D AGGATGAAAG AGAC/---- AGAGAGACAG 3070 hom 84 het 32 0 29 5 AGAC 1 0 245013 CASAVA_Build 11 41388508 1D TCCAAAGAAT G/- TTTTTTTCTT 3070 het 54 hom 17 2 12 4 G 1 0 245014 CASAVA_Build 11 41396074 10D ATATATACGT ATATATACAA/---------- ATATATACAA 3070 hom 78 het 37 0 26 13 ATATATACAA 2 1 245015 CASAVA_Build 11 41402064 8D GTAACTGAAT CATGGACG/-------- CATGATTGTG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 CATGGACG 1 0 245016 CASAVA_Build 11 41413214 1D AATTAAAAGT C/- CACAAGGTCC 3070 het 3070 hom 64 29 30 6 C 2 1 245017 CASAVA_Build 11 41434265 3D AGAGAGTGTA TCT/--- TCTTCTTCCA 3070 het 3070 hom 48 21 25 3 TCT 3 2 245018 CASAVA_Build 11 41438269 1D AGTGCTGCAT C/- CCCCCACCCC 3070 hom 90 het 32 0 30 4 C 6 5 245019 CASAVA_Build 11 41438670 1D TTTAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 12 11 245020 CASAVA_Build 11 41461284 1I TAACCTATAA -/C AATTTTTTCT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 C 0 1 245021 CASAVA_Build 11 41463271 2I CTAGCTCAGG --/TC TCTCCTCCTA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 TC 2 3 245022 CASAVA_Build 11 41474506 1I GTTTTTGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1950 hom 14 4 8 2 A 9 10 245023 CASAVA_Build 11 41483151 7D TCCTTCTTCT TTCTTCC/------- TTCTTCCTTC 3070 het 1651 hom 32 7 14 11 TTCTTCC 3 2 245024 CASAVA_Build 11 41483527 6D CATCTCTTTC TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 TG 11 8 245025 CASAVA_Build 11 41491185 3D ACTCTGCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 18 2 10 9 A 17 14 245026 CASAVA_Build 11 41501788 4D CAACATGCAC ATTG/---- ATTGATTGAT 3070 het 3070 ref 47 22 22 5 ATTG 3 2 245027 CASAVA_Build 11 41515171 1D GACTGCCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 14 12 A 15 14 245028 CASAVA_Build 11 41517191 2I AATGATGGAA --/TT AAAAAAAAAA 604 het 391 hom 38 1 9 28 T 0 2 245029 CASAVA_Build 11 41518947 1D TATCTAGTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3005 hom 27 10 10 7 T 10 9 245030 CASAVA_Build 11 41520047 1I TCCCAAAAAG -/A AAACTGGAAG 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 3 4 245031 CASAVA_Build 11 41525387 1I CCAGATTCAT -/A AAAGGAAGTC 3070 het 3070 hom 17 7 8 2 A 3 4 245032 CASAVA_Build 11 41532539 1I23M1I GTGGGAGGAA -CCAGTGGGAGATAATTTAATCCT-/CCCAGTGGGAGATAATTTAATCCTC CCACTGGGTT 3070 hom 47 het 17 0 13 7 N/A 0 0 245033 CASAVA_Build 11 41534314 1D CGTGAAATGC A/- AAAAAAAAAA 2880 het 2880 ref 30 18 7 5 A 13 12 245034 CASAVA_Build 11 41536188 1I AAAACTGGAG -/A AAAACATAGC 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 4 5 245035 CASAVA_Build 11 41538425 3I GTAGCCATGT ---/AAC AACAGCCTGA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 AAC 1 2 245036 CASAVA_Build 11 41538904 1I ATGTTGGCCA -/G GCTCGTCTTG 3070 hom 57 het 23 0 20 5 G 1 2 245037 CASAVA_Build 11 41542273 4D TTCAATGCAT AATG/---- AATACGTATT 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 AATG 1 0 245038 CASAVA_Build 11 41543976 1I TTTATGCATG -/T TTTTTATTTT 3070 hom 33 het 18 0 12 6 T 5 6 245039 CASAVA_Build 11 41545432 1D TAGTTAATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 10 9 245040 CASAVA_Build 11 41546959 1D AGATCTGGGA T/- TTTTTTATCC 3070 het 3070 hom 47 14 28 6 T 7 6 245041 CASAVA_Build 11 41549472 1I CATCTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 T 10 11 245042 CASAVA_Build 11 41552598 1I TAGCTCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1082 hom 31 8 12 11 T 13 14 245043 CASAVA_Build 11 41553533 3D TCAGTCTGAT ATC/--- AGGCAGAAAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATC 1 0 245044 CASAVA_Build 11 41558584 1D ATTTTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1190 hom 15 3 8 4 T 12 11 245045 CASAVA_Build 11 41561713 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 8 245046 CASAVA_Build 11 41565711 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 10 9 245047 CASAVA_Build 11 41573570 1D CTGGCTAATG T/- TTTTTTTTTT 2555 hom 28 het 18 0 10 8 T 13 12 245048 CASAVA_Build 11 41573720 1D CCTATATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 116 hom 29 1 21 7 T 15 14 245049 CASAVA_Build 11 41604336 8I TAGGCTTAGA --------/TGCACATC TGCACATCTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TGCACATC 1 2 245050 CASAVA_Build 11 41612431 1I CCCCCTTTCT -/A ATGGGGTTGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 245051 CASAVA_Build 11 41623727 2D ACCCAGTGAT GG/-- GGGGCTGCTG 3070 hom 48 het 17 0 17 1 G 6 4 245052 CASAVA_Build 11 41628299 4I GGCATTCTGG ----/TTTT TTTAATTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 3 7 245053 CASAVA_Build 11 41629033 7I AAACCACCTA -------/CTCAAGC CTCAGTAATG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 CTCAAGC 0 1 245054 CASAVA_Build 11 41631095 1I AAATTTATCA -/T TTTAACCATT 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 3 4 245055 CASAVA_Build 11 41634698 1D GTTATATGAG A/- AAAAAAAAAA 1179 het 1179 ref 35 27 3 5 A 12 11 245056 CASAVA_Build 11 41634928 5D AAAATATAAA TACTT/----- TACCGGTGAA 3070 hom 84 het 33 0 28 6 TACTT 1 0 245057 CASAVA_Build 11 41642558 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 34 het 17 0 11 6 T 9 8 245058 CASAVA_Build 11 41643558 1D TGCAGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 26 1 14 12 T 13 12 245059 CASAVA_Build 11 41644098 1I TTGCAATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 879 hom 22 2 18 2 A 10 11 245060 CASAVA_Build 11 41645018 1D CCCCCAAGGT A/- AAAAAAAAAA 1159 het 1159 ref 30 18 3 9 A 13 12 245061 CASAVA_Build 11 41655190 2I ACCTGAACAC --/TG GGCATTTTTC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TG 0 1 245062 CASAVA_Build 11 41658835 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 1 0 245063 CASAVA_Build 11 41677607 1D AGAGCTGATG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 T 9 8 245064 CASAVA_Build 11 41681262 1I CGCCTGTAAT -/C CCCAGCACTT 3070 hom 78 het 28 0 25 3 C 3 4 245065 CASAVA_Build 11 41682895 1D GGTTGAAATA T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 118 het 44 0 40 4 T 7 6 245066 CASAVA_Build 11 41683047 1I CTTTCTGCTC -/T TGGAATAGTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 2 245067 CASAVA_Build 11 41696119 2I CCCCCCCCCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 10 12 245068 CASAVA_Build 11 41700451 1I CCACACTGTC -/T TCTACAATGG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 1 2 245069 CASAVA_Build 11 41707862 1I CTCGTGTTGC -/T TTTTCATTAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 5 245070 CASAVA_Build 11 41708671 1D AATTTCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 47 1 38 8 T 11 10 245071 CASAVA_Build 11 41723591 1I TAGATTAAGG -/T GTGCCTAAGG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 0 1 245072 CASAVA_Build 11 41723651 1D GGATACGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 26 0 16 10 T 16 15 245073 CASAVA_Build 11 41724527 1D AAGCAACAAG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 144 het 52 0 48 6 A 8 7 245074 CASAVA_Build 11 41743113 1D TTCCACAGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 24 0 20 5 T 10 9 245075 CASAVA_Build 11 41758170 1D AATATGCCCC A/- AAATGCATGG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 3 245076 CASAVA_Build 11 41762191 1D GCTACTTTTT A/- AAAAAAAAAA 1796 het 1796 ref 34 18 7 9 A 15 14 245077 CASAVA_Build 11 41773064 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 19 2 T 10 9 245078 CASAVA_Build 11 41773557 3D CCAAATCAAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2781 hom 31 8 17 6 T 14 11 245079 CASAVA_Build 11 41777070 1I GCAAACAGAC -/A AAAAAAAAGC 2989 het 2989 ref 19 11 7 1 A 8 9 245080 CASAVA_Build 11 41790675 4D AAATGTAACT GAAA/---- GAGTTTATAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 GAAA 1 0 245081 CASAVA_Build 11 41793973 6D TTTTTTTTTT TTCGCC/------ TTTTCCTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 TTCGCC 1 0 245082 CASAVA_Build 11 41803658 1D AAATTGGGCT A/- AAAAGGTAGG 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 A 5 4 245083 CASAVA_Build 11 41806982 1D TGTTTGTTAC A/- ACCAACTCCA 3070 het 3070 hom 32 13 17 5 A 2 1 245084 CASAVA_Build 11 41807353 1I TGCTACGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 T 11 12 245085 CASAVA_Build 11 41814868 1D GGCAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 A 11 10 245086 CASAVA_Build 11 41827512 1D TTTTAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 10 245087 CASAVA_Build 11 41830064 1D AAATGTTACT A/- GAAAGAGATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 245088 CASAVA_Build 11 41844317 1D TTTGTCTTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2973 hom 37 16 18 3 T 10 9 245089 CASAVA_Build 11 41856116 1D AAACAATGAG A/- TTTTTCACCC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 1 0 245090 CASAVA_Build 11 41861921 1D CCTGTCATTT G/- CAACAACATG 3070 het 3070 hom 38 13 24 2 G 1 0 245091 CASAVA_Build 11 41862125 1D TAATGGGTAC A/- AAAAATGATA 3070 het 3070 ref 29 17 12 1 A 6 5 245092 CASAVA_Build 11 41866597 2D AATACAAAAC AT/-- GTACAATTGA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 AT 1 0 245093 CASAVA_Build 11 41867214 1D TATGTCCTGT G/- GGGAACATAC 3070 het 3070 hom 33 16 13 5 G 4 3 245094 CASAVA_Build 11 41872599 1D ACTGTTCCCA C/- TAATAAATTA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 C 1 0 245095 CASAVA_Build 11 41875310 1I TGGTTTATGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 T 8 9 245096 CASAVA_Build 11 41882631 1D CATAAACAAC A/- AAACTCTCAC 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 A 4 3 245097 CASAVA_Build 11 41884313 1I TTTTTGTCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 A 11 12 245098 CASAVA_Build 11 41889248 1D TCAATTTTGT G/- GGCGTAGAAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 G 3 2 245099 CASAVA_Build 11 41889742 1I TTAATCTCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 8 9 245100 CASAVA_Build 11 41893065 2D ATCATTTTAT TG/-- TGTCTATTTT 3070 het 3070 ref 33 19 13 2 TG 2 1 245101 CASAVA_Build 11 41894019 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2242 hom 18 6 8 4 T 11 10 245102 CASAVA_Build 11 41903006 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1047 hom 42 3 28 11 A 14 15 245103 CASAVA_Build 11 41907525 1I CAGGTTCAAG -/C GATTCTCCTG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 0 1 245104 CASAVA_Build 11 41911592 21I AATGATTGAC ---------------------/TCCTAGAGTCTCATGTTGCCT TCCTTCCTAC 3070 hom 156 het 54 0 50 5 TCCTAGAGTCTCATGTTGCCT 0 1 245105 CASAVA_Build 11 41923551 2D ATTATTTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 18 0 14 5 TA 7 6 245106 CASAVA_Build 11 41929091 1D ACAGTGATTG T/- TTAATGGTAG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 3 2 245107 CASAVA_Build 11 41938024 1I AAAAACAACA -/T GATCATTTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 1 245108 CASAVA_Build 11 41939175 12I AATGTGCAAG ------------/AACTGAGTTGAT AACTGAGTTG 3070 hom 38 het 23 0 16 7 AACTGAGTTGAT 1 2 245109 CASAVA_Build 11 41944674 1D GCTAAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 1830 het 1830 ref 28 22 4 2 T 12 11 245110 CASAVA_Build 11 41946291 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2591 het 117 hom 15 1 9 5 A 13 14 245111 CASAVA_Build 11 41952120 1I TATTTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 26 2 17 7 T 11 12 245112 CASAVA_Build 11 41962586 1D AGCTCTCAAC T/- TTTAAGATTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 4 3 245113 CASAVA_Build 11 41964874 1D GCTTTCAGCG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 61 29 25 8 T 9 8 245114 CASAVA_Build 11 41973854 1I TGAATCTTAA -/G TCATTTTTGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 0 1 245115 CASAVA_Build 11 41985644 1D TGGTCTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1956 hom 37 7 19 11 T 15 14 245116 CASAVA_Build 11 41988490 1D TAAGGCCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 12 11 245117 CASAVA_Build 11 41996805 1D CTACTAAAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 9 8 245118 CASAVA_Build 11 42001952 1D TTTCATTCAA T/- GGTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 23 13 7 T 1 0 245119 CASAVA_Build 11 42006514 1I AATAATATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 9 10 245120 CASAVA_Build 11 42019187 1D GGTGTCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 27 1 22 4 T 11 10 245121 CASAVA_Build 11 42035988 1I TAAAGTATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 387 hom 35 1 30 4 A 9 10 245122 CASAVA_Build 11 42039243 1D AAGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 1637 het 1637 ref 41 33 4 4 A 10 9 245123 CASAVA_Build 11 42048173 1I CCAACAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1170 hom 41 4 24 13 T 14 15 245124 CASAVA_Build 11 42069785 1I CAAAAAAGGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 8 9 245125 CASAVA_Build 11 42070978 1D AGCTGGGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 30 0 22 9 T 11 10 245126 CASAVA_Build 11 42074818 2D AAGCAGGTTG GT/-- GCTATTGAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 GT 1 0 245127 CASAVA_Build 11 42079700 1D CTGGCACCTA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 73 het 30 0 25 5 T 8 7 245128 CASAVA_Build 11 42081713 2D GAGTCACTTC CT/-- AAAATAACAT 3070 hom 147 het 52 0 48 6 CT 1 0 245129 CASAVA_Build 11 42081806 3I TCTTTTTTTC ---/CTT CTTTTCTTTC 3070 hom 88 het 37 0 27 10 CTT 1 2 245130 CASAVA_Build 11 42092357 5I TATATAGACA -----/TATAT TATATAATAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TATAT 1 2 245131 CASAVA_Build 11 42099913 3D AGGGCAAGAA CCC/--- CCCCCCACCC 1952 hom 18 het 9 0 7 2 C 9 6 245132 CASAVA_Build 11 42108678 2I TTTCATGGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2016 hom 29 10 11 8 TA 5 6 245133 CASAVA_Build 11 42110705 1I TTTTAAATAT -/A AAAAAAAACG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 8 9 245134 CASAVA_Build 11 42112485 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 114 het 45 0 39 7 A 9 8 245135 CASAVA_Build 11 42124102 22D AGGTTCAGTT GATTCAGTTCCAAAGGCTGTAC/---------------------- GATTCAGTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 9 GATTCAGTTCCAAAGGCTGTAC 2 1 245136 CASAVA_Build 11 42131907 1D TTAATTGAAG T/- TTTTTTTATG 3070 hom 99 het 39 0 34 6 T 8 7 245137 CASAVA_Build 11 42142645 2D AACAAATTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 78 het 36 0 27 10 AC 9 8 245138 CASAVA_Build 11 42145621 1I GTGGCAGGAA -/G TTAAACTGCA 3070 hom 126 het 46 0 41 5 G 0 1 245139 CASAVA_Build 11 42146104 1I AAGAAAGAAG -/A AAAAAGGAGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 5 6 245140 CASAVA_Build 11 42165682 1I ACTGAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1345 hom 33 3 26 4 A 11 12 245141 CASAVA_Build 11 42204111 1D TGCAATGGCT G/- GGATCTTGGC 3070 hom 74 het 36 0 29 7 G 3 2 245142 CASAVA_Build 11 42221025 9D GGAGGAAAAT TGATGTGTC/--------- TGATGTGTCT 3070 hom 87 het 35 0 29 11 TGATGTGTC 2 1 245143 CASAVA_Build 11 42252559 1I GGGAAGGAGA -/G TGAAGTGAGC 3070 hom 168 het 61 0 54 7 G 0 1 245144 CASAVA_Build 11 42258040 1I CATTTTTCAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 8 9 245145 CASAVA_Build 11 42259513 1I AATAGTATAT -/A TTTTTTTCAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 0 1 245146 CASAVA_Build 11 42306851 3D ACCTAATATA GAG/--- GAAGATGTGG 3070 het 3070 hom 63 27 28 11 GAG 1 0 245147 CASAVA_Build 11 42344189 3D AGTTACATTC CCA/--- CCAACAGTAT 3070 het 3070 hom 36 15 21 1 CCA 2 1 245148 CASAVA_Build 11 42347297 1I TAATAGAATT -/G TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 G 0 1 245149 CASAVA_Build 11 42360851 1I ACCACATGTT -/C TCACTCATAG 1409 het 1409 ref 12 7 3 2 C 0 1 245150 CASAVA_Build 11 42363268 1I ATTGACAATT -/A AAGCCATAGC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 2 3 245151 CASAVA_Build 11 42371002 1I GTTAAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2823 hom 38 11 21 6 T 10 11 245152 CASAVA_Build 11 42380037 1I TCAACAGGGT -/G AAAAAAAAAA 2952 het 2952 ref 24 12 9 3 G 0 1 245153 CASAVA_Build 11 42381425 1I AAAATTGAGA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 7 8 245154 CASAVA_Build 11 42387309 2I ACGCATACAC --/AT GTGTGTTTAA 3070 hom 75 het 36 0 24 12 AT 0 1 245155 CASAVA_Build 11 42388160 2D ATGTATGTGC AG/-- AGTGACCAGC 3070 het 3070 ref 42 18 19 6 AG 2 1 245156 CASAVA_Build 11 42388411 3D TTATTTTATT TTA/--- TTTTTTTCTG 3070 hom 45 het 30 0 17 14 TTA 1 0 245157 CASAVA_Build 11 42389164 1D CTATGTTAGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 9 8 245158 CASAVA_Build 11 42392711 3I TAAAATATTT ---/ATA ATAATGCAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATA 1 2 245159 CASAVA_Build 11 42395659 2I TTTCAATCCT --/AC AGAGACAGAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AC 0 1 245160 CASAVA_Build 11 42398120 1D GCAGAAAAAT A/- AAAAAATTTG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 7 6 245161 CASAVA_Build 11 42415855 1D ACACCTCAAA G/- ACTTGCTGGC 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 G 1 0 245162 CASAVA_Build 11 42416714 1D GGTGTTTGAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 40 18 16 7 A 9 8 245163 CASAVA_Build 11 42423714 4D CAGTACCGAT AAAC/---- AATGTAAAAA 3070 het 3070 ref 44 26 12 9 AAAC 1 0 245164 CASAVA_Build 11 42424334 1I ATTGCTAGTG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 8 9 245165 CASAVA_Build 11 42425243 2D CCATTCTCCT GC/-- CTCAGCCTCC 3070 het 3070 ref 22 9 8 5 GC 1 0 245166 CASAVA_Build 11 42428456 2I CATAAAAAAA --/AC ACAGTCATGT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 AC 1 2 245167 CASAVA_Build 11 42429486 1D TGTTATTCTA T/- TTGGAGGGTT 3070 het 3070 ref 51 30 15 7 T 3 2 245168 CASAVA_Build 11 42431922 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2253 het 1620 hom 21 7 5 11 A 14 13 245169 CASAVA_Build 11 42438479 1D TTAACTATGG T/- TAAGGCTCCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 1 245170 CASAVA_Build 11 42439275 1I CTGAAACAAG -/A AAAAATTGCT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 5 6 245171 CASAVA_Build 11 42447351 1D GATGCTTGTG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 8 7 245172 CASAVA_Build 11 42447914 1D TTGAAGTTTG A/- AAAATCGGTA 3070 hom 138 het 50 0 46 4 A 5 4 245173 CASAVA_Build 11 42449348 1D GATATTTTAG A/- AGTCATTCTT 3070 het 3070 ref 38 18 17 5 A 2 1 245174 CASAVA_Build 11 42450437 1I TTGGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 A 13 14 245175 CASAVA_Build 11 42451561 3D CACAGCAGTC CTT/--- CTATACTAAG 2651 het 2651 ref 21 11 7 3 CTT 1 0 245176 CASAVA_Build 11 42456504 2D CAGGGAATGA AC/-- AACAATAAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 7 AC 1 0 245177 CASAVA_Build 11 42458764 34D AAAGGAGATT ATTTTGGAGCTTTAAGGTTTGACTCCTCTGCTGA/---------------------------------- ATTTTGGACT 1983 het 1983 ref 30 20 7 14 ATTTTGGAGCTTTAAGGTTTGACTCCTCTGCTGA 1 0 245178 CASAVA_Build 11 42467405 1I GTAGTATGAC -/T ACATTTACTA 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 T 0 1 245179 CASAVA_Build 11 42468049 4D CAAAGAAGAA AAAT/---- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 AAAT 1 0 245180 CASAVA_Build 11 42468852 1I GGGATCCAGC -/T ATTTTGTAAA 3070 het 3070 ref 58 25 21 12 T 0 1 245181 CASAVA_Build 11 42473018 3D TCATTAATAT TAA/--- TAATATCACA 1433 het 1433 ref 7 4 3 0 TAA 2 1 245182 CASAVA_Build 11 42475730 2D ATGTATCGCT AA/-- GTTAGATTTA 3070 het 3070 ref 38 21 14 5 A 2 0 245183 CASAVA_Build 11 42483170 13D GGGTGGGAAC ACAGCCAAACCAT/------------- ATCAGTAGGC 3070 het 3070 hom 30 13 21 3 ACAGCCAAACCAT 1 0 245184 CASAVA_Build 11 42485571 2I GTCAAGCAAG --/TT TTTTTTTCCG 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 7 9 245185 CASAVA_Build 11 42491517 3I TTTGATCCTG ---/TCA TCATGTTGTT 3070 het 3070 hom 56 25 24 7 TCA 1 2 245186 CASAVA_Build 11 42491909 1I GCCTTAAATA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 T 6 7 245187 CASAVA_Build 11 42499261 1D CCTCTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 11 10 245188 CASAVA_Build 11 42512985 2I TCAGATTATG --/GT GTGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 56 22 24 10 GT 4 5 245189 CASAVA_Build 11 42541153 1I ATGCCATGTG -/A AAAAAGCCAG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 5 6 245190 CASAVA_Build 11 42542007 1D CTTTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 34 3 23 8 T 17 16 245191 CASAVA_Build 11 42549285 4D ACTTATAGAT AGAC/---- AGACAGATAG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 AGAC 2 1 245192 CASAVA_Build 11 42555132 4D ATTAAACAAA TAAT/---- TAATCATAAA 3070 het 3070 hom 43 19 23 2 TAAT 2 1 245193 CASAVA_Build 11 42565548 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAGAAA 2863 het 1794 hom 24 12 10 2 A 6 7 245194 CASAVA_Build 11 42577562 1D TAGAAAATAG A/- AAAAAACCAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 7 6 245195 CASAVA_Build 11 42579074 1D ACATACATAT A/- GGGGTGCACA 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 A 1 0 245196 CASAVA_Build 11 42598578 1I ACAGAAAGTT -/G GTTGATAGAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 1 2 245197 CASAVA_Build 11 42599380 1D ACTCACTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 13 12 245198 CASAVA_Build 11 42602693 1D AACAGTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 9 245199 CASAVA_Build 11 42604785 5D AAGAAGAAAC ACTAG/----- ACTAGAGGAC 3070 het 3070 ref 64 36 22 6 ACTAG 2 1 245200 CASAVA_Build 11 42605707 1I TTATCCAGAT -/G GGCCCAATTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 2 3 245201 CASAVA_Build 11 42607408 1I ATCCTCAGGG -/A AGAAGGATCA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 1 2 245202 CASAVA_Build 11 42610403 1D AGTGTTTGGG A/- AAAAACACAT 3070 het 3070 hom 49 20 25 5 A 6 5 245203 CASAVA_Build 11 42649631 1I AAAATAAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 8 9 245204 CASAVA_Build 11 42652927 1I ATACACTTAT -/A CAAAAAAAAA 3070 het 425 hom 32 2 25 5 A 0 1 245205 CASAVA_Build 11 42654270 1D TTACTACTTA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 94 het 35 0 31 5 T 8 7 245206 CASAVA_Build 11 42659278 1I GTGTATAAGC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 41 het 17 0 14 3 A 8 9 245207 CASAVA_Build 11 42659839 4I ACAAAACAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 62 het 23 0 21 4 AAAC 4 5 245208 CASAVA_Build 11 42660517 1D AACTCTCAAG A/- AAAAAATCAC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 7 6 245209 CASAVA_Build 11 42662868 2D12M6D TTCATAAATA ATATATGTATACATTATAAA/--ATATGTATACAT------ TATATTTTTA 3070 hom 105 het 31 0 36 2 N/A 0 0 245210 CASAVA_Build 11 42665096 4D TAGAATACAT TGAG/---- GTACCTCAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 8 TGAG 1 0 245211 CASAVA_Build 11 42672283 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 9 10 245212 CASAVA_Build 11 42673592 3D AAAATAAATA AAT/--- AATAAGACCT 3070 hom 106 het 39 0 36 4 AAT 2 1 245213 CASAVA_Build 11 42674081 1D AATCCACCAA G/- GCCCACTACT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 2 1 245214 CASAVA_Build 11 42675712 6I TAAAAACATA ------/TATTTG TATTTGCAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TATTTG 1 2 245215 CASAVA_Build 11 42684101 1D TCCATCTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 41 2 30 10 A 13 12 245216 CASAVA_Build 11 42687271 1D ACTGAGTCTG C/- CTCTCCAGCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 2 1 245217 CASAVA_Build 11 42693409 2I TATTAACTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 44 0 40 5 T 10 12 245218 CASAVA_Build 11 42694550 1D TCTTGTGTTT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 A 8 7 245219 CASAVA_Build 11 42698672 1D TTCCTAATAA C/- ATTATGAAGA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 C 1 0 245220 CASAVA_Build 11 42702277 1D TTTGACCGTC A/- AAAAAACTCC 3070 hom 135 het 52 0 46 7 A 7 6 245221 CASAVA_Build 11 42705238 2I CTTATTATAC --/AT GTGTGTGTGT 3070 hom 99 het 42 0 32 10 AT 0 1 245222 CASAVA_Build 11 42708596 1I TACCATCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 86 hom 36 1 31 4 T 9 10 245223 CASAVA_Build 11 42709983 1I ATCTTAAGGC -/A AAAAAAGTAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 7 245224 CASAVA_Build 11 42730933 1D TGTTTTGGTT A/- CTGTAGCTTT 3070 hom 53 het 19 0 18 2 A 1 0 245225 CASAVA_Build 11 42755013 1D GAAAAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 7 9 T 12 11 245226 CASAVA_Build 11 42761379 1D TCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2463 het 1680 hom 15 6 6 3 A 13 12 245227 CASAVA_Build 11 42761957 4I GAGATTTACA ----/GGTG GGTAATGATT 3070 het 3070 hom 53 15 30 8 GGTG 0 1 245228 CASAVA_Build 11 42764551 1I CAAGAGTGGT -/G GGGGGGAGGC 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 G 6 7 245229 CASAVA_Build 11 42775685 1D ACCATCAAAA T/- CCCTATTAGA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 T 1 0 245230 CASAVA_Build 11 42784140 1I ATTATAACAC -/A GTACATACCT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 A 0 1 245231 CASAVA_Build 11 42787095 1D CCCTTTTTTT C/- CTCACTTAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 C 2 1 245232 CASAVA_Build 11 42791645 1D GCCATTCCCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 T 9 8 245233 CASAVA_Build 11 42792358 1D AAAGCAAGAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 7 245234 CASAVA_Build 11 42795081 1I CATCTTAATA -/T TTTTTTCTAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 7 245235 CASAVA_Build 11 42803798 1D ATGTTAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 88 het 46 1 42 5 A 10 9 245236 CASAVA_Build 11 42804619 1I GTCAGATATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 416 hom 49 2 42 5 A 9 10 245237 CASAVA_Build 11 42816881 1I GAACAATAAT -/A AAATGCTTTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 3 4 245238 CASAVA_Build 11 42823984 1I AGAACTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 10 11 245239 CASAVA_Build 11 42831270 1D GCCATTATTT G/- GGGGATGTTG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 G 5 4 245240 CASAVA_Build 11 42833163 4D GGTCAACTAC AATT/---- AATTGACCAT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AATT 2 1 245241 CASAVA_Build 11 42835085 1I GTCTGATTAG -/T TTTTGTCTGT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 4 5 245242 CASAVA_Build 11 42838222 4D CGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAAATC 3070 het 3070 ref 27 17 9 3 AAAC 2 1 245243 CASAVA_Build 11 42839324 6I ATATGGTGAC ------/TTTATA TTTAATATGC 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 TTTATA 0 1 245244 CASAVA_Build 11 42839600 2D TCTGTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 T 13 11 245245 CASAVA_Build 11 42868768 4D TAAAAAACAA AAAC/---- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 34 17 17 2 AAAC 1 0 245246 CASAVA_Build 11 42896237 1D AATAATAGTT A/- GAGACTTTAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 A 1 0 245247 CASAVA_Build 11 42901174 2D AATCCATCTT GA/-- GTTTATTTTG 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 GA 1 0 245248 CASAVA_Build 11 42902364 1D GTGAATCTAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 52 25 19 8 T 8 7 245249 CASAVA_Build 11 42905802 1I GGCTGAGGCA -/G GAGAGTCGCT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 G 1 2 245250 CASAVA_Build 11 42905899 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 10 11 245251 CASAVA_Build 11 42907194 1I CAGTAATCAG -/T TTTTGAAGAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 4 5 245252 CASAVA_Build 11 42910907 1I AAATGGTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 9 10 245253 CASAVA_Build 11 42913556 2D TTCTCACCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 33 0 24 9 A 12 10 245254 CASAVA_Build 11 42917696 3D CCAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 AAG 3 2 245255 CASAVA_Build 11 42918382 1D GTAAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3044 hom 26 12 11 4 A 13 12 245256 CASAVA_Build 11 42934487 1D TTAAATATAC A/- AAAAAAAATT 1483 het 1483 ref 12 7 4 1 A 9 8 245257 CASAVA_Build 11 42935984 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2647 hom 26 9 8 9 A 12 11 245258 CASAVA_Build 11 42953127 11I ATAAATCAAA -----------/TCCTCAAGCAC TGAGAGTATA 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 TCCTCAAGCAC 0 1 245259 CASAVA_Build 11 42960626 1I ACAACAACAA -/C AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 C 0 1 245260 CASAVA_Build 11 42968368 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2232 het 1068 hom 15 4 7 4 A 10 11 245261 CASAVA_Build 11 42970595 1I GGGAAACAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 8 9 245262 CASAVA_Build 11 43010135 2D CCATATACAC AT/-- GTTATGTTTC 3070 het 3070 hom 48 21 23 5 AT 1 0 245263 CASAVA_Build 11 43025283 2D TATATAATAC GT/-- GTGTGTGCTT 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 GT 4 3 245264 CASAVA_Build 11 43032334 2I ACAAATAAAG --/AC ACACACACAC 3057 het 1691 hom 17 5 10 2 AC 7 8 245265 CASAVA_Build 11 43053032 2I AATGTAGGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 12 14 245266 CASAVA_Build 11 43055853 1D AGAAATATAA T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 8 7 245267 CASAVA_Build 11 43056889 2D CTGGGCACTC TG/-- TGTGTGTAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 TG 4 3 245268 CASAVA_Build 11 43070151 1D CCATAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 26 23 5 T 11 10 245269 CASAVA_Build 11 43083443 1D ATGAATTGAA G/- AACTTTGTTT 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 G 1 0 245270 CASAVA_Build 11 43088503 1D AGAGTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 25 1 16 8 A 15 14 245271 CASAVA_Build 11 43094608 1I TAGAGTCAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 8 9 245272 CASAVA_Build 11 43125177 1D TTGTTCAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2638 hom 26 9 13 5 T 12 11 245273 CASAVA_Build 11 43149791 2D TACACTACCG CC/-- CCCCCCCCGC 2821 het 1555 hom 35 11 9 15 C 10 8 245274 CASAVA_Build 11 43151353 1I TAACAGTGAC -/A AAACCCCTCC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 3 4 245275 CASAVA_Build 11 43159029 1D AAAAGTACCC A/- CCTCATAGGA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 1 0 245276 CASAVA_Build 11 43159403 1I TGACAATGGA -/C CCCCAAAGAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 4 5 245277 CASAVA_Build 11 43164712 2I TTAGTTTGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 10 12 245278 CASAVA_Build 11 43173830 2I CGTATGTAAC --/AT GTGCACATTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 0 1 245279 CASAVA_Build 11 43174928 1D37M1I CCCTACTTTG TTTCAACCTGGATGATCCAGAGCTTTTTCTCAAATAAA-/-TTCAACCTGGATGATCCAGAGCTTTTTCTCAAATAAAT TTTTTTCCTT 3070 het 2444 hom 26 6 17 14 N/A 0 0 245280 CASAVA_Build 11 43191319 1D AAATTAGCTG C/- GCATGGTGCC 3070 het 1604 hom 22 4 17 1 C 1 0 245281 CASAVA_Build 11 43191458 1I ACTATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 12 13 245282 CASAVA_Build 11 43206859 1D TCATGCAATA T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 T 7 6 245283 CASAVA_Build 11 43216872 1D TCTATCTATC T/- AACTGTATGT 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 T 1 0 245284 CASAVA_Build 11 43219944 1I AAATAAAAAA -/C ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 C 0 1 245285 CASAVA_Build 11 43222802 1D AGGCACTTGA T/- TTTTTTTTTT 1828 het 1828 ref 40 29 5 6 T 12 11 245286 CASAVA_Build 11 43236798 1I AGAAGAATAT -/A AAGGTATTTA 3070 hom 62 het 27 0 20 7 A 2 3 245287 CASAVA_Build 11 43237961 1I ACCCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 33 4 13 16 A 14 15 245288 CASAVA_Build 11 43239609 2D TATGATTTAG AC/-- ACACACACAC 2755 het 2755 ref 24 11 9 5 AC 7 6 245289 CASAVA_Build 11 43239987 1I CAATGAACAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 9 10 245290 CASAVA_Build 11 43243638 1I ATCACGTGCA -/C CAAGGGAGGT 3070 het 3070 hom 57 23 28 6 C 1 2 245291 CASAVA_Build 11 43247306 10I CAAATATGCT ----------/GGAGAAAGAA GGAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 55 16 28 11 GGAGAAAGAA 1 2 245292 CASAVA_Build 11 43253177 5D ATTAAGAGAT TAAAG/----- TAAAGACAGG 3070 het 2244 hom 15 5 10 1 TAAAG 2 1 245293 CASAVA_Build 11 43253523 1D GGGAAGGGCA G/- GGGGGATGAG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 G 6 5 245294 CASAVA_Build 11 43254369 1D AAATTGCCCC T/- ATTTGTCCCA 3070 het 3070 ref 56 26 25 5 T 1 0 245295 CASAVA_Build 11 43255575 1I AGATAGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 40 0 28 12 T 12 13 245296 CASAVA_Build 11 43256224 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 9 10 245297 CASAVA_Build 11 43265102 1D CAGGCACCCA C/- CCCCTAGACA 3070 hom 66 het 25 0 20 6 C 5 4 245298 CASAVA_Build 11 43268397 1I GCCAACTGAT -/A AAAAATGGCA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 5 6 245299 CASAVA_Build 11 43269389 1D TTGGTTCTGA G/- GCCTTTCAAT 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 G 2 1 245300 CASAVA_Build 11 43290614 1D TTCTTCTCAC G/- GAGCTTTTCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 2 1 245301 CASAVA_Build 11 43294515 1D TTAAGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 263 hom 29 1 21 8 T 12 11 245302 CASAVA_Build 11 43307505 1I AAAAAAAATT -/A AAAAGACAGA 2414 het 2414 ref 28 18 9 1 A 4 5 245303 CASAVA_Build 11 43323456 1D CGTTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 2686 het 2686 ref 25 16 7 2 G 1 0 245304 CASAVA_Build 11 43331799 1I ACTCCAGCTC -/A AAAAAAAAAA 2392 het 2392 ref 33 17 7 9 A 15 16 245305 CASAVA_Build 11 43333122 1I CAACACTTGT -/A ACTCAGCAAT 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 A 1 2 245306 CASAVA_Build 11 43362271 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2822 hom 27 12 11 4 A 13 12 245307 CASAVA_Build 11 43366294 4D AGTTTTTCTT AAAG/---- AAGCAACATA 3070 het 3070 ref 36 23 13 4 AAAG 1 0 245308 CASAVA_Build 11 43366524 3D GTAATATTTT AGG/--- AGAGTAAGAG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 AGG 1 0 245309 CASAVA_Build 11 43369253 1I GACTGAGCAC -/A AGTGGTTTAC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 1 2 245310 CASAVA_Build 11 43369735 4D TTTTTTTTTT TGCG/---- TTGCGTTCTT 3070 hom 42 het 32 1 24 8 TGCG 1 0 245311 CASAVA_Build 11 43371628 1D AGAAGCTCTC A/- AAACTCTGTT 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 A 4 3 245312 CASAVA_Build 11 43381206 4D GGGAAAAAAT AAAG/---- AAGACCAGAT 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 AAAG 1 0 245313 CASAVA_Build 11 43384693 3D CACAACCACC TTT/--- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 11 8 245314 CASAVA_Build 11 43385178 5D TGAGGAGCTT AAGAA/----- AAGACTGCCA 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 AAGAA 1 0 245315 CASAVA_Build 11 43394870 4D TTTTACATTG TAAT/---- TAATTAATTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 TAAT 3 2 245316 CASAVA_Build 11 43410362 1I ACTTTGACAA -/G GTATATTAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 1 2 245317 CASAVA_Build 11 43410911 1I CAAAGGCAAC -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 7 8 245318 CASAVA_Build 11 43418386 1D GTTGTTACAA C/- CCCAGCCCTC 3070 hom 120 het 45 0 39 6 C 4 3 245319 CASAVA_Build 11 43419088 1D TACATGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2600 hom 27 9 13 5 A 12 11 245320 CASAVA_Build 11 43431307 4I GACGAAAATA ----/AAAT AGAGAGTTAA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 AAAT 0 1 245321 CASAVA_Build 11 43437075 20D AGGAAAAAAT AATAGTTTGTATAAGGTTCG/-------------------- AATAGTTTGT 3070 het 3070 ref 44 26 15 8 AATAGTTTGTATAAGGTTCG 2 1 245322 CASAVA_Build 11 43452976 3D AGAAAATGTT AAG/--- AAAATCACAA 2408 het 2408 ref 18 10 6 3 AAG 1 0 245323 CASAVA_Build 11 43459014 1D AAGAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2919 hom 29 9 14 6 A 14 13 245324 CASAVA_Build 11 43459185 3D TAAAAAGGAG GTA/--- GTAGGCATAG 3070 hom 72 het 31 0 24 9 GTA 2 1 245325 CASAVA_Build 11 43459358 4D AAAGCAAACA AAAG/---- AAAGATAGAT 3070 het 3070 hom 46 16 23 8 AAAG 2 1 245326 CASAVA_Build 11 43460385 1D TTTTTAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 12 11 245327 CASAVA_Build 11 43461301 4D TCAAATAAAT TAAG/---- TAGTAAGTTT 3070 het 1213 hom 30 4 18 8 TAAG 1 0 245328 CASAVA_Build 11 43461317 1I GTAAGTTTTT -/A AAAAAATCTT 3070 het 255 hom 26 1 8 17 A 6 7 245329 CASAVA_Build 11 43464284 1I ACGCCATAGT -/C CCCCCCCTTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 7 8 245330 CASAVA_Build 11 43475692 2I TTCCTGACTC --/AG AGAGCCCGAG 3070 hom 75 het 26 0 25 1 AG 2 3 245331 CASAVA_Build 11 43477078 1I GAACCTCACA -/G GGCCTATTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 2 3 245332 CASAVA_Build 11 43478171 1D TTGGTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 A 11 10 245333 CASAVA_Build 11 43491245 1D GTTAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 32 1 24 7 T 11 10 245334 CASAVA_Build 11 43501354 1D ACCAGTCCAC A/- AAACACGGGG 1937 het 1937 ref 41 25 9 9 A 4 3 245335 CASAVA_Build 11 43501724 1D CACCCTGCTC T/- AGAATGTTGC 2052 het 2052 ref 42 22 6 15 T 1 0 245336 CASAVA_Build 11 43514015 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 17 1 13 3 T 11 10 245337 CASAVA_Build 11 43530718 6I ACTTATACTC ------/TTAATA TTAATATTTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TTAATA 1 2 245338 CASAVA_Build 11 43534243 1D TTGCAGGGGG A/- AAAAAGCCAG 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 A 6 5 245339 CASAVA_Build 11 43534673 4D CTCCTTTCTT CTCC/---- CTCCCTCCCT 3070 het 1298 hom 18 4 11 5 CTCC 4 3 245340 CASAVA_Build 11 43536551 1D GAGAGCAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 111 hom 27 1 21 5 T 10 9 245341 CASAVA_Build 11 43543025 10D TTTCTTCTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 13 9 4 T 19 9 245342 CASAVA_Build 11 43544157 4I AGAGGGGATG ----/CTCT CTCTGTATTT 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 CT 2 4 245343 CASAVA_Build 11 43563305 1I CCTCTGGATA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 8 9 245344 CASAVA_Build 11 43565443 1I AGCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 10 11 245345 CASAVA_Build 11 43579627 3D GTTAAAGAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2911 hom 47 14 16 18 T 19 16 245346 CASAVA_Build 11 43601514 1I TAAAGGTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 8 9 245347 CASAVA_Build 11 43602184 1I AATTCAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 54 21 20 13 A 9 10 245348 CASAVA_Build 11 43604073 2D ACATTTAAAA CT/-- CTTCTATTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 CT 2 1 245349 CASAVA_Build 11 43605363 1I TAGTCCTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 15 10 13 T 9 10 245350 CASAVA_Build 11 43612570 1D GAAGAATGCA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 8 7 245351 CASAVA_Build 11 43619058 1D CATTTACTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 10 9 245352 CASAVA_Build 11 43619359 1D TTTGTTGGGG A/- AAAAATGAGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 6 5 245353 CASAVA_Build 11 43626230 1I TTAAAGCCTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 8 9 245354 CASAVA_Build 11 43626877 2D GTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 2905 het 2067 hom 19 6 9 4 AG 2 1 245355 CASAVA_Build 11 43638586 3D ATGCTGTAAG TTA/--- TTAATTGAAG 3070 het 3070 ref 36 18 15 6 TTA 2 1 245356 CASAVA_Build 11 43641182 15D AAAAATTTTT TTGAGAGACAGGGTC/--------------- TTGCCTTGTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TTGAGAGACAGGGTC 1 0 245357 CASAVA_Build 11 43647237 1D ATGCTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 287 hom 31 2 23 6 A 14 13 245358 CASAVA_Build 11 43653736 1D TAATTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 A 13 12 245359 CASAVA_Build 11 43655820 1I ACATGTGGTG -/T TTGGGTTTTT 2277 hom 14 het 9 0 5 4 T 2 3 245360 CASAVA_Build 11 43658198 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 13 1 11 1 T 11 10 245361 CASAVA_Build 11 43658301 2I TCCCGGGTTC --/AA GTGATTCTCC 3070 hom 33 het 14 0 8 6 A 0 2 245362 CASAVA_Build 11 43660635 4D GCCACTGCAC TCCA/---- TCCAGCCTGG 2925 het 52 hom 15 2 10 6 TCCA 2 1 245363 CASAVA_Build 11 43660671 3D GACTCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1775 het 10 hom 13 0 6 7 A 22 19 245364 CASAVA_Build 11 43663413 21I GAAAACATGC ---------------------/TTTGCTTAGCCATGCTCAAGA ATCAAAGGAT 3070 hom 175 het 60 0 59 5 TTTGCTTAGCCATGCTCAAGA 0 1 245365 CASAVA_Build 11 43665157 3I AAAATTTGTC ---/AGA AGATTTACAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AGA 1 2 245366 CASAVA_Build 11 43670980 1I ATAGTAAGCA -/G TATAGAACCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 0 1 245367 CASAVA_Build 11 43683883 4D TTTTCCTCTC TCCT/---- CTTTTTTTTT 2187 hom 8 het 24 1 16 10 TCCT 1 0 245368 CASAVA_Build 11 43684318 6D ACAGAGATTG TTTATC/------ TTTAATAGCA 3070 het 3070 hom 26 10 14 4 TTTATC 1 0 245369 CASAVA_Build 11 43697753 3D AAAAAAAAAA AAT/--- ATATATATAT 3070 het 705 hom 24 3 10 13 AAT 1 0 245370 CASAVA_Build 11 43698943 1D GCTCACAGAT A/- TGGTATATTT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 1 0 245371 CASAVA_Build 11 43700960 1I GGGCAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 10 11 245372 CASAVA_Build 11 43702089 1D AGGAGGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 38 0 30 8 T 11 10 245373 CASAVA_Build 11 43705617 1D AATATAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 35 0 29 7 T 12 11 245374 CASAVA_Build 11 43712728 1I CGGGCCAACT -/G GGCCACAGCC 3070 hom 56 het 21 0 18 3 G 2 3 245375 CASAVA_Build 11 43716245 25D TGTTTGGTAA AGCATGTTTTGGTAAAACATGTTTT/------------------------- AGCATGTTTC 3070 hom 47 het 25 0 20 11 AGCATGTTTTGGTAAAACATGTTTT 1 0 245376 CASAVA_Build 11 43717828 1I CATTAAGTTT -/C AACACCTGAC 3070 hom 132 het 50 0 44 6 C 0 1 245377 CASAVA_Build 11 43735844 1I AGCACACACA -/C AAAAAAACAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 0 1 245378 CASAVA_Build 11 43743131 4I CCTGCTTTTG ----/GATT AATTGCATGC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 GATT 0 1 245379 CASAVA_Build 11 43750150 2D AAGTAATTGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 99 het 42 0 34 9 AT 7 6 245380 CASAVA_Build 11 43753611 1D ATTTTAAGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 10 9 245381 CASAVA_Build 11 43763223 1D GTAAACAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 39 1 28 11 T 11 10 245382 CASAVA_Build 11 43773151 1I TGGTTTTATG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 105 het 40 0 34 6 A 8 9 245383 CASAVA_Build 11 43774971 1I GTTTTGGGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1302 hom 42 3 36 3 T 9 10 245384 CASAVA_Build 11 43778636 1D CTGGAGGATT G/- TACAAGGCAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 0 245385 CASAVA_Build 11 43779720 40D TGATAGTTGG AGATATATATATATATATATATATATATATATATATATGT/---------------------------------------- ATATGTATGT 3070 hom 96 het 31 0 33 3 AGATATATATATATATATATATATATATATATATATATGT 1 0 245386 CASAVA_Build 11 43780104 1D ATGAAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 12 11 245387 CASAVA_Build 11 43785136 9I ATAAGAAAGA ---------/CACTGTTAT CACTGTTATC 3070 hom 132 het 50 0 43 8 CACTGTTAT 1 2 245388 CASAVA_Build 11 43791664 4D TAAAGAATAT TTTG/---- TTTATGTGCA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TTTG 1 0 245389 CASAVA_Build 11 43792291 1D GTTATTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 11 10 245390 CASAVA_Build 11 43802175 1D TTACACCGAG A/- TTTCTAACTT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 1 0 245391 CASAVA_Build 11 43804066 3D AACTTTAGAA ATT/--- ATTTTCTCCT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 ATT 2 1 245392 CASAVA_Build 11 43804212 1I TTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 24 0 20 4 C 0 1 245393 CASAVA_Build 11 43804782 2D AAATCAAATA AT/-- ACTTGGAGAT 3070 hom 102 het 38 0 35 5 AT 1 0 245394 CASAVA_Build 11 43806512 1I TCGTGATCCG -/C CCGCCTCGGC 2117 hom 18 het 7 0 6 2 C 2 3 245395 CASAVA_Build 11 43812495 1D TGGGATGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 30 2 19 9 T 13 12 245396 CASAVA_Build 11 43816777 1I CTGTTTTTCT -/C CCCCCCAGCA 3070 hom 62 het 32 0 27 5 C 6 7 245397 CASAVA_Build 11 43823597 2D GTCCTGTCTC TT/-- TTATTTCCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 4 2 245398 CASAVA_Build 11 43825214 2D GGGGAAGTGT AG/-- AGAGAATGTA 3070 hom 113 het 43 0 38 6 AG 3 2 245399 CASAVA_Build 11 43827444 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAATCC 2917 hom 41 het 43 0 14 31 AAAC 1 0 245400 CASAVA_Build 11 43836223 2D AGGAATTCTA TT/-- TTTTTTTCTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 9 7 245401 CASAVA_Build 11 43838815 3I TTATGTTTCC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 36 1 24 11 T 11 14 245402 CASAVA_Build 11 43843943 9I AATCTGTGGG ---------/GTCTGCTTC GTCTGCTTCT 1993 hom 18 het 26 0 7 19 GTCTGCTTC 1 2 245403 CASAVA_Build 11 43854159 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2874 het 89 hom 10 1 8 1 T 13 14 245404 CASAVA_Build 11 43855573 3I TCACAAGGTC ---/AGG AGATCGAGAC 3070 hom 72 het 27 0 25 5 AGG 0 1 245405 CASAVA_Build 11 43861453 1D TAATGAAATG A/- GAAATATTTC 3070 hom 120 het 41 0 41 0 A 1 0 245406 CASAVA_Build 11 43870990 1D TAATTGCAAG C/- TACCACTTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 1 0 245407 CASAVA_Build 11 43877999 1I TGGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 875 het 875 ref 42 21 6 15 A 17 18 245408 CASAVA_Build 11 43878210 2I GATATTAAAA --/AG ATTTGCAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AG 0 1 245409 CASAVA_Build 11 43890263 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAACAAG 557 het 77 hom 21 1 3 20 AAC 1 0 245410 CASAVA_Build 11 43891119 19D CAACACTCAT AAGTCAACCATGGTTCAAA/------------------- AAGTCAACCA 3070 hom 78 het 33 0 27 14 AAGTCAACCATGGTTCAAA 2 1 245411 CASAVA_Build 11 43892693 1I GTAAACTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 348 hom 42 1 35 6 A 10 11 245412 CASAVA_Build 11 43893665 1I CCCTCTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 9 10 245413 CASAVA_Build 11 43904762 1I GCAAAATTAG -/T TTTTTTCTCC 3070 hom 102 het 41 0 33 8 T 6 7 245414 CASAVA_Build 11 43911636 1D TGAAGTCAGA G/- GGGTGAAACT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 4 3 245415 CASAVA_Build 11 43919999 6D GTAGCTATTA TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 TTG 5 3 245416 CASAVA_Build 11 43925869 24D CAGTGAAAGA GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGG/------------------------ GAGAGAGAGA 3070 het 1450 hom 27 10 14 12 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGG 1 0 245417 CASAVA_Build 11 43931521 1D GTGGTGGGTG C/- CTGTAATCCC 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 C 2 1 245418 CASAVA_Build 11 43932715 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 22 1 12 9 T 13 12 245419 CASAVA_Build 11 43934553 1I ACTGCTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2187 hom 20 5 11 4 T 11 12 245420 CASAVA_Build 11 43942198 1D TGAAAATATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 164 hom 31 2 18 11 A 10 9 245421 CASAVA_Build 11 43943431 1D ATATAATAAC A/- ATGAACAATC 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 A 2 1 245422 CASAVA_Build 11 43948015 4I AACCCCCTGA ----/GTGG GTGGGTTTCC 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 GTGG 1 2 245423 CASAVA_Build 11 43955563 1D AACTTAACCA C/- CCATTGCTGG 3070 het 3070 hom 37 14 15 10 C 3 2 245424 CASAVA_Build 11 43956755 1I AGGGAGGAAG -/T TATTTCTCCC 3070 het 3070 hom 53 19 23 11 T 1 2 245425 CASAVA_Build 11 43964170 14D GCCGAGCATT CCATGTCACCCTCC/-------------- CCAGTCTTAT 3070 het 3070 ref 39 22 11 11 CCATGTCACCCTCC 1 0 245426 CASAVA_Build 11 43969631 1D CCAATATACA C/- CCCCCTGGCA 2610 het 2153 hom 19 8 9 3 C 6 5 245427 CASAVA_Build 11 43970353 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 31 het 18 0 13 5 T 8 7 245428 CASAVA_Build 11 43970780 1I GATCAATGTT -/A AGAGATTCAT 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 A 1 2 245429 CASAVA_Build 11 43971203 2I GCGGAATCAC --/AG AGTCTTCCAG 3070 het 3070 ref 45 19 15 11 AG 1 2 245430 CASAVA_Build 11 43975277 1I GTGGGGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 10 11 245431 CASAVA_Build 11 43977980 1D AAATATTCAG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 A 7 6 245432 CASAVA_Build 11 43980085 9D GGTGACAGGT CCTCTCAGA/--------- GCTAGCACAG 1832 het 1832 ref 19 11 6 5 CCTCTCAGA 1 0 245433 CASAVA_Build 11 44003746 1D ACTGTTTTTC A/- TATTTTCCTA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 1 0 245434 CASAVA_Build 11 44003882 1I TCTCAGTTAC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 33 0 29 4 A 8 9 245435 CASAVA_Build 11 44008685 2D AAAGAATCCA GG/-- GGATTTTTTT 3070 het 2260 hom 28 6 16 6 G 4 2 245436 CASAVA_Build 11 44035830 3D TTGCCCAGTT AAC/--- AACAACAGCA 3070 hom 95 het 35 0 30 7 AAC 3 2 245437 CASAVA_Build 11 44039019 1I TACAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 A 9 10 245438 CASAVA_Build 11 44040316 1D CATTCTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 11 10 245439 CASAVA_Build 11 44040497 2D TTTTTTTTCT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 184 hom 25 1 19 7 TC 1 0 245440 CASAVA_Build 11 44041154 2I GATTTTTCTC --/TT GTTTCGCCTT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 0 2 245441 CASAVA_Build 11 44052939 1D CTTCCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 T 14 13 245442 CASAVA_Build 11 44061278 2I ATCTTCTGGC --/CT CTCTTTCACC 3070 hom 134 het 48 0 41 7 CT 2 3 245443 CASAVA_Build 11 44065189 1D TGTGCTCATG A/- AAATTGTGTT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 4 3 245444 CASAVA_Build 11 44065540 1I ATATTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 9 10 245445 CASAVA_Build 11 44067660 9D ATGTTTCTGT TTGTTGTTG/--------- TTGTTGTTGT 3070 hom 94 het 43 0 32 15 TTG 9 6 245446 CASAVA_Build 11 44071841 1D ATGTCACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 30 1 20 9 T 12 11 245447 CASAVA_Build 11 44128429 1D ATATTAAAAC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 9 8 245448 CASAVA_Build 11 44147956 1I TTAGCTTTGA -/G TTTTTTGGAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 0 1 245449 CASAVA_Build 11 44150710 1D CTACCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2890 het 306 hom 32 2 14 16 T 17 16 245450 CASAVA_Build 11 44159227 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 20 1 14 5 A 13 12 245451 CASAVA_Build 11 44165423 3D CCTGCTTCAG CCT/--- CCTAAGTAAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CCT 2 1 245452 CASAVA_Build 11 44173550 2D ACGAGTGAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 82 het 32 0 26 7 CT 2 1 245453 CASAVA_Build 11 44177852 1I AAAGGATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 9 10 245454 CASAVA_Build 11 44212726 1I AGGTAGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 10 11 245455 CASAVA_Build 11 44229321 1I TTTTTTTTTT -/C CTCTTTTCAT 3070 het 180 hom 42 1 37 4 C 1 2 245456 CASAVA_Build 11 44249290 1I CTTACCCCCC -/A CAGGGCACTG 3070 hom 69 het 29 0 20 9 A 0 1 245457 CASAVA_Build 11 44250403 1I AGGCTGAGGT -/G GGTGGATCAC 3070 hom 79 het 31 0 26 5 G 2 3 245458 CASAVA_Build 11 44260479 1D TGCCAAGTTA C/- GGCGATGTAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 C 1 0 245459 CASAVA_Build 11 44263811 1D TTGTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 39 28 4 7 T 13 12 245460 CASAVA_Build 11 44269540 1D TTCTTTCTTT C/- TTTCTTTTTT 366 het 74 hom 24 2 5 18 C 1 0 245461 CASAVA_Build 11 44271553 1I AAAGAAAAAA -/T AAATATATAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 0 1 245462 CASAVA_Build 11 44275849 5D CTCAAAAAAT AATAA/----- AATAAAATAA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 AATAA 5 4 245463 CASAVA_Build 11 44276921 1D GAAACCCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 37 0 24 14 A 13 12 245464 CASAVA_Build 11 44292478 1I CAGGAGGCAG -/C CTTCCACATT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 C 1 2 245465 CASAVA_Build 11 44293106 4I CTCCTTCTCC ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 hom 86 het 33 0 24 9 CCTT 3 4 245466 CASAVA_Build 11 44306434 1I TTGCACTTCT -/C CTCTGGACCC 3070 hom 55 het 23 0 17 6 C 1 2 245467 CASAVA_Build 11 44310023 1I ACTATTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 23 9 9 5 T 9 10 245468 CASAVA_Build 11 44314324 1I TTACTGCGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 51 0 41 10 A 11 12 245469 CASAVA_Build 11 44316689 1D CCTTACAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 10 9 245470 CASAVA_Build 11 44320748 1D CTGGGGTGGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 2928 hom 26 7 15 5 T 9 8 245471 CASAVA_Build 11 44354125 8I TCAAGCACCA --------/CTATTTGG CTATTTGGCT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 CTATTTGG 1 2 245472 CASAVA_Build 11 44384724 1I ATGTAAAGGC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 55 1 48 6 A 8 9 245473 CASAVA_Build 11 44387670 1D GAAGTCATTA T/- TTTTGCTGCC 3070 hom 25 het 24 0 16 9 T 5 4 245474 CASAVA_Build 11 44388237 1D CCTGGGTCAT G/- ATGGGCCACC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 1 0 245475 CASAVA_Build 11 44388764 2I AAACAGAGCC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 46 16 15 15 AG 6 7 245476 CASAVA_Build 11 44388936 2I GAGAGGAAAG --/GA GAGGAAGAGC 3070 hom 99 het 35 0 30 5 GA 1 2 245477 CASAVA_Build 11 44427571 4I GATTTGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TTTG 2 3 245478 CASAVA_Build 11 44438536 14I GCGTCAGCCC --------------/TCAGTCAGGGCCCT GAAGGAAACA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 TCAGTCAGGGCCCT 0 1 245479 CASAVA_Build 11 44440082 4I GAAGGAAGGG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 AGAA 2 3 245480 CASAVA_Build 11 44443244 4D CACCAAACCC CACA/---- CACATTTAGC 3070 hom 96 het 33 0 33 1 CA 4 2 245481 CASAVA_Build 11 44451123 1D AGCCCAGCGC A/- GTACCCCTAG 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 1 0 245482 CASAVA_Build 11 44456262 3I GTATGTCTTT ---/ATC ATCAGCAGTG 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 ATC 1 2 245483 CASAVA_Build 11 44462787 1I CAATGAGACA -/G GTGTTAGTTT 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 G 1 2 245484 CASAVA_Build 11 44465443 1I CAGGGGCTGG -/A GGCAAAGGCC 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 A 0 1 245485 CASAVA_Build 11 44485996 1D TGGTTACATG C/- CCAGCTAAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 C 3 2 245486 CASAVA_Build 11 44502345 1D TAAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1916 hom 11 het 27 0 10 17 A 19 18 245487 CASAVA_Build 11 44548846 3D TGCCTGGCCT TTA/--- TTACCCTCCT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 TTA 2 1 245488 CASAVA_Build 11 44550747 2D GCTGGGAGAC AA/-- GAGTTAGATA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 A 2 0 245489 CASAVA_Build 11 44550944 4I CATATTGAAT ----/ATGG ATGGAGCTCT 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 ATGG 1 2 245490 CASAVA_Build 11 44560321 1I CCTGGGGTTT -/G GGGGCTGAAT 3070 hom 99 het 36 0 31 5 G 4 5 245491 CASAVA_Build 11 44564415 3I TTTAGGAGAT ---/GGG GGCAGAAAAA 3070 hom 74 het 31 0 24 7 G 2 5 245492 CASAVA_Build 11 44568357 1I TAGACCAGTA -/G GGCATGGCTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 2 3 245493 CASAVA_Build 11 44569960 1I TTTGTTTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 36 0 27 9 T 8 9 245494 CASAVA_Build 11 44579228 2D CCTGTGGTGG GA/-- GAGGGAGGCA 3070 hom 80 het 33 0 24 9 GA 2 1 245495 CASAVA_Build 11 44599402 1D TGGGGCCAGG C/- GGGGCGGCGG 1558 het 1558 ref 16 7 5 4 C 1 0 245496 CASAVA_Build 11 44601136 3D CTCTGCCCCA GAT/--- GATCTTCCAG 1177 het 1177 ref 18 8 4 8 GAT 2 1 245497 CASAVA_Build 11 44601264 3D TCTCCCCTGC AGA/--- AGGACAGAGA 3070 het 3070 ref 45 19 16 11 AGA 1 0 245498 CASAVA_Build 11 44613048 2D ATCCTCCCCC CA/-- CCCCAGGCTT 2923 hom 34 het 14 0 12 2 CA 1 0 245499 CASAVA_Build 11 44634026 2I CAGTAAATAT --/TC CTAATGTCAC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TC 0 1 245500 CASAVA_Build 11 44635496 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1812 het 1812 ref 15 6 6 3 A 11 12 245501 CASAVA_Build 11 44635892 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 983 hom 10 2 7 1 A 8 9 245502 CASAVA_Build 11 44640843 1I TCTGTTTCCA -/C CTCAGACCAG 3070 het 3070 hom 36 15 21 0 C 1 2 245503 CASAVA_Build 11 44651287 1I GTATATTTAC -/A ACAGCTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 1 2 245504 CASAVA_Build 11 44651792 2D GAGAGAGAGA CT/-- CTCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 37 19 14 4 CT 5 4 245505 CASAVA_Build 11 44655504 3I ACTGTGCAAA ---/TGT TGTCTGCCTC 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 TGT 1 2 245506 CASAVA_Build 11 44658967 1I GGGTGACTTC -/A TCTCAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 0 1 245507 CASAVA_Build 11 44670084 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 1747 hom 16 4 12 0 A 7 8 245508 CASAVA_Build 11 44670234 1D CCTCAAAAAC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 7 6 245509 CASAVA_Build 11 44680863 4D GGGAGGGAGG GAGA/---- GAGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 37 13 10 14 GA 5 3 245510 CASAVA_Build 11 44694650 1D AAACATTCTC G/- GGGCGCTTTA 3070 het 3070 hom 37 16 14 8 G 4 3 245511 CASAVA_Build 11 44704032 11D GACCTTGTCT CAAAAACAAAA/----------- CAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 9 CAAAAACAAAA 2 1 245512 CASAVA_Build 11 44711727 2I GTATCTGTAT --/TC TCATTTTATG 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 TC 1 2 245513 CASAVA_Build 11 44717924 2D CTCCTATGGG TT/-- TTTCCAGCCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 7 T 5 3 245514 CASAVA_Build 11 44720170 4I GTGGGATTTT ----/TATC TATCTCCATT 3070 het 2980 hom 26 8 11 7 TATC 1 2 245515 CASAVA_Build 11 44720416 4D CCTTCTTTCT TCCC/---- TCCCTCCCTC 1038 het 1038 ref 12 4 5 3 TCCC 5 4 245516 CASAVA_Build 11 44750552 1D GTTATGACAT G/- GAAAATGTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 G 2 1 245517 CASAVA_Build 11 44751543 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 2782 het 2291 hom 21 8 7 6 A 9 10 245518 CASAVA_Build 11 44773481 1I GCCCTGGAGC -/T TTCCCTGCCT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 2 3 245519 CASAVA_Build 11 44773789 21D TGATTGTCTA AGCTTCTGGGGCCCAGACCCC/--------------------- ATTTTCTGCC 3070 het 3070 hom 39 19 23 7 AGCTTCTGGGGCCCAGACCCC 1 0 245520 CASAVA_Build 11 44776502 1D AGGGAAAGAC G/- GGGAAAGCAA 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 G 4 3 245521 CASAVA_Build 11 44781466 1I AGCATGGGTT -/G GGGGGGGCAT 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 G 7 8 245522 CASAVA_Build 11 44787752 25D GGTGGGTGCT TGGAGTGTGTATCTCAAGAGGTGTG/------------------------- ATAGCTCTTC 3070 het 3070 ref 37 21 18 4 TGGAGTGTGTATCTCAAGAGGTGTG 1 0 245523 CASAVA_Build 11 44792365 1D AGAATAAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 18 24 5 T 10 9 245524 CASAVA_Build 11 44794125 1D CAAATGCAGT G/- GGGGAAAGCA 3070 hom 98 het 35 0 33 2 G 5 4 245525 CASAVA_Build 11 44794213 1I TCTGGGCCTT -/A AGTTTCTTGT 3070 het 3070 ref 37 19 18 0 A 1 2 245526 CASAVA_Build 11 44794297 1D AGACCAATGA T/- TAGCAGCTGC 3070 hom 144 het 51 0 46 5 T 2 1 245527 CASAVA_Build 11 44799817 12D CCATTCAAGG TCAGGGATGGTT/------------ TCTTCTTCAC 3070 het 3070 ref 56 30 24 11 TCAGGGATGGTT 1 0 245528 CASAVA_Build 11 44812605 1D GATGAATCTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 9 8 245529 CASAVA_Build 11 44819642 1D AATTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2852 het 2459 hom 24 8 7 9 A 13 12 245530 CASAVA_Build 11 44826133 1I GCTAATTTTT -/C AGTATTTTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 0 1 245531 CASAVA_Build 11 44827824 1I CACCCAAAGC -/A ACCTGCACAC 3070 het 3070 hom 53 19 23 11 A 1 2 245532 CASAVA_Build 11 44836513 1D CTCCTCTCCC T/- TTGAGTTATT 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 T 3 2 245533 CASAVA_Build 11 44839685 3I CATGAGAGGG ---/GAT GATGGACTTG 2304 het 2304 ref 14 7 6 1 GAT 1 2 245534 CASAVA_Build 11 44841923 1I TAGTAATAGT -/A CACTTCTCGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 1 245535 CASAVA_Build 11 44845052 1D CAAATTGGGG A/- AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 A 7 6 245536 CASAVA_Build 11 44848134 1D CACTTCCCCC A/- AGGGCATGGG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 2 1 245537 CASAVA_Build 11 44868964 1D ATGTTTATTT A/- AAAAAAGCAC 3070 het 1904 hom 18 4 11 3 A 7 6 245538 CASAVA_Build 11 44873831 1I GCCAGACATT -/C CCCCAGAGTT 3070 het 3070 hom 38 17 14 7 C 4 5 245539 CASAVA_Build 11 44881527 1D AAAGTCAGGG C/- AGGAATAACA 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 C 1 0 245540 CASAVA_Build 11 44881936 1I CTGGATTGCC -/T TGGGTTCCAA 3070 het 3070 hom 55 11 31 13 T 1 2 245541 CASAVA_Build 11 44885272 2I ATGAAGGGAC --/AG AGCCCCGGAC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 AG 1 2 245542 CASAVA_Build 11 44886769 1I GGCTGAGGTA -/G GAGGATGACT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 1 2 245543 CASAVA_Build 11 44891006 29D CATGTGCACA TGTGCCTGTGTGTGCACATGTGTGTTGTG/----------------------------- TGTGCATGTG 3070 hom 75 het 28 0 25 6 TGTGCCTGTGTGTGCACATGTGTGTTGTG 1 0 245544 CASAVA_Build 11 44898597 2I GCTCCTAGAC --/TT TTCAGGTTCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 4 245545 CASAVA_Build 11 44901948 1D9M1I GGCATCCTGT CCATGCCCCA-/-CATGCCCCAC ACCTCCCCAG 3070 hom 109 het 37 0 31 10 N/A 0 0 245546 CASAVA_Build 11 44906920 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 A 10 11 245547 CASAVA_Build 11 44910415 1I TCCTGTGAGA -/C CCCCCCTTTT 3070 hom 57 het 23 0 18 5 C 6 7 245548 CASAVA_Build 11 44911174 19I GGAGGCAGTG -------------------/GTGCCTGTGGGAGGCAGTA GTGGCTCGTG 3070 hom 55 het 25 0 15 10 GTGCCTGTGGGAGGCAGTA 0 1 245549 CASAVA_Build 11 44913423 1I CAGTGGGTGT -/G GGGGGGGCCG 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 G 7 8 245550 CASAVA_Build 11 44917860 1D TCGCATTGGG A/- AAAAAAACTG 2923 het 2923 ref 22 12 7 4 A 8 7 245551 CASAVA_Build 11 44920167 3D ACACCACACA CAT/--- ACACACCACA 3045 het 3045 ref 54 23 11 22 CAT 1 0 245552 CASAVA_Build 11 44925970 1I GTGAGAAGAT -/G GCACCAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 G 1 2 245553 CASAVA_Build 11 44934629 1I GACCACCCCC -/T ACCCCAGTGA 3070 het 2863 hom 33 13 14 6 T 0 1 245554 CASAVA_Build 11 44938394 3I GTGGAGGTGG ---/CTC TAAGGTCCCA 3070 hom 83 het 32 0 21 11 CTC 0 1 245555 CASAVA_Build 11 44941519 1D GGCCGGGCCT C/- CCCCCTCCCG 3070 hom 50 het 19 0 16 3 C 6 5 245556 CASAVA_Build 11 44944710 1D AAAGAAATCA T/- CCATAGTAAT 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 T 1 0 245557 CASAVA_Build 11 44964658 1D AGCTTTTTTT C/- CTTGAATGTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 2 1 245558 CASAVA_Build 11 44977520 1I ATTCTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 2331 het 207 hom 25 2 14 9 T 15 16 245559 CASAVA_Build 11 44977679 1I CACCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 10 11 245560 CASAVA_Build 11 44983387 1I CTGTTATGAA -/C AGTCCTGTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 0 1 245561 CASAVA_Build 11 44989636 1D GGCATAGTAT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 67 het 26 0 22 4 G 10 9 245562 CASAVA_Build 11 44994834 2D GCGTCTAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 25 0 18 8 T 13 11 245563 CASAVA_Build 11 44999199 1D ATCTCCTATA C/- CAAAGAGGCA 3070 hom 114 het 42 0 38 6 C 2 1 245564 CASAVA_Build 11 45012888 1I GGAGTCAAAC -/G TAGCCACAGG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 G 0 1 245565 CASAVA_Build 11 45017401 1D ACCATGAGAC T/- TTGGATAATG 3070 hom 144 het 54 0 49 6 T 3 2 245566 CASAVA_Build 11 45021427 1I TGCACTCCAA -/G GGCCCCCAAA 3070 hom 101 het 39 0 32 7 G 2 3 245567 CASAVA_Build 11 45031401 1I CCCACCAGCT -/C TGGAATTCTG 3070 hom 80 het 35 0 23 12 C 0 1 245568 CASAVA_Build 11 45032922 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1012 hom 15 6 8 1 C 0 1 245569 CASAVA_Build 11 45034462 3I TCTTTTTTGA ---/TGT TGTTCACATT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 TGT 1 2 245570 CASAVA_Build 11 45035682 1D GGATGGAGTG A/- AGGGAGTCAT 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 A 2 1 245571 CASAVA_Build 11 45069647 2D GCTTAGGGAA AC/-- ACAGTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 AC 2 1 245572 CASAVA_Build 11 45090096 1D ATTGTAATAG T/- TTTTTGGGGT 3070 het 3070 ref 37 18 11 9 T 6 5 245573 CASAVA_Build 11 45091947 5D GTGTGTGTGT GTGTG/----- TTTTGTTTTT 3070 het 2258 hom 27 9 14 6 GTGTG 1 0 245574 CASAVA_Build 11 45093619 2D GGATTAAACA CT/-- CTAGTTAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 CT 2 1 245575 CASAVA_Build 11 45112315 4D CATGCAAGGA GAGT/---- GAGTCAGTGG 3070 het 3070 ref 41 25 12 5 GAGT 2 1 245576 CASAVA_Build 11 45115542 1D CCTGAGTGAC A/- AGAGACTCCG 1726 het 1411 hom 12 5 6 1 A 2 1 245577 CASAVA_Build 11 45139259 3D ATAGAGATAA CAG/--- CAGCACCTAC 3070 het 3070 ref 48 23 18 9 CAG 2 1 245578 CASAVA_Build 11 45147868 2I CACAGATGGT --/AA ATAATGCAGC 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 1 3 245579 CASAVA_Build 11 45148470 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2831 het 2831 ref 29 17 9 3 A 10 11 245580 CASAVA_Build 11 45148743 2I TGGAACAAAC --/TG TGTCAGGCCA 3070 hom 132 het 48 0 43 5 TG 1 2 245581 CASAVA_Build 11 45166546 1I GAACCTACCC -/T TCTCATTCCG 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 T 1 2 245582 CASAVA_Build 11 45180871 2D GAAGCAAAAG GA/-- GAGAGAGGCC 3070 het 3070 ref 43 23 16 6 GA 4 3 245583 CASAVA_Build 11 45185576 6D TGGCAAGGCC TGGAGA/------ CATGTTTGAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TGGAGA 1 0 245584 CASAVA_Build 11 45189662 16I ATGGCCCCTG ----------------/TGCGGTCAGATGCTCC TGGATGGGAG 3070 hom 98 het 37 0 31 6 TGCGGTCAGATGCTCC 0 1 245585 CASAVA_Build 11 45194450 1D AACCTCCTTG C/- AAAGAGCTGC 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 C 1 0 245586 CASAVA_Build 11 45216739 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 het 1896 hom 28 7 17 4 A 6 7 245587 CASAVA_Build 11 45227182 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 1609 hom 21 5 15 1 A 8 7 245588 CASAVA_Build 11 45233078 1D TCATGTCTAC A/- AAAAATAAGC 3070 hom 118 het 44 0 36 8 A 6 5 245589 CASAVA_Build 11 45235965 1D CCGGACTCTC G/- GGGACCTCTT 2445 het 2308 hom 26 8 11 7 G 4 3 245590 CASAVA_Build 11 45253935 1I CCTGGGTATT -/G GGGGGGAATT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 G 6 7 245591 CASAVA_Build 11 45293584 3D ACCCATTTAC TCA/--- TCATTTGTTT 3070 het 3070 ref 39 26 10 4 TCA 2 1 245592 CASAVA_Build 11 45294246 1I TTTAAAAATA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 6 7 245593 CASAVA_Build 11 45301619 33D AGCAACTCGG AGAAGGATTCATCAAGAGGCTCACTCCAGTTCC/--------------------------------- AGAAGCAACT 2981 het 2981 ref 30 25 10 1 AGAAGGATTCATCAAGAGGCTCACTCCAGTTCC 1 0 245594 CASAVA_Build 11 45305046 3D CTATTTCTGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2550 hom 31 10 13 8 A 18 15 245595 CASAVA_Build 11 45311725 1D GTGTCCATTT G/- AAAGAACAAG 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 G 1 0 245596 CASAVA_Build 11 45354969 1I AGCCACAAGG -/C CCCAAGTACA 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 C 3 4 245597 CASAVA_Build 11 45364453 2I TTTATTTATT --/TA TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 9 10 6 TA 0 1 245598 CASAVA_Build 11 45370038 1D CATTCTTAGT C/- CCCCGTTCAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 C 5 4 245599 CASAVA_Build 11 45372388 1I GAGGCTTTGG -/C CATGCCCACG 3070 hom 98 het 44 0 31 13 C 1 2 245600 CASAVA_Build 11 45373765 2D ATGTGTCTGC GT/-- GTGTGTGTGT 992 het 992 ref 50 38 3 10 GT 7 6 245601 CASAVA_Build 11 45375269 3D ATACAGATGG AGA/--- AGAAATAGGA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 AGA 2 1 245602 CASAVA_Build 11 45401665 9D GGGGGAAAAC CCCGTTATT/--------- CCCGTTATTG 3070 het 3070 ref 41 21 14 11 CCCGTTATT 2 1 245603 CASAVA_Build 11 45420848 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2283 het 985 hom 12 3 5 4 T 11 12 245604 CASAVA_Build 11 45427293 14D TCCACTTCCC CCGACTTAAGCCTG/-------------- CCTCCCTCAC 3070 het 3070 hom 40 17 21 6 CCGACTTAAGCCTG 1 0 245605 CASAVA_Build 11 45441358 10D AGAAGGGGCC TTGGAGAATG/---------- TTCAGGGGGG 3070 het 3070 ref 33 15 13 8 TTGGAGAATG 1 0 245606 CASAVA_Build 11 45447144 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 901 het 222 hom 17 3 5 9 T 19 18 245607 CASAVA_Build 11 45500469 2I TGAAGTAGTC --/AT ATATTACATG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AT 2 3 245608 CASAVA_Build 11 45512890 1I TCTGGATGTG -/A AAGATGAGGC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 2 3 245609 CASAVA_Build 11 45525274 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 31 1 19 11 A 12 11 245610 CASAVA_Build 11 45527505 1I GCCTGGAGTC -/T GGGGGGGGGG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 0 1 245611 CASAVA_Build 11 45544974 2D GCTGGGACTC AT/-- GGACCATTTT 3070 hom 117 het 42 0 38 4 AT 1 0 245612 CASAVA_Build 11 45575869 1D TGTCCTGTCC T/- ATCCCACTGA 3070 hom 96 het 38 0 31 7 T 1 0 245613 CASAVA_Build 11 45579486 1I TTAAAAAAAA -/G GGGGGGGGTC 2577 hom 39 het 21 0 12 9 G 8 9 245614 CASAVA_Build 11 45624047 1I GGTAGAATGA -/G ACCATAAGGC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 245615 CASAVA_Build 11 45627577 1D GTGTCTGAAT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 34 het 20 0 14 6 G 14 13 245616 CASAVA_Build 11 45631658 2I TTAAACCTGA --/CT CCCCTGCAAG 3070 hom 106 het 42 0 33 9 CT 0 1 245617 CASAVA_Build 11 45635433 1D GATGAAAATG A/- AGGCAAGGCA 3070 hom 69 het 28 0 20 10 A 2 1 245618 CASAVA_Build 11 45648612 1I TGCTTCCCCC -/A GGTTCCCCAC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 0 1 245619 CASAVA_Build 11 45654237 2D CCCCTACCCC CT/-- CCCTCCTCCA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 CT 1 0 245620 CASAVA_Build 11 45670901 1D TGGTTGCTGT G/- GGGGTGTACC 3070 hom 61 het 26 0 16 10 G 5 4 245621 CASAVA_Build 11 45702634 1D TGGCCCCCTT G/- GCCTCCCTGG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 2 1 245622 CASAVA_Build 11 45738253 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1809 het 726 hom 10 3 5 2 A 15 14 245623 CASAVA_Build 11 45742149 1D TTATGTCTTG A/- AAAAAATACA 3070 hom 107 het 39 0 36 3 A 7 6 245624 CASAVA_Build 11 45746263 1D CAGGTTAGTT G/- GGGGGTTGTT 3070 hom 109 het 40 0 36 5 G 6 5 245625 CASAVA_Build 11 45751433 10D TGGTCACCCT AAATGGTTAA/---------- GGCTGTGTCC 3070 het 3070 ref 43 24 19 4 AAATGGTTAA 1 0 245626 CASAVA_Build 11 45757710 1D CCAAAGTGCT G/- GGGATTACAG 3070 hom 74 het 27 0 25 2 G 4 3 245627 CASAVA_Build 11 45760498 1I CTCTAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 12 13 245628 CASAVA_Build 11 45762745 1I TTTAAAAAAA -/T AAAAATAAAA 3070 het 2168 hom 18 7 10 1 T 0 1 245629 CASAVA_Build 11 45798100 2I ATAGCAGCCC --/CT CTGTAGCTCA 3070 hom 135 het 47 0 45 2 CT 1 2 245630 CASAVA_Build 11 45802845 1D ACTACACCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 699 hom 20 2 12 6 A 16 15 245631 CASAVA_Build 11 45803795 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1239 het 439 hom 16 4 3 9 T 20 18 245632 CASAVA_Build 11 45806186 8D CCTATCAATC CTCTAAAT/-------- CTCTAAATCT 3070 hom 102 het 43 0 35 9 CTCTAAAT 2 1 245633 CASAVA_Build 11 45807751 1D CAAGGCAGGG A/- AGCGGGAGAG 3070 hom 54 het 24 0 17 7 A 2 1 245634 CASAVA_Build 11 45821360 1I GCCACCTCTG -/C CACCCTGGAT 3070 hom 41 het 20 0 11 9 C 1 2 245635 CASAVA_Build 11 45825427 1I GTGAGGGGGC -/G GGGCCTGTTC 2097 hom 39 het 17 0 10 7 G 3 4 245636 CASAVA_Build 11 45829157 1D GCCTCAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 38 1 27 10 T 15 14 245637 CASAVA_Build 11 45831773 1D AGATGGAGGA C/- CCTGTGTCCT 3070 hom 105 het 41 0 33 8 C 3 2 245638 CASAVA_Build 11 45834567 1I AAGACTTTGA -/G GGTGGGGTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 2 3 245639 CASAVA_Build 11 45837458 13I CCCAGCACTT -------------/TGAGAGGCCAAAG TGAGAGGATC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 TGAGAGGCCAAAG 0 1 245640 CASAVA_Build 11 45837673 1D TGGGTGACAG A/- GCAAGATCCT 2724 hom 6 het 17 1 10 7 A 1 0 245641 CASAVA_Build 11 45840534 1I TTTCCAATAG -/C CCTGCAAGGT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 2 3 245642 CASAVA_Build 11 45860391 2I GAGCCACAAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 315 hom 63 3 42 18 GT 8 9 245643 CASAVA_Build 11 45872519 43D TCCCCCTTAA CCCACCCCAGTAGAGCCAGGGATCAGGCATAGGCTCTCTGACC/------------------------------------------- CCCAGCCCAG 1943 het 1943 ref 30 23 5 14 CCCACCCCAGTAGAGCCAGGGATCAGGCATAGGCTCTCTGACC 1 0 245644 CASAVA_Build 11 45891126 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 16 15 245645 CASAVA_Build 11 45894545 2D ACCCACAGAC TA/-- TGTGGAAACC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 TA 1 0 245646 CASAVA_Build 11 45909401 2I AAGGTAAGTT --/AG AGGTGTTGTG 3070 het 3070 ref 46 17 13 16 AG 1 2 245647 CASAVA_Build 11 45910275 5D TGATGCAGCC AGCCT/----- GTACTCCCGC 3070 hom 67 het 27 0 22 7 AGCCT 1 0 245648 CASAVA_Build 11 45918783 8I TTCCTTCATT --------/ATTTTATG ATTAAAATCA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 ATTTTATG 0 1 245649 CASAVA_Build 11 45928656 1I GATGAGCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 A 12 13 245650 CASAVA_Build 11 45935350 1D AGTAATGGAT A/- AAACTTGTGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 3 245651 CASAVA_Build 11 45939767 3D ATTGACGACA TGT/--- TACATAGAAG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TGT 1 0 245652 CASAVA_Build 11 45940436 2I GGTTTGGTAA --/CT CTGTGAACAG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 CT 1 2 245653 CASAVA_Build 11 45940801 2D GGTGGGTCGC CT/-- GAGGTCAGGA 3070 hom 72 het 26 0 23 4 CT 1 0 245654 CASAVA_Build 11 45944323 2I TACTGAAGAC --/TT TCACACTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 1 3 245655 CASAVA_Build 11 45945495 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 24 1 11 12 A 17 16 245656 CASAVA_Build 11 45952748 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTAT 3047 het 2415 hom 14 7 7 0 T 8 9 245657 CASAVA_Build 11 45956474 3D ACAGAGATGG TAA/--- TAATAATAAC 3070 het 2338 hom 26 6 16 6 TAA 4 3 245658 CASAVA_Build 11 45995099 1D TTAACCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 13 12 245659 CASAVA_Build 11 46010606 1D TACACCAAAT G/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 G 1 0 245660 CASAVA_Build 11 46021760 1D AAGGGCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 31 1 28 2 A 11 10 245661 CASAVA_Build 11 46027983 1D AAAAACAACG T/- TAAGACTATC 3070 hom 120 het 46 0 41 7 T 2 1 245662 CASAVA_Build 11 46041959 11D TTTCATCTGA TGAACCCACAT/----------- CATAGGATAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TGAACCCACAT 1 0 245663 CASAVA_Build 11 46049861 1D GATAATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 601 hom 40 2 35 3 A 11 10 245664 CASAVA_Build 11 46057556 1D TGACAGTGGC T/- TCCGAAAGGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 1 245665 CASAVA_Build 11 46062808 1D AGAATCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 523 hom 27 3 14 10 T 17 16 245666 CASAVA_Build 11 46067177 1I ACACAGTGTG -/C CCCCAAACTG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 C 4 5 245667 CASAVA_Build 11 46069965 1D TAGGCACACA C/- CCACTGGGCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 3 2 245668 CASAVA_Build 11 46070222 1D CCTATTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 29 0 18 12 A 15 14 245669 CASAVA_Build 11 46073316 1I GGAAATTGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 931 hom 33 3 24 6 A 9 10 245670 CASAVA_Build 11 46074517 1I CCATACTCCC -/T TCTAATTCCT 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 T 1 2 245671 CASAVA_Build 11 46078397 1D AACCTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1615 het 1615 ref 42 28 4 10 A 13 12 245672 CASAVA_Build 11 46087688 1I CAAAAGCTCA -/T TAATTAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 1 2 245673 CASAVA_Build 11 46088697 1I TCTATATTGG -/C CCATTAACAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 2 3 245674 CASAVA_Build 11 46088916 1D ATATTAACAA T/- TTTTTTTTTT 1977 het 1685 hom 24 9 6 9 T 15 14 245675 CASAVA_Build 11 46101149 1I ATGGGGGGGT -/G GGGGGGTTTT 1462 hom 21 het 9 0 7 2 G 6 7 245676 CASAVA_Build 11 46110878 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAACA 2777 het 707 hom 19 4 10 5 AAG 1 0 245677 CASAVA_Build 11 46117901 1D GTGTATTTTT A/- TGTATTTGTA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 1 0 245678 CASAVA_Build 11 46118160 1I GGATGAGGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 9 10 A 9 10 245679 CASAVA_Build 11 46122747 1D TCTCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2105 het 2105 ref 19 8 8 3 A 14 13 245680 CASAVA_Build 11 46140668 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2070 het 2070 ref 29 18 5 6 A 15 14 245681 CASAVA_Build 11 46142311 4D AGAAAGGGAG AGAC/---- AGACAGACAG 3070 hom 133 het 55 0 44 15 AGAC 3 2 245682 CASAVA_Build 11 46145689 1D GAACATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 13 12 245683 CASAVA_Build 11 46150942 1D TCCGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 1858 het 1619 hom 17 8 5 4 A 15 14 245684 CASAVA_Build 11 46152640 4D CTTAAGGAAA GAGT/---- AAGTGACTAA 3070 het 3070 ref 34 17 16 2 GAGT 1 0 245685 CASAVA_Build 11 46154455 1D GACTTTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1103 hom 47 11 13 24 T 17 16 245686 CASAVA_Build 11 46177916 2D CCCACCCACC CA/-- CACACACACA 2115 het 2115 ref 27 12 7 11 CA 7 6 245687 CASAVA_Build 11 46180519 4I CTGCTCTTAG ----/GACA GACAGAGGCA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 GACA 1 2 245688 CASAVA_Build 11 46206842 4D TGTATGTGTG TAGA/---- TAGATAGATA 3070 hom 72 het 27 0 25 5 TAGA 4 3 245689 CASAVA_Build 11 46210285 1I TAAAACTGCT -/A AAAAAAAAAA 1639 het 1639 ref 29 10 6 13 A 10 11 245690 CASAVA_Build 11 46264947 11D AAAAAAGAAA AAGAAAGAAAG/----------- AAGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 20 12 9 3 AAGAAAGAAAG 1 0 245691 CASAVA_Build 11 46298658 1D CACGACAGGT G/- GGGTGTGTGG 3070 hom 48 het 22 0 15 7 G 4 3 245692 CASAVA_Build 11 46298836 1I TCTCTCTCCA -/G GGATCTGGGC 3070 hom 60 het 25 0 16 9 G 2 3 245693 CASAVA_Build 11 46320768 1I GAGAGGAAAC -/T GTGGAAAAGT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 T 0 1 245694 CASAVA_Build 11 46351613 1I TTTTTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 1837 het 928 hom 10 4 4 2 T 11 12 245695 CASAVA_Build 11 46379387 3I CTCTTTTCGA ---/GAC GACAGAGTCT 3070 hom 81 het 32 0 25 7 GAC 1 2 245696 CASAVA_Build 11 46387336 1I ACTGGAACTC -/T TTTTTTTTTT 1920 het 1920 ref 41 17 8 16 T 13 14 245697 CASAVA_Build 11 46406716 1I CTTCTTCTTC -/T TTCTTTTTTT 3070 hom 71 het 29 0 23 6 T 2 3 245698 CASAVA_Build 11 46445049 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 24 1 17 6 T 14 13 245699 CASAVA_Build 11 46502017 2D ATTTTGAGAT AG/-- AGTTTCGCTC 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 AG 2 1 245700 CASAVA_Build 11 46549855 1D CCCTCTGTCG C/- CCCAGGCTGG 930 het 9 hom 10 0 2 8 C 4 3 245701 CASAVA_Build 11 46622002 1I TTCTCAAAAG -/C CCCATAACTC 1260 het 1260 ref 32 25 3 4 C 3 4 245702 CASAVA_Build 11 46650890 2D TGGTGTGGAG TC/-- GCAGAAAGAG 3070 hom 99 het 37 0 31 6 TC 1 0 245703 CASAVA_Build 11 46671534 1I GACTGTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 33 3 20 10 T 12 13 245704 CASAVA_Build 11 46681293 12D CAGCTGTAGC AGTGGTGACAGA/------------ AGTGGAGTCT 2267 het 2267 ref 46 22 11 15 AGTGGTGACAGA 1 0 245705 CASAVA_Build 11 46720560 5D TTGCCCAGGC TGGAG/----- TGTAGTGGAG 3070 het 2033 hom 23 8 8 9 TGGAG 1 0 245706 CASAVA_Build 11 46721861 5D TGAGCAATTA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 20 9 8 5 AAAAG 3 2 245707 CASAVA_Build 11 46736841 1D TCAAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 12 13 A 17 16 245708 CASAVA_Build 11 46743013 30I AAAAAAAATC ------------------------------/AATGAATACATTCCATTCTTTGATTTTAAA AATGAAGATA 3070 hom 63 het 15 0 22 0 AATGAATACATTCCATTCTTTGATTTTAAA 0 1 245709 CASAVA_Build 11 46753798 1I GTCCTTTGCA -/G GGGACATTGA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 G 3 4 245710 CASAVA_Build 11 46754967 5I CACAAATTAT -----/ATTAA ATTAAATAAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 ATTAA 1 2 245711 CASAVA_Build 11 46759556 3I TGTTACTCTT ---/CTC CTCAAAAGCC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CTC 1 2 245712 CASAVA_Build 11 46770332 3I AATAACAAAT ---/CTC CTACTATTCT 3070 hom 72 het 31 0 24 8 CTC 0 1 245713 CASAVA_Build 11 46772102 1I AGTAAAATGA -/T TTTTTGACAA 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 T 5 6 245714 CASAVA_Build 11 46772630 3D ATTTTTTTCC AAG/--- AAGAACTATA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 AAG 2 1 245715 CASAVA_Build 11 46779108 4D GGCCTAGTGC CTGA/---- CTTTCTACAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 7 CTGA 1 0 245716 CASAVA_Build 11 46794208 2D ACGACCCCCC CA/-- TTCCCCCCAA 3070 hom 134 het 49 0 45 4 CA 1 0 245717 CASAVA_Build 11 46796696 1D CTATTAATCT G/- GGGGGGGAGG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 8 7 245718 CASAVA_Build 11 46827810 1D TCTAAAATGG T/- TTAGAGTTGG 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 3 2 245719 CASAVA_Build 11 46833032 12I AGATTGAGAC ------------/CATCCTGGCTAA CACGGTGAAA 1798 hom 12 het 7 0 5 4 CATCCTGGCTAA 0 1 245720 CASAVA_Build 11 46858573 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 A 7 6 245721 CASAVA_Build 11 46860994 3D AAAACAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 2441 hom 30 10 19 2 AAC 4 3 245722 CASAVA_Build 11 46887578 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAGTAGC 1929 hom 18 het 8 0 7 1 A 5 6 245723 CASAVA_Build 11 46902266 1D CATCTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 A 11 10 245724 CASAVA_Build 11 46902586 1D TGCTTACTTC T/- TTTTTTTTTT 2927 het 306 hom 26 1 11 14 T 17 16 245725 CASAVA_Build 11 46903907 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 126 hom 28 2 12 14 A 14 13 245726 CASAVA_Build 11 46908337 1D CAGCAACACC T/- TTTTTTTTTT 1474 het 1474 ref 43 32 7 6 T 13 12 245727 CASAVA_Build 11 46915479 1D GTAACTTGCG T/- TAAGTTAGGC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 2 1 245728 CASAVA_Build 11 46916636 1D CCTGAAAAAT C/- CCCTGTGCTC 1942 het 1942 ref 19 13 5 1 C 4 3 245729 CASAVA_Build 11 46936881 1D GTTCATAGGC T/- TGAGAAGGTA 3070 het 2918 hom 38 12 24 2 T 2 1 245730 CASAVA_Build 11 46965618 1I GTGCAGCTAG -/T TTTGTCCAGT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 3 4 245731 CASAVA_Build 11 46966741 1I TGATGGTTAC -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 6 7 245732 CASAVA_Build 11 47000283 2I AAAATATCTT --/AA AAACATGACA 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 A 3 5 245733 CASAVA_Build 11 47011357 1D TGATTTCTGA T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 47 21 18 10 T 8 7 245734 CASAVA_Build 11 47012632 1D TAAAAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1681 hom 38 6 21 11 T 15 14 245735 CASAVA_Build 11 47025545 1D ATAGATTAGG A/- AGCCCAGAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 9 A 2 1 245736 CASAVA_Build 11 47031906 1I TCGTCTCTAC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3064 hom 24 12 10 2 A 7 8 245737 CASAVA_Build 11 47038262 1I AAAAAGAATC -/A GAAACTGAGA 3070 hom 33 het 22 0 20 2 A 0 1 245738 CASAVA_Build 11 47048395 2D GAGAGAGGGG GA/-- GAGAGAGAGA 842 het 842 ref 33 24 2 7 GA 10 9 245739 CASAVA_Build 11 47050845 5I AAAAATGAAC -----/TTATG TTATAATTAC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 TTATG 0 1 245740 CASAVA_Build 11 47053420 1D ATCGGTTGAA C/- CCAGGAGACA 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 C 3 2 245741 CASAVA_Build 11 47055091 1D AAACAGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 804 hom 28 3 19 6 A 15 14 245742 CASAVA_Build 11 47060618 2I GAAAATGAAC --/AG AGAGTTTATA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AG 2 3 245743 CASAVA_Build 11 47078999 1D AAATTCTTTG C/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 C 1 0 245744 CASAVA_Build 11 47081527 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2021 het 2021 ref 22 8 9 5 A 15 16 245745 CASAVA_Build 11 47085983 1I CGGTACAATT -/C CCCCCCCAGT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 C 7 8 245746 CASAVA_Build 11 47102067 2I TGACAAGAGT --/GA GACTCTGTCT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 GA 1 2 245747 CASAVA_Build 11 47108763 3D GTCTTGCCTC CTT/--- CTTCCCTTCC 3070 het 3070 ref 56 35 15 6 CTT 2 1 245748 CASAVA_Build 11 47117799 1D ACTGAACGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 10 11 A 15 14 245749 CASAVA_Build 11 47124493 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1396 het 304 hom 17 4 5 9 A 20 18 245750 CASAVA_Build 11 47129725 1I AGAGGGTGGC -/G GGGGGGAAGT 3070 hom 74 het 29 0 24 5 G 6 7 245751 CASAVA_Build 11 47136471 1I TTCCAAGCTG -/A AAAAAAAAAA 2608 het 2608 ref 22 9 9 4 A 10 11 245752 CASAVA_Build 11 47178874 4D CGTCTCAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 2869 het 712 hom 8 2 6 3 AAAT 3 2 245753 CASAVA_Build 11 47186117 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1024 hom 29 4 18 7 T 13 14 245754 CASAVA_Build 11 47240879 12D CTTAAGTGAT CCATGTGCCTCA/------------ GCCTCCCAAA 3070 het 3070 ref 24 14 11 2 CCATGTGCCTCA 1 0 245755 CASAVA_Build 11 47251468 2D TTTATCTACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 37 3 11 23 T 13 11 245756 CASAVA_Build 11 47251762 4D CATGCCTGGC CTAT/---- CTATTTTTTA 3070 het 2402 hom 23 9 10 5 CTAT 2 1 245757 CASAVA_Build 11 47255405 1D AGAGTAACAG T/- TTTCTCTTTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 3 245758 CASAVA_Build 11 47263909 6I GACAGATTAG ------/TCATTA TCATTATGCC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 TCATTA 1 2 245759 CASAVA_Build 11 47274202 5D GTTTATTAAC AAAAG/----- AAAACCATTT 3070 het 3070 ref 37 17 17 5 AAAAG 1 0 245760 CASAVA_Build 11 47282710 4I GCAAGATTTC ----/TGTT TGTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 TGTT 1 2 245761 CASAVA_Build 11 47288318 1I TTTCATTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1539 hom 13 4 7 2 T 9 10 245762 CASAVA_Build 11 47288841 1D GAGACCAGCC T/- TGACCAATAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 2 1 245763 CASAVA_Build 11 47291609 1D ACCTGGCTAG T/- TTTTTTTTTT 1143 het 181 hom 13 1 7 5 T 15 14 245764 CASAVA_Build 11 47293051 4I TATATTAATC ----/AATT ATTAATTGTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AATT 0 1 245765 CASAVA_Build 11 47294297 2D CGCACACACA CG/-- CGCACACACA 2872 het 2872 ref 25 12 10 4 CG 2 1 245766 CASAVA_Build 11 47304265 1D TGTAGAAAAT G/- GGGGTAATAC 3070 het 3070 hom 59 22 30 7 G 5 4 245767 CASAVA_Build 11 47308659 2D CCTGGCTGCA CT/-- CTCAGGGAAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 CT 2 1 245768 CASAVA_Build 11 47318362 4D ACGCACACAC ACAG/---- ACACAGACAC 3070 het 3070 ref 59 31 23 7 ACAG 1 0 245769 CASAVA_Build 11 47330998 1D CCTGTCCCTT C/- CCCCCTCACC 3070 hom 68 het 29 0 21 8 C 6 5 245770 CASAVA_Build 11 47331997 1D31M2D ACCCTGTCTC AAAAAAAAAAAAATAAAAATAGAAGAATGAAGAC/-AAAAAAAAAAAATAAAAATAGAAGAATGAAG-- ACAACACCAT 3070 het 59 hom 27 2 18 15 N/A 0 0 245771 CASAVA_Build 11 47333992 2I CCTCCTTACA --/CT CATGCTCACA 3070 hom 175 het 62 0 59 3 CT 0 1 245772 CASAVA_Build 11 47334087 4D12M1D ACAATGCAAC CACTCACTCATGCTCAC/----CACTCATGCTCA- ACCCACACAC 3070 het 557 hom 53 4 23 34 N/A 0 0 245773 CASAVA_Build 11 47334470 2D ACAACCCACT CA/-- CACACACCTG 3070 hom 151 het 55 0 48 7 CA 4 3 245774 CASAVA_Build 11 47334649 5D ACTCACACCT GCTCA/----- CACACACCTC 3070 hom 147 het 53 0 49 5 GCTCA 1 0 245775 CASAVA_Build 11 47335420 1D67M4I GCTCACTTAT CACTCACACGCTCACACCAGCTCTTTCACACCTCATTGACACCTGCTCACTCATATTTCACACCACTT----/-ACTCACACGCTCACACCAGCTCTTTCACACCTCATTGACACCTGCTCACTCATATTTCACACCACTTACAC ACACTTGCAC 3070 hom 154 het 58 0 52 42 N/A 0 0 245776 CASAVA_Build 11 47336853 2I GGCAAACATG --/CA CACACACACA 3070 het 2917 hom 41 13 15 13 CA 7 8 245777 CASAVA_Build 11 47337265 3D GAGACTGGAG GAA/--- GAAGACCAGG 3070 hom 53 het 22 0 16 6 GAA 2 1 245778 CASAVA_Build 11 47340034 6D TCAGAAATGC TTTTAG/------ ACCTGGGTAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTTTAG 1 0 245779 CASAVA_Build 11 47341060 1I TTACAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 155 hom 22 1 21 0 T 8 9 245780 CASAVA_Build 11 47349795 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 21 1 16 4 A 15 16 245781 CASAVA_Build 11 47350510 1D AGCCACCACG C/- CCCAGCCTAT 3070 hom 111 het 42 0 35 8 C 4 3 245782 CASAVA_Build 11 47366693 1I AGCGAGTGTT -/C CATTGCATGT 3070 hom 75 het 30 0 22 8 C 1 2 245783 CASAVA_Build 11 47370475 3D CATGCTGGAC TTT/--- TTTTTTTTTT 409 het 409 ref 21 12 2 7 T 21 18 245784 CASAVA_Build 11 47372081 1I AAAGTCATCT -/C CCCTCCCCTT 3070 hom 59 het 27 0 20 7 C 3 4 245785 CASAVA_Build 11 47380497 1D CTTAAAATAG T/- TTTTTTTTTA 3025 hom 24 het 11 0 9 2 T 10 9 245786 CASAVA_Build 11 47384168 4I ATATACACCT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 TTTA 3 4 245787 CASAVA_Build 11 47393865 1I GCCCAAGGAT -/C CCAGGGTGCA 3070 hom 55 het 22 0 18 4 C 2 3 245788 CASAVA_Build 11 47399815 2D AGGCTCACTC TG/-- TCATCCAGGC 1218 hom 15 het 14 0 5 9 TG 1 0 245789 CASAVA_Build 11 47404911 1D GCAAAGGGCC A/- AAAAGGCATG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 5 4 245790 CASAVA_Build 11 47407602 4D ATTCTTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 TTTG 3 2 245791 CASAVA_Build 11 47409307 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 8 9 245792 CASAVA_Build 11 47414646 1D TCTACTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 18 0 11 7 T 13 12 245793 CASAVA_Build 11 47419414 1D GCACAGGGTA G/- GGGGGGCAGG 3070 hom 63 het 23 0 17 8 G 7 6 245794 CASAVA_Build 11 47441845 6D CCTTTGCTTC TGGAGT/------ AGCTGGGACC 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 TGGAGT 1 0 245795 CASAVA_Build 11 47441950 1I ATCCTCCCAC -/T TTGGCCTCCC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 3 245796 CASAVA_Build 11 47448415 1D CATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1131 hom 22 3 11 8 T 12 11 245797 CASAVA_Build 11 47452026 14D ACTCAATGAT TTTCTTTTTTTTTC/-------------- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 17 17 13 TTTCTTTTTTTTTC 1 0 245798 CASAVA_Build 11 47469384 1D TCCACCTCCC A/- GGTTCAAGTG 1825 het 956 hom 6 2 4 0 A 1 0 245799 CASAVA_Build 11 47476371 9D CTCATATCTA CAAAAAGTT/--------- TAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 CAAAAAGTT 1 0 245800 CASAVA_Build 11 47489479 2I GCCCTCAGGA --/GG TAACCTCTTG 2931 het 2404 hom 33 9 7 17 G 0 2 245801 CASAVA_Build 11 47495843 1D TACAATGGCG C/- AATATTGGCT 3070 het 3070 ref 27 12 7 8 C 1 0 245802 CASAVA_Build 11 47498139 1I ACAAGCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 10 11 245803 CASAVA_Build 11 47504069 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 26 0 19 7 A 12 11 245804 CASAVA_Build 11 47507019 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 1980 het 1980 ref 16 7 5 4 A 11 12 245805 CASAVA_Build 11 47519421 1I CAAGAGCTTA -/C CTCAATCTCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 1 2 245806 CASAVA_Build 11 47521890 1D CCCCGTCTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3029 hom 26 9 12 5 A 10 9 245807 CASAVA_Build 11 47531946 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTC 452 het 452 ref 18 10 2 6 A 1 0 245808 CASAVA_Build 11 47533508 2I CTAACTCGAT --/AG AAACTTCTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AG 0 1 245809 CASAVA_Build 11 47543298 1I ACCCGCACCT -/G GGGTCACTGC 3070 hom 104 het 38 0 24 14 G 3 4 245810 CASAVA_Build 11 47586514 1I GGCTTTTGAG -/A AAAGATGGGA 3070 hom 135 het 47 0 42 5 A 3 4 245811 CASAVA_Build 11 47591862 1I TCTGTTGGGA -/G GCTTGTTCAC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 G 1 2 245812 CASAVA_Build 11 47593920 4I GCCACCACGC ----/CTGT CTAATTTTTG 3070 hom 38 het 14 0 13 1 CTGT 0 1 245813 CASAVA_Build 11 47607880 1I TCTGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2460 het 2460 ref 34 17 7 10 A 13 14 245814 CASAVA_Build 11 47615090 1I AAGAACTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 966 hom 24 6 12 6 T 15 16 245815 CASAVA_Build 11 47630294 2D CTCCCCCTCC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 32 13 13 9 CT 6 5 245816 CASAVA_Build 11 47638849 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 53 het 19 0 18 1 T 7 8 245817 CASAVA_Build 11 47647809 1D CTGTCTCAAT A/- AAAAAAAAAA 2201 het 1290 hom 10 5 5 0 A 12 11 245818 CASAVA_Build 11 47660432 1D AGATGAAGGG T/- TAACAAAACT 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 T 2 1 245819 CASAVA_Build 11 47663192 1D AAAAAATTTA G/- CCAGGCATGG 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 G 1 0 245820 CASAVA_Build 11 47671667 2D CCAAAAATAT GA/-- GTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 GA 1 0 245821 CASAVA_Build 11 47678121 3I AGTCTTGCTC ---/TAT TATTGCTCAG 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TAT 1 2 245822 CASAVA_Build 11 47678720 4D AATAAATTTA AAAC/---- AAACAAACCA 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 AAAC 3 2 245823 CASAVA_Build 11 47683442 1I AAAGAATGAG -/A AAAAAAGGGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 6 7 245824 CASAVA_Build 11 47689038 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2347 het 18 hom 19 1 7 11 A 15 14 245825 CASAVA_Build 11 47700382 1D CCCGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 15 5 T 12 11 245826 CASAVA_Build 11 47712129 1I TGTTTATGCC -/A AAAAAAAAAA 1790 het 1108 hom 36 8 10 18 A 17 18 245827 CASAVA_Build 11 47714208 1D TCCGACTCAC A/- AAAAAAAAAC 1021 hom 7 het 4 0 3 1 A 10 9 245828 CASAVA_Build 11 47718085 8D TTTATGTATT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 2247 het 2247 ref 14 6 5 4 TTTG 5 3 245829 CASAVA_Build 11 47718728 1D TATGTATTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 52 25 16 11 T 10 9 245830 CASAVA_Build 11 47722549 2D CTACAGGCAC AT/-- GTCATCATAC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 AT 1 0 245831 CASAVA_Build 11 47727453 9I TAATCCCAGC ---------/ACTTTGGGA GTCTGAGGCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ACTTTGGGA 0 1 245832 CASAVA_Build 11 47733764 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2610 hom 32 12 15 7 A 14 13 245833 CASAVA_Build 11 47735962 4I TTTATGTATA ----/TATG TATGTAAGAG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 TATG 1 2 245834 CASAVA_Build 11 47737346 1D TGCGCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 11 10 245835 CASAVA_Build 11 47739725 1D ATCTCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 32 1 27 4 A 11 10 245836 CASAVA_Build 11 47743780 5I TAAAAATACA -----/AAAAT AAAAATAAAA 2457 hom 12 het 5 0 5 0 AAAAT 0 1 245837 CASAVA_Build 11 47758669 1D TAAAATACCC T/- TTTTTTTTTT 1612 hom 32 het 23 0 7 16 T 17 16 245838 CASAVA_Build 11 47769287 1I TTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 T 9 10 245839 CASAVA_Build 11 47775278 9I GAAATGTGGA ---------/AATTCACTG AAGGGAGAAG 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 AATTCACTG 0 1 245840 CASAVA_Build 11 47785964 5I AGTACATAAG -----/TATAA TATAATACAT 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 TATAA 1 2 245841 CASAVA_Build 11 47794910 1D CCTCAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 2793 het 62 hom 15 1 12 2 A 15 14 245842 CASAVA_Build 11 47799111 2D GTGCCCAGCC CT/-- GTTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 17 6 CT 1 0 245843 CASAVA_Build 11 47802943 1D TTTTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2460 het 2460 ref 16 8 6 2 T 11 10 245844 CASAVA_Build 11 47806726 2D TCTAAAACTC AT/-- ATGGAATTGA 2696 het 2696 ref 25 10 6 10 AT 2 1 245845 CASAVA_Build 11 47807313 1I ATACTACTTG -/C CAAGTCATAA 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 C 1 2 245846 CASAVA_Build 11 47811939 1D AAGCTTTCCT G/- GGAAACAACA 3070 het 1312 hom 45 5 22 18 G 3 2 245847 CASAVA_Build 11 47811966 1D ACACATCATC A/- CAATTCAGTG 3070 het 1261 hom 40 3 14 23 A 1 0 245848 CASAVA_Build 11 47813610 1D TTCATACTGA C/- CCCTCCTTCA 3070 het 3070 ref 53 24 23 7 C 4 3 245849 CASAVA_Build 11 47828952 40D TCTCATTCTC ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 18 het 13 0 7 7 AT 26 6 245850 CASAVA_Build 11 47832965 1D CTCTGTTTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 A 10 9 245851 CASAVA_Build 11 47848737 1D ATTCTTTCTC T/- CTTTCTCCCT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 1 0 245852 CASAVA_Build 11 47856134 1D AGGGTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 22 1 14 7 T 14 13 245853 CASAVA_Build 11 47856902 4D CAGGGCATGG TGGC/---- TCATGCCTGT 2624 het 2624 ref 15 7 6 2 TGGC 1 0 245854 CASAVA_Build 11 47857240 1D AGGAGCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 18 0 14 4 T 11 10 245855 CASAVA_Build 11 47862524 1I ATGCCTGGCC -/T TTTTTTTTTT 717 het 498 hom 10 4 4 2 T 13 14 245856 CASAVA_Build 11 47864818 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 11 10 245857 CASAVA_Build 11 47866019 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2942 het 573 hom 23 3 11 9 A 15 14 245858 CASAVA_Build 11 47880878 1D TAAATAAAAT A/- AAAAAAATTT 2524 het 2524 ref 16 7 8 1 A 8 7 245859 CASAVA_Build 11 47881269 1D TTTTTCTTTT C/- TTTTTTTGAG 3070 het 1704 hom 34 6 21 7 C 1 0 245860 CASAVA_Build 11 47888524 1I GCAACCTCCA -/C CTCCCGGGTT 3070 hom 31 het 14 0 10 4 C 1 2 245861 CASAVA_Build 11 47899199 3D GTTCAAGCAA TTC/--- TTCTGCCTCA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TTC 2 1 245862 CASAVA_Build 11 47906251 2D CCTGGGTGAC AG/-- AGTTAGACTC 3070 het 418 hom 11 1 10 2 AG 2 1 245863 CASAVA_Build 11 47907314 1I CACGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 1114 het 257 hom 6 1 5 0 C 3 4 245864 CASAVA_Build 11 47911721 4I CAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 2972 hom 24 het 12 0 8 4 AAAG 2 3 245865 CASAVA_Build 11 47913808 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 25 0 14 11 A 14 13 245866 CASAVA_Build 11 47918159 1D CATTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2737 hom 26 het 21 0 11 10 A 13 12 245867 CASAVA_Build 11 47922485 20D CTGGAGATTA AATAATGGAGACTAAGATTC/-------------------- AATAATGGAG 3070 het 3070 hom 27 13 14 5 AATAATGGAGACTAAGATTC 1 0 245868 CASAVA_Build 11 47923106 2I AGGTGTATGT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 19 9 9 AC 8 9 245869 CASAVA_Build 11 47939346 1D GCTACTTTTT C/- TTTTGGTAGT 3070 het 2910 hom 20 10 9 2 C 1 0 245870 CASAVA_Build 11 47951102 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 17 0 14 3 T 11 10 245871 CASAVA_Build 11 47952863 3I GTTAGTGGAC ---/TTG TTGTTAAACA 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 TTG 1 2 245872 CASAVA_Build 11 47961314 1D CAAAGTGCTA T/- TTTTTTTTTT 994 het 994 ref 21 15 3 3 T 11 10 245873 CASAVA_Build 11 47980265 1D CCTATTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1797 hom 22 het 21 0 7 14 T 19 18 245874 CASAVA_Build 11 47981082 1D TAGAGAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 10 9 245875 CASAVA_Build 11 47981601 1D TATTATCATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 10 9 245876 CASAVA_Build 11 48000336 1D TCATGCCTGT A/- AATCCTAGCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 3 2 245877 CASAVA_Build 11 48025627 2D CCTATGGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 894 hom 20 2 13 5 T 14 12 245878 CASAVA_Build 11 48028847 1D ATTTAGGGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 36 7 T 10 9 245879 CASAVA_Build 11 48067178 1I CGTGCTGTGC -/G GCCAGGAGGG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 G 1 2 245880 CASAVA_Build 11 48073708 1D AAACATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1262 hom 36 8 16 12 T 17 16 245881 CASAVA_Build 11 48095745 1I AGCCTGTCTG -/A AAAAAAACAA 2822 het 2822 ref 25 15 7 3 A 7 8 245882 CASAVA_Build 11 48120185 3I AGTTTTATTA ---/TTT TGCTCACGGA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 T 1 4 245883 CASAVA_Build 11 48136907 1I CATAGTGAGA -/C CCCCCATCTC 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 C 5 6 245884 CASAVA_Build 11 48148885 1I TGTTGGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 515 hom 49 3 33 13 T 13 14 245885 CASAVA_Build 11 48157869 2D TTTTTTTTAT AA/-- GACAAGTTCT 3070 het 1984 hom 17 5 10 2 A 2 0 245886 CASAVA_Build 11 48173229 4D TAAAAGACAT TAGA/---- TAATTAATAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 TAGA 1 0 245887 CASAVA_Build 11 48177206 2I CGGTTCCATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2340 hom 22 7 8 7 TG 7 8 245888 CASAVA_Build 11 48177321 2I CATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1330 hom 18 6 10 2 TG 6 7 245889 CASAVA_Build 11 48178754 1D TTAAAGAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 A 8 7 245890 CASAVA_Build 11 48226250 2I TATTTTTTTC --/AG AGTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 AG 1 2 245891 CASAVA_Build 11 48230077 4I TACAAGTGCA ----/TGTG TGTGTCTTTT 3070 het 3070 ref 50 29 18 3 TG 2 4 245892 CASAVA_Build 11 48230750 1D AGCCATCTTG A/- GTTAATTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 1 0 245893 CASAVA_Build 11 48233152 1D ATACTAATTC A/- CAAGGATTTA 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 A 1 0 245894 CASAVA_Build 11 48237306 1D CTGCCTTTTG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 7 6 245895 CASAVA_Build 11 48242558 3D GCGCAGACAC CTT/--- CTTCATTAGC 3070 het 3070 ref 46 26 15 6 CTT 2 1 245896 CASAVA_Build 11 48245606 1D TTACTTTGAT A/- AAAAATACTC 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 A 6 5 245897 CASAVA_Build 11 48245945 1I CCAAATTGCA -/T TTTTCCATTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 4 5 245898 CASAVA_Build 11 48246060 4I AGTTCTGCGC ----/TTTA TTTATCTATA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TTTA 1 2 245899 CASAVA_Build 11 48247362 1D TTTATTCTAT A/- AAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 7 6 245900 CASAVA_Build 11 48248746 2I3M2I AAATCAAGCT --TTA--/TATTAAG AAAGTAAAGG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 N/A 0 0 245901 CASAVA_Build 11 48270345 1D CTTGCCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2336 hom 25 6 12 7 T 12 11 245902 CASAVA_Build 11 48270710 1I TGCAGGACAG -/T GGGTGCAGTG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 0 1 245903 CASAVA_Build 11 48279252 1I CGAAGGAACA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 8 9 245904 CASAVA_Build 11 48279329 1D TGTGTAAGGT C/- CCCCCCCTTT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 C 8 7 245905 CASAVA_Build 11 48285977 3D TGATGAAGAG AAC/--- AACCAGGAAG 3070 het 3070 ref 50 28 13 12 AAC 2 1 245906 CASAVA_Build 11 48297364 1D GAGGGAGGGG A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 59 15 16 28 A 8 7 245907 CASAVA_Build 11 48297648 3I ATGCTTTCAG ---/GAA AAAGGTCTGG 3070 het 3070 ref 67 47 15 7 GAA 0 1 245908 CASAVA_Build 11 48297794 1I TGCATATATG -/A ATAAGTATTA 3070 het 3070 ref 77 49 22 6 A 1 2 245909 CASAVA_Build 11 48297841 1D TTCTATTGTA T/- AACATGTGGG 3070 het 3070 ref 70 41 15 16 T 1 0 245910 CASAVA_Build 11 48298022 3I64M1D12M1D CTTTTTGTTA ---TTGTTTTTCCTTTTTCCATAAAGCTGAAGGCCAGGATAGTTGAAAAGAGTACAAGAGTTTATAGAAAACTTGGTAGAG/TTTTTATTTTTCCTTTTTCCATAAAGCTGAAGGCCGGGATAGCTGAAAAGAGTACAAGAGCTTATAG-AAACTTCGTAGA- TTCCAATTTA 3070 het 3070 ref 62 61 29 21 N/A 0 0 245911 CASAVA_Build 11 48298640 1D AATTTACCCA G/- CAATTCCTTA 3007 het 3007 ref 57 40 9 9 G 1 0 245912 CASAVA_Build 11 48298833 4I GAGTAATAAA ----/CACT TACTGAATGA 3070 het 3070 ref 89 47 30 12 CACT 0 1 245913 CASAVA_Build 11 48299009 1I GCCTAGGACC -/T ATGCCTAGAA 3070 het 3070 hom 92 39 40 13 T 0 1 245914 CASAVA_Build 11 48299927 5D AAATAAAAAG TTGAA/----- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 58 24 31 8 TTGAA 1 0 245915 CASAVA_Build 11 48300747 3D CATTTTCTCT ACC/--- ACTGCTGTGT 2345 het 2345 ref 50 36 7 8 ACC 1 0 245916 CASAVA_Build 11 48301078 5D16M1I40M2D AAATGGCAGA GAAGGGGAGGGATTCAAACCC-GATGTGTTTAAGTGACAGTATGGTACTGTGAAGCCCACAAAC/-----GGAGGGATTCAAACCCAGATGTGTTTAAGTGACAGTATGGTACCGTGAAACCCACAA-- TCTGTGGCAA 3070 het 3070 ref 66 81 19 9 N/A 0 0 245917 CASAVA_Build 11 48301217 1I TCTTCCTCTG -/A AAAATGAGGA 3070 het 3070 ref 68 48 13 7 A 4 5 245918 CASAVA_Build 11 48301754 3I9M1I AATTACTGAG ---ATGAGTATT-/ACAATGAGTATTC CCTGGGGAAA 3070 het 3070 ref 64 38 22 10 N/A 0 0 245919 CASAVA_Build 11 48301870 1D GGGAGGAAAC G/- TTAACTGTTA 3070 het 3070 ref 78 50 23 6 G 1 0 245920 CASAVA_Build 11 48302279 1D AGCATCTGTT C/- CCTCCGCCCT 3070 het 3070 ref 68 48 15 6 C 3 2 245921 CASAVA_Build 11 48302355 2I GATACTCCCC --/AT TTTTTTTAAA 272 het 272 ref 72 40 4 28 AT 0 1 245922 CASAVA_Build 11 48302643 1D TTTATATCAA T/- TTGTATTAGC 3070 het 3070 ref 66 41 16 9 T 3 2 245923 CASAVA_Build 11 48302710 1I AAGAAGAAAG -/C TTTAATTCAA 3070 het 3070 ref 57 44 9 4 C 0 1 245924 CASAVA_Build 11 48303064 1D CAATGTTTTT C/- CCCCATGCAA 3070 het 3070 hom 75 32 37 8 C 5 4 245925 CASAVA_Build 11 48303237 9D TGTGGTCTTT TTGCTGATC/--------- TATGTGGTCA 3070 het 3070 ref 89 45 36 23 TTGCTGATC 1 0 245926 CASAVA_Build 11 48304140 1D CAAGCCTTAC T/- TTTTTTGTAT 2589 het 2589 ref 39 26 9 4 T 7 6 245927 CASAVA_Build 11 48307196 4I CTTTTGTTTT ----/TCTA TCTCTTTTAG 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 TCTA 0 1 245928 CASAVA_Build 11 48307481 1D ACATATTCAC T/- TTTTACACTA 3070 het 3070 ref 52 24 12 17 T 5 4 245929 CASAVA_Build 11 48307582 5D CCATCATCCT AAGTG/----- AACTAACGCA 3070 het 3070 ref 49 35 9 8 AAGTG 1 0 245930 CASAVA_Build 11 48307735 14I GGATTGAAAA --------------/ACCAACTATTGGGT ACTATGCCAT 2428 het 2428 ref 59 46 8 5 ACCAACTATTGGGT 0 1 245931 CASAVA_Build 11 48307942 2I CCCATAACTC --/CA TGTCTAATAA 3070 het 3070 ref 79 40 31 8 CA 0 1 245932 CASAVA_Build 11 48308918 1I TCTAGTAATT -/A AAAATTATTA 3070 het 3070 ref 66 40 15 11 A 4 5 245933 CASAVA_Build 11 48309142 1I TCCAGTCCTC -/A ATCATCTTTT 3070 het 3070 ref 71 43 22 7 A 1 2 245934 CASAVA_Build 11 48309257 2I TATGACATAA --/AT ATATGTGATA 3070 het 3070 ref 68 40 22 7 AT 2 3 245935 CASAVA_Build 11 48309549 2D TTAGGGAAAA AG/-- AAAAACAAAC 635 het 635 ref 91 48 5 39 AG 1 0 245936 CASAVA_Build 11 48310966 4I GTGTGCATGT ----/GTTA GTATGTATTT 3070 het 3070 ref 62 41 14 7 GTTA 0 1 245937 CASAVA_Build 11 48311534 4D AAAACGGCAC TTGT/---- TTTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 42 31 9 4 TTGT 1 0 245938 CASAVA_Build 11 48312215 1I54M1D AAACAACTTT -AAAAAATCATTTTTTTCACTTCTGTTGAACCCCTTTCCCTCAAGTGGAATTTTGT/AAAAAAATCATTTTTTTCACTTCTCTTGAACCCCTTTCCCTGAAGTGGAATTTTG- TTTTAATGAA 3070 het 3070 ref 39 45 10 19 N/A 0 0 245939 CASAVA_Build 11 48312469 1D TTATGGAATT A/- TAAATTACTG 3070 het 3070 ref 65 33 24 8 A 1 0 245940 CASAVA_Build 11 48312772 1I TTAGCTACTT -/A ACCTTGAACA 3070 het 3070 ref 56 34 17 7 A 1 2 245941 CASAVA_Build 11 48313014 4D18M2I CAATTATATT CAAATAATGAAATATTTTAGAC--/----TAATTAAATATTTTAGACAG AGGTAAATTC 3070 het 3070 ref 64 46 20 11 N/A 0 0 245942 CASAVA_Build 11 48313547 6I CACATACTTT ------/TCCTTG TCCTTGTCAT 3070 het 3070 ref 79 59 13 7 TCCTTG 1 2 245943 CASAVA_Build 11 48313620 3I CAAGTGTAGG ---/TCA TGGTGTTCTT 3070 het 3070 ref 58 33 17 9 TCA 0 1 245944 CASAVA_Build 11 48313731 1I GGTATTTAAC -/A AACACCTGAT 3070 het 3070 ref 75 54 14 7 A 2 3 245945 CASAVA_Build 11 48313849 1D ATTCTTTTCC T/- TTGTGGGAAA 3070 het 3070 ref 70 49 15 7 T 3 2 245946 CASAVA_Build 11 48315921 1I TGGTCTCTTT -/C TCTTTCTGGG 3070 het 3070 ref 54 31 17 6 C 0 1 245947 CASAVA_Build 11 48316304 1I AAAGGTATGT -/A AAATAAAGCA 3070 het 3070 ref 72 34 30 8 A 3 4 245948 CASAVA_Build 11 48316944 1I GCAGGAAGAC -/A ACTGGCCCTG 3070 het 3070 ref 85 41 34 13 A 1 2 245949 CASAVA_Build 11 48317179 1I TTGCTTACAG -/A AAAACACACT 3070 het 3070 ref 57 32 18 7 A 4 5 245950 CASAVA_Build 11 48317545 4D CTCAGCCATA CTGT/---- CTGTCCTGAA 2886 het 2886 ref 58 41 13 7 CTGT 2 1 245951 CASAVA_Build 11 48317626 1D CTTAACTATA C/- ACTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 67 40 24 3 C 1 0 245952 CASAVA_Build 11 48317871 5D TTGTCAAGAT AAGTC/----- AAAGTATATG 3070 het 3070 ref 61 36 23 10 AAGTC 1 0 245953 CASAVA_Build 11 48318109 1D TCAAGCAGCA G/- GGGGTATAGG 2464 het 2464 ref 57 41 11 10 G 5 4 245954 CASAVA_Build 11 48319553 7I TCTCAAAATA -------/ACAAAAG AAAGAAACAA 3070 het 3070 ref 53 35 12 6 ACAAAAG 0 1 245955 CASAVA_Build 11 48320032 3D CTATTTTAAA AGG/--- GTGTATAAGG 3070 het 3070 ref 98 46 43 11 AGG 1 0 245956 CASAVA_Build 11 48320304 3I TATTTCAAAA ---/CAT CATGTTGTAC 3070 het 3070 ref 59 33 22 4 CAT 1 2 245957 CASAVA_Build 11 48320530 1I TTGGGAATTA -/C AACTACATTT 2539 het 2539 ref 35 25 6 4 C 0 1 245958 CASAVA_Build 11 48320640 3D ACTCATCAAC TCG/--- TCATCTATCC 1555 het 1555 ref 30 20 4 6 TCG 1 0 245959 CASAVA_Build 11 48321436 1I CTCACAGTGG -/C CCCCACCAGC 3070 het 3070 ref 59 34 19 6 C 4 5 245960 CASAVA_Build 11 48322155 1D TGAAAAAAAA G/- ACATGTAATG 3070 het 3070 ref 72 37 31 5 G 1 0 245961 CASAVA_Build 11 48322870 1D GGCACTGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 39 1 26 12 A 12 11 245962 CASAVA_Build 11 48322935 1I GGAGATACAA -/T TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 T 5 6 245963 CASAVA_Build 11 48323627 2I GAAGGAGGTT --/AG AGGTCTTAGA 3070 het 3070 ref 81 43 31 14 AG 1 2 245964 CASAVA_Build 11 48330577 1I ATTGTTCATC -/T TTTTTCATAG 3070 het 3070 ref 80 43 25 12 T 5 6 245965 CASAVA_Build 11 48330825 4D CCAGTACTAC AATA/---- AAACAAGATC 3070 het 3070 ref 58 36 19 5 AATA 1 0 245966 CASAVA_Build 11 48331593 1D CATTTAATAT A/- TATAAGAATG 3070 het 3070 ref 75 41 27 9 A 1 0 245967 CASAVA_Build 11 48331951 1I GTAGTAATAT -/G GGAAGTCAAG 3070 het 3070 ref 81 36 31 16 G 2 3 245968 CASAVA_Build 11 48332064 1I TGACTTCAGT -/A AGTTCTTAGC 3070 het 3070 ref 73 41 28 7 A 1 2 245969 CASAVA_Build 11 48332788 1D ATTCAAGTTC T/- TCTTTCAACT 3070 het 3070 ref 71 38 27 8 T 2 1 245970 CASAVA_Build 11 48333204 5D GGCATTGTTG AGCCT/----- AGCCTAGGAT 3070 het 3070 ref 76 39 32 9 AGCCT 2 1 245971 CASAVA_Build 11 48333794 6D GACCAGAAAA CAAAAG/------ CAAAACTTTC 3070 het 3070 ref 68 46 17 11 CAAAAG 1 0 245972 CASAVA_Build 11 48334922 1I AGGTATTTTT -/G AATGTAGATA 3070 het 3070 ref 78 39 29 10 G 0 1 245973 CASAVA_Build 11 48335114 3I40M2D AGTTCTCGTA ---CTGCTATAAGGAACTACCTGAGACCAGGAAATTTATGAAGAA/CTGCTGCTATAAGGAACTACCTGAGACCAGGAAATTTATGAAG-- AAGAGATTTA 3070 het 3070 ref 71 65 18 17 N/A 0 0 245974 CASAVA_Build 11 48335246 1D GGAAAGTGAA G/- GGGGAAGCAA 2274 het 2274 ref 41 28 5 8 G 5 4 245975 CASAVA_Build 11 48335881 1I GCAGTGCTTC -/A GTGAGGACTC 3070 het 3070 ref 45 31 8 6 A 0 1 245976 CASAVA_Build 11 48336382 1I CCAGAAAATG -/T GTTATTTTCT 3070 het 3070 ref 49 32 12 5 T 0 1 245977 CASAVA_Build 11 48336504 1D GAGCATAGGC T/- TTTTAGAAGC 3070 het 3070 ref 73 40 27 6 T 5 4 245978 CASAVA_Build 11 48336683 1D AATAAGTTCC T/- TTATCTCCAT 3070 het 3070 ref 69 41 19 9 T 3 2 245979 CASAVA_Build 11 48337694 1I15M1D CAGACAAAAA -AACCCAAAAACAGACA/TAAAACAAAAACAAAC- AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 57 48 11 8 N/A 0 0 245980 CASAVA_Build 11 48337747 1D CCTATTCAAT A/- AATGGTGCTG 3070 het 3070 ref 46 30 12 4 A 3 2 245981 CASAVA_Build 11 48338048 3D CCTACAGAAT CAA/--- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 45 29 11 5 CAA 1 0 245982 CASAVA_Build 11 48338873 4D22M6D ACATGGATAA ATTTATTTATGTAAACAAAACCACTTATACTC/----ATTTATGTAAACAAAACCACTT------ ATAAAACTAT 3070 het 3070 ref 63 53 18 6 N/A 0 0 245983 CASAVA_Build 11 48338967 1I ACTCTTCTAA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 67 43 19 5 T 6 7 245984 CASAVA_Build 11 48339508 10I TAACAAACCA ----------/GTCCAGGGAG AGCAATGTAG 3070 het 3070 ref 89 43 40 7 GTCCAGGGAG 0 1 245985 CASAVA_Build 11 48339941 4I CAGCCTGCTG ----/AGTA AGTAGCTGGA 2597 het 2597 ref 55 40 7 9 AGTA 1 2 245986 CASAVA_Build 11 48340540 1D14M2D TTATCCCAGT GGGGTGGGGGGTGGTTC/-GAGAGAGGGGGGGT-- CTATTTCTTC 3070 het 3070 hom 82 40 43 13 N/A 0 0 245987 CASAVA_Build 11 48340674 3D CTCGAAACTT CTC/--- CTCTCACCTT 3070 het 3070 ref 84 44 33 8 CTC 2 1 245988 CASAVA_Build 11 48340934 1D AATACACAAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 51 36 13 4 T 8 7 245989 CASAVA_Build 11 48341004 1I45M1D GACTTCTCTC -ATGCAACGGTTTAATCTTATTTTTTTTAAAAAAGCAAAACAAAGGA/TATGCAACGATTTAATCTTATTTCTTTAAAAAAAGCAAAACAAAGG- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 55 51 19 11 N/A 0 0 245990 CASAVA_Build 11 48341398 14D8M2D TAAACCACTT ACAAAAACAAACAAACAAACAAAC/--------------ACAAACAA-- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 67 35 32 12 N/A 0 0 245991 CASAVA_Build 11 48341533 1I GTTTTTGGCA -/C TCCCCTTAGT 3070 het 3070 ref 77 41 23 14 C 0 1 245992 CASAVA_Build 11 48342016 1D GCTGCAGCAG A/- GAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 68 32 33 8 A 1 0 245993 CASAVA_Build 11 48343021 4D CTTTGGCTGT AGAC/---- AGAGAAAATA 3070 het 3070 ref 69 41 26 3 AGAC 1 0 245994 CASAVA_Build 11 48343126 3D TGCTGCTTTA ACG/--- ACTCTCATTC 3070 het 3070 ref 82 44 33 7 ACG 1 0 245995 CASAVA_Build 11 48343165 4D TTCTCACCTA TCTC/---- TCTCTCTCAC 3070 het 3070 ref 77 35 16 32 TC 6 4 245996 CASAVA_Build 11 48343394 1D AATGTCCCCC T/- GATTAATAAT 3070 het 3070 ref 69 41 28 0 T 1 0 245997 CASAVA_Build 11 48343533 1I TTAAACTCAC -/A TATTCTGACC 3070 het 3070 ref 79 36 32 11 A 0 1 245998 CASAVA_Build 11 48344260 1D AAGGAAATAG T/- TTTCTTTTCA 3070 het 3070 hom 66 28 30 8 T 4 3 245999 CASAVA_Build 11 48344494 1D27M2I CCAAGCAAGA TGAATTCCGTTATGTTGTTCACTTGCTC--/-AAATTCCGTTACGTTGTTCACTTGCTCCA GAAATCCAGT 3070 het 3070 ref 51 49 20 3 N/A 0 0 246000 CASAVA_Build 11 48344749 10D55M1I ACAGACACAG AAAAACACATACACACATTCATTTATGTACACAAACATGATTTTATGATGTTGACATGTCAGGCA-/----------ACACACATTCATTCATACACACAAACATGATTTTATGATGTTGACATGTCAGGCAT TTTTTCCTAT 849 het 849 ref 71 92 3 16 N/A 0 0 246001 CASAVA_Build 11 48345436 2I ATTGGACAGA --/GT GTGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 70 35 26 9 GT 2 3 246002 CASAVA_Build 11 48345535 1I GTGCCTAAAC -/T TTTTTCATAT 3070 het 3070 ref 49 34 10 5 T 5 6 246003 CASAVA_Build 11 48345786 5I ACAAGCAATT -----/AAATA ATATTCAGAA 2401 het 2401 ref 19 12 5 2 AAATA 0 1 246004 CASAVA_Build 11 48348413 2I TGAAGATATC --/TA TGTCAGTGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TA 0 1 246005 CASAVA_Build 11 48373485 1D CATTTTTTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 10 9 246006 CASAVA_Build 11 48376897 3D AGGCAGAATA AAG/--- AAGAAGTGAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 3 AAG 3 2 246007 CASAVA_Build 11 48414974 1D TTTCTCTATC T/- GAGCCTGTGT 3070 het 3070 ref 27 19 8 0 T 1 0 246008 CASAVA_Build 11 48415694 1D ATGGCTGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 11 10 246009 CASAVA_Build 11 48418116 1I GTTGTTTACC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 7 8 246010 CASAVA_Build 11 48418464 8I ATTAATGTGG --------/AAAGAATA AAATAATAGC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AAAGAATA 0 1 246011 CASAVA_Build 11 48420613 4I GCATAGGATT ----/TTTG TTTGTTTGTG 3070 hom 60 het 24 0 20 5 TTTG 2 3 246012 CASAVA_Build 11 48422639 1I TTTTTTTCTA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 4 het 14 1 13 0 T 7 8 246013 CASAVA_Build 11 48443507 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1976 het 1976 ref 26 13 5 9 T 11 10 246014 CASAVA_Build 11 48465441 1I GAGAAGAAAA -/T TTAGAAAGTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 T 2 3 246015 CASAVA_Build 11 48482872 2D CACAGAAAGG CA/-- CAAGTAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 CA 2 1 246016 CASAVA_Build 11 48514480 32I ATGATTTTTA --------------------------------/TGTAATATATTGTGTTTTTCAGCCTGAGGAAC CTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 24 17 7 1 TGTAATATATTGTGTTTTTCAGCCTGAGGAAC 0 1 246017 CASAVA_Build 11 48514751 4I GAAGGTCCAT ----/GGAC ATCTCAGCAT 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 GGAC 0 1 246018 CASAVA_Build 11 48527528 1I CTTTTAAATA -/T TTTTTTTTAA 2391 het 2391 ref 24 17 5 2 T 8 9 246019 CASAVA_Build 11 48538059 1D AATAGAAATG A/- AAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 31 15 15 2 A 7 6 246020 CASAVA_Build 11 48538233 3I AACCCCTATG ---/TAT TATATCTACT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 TAT 1 2 246021 CASAVA_Build 11 48547530 1I GAAGGAATAA -/G ATGTTAAAAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 G 0 1 246022 CASAVA_Build 11 48552431 1D ATCATTCTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 9 8 246023 CASAVA_Build 11 48555400 1D TAAATCACTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 9 8 246024 CASAVA_Build 11 48561776 1D GGAAATAGAT A/- GGGGTGATTC 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 A 1 0 246025 CASAVA_Build 11 48568534 9D GGAGTCATTC TAGTTTAGG/--------- TAGTTTACCT 3070 het 3070 ref 56 29 23 5 TAGTTTAGG 1 0 246026 CASAVA_Build 11 48568621 1D ACTGTGGTTG T/- CCTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 10 6 T 1 0 246027 CASAVA_Build 11 48614534 1D TGTTGGTACA T/- TTTGTATTCT 3070 het 2840 hom 20 7 10 3 T 4 3 246028 CASAVA_Build 11 48617604 1D32M1D5M3D TCTTTCTTTC TTTTCTTTGTTTCTTTCTTTCTTTGTTTCTTTCTTTCTTTCC/-TTTCTTTGTTTCTTTCTTTCTTTCCTTCTTTC-TTCTT--- TTCTTTCTTC 1867 het 1867 ref 33 31 6 7 N/A 0 0 246029 CASAVA_Build 11 48646881 1D TTCCCTGGAC A/- AAAACTAGAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 5 4 246030 CASAVA_Build 11 48648214 1D ATATCACAAG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 35 0 24 12 A 9 8 246031 CASAVA_Build 11 48651169 1D ATATCCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 11 10 246032 CASAVA_Build 11 48658714 2D AGTTTACAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 29 1 19 9 A 13 11 246033 CASAVA_Build 11 48665007 1I CAGCAAAGAC -/A AAAACCACAT 3070 hom 55 het 22 0 19 3 A 4 5 246034 CASAVA_Build 11 48673180 1D CAGAGTTAAA C/- CTTTCTGTGG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 2 1 246035 CASAVA_Build 11 48676401 2D GCATTCATCT CA/-- CAGAGTTAAA 3070 het 3070 ref 28 12 11 6 CA 2 1 246036 CASAVA_Build 11 48676928 4I AGAGTTAAAC ----/CTTT CTTTCTTTGG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CTTT 2 3 246037 CASAVA_Build 11 48677920 1D CAATATTTCC T/- TTTTTTTCTT 2879 hom 18 het 9 0 7 2 T 8 7 246038 CASAVA_Build 11 48686698 1D ATTCTTCTAG T/- TTTTATTTGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 5 4 246039 CASAVA_Build 11 48690712 1D CTTTGCAGAT A/- CTAGAAGAAC 3070 hom 40 het 27 0 21 6 A 1 0 246040 CASAVA_Build 11 48694123 1I TGCAGTTTCT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 85 het 37 0 33 4 A 9 10 246041 CASAVA_Build 11 48696773 1D TTCATGTCAC A/- GAGTGGAATG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 0 246042 CASAVA_Build 11 48699798 3I AAAAGGAAAT ---/ATC ATCACATAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATC 1 2 246043 CASAVA_Build 11 48703788 10D AAACTAGACA GAAGGTTTCT/---------- GAGAAACTTC 3070 het 599 hom 24 4 19 2 GAAGGTTTCT 1 0 246044 CASAVA_Build 11 48705145 2D GAAATATCTT CC/-- CATAAAAACT 1366 het 1366 ref 22 18 3 1 C 3 1 246045 CASAVA_Build 11 48715903 1D AACCAAAGAC A/- AAAACCACAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 5 4 246046 CASAVA_Build 11 48729555 1D TTTATGTGAA G/- TTATTTCCTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 1 0 246047 CASAVA_Build 11 48731169 9I GAAATTATTC ---------/CAAACTGTT CAATCAAAAG 3070 hom 57 het 20 0 20 1 CAAACTGTT 0 1 246048 CASAVA_Build 11 48732297 1I AGCTATATCC -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 7 8 246049 CASAVA_Build 11 48732779 2I AGTTTCTCAG --/AA AAAACTTTGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 4 6 246050 CASAVA_Build 11 48736800 1I CAGATTTTAC -/A AAAAGACTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 4 5 246051 CASAVA_Build 11 48739537 1I AAAAAGACTG -/T TTTTTTGTAG 3070 het 339 hom 29 2 24 3 T 6 7 246052 CASAVA_Build 11 48744380 5I TTCAACTTTG -----/TTGGA TGAATGCACC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTGGA 0 1 246053 CASAVA_Build 11 48745620 1D ATATTCTGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 10 9 246054 CASAVA_Build 11 48753632 11I TCACCACAGG -----------/CCTCAAAGTGC CCTCGAATAT 3070 hom 90 het 41 0 31 10 CCTCAAAGTGC 0 1 246055 CASAVA_Build 11 48756663 4I TCACAATGCT ----/TCTG TCTATTTTTT 3070 het 122 hom 28 1 24 3 TCTG 0 1 246056 CASAVA_Build 11 48762708 1D CTGTGAGATG A/- ATTGACACAT 3070 het 150 hom 27 1 24 2 A 2 1 246057 CASAVA_Build 11 48766704 1D ATCCTATTTC T/- TTTTTTCAAC 3070 hom 45 het 18 0 16 3 T 7 6 246058 CASAVA_Build 11 48772805 2D TTCAATCCAA AC/-- AAAGTTTCAA 3070 het 201 hom 26 1 18 7 AC 1 0 246059 CASAVA_Build 11 48775960 1I TTTATGTAAA -/G ATATTTCCTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 G 0 1 246060 CASAVA_Build 11 48778432 2D TTTGTATTCT GA/-- GAGTTTGCTG 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 GA 2 1 246061 CASAVA_Build 11 48780160 1I TGTTGACAGT -/G GGGTGTCAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 3 4 246062 CASAVA_Build 11 48780408 10D TTGTTTTCCA TTTGCTTGGC/---------- AGATCTTCCT 1811 hom 10 het 5 0 4 1 TTTGCTTGGC 1 0 246063 CASAVA_Build 11 48783804 4I CAAAACCCTC ----/TGTT TGTAGAAACT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TGTT 0 1 246064 CASAVA_Build 11 48784341 1D GTGGATATTT G/- GAGCAATTTG 3070 het 851 hom 34 12 16 6 G 2 1 246065 CASAVA_Build 11 48787201 2I AAGCATTCTC --/AG AGAGATATTT 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 AG 2 3 246066 CASAVA_Build 11 48790848 2I ACATTTAACT --/CA CAGAGTTGAA 3070 hom 59 het 28 0 19 9 CA 1 2 246067 CASAVA_Build 11 48796323 1I ATATCTTCAC -/A AAAAAACTAG 3070 het 98 hom 62 3 31 28 A 6 7 246068 CASAVA_Build 11 48798394 1I AGAAGAATTC -/T GAGAAACTTC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 0 1 246069 CASAVA_Build 11 48806812 1D TGAACCTTTC T/- TTTTATTGAG 3070 het 388 hom 33 1 26 6 T 5 4 246070 CASAVA_Build 11 48808707 13I GTTTTGAAAC -------------/AATCTTTTTGTAG AATCTTCAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AATCTTTTTGTAG 0 1 246071 CASAVA_Build 11 48809617 1D AGGAAATCGC T/- TCATATAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 T 2 1 246072 CASAVA_Build 11 48836353 1D TTTTGAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 27 1 21 5 T 11 10 246073 CASAVA_Build 11 48836870 1D TTTGAAACAC T/- TTTTTTTGTG 1326 het 1326 ref 44 34 4 7 T 8 7 246074 CASAVA_Build 11 48852407 1I CAGAAACTTC -/T TTTTTATGTG 3070 het 25 hom 29 1 25 3 T 5 6 246075 CASAVA_Build 11 48855375 1I TGAAACACTC -/T TTTTGTGGAA 3070 het 1168 hom 56 11 26 19 T 4 5 246076 CASAVA_Build 11 48856524 1D TCAACTCAAA G/- GGTTGAACCT 3070 hom 93 het 33 0 31 3 G 3 2 246077 CASAVA_Build 11 48867738 5I AGAAATAAAG -----/AAAGA AAAGAAAAGA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 AAAGA 3 4 246078 CASAVA_Build 11 48882779 4D AGAATAAATA AAGT/---- AAGTATCTCT 2327 het 2327 ref 19 12 5 4 AAGT 2 1 246079 CASAVA_Build 11 48893251 1D AGGTATGTTC A/- ACTTTGTGAG 3070 het 47 hom 30 1 26 3 A 2 1 246080 CASAVA_Build 11 48906437 2I TGGTGTGGTG --/CT GAAATGATAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 CT 0 1 246081 CASAVA_Build 11 48910413 1I TTCTGTCTAG -/T TTTCAAGTGA 3070 hom 56 het 24 0 17 7 T 3 4 246082 CASAVA_Build 11 48920168 1I GTTTTTTTTT -/G TGAATATATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 246083 CASAVA_Build 11 48925632 3D AATATATATA TCC/--- TCCTGTTTGC 3070 hom 54 het 21 0 19 4 TCC 2 1 246084 CASAVA_Build 11 48928286 2D TTTTTATGTA TT/-- TTTTTTTTGG 3070 hom 30 het 17 0 11 6 T 10 8 246085 CASAVA_Build 11 48930396 1D AACTTGGAGT A/- AAAAAGACTC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 6 5 246086 CASAVA_Build 11 48931761 2I TTTCAAATGC --/AT ATATATATAT 2684 hom 18 het 10 0 7 3 AT 5 6 246087 CASAVA_Build 11 48932191 2D TGCCACATAC AT/-- TTTTTTTTAC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AT 1 0 246088 CASAVA_Build 11 48934768 1D AGCCCCTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 10 9 246089 CASAVA_Build 11 48935974 1D ATATGTGTAT A/- AAAATATATA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 5 4 246090 CASAVA_Build 11 48937314 1I AACCAATCAC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 8 246091 CASAVA_Build 11 48940337 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2007 het 22 hom 11 1 9 2 T 12 11 246092 CASAVA_Build 11 48947390 1I CACCCCATGT -/G ATTTTAAAAT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 0 1 246093 CASAVA_Build 11 48950905 3D TTATTAATAT TAA/--- TATTAATTAT 3032 het 3032 ref 15 7 7 1 TAA 1 0 246094 CASAVA_Build 11 48951602 2D GTCCCTATAT TA/-- TATATATATA 1356 hom 7 het 6 0 3 3 TA 8 7 246095 CASAVA_Build 11 48952682 2D TCAAATGCGT TC/-- TGTTTCTCTC 3070 het 3070 hom 23 10 13 1 TC 1 0 246096 CASAVA_Build 11 48953034 3I GTTCTCCATC ---/ATT ATTAACATCA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 ATT 1 2 246097 CASAVA_Build 11 48962818 2D ATGCATTCAA TT/-- TCTCTCTCCT 3070 het 3070 hom 25 8 14 5 T 3 1 246098 CASAVA_Build 11 48963130 5D ATCATGCACA TGTAT/----- TGTATTTTAT 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 TGTAT 2 1 246099 CASAVA_Build 11 48963739 1D AGAAATAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 17 1 8 8 A 14 13 246100 CASAVA_Build 11 48964522 4I TAAATAAAAG ----/AGAA AGAAACAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AGAA 1 2 246101 CASAVA_Build 11 48968131 2D GAATTTTATG CA/-- CACACACACA 2978 het 1857 hom 22 7 7 8 CA 10 9 246102 CASAVA_Build 11 48970561 1D AAAGTAAAAT A/- AAAAACCAAA 3070 het 2274 hom 19 6 11 2 A 6 5 246103 CASAVA_Build 11 48971894 1D ATGGTCTTTG T/- TTGGCAATTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 T 3 2 246104 CASAVA_Build 11 48974059 4I TAAAAAATCT ----/ACAA ACAAACAGTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 ACAA 1 2 246105 CASAVA_Build 11 48985112 1D CCTGCATTTT C/- CCCCCTACAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 C 6 5 246106 CASAVA_Build 11 48988167 6D TCATACCCAG ATAATA/------ ATTTTGTTTC 2944 het 2944 ref 35 25 7 6 ATA 2 0 246107 CASAVA_Build 11 48992699 1D GTTTTTTTTT C/- CCCCACTAAT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 C 5 4 246108 CASAVA_Build 11 48995604 2D AATTAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAC 2937 het 2937 ref 24 15 7 2 A 11 9 246109 CASAVA_Build 11 48997156 2D AACTTGGTAA AG/-- AGAGATAGAG 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 AG 3 2 246110 CASAVA_Build 11 49001090 3D TTGCTCAATA TTC/--- TTCTTAAATC 3070 het 3070 ref 36 25 10 1 TTC 2 1 246111 CASAVA_Build 11 49004191 1I AAGAAATGCC -/A AAAAAAAGTG 2426 het 2426 ref 23 13 5 5 A 7 8 246112 CASAVA_Build 11 49007179 3D AAAATATCTC ATT/--- ATCTTAAATC 3070 het 3070 ref 26 13 9 6 ATT 1 0 246113 CASAVA_Build 11 49007280 4D CTTTCTATGA TTGT/---- TTAATATAGT 3070 het 3070 ref 34 19 15 3 TTGT 1 0 246114 CASAVA_Build 11 49010605 1D GGGATTCAGT A/- AAAAAAAAAG 2990 het 2990 ref 24 13 7 5 A 10 9 246115 CASAVA_Build 11 49014209 2I CATTTGGGGC --/AA AAAAAAAAAG 2500 het 2500 ref 22 13 6 3 A 9 11 246116 CASAVA_Build 11 49015410 1D CTCAATATGT A/- AGTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 A 2 1 246117 CASAVA_Build 11 49016708 1D ATTAATTGAA T/- TTTTTTTTAA 3059 het 3059 ref 27 15 9 3 T 9 8 246118 CASAVA_Build 11 49033540 2I TCAGTTCTGC --/AA AAAAAAAAAA 1680 het 1680 ref 19 11 7 1 A 10 12 246119 CASAVA_Build 11 49034466 1D AGAAATAGCA T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 T 8 7 246120 CASAVA_Build 11 49049604 1D TGGTCTTTTC T/- TTTTTTGGTC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 7 6 246121 CASAVA_Build 11 49052107 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1374 het 868 hom 15 5 4 6 A 18 16 246122 CASAVA_Build 11 49066884 4D GGGTTGATCT TAAC/---- TAACTATTCA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TAAC 2 1 246123 CASAVA_Build 11 49072246 1I AATGACAAGC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 8 9 246124 CASAVA_Build 11 49081914 1I TTTGAATTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 9 10 246125 CASAVA_Build 11 49090171 3D ATCCTACATA AAT/--- AATACACTAT 3070 hom 60 het 21 0 21 1 AAT 2 1 246126 CASAVA_Build 11 49090448 1D TTTATGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 12 11 246127 CASAVA_Build 11 49093498 1D AAAAAAAAAA T/- GTTCAACACC 3070 het 765 hom 35 5 28 2 T 1 0 246128 CASAVA_Build 11 49096640 3D ACATTCGAAT AAC/--- AACATTAAGA 3070 het 3070 ref 39 24 12 4 AAC 2 1 246129 CASAVA_Build 11 49112431 1D GAACTAGATT G/- GGGGGGTCTT 3070 hom 92 het 38 0 32 6 G 7 6 246130 CASAVA_Build 11 49125575 1D TCTATTGTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 104 het 41 0 34 8 T 10 9 246131 CASAVA_Build 11 49129504 2I ACAAAAACTC --/AT GTGGCCACAC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AT 0 1 246132 CASAVA_Build 11 49129558 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 1578 hom 30 6 13 12 AC 8 7 246133 CASAVA_Build 11 49148195 4D AGTCCACAGG GTTT/---- CACATAATAT 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 GTTT 1 0 246134 CASAVA_Build 11 49151908 2I CTCTATTACT --/CC TCTCTTACCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 0 2 246135 CASAVA_Build 11 49154949 2I4M2I ATTTTGTTCC --TTAA--/TGTTAAAT CAATACTCCA 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 N/A 0 0 246136 CASAVA_Build 11 49156092 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2439 het 639 hom 19 3 8 9 A 13 12 246137 CASAVA_Build 11 49167595 1I GTGCCCTATG -/T TAATACAACA 3070 het 3070 ref 74 61 8 5 T 1 2 246138 CASAVA_Build 11 49168484 4I AGTTGTCACT ----/GTTA GTTAGAAAAG 3070 het 3070 ref 56 32 14 10 GTTA 1 2 246139 CASAVA_Build 11 49169864 2D CTCGCTCTGT CA/-- CCTAGGCTGG 3070 het 1369 hom 18 5 11 2 CA 1 0 246140 CASAVA_Build 11 49173804 1D GAGCAATAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 A 9 8 246141 CASAVA_Build 11 49179562 1D TGTATTTTAA T/- TTTTTTTATT 2700 het 2700 ref 16 9 6 1 T 8 7 246142 CASAVA_Build 11 49182187 4D AGAAAAAGGA AGAG/---- AGACTCAGAT 2119 het 2119 ref 41 34 5 5 AG 3 1 246143 CASAVA_Build 11 49186808 1I GAGGCGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 9 11 11 A 11 12 246144 CASAVA_Build 11 49192816 2D CTGTTTTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 TG 7 6 246145 CASAVA_Build 11 49201149 12I TCTCTCTCTG ------------/CTGTTTCTGTCT CTGTCTCTGT 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 CTGTTTCTGTCT 0 1 246146 CASAVA_Build 11 49205023 1I CTTCCTTCCT -/G TTCTTACTTG 1826 het 1826 ref 55 44 4 7 G 0 1 246147 CASAVA_Build 11 49206917 1I AGAATTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 8 9 246148 CASAVA_Build 11 49209336 1D GGGAGGGAGG A/- AAGAAGGTAG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 3 2 246149 CASAVA_Build 11 49210009 1I ATACAATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 T 11 12 246150 CASAVA_Build 11 49210891 1I CTAGCAATTT -/G GGTAAAATAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 G 2 3 246151 CASAVA_Build 11 49211286 4I TATTTGTTTA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 TTTG 3 4 246152 CASAVA_Build 11 49212552 1I GTGTTTCACC -/T TTGCCCTCAC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 2 3 246153 CASAVA_Build 11 49216232 1I AGAGGGGCTC -/A GGGGGGAAGA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 0 1 246154 CASAVA_Build 11 49217751 1I TGTTATTCAG -/C CTTCAAAGAA 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 C 1 2 246155 CASAVA_Build 11 49218126 10D TGTAAAAGTC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 het 2026 hom 25 8 16 1 AT 11 6 246156 CASAVA_Build 11 49218923 3D AATAAAAAAA AAC/--- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 AAC 1 0 246157 CASAVA_Build 11 49222550 2I TCTGAGAAAC --/TG TGTATGGGAG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 TG 1 2 246158 CASAVA_Build 11 49228102 1I ACTGTACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 11 12 246159 CASAVA_Build 11 49228354 1D TTTAAAAAAG A/- AAAAAACCTT 2746 het 2746 ref 19 10 7 2 A 7 6 246160 CASAVA_Build 11 49230814 3I TCGATGCTTC ---/TGT TGTTATAATA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 TGT 1 2 246161 CASAVA_Build 11 49244266 7D GTATACTACG TAATTAC/------- TAATTACATA 3070 het 3070 ref 22 12 10 1 TAATTAC 2 1 246162 CASAVA_Build 11 49244851 1D ACCAAATAGT G/- TGGCTCTGGT 3070 het 3070 ref 30 22 8 0 G 1 0 246163 CASAVA_Build 11 49248818 2I CAGGTAATAA --/AC ACAGTACCTG 3013 het 3013 ref 27 18 7 2 AC 1 2 246164 CASAVA_Build 11 49259052 2D TCATCTTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 24 10 12 TG 7 6 246165 CASAVA_Build 11 49259888 3I CCTTCCTCTC ---/ATT ATTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 37 25 12 0 ATT 1 2 246166 CASAVA_Build 11 49268853 1I TTCTAAGGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 9 10 246167 CASAVA_Build 11 49277643 3D ATTTTATTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 2255 het 1282 hom 13 7 6 0 T 15 12 246168 CASAVA_Build 11 49283821 1D TCTCTGTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 10 9 246169 CASAVA_Build 11 49289420 1I TTCAAGTCCA -/G GATATCCTTG 2933 het 2933 ref 16 8 6 2 G 1 2 246170 CASAVA_Build 11 49296815 2I ATAAATCCCC --/CT GTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 CT 0 1 246171 CASAVA_Build 11 49323616 2D TATTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1096 hom 27 5 7 16 T 13 11 246172 CASAVA_Build 11 49325614 2D TTAATATATC TT/-- TTTTTTTTTT 1228 het 1228 ref 21 11 4 6 T 14 12 246173 CASAVA_Build 11 49329081 4I TATTTATACC ----/TATT TATTCTTAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TATT 1 2 246174 CASAVA_Build 11 49330754 1D GCTGTCACAC T/- TTTTTTTTTT 2282 het 2282 ref 37 28 6 3 T 11 10 246175 CASAVA_Build 11 49335200 1I TGCCACCACG -/C CGGGCTAATT 904 het 904 ref 11 5 2 4 C 1 2 246176 CASAVA_Build 11 49346550 1D TCAGAAAGAC T/- AATATTTGTA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 1 0 246177 CASAVA_Build 11 49350953 2D TTGTGTGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 GT 7 6 246178 CASAVA_Build 11 49377470 1D TTTTTCATGA T/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 T 7 6 246179 CASAVA_Build 11 49387205 1I AAAAAAAAAA -/T GTCTTTTTAC 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 T 0 1 246180 CASAVA_Build 11 49390337 1I AGTGATGAAG -/T TTTGGATTCA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 3 4 246181 CASAVA_Build 11 49399699 1I TAATCATGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 A 7 8 246182 CASAVA_Build 11 49401712 1I CTTAGTTCTG -/A AAAAAGCAGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 5 6 246183 CASAVA_Build 11 49402521 3I GGCAGAGGCA ---/TTG TTGTTTTCAA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 TTG 1 2 246184 CASAVA_Build 11 49407493 1I TCAATTAGAG -/T TAACGTGTAG 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 1 2 246185 CASAVA_Build 11 49409160 1I AGTTTCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 10 11 246186 CASAVA_Build 11 49415828 1D AACAATTATG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 7 6 246187 CASAVA_Build 11 49420885 1D CATGGGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 17 15 0 A 11 10 246188 CASAVA_Build 11 49433949 5D CCTCTTCAGA TTCTT/----- TTCTTTTCTT 2243 hom 15 het 9 0 6 6 TTCTT 3 2 246189 CASAVA_Build 11 49438949 1I CGCCAGAAAG -/T TTTTTGTTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 5 6 246190 CASAVA_Build 11 49462514 1I ATTCAGATTC -/T TCTAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 1 2 246191 CASAVA_Build 11 49466480 2D CATAAATAAC TT/-- AAGATATGTG 2788 het 2788 ref 57 47 6 5 T 2 0 246192 CASAVA_Build 11 49466704 1D15M1D TGCCAAGTGA CTTTTGAAAATGATTTC/-TTTTGAAAATGATTT- CTAAACACAA 2571 het 2571 ref 52 52 6 3 N/A 0 0 246193 CASAVA_Build 11 49468487 1D TTTTGATGAC T/- TTTTTTTTTT 2919 het 2919 ref 19 7 6 6 T 12 11 246194 CASAVA_Build 11 49469611 1I TTATTAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 37 1 28 8 T 10 11 246195 CASAVA_Build 11 49471168 1D AAGCTGTCTG A/- AAAGGAAATT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 A 4 3 246196 CASAVA_Build 11 49473077 1I GAAGGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2524 hom 22 9 8 5 T 10 11 246197 CASAVA_Build 11 49475589 1D ATTTTAGATA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 T 8 7 246198 CASAVA_Build 11 49477884 1D CTGTAGAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 11 10 246199 CASAVA_Build 11 49481968 1D ACAGAAAAGG A/- AAAAAATAGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 7 6 246200 CASAVA_Build 11 49482276 1D TTAAAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 31 1 25 5 A 11 10 246201 CASAVA_Build 11 49490190 2D ATACACACAC AT/-- ATATGTATAT 2684 het 53 hom 10 2 6 2 AT 3 2 246202 CASAVA_Build 11 49490204 2I ATGTATATAT --/AC ACACATATAT 1234 het 160 hom 14 2 6 6 AC 2 3 246203 CASAVA_Build 11 49494074 2D GCACAAAATA TC/-- TCTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 TC 2 1 246204 CASAVA_Build 11 49503427 1D AAGATAAATG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2522 hom 20 8 7 5 T 9 8 246205 CASAVA_Build 11 49510266 1D ATAATTTTGC T/- TTTTCCTTTC 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 T 5 4 246206 CASAVA_Build 11 49518547 2D TGACATTCAC AT/-- GATTATCTAT 3070 het 3070 ref 33 21 10 4 AT 1 0 246207 CASAVA_Build 11 49519365 3I TGCATACGTT ---/ACC ACAATATAAA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 ACC 0 1 246208 CASAVA_Build 11 49523022 3I ACTATATAAC ---/ATT ATTTTCCTAC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 ATT 1 2 246209 CASAVA_Build 11 49532225 1D CATTTTACAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 7 6 246210 CASAVA_Build 11 49549582 1D GTATCTTTCA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 T 8 7 246211 CASAVA_Build 11 49558532 1I GTGAGCAATT -/A AAAAATGCCA 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 A 5 6 246212 CASAVA_Build 11 49562172 1I TCCTTGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 16 1 11 4 T 10 11 246213 CASAVA_Build 11 49563414 1I CTGATAAAGT -/A AACCATTTTA 3070 het 1153 hom 21 3 10 8 A 2 3 246214 CASAVA_Build 11 49563448 1I GAAAGAGTGA -/T TTTTTTTTCT 2802 het 2802 ref 24 9 6 9 T 8 9 246215 CASAVA_Build 11 49565153 1D ATTTCTAACT C/- CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 C 8 7 246216 CASAVA_Build 11 49576328 1I CATGATTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 246217 CASAVA_Build 11 49579104 12D CGCGCGCGCG CACACACACACA/------------ CACACACACA 3070 het 720 hom 25 5 15 6 CA 13 7 246218 CASAVA_Build 11 49579779 1I ATTTTTTTTT -/G TGTGTGTGTT 3070 het 268 hom 20 3 14 3 G 0 1 246219 CASAVA_Build 11 49588034 1I GTTCTAAATT -/G GGTTCTGGCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 G 2 3 246220 CASAVA_Build 11 49591816 1I GTTTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1520 het 1520 ref 18 11 6 1 A 10 11 246221 CASAVA_Build 11 49599039 1I3M9I CCATACTTGA -CTG---------/GCTGCCACCATAC GAGCAACTCC 2076 het 2076 ref 29 22 5 2 N/A 0 0 246222 CASAVA_Build 11 49607032 1D AGTTTTGTTC T/- TCTCCAAAGG 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 T 2 1 246223 CASAVA_Build 11 49608923 3D CTTACCAGGT GCC/--- AGAGAAAAAT 1933 hom 10 het 4 0 4 0 GCC 1 0 246224 CASAVA_Build 11 49616250 1D AAAAAACTCA T/- TTTTTTTTTT 2884 hom 6 het 28 1 11 16 T 13 12 246225 CASAVA_Build 11 49618419 2D AATGTGTGTC TT/-- TGACAAATTT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 3 1 246226 CASAVA_Build 11 49618766 1I GTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 11 12 246227 CASAVA_Build 11 49620513 1D TTTATCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 11 10 246228 CASAVA_Build 11 49620743 1I TATTAATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 22 1 16 5 T 13 14 246229 CASAVA_Build 11 49635980 1I TAAAACAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 31 0 17 14 A 11 12 246230 CASAVA_Build 11 49641164 9D TTTACGTGCA AAGAGTGTG/--------- AAGGCAAAGT 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 AAGAGTGTG 1 0 246231 CASAVA_Build 11 49642311 1I CCAATGGGGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 8 9 246232 CASAVA_Build 11 49652786 1I ATCTTTCTTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 246233 CASAVA_Build 11 49656910 1I AGCAAATGAC -/A AAAAAAAAAA 2847 het 467 hom 16 1 9 6 A 11 12 246234 CASAVA_Build 11 49665906 1D ATTAGGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 12 11 246235 CASAVA_Build 11 49666401 1I CAATCTCCCA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 7 8 246236 CASAVA_Build 11 49671113 1D CTGAGTAGCT C/- CCATAGATGT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 C 3 2 246237 CASAVA_Build 11 49682780 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 2820 het 145 hom 10 1 8 1 A 12 11 246238 CASAVA_Build 11 49685876 1D CTCATCAACA C/- CCCAACTGGT 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 C 4 3 246239 CASAVA_Build 11 49687040 1I TGAAACAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 A 9 10 246240 CASAVA_Build 11 49687981 1I ACCACAATTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 A 8 9 246241 CASAVA_Build 11 49689374 7D ATTTTTAAGC TTGTGGA/------- AAGATAGTTA 3070 het 3070 ref 22 14 8 2 TTGTGGA 1 0 246242 CASAVA_Build 11 49694898 1D7M3I AAGTAATAAT GTATGTCT---/-TAGTCCTAGA CACATCCTAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 N/A 0 0 246243 CASAVA_Build 11 49696618 1D ACACTTATGG T/- TCAGAGACTC 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 2 1 246244 CASAVA_Build 11 49699757 1D CATGAAGGCT G/- GAAACGACTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 G 2 1 246245 CASAVA_Build 11 49709435 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 15 1 13 1 A 11 10 246246 CASAVA_Build 11 49719863 1D CTCAAAAAAA C/- AAAACAAAAC 3070 hom 44 het 23 0 19 4 C 1 0 246247 CASAVA_Build 11 49726115 1I TTTCTAATAA -/T TTTTTTTTTT 1997 het 1997 ref 26 16 5 5 T 10 11 246248 CASAVA_Build 11 49732920 1D TTGTACTTCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 T 8 7 246249 CASAVA_Build 11 49736538 1D TTCTTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 548 hom 26 3 18 6 T 13 12 246250 CASAVA_Build 11 49736768 1D GCCAAAAAAA T/- ATTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 1 0 246251 CASAVA_Build 11 49743462 1I TATTTTACAG -/T TTTTCTATGC 1872 het 1872 ref 40 31 4 5 T 4 5 246252 CASAVA_Build 11 49744424 1D ATGTAACAAA C/- CTGCACATCC 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 C 2 1 246253 CASAVA_Build 11 49747390 1D TTTAGTAGCA G/- GCCTTTGGAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 G 2 1 246254 CASAVA_Build 11 49748107 3D TCTTGGTTTC TCT/--- TCTTCTTCTT 1286 het 1286 ref 30 22 3 5 TCT 4 3 246255 CASAVA_Build 11 49762915 2D TGTATAAATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TG 7 6 246256 CASAVA_Build 11 49764487 1I TCTTGGCCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 44 het 32 0 21 11 T 9 10 246257 CASAVA_Build 11 49765400 1D AGCTATGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 30 0 22 8 A 12 11 246258 CASAVA_Build 11 49766746 1I CTTTATTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 10 11 246259 CASAVA_Build 11 49777774 1I TTTTTTATCA -/T TGTCTTTTGC 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 T 1 2 246260 CASAVA_Build 11 49778175 4I ATTAAAGATG ----/ACTT ACTTACTCAA 2405 het 2405 ref 31 17 5 9 ACTT 1 2 246261 CASAVA_Build 11 49783109 2I ACTATCATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 1940 hom 30 9 14 7 AT 5 6 246262 CASAVA_Build 11 49783935 2I CTCAGAGTTG --/TT TTTTCTGTAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 4 6 246263 CASAVA_Build 11 49784661 3D GGATTCTCAA ACC/--- CTAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 ACC 1 0 246264 CASAVA_Build 11 49785770 1D CGTATTTCTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 9 8 246265 CASAVA_Build 11 49788179 1D ATTCAGTGCA G/- TCTCTTTACC 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 G 1 0 246266 CASAVA_Build 11 49792352 2D CCAATATCAC AG/-- GGGGTATAAA 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 AG 1 0 246267 CASAVA_Build 11 49792701 3D GTTGGGAGAG GAT/--- GATATTACTC 1498 het 1498 ref 26 10 7 10 GAT 2 1 246268 CASAVA_Build 11 49794109 1D ACAATACCCT A/- GTGGGACACT 3070 het 3070 ref 46 32 9 5 A 1 0 246269 CASAVA_Build 11 49798002 1D GGAAGTTGAC A/- ACTGGGAATG 3070 hom 70 het 26 0 21 5 A 2 1 246270 CASAVA_Build 11 49801037 1D CTCTTACCCT G/- GGGACCCAAA 3070 het 3070 ref 61 40 15 7 G 4 3 246271 CASAVA_Build 11 49802382 1D CTTTCATTTA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 29 21 8 0 T 7 6 246272 CASAVA_Build 11 49802911 4D CAAGCAAACA AGCC/---- AGCCAGCCAG 3070 hom 77 het 29 0 19 12 AGCC 4 3 246273 CASAVA_Build 11 49805457 10D58M1D GGAAGGAAAC AAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAGAGAAAAGCAAAGAAAAGAAACCTCAGTTTTTTTGAGTTTTGA/----------AAAGAAAAGAAAAGAAGAGAAAAGCAAAGAAAAGAAACCTCAGTTTTTTTGAGTTTTG- TTTTACTCCA 3070 het 3070 ref 35 35 13 9 N/A 0 0 246274 CASAVA_Build 11 49805659 1I TGATTCCGTA -/C AAAAGAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 0 1 246275 CASAVA_Build 11 49807078 2I ATGTGTATAT --/AC ACACACACAC 1875 het 581 hom 9 3 6 0 AC 8 9 246276 CASAVA_Build 11 49808212 1I TAAATATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 8 9 246277 CASAVA_Build 11 49812610 2I CATTTACCCA --/AT ATATAAGTCT 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 AT 2 3 246278 CASAVA_Build 11 49813908 1I AAAAGACTGT -/A AAAAAAAAAA 1790 het 1790 ref 27 13 6 8 A 13 14 246279 CASAVA_Build 11 49815464 2I ATATGTACTC --/AT ATATATATAT 1729 het 1729 ref 20 9 5 6 AT 5 6 246280 CASAVA_Build 11 49826570 1I TTCCTAAGTG -/A AAATAAGACA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 3 4 246281 CASAVA_Build 11 49838695 1D AGCTCTTTAC A/- GTGCCTTGAA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 1 0 246282 CASAVA_Build 11 49850827 4D ACACACACAC ACAA/---- ACAAACACAC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 ACAA 2 1 246283 CASAVA_Build 11 49857256 1I CTCATCACCA -/C CCCCAACTAG 2321 het 2321 ref 21 14 6 1 C 4 5 246284 CASAVA_Build 11 49857766 1D AAAGCCCCCC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2003 hom 22 5 10 7 T 9 8 246285 CASAVA_Build 11 49859471 1I AACCTGTTTG -/A AAATGGGTGT 3070 hom 49 het 21 0 17 4 A 3 4 246286 CASAVA_Build 11 49859553 1I ACAGAGTGGC -/T TTGGAACTGG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 2 3 246287 CASAVA_Build 11 49869215 5D CAACAATAAG AAGAA/----- AAGACCAAAC 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 AAGAA 1 0 246288 CASAVA_Build 11 49869445 1I TAAATTGAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 8 7 T 9 10 246289 CASAVA_Build 11 49876408 1D TACAGTTAAC T/- TTTTACACAA 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 5 4 246290 CASAVA_Build 11 49879684 1D GATCCTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 14 13 246291 CASAVA_Build 11 49883734 18I GTACAATTAA ------------------/CATATTATCGACCATAGT CACCCTTTTG 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 CATATTATCGACCATAGT 0 1 246292 CASAVA_Build 11 49886693 1D GTTTAACTTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 9 8 246293 CASAVA_Build 11 49892797 1I TTGACTTATG -/T TTTTTCCCTA 3070 het 2983 hom 22 9 10 3 T 5 6 246294 CASAVA_Build 11 49903060 1I CTACAGAAGA -/C TATAAGGGAA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 C 0 1 246295 CASAVA_Build 11 49904762 12D CACAGAAGAC AAAAAGCTGTAT/------------ CATTCCATGG 3070 het 3070 ref 23 15 8 3 AAAAAGCTGTAT 1 0 246296 CASAVA_Build 11 49910697 1D GTTCTCTAAA T/- TTCTTTTAGA 2121 het 2121 ref 33 19 5 10 T 3 2 246297 CASAVA_Build 11 49916662 1D TGTATACAAT A/- AAAAATAGAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 6 5 246298 CASAVA_Build 11 49917438 1I AAAAGAGGAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 7 8 246299 CASAVA_Build 11 49931586 1D ATTAACCACT G/- TGATCCATAG 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 G 1 0 246300 CASAVA_Build 11 49935531 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAT 2278 het 2278 ref 15 9 5 1 A 9 10 246301 CASAVA_Build 11 49940324 1D TGAAATGTCA C/- CCCCAATGTT 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 C 5 4 246302 CASAVA_Build 11 49943617 5D GTATATACCT AAAAG/----- ATTATAAATC 3070 het 3070 hom 17 8 9 1 AAAAG 1 0 246303 CASAVA_Build 11 49947965 4D CATAGATGAC ACAA/---- ACAAACAAAC 1280 het 1280 ref 48 44 3 4 ACAA 4 3 246304 CASAVA_Build 11 49952879 1I TACCCATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 10 11 246305 CASAVA_Build 11 49956406 4D AATTTTTGTT AGTC/---- AGTATTACTT 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 AGTC 1 0 246306 CASAVA_Build 11 49956485 1I ACATAGTTGA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 6 7 246307 CASAVA_Build 11 49958199 1D GCTTTACAAT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 8 7 246308 CASAVA_Build 11 49962984 1D AGTGTCAATT A/- AAAAAAAACA 2146 het 2146 ref 16 10 5 2 A 9 8 246309 CASAVA_Build 11 49969539 1D ATTCCTCAGC T/- TTTGTATTTA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 T 4 3 246310 CASAVA_Build 11 49970821 1D AGACCATCAA G/- GTGGTACCTC 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 G 2 1 246311 CASAVA_Build 11 49972366 4D GGAGTTCTTA TTAG/---- TTGTTTTTTT 595 het 384 hom 23 3 5 16 TTAG 1 0 246312 CASAVA_Build 11 49976067 1I AGGCAAAAAA -/G GGAGGTTTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 2 3 246313 CASAVA_Build 11 49979396 1D GCTCAATTTT C/- CCCTTTTCTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 4 3 246314 CASAVA_Build 11 49982103 18I TCTACTGTCT ------------------/ACATGAGACTCACCTAAC ACATAAGAAC 3070 hom 84 het 34 0 27 7 ACATGAGACTCACCTAAC 0 1 246315 CASAVA_Build 11 49991142 1D CCCCCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1923 het 1923 ref 35 17 7 11 A 15 14 246316 CASAVA_Build 11 49995270 1D ATTGATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 11 10 246317 CASAVA_Build 11 49998087 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2909 het 2457 hom 17 7 7 3 T 11 10 246318 CASAVA_Build 11 50003597 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 26 9 7 10 A 17 16 246319 CASAVA_Build 11 50012344 1D TACCTGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 21 0 19 2 T 14 13 246320 CASAVA_Build 11 50018847 1I CATTTAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 10 11 246321 CASAVA_Build 11 50019897 1I TGTTTCAATT -/A AAAAAAAAGG 2482 het 2482 ref 37 25 7 5 A 8 9 246322 CASAVA_Build 11 50021279 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 8 9 246323 CASAVA_Build 11 50025683 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 796 hom 25 3 12 10 A 19 18 246324 CASAVA_Build 11 50028309 1D GATATTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 A 12 11 246325 CASAVA_Build 11 50055019 1I TTACAATGGC -/T TTAAAAAAAA 1351 het 1351 ref 43 37 3 3 T 2 3 246326 CASAVA_Build 11 50056871 1D AGGCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 11 10 246327 CASAVA_Build 11 50060391 1I ATTCCAGGCC -/A GGGGGAGAGA 3070 het 2964 hom 34 9 15 10 A 0 1 246328 CASAVA_Build 11 50060575 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCCCCCA 1940 hom 15 het 7 0 5 2 C 9 10 246329 CASAVA_Build 11 50073303 1D ATAATAATAA T/- AAAAAAAGAA 3070 het 33 hom 17 1 16 2 T 1 0 246330 CASAVA_Build 11 50073834 2D TTAGAGGATC AA/-- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 A 9 7 246331 CASAVA_Build 11 50074876 3I GTTTTATAAA ---/GAG GAGATCCCCT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 GAG 1 2 246332 CASAVA_Build 11 50087267 5D ACATAAAAGA TATAT/----- TAAGTAGTTA 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 TATAT 1 0 246333 CASAVA_Build 11 50090346 1D TCATCGTAGT A/- GTACAGAGTC 3070 het 3070 hom 57 20 32 6 A 1 0 246334 CASAVA_Build 11 50097014 1D ATTAGGTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 21 7 T 13 12 246335 CASAVA_Build 11 50102566 4I GCACATGTGT ----/GCAC GCATGCATGC 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 GCAC 0 1 246336 CASAVA_Build 11 50102757 3I TACCATTTCT ---/TTA TTTTTATACT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TTA 0 1 246337 CASAVA_Build 11 50104457 1I ATCAAGGGCT -/G GGGGGGCTAG 2173 het 2173 ref 18 7 6 5 G 6 7 246338 CASAVA_Build 11 50109485 1I GGCATTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1089 hom 28 4 16 8 T 10 11 246339 CASAVA_Build 11 50115044 1D GCTGTCAAAC A/- AGGACATTTA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 2 1 246340 CASAVA_Build 11 50115933 2D CTGTCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 653 hom 33 4 11 19 A 13 11 246341 CASAVA_Build 11 50125863 4I TATCTATTTA ----/TCTG TCTATCTATC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TCTG 0 1 246342 CASAVA_Build 11 50126052 1D4M3D TCTATCTATC TATCTATC/-ATCT--- ATCTATCATC 3070 het 337 hom 30 2 21 10 N/A 0 0 246343 CASAVA_Build 11 50130472 1D GCAGGACAGA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 78 het 36 0 26 11 C 9 8 246344 CASAVA_Build 11 50141155 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 26 1 22 3 AG 1 0 246345 CASAVA_Build 11 50143951 1D TGCAAATGTC A/- AATATCAGGT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 3 2 246346 CASAVA_Build 11 50148937 1D ATTTCTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 9 246347 CASAVA_Build 11 50151306 1D TGGTGGTAGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 76 het 38 0 24 14 G 11 10 246348 CASAVA_Build 11 50151773 1I AGTTACACTA -/T TAATGTAATA 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 T 1 2 246349 CASAVA_Build 11 50160221 1D TCTACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 A 10 9 246350 CASAVA_Build 11 50160623 1D ATATTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 13 12 246351 CASAVA_Build 11 50175208 1D ATGAATCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 T 10 9 246352 CASAVA_Build 11 50178105 1D TTCCAAAGTT G/- GGGAATATCA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 G 4 3 246353 CASAVA_Build 11 50178800 2D CGTTCTATCA TT/-- TGAGTGTGTC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 3 1 246354 CASAVA_Build 11 50184752 3D AGAAGCGAGA ATC/--- ATCTGTTAGT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 ATC 2 1 246355 CASAVA_Build 11 50185566 1D AGACTCCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 12 11 246356 CASAVA_Build 11 50186995 1I AGTTGATCCA -/C CCGCCTCTGT 3070 hom 43 het 19 0 14 5 C 2 3 246357 CASAVA_Build 11 50189461 1D CCTTTTCCTG T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 8 7 246358 CASAVA_Build 11 50190004 1I CATGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 2551 het 1464 hom 9 3 6 0 C 4 5 246359 CASAVA_Build 11 50196124 1D CTTATTCAAA C/- ACGGGAGCCT 3070 het 3070 ref 20 8 9 3 C 1 0 246360 CASAVA_Build 11 50205911 5D CATGACTAAT TTAAA/----- TTGTCACTGC 3070 het 3070 ref 24 13 11 1 TTAAA 1 0 246361 CASAVA_Build 11 50206496 3I CAGCATAATA ---/AAC AACTACAGGG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AAC 1 2 246362 CASAVA_Build 11 50209978 3D ATAATGAGAA TTC/--- TTCTATCTAG 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 TTC 2 1 246363 CASAVA_Build 11 50215587 4D GACACGTAGT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 TTTC 5 4 246364 CASAVA_Build 11 50218794 1D GTGATGGTGA T/- TTATTAGATT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 3 2 246365 CASAVA_Build 11 50225945 2I GCAGAGTTTT --/TA TATATATATA 3070 het 474 hom 14 1 10 3 TA 8 9 246366 CASAVA_Build 11 50233551 1I AATATCACAG -/C CTAACAGAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 2 246367 CASAVA_Build 11 50246655 1I CAGGAAGAAG -/A GGGAAAAACA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 0 1 246368 CASAVA_Build 11 50254849 2I CACATGCAAC --/AT GTGTCACTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AT 0 1 246369 CASAVA_Build 11 50281804 1D GACCTATGGG A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 8 7 246370 CASAVA_Build 11 50285196 2I TTCATCTCAC --/AG AGTTGAACAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AG 1 2 246371 CASAVA_Build 11 50307608 1I ATTCAGCAGG -/C TTGGAAGCAC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 C 0 1 246372 CASAVA_Build 11 50312148 1D ATTTCCCCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 10 9 246373 CASAVA_Build 11 50312682 1D AACTAGAAAG A/- AATTATTTGA 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 A 3 2 246374 CASAVA_Build 11 50322426 2I GAATGGACAC --/TT GGGAGCACAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 0 2 246375 CASAVA_Build 11 50322910 1D TTGGAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 14 2 10 2 T 12 11 246376 CASAVA_Build 11 50327776 10D CCAGTCTTGT CTGGCCCAGC/---------- CTGGTCTTGT 1530 het 1530 ref 29 18 8 8 CTGGCCCAGC 1 0 246377 CASAVA_Build 11 50342205 2I TTTGGAAACA --/CT GTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 CT 0 1 246378 CASAVA_Build 11 50352078 1D ATCCCAGGAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 9 8 246379 CASAVA_Build 11 50357570 1I GGGGCTGATG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 7 8 246380 CASAVA_Build 11 50368815 1D AGGAAATATC T/- TCAGATAAAA 1866 het 1866 ref 15 10 4 1 T 2 1 246381 CASAVA_Build 11 50372341 1D AGAGTTAAAA C/- TTTTTTGGGA 3070 het 3070 hom 25 11 14 0 C 1 0 246382 CASAVA_Build 11 50379816 8D CATTGAAACC AAAAGTGA/-------- AAAAGTGAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 AAAAGTGA 2 1 246383 CASAVA_Build 11 50385825 1I TCTAGTTTTT -/A ATCCTGAGAT 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 A 1 2 246384 CASAVA_Build 11 50397672 4D ACTGAACATA TTTC/---- TTTTTTCATC 3070 het 3070 ref 24 13 11 1 TTTC 1 0 246385 CASAVA_Build 11 50403559 1D TGCAGATCCT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 9 8 246386 CASAVA_Build 11 50405362 3D GTATTTAGTG AGA/--- AGATTTCCAA 3046 het 3046 ref 22 14 8 0 AGA 2 1 246387 CASAVA_Build 11 50408733 4I TAGCTAAAAA ----/GTAG GTAGGGTATA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 GTAG 1 2 246388 CASAVA_Build 11 50409071 4I ACACAAAGGT ----/TATA ATACTGTTTT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 TA 0 2 246389 CASAVA_Build 11 50414931 1D TGACCATCAG A/- AAAAATGCAA 2497 het 2497 ref 31 23 6 2 A 6 5 246390 CASAVA_Build 11 50417774 1D TGCTGAATCC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 9 8 246391 CASAVA_Build 11 50421241 4D GCAGTTACTC AGAT/---- AGATAGCTTC 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 AGAT 2 1 246392 CASAVA_Build 11 50424734 1D TCCAGATCAA C/- GGTCACCAGA 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 C 1 0 246393 CASAVA_Build 11 50438217 9I GGAAACTTGG ---------/GAGGTCTTT GAGGCCAAGG 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 GAGGTCTTT 0 1 246394 CASAVA_Build 11 50441887 1D GGCCGAAGGC A/- AAAAAGCAAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 6 5 246395 CASAVA_Build 11 50444087 1D AAGCCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 11 10 246396 CASAVA_Build 11 50447995 2D AGTTTCTCAG AA/-- AAAGCTATTT 3070 het 3070 ref 36 24 10 4 A 5 3 246397 CASAVA_Build 11 50453983 2I GGATAAAAAC --/TG TTGTTCCAAA 3070 het 2703 hom 30 6 19 5 TG 0 1 246398 CASAVA_Build 11 50464804 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 1969 het 1969 ref 17 8 5 4 A 9 10 246399 CASAVA_Build 11 50472383 1D TTATTTCTAG T/- TTTTAACTGA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 5 4 246400 CASAVA_Build 11 50476067 1I AATTTTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 9 9 5 T 10 11 246401 CASAVA_Build 11 50482760 13D CTTCTAGGTT TTTTCTGAATAGA/------------- TTTCCTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 19 5 TTTTCTGAATAGA 1 0 246402 CASAVA_Build 11 50484941 1I TTCCTTATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 9 10 246403 CASAVA_Build 11 50492342 1I CCTGCTGAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 49 23 16 10 A 9 10 246404 CASAVA_Build 11 50499498 1I CAAAACTCTG -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 7 8 246405 CASAVA_Build 11 50513608 12D GTTTGGAAGC ATCGTTTTTCCA/------------ ATTCTGCGAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 ATCGTTTTTCCA 1 0 246406 CASAVA_Build 11 50514995 25I GATATTTGAT -------------------------/AGTTCATAGCAGCAATAGGCAAAAA AGCAAATATT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 AGTTCATAGCAGCAATAGGCAAAAA 0 1 246407 CASAVA_Build 11 50519975 1D GGAAATACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 10 9 246408 CASAVA_Build 11 50525413 1I TCTAGTTTTT -/A ATCTGAAGTT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 A 1 2 246409 CASAVA_Build 11 50536938 1I CTAGTTTCTA -/T CTGAAGATAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 0 1 246410 CASAVA_Build 11 50537631 1I ATCTAAAATA -/T TTTTTTCACC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 6 7 246411 CASAVA_Build 11 50537946 1I CTCCAAAAGC -/T TTTTTCTACT 2884 het 2884 ref 25 13 8 4 T 5 6 246412 CASAVA_Build 11 50557227 1I GCTGAAGGTG -/A AAAAAACGAA 3070 hom 55 het 24 0 19 5 A 6 7 246413 CASAVA_Build 11 50563029 1I GAAAAAAAAA -/T CTTCAAAAAA 1620 het 476 hom 21 4 10 7 T 0 1 246414 CASAVA_Build 11 50565817 3D ACCTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 ATA 4 3 246415 CASAVA_Build 11 50572240 1I TAAACTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 8 9 246416 CASAVA_Build 11 50572630 1D AGAGTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2629 hom 37 11 9 17 T 15 14 246417 CASAVA_Build 11 50576698 1D AAAAACAGTG T/- TTCCAAACTG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 3 2 246418 CASAVA_Build 11 50577088 1D TTGAATGAAC A/- CATCGCAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 A 1 0 246419 CASAVA_Build 11 50577627 3I TCTGAGAAAA ---/CTT CTTCTTTCCA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 CTT 2 3 246420 CASAVA_Build 11 50587615 1I AGATATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 10 11 246421 CASAVA_Build 11 50593170 1I TAGAATCCAC -/A AAAGGGATAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 3 4 246422 CASAVA_Build 11 50595185 1D TGAACCATTG T/- TTTGATTGAG 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 4 3 246423 CASAVA_Build 11 50601724 2D TTTTGAAACA CT/-- CTTTTTGTAG 3004 het 3004 ref 28 16 8 4 CT 2 1 246424 CASAVA_Build 11 50609036 1D TGAACCTTTC T/- CTTGATTGAG 2737 het 2737 ref 23 13 7 3 T 1 0 246425 CASAVA_Build 11 50612875 1D AGAATATACA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 8 7 246426 CASAVA_Build 11 50615095 1D GGGGTAAGGA T/- GCCCTATTTA 2816 het 2816 ref 16 8 7 1 T 1 0 246427 CASAVA_Build 11 50627516 2D CTGCTCAATC AA/-- AAGAGAGGTT 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 A 4 2 246428 CASAVA_Build 11 50638762 3D ATTTTGTTTA TTG/--- TTGTGAAGAT 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 TTG 2 1 246429 CASAVA_Build 11 50644739 7D GAGATGAATG CACACAT/------- CACAAAGAAG 2009 het 2009 ref 24 15 6 4 CACACAT 1 0 246430 CASAVA_Build 11 50652810 1I TATCTTTACA -/T TAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 1 2 246431 CASAVA_Build 11 50665871 1D ATCAAAGTCA T/- TTTTTTGTCC 1637 het 1637 ref 11 5 5 1 T 7 6 246432 CASAVA_Build 11 50674528 2D TACTTCTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 9 13 T 13 11 246433 CASAVA_Build 11 50680529 20D CAAAGGTCTC CAAATATCCACTTGCAGATT/-------------------- CTAGAAAAAG 3070 het 3070 ref 84 95 12 37 CAAATATCCACTTGCAGATT 1 0 246434 CASAVA_Build 11 50689720 10D TCTACCACAG GCTGAAACAT/---------- GCTGCAACAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 GCTGAAACAT 1 0 246435 CASAVA_Build 11 50691986 1D CTTGCAGATT C/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 C 1 0 246436 CASAVA_Build 11 50695007 1D TCTTTTAAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 T 9 8 246437 CASAVA_Build 11 50699256 15I GTGTGAAGAT ---------------/ATTTCATTTTCCAAA ATAGGCCTCA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 ATTTCATTTTCCAAA 0 1 246438 CASAVA_Build 11 50716906 1I TTCAACTCAC -/A CAGTTGAACC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 0 1 246439 CASAVA_Build 11 50718931 1D ATTCTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 13 12 246440 CASAVA_Build 11 50719519 1I TTTGAAACAC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 7 8 246441 CASAVA_Build 11 50737129 4D CATAAAAAAT AGAC/---- AGAAGCATTC 3070 het 3070 ref 41 25 12 7 AGAC 1 0 246442 CASAVA_Build 11 50740159 1D AACTTTGCAG C/- CCTATGGTGA 3070 hom 56 het 25 0 19 6 C 3 2 246443 CASAVA_Build 11 50740236 1D GATGGCTACA T/- TTCAACTCAC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 3 2 246444 CASAVA_Build 11 50948781 1I GAAAAAAAAA -/T ATTTTCAGAT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 0 1 246445 CASAVA_Build 11 50949545 1D TAATCCTTTC T/- TTTCATTCTG 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 4 3 246446 CASAVA_Build 11 50959952 2D CAAAGTGGTT TC/-- TGAGATAACT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TC 1 0 246447 CASAVA_Build 11 50978876 1I58M1D TACCTGAAGG -TATTTTTTTCACCATAGACCACAATGTGCTCCCAGATATCCATTCACAGATTATACGTA/TTTTTTTTTTCACAGTAGACCACAATGCGCTCCCAGATATCCATTCACAGATTATATGT- AACAGTGATT 1390 het 1390 ref 19 24 3 3 N/A 0 0 246448 CASAVA_Build 11 51016640 1D GAATCCAAAC A/- AAGGTTTAAT 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 A 3 2 246449 CASAVA_Build 11 51052483 1I AATATTCCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 9 10 246450 CASAVA_Build 11 51064095 1I GACTTACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 13 14 246451 CASAVA_Build 11 51067947 2I ATGGTGAAAA --/AG GCAATATTTT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 AG 0 1 246452 CASAVA_Build 11 51073923 8D AGCTCATTGT GGCCATCA/-------- GGCCATCAGA 3070 hom 68 het 29 0 23 9 GGCCATCA 2 1 246453 CASAVA_Build 11 51074829 1D TGGGATAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 T 10 9 246454 CASAVA_Build 11 51075401 2I TTCTACCAAA --/AT AGTGTTTCCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AT 0 1 246455 CASAVA_Build 11 51076149 1D TACACATCAC A/- AAGTGGTTTC 3070 het 3070 ref 59 26 21 12 A 3 2 246456 CASAVA_Build 11 51076461 1I GAATAAAAAA -/G GTTTAATTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 1 2 246457 CASAVA_Build 11 51076543 1I GGATATTGCC -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 7 8 246458 CASAVA_Build 11 51076846 1D GCAGTTTCTC A/- AAGAGCTTCT 3070 het 3070 ref 28 18 7 4 A 3 2 246459 CASAVA_Build 11 51079400 1I TGTTTCTCAG -/A AAGCTCCTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 3 246460 CASAVA_Build 11 51082845 1D AGATACTCGC T/- TTTTTTGCCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 6 246461 CASAVA_Build 11 51084956 9I AAAGTAGTTT ---------/CTCAGAGAG CTACTTTCTA 3070 hom 90 het 32 0 30 3 CTCAGAGAG 0 1 246462 CASAVA_Build 11 51091110 1I CTTTCTTCTG -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 7 8 246463 CASAVA_Build 11 51094199 1I TGCATTCATC -/A TCCCAGGGTT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 0 1 246464 CASAVA_Build 11 51098421 1I TGAAAAAAAA -/T ATCTTCGGAT 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 T 0 1 246465 CASAVA_Build 11 51112281 1I AGAAGCTTTC -/T GAGAAAGCAC 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 0 1 246466 CASAVA_Build 11 51117965 1I GGCTGAATCC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 A 7 8 246467 CASAVA_Build 11 51135671 1I CAAGCCCTGC -/T TTTTTTTTTG 1982 het 1982 ref 19 8 5 6 T 9 10 246468 CASAVA_Build 11 51138421 8D CACAATAAGC TCACCAAG/-------- GTCCATTCAG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 TCACCAAG 1 0 246469 CASAVA_Build 11 51141191 1I GTCTTTTTTT -/G TTGGTAAGCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 246470 CASAVA_Build 11 51142378 1D AACCCCTGCC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 8 7 246471 CASAVA_Build 11 51148088 1D TCAATGAGCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 18 9 6 A 9 8 246472 CASAVA_Build 11 51161040 1D4M6D AGAAAGAAGC TTTCTGAAAAA/-TGCT------ CTGCTATGTT 3070 het 3070 ref 40 24 17 2 N/A 0 0 246473 CASAVA_Build 11 51179251 5D CTGATATAAA CTTTT/----- CTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 47 21 21 7 CTTTT 2 1 246474 CASAVA_Build 11 51184922 1D TGGAATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 10 10 11 T 12 11 246475 CASAVA_Build 11 51190856 4D AGAATATACA TTGT/---- TTGAGCACAA 1711 het 1574 hom 9 4 5 1 TTGT 1 0 246476 CASAVA_Build 11 51221086 1I TGGATATTCA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 7 8 246477 CASAVA_Build 11 51234329 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 225 hom 16 2 7 7 A 9 10 246478 CASAVA_Build 11 51257524 2D ATGCACAAAC AT/-- ATGTTTAATT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 AT 2 1 246479 CASAVA_Build 11 51258268 1D CTGTCAGCAA G/- GGGAGATCAA 3070 hom 48 het 18 0 17 2 G 4 3 246480 CASAVA_Build 11 51265763 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAAACTA 2647 het 2647 ref 21 13 6 2 A 7 8 246481 CASAVA_Build 11 51281671 1I TACTAAAATT -/A AAAAAAAAGA 1760 het 1760 ref 17 10 4 3 A 8 9 246482 CASAVA_Build 11 51293832 1D ATATGCCATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 10 9 246483 CASAVA_Build 11 51295346 1I ATCCTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 A 11 12 246484 CASAVA_Build 11 51322013 1D ATGGAGTCCT G/- GAACTGGATT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 G 2 1 246485 CASAVA_Build 11 51322616 1D TAACCAGAGG T/- TTTTTTTAAA 2577 het 2577 ref 23 12 6 5 T 8 7 246486 CASAVA_Build 11 51327787 1I ATTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 10 11 246487 CASAVA_Build 11 51329629 1I AAAAACAAAA -/T ATATATATAT 2458 het 1760 hom 14 4 6 4 T 0 1 246488 CASAVA_Build 11 51330884 2D ATTGTATAGA CT/-- CTGACAGGAG 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 CT 2 1 246489 CASAVA_Build 11 51335544 1I AATAAACCCA -/C ATATCTATTA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 C 0 1 246490 CASAVA_Build 11 51338502 1D AACTAACACA C/- TTAACTATTG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 C 1 0 246491 CASAVA_Build 11 51340428 1D ATCACTTTAC G/- TGTGATCTCA 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 G 1 0 246492 CASAVA_Build 11 51345152 1D AAATATAAGG A/- AAAAAAACAA 2996 het 2996 ref 23 14 7 2 A 8 7 246493 CASAVA_Build 11 51359078 2D AGTATAATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 24 het 13 0 9 5 AT 9 8 246494 CASAVA_Build 11 51373134 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 A 10 11 246495 CASAVA_Build 11 51374110 1D ATTTAGAGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 10 9 246496 CASAVA_Build 11 51385619 1D AGACTTCAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 T 8 7 246497 CASAVA_Build 11 51394823 2D TATGTAAAAC TA/-- TATATATATA 3070 het 1693 hom 17 5 9 3 TA 7 6 246498 CASAVA_Build 11 51394913 1D GAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2588 hom 21 10 10 1 A 12 11 246499 CASAVA_Build 11 51395907 1D ACATTGACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2811 hom 28 9 13 6 T 10 9 246500 CASAVA_Build 11 51424432 2D TTCTAGAAAA AG/-- AGTGTTTAAA 3070 het 3070 ref 56 40 12 5 AG 2 1 246501 CASAVA_Build 11 51424645 2I TCTTCAACTC --/TG TGAGTTGAAT 2385 het 2385 ref 86 63 11 12 TG 1 2 246502 CASAVA_Build 11 51426899 1I TCTGAGAATG -/C TTCTGTTTAG 3070 het 3070 ref 89 74 9 6 C 0 1 246503 CASAVA_Build 11 51427155 2D TTCTACAAAA AG/-- AGAGAGTTTC 3070 het 3070 ref 72 43 24 6 AG 4 3 246504 CASAVA_Build 11 51427342 3I TGTTTCAAGA ---/CTT CTGCTCTATA 3070 het 3070 ref 64 43 16 5 CTT 0 1 246505 CASAVA_Build 11 51427681 1D TTTGGAAACT G/- CTCCAACAAA 836 het 836 ref 34 28 2 6 G 1 0 246506 CASAVA_Build 11 51428886 1I TCCATCAAAA -/C GAATGTTCAG 3070 het 3070 hom 92 21 25 46 C 0 1 246507 CASAVA_Build 11 51429138 1D ATGTGAAGAT A/- TTTCCTTTTC 3070 het 3070 ref 75 40 25 11 A 1 0 246508 CASAVA_Build 11 51431228 1I TTTCAAAACT -/G CTCTGTCAAA 3070 het 3070 ref 62 33 13 16 G 0 1 246509 CASAVA_Build 11 51431902 1I ATAGTGTTTC -/A AAACTGCTCT 3070 het 3070 ref 62 34 18 11 A 3 4 246510 CASAVA_Build 11 51432429 1I6M1D GCTCTATCAA -AGGAAAT/GAGGAAA- GTTCAACTTT 2099 het 2099 ref 52 39 9 5 N/A 0 0 246511 CASAVA_Build 11 51433187 1D ATATGAAGAT A/- TTTGCTTTTC 3070 het 3070 ref 80 38 15 27 A 1 0 246512 CASAVA_Build 11 51433757 1I CAGATTCTAC -/A AAAAACAGTG 3070 het 3070 ref 59 37 15 7 A 5 6 246513 CASAVA_Build 11 51433936 4D ACAAAAAGAG TGTT/---- TGTTTGAAAC 3070 het 3070 ref 53 25 22 12 TGTT 2 1 246514 CASAVA_Build 11 51434979 1D CTGCTTTACC A/- AAATAAAGGT 3070 het 3070 ref 67 52 8 9 A 4 3 246515 CASAVA_Build 11 51437714 2I CGAATGTTCA --/GC ACTCTGAGTT 3070 het 3070 ref 95 43 33 19 GC 0 1 246516 CASAVA_Build 11 51441914 1I CCAAATCTCC -/A ACTTGCAGAT 1752 het 1752 ref 38 31 4 3 A 1 2 246517 CASAVA_Build 11 51448263 1D GCATTTCAAA G/- GTGCTGTATC 1925 het 1925 ref 89 66 5 24 G 2 1 246518 CASAVA_Build 11 54520175 1D ATATCCCAGG A/- AAAAAAAAAC 2169 het 2169 ref 18 9 5 5 A 10 9 246519 CASAVA_Build 11 54533527 7I AATGCACTCC -------/CAGATAT CAGATATCAC 3070 hom 27 het 13 0 10 3 CAGATAT 1 2 246520 CASAVA_Build 11 54551579 1I CCTTTGTGTG -/A TGAATGCACA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 1 246521 CASAVA_Build 11 54552412 1D ACAAAAAAAA C/- GTTTACCTCT 3070 het 3070 ref 43 29 12 2 C 1 0 246522 CASAVA_Build 11 54555129 1D CAAATTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3014 het 3014 ref 28 14 8 6 A 11 10 246523 CASAVA_Build 11 54565872 1D AGTGCTGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 31 2 21 8 A 14 13 246524 CASAVA_Build 11 54573773 1D ATCCTTCTGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 13 hom 33 2 24 9 T 9 8 246525 CASAVA_Build 11 54574196 2D GGACAAAAAC AG/-- TGGATGCAAA 3070 het 3070 ref 25 17 8 0 AG 1 0 246526 CASAVA_Build 11 54574867 1D CTGCTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 A 13 12 246527 CASAVA_Build 11 54579236 1I TCTAAGATAG -/T TTTTTTCTAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 6 7 246528 CASAVA_Build 11 54580196 1D CAGTGTTTCC A/- AACTGCTGAA 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 A 3 2 246529 CASAVA_Build 11 54602140 1I ATATTACCTA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 T 6 7 246530 CASAVA_Build 11 54609668 1I AAGTTAAAAA -/C TTTGAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 C 0 1 246531 CASAVA_Build 11 54628695 1D TGAATATCCC A/- GGATAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 A 1 0 246532 CASAVA_Build 11 54633192 2I TTGTCGACAC --/AT ATATTCTCCC 3070 het 2965 hom 23 9 10 4 AT 2 3 246533 CASAVA_Build 11 54649080 2I AGCTTGGAAA --/CT CTATTTTTGT 3070 het 3070 ref 57 36 16 6 CT 1 2 246534 CASAVA_Build 11 54676623 1I TGCACACATC -/A CAAAGAAGTT 3070 het 3070 ref 34 18 16 0 A 0 1 246535 CASAVA_Build 11 54691034 2I GCAAAAAGAC --/TG TTTTTTGTAG 3070 hom 69 het 32 0 24 8 TG 0 1 246536 CASAVA_Build 11 54696761 4D TTTTCCTTCT AACA/---- AACAGGGTCC 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 AACA 2 1 246537 CASAVA_Build 11 54700172 1I AATCAAAAGC -/A ATGCTCAACT 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 A 1 2 246538 CASAVA_Build 11 54707001 2I AAAATATCAC --/TT TGCAGATCTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 1 3 246539 CASAVA_Build 11 54709198 1I TTTTTCAGCA -/C TGGCCTCAAA 1737 het 1737 ref 46 36 7 3 C 0 1 246540 CASAVA_Build 11 54713711 1D TGTTTCCAAA C/- GGCTCAATCA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 C 1 0 246541 CASAVA_Build 11 54720166 1I CAGAATCTGC -/A AAGGGACATT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 2 3 246542 CASAVA_Build 11 54722287 1I GCAGATTCTA -/C AAAAGACTGT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 C 0 1 246543 CASAVA_Build 11 54722392 1I TAGTTTTTTT -/A TTTTTTATTT 1948 het 1170 hom 14 4 4 6 A 0 1 246544 CASAVA_Build 11 54726514 1I AAATATCCCT -/G TTGCAGATTC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 G 0 1 246545 CASAVA_Build 11 54731210 1D ACGTCTTTCC T/- TTTTCACCTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 5 4 246546 CASAVA_Build 11 54733574 1D CTAATTAAAC T/- TAAAGAGCTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 2 1 246547 CASAVA_Build 11 54737812 1I TCTAGTTTTT -/A ATGGGAAGAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 1 2 246548 CASAVA_Build 11 54741404 1D TAGAAAAAGA C/- CGTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 C 2 1 246549 CASAVA_Build 11 54741636 1I TGCACACATC -/A AAAAGAAGTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 4 5 246550 CASAVA_Build 11 54744834 2D TCAGGAAATT TC/-- TGTCTAGTTT 3070 het 3070 ref 35 24 11 0 TC 1 0 246551 CASAVA_Build 11 54757340 2I TACATACTAT --/AA AAAGAGTATT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 3 5 246552 CASAVA_Build 11 54774066 1I TAGATTCTAC -/A AAAAAGAGTG 3070 het 3070 hom 49 17 15 17 A 5 6 246553 CASAVA_Build 11 54777742 1D AATGCTTCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 T 10 9 246554 CASAVA_Build 11 54785554 1D GGTAGAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 10 9 246555 CASAVA_Build 11 54786874 2I ATAAATATAT --/AA GATATAATTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 0 2 246556 CASAVA_Build 11 54795594 1D ATTAATTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 T 10 9 246557 CASAVA_Build 11 54801003 1D ACAATACCCT A/- GTGGGACATT 3070 het 3070 ref 52 34 16 3 A 1 0 246558 CASAVA_Build 11 54807306 1D CTTCTAAAAC A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 20 11 8 2 A 7 6 246559 CASAVA_Build 11 54856616 1I GGAGCAAGTT -/G TTCACTTTCC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 G 0 1 246560 CASAVA_Build 11 54866545 1D AAAACTGTTT A/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 1 0 246561 CASAVA_Build 11 54869185 4D AAATAAATAG ATAA/---- ATAAATAAAT 1748 het 1089 hom 9 3 5 1 ATAA 5 4 246562 CASAVA_Build 11 54869912 4D GCTGTATATT AGTC/---- AGAGGATATA 3070 het 3070 hom 53 24 23 7 AGTC 1 0 246563 CASAVA_Build 11 54872486 2D CCATTCATAT AA/-- GACATCTCTT 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 A 2 0 246564 CASAVA_Build 11 54876099 3I AAGATTACTT ---/AAC AATTCATAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AAC 0 1 246565 CASAVA_Build 11 54877204 1I TTAATCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 42 2 33 7 A 10 11 246566 CASAVA_Build 11 54882671 1I AATTGAAATG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 7 8 246567 CASAVA_Build 11 54888476 1I TAGTTCTTTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 8 9 246568 CASAVA_Build 11 54909964 1D GATTTTCCTG T/- TGAAATCAAG 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 T 2 1 246569 CASAVA_Build 11 54910028 1I GTAAGGTGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 9 10 246570 CASAVA_Build 11 54911711 1D AAGAATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 34 1 27 7 A 12 11 246571 CASAVA_Build 11 54926303 1D AAACCATATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 T 10 9 246572 CASAVA_Build 11 54933658 1D ATAATTTCCA T/- TTTTTGCATT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 6 5 246573 CASAVA_Build 11 54938918 1I CCTGAGGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 19 6 T 10 11 246574 CASAVA_Build 11 54943417 1D TGAGTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 17 12 T 12 11 246575 CASAVA_Build 11 54950511 1I TAAAGTACTT -/A ACAGTTGTTT 3070 het 3070 hom 40 20 17 3 A 1 2 246576 CASAVA_Build 11 54953056 18I CCCACTGACT ------------------/ACCATTTTTCATGTAAGA ATCATGAGCT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 ACCATTTTTCATGTAAGA 0 1 246577 CASAVA_Build 11 54954087 1I AATTGAGACC -/A AAAAAAGAGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 6 7 246578 CASAVA_Build 11 54956872 1D AAGCAAAACC A/- GTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 6 A 1 0 246579 CASAVA_Build 11 55000463 1I TCTATGTTTC -/T TTTTTTTTTA 2940 hom 24 het 12 0 9 3 T 9 10 246580 CASAVA_Build 11 55004527 4D AAGGCTTTTC TTTG/---- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 21 15 8 TTTG 2 1 246581 CASAVA_Build 11 55004964 49D AGATTCAGTT GCAAGAGACATAGTTTGTCATGGAACCTTTCTCTTCTCGCTCTCCTCAA/------------------------------------------------- GTAAGAGAAT 1739 het 1739 ref 15 12 4 3 GCAAGAGACATAGTTTGTCATGGAACCTTTCTCTTCTCGCTCTCCTCAA 1 0 246582 CASAVA_Build 11 55017093 1D GGGTGGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 30 8 A 12 11 246583 CASAVA_Build 11 55023733 1D CAAAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 12 11 246584 CASAVA_Build 11 55024709 1I10M1I AAAAAACCAA -TTCCCCTGAG-/CTTCTGTTGAGA AAGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 49 43 7 1 N/A 0 0 246585 CASAVA_Build 11 55024844 5I CTGCAAGGTC -----/ACTAG ACAGATAAAC 3070 het 3070 ref 54 40 12 2 ACTAG 0 1 246586 CASAVA_Build 11 55035704 2D CTCTCTTTCT TC/-- TCTCTCTTTC 3052 het 2021 hom 21 8 8 5 TC 4 3 246587 CASAVA_Build 11 55039269 1D TAAATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2349 hom 22 8 9 5 T 13 12 246588 CASAVA_Build 11 55045330 6I2M1I TTTCCATTAA ------AT-/TATGAGATG GATGAGATGA 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 N/A 0 0 246589 CASAVA_Build 11 55061697 78D TAATTGCATC CTACATTGTCACCCTGTACTCTCTGAAGTCTTGCAGCTCGGTAGGTTGACGCAACACACTTTCCACCTGTGGCTCCCA/------------------------------------------------------------------------------ CCACACAGTG 2649 het 2649 ref 31 40 8 10 CTACATTGTCACCCTGTACTCTCTGAAGTCTTGCAGCTCGGTAGGTTGACGCAACACACTTTCCACCTGTGGCTCCCA 1 0 246590 CASAVA_Build 11 55062520 3I AAACAAACAG ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 CAA 5 6 246591 CASAVA_Build 11 55065666 1I ATGGAATACT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 8 9 246592 CASAVA_Build 11 55065802 2I AAAACAAAAA --/AG AGGCAAATAA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 AG 1 2 246593 CASAVA_Build 11 55069996 1D TCTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2517 het 681 hom 26 6 8 12 T 17 16 246594 CASAVA_Build 11 55090209 2D ACAGGCAGGT TG/-- TGATTCTTCA 3070 het 3070 hom 47 19 20 10 TG 2 1 246595 CASAVA_Build 11 55123488 4I CTAGTTGTGC ----/TGGA TGGATAATGT 3070 het 3070 ref 65 30 28 7 TGGA 1 2 246596 CASAVA_Build 11 55134153 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1423 het 163 hom 16 2 4 10 T 16 15 246597 CASAVA_Build 11 55153122 6I TGCACTCTAA ------/TTTAAC TTTAACATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTTAAC 1 2 246598 CASAVA_Build 11 55173064 1D TTGGTGAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 10 9 246599 CASAVA_Build 11 55187825 1I ACTTCCACAG -/T TTTCCTGTGG 3070 het 3070 ref 52 22 21 9 T 3 4 246600 CASAVA_Build 11 55195454 1I CAAATTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3010 het 3010 ref 34 14 9 11 T 14 15 246601 CASAVA_Build 11 55203275 1D TGATAGATCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 T 10 9 246602 CASAVA_Build 11 55235042 1I ATCGCTGGCC -/T TTAATATACT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 2 3 246603 CASAVA_Build 11 55242797 9I AATTAAATAT ---------/CAATTTACA CACTATGATT 2814 het 2814 ref 24 8 7 9 CAATTTACA 0 1 246604 CASAVA_Build 11 55252319 2I AGAAAATCAC --/AT GTCCAAGCCC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 AT 0 1 246605 CASAVA_Build 11 55263698 1I AATTTCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2476 hom 24 9 10 5 A 10 11 246606 CASAVA_Build 11 55263862 1D TTTTCTTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 9 246607 CASAVA_Build 11 55265622 1D CAGAAAAGTG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 40 0 30 10 A 9 8 246608 CASAVA_Build 11 55266024 1I TTTGACACCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 T 8 9 246609 CASAVA_Build 11 55273357 1D AAGGAGAAAT A/- AAATCTTTTA 3070 het 1478 hom 14 4 10 0 A 4 3 246610 CASAVA_Build 11 55294755 1D TAACTTTCAT C/- CTGTGCTTAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 2 1 246611 CASAVA_Build 11 55299345 1D ATGTTAAAAG T/- TTTTTTTATG 3070 hom 123 het 44 0 42 3 T 8 7 246612 CASAVA_Build 11 55310058 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2470 het 31 hom 13 1 6 6 A 15 11 246613 CASAVA_Build 11 55335059 4D GCTAACATCT TAAA/---- TAAGTGTATT 3070 het 3070 ref 44 21 20 5 TAAA 1 0 246614 CASAVA_Build 11 55337783 1D CTTTGAAATG A/- AGTTTTTCTC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 2 1 246615 CASAVA_Build 11 55345613 1I TCCATTATGA -/T TTTTTTTATG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 7 8 246616 CASAVA_Build 11 55357169 2D ATATTTATAT TA/-- TATATATATA 2617 hom 21 het 11 0 8 3 TA 7 6 246617 CASAVA_Build 11 55360218 1D CAGAGGCAGA G/- GGGGGGGGCT 3070 hom 51 het 22 0 16 6 G 9 8 246618 CASAVA_Build 11 55364919 1D AATGAAATAA T/- TTTTATTTTA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 5 4 246619 CASAVA_Build 11 55365524 2I AAGAGGTCCT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 CA 5 6 246620 CASAVA_Build 11 55375466 1D TGTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 33 1 22 10 T 11 10 246621 CASAVA_Build 11 55385623 4D CAGGAGTCTA TAAC/---- TACTGAAGAT 2781 het 311 hom 8 1 6 1 TAAC 1 0 246622 CASAVA_Build 11 55405546 1D AATATATTCT G/- TTTTTTTTTC 1375 het 1375 ref 25 16 3 6 G 1 0 246623 CASAVA_Build 11 55408537 1D ATACCAATAT C/- CTGGCTGAGT 3070 het 3070 hom 23 8 13 3 C 2 1 246624 CASAVA_Build 11 55418979 1I GACTCCTTTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 8 9 246625 CASAVA_Build 11 55437389 1D ATTCCATCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 25 1 19 5 A 11 10 246626 CASAVA_Build 11 55439732 6D TTATCCTCTT ACAATG/------ ACAAGTAAGG 3070 hom 138 het 48 0 47 2 ACAATG 1 0 246627 CASAVA_Build 11 55440993 12D AAAACATGTG TTGAGGCCATGC/------------ TTTTTAAGAA 3070 het 3070 hom 23 12 12 4 TTGAGGCCATGC 1 0 246628 CASAVA_Build 11 55446776 1I TACAATCTCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 8 9 246629 CASAVA_Build 11 55460558 1I TTTATTGTTT -/A AAAAATAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 5 6 246630 CASAVA_Build 11 55466438 1D CGGGAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 695 hom 27 2 15 10 T 15 14 246631 CASAVA_Build 11 55477159 1D ACATTTCAGG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 8 7 246632 CASAVA_Build 11 55482246 2D TAAGTACAGT GA/-- GAGACATGAA 3070 het 3070 ref 54 28 23 3 GA 3 2 246633 CASAVA_Build 11 55486422 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 18 15 13 T 10 11 246634 CASAVA_Build 11 55498059 1I CTTGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 2849 het 1990 hom 20 6 10 4 A 12 13 246635 CASAVA_Build 11 55504489 1D TCTCTTTAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 9 8 246636 CASAVA_Build 11 55508904 1D AAACCCTCCG A/- AAAAAAAATC 3070 het 2944 hom 20 8 9 3 A 9 8 246637 CASAVA_Build 11 55516058 2D AACTTTAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2968 het 872 hom 12 2 7 3 A 12 10 246638 CASAVA_Build 11 55523747 4I TTGTATTGGC ----/TATA TATATATATA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 TA 7 9 246639 CASAVA_Build 11 55527514 1I GAAATTATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 27 1 20 6 A 12 13 246640 CASAVA_Build 11 55541562 1D AAGCAGAAAT A/- GGGGGAAAAA 2479 het 2479 ref 20 12 6 4 A 1 0 246641 CASAVA_Build 11 55544164 1I CAATAACAAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 25 het 37 1 29 7 A 8 9 246642 CASAVA_Build 11 55561805 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 35 1 25 9 A 13 12 246643 CASAVA_Build 11 55562743 1I TTCATGTTGA -/T TATTTTTACC 3070 het 3070 ref 53 28 22 3 T 1 2 246644 CASAVA_Build 11 55570174 1D TGTCCTAACT G/- GGAGGGGTCC 3070 hom 112 het 42 0 37 7 G 3 2 246645 CASAVA_Build 11 55573915 1D GTAGTGTAAG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 126 het 51 0 43 9 T 9 8 246646 CASAVA_Build 11 55575092 2D TACATATGTA AT/-- ATGTTTCATA 3070 hom 90 het 31 0 31 1 AT 2 1 246647 CASAVA_Build 11 55584813 1I TCAAAATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 12 10 14 A 13 14 246648 CASAVA_Build 11 55590489 1I TTTTTTGCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 8 9 246649 CASAVA_Build 11 55594924 2D ATATTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 16 14 246650 CASAVA_Build 11 55607956 2D ACATGCACAC AT/-- GTGAACACAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 6 AT 1 0 246651 CASAVA_Build 11 55620879 1D GTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 10 18 9 T 10 9 246652 CASAVA_Build 11 55632325 1D TAATATTATT A/- AAAAAACATA 3070 hom 48 het 21 0 17 5 A 7 6 246653 CASAVA_Build 11 55642620 14D AAATAATTTA AAATTTTAAATTTT/-------------- AATTAAAAAT 3070 hom 45 het 16 0 16 3 AAATTTT 2 0 246654 CASAVA_Build 11 55653980 1I AAAGGACTGG -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 A 6 7 246655 CASAVA_Build 11 55659324 1D GACCTTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 23 1 19 3 A 11 10 246656 CASAVA_Build 11 55662746 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 14 0 11 3 A 15 13 246657 CASAVA_Build 11 55663403 1D AATAAAGAAG T/- GACTACTTAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 1 0 246658 CASAVA_Build 11 55669978 3I AAAAAATTAA ---/ATT ATATTTTTAT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 ATT 0 1 246659 CASAVA_Build 11 55674382 1D TAAAAAAAAA T/- AATTGGAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 1 0 246660 CASAVA_Build 11 55678405 1I GACATTTTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 8 9 246661 CASAVA_Build 11 55680249 1D TCATGCCCTT G/- GCACCCCGCC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 G 2 1 246662 CASAVA_Build 11 55680985 2I ACAAATGAAA --/AC ACATCCCATG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AC 1 2 246663 CASAVA_Build 11 55682935 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATATATA 2987 het 679 hom 19 4 12 4 TGTA 1 0 246664 CASAVA_Build 11 55691046 1I AAACAACAAC -/A AAAACTATTG 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 4 5 246665 CASAVA_Build 11 55698435 5D CTGAATGATC TTAAG/----- TTAACTACCA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 TTAAG 1 0 246666 CASAVA_Build 11 55699595 2I ATTATGAAAC --/AT AGGTGAATAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AT 0 1 246667 CASAVA_Build 11 55711115 6I TTAGTATTCT ------/GCAACC GCAACCTCTA 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 GCAACC 1 2 246668 CASAVA_Build 11 55713818 1D TACTTTCAAT G/- GGGGGAAATT 3070 het 3070 hom 42 21 20 1 G 6 5 246669 CASAVA_Build 11 55719643 3D TTCAATTAGA GAG/--- GAGAAGTAAG 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 GAG 2 1 246670 CASAVA_Build 11 55739282 1D CAGGCCCAGA C/- CCAAGGTTCC 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 C 3 2 246671 CASAVA_Build 11 55751667 2D CCAAAACCCC AA/-- AGACCTGGTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 5 A 3 1 246672 CASAVA_Build 11 55771549 2I GTGTGTAGAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 AT 5 6 246673 CASAVA_Build 11 55790580 1I TTCACAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 827 hom 32 4 22 6 T 13 14 246674 CASAVA_Build 11 55795282 1I CAAAACGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 45 2 33 10 A 12 13 246675 CASAVA_Build 11 55796788 1I TTTAAAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 125 hom 34 1 24 9 T 15 16 246676 CASAVA_Build 11 55801271 1D TCATAGACAT G/- ATTATATATG 3070 het 2863 hom 14 6 7 1 G 1 0 246677 CASAVA_Build 11 55803410 1I TGCTACATCA -/T GCCATTACTA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 0 1 246678 CASAVA_Build 11 55825280 1I TTTTCTTTTC -/T TTCATGACTG 3070 hom 87 het 36 0 29 8 T 2 3 246679 CASAVA_Build 11 55829877 4D CATAATGCCC TTCT/---- TTGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 57 31 23 5 TTCT 1 0 246680 CASAVA_Build 11 55833419 1D ATTCTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 30 1 22 7 A 11 10 246681 CASAVA_Build 11 55839835 1I ATAGGCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 10 11 246682 CASAVA_Build 11 55840484 1D GGGCTTACGA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 8 7 246683 CASAVA_Build 11 55846819 2D CATTTAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 28 0 18 10 A 13 11 246684 CASAVA_Build 11 55867492 26I CTGAGGGCTT --------------------------/GAAAACAAGTGTCAAATACTGCTGAC AAATCTTTGT 3070 hom 78 het 25 0 26 1 GAAAACAAGTGTCAAATACTGCTGAC 0 1 246685 CASAVA_Build 11 55869444 1I45M1D AACAGCCAGA -TTTTTTTTTTCCTGCAGAAGGATGTATAATTGGGGGATTATACATC/TTTTTTTTTTTCCTGCAGAAGGATGTATAATTGGGGGATTATACAT- CCCCCAATTG 3070 het 369 hom 42 1 45 11 N/A 0 0 246686 CASAVA_Build 11 55872575 2D CCACTGTAAC AT/-- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 AT 1 0 246687 CASAVA_Build 11 55899326 1I ATAAACTGAA -/T TGTAAAGAAA 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 1 2 246688 CASAVA_Build 11 55913827 2D TTTCAATAAA AG/-- AGATTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 24 6 AG 2 1 246689 CASAVA_Build 11 55915408 1I CACTACTAGA -/G GGTAAGTAAT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 G 2 3 246690 CASAVA_Build 11 55918666 1D ATCAAGAGGT A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 A 7 6 246691 CASAVA_Build 11 55933377 1I ACTGGTGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 T 9 10 246692 CASAVA_Build 11 55936410 4D GTTGGGATAC AGGT/---- AGGTGTTAGC 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 AGGT 2 1 246693 CASAVA_Build 11 55937213 2I TCCTAGAAAA --/CT CTGTATTAAA 3070 het 3070 ref 59 26 25 8 CT 1 2 246694 CASAVA_Build 11 55948018 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 2351 het 1703 hom 13 4 7 2 A 6 7 246695 CASAVA_Build 11 55952383 2D AAAGTGTAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2757 hom 24 7 12 6 A 12 10 246696 CASAVA_Build 11 55965560 3D GTGCCTGTGA CAC/--- CACCTGAAGC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 CAC 2 1 246697 CASAVA_Build 11 55968550 1D TTTGTGTGTT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 73 het 29 0 25 4 G 9 8 246698 CASAVA_Build 11 55972978 1I GTTATCAGAT -/A AAAAAAAAAA 2240 het 2240 ref 26 10 6 10 A 11 12 246699 CASAVA_Build 11 56006770 1I TTTTGGTTAA -/C AAACAATTTC 2770 het 2770 ref 23 14 7 2 C 0 1 246700 CASAVA_Build 11 56020766 1D GCATGCCCCG C/- CACACCTGAC 2642 het 1533 hom 17 7 8 2 C 2 1 246701 CASAVA_Build 11 56025791 1I AAAGAACAAT -/A ATTGACTGAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 1 2 246702 CASAVA_Build 11 56035699 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 9 10 246703 CASAVA_Build 11 56036139 1D TAAATACTCA T/- TTTTTCTTGT 3070 het 3070 ref 25 12 11 4 T 6 5 246704 CASAVA_Build 11 56045867 1D CTACTATTTT C/- AAACGTTACG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 C 1 0 246705 CASAVA_Build 11 56054611 1D ATAGGCCTAT G/- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 30 17 3 G 4 3 246706 CASAVA_Build 11 56057123 1D AAAACAAATA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 T 2 1 246707 CASAVA_Build 11 56060844 4I GTTTCATTGT ----/TTTA TTTGTCTGTT 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 TTTA 0 1 246708 CASAVA_Build 11 56067454 2I TACCATAAAC --/TT TGGTTTTGGT 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 T 1 3 246709 CASAVA_Build 11 56070492 1D GTGGTTACAA C/- AAAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 19 21 7 C 1 0 246710 CASAVA_Build 11 56081272 1I TGTTCAGTCT -/C CCCTCCAGCT 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 C 3 4 246711 CASAVA_Build 11 56082071 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 A 13 14 246712 CASAVA_Build 11 56082547 2D ATTAGAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2627 hom 20 7 11 2 T 14 12 246713 CASAVA_Build 11 56088998 1D GTTTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 A 12 11 246714 CASAVA_Build 11 56106291 1D AACTTAAAAA T/- ATCACATAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 1 0 246715 CASAVA_Build 11 56107141 1I GTCCTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 1250 het 1250 ref 16 9 3 4 A 13 14 246716 CASAVA_Build 11 56107437 1D CAGTTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 11 10 246717 CASAVA_Build 11 56108583 1I AAAAAAAGTC -/A AAAGTCAACT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 3 4 246718 CASAVA_Build 11 56117896 1D CACTATGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 11 10 246719 CASAVA_Build 11 56119789 1I AATAAAAAAA -/T ATTGAGAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 1 246720 CASAVA_Build 11 56123935 2I ATCCAAACAG --/TA TATACAATGA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 TA 2 3 246721 CASAVA_Build 11 56131614 1I ACATTCTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 9 10 246722 CASAVA_Build 11 56132756 1D TTTCCTATGG C/- CCCCATAGAG 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 C 5 4 246723 CASAVA_Build 11 56133709 1D GAACATACAC A/- AAAGGAACAA 3070 het 3070 hom 43 18 23 3 A 4 3 246724 CASAVA_Build 11 56146244 6I4M2I TTGAAATTGT ------AATT--/AACAACAATTGA CTTTGTTTAA 3070 het 3070 ref 46 26 19 3 N/A 0 0 246725 CASAVA_Build 11 56160073 4D ATATACACAC ACAA/---- ACACACATAT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 ACAA 1 0 246726 CASAVA_Build 11 56172632 1D AGATTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 20 10 A 13 12 246727 CASAVA_Build 11 56213825 2D ATACAAACAC AT/-- ATATATATTT 3070 hom 45 het 34 0 14 21 AT 5 4 246728 CASAVA_Build 11 56217518 3D ATGCAAGGAT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 45 18 18 9 TTG 7 6 246729 CASAVA_Build 11 56220045 1I TTTTTAATAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 8 9 246730 CASAVA_Build 11 56223647 4I34M1I GACAGATGTA ----TGCTAGATATATTTTGCTCTACCCATTTCAATAG-/CGTTTGCTAGATATATTTCTCTCAACCCATTTCTCTAGT AACATTTGTA 3070 het 3070 ref 55 47 11 5 N/A 0 0 246731 CASAVA_Build 11 56223727 17D50M3D GAGTGGGTAG ATTTTCAAGTCATCATAAGAAATACTGTAGTATACATAAATTACATTTAAAACTGGTGTTTCAATTATTG/-----------------AGTGATACTGTACTATACATAAATTACATTTAAAATTGGTGTTTAAGTTA--- TTATTATTGT 2073 het 2073 ref 35 53 5 11 N/A 0 0 246732 CASAVA_Build 11 56224274 4D TTGCAAAGCC TGAT/---- TGTTGCAAAA 3070 het 3070 ref 62 34 26 21 TGAT 1 0 246733 CASAVA_Build 11 56225540 1D TATATAAGAA T/- TTGAATTGAA 1791 het 1791 ref 52 37 4 12 T 3 2 246734 CASAVA_Build 11 56226156 3I4M1D58M1D ATATTTTATT ---TTTATTTTTAATAGATATTTTATAGAGAGAATATGTATGTACAGGTGTGATTCAACAAAAGGAT/GTATTTA-TTTTAATAGATATTTTATAGAGAGAATATGTACATACAGGGGTGATTCCACAAAAGGA- ATTTCACTTA 2115 het 2115 ref 25 30 5 26 N/A 0 0 246735 CASAVA_Build 11 56226951 1D CATTTAAAAA G/- TGGATCTTAC 2068 het 2068 ref 61 52 5 5 G 1 0 246736 CASAVA_Build 11 56227078 14D22M6D CCCCATACAT ATATAAAATTATGGTTTATCAATATGAATAAAATTTAAAAAA/--------------GTTATCAATACAAATATAATTT------ CAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 47 47 16 12 N/A 0 0 246737 CASAVA_Build 11 56227345 1I CATGGACATT -/A ACAAAGTAAG 3070 hom 102 het 45 0 35 10 A 1 2 246738 CASAVA_Build 11 56227839 8D23M1I28M1D AAGAATATGC CCATATATCCATATATTGTAAACATAGCTCG-CTAAGTGCATATTCATATTATTTTATACT/--------CCATATATTATAAACGTGGCTGGCCTATGTACATATTCACATTATTTGATGC- TGGAAGTTAG 3070 het 3070 ref 38 44 9 11 N/A 0 0 246739 CASAVA_Build 11 56228436 2I GTGTGTGATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 28 het 24 0 17 7 TG 7 8 246740 CASAVA_Build 11 56229122 2D71M4I ATTCCTGATC CTCTACAGCACAGAGGACTTTGCAGAAGTCAGCCAGCTAACTCACATGGCAGTCACTGGTTAAGAGAAGCTCC----/--CTATGGCACAGAGGACTTTGCAGAAGTCAGCCAGCTAACTCACATGGCACTCACTGGTTAAGAGAAGCTCCCAAT TGAGATTTGT 2204 het 2204 ref 67 88 6 23 N/A 0 0 246741 CASAVA_Build 11 56230565 3I15M1D7M1I TCATCCCCAC ---AGGAGTGCCCTCCAGATTCAGGC-/AGGAGGAGTGCCCTCCAG-GTCAGACT TGCCTGAGAG 3070 het 3070 ref 63 45 17 12 N/A 0 0 246742 CASAVA_Build 11 56232839 1I ACTGAACTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1101 hom 45 3 26 16 A 13 14 246743 CASAVA_Build 11 56234578 1I TCTTCTAGGG -/T TTTTATGGTT 3070 hom 18 het 11 0 7 4 T 4 5 246744 CASAVA_Build 11 56241034 1D GAAAAAAGCA C/- CAGTGATGGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 C 2 1 246745 CASAVA_Build 11 56246305 1I ATCCTGGAGC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 7 8 246746 CASAVA_Build 11 56254178 2D CATCCGTTTC TT/-- TGTTAGAGCT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 3 1 246747 CASAVA_Build 11 56256221 2D TTTCAATGTT AA/-- GTCTCATTTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 2 0 246748 CASAVA_Build 11 56256587 1I TATATTTTGC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 A 8 9 246749 CASAVA_Build 11 56257190 2D TTTGTATAAC TT/-- ATGAATATCA 3070 het 3070 ref 38 20 17 2 T 2 0 246750 CASAVA_Build 11 56259440 2D GTGACTTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 89 hom 25 2 8 16 A 12 10 246751 CASAVA_Build 11 56264528 3I CCTGTGTCAG ---/TTC TTCTTCTCTG 2525 het 2525 ref 55 40 7 8 TTC 2 3 246752 CASAVA_Build 11 56264797 4I CATGCAGTGT ----/GAGA GAGAGCTACC 3070 hom 128 het 48 0 42 6 GA 2 4 246753 CASAVA_Build 11 56265304 1D GTTTGTTATG A/- TTTTGAGATC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 1 0 246754 CASAVA_Build 11 56269829 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2264 het 2264 ref 27 12 9 6 A 13 14 246755 CASAVA_Build 11 56274780 1I ATGTCAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 9 10 246756 CASAVA_Build 11 56277259 3I TTTGTGTATC ---/AAG GAGGTAAAGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAG 0 1 246757 CASAVA_Build 11 56281796 7D TTGCAGTTTT TTCCAAC/------- GTTTGTTAAA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 TTCCAAC 1 0 246758 CASAVA_Build 11 56286168 1I TTCCAACTTC -/G GTTTAGCAGG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 1 2 246759 CASAVA_Build 11 56303605 1I CGTGACTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2857 hom 23 8 9 6 T 9 10 246760 CASAVA_Build 11 56308507 1D TAATAATAAG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 8 7 246761 CASAVA_Build 11 56309333 2D AACCAACTTG AC/-- ACACCTGCAA 3070 hom 96 het 35 0 32 4 AC 3 2 246762 CASAVA_Build 11 56315638 1D GTAAAATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 25 1 20 4 A 12 11 246763 CASAVA_Build 11 56315878 1D TGGAATTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 12 11 246764 CASAVA_Build 11 56319503 2D ATAAAAGAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 AT 7 6 246765 CASAVA_Build 11 56319842 3D ACAAATAGGG TGC/--- AGTGTATACT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TGC 1 0 246766 CASAVA_Build 11 56322784 2I GCTTCAGTAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 19 het 42 1 21 20 A 9 11 246767 CASAVA_Build 11 56328969 1I TAATTGTTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 8 246768 CASAVA_Build 11 56331460 1I TCTCTTTTTT -/C CCTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 C 2 3 246769 CASAVA_Build 11 56337354 1D TTATTTCCAT A/- AGCAAGTATT 3070 hom 114 het 46 0 37 9 A 2 1 246770 CASAVA_Build 11 56344077 1D AAGGGTAAGC A/- AAAAGTGAAA 3070 hom 135 het 50 0 43 8 A 5 4 246771 CASAVA_Build 11 56344227 1I ATGGCAGCCA -/G GAGAAAACAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 1 2 246772 CASAVA_Build 11 56346922 4I TCAAACAGTT ----/AATA AATAGTCACT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AATA 1 2 246773 CASAVA_Build 11 56354708 1D TCAACAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 34 1 14 19 A 12 11 246774 CASAVA_Build 11 56366074 2D TGGAACCACG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 8 A 14 12 246775 CASAVA_Build 11 56366230 1I GCATATGGCA -/C CCCCCCCGCA 2060 het 2060 ref 27 16 5 6 C 7 8 246776 CASAVA_Build 11 56369074 9D AGCATGCTGG CAGCCCTCA/--------- CAGCCCTCAC 3070 het 3070 ref 35 15 10 12 CAGCCCTCA 2 1 246777 CASAVA_Build 11 56372759 1D CTTTTTGGGT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 61 het 27 0 21 6 G 9 8 246778 CASAVA_Build 11 56388262 12D CATTGACCTG GTCCACATCTTC/------------ GGGATAAGAA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 GTCCACATCTTC 1 0 246779 CASAVA_Build 11 56393244 1I TTGATGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 37 0 27 10 A 10 11 246780 CASAVA_Build 11 56431791 1D GGGTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 2809 het 2809 ref 25 13 7 5 T 12 11 246781 CASAVA_Build 11 56434281 1D ATAAAAACTA C/- TACTGCTGCT 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 C 1 0 246782 CASAVA_Build 11 56441134 1I TCTAAAGACA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 7 8 246783 CASAVA_Build 11 56446869 1I57M1I AGCAAATGTG -AAAAAAAAAAGTTGAAATAGTTGAATAAGACGAGCTCTTTGCAAAAAAAATTTGCCC-/AAAAAAAAAAAGTTGAAATAGTTGAATAAGACGAGCTCTTTGCAAAAAAAATTTGCCCA ATCTCCATTT 3070 het 2818 hom 32 11 17 20 N/A 0 0 246784 CASAVA_Build 11 56448698 4D GAAAGAAAGG AAGA/---- AAGAAAGGAA 186 het 186 ref 14 3 4 13 AAGA 2 1 246785 CASAVA_Build 11 56449192 1I ACATTTTATC -/A AAGAGGAAGT 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 2 3 246786 CASAVA_Build 11 56451082 1D TGAAAAAAAA C/- AATCTTAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 C 1 0 246787 CASAVA_Build 11 56462991 1D AGTAGAGACA G/- GGTTTCAACA 2560 het 2560 ref 21 12 8 1 G 3 2 246788 CASAVA_Build 11 56470076 13D GCTGCACCCA CTGACCTGCGCCC/------------- CTGTCTGGCA 1003 het 1003 ref 40 27 3 13 CTGACCTGCGCCC 1 0 246789 CASAVA_Build 11 56482887 1D TATTCCAGTT C/- CCACACGTTT 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 C 3 2 246790 CASAVA_Build 11 56483675 1D ATAAATTCAA T/- TTTCATGGCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 T 4 3 246791 CASAVA_Build 11 56487297 1D CATGTATGTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 9 8 246792 CASAVA_Build 11 56487860 1D TCTATGTGCC T/- TTTTTTTTTT 2186 het 1914 hom 23 7 10 6 T 17 16 246793 CASAVA_Build 11 56494804 1I TAATATAGTG -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 6 7 246794 CASAVA_Build 11 56496169 35I GCAATTAGAA -----------------------------------/AAATAAAAGCCAACCAATCTCAAAGCTAGCAGAAG AAAAGAAATA 3070 het 3070 hom 16 8 9 2 AAATAAAAGCCAACCAATCTCAAAGCTAGCAGAAG 0 1 246795 CASAVA_Build 11 56496309 1I ATTCACAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 9 10 246796 CASAVA_Build 11 56497660 1D ACCAATACCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 9 8 246797 CASAVA_Build 11 56503092 1D CTCAGTAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 999 hom 21 5 11 5 A 12 11 246798 CASAVA_Build 11 56503780 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2495 hom 33 7 13 13 A 15 16 246799 CASAVA_Build 11 56506585 1D TCTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 T 11 10 246800 CASAVA_Build 11 56514460 1I CCTACCAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 11 12 246801 CASAVA_Build 11 56521401 1D GGTCTCACAA G/- CATTATCGAC 3070 het 3070 ref 49 28 15 6 G 1 0 246802 CASAVA_Build 11 56532507 1D GCTCAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 A 11 10 246803 CASAVA_Build 11 56535324 1D TCCAATTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1754 hom 24 8 12 4 T 10 9 246804 CASAVA_Build 11 56543303 1D ATATTTATGC A/- AAAACTTAAT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 A 5 4 246805 CASAVA_Build 11 56544521 1D ACCAAAAAAA T/- AAAATATCTA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 1 0 246806 CASAVA_Build 11 56551280 1I ATACATAAAC -/T AATGCTGAAA 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 T 0 1 246807 CASAVA_Build 11 56551692 5D TTTAGACACA TTACT/----- TTATGCCACC 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 TTACT 1 0 246808 CASAVA_Build 11 56555178 4I CTTAATTCAT ----/TCTA TCTAAAGACT 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 TCTA 1 2 246809 CASAVA_Build 11 56560428 1D ACTTCATTCC T/- TTTTTTTTTC 1254 het 1254 ref 31 22 4 6 T 10 9 246810 CASAVA_Build 11 56560618 1D AAATATTTGT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 8 7 246811 CASAVA_Build 11 56562848 7D CTTCCATTAA ATAGAGT/------- ATAAAGACTC 3070 het 3070 ref 38 20 17 5 ATAGAGT 1 0 246812 CASAVA_Build 11 56566717 1I CTCTACACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 A 9 10 246813 CASAVA_Build 11 56566951 1D AACTGAAGAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 10 15 11 A 9 8 246814 CASAVA_Build 11 56569483 1I ATAGTGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 10 11 246815 CASAVA_Build 11 56571299 1D CTGCACATGT A/- ATCCCAGAAC 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 A 2 1 246816 CASAVA_Build 11 56575606 4D ATACATAAAT CAGG/---- CAGGCAGGCA 3070 het 3070 hom 32 8 13 12 CAGG 3 2 246817 CASAVA_Build 11 56583567 1I AAATATAAAC -/G GATTCAATTT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 G 1 2 246818 CASAVA_Build 11 56586802 1D ACAAATTTAT G/- GGGGGGCGGC 3070 hom 30 het 14 0 11 3 G 7 6 246819 CASAVA_Build 11 56588567 1D ACAAGGGAAG C/- CTTGTGTAAC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 C 2 1 246820 CASAVA_Build 11 56603604 4D TTTTCAGACT TAAA/---- TAGTCCTACA 3070 het 3070 ref 41 21 18 5 TAAA 1 0 246821 CASAVA_Build 11 56604150 1I AGCTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 11 12 246822 CASAVA_Build 11 56614509 1I TTAGAAAAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 8 9 246823 CASAVA_Build 11 56623602 1I TTATTAAAGA -/G GGATAATCAT 3070 hom 111 het 38 0 37 1 G 2 3 246824 CASAVA_Build 11 56633077 2I TCTGCGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 TG 5 6 246825 CASAVA_Build 11 56637376 1D AATTAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 18 9 A 11 10 246826 CASAVA_Build 11 56650525 2D AGCATGGGTG AC/-- AGAGGGAGAC 2521 het 1515 hom 12 4 6 2 AC 1 0 246827 CASAVA_Build 11 56656769 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2245 hom 26 8 15 3 A 11 10 246828 CASAVA_Build 11 56671288 1D TATTTAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 28 1 24 3 A 12 11 246829 CASAVA_Build 11 56671541 1D AAGCCATACA T/- TCTCAGTGGG 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 2 1 246830 CASAVA_Build 11 56672328 1D ACCCTGTAAG A/- TGGATGCTGT 3070 het 3070 ref 52 28 16 8 A 1 0 246831 CASAVA_Build 11 56673427 4D AAGGAAGAGG GGAA/---- GGAAGGAAGG 2069 het 1389 hom 30 8 11 12 GGAA 5 4 246832 CASAVA_Build 11 56682506 1I TGAGAGAGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 9 10 246833 CASAVA_Build 11 56683919 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2433 het 49 hom 19 1 10 8 A 17 18 246834 CASAVA_Build 11 56684265 1D CTTTCAGATT C/- AGTTGCTTCT 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 C 1 0 246835 CASAVA_Build 11 56701394 4D CTGACAAAAA GAAG/---- GAAGAGGAGG 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 GAAG 2 1 246836 CASAVA_Build 11 56702373 15I ACCATTTTTC ---------------/AGTTAATGTTAATAA CATAGGATGC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AGTTAATGTTAATAA 0 1 246837 CASAVA_Build 11 56708296 10D TTCCCTCTCT CTCCTGTGCA/---------- CTAATAACAG 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 CTCCTGTGCA 1 0 246838 CASAVA_Build 11 56709569 6D GACCTCATGA TCCACC/------ TCCACCCGCC 3070 het 1952 hom 20 7 11 7 TCCACC 2 1 246839 CASAVA_Build 11 56719276 6D TCACCACAGC AGGGAT/------ AGGTCTGCCA 3070 het 3070 hom 35 13 20 9 AGGGAT 1 0 246840 CASAVA_Build 11 56725694 4D GACAGAATCC AGTG/---- TGACTGGAAC 3070 het 3070 ref 47 23 20 5 AGTG 1 0 246841 CASAVA_Build 11 56732231 3D AAAAACTGGA AAT/--- AATAAGTTGA 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 AAT 2 1 246842 CASAVA_Build 11 56742117 1I GGAACTAAAA -/G TAGATCTACC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 G 0 1 246843 CASAVA_Build 11 56742992 1D TTCAGCATCC A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 7 6 246844 CASAVA_Build 11 56743649 1D CTTGTGGTTC A/- TGGAGCCCTT 3070 het 3070 ref 56 26 22 8 A 1 0 246845 CASAVA_Build 11 56755744 2D ACTGTCCCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 TC 10 9 246846 CASAVA_Build 11 56765757 1D TTGTGCCTGG C/- CTAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 C 2 1 246847 CASAVA_Build 11 56772330 5D CCCAGAACTT AAAAC/----- AAAATTATTA 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 AAAAC 1 0 246848 CASAVA_Build 11 56778441 1D AACTCCAACA C/- TGGAGATCAA 3070 het 3070 hom 50 19 27 5 C 1 0 246849 CASAVA_Build 11 56787176 1D TCTTTTTTTT C/- TCTCTCTCTC 2019 het 2019 ref 23 14 6 3 C 1 0 246850 CASAVA_Build 11 56790823 1I CTGTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 10 11 246851 CASAVA_Build 11 56795296 4I TTCCCAAACT ----/CACA CAGCCAGGAG 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 CA 1 3 246852 CASAVA_Build 11 56796877 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 A 13 12 246853 CASAVA_Build 11 56799584 1D GAGTCTGCAA G/- GGATGTTGCT 3070 het 3070 ref 65 35 23 7 G 3 2 246854 CASAVA_Build 11 56814148 1D ATTAAGAATT C/- CTACTGGGCT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 2 1 246855 CASAVA_Build 11 56815330 2I AAAGAGAGAA --/AG AACAAGTGCC 3070 hom 39 het 20 0 14 6 AG 0 1 246856 CASAVA_Build 11 56817279 2I GGTTCTCAGT --/TC TCACCATACG 3070 hom 98 het 38 0 31 7 TC 1 2 246857 CASAVA_Build 11 56817710 3I6M1D TGCAGCTCCT ---GGATCCT/GGAGGATCC- GGGAAACGTG 1360 het 141 hom 37 3 7 35 N/A 0 0 246858 CASAVA_Build 11 56822303 1D CATCCGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 38 0 26 12 T 12 11 246859 CASAVA_Build 11 56828813 2D CCAGCTTCTT GG/-- GGGAGACTGA 3070 hom 57 het 20 0 18 3 G 5 3 246860 CASAVA_Build 11 56829818 1I AACAATTAAC -/A AAAACCCCAT 3070 hom 65 het 26 0 22 4 A 4 5 246861 CASAVA_Build 11 56836188 1I GGCTACACTA -/T TTTTGCCTTG 3070 hom 178 het 65 0 59 6 T 4 5 246862 CASAVA_Build 11 56852151 3D CAGACCTTCC AGA/--- AGCTTATTAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 AGA 1 0 246863 CASAVA_Build 11 56868079 1I CTCCCCTTCC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 7 8 246864 CASAVA_Build 11 56873516 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1714 het 1626 hom 16 7 7 2 A 13 12 246865 CASAVA_Build 11 56875534 5D ATCTTTTCGG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 17 6 GTTTT 4 3 246866 CASAVA_Build 11 56877695 1I TCTCCCAAAC -/A AATTCATTTG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 2 3 246867 CASAVA_Build 11 56877888 2D AAATGTCACT CC/-- CCCCCCCCCG 3070 het 72 hom 30 2 9 19 C 11 9 246868 CASAVA_Build 11 56879440 8I CAGGCTGGAA --------/TGCAGTAG TGCAGTAGTG 2863 het 1335 hom 19 5 7 7 TGCAGTAG 2 3 246869 CASAVA_Build 11 56880342 1D AAAAAAGGGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 A 9 8 246870 CASAVA_Build 11 56881229 9D AAATCAGCCA GGCGTGGTG/--------- GCACGCACCT 3070 het 3070 hom 23 10 10 5 GGCGTGGTG 1 0 246871 CASAVA_Build 11 56894115 1I GCCTGAGCAA -/G GGGGCATGGG 3070 hom 72 het 32 0 23 9 G 4 5 246872 CASAVA_Build 11 56904467 3D ACAAAAAACA AAC/--- AAAAAAAAAA 2909 hom 27 het 13 0 9 4 AAC 1 0 246873 CASAVA_Build 11 56906901 1D AGCTCTAGAC A/- AAATTTGCTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 4 3 246874 CASAVA_Build 11 56908236 1I CAAGGTCACA -/C AGCAAGTAGA 3070 hom 87 het 34 0 27 7 C 0 1 246875 CASAVA_Build 11 56971696 1I CAGGTGTGGT -/G GCGGGCGCCT 2614 hom 18 het 7 0 7 0 G 1 2 246876 CASAVA_Build 11 56993500 1D GCGTGTGACA T/- TTTTTTTTTT 855 het 855 ref 39 33 3 3 T 12 11 246877 CASAVA_Build 11 57021251 4D ATGGCATGGC TCAG/---- TCAAAGGGTC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TCAG 1 0 246878 CASAVA_Build 11 57026006 17D AGGCACTGTT CTAAACACAACAGCCCC/----------------- ATAAGTCAGT 3070 hom 69 het 24 0 24 4 CTAAACACAACAGCCCC 1 0 246879 CASAVA_Build 11 57030756 4I TACTCTGCCC ----/TTTA TTTACTAGCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTTA 1 2 246880 CASAVA_Build 11 57078965 1D TGGATAAAGA T/- GGACTAGATG 3070 hom 141 het 54 0 47 8 T 1 0 246881 CASAVA_Build 11 57084673 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1638 het 60 hom 17 1 7 9 T 15 14 246882 CASAVA_Build 11 57087531 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 20 1 13 6 A 16 14 246883 CASAVA_Build 11 57100110 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 678 hom 27 3 13 11 A 15 14 246884 CASAVA_Build 11 57110951 3I TGGCACAGAG ---/AAC AACAGCAAAG 3070 hom 70 het 30 0 25 5 AAC 1 2 246885 CASAVA_Build 11 57120444 3I CCCAATGTAA ---/GTT GTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 28 0 24 4 GTT 1 2 246886 CASAVA_Build 11 57122982 2I GTGTATGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 536 hom 47 3 30 14 GT 7 8 246887 CASAVA_Build 11 57125451 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2928 het 1232 hom 23 5 11 7 A 12 14 246888 CASAVA_Build 11 57147913 10I GTCGTGCACA ----------/CCTGTGGTAC CAGCTACTCT 2760 het 2760 ref 24 14 7 3 CCTGTGGTAC 0 1 246889 CASAVA_Build 11 57150466 1D GCTATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1767 hom 22 8 10 4 T 13 12 246890 CASAVA_Build 11 57180966 1D AAACAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 30 1 21 8 A 11 10 246891 CASAVA_Build 11 57201902 1D TGTGCCTTTT C/- CTTCTCACAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 C 2 1 246892 CASAVA_Build 11 57211306 1I CCTTCCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 10 11 246893 CASAVA_Build 11 57242347 1I TTTCTCCCCA -/T TAGATGGACT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 1 2 246894 CASAVA_Build 11 57248660 1D TCTGGGGATT A/- AAAAAAAAAA 938 het 938 ref 27 15 3 9 A 15 14 246895 CASAVA_Build 11 57255037 5I AACACAAAAC -----/TTAAA TTAGTTAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTAAA 0 1 246896 CASAVA_Build 11 57260389 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 41 1 25 15 A 15 14 246897 CASAVA_Build 11 57265810 1I CAGTGGCGCC -/G GGGGGGGGCC 1540 het 1455 hom 16 5 7 4 G 8 9 246898 CASAVA_Build 11 57277179 1I GCCACCGTCC -/T TAGCGCGCTG 3044 het 2279 hom 21 7 10 4 T 1 2 246899 CASAVA_Build 11 57283834 1D TATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 12 11 246900 CASAVA_Build 11 57291742 1I CCATCTTATA -/G GATTGTTGTG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 1 2 246901 CASAVA_Build 11 57292194 1I AAGGTCTCTT -/A AAAACCTGAG 3070 het 2885 hom 26 8 15 3 A 4 5 246902 CASAVA_Build 11 57295471 9I GAGGTTATTT ---------/TATATAGAG TATATAGAGT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 TATATAGAG 1 2 246903 CASAVA_Build 11 57297171 4D TTTATATGTA TTAC/---- TTCATCATAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TTAC 1 0 246904 CASAVA_Build 11 57329599 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 10 9 246905 CASAVA_Build 11 57335845 4I TAATATTGTA ----/ATAG ATAGTTACTA 3070 hom 80 het 31 0 27 4 ATAG 1 2 246906 CASAVA_Build 11 57344489 1I GGTTATCCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 12 12 14 T 9 10 246907 CASAVA_Build 11 57344956 3D TGTAGACAAT ATG/--- ATGTGGTGAT 3070 het 3070 ref 55 30 19 6 ATG 2 1 246908 CASAVA_Build 11 57349794 2I TAGTCTTTTG --/GT GTGGGTACTT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 GT 1 2 246909 CASAVA_Build 11 57354975 1D ATTTTACTTT A/- AAAATTTTTT 3070 het 2674 hom 24 8 14 3 A 5 4 246910 CASAVA_Build 11 57355295 2D AAAAACTAAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 18 14 11 AC 7 6 246911 CASAVA_Build 11 57364816 1D CTATTTAGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 10 9 246912 CASAVA_Build 11 57408434 1I TCATGAGATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 9 10 246913 CASAVA_Build 11 57413371 1I AGACTCCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 10 10 A 11 12 246914 CASAVA_Build 11 57416726 3D GCTTTTTGTC CTT/--- CTTTCTGCTA 3070 het 3070 hom 49 24 22 4 CTT 2 1 246915 CASAVA_Build 11 57424669 4D GGATTTATAA CTTT/---- CTTCCTGACA 3070 het 3070 hom 52 18 24 10 CTTT 1 0 246916 CASAVA_Build 11 57431237 3I AGGGAGACTC ---/CTT CTCAACAAAA 3070 hom 50 het 21 0 17 4 CTT 0 1 246917 CASAVA_Build 11 57431519 1I TAAACACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2547 hom 25 8 10 7 T 11 12 246918 CASAVA_Build 11 57434159 1D TGCACATTGA T/- TTTTGTATCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 5 4 246919 CASAVA_Build 11 57437595 1D19M1D GACTCTGTCT AAAAAAAAAACCCAAAAACCA/-AAAAAAAAACCCAAAAACC- AAAAACTATA 3070 hom 74 het 28 0 25 12 N/A 0 0 246920 CASAVA_Build 11 57439411 4D CGCAACATAA AAAT/---- AAATAGGAAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 AAAT 2 1 246921 CASAVA_Build 11 57439477 2D CTAAAACTTG CT/-- CTCTCTGTTA 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 CT 4 3 246922 CASAVA_Build 11 57455994 2D TAAGCTCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 1437 het 713 hom 35 6 5 24 T 16 14 246923 CASAVA_Build 11 57456948 1D TGCTAGTTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 77 het 28 0 26 2 A 10 9 246924 CASAVA_Build 11 57460158 5I AACCAATAAA -----/TAACT TCACTGTTGG 3070 hom 119 het 44 0 39 5 TAACT 0 1 246925 CASAVA_Build 11 57481381 17I TGGCTGTATA -----------------/TTTTAATTTTAGTAAAT TTTCAAGAGT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TTTTAATTTTAGTAAAT 0 1 246926 CASAVA_Build 11 57492496 16I ACAAAACTCC ----------------/TCCTTCTTCTCTCCAT TCCTTCTTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 7 TCCTTCTTCTCTCCAT 0 1 246927 CASAVA_Build 11 57507127 4D CACGTTTAAG GATA/---- GATAAATAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 GATA 2 1 246928 CASAVA_Build 11 57508931 1D CTCCTGCTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 T 9 8 246929 CASAVA_Build 11 57529736 1I TAGCTTATAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 A 9 10 246930 CASAVA_Build 11 57535661 4D AATTAATGTT CATC/---- CATTCAATGG 3070 het 3070 ref 40 27 12 1 CATC 1 0 246931 CASAVA_Build 11 57535881 4I TAAAAGAATC ----/AGAA AGAAAAGCTA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 AGAA 1 2 246932 CASAVA_Build 11 57538762 4D GCAAAACAAA CTAT/---- CAGGCAGAAT 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 CTAT 1 0 246933 CASAVA_Build 11 57540212 4D ACACACACAC AAAA/---- AAAAAACCCC 707 het 707 ref 33 16 8 10 A 10 6 246934 CASAVA_Build 11 57541396 3I TAACATTTAT ---/AAC AACAATAATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAC 1 2 246935 CASAVA_Build 11 57543498 4I6M4D7M16D CCCCACTTCC ----TTTGCCAGTGGGGTTCTGTAGCCCCAACATTGG/GATGTGTCCC----GGTTTCT---------------- AGGTTGGGAT 3070 hom 98 het 29 0 33 5 N/A 0 0 246936 CASAVA_Build 11 57546094 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 0 1 246937 CASAVA_Build 11 57559316 1D GCAGAAAAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 8 7 246938 CASAVA_Build 11 57561252 1I ATTGTTAGCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 T 8 9 246939 CASAVA_Build 11 57562079 1I GCGCCCGGCC -/A AGAATAACTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 246940 CASAVA_Build 11 57566253 1D CCCTGGAATA G/- TCATTTATTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 0 246941 CASAVA_Build 11 57570328 2I TTGTTCCCTC --/CT CTCTCAGGGT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 CT 2 3 246942 CASAVA_Build 11 57571766 3D CTAATGATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 30 1 16 13 A 17 14 246943 CASAVA_Build 11 57578766 1D AGGTCAGAAG T/- TTTGAGACCA 3070 hom 94 het 35 0 31 4 T 4 3 246944 CASAVA_Build 11 57605842 2D TGATAGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2331 hom 7 het 13 0 8 6 T 18 16 246945 CASAVA_Build 11 57623355 5D AATATATAAC ATAAT/----- ATAATATATA 3070 hom 24 het 10 0 9 3 ATAAT 2 1 246946 CASAVA_Build 11 57626302 9D TTGTTTTGTA TACCCTTTT/--------- TACCCTTTTT 3070 hom 126 het 50 0 43 9 TACCCTTTT 2 1 246947 CASAVA_Build 11 57626607 1D GGGTGGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 26 0 21 5 T 11 10 246948 CASAVA_Build 11 57628398 1D TGGATGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 253 hom 38 1 26 11 T 14 13 246949 CASAVA_Build 11 57629129 1D AGAAGGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 12 11 246950 CASAVA_Build 11 57629877 1D TAATATTCTG T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 6 246951 CASAVA_Build 11 57635922 1I ATTTAGCCAC -/A GAGTCCTTTT 2151 het 2151 ref 38 21 10 7 A 0 1 246952 CASAVA_Build 11 57645212 4D ATAAATGCTC CTTT/---- CTTTTGATCT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 CTTT 2 1 246953 CASAVA_Build 11 57663332 1D TGTGCAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 12 11 246954 CASAVA_Build 11 57668867 1D TTGAGTGTTT C/- CTTTTGGCTG 3070 hom 119 het 49 0 37 14 C 2 1 246955 CASAVA_Build 11 57675825 1D CCCCAGACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 12 14 T 11 10 246956 CASAVA_Build 11 57677605 1D GCAAGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 13 12 T 13 12 246957 CASAVA_Build 11 57686212 1D CCTTCTTTGT A/- ACTGTGTAAC 3070 het 3070 hom 55 26 25 4 A 2 1 246958 CASAVA_Build 11 57690548 3D TGCAAGTATC TCT/--- TCTTATTAAA 3070 het 3070 ref 42 19 17 8 TCT 2 1 246959 CASAVA_Build 11 57703336 18D GCTTCCAAAG TGCTGATATTACAGGTGT/------------------ GAGCCACAGC 3070 het 3070 ref 30 21 8 6 TGCTGATATTACAGGTGT 1 0 246960 CASAVA_Build 11 57720514 30D ATAAAGATTG TGTATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 3070 het 513 hom 12 3 9 6 TGTATATATATATATATATATATATATATA 1 0 246961 CASAVA_Build 11 57724700 4I TCACCTGAAA ----/ACTC ACTCACTCAC 3070 het 3070 ref 54 21 16 17 ACTC 2 3 246962 CASAVA_Build 11 57728652 7D CAAGTCTCGT AAAAGTG/------- AAGAGACTGG 3070 het 3070 ref 43 21 17 10 AAAAGTG 1 0 246963 CASAVA_Build 11 57743243 8D CCCCTTTACC ATATCAGT/-------- AAACTGGAGA 3070 het 3070 hom 46 20 24 6 ATATCAGT 1 0 246964 CASAVA_Build 11 57745414 3I ATTTATTTAT ---/TTG TTATCTTTTT 2952 het 2952 ref 21 9 7 5 TTG 0 1 246965 CASAVA_Build 11 57748429 1I ATAAAAAAAG -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 6 7 246966 CASAVA_Build 11 57749980 2D GAAGTACCCC AA/-- CCCCCACCAA 3070 het 637 hom 26 4 18 4 A 2 0 246967 CASAVA_Build 11 57753144 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1947 hom 18 het 7 0 7 1 T 7 6 246968 CASAVA_Build 11 57756302 5D AAAAAAAGTT GAAAA/----- GAGTGAAACA 3070 het 3070 hom 35 13 18 7 GAAAA 1 0 246969 CASAVA_Build 11 57758182 1I GTGGGTGGGA -/T TTGTGGATCT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 T 2 3 246970 CASAVA_Build 11 57759020 8D GACTCCGTCT AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 2714 het 2714 ref 29 18 7 7 AAAC 6 4 246971 CASAVA_Build 11 57763317 3D CTGTAGAAAA TTG/--- TTGTCTGGGG 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 TTG 2 1 246972 CASAVA_Build 11 57767210 3D AGATCTTTCA CTT/--- CTTTGGTTAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 CTT 2 1 246973 CASAVA_Build 11 57770758 1D CTGTTGAAGA T/- TTTTTTTTTA 1850 het 1850 ref 47 37 4 6 T 10 9 246974 CASAVA_Build 11 57771542 1I GTCATATGAA -/G AAAAGCTCAA 1395 het 1395 ref 32 23 3 6 G 0 1 246975 CASAVA_Build 11 57772059 1D CATATTCTTA G/- TTATAAGTGG 3053 het 3053 ref 30 18 8 4 G 1 0 246976 CASAVA_Build 11 57778536 1I AATATATTAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 8 9 246977 CASAVA_Build 11 57779372 1I CTTTCAACAA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 6 7 246978 CASAVA_Build 11 57783178 8D TTCCTTTGAG AAATGTCT/-------- ATTTATGTCA 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 AAATGTCT 1 0 246979 CASAVA_Build 11 57785128 4I CAACGTGCAG ----/GTTT GTTACATATG 2386 het 2386 ref 16 9 5 2 GTTT 0 1 246980 CASAVA_Build 11 57787851 1I TGTCTAGGAC -/T TCCAGTACTT 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 T 1 2 246981 CASAVA_Build 11 57790705 1D TTTTTTAGTT A/- AAAATCTATT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 5 4 246982 CASAVA_Build 11 57792729 1D GGAAATCTAA G/- AAGCCTTCCT 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 G 1 0 246983 CASAVA_Build 11 57798804 2D ATACAACTGA GG/-- GGGTAACATA 3070 het 3070 hom 49 23 23 4 G 5 3 246984 CASAVA_Build 11 57802114 1I TGCATTTCTC -/T TAACGACCAG 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 T 1 2 246985 CASAVA_Build 11 57805326 2D GTCTTGACTC TT/-- TATCCAATTT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 3 1 246986 CASAVA_Build 11 57813300 1I TCCTCACCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 A 9 10 246987 CASAVA_Build 11 57823642 9I CTTTTTCAAC ---------/AGACGTTTA TGTGCTCCCT 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 AGACGTTTA 0 1 246988 CASAVA_Build 11 57825249 2I AGAGAGAGAG --/AA AAAAAAAGAA 3070 het 2149 hom 19 5 11 4 A 7 9 246989 CASAVA_Build 11 57857736 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 2381 het 1925 hom 12 4 6 2 T 6 7 246990 CASAVA_Build 11 57860461 1I ATGAATTTTC -/T TTCTTCTGTG 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 2 3 246991 CASAVA_Build 11 57861072 1D TATTTGTCTT A/- AAAAATGCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 5 246992 CASAVA_Build 11 57877489 1I TTATCAGTAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 8 9 246993 CASAVA_Build 11 57887869 1D CACATCCTCT C/- CAGCACCTGT 3070 het 1735 hom 11 4 7 0 C 2 1 246994 CASAVA_Build 11 57893089 1D TACTCTTCTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 9 8 246995 CASAVA_Build 11 57898992 1D ATATGATATA T/- TTACATATAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 3 2 246996 CASAVA_Build 11 57903775 1I AGAAAAAGCA -/T TTGATAAAAT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 2 3 246997 CASAVA_Build 11 57905395 1D GGAGGTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 22 10 A 11 10 246998 CASAVA_Build 11 57907960 1D CCTTTTTAAC A/- TTTAATATGT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 1 0 246999 CASAVA_Build 11 57921261 3I ACAAATTTAC ---/AAG AAGAAACAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 AAG 1 2 247000 CASAVA_Build 11 57923419 5D TCTAGAAGGC TTATA/----- TTATAGATGG 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 TTATA 2 1 247001 CASAVA_Build 11 57926257 1I CATGTGGTAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 8 9 247002 CASAVA_Build 11 57927369 1D TATAGATGAA G/- GGGAACGTTA 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 G 4 3 247003 CASAVA_Build 11 57930249 4I18M3I AGAGAGAAAG ----AGAGAGAGAGTTAGATAG---/AGACAGAGAGAGAGTTAGATAGTAT TATTATTACT 3070 het 3070 ref 28 17 15 3 N/A 0 0 247004 CASAVA_Build 11 57931583 3I TTAAATTTAT ---/TTC TTTTTTCATT 3070 het 2819 hom 18 8 10 0 TTC 0 1 247005 CASAVA_Build 11 57932267 12D CTTGAACCCG GGAGGCAGAGGC/------------ GGAGGCAGAG 2524 het 941 hom 15 4 6 6 GGAGGCAGAGGC 2 1 247006 CASAVA_Build 11 57932359 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 9 10 247007 CASAVA_Build 11 57933062 1I GATGGGTCAC -/A AAAACAGTGG 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 4 5 247008 CASAVA_Build 11 57936665 1D CCATTTCTGT A/- AAAAAGATGC 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 A 6 5 247009 CASAVA_Build 11 57940670 1D TTATCTTTTC A/- AAAAACTCTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 A 6 5 247010 CASAVA_Build 11 57943318 1I TAGGAAAATG -/T TTCATGACAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 2 3 247011 CASAVA_Build 11 57956325 1I CAATATGTGC -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 6 7 247012 CASAVA_Build 11 57959050 11D GACCCAATCT CAAAAACAAAA/----------- CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 6 CAAAAACAAAA 1 0 247013 CASAVA_Build 11 57966623 3I ATAAATGGTC ---/AAA AAAGTGACTC 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 A 3 6 247014 CASAVA_Build 11 57973586 5I GGGAACTAAT -----/TAAAC TAAAGAGCTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TAAAC 0 1 247015 CASAVA_Build 11 57984113 1I TGTGTTCTTG -/A AAAAATATTA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 5 6 247016 CASAVA_Build 11 57987747 12D TCAAAAAAAG GTGAAATGTAAT/------------ GTGAAATGTA 3070 hom 129 het 48 0 44 7 GTGAAATGTAAT 2 1 247017 CASAVA_Build 11 57990682 12I GAGATTCCTA ------------/AAGTGTCTCTTT AACTATCTCT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 AAGTGTCTCTTT 0 1 247018 CASAVA_Build 11 57995432 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2334 het 1824 hom 15 4 6 6 A 11 10 247019 CASAVA_Build 11 57996552 6I GTGTATATAT ------/ATATAC ATGTATATAT 2497 het 2497 ref 19 11 7 1 ATATAC 0 1 247020 CASAVA_Build 11 58001944 1D GGCTCTGTGT C/- CCCCCCTGAA 3070 het 3070 hom 41 14 20 8 C 7 6 247021 CASAVA_Build 11 58003165 4D GAAGGAAACT GATA/---- GATACTGATA 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 GATA 2 1 247022 CASAVA_Build 11 58004134 1D CTCTGAGCAG T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 7 6 247023 CASAVA_Build 11 58038762 2I CTTTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2495 het 574 hom 27 3 9 15 T 14 16 247024 CASAVA_Build 11 58041726 1D ACCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 19 6 T 12 11 247025 CASAVA_Build 11 58050570 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 20 0 16 5 A 13 12 247026 CASAVA_Build 11 58052325 2D CTTTCAATCT CA/-- GTGTCCTCAT 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 CA 1 0 247027 CASAVA_Build 11 58063052 3I CTTTAAAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 100 het 38 0 33 5 AAC 3 4 247028 CASAVA_Build 11 58066287 4I TTGGACATTA ----/TGAG TAAGTCAGGA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 TGAG 0 1 247029 CASAVA_Build 11 58086861 1D GAGCGACTTG T/- GGGGGGGAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 1 0 247030 CASAVA_Build 11 58105279 6D CACTCTTTAA TATTAC/------ TATTCGTAGA 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 TATTAC 1 0 247031 CASAVA_Build 11 58119622 1D AGTATCAATC T/- TTTTTTTTTT 2283 het 551 hom 26 5 9 12 T 17 16 247032 CASAVA_Build 11 58129612 1D TGCTTGACGA T/- TTTTTTTTTT 1131 het 1131 ref 50 35 6 9 T 11 10 247033 CASAVA_Build 11 58136769 1I AGAGTACCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 30 0 23 7 T 12 13 247034 CASAVA_Build 11 58142626 1I GGAAGTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 12 10 15 T 12 13 247035 CASAVA_Build 11 58159205 6D TTTGGGAATA CTTTTT/------ CTTTGTATAA 3070 het 3070 ref 52 28 22 2 CTTTTT 1 0 247036 CASAVA_Build 11 58160598 1I TTTTATTTTT -/A AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 6 7 247037 CASAVA_Build 11 58160818 1D AGTATCCAAT A/- GGGGGCAACA 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 A 1 0 247038 CASAVA_Build 11 58174248 2D ACATTGTCTC TG/-- TAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 TG 1 0 247039 CASAVA_Build 11 58174459 1I GATTACCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 A 10 11 247040 CASAVA_Build 11 58174550 1D AGTTTACATG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 9 8 247041 CASAVA_Build 11 58175640 1I TTCTAAATTA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 6 7 247042 CASAVA_Build 11 58175960 4D TTGTTTTCTT TCTC/---- TCTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 11 TC 4 2 247043 CASAVA_Build 11 58187305 1D ACTCTCCCCC T/- GGATATTAGG 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 1 0 247044 CASAVA_Build 11 58187651 2D CACTTGCTGT CA/-- TATATAGGGA 3070 het 3070 ref 56 26 24 7 CA 1 0 247045 CASAVA_Build 11 58188353 1I CAATATCCCA -/G GGGGGGTGTC 3070 het 3070 ref 45 21 12 12 G 6 7 247046 CASAVA_Build 11 58207157 4I GCTCATGGAT ----/AGAA AGAATCAATA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AGAA 1 2 247047 CASAVA_Build 11 58207651 1D CTAAAACCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 108 hom 28 1 22 5 A 12 11 247048 CASAVA_Build 11 58210834 3I CTGGAATAAA ---/TCT TCTTCAGATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TCT 1 2 247049 CASAVA_Build 11 58217624 3D AAGTTCCCTT CAA/--- CAACAACAGT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 CAA 3 2 247050 CASAVA_Build 11 58218180 1I ATCTAAGAAG -/T TTTTTTTTTT 2756 het 2756 ref 34 12 10 12 T 15 16 247051 CASAVA_Build 11 58220301 1D GATCAGTATA T/- TAAACTCATT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 2 1 247052 CASAVA_Build 11 58226654 4D TTAGAATCTC TGTT/---- TGATTCATTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 TGTT 1 0 247053 CASAVA_Build 11 58228347 1D TCCTCAAGGG A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 A 6 5 247054 CASAVA_Build 11 58229769 2I TAAATATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 1343 hom 27 5 10 12 TA 7 8 247055 CASAVA_Build 11 58233421 6I AAAGGCTTTA ------/GAAAGG GAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 GAAAGG 0 1 247056 CASAVA_Build 11 58240435 1I CCTCCTGCTG -/C CCCCTACCCC 3070 hom 117 het 44 0 38 6 C 4 5 247057 CASAVA_Build 11 58241202 1I CTTTTATATG -/C CCCCCCATCC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 C 6 7 247058 CASAVA_Build 11 58245425 1I TTAAACTTCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 7 8 247059 CASAVA_Build 11 58247278 1D ATACAGTGTC T/- TAACTAATAT 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 T 2 1 247060 CASAVA_Build 11 58281088 1D GAATTATGGG A/- GGGGTAGTTT 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 A 1 0 247061 CASAVA_Build 11 58290548 5D GGGAGAGGTT GGGAA/----- GGCAGTGAGA 3070 het 3070 hom 28 12 15 7 GGGAA 1 0 247062 CASAVA_Build 11 58299279 2I CTGTTCTAGT --/CA CACAACTGGA 3070 hom 95 het 35 0 30 5 CA 2 3 247063 CASAVA_Build 11 58303616 4I2M1I TAAAGAAATT ----TC-/GAGGTCT AATGGACTCA 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 N/A 0 0 247064 CASAVA_Build 11 58305299 1D ACTTTATCAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 9 8 247065 CASAVA_Build 11 58307877 1I ATGAGCAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 402 hom 38 1 34 3 T 9 10 247066 CASAVA_Build 11 58312705 16I CAAAACCTGT ----------------/GGACAGAAGTACATAG GGCTATAGAA 3070 het 3070 hom 48 21 17 10 GGACAGAAGTACATAG 0 1 247067 CASAVA_Build 11 58316304 1I AAAGTAAGGG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 A 7 8 247068 CASAVA_Build 11 58318029 1D TTCAAGAAAA C/- CCTATTTATG 3070 het 3070 ref 35 17 11 8 C 3 2 247069 CASAVA_Build 11 58319288 5D TTTCAGAAGT AAAGA/----- AAAGTTATAA 3070 het 3070 hom 32 15 17 1 AAAGA 1 0 247070 CASAVA_Build 11 58319853 3D TCATGCTTAA AAG/--- AAGGATTAGT 3070 het 3070 hom 34 11 17 7 AAG 2 1 247071 CASAVA_Build 11 58320857 1D GATGGGTTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 10 9 247072 CASAVA_Build 11 58326829 1D GATTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 11 10 247073 CASAVA_Build 11 58328408 3D CAGGATGTAT CTA/--- GTAGATATAT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 CTA 1 0 247074 CASAVA_Build 11 58347820 1I TTTGCATCAG -/A AAAAAACTAA 2342 het 2342 ref 24 12 6 6 A 6 7 247075 CASAVA_Build 11 58348880 6D ACCATATATT TAAGAC/------ TAAGACTAGA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 TAAGAC 2 1 247076 CASAVA_Build 11 58350484 4I AGATAAAAGA ----/TTTC TTTGTCAATT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 TTTC 0 1 247077 CASAVA_Build 11 58351396 1D ATAAAGCAAA C/- CAGTCTTACC 3070 het 2438 hom 17 5 10 3 C 2 1 247078 CASAVA_Build 11 58353811 5D ATAAAAGTAA TTCCT/----- TTCCTGCTAA 3070 het 3070 hom 32 9 16 9 TTCCT 2 1 247079 CASAVA_Build 11 58355820 2D AGCAGAAATA TT/-- TCTATGAAAT 3070 het 3070 ref 51 26 24 1 T 3 1 247080 CASAVA_Build 11 58360617 2I TGCAGTAAAG --/TA TGTGTATGTG 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 TA 0 1 247081 CASAVA_Build 11 58363920 1D AATTCCACTT A/- AAAAGTACAT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 5 4 247082 CASAVA_Build 11 58364157 2I TAATCTTCTG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 A 9 11 247083 CASAVA_Build 11 58367774 1I ATAGACAGGG -/A AAAAATGTAC 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 5 6 247084 CASAVA_Build 11 58370062 1I TATCAAAGAA -/T TTTTACATAT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 4 5 247085 CASAVA_Build 11 58372822 1I AGATGGAGAT -/A GGGGTAGAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 0 1 247086 CASAVA_Build 11 58375617 1I AAAAAGAATT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 8 247087 CASAVA_Build 11 58378743 2D1M3I TGTCTGAAAT CAA---/--ATGT AATGCTATTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 N/A 0 0 247088 CASAVA_Build 11 58381332 1D GAGCATTAAG A/- AAAAAACCCA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 7 6 247089 CASAVA_Build 11 58382518 2D GGGCTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 43 0 35 10 A 14 12 247090 CASAVA_Build 11 58383374 2I TAGCATTCAT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TC 7 8 247091 CASAVA_Build 11 58384382 4D TTTTACCACC TTGT/---- TTAAGTTTAC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 TTGT 1 0 247092 CASAVA_Build 11 58386106 10D ACAAACAAAC AAACAAAAAA/---------- AAACAGATTT 3070 hom 81 het 33 0 27 7 AAACAAAAAA 1 0 247093 CASAVA_Build 11 58386878 1D TTGGTTATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 9 247094 CASAVA_Build 11 58387179 4I GGTGGATATT ----/TTCA ATGCATATGT 3070 hom 126 het 44 0 41 3 TTCA 0 1 247095 CASAVA_Build 11 58388412 5D TAGATCTGGC ATTAA/----- ATTAAGATGT 3070 hom 104 het 41 0 32 11 ATTAA 2 1 247096 CASAVA_Build 11 58389199 2I GTAGTTCTGC --/AA AAAAAAAAGG 3070 hom 87 het 34 0 28 6 A 8 10 247097 CASAVA_Build 11 58389786 3I AGGAAGAAGG ---/CTT CAGGTGTCTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 CTT 0 1 247098 CASAVA_Build 11 58403228 1D GTCCCTTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 10 9 247099 CASAVA_Build 11 58403902 2D TTTTTTTCCT TG/-- TTTTTTTTTT 2706 het 343 hom 31 8 12 11 TG 1 0 247100 CASAVA_Build 11 58413071 1I AAATATGCTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 8 9 247101 CASAVA_Build 11 58419006 9D ATGCAAAAGC TAATACAGA/--------- TAATACAGAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TAATACAGA 2 1 247102 CASAVA_Build 11 58419443 1D GCCATCATAA C/- AAAATTTCAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 1 0 247103 CASAVA_Build 11 58419826 1D CAAGCCAAAA G/- CTTGCATAAG 3070 hom 87 het 32 0 29 4 G 1 0 247104 CASAVA_Build 11 58420760 1D TAACTTCTGT C/- GTTTTCAAAC 3070 hom 59 het 37 0 19 19 C 1 0 247105 CASAVA_Build 11 58422532 2D TTGTTTCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 29 0 20 12 T 14 12 247106 CASAVA_Build 11 58424953 10I CATTGGCCTT ----------/AATGGATGTC AATCTTCACC 3070 hom 105 het 41 0 34 7 AATGGATGTC 0 1 247107 CASAVA_Build 11 58434205 1I TTCCATACAT -/G TATGGCTCCT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 G 0 1 247108 CASAVA_Build 11 58439976 2I AACGAAACTT --/AA GTTAAGTTGC 3070 het 3070 hom 59 27 28 4 A 0 2 247109 CASAVA_Build 11 58448250 1D ATAAACACAC T/- TATGGATAAT 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 T 2 1 247110 CASAVA_Build 11 58451728 1I TCTAATGCCC -/T TTTTTTAACC 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 T 6 7 247111 CASAVA_Build 11 58454158 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 T 7 6 247112 CASAVA_Build 11 58468010 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 34 1 22 11 T 12 11 247113 CASAVA_Build 11 58473379 1D TGACCCTAGC T/- TGAGGAACAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 2 1 247114 CASAVA_Build 11 58475557 1D ATATGAACAT A/- AACTAATTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 4 A 3 2 247115 CASAVA_Build 11 58476099 6I CAATTCCAAC ------/TAATAA TAATAATAGT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TAA 2 4 247116 CASAVA_Build 11 58586654 3D GAGTAAAGTA CCG/--- CACTCAGTAA 3070 hom 68 het 28 0 23 5 CCG 1 0 247117 CASAVA_Build 11 58598477 1I ATTTCAGGGG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 8 9 247118 CASAVA_Build 11 58606753 1D TCAGCATACA T/- TTTTTTCGGG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 7 6 247119 CASAVA_Build 11 58606868 1D AACGAAGACC A/- CCCCCCCACC 3070 hom 60 het 21 0 19 2 A 1 0 247120 CASAVA_Build 11 58617819 2I GAAATTCTCA --/AG GAGCTGGGAG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 AG 0 1 247121 CASAVA_Build 11 58637260 4I AAATTGTGTG ----/TTAA TTGTGTAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TTAA 0 1 247122 CASAVA_Build 11 58642835 4D CCAAATACTT TCTC/---- TATGTCTGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TC 2 0 247123 CASAVA_Build 11 58657312 2D TATAAAGGAA AG/-- AGGTTTAATT 3070 hom 63 het 22 0 20 2 AG 2 1 247124 CASAVA_Build 11 58665845 2I AGAAAGAAAG --/AA AGAAGAAATA 3070 hom 77 het 28 0 26 2 A 1 3 247125 CASAVA_Build 11 58732408 2I CCTGGCTAGA --/CT CTTTGTTTGC 3070 het 3070 ref 55 27 15 13 CT 1 2 247126 CASAVA_Build 11 58738444 1D TCCGGGTATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 9 8 247127 CASAVA_Build 11 58740282 1D ACAACCATGT A/- AAAAAAAAAC 2969 het 2969 ref 36 18 9 9 A 10 9 247128 CASAVA_Build 11 58749364 4I AGAGTGAGTC ----/ATAA ATAGAGACAG 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 ATAA 0 1 247129 CASAVA_Build 11 58759147 1D TACATAAAAA G/- ACCAAACCTG 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 G 1 0 247130 CASAVA_Build 11 58762323 1I AGGACAATCC -/T TTAGCAAAAA 1914 het 1914 ref 19 12 4 3 T 2 3 247131 CASAVA_Build 11 58765743 1D TTCCTAGTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 9 8 247132 CASAVA_Build 11 58767233 1I AATCTGAGAT -/G GTATTTCATT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 G 1 2 247133 CASAVA_Build 11 58767607 1I TGAAAGGCTG -/A TGTGTTCATA 3070 het 3070 ref 34 23 8 3 A 0 1 247134 CASAVA_Build 11 58776561 1D AACTGACAAG T/- TTTACATTGT 3070 het 3070 hom 60 22 28 11 T 4 3 247135 CASAVA_Build 11 58780145 1D GCCCAGACAA T/- TTTTTTTTCC 2219 het 2219 ref 15 9 6 0 T 9 8 247136 CASAVA_Build 11 58806110 23I TTTAAGTATT -----------------------/ATGTAAACATACATACATGTAAA GTTAACTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ATGTAAACATACATACATGTAAA 0 1 247137 CASAVA_Build 11 58831572 1D AAACACAGAA T/- TTATTGTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 3 2 247138 CASAVA_Build 11 58857554 1I ATGACTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 A 10 11 247139 CASAVA_Build 11 58877621 1D CATTTCTTTC T/- TTATGTCCAT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 3 2 247140 CASAVA_Build 11 58885166 4D ACTACAAGAT AGAA/---- AGAAGTACAA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 AGAA 2 1 247141 CASAVA_Build 11 58893214 1I CAGAGATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 10 11 247142 CASAVA_Build 11 58903188 1D TTAACAGGTG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 A 9 8 247143 CASAVA_Build 11 58904218 5D TTTTGGTCTC TATTT/----- CATTTAGTTC 3070 het 3070 ref 34 21 13 6 TATTT 1 0 247144 CASAVA_Build 11 58905494 1D AGAATTACTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 8 247145 CASAVA_Build 11 58911740 1D GTGAGATGAA C/- CCAGTACCTC 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 C 3 2 247146 CASAVA_Build 11 58914185 1I ATTTAATAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 9 10 247147 CASAVA_Build 11 58925333 1D GCAACTAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 13 12 A 15 14 247148 CASAVA_Build 11 58927657 1I GGTTATAAAC -/A AAAAGAGATT 3070 het 3070 ref 54 22 21 11 A 4 5 247149 CASAVA_Build 11 58932485 3D CTTCTGAAAA CAT/--- CAGAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 21 13 4 CAT 1 0 247150 CASAVA_Build 11 58936878 1I TCCCCACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 16 14 15 A 14 15 247151 CASAVA_Build 11 58938736 1I ATTCAAAAAC -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 6 7 247152 CASAVA_Build 11 58945859 1I TTCATTTTAC -/A AAGCAACAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 3 247153 CASAVA_Build 11 58947106 4D AGAAGATCAT ACAA/---- ACAGTCAGCA 3070 het 3070 ref 40 25 14 2 ACAA 1 0 247154 CASAVA_Build 11 58947684 2D TGTATATTTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 36 19 13 4 TA 6 5 247155 CASAVA_Build 11 58950794 2D TTAGAAACAC AT/-- GTTTCCAACT 3070 het 3070 ref 41 23 11 8 AT 1 0 247156 CASAVA_Build 11 58955121 7D AATTGCTAGG TAAAACT/------- TAAACTAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 TAAAACT 1 0 247157 CASAVA_Build 11 58969032 1D AAATGTTGTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 8 7 247158 CASAVA_Build 11 58978786 2I ATTATTTAAA --/TT TTTTTTTTTT 2227 het 1556 hom 24 7 8 9 T 16 18 247159 CASAVA_Build 11 58985096 1I GTGCTTCCTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 A 8 9 247160 CASAVA_Build 11 58988612 1D AAGTCAGCAT A/- ATGAGGGACA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 2 1 247161 CASAVA_Build 11 58996633 1I AGAAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 12 24 11 A 13 14 247162 CASAVA_Build 11 59009775 2I AAATAGACTC --/TT GAGTAATAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 2 247163 CASAVA_Build 11 59029145 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2302 het 2302 ref 34 22 7 5 A 15 16 247164 CASAVA_Build 11 59041283 1I GACACTTGTC -/A AAAAAAAAAA 2175 het 2175 ref 31 10 7 14 A 12 13 247165 CASAVA_Build 11 59077340 8D ACAAAAAAAC AAAAAACA/-------- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 12 AAAAAACA 2 1 247166 CASAVA_Build 11 59130483 1D GCAGACACAG A/- AAAAAAAAAA 1184 het 1184 ref 44 28 4 13 A 14 13 247167 CASAVA_Build 11 59176200 2I CCTTTCTCTC --/TT TGTTACAATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 1 3 247168 CASAVA_Build 11 59185467 3D TGAAACTTCT TCC/--- TCCTCCTCAA 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 TCC 3 2 247169 CASAVA_Build 11 59217523 1D CAAAAAACCT A/- AAAAAGTATG 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 6 5 247170 CASAVA_Build 11 59275236 3I AAATGGGTAC ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 TAT 4 5 247171 CASAVA_Build 11 59314705 1D TGTGGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 1037 het 1037 ref 30 22 4 4 T 12 11 247172 CASAVA_Build 11 59382386 4I AACTTATGCG ----/TTGT TTATTTCTGA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 TTGT 0 1 247173 CASAVA_Build 11 59406314 1D CTTTTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 11 10 247174 CASAVA_Build 11 59468408 1D TATAAACTGC G/- GGGGGGGGGC 3070 het 19 hom 24 1 14 9 G 10 9 247175 CASAVA_Build 11 59470876 1D AGATTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 2747 het 2747 ref 41 26 6 9 T 15 14 247176 CASAVA_Build 11 59476457 1D AATGAGTGGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 9 8 247177 CASAVA_Build 11 59490217 1D ACCAGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2362 het 2362 ref 42 30 6 6 T 13 12 247178 CASAVA_Build 11 59500952 5D TGTTGGAGAT TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 TTTTA 3 2 247179 CASAVA_Build 11 59504687 9D GGCCTCCAGG ACTACACGT/--------- AATTTGTTCC 3070 het 3070 ref 38 25 12 6 ACTACACGT 1 0 247180 CASAVA_Build 11 59512987 1I CTATTTTTTT -/G GGTATGCATT 3070 het 3070 ref 51 30 15 6 G 2 3 247181 CASAVA_Build 11 59513717 1I GATTATTAGA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 T 7 8 247182 CASAVA_Build 11 59515361 1D CACCATCCAT G/- CCAACATCTA 3070 het 3070 ref 49 35 11 3 G 1 0 247183 CASAVA_Build 11 59518496 1I TATAGTCTAC -/T TTTTGAATAA 3070 het 3070 hom 35 11 23 1 T 4 5 247184 CASAVA_Build 11 59520875 17D AACCTTTGTA ACCTTGGTCCTCTGATT/----------------- ACCTGAGGAT 3070 het 3070 ref 37 19 17 4 ACCTTGGTCCTCTGATT 1 0 247185 CASAVA_Build 11 59522903 6D TTCCAAGAGA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 56 24 23 11 TG 10 7 247186 CASAVA_Build 11 59526040 3I CACAAAAATT ---/ATA ATGACTTTAA 3070 het 1884 hom 14 4 8 2 ATA 0 1 247187 CASAVA_Build 11 59546115 3I CTTATTTAAT ---/GTG GTGACAATAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 GTG 1 2 247188 CASAVA_Build 11 59553040 1D CTGAGCTCTC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 138 het 53 0 47 7 A 9 8 247189 CASAVA_Build 11 59559057 2D TTATTTACAC AT/-- ATGAGTTCAT 3070 het 3070 hom 41 16 25 1 AT 2 1 247190 CASAVA_Build 11 59569060 4I AATGGTCCTA ----/ACAG ACAATCTAGT 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 ACAG 0 1 247191 CASAVA_Build 11 59569191 4I TTTTATAATA ----/TTTC TTCTGATACA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 TTTC 0 1 247192 CASAVA_Build 11 59569658 8I ATACATAATC --------/TTGTACAT TTGTACATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTGTACAT 1 2 247193 CASAVA_Build 11 59570494 1D TACTTTCCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 A 10 9 247194 CASAVA_Build 11 59575926 1I CTCTTGCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 A 12 13 247195 CASAVA_Build 11 59576921 5I TGATTGTTGG -----/TTTTA TTTTATTTGA 3070 hom 74 het 44 1 37 6 TTTTA 1 2 247196 CASAVA_Build 11 59578478 3I TACTTGAAGT ---/TTG TTAAGAGAGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TTG 0 1 247197 CASAVA_Build 11 59588525 3I GTAGGTCAGC ---/AGA AGATCACATA 3070 hom 163 het 61 0 55 6 AGA 1 2 247198 CASAVA_Build 11 59594298 8I AATACCTCCT --------/TATGAAAA TAATTCTGAG 3070 het 3070 hom 54 23 24 7 TATGAAAA 0 1 247199 CASAVA_Build 11 59596549 7D TTTTTTTATT TTTTTTA/------- TTTTTTATTT 1046 het 1046 ref 15 4 3 8 TTTTTTA 3 2 247200 CASAVA_Build 11 59603275 1I CAGTAAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 10 247201 CASAVA_Build 11 59605016 4D GAACAGACTA ATAC/---- ATAAGGTATG 3070 het 3070 ref 27 17 9 3 ATAC 1 0 247202 CASAVA_Build 11 59620074 1D GTTCTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 2835 het 2430 hom 32 14 12 6 T 15 14 247203 CASAVA_Build 11 59631052 3D AACCTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 682 het 682 ref 21 6 2 14 TTG 4 3 247204 CASAVA_Build 11 59631394 6I TGCCTCTCTT ------/TTTCTC TTTCTCTGTC 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 TTTCTC 1 2 247205 CASAVA_Build 11 59632162 3D TCAGGCCACG CTT/--- CTACTCAAAT 3070 het 3070 ref 43 24 14 7 CTT 1 0 247206 CASAVA_Build 11 59649398 2D GAGACACAAC AT/-- ATAGACTTCT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 AT 2 1 247207 CASAVA_Build 11 59663854 1D ATTAGGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1315 hom 37 7 16 14 A 12 11 247208 CASAVA_Build 11 59675082 1D AGAATTCTCC A/- GTGACATAAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 1 0 247209 CASAVA_Build 11 59675190 3D ATAAGAAGAT CTC/--- CTTTATTCCT 3070 het 2894 hom 27 7 20 2 CTC 1 0 247210 CASAVA_Build 11 59680599 1I GTAGTCCTAC -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 46 14 28 4 T 6 7 247211 CASAVA_Build 11 59686982 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 2992 het 2992 ref 36 18 7 11 T 10 9 247212 CASAVA_Build 11 59701628 1I TGTTGTTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 T 7 8 247213 CASAVA_Build 11 59702887 1D TCTAAACATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 11 10 247214 CASAVA_Build 11 59711315 1I ATCCTAAGGG -/A AAAAAAAAAA 1933 het 1692 hom 15 6 6 3 A 11 12 247215 CASAVA_Build 11 59715264 1D ATAAAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3007 hom 31 9 15 7 A 10 9 247216 CASAVA_Build 11 59728446 2I AGTTCTGCTC --/TT GTCTGTGAGC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 2 247217 CASAVA_Build 11 59745307 1I TGTCTAGCCA -/T AAAGTGGGGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 247218 CASAVA_Build 11 59745507 2D ATCAATTAAC AG/-- AGGAAGAGAA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 AG 2 1 247219 CASAVA_Build 11 59751178 1D AGAGAAACTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 9 8 247220 CASAVA_Build 11 59756019 6D AATGAAAAGT TAAAGA/------ TAAAGTGCAA 3070 het 3070 hom 26 13 12 3 TAAAGA 1 0 247221 CASAVA_Build 11 59758836 1I ACCCCCCCCC -/A CCAAAATAAC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 0 1 247222 CASAVA_Build 11 59758932 1I GGCTGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 A 11 12 247223 CASAVA_Build 11 59768087 4D CTCAACGTTG GGTA/---- GGTAGGCAGA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 GGTA 2 1 247224 CASAVA_Build 11 59770946 5D AAGCAATGCA CCCAC/----- CCCCCGACAC 3070 het 3070 ref 36 15 14 9 CCCAC 1 0 247225 CASAVA_Build 11 59771077 2I CTCCTGTAAT --/CA CAGAAAACAC 3070 het 3070 ref 45 18 13 14 CA 1 2 247226 CASAVA_Build 11 59774497 3D GTTTGTAGTT CTC/--- CTTGAAGAGG 3070 het 3070 hom 25 8 14 4 CTC 1 0 247227 CASAVA_Build 11 59775493 1D CTCCTCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 21 9 4 A 11 10 247228 CASAVA_Build 11 59775838 2I CATGTTATTG --/TA TATAAATGCA 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 TA 2 3 247229 CASAVA_Build 11 59783786 1I TGTACCATAT -/A TTAAGTTGGC 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 0 1 247230 CASAVA_Build 11 59792355 2I AGAGCTGGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 T 12 14 247231 CASAVA_Build 11 59792493 2D ATAAATAATC TG/-- TACACCAAAC 3070 het 2915 hom 30 6 19 6 TG 1 0 247232 CASAVA_Build 11 59797475 1D TCTCTCGTAT C/- CTGCCTGACT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 C 2 1 247233 CASAVA_Build 11 59799783 1D GTGATGAAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 8 7 247234 CASAVA_Build 11 59800207 1I CCCATATGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 A 9 10 247235 CASAVA_Build 11 59816086 3I AGTTTCTCTC ---/CCA CCACCTGCCC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 CCA 1 2 247236 CASAVA_Build 11 59846020 1I TATAAGAAAT -/G GGTCATCCAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 G 2 3 247237 CASAVA_Build 11 59848827 3I CAGAACTAAT ---/AAA AAAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 4 7 247238 CASAVA_Build 11 59852817 2D GGGTAGAAGA AG/-- AGAGAGAGAG 2405 het 2405 ref 26 13 7 6 AG 7 6 247239 CASAVA_Build 11 59855291 3D ATTTATTAAT ATA/--- ATAATAATCC 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 ATA 3 2 247240 CASAVA_Build 11 59857293 1I ACACATGAAT -/A TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 0 1 247241 CASAVA_Build 11 59865647 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 CA 8 7 247242 CASAVA_Build 11 59867175 4I CATTTAAAGT ----/TTGA TTGCTTCTAG 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 TTGA 0 1 247243 CASAVA_Build 11 59874001 4D TTCAGTCTTC CTTA/---- CTTGACCTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 9 CTTA 1 0 247244 CASAVA_Build 11 59874709 3I GAAACAGACA ---/TCT TCTTTTTTCT 3070 hom 99 het 36 0 32 4 TCT 1 2 247245 CASAVA_Build 11 59880077 1D ATTTTCAGAT A/- TTTTTCAATC 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 A 1 0 247246 CASAVA_Build 11 59881975 1I GGGTTGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 10 11 247247 CASAVA_Build 11 59883995 4D TGGTTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 15 23 4 TTTG 5 4 247248 CASAVA_Build 11 59884580 1D AAGAGGAACA T/- GGTGGTACCC 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 T 1 0 247249 CASAVA_Build 11 59886405 2D CCTCCTTTTT TG/-- TGTGTTTCAC 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 TG 3 2 247250 CASAVA_Build 11 59900670 2D GAAAAAAAAT AC/-- AGTTAGTCTG 3070 het 3070 ref 38 21 15 3 AC 1 0 247251 CASAVA_Build 11 59909045 3I TTATAATGTA ---/TTT TTTTATACTC 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 4 7 247252 CASAVA_Build 11 59918015 1D GAAACAAACT A/- AAAAAAAAAA 1382 het 1382 ref 24 17 3 4 A 12 11 247253 CASAVA_Build 11 59918105 1I CCAAGTCAAT -/A AAATGTTATC 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 A 3 4 247254 CASAVA_Build 11 59921929 2D GCTCTAATCA TT/-- GTGGGCTTTG 3070 het 3070 hom 48 15 25 9 T 2 0 247255 CASAVA_Build 11 59931878 1I TTTACAAATA -/T TTTTTTCACA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 6 7 247256 CASAVA_Build 11 59933902 32D ATACAAAGAC TATGTCACTTAGGCTACAGTGGCACAAGATCA/-------------------------------- TATGTCACTT 3070 hom 34 het 17 0 11 12 TATGTCACTTAGGCTACAGTGGCACAAGATCA 2 1 247257 CASAVA_Build 11 59934523 3I ATCTATTATT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTG 2 3 247258 CASAVA_Build 11 59934881 1D ATTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 T 11 10 247259 CASAVA_Build 11 59937428 1I ATGAAAATAG -/T CAATCTTTCC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 0 1 247260 CASAVA_Build 11 59942385 3I CCTAATCGTG ---/TTT TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 T 6 9 247261 CASAVA_Build 11 59954308 3D AGAGGGAGAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1587 hom 30 8 17 7 A 14 11 247262 CASAVA_Build 11 59956027 1I ATCTTGGAGA -/T TTTTAAGAAC 3070 hom 129 het 54 0 44 10 T 4 5 247263 CASAVA_Build 11 60017426 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1735 het 878 hom 19 5 7 7 A 19 18 247264 CASAVA_Build 11 60035274 1I CAGAAGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 9 10 247265 CASAVA_Build 11 60035745 4D CTTTACAGAA GGTC/---- GGTCGATCAT 3070 het 3070 hom 35 12 15 9 GGTC 2 1 247266 CASAVA_Build 11 60040245 1D AGGGTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 17 10 T 12 11 247267 CASAVA_Build 11 60048171 1D TAGACAAATA T/- ACTGTATTGG 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 1 0 247268 CASAVA_Build 11 60062635 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 A 11 10 247269 CASAVA_Build 11 60066288 2D6M1D AAGGAAGGAA GGAGAAAGA/--AGGAAG- AAAAGAGAAA 1881 het 1881 ref 33 22 7 7 N/A 0 0 247270 CASAVA_Build 11 60069146 1I CAGATCCTGA -/G GGGGCCCAAT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 G 4 5 247271 CASAVA_Build 11 60074851 1D CAGCGAGGCT G/- GGGGGAGGGG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 6 5 247272 CASAVA_Build 11 60075206 1I CTTCCAGAGG -/A AAGATCAGGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 2 3 247273 CASAVA_Build 11 60075617 2I AATAATAAAC --/TT CTCTGAGCTA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 0 2 247274 CASAVA_Build 11 60076828 3I TCAATTCAAC ---/AAG AAGAGCTAAC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AAG 1 2 247275 CASAVA_Build 11 60080552 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 8 9 247276 CASAVA_Build 11 60086857 1I CTATCTCTAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 7 8 247277 CASAVA_Build 11 60088306 1I CCCGACTGGT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 7 8 247278 CASAVA_Build 11 60097534 2D CAGAAATAAA AT/-- AGAGTATATT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 AT 1 0 247279 CASAVA_Build 11 60136496 1I TTATTGTGTG -/C TTTTTCTTCA 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 C 0 1 247280 CASAVA_Build 11 60142519 1D CCACCGGACA G/- GGGGCCTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 G 5 4 247281 CASAVA_Build 11 60193174 1D GTAGCATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 T 12 11 247282 CASAVA_Build 11 60195787 5D TGTTACAAAC ATAAG/----- ATAACATTAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 ATAAG 1 0 247283 CASAVA_Build 11 60199703 1D TGAAATTTTT A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 A 7 6 247284 CASAVA_Build 11 60208441 1D TTTCTGTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2544 hom 30 11 11 8 T 12 11 247285 CASAVA_Build 11 60212461 13D TTAACACCTT GTTTTAACCACTC/------------- GTTTTAACCA 3070 hom 96 het 48 0 33 17 GTTTTAACCACTC 2 1 247286 CASAVA_Build 11 60231459 1I CTAGCAGACC -/A AGGAGCCAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 247287 CASAVA_Build 11 60237250 1D GGGTGGGTTG C/- CCCTTCACAC 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 C 4 3 247288 CASAVA_Build 11 60271511 2D TGCACACACA CT/-- CATTTGTACA 3070 het 3070 hom 66 23 29 15 CT 1 0 247289 CASAVA_Build 11 60271746 4D CCTACACGTG CACA/---- CACATTCACA 3070 het 3070 ref 81 44 28 11 CA 4 2 247290 CASAVA_Build 11 60284509 1I CCTTTGGACG -/T TTTTAAATCT 3070 hom 130 het 48 0 43 5 T 4 5 247291 CASAVA_Build 11 60299377 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAAAAGAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AG 1 2 247292 CASAVA_Build 11 60349257 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2668 het 2668 ref 32 17 8 7 A 14 13 247293 CASAVA_Build 11 60350217 1D GGGAGTGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 T 10 9 247294 CASAVA_Build 11 60360679 8D ACTCCATCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAGAA 3070 het 1138 hom 15 5 10 2 A 15 7 247295 CASAVA_Build 11 60364119 1D CCGTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 22 0 13 10 A 13 12 247296 CASAVA_Build 11 60370934 1D ATCTTTGGCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 49 het 23 0 15 8 T 9 8 247297 CASAVA_Build 11 60372325 1D CAGTTTAGCC T/- GGGCTGCTGA 2058 het 2058 ref 22 12 6 4 T 1 0 247298 CASAVA_Build 11 60383352 4I22M1D CTGATTCTCT ----CAGACCCACTTGCTGTCCCTCCT/CAGACAGACCCACTTGCTGTCCCTCC- CTCCCACATC 3070 hom 114 het 36 0 39 2 N/A 0 0 247299 CASAVA_Build 11 60387727 2I AGAAAAAGAC --/TG TTATTTAAGC 3070 hom 88 het 36 0 28 8 TG 0 1 247300 CASAVA_Build 11 60388789 2I GTGTGCGTGT --/GC GTGCGTGTGC 521 het 521 ref 40 7 5 28 GC 0 1 247301 CASAVA_Build 11 60390612 3D TCACTTGCAG GAA/--- TTAGTGCCAG 3070 het 3070 hom 44 16 15 14 GAA 1 0 247302 CASAVA_Build 11 60403129 1D GGATGTATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2975 hom 29 9 14 6 A 13 12 247303 CASAVA_Build 11 60413902 1I CCCCAAAGCT -/C CCCTCCTGGT 3070 hom 91 het 38 0 29 9 C 3 4 247304 CASAVA_Build 11 60431114 9I CAATTCACAT ---------/TGGCTTCCC TGCCCTTTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 6 TGGCTTCCC 0 1 247305 CASAVA_Build 11 60453131 5D TGTGTCCACC AAACT/----- AAACTCCTTC 3070 het 3070 ref 35 17 10 11 AAACT 2 1 247306 CASAVA_Build 11 60453952 1I CAGAAAGGGG -/C CCCCAGTGGT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 C 4 5 247307 CASAVA_Build 11 60458989 1I GGCCGCATAA -/G GGGGGGAAGC 3070 het 3070 hom 28 8 11 9 G 6 7 247308 CASAVA_Build 11 60464938 1D ATAATTCACT G/- GGGGAAAATA 3070 het 2316 hom 27 8 11 8 G 5 4 247309 CASAVA_Build 11 60470384 9D CAATAATACC ACCACCACT/--------- ACCACCACTA 3070 het 3070 ref 39 18 12 13 ACCACCACT 2 1 247310 CASAVA_Build 11 60471171 1I GTCTCAGATG -/C GACTTGTTCA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 0 1 247311 CASAVA_Build 11 60471235 1D CTATTCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 149 hom 32 1 19 12 T 13 12 247312 CASAVA_Build 11 60474666 1D ACCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 2212 het 1604 hom 14 6 6 2 A 15 14 247313 CASAVA_Build 11 60481887 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAAGAAGA 1488 het 37 hom 10 1 6 3 AG 0 1 247314 CASAVA_Build 11 60489660 1I AACCCCCACG -/C CCGGCCCCAT 3070 hom 39 het 16 0 12 4 C 2 3 247315 CASAVA_Build 11 60499173 5D ATACTAATCA TATTT/----- TATTTTATAA 3070 hom 105 het 37 0 36 4 TATTT 2 1 247316 CASAVA_Build 11 60504376 1I CATAGTGTGA -/C CCCCCACGTT 3070 hom 88 het 35 0 29 6 C 5 6 247317 CASAVA_Build 11 60509622 2I AGTAAATAGA --/AT ATATATATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AT 6 7 247318 CASAVA_Build 11 60511772 5I TATCTTTCCA -----/GAGAG TCGATTTCTT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 GAGAG 0 1 247319 CASAVA_Build 11 60517579 1I CACCCACCCG -/T TGCACTCTTC 3070 het 3070 hom 44 12 27 5 T 1 2 247320 CASAVA_Build 11 60521877 1D AAATAAAATG A/- AATTTTGAGT 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 A 3 2 247321 CASAVA_Build 11 60525646 1I AAATCGTCCC -/T TTTAGGTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 3 4 247322 CASAVA_Build 11 60528027 4I GCAGCTGCTG ----/CTCA CTCATTCATT 3070 hom 65 het 27 0 20 7 CTCA 1 2 247323 CASAVA_Build 11 60535487 1I GAGAGCTGAT -/A ACCACCTCAA 3070 het 2572 hom 27 10 13 4 A 1 2 247324 CASAVA_Build 11 60542730 3I TTAGCCAAGG ---/GTA GTAGCACGTG 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 GTA 1 2 247325 CASAVA_Build 11 60545253 1D AAATCATCCA G/- GTATGGTGGT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 G 2 1 247326 CASAVA_Build 11 60554294 1I CCTGCCCTCA -/G GAAGCTCAAC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 G 1 2 247327 CASAVA_Build 11 60580255 1I TTTAAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 9 10 10 A 9 10 247328 CASAVA_Build 11 60587437 1D CCGAGATCAT G/- GTGCCACGAG 3070 hom 95 het 41 0 36 5 G 2 1 247329 CASAVA_Build 11 60588182 1D TTTTTTTTTT G/- AGACGGAGTC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 1 0 247330 CASAVA_Build 11 60591391 10D GTGTGTGTGG GTGTGTGGGC/---------- GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 32 16 15 3 GTGTGTGGGC 1 0 247331 CASAVA_Build 11 60594837 2I CGGGGGCGGG --/GT GGGGGTAATC 3038 het 3038 ref 25 9 9 7 GT 0 1 247332 CASAVA_Build 11 60602857 1I TGAAGGGGGG -/A AAAAGCTTTA 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 A 4 5 247333 CASAVA_Build 11 60604931 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 966 het 966 ref 18 6 3 9 T 14 13 247334 CASAVA_Build 11 60617367 7D ATGGATGTGA GGGCAAG/------- GGGCAGGGGG 1871 het 1871 ref 21 8 7 9 GGGCAAG 1 0 247335 CASAVA_Build 11 60634270 1D ACAAGCAAAT A/- AAAAAAAAAC 1359 het 1359 ref 37 25 3 10 A 10 9 247336 CASAVA_Build 11 60636692 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 40 1 33 6 A 10 11 247337 CASAVA_Build 11 60651382 4D26M12I TCACTGCGGC GGCTCCCTAAGAAGGTGAAGCAACATGGGA------------/----CTCTAAGAAGGTGAAGCAACATGGGAACACATCCTAAG ACACATCCTA 3070 hom 131 het 26 0 41 5 N/A 0 0 247338 CASAVA_Build 11 60660660 4I CTGAAAAGAG ----/GTCA GTAAGACTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 GTCA 0 1 247339 CASAVA_Build 11 60663495 1D TAGAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 45 0 30 16 A 13 12 247340 CASAVA_Build 11 60666864 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGGAGGG 1372 hom 7 het 3 0 3 0 G 7 6 247341 CASAVA_Build 11 60668546 1I ATAGGGTGAG -/T CCCCCCCAGG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 0 1 247342 CASAVA_Build 11 60679153 2D CTCTGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 2635 het 10 hom 17 1 10 6 A 14 12 247343 CASAVA_Build 11 60680117 2I AGCAACCACT --/AA AAAAAGTGTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 5 7 247344 CASAVA_Build 11 60681472 2I TGTTTTTTTT --/AA CAATAGCCAT 3070 hom 118 het 44 0 40 4 A 0 2 247345 CASAVA_Build 11 60686138 1D TAATCAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 547 hom 35 3 19 13 T 15 14 247346 CASAVA_Build 11 60687322 5I ATGAAGAAGG -----/CAGTC TCAGCTGCTG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 CAGTC 0 1 247347 CASAVA_Build 11 60689373 4I TTGGGGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TTTG 2 3 247348 CASAVA_Build 11 60701894 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2102 het 141 hom 13 1 7 5 A 13 14 247349 CASAVA_Build 11 60706024 20D TCCCCCTTGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 14 9 T 31 11 247350 CASAVA_Build 11 60706848 1D CCTGTGTCAG A/- AAAAAAAAAA 1797 het 1797 ref 35 20 6 9 A 16 15 247351 CASAVA_Build 11 60710369 1D GTCTGGCTAA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 7 6 247352 CASAVA_Build 11 60729661 1D AGAATAAACA T/- TTTCCTAGCA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 4 3 247353 CASAVA_Build 11 60764770 3D GAAAGAAAGA AAG/--- AAAGAAAGAG 532 het 532 ref 11 4 4 3 AAG 1 0 247354 CASAVA_Build 11 60854479 1D TGAAGAAAGA G/- GAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 G 2 1 247355 CASAVA_Build 11 60856161 2I TCAAATGAAG --/AA AAGTCCCAGA 3070 hom 126 het 48 0 41 7 A 2 4 247356 CASAVA_Build 11 60864701 3I CGCGCCCGGC ---/CAT CCCTGCCTTC 3070 hom 11 het 19 1 16 2 CAT 0 1 247357 CASAVA_Build 11 60871587 10D ACCCTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 27 1 17 14 A 22 12 247358 CASAVA_Build 11 60872398 5I CCATGAAGAC -----/ATCAA AGAGGATCAT 3070 hom 135 het 50 0 44 6 ATCAA 0 1 247359 CASAVA_Build 11 60876355 1I TGTTCCCTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 397 hom 27 1 23 3 T 8 9 247360 CASAVA_Build 11 60878917 1I TCCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 2312 het 123 hom 24 2 12 11 C 0 1 247361 CASAVA_Build 11 60885028 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 4 A 12 11 247362 CASAVA_Build 11 60896226 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2018 het 653 hom 8 2 6 0 A 17 16 247363 CASAVA_Build 11 60902232 1I CTAATTTTAA -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 8 247364 CASAVA_Build 11 60905033 1I GTCTCGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 11 12 247365 CASAVA_Build 11 60909589 4I AAAGGGAGGC ----/AAAA AAAAGACATG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 4 8 247366 CASAVA_Build 11 60922308 1I TTCTGCCATC -/A GTATGGACAG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 0 1 247367 CASAVA_Build 11 60926072 1I TGTGGTTCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 9 10 247368 CASAVA_Build 11 60926580 1I TAAAGCCATG -/T TATCACTGCC 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 1 2 247369 CASAVA_Build 11 60933713 1D AAATAAACCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 13 12 247370 CASAVA_Build 11 60956742 1D TTTCGTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 37 0 29 8 T 12 11 247371 CASAVA_Build 11 60979327 3D CAAAAAAAAA AAG/--- AAGGAGCTGC 2456 het 1384 hom 20 7 9 5 AAG 2 1 247372 CASAVA_Build 11 60990852 4D GTGAGACCCA CTCT/---- GTCTCAAAAA 3070 hom 89 het 33 0 24 9 CT 2 0 247373 CASAVA_Build 11 61021568 2D GTGAGTGTGA GT/-- GTATGTGTGT 3070 hom 140 het 52 0 46 7 GT 2 1 247374 CASAVA_Build 11 61021787 2D TGGGTGTAAA TG/-- TGTGTGTGTT 3070 hom 110 het 46 0 35 12 TG 5 4 247375 CASAVA_Build 11 61026608 1D TTACTGAGGG C/- TCAGGAAGAA 3070 hom 94 het 34 0 30 4 C 1 0 247376 CASAVA_Build 11 61039557 1D CGCTGCAAAA T/- TTTTTTTTTT 1244 het 1244 ref 16 11 3 2 T 11 10 247377 CASAVA_Build 11 61122802 1D TATCCCCAGA C/- CCAGTGTGGA 3070 hom 116 het 46 0 37 9 C 3 2 247378 CASAVA_Build 11 61166478 1D ATTCTACAGG T/- AAGTGCTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 1 0 247379 CASAVA_Build 11 61167157 18D TGGGAGGTCA AGACGGGTGGATCACCTG/------------------ AAGTGAGGAG 3070 het 2155 hom 15 5 9 3 AGACGGGTGGATCACCTG 1 0 247380 CASAVA_Build 11 61167724 2D GAAACAATAT AA/-- GTGTGCATTT 3070 het 3070 hom 31 15 15 2 A 2 0 247381 CASAVA_Build 11 61177565 5I GGAAGGTCTC -----/TCTCT AAAAGTCAAC 3070 het 3070 ref 36 13 16 7 TCTCT 0 1 247382 CASAVA_Build 11 61181857 1D16M1I CCAAGCAAAA CAAAGGACAATCTTCTC-/-AAAGGACAATCTTCTCT TTGTATACAC 3070 het 819 hom 25 4 11 15 N/A 0 0 247383 CASAVA_Build 11 61182650 1D AAAAAAAAAA G/- GTCAGTTACA 3070 het 426 hom 43 2 33 10 G 2 1 247384 CASAVA_Build 11 61184769 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 13 2 A 11 12 247385 CASAVA_Build 11 61185036 1I AAGGATGTAC -/A GCAACTGAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 0 1 247386 CASAVA_Build 11 61186545 1D TGTGTGGGGG A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 A 7 6 247387 CASAVA_Build 11 61206088 10I ATGTTGAGGG ----------/TATTGGAGAC TAGGGTGGCA 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 TATTGGAGAC 0 1 247388 CASAVA_Build 11 61211707 2D TAGCACTCTC TT/-- ATCTGAATAG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 2 0 247389 CASAVA_Build 11 61215090 4I GTTCTCTTTG ----/CTGC CTGCCTGCTA 3070 hom 88 het 35 0 27 8 CTGC 2 3 247390 CASAVA_Build 11 61216930 1D TTAGTTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 28 2 23 3 A 11 10 247391 CASAVA_Build 11 61219338 4D GGAAGCTTTC TCTG/---- TCTGCCTGGG 3070 het 3070 ref 28 13 13 3 TCTG 2 1 247392 CASAVA_Build 11 61240592 1I CTCCAGCCAG -/A AGGATTTGTC 3070 hom 101 het 39 0 31 8 A 1 2 247393 CASAVA_Build 11 61250398 1D ACTCTAGTTT A/- AGGAGAAGAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 2 1 247394 CASAVA_Build 11 61258307 1D GCATGGCCGT G/- GGGGTGAGGG 2745 het 2234 hom 31 13 11 7 G 5 4 247395 CASAVA_Build 11 61270248 4D CCACCCTGAC AGAG/---- GGAGCTGGGC 2335 het 2001 hom 19 8 7 8 AG 2 0 247396 CASAVA_Build 11 61279877 1D GTGTGCAGGG A/- GCCTTGGAGG 3051 het 3051 ref 29 13 10 7 A 1 0 247397 CASAVA_Build 11 61282141 1D CCTGGAGTGA G/- GGGGGGAGGG 3070 hom 39 het 19 0 12 7 G 7 6 247398 CASAVA_Build 11 61294225 1D ACTCTGCCTT G/- GGGAGGACAG 2726 het 1831 hom 18 7 7 5 G 4 3 247399 CASAVA_Build 11 61382300 1D ATCTCGACTC A/- ACTGCAACCT 3070 hom 48 het 17 0 16 2 A 2 1 247400 CASAVA_Build 11 61383988 1I GAGCAACTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 8 9 247401 CASAVA_Build 11 61413118 1I TAATTTTGTA -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 7 8 247402 CASAVA_Build 11 61429720 1D TGCTCGTCTT C/- CCTGGAGGCC 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 C 3 2 247403 CASAVA_Build 11 61440553 1I CTGCCTTTCC -/A GGGGGGCTTC 3070 hom 95 het 36 0 27 9 A 0 1 247404 CASAVA_Build 11 61444498 4I GTGAGACACC ----/TCTA TCTAGGGGAG 3070 hom 55 het 24 0 14 10 TCTA 1 2 247405 CASAVA_Build 11 61449683 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 29 0 17 12 A 12 13 247406 CASAVA_Build 11 61450153 13D CCTTCCTGCC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2715 hom 39 13 19 9 A 23 10 247407 CASAVA_Build 11 61451767 8I GTTCTTGTGC --------/TAGTGAGT CAGTTCTCAC 3070 hom 117 het 44 0 39 7 TAGTGAGT 0 1 247408 CASAVA_Build 11 61453575 1I AAAAAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1579 hom 16 4 10 2 A 9 10 247409 CASAVA_Build 11 61457461 16I AGAGACAAGA ----------------/AATGGATTCTCACCTG GAGCCTCCAG 3070 hom 105 het 41 0 34 7 AATGGATTCTCACCTG 0 1 247410 CASAVA_Build 11 61460011 1I AGGAACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 21 0 13 8 A 10 11 247411 CASAVA_Build 11 61476682 2D GCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2106 hom 21 het 8 0 7 1 T 13 11 247412 CASAVA_Build 11 61506753 11D TCTTTCTTTG TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 997 het 603 hom 11 2 3 8 T 21 10 247413 CASAVA_Build 11 61510725 8I CAAAATAAAG --------/GTAAAAAT GTTAAGGGCA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 GTAAAAAT 0 1 247414 CASAVA_Build 11 61511177 2D TAAAAGACAC AG/-- AACAGCAAGC 3070 het 3070 ref 45 30 12 4 AG 1 0 247415 CASAVA_Build 11 61511523 1I CCCAGATTCA -/T TAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 T 1 2 247416 CASAVA_Build 11 61522590 1D AAAAAAATAC T/- TTCTGGGAGA 3070 het 3070 ref 37 21 13 5 T 3 2 247417 CASAVA_Build 11 61527311 2I ATATTCTCCC --/CA TACGCTGGGC 3070 hom 108 het 42 0 35 7 CA 0 1 247418 CASAVA_Build 11 61528668 2I GAATTAGGAT --/AC ACACACATAT 3070 hom 71 het 28 0 23 5 AC 3 4 247419 CASAVA_Build 11 61532965 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1081 het 265 hom 9 1 7 1 A 10 11 247420 CASAVA_Build 11 61534806 9D TAAAAAGTAA AAAACAAAC/--------- AAAACAAACA 1795 hom 15 het 7 0 5 2 AAAACAAAC 2 1 247421 CASAVA_Build 11 61535451 1D TTTCTTCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 120 het 47 0 39 8 T 10 9 247422 CASAVA_Build 11 61540262 5D GCCATTGCAT TCCAG/----- TCCGGGCAAC 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 TCCAG 1 0 247423 CASAVA_Build 11 61545407 1D TGATCCCCCC T/- AACTAAAGGA 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 T 1 0 247424 CASAVA_Build 11 61547938 1D AAAAGTTGAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 52 25 18 10 A 9 8 247425 CASAVA_Build 11 61581478 1I AAAATACCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 9 10 247426 CASAVA_Build 11 61597206 3I AGCTTTCAAC ---/AGA AAAGGGTCAT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 AGA 0 1 247427 CASAVA_Build 11 61619286 1D AGAAGAGATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 A 9 8 247428 CASAVA_Build 11 61624836 1D CCACCTACAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 2777 hom 14 6 8 0 T 9 8 247429 CASAVA_Build 11 61630319 2I GCCTGGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 1849 het 1849 ref 14 7 5 2 T 10 12 247430 CASAVA_Build 11 61630791 1I CATAAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2750 hom 27 8 15 4 T 13 14 247431 CASAVA_Build 11 61647019 3D CTTTCCCCCC CCG/--- CCTCCATATT 3070 het 2778 hom 17 10 7 1 CCG 1 0 247432 CASAVA_Build 11 61648474 5I GCTTGGCACC -----/TTGTT TTGTGCCTGT 2639 het 2639 ref 20 9 6 5 TTGTT 0 1 247433 CASAVA_Build 11 61650871 1I AACACCTAAT -/A ATGATGTAAA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 1 2 247434 CASAVA_Build 11 61652020 1D AGATGAGGCT A/- GGGGATGAGT 2058 het 2058 ref 27 14 7 6 A 1 0 247435 CASAVA_Build 11 61666735 1D GGTTCCCATC T/- GCCTTCTGTG 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 1 0 247436 CASAVA_Build 11 61667101 1I TAGGATTTGG -/C CCACACTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 2 3 247437 CASAVA_Build 11 61681370 4D CATGAATTAC TCTT/---- TCTTTATTTT 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 TCTT 2 1 247438 CASAVA_Build 11 61692460 1I ATCTTAATCG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 7 8 247439 CASAVA_Build 11 61699286 4I11M1I ATCTTTTCCT ----TTTCTTTTTTC-/TTTCTTTCTTTTTTCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 N/A 0 0 247440 CASAVA_Build 11 61702128 2D AGTCCAGAGA CT/-- CTGTGTGTCT 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 CT 2 1 247441 CASAVA_Build 11 61703451 1D CAATATTTCA T/- TTTCTGTTTC 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 T 4 3 247442 CASAVA_Build 11 61706190 1D GGTCGGGGGG A/- GGGGGTCGGT 3070 het 3070 hom 36 19 16 1 A 1 0 247443 CASAVA_Build 11 61707598 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1129 hom 19 3 11 5 T 12 11 247444 CASAVA_Build 11 61713090 3D CAGAAAGGGA AGC/--- AGCCTGCGGG 3070 het 3070 ref 33 17 13 8 AGC 2 1 247445 CASAVA_Build 11 61717340 1I CTCTACCCTT -/C CAATTGTCTT 3070 hom 96 het 36 0 28 8 C 1 2 247446 CASAVA_Build 11 61731422 1I CTCTGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 13 14 247447 CASAVA_Build 11 61735391 1D AACATTCTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 9 8 247448 CASAVA_Build 11 61736996 10D ACATATGTAC ACACATATGT/---------- ACACATATGT 3070 het 1153 hom 11 3 8 0 ACACATATGT 2 1 247449 CASAVA_Build 11 61744302 1D AACAAGTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 771 hom 27 3 19 5 A 12 11 247450 CASAVA_Build 11 61772422 1D CACACACAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 326 hom 28 1 25 2 A 10 9 247451 CASAVA_Build 11 61781973 1I CCACTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 38 1 28 9 A 13 14 247452 CASAVA_Build 11 61783388 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAAGTGTA 3070 hom 95 het 38 0 34 4 AG 0 1 247453 CASAVA_Build 11 61783732 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 67 het 26 0 23 3 A 10 9 247454 CASAVA_Build 11 61796304 1D AGAGACAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 26 3 18 5 A 13 12 247455 CASAVA_Build 11 61797369 2I AGCCTTGGTA --/CT CTCTCTCTGA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 CT 4 5 247456 CASAVA_Build 11 61800445 1I CGCCAATCAC -/T TGAAAATTAA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 1 2 247457 CASAVA_Build 11 61818312 1D ATGGTTGGGG A/- TGGTCAAATG 3070 hom 135 het 51 0 45 7 A 1 0 247458 CASAVA_Build 11 61820482 3D AATCAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 1249 het 298 hom 44 4 8 33 AAG 1 0 247459 CASAVA_Build 11 61825602 1D CATTTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2610 hom 29 10 12 7 A 12 11 247460 CASAVA_Build 11 61830752 1D ATGGGGTACG A/- AAAAAAAAAA 2475 het 837 hom 16 2 8 6 A 12 11 247461 CASAVA_Build 11 61833063 1I TTAAATAGTA -/C TCCATTGTGT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 C 0 1 247462 CASAVA_Build 11 61839957 1D GCCAATTCTT C/- CCAACCTCAT 3070 het 3070 ref 36 20 10 7 C 3 2 247463 CASAVA_Build 11 61841248 4D TCAAAAAACA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 hom 47 het 20 0 16 8 AAAC 2 1 247464 CASAVA_Build 11 61843054 1I GAGTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 12 12 A 10 11 247465 CASAVA_Build 11 61849627 1I AGTTCTTTCC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 A 8 9 247466 CASAVA_Build 11 61850312 4I CTCGTCCTGC ----/TACA TACAAAACCT 3070 het 3040 hom 25 9 10 6 TACA 1 2 247467 CASAVA_Build 11 61858688 4D CGTCTCAAAG AAGA/---- AAGAAAGAAA 3070 het 2939 hom 44 12 16 17 AAGA 3 2 247468 CASAVA_Build 11 61860470 2I CAGCAGAAAC --/AG AGGCCAGAGG 3070 hom 111 het 44 0 36 8 AG 1 2 247469 CASAVA_Build 11 61861788 1D GAAACTGAGA C/- CCCCAGCAGG 1735 hom 15 het 6 0 5 1 C 5 4 247470 CASAVA_Build 11 61866682 1D TGGCACACCT G/- GCAATCCCAG 3070 hom 94 het 38 0 32 6 G 2 1 247471 CASAVA_Build 11 61870857 3I ATCTCTACTA ---/AGT AAACTACAAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 AGT 0 1 247472 CASAVA_Build 11 61871017 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2933 hom 7 het 23 1 15 7 A 15 14 247473 CASAVA_Build 11 61871677 1I ATATTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 10 11 247474 CASAVA_Build 11 61872755 1D CTCCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 15 1 A 11 10 247475 CASAVA_Build 11 61873017 1D GGTTTTTTGT G/- GTTTTTTTTT 2341 het 2341 ref 25 12 10 3 G 2 1 247476 CASAVA_Build 11 61888294 4I TTATTAAATG ----/TGTC TGTGTGTGTG 3070 hom 41 het 17 0 14 3 TGTC 0 1 247477 CASAVA_Build 11 61890580 6I TAATTTGCTC ------/TTCCCT TTCCCTGACA 3070 het 3070 ref 27 16 7 4 TTCCCT 1 2 247478 CASAVA_Build 11 61892812 2D CAAAGGTCTC TG/-- TGTCATAAAC 3070 het 3070 ref 29 13 12 5 TG 2 1 247479 CASAVA_Build 11 61898601 3D TCTTTAGCTA TTG/--- TTACCACTTG 3070 het 3070 ref 26 14 11 4 TTG 1 0 247480 CASAVA_Build 11 61909228 1D GTTACTTTAA T/- TTGCTCTTCC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 3 2 247481 CASAVA_Build 11 61909751 2D CGTCTCTACT AA/-- AAATACAAAA 1036 het 661 hom 9 3 3 4 A 5 3 247482 CASAVA_Build 11 61915764 1I TGGAGAAGTG -/A TAGGAAACCC 3070 het 3070 ref 59 30 23 6 A 0 1 247483 CASAVA_Build 11 61916617 7D GCCCTGTATC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 9 A 17 10 247484 CASAVA_Build 11 61920821 1D CCTGGGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 25 0 16 9 T 13 12 247485 CASAVA_Build 11 61928162 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 1025 het 1025 ref 24 14 4 6 A 10 11 247486 CASAVA_Build 11 61930477 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 24 3 15 6 T 14 13 247487 CASAVA_Build 11 61934903 2D CCTCGCCAGA CT/-- CTCTGGGCAC 3070 het 2312 hom 32 9 14 10 CT 3 2 247488 CASAVA_Build 11 61957312 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 21 0 17 4 A 11 10 247489 CASAVA_Build 11 61960987 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2407 het 853 hom 15 4 6 6 A 13 11 247490 CASAVA_Build 11 61961476 1I CAATCTCAGC -/T CACTGCAACA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 0 1 247491 CASAVA_Build 11 61961555 1D15M1D GGCACTCATC TGCCACACTCAGCTAAT/-GCCACACTCAGCTAA- TTTTTTTGTA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 N/A 0 0 247492 CASAVA_Build 11 61976031 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1766 het 383 hom 5 1 4 0 T 11 12 247493 CASAVA_Build 11 61977368 1D GCTCAAGGGT A/- ATCTCTTCCA 3070 het 3070 ref 54 25 19 10 A 2 1 247494 CASAVA_Build 11 61978461 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 14 0 9 5 A 16 14 247495 CASAVA_Build 11 61978979 2D TATTTATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 2252 het 259 hom 21 2 7 13 T 16 14 247496 CASAVA_Build 11 61982129 1D GCCTGTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1586 hom 16 8 7 1 T 11 10 247497 CASAVA_Build 11 61992407 3D CAAAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 2421 hom 18 het 9 0 7 2 A 14 11 247498 CASAVA_Build 11 61994476 2I CCTGGGTGAC --/AG AGCAAGACTC 2255 hom 15 het 6 0 6 0 AG 1 2 247499 CASAVA_Build 11 61997733 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 18 1 11 7 A 12 11 247500 CASAVA_Build 11 62003517 2D GCCCAGCCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 31 0 22 11 T 12 10 247501 CASAVA_Build 11 62005129 15D TTCTCTTTTC TTTTTTTGGTTTTTT/--------------- TTTTTTTGGT 3070 hom 48 het 22 0 17 9 TTTTTTTGGTTTTTT 2 1 247502 CASAVA_Build 11 62010807 1D TTACCACCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 29 0 25 4 T 11 10 247503 CASAVA_Build 11 62074502 1D TTTTTGCTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 47 18 19 10 T 9 8 247504 CASAVA_Build 11 62082012 1I TGGGCATGGT -/G GCACGTGCCT 3057 het 3057 ref 25 12 8 6 G 1 2 247505 CASAVA_Build 11 62086469 2D ATACATACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 AT 7 6 247506 CASAVA_Build 11 62088393 1D CACCTGCAAT C/- CCCAGCTACT 1832 het 1832 ref 14 10 4 0 C 4 3 247507 CASAVA_Build 11 62101635 1I CCCATGTCAG -/A AAAAAAAAAA 2515 het 1905 hom 25 7 7 11 A 15 16 247508 CASAVA_Build 11 62103966 1I CACCTGCCTT -/G GCCTCCCAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 1 2 247509 CASAVA_Build 11 62116993 1D ATCCAGAAAG C/- TCATCTCAAC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 C 1 0 247510 CASAVA_Build 11 62121255 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 1185 het 1185 ref 16 10 5 1 A 10 11 247511 CASAVA_Build 11 62138280 1I CCAGACATCC -/T TAACCCCTCT 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 T 1 2 247512 CASAVA_Build 11 62165646 4I TGTTTTTTGC ----/TTTT TTTGAGACAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 3 7 247513 CASAVA_Build 11 62165811 2D TATTTTTGGT AG/-- AGACGGAGTT 2539 het 1715 hom 13 6 7 1 AG 2 1 247514 CASAVA_Build 11 62197718 1I CAAATAAAGC -/T TTTTTTTTTT 2225 het 2225 ref 23 13 5 5 T 15 16 247515 CASAVA_Build 11 62203446 1I GAAGAAATGT -/G CTTGCTCTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 0 1 247516 CASAVA_Build 11 62219582 1D CATGGTGAAA C/- CCCCCGTCTC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 6 5 247517 CASAVA_Build 11 62220516 1D ACATGCAACT A/- AAAATTTTTT 3070 het 89 hom 41 2 30 9 A 5 4 247518 CASAVA_Build 11 62225128 1D TCTGGCCAGT C/- CTCTGGCACA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 2 1 247519 CASAVA_Build 11 62226121 1I CTTAGTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 35 1 26 8 T 11 12 247520 CASAVA_Build 11 62228617 1D ATAACAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 9 8 247521 CASAVA_Build 11 62236564 3D CACCATGCAA GAG/--- GAGAGTCCTC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 GAG 2 1 247522 CASAVA_Build 11 62284780 1D CTCGTAAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 T 10 9 247523 CASAVA_Build 11 62294581 1D AGCCACCGCG C/- CCGGCCGGGA 3070 het 2497 hom 20 7 10 3 C 3 2 247524 CASAVA_Build 11 62309244 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2217 het 2217 ref 23 13 6 4 T 13 12 247525 CASAVA_Build 11 62338516 1D16M1D GGACTCTTCC TTTTTTTTTTTTTAGATA/-TTTTTTTTTTTGAGAT- AGAGTCTCAC 2021 het 431 hom 14 2 6 6 N/A 0 0 247526 CASAVA_Build 11 62346752 1D ATTTACGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 15 10 T 12 11 247527 CASAVA_Build 11 62348776 3D TAAAATGGGG GAT/--- AATAATAGTT 3070 het 3070 ref 41 24 16 2 GAT 1 0 247528 CASAVA_Build 11 62370992 1D GAGCATTCTC T/- TTTTTTTTTT 719 het 719 ref 16 7 3 6 T 15 14 247529 CASAVA_Build 11 62376740 1I CTGCAGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 10 11 247530 CASAVA_Build 11 62380876 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 35 0 23 14 T 15 14 247531 CASAVA_Build 11 62406411 1D AGGTTTTTTT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 G 10 9 247532 CASAVA_Build 11 62406829 1D AATTTTGCCC G/- GGTTCAAATT 3070 het 3070 hom 42 18 18 7 G 3 2 247533 CASAVA_Build 11 62407264 2D ATTTCCTTGA CT/-- CTGAGGATGA 3070 het 3070 ref 54 24 24 7 CT 2 1 247534 CASAVA_Build 11 62421819 27D CCAGCACTTT GGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACCTG/--------------------------- GGGTCGGGAG 2826 het 2826 ref 15 12 8 0 GGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACCTG 1 0 247535 CASAVA_Build 11 62425870 1I ACTTTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1267 hom 34 3 23 8 A 15 16 247536 CASAVA_Build 11 62456841 1I ACTCCGACTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 8 9 247537 CASAVA_Build 11 62463222 1D TTACTGAGGA G/- ACTTTCCTGA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 G 1 0 247538 CASAVA_Build 11 62467728 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2653 het 523 hom 15 4 9 2 A 12 11 247539 CASAVA_Build 11 62473967 2D TTCCTTTCTT TC/-- TTCTTTTCTT 287 het 287 ref 31 15 5 11 TC 1 0 247540 CASAVA_Build 11 62480687 1D ATAAAATGTC T/- TTTTTTTTTG 1200 het 1200 ref 43 34 4 5 T 10 9 247541 CASAVA_Build 11 62481483 1I AAGTTAAGGT -/G GGTGGACAAG 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 G 2 3 247542 CASAVA_Build 11 62540546 1I TCAGCCGCTT -/C CCCCCTGGGG 3070 hom 79 het 30 0 24 6 C 5 6 247543 CASAVA_Build 11 62560365 1D CCACAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1367 hom 20 4 11 5 T 11 10 247544 CASAVA_Build 11 62577492 1D CTTTGTCTAC T/- TTTTAATGGG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 5 4 247545 CASAVA_Build 11 62594343 1I GGTTAAAAAC -/T TAACTATCGT 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 T 1 2 247546 CASAVA_Build 11 62595574 1I CGATGCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1524 hom 41 5 33 3 T 13 14 247547 CASAVA_Build 11 62608987 1D GAGGATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 953 hom 26 10 8 8 T 15 14 247548 CASAVA_Build 11 62616440 1I GTAGAATTAG -/A AAAAAACTAG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 6 7 247549 CASAVA_Build 11 62629412 1I TCTGGCCCCA -/C ATTTCCCTTC 2013 hom 26 het 22 0 8 14 C 0 1 247550 CASAVA_Build 11 62630752 1D TTTTCATGTG T/- TTTTTGACTG 2471 hom 23 het 13 0 8 5 T 6 5 247551 CASAVA_Build 11 62639806 1I TGCTGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 20 8 T 10 11 247552 CASAVA_Build 11 62641016 1D TGGAGACATC T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 8 7 247553 CASAVA_Build 11 62642272 1I TTAGCTGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 247554 CASAVA_Build 11 62645564 3I11M1I CTCAAAAACT ---TGGTGAATGAC-/TAGTGGTGAATGACA AAAGGTTAGA 3070 hom 93 het 33 0 31 3 N/A 0 0 247555 CASAVA_Build 11 62652077 1D AGGAGCTGTT C/- CAGTATAATA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 2 1 247556 CASAVA_Build 11 62668821 1D TTACCTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 40 1 29 10 T 11 10 247557 CASAVA_Build 11 62674353 2D CCTATCATTC AT/-- ATATATATAT 2584 hom 24 het 24 0 8 17 AT 7 6 247558 CASAVA_Build 11 62674448 2D TACTGGTCTG TC/-- TCTCTGTAGA 3070 hom 60 het 29 0 21 9 TC 3 2 247559 CASAVA_Build 11 62674922 1I TATATATATA -/T TATATTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 2 247560 CASAVA_Build 11 62677977 1I TATTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 180 hom 30 1 20 9 T 11 12 247561 CASAVA_Build 11 62678426 1I CCTATTCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 97 hom 32 1 28 3 T 10 11 247562 CASAVA_Build 11 62680549 1D CTAGAATTGG A/- GGACCCCAAG 3070 hom 74 het 30 0 24 6 A 1 0 247563 CASAVA_Build 11 62682282 1D CTTATGAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 46 het 31 1 25 5 T 10 9 247564 CASAVA_Build 11 62683750 1D CTTTGGAACT G/- GGGCAATATT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 G 4 3 247565 CASAVA_Build 11 62694394 1I ACAGAGACAC -/A AAAACCACTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 4 5 247566 CASAVA_Build 11 62697948 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 902 het 902 ref 29 16 2 11 T 15 14 247567 CASAVA_Build 11 62702113 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTTTGC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 0 1 247568 CASAVA_Build 11 62725866 3I TCAATAAAAA ---/AAC AACCCCATTA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 AAC 1 2 247569 CASAVA_Build 11 62729884 1I CCAAAACCCG -/T TTGGAAACAC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 2 3 247570 CASAVA_Build 11 62740887 1I ATTTTCTTAT -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 8 247571 CASAVA_Build 11 62746216 2D CTGAGAATAA TG/-- TAATTGGTAT 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 TG 1 0 247572 CASAVA_Build 11 62746856 1D CTATACCCAG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 416 hom 25 1 19 5 T 9 8 247573 CASAVA_Build 11 62748856 1D ATCTTGAAAA G/- GTTGTTTTAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 2 1 247574 CASAVA_Build 11 62769849 1D GCAACAACTC T/- TTTTTTTTTT 1504 het 1346 hom 21 6 8 7 T 15 14 247575 CASAVA_Build 11 62793804 11D ATTTGCTTAA TGGAAGCAAAC/----------- TGTATACTGA 324 het 324 ref 40 25 3 15 TGGAAGCAAAC 1 0 247576 CASAVA_Build 11 62817791 1D AGTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 496 hom 28 2 20 6 T 11 10 247577 CASAVA_Build 11 62822003 1I TGATTCCATC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 8 9 247578 CASAVA_Build 11 62822462 1D TAAGGAATAT G/- GCACTGCTGT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 2 1 247579 CASAVA_Build 11 62830563 1D CAAAATCTAC T/- TTATCTGTTG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 3 2 247580 CASAVA_Build 11 62831378 1D TTTCTGTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 33 0 25 10 T 10 9 247581 CASAVA_Build 11 62831551 4D TCTTTTCAAA AAAC/---- AAACAAATTT 3070 hom 69 het 27 0 24 5 AAAC 2 1 247582 CASAVA_Build 11 62833137 1I TCCCTCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 24 1 18 5 T 12 13 247583 CASAVA_Build 11 62835678 1D TTCTTTGTAA T/- TTTTCTCTCT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 5 4 247584 CASAVA_Build 11 62857282 1I CAGTTTTTCT -/G CTCTGTCTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 0 1 247585 CASAVA_Build 11 62859088 1D TATTAACTAA C/- TATTTAGGAT 3070 het 3070 hom 51 24 25 4 C 1 0 247586 CASAVA_Build 11 62859978 3I TTTTGTCCCA ---/TTC TTCTTCCCGT 3070 hom 94 het 36 0 31 5 TTC 2 3 247587 CASAVA_Build 11 62861375 1D ATAATGAAAC A/- AATCAGGTCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 3 2 247588 CASAVA_Build 11 62868471 1D TAAACACTAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 7 247589 CASAVA_Build 11 62879209 7I TCTGTATCCA -------/TTGATGG TTGATGGGCA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 TTGATGG 1 2 247590 CASAVA_Build 11 62880567 1D TTTCATTTTC T/- TTGTGGCTAT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 3 2 247591 CASAVA_Build 11 62885169 1I GGTAGGAGGA -/G GGGGGGGTTG 3070 hom 84 het 34 0 23 11 G 7 8 247592 CASAVA_Build 11 62885547 6I2M11I TGGAAGATGT ------GC-----------/CATTGAGCCTTGTATGGAA AGGGGATGAT 3070 hom 104 het 37 0 33 6 N/A 0 0 247593 CASAVA_Build 11 62896374 3D TAAAATCGGA AAT/--- AATCTATAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 AAT 2 1 247594 CASAVA_Build 11 62906247 1D GAGGCAGCAC A/- AAAAAAAAAA 2729 het 2729 ref 38 27 6 7 A 11 10 247595 CASAVA_Build 11 62908098 5D TCCATCTAAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 5 A 15 10 247596 CASAVA_Build 11 62912769 1D TCCACCTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 10 9 247597 CASAVA_Build 11 62939908 1D CTGGGTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 38 0 28 11 A 13 12 247598 CASAVA_Build 11 63024879 3I AATATACAAC ---/AAT GAGTGATGGT 3070 hom 117 het 43 0 37 6 AAT 0 1 247599 CASAVA_Build 11 63031679 2I TGATGCTTGG --/AA AAAGAGTCAG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 3 5 247600 CASAVA_Build 11 63064576 1I ATGAAAGGGG -/A AAAAAACGAA 3070 het 2505 hom 23 9 11 3 A 6 7 247601 CASAVA_Build 11 63087677 1I CGAGGCAGGA -/G AATGGCGTCA 3070 hom 84 het 30 0 25 5 G 0 1 247602 CASAVA_Build 11 63088869 1I TGCCTGCCCT -/C CCCCTTGCAA 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 C 4 5 247603 CASAVA_Build 11 63112523 4D TGGTCTCCTG CTTT/---- CTTTCACTGC 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 CTTT 2 1 247604 CASAVA_Build 11 63114003 6D TTGTCCCCAC CCTTGT/------ CCCAACTGTG 2241 het 2241 ref 25 11 6 8 CCTTGT 1 0 247605 CASAVA_Build 11 63116427 18D GTTGGCCAGG CTGGTCTCGAACTCAAGC/------------------ CTGGTCCGAG 3070 het 2349 hom 13 6 8 5 CTGGTCTCGAACTCAAGC 1 0 247606 CASAVA_Build 11 63126634 1D TGGTTTGTAC T/- TTTTTTTTTT 1257 het 1257 ref 40 27 4 9 T 12 11 247607 CASAVA_Build 11 63136402 1I ATTTAAGCTG -/C TAGAACTGAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 247608 CASAVA_Build 11 63137731 6D GCTGTCCGGG TGTGGC/------ TCCGGAGGGC 2399 hom 27 het 12 0 9 4 TGTGGC 1 0 247609 CASAVA_Build 11 63141971 1I ATTAAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2338 hom 28 8 11 9 T 10 11 247610 CASAVA_Build 11 63154299 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1754 het 1754 ref 22 10 4 8 A 17 16 247611 CASAVA_Build 11 63159446 1I AAAATGTGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 9 10 247612 CASAVA_Build 11 63159764 1D CCAGGAATTA G/- CAAAAACACA 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 G 1 0 247613 CASAVA_Build 11 63160791 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 950 hom 27 4 17 6 A 15 14 247614 CASAVA_Build 11 63167907 3I AAAAATTTTG ---/AAT AAGAATAACA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AAT 0 1 247615 CASAVA_Build 11 63170115 1I CCTACCCCCA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 48 het 19 0 16 3 T 7 8 247616 CASAVA_Build 11 63170539 4D ATTATATTTA AAAT/---- AAATATTCTA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 AAAT 2 1 247617 CASAVA_Build 11 63222181 1D TTTCATAGTC T/- TTTTTTTTTT 1440 het 1440 ref 35 22 4 9 T 13 12 247618 CASAVA_Build 11 63228669 1D ATGTTTGACT A/- AAAAAAAAAA 1325 het 1325 ref 30 21 3 7 A 13 12 247619 CASAVA_Build 11 63230765 3D GACAATATTT TTA/--- TTTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TTA 1 0 247620 CASAVA_Build 11 63250935 5D AAGAAGAAGT GAGCC/----- GAGTTTGTAG 1223 hom 12 het 6 0 5 2 GAGCC 1 0 247621 CASAVA_Build 11 63283768 1D CCACACAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 28 2 21 6 T 15 14 247622 CASAVA_Build 11 63348660 2D TTTCAATGAC AT/-- GTGTGTGCTC 3070 hom 101 het 40 0 32 10 AT 1 0 247623 CASAVA_Build 11 63348812 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 33 3 18 13 A 15 14 247624 CASAVA_Build 11 63363835 1D GCCAACCCCC G/- TCTCCCCTCA 3070 hom 74 het 29 0 24 5 G 1 0 247625 CASAVA_Build 11 63375562 1I TTTCACTTTC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 56 het 23 0 19 4 T 7 8 247626 CASAVA_Build 11 63376722 1D AATAAGAACT A/- AAAAAAAAAA 1627 het 1627 ref 35 13 6 16 A 15 14 247627 CASAVA_Build 11 63379498 2I CTTGAGCCCA --/AG AGGTCAAGGC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AG 1 2 247628 CASAVA_Build 11 63386512 1I ATGTCTTGCA -/G GCGGAATTTA 3070 hom 132 het 51 0 43 8 G 1 2 247629 CASAVA_Build 11 63386916 1I ACTCCCCACC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 107 het 41 0 36 5 A 8 9 247630 CASAVA_Build 11 63390754 1D CTCATCTGTG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 T 7 6 247631 CASAVA_Build 11 63396610 11D CTGCTTTCCC AGAGGCCATAA/----------- ACCTGCCTTT 3070 hom 108 het 35 0 35 2 AGAGGCCATAA 1 0 247632 CASAVA_Build 11 63400269 13D AGATGACCAG AACTTAGCCTTCA/------------- AACTTAGCCT 3070 hom 117 het 47 0 39 12 AACTTAGCCTTCA 2 1 247633 CASAVA_Build 11 63400760 5D CTTGGAGCCA TCTTT/----- TCTTCCCTGC 3070 hom 81 het 30 0 27 5 TCTTT 1 0 247634 CASAVA_Build 11 63411774 3I TCGTTGGTCT ---/AGA AGAAGGGGAG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 AGA 1 2 247635 CASAVA_Build 11 63419707 12D CTCCTGTCCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2300 het 6 hom 19 1 8 12 T 28 16 247636 CASAVA_Build 11 63447444 1D TTGCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 39 0 29 11 A 11 10 247637 CASAVA_Build 11 63455682 1I TCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 8 9 247638 CASAVA_Build 11 63472787 1D TATATTTTTT G/- GTAGAGAAGG 1221 hom 10 het 5 0 4 1 G 2 1 247639 CASAVA_Build 11 63483169 1D CCCTGTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2982 hom 21 het 14 0 8 7 A 17 16 247640 CASAVA_Build 11 63483816 1I GATTGTGCCA -/T GATACTCCAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 0 1 247641 CASAVA_Build 11 63484504 1I ATCTCTGTCA -/C CCAGGCTGGA 3070 hom 108 het 40 0 37 7 C 2 3 247642 CASAVA_Build 11 63514063 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1780 het 1313 hom 18 9 5 4 A 15 14 247643 CASAVA_Build 11 63538241 3D CTGCAAAGTG TCC/--- TCCAAAAGGA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 TCC 2 1 247644 CASAVA_Build 11 63589672 1D CCAGTCTCTA C/- TAAAAAATAC 2660 hom 18 het 7 0 7 0 C 1 0 247645 CASAVA_Build 11 63596472 1D CGGCTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 A 13 12 247646 CASAVA_Build 11 63605678 2D GGGACCACTC TG/-- GGTGTAGACT 3070 het 3070 hom 37 13 15 10 TG 1 0 247647 CASAVA_Build 11 63607137 1D ACTGAGGCTC A/- GGGGGGCAAA 3070 hom 77 het 29 0 25 4 A 1 0 247648 CASAVA_Build 11 63608058 4I GGGTTCCGGC ----/CTAA CTTTCACTGG 3070 hom 79 het 31 0 25 6 CTAA 0 1 247649 CASAVA_Build 11 63620033 1I CCCACCCCCC -/A AGGGGCCCAT 3070 hom 54 het 22 0 17 5 A 1 2 247650 CASAVA_Build 11 63638405 1D7M8D GGATGGATGG ATGGACAGGTGCATGT/-TGGACAG-------- ATGAATGGAT 3070 het 3070 ref 53 17 17 27 N/A 0 0 247651 CASAVA_Build 11 63638603 1D20M1D ATGCATGGAT GGATGGATGGATGGATGGACAG/-GACGGATGGATGGACGGACA- GTAGATGCAT 3070 het 3070 ref 72 52 8 28 N/A 0 0 247652 CASAVA_Build 11 63642643 1D CTGGGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 35 1 27 7 T 12 11 247653 CASAVA_Build 11 63664012 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 19 0 12 7 A 10 11 247654 CASAVA_Build 11 63671790 2D GATGTTCTAT TA/-- TATATATATA 2889 hom 22 het 11 0 8 3 TA 8 7 247655 CASAVA_Build 11 63682773 1D GGAACAAGGA C/- CCAAAGCCAG 3070 hom 53 het 23 0 16 7 C 3 2 247656 CASAVA_Build 11 63705276 11D TTCTCTGATT AATAATTATTA/----------- GATAATAATT 3070 hom 62 het 23 0 20 5 AATAATTATTA 1 0 247657 CASAVA_Build 11 63763832 3D GCAGCTTCCT TCA/--- TCATCAGTTG 3070 hom 82 het 30 0 26 4 TCA 3 2 247658 CASAVA_Build 11 63891365 1D AGATAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 17 0 11 6 T 11 10 247659 CASAVA_Build 11 63892118 2D CCCACCAGAG TC/-- TCCTCACCCG 3070 hom 51 het 21 0 16 5 TC 2 1 247660 CASAVA_Build 11 63895150 10D AGACTCCGTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 979 hom 23 het 14 0 7 7 A 25 15 247661 CASAVA_Build 11 63900987 2I AGCTTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 12 14 247662 CASAVA_Build 11 63903975 2I AGTGTGTGAA --/TG TGTGTGTAAG 3070 hom 225 het 79 0 75 4 TG 3 4 247663 CASAVA_Build 11 63904057 2D ATGTGTGTTA GT/-- GTGTGTCAGT 3070 hom 171 het 65 0 54 17 GT 4 3 247664 CASAVA_Build 11 63904285 2D38M10I GGGTGTGAGC GTGTGTGTGTATGTGGGTGTGAGTGTGTGAGCGTGAGTGT----------/--GTGTGTGTATGTGGGTGTGAGTGTGTGAGCGTGAGTGTGAGAGTGTGA GAGAGTGTGT 3070 het 283 hom 52 7 24 39 N/A 0 0 247665 CASAVA_Build 11 63907378 27D CCAGGCTGGT CTCGAACTCCTAACCTCAGGTGATCCA/--------------------------- CCCACCTCGG 3070 hom 75 het 23 0 26 0 CTCGAACTCCTAACCTCAGGTGATCCA 1 0 247666 CASAVA_Build 11 63916576 1I TCTTTTAGGG -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 7 8 247667 CASAVA_Build 11 63941798 1D TGCCTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 12 11 247668 CASAVA_Build 11 63950472 1D AGTGGATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 11 10 247669 CASAVA_Build 11 63951792 4D TTTTTATATG TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 TTTC 3 2 247670 CASAVA_Build 11 63961356 1D ATACCCAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 923 hom 37 7 18 12 A 12 11 247671 CASAVA_Build 11 63962939 1D GCGCTTTGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 9 8 247672 CASAVA_Build 11 63975911 10I AGGGTTGCCC ----------/TCGGTGGCCT GGGCCTGGCA 3070 hom 47 het 21 0 14 7 TCGGTGGCCT 0 1 247673 CASAVA_Build 11 63995886 1D AAAATATGTG T/- TTTTTTATAT 3070 hom 54 het 24 0 19 6 T 7 6 247674 CASAVA_Build 11 63996058 1D CTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 25 1 15 10 T 15 14 247675 CASAVA_Build 11 63996212 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 23 2 17 4 T 11 10 247676 CASAVA_Build 11 64004495 1D GTGTCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 2707 het 2707 ref 34 16 8 10 T 15 14 247677 CASAVA_Build 11 64016005 4I ACACATATTG ----/ATTA ATATGTGTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATTA 0 1 247678 CASAVA_Build 11 64019509 1I TGGGTTGTTT -/A AATTTTTTAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 2 3 247679 CASAVA_Build 11 64025016 60D GCTCCCGGGG CCGGCTGGGCCTGCTTGTGGGTAAGGGAGAGAGGACAGAAGCCTGTGCTGCTCAGGAGCC/------------------------------------------------------------ CCCACCACAT 2988 hom 27 het 9 0 7 5 CCGGCTGGGCCTGCTTGTGGGTAAGGGAGAGAGGACAGAAGCCTGTGCTGCTCAGGAGCC 1 0 247680 CASAVA_Build 11 64059743 1D GTCTAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 23 2 10 11 A 12 11 247681 CASAVA_Build 11 64067721 1D ATCTCTATTA T/- TTTTTTTTTT 3057 het 3057 ref 22 10 9 3 T 12 11 247682 CASAVA_Build 11 64068002 4D43M5D GGGGAAAGAA AGAGAGAGAAAGGAAGGGAGGGGAAAGAAAGAAAAAAGAAAAGAAAGAGAAA/----AGAGAAAGGAAGGGAGGGGAAAGAAAGAAAAAAGAAAAGAAAG----- AAAGAGAGAA 926 het 926 ref 18 16 5 14 N/A 0 0 247683 CASAVA_Build 11 64083727 1I GGGATGCCTC -/T AGCAGAAATG 2811 het 2811 ref 25 10 9 6 T 0 1 247684 CASAVA_Build 11 64102496 1I GCGTGGGGGA -/C CTGGGCCTGG 3070 hom 53 het 24 0 16 8 C 1 2 247685 CASAVA_Build 11 64102822 1D TTTTTTTTTT C/- AGGAGAAATA 3070 het 184 hom 31 4 17 11 C 1 0 247686 CASAVA_Build 11 64105908 1D TAGGACCCCC T/- CACCACCACT 3070 het 3070 ref 48 24 13 11 T 1 0 247687 CASAVA_Build 11 64106708 18D TAACATGGGT TGGGGGCCCTCATTATCC/------------------ TGGGGGCCCT 3070 het 3070 ref 35 16 15 10 TGGGGGCCCTCATTATCC 2 1 247688 CASAVA_Build 11 64111841 5D ACTCTGACTC AACTT/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 24 6 AACTT 1 0 247689 CASAVA_Build 11 64113961 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1487 het 1487 ref 33 13 5 15 T 17 16 247690 CASAVA_Build 11 64170861 1I TTGGCAGTCA -/G GGCTGGAACA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 2 3 247691 CASAVA_Build 11 64197737 2I TTGTTTTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 83 het 35 0 27 8 TG 7 8 247692 CASAVA_Build 11 64205862 5I TAAGAAAATT -----/GGCAC GGATGAGTAT 3070 hom 141 het 56 0 47 9 GGCAC 0 1 247693 CASAVA_Build 11 64231001 1D TGTATCCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 27 0 12 15 T 17 16 247694 CASAVA_Build 11 64238265 2I GAGCCCAACC --/CA TCAGCCCGCT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 CA 0 1 247695 CASAVA_Build 11 64300091 1I ATTTTTTTTT -/C TTTCAGAAAG 3070 het 321 hom 38 1 32 5 C 0 1 247696 CASAVA_Build 11 64305383 2D CTACTTCGAA AC/-- ACTGACTCCA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 AC 2 1 247697 CASAVA_Build 11 64317265 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 10 247698 CASAVA_Build 11 64318416 1I TCTGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 11 247699 CASAVA_Build 11 64330762 3D CACCCCCTCT TCA/--- TCAGTGCTCC 3070 hom 71 het 30 0 22 8 TCA 2 1 247700 CASAVA_Build 11 64337337 15D CTGCCTCTAC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 2572 het 171 hom 18 4 10 10 A 29 14 247701 CASAVA_Build 11 64338739 2D CCTTCTAGAC AG/-- GGGCTCTGGA 3070 hom 99 het 37 0 33 7 AG 1 0 247702 CASAVA_Build 11 64352327 4D CCCCACTGCC TCAT/---- TCATTCATTC 3070 hom 81 het 36 0 25 12 TCAT 4 3 247703 CASAVA_Build 11 64355280 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 22 1 18 3 A 11 12 247704 CASAVA_Build 11 64369554 10I TTCTGATTTC ----------/TGTCCAGCTG TGTCCAGCTG 3070 hom 73 het 29 0 23 6 TGTCCAGCTG 1 2 247705 CASAVA_Build 11 64371227 1I GGGGGAGGGG -/A GCAGGAGTTC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 A 0 1 247706 CASAVA_Build 11 64376437 1I GTGCCGAGGG -/C CCTGCAGGTG 3070 hom 57 het 25 0 18 7 C 2 3 247707 CASAVA_Build 11 64377204 1D TGCTCAACCT G/- GGGGCCAGGG 3070 hom 37 het 17 0 12 5 G 5 4 247708 CASAVA_Build 11 64404019 2I GGGAACTGAG --/TC TGGTGGAATC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 TC 0 1 247709 CASAVA_Build 11 64443391 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2749 hom 17 het 13 0 9 4 A 13 12 247710 CASAVA_Build 11 64445384 5I TGGATTCCAG -----/TCAAC TCAAGAGGTC 3070 hom 66 het 27 0 20 7 TCAAC 0 1 247711 CASAVA_Build 11 64446370 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 8 7 247712 CASAVA_Build 11 64448549 1I AGCCCATCCC -/A ACTCTGCTCT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 1 2 247713 CASAVA_Build 11 64459342 4I CACCGTCCAC ----/TCTG TCAGCTCTTT 2351 het 2351 ref 34 19 7 8 TCTG 0 1 247714 CASAVA_Build 11 64474627 4D TCCATTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 55 23 19 14 TTTC 4 3 247715 CASAVA_Build 11 64479371 1I GAGGAAGCAG -/A AAAAAAAAAG 349 het 349 ref 32 17 5 10 A 9 10 247716 CASAVA_Build 11 64486496 5D TTACGTCCCA GTAAC/----- TATTATTAAG 3070 het 3070 ref 39 22 13 7 GTAAC 1 0 247717 CASAVA_Build 11 64494258 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCC 3070 het 1450 hom 12 3 8 1 A 4 5 247718 CASAVA_Build 11 64501279 20I GGACCCCAGC --------------------/AAGGAGGTGAAACTTCCAAG AAGGAGGTGA 3070 hom 105 het 42 0 35 8 AAGGAGGTGAAACTTCCAAG 0 1 247719 CASAVA_Build 11 64533863 1I CTTTCTTGTG -/A AAAAAAAAAT 514 het 514 ref 24 10 4 10 A 9 10 247720 CASAVA_Build 11 64536614 14D TAGACATTTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 2165 het 619 hom 11 2 7 2 T 24 10 247721 CASAVA_Build 11 64551495 1I GCGCAGGCCT -/G GGCGAGGCGG 1663 hom 26 het 12 0 6 6 G 2 3 247722 CASAVA_Build 11 64564789 1I AGCATAGTCT -/C CAGGGAAATA 2097 hom 41 het 17 0 7 10 C 1 2 247723 CASAVA_Build 11 64588466 1D ACTCTGTCGC A/- AAAAAAAAAA 1406 hom 7 het 16 0 5 11 A 19 18 247724 CASAVA_Build 11 64600348 2I CATTTTTTGT --/AG AGTCAGGATC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AG 1 2 247725 CASAVA_Build 11 64608030 1D CAGACATAAC T/- TAGGCTCCGT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 2 1 247726 CASAVA_Build 11 64618018 4I GGGGTTTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 64 het 29 0 20 9 TTTG 2 3 247727 CASAVA_Build 11 64619601 1I CTGGCCTGTA -/T TTTTTTTTTT 1516 het 372 hom 8 1 5 2 T 10 11 247728 CASAVA_Build 11 64654934 1I GGGGCCTGTG -/C CCTGCTGTGC 3070 hom 72 het 27 0 21 6 C 2 3 247729 CASAVA_Build 11 64666463 1I CCTGGCTAAC -/T TTTTTTATTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 6 7 247730 CASAVA_Build 11 64694653 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2287 hom 40 het 16 0 14 2 T 9 10 247731 CASAVA_Build 11 64716688 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 11 10 247732 CASAVA_Build 11 64721269 4D ATCAATTACT GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 hom 90 het 38 0 31 9 GAAA 4 3 247733 CASAVA_Build 11 64722190 1D AATCAGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 26 1 16 10 T 12 11 247734 CASAVA_Build 11 64727246 3I ACATTCTCTC ---/TCT TTTTTTTTTT 1332 het 259 hom 29 3 9 17 TCT 0 1 247735 CASAVA_Build 11 64731962 5D CTCCATCTCA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 hom 59 het 22 0 20 2 AAAAG 4 3 247736 CASAVA_Build 11 64739299 1D GGGTGGGGGT G/- GGGGGGGGTG 1389 het 109 hom 11 2 6 3 G 9 8 247737 CASAVA_Build 11 64749772 4I TTCTGGAAAC ----/AGTA AGCAAAAGCC 3070 hom 78 het 31 0 25 6 AGTA 0 1 247738 CASAVA_Build 11 64768716 9D4M1D TAATTTTTAA AGTTTTTGTAGAGA/---------AGAG- CAGGGTCTTG 3070 hom 33 het 12 0 10 3 N/A 0 0 247739 CASAVA_Build 11 64769411 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2482 het 331 hom 20 1 11 8 T 14 15 247740 CASAVA_Build 11 64775281 2D ATATACATAT AC/-- ACACACACAT 772 het 772 ref 19 6 12 1 AC 5 4 247741 CASAVA_Build 11 64791841 1I AAAGTACAAA -/T TTTTTTTTTT 1688 het 1688 ref 22 5 5 12 T 15 16 247742 CASAVA_Build 11 64837004 1D GCTCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2364 het 532 hom 18 2 8 8 T 15 14 247743 CASAVA_Build 11 64849394 1D TCAGCCCGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 11 10 247744 CASAVA_Build 11 64936390 1I TGCCCTGGGT -/A ACCTCTGCTG 3070 hom 71 het 27 0 19 8 A 1 2 247745 CASAVA_Build 11 64944632 1I GTCCCTACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 29 het 11 0 10 1 A 9 10 247746 CASAVA_Build 11 64962412 12I TTCTAAGAAT ------------/TTTTCCTTCTAA ATTTATTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 14 3 TTTTCCTTCTAA 0 1 247747 CASAVA_Build 11 64980116 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 642 het 263 hom 18 3 4 11 A 19 18 247748 CASAVA_Build 11 64994351 2D AAAATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 17 0 13 4 TA 10 9 247749 CASAVA_Build 11 64997556 2D CCAAAACAAT AA/-- AAAGAGTGAG 3070 het 3070 ref 34 17 13 6 A 5 3 247750 CASAVA_Build 11 65025056 1D AGTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 1943 het 1943 ref 39 23 5 11 T 12 11 247751 CASAVA_Build 11 65059598 2D TGGCCGAAGT CA/-- CACAGTCAGG 3070 het 3070 ref 36 21 9 8 CA 3 2 247752 CASAVA_Build 11 65068337 2D ACCTCCACCT TC/-- TCTCTCACAG 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 TC 4 3 247753 CASAVA_Build 11 65074075 4D ATGAACAAAA ACAG/---- ACAAAAATTT 3070 het 3070 ref 42 24 13 7 ACAG 1 0 247754 CASAVA_Build 11 65074709 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2399 het 121 hom 13 1 8 4 A 13 12 247755 CASAVA_Build 11 65091845 4D CCATCTCAAA AAAC/---- AAACAAGCAA 3070 hom 78 het 28 0 26 5 AAAC 2 1 247756 CASAVA_Build 11 65120246 1D CTTAGCAAAG A/- AACATGGCAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 3 2 247757 CASAVA_Build 11 65121561 6I TGTGGCCAGG ------/TTGGTC TTGAACTCCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TTGGTC 0 1 247758 CASAVA_Build 11 65138725 11I CATTATTTTC -----------/TTTCTTTTTTT TTTCTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 TTTCTTTTTTT 0 1 247759 CASAVA_Build 11 65194498 1D ACCACAAAAG A/- AAAAAATAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 6 247760 CASAVA_Build 11 65196756 2D TATCTCACAC TG/-- TATACAAAAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TG 1 0 247761 CASAVA_Build 11 65197165 1D AGGTAACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 30 1 19 10 T 12 11 247762 CASAVA_Build 11 65200946 3D ATCCTTAGGA TTT/--- TCTACATAGA 3070 het 3070 ref 27 17 7 3 T 4 1 247763 CASAVA_Build 11 65210441 4D TAATCCCAGC TACT/---- TGGGAGGCTG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 TACT 1 0 247764 CASAVA_Build 11 65214088 2D AGGGTATGAC TT/-- AACCACAGGT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 2 0 247765 CASAVA_Build 11 65214840 1I46M1I CAATACAGAA -GTTACATGGATGTAATAACCTTTCCAAGTCCATAATTTAAATTAGA-/GGTTACATGGATGTAATAACCTTTCCAAGTCCATAATTTAAATTAGAT CTTTTTTTGA 3070 hom 144 het 42 0 49 4 N/A 0 0 247766 CASAVA_Build 11 65223073 1D GACCAAGTCA G/- GGGCATAGAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 4 3 247767 CASAVA_Build 11 65235245 3D GGGATTTGTC TGA/--- TGTTTTTCTC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 TGA 1 0 247768 CASAVA_Build 11 65247516 5D TCCTAATGAT TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TTTTA 3 2 247769 CASAVA_Build 11 65248857 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAATCC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 7 8 247770 CASAVA_Build 11 65252041 21D CCCTGTAGCA GGCCAAGCAGGACCTGGCGCC/--------------------- GGCCAAGCAG 3070 hom 43 het 20 0 12 11 GGCCAAGCAGGACCTGGCGCC 2 1 247771 CASAVA_Build 11 65253630 1D TTTTAACCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 14 0 13 2 T 10 9 247772 CASAVA_Build 11 65257979 2I TAGAACTACC --/AT ATATGATCCA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AT 2 3 247773 CASAVA_Build 11 65262520 1D TTCTTTTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 10 9 247774 CASAVA_Build 11 65275359 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 31 0 25 6 T 12 11 247775 CASAVA_Build 11 65307889 4I GTCTCAAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 36 het 19 0 13 6 AAAT 2 3 247776 CASAVA_Build 11 65309093 1I TGTGCTCCAG -/C CCAGGCGACC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 2 3 247777 CASAVA_Build 11 65313693 1I AGCCAACCAT -/G GACCCCAGAG 3070 hom 76 het 31 0 22 9 G 1 2 247778 CASAVA_Build 11 65326723 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 21 1 13 7 A 17 16 247779 CASAVA_Build 11 65334674 14D TCGCAAACAC GCACACTCACACAT/-------------- GCACACTCAC 2837 het 2837 ref 35 18 9 10 GCACACTCACACAT 1 0 247780 CASAVA_Build 11 65338926 1D CGCATTAATC T/- TCCTGTGCCT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 2 1 247781 CASAVA_Build 11 65339886 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 19 6 T 10 11 247782 CASAVA_Build 11 65341444 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1488 het 639 hom 15 2 8 6 A 17 16 247783 CASAVA_Build 11 65346620 1I CCTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2368 het 936 hom 24 3 11 10 T 13 14 247784 CASAVA_Build 11 65348535 1D TGGCATTTCA G/- GCTTGAGCCA 3070 hom 87 het 34 0 28 6 G 2 1 247785 CASAVA_Build 11 65353263 1D CAACAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 27 1 16 11 A 13 12 247786 CASAVA_Build 11 65358221 25D CAATCATGCG GTGGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGT/------------------------- GTGGTCTGCC 3070 hom 86 het 29 0 24 9 GTGGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGT 1 0 247787 CASAVA_Build 11 65368485 1D CCTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 23 1 10 12 A 13 12 247788 CASAVA_Build 11 65369143 1I CCAGGAGTTC -/A AACCAGCCTG 3070 hom 9 het 15 0 9 6 A 2 3 247789 CASAVA_Build 11 65373690 1D GCCTCCCCCA G/- GGGGTGGTAG 3070 hom 101 het 39 0 30 10 G 5 4 247790 CASAVA_Build 11 65377870 2I GCATCCTCAG --/CC CCCTCTCTCC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 C 3 5 247791 CASAVA_Build 11 65391673 1I ACTGAGATCA -/G ATATGGAAAA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 G 0 1 247792 CASAVA_Build 11 65411836 2I TCTGGCGGGG --/CC CCTAGCAGGG 3070 hom 93 het 35 0 25 10 C 2 4 247793 CASAVA_Build 11 65438664 1D GACTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 25 1 13 12 A 13 12 247794 CASAVA_Build 11 65450633 2D TATATGTATA TG/-- TGTGTGCCTA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 TG 4 3 247795 CASAVA_Build 11 65507142 1I CTAATGTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 398 hom 43 1 34 8 T 9 10 247796 CASAVA_Build 11 65509776 1I CTCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 22 1 19 2 A 10 11 247797 CASAVA_Build 11 65528887 4D CTTTCACAGT AATA/---- AATATTTTCT 3070 hom 75 het 27 0 25 5 AATA 2 1 247798 CASAVA_Build 11 65534475 2D CTTTTGTCTC TT/-- GTCTTTTATT 3070 het 390 hom 25 1 21 4 T 2 0 247799 CASAVA_Build 11 65535047 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 23 8 T 12 11 247800 CASAVA_Build 11 65551963 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1264 hom 29 5 13 11 T 13 14 247801 CASAVA_Build 11 65556825 16D GGCACCTGCC CTGACGCCCAGCAAAT/---------------- CTGACGCCCA 2074 het 2074 ref 12 7 5 0 CTGACGCCCAGCAAAT 2 1 247802 CASAVA_Build 11 65561414 1I TTTGGATCAT -/G GGGGTAGATC 2043 het 2043 ref 26 19 7 0 G 4 5 247803 CASAVA_Build 11 65562402 6I CCACTGCACC ------/TGGCCA TGGCCATGCA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 TGGCCA 1 2 247804 CASAVA_Build 11 65586614 3I GTCTTCAAAT ---/TTA TTCTTATTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 TTA 0 1 247805 CASAVA_Build 11 65620257 13D TTTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1926 hom 32 12 15 7 T 24 11 247806 CASAVA_Build 11 65638154 1I GTTCAGCTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 9 10 247807 CASAVA_Build 11 65640943 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 29 0 23 6 A 11 10 247808 CASAVA_Build 11 65647891 1D AAGTATATAC T/- TTTTTTTTTT 2370 het 1508 hom 19 6 7 6 T 13 12 247809 CASAVA_Build 11 65652931 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2156 het 2156 ref 30 12 9 9 A 15 16 247810 CASAVA_Build 11 65655814 1D ATCTCTATGT A/- AAAAAAAAAG 1383 het 1383 ref 26 21 3 2 A 10 9 247811 CASAVA_Build 11 65658614 1D TTTTGATGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 T 9 8 247812 CASAVA_Build 11 65663011 3I TACAGGTGTG ---/GTA AGCCACTGTG 3070 het 1725 hom 18 5 10 3 GTA 0 1 247813 CASAVA_Build 11 65674520 1I ACTAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 10 11 247814 CASAVA_Build 11 65680901 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 1197 het 1197 ref 21 8 4 9 A 15 14 247815 CASAVA_Build 11 65681895 1I AGCCTATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2785 hom 28 11 14 3 A 12 13 247816 CASAVA_Build 11 65689767 2I TGTGGGTATT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 TA 5 6 247817 CASAVA_Build 11 65698405 1D TGGAAAATAC T/- TTTGACAGTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 4 3 247818 CASAVA_Build 11 65700098 1D TGGACTTTCC A/- AAAATATAGA 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 A 5 4 247819 CASAVA_Build 11 65700463 1I AAGATCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 27 2 13 12 T 15 16 247820 CASAVA_Build 11 65710904 1I TGTAGGCCCG -/T TAACGTTGCC 3070 het 3070 hom 55 24 26 5 T 1 2 247821 CASAVA_Build 11 65724526 1I GGAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 11 12 247822 CASAVA_Build 11 65727540 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 10 9 247823 CASAVA_Build 11 65727920 5D CTGGAGACTT AACTC/----- TAATACCTGA 3070 het 3070 hom 32 16 16 1 AACTC 1 0 247824 CASAVA_Build 11 65747443 1D GCCCGGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 25 2 11 12 T 13 12 247825 CASAVA_Build 11 65754005 1I AGTCCATCCC -/A AAAAAAAAAA 1763 het 1761 ref 17 6 6 5 A 13 14 247826 CASAVA_Build 11 65776327 4I TTATGCCTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3023 hom 24 7 14 3 TTTG 3 4 247827 CASAVA_Build 11 65792283 1I TATTAGTCTT -/A ACTAGAACCC 3070 het 3047 hom 32 8 17 7 A 1 2 247828 CASAVA_Build 11 65800319 3D GAGGGGGCAC CTT/--- CTCCAGATGA 2940 het 2940 ref 29 12 12 5 CTT 1 0 247829 CASAVA_Build 11 65801853 1I GCTGAGAGGG -/C CCCCCACTGC 2920 het 1601 hom 18 7 10 1 C 5 6 247830 CASAVA_Build 11 65815419 2D ATGGGAAAAC TG/-- AGGTTGAGAG 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 TG 1 0 247831 CASAVA_Build 11 65821398 1D GGAGCTACAT C/- CACTTGGAGA 3070 hom 81 het 32 0 25 7 C 2 1 247832 CASAVA_Build 11 65831248 5D AGCCTCCCAA AGTGC/----- AGTGCTGGGA 3070 hom 69 het 24 0 20 5 AGTGC 2 1 247833 CASAVA_Build 11 65852337 1I TTTCAGGCCA -/C CCAGTAGGCC 3070 hom 86 het 35 0 27 8 C 2 3 247834 CASAVA_Build 11 65853669 2I TTTTCATTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 25 1 20 4 T 12 14 247835 CASAVA_Build 11 65867911 2I TGGTGGAGAA --/AG AGAGTTTTAG 3070 hom 100 het 38 0 32 6 AG 2 3 247836 CASAVA_Build 11 65877485 1I GATAATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 13 14 247837 CASAVA_Build 11 65883748 18D TATTATGTTG TTGACCCTGCCTGTGACC/------------------ TTGACCCTGC 3070 het 3070 ref 41 26 14 7 TTGACCCTGCCTGTGACC 1 0 247838 CASAVA_Build 11 65888000 2I GTTCAACCCA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 27 9 T 9 11 247839 CASAVA_Build 11 65914274 4I41M2I CAAAAAGAAT ----TTTCTTTCTTTCTTTTCTTTCTTCTCTTTTTCTTTCTCTCC--/TTTCTTTCTTTCTTTCTTTTCTTTCTTCTCTTTTTCTTTCTCTCCCT CTCTCTCTCT 3070 hom 66 het 31 0 22 17 N/A 0 0 247840 CASAVA_Build 11 65914326 3I TCTCTCTCTC ---/TCT TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 24 1 11 12 TCT 0 1 247841 CASAVA_Build 11 65925104 3I CTAAAAATGC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 28 0 18 10 A 10 13 247842 CASAVA_Build 11 65930974 1I ACATCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 894 hom 36 2 20 14 A 12 13 247843 CASAVA_Build 11 65958938 1I CGTCTCAAAA -/G AAAAAAAAAG 3070 het 1116 hom 20 4 13 3 G 0 1 247844 CASAVA_Build 11 65970747 1D GGTTTGGGGC T/- TTTTTTTTTT 2196 het 2196 ref 40 26 6 8 T 12 11 247845 CASAVA_Build 11 65987458 3I TGTTTTTTTC ---/TCT TCTTCTTAAT 2173 het 2173 ref 24 13 6 5 TCT 2 3 247846 CASAVA_Build 11 66002647 2I AGGAGGTCAG --/AC AGCCCTGGTC 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 AC 0 1 247847 CASAVA_Build 11 66026522 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1353 het 864 hom 11 3 3 5 T 12 11 247848 CASAVA_Build 11 66028236 8I TGGTCTCAAA --------/CTCCTGAG CTCAAGCAAT 3070 het 3070 ref 48 30 14 4 CTCCTGAG 0 1 247849 CASAVA_Build 11 66037981 2I GTGGAAAGCT --/GA GAGATCAAGG 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 GA 2 3 247850 CASAVA_Build 11 66049464 2D AATAGAAAAA TT/-- AGCCAAGCAT 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 T 2 0 247851 CASAVA_Build 11 66069254 1D GCCCGACTAA T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 T 7 6 247852 CASAVA_Build 11 66076417 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2019 het 1175 hom 10 5 5 1 A 12 11 247853 CASAVA_Build 11 66085071 3I CCCATATTAG ---/TTA TAAATGATGC 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 TTA 0 1 247854 CASAVA_Build 11 66096387 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2328 hom 20 6 12 2 A 10 11 247855 CASAVA_Build 11 66122387 7D8M2D16M3D CATGTCTACT AAAAGAAAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGCATGG/-------AAAAATAC--AAAAATTAGCCGGGCA--- TGGTGGTGTG 1273 het 1273 ref 19 16 4 1 N/A 0 0 247856 CASAVA_Build 11 66126699 1D GGCAAGCCCA G/- CAAAAGAAAC 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 G 1 0 247857 CASAVA_Build 11 66138684 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 4 5 247858 CASAVA_Build 11 66152562 3I TTGTGGATGC ---/TAA TAACTGGGGT 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 TAA 1 2 247859 CASAVA_Build 11 66153967 2I CTACCAAAAG --/AA AAAAGAAAAA 3070 hom 132 het 45 0 44 1 A 4 6 247860 CASAVA_Build 11 66154637 3D AAAACATAAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 2436 hom 27 6 16 5 AAC 3 2 247861 CASAVA_Build 11 66160787 1I ATTATTACTT -/A ACAATGAGTT 3070 het 3070 hom 45 16 18 11 A 1 2 247862 CASAVA_Build 11 66162201 1D GTGGTGGGTT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 47 het 23 0 14 9 G 8 7 247863 CASAVA_Build 11 66175972 6D CCTAATACTT TCACTA/------ TGGGGATTCA 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 TCACTA 1 0 247864 CASAVA_Build 11 66276190 1D CCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2196 het 2196 ref 40 18 7 15 T 17 16 247865 CASAVA_Build 11 66334945 1I TCTCCCTTCA -/G GGCTCCAATT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 2 3 247866 CASAVA_Build 11 66359357 4D AAATATCCTG TTTC/---- TTTCTTTATG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 TTTC 2 1 247867 CASAVA_Build 11 66380077 2I TGGTGACTTC --/CT CTGTTTCCCA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 CT 1 2 247868 CASAVA_Build 11 66420970 8D CCTTTTGTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 2993 het 2993 ref 30 13 7 11 TTTG 5 3 247869 CASAVA_Build 11 66455638 1I CAAAATGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 A 9 10 247870 CASAVA_Build 11 66463430 1I GGCATCCATA -/G GGGGGGTCTT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 G 6 7 247871 CASAVA_Build 11 66543185 2I GGTGGCAGAC --/AA GAGAGAAAAT 3070 hom 80 het 30 0 27 3 A 0 2 247872 CASAVA_Build 11 66560821 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAATA 1757 het 921 hom 10 3 5 2 A 8 9 247873 CASAVA_Build 11 66571387 1I GTGATCTTGG -/C TCACTGCAAC 2947 hom 21 het 11 0 7 4 C 0 1 247874 CASAVA_Build 11 66597443 4I AACAGCAAAA ----/AAAC CCATCAAGGG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 AAAC 0 1 247875 CASAVA_Build 11 66625700 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 533 het 533 ref 33 15 5 13 C 0 1 247876 CASAVA_Build 11 66633849 1I GTATAATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1322 hom 30 7 17 6 A 14 15 247877 CASAVA_Build 11 66669928 1I CCTTTGGGAA -/T TTTTTTTTTT 1347 het 1347 ref 37 25 4 8 T 13 14 247878 CASAVA_Build 11 66695536 2D GTTGAGATCT GA/-- GAGGTTAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 12 8 GA 2 1 247879 CASAVA_Build 11 66722044 1I AAAGTAAGAT -/A AAAAATTCCT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 5 6 247880 CASAVA_Build 11 66761489 3D AAATTTTTCT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 367 hom 23 5 14 5 TTA 5 4 247881 CASAVA_Build 11 66774022 1I CCTCTCCAAC -/A GTGACCTTTC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 0 1 247882 CASAVA_Build 11 66797568 2I GCAGGAGCTG --/CC CCCCCAGTGG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 C 5 7 247883 CASAVA_Build 11 66822104 15D TGAGGTTTTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 7 T 25 10 247884 CASAVA_Build 11 66840653 1I TCTGAGGGCT -/C CCCCCCCGCC 3070 hom 66 het 26 0 20 6 C 7 8 247885 CASAVA_Build 11 66840986 1D AAATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 15 0 11 4 T 13 12 247886 CASAVA_Build 11 66848624 2I TTCTTTCTTT --/TC TCTCTCTTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TC 3 4 247887 CASAVA_Build 11 66855134 1D GGACTATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 37 1 27 9 A 21 20 247888 CASAVA_Build 11 66855845 13I CTATAATCCC -------------/TTTGGGAGGGATA AGCACTTTGG 3070 het 2260 hom 15 6 9 0 TTTGGGAGGGATA 0 1 247889 CASAVA_Build 11 66892075 1I TGCCAGTCTT -/C CAGTCCCACT 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 C 1 2 247890 CASAVA_Build 11 66893974 1D ATCTGGGCAG A/- AAAAAACGGC 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 7 6 247891 CASAVA_Build 11 66908365 4D GCCCGGCTAA TTTT/---- TGTATTTTTT 1126 het 1126 ref 12 8 3 1 T 5 1 247892 CASAVA_Build 11 66910216 15D TGCATCCAGG ATATGTTGAATGAAT/--------------- ATATGTTGAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 6 ATATGTTGAATGAAT 2 1 247893 CASAVA_Build 11 66919610 3I TGCAACCAGT ---/CCC CCCCTCCCTG 2240 het 2240 ref 27 11 8 8 C 4 7 247894 CASAVA_Build 11 66935852 2D GGAGCCCTAA CT/-- CACAGGCTGG 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 CT 1 0 247895 CASAVA_Build 11 66940813 2D GCGCCAGCCT CA/-- GAGAGGGGAG 3070 het 2176 hom 27 10 12 5 CA 1 0 247896 CASAVA_Build 11 66987605 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2902 het 2902 ref 33 17 10 6 T 13 12 247897 CASAVA_Build 11 67005634 1I TGTGACTGGT -/G ACTGTTATTT 3070 hom 75 het 26 0 25 1 G 0 1 247898 CASAVA_Build 11 67013936 4I GTGACATCGA ----/TGTT TGTTTGATGC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 TGTT 1 2 247899 CASAVA_Build 11 67055455 3I TCTCCAGCCC ---/AGA AGGAGCTATA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 AGA 0 1 247900 CASAVA_Build 11 67058446 1D TACAACAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 11 10 247901 CASAVA_Build 11 67071709 1D ACAGCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 A 11 10 247902 CASAVA_Build 11 67072910 2I GCTTAAAACA --/AC ACACACTTAT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 AC 3 4 247903 CASAVA_Build 11 67078166 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 A 13 12 247904 CASAVA_Build 11 67088519 1D GAAAAGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 13 21 16 T 11 10 247905 CASAVA_Build 11 67104489 6D TCAGGAGGCT GAGGCA/------ GGAGAATCAC 2229 het 2229 ref 14 7 7 1 GAGGCA 1 0 247906 CASAVA_Build 11 67105235 5I CTATGCCTGT -----/CTTTA CTTTAATCTC 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 CTTTA 1 2 247907 CASAVA_Build 11 67105337 3D TAGAGGACAA TTG/--- TTGTGTGTTT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 TTG 2 1 247908 CASAVA_Build 11 67114621 1I AACTACCCCC -/T GGCAGGGAGA 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 T 0 1 247909 CASAVA_Build 11 67132273 1I AGTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 511 hom 26 3 19 4 A 13 14 247910 CASAVA_Build 11 67137345 3D GGGTTCAGGG TCT/--- TCCTGTGAAC 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 TCT 1 0 247911 CASAVA_Build 11 67142843 2I CCAGGGAGTT --/CC CCCTCCTACC 3070 hom 72 het 30 0 23 7 C 3 5 247912 CASAVA_Build 11 67145759 1D GTTCTTGGGC A/- GGGGGAGAAA 2966 het 1565 hom 16 7 8 1 A 1 0 247913 CASAVA_Build 11 67149493 16D AGCAGAAAGG AAAGAGACAGGAAGTC/---------------- AAAGAAAGAG 271 het 271 ref 20 7 5 12 AAAGAGACAGGAAGTC 1 0 247914 CASAVA_Build 11 67161404 1D AGCAAGGCCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 219 hom 17 2 12 4 T 9 8 247915 CASAVA_Build 11 67162340 1D TTTTACAATT A/- AAATGTTTTA 1911 het 1911 ref 10 5 4 1 A 4 3 247916 CASAVA_Build 11 67174919 1D ATCTCTGGCC A/- GGCCAAGGGC 3070 hom 48 het 19 0 16 4 A 1 0 247917 CASAVA_Build 11 67175551 1I AAAATACTGG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 9 247918 CASAVA_Build 11 67177176 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 28 0 23 5 T 10 9 247919 CASAVA_Build 11 67182748 3I ACAAGGTCTC ---/ATT ATGTTTCCCA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 ATT 0 1 247920 CASAVA_Build 11 67191340 1I ACAGGGTGGC -/T TGTGAGTGTT 3070 hom 80 het 35 0 24 11 T 1 2 247921 CASAVA_Build 11 67202858 4D ACACTAATGG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 75 het 31 0 26 7 TA 7 5 247922 CASAVA_Build 11 67219045 1D TTTTAACCTT A/- ACGTGCTTGA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 2 1 247923 CASAVA_Build 11 67231246 1I TGGCTCATGC -/T TTATAATCCT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 T 2 3 247924 CASAVA_Build 11 67231497 1D TCGCTGGCAG C/- CCCTTATAGA 3070 het 3070 ref 44 30 11 3 C 4 3 247925 CASAVA_Build 11 67233302 2D24M1D TGGACAAAAT CACAGAGTTGCTTTGGGAGCGAGGGTG/--CAGAGGTGCTTTAGGAGCGAGGGT- GCAATCAGAC 3070 het 3070 ref 26 28 10 2 N/A 0 0 247926 CASAVA_Build 11 67247584 1I CACTTGCGGA -/C CATACACCGC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 1 2 247927 CASAVA_Build 11 67269632 12D8M6D CACACATGCA CATGCACACTCGCACACATGCGCACA/------------CACACATG------ CACATGCACA 1997 het 1997 ref 73 78 10 12 N/A 0 0 247928 CASAVA_Build 11 67269743 4D ATGCACACAT ACAC/---- ACACACCACT 3070 het 3070 hom 53 24 26 3 AC 5 3 247929 CASAVA_Build 11 67273946 1D ATTGGGCTAC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 25 het 28 1 24 3 T 9 8 247930 CASAVA_Build 11 67291149 1I AAGATTTTTA -/G GGCAGTGAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 2 3 247931 CASAVA_Build 11 67297179 1D TAATTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 11 10 247932 CASAVA_Build 11 67303425 1D TAAATATAAG A/- AGAAGAGGGA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 A 2 1 247933 CASAVA_Build 11 67311500 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2971 het 170 hom 20 3 9 8 T 15 14 247934 CASAVA_Build 11 67311762 1I TGCTCGAATT -/A ATAGGCACGA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 1 2 247935 CASAVA_Build 11 67317440 1D GGGTGGGGGG T/- GTGTCCAAGT 910 het 910 ref 26 16 3 7 T 1 0 247936 CASAVA_Build 11 67318580 1I TTACAGTGTT -/G GGATTACAGG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 G 2 3 247937 CASAVA_Build 11 67318850 1I GAGCTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 A 9 10 247938 CASAVA_Build 11 67321418 1D AGAAGTGGTT G/- TTTTCCTCCT 3070 hom 32 het 14 0 10 4 G 1 0 247939 CASAVA_Build 11 67323774 1D CCTTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1202 het 1202 ref 27 17 3 8 A 11 10 247940 CASAVA_Build 11 67331820 3I AAGAAATCTT ---/TTC TTCTTTTGTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TTC 1 2 247941 CASAVA_Build 11 67331995 1D GCCATTTTTG T/- TATTTTTAGT 2629 hom 15 het 6 0 6 0 T 2 1 247942 CASAVA_Build 11 67343092 4I ATTTTTATTG ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 TTTA 2 3 247943 CASAVA_Build 11 67346475 1D GACTCCGTAT A/- AAAAAAAAAA 2158 het 198 hom 18 2 8 8 A 14 13 247944 CASAVA_Build 11 67349602 11I TAGAAAGAGA -----------/TGGACTCCCTG TGTTTGAAAT 3070 hom 27 het 16 0 10 6 TGGACTCCCTG 0 1 247945 CASAVA_Build 11 67351982 1D TGACCCCCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 27 0 11 16 T 10 9 247946 CASAVA_Build 11 67353651 1D TCACCATCAT C/- CCTATTTCAC 3070 het 3070 ref 77 55 11 12 C 3 2 247947 CASAVA_Build 11 67354192 2D CACTGGCCTC TG/-- AGTTCCCTCA 2967 het 2967 ref 29 19 7 3 TG 1 0 247948 CASAVA_Build 11 67355566 1I AAAAGAAAAC -/A AAAAAAGATA 1375 het 1375 ref 19 13 3 3 A 6 7 247949 CASAVA_Build 11 67356805 6D TTTTGTTTAC TTATTT/------ TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 10 10 19 TTATTT 1 0 247950 CASAVA_Build 11 67360252 1D TCAGACAGGG C/- TAGGAAACCG 2303 het 2303 ref 15 8 6 1 C 1 0 247951 CASAVA_Build 11 67361903 9I TCTCAAAAAA ---------/CAAAAAACC CAAAAACTTG 2037 het 2037 ref 15 9 5 1 CAAAAAACC 0 1 247952 CASAVA_Build 11 67362751 1I TTTTGGTTTC -/T TGTAACTGCA 3070 het 991 hom 14 3 9 2 T 1 2 247953 CASAVA_Build 11 67363282 1D ATTTATAAAG A/- AAAAAGAGGT 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 A 6 5 247954 CASAVA_Build 11 67364415 1I ATATGAAAAG -/A AACCATGCTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 2 3 247955 CASAVA_Build 11 67371496 1I AAAACGGTGG -/T TGCAGGGGGC 2662 het 2662 ref 43 30 6 7 T 1 2 247956 CASAVA_Build 11 67385514 1D GCTAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 279 hom 26 2 14 10 T 15 14 247957 CASAVA_Build 11 67390312 1D GTAACTTGAT G/- GGGATGGCAT 1933 hom 10 het 5 0 4 1 G 4 3 247958 CASAVA_Build 11 67396347 7I GGCAGAAGAT -------/GGGCCAG GGGCCAGGGG 3070 het 1619 hom 28 7 11 10 GGGCCAG 2 3 247959 CASAVA_Build 11 67396549 1I CTTTTATTTT -/C TTTTGAGACA 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 C 0 1 247960 CASAVA_Build 11 67399406 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 8 7 247961 CASAVA_Build 11 67411416 3D GATCTAGGCG TTC/--- TTCTTCTTCT 2962 het 2962 ref 23 10 7 7 TTC 5 4 247962 CASAVA_Build 11 67412097 2D AACTACTAAC AA/-- GACAATAGAC 3070 het 3070 ref 37 27 7 3 A 2 0 247963 CASAVA_Build 11 67414111 4D TGCCATCATT GTAA/---- GTAAGTTTCC 3070 hom 87 het 35 0 28 8 GTAA 2 1 247964 CASAVA_Build 11 67414764 1D GGCCTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 637 hom 20 3 12 5 T 13 12 247965 CASAVA_Build 11 67422926 5I CTGACTTCAA -----/ACTAT ACTACAAGGC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 ACTAT 0 1 247966 CASAVA_Build 11 67425072 1D CACTCTCCAT C/- CCCCCCCCCT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 10 9 247967 CASAVA_Build 11 67425602 2I GGTTCAAGCA --/AT AACTCCTGCC 2230 het 2230 ref 39 29 5 5 AT 0 1 247968 CASAVA_Build 11 67426837 1I GTTGGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 29 1 14 14 A 14 15 247969 CASAVA_Build 11 67430973 1I GGATCCATGT -/C CTCCCTGTAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 1 2 247970 CASAVA_Build 11 67441114 2D TCCAAAAAAA AG/-- GATATCAGTC 1354 het 1354 ref 39 31 3 6 AG 1 0 247971 CASAVA_Build 11 67447005 1I CCACTCCCCT -/A CTTCTCACCT 3070 het 3070 ref 73 54 17 2 A 0 1 247972 CASAVA_Build 11 67448787 1I CATGATTTTA -/C TTATATGTGG 1783 het 1783 ref 44 32 4 8 C 0 1 247973 CASAVA_Build 11 67455195 1D CAGGATATAT C/- TAAGGGGTTC 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 C 1 0 247974 CASAVA_Build 11 67456919 1D ATCTCACCCC T/- AGATCACTGT 1473 het 1473 ref 35 28 5 3 T 1 0 247975 CASAVA_Build 11 67462398 1D CCCATTTCCC A/- AAAAAATGAT 1231 het 1231 ref 54 47 3 4 A 7 6 247976 CASAVA_Build 11 67463086 3D TGTTTGTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1239 hom 21 8 9 5 T 13 10 247977 CASAVA_Build 11 67465950 1D TGCCTCTCAC T/- CCTGCTGTTG 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 T 1 0 247978 CASAVA_Build 11 67467910 1I TATTTGCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 11 12 247979 CASAVA_Build 11 67469764 2D TATTTTTTTT TA/-- TTTTTTTTAT 1183 het 1183 ref 13 9 3 2 TA 1 0 247980 CASAVA_Build 11 67471315 1D GGGAAAAGCT G/- CCCCCCAGAA 2946 het 2946 ref 33 19 9 6 G 1 0 247981 CASAVA_Build 11 67471898 1D AAGGATCAGC A/- AATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 29 8 4 A 3 2 247982 CASAVA_Build 11 67473243 1D TTTAGCTTGA T/- TTAGCCATTT 3070 het 3070 ref 46 30 14 2 T 3 2 247983 CASAVA_Build 11 67483707 1I TGTCATCTGG -/T TTGGTTGTTG 3070 het 1867 hom 18 5 11 2 T 2 3 247984 CASAVA_Build 11 67484773 1D AGCAAAAAAA G/- AAATCATTTT 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 G 1 0 247985 CASAVA_Build 11 67501832 1D CTAATATCCA G/- GGGGGAAGAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 G 6 5 247986 CASAVA_Build 11 67502731 1I26M1I AGAAGCACAC -GGGTTACTTCACGAGCTTTCTCAGTT-/GGGGTTACTTCACGAGCTTTCTCAGTTC GTGTTGGATA 2315 het 2315 ref 37 27 5 8 N/A 0 0 247987 CASAVA_Build 11 67509399 4D TTAATATTAA TAAT/---- TAATTTTAAT 1920 het 1920 ref 27 19 7 2 TAAT 2 1 247988 CASAVA_Build 11 67513533 2D TATCAGGTGT AA/-- ATATGTGTTG 3070 het 3070 ref 67 42 12 14 A 3 1 247989 CASAVA_Build 11 67521258 1I CTAGGCCCCG -/C CCTGACACAG 3070 hom 44 het 21 0 13 8 C 2 3 247990 CASAVA_Build 11 67521740 1I TGGCCAGGAA -/G GCCACTGCCA 3070 hom 66 het 26 0 20 6 G 1 2 247991 CASAVA_Build 11 67542641 1I CCCTCAGGAA -/C CTCCGGGCCT 3070 hom 54 het 22 0 15 7 C 1 2 247992 CASAVA_Build 11 67545870 1I TGGGCTGCGG -/C CGTGTGGCCA 3070 hom 33 het 23 0 18 5 C 1 2 247993 CASAVA_Build 11 67551955 1I GCCATGGAGG -/C CCAAGGCTGC 3070 hom 47 het 20 0 15 5 C 2 3 247994 CASAVA_Build 11 67561466 1I GAGACCTTGA -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 42 het 20 0 13 7 C 8 9 247995 CASAVA_Build 11 67563720 1I GGCTGGGTGA -/C CCCTGGCTAG 2404 hom 28 het 12 0 9 3 C 3 4 247996 CASAVA_Build 11 67570690 2D TGGGGTCACA AC/-- ACAGCCCCTG 3070 hom 80 het 36 0 25 11 AC 2 1 247997 CASAVA_Build 11 67576261 6I GAGAAACGAT ------/GGGCCA GGGCCAGGGC 2594 hom 30 het 13 0 10 3 GGGCCA 1 2 247998 CASAVA_Build 11 67587536 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 29 1 18 10 A 14 15 247999 CASAVA_Build 11 67591052 1D CCCCTGCTTT G/- TTCTTGCCTG 3070 hom 84 het 33 0 26 7 G 1 0 248000 CASAVA_Build 11 67611029 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 12 11 248001 CASAVA_Build 11 67636150 1D GTCCACATGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 127 hom 16 1 14 1 A 9 8 248002 CASAVA_Build 11 67636340 1D CTCTTGTCGC A/- ACAGTCTGGA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 2 1 248003 CASAVA_Build 11 67644273 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3010 het 192 hom 23 2 10 12 A 16 15 248004 CASAVA_Build 11 67645962 1I ACAGGCGCGT -/C CTCGCCCTGT 3070 hom 48 het 17 0 12 5 C 1 2 248005 CASAVA_Build 11 67654905 1I TACTAAAAAA -/T ACAAAAAATT 3070 hom 42 het 17 0 13 4 T 0 1 248006 CASAVA_Build 11 67656976 1I AGAGAAAATG -/A AAGAAAGAGA 3070 het 76 hom 15 1 11 3 A 2 3 248007 CASAVA_Build 11 67696440 1D ACCTAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 833 het 833 ref 25 18 3 4 T 12 11 248008 CASAVA_Build 11 67760918 4D TGTGTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 266 hom 7 het 6 0 3 3 TTTG 4 3 248009 CASAVA_Build 11 67765918 1D AATAATCACA T/- TTAAATTTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 3 2 248010 CASAVA_Build 11 67782238 2D TTGTGTTCCT CA/-- CAAGGCAGGT 2542 het 2542 ref 36 17 10 9 CA 2 1 248011 CASAVA_Build 11 67793156 1D TCTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 21 19 9 T 13 12 248012 CASAVA_Build 11 67794092 1I CGGGACCCCA -/C CCAGTTATTC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 C 2 3 248013 CASAVA_Build 11 67799110 1I TGTGTTTCTA -/T TTAAAGATGC 3070 het 3070 ref 46 23 16 8 T 2 3 248014 CASAVA_Build 11 67804212 3D ATTATGGATT ATG/--- ATGGTAGTTA 3070 het 3070 ref 31 19 11 2 ATG 2 1 248015 CASAVA_Build 11 67846889 1D CCCATGGTCC T/- GCAGTAAGAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 1 0 248016 CASAVA_Build 11 67852288 1D AGGAACAGTA G/- ATCATTTGAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 G 1 0 248017 CASAVA_Build 11 67868521 1D AGCCACCACG C/- CCCAGCTAAT 3070 hom 71 het 27 0 23 5 C 4 3 248018 CASAVA_Build 11 67881348 1D TTTAGAGGTT C/- ATTTACAGCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 0 248019 CASAVA_Build 11 67884465 1I TGTAGCTCCA -/G GGTCTGGTCT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 2 3 248020 CASAVA_Build 11 67888971 1I GGCTGCTACA -/C CCCAGCTTTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 3 4 248021 CASAVA_Build 11 67889320 1I CAGATGGGGA -/G GATGTCACTC 3070 hom 66 het 27 0 20 7 G 1 2 248022 CASAVA_Build 11 67889431 1I CCATGTGGAC -/G GGGCCAGCGA 2373 hom 33 het 15 0 10 6 G 3 4 248023 CASAVA_Build 11 67902214 1D ATCTTGTTTG T/- TTGTGAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 3 2 248024 CASAVA_Build 11 67906926 1D ACTTTAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 13 12 248025 CASAVA_Build 11 67915356 1D CAGTGATATG T/- TACATGTGTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 2 1 248026 CASAVA_Build 11 67920774 1I GACACACACA -/G GGGTTTTAGC 3070 hom 87 het 35 0 27 8 G 3 4 248027 CASAVA_Build 11 67921691 3D TTCCCATCAC CGT/--- CGTCATCATC 3070 hom 87 het 34 0 27 7 CGT 2 1 248028 CASAVA_Build 11 67931007 1I AAGCCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 678 hom 26 2 18 6 A 11 12 248029 CASAVA_Build 11 67931731 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1424 hom 18 het 7 0 7 0 A 11 10 248030 CASAVA_Build 11 67933775 1D TGCCTGTAAT C/- CCCACCTACT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 4 3 248031 CASAVA_Build 11 67946400 1I GGAGGGGAGC -/T TTTTCCTTCA 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 4 5 248032 CASAVA_Build 11 67950639 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2832 hom 29 9 11 9 T 9 10 248033 CASAVA_Build 11 67975044 1I CATCTGTACT -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 5 6 248034 CASAVA_Build 11 67983551 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAATTAA 3070 hom 42 het 19 0 13 7 A 7 6 248035 CASAVA_Build 11 67986587 1D TTCTTAGTGT A/- AGTCCTCCTT 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 A 2 1 248036 CASAVA_Build 11 67998088 1D AGCAATTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2489 hom 42 14 13 15 T 17 16 248037 CASAVA_Build 11 68010064 1D AAAATACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2251 hom 19 7 9 3 A 12 11 248038 CASAVA_Build 11 68011397 16D AGGAGTATGA GGTTGCAGTGAGCTAT/---------------- GATCAGCCTG 3070 hom 33 het 12 0 9 5 GGTTGCAGTGAGCTAT 1 0 248039 CASAVA_Build 11 68018177 1I AATAAAAAAG -/T ATAATTAGAT 1690 het 255 hom 14 1 7 6 T 0 1 248040 CASAVA_Build 11 68027801 2I AGACAAATAA --/CT CTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 CT 1 2 248041 CASAVA_Build 11 68028263 1D GTAGAAATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 10 9 248042 CASAVA_Build 11 68032085 2D CCTCATGTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 4 A 13 11 248043 CASAVA_Build 11 68039510 2D CAATGAGAAC AT/-- AGAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 49 34 10 5 AT 1 0 248044 CASAVA_Build 11 68051671 3I TCAGAATTGT ---/TTC TCTATGTTAT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 TTC 0 1 248045 CASAVA_Build 11 68052478 2D TTGTGTGTGT GG/-- GGGGGGGGGC 3070 het 39 hom 26 2 15 9 G 11 9 248046 CASAVA_Build 11 68062098 1I ATTCTAGCAG -/T TAAGTCCAGG 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 T 1 2 248047 CASAVA_Build 11 68064735 1I ACCACACCCA -/G GGGGGGCCAG 3070 het 2956 hom 25 11 8 6 G 6 7 248048 CASAVA_Build 11 68065554 2I TTAAGAGGAT --/GG GGAGTGGCTT 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 G 2 4 248049 CASAVA_Build 11 68067448 1I GCCAGGTCTG -/T TTTTTTTTTT 2663 het 1645 hom 27 6 8 13 T 13 14 248050 CASAVA_Build 11 68071896 2I ATTAATGGAC --/AT GTGCTAATTT 2116 het 2116 ref 26 18 5 3 AT 0 1 248051 CASAVA_Build 11 68072468 1D CCTAGGTATG T/- AGGATGTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 17 4 T 1 0 248052 CASAVA_Build 11 68080580 2I ATTTCTCATT --/AA AAAAAAAAAA 1895 het 1259 hom 23 5 11 7 A 14 16 248053 CASAVA_Build 11 68086098 1I AACATTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 A 11 12 248054 CASAVA_Build 11 68096908 1I AACCCTGTAC -/T TTCTTACCCT 3070 hom 99 het 40 0 36 4 T 2 3 248055 CASAVA_Build 11 68096991 1D GCATAGGATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 10 9 248056 CASAVA_Build 11 68100671 1D TTTAAACACA T/- TTAAGTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 T 3 2 248057 CASAVA_Build 11 68101346 1I ATAATCAGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 8 9 248058 CASAVA_Build 11 68111219 4D TCCATTATAA CACC/---- CCCCCCCCCC 1549 het 208 hom 16 3 5 9 CACC 1 0 248059 CASAVA_Build 11 68114683 5D CTTCCTACAC TTTTA/----- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 TTTTA 1 0 248060 CASAVA_Build 11 68117261 1D CAACCGTCTG T/- TTTTTTGTTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 7 6 248061 CASAVA_Build 11 68119245 13D ATAAAAATAA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 899 het 899 ref 15 3 3 9 T 31 18 248062 CASAVA_Build 11 68127181 10D GTAAAGAAAA CCCATGAAAC/---------- CCCTCTTTAG 3070 het 3070 hom 28 12 15 3 CCCATGAAAC 1 0 248063 CASAVA_Build 11 68136618 1D AGTGGACACC T/- TTTTTTTTTT 1936 het 1936 ref 48 31 6 12 T 13 12 248064 CASAVA_Build 11 68137795 5D GGTAGAGATT AAGTA/----- AAGTATTTAT 3070 het 3070 hom 48 16 27 6 AAGTA 2 1 248065 CASAVA_Build 11 68138644 3D GTCTAATGCC TTA/--- TTATTTCTGA 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 TTA 2 1 248066 CASAVA_Build 11 68143317 2I GAAAGGGTCT --/TC TGTTTCTAGC 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 TC 0 1 248067 CASAVA_Build 11 68144740 1I GGTCAAATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 9 10 248068 CASAVA_Build 11 68164049 2I GAGAGGTAAC --/AT AGAGTAATTT 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 AT 0 1 248069 CASAVA_Build 11 68166639 2I CCATCTCAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 126 hom 16 1 13 2 AT 6 7 248070 CASAVA_Build 11 68173345 1D CCAAGGATGG A/- AATCCTGAAA 3070 hom 106 het 38 0 36 2 A 3 2 248071 CASAVA_Build 11 68191061 1D GGGGAGACGA G/- GGGTGCGGGG 1839 het 208 hom 12 2 5 5 G 4 3 248072 CASAVA_Build 11 68192145 1D GCACCCCCCA C/- CCCCCAGCCG 2693 hom 38 het 19 0 11 8 C 6 5 248073 CASAVA_Build 11 68196532 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1590 hom 42 het 21 0 14 7 T 15 16 248074 CASAVA_Build 11 68202509 2I CAATACATCC --/TA TATATATATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TA 6 7 248075 CASAVA_Build 11 68233134 4I AAAGAAAAGA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 AAAG 3 4 248076 CASAVA_Build 11 68235487 4D GCGTTTGAGA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 163 het 67 0 55 12 GT 8 6 248077 CASAVA_Build 11 68245105 4D AACATCTTTC TTTT/---- ATTACTCATC 3070 hom 99 het 35 0 34 5 T 4 0 248078 CASAVA_Build 11 68250363 1D GCAGCCTAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 A 10 9 248079 CASAVA_Build 11 68253414 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 6 5 248080 CASAVA_Build 11 68261966 4D CAAAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AAAC 4 3 248081 CASAVA_Build 11 68265470 1I TTTTAAACCT -/G GCAACTAGGC 3070 het 3070 hom 48 18 27 3 G 1 2 248082 CASAVA_Build 11 68275772 1I GGCACTCCCA -/G GGTTCAGCCG 3070 hom 35 het 14 0 12 2 G 2 3 248083 CASAVA_Build 11 68277335 4D CAACAAAAAA CACT/---- CACAGAAGCA 3070 het 3070 hom 27 11 13 5 CACT 1 0 248084 CASAVA_Build 11 68282305 4D GAGTGAGACC CTGT/---- CTAAAACAAA 3070 het 2306 hom 24 7 15 2 CTGT 1 0 248085 CASAVA_Build 11 68283917 2I ACAAAAAAAT --/AC ACACACACAC 3037 het 3037 ref 27 10 9 8 AC 7 8 248086 CASAVA_Build 11 68285987 1I TTTGTCTCGG -/A AAAAAAGAGC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 6 7 248087 CASAVA_Build 11 68290871 1D ATCAAGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1228 hom 19 6 11 2 A 15 14 248088 CASAVA_Build 11 68296557 1I AACAGGGGTT -/G GCCAGGTGCA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 G 1 2 248089 CASAVA_Build 11 68314597 1I AGCACCTGGA -/C CCCCCCCAGA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 C 7 8 248090 CASAVA_Build 11 68323225 1I TTCATACGGA -/C AAAATTTCAT 3070 het 3070 hom 37 19 17 1 C 0 1 248091 CASAVA_Build 11 68326475 2D CCGTCTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 24 0 13 11 A 16 14 248092 CASAVA_Build 11 68337741 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1447 het 4 hom 24 0 9 15 A 12 13 248093 CASAVA_Build 11 68341099 1D GTGGTTGTGT G/- GGGGGTGGGT 3070 hom 62 het 26 0 17 9 G 6 5 248094 CASAVA_Build 11 68344213 1D AGCTGGGACT A/- ATAGGCATGC 3070 hom 105 het 38 0 34 4 A 2 1 248095 CASAVA_Build 11 68350778 1I ACTCCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2386 het 674 hom 16 2 9 5 A 13 14 248096 CASAVA_Build 11 68352787 4I GCTTGGGCAA ----/GCAG GCGTCCGCCT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 GCAG 0 1 248097 CASAVA_Build 11 68366484 1D CCCCGTCTCT A/- AAAAAAAAAG 1115 het 1115 ref 30 21 3 6 A 10 9 248098 CASAVA_Build 11 68372651 6D4M8D TGCATGCACG CACACACGCGCACGCACA/------CGCG-------- CACGCACACG 3070 het 3070 ref 44 25 17 7 N/A 0 0 248099 CASAVA_Build 11 68386486 1D CTTTCTTCGA T/- TTTTCCCAAG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 5 4 248100 CASAVA_Build 11 68390528 1I ATTCCAGCAT -/C CGCCCCTGCC 2501 hom 15 het 8 0 6 2 C 1 2 248101 CASAVA_Build 11 68393213 1I GCAAAAAAAA -/G CCAAAAGTGA 3070 het 2959 hom 21 7 10 4 G 0 1 248102 CASAVA_Build 11 68404367 1D GACAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1041 hom 24 8 10 6 A 15 14 248103 CASAVA_Build 11 68406461 5I CTTTGAGTGT -----/TGGCC TGGTTCTGGA 2783 het 2783 ref 27 14 7 6 TGGCC 0 1 248104 CASAVA_Build 11 68418087 1D ACAAATAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 12 het 32 1 23 8 A 9 8 248105 CASAVA_Build 11 68430691 1I TTTCTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 22 2 14 6 C 0 1 248106 CASAVA_Build 11 68436559 1D ACATGGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1501 hom 19 4 7 8 T 13 12 248107 CASAVA_Build 11 68438337 1I AATTTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2239 het 2239 ref 19 8 8 3 A 12 13 248108 CASAVA_Build 11 68443275 5D CACTGTGTTG CTCCT/----- CTCCTCTCCT 3070 het 1191 hom 17 5 10 4 CTCCT 4 3 248109 CASAVA_Build 11 68445230 1I TGAACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 11 12 248110 CASAVA_Build 11 68450052 1I TCAGCCATTA -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 6 7 248111 CASAVA_Build 11 68468588 1D CCTCCTGGGC T/- TCAAGGGATC 3070 hom 87 het 30 0 29 1 T 2 1 248112 CASAVA_Build 11 68470647 1I TGGTAAGGCA -/G GGCTTTCTGA 3070 hom 24 het 28 1 19 8 G 2 3 248113 CASAVA_Build 11 68479391 1D CAAGCCACTC A/- AACCCCTCCA 3070 hom 84 het 31 0 26 5 A 3 2 248114 CASAVA_Build 11 68487244 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3018 het 3018 ref 36 17 11 8 T 11 12 248115 CASAVA_Build 11 68507787 1I GTTTTAGTGG -/T TTTGCTGGCA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 3 4 248116 CASAVA_Build 11 68508114 4I GCCACTGTGC ----/CCAG CCTACTTACA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 CCAG 0 1 248117 CASAVA_Build 11 68563329 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTC 1016 het 1016 ref 21 13 3 5 T 10 9 248118 CASAVA_Build 11 68564495 6I TAGGAGCAGG ------/CGTATA CCTAAAGTCT 3070 hom 147 het 54 0 49 5 CGTATA 0 1 248119 CASAVA_Build 11 68566501 1I ACCCTGGTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 49 hom 33 1 26 6 T 9 10 248120 CASAVA_Build 11 68582571 1D AGTGCCGATG T/- GGGGGCTGGA 3070 hom 48 het 19 0 15 4 T 1 0 248121 CASAVA_Build 11 68585899 5D AGGACTGTGG GTGGT/----- GTGGTGGCCG 3070 hom 71 het 27 0 23 7 GTGGT 2 1 248122 CASAVA_Build 11 68593906 1I TGCAGGGAGG -/C TTTCAGCTCT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 0 1 248123 CASAVA_Build 11 68594071 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 21 1 17 3 T 12 11 248124 CASAVA_Build 11 68596271 1I TGTCTTCGTG -/C CCCCCCGGGG 3070 hom 43 het 18 0 11 7 C 6 7 248125 CASAVA_Build 11 68598019 1D GATTGGATTA G/- GGCCCATTCT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 3 2 248126 CASAVA_Build 11 68598625 1D GGGGCTCAGG A/- AGCAGCTCTT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 2 1 248127 CASAVA_Build 11 68602204 1I TTCACACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 552 hom 28 3 22 3 T 13 14 248128 CASAVA_Build 11 68613961 1D GCCTTTTGTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 105 het 39 0 33 6 T 8 7 248129 CASAVA_Build 11 68614239 34D CTCTCTCTGT CTCATCTATTCACAGCTGGGAATGATACTAATAC/---------------------------------- CTCCGATTTT 3070 hom 83 het 29 0 25 10 CTCATCTATTCACAGCTGGGAATGATACTAATAC 1 0 248130 CASAVA_Build 11 68616249 1I CATAATGCCA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 7 8 248131 CASAVA_Build 11 68622667 1D TTAAACCATT C/- CCAGGCTGAA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 C 3 2 248132 CASAVA_Build 11 68643959 1D GTAAAGTGAC T/- TTTGCATAAG 3070 het 3070 hom 36 10 16 10 T 4 3 248133 CASAVA_Build 11 68644962 1I ACTCCAAGGT -/G GTTATAATTT 3070 het 3070 ref 44 17 19 8 G 1 2 248134 CASAVA_Build 11 68649239 6I GCACATAATC ------/AATATT AAAATTATTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AATATT 0 1 248135 CASAVA_Build 11 68650780 1D AGATTTGCCC G/- GAGTTGCAGA 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 G 2 1 248136 CASAVA_Build 11 68653666 1I TGTGTTAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 10 11 248137 CASAVA_Build 11 68654523 1I GGGCCTTGAT -/G GGCGTGATGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 2 3 248138 CASAVA_Build 11 68662737 3I CCAAGAAGCC ---/ACA ACATCTTTTA 3070 hom 89 het 36 0 30 6 ACA 1 2 248139 CASAVA_Build 11 68666525 1I CTGTTAAACC -/A CCTGAAACTG 3070 hom 153 het 54 0 48 6 A 0 1 248140 CASAVA_Build 11 68674057 2I TCTCTCTCTG --/TT TTTTTTTTTT 2900 het 430 hom 32 1 20 11 T 14 16 248141 CASAVA_Build 11 68674728 3D TATCTGCTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 2387 hom 9 het 27 1 12 14 T 17 14 248142 CASAVA_Build 11 68686526 5D TTGGCCATGA TATTT/----- TATTTAACTT 3070 hom 105 het 41 0 35 8 TATTT 2 1 248143 CASAVA_Build 11 68691270 4D AAACAAACAA ACAG/---- ACAAACAGAC 3070 hom 142 het 54 0 48 7 ACAG 1 0 248144 CASAVA_Build 11 68698718 1D20M3I ATATTAACTG TTTTAACAAGCAACCCACTAA---/-TTTAACAAGCAACCCACTAATTT TTGTAGCACC 3070 hom 111 het 34 0 38 6 N/A 0 0 248145 CASAVA_Build 11 68699886 3D CACACTTGCT TAA/--- TAATGTGGCT 3070 hom 109 het 40 0 33 7 TAA 2 1 248146 CASAVA_Build 11 68700122 8D AGGTCTATGT TCACCTCC/-------- TATGCTGGGT 3070 hom 51 het 20 0 18 6 TCACCTCC 1 0 248147 CASAVA_Build 11 68713178 6D26M11D CATCATTGTC GTCATAATCACCATTATCATCATTGTCATCATCACCATTATCA/------ATCATCATCATCACCATTGTCATCAT----------- TCGTCATCAT 642 het 642 ref 58 73 3 14 N/A 0 0 248148 CASAVA_Build 11 68718236 1I CCTCCTCTAG -/C CCTGGTTTCT 3070 hom 93 het 35 0 29 6 C 2 3 248149 CASAVA_Build 11 68741320 1I TCTCGAATCA -/G GTATCTTTCC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 G 1 2 248150 CASAVA_Build 11 68742057 1D CATTTGACTG T/- CCCCATCTGT 3070 hom 54 het 21 0 17 4 T 1 0 248151 CASAVA_Build 11 68754765 1D GCACCAGTTA G/- CTATTACTGT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 G 1 0 248152 CASAVA_Build 11 68766332 1D TTCTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 41 3 24 14 T 13 12 248153 CASAVA_Build 11 68766643 21D TTTGTGGGGA TCTGGGGTCCACACAGAGGCC/--------------------- TCTGGGGAGA 3070 hom 59 het 23 0 20 5 TCTGGGGTCCACACAGAGGCC 1 0 248154 CASAVA_Build 11 68768269 1I ACCCTCCATG -/T ATGGGGGAAT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 T 0 1 248155 CASAVA_Build 11 68831761 1D CCTTGGGGGG A/- GGTTCTGGGT 3070 hom 57 het 20 0 16 4 A 1 0 248156 CASAVA_Build 11 68835093 1I GTCCTGAGCC -/G GGGGGGTTCT 3070 hom 53 het 21 0 16 5 G 6 7 248157 CASAVA_Build 11 68837620 1I11M2I GAGGGGCTGA -CGTGGCCTCCA--/GCCTGGCCTCCAGG GCGCTTGCTC 2441 het 4 hom 18 0 8 11 N/A 0 0 248158 CASAVA_Build 11 68845489 1D CCTGACACTT C/- CCCCATTCTG 3070 hom 117 het 47 0 33 14 C 5 4 248159 CASAVA_Build 11 68887554 1D ATGGTAAATG T/- TTTTTACCAC 3070 het 3070 ref 19 8 8 3 T 6 5 248160 CASAVA_Build 11 68888831 1D TACCTTTCTT A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 7 6 248161 CASAVA_Build 11 68890524 5I GATAGTGTCT -----/ACTAA ACTAAACTAT 3070 het 3070 ref 37 17 9 11 ACTAA 1 2 248162 CASAVA_Build 11 68897912 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3064 hom 11 het 15 0 8 7 A 15 14 248163 CASAVA_Build 11 68920521 1I CATTTGTGGG -/C CCCCCCCTGT 3070 het 2884 hom 25 8 11 6 C 7 8 248164 CASAVA_Build 11 68930183 1I AATTTGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 8 9 248165 CASAVA_Build 11 68930341 1D CCTTTGATGC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 8 248166 CASAVA_Build 11 68942238 1I AAAAATTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 12 13 248167 CASAVA_Build 11 68969526 2I CCTTCCTGAC --/AT ATAAAATGAT 3070 hom 51 het 18 0 15 3 AT 1 2 248168 CASAVA_Build 11 68978880 1D TGGGGGGGGG A/- AGCACTCTGT 3070 hom 70 het 32 0 22 12 A 2 1 248169 CASAVA_Build 11 68979962 1I TTGAGAGCAG -/T TGTGCTTACC 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 T 1 2 248170 CASAVA_Build 11 68980378 1I GTCCAGCCAT -/G CAACTAAGAA 3070 hom 160 het 59 0 54 5 G 0 1 248171 CASAVA_Build 11 68983122 2I AATATTTGAA --/TT TTTCTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 20 7 T 3 5 248172 CASAVA_Build 11 68989288 1D GTGTCCCAGC A/- CACACACAGG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 1 0 248173 CASAVA_Build 11 68990341 2D CCTGATTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 34 1 13 22 A 13 11 248174 CASAVA_Build 11 69020115 1I AAGGTGGGTT -/G GTGCAGAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 19 7 G 1 2 248175 CASAVA_Build 11 69031274 1I TGTTTTTTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 8 9 248176 CASAVA_Build 11 69039722 4D CTCATGAATG GATT/---- AAGACATTCA 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 GATT 1 0 248177 CASAVA_Build 11 69059687 1D GGCTGTTCTT G/- GAACTTCTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 2 1 248178 CASAVA_Build 11 69070993 1I GGAAGAAAAG -/A ACTGTGCAAC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 1 2 248179 CASAVA_Build 11 69072338 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 33 1 22 10 A 15 16 248180 CASAVA_Build 11 69073954 2D ACTGGAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 13 11 248181 CASAVA_Build 11 69075412 1D CAAATGGCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 30 2 14 14 T 13 12 248182 CASAVA_Build 11 69083562 2D TGATAATCAC AT/-- ATGACATAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 AT 2 1 248183 CASAVA_Build 11 69091443 1D AATGTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 30 2 19 9 T 15 14 248184 CASAVA_Build 11 69102473 1D TCTATGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 9 12 T 12 11 248185 CASAVA_Build 11 69102713 1D TGGGTAAAGA T/- ACTAGTTACC 3070 het 3070 hom 28 14 13 2 T 1 0 248186 CASAVA_Build 11 69105529 3D CAGAGGGAGG AGA/--- AGAAGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 AGA 2 1 248187 CASAVA_Build 11 69118964 14I GAAGGGGTCT --------------/TCTCCTTCCACAGG TCTCCTGGGA 3070 hom 96 het 39 0 25 14 TCTCCTTCCACAGG 0 1 248188 CASAVA_Build 11 69132446 1I TAACAGAGAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 8 9 248189 CASAVA_Build 11 69138877 1D ACTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 10 9 248190 CASAVA_Build 11 69144431 3D CTTGCCAGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 21 6 11 4 A 16 13 248191 CASAVA_Build 11 69150301 1I TTTGGGGGGA -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 7 8 248192 CASAVA_Build 11 69152066 3I CAGCTGACAC ---/CTT CTTCAGCACC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 CTT 1 2 248193 CASAVA_Build 11 69161520 4I AGGGGCTGGG ----/GCCA GCCGGAAGGC 1138 het 1138 ref 22 8 7 7 GCCA 0 1 248194 CASAVA_Build 11 69172660 1D ACAATCAAAA G/- GGTTTGTGGC 2341 het 2341 ref 22 12 5 5 G 3 2 248195 CASAVA_Build 11 69184385 1D GTGTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 23 2 13 8 T 13 12 248196 CASAVA_Build 11 69192625 3D TTCTGTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 13 10 248197 CASAVA_Build 11 69205904 1I ATTTTATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2493 hom 21 6 11 4 A 10 11 248198 CASAVA_Build 11 69206114 1I TTTGGGTTTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 8 9 248199 CASAVA_Build 11 69206426 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 339 hom 34 1 29 4 A 9 10 248200 CASAVA_Build 11 69207647 1I TAAATAAAGA -/T TTTAAAATAA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 3 4 248201 CASAVA_Build 11 69209159 1D ACTCCACATG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 80 het 38 0 23 15 T 8 7 248202 CASAVA_Build 11 69210768 5I CAGGTTACCC -----/TGATG GGCTCTGATG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TGATG 0 1 248203 CASAVA_Build 11 69230708 1I GTCCAAGGCA -/C CCTGGATGTC 3070 hom 90 het 31 0 28 3 C 2 3 248204 CASAVA_Build 11 69233059 3D GGAGGGAAAT GGG/--- GGCCCCAGAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 G 5 2 248205 CASAVA_Build 11 69240510 1D GCCCTTGTCT C/- CTTTGCAGCA 3070 het 3070 hom 48 14 20 14 C 2 1 248206 CASAVA_Build 11 69241467 3D CTTCCCTCCT CTC/--- CTCCTCCTCC 2931 het 2318 hom 25 7 9 11 CTC 4 3 248207 CASAVA_Build 11 69247932 9D GACATAGACA GATGTCCCT/--------- GGCATTCCAT 3035 het 3035 ref 30 15 9 9 GATGTCCCT 1 0 248208 CASAVA_Build 11 69255735 1D TGTTGCTATT G/- TTGTTGTTTT 3070 hom 111 het 39 0 35 4 G 1 0 248209 CASAVA_Build 11 69259882 1D ACATGCACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 9 8 248210 CASAVA_Build 11 69259952 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 22 0 16 7 T 14 12 248211 CASAVA_Build 11 69263405 4D TTCGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AAAT 5 4 248212 CASAVA_Build 11 69265612 1D TATTAACACC A/- AAGAACCAGT 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 A 3 2 248213 CASAVA_Build 11 69276730 1I GATTTGGGGC -/T TGAATGTGGC 157 hom 6 het 15 0 1 14 T 1 2 248214 CASAVA_Build 11 69278641 10I TGTATTTATG ----------/TATTTATTTA TTTTTATTTA 2416 het 2012 hom 17 9 5 3 TATTTATTTA 0 1 248215 CASAVA_Build 11 69290307 1I20M15D TGTTGTGCCA -GGCAACAGCGAGACTCTGACAAAAAAAAAAAAGAA/GGGCAACAGCGAGACTCTGAC--------------- AAAAAAAAAA 1747 het 31 hom 5 1 5 1 N/A 0 0 248216 CASAVA_Build 11 69292017 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 2060 het 302 hom 29 2 13 14 A 9 10 248217 CASAVA_Build 11 69293886 1I TCTATAATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 101 het 41 0 34 7 T 9 10 248218 CASAVA_Build 11 69302017 2D CTATATATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 28 1 24 3 T 16 14 248219 CASAVA_Build 11 69304597 1D GTTTTCCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 11 10 248220 CASAVA_Build 11 69309422 1D TCAACAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 35 2 16 17 T 15 14 248221 CASAVA_Build 11 69310659 1D CTTTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1054 hom 22 3 17 2 T 15 14 248222 CASAVA_Build 11 69313814 1D TGGGGTGGGC G/- GGGGGGGTCC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 G 8 7 248223 CASAVA_Build 11 69317156 1D ATCAGCACCA C/- CCCCATCAGC 3070 het 2362 hom 28 8 15 6 C 5 4 248224 CASAVA_Build 11 69320505 1D CACTCAGAAC A/- AAATGCAGAG 3070 hom 104 het 37 0 28 11 A 4 3 248225 CASAVA_Build 11 69322753 1I TTCTTTTTTT -/A TTATTATTAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 0 1 248226 CASAVA_Build 11 69323411 1I AGCTGCCAGC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 7 8 248227 CASAVA_Build 11 69352440 11D8M2D GGGTGCATGT CTGAGGCCTGACTGGGCTGCA/-----------CTGGGGTG-- CACTGTCCCA 602 het 602 ref 28 23 3 7 N/A 0 0 248228 CASAVA_Build 11 69393847 1D AAAAATGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 11 10 248229 CASAVA_Build 11 69401129 1D CGTTTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 37 1 19 17 T 13 12 248230 CASAVA_Build 11 69402371 1I CCTCACTCCA -/G CCAACACACC 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 G 0 1 248231 CASAVA_Build 11 69406634 1D ATGTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1568 het 672 hom 20 8 5 7 T 17 16 248232 CASAVA_Build 11 69411957 7D CACACACAAG GCAAAGA/------- CATACACAAA 3070 het 3070 ref 76 37 11 39 GCAAAGA 1 0 248233 CASAVA_Build 11 69415790 1D20M1D GAGCTCCAGA GGGTGATCCCCCACATCCTGTG/-GGTGATCCCCCACATCCTGT- GAGAGATCAA 3070 hom 51 het 21 0 15 10 N/A 0 0 248234 CASAVA_Build 11 69415851 1D18M2D11M1D CCCAGGTCGC TTCCGGTTTCCTCCCAGTTTCTTGGTGTCCTTG/-TCCGGTTTCCTCCCAGTT--CTGGTGTCCTT- GACTACTGGC 3070 hom 57 het 14 0 19 3 N/A 0 0 248235 CASAVA_Build 11 69416892 1D CGGAAACCAG A/- AAGCACTGAC 3070 hom 111 het 44 0 36 8 A 3 2 248236 CASAVA_Build 11 69416988 1D CTTTCCAACA G/- GGAAGAGCCG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 G 3 2 248237 CASAVA_Build 11 69423777 2I AAAGAGAGAA --/AG AGAAAAGGAA 2303 het 2303 ref 31 15 10 6 AG 1 2 248238 CASAVA_Build 11 69425384 1D25M1I TGGGTTCAAG ACGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAA-/-CGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG TAGCTGGGAT 3070 hom 30 het 11 0 10 4 N/A 0 0 248239 CASAVA_Build 11 69431588 1I GAGCTTCAAC -/T TTAGGTTGGG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 2 3 248240 CASAVA_Build 11 69435331 1D TGGGGGTGTT G/- GGGGGATGTG 3070 hom 39 het 15 0 12 3 G 6 5 248241 CASAVA_Build 11 69465130 2I TATTCCATCG --/TA TATATATATC 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 TA 4 5 248242 CASAVA_Build 11 69466363 1D ACTCCCTAGC T/- TGCTCACCCC 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 2 1 248243 CASAVA_Build 11 69469957 4D CAGGCATTTA TTAC/---- TTACATTTCT 3070 het 3070 hom 53 23 27 8 TTAC 2 1 248244 CASAVA_Build 11 69473035 1D GCACAGGGCT G/- GGGAGGAGGG 1882 het 1882 ref 26 12 5 10 G 4 3 248245 CASAVA_Build 11 69492316 1D GCGTGCTGCC A/- AAGTTCTGTG 3070 het 3070 hom 26 12 11 4 A 3 2 248246 CASAVA_Build 11 69508116 11D3M15D GTGCCTGTGT GGGATTTTGAGTCCGGACTGAAACGAGAT/-----------TCC--------------- CATTTCTGAG 3070 hom 90 het 28 0 30 4 N/A 0 0 248247 CASAVA_Build 11 69517858 1D TTGTCGTTAA C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 9 8 248248 CASAVA_Build 11 69518852 5I GCACTGTTTT -----/TTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TTTTG 0 1 248249 CASAVA_Build 11 69519917 2D CTTAATAGAC TA/-- TATAGAAGGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TA 3 2 248250 CASAVA_Build 11 69520823 7D TCCCTGGGTT GTGGGTG/------- GTGGGTGGAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 GTGGGTG 2 1 248251 CASAVA_Build 11 69524076 1D GAGATGGGCC G/- GGGGGGGATG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 G 8 7 248252 CASAVA_Build 11 69524251 1D GGGGCTGAAA T/- TTCAAAGCGC 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 3 2 248253 CASAVA_Build 11 69525528 6D TTCAATAAGA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 TG 12 9 248254 CASAVA_Build 11 69526788 1D CACAGATTAG A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 5 A 7 6 248255 CASAVA_Build 11 69528048 2I ATGAGAGAGA --/GT GTGTGTGCAA 3070 het 3070 ref 51 21 20 10 GT 3 4 248256 CASAVA_Build 11 69529738 1I CTGGGGAAAT -/A AAACACCAAC 3070 het 3070 hom 57 26 25 6 A 3 4 248257 CASAVA_Build 11 69530291 4D TGTATTTCAC TCTT/---- TCTTTCTTCC 631 het 631 ref 26 16 6 4 TCTT 3 2 248258 CASAVA_Build 11 69533365 1I AATTCACAAA -/G TAAAAAGGTT 3070 het 3070 hom 46 23 20 3 G 0 1 248259 CASAVA_Build 11 69539779 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2627 het 1216 hom 20 6 8 7 T 11 10 248260 CASAVA_Build 11 69543318 4I CCGAGCCAAT ----/TGTG TGTATCTTCC 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 TG 1 3 248261 CASAVA_Build 11 69559136 1D ATGACCCTGC T/- TTTTTTTTCT 3004 het 3004 ref 27 15 9 3 T 9 8 248262 CASAVA_Build 11 69567806 1D AGCACAAAGG A/- AGGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 A 2 1 248263 CASAVA_Build 11 69573339 1D AGGATAAATG C/- TAAAAGGTAA 3070 het 3070 ref 51 20 21 10 C 1 0 248264 CASAVA_Build 11 69576286 24D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------------ TTTTTTTTTT 743 het 743 ref 13 5 2 9 T 38 14 248265 CASAVA_Build 11 69580585 3D GTTTTACATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2002 hom 32 8 14 10 T 17 14 248266 CASAVA_Build 11 69595374 1D GATTAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 36 2 27 7 T 12 11 248267 CASAVA_Build 11 69600188 1D ATTTTTACTC T/- TTTTTTTTTT 1621 het 1621 ref 33 27 4 2 T 12 11 248268 CASAVA_Build 11 69601784 1D AAGCTTCACT C/- CCCCCGGAGG 3070 hom 42 het 22 0 15 7 C 6 5 248269 CASAVA_Build 11 69617154 1I TAAAGAAGAT -/C ATGGCCAACA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 0 1 248270 CASAVA_Build 11 69619639 3D TTTTATTTCT AGG/--- AGTTCTATTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AGG 1 0 248271 CASAVA_Build 11 69626784 2D AGATGCACCG CC/-- CCCCCTCAAC 3070 hom 81 het 29 0 26 3 C 7 5 248272 CASAVA_Build 11 69653383 1D ACCCCCCGCC T/- TTTTTTTTTT 1329 het 1329 ref 25 6 4 15 T 13 12 248273 CASAVA_Build 11 69656695 2I CAGCGCTGGA --/GG GGGAGTTCAG 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 G 3 5 248274 CASAVA_Build 11 69682600 7D ACCCCCTCGG TGGGGGC/------- TGGGGGCTGG 2706 hom 35 het 19 0 11 9 TGGGGGC 3 2 248275 CASAVA_Build 11 69693896 1I GGGGAAGTTT -/G GGGCTCTGGA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 G 3 4 248276 CASAVA_Build 11 69695140 1I AATTGTGTGA -/C CCCCCAGAGC 3070 hom 106 het 41 0 31 10 C 5 6 248277 CASAVA_Build 11 69702321 1D GGTATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 42 2 21 19 T 15 14 248278 CASAVA_Build 11 69704033 1D TTTCTGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 24 1 15 8 T 12 11 248279 CASAVA_Build 11 69712642 1I TATTTATGGG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 80 het 32 0 23 9 T 8 9 248280 CASAVA_Build 11 69719704 1D AATTTTTTTT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 A 8 7 248281 CASAVA_Build 11 69722030 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAATAT 1814 hom 12 het 6 0 5 1 A 8 7 248282 CASAVA_Build 11 69729726 1I GCATTTGGTG -/A CAGCCCCTTT 3070 hom 99 het 36 0 30 6 A 0 1 248283 CASAVA_Build 11 69745784 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1259 het 1259 ref 16 9 3 4 A 12 11 248284 CASAVA_Build 11 69759925 1D TTTTTTTTTT A/- AGAGATGGAG 3070 hom 67 het 27 0 22 7 A 2 1 248285 CASAVA_Build 11 69811383 1D ACACCCGGCC T/- TTTTTTTTTG 1013 het 1013 ref 24 16 3 6 T 10 9 248286 CASAVA_Build 11 69846704 2D TGAGCCCCAC AT/-- ATGTTTCTGT 3070 het 2849 hom 35 9 22 4 AT 2 1 248287 CASAVA_Build 11 69871569 1D CAGCCTGGCC A/- ACATGGTGAA 3070 hom 9 het 12 0 8 4 A 2 1 248288 CASAVA_Build 11 69918927 6D CAGCCACCAG TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 TTTTGT 3 2 248289 CASAVA_Build 11 69973344 1I ACAGAGGCCA -/G GGTCACTCAG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 2 3 248290 CASAVA_Build 11 70000149 1I AAACCTGCAA -/C CCCCCCCTTC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 C 7 8 248291 CASAVA_Build 11 70005718 1D CCGTCCTGGA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 87 het 34 0 26 8 C 9 8 248292 CASAVA_Build 11 70013587 1I CATTTCGAGA -/C CCTGACCCAA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 C 2 3 248293 CASAVA_Build 11 70033197 1D ATCCCATTGA G/- GGGGGGCTCC 2712 het 2712 ref 31 18 9 4 G 7 6 248294 CASAVA_Build 11 70050716 5D GGTATGCCAA CCGCC/----- CCGCCCAGGT 3070 hom 48 het 19 0 14 8 CCGCC 2 1 248295 CASAVA_Build 11 70069851 17D12M1D ATTTATTTAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATG/-----------------TTTTGTAGAGAT- GGGGTCACAC 3070 het 2755 hom 30 12 15 3 N/A 0 0 248296 CASAVA_Build 11 70078262 5D ACAGAAAAAT TGCAC/----- TGCACAGAAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TGCAC 2 1 248297 CASAVA_Build 11 70082450 1D GATTCTACAC T/- TGGGCACTGG 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 2 1 248298 CASAVA_Build 11 70085474 1I AGAGATGGCA -/G GGGGGGGTCT 3070 hom 61 het 30 0 17 13 G 7 8 248299 CASAVA_Build 11 70093693 2I ACAGAGACAT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 2963 hom 41 12 17 12 AG 7 8 248300 CASAVA_Build 11 70102008 2D CAGGGCACAC TG/-- TACTTCCCAG 3070 het 3070 hom 41 14 23 6 TG 1 0 248301 CASAVA_Build 11 70141248 2I TTGTCAAAAC --/AG GGGCAGTCAG 3070 hom 101 het 41 0 32 9 AG 0 1 248302 CASAVA_Build 11 70147076 3I CTCCTCCGAG ---/GCT GTTGCCGACC 3070 hom 54 het 20 0 16 4 GCT 0 1 248303 CASAVA_Build 11 70148359 1I GGTGATGGTG -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 C 7 8 248304 CASAVA_Build 11 70160144 2D CTGTGTGTAT GA/-- GTGTGTATGC 3070 hom 266 het 102 0 86 20 GA 1 0 248305 CASAVA_Build 11 70160327 2D CATGTGTGTG TA/-- TGAATGTGAG 3070 hom 170 het 63 0 56 8 TA 1 0 248306 CASAVA_Build 11 70160451 6D TGTGTAAGCA CGTGTG/------ TGAACATATG 3070 hom 129 het 52 0 44 10 CGTGTG 1 0 248307 CASAVA_Build 11 70160492 12D TGTGTGAATA TGTGTGAGCATG/------------ TGTGTGAGCA 3070 hom 51 het 54 1 34 26 TGTGTGAGCATG 2 1 248308 CASAVA_Build 11 70160742 1I TTTCTCTCAG -/T TCTGGCGGCG 3070 hom 141 het 51 0 46 5 T 1 2 248309 CASAVA_Build 11 70160819 12D GGTGCATTCA TGTGTGTGCACG/------------ TGTGTGTGCA 3070 hom 119 het 42 0 40 6 TGTGTGTGCACG 1 0 248310 CASAVA_Build 11 70164813 1D ATTCTAAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 10 9 248311 CASAVA_Build 11 70164856 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1811 het 1811 ref 20 7 5 8 T 11 12 248312 CASAVA_Build 11 70193167 1I TCCAAGGTCC -/A AGGCCAGCAG 3070 hom 62 het 26 0 21 5 A 1 2 248313 CASAVA_Build 11 70270570 1I CCCCCACACT -/G GGGGGAGGGC 2924 hom 41 het 17 0 9 8 G 5 6 248314 CASAVA_Build 11 70287100 2D CAGGGGACAC AG/-- GGGCACAGAG 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 AG 1 0 248315 CASAVA_Build 11 70300789 1D CATTCATCTA C/- CCACCCACCC 3070 hom 127 het 49 0 37 13 C 3 2 248316 CASAVA_Build 11 70303704 12I TCGGTCCCAT ------------/CAGGGCACATTG CAGGACTCTC 3070 hom 65 het 23 0 20 3 CAGGGCACATTG 0 1 248317 CASAVA_Build 11 70349530 2I GAAATGATGA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 18 het 26 1 19 6 T 9 11 248318 CASAVA_Build 11 70351181 1I AGGAAAGCTG -/C CCCCTTGGAA 3070 hom 68 het 27 0 22 5 C 4 5 248319 CASAVA_Build 11 70353388 1D AGGATGAGGC T/- TTGGACACAA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 3 2 248320 CASAVA_Build 11 70374950 6D AAGAACAGAC TTTCCT/------ TCAGAAAAGA 3070 hom 75 het 26 0 24 2 TTTCCT 1 0 248321 CASAVA_Build 11 70405490 2I TTTAATTTTA --/AT TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AT 0 1 248322 CASAVA_Build 11 70411038 2D AAGGATTAAC TG/-- TGGTATTCAC 3070 hom 102 het 42 0 35 8 TG 2 1 248323 CASAVA_Build 11 70411117 1I TCCCATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 941 hom 32 4 22 6 T 15 16 248324 CASAVA_Build 11 70412221 1D CAATATGTGT C/- CCACCCTTGA 3070 hom 137 het 47 0 44 3 C 3 2 248325 CASAVA_Build 11 70434560 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 118 hom 16 1 11 4 A 15 14 248326 CASAVA_Build 11 70434653 2D TTGGTGGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 505 het 505 ref 39 29 3 9 GT 7 6 248327 CASAVA_Build 11 70443126 1D TTACTACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2629 hom 27 10 13 4 T 13 12 248328 CASAVA_Build 11 70446079 3I TAGAAGGAGA ---/GAG GATGAAAAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GAG 0 1 248329 CASAVA_Build 11 70448102 1D GCTGCTCCTA G/- GATCTCGGGG 3070 hom 48 het 20 0 16 5 G 2 1 248330 CASAVA_Build 11 70474531 2D CAGCTAATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TG 8 7 248331 CASAVA_Build 11 70476544 1D TCGTGTGTCC G/- GGGGGGCCTG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 7 6 248332 CASAVA_Build 11 70477094 1I AGAACTGATA -/G GGATACATTT 3070 het 3070 ref 52 32 15 5 G 2 3 248333 CASAVA_Build 11 70501515 8I TCAAGGCATA --------/GTGCATTC GTGCATTCCG 3070 het 3070 hom 48 12 25 11 GTGCATTC 1 2 248334 CASAVA_Build 11 70512823 7D GTGATGGTGA TTGATGG/------- TGATAATGGT 297 het 297 ref 82 70 4 11 TTGATGG 1 0 248335 CASAVA_Build 11 70512872 3I TGATGGTGAT ---/GGA GGTGATGATG 3070 het 3070 hom 73 33 25 15 GGA 0 1 248336 CASAVA_Build 11 70534502 2D GACTGTACTC AT/-- AGAGGTCGGG 3000 het 2910 hom 24 10 9 5 AT 1 0 248337 CASAVA_Build 11 70538262 2I TCTCTTGCGA --/CT CTGTCTTATG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 CT 1 2 248338 CASAVA_Build 11 70542722 5I AACTCTGATT -----/TAAGA TACTTTTTCA 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 TAAGA 0 1 248339 CASAVA_Build 11 70551118 1D AAAGGCCCCA C/- CTCCAATCAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 C 2 1 248340 CASAVA_Build 11 70560634 1I TCTAGTCCAC -/A ACGCCTGGGA 3070 hom 123 het 45 0 40 5 A 1 2 248341 CASAVA_Build 11 70563778 2I ACACACACAC --/AT GGTCGCATAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AT 0 1 248342 CASAVA_Build 11 70604741 2D GGCGCAGCCA CT/-- CTCTGGAACA 3070 hom 118 het 50 0 37 14 CT 3 2 248343 CASAVA_Build 11 70621842 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 15 9 A 11 10 248344 CASAVA_Build 11 70663875 5I AGGTGGGAAT -----/TGAGG TGAACAATGA 1375 het 1375 ref 12 8 3 1 TGAGG 0 1 248345 CASAVA_Build 11 70677254 2I TTTGTATGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 12 14 248346 CASAVA_Build 11 70695975 1D CCCAGAACCC A/- AGCAGCTCGT 3070 het 3070 ref 43 24 12 8 A 2 1 248347 CASAVA_Build 11 70702429 1I TGTTTGTGAT -/C CCCCGAAATT 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 C 4 5 248348 CASAVA_Build 11 70716120 1I AACAGACAGG -/T TTTGAATCCC 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 T 3 4 248349 CASAVA_Build 11 70732696 2I GTTATACCAG --/AC ACAGAGAATG 3070 het 3070 hom 50 11 27 12 AC 1 2 248350 CASAVA_Build 11 70746098 6D CCCTGTGAGG GAGGGA/------ CATGAACATG 3070 het 3070 hom 41 18 18 9 GAGGGA 1 0 248351 CASAVA_Build 11 70755520 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1429 hom 23 4 18 1 A 13 12 248352 CASAVA_Build 11 70765121 2I CTGCTATAAC --/AG AATACCACAG 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 AG 0 1 248353 CASAVA_Build 11 70766315 2D ATGTTCAAAA AG/-- TCTTCTTATC 3070 het 3070 ref 42 26 14 4 AG 1 0 248354 CASAVA_Build 11 70767385 2I AGCATCTCTC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 54 21 20 13 CT 6 7 248355 CASAVA_Build 11 70767544 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2448 hom 28 9 13 6 A 11 10 248356 CASAVA_Build 11 70768421 4I CACTCTGGAA ----/TAGT TAGTATAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 TAGT 1 2 248357 CASAVA_Build 11 70769930 2D CCCCAAGTTA TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 10 8 248358 CASAVA_Build 11 70773294 1D AGAGTCAGGA G/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 8 G 6 5 248359 CASAVA_Build 11 70774822 1D TGTCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1652 hom 32 8 14 10 A 15 14 248360 CASAVA_Build 11 70783762 1I AGCTATTAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 8 9 248361 CASAVA_Build 11 70798951 3I TCTAATTTGC ---/AAT AGAGCCTGAG 3070 hom 153 het 53 0 51 2 AAT 0 1 248362 CASAVA_Build 11 70804731 1I AAGGGACATT -/C CAATGGTCTT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 1 2 248363 CASAVA_Build 11 70806168 13D ACTCTATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAGT 3070 hom 34 het 17 0 13 7 A 21 8 248364 CASAVA_Build 11 70819194 8I CCATTTGTGG --------/GTGGTGGT GTGGTGGTGT 3070 hom 99 het 39 0 27 12 GTGGTGGT 1 2 248365 CASAVA_Build 11 70843287 3I GAAGAAGGCT ---/TGG TGGCCAAAAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TGG 1 2 248366 CASAVA_Build 11 70843593 2I AGGCGTACTC --/AT GTGTATACAG 3070 hom 132 het 46 0 44 2 AT 0 1 248367 CASAVA_Build 11 70843709 1I TTTGTTTTTT -/G TTTTTATCCT 3070 hom 146 het 54 0 48 6 G 0 1 248368 CASAVA_Build 11 70849392 1D CATATTTGAA G/- GTATTTTTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 2 1 248369 CASAVA_Build 11 70865416 3I TCTCCCCGTT ---/CCC CACGTCAGAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 4 248370 CASAVA_Build 11 70880138 4I AGACATGCTT ----/AGTC AGCTTCGCCA 3070 hom 116 het 41 0 36 5 AGTC 0 1 248371 CASAVA_Build 11 70889077 1I GGACCGTTGA -/C CCCCCCGAGG 3070 hom 107 het 42 0 32 10 C 6 7 248372 CASAVA_Build 11 70889282 1D AGGAATGCTG A/- ACATTTGGGA 3070 hom 120 het 48 0 38 11 A 2 1 248373 CASAVA_Build 11 70894221 7D GAGCCCAAGC TAAGCCA/------- TCATGTCCTC 3070 het 3070 ref 33 20 9 5 TAAGCCA 1 0 248374 CASAVA_Build 11 70896560 1D CTCTTTATCT G/- GTATTCAATA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 2 1 248375 CASAVA_Build 11 70899436 1D AGCCTCCAGT A/- GAAAAATTCT 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 1 0 248376 CASAVA_Build 11 70900101 1D GGGTCCTACG C/- CCATGGAGTC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 3 2 248377 CASAVA_Build 11 70906635 4D ACATATGCAC ACAT/---- ACATACATAC 3070 hom 78 het 37 0 27 11 ACAT 5 4 248378 CASAVA_Build 11 70913265 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 12 0 10 2 A 10 11 248379 CASAVA_Build 11 70915467 2I CCATTCTAAC --/CT CTTTCCTTTA 3070 hom 44 het 19 0 14 5 CT 1 2 248380 CASAVA_Build 11 70920657 1I AACAAAAAAA -/C CCCACAAAAC 3070 het 10 hom 29 1 15 13 C 3 4 248381 CASAVA_Build 11 70921475 1D ACAGAAAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 7 248382 CASAVA_Build 11 70949896 1D GTCTTCTTTT G/- AGAAGTGTCT 3070 het 3070 ref 52 39 12 2 G 1 0 248383 CASAVA_Build 11 70959493 4I GTGTGTGAGT ----/GTGA GTGAGTGTGA 3070 hom 192 het 80 0 62 18 GTGA 1 2 248384 CASAVA_Build 11 70969183 4D TTGGTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTTTG 3070 hom 30 het 36 0 16 21 TTTG 2 1 248385 CASAVA_Build 11 70972522 3D GTGGAGATCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 22 0 14 8 T 19 16 248386 CASAVA_Build 11 70974218 1D TCATACTCCA C/- CCCCTGGAGA 1007 het 1007 ref 26 22 3 1 C 5 4 248387 CASAVA_Build 11 70977471 1I TTGGCTAACG -/A ATGCCAGACT 1178 het 1178 ref 25 20 4 2 A 1 2 248388 CASAVA_Build 11 70979624 16I TTGAGAGTAG ----------------/TATCATCCTCTCCCCC TTCCATATTG 3070 hom 60 het 22 0 18 5 TATCATCCTCTCCCCC 0 1 248389 CASAVA_Build 11 70980567 1I GTTTACAAAC -/A GGGGTGGTGT 2061 hom 17 het 8 0 6 2 A 0 1 248390 CASAVA_Build 11 70982581 3D TGTGTCTTCT TCG/--- TTTTGGTGTC 2912 hom 9 het 8 0 7 1 TCG 1 0 248391 CASAVA_Build 11 70988363 1D CAATAAACCA G/- GGGCACAATG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 4 3 248392 CASAVA_Build 11 71002977 1D CCCCCCATAC T/- GTGGTGACTT 2411 het 2411 ref 31 21 6 4 T 1 0 248393 CASAVA_Build 11 71004144 1I CGTGAAGTAA -/C GCCGTGTGCT 2304 het 2304 ref 34 23 5 6 C 0 1 248394 CASAVA_Build 11 71006003 1D CTGCGATATT G/- GGAGTAATAG 3070 het 3070 ref 45 24 11 10 G 3 2 248395 CASAVA_Build 11 71018466 1I56M1I ATGTGGCCAG -TTTTTTTTTTTTCTTTGCAAATTTGCCACGTGGTTAAAAGGAATGTGGATTATTTG-/TTTTTTTTTTTTTCTTTGCAAATTTGCCACGTGGTTAAAAGGAATGTGGATTATTTGT TTTTTTTTAG 3070 het 6 hom 23 1 17 22 N/A 0 0 248396 CASAVA_Build 11 71020939 1I ATCCTTTACC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 8 9 248397 CASAVA_Build 11 71024988 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAAAG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 0 1 248398 CASAVA_Build 11 71025380 1I CCGAGTAGCT -/G GGACTACAGG 1188 het 1188 ref 15 9 4 2 G 2 3 248399 CASAVA_Build 11 71029279 1D GGGCAGATGA G/- GGCCCGCTGA 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 G 3 2 248400 CASAVA_Build 11 71033114 1D GTTCTCGGAT C/- CCCCCCGGCC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 7 6 248401 CASAVA_Build 11 71034684 3I ATTTTGTAAA ---/AAG AATGTCTTGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AAG 0 1 248402 CASAVA_Build 11 71040141 3D CTCATTAACC TTT/--- TTTTTTTTTT 2069 het 408 hom 35 6 11 18 T 21 18 248403 CASAVA_Build 11 71043515 12I CACCCATCTT ------------/TCCGTCCACCCA TCTATCCACC 2620 hom 27 het 10 0 8 2 TCCGTCCACCCA 0 1 248404 CASAVA_Build 11 71044451 1I GCTGTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 17 0 10 7 A 10 11 248405 CASAVA_Build 11 71046719 1I GAGACTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3019 het 1129 hom 24 5 11 8 A 14 15 248406 CASAVA_Build 11 71053407 1D TCCCCCTTTT A/- CTGCAGAATG 3070 hom 90 het 33 0 29 4 A 1 0 248407 CASAVA_Build 11 71054612 1D TTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 7 hom 21 1 11 9 T 10 9 248408 CASAVA_Build 11 71056957 1D ATTTTCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 11 1 9 1 T 11 10 248409 CASAVA_Build 11 71060164 1I TTGATTTCGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 9 10 248410 CASAVA_Build 11 71061491 1I TGGCACTTGG -/A AAAGAGAGTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 3 4 248411 CASAVA_Build 11 71062072 1I TTTCCTACAA -/C CGGGTGTGCT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 1 2 248412 CASAVA_Build 11 71099087 1I CCGATAAAGT -/A AGAATAAACG 3070 het 3070 ref 42 31 10 1 A 1 2 248413 CASAVA_Build 11 71101960 1I TTTAACTAGA -/T CCCCCTCCCC 2268 het 2268 ref 20 14 5 1 T 0 1 248414 CASAVA_Build 11 71103919 3I GTCATAGGTA ---/GTT AAGAGACAAA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 GTT 0 1 248415 CASAVA_Build 11 71111919 2D45M2D CATCTTCTGC CAGCCTCTCTCATCTCTCTCCCTCTCCTTCACTTCCTTCCGGATCACAA/--ATCTCTCTCATCTCTCTCCCTCTCCTTCACTTCCTTCTGGATCAC-- AGGCCTTTTG 2339 het 2339 ref 32 29 5 14 N/A 0 0 248416 CASAVA_Build 11 71122072 1D AATTTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1246 hom 26 5 16 6 A 13 12 248417 CASAVA_Build 11 71131440 2D CCAGCACAAT TG/-- TAGGAGAGAC 1360 het 1360 ref 31 26 3 2 TG 1 0 248418 CASAVA_Build 11 71142148 1D132M2D GGGTCATTCT CAAGTCTTGTTCAAGGATAAAATGATTTATTGATGGCCGTAATTAAAAAGCAATGCCAACAGAAGCAGCTTCAGCATTTTTCATTTGTACTTACACATGAGCAAGAGCAGTTTAGGGAAACGGGTGCCTTCAGAT/-AAGTCTTGTTCAAGGATAAAATGATTTATTGATAGCCGTAATTAAAAAGCAATGCCAACAGAAGCAGCGTCAGCATTTTTCATTTGTACTTACACATGAGCAAGAGCAGTTTAGGGAAACGGGTGCCTTCAG-- TCTGTTTTCT 2417 het 2417 ref 32 51 7 19 N/A 0 0 248419 CASAVA_Build 11 71142857 4D TGAAAATTAG TAGA/---- TAGAAATTCA 1645 het 1645 ref 59 54 4 2 TAGA 2 1 248420 CASAVA_Build 11 71143513 3I CTGTCAAAAA ---/AAC AGAAAGGAAA 1900 het 1900 ref 32 25 5 2 AAC 0 1 248421 CASAVA_Build 11 71146113 3D CAATATATTA TTG/--- TTATCACACC 2842 het 2842 ref 42 31 9 4 TTG 1 0 248422 CASAVA_Build 11 71155383 1I TTAAAGAGGC -/A ATTTAAGAAT 1370 het 1370 ref 38 31 3 4 A 1 2 248423 CASAVA_Build 11 71159236 1D CCCAAAGCTG A/- ACCGGTTGCT 1125 het 1125 ref 37 31 3 3 A 2 1 248424 CASAVA_Build 11 71160213 2D ACCGTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1315 het 621 hom 19 5 6 9 A 16 14 248425 CASAVA_Build 11 71167008 2D CCCGGAACAC TG/-- TGATTACTGC 3070 het 3070 ref 54 39 12 3 TG 2 1 248426 CASAVA_Build 11 71167226 4D CTTCTGCTGA ACCG/---- ACCATTAGGC 3070 het 3070 ref 60 45 11 5 ACCG 1 0 248427 CASAVA_Build 11 71193232 1D ACCTAGAAGC G/- GGGGTAGTCC 3070 hom 42 het 15 0 13 2 G 5 4 248428 CASAVA_Build 11 71201767 3I CAGAAATCTG ---/ACA ACACTGGTCA 3070 hom 80 het 29 0 24 5 ACA 1 2 248429 CASAVA_Build 11 71202160 1I GAGTCCCCCC -/T GAATGGGCTC 2482 hom 24 het 10 0 7 3 T 0 1 248430 CASAVA_Build 11 71206720 1I AAGTATCCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 9 10 248431 CASAVA_Build 11 71207191 4I2M4D CACAGGGGTA ----TCAGGA/GTCTTC---- AAAGAGTCAG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 N/A 0 0 248432 CASAVA_Build 11 71211045 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 13 14 248433 CASAVA_Build 11 71214029 1D ACCACACAAA T/- AGAATTTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 0 248434 CASAVA_Build 11 71214601 1I TCTACACCTG -/T TTAACATCAA 3070 het 359 hom 39 2 32 5 T 2 3 248435 CASAVA_Build 11 71215638 7I TAGAGTCTTA -------/TGGAGAC TCTACATTCT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 TGGAGAC 0 1 248436 CASAVA_Build 11 71261254 1D CATCTCTACT A/- AAAAAATACC 2454 hom 15 het 9 0 6 3 A 7 6 248437 CASAVA_Build 11 71267980 1D ACTTTTTGTA T/- GGTGAGAGTT 3070 het 2300 hom 33 5 24 4 T 1 0 248438 CASAVA_Build 11 71271731 1I AAACTTAACC -/A AAAAGATGAA 1740 het 1740 ref 37 33 4 0 A 4 5 248439 CASAVA_Build 11 71296172 1D TTGCCCCCCC T/- GGCTCTTAGG 3070 hom 37 het 16 0 12 4 T 1 0 248440 CASAVA_Build 11 71304409 1I TTTGGGACTT -/A ACAGTGAGTG 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 1 2 248441 CASAVA_Build 11 71308299 16D GGCCAGGTTG GTTTTTTTTTTTGTTT/---------------- GTTTTTTTTT 1380 hom 21 het 9 0 7 3 GTTTTTTTTTTTGTTT 1 0 248442 CASAVA_Build 11 71319237 1D CCAATCACTA G/- AGACTACAGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 1 0 248443 CASAVA_Build 11 71325103 3I TTTATTTTTT ---/AAG AGACAGAGTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AAG 0 1 248444 CASAVA_Build 11 71325525 1I TTAATGCTTT -/G AATGCAGGGA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 G 0 1 248445 CASAVA_Build 11 71334493 1I CATCAATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 9 248446 CASAVA_Build 11 71336178 1I GACCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 503 hom 33 3 20 10 A 12 13 248447 CASAVA_Build 11 71337640 1D ACCTACCAGG T/- TTCATGAGCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 3 2 248448 CASAVA_Build 11 71341502 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 23 0 15 8 A 11 12 248449 CASAVA_Build 11 71346011 1D TTAACCCAGC T/- TAATTGAGTG 3070 hom 73 het 30 0 25 5 T 2 1 248450 CASAVA_Build 11 71353135 4I ATCTGAGAGT ----/AGAG AGAGTTTCAC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AG 2 4 248451 CASAVA_Build 11 71356763 1I ATGAACGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 19 0 16 3 T 11 12 248452 CASAVA_Build 11 71363363 1D AATTTCTGCC A/- TAGTCAGAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 0 248453 CASAVA_Build 11 71369045 1D AAAATGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 914 hom 27 2 17 8 T 12 11 248454 CASAVA_Build 11 71369910 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 8 9 248455 CASAVA_Build 11 71373633 1I TTTTAAAAAT -/A AGAGATGAGG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 1 2 248456 CASAVA_Build 11 71379931 1I TGAAATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 28 2 24 2 A 10 11 248457 CASAVA_Build 11 71381529 4D AATATTTCTA TTTT/---- TTTTTTCAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 T 10 6 248458 CASAVA_Build 11 71382171 6I TTTGTCCCTT ------/TGTCTC TGGCTTTTTT 3070 hom 128 het 48 0 43 5 TGTCTC 0 1 248459 CASAVA_Build 11 71391097 1I GTGCTGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 34 2 22 10 T 10 11 248460 CASAVA_Build 11 71398424 1D GTGCAGAGCC T/- TACTCTAAGG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 1 248461 CASAVA_Build 11 71405670 13D TCATCCCTAA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 26 0 25 3 T 25 12 248462 CASAVA_Build 11 71406192 1I TTGACTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 47 1 40 6 A 10 11 248463 CASAVA_Build 11 71406557 6D ATCACCCAGA GTCAAC/------ GCTGACCCCA 3070 hom 92 het 33 0 25 9 GTCAAC 1 0 248464 CASAVA_Build 11 71410698 2D TTCTGTGGGG GA/-- AAAAAAACAC 3070 hom 84 het 32 0 29 4 GA 1 0 248465 CASAVA_Build 11 71416249 1I CTATAAGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 68 het 44 1 38 5 A 9 10 248466 CASAVA_Build 11 71418027 2I GTTAGAAGCA --/AC ACATGGTTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AC 1 2 248467 CASAVA_Build 11 71422059 10D ATGTTCTTTG TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 25 15 248468 CASAVA_Build 11 71433297 1D GGGTTACTTT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 69 het 26 0 21 5 G 10 9 248469 CASAVA_Build 11 71436181 1D GACACGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 9 8 248470 CASAVA_Build 11 71437070 1D GAAAATCAAC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 8 7 248471 CASAVA_Build 11 71440166 1I AATTCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 2308 het 829 hom 24 3 9 12 T 17 18 248472 CASAVA_Build 11 71445020 1I CCCATCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2980 het 192 hom 19 2 12 5 T 13 14 248473 CASAVA_Build 11 71453543 1I AACAAACAAA -/C AAAAAGGCAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 248474 CASAVA_Build 11 71462889 20I ACTCCATCTC --------------------/AAAACAAAAACAAAGACAAA AAAAAAAATT 3070 hom 31 het 12 0 11 1 AAAACAAAAACAAAGACAAA 0 1 248475 CASAVA_Build 11 71475448 4I GGGTTGCTCT ----/GTTA GTCAAGAAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GTTA 0 1 248476 CASAVA_Build 11 71477708 2D CACTGGTCTT TC/-- TCTGTCCTCC 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 TC 2 1 248477 CASAVA_Build 11 71515112 3D AAACAAGGAT CAG/--- CAATGTTTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 4 CAG 1 0 248478 CASAVA_Build 11 71534009 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 23 2 18 3 A 13 12 248479 CASAVA_Build 11 71538598 1D CTGCTTATTA G/- GGCCAAAGGT 3070 hom 27 het 14 0 9 6 G 3 2 248480 CASAVA_Build 11 71540265 4I GTTCTGTGAC ----/AAAG AACAATTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAAG 0 1 248481 CASAVA_Build 11 71546267 1I AATCCAATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 9 10 248482 CASAVA_Build 11 71551647 1D TTTATTGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 29 0 20 10 A 11 10 248483 CASAVA_Build 11 71569739 3I TCCAAAGGAG ---/TAA TGTTTGCCAA 1344 het 1344 ref 50 39 3 8 TAA 0 1 248484 CASAVA_Build 11 71631516 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2181 hom 9 het 10 0 8 2 T 15 14 248485 CASAVA_Build 11 71665645 1D TGCTACCATA C/- CCAGCTAATT 3070 hom 72 het 29 0 23 6 C 3 2 248486 CASAVA_Build 11 71667981 1D TGTTATCTCC T/- TTTTTTTTTA 997 het 997 ref 53 38 3 12 T 10 9 248487 CASAVA_Build 11 71765345 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 9 8 248488 CASAVA_Build 11 71790953 1I ACTGTATCTC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 47 17 28 2 A 7 8 248489 CASAVA_Build 11 71851078 1I TTTAGGATGC -/T TGTGGACTCA 3070 hom 110 het 40 0 36 4 T 1 2 248490 CASAVA_Build 11 71852261 1I TAACATTGTC -/A AAGTTAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 2 3 248491 CASAVA_Build 11 71854523 2D TCCTTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2360 het 158 hom 26 3 11 12 T 18 16 248492 CASAVA_Build 11 71856515 3I AAAACATGAG ---/AAA AAAAAAAGAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 7 10 248493 CASAVA_Build 11 71858801 3D ATTAATTTTT ATA/--- ATGTCATAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATA 1 0 248494 CASAVA_Build 11 71862935 1I CCATCAAGAG -/T TTTAGATGTA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 T 3 4 248495 CASAVA_Build 11 71867144 1I TGAGCTCCGG -/A ATTTAAGACC 3070 hom 50 het 22 0 16 6 A 1 2 248496 CASAVA_Build 11 71871807 1D AAGAAACTGG A/- AAAAAATCAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 6 248497 CASAVA_Build 11 71882867 1I GCATCCCAGC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 8 9 248498 CASAVA_Build 11 71896392 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 5 T 10 9 248499 CASAVA_Build 11 71900972 2D GCCAGGATGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TC 6 5 248500 CASAVA_Build 11 71907149 1I TGCATTCTAT -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 7 8 248501 CASAVA_Build 11 71915785 1D TCGATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 11 10 248502 CASAVA_Build 11 71916879 1I TTACCCGTCC -/A AAAAAATGTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 6 7 248503 CASAVA_Build 11 71917034 1I GACACCATCA -/C ATTTGCTCAC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 C 0 1 248504 CASAVA_Build 11 71937682 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTGA 2202 het 2202 ref 17 8 8 1 A 1 0 248505 CASAVA_Build 11 71938653 1D ATAGAGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 45 3 18 25 T 19 18 248506 CASAVA_Build 11 71940447 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1841 het 1841 ref 24 11 6 7 A 15 16 248507 CASAVA_Build 11 71946894 1D ACTCCAGGTA G/- GGACACATTC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 G 3 2 248508 CASAVA_Build 11 71951634 61D CCTATGATAT TTGTTCCCCAGGCCTCAGGTGCAGAGGGCTGAGCTAATCCTACTCCTGAGTTCACAGCGTG/------------------------------------------------------------- GAACCATCAT 3070 het 3070 ref 34 29 14 4 TTGTTCCCCAGGCCTCAGGTGCAGAGGGCTGAGCTAATCCTACTCCTGAGTTCACAGCGTG 1 0 248509 CASAVA_Build 11 71953359 1D TAAAGATCGA C/- CCCCTGACCT 3070 het 3070 ref 27 12 13 3 C 5 4 248510 CASAVA_Build 11 71957109 1I AATTTGGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 660 hom 37 2 27 8 T 10 11 248511 CASAVA_Build 11 71966299 1D GCGGGTGCAT G/- GGGGGCAGAG 3070 hom 69 het 29 0 22 8 G 6 5 248512 CASAVA_Build 11 71966451 7D GATCACCTGA AGTCAGG/------- AGTTCAAGAC 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 AGTCAGG 1 0 248513 CASAVA_Build 11 71970002 1I TGTCCCAGGG -/A AGGGGACCCC 3070 hom 67 het 28 0 19 9 A 1 2 248514 CASAVA_Build 11 71973807 1D AAGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 37 0 17 20 T 15 14 248515 CASAVA_Build 11 71977080 1D GGGCTCAAAA G/- ATCCACAGCT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 G 1 0 248516 CASAVA_Build 11 71994546 3I CCCAGGCCTT ---/ATA ATAGCAGGTA 3070 het 3070 ref 56 24 24 8 ATA 1 2 248517 CASAVA_Build 11 72007745 2D ACAGCGTGCG CA/-- CACACACACA 3070 het 1571 hom 31 7 9 15 CA 9 8 248518 CASAVA_Build 11 72010872 1I GGCTACCATT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 A 6 7 248519 CASAVA_Build 11 72044182 2D AGTGAGTGCC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 59 25 12 23 TG 7 6 248520 CASAVA_Build 11 72062445 1I CTCCCTCTCC -/A GGGTCCTGAA 3070 het 2665 hom 33 11 15 7 A 0 1 248521 CASAVA_Build 11 72066908 1D GGTCCCTTGT C/- GATCCAGCCC 3070 hom 62 het 25 0 21 4 C 1 0 248522 CASAVA_Build 11 72076701 1D TTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2623 hom 25 10 12 3 T 10 9 248523 CASAVA_Build 11 72104058 1I CAGGGTGGAT -/G GGCTTATTTT 3070 hom 117 het 45 0 32 13 G 2 3 248524 CASAVA_Build 11 72149513 1D TGTTCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 2938 het 2938 ref 37 18 8 11 T 15 14 248525 CASAVA_Build 11 72177762 2D CTGGTCTCGA AC/-- TTCTGGCCTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AC 1 0 248526 CASAVA_Build 11 72179056 1I CAGTGAGTTC -/T TGGCCTCTCT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 1 2 248527 CASAVA_Build 11 72185203 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTAGAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 6 248528 CASAVA_Build 11 72191596 1D CGGGAGGCTG A/- AAATGGGAGG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 4 3 248529 CASAVA_Build 11 72195817 4I CCCATTAGGC ----/CTCT CTAATACTGG 3070 hom 105 het 38 0 34 4 CT 1 3 248530 CASAVA_Build 11 72200484 1D TTGTCTTTAC A/- AGAAAAATTT 2869 hom 23 het 10 0 8 2 A 2 1 248531 CASAVA_Build 11 72218281 4I TATTTTTATC ----/TCTA TCTATCTCCT 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 TCTA 1 2 248532 CASAVA_Build 11 72219482 4I TTTCCTTGCT ----/ATTC ATTCATTCAT 3070 hom 107 het 45 0 35 10 ATTC 3 4 248533 CASAVA_Build 11 72223591 1I ATTCCATTCC -/T TTTACAATTG 3070 hom 100 het 37 0 32 5 T 3 4 248534 CASAVA_Build 11 72232056 3I CAAGTTTACA ---/GGG CACACAATTT 3070 het 3070 ref 53 31 22 0 G 0 3 248535 CASAVA_Build 11 72234143 13D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAC/------------- AACAACAAAC 2753 het 867 hom 17 6 13 5 AAAAAAAAAAAAC 1 0 248536 CASAVA_Build 11 72246129 2D TGCTTACTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2717 het 148 hom 24 2 9 13 T 20 18 248537 CASAVA_Build 11 72250625 1D ACGCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 174 hom 26 1 15 10 A 18 17 248538 CASAVA_Build 11 72254950 5D CTGTTCTGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 TTTTG 3 2 248539 CASAVA_Build 11 72260298 1D TGGAGCTGGT G/- CAGTGGCTTG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 0 248540 CASAVA_Build 11 72260980 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 26 1 13 12 T 18 16 248541 CASAVA_Build 11 72273931 2I GAAACCAAGT --/GA GAGATTATTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GA 2 3 248542 CASAVA_Build 11 72279080 3D ACAAAACAAT ATA/--- ATAACAGCAA 3070 het 3070 hom 29 10 11 10 ATA 2 1 248543 CASAVA_Build 11 72279366 1D TTCATATAAC T/- TTTTTTTTTT 1720 het 1720 ref 33 21 6 6 T 13 12 248544 CASAVA_Build 11 72281602 1I TGGCTGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 10 11 248545 CASAVA_Build 11 72290012 3D ATCACTTGAG CCC/--- AGGAGAGGGG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 3 0 248546 CASAVA_Build 11 72297036 2D CAATCAACAT GA/-- GAGTGCAGAT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 GA 2 1 248547 CASAVA_Build 11 72306586 1D GTCTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 1229 het 1229 ref 29 23 3 3 A 15 14 248548 CASAVA_Build 11 72317535 1I ATTTAGCATT -/A AGGTATATCT 2509 hom 15 het 7 0 6 1 A 1 2 248549 CASAVA_Build 11 72319790 2D AATAATTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 2962 hom 27 het 11 0 10 1 T 17 15 248550 CASAVA_Build 11 72336449 19I ATAATTTTCT -------------------/GATTATAGAATACATGCTC CATAAAGAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 GATTATAGAATACATGCTC 0 1 248551 CASAVA_Build 11 72345713 1D GACTCTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 26 0 18 8 T 13 12 248552 CASAVA_Build 11 72350099 9D AAGAAGTTTT TTGTTGTTG/--------- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 TTG 9 6 248553 CASAVA_Build 11 72351295 1I AAATTCCCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 10 11 248554 CASAVA_Build 11 72354896 4I TCTGTCGCCC ----/AGGA AGGAAGGAGT 3070 hom 98 het 40 0 30 11 AGGA 2 3 248555 CASAVA_Build 11 72361444 3D GCCCCTTGTG GGC/--- GGCACCAGAG 3070 het 3070 ref 34 17 14 6 GGC 2 1 248556 CASAVA_Build 11 72369369 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 2571 het 51 hom 15 1 9 5 TA 11 9 248557 CASAVA_Build 11 72374386 2I AGTCCTGGGA --/CT CTCTGCCCTG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 CT 2 3 248558 CASAVA_Build 11 72427943 1I AGGGTGCAGT -/G GCTCACACCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 2 248559 CASAVA_Build 11 72428211 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 A 11 12 248560 CASAVA_Build 11 72428619 3I ATTCATGAGG ---/ATA ATATCACAAA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 ATA 1 2 248561 CASAVA_Build 11 72438378 1D AGAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1069 hom 7 het 6 0 3 3 A 17 16 248562 CASAVA_Build 11 72438566 1D AAAGGACCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 5 A 10 9 248563 CASAVA_Build 11 72444037 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 14 13 248564 CASAVA_Build 11 72467330 1I CTATTCTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 14 15 11 A 13 14 248565 CASAVA_Build 11 72489557 1I CTACGTGGGA -/T TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 43 30 5 8 T 13 14 248566 CASAVA_Build 11 72491912 4D CTGTACACTT AAGG/---- TAGATGGATT 3070 het 3070 ref 41 22 16 5 AAGG 1 0 248567 CASAVA_Build 11 72497245 1D TAGATTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 17 1 13 3 T 11 10 248568 CASAVA_Build 11 72498844 1D AGTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 11 10 248569 CASAVA_Build 11 72500157 1D TTCTCCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 18 11 8 T 13 12 248570 CASAVA_Build 11 72505645 1D ATTTTTCCCC A/- AAAAAAATCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 7 248571 CASAVA_Build 11 72553144 1I TTCAACCAGC -/A AAATAATAAG 3070 hom 160 het 57 0 53 4 A 3 4 248572 CASAVA_Build 11 72557131 1I ATTCCCGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 556 hom 31 2 18 11 T 14 15 248573 CASAVA_Build 11 72564575 4D TCTCTTTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 86 het 36 0 28 9 TCTT 4 3 248574 CASAVA_Build 11 72568113 1D CCTCTGATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 41 het 19 0 14 5 T 10 9 248575 CASAVA_Build 11 72568665 2D ACGTGGCAAA TC/-- TCTGTCTCTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 TC 2 1 248576 CASAVA_Build 11 72572814 4I GAAGGCTCTG ----/ATAA ATAAAGAAGA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 ATAA 1 2 248577 CASAVA_Build 11 72588478 1D CAGCACAATA T/- TTTTTTGAGG 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 T 7 6 248578 CASAVA_Build 11 72592501 1I AGAAAGACAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 76 het 37 0 30 7 A 8 9 248579 CASAVA_Build 11 72595160 2D GTATTTAGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TA 6 5 248580 CASAVA_Build 11 72596799 1D AAGAAAAGCC T/- AAAAAGTATA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 T 1 0 248581 CASAVA_Build 11 72597420 1D GACCCTGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 9 248582 CASAVA_Build 11 72600151 4I GAAAAGAAAG ----/AAGA AAGGAAGGAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AAGA 0 1 248583 CASAVA_Build 11 72600208 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAGGAA 3006 het 3006 ref 24 10 8 7 A 7 6 248584 CASAVA_Build 11 72605122 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 6 7 248585 CASAVA_Build 11 72612079 1D TCTGCTGGGG A/- ACACCTGGGA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 2 1 248586 CASAVA_Build 11 72612157 11I ACAGGCAGAC -----------/ACATTAATGTG ACAGCCTCCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 ACATTAATGTG 0 1 248587 CASAVA_Build 11 72665810 1I GAAATACAGA -/T TTTTTTTTTT 1668 het 1668 ref 23 13 5 5 T 15 16 248588 CASAVA_Build 11 72801925 1I TCAGCCTGTT -/C CCTGGATTCA 3070 hom 97 het 40 0 30 10 C 2 3 248589 CASAVA_Build 11 72822061 1D CCTTTGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 12 11 248590 CASAVA_Build 11 72825211 1D ACCAAAACAA T/- GACCAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 0 248591 CASAVA_Build 11 72868095 2D TCATTTGATC TA/-- TGTTTTAAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TA 1 0 248592 CASAVA_Build 11 72869078 4D ATAGAAAATT TCTC/---- TCTCTCTCTT 3070 hom 90 het 36 0 30 9 TC 6 4 248593 CASAVA_Build 11 72912558 1I TTTTCCCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 31 2 19 10 T 13 14 248594 CASAVA_Build 11 72923373 1D TGGGATTACA G/- GGTGTAAGCC 3070 hom 54 het 21 0 19 3 G 3 2 248595 CASAVA_Build 11 72944822 1I33M1D AGGATCATTT -GGGCCAGGAGTTCAAGAACAGCCTGGGCAACATA/GGGGCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACAT- AGTGAAACCC 3070 hom 78 het 23 0 27 7 N/A 0 0 248596 CASAVA_Build 11 72948927 1D CATGCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1189 het 1189 ref 39 29 3 7 T 11 10 248597 CASAVA_Build 11 72961503 4I TGACCTTCCT ----/TCCC TCCACTATTG 1439 het 1439 ref 11 8 3 0 TCCC 0 1 248598 CASAVA_Build 11 72991696 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 7 8 248599 CASAVA_Build 11 72993484 4I AGTGAATCAC ----/AAAT GAATCTGCAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AAAT 0 1 248600 CASAVA_Build 11 72994271 4D CGGTGGTCCG ATGC/---- ATCTCTGTGG 3070 het 3070 hom 37 17 15 6 ATGC 1 0 248601 CASAVA_Build 11 73023856 1D CACCACCCCC T/- CTAAACTCTC 3070 het 3070 ref 57 26 23 9 T 1 0 248602 CASAVA_Build 11 73029449 1D AAATCTTCTG C/- AGAGAGGAAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 C 1 0 248603 CASAVA_Build 11 73042723 1I AGAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 A 11 12 248604 CASAVA_Build 11 73048336 1D GAATTCAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 A 10 9 248605 CASAVA_Build 11 73058940 1D TGTGTACAAG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 7 6 248606 CASAVA_Build 11 73059308 2I TATGACAAAC --/AT ATATTTAACT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AT 2 3 248607 CASAVA_Build 11 73064706 6D ATCCCATCTT TAAGTA/------ TAAGTTACTG 3070 het 3070 ref 35 19 15 4 TAAGTA 1 0 248608 CASAVA_Build 11 73068421 2D GAGCTGTGGG AA/-- AGAGAGAAAA 3070 het 3070 hom 52 22 25 6 A 3 1 248609 CASAVA_Build 11 73071789 4D AATCACAATC TATT/---- TATTATCACA 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 TATT 2 1 248610 CASAVA_Build 11 73076554 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2945 hom 26 8 16 2 A 9 10 248611 CASAVA_Build 11 73077818 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2449 hom 26 8 12 7 A 13 12 248612 CASAVA_Build 11 73079249 1D CAGCTAATTC T/- TTTTTTTTTT 2544 het 267 hom 17 2 7 8 T 13 12 248613 CASAVA_Build 11 73095207 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1501 hom 19 5 10 5 A 15 14 248614 CASAVA_Build 11 73105328 1D TATTTAATTG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 9 8 248615 CASAVA_Build 11 73111020 17D ATATATATAT ATATATATATATATATA/----------------- TTTTTTTTTT 548 het 298 hom 4 2 3 0 ATATATATATATATATA 1 0 248616 CASAVA_Build 11 73111311 7D TATAGGCATG AGCCACT/------- ACACCCTGCC 3070 het 3070 ref 38 21 15 4 AGCCACT 1 0 248617 CASAVA_Build 11 73116123 1D TATCTCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 23 3 13 9 A 13 12 248618 CASAVA_Build 11 73125123 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 35 het 16 0 13 4 A 10 9 248619 CASAVA_Build 11 73129305 1D TAGCTGGCCA G/- GAGCAGCGGC 1874 het 1264 hom 16 6 6 4 G 2 1 248620 CASAVA_Build 11 73133672 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1172 het 1097 hom 14 4 7 3 A 15 16 248621 CASAVA_Build 11 73146833 3I CTACAGACTT ---/CTA CTAACGCATA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 CTA 1 2 248622 CASAVA_Build 11 73151585 1I GACAGGATTG -/A AAAAAGTGCC 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 5 6 248623 CASAVA_Build 11 73167929 1I AGGACCTTAC -/A AAAGGTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 3 4 248624 CASAVA_Build 11 73177862 1I AAGATAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 9 10 248625 CASAVA_Build 11 73194803 1I AGCAGAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 T 11 12 248626 CASAVA_Build 11 73196082 1I TTCCATCTTC -/T TTTTTTTTTT 2891 het 2891 ref 32 13 10 9 T 11 12 248627 CASAVA_Build 11 73200139 1I GAAGGAGAGG -/T TTTTTTTAAA 2684 het 2684 ref 26 14 9 3 T 7 8 248628 CASAVA_Build 11 73209433 4I TGAGTGGATA ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 AT 6 8 248629 CASAVA_Build 11 73209697 1D TTGTAATTAC T/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 7 6 248630 CASAVA_Build 11 73219270 1D CTAAGCCTAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 8 7 248631 CASAVA_Build 11 73228048 1I GTAGGGATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 T 9 10 248632 CASAVA_Build 11 73241838 1I AATGGGTATC -/A AAAAATAGAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 5 6 248633 CASAVA_Build 11 73264820 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1166 het 1166 ref 29 8 7 14 A 15 14 248634 CASAVA_Build 11 73285000 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 1806 het 1366 hom 21 7 6 8 T 11 10 248635 CASAVA_Build 11 73291349 1I AATATGTATG -/T GACCTTTAGC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 0 1 248636 CASAVA_Build 11 73294853 2I GAAAAATCTT --/AG TTCTCTAGTG 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 AG 0 1 248637 CASAVA_Build 11 73305005 12I CTGCTACTTC ------------/AGAGTATATTAT AGAGTATATT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 AGAGTATATTAT 1 2 248638 CASAVA_Build 11 73309993 1D ACTGCCTCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 28 2 17 9 A 15 14 248639 CASAVA_Build 11 73310087 1I CTTTTTGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 T 11 12 248640 CASAVA_Build 11 73314714 4D ATTGAGACTA TCTC/---- TATATATTGC 3070 het 3070 hom 26 13 13 1 TC 2 0 248641 CASAVA_Build 11 73314805 2D TCTTTCTTTC TT/-- TCTTTTTTTT 3070 het 1429 hom 27 5 16 6 T 3 1 248642 CASAVA_Build 11 73348442 5D ATTTTTACTT TATTA/----- TTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 23 9 12 4 TATTA 1 0 248643 CASAVA_Build 11 73358439 4D CCCATGTCTT AAAC/---- AAAGTTTCTG 3070 hom 107 het 40 0 35 7 AAAC 1 0 248644 CASAVA_Build 11 73360847 1I TCTTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 397 hom 37 1 35 1 A 10 11 248645 CASAVA_Build 11 73364508 3D TAATCCAGGA CTT/--- CTTTTGGAGG 3070 hom 99 het 36 0 32 7 CTT 2 1 248646 CASAVA_Build 11 73372191 1I TTAGGGACCA -/G GGACACTAAA 3070 hom 48 het 19 0 15 4 G 2 3 248647 CASAVA_Build 11 73378036 7D AATTCTGACC ACCAACA/------- ACCAAGAGGG 3070 hom 62 het 23 0 21 3 ACCAACA 1 0 248648 CASAVA_Build 11 73382962 1D CCGTCTCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 25 1 18 8 A 12 11 248649 CASAVA_Build 11 73384563 1I GAGGAGCCAT -/G GAAACAAGCA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 G 1 2 248650 CASAVA_Build 11 73385162 2I ACCCTGTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 10 12 248651 CASAVA_Build 11 73434271 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 248652 CASAVA_Build 11 73437583 3I GTCTGGGAAA ---/TTC TTCTTTCTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTC 1 2 248653 CASAVA_Build 11 73455348 1I AGACCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 25 1 18 6 T 11 12 248654 CASAVA_Build 11 73461410 1I TTGTCTGTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 80 het 36 0 28 8 T 9 10 248655 CASAVA_Build 11 73464060 1D GCGATATTTT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 25 het 25 1 15 9 G 9 8 248656 CASAVA_Build 11 73467801 2I TGCTTTAAAA --/GT GTGAAATGTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 GT 1 2 248657 CASAVA_Build 11 73481469 2I AAATTATACC --/CT GAGTTCAGGA 3070 hom 168 het 63 0 55 8 CT 0 1 248658 CASAVA_Build 11 73485179 1D AAAAAAATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 9 248659 CASAVA_Build 11 73485843 1D CCTCACCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 25 1 20 6 A 15 14 248660 CASAVA_Build 11 73488589 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2714 het 117 hom 13 1 8 5 A 15 14 248661 CASAVA_Build 11 73511606 14I AATGCATAGC --------------/TGTCTGGCAAGTGA TGTCATGCCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TGTCTGGCAAGTGA 0 1 248662 CASAVA_Build 11 73516170 1D GGTTGCTTAA T/- TTTTTTTTTT 2177 het 2177 ref 34 21 5 8 T 15 14 248663 CASAVA_Build 11 73520282 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 11 12 248664 CASAVA_Build 11 73537650 4D CATTTAGATT CAAA/---- CAGTTCGATA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 CAAA 1 0 248665 CASAVA_Build 11 73538052 1D TTGCTTAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 35 0 31 4 A 10 9 248666 CASAVA_Build 11 73547416 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 19 1 17 3 A 11 10 248667 CASAVA_Build 11 73548351 1D TCAAAAAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 9 8 248668 CASAVA_Build 11 73555010 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1907 het 107 hom 15 2 6 8 A 19 18 248669 CASAVA_Build 11 73556773 1I TCATCTCTCC -/A AACTTGTTTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 2 3 248670 CASAVA_Build 11 73585348 3I AGAAAGTAAA ---/GTG GTGAAAGAAC 3070 hom 97 het 38 0 30 8 GTG 1 2 248671 CASAVA_Build 11 73657877 3D AGACTCAGTT CTC/--- CTCAGCGCCT 3070 het 3070 ref 53 26 21 7 CTC 2 1 248672 CASAVA_Build 11 73662475 1D CTCAATACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 27 1 21 5 T 11 10 248673 CASAVA_Build 11 73672586 2D CATAGCACAA CT/-- CTCTGCCCAC 3070 het 3070 hom 48 18 21 10 CT 3 2 248674 CASAVA_Build 11 73677898 1I CCATTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 20 1 16 3 A 13 14 248675 CASAVA_Build 11 73702172 15D AGGGAAATGT CCTTCCTGGAACAGC/--------------- CCTAATCCAG 3070 het 3070 hom 50 20 30 9 CCTTCCTGGAACAGC 1 0 248676 CASAVA_Build 11 73713784 1I TTTCCACAGC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 9 248677 CASAVA_Build 11 73740666 1D4M2D AAAAAAAAAA TAAATAA/-AAAT-- AAATAAAAAT 3070 hom 47 het 19 0 16 4 N/A 0 0 248678 CASAVA_Build 11 73741870 1I ACCCAGAATG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 T 7 8 248679 CASAVA_Build 11 73745533 1D TGGCAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 17 1 11 5 T 11 10 248680 CASAVA_Build 11 73746461 1D AAACTTGGAA G/- AATCTATGAT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 G 1 0 248681 CASAVA_Build 11 73748258 2D ACGTACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 99 het 41 0 34 8 AT 8 7 248682 CASAVA_Build 11 73755153 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 13 12 248683 CASAVA_Build 11 73760824 1D TCAATAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 564 hom 30 3 21 6 A 14 13 248684 CASAVA_Build 11 73761719 1I TTTTGCCATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 8 9 248685 CASAVA_Build 11 73769061 4D CAATCATTCT TTCC/---- TATTTAAATA 3070 hom 68 het 28 0 23 5 TTCC 1 0 248686 CASAVA_Build 11 73777029 1D AAATAAAATT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 7 248687 CASAVA_Build 11 73778812 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2225 het 725 hom 15 4 7 4 A 13 12 248688 CASAVA_Build 11 73780522 6D TATATAAGCT GGTATG/------ GGTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 41 20 21 0 GGTATG 1 0 248689 CASAVA_Build 11 73782671 1D GAAAGCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 29 1 18 10 A 12 11 248690 CASAVA_Build 11 73783644 2I TCAGTTTCTC --/TA TGTTAAAAGA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 TA 0 1 248691 CASAVA_Build 11 73792355 1D GCAGCAAGAA T/- TTGAATTTTC 3070 het 3070 hom 26 9 13 5 T 3 2 248692 CASAVA_Build 11 73794616 3I GGCTCTGGCT ---/AGA ACCTTCAGTA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 AGA 0 1 248693 CASAVA_Build 11 73799676 1I GGCATATGTA -/C CTGAGAAAGT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 C 1 2 248694 CASAVA_Build 11 73809481 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2192 het 1857 hom 16 7 7 2 A 14 15 248695 CASAVA_Build 11 73810415 2I CCTTTCCTTC --/AA AGACACCTAC 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 1 3 248696 CASAVA_Build 11 73813150 1I TCAACTTTTT -/G GGGACCCTGA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 G 3 4 248697 CASAVA_Build 11 73818008 1I GCAAAAAGGA -/T TTGCACATCA 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 T 2 3 248698 CASAVA_Build 11 73821638 1I CTATGGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 9 13 T 13 14 248699 CASAVA_Build 11 73827996 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 8 9 248700 CASAVA_Build 11 73828796 1D CTACTGAATA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 48 21 18 10 T 8 7 248701 CASAVA_Build 11 73829759 7I GCTAAAGAGC -------/AGTGAAG ATCCTACTGC 3070 het 3070 ref 48 31 13 5 AGTGAAG 0 1 248702 CASAVA_Build 11 73831461 3I TCGGGCCAAG ---/CAC CGTTCTGGGG 3070 hom 138 het 51 0 44 7 CAC 0 1 248703 CASAVA_Build 11 73835302 2D GACTCTAAAC AA/-- GTGTGCTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 2 0 248704 CASAVA_Build 11 73837821 1D GTGGGGGGAT G/- GGGGGTAGAG 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 G 6 5 248705 CASAVA_Build 11 73866674 1I CAAGTGATAC -/G CCCACCTTGG 3070 hom 72 het 28 0 23 8 G 0 1 248706 CASAVA_Build 11 73872655 2D GGGAGTTTTC AG/-- AGAGAGACTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AG 4 3 248707 CASAVA_Build 11 73881243 1I TGGCTTCAAG -/A CAGCTGCACT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 0 1 248708 CASAVA_Build 11 73890570 3D AGACTCATCC ACG/--- ACAACTTCCA 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 ACG 1 0 248709 CASAVA_Build 11 73892032 1I CCAAAAATAT -/A AAAAAATCAG 3070 het 1201 hom 15 5 9 1 A 6 7 248710 CASAVA_Build 11 73896659 1D TTTGAGAGGC T/- TAAGGTGGGA 3070 hom 79 het 30 0 25 6 T 2 1 248711 CASAVA_Build 11 73898725 2D CAGAGCAAAC TT/-- TTTCCAAATT 3070 het 3070 ref 33 14 14 6 T 5 3 248712 CASAVA_Build 11 73910123 2D GAAGGGAAAC AA/-- GAGATTGTAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 A 2 0 248713 CASAVA_Build 11 73913804 1D CCATAGTTAT G/- TTTGTCTTCC 3070 het 3070 hom 28 11 11 7 G 1 0 248714 CASAVA_Build 11 73914531 6D AACCTTTTTG CCTAGC/------ CCAAATGAAT 3070 het 3070 ref 30 18 11 4 CCTAGC 1 0 248715 CASAVA_Build 11 73918369 1I TTTCTGGTGA -/T TTTTTTTTTT 2414 het 2414 ref 25 9 9 7 T 12 13 248716 CASAVA_Build 11 73918621 1D GTAATCCTCC T/- GCCTCGGCCT 3070 het 3070 ref 22 11 11 0 T 1 0 248717 CASAVA_Build 11 73920492 6I ATTGTAGTTG ------/TCTTTT TCTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TCTTTT 1 2 248718 CASAVA_Build 11 73922864 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1388 het 1388 ref 12 9 3 0 A 11 10 248719 CASAVA_Build 11 73927006 1D GATTCTTCAC T/- TGCTTCAGGC 3070 het 1366 hom 19 3 12 5 T 2 1 248720 CASAVA_Build 11 73928371 3D CCACAAATTC TTA/--- TTATTATTAC 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 TTA 4 3 248721 CASAVA_Build 11 73929351 2D CCAGAGAGAC AG/-- AGAAAATGCT 3070 het 3070 ref 56 32 16 9 AG 2 1 248722 CASAVA_Build 11 73929791 3I TACGCAGCTC ---/AGA AGAAGTGTTA 3070 het 3070 hom 46 21 17 8 AGA 1 2 248723 CASAVA_Build 11 73946019 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2883 hom 18 het 11 0 10 1 A 16 14 248724 CASAVA_Build 11 73952926 15D GCCCCTTGGG AAGCATCTAATTTAA/--------------- AAGCATCTAA 3070 hom 90 het 41 0 31 18 AAGCATCTAATTTAA 3 2 248725 CASAVA_Build 11 73953484 3I GAGTTTCTAT ---/AAA GTAAAAACAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 3 248726 CASAVA_Build 11 73954582 1I TATAAGAAAA -/G GAAGAGACCA 3070 hom 104 het 38 0 33 5 G 1 2 248727 CASAVA_Build 11 73958425 1D TATCACCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 23 het 38 1 30 7 T 10 9 248728 CASAVA_Build 11 73962838 2I AAAAACATAC --/AA AAAAAAAAAA 2248 hom 18 het 9 0 6 3 A 10 12 248729 CASAVA_Build 11 73964282 1I ATTGTTTCCG -/T TTTTTACTTT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 5 6 248730 CASAVA_Build 11 73968059 1D AAAACAACTT A/- AAAAGAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 5 4 248731 CASAVA_Build 11 73968313 2I CCCTGTGGGG --/TC TCTAGCAGCA 3070 hom 116 het 45 0 34 11 TC 1 2 248732 CASAVA_Build 11 73974272 2I GTGAACACTC --/TT TGAGGTCTCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 1 3 248733 CASAVA_Build 11 73976031 1D CTATGTTTCC T/- AAGCTGGACT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 T 1 0 248734 CASAVA_Build 11 73980783 1D CTTCTATCCG A/- AACACTCAGC 3070 hom 117 het 42 0 37 5 A 3 2 248735 CASAVA_Build 11 73988062 1I TCTCAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 2655 het 230 hom 21 1 10 10 T 17 18 248736 CASAVA_Build 11 73998107 1I GGACTTTTGC -/T CTGTTGGCCA 1122 hom 7 het 4 0 3 1 T 0 1 248737 CASAVA_Build 11 74002124 1D CAGGATCAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 98 het 42 0 32 10 T 9 8 248738 CASAVA_Build 11 74006930 3I TTATCAAAAA ---/AAG CAAGAATATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAG 0 1 248739 CASAVA_Build 11 74013967 1I AGGAGGAATG -/T TTTCTGAATA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 3 4 248740 CASAVA_Build 11 74036109 2I CTGCAAGGTC --/TT TCTCCCACAT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 1 3 248741 CASAVA_Build 11 74043543 1I AAAAGCAAGA -/C CAACAATTCA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 C 1 2 248742 CASAVA_Build 11 74045438 4D TATTTCAGGG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 20 5 T 16 12 248743 CASAVA_Build 11 74046214 4D CTGATTGCAT AAAC/---- AAACAAAAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 6 AAAC 2 1 248744 CASAVA_Build 11 74071187 1I ACAGTCTCGT -/C CCTCAGGGCT 3070 hom 66 het 30 0 21 9 C 2 3 248745 CASAVA_Build 11 74074349 3D GTGCAGGCTC CTT/--- CTTGAAAGGG 3070 het 3070 ref 46 22 19 7 CTT 2 1 248746 CASAVA_Build 11 74083790 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2409 het 2295 hom 23 7 10 6 A 12 13 248747 CASAVA_Build 11 74086980 6I TAAGCCATGC ------/TGGTCT TAAACTCCTG 1280 het 1280 ref 17 12 3 2 TGGTCT 0 1 248748 CASAVA_Build 11 74104725 1D TTTCATTAAT A/- GGGGTAGACT 3070 hom 21 het 10 0 8 3 A 1 0 248749 CASAVA_Build 11 74109296 3D CTCATGCCTC CTT/--- CTCATTTTCC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 CTT 1 0 248750 CASAVA_Build 11 74113693 1I TCTTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 26 2 19 5 T 13 14 248751 CASAVA_Build 11 74114303 1I TGATAAAAGG -/T TTTTTTTATG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 7 8 248752 CASAVA_Build 11 74117222 3D GTTCTGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 96 het 44 0 31 15 TTG 7 6 248753 CASAVA_Build 11 74131250 1I ACAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1738 het 425 hom 18 3 7 8 A 17 18 248754 CASAVA_Build 11 74157729 5D GCCTCAAAAG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 AAACA 3 2 248755 CASAVA_Build 11 74163073 1I AGAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 9 het 31 1 26 4 A 9 10 248756 CASAVA_Build 11 74246353 2D CAGAATATAC AT/-- AGTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 45 20 23 4 AT 1 0 248757 CASAVA_Build 11 74275241 1D AACACGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 11 10 248758 CASAVA_Build 11 74287205 2D CCTACAAGAA AC/-- ACACCTCATC 3070 hom 69 het 27 0 24 5 AC 3 2 248759 CASAVA_Build 11 74303002 2I TAGAAGTGAC --/AT ATAAAATATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 1 2 248760 CASAVA_Build 11 74304403 3D CTGTTGATAC AAT/--- AATACTAGCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAT 2 1 248761 CASAVA_Build 11 74318171 1I CAAGACTCTC -/T TTTTGCCTGC 3070 hom 70 het 26 0 23 3 T 4 5 248762 CASAVA_Build 11 74334311 1I CATAACCCCT -/A GGTTACATTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 0 1 248763 CASAVA_Build 11 74341911 1D TTTAATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2910 hom 35 10 13 12 T 15 14 248764 CASAVA_Build 11 74349196 1I GATTAACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1398 hom 40 4 24 12 T 14 15 248765 CASAVA_Build 11 74349298 1I TTTCCTGTTC -/T TTTGTGTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 3 4 248766 CASAVA_Build 11 74355467 1I TTTTGTTTTC -/G TTTTTTTTGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 0 1 248767 CASAVA_Build 11 74356131 1I TATTTATAAT -/A GTAGGGACTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 0 1 248768 CASAVA_Build 11 74361587 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 5 A 1 0 248769 CASAVA_Build 11 74362805 1I TTTGTAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 38 2 29 7 T 11 12 248770 CASAVA_Build 11 74374269 2D CAAACAACCC CT/-- GTGTTCAGGT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 CT 1 0 248771 CASAVA_Build 11 74385814 1D TTCTCTCTAG C/- CATGAAAGTC 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 C 2 1 248772 CASAVA_Build 11 74392886 1I ATATGAAAGT -/G CCAGTTTCTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 0 1 248773 CASAVA_Build 11 74395736 2I AATAATGCTC --/AG AGTTCTGTAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AG 1 2 248774 CASAVA_Build 11 74397251 1D TATCAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 30 4 16 10 T 15 14 248775 CASAVA_Build 11 74400428 1D GCTTGCAACC A/- AAAGAATTTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 4 A 4 3 248776 CASAVA_Build 11 74409413 9D ATGAAAACGG ACTAATACA/--------- ACTAATACAC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 ACTAATACA 2 1 248777 CASAVA_Build 11 74430517 1D TATCCTAAGG A/- AAAAAAAAAA 1974 hom 26 het 20 0 9 11 A 15 14 248778 CASAVA_Build 11 74437012 1D CCCCTTTACC T/- TAAGTTTATG 3070 het 3070 ref 27 14 8 6 T 2 1 248779 CASAVA_Build 11 74443172 1D TCAAGTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 11 10 248780 CASAVA_Build 11 74445241 1D TGAAAGAGTC A/- AAAAGCTTTT 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 A 5 4 248781 CASAVA_Build 11 74445798 5D TATTCTCACT TTCCG/----- TTGATCCTCA 3070 het 3070 hom 45 22 23 3 TTCCG 1 0 248782 CASAVA_Build 11 74450184 7D TAATAATAAT AAAATAA/------- AAAATAAAAA 1440 het 924 hom 7 2 5 1 AAAATAA 3 2 248783 CASAVA_Build 11 74455458 1I AAAGAGATTG -/A AAGGGGAAAA 3070 hom 96 het 40 0 36 4 A 2 3 248784 CASAVA_Build 11 74468145 1D TTTTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 13 12 T 13 12 248785 CASAVA_Build 11 74479540 2D GGGATTTCCT CA/-- CACACACACT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 CA 5 4 248786 CASAVA_Build 11 74482498 22D TTTCTTTTTC TTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------- TTTTTTTTTT 1787 het 686 hom 15 6 7 11 TTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT 1 0 248787 CASAVA_Build 11 74488601 2I AGGAAGAAAG --/AA AAAAGAAAGA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 4 6 248788 CASAVA_Build 11 74491800 34D TCCGTCTGAA ATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------- ATATATATAT 1644 het 70 hom 5 1 4 0 AT 26 9 248789 CASAVA_Build 11 74507218 1I CGTCTCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2773 hom 30 11 10 9 A 10 11 248790 CASAVA_Build 11 74517768 1I GAATGTGACT -/G GGGGCTACAC 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 G 4 5 248791 CASAVA_Build 11 74530698 2I TAAGACAGAC --/AG AGAAATATGA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 AG 1 2 248792 CASAVA_Build 11 74531080 1D GCCTCTTACC A/- ACTGTGTGAC 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 A 2 1 248793 CASAVA_Build 11 74533356 3D GAGCAGGGCC CTT/--- CTTCCAAATT 1767 het 1767 ref 22 15 6 1 CTT 2 1 248794 CASAVA_Build 11 74551403 9D CCACAATGGG CACAGAAAA/--------- CACACCTGGA 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 CACAGAAAA 1 0 248795 CASAVA_Build 11 74554124 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2950 het 1347 hom 37 10 13 14 A 18 17 248796 CASAVA_Build 11 74557800 1I ACAGTACCTT -/C CCCCCGGGGT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 5 6 248797 CASAVA_Build 11 74639072 1I TCTTCTACCT -/G GAAGGTCTGT 3070 hom 45 het 18 0 14 4 G 1 2 248798 CASAVA_Build 11 74647095 1I TGCACCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 12 13 248799 CASAVA_Build 11 74653691 1D CCAAGAAAAG A/- AGGGGCTTAT 2985 het 2985 ref 37 21 10 7 A 2 1 248800 CASAVA_Build 11 74662042 5D GCGAGGCAGC TGGGG/----- TGGGGTGGGG 3070 hom 51 het 22 0 13 10 TGGGG 4 3 248801 CASAVA_Build 11 74662389 6D GGAGGGGCAC CCCATG/------ TTGGGTCTAA 3070 hom 141 het 49 0 45 5 CCCATG 1 0 248802 CASAVA_Build 11 74664907 1I CAGGGCCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 279 hom 51 2 35 14 A 9 10 248803 CASAVA_Build 11 74665804 1D CCAAAGCCTT C/- CCCTCAAGGA 3070 het 3070 ref 32 17 9 7 C 4 3 248804 CASAVA_Build 11 74718985 1I GAAAGAAAGC -/T ATAAGCACAG 3070 het 3070 hom 34 14 20 0 T 0 1 248805 CASAVA_Build 11 74720793 1D CTACCTACCC A/- AAATCCTGTA 3070 het 2690 hom 24 9 10 5 A 4 3 248806 CASAVA_Build 11 74723622 1D GCTTGGAAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2905 hom 21 10 9 2 T 10 9 248807 CASAVA_Build 11 74780886 1I ATCATTGGCA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 6 7 248808 CASAVA_Build 11 74782008 1I GCTGGAGTGC -/A AGAGGCACGA 3070 het 156 hom 15 2 9 4 A 1 2 248809 CASAVA_Build 11 74783196 4I CGACTTCAAT ----/TCTC TCTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 TC 2 4 248810 CASAVA_Build 11 74792309 2I GGACCACAAA --/GT GTGGGTAATT 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 GT 1 2 248811 CASAVA_Build 11 74797183 1I AAAAAAAAAA -/C CCCAGATTTG 3070 het 2652 hom 21 8 8 5 C 3 4 248812 CASAVA_Build 11 74813734 2D GGATTATGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 12 10 248813 CASAVA_Build 11 74813970 1D GTCTGGGCTG T/- TTGATGGGAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 3 2 248814 CASAVA_Build 11 74814895 1I TGATCCGCCC -/T GCCTTGGCCT 2958 hom 6 het 9 0 7 2 T 0 1 248815 CASAVA_Build 11 74835039 1D CAGGACTCCA G/- GAAGGCCCCA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 G 2 1 248816 CASAVA_Build 11 74877875 1I AAAAAATTAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 8 9 248817 CASAVA_Build 11 74882062 2D GTTAAACTCT TC/-- TCTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 TC 2 1 248818 CASAVA_Build 11 74882926 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 585 het 500 hom 23 3 5 15 AG 2 1 248819 CASAVA_Build 11 74886248 2I ACCCTCTCTC --/TT GGCGCCTGCA 3070 het 3070 hom 25 12 9 4 T 0 2 248820 CASAVA_Build 11 74887538 13I ACCTTACATG -------------/CTTTATCTCATAT AGTCTGTTGA 3070 hom 102 het 36 0 34 3 CTTTATCTCATAT 0 1 248821 CASAVA_Build 11 74910495 4D GGGAGGAACC ACAA/---- ACAAAGGGGC 3070 hom 75 het 31 0 23 9 ACAA 2 1 248822 CASAVA_Build 11 74912374 2I GAAAGGAGAT --/CA CACAGGTGTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CA 2 3 248823 CASAVA_Build 11 74920075 2I CCAACAGGGA --/GG GGGGATGGGC 3070 hom 32 het 13 0 10 3 G 4 6 248824 CASAVA_Build 11 74920853 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 35 2 26 7 A 11 12 248825 CASAVA_Build 11 74922046 1D ACAAGTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 16 0 10 6 T 12 11 248826 CASAVA_Build 11 74922349 1I GTCTCAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 C 0 1 248827 CASAVA_Build 11 74954309 4D TGGACACAGG ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 93 het 40 0 30 12 AC 8 6 248828 CASAVA_Build 11 74955689 3I CGTTCAGGGG ---/TCC TCCTCCTCCT 3070 hom 60 het 28 0 18 10 TCC 5 6 248829 CASAVA_Build 11 74956999 1D AGAAAAAGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 22 0 12 10 A 10 9 248830 CASAVA_Build 11 74973785 2D TCTCTTTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TG 10 9 248831 CASAVA_Build 11 74982680 1D CCTTCTAGGG A/- GGATTAGCTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 4 A 1 0 248832 CASAVA_Build 11 75010396 1I AAGAAGACAC -/A AAACTGTCAT 3070 hom 92 het 35 0 31 4 A 3 4 248833 CASAVA_Build 11 75077745 2I CACCCCCCCA --/AC ACACACACAC 3070 hom 55 het 40 1 29 10 AC 6 7 248834 CASAVA_Build 11 75079463 2D AAATGGACAG GC/-- AGAGAGAATA 3070 het 3070 hom 41 20 16 5 GC 1 0 248835 CASAVA_Build 11 75086414 1I TTATTAAAGA -/C AAGGTCTTGC 3070 hom 89 het 37 0 30 7 C 0 1 248836 CASAVA_Build 11 75093260 4D TAAAAATACT AAAA/---- AAAAAAAAAA 2058 hom 18 het 12 0 7 5 A 22 18 248837 CASAVA_Build 11 75096495 4D TTCATCCATT CATG/---- CATGCATGCA 3070 hom 54 het 22 0 16 6 CATG 5 4 248838 CASAVA_Build 11 75098651 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 119 hom 28 1 22 5 A 12 11 248839 CASAVA_Build 11 75099697 3I TAATGTATAT ---/AGA AGAATTTATA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 AGA 1 2 248840 CASAVA_Build 11 75151407 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 14 3 A 14 13 248841 CASAVA_Build 11 75246481 1D GTACTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 2126 het 2126 ref 57 31 7 19 T 13 12 248842 CASAVA_Build 11 75261065 1I CCTCGTATAC -/A AAAGTGATCT 3070 hom 44 het 24 0 13 11 A 3 4 248843 CASAVA_Build 11 75313245 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTGT 1643 hom 10 het 9 0 4 5 T 9 8 248844 CASAVA_Build 11 75324454 1D CAGTACTCCC A/- AAATAAATCA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 4 3 248845 CASAVA_Build 11 75384194 1D TGTCATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 10 A 15 14 248846 CASAVA_Build 11 75384938 1D TAACATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 39 2 27 10 A 12 11 248847 CASAVA_Build 11 75435625 1I CTTGTAGAAC -/A ATTTTGTTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 1 2 248848 CASAVA_Build 11 75470631 1D GAACCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 2462 het 2417 hom 26 12 7 8 A 17 16 248849 CASAVA_Build 11 75495622 7D TTTGATGGGC TGATTAA/------- ACTGATTAAA 3070 het 3070 hom 47 20 24 9 TGATTAA 1 0 248850 CASAVA_Build 11 75536702 1I CTACTAAAAA -/T AAAAAAAATA 1083 hom 10 het 6 0 4 2 T 0 1 248851 CASAVA_Build 11 75540560 1I CTAGAATCTT -/C CCCCCCTAAC 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 C 6 7 248852 CASAVA_Build 11 75541378 1D GCGTTGATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 9 10 T 10 9 248853 CASAVA_Build 11 75558456 1I CTCCGCTGCA -/G GCTCAGGGCC 3070 het 2521 hom 29 12 11 6 G 1 2 248854 CASAVA_Build 11 75559361 7I GTGTTTTCCA -------/GGCTCAG GCTGGGAGGA 3070 het 3070 hom 22 11 8 3 GGCTCAG 0 1 248855 CASAVA_Build 11 75565540 1D CAACCCAGGA G/- GGGGCCCCTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 G 5 4 248856 CASAVA_Build 11 75573160 1I TGCCTGAAGA -/G GGGGGAGATC 3070 hom 91 het 35 0 28 7 G 5 6 248857 CASAVA_Build 11 75578744 1I CTGAGGGCAC -/A GGGGGAGGGG 2609 het 699 hom 20 3 10 7 A 0 1 248858 CASAVA_Build 11 75585087 1D CACCCATGAA C/- CCATCCCTCC 3070 het 3070 ref 55 29 16 11 C 3 2 248859 CASAVA_Build 11 75595467 1I GAACCGGAGA -/C CCCAGGAGAG 3070 hom 41 het 18 0 12 6 C 3 4 248860 CASAVA_Build 11 75595565 1I GACAGACGCA -/G ACCTGGGACG 1704 het 1704 ref 21 12 5 4 G 0 1 248861 CASAVA_Build 11 75600871 1I GAAAGACAGT -/G GGGCTTGGGG 3070 het 3070 ref 43 19 13 11 G 3 4 248862 CASAVA_Build 11 75601248 1D TCTCACCCAC A/- AAATGGGAAT 3070 het 3070 hom 29 12 13 6 A 4 3 248863 CASAVA_Build 11 75612354 1I AAAAAAAAAA -/C AACAAAACTA 3070 hom 36 het 36 1 29 6 C 0 1 248864 CASAVA_Build 11 75612966 1D ACATTCTCAT A/- AAAAAACACC 3070 hom 102 het 41 0 34 9 A 7 6 248865 CASAVA_Build 11 75624433 1I CCTCTTCGAA -/T TGTGCCAGGT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 1 2 248866 CASAVA_Build 11 75627003 2D GTAATTAGAG AC/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 108 het 42 0 35 8 AC 1 0 248867 CASAVA_Build 11 75631882 1I ATGCAGGTGG -/A CAGAGCCCAG 3070 hom 100 het 39 0 28 11 A 0 1 248868 CASAVA_Build 11 75641009 2D GGCATGATGT GA/-- GAGATCCAGC 3070 hom 81 het 29 0 24 6 GA 3 2 248869 CASAVA_Build 11 75644309 1I GCCTCACCCC -/T TGGTGGGGTT 3070 hom 84 het 32 0 26 6 T 1 2 248870 CASAVA_Build 11 75652969 2I ATATATACAT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 1394 hom 18 4 12 2 AG 8 9 248871 CASAVA_Build 11 75655657 1I GTCTTATCTG -/A AAAAAAAATG 2571 het 2571 ref 33 20 7 6 A 8 9 248872 CASAVA_Build 11 75669158 1I ACCACTTGTT -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 6 7 248873 CASAVA_Build 11 75679681 1D AGTTTTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 13 12 248874 CASAVA_Build 11 75683269 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 540 het 214 hom 4 1 2 1 A 12 11 248875 CASAVA_Build 11 75689337 1I ACCATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 34 20 4 10 T 13 14 248876 CASAVA_Build 11 75715257 4D AAAAAAACCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 86 het 31 0 29 2 AAAC 3 2 248877 CASAVA_Build 11 75752282 4I TCCAGGGGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 TTTG 3 4 248878 CASAVA_Build 11 75763079 1D TTCATTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 565 hom 39 4 26 9 A 15 14 248879 CASAVA_Build 11 75778161 1D GGCAGCAAGG C/- TGGGACAGAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 C 1 0 248880 CASAVA_Build 11 75786017 10D TTATGGCTGA ATAACATTCC/---------- ATTGTGTGAA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 ATAACATTCC 1 0 248881 CASAVA_Build 11 75796635 1I TCTGTATGCT -/A AAAACAAACC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 4 5 248882 CASAVA_Build 11 75802539 1I ATAATGATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 129 het 49 0 43 6 A 9 10 248883 CASAVA_Build 11 75803368 1I AAAATAGTCT -/C CAAGGCTTAT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 C 1 2 248884 CASAVA_Build 11 75804232 1D TCATACTGTT C/- TTTCAAAGAG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 C 1 0 248885 CASAVA_Build 11 75810879 1I GGAAGGTAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 T 9 10 248886 CASAVA_Build 11 75818059 1D AAAAAGGGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 54 20 25 10 T 10 9 248887 CASAVA_Build 11 75835042 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 1270 het 1270 ref 20 8 8 4 TA 6 7 248888 CASAVA_Build 11 75838750 2D GTACATTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2518 het 1753 hom 47 11 11 25 T 16 14 248889 CASAVA_Build 11 75839036 4D TGTTTCCTGA AACT/---- AACTATTTCC 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 AACT 2 1 248890 CASAVA_Build 11 75858025 1D GCATTGTGCT C/- CAGGAAGCTA 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 C 2 1 248891 CASAVA_Build 11 75877217 1D ATTTATGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 39 1 28 10 T 10 9 248892 CASAVA_Build 11 75888769 1D AGCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2877 het 2877 ref 30 14 9 8 A 16 15 248893 CASAVA_Build 11 75899816 1D AATTACTTTC T/- TTTTAAGAGA 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 T 5 4 248894 CASAVA_Build 11 75909501 4D GTATAAAACT TAAG/---- TAAGGAATAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TAAG 2 1 248895 CASAVA_Build 11 75929426 1D TGACTTTTCT A/- AACAGGAAGT 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 A 3 2 248896 CASAVA_Build 11 75939053 1I AATGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 9 10 248897 CASAVA_Build 11 75951854 1D TGGAAGATAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 9 8 248898 CASAVA_Build 11 75980844 1D GGTATAGACA G/- GATGGCTCAG 3070 hom 90 het 32 0 29 3 G 2 1 248899 CASAVA_Build 11 75987526 1D TCAACAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 13 6 A 13 12 248900 CASAVA_Build 11 76001336 4D TTGCCTTTTT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 59 het 36 0 19 18 TTCC 6 5 248901 CASAVA_Build 11 76001405 1D TTTTTATTTT A/- TTTTTTTTCA 2545 het 2545 ref 22 9 8 5 A 1 0 248902 CASAVA_Build 11 76008606 1I CAGGAAACTC -/T TGGATGATGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 1 2 248903 CASAVA_Build 11 76009172 2D TTATGAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 14 12 248904 CASAVA_Build 11 76018831 1I CACCTTGTCT -/G TCTCCAGGAC 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 G 0 1 248905 CASAVA_Build 11 76027364 1I CTCTGTGCCT -/G GGTTGGCCAA 3070 hom 123 het 48 0 38 10 G 2 3 248906 CASAVA_Build 11 76030097 1I AATAGATTTC -/T TTTTTTTTTG 1465 het 1465 ref 19 14 4 1 T 9 10 248907 CASAVA_Build 11 76030408 3D ATGGTTTAAG ACA/--- ACAAGTTTCA 3070 hom 126 het 45 0 43 4 ACA 2 1 248908 CASAVA_Build 11 76037287 1I TTGATACGTA -/T ATCACCATTT 3070 hom 148 het 57 0 50 7 T 0 1 248909 CASAVA_Build 11 76040770 1D GAAAAGTGAG A/- CCTTGGAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 1 0 248910 CASAVA_Build 11 76050478 3D ATAGACAGAT AGA/--- AGGACAAATA 3070 het 3070 hom 24 7 17 0 AGA 1 0 248911 CASAVA_Build 11 76083389 1I GTGACCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 10 11 248912 CASAVA_Build 11 76091898 1D CCCTATTGAG T/- TTGGGGGTAT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 3 2 248913 CASAVA_Build 11 76094309 12I TGTCCAACAA ------------/AAGCAGAGACAC AAGCTTTACA 3070 het 3070 hom 55 16 23 16 AAGCAGAGACAC 0 1 248914 CASAVA_Build 11 76100605 12D TTTTTGCTGA AATAATGAACAT/------------ AATAATCAAT 1863 het 205 hom 5 1 4 3 AATAATGAACAT 1 0 248915 CASAVA_Build 11 76153392 2D CTCTGGACTC CA/-- GTGTGTCCTT 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 CA 1 0 248916 CASAVA_Build 11 76165844 2I TTTTAGGTTT --/TC TCTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 TC 2 3 248917 CASAVA_Build 11 76168494 1I AGGCCAAGGC -/A AGGAGGACTG 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 A 1 2 248918 CASAVA_Build 11 76180203 4D TAGGGACTTG GTGT/---- CCTGTGTCCC 3070 het 3070 ref 36 18 11 8 GT 2 0 248919 CASAVA_Build 11 76188684 1D GACCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1081 het 1000 hom 21 6 4 11 A 19 18 248920 CASAVA_Build 11 76236480 1I GACTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 805 hom 51 2 38 11 T 10 11 248921 CASAVA_Build 11 76237403 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 23 3 AAAG 1 0 248922 CASAVA_Build 11 76243837 14D AAAGCTTTCA AAATTTGGGTTGTT/-------------- AGTCGAAAAT 3070 hom 69 het 23 0 24 3 AAATTTGGGTTGTT 1 0 248923 CASAVA_Build 11 76243969 2D ATGTAACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1176 hom 17 het 20 0 6 14 T 16 14 248924 CASAVA_Build 11 76248152 2D TTGTCCTCTC TT/-- TTACCTTTGA 3070 hom 90 het 32 0 30 4 T 4 2 248925 CASAVA_Build 11 76248844 2I AGTATTAGAC --/TT TTGAAGTTGG 3070 hom 85 het 33 0 27 6 T 2 4 248926 CASAVA_Build 11 76248982 1I AGCAGCATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 9 10 248927 CASAVA_Build 11 76251624 21I GTTTAGAACC ---------------------/AAGGTTTTGGATTCAAATCAA AAGAAAAAAC 3070 hom 75 het 26 0 26 2 AAGGTTTTGGATTCAAATCAA 0 1 248928 CASAVA_Build 11 76253540 1I GATCCACCTG -/C TTCAGCCTCC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 0 1 248929 CASAVA_Build 11 76258366 1D7M1D GGCAACCACC TTTTCTACT/-TTTCTAC- TTTCTGTCTC 3070 hom 101 het 34 0 32 4 N/A 0 0 248930 CASAVA_Build 11 76266622 1D CACAGCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 38 1 30 7 T 11 10 248931 CASAVA_Build 11 76270951 1I CCCGCGTCAA -/C CTGCCAAAGT 3070 hom 24 het 10 0 8 2 C 1 2 248932 CASAVA_Build 11 76277370 10D CCAAAATAGG CAGACCACAA/---------- CATAGTAGCT 3070 hom 129 het 48 0 42 10 CAGACCACAA 1 0 248933 CASAVA_Build 11 76279808 1D AAGACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 12 11 248934 CASAVA_Build 11 76289963 1I TCCAACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 583 hom 37 3 22 12 A 14 15 248935 CASAVA_Build 11 76290741 1D CCTTGTGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 10 9 248936 CASAVA_Build 11 76292187 1D TTATGGCCAA G/- GGGAATCCCA 1985 hom 15 het 8 0 6 3 G 4 3 248937 CASAVA_Build 11 76296048 1D CAAATTTATT G/- TGAAACTAGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 0 248938 CASAVA_Build 11 76297149 4D CCAATAGTAG ACAA/---- ACAGAGAGCC 3070 hom 69 het 26 0 24 3 ACAA 1 0 248939 CASAVA_Build 11 76301263 4I TTGTGATCTC ----/TATT TATAGATTAA 3070 hom 85 het 35 0 29 6 TATT 0 1 248940 CASAVA_Build 11 76301401 4I TTTTCTCTTG ----/TGTT TGTTTATATA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 TGTT 1 2 248941 CASAVA_Build 11 76305226 1D GTTAAAACGG T/- TAAGTGCTGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 2 1 248942 CASAVA_Build 11 76307672 7D TTGGCAAAAT GAACTTG/------- CATTGGGGAA 3070 hom 141 het 49 0 47 4 GAACTTG 1 0 248943 CASAVA_Build 11 76311842 1I AAGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 770 hom 51 2 42 7 A 11 12 248944 CASAVA_Build 11 76316151 1I TTCTATTCTG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 8 9 248945 CASAVA_Build 11 76332442 3D GTGTTGAAGA CCC/--- CCCCCCCCAC 3070 hom 69 het 26 0 23 4 C 11 8 248946 CASAVA_Build 11 76332606 2D ACCTTTGTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 13 11 248947 CASAVA_Build 11 76333192 1I TGGCTGATTC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 7 248948 CASAVA_Build 11 76337773 2I AATAAATGTG --/TA TATCGGAGCA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 TA 1 2 248949 CASAVA_Build 11 76338975 2D AAGCCGGAGT AG/-- AGTCTAAAGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AG 2 1 248950 CASAVA_Build 11 76343284 1D19M1I GTTTGGTTGG TTTTTTTTTTTGTTTTTTGC-/-TTTTTTTTTTGTTTTTTGCT TTTTTTTTTG 3070 het 55 hom 32 1 29 6 N/A 0 0 248951 CASAVA_Build 11 76352007 10I GAAGTTATGC ----------/AGACAGTTTT ATAGATAAGT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 AGACAGTTTT 0 1 248952 CASAVA_Build 11 76352170 3D AACACATTAG ACA/--- ACGAGACCAG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 ACA 1 0 248953 CASAVA_Build 11 76358650 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 10 11 248954 CASAVA_Build 11 76368533 2I ACATTTTATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 26 0 24 2 A 10 12 248955 CASAVA_Build 11 76377728 1D TATTTGCTTT A/- AAAAATGTCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 5 248956 CASAVA_Build 11 76381567 1D TCTCCCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 38 0 22 16 T 12 11 248957 CASAVA_Build 11 76382829 1D TTAAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 32 0 20 12 T 13 12 248958 CASAVA_Build 11 76386372 1I TACTAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 111 het 47 0 37 10 A 8 9 248959 CASAVA_Build 11 76388072 1I TGTGGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 10 11 248960 CASAVA_Build 11 76390853 1D ACCTATCTCT A/- AAATAGTCAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 4 3 248961 CASAVA_Build 11 76414948 1D TCATGTACAC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 7 6 248962 CASAVA_Build 11 76429252 1D GGCGTGCAGC T/- TGCCTGGCGC 527 het 35 hom 13 1 2 10 T 2 1 248963 CASAVA_Build 11 76433756 1D CAACTATAAA T/- TACAAATGAA 3070 hom 88 het 33 0 26 7 T 2 1 248964 CASAVA_Build 11 76436983 1D GAACTCATCC T/- TTTTTATGGC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 6 5 248965 CASAVA_Build 11 76438937 2D TCAACATAAA AC/-- ACCAACAGCA 3070 hom 51 het 20 0 17 5 AC 2 1 248966 CASAVA_Build 11 76443345 1D TTAGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2754 hom 19 het 17 0 12 6 A 17 16 248967 CASAVA_Build 11 76445824 1D TTTGGTGGGT A/- GGGGGCAAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 0 248968 CASAVA_Build 11 76447232 1D CCATCTCCAC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 6 248969 CASAVA_Build 11 76449831 1I TTACAGAAGC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 34 0 27 7 T 8 9 248970 CASAVA_Build 11 76467481 2D TGTACAAGTC TT/-- TTACCTTCTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 2 248971 CASAVA_Build 11 76483950 9I GGGTGTAGGG ---------/CCACCACCT CCAGTCCTCA 2709 het 1887 hom 20 7 7 6 CCACCACCT 0 1 248972 CASAVA_Build 11 76497431 1D ATAAGGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 A 12 11 248973 CASAVA_Build 11 76502431 24I CTGGATGCAG ------------------------/GCTTGTCTTCCCCACTCCACAGGA GTCGACCCAG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 GCTTGTCTTCCCCACTCCACAGGA 0 1 248974 CASAVA_Build 11 76537929 1I GCAGGAGGGA -/C CCCCCCTGAT 2649 het 2649 ref 27 15 7 5 C 6 7 248975 CASAVA_Build 11 76552525 1I GCTAATGGAC -/A TTTTGGGGTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 0 1 248976 CASAVA_Build 11 76568957 16I CTTGTCCTAT ----------------/CTGCCAAATTATTTGG CAAAGTCATG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 CTGCCAAATTATTTGG 0 1 248977 CASAVA_Build 11 76570929 1I GGTGGCCGTA -/G GTGATGAGGG 3070 hom 87 het 34 0 24 10 G 1 2 248978 CASAVA_Build 11 76571380 1I TCCTCTGCAG -/A AAAAAGGATC 3070 het 2647 hom 31 7 12 12 A 5 6 248979 CASAVA_Build 11 76579283 7I CTGGGGCCTG -------/GAGCACT GGGTGCTGGG 183 het 183 ref 42 22 2 18 GAGCACT 0 1 248980 CASAVA_Build 11 76585423 2I CCCTCATGGG --/CT CTCTCATGGG 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 CT 2 3 248981 CASAVA_Build 11 76586635 1D TGTGCTCAGT G/- GTGCACGGGA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 G 2 1 248982 CASAVA_Build 11 76606211 3D GCTTAAGAGT CTA/--- CTACTGCATG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 CTA 2 1 248983 CASAVA_Build 11 76606790 1I TGAGCTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 11 12 248984 CASAVA_Build 11 76607541 1D CGCAATAAAC A/- ATACGTGTGC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 2 1 248985 CASAVA_Build 11 76609804 1D CCCTTTAGCA T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 25 13 7 5 T 7 6 248986 CASAVA_Build 11 76628824 1I TCACAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 10 11 248987 CASAVA_Build 11 76630790 1D AGATAGAGGG A/- AATGTTTTGA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 3 2 248988 CASAVA_Build 11 76643862 1I TATTAATGCT -/A AAAAAAATGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 8 248989 CASAVA_Build 11 76668519 1I CCACCATATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 9 10 248990 CASAVA_Build 11 76669119 1I TTTCGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 A 11 12 248991 CASAVA_Build 11 76671172 1I CATGGCGAAA -/C CCTGTCTCCA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 2 3 248992 CASAVA_Build 11 76685019 1D TTTTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2376 hom 16 5 9 2 T 13 12 248993 CASAVA_Build 11 76689227 1D CACACCTCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 10 9 248994 CASAVA_Build 11 76693047 4I AAAAAGCAAG ----/ACAA ACAAAACTAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ACAA 1 2 248995 CASAVA_Build 11 76694769 1D AATTGTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 22 6 9 8 T 13 12 248996 CASAVA_Build 11 76698882 5D TGTTTTTTGT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 51 het 30 0 18 13 TTTTG 4 3 248997 CASAVA_Build 11 76701520 1I TCAGGGTAAC -/A AAAAAAAAAA 1265 het 1265 ref 58 46 4 8 A 11 12 248998 CASAVA_Build 11 76707593 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAACA 3070 het 2876 hom 24 13 7 4 T 0 1 248999 CASAVA_Build 11 76728184 1D GTAGTGGAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 10 9 249000 CASAVA_Build 11 76731957 1D AAGCTTACGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 511 hom 38 4 26 8 A 17 16 249001 CASAVA_Build 11 76754540 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1719 hom 19 6 11 2 A 13 12 249002 CASAVA_Build 11 76757361 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTTGAG 3070 het 1357 hom 19 4 13 2 A 0 1 249003 CASAVA_Build 11 76762351 2D CATTTTATCC CT/-- GTAAGTGCCC 3070 het 3070 ref 27 13 13 2 CT 1 0 249004 CASAVA_Build 11 76780206 4I TACACACAGA ----/AAGC AAGCCAGTAT 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 AAGC 1 2 249005 CASAVA_Build 11 76783538 10D CTCTGTCTCA AAAACAAAAC/---------- AAAACAAAAC 3070 het 2180 hom 20 6 14 1 AAAAC 4 2 249006 CASAVA_Build 11 76794250 1D GCATGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 11 10 249007 CASAVA_Build 11 76795479 1I ATTTCAAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 49 16 22 11 A 8 9 249008 CASAVA_Build 11 76820996 1I TTAATCTGAT -/A AAAGGCATCT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 3 4 249009 CASAVA_Build 11 76821527 1D AACTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 1226 het 1226 ref 32 29 3 0 A 11 10 249010 CASAVA_Build 11 76826437 1D AATATAGACT A/- AAACAAATCA 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 A 4 3 249011 CASAVA_Build 11 76828266 1D CTTTTCAGAC A/- ATTACAGAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 2 1 249012 CASAVA_Build 11 76836066 1I GACAAAACTT -/G GGAGGCGAAA 3070 het 3070 hom 49 22 20 7 G 2 3 249013 CASAVA_Build 11 76844273 1I AAGCCCAGCC -/T GGGTCCATTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 0 1 249014 CASAVA_Build 11 76848508 1I GCCTGAGCCA -/C CCCCCGCGAG 1103 het 1103 ref 12 5 3 4 C 5 6 249015 CASAVA_Build 11 76849246 1I CCAGGAGCAC -/T TTTTTTTTTT 2136 het 2136 ref 30 17 7 6 T 11 12 249016 CASAVA_Build 11 76858381 1I GTGAAGAGAC -/T TTTTTTTTTT 2696 het 2696 ref 38 16 10 12 T 15 16 249017 CASAVA_Build 11 76861549 1I TCACAACGCC -/A ACACCCACTA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 1 2 249018 CASAVA_Build 11 76865209 1D AAATTGAGGA T/- TTGGGGAAAG 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 T 3 2 249019 CASAVA_Build 11 76870955 27D GTGCTGGGAT TACTGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCC/--------------------------- TATTTTGCTT 2750 het 2750 ref 14 12 8 2 TACTGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCC 1 0 249020 CASAVA_Build 11 76875570 1I TCTAAGCCAC -/A AGGACTGCAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 1 2 249021 CASAVA_Build 11 76901074 1I GTGTGGTCTC -/T TGTGAGCAGG 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 T 1 2 249022 CASAVA_Build 11 76903538 23I AACAATCCTG -----------------------/CAAGGTATATATTGGCTCCATTT CACAGGTGCA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 CAAGGTATATATTGGCTCCATTT 0 1 249023 CASAVA_Build 11 76908696 1I TGGCCTGTGG -/C CCCCCCCCTC 1353 het 1353 ref 22 9 4 9 C 8 9 249024 CASAVA_Build 11 76919337 3I TCCACCCCTC ---/ATT ATACTTCCTG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 ATT 0 1 249025 CASAVA_Build 11 76919647 5I CCAGATTTAA -----/TCTCC TCTGGCTGTA 3070 het 3070 ref 37 21 8 8 TCTCC 0 1 249026 CASAVA_Build 11 76921661 1I AGGCTGAAGT -/G GGAGGATCAC 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 G 2 3 249027 CASAVA_Build 11 76925802 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 A 13 12 249028 CASAVA_Build 11 76954948 3I ACTGTTATTA ---/TCT TCTTGCTAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TCT 1 2 249029 CASAVA_Build 11 76972941 4D TCAATTTTTC TTCT/---- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 36 13 21 3 TTCT 1 0 249030 CASAVA_Build 11 76992634 1D AAAAATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 12 11 249031 CASAVA_Build 11 77032682 1I GCCTTTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 T 10 11 249032 CASAVA_Build 11 77037238 1D CTTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1797 hom 20 4 12 5 T 12 11 249033 CASAVA_Build 11 77051278 1I AAAACAAATT -/A AGTGAACATA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 1 2 249034 CASAVA_Build 11 77057615 2I AACGGCTCTC --/AT ATTTATTTTA 3070 hom 144 het 50 0 49 1 AT 1 2 249035 CASAVA_Build 11 77088115 10I ACAAAAGAAG ----------/AAACTTAAAA AAAACATTAA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AAACTTAAAA 0 1 249036 CASAVA_Build 11 77123002 1D TACTTTTTTT G/- GGGGGGGGTA 1809 het 1809 ref 21 13 5 3 G 9 8 249037 CASAVA_Build 11 77140151 2D TTTATTAAAC AA/-- ATTTAAAATT 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 A 3 1 249038 CASAVA_Build 11 77153829 1D ATAGTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 7 A 11 10 249039 CASAVA_Build 11 77174703 1I AAAAAGAAAC -/A ATCTGCATAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 1 2 249040 CASAVA_Build 11 77177192 1D AAGACAGGTT A/- AAAAAAAAAA 2312 het 1676 hom 30 6 9 15 A 17 16 249041 CASAVA_Build 11 77197051 3I AAACAAAAAC ---/ACA ACAACAACAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 ACA 3 4 249042 CASAVA_Build 11 77204455 3D AAAATAATCC CCA/--- CAATATTTAC 3070 het 3070 hom 43 16 23 5 CCA 1 0 249043 CASAVA_Build 11 77221025 1D ATAGAGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1689 hom 22 6 9 7 T 13 12 249044 CASAVA_Build 11 77241452 1I ATATAAATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 10 14 2 T 8 9 249045 CASAVA_Build 11 77271096 1I GACAAGTCAG -/T ACCCTCTCAA 3070 het 3070 ref 52 27 23 2 T 0 1 249046 CASAVA_Build 11 77287979 1D TTTAGAATTA G/- GGTGCATAAC 3070 het 3070 hom 27 10 10 8 G 3 2 249047 CASAVA_Build 11 77296751 1I28M1I TGGTAAAATG -TTTGATTCATAGCTTTACACTGAAAAGT-/TTTTGATTCATAGCTTTACACTGAAAAGTA ATACTAAGAG 3070 hom 135 het 44 0 46 4 N/A 0 0 249048 CASAVA_Build 11 77297541 1I ATTATTTTTT -/A AAAAGGTATT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 4 5 249049 CASAVA_Build 11 77306781 1I CACAGTTAGA -/T TCTGAATTGT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 1 2 249050 CASAVA_Build 11 77307993 1I TGTTGTTACA -/T TTTTTTTTTT 2459 het 2459 ref 19 7 7 5 T 11 12 249051 CASAVA_Build 11 77314884 1I ACATAGCAGG -/A AAAAAAAAAA 2362 het 2362 ref 25 10 6 9 A 10 11 249052 CASAVA_Build 11 77319511 1D CCATCTCTAT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 15 8 7 1 A 8 7 249053 CASAVA_Build 11 77335609 1I TCAGGAAAAC -/A ATTCATGATC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 1 2 249054 CASAVA_Build 11 77343730 27D GAACTATTTC TTTCTATATTAAGAAATTCTGGGGCTG/--------------------------- GGAGTAGTGG 1966 het 1966 ref 22 16 5 3 TTTCTATATTAAGAAATTCTGGGGCTG 1 0 249055 CASAVA_Build 11 77361113 1D CTCTCAATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 10 9 249056 CASAVA_Build 11 77368874 1D ACATGCCCCC T/- ATCTTTGCTC 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 T 1 0 249057 CASAVA_Build 11 77382341 1I ATTTTGTATT -/A TGTATTAACA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 0 1 249058 CASAVA_Build 11 77386535 1I TCTATATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1879 hom 26 7 15 4 A 12 13 249059 CASAVA_Build 11 77407401 1D AGTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1720 hom 20 4 14 2 A 11 10 249060 CASAVA_Build 11 77416138 1D CTCACTACAA C/- CTCTGCCTCC 3070 hom 39 het 16 0 13 3 C 2 1 249061 CASAVA_Build 11 77421073 1I TGCCTCTTGC -/A AAGGCACAGG 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 A 2 3 249062 CASAVA_Build 11 77421324 8I CAGGCCAGGA --------/CACAAGGC CAGTACTGCC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 CACAAGGC 0 1 249063 CASAVA_Build 11 77429373 1I TTATTATTTT -/A TTTTTTTTTG 3070 hom 43 het 21 0 19 2 A 0 1 249064 CASAVA_Build 11 77444310 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1252 het 1252 ref 12 6 4 2 T 17 16 249065 CASAVA_Build 11 77448742 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2712 het 350 hom 21 1 16 4 A 14 15 249066 CASAVA_Build 11 77449202 1D CCTAAAGTGC T/- TGGGATTACA 3070 hom 35 het 20 0 14 6 T 2 1 249067 CASAVA_Build 11 77453385 3D ATCAGTGACT TTG/--- TTAAGAATTT 3070 het 3070 ref 30 19 10 3 TTG 1 0 249068 CASAVA_Build 11 77457471 3D GAGCAAGACT GTC/--- GTCTCAAAAA 2004 het 21 hom 12 1 8 3 GTC 2 1 249069 CASAVA_Build 11 77460884 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 1557 hom 18 4 11 3 T 6 7 249070 CASAVA_Build 11 77467594 3D AACTTTTGTA TTT/--- TTTTGTAGGG 1968 het 1968 ref 16 7 5 4 T 7 4 249071 CASAVA_Build 11 77469461 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 11 12 249072 CASAVA_Build 11 77482806 2I6M1I GCATATTCTG --AGAGTG-/AAAGAGTGA AAAAAAAAAG 2110 het 2110 ref 16 11 5 1 N/A 0 0 249073 CASAVA_Build 11 77502407 5D ACTCCATCTT AAACA/----- AAAACAAAAA 2078 het 2078 ref 27 15 10 6 AAACA 1 0 249074 CASAVA_Build 11 77506765 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2912 het 760 hom 25 5 12 8 A 15 14 249075 CASAVA_Build 11 77510204 1I ACTTGAGCTT -/G GGGGTCTGAG 3070 hom 39 het 18 0 13 5 G 4 5 249076 CASAVA_Build 11 77511561 1D CGCAAGGGTT A/- AAGACATTCC 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 3 2 249077 CASAVA_Build 11 77511727 2I ATGAGGTCGG --/AA TGCAGCGGCT 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 A 0 2 249078 CASAVA_Build 11 77516022 1D GATGAATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 A 11 10 249079 CASAVA_Build 11 77516407 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 918 het 918 ref 29 15 4 10 T 15 16 249080 CASAVA_Build 11 77529796 3I CCTGGGCTCA ---/AGC AGCAGTCCTC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 AGC 1 2 249081 CASAVA_Build 11 77539986 2D TGTCTTGCTC AG/-- GGGAAGAGAG 3070 het 3070 hom 61 25 30 8 AG 1 0 249082 CASAVA_Build 11 77542326 20D GCCACCACAC CCAGCTAATTTTTGTATATT/-------------------- TGTAGAGACA 3070 het 3070 ref 22 16 10 1 CCAGCTAATTTTTGTATATT 1 0 249083 CASAVA_Build 11 77569354 2I TATACCTATT --/AC AGTGGCTCAT 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 AC 0 1 249084 CASAVA_Build 11 77569594 4I TTCTTGTGAT ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 AGTG 1 2 249085 CASAVA_Build 11 77570530 1D CATAAACAGG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 51 25 22 5 A 8 7 249086 CASAVA_Build 11 77590532 1I GATGGCAGAG -/C CCTTCCCCAT 3070 het 3070 ref 64 35 21 8 C 2 3 249087 CASAVA_Build 11 77591324 1I AACAAAACTT -/C CCGTTATTTA 3070 het 3070 hom 32 14 18 0 C 2 3 249088 CASAVA_Build 11 77597982 3D GCGTGCTGTT GTG/--- AGCATGTACG 3070 het 3070 ref 63 33 24 6 GTG 1 0 249089 CASAVA_Build 11 77601148 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 48 24 15 9 T 6 7 249090 CASAVA_Build 11 77601250 4D TTGAGTCTTC CTAT/---- CTATCTGTGA 3070 het 3070 ref 41 22 17 7 CTAT 2 1 249091 CASAVA_Build 11 77602100 4I CTTGTCAGCT ----/AGTC AGTCAGTCAC 3070 het 3070 ref 33 12 9 12 AGTC 2 3 249092 CASAVA_Build 11 77602305 6D GGGTGTGAAT TCTAAG/------ TCTAAGTCTC 2977 het 2977 ref 20 8 8 4 TCTAAG 2 1 249093 CASAVA_Build 11 77602963 4D CTGGCTGTCC TGTT/---- TGTTTGTTTC 1469 het 1469 ref 14 7 5 4 TGTT 3 2 249094 CASAVA_Build 11 77603192 1I TTAGAGTCCT -/G GATTTTACTG 1349 het 1349 ref 16 6 4 6 G 1 2 249095 CASAVA_Build 11 77603529 9D CCAAGAGCCC TCTACTGAA/--------- TCTACTGAAG 1983 het 1983 ref 38 23 8 9 TCTACTGAA 2 1 249096 CASAVA_Build 11 77605834 4I TTCCCTGATC ----/ATTA CCCCACTCCT 3070 het 3070 hom 48 17 20 11 ATTA 0 1 249097 CASAVA_Build 11 77625470 1D ACTTTGATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 10 9 249098 CASAVA_Build 11 77630817 2D AATCAGTAAC AA/-- GAGGAAATTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 2 0 249099 CASAVA_Build 11 77633086 4D ATTCTGTCTC AAAA/---- GAAAGAAAAA 3070 het 2484 hom 22 8 10 5 A 4 0 249100 CASAVA_Build 11 77633270 1D ACTCAACAGC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 9 8 249101 CASAVA_Build 11 77634020 1I TTTTGAAAAG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 6 7 249102 CASAVA_Build 11 77638543 1D AAATTGACTG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 26 10 9 7 T 9 8 249103 CASAVA_Build 11 77639808 2D AGTTGAAATT TA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 TA 1 0 249104 CASAVA_Build 11 77640437 3D CCTGGACTTG CTT/--- CTTCTTCTGT 3070 het 3070 ref 67 39 25 6 CTT 3 2 249105 CASAVA_Build 11 77645704 1D TTTTAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 11 10 249106 CASAVA_Build 11 77647300 1I TAATTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 T 10 11 249107 CASAVA_Build 11 77649772 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 TG 5 6 249108 CASAVA_Build 11 77652058 4D CCGGGCGCAG TCAC/---- TCACACCTGT 3070 het 3070 ref 29 10 12 7 TCAC 2 1 249109 CASAVA_Build 11 77652594 1D CTCCTGTCAA T/- TTTTTTTTTT 2844 het 1565 hom 23 6 9 9 T 17 16 249110 CASAVA_Build 11 77653101 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2974 hom 34 10 14 11 T 11 10 249111 CASAVA_Build 11 77653270 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1283 het 1283 ref 14 5 4 5 T 11 12 249112 CASAVA_Build 11 77653898 6D TCTATACCAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 3 het 23 1 14 10 AT 10 7 249113 CASAVA_Build 11 77657733 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 10 9 249114 CASAVA_Build 11 77662119 1I ATTTTGGAGC -/T TTTAAGATTT 3070 het 2624 hom 20 6 11 3 T 3 4 249115 CASAVA_Build 11 77662697 1D ATTAAACCTG T/- TTTTTTTTTT 2421 het 2421 ref 31 15 7 9 T 11 10 249116 CASAVA_Build 11 77667273 1D GTTTTCACCA T/- TATTGGTCAG 1025 het 1025 ref 18 12 3 3 T 2 1 249117 CASAVA_Build 11 77667420 1D AACATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2843 het 2843 ref 28 12 12 4 T 11 10 249118 CASAVA_Build 11 77667685 1I CCTCTACCAC -/T TTTTTTTTAC 2733 het 2289 hom 23 5 9 9 T 8 9 249119 CASAVA_Build 11 77675327 5I TAATAAAACT -----/TAAAA TATACGTAAG 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 TAAAA 0 1 249120 CASAVA_Build 11 77676066 1I TCAACCTCCT -/G GGCTCAAGTG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 2 3 249121 CASAVA_Build 11 77676344 1I GCTCTTATCA -/T TTTTTTTTTT 2200 het 1199 hom 29 4 12 13 T 17 18 249122 CASAVA_Build 11 77676501 1I CACTGCCACA -/C CTGGCTAATT 3070 het 2773 hom 22 7 12 3 C 1 2 249123 CASAVA_Build 11 77679777 1I AAGAAGTGGT -/G GGCAGGATTT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 G 2 3 249124 CASAVA_Build 11 77682607 6D TATGAGTCTT TTTTTA/------ TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 TTTTTA 3 2 249125 CASAVA_Build 11 77691918 1D TGGTTTAGGC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 8 7 249126 CASAVA_Build 11 77707798 1D TCAGCCTCTG A/- AACAAGGCTG 3070 het 3070 ref 38 13 13 12 A 3 2 249127 CASAVA_Build 11 77708566 2I AGAAACAGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2503 hom 38 8 18 12 T 14 16 249128 CASAVA_Build 11 77711718 1I CACTCATATG -/T TTTATTGCAG 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 3 4 249129 CASAVA_Build 11 77725172 4D GTAATAGTTG TTGT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 894 hom 25 6 12 9 TTGT 1 0 249130 CASAVA_Build 11 77735272 10I GCTGCCTGAG ----------/AAGAGAAGAC AAGAGAAGAG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 AAGAGAAGAC 0 1 249131 CASAVA_Build 11 77750563 6D AAACTTATCC TAGAGA/------ TAAACTAACA 3070 het 3070 ref 37 22 11 7 TAGAGA 1 0 249132 CASAVA_Build 11 77750776 1D ATTATGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 13 12 249133 CASAVA_Build 11 77768532 1I AAGATCTTCT -/A AGTAAGACCA 3070 het 3070 hom 45 17 27 1 A 1 2 249134 CASAVA_Build 11 77768908 1I GAATGAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 19 8 T 13 14 249135 CASAVA_Build 11 77770369 1I GTAAATAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 11 12 249136 CASAVA_Build 11 77776741 1D TGACTCCGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2958 hom 31 13 12 6 T 14 13 249137 CASAVA_Build 11 77799687 1I TACAAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 11 12 249138 CASAVA_Build 11 77811808 6I CCCTGGAACT ------/TAAAAA TAAATTAAAA 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 TAAAAA 0 1 249139 CASAVA_Build 11 77831316 2D GTAAAGTCTT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 17 6 TC 1 0 249140 CASAVA_Build 11 77835740 1D GACATTTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 A 10 9 249141 CASAVA_Build 11 77835864 1I TGTTAGTGTT -/G TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 G 0 1 249142 CASAVA_Build 11 77836727 2D TTAAAATAAC TA/-- AGAGTAAATT 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 TA 1 0 249143 CASAVA_Build 11 77839597 1I GCAGGCCTCT -/A AACTCCTGAC 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 2 3 249144 CASAVA_Build 11 77847183 5D AATACACAGA GGTGG/----- GGTGGGGACT 3070 het 3070 ref 43 23 12 9 GGTGG 2 1 249145 CASAVA_Build 11 77855663 1D GCTTCCAGGG T/- TAGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 T 2 1 249146 CASAVA_Build 11 77858470 2I GAGAGAGAGA --/GC GAGCGAGAGA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 GC 0 1 249147 CASAVA_Build 11 77860215 1I TTGAACTATC -/T TTTTTTTTTC 2287 het 1622 hom 16 6 6 4 T 9 10 249148 CASAVA_Build 11 77863822 1I CTACTTCTGT -/A AGTGTTAACT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 1 2 249149 CASAVA_Build 11 77869389 1D CAACTAATTT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 1742 hom 17 5 8 4 G 8 7 249150 CASAVA_Build 11 77880084 1I TTGTGTGGCC -/A GAATGCCCCT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 A 0 1 249151 CASAVA_Build 11 77881722 6D TTTTAATGTC ACAGAT/------ ACCTGGTATT 2022 het 2022 ref 23 15 7 4 ACAGAT 1 0 249152 CASAVA_Build 11 77885430 4I TAATGAGAAT ----/GATA GATATATTCT 3070 het 3070 hom 54 25 26 3 GATA 1 2 249153 CASAVA_Build 11 77900416 1D GTCTCCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2115 het 2115 ref 15 8 5 2 A 13 12 249154 CASAVA_Build 11 77913081 3D TAATTTATTC CAA/--- CAACAACAGT 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 CAA 3 2 249155 CASAVA_Build 11 77929181 1D AATGGAAAAC T/- TATTTGACCT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 T 2 1 249156 CASAVA_Build 11 77955665 4I TCATCCATTC ----/TTTT TAAGTCTTGT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 1 5 249157 CASAVA_Build 11 77957818 1I TTTTGCAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 9 249158 CASAVA_Build 11 78077466 1I CAGGACTTAG -/C CTAGATAAAT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 C 1 2 249159 CASAVA_Build 11 78078168 1I CCCTACTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 31 2 19 10 T 11 12 249160 CASAVA_Build 11 78083496 3D ACTGGAATTC AGA/--- AGGTTTTCCT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 AGA 1 0 249161 CASAVA_Build 11 78084466 1D TATAAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 906 hom 31 3 19 9 T 13 12 249162 CASAVA_Build 11 78085174 4D TGGTAGAGCC TGAG/---- TGAGTGATAG 3070 hom 106 het 41 0 36 8 TGAG 2 1 249163 CASAVA_Build 11 78097659 5D TTTCTTTTTC TTTCT/----- TTTTTTTTTT 598 het 10 hom 11 0 4 8 TTTCT 1 0 249164 CASAVA_Build 11 78106983 1I AAGTGATTCA -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 101 het 39 0 33 6 T 6 7 249165 CASAVA_Build 11 78108094 5I TTTACTACTT -----/ATATA ATAAATATAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 ATATA 0 1 249166 CASAVA_Build 11 78115464 1I CCGCTTTGCC -/T TCTGTCATGA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 1 2 249167 CASAVA_Build 11 78117685 1I ACTGCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 536 hom 41 2 32 7 A 11 12 249168 CASAVA_Build 11 78117917 1D CATTCTTTTA G/- GTCCTGGCCA 3070 hom 107 het 38 0 34 4 G 2 1 249169 CASAVA_Build 11 78133578 1D AATCTCTTAG T/- TAACTTTTTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 1 249170 CASAVA_Build 11 78150392 1D TCTTAGCACA C/- CCCCCCAGCC 3070 hom 87 het 39 0 29 10 C 7 6 249171 CASAVA_Build 11 78150461 1D GTAGGCACTG T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 99 het 43 0 34 10 T 8 7 249172 CASAVA_Build 11 78151508 1I TTCTACAGTG -/A AGGGGGAATG 3070 hom 89 het 35 0 28 7 A 1 2 249173 CASAVA_Build 11 78152625 31I GACATAGGCC -------------------------------/AAGTCCTCTGCTGGCCACGTGGCCCTTCTTT AAGTGAACAA 3070 hom 114 het 37 0 34 8 AAGTCCTCTGCTGGCCACGTGGCCCTTCTTT 0 1 249174 CASAVA_Build 11 78155400 2I GCTCCCCCAA --/TT TTTTTTTTTT 1829 het 902 hom 25 3 8 14 T 16 18 249175 CASAVA_Build 11 78158130 2D TAATATATAA CT/-- CTACAACAGC 3070 hom 153 het 59 0 50 11 CT 2 1 249176 CASAVA_Build 11 78167021 1I TATGTGGGGC -/G GGGGGGAGGG 2457 hom 15 het 11 0 6 5 G 6 7 249177 CASAVA_Build 11 78170946 3D GAGGTCAGGA GTT/--- GTTAGAGACC 3070 hom 53 het 23 0 15 8 GTT 2 1 249178 CASAVA_Build 11 78173748 1D TTCTGTTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 30 4 23 3 G 1 0 249179 CASAVA_Build 11 78174668 1D CCCTTCATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2841 hom 32 11 15 6 A 10 9 249180 CASAVA_Build 11 78177992 1D TGTATGAGAC T/- GTCCCACGTG 3070 het 3070 ref 42 17 11 14 T 1 0 249181 CASAVA_Build 11 78178630 1D TAGCTGTAAG C/- TTCCTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 C 1 0 249182 CASAVA_Build 11 78204079 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 31 0 25 6 A 13 12 249183 CASAVA_Build 11 78213396 1D GGGTTTCACC A/- ATGTTGCCCA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 2 1 249184 CASAVA_Build 11 78234468 1D CGACTGACAG A/- AAAAAAAAAG 1323 het 1323 ref 29 20 3 7 A 10 9 249185 CASAVA_Build 11 78260050 6I TCTTTGTTGG ------/CATCAA CATCATCTTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CATCAA 0 1 249186 CASAVA_Build 11 78265918 1I AATACTGTGG -/T TTTTTTCAGC 3070 hom 129 het 46 0 42 4 T 6 7 249187 CASAVA_Build 11 78269151 20D AATAAATACT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/-------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 314 hom 18 4 12 7 A 32 12 249188 CASAVA_Build 11 78273159 2D AGCCCAGGGC TA/-- TTATATAGCA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TA 1 0 249189 CASAVA_Build 11 78275400 1D TGCTGACTCT C/- CAGGAAACAA 3070 het 3070 ref 54 22 21 11 C 2 1 249190 CASAVA_Build 11 78323098 7D CTCAGGGAAA CATGAAT/------- CATGTGGGAT 3070 hom 138 het 48 0 45 5 CATGAAT 1 0 249191 CASAVA_Build 11 78331138 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2916 hom 22 10 10 2 A 17 16 249192 CASAVA_Build 11 78351023 1D TTGATGAAGC A/- GGATGAACAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 1 0 249193 CASAVA_Build 11 78354515 3D TGAAGTACAG TTA/--- TTATTGGAAA 3070 het 3070 ref 51 30 18 3 TTA 2 1 249194 CASAVA_Build 11 78368443 1D TGAGGAGACA G/- GCCATGTTCA 3070 het 3070 hom 50 21 22 9 G 2 1 249195 CASAVA_Build 11 78378081 3D AGAGAGCCAC ATA/--- ATATTTTTTG 3070 hom 105 het 37 0 36 3 ATA 2 1 249196 CASAVA_Build 11 78380000 1I TTTTGAGGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 9 10 249197 CASAVA_Build 11 78389146 2D TTATAATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 TA 6 5 249198 CASAVA_Build 11 78390171 1I CAGCAGGAGA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 2445 hom 39 11 12 16 C 8 9 249199 CASAVA_Build 11 78451078 2D TTTCATTTAG CT/-- CAGCTAGACC 3070 het 3070 hom 42 19 19 6 CT 1 0 249200 CASAVA_Build 11 78452171 1I CCAGCAGGCC -/T TCCTCTTCAC 3070 het 1223 hom 34 6 18 10 T 1 2 249201 CASAVA_Build 11 78452778 4D TCTCACATAC TTAT/---- TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 TTAT 1 0 249202 CASAVA_Build 11 78454482 11I GGACAGAGGC -----------/TGGGGAGGACA TGGGTAAGAG 3070 het 3070 ref 56 28 22 6 TGGGGAGGACA 0 1 249203 CASAVA_Build 11 78455154 1D AACTTGTGCT C/- CCCTGGTGTG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 C 4 3 249204 CASAVA_Build 11 78456308 25D CATCTCGGGA CTAGGATGTCTTAGGAACTTAACTC/------------------------- CTAGGAAAAT 3070 hom 147 het 50 0 49 11 CTAGGATGTCTTAGGAACTTAACTC 1 0 249205 CASAVA_Build 11 78460149 12D GTGCTGCAAA GTGGGAGTGTGG/------------ GTGGGAGTGT 3070 het 3070 ref 29 10 10 11 GTGGGAGTGTGG 1 0 249206 CASAVA_Build 11 78461178 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 29 2 21 6 A 16 14 249207 CASAVA_Build 11 78468682 1I TACTACCTCA -/G GGGGGCTGAA 3070 hom 68 het 28 0 23 5 G 5 6 249208 CASAVA_Build 11 78474439 8I TTGGCTAATG --------/TCACTCTT TAAAACACCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TCACTCTT 0 1 249209 CASAVA_Build 11 78486915 1D GTCTCCCCCA C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 59 het 29 0 16 13 C 9 8 249210 CASAVA_Build 11 78494607 1D AGGCTTACCT A/- AGTAAAACAA 3070 het 3070 hom 44 18 25 1 A 2 1 249211 CASAVA_Build 11 78505204 8D CGGTGCTGTG AAATAGTA/-------- AAATAGTATT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AAATAGTA 2 1 249212 CASAVA_Build 11 78516204 1I TGGCAAATAC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 77 het 34 0 25 9 T 8 9 249213 CASAVA_Build 11 78519170 2I AATGCAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 25 0 11 14 A 10 12 249214 CASAVA_Build 11 78524443 1I ATCATATATA -/T CATATATGTA 816 het 816 ref 12 5 2 5 T 0 1 249215 CASAVA_Build 11 78530100 1D TGGATAAATT C/- CTAGACATAC 3070 het 3070 ref 41 18 17 7 C 2 1 249216 CASAVA_Build 11 78538246 1I ATAGGTTTTT -/A AAAAAACATC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 6 7 249217 CASAVA_Build 11 78542834 1I TTGGGTAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 16 20 6 A 9 10 249218 CASAVA_Build 11 78551160 8D TTTGCTGTTA TTATTTAT/-------- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 TTAT 6 4 249219 CASAVA_Build 11 78555826 2D GCAGTTCTAC AG/-- AGTTACCAAA 3070 het 2645 hom 33 10 13 11 AG 2 1 249220 CASAVA_Build 11 78565829 1I TGTTTAAACC -/T TTTTTTTTTT 2618 het 2618 ref 32 11 10 11 T 10 11 249221 CASAVA_Build 11 78570645 1I TCAAAGAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 38 2 27 9 A 13 14 249222 CASAVA_Build 11 78585922 3D TTCAAGTGGT ATC/--- ATGCCCATTT 3070 het 3070 hom 33 11 10 14 ATC 1 0 249223 CASAVA_Build 11 78602712 4I TGAGGTGGAG ----/TCTC TCTCTGTCTG 3070 hom 58 het 23 0 16 8 TC 2 4 249224 CASAVA_Build 11 78610041 1I AGAATATGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 T 8 9 249225 CASAVA_Build 11 78635576 1D CGGTGTTCTA T/- TTTTTGCCCT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 6 5 249226 CASAVA_Build 11 78654236 1D TAATTTCCCC T/- GTTTCTGTTC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 1 0 249227 CASAVA_Build 11 78671510 1D TTAAAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 11 5 A 11 10 249228 CASAVA_Build 11 78673946 1I ATAAATAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 A 9 10 249229 CASAVA_Build 11 78717481 2I TTAAGCATGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AT 5 6 249230 CASAVA_Build 11 78720334 7I AGGAGGGAAA -------/GCATCCC CTCAACTCAC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 GCATCCC 0 1 249231 CASAVA_Build 11 78721941 4I CCATCCATCT ----/ATCC ATCCATCCAT 3070 het 3070 hom 45 18 16 11 ATCC 4 5 249232 CASAVA_Build 11 78728257 24D TCCTCATCAT CCCAGTGAGATGTGCCTTATTATG/------------------------ CCCATTTTAC 3070 het 3070 ref 32 20 13 6 CCCAGTGAGATGTGCCTTATTATG 1 0 249233 CASAVA_Build 11 78739297 1I TAATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1413 hom 29 5 21 4 T 11 12 249234 CASAVA_Build 11 78743503 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 C 1 0 249235 CASAVA_Build 11 78747374 9D TCCTTCCCTC CCTCCCTTG/--------- CCTCCCTTGC 3070 het 3070 ref 28 15 8 13 CCTCCCTTG 2 1 249236 CASAVA_Build 11 78747445 1I TTTCCTTTCC -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 90 het 36 0 28 8 T 6 7 249237 CASAVA_Build 11 78751419 1I AGCTCTGTGA -/C CCTGGGTAAG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 2 3 249238 CASAVA_Build 11 78774426 1D ATTTTTCCCC T/- ATCCTTTGGG 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 1 0 249239 CASAVA_Build 11 78779292 3I GGAAAGAGAG ---/GCC GCCGATTCAG 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 GCC 1 2 249240 CASAVA_Build 11 78780106 1D GGAACCAGGC T/- CCCCTAGGGT 2351 het 2351 ref 33 18 11 4 T 1 0 249241 CASAVA_Build 11 78780654 1I TTTCCCTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 A 9 10 249242 CASAVA_Build 11 78782037 1I GCAAGTTCCT -/A AGACAGATAT 3070 het 3070 hom 60 20 32 8 A 1 2 249243 CASAVA_Build 11 78806826 7D AGTAACATAA ATTATAT/------- ATTATATATG 3070 het 3070 ref 40 21 16 6 ATTATAT 2 1 249244 CASAVA_Build 11 78878024 1I TTTTGGTTCA -/G GGGTACATGT 3070 het 1863 hom 28 15 9 4 G 3 4 249245 CASAVA_Build 11 78886195 1D AAAATGAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 A 9 8 249246 CASAVA_Build 11 78889609 1D GGCAAACAAG A/- AAAACACACA 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 A 5 4 249247 CASAVA_Build 11 78902566 1D TCTATGCAAC T/- TTTAGTAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 3 249248 CASAVA_Build 11 78908397 2D GGCGGCGGGT GG/-- GGGGGGGGCC 2501 hom 23 het 12 0 8 5 G 10 8 249249 CASAVA_Build 11 78911642 1D ACTCTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 25 1 19 6 A 13 12 249250 CASAVA_Build 11 78917516 1I TTTGGGCAAG -/T GTTTTTCTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 249251 CASAVA_Build 11 78919020 1D CTTCATAAGC T/- TGGAAAGCCT 3070 het 579 hom 24 4 13 7 T 2 1 249252 CASAVA_Build 11 78935911 1D TAATCATATT A/- ATGATTATCA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 2 1 249253 CASAVA_Build 11 78938658 1D TAACCTGCCT G/- CCTCTCTGTC 3070 het 3070 hom 41 15 14 14 G 1 0 249254 CASAVA_Build 11 78939726 1D TCCAAAACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 T 9 8 249255 CASAVA_Build 11 78941270 1I AGTTCACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 T 10 11 249256 CASAVA_Build 11 78968933 1D ATACGACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1394 hom 38 9 15 14 T 15 14 249257 CASAVA_Build 11 78980951 2D AATATTCCAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 138 het 56 0 46 10 TG 8 7 249258 CASAVA_Build 11 78989737 3D TGTCCTCTCC CTG/--- CTGCTGCTGC 2799 het 2664 hom 26 10 8 9 CTG 4 3 249259 CASAVA_Build 11 78990247 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 945 hom 28 3 21 4 T 12 11 249260 CASAVA_Build 11 79028625 1I CCCCTCCATT -/G GGGTGAATTA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 3 4 249261 CASAVA_Build 11 79031904 1I ATAACGGGAG -/A GGGGGAAGGA 3070 hom 38 het 19 0 14 5 A 0 1 249262 CASAVA_Build 11 79035948 1D GGTTTAGCAC T/- TACTTTTGAA 3070 hom 135 het 49 0 44 5 T 2 1 249263 CASAVA_Build 11 79036311 1I TCATAGGCAG -/A AAGGCACTTG 3070 hom 144 het 58 0 49 9 A 2 3 249264 CASAVA_Build 11 79047881 6D GGTCATTTTC CAGTAT/------ CATTCTTTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 9 CAGTAT 1 0 249265 CASAVA_Build 11 79051608 26D TTTATAAGAG ACATTTAGAACTTACAATCAAAAAGC/-------------------------- CATTTATTAA 3070 hom 57 het 18 0 20 4 ACATTTAGAACTTACAATCAAAAAGC 1 0 249266 CASAVA_Build 11 79104565 1I GTTTTGAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 8 9 249267 CASAVA_Build 11 79107376 2I TACTAAAAAT --/AA CCAAAAATTA 2462 het 1502 hom 13 4 7 2 A 0 2 249268 CASAVA_Build 11 79107763 1I AGAGCAGGAG -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 7 8 249269 CASAVA_Build 11 79118016 14D CTTAATTCCC TTGTTTATAAACAA/-------------- TTGTTTATAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 11 TTGTTTATAAACAA 3 2 249270 CASAVA_Build 11 79121019 18I CCTTTTGGGT ------------------/TCAAGCGATTCTTCTGCC TCAGCCTCCT 3070 het 2988 hom 22 8 10 5 TCAAGCGATTCTTCTGCC 0 1 249271 CASAVA_Build 11 79125651 1I AATGCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 11 12 249272 CASAVA_Build 11 79126297 2D GGGAGGAAAC AT/-- GTGTGGGGAG 3070 het 3070 hom 46 19 20 8 AT 1 0 249273 CASAVA_Build 11 79126597 1I AAGTGGCTGG -/A AAGGGTTGCA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 A 2 3 249274 CASAVA_Build 11 79137942 2D ATATATATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TA 8 7 249275 CASAVA_Build 11 79142406 4D GTTTCAAAAG AGTT/---- AGAAGTGAGG 3070 het 3070 hom 51 22 24 7 AGTT 1 0 249276 CASAVA_Build 11 79144757 1I TGAAATGTGA -/C TTTTTCCCCC 2045 het 2045 ref 29 19 6 4 C 0 1 249277 CASAVA_Build 11 79146684 6I CATACATGCA ------/CACATG CACATGCACA 3070 het 3070 hom 56 23 19 14 CACATG 1 2 249278 CASAVA_Build 11 79154967 1I AACTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 10 11 249279 CASAVA_Build 11 79155498 1I CATGTAATCT -/A AGTCTTCCCC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 1 2 249280 CASAVA_Build 11 79158169 1I CAATTAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2663 hom 31 12 12 7 T 13 14 249281 CASAVA_Build 11 79161276 1D CCGTGAATTT A/- AAGGCAGTTA 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 A 3 2 249282 CASAVA_Build 11 79174835 1I TGCTATATAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 9 10 249283 CASAVA_Build 11 79199490 2I ACAGATGGAC --/TA TATAGTTCCC 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 TA 2 3 249284 CASAVA_Build 11 79206643 1I ACATAAGGTA -/C TATAAGGCTG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 0 1 249285 CASAVA_Build 11 79207871 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 9 8 249286 CASAVA_Build 11 79216079 1I AAGAGGAAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 48 27 12 9 A 8 9 249287 CASAVA_Build 11 79221259 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 11 12 249288 CASAVA_Build 11 79248952 1I TAAAATAAAC -/A AAACTCAGAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 3 4 249289 CASAVA_Build 11 79249666 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 210 hom 33 2 29 2 A 16 15 249290 CASAVA_Build 11 79255596 4I ACTGGCAAAT ----/TAGA TAAAGTGTCA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TAGA 0 1 249291 CASAVA_Build 11 79363462 10D TGTCCAGCTA ATTTTATTTT/---------- ATTTTATTTT 1846 het 1846 ref 16 5 4 7 ATTTT 6 4 249292 CASAVA_Build 11 79370119 1I AAGGAAAGGT -/A AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 64 36 21 7 A 6 7 249293 CASAVA_Build 11 79373425 1I TCTTTTTAGT -/A AAAGTCTTAG 2903 het 2903 ref 30 17 7 6 A 3 4 249294 CASAVA_Build 11 79377516 2I AGTTGTACCG --/CA CATGTTTAGA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 CA 1 2 249295 CASAVA_Build 11 79387981 1D ACTCCGTCGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2062 hom 22 7 10 5 A 10 9 249296 CASAVA_Build 11 79393379 3I GTTGCCACAA ---/CCC CAAAATACCA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 C 1 4 249297 CASAVA_Build 11 79482748 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 A 8 7 249298 CASAVA_Build 11 79501564 1I CCTACCAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 9 10 A 10 11 249299 CASAVA_Build 11 79518445 1I TTAGTTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 39 3 29 7 T 10 11 249300 CASAVA_Build 11 79523781 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 462 hom 15 het 22 0 6 16 AC 7 5 249301 CASAVA_Build 11 79548505 1I TTTCTTAGCC -/A ACTAGGGATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 249302 CASAVA_Build 11 79548636 3I AAATTTTATG ---/TAT TATTAAGTAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TAT 1 2 249303 CASAVA_Build 11 79555270 1I AGTAATAGGG -/A TAAGTGAGAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 0 1 249304 CASAVA_Build 11 79561748 1I TGAATGCTAG -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 8 249305 CASAVA_Build 11 79572986 1I ATTTAACTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 8 9 249306 CASAVA_Build 11 79577371 1I AGGAAGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 640 hom 34 2 24 8 A 10 11 249307 CASAVA_Build 11 79604022 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 22 0 16 6 A 14 12 249308 CASAVA_Build 11 79604963 1D CCAGTCATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 656 hom 30 4 19 7 A 15 14 249309 CASAVA_Build 11 79616845 1D TCTGAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 417 hom 33 1 29 3 A 10 9 249310 CASAVA_Build 11 79639077 4D TTAAATGACA CTTG/---- CTTGTACTGG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 CTTG 2 1 249311 CASAVA_Build 11 79658924 1D TCTATACACA T/- TTTTTGTGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 5 249312 CASAVA_Build 11 79661127 2D AGGTAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 49 0 41 9 A 12 10 249313 CASAVA_Build 11 79661445 1I TGATAACCAC -/A AAGACAAAAC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 3 249314 CASAVA_Build 11 79664549 2D GATTATACAC TA/-- TGACCAAGTG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 TA 1 0 249315 CASAVA_Build 11 79672444 1D TCACCTATGT A/- AAAAAATAGT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 A 7 6 249316 CASAVA_Build 11 79677873 1D TTATGGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 12 11 249317 CASAVA_Build 11 79686361 1I TGTAGATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 13 14 249318 CASAVA_Build 11 79687736 1D TGTATGAAAT A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 7 6 249319 CASAVA_Build 11 79688185 4D ACACCCTTAG CTCT/---- CTCTCTCTGC 3070 het 3070 hom 48 21 22 6 CT 6 4 249320 CASAVA_Build 11 79710509 1I TGCCACATAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 9 10 249321 CASAVA_Build 11 79731589 2D ATCTTTCCTC AT/-- AGAACTTACC 3070 het 3070 ref 47 25 18 5 AT 1 0 249322 CASAVA_Build 11 79800382 2I AGTCAACAAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 9 11 249323 CASAVA_Build 11 79801105 5D TATAAATTTC AAAAT/----- AAAATAAATC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAAAT 2 1 249324 CASAVA_Build 11 79878773 2D TTATATACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AT 7 6 249325 CASAVA_Build 11 79879582 2D AAAGTGGAGA AG/-- CTCTGGCTGT 3070 hom 132 het 47 0 44 5 AG 1 0 249326 CASAVA_Build 11 79881752 4I ATTTACACAA ----/ATGT ATGTACATTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATGT 1 2 249327 CASAVA_Build 11 79882961 3D TTTATCTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 29 1 24 6 T 20 17 249328 CASAVA_Build 11 79901433 2I48M1D CATCTGTGGC --TGAGAATAAATCTGCTCTGTCCAGAAGTGACATTCCATTCCTTTATAAC/TGTGAGAATAAATCTGCTCTGTCCAGAAGTGACATTCCATTCCTTTATAA- CTCTCTTTTC 3070 hom 144 het 38 0 49 6 N/A 0 0 249329 CASAVA_Build 11 79902025 1I CATTGTAATA -/T TTTTTTTGAC 3070 het 308 hom 52 1 48 3 T 7 8 249330 CASAVA_Build 11 79902744 1D9M34D AGACTGTTAG TTTTGTTGCTGAGGTTCTAAGTCACTGGAGATGTGAAAGGTTAG/-TTTGTTGCT---------------------------------- GTAGTAGACA 3070 hom 84 het 34 0 30 6 N/A 0 0 249331 CASAVA_Build 11 79908153 1D TGTCAAGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 112 het 43 0 37 7 A 10 9 249332 CASAVA_Build 11 79916647 34I AGTAATGTGA ----------------------------------/AAATGTAATGCCTATGTCTTAGACTCACTATGAG ATATAGTGCT 3070 het 3070 ref 31 17 14 3 AAATGTAATGCCTATGTCTTAGACTCACTATGAG 0 1 249333 CASAVA_Build 11 79923191 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 10 16 T 11 10 249334 CASAVA_Build 11 79924379 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 11 12 249335 CASAVA_Build 11 79928042 2I CTTGTTTGCA --/TG TGTTCATACA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 TG 1 2 249336 CASAVA_Build 11 79929655 1I ACTCAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 15 16 A 10 11 249337 CASAVA_Build 11 79939584 1I TCTGTGGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 A 11 12 249338 CASAVA_Build 11 79956201 1D TGGTTAGATT G/- GCATTTAGAA 3070 het 3070 hom 36 14 13 10 G 2 1 249339 CASAVA_Build 11 79956232 5I TGTAGTCCTA -----/TAGAT TATCTGCCTG 3070 het 2718 hom 31 6 12 13 TAGAT 0 1 249340 CASAVA_Build 11 79961193 5D AACCGAGACT GAGAA/----- GAGAAAGGGG 3070 het 3070 hom 45 22 18 7 GAGAA 2 1 249341 CASAVA_Build 11 79966697 9D5M1D6M13D GATGTCACCC AATTAGTGGGTGACAGGAATTGGTAACAGAGAGA/---------GTCAC-CCAATT------------- TGGAGTTGGG 3070 het 3070 ref 29 19 17 4 N/A 0 0 249342 CASAVA_Build 11 79969873 1D AAAGAGCCCC T/- GGAATTATGG 3070 het 3070 ref 22 12 9 2 T 1 0 249343 CASAVA_Build 11 79970640 1D AGTTCCTCAC A/- AAAACTGAAC 3070 het 63 hom 35 1 29 5 A 5 4 249344 CASAVA_Build 11 79974642 1D ACTTTGTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 A 11 10 249345 CASAVA_Build 11 79983552 1I TTACAATAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 A 8 9 249346 CASAVA_Build 11 79991482 1D TTCAACTTTG T/- TTTTTTTTTT 1438 het 1438 ref 27 11 5 11 T 17 16 249347 CASAVA_Build 11 80003793 1D TTCCCAACTC A/- AGACTTCATT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 2 1 249348 CASAVA_Build 11 80004733 1D TATTAAGTGC T/- TGGCACAGTA 3070 het 3070 ref 54 23 23 9 T 2 1 249349 CASAVA_Build 11 80026819 1D GAGATGAGAA T/- TTGTGTGCAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 3 2 249350 CASAVA_Build 11 80042416 3I TCATGGAATC ---/ATT GTTGTTGTTC 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 ATT 0 1 249351 CASAVA_Build 11 80042934 3I ACTTAAGACT ---/CTA AGAACCCACT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 CTA 0 1 249352 CASAVA_Build 11 80059926 1I CAATTGGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 T 9 10 249353 CASAVA_Build 11 80060741 1D GCCGATTTGC T/- TTTTTTTTTT 2227 het 2227 ref 48 38 5 6 T 11 10 249354 CASAVA_Build 11 80086792 1I ACACAAGACT -/G GCCAACATGG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 G 1 2 249355 CASAVA_Build 11 80090931 1D GTGAGGAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 9 8 249356 CASAVA_Build 11 80103981 1I GATTTGATAA -/C CCCTGGCATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 3 4 249357 CASAVA_Build 11 80118634 1D TCCTGTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 9 T 11 10 249358 CASAVA_Build 11 80121863 1D AAAATCAAAT A/- AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 34 11 21 3 A 7 6 249359 CASAVA_Build 11 80143369 2I AAGATAATGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2074 hom 24 8 10 6 A 12 14 249360 CASAVA_Build 11 80145874 2D CATAGAAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 2047 het 2047 ref 39 24 6 10 A 14 12 249361 CASAVA_Build 11 80214823 6I TAAGGCTTTT ------/AAGTTA AACTATAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AAGTTA 0 1 249362 CASAVA_Build 11 80253095 1D CATCTTTATC A/- AGCACTGCTA 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 A 2 1 249363 CASAVA_Build 11 80253903 2D ATGCACACAC AT/-- GTTCATTGCA 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 AT 1 0 249364 CASAVA_Build 11 80267522 6D TCCCAAACTG CTGAGA/------ CTACAGGCGT 2497 het 2497 ref 14 8 6 1 CTGAGA 1 0 249365 CASAVA_Build 11 80269693 1I TAAATTTACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 A 9 10 249366 CASAVA_Build 11 80280448 1I TAGCCAGCCT -/G CTACAGACTG 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 G 0 1 249367 CASAVA_Build 11 80284126 1I CTCTCTCATA -/G GTATGTAGAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 G 1 2 249368 CASAVA_Build 11 80289698 12D TCACCTACAT ACAGGCTCTATA/------------ TCACCCTTCA 3070 het 3070 ref 42 26 14 5 ACAGGCTCTATA 1 0 249369 CASAVA_Build 11 80296267 3D GTAGAATCAA TAT/--- TGTGAAAATC 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 TAT 1 0 249370 CASAVA_Build 11 80299752 4D GGGATGTTAG CTAA/---- CTAACAACTC 3070 het 3070 ref 40 19 19 3 CTAA 2 1 249371 CASAVA_Build 11 80302602 1I GAATAACCAC -/T CCCCCGCTCC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 0 1 249372 CASAVA_Build 11 80306997 2I ATATGCATAA --/AT ATATATATAT 2351 het 2351 ref 19 9 5 5 AT 7 8 249373 CASAVA_Build 11 80312240 1D TACACAGACT A/- GGAAATATAG 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 A 1 0 249374 CASAVA_Build 11 80313847 1I AGGAACTCGA -/C CGGGTGTTGA 3070 het 3070 ref 58 28 24 6 C 1 2 249375 CASAVA_Build 11 80319329 1I GAAACTAGTA -/G GAGTAGAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 G 1 2 249376 CASAVA_Build 11 80322949 4I ATACAGCATG ----/GAAA GAAAGGCATG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 GAAA 1 2 249377 CASAVA_Build 11 80325932 2D AGTGACACAA TC/-- TCGGCTCACT 3070 het 2914 hom 20 7 11 2 TC 2 1 249378 CASAVA_Build 11 80327536 4I CCTTTAAAAG ----/GAAT GAAATTCTGA 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 GAAT 0 1 249379 CASAVA_Build 11 80333056 1I TTGCATCAGC -/T TGAGCTTTTG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 1 2 249380 CASAVA_Build 11 80336747 1D AGAAGATGGT G/- GGAATAGTAA 3070 het 3070 ref 32 19 12 2 G 3 2 249381 CASAVA_Build 11 80341549 1I TTACCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2766 het 2766 ref 27 15 8 4 A 10 11 249382 CASAVA_Build 11 80343878 5I AGTTGATGAA -----/TTAAG TTAATAAGAT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 TTAAG 0 1 249383 CASAVA_Build 11 80346612 1D CATAATTTGT A/- AATGGCTGAG 2504 het 2504 ref 35 22 6 9 A 3 2 249384 CASAVA_Build 11 80351093 6D ATTTTAATAG TTTATA/------ TTTATTGTAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 TTTATA 1 0 249385 CASAVA_Build 11 80363516 2I AGTTAATGAT --/AA ACACACTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 1 3 249386 CASAVA_Build 11 80368061 1I TACTCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 A 10 11 249387 CASAVA_Build 11 80380954 2I AAAAGCACAC --/TT TGCCTTTGCC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 1 3 249388 CASAVA_Build 11 80400916 1D TAGTGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1145 het 1145 ref 34 24 3 7 A 12 11 249389 CASAVA_Build 11 80406562 1I TGCTGATGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 9 10 249390 CASAVA_Build 11 80410086 4I GAGGCTGATA ----/AGGG AGGATCACTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 AGGG 0 1 249391 CASAVA_Build 11 80432905 2D CTCCAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 13 11 249392 CASAVA_Build 11 80433862 1D ATATATATAT A/- TATATTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 1 0 249393 CASAVA_Build 11 80438149 3D GAAGGAGCTT TTG/--- TTAAGTGGCC 3070 het 3070 hom 45 20 19 7 TTG 1 0 249394 CASAVA_Build 11 80442823 1D GGAACATACT A/- AAATTGCACA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 4 3 249395 CASAVA_Build 11 80445411 1D CATCACTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 29 1 25 3 T 12 11 249396 CASAVA_Build 11 80445699 1D CAAGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 38 0 31 8 T 12 11 249397 CASAVA_Build 11 80455293 1D TCTTATACTC T/- CAAAGCAGGT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 T 1 0 249398 CASAVA_Build 11 80456961 1D CCTTCTGAGA C/- TCCAATGTTA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 C 1 0 249399 CASAVA_Build 11 80463330 2D CATTTGAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 549 hom 32 2 20 10 T 16 14 249400 CASAVA_Build 11 80475600 1I CTTGGAACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 85 het 34 0 29 5 A 9 10 249401 CASAVA_Build 11 80504904 1D TAGGATGACT A/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 15 16 1 A 1 0 249402 CASAVA_Build 11 80508833 1D GTTTTATATC T/- TATTGATTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 2 1 249403 CASAVA_Build 11 80510955 1D AGAACAAGAA C/- CCTTTGGTTT 3070 het 3070 ref 33 21 9 4 C 3 2 249404 CASAVA_Build 11 80512036 1I ACATTGTTCC -/A CTCCCTAGTC 3070 hom 27 het 10 0 8 2 A 0 1 249405 CASAVA_Build 11 80513078 1D4M6D TCCCCTTCTT AATCAATATGG/-TTCA------ AGGGCCTGTT 643 het 643 ref 11 5 3 4 N/A 0 0 249406 CASAVA_Build 11 80514543 1D TCTTAGAACC T/- TCTCATTTCC 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 2 1 249407 CASAVA_Build 11 80524708 1I ACCAAGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2360 hom 40 7 23 10 T 12 13 249408 CASAVA_Build 11 80526364 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 T 11 10 249409 CASAVA_Build 11 80528471 1D TGGCACTCAA T/- AAATATGTGT 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 T 1 0 249410 CASAVA_Build 11 80531264 1I TTGACTGTAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 7 8 249411 CASAVA_Build 11 80531774 2D ATTTAAAATT TG/-- GAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 24 13 11 1 TG 1 0 249412 CASAVA_Build 11 80539634 2I CATTTAACAA --/AT ATGATTTTAT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 AT 1 2 249413 CASAVA_Build 11 80542020 1I AAAAACAAAC -/A AAAAACTTTG 3070 hom 123 het 45 0 42 4 A 5 6 249414 CASAVA_Build 11 80543257 1D ATTTATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 279 hom 42 2 31 9 T 15 14 249415 CASAVA_Build 11 80549911 1I AAAACTTTTA -/T GTTAACATTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 0 1 249416 CASAVA_Build 11 80552839 1D GCAGGTAAAC A/- AATTTTACTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 3 2 249417 CASAVA_Build 11 80574546 1D CATTTTAGTA G/- CTCAATGAAT 3070 het 3070 hom 69 16 47 6 G 1 0 249418 CASAVA_Build 11 80597256 1D GTGTGGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 31 11 11 9 T 13 12 249419 CASAVA_Build 11 80599275 1D CTTGGAGTTC T/- TTTTTTTTTT 1283 het 1283 ref 39 31 4 4 T 11 10 249420 CASAVA_Build 11 80610974 6I TCACTCTACC ------/GATCTA TCAAACACTA 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 GATCTA 0 1 249421 CASAVA_Build 11 80611826 5I TTTAAAAGTG -----/ATATA ATATAGTTAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 ATATA 1 2 249422 CASAVA_Build 11 80618321 3I GGAGACAGGG ---/AGA AGAAGTGGGA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 AGA 1 2 249423 CASAVA_Build 11 80619543 2I GTCTAATAAG --/TA ATTATTTTCA 3070 het 3070 hom 57 22 23 12 TA 0 1 249424 CASAVA_Build 11 80622075 2D CAGAAGTCAA AG/-- AGTGACATCT 3070 het 3070 hom 42 15 22 6 AG 2 1 249425 CASAVA_Build 11 80649166 1I TCAAATGTAG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 A 7 8 249426 CASAVA_Build 11 80657293 1D ACCCCTTAAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 9 8 249427 CASAVA_Build 11 80658203 1I TGTAATAAAA -/G GGGAACTTCT 3070 het 3070 hom 40 20 16 4 G 3 4 249428 CASAVA_Build 11 80681911 1D CTTTTAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1612 het 1612 ref 43 33 4 7 T 13 12 249429 CASAVA_Build 11 80699543 3I GGCATAGGGT ---/AGA CTGAGAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 AGA 0 1 249430 CASAVA_Build 11 80701026 1I CCTATCTGAC -/A AGTTTTATAG 3070 hom 39 het 41 1 27 13 A 1 2 249431 CASAVA_Build 11 80703418 1D TCTAAACATA G/- GAAAAGGTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 2 1 249432 CASAVA_Build 11 80725898 1D TTGTGATCTT A/- AAAAAAAAAA 1317 het 1317 ref 46 36 3 7 A 11 10 249433 CASAVA_Build 11 80736805 1D AAATAAAAAT A/- AAAATAAAAT 99 het 99 ref 30 17 2 12 A 5 4 249434 CASAVA_Build 11 80742112 1I TAATATTAAC -/A AACTTTTTAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 2 3 249435 CASAVA_Build 11 80745371 3I ATAAGAAGGA ---/AAT AATAATGTAA 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 AAT 2 3 249436 CASAVA_Build 11 80761914 1I TTAGTGTATC -/A AAACAACAGC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 3 4 249437 CASAVA_Build 11 80784029 1I GAGAAGTGAC -/A AGGCTTGAAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 1 2 249438 CASAVA_Build 11 80837802 1D CCAGAATATG A/- AAAAAAAAAA 744 het 744 ref 39 30 2 7 A 11 10 249439 CASAVA_Build 11 80843133 1D GAGCTTGCAG T/- TGAGCCGAGA 3070 het 60 hom 12 1 8 3 T 2 1 249440 CASAVA_Build 11 80884027 4I GGAGTTTCAA ----/CCAG CCAGTTTCTT 3070 hom 98 het 37 0 33 4 CCAG 1 2 249441 CASAVA_Build 11 80898497 1I CGGTATTCAG -/C CACTGCAGTG 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 C 1 2 249442 CASAVA_Build 11 80898588 1D TTCTTCACTC T/- TTTTTGGGGT 3070 het 3070 hom 48 25 20 3 T 6 5 249443 CASAVA_Build 11 80960581 1D AGTCTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 A 11 10 249444 CASAVA_Build 11 80962494 1I TACTCTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3032 het 2488 hom 19 7 7 5 A 10 11 249445 CASAVA_Build 11 80979539 9D GGGTTATTTG GCTCATGAT/--------- TCTGATAGCT 3070 het 3070 hom 33 15 17 5 GCTCATGAT 1 0 249446 CASAVA_Build 11 80989802 1D CCTGGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 1424 het 1424 ref 49 32 5 12 T 12 11 249447 CASAVA_Build 11 80999230 1D CTCATATACT A/- AAAAAAAAAA 2970 het 2969 ref 35 16 8 13 A 17 16 249448 CASAVA_Build 11 80999800 2D GCATGCGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 52 19 19 15 GT 8 7 249449 CASAVA_Build 11 81002432 1D TCTTCAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2453 hom 24 8 8 8 A 15 14 249450 CASAVA_Build 11 81004872 1I TCAACTACTT -/G GGAGGCTGAG 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 G 2 3 249451 CASAVA_Build 11 81009523 1D ATAGTTAAAC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 A 8 7 249452 CASAVA_Build 11 81017173 1D AAAAGTGGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 12 21 0 T 10 9 249453 CASAVA_Build 11 81032978 1I TTTGAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 A 10 11 249454 CASAVA_Build 11 81049715 12D CATTATCCAG TTCCAAAGTTGC/------------ TTCCACATTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 6 TTCCAAAGTTGC 1 0 249455 CASAVA_Build 11 81063805 1I AATTGAGACC -/A AAAAAAAAAA 2978 het 2978 ref 28 15 9 4 A 12 13 249456 CASAVA_Build 11 81064156 1D AAAATCTCCT A/- AAAAAAAAAA 2866 het 2744 hom 27 10 9 8 A 16 15 249457 CASAVA_Build 11 81070429 4I AGGTTGTCTT ----/CTTA CTTTCTTGGT 3070 het 3070 ref 43 21 19 4 CTTA 0 1 249458 CASAVA_Build 11 81070495 1I TTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 T 8 9 249459 CASAVA_Build 11 81074389 2D TTACATTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2786 hom 37 14 12 11 T 16 14 249460 CASAVA_Build 11 81077043 1I TGTAATTTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 A 9 10 249461 CASAVA_Build 11 81089663 1D GAAATTTCCA G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 G 2 1 249462 CASAVA_Build 11 81090520 1I GATGAGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 10 11 249463 CASAVA_Build 11 81094271 1I CTCTGACAGG -/C CCCAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 C 3 4 249464 CASAVA_Build 11 81096541 2I AGAGAGAGAG --/AC AGAGAGGCCA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 AC 0 1 249465 CASAVA_Build 11 81099372 1I ATATACAAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 T 8 9 249466 CASAVA_Build 11 81103102 3I TATCCTTGTG ---/TCC CTGTGACCTG 3070 het 3070 hom 40 10 24 6 TCC 0 1 249467 CASAVA_Build 11 81108600 1D GTGCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 11 10 249468 CASAVA_Build 11 81110846 3I TTAAAACACC ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 9 12 249469 CASAVA_Build 11 81112403 1I ACCATATATT -/A AATCAAATCA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 2 3 249470 CASAVA_Build 11 81117293 1D AGCCACAGCA C/- CCGGCCTGCT 2678 het 2678 ref 23 12 7 4 C 3 2 249471 CASAVA_Build 11 81122708 1I CTTATGAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 9 10 249472 CASAVA_Build 11 81123142 1D TTTTTTTTTT C/- TCTCTCTCTC 2342 het 2342 ref 42 21 8 13 C 1 0 249473 CASAVA_Build 11 81132452 4D GGTTCTTGGT CTCA/---- CTAACTTCAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 CTCA 1 0 249474 CASAVA_Build 11 81137197 3I CAGGTCCAAG ---/TTA TTATTTTCTA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 TTA 1 2 249475 CASAVA_Build 11 81138705 1I ATGTAATGAG -/T CTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 0 1 249476 CASAVA_Build 11 81145934 1I AAGAAGAAAC -/A AAAGGAAGGA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 3 4 249477 CASAVA_Build 11 81150668 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 TA 5 6 249478 CASAVA_Build 11 81150915 2D CAATTGAACA CT/-- CTGCGTAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 CT 2 1 249479 CASAVA_Build 11 81152851 1I ATCATATTAA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 8 9 249480 CASAVA_Build 11 81153326 1D GCCTAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 21 12 A 11 10 249481 CASAVA_Build 11 81153601 1D CTTCTATTTA T/- TTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 6 5 249482 CASAVA_Build 11 81154256 1D ATCTCTTAAT C/- TTTTATAACA 3070 het 3070 ref 32 17 10 6 C 1 0 249483 CASAVA_Build 11 81156627 6I CCATAAATAC ------/TAAATA TAAATACTAA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 TAAATA 1 2 249484 CASAVA_Build 11 81158667 1I GCCATTGCAT -/C CCCTGTGACC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 C 3 4 249485 CASAVA_Build 11 81160466 10D51M1D TCCATAGGCA AAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAGGTCACTTTTGTATCACTTGATGATACAATGCACCAGA/----------AAAAAAAAAGAAAAGGTCACTTTTGTATCACTTGATGATACAATGCACCAG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 24 10 19 N/A 0 0 249486 CASAVA_Build 11 81160892 4D ACTCACCCTG TCTC/---- TCTCTGTTCT 3070 het 3070 hom 47 20 25 3 TC 4 2 249487 CASAVA_Build 11 81167955 1I TAACAATAAT -/A AAAAATAGGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 5 6 249488 CASAVA_Build 11 81176622 1I AGTATGTTTG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 A 7 8 249489 CASAVA_Build 11 81177994 1I GGATTCTTTA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 T 6 7 249490 CASAVA_Build 11 81186397 4I CTCTCTTTCT ----/TCTC TCTTTCTCTC 3070 het 2589 hom 24 6 16 2 TC 1 3 249491 CASAVA_Build 11 81202559 2D AACTGAACTG AT/-- AATATTGTTA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 AT 1 0 249492 CASAVA_Build 11 81203218 1I CGAGAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2325 hom 44 9 15 20 A 15 16 249493 CASAVA_Build 11 81204258 1I ATTACTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 11 12 249494 CASAVA_Build 11 81223907 1I GATAAAGAAG -/C CCTGCCATTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 2 3 249495 CASAVA_Build 11 81225714 1I TATTCAGGTC -/T TTTGCCTATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 3 4 249496 CASAVA_Build 11 81235814 10I AAAGATAGTA ----------/AAAGAATAAC AAAGTAATAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 AAAGAATAAC 0 1 249497 CASAVA_Build 11 81243102 6D TATAACCAAA TAAAAT/------ TTGTTCCAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 TAAAAT 1 0 249498 CASAVA_Build 11 81245118 4D TAGGAAAAAT GTAA/---- GTATGTCATG 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 GTAA 1 0 249499 CASAVA_Build 11 81267202 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 467 het 467 ref 28 21 2 5 C 1 0 249500 CASAVA_Build 11 81276559 1I GGTCAGAATG -/A ATTGATGGCT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 1 2 249501 CASAVA_Build 11 81281698 13D GGGCTCCCAG GTGGCATGCACTA/------------- GTGCTTGCAA 19 het 19 ref 32 16 1 19 GTGGCATGCACTA 1 0 249502 CASAVA_Build 11 81287062 1D TGAGCTGAAA C/- TTAAAATGAC 2403 het 2403 ref 23 15 7 1 C 1 0 249503 CASAVA_Build 11 81311955 1D AAGATTTTTT G/- CTTAGCCAAA 2951 het 2951 ref 25 12 7 8 G 1 0 249504 CASAVA_Build 11 81325655 2D TATTATATGA CT/-- CTATGTATTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 CT 2 1 249505 CASAVA_Build 11 81332755 1D TGAAAACGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 10 9 249506 CASAVA_Build 11 81334055 6I AACTTAGAAA ------/ATAAAT ATAAAGTATT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 ATAAAT 0 1 249507 CASAVA_Build 11 81342145 1I AAAGCTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 14 0 9 5 A 10 11 249508 CASAVA_Build 11 81347797 1I TTCATCGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 A 11 12 249509 CASAVA_Build 11 81348618 1I GAAGACTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 11 12 249510 CASAVA_Build 11 81350212 2D AAATTACTCT AC/-- GGTTTTTCTG 2772 het 2772 ref 20 13 6 1 AC 1 0 249511 CASAVA_Build 11 81354633 1D CTTTTTATTG A/- GGCATATATT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 1 0 249512 CASAVA_Build 11 81356436 1D AGGGATCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 12 11 249513 CASAVA_Build 11 81357479 8D GTTATGTGTG TGTGTGTT/-------- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 59 34 20 9 TGTGTGTT 1 0 249514 CASAVA_Build 11 81370702 1I GTGACTGTAG -/T TTTTTTTTTT 1355 het 1224 hom 27 5 8 14 T 15 16 249515 CASAVA_Build 11 81397613 1I ATTTTATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 10 12 T 10 11 249516 CASAVA_Build 11 81407598 2D CACACACACA CG/-- CACACACACA 3070 het 1151 hom 23 7 14 3 CG 1 0 249517 CASAVA_Build 11 81417427 3I CCTTCTACAA ---/AAC AACAACTCCT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 AAC 2 3 249518 CASAVA_Build 11 81417735 3I TCCCACAATT ---/ACC ACTATTCCTG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 ACC 0 1 249519 CASAVA_Build 11 81420842 1I GTCTGTTCTT -/A AGAGTTCTGC 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 A 1 2 249520 CASAVA_Build 11 81421105 1I CAGCCTGCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 8 9 249521 CASAVA_Build 11 81428610 1D ACAGACTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2780 hom 28 8 16 4 T 11 10 249522 CASAVA_Build 11 81429415 1I AGACTTGCTG -/A AAAACTACAT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 4 5 249523 CASAVA_Build 11 81429777 11I CAGATGCCAC -----------/CTGACATCTGA CGATATAAAA 3070 het 3070 ref 44 27 15 3 CTGACATCTGA 0 1 249524 CASAVA_Build 11 81433024 2D ATACATACAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 28 9 10 10 TA 9 8 249525 CASAVA_Build 11 81434452 1D CAGAAAATAT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 7 249526 CASAVA_Build 11 81447330 3I TGTAAATATA ---/AAC AAGATAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAC 0 1 249527 CASAVA_Build 11 81447530 1I GATAACTGAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 A 8 9 249528 CASAVA_Build 11 81454458 15D51M2D ATATTGACCG TGGGCTTGTCATACATGGCTATTATTATTTTTAGGTATGTTCTTTCGATGCCTAGTTTAGTGAGGATT/---------------TGGCTATTATTATTTTTAGGTATGTTCTTTCGATGCCTAGTTTAGTGAGGA-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 21 10 20 N/A 0 0 249529 CASAVA_Build 11 81464123 1I TTTGAAGTAA -/C CTCTGCTGAG 3070 hom 144 het 54 0 48 6 C 1 2 249530 CASAVA_Build 11 81468153 1I TTTATCTTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 A 9 10 249531 CASAVA_Build 11 81478072 1D AGAGAATATG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 A 9 8 249532 CASAVA_Build 11 81479808 1D CCTTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 37 1 20 16 A 16 15 249533 CASAVA_Build 11 81519752 1D TGGAAGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1777 hom 51 10 22 19 T 12 11 249534 CASAVA_Build 11 81572446 1I GTTGTTGCAG -/T TTTTGCTCCT 3070 hom 162 het 62 0 54 8 T 4 5 249535 CASAVA_Build 11 81582208 1I AGCCTTATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 15 12 A 13 14 249536 CASAVA_Build 11 81593050 1D CTAGTTGAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 10 9 249537 CASAVA_Build 11 81597789 1D CTCTCACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 14 11 A 12 11 249538 CASAVA_Build 11 81600878 1D AAAAATCCTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 15 17 1 A 9 8 249539 CASAVA_Build 11 81602617 1I GGTTTGGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 A 10 11 249540 CASAVA_Build 11 81607148 4D AAATCTTCCT ATAA/---- ATATTTATCT 3070 het 3070 ref 37 21 12 7 ATAA 1 0 249541 CASAVA_Build 11 81611880 1I TTTTTTTGTG -/T TGGTTTTTGC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 1 2 249542 CASAVA_Build 11 81613724 4D GATAAATATA AATG/---- AATATTTATA 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 AATG 1 0 249543 CASAVA_Build 11 81614315 2I CAGAAGTTTC --/CT CTCTGATTGC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 CT 2 3 249544 CASAVA_Build 11 81618390 1I GGAAAGAAGA -/T TTTTTATTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 5 6 249545 CASAVA_Build 11 81618668 8I CAATAAGTAT --------/TATCTCCA TATCTCCAGG 3070 hom 99 het 43 0 33 10 TATCTCCA 1 2 249546 CASAVA_Build 11 81620232 1I CTCTGGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 10 11 249547 CASAVA_Build 11 81627689 1D CATTTTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 670 hom 28 2 23 4 T 11 10 249548 CASAVA_Build 11 81628195 2I CAACTAAACT --/AC AGAGTTGGTG 3070 hom 75 het 30 0 20 10 AC 0 1 249549 CASAVA_Build 11 81642874 4I GTTATGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTTG 2 3 249550 CASAVA_Build 11 81645471 3I CTTTGATTTA ---/TTT TGAATTTTTT 3070 het 3070 hom 46 10 32 4 T 1 4 249551 CASAVA_Build 11 81650821 1D TACACAAAAT A/- AAATATGAAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 4 3 249552 CASAVA_Build 11 81656489 1I GAATATTGTC -/T TCTTAAAACT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 1 2 249553 CASAVA_Build 11 81660590 2I TTTTTATGGG --/CA GAAACACTGT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 CA 0 1 249554 CASAVA_Build 11 81679991 4D TATACCACAT TTTC/---- TTTATTTCTC 3070 het 3070 ref 56 25 24 9 TTTC 1 0 249555 CASAVA_Build 11 81684155 1D TGTGTTTCTA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 T 7 6 249556 CASAVA_Build 11 81685308 1I TCTCTTTATA -/T TTTTGTGCAT 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 4 5 249557 CASAVA_Build 11 81689797 1D CTTTATTGAT A/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 A 1 0 249558 CASAVA_Build 11 81692776 3I AATTGGAAAA ---/AAG AAATTTTATC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAG 0 1 249559 CASAVA_Build 11 81695083 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 38 1 20 17 T 11 10 249560 CASAVA_Build 11 81696598 1I GTATTATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 11 12 249561 CASAVA_Build 11 81699775 7I TAAAGAAAGA -------/ACTGTTC AGAATTTTGC 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 ACTGTTC 0 1 249562 CASAVA_Build 11 81702611 2D AAAATGTGAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 23 0 12 11 AT 7 6 249563 CASAVA_Build 11 81702768 1D ATGTTATGTT G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 19 1 17 1 G 1 0 249564 CASAVA_Build 11 81709476 1I TCTCCACAAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 T 9 10 249565 CASAVA_Build 11 81711841 1I TAGCTGTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 9 10 249566 CASAVA_Build 11 81711974 4I TTTATAACAC ----/ATTT ATTTATTGCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 ATTT 1 2 249567 CASAVA_Build 11 81717612 1D TCATTTTCAT C/- CCTTTACTTT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 C 3 2 249568 CASAVA_Build 11 81724261 3D AGTCTATAAA TCT/--- TCTTTGCACT 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 TCT 2 1 249569 CASAVA_Build 11 81748646 1I CTTTGTCAGG -/A AACCCAGAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 3 249570 CASAVA_Build 11 81749307 1I TGAATAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 28 1 22 5 A 11 12 249571 CASAVA_Build 11 81757984 1I AACCTAGGAG -/C CAATAGGCTA 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 C 1 2 249572 CASAVA_Build 11 81763944 1I TGTTTATGTT -/C CCCCACTGCA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 C 4 5 249573 CASAVA_Build 11 81768448 1D TGAGAGTGGG T/- AATTTATAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 4 T 1 0 249574 CASAVA_Build 11 81775326 1D37M1D CTCTTCAATT AAAAAAAAAGAAAGCAGAAAGAGAAGACCACAAAACAAC/-AAAAAAAAGAAAGCAGAAAGAGAAGACCACAAAACAA- CACAAAACAA 3070 hom 78 het 23 0 27 6 N/A 0 0 249575 CASAVA_Build 11 81779863 2D TATTTTAAAC AT/-- ATATTTAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AT 3 2 249576 CASAVA_Build 11 81786835 1D TGTGCATGAT G/- GGATATAAGG 3070 hom 160 het 57 0 54 3 G 3 2 249577 CASAVA_Build 11 81792223 1I ATTTGGACTT -/C TCAACTACAG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 C 0 1 249578 CASAVA_Build 11 81800689 3I TTTTTTAATT ---/TTA TTATTATTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 TTA 2 3 249579 CASAVA_Build 11 81803163 1I TTTCTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 A 10 11 249580 CASAVA_Build 11 81805750 1I GACATTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 15 8 T 11 12 249581 CASAVA_Build 11 81812266 1I TGACGACCTT -/A AAAAAAAAAA 2562 het 1266 hom 35 9 11 15 A 15 16 249582 CASAVA_Build 11 81813380 1I GGCAGCATGC -/A ATCTGTAATC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 2 249583 CASAVA_Build 11 81820405 1D GACAGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 374 hom 31 4 13 14 A 15 14 249584 CASAVA_Build 11 81824197 1D AGTAAAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 12 11 249585 CASAVA_Build 11 81824393 2D TATTTATGAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 35 0 26 10 TG 9 8 249586 CASAVA_Build 11 81840905 1I TTGTGCAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 G 4 5 249587 CASAVA_Build 11 81868977 1D CACTTCAGCC T/- CCCAAAGTGC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 1 0 249588 CASAVA_Build 11 81877109 1D TTACAAAAAA C/- AAACTAACAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 1 0 249589 CASAVA_Build 11 81879004 1D TTCCTAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 558 hom 29 2 13 14 T 13 12 249590 CASAVA_Build 11 81879643 1D GGTGAATAAC T/- TTTTGTTGTG 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 5 4 249591 CASAVA_Build 11 81881490 2D TGCAATGCCC CT/-- GTTTTTGTTC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CT 1 0 249592 CASAVA_Build 11 81881947 1D TGCTTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 132 het 48 0 44 8 A 9 8 249593 CASAVA_Build 11 81883744 2I TAGCTAACAC --/TG TGCAATTTTG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 TG 1 2 249594 CASAVA_Build 11 81887588 1I TGTTGGATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 684 hom 29 2 22 5 T 9 10 249595 CASAVA_Build 11 81900639 4I TTATTTTGTG ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 105 het 48 0 36 12 TGTT 3 4 249596 CASAVA_Build 11 81904568 1D TTTCTATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 38 2 31 5 A 12 11 249597 CASAVA_Build 11 81923011 1D AAATGGTCAT A/- AAAAATAACC 3070 het 3070 ref 41 25 16 1 A 6 5 249598 CASAVA_Build 11 81927769 3D TCATCAAAAA ATT/--- ATATGAAGAG 3070 het 2649 hom 30 7 22 1 ATT 1 0 249599 CASAVA_Build 11 81936492 1I AGCAAATACC -/A AAAAAAAAAA 1226 het 1226 ref 34 24 4 6 A 15 16 249600 CASAVA_Build 11 81943120 2D AAAGATTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 44 5 19 20 A 18 16 249601 CASAVA_Build 11 81956197 1I GGGAAATGTC -/A AGACCAGAGG 3070 hom 45 het 29 0 16 13 A 1 2 249602 CASAVA_Build 11 81965333 2D TCTTTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 TC 9 8 249603 CASAVA_Build 11 81973117 1I TAGTTTTCTT -/C TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 C 0 1 249604 CASAVA_Build 11 81981601 1D GCAACATAAC G/- GAGATAGCCA 3070 het 3070 hom 43 19 20 8 G 2 1 249605 CASAVA_Build 11 81990717 1D TACTATGTTT C/- CCCATTATGC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 C 4 3 249606 CASAVA_Build 11 81994594 1D TTATAAAGCT A/- TTAATGCTAT 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 A 1 0 249607 CASAVA_Build 11 81994683 1D TTTGCCTTCT A/- AAAAGTTTGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 5 4 249608 CASAVA_Build 11 81995864 1D TGGGATACAC T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 249609 CASAVA_Build 11 82009140 1I TCTTGACTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 960 hom 35 3 19 13 A 14 15 249610 CASAVA_Build 11 82024139 1D ACACTGGAAG A/- AGAATAACAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 A 2 1 249611 CASAVA_Build 11 82025747 5D AATCCTTTCT TAAGA/----- TATTTGTGAA 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 TAAGA 1 0 249612 CASAVA_Build 11 82031083 4I ACCTCCCCTG ----/CTCT CTCTTCTTCC 3070 hom 123 het 49 0 41 8 CT 2 4 249613 CASAVA_Build 11 82047644 3I ATGAGGATGT ---/GAA GAAAAAGGAG 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 GAA 1 2 249614 CASAVA_Build 11 82047988 1D TCACTTGAAG T/- TCAGGAGTTC 2564 het 2564 ref 21 9 6 6 T 2 1 249615 CASAVA_Build 11 82049721 2D TATGTTTGCG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 TA 6 5 249616 CASAVA_Build 11 82054184 1I ACTCAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 9 10 249617 CASAVA_Build 11 82057455 1I ACTTTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 10 11 249618 CASAVA_Build 11 82079167 3I TGGGATTCAG ---/AAC AACATGTCAC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 AAC 1 2 249619 CASAVA_Build 11 82080064 1D ACAAAACAAG A/- AAAAAAGTGG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 7 6 249620 CASAVA_Build 11 82087091 1D TGAGAGCAGA G/- GCCCTTGTGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 G 2 1 249621 CASAVA_Build 11 82092547 2D AAATTTTCCC CT/-- GTGTCTCCAA 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 CT 1 0 249622 CASAVA_Build 11 82094060 1D25M1D TCACACAAGT AAAAAAAAAATTATTCAAAAGCCACAG/-AAAAAAAAATTATTCAAAAGCCACA- TACCTATAGC 3070 het 3070 hom 50 25 26 9 N/A 0 0 249623 CASAVA_Build 11 82095243 3I CTCTCTTCAG ---/TTT TTTTAAGTAA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 4 7 249624 CASAVA_Build 11 82103306 11D AGGAGTCCAA ACCCTGTCCCC/----------- ACCCTTTGAG 3070 het 3070 hom 65 29 30 12 ACCCTGTCCCC 1 0 249625 CASAVA_Build 11 82107136 3I AGTTTTTGTT ---/CTG AGATGCTTTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 CTG 0 1 249626 CASAVA_Build 11 82110406 1D GCAAATGGGA G/- CTGCTGGCAC 3070 hom 138 het 53 0 44 9 G 1 0 249627 CASAVA_Build 11 82149117 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1087 hom 31 4 17 10 T 15 16 249628 CASAVA_Build 11 82193520 1I CACGCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 10 11 249629 CASAVA_Build 11 82196432 1D ACAAAAACAG A/- GACATAAATT 3070 het 3070 hom 48 22 24 3 A 1 0 249630 CASAVA_Build 11 82217062 2D CAGTCCCAGG TC/-- TGCCTCTCAT 3070 het 3070 hom 44 17 26 3 TC 1 0 249631 CASAVA_Build 11 82219922 18D CTGAAAATGA CTATTGGTAAAATAATGC/------------------ CTACAAGTTG 3070 het 3070 ref 29 14 13 5 CTATTGGTAAAATAATGC 1 0 249632 CASAVA_Build 11 82232680 1I CTGATGTGGG -/A AAAAAAAAAA 2322 het 2317 hom 39 11 12 16 A 17 18 249633 CASAVA_Build 11 82257285 1D CAGAGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 11 10 T 11 10 249634 CASAVA_Build 11 82263715 1D GTAAAACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1545 hom 25 8 13 5 A 12 11 249635 CASAVA_Build 11 82302960 2D TGAAACAAAG TT/-- TGTGTTAAGT 3070 het 3070 hom 18 7 10 1 T 3 1 249636 CASAVA_Build 11 82304379 8I AAATCCTTGG --------/CATCCATC CTAGGGCTTA 3070 het 3070 ref 52 22 19 11 CATC 0 2 249637 CASAVA_Build 11 82305845 1I GGTGCTTACC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 7 8 249638 CASAVA_Build 11 82314676 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 961 het 961 ref 26 11 4 11 A 15 14 249639 CASAVA_Build 11 82316321 1D GTTGTATTTC A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 A 7 6 249640 CASAVA_Build 11 82319445 4I TTAAAAAAAA ----/AAAG AAGAAGTTAC 3070 het 3070 hom 46 11 24 11 AAAG 0 1 249641 CASAVA_Build 11 82329155 1I AAGATCAATG -/A AAAAAAAAAA 1603 het 1603 ref 23 14 5 4 A 10 11 249642 CASAVA_Build 11 82337172 2I TCTATATCTT --/TA TGTCTTCGAT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 TA 0 1 249643 CASAVA_Build 11 82341987 1I GTTTTCTTGA -/T TTTTTTCAAA 2133 het 2133 ref 21 9 7 5 T 6 7 249644 CASAVA_Build 11 82352043 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 C 1 0 249645 CASAVA_Build 11 82359916 1I GTCTAGCTCA -/G GGTTTGTGGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 2 3 249646 CASAVA_Build 11 82372289 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 12 11 249647 CASAVA_Build 11 82379756 1I AGTGGTCCTG -/C CCACTCACCA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 C 2 3 249648 CASAVA_Build 11 82391391 7I TTGGGAGGCT -------/GAGGCAG GAGGATCATT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 GAGGCAG 0 1 249649 CASAVA_Build 11 82400110 1I ACATAATGTC -/A AGTTTGTAAG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 A 1 2 249650 CASAVA_Build 11 82411666 4I TATGTATGTG ----/TATA TATATATATA 3070 het 3063 hom 29 12 11 6 TA 6 8 249651 CASAVA_Build 11 82414565 13D TAGATAAACA GATATAGATAGAT/------------- GATATAGATA 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 GATATAGATAGAT 1 0 249652 CASAVA_Build 11 82415506 1D TATTTTTATT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 8 7 249653 CASAVA_Build 11 82420223 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 10 11 T 12 13 249654 CASAVA_Build 11 82430720 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 850 het 850 ref 27 10 5 12 A 19 18 249655 CASAVA_Build 11 82435905 1D CAATCTACTC T/- TATTGGCCTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 T 2 1 249656 CASAVA_Build 11 82443389 1I TGTGTCTACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 11 12 A 11 12 249657 CASAVA_Build 11 82444598 1D GATCTTGGAC T/- TTTCCAGCCT 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 T 4 3 249658 CASAVA_Build 11 82452811 5I ATGTTATTTC -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 het 2283 hom 31 7 16 8 TTTCT 2 3 249659 CASAVA_Build 11 82455122 1I ATTAGAATGA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 T 7 8 249660 CASAVA_Build 11 82460244 1D CAGAGCTTTT C/- CCCTTAGCTG 2891 het 2891 ref 27 11 9 7 C 4 3 249661 CASAVA_Build 11 82466163 19D GTATGCAGTT ATGTATTCATGAAGTATTC/------------------- ATGTATTCAT 3070 het 3070 ref 34 24 9 8 ATGTATTCATGAAGTATTC 1 0 249662 CASAVA_Build 11 82496258 1I CTTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 9 10 249663 CASAVA_Build 11 82506140 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1055 hom 27 6 15 8 A 19 18 249664 CASAVA_Build 11 82511818 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2394 hom 29 7 16 6 T 11 12 249665 CASAVA_Build 11 82524577 1I AAAAATTTAA -/T TTTTGTGGAT 2782 het 2782 ref 14 7 7 0 T 4 5 249666 CASAVA_Build 11 82526691 1D CATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1848 hom 29 7 13 9 T 13 12 249667 CASAVA_Build 11 82527763 1D CCGATCTTTC T/- TTTACTCAAC 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 T 4 3 249668 CASAVA_Build 11 82530838 1D ATTCATATAG A/- AAAGTCTTAC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 4 3 249669 CASAVA_Build 11 82533651 7D TCAAAAACTT AAACCCA/------- GGGGTCCCTC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AAACCCA 1 0 249670 CASAVA_Build 11 82534291 2D TGTTCTAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 2798 het 225 hom 23 1 10 12 T 20 18 249671 CASAVA_Build 11 82535582 1I ACAGGAGGAG -/T AAAAACATTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 0 1 249672 CASAVA_Build 11 82538899 1D TTTCAATGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 10 9 249673 CASAVA_Build 11 82539048 1D GTCAAATATA C/- AATGGTAAAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 1 0 249674 CASAVA_Build 11 82539519 1I TTTTTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 11 12 249675 CASAVA_Build 11 82541889 1I TTAAAGAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 633 hom 24 2 19 3 A 9 10 249676 CASAVA_Build 11 82543714 3D CTTTGGAGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 29 0 16 13 T 17 14 249677 CASAVA_Build 11 82545364 16D CAGAAAGCCT CCGCTCCCTCCAACCC/---------------- CCGCTCCCTC 2684 hom 49 het 23 0 12 13 CCGCTCCCTCCAACCC 2 1 249678 CASAVA_Build 11 82567800 1D TGTAAAATCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 10 9 249679 CASAVA_Build 11 82570209 1D TTGAAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 2998 het 1538 hom 23 8 10 5 T 13 12 249680 CASAVA_Build 11 82570486 2D TATTGAAGAT AC/-- ACAGTAAAAA 1595 het 1595 ref 23 17 4 3 AC 2 1 249681 CASAVA_Build 11 82574138 2I TATTTTGCAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 AT 8 9 249682 CASAVA_Build 11 82574292 1D CTAAAGGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 10 9 249683 CASAVA_Build 11 82575349 5D AGCTTTTTTA TTTTT/----- TTAAGAATCA 3070 het 3070 ref 36 19 16 5 T 7 2 249684 CASAVA_Build 11 82576165 1D AATGGGTAGT G/- TGGATGAGAG 2548 het 2548 ref 18 12 6 4 G 1 0 249685 CASAVA_Build 11 82577122 5D TTTTCTTTTA AATTG/----- AATTGAAGTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 4 AATTG 2 1 249686 CASAVA_Build 11 82584677 2D CTAGGGCAAC AG/-- GGGCCCACCA 2803 het 2803 ref 18 8 8 2 AG 1 0 249687 CASAVA_Build 11 82589008 3D GTCTTTTAAA CTT/--- CTTTGGCTTT 3070 het 3070 ref 53 29 17 7 CTT 2 1 249688 CASAVA_Build 11 82609606 6D CTATTTCTGG ATATTT/------ ATATTTATCT 3070 het 3070 hom 44 20 21 6 ATATTT 2 1 249689 CASAVA_Build 11 82614255 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2754 het 161 hom 24 4 7 13 A 13 12 249690 CASAVA_Build 11 82615491 5D CCCTGCCTCT AAACA/----- AAACAAAACA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 AAACA 5 4 249691 CASAVA_Build 11 82616172 5D TTGTGGTGAT ATGAG/----- AGAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 ATGAG 1 0 249692 CASAVA_Build 11 82620792 3D AAATTTTAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3052 hom 8 het 23 0 10 13 T 17 14 249693 CASAVA_Build 11 82626074 5D AAAGAAAAAA CTTTT/----- CTTTTGAGGA 3070 het 3070 hom 37 16 19 4 CTTTT 2 1 249694 CASAVA_Build 11 82627695 1I CTAGACCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 11 12 249695 CASAVA_Build 11 82628362 1D TTGTGCCTTT G/- TCAGATCAGT 3070 hom 126 het 48 0 43 6 G 1 0 249696 CASAVA_Build 11 82631133 1I GGTGAGATTT -/G GGTGTATTTA 3070 hom 117 het 43 0 36 7 G 2 3 249697 CASAVA_Build 11 82635810 1I GAGATGTAGA -/T TTTTTTTTTT 2700 het 2700 ref 28 9 7 12 T 13 14 249698 CASAVA_Build 11 82647037 1D TTAATGAAAC A/- AAAAAAAAAG 1489 het 1489 ref 45 33 4 8 A 10 9 249699 CASAVA_Build 11 82647491 3D GTTTGACAAC ATT/--- ATAAGCTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 ATT 1 0 249700 CASAVA_Build 11 82657120 1D AATGGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 12 1 8 3 A 13 12 249701 CASAVA_Build 11 82661791 1D63M1D CTGGCACATT AAATAAACACTAAATATTAGTGTTTATATGTTATTAATATATAGCTTTTTTAAAACCTTAAGATA/-AATAAACACTAAATATTAGTGTTTATATGTTATTAATATATAGCTTTTTTAAAACCTTAAGAT- AATTATTTAA 3070 hom 163 het 38 0 55 4 N/A 0 0 249702 CASAVA_Build 11 82662810 1D ATTGATAAGG A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 7 6 249703 CASAVA_Build 11 82670718 1D CCTCAAGCTT G/- TCGAGAACAC 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 G 1 0 249704 CASAVA_Build 11 82671761 2I CTCTTTACAG --/AA AAAGTTTGTC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 3 5 249705 CASAVA_Build 11 82678935 1D GAAAATCCTT A/- ATACATGTAT 3070 het 3070 ref 38 22 15 2 A 2 1 249706 CASAVA_Build 11 82692921 1D CTGCCAGTTG C/- CCCATTGGCT 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 C 4 3 249707 CASAVA_Build 11 82695778 1D AGAAAATGCA T/- TTTTTTTTAT 2995 het 2995 ref 23 11 7 6 T 9 8 249708 CASAVA_Build 11 82718797 1I AAAATAAAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 7 8 249709 CASAVA_Build 11 82723090 1I TTCTGCCAGC -/A GATGGCCTTT 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 A 0 1 249710 CASAVA_Build 11 82726484 1D CTAAGAAGTC A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 A 7 6 249711 CASAVA_Build 11 82758286 1D CATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1722 het 1722 ref 39 24 5 10 T 13 12 249712 CASAVA_Build 11 82768363 1I AGCATTCCAC -/A AAAAAAAAAA 1570 het 1570 ref 43 34 5 4 A 10 11 249713 CASAVA_Build 11 82789369 1D GAAGAGCCGG C/- CCCTGTTTTC 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 C 4 3 249714 CASAVA_Build 11 82796453 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2655 het 2655 ref 25 9 8 8 T 12 13 249715 CASAVA_Build 11 82812666 9I GAGATATTTT ---------/GCAGACCCG GCAATCCCGC 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 GCAGACCCG 0 1 249716 CASAVA_Build 11 82827302 2I AGACTTCCTC --/TT TTTTTTTTTT 2295 het 2295 ref 44 19 11 14 T 13 15 249717 CASAVA_Build 11 82829991 1I AGAGGGAAGA -/C CCCCCCCTAT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 C 7 8 249718 CASAVA_Build 11 82847036 1I TATAATTGTT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 6 7 249719 CASAVA_Build 11 82851948 1I GGCTATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 18 8 A 12 13 249720 CASAVA_Build 11 82853510 2D AGTGTTTACA AT/-- ATGAAGATTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 AT 2 1 249721 CASAVA_Build 11 82857818 1I AGTAATGACC -/A AAAAAAAAAA 2167 het 2167 ref 41 17 8 16 A 15 16 249722 CASAVA_Build 11 82858858 3D ACACAATTAC GAT/--- GATATTTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 GAT 2 1 249723 CASAVA_Build 11 82860671 3I AGAAACATTT ---/GGA GGAGGAGTTT 3070 het 3070 hom 60 21 35 4 GGA 2 3 249724 CASAVA_Build 11 82864408 5D TCTCTTCTTT TTTTC/----- TTTTCTTTTC 2925 het 482 hom 11 1 7 7 TTTTC 4 3 249725 CASAVA_Build 11 82866434 1I AAAAGAGGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 381 hom 36 1 27 8 T 9 10 249726 CASAVA_Build 11 82868066 1D ATGCTATAAC G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 G 9 8 249727 CASAVA_Build 11 82873198 9D AGAAGACCCA GAATTTTTT/--------- GAATTTTTTG 3070 hom 84 het 37 0 27 11 GAATTTTTT 2 1 249728 CASAVA_Build 11 82873811 1I CTGATCAGGT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 7 8 249729 CASAVA_Build 11 82874843 1D CCCAAATTTT C/- CTAGTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 C 2 1 249730 CASAVA_Build 11 82874956 1D AAAATAAAAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 A 8 7 249731 CASAVA_Build 11 82875671 1D GCTGCTGTAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 T 8 7 249732 CASAVA_Build 11 82876020 4D AACAATAACT AACA/---- AACATTTATT 3070 hom 108 het 42 0 37 7 AACA 2 1 249733 CASAVA_Build 11 82878648 3I AGAGGCATGA ---/GAT GATATAAACT 3070 hom 129 het 49 0 43 6 GAT 1 2 249734 CASAVA_Build 11 82880573 4I TCCCTTCTGA ----/ACTT ACTTACTTCA 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 ACTT 2 3 249735 CASAVA_Build 11 82883421 2D TACCAGTGCC TA/-- TGTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 TA 1 0 249736 CASAVA_Build 11 82886226 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAACAAAA 466 het 145 hom 20 1 4 15 A 5 6 249737 CASAVA_Build 11 82887466 1D AAGAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 13 12 249738 CASAVA_Build 11 82891158 4I TAAAATATAA ----/TCTC TCTCTATTTT 3070 hom 61 het 24 0 21 3 TC 2 4 249739 CASAVA_Build 11 82893666 10I TCCATGAGCA ----------/TGAGCCCACT GCCACACTTC 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TGAGCCCACT 0 1 249740 CASAVA_Build 11 82900418 1D AGAAGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 449 hom 42 4 27 11 T 18 17 249741 CASAVA_Build 11 82911027 1I GGTGTGTACC -/A AAAAGAAAGT 3070 hom 105 het 39 0 35 5 A 4 5 249742 CASAVA_Build 11 82911220 1D CAACCTATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 A 11 10 249743 CASAVA_Build 11 82911496 2D AATTTTAGAG CC/-- CCCCCCCCCT 1875 het 209 hom 17 3 5 10 C 11 9 249744 CASAVA_Build 11 82914673 2D AAATGAGTCT CA/-- GTTTCTTCAT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 CA 1 0 249745 CASAVA_Build 11 82917239 2D CAAATATTGC CT/-- CTTTGAAGCC 3070 hom 84 het 32 0 29 5 CT 2 1 249746 CASAVA_Build 11 82919883 1D CTTTTGTGTA C/- CAAAGAACAC 3070 hom 105 het 42 0 35 8 C 2 1 249747 CASAVA_Build 11 82921727 1D AGAGAGGTAG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 7 6 249748 CASAVA_Build 11 82928401 4D AAGTAGAATG TAAA/---- TAAATATCAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 TAAA 2 1 249749 CASAVA_Build 11 82930769 1D GGCCTATAGA T/- TCCCCCAAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 1 249750 CASAVA_Build 11 82945715 3I CCATGATTAC ---/AAT AATTGTCTGG 3070 het 3070 ref 54 29 16 9 AAT 1 2 249751 CASAVA_Build 11 82948810 1D TGAACTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1738 het 1738 ref 37 24 5 8 T 13 12 249752 CASAVA_Build 11 82985510 1D TCTTTTTCTG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 T 8 7 249753 CASAVA_Build 11 82990327 22D CTCGGCCTCC CATGTAGCTGGGACTACAGGCA/---------------------- CATGCCAACA 3070 het 3070 ref 32 17 15 3 CATGTAGCTGGGACTACAGGCA 1 0 249754 CASAVA_Build 11 82992338 1I TCTAACACTT -/G GAATCAACTG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 G 1 2 249755 CASAVA_Build 11 83001529 1I GAGGCTCCAT -/C CCAGGGCTTT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 C 2 3 249756 CASAVA_Build 11 83008939 3D22M4D TACTATAATG TGATGATATCTTTAAAAAAAATCTGTTTT/---TGATATCTTTAAAAAAAATCTG---- TTTAAACACA 3070 het 3070 hom 38 19 24 4 N/A 0 0 249757 CASAVA_Build 11 83015679 2D GGCAAGCAAT GG/-- GATGAGAGAG 3070 het 3070 ref 34 15 17 2 G 3 1 249758 CASAVA_Build 11 83026276 9D TTCAACCCTG GATCGCCGT/--------- GAAGCCATTT 3070 het 3070 ref 47 30 16 8 GATCGCCGT 1 0 249759 CASAVA_Build 11 83031303 1D TCATGCATGC T/- TTGTTTTATA 3070 het 3070 ref 52 28 17 7 T 3 2 249760 CASAVA_Build 11 83035050 4I ATATGAAACA ----/GAGT GAGAGAGAGA 3070 het 2369 hom 36 14 12 10 GAGT 0 1 249761 CASAVA_Build 11 83125134 1D TTTTAGATAC A/- AAAAAAAAAG 1236 het 1236 ref 43 34 4 5 A 10 9 249762 CASAVA_Build 11 83127667 1D CAGAGCTCAG T/- TAAGTGTGCA 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 T 2 1 249763 CASAVA_Build 11 83130545 1I TAAAAAAAAA -/G AAATGCAAAA 3070 het 2409 hom 23 8 11 4 G 0 1 249764 CASAVA_Build 11 83131000 7D ATAACTATGT ATATGAA/------- ATATCAAAAC 3070 het 3070 hom 20 9 12 2 ATATGAA 1 0 249765 CASAVA_Build 11 83134493 1I ACGCTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 1830 het 1830 ref 15 6 4 5 A 13 14 249766 CASAVA_Build 11 83141429 1I CAATAGAGAG -/A AAAATGTTGA 3070 het 3070 ref 45 26 18 1 A 4 5 249767 CASAVA_Build 11 83166842 4I CTTGCTTTAT ----/AGTC AGTCCTCTTT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 AGTC 1 2 249768 CASAVA_Build 11 83178230 1D CACCCCTAAA C/- AAACTGATGA 1176 het 1176 ref 13 5 5 3 C 1 0 249769 CASAVA_Build 11 83186193 1D GTCTGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2568 hom 37 9 22 6 T 11 10 249770 CASAVA_Build 11 83189358 1I GCTTATAGTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 A 8 9 249771 CASAVA_Build 11 83194048 2I AGCTTCTCCC --/AT ATATATATAT 2225 het 2225 ref 26 12 7 7 AT 6 7 249772 CASAVA_Build 11 83205680 2D TGCCCATGCA TT/-- GTTGGCCATG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 2 0 249773 CASAVA_Build 11 83214780 1I CAGGACACCA -/T TTGAAAGGCT 3070 het 3070 hom 47 18 23 7 T 2 3 249774 CASAVA_Build 11 83226772 1I ATTAGGACTC -/T TGACATTTGT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 T 1 2 249775 CASAVA_Build 11 83232306 2I TCATGAACGG --/AA AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 8 10 249776 CASAVA_Build 11 83233075 1D ATCTCTATTG A/- AAAAAAAAAA 2205 het 158 hom 11 1 7 3 A 15 14 249777 CASAVA_Build 11 83235619 5I CTTCTAATCA -----/TTATT TTATCTCCCA 1353 het 715 hom 15 4 5 6 TTATT 0 1 249778 CASAVA_Build 11 83260330 22I CCACTATGTG ----------------------/CTCAGTCACAATGATTATGTGC CACGTTATCT 3070 het 3070 hom 45 20 27 3 CTCAGTCACAATGATTATGTGC 0 1 249779 CASAVA_Build 11 83262848 8D35M4D AAGGAAAGAA AGAAAGATAGAAAGAGAAAGAGAGAAAAAAGGACAAAAGAAAGAGAA/--------AGAAAGAGAAAGAGAGAAAAAAGGACAAAAGAAAG---- AGAAAGACAG 3070 het 3070 hom 25 14 13 6 N/A 0 0 249780 CASAVA_Build 11 83263232 1I TTTATTTTTT -/A TATTTTTTTA 3070 het 1354 hom 13 3 10 0 A 0 1 249781 CASAVA_Build 11 83266437 4D GTGAACTAAG ATAA/---- ATAGAGTCAA 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 ATAA 1 0 249782 CASAVA_Build 11 83269739 1D CCATTTTTTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 10 het 39 1 25 13 A 8 7 249783 CASAVA_Build 11 83271148 1D TTAAATCAAA T/- TTAGAGCCCC 3070 het 3070 ref 45 22 18 7 T 3 2 249784 CASAVA_Build 11 83283657 1I TGCAAATGAC -/A ACAATGGATT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 1 2 249785 CASAVA_Build 11 83288376 2I TGTGAGGTCT --/CC CCAGCCACGT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 C 2 4 249786 CASAVA_Build 11 83297432 1I ATATGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 T 11 12 249787 CASAVA_Build 11 83307453 1D GCCTGTCAAA G/- GGCAGAGTGG 3070 het 3012 hom 30 8 11 11 G 3 2 249788 CASAVA_Build 11 83307532 1D AATCTTGGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 11 10 249789 CASAVA_Build 11 83309042 1D TTTATTTTCT C/- TTCTCTGAGA 3070 het 3070 hom 43 20 19 5 C 1 0 249790 CASAVA_Build 11 83309478 1D AAGCTAGAAA G/- TTGTGGAGGC 3070 het 3070 ref 48 27 12 9 G 1 0 249791 CASAVA_Build 11 83310543 1D CACTTTTAAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 8 7 249792 CASAVA_Build 11 83320858 3D CTTGCAATCA AAC/--- AACAACATTA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 AAC 3 2 249793 CASAVA_Build 11 83335930 1D ACATTCTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 T 10 9 249794 CASAVA_Build 11 83341393 2D AAAGCAAAAA CT/-- CTCTCATTGC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 CT 3 2 249795 CASAVA_Build 11 83363159 1D AGGTGTTTTG T/- TAAGTATTAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 2 1 249796 CASAVA_Build 11 83363328 2D CGTATTTGGT CA/-- CAGAGTCTAT 3070 hom 169 het 62 0 57 6 CA 2 1 249797 CASAVA_Build 11 83377653 1I TCTGTAATGA -/C ATGGTTTTTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 0 1 249798 CASAVA_Build 11 83385813 2D AACTAAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 36 1 28 8 A 13 11 249799 CASAVA_Build 11 83388649 1D TGGAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 249800 CASAVA_Build 11 83393590 1I ACCAGAGTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 9 10 249801 CASAVA_Build 11 83415297 6D AGTTCCACAC TTATAG/------ TTATATATCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TTATAG 1 0 249802 CASAVA_Build 11 83419924 1D CCAGAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1845 hom 30 8 12 10 A 17 16 249803 CASAVA_Build 11 83425107 1D CTCCAAAATG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 8 249804 CASAVA_Build 11 83449229 4D AACTTTCCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 3 T 15 11 249805 CASAVA_Build 11 83452226 1I TCAAGGTACT -/A AAATATTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 4 249806 CASAVA_Build 11 83457221 11D2M2D AAATATTAAT GGAGTTCCCAGACTT/-----------AC-- AGCAAATAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 3 N/A 0 0 249807 CASAVA_Build 11 83467604 1I GCATCTTAAA -/C TTAACATTGT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 C 0 1 249808 CASAVA_Build 11 83467970 1I TTTTGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 11 12 249809 CASAVA_Build 11 83485592 1D CATTTACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 37 2 28 7 A 13 12 249810 CASAVA_Build 11 83496185 1I CCATCTTTAA -/T TTTTCCTTAT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 T 4 5 249811 CASAVA_Build 11 83497483 1I AGAACAGAGA -/C GGCAAGTTGC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 C 0 1 249812 CASAVA_Build 11 83511276 1D GCAAACAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 120 het 48 0 39 9 A 10 9 249813 CASAVA_Build 11 83522319 3D TAATTTTTTC CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 hom 73 het 31 0 24 7 CTT 5 4 249814 CASAVA_Build 11 83531611 1D GCCAATTCTC A/- TACTAAATCC 3070 het 3070 ref 46 23 18 6 A 1 0 249815 CASAVA_Build 11 83531875 2I TTTTAGTCAG --/TA TATATAAAAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 TA 3 4 249816 CASAVA_Build 11 83534953 1I TATCATCTTA -/C CTCCATGGTG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 1 2 249817 CASAVA_Build 11 83541022 4I TTTTAAAATC ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 72 het 35 0 24 11 TGTT 4 5 249818 CASAVA_Build 11 83558389 1D CATGATAAAA C/- CCCATCTCTA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 4 3 249819 CASAVA_Build 11 83565009 2D CAGTAAAGCT TA/-- TATATATATA 3070 hom 30 het 19 0 11 8 TA 9 8 249820 CASAVA_Build 11 83565564 5D TTGCTCTCTC TCTTT/----- TCTTTTCTTT 3070 hom 84 het 38 0 29 10 TCTTT 4 3 249821 CASAVA_Build 11 83566696 1D ATGATTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 32 1 26 5 A 11 10 249822 CASAVA_Build 11 83590272 1D GGTTCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 749 hom 30 3 18 9 T 15 14 249823 CASAVA_Build 11 83591824 1I AAAGAAATAT -/A AAAAAATTCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 6 7 249824 CASAVA_Build 11 83594247 3D GAATTAAATT AAA/--- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 11 8 249825 CASAVA_Build 11 83598309 1I GTTCCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 11 12 249826 CASAVA_Build 11 83599236 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAATCTTC 3062 hom 42 het 17 0 15 2 AG 0 1 249827 CASAVA_Build 11 83609566 1I TTCACCTCCA -/G GGCTCAAGCG 3070 hom 54 het 22 0 17 5 G 2 3 249828 CASAVA_Build 11 83647999 1D ACTTATTACT G/- GAGATTAGTT 3070 hom 63 het 23 0 20 3 G 2 1 249829 CASAVA_Build 11 83648727 4D TTACCATCTC TGTT/---- TGATCCTCCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TGTT 1 0 249830 CASAVA_Build 11 83655923 5D TACAAAAGTA TAGAT/----- TAAAGTAGTT 3070 het 3070 hom 53 24 24 6 TAGAT 1 0 249831 CASAVA_Build 11 83657342 2D TTAGTAGAGA TG/-- GGGTTTCACT 1852 het 934 hom 8 3 4 1 TG 1 0 249832 CASAVA_Build 11 83657730 4D ACTGAGAAAG TATC/---- TACTATTGCT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 TATC 1 0 249833 CASAVA_Build 11 83664048 1D TGTGCTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 13 12 249834 CASAVA_Build 11 83667164 3D TTCCAGATCA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 26 0 15 12 T 12 9 249835 CASAVA_Build 11 83667495 4D TAAACATTAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 TTTA 5 4 249836 CASAVA_Build 11 83676678 1I ACGGGAGAGA -/G GCAGTCCTTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 1 2 249837 CASAVA_Build 11 83684961 2I AAATACTTAG --/AA AATGAACAAC 3070 het 3070 ref 34 24 7 3 A 2 4 249838 CASAVA_Build 11 83685818 1D CCTCAAAGAA T/- TTGAAAAAAA 3070 het 506 hom 36 3 17 16 T 3 2 249839 CASAVA_Build 11 83701668 1I GCCCGGCCAA -/T TTTTTTTGTA 2618 het 846 hom 10 2 6 2 T 7 8 249840 CASAVA_Build 11 83889041 1D TGGTTGCAAG A/- AAAAAAAAAA 1862 het 1862 ref 29 15 8 7 A 15 14 249841 CASAVA_Build 11 83893325 1I AATTGTGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 9 10 249842 CASAVA_Build 11 83893522 1I AACATCTATA -/T ATTGACTCTA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 T 0 1 249843 CASAVA_Build 11 83904676 4I GTGTTCTTGA ----/ACAG ACAATGAGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ACAG 0 1 249844 CASAVA_Build 11 83925761 3D TGCCATAACC CTA/--- CTACTATATA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 CTA 3 2 249845 CASAVA_Build 11 83970604 1D CTCAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 1363 het 967 hom 21 5 5 11 A 19 18 249846 CASAVA_Build 11 84025476 1D GGGATGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 15 14 249847 CASAVA_Build 11 84067855 1I AATAAAAGAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 8 9 249848 CASAVA_Build 11 84070519 1D AACCTTATTG A/- AAAAAAAAAA 1294 het 1294 ref 32 20 4 8 A 12 11 249849 CASAVA_Build 11 84102881 2D AAAAAAAAAC AT/-- ATACCAAAAT 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 AT 2 1 249850 CASAVA_Build 11 84110238 2D CAGAAAGACC AA/-- AAAAAAAAAA 2933 het 2933 ref 33 11 10 12 A 15 13 249851 CASAVA_Build 11 84144125 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 60 het 26 0 20 7 T 8 7 249852 CASAVA_Build 11 84161066 4D CTGACAGCAT TAGA/---- TAGATCATTG 3070 het 3070 ref 40 23 17 1 TAGA 2 1 249853 CASAVA_Build 11 84190790 1D ACTTTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 1053 het 1053 ref 39 24 5 11 A 11 10 249854 CASAVA_Build 11 84198144 5I AATAAAAGTC -----/ATAAG ATAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 ATAAG 1 2 249855 CASAVA_Build 11 84207623 6I CCAGGCAGTC ------/CATTAT CATTATCATC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 CATTAT 1 2 249856 CASAVA_Build 11 84209421 1I GTGAAATACC -/T TTTTTTTTTT 2806 het 2806 ref 29 9 9 11 T 11 12 249857 CASAVA_Build 11 84210787 1D AATATCCTTT G/- CCCTCCAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 G 1 0 249858 CASAVA_Build 11 84221756 1D ATGAACTATA G/- AAAAATTTTA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 G 1 0 249859 CASAVA_Build 11 84227094 1I TGAATGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 37 1 29 7 A 10 11 249860 CASAVA_Build 11 84233023 1D AAAGTGGCTA G/- GCACAATGCC 3070 hom 69 het 29 0 23 8 G 2 1 249861 CASAVA_Build 11 84239068 1D CCACTTCGAC T/- TTAGCAAAAC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 3 2 249862 CASAVA_Build 11 84254893 1D TAGTGTAGTC T/- TCTGACAACA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 2 1 249863 CASAVA_Build 11 84273018 5D GTCTAAATGT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 AAAAC 5 4 249864 CASAVA_Build 11 84274553 1I GTAAAAACTG -/C CAAGATAACT 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 C 1 2 249865 CASAVA_Build 11 84277365 2D CATCTCAGGC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 20 12 2 A 11 9 249866 CASAVA_Build 11 84277803 5I TTAAAATCTC -----/TTATA TTAAACTTAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTATA 0 1 249867 CASAVA_Build 11 84283587 3D CCCCTTGCGG ATT/--- CTGAGCCAGC 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 ATT 1 0 249868 CASAVA_Build 11 84285834 2D TACTAGTTAC AT/-- ATATATATAT 2952 het 2952 ref 27 10 9 8 AT 8 7 249869 CASAVA_Build 11 84307034 4D GAGAAATTGT ACTC/---- ACTAAGTCAA 3070 hom 84 het 31 0 29 5 ACTC 1 0 249870 CASAVA_Build 11 84309406 2I TTTGTAAATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TG 7 8 249871 CASAVA_Build 11 84326077 1D ATACCAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2719 hom 33 9 11 13 A 17 16 249872 CASAVA_Build 11 84384751 1I TTGTGGACAA -/T TTTTTTTTTT 1141 het 1141 ref 42 31 3 8 T 10 11 249873 CASAVA_Build 11 84466335 4I GTCAAAAGTT ----/ATAC ATAAAAATGA 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 ATAC 0 1 249874 CASAVA_Build 11 84466648 4D GCTGTAAATG CTAA/---- CTAACATGTT 3070 het 3070 ref 47 24 22 2 CTAA 2 1 249875 CASAVA_Build 11 84467715 1D ATGTGTTTTA G/- GGGGGGGGTC 3070 het 3070 hom 56 18 27 11 G 9 8 249876 CASAVA_Build 11 84516075 2I AAAGCCTCCC --/CT GATATTTATC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 CT 0 1 249877 CASAVA_Build 11 84540075 1D GTACAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 551 hom 41 2 29 10 T 13 12 249878 CASAVA_Build 11 84590962 1I TCTAATCAAA -/T TTGCAAAGGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 2 3 249879 CASAVA_Build 11 84604706 1I TTTGGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 281 hom 20 2 14 4 A 13 14 249880 CASAVA_Build 11 84617881 1I CAACACAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 10 11 249881 CASAVA_Build 11 84662815 1I TGGAGAGGGG -/A AGGGATAGCA 3070 hom 45 het 23 0 15 8 A 1 2 249882 CASAVA_Build 11 84671211 1I AATAAAAATT -/A AAGAAAAAAC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 2 3 249883 CASAVA_Build 11 84671748 2D GGTCACAAAC AG/-- GGGAACAACA 3070 het 3070 ref 34 16 12 7 AG 1 0 249884 CASAVA_Build 11 84691000 2I AAGAAATAAC --/TT ATATTTTACT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 0 2 249885 CASAVA_Build 11 84698122 1I GTTTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1495 hom 29 7 20 2 A 15 16 249886 CASAVA_Build 11 84705647 1I AAAGCAATGT -/A AAAAAAGATA 3070 hom 132 het 53 0 45 8 A 6 7 249887 CASAVA_Build 11 84723934 1I GCATCTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 770 hom 35 2 28 5 T 11 12 249888 CASAVA_Build 11 84724289 2I CTCTTGTAAG --/GC AGGCCTTATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GC 0 1 249889 CASAVA_Build 11 84745749 1I TCTCTTATAG -/A AAATGGCACC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 3 4 249890 CASAVA_Build 11 84768865 1I ACAAAAAATG -/T TAAGACATGA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 1 2 249891 CASAVA_Build 11 84781118 1D TCACAAAACT A/- AAAAAAAAAA 1136 het 1136 ref 34 29 3 2 A 15 14 249892 CASAVA_Build 11 84784421 6D GCTGAGGCTT GAGTAG/------ CTCACAGTGT 3070 hom 63 het 22 0 21 3 GAGTAG 1 0 249893 CASAVA_Build 11 84795175 1I GAATTCTGTT -/A AAATCTAAGC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 3 4 249894 CASAVA_Build 11 84811665 1I TTTGGGTCCA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 8 9 249895 CASAVA_Build 11 84813738 6I ACAAAAAAAC ------/AAAAAA AAACCCACCA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 A 3 9 249896 CASAVA_Build 11 84865052 1I AATGTGAAGG -/C CCTAAGACAT 3070 hom 88 het 32 0 29 3 C 2 3 249897 CASAVA_Build 11 84876113 1I CCAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1311 het 1311 ref 36 22 4 10 A 15 16 249898 CASAVA_Build 11 84878577 1I AAGGACATGC -/A AAAAAATGAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 6 7 249899 CASAVA_Build 11 84883587 1I GTGATACCAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 8 9 249900 CASAVA_Build 11 84885549 4D AAGGAAAACT AACA/---- AACAGAAAGG 3070 het 3070 hom 30 11 15 6 AACA 2 1 249901 CASAVA_Build 11 84900417 1I TTGAAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 468 hom 39 2 28 9 T 13 14 249902 CASAVA_Build 11 85062976 1D TAAGCAGGCA T/- AAAAACTTTA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 T 1 0 249903 CASAVA_Build 11 85071305 1D TACTCCCCCC A/- ACGCGATCTT 2205 hom 28 het 15 0 8 7 A 2 1 249904 CASAVA_Build 11 85071349 1I AACGTGGAGT -/C CCTGGAGCCC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 2 3 249905 CASAVA_Build 11 85077850 2I ACATTTCTCT --/TC TGTCCTTTTC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TC 0 1 249906 CASAVA_Build 11 85083406 1I TTAAGGTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 34 2 26 6 T 11 12 249907 CASAVA_Build 11 85089029 1D TTTTTTTTTT G/- CCACAATAAC 3070 het 697 hom 35 11 16 8 G 1 0 249908 CASAVA_Build 11 85095568 2I AGTTTCACTC --/TT GTCACCCATG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 0 2 249909 CASAVA_Build 11 85096240 4D GGAGAATTGA ACAG/---- ACAAAGTCAA 3070 hom 117 het 41 0 40 2 ACAG 1 0 249910 CASAVA_Build 11 85112650 1I AATCCCAATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 302 hom 30 1 27 2 A 8 9 249911 CASAVA_Build 11 85124449 1I CTCCATGGCC -/A AAAAAAAAAA 3019 het 2038 hom 21 7 9 5 A 12 13 249912 CASAVA_Build 11 85135984 1I TATGTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 673 hom 40 2 30 8 A 12 13 249913 CASAVA_Build 11 85139479 1D CATCACAATG A/- ATGGTGTCTC 3070 hom 159 het 60 0 53 8 A 2 1 249914 CASAVA_Build 11 85145933 1I ATTCTAAAAA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 7 249915 CASAVA_Build 11 85148222 3D ATTCTGTACC AAA/--- AATAGCTACT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 5 2 249916 CASAVA_Build 11 85148459 4D AAGACATTAC TTCA/---- TTTTCTTTTT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TTCA 1 0 249917 CASAVA_Build 11 85149478 1I TGTGTCAAAG -/C CTCTGAGGGT 3070 hom 103 het 38 0 33 5 C 1 2 249918 CASAVA_Build 11 85155774 1I CAGCAATTAG -/T CAAAGTTAAA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 0 1 249919 CASAVA_Build 11 85162653 1I68M1I AGCTATGTGG -TTTTTTCTTTTACCAAGAGGAAGGAAAATCTCTAAAAGGAATAAATTATACACTAAACTTTCTGAAAA-/TTTTTTTCTTTTACCAAGAGGAAGGAAAATCTCTAAAAGGAATAAATTATACACTAAACTTTCTGAAAAT TCTCAAGCCC 3070 het 11 hom 31 1 47 9 N/A 0 0 249920 CASAVA_Build 11 85163284 5D ATGTGAAATG AGACC/----- AGTTAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 AGACC 1 0 249921 CASAVA_Build 11 85168329 1I TCATCAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 491 hom 33 2 25 6 T 11 12 249922 CASAVA_Build 11 85197578 1D CTCTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 24 9 A 13 12 249923 CASAVA_Build 11 85265147 4I GAAAGTAAGG ----/TGAA TGAATAGTAG 3070 het 3070 hom 50 15 31 4 TGAA 1 2 249924 CASAVA_Build 11 85324579 1I56M1I GCCCAGCCAT -GCTTAGTATGCATCTGGCCTGTGAACCTGTGCCCACTTGTCCATGTGCTTACTATG-/GGCTGGATGTGCATCTGGCCTATGACCCTGTGCCCACTTGTCCATGTGCTTACTGTGA AGCCTGTGCC 2448 het 2448 ref 53 62 7 10 N/A 0 0 249925 CASAVA_Build 11 85326644 1D CAAAAGTCTG A/- AAAAACATCT 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 A 6 5 249926 CASAVA_Build 11 85327601 1D ACTTTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 10 10 A 12 11 249927 CASAVA_Build 11 85331651 1I GTAATTGATC -/A GGGGCGCCCA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 A 0 1 249928 CASAVA_Build 11 85333826 1D TTATCCGTGA C/- AATCAACAAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 7 C 1 0 249929 CASAVA_Build 11 85342135 2I GGGAAGAGAC --/AA AGTTAGCCTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 A 1 3 249930 CASAVA_Build 11 85345739 1I AAACATACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 16 14 A 11 12 249931 CASAVA_Build 11 85348034 2D ATCAAAGCTC AA/-- TGGCTGGGCA 3070 het 3070 hom 34 9 18 9 A 2 0 249932 CASAVA_Build 11 85348900 4I CCATCCAAAG ----/ATCT ATTACTGAAG 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 ATCT 0 1 249933 CASAVA_Build 11 85353375 1D CCGTGCTCTG T/- TATGTCTTTC 3070 het 3070 ref 62 34 21 8 T 2 1 249934 CASAVA_Build 11 85356631 3I AGCCACTGCA ---/AAC AACAACAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AAC 2 3 249935 CASAVA_Build 11 85362597 1D TCTAGATGTC A/- AAACAGTACG 3070 het 3070 hom 51 19 23 9 A 4 3 249936 CASAVA_Build 11 85374345 4D CATCAGCTTA TTGG/---- TTGTTCTCTT 3070 het 3070 ref 39 24 13 5 TTGG 1 0 249937 CASAVA_Build 11 85407598 3I AAAAGAAAAA ---/AAG AATGAGATGG 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 AAG 0 1 249938 CASAVA_Build 11 85407962 1I ATATTCTTGA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 7 8 249939 CASAVA_Build 11 85411464 2I TTAGAAAAAC --/AT GTTCTTTTAC 1259 het 1259 ref 24 14 3 7 AT 0 1 249940 CASAVA_Build 11 85412965 1I ATTTTGTAAC -/A ATGGGTCCTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 1 2 249941 CASAVA_Build 11 85414234 1I AAAGCAAATA -/T TTACATAGCA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 2 3 249942 CASAVA_Build 11 85419866 1D GGATATAGAC A/- AAATATATAG 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 A 4 3 249943 CASAVA_Build 11 85421960 2I ATGGTGCATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 GT 5 6 249944 CASAVA_Build 11 85423815 1D TGAGGAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 18 5 T 13 12 249945 CASAVA_Build 11 85424471 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAC 1674 het 1674 ref 12 6 5 1 A 10 9 249946 CASAVA_Build 11 85426388 1D GACACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 11 10 249947 CASAVA_Build 11 85427411 3I CGGAGGTTGC ---/AGT GAGCTGAGAT 1071 het 1071 ref 10 3 3 4 AGT 0 1 249948 CASAVA_Build 11 85427801 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 13 14 249949 CASAVA_Build 11 85433274 2I TTTATTACAC --/AT GATTAAGTGA 3070 het 3070 ref 34 19 8 7 AT 0 1 249950 CASAVA_Build 11 85443997 3I TCCAGCCTGG ---/ACA ACAAGAGCAA 1510 het 1510 ref 20 8 6 6 ACA 1 2 249951 CASAVA_Build 11 85444018 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1480 het 1480 ref 23 11 4 8 A 15 16 249952 CASAVA_Build 11 85444193 4I GCTGAAAGAA ----/TGTC TGACCCAAAT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 TGTC 0 1 249953 CASAVA_Build 11 85446278 2I TAAAAAATTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 TG 7 8 249954 CASAVA_Build 11 85446864 2D TAAAATATGG CA/-- CACATTCCTA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 CA 3 2 249955 CASAVA_Build 11 85450021 9D ACTCCATCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 1768 het 1768 ref 28 13 7 10 A 25 16 249956 CASAVA_Build 11 85452068 2D ACACAAAAGG TA/-- TATAGATGCC 3070 het 3070 ref 21 11 10 1 TA 3 2 249957 CASAVA_Build 11 85456469 2I AGGAACTGAT --/AA AAGAGTATCA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 2 4 249958 CASAVA_Build 11 85459246 1D AAGAACACAC A/- AGTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 2 1 249959 CASAVA_Build 11 85469692 1D AGTTTTTCCG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 10 9 249960 CASAVA_Build 11 85470609 2D TCTAGATTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 623 hom 41 6 11 24 T 18 16 249961 CASAVA_Build 11 85471428 1D AAGGAGTGGT A/- GAGAGGACTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 1 0 249962 CASAVA_Build 11 85471940 1I ATTTGTCTAA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 6 7 249963 CASAVA_Build 11 85554649 1D AGGTCTAATA T/- CCAGCATCTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 1 0 249964 CASAVA_Build 11 85567252 15D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2883 hom 19 9 11 5 A 26 11 249965 CASAVA_Build 11 85577748 1D CATATACTTA G/- GAGTGACATT 3070 het 3070 hom 41 15 21 6 G 2 1 249966 CASAVA_Build 11 85582233 1D TAATCTCACC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 9 8 249967 CASAVA_Build 11 85597368 2I AAAATGTTTT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 46 23 12 11 AC 7 8 249968 CASAVA_Build 11 85601431 1D TCTTATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 13 12 T 13 12 249969 CASAVA_Build 11 85619513 1D AGAAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 5 A 11 10 249970 CASAVA_Build 11 85641202 1I AGAATTGGCG -/T TCCTTTTTTT 3070 het 169 hom 29 1 24 4 T 1 2 249971 CASAVA_Build 11 85648083 1I CACCCAGGTT -/G GAGTGCAGTG 3070 hom 74 het 28 0 24 4 G 1 2 249972 CASAVA_Build 11 85649094 1I TTTTTAAAAA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 6 7 249973 CASAVA_Build 11 85649207 11I GTGTGAGCTA -----------/CTGCACCTGGC CTGCTGTACA 3070 hom 78 het 27 0 27 2 CTGCACCTGGC 0 1 249974 CASAVA_Build 11 85653130 4I GTAAAGACTA ----/TATT TATTTATTTA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 TATT 4 5 249975 CASAVA_Build 11 85659046 1D TTTTGTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 40 3 20 17 T 16 15 249976 CASAVA_Build 11 85660632 1I TGGTCTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 47 2 32 13 T 10 11 249977 CASAVA_Build 11 85680596 1D GCTGAGGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 28 0 20 8 A 14 13 249978 CASAVA_Build 11 85684452 3D GGGCATTTTG ACA/--- ACATGATTTC 3070 hom 144 het 53 0 49 5 ACA 2 1 249979 CASAVA_Build 11 85685451 1D GGCTGTCTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 249980 CASAVA_Build 11 85690154 1D AATGCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 2275 het 31 hom 17 1 9 7 T 17 16 249981 CASAVA_Build 11 85690219 1D ATCCACATAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 7 249982 CASAVA_Build 11 85704015 1I ATAAAATAAC -/T TTCCTTTTTT 3070 het 74 hom 22 1 21 0 T 2 3 249983 CASAVA_Build 11 85704374 16I ATGAAGATGA ----------------/AGAGTTTACCACTCAT AGACCATTAG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 AGAGTTTACCACTCAT 0 1 249984 CASAVA_Build 11 85708319 2D TCAAAAGTTT TA/-- TGTTTATATA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 TA 1 0 249985 CASAVA_Build 11 85715382 1I ATTTGGATGG -/C GATGGAAGTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 0 1 249986 CASAVA_Build 11 85717880 1D GTGATGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 26 7 A 12 11 249987 CASAVA_Build 11 85718265 2D CTGTGATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 8 T 15 13 249988 CASAVA_Build 11 85727903 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 8 9 249989 CASAVA_Build 11 85730042 1D TTTTTCCTCA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 7 6 249990 CASAVA_Build 11 85730761 1I CTGATGAGTG -/A AAATTAGAAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 3 4 249991 CASAVA_Build 11 85731999 2D CTGCTGTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 14 12 249992 CASAVA_Build 11 85737525 1I TAAAAAAAAA -/C GTCTTAAAAT 3070 het 305 hom 20 2 15 3 C 0 1 249993 CASAVA_Build 11 85743823 4D CACATAAGAT ACAC/---- AAATAAAATT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 AC 2 0 249994 CASAVA_Build 11 85756081 1I GTTTCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 A 10 11 249995 CASAVA_Build 11 85777509 1D AAATGAAAAT A/- AAGCTAACAT 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 A 3 2 249996 CASAVA_Build 11 85788821 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2469 het 520 hom 19 2 8 9 A 18 17 249997 CASAVA_Build 11 85791244 3D CTATAAATAA TGT/--- TGTGAAAATA 3070 het 3070 ref 35 23 9 5 TGT 2 1 249998 CASAVA_Build 11 85797929 1D AAAAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 7 T 13 12 249999 CASAVA_Build 11 85826236 4I CACTTTATAG ----/ATCA ATTTGAATAT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 ATCA 0 1 250000 CASAVA_Build 11 85832621 1D CTTCATCACT G/- GGCCCTCCTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 G 3 2 250001 CASAVA_Build 11 85859129 1D ACTCTTGGTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 T 9 8 250002 CASAVA_Build 11 85861885 2D AGGTTGGGCC CA/-- CACAGCAGCT 3070 het 2938 hom 33 10 15 8 CA 3 2 250003 CASAVA_Build 11 85866052 3I AAATAAAGTG ---/AAT AATAGTACCT 3070 hom 121 het 48 0 41 7 AAT 1 2 250004 CASAVA_Build 11 85866157 3D TAATTAAGAG TTA/--- TTATTGTTAT 3070 het 3070 hom 40 19 21 2 TTA 2 1 250005 CASAVA_Build 11 85894258 1D GATTCCCAGG T/- TAAGGGAGCC 3070 hom 102 het 37 0 33 4 T 2 1 250006 CASAVA_Build 11 85896189 1I CTCAGGTGCC -/A AAAAATGCCC 3070 hom 99 het 34 0 33 1 A 5 6 250007 CASAVA_Build 11 85896667 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 35 3 24 8 A 15 14 250008 CASAVA_Build 11 85902525 1D CAATGACCTC A/- GCAATGTATT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 1 0 250009 CASAVA_Build 11 85905060 2D TCTCTCTCTC TT/-- TGTGTGTGTG 1895 het 1895 ref 25 11 12 3 T 3 1 250010 CASAVA_Build 11 85909249 2D TCACAGAGTG CT/-- AGAGAGCTGC 3070 het 3070 ref 33 16 11 9 CT 1 0 250011 CASAVA_Build 11 85961766 1I CATAAATGTC -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 6 7 250012 CASAVA_Build 11 85979875 18D GCCAAAGCAC TGGAGGAGTTGGAGGAGT/------------------ TGGAGGAGTT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TGGAGGAGT 3 1 250013 CASAVA_Build 11 85994494 1I CAGAGGGGGA -/G GGGTTAGAGC 3070 hom 125 het 47 0 41 6 G 3 4 250014 CASAVA_Build 11 86006498 1D ATAAAATTTC T/- TTTTTGGGTG 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 T 6 5 250015 CASAVA_Build 11 86008714 4D GTGCTAACAT GTCA/---- GTATTTTTTA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 GTCA 1 0 250016 CASAVA_Build 11 86023381 2D GTCTTTTGTG TT/-- TTTTTTTGTT 3070 hom 107 het 39 0 36 4 T 9 7 250017 CASAVA_Build 11 86024954 1D69M2I TTTTTCTTTC TTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTAATCTATATGAGACTAACTAAGGTATTTGCCCCTTGGAGCTTTTAT--/-TTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTAATCTATATGAGACTAACTAAGGTATTTGCCCCTTGGAGCTTTTATAG AGTCTTTAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 33 N/A 0 0 250018 CASAVA_Build 11 86029727 2D CAATTTCACT GG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 45 het 19 0 14 5 G 11 9 250019 CASAVA_Build 11 86032007 1I ATGCCCCCTA -/C CCCATGACTT 3070 hom 80 het 35 0 24 11 C 3 4 250020 CASAVA_Build 11 86037206 1I AAAACCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 24 1 19 4 A 13 14 250021 CASAVA_Build 11 86066139 1I TGGGGGAGCC -/A AATGGGGCCA 3070 hom 117 het 47 0 38 9 A 2 3 250022 CASAVA_Build 11 86075046 1I CTTAGTTGGC -/T TTTAGGATAC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 3 4 250023 CASAVA_Build 11 86084958 1D GCCTGGCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 30 1 26 3 A 11 10 250024 CASAVA_Build 11 86087715 4D ATTATTTGAT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 38 0 31 9 TG 9 7 250025 CASAVA_Build 11 86093703 1I CTCAGAGAAG -/C TAAATAATTT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 C 0 1 250026 CASAVA_Build 11 86111543 1D38M1I AACTGAAAAC AAAAAAACAATTTAAATAGAAGACAAAAATACAAAAAAA-/-AAAAAACAATTTAAATAGAAGACAAAAATACAAAAAAAG AAAATCCCAA 3070 het 3070 hom 30 17 21 2 N/A 0 0 250027 CASAVA_Build 11 86122149 2I TTAAAATCAC --/AT AATCATTTCA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 AT 0 1 250028 CASAVA_Build 11 86158417 1D GGAGGCCCAT C/- CCCTAGGCTT 3070 het 2592 hom 20 8 9 3 C 4 3 250029 CASAVA_Build 11 86164820 2I CTGCAGAAAC --/AG AGTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 AG 1 2 250030 CASAVA_Build 11 86167279 4D CTGTGATAAC TTAA/---- TTGTCATCAT 3070 het 3070 ref 38 15 15 9 TTAA 1 0 250031 CASAVA_Build 11 86171935 2D ACACACACAC AT/-- GCCCCAAGAC 3006 het 3006 ref 37 16 16 5 AT 1 0 250032 CASAVA_Build 11 86180903 5D ATCAGAGTAG GAAGA/----- GAAGAGGTCA 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 GAAGA 2 1 250033 CASAVA_Build 11 86185688 4D TATATTTGAT TTTG/---- TTTATGTCCA 3070 het 3070 hom 41 13 27 3 TTTG 1 0 250034 CASAVA_Build 11 86202380 3D AATATATTTA TAT/--- TAACAGCCAT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 TAT 1 0 250035 CASAVA_Build 11 86233102 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 172 hom 27 1 23 4 A 10 9 250036 CASAVA_Build 11 86233781 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 994 het 994 ref 30 19 4 7 A 15 14 250037 CASAVA_Build 11 86251547 1D GTGATGTACA C/- CCTGTGATAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 3 2 250038 CASAVA_Build 11 86252102 1I TGGCACCCAG -/C AGGATACAGG 3070 hom 68 het 30 0 23 7 C 0 1 250039 CASAVA_Build 11 86252481 1I TAACAGATGC -/A AGACAAAGCC 3070 hom 87 het 38 0 30 9 A 1 2 250040 CASAVA_Build 11 86253361 4D TGCAAGACTG ATTT/---- ATTATCTTAC 3070 hom 175 het 63 0 59 6 ATTT 1 0 250041 CASAVA_Build 11 86255548 2D ATCTCCACAT AC/-- ACCAGCTCCC 3070 hom 90 het 32 0 29 4 AC 2 1 250042 CASAVA_Build 11 86258953 3I GAGGGGAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 85 het 33 0 27 6 AAC 3 4 250043 CASAVA_Build 11 86261888 4D ACATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 1782 hom 15 het 6 0 6 0 AC 9 7 250044 CASAVA_Build 11 86264896 1D AATTTCGGAG T/- AAACATCACC 3070 hom 64 het 29 0 21 8 T 1 0 250045 CASAVA_Build 11 86265423 2D ACATTGCAAT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 9 250046 CASAVA_Build 11 86265527 1D AACCAATTAG A/- AAGACAAGTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 3 2 250047 CASAVA_Build 11 86265925 2I AGGGCAATGA --/CT CTGTTTTCTC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 CT 1 2 250048 CASAVA_Build 11 86266875 2D AAAAATACAC TT/-- GAGAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 2 0 250049 CASAVA_Build 11 86295072 1D AGGATCCCCC T/- GAGGCTGCGC 3070 hom 25 het 13 0 8 5 T 1 0 250050 CASAVA_Build 11 86296572 1I AGCAGCTCTA -/T TTTTTCCCTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 5 6 250051 CASAVA_Build 11 86301104 2I AATTGCACAC --/AT GTTAGGCCTT 3070 hom 132 het 48 0 44 4 AT 0 1 250052 CASAVA_Build 11 86303824 1I TAATTGGAAA -/G ACCCGAATTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 0 1 250053 CASAVA_Build 11 86306898 1D GTATATACAG A/- AATGAATGTA 3070 het 3070 hom 52 24 26 2 A 3 2 250054 CASAVA_Build 11 86311174 6D AAAAATAAAC AAATAA/------ AAATAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 19 20 9 AAATAA 3 2 250055 CASAVA_Build 11 86313937 1D TCTCTTGGCA G/- GGAATTACCC 3070 het 2511 hom 31 6 20 6 G 3 2 250056 CASAVA_Build 11 86318877 1D AAGTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 A 11 10 250057 CASAVA_Build 11 86320521 1I TGTACTTCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 24 9 9 T 8 9 250058 CASAVA_Build 11 86321296 1D TTTCCATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 13 12 250059 CASAVA_Build 11 86323067 1D CTCTCTCTCT C/- TTTGGTTTTT 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 C 1 0 250060 CASAVA_Build 11 86324091 1I TGCTGTGGAC -/G GGCAAAGGCA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 G 2 3 250061 CASAVA_Build 11 86325572 1D CAGAGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 26 4 14 8 A 15 14 250062 CASAVA_Build 11 86349867 3I AGGCACTTTT ---/TAA TAATATTCTC 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 TAA 1 2 250063 CASAVA_Build 11 86361276 1I CAAAAAAAAA -/T AATAATAATA 2967 het 2967 ref 20 11 8 1 T 0 1 250064 CASAVA_Build 11 86372947 1I TTTACATGGT -/A ATACATCAGC 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 A 1 2 250065 CASAVA_Build 11 86388558 2I TCTCTCTCTC --/TT GCCTGCAGGT 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 T 0 2 250066 CASAVA_Build 11 86391322 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAGAA 1666 het 1666 ref 16 9 5 2 A 7 8 250067 CASAVA_Build 11 86392743 4D TCCCTCCCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 1121 het 1032 hom 20 8 7 5 CCTT 5 4 250068 CASAVA_Build 11 86396511 1D CATAATGAGA C/- CCCCATCTCT 1120 het 1120 ref 26 10 5 11 C 5 4 250069 CASAVA_Build 11 86397878 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 17 11 4 3 A 11 10 250070 CASAVA_Build 11 86400064 1D AAGTATATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 203 hom 28 4 11 13 A 12 11 250071 CASAVA_Build 11 86408344 1I TGGGCCTTCT -/G GGCAGTGTCT 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 G 2 3 250072 CASAVA_Build 11 86410621 2D TTTTCCCTTC TT/-- TTTCTAAATG 2292 het 1428 hom 12 4 6 2 T 5 3 250073 CASAVA_Build 11 86416281 2D ATATATAGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AT 7 6 250074 CASAVA_Build 11 86418066 1D40M1D GAGTTTCAAG AAAAAAAAAGTATTGTTTAAAAAAAGCAGTAGAACCTTCACA/-AAAAAAAAGTATTGTTTAAAAAAAGCAGTAGAACCTTCAC- AAAGTAAAAT 3070 hom 132 het 35 0 44 3 N/A 0 0 250075 CASAVA_Build 11 86420003 1D ATGGAAATAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 8 7 250076 CASAVA_Build 11 86421587 1I CCAACTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 12 13 250077 CASAVA_Build 11 86422583 1D CGAGTTTGCC G/- TACTTTGCCA 3070 hom 129 het 48 0 44 5 G 1 0 250078 CASAVA_Build 11 86431646 4D GTAGTTTTGT TTTG/---- TTTTTTTTTT 12 het 12 ref 14 10 1 3 TTTG 1 0 250079 CASAVA_Build 11 86463120 2D ATAGAAAAAC TG/-- TGTATATTGG 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 TG 2 1 250080 CASAVA_Build 11 86464579 2D ATAAACAGGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 45 13 28 4 TC 8 7 250081 CASAVA_Build 11 86467483 1I TTTGTATTTC -/T TTTTTTTTTA 2623 het 2493 hom 16 6 6 4 T 9 10 250082 CASAVA_Build 11 86469990 1D TATTGTTTGA T/- TTTTTTTGTT 2603 het 2603 ref 28 17 8 3 T 8 7 250083 CASAVA_Build 11 86473004 1D GCAGTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 34 9 T 13 12 250084 CASAVA_Build 11 86475981 3D TCTTATTTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2988 hom 35 13 16 7 A 17 14 250085 CASAVA_Build 11 86478251 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 9 8 250086 CASAVA_Build 11 86480591 1D TTAATGTTAT G/- TTGTTTGATA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 G 1 0 250087 CASAVA_Build 11 86483928 1D ATCAGAACTC A/- ACAATGTCAG 3070 het 3070 hom 48 17 29 2 A 2 1 250088 CASAVA_Build 11 86484800 16I CTCCTTCACC ----------------/ATATATATAAAGAAAT AATATAAAGA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 ATATATATAAAGAAAT 0 1 250089 CASAVA_Build 11 86484866 1I GAAAACTAGC -/A AAAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 A 4 5 250090 CASAVA_Build 11 86485691 1I GAAGCCACTC -/T TTTTTTTTTT 1621 het 1621 ref 28 8 9 11 T 13 14 250091 CASAVA_Build 11 86487094 1D TGACTGCATT A/- ATGTTGTATT 3070 het 3070 hom 21 8 13 0 A 2 1 250092 CASAVA_Build 11 86494800 1D TATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 12 11 250093 CASAVA_Build 11 86498492 1I GCTAACATAC -/T TTTGAAATAA 3070 hom 82 het 41 0 28 13 T 3 4 250094 CASAVA_Build 11 86499449 2D TTTAAAGGAA TG/-- TGTGTGTGTG 444 het 444 ref 38 27 3 9 TG 6 5 250095 CASAVA_Build 11 86501084 1I CTGTGTTCTG -/T TAGCTCTCTG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 1 2 250096 CASAVA_Build 11 86502430 4I ATTTCAGGAC ----/TTTG TTTGGTCACT 3070 het 3070 hom 55 17 29 9 TTTG 1 2 250097 CASAVA_Build 11 86518812 1D GTACATTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 13 8 A 12 11 250098 CASAVA_Build 11 86520100 2I TTGTTTGTTG --/GT GTGTATCCCT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 GT 2 3 250099 CASAVA_Build 11 86522709 1D TATGCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 34 0 26 8 T 11 10 250100 CASAVA_Build 11 86524411 1D GACTGTTGTA G/- GTCCTTTGCA 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 G 2 1 250101 CASAVA_Build 11 86529734 1D AACTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 13 12 250102 CASAVA_Build 11 86540290 1D TTTGTGGGTC T/- TTTACCTATT 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 T 4 3 250103 CASAVA_Build 11 86561187 1D TTAGAATGGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 8 7 250104 CASAVA_Build 11 86564282 4D TTTTGTCCTT AAAC/---- AAAACAAACA 3070 het 3070 ref 35 18 16 3 AAAC 1 0 250105 CASAVA_Build 11 86567651 1I AATAATGCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 A 9 10 250106 CASAVA_Build 11 86568629 3D TGTTTTTTTC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 35 12 12 11 TGT 6 5 250107 CASAVA_Build 11 86576783 1D CCTTACAGAA C/- CCCCTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 C 5 4 250108 CASAVA_Build 11 86576879 2D TGTAGTTTGT AC/-- AGTCATATTT 3070 het 3070 ref 45 25 18 5 AC 1 0 250109 CASAVA_Build 11 86577217 1D CATGATGAAA C/- CCCCCCTCTC 2762 het 2689 hom 19 9 7 3 C 7 6 250110 CASAVA_Build 11 86577395 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 544 hom 23 2 15 6 A 13 14 250111 CASAVA_Build 11 86587582 1D CTTCTATGTC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 T 7 6 250112 CASAVA_Build 11 86589453 1D CCATGTCCTG T/- TATCCATTGA 3070 hom 138 het 50 0 45 6 T 2 1 250113 CASAVA_Build 11 86603255 1D TCTGTAACAC T/- TTTTTTTTTT 1348 het 1348 ref 41 32 5 4 T 12 11 250114 CASAVA_Build 11 86612022 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2261 het 1346 hom 10 3 7 0 T 12 11 250115 CASAVA_Build 11 86628142 2D TACATAACAC TT/-- GGCAGGTCCA 2950 het 2950 ref 20 12 7 2 T 2 0 250116 CASAVA_Build 11 86628442 1D AATATGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 12 11 250117 CASAVA_Build 11 86629225 1I AGTCATGTAG -/A AAAAGAGATC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 4 5 250118 CASAVA_Build 11 86629582 10I ATAGATTGAA ----------/TGGTTCCAAC TTGTCATAGC 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 TGGTTCCAAC 0 1 250119 CASAVA_Build 11 86629733 3I TTTTAGAAAC ---/ATT ATTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 ATT 1 2 250120 CASAVA_Build 11 86637319 1I AATTATATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 9 10 250121 CASAVA_Build 11 86639894 1I TTTAGGAGTT -/A ATCAGCATGT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 1 2 250122 CASAVA_Build 11 86640292 2D ATATTATGAT TA/-- TGTTACCATA 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 TA 1 0 250123 CASAVA_Build 11 86641808 1I TTATTGGTAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 7 8 250124 CASAVA_Build 11 86644347 1D CTCTTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2410 hom 42 8 22 12 A 12 11 250125 CASAVA_Build 11 86660255 5I AGAATGCAAA -----/TATCT TATTAATAAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TATCT 0 1 250126 CASAVA_Build 11 86700862 1D TTTCTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 2128 het 2128 ref 39 27 5 8 T 13 12 250127 CASAVA_Build 11 86723129 1I ACATCTAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 9 10 250128 CASAVA_Build 11 86742411 2D TCAGTGGGTA AC/-- ACAGCTCTTG 3070 het 3070 ref 57 29 25 4 AC 2 1 250129 CASAVA_Build 11 86755420 1D AGTTTTTTTT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 8 7 250130 CASAVA_Build 11 86826930 1I AATTGCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 670 hom 32 2 21 9 T 13 14 250131 CASAVA_Build 11 86866065 3D TGTTTTCTAA AGT/--- AGTTGCATCT 3070 het 3070 hom 52 16 30 8 AGT 2 1 250132 CASAVA_Build 11 86889758 1I CTCTAGCTTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 7 8 250133 CASAVA_Build 11 86902326 1I AAAAAAGCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 9 10 250134 CASAVA_Build 11 86905715 1D GTGTCAACCA G/- GGTTGGCCAA 3070 het 3070 ref 63 30 27 6 G 3 2 250135 CASAVA_Build 11 86906821 1D32M1I CTAAAAATAC AAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCATGCC-/-AAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCATGCCT TGTAATTTCA 3070 het 1504 hom 6 5 8 0 N/A 0 0 250136 CASAVA_Build 11 86907369 3D TATTTATTTA TTT/--- TTTGTTTTTT 65 het 65 ref 21 14 1 6 T 6 3 250137 CASAVA_Build 11 86999184 1D GTCTACTATC A/- AAAAAAAAAA 2619 het 1202 hom 20 4 6 11 A 14 13 250138 CASAVA_Build 11 87036547 1D TCTCTTGATG T/- TTTTTTTTTT 3068 het 3068 ref 36 16 10 10 T 15 14 250139 CASAVA_Build 11 87082573 1I TTTAGAATAG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 6 7 250140 CASAVA_Build 11 87083896 3I TTGTGCAGTC ---/TGT TGTTATATCA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TGT 1 2 250141 CASAVA_Build 11 87094122 2D TCTTTCATAG TT/-- TTTTTTTTTT 2599 hom 25 het 34 0 17 18 T 26 24 250142 CASAVA_Build 11 87094587 1D ATGGGATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 13 12 250143 CASAVA_Build 11 87096329 1I ATTTTTTCAA -/T GTTTTAAGAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 250144 CASAVA_Build 11 87096876 1I TCAATGGGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 11 12 250145 CASAVA_Build 11 87105091 1I TGTTACTAAT -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 A 6 7 250146 CASAVA_Build 11 87106291 1I AATCATTGAG -/A AGGGTCTAAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 1 2 250147 CASAVA_Build 11 87107642 5I TAAGTCCAAT -----/CATAA CATAACATTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CATAA 1 2 250148 CASAVA_Build 11 87178807 2I TCTAAAACTC --/CT CTGGAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 CT 1 2 250149 CASAVA_Build 11 87182237 1I ATGCTTGTGA -/T TTTTTGCACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 5 6 250150 CASAVA_Build 11 87185214 2I TTATTGAGAG --/TT TTTTTTAGCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 6 8 250151 CASAVA_Build 11 87191871 1D CCTCTCCTCC T/- TTTTATAGGG 3070 hom 159 het 60 0 53 7 T 5 4 250152 CASAVA_Build 11 87194145 2D AGAAAACACT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 129 het 55 0 41 14 AC 9 8 250153 CASAVA_Build 11 87198231 1I GAAAGCTCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 A 9 10 250154 CASAVA_Build 11 87199345 1D GAATAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 19 11 A 13 12 250155 CASAVA_Build 11 87224110 5D AAAGAAGTAA TTAAG/----- TTAAAGTTGT 3070 het 3070 ref 30 13 15 5 TTAAG 1 0 250156 CASAVA_Build 11 87242670 1I CCTGCAAAGG -/T TTTTTGTTTT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 5 6 250157 CASAVA_Build 11 87275988 1I GCAGAAAATA -/T TTTGAAAAGC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 3 4 250158 CASAVA_Build 11 87276473 1I AGTTGGTGCA -/T TTTTTTATAC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 6 7 250159 CASAVA_Build 11 87277717 7I GCTGATGTGC -------/CTGCCCT CTGCCCAGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CTGCCCT 0 1 250160 CASAVA_Build 11 87281827 2I TTCCAGATTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TG 8 9 250161 CASAVA_Build 11 87283778 1D GCCCATATCA T/- TATGTGAGTC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 1 250162 CASAVA_Build 11 87297875 4D CAGCACCTTT CTTA/---- CTTCTCATAT 3070 hom 111 het 41 0 37 5 CTTA 1 0 250163 CASAVA_Build 11 87299174 15D GTTCATTTTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 20 7 T 26 11 250164 CASAVA_Build 11 87307470 1D GGGTCACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 39 2 31 6 A 12 11 250165 CASAVA_Build 11 87312502 1D GAGAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 16 11 A 13 12 250166 CASAVA_Build 11 87322248 1I GCATGGAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 11 14 A 15 16 250167 CASAVA_Build 11 87323679 1D GAGAAATTAA G/- GGTTGCTATA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 G 3 2 250168 CASAVA_Build 11 87341497 3D GTTTTAAATG TTT/--- TTAATTTTAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 5 2 250169 CASAVA_Build 11 87344676 4D CCTTGTAACT GTAA/---- GTAAGTAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 9 12 GTAA 3 2 250170 CASAVA_Build 11 87344897 1I TGAGAAGAAC -/A AAAAATATCC 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 A 5 6 250171 CASAVA_Build 11 87345938 1I AGATTAACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 97 hom 32 1 26 5 A 9 10 250172 CASAVA_Build 11 87357090 15D GCTTCAAGTG TACAGATACAGACAA/--------------- TAATTCTATC 3070 hom 123 het 42 0 40 6 TACAGATACAGACAA 1 0 250173 CASAVA_Build 11 87360462 3D GTGTAAAAGC GTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 44 0 24 20 GTT 1 0 250174 CASAVA_Build 11 87445623 1D CAAAAAGTAG A/- AAAAAAAAAG 1199 het 1199 ref 34 28 3 4 A 10 9 250175 CASAVA_Build 11 87477132 3I AATTTACTGC ---/ATA ATGTCTGTCC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 ATA 0 1 250176 CASAVA_Build 11 87478298 1D GAGGAATTTA T/- TGCCTCTTGT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 2 1 250177 CASAVA_Build 11 87480376 1D TAATCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 11 10 250178 CASAVA_Build 11 87499520 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 11 10 250179 CASAVA_Build 11 87502759 4D GAACAAAAAA AAAC/---- AGCCATAAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 3 AAAC 1 0 250180 CASAVA_Build 11 87511605 1D TTTTTTTTTT A/- TTATTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 1 0 250181 CASAVA_Build 11 87516370 5D GTGTCTAAAT TTAAA/----- TCATTAAGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 6 TTAAA 1 0 250182 CASAVA_Build 11 87539196 1D CCCAAACACC T/- AGTATTAAAA 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 T 1 0 250183 CASAVA_Build 11 87541485 1D TAAAACTGCA T/- TTTTATATAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 5 4 250184 CASAVA_Build 11 87543687 1I TAAAACTGGA -/G TTGGGTTTTT 3070 hom 109 het 42 0 37 5 G 0 1 250185 CASAVA_Build 11 87556596 2D TTTTTCCTAT CC/-- CTTACCACTC 3070 hom 117 het 43 0 40 5 C 3 1 250186 CASAVA_Build 11 87564424 1D AAACATCCAC T/- TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 T 7 6 250187 CASAVA_Build 11 87586410 4D AATAAATATG CTGA/---- CTAATAGACT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CTGA 1 0 250188 CASAVA_Build 11 87588163 1I AGAGAGAGAG -/A AGAAAAAAAA 3070 het 89 hom 33 1 27 5 A 1 2 250189 CASAVA_Build 11 87609197 10I ACCTTAACAA ----------/ACTTAGGAAC ACTTAGGAAA 3070 hom 111 het 45 0 38 8 ACTTAGGAAC 0 1 250190 CASAVA_Build 11 87609872 1I GGGAAAAGGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 6 7 250191 CASAVA_Build 11 87664306 3I GAAAAAAGAA ---/AAG AAAGTAAAGA 2817 het 2817 ref 20 13 7 0 AAG 0 1 250192 CASAVA_Build 11 87683266 4D GAGTGACTCA CTAT/---- CTAAGACTTC 3070 het 3070 ref 39 23 14 4 CTAT 1 0 250193 CASAVA_Build 11 87683715 2I CAGTAGCCTG --/CT CTGTTTCGCT 3070 hom 138 het 51 0 45 6 CT 1 2 250194 CASAVA_Build 11 87685464 1I AATGTGCCCC -/T TTTCAAAACA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 3 4 250195 CASAVA_Build 11 87699343 1I TTCTTTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1923 hom 31 11 13 7 A 15 16 250196 CASAVA_Build 11 87701997 3I GAGAAACAGT ---/AGA AGGTTAGAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AGA 0 1 250197 CASAVA_Build 11 87706704 1I CTATTTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2906 hom 33 11 13 9 T 10 11 250198 CASAVA_Build 11 87709859 1I CGCTGGGCAG -/A AAAGTCCCTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 3 4 250199 CASAVA_Build 11 87725434 2I TTTTGAGATG --/GT GAGTCTCGCT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 GT 0 1 250200 CASAVA_Build 11 87729365 3I AATATGTAGC ---/TTA TTATTTTCTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTA 1 2 250201 CASAVA_Build 11 87729859 1I AAAACAAAAA -/C AAAAACAAAA 2386 hom 18 het 9 0 7 2 C 0 1 250202 CASAVA_Build 11 87730306 2I TGGCAAAGAG --/AC ATGAAAGTTT 3070 hom 148 het 58 0 50 8 AC 0 1 250203 CASAVA_Build 11 87732959 1D CATCTATTGC T/- TTTTTTTTTT 1253 het 1253 ref 25 18 3 4 T 12 11 250204 CASAVA_Build 11 87737436 1D TAGGTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 7 A 11 10 250205 CASAVA_Build 11 87744396 3I CTTCTCAGTG ---/TTA TTATAGACAG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TTA 1 2 250206 CASAVA_Build 11 87760840 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1384 hom 26 5 15 6 A 15 16 250207 CASAVA_Build 11 87792874 1I AGTTTCAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1528 hom 50 5 30 15 A 13 14 250208 CASAVA_Build 11 87794737 1D TCCAGGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 33 0 29 4 T 12 11 250209 CASAVA_Build 11 87796284 1I ATTTTATCAA -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 7 250210 CASAVA_Build 11 87797136 12D CTTAGCTTGG GGTGTTATAATA/------------ AGATGCTACC 3070 hom 102 het 34 0 34 5 GGTGTTATAATA 1 0 250211 CASAVA_Build 11 87804263 4I AGAAAATAAT ----/AAAG AAGACCAGAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AAAG 0 1 250212 CASAVA_Build 11 87817962 1D TTACAGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 33 1 27 6 A 11 10 250213 CASAVA_Build 11 87818827 1D AATGTATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1313 hom 49 6 19 25 T 12 11 250214 CASAVA_Build 11 87823622 1D TTGACAAGGG A/- AAAAATTCCC 3070 het 3070 hom 44 18 21 7 A 6 5 250215 CASAVA_Build 11 87827616 1I TCGATGATTA -/T TATTTTCCAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 T 1 2 250216 CASAVA_Build 11 87828649 1D AAATGAGCCT A/- AAAAAAAAAA 2030 het 2030 ref 31 14 5 12 A 15 14 250217 CASAVA_Build 11 87841838 1I CAGCTACTTA -/T TTTTTTATTT 3070 het 2559 hom 25 6 16 3 T 6 7 250218 CASAVA_Build 11 87848468 1D ATCTCTGTCA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 7 T 7 6 250219 CASAVA_Build 11 87872307 1I TTTATTTCAG -/A AGACCGAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 1 2 250220 CASAVA_Build 11 87889540 1I ATTATCCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 688 hom 40 2 24 14 T 11 12 250221 CASAVA_Build 11 87910095 1D ATCACCCTCT G/- GGCCCCTTGT 3070 het 3070 hom 46 12 22 13 G 3 2 250222 CASAVA_Build 11 87914552 2D ACAGGATTGA TG/-- TTTTATGTAG 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 TG 1 0 250223 CASAVA_Build 11 87915181 4D AAAAAGGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 AAAC 3 2 250224 CASAVA_Build 11 87916407 1I AGAGAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1055 hom 21 3 12 6 A 10 11 250225 CASAVA_Build 11 87968839 1I TAGACTAAGC -/T TTTAATCACT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 3 4 250226 CASAVA_Build 11 87979676 2I GAGTGTGGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 A 10 12 250227 CASAVA_Build 11 87994910 1D CACAACACTA T/- TTTCAACCAT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 T 4 3 250228 CASAVA_Build 11 88000180 1D TTTACCCTAT A/- ATTTCTTTGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 2 1 250229 CASAVA_Build 11 88015909 1I ACTTTATAAG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 7 8 250230 CASAVA_Build 11 88016092 3I GCCATGCTTT ---/ACA ACAACTAGAT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 ACA 1 2 250231 CASAVA_Build 11 88016578 1D TTTCAGTAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 9 8 250232 CASAVA_Build 11 88019192 1D TTAAGTAAAA C/- ATACTGAAGT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 1 0 250233 CASAVA_Build 11 88019312 1D GCTTAGAAGG A/- AAACAAAAAT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 4 3 250234 CASAVA_Build 11 88020186 3I TCCTTAGAAA ---/AAG AAGAACCAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAG 1 2 250235 CASAVA_Build 11 88021470 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 1 A 13 11 250236 CASAVA_Build 11 88028949 14I GGACCTTCAA --------------/TATTCTTGTACTAC TTTAATTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TATTCTTGTACTAC 0 1 250237 CASAVA_Build 11 88032705 4I AATATAATTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTTC 2 3 250238 CASAVA_Build 11 88037151 1D AAAAAACTGG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 8 7 250239 CASAVA_Build 11 88043368 4I ATAGGCAAAA ----/AGAT AGTCTGAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AGAT 0 1 250240 CASAVA_Build 11 88046709 1D CACTATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 44 1 37 6 A 12 11 250241 CASAVA_Build 11 88050879 1I AATTTCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 255 hom 27 2 19 6 T 13 14 250242 CASAVA_Build 11 88052758 1I AAAAACAAAT -/A AGACAAAAAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 1 2 250243 CASAVA_Build 11 88072566 2D CTGCACGAGC AG/-- AGTGTCCAGG 3070 hom 113 het 44 0 38 7 AG 2 1 250244 CASAVA_Build 11 88073401 1D GAAATCAAAA G/- TATTTTCCAT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 G 1 0 250245 CASAVA_Build 11 88075907 1I TGGGCAATCC -/A AAAATGAAGA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 4 5 250246 CASAVA_Build 11 88076205 4I ACCTGAGGGA ----/TGGT TGGTATGTAG 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TGGT 1 2 250247 CASAVA_Build 11 88084617 1I ACAAAAGTTT -/A AGAGACTTTT 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 1 2 250248 CASAVA_Build 11 88088250 1D TTTTTTCATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 43 0 36 9 A 10 9 250249 CASAVA_Build 11 88090682 4D CTATAATAAC TATT/---- TATAGTTAGA 3070 hom 99 het 34 0 34 1 TATT 1 0 250250 CASAVA_Build 11 88091816 4D TATCCCTTGT CAAA/---- CAAACACTAT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 CAAA 2 1 250251 CASAVA_Build 11 88093130 4I GAGGGGAAAG ----/TGTT TGTTTATACC 3070 hom 123 het 43 0 41 2 TGTT 1 2 250252 CASAVA_Build 11 88097228 2D ACTCCTAACT AA/-- CTGCCCTCCA 3070 hom 117 het 41 0 40 2 A 2 0 250253 CASAVA_Build 11 88099601 1I ATATCCAGCC -/A AACTAAACTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 2 3 250254 CASAVA_Build 11 88118130 6D61M1I CACCCACCCA CCTCAGCCTCAGCCTCCCAAGTAGATGGGACTACAGGCACGTGCCACCCCACCTAGCTAATATTGTA-/------CCTCAGCCTCCCAAGTAGATGGGACTACAGGCACGTGCCACCCCACCTAGCTAATATTGTAT TTTTTTGTAG 3070 hom 57 het 21 0 19 17 N/A 0 0 250255 CASAVA_Build 11 88119387 1D TTCTGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 29 2 20 8 A 13 12 250256 CASAVA_Build 11 88120522 1I GCTATCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1505 hom 44 5 23 16 A 13 14 250257 CASAVA_Build 11 88120636 3D CTGATTTGTG TTA/--- TTTTTTATTA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TTA 1 0 250258 CASAVA_Build 11 88133150 5I AGACTAATAA -----/AGAAG AGAGAAGATC 2708 het 2708 ref 21 12 8 1 AGAAG 0 1 250259 CASAVA_Build 11 88134662 7I GTACTGGTAC -------/ACAGACA ACAGACACAT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 ACAGACA 1 2 250260 CASAVA_Build 11 88135322 2I ACTCAGAATG --/AC TATTATTAAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 AC 0 1 250261 CASAVA_Build 11 88136098 1I TGAGGGAGTC -/T TGTAGGGTTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 1 2 250262 CASAVA_Build 11 88136372 1D TAGCATATGT G/- TTTGGGCTCA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 G 1 0 250263 CASAVA_Build 11 88137411 1D ATAACCATTC T/- TAGACAATAC 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 2 1 250264 CASAVA_Build 11 88141445 1D ATAAAAATTG A/- AAAAAAAAAG 3065 het 3065 ref 26 16 7 4 A 10 9 250265 CASAVA_Build 11 88142203 1D TTGCCAACTG T/- TAAGTGTCTA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 T 2 1 250266 CASAVA_Build 11 88144851 1D CTTATCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 12 11 250267 CASAVA_Build 11 88148722 2D CTGAGAAGAC TG/-- TGTATTCAGT 3070 het 3070 ref 40 23 12 6 TG 2 1 250268 CASAVA_Build 11 88170644 1I TGCTGTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 11 12 250269 CASAVA_Build 11 88173232 1I TACAGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 10 22 7 A 10 11 250270 CASAVA_Build 11 88175302 1I AATTCAACAA -/C CCTTCATGCT 3070 het 3070 hom 21 7 13 1 C 2 3 250271 CASAVA_Build 11 88178363 1I GTTGGTTTCC -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 A 6 7 250272 CASAVA_Build 11 88182586 1I TTAATATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 11 12 250273 CASAVA_Build 11 88185116 1I GATAATTATA -/T GTGATACGTC 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 0 1 250274 CASAVA_Build 11 88196343 1I AGGGGATTTC -/A AAAAAAAAAA 1669 het 1669 ref 25 10 8 7 A 11 12 250275 CASAVA_Build 11 88201998 1I ACTATGTTGG -/C CATGCTTGGT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 C 1 2 250276 CASAVA_Build 11 88207421 2I AAAACAGCAC --/AT GTGTCCAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AT 0 1 250277 CASAVA_Build 11 88211800 1D ATTTCTAAAC T/- TTTAAGCTAT 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 T 4 3 250278 CASAVA_Build 11 88217348 1D TTCTTCAGCC T/- ATGAATCAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 0 250279 CASAVA_Build 11 88218138 2I GATCACTTGC --/CT TTTTTTTTTT 717 het 717 ref 40 16 6 18 CT 0 1 250280 CASAVA_Build 11 88219573 4D GAAGGAGCAA AAAG/---- AGAGATTTTC 3070 het 3070 ref 26 16 9 3 AAAG 1 0 250281 CASAVA_Build 11 88223697 1I TTAATGAAAA -/G GGGGATTAAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 G 4 5 250282 CASAVA_Build 11 88223966 1D ATTCTAATTA C/- ATCCGCATTT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 C 1 0 250283 CASAVA_Build 11 88226405 2D TTAAAAAGAC AT/-- ATTCATATTA 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 AT 2 1 250284 CASAVA_Build 11 88226530 1D AATAAAAAAA T/- AAACTAGCAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 T 1 0 250285 CASAVA_Build 11 88226705 2I AATAGAAAAC --/TT TTCACGGAAG 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 T 2 4 250286 CASAVA_Build 11 88234276 3I TAAGTTTTTA ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 2806 hom 20 7 9 4 TTG 5 6 250287 CASAVA_Build 11 88236205 1D GACCAGATTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 9 8 250288 CASAVA_Build 11 88236470 1I TAAAGAGCAT -/A AAAAAACTGT 2872 het 2872 ref 22 12 6 4 A 6 7 250289 CASAVA_Build 11 88243274 1I CAAGAACTTT -/A AATAGGTCAC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 2 3 250290 CASAVA_Build 11 88245772 1I ACTATATGCT -/G CATACAAGAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 G 0 1 250291 CASAVA_Build 11 88246990 1I GAGATGATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 9 10 250292 CASAVA_Build 11 88254245 1D GAGGGCAAAA G/- ATAAACATCT 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 G 1 0 250293 CASAVA_Build 11 88254339 1D GTTTCAGTTA T/- ATGGAATAGC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 1 0 250294 CASAVA_Build 11 88254711 4I TATATAAAAC ----/TGTT TGAGGCTTTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TGTT 0 1 250295 CASAVA_Build 11 88263327 1D TAATTGGCTT A/- AAAAATAGTG 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 A 6 5 250296 CASAVA_Build 11 88264398 1I TGTTCCAAAA -/T TTGTATGGGA 2748 het 392 hom 14 1 8 5 T 2 3 250297 CASAVA_Build 11 88264427 17I TTCTAATGTC -----------------/TAAGTATATGCTATCAA TCATAATTAA 3070 hom 21 het 8 0 8 2 TAAGTATATGCTATCAA 0 1 250298 CASAVA_Build 11 88264973 2D ACAAGAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 23 2 19 3 T 18 16 250299 CASAVA_Build 11 88267493 1D TTCCTGTTTG T/- GTTCTCCTCA 3070 hom 65 het 26 0 21 5 T 1 0 250300 CASAVA_Build 11 88269308 4D GAGAATCTAT TATC/---- TATCTATCTG 3070 het 2580 hom 19 7 9 4 TATC 3 2 250301 CASAVA_Build 11 88272224 1I TATTTGGAAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 7 8 250302 CASAVA_Build 11 88282226 1D TTCCACTGCC A/- AGGTAAATCA 3070 hom 65 het 24 0 19 7 A 2 1 250303 CASAVA_Build 11 88283662 1D GTAGAACGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 92 het 37 0 30 7 T 10 9 250304 CASAVA_Build 11 88286380 1D CCATATCTTC T/- TTTTTTTTCC 2651 het 2651 ref 28 10 9 9 T 9 8 250305 CASAVA_Build 11 88288387 3D ATATTCTCTC ATT/--- ATCTAATCAA 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 ATT 1 0 250306 CASAVA_Build 11 88289590 5I AAGAGAGAGA -----/AGAGT AAAGAGAACT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 AGAGT 0 1 250307 CASAVA_Build 11 88291577 1I GTATGAAGTT -/A AAATGTAGAG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 3 4 250308 CASAVA_Build 11 88295853 1I TTTCATCTCA -/C CCCATTTAAA 3070 het 3070 ref 25 17 8 0 C 3 4 250309 CASAVA_Build 11 88296656 2I GTATACCTGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 20 9 11 0 AT 5 6 250310 CASAVA_Build 11 88297073 1I GAGCTTCCTT -/A AAAATTTTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 4 5 250311 CASAVA_Build 11 88298140 5I TTTTTGCTGC -----/TTTAT TTTATTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 TTTAT 1 2 250312 CASAVA_Build 11 88300062 1D TCTAGGGCTA T/- TTACACGTAG 2673 het 2673 ref 18 9 7 2 T 3 2 250313 CASAVA_Build 11 88303069 1D CACCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 12 11 250314 CASAVA_Build 11 88303765 1D GTCTTTCTTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 31 0 21 11 A 9 8 250315 CASAVA_Build 11 88303894 1I TTAATGAGAG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 8 250316 CASAVA_Build 11 88308166 2I AGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 28 9 11 8 TG 6 7 250317 CASAVA_Build 11 88311369 2I TATTACTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 12 14 250318 CASAVA_Build 11 88324942 4D ATACAAACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 90 het 37 0 30 8 AC 10 8 250319 CASAVA_Build 11 88325444 1I GAAAGAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 26 1 22 3 T 10 11 250320 CASAVA_Build 11 88326561 1I ATTTATGGTG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 7 8 250321 CASAVA_Build 11 88327186 2I AGAGAATGCT --/AA AAAGTGTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 3 5 250322 CASAVA_Build 11 88329805 1D TAGTCCATTG T/- TTGTAATTTA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 3 2 250323 CASAVA_Build 11 88337188 1I GCACAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 1376 het 1261 hom 15 5 5 5 T 10 11 250324 CASAVA_Build 11 88340247 1I TTTCTTATAC -/T TTTGGCACCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 3 4 250325 CASAVA_Build 11 88349363 1D AGGGCTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 A 12 11 250326 CASAVA_Build 11 88349676 1I CTATAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 10 11 250327 CASAVA_Build 11 88353828 1I CCCTAATCAG -/A AAAAAAAAAA 2188 het 2188 ref 21 11 6 4 A 10 11 250328 CASAVA_Build 11 88373796 7I AGGGAAATGC -------/AAATTAA AAATTAAAAC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 AAATTAA 1 2 250329 CASAVA_Build 11 88375813 1I CTTTATAGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 8 9 250330 CASAVA_Build 11 88406869 2I TAATTATTAT --/GA GAGGTCGAAT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 GA 1 2 250331 CASAVA_Build 11 88419360 1D ATAAAACATC A/- GTCAGATTTT 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 A 1 0 250332 CASAVA_Build 11 88446608 1D TAAGCTCATA C/- CTATTTATGA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 C 2 1 250333 CASAVA_Build 11 88485421 4D ACATACATAT ACAC/---- ACACATATAT 2533 het 2533 ref 23 14 6 3 AC 4 2 250334 CASAVA_Build 11 88493735 1D ATTCATGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 25 0 14 11 T 13 12 250335 CASAVA_Build 11 88497512 4D AGTAGTTTTG TATT/---- TAGTCTTTAT 3070 het 3070 hom 25 10 13 3 TATT 1 0 250336 CASAVA_Build 11 88501539 1D TGGGGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1544 het 1544 ref 18 7 6 6 T 12 11 250337 CASAVA_Build 11 88502710 1I ACCTTTTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 9 10 250338 CASAVA_Build 11 88509029 7I TATAGTACAT -------/TGTATAA TATATAATAC 2193 het 2193 ref 52 41 6 5 TGTATAA 0 1 250339 CASAVA_Build 11 88509833 4I ATCGGTAGAC ----/AGTA AGTGACAAGA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 AGTA 0 1 250340 CASAVA_Build 11 88517281 1D TCACCACATA C/- ACACAAACGG 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 C 1 0 250341 CASAVA_Build 11 88523033 1I AAAAACTGTT -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 6 7 250342 CASAVA_Build 11 88526700 1D GTTAAGCAAC A/- ATCTATTAAA 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 A 2 1 250343 CASAVA_Build 11 88531057 1D TCTGAAACTT G/- CTTATTTCAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 1 0 250344 CASAVA_Build 11 88532704 2D CTGGCACATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 30 1 20 9 T 16 14 250345 CASAVA_Build 11 88535539 3D GTAATAACAG CTT/--- TTTTTAATCC 3070 het 3070 ref 34 20 12 4 CTT 1 0 250346 CASAVA_Build 11 88536331 3D AGCAATCCTG CTA/--- CTAACAATCC 3070 het 3070 ref 48 26 17 6 CTA 2 1 250347 CASAVA_Build 11 88544855 2D AGTGAATAAA AG/-- AGAAAAACAT 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 AG 2 1 250348 CASAVA_Build 11 88550173 1I ATCAGAAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 9 10 250349 CASAVA_Build 11 88555689 1D AACAAAGAGG A/- AAAAACATTT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 6 5 250350 CASAVA_Build 11 88562265 1D ACTGCACATC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 10 9 250351 CASAVA_Build 11 88568486 4D GACTCTTCCC ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 het 1298 hom 16 6 8 3 ATAA 6 5 250352 CASAVA_Build 11 88568711 4D TACTTTTTCT TTTA/---- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 TTTA 2 1 250353 CASAVA_Build 11 88570715 4D TGATATTATG CTTC/---- CTTCTCTAGA 3070 het 3070 hom 52 24 25 4 CTTC 2 1 250354 CASAVA_Build 11 88573366 3D TTTATGACTA CTT/--- CTCATTTGTA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 CTT 1 0 250355 CASAVA_Build 11 88574044 2D GGCAAAAAAG AA/-- AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 8 6 250356 CASAVA_Build 11 88574915 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 TG 6 5 250357 CASAVA_Build 11 88577214 1D AGATTATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 T 13 12 250358 CASAVA_Build 11 88579478 3I TCCATTCAAT ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 AAC 3 4 250359 CASAVA_Build 11 88588342 5I TAATAATAGT -----/AATAA AATAAAATAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 AATAA 3 4 250360 CASAVA_Build 11 88592961 2I CTAGGTAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 A 10 12 250361 CASAVA_Build 11 88597746 1D GTAAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 T 11 10 250362 CASAVA_Build 11 88607791 1I TTCAATTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2035 hom 33 5 18 10 A 14 15 250363 CASAVA_Build 11 88618737 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 29 1 22 7 A 12 11 250364 CASAVA_Build 11 88618980 1I TCCACCACTA -/G AAACTCACAG 2403 het 2403 ref 26 17 6 3 G 0 1 250365 CASAVA_Build 11 88686071 3I TATTATTATC ---/ATT ATTATTTTAA 1711 hom 12 het 5 0 5 0 ATT 2 3 250366 CASAVA_Build 11 88702295 1D AAGGGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 20 1 16 5 A 12 11 250367 CASAVA_Build 11 88710878 1D AATAGTCTAG A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 A 7 6 250368 CASAVA_Build 11 88728141 4I ATATATATTC ----/GTGT ATATATATAT 1900 het 1900 ref 16 8 4 4 GT 0 2 250369 CASAVA_Build 11 88825851 2D AAGGGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 1407 het 1407 ref 25 18 4 4 CT 2 1 250370 CASAVA_Build 11 88850591 1I GCTGCTTGAC -/A GAAGGTTTTA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 A 0 1 250371 CASAVA_Build 11 88860257 7I GTCCTTCCTG -------/CCTATAA TACTAGTACA 3070 het 3070 hom 58 19 34 5 CCTATAA 0 1 250372 CASAVA_Build 11 88863780 3I TCCTCCACAT ---/CTC CTCTCCCATC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 CTC 1 2 250373 CASAVA_Build 11 88863878 1I TAAAGTTTTG -/T TAAGTTGAGA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 1 2 250374 CASAVA_Build 11 88864898 5I GGGCTCTAGG -----/GGAAC TTAGGTTCAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 GGAAC 0 1 250375 CASAVA_Build 11 88870230 1I ATAGTCTCAC -/T TCACTTTCTG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 1 2 250376 CASAVA_Build 11 88872693 2I AGCACCTCTC --/TT ATTATTATTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 2 250377 CASAVA_Build 11 88881889 3D AATAATGAAT ATC/--- ATAATTCTGT 3070 het 3070 ref 43 22 15 8 ATC 1 0 250378 CASAVA_Build 11 88882067 4I TACTAATATA ----/ATAG ATAGTGTCTC 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 ATAG 1 2 250379 CASAVA_Build 11 88890449 1D AACTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 12 11 250380 CASAVA_Build 11 88891194 1I AGTCTTGGGG -/A GGGGGACAAA 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 A 0 1 250381 CASAVA_Build 11 88900798 1D GCCTGTGAAA G/- CATCTGGGAG 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 G 1 0 250382 CASAVA_Build 11 88911537 1D CACCCCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 T 12 11 250383 CASAVA_Build 11 88913246 1I TCAAAAGCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 T 9 10 250384 CASAVA_Build 11 88914798 1D ATTTTTGTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 20 15 8 T 10 9 250385 CASAVA_Build 11 88916747 1D CTTATAAGTA T/- ATTGCTGGGG 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 T 1 0 250386 CASAVA_Build 11 88921712 1D GCTTATCTCC A/- GACTCACCCC 3070 het 3070 hom 25 13 12 0 A 1 0 250387 CASAVA_Build 11 88925652 1I TAACTTACTG -/T TGAGTCAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 1 2 250388 CASAVA_Build 11 88926693 1D AACAAACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 27 0 16 11 T 17 16 250389 CASAVA_Build 11 88927999 1I CAGAGTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3056 het 3056 ref 28 15 8 5 A 10 11 250390 CASAVA_Build 11 88944126 1D TGATTTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 T 13 12 250391 CASAVA_Build 11 88944508 1I TACTTTTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2871 hom 24 7 11 6 A 13 14 250392 CASAVA_Build 11 88948086 4D GGTACATTGT AGTA/---- AGTGTTTAAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 AGTA 1 0 250393 CASAVA_Build 11 88963490 1I AAAAAAAAAG -/A AAAATTTGTT 1440 het 1440 ref 14 5 3 6 A 4 5 250394 CASAVA_Build 11 88963624 1D ATTATTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1638 hom 15 6 8 1 T 12 11 250395 CASAVA_Build 11 88978776 1I ATGAGTTTGG -/C CCACTGTTCA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 C 2 3 250396 CASAVA_Build 11 88978998 11D TGTCTTATGC TTGTGTGGAAT/----------- ACAGCCATGC 3070 het 3070 ref 29 18 10 5 TTGTGTGGAAT 1 0 250397 CASAVA_Build 11 88979255 1D GCTGACCAAA T/- AGAATTTTGC 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 T 1 0 250398 CASAVA_Build 11 88980721 1I GAGGGTATAC -/A TCAACTTTCC 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 A 0 1 250399 CASAVA_Build 11 88983306 1I AAGGACTCAG -/A TAAAGGAAAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 0 1 250400 CASAVA_Build 11 88983868 5D TAAATGATAA TTATC/----- TTATATAAAA 2905 het 2905 ref 19 10 6 3 TTATC 1 0 250401 CASAVA_Build 11 88984874 1D TCACACGGCT C/- CCCCTGCCTA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 C 5 4 250402 CASAVA_Build 11 88985744 1I AAGTGCACAT -/A ATAAGTCACA 3070 het 3070 ref 49 28 17 4 A 1 2 250403 CASAVA_Build 11 88995372 1D37M2D TTTTTAATGT CCCCCCCACCCCACAATTTTCCAGACTGTTTGCTCCACGA/-CCCCCCACCCCACAATTTTCCAGACTGTTTGCTCCAC-- GAGAGGAGAC 1902 het 1902 ref 13 13 6 0 N/A 0 0 250404 CASAVA_Build 11 88995665 1D CAGATATGCC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 9 8 250405 CASAVA_Build 11 88997580 1D GTAGGCTTTG A/- GGGTGAGGTG 3070 het 3070 ref 34 20 14 1 A 1 0 250406 CASAVA_Build 11 88998195 2I TTCGGTGTGC --/AG AGTTTTGACT 662 het 662 ref 28 21 2 5 AG 1 2 250407 CASAVA_Build 11 89002689 1D AAGGTCTGGT A/- AAAAAAGGCA 2878 het 2878 ref 30 18 7 6 A 7 6 250408 CASAVA_Build 11 89003800 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2115 het 825 hom 13 4 6 3 T 13 14 250409 CASAVA_Build 11 89004733 1I CTTTGTCATG -/A TTTTTCCTGT 2636 het 2636 ref 21 11 7 3 A 0 1 250410 CASAVA_Build 11 89014336 2D AATTATTTTT AG/-- AGAGGCAATG 3070 het 2247 hom 18 6 9 3 AG 3 2 250411 CASAVA_Build 11 89015197 1I AAATTTTATT -/A AAAAAAAAAG 2375 het 878 hom 15 3 7 5 A 9 10 250412 CASAVA_Build 11 89020038 1I TGCTGGTTAG -/T TTTTTTTTTA 2467 het 1396 hom 13 4 8 1 T 9 10 250413 CASAVA_Build 11 89021540 1D CACATTTTTC T/- TTTGAGATGA 2845 het 2845 ref 33 26 6 1 T 4 3 250414 CASAVA_Build 11 89022922 1I TGTTTACAAG -/T ATTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 22 8 4 T 0 1 250415 CASAVA_Build 11 89025581 5D ATATTGATTA TATTT/----- TATTAATGGT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 TATTT 1 0 250416 CASAVA_Build 11 89030418 12D TGTCTACAGC TGAGGCAATCCT/------------ TGAAGGGGCT 3070 het 3070 ref 20 9 11 4 TGAGGCAATCCT 1 0 250417 CASAVA_Build 11 89036601 3I ATAAATTGTT ---/GAA GAACAATTTA 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 GAA 1 2 250418 CASAVA_Build 11 89039329 3D AGACAACAAA TCT/--- TCTCCAAATG 3070 het 3070 ref 32 17 13 5 TCT 2 1 250419 CASAVA_Build 11 89039837 1I TCCATTTACA -/C CCCCAAAGCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 4 5 250420 CASAVA_Build 11 89043606 1I GTTTTCTGAA -/T TTTTTTTTTA 3041 het 3041 ref 19 9 7 3 T 9 10 250421 CASAVA_Build 11 89044590 1D GAACCTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2682 hom 38 14 13 11 T 14 13 250422 CASAVA_Build 11 89044971 4D AATTATATTG TTTA/---- TTTATTTTTG 3070 het 3070 ref 25 13 10 4 TTTA 2 1 250423 CASAVA_Build 11 89048136 1D ATTTTCTTTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 2947 hom 19 9 9 1 A 9 8 250424 CASAVA_Build 11 89048347 1I CTGATATCTC -/A AAAAAAACTT 2453 het 2453 ref 27 16 6 5 A 7 8 250425 CASAVA_Build 11 89050126 2D GTACGGTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 A 14 12 250426 CASAVA_Build 11 89050267 1I TCTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 1627 het 1627 ref 26 13 5 8 T 10 11 250427 CASAVA_Build 11 89053212 1D AAAATGCAGA T/- TTTTGAGAGG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 5 4 250428 CASAVA_Build 11 89054394 2D TCAGTCTGAT AC/-- ACAGCTGCAT 2856 het 2856 ref 31 15 12 5 AC 2 1 250429 CASAVA_Build 11 89059083 1D CAGGCAAGAC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 8 7 250430 CASAVA_Build 11 89065068 1D ACTAAGGTAA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 7 6 250431 CASAVA_Build 11 89068607 1D ATAGAAACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 10 9 250432 CASAVA_Build 11 89089664 1D TTTTAGTATG T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 16 8 8 1 T 7 6 250433 CASAVA_Build 11 89089805 2I CCTACATCTC --/TA TGTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TA 0 1 250434 CASAVA_Build 11 89092329 1I GTTGAACTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 25 1 19 5 C 0 1 250435 CASAVA_Build 11 89095621 1D TTTCTACAAA T/- AAAAAAGAGA 1542 het 1542 ref 37 29 4 5 T 1 0 250436 CASAVA_Build 11 89101104 1D TGTCTACAGG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 8 7 250437 CASAVA_Build 11 89135847 4I ACAGGCTTTC ----/ACCA ACCATGTTGG 2304 het 2304 ref 38 27 6 5 ACCA 1 2 250438 CASAVA_Build 11 89150172 1I CACAGCCACA -/G CCCAATAGGA 1256 het 1256 ref 47 32 4 11 G 0 1 250439 CASAVA_Build 11 89158938 1D ACTCTTTGTA C/- CCCTTTCCAG 1547 hom 21 het 10 0 4 6 C 4 3 250440 CASAVA_Build 11 89159700 1I CAACTACTTG -/T TGAACTATGT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 1 2 250441 CASAVA_Build 11 89189024 1I AAACCTGGAA -/T TTCCTAGAGT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 T 2 3 250442 CASAVA_Build 11 89210633 3D TGCTAACGTA AAC/--- AACAGGTGTA 2100 het 2100 ref 28 19 7 2 AAC 2 1 250443 CASAVA_Build 11 89248457 1D TCCTATTGGG C/- TGTGGCTGTG 3070 het 3070 ref 48 33 13 3 C 1 0 250444 CASAVA_Build 11 89395880 1I AATTATTGTC -/T TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 6 7 250445 CASAVA_Build 11 89399428 1I TATCACACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 11 12 250446 CASAVA_Build 11 89471841 2I CTAACGAACA --/CT CACACACACA 3070 het 3070 ref 42 26 9 7 CT 0 1 250447 CASAVA_Build 11 89472171 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTTAAA 1425 het 1425 ref 42 32 4 6 CT 1 2 250448 CASAVA_Build 11 89477722 1D12M1D TAAGCCCCTG AAAAAAAATGTTAC/-AAAAAAATGTTA- CCATCAGGGT 983 het 983 ref 28 24 4 2 N/A 0 0 250449 CASAVA_Build 11 89483343 2D TCCTCTAATA AG/-- AGAGTCAAGC 2354 het 2354 ref 44 37 5 3 AG 3 2 250450 CASAVA_Build 11 89506646 1I AAAGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 11 12 250451 CASAVA_Build 11 89558690 2D TTTTTTTTTT TA/-- TATACATTTA 3070 het 3070 ref 32 14 10 10 TA 3 2 250452 CASAVA_Build 11 89562586 2I ACTCTATCTC --/AA AAAAAAAAAA 2506 het 2463 hom 21 7 10 4 A 12 14 250453 CASAVA_Build 11 89563017 3I TTTGATTCTC ---/ACA ACAATTCTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 ACA 1 2 250454 CASAVA_Build 11 89566070 4I CTTTTGTAAA ----/AGTT AGGGAGTTAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 AGTT 0 1 250455 CASAVA_Build 11 89567767 1I ATGAAAAAAA -/C CCTTCAATGG 3070 hom 92 het 38 0 30 8 C 2 3 250456 CASAVA_Build 11 89569223 4I AAGCACTAAT ----/AAAC AAATGGCCAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAAC 0 1 250457 CASAVA_Build 11 89571026 21I CATGTTATAT ---------------------/AAAGCCTATTCACTCAACTGA CAGAAGCAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 5 AAAGCCTATTCACTCAACTGA 0 1 250458 CASAVA_Build 11 89572038 1I TGAACAACAA -/C AAAAAAACCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 0 1 250459 CASAVA_Build 11 89573022 5I TAAAGAACTG -----/TTGTA TTGTATTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTGTA 1 2 250460 CASAVA_Build 11 89573463 2I TACATATGTA --/TG TGTGTGTGTG 1542 het 1542 ref 23 11 4 8 TG 8 9 250461 CASAVA_Build 11 89578264 2D TATTTTTGGA AG/-- AGTTACTTAC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AG 2 1 250462 CASAVA_Build 11 89580099 4I CTATTTTCTA ----/CTAT CTAATTATCA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CTAT 0 1 250463 CASAVA_Build 11 89583197 4I TGATGCTACT ----/CAGA CAGAGTCTCT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 CAGA 1 2 250464 CASAVA_Build 11 89584695 4I TGTATACATA ----/ATTT ATTTAAGTCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATTT 1 2 250465 CASAVA_Build 11 89585619 2I AGCTAATTTA --/TT TTTTTTTTGG 3070 hom 93 het 40 0 31 9 T 8 10 250466 CASAVA_Build 11 89586151 3D ACTTGCAGCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 37 4 12 22 A 17 14 250467 CASAVA_Build 11 89587363 7D ATACTTATTA GTTATAT/------- GACCTTAAGC 3070 hom 117 het 41 0 40 3 GTTATAT 1 0 250468 CASAVA_Build 11 89588451 4I GTAACTATCT ----/TTAG TTAGTTAATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTAG 1 2 250469 CASAVA_Build 11 89590696 1D TGGGCAACAC A/- GTGAAACTCC 2052 hom 21 het 17 0 7 10 A 1 0 250470 CASAVA_Build 11 89591016 1D GAAAACAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 12 11 250471 CASAVA_Build 11 89596044 1D GGAAGTGGAG C/- CCAGACAACA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 C 3 2 250472 CASAVA_Build 11 89610107 1D CAACACACAC A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 A 8 7 250473 CASAVA_Build 11 89631523 1D TCAAAATATA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 T 8 7 250474 CASAVA_Build 11 89634145 1D TGTAATTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 12 11 250475 CASAVA_Build 11 89646040 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAATGATG 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 5 6 250476 CASAVA_Build 11 89655296 1I TAAGTAGGCC -/T TTTTTTTTTT 1505 het 1505 ref 36 11 10 15 T 17 18 250477 CASAVA_Build 11 89666091 7I AATTAAAAGA -------/TAAAAAT TAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 TAAAAAT 0 1 250478 CASAVA_Build 11 89676848 1I GATAAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 11 12 250479 CASAVA_Build 11 89678065 2D TAATCAAATC TT/-- TTACTCTTCT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 4 2 250480 CASAVA_Build 11 89682945 1D TTTCTTTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 A 11 10 250481 CASAVA_Build 11 89690779 1D TTATTCAACC T/- TTTTTCAATG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 6 5 250482 CASAVA_Build 11 89695319 1I TCTTTAGCCT -/C CCCCCCTGCA 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 C 6 7 250483 CASAVA_Build 11 89696396 2D CTCAATTTTT AG/-- AGTTTTTTTG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AG 2 1 250484 CASAVA_Build 11 89707778 1D ATTTTCTGAT G/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 G 1 0 250485 CASAVA_Build 11 89708643 5I CAGTGGACTG -----/TACTT TATGTTTCAC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 TACTT 0 1 250486 CASAVA_Build 11 89711494 4D TTTTAAAAAT AAAC/---- AAATTTTGCT 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 AAAC 1 0 250487 CASAVA_Build 11 89716090 4D AGTGAGAGAG ACAA/---- ACAAGTGAAT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 ACAA 2 1 250488 CASAVA_Build 11 89718103 1D GCTATTTATT G/- GGTCCCTCCC 2833 het 2833 ref 25 12 8 5 G 3 2 250489 CASAVA_Build 11 89727813 4D TGTGTATGTA TATG/---- TATGTATGTA 3070 hom 59 het 36 0 20 19 TATG 4 3 250490 CASAVA_Build 11 89735750 1D AGCTACTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 35 2 29 5 T 11 10 250491 CASAVA_Build 11 89748786 1I AATTTAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 T 12 13 250492 CASAVA_Build 11 89756167 1D GGCTCAGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1714 hom 31 7 9 15 A 17 16 250493 CASAVA_Build 11 89759160 3D ATTCTGTTGT AGC/--- AGCACAAATG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 AGC 2 1 250494 CASAVA_Build 11 89762202 4I AATCTCACTC ----/TCTT TATCTGTAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 TCTT 0 1 250495 CASAVA_Build 11 89763164 1D TTGTGTTGAC A/- AAAAAATATC 3070 hom 129 het 49 0 44 6 A 7 6 250496 CASAVA_Build 11 89782441 3D ACAAGTACTC GTT/--- GTTGATGGTG 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 GTT 2 1 250497 CASAVA_Build 11 89792664 1D TCTGAAACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 11 10 250498 CASAVA_Build 11 89795233 5I CATAAAATTA -----/AAAAT AAAAGTTGAA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 AAAAT 0 1 250499 CASAVA_Build 11 89796801 1D GTAGTGCTTA T/- TATACAATTG 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 T 2 1 250500 CASAVA_Build 11 89801625 1I TGTAACACTT -/A AAAAAAAAAA 602 het 602 ref 41 23 4 14 A 15 16 250501 CASAVA_Build 11 89804784 1I CCTTCTCTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 25 11 7 7 T 8 9 250502 CASAVA_Build 11 89817354 2I TATAATTGAC --/AT AGTTTAAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 0 1 250503 CASAVA_Build 11 89823872 33I ATACATTTAG ---------------------------------/AAGCATTTTGACGGGTGCACTACTGATAGAAGC AAGCATTTTT 3070 het 3070 hom 45 21 22 6 AAGCATTTTGACGGGTGCACTACTGATAGAAGC 0 1 250504 CASAVA_Build 11 89827265 6I ATAAACAATT ------/AAAAAC AAAGAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 28 13 3 AAAAAC 0 1 250505 CASAVA_Build 11 89839180 1D CTAAAATGTC A/- AACTGGCTGG 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 A 3 2 250506 CASAVA_Build 11 89840384 19D CAACAATTAC GGTATGATCCAACAATTAT/------------------- GGTATGATCC 3070 het 3070 ref 43 22 14 10 GGTATGATCCAACAATTAT 2 1 250507 CASAVA_Build 11 89840586 5D ATTCAGTGAT AAAAG/----- AAAATAAACT 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 AAAAG 1 0 250508 CASAVA_Build 11 89842331 4I CATACTAACG ----/TTAA TTAAGATATT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 TTAA 1 2 250509 CASAVA_Build 11 89845170 1D TACCACTCTA T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 7 6 250510 CASAVA_Build 11 89847201 2D AAGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 44 het 27 0 15 12 T 11 9 250511 CASAVA_Build 11 89853622 1I CAATAAAGCT -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 G 1 2 250512 CASAVA_Build 11 89862802 11D GGAAGAATGG GTCTGGGGCAT/----------- GTCAGAGGTC 3070 het 3070 ref 33 17 16 5 GTCTGGGGCAT 1 0 250513 CASAVA_Build 11 89866446 3I TAGCCCCCAC ---/TCT TCTTCTTTGT 3070 het 3070 ref 58 31 23 4 TCT 2 3 250514 CASAVA_Build 11 89868071 1I ACCTCTGCCT -/C CCTGGTTCAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 2 3 250515 CASAVA_Build 11 89868908 1D GTTTTTGTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 10 9 250516 CASAVA_Build 11 89875332 4I GTAAAACCTT ----/TATC TAAGATTCCT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TATC 0 1 250517 CASAVA_Build 11 89879259 1D CTCCTTGTGA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 8 7 250518 CASAVA_Build 11 89889974 1I TATGCTTCAG -/A AAAAAAAAAA 2569 het 2569 ref 32 16 8 8 A 11 12 250519 CASAVA_Build 11 89890608 1D CAATGTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 A 11 10 250520 CASAVA_Build 11 89890976 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1136 het 1136 ref 24 13 3 8 T 14 13 250521 CASAVA_Build 11 89911078 3I AATAATAAAG ---/ATA ATAATAATAG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 ATA 3 4 250522 CASAVA_Build 11 89912101 1I AATCATACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 13 12 T 13 14 250523 CASAVA_Build 11 89918576 3I GCACTCACTG ---/TCA TCATTTCTTG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 TCA 1 2 250524 CASAVA_Build 11 89924848 1D TTTTTTTCCC T/- TTTTCTCTCA 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 T 5 4 250525 CASAVA_Build 11 89925553 1D TCCACAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 T 12 11 250526 CASAVA_Build 11 89926517 3D ATAAATATAT ATA/--- TTTTTTTTTT 927 het 927 ref 31 12 4 15 ATA 1 0 250527 CASAVA_Build 11 89935468 2I CCAAACTTCC --/CA AAGCAATGTA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 CA 0 1 250528 CASAVA_Build 11 89936298 1I ATAAGTGGCC -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 6 7 250529 CASAVA_Build 11 89937586 1I ACAATGCAAT -/C AGAGAGACAG 3070 het 3070 hom 29 8 19 2 C 0 1 250530 CASAVA_Build 11 89938339 1I TATTTTGGGA -/T TTTTCTAAAT 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 4 5 250531 CASAVA_Build 11 89939877 1I TTTAAAATAC -/T TTTTTCCTCT 1591 het 1591 ref 33 17 5 11 T 5 6 250532 CASAVA_Build 11 89940797 1I ACTTTTCTAC -/T TTGATGCCAG 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 2 3 250533 CASAVA_Build 11 89941334 3D GGGAGGTGTT TTG/--- TTTTTTTTTT 1162 het 1162 ref 20 8 7 6 TTG 1 0 250534 CASAVA_Build 11 89943683 1I TTTCTTTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 A 10 11 250535 CASAVA_Build 11 89960212 1I CAACATCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 10 11 250536 CASAVA_Build 11 89965580 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2519 het 1438 hom 16 5 7 4 A 13 14 250537 CASAVA_Build 11 89969123 1I CCATTTTTTT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 7 8 250538 CASAVA_Build 11 89969977 1D AACCAAAGAT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 36 17 17 4 A 7 6 250539 CASAVA_Build 11 89974035 4D GCAGAGAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 49 16 29 7 AAAC 3 2 250540 CASAVA_Build 11 89977514 1D TTCAGAATGA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 8 7 250541 CASAVA_Build 11 89980417 4D TCCTCTGACC AAGT/---- AAGTGGCTAA 3070 het 3070 ref 64 33 25 9 AAGT 2 1 250542 CASAVA_Build 11 89987531 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3014 het 3014 ref 36 16 11 9 TG 5 6 250543 CASAVA_Build 11 89988943 1D11M1D ACTATAATTT GGTTGGCAGTAAT/-GTACCCTATCA- TCTACCCTAG 3070 het 3070 hom 40 17 22 5 N/A 0 0 250544 CASAVA_Build 11 89989913 1I AATTACTGTA -/T TTTGTGTAAG 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 3 4 250545 CASAVA_Build 11 89995534 1D AATTGAGGAG T/- TAGGGACTCC 3070 het 3070 ref 61 40 18 4 T 2 1 250546 CASAVA_Build 11 90004638 1I CTGAGTTTCA -/T TATCTGTCAT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 1 2 250547 CASAVA_Build 11 90012793 1D ATTTCATTTT A/- TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 30 9 19 3 A 1 0 250548 CASAVA_Build 11 90013093 4I TTAAAAACAC ----/TGAT TGAGATGGAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 TGAT 0 1 250549 CASAVA_Build 11 90014999 1I ATGAAAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 414 hom 40 1 29 10 T 9 10 250550 CASAVA_Build 11 90019553 1I TGACAATAAA -/G GGTTTAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 2 3 250551 CASAVA_Build 11 90023179 1I AAGACAGTGT -/G GTGACTCCTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 1 2 250552 CASAVA_Build 11 90024072 2I CAAAGAAAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 221 hom 33 1 22 10 A 11 13 250553 CASAVA_Build 11 90046654 1D GCCATCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 11 10 250554 CASAVA_Build 11 90090409 1D ATTCCAGCAA T/- ATGGGAAGGT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 1 0 250555 CASAVA_Build 11 90095954 1D TAACCTTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 29 0 21 8 T 10 9 250556 CASAVA_Build 11 90099721 1I ATAGGAATAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 9 10 250557 CASAVA_Build 11 90104305 2I TTATTTAATC --/AA GAGTGGTTTT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 0 2 250558 CASAVA_Build 11 90109606 4I GATTGTACAC ----/ACAT ACATATTTAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 ACAT 1 2 250559 CASAVA_Build 11 90111565 1D GTTTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 40 1 31 8 A 13 12 250560 CASAVA_Build 11 90113090 2I ATTTTTGTCT --/GA GAGTGCCTAG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 GA 1 2 250561 CASAVA_Build 11 90115802 1I69M1D ATTTGTTATG -ATTTCTAAGAATTTCAGCATCTTGTAAGAATAATTTATCGTCATTACATTTTCCCTTGGCTATACTTGAT/AATTTCTAAGAATTTCAGCATCTTGTAAGAATAATTTATCGTCATTACATTTTCCCTTGGCTATACTTGA- TTTTTTAAAA 3070 hom 105 het 20 0 36 4 N/A 0 0 250562 CASAVA_Build 11 90120206 13D AGCAGTGTGA AGTCTCTGAGATT/------------- GCTTCTCAGG 3070 hom 123 het 39 0 41 3 AGTCTCTGAGATT 1 0 250563 CASAVA_Build 11 90122996 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 45 2 34 9 T 19 18 250564 CASAVA_Build 11 90132768 4D AGATGTTAAA TAGT/---- TGGTTTTTGT 3070 hom 157 het 57 0 53 5 TAGT 1 0 250565 CASAVA_Build 11 90135812 2I CTTATTTAAC --/AT ATAAAATCAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AT 1 2 250566 CASAVA_Build 11 90137559 5I CATTCTGGTG -----/GGGGC GGGGGGGGCA 3070 hom 91 het 34 0 27 7 GGGGC 0 1 250567 CASAVA_Build 11 90140454 3D GAAAATTGAA AAC/--- AATGGGGGAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAC 1 0 250568 CASAVA_Build 11 90145076 1I AACTGCAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 0 1 250569 CASAVA_Build 11 90149357 2D ACTCCATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 A 16 14 250570 CASAVA_Build 11 90155357 1I ACACGAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1190 hom 26 3 17 6 T 10 11 250571 CASAVA_Build 11 90168088 2D AGGAGTGGTT TA/-- TACCATTTAG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TA 2 1 250572 CASAVA_Build 11 90169443 21I TCCAGATAGT ---------------------/CTTCCTTACAACTATCCAATA CTGCCATTGT 3070 hom 132 het 43 0 45 1 CTTCCTTACAACTATCCAATA 0 1 250573 CASAVA_Build 11 90172720 1D TGAGACATTT C/- CTAGTATTCT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 2 1 250574 CASAVA_Build 11 90173001 1I TATTTATATA -/T TTTTTATTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 5 6 250575 CASAVA_Build 11 90175900 2D TCTGTATCTC TT/-- TAATATTTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 3 1 250576 CASAVA_Build 11 90176613 4I ATTGGCTGAC ----/ACTT ACGCATGTGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ACTT 0 1 250577 CASAVA_Build 11 90176808 1I CTCCCCCCGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 30 1 21 8 A 11 12 250578 CASAVA_Build 11 90178972 1I AGATTACACA -/T TTTTTTCCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 250579 CASAVA_Build 11 90183120 1I GACCACAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 34 2 22 10 T 12 13 250580 CASAVA_Build 11 90197296 3D TTTGAAAACT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 22 0 12 11 A 19 16 250581 CASAVA_Build 11 90206560 1I TGGATTATCA -/T TGGGAGTGAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 1 2 250582 CASAVA_Build 11 90219790 1I CATGATTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 32 1 20 11 A 12 13 250583 CASAVA_Build 11 90222250 1D AGAAGTTATT A/- CTCATGGCAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 0 250584 CASAVA_Build 11 90228811 3D AAAATAACTA ACT/--- AACTAACTAA 1977 hom 21 het 15 0 8 7 ACT 1 0 250585 CASAVA_Build 11 90229342 4I TTTTACTCAA ----/TTTC TTTCTTTAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTTC 1 2 250586 CASAVA_Build 11 90229600 1I TCTAATTTTT -/C AAAATGGCAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 0 1 250587 CASAVA_Build 11 90232997 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 7 8 250588 CASAVA_Build 11 90233588 1I AGAAAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 30 7 A 13 14 250589 CASAVA_Build 11 90237869 4I ACATATTTGG ----/TCTT TCTTTGTCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TCTT 1 2 250590 CASAVA_Build 11 90238315 4I ATATAAAAAA ----/TAAG TAAGTAAGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TAAG 2 3 250591 CASAVA_Build 11 90239132 1I TATCTTGGCT -/C CTTGACTTCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 1 2 250592 CASAVA_Build 11 90249368 1I CGTGGTGAAA -/C CCCATCTTTA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 3 4 250593 CASAVA_Build 11 90273051 7I GAGTAGCTTG -------/AATGGTA AATGGTAATC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AATGGTA 1 2 250594 CASAVA_Build 11 90275624 1I ATGTTAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 622 hom 30 3 19 8 A 13 14 250595 CASAVA_Build 11 90284164 1I TTTCACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 281 hom 39 1 33 5 T 11 12 250596 CASAVA_Build 11 90293470 1I TGGTTCAACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 361 hom 39 1 33 5 T 9 10 250597 CASAVA_Build 11 90295309 1I TTTTGGGGGT -/G GGGGGGGTAA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 7 8 250598 CASAVA_Build 11 90297330 4I TAAGTGTATG ----/TGTT TATGTGTGTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TGTT 0 1 250599 CASAVA_Build 11 90298172 6D AACTCTATCA TTATTT/------ TTATTTTTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTATTT 2 1 250600 CASAVA_Build 11 90298432 1I GTACTTTTTT -/A TTTAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 1 250601 CASAVA_Build 11 90300782 1I CAGCTATGCA -/T TTTCCATTGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 4 250602 CASAVA_Build 11 90305546 1I ATGTTAGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 10 250603 CASAVA_Build 11 90308074 2I AGAGATGAGA --/CT CTTACACATG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 CT 1 2 250604 CASAVA_Build 11 90309291 2D GATCAGTCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 12 10 250605 CASAVA_Build 11 90312828 1I ATAAGAAGAT -/G GGTACACATC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 2 3 250606 CASAVA_Build 11 90313884 1I GATATCTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 9 10 250607 CASAVA_Build 11 90317752 4D CCACCCAGTA TTAC/---- TTAATCAGAA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 TTAC 1 0 250608 CASAVA_Build 11 90326972 1I ATTAGTGTGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 9 250609 CASAVA_Build 11 90327452 1I CTCCCCTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 39 1 34 4 T 10 11 250610 CASAVA_Build 11 90335621 1D ATAAAAATAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 9 8 250611 CASAVA_Build 11 90337041 1I AATAGGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1424 hom 32 4 25 3 T 14 15 250612 CASAVA_Build 11 90351410 3I AAAATAAATG ---/GAA GAAGAAACAA 3070 hom 75 het 26 0 25 1 GAA 2 3 250613 CASAVA_Build 11 90353564 1D CAGTATTTCA C/- CATTTTGGCC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 2 1 250614 CASAVA_Build 11 90361737 1I AATACAAAAT -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 7 8 250615 CASAVA_Build 11 90364842 1D AAGGCAAAAT A/- TATTTTATTT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 1 0 250616 CASAVA_Build 11 90388100 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 26 het 13 0 12 1 A 9 8 250617 CASAVA_Build 11 90388234 1I17M4I28M3D CGCGCCACTG -ACTCCAGCCTGGGTGAC----AGAGAGAGATTCCCTATCATAAAAAAAAAAG/CACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGAGAGAGATTCCCTATCATAAAAAAAA--- AAAAGAAAAA 3070 het 409 hom 15 5 10 4 N/A 0 0 250618 CASAVA_Build 11 90388498 4D CTTTTCACAA TTTG/---- TTTTTCTTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTTG 1 0 250619 CASAVA_Build 11 90392931 1I GGTGGGGGGA -/G GGGGGAGGGA 2220 hom 12 het 6 0 5 1 G 5 6 250620 CASAVA_Build 11 90398051 1D GTATCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 43 3 25 15 A 12 11 250621 CASAVA_Build 11 90399064 3I TTGTGACATT ---/CAG CAGATGATTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 CAG 1 2 250622 CASAVA_Build 11 90402349 4D GTGTGTGTGT GTGA/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 45 het 44 0 23 22 GTGA 1 0 250623 CASAVA_Build 11 90404082 2D CTAGTTTTCC TA/-- TATATATATA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 TA 6 5 250624 CASAVA_Build 11 90407963 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTCCATTT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 0 1 250625 CASAVA_Build 11 90412626 1D AATAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 11 10 250626 CASAVA_Build 11 90423447 1I TTCACACCAC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 250627 CASAVA_Build 11 90424803 1I TCAAAAATTT -/A AAAAAATATT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 6 7 250628 CASAVA_Build 11 90425834 1I TTTTTTCCCC -/T AAAACACCAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 0 1 250629 CASAVA_Build 11 90434785 4D TCATATTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 45 1 34 10 T 15 11 250630 CASAVA_Build 11 90447683 1D CACACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 A 13 12 250631 CASAVA_Build 11 90451745 1I TACTTTTTTG -/T TGTGCTTTGT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 1 2 250632 CASAVA_Build 11 90453950 1I TTCTTAAGTG -/C CCCAGGAGTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 3 4 250633 CASAVA_Build 11 90454946 1D CCTTTCCTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 10 9 250634 CASAVA_Build 11 90455348 1I AAACAGAAAT -/G TTTTTTTACT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 0 1 250635 CASAVA_Build 11 90463467 1D GTCTAATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 39 0 27 12 T 12 11 250636 CASAVA_Build 11 90463831 6I ACAATTGTAA ------/TATACT TATACTTGTA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 TATACT 1 2 250637 CASAVA_Build 11 90465498 1D CCTCTTTTGC A/- AATATTGTAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 3 2 250638 CASAVA_Build 11 90469114 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAGCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 8 250639 CASAVA_Build 11 90473667 1I ATATAACTGA -/T TTTTTAACTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 5 6 250640 CASAVA_Build 11 90473897 3D CCTAGAACTT CTC/--- CTTTTGTGTA 3070 hom 105 het 37 0 36 3 CTC 1 0 250641 CASAVA_Build 11 90478863 1I TTTCATAATA -/C CACTGTTATA 3070 hom 103 het 40 0 36 4 C 1 2 250642 CASAVA_Build 11 90481109 1D AATTAAGTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 137 het 49 0 46 13 T 8 7 250643 CASAVA_Build 11 90489473 1I AAGTACTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 T 10 11 250644 CASAVA_Build 11 90492846 1I TATGGGCTTG -/T TTTCCAGGAA 3070 het 3070 hom 57 26 26 5 T 3 4 250645 CASAVA_Build 11 90495571 7D ACAATGTACA AGGTTTC/------- CTTTTTTCCA 2514 het 2514 ref 23 17 6 1 AGGTTTC 1 0 250646 CASAVA_Build 11 90502668 3I TTCTGTCAGC ---/ACA ACTTTTATTT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 ACA 0 1 250647 CASAVA_Build 11 90504096 2D GGAAATGGGA CT/-- CTCTTTGTAT 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 CT 3 2 250648 CASAVA_Build 11 90507980 1I GTTCTATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 811 hom 42 2 29 11 A 10 11 250649 CASAVA_Build 11 90512702 4I ATAAATAAAT ----/AATA AATAAAATAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 AATA 1 2 250650 CASAVA_Build 11 90513324 1I ACCAGGATTC -/T TTTTTTTTTT 3061 het 3061 ref 35 10 11 14 T 15 16 250651 CASAVA_Build 11 90514261 2I TGCATTTAAA --/AT AGTTATCTAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AT 0 1 250652 CASAVA_Build 11 90523221 1D TCAATCTCAG C/- TCACTGCAAC 3070 het 435 hom 14 1 11 2 C 1 0 250653 CASAVA_Build 11 90524580 5D GCAGAAGGAA TAGAG/----- TAAAGGGGGA 3070 het 3070 ref 35 15 13 8 TAGAG 1 0 250654 CASAVA_Build 11 90530247 1I GGCCAATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 10 11 250655 CASAVA_Build 11 90530379 2I34M4I TAATGTACAA --ACACACACACACACACAAACATACGCAAACACAC----/ACACACACACACACACACAAACATACGCAAACACACTACA TACATAAACA 3070 het 3070 ref 49 25 22 16 N/A 0 0 250656 CASAVA_Build 11 90533107 40I AATTCTTCCA ----------------------------------------/AAGAGGTCAGACACATTCTGGGTATTTCATCTGAAGATAT AGTCCTGACC 3070 het 3070 ref 44 23 17 8 AAGAGGTCAGACACATTCTGGGTATTTCATCTGAAGATAT 0 1 250657 CASAVA_Build 11 90539992 5I AGAAAGACTT -----/AGTAA AGTACTCTCC 3070 het 3070 ref 47 26 20 1 AGTAA 0 1 250658 CASAVA_Build 11 90541228 1I AAAGATTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 25 19 9 A 10 11 250659 CASAVA_Build 11 90545777 1D TTCCTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 15 14 250660 CASAVA_Build 11 90547561 1D CTATTTCACT G/- GTTGTATATG 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 G 2 1 250661 CASAVA_Build 11 90550971 1I AGGCAATCAA -/T ATTTGACAAA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 0 1 250662 CASAVA_Build 11 90551498 2I CTATAATATA --/TG TGTGTTGTCT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TG 2 3 250663 CASAVA_Build 11 90561684 1I TTTTATACCC -/T TTATTATATT 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 T 2 3 250664 CASAVA_Build 11 90561934 1D AATATGTTAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 T 9 8 250665 CASAVA_Build 11 90563682 1D TTTGAAATTC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 9 8 250666 CASAVA_Build 11 90569843 1D TTATCTATCC A/- AAAAATCTAC 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 A 6 5 250667 CASAVA_Build 11 90577709 1I TCTGCAACTG -/T TTTTTTTTTT 2404 het 2404 ref 28 15 6 7 T 11 12 250668 CASAVA_Build 11 90584673 1D CCAGAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 239 hom 39 4 17 18 T 15 14 250669 CASAVA_Build 11 90585417 2I TACAAACAAA --/AT ATTGAAACCC 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 AT 1 2 250670 CASAVA_Build 11 90586454 3I AAAGTAGAGA ---/GAT TAAAATGGGG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 GAT 0 1 250671 CASAVA_Build 11 90593328 1I ACCATTCAGC -/T GGTATATTAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 250672 CASAVA_Build 11 90594538 5I TGCAGCTCTC -----/CTCTA CTCTACTGTG 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 CTCTA 1 2 250673 CASAVA_Build 11 90597583 1D TGCAAAAACC A/- ACAAGCATTC 2687 hom 18 het 7 0 7 0 A 2 1 250674 CASAVA_Build 11 90600595 1I TTAAAAGAAG -/C CCCCTCAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 4 5 250675 CASAVA_Build 11 90604026 1D CTTTGAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 30 1 28 1 A 13 12 250676 CASAVA_Build 11 90605365 1I TCTAGACCCA -/T TTTTTCCCAC 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 T 5 6 250677 CASAVA_Build 11 90605446 1I CTAACTATTA -/G ATTTTTCCTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 0 1 250678 CASAVA_Build 11 90608623 2I GATATATAAC --/AT ATATATGTTA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 AT 3 4 250679 CASAVA_Build 11 90624487 2I GGTATCTAGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 79 het 33 0 25 8 TG 5 6 250680 CASAVA_Build 11 90632722 34D TGCAATTGGT GAAATTTAGTGAAGAAGGACTGTTCACAGGGGGC/---------------------------------- GAAATTTAGT 3070 hom 67 het 27 0 23 11 GAAATTTAGTGAAGAAGGACTGTTCACAGGGGGC 1 0 250681 CASAVA_Build 11 90638712 1I AAAACCTGGT -/A TTGATCCTAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 0 1 250682 CASAVA_Build 11 90646622 1I GAAAGAGTCT -/G GAGGTCTCAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 2 250683 CASAVA_Build 11 90650943 1I AAATATTTAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 9 250684 CASAVA_Build 11 90653708 1I CCCAATTAGC -/T GATCTAATTC 3070 hom 152 het 57 0 51 6 T 0 1 250685 CASAVA_Build 11 90656917 2I CAGATTTTAT --/GA GAAATTCCAG 3070 hom 63 het 28 0 21 7 GA 1 2 250686 CASAVA_Build 11 90659801 1I TTAAAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 382 hom 31 1 26 4 A 9 10 250687 CASAVA_Build 11 90661247 6I CAAATAGAAC ------/AAATAA AAATAAAAAC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AAATAA 1 2 250688 CASAVA_Build 11 90663037 1D GTAAAAAAGG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 8 7 250689 CASAVA_Build 11 90664400 11D GTGATACAGT TTAAAGACACC/----------- TTGAAGACAC 3070 het 3070 hom 39 22 17 8 TTAAAGACACC 1 0 250690 CASAVA_Build 11 90665124 1D GCTTTATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 11 10 250691 CASAVA_Build 11 90666454 1D CATTTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 28 0 20 8 A 11 10 250692 CASAVA_Build 11 90673894 4I ACTTGGTGAG ----/TAAT TAAGACAATG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TAAT 0 1 250693 CASAVA_Build 11 90683320 1I CAATGGGGGT -/G AAGGGATGTA 3070 hom 99 het 40 0 32 8 G 0 1 250694 CASAVA_Build 11 90697045 4D AGACAGTAAA TTTC/---- TTTCAATATT 3070 het 3070 hom 32 14 15 6 TTTC 2 1 250695 CASAVA_Build 11 90698513 4I ATATATTGGA ----/ATAT AGACATACAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 AT 0 2 250696 CASAVA_Build 11 90714548 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 8 7 250697 CASAVA_Build 11 90732127 1I CAAGTAAAAA -/T TTTTTTTATT 1893 hom 21 het 10 0 8 2 T 7 8 250698 CASAVA_Build 11 90737589 30D CTGTTAAAAG TTGTACAGATGACAAGAGGGACAATATCCC/------------------------------ TTGTACAGAT 3070 het 3070 ref 29 15 7 11 TTGTACAGATGACAAGAGGGACAATATCCC 1 0 250699 CASAVA_Build 11 90746308 1I TTTTATGTCC -/A TTTTTCTTTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 1 250700 CASAVA_Build 11 90774898 5I56M2I AGGACATAGA -----TATGCGCAAAGACTTCATGACTAAAACACTTCTGCTCAGCAAAAGAAACTATCATC--/TATGGTATGGGCGAAGACTTCATGACTAAAACACTTCTGCTCAGCAAAAGAAACTATCATCAG AGTGAACAGG 3070 het 3070 ref 41 43 8 14 N/A 0 0 250701 CASAVA_Build 11 90780397 1I AAAGAATATG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 7 8 250702 CASAVA_Build 11 90784811 1D AGAATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 15 14 250703 CASAVA_Build 11 90792228 2I GAATATACAC --/AT GTTTGCTCTA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 AT 0 1 250704 CASAVA_Build 11 90794271 1D CCCTGACCTC T/- TTGCGCCTCT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 3 2 250705 CASAVA_Build 11 90796068 1I GTGAGGCCTG -/C ATCTCAGTTT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 C 0 1 250706 CASAVA_Build 11 90821938 1D AATAAATAAA T/- AAAAAAGATT 3070 het 2677 hom 21 7 13 2 T 1 0 250707 CASAVA_Build 11 90827193 2D ACAGGAGGAC AT/-- GTGTAGGTTA 3070 het 3070 ref 31 13 14 6 AT 1 0 250708 CASAVA_Build 11 90829403 3I ATCAACACAA ---/AAC ACAATAAATA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 AAC 0 1 250709 CASAVA_Build 11 90832004 5D CTAAAGAACT TAAAA/----- TAACGTAATT 3070 het 3070 hom 37 13 20 5 TAAAA 1 0 250710 CASAVA_Build 11 90846620 1I AATAATGAAG -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 A 7 8 250711 CASAVA_Build 11 90861494 1I ACCTCCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 T 10 11 250712 CASAVA_Build 11 90862423 1D GGAGGTGGCA G/- GGGGGTGCAA 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 G 6 5 250713 CASAVA_Build 11 90863104 2D CCCACCCCCG CC/-- CCAGCCCTCT 2353 het 69 hom 9 1 7 1 C 4 2 250714 CASAVA_Build 11 90867491 4I ATAAAGTTGA ----/ACTT ACTTCTTAGC 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 ACTT 1 2 250715 CASAVA_Build 11 90869782 2I7M4D3M2I AGCCATATTT --TTGGAACCAAAATA--/TATTTTAAC----TTAGG TGGAACCAAA 3070 het 3070 ref 35 25 13 4 N/A 0 0 250716 CASAVA_Build 11 90875475 1D GAAATCGAAG A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 A 7 6 250717 CASAVA_Build 11 90877628 1I TAACTCCTAA -/T GCTATCCCTC 2261 het 1868 hom 15 8 6 1 T 0 1 250718 CASAVA_Build 11 90890824 3I GTTTGAAAGT ---/TGA AGTACCCTCA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 TGA 0 1 250719 CASAVA_Build 11 90892462 1D TTTGATAAAT C/- ATAGGAAGTA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 C 1 0 250720 CASAVA_Build 11 90898602 1D TGAGCATCAG A/- AAAAAAAAAG 2504 het 2504 ref 27 15 8 4 A 10 9 250721 CASAVA_Build 11 90899678 1I AAACAATTCA -/T TTTTCCCATA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 4 5 250722 CASAVA_Build 11 90924067 1D TTACTCTCTT A/- ATGGCGGCTA 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 A 2 1 250723 CASAVA_Build 11 90925326 1I TTATTGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 10 11 250724 CASAVA_Build 11 90944217 3D GTAATTGGAC TTA/--- TTAATTCAAA 3070 het 3070 ref 43 22 20 3 TTA 2 1 250725 CASAVA_Build 11 90944895 2I TCTTGAAAAC --/AT GTGTTATTTT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 AT 0 1 250726 CASAVA_Build 11 90947236 1I TGTTAAACTA -/T TAAATCTCAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 1 2 250727 CASAVA_Build 11 90948539 1I AAGAAAATAC -/T TAATGATAGA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 1 2 250728 CASAVA_Build 11 90951478 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTCCAAT 711 hom 5 het 2 0 2 1 T 5 6 250729 CASAVA_Build 11 90953255 1I AAATTGAGGC -/A ATAATTAATA 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 1 2 250730 CASAVA_Build 11 90962885 1D TTTTTCTACA T/- TTTTTATATA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 6 5 250731 CASAVA_Build 11 90963595 1D TATTGCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 11 10 250732 CASAVA_Build 11 90964154 1D TTTGCATGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 49 19 27 4 T 9 8 250733 CASAVA_Build 11 90972388 1D AGCTGCTATA C/- CAGATGTAGT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 C 2 1 250734 CASAVA_Build 11 90975134 1D TCCATCAGTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 18 7 4 A 9 8 250735 CASAVA_Build 11 90977707 1I TCATGAAATT -/A AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 14 6 5 3 A 15 16 250736 CASAVA_Build 11 90979987 1D TGCTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 14 13 250737 CASAVA_Build 11 91002584 2D TTGAGGACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2836 hom 27 7 16 5 A 13 11 250738 CASAVA_Build 11 91006599 8D ATAAAATAAT ATATTATG/-------- ATAAAAATCA 3070 het 3070 ref 34 23 11 2 ATATTATG 1 0 250739 CASAVA_Build 11 91008608 1I TTAGCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 12 13 250740 CASAVA_Build 11 91009010 1I TATCATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 9 11 T 13 14 250741 CASAVA_Build 11 91010023 2D ATGTGAGGAC AT/-- GTGATTTGGG 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 AT 1 0 250742 CASAVA_Build 11 91027094 1I TCAGAATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 10 11 250743 CASAVA_Build 11 91042599 1D TCAGCAAATT A/- AAAAATAAAT 2265 het 2265 ref 27 10 5 12 A 6 5 250744 CASAVA_Build 11 91042630 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 339 hom 23 3 14 7 AT 6 5 250745 CASAVA_Build 11 91044871 1D TGAAACTGGA C/- CCCCCCCTTA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 C 8 7 250746 CASAVA_Build 11 91045856 2D ATATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 AT 7 6 250747 CASAVA_Build 11 91057801 3I AATCGTAAAA ---/CTT CATGGCAGCA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 CTT 0 1 250748 CASAVA_Build 11 91058662 5D TTACCTAGTG TATTT/----- TATTTTATTT 3070 het 56 hom 22 2 9 11 TATTT 8 7 250749 CASAVA_Build 11 91059539 4D TTGAGAGTTT GAGA/---- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 12 3 GA 2 0 250750 CASAVA_Build 11 91069263 1I AAATAAACAT -/G GTACTGTCTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 2 250751 CASAVA_Build 11 91081528 1D CTGCAACTGA C/- CTTTTTGGGT 3070 het 3070 hom 38 19 18 1 C 2 1 250752 CASAVA_Build 11 91082993 1D TGTAATGTAA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 8 7 250753 CASAVA_Build 11 91085096 1D TACACTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 11 10 250754 CASAVA_Build 11 91086011 1D GAAATTATTT A/- AAAAAAAAAA 1215 het 1215 ref 36 25 3 8 A 13 12 250755 CASAVA_Build 11 91144693 2I CTGATTTCCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 11 13 250756 CASAVA_Build 11 91154779 4D TTGAATATGG TTAA/---- TTGATTTCAC 3070 het 3070 ref 33 16 15 3 TTAA 1 0 250757 CASAVA_Build 11 91177956 1D ATGAGATCCA C/- CTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 40 20 13 9 C 2 1 250758 CASAVA_Build 11 91178381 4I ATTTTCCTGA ----/TGGT TAGTGATGTT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 TGGT 0 1 250759 CASAVA_Build 11 91178503 1I TTTTTTTTTT -/G TTTGCTATTG 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 G 0 1 250760 CASAVA_Build 11 91187042 1D TCTCCATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 11 10 250761 CASAVA_Build 11 91196168 2I GGGTCCTTCC --/AA AGTTAGTTTG 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 A 1 3 250762 CASAVA_Build 11 91197385 2D TTTTTTAAAG AT/-- ATTGTTATTT 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 AT 2 1 250763 CASAVA_Build 11 91211965 3D GGTGGCTTAA AAC/--- AACAGAAATT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 AAC 2 1 250764 CASAVA_Build 11 91224345 8I TGTTTTAAGG --------/ATGTGGAC ATCTACATAT 3070 het 3070 ref 45 30 15 0 ATGTGGAC 0 1 250765 CASAVA_Build 11 91235592 1I ATAAACATAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 9 10 250766 CASAVA_Build 11 91247303 1I TACATTGCCC -/T TTTTTTTTTT 2082 het 446 hom 23 2 11 10 T 13 14 250767 CASAVA_Build 11 91252631 3I ATGTTAATCA ---/AAG AAGAAACACA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 AAG 1 2 250768 CASAVA_Build 11 91252817 1I GCCTTTTTTT -/C CCCCTTTGAA 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 C 4 5 250769 CASAVA_Build 11 91256199 1D ACTTCCCTTT G/- GCCTACAAAT 2662 het 2662 ref 27 16 6 5 G 2 1 250770 CASAVA_Build 11 91256400 1I AGTTTTGTCA -/T TTTTTTACCC 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 6 7 250771 CASAVA_Build 11 91257912 1D GTGGTAAGCA T/- TTAAAGCAAT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 3 2 250772 CASAVA_Build 11 91258967 1D CAAAATAGAT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 A 8 7 250773 CASAVA_Build 11 91259113 1D AAACAGACAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 8 7 250774 CASAVA_Build 11 91264341 1D AAATCCCAGG C/- TTCTGATTTC 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 C 1 0 250775 CASAVA_Build 11 91265169 1I CTCCCCTGTC -/T TGTATATTAT 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 T 1 2 250776 CASAVA_Build 11 91266081 1I TTTTTTTTTT -/A AATTACTCCT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 2 3 250777 CASAVA_Build 11 91267911 1I TATAATTTAA -/G AAGGTAGTTT 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 G 0 1 250778 CASAVA_Build 11 91276306 1I TGATGGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 11 12 250779 CASAVA_Build 11 91286811 2I ATCCTAAGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 12 14 250780 CASAVA_Build 11 91318722 1D TTTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 1461 het 792 hom 18 6 4 8 T 17 16 250781 CASAVA_Build 11 91352620 1I ACATAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 12 13 250782 CASAVA_Build 11 91376912 1I TATTCTCAGT -/A AAACCCCATC 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 A 3 4 250783 CASAVA_Build 11 91436338 1I GTAGTGTGAT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 88 het 35 0 29 6 A 7 8 250784 CASAVA_Build 11 91438558 6D TCAGAGTCCA AAGGCC/------ AAGGTGTAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 1 AAGGCC 1 0 250785 CASAVA_Build 11 91441832 1D TTATGGCTGA T/- TTTTGCTTTC 3070 hom 77 het 30 0 26 4 T 5 4 250786 CASAVA_Build 11 91444743 1D GTATTGAAAG A/- AAAAAAATGC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 8 7 250787 CASAVA_Build 11 91466687 1I ATGTAAAGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 10 22 2 T 9 10 250788 CASAVA_Build 11 91478203 1I TGAATTAATG -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 250789 CASAVA_Build 11 91479706 3I TTTCAGGTAA ---/ATC ATCAGCCTCT 3070 het 3070 ref 31 20 7 4 ATC 1 2 250790 CASAVA_Build 11 91480277 1I GGTGCAGCAC -/A ACTGGGTGGC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 1 2 250791 CASAVA_Build 11 91480729 12D GAAAATACAA TCTGCACAATAG/------------ GGGACAGAGG 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 TCTGCACAATAG 1 0 250792 CASAVA_Build 11 91481250 1D GGAAGTTATG C/- CTCCTTGAGC 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 C 2 1 250793 CASAVA_Build 11 91492581 1I ACTGATTTCA -/T TTTTTTGTCA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 6 7 250794 CASAVA_Build 11 91507279 1D CAATTTGCTC A/- CAACCACATC 3070 het 3070 ref 47 27 13 8 A 1 0 250795 CASAVA_Build 11 91507885 4D ACCATGCCAG CCCA/---- TCCATTAACC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 CCCA 1 0 250796 CASAVA_Build 11 91508007 1D CATTGGGGTC T/- GGGTCTCCTG 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 T 1 0 250797 CASAVA_Build 11 91511703 1D TTGAGAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1140 hom 39 9 13 18 A 12 11 250798 CASAVA_Build 11 91515238 1I TGTGAGAATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 A 8 9 250799 CASAVA_Build 11 91516895 2I TCTATTTGTT --/TC TGTTAATATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TC 0 1 250800 CASAVA_Build 11 91517652 1I CAGTATTAAA -/G TGTTCTGAAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 250801 CASAVA_Build 11 91519131 1I TAGGCCTCTT -/G GTGAAGTCAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 G 1 2 250802 CASAVA_Build 11 91520400 1I AAGATAGTGA -/C CCCCCCACCC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 C 6 7 250803 CASAVA_Build 11 91520682 1D AACAAAAAAA G/- TTTTCAATGC 3070 het 3070 ref 36 21 13 3 G 1 0 250804 CASAVA_Build 11 91524588 1I TGTTTCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 17 1 12 4 A 13 14 250805 CASAVA_Build 11 91526349 1D GAGCTAGACA T/- TTTGTATATG 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 T 4 3 250806 CASAVA_Build 11 91526845 1I GGTAGAGCTC -/T TGGAAAGGAA 3070 het 548 hom 28 2 21 5 T 1 2 250807 CASAVA_Build 11 91527050 1I AGCAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 A 10 11 250808 CASAVA_Build 11 91533490 1D TTCACTTAAA G/- CAAATGCTAA 3070 het 3070 hom 45 22 22 1 G 1 0 250809 CASAVA_Build 11 91548382 1I GTATAATAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 1847 hom 19 6 9 4 A 7 8 250810 CASAVA_Build 11 91556428 1D AATGTATCAG C/- CCTCTGGGGA 3070 hom 123 het 46 0 40 6 C 3 2 250811 CASAVA_Build 11 91559846 1D CTAATTCTAG A/- AAAGGCAAAG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 4 3 250812 CASAVA_Build 11 91562303 1I TAAAAAAATG -/A TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 0 1 250813 CASAVA_Build 11 91563099 7I TGTCTTGTCT -------/TGCGAGG CACCCCACCA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 TGCGAGG 0 1 250814 CASAVA_Build 11 91565031 1D TGTTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3041 het 3041 ref 37 17 9 11 A 12 11 250815 CASAVA_Build 11 91575047 1I ATTTTAGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 A 10 11 250816 CASAVA_Build 11 91587358 1I CTTCATTAGG -/A GTATAAAACT 3070 hom 118 het 45 0 40 5 A 0 1 250817 CASAVA_Build 11 91589405 3I AAGCATGGCT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 12 15 250818 CASAVA_Build 11 91591667 2I8M4I GAGAGAAAAG --AAAAAGAA----/AAAAAAAGAAAAAG AGAAAGAAAA 3070 hom 63 het 21 0 22 2 N/A 0 0 250819 CASAVA_Build 11 91598786 1D GTCTGACCAT C/- CCCAGGAGTG 3070 hom 48 het 17 0 11 6 C 4 3 250820 CASAVA_Build 11 91600567 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 30 3 21 6 T 14 13 250821 CASAVA_Build 11 91600738 1I GTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 10 11 250822 CASAVA_Build 11 91602168 8I AGACTCAGAG --------/AGTAAATA AGTAAATATC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AGTAAATA 1 2 250823 CASAVA_Build 11 91603053 4I ATTTAAAATA ----/ATTT ATTTTTTGTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ATTT 1 2 250824 CASAVA_Build 11 91603281 1D TTAATTTTTA T/- ATTTTTAGTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 1 0 250825 CASAVA_Build 11 91641248 13I AATCTGAACA -------------/ATTGTAAAAAATC TGTTTGACAA 3070 het 3070 ref 33 11 12 10 ATTGTAAAAAATC 0 1 250826 CASAVA_Build 11 91641285 1D ATAGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 2742 het 2742 ref 32 11 8 14 T 12 11 250827 CASAVA_Build 11 91641743 1D GAAGCTATTA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 7 6 250828 CASAVA_Build 11 91675125 1I AAAAATAGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 9 10 250829 CASAVA_Build 11 91688166 1I AAAACAAAAG -/T TAAGTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 1 2 250830 CASAVA_Build 11 91693250 1I AGGCCTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 10 11 250831 CASAVA_Build 11 91693695 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGGGTAC 1276 het 353 hom 27 6 5 16 G 8 7 250832 CASAVA_Build 11 91701909 1I TCATCCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 11 12 250833 CASAVA_Build 11 91706549 1D CTTAAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 11 10 250834 CASAVA_Build 11 91708027 1D TGTTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 2158 het 2158 ref 34 16 10 8 A 15 14 250835 CASAVA_Build 11 91712969 1D AATTTGGCGG A/- ACCTTTTCAG 1842 het 1842 ref 18 9 6 5 A 2 1 250836 CASAVA_Build 11 91716138 1D TGGTTAGGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 T 9 8 250837 CASAVA_Build 11 91724482 1I CATCTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 10 11 250838 CASAVA_Build 11 91745479 1D GGGCAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2803 hom 22 9 10 3 T 12 11 250839 CASAVA_Build 11 91747668 2D TTTTTTTTTT TA/-- ATTGTACAAT 3070 het 3070 ref 41 24 13 6 TA 1 0 250840 CASAVA_Build 11 91748340 14I AAGATGAGAC --------------/TTACGGAGATGAAG TTATTTTCCC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 TTACGGAGATGAAG 0 1 250841 CASAVA_Build 11 91752504 2I AGTCAGGAGC --/AG AGTCTTCAGA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 AG 1 2 250842 CASAVA_Build 11 91758879 1D GAAGGATCGC T/- TGAGCCTGGG 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 2 1 250843 CASAVA_Build 11 91762833 1I AAAAAGCCTG -/T TTTTTTTTTT 1831 het 1831 ref 24 10 5 9 T 10 11 250844 CASAVA_Build 11 91810756 1D GACCTGAGCT A/- AAGGAAGGGT 3070 het 3070 hom 52 15 34 4 A 3 2 250845 CASAVA_Build 11 91817146 8D ATTATGAAGA AGAAGATC/-------- AGAAGATCTG 3070 het 3070 ref 41 17 18 7 AGAAGATC 2 1 250846 CASAVA_Build 11 91831402 2D AGCCACCAGC AG/-- AGTGACCTTT 3070 het 3070 ref 52 27 19 7 AG 2 1 250847 CASAVA_Build 11 91846167 4I ATGAAGGGAT ----/AGAG AGAGATATCA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 AG 2 4 250848 CASAVA_Build 11 91908309 1I TAGCTGTGAA -/G GGTGAGGTTC 3070 het 3070 ref 45 28 17 0 G 2 3 250849 CASAVA_Build 11 91922394 3D AGGTACAGGT TGA/--- TGATGATGAT 3070 het 3070 ref 42 23 14 8 TGA 5 4 250850 CASAVA_Build 11 91924232 1D TTTGTTTTGT G/- TGTGTGTGTG 3070 het 244 hom 31 4 13 14 G 1 0 250851 CASAVA_Build 11 91925598 1D CAGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 29 1 23 5 A 11 10 250852 CASAVA_Build 11 91927871 1D CAAAAGCTTT G/- AGACCACACA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 G 1 0 250853 CASAVA_Build 11 91931126 1D GCTCTTGCTT A/- AACTAGCATT 3070 het 3070 ref 41 19 17 7 A 3 2 250854 CASAVA_Build 11 91933307 1I TTTTGCGTCT -/A AACAGCCCAT 2028 het 2028 ref 21 12 5 5 A 2 3 250855 CASAVA_Build 11 91936076 2D TAATATGGAC TA/-- TATATATAAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TA 5 4 250856 CASAVA_Build 11 91941204 1I ATGAGATAGT -/G GGAAGTAGAC 3070 het 3070 ref 54 26 24 4 G 2 3 250857 CASAVA_Build 11 91949720 1I CAAGAATGTT -/A ACAGCATACA 3070 het 3070 ref 47 23 13 11 A 1 2 250858 CASAVA_Build 11 91951040 1I CCAACACTGA -/T TAATAATATT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 1 2 250859 CASAVA_Build 11 91955901 1I TATTTTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2794 hom 29 7 18 4 A 11 12 250860 CASAVA_Build 11 91957287 1D ATTTGACAGC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 7 6 250861 CASAVA_Build 11 91957460 1D ACAGGTCTTC A/- AACAGGCTAC 3070 hom 96 het 38 0 30 9 A 3 2 250862 CASAVA_Build 11 91958643 1D TGCTTTCCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 23 17 9 T 10 9 250863 CASAVA_Build 11 91961022 1I TTACCTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 10 11 250864 CASAVA_Build 11 91986215 2D ATATTTTTTT TA/-- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 29 14 15 1 TA 1 0 250865 CASAVA_Build 11 91995096 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2603 het 2603 ref 25 13 8 4 A 11 12 250866 CASAVA_Build 11 91995992 25D ATGTTGCTAC ATGTTGCTACATGTTGCTACATTAG/------------------------- TCAAATCTGA 3070 het 3070 ref 50 36 20 9 ATGTTGCTACATGTTGCTACATTAG 1 0 250867 CASAVA_Build 11 91999286 1D AGCGTATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1981 hom 21 8 9 4 T 13 12 250868 CASAVA_Build 11 92001301 1I AAGAAAAATG -/C CTCTGCCCTC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 C 1 2 250869 CASAVA_Build 11 92005124 1I TCACTCAGTA -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 51 22 24 5 T 6 7 250870 CASAVA_Build 11 92017854 1I CCAAAAAGTG -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 7 8 250871 CASAVA_Build 11 92018305 2I TGCTTTTCAG --/AA AAAAAAAAAA 2608 het 2608 ref 36 15 10 11 A 14 16 250872 CASAVA_Build 11 92022928 1D TGAAATGCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 10 9 250873 CASAVA_Build 11 92025036 1I GCAGCCAACA -/C CCCCACTTTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 4 5 250874 CASAVA_Build 11 92026052 2I GTGTGCACAC --/AT GTGTGCATGT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 AT 0 1 250875 CASAVA_Build 11 92027782 4D ATTCCCTCCT GTAA/---- GTTCCTACCT 3070 het 3070 ref 45 20 17 9 GTAA 1 0 250876 CASAVA_Build 11 92085408 1I AATTAAAATG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 8 9 250877 CASAVA_Build 11 92086839 2I AAAGAGGAGA --/CT CTCTCTAACA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 CT 3 4 250878 CASAVA_Build 11 92089802 1D ATATATTTGC T/- GAATGATCTA 3070 het 3070 hom 55 21 26 9 T 1 0 250879 CASAVA_Build 11 92092320 37D TGAAACCTGT ATTCTTTAAGTCATCTGTAGATTACTGATAATACCTA/------------------------------------- ATACAGTGTA 2858 het 2858 ref 27 25 6 7 ATTCTTTAAGTCATCTGTAGATTACTGATAATACCTA 1 0 250880 CASAVA_Build 11 92104517 1I TTCTCTTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 9 12 A 10 11 250881 CASAVA_Build 11 92107962 1I TGAAACCACC -/T TGTGCTGAAT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 T 1 2 250882 CASAVA_Build 11 92112157 1D AGCCTGCATG T/- TATGGTAATG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 2 1 250883 CASAVA_Build 11 92138604 1I TTTTTTTTGA -/G GGGGGGGGTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 G 8 9 250884 CASAVA_Build 11 92140066 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1064 hom 26 7 11 8 A 17 16 250885 CASAVA_Build 11 92153869 1D AATAAGGTTC T/- TTTTTTTCTT 922 het 879 hom 12 4 3 5 T 8 7 250886 CASAVA_Build 11 92175844 1I CTGAGACCTC -/T TTTTTTGATT 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 6 7 250887 CASAVA_Build 11 92187214 2D CATTATTGTT AG/-- AGTCATTGCC 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 AG 2 1 250888 CASAVA_Build 11 92232185 1D CATGTTAGTG T/- TTTGGCTCTT 3070 het 3070 ref 45 19 20 7 T 4 3 250889 CASAVA_Build 11 92240725 1I AGTAGGCATT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 8 9 250890 CASAVA_Build 11 92244607 2D CAAGCATCTC TA/-- TTTTTAACAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 TA 1 0 250891 CASAVA_Build 11 92246944 1D TCTGAACAAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 8 7 250892 CASAVA_Build 11 92296319 1D TGAGGAATAG T/- TTTGGAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 4 3 250893 CASAVA_Build 11 92328515 1D GTATCTATCT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 9 8 250894 CASAVA_Build 11 92330903 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 1304 het 1304 ref 31 19 4 8 A 15 14 250895 CASAVA_Build 11 92332135 4D TGTTTGTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 31 0 29 3 T 17 13 250896 CASAVA_Build 11 92333014 1D AGCTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 12 11 250897 CASAVA_Build 11 92349339 1I AAGAAAAGGC -/A AAAAAAAGCC 3070 het 250 hom 40 1 32 7 A 7 8 250898 CASAVA_Build 11 92349683 4D ACTGGGTGTC TGTT/---- TCTTTATCTA 2649 het 2649 ref 24 14 7 4 TGTT 1 0 250899 CASAVA_Build 11 92357282 10I CTAAGGATTC ----------/TCTTTGAGCT TCAGCCACTT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TCTTTGAGCT 0 1 250900 CASAVA_Build 11 92363106 1I CTCATCTCTT -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 7 8 250901 CASAVA_Build 11 92363428 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAAGACAGTG 3070 hom 13 het 26 1 19 8 AC 1 0 250902 CASAVA_Build 11 92365641 5I CGGTATTATA -----/ATGTT ATAACAGGAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATGTT 0 1 250903 CASAVA_Build 11 92401960 1I CGAAGAAAAC -/A AAATTGAAAA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 3 4 250904 CASAVA_Build 11 92409202 2D CAAATAAAAA AG/-- AGAAAGTCAG 3070 hom 92 het 33 0 31 2 AG 2 1 250905 CASAVA_Build 11 92409921 1D TGTTGAACAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 119 het 45 0 40 5 T 9 8 250906 CASAVA_Build 11 92414792 3I TTTAATGTTT ---/AGA AGCTCTAGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AGA 0 1 250907 CASAVA_Build 11 92424736 5D AAAAAAAAAA GAAAG/----- AAAGAAAGAA 668 het 481 hom 25 4 9 14 GAAAG 1 0 250908 CASAVA_Build 11 92427478 1I ATTAGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 35 1 23 11 T 11 12 250909 CASAVA_Build 11 92460515 1D GTAGGATCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 9 8 250910 CASAVA_Build 11 92492165 1I GAGTGAGAGA -/T TTTTTTAGGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 250911 CASAVA_Build 11 92554007 1D TTCATCTTAC T/- TTGATTTGCC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 3 2 250912 CASAVA_Build 11 92574346 1D AGACCGCCAT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 8 250913 CASAVA_Build 11 92578260 1D ATACTACATC T/- TTCCTTGTGG 3070 hom 75 het 32 0 25 9 T 3 2 250914 CASAVA_Build 11 92579948 1I CTTCAGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 47 0 33 14 T 10 11 250915 CASAVA_Build 11 92620353 1D CTATTTAGTC T/- TTTGCCTGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 4 3 250916 CASAVA_Build 11 92634781 1D CAGAATCTTA C/- CCAAACATTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 3 2 250917 CASAVA_Build 11 92653707 1D TGTGCATCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 353 hom 40 1 30 9 T 13 12 250918 CASAVA_Build 11 92663843 15I AGGATGGCAT ---------------/CATCTGTGTTATTCA CATCTGTGTT 3070 hom 98 het 40 0 28 12 CATCTGTGTTATTCA 1 2 250919 CASAVA_Build 11 92668406 2I ACACAAACTC --/TG TAGGTTGTCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TG 0 1 250920 CASAVA_Build 11 92672066 2D ACATATATAA AT/-- ATATATATAT 2839 hom 24 het 12 0 9 3 AT 8 7 250921 CASAVA_Build 11 92676902 3D TGGGCAGGAT CTC/--- CTACCTGGGG 3070 hom 53 het 22 0 17 5 CTC 1 0 250922 CASAVA_Build 11 92700447 1D TTTTGGCACC A/- GGGGGTATGG 3070 hom 75 het 26 0 24 4 A 1 0 250923 CASAVA_Build 11 92702297 1D AATATACGCG T/- TTTCAGAATA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 4 3 250924 CASAVA_Build 11 92703103 1D GGATGATGAA C/- TCCCCAGCGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 1 0 250925 CASAVA_Build 11 92703979 2I TCCGCTCTGT --/CC CTCTCTTAAT 3070 hom 114 het 39 0 39 1 C 1 3 250926 CASAVA_Build 11 92707410 1I GATTATATCT -/G GGGGAAAAGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 4 5 250927 CASAVA_Build 11 92707673 4I AATTATAGAA ----/TGAG TAAGTGATCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TGAG 0 1 250928 CASAVA_Build 11 92709216 1I ACACAGAGCC -/A AACCATATCA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 A 2 3 250929 CASAVA_Build 11 92709431 1D TTGACCTTAA C/- CCCCCCAGTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 7 6 250930 CASAVA_Build 11 92710230 6I TGAATAAATT ------/ATAGTA ATATATTATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 ATAGTA 0 1 250931 CASAVA_Build 11 92710773 1I TCAGGTGCAT -/A CCCACCTAAC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 0 1 250932 CASAVA_Build 11 92722229 2I AATGTGATAT --/CA CTGCTTTACC 3070 hom 148 het 52 0 50 2 CA 0 1 250933 CASAVA_Build 11 92722400 1D TGAAATTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 39 0 33 6 A 12 11 250934 CASAVA_Build 11 92729096 3D GTGGAACTTA GTT/--- TTTTGGCATA 3070 hom 135 het 47 0 46 3 GTT 1 0 250935 CASAVA_Build 11 92743107 3I ACTAAGAAAA ---/AAT AACGAGAGTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 AAT 0 1 250936 CASAVA_Build 11 92752630 2D CCTATTTTGA TT/-- TTTTCTTATG 3070 hom 105 het 39 0 35 5 T 6 4 250937 CASAVA_Build 11 92753146 3I TGTGACTCAC ---/ATT ATATTTTTAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATT 0 1 250938 CASAVA_Build 11 92791992 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAAAAA 3070 hom 18 het 16 0 14 3 ATA 3 2 250939 CASAVA_Build 11 92800705 2I ATCATCACTG --/GC CATCAGAGAA 1434 hom 7 het 3 0 3 0 GC 0 1 250940 CASAVA_Build 11 92803910 4D ACACTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 19 1 11 8 A 20 16 250941 CASAVA_Build 11 92828505 1D TAAATCACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 17 het 25 1 17 8 A 10 9 250942 CASAVA_Build 11 92833306 3D TCAATTTAAC AAG/--- AAGAACTAAC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AAG 2 1 250943 CASAVA_Build 11 92837059 1D TAGGTAACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 25 0 16 9 A 10 9 250944 CASAVA_Build 11 92894921 3D ACAAAACAAA AAC/--- AAAATGTCAG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AAC 1 0 250945 CASAVA_Build 11 92899115 1I AATATTTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 31 4 21 6 A 15 16 250946 CASAVA_Build 11 92901459 1I CAGGGAGACA -/G GTGCAAGGGG 3070 hom 99 het 38 0 32 6 G 1 2 250947 CASAVA_Build 11 92904984 2D ATTCAGAGTT CA/-- CACAGTCATA 3070 hom 141 het 53 0 48 7 CA 3 2 250948 CASAVA_Build 11 92914929 1I TGTAAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 37 2 26 9 A 11 12 250949 CASAVA_Build 11 92922441 5I TTATTTATTT -----/ATTTA TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 4 ATTTA 0 1 250950 CASAVA_Build 11 92923975 1I31M5D CAGTGGAGAG -AAAAAATGTATATAATTACAAATTTTACAAATGATG/AAAAAAATGTATATAATTACAAATTTTACAAA----- TTAAGCGTGC 3070 hom 117 het 34 0 40 6 N/A 0 0 250951 CASAVA_Build 11 92931239 1D GATATGTCTT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 8 7 250952 CASAVA_Build 11 92931506 1I ATCCGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 42 2 34 6 A 12 13 250953 CASAVA_Build 11 92933990 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTGT 2083 hom 12 het 5 0 5 0 T 9 8 250954 CASAVA_Build 11 92934143 6D47M4D TAAATCTCTC TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACATATATAC/------TCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATACATAT---- ATACACTCAT 3070 hom 60 het 11 0 21 2 N/A 0 0 250955 CASAVA_Build 11 92940611 5I TCCACCCAAG -----/TGAGT TAGTGTCAAG 3070 hom 122 het 42 0 34 8 TGAGT 0 1 250956 CASAVA_Build 11 92959007 1I AACGACGCTG -/A AGGCTATGCC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 1 2 250957 CASAVA_Build 11 92963463 1I AAGGACATGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 8 9 250958 CASAVA_Build 11 92990796 1I TCCATGGCCA -/T CTTTCGATCA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 0 1 250959 CASAVA_Build 11 93013182 1D TAAGAAGGAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 8 250960 CASAVA_Build 11 93017942 2D CAAATGTTCA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 AT 8 7 250961 CASAVA_Build 11 93040815 1D CAAGTAAAAT C/- CATGTCAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 2 1 250962 CASAVA_Build 11 93043212 1D TATTTTTTTT A/- AAAAAATGTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 6 250963 CASAVA_Build 11 93045647 6D AAATCCTGTT ATAATC/------ AATAAGGATT 3070 hom 117 het 43 0 40 5 ATAATC 1 0 250964 CASAVA_Build 11 93048607 1I AATAATAATC -/A AAAACCTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 4 5 250965 CASAVA_Build 11 93055411 1D GAAGGTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 32 1 27 4 A 11 10 250966 CASAVA_Build 11 93091920 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 8 9 250967 CASAVA_Build 11 93114219 6I CTGGCCTGGT ------/GCGTGA GTCCTAGAGC 3070 hom 50 het 23 0 13 10 GCGTGA 0 1 250968 CASAVA_Build 11 93120457 4I AAGTCCAAAT ----/TCTG TCTGTCTAAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TCTG 1 2 250969 CASAVA_Build 11 93147962 5D ACTCGATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 17 12 250970 CASAVA_Build 11 93150613 1I CTGTAGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 269 hom 27 1 21 5 T 12 13 250971 CASAVA_Build 11 93164896 1I GGCAGTCAGC -/G GGGCTGGCTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 G 3 4 250972 CASAVA_Build 11 93166329 1D CTAAGAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 12 11 250973 CASAVA_Build 11 93166931 1D TATAGGTAGG A/- AAAAATAGAT 3070 hom 66 het 25 0 22 4 A 6 5 250974 CASAVA_Build 11 93168375 1D CAAACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 27 1 22 4 A 14 13 250975 CASAVA_Build 11 93196019 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 28 0 21 7 T 11 10 250976 CASAVA_Build 11 93196667 2I CAGATATCTC --/TT TGATACACTG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 1 3 250977 CASAVA_Build 11 93205367 1I CTTAAAAAAT -/A AATACACTGT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 2 3 250978 CASAVA_Build 11 93207413 5D CAACATGGCA CATGT/----- AAAGTCCGGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CATGT 1 0 250979 CASAVA_Build 11 93214070 1I GACTTCAAAA -/G GAGTACTTCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 2 250980 CASAVA_Build 11 93219015 2I TAGATATAGT --/AA AAGTTTTTTT 3070 hom 46 het 25 0 16 9 A 2 4 250981 CASAVA_Build 11 93219065 1I TAAGGGATAT -/A AGCTGTCCTT 3070 hom 57 het 25 0 20 6 A 1 2 250982 CASAVA_Build 11 93253800 2D AATTTTTGTA TT/-- TTCAGTTGAG 3070 hom 101 het 37 0 33 5 T 4 2 250983 CASAVA_Build 11 93262373 1I TAATTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 7 8 250984 CASAVA_Build 11 93268193 1D AACAGTGATA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 43 0 36 8 T 9 8 250985 CASAVA_Build 11 93269333 3I AATGCAGCTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 157 het 56 0 53 5 TTG 5 6 250986 CASAVA_Build 11 93270498 2D ACTTCATGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 22 0 16 7 A 14 12 250987 CASAVA_Build 11 93271384 1I CTATTAGTTC -/T GCTTGGTCCA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 0 1 250988 CASAVA_Build 11 93273129 1D TACTGGTACC A/- AAACAGAGAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 4 3 250989 CASAVA_Build 11 93274717 2D AAATACACAC AG/-- AAGCACACAC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 AG 1 0 250990 CASAVA_Build 11 93277154 2D4M12D TGGGTCATAC GTCCCAGGCAGCTGGGGC/--CCTA------------ AGACGGGTCC 3070 hom 147 het 47 0 46 13 N/A 0 0 250991 CASAVA_Build 11 93283655 2I TACATTTTAC --/TT TTATTTTAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 2 4 250992 CASAVA_Build 11 93285169 1D TATCACATTT A/- AAAATGTATT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 5 4 250993 CASAVA_Build 11 93301124 1D TCTATTATGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 T 9 8 250994 CASAVA_Build 11 93306219 1D GTATCTTGTA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 107 het 42 0 35 7 T 7 6 250995 CASAVA_Build 11 93322532 1D ACAACTTGGC T/- AAGGCAAAGC 3070 hom 132 het 48 0 44 4 T 1 0 250996 CASAVA_Build 11 93323243 1I GTGAGGATCA -/G GTAAGATAAT 3070 hom 89 het 37 0 30 7 G 1 2 250997 CASAVA_Build 11 93329677 1D TAATCTCGTC T/- TGTTTCCTGG 3070 hom 93 het 37 0 29 8 T 2 1 250998 CASAVA_Build 11 93363484 1I TAGGTGGTAA -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 8 250999 CASAVA_Build 11 93365631 2I TACAAAATTG --/AA AAAAAAAATT 3070 hom 65 het 43 0 22 21 A 8 10 251000 CASAVA_Build 11 93401758 6I AAACAAACTA ------/CTTTCT CTTTCTCTTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 CTTTCT 1 2 251001 CASAVA_Build 11 93417578 1D TCTCCAAACC T/- TTTTTTTTTT 2464 het 2464 ref 41 18 7 17 T 17 16 251002 CASAVA_Build 11 93421581 3D CCCAGGAAAC CTT/--- CTCTCTATCC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 CTT 1 0 251003 CASAVA_Build 11 93421944 1D CAAAAGAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 48 het 20 0 17 4 A 9 8 251004 CASAVA_Build 11 93422139 1I TACCCCCTCC -/A AAACCCAAAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 3 4 251005 CASAVA_Build 11 93422433 2I AGGATGTAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 28 1 16 11 A 16 18 251006 CASAVA_Build 11 93430742 1D ACTCTAGGTT A/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 1 0 251007 CASAVA_Build 11 93431496 1D TTAAGTATTA G/- GACTATTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 2 1 251008 CASAVA_Build 11 93447276 2D TCAGAATGAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 47 21 22 5 TG 7 6 251009 CASAVA_Build 11 93448256 2I GAGATCCGCA --/AC AGAGCCAGAG 3070 hom 114 het 44 0 38 6 AC 0 1 251010 CASAVA_Build 11 93449424 1I AAAATTCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 11 12 251011 CASAVA_Build 11 93455898 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 1530 het 1530 ref 20 9 6 5 A 17 18 251012 CASAVA_Build 11 93456582 1I GAGTAGTACA -/T TTTCAGTGTC 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 3 4 251013 CASAVA_Build 11 93479108 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1604 het 1413 hom 21 6 7 8 T 17 16 251014 CASAVA_Build 11 93480672 2D ATTTGTGCAC AT/-- GTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 45 24 16 7 AT 1 0 251015 CASAVA_Build 11 93490139 2D CTCTCTGGGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 16 23 12 TG 8 7 251016 CASAVA_Build 11 93492729 12D TTCAGATGGG AAACACTCAGGC/------------ ATCAACAGGC 3070 het 3070 ref 25 18 9 3 AAACACTCAGGC 1 0 251017 CASAVA_Build 11 93498941 21D AAAAAGGGGG CATTTGAGCCTAAAAAGGGGC/--------------------- CATTTGAGCC 3070 het 3070 ref 48 25 20 10 CATTTGAGCCTAAAAAGGGGC 1 0 251018 CASAVA_Build 11 93503367 24I ACTGGTTGAA ------------------------/AACAGCACTAAGTAAATACTAACC TGATGGTGGC 3070 het 3070 hom 38 14 18 8 AACAGCACTAAGTAAATACTAACC 0 1 251019 CASAVA_Build 11 93519158 1D ATCAAGTTGG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 52 20 27 6 A 8 7 251020 CASAVA_Build 11 93522869 1D GGAAGTCAGT G/- GGGGAGGAAG 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 G 5 4 251021 CASAVA_Build 11 93528882 5I GAGAATTGTC -----/TAATG TAAGAGTTGG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 TAATG 0 1 251022 CASAVA_Build 11 93539813 1I AGTCACTTTA -/G GTCAGTTGGT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 G 1 2 251023 CASAVA_Build 11 93550983 1I CCTATGGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 9 10 251024 CASAVA_Build 11 93555356 1D TAGGATATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 T 10 9 251025 CASAVA_Build 11 93556841 1I AGGAAGGACG -/T TAACACTATA 3070 het 3070 hom 57 23 26 8 T 1 2 251026 CASAVA_Build 11 93561009 1I AGGAAGCTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 428 hom 29 1 25 3 T 9 10 251027 CASAVA_Build 11 93572592 4D GTTGATTAAC TGAT/---- TGATTGATTC 3070 het 3070 ref 49 22 20 11 TGAT 3 2 251028 CASAVA_Build 11 93575474 1I ATTATATAAC -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 A 6 7 251029 CASAVA_Build 11 93579009 5I AATAAAAAAG -----/AGATT AGAGAAACAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 AGATT 0 1 251030 CASAVA_Build 11 93582978 3D TGTTGAAGAT CTA/--- CTATCCAGAG 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 CTA 2 1 251031 CASAVA_Build 11 93586602 6D GGAGAGAATA TCGGTC/------ TCCTTGTCCA 3070 het 3070 ref 52 24 24 6 TCGGTC 1 0 251032 CASAVA_Build 11 93587904 4I ATTTGAGAGG ----/ATCT ATCTGTTTAA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 ATCT 1 2 251033 CASAVA_Build 11 93592397 6D TCTGAGAAAT AAAGAG/------ AGAGAGTACA 3070 het 2490 hom 15 6 9 1 AAAGAG 1 0 251034 CASAVA_Build 11 93596443 4D GTAGAGAAAT AGAG/---- AGAATGGTAT 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 AG 3 1 251035 CASAVA_Build 11 93632506 1I TGTGGTGGCC -/T TGTCTGGTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 1 2 251036 CASAVA_Build 11 93634567 4D AGTTATTGAA TTAT/---- TTATTTATAG 3070 het 3070 ref 32 16 15 4 TTAT 3 2 251037 CASAVA_Build 11 93635782 3D CATATAGTGT TTG/--- TTATTTTGTG 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 TTG 1 0 251038 CASAVA_Build 11 93644549 2I ATTATTATTT --/TA TATCTTTTTC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TA 1 2 251039 CASAVA_Build 11 93647161 1I TTCCCTGGCT -/C CCTGCTGCAT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 C 2 3 251040 CASAVA_Build 11 93666743 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 10 9 251041 CASAVA_Build 11 93676311 1I ATTTAACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 534 hom 36 2 23 11 A 15 16 251042 CASAVA_Build 11 93697088 4I CCTCCCAACA ----/TATT TATTTTTAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TATT 1 2 251043 CASAVA_Build 11 93697959 1D AAGCCACACA G/- GGTTGAAAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 7 G 3 2 251044 CASAVA_Build 11 93703489 1D ACCCCTCCCC A/- GTCCCACCAC 3070 hom 71 het 28 0 21 7 A 1 0 251045 CASAVA_Build 11 93709886 1I GTCCACCCTC -/A AAAATACAGC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 A 4 5 251046 CASAVA_Build 11 93712278 1D GCCCAACTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 13 0 9 4 T 10 9 251047 CASAVA_Build 11 93715046 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 6 5 251048 CASAVA_Build 11 93730461 1I TAATCATGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 7 8 251049 CASAVA_Build 11 93731440 50D CACTTTAGGA AGCTGAAGCAGGTAGTGAGTCACTTGAGGCCAGGAGTTAGAGACCAGCCT/-------------------------------------------------- GGGCAAAATG 2524 het 2524 ref 21 28 7 3 AGCTGAAGCAGGTAGTGAGTCACTTGAGGCCAGGAGTTAGAGACCAGCCT 1 0 251050 CASAVA_Build 11 93750996 2D TTCAAAATCT TG/-- TGTCTTGAAA 3070 het 3070 hom 50 14 29 9 TG 2 1 251051 CASAVA_Build 11 93752185 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2228 het 875 hom 29 6 11 12 A 17 16 251052 CASAVA_Build 11 93780930 1I TTTTAGAATT -/G TTTTTTTCTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 251053 CASAVA_Build 11 93782807 1I TAAAATGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 T 10 11 251054 CASAVA_Build 11 93785693 2D GACTTTTCCC CT/-- GAGATATATG 3070 het 3070 hom 55 22 31 3 CT 1 0 251055 CASAVA_Build 11 93799229 26D TCATTAAGAG AATCAAATTAACAATTTGTTAATTTA/-------------------------- AATCAAATTA 3070 hom 75 het 24 0 26 1 AATCAAATTAACAATTTGTTAATTTA 2 1 251056 CASAVA_Build 11 93813245 1I TCAAACATTT -/A AAAAAAAAAA 2295 het 2295 ref 39 14 10 15 A 15 16 251057 CASAVA_Build 11 93817204 11D TATTGTTTTT GTTCTGTTTTC/----------- GTTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 46 27 17 5 GTTCTGTTTTC 2 1 251058 CASAVA_Build 11 93829330 1D ATGTACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 A 11 10 251059 CASAVA_Build 11 93830856 1I CATCCAGAGT -/C CATAGAGTGA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 1 2 251060 CASAVA_Build 11 93831206 2I TCTTTGAAAT --/TC CTTTCCCAAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TC 0 1 251061 CASAVA_Build 11 93841652 1I AAATGTAAAC -/A GCCACATGTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 0 1 251062 CASAVA_Build 11 93847262 4D ATGACATAAA TAAG/---- TAAGTAAATA 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 TAAG 2 1 251063 CASAVA_Build 11 93850616 1D GAAGCTTAAA G/- GGAACAGTGT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 G 3 2 251064 CASAVA_Build 11 93862397 2I AAATGTGATC --/AA GTTTTGGACT 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 A 0 2 251065 CASAVA_Build 11 93864711 1I GGTAGGTCAG -/A ATACTTTTCA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 1 2 251066 CASAVA_Build 11 93874573 1I TCACTTTGGG -/C CAAAAAAAAA 2658 het 2658 ref 30 15 10 5 C 1 2 251067 CASAVA_Build 11 93887064 1D TTACATGCTA G/- GCATTCCACA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 G 2 1 251068 CASAVA_Build 11 93889443 1D AATTGTGTAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 6 A 7 6 251069 CASAVA_Build 11 93890671 1I TCATGTCTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1334 hom 20 3 11 6 A 9 10 251070 CASAVA_Build 11 93891232 5D CAGTGGAGCC CAAGA/----- ATTTGGATTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 5 CAAGA 1 0 251071 CASAVA_Build 11 93892257 5D TTTTCTAAGT CTATA/----- CTGTTATATT 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 CTATA 1 0 251072 CASAVA_Build 11 93904252 4D GACTGTGTTT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 CAAA 6 5 251073 CASAVA_Build 11 93904692 1D ATTTTTTCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1012 hom 49 8 20 21 T 10 9 251074 CASAVA_Build 11 93910880 1D TGGGGAGGAC A/- ATGTGATAGT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 2 1 251075 CASAVA_Build 11 93911385 1D TGTACACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 23 15 13 T 13 12 251076 CASAVA_Build 11 93911949 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2881 het 2668 hom 23 9 8 6 T 15 14 251077 CASAVA_Build 11 93912999 1I TCTCCATGCC -/T CATCTCATCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 0 1 251078 CASAVA_Build 11 93920984 1D ATTTTACCAA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 9 8 251079 CASAVA_Build 11 93924644 1I CTAATATACT -/A AAAAAAAAAA 2386 het 2386 ref 21 10 6 5 A 10 11 251080 CASAVA_Build 11 93926543 1I TCGTTCAGGC -/T GGAGTGCGGT 953 het 953 ref 10 5 3 2 T 0 1 251081 CASAVA_Build 11 93926637 1D TGGGACTACA C/- GGCGCCCGCC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 C 1 0 251082 CASAVA_Build 11 93953450 1I AATTTCGAAT -/A AAAAGTTCTT 3070 het 3070 ref 52 28 19 5 A 4 5 251083 CASAVA_Build 11 93960735 1I AAAAAGCTCA -/C CATATACTGC 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 C 1 2 251084 CASAVA_Build 11 93974169 4D TGTAGGGTGT GTTA/---- GTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 GTTA 1 0 251085 CASAVA_Build 11 93983041 2D AATATTCTAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 TG 7 6 251086 CASAVA_Build 11 93989159 2D AAAGGGTCTC TT/-- TGATATAATT 3070 het 3070 hom 40 16 22 3 T 3 1 251087 CASAVA_Build 11 93997449 4D TTTTCATGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 42 24 15 6 AGTG 2 1 251088 CASAVA_Build 11 94034447 8D TCAACACTTG CCACAAAC/-------- CCACAAACCC 3070 het 3070 ref 38 21 11 10 CCACAAAC 3 2 251089 CASAVA_Build 11 94050703 4D TGTGGTTCTT AGAC/---- AGTCCTCCTG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 AGAC 1 0 251090 CASAVA_Build 11 94057321 1D ACCCAGGGGA C/- AGACCTACCA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 C 1 0 251091 CASAVA_Build 11 94064840 2I GTTTTGCCCC --/AT ATATATATAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 5 6 251092 CASAVA_Build 11 94070681 4D ATGAAAGAAT AAAG/---- AGTCAATGGA 3070 het 3070 ref 45 22 19 8 AAAG 1 0 251093 CASAVA_Build 11 94074534 1I GGGCCGATGT -/C GGGCGGGTCA 3070 het 889 hom 21 3 12 6 C 0 1 251094 CASAVA_Build 11 94080262 1D GATGATAAAC G/- GCTTTTGGAA 3070 het 3070 hom 45 16 27 2 G 2 1 251095 CASAVA_Build 11 94082178 1I CTCTCTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 563 hom 46 2 39 5 A 10 11 251096 CASAVA_Build 11 94085487 3D TTGGATTGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 30 10 15 7 TTG 5 4 251097 CASAVA_Build 11 94088737 1D AAGTTTTCAG C/- CAGTATGTTT 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 C 2 1 251098 CASAVA_Build 11 94091559 4D TGGCTTTCTG TTGA/---- TTGTCAGTTT 3070 het 3070 ref 23 14 8 4 TTGA 1 0 251099 CASAVA_Build 11 94099381 12I TGCTGTCATT ------------/AGCTGCTTCAGC AGAAAGTATT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AGCTGCTTCAGC 0 1 251100 CASAVA_Build 11 94113693 1D CTGGTGCTTG T/- GCGGGTTCGT 3070 hom 63 het 23 0 21 3 T 1 0 251101 CASAVA_Build 11 94129808 1D ACCTAGCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 912 hom 33 2 25 8 T 11 10 251102 CASAVA_Build 11 94140547 26D TTTTCCCAGA GTCGCTTACTTTCTTTACCTCTACTC/-------------------------- AGGCAGATAA 3070 het 3070 ref 29 26 16 3 GTCGCTTACTTTCTTTACCTCTACTC 1 0 251103 CASAVA_Build 11 94152675 1D TGGCCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 11 10 251104 CASAVA_Build 11 94157783 2D AATAATGTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 43 0 33 10 A 13 11 251105 CASAVA_Build 11 94159381 7D TGGTTGTTAC TTCTTTT/------- TTCTTTTTTC 3070 hom 63 het 30 0 21 11 TTCTTTT 3 2 251106 CASAVA_Build 11 94176140 3I AAGGCCCTTT ---/AAA AGGCCCCTTT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 1 4 251107 CASAVA_Build 11 94214392 1I AAACCAAGAG -/C CCTGTGCCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 2 3 251108 CASAVA_Build 11 94241313 1D TCTTGAGGAA G/- GGGGTAAGGA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 G 5 4 251109 CASAVA_Build 11 94251751 1I TGGCTAACTG -/A AAAAAACATT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 7 251110 CASAVA_Build 11 94258991 1I AAATAGAGCT -/A ACAATGGAGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 1 2 251111 CASAVA_Build 11 94261515 1I TTCACCAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 122 hom 37 2 29 6 T 9 10 251112 CASAVA_Build 11 94262655 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 17 0 11 7 A 15 14 251113 CASAVA_Build 11 94263920 1D CCTTGTAGAA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 2 1 251114 CASAVA_Build 11 94272433 1D ACATCACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 671 hom 30 2 26 2 A 12 11 251115 CASAVA_Build 11 94285079 4I CCACAGTATC ----/CTAA CTAAGCCTAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CTAA 1 2 251116 CASAVA_Build 11 94290161 2I CCGTACTGGG --/TA TATGGGTATT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TA 1 2 251117 CASAVA_Build 11 94311787 1I TTAGTTGCAA -/G GCTCAAAGGC 3070 hom 138 het 53 0 37 16 G 1 2 251118 CASAVA_Build 11 94314663 1I TTATAGTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 730 hom 35 3 18 14 T 14 15 251119 CASAVA_Build 11 94315337 1I ACCTGGATAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 438 hom 25 1 22 2 T 8 9 251120 CASAVA_Build 11 94325727 5D ACATATTTTG TATGT/----- TATATGTATT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TATGT 1 0 251121 CASAVA_Build 11 94327108 2D CCTCAGTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 23 2 11 11 T 20 18 251122 CASAVA_Build 11 94328201 2D ACTACATCTT TA/-- TGTTTGTTTA 3070 hom 102 het 35 0 35 1 TA 1 0 251123 CASAVA_Build 11 94329226 4D GAAAACTATC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 78 het 33 0 26 8 GT 11 9 251124 CASAVA_Build 11 94329573 3I AAGAAATTAC ---/AAG AAGAAAGCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAG 1 2 251125 CASAVA_Build 11 94330418 1D CCTTTTAGAA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 57 het 27 0 20 8 T 8 7 251126 CASAVA_Build 11 94331839 3D4M1D CCTATTTCTT TTCTTTCT/---TTTC- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 28 0 24 5 N/A 0 0 251127 CASAVA_Build 11 94334747 2D AGTTTCACTC TT/-- GTCGTCCAGG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 2 0 251128 CASAVA_Build 11 94336123 1I AGGGGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 11 251129 CASAVA_Build 11 94337086 3I ACAAGCCCAT ---/ATA ATGTGTGTGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATA 0 1 251130 CASAVA_Build 11 94339156 1I GCCAGTGAGA -/T TAAGGAGAGG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 1 2 251131 CASAVA_Build 11 94346106 5D TTTACGCAGT AGGCG/----- AGCTGCCTGT 3070 hom 57 het 21 0 18 4 AGGCG 1 0 251132 CASAVA_Build 11 94349875 1I CACATAATAT -/A AAAAATCACA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 5 6 251133 CASAVA_Build 11 94360757 1D GGTTGCTGTC T/- TAACAGTATT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 2 1 251134 CASAVA_Build 11 94364176 4D AAAGCAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 AAAG 3 2 251135 CASAVA_Build 11 94370052 1I TCTCATTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 32 1 22 9 A 10 11 251136 CASAVA_Build 11 94429593 3I GATGAACATC ---/AAT GTAAAAATTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AAT 0 1 251137 CASAVA_Build 11 94440551 1I CGCGCTACAG -/C CGCTCTCCCT 3070 hom 56 het 24 0 18 6 C 1 2 251138 CASAVA_Build 11 94441282 1I TGTCAAGACA -/T TGCTTCAACA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 1 2 251139 CASAVA_Build 11 94444140 1D AGGTATCAAT C/- CCCAAAAGTG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 4 3 251140 CASAVA_Build 11 94444947 6D CTATTGAGAT ATATAC/------ ATATACATAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ATATAC 3 2 251141 CASAVA_Build 11 94445094 4D TGTAAATAGA ATAT/---- ATATAAAGTC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AT 4 2 251142 CASAVA_Build 11 94446949 3I TGTGTATTGA ---/CTT CTTCTTCCCT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 CTT 2 3 251143 CASAVA_Build 11 94452983 1D CTTTGGAAGG T/- TTTTAGGTCA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 5 4 251144 CASAVA_Build 11 94461088 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTGTGT 1962 het 264 hom 6 1 5 0 T 7 6 251145 CASAVA_Build 11 94463210 1I13M1I10M1I GTCCCCGGAG -TTAGCCTGCCTCG-CCCCTGTCGA-/TTTAGCCTGCCTCGCCCCCTGTCGAG GCTACAATAA 3070 hom 54 het 19 0 19 3 N/A 0 0 251146 CASAVA_Build 11 94463790 1I GGAAAGATAA -/G GCCAGTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 G 1 2 251147 CASAVA_Build 11 94464553 2I GATATTTGGG --/AT ACCAAGAGAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AT 0 1 251148 CASAVA_Build 11 94468116 3D CCAAAGACAT CTC/--- CACCCTCTCT 3070 hom 151 het 56 0 51 6 CTC 1 0 251149 CASAVA_Build 11 94468242 66I ATGGTTCCAA ------------------------------------------------------------------/AAGCAGTCACTCACAATTTCTTCCTTACTGTGATGCACACAGCAAAACAGGGACCACACATGCTAT CCTTTGTTGA 3070 hom 57 het 22 0 20 8 AAGCAGTCACTCACAATTTCTTCCTTACTGTGATGCACACAGCAAAACAGGGACCACACATGCTAT 0 1 251150 CASAVA_Build 11 94474356 2D TAAAAATAAC AT/-- ATGCTTATGG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AT 2 1 251151 CASAVA_Build 11 94479633 1D TTCATAGACA C/- CCCCCCCTTT 3070 het 3070 hom 29 13 12 5 C 8 7 251152 CASAVA_Build 11 94495253 1I ACCATGTTGG -/C CAGGCTGGTC 3070 hom 42 het 16 0 14 2 C 1 2 251153 CASAVA_Build 11 94495327 2D TGGGTTTATA TG/-- TGCGTGAGCC 3070 hom 81 het 28 0 28 1 TG 2 1 251154 CASAVA_Build 11 94496092 1D TAATGTCCGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1961 hom 21 7 12 3 T 12 11 251155 CASAVA_Build 11 94496401 3D TATAAATACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 251 hom 38 4 13 22 A 17 14 251156 CASAVA_Build 11 94503137 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 10 11 251157 CASAVA_Build 11 94508368 36I CTCTGTCGCC ------------------------------------/CAGGCTGGAGTACAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTG CAAGCTCCGC 3070 hom 25 het 12 0 10 4 CAGGCTGGAGTACAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTG 0 1 251158 CASAVA_Build 11 94511865 1I GTTTTATTGA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 T 7 8 251159 CASAVA_Build 11 94517989 3I TTACCCAGAT ---/CAG CAGCAGCAAC 3070 het 3070 hom 41 9 25 7 CAG 2 3 251160 CASAVA_Build 11 94520986 1I TAACAAACCA -/C CTCCATAACT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 1 2 251161 CASAVA_Build 11 94545931 1D CGCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2951 het 2951 ref 28 11 10 8 A 13 12 251162 CASAVA_Build 11 94560829 2D CCCATGGCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 11 9 A 16 14 251163 CASAVA_Build 11 94565764 1D GATGCAATAG A/- TCCTAAAAAC 3070 het 3070 hom 50 19 25 6 A 1 0 251164 CASAVA_Build 11 94571735 2D CATAATAAAC AT/-- GTACTAAAGT 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 AT 1 0 251165 CASAVA_Build 11 94579968 4D AGTTTAAAAC ACTT/---- ACTTCCAAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 2 ACTT 2 1 251166 CASAVA_Build 11 94580566 5D ATAATTTACA TAATT/----- TAATAGCAGA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TAATT 1 0 251167 CASAVA_Build 11 94580873 1I ATTGTCAGGA -/T TTATGGTATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 2 3 251168 CASAVA_Build 11 94585961 1I CCTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 2556 het 2556 ref 22 12 8 2 A 9 10 251169 CASAVA_Build 11 94591929 4D ACAATATAAA AATT/---- AATCTCAGGA 3070 het 3070 hom 28 9 17 3 AATT 1 0 251170 CASAVA_Build 11 94592570 2I TTGAAAAATA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 11 13 251171 CASAVA_Build 11 94593492 4D TTTCATTAGT TTTA/---- TTTACACTTT 3070 het 3070 hom 35 13 22 1 TTTA 2 1 251172 CASAVA_Build 11 94599995 1D AGTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 12 11 251173 CASAVA_Build 11 94602332 1D AAATAGGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 10 9 251174 CASAVA_Build 11 94602953 3D CCTCAGTCTT CTC/--- CTCCCCCAAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 CTC 2 1 251175 CASAVA_Build 11 94616316 1I AAATTTTCCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 8 9 251176 CASAVA_Build 11 94621212 1D TTTTTTTTTT G/- GCTTGGCTGC 3070 het 2503 hom 40 9 17 14 G 2 1 251177 CASAVA_Build 11 94664818 1D ACCTGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 1627 het 1627 ref 46 24 6 16 T 16 15 251178 CASAVA_Build 11 94673928 1D CATTCGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 651 hom 39 3 27 10 A 13 12 251179 CASAVA_Build 11 94674581 1D CCTGAGTGCA T/- TCTGCCCACA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 2 1 251180 CASAVA_Build 11 94679283 1I AATTTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 774 hom 40 3 28 9 T 15 16 251181 CASAVA_Build 11 94698876 5I GAGCAGTCTT -----/TGTAA TGTCTCCATC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TGTAA 0 1 251182 CASAVA_Build 11 94701549 11D CTGTAATCCC AGCTACTTGGG/----------- AGGCTGAGGC 3070 hom 63 het 23 0 21 3 AGCTACTTGGG 1 0 251183 CASAVA_Build 11 94709728 1D CAGTAGGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 10 9 251184 CASAVA_Build 11 94717231 1I ATTTTTGGAA -/T TTTTTAAGCT 3070 hom 116 het 44 0 39 5 T 5 6 251185 CASAVA_Build 11 94721631 1I AGTGCTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 838 hom 27 2 19 6 A 11 12 251186 CASAVA_Build 11 94722944 9D TAGGTCAGAA AATATGTCT/--------- AATATGTCTT 3070 hom 72 het 26 0 24 4 AATATGTCT 2 1 251187 CASAVA_Build 11 94724626 1D TAACTGAACC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 28 0 21 8 A 9 8 251188 CASAVA_Build 11 94750203 1D CACTTTGCCA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 40 23 14 5 T 7 6 251189 CASAVA_Build 11 94774746 4D GTATGTGTAC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 66 het 28 0 22 7 TA 9 7 251190 CASAVA_Build 11 94778485 4I TCTTAGAGAC ----/TGTT TGATCCATTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TGTT 0 1 251191 CASAVA_Build 11 94790953 1I TCACCCCACC -/A ACTCTCCAGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 2 251192 CASAVA_Build 11 94792045 1I AGGATTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 36 1 30 5 T 10 11 251193 CASAVA_Build 11 94794212 1D TGAAGTGATT G/- GAGTCCAGTG 3070 hom 147 het 58 0 49 10 G 2 1 251194 CASAVA_Build 11 94800906 1D CCATCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 35 10 A 11 10 251195 CASAVA_Build 11 94808833 1I GAACATGGAT -/A AAAATGTAAG 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 4 5 251196 CASAVA_Build 11 94831199 1I TCAGGATGTA -/T TGATTTCTCA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 1 2 251197 CASAVA_Build 11 94835021 1I CCTCTTTTTT -/C CTCTTCCTTT 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 C 1 2 251198 CASAVA_Build 11 94838321 1I ATACAATTGA -/T TTTTTTATAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 7 251199 CASAVA_Build 11 94838695 1I ATTTTTTTCA -/T GAGTGTGTGA 3070 hom 138 het 54 0 47 7 T 0 1 251200 CASAVA_Build 11 94839939 1D AATGCTAAAA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 7 6 251201 CASAVA_Build 11 94840644 2I TTCCGAAGTG --/AT GTTTGCATTT 3070 hom 70 het 29 0 26 3 AT 0 1 251202 CASAVA_Build 11 94858145 4I GTTAACTCAT ----/TGTC TGAGATAATC 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 TGTC 0 1 251203 CASAVA_Build 11 94858923 3I AATTACCTGA ---/GAG CAGAGTTTAA 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 GAG 0 1 251204 CASAVA_Build 11 94861587 1I AGTATATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 9 10 251205 CASAVA_Build 11 94862823 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1228 het 701 hom 17 3 5 9 T 13 14 251206 CASAVA_Build 11 94871318 1I AAACCAGAAG -/A ATTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 1 2 251207 CASAVA_Build 11 94874938 1I TAAGCTCAAG -/C CCCATGCCCC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 C 3 4 251208 CASAVA_Build 11 94877876 1I CTTTAACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 13 15 A 11 12 251209 CASAVA_Build 11 94880019 2D AACCATCAAA AG/-- AGTAGGAAAA 3070 het 3070 ref 60 32 24 4 AG 2 1 251210 CASAVA_Build 11 94902353 8I4M1I GATTTGACCT --------GCAT-/AACCATGAGCATG GCATGTGCTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 5 N/A 0 0 251211 CASAVA_Build 11 94905236 1I ACAAGTTTAG -/A ACTGTACTGG 3070 het 3070 hom 52 22 23 7 A 1 2 251212 CASAVA_Build 11 94910521 12I AAACAGGAGA ------------/TTTTACTCCACC TTTTGATCAC 3070 het 3070 hom 36 9 20 7 TTTTACTCCACC 0 1 251213 CASAVA_Build 11 94918974 1D TCCTCAACCT C/- TTTGTTTCTT 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 C 1 0 251214 CASAVA_Build 11 94919666 3I GAACTTCAGT ---/CTG CTGTTCAGCT 3070 het 3070 hom 54 26 26 2 CTG 1 2 251215 CASAVA_Build 11 94920013 2D TGGCATCCTC TT/-- TGTCCAGTGA 3070 het 3070 hom 55 25 25 5 T 3 1 251216 CASAVA_Build 11 94920767 1I TCTCTCCCTT -/A AAAGATAGCT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 3 4 251217 CASAVA_Build 11 94926686 1I ATACACTCCA -/G GGAAATCTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 G 2 3 251218 CASAVA_Build 11 94928864 1D TGATTACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1871 hom 41 9 16 17 A 17 16 251219 CASAVA_Build 11 94929867 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 A 8 7 251220 CASAVA_Build 11 94935632 3D TAGGAGAAGT TGG/--- TGGTTTTTTG 3070 het 3070 ref 51 28 18 8 TGG 2 1 251221 CASAVA_Build 11 94938249 1D ATTCTTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 33 0 24 9 A 12 11 251222 CASAVA_Build 11 94946589 1I TATCTGTTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 4 hom 34 1 25 8 A 9 10 251223 CASAVA_Build 11 94947017 11D TAAGTGGGGG TTGGTGAAAAT/----------- TTGTTTAGAA 1751 het 409 hom 27 4 10 18 TTGGTGAAAAT 1 0 251224 CASAVA_Build 11 94948804 1D TAAACTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 11 10 251225 CASAVA_Build 11 94955810 1D TTAATAAATA T/- TTTGTGGATG 3070 het 3070 hom 52 20 28 6 T 4 3 251226 CASAVA_Build 11 94961330 1D TTCAGATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 9 21 6 A 12 11 251227 CASAVA_Build 11 94973076 1I CCCAGGGTTA -/G GGGGGCTGTC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 G 5 6 251228 CASAVA_Build 11 94985641 1D ATAAAAATCC T/- TTTTAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 5 4 251229 CASAVA_Build 11 94987558 1I TAGCCAATGA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 6 7 251230 CASAVA_Build 11 94990837 4D AAAAGAAAAT TGAC/---- TGTGTAAATA 3070 het 3070 ref 37 15 16 7 TGAC 1 0 251231 CASAVA_Build 11 95006114 2I GTTGAGTATT --/TG TATATGTTGA 1951 het 1951 ref 12 5 4 3 TG 0 1 251232 CASAVA_Build 11 95011027 1D CTGTGTAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 11 10 251233 CASAVA_Build 11 95022259 1D AAGGATTGTG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 9 8 251234 CASAVA_Build 11 95027686 12I GATCTCTTGA ------------/CCTTGTGATCAG CCTGCTTCAG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 CCTTGTGATCAG 0 1 251235 CASAVA_Build 11 95034415 1D ACACACACAC A/- ACCACACTTT 528 hom 5 het 15 0 2 13 A 2 1 251236 CASAVA_Build 11 95037106 1I CTTAGTACTG -/T TTTTGCTACA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 4 5 251237 CASAVA_Build 11 95038041 2D TTTTCATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 22 12 T 12 10 251238 CASAVA_Build 11 95038096 2D TTGTGTGTTC TA/-- TACACTGGGA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 TA 2 1 251239 CASAVA_Build 11 95044169 1D ATGTACCACA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 114 het 48 0 39 10 T 9 8 251240 CASAVA_Build 11 95063711 1D GCTCTGTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 T 10 9 251241 CASAVA_Build 11 95070156 2D CAAAACACAC AG/-- AGTTACCTTA 3070 het 3070 ref 47 21 20 8 AG 2 1 251242 CASAVA_Build 11 95071331 1I TTCTTCATTA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 T 7 8 251243 CASAVA_Build 11 95077822 1D CATTCTTCAC G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 100 het 36 0 34 2 G 5 4 251244 CASAVA_Build 11 95086907 1I AAATTCTGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 7 8 251245 CASAVA_Build 11 95087331 1I CTCAAAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 392 hom 42 1 37 4 T 9 10 251246 CASAVA_Build 11 95087508 1I CTGCCTGACA -/G GCCCCAGTGT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 1 2 251247 CASAVA_Build 11 95090854 1I TTTTTTTTTT -/C CTGTCCTTAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 C 1 2 251248 CASAVA_Build 11 95091707 1D ATTTAAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1553 het 335 hom 26 4 7 15 T 19 18 251249 CASAVA_Build 11 95092166 2D TAAATTTTTC AT/-- GTTTCCTATA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 AT 1 0 251250 CASAVA_Build 11 95107609 4D GGAAGGTAGA AAGG/---- AAGGAAGGAA 3070 het 1119 hom 24 6 11 8 AAGG 5 4 251251 CASAVA_Build 11 95131048 1I TTTTTTGACA -/G GGTCTTGCTC 3070 hom 65 het 26 0 21 5 G 2 3 251252 CASAVA_Build 11 95131341 1I CAGGTCTATG -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 7 8 251253 CASAVA_Build 11 95145933 3D AATCTCCAAG TTC/--- TTATCTCAAT 3070 het 2921 hom 26 6 18 2 TTC 1 0 251254 CASAVA_Build 11 95147521 6D TGACTAATAT ATAAGA/------ ATCTGATATA 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 ATAAGA 1 0 251255 CASAVA_Build 11 95148451 1D CTATAAGCCC A/- ATAATTAATT 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 2 1 251256 CASAVA_Build 11 95154638 3D TTTAGAAAAC ACT/--- ACAACATGGT 3070 het 3070 hom 29 10 15 7 ACT 1 0 251257 CASAVA_Build 11 95165735 1I GGCAACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 28 0 20 8 A 13 14 251258 CASAVA_Build 11 95166229 2I TCTGACTTTT --/TA GGTCCTTCGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TA 0 1 251259 CASAVA_Build 11 95166364 2I CATGTTCCTC --/TT TGTGTCTTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 3 251260 CASAVA_Build 11 95168312 1I GCTGTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 11 12 251261 CASAVA_Build 11 95168655 2D TTTCCTCAAC AT/-- GTGTACACAA 3070 het 3070 ref 55 28 24 4 AT 1 0 251262 CASAVA_Build 11 95173576 5D AAATTTTCTG GTTAT/----- GTTATCAGAT 3070 het 3070 ref 33 20 12 6 GTTAT 2 1 251263 CASAVA_Build 11 95176505 1D ACTTTCCATC T/- TTTTTTTTTT 375 het 375 ref 16 11 2 3 T 12 11 251264 CASAVA_Build 11 95176558 1I ACAAAAGAGC -/T TTTTTTTTTG 2685 het 2685 ref 18 8 7 3 T 9 10 251265 CASAVA_Build 11 95184757 2D AAAAACCTAC AT/-- ATTTGTTTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 2 1 251266 CASAVA_Build 11 95186882 3D ATTGATTGGA TCT/--- CACTCTGTCT 3070 het 3070 hom 36 9 25 4 TCT 1 0 251267 CASAVA_Build 11 95188322 1D TTATGGTATC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 T 9 8 251268 CASAVA_Build 11 95191224 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2648 het 2460 hom 22 7 7 8 A 15 16 251269 CASAVA_Build 11 95192717 3I ATTTGTAGAT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TTG 3 4 251270 CASAVA_Build 11 95196443 2D AAATGTAAAC AG/-- AGATAAAGAT 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 AG 2 1 251271 CASAVA_Build 11 95197219 2D TACTTGTAGA CT/-- CTAATATGAT 3070 het 3070 ref 55 36 15 6 CT 2 1 251272 CASAVA_Build 11 95200914 1D TGACTTTATT A/- AATCTTACTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 A 3 2 251273 CASAVA_Build 11 95201293 2I GTATATAAAC --/AT ATCTAGGTAG 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 AT 1 2 251274 CASAVA_Build 11 95203723 4I ATGTATTATT ----/TGAG TTTCAGTTAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TGAG 0 1 251275 CASAVA_Build 11 95205257 1D TAGGATCCTT A/- AGATTTTGGG 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 A 2 1 251276 CASAVA_Build 11 95218520 2I TCTGTAACAC --/TA TGCATGAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TA 0 1 251277 CASAVA_Build 11 95223088 1D TCTAGGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 10 3 A 12 11 251278 CASAVA_Build 11 95228064 4D TTTGTCCATT TTTA/---- TTTATTTACT 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 TTTA 3 2 251279 CASAVA_Build 11 95229061 1I GGGGGACACA -/G GGTTGTCCTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 2 3 251280 CASAVA_Build 11 95240629 1D AAAGGCCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 23 2 17 4 A 14 13 251281 CASAVA_Build 11 95246460 2I AGCTTTTGAA --/TG TGTTTGCTCT 887 hom 5 het 2 0 2 1 TG 1 2 251282 CASAVA_Build 11 95254287 1I CAGACTATTG -/A ATTTACCCAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 2 251283 CASAVA_Build 11 95260235 1I TTTTTTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 10 11 251284 CASAVA_Build 11 95264262 1I GACTCTCACC -/A AAAAAAAAAA 2770 het 2063 hom 30 7 8 15 A 12 13 251285 CASAVA_Build 11 95267973 1I GGGCCAGGAG -/A AAAAAAAAAA 727 het 727 ref 35 17 6 12 A 13 14 251286 CASAVA_Build 11 95269871 1D ACTCCCCATT A/- CACTGTCACT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 A 1 0 251287 CASAVA_Build 11 95271075 1I GTTGGTTTTT -/A AAAAAAAAAA 1572 het 1572 ref 34 11 8 15 A 17 18 251288 CASAVA_Build 11 95273440 1D GTAGATAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 19 12 T 12 11 251289 CASAVA_Build 11 95287424 4I ATTCAAAGGT ----/AAAG AAAATTCTCT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 AAAG 0 1 251290 CASAVA_Build 11 95293511 3D TACAGATTGC ACA/--- ACAGCCTGTA 3070 het 3070 ref 34 19 10 7 ACA 2 1 251291 CASAVA_Build 11 95299692 1I CAGCAGCGTA -/T TGGTATAAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 1 2 251292 CASAVA_Build 11 95300144 4D ATTTGCAAAC TATT/---- TATCTGACAA 3070 het 3070 ref 27 13 9 6 TATT 1 0 251293 CASAVA_Build 11 95305386 1D ATATAACTAC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 7 6 251294 CASAVA_Build 11 95311465 4D AGCCTTATTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 21 het 16 0 8 8 TTTA 5 4 251295 CASAVA_Build 11 95315327 1D CATGACTTTA G/- TATTTAAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 0 251296 CASAVA_Build 11 95317492 1I CTTCAAGGGA -/G CCCCTTTTAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 0 1 251297 CASAVA_Build 11 95340911 1D AGAGACAGGG T/- TTTCACCATG 2952 hom 18 het 7 0 7 0 T 4 3 251298 CASAVA_Build 11 95347476 2I TTGAAAGGGA --/AT ATAGTGTTAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AT 1 2 251299 CASAVA_Build 11 95348092 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 28 0 24 4 A 10 8 251300 CASAVA_Build 11 95360823 1I9M1I ACAGTTTTGA -TTTTATGCC-/TTTTTATGCCA AGCATGGACT 3070 hom 81 het 27 0 28 0 N/A 0 0 251301 CASAVA_Build 11 95361299 1I CTCCACCAGA -/G GGCTAAACTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 2 3 251302 CASAVA_Build 11 95364163 1D CAAGTTTGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 502 hom 44 3 23 18 T 9 8 251303 CASAVA_Build 11 95380851 2D AAAAAAAAAA AT/-- TTTTCAGTGA 3070 het 6 hom 15 1 13 1 AT 1 0 251304 CASAVA_Build 11 95381017 1D44M1D ACTTTTAACC TTTTTTTTCCTCAGCAATTTGGGTAGGTTGGTTGTATCGGATTCTA/-TTTTTTTCCTCAGCAATTTGGGTAGGTTGGTTGTATCGGATTCT- GTTACTTGTA 3070 hom 151 het 37 0 51 8 N/A 0 0 251305 CASAVA_Build 11 95382331 1I TGTTATTTAC -/A AAAGAAATCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 3 4 251306 CASAVA_Build 11 95382887 1I TTAAAAGACC -/A AACCAATTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 3 251307 CASAVA_Build 11 95391409 1D AAGGAAGTGA T/- TTAATGGATT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 T 3 2 251308 CASAVA_Build 11 95423866 6I TTGGTTTAGT ------/GTCATG GTCATTTCCT 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 GTCATG 0 1 251309 CASAVA_Build 11 95433261 1I ATTTGTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 T 11 12 251310 CASAVA_Build 11 95435913 1I CTTTGGTGAT -/C TTTTCTTTCC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 C 0 1 251311 CASAVA_Build 11 95439485 1D TTAAACATTT A/- TTATGTGCCA 3070 hom 99 het 35 0 33 3 A 1 0 251312 CASAVA_Build 11 95440403 1I TCCCATTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 38 1 36 1 T 10 11 251313 CASAVA_Build 11 95454327 1D TCATATATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 9 22 5 A 10 9 251314 CASAVA_Build 11 95454980 1D GTTAAGGTAT G/- GACTTAACTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 1 251315 CASAVA_Build 11 95457981 2D GCTATGCGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 24 16 12 TG 8 7 251316 CASAVA_Build 11 95459275 1D CTTCCTTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 10 9 251317 CASAVA_Build 11 95461870 1I TGACAAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 16 12 A 10 11 251318 CASAVA_Build 11 95464309 1I CAGCTTTATT -/C CAATACTCAG 3070 het 3070 ref 57 28 20 9 C 1 2 251319 CASAVA_Build 11 95466802 1D CTCTAGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 154 het 56 0 52 4 T 10 9 251320 CASAVA_Build 11 95466909 1D ATCTACTTTT C/- TTCCTATAAT 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 C 1 0 251321 CASAVA_Build 11 95469835 2D CGAGGCCCAC TG/-- TGAATGCCTA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TG 2 1 251322 CASAVA_Build 11 95473548 1D TCAAAATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 28 2 17 9 T 12 11 251323 CASAVA_Build 11 95474587 1D ACTATCCTAT G/- GACAAGGCAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 2 1 251324 CASAVA_Build 11 95478687 1I GTTATAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 31 1 24 6 A 11 12 251325 CASAVA_Build 11 95483506 1D CGTATATGGC A/- AAATCTTATT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 4 3 251326 CASAVA_Build 11 95484765 1I CTTTTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 10 11 251327 CASAVA_Build 11 95485896 1D TTTGCAGGGC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 54 het 23 0 18 6 A 9 8 251328 CASAVA_Build 11 95485993 2I ACAAAAAAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 37 1 33 3 AC 0 1 251329 CASAVA_Build 11 95490102 1I TGCAAAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1594 hom 33 7 13 13 T 15 16 251330 CASAVA_Build 11 95491118 3I GTAATCATTG ---/TAA TAATCCCCAT 3070 het 3070 ref 53 32 17 4 TAA 1 2 251331 CASAVA_Build 11 95491374 1D TGTTTATAGC A/- GTGTGAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 1 0 251332 CASAVA_Build 11 95493896 1I GCCAGAGTCA -/G GGGGGGAGTG 3070 hom 150 het 54 0 50 4 G 6 7 251333 CASAVA_Build 11 95499255 4D TTGTAGTCCC AGCT/---- AGCTACTTGG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 AGCT 2 1 251334 CASAVA_Build 11 95503583 1D TTTATTCTGA T/- TTTTTTTTTT 1313 het 1313 ref 35 23 3 11 T 13 12 251335 CASAVA_Build 11 95512355 1I TAACAGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 12 13 251336 CASAVA_Build 11 95518821 4D ACTCCGTCTC AAAA/---- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 31 14 14 8 A 11 7 251337 CASAVA_Build 11 95532323 1D TGCGAGCTCC G/- GCCTCCCGGG 1344 hom 12 het 6 0 5 1 G 2 1 251338 CASAVA_Build 11 95533676 6D TATCTATTAT TGATTA/------ TAAGTGCGCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TGATTA 1 0 251339 CASAVA_Build 11 95556143 1I GAATTTTAGA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 72 het 26 0 23 3 T 6 7 251340 CASAVA_Build 11 95566276 1D CAGTTTGCAA T/- CTCTACTTGG 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 T 1 0 251341 CASAVA_Build 11 95575442 1D CCAGATGAAA T/- TTTTTTTTTT 2335 het 2335 ref 23 12 7 4 T 15 14 251342 CASAVA_Build 11 95605284 1D AAGGAAGGCA T/- TTTTTTTTTT 2557 het 6 hom 21 1 11 9 T 12 11 251343 CASAVA_Build 11 95605935 3I CAAACAAAGA ---/AGG AAAAACAATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AGG 0 1 251344 CASAVA_Build 11 95606172 1D TTATGTCAGG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 69 het 34 0 24 10 A 8 7 251345 CASAVA_Build 11 95609245 1I CGAAAGTCTG -/T TATCTTTCAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 1 2 251346 CASAVA_Build 11 95612385 5I GTATCTTGAG -----/TTTCT TTTATGTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTTCT 0 1 251347 CASAVA_Build 11 95623099 1I TTTTAAATTG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 7 8 251348 CASAVA_Build 11 95630514 1I ACTTGGAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 9 10 251349 CASAVA_Build 11 95630769 1I TCTGATAAAA -/G TGCCTACAGA 3070 het 3070 ref 53 23 21 9 G 0 1 251350 CASAVA_Build 11 95644539 5I AAATAAACCT -----/CTTTC CTTTATAAAT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 CTTTC 0 1 251351 CASAVA_Build 11 95647774 2D TCATTTATAC AT/-- ATTTTAAAGT 3070 het 3070 ref 55 27 26 2 AT 2 1 251352 CASAVA_Build 11 95672080 1I AAAGAGAGGC -/A ACAAGTTAAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 1 2 251353 CASAVA_Build 11 95677494 7D GTACATCTGC AAGTAAT/------- GAATGTATTC 3070 het 3070 ref 45 20 20 6 AAGTAAT 1 0 251354 CASAVA_Build 11 95695921 1I CTACTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2900 hom 44 11 14 19 A 14 15 251355 CASAVA_Build 11 95706166 1D GGAGTAAGCG A/- AAAAAAAAAA 1063 het 1063 ref 39 26 3 10 A 12 11 251356 CASAVA_Build 11 95717340 2D CTCTGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 34 8 11 16 A 16 14 251357 CASAVA_Build 11 95721161 1I TTGGAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 10 11 251358 CASAVA_Build 11 95724226 3D TCAATGATAT TGA/--- TGATGATGAT 3070 het 3070 ref 42 18 17 10 TGA 5 4 251359 CASAVA_Build 11 95724574 2I TAGTGCCTTA --/AT ATTTACAAAT 3070 het 3070 hom 49 19 26 4 AT 1 2 251360 CASAVA_Build 11 95732404 1D TGCCAAGTTC G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 G 5 4 251361 CASAVA_Build 11 95740633 1D AATGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1595 het 378 hom 23 6 4 13 T 19 18 251362 CASAVA_Build 11 95763383 1I TAAGACTGTT -/G GAAGTGAGCC 3070 het 3070 ref 45 29 10 6 G 1 2 251363 CASAVA_Build 11 95765084 2D TGACAAACTC TT/-- TGCAATATGG 3070 het 3070 ref 56 29 24 4 T 3 1 251364 CASAVA_Build 11 95768893 2D TGTATAAGAC AT/-- GTTCTAGATC 3070 het 3070 ref 55 31 20 5 AT 1 0 251365 CASAVA_Build 11 95788673 4D CAATCAGTGT TTGG/---- TTGTCATCAG 3070 het 2979 hom 23 8 13 5 TTGG 1 0 251366 CASAVA_Build 11 95793134 1I AAACAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 9 10 251367 CASAVA_Build 11 95797798 1I TTTTTTTTTT -/C CTAGAGGTTG 3070 het 378 hom 32 2 24 6 C 1 2 251368 CASAVA_Build 11 95797889 1D GTCTAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 1892 het 1892 ref 38 28 5 5 T 13 12 251369 CASAVA_Build 11 95826498 4D ACTCTTCTAT ACAC/---- ACACAGATTC 3070 het 3070 hom 48 19 24 8 AC 4 2 251370 CASAVA_Build 11 95846815 4I AACTTCAACA ----/ATAG ATAGATCAAG 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 ATAG 1 2 251371 CASAVA_Build 11 95850045 1I AGAAGAAAAA -/G CATCTGAATT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 G 0 1 251372 CASAVA_Build 11 95865955 1D GATAAATAGA T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 T 7 6 251373 CASAVA_Build 11 95869861 1I TTTAATTTTT -/A AAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 3 4 251374 CASAVA_Build 11 95871229 1I TCCCACCAGG -/C CCCACCTCCA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 C 3 4 251375 CASAVA_Build 11 95880707 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1764 het 407 hom 14 1 10 3 A 15 16 251376 CASAVA_Build 11 95909632 3D TTTCACAGCG TTC/--- TTCTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 TTC 2 1 251377 CASAVA_Build 11 95915177 2D TTCATTAGAG TT/-- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 T 9 7 251378 CASAVA_Build 11 95915379 1D GTTCTAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 512 hom 36 3 13 20 T 12 11 251379 CASAVA_Build 11 95942867 1D TATATATAGT A/- AAATATGTTT 1380 hom 7 het 3 0 3 0 A 4 3 251380 CASAVA_Build 11 95944233 9D GGATACTTGT TGATGCCTA/--------- GGTTGTGGGC 3070 het 3070 ref 33 24 13 4 TGATGCCTA 1 0 251381 CASAVA_Build 11 95946398 14I26M1D AGAGAGAGAA --------------ATAGAGCTATAAACATTCAAAGTTGGC/ATAATCTTAGAACCATAGAGCTATAAACATTCAAAGTTGG- AGGTATTTAA 3070 het 969 hom 32 3 17 19 N/A 0 0 251382 CASAVA_Build 11 95947692 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAATT 413 het 413 ref 11 4 3 4 A 8 9 251383 CASAVA_Build 11 95947720 4D AAAAAAAATT AAAA/---- AAAGATACCC 999 het 999 ref 10 6 3 2 A 7 3 251384 CASAVA_Build 11 95949348 2D ATGATTAAAC AT/-- ATTTTCCTTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 AT 2 1 251385 CASAVA_Build 11 95957696 1D TCTCCCATCA G/- GGGATTGTAG 3070 hom 129 het 44 0 44 0 G 4 3 251386 CASAVA_Build 11 95974548 1I AACTCACTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 9 11 10 A 9 10 251387 CASAVA_Build 11 95978978 3D TGAGAGAGTG GTT/--- GAGGTTGAAG 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 GTT 1 0 251388 CASAVA_Build 11 95986185 1D TTTTTTTTTT G/- TAAATTTGTT 1591 het 780 hom 26 9 8 9 G 1 0 251389 CASAVA_Build 11 96010151 6D AAAAAAAAGG AAAAGA/------ AAAAGAAAAA 2698 hom 33 het 13 0 12 2 AAAAGA 3 2 251390 CASAVA_Build 11 96023100 1D CGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 777 hom 32 3 21 8 T 12 11 251391 CASAVA_Build 11 96025610 1D AGCTATATTT A/- AAAAAAAAAA 1626 het 1626 ref 44 28 4 13 A 15 14 251392 CASAVA_Build 11 96027215 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTTGCC 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 A 5 4 251393 CASAVA_Build 11 96030589 1D TTCTTCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 13 12 251394 CASAVA_Build 11 96032720 1I TAAACTTCTT -/G GATTCTTACA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 G 1 2 251395 CASAVA_Build 11 96057112 1I AGGCGCCAAG -/A AAAAAAAAAA 1511 het 1511 ref 33 22 4 7 A 11 12 251396 CASAVA_Build 11 96072476 1I TGGCTGACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 9 10 251397 CASAVA_Build 11 96092551 1I AATTAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2404 hom 21 8 10 3 T 10 11 251398 CASAVA_Build 11 96096188 1D CTGGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 10 15 A 15 14 251399 CASAVA_Build 11 96107137 11I ATGTATTTAA -----------/ATTTATTTGCT TTTTTAACTT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 ATTTATTTGCT 0 1 251400 CASAVA_Build 11 96107794 2I ATATAATAAC --/TT ATGCTATAAC 1245 het 1245 ref 10 5 4 1 T 0 2 251401 CASAVA_Build 11 96112663 1D CTCTTTTTTG T/- TTTCCTTTGC 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 T 4 3 251402 CASAVA_Build 11 96115671 1I ATACTACACA -/T TTTTTTGTCC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 6 7 251403 CASAVA_Build 11 96120738 1I TCTGGTGGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 8 9 251404 CASAVA_Build 11 96133531 1D GTTTTGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 321 hom 41 1 31 9 T 11 10 251405 CASAVA_Build 11 96137987 1I TTATGAAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 8 9 251406 CASAVA_Build 11 96142406 2D TATTTTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 31 0 16 17 T 17 15 251407 CASAVA_Build 11 96144956 1I CTTCTCTACC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 7 8 251408 CASAVA_Build 11 96146137 2D GGTGTAATGT AA/-- AGTTATTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 21 1 A 3 1 251409 CASAVA_Build 11 96148008 1I ATGTAAACAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 9 10 251410 CASAVA_Build 11 96154375 1I GTTAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 11 12 251411 CASAVA_Build 11 96157270 1I GCACAAATTG -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 7 8 251412 CASAVA_Build 11 96158215 1D TCTCAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 10 9 251413 CASAVA_Build 11 96160716 4I TACCAGGCAC ----/ATTA AATAGCCCAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 ATTA 0 1 251414 CASAVA_Build 11 96165193 1I CTATGTGGGC -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 7 8 251415 CASAVA_Build 11 96167568 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 89 hom 17 1 14 2 T 9 8 251416 CASAVA_Build 11 96168492 1D CTTCAATCAC T/- TGATACCCTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 2 1 251417 CASAVA_Build 11 96176408 1D GTGTGTTGTT C/- CCCTCTATGT 3070 hom 103 het 42 0 35 7 C 4 3 251418 CASAVA_Build 11 96182850 10D ATACTGAAAA AAAAAAAACC/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 38 2 29 7 AAAAAAAACC 1 0 251419 CASAVA_Build 11 96183279 1D TTTTAAAATA T/- TTTTTGGGTT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 6 5 251420 CASAVA_Build 11 96184551 2D TTATTATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 614 hom 31 6 15 11 T 13 11 251421 CASAVA_Build 11 96186197 3D GTTTTGCAGT TTG/--- TTGTTGTCAA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 TTG 3 2 251422 CASAVA_Build 11 96194766 1I TCAACTATGA -/G AGAGATCAAT 3070 hom 64 het 28 0 22 6 G 0 1 251423 CASAVA_Build 11 96197947 2D GGCTCATAAC TG/-- TAGATGGGCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TG 1 0 251424 CASAVA_Build 11 96202002 1D ACTTTTCTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 9 8 251425 CASAVA_Build 11 96204662 1I GAAGACTTAC -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 56 27 27 2 T 6 7 251426 CASAVA_Build 11 96220354 4I TCTCTCTCTC ----/TCTG TCTCTTAATT 3070 het 22 hom 39 1 29 9 TCTG 0 1 251427 CASAVA_Build 11 96222217 1D TCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 26 0 14 12 T 15 14 251428 CASAVA_Build 11 96230808 2D CTCTAAACGT TC/-- TGTTAGTCTC 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 TC 1 0 251429 CASAVA_Build 11 96234147 2I TTTGATGCCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 11 13 251430 CASAVA_Build 11 96252835 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAGCCCTA 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 A 4 5 251431 CASAVA_Build 11 96253481 2D CGTATACATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 34 het 27 1 25 2 TA 8 7 251432 CASAVA_Build 11 96255371 2I TGAGGAGACA --/GC TATTGCTCAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 GC 0 1 251433 CASAVA_Build 11 96255723 2I CTAGTCAACC --/AG AGAGTTCCTC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 AG 2 3 251434 CASAVA_Build 11 96257051 1I ATAATTAATA -/T TTTAGATTTC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 3 4 251435 CASAVA_Build 11 96259415 5D CTCCAGTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2892 het 906 hom 23 8 8 9 T 17 12 251436 CASAVA_Build 11 96262078 1I GAGTTCCAAC -/T GTCCTGAGCA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 0 1 251437 CASAVA_Build 11 96262701 1D ATCTATTAAA C/- AAATATTTAT 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 C 1 0 251438 CASAVA_Build 11 96277275 1D CACTCATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 36 1 31 4 T 11 10 251439 CASAVA_Build 11 96278627 8D CTGGTCTTTA TTGCTTCT/-------- TTTCATTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 TTGCTTCT 1 0 251440 CASAVA_Build 11 96278857 1D CTCAAAAACC A/- AATAAAGAAA 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 A 3 2 251441 CASAVA_Build 11 96293571 3I TTCTCGGCAT ---/GAA GAACAAAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GAA 1 2 251442 CASAVA_Build 11 96297844 1D TCCATTTCTT G/- AATTTGCCTC 2911 het 2911 ref 22 12 7 3 G 1 0 251443 CASAVA_Build 11 96301081 2I ATTTAGCTAT --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 8 10 251444 CASAVA_Build 11 96302935 1D AAACCACTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 82 het 31 0 27 4 A 10 9 251445 CASAVA_Build 11 96303510 1I TTATATACAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 7 8 251446 CASAVA_Build 11 96303984 1D ATTATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2324 hom 27 6 15 6 T 11 10 251447 CASAVA_Build 11 96307821 1D ATTACAGATT A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 46 21 23 3 A 7 6 251448 CASAVA_Build 11 96309472 1D CTACATGCAA T/- TTGAAGTGTT 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 T 3 2 251449 CASAVA_Build 11 96310460 1I CATTCTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 A 10 11 251450 CASAVA_Build 11 96313215 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 970 het 72 hom 7 2 4 1 A 13 12 251451 CASAVA_Build 11 96313243 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAGAAAGAA 1059 het 17 hom 8 0 4 4 AG 2 3 251452 CASAVA_Build 11 96313866 9D GTAAAGAGTG ATTACAATC/--------- ACTTTCATTC 3070 hom 141 het 50 0 48 6 ATTACAATC 1 0 251453 CASAVA_Build 11 96314582 1I ATGCTCTCCG -/C CCCCCCAGCT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 C 6 7 251454 CASAVA_Build 11 96316130 1I ATGGAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 995 hom 31 5 13 13 T 14 15 251455 CASAVA_Build 11 96318208 1D TGAAAAAGAG A/- AGAGCATTTT 3070 het 2021 hom 22 5 13 4 A 2 1 251456 CASAVA_Build 11 96318440 1I CATTTCGATA -/T GCAATAAGAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 0 1 251457 CASAVA_Build 11 96324510 1D CAAACACATG A/- AAAAAAAAAT 2851 het 2851 ref 38 22 9 7 A 10 9 251458 CASAVA_Build 11 96339162 2D CAGTGGAGTA GT/-- AGAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 GT 1 0 251459 CASAVA_Build 11 96339663 4I ATATGGTAAT ----/TGTC TGGGAGAGTA 3070 hom 114 het 48 0 38 10 TGTC 0 1 251460 CASAVA_Build 11 96340103 11I GAGTCAGTGA -----------/GTGAATGAATG GTGAATGAAT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 GTGAATGAATG 1 2 251461 CASAVA_Build 11 96340311 1I AATACATTGT -/G GGGAGGTGGA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 G 3 4 251462 CASAVA_Build 11 96343301 2D AATTTATTGT AC/-- AGTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 AC 1 0 251463 CASAVA_Build 11 96349935 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1471 het 1011 hom 14 6 6 2 A 15 14 251464 CASAVA_Build 11 96351469 1I TAAATTTGGT -/A AAAAATGTAT 3070 het 3070 ref 44 19 21 4 A 5 6 251465 CASAVA_Build 11 96352365 1D CATAAATAAT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 A 8 7 251466 CASAVA_Build 11 96374638 1D TTTGTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2517 hom 22 8 12 2 A 13 12 251467 CASAVA_Build 11 96376094 1D GCTATTTTAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 T 8 7 251468 CASAVA_Build 11 96389739 2I CTCAGTTTCC --/TA TATGTTTTGC 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 TA 1 2 251469 CASAVA_Build 11 96402076 1D ATTGTATACG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 A 9 8 251470 CASAVA_Build 11 96424354 1D CTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2277 het 2277 ref 33 13 12 8 T 15 14 251471 CASAVA_Build 11 96435835 1I31M2I5M1I GGCTACCATA -TTGACTGCACAGATACAAAATATTTCAAAAA--GACCA-/TTTGACTGCACAGATACAAAATATTTCAAAAAAGGACAAT AAAGAATAGC 3070 hom 127 het 38 0 36 11 N/A 0 0 251472 CASAVA_Build 11 96440717 1D GATAAAATTG C/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 C 1 0 251473 CASAVA_Build 11 96447506 1I GCTTCTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 28 18 10 T 12 13 251474 CASAVA_Build 11 96454951 7I TGTTGCAATT -------/TGAATAA TTTCCCACAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 TGAATAA 0 1 251475 CASAVA_Build 11 96455779 6I TCAAAAGAAA ------/TGGTCT TGGTCTTAAA 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 TGGTCT 1 2 251476 CASAVA_Build 11 96479666 1D AACCTCTGCC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 T 8 7 251477 CASAVA_Build 11 96480217 8D GGCCCTATGA AGTTTGGG/-------- AAGTTATATG 3070 het 3070 hom 29 15 14 1 AGTTTGGG 1 0 251478 CASAVA_Build 11 96488220 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 36 2 26 8 A 14 13 251479 CASAVA_Build 11 96496449 1D TCTTCATTAA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 7 251480 CASAVA_Build 11 96512858 1I GTGTTGGTTT -/A AAAAATGTCA 3070 hom 87 het 35 0 27 8 A 5 6 251481 CASAVA_Build 11 96514438 1D AATTTATCCG T/- TTTTTTCTAG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 7 6 251482 CASAVA_Build 11 96516475 1I ACTTTGGCAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 9 10 251483 CASAVA_Build 11 96520465 1D GAAGCTGCTC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 8 7 251484 CASAVA_Build 11 96567836 4D GATTATTTGT TGAA/---- TGAATGAATG 3070 hom 87 het 43 0 29 15 TGAA 6 5 251485 CASAVA_Build 11 96570733 4D CATGATTTGG CTCT/---- CTATTATTGG 3070 hom 57 het 21 0 20 3 CT 3 1 251486 CASAVA_Build 11 96571404 1I CTCTTTTTTT -/G TGTGTGTCTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 0 1 251487 CASAVA_Build 11 96595168 1I TGCCAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 A 12 13 251488 CASAVA_Build 11 96597280 1D TGCACACCAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 T 9 8 251489 CASAVA_Build 11 96620000 1I TGTTCCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 8 16 7 T 10 11 251490 CASAVA_Build 11 96621046 1I TTGTATTATC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 50 22 20 8 T 8 9 251491 CASAVA_Build 11 96624381 3I TTGGTCTCAC ---/AGT AGTAGCCAGT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 AGT 1 2 251492 CASAVA_Build 11 96629288 1D GGGAGGCCGA G/- GTGGGCGGAT 1860 het 92 hom 7 1 5 1 G 2 1 251493 CASAVA_Build 11 96635058 1D GTCAAAGGAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 A 9 8 251494 CASAVA_Build 11 96653007 1I AATTTACAAT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 7 8 251495 CASAVA_Build 11 96654204 4D AGCATTACAC TGTT/---- TGAAAACCAA 3070 het 3070 ref 46 28 15 5 TGTT 1 0 251496 CASAVA_Build 11 96660040 1I GAGACACATC -/A AAAAAAAAAA 1863 het 1863 ref 29 10 9 10 A 13 14 251497 CASAVA_Build 11 96660068 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAACT 1804 het 1804 ref 29 11 9 9 A 8 9 251498 CASAVA_Build 11 96670257 6I TTTCCATTCT ------/CTTAAA CTTAGTGAGG 3070 het 3070 hom 52 22 28 2 CTTAAA 0 1 251499 CASAVA_Build 11 96674277 2D TCAACTGGAC TA/-- TATATATATA 3070 het 12 hom 17 1 9 7 TA 9 8 251500 CASAVA_Build 11 96691717 1D CCATGTATAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 9 8 251501 CASAVA_Build 11 96695413 2I TTATAAAAAC --/AG AGAATCACGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AG 1 2 251502 CASAVA_Build 11 96706767 4I ATAAAAAATA ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 22 9 AAAC 1 2 251503 CASAVA_Build 11 96712051 2I TGTTTCTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 29 8 T 10 12 251504 CASAVA_Build 11 96720921 1D CAAACTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 T 13 12 251505 CASAVA_Build 11 96722117 1D AATGTTATAC T/- TTGTGCCGCA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 T 3 2 251506 CASAVA_Build 11 96729716 2D CCAAAAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 37 0 23 14 A 15 13 251507 CASAVA_Build 11 96729883 1D ATTTTATATA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 8 7 251508 CASAVA_Build 11 96730522 3D GAATGAATCT AGA/--- AGAAAGAAAC 3070 het 3070 hom 43 12 25 6 AGA 2 1 251509 CASAVA_Build 11 96733699 4I CCAGCAAACT ----/CTAA CTGACAGATT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 CTAA 0 1 251510 CASAVA_Build 11 96734285 1D TTATAGTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1460 hom 25 4 11 10 A 19 18 251511 CASAVA_Build 11 96735282 4I TGCTTGTGAA ----/TAAC TAACTGAGCA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TAAC 1 2 251512 CASAVA_Build 11 96739049 4I TAGGCAAAGT ----/GCAC GCACAATTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 GCAC 1 2 251513 CASAVA_Build 11 96741898 1I CAACTAGAAA -/G CTTCTGCACA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 251514 CASAVA_Build 11 96742458 1I GCCTTGGATC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 36 0 28 8 A 10 11 251515 CASAVA_Build 11 96743517 4D GCATATCTCT AACA/---- AACATGACTG 3070 het 3070 hom 54 22 28 7 AACA 2 1 251516 CASAVA_Build 11 96747512 5D AAGAATTCCC CATTT/----- AATAAGTGGT 3070 hom 87 het 33 0 30 6 CATTT 1 0 251517 CASAVA_Build 11 96750845 4D ATGTTAAACA TAGT/---- TAGTTACTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 TAGT 2 1 251518 CASAVA_Build 11 96751965 3I TGTACAGCAA ---/TAT TATTATTATG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 TAT 3 4 251519 CASAVA_Build 11 96752978 10D TGGCCTCCAC CTCCATCCAT/---------- GTCCCTGCAA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 CTCCATCCAT 1 0 251520 CASAVA_Build 11 96753058 1I ATGTACCACA -/T TTTCTGGATC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 3 4 251521 CASAVA_Build 11 96753165 4I TATAATAGAA ----/TGAT TGATGTATAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TGAT 1 2 251522 CASAVA_Build 11 96757312 4I AACCTTCTGC ----/TGTT TGTTAGTTAC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 TGTT 1 2 251523 CASAVA_Build 11 96759826 1D ATACATTTGA G/- GGGGCCTTGA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 G 5 4 251524 CASAVA_Build 11 96762841 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2548 hom 21 6 10 5 A 11 12 251525 CASAVA_Build 11 96764072 1I ACAGAAAGGG -/A AAAAATGTAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 A 5 6 251526 CASAVA_Build 11 96774205 4D TACTTTCTCC CAAA/---- CAAACAGAAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 CAAA 2 1 251527 CASAVA_Build 11 96777219 1D CAGGAGACAT A/- GGGGATATGA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 1 0 251528 CASAVA_Build 11 96779478 4D TATGGAAAAA TATT/---- TATTAATTAT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 TATT 2 1 251529 CASAVA_Build 11 96790968 2I TGCATGTCTC --/TT TTCGTAGAAC 3070 hom 114 het 48 0 38 10 T 2 4 251530 CASAVA_Build 11 96794768 1I TTGCTTCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 9 10 251531 CASAVA_Build 11 96796677 1I TTCTGTATTT -/A AAAAAAAAAA 2652 het 2652 ref 30 15 8 7 A 13 14 251532 CASAVA_Build 11 96799339 3I ACAAATCGCT ---/TTA TTTAGAGAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTA 0 1 251533 CASAVA_Build 11 96799936 1D GCTTTTGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 11 10 251534 CASAVA_Build 11 96800754 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2727 hom 23 9 11 4 A 13 12 251535 CASAVA_Build 11 96801509 1I TAAAACACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 T 9 10 251536 CASAVA_Build 11 96807199 1I TTTTTTTGGC -/G GGGGGGAAGG 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 G 6 7 251537 CASAVA_Build 11 96807642 3I AGTGATGCAG ---/AGT TTTTTTTACT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AGT 0 1 251538 CASAVA_Build 11 96812359 2I TATATATATA --/AT ATATATATAT 2033 het 2033 ref 22 10 5 7 AT 6 7 251539 CASAVA_Build 11 96836778 4D AAAATATCAG ATTA/---- ATTGTTACAA 3070 het 3070 hom 38 17 15 9 ATTA 1 0 251540 CASAVA_Build 11 96842649 7D GAGAGAAAAA AACACAG/------- AACTGACATT 3070 het 3070 hom 33 14 18 4 AACACAG 1 0 251541 CASAVA_Build 11 96852168 1D AAATTAAAAA T/- GTGTCATTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 T 1 0 251542 CASAVA_Build 11 96865313 1I TTTGTTTTTT -/G TTTTTTTTTG 3070 het 124 hom 36 4 15 17 G 0 1 251543 CASAVA_Build 11 96868108 1D GGACCTATTA T/- TTTAACCTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 4 3 251544 CASAVA_Build 11 96872462 1I CTCCCAAAAA -/T GTCTTAGTTT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 0 1 251545 CASAVA_Build 11 96885088 1I ACTGAAAATA -/C AGTTTCTCAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 251546 CASAVA_Build 11 96896317 1D CTATTTTGTC A/- AAATCTTTTA 3070 het 3070 hom 41 15 19 9 A 4 3 251547 CASAVA_Build 11 96901904 12D CATTTATAAG AGCAATCATAAA/------------ ATAAATTGTA 3070 het 3070 ref 38 21 14 6 AGCAATCATAAA 1 0 251548 CASAVA_Build 11 96906974 2I TTTAAATTTT --/AA AAGAGTTAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 4 251549 CASAVA_Build 11 96913229 1I CTAGGCAGAT -/G GGGGGGGTCC 3070 hom 44 het 21 0 14 7 G 7 8 251550 CASAVA_Build 11 96919421 5I GAACTTAAAG -----/TAAAA TTTAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TAAAA 0 1 251551 CASAVA_Build 11 96943117 1I TGAGTATCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 48 1 36 11 A 10 11 251552 CASAVA_Build 11 96955576 1D AAGGTGCTAC T/- TTTTAAAAAG 3070 hom 24 het 12 0 9 5 T 5 4 251553 CASAVA_Build 11 96962343 1I AACTTCTAAT -/A AAAAACAACC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 5 6 251554 CASAVA_Build 11 96966486 4I TTAAGCTACT ----/CAAG AAGATATCAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CAAG 0 1 251555 CASAVA_Build 11 96969627 1I AACACCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 43 1 35 7 A 10 11 251556 CASAVA_Build 11 96974031 1D AAATAAAAAG A/- AAAAAACGCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 6 251557 CASAVA_Build 11 96990983 3I TGTGTAGTCA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 28 0 22 6 T 11 14 251558 CASAVA_Build 11 96994380 29D ACATATATGT ATATATACATATTTATATATGTATATATA/----------------------------- ATATATACAT 2479 hom 12 het 11 0 5 7 ATATATACATATTTATATATGTATATATA 2 1 251559 CASAVA_Build 11 97027519 1I TGGTTTGGTG -/C CTTCTTGGCT 3070 hom 101 het 37 0 34 3 C 1 2 251560 CASAVA_Build 11 97037594 1D TATGGTGAAA C/- CCCTGCCTCT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 4 3 251561 CASAVA_Build 11 97061960 1D CTAATGTTAT A/- AAAAAAGCCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 6 251562 CASAVA_Build 11 97067635 1I TTCTGAGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 909 hom 34 2 28 4 A 9 10 251563 CASAVA_Build 11 97086210 1D TAATTTTTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 44 0 37 8 A 10 9 251564 CASAVA_Build 11 97099750 1D ACAAATAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 40 0 30 10 T 10 9 251565 CASAVA_Build 11 97105154 8D TATGTGTGGG TATATATA/-------- TATATATATA 2006 het 258 hom 23 4 5 16 TA 12 8 251566 CASAVA_Build 11 97114301 1I TTATTTTTGC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 55 19 26 10 T 7 8 251567 CASAVA_Build 11 97117458 1I AGAGACTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 T 11 12 251568 CASAVA_Build 11 97122700 1I CTTCTCTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 9 10 251569 CASAVA_Build 11 97123531 1D TGTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 1810 het 482 hom 30 5 10 16 T 11 10 251570 CASAVA_Build 11 97123551 1D TGTTTGCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 26 0 17 9 T 12 11 251571 CASAVA_Build 11 97125038 8I TCATTGTCTG --------/CCGTTGAT CCGTTGATCC 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 CCGTTGAT 1 2 251572 CASAVA_Build 11 97125048 2I CCGTTGATCC --/GT TGATCCTCTT 975 het 975 ref 42 20 4 18 GT 0 1 251573 CASAVA_Build 11 97134398 1D CAGCCAGAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 A 9 8 251574 CASAVA_Build 11 97142738 1D ACATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 10 10 8 A 13 12 251575 CASAVA_Build 11 97152120 12I CTGTTTATAG ------------/ATCTGAACATTA ATCAAGTAAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 ATCTGAACATTA 0 1 251576 CASAVA_Build 11 97162864 4I CTGTATCTCT ----/CTCA CTCACTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 CTCA 1 2 251577 CASAVA_Build 11 97162992 1D CCCAATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 14 13 T 15 14 251578 CASAVA_Build 11 97188984 1D CATTAACATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 A 10 9 251579 CASAVA_Build 11 97196010 5D TAGATATTAA GAAAT/----- GAAAGAAATA 3070 het 3070 hom 36 14 21 3 GAAAT 1 0 251580 CASAVA_Build 11 97226365 1D ATTCATTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 31 1 25 6 A 12 11 251581 CASAVA_Build 11 97239412 1I GAGAAACACG -/A AACAAAAAGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 2 3 251582 CASAVA_Build 11 97269780 1I AGTGTATATA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 251583 CASAVA_Build 11 97270510 1I ATTTCTGACA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 8 251584 CASAVA_Build 11 97274117 1I GGATTACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 725 hom 31 2 27 2 A 10 11 251585 CASAVA_Build 11 97283614 2D AACTCTTTAA AC/-- ACAGATGTCA 3070 hom 84 het 30 0 28 3 AC 2 1 251586 CASAVA_Build 11 97291177 2I GTATATATAC --/AT ATATATGTAG 1454 hom 7 het 5 0 3 2 AT 3 4 251587 CASAVA_Build 11 97304470 1D AAGAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 1908 het 1908 ref 46 37 5 4 A 11 10 251588 CASAVA_Build 11 97306068 4I TTCTGTTTTT ----/TTTA ATTGAAAATC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTTA 0 1 251589 CASAVA_Build 11 97309222 1I TTGCTGCTGG -/T TGGGAATGCA 3070 hom 126 het 43 0 43 0 T 1 2 251590 CASAVA_Build 11 97315450 1I AAGAAAAGAC -/A AAAGGCTAAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 3 4 251591 CASAVA_Build 11 97320977 2D AGTGTATAGG TC/-- TTTTACTTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 1 TC 1 0 251592 CASAVA_Build 11 97328109 1D ATGTACATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 42 1 29 12 T 15 14 251593 CASAVA_Build 11 97349584 13D25M1D GCTGCAGGCA CTTCGCCTGCGCGCTTCGCCTGCAAGAGCCTCCCCGTCT/-------------CTTCGCCTGCACGAGCCTCCCCGTC- TGAGTATTTC 3070 hom 77 het 25 0 23 13 N/A 0 0 251594 CASAVA_Build 11 97350977 1D TTGGATGATA G/- GTTTAGATGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 2 1 251595 CASAVA_Build 11 97351372 2D TCACTTGCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 135 het 51 0 46 6 A 13 11 251596 CASAVA_Build 11 97356207 5D32M1D AAATAAAATG AATTAAATTGTCTAACAGTTTGACAAATTTTCAAGAGA/-----AATTGTCTAACAGTTTGACAAATTTTCAAGAG- ATTTTGATAA 3070 hom 105 het 27 0 36 3 N/A 0 0 251597 CASAVA_Build 11 97359334 1D GTTTTGTTGC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 76 het 28 0 26 3 A 9 8 251598 CASAVA_Build 11 97362056 2D CTTGTTAATT CC/-- TCACAGCACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 2 0 251599 CASAVA_Build 11 97365254 1I TATTTATATA -/T TATATATTAG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 1 2 251600 CASAVA_Build 11 97365932 3I22M1D AGATTCAAGC ---ACATTTAAAGGCCAATGAAATAT/ACAACATTTAAAGGCCAATGAAATA- TTTCCCCTGA 3070 hom 117 het 37 0 40 2 N/A 0 0 251601 CASAVA_Build 11 97366748 3D TGACCCTCCT GAC/--- GACTCATTCC 3070 hom 119 het 47 0 38 11 GAC 2 1 251602 CASAVA_Build 11 97367111 4D AAAAGTGTAC AAAT/---- AATGCATAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 7 AAAT 1 0 251603 CASAVA_Build 11 97368537 4D AGAAATTGAG TTCT/---- TTATTATGAT 2801 hom 17 het 22 0 6 20 TTCT 1 0 251604 CASAVA_Build 11 97370010 1I TTTTTTTTTT -/A AAATGAGTAT 3070 het 140 hom 32 1 28 3 A 3 4 251605 CASAVA_Build 11 97370360 4I TATCTGGATC ----/TATT TATTTATGTG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TATT 1 2 251606 CASAVA_Build 11 97371510 6D CTCTGGTATT AGAATA/------ AAAGTTTTGA 3070 hom 77 het 28 0 26 4 AGAATA 1 0 251607 CASAVA_Build 11 97372167 3I ATCAACAAGG ---/GTA GATATTCTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GTA 0 1 251608 CASAVA_Build 11 97374165 9D GCTGTTGCTT CTGTTGCTG/--------- CTGTTAATAC 3070 het 3070 hom 38 16 22 5 CTGTTGCTG 1 0 251609 CASAVA_Build 11 97374592 2I AATAAAAACT --/AA AAGAGATTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 4 251610 CASAVA_Build 11 97376231 2I AAGATAAAGT --/AA AATATATGCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 4 251611 CASAVA_Build 11 97381097 2I CACACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 501 hom 26 3 22 1 CA 7 8 251612 CASAVA_Build 11 97382150 1I TGAGAACTAA -/T TGCTTAAACG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 1 2 251613 CASAVA_Build 11 97383914 1D CATTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 T 11 10 251614 CASAVA_Build 11 97385776 1D TTAACAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 25 1 15 10 T 15 14 251615 CASAVA_Build 11 97386448 2D GTGAAATAAT TG/-- TCTTTCTTCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TG 1 0 251616 CASAVA_Build 11 97387048 1I CTGAATTAGA -/T TTTTTAAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 5 6 251617 CASAVA_Build 11 97391503 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 27 1 18 8 A 10 11 251618 CASAVA_Build 11 97401270 4D ATCAACTACC CTAG/---- CTTCTTTATT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 CTAG 1 0 251619 CASAVA_Build 11 97401684 3I CAACTTTTTA ---/AAC AACATTAACT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAC 1 2 251620 CASAVA_Build 11 97407720 2D TTAGGAAAGA CT/-- CTGTAAGAGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CT 2 1 251621 CASAVA_Build 11 97411403 3D TATTCAGAAT CTA/--- CAAAGAACTC 3070 hom 105 het 37 0 34 3 CTA 1 0 251622 CASAVA_Build 11 97413442 1D AACAACAAAT C/- CGAAGAGTAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 2 1 251623 CASAVA_Build 11 97416408 11D TCTAATAGGA GAGTCTAATAG/----------- GAGTCTAATA 3070 hom 105 het 37 0 36 4 GAGTCTAATAG 2 1 251624 CASAVA_Build 11 97419068 1I TTGTGATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 11 12 251625 CASAVA_Build 11 97424988 11I AATTATTCAC -----------/TAATTTTTTGT TAATTTTTTG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TAATTTTTTGT 1 2 251626 CASAVA_Build 11 97425449 1I ACTCATGCTG -/T TTTTTTTACC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 7 8 251627 CASAVA_Build 11 97425881 3D ATTTTATAAC AAG/--- AAGTGTATAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 AAG 2 1 251628 CASAVA_Build 11 97427895 4I AATTAGTGAA ----/TATC TATTCTACAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TATC 0 1 251629 CASAVA_Build 11 97431886 1I CGCTTGGCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 8 9 251630 CASAVA_Build 11 97432394 1I TAAGCATACA -/T TTTTCTCCGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 4 5 251631 CASAVA_Build 11 97432959 1I ATATTTTTTT -/C CCGTGGTCTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 2 3 251632 CASAVA_Build 11 97433599 1I ATAGAAATCT -/A AATTTATAAT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 2 3 251633 CASAVA_Build 11 97447568 1D TGTCAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 11 10 251634 CASAVA_Build 11 97467099 3I TAGTGCTGGT ---/TCA TCAGGCACGC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TCA 1 2 251635 CASAVA_Build 11 97468478 1D TTGGAAATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 46 0 36 10 A 10 9 251636 CASAVA_Build 11 97476234 1D TTCAGTAAAT G/- TAAGACTGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 1 0 251637 CASAVA_Build 11 97480878 16D TGTGTGTGTG TGTGTATATATATATA/---------------- TATATATATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TGTGTATATATATATA 1 0 251638 CASAVA_Build 11 97532396 1D TGGGGGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 31 1 21 9 T 11 10 251639 CASAVA_Build 11 97533629 2D GCAAATCCAC AT/-- GTTTAGTCTA 3070 hom 135 het 50 0 45 7 AT 1 0 251640 CASAVA_Build 11 97536833 1I AGCTGTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 36 2 22 12 T 13 14 251641 CASAVA_Build 11 97539585 1D GCTTTATTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 251642 CASAVA_Build 11 97552338 1D ATAAAAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 632 hom 30 3 21 6 A 12 11 251643 CASAVA_Build 11 97553369 1D GAGGCTAAGA C/- TGCAGTGGGC 3070 hom 63 het 24 0 19 5 C 1 0 251644 CASAVA_Build 11 97560306 1I TACCTGAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 903 hom 37 2 33 2 A 8 9 251645 CASAVA_Build 11 97586217 1D TCATTACCCC T/- GATATGTATA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 1 0 251646 CASAVA_Build 11 97604014 5I ACTTATATGG -----/TAAAT TATTTTATTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TAAAT 0 1 251647 CASAVA_Build 11 97605791 3D ATTCAATAAT AGA/--- AGAAGAAATG 3070 hom 120 het 45 0 41 5 AGA 3 2 251648 CASAVA_Build 11 97619150 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 466 hom 12 het 17 0 5 13 A 15 13 251649 CASAVA_Build 11 97619384 1I TGTTTTAATA -/T AATACTTACT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 0 1 251650 CASAVA_Build 11 97631074 5D ATATTATGTG TTAAC/----- TTCTCTAAGG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 TTAAC 1 0 251651 CASAVA_Build 11 97655198 1D AGATATTTGG A/- AGTTATGGTT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 2 1 251652 CASAVA_Build 11 97658885 2I TAGTTCTCTC --/TT AAGTAATTAA 3070 hom 94 het 35 0 32 3 T 0 2 251653 CASAVA_Build 11 97661489 3D AGGGGAGCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 32 1 20 13 A 14 11 251654 CASAVA_Build 11 97662098 6D TGTCAACATC TTAATA/------ TTAAACTCCC 3070 hom 78 het 30 0 27 7 TTAATA 1 0 251655 CASAVA_Build 11 97663061 1I CTCTTACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 25 3 17 5 A 16 17 251656 CASAVA_Build 11 97663586 2D TTTAGAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 12 10 251657 CASAVA_Build 11 97663981 12I GTATTTAAGA ------------/ACAGTCTTTGTG GCTTCTGTTT 3070 hom 84 het 29 0 27 3 ACAGTCTTTGTG 0 1 251658 CASAVA_Build 11 97668982 1I CTCTGGAGAA -/C CTTGATTAAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 1 2 251659 CASAVA_Build 11 97672424 1D TTTATTAGTG T/- TTTTTGTAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 T 6 5 251660 CASAVA_Build 11 97672906 2I TCTGAGACTC --/TG TTCAACTTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TG 0 1 251661 CASAVA_Build 11 97673174 1I TCCTTTAGTT -/C TTTGAAGATT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 C 0 1 251662 CASAVA_Build 11 97674302 1D CAGTTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 19 5 T 12 11 251663 CASAVA_Build 11 97678892 4D TACATATATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TG 7 5 251664 CASAVA_Build 11 97681076 4D CTTAGGCTGT CAGA/---- CAGACAAAAT 3070 hom 129 het 45 0 44 2 CAGA 2 1 251665 CASAVA_Build 11 97681537 2D TTGTTTCTGA TC/-- TCTTTCTGTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TC 2 1 251666 CASAVA_Build 11 97681983 1D GTAAGACTGC A/- AAAAATACTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 6 5 251667 CASAVA_Build 11 97690294 4D3M2I ATACAGAAGT GAGAAAC--/----AACAT GTTGTTCAGA 3070 hom 110 het 40 0 36 5 N/A 0 0 251668 CASAVA_Build 11 97691349 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAAGGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AC 0 1 251669 CASAVA_Build 11 97692998 1I TCTGGAAACA -/T TTTTTCAGAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 5 6 251670 CASAVA_Build 11 97695378 1I ATGTGACAGG -/A AAAAATGGTA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 5 6 251671 CASAVA_Build 11 97696266 2I AGAAGATGTG --/AA ATTATATTTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 1 3 251672 CASAVA_Build 11 97696910 1I AGCTTACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 10 251673 CASAVA_Build 11 97698185 5D GAATCAATTT AAGTA/----- AAGTACTATA 3070 hom 59 het 22 0 20 5 AAGTA 2 1 251674 CASAVA_Build 11 97700805 4D AGCATTGTGC CTTT/---- CTATTATCGT 1314 hom 15 het 12 0 4 9 CTTT 1 0 251675 CASAVA_Build 11 97713892 1D TTTGGAATTC T/- TTTTTTTTTT 2189 het 2029 hom 32 10 9 13 T 17 16 251676 CASAVA_Build 11 97715462 1D TTGACAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 6 T 12 11 251677 CASAVA_Build 11 97717404 1D CCTGAGTCTT C/- CTACTCCATC 3070 hom 96 het 33 0 32 1 C 2 1 251678 CASAVA_Build 11 97722564 1D CTTTCTGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 11 7 T 13 12 251679 CASAVA_Build 11 97728569 5I GGTGCAGAGT -----/GGTAA GGGGTGTATG 3070 hom 83 het 32 0 25 7 GGTAA 0 1 251680 CASAVA_Build 11 97731374 2D ATAAGTAGAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 29 het 13 0 9 4 TA 7 6 251681 CASAVA_Build 11 97736170 3I TTATAAACAT ---/ATC ATAAAGGAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ATC 0 1 251682 CASAVA_Build 11 97737840 2D CTTTGTTATT TC/-- TCTCTCTCTC 1388 het 14 hom 16 1 7 8 TC 9 8 251683 CASAVA_Build 11 97744946 5I CAATACTACT -----/TTATG TTATGTTACA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 TTATG 1 2 251684 CASAVA_Build 11 97749532 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 16 7 A 13 12 251685 CASAVA_Build 11 97755784 16D ACACCTGCTG TTAGTTAAAATATGCT/---------------- TTAGTTAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 14 15 TTAGTTAAAATATGCT 1 0 251686 CASAVA_Build 11 97756041 3I GTACCTTACT ---/AAC GAGAGATTTC 3070 hom 80 het 38 0 30 8 AAC 0 1 251687 CASAVA_Build 11 97756319 2I ATATTACCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 28 8 T 10 12 251688 CASAVA_Build 11 97758054 1D TTTTTGAGAT A/- AAAAAATGTG 3070 hom 99 het 39 0 33 7 A 7 6 251689 CASAVA_Build 11 97759222 2I CTGGAGAGAG --/AT TTTCTAGGCT 3070 het 3070 ref 44 20 13 11 AT 0 1 251690 CASAVA_Build 11 97767781 1D TGTTAGTAAT C/- CTCCATATAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 2 1 251691 CASAVA_Build 11 97774973 18D TATGTGTGCC GTGTGTGTGTGTGTGTGT/------------------ GTGTGTGTGT 3070 hom 33 het 18 0 12 9 GT 16 7 251692 CASAVA_Build 11 97775043 1I ATAATATTTC -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 7 8 251693 CASAVA_Build 11 97775414 1I TAGAATTGTT -/A AAAAAATCTA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 6 7 251694 CASAVA_Build 11 97776322 1D TTCTGTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 26 0 16 12 A 12 11 251695 CASAVA_Build 11 97777643 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1354 hom 33 het 13 0 12 1 T 15 16 251696 CASAVA_Build 11 97782148 1D TTTAACTGAT A/- AGGTCTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 5 A 2 1 251697 CASAVA_Build 11 97783258 2D ATTATTATTA TT/-- TTTTTTTAGA 488 het 82 hom 9 1 2 6 T 9 7 251698 CASAVA_Build 11 97784936 4I GATATATGAT ----/TATC TATCTATTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TATC 1 2 251699 CASAVA_Build 11 97788293 2D AATAACTGAC TT/-- TTAATGAGGC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 4 2 251700 CASAVA_Build 11 97788484 2D AAAGACTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 96 het 42 0 32 14 TG 10 9 251701 CASAVA_Build 11 97790422 2D CTTGGATAAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TC 7 6 251702 CASAVA_Build 11 97790825 4D TAAGTTACTT AGTC/---- AGTAACTGGT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 AGTC 1 0 251703 CASAVA_Build 11 97802444 1D AGGTTATGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 50 0 39 11 T 10 9 251704 CASAVA_Build 11 97807741 3I GCCAGGCTGG ---/TGT TGAACTCCTG 3070 hom 51 het 22 0 14 8 TGT 0 1 251705 CASAVA_Build 11 97810718 1I CCACCCCCAA -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 6 7 251706 CASAVA_Build 11 97813756 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 8 9 251707 CASAVA_Build 11 97817158 1I TGAATTTATG -/T TTTTTTAGTT 3070 het 9 hom 39 1 35 3 T 6 7 251708 CASAVA_Build 11 97820390 1I AATAATTCAT -/A AAGAAATTAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 2 3 251709 CASAVA_Build 11 97823731 1D TTATTACTAC A/- AAATTTTCTA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 4 3 251710 CASAVA_Build 11 97823965 1I36M1I AGACTGAAAC -AAAAGGCTGTTTGAATTTATGAACATATAAACCAGT-/AAAAAGGCTGTTTGAATTTATGAACATATAAACCAGTA AAACTCCTAG 3070 hom 138 het 37 0 46 8 N/A 0 0 251711 CASAVA_Build 11 97824327 2I CTACCCGGCA --/AC CATCCTGTGT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 AC 0 1 251712 CASAVA_Build 11 97829981 1I GCATGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 662 hom 37 4 17 16 A 13 14 251713 CASAVA_Build 11 97832188 2I ATTTCAAACC --/AA GAGAGAGAGA 3070 hom 87 het 32 0 28 4 A 0 2 251714 CASAVA_Build 11 97832671 2I GTGCAAGGTT --/AC ATACTGAGTG 3070 hom 60 het 24 0 21 5 AC 0 1 251715 CASAVA_Build 11 97836201 1D GTGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 28 1 25 2 A 11 10 251716 CASAVA_Build 11 97836947 4D ATATTTGTTA TAAT/---- TAATTAATTA 2550 het 2550 ref 21 7 9 6 TAAT 3 2 251717 CASAVA_Build 11 97842800 3I CGCCTTTGCC ---/AGG AGGAGAAGCC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AGG 1 2 251718 CASAVA_Build 11 97852195 2I TACTGTAAAG --/AT AATTGACGAG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AT 0 1 251719 CASAVA_Build 11 97853651 1I GAGGCCTCAG -/A AAAACTTACA 3070 het 2532 hom 22 6 14 2 A 4 5 251720 CASAVA_Build 11 97863998 1I ATTTAAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 11 12 251721 CASAVA_Build 11 97869324 1I TAATGGTATC -/A AAAAAAAAAA 2690 het 2690 ref 28 15 8 5 A 13 14 251722 CASAVA_Build 11 97870221 4I TTCTGAAGGC ----/CTTT CTATTTTTAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTTT 0 1 251723 CASAVA_Build 11 97879878 2I CCAAATATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 AT 5 6 251724 CASAVA_Build 11 97880109 1D TTTTTTTAAA T/- TGACTATAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 251725 CASAVA_Build 11 97882445 1I GTTTATTTTC -/T TCCTTTTTAT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 1 2 251726 CASAVA_Build 11 97882598 1D ACAAAAACTA C/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 1 0 251727 CASAVA_Build 11 97883009 4D TCTTTTCTTG TTGT/---- TTTTTTGTTT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 TTGT 1 0 251728 CASAVA_Build 11 97886936 1D ATTTGTTTGG T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 6 251729 CASAVA_Build 11 97887049 1I ATTCTGCTGA -/C TGGTTTTTTG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 0 1 251730 CASAVA_Build 11 97888393 1D TTTGTATTTA T/- TTTTTGGAGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 6 5 251731 CASAVA_Build 11 97891268 1D TGCTTCTGCA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 130 het 48 0 44 4 T 7 6 251732 CASAVA_Build 11 97941394 1I GCTTTACCAC -/A GTCATTGCAT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 0 1 251733 CASAVA_Build 11 97944429 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 1691 het 476 hom 7 1 5 1 T 10 9 251734 CASAVA_Build 11 97956689 3D AAAGAGAAAG AGA/--- AGAAAAAGAA 3070 het 2182 hom 14 5 9 1 AGA 2 1 251735 CASAVA_Build 11 97970882 1D CCAAATATAA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 T 7 6 251736 CASAVA_Build 11 97978354 1I TTATTCCGGG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 7 8 251737 CASAVA_Build 11 97984734 1D TTGGCAGTTG T/- TTTTATAATA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 T 5 4 251738 CASAVA_Build 11 97986065 6D GCTGTGGCGC GATCTT/------ GATCTTGGCT 784 het 784 ref 10 3 2 6 GATCTT 2 1 251739 CASAVA_Build 11 97989484 2I GTGGTGTGAT --/TA TGTTTCACTG 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 TA 0 1 251740 CASAVA_Build 11 97991070 2D TTTGAAACAA AG/-- AGGTAAGCTA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 AG 2 1 251741 CASAVA_Build 11 97998724 1I TTCCAACTGT -/G GTCAAATTCT 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 G 1 2 251742 CASAVA_Build 11 98000621 1I CGTAAAATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 9 10 251743 CASAVA_Build 11 98000927 3D AGATGTAAAT TAG/--- TAGTAATAAT 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 TAG 2 1 251744 CASAVA_Build 11 98002827 1D CCTAGACCAT A/- ACTCCTGATG 3070 het 3070 hom 50 15 25 10 A 2 1 251745 CASAVA_Build 11 98003423 1D GTTGTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2771 hom 28 11 9 8 T 13 12 251746 CASAVA_Build 11 98003739 2D TTGATTTTTT AA/-- GTTATATTTT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 2 0 251747 CASAVA_Build 11 98006905 1I GACACGCAGA -/T TTTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 T 6 7 251748 CASAVA_Build 11 98010935 1D TACTTTATTT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 23 10 12 2 A 8 7 251749 CASAVA_Build 11 98011163 1I TTAGTGGTGA -/T TTTTTTTTTA 2615 het 2615 ref 26 16 6 4 T 9 10 251750 CASAVA_Build 11 98012303 1D AAATGGATCT G/- GAAATGAGGT 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 G 2 1 251751 CASAVA_Build 11 98016203 1D TTATGGGGAG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 A 8 7 251752 CASAVA_Build 11 98029501 1D TCTTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 20 19 10 A 11 10 251753 CASAVA_Build 11 98033992 1I GCACCAAATC -/T TCTGGTGCCT 3070 het 3070 hom 53 20 28 5 T 1 2 251754 CASAVA_Build 11 98042809 1D CAAACTGTGG T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 8 7 251755 CASAVA_Build 11 98051072 1I TTGAATGCCA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 7 8 251756 CASAVA_Build 11 98053958 1D ATTTTTTTTT A/- AAATTTACTG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 4 3 251757 CASAVA_Build 11 98060787 2I ATCATATGGT --/CG CTCTATTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 CG 0 1 251758 CASAVA_Build 11 98061141 1D CATTGTTACA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 38 18 19 2 T 8 7 251759 CASAVA_Build 11 98064786 2I GCACTAATAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 T 10 12 251760 CASAVA_Build 11 98070853 1D ATGAGAAAAA G/- GGTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 G 3 2 251761 CASAVA_Build 11 98084413 18D TTAAACTGTC CAGCCTTAACAATTTAAG/------------------ CACCCTACCT 3070 het 3070 ref 43 24 22 3 CAGCCTTAACAATTTAAG 1 0 251762 CASAVA_Build 11 98085850 1D GAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3038 het 1581 hom 23 9 9 5 A 15 14 251763 CASAVA_Build 11 98095611 5I TAGTAAATAA -----/TAACT TAACTGTATA 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 TAACT 1 2 251764 CASAVA_Build 11 98107934 1D TAGCACATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 12 11 251765 CASAVA_Build 11 98109650 4D TCTCACCAAC TGTT/---- TGTTTGTTCA 3070 het 3070 hom 29 11 13 8 TGTT 3 2 251766 CASAVA_Build 11 98117039 1D TGCTCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 12 11 251767 CASAVA_Build 11 98128184 1D CAATTGCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 10 9 251768 CASAVA_Build 11 98132886 1D ATTTCTTTGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 54 het 21 0 19 3 T 8 7 251769 CASAVA_Build 11 98142484 1D GTTATCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 24 16 12 A 12 11 251770 CASAVA_Build 11 98142622 2I GCCATGTAAC --/TT AGTATCTCTA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 T 0 2 251771 CASAVA_Build 11 98148959 1D CCCTTTAGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 18 12 12 T 10 9 251772 CASAVA_Build 11 98151496 1D CTGATTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 12 11 251773 CASAVA_Build 11 98169541 2I ATATTGAAAG --/AA AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 8 10 251774 CASAVA_Build 11 98185202 1D GAGAAATACT G/- TGCCTCCAAA 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 G 1 0 251775 CASAVA_Build 11 98194492 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 11 10 251776 CASAVA_Build 11 98197948 28I TCTGTTGAAG ----------------------------/ATCTTTTGGGTGTACATATTTATTTATT ATTGATTATC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 ATCTTTTGGGTGTACATATTTATTTATT 0 1 251777 CASAVA_Build 11 98201580 1D55M4I AATGAACATT AAAAAAAAAAATGACAGGTAAATAAACCTTGAAAGAGGATGATAGTATCTGCTCAC----/-AAAAAAAAAATGACAGGTAAATAAACCTTGAAAGAGGATGATAGTATCTGCTCACTGAT TGCTGCAAAG 3070 hom 144 het 29 0 49 2 N/A 0 0 251778 CASAVA_Build 11 98206541 1I TTAGGGCTCT -/C CAGACACTTC 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 C 1 2 251779 CASAVA_Build 11 98208530 1D GTCTGTGGAA T/- TTTTGTAATG 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 5 4 251780 CASAVA_Build 11 98212871 1I GTTTCAGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 10 251781 CASAVA_Build 11 98230541 2I TACAAATGGC --/TA TATATATATA 3070 het 540 hom 41 2 34 5 TA 7 8 251782 CASAVA_Build 11 98231084 3I AGCTATGACG ---/AAA AAAAAAATAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 7 10 251783 CASAVA_Build 11 98245711 3I TTGAATCCAC ---/AGA AGAAGAGAGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AGA 2 3 251784 CASAVA_Build 11 98258377 1I CAGACACAAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 89 het 40 0 29 11 A 7 8 251785 CASAVA_Build 11 98262292 1I TACTTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 27 2 16 9 A 11 12 251786 CASAVA_Build 11 98268024 1I TCAAATTTCA -/T TTTTTTCATT 3070 hom 142 het 57 0 48 9 T 6 7 251787 CASAVA_Build 11 98274275 1I CGAACTGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 833 hom 51 4 28 19 A 15 16 251788 CASAVA_Build 11 98288652 1D TTCTGTTGAT A/- AGATATATCA 3070 hom 132 het 45 0 45 0 A 2 1 251789 CASAVA_Build 11 98290946 1D TTGATGACAT A/- CCCTCAGCTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 1 0 251790 CASAVA_Build 11 98291035 2I AGGATAAAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 27 1 22 9 T 14 16 251791 CASAVA_Build 11 98291702 1I TTTTTTTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 9 10 251792 CASAVA_Build 11 98297426 3I TGGTAAAAAT ---/ATA ATAATAAATA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 ATA 2 3 251793 CASAVA_Build 11 98305337 1D GGACTTCCAA G/- GAGGTTTGCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 1 251794 CASAVA_Build 11 98305431 1I TTATATCAGG -/T TTTGTTGATT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 3 4 251795 CASAVA_Build 11 98311708 1I AGGCTTACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 43 0 31 12 T 10 11 251796 CASAVA_Build 11 98328979 7I CCATGAATCA -------/CCATGCC CCATGCCCAG 3070 het 1946 hom 21 7 10 4 CCATGCC 1 2 251797 CASAVA_Build 11 98364465 1I TCACCAGCAA -/T TGTTTTATTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 1 2 251798 CASAVA_Build 11 98372176 5D ATATGCGTGA AACAT/----- AACATATGTA 3070 het 3070 ref 52 30 19 5 AACAT 2 1 251799 CASAVA_Build 11 98398450 1D TATTTCATGC T/- CAAATTATTC 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 T 1 0 251800 CASAVA_Build 11 98435537 6I TTCACACACC ------/TTCACA TTCTCATTGA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 TTCACA 0 1 251801 CASAVA_Build 11 98506088 1D TAAATGCCCC A/- ATTAAAATAC 3070 hom 76 het 29 0 25 4 A 2 1 251802 CASAVA_Build 11 98506642 4I ATTGATCACA ----/TAAT TAATTGGAAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TAAT 1 2 251803 CASAVA_Build 11 98507056 14I CAAAAAATTA --------------/GCTGGGCCTGGTGG CAGGCACCTG 1854 hom 10 het 4 0 4 0 GCTGGGCCTGGTGG 0 1 251804 CASAVA_Build 11 98508151 1D CTTTCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 32 1 27 4 A 12 11 251805 CASAVA_Build 11 98509322 1I AAGCAATTGC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 8 9 251806 CASAVA_Build 11 98511582 1I ATAAAGTTTC -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 6 7 251807 CASAVA_Build 11 98512724 1D GACATGGGTT G/- TTTTAATGGA 3070 hom 129 het 47 0 43 5 G 1 0 251808 CASAVA_Build 11 98513770 1D TGGTGATTAT G/- TGAGCAGATT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 1 0 251809 CASAVA_Build 11 98515042 3D CCCCTCCCCA CCC/--- CCCCCCCCCA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 12 9 251810 CASAVA_Build 11 98516840 1I TTTTCTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 33 0 28 5 T 10 11 251811 CASAVA_Build 11 98519262 4I ATATTTTAAA ----/ATAT ATATGTAATA 2963 hom 18 het 7 0 7 0 AT 2 4 251812 CASAVA_Build 11 98519478 1I TTCTTTCTCT -/C CCTGGCTCCC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 C 2 3 251813 CASAVA_Build 11 98521318 1I CCAGAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 11 251814 CASAVA_Build 11 98524374 1D ATCTAATCAG C/- CAAGGTGGGC 3070 hom 96 het 35 0 32 4 C 2 1 251815 CASAVA_Build 11 98529430 1D TCAGATCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 T 15 14 251816 CASAVA_Build 11 98539349 1D ATTATTTGAG T/- TATGTATGCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 2 1 251817 CASAVA_Build 11 98542795 1I TTGAATTACA -/T TTTGATTTAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 3 4 251818 CASAVA_Build 11 98548158 1D CTTTTTATAC A/- AAAATAAGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 5 4 251819 CASAVA_Build 11 98553087 1D TATTCCAAGC T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 94 het 43 0 37 6 T 7 6 251820 CASAVA_Build 11 98560915 4D TCCAGATGAT AAAG/---- AAACTTGAAC 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 AAAG 1 0 251821 CASAVA_Build 11 98561229 1D TAACTAAAGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 83 het 32 0 28 5 T 8 7 251822 CASAVA_Build 11 98563826 4D TTATACATTT AAGA/---- AAGTCTTAAT 3070 het 3070 ref 27 12 13 4 AAGA 1 0 251823 CASAVA_Build 11 98581099 5I TGACAAACTC -----/AAATT AATAAGCAAA 1797 het 1797 ref 27 13 6 8 AAATT 0 1 251824 CASAVA_Build 11 98581126 1I ACAAAAAAAA -/T CTCCAAGAAA 794 het 794 ref 26 12 4 10 T 0 1 251825 CASAVA_Build 11 98585426 4I ATCTTGCATG ----/AACT AACAGAGAAA 3070 hom 139 het 51 0 43 8 AACT 0 1 251826 CASAVA_Build 11 98589425 2D ATATACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1592 hom 15 5 8 2 AT 7 6 251827 CASAVA_Build 11 98593219 1D GATCTGTCTT A/- AGACATTTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 2 1 251828 CASAVA_Build 11 98596898 1D TCTGGAATTG C/- CCCACTTGTC 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 C 4 3 251829 CASAVA_Build 11 98610993 1D TACCCTTTTT C/- TTTTTTTGGA 3070 het 751 hom 17 2 13 2 C 1 0 251830 CASAVA_Build 11 98622238 3D4M6D ATTACACTAC CCACACATTATTT/---CACA------ CATCTGATTA 3070 het 3070 ref 41 24 20 2 N/A 0 0 251831 CASAVA_Build 11 98626467 1I TAGCAATATT -/A AAAAATCTAA 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 A 5 6 251832 CASAVA_Build 11 98628898 1D CTTAAATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 12 11 251833 CASAVA_Build 11 98638542 1D TCTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 11 10 251834 CASAVA_Build 11 98641160 1D AGAAAAAATG T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 T 7 6 251835 CASAVA_Build 11 98643981 10D TTCTTATTTA GTTAAGGTAT/---------- GTGGCAGTCC 3070 het 3070 ref 32 17 15 4 GTTAAGGTAT 1 0 251836 CASAVA_Build 11 98656907 1D CTTGCAGATT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 24 10 10 7 A 8 7 251837 CASAVA_Build 11 98668195 1I TTACAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 10 11 251838 CASAVA_Build 11 98669062 1I TGGTTAAGAC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 7 8 251839 CASAVA_Build 11 98673414 8D GCAGATGACA TGCTGTAG/-------- TGCCAAACCC 3070 het 3070 ref 43 28 12 4 TGCTGTAG 1 0 251840 CASAVA_Build 11 98677250 1D GACTGAACTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 23 10 2 A 9 8 251841 CASAVA_Build 11 98686880 1D TTATTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 14 7 T 11 10 251842 CASAVA_Build 11 98701239 1I AGCAAAGTTG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 A 7 8 251843 CASAVA_Build 11 98704849 1D CAGGAAAAAG A/- AAAAAAAACC 2252 het 2252 ref 18 12 6 1 A 9 8 251844 CASAVA_Build 11 98708250 5D TCTCAGTCTC ATCTT/----- ATATGAAATA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 ATCTT 1 0 251845 CASAVA_Build 11 98710088 4D ATCTCAGACT CTCA/---- CTCACAAATA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 CTCA 2 1 251846 CASAVA_Build 11 98710779 3I TTCTTTTTTC ---/TTT TTAATTGTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 5 251847 CASAVA_Build 11 98713811 1D ATAAAAGTTT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 7 6 251848 CASAVA_Build 11 98715142 1I ACATTAAAAT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 7 8 251849 CASAVA_Build 11 98715730 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 21 3 18 0 A 14 13 251850 CASAVA_Build 11 98728192 1D TCACAGCATT A/- AAAAGGCAGT 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 A 5 4 251851 CASAVA_Build 11 98732130 1D GCCTTAACCA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 C 9 8 251852 CASAVA_Build 11 98732883 2D AGTGAAAAAC AT/-- GTGTATATAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 AT 1 0 251853 CASAVA_Build 11 98734338 1I GAAACCCTGT -/A CTCTACTACA 2279 het 2279 ref 14 9 5 0 A 0 1 251854 CASAVA_Build 11 98737731 10D TCTTTAAAGA TCATCCGTGT/---------- CATGGCATGC 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 TCATCCGTGT 1 0 251855 CASAVA_Build 11 98738847 1I TGCCACACTG -/T TTTTTATTAC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 5 6 251856 CASAVA_Build 11 98744171 9D ATAATTGTAA AAATTTAAT/--------- TTTTATTAGG 3070 het 3070 hom 32 12 20 0 AAATTTAAT 1 0 251857 CASAVA_Build 11 98753720 3D ATGTACAGAT TAG/--- TTCCTCACTT 1414 het 1414 ref 64 34 6 25 TAG 1 0 251858 CASAVA_Build 11 98757102 1D AAGCCTAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 648 hom 40 2 33 5 A 10 9 251859 CASAVA_Build 11 98761120 1I TCTCTTAGCA -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 hom 28 12 9 7 T 6 7 251860 CASAVA_Build 11 98762844 1I CCATTTAAAC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 A 7 8 251861 CASAVA_Build 11 98766073 1I AAAATAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3061 hom 24 8 12 4 T 10 11 251862 CASAVA_Build 11 98772125 1I TCATGGAATG -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 7 8 251863 CASAVA_Build 11 98775096 1I GCATTTGTGG -/A AATAAAAAAA 3070 het 804 hom 31 2 25 4 A 2 3 251864 CASAVA_Build 11 98775549 1D GGCAAAGGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 9 251865 CASAVA_Build 11 98777801 1D ATGGCACTAC T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 120 het 49 0 41 9 T 8 7 251866 CASAVA_Build 11 98779081 1D CCAAGTAGCT G/- GGACTACAGG 3070 hom 11 het 11 0 8 3 G 3 2 251867 CASAVA_Build 11 98780230 1D AGATCAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 33 0 29 4 T 11 10 251868 CASAVA_Build 11 98780443 1I TTGCTTTTTA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 7 8 251869 CASAVA_Build 11 98783387 1I CAAAGTCCTT -/C CCACTCTTCT 3070 hom 94 het 37 0 30 7 C 2 3 251870 CASAVA_Build 11 98785798 8D AGAAAAAGGA TGTGATAT/-------- TGGGAAAGGA 3070 het 3070 ref 35 21 15 4 TGTGATAT 1 0 251871 CASAVA_Build 11 98791005 2I GCTAAAACAC --/AA ACTCTTTGGA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 1 3 251872 CASAVA_Build 11 98791257 1D GTGACTGGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 A 10 9 251873 CASAVA_Build 11 98805154 3I CTTAAAGTTT ---/CTG TTTTTCTGAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 CTG 0 1 251874 CASAVA_Build 11 98806296 2D GTGTAAAATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1007 hom 23 3 14 6 AT 7 6 251875 CASAVA_Build 11 98806328 6D GCATGTGTGT ATATAC/------ ATATACATAT 3070 het 406 hom 22 1 8 14 ATATAC 3 2 251876 CASAVA_Build 11 98806940 1D TTCCTGGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 21 4 9 8 T 15 14 251877 CASAVA_Build 11 98813951 4D TGTTTCTGTC AGTT/---- AGTTAGTATA 3070 hom 60 het 28 0 21 8 AGTT 2 1 251878 CASAVA_Build 11 98839720 1I TACAAATTAA -/T TTAAATTCTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 3 251879 CASAVA_Build 11 98844596 1D AGTTTTCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 33 0 21 13 T 12 11 251880 CASAVA_Build 11 98846756 1I CACAAATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 9 10 251881 CASAVA_Build 11 98847091 1I TAATGTTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 33 1 27 5 A 11 12 251882 CASAVA_Build 11 98847578 1I ACTTCATGTG -/T TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 52 39 4 9 T 10 11 251883 CASAVA_Build 11 98852023 1I TCTCTTTTTT -/C CCCCCAAAGA 3070 hom 103 het 42 0 35 7 C 5 6 251884 CASAVA_Build 11 98855208 1I CCCTTCACAC -/T TTTTTTTTTT 2911 het 2911 ref 31 21 7 3 T 10 11 251885 CASAVA_Build 11 98855962 1D TTGGCTAAAA G/- TAGAGATACA 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 G 1 0 251886 CASAVA_Build 11 98861185 1D AAAATTGTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 10 9 251887 CASAVA_Build 11 98864303 1D TAGTAGAGAC G/- GGGTTTCACC 3055 het 1502 hom 17 5 9 4 G 4 3 251888 CASAVA_Build 11 98864872 2D AAAAGCAAAC AG/-- AAAGTATTAG 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 AG 1 0 251889 CASAVA_Build 11 98873341 1I TGTTAAGAAG -/A AAAAATGCTC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 5 6 251890 CASAVA_Build 11 98876071 12D TGATAATGAA AAAAACAGAGGC/------------ AAAACACACT 3070 het 3070 ref 30 18 11 4 AAAAACAGAGGC 1 0 251891 CASAVA_Build 11 98882549 1D AAAAGTGTGT G/- TTTTTTCTCT 3070 het 38 hom 30 2 15 13 G 1 0 251892 CASAVA_Build 11 98889675 1I ATGCTCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 10 11 251893 CASAVA_Build 11 98891891 1D TAATTTTATG A/- AAAAAAAAAA 2237 het 2237 ref 44 31 5 8 A 12 11 251894 CASAVA_Build 11 98892078 1I GCTAATTGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 9 25 9 A 8 9 251895 CASAVA_Build 11 98901090 1I AAAGGGAGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 9 10 251896 CASAVA_Build 11 98901939 5I ACATTAATGT -----/TTTAA TTTATCACTT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 TTTAA 0 1 251897 CASAVA_Build 11 98902902 1D TGAACAAACA G/- GTTGTGCATT 3070 het 3070 hom 50 14 26 11 G 2 1 251898 CASAVA_Build 11 98904884 10D TGCATGCCCA TAATACCAGC/---------- TAATACCAGC 2000 het 2000 ref 18 7 7 4 TAATACCAGC 2 1 251899 CASAVA_Build 11 98905020 4D GAGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 AAAC 4 3 251900 CASAVA_Build 11 98906412 1I TAGTCTAGGC -/A AATGTACAAG 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 A 2 3 251901 CASAVA_Build 11 98910451 4D AATTTGGGCA TAGT/---- TAGAATAATT 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 TAGT 1 0 251902 CASAVA_Build 11 98912204 1D TAAGAAAATC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 8 7 251903 CASAVA_Build 11 98920336 8I CATTTAAACT --------/CATGTAAA CATGTAAATT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 CATGTAAA 1 2 251904 CASAVA_Build 11 98921952 1I AGTAGGAAAT -/G GAAAAAGTCA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 G 1 2 251905 CASAVA_Build 11 98925034 1D TGTCAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 12 11 251906 CASAVA_Build 11 98934140 1I GTTGGGTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 8 9 251907 CASAVA_Build 11 98948710 1I GGTTTTTTTT -/A AAAAAATAGA 3070 hom 82 het 31 0 28 3 A 6 7 251908 CASAVA_Build 11 98949113 1I CCAAGGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 11 12 251909 CASAVA_Build 11 98958671 1I ATTTGTCTAA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 7 8 251910 CASAVA_Build 11 98960882 1I32M5D ACAAGATCTG -TTGCCAATGGCAACATTCAAGCTTTTGTGTAAAAACT/TTTGCCAATGGCAACATTCAAGCTTTTGTGTAA----- AAAATTTTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 11 N/A 0 0 251911 CASAVA_Build 11 98963702 4D GTTCTCTCTT AAAC/---- AAAATAAATG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 AAAC 1 0 251912 CASAVA_Build 11 98971298 1D ATTATATATT A/- AAAAATAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 6 5 251913 CASAVA_Build 11 98973456 1D TTTAAGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 256 hom 39 1 34 4 A 11 10 251914 CASAVA_Build 11 98976180 1I ACAAATGAAG -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 55 29 21 5 A 7 8 251915 CASAVA_Build 11 98976704 1D TTCTCCTTTC T/- TTTTTTCACC 3070 hom 122 het 49 0 41 8 T 7 6 251916 CASAVA_Build 11 98984042 1D AGAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 15 14 251917 CASAVA_Build 11 98985173 1D ATGTCTCTTT G/- TATTTGATAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 5 G 1 0 251918 CASAVA_Build 11 98991021 7D TATATAAAAA TATATAT/------- TATATAGATA 2558 het 1281 hom 10 3 7 0 TATATAT 1 0 251919 CASAVA_Build 11 98991699 1I ACACATCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 458 hom 41 3 34 4 T 12 13 251920 CASAVA_Build 11 99001718 2D AATTAAAAAG AT/-- ATTGATTGAG 3070 hom 72 het 30 0 25 6 AT 2 1 251921 CASAVA_Build 11 99001865 6D ATATATATAT ACACAC/------ ACACACACAC 1547 hom 26 het 27 0 13 19 AC 10 7 251922 CASAVA_Build 11 99003404 1I TTAATGTGAG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 6 7 251923 CASAVA_Build 11 99004642 4I AGCTCATAAA ----/TAAT TCTTATAGGT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TAAT 0 1 251924 CASAVA_Build 11 99005564 2I54M3D GATTTTTCTC --ATCATCAAAAAATTAACAATTGATGTACATATAATTTTAAAAAACCTTAATTCTTAC/AAATCATCAAAAAATTAGCAATTGATGTACATATAATTTTAAAAAACCTTAATTCT--- TACTCGATGT 3070 hom 111 het 34 0 38 12 N/A 0 0 251925 CASAVA_Build 11 99006182 8D TGTGTGTGTG TATATACA/-------- TATATATATA 3070 hom 69 het 24 0 24 2 TATATACA 1 0 251926 CASAVA_Build 11 99006533 1D TTCTCAAGAC A/- AAAATCTTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 5 4 251927 CASAVA_Build 11 99007586 1I TTTCAAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 26 1 23 2 T 10 11 251928 CASAVA_Build 11 99007659 4I ACACACAAAG ----/ACAC ACACACACAT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AC 4 6 251929 CASAVA_Build 11 99011432 1I CAGAAGTAAT -/A AAAACAAATT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 4 5 251930 CASAVA_Build 11 99012324 2D TTTTTTTTTT TC/-- TTTTTTTTTG 3070 het 288 hom 39 4 18 17 TC 1 0 251931 CASAVA_Build 11 99012735 1D GTGGGGGGAT G/- GACGAGATCA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 2 1 251932 CASAVA_Build 11 99014020 4D TGAAACTGAG AAAC/---- AAACAAAGGT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AAAC 2 1 251933 CASAVA_Build 11 99017351 3D TTGGTTCCAA TCC/--- TCCTCCCGGC 3070 hom 132 het 50 0 45 7 TCC 3 2 251934 CASAVA_Build 11 99019171 4I AAGTCTTGAA ----/TATG TATGTGTGTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TATG 1 2 251935 CASAVA_Build 11 99019799 5I TAATTTTAAT -----/TAAAA TAAAAATGTA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 TAAAA 1 2 251936 CASAVA_Build 11 99019963 1D CCTTAAAATA T/- TTTGAATTAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 4 3 251937 CASAVA_Build 11 99020105 2I AAAAAGACTG --/TC TCTCTAGCGT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TC 2 3 251938 CASAVA_Build 11 99021724 1I GAACATTGCA -/C CACTTGGGCC 3070 hom 48 het 17 0 16 2 C 1 2 251939 CASAVA_Build 11 99022985 4D ATTAACCCCA TTTG/---- TTTGTTTCTG 3070 het 3070 ref 39 21 18 0 TTTG 2 1 251940 CASAVA_Build 11 99025126 4D GTGAATTTAA AAAT/---- AAATAATATT 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 AAAT 2 1 251941 CASAVA_Build 11 99025686 1D AAACATTAAG T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 6 251942 CASAVA_Build 11 99027170 4D CAGAAATCCC ACAA/---- ACAATCATCA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 ACAA 2 1 251943 CASAVA_Build 11 99030836 1D GTTGCAGCAG A/- AAAAAAGGTT 3070 hom 92 het 36 0 31 5 A 7 6 251944 CASAVA_Build 11 99032467 4I TGGAAAATGG ----/AAGA AAGAAAGATA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 AAGA 2 3 251945 CASAVA_Build 11 99032887 1D AGACATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 27 1 23 4 A 11 10 251946 CASAVA_Build 11 99033009 1D AAAAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 37 0 33 4 A 12 11 251947 CASAVA_Build 11 99039060 4D ATAGTCTGAT AGAA/---- AGCTGCAATG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AGAA 1 0 251948 CASAVA_Build 11 99041893 1D TTGTTAACTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 9 8 251949 CASAVA_Build 11 99043249 1I TAATAAATTT -/C TGTAAATAGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 0 1 251950 CASAVA_Build 11 99043896 1D AAAGCAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 10 9 251951 CASAVA_Build 11 99047090 4I GTAGATTGAG ----/TTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 25 0 20 5 TTTC 0 1 251952 CASAVA_Build 11 99049706 1D GTCCCTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 36 1 27 9 A 12 11 251953 CASAVA_Build 11 99057280 1I CTACTAAGAA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 7 8 251954 CASAVA_Build 11 99063113 2D TTTTGTACAC TG/-- TTATTTAGTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 TG 1 0 251955 CASAVA_Build 11 99074223 5I AAAATAAAGA -----/TAACT TAAGAATATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TAACT 0 1 251956 CASAVA_Build 11 99074856 1D ACAAAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 637 hom 32 2 15 15 A 15 14 251957 CASAVA_Build 11 99079124 4D TTTAATTTCC TGAG/---- TGTTTTTTAT 3070 hom 68 het 31 0 23 10 TGAG 1 0 251958 CASAVA_Build 11 99082782 1I GTGTCTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 14 15 251959 CASAVA_Build 11 99090795 2I GCTCATGTGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 31 1 19 12 A 12 14 251960 CASAVA_Build 11 99091967 1I CATCTAATTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 9 251961 CASAVA_Build 11 99110648 1I ATTACACTGA -/T TTTTTTTTTT 1989 het 1989 ref 37 10 8 19 T 14 15 251962 CASAVA_Build 11 99118305 4I CATCAGATTG ----/TACT TACTTAACAC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 TACT 1 2 251963 CASAVA_Build 11 99121465 1I GCAGCCTTGT -/G AAATAGCTTT 3070 hom 105 het 42 0 34 8 G 0 1 251964 CASAVA_Build 11 99121670 1I CCTGAAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 11 12 251965 CASAVA_Build 11 99128004 1I GAACTGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 11 12 251966 CASAVA_Build 11 99129929 1D GCACCCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1925 hom 25 6 11 8 A 12 11 251967 CASAVA_Build 11 99139078 3D CTGTATCAAC AAT/--- GTTTTCTCTG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 AAT 1 0 251968 CASAVA_Build 11 99140308 1I CAGCCACATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 9 10 251969 CASAVA_Build 11 99143569 2D TTTTTAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 33 2 16 15 A 13 11 251970 CASAVA_Build 11 99148013 1D TTCTGAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1814 hom 32 7 18 8 T 13 12 251971 CASAVA_Build 11 99150436 1D TAGGAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2642 hom 27 8 12 9 A 13 12 251972 CASAVA_Build 11 99151299 1I TTTCCTGGGG -/A ATAAATGGTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 1 2 251973 CASAVA_Build 11 99151738 4D ATATACGATC TTGA/---- TTGATTATCA 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 TTGA 2 1 251974 CASAVA_Build 11 99152127 1I TATGGGGTTA -/C AATTCAGTAG 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 C 0 1 251975 CASAVA_Build 11 99154795 4D62M4D AATTTTTCTC TATTTGTGTTAAATTTATAAAAGAATATGGTAAATTAATTTCATAGCATTTTATTACATCATTCTCAAAT/----TGTGTTAAATTTATAAAAGAATATGGTAAATTAATTTCATAGCATTTTATTACATCATTCTC---- AATTCTATAT 3070 het 3070 hom 34 23 28 5 N/A 0 0 251976 CASAVA_Build 11 99163032 1D AAACTACATG T/- TTTTTTTTTG 2803 hom 27 het 11 0 10 2 T 10 9 251977 CASAVA_Build 11 99163455 1D GTAGTTTTTA C/- CCAGAAAAAA 3070 het 394 hom 24 2 18 4 C 3 2 251978 CASAVA_Build 11 99167054 1D TTGTTGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 210 hom 29 3 12 16 T 11 10 251979 CASAVA_Build 11 99169347 1I TTTATTAATC -/T TTCTGTATGG 2548 het 2548 ref 20 12 6 2 T 2 3 251980 CASAVA_Build 11 99170795 1I TCCACTTACC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 T 7 8 251981 CASAVA_Build 11 99171530 1I CCTTTAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 13 14 251982 CASAVA_Build 11 99176010 1I ATTGTTTCTG -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 7 8 251983 CASAVA_Build 11 99177577 2I ACTCTTTTTT --/TA AAATTTATGT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 TA 0 1 251984 CASAVA_Build 11 99182832 1D CAATTAGTTC T/- TGCAAGATAA 3070 hom 105 het 41 0 37 4 T 2 1 251985 CASAVA_Build 11 99183632 1D CAATATAATA T/- TAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 2 1 251986 CASAVA_Build 11 99184295 1I TTGAGGCTAC -/A AAAAATCACA 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 A 5 6 251987 CASAVA_Build 11 99190985 1I GGGGAAACTG -/C CCCCCCTGAC 3070 het 2795 hom 25 8 12 5 C 6 7 251988 CASAVA_Build 11 99203955 2D ACTCATCACA AG/-- AGAGTTATTG 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 AG 3 2 251989 CASAVA_Build 11 99216134 1D CGCAAAATCA T/- TTAGTTAAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 3 2 251990 CASAVA_Build 11 99217743 3D ATATATATAT GTG/--- GTGTGTGTGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 GTG 2 1 251991 CASAVA_Build 11 99217834 5D ATACATATAT ATATA/----- TTTTTTTTTT 2431 het 735 hom 9 3 5 2 ATATA 1 0 251992 CASAVA_Build 11 99226999 1I TAACAGATTT -/G AGCAGCTGCT 3070 hom 51 het 19 0 17 4 G 0 1 251993 CASAVA_Build 11 99227088 1D AAATTCTCCC A/- TAAATAAATA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 A 1 0 251994 CASAVA_Build 11 99229353 1I ATATATATAT -/A TTTTTTGAGA 2529 het 2529 ref 13 6 6 1 A 0 1 251995 CASAVA_Build 11 99232568 1I AGACTAAATA -/G TTTGAGAACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 251996 CASAVA_Build 11 99234559 1I CTTTAGAAAG -/T ATTCTGTGGC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 0 1 251997 CASAVA_Build 11 99234870 1I TTTACCTTCA -/T TTTGAACTTC 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 3 4 251998 CASAVA_Build 11 99238307 3I TTATAACAGA ---/TGT TGTTTTTTTT 3070 hom 133 het 49 0 44 5 TGT 1 2 251999 CASAVA_Build 11 99246755 1I ATCTCATATA -/C CTTTGGAAGA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 C 1 2 252000 CASAVA_Build 11 99249042 1I CTGCCACCCA -/G GGCAGGAGCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 2 3 252001 CASAVA_Build 11 99253554 1D TCTTTAGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 40 0 32 9 A 10 9 252002 CASAVA_Build 11 99264937 1I AGGGTTCAGT -/G TATTTAATTT 3070 het 3070 hom 52 19 28 5 G 0 1 252003 CASAVA_Build 11 99270458 1D TACCAGCAGC A/- AAAAAAAAAA 1455 het 1334 hom 25 6 6 13 A 14 13 252004 CASAVA_Build 11 99283646 1I ATATGACACA -/T TTTTCTCAAC 3070 het 3070 hom 24 8 10 6 T 4 5 252005 CASAVA_Build 11 99295201 1D CAACTTGTGT G/- GCGCTGTAGT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 2 1 252006 CASAVA_Build 11 99300467 1I ATTTTTGTCA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 8 9 252007 CASAVA_Build 11 99322749 4I AAATCCCCTA ----/TTAT TTAGTACTAG 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 TTAT 0 1 252008 CASAVA_Build 11 99322979 20I AGTATGTTTT --------------------/TCATCATAAATATGATATAA ACATTATAAA 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 TCATCATAAATATGATATAA 0 1 252009 CASAVA_Build 11 99323175 1I GAACTCAACT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 8 9 252010 CASAVA_Build 11 99329588 1D TGATCATGCC A/- AGGGCAAAGG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 2 1 252011 CASAVA_Build 11 99330301 1D CCATACTGTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 A 9 8 252012 CASAVA_Build 11 99335870 1D TATTTGTCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 T 10 9 252013 CASAVA_Build 11 99336302 2I ACTTTTATGT --/TC TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 TC 0 1 252014 CASAVA_Build 11 99337923 6D TATAGATAGA TATAGT/------ TATATATACA 3070 het 3070 ref 34 18 13 6 TATAGT 1 0 252015 CASAVA_Build 11 99338057 5D AACATAAAAT TACTC/----- TAAGGAAGAC 3070 het 3070 ref 30 19 11 0 TACTC 1 0 252016 CASAVA_Build 11 99348286 1I GTTTCTGGGG -/A CAGTCCTAGA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 0 1 252017 CASAVA_Build 11 99348524 4D AACCACACCC AGCT/---- AGCAGACTAT 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 AGCT 1 0 252018 CASAVA_Build 11 99348922 2D TACTTGCGAC AT/-- GTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 AT 1 0 252019 CASAVA_Build 11 99359075 2D ATGCAATGAG AC/-- ATGTACTAAG 3070 het 3070 ref 58 30 22 7 AC 1 0 252020 CASAVA_Build 11 99359328 1I GAGGTATCAG -/T TAAGTATAGG 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 1 2 252021 CASAVA_Build 11 99363473 4I ATGAATATAT ----/ATAC ATATATATAT 3070 het 122 hom 27 2 9 16 ATAC 0 1 252022 CASAVA_Build 11 99365461 2I ATAGACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 AC 5 6 252023 CASAVA_Build 11 99367290 1D GTCCCTGTAG T/- TCCAGCTACT 3070 het 1998 hom 15 5 10 0 T 2 1 252024 CASAVA_Build 11 99370110 1I CAATGGCAAC -/A AAAAGAATGT 2389 het 2389 ref 24 16 6 2 A 4 5 252025 CASAVA_Build 11 99370256 3D AGCCTAAAAT GTC/--- GTACAACCTT 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 GTC 1 0 252026 CASAVA_Build 11 99378792 1I TGTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 T 9 10 252027 CASAVA_Build 11 99382709 1D TGTTCTTAAT G/- GTATATAGAA 3070 het 3070 ref 27 17 8 5 G 2 1 252028 CASAVA_Build 11 99386571 1I AGAAATGTGG -/T TTTTCAGAAC 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 4 5 252029 CASAVA_Build 11 99406158 1D CTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 11 10 252030 CASAVA_Build 11 99420113 2D ACATATCATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 27 0 20 8 TA 7 6 252031 CASAVA_Build 11 99420436 1I TGCTAACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 10 11 252032 CASAVA_Build 11 99423202 1D TCTTTGAACA C/- CATGGTTCAC 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 C 2 1 252033 CASAVA_Build 11 99423785 1I TTTTATAAAG -/A AAAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 6 7 252034 CASAVA_Build 11 99424249 1D ATCCTCAGAT C/- CCCCAGGTTC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 C 5 4 252035 CASAVA_Build 11 99430896 3I TGCCCAACAA ---/AAG AAGAGTAGAG 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 AAG 1 2 252036 CASAVA_Build 11 99433633 1D CCCGAGGTCA C/- CATAGCATCT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 C 2 1 252037 CASAVA_Build 11 99439177 1D CCAGAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 A 11 10 252038 CASAVA_Build 11 99443774 1D AATGGTATCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 17 7 A 10 9 252039 CASAVA_Build 11 99459349 1I TCACTTATCA -/C TCAGGGGATG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 C 0 1 252040 CASAVA_Build 11 99463983 1I AGGCAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 2812 het 2812 ref 32 16 7 9 A 11 12 252041 CASAVA_Build 11 99467174 1I AGTACTGTTG -/C CCCAGAGTGT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 C 3 4 252042 CASAVA_Build 11 99475248 1I CATTTCAGGC -/A AAACTGGGGT 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 A 3 4 252043 CASAVA_Build 11 99478539 1I TGCCAAATGT -/A AAAAAGTGGT 3070 hom 49 het 25 0 17 8 A 5 6 252044 CASAVA_Build 11 99482430 1D GAGGGAATGA G/- GGAGGAGGGA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 G 3 2 252045 CASAVA_Build 11 99486211 4I CTAGAAATCT ----/AATA AATAATGCCA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 AATA 1 2 252046 CASAVA_Build 11 99493676 1I TTGCAGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 20 20 13 T 11 12 252047 CASAVA_Build 11 99493974 1D CTCGCAGTTG T/- TTTTTTTTTC 1539 het 1539 ref 44 33 5 6 T 10 9 252048 CASAVA_Build 11 99496039 1I TAATATCTCC -/T TTTATGCCTG 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 T 3 4 252049 CASAVA_Build 11 99502480 4D ATTGTCCTTC TCTG/---- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 22 8 TCTG 1 0 252050 CASAVA_Build 11 99512203 1I GCTATTTCAA -/T TCTTCTGTTC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 T 1 2 252051 CASAVA_Build 11 99512726 1D4M1D GGTTTCCACA TTGTTA/-TGTT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 19 8 11 1 N/A 0 0 252052 CASAVA_Build 11 99514192 1I GGCACTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 11 12 252053 CASAVA_Build 11 99518701 1I AATGATGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 10 11 252054 CASAVA_Build 11 99523670 4I AGAAAATGAC ----/TGAG TAATAGGATT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TGAG 0 1 252055 CASAVA_Build 11 99524664 4D AGATATATCT AACA/---- AACAAACACG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 AACA 3 2 252056 CASAVA_Build 11 99524781 4I ATTTATTTGA ----/TTGT TTGTTTGGTA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 TTGT 1 2 252057 CASAVA_Build 11 99525173 5I TTTTCATATG -----/AAAGT AAAGTACAAA 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 AAAGT 1 2 252058 CASAVA_Build 11 99530288 4D TATCCAGTCT ATCA/---- ATCATTGATG 3070 het 3070 ref 33 19 13 3 ATCA 2 1 252059 CASAVA_Build 11 99541400 3I GAAAAGTGAC ---/TAA TAATGTATCA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 TAA 1 2 252060 CASAVA_Build 11 99546837 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 10 11 252061 CASAVA_Build 11 99557235 1D AAACTGATTG A/- AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 A 7 6 252062 CASAVA_Build 11 99566670 3D GTTTTTATGC TGT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 TGT 1 0 252063 CASAVA_Build 11 99567038 2I AGTAAAACAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 9 11 252064 CASAVA_Build 11 99572275 3D CAATATTTTG TAT/--- TATTTTGTAG 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TAT 2 1 252065 CASAVA_Build 11 99574358 2D GTCTGTCTAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 55 20 21 14 AC 9 8 252066 CASAVA_Build 11 99577573 5D TCCTGTTTTC CTTTA/----- CTTGTCTTTC 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 CTTTA 1 0 252067 CASAVA_Build 11 99581634 11I AACAAAAAAT -----------/ACAAATATAAA ACAGTACAGT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 ACAAATATAAA 0 1 252068 CASAVA_Build 11 99598944 1I TTCCCCATTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 A 7 8 252069 CASAVA_Build 11 99623743 1I TATTGAAATA -/T TTTTTTCATG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 6 7 252070 CASAVA_Build 11 99647533 1I GTTCACCTTC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 7 8 252071 CASAVA_Build 11 99651039 1I TTAAACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 888 hom 56 3 44 9 A 10 11 252072 CASAVA_Build 11 99673531 1I GTTGGGAGTT -/C TTTTTCTCCT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 C 0 1 252073 CASAVA_Build 11 99679508 7D CTTGTGATGC GCTTTAT/------- CCTTTATCCT 3070 het 51 hom 27 3 23 4 GCTTTAT 1 0 252074 CASAVA_Build 11 99683459 1D TGTGTATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 A 12 11 252075 CASAVA_Build 11 99686646 2I AAGGTAAAGA --/GT GAGAGAGTCT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 GT 0 1 252076 CASAVA_Build 11 99704131 1D TGTCGCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 39 1 33 5 A 11 10 252077 CASAVA_Build 11 99710925 1D CTTGATAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 16 1 11 4 A 16 15 252078 CASAVA_Build 11 99711106 1I AAATGGCTCC -/A AAAAAAAATT 2989 het 2229 hom 22 7 9 6 A 8 9 252079 CASAVA_Build 11 99711710 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2676 het 2676 ref 26 13 7 6 A 11 12 252080 CASAVA_Build 11 99719373 1I GTGGGATGAT -/C CCCCACTGAG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 C 4 5 252081 CASAVA_Build 11 99723669 1I CCATTGTCTT -/A ACTGACTCCT 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 A 1 2 252082 CASAVA_Build 11 99724141 1D TCAATAACTA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 7 6 252083 CASAVA_Build 11 99725550 1I TTTTGTTTTC -/T TTTGCTATGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 3 4 252084 CASAVA_Build 11 99731549 2D CGTGAGTAAC AT/-- ATTGCATTAC 3070 het 3070 hom 41 15 19 8 AT 2 1 252085 CASAVA_Build 11 99740147 2D CAATATTGGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TA 6 5 252086 CASAVA_Build 11 99805655 1D GTTTGATTTG A/- AAAAAAAAAA 1563 het 1563 ref 52 41 4 7 A 12 11 252087 CASAVA_Build 11 99847893 1I TTCTATCCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 9 10 252088 CASAVA_Build 11 99880826 1D CACCTAAAAC G/- AGTGAACTTT 3070 het 3070 hom 42 13 18 12 G 1 0 252089 CASAVA_Build 11 99881664 1D ACTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 17 13 5 A 13 12 252090 CASAVA_Build 11 99892791 4D CAACAATGGA AAAC/---- AGACAACAAT 3070 het 3070 hom 56 24 26 7 AAAC 1 0 252091 CASAVA_Build 11 99909543 2D ATGCAATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1719 hom 22 8 9 5 A 16 14 252092 CASAVA_Build 11 99919005 13D CTCCAGAGTG CAGTGTGAACGTT/------------- CAGTGCCTTA 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 CAGTGTGAACGTT 1 0 252093 CASAVA_Build 11 99920441 3I TGACAATTTT ---/CTC CTCCTTGTTG 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 CTC 1 2 252094 CASAVA_Build 11 99924106 3D AAACTTAACC TTT/--- TTTTTTTTTT 2045 het 484 hom 14 5 6 3 T 28 25 252095 CASAVA_Build 11 99925359 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 36 3 14 19 A 11 12 252096 CASAVA_Build 11 99934262 3D AACTGGGAAT AAG/--- AAGTTCTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 AAG 2 1 252097 CASAVA_Build 11 99935045 1D ATTCATTGAG C/- CCAAGAGGCA 3070 hom 60 het 22 0 20 3 C 3 2 252098 CASAVA_Build 11 99966335 1I TAGCTTTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 9 10 252099 CASAVA_Build 11 99967125 3D TTAGATCTTC TTG/--- TTGAATTGAA 2694 het 2694 ref 32 20 8 4 TTG 2 1 252100 CASAVA_Build 11 99968228 1D GATCTAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 13 30 8 A 12 11 252101 CASAVA_Build 11 99989323 1D ACTCTTTCTC A/- ACAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 2 1 252102 CASAVA_Build 11 99990126 1I TATGTAAAAA -/T AAAAATTAGT 3070 het 3070 hom 24 12 10 2 T 0 1 252103 CASAVA_Build 11 99992013 1D GAGAAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2280 hom 39 11 18 10 A 15 14 252104 CASAVA_Build 11 99995773 1D AGTAAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 11 10 252105 CASAVA_Build 11 99996299 1I TGCCCAGGCT -/G GAGTGCAGTG 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 1 2 252106 CASAVA_Build 11 100002500 6I CCCGGCAGAC ------/ATACTT ATAAATAAAA 3070 hom 56 het 27 0 20 7 ATACTT 0 1 252107 CASAVA_Build 11 100017060 2I ATCATTATCC --/TA TTTGATAAGG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 TA 0 1 252108 CASAVA_Build 11 100017124 1I GTGAGAGAAA -/T GACAAGTATA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 0 1 252109 CASAVA_Build 11 100027585 3D ATGAAATTGA AAC/--- AACAACAATA 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 AAC 3 2 252110 CASAVA_Build 11 100038574 4I ACTTACATTC ----/CTAT GATAAAGTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 CTAT 0 1 252111 CASAVA_Build 11 100044355 1I ATTTATTGTC -/A AAACATGAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 3 4 252112 CASAVA_Build 11 100046565 2D ACACCCCCCC CA/-- CACACACACC 3070 hom 66 het 27 0 21 6 CA 5 4 252113 CASAVA_Build 11 100054440 1D CTTGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1728 het 1728 ref 34 25 4 5 T 13 12 252114 CASAVA_Build 11 100067243 1D TGCTTATTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 9 8 252115 CASAVA_Build 11 100080813 1D AGCTACCCAA G/- GAGGCTGAGG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 2 1 252116 CASAVA_Build 11 100127298 2D CTCAGCTCAC TG/-- TGCAGCCTCC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 TG 2 1 252117 CASAVA_Build 11 100141309 3D GTGTGGCAAT GTG/--- GTGAACTGGG 3070 het 3070 hom 48 18 23 9 GTG 2 1 252118 CASAVA_Build 11 100144257 2I AATGACTAAG --/AA GAGACATCGA 3070 het 3070 hom 48 19 27 2 A 0 2 252119 CASAVA_Build 11 100147007 1I ATTATCTTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 8 9 252120 CASAVA_Build 11 100150673 1I AGGTGGTGTT -/A ATTCTATCAG 3070 het 3070 hom 57 24 29 4 A 1 2 252121 CASAVA_Build 11 100163063 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2554 hom 18 het 7 0 7 5 A 7 6 252122 CASAVA_Build 11 100163922 1D GAGATGCCCC T/- AACCCTATGC 3070 hom 111 het 45 0 37 8 T 1 0 252123 CASAVA_Build 11 100168694 8D TGGAATTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 31 2 26 6 T 18 10 252124 CASAVA_Build 11 100178583 5I CCTGTTGGCG -----/AGGCT AGTCTCAAAC 3070 hom 45 het 17 0 14 3 AGGCT 0 1 252125 CASAVA_Build 11 100179155 1I AATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 828 hom 26 4 18 4 A 13 14 252126 CASAVA_Build 11 100182538 1I ACCTGAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 83 het 35 0 28 7 A 8 9 252127 CASAVA_Build 11 100184010 1I TAAAGGACAG -/A AAAAATAAAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 5 6 252128 CASAVA_Build 11 100212672 1D TGTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2811 het 2711 hom 32 11 10 11 T 14 13 252129 CASAVA_Build 11 100225162 7D GTATTGACAT ATCACTC/------- ATTCTTCACA 3070 het 3070 ref 49 31 17 5 ATCACTC 1 0 252130 CASAVA_Build 11 100238365 3D GGAAATCTTT TTC/--- TTATTTGGAG 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 TTC 1 0 252131 CASAVA_Build 11 100238979 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 346 het 258 hom 19 2 4 13 A 16 15 252132 CASAVA_Build 11 100239001 6D AAAACACAAA ACACAC/------ ACACACACAC 1951 hom 26 het 18 0 9 10 AC 11 8 252133 CASAVA_Build 11 100244302 1D TTTGATCATC T/- TTTTTAACAA 3070 het 3070 hom 52 24 25 4 T 6 5 252134 CASAVA_Build 11 100245347 1D ATCTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 14 13 T 13 12 252135 CASAVA_Build 11 100252357 1D GAAGGTCAGG T/- AAAAACACTT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 1 0 252136 CASAVA_Build 11 100253065 1D TCTCTTAAAG C/- CAAATTCTTG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 2 1 252137 CASAVA_Build 11 100256885 1I TGATAGGATT -/G TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 G 0 1 252138 CASAVA_Build 11 100281762 1D TACTAAAGAT A/- ACCAAAATTA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 2 1 252139 CASAVA_Build 11 100282523 1D TGGAAACTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 9 8 252140 CASAVA_Build 11 100294082 1D ACTCATTTTA T/- TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 T 7 6 252141 CASAVA_Build 11 100295075 1D ATGCTCAATT C/- CCCCCTGCAA 3070 het 3070 ref 48 21 15 12 C 6 5 252142 CASAVA_Build 11 100303553 1I TCTGCTGGGC -/T TTTATCAGCT 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 T 3 4 252143 CASAVA_Build 11 100311002 1I GGAATTGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 9 10 252144 CASAVA_Build 11 100316785 2D TTAAGAACTC AT/-- ATTCTAGTCA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 AT 2 1 252145 CASAVA_Build 11 100317555 10D TCTAAGACAC TCTACCCTAT/---------- ACCGCTGTCC 3070 het 3070 ref 55 27 27 5 TCTACCCTAT 1 0 252146 CASAVA_Build 11 100321277 1I TTGGAATCAA -/T TTCTTTCAAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 T 2 3 252147 CASAVA_Build 11 100324309 1D TTCTCTTAAC T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 7 6 252148 CASAVA_Build 11 100326098 1D TTAATTTTTA T/- TTCTTTGGTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 3 2 252149 CASAVA_Build 11 100329952 1I TCAAAGGAAC -/A AAATTACATT 3070 het 3070 ref 53 23 21 9 A 3 4 252150 CASAVA_Build 11 100331173 1D AGTTTACAGA G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 G 5 4 252151 CASAVA_Build 11 100331748 1I GTGTTTTTGA -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 6 7 252152 CASAVA_Build 11 100332123 3D TCAAAAGGGA CAT/--- CATATTCCAG 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 CAT 2 1 252153 CASAVA_Build 11 100332537 5D GGTGCTGAGA AATAT/----- AATCTTCTTG 3070 het 3070 ref 54 28 25 2 AATAT 1 0 252154 CASAVA_Build 11 100334052 1I18M3D CTAGGGTTAC -TTTTTTTTGTCTCAGTTTTTG/ATTTTTTTTGTCTCAGTTT--- TTGTTGTCCT 3070 het 3070 hom 35 20 22 0 N/A 0 0 252155 CASAVA_Build 11 100334860 1I CCTTTCTTGA -/T TTTTTATCAT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 5 6 252156 CASAVA_Build 11 100335030 2I TCACTACCAC --/AT GTGATGAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 AT 0 1 252157 CASAVA_Build 11 100344885 1D TTGTTTTTTT G/- TGTGTGTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 21 5 G 1 0 252158 CASAVA_Build 11 100353040 1D GAGTGGGTAC A/- GTCCACTTCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 1 0 252159 CASAVA_Build 11 100356722 1D AGGTTGGCCA G/- GCTGGTCTTG 1382 het 1382 ref 9 4 3 2 G 2 1 252160 CASAVA_Build 11 100360283 1I CTCTAATTTA -/T TTTTTAAGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 5 6 252161 CASAVA_Build 11 100362790 1D ACTTCACTTG A/- AAAAAAAAAA 1380 het 1380 ref 55 44 4 8 A 11 10 252162 CASAVA_Build 11 100374797 4D AAGAGGATAC AAAG/---- AAAGAAGTGT 3070 het 3070 ref 25 12 10 7 AAAG 2 1 252163 CASAVA_Build 11 100378422 1D AAGTGCGGGT G/- GGGTTGCCTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 4 3 252164 CASAVA_Build 11 100381559 1I TTTAGAATGG -/A AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 44 27 15 2 A 6 7 252165 CASAVA_Build 11 100388252 1D GCCGCTTGTC T/- TTTTCCTCAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 5 4 252166 CASAVA_Build 11 100391546 3D AATTCTTATT AAG/--- AAGATTAGGA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 AAG 2 1 252167 CASAVA_Build 11 100396891 7I GTGGTGTGAA -------/GCTATTT GCTTATTATT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 GCTATTT 0 1 252168 CASAVA_Build 11 100414791 2I TATGGATAAG --/AT ATAGTTTACT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AT 1 2 252169 CASAVA_Build 11 100415501 1D ATTACTCAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 9 8 252170 CASAVA_Build 11 100422055 4D TTTATTTATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 21 het 14 0 8 6 TTTA 5 4 252171 CASAVA_Build 11 100429302 7D AGAAAAATTG CTACTCT/------- CTTCTTAGAA 3070 het 3070 ref 35 21 14 5 CTACTCT 1 0 252172 CASAVA_Build 11 100432185 3I AAAAAAAAAA ---/AAC ACACTTTTCC 3070 het 30 hom 33 1 31 1 AAC 0 1 252173 CASAVA_Build 11 100438809 5I GCATCAATCG -----/AATGA AATGAAATAG 3070 hom 89 het 34 0 30 4 AATGA 1 2 252174 CASAVA_Build 11 100441219 4I ATTAAAGTAG ----/TTGT TTGTTTTGAC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TTGT 1 2 252175 CASAVA_Build 11 100448023 1I CAAAGAGAAA -/G GTCGGGTTAC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 1 2 252176 CASAVA_Build 11 100455363 1D GCTCAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3022 hom 33 8 18 7 A 11 10 252177 CASAVA_Build 11 100457370 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2555 hom 27 9 9 11 A 13 12 252178 CASAVA_Build 11 100461309 1D AGGCAGAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 77 het 29 0 26 3 A 9 8 252179 CASAVA_Build 11 100462260 1D TTTACCACAT G/- AGAAGAATTA 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 G 1 0 252180 CASAVA_Build 11 100463969 1D TTATCGTTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 10 9 252181 CASAVA_Build 11 100466141 4I TCTGTCTCAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 2387 hom 14 7 7 0 AAAT 3 4 252182 CASAVA_Build 11 100472940 1D TACATGGCAT A/- ATGATAAATA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 A 2 1 252183 CASAVA_Build 11 100475735 1D TAATCACCCA C/- CAAACACAGA 3070 het 3070 ref 50 33 13 4 C 2 1 252184 CASAVA_Build 11 100483827 2D AAAAAGAAAG AA/-- AAAGGTAGAA 3070 het 263 hom 25 5 11 9 A 5 3 252185 CASAVA_Build 11 100489051 1D CCTTCACAAC A/- AAATCAAATA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 4 3 252186 CASAVA_Build 11 100501218 2I AAAATCTGAA --/AC ACACTATGCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AC 2 3 252187 CASAVA_Build 11 100508402 1I TAGTTTGGGG -/A AAAAAAACCA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 7 8 252188 CASAVA_Build 11 100510679 1I GCTTTTTTTT -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 6 7 252189 CASAVA_Build 11 100516214 1D GGCAGATCAG C/- CCCCAAGGGC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 C 5 4 252190 CASAVA_Build 11 100522864 16I TAAATATTGT ----------------/GTTTTAAAAAATTGGG GTTTTAAAAA 3070 het 2903 hom 24 8 13 3 GTTTTAAAAAATTGGG 0 1 252191 CASAVA_Build 11 100531517 1D TTCATCTTTC T/- TTTTTTTTTG 1309 het 1309 ref 31 20 3 8 T 10 9 252192 CASAVA_Build 11 100536128 2I GAGGTCTTAC --/AA AAAATCTTTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 6 252193 CASAVA_Build 11 100548999 1I TTTTTTTTCC -/T CTTAAAATAA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 T 0 1 252194 CASAVA_Build 11 100549674 1I AATCTATGGT -/G GGGACACTGA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 G 3 4 252195 CASAVA_Build 11 100551084 1D AAAATAGTAG T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 6 5 252196 CASAVA_Build 11 100551219 1D TTAGACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 30 1 20 9 T 13 12 252197 CASAVA_Build 11 100557490 1I ACCAGCATCA -/C TGTAGACTCT 3070 hom 153 het 56 0 51 5 C 0 1 252198 CASAVA_Build 11 100560167 3I CACAAAAGGT ---/AGA AGAAGTAATT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 AGA 1 2 252199 CASAVA_Build 11 100560394 2D GTTCTGTGAC AG/-- AGTTTTCACT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AG 2 1 252200 CASAVA_Build 11 100563609 1I100M1I CTCACATCTT -AATTTACTTAGTTACTTACAGTCCTTTCATTTTAAGAGAGTTGCATGTCACACTTTGTATATTAAGTAAAATTTATATAAACATACACATGAAACAGGTA-/AAATTTACTTAGTTACTTACAGTCCTTTCATTTTAAGAGAGTTGCATGTCACACTTTGTATATTAAGTAAAATTTATATAAACGTACACATGAAACAGGTAT TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 32 21 36 9 N/A 0 0 252201 CASAVA_Build 11 100597731 1I TTTTCTATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 24 10 4 T 8 9 252202 CASAVA_Build 11 100605792 1D AGGCCAAGGC G/- GGCAGGTCAT 3070 het 2867 hom 20 8 11 2 G 3 2 252203 CASAVA_Build 11 100609532 1I TCATTTGCCA -/G GGAAGGATTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 2 3 252204 CASAVA_Build 11 100611491 1D CACTGGTCCC T/- TGGGGGGAAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 2 1 252205 CASAVA_Build 11 100622780 1I AAATTAACTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 634 hom 20 6 8 6 T 8 9 252206 CASAVA_Build 11 100624807 1I CATTTGGCTA -/T CCCTTTCACC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 0 1 252207 CASAVA_Build 11 100632518 7D AATGTTGCCA GGAGAAG/------- GGAGAAGGGA 3070 het 3070 ref 26 15 8 5 GGAGAAG 2 1 252208 CASAVA_Build 11 100646559 1I ATGAGTTCTG -/T TTTTGACATG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 4 5 252209 CASAVA_Build 11 100667240 1D AGCTAACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 29 1 24 7 T 12 11 252210 CASAVA_Build 11 100687297 1I CCACTTTATG -/T TTTTGTTTGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 4 5 252211 CASAVA_Build 11 100692986 1I GATAAATACA -/C CCATTCCAAA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 C 2 3 252212 CASAVA_Build 11 100695640 1D ATTTCTTCTC T/- GCGTTATCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 1 0 252213 CASAVA_Build 11 100698053 1D GGCAAGGGCT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 17 12 11 A 9 8 252214 CASAVA_Build 11 100698558 1D AAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 255 hom 5 het 10 0 2 8 A 10 9 252215 CASAVA_Build 11 100701004 1I AAAGAGACTA -/T TTTTTTTTTT 1075 het 1075 ref 60 43 3 14 T 11 12 252216 CASAVA_Build 11 100711526 4I CTCCCGTCTT ----/TCTC TCTCTCTTCC 3070 hom 93 het 43 0 26 17 TC 3 5 252217 CASAVA_Build 11 100716537 5D CCACCACTAT GCCTG/----- GCCTGGCTAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 GCCTG 2 1 252218 CASAVA_Build 11 100718225 1D TCCAAGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 11 10 252219 CASAVA_Build 11 100719071 2D ATATAATAAT TC/-- TTTTTTCTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TC 1 0 252220 CASAVA_Build 11 100723629 1D CATTCCCTCA T/- TTTTTAATTT 3070 hom 79 het 36 0 27 9 T 6 5 252221 CASAVA_Build 11 100725390 1D GCTATGATGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 9 8 252222 CASAVA_Build 11 100726442 3I CGAGGAAAAC ---/CTT CTTGACACAA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 CTT 1 2 252223 CASAVA_Build 11 100726943 1D CATCTGACAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 8 7 252224 CASAVA_Build 11 100728997 1D GAATACTTAT G/- TACAACAATC 3070 hom 126 het 49 0 43 8 G 1 0 252225 CASAVA_Build 11 100751232 1D GATGGGGTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 7 6 252226 CASAVA_Build 11 100766799 1I TCTTGATTTT -/A AAAATCTAGA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 4 5 252227 CASAVA_Build 11 100769394 1D TGGATTATGT A/- AAAACAGAAT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 5 4 252228 CASAVA_Build 11 100789486 1I CCTCTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 36 1 29 6 A 10 11 252229 CASAVA_Build 11 100790924 1D TTTAGTTGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 10 9 252230 CASAVA_Build 11 100797362 4I GTTCTGCAAA ----/TGTC TGGTAGGTCC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TGTC 0 1 252231 CASAVA_Build 11 100798625 1D CTTCTCTTGA C/- TTTTTTTGTC 3070 hom 81 het 32 0 28 5 C 1 0 252232 CASAVA_Build 11 100802473 1I TAGAGGTAAA -/G CTTTTAGCTT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 G 0 1 252233 CASAVA_Build 11 100811964 3D CATGTAAACA TCT/--- TCTTTGCTTG 3070 het 3070 ref 54 32 20 3 TCT 2 1 252234 CASAVA_Build 11 100814822 1D CAAACATATG A/- AAAAAAGCTC 3070 het 3070 ref 29 19 7 7 A 7 6 252235 CASAVA_Build 11 100815314 1I TATCCTTAGC -/A AACTAATGCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 3 252236 CASAVA_Build 11 100815570 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 11 10 252237 CASAVA_Build 11 100825752 2I GTGTTTTTTC --/AA AGATTCTCAA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 1 3 252238 CASAVA_Build 11 100828186 4I AGCCACAAAC ----/TAAA TAGGGCAAGT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 TAAA 0 1 252239 CASAVA_Build 11 100829067 3D CAAGAGTGAT AAG/--- AAGTCAACTA 3070 hom 144 het 52 0 48 4 AAG 2 1 252240 CASAVA_Build 11 100830773 1D CAATACTTTA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 117 het 46 0 39 8 T 8 7 252241 CASAVA_Build 11 100838143 1I TACCATGCTG -/T TTTGGTTACT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 3 4 252242 CASAVA_Build 11 100842917 1I GGTGGGGGAG -/A AAATTCCCCA 3070 hom 113 het 41 0 37 4 A 3 4 252243 CASAVA_Build 11 100846744 10D AATCAAGTTG CCCCGCCCCC/---------- CCCCCCTCCC 3070 hom 61 het 25 0 20 6 CCCCGCCCCC 1 0 252244 CASAVA_Build 11 100851619 1D CTTCTACTTC T/- TTGAGTTTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 3 2 252245 CASAVA_Build 11 100854416 14I TTTTCAAAGC --------------/TTCCCCTCCTCTTG TTCCTCCCAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTCCCCTCCTCTTG 0 1 252246 CASAVA_Build 11 100855774 4D AATATTCCTG TGTT/---- TGTTAGGTTG 3070 hom 57 het 26 0 20 7 TGTT 2 1 252247 CASAVA_Build 11 100861220 1D AGTATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 11 10 252248 CASAVA_Build 11 100861531 1I TTTTTTTTTT -/A AATTCTCAAT 3070 het 130 hom 30 1 25 4 A 2 3 252249 CASAVA_Build 11 100862026 5D TGGTGTTTTC TTGTT/----- TTGTTTTGTT 3070 hom 105 het 42 0 35 8 TTGTT 5 4 252250 CASAVA_Build 11 100863578 1I GTAAAAAGGG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 8 252251 CASAVA_Build 11 100865323 5D ATAAAAAGAT TAATC/----- TAAATTTTAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAATC 1 0 252252 CASAVA_Build 11 100865578 3D ATTTTCAATA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 12 9 252253 CASAVA_Build 11 100867375 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 14 2 A 13 12 252254 CASAVA_Build 11 100868523 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 10 9 252255 CASAVA_Build 11 100872021 2D GTGGCAGCAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 38 het 37 1 25 12 GA 10 9 252256 CASAVA_Build 11 100874862 9I CCTGAAGGGC ---------/TTCCTGTAT TTCCCTGAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTCCTGTAT 0 1 252257 CASAVA_Build 11 100876595 2D CTAAAATTTC AT/-- ATATATGTGT 3070 hom 81 het 33 0 28 7 AT 4 3 252258 CASAVA_Build 11 100878905 5I TCTCTCAGCA -----/CAGAG TATAGAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CAGAG 0 1 252259 CASAVA_Build 11 100885025 1D AAGACCCATG A/- AAAAAAGGCA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 7 6 252260 CASAVA_Build 11 100889524 1I CATATGCACC -/A AAAAAAATGG 3070 het 357 hom 43 1 37 5 A 7 8 252261 CASAVA_Build 11 100890220 1I GGTATGGCAG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 140 het 54 0 46 8 A 7 8 252262 CASAVA_Build 11 100891544 1D TTTGTCACAG T/- TTTTAGGAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 5 4 252263 CASAVA_Build 11 100895260 3I ATATATACAC ---/CTA CTATGTACCC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CTA 1 2 252264 CASAVA_Build 11 100911336 2D ATCTTATTAT TA/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 7 TA 1 0 252265 CASAVA_Build 11 100916858 1D AAACCTGCAA G/- GAACTATAAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 G 2 1 252266 CASAVA_Build 11 100917470 1I GCCCGGGTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 58 het 25 0 19 6 T 6 7 252267 CASAVA_Build 11 100921147 4D AAAATATTTG AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 108 het 44 0 37 8 AAAT 3 2 252268 CASAVA_Build 11 100933571 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAACC 1445 het 286 hom 24 4 5 15 A 9 8 252269 CASAVA_Build 11 100936240 1I GCTTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 45 1 36 8 A 11 12 252270 CASAVA_Build 11 100937047 4I TCAGATTGAG ----/TTTC TTTGACATTC 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TTTC 0 1 252271 CASAVA_Build 11 100961752 1I TTCCTCTGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 36 2 26 8 G 0 1 252272 CASAVA_Build 11 100962752 2D AATTACATTG TT/-- TTATATATAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 2 252273 CASAVA_Build 11 101011663 1I CAACATAACC -/A AAAAAAAAAA 2478 het 2478 ref 28 16 7 5 A 10 11 252274 CASAVA_Build 11 101089022 1I AACAAACATG -/A AAAAAAAAAT 1281 het 1281 ref 44 32 3 9 A 9 10 252275 CASAVA_Build 11 101101374 2I GAAAAACTTT --/TA AAACCTATTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TA 0 1 252276 CASAVA_Build 11 101235257 1I TCTCAAGGTG -/T TTTTTTTTTT 1342 het 1342 ref 42 19 7 16 T 14 15 252277 CASAVA_Build 11 101364720 2I TATGTATATG --/TA TATATATATA 1496 het 1496 ref 15 7 5 3 TA 8 9 252278 CASAVA_Build 11 101389424 1D GTGGTGGAAA G/- GCCTCAGTAG 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 G 2 1 252279 CASAVA_Build 11 101420232 1I AAAAATGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 38 1 27 10 T 14 15 252280 CASAVA_Build 11 101430496 2I ACATGGCAAA --/AC CCTGTCTCTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AC 0 1 252281 CASAVA_Build 11 101451175 5D GTATTTCCCA ATGGC/----- ATAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 33 21 12 3 ATGGC 1 0 252282 CASAVA_Build 11 101470695 1I TCTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1856 hom 48 9 22 17 T 15 16 252283 CASAVA_Build 11 101477046 1D3M1D6M1D13M1D ATGACAAAGC AAGCAAGTCACAAGAATGTTAAAACA/-AGC-AGTCAC-AGAATGTTAAAAC- TATAAACATG 3070 hom 39 het 16 0 14 3 N/A 0 0 252284 CASAVA_Build 11 101478037 1D GAACCCCCCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 242 hom 30 1 23 6 A 10 9 252285 CASAVA_Build 11 101491496 1I GTTCGTACAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 9 10 252286 CASAVA_Build 11 101491541 1I TCTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 29 0 18 11 T 9 10 252287 CASAVA_Build 11 101497380 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 36 1 28 7 A 14 15 252288 CASAVA_Build 11 101501299 2D TTTCTCATTC TT/-- TTTTTTTTCT 2599 hom 29 het 17 0 11 6 T 10 8 252289 CASAVA_Build 11 101504907 1I CCTCCCTCTC -/T GCTTCCCTAT 3070 hom 93 het 36 0 27 9 T 0 1 252290 CASAVA_Build 11 101515170 1D CTCTTGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 27 9 A 13 12 252291 CASAVA_Build 11 101516133 3I CTGTCCCTGT ---/AAA AAAAAAAAAA 1188 hom 28 het 36 0 8 28 A 11 14 252292 CASAVA_Build 11 101524340 3D ATCTGAGAAA TGT/--- TGTGTGATAG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TGT 2 1 252293 CASAVA_Build 11 101536643 1D AACTGGAATT G/- GCAGTTGCCA 3070 hom 125 het 47 0 41 9 G 2 1 252294 CASAVA_Build 11 101538929 1D TTTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 824 hom 23 2 16 5 T 12 11 252295 CASAVA_Build 11 101548135 1I ACTTCTTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 9 10 252296 CASAVA_Build 11 101563311 1D TTTGGGTGTT A/- AAAAAAGTAA 3070 hom 128 het 50 0 43 7 A 7 6 252297 CASAVA_Build 11 101564594 1D AACAGGCTGT A/- CAGTTCTGTA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 1 0 252298 CASAVA_Build 11 101575365 1D AATTGTTGGC T/- TTTTTCGTAT 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 T 6 5 252299 CASAVA_Build 11 101580171 1I AGAAAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 1186 het 1186 ref 41 23 4 14 A 15 16 252300 CASAVA_Build 11 101581097 1I CAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 27 1 19 7 T 13 14 252301 CASAVA_Build 11 101601124 1D TTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1361 het 1361 ref 28 19 4 5 A 11 10 252302 CASAVA_Build 11 101609397 1D TATTTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 1366 het 1366 ref 34 23 3 8 T 13 12 252303 CASAVA_Build 11 101630639 1I GATTTGAAGC -/T TTTTTCAACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 5 6 252304 CASAVA_Build 11 101631855 1I GTCTGATGCC -/T TTTTTTTTTC 2771 hom 54 het 26 0 18 8 T 9 10 252305 CASAVA_Build 11 101633728 1D CTTTTTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 11 10 252306 CASAVA_Build 11 101636223 1I CTCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 678 hom 28 3 18 7 A 15 16 252307 CASAVA_Build 11 101653874 1D CCTCAAAAAC A/- AAAACAAAAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 5 4 252308 CASAVA_Build 11 101653951 1I TAAGGGACCC -/G GCAGTCATTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 1 2 252309 CASAVA_Build 11 101654030 1I CCAAGGGAAA -/G GGCCTTACAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 2 3 252310 CASAVA_Build 11 101655008 1I CAAAGAAGAT -/C CATTAAAGCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 2 252311 CASAVA_Build 11 101655409 1I TTTCCAATTT -/A AAAAAAGCTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 6 7 252312 CASAVA_Build 11 101663117 1I GGGGAGAACA -/G GGTGGCTCCC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 2 3 252313 CASAVA_Build 11 101663184 1D CTGCTTTTAC T/- TGTGATTAGA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 2 1 252314 CASAVA_Build 11 101691519 1D CTCTGTTCCA G/- GGCTGGAGTG 3070 hom 62 het 26 0 20 6 G 3 2 252315 CASAVA_Build 11 101692792 1I53M1I CAAACCAAAC -AAAAGTATTTCCATACAGAAAATTTACCAAGCCATTTCAATCTTTAAAATGGT-/AAAAAGTATTTCAATACAGAAAATTAACAAAGCAATTTCAATCTTTAAAATGGTA AAAATAAACT 3070 hom 4 het 24 1 14 22 N/A 0 0 252316 CASAVA_Build 11 101705883 1I AAAATAATTT -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 151 het 53 0 51 2 A 7 8 252317 CASAVA_Build 11 101714978 1D GCTGGGAGAC T/- TATTTCCTTG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 2 1 252318 CASAVA_Build 11 101715152 1I GCACCATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 738 hom 47 2 35 10 T 11 12 252319 CASAVA_Build 11 101715546 1D ATAGCTTCCA T/- TCCAACCTTT 3070 hom 144 het 54 0 48 7 T 2 1 252320 CASAVA_Build 11 101716897 3I TGGAATGTGA ---/GAG GAGATTTCTT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 GAG 1 2 252321 CASAVA_Build 11 101719100 1I ATAAAGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 11 12 252322 CASAVA_Build 11 101723020 2I CCGGGCATCC --/CT TGGCCTCCCA 3070 hom 64 het 26 0 16 10 CT 0 1 252323 CASAVA_Build 11 101736726 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1098 het 1098 ref 36 19 4 13 T 11 12 252324 CASAVA_Build 11 101759046 3I GAATTCATTA ---/CTT CTTAAAGTAT 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 CTT 1 2 252325 CASAVA_Build 11 101774608 1D CGGTCTATAA G/- GATCCAGATG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 G 2 1 252326 CASAVA_Build 11 101776844 7D CGTAAGACTC AAAAAAA/------- CAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 7 A 7 0 252327 CASAVA_Build 11 101794012 1I AGGGAAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 27 0 17 10 A 10 11 252328 CASAVA_Build 11 101825493 1I TCCCCCACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 9 10 252329 CASAVA_Build 11 101837709 1D AAAAGGGGGG A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 7 6 252330 CASAVA_Build 11 101838376 1D CTGAGTGATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 10 9 252331 CASAVA_Build 11 101848221 4D CATGTCAAAC TCTT/---- TCTTTATTGC 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 TCTT 2 1 252332 CASAVA_Build 11 101855218 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 864 hom 36 3 26 8 A 12 11 252333 CASAVA_Build 11 101868047 1D AGACAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 26 0 14 12 A 14 13 252334 CASAVA_Build 11 101875365 23I AAATAAAATT -----------------------/CAATCTTGTTTGAGCTCCTCTCC TGCTAGCTTT 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 CAATCTTGTTTGAGCTCCTCTCC 0 1 252335 CASAVA_Build 11 101896878 1D TGTCCCTGGG A/- CAAAGATTCT 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 A 1 0 252336 CASAVA_Build 11 101900708 2I TCTTCTGTGT --/GG GTAGCATTAT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 G 1 3 252337 CASAVA_Build 11 101902156 1D AAACCCACGT A/- AAAAAAAAAA 914 hom 7 het 5 0 3 2 A 12 11 252338 CASAVA_Build 11 101903644 1I AATGTTTGAC -/T CCCTAGGAAA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 0 1 252339 CASAVA_Build 11 101913766 1D CCCTGTTCTT A/- AAAAAAAAAA 1188 het 1188 ref 33 25 3 6 A 12 11 252340 CASAVA_Build 11 101940396 1D31M1D CAAATCATTC TTTTTTTTATTCTTATTTTTATTATTATTATTA/-TTTTTTTATTCTTATTTTTATTATTATTATT- TTTTTTTTGA 2680 het 1219 hom 15 3 6 7 N/A 0 0 252341 CASAVA_Build 11 101940897 1I CATGTATACA -/T TCTCCAAATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 2 252342 CASAVA_Build 11 101946673 1D AGCAGGGAAC A/- AAAAAGATAC 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 6 5 252343 CASAVA_Build 11 101949165 1I ATGTTGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 11 12 252344 CASAVA_Build 11 101949735 1I AACTGCATAG -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 7 8 252345 CASAVA_Build 11 101950393 17I CCCACCTCAG -----------------/TGGTCCCACCTCCCACC CCTTCCAAGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TGGTCCCACCTCCCACC 0 1 252346 CASAVA_Build 11 101954252 1D TCTCAGCTAA C/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 36 18 15 8 C 1 0 252347 CASAVA_Build 11 101955747 1I CTGTTAACTC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 9 252348 CASAVA_Build 11 101956366 1I GGCAGCAGAT -/C CCACCCACCA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 C 2 3 252349 CASAVA_Build 11 101957119 4D ACGCACACAC CACA/---- CACACACACA 3070 hom 23 het 51 1 35 17 CA 11 9 252350 CASAVA_Build 11 101970856 1I TTTCTTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 het 42 hom 30 3 21 6 C 0 1 252351 CASAVA_Build 11 101973936 1I TCGAACTCCC -/T GACCTCAGGT 2540 het 1347 hom 14 4 6 4 T 0 1 252352 CASAVA_Build 11 101973990 1I TTACAGGCGT -/G AGACACCATG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 0 1 252353 CASAVA_Build 11 101974954 2D TTCTTCTATC TT/-- TTTTTTTTTT 1761 het 167 hom 27 2 6 19 T 18 16 252354 CASAVA_Build 11 101978287 1I GATTAAAAAA -/T ATATATAGAA 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 T 0 1 252355 CASAVA_Build 11 101979962 2D AACAGAGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 12 10 252356 CASAVA_Build 11 101984627 4I AAGGAAAAAC ----/ACAA ATAAACCGAC 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 ACAA 0 1 252357 CASAVA_Build 11 101990745 1D CTACAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 9 A 11 10 252358 CASAVA_Build 11 101995515 2D ATTAAAAAAA AC/-- AAAATAAATG 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 AC 1 0 252359 CASAVA_Build 11 101996459 1I AAAATTGTAG -/A ATTTTTGGGT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 1 2 252360 CASAVA_Build 11 101997964 13D ACAAACAAAC AAACCCAGAATAA/------------- AATCCTGGAT 2857 het 2857 ref 20 15 6 8 AAACCCAGAATAA 1 0 252361 CASAVA_Build 11 102002967 4D TAAAAAAAAA GAAT/---- GAATGAATGT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 GAAT 3 2 252362 CASAVA_Build 11 102004705 1I GATTCTGAGT -/G GATCAGTCAC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 G 1 2 252363 CASAVA_Build 11 102005430 2I TATATATACA --/CG CACACATATA 2416 het 2416 ref 17 10 5 2 CG 0 1 252364 CASAVA_Build 11 102006234 1D TGTAATTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1770 hom 24 5 13 6 A 13 12 252365 CASAVA_Build 11 102020652 1I ATCACTTGAA -/C CCGGGAGGCA 2101 hom 12 het 6 0 5 1 C 2 3 252366 CASAVA_Build 11 102029806 1D TCAGTCACAT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 53 17 23 13 C 10 9 252367 CASAVA_Build 11 102060432 2D GGGAGGCCTC AG/-- GAAACTTACA 3070 het 3070 hom 28 11 14 5 AG 1 0 252368 CASAVA_Build 11 102077242 1I CATCGGACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 345 hom 41 1 35 5 A 9 10 252369 CASAVA_Build 11 102084774 3D TAAATAAGAA ATT/--- ATTAAATAAA 3070 het 471 hom 13 1 11 1 ATT 2 1 252370 CASAVA_Build 11 102094045 1D GAGACTCCAT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 C 10 9 252371 CASAVA_Build 11 102098137 1D TAACATTGCT G/- GTAGTCCTCT 3070 hom 132 het 48 0 44 5 G 2 1 252372 CASAVA_Build 11 102102282 1D ATGCTGTGAT G/- GGTGCTAGAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 3 2 252373 CASAVA_Build 11 102106679 1I AAGCCCAGTC -/A AGTGCCTCTA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 1 2 252374 CASAVA_Build 11 102117004 1I ATTATTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 12 13 252375 CASAVA_Build 11 102124105 1I ATATTCTGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 8 9 252376 CASAVA_Build 11 102128331 2I AGCTACACAG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 GT 7 8 252377 CASAVA_Build 11 102130617 3I TGATATATTT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 30 0 20 10 TTG 0 1 252378 CASAVA_Build 11 102138130 4I TGTTGTTTAT ----/TTGC TTGCTTGGTT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 TTGC 1 2 252379 CASAVA_Build 11 102138560 2D CTGTAATTTT TC/-- TCTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 47 17 25 8 TC 2 1 252380 CASAVA_Build 11 102144017 2D CCGGGTACAC AT/-- GTTACTTTTT 2313 het 2313 ref 32 13 8 12 AT 1 0 252381 CASAVA_Build 11 102147927 1I GATTCCTGCA -/T TGACAATGAA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 1 2 252382 CASAVA_Build 11 102156806 2D TTCACGTCTC TG/-- TATTTACTTA 3070 het 3070 ref 31 18 9 5 TG 1 0 252383 CASAVA_Build 11 102158297 16D GTTCTCATAT AGCCTGCAGAACCGTG/---------------- AACCAATTAA 3070 het 3070 hom 37 18 18 6 AGCCTGCAGAACCGTG 1 0 252384 CASAVA_Build 11 102181256 1I TTATATATAT -/A AAAAAATATA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 6 7 252385 CASAVA_Build 11 102210037 1I GCACCTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 64 het 29 0 25 4 A 9 10 252386 CASAVA_Build 11 102210258 2D TGTTGGAAAC AG/-- GGGTGGGAGG 2787 het 2787 ref 28 19 8 2 AG 1 0 252387 CASAVA_Build 11 102219045 1I ACGTTGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 A 10 11 252388 CASAVA_Build 11 102221158 1I TGATGGGGGG -/A AAAAACCATG 3070 hom 108 het 39 0 35 4 A 5 6 252389 CASAVA_Build 11 102230534 1D CAAACTGTTT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 26 14 12 2 A 8 7 252390 CASAVA_Build 11 102236639 1D ATTGATATAG A/- AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 A 7 6 252391 CASAVA_Build 11 102241058 2I TTGGAATTAG --/AT ATATTGTGTT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 AT 2 3 252392 CASAVA_Build 11 102242487 7D CCAATATTTC TTTCCAT/------- TGTCTTCACA 3070 het 3070 ref 59 34 24 3 TTTCCAT 1 0 252393 CASAVA_Build 11 102244004 1I GAGGAACAAG -/T TGGTGCCTAA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 T 1 2 252394 CASAVA_Build 11 102269596 1I GCAGAGTTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 8 9 252395 CASAVA_Build 11 102274035 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2717 het 2542 hom 26 10 7 9 T 13 14 252396 CASAVA_Build 11 102298755 1D TAAACTTGAT C/- CCCCCCCAAC 3070 het 3070 ref 44 23 14 9 C 8 7 252397 CASAVA_Build 11 102298922 1D TTAAAAAGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 8 252398 CASAVA_Build 11 102299319 1D TTTTAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 929 hom 29 8 12 9 A 12 11 252399 CASAVA_Build 11 102299372 1I CCTGGAGCCA -/G GGAATACTTC 3070 hom 45 het 26 0 16 10 G 2 3 252400 CASAVA_Build 11 102331962 1D CTTAGCAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 47 1 37 9 T 13 12 252401 CASAVA_Build 11 102332088 1D TTTACTACTG C/- CTGGTAAATT 3070 het 2271 hom 49 8 25 16 C 2 1 252402 CASAVA_Build 11 102332109 2D ATAAACTGCA TT/-- TTCTCTAGAA 3070 het 2039 hom 46 6 20 21 T 4 2 252403 CASAVA_Build 11 102334799 1D AGGCGCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 731 hom 26 3 20 4 A 15 14 252404 CASAVA_Build 11 102334896 3D GGAACAAAAC AAA/--- GAAGAGCTCA 3070 het 3070 hom 45 19 24 5 A 3 0 252405 CASAVA_Build 11 102339127 6D ATTAAGAACA TAAAGT/------ TAAATGATTC 3070 hom 154 het 54 0 51 4 TAAAGT 1 0 252406 CASAVA_Build 11 102349483 1I ATTTCAGTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 T 8 9 252407 CASAVA_Build 11 102352318 1D AGAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 149 het 35 hom 6 1 2 4 A 13 12 252408 CASAVA_Build 11 102363192 1D TACATAATAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2393 hom 22 7 13 2 T 9 8 252409 CASAVA_Build 11 102384221 1I AATTTTGAAA -/G GTAATCAGGA 3070 het 3070 ref 45 28 15 2 G 1 2 252410 CASAVA_Build 11 102386871 6D CTGAAGTGAT GATTGC/------ GATTGCAAAT 3070 het 3070 ref 50 25 21 5 GATTGC 2 1 252411 CASAVA_Build 11 102389130 4D GGTTTAATTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 1713 het 1015 hom 19 5 5 11 A 20 16 252412 CASAVA_Build 11 102401892 2I TGTATATATG --/TA TATATATACA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 TA 4 5 252413 CASAVA_Build 11 102429286 3D AGTGTGCATC ATT/--- GACATTACAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATT 1 0 252414 CASAVA_Build 11 102437537 1D CTCTTAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3039 het 3039 ref 37 16 8 13 A 17 16 252415 CASAVA_Build 11 102499767 1D CCTCCTGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 33 0 25 9 T 11 10 252416 CASAVA_Build 11 102506586 1D TGCATATTTT A/- AAAAATGTAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 6 5 252417 CASAVA_Build 11 102520822 1D ATGATAATTA G/- TTATTTTTTT 3070 het 177 hom 24 1 17 6 G 1 0 252418 CASAVA_Build 11 102526290 2D TATGATAGAC AA/-- GAGATGATGG 3070 hom 132 het 51 0 44 8 A 2 0 252419 CASAVA_Build 11 102530282 2D ACATACACAA GT/-- GTGTGTGTAC 3070 het 3070 hom 35 15 14 8 GT 5 4 252420 CASAVA_Build 11 102531251 1D TGACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 33 0 28 5 T 12 11 252421 CASAVA_Build 11 102538172 2I ATTCTCACTC --/TT TAGCTTCAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 3 252422 CASAVA_Build 11 102540165 1I TGGGTTAGGG -/A AAATGACAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 3 4 252423 CASAVA_Build 11 102561537 1D CATTAACAGC T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 8 7 252424 CASAVA_Build 11 102566983 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2255 het 14 hom 13 1 7 5 T 14 13 252425 CASAVA_Build 11 102570238 1I TATACCACTC -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 7 8 252426 CASAVA_Build 11 102587146 1I GTCGAGGATG -/T TTTTTTGGGT 3070 hom 151 het 61 0 51 10 T 6 7 252427 CASAVA_Build 11 102589567 1D TGTGTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 18 6 A 12 11 252428 CASAVA_Build 11 102591610 2I TTACTGTGTG --/TA TGTAAAATTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TA 0 1 252429 CASAVA_Build 11 102595307 1I AATCCCAGCA -/T TTTTGGGAGG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 4 5 252430 CASAVA_Build 11 102599522 2I AGACTAAAAT --/TC AACATGTTGG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TC 0 1 252431 CASAVA_Build 11 102600358 2I GCCCTTTCCC --/CT GAGTCTCCAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 CT 0 1 252432 CASAVA_Build 11 102601895 1I TTCCTAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 17 21 12 T 12 13 252433 CASAVA_Build 11 102602241 1I CAGTTCTCAT -/G GGGGAATGCA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 G 4 5 252434 CASAVA_Build 11 102604571 3D ATTGGTTGTG TTT/--- TTGTTTAGTG 3070 het 3070 ref 33 15 10 10 T 5 2 252435 CASAVA_Build 11 102607538 3I CATTTTTGAA ---/TAT TATTAGTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 TAT 1 2 252436 CASAVA_Build 11 102608839 1D GTGCTCTGTG T/- TTATCCAGTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 3 2 252437 CASAVA_Build 11 102609233 2D TAAATGCTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 43 0 34 10 T 13 11 252438 CASAVA_Build 11 102613493 1I ATTTACTTTT -/A AAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 A 4 5 252439 CASAVA_Build 11 102613678 1I ATTGCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 31 0 23 8 A 10 11 252440 CASAVA_Build 11 102617569 1D TATTGAATGC T/- AGCATAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 T 1 0 252441 CASAVA_Build 11 102628040 1D ATTAAAAACA T/- TTTTTTTTTT 2959 het 2959 ref 36 13 11 12 T 15 14 252442 CASAVA_Build 11 102646132 4D ATTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 133 het 88 hom 11 1 1 9 A 17 13 252443 CASAVA_Build 11 102655603 1I TTCTATGTGA -/T TTGGTGTCTT 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 T 2 3 252444 CASAVA_Build 11 102659963 1I ACTTTTAACA -/G GAACCCTGCA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 1 2 252445 CASAVA_Build 11 102667810 3D ATTATAGCTA CTT/--- CTTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 5 CTT 2 1 252446 CASAVA_Build 11 102676843 4D AGTCAGTAAG TAGT/---- TATTTTAAAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 TAGT 1 0 252447 CASAVA_Build 11 102681652 4D TTCCACAAAT AGTC/---- AGTAAATTTT 3070 het 3070 ref 43 26 14 5 AGTC 1 0 252448 CASAVA_Build 11 102697746 1I AAGTATAGCC -/A AAAGATTTCA 3070 hom 104 het 48 0 44 4 A 3 4 252449 CASAVA_Build 11 102699346 16I AAGCAGTGCT ----------------/TGCATACTAGTGTGTG TCTACACGTT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 TGCATACTAGTGTGTG 0 1 252450 CASAVA_Build 11 102699410 2D GAATATATAA AT/-- ATATATATAT 2041 het 2041 ref 18 5 6 7 AT 9 8 252451 CASAVA_Build 11 102701636 3I GTTCTTCCTT ---/AAA AAAATGCCTG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 4 7 252452 CASAVA_Build 11 102705636 1I TCTCCTTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 T 8 9 252453 CASAVA_Build 11 102706242 2D TCATTTGTGT TA/-- TGTTTGTACG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 TA 1 0 252454 CASAVA_Build 11 102708239 1D11M4D ACATAAGGAG AAAAAAACTGGGAAAA/-AAAAAACTGGG---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 N/A 0 0 252455 CASAVA_Build 11 102708449 1I AGACTGAAAT -/A ACTGACCCTA 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 A 1 2 252456 CASAVA_Build 11 102708941 1D51M4I ACTCCAACTC AAAAAAAAAAAAATCTTTCTTAAATAAAACAGAATTTATTGCCAGCAGACTT----/-AAAAAAAAAAAATCTTTCTTAAATAAAACAGAATTTATTGCCAGCAGACTTACTC TATAAGATTG 3070 het 35 hom 22 1 15 20 N/A 0 0 252457 CASAVA_Build 11 102710431 1I TGTAATGAAG -/T TTTTTTTTAA 2349 het 2349 ref 27 16 6 5 T 8 9 252458 CASAVA_Build 11 102716357 2I TCAATATTTT --/AC AGTTACGTCA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 AC 0 1 252459 CASAVA_Build 11 102726257 3D GTATTATAAA TTG/--- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 TTG 1 0 252460 CASAVA_Build 11 102730746 1D TTGTAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1663 hom 39 11 16 13 T 15 14 252461 CASAVA_Build 11 102732453 4D CTTTGCAGTC TTAT/---- TTGTTTTCTG 3070 het 3070 hom 32 12 18 4 TTAT 1 0 252462 CASAVA_Build 11 102737432 1D TAAGACAGGG A/- TAAGGAATTT 3070 het 3070 hom 29 9 18 3 A 1 0 252463 CASAVA_Build 11 102740265 1D CTTTTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 19 13 T 13 12 252464 CASAVA_Build 11 102740538 1D AATCTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 10 11 T 15 14 252465 CASAVA_Build 11 102742270 1D AGTCAAAGTT A/- AAGTCTTTGT 3070 het 3070 ref 49 28 19 2 A 3 2 252466 CASAVA_Build 11 102749331 12D CTTTTTTGAC TCTGATTTTGAG/------------ TCTTCTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 8 TCTGATTTTGAG 1 0 252467 CASAVA_Build 11 102753882 1I ACCATGTTGG -/C CCAGCTGGTC 3070 hom 84 het 30 0 26 4 C 2 3 252468 CASAVA_Build 11 102754066 1I AAACAGGGAT -/A AAAAAATTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 6 7 252469 CASAVA_Build 11 102754625 2I TAAAAGTGTT --/TC TCTTTGTGCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TC 1 2 252470 CASAVA_Build 11 102758063 1I TTTAATACCT -/G GTTGATGGTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 1 2 252471 CASAVA_Build 11 102759418 3I AAATCTTTAT ---/TTA TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TTA 0 1 252472 CASAVA_Build 11 102759603 1D TAGTAGGGAC G/- GGGTTTCACC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 4 3 252473 CASAVA_Build 11 102764650 1I TAGCATGAAG -/C GTTGTTGAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 0 1 252474 CASAVA_Build 11 102767848 1D TGCCCCTACT G/- GGGGGTGCCT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 6 5 252475 CASAVA_Build 11 102774680 1I TTGAAAGTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 8 9 252476 CASAVA_Build 11 102785764 4D CTCTGTGTAA AGTT/---- AGTTATTTCT 3070 het 3070 hom 36 14 17 7 AGTT 2 1 252477 CASAVA_Build 11 102788081 11D CAAAATAAAA GTTAAATTTTT/----------- GTTAAATTTT 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 GTTAAATTTTT 2 1 252478 CASAVA_Build 11 102789338 2D ATGTTAAATA AC/-- AGTTTACTAT 3070 het 3070 ref 33 20 13 0 AC 1 0 252479 CASAVA_Build 11 102795053 5I GCCCACAGCA -----/ACTCC ACAGGCTGGA 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 ACTCC 0 1 252480 CASAVA_Build 11 102798916 1I CTCTGCAGGA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 7 8 252481 CASAVA_Build 11 102799004 2I TTATGAAAAC --/AA GAGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 0 2 252482 CASAVA_Build 11 102799347 13D CCAAAAAAGT AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2228 hom 23 9 13 2 A 30 17 252483 CASAVA_Build 11 102800206 2I AGTAAAAACA --/AT TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 AT 0 1 252484 CASAVA_Build 11 102801158 1I ATTACAGGTG -/T GCGCCACCTG 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 0 1 252485 CASAVA_Build 11 102801672 24D AAGACTTGGC TCTCACTAGCCTTTGTGAGCTGGT/------------------------ TCAATCACAT 1855 het 1855 ref 17 14 4 2 TCTCACTAGCCTTTGTGAGCTGGT 1 0 252486 CASAVA_Build 11 102802055 1D TCTGTGCCTT A/- AAGACATGTT 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 A 3 2 252487 CASAVA_Build 11 102804248 4I CCTACCATGG ----/GTTC TCTATATCAT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 GTTC 0 1 252488 CASAVA_Build 11 102804989 3D ACTTGAGCCT AGG/--- AGTTCAAGAC 2474 het 969 hom 11 3 6 2 AGG 1 0 252489 CASAVA_Build 11 102805199 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1029 hom 19 3 15 1 A 10 9 252490 CASAVA_Build 11 102805399 1D CTGTACTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 11 10 252491 CASAVA_Build 11 102805913 3D CAAATGAAAG TTC/--- TTCTGACATT 3070 het 3070 hom 48 22 23 4 TTC 2 1 252492 CASAVA_Build 11 102806677 4D CTGTCTTTAC CTGA/---- CTATTATAGA 3070 het 3070 ref 54 26 21 10 CTGA 1 0 252493 CASAVA_Build 11 102808610 4I25M1D AAAAAAAATT ----GAGAAATGCTCATTAAAATGATGTAT/AAGAGAGAAATGCTCATTAAAATGATGTA- AACATAACTA 3070 het 3070 ref 45 29 23 4 N/A 0 0 252494 CASAVA_Build 11 102810363 1D TTTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2191 hom 29 9 14 6 T 15 14 252495 CASAVA_Build 11 102812487 1D TGTCTTCCTC T/- GCTTGTTGCA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 1 0 252496 CASAVA_Build 11 102813449 1I TTGTTAAAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 8 9 252497 CASAVA_Build 11 102814473 1I GCAGGTTGAG -/C CCCAGATCCA 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 C 3 4 252498 CASAVA_Build 11 102818908 1D TTATGAGCCC T/- TTTTTTTTTT 2603 het 2603 ref 30 11 11 9 T 13 12 252499 CASAVA_Build 11 102825612 3I CATTTTCATT ---/GTC ATTATTCTTA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 GTC 0 1 252500 CASAVA_Build 11 102833511 8I ACTTAAAAAA --------/TAATGAAC TAATGATATA 3070 het 2369 hom 19 6 9 4 TAATGAAC 0 1 252501 CASAVA_Build 11 102836255 9D TATAGCATCA TTTTTTAAT/--------- TTAGGAGTAT 3070 het 3070 ref 33 21 11 5 TTTTTTAAT 1 0 252502 CASAVA_Build 11 102837665 2D GTCTTCAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 12 10 252503 CASAVA_Build 11 102840954 5I TTCATACTAT -----/GTTCA GTTCAGTACT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GTTCA 1 2 252504 CASAVA_Build 11 102848317 1I AAAAAGAATT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 7 8 252505 CASAVA_Build 11 102854003 1I TTAAAAAGTT -/C CCCCTGAGCG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 C 4 5 252506 CASAVA_Build 11 102860140 1D ATTCAAGTGT G/- GCCATGTGAC 3070 het 3070 hom 36 9 22 6 G 2 1 252507 CASAVA_Build 11 102862578 3D TCTTTCAGCG CCC/--- CCCCCCCCCA 3070 het 833 hom 27 4 21 2 C 12 9 252508 CASAVA_Build 11 102874576 2D GCATACAAAA AC/-- ACAGCATTAT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 AC 2 1 252509 CASAVA_Build 11 102874835 1D TTTTAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 T 12 11 252510 CASAVA_Build 11 102879590 1I ATAGAGACAT -/A AAAAAACCCT 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 A 6 7 252511 CASAVA_Build 11 102886095 3I TTTATATTTA ---/CAT ACTTGGTATT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CAT 0 1 252512 CASAVA_Build 11 102887229 5I ATTTCAGTTC -----/TTTTA TTTTATTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TTTTA 1 2 252513 CASAVA_Build 11 102889462 1I GAATGAGAGT -/A AATATTTGCA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 2 3 252514 CASAVA_Build 11 102896643 1D ATCCAAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 11 10 252515 CASAVA_Build 11 102898256 1D TTATATTAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 10 9 252516 CASAVA_Build 11 102902832 3D ACATTAAAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 22 5 T 14 11 252517 CASAVA_Build 11 102909982 2I AAACTATATG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 11 252518 CASAVA_Build 11 102911546 1D TTTAAAAACC A/- AATTTGCATT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 3 2 252519 CASAVA_Build 11 102926076 2D ACTCCTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 40 1 28 11 T 14 12 252520 CASAVA_Build 11 102927740 1D ACTGGCCAAT A/- AAAGCAAATT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 4 3 252521 CASAVA_Build 11 102938784 1I ACCACAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 10 11 252522 CASAVA_Build 11 102943490 2D TGAAAATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 93 het 39 0 32 8 TA 6 5 252523 CASAVA_Build 11 102950201 1D TATCACCTTC A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 81 het 28 0 28 2 A 8 7 252524 CASAVA_Build 11 102954841 3D GTGCATGCAG TGA/--- TTACCAGTCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TGA 1 0 252525 CASAVA_Build 11 102960681 2I TAGTCTCTTT --/TA TATAGGCTGG 3070 het 3070 hom 44 13 19 12 TA 2 3 252526 CASAVA_Build 11 102962649 3D TGAAGATAAC AAT/--- AATAGCATTT 3070 het 3070 ref 50 30 18 5 AAT 2 1 252527 CASAVA_Build 11 102973775 1D CCAAATCTCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 9 8 252528 CASAVA_Build 11 102979505 1I TTCTCCTCTG -/T TATAGTAACT 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 T 1 2 252529 CASAVA_Build 11 102980065 1D TTCTCCTATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 10 9 252530 CASAVA_Build 11 102980120 8D AGAAGGAGGA CTGTAAGC/-------- CTGTGGAGGA 2679 het 2679 ref 23 7 9 15 CTGTAAGC 1 0 252531 CASAVA_Build 11 102984044 1D GAAATTTCAT G/- CCATCCTCAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 G 1 0 252532 CASAVA_Build 11 102987493 1I AGTGCTGTGG -/T TTTTCAGCTC 3070 het 3070 ref 56 28 21 7 T 4 5 252533 CASAVA_Build 11 102987564 9D GTCTAACCTT TTTTCAAGG/--------- TTTTCAAGGT 3070 het 3070 ref 39 19 12 12 TTTTCAAGG 3 2 252534 CASAVA_Build 11 102988697 1D AGATCAAATT A/- ATGAAATAAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 4 A 2 1 252535 CASAVA_Build 11 102989472 2I CAATTAAAAG --/AC ACAGACTGGC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AC 1 2 252536 CASAVA_Build 11 102992559 1I AATTTACGAG -/A AAAAAAAAAA 2203 het 459 hom 9 1 6 2 A 10 11 252537 CASAVA_Build 11 102994979 1I TGCAAAATTT -/G GGGAAAAAAA 2673 het 164 hom 25 3 9 13 G 3 4 252538 CASAVA_Build 11 102997083 3D AGTCACTGGA TCT/--- CAGCCTTACC 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 TCT 1 0 252539 CASAVA_Build 11 103007514 1D ATGCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 24 1 17 6 A 15 14 252540 CASAVA_Build 11 103007966 1I TCATCAACAT -/G GGGGCAAAGG 3070 hom 115 het 42 0 39 3 G 4 5 252541 CASAVA_Build 11 103008251 1I TACCGCCGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 694 hom 32 2 26 4 T 11 12 252542 CASAVA_Build 11 103010109 1D TCCTGAAAAT A/- ATTTACTGCC 3070 hom 138 het 48 0 47 1 A 2 1 252543 CASAVA_Build 11 103012474 1D TTCCCAGCAC T/- TTGGGAGGCT 3070 hom 77 het 28 0 25 3 T 3 2 252544 CASAVA_Build 11 103016683 1D TTTGAAAGTT C/- CATGCAACCA 3070 hom 132 het 53 0 45 8 C 2 1 252545 CASAVA_Build 11 103049703 1D TTTTTTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 295 hom 49 2 34 14 A 10 9 252546 CASAVA_Build 11 103066289 1I TTACTTGTGA -/T TTTCTTCTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 3 4 252547 CASAVA_Build 11 103067387 10D CTTGATGAAC TCACCCTTTA/---------- TCACCATATA 608 het 214 hom 39 2 5 34 TCACCCTTTA 1 0 252548 CASAVA_Build 11 103067848 1I AAAATTGTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 8 9 252549 CASAVA_Build 11 103077070 2I CACTGCAAAC --/TG TACAGTGCAA 3070 hom 159 het 56 0 53 3 TG 0 1 252550 CASAVA_Build 11 103077495 2D TTGGGTGAAG AA/-- TGAATGAATG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 2 0 252551 CASAVA_Build 11 103078273 1D TTTTGCTGTG A/- ACAACACATG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 2 1 252552 CASAVA_Build 11 103081976 1D GATAGTAGTA T/- TTTTTTAACA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 6 252553 CASAVA_Build 11 103083687 7D GAAGTTTTAG ATGACAC/------- ATATTGAAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 8 ATGACAC 1 0 252554 CASAVA_Build 11 103090240 1D TGTAATGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1164 hom 39 4 26 10 A 13 12 252555 CASAVA_Build 11 103092811 1D AAGCGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 134 het 55 0 45 11 A 10 9 252556 CASAVA_Build 11 103093382 1D CTTGAAAAAC A/- TATTTGAGGA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 0 252557 CASAVA_Build 11 103094594 6D TGCTCTTTTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 hom 87 het 32 0 29 4 TTG 6 4 252558 CASAVA_Build 11 103095731 1D GAACAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 11 10 252559 CASAVA_Build 11 103097563 3D ATGTTCTGCC CAA/--- CAACAGCTGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 CAA 2 1 252560 CASAVA_Build 11 103109026 2D AAGGGTGGCC AA/-- CTGCCCTGGT 3070 hom 132 het 46 0 45 4 A 2 0 252561 CASAVA_Build 11 103120297 1D CTTTTATGCC T/- GCGTAGTATT 3070 hom 102 het 35 0 34 2 T 1 0 252562 CASAVA_Build 11 103146293 2I CAAACTAGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 29 0 19 10 T 12 14 252563 CASAVA_Build 11 103152338 1I ACATATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 732 hom 31 2 25 4 T 12 13 252564 CASAVA_Build 11 103154956 2I AAATTTAAAA --/CT CTGAAAAATG 3070 hom 108 het 38 0 35 3 CT 1 2 252565 CASAVA_Build 11 103157985 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 21 1 12 8 T 15 14 252566 CASAVA_Build 11 103167883 1D GGAATAGTTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 7 252567 CASAVA_Build 11 103169940 3I GACTTTGAGA ---/TGT TGTTTCTCCA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TGT 1 2 252568 CASAVA_Build 11 103171122 1D GAAGAAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 39 1 35 3 A 12 11 252569 CASAVA_Build 11 103209262 1D TTTTATATCC A/- TCTAAACTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 1 0 252570 CASAVA_Build 11 103209914 1I AGTGGGAGAC -/T TTAACATCCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 3 252571 CASAVA_Build 11 103224105 1D CTATAGAGGA C/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 C 1 0 252572 CASAVA_Build 11 103243317 8D AGAAGCTGTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 hom 135 het 56 0 46 16 TTTG 5 3 252573 CASAVA_Build 11 103249068 6D TACATGTACT TGATAA/------ TGATAATATA 3070 hom 78 het 29 0 27 6 TGATAA 2 1 252574 CASAVA_Build 11 103252365 1D TTTGAGAAGC A/- GTGTTCTAGA 3070 hom 78 het 29 0 26 4 A 1 0 252575 CASAVA_Build 11 103273546 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 33 1 25 7 T 12 11 252576 CASAVA_Build 11 103273888 1D AAATTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 33 0 25 8 T 11 10 252577 CASAVA_Build 11 103275907 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 22 0 14 8 A 17 16 252578 CASAVA_Build 11 103293534 1D ACAGGCACTA T/- TTTTTTTTTT 2165 het 2165 ref 42 30 5 8 T 11 10 252579 CASAVA_Build 11 103342779 1D CAATCCTGAT A/- ACCCTTGATG 3070 hom 78 het 31 0 25 8 A 2 1 252580 CASAVA_Build 11 103363004 2D CACTTTCCAA CC/-- CCCCCCCACC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 9 7 252581 CASAVA_Build 11 103376519 1I TCTGCCTTCT -/G ATTAAACAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 0 1 252582 CASAVA_Build 11 103398678 3D CTATAAACAT ATA/--- ATGTGTGTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 4 ATA 1 0 252583 CASAVA_Build 11 103404718 1D GTTTTGAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 29 9 A 10 9 252584 CASAVA_Build 11 103416657 1D TGATTTTAAA T/- TTTTTTTGAC 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 8 7 252585 CASAVA_Build 11 103427038 1I GTGATACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 9 10 252586 CASAVA_Build 11 103430483 1D ATCACATGGG T/- GATGAGATAC 3070 hom 154 het 55 0 52 4 T 1 0 252587 CASAVA_Build 11 103451316 1D TTTCTCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 25 1 20 5 T 12 11 252588 CASAVA_Build 11 103458567 1D AATAAATTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 T 9 8 252589 CASAVA_Build 11 103464865 1I GGGATGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 41 2 29 10 A 10 11 252590 CASAVA_Build 11 103466691 2I CAATAGAGAA --/AT ATAGCAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AT 1 2 252591 CASAVA_Build 11 103470066 3I TGCCTCTTAA ---/ATT ACCAGCCCTC 3070 hom 141 het 51 0 46 5 ATT 0 1 252592 CASAVA_Build 11 103471559 4I GAAAGGAAAG ----/AGAA AGACTTATTT 3070 hom 103 het 39 0 34 5 AGAA 0 1 252593 CASAVA_Build 11 103472180 1I TTTTTCCTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 407 hom 32 1 24 7 A 9 10 252594 CASAVA_Build 11 103474913 4D TTAAAAATCA CTTT/---- CTTAGTTAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 6 CTTT 1 0 252595 CASAVA_Build 11 103494656 2I TATATATTAT --/TA TATGTTATTA 1178 het 495 hom 6 1 3 2 TA 1 2 252596 CASAVA_Build 11 103497250 1I ATTTTAATTC -/A GTGAAGTAAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 0 1 252597 CASAVA_Build 11 103498667 1D ATTTTTTTTT A/- AATTTTCTTC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 3 2 252598 CASAVA_Build 11 103499946 1I GAGTTTATAT -/G ATATGAAGAA 3070 hom 144 het 56 0 49 7 G 0 1 252599 CASAVA_Build 11 103502792 1I TCCAATTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 9 10 252600 CASAVA_Build 11 103517338 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 1239 het 1239 ref 32 20 4 9 T 15 14 252601 CASAVA_Build 11 103519932 5D ATGTCATCTC ATCTT/----- GGCTTCCAAC 3070 het 3070 ref 45 27 15 6 ATCTT 1 0 252602 CASAVA_Build 11 103543728 1I TACCTAAATG -/A AAGCCAAAAT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 2 3 252603 CASAVA_Build 11 103581345 2D GCCAGGCATG GT/-- GACTCATTTC 2053 het 2053 ref 16 9 5 4 GT 1 0 252604 CASAVA_Build 11 103583578 4D TACATATTGC CAGA/---- CAGTGTTCAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 CAGA 1 0 252605 CASAVA_Build 11 103592167 2I TTATTTTCAG --/TC TATGTATATC 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 TC 0 1 252606 CASAVA_Build 11 103600567 2D TGTTAGAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 125 hom 22 4 12 7 A 11 9 252607 CASAVA_Build 11 103603685 2D GATTTATAAA AT/-- ATGTCACCAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 AT 2 1 252608 CASAVA_Build 11 103616479 1I TCTCTCTCTC -/T ATATATGTGT 2964 hom 24 het 12 0 9 3 T 0 1 252609 CASAVA_Build 11 103617241 8I TTGGTATTCT --------/CTGACACA CTGTATTTGC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 CTGACACA 0 1 252610 CASAVA_Build 11 103626763 1D ATCTGTGTTC A/- CCAAGATTCC 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 A 1 0 252611 CASAVA_Build 11 103634154 1D CTCAAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 676 hom 37 3 15 20 T 15 14 252612 CASAVA_Build 11 103650063 2D CTTTGTGTGT TA/-- TATATGTCTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 TA 3 2 252613 CASAVA_Build 11 103651011 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 10 9 252614 CASAVA_Build 11 103657047 6D CTTTAAAGAA TTAAAC/------ TTAAGCCTTC 2164 hom 12 het 5 0 5 2 TTAAAC 1 0 252615 CASAVA_Build 11 103668112 1D TTTTACTAAC A/- AAAAATAGAA 3070 het 3070 hom 51 21 29 1 A 6 5 252616 CASAVA_Build 11 103669530 1I GATTCACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 55 30 17 8 A 9 10 252617 CASAVA_Build 11 103671142 11I TGGGTTCTGG -----------/TCCCTTGTTAA TCCCATGTTG 3070 hom 125 het 47 0 41 8 TCCCTTGTTAA 0 1 252618 CASAVA_Build 11 103677000 3D CATGACTGTA GTT/--- GATATTTTTA 3070 het 3070 ref 40 22 17 3 GTT 1 0 252619 CASAVA_Build 11 103677937 1D ACATTCCTTT C/- CTGGAATTTT 3070 het 3070 hom 49 18 23 10 C 2 1 252620 CASAVA_Build 11 103681477 3D TTTCCCATCA TCT/--- TCTTGTCCTA 3070 hom 66 het 30 0 23 8 TCT 2 1 252621 CASAVA_Build 11 103685961 1D TTAACATATT A/- AAAAAATAGA 2277 het 1404 hom 11 4 6 1 A 7 6 252622 CASAVA_Build 11 103686976 1I ACTTGTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 26 2 17 7 A 13 14 252623 CASAVA_Build 11 103690970 1D GAGAGAAGCA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 99 het 37 0 33 6 T 8 7 252624 CASAVA_Build 11 103697680 2I ATAAATAGAG --/AT GAATTTATTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AT 0 1 252625 CASAVA_Build 11 103698004 1I TTCCTTTGAG -/C CTTCTTTGGT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 C 1 2 252626 CASAVA_Build 11 103701004 1D CAAGCATATG A/- ATAAAGCTTA 3070 het 3070 ref 27 18 9 2 A 2 1 252627 CASAVA_Build 11 103707160 4D TATTATTTAC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 42 17 25 1 TTAT 5 4 252628 CASAVA_Build 11 103725269 1I GGCTGCTTGG -/T TTTTTGTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 5 6 252629 CASAVA_Build 11 103727888 3D TAAAATATGT ATA/--- ATAATATAAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 ATA 3 2 252630 CASAVA_Build 11 103739159 1D TTGGCACTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 A 10 9 252631 CASAVA_Build 11 103739266 2D TGTGGCTGTC AT/-- AGAAATATTT 3070 hom 105 het 41 0 33 8 AT 1 0 252632 CASAVA_Build 11 103741848 1D GTGGTGAGTG T/- TTACAGCTCA 3070 hom 86 het 33 0 28 5 T 3 2 252633 CASAVA_Build 11 103753281 1D CATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1183 het 1183 ref 22 12 3 7 T 15 14 252634 CASAVA_Build 11 103757983 1I ACAAAATTGG -/A AAAAAATATA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 6 7 252635 CASAVA_Build 11 103759703 1D AGTGTTCTTG T/- TTTTCTATGC 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 T 5 4 252636 CASAVA_Build 11 103762766 1I TTATTTAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 11 12 252637 CASAVA_Build 11 103763357 1I CCGTGAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 10 11 252638 CASAVA_Build 11 103773171 2I TCTCCTGAGT --/AG AGAGTGATTA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 AG 2 3 252639 CASAVA_Build 11 103790762 1D AAGTTATTTT C/- ATTGAGGTTA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 C 1 0 252640 CASAVA_Build 11 103793167 1I TAAATGAGCA -/T TGACTTCAAT 3070 hom 123 het 44 0 40 4 T 1 2 252641 CASAVA_Build 11 103795812 1I TTTATTAAGC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 8 9 252642 CASAVA_Build 11 103801972 13D TAATATTTGC CCCATTTATAATA/------------- CCCATTTGTT 3070 het 3070 hom 44 20 23 6 CCCATTTATAATA 1 0 252643 CASAVA_Build 11 103823221 1I ACAGACTTAG -/A AAAAAAAAAC 2412 het 2412 ref 29 20 6 3 A 9 10 252644 CASAVA_Build 11 103825848 1I GCTCAGTGTC -/A TAGGACATTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 252645 CASAVA_Build 11 103828940 1D TCTGGTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 37 2 30 6 T 13 12 252646 CASAVA_Build 11 103837266 4I TGTCTTTTAC ----/CTGA CTATTTGTTC 3070 hom 178 het 63 0 60 3 CTGA 0 1 252647 CASAVA_Build 11 103851296 1D TCTCTTCTGT A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 7 252648 CASAVA_Build 11 103856337 5D AGAAAGAATT AAAAC/----- AGAATTAGAG 2700 het 2700 ref 15 9 6 1 AAAAC 1 0 252649 CASAVA_Build 11 103858949 2I AAATAGTAAA --/AC ACTGCTGAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AC 1 2 252650 CASAVA_Build 11 103864228 1D ATTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 973 het 973 ref 37 25 3 9 T 11 10 252651 CASAVA_Build 11 103864887 2D TCTTAACCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2743 hom 32 8 16 9 T 13 11 252652 CASAVA_Build 11 103869391 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2923 het 818 hom 16 2 7 7 A 13 11 252653 CASAVA_Build 11 103877721 2I GTAAAAAGAA --/AC ACACATCACA 3070 hom 91 het 50 0 30 20 AC 2 3 252654 CASAVA_Build 11 103882535 5D CAAATATACA TATGT/----- TATGATATAC 2295 het 2295 ref 11 6 5 0 TATGT 1 0 252655 CASAVA_Build 11 103884610 28D TGTATTTTAC ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 2796 het 1210 hom 12 3 6 5 AT 20 6 252656 CASAVA_Build 11 103885231 13D CAAATCAACA AGCACTAGTTAAG/------------- AGCACTAGTA 3070 het 3070 ref 36 19 17 4 AGCACTAGTTAAG 1 0 252657 CASAVA_Build 11 103885550 1I TAAAATTGGC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 T 8 9 252658 CASAVA_Build 11 103886414 1I TTCTTGAGTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 8 9 252659 CASAVA_Build 11 103886964 1D TAATTTAAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 9 8 252660 CASAVA_Build 11 103889519 1D GGGAGGCCTT A/- ACAATCATGG 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 A 2 1 252661 CASAVA_Build 11 103890728 1I TTCCTTTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 9 10 252662 CASAVA_Build 11 103907657 2D GAGAGGGAGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 2680 hom 34 13 16 6 GA 6 5 252663 CASAVA_Build 11 103914916 2D TCTCTCCATA TG/-- TGTGTGTGTG 1351 het 708 hom 19 5 7 7 TG 10 9 252664 CASAVA_Build 11 103916513 1D AAATCTATTT G/- CTCTCTTAAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 G 1 0 252665 CASAVA_Build 11 103925549 4D TCTCTTTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 2698 het 2167 hom 34 14 16 6 TCTT 3 2 252666 CASAVA_Build 11 103928247 1D TCCAACTGTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 12 20 8 A 9 8 252667 CASAVA_Build 11 103929717 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 TA 7 6 252668 CASAVA_Build 11 103935574 1D AACATAAATC T/- TTCACACTCA 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 T 3 2 252669 CASAVA_Build 11 103935938 1I CTGGACAAAC -/T AAAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 0 1 252670 CASAVA_Build 11 103936034 1D GGTGAGAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 138 het 54 0 47 7 A 9 8 252671 CASAVA_Build 11 103936716 1I CTGAAGAAAA -/T ATAGTGTCCT 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 T 0 1 252672 CASAVA_Build 11 103957684 1I AAATCCTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 12 252673 CASAVA_Build 11 103966449 5D CTAGCCAATG GGTAT/----- GGTATGCTTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 6 GGTAT 2 1 252674 CASAVA_Build 11 103982259 1D TTGGATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 8 9 T 11 10 252675 CASAVA_Build 11 103984080 1D ATATTTCTGT A/- AAGATTTGGT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 3 2 252676 CASAVA_Build 11 104011252 1I AAATGATAGA -/T TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 30 23 3 4 T 11 12 252677 CASAVA_Build 11 104042384 1I CTTATTTAAT -/A AAAATGTATC 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 A 4 5 252678 CASAVA_Build 11 104052962 1I20M1D ATAGGCCACT -GGGTCAAAATTGGAGGGTACT/GGGGTCAAAATTGGAGGGTAC- TTTTTTCTTT 1291 het 1291 ref 9 4 3 3 N/A 0 0 252679 CASAVA_Build 11 104067176 1I AGACTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1961 hom 37 8 18 11 A 16 17 252680 CASAVA_Build 11 104078027 1I AAATTTTAAC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 T 7 8 252681 CASAVA_Build 11 104079060 3I CAAATATCGT ---/TAA TTGGCTAATA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TAA 0 1 252682 CASAVA_Build 11 104082208 6I TGTGTGTGTG ------/TATATA TATATATATA 2650 het 2650 ref 28 13 7 8 TA 5 8 252683 CASAVA_Build 11 104084572 4D AGAATAAAAG TAAT/---- TATATTTCCT 3070 het 3070 ref 42 24 13 6 TAAT 1 0 252684 CASAVA_Build 11 104084934 1D TCTACCTGAT C/- CATACCTATC 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 C 2 1 252685 CASAVA_Build 11 104086906 1I GTCATCCTAG -/T TGGGTATAAA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 1 2 252686 CASAVA_Build 11 104087932 1I TATCTATTGA -/C ATAATCATGT 2555 het 2555 ref 28 14 6 8 C 0 1 252687 CASAVA_Build 11 104093829 2I ACCTTTTATT --/AA AAAAAACAAC 1708 het 1708 ref 47 17 14 17 A 6 8 252688 CASAVA_Build 11 104100268 1D ATCTAAGATG A/- AAGCTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 A 3 2 252689 CASAVA_Build 11 104111999 1D GGTTTTTGGG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3052 hom 27 10 11 7 T 9 8 252690 CASAVA_Build 11 104113029 1D TTATATATTG T/- TATCTTACTT 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 T 2 1 252691 CASAVA_Build 11 104116062 1D TGCTTTGAAG C/- AAAATTTTAT 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 C 1 0 252692 CASAVA_Build 11 104116927 2I TAGGGGGAGG --/TA TATTCTAATG 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 TA 1 2 252693 CASAVA_Build 11 104119138 1I GGTATTGGGA -/G GATTCCCTTT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 G 1 2 252694 CASAVA_Build 11 104119228 1D TTTGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2096 hom 16 6 9 1 T 11 10 252695 CASAVA_Build 11 104122391 1I TAAAGCATAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 884 hom 24 2 11 11 T 2 3 252696 CASAVA_Build 11 104124068 6I AAGACGGCGA ------/TGAGAG TGACCTCTGG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 TGAGAG 0 1 252697 CASAVA_Build 11 104124699 1D TCTTACAGTC T/- ACAGAAGCCT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 1 0 252698 CASAVA_Build 11 104125329 2I TTTTTAAAGG --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 57 het 36 0 20 16 A 8 10 252699 CASAVA_Build 11 104126085 7D GTCTCCTTTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 866 hom 31 5 15 11 A 21 14 252700 CASAVA_Build 11 104126961 1D ATAGGTGGGA T/- TGTAATTCTC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 2 1 252701 CASAVA_Build 11 104128559 1D AAAGAAAAAA C/- ATATTCACAG 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 C 1 0 252702 CASAVA_Build 11 104136494 23D CCTACAAGAA ATTCATTTTACTTGTAAAGACAT/----------------------- GTACACTAAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 14 ATTCATTTTACTTGTAAAGACAT 1 0 252703 CASAVA_Build 11 104137047 1I AACTCAATGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1374 hom 37 4 29 4 A 9 10 252704 CASAVA_Build 11 104155771 1D AATTAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 23 2 20 1 T 13 12 252705 CASAVA_Build 11 104160167 1I CTTATCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 10 11 252706 CASAVA_Build 11 104161783 1I TCTTGTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 10 11 252707 CASAVA_Build 11 104166178 4I ATGTTATAAA ----/ATAC ATACATTATA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 ATAC 1 2 252708 CASAVA_Build 11 104173296 4D GAAAAAGTAC ACAA/---- ACAAAGCAGT 3070 het 3070 hom 43 19 22 4 ACAA 2 1 252709 CASAVA_Build 11 104175310 1D GAAATTTTGA G/- TTGCTCTTCT 3070 het 3070 hom 43 13 24 6 G 1 0 252710 CASAVA_Build 11 104176692 1I GACTTAGCAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 8 9 252711 CASAVA_Build 11 104192072 3D ATCAAGCACA TAT/--- TATTGGGTCA 3070 het 3070 ref 33 20 11 4 TAT 2 1 252712 CASAVA_Build 11 104194803 1I32M1D TACAAAGGTG -TTTTTTTTTTTCCTTACACTTACTTCCTTTAGA/TTTTTTTTTTTTCCTTACACTTACTTCCTTTAG- AAGATCCTTA 3070 het 908 hom 38 4 16 23 N/A 0 0 252713 CASAVA_Build 11 104195947 12D TTAAGCAGTG TCAGTGTTTTTC/------------ TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 18 5 TCAGTGTTTTTC 1 0 252714 CASAVA_Build 11 104196240 1D AAGTCTTTGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 8 7 252715 CASAVA_Build 11 104204715 1I TTCAACAAGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 8 9 252716 CASAVA_Build 11 104212149 1I TGTGGAATGA -/T TTTTTTTTTT 2976 het 2976 ref 29 14 8 7 T 11 12 252717 CASAVA_Build 11 104215747 4D TCTTTCATGA TTGT/---- TTATTAGCTA 3070 het 3070 ref 39 22 13 6 TTGT 1 0 252718 CASAVA_Build 11 104222056 1D AAGAGCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2117 hom 33 6 15 12 T 15 14 252719 CASAVA_Build 11 104226106 1D TGATACTGTG T/- TAGAGCCGTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 2 1 252720 CASAVA_Build 11 104231059 5I GTCAAAAAAT -----/AAAAC AAAATATGCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AAAAC 0 1 252721 CASAVA_Build 11 104231473 4I TAAAACACAG ----/ACAA ACAGACATTA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 ACAA 0 1 252722 CASAVA_Build 11 104232226 1I TATAATCTGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 A 8 9 252723 CASAVA_Build 11 104235335 1D CTTTTAAATA C/- CCCAGAGCAT 3070 hom 90 het 31 0 30 2 C 4 3 252724 CASAVA_Build 11 104235784 10I TTGCAAGGCA ----------/CACTAAACAG ATTTAAACAC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 CACTAAACAG 0 1 252725 CASAVA_Build 11 104239799 4I ATCAATGTAA ----/AAAC AAACAAACTG 3070 hom 99 het 44 0 33 11 AAAC 2 3 252726 CASAVA_Build 11 104240420 1D GGCCCAGTAC T/- TCATTAGTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 252727 CASAVA_Build 11 104243738 1D AATTAATATC A/- ATCTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 A 2 1 252728 CASAVA_Build 11 104245015 4I ACACAGTGAG ----/GAAA GAAAGGATAG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 GAAA 1 2 252729 CASAVA_Build 11 104246301 1D ATAAAGCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 29 0 25 5 A 11 10 252730 CASAVA_Build 11 104263047 1I AAGATGAATT -/A AGAGCTTTGG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 2 252731 CASAVA_Build 11 104263322 1I TAACTTTGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 8 9 252732 CASAVA_Build 11 104265080 2D AAAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 30 het 19 0 11 8 AG 9 8 252733 CASAVA_Build 11 104267795 1D TTTGCAAAAT A/- GAGCTAGAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 1 0 252734 CASAVA_Build 11 104271232 1D AGAAAGAAAA G/- TGGGAGATTA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 G 1 0 252735 CASAVA_Build 11 104275629 6D TACAGATTGT TTTTTG/------ TTTTTTCTAT 3070 hom 117 het 45 0 39 7 TTTTTG 1 0 252736 CASAVA_Build 11 104276546 7D ACTCTGTCTC CAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 CAAAAAA 1 0 252737 CASAVA_Build 11 104280742 4I TGGGTAAAAT ----/AACA AACAGACAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AACA 1 2 252738 CASAVA_Build 11 104281568 1I GTTTTGAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 10 252739 CASAVA_Build 11 104285077 3D AAGACATTGA CTT/--- CTTCTTTCTC 3070 hom 111 het 47 0 38 11 CTT 3 2 252740 CASAVA_Build 11 104289861 1D AGCAGGTATT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 120 het 47 0 41 7 A 8 7 252741 CASAVA_Build 11 104291533 1D GGAAGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 A 11 10 252742 CASAVA_Build 11 104293089 4D CAGAGACAGG TAAC/---- TAACTGACTG 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TAAC 2 1 252743 CASAVA_Build 11 104295510 2I CAACAAAAAC --/AT AGGACACCCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AT 0 1 252744 CASAVA_Build 11 104303296 1D CCATGCTTTT C/- CCCCCGCTGG 3070 hom 84 het 37 0 23 14 C 6 5 252745 CASAVA_Build 11 104310808 1D AAATAGCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 941 hom 41 4 27 10 A 15 14 252746 CASAVA_Build 11 104315449 1D ATATTGGAGG A/- AAAAAGTTCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 6 5 252747 CASAVA_Build 11 104378978 1I TACAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 509 hom 43 2 31 10 A 10 11 252748 CASAVA_Build 11 104386276 2I TCATTATATC --/AT ATGAGTAATT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 AT 1 2 252749 CASAVA_Build 11 104388686 1D TGGGTATTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 10 9 252750 CASAVA_Build 11 104390234 1I CCAGATGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 10 11 T 11 12 252751 CASAVA_Build 11 104415115 1D GAGGACATCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 12 11 252752 CASAVA_Build 11 104422818 1I TCATTTATCA -/T TTTTTTTTTT 2726 het 2726 ref 32 14 8 10 T 15 16 252753 CASAVA_Build 11 104427145 2I CTACAATCTC --/TT TCATTATTTT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 1 3 252754 CASAVA_Build 11 104443352 1D GATACAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 T 11 10 252755 CASAVA_Build 11 104449222 1D TTTAACCCAA G/- GGGCTTTCTC 3070 hom 87 het 37 0 28 9 G 4 3 252756 CASAVA_Build 11 104449874 5D TTAATCACTA CTTAT/----- CTTAGGAGGA 3070 hom 123 het 44 0 42 7 CTTAT 1 0 252757 CASAVA_Build 11 104452473 1I CTGTCCTTGA -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 30 1 25 4 G 1 2 252758 CASAVA_Build 11 104456548 2I CTGTGGGAGG --/AA AAAAAAAGAA 3070 hom 77 het 35 0 25 10 A 7 9 252759 CASAVA_Build 11 104458580 2D GATGGATGAA CT/-- GACAGAAGTA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 CT 1 0 252760 CASAVA_Build 11 104460880 1I ATAAAGAGAG -/A ATTCTTTGCC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 1 2 252761 CASAVA_Build 11 104464073 1D AAGGCACATC A/- AAAAAAAAAA 1432 het 1432 ref 27 14 4 9 A 15 14 252762 CASAVA_Build 11 104464665 8D CTTAGACCTG ATAAACTA/-------- ATTCAGAAAC 3070 het 3070 ref 29 17 12 1 ATAAACTA 1 0 252763 CASAVA_Build 11 104464874 2I TTAATGAAAG --/AT ATATTAAAGA 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 AT 2 3 252764 CASAVA_Build 11 104466171 1I ATAAAAAAAA -/C AATATCAATA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 C 0 1 252765 CASAVA_Build 11 104467803 12I3M3I TTGCTAAAAG ------------AAA---/TTCTCTTTTAGCAAAGAG TGTAAGTTAT 3070 het 3070 ref 38 24 12 3 N/A 0 0 252766 CASAVA_Build 11 104479368 12D TCAGTGAGTT CATGGCTTGTAC/------------ AAAGTATGAC 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 CATGGCTTGTAC 1 0 252767 CASAVA_Build 11 104509401 2I GGTCTAAAAT --/AA AGAGGTAGCA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 1 3 252768 CASAVA_Build 11 104523220 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAGTC 2882 het 2882 ref 23 14 7 2 A 8 7 252769 CASAVA_Build 11 104523435 2I TTGATACTAT --/AC GTCATGTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 AC 0 1 252770 CASAVA_Build 11 104530687 1D29M1D GCTTAAAAAT AAAAAAAAAAAAACAACACTTCCCCAAGTTA/-AAAAAAAAAAAACAACACTTCCCCAAGTT- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 28 5 14 16 N/A 0 0 252771 CASAVA_Build 11 104531506 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTTTCAG 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 2 3 252772 CASAVA_Build 11 104545652 2D ATATAATATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2600 hom 21 6 12 3 AT 7 6 252773 CASAVA_Build 11 104552080 1D AGATTGTTAC T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 6 252774 CASAVA_Build 11 104560057 1I GTTACGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 A 10 11 252775 CASAVA_Build 11 104565215 1D TTTAAAGTTG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 A 8 7 252776 CASAVA_Build 11 104566701 2D GCTCTGCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 1663 het 1663 ref 37 13 6 18 A 18 16 252777 CASAVA_Build 11 104569696 2D ACTAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAT 1689 het 1293 hom 12 4 4 5 A 11 9 252778 CASAVA_Build 11 104569857 16D TCTATCTCAA AAAAAAAAAAAAAAAG/---------------- AAAAAAAAAG 3059 het 2026 hom 17 7 10 2 AAAAAAAAAAAAAAAG 1 0 252779 CASAVA_Build 11 104581593 1D TTGCTATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 13 11 T 11 10 252780 CASAVA_Build 11 104585782 1I TCACTCTCAT -/C CCCCCCCCCA 1565 het 1565 ref 37 13 5 19 C 9 10 252781 CASAVA_Build 11 104599945 1D CTAAAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 44 0 33 12 T 11 10 252782 CASAVA_Build 11 104610280 2D ATATATACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 15 17 5 AC 7 6 252783 CASAVA_Build 11 104612169 1I CAAGGTCAAC -/A AAAATGATAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 4 5 252784 CASAVA_Build 11 104614276 1I TTAAGAAGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 252785 CASAVA_Build 11 104616172 4D AGTAGTTGCT ACTA/---- ACTAAGATAA 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 ACTA 2 1 252786 CASAVA_Build 11 104626568 1D TTAAAAAATA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 8 7 252787 CASAVA_Build 11 104626800 1I ATAGTTTCAC -/A AGAGTTCAGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 1 2 252788 CASAVA_Build 11 104626951 1I TTAGTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2654 hom 39 9 18 12 T 12 13 252789 CASAVA_Build 11 104637419 1I AATTGTATAA -/T TTTTTTTTCT 2745 het 2745 ref 27 11 9 7 T 8 9 252790 CASAVA_Build 11 104645799 1D CAACCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 28 0 21 8 T 11 10 252791 CASAVA_Build 11 104656975 1I GAGACTGGGG -/A AAAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 6 7 252792 CASAVA_Build 11 104665406 1D AAGCCCATTT A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 8 7 252793 CASAVA_Build 11 104667350 1D TGTGTATTAA T/- TGTATATCAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 T 2 1 252794 CASAVA_Build 11 104671800 1D56M2D TTTTCCTCAT CTTTGAGGATTTATCCACCTTTTATCTTTGAGGCTGATGACCTTTGGATGGGGTTTCTG/-TTTCTGTATTTATCTCCCTTTGATATTTGAGGCTGATGGCCTTTTGATGGGGTTTC-- TGTGTGGGGG 1299 het 1299 ref 40 55 3 5 N/A 0 0 252795 CASAVA_Build 11 104672435 1I ATAGCGGACG -/C CCCCCCCCGC 3070 het 416 hom 20 1 17 2 C 8 9 252796 CASAVA_Build 11 104675208 1I TTATAAAAAC -/A GCAAAATACC 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 A 0 1 252797 CASAVA_Build 11 104685232 3I CTCTTTGTAT ---/TAC TACTAGACTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAC 1 2 252798 CASAVA_Build 11 104688300 4I TTCACTCATT ----/AGTC AGTTAGGCAC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 AGTC 0 1 252799 CASAVA_Build 11 104698978 1D TTCCAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 2601 het 2601 ref 22 11 8 3 T 11 10 252800 CASAVA_Build 11 104705007 1D TCAAGCCAGT C/- CGGCTATTGT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 C 2 1 252801 CASAVA_Build 11 104721637 1I GGGCCAAATG -/A AAAAATCTAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 A 5 6 252802 CASAVA_Build 11 104731365 1I TTATTTAATG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 T 7 8 252803 CASAVA_Build 11 104734004 1D GGAGAGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 286 hom 38 1 24 14 A 14 13 252804 CASAVA_Build 11 104734429 1I AATTCAGAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 417 hom 33 1 29 3 T 8 9 252805 CASAVA_Build 11 104735469 2I TTCATGAACA --/CT CTCAAAATAA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 CT 1 2 252806 CASAVA_Build 11 104737028 1I AAACTGCTGT -/A AAGTGGCACT 3070 het 3070 hom 39 14 24 1 A 2 3 252807 CASAVA_Build 11 104738751 1I TTTAATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2122 hom 35 11 21 3 T 14 15 252808 CASAVA_Build 11 104758927 18I TTCTGCAAAG ------------------/TCCAGCTCATTTGTATTT TCTTTAAAGT 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 TCCAGCTCATTTGTATTT 0 1 252809 CASAVA_Build 11 104760530 1I AGAAAATGGA -/G CTACCATTAT 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 G 0 1 252810 CASAVA_Build 11 104765811 7I CAATACAAAT -------/GGAAACC TTTTGAAGCG 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 GGAAACC 0 1 252811 CASAVA_Build 11 104766612 3D AGTGATACAC ACA/--- ACAACATAGG 3070 het 3070 hom 45 21 20 5 ACA 3 2 252812 CASAVA_Build 11 104773075 4D TTAAAAATGA TTTT/---- TTTCTCATTC 3070 het 3070 ref 37 15 15 9 T 7 3 252813 CASAVA_Build 11 104777948 3D CAGCTGTGTA TAT/--- TGTCTGATGC 3070 het 3070 ref 40 21 18 4 TAT 1 0 252814 CASAVA_Build 11 104790529 2I ACATGCACAC --/AT ATGTTTATTG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AT 1 2 252815 CASAVA_Build 11 104793854 1D AGTGTTGTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 T 10 9 252816 CASAVA_Build 11 104795102 4D TTAGATCAAG TATA/---- TATATAAGGT 3070 hom 114 het 43 0 39 6 TA 5 3 252817 CASAVA_Build 11 104816200 1D AGAAATAATA C/- ATAAATTCAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 1 0 252818 CASAVA_Build 11 104816736 4D TGCATTTCTC AGTT/---- GATAATAATG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 AGTT 1 0 252819 CASAVA_Build 11 104826272 3D TTCAGGCTCA TCT/--- TCTGACTGGT 3070 het 3070 ref 39 19 18 4 TCT 2 1 252820 CASAVA_Build 11 104829619 1D ATCATTCTGT G/- GGTATTAAAG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 G 3 2 252821 CASAVA_Build 11 104834636 1I AGAGGAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 11 12 A 12 13 252822 CASAVA_Build 11 104841275 2D GTATTCATTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 8 A 13 11 252823 CASAVA_Build 11 104853136 1D CTGTTCCAGG C/- CCACGTGTTT 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 C 3 2 252824 CASAVA_Build 11 104854520 1I ACAAAGCGCT -/G AAGAATAATG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 G 0 1 252825 CASAVA_Build 11 104855126 1D AGGGCAGTTT C/- CCCCATACTG 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 C 5 4 252826 CASAVA_Build 11 104857163 5D AATGCTGATA TGAGT/----- TAAGACTTTG 3070 het 3070 ref 43 32 11 5 TGAGT 1 0 252827 CASAVA_Build 11 104860085 2D ATTTTTTGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 244 hom 21 2 13 7 TA 7 6 252828 CASAVA_Build 11 104867906 1I TTTGCCTTTA -/T TTTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 T 6 7 252829 CASAVA_Build 11 104868341 4I CAGGTCAGAC ----/TGTT TGGGAAGCAT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 TGTT 0 1 252830 CASAVA_Build 11 104873214 4D GAGGACAGAG TATC/---- TATCTACACA 3070 het 3070 ref 48 21 23 5 TATC 2 1 252831 CASAVA_Build 11 104884277 1D GGACTGGGTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 9 8 252832 CASAVA_Build 11 104884863 2D TCTTCCTCTT GA/-- GAGGGAACAT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 GA 2 1 252833 CASAVA_Build 11 104888526 4D ATAAAGTAAT ATTA/---- ATTATCAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 ATTA 2 1 252834 CASAVA_Build 11 104892878 4I TCTGGAGTTT ----/AGGA CCATTATATC 3070 hom 105 het 45 0 36 9 AGGA 0 1 252835 CASAVA_Build 11 104892912 1D AATGTCCATT A/- AAAAAAAAAA 1619 het 1619 ref 44 16 5 23 A 12 11 252836 CASAVA_Build 11 104896548 6D4M14D AATTCTGTCT AATTCAGAATTCTGTCTAATTCTG/------GAAT-------------- TCTTCCCTAA 3070 hom 75 het 24 0 26 0 N/A 0 0 252837 CASAVA_Build 11 104896656 3I GTATGCTCAA ---/CAC ATTTGTACCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 CAC 0 1 252838 CASAVA_Build 11 104903099 1I GCATCTAGCC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 T 8 9 252839 CASAVA_Build 11 104904692 1I TTTAGAATAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 8 9 252840 CASAVA_Build 11 104912630 1D TACACTGGAC T/- TCTTGTTTAT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 2 1 252841 CASAVA_Build 11 104921124 1D TTCGTCAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 11 10 252842 CASAVA_Build 11 104927636 2D TTTTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 2738 het 1820 hom 25 8 9 8 T 13 11 252843 CASAVA_Build 11 104938225 2I CAATGGTAAC --/AT GTGGGTAAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AT 0 1 252844 CASAVA_Build 11 104939311 1D TTGTTCCACC A/- AAAAAAAAAA 1418 het 1418 ref 35 20 5 10 A 12 11 252845 CASAVA_Build 11 104943441 31D GCCTCACCCT CCCGAATGCTGGGACTACAGGCATTCACCAG/------------------------------- CATGCCCAGC 3070 hom 75 het 25 0 24 5 CCCGAATGCTGGGACTACAGGCATTCACCAG 1 0 252846 CASAVA_Build 11 104947469 1D ATGCTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 2934 het 2934 ref 29 14 10 5 T 12 11 252847 CASAVA_Build 11 104952656 2D TATTCTATAA AT/-- ATATATATAT 2914 hom 18 het 10 0 7 3 AT 9 8 252848 CASAVA_Build 11 104969181 1D AATCAAAAAG T/- TTTTAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 5 4 252849 CASAVA_Build 11 104973668 1I AAACTTTTAA -/G GAATTCTTCT 3070 hom 162 het 59 0 53 6 G 1 2 252850 CASAVA_Build 11 104974679 1D GAAGATAAAA G/- TTATTTTTCA 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 G 1 0 252851 CASAVA_Build 11 104980517 1I TATGTGTGTG -/T TTTTTGCATA 3070 het 3070 ref 47 29 14 4 T 5 6 252852 CASAVA_Build 11 104986808 3D CTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 27 2 11 14 T 19 16 252853 CASAVA_Build 11 104988545 1D TATTTAGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 119 het 45 0 40 6 T 10 9 252854 CASAVA_Build 11 104995014 1D ATATGACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 6 A 11 10 252855 CASAVA_Build 11 105006317 1I CCTGACTGAC -/A ATGGTGAGAC 3000 het 2032 hom 16 5 8 3 A 1 2 252856 CASAVA_Build 11 105013133 1D TGATTAGAAG C/- TTTGTTATCC 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 C 1 0 252857 CASAVA_Build 11 105013401 1I GTTAGCACAA -/T TTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 6 7 252858 CASAVA_Build 11 105026300 1D TTTCCATGCA G/- TGGGAATTCC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 G 1 0 252859 CASAVA_Build 11 105027303 1I AACCTGCATT -/A AGCATCATCT 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 A 1 2 252860 CASAVA_Build 11 105030293 1D GCCCCCACTG A/- AAAAAAAAAA 1442 het 1442 ref 35 27 4 4 A 11 10 252861 CASAVA_Build 11 105032348 1D CTAAACCAAT A/- AAAAAACCCT 3070 het 3070 hom 23 8 14 1 A 7 6 252862 CASAVA_Build 11 105032980 1I GCTCCAGAAA -/G AAAAAAGGGT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 0 1 252863 CASAVA_Build 11 105037012 1D AGCCCTAACA C/- CAATTTTCAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 C 2 1 252864 CASAVA_Build 11 105037633 2I AGAGAGAAAA --/AG AGAAGAGGAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AG 1 2 252865 CASAVA_Build 11 105039117 1D AACTTTATTA C/- CAAGTTCATT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 C 2 1 252866 CASAVA_Build 11 105045327 2I ATATCATGTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 AT 5 6 252867 CASAVA_Build 11 105052459 1D TAAAAATTAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 7 252868 CASAVA_Build 11 105052751 1I GTAGCTCTAG -/A AAAGGGAAAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 3 4 252869 CASAVA_Build 11 105061671 1I86M1D ATATGAAGAT -GAAAAATGCAGGGTATATTAGCAGGATTATAGGGGAAACATTAACCTGGTATGGATTACTTGTGCAAGAAAACAGAGGCATCAATCA/GGAAAAATGCAGGGTATATTAGCAGGATTATAGGGGAAACATTAACCTGGTATGGATTACTTGTGCAAGAAAACAGAGGCATCAATC- AAAAAGTCAA 3070 het 134 hom 38 1 38 25 N/A 0 0 252870 CASAVA_Build 11 105072703 1D TTCTTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2137 hom 21 6 12 3 T 12 11 252871 CASAVA_Build 11 105073814 4D CTGGAGTGAA AGAG/---- AGAGAGCCTA 3070 het 3070 ref 41 22 13 8 AG 5 3 252872 CASAVA_Build 11 105074855 1D GCAGCCACTT A/- AGATAGGAAG 3070 hom 138 het 49 0 46 3 A 2 1 252873 CASAVA_Build 11 105088654 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 T 8 7 252874 CASAVA_Build 11 105090191 2D TTTGAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 11 9 252875 CASAVA_Build 11 105092042 8D GTAATTTCCC TAAAAGTT/-------- TAAAAGTTTC 3070 het 3070 ref 40 25 12 6 TAAAAGTT 2 1 252876 CASAVA_Build 11 105099100 1D GTGAGCAATC A/- ATGAGAAAGG 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 A 2 1 252877 CASAVA_Build 11 105100261 2I AAAATGTGAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AT 5 6 252878 CASAVA_Build 11 105100353 2I GTGCACACAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AC 5 6 252879 CASAVA_Build 11 105105063 2D AAAAAAGAAA AG/-- AGAGAAGAAT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 AG 3 2 252880 CASAVA_Build 11 105114332 1D GCTGGAGCAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 A 8 7 252881 CASAVA_Build 11 105124320 1D ACTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 2257 het 2257 ref 28 11 6 11 T 13 12 252882 CASAVA_Build 11 105132696 1D GACTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2403 hom 28 7 15 6 A 11 10 252883 CASAVA_Build 11 105134973 2D CTAATGTCAT GA/-- GAGATCTCAG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 GA 3 2 252884 CASAVA_Build 11 105135924 4D TGAATGAATG AATC/---- ATATGGTCTC 3070 het 3070 ref 36 19 16 4 AATC 1 0 252885 CASAVA_Build 11 105137963 1I GAAGTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 2933 het 2933 ref 24 10 10 4 T 15 16 252886 CASAVA_Build 11 105163618 1I TCACCATGTT -/G GCCAGGCTGG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 1 2 252887 CASAVA_Build 11 105167642 2I TAGCTCAACT --/TA TATAGAGAAT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 TA 2 3 252888 CASAVA_Build 11 105168851 1I TCCAACATAC -/A AAGACAGGCT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 2 3 252889 CASAVA_Build 11 105170369 2D GTGTGCCGGG GT/-- GTGTGTGTGT 905 het 905 ref 12 6 6 0 GT 10 9 252890 CASAVA_Build 11 105176716 1I TACATTAAAA -/T ATTTTAATTT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 0 1 252891 CASAVA_Build 11 105178712 1I TATGTCATTG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 7 8 252892 CASAVA_Build 11 105179781 1D GTGCTATACC A/- AAAAAAAAAA 1745 het 1201 hom 31 9 6 16 A 18 17 252893 CASAVA_Build 11 105191612 1D AAAAACGACC A/- AAAAAAAAAA 1681 het 1681 ref 37 26 5 6 A 11 10 252894 CASAVA_Build 11 105192935 9D CAGCCTGGGT AACAAGTGA/--------- AACAGAGTGA 3070 hom 82 het 27 0 25 5 AACAAGTGA 1 0 252895 CASAVA_Build 11 105213015 2D AATGGCGGGC AA/-- GAGAGAGGAG 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 2 0 252896 CASAVA_Build 11 105232380 1D TTTTTGAAGC T/- TCTGAATGTG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 2 1 252897 CASAVA_Build 11 105238589 22D AAGAAAAGTC AGTGGAATACTGTATATAATTT/---------------------- AGTGGAATAC 3070 het 3070 ref 32 23 10 4 AGTGGAATACTGTATATAATTT 1 0 252898 CASAVA_Build 11 105246484 1D GGAAAGGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 43 1 32 10 A 12 11 252899 CASAVA_Build 11 105257825 1D ATTTTTCCCA C/- CCCATTTTAC 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 C 4 3 252900 CASAVA_Build 11 105259213 1D GCACCGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 705 hom 26 6 14 7 T 15 14 252901 CASAVA_Build 11 105260927 2D ACAGGGGCTT AG/-- AGAGAGTGCA 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 AG 4 3 252902 CASAVA_Build 11 105297803 1D GGAAGATACC A/- AAAAGTGATA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 5 4 252903 CASAVA_Build 11 105302156 1I GACTGAAGGT -/A AAAACAAGTT 3070 hom 159 het 59 0 52 7 A 4 5 252904 CASAVA_Build 11 105306525 2D AAAGATACTT TA/-- TTCTTTTTAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 TA 1 0 252905 CASAVA_Build 11 105317354 1D AAGACACAAC A/- AACATCCCTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 3 2 252906 CASAVA_Build 11 105326462 5D ATTAGAACTT AAATC/----- AATAAGAACT 3070 het 3070 ref 36 19 14 6 AAATC 1 0 252907 CASAVA_Build 11 105332104 4I CAATATGCAG ----/GTTT GTTACATATG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 GTTT 0 1 252908 CASAVA_Build 11 105342354 1D GCCTGTCTTG T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 8 7 252909 CASAVA_Build 11 105343123 3I CAAATTTTTA ---/TTG TTATCACAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TTG 0 1 252910 CASAVA_Build 11 105343641 2D TTTGTATACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 32 1 21 12 A 15 13 252911 CASAVA_Build 11 105351292 1D TTACAAACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 10 9 252912 CASAVA_Build 11 105354293 2D TGTGAAGACC AT/-- ATCCTGAGTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AT 2 1 252913 CASAVA_Build 11 105365132 3D CAATTTTATC AAT/--- AATATTTTCA 3070 hom 111 het 41 0 38 6 AAT 2 1 252914 CASAVA_Build 11 105365386 5I AATTATTACC -----/ATTTA ATTTAACTGT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 ATTTA 1 2 252915 CASAVA_Build 11 105373240 3D GAGGAGAAGA AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 hom 46 het 25 0 13 14 AGG 6 5 252916 CASAVA_Build 11 105380764 3I AAATGTAGAG ---/CAA CACAGTAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CAA 0 1 252917 CASAVA_Build 11 105387569 1I CAGAGTCTGT -/C CCTTTCCCCA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 C 2 3 252918 CASAVA_Build 11 105388082 2D AAAGATAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1597 hom 31 9 14 8 A 15 13 252919 CASAVA_Build 11 105390882 1I ATGCAAAAAC -/A AAAAGAAAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 4 5 252920 CASAVA_Build 11 105402153 1I10M1I ATTCCATAGG -TGCTTTTCCA-/TTGCTTTTCCAT TTTGTTTCCT 3070 hom 93 het 33 0 31 5 N/A 0 0 252921 CASAVA_Build 11 105405871 1D TGTATAAATG T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 6 252922 CASAVA_Build 11 105410468 2I GCCAAGCATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 T 10 12 252923 CASAVA_Build 11 105414757 1D AATCTACGTT C/- TTTTTAATGA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 C 1 0 252924 CASAVA_Build 11 105417568 5D AACATGTCCA AAATG/----- ACTGCCAGCA 3070 het 3070 hom 55 26 25 6 AAATG 1 0 252925 CASAVA_Build 11 105422491 3I ATTTGGTCTG ---/TTC TTCTTAGCTC 3070 hom 120 het 47 0 39 8 TTC 1 2 252926 CASAVA_Build 11 105424668 1D TTAGAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 11 10 252927 CASAVA_Build 11 105426653 1I GGTGATCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 A 10 11 252928 CASAVA_Build 11 105427701 1I GAATACTATT -/A ATCAATACCA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 1 2 252929 CASAVA_Build 11 105436091 1D CCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 10 9 252930 CASAVA_Build 11 105443547 1I AAACTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 867 hom 20 2 10 8 A 12 13 252931 CASAVA_Build 11 105444670 4D ACGGTACCCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 111 het 43 0 37 7 AAAC 3 2 252932 CASAVA_Build 11 105446274 1D AGGAAAAAAA T/- ATTTGCAAAC 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 1 0 252933 CASAVA_Build 11 105450059 1I ACCCCCCCCC -/A ACACACATAC 3070 hom 108 het 40 0 34 6 A 1 2 252934 CASAVA_Build 11 105466832 4D AGTTAGAAAG TACT/---- TACTTAAAGC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 TACT 2 1 252935 CASAVA_Build 11 105469859 1I TGCAACTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 731 hom 24 2 14 8 T 12 13 252936 CASAVA_Build 11 105494556 1I CAAAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 25 1 19 5 T 11 12 252937 CASAVA_Build 11 105507173 1I AGAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 57 1 46 10 A 10 11 252938 CASAVA_Build 11 105516577 2D TGAGATGGAG TC/-- TCTCTCTGTC 970 het 916 hom 15 3 5 7 TC 4 3 252939 CASAVA_Build 11 105533033 10I CAATGCACAG ----------/GTGCAATGCA CAGCAGCAGC 2670 het 298 hom 33 2 14 17 GTGCAATGCA 0 1 252940 CASAVA_Build 11 105533081 2I CAGCTGGAAA --/CT CTGGGAGGAG 3070 hom 100 het 40 0 34 6 CT 1 2 252941 CASAVA_Build 11 105539159 1D ACCACAGGAT G/- ATGGCTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 G 1 0 252942 CASAVA_Build 11 105543337 1I TTGCAAGGGG -/A AAAAACAAAC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 5 6 252943 CASAVA_Build 11 105545099 2D ACTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 31 1 25 5 T 21 19 252944 CASAVA_Build 11 105551159 1D GGGGGTATTT A/- AACTCCCCCA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 3 2 252945 CASAVA_Build 11 105551731 2D GGGAAAGGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 35 1 23 12 T 17 15 252946 CASAVA_Build 11 105553081 1I CACTGGCAGA -/T AGAGCACGCC 3070 hom 61 het 27 0 22 5 T 0 1 252947 CASAVA_Build 11 105554371 2D AAGTAACAAC TA/-- TTGTAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TA 1 0 252948 CASAVA_Build 11 105554494 1I ATGTTTACTG -/T TTTGAGTGGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 3 4 252949 CASAVA_Build 11 105555944 1D AAATTCCAAT G/- TCTAAGTATA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 0 252950 CASAVA_Build 11 105556034 8I TTTAATAATT --------/TAATAATG TAATAGGTAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TAATAATG 0 1 252951 CASAVA_Build 11 105559250 1D TCTTTGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 7 T 11 10 252952 CASAVA_Build 11 105559859 1D GGCTTGGGGG T/- GGTACCTTGG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 1 0 252953 CASAVA_Build 11 105561289 1I TCAGATTGCA -/G AGCTCCACGG 3070 hom 63 het 25 0 19 6 G 0 1 252954 CASAVA_Build 11 105561569 1D CATGCTTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 9 252955 CASAVA_Build 11 105562324 1D GGACTGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 34 2 23 9 A 13 12 252956 CASAVA_Build 11 105568703 5I AAAATAAAAA -----/AAAAC AAAACAGCAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AAAAC 1 2 252957 CASAVA_Build 11 105586432 1I CCTTCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 843 hom 38 2 32 4 T 11 12 252958 CASAVA_Build 11 105587913 1I GGTAAACTTT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 8 9 252959 CASAVA_Build 11 105591507 1I ATGAGCCTTA -/C AGTAAAGAGA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 0 1 252960 CASAVA_Build 11 105607046 1I CTAATGGCTT -/A GCATACTACC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 1 252961 CASAVA_Build 11 105628585 4I CTGTATCAGA ----/TGCT TTTTGTACTA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 TGCT 0 1 252962 CASAVA_Build 11 105634872 3D CCACATTAAT ATA/--- ATGTTTCTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATA 1 0 252963 CASAVA_Build 11 105640180 1I TCTCAACTGT -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 8 252964 CASAVA_Build 11 105642337 2I TGGAAGAGAC --/TT TGGAACTGGG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 1 3 252965 CASAVA_Build 11 105646739 1D TTTTTAAATC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 100 het 42 0 35 8 T 9 8 252966 CASAVA_Build 11 105649108 2D ATTATATGAA AT/-- ATATATATAT 1293 hom 10 het 5 0 4 1 AT 8 7 252967 CASAVA_Build 11 105654133 1I TATACCCTTG -/C CAAAATCCCA 3070 hom 107 het 39 0 35 4 C 1 2 252968 CASAVA_Build 11 105663041 1I CACATCAGCC -/A AAGGGAGACT 3070 hom 113 het 43 0 33 10 A 2 3 252969 CASAVA_Build 11 105669038 4D GCGTTCTTTC TCTA/---- TCTATGACGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TCTA 2 1 252970 CASAVA_Build 11 105674291 2D CCTGCCTGAT GG/-- GGGGTATAGA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 G 6 4 252971 CASAVA_Build 11 105675412 1D TTGGTCTCCT G/- GGTTGACCTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 G 3 2 252972 CASAVA_Build 11 105677185 4D CCTGCTTTTC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 106 het 41 0 35 7 AT 7 5 252973 CASAVA_Build 11 105696119 1I ACTTAATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 20 1 17 2 A 15 16 252974 CASAVA_Build 11 105696639 1D TTTAGGTTCC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 8 7 252975 CASAVA_Build 11 105699108 3I GATTTTAATT ---/AAA AAATTGATTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 3 6 252976 CASAVA_Build 11 105702143 1I GCTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 61 hom 36 1 30 5 A 9 10 252977 CASAVA_Build 11 105768759 1D CTTCAAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 11 10 252978 CASAVA_Build 11 105769482 1D ATTGCCTCAC A/- GTTCTGTAGG 3070 hom 78 het 29 0 27 5 A 1 0 252979 CASAVA_Build 11 105770168 1D ACATTCTCCT C/- GTCTATGAGA 3070 hom 129 het 47 0 44 5 C 1 0 252980 CASAVA_Build 11 105771390 6D GCAACCAGCT GAAGGA/------ GAAGGAGAGA 3070 hom 56 het 24 0 17 8 GAAGGA 2 1 252981 CASAVA_Build 11 105776122 5I CATGCCGCTG -----/CAGTT CAGTTCAGAC 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 CAGTT 1 2 252982 CASAVA_Build 11 105786713 1D ACAGAAAAAA G/- GATAAAGCTG 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 G 2 1 252983 CASAVA_Build 11 105797278 1D AGGAGGAATC A/- CCAGAAGATG 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 A 1 0 252984 CASAVA_Build 11 105800551 2I TTTTGAGCAA --/CT CTCTGTTACT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 CT 2 3 252985 CASAVA_Build 11 105803865 2D ACACTAGCAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 36 10 15 11 AC 9 8 252986 CASAVA_Build 11 105808353 1I GAACAGTGGT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 8 9 252987 CASAVA_Build 11 105809932 4I AGTGATTAAC ----/AGTA AGTGTCTTAA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 AGTA 0 1 252988 CASAVA_Build 11 105814853 1I ATCATTGGTG -/A AACTTAGGAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 2 3 252989 CASAVA_Build 11 105817393 1I TCATGGATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 9 10 252990 CASAVA_Build 11 105823445 1I TTCTCCATTC -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 T 7 8 252991 CASAVA_Build 11 105824987 1D TAGAATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 T 12 11 252992 CASAVA_Build 11 105826571 4D GAATCTAGAC TGTT/---- TGTTGGACAC 3070 het 3070 hom 32 12 19 3 TGTT 2 1 252993 CASAVA_Build 11 105826867 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1001 hom 7 het 3 0 3 0 T 6 7 252994 CASAVA_Build 11 105827945 1D TTTTTTTTTT G/- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 G 1 0 252995 CASAVA_Build 11 105861648 1I CTTCACAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 9 10 252996 CASAVA_Build 11 105882819 1I GCTATCACTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 9 10 252997 CASAVA_Build 11 105910689 1D ATATTCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 11 10 T 13 12 252998 CASAVA_Build 11 105913242 6D ACGGAGAACT CAAATG/------ TGTCCGTGTT 3070 hom 68 het 25 0 23 4 CAAATG 1 0 252999 CASAVA_Build 11 105918520 1D GATTTGAGAC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 9 8 253000 CASAVA_Build 11 105920045 1D GGAGGCTGAT G/- GGAGGAGAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 3 2 253001 CASAVA_Build 11 105921368 1I AGGACAAAAA -/T ATTAGAAAAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 0 1 253002 CASAVA_Build 11 105941689 1I AATTTATTAA -/C CTCCCTACAA 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 C 1 2 253003 CASAVA_Build 11 105947994 4I TATATTTTTC ----/TCTT TCTTTCATAT 3070 het 3070 hom 20 7 11 2 TCTT 1 2 253004 CASAVA_Build 11 105954998 2D TTAAAATTGT CC/-- TGGTGGCACC 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 C 2 0 253005 CASAVA_Build 11 105959627 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTGAGTAC 3070 hom 72 het 26 0 25 2 T 5 4 253006 CASAVA_Build 11 105994935 1D CATCTTCACC T/- TTTTTTTTTT 1592 het 1592 ref 29 14 7 8 T 13 12 253007 CASAVA_Build 11 105994959 1D TAATCTCAGG A/- AAAAAAAGTT 2405 het 2405 ref 24 13 6 5 A 8 7 253008 CASAVA_Build 11 105999336 1I CTCATGCTGG -/C CCTGGTTCTT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 C 2 3 253009 CASAVA_Build 11 106002297 1D AGGTGATAGC A/- AAAAAAAAAA 1711 het 1711 ref 29 21 4 6 A 13 12 253010 CASAVA_Build 11 106034170 1I TCTAGTGGTG -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 T 6 7 253011 CASAVA_Build 11 106051663 1D TCAAGACAAA G/- GTTTTCTTAA 3070 het 3070 ref 28 18 9 4 G 2 1 253012 CASAVA_Build 11 106065930 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2490 het 962 hom 18 5 9 4 A 15 16 253013 CASAVA_Build 11 106077570 1I GAAGGGTAAG -/A GGGGAGGAGA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 0 1 253014 CASAVA_Build 11 106079466 3D TTTGATGATG GAA/--- GAAGAAGGTT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 GAA 3 2 253015 CASAVA_Build 11 106089940 1I TTTTACACTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 7 8 253016 CASAVA_Build 11 106090683 1I TCTCACAACT -/G GGGAGGGAGA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 G 3 4 253017 CASAVA_Build 11 106094229 4D GGTAAAATTT TAAA/---- TAATTAATAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 6 TAAA 1 0 253018 CASAVA_Build 11 106099855 2I TTGAAATGTA --/TT TTGTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 T 2 4 253019 CASAVA_Build 11 106109144 1D AGGAGTTTTA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 45 22 23 0 T 7 6 253020 CASAVA_Build 11 106111919 1D AAATTATTAG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 8 7 253021 CASAVA_Build 11 106116585 24D ACCATATCAC TGTATGTATGTATGTATGTATGTA/------------------------ TGTATGTATG 3070 het 3070 hom 61 17 20 26 TGTA 10 4 253022 CASAVA_Build 11 106117424 7D GTATCAAAGG AGAAGGA/------- AGAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 17 6 AGAAGGA 2 1 253023 CASAVA_Build 11 106124228 4I CTGTCAAAAC ----/AATA AACCTGAAAC 3070 het 3070 hom 46 16 28 2 AATA 0 1 253024 CASAVA_Build 11 106126672 1I TAGTGGATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 A 10 11 253025 CASAVA_Build 11 106140931 1I GGGCAGGAAT -/A AAATAGTGCA 3070 het 48 hom 21 1 17 3 A 3 4 253026 CASAVA_Build 11 106141111 1I AATATGTAAA -/C TGTCAAGCTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 253027 CASAVA_Build 11 106142484 1I TTCAGAGATC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 433 hom 29 1 17 11 T 8 9 253028 CASAVA_Build 11 106146785 1I CAAATCAGGG -/A AATGCTGTGA 2713 hom 40 het 15 0 8 7 A 2 3 253029 CASAVA_Build 11 106147694 1I TGTCTTGAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 2060 hom 26 6 16 4 A 8 9 253030 CASAVA_Build 11 106151414 1I ACCAATTACG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 11 12 253031 CASAVA_Build 11 106153654 1I ATTAGGAGAA -/T TATCTAATGT 3070 het 2262 hom 15 6 8 1 T 1 2 253032 CASAVA_Build 11 106154870 4I TGCTTCCAGC ----/ATAA ATAAATATAC 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 ATAA 1 2 253033 CASAVA_Build 11 106155593 1I ATCTTTTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 396 hom 47 1 36 10 A 9 10 253034 CASAVA_Build 11 106158700 2I GGAAACACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 AC 6 7 253035 CASAVA_Build 11 106163352 3I CCTTACTTTG ---/ATT TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 20 1 13 6 ATT 0 1 253036 CASAVA_Build 11 106167477 4D GTGAAGGAGA CAGT/---- CAGTGGAAAC 3070 het 3070 ref 24 10 11 4 CAGT 2 1 253037 CASAVA_Build 11 106168608 1I CTGAATGGGC -/A AAAAGCTGGA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 4 5 253038 CASAVA_Build 11 106170434 2D TGTCCTCACT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 65 het 28 0 22 8 AC 10 9 253039 CASAVA_Build 11 106184158 5D TTCCTAAACA AGTTT/----- AGTTTAAGAA 3070 het 2405 hom 21 6 14 4 AGTTT 2 1 253040 CASAVA_Build 11 106185864 5D TAAAAAAATC AATTT/----- AATTCACATG 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 AATTT 1 0 253041 CASAVA_Build 11 106196962 2D GGATTTGAAT TC/-- TTTTTTGATA 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 TC 1 0 253042 CASAVA_Build 11 106204237 1D TTTTCCTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 50 het 22 0 16 7 T 10 9 253043 CASAVA_Build 11 106221219 1D GCGGCCGATT A/- AAAAAAAAAA 155 het 155 ref 27 17 2 8 A 12 11 253044 CASAVA_Build 11 106235237 1I AACTTCCCTG -/A AAAAAACAGT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 6 7 253045 CASAVA_Build 11 106236213 1D TGAACATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 17 9 T 13 12 253046 CASAVA_Build 11 106238266 1D AATGAGATAT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 8 7 253047 CASAVA_Build 11 106238429 1I AAAAACAAAC -/A AACAAACAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 3 253048 CASAVA_Build 11 106239589 1D TTTAGAGTAG T/- TTTTTCTAAT 2848 het 2848 ref 20 12 7 1 T 6 5 253049 CASAVA_Build 11 106247009 1D AGCAACTAAT A/- AACAATTTTA 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 A 3 2 253050 CASAVA_Build 11 106252343 1D TAATTGCTAC T/- TTAATTCAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 T 3 2 253051 CASAVA_Build 11 106255049 1D CAGAACAGTC T/- TTTTTAGTGC 3070 het 3070 ref 57 30 20 9 T 6 5 253052 CASAVA_Build 11 106268579 1I AGAATGTTCC -/A AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 6 7 253053 CASAVA_Build 11 106269402 2I CATAGGCCAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AT 5 6 253054 CASAVA_Build 11 106276645 1D AGGGAGTCAC A/- TGAATTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 1 0 253055 CASAVA_Build 11 106283338 6D CAATTCTTTT TTTTAA/------ TTTTATTATT 3070 het 562 hom 17 2 10 5 TTTTAA 1 0 253056 CASAVA_Build 11 106289061 2D TTTTCAAAAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 AT 9 8 253057 CASAVA_Build 11 106296087 1I GAACGCCATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 A 8 9 253058 CASAVA_Build 11 106307521 1I TCTGGAAAAT -/C CAATGTCCAT 3070 hom 138 het 53 0 47 17 C 1 2 253059 CASAVA_Build 11 106312654 1D TTGCTCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 12 11 253060 CASAVA_Build 11 106318479 2D ACAATATTCC GT/-- GTGTCACTGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GT 3 2 253061 CASAVA_Build 11 106320248 1D CAGGCATAGT G/- GTGCAGGCCC 3070 hom 36 het 15 0 12 3 G 2 1 253062 CASAVA_Build 11 106321342 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAACAC 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 7 8 253063 CASAVA_Build 11 106336170 1I GTTTTGAATT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 0 1 253064 CASAVA_Build 11 106352879 4I CCATTTCAAA ----/TTGT TTGACCCAGG 3070 hom 120 het 42 0 40 2 TTGT 0 1 253065 CASAVA_Build 11 106356813 2D ACACAGGCAA CC/-- CCACAGGGTT 3070 hom 99 het 38 0 33 6 C 4 2 253066 CASAVA_Build 11 106360576 2D ATGATGGATA TT/-- GTCATAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 T 2 0 253067 CASAVA_Build 11 106369475 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 8 9 253068 CASAVA_Build 11 106371932 1I TGAGAATAAA -/G GAAGTAATAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 G 1 2 253069 CASAVA_Build 11 106408998 1D CTGGAGTAAA G/- GGGGCAGTAC 3070 hom 75 het 31 0 26 6 G 5 4 253070 CASAVA_Build 11 106420723 3D AAAGCACATC AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 78 het 39 0 26 14 AAT 7 6 253071 CASAVA_Build 11 106422887 2D CTATGTGAGT AG/-- AGTCTCCCGT 3070 het 3070 ref 50 23 23 5 AG 2 1 253072 CASAVA_Build 11 106447160 1D ACTATCATTG C/- CTTGACAGTA 3070 hom 81 het 37 0 28 10 C 2 1 253073 CASAVA_Build 11 106450637 1D CTCCACCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 11 10 253074 CASAVA_Build 11 106485732 1D TTTCAAGATT A/- AAACAGACAC 3070 het 3070 ref 36 21 9 7 A 4 3 253075 CASAVA_Build 11 106497887 1D CTGCCCTGGG C/- CGGGGGGAGC 3070 hom 126 het 45 0 41 4 C 2 1 253076 CASAVA_Build 11 106498228 3D ATCACTAAGG CAA/--- CAAGGTCTTT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 CAA 2 1 253077 CASAVA_Build 11 106499640 1I AATTGTTTGA -/T TTTTTTCAGT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 6 7 253078 CASAVA_Build 11 106500688 3I AGAAATTAAT ---/AAC AACAGGAACT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAC 1 2 253079 CASAVA_Build 11 106519127 2D GCATGCCAGG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 12 21 15 AC 9 8 253080 CASAVA_Build 11 106525836 2D CAGGGACTAG AA/-- AAAGTCTACT 3070 het 3070 ref 47 29 16 3 A 5 3 253081 CASAVA_Build 11 106526341 4D AGTCAAGCAG AAAC/---- AAACACACAC 3070 het 3070 hom 48 19 27 5 AAAC 2 1 253082 CASAVA_Build 11 106533131 1I CCTTACTGAC -/T TATACCTTCT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 1 2 253083 CASAVA_Build 11 106558648 4D TTTGTACTCT CTTA/---- CTTACGACAT 3070 het 3070 hom 36 11 21 5 CTTA 2 1 253084 CASAVA_Build 11 106564913 1D ACCATTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 17 10 A 11 10 253085 CASAVA_Build 11 106573405 1D TCTAAGAGAA T/- TTTTGTCCTA 3070 het 3070 hom 28 10 18 1 T 5 4 253086 CASAVA_Build 11 106574702 2I AAAGCAAAAA --/AG AAAGATCTGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AG 0 1 253087 CASAVA_Build 11 106577045 1I AGCCTCTAAC -/A AAAAAAGTAG 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 6 7 253088 CASAVA_Build 11 106589438 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 34 4 13 17 A 17 16 253089 CASAVA_Build 11 106596279 1D CTATGTGTGT C/- CCCCCACCCC 3070 het 3070 ref 57 31 20 6 C 6 5 253090 CASAVA_Build 11 106596640 2I CCATCTCTAT --/TG TGTACCCTAT 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 TG 1 2 253091 CASAVA_Build 11 106597856 2I TCACCTTAAA --/GT GTGTGTGGCC 3070 hom 99 het 43 0 33 10 GT 3 4 253092 CASAVA_Build 11 106600788 1I GGGTAGTAGC -/G CAAGAAAAAG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 G 0 1 253093 CASAVA_Build 11 106602249 1I ATCTCCCCCC -/A CTCTTAATTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 0 1 253094 CASAVA_Build 11 106603563 1D TACCAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 27 0 18 9 A 12 11 253095 CASAVA_Build 11 106606357 1I TAGTTCTCAT -/A ACCAAACTGC 3070 het 3070 ref 38 16 10 12 A 1 2 253096 CASAVA_Build 11 106607394 6I TTCCTTCACC ------/CCACTT CCCCAACAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CCACTT 0 1 253097 CASAVA_Build 11 106613073 1I TTCTTCTGGC -/A AAAAAGGTTC 3070 hom 33 het 15 0 11 4 A 5 6 253098 CASAVA_Build 11 106619393 4D ATGACCGAGG CAGA/---- CAAAGAACTC 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 CAGA 1 0 253099 CASAVA_Build 11 106619807 16D ATTATTACTC TTATAATACAGATTAT/---------------- TAAACTGAGG 3070 het 3070 ref 24 17 8 3 TTATAATACAGATTAT 1 0 253100 CASAVA_Build 11 106622197 2D GAAAAGTTTG AA/-- AGTTTTAACT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 A 3 1 253101 CASAVA_Build 11 106624203 17D CATGAAGTTG GTTAACATATTTGATCA/----------------- GTCAACACCT 3070 het 3070 ref 48 27 18 7 GTTAACATATTTGATCA 1 0 253102 CASAVA_Build 11 106624364 1I TTTCCAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2040 hom 23 6 10 7 A 13 14 253103 CASAVA_Build 11 106626123 4D TTTTGCCATC AGAA/---- AGAAAGACTG 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 AGAA 2 1 253104 CASAVA_Build 11 106629030 1D ACGATTGGCA C/- AAACTACCAG 3070 het 3070 ref 41 24 12 6 C 1 0 253105 CASAVA_Build 11 106629407 3I CCCCATCCTT ---/TTA TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 TTA 0 1 253106 CASAVA_Build 11 106629521 1D CACATCCTCA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 T 8 7 253107 CASAVA_Build 11 106629657 3I CCTCCAAAGA ---/AAG AAGAAGTAAA 2735 het 2322 hom 14 6 6 2 AAG 2 3 253108 CASAVA_Build 11 106631704 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGTTTCAC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 5 4 253109 CASAVA_Build 11 106633177 1D TCAGAACTAA G/- GGTTCTCTAT 3070 hom 81 het 34 0 27 8 G 3 2 253110 CASAVA_Build 11 106634409 1I CCCATCATGA -/C CCCTCAGATC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 C 3 4 253111 CASAVA_Build 11 106637546 1D TTGATGCCAC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 90 het 34 0 29 5 A 8 7 253112 CASAVA_Build 11 106638423 8D TGTTTTTTTT TTTTTTTG/-------- TTTTTGTTTT 3070 het 506 hom 32 4 16 17 TTTTTTTG 1 0 253113 CASAVA_Build 11 106642938 2D AGAATGAAAG AA/-- AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 A 8 6 253114 CASAVA_Build 11 106645596 3D ACAATCTTGA CTT/--- CTTGACCTTT 3070 het 3070 hom 48 23 21 4 CTT 2 1 253115 CASAVA_Build 11 106649354 1I CAGAGTATAG -/A TATTTAAATT 3070 hom 48 het 31 0 17 14 A 0 1 253116 CASAVA_Build 11 106649685 2I TAAGTATGAA --/GT GAAAAGTGGA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 GT 0 1 253117 CASAVA_Build 11 106659471 1D TTAACACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 11 10 253118 CASAVA_Build 11 106659560 4D GCTTTTTTGT TTTC/---- TTTTTCTTAT 3070 het 2922 hom 20 7 11 2 TTTC 1 0 253119 CASAVA_Build 11 106660209 1I TCATATCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 A 8 9 253120 CASAVA_Build 11 106662151 4I CATGTCTTAC ----/TGTT TATCATTAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TGTT 0 1 253121 CASAVA_Build 11 106663821 55D GCCATAATTA CTTAGACTTCTGAGACTTTTAAAAATTTGCCCCAACTATTTCAAGATATTCTTAT/------------------------------------------------------- CTCCTGAAAA 3070 het 3070 ref 35 35 9 7 CTTAGACTTCTGAGACTTTTAAAAATTTGCCCCAACTATTTCAAGATATTCTTAT 1 0 253122 CASAVA_Build 11 106666272 2I TAGCTCCCAC --/AT ATGATAATAT 3070 hom 144 het 54 0 48 6 AT 1 2 253123 CASAVA_Build 11 106675759 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 9 253124 CASAVA_Build 11 106676938 1I AACTTGGGTG -/A ATGGAATGAA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 1 2 253125 CASAVA_Build 11 106678310 4D GAAAAAAGAC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 75 het 27 0 26 3 AAAT 5 4 253126 CASAVA_Build 11 106679081 1D TGAGAAAGCT A/- AAAGTGGCTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 4 3 253127 CASAVA_Build 11 106683264 1I ACTCTTGTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 8 9 A 9 10 253128 CASAVA_Build 11 106685664 1D CATGTGGTTT G/- GCACCTGTAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 G 2 1 253129 CASAVA_Build 11 106685992 2D AGTGTGTGCA GT/-- GTGTGAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 GT 3 2 253130 CASAVA_Build 11 106687182 2D CAATGAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 180 hom 35 4 16 15 A 12 10 253131 CASAVA_Build 11 106688172 4D ACCAACTGAA TTCT/---- TTGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 14 2 TTCT 1 0 253132 CASAVA_Build 11 106693706 3I ACTGTTAGTT ---/TTG TTGTTCTTTT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 TTG 1 2 253133 CASAVA_Build 11 106695140 1I GATTAGATGA -/T TTTTTTTTGC 2926 het 1863 hom 25 5 8 12 T 8 9 253134 CASAVA_Build 11 106696059 5I TTCTTCATTC -----/CTTTT CATTATTTTT 3070 hom 72 het 25 0 23 2 CTTTT 0 1 253135 CASAVA_Build 11 106697662 3D AGATCTACTA CTC/--- TGCCATATTG 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 CTC 1 0 253136 CASAVA_Build 11 106706754 1I CAAGTGGGTC -/A ATTTATAGCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 253137 CASAVA_Build 11 106712652 1D CTGAACATCT A/- AAAAAAAAAA 1116 het 1116 ref 27 22 3 2 A 12 11 253138 CASAVA_Build 11 106713872 1I CAGTTTCCCC -/A AAGGTAACAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 2 3 253139 CASAVA_Build 11 106721172 4D AACTTTATTG TTAC/---- TTACTTCAAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TTAC 2 1 253140 CASAVA_Build 11 106725561 1I AAACTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 863 hom 49 4 33 12 A 10 11 253141 CASAVA_Build 11 106727044 4D GCTACTGTAT AGAG/---- AAAGGGCAAA 3070 het 3070 hom 42 17 23 7 AG 2 0 253142 CASAVA_Build 11 106728219 2D GTGTTCCCAC GA/-- AATGCAAGAG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 GA 1 0 253143 CASAVA_Build 11 106728635 1D AAAAGAGAAG A/- AAAAGAAGAT 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 A 5 4 253144 CASAVA_Build 11 106734992 7D TTGTGAACAA AACAGCC/------- ATGCACAGAT 3070 het 3070 hom 41 16 21 9 AACAGCC 1 0 253145 CASAVA_Build 11 106744061 2D GACCCCCCCC CA/-- CACAAAAATA 3070 hom 22 het 21 0 9 13 CA 3 2 253146 CASAVA_Build 11 106747442 1I TACAGACTGA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 81 hom 33 1 29 3 T 6 7 253147 CASAVA_Build 11 106747519 2I TTGTTAAACA --/TC TGAGGTTCTA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 TC 0 1 253148 CASAVA_Build 11 106748308 1D AAAAGGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 57 22 24 12 A 11 10 253149 CASAVA_Build 11 106754788 4D TAACAAAAAA AAAG/---- AAAGATAGCA 2615 het 2615 ref 22 14 7 4 AAAG 2 1 253150 CASAVA_Build 11 106761259 1I TAAATAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 11 253151 CASAVA_Build 11 106771882 1I AAATGTTATT -/A ACAAGCTGGC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 253152 CASAVA_Build 11 106773788 1I GGACTCTGTG -/A AAAACCCCCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 5 253153 CASAVA_Build 11 106776181 4I AAATTGAAAA ----/AAAC AAACAAACCA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AAAC 2 3 253154 CASAVA_Build 11 106781492 2D TGATGAACTA AC/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AC 1 0 253155 CASAVA_Build 11 106783337 1D TCCCCCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2793 hom 35 10 18 7 A 12 11 253156 CASAVA_Build 11 106783582 7I TGCTGCTGGG -------/TCATTCT TCCCTCTCTA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TCATTCT 0 1 253157 CASAVA_Build 11 106793695 2D GGTTCGAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2321 hom 25 8 10 7 T 16 14 253158 CASAVA_Build 11 106799864 1D ATATATGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 A 11 10 253159 CASAVA_Build 11 106800120 1D CATTTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2247 hom 36 9 16 11 T 12 11 253160 CASAVA_Build 11 106800392 2D CTTTTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2480 hom 19 8 9 4 A 12 10 253161 CASAVA_Build 11 106802111 3D CTCACAAACA AAC/--- AATAGCTCAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 7 AAC 1 0 253162 CASAVA_Build 11 106803164 5I CAGGAATCTT -----/TTTTC TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 TTTTC 0 1 253163 CASAVA_Build 11 106803819 1D CCTCCCACCG A/- AAATTACACA 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 A 4 3 253164 CASAVA_Build 11 106804526 4I12M1I ATAGCTACTG ----CTTTCAGCTCTT-/AATTCTTTCAGCTCTTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 17 2 N/A 0 0 253165 CASAVA_Build 11 106805743 1D GATTCTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1018 hom 39 4 17 18 A 17 16 253166 CASAVA_Build 11 106807222 2D TTAGGATAAT AA/-- AAGTTTAAAG 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 A 4 2 253167 CASAVA_Build 11 106809783 1D AAAATAAATA T/- TTTTCTTTAA 1948 het 1948 ref 11 5 4 2 T 5 4 253168 CASAVA_Build 11 106810372 1I TCAATTACTT -/A AATAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 2 3 253169 CASAVA_Build 11 106810609 11D ATTACACAGC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAGAAA 3070 het 1797 hom 30 10 18 4 A 17 6 253170 CASAVA_Build 11 106813098 3D CATTACCATC ATT/--- ATTGAGTAGT 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 ATT 2 1 253171 CASAVA_Build 11 106818485 1D CAGGCGTGGT G/- GGCACACAAC 3070 hom 39 het 15 0 13 4 G 3 2 253172 CASAVA_Build 11 106819578 2D CTCACTTCAG CA/-- CAGAGCTTCA 3070 het 3070 hom 36 16 19 2 CA 2 1 253173 CASAVA_Build 11 106822727 1D AACCTATACT C/- ATTTTCACAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 C 1 0 253174 CASAVA_Build 11 106825584 5I ATATTATTTG -----/AAAGT AGAGTATGGT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 AAAGT 0 1 253175 CASAVA_Build 11 106863071 1I ATAAATACAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 A 8 9 253176 CASAVA_Build 11 106863995 1I TTAAATTGGC -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 A 7 8 253177 CASAVA_Build 11 106870846 5D AGCCACACTG GCCTC/----- CTGCGGTTCT 2948 het 2948 ref 37 17 10 13 GCCTC 1 0 253178 CASAVA_Build 11 106882945 1I GGGGTAATCA -/T TGCCAATTTA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 1 2 253179 CASAVA_Build 11 106888154 2D TAATATACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 87 het 39 0 30 10 AC 9 8 253180 CASAVA_Build 11 106888246 4I AGGGTTTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 65 het 31 0 22 9 TTTG 3 4 253181 CASAVA_Build 11 106894016 2D TAAAAATAAA AT/-- ACAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 15 13 1 AT 1 0 253182 CASAVA_Build 11 106894753 4I GGTAAATCTC ----/TGTT TGGGGCTCTC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TGTT 0 1 253183 CASAVA_Build 11 106905448 1D TCTCCTACTT C/- TTTTTTTTTT 2060 het 2060 ref 20 11 8 1 C 1 0 253184 CASAVA_Build 11 106913656 1D AGTTGAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2103 hom 26 7 10 9 A 15 14 253185 CASAVA_Build 11 106914158 1I TGACAGTATA -/G TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 G 0 1 253186 CASAVA_Build 11 106915595 1D TTCCCTGATT C/- CTACTGGTAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 2 1 253187 CASAVA_Build 11 106923605 3I TAAGGGTTTT ---/AAG AAGAATATGT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 AAG 1 2 253188 CASAVA_Build 11 106924792 2D ATTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2289 hom 23 8 12 3 T 13 11 253189 CASAVA_Build 11 106939456 14D TTAGAATTAA ATTTATTTATTATT/-------------- ATTTATTTAT 3070 hom 96 het 33 0 33 2 ATTTATTTATTATT 1 0 253190 CASAVA_Build 11 106943959 1D ATTTGTAGAC A/- AAAAAAAAAA 1648 het 1648 ref 33 18 4 11 A 13 12 253191 CASAVA_Build 11 106946788 1D GACTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 39 1 31 7 T 18 17 253192 CASAVA_Build 11 106948576 3D GAGAATTCAT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 117 het 49 0 39 10 TTA 4 3 253193 CASAVA_Build 11 106949257 1D CAGGCACCAC A/- AAAAAATAAT 3070 hom 81 het 38 0 26 12 A 7 6 253194 CASAVA_Build 11 106955808 2D CCAGCTAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 20 0 18 4 T 14 12 253195 CASAVA_Build 11 106968188 1I AATGAATATG -/T TTGTCAGCCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 253196 CASAVA_Build 11 106979813 1D GACCTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1168 het 1168 ref 30 17 4 9 A 13 12 253197 CASAVA_Build 11 107007334 1D AATTGCACTA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 53 het 32 0 16 16 C 11 10 253198 CASAVA_Build 11 107013643 1D CAAACAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 30 2 22 6 A 13 12 253199 CASAVA_Build 11 107017254 2D AAAAAATAAG TA/-- TATATATATA 3070 het 64 hom 23 1 17 8 TA 8 7 253200 CASAVA_Build 11 107024701 1I TTAGTGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 827 hom 32 3 24 5 T 12 13 253201 CASAVA_Build 11 107031096 2I CTTGCACATC --/TG TGTGTATATA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 TG 2 3 253202 CASAVA_Build 11 107038942 2I TGAGATTACA --/CC GGTGTGAGCC 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 C 0 2 253203 CASAVA_Build 11 107052309 2D ACACAGATCC TT/-- TCTTTGAAAT 3070 hom 181 het 64 0 61 3 T 3 1 253204 CASAVA_Build 11 107052623 1D CTCCTCCATT A/- GGGGGAACCC 3070 hom 81 het 34 0 27 8 A 1 0 253205 CASAVA_Build 11 107055314 3I AGTTTGTTAC ---/AAG AAGAGAGTCA 3070 het 3070 ref 59 33 19 7 AAG 1 2 253206 CASAVA_Build 11 107056168 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 833 hom 42 3 27 12 A 13 14 253207 CASAVA_Build 11 107059409 1D TGTGAGAAGA G/- AGAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 G 1 0 253208 CASAVA_Build 11 107061049 1I ATATACTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 9 10 253209 CASAVA_Build 11 107061739 2D TTACAAACAA CT/-- CTCTCTGTTT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 CT 4 3 253210 CASAVA_Build 11 107062758 1I TAATAAAAAA -/T GATAATGTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 0 1 253211 CASAVA_Build 11 107070393 1I ATATAAATTA -/T TTCAAATTGA 3070 het 3070 ref 22 10 7 5 T 2 3 253212 CASAVA_Build 11 107072625 1D AATCTTTAGT A/- AAAAAATACC 3070 hom 102 het 40 0 32 9 A 7 6 253213 CASAVA_Build 11 107079034 1I CTAATAGAAC -/T TTTAGAACTG 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 T 3 4 253214 CASAVA_Build 11 107079953 1D GACCATTTTT G/- CACACCCCAT 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 G 1 0 253215 CASAVA_Build 11 107086446 2I GAGATTAAGA --/TG TGTTTGTGTA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 TG 1 2 253216 CASAVA_Build 11 107088111 1I ATTTGTGTTC -/A GGGGGACATG 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 0 1 253217 CASAVA_Build 11 107121067 2D GTGAAATGTC TG/-- TAAAAGCAGG 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TG 1 0 253218 CASAVA_Build 11 107122773 1I CACCACAGTT -/A TAAAAAAAAG 2470 het 2470 ref 24 12 6 6 A 0 1 253219 CASAVA_Build 11 107130883 1D CCACCTCTAT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 7 6 253220 CASAVA_Build 11 107141090 1D ACAGAGTGGG A/- AAAAAAATCT 1382 het 1382 ref 17 14 3 0 A 8 7 253221 CASAVA_Build 11 107152847 9I TATTTTTTGT ---------/AGAGATGGG ATCTCACTAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AGAGATGGG 0 1 253222 CASAVA_Build 11 107160609 5I TCACTGTGTT -----/ACCCA GGCTGACCTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 ACCCA 0 1 253223 CASAVA_Build 11 107168842 8D ATCTTTTTAT TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 24 8 9 8 TTTC 6 4 253224 CASAVA_Build 11 107176364 2D TAAATAAGGA TT/-- TGTCTGGATA 3070 het 3070 hom 41 15 22 6 T 3 1 253225 CASAVA_Build 11 107177568 2D TGGATCTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2818 hom 24 8 11 5 A 13 11 253226 CASAVA_Build 11 107182610 1I AAACATAAAC -/A AAATTTGCTG 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 A 3 4 253227 CASAVA_Build 11 107211370 2I CCACAGTGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 T 11 13 253228 CASAVA_Build 11 107211682 1D ATTCAGCATG T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 43 19 17 7 T 8 7 253229 CASAVA_Build 11 107212170 4D TTTCTTTTTC TTTT/---- TTGTTTCCCT 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 T 6 2 253230 CASAVA_Build 11 107222151 1D TTGGTAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2469 hom 21 7 13 2 A 11 10 253231 CASAVA_Build 11 107230379 3D AAAAATGATG ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 ATA 5 4 253232 CASAVA_Build 11 107234327 1I TAATAGTGCC -/A ACAGGGTGGG 3070 het 2193 hom 30 8 11 11 A 1 2 253233 CASAVA_Build 11 107240292 4D GGGCTTCCTC ATAG/---- ATAGCTAGGT 3070 het 3070 hom 37 15 19 5 ATAG 2 1 253234 CASAVA_Build 11 107243005 13D CGAACTCCTG ACTTCAGGTGATC/------------- CACCCACCTC 2224 het 2166 hom 14 8 7 0 ACTTCAGGTGATC 1 0 253235 CASAVA_Build 11 107245355 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2095 hom 19 8 11 0 A 15 14 253236 CASAVA_Build 11 107257105 4I TGAAAGCAAG ----/TTAA TTAAGAAAGT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 TTAA 1 2 253237 CASAVA_Build 11 107269231 3I AAGATAAATC ---/AGG AGGAGTCAGT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 AGG 1 2 253238 CASAVA_Build 11 107269365 1I AGATTTGAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 54 24 20 10 T 9 10 253239 CASAVA_Build 11 107279231 1D ACTCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1964 hom 21 6 14 1 T 12 11 253240 CASAVA_Build 11 107289487 4D AAAAAAAAAA AAAC/---- AGATTCCCTT 3070 het 2901 hom 15 7 8 1 AAAC 1 0 253241 CASAVA_Build 11 107293389 3D CCCGTCTCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 32 13 12 9 AAC 7 6 253242 CASAVA_Build 11 107297138 4I GCCATTTTCA ----/CTTT CTTCTTAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 CTTT 0 1 253243 CASAVA_Build 11 107300577 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 AG 1 2 253244 CASAVA_Build 11 107306173 1D ATGTTTTTCC T/- TTTCAAGAAG 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 4 3 253245 CASAVA_Build 11 107310676 1D CAGCCTGGCC A/- AACATGGTGA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 3 2 253246 CASAVA_Build 11 107312342 23D TCTTCCCTTA TCCCACTGGCTTATCTTCTCTTC/----------------------- TCCCACTGGC 3070 het 3070 ref 35 18 15 9 TCCCACTGGCTTATCTTCTCTTC 1 0 253247 CASAVA_Build 11 107322173 1D GTTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1721 hom 19 7 9 3 A 11 10 253248 CASAVA_Build 11 107326116 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2123 het 1011 hom 10 4 6 0 A 13 12 253249 CASAVA_Build 11 107333271 1D GAGCAGGAGA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 45 26 16 4 T 8 7 253250 CASAVA_Build 11 107335057 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 5 A 11 10 253251 CASAVA_Build 11 107336146 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1987 het 1124 hom 15 5 5 6 A 17 16 253252 CASAVA_Build 11 107339008 1D GAAATGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 T 11 10 253253 CASAVA_Build 11 107342247 1I GTAAATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 10 11 253254 CASAVA_Build 11 107343237 4I TTACTTTTTA ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTTG 1 2 253255 CASAVA_Build 11 107347503 1D AAACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 25 1 11 13 A 13 12 253256 CASAVA_Build 11 107347515 2D AAAAAAAAAA AT/-- AAGAACATTT 3070 het 44 hom 26 2 14 11 AT 1 0 253257 CASAVA_Build 11 107348356 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 8 9 253258 CASAVA_Build 11 107362458 18I AATCAACCTA ------------------/AATGCTCAACAATGACAG ATTGGATTGA 3070 het 3070 ref 47 31 10 6 AATGCTCAACAATGACAG 0 1 253259 CASAVA_Build 11 107370282 1D GCTTTTTTTG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 7 6 253260 CASAVA_Build 11 107373760 1D GTTAAAAAAA T/- GATTGAAGTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 0 253261 CASAVA_Build 11 107383691 9D TGTTTGTAGT TTTTTTTTG/--------- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 23 11 10 3 TTTTTTTTG 2 1 253262 CASAVA_Build 11 107392169 5D GGTTTTTCTT TTCTC/----- TTCTCTTCTC 2756 het 2756 ref 32 12 9 12 TTCTC 4 3 253263 CASAVA_Build 11 107396472 1I GTGTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 2888 het 2406 hom 26 11 8 7 T 13 14 253264 CASAVA_Build 11 107398031 13I TCCTCCCACC -------------/TTGGTCTCCCAAA GTGCTGGAAT 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 TTGGTCTCCCAAA 0 1 253265 CASAVA_Build 11 107414653 1D CTTGGAGTAC A/- CTAAAGCAGT 3070 hom 10 het 27 1 21 5 A 1 0 253266 CASAVA_Build 11 107418840 1D CCTGGGACTA C/- AGGAGCGCAC 3070 het 3070 ref 25 13 7 5 C 1 0 253267 CASAVA_Build 11 107420445 1D ACAGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2499 het 2499 ref 19 9 7 3 A 13 12 253268 CASAVA_Build 11 107424056 1D GCTTAAGAAA T/- TTTTTTTTTT 1053 het 1053 ref 25 19 3 3 T 15 14 253269 CASAVA_Build 11 107425185 1D TTGTGACTAG T/- TTTCTTTCAC 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 4 3 253270 CASAVA_Build 11 107439599 3I AATTTAAAAA ---/AAT AAATAAATAA 2984 hom 15 het 9 0 6 3 AAT 0 1 253271 CASAVA_Build 11 107443412 5D CAAAAGTCTT ATGAA/----- ATAATATTCA 3070 het 3070 ref 31 15 14 4 ATGAA 1 0 253272 CASAVA_Build 11 107446562 1I TTCTAAAGGA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 7 8 253273 CASAVA_Build 11 107453550 2I CCTGGGCAAC --/AA GAGTGAAACT 3070 hom 21 het 12 0 8 4 A 0 2 253274 CASAVA_Build 11 107458737 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 10 8 5 T 11 10 253275 CASAVA_Build 11 107465977 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 19 1 14 4 A 10 11 253276 CASAVA_Build 11 107467305 1I TTTCTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 2512 het 2512 ref 19 10 6 3 A 10 11 253277 CASAVA_Build 11 107469213 3D ATTTGGATGA TCT/--- TCTAGCATTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 11 TCT 2 1 253278 CASAVA_Build 11 107476043 1I TTACAAATTG -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 T 6 7 253279 CASAVA_Build 11 107485794 19D ACACACCACC TAGGTAATTTTTTTTTTAT/------------------- TTGCCTAGGT 3070 hom 66 het 23 0 22 3 TAGGTAATTTTTTTTTTAT 1 0 253280 CASAVA_Build 11 107496479 1D ACCCTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 11 17 16 A 12 11 253281 CASAVA_Build 11 107496833 1D TAGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2489 hom 26 7 12 7 A 13 12 253282 CASAVA_Build 11 107499006 2I TATTAAAAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 2242 hom 20 7 9 4 AC 6 7 253283 CASAVA_Build 11 107513873 1I AACAGCGAGA -/C CCTGTCTAAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 2 3 253284 CASAVA_Build 11 107514093 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 41 het 16 0 14 2 T 5 6 253285 CASAVA_Build 11 107517721 4I GATTTTGAAA ----/AAGT AATTCTAGAA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 AAGT 0 1 253286 CASAVA_Build 11 107519873 1I TCTATACAGT -/G AAAAAAAAAA 1076 het 1076 ref 15 5 4 6 G 0 1 253287 CASAVA_Build 11 107520644 1D CCCCGCAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 73 het 32 0 21 11 A 10 9 253288 CASAVA_Build 11 107521982 1D AGACTGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 24 10 4 A 12 11 253289 CASAVA_Build 11 107524104 4D TCTGGGAAAA AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 AATT 3 2 253290 CASAVA_Build 11 107525098 1D TTAAAGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2124 hom 21 6 11 4 T 12 11 253291 CASAVA_Build 11 107534320 1I AAGGGGTAGT -/A ATTCACTCTA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 1 2 253292 CASAVA_Build 11 107536505 1D AAAACTTTTT C/- TTTTCCCCCG 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 C 1 0 253293 CASAVA_Build 11 107541955 1I TCCTGGGCTC -/A AGTGATCCAC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 1 2 253294 CASAVA_Build 11 107553657 1D TAAAGTTCCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 9 8 253295 CASAVA_Build 11 107555218 1D18M3I CATATTATAC TTTTTTTTTGATGGAGTGT---/-TTTTTTTTGACGGAGTGTTCC TCTCGTTGCC 2300 het 2300 ref 38 34 5 10 N/A 0 0 253296 CASAVA_Build 11 107557402 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 8 9 253297 CASAVA_Build 11 107559911 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 536 hom 30 3 22 5 A 11 12 253298 CASAVA_Build 11 107571573 1D TCACCCAGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 T 10 9 253299 CASAVA_Build 11 107572445 4D GAAAAATCTA TAAT/---- TAAATTGGGA 3070 het 3070 hom 39 12 26 2 TAAT 1 0 253300 CASAVA_Build 11 107574450 2I CCAAGCAGAC --/AG GGGTAGGGTA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AG 0 1 253301 CASAVA_Build 11 107580318 1I AGCAACACGT -/G GGGGTTACCT 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 G 4 5 253302 CASAVA_Build 11 107580482 9D CAAAACCCTG GAACCTGCC/--------- GAACCTGCCG 2660 het 2658 ref 38 11 10 21 GAACCTGCC 2 1 253303 CASAVA_Build 11 107587300 1D GCATAATGGC A/- AAAATGCCAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 5 4 253304 CASAVA_Build 11 107592456 1D AGGGTCAGGG A/- AAAAAAAAAA 985 het 985 ref 34 26 3 5 A 11 10 253305 CASAVA_Build 11 107592592 5I AGCATAACCT -----/GGAAA GGAATCATTA 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 GGAAA 0 1 253306 CASAVA_Build 11 107603670 2D TCCTTGAAAT AA/-- GTGTGATTAG 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 A 2 0 253307 CASAVA_Build 11 107609805 1D CAAAACTATG A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 8 7 253308 CASAVA_Build 11 107610778 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 18 10 A 11 12 253309 CASAVA_Build 11 107616640 1D TAGGGCACTT A/- ACCATGAATG 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 A 2 1 253310 CASAVA_Build 11 107620571 1D AATGCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 42 0 38 4 T 11 10 253311 CASAVA_Build 11 107650283 2D AGGTTTTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 TG 6 5 253312 CASAVA_Build 11 107656918 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTCTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 A 2 3 253313 CASAVA_Build 11 107672169 1D TTTTCATCTT C/- CTATACCAAT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 C 2 1 253314 CASAVA_Build 11 107688624 2D CTAATACTGA CT/-- CTGCCACTTC 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 CT 2 1 253315 CASAVA_Build 11 107690392 1D GTTTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 T 13 12 253316 CASAVA_Build 11 107699994 1D AAAATATTTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 118 het 45 0 40 5 A 9 8 253317 CASAVA_Build 11 107701923 3D TGCTGCTTTC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 ATT 5 4 253318 CASAVA_Build 11 107710156 1D CTATAGACTG T/- TACTTTCATT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 2 1 253319 CASAVA_Build 11 107757873 4D TTCCTCCTTG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 41 16 15 11 CT 10 8 253320 CASAVA_Build 11 107768368 1D TTTGGGGTGT C/- TTCTGCTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 C 1 0 253321 CASAVA_Build 11 107770651 1D GATTAGGAAA C/- AGCATAGTGG 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 C 1 0 253322 CASAVA_Build 11 107778669 2I CCTTTGGAAT --/CC CCCTCTCTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 C 3 5 253323 CASAVA_Build 11 107793905 1D CTGATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 30 1 21 9 A 13 12 253324 CASAVA_Build 11 107796073 1D TTTTGTAATT A/- ACCATTTATA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 2 1 253325 CASAVA_Build 11 107805357 1I GTTTTATAAT -/A AAAAATCAAA 3070 hom 92 het 37 0 32 5 A 5 6 253326 CASAVA_Build 11 107807115 1D TAGTATAAAC A/- AAAAAAAAAT 1380 het 1380 ref 34 28 3 4 A 10 9 253327 CASAVA_Build 11 107829057 2I GCACGTTGTG --/CA CATGTACCCT 3070 hom 27 het 12 0 9 3 CA 1 2 253328 CASAVA_Build 11 107839185 4D ATGTTTAGAA AGAC/---- AGAGGCTAAA 3070 het 3070 hom 30 13 17 1 AGAC 1 0 253329 CASAVA_Build 11 107840283 1I CGCCAGGCTG -/A GAATGCAGTG 2085 het 2085 ref 20 10 6 4 A 0 1 253330 CASAVA_Build 11 107842923 3I GGAGAAGAAA ---/AAC AACTAACCTA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 AAC 1 2 253331 CASAVA_Build 11 107850726 1I TTCCTTAAAG -/A TGTAGCCGGG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 0 1 253332 CASAVA_Build 11 107857664 1D TGTTCAAAGC A/- AAAAAGAGAT 3070 het 3070 ref 37 15 17 5 A 6 5 253333 CASAVA_Build 11 107876262 1I ACACCCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3028 het 3028 ref 32 12 11 9 T 13 14 253334 CASAVA_Build 11 107884876 1I TTCCTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 T 10 11 253335 CASAVA_Build 11 107891399 32I CTTAGTTGGA --------------------------------/TGGATTGGAGCAATATATGTAATTAAAAGTGC TATATAATAT 3070 het 3070 hom 20 8 12 3 TGGATTGGAGCAATATATGTAATTAAAAGTGC 0 1 253336 CASAVA_Build 11 107899073 1D TTGGCATCCT A/- AAGTGCTGGG 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 A 3 2 253337 CASAVA_Build 11 107909147 1D CTACATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3036 het 3036 ref 27 13 7 7 T 11 10 253338 CASAVA_Build 11 107918272 1D AGGTGTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 11 13 T 12 11 253339 CASAVA_Build 11 107922761 1D TTTTCTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 171 hom 23 1 17 5 T 13 12 253340 CASAVA_Build 11 107924167 1I AGTTTTTGAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 8 9 253341 CASAVA_Build 11 107928102 2I3M3I GTGAAGGAAG --AGA---/GCAGAGTG AAGCCCTGTG 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 N/A 0 0 253342 CASAVA_Build 11 107938999 1I CTAGTTAGGG -/T TTTAAGTCCC 3070 hom 108 het 44 0 35 9 T 3 4 253343 CASAVA_Build 11 107945780 4I ACGGAGGTGC ----/CTAG CTAGACCTCT 3070 hom 89 het 37 0 29 8 CTAG 1 2 253344 CASAVA_Build 11 107946165 11I GCATTTTTAA -----------/TTTTTATTATT TTTTTATTAT 2875 het 2875 ref 14 6 6 2 TTTTTATTATT 1 2 253345 CASAVA_Build 11 107947988 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 742 hom 25 4 10 11 A 12 13 253346 CASAVA_Build 11 107948344 1D TCACTTTCTG T/- TTTCCTAGTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 4 3 253347 CASAVA_Build 11 107950313 2D AGACCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2892 hom 40 11 23 6 A 13 11 253348 CASAVA_Build 11 107956630 2D AAAATGTGGC AT/-- ATATATACTG 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 AT 4 3 253349 CASAVA_Build 11 107972839 1D TCTCCAAAGG T/- TTGTTTTATG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 3 2 253350 CASAVA_Build 11 107974474 2D GAAAATTAAC AG/-- AGTGATATGG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AG 2 1 253351 CASAVA_Build 11 107974966 2I CTCCGGAAAA --/AG AGAGACGGAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AG 2 3 253352 CASAVA_Build 11 107982813 1D CACTTACAGA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 T 7 6 253353 CASAVA_Build 11 107990487 5D2M4D GAGAAGAAGC TACTTCTGAAA/-----CT---- GAAGTATTAA 3070 het 3070 ref 51 32 22 3 N/A 0 0 253354 CASAVA_Build 11 107992145 4D CAGCCTGGGT GACA/---- GACAGAGACC 2591 het 2591 ref 18 8 7 4 GACA 2 1 253355 CASAVA_Build 11 107995743 1I AATGGAGCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 28 0 24 4 T 9 10 253356 CASAVA_Build 11 107999609 1I TCTATTCTTA -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 6 7 253357 CASAVA_Build 11 108018371 1I TAAAAAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 8 9 253358 CASAVA_Build 11 108021382 1D AGCTATGGAA C/- CATCACCATG 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 C 2 1 253359 CASAVA_Build 11 108021585 1I TATGACTGGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 8 9 253360 CASAVA_Build 11 108026058 1I TAAATGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 11 12 253361 CASAVA_Build 11 108027416 1I CCCCAACTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3038 hom 32 11 17 4 A 10 11 253362 CASAVA_Build 11 108035399 1I AACTTGATGG -/T TAAAAAAAAA 3070 het 229 hom 33 3 24 6 T 1 2 253363 CASAVA_Build 11 108039348 4D AAGTCTACTT TCTC/---- TATTATTTTG 3070 het 3070 hom 39 14 17 10 TC 2 0 253364 CASAVA_Build 11 108045034 1D GGAGCTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 T 15 14 253365 CASAVA_Build 11 108061578 1D GGCATGGTCA T/- TGTGTTAAGC 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 2 1 253366 CASAVA_Build 11 108073541 11D AGTTGAGAAA TTTCCCTGTAT/----------- TTTCCTTAAC 3070 het 3070 hom 27 12 16 1 TTTCCCTGTAT 1 0 253367 CASAVA_Build 11 108079276 1D AAGTGTAGAT C/- TTTTTTTTTG 3070 het 2174 hom 20 8 8 4 C 1 0 253368 CASAVA_Build 11 108084284 1D CATTAAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 579 hom 28 2 12 14 T 16 15 253369 CASAVA_Build 11 108104442 16D ACATTTGTTC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2934 hom 26 12 10 6 T 27 11 253370 CASAVA_Build 11 108106787 1I TACCTGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 624 hom 37 2 29 6 T 13 14 253371 CASAVA_Build 11 108112092 1D TCCCTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 2914 het 1622 hom 31 6 9 17 T 17 16 253372 CASAVA_Build 11 108114189 1I GAGACTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 28 12 T 13 14 253373 CASAVA_Build 11 108162944 1D AATGTTTAGC A/- CTCCCTTTAG 3070 het 3070 hom 53 24 23 6 A 1 0 253374 CASAVA_Build 11 108169824 1D GAGATAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 39 2 21 16 T 13 12 253375 CASAVA_Build 11 108170496 1D TTCTGTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 11 10 253376 CASAVA_Build 11 108170839 1D TTTCGGCTCA C/- CTGTAACCTC 3070 hom 47 het 18 0 15 3 C 2 1 253377 CASAVA_Build 11 108179197 1I CTAGTAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 15 16 253378 CASAVA_Build 11 108187830 1I TTATAAATAT -/G GGGGGGGGGA 3070 hom 46 het 23 0 14 9 G 9 10 253379 CASAVA_Build 11 108189239 6D TTTTCAAATA CTTTAT/------ CTTTGCTGGT 3070 het 3070 ref 47 25 19 5 CTTTAT 1 0 253380 CASAVA_Build 11 108201969 1D TTAATTTCAT A/- ATAGCTGTGA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 2 1 253381 CASAVA_Build 11 108206951 4D TTTAAATCAT AAAC/---- AAGTTCTATT 3070 het 3070 ref 21 14 7 1 AAAC 1 0 253382 CASAVA_Build 11 108208145 1D CCAAGAGTCA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 7 6 253383 CASAVA_Build 11 108210197 2I AGGCACCTAC --/CT CTACCATATT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 CT 1 2 253384 CASAVA_Build 11 108216352 5D ATTATTAGAT AAAAC/----- AAGAGTTATT 3070 het 3070 ref 28 14 10 7 AAAAC 1 0 253385 CASAVA_Build 11 108225686 1D TAGGAAAAAT A/- AAGCATTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 3 2 253386 CASAVA_Build 11 108230666 1I GGACACAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 31 1 21 9 T 10 11 253387 CASAVA_Build 11 108230912 1I TTCTGCCTAG -/A TTATATTATG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 0 1 253388 CASAVA_Build 11 108235386 1I AGTAAGGTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 A 9 10 253389 CASAVA_Build 11 108254728 1I AACATAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 47 1 29 17 T 10 11 253390 CASAVA_Build 11 108263897 2I CAGCTTTTTT --/CC CCCCCCCACT 2690 het 2690 ref 35 16 11 8 C 7 9 253391 CASAVA_Build 11 108272292 1I CCTTCACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 51 1 37 13 T 11 12 253392 CASAVA_Build 11 108281248 2D TAGATTGTTT AA/-- GGGGGGGGGG 1149 het 386 hom 14 4 7 3 A 2 0 253393 CASAVA_Build 11 108281325 1I TTATAGTACG -/T TCTTTATATT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 2 253394 CASAVA_Build 11 108283125 1I GGAATGATGA -/G GGAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 G 2 3 253395 CASAVA_Build 11 108295893 1I TGTCCTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 36 1 28 7 T 10 11 253396 CASAVA_Build 11 108298156 1D ACTCCAGCCT G/- GGCAACAGAG 2675 hom 21 het 10 0 8 2 G 3 2 253397 CASAVA_Build 11 108302251 1I TTAACTGGAT -/G GATTTATGAC 3070 hom 66 het 29 0 22 7 G 1 2 253398 CASAVA_Build 11 108318470 4D AGTTTCTGGC CAGG/---- CAGGCATGGT 3070 hom 72 het 27 0 22 5 CAGG 2 1 253399 CASAVA_Build 11 108324655 1D TTTTTTTTTT G/- GGAGACAGAG 3070 het 951 hom 31 4 24 3 G 3 2 253400 CASAVA_Build 11 108344104 2I TCCTTGCCTC --/TT TGCAGTGGAA 3070 hom 157 het 56 0 53 3 T 1 3 253401 CASAVA_Build 11 108344711 1D GCACTATTTT G/- GGCTCACTGC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 G 3 2 253402 CASAVA_Build 11 108350108 1I AAAGCTTCAC -/A AGTGACAGTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 2 253403 CASAVA_Build 11 108351231 1D AATATTTGCA G/- GCACACACAA 3070 hom 72 het 31 0 23 8 G 2 1 253404 CASAVA_Build 11 108351328 1I CACTCTATGA -/T TTTTTTTTTT 2353 het 732 hom 18 4 9 5 T 15 16 253405 CASAVA_Build 11 108357036 1D GTAAAGTGAA C/- CCAGGGTAGT 2852 het 2852 ref 33 18 11 5 C 3 2 253406 CASAVA_Build 11 108358929 6D TGGTCCCAAG CAGATT/------ CAGATTCCTG 3070 hom 132 het 47 0 43 7 CAGATT 2 1 253407 CASAVA_Build 11 108364075 1I TTGGAAAGAC -/T TTTCTTTTTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 3 4 253408 CASAVA_Build 11 108366653 2I TCTCTCTCTC --/TT GACTTTTATA 3070 het 525 hom 52 2 48 2 T 0 2 253409 CASAVA_Build 11 108366973 2I ATATGTATAT --/TA TATATATATA 3070 het 41 hom 18 2 14 2 TA 6 7 253410 CASAVA_Build 11 108366985 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTTTA 3070 het 5 hom 17 1 13 3 TG 3 4 253411 CASAVA_Build 11 108372895 1I CTATACTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 33 1 30 2 T 10 11 253412 CASAVA_Build 11 108382428 1I AGGCACTTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 27 11 5 A 9 10 253413 CASAVA_Build 11 108394495 1D TGAAGTTAAC T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 8 7 253414 CASAVA_Build 11 108395067 5D GAGAGCATGG TCTTA/----- TCTTAGGTTA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 TCTTA 2 1 253415 CASAVA_Build 11 108397461 1D CAAATCATCT C/- CCAAAGGCCC 3070 het 3070 ref 51 22 15 15 C 3 2 253416 CASAVA_Build 11 108398665 1I AACACTAACA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 1 2 253417 CASAVA_Build 11 108412774 6D AGAACAGGGG TGGGGC/------ AAGTCAAAGG 3070 het 3070 ref 44 23 20 2 TGGGGC 1 0 253418 CASAVA_Build 11 108416826 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 5 A 12 11 253419 CASAVA_Build 11 108417237 2D AAGACTTGAC TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 19 18 8 T 10 8 253420 CASAVA_Build 11 108418366 1I TGTGTACAAA -/G TGATGAACCC 3070 het 3070 ref 57 30 24 3 G 0 1 253421 CASAVA_Build 11 108433737 1D GGAAAAACAC T/- TTTTTTTTTC 1653 het 1653 ref 36 27 4 6 T 10 9 253422 CASAVA_Build 11 108468595 2I CTAAGAAGAC --/TG TGCTCCTGTT 3070 het 3070 hom 66 25 33 8 TG 1 2 253423 CASAVA_Build 11 108470258 1I TCTTCAAAAT -/A AAATAAAGTT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 3 4 253424 CASAVA_Build 11 108476733 1D TACATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2694 hom 29 11 9 9 T 14 13 253425 CASAVA_Build 11 108483916 1D TTTTTTTTTT A/- AGTAGAGATG 2298 hom 12 het 5 0 5 0 A 2 1 253426 CASAVA_Build 11 108531134 1D AGAACTTGAA G/- GAGATACTTG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 G 2 1 253427 CASAVA_Build 11 108532243 7D CATAGGTTGA TTTCTGT/------- TACCAAATTT 3070 hom 117 het 40 0 40 6 TTTCTGT 1 0 253428 CASAVA_Build 11 108538630 1D AGCCTCTCTC A/- ACATTTTTTT 3070 hom 118 het 43 0 40 4 A 2 1 253429 CASAVA_Build 11 108539229 1D CCCTGACAGG C/- CCCCAGTGTG 3070 hom 78 het 30 0 23 8 C 5 4 253430 CASAVA_Build 11 108540522 1D CATAGACAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 82 het 35 0 32 3 A 10 9 253431 CASAVA_Build 11 108562435 6I GCAAGTGTTC ------/TCACTG TTCACTTCCC 3070 hom 27 het 10 0 9 1 TCACTG 0 1 253432 CASAVA_Build 11 108562631 1D ATGGGCATTT G/- GGTTGGTTCC 3070 het 3070 hom 17 7 10 1 G 3 2 253433 CASAVA_Build 11 108570462 1I TTCCCTCTTC -/T TCCCTCCTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 1 2 253434 CASAVA_Build 11 108577671 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1715 het 1715 ref 37 20 7 10 A 15 14 253435 CASAVA_Build 11 108581672 1I CTGCGCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 21 6 T 10 11 253436 CASAVA_Build 11 108584018 1D TTCTTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 739 hom 39 3 30 6 T 13 12 253437 CASAVA_Build 11 108585275 1D AATAATCCAG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 83 het 37 0 29 8 T 8 7 253438 CASAVA_Build 11 108590344 2D ATATACACAC AT/-- ATATGTGTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AT 3 2 253439 CASAVA_Build 11 108594624 1I TTTTGAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 925 hom 28 2 21 5 T 10 11 253440 CASAVA_Build 11 108608078 4D ATAATTTTCT CAAA/---- CAGAGAAACT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 CAAA 1 0 253441 CASAVA_Build 11 108608992 6D ATATATGTAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 50 het 30 0 26 9 AT 11 8 253442 CASAVA_Build 11 108619824 3I CTAGAAAACA ---/ACT AAAGAAATGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 ACT 0 1 253443 CASAVA_Build 11 108620264 6D AAAAAAAAAA AAAAAG/------ AAATTTTGAG 3070 hom 12 het 32 1 19 12 AAAAAG 1 0 253444 CASAVA_Build 11 108639776 1I TTCTGTTGGG -/T TTTTTTTTTT 2778 het 2778 ref 27 11 10 6 T 11 12 253445 CASAVA_Build 11 108646353 1I ATGTTGAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1496 hom 36 4 27 5 T 9 10 253446 CASAVA_Build 11 108648533 1I CTTTGTTTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 384 hom 38 1 32 5 T 9 10 253447 CASAVA_Build 11 108649954 1D TGCCGGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 15 14 253448 CASAVA_Build 11 108650449 1D GCCAGGCATG T/- TTTTTCACAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 6 5 253449 CASAVA_Build 11 108662470 2I CATAAAAATT --/AA GAGAGGTAAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 0 2 253450 CASAVA_Build 11 108673790 1I CACGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 1875 hom 12 het 5 0 5 0 C 4 5 253451 CASAVA_Build 11 108689056 1I ATTTACTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 43 0 30 13 T 12 13 253452 CASAVA_Build 11 108697856 1D CTCAAGCGAT C/- CCACCCACCT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 3 2 253453 CASAVA_Build 11 108717292 1I TGTAGAGGCA -/G GGTCTCACTT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 G 2 3 253454 CASAVA_Build 11 108722839 4I TATTATTTCA ----/TCTG TACTTCCATT 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 TCTG 0 1 253455 CASAVA_Build 11 108724952 1I GCAATTTTTC -/T TTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 6 7 253456 CASAVA_Build 11 108731575 3I GTTTAGGGGC ---/AGA AGAAGACCTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AGA 2 3 253457 CASAVA_Build 11 108732110 1I CTTTATGTTG -/A AATTTCTTCT 3070 hom 86 het 34 0 28 6 A 2 3 253458 CASAVA_Build 11 108741438 1I ACTGAGGGCC -/T TTTGGGGAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 3 4 253459 CASAVA_Build 11 108747769 1I GAACCATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 11 12 253460 CASAVA_Build 11 108749406 3I TGGCAGATGG ---/AGA AGAAGACAAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 AGA 2 3 253461 CASAVA_Build 11 108750993 1I GAACTAAATG -/A AAAAAAAAAA 1853 het 1853 ref 37 18 6 13 A 12 13 253462 CASAVA_Build 11 108752025 4I AGGTAAGTTA ----/GTTT ATTTTCCAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GTTT 0 1 253463 CASAVA_Build 11 108758383 1I AGGTCATTCC -/T TTTTTGTTCT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 5 6 253464 CASAVA_Build 11 108787054 2I AGCAGTATTT --/AG AGTCTGTGGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AG 1 2 253465 CASAVA_Build 11 108821589 1D TTAAAGTGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2669 hom 19 7 9 3 A 10 9 253466 CASAVA_Build 11 108839392 1I AGCAATTTGT -/A AAAAAAAAAA 3046 het 3046 ref 32 14 8 10 A 11 12 253467 CASAVA_Build 11 108841688 1D TGTCAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 683 hom 36 3 18 15 A 16 15 253468 CASAVA_Build 11 108844044 1I ACTCAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 20 1 17 2 A 11 12 253469 CASAVA_Build 11 108853348 3D CACTCGCTAT AAA/--- AAAATTAAAT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 7 4 253470 CASAVA_Build 11 108889645 2D GGAGAATACA AG/-- AGAGATAGAG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 AG 3 2 253471 CASAVA_Build 11 108891896 4D GTCTTTTTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2564 hom 29 8 15 6 A 15 11 253472 CASAVA_Build 11 108901075 1D TAAAATTGTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 10 9 253473 CASAVA_Build 11 108901472 30D ACAAACAAAC AAAAAACAAAAAACAAAAAAACAAAAACAA/------------------------------ AAAAAAAGAA 2313 het 2313 ref 15 15 6 2 AAAAAACAAAAAACAAAAAAACAAAAACAA 1 0 253474 CASAVA_Build 11 108901579 3D AAGCATTAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 31 13 13 8 AAC 7 6 253475 CASAVA_Build 11 108905926 1D GTAACAAACC T/- GCACGTTGTA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 1 0 253476 CASAVA_Build 11 108907058 1I GTTTTTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 232 hom 33 1 24 8 T 9 10 253477 CASAVA_Build 11 108915317 1D AGGCCCACAG T/- TAAGTACTAC 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 2 1 253478 CASAVA_Build 11 108964151 1D CACATACGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 47 16 24 8 T 9 8 253479 CASAVA_Build 11 108968928 1I AGTGTTTGAG -/T TTCAAATATG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 2 3 253480 CASAVA_Build 11 108975073 1D AGAACAGAGG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 7 6 253481 CASAVA_Build 11 108981829 1D TCTATTACTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 9 8 253482 CASAVA_Build 11 108983830 1D AAGTGTAAAG A/- AAAAAGTATT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 6 5 253483 CASAVA_Build 11 108989210 1I ATGAGGGGGT -/G GGGGGGATAA 3070 het 2144 hom 28 7 13 8 G 6 7 253484 CASAVA_Build 11 108990591 2I AATCAGTAGT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 A 9 11 253485 CASAVA_Build 11 108996706 1D TAGATTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 7 15 7 T 12 11 253486 CASAVA_Build 11 109006264 5D TGATATAATA TAATT/----- TGTCTATTTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 8 TAATT 1 0 253487 CASAVA_Build 11 109014032 2D TGGCTCTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 14 12 253488 CASAVA_Build 11 109023143 5D TTGCAGTAAT AGAGA/----- AGAGAAGTCA 3070 het 3070 hom 34 12 16 8 AGAGA 2 1 253489 CASAVA_Build 11 109023657 1D CCTTTCCCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 A 10 9 253490 CASAVA_Build 11 109027895 2I TATTTTTCCC --/CT GTTAGCAATT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 CT 0 1 253491 CASAVA_Build 11 109031204 1I AAAACTCTCC -/T TTTTAAAACC 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 T 4 5 253492 CASAVA_Build 11 109041228 2I TCTGCAGGAC --/TG TGTTTTATAC 3070 het 3070 hom 31 7 20 4 TG 1 2 253493 CASAVA_Build 11 109042814 2D TTGAGAGGAA AC/-- ACACAATGAA 3070 het 3070 hom 31 12 19 1 AC 3 2 253494 CASAVA_Build 11 109050872 1I GAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 A 9 10 253495 CASAVA_Build 11 109067435 1I AAATAAATGA -/C CCCCCCCCCA 3070 het 132 hom 21 1 16 4 C 9 10 253496 CASAVA_Build 11 109077146 2I ATTACCTGAC --/TT TATATACTAC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 1 3 253497 CASAVA_Build 11 109101194 1D CATGTAAGTG A/- AAAAAAAAAA 1868 het 1868 ref 32 26 4 2 A 13 12 253498 CASAVA_Build 11 109123006 2D AGTTAATAAC TT/-- AATCCTGTGG 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 T 2 0 253499 CASAVA_Build 11 109127200 1D TATAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 11 10 253500 CASAVA_Build 11 109140835 2D GGAAAAAGAG CT/-- CTGAAGCCCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CT 2 1 253501 CASAVA_Build 11 109165828 1I AAATAAGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 9 10 253502 CASAVA_Build 11 109192760 1I AGAATGAATT -/C CCCCCCCACT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 C 7 8 253503 CASAVA_Build 11 109197237 2D TTTAAAATGT GA/-- GATTCAAACC 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 GA 2 1 253504 CASAVA_Build 11 109202110 1I TGCAAGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 9 10 253505 CASAVA_Build 11 109203278 3D ATATTTGTAG AGC/--- AGCATCTATT 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 AGC 2 1 253506 CASAVA_Build 11 109206339 1I TTACTTACTC -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 7 8 253507 CASAVA_Build 11 109207229 1D GTCAAAGGCC T/- GACTGACAGA 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 1 0 253508 CASAVA_Build 11 109215831 2D ACTTATTTGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 11 9 253509 CASAVA_Build 11 109217158 4D AAAGAGAAAA AAGG/---- AAGGAAGGAA 3070 hom 72 het 31 0 22 12 AAGG 5 4 253510 CASAVA_Build 11 109220365 1I TGATGGTCTC -/A AGGGCATTCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 2 253511 CASAVA_Build 11 109221477 1I TAGACAAGAG -/A TTTTTTTCCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 0 1 253512 CASAVA_Build 11 109232519 1D AAACTGAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 A 9 8 253513 CASAVA_Build 11 109233582 11D GCATTTCAGT AGCAAACAGTA/----------- ACTAGTTTTG 3070 het 3070 ref 37 24 16 6 AGCAAACAGTA 1 0 253514 CASAVA_Build 11 109241784 12I CAGCAGCAGC ------------/CCCAGGTCCCCA TGACATCTTA 3070 hom 107 het 38 0 30 8 CCCAGGTCCCCA 0 1 253515 CASAVA_Build 11 109243070 3I TGGATCACAT ---/GAA GGACTTCATG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 GAA 0 1 253516 CASAVA_Build 11 109253545 1D AAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2211 het 2211 ref 30 22 5 3 T 12 11 253517 CASAVA_Build 11 109260211 1I ACTCAAGGAA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 7 8 253518 CASAVA_Build 11 109265968 1D AGCATACTTT G/- TCTTTGTCAC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 G 1 0 253519 CASAVA_Build 11 109273832 2I TAGTAATTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2687 hom 25 7 10 8 T 10 12 253520 CASAVA_Build 11 109287444 1D CATCAACAGA G/- GAGTAGATTT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 G 2 1 253521 CASAVA_Build 11 109291596 1I ATTTTCTGTA -/G GATTACTGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 2 253522 CASAVA_Build 11 109300523 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 22 0 16 6 A 17 14 253523 CASAVA_Build 11 109314626 1D CCAAATACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 8 20 4 A 10 9 253524 CASAVA_Build 11 109316595 1I CTCCAGCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 31 2 17 12 A 15 16 253525 CASAVA_Build 11 109355361 1I ACTACGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 24 1 14 9 A 14 15 253526 CASAVA_Build 11 109362846 2I TAGTCCAAGT --/AG AGAGACACAC 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 AG 2 3 253527 CASAVA_Build 11 109373040 1D ATAATATAGC T/- TTTTTTTTTT 2860 het 1457 hom 30 4 11 15 T 15 14 253528 CASAVA_Build 11 109379489 2D AACTACAGTC AT/-- GTGTCGCTTA 3070 het 3070 hom 41 17 21 5 AT 1 0 253529 CASAVA_Build 11 109381670 1I ACAACCCCTT -/A AAAATTGGGT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 4 5 253530 CASAVA_Build 11 109387239 1D TTAAAACAGC T/- TTTTTTTTTT 2619 het 710 hom 23 7 7 9 T 17 16 253531 CASAVA_Build 11 109395116 1D GAATAGTATG C/- CATCACCCTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 C 2 1 253532 CASAVA_Build 11 109411102 3D GAAATCAAAT AAC/--- AACGTATATG 3070 het 3070 hom 43 17 18 11 AAC 2 1 253533 CASAVA_Build 11 109411806 2D TTTTCTCATA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 14 12 253534 CASAVA_Build 11 109418085 1I TGTAAGGTCA -/G GGTAGGCCTC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 2 3 253535 CASAVA_Build 11 109428772 1D CAATGGGAAA G/- ATGTATAAAC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 G 1 0 253536 CASAVA_Build 11 109435081 1D GTGATATATA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 9 8 253537 CASAVA_Build 11 109436130 75D AAATGGTGCT GAACAGTTTCTCTTAGTTTTCAGTTTCTATCATGATTCATCCAACAAGTCATTATTGAAAAATTATTGTGAGCCA/--------------------------------------------------------------------------- GACAGTATCC 3070 hom 75 het 17 0 25 4 GAACAGTTTCTCTTAGTTTTCAGTTTCTATCATGATTCATCCAACAAGTCATTATTGAAAAATTATTGTGAGCCA 1 0 253538 CASAVA_Build 11 109437359 1D TTGGTTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 620 hom 41 2 24 15 A 15 14 253539 CASAVA_Build 11 109439782 1I TTTCAGTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 9 10 253540 CASAVA_Build 11 109452557 3D ACATTTTAAC AGG/--- AGATTTGGTG 3070 het 3070 hom 42 12 25 7 AGG 1 0 253541 CASAVA_Build 11 109458829 1D AGAGAGAGCA G/- CTGATGTGAA 3070 het 3070 ref 43 21 14 10 G 1 0 253542 CASAVA_Build 11 109460410 1I TGATAGGTTG -/T TGAGGGAAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 1 2 253543 CASAVA_Build 11 109464313 6D CTTGTACACA GCAGGT/------ GCTTAGTAAA 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 GCAGGT 1 0 253544 CASAVA_Build 11 109467324 1D GACTCTATAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 A 9 8 253545 CASAVA_Build 11 109475796 1I AGTCCTACAC -/A AAAGTAATTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 3 4 253546 CASAVA_Build 11 109475960 4I TAGTCATAAG ----/AATT AATTGATAGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 AATT 1 2 253547 CASAVA_Build 11 109476043 1I GGCTCCCTGA -/G GGCAAGGACT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 2 3 253548 CASAVA_Build 11 109486647 3I TGTTCTGTCA ---/CTT CTTCTGAGTA 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 CTT 1 2 253549 CASAVA_Build 11 109487360 1D TTGTTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 11 10 253550 CASAVA_Build 11 109487495 1I TTTCTGAGAC -/A AAGTCTTGGT 3070 het 219 hom 24 2 15 7 A 2 3 253551 CASAVA_Build 11 109487912 2D ACGTGCACAC AT/-- GTACACATGA 3070 het 3070 hom 56 21 26 11 AT 1 0 253552 CASAVA_Build 11 109488935 1D CGCCCCCCCC T/- ACCAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 1 0 253553 CASAVA_Build 11 109495332 1D CCAGACATCC T/- TCAATCAGAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 2 1 253554 CASAVA_Build 11 109497536 1D CAGCAGTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 T 10 9 253555 CASAVA_Build 11 109500751 1D GCAGCTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 T 15 14 253556 CASAVA_Build 11 109505756 2D TTTTGATTGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 T 11 9 253557 CASAVA_Build 11 109510439 1D GCTGCTGTGA T/- TTTGTTACTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 T 4 3 253558 CASAVA_Build 11 109511727 4I TGAGATAACA ----/TTAT TTATCTAATA 3070 het 3070 hom 43 10 24 9 TTAT 1 2 253559 CASAVA_Build 11 109514172 2D AGATAAAAAG AT/-- ATGTGTATAA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 AT 2 1 253560 CASAVA_Build 11 109519998 1I AGAAAATCAG -/T TGCATGTCCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 2 253561 CASAVA_Build 11 109526290 1I AGGTTTTCAA -/T TTTCATTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 3 4 253562 CASAVA_Build 11 109527835 27D TATGTTAGAT GGTTCTAGGGTTTCCCAGGGAACCCTA/--------------------------- GAACAAAATA 3070 hom 102 het 33 0 35 1 GGTTCTAGGGTTTCCCAGGGAACCCTA 1 0 253563 CASAVA_Build 11 109529489 1D ATAAGCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 32 1 25 6 T 11 10 253564 CASAVA_Build 11 109530305 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 15 1 12 2 A 13 14 253565 CASAVA_Build 11 109531234 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2992 het 105 hom 19 1 10 8 A 15 14 253566 CASAVA_Build 11 109531473 1I TTTAGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 205 hom 33 1 26 6 A 10 11 253567 CASAVA_Build 11 109531860 1I AGAGTAAATT -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 7 8 253568 CASAVA_Build 11 109532049 53D TGGCAGAGGC ATTATATTTTTATATATTTTATATATATAAATATATATTTATATTTTTAGGTA/----------------------------------------------------- TTATAGGTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 ATTATATTTTTATATATTTTATATATATAAATATATATTTATATTTTTAGGTA 1 0 253569 CASAVA_Build 11 109534971 1I ACTGTTCGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 8 253570 CASAVA_Build 11 109536348 2D AAAACTTTTT TC/-- TCTTTTGTAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TC 2 1 253571 CASAVA_Build 11 109548111 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1918 het 128 hom 9 3 5 3 A 18 17 253572 CASAVA_Build 11 109549297 3D GTTCCCCAGG TAC/--- TTCCACAGGC 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 TAC 1 0 253573 CASAVA_Build 11 109554276 1D CAAAAACAGT G/- GCTGTGCTGG 3070 het 3070 hom 55 25 27 3 G 2 1 253574 CASAVA_Build 11 109568790 1D TTGAAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 27 2 19 6 A 11 10 253575 CASAVA_Build 11 109569478 5D TACAAAACAA AATAG/----- AATAAACTAT 3070 hom 120 het 42 0 41 4 AATAG 1 0 253576 CASAVA_Build 11 109577480 2D GATGACAGTA TT/-- TTAGCTGAAG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 4 2 253577 CASAVA_Build 11 109579993 2D GAAAAGAAAT GA/-- GACACCACTT 3070 hom 72 het 27 0 22 5 GA 2 1 253578 CASAVA_Build 11 109593843 3I TCTTCCTCTA ---/GAT GATGTTTTAA 3070 hom 109 het 41 0 37 4 GAT 1 2 253579 CASAVA_Build 11 109597946 5D AATGCAAATG TATAT/----- TATGTCTATA 3070 hom 90 het 33 0 31 5 TATAT 1 0 253580 CASAVA_Build 11 109601838 1I AAAGAAGAAG -/A AAAAAAATAC 1935 het 1935 ref 23 14 5 4 A 7 8 253581 CASAVA_Build 11 109606881 1D GCCCTTCCAG A/- AAAGGTCCAG 3070 hom 62 het 25 0 21 4 A 4 3 253582 CASAVA_Build 11 109608491 4D TCTCAACAAA TAAT/---- TAAGATTATG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TAAT 1 0 253583 CASAVA_Build 11 109609633 3I TGAGCTTCAA ---/GTC AGTGACAGAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GTC 0 1 253584 CASAVA_Build 11 109628712 2D CAACTCATTA CT/-- CTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 CT 2 1 253585 CASAVA_Build 11 109632973 1I AAGACAATTG -/T AGTTATTAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 0 1 253586 CASAVA_Build 11 109639498 3D TAAAATCTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 18 0 13 5 A 14 11 253587 CASAVA_Build 11 109646148 2I TATGAACATC --/AT AGAGTATACT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 0 1 253588 CASAVA_Build 11 109649950 3D CTAAATCAGA CTT/--- CTTATTTCCC 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 CTT 2 1 253589 CASAVA_Build 11 109650586 2D CACACTTCTC AT/-- ATATTCTGTT 3070 hom 80 het 31 0 26 6 AT 3 2 253590 CASAVA_Build 11 109654165 1I GTAAGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 29 1 20 8 T 10 11 253591 CASAVA_Build 11 109655697 1D ACTTTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 26 1 21 5 A 12 11 253592 CASAVA_Build 11 109666766 4I CAAATAAAAC ----/TTTA TTTATAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTTA 1 2 253593 CASAVA_Build 11 109674255 1I ATCGATGAAT -/A AAGACAGCTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 2 3 253594 CASAVA_Build 11 109675363 7D TCTCTGGTCA TCCTCAC/------- TGCTCATTTT 3070 het 3070 ref 43 30 13 4 TCCTCAC 1 0 253595 CASAVA_Build 11 109677718 2D CATCTCTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2339 hom 27 9 12 7 A 14 12 253596 CASAVA_Build 11 109678211 3D AGCCCAAAAC CTT/--- CTAAGTTGAG 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 CTT 1 0 253597 CASAVA_Build 11 109679177 1I CTAAAAAAAA -/G AAAAAATTAA 3070 het 2371 hom 24 9 11 4 G 0 1 253598 CASAVA_Build 11 109682183 1D TTTTTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2969 hom 35 13 19 3 T 12 11 253599 CASAVA_Build 11 109687898 1I TGCTAGCCCA -/G GGGGGAAATA 3070 het 3070 hom 37 9 21 7 G 5 6 253600 CASAVA_Build 11 109695957 1I AAAACTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 15 12 T 10 11 253601 CASAVA_Build 11 109700508 2I AGAAAGAAAC --/AG AAGTTATCCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AG 0 1 253602 CASAVA_Build 11 109702829 1D TGACTACTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 56 het 23 0 18 5 A 10 9 253603 CASAVA_Build 11 109708645 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 37 het 15 0 13 2 A 9 10 253604 CASAVA_Build 11 109709828 4I TGATGCTTGT ----/GTAG GTAGGCCATA 3070 hom 90 het 37 0 28 9 GTAG 1 2 253605 CASAVA_Build 11 109712812 1D GCCTGGCCTA T/- TTTTTTTTTT 2091 het 730 hom 12 2 6 4 T 15 14 253606 CASAVA_Build 11 109712975 1I TTTCTTAAAC -/A AAAGTCAATC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 3 4 253607 CASAVA_Build 11 109713266 1D CCAGCTACCT G/- GGGGGGCTGA 1967 hom 15 het 6 0 6 0 G 7 6 253608 CASAVA_Build 11 109714264 1I AACCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 28 0 20 8 A 10 11 253609 CASAVA_Build 11 109714983 1D TCCACCTCCA G/- GGGTTCAAAG 3070 hom 45 het 18 0 14 4 G 4 3 253610 CASAVA_Build 11 109718000 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 19 8 T 10 11 253611 CASAVA_Build 11 109728922 2D TGAGGTGGGA GG/-- TTCACCTGAG 3070 het 3070 hom 24 8 13 4 G 2 0 253612 CASAVA_Build 11 109731096 1I AGCACTTATG -/A AAAAAGGATA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 5 6 253613 CASAVA_Build 11 109739832 2D CTAGATCTCT CA/-- GTTGGTTCCA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 CA 1 0 253614 CASAVA_Build 11 109740684 1I CTCACTAACC -/T TGTGGTCTTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 1 2 253615 CASAVA_Build 11 109742731 1I TCCCCCCATA -/C CCTTTCAGAG 3070 hom 105 het 43 0 34 9 C 2 3 253616 CASAVA_Build 11 109742915 1I GTCCTGAAAT -/G AGTTTTATTA 2123 hom 15 het 9 0 6 3 G 0 1 253617 CASAVA_Build 11 109746425 1I TTTGGCAAAC -/T TTTGGTAATC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 3 4 253618 CASAVA_Build 11 109756532 1D GAGGAGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 19 20 16 T 13 12 253619 CASAVA_Build 11 109764804 1D TGGGAGCTAT A/- GACTGGAGCT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 1 0 253620 CASAVA_Build 11 109772116 1D GATCATGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 19 7 2 T 10 9 253621 CASAVA_Build 11 109788572 1D GTGGTATGTC A/- AAAAAATCTC 3070 hom 154 het 53 0 52 2 A 7 6 253622 CASAVA_Build 11 109796512 4I TCTAATAAAA ----/CTAT CTATCTCATG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 CTAT 1 2 253623 CASAVA_Build 11 109800457 1I AAATCCTACT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 8 9 253624 CASAVA_Build 11 109801690 1D CCCCACAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 38 1 30 7 A 11 10 253625 CASAVA_Build 11 109802800 2I TTTTTTCCCA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 9 11 253626 CASAVA_Build 11 109804576 1I TGGTCTTACT -/A AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 5 6 253627 CASAVA_Build 11 109809671 2D ACATTCTGGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AC 7 6 253628 CASAVA_Build 11 109811959 1I TATTTTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 11 12 253629 CASAVA_Build 11 109816094 1D GGATCATCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 52 28 20 5 T 9 8 253630 CASAVA_Build 11 109819235 1I TGTAGGAAAA -/T TGTCTCAAGT 2746 het 2746 ref 23 10 7 6 T 1 2 253631 CASAVA_Build 11 109821340 1D TACAGTACAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 19 18 1 T 8 7 253632 CASAVA_Build 11 109827066 1D ATGAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 12 11 253633 CASAVA_Build 11 109829406 1D AAGGAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 T 13 12 253634 CASAVA_Build 11 109833348 4I TTCACCTATT ----/AGAG AGAACAGAAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 AG 1 3 253635 CASAVA_Build 11 109833684 3I AAAATTAAAG ---/ATA ATAGTAATAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 ATA 1 2 253636 CASAVA_Build 11 109836151 1D ATAGAGGGGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 8 7 253637 CASAVA_Build 11 109837492 1I GTAATTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 10 11 253638 CASAVA_Build 11 109842688 4D ATACAAAATT AAGC/---- AAGCAGAGCC 3070 het 3070 hom 39 16 21 4 AAGC 2 1 253639 CASAVA_Build 11 109843380 2I CATTTGGCTC --/TG TGGCAGTCAC 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 TG 1 2 253640 CASAVA_Build 11 109844478 1D GATAAGTTTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 A 9 8 253641 CASAVA_Build 11 109846791 1D AAACCAAGAG T/- TCTTGAGGTT 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 T 2 1 253642 CASAVA_Build 11 109850325 1I AGTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 12 11 T 11 12 253643 CASAVA_Build 11 109861643 1D CTTTCATAAT G/- GGGAAAAAAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 4 3 253644 CASAVA_Build 11 109867085 1D TTCTGGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 9 11 7 T 11 10 253645 CASAVA_Build 11 109879233 1D AATTGGTCCA T/- TTCATCTAAG 3070 het 3070 hom 33 8 18 7 T 3 2 253646 CASAVA_Build 11 109892315 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2771 het 206 hom 10 1 8 1 T 13 12 253647 CASAVA_Build 11 109895534 1I TTGCTACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 9 10 253648 CASAVA_Build 11 109909651 4I CACGTGGGAG ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 ref 64 29 20 15 CA 6 8 253649 CASAVA_Build 11 109914342 1D TAATGCATCC A/- TGGACCACTG 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 1 0 253650 CASAVA_Build 11 109916731 1D CTGCATCCCT G/- CCTCTCCCTG 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 G 1 0 253651 CASAVA_Build 11 109921522 1I GACAATGGGG -/A ACATTATCAT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 1 2 253652 CASAVA_Build 11 109922089 1I ATTAAAAACA -/G AAACCACATG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 0 1 253653 CASAVA_Build 11 109933788 5I TGCTCTGATC -----/TTAGT TATTTCTTGC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TTAGT 0 1 253654 CASAVA_Build 11 109935261 2D ATTGTATAAC TT/-- TAAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 3 1 253655 CASAVA_Build 11 109950227 1D GGAAAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2934 hom 39 11 17 12 A 13 12 253656 CASAVA_Build 11 109954442 4I GTTGTTGTGG ----/TCTT TCTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 TCTT 1 2 253657 CASAVA_Build 11 109960327 1I TCCCAAAAAG -/T TACAAATATA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 1 2 253658 CASAVA_Build 11 109960779 2I TTTCTGATTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 AT 6 7 253659 CASAVA_Build 11 109963698 1I ATTACTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 10 11 253660 CASAVA_Build 11 109966055 1D ACCCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1415 het 1415 ref 35 15 6 15 A 18 17 253661 CASAVA_Build 11 109978157 1I CCACAACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 8 9 T 10 11 253662 CASAVA_Build 11 109981452 1D CACTTAAGGC A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 8 7 253663 CASAVA_Build 11 109986245 4I ATCTAAACAC ----/AATT AATAATACTA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 AATT 0 1 253664 CASAVA_Build 11 110000561 1I ATGTATCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 11 12 253665 CASAVA_Build 11 110002877 1I CTTTCAATTT -/C CATAGTATTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 1 2 253666 CASAVA_Build 11 110010876 1D ATGAGAACAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 T 10 9 253667 CASAVA_Build 11 110015172 2D TTATTCGATA CC/-- CCCCCCCCAC 3070 het 2703 hom 29 10 15 5 C 10 8 253668 CASAVA_Build 11 110058933 1I GCAGAGATTT -/A AAAAGTACCT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 4 5 253669 CASAVA_Build 11 110060806 9I GGAAACAATG ---------/GGAACACAT GGACAGAAAC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 GGAACACAT 0 1 253670 CASAVA_Build 11 110061131 3I CCATAAAATT ---/AGA AGAAGTTTAA 3070 het 3070 hom 37 13 23 1 AGA 1 2 253671 CASAVA_Build 11 110061428 1I GTGCCACATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 8 9 253672 CASAVA_Build 11 110065895 1I CCTGCTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 19 16 14 A 14 15 253673 CASAVA_Build 11 110070392 1D GCCTAACCAT A/- AATGAATAAA 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 A 3 2 253674 CASAVA_Build 11 110072405 1I TTTTATCCCA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 8 9 253675 CASAVA_Build 11 110080510 1D ATAAACTGGG C/- TATATTGCCT 3070 het 3070 hom 44 15 21 9 C 1 0 253676 CASAVA_Build 11 110083797 1D CATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 T 11 10 253677 CASAVA_Build 11 110084386 4I TCACAGCAGT ----/TTTA TTTGTGATAG 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 TTTA 0 1 253678 CASAVA_Build 11 110098722 1I CTTTTTAATG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 T 8 9 253679 CASAVA_Build 11 110101958 1I CTGATGATAG -/T TTTTTTTTTT 2840 het 2840 ref 20 10 6 4 T 10 11 253680 CASAVA_Build 11 110103213 1I TAAGTTGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 11 22 9 T 9 10 253681 CASAVA_Build 11 110117521 2I CCACAGCAGT --/TG TGGCATTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 TG 1 2 253682 CASAVA_Build 11 110126137 1I TTTTTTTTTT -/G CTAGTATAAT 2858 het 2858 ref 26 14 10 2 G 0 1 253683 CASAVA_Build 11 110128700 1D GGTTGGTAGA T/- TTTTTTTTTT 2910 het 2910 ref 28 12 7 9 T 12 11 253684 CASAVA_Build 11 110129448 1D TGTTCAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 11 10 253685 CASAVA_Build 11 110130176 1D CACTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 10 7 T 15 14 253686 CASAVA_Build 11 110134758 1I AAATGCAACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 T 9 10 253687 CASAVA_Build 11 110148896 1D CACCTCTCTG A/- CCTCATCCCC 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 1 0 253688 CASAVA_Build 11 110149229 1D TAGGTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 14 13 253689 CASAVA_Build 11 110157200 1D GTAGTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2525 hom 34 7 17 10 T 13 12 253690 CASAVA_Build 11 110170090 3D TTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1652 het 1652 ref 18 8 6 5 T 15 12 253691 CASAVA_Build 11 110172686 10D ACACTACCTT AAAACAAAAC/---------- AAAACAAAGC 3070 het 3070 ref 44 27 14 5 AAAAC 3 1 253692 CASAVA_Build 11 110175166 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1438 het 33 hom 20 1 10 9 T 19 18 253693 CASAVA_Build 11 110180909 5D ATTCAATTCA CAAAG/----- GATCCATTAG 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 CAAAG 1 0 253694 CASAVA_Build 11 110181909 2I CCTGTGCTCT --/GA CAGGGCAGTG 3070 het 3070 ref 61 27 28 6 GA 0 1 253695 CASAVA_Build 11 110186825 5I TTTTTGTGAG -----/AATTA AATAAGATAA 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 AATTA 0 1 253696 CASAVA_Build 11 110190196 3D TATTAACCTC TTA/--- TTATCAGAAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 TTA 2 1 253697 CASAVA_Build 11 110190882 1D AATGTATACA T/- TTTTTTTGCC 2981 het 2981 ref 18 11 7 2 T 8 7 253698 CASAVA_Build 11 110197790 1I TTGCAGGTTA -/T TTTAACATGA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 3 4 253699 CASAVA_Build 11 110205284 1I TAAAGCTGAC -/T TTTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 T 5 6 253700 CASAVA_Build 11 110205465 2I ATCAAGAGAC --/AT CTCATCTACT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 AT 0 1 253701 CASAVA_Build 11 110227017 2I GTCACAGCTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 17 het 45 1 26 18 TG 7 8 253702 CASAVA_Build 11 110232349 1D CGAACCTCAC A/- TGAGGAGATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 0 253703 CASAVA_Build 11 110235719 1D CTCATTAATT G/- GTTCCCCCTC 3070 hom 92 het 37 0 32 6 G 2 1 253704 CASAVA_Build 11 110239347 2D ACATATACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 328 hom 42 2 34 8 AT 7 6 253705 CASAVA_Build 11 110254037 12I TATGCTTCCA ------------/TATATGCTTCCT TATATATGCT 3070 hom 54 het 25 0 17 8 TATATGCTTCCT 0 1 253706 CASAVA_Build 11 110305008 26D TATCTATGTG TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 3070 hom 84 het 30 0 29 4 TA 23 10 253707 CASAVA_Build 11 110307903 5D GTTATGAGTC TTTAG/----- TTTATTTTAC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TTTAG 1 0 253708 CASAVA_Build 11 110328879 1D GAGGCTGAGA G/- GGTCAGAGCA 3070 hom 111 het 40 0 35 6 G 3 2 253709 CASAVA_Build 11 110329119 2I AATTCCTAAC --/AT AGTATTTTCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 0 1 253710 CASAVA_Build 11 110337801 4D TTGTCTCAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 AAAG 4 3 253711 CASAVA_Build 11 110352093 1D CTGGCATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 11 10 253712 CASAVA_Build 11 110354092 1I TAAGTAAGAT -/A AGCCAGCCAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 1 2 253713 CASAVA_Build 11 110379859 1I TGGCAAGAAG -/A TGCCCTGGAC 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 A 0 1 253714 CASAVA_Build 11 110393997 1D TGTGTTTCAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 18 10 8 A 9 8 253715 CASAVA_Build 11 110395659 2I CTCCTCCACC --/CT GAGATGTCTC 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 CT 0 1 253716 CASAVA_Build 11 110413238 1D GTCCATTGGT C/- CTGAAGCAAT 3070 het 3070 hom 68 29 34 5 C 2 1 253717 CASAVA_Build 11 110420346 1I CCACTTATAA -/G TAAAAAGATG 3070 het 3070 hom 33 7 21 5 G 0 1 253718 CASAVA_Build 11 110436310 1D GGCAATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 A 13 12 253719 CASAVA_Build 11 110450060 2D GAACAAGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2226 hom 42 14 14 14 A 17 15 253720 CASAVA_Build 11 110456748 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 687 het 687 ref 23 11 5 7 A 15 16 253721 CASAVA_Build 11 110461068 1D GTCACCTCTT A/- ACAGATTTTT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 A 2 1 253722 CASAVA_Build 11 110461678 2I AGGCAGAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 10 12 253723 CASAVA_Build 11 110477707 1D AATGAAACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 A 10 9 253724 CASAVA_Build 11 110485293 4I AGCATCAGAC ----/ACAA ACAATTTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 ACAA 1 2 253725 CASAVA_Build 11 110485485 1I AATTTTTTTT -/A AAAAAAACCT 3070 het 2263 hom 27 8 15 4 A 7 8 253726 CASAVA_Build 11 110508943 1D TGCTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 36 1 27 8 T 11 10 253727 CASAVA_Build 11 110518683 1D GATGATGTGG A/- AAAAAAAAAA 1296 het 1296 ref 33 27 3 3 A 11 10 253728 CASAVA_Build 11 110527969 12I ACCATTACTT ------------/AAAGAGCACTAA ACCAGTTTGC 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 AAAGAGCACTAA 0 1 253729 CASAVA_Build 11 110532394 1I AATGAGTGTT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 6 7 253730 CASAVA_Build 11 110533066 1D GTGTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 2808 het 2808 ref 21 9 9 4 A 15 14 253731 CASAVA_Build 11 110541913 2I CATAATTTTC --/CT CTGTTTCTTC 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 CT 1 2 253732 CASAVA_Build 11 110545508 2D CGCGCGCATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3 hom 42 1 32 9 CA 9 8 253733 CASAVA_Build 11 110555862 4D GTGTACCTAT GTGA/---- GTGTGTGCAC 3070 het 3070 hom 43 16 20 9 GTGA 1 0 253734 CASAVA_Build 11 110567459 4I CAGATATTGC ----/CTTT ATTTATTTAT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 CTTT 0 1 253735 CASAVA_Build 11 110589679 1D TAGGCCGTAG C/- CAGGGAGTGG 3070 het 3070 ref 43 18 12 13 C 2 1 253736 CASAVA_Build 11 110590876 1D ACTACATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1068 hom 19 4 9 7 A 13 12 253737 CASAVA_Build 11 110591587 4D TTCTTTTTGC TTGT/---- TTGTTTATGC 2799 het 2799 ref 22 16 6 1 TTGT 2 1 253738 CASAVA_Build 11 110593025 1I AAGAAAAAAA -/C AATACAAAAT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 C 0 1 253739 CASAVA_Build 11 110594189 1D CTCAAGACCG T/- TAAGGTCATC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 2 1 253740 CASAVA_Build 11 110594555 1D CTACTCCCAC T/- TTTATAGGGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 4 3 253741 CASAVA_Build 11 110601760 1I AAAATATATG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 7 8 253742 CASAVA_Build 11 110602281 1I GTGAAAGCAG -/A AAAAAAGCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 253743 CASAVA_Build 11 110604819 1I TTAATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 16 8 A 11 12 253744 CASAVA_Build 11 110611552 1I TAATATAAAC -/A AAATAGACAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 3 4 253745 CASAVA_Build 11 110619976 2D CCCTGCTTGG AA/-- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 9 7 253746 CASAVA_Build 11 110621011 1I ACTCTTTTTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 7 8 253747 CASAVA_Build 11 110645150 1I GAAAAAAAAA -/C ATCTTCCGAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 C 0 1 253748 CASAVA_Build 11 110652587 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAG 3070 het 1506 hom 19 4 13 2 AG 1 0 253749 CASAVA_Build 11 110652686 2D AAGTGCTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2980 hom 27 13 10 4 A 14 12 253750 CASAVA_Build 11 110659356 1D GAGTGAAGGA G/- TCCATGAGGC 3070 het 3070 ref 39 22 13 6 G 1 0 253751 CASAVA_Build 11 110662438 5I ATGACCACAT -----/AAAAC AAAACTCATT 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 AAAAC 1 2 253752 CASAVA_Build 11 110677447 9D ATGCTGTTCA TGTGCAATG/--------- TGTGACTTCA 3070 het 3070 hom 41 19 20 4 TGTGCAATG 1 0 253753 CASAVA_Build 11 110680249 4D TAGTTGAGAT TAAA/---- TAAATGTTAG 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 TAAA 2 1 253754 CASAVA_Build 11 110689386 1D AACAGTAGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 9 8 253755 CASAVA_Build 11 110695951 1D AAAAAAAAAA T/- TTTGCCGGAC 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 4 3 253756 CASAVA_Build 11 110734536 2D CACACATACA CT/-- CTCACACACT 3070 hom 91 het 53 0 28 25 CT 2 1 253757 CASAVA_Build 11 110734632 2I CATACACATA --/CT CTCACACACA 3070 hom 138 het 47 0 45 2 CT 1 2 253758 CASAVA_Build 11 110737139 1D GCAGTCTAAC G/- GGGAAGACAA 3070 hom 75 het 30 0 25 6 G 4 3 253759 CASAVA_Build 11 110739995 1D ATTTGGCCCC T/- ATAAGGGCTT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 1 0 253760 CASAVA_Build 11 110741793 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 21 0 15 6 A 16 14 253761 CASAVA_Build 11 110743552 1D CGACACTGCA G/- GTTAATCATC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 G 2 1 253762 CASAVA_Build 11 110748347 1D TCTGCAGGGC T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 8 7 253763 CASAVA_Build 11 110749694 1I CTACAAGTGC -/T TTGTCCCCAG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 2 3 253764 CASAVA_Build 11 110753153 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 20 1 16 3 A 14 12 253765 CASAVA_Build 11 110754624 1I ACAAGTCACA -/C CCTGGCAGAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 C 2 3 253766 CASAVA_Build 11 110759012 3I AGTTTCTCTT ---/CTC CAAAATACCT 3070 hom 156 het 55 0 52 3 CTC 0 1 253767 CASAVA_Build 11 110778155 1I ATGTGATTTT -/G CTCCTCATTC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 G 0 1 253768 CASAVA_Build 11 110786119 1I TCTGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 37 1 27 9 T 11 12 253769 CASAVA_Build 11 110788321 4D TTGTCCTAAG TTTC/---- TTTCTTTCTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTTC 3 2 253770 CASAVA_Build 11 110792571 1D CCTGGGTGGG C/- CAATGTGAGC 3070 hom 62 het 29 0 22 7 C 2 1 253771 CASAVA_Build 11 110793436 15D TTTGGTTCCA TCTTGCAAAAGCTGG/--------------- GCAGAAAGAA 3070 hom 102 het 37 0 34 8 TCTTGCAAAAGCTGG 1 0 253772 CASAVA_Build 11 110805874 2D GTTGTTGGTG TT/-- TTTTGTTTTG 689 het 689 ref 41 21 8 13 T 6 4 253773 CASAVA_Build 11 110808587 4D TCAAAAAAAT AAAG/---- AAAGAAAATA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 AAAG 2 1 253774 CASAVA_Build 11 110817051 1D CTCTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 72 hom 27 1 15 11 T 14 13 253775 CASAVA_Build 11 110818645 1D AAAGACAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 32 0 23 9 A 11 10 253776 CASAVA_Build 11 110824821 1D CATAGTTATA C/- CCAAAAAAAA 3070 hom 58 het 25 0 20 6 C 3 2 253777 CASAVA_Build 11 110831977 1D GGAGGGGCTT C/- CCATGCAATG 3070 hom 66 het 27 0 18 10 C 3 2 253778 CASAVA_Build 11 110834235 7D CTTTGATGCT CCTAGGC/------- CCATAAGCTC 3070 hom 84 het 29 0 25 8 CCTAGGC 1 0 253779 CASAVA_Build 11 110837607 1D CGAGATTGCG C/- CATTGCCCTC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 C 2 1 253780 CASAVA_Build 11 110854907 1D AGCTGAAAAC T/- TTCCAAATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 3 2 253781 CASAVA_Build 11 110858773 1I AAAACTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 11 12 253782 CASAVA_Build 11 110864597 2D AGAGACAACT CA/-- CAGAATAGGA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 CA 2 1 253783 CASAVA_Build 11 110864990 1I TGAAGCAGGA -/G AATCACTTGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 253784 CASAVA_Build 11 110866215 2I TCTCAAAAAT --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 8 10 253785 CASAVA_Build 11 110867877 1D GTTGATTATA T/- TTTTTCCCCT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 6 5 253786 CASAVA_Build 11 110872828 2I CAATTGACAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 9 11 253787 CASAVA_Build 11 110876615 1I AGTAATCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 18 13 T 10 11 253788 CASAVA_Build 11 110877004 1D CTAGATAACA G/- TAAAGCACTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 G 1 0 253789 CASAVA_Build 11 110904095 2I CATCTCTACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 13 15 253790 CASAVA_Build 11 110907237 5D CATGACTCAA TCAAT/----- TCAATTCAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 8 TCAAT 3 2 253791 CASAVA_Build 11 110913951 4D GGAGGGGGCT TCTG/---- TCTAATTAAA 3070 het 3070 ref 39 16 18 7 TCTG 1 0 253792 CASAVA_Build 11 110927940 2D TGTATGTGTA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 375 hom 43 3 34 6 TG 5 4 253793 CASAVA_Build 11 110936867 3D TTTTTCAAAG AAT/--- AATAAAATCA 3070 hom 91 het 34 0 31 3 AAT 2 1 253794 CASAVA_Build 11 110938117 1D CAGCTTAAAA G/- TTTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 G 1 0 253795 CASAVA_Build 11 110943918 4D GAACATAAAC TGAG/---- TATTAGAGAA 3070 het 3070 ref 17 9 7 1 TGAG 1 0 253796 CASAVA_Build 11 110950669 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 9 253797 CASAVA_Build 11 110964862 1I ATCCAAGTTG -/T TGCTTTATTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 2 253798 CASAVA_Build 11 110967029 1D CTCCAGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 867 hom 43 2 34 7 T 12 11 253799 CASAVA_Build 11 110975789 4D45M1I ACATTTGCCT TATCTATCTGTGCTAAACTACTTGACAGTAAGTTGCATATATCAAAAGG-/----TATCTGTGCTAAACTACTTGACAGTAAGTTGCATATATCAAAAGGT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 20 13 9 5 N/A 0 0 253800 CASAVA_Build 11 110984934 1I TACTTTTAAA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 7 8 253801 CASAVA_Build 11 110986526 3D TAATTCTTTG TCC/--- TCCTGTATAA 3070 het 3070 ref 22 13 7 3 TCC 2 1 253802 CASAVA_Build 11 110991073 1D ACTCTGTATC A/- AATAAATAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 3 2 253803 CASAVA_Build 11 110993743 2I TTATATATAC --/AT GTCACCATAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 0 1 253804 CASAVA_Build 11 110997430 2D TATTCATTCA TC/-- TATCTATTGA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 TC 1 0 253805 CASAVA_Build 11 110998649 4D TTCAGTACTT TAAA/---- TATGTTGCTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 TAAA 1 0 253806 CASAVA_Build 11 111007784 1D CATCTGACTA G/- GCTTACGCCA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 G 2 1 253807 CASAVA_Build 11 111023486 1D CAGAGGGAGA C/- CCCCATCTCG 2509 hom 37 het 24 0 12 12 C 5 4 253808 CASAVA_Build 11 111024211 5D TATAACAAAA TACCT/----- TAAACTGGGT 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 TACCT 1 0 253809 CASAVA_Build 11 111027678 4D TCATTCATTC ATTT/---- AACAGATATG 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 ATTT 1 0 253810 CASAVA_Build 11 111050006 1D AGACTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 132 hom 30 1 18 11 A 12 11 253811 CASAVA_Build 11 111065834 1D TAGTCTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 T 10 9 253812 CASAVA_Build 11 111065919 2D TGTGTATGTG TA/-- TATATATATA 2452 het 2452 ref 27 12 11 4 TA 8 7 253813 CASAVA_Build 11 111066207 1D AAGGTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1979 hom 29 11 10 8 T 17 16 253814 CASAVA_Build 11 111078860 4I AACCAAAGTC ----/TGTT TGTTTCTAGA 3070 hom 114 het 48 0 38 10 TGTT 1 2 253815 CASAVA_Build 11 111080845 1I TTCTTTCCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 9 10 253816 CASAVA_Build 11 111092349 1I CAACTCTACT -/A AAAAATACAA 3070 het 500 hom 17 2 15 0 A 5 6 253817 CASAVA_Build 11 111115282 1I TAAGGTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 11 12 253818 CASAVA_Build 11 111124136 1D AATCATAAAC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 A 9 8 253819 CASAVA_Build 11 111131525 1I CATCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1094 het 224 hom 26 5 7 14 T 17 18 253820 CASAVA_Build 11 111133770 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 775 het 775 ref 22 10 5 7 A 19 18 253821 CASAVA_Build 11 111144589 2D ATTATTGTGT TG/-- TGTGTGTGTG 1063 het 1063 ref 44 28 3 14 TG 10 9 253822 CASAVA_Build 11 111144989 1I ATGTAAAAAG -/T TCACCTGGGG 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 1 2 253823 CASAVA_Build 11 111149693 1I TTGTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 2726 het 2317 hom 34 10 8 16 T 14 15 253824 CASAVA_Build 11 111159831 5D TTCTTTGCGC TATAT/----- TATAATTAAG 1189 het 1189 ref 30 20 5 8 TATAT 1 0 253825 CASAVA_Build 11 111188984 1I23M2I TCAAAGAAGC -GACTGTCTTTTCACCAGCTGGTG--/GGACTGTCTTTTCACCAGCTGGTGCT TAGACAACTG 3070 hom 114 het 36 0 39 6 N/A 0 0 253826 CASAVA_Build 11 111198167 1D CAGGGTGAAA C/- CCCTGTCTCT 3070 hom 38 het 17 0 13 4 C 4 3 253827 CASAVA_Build 11 111202326 1D TCCAGAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2499 hom 29 10 14 5 A 12 11 253828 CASAVA_Build 11 111205466 1I CAATATCACA -/T TGTTTACATC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 1 2 253829 CASAVA_Build 11 111229014 1D ACTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 1216 het 1216 ref 33 24 4 5 A 13 12 253830 CASAVA_Build 11 111263984 1D CATACCATAA T/- TTCTATATGT 3070 het 41 hom 20 1 14 5 T 3 2 253831 CASAVA_Build 11 111264424 4D CAACGCTTAT TTTG/---- TTTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 41 26 13 3 TTTG 1 0 253832 CASAVA_Build 11 111276120 1I ACTGTTCTTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 6 7 253833 CASAVA_Build 11 111276829 1D TTTATTGTTG C/- CTATCTTTCT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 C 2 1 253834 CASAVA_Build 11 111321712 1D CTGACATGGA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 89 het 38 0 31 8 T 9 8 253835 CASAVA_Build 11 111336529 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1516 het 1516 ref 20 13 4 3 A 15 14 253836 CASAVA_Build 11 111358317 1I GGCCAGGGAG -/C CCTGGAACCT 3070 hom 70 het 27 0 21 6 C 2 3 253837 CASAVA_Build 11 111379733 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 2822 het 2822 ref 19 8 6 5 A 9 10 253838 CASAVA_Build 11 111391866 1D GCCTCAGCCT C/- CCCAAGTAAC 1036 hom 7 het 3 0 3 0 C 4 3 253839 CASAVA_Build 11 111411892 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 1552 hom 10 het 4 0 4 0 T 5 6 253840 CASAVA_Build 11 111420976 1I CTCAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 24 0 16 8 A 12 13 253841 CASAVA_Build 11 111421212 1D GGCATCTTTA G/- GTTGTTTAGT 3070 hom 50 het 21 0 17 4 G 2 1 253842 CASAVA_Build 11 111442572 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 15 1 11 3 A 13 14 253843 CASAVA_Build 11 111459133 1D TGAAGAGATT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 282 hom 35 1 33 1 A 1 0 253844 CASAVA_Build 11 111465588 1I GGCTTCTCTT -/A ACTGCTTCTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 253845 CASAVA_Build 11 111472847 4I TGATGAAATG ----/GAGT GAGTCTTCCA 3070 het 3070 hom 52 16 20 16 GAGT 1 2 253846 CASAVA_Build 11 111487258 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 10 9 253847 CASAVA_Build 11 111489821 1I CTAACCAGAA -/T TCAAGTGTAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 1 2 253848 CASAVA_Build 11 111493457 1I TCACTATCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 8 9 253849 CASAVA_Build 11 111494223 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2802 het 57 hom 24 1 12 11 A 17 16 253850 CASAVA_Build 11 111498944 23D TAGCTTTACA ACCCAGGAATGTCTTTCTCAAGG/----------------------- ACCCAGGAGC 2720 het 2720 ref 23 18 7 6 ACCCAGGAATGTCTTTCTCAAGG 1 0 253851 CASAVA_Build 11 111509643 1D TCCAACCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 774 hom 37 5 13 19 T 17 16 253852 CASAVA_Build 11 111509883 1I TTGCTCTGTC -/A ACCCAGGCTG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 1 2 253853 CASAVA_Build 11 111513253 4I CTCTCTTTCT ----/CTTC CTTCCTTTCT 1874 het 839 hom 14 5 8 1 CTTC 1 2 253854 CASAVA_Build 11 111516190 4I TCCCTCTCTC ----/TCTT TCTTTCTCTT 1882 hom 12 het 7 0 5 2 TCTT 1 2 253855 CASAVA_Build 11 111521064 1I CCTTCAAAGA -/T GCCTGAAAGA 3070 hom 117 het 50 0 40 10 T 0 1 253856 CASAVA_Build 11 111524916 3I CTATATCATT ---/AAA ATACTCATAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 1 4 253857 CASAVA_Build 11 111529118 1D CCACCAACCC G/- GGAACCTTCC 3032 het 3032 ref 23 12 10 1 G 3 2 253858 CASAVA_Build 11 111534964 5D GTGTTTTAAA AACTC/----- AACTCACTCT 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 AACTC 2 1 253859 CASAVA_Build 11 111537847 4I CCTGTTGAAT ----/GGGA AGGTATGGGA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 GGGA 0 1 253860 CASAVA_Build 11 111546339 9D TTTTCTTTAT TTTGTCCTG/--------- TTAGTCTCCA 3070 het 3070 ref 32 18 14 3 TTTGTCCTG 1 0 253861 CASAVA_Build 11 111553943 1D CTGGGTTCAA T/- GCGATTCTCC 3070 hom 60 het 23 0 19 5 T 1 0 253862 CASAVA_Build 11 111555069 4D AAGGAGAGAG AAGA/---- AATTTGGAGC 3070 het 3070 ref 41 22 12 9 AAGA 1 0 253863 CASAVA_Build 11 111558775 5I CCCTAGAACT -----/TAAAA TATATATATA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 TAAAA 0 1 253864 CASAVA_Build 11 111562156 1D GGAGAGGCTG T/- AATGTATTGT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 1 0 253865 CASAVA_Build 11 111562343 1D CAAGGTCTTG C/- CTTCCCCTTG 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 C 2 1 253866 CASAVA_Build 11 111564406 1D AACTTCACAC T/- TTCCTGTTGA 3070 het 3070 hom 41 14 27 0 T 3 2 253867 CASAVA_Build 11 111571138 1I GCGCAATCTC -/G GCTCATTGCA 3070 hom 28 het 14 0 9 5 G 1 2 253868 CASAVA_Build 11 111575426 1I CTTTGGATGT -/G CTGTTTCAAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 0 1 253869 CASAVA_Build 11 111577576 1D ACTGCACCTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 33 19 12 4 A 8 7 253870 CASAVA_Build 11 111583893 1I TATATAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 20 5 T 12 13 253871 CASAVA_Build 11 111584354 1I GTATATTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 32 1 24 7 T 12 13 253872 CASAVA_Build 11 111587997 2I AAGCTAATAA --/CT CTTTATGAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 CT 1 2 253873 CASAVA_Build 11 111601572 1I CCAAACACTG -/C CATGTTCTCA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 1 2 253874 CASAVA_Build 11 111603803 1D TTGGGGGGAA T/- AATAAAGAGG 3070 hom 113 het 43 0 35 8 T 1 0 253875 CASAVA_Build 11 111611001 1D TTCAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 1175 het 1175 ref 18 9 3 6 T 17 16 253876 CASAVA_Build 11 111627217 1D TTTGTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 23 1 14 8 A 15 14 253877 CASAVA_Build 11 111627763 1D CTGTGAAAAG C/- TGTGGAAATT 3070 hom 70 het 28 0 23 6 C 1 0 253878 CASAVA_Build 11 111630274 2I GTGGTGTGTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 88 het 70 1 40 29 GT 5 6 253879 CASAVA_Build 11 111630498 3I TATATGTGAT ---/GTG GTGCGTGTGG 3070 hom 135 het 55 0 44 11 GTG 1 2 253880 CASAVA_Build 11 111630882 28D CGTGTGTGTG GTGTGTGTGATATGTATGTGAGTGTGGT/---------------------------- GTGTGTGTGA 1593 hom 18 het 16 0 7 16 GTGTGTGTGATATGTATGTGAGTGTGGT 1 0 253881 CASAVA_Build 11 111630998 18D TATGTGTGTG TGTGTGGTGTGTGTGGTA/------------------ TGTGTGGTGT 3070 het 27 hom 25 1 12 14 TGTGTGGTGTGTGTGGTA 2 1 253882 CASAVA_Build 11 111632824 1I TCCTGCTTTT -/C CCCTTCCATT 3070 hom 117 het 48 0 39 9 C 3 4 253883 CASAVA_Build 11 111633306 1I CTCTCGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 484 hom 36 3 24 9 T 13 14 253884 CASAVA_Build 11 111637282 4D GAAAGTCATA AAAC/---- AAACAGCAGC 3070 hom 81 het 28 0 26 2 AAAC 2 1 253885 CASAVA_Build 11 111637800 1D AAGAAAAAAA C/- ATCCCAGGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 C 1 0 253886 CASAVA_Build 11 111643771 5I CTGAGCTGAA -----/TCAGG ATAAATTTCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TCAGG 0 1 253887 CASAVA_Build 11 111645804 1D GCTAATCTTT C/- TTATCAACAA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 C 1 0 253888 CASAVA_Build 11 111646106 4D TTTTTTTTGA GAGG/---- GAGTCTCACT 3070 het 47 hom 16 1 13 2 GAGG 1 0 253889 CASAVA_Build 11 111646703 1I TCTCTCCCTT -/C CTGAGCAACG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 C 1 2 253890 CASAVA_Build 11 111647804 6D GCCTGGCTAA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 28 1 23 6 T 18 12 253891 CASAVA_Build 11 111651228 1D TCACACCTCT G/- GGGGGCTGTC 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 G 6 5 253892 CASAVA_Build 11 111689558 4D GTTCTAGTGA CTAG/---- CTAGCGGTCA 3070 het 3070 ref 58 28 22 8 CTAG 2 1 253893 CASAVA_Build 11 111716641 1I GAAAAAAAGA -/G GAAAAAACAA 2397 het 1235 hom 23 8 9 6 G 1 2 253894 CASAVA_Build 11 111745025 3D TTTTCTTCTC CTT/--- ATGATTTTCT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 CTT 1 0 253895 CASAVA_Build 11 111749268 2D TTGTGTCCTC TT/-- TTATTTTGTT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 4 2 253896 CASAVA_Build 11 111757013 1D TGTAAAAATG T/- TTTTTTTTTT 1664 het 1664 ref 40 30 4 6 T 12 11 253897 CASAVA_Build 11 111759941 1I TAGCTGGAAG -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 7 8 253898 CASAVA_Build 11 111761038 1I TGGTATACAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 9 253899 CASAVA_Build 11 111762598 1D TTTTTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 5 T 13 12 253900 CASAVA_Build 11 111762812 1I GTTTGCCAGG -/A ATGGTCTCCA 1931 hom 12 het 6 0 5 1 A 1 2 253901 CASAVA_Build 11 111763164 1D TATCAATACA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 8 7 253902 CASAVA_Build 11 111763432 2D TTGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 41 0 39 4 T 12 10 253903 CASAVA_Build 11 111765917 1D AAACTGTGAG A/- AAATGCATTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 4 3 253904 CASAVA_Build 11 111766865 4I GATTTTGCAC ----/TGTT TGTTCACTTT 3070 hom 63 het 25 0 20 5 TGTT 1 2 253905 CASAVA_Build 11 111777365 1D TTTGGGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 T 11 10 253906 CASAVA_Build 11 111804795 5D TTTTAATTTA ATTTT/----- ATTTTAAGTT 3070 het 2640 hom 14 7 7 1 ATTTT 2 1 253907 CASAVA_Build 11 111809537 1I GACCTTAACA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 2416 hom 21 5 13 3 T 7 8 253908 CASAVA_Build 11 111812621 1D CATCCACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 20 2 11 8 A 13 12 253909 CASAVA_Build 11 111830136 6D CCCAGGAGGT CAAGGC/------ TACAGTGAAC 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 CAAGGC 1 0 253910 CASAVA_Build 11 111849119 2D CTCTGTCTGG TA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TA 1 0 253911 CASAVA_Build 11 111861209 1I ATTTCTAGAT -/C CCCAGGCTTT 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 C 3 4 253912 CASAVA_Build 11 111861921 1I ATATATATTC -/T TTTTTTTTTT 1987 het 1987 ref 27 15 7 5 T 13 14 253913 CASAVA_Build 11 111863640 1D ATTATGGATC T/- TTTGGATCCA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 T 4 3 253914 CASAVA_Build 11 111880845 4I GTAAAAAAAA ----/AATT AAGGCTCAGT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 AATT 0 1 253915 CASAVA_Build 11 111883264 1D TCTAGCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 12 11 253916 CASAVA_Build 11 111884431 1I TTTATCTTTT -/A AAAATACACA 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 A 4 5 253917 CASAVA_Build 11 111896397 2D GTGGCTTCTC TG/-- AAGCTCAGCC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TG 1 0 253918 CASAVA_Build 11 111896810 20I AGGTCTCAGT --------------------/GCAATGCACAGTGGCCTGGG TCCACCCTTT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 GCAATGCACAGTGGCCTGGG 0 1 253919 CASAVA_Build 11 111899081 1D ATGTGTGGGC T/- TTTTTTTTTT 2677 het 2677 ref 36 18 7 11 T 13 12 253920 CASAVA_Build 11 111902475 1I TTATTACCCC -/T GTTTTACAGT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 0 1 253921 CASAVA_Build 11 111908823 1I TAGAATGACC -/A AAAAAAAAAA 2870 het 1158 hom 47 6 15 26 A 17 18 253922 CASAVA_Build 11 111920336 2I GGAGGAAGGG --/AT ATATATTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 AT 3 4 253923 CASAVA_Build 11 111937332 2I ACTCTCGTTG --/TC TCTCTGCTCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TC 2 3 253924 CASAVA_Build 11 111971463 1I CACATATACC -/T TCTACCTTTG 3070 het 3070 hom 44 22 19 3 T 1 2 253925 CASAVA_Build 11 111976677 3I GTATTTTATG ---/TTT TTTTTTTTTT 2827 het 1267 hom 28 6 12 10 T 14 17 253926 CASAVA_Build 11 111977600 1I GGCTTTGGGC -/T TTTTTTATTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 7 253927 CASAVA_Build 11 111979648 1I TCTCAGACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 32 0 19 13 T 12 13 253928 CASAVA_Build 11 111982986 1D GTGGAGGAGG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 144 het 53 0 47 7 A 9 8 253929 CASAVA_Build 11 111983388 1I TTAAAGTGCT -/C CCCCCCCAGG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 7 8 253930 CASAVA_Build 11 111990036 2D ACAATTAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 28 1 15 13 T 16 14 253931 CASAVA_Build 11 111992772 2D TCTCTCTCTT CA/-- CACACACACA 3070 hom 133 het 49 0 41 8 CA 11 10 253932 CASAVA_Build 11 111993618 1I GGTTTGAATT -/G GCAGCCTCAC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 G 1 2 253933 CASAVA_Build 11 112006570 1I CTTTGGGGGG -/C TTTTCACCTG 3070 hom 69 het 30 0 23 7 C 0 1 253934 CASAVA_Build 11 112018301 4I GATTAATTAA ----/TTGT TTGTTTGTAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTGT 2 3 253935 CASAVA_Build 11 112027119 4D GAGCTGTGCT ATTG/---- ATTGAAATGA 3070 het 3070 ref 42 22 17 7 ATTG 2 1 253936 CASAVA_Build 11 112037482 3D GGTAAGACGT AGA/--- AGGAGAGAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AGA 1 0 253937 CASAVA_Build 11 112040985 6I ACAATAAACA ------/TGTATT TATGCGACTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TGTATT 0 1 253938 CASAVA_Build 11 112050626 1I CAATATCACT -/G ATCATTAGAG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 0 1 253939 CASAVA_Build 11 112052551 1I TCATTTCTTG -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 31 16 12 3 T 7 8 253940 CASAVA_Build 11 112053617 1I ATATATATAC -/A ATGCAAATAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 1 2 253941 CASAVA_Build 11 112058432 2I GTCTTGACTC --/TT TATCCAATTT 3070 hom 27 het 10 0 9 1 T 1 3 253942 CASAVA_Build 11 112062723 1D TACTTCAGGT C/- AATACTATGA 3070 hom 184 het 68 0 61 8 C 1 0 253943 CASAVA_Build 11 112118758 1D GTGGATGATG A/- GACCTCTACT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 A 1 0 253944 CASAVA_Build 11 112120575 8D GTGAAAGAGA GACAGACG/-------- GACAGATGGA 3070 hom 69 het 33 0 26 8 GACAGACG 1 0 253945 CASAVA_Build 11 112120887 1I CTTCATTTCA -/T TTTTTTCCTG 3070 hom 107 het 39 0 35 4 T 6 7 253946 CASAVA_Build 11 112121737 1D AAATGCAGAT C/- CCCACATGCA 3070 hom 132 het 50 0 42 9 C 4 3 253947 CASAVA_Build 11 112123379 2D CTCAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 9 7 A 14 12 253948 CASAVA_Build 11 112147412 1D GAGTTTAAAC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 5 T 7 6 253949 CASAVA_Build 11 112164874 1I TTATTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 T 10 11 253950 CASAVA_Build 11 112178435 4I GGAACAAGAC ----/AATG AATGATGCCC 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 AATG 1 2 253951 CASAVA_Build 11 112178988 1I CAGAAAAAAA -/C ATTCCAAAAT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 C 0 1 253952 CASAVA_Build 11 112179890 24D GATTCTGTCT CAAAAACAAAAACAAAAACAAAAA/------------------------ CAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 22 11 9 4 CAAAAA 6 2 253953 CASAVA_Build 11 112182324 2I GTGGTGGCAA --/AG AGAGAGGCCA 3070 het 3070 ref 57 23 21 13 AG 3 4 253954 CASAVA_Build 11 112183451 1I CAACTGAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 9 10 253955 CASAVA_Build 11 112184309 3I TCTCTAGCAG ---/CCT CCTCCTCCTC 3070 hom 79 het 33 0 24 9 CCT 3 4 253956 CASAVA_Build 11 112191569 2I CTAATCCTAT --/CA CAGTGTCCCA 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 CA 1 2 253957 CASAVA_Build 11 112192093 5D TACCAATTTT CTTCC/----- CTTTCACTCC 3070 het 3070 hom 41 19 20 4 CTTCC 1 0 253958 CASAVA_Build 11 112194032 1I GGTGGGAGTT -/G GGGGAAGTTG 3070 het 3070 ref 32 12 14 6 G 4 5 253959 CASAVA_Build 11 112198573 1D AGAGCAGCAT G/- GAAGAGATGA 3070 het 2937 hom 19 8 10 1 G 2 1 253960 CASAVA_Build 11 112202439 1I CCTGTTTTGC -/T TGTTCCATTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 1 2 253961 CASAVA_Build 11 112202660 2I CTACTAAAGG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 76 het 32 0 26 6 T 9 11 253962 CASAVA_Build 11 112203412 1I TCCCTAGTTA -/C CCTTGACCAG 1484 hom 12 het 6 0 5 1 C 2 3 253963 CASAVA_Build 11 112221080 4D GATTTGGAAT ATTC/---- AACTGGTAAG 3070 hom 72 het 27 0 24 4 ATTC 1 0 253964 CASAVA_Build 11 112226373 1I TAAGAGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 12 13 253965 CASAVA_Build 11 112263151 1I TCAGCACATT -/C CCCCCTGGAG 3070 het 3070 ref 40 15 14 11 C 5 6 253966 CASAVA_Build 11 112272730 1I CTACACATTC -/T TTTTTTTTTA 2302 het 2302 ref 24 8 7 9 T 9 10 253967 CASAVA_Build 11 112274843 1I TGAGACACTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 62 26 30 6 T 7 8 253968 CASAVA_Build 11 112291134 1I TAGACTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3020 hom 50 12 26 12 A 13 14 253969 CASAVA_Build 11 112292226 1D ATCTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 11 12 A 11 10 253970 CASAVA_Build 11 112300590 2D CTGGACTGAA CC/-- CAAAGCAGGT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 C 3 1 253971 CASAVA_Build 11 112332394 1D TTCTGCACAA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 T 2 1 253972 CASAVA_Build 11 112337176 1I GCATCTGCCT -/C CCCTGTCTCT 3070 hom 66 het 27 0 18 9 C 3 4 253973 CASAVA_Build 11 112337518 1I32M1D CCGCGGCAAG -ACATCCCTCCCAGCCAGCAGATTACAATGCTGC/AACATCCCTCCCAGCCAGCAGATTACAATGCTG- CAAACTAAGG 3070 hom 49 het 16 0 13 8 N/A 0 0 253974 CASAVA_Build 11 112341007 1I TTATCTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 10 11 253975 CASAVA_Build 11 112352906 4D TGCAAACGTC AGGT/---- AATTCTATGA 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 AGGT 1 0 253976 CASAVA_Build 11 112353051 1D AAACTTTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 652 hom 36 2 31 3 A 12 11 253977 CASAVA_Build 11 112359353 1I AAAATTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 T 10 11 253978 CASAVA_Build 11 112360882 1D CACTATCCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 T 10 9 253979 CASAVA_Build 11 112361549 1I TGTATACAGA -/T TTTTTACCTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 5 6 253980 CASAVA_Build 11 112367441 1I GCCTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 10 11 253981 CASAVA_Build 11 112376750 8D32M1D TTATATATAC ATATATATATATATATATATATATATATATACACAAAAAAT/--------ATATATATATATATACACACACACACACACAA- ATATATATAT 2423 het 901 hom 19 3 7 15 N/A 0 0 253982 CASAVA_Build 11 112379952 3D ACGTCAGGGA GAG/--- GAGAAGATGA 3070 het 3070 hom 42 20 20 4 GAG 2 1 253983 CASAVA_Build 11 112380424 1I ATTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3008 hom 29 9 16 4 A 10 11 253984 CASAVA_Build 11 112380756 1I GATTCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 11 12 253985 CASAVA_Build 11 112385963 1D CTGCATCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 A 12 11 253986 CASAVA_Build 11 112394115 1D TAATTGTGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 35 0 28 7 A 10 9 253987 CASAVA_Build 11 112404446 13D TCTATGAATT AATGTTTCCTAGA/------------- AAGTTGTCTC 3070 het 3070 ref 49 28 21 2 AATGTTTCCTAGA 1 0 253988 CASAVA_Build 11 112405996 1D TTTATTTGAT A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 49 20 23 8 A 8 7 253989 CASAVA_Build 11 112407619 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2559 het 2559 ref 18 9 6 3 A 10 11 253990 CASAVA_Build 11 112410208 1D GACAATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 T 11 10 253991 CASAVA_Build 11 112416092 4I AATAATTTTA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 AAAT 3 4 253992 CASAVA_Build 11 112417613 1I ATTGTGTCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 9 10 253993 CASAVA_Build 11 112421281 3D GCGGTGAGAA CTT/--- CTCAGCGGGT 3070 het 3070 ref 38 16 14 11 CTT 1 0 253994 CASAVA_Build 11 112422735 2D AAGAAAGAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 AG 7 6 253995 CASAVA_Build 11 112422814 8D GGAAGGAAGG GAAAGGAA/-------- GAAAGGAAGA 3070 hom 99 het 40 0 34 8 GAAAGGAA 3 2 253996 CASAVA_Build 11 112426601 1I AATTTAATGT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 8 253997 CASAVA_Build 11 112452108 2D GGTCAGAAGG CC/-- CCACACACAG 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 C 4 2 253998 CASAVA_Build 11 112464474 9D ATGGCATAGC GATCTCACT/--------- GATCATTGGG 3070 het 3070 ref 38 19 13 9 GATCTCACT 1 0 253999 CASAVA_Build 11 112478934 4I TTTCTGCGTG ----/TTAT TTTGTGATTA 3070 het 3070 ref 47 29 16 2 TTAT 0 1 254000 CASAVA_Build 11 112486140 1D AGATGTTCTA T/- TTTAATCAAA 3070 het 3070 ref 47 27 14 7 T 4 3 254001 CASAVA_Build 11 112487695 2D TATGTATCAC AT/-- ATATATATGT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 AT 5 4 254002 CASAVA_Build 11 112497168 2I TTTTTTTTTT --/TC TTTTTGAGAC 3070 hom 63 het 32 0 21 11 TC 0 1 254003 CASAVA_Build 11 112502088 1D ACCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3045 het 3045 ref 26 12 8 6 A 15 14 254004 CASAVA_Build 11 112516833 1I GAGGATTTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 T 8 9 254005 CASAVA_Build 11 112534226 1D TCATTCATTG T/- TGGGAAAATG 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 T 2 1 254006 CASAVA_Build 11 112541937 1I TTATTTTTAC -/T TTATTTTTAG 2652 het 963 hom 12 2 9 1 T 2 3 254007 CASAVA_Build 11 112543476 2I TTTTTTAATT --/AA AAAAAAAAAA 1248 het 957 hom 24 5 10 9 A 12 14 254008 CASAVA_Build 11 112559704 1D TGACCTCCTC A/- ACCTTGGGAC 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 A 2 1 254009 CASAVA_Build 11 112565814 1D ACAAACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 13 12 254010 CASAVA_Build 11 112568194 1I AGAAGGCCTA -/T TCTTATCAGG 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 T 1 2 254011 CASAVA_Build 11 112568357 1D GAACAGGAAA G/- GTGGCCTGAA 3070 het 3070 hom 53 15 26 12 G 2 1 254012 CASAVA_Build 11 112626897 1D GCCCAGATAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 1854 hom 24 5 10 9 T 8 7 254013 CASAVA_Build 11 112663726 27D TAAGCCAGCA TTGGTGTGGTGTAGCCCTGCTGTGGTG/--------------------------- CTCTGCCCTG 2910 het 2910 ref 36 32 9 6 TTGGTGTGGTGTAGCCCTGCTGTGGTG 1 0 254014 CASAVA_Build 11 112670099 1D CTTGGAATAT C/- CCCCCTGTCT 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 C 6 5 254015 CASAVA_Build 11 112687632 1I CCTGGGGGGG -/C CAGCAGGACA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 1 2 254016 CASAVA_Build 11 112691086 1I GAAGAAACCC -/T TAGCGATTAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 1 2 254017 CASAVA_Build 11 112693733 1D CCTCTTCATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 T 9 8 254018 CASAVA_Build 11 112694542 1I GTGAATTTTT -/G GGGGGGGATG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 G 7 8 254019 CASAVA_Build 11 112710389 2D CCCAGGTCCA CT/-- AAGATATAAT 3070 hom 101 het 40 0 33 9 CT 1 0 254020 CASAVA_Build 11 112743653 2I ATTTGGTGAC --/AG GGGGGTGGGC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 AG 0 1 254021 CASAVA_Build 11 112743784 7I ACAGGCCACT -------/GTAGAGA AGCCAGGACC 3070 hom 117 het 41 0 36 5 GTAGAGA 0 1 254022 CASAVA_Build 11 112752455 1D CTCTGATGTC T/- TTTTTTTTTT 1750 het 1750 ref 49 30 4 15 T 12 11 254023 CASAVA_Build 11 112756605 1I TGTTTTTTGG -/T TTTTTGATTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 5 6 254024 CASAVA_Build 11 112758901 7I CTTATGCAGA -------/GATCCCT GATACCCTCA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 GATCCCT 0 1 254025 CASAVA_Build 11 112777079 1I GACCACACCT -/A GTCCAGTGCC 3070 hom 105 het 50 0 33 17 A 0 1 254026 CASAVA_Build 11 112797537 1D AACCAGCGTG C/- TTTTCATACA 3070 hom 168 het 61 0 55 7 C 1 0 254027 CASAVA_Build 11 112799216 1D TTTAATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 10 9 254028 CASAVA_Build 11 112811263 1D GACTCAGTGT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 39 het 18 0 14 5 G 9 8 254029 CASAVA_Build 11 112823407 1I CCACCCTCTG -/A AAAAAAAAAA 2487 het 232 hom 24 2 14 8 A 15 16 254030 CASAVA_Build 11 112834327 1D ATATCACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 340 hom 31 1 26 4 A 11 10 254031 CASAVA_Build 11 112839438 1D GGTCCCTTTC T/- TTACAGCCTT 3070 hom 84 het 34 0 28 9 T 3 2 254032 CASAVA_Build 11 112842368 1I CCCCCCAGTG -/C CATTTTCTCC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 C 1 2 254033 CASAVA_Build 11 112851462 1I TCCCCGGCCT -/G GAACGGGTAG 1812 hom 12 het 5 0 5 0 G 1 2 254034 CASAVA_Build 11 112855146 1I AGTATGGGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 9 10 254035 CASAVA_Build 11 112864342 1D AGCCGTGGTC T/- TTTTTTTTTT 803 het 803 ref 37 25 3 9 T 12 11 254036 CASAVA_Build 11 112892552 20D GTGGGAAATT AAATCTCTTTGAGGGGGAAA/-------------------- GATCCTTTTC 3070 hom 105 het 37 0 35 7 AAATCTCTTTGAGGGGGAAA 1 0 254037 CASAVA_Build 11 112896959 1D TATTGTTGAT A/- AAAAAGATTC 3070 hom 138 het 55 0 45 10 A 6 5 254038 CASAVA_Build 11 112899235 1D TTTCACTGAG A/- CAGAATAAGC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 0 254039 CASAVA_Build 11 112902352 1D TCCAATTCTA G/- ATGTTATAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 1 0 254040 CASAVA_Build 11 112926621 1I TAGTTCACAG -/T TTACTCTTCA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 2 3 254041 CASAVA_Build 11 112959990 1D CTCTGAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2547 hom 30 9 15 6 A 13 12 254042 CASAVA_Build 11 112962724 3D AAAAAAAAAA GAG/--- AGAGAGAGAG 683 het 683 ref 26 11 6 11 GAG 1 0 254043 CASAVA_Build 11 112971257 1D ATGAATTAAA C/- AACACAGATT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 C 1 0 254044 CASAVA_Build 11 112981349 3D AATGAAAAAG AGA/--- AGGAGACAAA 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 AGA 1 0 254045 CASAVA_Build 11 113006387 1I CTCTGCCAAT -/C CCAAGAGATG 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 C 2 3 254046 CASAVA_Build 11 113009742 2D TCAGGTAAAC AT/-- AGAAATATTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 AT 1 0 254047 CASAVA_Build 11 113010418 1I TAACATTCAG -/C CCCTGGAATT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 C 3 4 254048 CASAVA_Build 11 113016840 2D AAAAAATTAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 GT 10 9 254049 CASAVA_Build 11 113018517 16I ATGAAGGGAT ----------------/AAGTGGATGGGTGATC AAGTGTAGGT 1943 het 1618 hom 10 4 5 2 AAGTGGATGGGTGATC 0 1 254050 CASAVA_Build 11 113019964 5D TGGGAGCTGC TGTAT/----- GGGGCCTTTG 3070 het 3070 hom 69 29 34 9 TGTAT 1 0 254051 CASAVA_Build 11 113047857 1I AGGCCGAGGT -/G GGTGGATCAC 3070 het 2693 hom 27 8 12 7 G 2 3 254052 CASAVA_Build 11 113054897 15I TAGCTACTTT ---------------/TCAGCATCTGTCTCC GACTAGATGG 3070 het 3070 hom 42 18 23 2 TCAGCATCTGTCTCC 0 1 254053 CASAVA_Build 11 113056552 2D CGTCAGAAGA CT/-- CTGTGGAGAA 3070 het 3070 ref 43 23 16 5 CT 2 1 254054 CASAVA_Build 11 113068187 1I TGGCAATGAC -/T TGTTATTTGG 3070 hom 188 het 68 0 62 6 T 1 2 254055 CASAVA_Build 11 113077366 1I GCAAAAAAGT -/A GAAGCATTTT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 A 0 1 254056 CASAVA_Build 11 113077712 1D ATAGTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 10 9 254057 CASAVA_Build 11 113088422 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTGCT 1189 het 992 hom 6 2 4 0 T 8 7 254058 CASAVA_Build 11 113092609 1D CGCAATGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 39 1 32 6 T 11 10 254059 CASAVA_Build 11 113094516 2D AATGTTTTTT AA/-- AAAGTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 5 3 254060 CASAVA_Build 11 113111737 3D AACATCATCC ACT/--- ACGTTTGAGA 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 ACT 1 0 254061 CASAVA_Build 11 113113375 1D AACAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 13 12 254062 CASAVA_Build 11 113114866 1I TTATGTGAAT -/C CCTGACCTGG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 C 2 3 254063 CASAVA_Build 11 113115849 1I CATTTATATG -/T TTTTAAAATC 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 T 4 5 254064 CASAVA_Build 11 113116128 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAACAC 2513 het 2513 ref 26 15 7 4 A 7 8 254065 CASAVA_Build 11 113117033 5D AACTAAAAAA TACTT/----- TAAATAGTAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 7 TACTT 1 0 254066 CASAVA_Build 11 113121944 1D GGCAATGTCT G/- GAGATATTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 G 2 1 254067 CASAVA_Build 11 113129987 1D GGAAGAATAT G/- CCATCTTGAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 G 1 0 254068 CASAVA_Build 11 113134139 1I TAAGCATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 A 10 11 254069 CASAVA_Build 11 113136624 1I TCCCCCCTCT -/A AAAAAAAAAA 1601 het 556 hom 24 5 10 9 A 13 14 254070 CASAVA_Build 11 113150719 1D ATTTGCATTA T/- TTTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 6 5 254071 CASAVA_Build 11 113151054 6D GAAAACCAAA TCAATT/------ TCTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 44 22 16 11 TCAATT 1 0 254072 CASAVA_Build 11 113162805 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1368 het 1368 ref 15 9 3 3 A 12 11 254073 CASAVA_Build 11 113170426 1D TGGAGGGAAG T/- TTTTTTTTTT 1595 het 1595 ref 26 14 4 8 T 13 12 254074 CASAVA_Build 11 113171971 4D AAAATGAATA AACT/---- AACAGCTACA 3070 het 3070 ref 50 22 25 4 AACT 1 0 254075 CASAVA_Build 11 113174525 5D AAGTCCTTAA TACTT/----- TACTTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 7 TACTT 2 1 254076 CASAVA_Build 11 113183316 1D TTGTCAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 11 10 254077 CASAVA_Build 11 113193568 1I ACATACCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 A 10 11 254078 CASAVA_Build 11 113194107 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCCCTC 1354 het 1354 ref 12 6 4 2 AG 2 1 254079 CASAVA_Build 11 113206112 4D GTCCTGACTA AAAC/---- AAACTCTAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 AAAC 2 1 254080 CASAVA_Build 11 113218798 1I TATTTGCTTT -/A AAAATCAAGA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 4 5 254081 CASAVA_Build 11 113225437 4I GTGGCCAGTG ----/GTCA GTCACATGAT 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 GTCA 1 2 254082 CASAVA_Build 11 113227785 1I CATTTCTTTC -/A TTCTGTCCTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 0 1 254083 CASAVA_Build 11 113231033 2D TTTAAAACTC TG/-- TGTTTGACTA 3070 het 3070 hom 45 23 20 2 TG 2 1 254084 CASAVA_Build 11 113231203 2I CCCTTCAGCC --/TT TTAACATCTT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 T 2 4 254085 CASAVA_Build 11 113231284 3D GCTCAATCTA AAC/--- AACTGGCTGG 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 AAC 2 1 254086 CASAVA_Build 11 113249698 3I AACATCTAAC ---/AAT AATATTTCCA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AAT 1 2 254087 CASAVA_Build 11 113252252 1D TTTCGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2209 het 2209 ref 35 12 10 13 T 13 12 254088 CASAVA_Build 11 113254766 1I ATAGCACGGG -/A AAGACCGGCC 2743 het 2743 ref 23 14 7 2 A 2 3 254089 CASAVA_Build 11 113294595 1I AATCTATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 T 11 12 254090 CASAVA_Build 11 113296320 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 6 7 254091 CASAVA_Build 11 113297444 4I AGTCCCAGAT ----/ACTC GGGAGGCTGA 2985 het 617 hom 13 2 8 3 ACTC 0 1 254092 CASAVA_Build 11 113308585 2I TGTTTTGGAA --/AC ACAGTGTTAG 3070 hom 114 het 41 0 37 4 AC 1 2 254093 CASAVA_Build 11 113310692 1I GCAAGCAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 32 1 22 9 T 13 14 254094 CASAVA_Build 11 113339214 1D TCTAGTCGGA G/- GGGGGGGGGG 3070 het 167 hom 39 4 21 14 G 11 10 254095 CASAVA_Build 11 113345650 1D TTCCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2399 het 2399 ref 27 14 6 7 T 13 12 254096 CASAVA_Build 11 113352504 6D AAAAATAGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 1000 hom 26 6 11 11 TG 21 18 254097 CASAVA_Build 11 113353395 2I GGGCCACCTG --/CT CTCCGACCTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 CT 1 2 254098 CASAVA_Build 11 113358282 1I TTTCCAAGGG -/A GGTAGTTGAC 3070 hom 95 het 35 0 30 5 A 0 1 254099 CASAVA_Build 11 113360833 5D24M1I CTGGGTGACA AGTCTGACTGAGACTCCGTCTCAAAAAAG-/-----GACTGAGACTCCGTCTCAAAAAAGA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 16 0 17 5 N/A 0 0 254100 CASAVA_Build 11 113363505 1I TCTCTACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 10 11 254101 CASAVA_Build 11 113365131 1D GTTTCTATTG A/- AAAAAAAAAA 2585 het 243 hom 19 3 8 8 A 15 14 254102 CASAVA_Build 11 113372943 1D TCACAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1106 hom 22 5 10 7 T 15 14 254103 CASAVA_Build 11 113373324 1D AACCCTTCCA C/- CCCCCCTGCC 3070 het 3070 hom 52 17 22 15 C 7 6 254104 CASAVA_Build 11 113384813 1D CTGGCCCACA T/- TTTTTTTTTT 3056 het 200 hom 31 1 13 17 T 16 15 254105 CASAVA_Build 11 113392038 1I CCTGTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1234 hom 23 4 14 5 T 13 14 254106 CASAVA_Build 11 113398722 1D AGCTAAAAAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 132 het 50 0 41 9 A 9 8 254107 CASAVA_Build 11 113417203 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 421 hom 31 1 26 4 T 9 10 254108 CASAVA_Build 11 113424265 1I TCAGCCAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 17 8 T 10 11 254109 CASAVA_Build 11 113453404 1I TTTCTATGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 T 9 10 254110 CASAVA_Build 11 113456166 1D TCAGCATGTA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 6 254111 CASAVA_Build 11 113457349 1I TGTTGATATC -/T TATGACAGAG 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 1 2 254112 CASAVA_Build 11 113460438 4D GGGATAAGAG CTCC/---- GGAGGAGGAG 3070 het 2797 hom 23 7 11 8 CTCC 1 0 254113 CASAVA_Build 11 113461433 4D TGTATGACTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TG 8 6 254114 CASAVA_Build 11 113463353 1D GAATGTGATG T/- GTTTGAGCTA 3070 het 3070 hom 48 20 26 2 T 1 0 254115 CASAVA_Build 11 113470172 1D GCGTGAACCC G/- GGAGGCAGAG 3070 hom 30 het 12 0 11 2 G 3 2 254116 CASAVA_Build 11 113474474 1D GACTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 29 3 18 8 A 15 14 254117 CASAVA_Build 11 113500012 1I TTTGCGGAGA -/T TGGTCGGGGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 2 254118 CASAVA_Build 11 113518695 1D GCCTTGGGGA G/- GGGGAGCTGG 2861 het 1034 hom 19 4 9 6 G 5 4 254119 CASAVA_Build 11 113522781 2D ATTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2484 het 179 hom 19 3 10 7 A 18 16 254120 CASAVA_Build 11 113543319 1D AGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1073 het 1073 ref 25 8 6 11 T 15 14 254121 CASAVA_Build 11 113562206 1I CCTAGCAATG -/A GGAAGAACAC 3070 het 3070 hom 43 19 17 7 A 0 1 254122 CASAVA_Build 11 113562562 1D TTTCTCCTGT C/- CCCCCCATCA 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 C 7 6 254123 CASAVA_Build 11 113572336 22I AAAAAGAGGC ----------------------/AAAGAAACAGACAAAGATAGCT AAGGTCATTC 3070 het 3070 ref 41 21 12 9 AAAGAAACAGACAAAGATAGCT 0 1 254124 CASAVA_Build 11 113574341 1D TCCAAGCACA G/- GGGCTCTCGG 3070 hom 75 het 33 0 24 10 G 4 3 254125 CASAVA_Build 11 113586618 1I GGTAAACTTC -/T CCAGAGCAAG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 0 1 254126 CASAVA_Build 11 113592876 3D ATAGAGATAT TTA/--- TTATACACAG 3070 hom 114 het 40 0 39 3 TTA 2 1 254127 CASAVA_Build 11 113595593 1D AAAAAAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 33 1 25 7 A 11 10 254128 CASAVA_Build 11 113601585 1D AACACCTCCC A/- AGAGGCCCCA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 2 1 254129 CASAVA_Build 11 113613639 1D ACATGCGAAC A/- ATCAGCTAGG 3063 het 3063 ref 27 16 7 4 A 2 1 254130 CASAVA_Build 11 113622394 5I ATCTGATGCG -----/ATCAC ATCACATCAC 3070 hom 166 het 62 0 56 6 ATCAC 2 3 254131 CASAVA_Build 11 113623836 1I TGCCTTCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1397 hom 37 4 25 8 T 12 13 254132 CASAVA_Build 11 113630024 4I ACATTTACAC ----/CTCA CTCATGTGCT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 CTCA 1 2 254133 CASAVA_Build 11 113631352 4D TCTCTTTCTC TCTT/---- TCTCTCCTCC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 TCTT 1 0 254134 CASAVA_Build 11 113631651 1D GACAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 574 hom 24 3 16 5 A 15 14 254135 CASAVA_Build 11 113634821 1I GCGTGTGCTG -/T TTTCCTCTTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 3 4 254136 CASAVA_Build 11 113676540 4I GTCAATTACT ----/GAGA GAGAGTGTTA 3070 hom 150 het 57 0 49 8 GA 2 4 254137 CASAVA_Build 11 113683606 1I TAGTCTGGCT -/C CTGCCAACCT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 C 1 2 254138 CASAVA_Build 11 113685512 2D GCTAAGCTCA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 84 het 40 0 29 11 TC 9 8 254139 CASAVA_Build 11 113691249 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 9 8 254140 CASAVA_Build 11 113700235 1D GTCTCTAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 60 het 21 0 20 4 A 9 8 254141 CASAVA_Build 11 113702835 1I AAATGTTTAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 70 het 47 1 38 8 A 9 10 254142 CASAVA_Build 11 113706386 1D GAATGACTTC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 9 8 254143 CASAVA_Build 11 113706732 1D AAAGAAGGAG A/- TGATCACCCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 0 254144 CASAVA_Build 11 113713233 2I17M3D ACTGTACTCC --AGAGAGACTCTGTCTCCAAA/AGAGAGAGACTCTGTCTCC--- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 17 0 15 3 N/A 0 0 254145 CASAVA_Build 11 113720383 1I AACTTGTCTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 7 8 254146 CASAVA_Build 11 113725748 1I TTCTATTTAA -/T TTTTTGTAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 5 6 254147 CASAVA_Build 11 113735567 9I CATTTAATTA ---------/TTCTGCTAC TGTTAGAAAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TTCTGCTAC 0 1 254148 CASAVA_Build 11 113735941 14D GTAACTGTCA AAAAAACAAAAAAC/-------------- AAAAAACAAA 3070 het 841 hom 20 3 10 8 AAAAAAC 3 1 254149 CASAVA_Build 11 113737359 2I GCAAACATAC --/AA AAAAAAAAAA 1059 het 1059 ref 24 11 6 7 A 10 12 254150 CASAVA_Build 11 113748360 16I AAGAGACACA ----------------/GACATGTGGAGAAGAG GACATGTGGA 3070 het 300 hom 28 2 13 13 GACATGTGGAGAAGAG 1 2 254151 CASAVA_Build 11 113759782 1D TGAGTTGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 25 0 13 12 T 15 14 254152 CASAVA_Build 11 113761394 5I AACTACTTGT -----/TTTGA TTTGATTTGA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TTTGA 3 4 254153 CASAVA_Build 11 113764526 1I TTAATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 448 hom 31 1 19 11 T 11 12 254154 CASAVA_Build 11 113774357 5I CCTTGGAAAG -----/TTTAT TTTATCTCCT 3070 het 3070 hom 46 16 26 4 TTTAT 1 2 254155 CASAVA_Build 11 113781763 1I TTGAATTGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 9 10 254156 CASAVA_Build 11 113785305 4I CATGTTTGTT ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 TTTG 1 2 254157 CASAVA_Build 11 113786170 1I TAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3011 hom 34 9 17 8 A 10 11 254158 CASAVA_Build 11 113796818 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2301 het 1134 hom 21 7 6 8 T 13 12 254159 CASAVA_Build 11 113799500 1D GTAAGGACTT A/- ACTCCTGCCA 3070 het 3070 ref 30 16 11 5 A 2 1 254160 CASAVA_Build 11 113800875 1D TCCCAGGATT G/- GGTCCCTCAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 G 3 2 254161 CASAVA_Build 11 113810460 1I TTAGAGTGGT -/G GGTTGGAGCC 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 G 2 3 254162 CASAVA_Build 11 113825375 4I AAATTAATAA ----/ATAT ATTAGAAATA 2561 het 2561 ref 15 9 6 0 AT 1 3 254163 CASAVA_Build 11 113829911 9I AGGCACACCC ---------/TGGATTACA TCTGGTATTC 3070 het 3070 ref 41 25 10 6 TGGATTACA 0 1 254164 CASAVA_Build 11 113835079 3D AAATTTTATA AAT/--- AATTTTATTT 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 AAT 2 1 254165 CASAVA_Build 11 113837475 1D TTTGGCTAAA T/- TTTATATAAC 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 4 3 254166 CASAVA_Build 11 113839070 4D TTCAGAAAAA TATC/---- TATATCTGTG 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 TATC 1 0 254167 CASAVA_Build 11 113842488 2D AATTTCTTGA AT/-- ATATATATAT 2156 het 1463 hom 14 5 6 3 AT 7 6 254168 CASAVA_Build 11 113842741 5D TATTCCCAGC CTTTT/----- CTTCTTATTT 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 CTTTT 1 0 254169 CASAVA_Build 11 113844086 1I AAAAAATTGC -/A AAAAAGTCTC 229 het 229 ref 14 4 3 7 A 5 6 254170 CASAVA_Build 11 113848323 1D CTGAGGAGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 10 9 254171 CASAVA_Build 11 113851093 9I GGTCAGTTTC ---------/CAACATTTT CAACATTTTA 3070 het 3070 hom 38 11 16 11 CAACATTTT 1 2 254172 CASAVA_Build 11 113856170 2I AATGTCAGAC --/TA TGTTTTGGTC 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 TA 0 1 254173 CASAVA_Build 11 113882045 5D AAGAAATATT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 2141 hom 23 13 8 2 A 18 13 254174 CASAVA_Build 11 113884816 1I CAACAAAAGC -/A AAAATTGACA 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 A 4 5 254175 CASAVA_Build 11 113900204 1I GTCTAGCCAC -/A AACTGGTTTC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 2 3 254176 CASAVA_Build 11 113902371 70D AGTGACATTT TAAATTGCCTTTCTGCAGATCATGCTTTTGTTAAATTGTGAATTTGCATTTTAAACCACAAAGTGGATCA/---------------------------------------------------------------------- TACCACTCTC 3070 het 3070 ref 20 25 7 3 TAAATTGCCTTTCTGCAGATCATGCTTTTGTTAAATTGTGAATTTGCATTTTAAACCACAAAGTGGATCA 1 0 254177 CASAVA_Build 11 113903838 1I TTGGACCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 A 10 11 254178 CASAVA_Build 11 113922404 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 99 hom 27 1 12 14 T 13 14 254179 CASAVA_Build 11 113924897 3I AGACATCTTT ---/GGG GAGGGAAAAC 3070 het 3070 ref 62 42 18 2 G 1 4 254180 CASAVA_Build 11 113925034 1D16M1D50M1D GAGTGACATT AAAAAAATAGAGAATAGTGAAAAAAGTAGCAGAGCACTGCTACTGAATGCACAAAGCCAGGCTGATGGA/-AAAAAATAGAGAATAG-GAAAAAAGTAGTAGAGCACTGCTACTGAATGCACCAAGCCAGGCTGGTGG- ATTCTACCAA 3070 het 3070 ref 86 69 37 33 N/A 0 0 254181 CASAVA_Build 11 113925278 2D41M1D TGAGATATAC ATCTTAAATAAAATATTGGCAAGCAATCCAAATGAACATTACAC/--CTTAAATAAAATATTGGCAAGCAATCCAAATGAACATTATA- AAAAATAATA 3070 het 3070 ref 81 77 9 34 N/A 0 0 254182 CASAVA_Build 11 113925575 1D AAGGGAAACA C/- TAAAGGCTTT 3070 het 3070 hom 82 27 46 10 C 1 0 254183 CASAVA_Build 11 113925822 6I13M4I TAGTAGGAAA ------TAATATATAAAAA----/TAAAATTAATATATTAAAAAATC AATAGCTTTT 3070 het 3070 hom 64 25 39 11 N/A 0 0 254184 CASAVA_Build 11 113926666 2D AAAAAATAAC TT/-- TTGCATGGAA 3070 het 3070 ref 85 40 36 11 T 4 2 254185 CASAVA_Build 11 113926734 17I TACATGGCCA -----------------/GGTAATATATACACCTC GATTGAGTGT 3070 het 3070 ref 81 38 26 17 GGTAATATATACACCTC 0 1 254186 CASAVA_Build 11 113926924 1D75M1I GATAGGGCAG TAGTTGAGGTGGGGGAGGAGGGGCAGGACTAATGGAGTGGGACTGACTTGAGGCACGTCACACAGGTGAGGGCTTA-/-AGTTGAAGTGGGGGAGGAGGGGCAGGACTAATAGAGTGGAACTGACTTGAGGCTGGTCGCACAGGTGAGGGCTTAC CTGTGTGATC 3070 het 3070 ref 68 81 29 22 N/A 0 0 254187 CASAVA_Build 11 113927730 1D GTGTGAGGAA G/- GGGGAAGAAG 3070 het 3070 ref 56 31 18 15 G 5 4 254188 CASAVA_Build 11 113927977 1I20M1I AATCCAAAAA -GTTCTGTGTTTTGAATCTGG-/GGTTCTATGTTTTGAATCTGGT ATGCGCAGAG 2815 het 2815 ref 72 52 11 23 N/A 0 0 254189 CASAVA_Build 11 113928223 4D TGTTGAGACC AAAT/---- GAATGAATAC 3070 het 3070 hom 79 37 36 9 AAAT 1 0 254190 CASAVA_Build 11 113928844 1D AAAATTAATG A/- AATAAACATT 3070 het 3070 hom 100 41 54 6 A 3 2 254191 CASAVA_Build 11 113929455 1D AGAGTTTTGG A/- AATTTATTAA 3070 het 3070 ref 90 42 34 22 A 3 2 254192 CASAVA_Build 11 113934089 6D TAAATTTTAT TTATAA/------ TTATAAATAT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 TTATAA 2 1 254193 CASAVA_Build 11 113949404 1D AAGTCACCTA T/- TTAATAACAC 3070 het 3070 hom 48 21 24 4 T 3 2 254194 CASAVA_Build 11 113952288 4D TGGATGGGAC TTAA/---- TTAAACTAAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 7 TTAA 2 1 254195 CASAVA_Build 11 113973048 1D TACTTGAAGG A/- TAGACTCTGA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 1 0 254196 CASAVA_Build 11 113974225 36I TGTGGCTTTG ------------------------------------/TGGGGTTCAGTCCCTGCAGCTGCTCTCAAGGGCTGA TGTTGAGTGC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 TGGGGTTCAGTCCCTGCAGCTGCTCTCAAGGGCTGA 0 1 254197 CASAVA_Build 11 113982223 3I TGGATAATAA ---/TCT ATGTTGCCTC 3070 het 3070 ref 65 33 26 6 TCT 0 1 254198 CASAVA_Build 11 114024881 2I AAGAGGAAAC --/AA AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 7 9 254199 CASAVA_Build 11 114028684 2D TCAAGAATGG CT/-- CTGTGTTTTG 3070 het 3070 ref 56 29 23 4 CT 2 1 254200 CASAVA_Build 11 114035366 1D TCTGTTAAAC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 8 7 254201 CASAVA_Build 11 114038162 4D GTGCACTGGG GAGA/---- GAGAGAGAGT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 GA 6 4 254202 CASAVA_Build 11 114047271 3I TAGAGGAATT ---/AGA AGGAGAGGAT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 AGA 0 1 254203 CASAVA_Build 11 114048329 5D AATGCAAAAT AAATC/----- AGTAAAGGAA 3070 het 3070 ref 37 23 14 4 AAATC 1 0 254204 CASAVA_Build 11 114059358 1I AGAGTCAAAG -/T TTTTTTTTTT 2717 het 266 hom 15 1 9 5 T 14 15 254205 CASAVA_Build 11 114059865 7D TTAACCAGGA GTTACAT/------- GTTACATTCC 3070 het 3070 ref 51 26 20 9 GTTACAT 2 1 254206 CASAVA_Build 11 114067764 1D CAAGGAAAGT G/- GGGTCTGCCT 3070 het 3070 hom 39 17 16 7 G 4 3 254207 CASAVA_Build 11 114070779 1I TTGTTTTGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 8 9 254208 CASAVA_Build 11 114090186 1D AATTCTAGTC T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 58 26 26 6 T 6 5 254209 CASAVA_Build 11 114096559 1I ATTTCAAAGC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 7 8 254210 CASAVA_Build 11 114101451 1I TTCCTGAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 15 15 10 T 9 10 254211 CASAVA_Build 11 114102900 13I CAGAAGCTTT -------------/CTCTACAGCTCTC CTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 CTCTACAGCTCTC 0 1 254212 CASAVA_Build 11 114106977 2D CATAGATGGC TG/-- TTATTATTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 8 TG 1 0 254213 CASAVA_Build 11 114108773 12I AGATTAATTT ------------/AGTCACTCTTCC AGTGATTCAA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 AGTCACTCTTCC 0 1 254214 CASAVA_Build 11 114112610 5D GGATTAAGAG ACTAA/----- AGTAAAGACA 2948 het 1791 hom 14 4 8 2 ACTAA 1 0 254215 CASAVA_Build 11 114115966 2I TACCAAACAC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TA 5 6 254216 CASAVA_Build 11 114116329 3D GAATAATAAT ATG/--- ATGAACAGGC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 ATG 2 1 254217 CASAVA_Build 11 114117172 3I TCTCTTCTCT ---/TGC TGCTTTCAAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TGC 1 2 254218 CASAVA_Build 11 114123243 1D TAGCTATAGC A/- ACCCGGAATA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 2 1 254219 CASAVA_Build 11 114129327 1D CCTGTCTTAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 A 9 8 254220 CASAVA_Build 11 114129920 4D TGTGCCACAT TGAC/---- TGGGTTTGAA 3070 het 3070 ref 57 29 23 5 TGAC 1 0 254221 CASAVA_Build 11 114130644 1D TGAGAGCTCC A/- GGGGGTATAA 3070 het 3070 hom 31 9 12 12 A 1 0 254222 CASAVA_Build 11 114134094 3D GACACTATGA CTT/--- CTTCTCCGTC 3070 het 3070 hom 55 22 28 6 CTT 2 1 254223 CASAVA_Build 11 114140360 3D AGTTTTCTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 37 1 30 6 A 14 11 254224 CASAVA_Build 11 114141187 1I TACAGACATA -/C CTTTTTTTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 1 2 254225 CASAVA_Build 11 114141384 1D TCTTAGATAT A/- ATGCTGTTGC 3070 het 3070 hom 50 23 25 4 A 2 1 254226 CASAVA_Build 11 114144043 7D AGGGGTCCAG TTTCAGT/------- TTTCTGCATA 2913 het 1170 hom 17 5 8 4 TTTCAGT 1 0 254227 CASAVA_Build 11 114149629 2I CATTTGAATC --/AG GGGACTGAGT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AG 0 1 254228 CASAVA_Build 11 114163113 4D GCACACACAC AAAA/---- AAAAAGTGAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 7 A 9 5 254229 CASAVA_Build 11 114166892 1D GGATTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 865 hom 37 3 29 5 T 11 10 254230 CASAVA_Build 11 114175917 4D TCCCTCTCCC TCTT/---- TCTTTCTAGG 3070 het 3070 hom 35 16 14 8 TCTT 2 1 254231 CASAVA_Build 11 114176998 4D TTCAACAAAC ACTG/---- AGCACTTCTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ACTG 1 0 254232 CASAVA_Build 11 114177594 11D ACCAGGATGT GAAGAAAAGGA/----------- GAAGAAAAGG 3070 hom 123 het 46 0 39 13 GAAGAAAAGGA 2 1 254233 CASAVA_Build 11 114178836 1I AAAGATAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 9 10 254234 CASAVA_Build 11 114179503 2I CTCCCTCAGG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 60 het 40 1 33 6 TC 7 8 254235 CASAVA_Build 11 114179518 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 1862 het 694 hom 37 4 11 22 C 0 1 254236 CASAVA_Build 11 114182378 1D AAAAGCTTTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 9 8 254237 CASAVA_Build 11 114196281 3D GCTTCGTGTT AGA/--- AGATTTTGCC 3070 het 3070 hom 22 9 12 3 AGA 2 1 254238 CASAVA_Build 11 114201189 1I CCTTCAGAAA -/G GGGGGGGCAC 1657 het 1657 ref 29 17 7 5 G 7 8 254239 CASAVA_Build 11 114204612 2D AGGCCTTTGA AC/-- ACAAAGAGGA 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 AC 2 1 254240 CASAVA_Build 11 114215715 8D34M1I TATTCCCAGC TTTTTATTTTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTCTTTTTC-/--------TTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTCTTTTTCT TTTTTTTTTA 3070 het 1014 hom 16 4 8 5 N/A 0 0 254241 CASAVA_Build 11 114228962 2I AATAATAATC --/AT GTGTGAGGAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 AT 0 1 254242 CASAVA_Build 11 114234733 2I CTGATCAGGA --/AG AGAGAGAGAG 2288 het 2288 ref 25 11 9 5 AG 7 8 254243 CASAVA_Build 11 114245007 3D ATAATATTTT ATA/--- ATAATTATAT 1530 het 1135 hom 10 3 5 2 ATA 2 1 254244 CASAVA_Build 11 114248018 1D ACCCTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 24 0 17 7 A 13 12 254245 CASAVA_Build 11 114252760 1I TGAGGGATGC -/A CTGCAAGCTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 1 254246 CASAVA_Build 11 114255559 1I CTATAGACCC -/A AGAGATGGGT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 254247 CASAVA_Build 11 114261579 1I CAACTGATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 907 hom 26 2 21 3 A 10 11 254248 CASAVA_Build 11 114262795 1I CCCCCACATA -/C CCACACAAAC 3070 hom 131 het 48 0 43 5 C 2 3 254249 CASAVA_Build 11 114263705 3I GCCCTGAGGC ---/AGG AGGGGTTGGC 3070 hom 83 het 36 0 25 11 AGG 1 2 254250 CASAVA_Build 11 114264030 2I CAACAAACAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 35 0 15 20 T 10 12 254251 CASAVA_Build 11 114265269 6D GGTTTGGTCA GGGAAT/------ GGGAATGGAA 3070 hom 75 het 40 0 32 8 GGGAAT 2 1 254252 CASAVA_Build 11 114268241 1I CTGGGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 9 10 254253 CASAVA_Build 11 114283067 1I GCTTCTCCCC -/T TTTTTCCTCA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 5 6 254254 CASAVA_Build 11 114284231 9D TGAGATTGAA AGGATAAAT/--------- AGTGGTTAGC 3070 het 3070 hom 33 11 22 4 AGGATAAAT 1 0 254255 CASAVA_Build 11 114293932 8D CTGCCTGTTA AATGGATG/-------- AATGGATGAA 3070 het 3070 ref 48 23 19 10 AATGGATG 2 1 254256 CASAVA_Build 11 114314700 1D CATGTGGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 217 hom 34 1 26 7 A 12 11 254257 CASAVA_Build 11 114320645 3I AACAAAAACT ---/ACA ACATTGTCAC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 ACA 1 2 254258 CASAVA_Build 11 114326576 1D CCTTGACCCC T/- GGGAGACCCT 3070 hom 92 het 39 0 30 9 T 1 0 254259 CASAVA_Build 11 114337823 1I GAACGTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1676 hom 51 5 36 10 T 11 12 254260 CASAVA_Build 11 114340198 1I TTTAATGGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 123 het 48 0 40 8 T 9 10 254261 CASAVA_Build 11 114344579 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3067 hom 24 het 9 0 9 0 TA 9 8 254262 CASAVA_Build 11 114350050 1D ATTTTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 31 1 25 5 T 13 12 254263 CASAVA_Build 11 114352045 4I TAAAATACTA ----/TAAC TATGAAAAGC 3070 hom 85 het 32 0 29 3 TAAC 0 1 254264 CASAVA_Build 11 114364591 1I CTGCTGTTAA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 251 hom 36 1 32 3 T 7 8 254265 CASAVA_Build 11 114366747 1D GACTTTGGTC A/- ACTAACTGGA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 A 2 1 254266 CASAVA_Build 11 114370068 1D AATTCACCTG A/- AAAAAAAAAA 2757 het 2757 ref 34 13 11 10 A 13 12 254267 CASAVA_Build 11 114373538 1I CCTTGCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 11 254268 CASAVA_Build 11 114377115 2D TTTTGTAAGC AT/-- GAATATTCCA 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 AT 1 0 254269 CASAVA_Build 11 114378224 1D GCTGGTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 8 9 A 11 10 254270 CASAVA_Build 11 114378995 1I TCAACAAAAC -/A AAGGCTATAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 2 3 254271 CASAVA_Build 11 114380789 2D TCAAGATGCC AT/-- ATATATATAT 1770 het 1770 ref 32 9 7 16 AT 8 7 254272 CASAVA_Build 11 114382365 1I ATTTTAAAGG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 48 14 24 10 T 8 9 254273 CASAVA_Build 11 114386087 1I GTGAAAGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 9 10 254274 CASAVA_Build 11 114391573 1D TTTTTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2211 hom 28 8 13 8 A 12 11 254275 CASAVA_Build 11 114392288 1I AGATAAGCTA -/T AAAATCATAG 3070 het 3070 ref 34 15 9 10 T 0 1 254276 CASAVA_Build 11 114400226 2D TGCACACACA TG/-- TTTATAGCAG 3070 het 3070 hom 50 19 27 4 TG 1 0 254277 CASAVA_Build 11 114406826 2D TGAAGTTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 A 13 11 254278 CASAVA_Build 11 114410931 1I ACTGAAAGAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 8 9 254279 CASAVA_Build 11 114425380 1D TATTGTGAGA T/- TTTTTTTTTT 1314 het 1314 ref 35 22 6 7 T 15 14 254280 CASAVA_Build 11 114425667 1D AGGGCTATAG T/- TATAGTTTAC 3070 het 3070 ref 34 15 12 8 T 2 1 254281 CASAVA_Build 11 114448756 2D CAGCCAAAAT GA/-- GAGCTCCCAC 3070 het 2521 hom 31 7 19 6 GA 2 1 254282 CASAVA_Build 11 114450112 24D GAATGTGGGG CCTCACAGATACTGTGACCTCTGC/------------------------ CCAAGGTCAC 3070 het 3070 ref 41 23 18 7 CCTCACAGATACTGTGACCTCTGC 1 0 254283 CASAVA_Build 11 114462993 1D GGGTATGCTG T/- TAAGGATTAA 3070 het 3070 ref 53 25 25 4 T 2 1 254284 CASAVA_Build 11 114469052 2D CTCATCCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 13 11 254285 CASAVA_Build 11 114469197 2D ATTTTAACTC TT/-- CAGTCATCTT 3070 hom 75 het 33 0 26 8 T 2 0 254286 CASAVA_Build 11 114471638 1I CTCCTGGGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 98 het 39 0 33 6 A 9 10 254287 CASAVA_Build 11 114497138 5I TGGCAGGGCA -----/GCAGG GCAGGGACGT 3070 hom 99 het 40 0 29 11 GCAGG 1 2 254288 CASAVA_Build 11 114502585 3I CATTTATAAA ---/ACC AAAAAGTCTC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 ACC 0 1 254289 CASAVA_Build 11 114513191 1D TTCAAACACC A/- TACTGAGGGC 3070 hom 113 het 45 0 36 9 A 1 0 254290 CASAVA_Build 11 114527380 1I TCCTAATCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 10 11 254291 CASAVA_Build 11 114549620 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 27 1 19 7 T 11 12 254292 CASAVA_Build 11 114551306 1D AGCACAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 485 hom 43 2 21 20 A 15 14 254293 CASAVA_Build 11 114555342 3D CCACCAACGG TTT/--- TTATTTTATT 3070 hom 117 het 44 0 39 7 T 5 2 254294 CASAVA_Build 11 114564832 1D TTATTGGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 10 het 19 1 15 4 T 10 9 254295 CASAVA_Build 11 114565493 3I TTACGTAGGG ---/AGA AGGACTTATC 3070 hom 111 het 42 0 36 6 AGA 0 1 254296 CASAVA_Build 11 114573377 4I17M2I CCCAGTTTTA ----AACATATCTTTTCTAAG--/AACTAACATATCTTTTCTAAGCA CAGTCTTGTC 3070 hom 111 het 35 0 38 2 N/A 0 0 254297 CASAVA_Build 11 114578118 1I ACTAAGTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 48 0 36 12 A 12 13 254298 CASAVA_Build 11 114586972 1I GATGTCGTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 45 0 36 9 A 8 9 254299 CASAVA_Build 11 114587118 4D TGGAGGCCAC AGGT/---- AGGGAAGCAT 3070 hom 132 het 46 0 45 2 AGGT 1 0 254300 CASAVA_Build 11 114589991 1D ATTAAAAAAA C/- AGACACATTT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 C 1 0 254301 CASAVA_Build 11 114600220 1D GGAATGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2870 hom 38 12 18 8 A 11 10 254302 CASAVA_Build 11 114601244 1I TAATAAAAAA -/G GGGGGGGGGA 3070 hom 40 het 18 0 12 6 G 9 10 254303 CASAVA_Build 11 114625901 1D GTAGTGCGAT C/- TCGGCTCACT 3070 hom 58 het 25 0 20 5 C 1 0 254304 CASAVA_Build 11 114648008 1I TCATTATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1336 hom 44 5 32 7 T 13 14 254305 CASAVA_Build 11 114667531 6D GCTAGCCTTC CTTCCT/------ CTTCAAGAAT 3070 het 3070 ref 43 23 19 4 CTTCCT 1 0 254306 CASAVA_Build 11 114670697 1I TGGGCGCAGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 35 het 15 0 12 3 G 1 2 254307 CASAVA_Build 11 114681062 1D TCTGAGAGAT A/- ACACCGAAAT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 2 1 254308 CASAVA_Build 11 114683439 1I TTAAGCCAGG -/A AAAAAAAAAA 1234 het 1234 ref 22 10 4 8 A 10 11 254309 CASAVA_Build 11 114683449 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1976 het 1976 ref 23 11 5 7 T 1 0 254310 CASAVA_Build 11 114690070 1I27M1I CCCCAGGAAA -ACCTGTACAAACGCCACCACTATGCTC-/CACCTGTACAAACGCCACCACTATGCTCG GTATTAGCAG 3070 hom 159 het 53 0 52 9 N/A 0 0 254311 CASAVA_Build 11 114693639 1I ATCATCTGGC -/A TGAAGCTGCA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 A 0 1 254312 CASAVA_Build 11 114695718 1I AAAATAATGC -/A AAAAATGCAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 5 6 254313 CASAVA_Build 11 114699966 1D ATGCTGTGGG A/- AAAAGAAAGA 3070 hom 169 het 59 0 56 4 A 5 4 254314 CASAVA_Build 11 114700443 1I TCGTGGAAAA -/G GAACATGACA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 1 2 254315 CASAVA_Build 11 114703450 1I TACATAAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 10 11 254316 CASAVA_Build 11 114714798 4D CCTTCTTTTA TTTT/---- TTTTATTTTT 789 het 448 hom 9 3 5 1 T 8 4 254317 CASAVA_Build 11 114720027 1I68M1I AATTCACTTC -TGGTCTCCTTACAATGTGACTCAAGATGTAAAAATGTTCACAATCAGTTCAGCATTGATATGGACACA-/TTGGTCTCCTTACAATGTGACTCAAGATGTAAAAATGTTCACAATCAGTTCAGCATTGATATGGACACAT GAATTCAAGT 3070 hom 126 het 46 0 43 25 N/A 0 0 254318 CASAVA_Build 11 114720207 1I CCTCCAATCC -/A AATCTCTGGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 2 3 254319 CASAVA_Build 11 114722038 1I TTTCCAGAGA -/C CTTCGGTTTG 3070 hom 123 het 43 0 41 2 C 1 2 254320 CASAVA_Build 11 114726567 1I CATACTAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 A 11 12 254321 CASAVA_Build 11 114727064 1I GGAAACAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 8 9 254322 CASAVA_Build 11 114731637 14D TAAATTACTA ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 het 1058 hom 36 6 15 18 AC 15 8 254323 CASAVA_Build 11 114734143 4D CTTCTCTCAC TCAT/---- TGTCATTTAT 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 TCAT 1 0 254324 CASAVA_Build 11 114741185 4D ACAGAAAGTG ATTC/---- ATTGTTTCTA 3070 het 3070 ref 48 29 18 2 ATTC 1 0 254325 CASAVA_Build 11 114741991 1I TTCAGATTAA -/T GACTCCTTTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 0 1 254326 CASAVA_Build 11 114747752 1I TTTTTTAAGT -/A AGACCCAACT 3070 hom 68 het 26 0 22 4 A 1 2 254327 CASAVA_Build 11 114750808 1I AAGTAGTTAT -/A ACTCACGGAC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 1 2 254328 CASAVA_Build 11 114756154 3D ACAATCGGGG GAA/--- GAAAGAATTA 286 het 9 hom 27 0 5 26 GAA 2 1 254329 CASAVA_Build 11 114761088 4I CTGAACAGCC ----/TTTA TTTATTTGTA 3070 het 3070 hom 42 11 16 15 TTTA 1 2 254330 CASAVA_Build 11 114762643 1I GAGGGCAGAG -/C CCTCATGACC 3070 hom 83 het 33 0 27 6 C 2 3 254331 CASAVA_Build 11 114764499 12I GGGTAGAAGG ------------/ACATTGGGTATT ACATTGGGTA 3070 het 3070 ref 58 28 19 12 ACATTGGGTATT 0 1 254332 CASAVA_Build 11 114773622 1I7M1I20M2I15M1I32M1I TTATTCTCAA -TGACAAT-AGAGACATTGTACTCTATCA--GTTACGTTAATGACT-AGGAAGTGTACCATACAGTTGGAACTCTTAAC-/GTGACAATAAGAGACATTGTACTCTATCATGTTTACGTTAATGACTAAGGAAGTGTACCATACAGTTAGAACTCTTAACA AGGCATGCAC 3070 hom 81 het 35 0 28 27 N/A 0 0 254333 CASAVA_Build 11 114775748 1D CATATAGAAA C/- CCTCTTTCAC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 C 3 2 254334 CASAVA_Build 11 114779226 1D ACAAAGGTGG A/- ACTGAAAAAC 3070 hom 114 het 45 0 39 7 A 2 1 254335 CASAVA_Build 11 114785666 1D AAGCTTGAAG A/- AAAAAAAAAA 1750 het 1750 ref 41 24 4 13 A 15 14 254336 CASAVA_Build 11 114789501 1D ACAAGACTTG A/- AACATGATCA 3070 het 3070 ref 36 17 12 9 A 3 2 254337 CASAVA_Build 11 114790648 1I13M1I42M1I CACTGTGGCA -TTTGTCATCCAAC-TTGTCAGAAAAATTGCCCTGGAAAACAATCAACACTTCATTC-/TTTTGTCATCCAACTTTGTCAGAAAAATTGCCCTGGAAAACAATCAACACTTCATTCT TTGCTCATTC 3070 hom 129 het 43 0 44 18 N/A 0 0 254338 CASAVA_Build 11 114791245 1D TTTCTCTATA T/- AACTGACAGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 0 254339 CASAVA_Build 11 114796570 1D AGGTTCCTAC T/- TCAAAGAGGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 2 1 254340 CASAVA_Build 11 114798960 1I CTACGGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 T 11 12 254341 CASAVA_Build 11 114802976 1I TCTGTTCATT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 7 8 254342 CASAVA_Build 11 114805645 1D ATGCACTAAG C/- TCTGCTGAGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 1 0 254343 CASAVA_Build 11 114814454 2I TGGGAAATGT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 A 9 11 254344 CASAVA_Build 11 114814650 1I TGGTTTGATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 9 10 254345 CASAVA_Build 11 114815116 8I AGGCTAACCA --------/TAGTAAAG GGTATCCATT 3070 het 3070 ref 51 25 22 4 TAGTAAAG 0 1 254346 CASAVA_Build 11 114821434 1D ATCATTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 28 1 25 2 A 12 11 254347 CASAVA_Build 11 114822114 3D GTGCTTTACA TAT/--- TATTATCATT 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 TAT 3 2 254348 CASAVA_Build 11 114829317 1D AAAAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 2675 het 2675 ref 28 10 10 8 A 12 11 254349 CASAVA_Build 11 114841713 1D CCTCTATAAC T/- TTTTACAGGC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 5 4 254350 CASAVA_Build 11 114863966 1I CAATCCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 726 hom 33 2 23 8 A 12 13 254351 CASAVA_Build 11 114865136 1I TCTTTAATGA -/T TGCCCAACAA 3070 hom 151 het 56 0 51 5 T 1 2 254352 CASAVA_Build 11 114890461 1D AGGCAAGATC T/- TGTGAAAAGT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 T 2 1 254353 CASAVA_Build 11 114897615 1I CTGCCAGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 A 9 10 254354 CASAVA_Build 11 114898216 1I CATTTAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 10 11 254355 CASAVA_Build 11 114909020 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2969 het 2969 ref 33 13 10 10 T 11 10 254356 CASAVA_Build 11 114928991 1I ACAAAATACG -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 C 8 9 254357 CASAVA_Build 11 114944460 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTA 854 het 854 ref 12 6 2 5 A 1 0 254358 CASAVA_Build 11 114956247 4D AGCGCTGCTG GAGT/---- GAGTGAGAAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 GAGT 2 1 254359 CASAVA_Build 11 114966325 1D CTGTGCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 8 9 A 13 12 254360 CASAVA_Build 11 114967727 1D TGGTGCAATC T/- CGGCTCACTG 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 1 0 254361 CASAVA_Build 11 114978701 1I CCAAAATTCT -/G GGATGACAGG 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 G 2 3 254362 CASAVA_Build 11 114985123 1I AGAGCACTAT -/G GAAAGGGAGG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 G 1 2 254363 CASAVA_Build 11 114996647 1I ATCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2217 het 729 hom 20 4 13 3 T 15 16 254364 CASAVA_Build 11 115002996 1D TTCCCCCTCC T/- TTTTTTTTTT 1459 het 1459 ref 44 31 5 8 T 12 11 254365 CASAVA_Build 11 115005507 1I GGATCCTTGT -/G GGAAGCTGAG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 2 3 254366 CASAVA_Build 11 115005782 1D GAGCCCCCCC T/- GACCTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 17 12 10 T 1 0 254367 CASAVA_Build 11 115006729 1I TAATAGAGTA -/G GCTGATTTTA 3070 hom 153 het 56 0 50 6 G 1 2 254368 CASAVA_Build 11 115008247 1I ACAGTGTGTC -/T TTCTGCACAC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 2 3 254369 CASAVA_Build 11 115011935 2I AAGAAGTAAC --/TG TTTTATATTA 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 TG 0 1 254370 CASAVA_Build 11 115012126 3I AAAAAGAAAA ---/AAC AAGGGAAAAG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 AAC 0 1 254371 CASAVA_Build 11 115012632 2D AGAGTATCAG CT/-- CTCTGCCATC 3070 het 3070 hom 28 11 11 7 CT 3 2 254372 CASAVA_Build 11 115018588 4I GGTTATTGAA ----/AAAT AAATCCAGAC 3070 hom 107 het 43 0 34 9 AAAT 1 2 254373 CASAVA_Build 11 115018682 1I AAGCGAGGGC -/T TGGGAGGATG 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 1 2 254374 CASAVA_Build 11 115023014 4D CTTAAAGGGT TTTG/---- TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 TTTG 1 0 254375 CASAVA_Build 11 115023199 15D TGTAAAACAT AACATAACAAAACAA/--------------- AACAAAACAA 3070 hom 90 het 31 0 29 4 AACATAACAAAACAA 1 0 254376 CASAVA_Build 11 115026119 1I GTCCACTGCA -/G GGTTGCAGAG 3070 hom 114 het 42 0 37 5 G 2 3 254377 CASAVA_Build 11 115029540 1I TCCCCTATCC -/T TTGGGTGTCG 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 2 3 254378 CASAVA_Build 11 115029968 2D ACACACACAC AT/-- GGTAGCGGTT 3070 het 3070 ref 42 23 12 8 AT 1 0 254379 CASAVA_Build 11 115032841 1D TTCCCATCAA G/- GAGCTGAGGT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 G 2 1 254380 CASAVA_Build 11 115033684 1D TTGAAAATGG A/- AGGGTACTGA 3070 hom 126 het 49 0 42 8 A 2 1 254381 CASAVA_Build 11 115034097 1I TCGCCTCTAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 8 9 254382 CASAVA_Build 11 115039043 2D CTCTGAAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 14 14 T 14 12 254383 CASAVA_Build 11 115046081 7I CTGTTCCTTG -------/ACACCTC AGGTGGCTGG 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 ACACCTC 0 1 254384 CASAVA_Build 11 115047291 1D CTTCCTCCCC A/- ACTTCCTCCT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 2 1 254385 CASAVA_Build 11 115054253 30D AGAGAGGGAA ACACACACACACACACACACACACACACAC/------------------------------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 33 20 21 0 AC 23 8 254386 CASAVA_Build 11 115057969 3I GTGAGCTGAG ---/ATC ATGCCACTGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 ATC 0 1 254387 CASAVA_Build 11 115060060 14D TAGGTGGGGA CTTAATTGGGGGGG/-------------- CTTTATAGGT 3070 het 3070 ref 29 13 14 5 CTTAATTGGGGGGG 1 0 254388 CASAVA_Build 11 115062143 2I GCAAAGTTTT --/TC TCTGTGTCTT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 TC 1 2 254389 CASAVA_Build 11 115064373 1D TGAGCTGGGG A/- AAGCTGTCCA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 3 2 254390 CASAVA_Build 11 115064786 2I GAAGAGAGAA --/AT AGGCATTGTG 3070 hom 71 het 26 0 24 2 AT 0 1 254391 CASAVA_Build 11 115066570 4I AAGAAAAAAT ----/TTAA TTAGGTGATC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTAA 0 1 254392 CASAVA_Build 11 115066916 4D AGTAAGTAAG TAAA/---- TAAATAAATA 2566 het 2566 ref 29 17 11 3 TAAA 3 2 254393 CASAVA_Build 11 115067699 2I CAAATGTAAC --/TG TGTCAAATGG 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TG 1 2 254394 CASAVA_Build 11 115068951 1I GAGCACACAC -/A AGTACACACC 3070 hom 117 het 49 0 38 11 A 1 2 254395 CASAVA_Build 11 115070792 1I TGCTCCACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 11 12 254396 CASAVA_Build 11 115078506 1D GTGATAACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 4 A 11 10 254397 CASAVA_Build 11 115079304 1D TGAATATTTG A/- AAATGTTTCA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 4 3 254398 CASAVA_Build 11 115079942 1I TCAAAAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 A 11 12 254399 CASAVA_Build 11 115081614 1I CAGCTCCAGT -/C CCACTCATGT 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 C 2 3 254400 CASAVA_Build 11 115082373 2D AAAAAATAAA AG/-- AGTATAAGTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 AG 2 1 254401 CASAVA_Build 11 115085316 1I CCAGAAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 9 10 254402 CASAVA_Build 11 115085592 1D TTTCGCCTCA T/- TTTTTTTTTT 1812 het 1812 ref 19 10 6 3 T 12 11 254403 CASAVA_Build 11 115088532 1D AATTGCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 13 12 254404 CASAVA_Build 11 115089798 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 12 11 254405 CASAVA_Build 11 115094202 5D TTTTCAGAGC GGCTG/----- GGCTGCAGCA 3070 het 3070 ref 35 19 12 8 GGCTG 2 1 254406 CASAVA_Build 11 115110141 1D GTCACCTTTA T/- TACCTCTGTA 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 T 2 1 254407 CASAVA_Build 11 115146114 1D TCTTCAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2955 hom 35 10 19 6 A 11 10 254408 CASAVA_Build 11 115170436 1I ACTGGGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3032 hom 34 10 11 13 T 14 15 254409 CASAVA_Build 11 115171177 1D6M2D8M3D12M1I AAGAAAGAAA GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA-/-AAAGAA--AAAGAAAG---GAAAGAAAGAAAT AATAGAGACC 1876 het 1876 ref 15 12 4 1 N/A 0 0 254410 CASAVA_Build 11 115174028 1D TGGCCCAGGT G/- CCTGCCCCAA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 G 1 0 254411 CASAVA_Build 11 115232525 1D CTTATTTTAG A/- AAAAAAAATT 1513 het 1513 ref 18 11 4 3 A 9 8 254412 CASAVA_Build 11 115234152 1D ATAAGGTGTG A/- AAGCAAGTAA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 3 2 254413 CASAVA_Build 11 115239715 1I CTGTTGACGA -/T TTGTATGGTT 3070 hom 57 het 32 0 19 13 T 2 3 254414 CASAVA_Build 11 115243281 1I TGTTCTGATC -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 T 6 7 254415 CASAVA_Build 11 115247217 2D GCTATGTGTC AA/-- GAGTTGCTTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 2 0 254416 CASAVA_Build 11 115257966 1D AGTTGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2794 hom 25 8 9 9 T 15 14 254417 CASAVA_Build 11 115259129 5D CTGTGTTTAC TCAAG/----- TCTTTTGCGC 3070 het 3070 hom 36 14 22 1 TCAAG 1 0 254418 CASAVA_Build 11 115271289 20D TCCATCCATC CATCCATCCATCCATCCATA/-------------------- ATTCACCTAT 3070 het 3070 ref 48 31 18 10 CATCCATCCATCCATCCATA 1 0 254419 CASAVA_Build 11 115272133 4D TTAAAGCGTG TATT/---- TATTTCACAC 3070 het 3070 ref 45 25 17 5 TATT 2 1 254420 CASAVA_Build 11 115272776 1D GGTGTTAAGG A/- AAACAACATT 3070 het 3070 hom 47 22 19 6 A 4 3 254421 CASAVA_Build 11 115273938 1D TTTATGCCTC G/- TTGACACTTA 3070 hom 33 het 22 0 12 10 G 1 0 254422 CASAVA_Build 11 115273981 1I ATCCCTCCAA -/G GGTCATGTTC 3070 hom 51 het 28 0 17 11 G 2 3 254423 CASAVA_Build 11 115276173 1I CTTGCAAGAT -/G GGATGAGCTC 3070 hom 105 het 42 0 34 8 G 2 3 254424 CASAVA_Build 11 115283632 1D GATGAACCAC A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 A 8 7 254425 CASAVA_Build 11 115285588 1D ACAATACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 12 11 254426 CASAVA_Build 11 115298325 1I TCTATGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 540 hom 41 4 30 7 T 11 12 254427 CASAVA_Build 11 115308505 5D38M1D CGTGTGCGAT CAATCAGTAATGTAATCCTCTGCTGGTAGAACACAAAAACAAAG/-----TGTAATGTAATCCTCTGCTGGTAGAACACAAAAACAAA- CCCCACCTTG 3070 het 3070 ref 53 40 28 8 N/A 0 0 254428 CASAVA_Build 11 115316519 1I TATCTACCTC -/T TTTTTGCTTA 3070 het 3070 hom 48 20 20 8 T 5 6 254429 CASAVA_Build 11 115397975 1I AATTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 24 0 16 8 T 13 14 254430 CASAVA_Build 11 115398526 5I GATGTTATCG -----/CTCAA CTCACTATTT 3070 het 2622 hom 23 7 14 2 CTCAA 0 1 254431 CASAVA_Build 11 115404821 1I AATCAGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 10 11 254432 CASAVA_Build 11 115405226 1D ATTTGAAAAA G/- ATACTTGCAC 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 G 1 0 254433 CASAVA_Build 11 115420773 1D TCCTTCTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 29 3 20 7 T 11 10 254434 CASAVA_Build 11 115452578 1D GCAACTCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 862 hom 24 2 11 11 A 15 14 254435 CASAVA_Build 11 115455368 1D AAAAAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 12 11 254436 CASAVA_Build 11 115459331 1I TATCTAACTA -/C CCCTGGACCA 3070 hom 75 het 43 1 37 5 C 3 4 254437 CASAVA_Build 11 115484205 1D CAGCCTTCCT A/- AACACACCCT 3070 het 3070 hom 50 21 22 8 A 3 2 254438 CASAVA_Build 11 115498587 9D AGAAGGGGTG TGTTTTGGT/--------- TGCTATTAAC 3070 het 3070 hom 27 10 17 2 TGTTTTGGT 1 0 254439 CASAVA_Build 11 115501683 1D AGAAGACAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 T 9 8 254440 CASAVA_Build 11 115516208 1I TCTCTAGGTT -/A AAAGCAAACT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 3 4 254441 CASAVA_Build 11 115517723 1D GAAGTTACCC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 46 13 25 9 A 9 8 254442 CASAVA_Build 11 115518571 1D TGATCAAGCA T/- AGGATTTATA 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 T 1 0 254443 CASAVA_Build 11 115519020 10I GGGTGAGAGA ----------/GTGAGACTCT GTCTCAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 GTGAGACTCT 0 1 254444 CASAVA_Build 11 115519477 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 6 7 254445 CASAVA_Build 11 115528895 1D CTCTGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 13 12 254446 CASAVA_Build 11 115540043 3I CGTCTCTACT ---/GTA GTTGGTCTCC 3070 hom 92 het 43 0 37 6 GTA 0 1 254447 CASAVA_Build 11 115540576 1I AGCTGCTGTC -/T TTGTACAGTT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 2 3 254448 CASAVA_Build 11 115542168 27I GACCAATTCT ---------------------------/CATGGGCTGGGTACCTGGCTTGAGGGA CATGCTATAT 3070 het 3070 ref 67 31 25 11 CATGGGCTGGGTACCTGGCTTGAGGGA 0 1 254449 CASAVA_Build 11 115548765 1I GATCAGGATT -/A CAAATGCAAA 3070 het 3070 hom 52 15 26 11 A 0 1 254450 CASAVA_Build 11 115549440 1I CATCTATATC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 8 9 254451 CASAVA_Build 11 115549855 1I CATCAGGCAC -/A AATGAGTCAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 2 3 254452 CASAVA_Build 11 115570521 1D GAGGTTATCC T/- ACCTGTGAGG 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 T 1 0 254453 CASAVA_Build 11 115572206 4D GAAAATAGAC AGAT/---- AGATGATAGA 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 AGAT 2 1 254454 CASAVA_Build 11 115574337 3D ACTGGAGTCA GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 434 hom 24 4 12 9 GAG 10 9 254455 CASAVA_Build 11 115577401 1I GCCAATAAGA -/C CATACAACCT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 C 1 2 254456 CASAVA_Build 11 115579965 2D GTAAACACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 32 0 27 6 A 13 11 254457 CASAVA_Build 11 115583725 2D GGGGACAAAG GA/-- GAGACACTGT 2035 het 2035 ref 21 8 7 6 GA 3 2 254458 CASAVA_Build 11 115588526 1D CTACTAGACC A/- TGGCTCTATT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 1 0 254459 CASAVA_Build 11 115590336 2I GATTCTAAAC --/CA CATGGGGTTG 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 CA 1 2 254460 CASAVA_Build 11 115591116 1D GATCCAGAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 9 8 254461 CASAVA_Build 11 115597463 1D ATCCCTGGTT C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 C 8 7 254462 CASAVA_Build 11 115601613 4D CACACCCAAC ACTG/---- ACTGGCCCTT 2156 het 2156 ref 28 16 8 4 ACTG 2 1 254463 CASAVA_Build 11 115606490 1D ACTGAGCCTC A/- AAAAAAGGTG 3070 hom 86 het 35 0 29 7 A 7 6 254464 CASAVA_Build 11 115623716 3I TCATCTTTTT ---/CTC CTCCTTACAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTC 1 2 254465 CASAVA_Build 11 115629985 3I TCAGCCACTC ---/AAG AAGAGCAGGC 3070 het 3070 hom 56 25 27 4 AAG 1 2 254466 CASAVA_Build 11 115630221 1D20M1I CATCCACCTC AAAAAAAACCTGACTTTGTAC-/-AAAAAAACCTGACTTTGTACA AAAAAGGTCT 3070 hom 114 het 37 0 39 5 N/A 0 0 254467 CASAVA_Build 11 115632271 1D CTGCTCCCAA C/- CCCCCAGGAC 3070 het 3070 ref 35 16 11 10 C 6 5 254468 CASAVA_Build 11 115633013 10D CCCTTCTATC TTATCTTATT/---------- TTATCTTATT 3070 hom 99 het 41 0 34 10 TTATCTTATT 2 1 254469 CASAVA_Build 11 115657721 4D ACATGCTGAA CATG/---- CCCTGTGTAT 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 CATG 1 0 254470 CASAVA_Build 11 115660287 1I ACAACAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 10 11 254471 CASAVA_Build 11 115663465 1I AAAGTACTGA -/G GGGGAAAAAT 3070 het 230 hom 12 2 7 3 G 4 5 254472 CASAVA_Build 11 115686972 3I TCTCAGTATT ---/TTC TTTTCAAATC 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 TTC 0 1 254473 CASAVA_Build 11 115692765 1I AACAAAACAA -/C AACAAAAAAA 1403 het 1403 ref 23 15 5 3 C 0 1 254474 CASAVA_Build 11 115694719 3D ATAATAAGTG TTA/--- TTATGCCCTT 3070 het 3070 hom 47 20 22 6 TTA 2 1 254475 CASAVA_Build 11 115694856 1D TTTTATCCTG T/- TTAGGTGCTG 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 3 2 254476 CASAVA_Build 11 115695193 3D TGTATACTCT TAG/--- TAGTATCCAG 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 TAG 2 1 254477 CASAVA_Build 11 115695529 1D ATGCTAACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 10 9 254478 CASAVA_Build 11 115695751 1D TGCATTGAAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 A 8 7 254479 CASAVA_Build 11 115696395 4D ATAAGGAAAA AAAT/---- AAATAAAGCT 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 AAAT 2 1 254480 CASAVA_Build 11 115697125 2D TATTCATATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 12 10 254481 CASAVA_Build 11 115698968 1I GAAACATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 T 11 12 254482 CASAVA_Build 11 115701581 1D ATAGACACTG A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 58 28 29 1 A 7 6 254483 CASAVA_Build 11 115733764 1D CGCACTCCCC A/- AAGTGGCCCT 3007 het 3007 ref 31 16 9 6 A 3 2 254484 CASAVA_Build 11 115749970 11I GCTGAGAAGT -----------/CCCACGATCTG CCCACGATCT 3070 hom 85 het 35 0 26 10 CCCACGATCTG 1 2 254485 CASAVA_Build 11 115750331 5D TTGTGCTGTG ACTCT/----- ACCATCCTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 ACTCT 1 0 254486 CASAVA_Build 11 115751567 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2146 het 414 hom 20 2 8 10 T 19 18 254487 CASAVA_Build 11 115756344 5I AGTGGAAAAA -----/TAAAT TAGTGAACAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TAAAT 0 1 254488 CASAVA_Build 11 115761452 1D AAAAATATTT A/- AAAAAAATTA 1728 hom 8 het 7 0 5 2 A 8 7 254489 CASAVA_Build 11 115789498 2D GGATGGGGCA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 TC 6 5 254490 CASAVA_Build 11 115799760 2D ACCCACTGCC CT/-- CTCTCCAGCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CT 3 2 254491 CASAVA_Build 11 115815419 1I AAGCACTTTT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 A 6 7 254492 CASAVA_Build 11 115816515 1I TTTGCTATAT -/A AAGGTGACAT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 2 3 254493 CASAVA_Build 11 115818770 2D TGAAAATCAA CC/-- CCCCCAAGTG 3070 hom 100 het 36 0 34 3 C 7 5 254494 CASAVA_Build 11 115825623 1D GAAAATAGAT A/- AACAAATTGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 2 254495 CASAVA_Build 11 115864378 3D TTTGTGACCT GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 3070 hom 46 21 20 6 GAG 4 3 254496 CASAVA_Build 11 115866079 2I AATGTGCTTT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 A 9 11 254497 CASAVA_Build 11 115866811 3I2M2I GACCATTAAG ---CC--/GAACCTA CCTCCTGGGG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 N/A 0 0 254498 CASAVA_Build 11 115874747 1I GTTTCAGAGG -/A AAAAAAAAAA 2672 het 2672 ref 29 14 8 7 A 11 12 254499 CASAVA_Build 11 115877985 1I ATCTCATCTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 7 8 254500 CASAVA_Build 11 115899671 1D TGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3032 hom 33 het 17 0 10 7 A 17 16 254501 CASAVA_Build 11 115900156 2D CTACAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 A 14 12 254502 CASAVA_Build 11 115901259 1D CAGAGCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 13 12 254503 CASAVA_Build 11 115904431 2D GTCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 41 het 18 0 13 5 A 11 9 254504 CASAVA_Build 11 116002224 2I AAAACACCAC --/AT GTCAAAATAC 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 AT 0 1 254505 CASAVA_Build 11 116003901 1I CTTCAAAATA -/C CCTATGGAGG 3070 het 3070 hom 57 23 26 8 C 2 3 254506 CASAVA_Build 11 116006580 3D TTCACATGTC CTT/--- CTTGTTTGTC 3070 het 3070 ref 49 29 15 5 CTT 2 1 254507 CASAVA_Build 11 116007685 4I CCTACTGTTT ----/ATTG ATTATTATAC 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 ATTG 0 1 254508 CASAVA_Build 11 116008057 1I AGCCAAGGAC -/T TAAGCACGGC 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 T 1 2 254509 CASAVA_Build 11 116015931 10D ATTCCTTTGA GTGTGTGTGT/---------- GTGTGTGTGT 3070 het 2084 hom 47 9 27 17 GT 13 8 254510 CASAVA_Build 11 116021589 1D TGTTCCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 21 10 A 11 10 254511 CASAVA_Build 11 116027434 1D GAGTGAAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 27 0 21 6 T 10 9 254512 CASAVA_Build 11 116028181 2D4M5D CGCTAACCAC TTTACAAGTGG/--TACA----- CTTAGTGTAG 3070 het 3070 ref 62 38 25 9 N/A 0 0 254513 CASAVA_Build 11 116031243 2D GAAATCTAAC CT/-- GAGCTCCTCG 3070 het 3070 hom 57 23 26 8 CT 1 0 254514 CASAVA_Build 11 116034813 1I AAGGACCACA -/G GTCGCCAGAA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 G 1 2 254515 CASAVA_Build 11 116035963 1D GGTGAGCTTT G/- GGGGGGCCTA 3070 het 3070 hom 37 14 14 11 G 7 6 254516 CASAVA_Build 11 116039498 1D6M1D AGAAAAAAAA TAATAACT/-AATAAC- TGGAGGAGAA 3070 het 3070 hom 26 10 15 6 N/A 0 0 254517 CASAVA_Build 11 116048779 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 11 10 254518 CASAVA_Build 11 116048974 1I TGAATGGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 9 11 A 9 10 254519 CASAVA_Build 11 116051191 1I GAAGAGAAAC -/A AAAATCAACG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 4 5 254520 CASAVA_Build 11 116052147 1I TATATGGTTT -/G ACAGGATCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 254521 CASAVA_Build 11 116054668 2D GAGAGAGAGA AT/-- GAATGAATGA 3070 het 339 hom 63 4 34 26 AT 1 0 254522 CASAVA_Build 11 116057492 1I ACACAGGTTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 8 9 254523 CASAVA_Build 11 116057683 1D CAGGAGAAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 9 8 254524 CASAVA_Build 11 116058488 1I CAATAAAGAA -/T TCACTACTTG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 1 2 254525 CASAVA_Build 11 116058684 1I GGTGAGTCCT -/G GCTGGGTGCA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 G 1 2 254526 CASAVA_Build 11 116059710 1I AATATTACCT -/G GATAAAGAGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 1 2 254527 CASAVA_Build 11 116060244 1I CGTGTGATAT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 7 8 254528 CASAVA_Build 11 116074483 1D CAGTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 2744 het 74 hom 28 2 13 13 A 17 16 254529 CASAVA_Build 11 116075868 1D TACTAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 2854 hom 22 8 9 5 A 7 6 254530 CASAVA_Build 11 116079825 2D GCTTCACATC TG/-- TGGACCCATT 3070 hom 87 het 31 0 27 4 TG 2 1 254531 CASAVA_Build 11 116080884 1I GTGCCCACCA -/C TGAGCATGCC 3070 hom 87 het 34 0 28 6 C 0 1 254532 CASAVA_Build 11 116093586 1D TCTGTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 2779 het 2775 hom 35 13 10 12 T 14 13 254533 CASAVA_Build 11 116094328 1D GCACCTTCAT A/- AACTGGCCTG 3070 het 3070 ref 52 22 22 9 A 3 2 254534 CASAVA_Build 11 116099036 2D3M3I TCCCTCCTGC CTTCA---/--TGAAAG GGCCTTCCTA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 N/A 0 0 254535 CASAVA_Build 11 116119051 4D TAATGCCTAC TAAA/---- TAAACATAGA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 TAAA 2 1 254536 CASAVA_Build 11 116128424 1D AAATACTAGT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 A 9 8 254537 CASAVA_Build 11 116134945 1D AAGCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3005 hom 39 9 22 9 A 13 12 254538 CASAVA_Build 11 116137336 1D GCTAATGTAC A/- ATATTTATTT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 2 1 254539 CASAVA_Build 11 116167244 1D CTTTGATTCT G/- GGGACTGCAG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 G 4 3 254540 CASAVA_Build 11 116183460 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 9 10 254541 CASAVA_Build 11 116187560 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 3001 het 2938 hom 15 8 7 0 AG 2 1 254542 CASAVA_Build 11 116192117 1D GAAACCTTGC T/- TTTTTTTTTT 634 het 634 ref 38 30 3 5 T 12 11 254543 CASAVA_Build 11 116196722 4D ACTTCTTTGG GACA/---- GACAGACAGA 3070 het 3070 hom 39 13 15 15 GACA 4 3 254544 CASAVA_Build 11 116215378 2I GATCAGACTC --/AT GTGACTGCTG 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 AT 0 1 254545 CASAVA_Build 11 116218789 3D AGATGATCCA CCC/--- CCATCGGCCT 3070 het 3070 ref 33 14 12 8 C 5 2 254546 CASAVA_Build 11 116224135 2I ATACAAAAAA --/TT GGGTGGCGGG 1807 het 1807 ref 13 8 4 1 T 0 2 254547 CASAVA_Build 11 116253695 6I AAAACCACCC ------/TCTATT TCTAAGTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 TCTATT 0 1 254548 CASAVA_Build 11 116254308 1D TCTCTCTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1387 hom 36 8 16 12 T 16 15 254549 CASAVA_Build 11 116287435 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2860 hom 30 10 12 8 A 12 13 254550 CASAVA_Build 11 116289514 1D AATGAGACAC T/- TTCTACAACA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 3 2 254551 CASAVA_Build 11 116294305 1I TCTCCTACAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 44 24 11 9 T 8 9 254552 CASAVA_Build 11 116297854 1D TGGTTCAATC T/- TTTTTTTTTT 994 het 994 ref 32 20 3 9 T 12 11 254553 CASAVA_Build 11 116317335 1D AAAAACATGT A/- AAAAAAAAAA 2628 het 2376 hom 25 10 10 5 A 15 14 254554 CASAVA_Build 11 116319109 2I CTTAGAAATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 10 12 254555 CASAVA_Build 11 116325043 1I GCTTAGAGAG -/A AAATTTATAG 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 A 3 4 254556 CASAVA_Build 11 116330403 1I CTATCAAATC -/A AAAAAAAAAA 2687 het 2687 ref 36 18 9 9 A 13 14 254557 CASAVA_Build 11 116342614 1D AAAAAAGTAG T/- TTATTTCCAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 3 2 254558 CASAVA_Build 11 116345469 29D GTTTCTTGAT AGATCAAGTTGGCATTTTTTGAAACTAAG/----------------------------- AGATCAAGTT 3070 het 3070 ref 35 21 11 14 AGATCAAGTTGGCATTTTTTGAAACTAAG 2 1 254559 CASAVA_Build 11 116363259 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACACA 3070 het 2398 hom 39 16 18 5 C 0 1 254560 CASAVA_Build 11 116369363 1I GAAAACCAAC -/A CTAGAAACAA 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 A 0 1 254561 CASAVA_Build 11 116384391 7I ACATAAAGGC -------/AAAAGAG AAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 AAAAGAG 1 2 254562 CASAVA_Build 11 116387446 1D TAAACGGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 11 10 254563 CASAVA_Build 11 116389735 1D AAAACTGAGA C/- CCAGAGAAGG 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 C 3 2 254564 CASAVA_Build 11 116390524 1D GGGCTCATCT C/- CAAAATATAG 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 C 2 1 254565 CASAVA_Build 11 116391505 1D GTCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2499 hom 18 7 10 1 T 13 12 254566 CASAVA_Build 11 116394643 5I TTTTATTTTA -----/TTTAT TTTATTTTTT 2187 het 2187 ref 20 12 7 1 TTTAT 1 2 254567 CASAVA_Build 11 116399341 3D CACCTGATGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2199 het 1103 hom 24 7 7 11 T 17 14 254568 CASAVA_Build 11 116401496 1D CTGAGACCAC A/- GGCATGTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 A 1 0 254569 CASAVA_Build 11 116404115 1I GAAATGACGG -/T TAGGACTCAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 1 2 254570 CASAVA_Build 11 116404889 18I TGCTTTGTCA ------------------/CCAAGGCTGGATGGAGTG CAGTGGTGTG 3070 het 3070 hom 43 16 20 8 CCAAGGCTGGATGGAGTG 0 1 254571 CASAVA_Build 11 116412169 1D TAAAAAAAAA T/- AATGTAGGTA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 1 0 254572 CASAVA_Build 11 116413720 2D AAGAAGAAAA AC/-- ACACACACAA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 AC 5 4 254573 CASAVA_Build 11 116417836 1D ATCCCTACTC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 50 28 21 2 T 8 7 254574 CASAVA_Build 11 116420415 1D CTGCTGACTT A/- AGAGATTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 A 2 1 254575 CASAVA_Build 11 116425888 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2582 het 2582 ref 23 12 8 3 A 10 11 254576 CASAVA_Build 11 116441526 4I AAATTTAGTA ----/TCTT TCTTCAATAT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 TCTT 1 2 254577 CASAVA_Build 11 116442461 1I GAAACAATCC -/T TTTTTTTTTT 2445 het 2083 hom 30 8 12 10 T 16 17 254578 CASAVA_Build 11 116445102 2D GTTGTTAAGA TT/-- TTTTTTTGGG 103 het 103 ref 22 5 2 15 T 9 7 254579 CASAVA_Build 11 116451473 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2003 het 1652 hom 26 10 10 6 T 15 14 254580 CASAVA_Build 11 116454917 1D ATGATATCCT A/- AAAAAAAAAA 2903 het 2903 ref 19 8 8 3 A 13 12 254581 CASAVA_Build 11 116456256 1D TGGCAACATC T/- TACATGATTT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 T 2 1 254582 CASAVA_Build 11 116458306 3D GAAACAATGC CCA/--- CCAATTCATG 3070 het 3070 hom 48 22 22 5 CCA 2 1 254583 CASAVA_Build 11 116469605 1I TTTAAAAAAA -/G AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 G 0 1 254584 CASAVA_Build 11 116470356 1D CATAATGAGA C/- CCCCATCTCT 2598 het 2598 ref 16 9 6 1 C 5 4 254585 CASAVA_Build 11 116476037 1D TGGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1802 hom 19 5 11 3 T 11 10 254586 CASAVA_Build 11 116478523 1D TACTACTCTG A/- AAAAAAAAAG 1380 het 1380 ref 41 33 4 4 A 10 9 254587 CASAVA_Build 11 116483721 1D ATGGATTAAC T/- TCAGAGTTAA 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 T 2 1 254588 CASAVA_Build 11 116494921 2D ACTTTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2691 het 1810 hom 20 8 7 5 A 15 13 254589 CASAVA_Build 11 116499670 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 1383 hom 15 3 10 2 A 8 7 254590 CASAVA_Build 11 116500204 1D GAGTCAAGGC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 37 11 17 9 A 8 7 254591 CASAVA_Build 11 116500989 2D ACTCCGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1385 hom 27 5 17 5 A 14 12 254592 CASAVA_Build 11 116504933 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 11 5 A 15 14 254593 CASAVA_Build 11 116508401 1D ATTCTGTCCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2357 hom 24 8 14 2 A 10 9 254594 CASAVA_Build 11 116521374 1I GGGTTGGGCC -/G GGGGGTAAAG 3070 het 3036 hom 22 9 11 2 G 5 6 254595 CASAVA_Build 11 116522765 2D CCATCTATTG GA/-- AAAAAAAAAA 2053 het 2053 ref 26 10 10 7 GA 1 0 254596 CASAVA_Build 11 116525183 1D ATTTCTTCAA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 7 6 254597 CASAVA_Build 11 116529306 1I AGTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 2555 hom 25 8 14 3 G 0 1 254598 CASAVA_Build 11 116530046 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 8 9 254599 CASAVA_Build 11 116539114 13I ATTTCTGCCC -------------/TGGCTGAGTGTGG TGGCTCAACA 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 TGGCTGAGTGTGG 0 1 254600 CASAVA_Build 11 116557280 5D GGGCTCATAG TCTCT/----- GGAGCCACGT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 TCTCT 1 0 254601 CASAVA_Build 11 116575758 3D CCAAGGAGGT GAG/--- GAGTGTGTGA 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 GAG 2 1 254602 CASAVA_Build 11 116590319 8I GCTGTACTGT --------/CAAGGAGG CAAGGAGGAT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 CAAGGAGG 1 2 254603 CASAVA_Build 11 116591292 1D TGGCTAATTT G/- TGTGTGTGTG 1245 hom 7 het 3 0 3 0 G 1 0 254604 CASAVA_Build 11 116591640 1D TTTTGTATCG T/- TTTTTTTTTT 1377 het 91 hom 7 1 4 2 T 17 16 254605 CASAVA_Build 11 116596462 1D GAGCCACCAT G/- GGGGGGCCTC 2504 het 2504 ref 24 12 10 2 G 7 6 254606 CASAVA_Build 11 116617505 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2008 het 1991 hom 25 12 8 5 A 17 16 254607 CASAVA_Build 11 116636004 1D AATTCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 936 het 936 ref 34 26 3 5 T 13 12 254608 CASAVA_Build 11 116639245 4I CTCGCTGTGT ----/CTCC TGGCTGGAGT 1763 het 1725 hom 15 5 4 6 CTCC 0 1 254609 CASAVA_Build 11 116649405 1I TATGTTGTAT -/A GGGGAAGAGA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 0 1 254610 CASAVA_Build 11 116697797 1I AATTTTTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 9 10 254611 CASAVA_Build 11 116706576 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 9 8 254612 CASAVA_Build 11 116707357 1I TTTGTGTAAC -/A TTTTCTGTAT 3070 hom 86 het 42 0 37 5 A 0 1 254613 CASAVA_Build 11 116707677 1I TGCTGGTGTA -/T TTTTTTTTTT 2356 het 2356 ref 31 10 10 11 T 14 15 254614 CASAVA_Build 11 116709129 2I TTGTAGAGAC --/AG GGTCTCACTA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 AG 0 1 254615 CASAVA_Build 11 116721562 1D ACTGTCAGCT G/- AAGAATCACA 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 G 1 0 254616 CASAVA_Build 11 116726135 1D GCACCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 1768 het 40 hom 10 1 4 5 T 12 11 254617 CASAVA_Build 11 116733350 9D GTTAATATTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2335 het 172 hom 12 2 8 4 T 20 11 254618 CASAVA_Build 11 116734329 2I GGAGTCTGTA --/AT TTTCCATAAA 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 AT 0 1 254619 CASAVA_Build 11 116738650 1D TATCCATTTC T/- TTTTTTTTCT 2996 het 2996 ref 31 12 9 10 T 9 8 254620 CASAVA_Build 11 116753114 2I ACAGTTTTTC --/CA CAGATGGGGC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 CA 1 2 254621 CASAVA_Build 11 116785935 1D GCCTCCTCCT C/- CTCCTCTTCC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 C 2 1 254622 CASAVA_Build 11 116799683 4D TCCGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 AAAC 5 4 254623 CASAVA_Build 11 116801317 1D GTCTCTACGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 7 A 10 9 254624 CASAVA_Build 11 116814247 1I CAGCCCCCGG -/A CGGGTCTGAC 2352 het 668 hom 22 7 8 7 A 0 1 254625 CASAVA_Build 11 116814517 3D AGCACTGATC TAG/--- TAGTCCATTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 TAG 2 1 254626 CASAVA_Build 11 116817959 6D60M3D AGTGTGTGTA TGTGTGTGTGTGTGTTAGTGTATGTGTGTGCGCAGATGCGTGTTTGTGCACATGCATGTGAGTGCATGT/------TGTGTGTGTTAGTGTATGTGTGTGCGCAGATGCGTGTTTGTGCACATGCATGTGAGTGCA--- TGTGTATGTG 3070 het 3070 hom 71 53 54 12 N/A 0 0 254627 CASAVA_Build 11 116821259 1I CAGGAGGTCC -/G GGGGGGGCAG 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 G 7 8 254628 CASAVA_Build 11 116825767 1D AAAGAGGCAG A/- GGGGAAAATA 3070 het 3070 hom 37 17 20 0 A 1 0 254629 CASAVA_Build 11 116831773 1D GCTGGGGTGG T/- TGTGGAGGAC 3070 het 3070 hom 52 21 22 10 T 2 1 254630 CASAVA_Build 11 116834007 1I TCCCTGGCGG -/T CCCTGGGGTA 3070 het 3070 ref 42 15 14 13 T 0 1 254631 CASAVA_Build 11 116836997 1I ATATCAACAC -/G TGAAACTAGA 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 G 0 1 254632 CASAVA_Build 11 116843050 2I GGGCTGGAAA --/AC ACTCTCATCC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 AC 1 2 254633 CASAVA_Build 11 116847454 1I AAGATAAACC -/T TGTTTAAACT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 1 2 254634 CASAVA_Build 11 116876482 1I GACATTGGGG -/C TGACAGAGAT 3070 hom 132 het 51 0 42 9 C 0 1 254635 CASAVA_Build 11 116880626 1D GGACAAGAGG A/- AATACGGAGT 3070 het 3070 hom 42 11 24 7 A 3 2 254636 CASAVA_Build 11 116882647 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 8 9 254637 CASAVA_Build 11 116886392 3I AAACAAGTCC ---/CAT CATATTTTGG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CAT 1 2 254638 CASAVA_Build 11 116897688 1D CTCAGAAACC G/- GGGGGGGCAC 2169 het 1942 hom 22 9 7 6 G 8 7 254639 CASAVA_Build 11 116908057 1I CAGGAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 2115 het 2115 ref 23 8 10 5 A 10 11 254640 CASAVA_Build 11 116913058 18D GACAGCACCA CTCATAGGGACATATGGT/------------------ CAGCCAGCCT 3070 het 3070 ref 38 26 11 6 CTCATAGGGACATATGGT 1 0 254641 CASAVA_Build 11 116914855 11D TCCTGACTGG CCACCCTGAAT/----------- CCACCACTGC 2165 het 1949 hom 24 8 12 5 CCACCCTGAAT 1 0 254642 CASAVA_Build 11 116916826 1D TCCTGTCACT G/- GGGGGTATTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 G 6 5 254643 CASAVA_Build 11 116919727 1I TATAGGGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 648 hom 39 2 25 12 T 10 11 254644 CASAVA_Build 11 116926346 20D CCTCCCTGGC CCCAGTGTCTGGCCTGAAAG/-------------------- CCCAGTGTCT 3070 het 3070 ref 44 19 11 23 CCCAGTGTCTGGCCTGAAAG 2 1 254645 CASAVA_Build 11 116930308 4D TTTATTATTT ATTA/---- TTTTTATTTT 2897 het 2784 hom 17 8 6 4 ATTA 1 0 254646 CASAVA_Build 11 116932447 4D TCTTTTCCAG TTAA/---- TTTCTCTCAC 3070 hom 117 het 44 0 39 6 TTAA 1 0 254647 CASAVA_Build 11 116935056 3I AGACAGAAAA ---/ACG ACAGACACAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 ACG 0 1 254648 CASAVA_Build 11 116940683 2D TCTCTCTCTC TT/-- TCTTTCTTTC 889 het 889 ref 22 8 5 9 T 3 1 254649 CASAVA_Build 11 116942281 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 1861 het 748 hom 15 5 6 4 C 1 0 254650 CASAVA_Build 11 116953313 4D TTCCTTCCTT CCTC/---- CCTCCCTCCC 824 het 452 hom 13 2 3 8 CCTC 6 5 254651 CASAVA_Build 11 116956505 1I GCTAAATAAA -/T TGTTGGCCAT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 1 2 254652 CASAVA_Build 11 116963179 2I TTCTTTCCAA --/CC CCCCCCCCCA 3070 hom 60 het 33 0 17 16 C 9 11 254653 CASAVA_Build 11 116966293 1D TACATAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1895 hom 30 11 12 7 A 17 16 254654 CASAVA_Build 11 116972381 4D GGTTGAGGAG GAGA/---- GAGAGAGAAG 3070 het 3070 hom 42 14 20 10 GA 6 4 254655 CASAVA_Build 11 116973845 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 12 8 7 A 10 9 254656 CASAVA_Build 11 116975062 17I CCGCAAAACC -----------------/AGAAATCTTTTCTTAGT ACCTCACAGG 3070 het 3070 hom 41 19 16 6 AGAAATCTTTTCTTAGT 0 1 254657 CASAVA_Build 11 116984797 12I ATTGAGCATT ------------/ATGCATTTTAAA ATATCTGCCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 ATGCATTTTAAA 0 1 254658 CASAVA_Build 11 116985217 4D TTGATTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2824 het 637 hom 20 2 8 10 TTTC 5 4 254659 CASAVA_Build 11 116986766 1D ACCAAAACAA C/- CCCCCCCCCC 1977 het 177 hom 23 3 8 12 C 12 11 254660 CASAVA_Build 11 116987703 1D TTAAGTCATT C/- CCTTACCTTC 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 C 3 2 254661 CASAVA_Build 11 117001295 3D TGCCCTTGGG AGA/--- AGAAGGAGAG 3070 het 3070 hom 37 17 16 6 AGA 2 1 254662 CASAVA_Build 11 117002135 4D CCCCCCCCCC TCCT/---- TCTTCTGGCA 1395 het 88 hom 26 1 8 18 TCCT 1 0 254663 CASAVA_Build 11 117022089 1I TCAAAGTCAG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 8 254664 CASAVA_Build 11 117022767 2I GAGGTCTCCT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 253 hom 40 1 26 13 AG 6 7 254665 CASAVA_Build 11 117022780 1D GAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 402 het 402 ref 35 9 1 26 A 13 12 254666 CASAVA_Build 11 117035645 1D GCCTCACACA T/- TTTTTTTTTT 2361 het 1499 hom 16 5 8 3 T 12 11 254667 CASAVA_Build 11 117035812 1D CCTAGCTAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 852 hom 13 2 10 1 T 9 8 254668 CASAVA_Build 11 117038954 1D CATCCACTTG C/- CCCCCGGAGA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 C 6 5 254669 CASAVA_Build 11 117054663 1I CTTTCAGGAC -/A AATGGCATGC 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 2 3 254670 CASAVA_Build 11 117058622 1D TAGGTGAAAC T/- TACCCCTCGC 3070 het 3070 ref 33 13 11 10 T 2 1 254671 CASAVA_Build 11 117067727 1I TCTCTCCCCA -/G GGGGGGTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 G 6 7 254672 CASAVA_Build 11 117091039 1I ATAAGTCATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 23 0 15 8 A 9 10 254673 CASAVA_Build 11 117092914 11D AAATTCCCAT CCCAGATGCAC/----------- CCCAGATGCA 3070 hom 99 het 40 0 33 8 CCCAGATGCAC 2 1 254674 CASAVA_Build 11 117098232 1I TGGGGGAGCT -/A AAAAAAAAAA 1810 het 320 hom 30 3 6 21 A 17 18 254675 CASAVA_Build 11 117101609 4D GGAGGGAGGC CGGG/---- CCTCCCAGGG 3070 hom 53 het 23 0 13 11 CGGG 1 0 254676 CASAVA_Build 11 117104465 1D ATATAAAAAA C/- CCTTAGGAAT 3070 hom 72 het 29 0 24 6 C 3 2 254677 CASAVA_Build 11 117109069 1I GAGGACATGC -/A GGGGGAAGGG 3070 hom 84 het 34 0 23 11 A 0 1 254678 CASAVA_Build 11 117120949 1I CAACCAGCAC -/A ACCTCCTGAG 3070 hom 99 het 36 0 31 5 A 1 2 254679 CASAVA_Build 11 117121153 1I TACCTGGGGC -/G GGGGGTGGCT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 G 5 6 254680 CASAVA_Build 11 117135667 3D GCAGTGAAAA AAG/--- AAGGCCTCGC 3070 het 3070 ref 28 16 9 6 AAG 2 1 254681 CASAVA_Build 11 117146597 1D ACACAGACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 33 5 15 13 A 13 12 254682 CASAVA_Build 11 117157217 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 2161 het 434 hom 10 3 6 1 A 14 13 254683 CASAVA_Build 11 117173778 1D GCTACCTGTG T/- TATCTTCCTC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 2 1 254684 CASAVA_Build 11 117180857 1D CTCATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 12 8 A 10 9 254685 CASAVA_Build 11 117185922 2D ACATTCACAT AC/-- ACACATTCCC 3070 het 3070 ref 76 37 30 11 AC 3 2 254686 CASAVA_Build 11 117205840 1D AAGAAGCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 18 0 9 9 T 11 10 254687 CASAVA_Build 11 117207627 4I GTTGGGAGGT ----/AGAG AGAGGCAGTG 3070 hom 156 het 56 0 46 10 AG 2 4 254688 CASAVA_Build 11 117210347 1D CAGCTGCTCA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 110 het 44 0 37 9 T 8 7 254689 CASAVA_Build 11 117212687 3D AGGGCTGAGC AGG/--- AGGAGAGGAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 10 AGG 2 1 254690 CASAVA_Build 11 117227208 2D CTCTTGTGTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 43 16 15 12 CT 7 6 254691 CASAVA_Build 11 117235040 5D GAGGCTGCTC GAAAG/----- TCCATTTGCT 3070 het 3070 ref 37 16 14 8 GAAAG 1 0 254692 CASAVA_Build 11 117241847 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 8 9 254693 CASAVA_Build 11 117242065 1D GCACCGGGAA G/- GGGGGAAATG 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 G 6 5 254694 CASAVA_Build 11 117245792 4D TGGTCTTTCA GTGC/---- GTGCCGGCCT 3070 hom 100 het 38 0 32 7 GTGC 2 1 254695 CASAVA_Build 11 117280787 24D TAGATAAGAT TATATATATATATATATATATATA/------------------------ TATATATATA 1530 het 25 hom 11 1 5 5 TA 21 9 254696 CASAVA_Build 11 117282646 1D CAGCATAGGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 T 8 7 254697 CASAVA_Build 11 117284027 1D GGTGGGGAGA G/- CACTGCTTGG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 1 0 254698 CASAVA_Build 11 117302794 4D TGACTCCATC TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 hom 44 12 21 12 TCTA 3 2 254699 CASAVA_Build 11 117307573 1I GGCGGGTGGC -/G GGGGGGACAC 3070 het 2711 hom 26 9 12 5 G 6 7 254700 CASAVA_Build 11 117311779 2D AAATATGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 1571 hom 11 het 20 0 6 14 T 18 16 254701 CASAVA_Build 11 117313920 1D GCTGGGCGCT G/- TGGCTCACGC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 G 1 0 254702 CASAVA_Build 11 117320729 1D GAAGCTCAGG C/- CAATAAGAGG 3070 hom 135 het 52 0 44 8 C 2 1 254703 CASAVA_Build 11 117321695 1I TGCTTTCCTG -/C CGCCATGTGC 3070 hom 141 het 52 0 47 5 C 1 2 254704 CASAVA_Build 11 117322930 1D ATGAAGTCAT C/- CCCCCTGAGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 C 6 5 254705 CASAVA_Build 11 117328440 1D CCGAGTAGCT G/- GGACTACAGG 3070 het 1041 hom 14 3 7 5 G 3 2 254706 CASAVA_Build 11 117335118 4D TACAAAAAAA TAGT/---- TAGAGAGAAT 3070 het 3070 hom 32 16 15 4 TAGT 1 0 254707 CASAVA_Build 11 117346288 1I CTAGAGAGCT -/C TGCCTGGCTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 0 1 254708 CASAVA_Build 11 117353686 4I GGTGGCGCGT ----/CCAG CTGGAGTCTG 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 CCAG 0 1 254709 CASAVA_Build 11 117396973 1I CAGGGTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 9 9 T 11 12 254710 CASAVA_Build 11 117410123 4D GAAACCAGTA GATG/---- GATGGAGGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GATG 2 1 254711 CASAVA_Build 11 117410882 1I TCCTTCTGAA -/T TTTTTTTTTT 2180 het 1619 hom 27 8 9 10 T 15 16 254712 CASAVA_Build 11 117413031 1D GTCTCTCAGT C/- CCCCCTCTCA 1158 het 1158 ref 17 8 6 4 C 6 5 254713 CASAVA_Build 11 117418046 3I GAAGAAAGGA ---/AAT AATAAAGCTT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 AAT 1 2 254714 CASAVA_Build 11 117419204 1D TGGTAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 34 1 24 9 T 13 12 254715 CASAVA_Build 11 117420726 1D TTCATTCTAC T/- AAAAAAAAAA 3070 het 114 hom 14 2 10 2 T 1 0 254716 CASAVA_Build 11 117442750 1D ACCTTGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 237 hom 31 2 20 10 A 13 12 254717 CASAVA_Build 11 117446657 22D ACAGGATGTT CACTGAGACTGCCGGCAAATTA/---------------------- CACGGACAAT 3070 het 3070 ref 30 17 13 3 CACTGAGACTGCCGGCAAATTA 1 0 254718 CASAVA_Build 11 117451557 3I AAATATTGGG ---/GTT GTTGTTGTTG 3070 het 2972 hom 47 7 28 12 GTT 3 4 254719 CASAVA_Build 11 117451855 1I CCCCTGGCCA -/G GGGGGCAGCT 3070 hom 37 het 16 0 11 5 G 5 6 254720 CASAVA_Build 11 117461152 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 33 0 20 13 T 15 14 254721 CASAVA_Build 11 117463938 2D GGAAGAGCTG GA/-- GAGATGCTGG 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 GA 3 2 254722 CASAVA_Build 11 117464322 1I ATGTCTTCCT -/G CTGCCGGTGA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 G 0 1 254723 CASAVA_Build 11 117466540 1I CATCTCTACG -/A AAAAAAAAAA 2069 het 661 hom 15 2 7 6 A 15 16 254724 CASAVA_Build 11 117467638 1D TGCTGCCCAT C/- CTGGTTGGCA 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 C 2 1 254725 CASAVA_Build 11 117494648 1D TCAGCCAGGA G/- CCAGGGATAA 3070 hom 120 het 43 0 38 6 G 1 0 254726 CASAVA_Build 11 117515468 14I TAGCATCTGG --------------/CACAGTGCCTTGCA CACAGTGCCT 3070 hom 90 het 40 0 30 10 CACAGTGCCTTGCA 0 1 254727 CASAVA_Build 11 117548818 1D TTCTTCTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 27 4 13 10 T 17 16 254728 CASAVA_Build 11 117555801 1I ATTGCTTAGC -/A ACCAAGGGAA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 1 2 254729 CASAVA_Build 11 117559268 1D TCCTGTTGTG A/- AAAAAAAATG 2547 het 2547 ref 29 17 6 7 A 9 8 254730 CASAVA_Build 11 117560193 11D CACTCTGGAG GGAGGCTGTGA/----------- GGAGGCTGAG 3070 hom 63 het 24 0 21 5 GGAGGCTGTGA 1 0 254731 CASAVA_Build 11 117584022 8I CAGGCATGGT --------/GATGCACA GATGCACACC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 GATGCACA 1 2 254732 CASAVA_Build 11 117584166 3D CTAAAAAAAA AAG/--- AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AAG 1 0 254733 CASAVA_Build 11 117585624 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2679 hom 18 7 10 1 T 10 9 254734 CASAVA_Build 11 117587944 1D AATTTACCCC T/- CTCACCTGCT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 1 0 254735 CASAVA_Build 11 117595015 1D TAATAGTGTA T/- GGGGGGTTAA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 1 0 254736 CASAVA_Build 11 117604651 1D GATGATTTAA T/- TTGCAAAGAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 3 2 254737 CASAVA_Build 11 117605910 2D CAAAGACCAC AT/-- GTTAGGATCC 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 AT 1 0 254738 CASAVA_Build 11 117607394 1D GAAATGTCTG T/- TATCAGTCTC 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 T 2 1 254739 CASAVA_Build 11 117610651 2I TAAATAAATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 CA 8 9 254740 CASAVA_Build 11 117614062 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 10 9 254741 CASAVA_Build 11 117621336 4D TACGATAGTC CATT/---- AAGAAAGAAG 3070 hom 96 het 37 0 32 7 CATT 1 0 254742 CASAVA_Build 11 117622360 1I AATAATACCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 11 12 254743 CASAVA_Build 11 117622920 1D GTGTTACTAG A/- TCCTGGTAAG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 1 0 254744 CASAVA_Build 11 117624577 1I AGGGCTGGTG -/A AAAAAAAAAA 2815 het 2815 ref 29 14 7 8 A 10 11 254745 CASAVA_Build 11 117624968 4I CGGTTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 84 het 40 0 29 11 TTTG 3 4 254746 CASAVA_Build 11 117631597 1I42M1I TTTTATTTGC -TTTTTTCCTATGCTTTTAAAGTAAATTGCTGACATTTACCCC-/TTTTTTTCATATGCTTTTAAAGTAAATTGCTGACATTTACCCCT AATACTCCAG 3070 het 3070 ref 41 27 15 13 N/A 0 0 254747 CASAVA_Build 11 117632071 1D TCACTGGAGC T/- TTAGCCTATA 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 T 3 2 254748 CASAVA_Build 11 117632181 4D ATATCAAGAA CTTT/---- CTTATGAGCG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 CTTT 1 0 254749 CASAVA_Build 11 117633788 3D ATACAAAATT AGC/--- TGGGCATGGT 3070 het 179 hom 9 1 8 0 AGC 1 0 254750 CASAVA_Build 11 117635751 1I GTAAAATCAA -/C CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 C 7 8 254751 CASAVA_Build 11 117652916 1I ACTAATGAAA -/C AGAATTTTGT 3070 hom 144 het 53 0 48 5 C 0 1 254752 CASAVA_Build 11 117655700 1D CACTGTGCTG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 78 het 33 0 27 7 A 8 7 254753 CASAVA_Build 11 117656007 1D AAGTCAATAA T/- TTTTTTTTTT 2020 het 2020 ref 34 16 6 12 T 19 18 254754 CASAVA_Build 11 117656571 1I CAGTCTAATG -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 C 8 9 254755 CASAVA_Build 11 117661122 1D TTTTTAAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 27 het 16 0 10 6 A 9 8 254756 CASAVA_Build 11 117680196 1I AGAATATAGG -/C TAAAAAGTGG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 C 0 1 254757 CASAVA_Build 11 117711398 1I CTAAAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 23 19 9 A 12 13 254758 CASAVA_Build 11 117858690 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 89 het 38 0 29 9 AAG 6 5 254759 CASAVA_Build 11 117859302 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 27 het 10 0 9 1 A 7 6 254760 CASAVA_Build 11 117939973 1D CTAAAAATAC T/- AAAATTAGCT 1612 het 1612 ref 11 6 4 1 T 1 0 254761 CASAVA_Build 11 117973499 4I TGAAGTTATT ----/AGAG AGCCTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 AG 1 3 254762 CASAVA_Build 11 117987950 3I GAGCCATGCA ---/ATC ATCATCACAA 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 ATC 2 3 254763 CASAVA_Build 11 117997012 1I GGGAATGAGA -/C CCTGTCCTTT 3070 het 3070 hom 29 12 10 7 C 2 3 254764 CASAVA_Build 11 118000427 1I AGGATGGGTC -/T TTAGAGCTGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 2 3 254765 CASAVA_Build 11 118012494 1D GGATTACCTC A/- ATGCTGTCCT 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 A 2 1 254766 CASAVA_Build 11 118028092 1D ACTTCCCCCC T/- AACCTGGTCC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 1 0 254767 CASAVA_Build 11 118043274 1D ATTTTTTCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 36 het 14 0 12 3 T 8 7 254768 CASAVA_Build 11 118044197 1D14M1D ACCAAAACCA GGATGAAGACACATCA/-GATGAAGACACATC- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 5 N/A 0 0 254769 CASAVA_Build 11 118049955 2I CACTGAGTAA --/CT CTGCATTCCC 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 CT 1 2 254770 CASAVA_Build 11 118050983 1D TGAGTCAACT C/- CCCCAAAAGT 3070 hom 63 het 31 0 22 9 C 5 4 254771 CASAVA_Build 11 118051720 1I4M1I ACCTCCCAGG -TCAA-/TTCAAG TGATTCTCAC 3070 hom 33 het 14 0 12 5 N/A 0 0 254772 CASAVA_Build 11 118052641 1D14M1D25M1D7M1I GAGCCAAAAT GCTCACCACTGCACTGCCAGCCTGGGCAACAGAGCTAGATTGCTGTCTC-/-CTCACCACTGCACT-CCAGCCTGGGCAACAGAGCTAGATT-CTGTCTCA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 17 0 20 3 N/A 0 0 254773 CASAVA_Build 11 118052783 1D GAGATTCCAA G/- GAGCTTAGAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 2 1 254774 CASAVA_Build 11 118053833 1I ATTGCTCAGG -/A CAAAACCTAT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 0 1 254775 CASAVA_Build 11 118056103 1D GTAATGAGTC T/- TTTTTTTTTT 650 het 650 ref 26 7 3 16 T 17 16 254776 CASAVA_Build 11 118056437 1D TTGCCAAGGG A/- AATGGGCTGG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 3 2 254777 CASAVA_Build 11 118060265 1D TCTGAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 2379 het 2379 ref 24 13 7 4 T 13 12 254778 CASAVA_Build 11 118060866 1D ATAGGTAAGG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 36 11 24 1 T 8 7 254779 CASAVA_Build 11 118063308 2D ATTTCCCACC CT/-- CTGTGTTAAG 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 CT 2 1 254780 CASAVA_Build 11 118068914 1I GATCTCCGGG -/A GACACTAGTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 0 1 254781 CASAVA_Build 11 118071594 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 22 0 12 10 A 15 14 254782 CASAVA_Build 11 118075892 1I CCCATTGATG -/A AAAAAATCTC 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 6 7 254783 CASAVA_Build 11 118076270 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAAAGAAG 3070 het 753 hom 29 9 17 3 AG 0 1 254784 CASAVA_Build 11 118080076 10D TCTTTTCTTG GTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 16 7 GTTTTTTTTT 1 0 254785 CASAVA_Build 11 118080316 1D8M1D CTCCTGACCT GCAGGTGATA/-CAGGTGAT- CTGCCCGCCT 3070 hom 69 het 24 0 23 2 N/A 0 0 254786 CASAVA_Build 11 118080465 4I ATTTATTTAA ----/TTAT TTATTTATCA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 TTAT 2 3 254787 CASAVA_Build 11 118085787 1D CCCAAGCTGG T/- AGTGTAATGG 3070 hom 41 het 16 0 12 4 T 1 0 254788 CASAVA_Build 11 118089834 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTAATTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 6 5 254789 CASAVA_Build 11 118096274 1D CAGGTGAGTT G/- AACAGTCCGA 2233 hom 28 het 12 0 9 3 G 1 0 254790 CASAVA_Build 11 118104279 1D CTGTGGTGCT G/- GGGGCATTCC 3070 hom 36 het 15 0 8 7 G 5 4 254791 CASAVA_Build 11 118107629 1D TTTCACAAGG C/- CAATGTCATC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 C 2 1 254792 CASAVA_Build 11 118109915 4I AGCAACAAAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 AAAC 2 3 254793 CASAVA_Build 11 118111274 1I CTGGCATTAC -/T TTTTGAGGCA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 4 5 254794 CASAVA_Build 11 118111963 1D6M2D ACCTACTGAT CCCACCCCA/-CCACCC-- CCCTTGGCCT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 N/A 0 0 254795 CASAVA_Build 11 118112668 1D11M1D3M1D GCCTTACTCC AAACCTCCGCCTACCTA/-AACCTCCGCCT-CCT- GGGTTCAAGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 N/A 0 0 254796 CASAVA_Build 11 118114696 1D TGAACCCGGG T/- AGGTGGAGGT 3070 hom 29 het 12 0 10 2 T 1 0 254797 CASAVA_Build 11 118123821 2D AAAAACAGAG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 48 het 20 0 16 4 C 14 12 254798 CASAVA_Build 11 118125927 1D ATCTCCAAGG C/- AATTGTGGGT 3070 hom 41 het 16 0 13 3 C 1 0 254799 CASAVA_Build 11 118126070 4D GGGTTTTGAA AAAT/---- AAAATATGGA 3070 hom 63 het 22 0 22 2 AAAT 1 0 254800 CASAVA_Build 11 118127036 1I64M1I ATTTACAAAG -TTATACAAGTATACACACCCAATTTTCTATGGGACACGCTTTGCCACAGAGGAAAGAGGGCCAA-/TTTATACAAGTATACACACCCAATTTTCTATGGGACACGCTTTGCCACAGAGGAAAGAGGGCCAAG GCTCTGACAT 3070 hom 48 het 7 0 17 3 N/A 0 0 254801 CASAVA_Build 11 118137432 1D CTACTCGGGA G/- GGCTGAGGCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 3 2 254802 CASAVA_Build 11 118138277 1I CAACGCTGAT -/A CACTATAGAT 3070 hom 96 het 35 0 33 6 A 0 1 254803 CASAVA_Build 11 118138433 1I AAATCACCTG -/A CAACGCCGTA 3070 hom 98 het 39 0 31 8 A 0 1 254804 CASAVA_Build 11 118139413 1I21M1I ATACGTGCAG -CCGTCACTGACCACAACATTG-/TCCGTCACTGACCACAACATTGT TATGCAGCAC 3070 hom 93 het 33 0 31 7 N/A 0 0 254805 CASAVA_Build 11 118140176 1I AGTGATCTCA -/T TCTTGCTGTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 2 254806 CASAVA_Build 11 118140331 1I20M1D TCTAAGTTGG -CCAATTTTTCGGCACGACAAT/TCCAATTTTTCGGCACGACAA- ACCACCCCAT 3070 hom 69 het 28 0 24 9 N/A 0 0 254807 CASAVA_Build 11 118142831 1I TTGAGACAGA -/G TCTCGCTCTG 1991 hom 15 het 8 0 6 2 G 0 1 254808 CASAVA_Build 11 118144401 1D TTTGAATTCT C/- ACATGAATAG 3070 hom 84 het 35 0 29 7 C 1 0 254809 CASAVA_Build 11 118145596 1I6M1I AAAAGCTTGA -TCGTTG-/CTAGTTGT AAAAATTGTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 N/A 0 0 254810 CASAVA_Build 11 118147217 1D GTATCCTAAT C/- CCCCTTTTCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 5 4 254811 CASAVA_Build 11 118147940 1D TCCTTCTATG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 9 8 254812 CASAVA_Build 11 118153160 2D CACTCCACAC AT/-- GTTGGCTCAA 3070 hom 175 het 64 0 58 8 AT 1 0 254813 CASAVA_Build 11 118159014 4D TAAAATGAGA AAGT/---- AAGTGACGGA 3070 hom 99 het 34 0 33 1 AAGT 2 1 254814 CASAVA_Build 11 118159531 1I AGCCTAGCCT -/G GCAAACATGA 1773 hom 10 het 8 0 4 4 G 1 2 254815 CASAVA_Build 11 118163407 1I AACAAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 10 11 254816 CASAVA_Build 11 118172597 4D AATACAACTG TGAT/---- TGTAGGTTTG 3070 hom 126 het 48 0 42 7 TGAT 1 0 254817 CASAVA_Build 11 118173215 12D TTCTCAACTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2550 het 2003 hom 23 9 8 6 T 23 11 254818 CASAVA_Build 11 118181751 4D GATTTCGAAG CAGC/---- AGCAGGATGA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 CAGC 1 0 254819 CASAVA_Build 11 118181962 1D2M1D AATTCACTGA GCAG/-CA- ATAAGTTAAA 3070 hom 96 het 35 0 32 4 N/A 0 0 254820 CASAVA_Build 11 118184676 4D GCAGAATAAC AACT/---- AATAAATTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AACT 1 0 254821 CASAVA_Build 11 118185093 1I TATTCCTGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 254822 CASAVA_Build 11 118188402 1D6M1D CCAGGAGGTT AGAGGCTA/-GAGGCT- GCATTGAGCT 3070 hom 42 het 15 0 13 2 N/A 0 0 254823 CASAVA_Build 11 118188519 1I AACGTCACGA -/T TAACACTTTC 3070 hom 54 het 21 0 19 4 T 1 2 254824 CASAVA_Build 11 118193785 3D TTGTTCATTC TTG/--- TTGTGCTGTT 3070 hom 129 het 46 0 44 3 TTG 2 1 254825 CASAVA_Build 11 118195948 2D GCAGAAAAGG TA/-- TATTTCAAGA 3070 hom 42 het 17 0 14 4 TA 2 1 254826 CASAVA_Build 11 118197517 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 18 1 11 6 A 13 14 254827 CASAVA_Build 11 118203628 6D CTCTGTCTCA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 2800 het 2800 ref 26 17 8 2 AAAAAC 3 2 254828 CASAVA_Build 11 118205216 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAATAAA 3070 hom 22 het 10 0 8 3 A 9 6 254829 CASAVA_Build 11 118206606 1D GCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 32 2 22 9 A 13 12 254830 CASAVA_Build 11 118209521 2I GGAAAGGGAT --/AG AGACTCTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AG 1 2 254831 CASAVA_Build 11 118226710 4D CCAAATTTTT TTTC/---- TTTTCTTTTC 406 het 211 hom 22 1 3 19 TTTC 1 0 254832 CASAVA_Build 11 118229261 1I TGGCATTTGT -/A AACTGTCATG 3070 hom 72 het 25 0 23 2 A 2 3 254833 CASAVA_Build 11 118235392 1I TTTCCAAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 8 9 254834 CASAVA_Build 11 118241448 1I ACAGGTGCAC -/G GCCACCAAGC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 2 254835 CASAVA_Build 11 118243921 5D ATGTTGATTC TAAAA/----- TAAAATAAAA 3070 hom 39 het 21 0 13 8 TAAAA 3 2 254836 CASAVA_Build 11 118244106 1D CCATCTCTAC T/- TAAAAATACA 2782 hom 24 het 9 0 8 1 T 2 1 254837 CASAVA_Build 11 118286812 1I ACAGGGAGAC -/A AAGACACGCA 1964 hom 18 het 10 0 7 3 A 2 3 254838 CASAVA_Build 11 118286849 1I17M1I GAGGCGCGCC -GAGGCCAGGGAAGCGCC-/GGAGGCCAGGGAAGCGCCG GCCGGAGCGG 1176 hom 24 het 15 0 6 9 N/A 0 0 254839 CASAVA_Build 11 118290533 1I8M1I8M1I ATGCCTGTGA -CCTCTGCA-GGGAGACA-/TCCTCTGCAGGGGAGACAG GAAGGCCACA 3070 hom 42 het 17 0 14 6 N/A 0 0 254840 CASAVA_Build 11 118305294 1I GAGCAGGCAG -/C CAAGGCTTGG 769 hom 10 het 4 0 4 0 C 1 2 254841 CASAVA_Build 11 118305805 1I CCCACCGCCG -/C CCTCAGGGAC 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 2 3 254842 CASAVA_Build 11 118322473 1D CTCCTCCATG T/- TTCCAGAATC 3070 hom 82 het 34 0 28 6 T 3 2 254843 CASAVA_Build 11 118322691 1I20M1I CATGGTGAAA -CCTGTCTCTATCAAAAACAC-/CCCTGTCTCTATCAAAAACACA AAAATTAGCC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 N/A 0 0 254844 CASAVA_Build 11 118322864 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 16 0 12 4 A 15 14 254845 CASAVA_Build 11 118323009 1D GGGCTGAAGG A/- ATCGGTCTCC 3070 hom 102 het 39 0 33 7 A 2 1 254846 CASAVA_Build 11 118349025 1I ATTTTCTTTA -/C CCCTAGATTG 3070 hom 70 het 31 0 23 8 C 3 4 254847 CASAVA_Build 11 118359187 1D ACAGGCACAT G/- GCCACCAGGC 3070 hom 42 het 15 0 15 2 G 2 1 254848 CASAVA_Build 11 118363501 1I TTGAGCAAAC -/G GGGATAAGAC 3070 hom 81 het 35 0 24 11 G 3 4 254849 CASAVA_Build 11 118374053 1I CGAGGGGTCA -/G GGGTCAGAGG 1467 hom 16 het 9 0 5 4 G 3 4 254850 CASAVA_Build 11 118378602 1D AAGCTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1148 hom 27 4 11 12 T 15 14 254851 CASAVA_Build 11 118379059 1I9M2I5M1I ATAGAGCTTC -TCTGGTGCT--GTGGC-/TTCTGGTGCTTGTTGGCT TTAACATTCA 3070 hom 54 het 27 0 18 10 N/A 0 0 254852 CASAVA_Build 11 118379101 2I20M1I ACAAGTGCGT --GTGTCTTCTGTCTTCTTCAT-/TGTTGTCTTCTGTCTTCTTCATG GGAGACTCAG 3070 hom 30 het 20 0 11 13 N/A 0 0 254853 CASAVA_Build 11 118394458 1I TTGTGACGCA -/G TACTATAGCG 3070 hom 72 het 25 0 24 1 G 0 1 254854 CASAVA_Build 11 118398715 1D13M1D GCTACTCAAG TAGGCTGAGGCAAGC/-AGGCTGAGGCAAG- AGAATCGCTT 3070 hom 54 het 20 0 17 6 N/A 0 0 254855 CASAVA_Build 11 118403646 1D GACAACCACA C/- CACAGTGCCC 3070 hom 122 het 47 0 37 10 C 2 1 254856 CASAVA_Build 11 118408914 16D CTTCAGGTGA TCTGCCCCCCTTGGCC/---------------- TCCCAAAGTG 1996 het 1996 ref 13 8 5 3 TCTGCCCCCCTTGGCC 1 0 254857 CASAVA_Build 11 118412276 1I AAATAAATAA -/T TTTTTTTTTT 1456 het 1456 ref 16 8 5 3 T 10 11 254858 CASAVA_Build 11 118418911 1D AATACAAAAA T/- TTAGCCAGGT 3070 hom 87 het 35 0 26 9 T 3 2 254859 CASAVA_Build 11 118420968 1D GGAGCTGGAT G/- GGGAATGGGG 3070 hom 51 het 20 0 17 4 G 4 3 254860 CASAVA_Build 11 118432224 1I GCCTACTTCT -/C CCCTTCTCCC 3070 hom 126 het 44 0 40 4 C 3 4 254861 CASAVA_Build 11 118437240 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 701 het 628 hom 18 4 5 9 A 17 16 254862 CASAVA_Build 11 118438459 3I TATGATTTAA ---/CTT ATATCAAGTT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 CTT 0 1 254863 CASAVA_Build 11 118438784 2I AATTTTTGTA --/TT TTTAGTAGGG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 3 5 254864 CASAVA_Build 11 118440641 6D AAAATAAAAT AAAATA/------ AGATAAAAAT 3021 het 3021 ref 22 14 8 0 AAAATA 1 0 254865 CASAVA_Build 11 118442606 2D AAAATGATGC TA/-- TGTCACTTCT 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 TA 1 0 254866 CASAVA_Build 11 118442834 1I CTGCCACTAT -/G GAAAGGGGGA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 G 1 2 254867 CASAVA_Build 11 118444863 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 2320 hom 8 het 6 0 5 1 G 2 3 254868 CASAVA_Build 11 118445150 1I TTGCCACGTT -/C CCTACAGCTT 3070 hom 99 het 37 0 31 6 C 2 3 254869 CASAVA_Build 11 118446532 2I ATTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 12 14 254870 CASAVA_Build 11 118460230 1D CTACATGTAG C/- GTTTGTGCTC 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 C 1 0 254871 CASAVA_Build 11 118479609 2I AGAGGGGAAA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 74 het 29 0 24 5 CT 1 2 254872 CASAVA_Build 11 118481568 1D AAGAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 1362 het 1221 hom 24 5 6 14 A 17 16 254873 CASAVA_Build 11 118490558 1D CCTGCCCTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 9 8 254874 CASAVA_Build 11 118503341 1I ATGAATGTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 432 hom 34 1 20 13 T 8 9 254875 CASAVA_Build 11 118535302 7D AGCTACTGGG GGCAATA/------- ACCCTACAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 4 GGCAATA 1 0 254876 CASAVA_Build 11 118537052 1I TGTACCCCAG -/C CCCTGCAGCA 3070 hom 62 het 26 0 19 7 C 3 4 254877 CASAVA_Build 11 118539838 1D GGTGAATGAC T/- TTTTTTTTTT 2168 het 2168 ref 57 34 6 17 T 13 12 254878 CASAVA_Build 11 118567835 1D GATTAGGAAA G/- GGAACCCAGA 3070 hom 67 het 30 0 23 7 G 3 2 254879 CASAVA_Build 11 118570695 1I TCACTGCCCA -/C CCCTCTCTCA 3070 hom 46 het 18 0 15 3 C 3 4 254880 CASAVA_Build 11 118579576 1I TGAACCCGAA -/G GTGGAGGTTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 1 2 254881 CASAVA_Build 11 118598091 1I CTTTAGAGAT -/A AAAAATATTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 5 6 254882 CASAVA_Build 11 118648901 1D TGTCGTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 25 15 4 6 T 15 14 254883 CASAVA_Build 11 118655093 1D TTCTGTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1029 het 1029 ref 43 31 3 9 T 13 12 254884 CASAVA_Build 11 118658259 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1482 het 1482 ref 31 21 5 5 A 15 14 254885 CASAVA_Build 11 118685592 3D CACTCAACGT GGA/--- GGAGATGGTG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 GGA 2 1 254886 CASAVA_Build 11 118704483 1I TGTGTTTTTA -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 6 7 254887 CASAVA_Build 11 118707426 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 10 9 254888 CASAVA_Build 11 118728191 4I CAGAGTACTC ----/AGAT GGAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 AGAT 0 1 254889 CASAVA_Build 11 118734244 1D GCAGCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 11 10 254890 CASAVA_Build 11 118746529 2I AATGACGATA --/AG AGGGGTGGAG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AG 1 2 254891 CASAVA_Build 11 118758660 1I GCCAGGCCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 19 1 9 9 T 10 11 254892 CASAVA_Build 11 118761051 1D CTTTGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 871 hom 29 2 19 8 T 13 12 254893 CASAVA_Build 11 118763464 2I CTACAGACTC --/AG ATATGCAGGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AG 0 1 254894 CASAVA_Build 11 118787262 1I GATGGGGTTT -/C ACCATGTTGG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 0 1 254895 CASAVA_Build 11 118787983 1D ATTTGCCATC T/- TTTTTTTTTT 2773 het 2773 ref 22 13 7 2 T 13 12 254896 CASAVA_Build 11 118791835 1I CTCTTGACTT -/G GGGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 G 3 4 254897 CASAVA_Build 11 118793746 1I AGCTGAGAAG -/A AAAAAGCAGA 3070 het 3070 ref 55 35 16 4 A 5 6 254898 CASAVA_Build 11 118803316 1D GTGAGTCATG C/- CCCCCCCCGC 3070 het 2244 hom 31 12 10 9 C 9 8 254899 CASAVA_Build 11 118808756 1I AGGAGTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2582 hom 29 8 9 12 T 13 14 254900 CASAVA_Build 11 118816311 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 146 hom 26 1 21 5 A 12 11 254901 CASAVA_Build 11 118817008 1I ATTTTTGCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 9 10 254902 CASAVA_Build 11 118827259 6I GCAACCTCCG ------/CTTCCC AGAATCAAGC 3070 hom 27 het 11 0 10 2 CTTCCC 0 1 254903 CASAVA_Build 11 118830334 3I GGCGATGAAC ---/AGT AGATTCAAGG 3070 hom 154 het 54 0 52 2 AGT 0 1 254904 CASAVA_Build 11 118832207 4I AAATGGTATT ----/TCTC TGTCTGTAGG 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 TC 0 2 254905 CASAVA_Build 11 118835447 1D GATGTGGAAG C/- CCTGGGGCAC 3070 hom 98 het 38 0 29 10 C 3 2 254906 CASAVA_Build 11 118847718 1I GCAGGTCTCA -/G GGTGCCCGGG 3070 hom 54 het 22 0 15 7 G 2 3 254907 CASAVA_Build 11 118858980 1D CACCCTGCCC G/- GCAAAGTCCT 3070 hom 98 het 40 0 30 10 G 2 1 254908 CASAVA_Build 11 118859540 1D TGGCCCGGCA G/- GGCACTGGGC 3070 hom 33 het 21 0 10 11 G 3 2 254909 CASAVA_Build 11 118859633 1D TCTGCCCATG T/- TTCTGGTGTG 3070 hom 59 het 22 0 19 3 T 3 2 254910 CASAVA_Build 11 118860103 1D TGTGGGGGGT C/- CTAGTCTGGG 3070 hom 37 het 19 0 10 9 C 2 1 254911 CASAVA_Build 11 118862170 1I GTTGAGGCGC -/T CTTGTTTCTC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 0 1 254912 CASAVA_Build 11 118862382 1D13M1D TTTTACATGA TTTTCAAAATCTTTA/-TTTCAAAATCTTT- GGGCAGCAAA 414 hom 7 het 4 0 3 1 N/A 0 0 254913 CASAVA_Build 11 118867548 1D8M1D7M1D3M1D3M1D ACGGGGGCAG TGAATGTCTAGGTATCTACTGTGTGC/-GAATGTCT-GGTATCT-CTG-GTG- CGAAGGAGGA 3070 hom 63 het 21 0 21 6 N/A 0 0 254914 CASAVA_Build 11 118868759 1I GGGAGGACCA -/C CCTGGGCGGA 3070 hom 97 het 37 0 30 7 C 2 3 254915 CASAVA_Build 11 118876165 1D CTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 A 10 9 254916 CASAVA_Build 11 118876253 6I ATGGTTTGGC ------/TCTGTG TCCCCACCCA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 TCTGTG 0 1 254917 CASAVA_Build 11 118880578 3D TAAGGCAAGA CTC/--- CACCTCTACA 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 CTC 1 0 254918 CASAVA_Build 11 118890730 1D ACTGTGCATT A/- ACTATTGGCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 1 254919 CASAVA_Build 11 118891268 1I GGTCTAAACT -/G AATCCCTTTT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 G 0 1 254920 CASAVA_Build 11 118897936 1D GAAGATGGTG C/- CCAATGAACC 3070 hom 137 het 50 0 45 5 C 3 2 254921 CASAVA_Build 11 118898863 1D TACTGAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 353 hom 27 1 16 10 T 12 11 254922 CASAVA_Build 11 118906057 1I CAGCCACCCA -/G GGCAATGCCA 3070 hom 94 het 35 0 30 5 G 2 3 254923 CASAVA_Build 11 118906608 1I CAGGCTGCAC -/T TTGACCCACT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 2 3 254924 CASAVA_Build 11 118909705 1D TGGCGTGTCT C/- CCCCCCCAGG 3070 hom 70 het 32 0 18 15 C 8 7 254925 CASAVA_Build 11 118912293 1I ACCTGGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 28 1 23 4 T 10 11 254926 CASAVA_Build 11 118913806 7I CTGCACAGCC -------/AAACTGT GCCCATAGAG 3070 hom 150 het 55 0 50 5 AAACTGT 0 1 254927 CASAVA_Build 11 118914515 1I CCACTCTTAG -/T TTCCCACAGG 3070 hom 132 het 49 0 42 7 T 2 3 254928 CASAVA_Build 11 118920353 1D TGCAGAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 12 11 254929 CASAVA_Build 11 118922797 1D GGGGGTGGTT C/- CCCAGTGGGG 3070 hom 42 het 23 0 15 8 C 4 3 254930 CASAVA_Build 11 118922878 1D CTGCAGTGGG A/- AGCTTGAGGT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 2 1 254931 CASAVA_Build 11 118925448 1I GTTTCATGAA -/C CTTGATATAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 1 2 254932 CASAVA_Build 11 118925897 1I TCTAAAACTA -/T TTTTTAATAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 5 6 254933 CASAVA_Build 11 118927618 1I CTACAGATTC -/A AAATTAGGTA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 3 4 254934 CASAVA_Build 11 118929232 1D AGAGTTAGTA T/- TTTTTTATTC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 T 7 6 254935 CASAVA_Build 11 118937037 1I16M1D GGACCTGTGG -CCCTTTGACACAAACCG/CCCCTTTGACACAAACC- GAAGACCAGA 3070 hom 84 het 30 0 22 12 N/A 0 0 254936 CASAVA_Build 11 118938407 1I CAACAAAGAT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 7 8 254937 CASAVA_Build 11 118944437 1D ACTCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 36 3 25 9 A 15 14 254938 CASAVA_Build 11 118945021 1I CCCTGCTGAA -/T TTTTTTGTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 6 7 254939 CASAVA_Build 11 118945150 1D TCTCTCCCCC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 59 het 27 0 22 5 T 6 5 254940 CASAVA_Build 11 118945983 1I CCAAAGTGCA -/G GGATAACAGG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 2 3 254941 CASAVA_Build 11 118949577 2I5M3I4M2D CTCTCCCTGG --ATCCA---AGCTTG/CAATCCAGACAGCT-- TCGATCTGAT 3070 hom 81 het 27 0 28 4 N/A 0 0 254942 CASAVA_Build 11 118951991 3I TCACTGGATT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 98 het 48 0 32 16 TTG 5 6 254943 CASAVA_Build 11 118956077 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 9 8 254944 CASAVA_Build 11 118957543 1D GCAACATGTC A/- AAAACCCTGT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 5 4 254945 CASAVA_Build 11 118957724 1D ATTGGGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 18 7 A 11 10 254946 CASAVA_Build 11 118958211 1D AAGAATTTGG A/- AAAAACGCTC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 6 5 254947 CASAVA_Build 11 118959275 1D AGTGCTGGGA T/- TAGAGACATG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 1 254948 CASAVA_Build 11 118960046 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 26 0 22 4 A 12 11 254949 CASAVA_Build 11 118961610 1D CTGGGTAGGG C/- CCCAGAAACC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 4 3 254950 CASAVA_Build 11 118961742 1D39M1I GAGGTGTTGG AAGGACTGACCCGGGATAAACCTGAGTGATCCCAGACTCA-/-AGGTCTGACCCGGGATAAACCTGAGTGATCCCAGACTCAG GGCTCTCAAA 3070 hom 129 het 32 0 43 8 N/A 0 0 254951 CASAVA_Build 11 118963737 1I GAGGTGGTTA -/G GCCATGAGGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 1 2 254952 CASAVA_Build 11 118964634 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 12 11 254953 CASAVA_Build 11 118974398 1D AAACCACTGT G/- GTAGGTGATC 3070 hom 96 het 34 0 31 3 G 2 1 254954 CASAVA_Build 11 118981691 1D TCTGCTCTAA T/- TTATAAATGG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 3 2 254955 CASAVA_Build 11 119000871 1I GGCTATGTAT -/G GGGGAGCACA 3070 hom 50 het 20 0 17 3 G 4 5 254956 CASAVA_Build 11 119002783 1I TCTGTTCCCA -/G GGAGGCCCTT 3070 hom 73 het 31 0 20 11 G 2 3 254957 CASAVA_Build 11 119005345 1D AACCATGGAG T/- GGTCAGGCGG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 1 0 254958 CASAVA_Build 11 119010363 1I CTGCTCCCTG -/C CCCTGGATGG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 C 3 4 254959 CASAVA_Build 11 119014895 1D GGGCTCCTCA G/- GGGTCATGGG 3070 hom 42 het 21 0 12 10 G 4 3 254960 CASAVA_Build 11 119018102 4D GAGGGTCCAC CGGG/---- CGGGCCTCTG 3070 hom 99 het 37 0 31 7 CGGG 2 1 254961 CASAVA_Build 11 119021025 2I TGATGCAGGC --/CA CACAGGTGTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 CA 2 3 254962 CASAVA_Build 11 119066964 1I TCTCAGGACA -/C CAGCCTGAGC 3070 hom 105 het 39 0 34 5 C 1 2 254963 CASAVA_Build 11 119068032 1I TCCCATGCTT -/C CCCCGCCCGA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 C 4 5 254964 CASAVA_Build 11 119073200 1D17M1D TCAAGCAATT AAAAAAATATGCATTTTAT/-AAAAAATATGCATTTTA- TTTTTGCACA 3070 hom 77 het 24 0 26 7 N/A 0 0 254965 CASAVA_Build 11 119075292 1D TTTCCCACGG C/- CCCCGGCCAG 3070 hom 64 het 25 0 21 4 C 5 4 254966 CASAVA_Build 11 119075414 1D AGGCCCCTGT C/- CCCAGCGGCC 1580 hom 23 het 13 0 7 6 C 4 3 254967 CASAVA_Build 11 119078518 1I CCGTTCTCTC -/T AGTTATACAG 2283 het 2283 ref 24 8 6 10 T 0 1 254968 CASAVA_Build 11 119086355 1D CACACACACA G/- CCCTGCATGC 3070 hom 123 het 48 0 42 9 G 1 0 254969 CASAVA_Build 11 119087024 4D GGGCACGGGA GGCT/---- GGCTGGGCAC 2268 hom 20 het 14 0 8 6 GGCT 2 1 254970 CASAVA_Build 11 119120343 1I CCAGGCCAAG -/A CAGATACATT 3070 hom 154 het 55 0 52 3 A 0 1 254971 CASAVA_Build 11 119120958 2D TAATTTGCAC AA/-- AGTTATCACA 3070 het 3070 hom 55 24 28 6 A 3 1 254972 CASAVA_Build 11 119130446 1I CAGAAGCCAG -/A AGGTAAGAGA 3070 hom 132 het 48 0 41 7 A 1 2 254973 CASAVA_Build 11 119132402 1D TGCGTGATGC A/- AAAAATATAA 3070 hom 84 het 38 0 28 10 A 6 5 254974 CASAVA_Build 11 119137169 1I GAAAGGCCCA -/G GGTGAGTGGG 3070 hom 74 het 31 0 24 7 G 2 3 254975 CASAVA_Build 11 119152346 1I AGGAGCATGT -/G TTCTGGAGCC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 G 0 1 254976 CASAVA_Build 11 119163757 1D GGCTCACTGC A/- AACCTCCACC 3070 hom 88 het 31 0 28 3 A 3 2 254977 CASAVA_Build 11 119164856 1I GTTTGGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2476 hom 31 12 12 7 T 11 12 254978 CASAVA_Build 11 119166735 2D ACACTTGCAT AC/-- ACACACACAC 999 het 999 ref 57 43 3 11 AC 7 6 254979 CASAVA_Build 11 119170346 1I AGCCGGCTGC -/T GTTTGACAGG 2956 hom 24 het 12 0 9 3 T 0 1 254980 CASAVA_Build 11 119172142 1D10M1D AATAGTGAGT ACCCCCATGGTA/-CCCCCATGGT- CTGGGGATCA 3070 hom 102 het 38 0 33 10 N/A 0 0 254981 CASAVA_Build 11 119173176 1D CAGAGAAAAA G/- GGGGCTCCTG 3070 hom 72 het 30 0 23 7 G 5 4 254982 CASAVA_Build 11 119188644 6I GTGTGTATGC ------/GTGTGT GTGTGTGTAT 3070 hom 109 het 58 0 37 21 GT 4 7 254983 CASAVA_Build 11 119190319 1D CAAAACTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 12 11 254984 CASAVA_Build 11 119191103 1D CTTTTGCCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 T 10 9 254985 CASAVA_Build 11 119192376 24D CATTCCGTTT CCTTCTAAAAGCTTCATTATTAGG/------------------------ CCTTTGACAC 1651 het 1651 ref 16 13 5 3 CCTTCTAAAAGCTTCATTATTAGG 1 0 254986 CASAVA_Build 11 119195238 1I CCCTTACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 12 8 T 10 11 254987 CASAVA_Build 11 119212138 1I ATGGTTTGGC -/A AAATTGGGAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 3 4 254988 CASAVA_Build 11 119225403 7D GAGGGTCTTG GCTCCAA/------- GCTGATGCTC 3070 het 3070 ref 50 23 23 7 GCTCCAA 1 0 254989 CASAVA_Build 11 119276463 1I CTCCAGCCTG -/T GCTGGTTCCC 3070 hom 86 het 32 0 27 5 T 0 1 254990 CASAVA_Build 11 119277551 1D TGGATGGACC G/- GGGCTGTTTT 3070 hom 111 het 40 0 32 8 G 4 3 254991 CASAVA_Build 11 119287486 1D TTAGATAGGT A/- AGGTAGGTAG 3070 het 3070 hom 41 14 22 7 A 2 1 254992 CASAVA_Build 11 119292041 1I ATCATTTCCA -/C CCCCCCGTGA 3070 het 3070 ref 58 27 22 9 C 6 7 254993 CASAVA_Build 11 119335050 1D AGTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 53 34 3 16 T 13 12 254994 CASAVA_Build 11 119365644 1I GTTTTTGGGA -/T TTTTCTGGGA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 4 5 254995 CASAVA_Build 11 119377258 1I GCCTGGTTTG -/T TTTTGAATTG 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 4 5 254996 CASAVA_Build 11 119380853 1D AATCTCAGCT C/- CCCTGCCTGG 3070 het 3070 ref 53 28 22 3 C 4 3 254997 CASAVA_Build 11 119385630 1D ACAAAGTCAT G/- GGAGTAGGGG 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 G 3 2 254998 CASAVA_Build 11 119391253 1D GCAGTAACTA C/- CCCCCCCCCC 2986 het 1253 hom 31 7 11 13 C 11 10 254999 CASAVA_Build 11 119391808 6I CATGAGGAGT ------/TCTAAC TCTAACACTT 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 TCTAAC 1 2 255000 CASAVA_Build 11 119393153 1I CTCCATCATC -/T TATCAGCCGG 3070 het 3070 hom 51 15 26 10 T 1 2 255001 CASAVA_Build 11 119396408 1D GATGAATTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 284 hom 32 1 26 5 A 10 9 255002 CASAVA_Build 11 119399852 1D CTCCTGGCAC A/- GCTGGGTTCA 3070 het 3070 ref 61 29 25 7 A 1 0 255003 CASAVA_Build 11 119402837 1I AGGAGGAACG -/A ACAATTCCAG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 1 2 255004 CASAVA_Build 11 119402898 1D TGTAGCTTCA T/- TTCTGAGTCA 3070 het 3070 hom 27 10 11 8 T 3 2 255005 CASAVA_Build 11 119448999 1I TGTTTTGATA -/G GGGGGGTCAG 2782 het 2782 ref 31 11 11 9 G 6 7 255006 CASAVA_Build 11 119456941 1I GCTGGCTCAG -/C CCCTGGCTCT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 C 3 4 255007 CASAVA_Build 11 119466414 1I ACAGACACTT -/C CCTGCCCCAA 3070 hom 155 het 55 0 48 7 C 2 3 255008 CASAVA_Build 11 119470286 1I CAGATATTAG -/T TTTCACTTAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 3 4 255009 CASAVA_Build 11 119471369 1I CTGAGTGCAA -/G GTGCACCCCT 3070 het 3070 ref 58 29 22 7 G 1 2 255010 CASAVA_Build 11 119480196 13D5M2D TAGTGCAAGA GTAAATTACATTGGACGAAG/-------------GACGA-- AGAGTCCCAA 3070 het 3070 ref 32 19 16 1 N/A 0 0 255011 CASAVA_Build 11 119482907 1I GCACCTCTCT -/C CCCCCCTAGG 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 C 6 7 255012 CASAVA_Build 11 119496099 1D GTGGGGGGGG T/- GGCGCATTCC 3070 hom 47 het 27 0 20 7 T 1 0 255013 CASAVA_Build 11 119499108 2D TTTCCCCAAC CT/-- CTCAGAGAAT 3070 hom 81 het 31 0 25 6 CT 2 1 255014 CASAVA_Build 11 119521967 1I GTAAAGCAAC -/T TTGCCCAAGG 3070 het 3070 ref 43 23 10 10 T 2 3 255015 CASAVA_Build 11 119543354 1I AACTAAAGTT -/C AAAAATATGA 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 C 0 1 255016 CASAVA_Build 11 119545453 1I GGGAGGCCCA -/G GGAGTGTGTG 3070 hom 37 het 16 0 13 3 G 2 3 255017 CASAVA_Build 11 119550842 1D AGAGGTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 42 0 35 8 A 12 11 255018 CASAVA_Build 11 119553923 4D GGAAGGAAGC AAGG/---- AAGGAAGGAA 3070 het 1881 hom 27 10 11 8 AAGG 4 3 255019 CASAVA_Build 11 119587829 1D CCTCTTTCCT C/- CTATGGGCCT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 C 2 1 255020 CASAVA_Build 11 119594269 1D AATCCATCCA C/- CCCCGTTCCT 3070 hom 66 het 27 0 21 6 C 5 4 255021 CASAVA_Build 11 119606903 1D GGAGGGAGCT G/- TCCCATCAGT 3070 hom 72 het 27 0 24 4 G 1 0 255022 CASAVA_Build 11 119607238 3I CCTTGGGCTC ---/CTT CTTAGTCTCA 3070 hom 92 het 36 0 26 10 CTT 1 2 255023 CASAVA_Build 11 119608043 11D GAGGCCAGAA ACCCAGCCCTG/----------- ACTGGTGCTG 3070 hom 104 het 34 0 30 11 ACCCAGCCCTG 1 0 255024 CASAVA_Build 11 119648825 1D TCTTCTTTCT G/- GGGTTCTGTT 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 G 4 3 255025 CASAVA_Build 11 119656567 4I GAGAGAGAGA ----/GAGT GTGTGTTTGT 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 GAGT 0 1 255026 CASAVA_Build 11 119657833 1I GATTCAATGA -/G ATCTTGAGTG 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 G 0 1 255027 CASAVA_Build 11 119659384 1I TCTGGGGAGT -/C CCAAGTGCAT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 C 2 3 255028 CASAVA_Build 11 119659865 1D AATGCATGGA G/- GCAAGCGGAT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 G 2 1 255029 CASAVA_Build 11 119661811 1I GGTTTTTCTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 7 8 255030 CASAVA_Build 11 119663611 8I AACCCTTGTG --------/CCTAGAGC CCTAGAGCCC 3070 het 3070 hom 45 12 20 13 CCTAGAGC 1 2 255031 CASAVA_Build 11 119667733 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3009 het 464 hom 15 1 8 6 T 13 12 255032 CASAVA_Build 11 119680539 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 7 8 255033 CASAVA_Build 11 119702131 1I TAATTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 24 10 T 11 12 255034 CASAVA_Build 11 119711846 1D TCCAGGACAA G/- GGGGGCTGGT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 6 5 255035 CASAVA_Build 11 119718981 1D CTTAGCAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 92 het 42 0 33 9 T 10 9 255036 CASAVA_Build 11 119726551 4D CTATCACATA CTGT/---- CTTTTTATGT 3070 hom 96 het 34 0 33 3 CTGT 1 0 255037 CASAVA_Build 11 119742934 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 12 11 255038 CASAVA_Build 11 119748943 1I TGAAACAAGA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 6 7 255039 CASAVA_Build 11 119752142 1D AAATGTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 35 1 27 7 T 11 10 255040 CASAVA_Build 11 119760798 1D CAAAAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 2435 het 2435 ref 42 18 8 16 T 17 16 255041 CASAVA_Build 11 119769178 5I TTGATTAAAA -----/TAATT TAATTTAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TAATT 1 2 255042 CASAVA_Build 11 119779438 1D AAAGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 314 het 314 ref 30 26 3 1 A 12 11 255043 CASAVA_Build 11 119786213 1D TGTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 23 3 13 7 T 13 12 255044 CASAVA_Build 11 119790347 1I GTTTGAGTAT -/G TTTATTTAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 0 1 255045 CASAVA_Build 11 119795385 1I TTTCCTTTTG -/T TGTTATCTTA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 1 2 255046 CASAVA_Build 11 119801680 1D TGTATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 22 2 13 7 A 17 16 255047 CASAVA_Build 11 119812903 5I TAAGGAAGAT -----/AAATA AAGAGAGTTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAATA 0 1 255048 CASAVA_Build 11 119825754 1I TTGTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 469 hom 34 2 26 6 A 11 12 255049 CASAVA_Build 11 119836503 1D TCGTCTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 40 0 35 6 A 12 11 255050 CASAVA_Build 11 119837904 23I TTATACAGAC -----------------------/CATTCAAACTTCCTCCATACCAG TAATAGGCTG 3070 hom 90 het 31 0 30 5 CATTCAAACTTCCTCCATACCAG 0 1 255051 CASAVA_Build 11 119840923 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 45 het 26 0 20 6 A 8 9 255052 CASAVA_Build 11 119851625 2D GATTCTGTGA AC/-- AGTTTTCTGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AC 1 0 255053 CASAVA_Build 11 119853001 21D AGAGTGGGTT TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG/--------------------- TTGTTGTTGT 3070 het 585 hom 34 4 17 14 TTG 13 6 255054 CASAVA_Build 11 119856642 5I TCAGGAAGTA -----/AGTCT TTAGGAAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AGTCT 0 1 255055 CASAVA_Build 11 119859347 1I CCCAGATAAA -/T TTTTTTTTTT 918 het 837 hom 11 3 5 3 T 15 16 255056 CASAVA_Build 11 119867954 1D TCCTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 30 4 19 7 A 15 14 255057 CASAVA_Build 11 119875785 1I AAATGTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 31 1 24 6 T 11 12 255058 CASAVA_Build 11 119884789 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 29 1 26 2 A 12 11 255059 CASAVA_Build 11 119895800 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1807 het 912 hom 27 7 10 10 T 11 10 255060 CASAVA_Build 11 119911214 6I GGAAGGGGGG ------/GTTGCC TGCAGATCTT 2888 hom 27 het 12 0 9 3 GTTGCC 0 1 255061 CASAVA_Build 11 119946085 2I AGCTTGTCTC --/AT GTGGGGAACC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 0 1 255062 CASAVA_Build 11 119946771 1D TTAAATGAAT A/- GTCAGAATTT 3070 hom 141 het 52 0 48 5 A 1 0 255063 CASAVA_Build 11 119961263 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 16 0 10 6 T 12 11 255064 CASAVA_Build 11 120021050 6D ATGGTGTGTA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 68 27 31 13 GT 9 6 255065 CASAVA_Build 11 120028954 1I GTGATACATG -/C CCCCAAAGAG 3070 het 3070 hom 44 12 19 13 C 4 5 255066 CASAVA_Build 11 120040892 3D ATTTATTTTA TAC/--- TCTGTCTTAC 3070 het 3070 hom 52 22 26 5 TAC 1 0 255067 CASAVA_Build 11 120046187 1I TTTCTTGCCC -/T CTCACTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 0 1 255068 CASAVA_Build 11 120047417 2D GCTTTTTTTC AT/-- ATGTTTGTTG 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 AT 2 1 255069 CASAVA_Build 11 120053360 13D GATGTAGGAG AGTACTGCTATGT/------------- GTGAAGAATG 3070 het 3070 ref 56 35 19 7 AGTACTGCTATGT 1 0 255070 CASAVA_Build 11 120054540 2D ACTAGAAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 16 0 11 5 T 13 11 255071 CASAVA_Build 11 120054855 1D CCTGGCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 22 0 16 6 T 12 11 255072 CASAVA_Build 11 120056525 2D GTAGGAATGA CT/-- CATTCTTATC 3070 het 3070 ref 41 23 16 4 CT 1 0 255073 CASAVA_Build 11 120060636 1I ATAAAGATGC -/T TTTTTTTTTT 2115 het 2115 ref 24 6 8 11 T 11 12 255074 CASAVA_Build 11 120063187 1D ACCATGCCTT G/- GGTCTTTTCA 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 G 3 2 255075 CASAVA_Build 11 120076052 4D TTGGTTTTTT TGTG/---- TGTGACAGGA 3070 het 3070 hom 40 19 18 4 TG 4 2 255076 CASAVA_Build 11 120084840 1I GGCTGCTTTC -/T GATGGGCCAG 3070 het 2948 hom 35 11 17 7 T 0 1 255077 CASAVA_Build 11 120086136 1I TAGGACAGAC -/G TTATCTGTAC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 G 0 1 255078 CASAVA_Build 11 120087908 1I TTATTATACA -/C CTGCACTGTG 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 C 1 2 255079 CASAVA_Build 11 120095053 4D ACAAGATTTT AAAG/---- AAATCCAACA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 AAAG 1 0 255080 CASAVA_Build 11 120209721 1D TACAGACACA T/- TTTTCCCCCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 5 4 255081 CASAVA_Build 11 120210522 1D GGGCCTCAGC A/- AGGATGGGAA 3070 hom 87 het 35 0 27 9 A 2 1 255082 CASAVA_Build 11 120219622 1D TGGGCTTCGG T/- TTTTTTATCT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 T 7 6 255083 CASAVA_Build 11 120231484 1I TTATGGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 38 1 19 18 T 15 16 255084 CASAVA_Build 11 120244667 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 11 10 255085 CASAVA_Build 11 120254533 1D TTATGCCCCG C/- CCCCCCCCCT 3070 het 41 hom 28 2 19 7 C 10 9 255086 CASAVA_Build 11 120277227 17D CTCAAGACCT GCTCGCTGCATCCTGCC/----------------- GCTCGCTGCA 3070 hom 78 het 31 0 21 14 GCTCGCTGCATCCTGCC 2 1 255087 CASAVA_Build 11 120284354 2I ACACACACAC --/AT ACATACACAC 3070 hom 92 het 36 0 31 5 AT 0 1 255088 CASAVA_Build 11 120290108 1I AATTGCCTGT -/A AAGGAGTTCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 2 3 255089 CASAVA_Build 11 120301893 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2921 hom 28 8 18 2 A 13 12 255090 CASAVA_Build 11 120301906 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAAAA 3070 het 3063 hom 24 10 11 4 G 1 0 255091 CASAVA_Build 11 120303107 7I GTTGGGTCTT -------/TATTGTC TATGAACTTG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TATTGTC 0 1 255092 CASAVA_Build 11 120303311 1D CATGGCAAAA C/- CCCATCTCTA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 4 3 255093 CASAVA_Build 11 120305762 3I CGGCTTCAAG ---/TCT TCCTTAGGTT 3070 hom 95 het 36 0 29 7 TCT 0 1 255094 CASAVA_Build 11 120305922 2I GGCCACGTTT --/AG GGGGGGGGGG 3070 hom 52 het 34 1 24 9 AG 0 1 255095 CASAVA_Build 11 120315032 22D CATTAGAACT GAGCACCAGTTCTGGGCTTTTC/---------------------- CCACTGCCCC 3070 het 3070 ref 39 30 15 2 GAGCACCAGTTCTGGGCTTTTC 1 0 255096 CASAVA_Build 11 120337964 16D TATCTCTGTA TAGTCCTAAATGAACC/---------------- TAGTCCTAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 10 TAGTCCTAAATGAACC 2 1 255097 CASAVA_Build 11 120338743 2D CATTCTAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 328 hom 49 1 33 15 T 16 14 255098 CASAVA_Build 11 120339996 4I ACTGCAACCT ----/CCGC CCGCCTCCCA 1435 het 1435 ref 10 7 3 0 CCGC 1 2 255099 CASAVA_Build 11 120355893 1D AGCTGGGATT A/- ACAGGTGTGA 3070 hom 80 het 35 0 24 11 A 2 1 255100 CASAVA_Build 11 120356937 1I TGACTGCCCC -/T GACACTGACG 3070 het 3070 ref 61 25 25 11 T 0 1 255101 CASAVA_Build 11 120358665 1D CATTATTAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 7 T 8 7 255102 CASAVA_Build 11 120361040 5D GAGCCACTGT GCCCA/----- GCCCTATCCT 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 GCCCA 1 0 255103 CASAVA_Build 11 120361561 2D AAAAAAAAAA AG/-- TGAGATCATT 3070 het 257 hom 38 5 18 15 AG 1 0 255104 CASAVA_Build 11 120363819 4D ATTCAGAGAG AAAC/---- AAACAGCCGC 3070 hom 115 het 45 0 35 10 AAAC 2 1 255105 CASAVA_Build 11 120368234 1D GGTGTGGTGT G/- GTGTGTGTGT 920 het 920 ref 42 21 4 17 G 2 1 255106 CASAVA_Build 11 120370993 1I CCAGCTACTT -/G GGGGGGCTGT 2872 het 2872 ref 22 11 8 3 G 6 7 255107 CASAVA_Build 11 120376803 1I ACCCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 1370 het 494 hom 13 3 7 3 A 17 18 255108 CASAVA_Build 11 120377614 2D GCAAAGAAAC TT/-- TTCCTACAGG 3070 het 3070 ref 45 24 20 1 T 4 2 255109 CASAVA_Build 11 120380144 1D ACGCCCCCCA C/- CCCCCCCCAC 2437 hom 22 het 12 0 9 3 C 9 8 255110 CASAVA_Build 11 120484481 2D CACCCCCAGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 2485 hom 42 10 15 19 AC 8 7 255111 CASAVA_Build 11 120498772 3D ACCCTGTTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 32 0 18 14 A 15 12 255112 CASAVA_Build 11 120510494 1D TCCCAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 24 0 19 5 T 11 10 255113 CASAVA_Build 11 120511882 1I TTTTATGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 28 1 20 7 T 11 12 255114 CASAVA_Build 11 120556733 2D TTCTTATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1195 hom 37 10 9 19 T 18 16 255115 CASAVA_Build 11 120592453 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 AC 6 5 255116 CASAVA_Build 11 120597738 1I TAACTTTCAC -/A GGGACCATTC 3070 hom 157 het 56 0 53 3 A 0 1 255117 CASAVA_Build 11 120602679 3I TGTGAGGTGT ---/CCA CCACCCCTGC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 CCA 1 2 255118 CASAVA_Build 11 120609221 1I TTACTATTAA -/T TTTAAGCTGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 3 4 255119 CASAVA_Build 11 120629358 1I GATGAGCTTT -/G GGTGGGGACA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 2 3 255120 CASAVA_Build 11 120674070 1I AGGGCTGTGC -/T ACCACGCCCG 3070 hom 75 het 28 0 24 4 T 0 1 255121 CASAVA_Build 11 120730125 6I ACCAAAAGTT ------/ATAATC ATATAGCTCT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 ATAATC 0 1 255122 CASAVA_Build 11 120730382 2D AGTTGGTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 TG 6 5 255123 CASAVA_Build 11 120732112 2I GGAAGAAACT --/GA GTTTGCTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 24 8 GA 0 1 255124 CASAVA_Build 11 120735987 1I CCTCCCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2949 hom 28 11 10 7 T 10 11 255125 CASAVA_Build 11 120736288 3D CTTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2047 het 1091 hom 21 8 6 8 T 17 14 255126 CASAVA_Build 11 120753541 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2114 hom 20 7 11 2 A 16 15 255127 CASAVA_Build 11 120764182 1D CTATTACAAT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 35 15 14 8 A 7 6 255128 CASAVA_Build 11 120764958 5D ATCTGGTAAA AGGAG/----- AGGAGAACTG 3070 het 3070 ref 43 25 14 6 AGGAG 2 1 255129 CASAVA_Build 11 120781245 1I GACTCAGCCT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 A 7 8 255130 CASAVA_Build 11 120781683 1I AAAAGAAAAC -/A AAAAGGGAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 4 5 255131 CASAVA_Build 11 120786308 1D CTACCCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 39 0 26 13 T 12 11 255132 CASAVA_Build 11 120798380 1D ATTCTTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 23 5 T 11 10 255133 CASAVA_Build 11 120812918 1D GTTACTGAGG A/- ATGCTGCAGA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 2 1 255134 CASAVA_Build 11 120839180 1I ATTTTCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 10 11 255135 CASAVA_Build 11 120849494 1D GAGCTGTCCA G/- GGGTACAGTC 3070 het 3070 hom 27 9 15 4 G 4 3 255136 CASAVA_Build 11 120851228 1D AAGGTAGGAT A/- AAAATGTCAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 5 4 255137 CASAVA_Build 11 120866349 1I GAAGTGGGAG -/T TTTTTCTCTA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 5 6 255138 CASAVA_Build 11 120903117 1I TTGTTGAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 737 hom 26 3 20 3 T 11 12 255139 CASAVA_Build 11 120911009 1D TTGCTTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 T 13 12 255140 CASAVA_Build 11 120917130 2I ATCTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTA 3070 het 1931 hom 35 11 16 8 TG 0 1 255141 CASAVA_Build 11 120925590 1I CAGAGTCTTA -/G AATTGGGAAC 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 G 0 1 255142 CASAVA_Build 11 120957466 1D CCTTGTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 A 10 9 255143 CASAVA_Build 11 120970035 1D TTGATTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 312 hom 33 1 24 8 T 13 12 255144 CASAVA_Build 11 120980473 1D TAGTCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3020 hom 36 11 17 8 T 13 12 255145 CASAVA_Build 11 120998283 1I TAGATAGTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 9 10 255146 CASAVA_Build 11 121002373 1D GTTGCTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 467 hom 33 3 22 8 T 13 12 255147 CASAVA_Build 11 121007284 5I GTCACTTTCC -----/TTTTT TAAGTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 1 6 255148 CASAVA_Build 11 121025960 2D CAATAAACAC AA/-- GAGATTACGA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 2 0 255149 CASAVA_Build 11 121032340 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 2045 hom 23 7 11 5 A 7 8 255150 CASAVA_Build 11 121036326 2D GGCAAGGTTC GG/-- GGGGGGGGGG 2773 het 636 hom 22 2 9 11 G 12 10 255151 CASAVA_Build 11 121038194 19I GCACCAACTT -------------------/CAGAGCACAAAGCAGTTTC CATGAAGAGC 3070 het 3070 hom 45 16 28 3 CAGAGCACAAAGCAGTTTC 0 1 255152 CASAVA_Build 11 121039734 3D AGTTGCCTTA TTC/--- TTTAACAAGC 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 TTC 1 0 255153 CASAVA_Build 11 121043491 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2631 het 538 hom 17 3 9 6 A 18 14 255154 CASAVA_Build 11 121045947 1I AGCTCTAGTA -/T TGCTTCTTCA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 1 2 255155 CASAVA_Build 11 121047574 8I TCCACCCTCA --------/TCCCTGCC TCCCTGCCTC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 TCCCTGCC 1 2 255156 CASAVA_Build 11 121048080 1D AGAGAAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 13 12 255157 CASAVA_Build 11 121052950 1I CAAATTCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 A 9 10 255158 CASAVA_Build 11 121074890 1I AATCTCAGTG -/T CCCCCTCAAC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 0 1 255159 CASAVA_Build 11 121086609 3D TCTATATAAA TAT/--- TATTATATTA 3070 het 1037 hom 13 3 9 1 TAT 3 2 255160 CASAVA_Build 11 121089390 4D ACATGGAACC AATA/---- AATAAATACT 3070 hom 105 het 42 0 34 10 AATA 3 2 255161 CASAVA_Build 11 121091073 1I ATAAATAGTT -/A ACTCTGAAGC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 1 2 255162 CASAVA_Build 11 121093454 1I GCTGCTGCAG -/A AAAATCCCAA 3070 hom 151 het 59 0 51 8 A 4 5 255163 CASAVA_Build 11 121095103 1I GAACTTCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 8 9 255164 CASAVA_Build 11 121096282 1I CACCATTCAG -/C AAGCCACCGT 3070 hom 140 het 54 0 46 8 C 0 1 255165 CASAVA_Build 11 121129383 5D13M1D AATAATAAAA AAAAGAAAATTACCCATTA/-----AAAATTACCCATT- AAAAAAAAAG 2792 het 127 hom 6 1 7 2 N/A 0 0 255166 CASAVA_Build 11 121159660 1I GATTTGCGTA -/T TTTTGAACCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 4 5 255167 CASAVA_Build 11 121164970 4I GGTGAACCAT ----/GATA GATATTTAAG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 GATA 1 2 255168 CASAVA_Build 11 121165414 10D TGTGTGTGTA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 2309 het 14 hom 18 1 16 1 TG 13 8 255169 CASAVA_Build 11 121185786 1I TTATTTTTTT -/C CCCTGGTAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 C 3 4 255170 CASAVA_Build 11 121190337 1D TGCACTTAGC T/- TTTTTTTTTT 2575 het 2575 ref 33 19 7 7 T 15 14 255171 CASAVA_Build 11 121190810 1D ATCTAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 2430 het 2430 ref 46 35 7 4 A 12 11 255172 CASAVA_Build 11 121195714 1I TGTTATGTCT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 7 8 255173 CASAVA_Build 11 121196659 2I GGCTGGAGAG --/TA TATATATTTA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 TA 3 4 255174 CASAVA_Build 11 121223823 1D ACCAGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 20 0 12 8 T 15 14 255175 CASAVA_Build 11 121226125 1D GAATTTACTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 T 8 7 255176 CASAVA_Build 11 121237401 3D CACAGTAGTA AAG/--- ACTGGTATAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 AAG 1 0 255177 CASAVA_Build 11 121242202 5D CTTTACATTC TCTTT/----- TCTTTACTAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 TCTTT 2 1 255178 CASAVA_Build 11 121244214 1D CTGAAAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 10 9 255179 CASAVA_Build 11 121253763 4D GATGATAAAT TAGA/---- TAGAAGATAG 3070 het 3070 ref 37 17 17 8 TAGA 2 1 255180 CASAVA_Build 11 121256329 1I TCTCTTTTTT -/G GGGGGGGTGG 2957 het 2957 ref 26 11 8 7 G 7 8 255181 CASAVA_Build 11 121256591 13I ACTGGGGAGA -------------/AAGGGGAGAAAGG AAGAGGATGA 3070 het 3070 ref 39 17 17 9 AAGGGGAGAAAGG 0 1 255182 CASAVA_Build 11 121257332 7I TTTATGTGAT -------/TAGTAAG TAGTAAGGCT 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 TAGTAAG 1 2 255183 CASAVA_Build 11 121263464 4D AAAAAAGGAA AAAG/---- AGAGGGTTGT 3070 het 3070 ref 51 26 22 5 AAAG 1 0 255184 CASAVA_Build 11 121264214 1I CAAACAACTC -/A AAAAAACATT 2551 het 2551 ref 28 18 7 3 A 6 7 255185 CASAVA_Build 11 121274949 4I TGTAAATAAA ----/TAAT TAAAGCATGA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TAAT 0 1 255186 CASAVA_Build 11 121278880 19D AATGAGACAC ATCTGCTTTAGGGAGGACT/------------------- ATCTGCTTTA 3070 het 3070 ref 40 22 18 7 ATCTGCTTTAGGGAGGACT 1 0 255187 CASAVA_Build 11 121279734 4D TCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 24 11 12 5 AAAC 5 4 255188 CASAVA_Build 11 121280290 1D TTTGAATACC T/- TTTTTTTTTT 1674 het 1043 hom 23 5 7 11 T 15 14 255189 CASAVA_Build 11 121282260 4I ATACAGAGAG ----/AAGA AAGACCATGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AAGA 1 2 255190 CASAVA_Build 11 121282477 1I TACTCAGTTT -/A GACTACTTTT 3070 hom 95 het 39 0 29 10 A 0 1 255191 CASAVA_Build 11 121285630 16D GTATGTTGCA GGAAACTGCCACTGTG/---------------- GGAAATAATG 3070 hom 129 het 44 0 43 5 GGAAACTGCCACTGTG 1 0 255192 CASAVA_Build 11 121289521 8I15M3I ACTCTGTCTC --------AATAAATAAACAAAC---/AATAAGTAAATAAATAAACAAACTGT AAACAAACAA 3070 hom 47 het 16 0 16 3 N/A 0 0 255193 CASAVA_Build 11 121289767 4D TGTTCAAAAT ACTC/---- ACACTTCATT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 ACTC 1 0 255194 CASAVA_Build 11 121292131 1I TCTCTCTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 8 9 255195 CASAVA_Build 11 121301112 4D GGCTCAAATA TAGC/---- TAGCTGAAGG 3070 hom 87 het 31 0 30 3 TAGC 2 1 255196 CASAVA_Build 11 121309653 1D TCTATTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 11 10 255197 CASAVA_Build 11 121312061 4D TTCTAAAGAG TTTC/---- TTTTTCTTTT 3070 het 2302 hom 42 13 14 16 TTTC 1 0 255198 CASAVA_Build 11 121317604 1I TCTCATTATA -/T TTTTTAAGTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 5 6 255199 CASAVA_Build 11 121326894 3D ATGTACTCCA GGG/--- CTCCCCATCA 3070 het 3070 hom 45 21 19 6 G 3 0 255200 CASAVA_Build 11 121347958 1D TTCAGCAGAG A/- AATGACAAAC 3070 hom 102 het 40 0 35 7 A 3 2 255201 CASAVA_Build 11 121353446 1I CCCTTTTCAA -/T AGATGGTACT 3070 hom 38 het 15 0 13 2 T 0 1 255202 CASAVA_Build 11 121362640 1I TCCCCCCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 32 3 19 10 A 12 13 255203 CASAVA_Build 11 121367538 1I GTGTGTTCAG -/T TAAGTGTTAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 1 2 255204 CASAVA_Build 11 121368175 1D TCATTGCTTT A/- AAAAAATTCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 7 6 255205 CASAVA_Build 11 121385242 4I TGGCCCACAT ----/AAAG AAAAACGTAG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AAAG 0 1 255206 CASAVA_Build 11 121391120 3D AGGAATGCTG CCA/--- CCACCAGGAG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 CCA 3 2 255207 CASAVA_Build 11 121394825 10D7M4D TAATAAACTA TTATATACTTAATAAACTAAA/----------AATAAAC---- TAAAGATATA 425 het 425 ref 4 2 1 2 N/A 0 0 255208 CASAVA_Build 11 121403635 1I CAGAATACTT -/A AAACTGGGCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 3 4 255209 CASAVA_Build 11 121410251 1I CAAGGTTCTC -/T GAACACATCT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 0 1 255210 CASAVA_Build 11 121410462 1D TTCATTAGCC T/- TTTCTGAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 5 T 4 3 255211 CASAVA_Build 11 121411814 1I TGCAGATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 32 1 21 10 T 10 11 255212 CASAVA_Build 11 121415381 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 7 8 255213 CASAVA_Build 11 121418744 4D CATTCTCTTC TTGA/---- TTAATTCTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 5 TTGA 1 0 255214 CASAVA_Build 11 121420679 2D12M1D AAAAAATCAC AAAAAAAAAACTCCT/--AAAAAAAACTCC- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 17 3 N/A 0 0 255215 CASAVA_Build 11 121432536 1I ATCTGATGAG -/A AATCCTGTAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 2 3 255216 CASAVA_Build 11 121446321 4D CTCTCTCTCT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 58 het 30 0 19 12 CA 11 9 255217 CASAVA_Build 11 121478794 1I TTCAGATGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 97 het 54 1 47 6 A 9 10 255218 CASAVA_Build 11 121495906 3I AAATCCACTT ---/ATC ATTAAAAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ATC 0 1 255219 CASAVA_Build 11 121496821 1D GGTCAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1004 hom 31 3 22 6 T 11 10 255220 CASAVA_Build 11 121509937 1D ACAGCAGAAC T/- GAAAGGTGAA 3070 hom 92 het 37 0 27 10 T 1 0 255221 CASAVA_Build 11 121510813 1I CTATCTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 24 1 18 5 A 13 14 255222 CASAVA_Build 11 121513105 1I ACCTATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 10 11 255223 CASAVA_Build 11 121513366 1D TTTTCCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 33 1 27 5 T 12 11 255224 CASAVA_Build 11 121520714 1D GATAACATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 9 8 255225 CASAVA_Build 11 121523878 1I GGGGCGGAGC -/G GGGGGGGCTG 3070 hom 68 het 28 0 21 7 G 7 8 255226 CASAVA_Build 11 121532661 1D AAAGAGAAGG A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 7 6 255227 CASAVA_Build 11 121534136 1D TGATACTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 34 0 24 10 A 13 12 255228 CASAVA_Build 11 121556349 7D AGAGAACTTA AAAAAGG/------- AAAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 41 18 19 7 AAAAAGG 2 1 255229 CASAVA_Build 11 121562019 1D AACTTAACCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 10 9 255230 CASAVA_Build 11 121563256 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 26 0 16 10 T 15 14 255231 CASAVA_Build 11 121567272 5I AAAGCAAATG -----/TTTTA TTTTACTTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTTTA 1 2 255232 CASAVA_Build 11 121571433 8I CTCGAACTCC --------/TGATCTCG TGATCTGCCT 3070 hom 20 het 9 0 7 2 TGATCTCG 0 1 255233 CASAVA_Build 11 121612108 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTATATATA 3070 het 956 hom 18 3 14 1 TA 0 1 255234 CASAVA_Build 11 121698336 1I CTCTCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 A 10 11 255235 CASAVA_Build 11 121709307 1I ATTTGTATAG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 7 8 255236 CASAVA_Build 11 121722788 1D GAAGATTATT C/- TTATATATAC 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 C 1 0 255237 CASAVA_Build 11 121726052 1D CAGTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 1559 het 1559 ref 51 37 4 10 T 12 11 255238 CASAVA_Build 11 121751723 1D CTTGGGCCTT A/- AGGGAACCTC 3070 het 3070 ref 47 21 20 7 A 2 1 255239 CASAVA_Build 11 121753275 2I GCGGGGGGGG --/GA GGGGAGGGAA 1411 het 296 hom 12 1 7 4 GA 0 1 255240 CASAVA_Build 11 121758158 1I TTGAACTAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 8 9 255241 CASAVA_Build 11 121761734 10D AAATATTAGT TCCCCTCCCG/---------- GCATTTCATA 619 het 619 ref 42 18 3 26 TCCCCTCCCG 1 0 255242 CASAVA_Build 11 121772181 1I GGGTGCTAGC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 7 8 255243 CASAVA_Build 11 121779466 2I TTTTCTACAG --/CC CACACATTCT 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 C 1 3 255244 CASAVA_Build 11 121789302 1D CAGACTGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2681 hom 17 7 8 2 A 10 9 255245 CASAVA_Build 11 121794423 2D AGAGGTCAAA GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 7 het 34 0 22 12 G 12 10 255246 CASAVA_Build 11 121809514 1I TTTCCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2581 het 395 hom 28 2 13 13 T 17 18 255247 CASAVA_Build 11 121810600 2I GAGAGAAAAA --/AT AGTTTTTTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AT 0 1 255248 CASAVA_Build 11 121824620 1I TATAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 13 14 255249 CASAVA_Build 11 121834328 2D ATTTATGAGG CA/-- AAATAATAGG 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 CA 1 0 255250 CASAVA_Build 11 121835507 3D AATATATTTT ATA/--- ATAATATAAT 1777 hom 12 het 5 0 5 0 ATA 3 2 255251 CASAVA_Build 11 121843177 1I CTGTAGGGGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 41 het 25 0 22 3 A 8 9 255252 CASAVA_Build 11 121851341 1D ACAATCATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 47 1 36 10 A 11 10 255253 CASAVA_Build 11 121856577 1I AGATAGGCAC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 7 8 255254 CASAVA_Build 11 121857800 1I AGTGGGGAAA -/T TGTGTTAAAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 1 2 255255 CASAVA_Build 11 121869611 2I TACGGTAGAC --/TG TGTAGAGTTT 3070 hom 89 het 41 0 30 11 TG 1 2 255256 CASAVA_Build 11 121881498 1I AACCTTCCCT -/A ACCTCAACCA 3070 hom 134 het 53 0 40 13 A 1 2 255257 CASAVA_Build 11 121886942 2D AAAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 1106 hom 18 3 13 4 A 11 9 255258 CASAVA_Build 11 121893706 9I CATTCTCCCT ---------/AACGTCTAC AACAGTGTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AACGTCTAC 0 1 255259 CASAVA_Build 11 121896293 8D ACAGATTTAA AATTTGTG/-------- GAGAGTTTTA 3070 het 3070 hom 40 19 20 4 AATTTGTG 1 0 255260 CASAVA_Build 11 121900554 1D ACCTTCCCTT C/- CCTCCATTTA 3070 het 3070 hom 45 13 20 13 C 3 2 255261 CASAVA_Build 11 121902716 2D CTTCTAAAAA AT/-- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 AT 1 0 255262 CASAVA_Build 11 121907635 1D AAGGAGTAGG A/- AAAAAAAAAA 2430 het 2430 ref 25 11 9 5 A 12 11 255263 CASAVA_Build 11 121913928 1D AGAAAACTAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 9 8 255264 CASAVA_Build 11 121918643 1D ATTCCTAAGG T/- TTTTTTTGTT 2645 het 2645 ref 22 10 9 3 T 8 7 255265 CASAVA_Build 11 121941766 1D TCAAAAAGAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 54 18 33 3 A 8 7 255266 CASAVA_Build 11 121945585 3D TGAGACCAAA AAG/--- AAGAAGATCA 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 AAG 3 2 255267 CASAVA_Build 11 121974298 1D ATGTTTGGAA G/- CTCAGCTGAA 3070 hom 99 het 39 0 33 7 G 1 0 255268 CASAVA_Build 11 121983343 1I GACTCTAGCT -/A AAAAAAAAAA 1113 hom 5 het 25 0 6 19 A 11 12 255269 CASAVA_Build 11 121987731 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 697 hom 29 3 17 9 A 13 14 255270 CASAVA_Build 11 121989237 1D TCTCTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 1062 het 1062 ref 30 13 6 11 A 17 16 255271 CASAVA_Build 11 121995384 1D CATACCCTTT A/- AAAAAAAAAA 2980 het 2980 ref 37 19 9 10 A 12 11 255272 CASAVA_Build 11 121998809 1D CCCAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2426 hom 27 8 15 5 A 13 12 255273 CASAVA_Build 11 122007090 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1187 het 1187 ref 18 11 3 4 A 17 16 255274 CASAVA_Build 11 122083709 1D CTCCGCCTCC T/- GTGTTCAAGC 2828 het 414 hom 9 1 7 1 T 1 0 255275 CASAVA_Build 11 122098629 1I CTGGTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1227 hom 26 3 18 5 T 13 14 255276 CASAVA_Build 11 122101481 1I GCAGTAGCGA -/T CATTATACTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 1 255277 CASAVA_Build 11 122104922 4I TGCTTTCGGC ----/TCTT TCTATCACCC 3070 hom 101 het 36 0 34 2 TCTT 0 1 255278 CASAVA_Build 11 122107459 4D ACTAGATAAC TAAG/---- TGACTAACAG 3070 hom 120 het 43 0 40 6 TAAG 1 0 255279 CASAVA_Build 11 122110854 1I CTTATCACAG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 255280 CASAVA_Build 11 122113530 1D CCCCTAGCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 130 het 50 0 39 11 T 10 9 255281 CASAVA_Build 11 122113704 1D GTAAGGAATA G/- GTCAGGACGC 3070 hom 105 het 36 0 34 2 G 2 1 255282 CASAVA_Build 11 122120627 2I CATGTGCAAC --/TG TGTGTGTGAC 3070 hom 228 het 85 0 76 9 TG 4 5 255283 CASAVA_Build 11 122127033 4I TCCCGGCCTC ----/TCAT TCATGTTTTG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 TCAT 1 2 255284 CASAVA_Build 11 122129416 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2552 hom 10 het 17 0 11 6 T 17 16 255285 CASAVA_Build 11 122129927 2D CATATCTGCA CT/-- CTCTGACATG 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 CT 3 2 255286 CASAVA_Build 11 122131999 4I AAGCATTAAC ----/ACAT ACGTGTTGGC 3070 het 3070 ref 62 30 24 8 ACAT 0 1 255287 CASAVA_Build 11 122141006 1D ATAAAAGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 T 11 10 255288 CASAVA_Build 11 122146679 1I CACCACCCAC -/A TAAATATTCA 3070 hom 140 het 53 0 46 7 A 0 1 255289 CASAVA_Build 11 122153540 1D TGTCCACAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 107 het 41 0 35 6 T 10 9 255290 CASAVA_Build 11 122184895 1I TCGTAAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 11 255291 CASAVA_Build 11 122194019 1I CCAATAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 34 2 21 11 A 10 11 255292 CASAVA_Build 11 122208790 1I CTTTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 643 hom 24 2 21 1 A 11 12 255293 CASAVA_Build 11 122209548 1I3M4D TTTTATTGGA -ACACAGC/TTCA---- CTCATTCACT 3070 het 3070 ref 33 21 12 2 N/A 0 0 255294 CASAVA_Build 11 122222328 1I CCGGGTTCAA -/G TGATTCTCCT 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 G 0 1 255295 CASAVA_Build 11 122225641 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1139 het 1139 ref 30 24 3 4 A 12 11 255296 CASAVA_Build 11 122235350 1I TATTTTAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 57 hom 18 1 16 1 A 9 10 255297 CASAVA_Build 11 122237938 1I CAGATAAGAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 51 16 26 9 A 8 9 255298 CASAVA_Build 11 122238813 1D TCGTTTCTTT G/- TTTTCCCATC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 G 1 0 255299 CASAVA_Build 11 122241327 1D AAGATTTCTC T/- CTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 0 255300 CASAVA_Build 11 122242526 1D TTAGAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 29 1 18 10 T 15 14 255301 CASAVA_Build 11 122243273 2D CTCCAGTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 38 0 24 14 A 16 14 255302 CASAVA_Build 11 122259504 1D CGGCACAACC T/- TTTTTTTTTT 1974 het 1974 ref 34 17 8 9 T 12 11 255303 CASAVA_Build 11 122263972 1I CGTCTTCCCC -/T CCCTTTTTTT 3070 hom 106 het 40 0 35 5 T 0 1 255304 CASAVA_Build 11 122265252 1I GTATCCATGG -/C TTTCGCATCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 0 1 255305 CASAVA_Build 11 122265976 2D CAGTTTCTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 13 het 17 0 12 7 T 11 9 255306 CASAVA_Build 11 122274908 1D CTTCCTGCCC T/- TCTCAGCCTT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 T 2 1 255307 CASAVA_Build 11 122277381 1D ATACTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 15 1 12 2 T 11 10 255308 CASAVA_Build 11 122277496 1I TTTTTCTATT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 6 7 255309 CASAVA_Build 11 122294303 3D TAAGGAGACA AAT/--- AATAAGGCTG 3070 hom 97 het 38 0 32 8 AAT 2 1 255310 CASAVA_Build 11 122313161 1D TTTTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 23 1 16 6 T 15 14 255311 CASAVA_Build 11 122330740 8I AAATTTTTAA --------/AATGGAAT AATTAACAGG 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 AATGGAAT 0 1 255312 CASAVA_Build 11 122332075 1D AGGTATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2543 hom 25 10 12 3 A 13 12 255313 CASAVA_Build 11 122335629 1I TAAAGCTTTT -/G GTTTTATATT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 G 1 2 255314 CASAVA_Build 11 122337238 1D TTTATTGTTG T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 8 7 255315 CASAVA_Build 11 122337324 1I GGTTCACTGC -/A AACTCCGCCT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 2 3 255316 CASAVA_Build 11 122338228 1D CTTTGGAAAT G/- TACTCCTATG 3070 het 3070 hom 25 8 11 7 G 1 0 255317 CASAVA_Build 11 122338963 1I TACCTAATAG -/T TTTTTTAGCA 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 T 6 7 255318 CASAVA_Build 11 122340466 1I TTTAAGATTA -/C CTTTTCCTAT 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 C 1 2 255319 CASAVA_Build 11 122344227 2D CCCATAACTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 A 11 9 255320 CASAVA_Build 11 122345298 10I AAAAAAAAAA ----------/ACAAACAAAC AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 15 2 9 4 ACAAACAAAC 0 1 255321 CASAVA_Build 11 122346557 2I CACAGGCGCC --/CG CCACCAGTCC 862 het 862 ref 11 8 3 0 CG 0 1 255322 CASAVA_Build 11 122347670 2I ATATATATAT --/AA ATACACACAA 2051 het 1111 hom 9 3 6 0 A 1 3 255323 CASAVA_Build 11 122348364 29D CAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAC/----------------------------- ACAGAGTAAT 1771 het 1771 ref 12 9 6 3 AAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAC 1 0 255324 CASAVA_Build 11 122365613 3D GTGGTGATGA TGG/--- TGGTGGTGGT 500 het 217 hom 27 3 5 19 TGG 4 3 255325 CASAVA_Build 11 122395880 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 2267 het 19 hom 13 1 9 3 TC 0 1 255326 CASAVA_Build 11 122403076 3D GTACAATAAG AAT/--- AATAATAGTA 3070 het 3070 ref 47 20 21 7 AAT 3 2 255327 CASAVA_Build 11 122415379 1D AAATACAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1230 hom 15 4 10 1 A 10 9 255328 CASAVA_Build 11 122467797 1I GAAGGCTTGG -/C CTTCTGAAGG 3070 het 3070 hom 50 19 21 10 C 1 2 255329 CASAVA_Build 11 122471219 1D CCAGTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2831 hom 32 11 14 7 T 12 11 255330 CASAVA_Build 11 122476500 2I CTTTCCCCAG --/CC GCGGCGCCTC 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 C 0 2 255331 CASAVA_Build 11 122506620 1D AGGGTTGGGG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 8 7 255332 CASAVA_Build 11 122506760 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 944 het 526 hom 24 9 4 12 T 19 18 255333 CASAVA_Build 11 122516769 3I CTCTAATGTT ---/GGA GGAGGTGGGC 3070 het 3070 ref 52 27 14 11 GGA 1 2 255334 CASAVA_Build 11 122519440 1I TATGGGGGGC -/G GGGGGGGGCA 3026 het 3026 ref 27 10 9 8 G 8 9 255335 CASAVA_Build 11 122519731 1I TCTTGTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1901 hom 32 5 14 13 T 14 15 255336 CASAVA_Build 11 122523735 1I AGACACTGAC -/T TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 44 20 5 19 T 16 17 255337 CASAVA_Build 11 122548357 1I TTTTGAGATG -/T TTAATTTGTG 3070 hom 87 het 33 0 27 6 T 2 3 255338 CASAVA_Build 11 122565920 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 32 0 26 6 A 22 20 255339 CASAVA_Build 11 122573023 1D CAGATCACAA T/- AGAATTAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 1 0 255340 CASAVA_Build 11 122573228 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 12 7 T 13 11 255341 CASAVA_Build 11 122577490 1D AAAAAGGAAA G/- AAGGAAAGCA 1429 het 44 hom 16 1 12 3 G 1 0 255342 CASAVA_Build 11 122602506 1I GTCCTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 12 13 255343 CASAVA_Build 11 122624077 11D TCTTTCTTCT TTCTCTCCTTC/----------- CTTTCTTCCT 1294 het 1294 ref 33 26 6 5 TTCTCTCCTTC 1 0 255344 CASAVA_Build 11 122664992 1D TGCACTCCCT A/- AATTCCCACA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 3 2 255345 CASAVA_Build 11 122667473 1D TAGACGTGTT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 37 14 13 11 A 8 7 255346 CASAVA_Build 11 122701242 1D TCTAGTCTTT C/- CACTCCTGGG 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 C 2 1 255347 CASAVA_Build 11 122728094 1D TCTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1804 het 1778 hom 29 11 9 9 T 17 16 255348 CASAVA_Build 11 122770481 3I CTCTTCTCTT ---/CTC CTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 CTC 0 1 255349 CASAVA_Build 11 122787873 3D TTTGAAAACA ATT/--- ATTATGAACA 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 ATT 2 1 255350 CASAVA_Build 11 122788689 12D TCATTTTTTA ATAAAAAAAAAC/------------ TAAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 21 11 10 2 ATAAAAAAAAAC 1 0 255351 CASAVA_Build 11 122789431 1I TTTGCCCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 11 255352 CASAVA_Build 11 122798868 1D TTCCTCCCTT C/- CCCCAGATTT 3070 hom 93 het 33 0 31 3 C 5 4 255353 CASAVA_Build 11 122809756 1I GGAACCTTCA -/T TTTTGTTGGA 2582 het 2582 ref 35 20 6 9 T 4 5 255354 CASAVA_Build 11 122817727 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 8 9 255355 CASAVA_Build 11 122818776 1D ATTATTTATG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 2469 hom 28 9 10 9 C 9 8 255356 CASAVA_Build 11 122819490 1D CTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 31 1 23 7 T 12 11 255357 CASAVA_Build 11 122823952 1D ATATGTATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 9 8 255358 CASAVA_Build 11 122824281 2I AGCGATTCTC --/TT GTGTGTGCCA 1788 het 1788 ref 18 11 5 2 T 0 2 255359 CASAVA_Build 11 122834610 1D GGCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2711 hom 41 11 19 11 T 15 14 255360 CASAVA_Build 11 122835178 1D CCTTATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 13 12 255361 CASAVA_Build 11 122838281 2I GCAGAGCAGA --/CT CTCGTTACTT 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 CT 1 2 255362 CASAVA_Build 11 122850647 8D ATTTTTATTA ACAAAGAC/-------- ACAAAGACAT 3070 hom 105 het 40 0 35 8 ACAAAGAC 2 1 255363 CASAVA_Build 11 122853705 1D CTCTTTTTTT G/- TTTTTCAGAT 3070 hom 29 het 13 0 10 3 G 1 0 255364 CASAVA_Build 11 122881120 1I AATATATTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 9 10 255365 CASAVA_Build 11 122891692 1I TATTCAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 30 0 20 10 T 12 13 255366 CASAVA_Build 11 122905095 2D CCTCCGACAC AT/-- GTGTACACGC 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 AT 1 0 255367 CASAVA_Build 11 122906118 1I GGAGGGTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 13 14 T 13 14 255368 CASAVA_Build 11 122911159 1D CTTTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 12 10 A 13 12 255369 CASAVA_Build 11 122915360 1D TGTCCAAAAA T/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 T 1 0 255370 CASAVA_Build 11 122916521 1D TTGACTGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 25 0 20 6 T 10 9 255371 CASAVA_Build 11 122918894 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 146 hom 22 2 19 1 T 11 10 255372 CASAVA_Build 11 122921669 1D AATCTTTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 46 0 36 10 T 10 9 255373 CASAVA_Build 11 122922093 2D AATTGGTCCC CT/-- GAGTTAAATT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 CT 1 0 255374 CASAVA_Build 11 122928192 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2318 hom 28 het 16 0 8 8 T 19 18 255375 CASAVA_Build 11 122943919 3D TTCCAGGCTT GAG/--- GAGATCCCTA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 GAG 2 1 255376 CASAVA_Build 11 122945047 1D TCTCTGGACC T/- TTTTATATTC 3070 hom 111 het 44 0 35 11 T 5 4 255377 CASAVA_Build 11 122953726 1D GAGGCTCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 18 6 T 12 11 255378 CASAVA_Build 11 122983608 1D TAGGACTTGA C/- CCCTACAGGG 3070 hom 105 het 42 0 35 8 C 4 3 255379 CASAVA_Build 11 122987128 1D TTACGCAGGA G/- GGATTGCTTG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 3 2 255380 CASAVA_Build 11 122997780 5D12M1D ATTGTCTTTC TTTCTTTTCTTTCTTTCT/-----TTCCTTTCTTTC- TTTTCTTTCT 3070 hom 32 het 28 0 14 14 N/A 0 0 255381 CASAVA_Build 11 123012617 2D TTCTATTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2418 hom 34 11 14 9 T 13 11 255382 CASAVA_Build 11 123030613 1I GCCCCTCCCA -/G GGCCCAGCGC 1052 hom 12 het 5 0 3 2 G 2 3 255383 CASAVA_Build 11 123045415 1I ATACTGCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 787 hom 35 2 28 5 T 10 11 255384 CASAVA_Build 11 123045425 1I TTTTTTTTTT -/A AAATCAATAA 3070 het 788 hom 34 2 27 5 A 3 4 255385 CASAVA_Build 11 123086753 1D CCCTTCCCCC T/- GCCCATTCCA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 1 0 255386 CASAVA_Build 11 123105458 11D CTTGGTATAG GAGAAATGTCC/----------- GAGAAATGTC 3070 hom 123 het 42 0 41 4 GAGAAATGTCC 2 1 255387 CASAVA_Build 11 123110934 1D TTGGCATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 42 0 32 10 A 12 11 255388 CASAVA_Build 11 123113609 5I TATTCTAAAC -----/TAAAA TGTTTTTGAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TAAAA 0 1 255389 CASAVA_Build 11 123114468 2I AGAGTAACTG --/CT CTCTCATTTG 3070 hom 151 het 53 0 51 2 CT 2 3 255390 CASAVA_Build 11 123115440 1I AGGTGTAATA -/T TTTTGATCAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 4 5 255391 CASAVA_Build 11 123116859 1I GCTTGAGGGG -/A ACCTCAGGGT 3070 hom 77 het 30 0 20 10 A 1 2 255392 CASAVA_Build 11 123151648 1D ACTTCTTTCG T/- TTTTCTTAGC 3070 hom 87 het 33 0 27 6 T 5 4 255393 CASAVA_Build 11 123169333 1I CAGCTAGGAC -/A AATTGCTGCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 3 255394 CASAVA_Build 11 123177061 1D TTTTTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 40 1 30 9 T 13 12 255395 CASAVA_Build 11 123183218 5D AGACCTCCCC ATTTT/----- AGGTAAAAAC 3070 hom 99 het 36 0 33 4 ATTTT 1 0 255396 CASAVA_Build 11 123185999 1I TTCTCAGGTA -/T TTTTCCCCAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 4 5 255397 CASAVA_Build 11 123189927 2D ACCTTTCTGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 7 6 255398 CASAVA_Build 11 123220953 1D AATGTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 33 1 21 11 T 15 14 255399 CASAVA_Build 11 123224679 3D CTTCTAGATT TTC/--- TTTTTTTTGT 3070 hom 77 het 39 1 35 3 TTC 1 0 255400 CASAVA_Build 11 123233248 1I TGGGCCCCCC -/T TTTTTTTTTT 2595 het 866 hom 22 2 9 11 T 13 14 255401 CASAVA_Build 11 123240864 8D CTTGAGAAAA TACCTCAT/-------- TGCTTTCTTC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TACCTCAT 1 0 255402 CASAVA_Build 11 123248889 1D GTCTAGTACA T/- TTTTTTTTTT 1610 het 1610 ref 17 8 5 4 T 13 12 255403 CASAVA_Build 11 123263942 1D TGAGGATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 24 1 18 5 T 14 13 255404 CASAVA_Build 11 123278966 1I ATTTTTTTTT -/A AATGGGTGGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 3 255405 CASAVA_Build 11 123279117 4D AAGGATGTGC TTAG/---- TTAGGTTACA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 TTAG 2 1 255406 CASAVA_Build 11 123281601 1D CCTCAGCCTC T/- AGTTTATGCA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 1 0 255407 CASAVA_Build 11 123285597 2I GGAGAAAAGC --/TG TGTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TG 2 3 255408 CASAVA_Build 11 123291005 1I AAAGACACAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1537 hom 26 4 16 6 A 9 10 255409 CASAVA_Build 11 123294090 1I AACCAGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2780 hom 34 9 21 4 A 9 10 255410 CASAVA_Build 11 123296068 1I TTTTAAACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 9 10 255411 CASAVA_Build 11 123299307 1D ATTCTATATG T/- GCACTGTCCA 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 T 1 0 255412 CASAVA_Build 11 123299456 3I ATAATTCTGG ---/TAT TATGTACAAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TAT 1 2 255413 CASAVA_Build 11 123299745 1I AGATTCATCA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 8 9 255414 CASAVA_Build 11 123301546 2D GGGAAGACAC AT/-- GAGTATTTGA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 AT 1 0 255415 CASAVA_Build 11 123303498 1D TGCCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 17 1 10 6 T 14 13 255416 CASAVA_Build 11 123306024 1D CAAATATCTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 9 8 255417 CASAVA_Build 11 123307631 12D ATGACTTTTA AAATATATGCAT/------------ ACATGCATAC 3070 het 1063 hom 34 5 20 12 AAATATATGCAT 1 0 255418 CASAVA_Build 11 123307754 1I TCACTGCTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 9 10 255419 CASAVA_Build 11 123312592 2D TGTGTCTAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 712 hom 54 5 16 33 T 16 14 255420 CASAVA_Build 11 123312822 4D GTCTAGTAGT GTTG/---- GTTGGTCCTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 7 GTTG 2 1 255421 CASAVA_Build 11 123317434 1D CATTGCCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 10 9 255422 CASAVA_Build 11 123321529 4D AATGTCACAC AGTT/---- AGAAGTTGTT 3070 hom 138 het 52 0 47 7 AGTT 1 0 255423 CASAVA_Build 11 123322192 4D CACTTGTCAT CTTA/---- CTTCATCTGT 3070 het 3070 hom 38 17 21 0 CTTA 1 0 255424 CASAVA_Build 11 123322562 1I TCTTTTGTTT -/C TTTTTTTTTC 3070 hom 53 het 21 0 15 6 C 0 1 255425 CASAVA_Build 11 123324520 1I AAGTTTTTTT -/C GAGACCAAGC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 0 1 255426 CASAVA_Build 11 123331330 1D AAACCCGCAT G/- TTCTTACTTG 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 G 1 0 255427 CASAVA_Build 11 123331590 1I TACAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 9 10 255428 CASAVA_Build 11 123333540 1D AATTTGTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 42 1 32 9 T 11 10 255429 CASAVA_Build 11 123333812 1D TTTTATCATC T/- TTTTTTTTTT 3059 hom 8 het 23 0 8 16 T 15 14 255430 CASAVA_Build 11 123337824 1I CAGAATGGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 26 7 A 12 13 255431 CASAVA_Build 11 123338270 1I AGGAACAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 255432 CASAVA_Build 11 123339275 1D ACTCTATAAT A/- AAAAAATGGA 3070 hom 84 het 35 0 27 8 A 7 6 255433 CASAVA_Build 11 123340210 1I TGAGTATACA -/T TCCCTATAAT 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 1 2 255434 CASAVA_Build 11 123345396 5D AAAGATACAA TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 12 11 7 TTTCT 3 2 255435 CASAVA_Build 11 123349362 2D TGAGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 47 0 36 13 TG 9 8 255436 CASAVA_Build 11 123351194 2D ATGGCCTGGT AA/-- AAGTTATTTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 A 4 2 255437 CASAVA_Build 11 123353847 3D GACTGTAAGA ATT/--- ATTTGCAGAA 3070 het 3070 hom 53 23 28 2 ATT 2 1 255438 CASAVA_Build 11 123361163 7I AGCCCTTATG -------/ACAGAAC ACAGAACTGG 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 ACAGAAC 1 2 255439 CASAVA_Build 11 123361510 1I TGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 A 10 11 255440 CASAVA_Build 11 123368301 1D AACCAATTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 9 8 255441 CASAVA_Build 11 123373782 2D TTTCTAGTCT CA/-- GTTTCTCATT 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 CA 1 0 255442 CASAVA_Build 11 123373878 1D TCAATTCCTG T/- TTTAAATTTT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 4 3 255443 CASAVA_Build 11 123376358 1D GGGGCAATGT G/- GGGAGGCACG 3070 het 3070 ref 30 19 11 0 G 4 3 255444 CASAVA_Build 11 123382316 1I GACAAATTTG -/A AAGTACATTT 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 A 2 3 255445 CASAVA_Build 11 123382359 1D TAATGTTTTT G/- TTTCCTAAAG 3070 het 2512 hom 24 7 11 6 G 1 0 255446 CASAVA_Build 11 123386281 1I CATCAATAGA -/T TTTTTTTAAC 541 het 541 ref 16 8 4 5 T 7 8 255447 CASAVA_Build 11 123396714 4I TAAAATCCGT ----/TAGA TAGATAGACA 3070 hom 152 het 55 0 51 4 TAGA 2 3 255448 CASAVA_Build 11 123401826 4D7M4D ATTTCAGATG AAGTAAATATTTAAA/----AAATGTT---- TGAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 26 19 9 3 N/A 0 0 255449 CASAVA_Build 11 123407727 1D GAGGGCTATA G/- GTGTCAAACT 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 G 2 1 255450 CASAVA_Build 11 123427080 1D TTCTATGATG T/- TTTTTTATAG 3070 hom 81 het 35 0 28 8 T 7 6 255451 CASAVA_Build 11 123428281 4D CCATTTGCTT TTTG/---- TTTGTTAGCC 3070 het 3070 ref 35 16 14 9 TTTG 2 1 255452 CASAVA_Build 11 123433298 1D TGTTCTAGCA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 T 8 7 255453 CASAVA_Build 11 123434371 1I TCTTTTTGAG -/T TAGTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 1 2 255454 CASAVA_Build 11 123436239 1D AGTTTGCTCC T/- TTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 6 5 255455 CASAVA_Build 11 123436615 1D TTTTTATAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 74 hom 37 2 17 18 T 9 8 255456 CASAVA_Build 11 123438233 33D CCTAAATTAC ATACACATTGTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTT/--------------------------------- ATACACATTG 3070 het 2969 hom 21 10 14 6 ATACACATTGTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTT 1 0 255457 CASAVA_Build 11 123438276 1I ATACACATTG -/T TTTTTTACAA 3070 het 832 hom 21 3 7 12 T 6 7 255458 CASAVA_Build 11 123440875 1D CAGTTATTGA C/- CTTTGTAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 C 2 1 255459 CASAVA_Build 11 123440991 4D TCATTTGTCC TTTG/---- TTTTCCTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 18 4 TTTG 1 0 255460 CASAVA_Build 11 123441132 1D ATGAGTTCTA G/- GGTTTTTTTT 3070 het 25 hom 21 1 19 2 G 3 2 255461 CASAVA_Build 11 123445866 1I ACTGGTCAAT -/G GGCCTGCCGG 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 G 2 3 255462 CASAVA_Build 11 123448937 1I GGAATCTCAG -/A AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 A 5 6 255463 CASAVA_Build 11 123455239 1I ATTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 24 5 A 14 15 255464 CASAVA_Build 11 123459380 1I GCAGGCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 10 11 255465 CASAVA_Build 11 123465222 1I TTTACAAAGG -/C TTCCTAACCC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 C 0 1 255466 CASAVA_Build 11 123481737 11I ATAGGAGTGT -----------/GAAGGGTAGAG GAAGAAACAA 3070 hom 126 het 50 0 42 8 GAAGGGTAGAG 0 1 255467 CASAVA_Build 11 123482699 1D ATCTTTAAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 9 8 255468 CASAVA_Build 11 123483602 1I TAACCCCTGC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 7 8 255469 CASAVA_Build 11 123500864 1I AGTATTCCAC -/A AAAATGACTA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 4 5 255470 CASAVA_Build 11 123516388 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 11 10 255471 CASAVA_Build 11 123529446 3I GCTTTATCTT ---/ATG ATGATGATGA 3070 het 3070 ref 39 13 17 9 ATG 4 5 255472 CASAVA_Build 11 123530302 1D TTTCTACTAT A/- AAAAAATAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 3 A 7 6 255473 CASAVA_Build 11 123536111 5D TTCTCTCAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 AAAAG 3 2 255474 CASAVA_Build 11 123536734 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 A 9 8 255475 CASAVA_Build 11 123539126 1D AAACATTTAG A/- AAATAATACT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 4 3 255476 CASAVA_Build 11 123541331 1D ATTGACTTAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 T 9 8 255477 CASAVA_Build 11 123548714 1D CATAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 47 0 32 15 A 12 11 255478 CASAVA_Build 11 123548993 2I TAATCCTGTC --/TT TATTTCTACT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 1 3 255479 CASAVA_Build 11 123553408 1D GTGTTAAGAT C/- CAGTCTAGGG 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 C 2 1 255480 CASAVA_Build 11 123557907 1I ACCTCTTTTC -/T TTTTGTTTTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 4 5 255481 CASAVA_Build 11 123566693 2D CTTAGTCTGT AA/-- GAGAGAGTGC 3070 het 3070 ref 50 27 20 3 A 2 0 255482 CASAVA_Build 11 123569236 2D15M2I GTAAATAAAT TCTGTTTTGCATTTTAA--/--TGTTTTGCATTTTAAAG AGAGAGAGAG 3070 het 1777 hom 30 5 18 18 N/A 0 0 255483 CASAVA_Build 11 123569572 1D TTTCACTTTG T/- TTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 33 10 21 3 T 7 6 255484 CASAVA_Build 11 123572530 1I TCAGCTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 A 12 13 255485 CASAVA_Build 11 123572997 4I TAATTTTCTC ----/TGTT TGTATCTATG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 TGTT 0 1 255486 CASAVA_Build 11 123573563 1I CCTGGTCCTG -/C CCCCTAGTAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 C 4 5 255487 CASAVA_Build 11 123574499 3D AAATCCCAAG CTC/--- CTCTAGCAGA 3070 het 3070 ref 36 23 10 4 CTC 2 1 255488 CASAVA_Build 11 123576124 4I CTTACTCTTT ----/TTTG TTCTGTTTTT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TTTG 0 1 255489 CASAVA_Build 11 123577135 2I ACGCCCTGTA --/AC ACGCGCCCAC 3002 het 2891 hom 26 10 10 6 AC 1 2 255490 CASAVA_Build 11 123577688 3D GGGTTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGG 3070 hom 12 het 28 1 18 12 TTG 4 3 255491 CASAVA_Build 11 123581233 4D AATTAAAATT ACTC/---- AGTAAGTGCC 3070 het 3070 hom 46 23 23 3 ACTC 1 0 255492 CASAVA_Build 11 123582591 1D CACTGATATG A/- AAAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 A 7 6 255493 CASAVA_Build 11 123583913 2I GGACCAGGGG --/AA AGTGTCTTCT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 1 3 255494 CASAVA_Build 11 123584819 1I ATTGCTTACA -/G TCAGACACAC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 0 1 255495 CASAVA_Build 11 123593313 2D CAGTCTAGCA CT/-- CTGTCCAACA 3070 het 3070 hom 55 24 26 6 CT 2 1 255496 CASAVA_Build 11 123596328 1D TCACTTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 12 11 255497 CASAVA_Build 11 123598941 4I AAAAGGCCAT ----/AGTC AGATATACGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AGTC 0 1 255498 CASAVA_Build 11 123600530 1D ATAAACCAAA G/- GTCATCTAAA 3070 het 2298 hom 18 6 10 2 G 2 1 255499 CASAVA_Build 11 123605643 2D AAAGAAAGAC AG/-- AGGAAGAGAT 3070 hom 87 het 32 0 29 5 AG 2 1 255500 CASAVA_Build 11 123608106 3I TTATAAAACT ---/ACA ACAACTTTCA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 ACA 1 2 255501 CASAVA_Build 11 123608281 5D AAAAATAATT GAAAA/----- GAAAAAATAC 3070 hom 45 het 16 0 16 2 GAAAA 2 1 255502 CASAVA_Build 11 123610747 3I AATTAGATGA ---/TGT TATTTTACTT 3070 hom 110 het 44 0 37 7 TGT 0 1 255503 CASAVA_Build 11 123614537 40D CTGTTCTTCA TTGATCTCTGCCATTCCACTGTCTTTACCCCCAAAATGCT/---------------------------------------- GGTGAACTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 8 TTGATCTCTGCCATTCCACTGTCTTTACCCCCAAAATGCT 1 0 255504 CASAVA_Build 11 123618001 1D24M4D TTTACATTTA TTTTTTATTTTTTTTCAGTAGTAAATTAT/-TTTTTATTTTTTTTCAGTAGTAAA---- TTATTTATTT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 N/A 0 0 255505 CASAVA_Build 11 123618528 3D TTTCAGTTCC ATG/--- ATGGCATATG 3070 hom 93 het 41 0 32 9 ATG 2 1 255506 CASAVA_Build 11 123619032 5D TGATTACAAT TAAAG/----- TAATCAAAAA 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 TAAAG 1 0 255507 CASAVA_Build 11 123620539 1I TGGCTATGAC -/A AAAAATGTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 5 6 255508 CASAVA_Build 11 123620967 1D TAAGAATTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 55 het 23 0 22 1 T 9 8 255509 CASAVA_Build 11 123623659 4D CATATAAGAC AGAG/---- AGAGAGAGGA 3070 hom 60 het 23 0 21 4 AG 6 4 255510 CASAVA_Build 11 123624791 1I AATAGGTAAC -/A AATACAATGA 3070 hom 63 het 31 0 27 4 A 2 3 255511 CASAVA_Build 11 123625384 3I AAATATTTAA ---/AAG AAGAAAGGGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAG 1 2 255512 CASAVA_Build 11 123628626 2D TTATTTTGAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TG 7 6 255513 CASAVA_Build 11 123628763 4I TTATACAATA ----/GATT GTTTTTAACT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GATT 0 1 255514 CASAVA_Build 11 123629485 3I TTAAATCTGT ---/TAA TTGTTTTCTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TAA 0 1 255515 CASAVA_Build 11 123631461 7I3M7I CTAAACCCAG -------GTT-------/GACAAATGTTCACAGCA TAGCAATCAA 3070 hom 111 het 40 0 38 5 N/A 0 0 255516 CASAVA_Build 11 123632264 1I GAAAGAGATG -/A AGAGATAGTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 2 255517 CASAVA_Build 11 123634268 5I CATTTGTGTG -----/TTTTA TTTTTATTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTTA 0 1 255518 CASAVA_Build 11 123634669 4I CTACAGAGAT ----/TAAG TAGTGTCTGG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 TAAG 0 1 255519 CASAVA_Build 11 123635282 1D TAGTCATGCA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 69 het 29 0 24 7 T 8 7 255520 CASAVA_Build 11 123635772 5D ATATGGTAAA TCTCT/----- TCTCTTATTA 3070 het 3070 ref 42 21 19 6 TCTCT 2 1 255521 CASAVA_Build 11 123636126 2I CATTCTACTC --/TT TATCTCCATG 3070 hom 81 het 32 0 28 6 T 1 3 255522 CASAVA_Build 11 123636331 5I TTTGTCTAAT -----/TTATC TTAAGATTAC 3070 hom 117 het 43 0 40 10 TTATC 0 1 255523 CASAVA_Build 11 123637264 3D AATTATTAGA AAT/--- AATTTAAATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AAT 2 1 255524 CASAVA_Build 11 123637604 1I TCTTACACAC -/A AAAATCCTGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 4 5 255525 CASAVA_Build 11 123638097 5D ATTCAGGTGT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 TTTTG 3 2 255526 CASAVA_Build 11 123638158 1D ATGGTGTTAA T/- TTTCATTTCC 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 T 4 3 255527 CASAVA_Build 11 123638419 2D TAATCGAAAC AT/-- TGTTAGTTTT 2748 het 2748 ref 19 7 7 5 AT 1 0 255528 CASAVA_Build 11 123638454 5I TTTTAAAAAA -----/TATTT TATTTTATTT 2874 hom 24 het 13 0 9 4 TATTT 2 3 255529 CASAVA_Build 11 123638834 4D AGAAGTTTTA TAGT/---- TAGTTTTATG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TAGT 2 1 255530 CASAVA_Build 11 123639252 1D TATTAATAGG T/- TAATAATGTT 3070 hom 120 het 58 0 40 20 T 2 1 255531 CASAVA_Build 11 123641746 5I GGCCTTTGAA -----/TTTTT TTTTTCTTTC 2597 hom 39 het 19 0 13 6 T 5 10 255532 CASAVA_Build 11 123642155 4D ACATACAGCA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TTTG 3 2 255533 CASAVA_Build 11 123642658 10D19M1D TTTATTCACC CTTTGTTTTTCTTTGTTTTTCATTTTCTTC/----------CTTTGTTTTTCATTTTCTT- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 25 1 25 5 N/A 0 0 255534 CASAVA_Build 11 123643297 5I TAATAAGACA -----/TAGAG TAGACACTCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TAGAG 0 1 255535 CASAVA_Build 11 123643560 1I CCCTGTATAA -/T TTTTCCTATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 4 5 255536 CASAVA_Build 11 123643735 4D GTGGAATGAC TAAA/---- TCAAGCTAAT 3070 hom 93 het 33 0 32 3 TAAA 1 0 255537 CASAVA_Build 11 123643976 1D ACCATTTTAC G/- TGCTGCTTTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 0 255538 CASAVA_Build 11 123644642 1I TTTAATATAC -/T TTGGATATCA 3070 hom 129 het 44 0 44 0 T 2 3 255539 CASAVA_Build 11 123645772 2I TATTGTTCTG --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 T 8 10 255540 CASAVA_Build 11 123646810 3I ATAATAAGAA ---/AAC AACCCATAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 5 AAC 1 2 255541 CASAVA_Build 11 123650748 1I TTTGTTATTC -/T TTTTTTTTTT 2940 het 2940 ref 32 11 9 12 T 11 12 255542 CASAVA_Build 11 123651719 3D GCTAGGCTGT CTC/--- CTCCTCCTCT 3070 het 3070 hom 46 16 22 9 CTC 4 3 255543 CASAVA_Build 11 123652630 1D TCCTTTGAGT C/- CCCCCAGCAC 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 C 6 5 255544 CASAVA_Build 11 123653993 1D16M2I AAGAAAAAAG AAAAAAAAAAAATGGTT--/-AAAAAAAAAAATGGTTTG TTTTTTTTTG 3070 het 1028 hom 25 8 10 8 N/A 0 0 255545 CASAVA_Build 11 123657024 1I TACCCAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 9 10 255546 CASAVA_Build 11 123659280 1D TTGGTTTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 10 9 255547 CASAVA_Build 11 123660354 1D AATCAATCGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 10 9 255548 CASAVA_Build 11 123660719 4D GACAAGCAAA AAAT/---- AAATAACCCC 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 AAAT 2 1 255549 CASAVA_Build 11 123664178 1D AATCTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 30 0 21 9 T 12 11 255550 CASAVA_Build 11 123672197 1D TGGACTATGT A/- ATAAAATCAA 2744 het 2744 ref 15 9 6 0 A 2 1 255551 CASAVA_Build 11 123673877 2I CTTAATATCT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 9 11 255552 CASAVA_Build 11 123682332 7D GACTTTCCAT GAGGAGA/------- GAGGATTTTG 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 GAGGAGA 1 0 255553 CASAVA_Build 11 123684335 3D ATCCATGAAG AAC/--- AACAAGGAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 7 AAC 2 1 255554 CASAVA_Build 11 123695849 1D ACCTTAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 18 9 A 11 10 255555 CASAVA_Build 11 123706506 1D AATAGAATTA C/- CATATAACCC 3070 het 3070 hom 41 14 25 3 C 2 1 255556 CASAVA_Build 11 123716190 11D TTTTTTTTTC TTTTCTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 1247 hom 20 4 10 8 TTTTCTTTTTT 1 0 255557 CASAVA_Build 11 123717536 1D ATAATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2163 hom 37 10 15 12 T 13 12 255558 CASAVA_Build 11 123719179 3D TTACTATAAC TTT/--- TTTATTTTAT 3070 het 3070 ref 25 16 8 2 T 6 3 255559 CASAVA_Build 11 123720441 1I AATGCAAAAG -/A AAAGATATTG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 3 4 255560 CASAVA_Build 11 123722225 1D TGTCTTATTT A/- AAAACTTGCC 3070 het 3070 hom 48 21 22 7 A 5 4 255561 CASAVA_Build 11 123722591 2I ATCTAGAGAG --/AC AATCAACAGA 3070 het 3070 hom 28 7 15 6 AC 0 1 255562 CASAVA_Build 11 123723318 1D AACTATATGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 9 8 255563 CASAVA_Build 11 123723631 4D AAGGACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 AC 9 7 255564 CASAVA_Build 11 123724560 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 7 6 255565 CASAVA_Build 11 123725997 6I TCAAAATTTC ------/ATGTAT ATGTATATGG 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 ATGTAT 1 2 255566 CASAVA_Build 11 123728083 1I TTAAAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 10 255567 CASAVA_Build 11 123732013 3D TATTAACTTA TTT/--- TTTTAGGCTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 T 7 4 255568 CASAVA_Build 11 123737222 1I TGAGATTTGA -/T TATTTTGTAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 2 255569 CASAVA_Build 11 123738721 4D CCTAACATCT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 A 15 11 255570 CASAVA_Build 11 123759265 11D AAATCTCCTT TCCTGGCATTC/----------- CTCTGTTCTG 3070 het 3070 ref 24 16 8 5 TCCTGGCATTC 1 0 255571 CASAVA_Build 11 123765867 1D AGTTTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 11 10 255572 CASAVA_Build 11 123769477 1I TTGCAACACA -/T TTTTTTGTTA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 T 6 7 255573 CASAVA_Build 11 123774992 1D CAGAATTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2657 hom 39 10 13 18 T 15 14 255574 CASAVA_Build 11 123817167 1D TACCTAATCC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 47 14 31 2 T 8 7 255575 CASAVA_Build 11 123821308 2D CAATGTTTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 37 24 10 6 CA 6 5 255576 CASAVA_Build 11 123826341 3I AGAAATTAAA ---/GAG GAGATGTCAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 GAG 1 2 255577 CASAVA_Build 11 123828780 10I AACAATAATT ----------/ATAATTTCAA ATAATTTCAA 3070 het 3070 hom 35 16 14 6 ATAATTTCAA 1 2 255578 CASAVA_Build 11 123839422 4D AAAAAATCTT TGTC/---- TGAAACAAGT 3070 het 3070 hom 37 11 23 6 TGTC 1 0 255579 CASAVA_Build 11 123843076 2I AAAAACTGTG --/CT CTGTTTGGAT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 CT 1 2 255580 CASAVA_Build 11 123845826 1I CCTGCCTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 T 9 10 255581 CASAVA_Build 11 123856287 1D TGACCCAAAG A/- AAAGCGATAC 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 A 4 3 255582 CASAVA_Build 11 123858804 10D TCTTTCCTCT CGCTTCCTCC/---------- CTATTGCCAT 3070 het 3070 ref 50 33 17 3 CGCTTCCTCC 1 0 255583 CASAVA_Build 11 123860277 1D ATTCATTATC A/- AAAAATTAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 6 5 255584 CASAVA_Build 11 123868107 2I ATCCCGATGA --/CT CTGCACACCC 3070 het 3070 hom 62 25 25 12 CT 1 2 255585 CASAVA_Build 11 123907154 1D ACACTATAAG A/- AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 40 30 4 9 A 12 11 255586 CASAVA_Build 11 123924734 1I GGTCAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 326 hom 32 1 27 4 T 11 12 255587 CASAVA_Build 11 123939692 2D ATTGGACTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 44 1 30 14 A 14 12 255588 CASAVA_Build 11 123948783 2D GATAACTGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 27 0 13 14 A 16 14 255589 CASAVA_Build 11 123955947 40D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/---------------------------------------- AAAAAAAAAA 1812 het 392 hom 5 2 5 0 A 52 12 255590 CASAVA_Build 11 123980510 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2282 het 2282 ref 32 21 5 6 A 10 11 255591 CASAVA_Build 11 123999991 1I AATAATGTGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 7 8 255592 CASAVA_Build 11 124008240 1I ACCTCTTTAA -/C CCTTTGTATT 3070 hom 160 het 62 0 54 8 C 2 3 255593 CASAVA_Build 11 124019460 8D CTGTGGTGAG AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 30 3 23 7 A 21 13 255594 CASAVA_Build 11 124076959 1I TCAAGTGATT -/C TCCCACCTCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 0 1 255595 CASAVA_Build 11 124085455 10I CATTTTGGCA ----------/GGCCGAGCTG GGCAGATCAA 3070 hom 66 het 21 0 23 1 GGCCGAGCTG 0 1 255596 CASAVA_Build 11 124085893 1I CAGAACAAAA -/G GGCATAGTCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 2 3 255597 CASAVA_Build 11 124092445 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 10 11 255598 CASAVA_Build 11 124108981 2D AATTAATGAC AT/-- AGCCATAGCC 3070 het 3070 ref 38 17 16 7 AT 1 0 255599 CASAVA_Build 11 124125146 1D CCACTATTGG A/- AATTCTGATT 3070 het 3070 hom 47 18 21 9 A 3 2 255600 CASAVA_Build 11 124159589 2D AAAAATTAAA CC/-- CCCCCCCCGC 3070 hom 54 het 24 0 17 7 C 10 8 255601 CASAVA_Build 11 124174730 1I GCAGGAACAT -/C CTCAATTGGC 3070 hom 34 het 14 0 12 2 C 1 2 255602 CASAVA_Build 11 124190249 2I TCTTTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 2316 het 1925 hom 24 10 10 4 TC 0 1 255603 CASAVA_Build 11 124198196 1I GGCAGGAGTC -/G GGGGGATGTT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 G 5 6 255604 CASAVA_Build 11 124202240 1I TCTACCCCTT -/C CCCCATCTTC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 C 4 5 255605 CASAVA_Build 11 124204381 2I TTGAACCTGA --/GG GTAATCATGG 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 G 1 3 255606 CASAVA_Build 11 124205529 1D ATAACATTTT A/- AAAACATGAT 3070 het 3070 ref 44 23 17 6 A 5 4 255607 CASAVA_Build 11 124224176 10D GGAGGGATGC GGGAGAGAAA/---------- GGGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 6 GGGAGAGAAA 1 0 255608 CASAVA_Build 11 124226153 2D AAAGCTGAAA TT/-- TTTTTTTTTT 1035 het 1035 ref 25 9 7 10 T 12 10 255609 CASAVA_Build 11 124228610 1D TAGAAAGAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 67 hom 31 2 19 10 A 10 9 255610 CASAVA_Build 11 124233231 1I AGGACATCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2863 hom 17 8 8 1 A 9 10 255611 CASAVA_Build 11 124284159 8D ACAATTCATC CAGAGATG/-------- CAATATTGTT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 CAGAGATG 1 0 255612 CASAVA_Build 11 124284524 6I39M2I GTTACATATG ------TATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTC--/TATACATATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGT GTCATTTAAT 3070 het 1858 hom 13 5 10 2 N/A 0 0 255613 CASAVA_Build 11 124292623 1I AGTTCTGCCT -/A GGTGTTGTTT 3070 het 3070 ref 40 22 10 8 A 0 1 255614 CASAVA_Build 11 124293339 1I ACTCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2877 hom 29 10 13 6 A 15 16 255615 CASAVA_Build 11 124294443 4I AACAACACAA ----/AAAC AAACAAACCC 3070 hom 102 het 44 0 33 11 AAAC 2 3 255616 CASAVA_Build 11 124310414 2D GCTCTGTAAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 10 25 10 TG 10 9 255617 CASAVA_Build 11 124314052 1D TGATGCTGGC T/- TTTTTTTTTT 1269 het 1269 ref 44 32 3 9 T 12 11 255618 CASAVA_Build 11 124320037 1I CTTGCTTCCT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 8 9 255619 CASAVA_Build 11 124320699 1I CTTCAAGAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 9 10 255620 CASAVA_Build 11 124320935 3D GCAGTGAGCC GAG/--- ATCGCATCAC 3070 het 2283 hom 21 6 13 3 GAG 1 0 255621 CASAVA_Build 11 124323243 1D AATGGAAAGC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 9 8 255622 CASAVA_Build 11 124324247 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 18 0 15 4 A 10 9 255623 CASAVA_Build 11 124335349 108D AAAATTATCT AAAGAAAAGTGCCGCGGAGCCTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------------------------------------------------------------------------------------------ AAAGAAAAGT 2495 hom 18 het 9 0 7 3 AAAGAAAAGTGCCGCGGAGCCTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 255624 CASAVA_Build 11 124337755 1D AATTCAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 13 12 255625 CASAVA_Build 11 124353925 1I CCATTTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 26 9 9 T 11 12 255626 CASAVA_Build 11 124360751 1I ATAAAATGTC -/T ATGCATGTGC 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 T 0 1 255627 CASAVA_Build 11 124384334 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 23 1 17 6 A 15 14 255628 CASAVA_Build 11 124395048 2D ATTTCTATGT GG/-- GGGGGGGCAC 3070 hom 93 het 37 0 31 7 G 9 7 255629 CASAVA_Build 11 124408823 3D GCCATCTTTT AAA/--- AAGCTATATT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 5 2 255630 CASAVA_Build 11 124411489 5I TTTGTTTCTT -----/TTCTC TTCCTACTTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TTCTC 0 1 255631 CASAVA_Build 11 124413027 1I AGAAAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 24 1 14 9 T 14 15 255632 CASAVA_Build 11 124420026 1I GTGAATTGAC -/T TGTTTGACAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 1 2 255633 CASAVA_Build 11 124422848 4D TCATCTTTCA TCAC/---- TCACTCCATC 3070 het 3070 hom 45 15 28 4 TCAC 2 1 255634 CASAVA_Build 11 124437298 1I CTTCTACTTA -/T TGCCTTTCTT 3070 het 37 hom 46 1 40 5 T 1 2 255635 CASAVA_Build 11 124463949 1I TGGAAGGTGA -/C TGGGGGCCGG 3070 hom 35 het 15 0 11 4 C 0 1 255636 CASAVA_Build 11 124464062 5I CTATATGCCA -----/GCTCT GCTCTAGGAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 GCTCT 1 2 255637 CASAVA_Build 11 124468536 3D GGACTCAGAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 23 2 19 3 T 26 23 255638 CASAVA_Build 11 124479022 1I ATGAACTGGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 A 8 9 255639 CASAVA_Build 11 124485283 6D AATAGCTAAA TTATTG/------ TTATTGAGTA 3070 hom 90 het 32 0 30 3 TTATTG 2 1 255640 CASAVA_Build 11 124500443 1D AGTGGGTCAG A/- TAGACTTCTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 0 255641 CASAVA_Build 11 124503557 1D TCTGTGTACA G/- GTGATCTCTC 3070 hom 99 het 37 0 33 5 G 2 1 255642 CASAVA_Build 11 124514959 1D CCTTCCCCCT C/- CCCCCCTGCT 3070 hom 29 het 33 0 21 13 C 7 6 255643 CASAVA_Build 11 124517216 4I ATAAAGCTTG ----/AGGA AGGAAGGCGG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 AGGA 1 2 255644 CASAVA_Build 11 124528794 3I AGTGGAACCT ---/ATG ATGAACTGCT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 ATG 1 2 255645 CASAVA_Build 11 124535044 2D TCCCAGGGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 37 2 14 22 A 14 12 255646 CASAVA_Build 11 124546125 1D GCCAGAAAGC G/- GCCACAGAAG 1818 het 1818 ref 18 6 6 6 G 2 1 255647 CASAVA_Build 11 124548171 2D CTACAGCTAA GC/-- AGTGTGCACA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 GC 1 0 255648 CASAVA_Build 11 124558305 15D CGATGAATCC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2171 hom 25 het 19 0 11 8 T 29 14 255649 CASAVA_Build 11 124561227 1I CTCGTTATGG -/T TTTGATTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 3 4 255650 CASAVA_Build 11 124576492 2D TCCTTGGTAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 11 9 255651 CASAVA_Build 11 124582132 1D TTCAGGTGGC G/- GGGGGTGAGG 1805 hom 16 het 7 0 6 1 G 6 5 255652 CASAVA_Build 11 124583891 2D TACCATTAAC AG/-- AAATAGTAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AG 1 0 255653 CASAVA_Build 11 124607935 1D AATCCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1025 het 1025 ref 33 17 3 13 T 12 11 255654 CASAVA_Build 11 124629932 1I AGTCTGAGGT -/C CCCAAGGGGC 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 C 3 4 255655 CASAVA_Build 11 124632114 1I CTGTGTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2397 hom 30 8 11 11 T 12 13 255656 CASAVA_Build 11 124704375 3D GCTTTTAAAA AAG/--- AAGCATTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 19 3 AAG 2 1 255657 CASAVA_Build 11 124782857 1D AAAAAACAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 32 0 25 7 C 1 0 255658 CASAVA_Build 11 124789853 1D TATTTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 804 hom 27 3 19 7 A 13 12 255659 CASAVA_Build 11 124795632 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 11 10 255660 CASAVA_Build 11 124801025 2D GAGATACTGG AC/-- GTCCAGGAGG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AC 1 0 255661 CASAVA_Build 11 124805865 1I TTATGATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 632 hom 33 3 19 11 A 11 12 255662 CASAVA_Build 11 124809734 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 11 10 255663 CASAVA_Build 11 124822940 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAACTC 3070 hom 72 het 26 0 23 4 AAAG 2 1 255664 CASAVA_Build 11 124838839 2D AATTCCAAAC AT/-- ATCTTTGCCC 3070 hom 126 het 48 0 41 7 AT 2 1 255665 CASAVA_Build 11 124839835 1D ATTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 9 255666 CASAVA_Build 11 124852963 1I AGCTTTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1203 hom 25 6 10 9 A 13 14 255667 CASAVA_Build 11 124870862 1D TACCTCGCCG C/- CCTGCCTTCA 3070 hom 29 het 13 0 10 3 C 3 2 255668 CASAVA_Build 11 124886926 1I ATACAAGAGG -/A TATTTATTTT 3070 hom 34 het 18 0 9 9 A 0 1 255669 CASAVA_Build 11 124891952 1I ATTGCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 30 0 21 9 T 10 11 255670 CASAVA_Build 11 124895997 1I TATACATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 22 1 20 1 T 10 11 255671 CASAVA_Build 11 124898458 1I GTTCTCCTCC -/A AGTATAAACT 3070 hom 72 het 25 0 23 2 A 1 2 255672 CASAVA_Build 11 124901152 1I GCCTGGCCAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 6 7 255673 CASAVA_Build 11 124903635 1D GACTGGCAGG C/- CCTGGGTAAC 3070 hom 75 het 29 0 23 6 C 3 2 255674 CASAVA_Build 11 124906333 1D GAGAAGTCAC T/- TTTTTTTTTT 1449 het 465 hom 25 6 6 13 T 19 18 255675 CASAVA_Build 11 124930267 1D AATGGCTAAA G/- GGGGCCCAGT 3070 het 3070 hom 27 13 10 4 G 5 4 255676 CASAVA_Build 11 124940935 1I CTGGTTGGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 9 10 255677 CASAVA_Build 11 124947714 1D TCTCTCGGCC T/- TTTTTTTTTT 1405 het 1405 ref 44 26 5 13 T 12 11 255678 CASAVA_Build 11 124957511 1I GAAGCAAAGA -/C CCCTGGCAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 C 3 4 255679 CASAVA_Build 11 124968961 3D CCTAGTCCAG TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 hom 106 het 46 0 34 14 TGT 4 3 255680 CASAVA_Build 11 124993217 4I GCCCTAGCTA ----/ATCT ATCTATAGGA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 ATCT 1 2 255681 CASAVA_Build 11 125004834 1I ATAAGAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 18 16 12 T 13 14 255682 CASAVA_Build 11 125012430 2I GCTTTAATTC --/TT TTTCTCTTCC 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 3 5 255683 CASAVA_Build 11 125012799 4D CAGAAATAAT TTTG/---- TTTATTAATA 3070 het 3070 ref 27 15 10 5 TTTG 1 0 255684 CASAVA_Build 11 125016896 1D TCTGATTACC T/- TTTTTTTTTT 1776 het 1776 ref 43 29 4 10 T 12 11 255685 CASAVA_Build 11 125023217 1I CTGTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1316 hom 27 3 19 5 T 11 12 255686 CASAVA_Build 11 125032581 1I TTTCCCCCAG -/A AAATAATCAC 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 A 3 4 255687 CASAVA_Build 11 125048318 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 449 hom 28 1 17 10 T 12 13 255688 CASAVA_Build 11 125048580 2D CGCTGGGATT AC/-- AGGCGTGAGC 3070 het 1742 hom 21 4 16 1 AC 1 0 255689 CASAVA_Build 11 125056169 1I CCCTATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1911 hom 40 7 22 11 A 15 16 255690 CASAVA_Build 11 125062274 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 A 13 12 255691 CASAVA_Build 11 125067269 2I TATATGGGAA --/CT CTCTGTATTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 CT 2 3 255692 CASAVA_Build 11 125073784 2I AGAGAGGCCA --/CT GTTTAATAGG 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 CT 0 1 255693 CASAVA_Build 11 125075463 2D AAAGAAGAAT GA/-- GTGTAATATG 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 GA 1 0 255694 CASAVA_Build 11 125078646 2D AGGAGTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1467 hom 27 6 14 7 T 14 12 255695 CASAVA_Build 11 125083759 1I GAGACACAAC -/A AAAAAAAAGA 2126 het 2126 ref 25 14 6 5 A 8 9 255696 CASAVA_Build 11 125085261 3I AAAAGAAACT ---/ATC ATCATCAGAG 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 ATC 2 3 255697 CASAVA_Build 11 125100008 1D CCAGGGAGGC T/- GAGTCCACCT 3070 het 3070 ref 45 21 19 6 T 1 0 255698 CASAVA_Build 11 125103651 1I TGGAGTACTG -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 6 7 255699 CASAVA_Build 11 125107717 1D TGGTAGTAGT G/- ATGTGATGAG 3070 hom 117 het 41 0 37 5 G 1 0 255700 CASAVA_Build 11 125114927 4I TACTAAAAAA ----/AAAG AAAAAATGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAAG 0 1 255701 CASAVA_Build 11 125115252 1I TGTTATTGCC -/A CCACAGCGTG 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 0 1 255702 CASAVA_Build 11 125116249 1D AAACCTACAC A/- AATTGATAAA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 3 2 255703 CASAVA_Build 11 125116491 1D AACTTGTTTG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 9 8 255704 CASAVA_Build 11 125117933 7D ACTCCATCTC AAAAATA/------- AAAAATAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AAAAATA 3 2 255705 CASAVA_Build 11 125118804 1I ACATACACAG -/A AAAGGCTCCC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 3 4 255706 CASAVA_Build 11 125122587 1D TTCCTCCACC T/- TTCTTTCCCC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 3 2 255707 CASAVA_Build 11 125126396 1D CCAGTGTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 10 9 255708 CASAVA_Build 11 125126568 1D ATGGCCTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 12 23 9 T 10 9 255709 CASAVA_Build 11 125126858 1D TAACTAAGAC T/- TCCAAATGAA 3070 het 3070 hom 44 15 23 7 T 2 1 255710 CASAVA_Build 11 125128106 4I GGTAAAGAAG ----/TTCC TTCCCTTCGT 3070 hom 101 het 41 0 34 7 TTCC 1 2 255711 CASAVA_Build 11 125129362 1I AATTATGCTC -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 7 8 255712 CASAVA_Build 11 125133840 39D TCAAATTAGA ATTCAGGACTAAGAAACTCACTCAAAACCACACAACTAC/--------------------------------------- ATTCAGGACT 2425 hom 15 het 22 0 6 19 ATTCAGGACTAAGAAACTCACTCAAAACCACACAACTAC 2 1 255713 CASAVA_Build 11 125142576 1D ACCTCAGTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 10 9 255714 CASAVA_Build 11 125151934 1D GTCTGTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 22 0 14 9 T 11 10 255715 CASAVA_Build 11 125159995 1I AAATGTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 833 hom 36 2 29 5 T 10 11 255716 CASAVA_Build 11 125167163 1D AATTATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 11 10 255717 CASAVA_Build 11 125175606 1I TTTTTCTGGC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 30 9 16 6 T 8 9 255718 CASAVA_Build 11 125175749 1I TTCTTTCTGA -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 5 6 255719 CASAVA_Build 11 125180089 1I TCTTACAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2566 hom 28 6 13 9 T 11 12 255720 CASAVA_Build 11 125185786 5I AAATTTTTTA -----/TTTTT TTTATTTGTG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 3 8 255721 CASAVA_Build 11 125187583 1I ATATCTTACC -/T TTTTATTTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 4 5 255722 CASAVA_Build 11 125197514 4D AACTATAAAC CATT/---- CATTGCTCAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 CATT 2 1 255723 CASAVA_Build 11 125201663 1D TACAGGTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 15 21 6 T 10 9 255724 CASAVA_Build 11 125211790 4I ATTGCAAGTT ----/TAAC TATTTCTTGA 3070 hom 120 het 41 0 41 0 TAAC 0 1 255725 CASAVA_Build 11 125220517 1I CTTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAC 2235 het 2235 ref 25 11 7 7 A 9 10 255726 CASAVA_Build 11 125251271 1D TCAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 24 1 20 3 A 16 15 255727 CASAVA_Build 11 125262445 1D GCCGTTAGCC A/- AGGTTTGAGG 2790 het 2790 ref 34 15 10 10 A 2 1 255728 CASAVA_Build 11 125265037 7D ACATGTTTTC TGTTTAT/------- TAATTTTTGT 3070 het 3070 hom 42 17 20 7 TGTTTAT 1 0 255729 CASAVA_Build 11 125265348 1I61M1D CTGCGCCCAG -CTGTTTGTTAGTTATTATTCGTTTGGTACGGCATCTGTCTTTTCTCCCCTATCTTACTGATA/CCTGTTTGTTAGTTATTATTCGTTTGGTACGGCATCTGTCTTTTCTCCCCTATCTTACTGAT- ATGTGTACCC 3070 het 13 hom 38 1 35 22 N/A 0 0 255730 CASAVA_Build 11 125266529 2I CTTTTCTAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 22 0 14 8 T 10 12 255731 CASAVA_Build 11 125268777 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTAAGAGC 3070 het 2099 hom 30 6 18 6 C 1 0 255732 CASAVA_Build 11 125272628 2D ATGAAAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 255 hom 28 1 21 6 A 14 12 255733 CASAVA_Build 11 125276236 1D AAGTAGCTTT A/- AAATACTTTC 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 A 4 3 255734 CASAVA_Build 11 125278657 18D TTTACTATTA GAATTCAAATTAAAAGCT/------------------ GAAATGAATA 3070 het 3070 ref 31 15 15 8 GAATTCAAATTAAAAGCT 1 0 255735 CASAVA_Build 11 125281427 2I ATATTCAATA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 9 11 255736 CASAVA_Build 11 125283285 1D AAGTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 44 0 40 4 T 11 10 255737 CASAVA_Build 11 125286021 1I TGTGTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 2619 het 1779 hom 25 7 11 7 T 13 14 255738 CASAVA_Build 11 125288966 2D ATAACAATCC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 25 0 10 16 A 11 9 255739 CASAVA_Build 11 125295542 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 22 0 19 3 A 12 11 255740 CASAVA_Build 11 125298686 1D TCGGGAGGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 10 9 255741 CASAVA_Build 11 125302445 1I TCTGCTGAGG -/T TAGAAACAGC 3070 het 2556 hom 23 6 10 7 T 1 2 255742 CASAVA_Build 11 125308497 1D CACTTAAGAG T/- GTCCTGGTCG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 1 0 255743 CASAVA_Build 11 125317358 18D CCCTGATACA GGATAAACGTTAGCTGAG/------------------ GGGGATCCGT 3070 het 3070 ref 32 22 9 4 GGATAAACGTTAGCTGAG 1 0 255744 CASAVA_Build 11 125320685 1D TCGGAAACGT C/- CTCGCTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 C 2 1 255745 CASAVA_Build 11 125348012 3I ATACTGTGGG ---/GCA GCAGCTCCTC 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 GCA 1 2 255746 CASAVA_Build 11 125349683 4I TTAAATACAT ----/AAGA AATAAAAGCA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AAGA 0 1 255747 CASAVA_Build 11 125350057 1I CCTGAAGACT -/C CCATGTCTGC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 2 3 255748 CASAVA_Build 11 125351650 2I TGTCTTAAAG --/TT GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 0 2 255749 CASAVA_Build 11 125366762 1D TCTAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 12 11 255750 CASAVA_Build 11 125372250 6D GTCTCAAAAT ATATAA/------ ATATATGGAT 3070 het 3070 hom 33 17 16 7 ATATAA 1 0 255751 CASAVA_Build 11 125375723 4I TGGTAAGGTT ----/TTTG TTTTTCAGAC 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 TTTG 0 1 255752 CASAVA_Build 11 125376301 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1764 het 298 hom 19 2 6 11 T 15 14 255753 CASAVA_Build 11 125376622 2D ATTTTGAGTC AG/-- AGTTAATGAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 AG 2 1 255754 CASAVA_Build 11 125377173 1D AAATAAAGCT A/- AAATGTCTTT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 4 3 255755 CASAVA_Build 11 125379587 5D AATTAAGACA ATATT/----- ATATTATGTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 ATATT 2 1 255756 CASAVA_Build 11 125380410 27D CTGTCTCAAA AAAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAAC/--------------------------- AAAAAAAAAC 3070 het 67 hom 21 1 18 4 AAAAAAAAAAAAAACAAACAAACAAAC 1 0 255757 CASAVA_Build 11 125382108 1D TGCTGCTGTG A/- AAAAAAAAAT 1128 het 1128 ref 42 35 3 5 A 10 9 255758 CASAVA_Build 11 125395031 1D GAAAGCAGCT G/- GGGCAAGCTA 3070 het 2802 hom 27 9 10 8 G 4 3 255759 CASAVA_Build 11 125396097 1I GATTATAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 45 0 35 10 A 12 13 255760 CASAVA_Build 11 125396314 1I CAGTAATTTC -/A AAGAAAACCC 3070 het 3070 ref 42 17 12 13 A 2 3 255761 CASAVA_Build 11 125398255 1D AAAATATGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 40 het 30 1 26 3 T 9 8 255762 CASAVA_Build 11 125412211 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1749 hom 27 6 13 9 T 11 10 255763 CASAVA_Build 11 125420132 2D ATAATTTAAA AT/-- ATATATATAG 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 AT 5 4 255764 CASAVA_Build 11 125421615 1I CTAAATAATA -/T TTTTTAAAAA 2966 het 2966 ref 34 17 8 9 T 5 6 255765 CASAVA_Build 11 125423808 1D CAATTTAGTT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 1 0 255766 CASAVA_Build 11 125452476 3D GCCAATTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 27 0 22 5 T 14 11 255767 CASAVA_Build 11 125459088 4I CCTATCTTTA ----/GAGT GAGTCTCCGC 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 GAGT 1 2 255768 CASAVA_Build 11 125462686 1I AGAAGAAAGC -/T AAAAAGAAGT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 0 1 255769 CASAVA_Build 11 125463293 1I AGATCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 29 2 23 7 A 10 11 255770 CASAVA_Build 11 125465875 7I TCACATTTGG -------/CCTAGTT CCTAGTTCCA 3070 hom 143 het 64 0 47 17 CCTAGTT 1 2 255771 CASAVA_Build 11 125468738 1D AATTCCATTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 8 255772 CASAVA_Build 11 125476604 1I GGGCCTGGCC -/G TCTTTGTTCT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 G 0 1 255773 CASAVA_Build 11 125481263 1D GCCACTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 107 het 44 0 36 8 T 10 9 255774 CASAVA_Build 11 125488385 1I AAGGTATCCC -/G GGGGGAAGAG 3070 het 1653 hom 22 6 10 6 G 5 6 255775 CASAVA_Build 11 125488477 18D TGGCCTGGTA TTCACACAGAAAAGTGAC/------------------ TCCCACACCT 3070 het 3070 ref 21 14 11 1 TTCACACAGAAAAGTGAC 1 0 255776 CASAVA_Build 11 125504694 1D23M1I GAGCAAGACT CCCATCTTAAAAACAAAATGAAAC-/-CCATCTTAAAAACAAAACGAAACA AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 16 9 11 3 N/A 0 0 255777 CASAVA_Build 11 125505067 1I CAGCCACACA -/C CAGCTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 C 1 2 255778 CASAVA_Build 11 125507540 1I TTAAAACAGA -/C CTGCAGGCGT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 1 2 255779 CASAVA_Build 11 125509968 2D CCTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AG 2 1 255780 CASAVA_Build 11 125517728 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 7 8 255781 CASAVA_Build 11 125518456 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 3004 hom 26 het 13 0 9 4 A 1 0 255782 CASAVA_Build 11 125531322 1D TCCCTCACGA T/- TTAGCCCTTT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 3 2 255783 CASAVA_Build 11 125532306 1I ATCTTTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2241 hom 30 9 12 9 T 14 15 255784 CASAVA_Build 11 125535792 1D CAAGCTTTAG T/- TTATACACAA 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 T 3 2 255785 CASAVA_Build 11 125536748 1I CCCCCTGCCC -/T TTTTTTTTTT 2262 het 2262 ref 20 8 5 7 T 10 11 255786 CASAVA_Build 11 125556490 5D TTAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAGCA 3070 het 3070 hom 26 12 13 3 AAAAG 1 0 255787 CASAVA_Build 11 125557724 1I AACTGGCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 10 11 255788 CASAVA_Build 11 125569775 3I GGAAAAATTG ---/GAC GACATCAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 GAC 1 2 255789 CASAVA_Build 11 125571706 1D TGTCTCTACT A/- AAAATACAAA 1586 het 1303 hom 8 3 4 1 A 5 4 255790 CASAVA_Build 11 125589458 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1299 het 907 hom 9 2 4 3 A 14 15 255791 CASAVA_Build 11 125602056 1D GACCCCGTCC A/- AAAAAAAAAA 2836 hom 37 het 23 0 11 12 A 15 14 255792 CASAVA_Build 11 125646345 4I AATGCATGAA ----/AAGG GAGACTGATG 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 AAGG 0 1 255793 CASAVA_Build 11 125656972 10D AGGTGTACTT GGTAGAGTCA/---------- GGTAGAGTCA 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 GGTAGAGTCA 2 1 255794 CASAVA_Build 11 125666237 4I GAGTGAGGAG ----/GGGA GGGAGGCCTG 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 GGGA 1 2 255795 CASAVA_Build 11 125672346 5D AGTCTCCTCC CTTTA/----- CTTTATCTGT 3070 het 3070 ref 40 22 14 7 CTTTA 2 1 255796 CASAVA_Build 11 125678004 1D GTACCAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 12 7 T 11 10 255797 CASAVA_Build 11 125682448 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAGA 3070 het 763 hom 18 5 12 1 G 0 1 255798 CASAVA_Build 11 125692506 1D CATTTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 13 12 255799 CASAVA_Build 11 125700314 1I AAAATTAAAC -/A AGTAAAAATG 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 1 2 255800 CASAVA_Build 11 125715432 1I TGCTTAATTC -/T TTTTTTTTTT 510 het 510 ref 24 13 3 8 T 13 14 255801 CASAVA_Build 11 125722186 1I TCCCTCTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1740 hom 22 6 11 5 A 9 10 255802 CASAVA_Build 11 125728459 4D GGAAGGAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 41 21 13 12 AAAG 3 2 255803 CASAVA_Build 11 125736471 1D TTGGCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 533 hom 34 3 22 9 T 15 14 255804 CASAVA_Build 11 125765225 1I GAGGCAGAGC -/T TGCAGTGAGC 3070 hom 42 het 19 0 14 5 T 1 2 255805 CASAVA_Build 11 125765966 1I CTCCCCCCAG -/C CCCTTGGCAG 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 C 3 4 255806 CASAVA_Build 11 125794083 2I GTGTCTCCCC --/CT GTTTCTCTTC 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 CT 0 1 255807 CASAVA_Build 11 125803427 1D GCATGGTTGT C/- CAGGTTTCTG 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 C 2 1 255808 CASAVA_Build 11 125812689 2D ATATGTGCAC AT/-- GTCACAACAT 3070 hom 169 het 63 0 57 8 AT 1 0 255809 CASAVA_Build 11 125814599 1I ACATGAGGCT -/C CCTGCTCAGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 2 3 255810 CASAVA_Build 11 125826219 2D CATGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 219 het 90 0 69 23 TG 6 5 255811 CASAVA_Build 11 125826462 2I15M4D TGTGCGTATG --TGAGTGTGACTATGTGTGA/CATGTGTGTGCGTATGT---- GCGTGTGCAT 3070 het 1790 hom 80 15 44 33 N/A 0 0 255812 CASAVA_Build 11 125826913 2D CTACTCTGAT CC/-- CAACATTCTT 3070 hom 141 het 50 0 47 4 C 3 1 255813 CASAVA_Build 11 125829201 1D CCTCCCATCG C/- CCGGATTCAC 3070 hom 48 het 21 0 16 5 C 3 2 255814 CASAVA_Build 11 125832465 2I11M2I TGTATGTCTC --TGTGTGTATGC--/TGTGTGTGTATGCGT GTGTATGTGT 3070 hom 146 het 55 0 49 10 N/A 0 0 255815 CASAVA_Build 11 125833569 1D GCCTTACTCT G/- GAGTTCGGAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 2 1 255816 CASAVA_Build 11 125839644 6D TCAGAAGAAG AAGAAA/------ AAGAAAAAGA 3070 hom 50 het 25 0 16 13 AAGAAA 3 2 255817 CASAVA_Build 11 125849066 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2617 het 286 hom 9 1 7 1 T 15 14 255818 CASAVA_Build 11 125872315 6D GTGAGTGTGA GTGTGT/------ GAGAGTGAGT 3070 het 901 hom 49 8 24 20 GT 3 0 255819 CASAVA_Build 11 125873084 2I TAACCTTCCT --/AG AGGCCCTGCA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AG 1 2 255820 CASAVA_Build 11 125880680 1I CCATCTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 104 hom 28 1 25 2 A 9 10 255821 CASAVA_Build 11 125881345 1I AATCTATAAG -/A AAAAAATTAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 6 7 255822 CASAVA_Build 11 125881883 1I ATAGCAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 40 1 32 7 T 12 13 255823 CASAVA_Build 11 125886433 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 593 hom 33 2 22 9 A 12 11 255824 CASAVA_Build 11 125904758 1I CTGTCTGCTT -/G GATCCACTTG 3070 het 320 hom 30 1 25 4 G 1 2 255825 CASAVA_Build 11 125911371 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 37 0 28 10 TG 9 8 255826 CASAVA_Build 11 125934665 1I TGCAGGGAGA -/G GGGTGTCTGT 3070 hom 135 het 49 0 44 5 G 3 4 255827 CASAVA_Build 11 125954727 3D GAGGCAAATG CAC/--- CACCTGTGGC 3070 hom 138 het 51 0 45 8 CAC 2 1 255828 CASAVA_Build 11 125956758 1D ATATGTATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 414 hom 35 1 30 4 T 10 9 255829 CASAVA_Build 11 125963506 1I TGCAAAATGC -/A AAGTTACCTG 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 2 3 255830 CASAVA_Build 11 125965374 3D AAGCAAAGCC TAG/--- AAGAAGAACA 3070 het 3070 hom 41 14 24 4 TAG 1 0 255831 CASAVA_Build 11 125969412 1I CGTACTGTGA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 7 8 255832 CASAVA_Build 11 125971390 1I GCATATGGTA -/T GATGTTGAGT 3070 het 3070 ref 49 24 23 2 T 0 1 255833 CASAVA_Build 11 125983570 4D GTGCCCTTCC TCTG/---- TCTGTGGGAG 3070 het 2036 hom 29 7 21 2 TCTG 2 1 255834 CASAVA_Build 11 125991392 2D GGAAAAGGAA AG/-- AGGGGGAGAA 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 AG 2 1 255835 CASAVA_Build 11 125991572 2I TTCCAGAAAA --/CT CTCTCTCTGG 3070 hom 126 het 49 0 41 8 CT 4 5 255836 CASAVA_Build 11 125993381 1I ATGAGAACTC -/T ACCCACATGA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 0 1 255837 CASAVA_Build 11 126002125 1I AAAAAACAAA -/C AAAAAAAGAA 3070 het 678 hom 22 2 19 1 C 0 1 255838 CASAVA_Build 11 126005572 1I CCCCTTTTGC -/T TATTTGTTCA 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 T 1 2 255839 CASAVA_Build 11 126021421 1I10M1I TTTGTTCTTG -TTAGTGCCTT-/TTTAGTGCCTTC CCTGCACTGG 3070 hom 60 het 22 0 20 6 N/A 0 0 255840 CASAVA_Build 11 126023874 1I AACTATATCT -/A AAAATAAATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 4 5 255841 CASAVA_Build 11 126028479 14D TGCTGCCTCA GTTTGTAAGTAGGC/-------------- ATTTGACCTT 2721 het 2721 ref 28 16 8 5 GTTTGTAAGTAGGC 1 0 255842 CASAVA_Build 11 126029293 2D CACCTGACAG GT/-- GGCGGGGAAG 3070 hom 111 het 47 0 34 13 GT 1 0 255843 CASAVA_Build 11 126035731 2D GTTGAATGCC CA/-- CATTGGAGGA 3070 het 3070 ref 60 32 20 8 CA 2 1 255844 CASAVA_Build 11 126036327 1I45M1I TGTGTCTCAG -AAAAAATAGCAACTAGCAGAGGGTCATGCCTCATGTGAGTTTCTG-/AAAAAAATAGCAACTAGCAGAGGGTCATGCCTCATGTGAGTTTCTGA TAAGTATTGT 3070 het 3070 hom 63 39 45 11 N/A 0 0 255845 CASAVA_Build 11 126055503 2D TCTACTGGAG AT/-- ATATATATAT 1192 het 1192 ref 34 21 4 9 AT 9 8 255846 CASAVA_Build 11 126079065 1I AAATGGAATT -/G TCTGTCAGAT 3070 hom 144 het 52 0 48 4 G 0 1 255847 CASAVA_Build 11 126082941 1I TGTGATGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 508 hom 42 3 25 14 T 12 13 255848 CASAVA_Build 11 126083444 1I TCCTCACCAA -/G GGCATTTAGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 2 3 255849 CASAVA_Build 11 126091859 1I GTGTTGGGGG -/T GGGGGGGAAG 3070 het 129 hom 24 1 20 3 T 0 1 255850 CASAVA_Build 11 126098309 1D AGGTACTTAG C/- ATACAGAGCT 3070 het 3070 hom 50 18 26 7 C 1 0 255851 CASAVA_Build 11 126100454 1I CAAAGCAAAA -/C AAAAGGGTTC 3070 hom 163 het 60 0 55 5 C 0 1 255852 CASAVA_Build 11 126104033 2D GCAGACGCTA GC/-- TCCAAAGCTT 3070 hom 66 het 25 0 20 6 GC 1 0 255853 CASAVA_Build 11 126108637 8D TTGATATTCA GCCATTAT/-------- GCCATTATAC 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 GCCATTAT 2 1 255854 CASAVA_Build 11 126115517 1I TGGTCTGGAA -/T TTGTCTGCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 3 255855 CASAVA_Build 11 126119345 1I AACACACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 19 8 T 13 14 255856 CASAVA_Build 11 126119982 1D AGTAAGTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 23 9 A 15 14 255857 CASAVA_Build 11 126124750 1D AGTCCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 8 A 11 10 255858 CASAVA_Build 11 126154900 6D CATTATGATG CCTTCT/------ CCTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 51 30 19 5 CCTTCT 1 0 255859 CASAVA_Build 11 126173303 1D TGGAGAGGCC A/- CCAGGTGGCC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 1 0 255860 CASAVA_Build 11 126173483 1D TGTCCAGGGC A/- TTGAGTATCC 3070 hom 86 het 34 0 27 7 A 1 0 255861 CASAVA_Build 11 126177041 1I GCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 50 23 23 4 A 9 10 255862 CASAVA_Build 11 126193917 5D TCAGGTCAGC CTCTA/----- CTCTACCTGC 3070 het 3070 hom 28 15 12 4 CTCTA 2 1 255863 CASAVA_Build 11 126194222 2I CAGCCCAGTG --/AA AAGAGGGTAG 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 A 2 4 255864 CASAVA_Build 11 126195418 1I GCAAGCCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 11 14 10 A 9 10 255865 CASAVA_Build 11 126197595 2I AATAGGAATT --/TA TATGTTTCCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 TA 1 2 255866 CASAVA_Build 11 126211586 5I GTGCCTGAAC -----/TTAAG TTAAACTAAA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 TTAAG 0 1 255867 CASAVA_Build 11 126222084 5D TTCTTAGAGT GAAAA/----- GAAAACCTGC 3070 het 3070 hom 25 10 11 6 GAAAA 2 1 255868 CASAVA_Build 11 126224386 1D TTACCCTATA C/- AGTCTCAGAA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 C 1 0 255869 CASAVA_Build 11 126225040 13I3M3I TCAAAGCTGA -------------CAA---/TTATTTGAGTAATCAAATC CTCCCAAAAT 3070 het 3070 ref 46 24 23 1 N/A 0 0 255870 CASAVA_Build 11 126241696 1I GCCACTCCTG -/T TTTTCACGCC 2058 het 2058 ref 22 10 6 6 T 4 5 255871 CASAVA_Build 11 126243244 1D GGACTACTTC A/- AAATTAACCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 4 3 255872 CASAVA_Build 11 126243371 1D25M1D GCTGCACCAG TGCGGTCCAGCAGGGCAGCCCTTGACT/-GCGGTCCAGCAGGGCAGCCCTTGAC- GAGGGCTTGG 3070 hom 75 het 21 0 24 6 N/A 0 0 255873 CASAVA_Build 11 126255744 1I AAAGTTGTGG -/T TTTTTTTTTT 2834 het 2834 ref 36 11 12 13 T 15 16 255874 CASAVA_Build 11 126256529 1D TGGTTTAATC A/- GTCAGCGTCA 3070 het 3070 ref 29 17 9 5 A 1 0 255875 CASAVA_Build 11 126257643 1I TACAAAGAGA -/T TAGTCTGGAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 1 2 255876 CASAVA_Build 11 126262065 1I AACATTCAAG -/A AAAAAAGGAT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 6 7 255877 CASAVA_Build 11 126274116 1I AGGGGAGTTT -/G GGGGGGGGTC 3070 het 3070 hom 31 8 12 11 G 8 9 255878 CASAVA_Build 11 126281727 1D CCTTTCACTG T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 43 24 11 9 T 8 7 255879 CASAVA_Build 11 126294081 3D TGTATTGTTA CAT/--- CATATTATAT 3070 het 2765 hom 17 7 8 2 CAT 2 1 255880 CASAVA_Build 11 126300081 2D GATAAAATTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 29 0 17 12 A 14 12 255881 CASAVA_Build 11 126300204 4D TAAAAAGGTC GGGG/---- GGGGGGGGGG 2233 het 314 hom 24 4 7 14 G 15 11 255882 CASAVA_Build 11 126302335 4D GGGGAGTAAG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 108 het 46 0 37 12 CA 7 5 255883 CASAVA_Build 11 126304633 4D AGCAGAAAAC AAAT/---- AAAAATAAGA 3070 het 3070 hom 49 21 25 5 AAAT 1 0 255884 CASAVA_Build 11 126305055 2D GGGGGAGCCA CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 664 hom 29 10 13 6 C 13 11 255885 CASAVA_Build 11 126305174 1D AGCATAATTA T/- TTGTTGTACA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 3 2 255886 CASAVA_Build 11 126305365 1D TAAACCCTTG A/- CATGTTACTG 3070 het 3070 ref 41 17 19 6 A 1 0 255887 CASAVA_Build 11 126306460 1D CCCTCCATAC A/- TTCCTTCTTT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 A 1 0 255888 CASAVA_Build 11 126308381 4D TCTTTCTCAT GGCA/---- GTTTCTTTAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 9 GGCA 1 0 255889 CASAVA_Build 11 126308886 1I ACCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 929 hom 33 2 24 7 A 11 12 255890 CASAVA_Build 11 126315509 1I CTAGATTATG -/A AAAAAGTATA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 5 6 255891 CASAVA_Build 11 126316371 1D ACAAACAAAC A/- AAAAACCCTC 3070 het 3070 hom 47 12 18 17 A 6 5 255892 CASAVA_Build 11 126316400 1D TTTATTTAAC T/- GGCCAAAATT 3070 het 1419 hom 35 3 22 10 T 1 0 255893 CASAVA_Build 11 126328729 4I ATAGAGAGAC ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AG 5 7 255894 CASAVA_Build 11 126335454 4I TTGTTTTGGG ----/GTTT GTTTGTCATT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 GTTT 1 2 255895 CASAVA_Build 11 126376465 1I TGGATCTTAG -/T TTGCTTTGCA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 2 3 255896 CASAVA_Build 11 126380708 1I TATCTCCTTG -/T TTTCCCCAGA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 3 4 255897 CASAVA_Build 11 126384831 6D TGAGACCCTG GCAAAA/------ TAATGTATGC 3070 het 3070 ref 53 25 23 6 GCAAAA 1 0 255898 CASAVA_Build 11 126389122 35I ACTGATGGCT -----------------------------------/GAGCCCAACTGGAAATCAGACAGAAAAGAAATCTG GAGCGAATTC 3070 het 3070 ref 52 25 18 9 GAGCCCAACTGGAAATCAGACAGAAAAGAAATCTG 0 1 255899 CASAVA_Build 11 126389545 2I TGGGAGGTCT --/CA GTCTTTTCAT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 CA 0 1 255900 CASAVA_Build 11 126394449 1D CACAGATGTT A/- AAAGGCCATT 3070 het 3070 ref 48 20 16 13 A 4 3 255901 CASAVA_Build 11 126417268 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAACCCT 3070 het 3070 ref 36 20 11 6 A 7 6 255902 CASAVA_Build 11 126435888 1I TTTATTTTTA -/T ATTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 0 1 255903 CASAVA_Build 11 126451514 1D GTATTATGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 A 10 9 255904 CASAVA_Build 11 126458422 3D ACAGCACTCG AGC/--- TCTGCTAAGG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 AGC 1 0 255905 CASAVA_Build 11 126465002 1I TAATAGCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 A 12 13 255906 CASAVA_Build 11 126511902 2I CTGCTGACAC --/AT GTTACTTCTG 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 AT 0 1 255907 CASAVA_Build 11 126515643 1I ACAGTCAATG -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 44 24 20 0 A 6 7 255908 CASAVA_Build 11 126523456 1I GAATTGTTTT -/G TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 G 0 1 255909 CASAVA_Build 11 126525111 2I AAGATGTGCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 A 10 12 255910 CASAVA_Build 11 126533824 1D AGGTGCTAAA T/- TCCTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 5 T 2 1 255911 CASAVA_Build 11 126533987 1I ATGCCACCCC -/T GGTCCCTCTC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 T 0 1 255912 CASAVA_Build 11 126542203 2I TAAATCTAAC --/TA TATGCTATTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 TA 1 2 255913 CASAVA_Build 11 126542385 4D GAATAATAAT AATA/---- AAGTGATAGA 3070 het 3070 ref 32 18 10 7 AATA 1 0 255914 CASAVA_Build 11 126542909 1I ATTACCTCAA -/C AACACAATAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 C 0 1 255915 CASAVA_Build 11 126551427 1I ATGTAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 552 hom 42 2 32 8 A 11 12 255916 CASAVA_Build 11 126556256 3D TCCATCAGTC TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 147 het 60 0 49 13 T 12 9 255917 CASAVA_Build 11 126557722 1D CCCTATAGCC A/- AGAAGAGAGT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 2 1 255918 CASAVA_Build 11 126561258 3I ACTAAATACA ---/TAC TACACTGCAC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 TAC 1 2 255919 CASAVA_Build 11 126562903 1D CAGTCTCAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 9 8 255920 CASAVA_Build 11 126571160 1I CTTTTGTTTT -/C CTAGTCGCAT 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 C 1 2 255921 CASAVA_Build 11 126572424 2I TTAGGTGAGA --/CT CTAAAAGAAT 3070 het 1832 hom 17 5 10 2 CT 1 2 255922 CASAVA_Build 11 126572697 1I GCAGAATTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 9 10 255923 CASAVA_Build 11 126583882 4D AAACAAACAA AAAC/---- AAACAAATGA 3070 het 3070 ref 45 30 14 4 AAAC 2 1 255924 CASAVA_Build 11 126584320 1D TTCAGGAGTT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 14 9 G 1 0 255925 CASAVA_Build 11 126608739 15D TGTGACAGAG CTGCTAGTGTCATTT/--------------- TTGCTATGTA 3070 het 3070 ref 36 22 14 3 CTGCTAGTGTCATTT 1 0 255926 CASAVA_Build 11 126617590 2D ATCCACTCCA CT/-- CTCTATTCTT 3070 het 3070 ref 50 28 15 8 CT 3 2 255927 CASAVA_Build 11 126631835 1I ACAAGGTAGC -/A AAACCTGGAA 3070 hom 144 het 56 0 49 7 A 3 4 255928 CASAVA_Build 11 126656744 1I ACAATGCATT -/A AAAATTCTTA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 4 5 255929 CASAVA_Build 11 126657560 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 2232 het 1504 hom 21 7 8 6 A 12 13 255930 CASAVA_Build 11 126665236 1I TTTGAAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 236 hom 20 1 13 6 T 11 12 255931 CASAVA_Build 11 126682282 3D ATAAAATAAA GAG/--- GAGAAGAACA 3070 hom 123 het 44 0 41 5 GAG 2 1 255932 CASAVA_Build 11 126689553 2I65M2D GTGTAAACAT --GTTTTAATTTTTTTTTAAGTTTTAAGGATTAAATACACTGTGTTTTTATCCTTAAAAATTAATATAA/AAGTTTTAATTTTTTTTTAAGTTTTAAGGATTAAATACACTGTGTTTTTATCCTTAAAAATTAATAT-- GTCAGGTAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 16 N/A 0 0 255933 CASAVA_Build 11 126690526 1D GGAGAGTTTG A/- AAAAAATTTA 3070 hom 56 het 23 0 19 5 A 7 6 255934 CASAVA_Build 11 126692612 1D AAGTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 32 1 25 6 T 11 10 255935 CASAVA_Build 11 126692871 5D GCCAATTTCT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 66 het 33 0 23 10 AAAAC 5 4 255936 CASAVA_Build 11 126693368 1I TTACCTCCCA -/C TGGGTCCCTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 0 1 255937 CASAVA_Build 11 126694021 1D GATTGGCAGG T/- GGAAAATTTG 3070 het 3070 ref 48 21 13 14 T 1 0 255938 CASAVA_Build 11 126695612 1D AAATGATCTT C/- TTTGACTCCA 3070 hom 69 het 24 0 23 1 C 1 0 255939 CASAVA_Build 11 126697338 2D TATAAACATA AC/-- ACAATATATT 3070 hom 33 het 16 0 12 5 AC 2 1 255940 CASAVA_Build 11 126698972 6D TGCCATATTA TTCTTC/------ TTAAGATTAC 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TTC 2 0 255941 CASAVA_Build 11 126704799 1I CATGGAATAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 8 255942 CASAVA_Build 11 126709119 1D CAGTTTTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 G 1 0 255943 CASAVA_Build 11 126709556 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 559 hom 24 2 16 6 A 17 16 255944 CASAVA_Build 11 126714210 1I AGGAAAGAGC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 135 het 52 0 45 7 A 8 9 255945 CASAVA_Build 11 126714434 3I TCCTTGTAAA ---/GTG GGTATTATCA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 GTG 0 1 255946 CASAVA_Build 11 126714572 1I CCAATAATTG -/A AGGGGGAAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 1 2 255947 CASAVA_Build 11 126714789 1I TTAGAAATCA -/C TGGAATAGGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 0 1 255948 CASAVA_Build 11 126715951 11D ATTTTTCCCC CCATCCTTCTA/----------- CCCTATCCTT 3070 het 2672 hom 49 10 16 27 CCATCCTTCTA 1 0 255949 CASAVA_Build 11 126716661 6D GGAGTTAGGA AGAACC/------ AGCTTATAAT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 AGAACC 1 0 255950 CASAVA_Build 11 126717881 1I ATCACTTGAA -/C CCAGGAGGCA 3070 hom 75 het 26 0 24 7 C 2 3 255951 CASAVA_Build 11 126717966 2D TGGGAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 25 0 19 7 A 13 11 255952 CASAVA_Build 11 126719539 1D TTCAAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 25 1 17 8 T 13 12 255953 CASAVA_Build 11 126728761 1I TTTGGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 36 0 24 12 T 11 12 255954 CASAVA_Build 11 126744136 1I TGTTGTGGGG -/T TGGGGGAGGC 1967 hom 12 het 5 0 5 0 T 1 2 255955 CASAVA_Build 11 126750941 16D TCTTTGAGAT TATATATATATATATA/---------------- TATATATATA 1902 hom 12 het 6 0 5 1 TA 15 7 255956 CASAVA_Build 11 126783768 1I ATATTGGTTC -/A ATTTACTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 2 255957 CASAVA_Build 11 126792035 4D GTGTGTGTGT GACA/---- GACAGAGAGA 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 GACA 2 1 255958 CASAVA_Build 11 126805679 1I AATCCGTCTT -/C CCCCCGCTTC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 C 5 6 255959 CASAVA_Build 11 126810344 4D TTTTTCTTTC CTGT/---- CTTTCTTCGT 3070 het 3070 ref 40 24 10 8 CTGT 1 0 255960 CASAVA_Build 11 126812680 6D CATTTCAAGT TCAAGG/------ TGTTGAACAC 3070 het 3070 hom 49 15 30 5 TCAAGG 1 0 255961 CASAVA_Build 11 126813447 1I ATTCCTTTTT -/C CCCCCCAGCT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 C 6 7 255962 CASAVA_Build 11 126820108 2D ACTTGAAGAC TT/-- TGTCTTGGAG 3070 het 3070 hom 34 11 21 3 T 3 1 255963 CASAVA_Build 11 126823605 1I ATATCCATCA -/G GGTAGGCTAG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 2 3 255964 CASAVA_Build 11 126823998 3I AAGATCACTC ---/GGA GGAGATAAAA 2473 het 2473 ref 27 16 6 5 GGA 1 2 255965 CASAVA_Build 11 126826569 2D TAACAGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 12 10 255966 CASAVA_Build 11 126829631 2I28M4I GTGAGTTGGA --TTTTTTTTTTTTGCTGTTTGTTCTCATT----/TTTTTTTTTTTTTTGCTGTTTGTTCTCATTTTTA TTTATTTATG 3070 het 3070 ref 40 19 19 13 N/A 0 0 255967 CASAVA_Build 11 126830655 4I ACTAATTAAC ----/CTGT CTATCATCAC 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 CTGT 0 1 255968 CASAVA_Build 11 126832158 1I TGGATATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 9 10 255969 CASAVA_Build 11 126834425 3D AGAAAAGAAT AAG/--- AAGAGCAAAG 3070 het 3070 hom 64 30 32 4 AAG 2 1 255970 CASAVA_Build 11 126840298 1I ACCAAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 9 10 255971 CASAVA_Build 11 126840971 6I AAAACAAACA ------/AACAAC AACAACAACA 2959 het 2959 ref 23 12 8 3 AAC 4 6 255972 CASAVA_Build 11 126852474 1I ATAAATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 34 0 24 10 T 13 14 255973 CASAVA_Build 11 126863025 3D TACTAATAAA GAC/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 34 17 15 6 GAC 1 0 255974 CASAVA_Build 11 126868126 1D AGCAATGTAG A/- AATCACGGCT 3070 het 3070 ref 42 18 20 5 A 3 2 255975 CASAVA_Build 11 126895239 1D CTATTATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 11 10 255976 CASAVA_Build 11 126925610 3I ATCAGTAAAT ---/ATA ATGTAAATTT 3070 het 3070 hom 23 7 14 2 ATA 0 1 255977 CASAVA_Build 11 126948048 3I TAAAATAGAG ---/AAT AAAAAATAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAT 0 1 255978 CASAVA_Build 11 126954590 2D AAAAGATTGA TT/-- TTTTTTTTAG 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 10 8 255979 CASAVA_Build 11 126961208 4D GTGTTGAGAG ACTC/---- ACTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 ACTC 2 1 255980 CASAVA_Build 11 126963362 2D CCATCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 2083 hom 20 7 12 1 A 11 9 255981 CASAVA_Build 11 126967397 3I GAAGGAAGAA ---/GGG AGGGAGGGAA 253 het 253 ref 31 20 3 8 G 0 3 255982 CASAVA_Build 11 126969045 1D AATATAATCC A/- TTTTTTACAT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 1 0 255983 CASAVA_Build 11 126973349 2I TAAACATAAC --/TT AAGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 0 2 255984 CASAVA_Build 11 126975366 34D GTTTTAAACA TATGATTCCATTCTCTCTTTTATGTTTCCATTCT/---------------------------------- TATGATTCCA 1193 het 1193 ref 27 14 6 13 TATGATTCCATTCTCTCTTTTATGTTTCCATTCT 1 0 255985 CASAVA_Build 11 126976009 4D GGCAGTCTGC AAAT/---- ATTTGCCCTT 3070 het 3070 hom 47 19 23 7 AAAT 1 0 255986 CASAVA_Build 11 126977524 1D TCTTTGAATT A/- AAAAATTCTA 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 A 6 5 255987 CASAVA_Build 11 126983566 1I GTATGGAAAA -/G GAGGAAGGAT 3070 het 3070 hom 48 19 26 3 G 1 2 255988 CASAVA_Build 11 126986116 5I AAGGTGGGAG -----/TTTTA TAGCTGTGTT 3070 het 3070 hom 50 24 19 7 TTTTA 0 1 255989 CASAVA_Build 11 127000004 1D ACAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1568 het 1568 ref 21 14 5 2 A 13 12 255990 CASAVA_Build 11 127016627 5D CTGGAACATC TTATT/----- TTATTTGTTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 5 TTATT 2 1 255991 CASAVA_Build 11 127022749 1D AAGGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3017 het 2112 hom 31 11 9 11 T 15 14 255992 CASAVA_Build 11 127035571 1D ATATATCCAA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 T 7 6 255993 CASAVA_Build 11 127069326 3D TTCATTTCTT ATC/--- ATTATCAAGT 3070 het 3070 ref 59 29 24 7 ATC 1 0 255994 CASAVA_Build 11 127074467 1D GTAAAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 11 10 255995 CASAVA_Build 11 127077137 6D TATATTTATA TAAGAT/------ TAAGATTAAG 3070 het 2927 hom 26 7 15 7 TAAGAT 2 1 255996 CASAVA_Build 11 127118653 13D TACTTGTTCT ATCAATTATTGAC/------------- ATCAATTATT 3070 het 3070 ref 30 18 10 5 ATCAATTATTGAC 1 0 255997 CASAVA_Build 11 127128340 1I TTATATCTTG -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 T 6 7 255998 CASAVA_Build 11 127131443 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 22 4 T 12 11 255999 CASAVA_Build 11 127134617 1I CGTCCTGGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 9 10 256000 CASAVA_Build 11 127136558 1D GCAACAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 12 11 256001 CASAVA_Build 11 127136796 1D ATTGCCTCGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 20 15 8 T 9 8 256002 CASAVA_Build 11 127182476 1D TGTGTATGTG T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 7 6 256003 CASAVA_Build 11 127195687 1D GACTCTACAA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 7 6 256004 CASAVA_Build 11 127218810 2I CACACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 56 28 14 14 CA 7 8 256005 CASAVA_Build 11 127218931 1D GTGACAGATA T/- TTTTTTATCA 3070 hom 87 het 35 0 30 8 T 7 6 256006 CASAVA_Build 11 127219721 1I AGCACATTTG -/T TTAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 2 3 256007 CASAVA_Build 11 127229044 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAA 3070 het 3070 ref 45 19 19 8 C 1 0 256008 CASAVA_Build 11 127230267 27I GATATTCAGT ---------------------------/CATTCTAACACAATTTGTTAAAATAAC CATTCTAACG 3070 het 3070 ref 31 18 10 5 CATTCTAACACAATTTGTTAAAATAAC 0 1 256009 CASAVA_Build 11 127240261 1D CAAGAAACTC T/- TTACCTTCTA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 3 2 256010 CASAVA_Build 11 127250625 2D TCTGTGAGGC CT/-- CTCTCTCTGC 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 CT 5 4 256011 CASAVA_Build 11 127265083 1D AACCCTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 14 11 15 A 14 13 256012 CASAVA_Build 11 127277890 1D AACCATTTAC T/- TTTTTTTTTT 777 het 777 ref 53 42 3 8 T 11 10 256013 CASAVA_Build 11 127278540 1D CAGCCCGGGG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 T 9 8 256014 CASAVA_Build 11 127283399 1D AATTGTAAGT A/- AAGTTTTCTC 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 A 3 2 256015 CASAVA_Build 11 127284637 9I CTATAGTATT ---------/TGTTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 TGTTTTTTG 0 1 256016 CASAVA_Build 11 127285631 1I GCAAAAGCTC -/T TTAGTTTAAT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 2 3 256017 CASAVA_Build 11 127286377 2D TTCCTAGGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2930 het 2930 ref 26 11 7 8 T 13 11 256018 CASAVA_Build 11 127286940 1I ATTTATTGAC -/T TGCATATGTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 1 2 256019 CASAVA_Build 11 127292808 5D TACAAAAATT AACTC/----- AAGATGGATT 3070 het 3070 ref 35 18 14 6 AACTC 1 0 256020 CASAVA_Build 11 127293796 1D CACACTGGGG C/- TTTTTTGGGG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 C 1 0 256021 CASAVA_Build 11 127297048 4D AAGTTTGCGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 AAAC 3 2 256022 CASAVA_Build 11 127299425 1D GCAAGCTCTG C/- CCCCCCAGAT 3070 het 3070 hom 21 9 12 4 C 7 6 256023 CASAVA_Build 11 127301665 1I AAAGTGGGGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 7 8 256024 CASAVA_Build 11 127303002 6D TGTTCACTGG TTTAAC/------ TTTTATAAAC 3070 het 3070 ref 50 27 19 5 TTTAAC 1 0 256025 CASAVA_Build 11 127303883 1I CACTAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 11 12 256026 CASAVA_Build 11 127306303 5I TATACTGAAC -----/TATCT TATCTTCTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TATCT 1 2 256027 CASAVA_Build 11 127306950 1I CTCCTAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 27 1 19 7 A 12 13 256028 CASAVA_Build 11 127334009 1D TTAAATTCTG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 7 256029 CASAVA_Build 11 127336868 1D ATGAACACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 34 1 29 4 A 12 11 256030 CASAVA_Build 11 127339785 1I CAGCTCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1350 hom 45 4 28 13 T 13 14 256031 CASAVA_Build 11 127344985 5I TGGCACTCTC -----/TAAAT TAAAGAATTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TAAAT 0 1 256032 CASAVA_Build 11 127349051 1I CAGAACAAAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 8 9 256033 CASAVA_Build 11 127349312 1D AGCATAGAAA C/- TTACCAGAGA 3070 hom 93 het 37 0 31 7 C 1 0 256034 CASAVA_Build 11 127350142 4I TCTCTCAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 2136 hom 18 het 8 0 7 1 AAAT 3 4 256035 CASAVA_Build 11 127358140 5D CATTTTCTAG TTAGC/----- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 TTAGC 1 0 256036 CASAVA_Build 11 127362045 35I TCCTTTGTGC -----------------------------------/TATCTCATAGGCAAAAAGCCTTCCAGACATTAGAA TAACAGATGA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TATCTCATAGGCAAAAAGCCTTCCAGACATTAGAA 0 1 256037 CASAVA_Build 11 127378488 1D CAGTTTTTTT G/- TTTTTTATCT 3070 het 104 hom 33 1 29 3 G 1 0 256038 CASAVA_Build 11 127379007 1I TTTAATACCA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 256039 CASAVA_Build 11 127379914 2I AAAAATAGAA --/AG AGATAATTCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AG 1 2 256040 CASAVA_Build 11 127382550 1D ACAACAACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 95 het 38 0 32 7 A 10 9 256041 CASAVA_Build 11 127393521 1I ATTTTCTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 9 256042 CASAVA_Build 11 127398000 4I AAAGATAAAT ----/GATA GATAGTGATA 3070 hom 68 het 28 0 23 5 GATA 1 2 256043 CASAVA_Build 11 127401782 1I CTTTTATGAC -/T GCTCTTTGGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 256044 CASAVA_Build 11 127448044 12D CAACAGCTCA ACTATTCCAGAC/------------ ATACCCCTGC 3070 hom 108 het 40 0 36 7 ACTATTCCAGAC 1 0 256045 CASAVA_Build 11 127451188 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 8 256046 CASAVA_Build 11 127461794 2D CTGTGGCCTC TG/-- TTGGGAATAT 3070 hom 102 het 41 0 33 9 TG 1 0 256047 CASAVA_Build 11 127464722 3I TGGCCAGGCT ---/GAG AATTTTCCAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 GAG 0 1 256048 CASAVA_Build 11 127472236 2D41M1I AGATACATAG ATATATATATATAGAGAGAGATACAGATAGAGATAGAGATATC-/--ATATATATATAGAGAGAGATACAGATAGAGATAGAGATATCT TATTGATTAT 3070 hom 87 het 24 0 30 9 N/A 0 0 256049 CASAVA_Build 11 127484999 3I AACAGAAATC ---/ACA ACAAACTGTC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 ACA 1 2 256050 CASAVA_Build 11 127497155 1I TGATTTGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 337 hom 25 1 16 8 A 13 14 256051 CASAVA_Build 11 127500494 5I TGAGACTGAG -----/CAAAA CAAAACTAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CAAAA 1 2 256052 CASAVA_Build 11 127502924 1I TTCATCATAG -/T GGGGAAGATT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 0 1 256053 CASAVA_Build 11 127521323 2D AAAAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2080 hom 15 7 7 2 A 13 11 256054 CASAVA_Build 11 127538297 5I TTATTAACAT -----/AGAAA AGAAATGTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AGAAA 1 2 256055 CASAVA_Build 11 127543426 1D CCATAAGTAC A/- AATGTAATGA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 3 2 256056 CASAVA_Build 11 127543602 1I TTGTGATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 11 13 T 11 12 256057 CASAVA_Build 11 127562224 2I CTCTGTGCCC --/CA GTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 CA 0 1 256058 CASAVA_Build 11 127564326 2D TATAGTATGC AT/-- ATGTGTATAT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 AT 2 1 256059 CASAVA_Build 11 127564402 4D TGCATATGTG TATA/---- TATACATATA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 TA 4 2 256060 CASAVA_Build 11 127564992 1I TCAGAAGGTG -/T TTGTATGACT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 2 3 256061 CASAVA_Build 11 127573036 3I TTATATGACT ---/ATA ATGTTATATT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 ATA 0 1 256062 CASAVA_Build 11 127575455 1D TCATGCTCAC A/- AGGCTTGAAA 3070 het 3070 ref 57 25 22 10 A 2 1 256063 CASAVA_Build 11 127577926 5I CTATGCATTG -----/AGTGT TGAGGACGGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 AGTGT 0 1 256064 CASAVA_Build 11 127578138 1D ATAAATTTAC A/- GAGAGAAAAA 3070 het 1313 hom 15 4 11 0 A 1 0 256065 CASAVA_Build 11 127579644 1I GTGTGCCTTG -/T TTTTTTCACA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 6 7 256066 CASAVA_Build 11 127579773 5D21M5I CTTTGTATTC TTATATTATAGATTCAATTGCTTCAT-----/-----TTATAGATTCAATTGCTTCATTACAG TATTCATTTT 3070 het 3070 hom 32 14 19 6 N/A 0 0 256067 CASAVA_Build 11 127580327 1D GAATTTTATA C/- TAAAATTGGT 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 C 1 0 256068 CASAVA_Build 11 127584546 3D TTGTCTTCAG ATA/--- ATAATTTCTC 3070 het 3070 hom 27 13 13 2 ATA 2 1 256069 CASAVA_Build 11 127588035 1I ATAGAGTTAA -/T TGCTCTGAAA 3070 het 3070 hom 53 22 29 2 T 1 2 256070 CASAVA_Build 11 127591303 1D TGAGTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 35 3 24 12 A 12 11 256071 CASAVA_Build 11 127592012 4I TATTTAGCTC ----/TTCT TTAAGTTTCA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TTCT 0 1 256072 CASAVA_Build 11 127595402 1D ATGAAGCCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 10 9 256073 CASAVA_Build 11 127607759 5D TACACAGTCC ACAGT/----- ACATTTTCAA 3070 hom 90 het 34 0 29 8 ACAGT 1 0 256074 CASAVA_Build 11 127609291 2D CTGTGCAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 12 10 256075 CASAVA_Build 11 127613804 2D ATAGCCAGCT AA/-- CACCAGAGAC 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 2 0 256076 CASAVA_Build 11 127613997 3D CAGAAAAAAA AAG/--- AGTTAATTGA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AAG 1 0 256077 CASAVA_Build 11 127616256 1D CTTTGTACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 10 9 256078 CASAVA_Build 11 127616692 1I AGAATTCAAA -/T GTTTTCACTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 0 1 256079 CASAVA_Build 11 127620115 4D AAGAAAAAGG AATT/---- ATGGCTTGCC 3070 het 3070 ref 49 25 20 6 AATT 1 0 256080 CASAVA_Build 11 127624458 4D CTGTTTTAGC ACCT/---- GTTTGGCACC 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 ACCT 1 0 256081 CASAVA_Build 11 127635665 1D TTTTTCCTTG A/- AAAGGTCACT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 4 3 256082 CASAVA_Build 11 127679536 1I GCATTAGACA -/T TTTTTTTTTT 1213 het 1213 ref 51 43 3 5 T 10 11 256083 CASAVA_Build 11 127697148 1D TTCTTATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 35 0 29 6 T 12 11 256084 CASAVA_Build 11 127701991 2D CTCACAGACA CT/-- CTCATGCGAG 3070 het 3070 hom 43 22 20 2 CT 2 1 256085 CASAVA_Build 11 127711222 1I GGGTACCAAT -/A AGCCAGACAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 1 2 256086 CASAVA_Build 11 127713133 1D CACTCTAATA G/- GGGGAGTTAA 3070 het 3070 hom 58 25 27 7 G 5 4 256087 CASAVA_Build 11 127715652 1I AGGAGAGATG -/T TGGTCAAAGG 3070 hom 78 het 29 0 27 4 T 1 2 256088 CASAVA_Build 11 127716918 1D AGAAAGCCAG A/- AGAGAAACAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 2 1 256089 CASAVA_Build 11 127735290 4I CACAAAGCCC ----/TTTG TTTGAGTTAG 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 TTTG 1 2 256090 CASAVA_Build 11 127744688 1D AATAGAATTT C/- CCACCCTTGC 3070 het 3070 hom 43 21 19 3 C 3 2 256091 CASAVA_Build 11 127748628 1I CAGTTAGCAA -/T TACGCTAGTG 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 1 2 256092 CASAVA_Build 11 127763967 2D ATAATAAGGG CA/-- CACACACACA 1036 het 1036 ref 41 28 3 11 CA 8 7 256093 CASAVA_Build 11 127764023 1I TCTCCTCCAA -/G AAGCCTTCCC 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 G 0 1 256094 CASAVA_Build 11 127767335 1D CTGCCTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 10 8 T 13 12 256095 CASAVA_Build 11 127777392 2I GCACATGAAA --/CT CTCAGCTAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CT 1 2 256096 CASAVA_Build 11 127781793 1D CTCAATGTGG A/- AGCTGAGAAG 3070 hom 102 het 36 0 34 3 A 2 1 256097 CASAVA_Build 11 127803352 1I CCCCGACAGG -/C CCTGGTGTGT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 C 2 3 256098 CASAVA_Build 11 127812656 1I CTGAATCTAG -/A AAATTTTTTT 3070 het 164 hom 41 1 30 10 A 3 4 256099 CASAVA_Build 11 127841817 1I GGAATGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 9 10 256100 CASAVA_Build 11 127856530 1D GGAGGCTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1739 hom 39 6 26 7 A 16 15 256101 CASAVA_Build 11 127862990 2I CTTACTATCT --/CA CACAGTTATT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 CA 2 3 256102 CASAVA_Build 11 127874533 1D GCACTTGTAG T/- TATTATCTTT 3070 hom 99 het 41 0 34 10 T 2 1 256103 CASAVA_Build 11 127894971 1D AAAGGTCCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 A 10 9 256104 CASAVA_Build 11 127898114 1I CCATGAGCTT -/C CCGTAAGCTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 C 2 3 256105 CASAVA_Build 11 127900135 1D GGCACTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 11 10 256106 CASAVA_Build 11 127917672 1D TTAAGGTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 10 9 256107 CASAVA_Build 11 127927828 1I TGGGATGGAC -/T GAGGTCTTGT 3070 het 3070 ref 60 26 25 9 T 0 1 256108 CASAVA_Build 11 127935218 1D GATGGTCTCC T/- TTTTTTTTTT 992 het 992 ref 45 29 6 10 T 13 12 256109 CASAVA_Build 11 127939174 1I TTTGGTCAGA -/G GGTATTTGGC 3070 hom 123 het 49 0 40 9 G 2 3 256110 CASAVA_Build 11 127951579 1I GCATAAATAC -/A AAGCAATTGT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 2 3 256111 CASAVA_Build 11 127965699 1I GAAAAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 0 1 256112 CASAVA_Build 11 127971562 2D TGTCTAAAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 AG 10 9 256113 CASAVA_Build 11 127987647 1D TAATTTAAAG A/- AAAAAAGATT 3070 het 3059 hom 26 9 14 3 A 7 6 256114 CASAVA_Build 11 127991352 2D GGCTGGGCCA TG/-- TGGGGAGGAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 TG 2 1 256115 CASAVA_Build 11 127992678 2I AGGAGCAGCT --/GG GAGAGAATGT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 G 1 3 256116 CASAVA_Build 11 128001388 1D TGTAAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 8 T 11 10 256117 CASAVA_Build 11 128003717 1D TTATTAACAA C/- AACAAAAAAA 1021 het 1021 ref 36 28 5 3 C 1 0 256118 CASAVA_Build 11 128006993 4D GAATCCAAAA AATT/---- AATTAACTCT 3070 het 3070 ref 32 19 10 7 AATT 2 1 256119 CASAVA_Build 11 128009384 1I AACTACAGTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 0 1 256120 CASAVA_Build 11 128014875 2I ATGCAAATGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 A 12 14 256121 CASAVA_Build 11 128043560 3I CCAAACCTTA ---/GCC CATGCTGGAG 3070 hom 104 het 39 0 33 6 GCC 0 1 256122 CASAVA_Build 11 128073140 1D GTCATTAACT C/- CAGAAGAGTA 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 C 2 1 256123 CASAVA_Build 11 128107116 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 598 het 598 ref 28 6 6 19 AAAG 1 0 256124 CASAVA_Build 11 128108282 1D TTGCAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 39 0 32 7 T 11 10 256125 CASAVA_Build 11 128126464 1D TTTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 27 1 14 12 T 15 14 256126 CASAVA_Build 11 128143427 1D CCCACTCTCT G/- GGGGGGCAGG 3070 hom 49 het 21 0 16 5 G 7 6 256127 CASAVA_Build 11 128143622 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 17 1 11 5 A 15 14 256128 CASAVA_Build 11 128150028 1I AAGAGCAGAT -/A AACAAGGTTG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 2 3 256129 CASAVA_Build 11 128152447 1D TCTGACCTGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 A 9 8 256130 CASAVA_Build 11 128152946 1I GACGCTTGCG -/C CCCCCTGGCC 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 C 5 6 256131 CASAVA_Build 11 128157264 1I ACAAGCCAAA -/G ATTTTCGCCA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 G 0 1 256132 CASAVA_Build 11 128204081 1I TTATTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 901 hom 22 2 14 6 T 12 13 256133 CASAVA_Build 11 128204303 1D TCAAACTTTT G/- GGGTCCAAAT 3070 hom 29 het 12 0 11 1 G 4 3 256134 CASAVA_Build 11 128204383 1I ATTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 1721 hom 8 het 11 0 7 4 T 13 14 256135 CASAVA_Build 11 128261587 3I CAGTGTGCAT ---/AGG AGTCACCTGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AGG 0 1 256136 CASAVA_Build 11 128268805 1D CCAAGGGTGA G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 67 het 40 1 32 7 G 9 8 256137 CASAVA_Build 11 128269289 2D TTCTGCATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 877 hom 39 5 20 14 T 14 12 256138 CASAVA_Build 11 128271297 4D TCAATCTCTT TGTC/---- TGCTGCAGTC 3070 het 3070 hom 52 22 26 5 TGTC 1 0 256139 CASAVA_Build 11 128279861 4I TGGGGGTTCG ----/CTGA CTGACTAATT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 CTGA 1 2 256140 CASAVA_Build 11 128287613 4I TTGTTGTTGT ----/TTTG TTTGTTTATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTTG 1 2 256141 CASAVA_Build 11 128288688 2I TCTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 48 0 33 15 T 10 12 256142 CASAVA_Build 11 128289259 4D GTCAGAATCA GGAC/---- ACAGGCTGCA 1956 het 1956 ref 29 12 9 8 GGAC 1 0 256143 CASAVA_Build 11 128292212 1I ATCACCTTGT -/C CCCTCATTCC 3070 hom 100 het 37 0 34 3 C 3 4 256144 CASAVA_Build 11 128304762 2D CCGAGGGGAG CC/-- CCCCCCTCCC 3070 hom 70 het 28 0 22 8 C 8 6 256145 CASAVA_Build 11 128305633 1I TAGGGAGGCC -/G GGGGTAGGGA 780 het 3 hom 5 0 3 2 G 4 5 256146 CASAVA_Build 11 128308580 1I TCTGCAATGT -/C CCCCCCTACA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 C 6 7 256147 CASAVA_Build 11 128321293 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 26 0 22 5 A 11 10 256148 CASAVA_Build 11 128334461 1I AGGCGGCAGT -/G ACAAGGCAGA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 0 1 256149 CASAVA_Build 11 128347492 3D ACAACACACC CTG/--- CTGAAAAGTG 3070 het 3070 ref 42 18 15 11 CTG 2 1 256150 CASAVA_Build 11 128358501 1I TCGCAAGGAC -/A AAAAAACCAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 6 7 256151 CASAVA_Build 11 128359129 1D ATCCTGTAAT A/- AAAAACATAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 6 5 256152 CASAVA_Build 11 128363093 3D TTAATTAGTT AAG/--- AAGGAGTGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AAG 2 1 256153 CASAVA_Build 11 128371401 5D GTAATTAAAA TTACT/----- TTAATTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 6 TTACT 1 0 256154 CASAVA_Build 11 128373060 1D ACTCTGACAG T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 8 7 256155 CASAVA_Build 11 128400922 2D ATGTTATGTA AT/-- ATATATGTTA 3035 hom 21 het 9 0 8 1 AT 4 3 256156 CASAVA_Build 11 128416598 1D CAGGTTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 32 4 17 11 A 17 16 256157 CASAVA_Build 11 128419806 1I AATCTGCAAC -/T TGCCTGAGAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 1 2 256158 CASAVA_Build 11 128423585 1D AAAGTATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 11 10 256159 CASAVA_Build 11 128429171 1D CTCTTGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 30 1 22 7 A 12 11 256160 CASAVA_Build 11 128439244 1I AAAGAGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 11 12 256161 CASAVA_Build 11 128449380 2I TGTGTTTTAC --/AT ATATATATGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 4 5 256162 CASAVA_Build 11 128450720 5D GAAAATCAAT AAGAA/----- AATAGTTGAC 3070 hom 96 het 33 0 33 2 AAGAA 1 0 256163 CASAVA_Build 11 128478530 2D TGTCAAACAC AT/-- ATAACCATAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AT 2 1 256164 CASAVA_Build 11 128502875 3D11M1I TCATAAAAAT AACAAGTTTTCCTA-/---AAGTTTTCCTAT TTTTCATGTT 3070 hom 102 het 33 0 35 1 N/A 0 0 256165 CASAVA_Build 11 128510872 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 9 10 256166 CASAVA_Build 11 128529995 1D AATAACATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 9 8 256167 CASAVA_Build 11 128578357 1I TGACGACCCG -/T TTTTTGCCTT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 T 5 6 256168 CASAVA_Build 11 128584774 1D CAAATTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 24 3 17 6 A 13 12 256169 CASAVA_Build 11 128588968 1D AGAATAAATA G/- TTTTGTAGGG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 1 0 256170 CASAVA_Build 11 128598477 1I TTGAAGAGTG -/A CTTTTATTTG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 0 1 256171 CASAVA_Build 11 128600679 4I AACTTTACAG ----/AATT ATTACAGAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AATT 0 1 256172 CASAVA_Build 11 128602580 1D TTGACAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 26 10 A 13 12 256173 CASAVA_Build 11 128605332 3I AGGTTGAGAA ---/AAC AAACCTAAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AAC 0 1 256174 CASAVA_Build 11 128605651 1I42M1I TCTCACAATA -TTTTGTTAAATATGGAAAAAGCAAACAAGTTTAGTATAGGCA-/TTTTTGTTAAATATGGAAAAAGCAAACAAGTTTAGTATAGGCAT TTGTGTCTTC 3070 hom 96 het 28 0 33 5 N/A 0 0 256175 CASAVA_Build 11 128613950 1D ACAATAATAA T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 8 7 256176 CASAVA_Build 11 128622107 1I CCACAGAGTA -/C CCTCTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 2 3 256177 CASAVA_Build 11 128622346 1I TGTTTACATG -/C CTAAAAGTAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 2 256178 CASAVA_Build 11 128637889 1D GCAACACACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 519 hom 39 2 31 6 A 10 9 256179 CASAVA_Build 11 128638659 1I GGCTACTGGC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 8 9 256180 CASAVA_Build 11 128649124 1D AGCCGGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 29 1 22 6 A 13 12 256181 CASAVA_Build 11 128663127 1D AGTGTCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 26 2 16 8 T 15 14 256182 CASAVA_Build 11 128665386 4D GGGTAAGATG TAAA/---- TAAACCACGC 3070 hom 90 het 34 0 27 9 TAAA 2 1 256183 CASAVA_Build 11 128667112 2D CAAAGCAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 37 1 29 9 T 14 12 256184 CASAVA_Build 11 128668395 1D AGAGTCACTA G/- GTAATTTTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 G 2 1 256185 CASAVA_Build 11 128673384 4I TTCAAATATT ----/TTAG TTAGGTGATA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 TTAG 1 2 256186 CASAVA_Build 11 128679731 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 5 A 11 10 256187 CASAVA_Build 11 128686903 1I AAAAAAAAAA -/G AGATGCTAGT 2493 het 1441 hom 19 8 8 3 G 0 1 256188 CASAVA_Build 11 128713981 1I TCTGCATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 18 0 10 8 T 11 12 256189 CASAVA_Build 11 128725002 14I CTTTGACATG --------------/CTCCAAAGGTAACC CTTTAGTTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 CTCCAAAGGTAACC 0 1 256190 CASAVA_Build 11 128733195 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 14 13 256191 CASAVA_Build 11 128734571 1I CTCCCCACCA -/C CCCCCCCAAC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 7 8 256192 CASAVA_Build 11 128737201 2I ATACAGTAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 21 0 15 7 T 16 18 256193 CASAVA_Build 11 128743911 1D CTCTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1111 hom 34 3 15 16 T 15 14 256194 CASAVA_Build 11 128764664 1I TGTTACTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 T 11 12 256195 CASAVA_Build 11 128764834 1I TTTTTTTTTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 413 hom 30 2 21 7 A 8 9 256196 CASAVA_Build 11 128768626 1D TAGGATATCC T/- TTTTTTTTTT 1396 het 1396 ref 34 20 4 10 T 13 12 256197 CASAVA_Build 11 128769620 1I TTTTAGTGGC -/T TTTTTTTTGG 2779 het 2311 hom 19 7 8 4 T 8 9 256198 CASAVA_Build 11 128777430 1I TCCCCATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 59 21 23 15 A 10 11 256199 CASAVA_Build 11 128797489 2I CTGCCTCCTC --/CA CAACTCCTCG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 CA 1 2 256200 CASAVA_Build 11 128799668 5D CTGTCACCAG GCACT/----- GTACTCTCTA 3070 het 3070 ref 41 23 14 8 GCACT 1 0 256201 CASAVA_Build 11 128805395 3I ATTCAGAAAA ---/AAT AATGTGACAT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 AAT 1 2 256202 CASAVA_Build 11 128807090 6D TATTATTTTA TTTATT/------ TTTATTTTTA 2867 het 2112 hom 15 5 7 3 TTTATT 4 3 256203 CASAVA_Build 11 128807639 3D CCCCTTTCCC AGG/--- AGAACACCCA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 AGG 1 0 256204 CASAVA_Build 11 128809223 1D AAAGGCAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 A 10 9 256205 CASAVA_Build 11 128809363 1I AGTTTATATG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 10 256206 CASAVA_Build 11 128815018 3I AGTCAGAGAA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 T 10 13 256207 CASAVA_Build 11 128816743 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGGTCTCA 3048 het 1621 hom 16 4 8 4 G 5 6 256208 CASAVA_Build 11 128817742 8I ATGGGCATCT --------/GTTTCTCA GTTTCTCAGC 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 GTTTCTCA 1 2 256209 CASAVA_Build 11 128826635 1I CCGTCTCCCT -/C CCCTCCCACA 3070 hom 109 het 43 0 35 8 C 3 4 256210 CASAVA_Build 11 128852843 5I TTTTTAAATG -----/TTTAC TTTATTTGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTTAC 0 1 256211 CASAVA_Build 11 128861644 1I TATTTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 T 10 11 256212 CASAVA_Build 11 128879782 10D AAGATCAGCA ATCCACCACT/---------- ATCCACCACA 3070 het 3070 hom 31 14 13 5 ATCCACCACT 1 0 256213 CASAVA_Build 11 128889306 1D TTTTAAGCCC T/- GCGTGCATTA 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 T 1 0 256214 CASAVA_Build 11 128898085 1I AAAATATTTG -/A AAACTACATA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 3 4 256215 CASAVA_Build 11 128905528 1I AAGAGCTGGA -/G GGGGGGAGAG 3070 hom 55 het 22 0 16 6 G 6 7 256216 CASAVA_Build 11 128910413 1D CAAAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 44 1 40 3 A 11 10 256217 CASAVA_Build 11 128917740 8I TGTAAATTCA --------/CTTAGGGT AATACCCTCC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 CTTAGGGT 0 1 256218 CASAVA_Build 11 128920091 1D CAGAGTGGTA G/- AAGAGGACAG 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 G 1 0 256219 CASAVA_Build 11 128940063 1D ACACAGCCAT A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 51 32 14 6 A 7 6 256220 CASAVA_Build 11 128940257 1I GGCAGGGGTT -/A AAAAATTCCC 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 A 5 6 256221 CASAVA_Build 11 128940601 1D ACTGAAAGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 9 8 256222 CASAVA_Build 11 128947379 1I GCTCCACGTC -/T TTTTTTTTTT 1782 het 1782 ref 28 7 8 13 T 15 16 256223 CASAVA_Build 11 128960917 1D TATTTTTTGT G/- TTTTTTTTTT 1905 het 1732 hom 14 7 5 2 G 1 0 256224 CASAVA_Build 11 128995217 1D CAAGGAAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 10 9 256225 CASAVA_Build 11 129016558 1I TAACCCTTGA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 C 8 9 256226 CASAVA_Build 11 129070153 2D CACACACACA CC/-- CCCAAGAATG 3070 hom 77 het 30 0 24 6 C 5 3 256227 CASAVA_Build 11 129073908 1I TTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1948 hom 26 7 10 9 T 11 12 256228 CASAVA_Build 11 129079253 2D AAGTACACAC AG/-- GCTGTTTTCC 3070 het 3070 hom 24 7 10 7 AG 1 0 256229 CASAVA_Build 11 129082772 5I TGTTTTGTTC -----/TGTTT TGTTTTGTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 TGTTT 2 3 256230 CASAVA_Build 11 129084658 1D AAGAAGGAAA C/- AGTTATTATC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 1 0 256231 CASAVA_Build 11 129094695 13D ACCCTGCCAC CCTATCCTTTCCG/------------- CCTCTGTCGT 3070 het 3070 ref 43 21 19 7 CCTATCCTTTCCG 1 0 256232 CASAVA_Build 11 129096980 1D GACAGCAGAG C/- AGAAAGGCGT 3070 het 3070 hom 31 16 12 5 C 1 0 256233 CASAVA_Build 11 129097691 2D TGGATTACAG AT/-- ATTGGCTATG 3070 het 3070 hom 49 19 27 4 AT 2 1 256234 CASAVA_Build 11 129099721 1D TCCTCATATG A/- TTTTTCCCCA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 1 0 256235 CASAVA_Build 11 129100528 1D TTATTTTTTT C/- CATAGGTTAG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 C 2 1 256236 CASAVA_Build 11 129100971 1I TCCACTGTCA -/G TCCAACTGAC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 G 0 1 256237 CASAVA_Build 11 129102150 1I GGTAAGTGGT -/A AAAGTGTGGA 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 A 3 4 256238 CASAVA_Build 11 129105743 3I TGAGGAGCTC ---/AAG AAGAAGGTGA 3070 het 3070 ref 50 22 17 11 AAG 2 3 256239 CASAVA_Build 11 129108810 12D AGGTTTGCAA ACCCAGTCTGAC/------------ ACCCAATGAT 3070 het 3070 ref 50 25 23 8 ACCCAGTCTGAC 1 0 256240 CASAVA_Build 11 129109227 1I TTCCCCCCCC -/T GCTGCCTTCA 2811 het 1005 hom 22 4 13 5 T 0 1 256241 CASAVA_Build 11 129117532 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1182 hom 29 het 23 0 6 17 T 19 18 256242 CASAVA_Build 11 129118061 1I AGTACTCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 365 hom 50 1 46 3 T 9 10 256243 CASAVA_Build 11 129119851 1D ACTAATAATA C/- AAAAACTAGC 1412 het 1345 hom 6 3 3 0 C 1 0 256244 CASAVA_Build 11 129124526 1D AGGACAGGGG A/- AGACTTTATT 3070 het 3070 hom 44 21 20 4 A 2 1 256245 CASAVA_Build 11 129128251 1D TCTAAAAAAA T/- ATATATATAT 1955 het 352 hom 9 1 5 3 T 1 0 256246 CASAVA_Build 11 129142569 1I CCAGACATGC -/A AAAAAAAAAA 2943 het 2943 ref 39 13 12 14 A 15 16 256247 CASAVA_Build 11 129155402 1D CTGGAATATT G/- TTCCAGATTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 G 1 0 256248 CASAVA_Build 11 129157984 6I AACTTAAAGT ------/ATAATA ATAATAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 ATA 2 4 256249 CASAVA_Build 11 129160670 1D CCCCATGGAG A/- AAAAAAAAAA 1300 het 1300 ref 35 20 4 11 A 12 11 256250 CASAVA_Build 11 129161895 4I TACGTAGGTC ----/TTCT TTAAGTTCTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTCT 0 1 256251 CASAVA_Build 11 129162010 6D CCAAATGATT TTCTAA/------ TTCTATCATT 3070 het 3070 ref 26 13 11 4 TTCTAA 1 0 256252 CASAVA_Build 11 129176047 1I AATTTAAACT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 8 9 256253 CASAVA_Build 11 129187970 2D CCCGTCTCAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 83 het 34 0 27 7 AC 9 8 256254 CASAVA_Build 11 129202642 1I GGCGCAGTGG -/T CTCACACCTA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 0 1 256255 CASAVA_Build 11 129203130 4D CATACATGCC GTCT/---- GTCATTAACC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 GTCT 1 0 256256 CASAVA_Build 11 129207735 1D ATAGTTGTAA T/- TTTTTTATAA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 T 7 6 256257 CASAVA_Build 11 129208355 1D8M1D AAAAAATAAA CAGAAAAATA/-AAAAAAAT- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 16 8 N/A 0 0 256258 CASAVA_Build 11 129209608 2D GAAAGAAAAA AC/-- AGAGCTGTAG 3070 hom 33 het 15 0 12 4 AC 1 0 256259 CASAVA_Build 11 129209919 3D CCATCTCCAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 21 0 13 9 A 17 14 256260 CASAVA_Build 11 129211398 3I TCACAGCTGG ---/AGA AGAATTTTGC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AGA 1 2 256261 CASAVA_Build 11 129216643 1D CCCACACAGA G/- GGACTGACAG 3070 hom 58 het 23 0 19 4 G 3 2 256262 CASAVA_Build 11 129223612 6D ACCGTGGAAA GAGAGG/------ GAGAGGGAGA 2974 het 2974 ref 26 15 9 4 GAGAGG 4 3 256263 CASAVA_Build 11 129236156 4D ACATTTGAGG TTTC/---- TTTAAGTGTA 3070 het 3070 ref 50 24 19 11 TTTC 1 0 256264 CASAVA_Build 11 129237203 1I AATTTCTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 40 1 25 14 T 13 14 256265 CASAVA_Build 11 129259314 1I CTGGTCACTT -/G TCAAAAGTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 0 1 256266 CASAVA_Build 11 129267459 6D TCCAATTCCA TCCAGT/------ TTGCTGCAAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 4 TCCAGT 1 0 256267 CASAVA_Build 11 129282095 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 20 1 14 5 A 13 14 256268 CASAVA_Build 11 129283519 1I AAAGCTGCAG -/T GAGCCACGAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 256269 CASAVA_Build 11 129288165 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2756 hom 26 11 12 4 A 12 11 256270 CASAVA_Build 11 129291027 4D GCTTAAAGCA AACT/---- AACAATTTCA 3070 het 3070 ref 31 16 12 6 AACT 1 0 256271 CASAVA_Build 11 129303035 1D GTTCTTCTGC T/- TTCCTGAGTT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 T 3 2 256272 CASAVA_Build 11 129327042 1D AACAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 1049 het 1049 ref 29 23 4 3 A 11 10 256273 CASAVA_Build 11 129404179 1D GATCATCATG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 T 8 7 256274 CASAVA_Build 11 129412131 1I CCGTCTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2203 hom 20 6 9 5 A 13 14 256275 CASAVA_Build 11 129429948 1I ATAACATAGC -/T GAGTATAGAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 0 1 256276 CASAVA_Build 11 129461632 2D TGATGAATTC CA/-- GTTTATCTAT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 CA 1 0 256277 CASAVA_Build 11 129468856 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 1824 het 1824 ref 28 18 4 6 T 11 12 256278 CASAVA_Build 11 129470216 4I ATGTTATAAT ----/AATG GAGATAGACC 3070 hom 160 het 57 0 54 3 AATG 0 1 256279 CASAVA_Build 11 129521022 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 1918 het 579 hom 11 2 5 4 T 9 10 256280 CASAVA_Build 11 129568582 1I GGTGTTGCTC -/T TTTTTTTTTT 2300 het 1490 hom 26 6 11 9 T 13 14 256281 CASAVA_Build 11 129647336 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 25 16 4 5 A 11 12 256282 CASAVA_Build 11 129687094 2D TAAAACCCAT GA/-- GAGTCTGAAG 3070 het 3070 ref 40 23 11 8 GA 2 1 256283 CASAVA_Build 11 129689188 1I GGTGGCAACA -/C CTCCGGCCGC 1230 hom 33 het 12 0 8 4 C 1 2 256284 CASAVA_Build 11 129707808 1I ATAAGCCCAA -/T TATGTCTCTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 1 2 256285 CASAVA_Build 11 129709210 18D CCACTGACAG TGTATGAGGTTTCCCCTT/------------------ TTCTCTACAT 3070 het 3070 ref 29 22 12 4 TGTATGAGGTTTCCCCTT 1 0 256286 CASAVA_Build 11 129717215 1I TGCTGAGGTT -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 6 7 256287 CASAVA_Build 11 129740749 7D TTGAGGTTTA TTGTTTT/------- TTGTTTTTTT 2005 het 1752 hom 17 7 6 4 TTGTTTT 2 1 256288 CASAVA_Build 11 129743293 8D CAGTCTCTTA TCCATGAC/-------- CTCACCATGG 3070 het 3070 hom 38 16 20 4 TCCATGAC 1 0 256289 CASAVA_Build 11 129750037 1D AGTTCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 1700 het 1700 ref 39 28 5 6 T 15 14 256290 CASAVA_Build 11 129763036 1I GCCTGCCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 45 het 18 0 14 4 T 7 8 256291 CASAVA_Build 11 129781743 3D CGGCTCCTAG TAT/--- TTGATGAATA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TAT 1 0 256292 CASAVA_Build 11 129786864 9D AATGACTGTG TGGCCTGCA/--------- TGGCTTTGTG 3070 het 3070 ref 53 27 24 7 TGGCCTGCA 1 0 256293 CASAVA_Build 11 129794008 3I GTCCTCATGA ---/CCT CCTCCTCATC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 CCT 2 3 256294 CASAVA_Build 11 129806990 4D TAAAAAAATT AGAA/---- AGAATATTAA 3070 het 3070 ref 21 12 7 3 AGAA 2 1 256295 CASAVA_Build 11 129808061 10D TGCCCACCTC AGTCTCCCAA/---------- AGTGCTGGGG 2431 het 2430 ref 18 8 7 11 AGTCTCCCAA 1 0 256296 CASAVA_Build 11 129820137 11D AGATGGCTTA GACCCCCAGTC/----------- GTCCTCTGGG 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 GACCCCCAGTC 1 0 256297 CASAVA_Build 11 129826279 1D TGCCATGCTC T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 8 7 256298 CASAVA_Build 11 129827246 3I CTGGGGGAAG ---/GTA GTACAGTATT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 GTA 1 2 256299 CASAVA_Build 11 129840979 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1947 het 1865 hom 17 6 6 5 T 15 14 256300 CASAVA_Build 11 129865460 2D AAAGTAATTA AT/-- ATACAAAAAG 3070 hom 85 het 32 0 29 3 AT 2 1 256301 CASAVA_Build 11 129867508 1I CTCTTTTGGA -/T TTTTCTACAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 4 5 256302 CASAVA_Build 11 129870752 1D GAAAAAAATT A/- AAATTTTTTT 2278 het 2278 ref 32 12 13 7 A 4 3 256303 CASAVA_Build 11 129876728 1I CTGTTTCTAC -/A AAAAAAATTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 7 8 256304 CASAVA_Build 11 129876960 1D ATTCTGGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 7 T 11 10 256305 CASAVA_Build 11 129880715 4D TTGTTAGTAC TGAG/---- TATTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 7 TGAG 1 0 256306 CASAVA_Build 11 129886511 4D CTATCTATCC ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 hom 74 het 31 0 24 9 ATCT 5 4 256307 CASAVA_Build 11 129900245 3I GTTGTGAATT ---/AAA AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 9 12 256308 CASAVA_Build 11 129904935 1I ATGCTTTTTT -/G GGGGGGGGGC 3070 hom 51 het 21 0 17 4 G 9 10 256309 CASAVA_Build 11 129906492 1I AGCAGACCTT -/A ACTCTGATTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 1 2 256310 CASAVA_Build 11 129925853 3I TGAGGTGTAT ---/AAG AAGGAGAGAG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 AAG 1 2 256311 CASAVA_Build 11 129932566 1I AATCCTAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 16 7 A 11 12 256312 CASAVA_Build 11 129935997 1I TAATTGTTTA -/T TGTTGATCTC 3070 hom 86 het 33 0 27 6 T 1 2 256313 CASAVA_Build 11 129938301 1I TTAATTAATT -/A AAAATTCCAC 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 4 5 256314 CASAVA_Build 11 129959382 4I GCTGAAAGGC ----/AGAG TCATGCTCCC 3070 hom 156 het 58 0 51 7 AG 0 2 256315 CASAVA_Build 11 129994023 4D TACGCAAACA TACC/---- TACCTCTCCA 3070 hom 102 het 39 0 33 7 TACC 2 1 256316 CASAVA_Build 11 129999205 2I AATGTGTGTA --/TG TGTGTGCGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TG 3 4 256317 CASAVA_Build 11 130005403 1I ATTTATTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 T 9 10 256318 CASAVA_Build 11 130010935 2I TTCATCTCAG --/AA AAAAAAAAAA 2804 het 263 hom 26 1 9 16 A 14 16 256319 CASAVA_Build 11 130010998 1I AGTTAAAAAA -/C AAAACAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 0 1 256320 CASAVA_Build 11 130016139 4D TTTCTTGCGG TTGT/---- TTGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TTGT 1 0 256321 CASAVA_Build 11 130016423 12D GGTTTCACCG TGTTAGCCAGGA/------------ TGGTCTCGAT 1392 hom 10 het 4 0 4 0 TGTTAGCCAGGA 1 0 256322 CASAVA_Build 11 130017217 1I ATTTTCTGGC -/A AAAAAGAAAG 2884 het 2884 ref 31 17 8 6 A 5 6 256323 CASAVA_Build 11 130026621 10D CATGTGTGCG CACACACACA/---------- CACACACACA 3070 het 3070 ref 44 23 13 9 CA 11 6 256324 CASAVA_Build 11 130108182 1I AAGCAAATAG -/A AATCTCTCAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 2 3 256325 CASAVA_Build 11 130136389 1I AACAGCTGTG -/A TTAGTTGTCA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 0 1 256326 CASAVA_Build 11 130138210 1I TTAAACAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 8 9 256327 CASAVA_Build 11 130154073 1I TGAATATATG -/A AAAAACCATT 3070 hom 156 het 56 0 52 4 A 5 6 256328 CASAVA_Build 11 130156181 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAATGCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 7 6 256329 CASAVA_Build 11 130157808 1D GAGAAAGTGG A/- AAAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 A 6 5 256330 CASAVA_Build 11 130170808 2I GCAATAAGAC --/AA AAAAAAAAAG 2537 het 2537 ref 30 18 7 5 A 9 11 256331 CASAVA_Build 11 130179073 1D AAGTAAGCTG T/- TTTTATTGGT 3070 het 3070 ref 32 18 8 8 T 5 4 256332 CASAVA_Build 11 130192663 1I TTGTCCACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 A 9 10 256333 CASAVA_Build 11 130245015 1D GCTGATATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 11 10 256334 CASAVA_Build 11 130245931 1D ACATATAGTT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 3070 ref 30 14 11 6 G 10 9 256335 CASAVA_Build 11 130251707 4D CATGAGGGGA AGGT/---- AGGTATGGGG 3070 het 3070 ref 60 33 24 5 AGGT 2 1 256336 CASAVA_Build 11 130264638 3I TGCAAAACTT ---/GCC TGAGTGATAC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 GCC 0 1 256337 CASAVA_Build 11 130266473 1I GCATTCCTCT -/G GGAAGGGAAG 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 G 2 3 256338 CASAVA_Build 11 130269220 1D CAGCACTGAC A/- ATCTCCATCT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 2 1 256339 CASAVA_Build 11 130272043 2I TAGAGTTCCA --/CT CAGAAAGCGC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 CT 0 1 256340 CASAVA_Build 11 130273258 1I ACTTACTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 11 13 T 12 13 256341 CASAVA_Build 11 130280466 1D GAAAAAAGAC A/- ATTTCCATCT 3070 het 3070 ref 44 20 21 3 A 2 1 256342 CASAVA_Build 11 130283815 1D TCTACTCATA C/- AAGACCAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 C 1 0 256343 CASAVA_Build 11 130285480 5D TCACATCTTC CAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 2117 hom 23 8 13 5 CAAAA 1 0 256344 CASAVA_Build 11 130286341 1D AGAGTTGTCA T/- AACAGCACAC 3070 hom 38 het 23 0 13 10 T 1 0 256345 CASAVA_Build 11 130288701 2D ATTCAAGTGT GG/-- AAGGCAAGTA 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 G 2 0 256346 CASAVA_Build 11 130289000 6I GTTCTATTTG ------/AAATAT AAAATAAATA 1293 het 1293 ref 27 13 4 10 AAATAT 0 1 256347 CASAVA_Build 11 130289028 1D AATCCAGGGA C/- CCCCTCCTTA 1702 het 1702 ref 29 19 6 5 C 5 4 256348 CASAVA_Build 11 130327106 1D ACAAAGAACT G/- TGAGAAATTT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 G 1 0 256349 CASAVA_Build 11 130339269 1D GTGATTTAAT A/- ACACTATTTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 2 1 256350 CASAVA_Build 11 130358347 1D GGGTTACAAT A/- AAAATCATAG 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 5 4 256351 CASAVA_Build 11 130389887 1I ATTAAAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 10 11 256352 CASAVA_Build 11 130391821 1D TTTGTCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 T 13 12 256353 CASAVA_Build 11 130417790 1I GAATTTACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 9 10 256354 CASAVA_Build 11 130426769 19D ACTGCAGTGA GTGCCCAAGAATCCACAAG/------------------- GTGCCCCGAG 3070 het 3070 ref 48 24 25 3 GTGCCCAAGAATCCACAAG 1 0 256355 CASAVA_Build 11 130427746 4D CATCTATCTT TATC/---- TATCTATGTA 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 TATC 2 1 256356 CASAVA_Build 11 130427906 6I CAGACCTCTT ------/CTACAG CCACACCTGG 3070 hom 93 het 36 0 28 8 CTACAG 0 1 256357 CASAVA_Build 11 130429001 2D TGATAGGGTT CA/-- CACACTGCTA 3070 hom 111 het 42 0 37 7 CA 3 2 256358 CASAVA_Build 11 130431560 1I GTGCAGGGCG -/C CTGTATAGGG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 C 1 2 256359 CASAVA_Build 11 130432696 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 37 1 30 6 A 11 10 256360 CASAVA_Build 11 130433682 1I GACCGCATGA -/C CTTTCCAGTG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 1 2 256361 CASAVA_Build 11 130434283 2I TTCTATTCAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 12 14 256362 CASAVA_Build 11 130452395 1I TGTTCACTGG -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 11 het 32 1 20 11 C 8 9 256363 CASAVA_Build 11 130455486 6D TAAAATTTTA TTATTC/------ TAATTTTGCA 3070 het 3070 ref 30 15 14 3 TTATTC 1 0 256364 CASAVA_Build 11 130455797 1I ATGTTAATCA -/G GGGGCTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 4 5 256365 CASAVA_Build 11 130458680 1D CCAATTGTTC T/- TTTTTTTTTT 2878 hom 15 het 6 0 6 0 T 11 10 256366 CASAVA_Build 11 130463544 1D TACTGTTTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 T 9 8 256367 CASAVA_Build 11 130465765 1I GTATGGAAAT -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 256368 CASAVA_Build 11 130477383 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 20 19 8 T 12 11 256369 CASAVA_Build 11 130479573 1D TTTTCTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2791 hom 29 10 15 4 A 12 11 256370 CASAVA_Build 11 130481396 2I TGTGCAGAGC --/AG GCGGTCCATG 3070 hom 111 het 38 0 38 0 AG 0 1 256371 CASAVA_Build 11 130481780 1D GTAGTGGAAG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 A 7 6 256372 CASAVA_Build 11 130483607 1D GTATTTCTTT A/- AAGCTGCAAA 3070 het 3070 hom 56 25 23 9 A 3 2 256373 CASAVA_Build 11 130490894 1D AAACAAATGG A/- AAAACATTCT 2802 het 2451 hom 12 5 6 1 A 5 4 256374 CASAVA_Build 11 130492348 1I CAGGAATGGG -/A ACATCACGTA 2400 hom 15 het 7 0 6 1 A 1 2 256375 CASAVA_Build 11 130514992 6D TTATTCTACC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 1795 hom 30 8 13 9 A 19 13 256376 CASAVA_Build 11 130526619 4D AATCAAAAAC AAAT/---- AAATAAAACA 3070 het 3070 ref 45 27 15 9 AAAT 2 1 256377 CASAVA_Build 11 130539519 2I AATGGAGCTC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 AG 5 6 256378 CASAVA_Build 11 130544801 7D AACAACCTTG TTAATAA/------- TTACAAAGTT 3070 het 3070 ref 45 32 12 4 TTAATAA 1 0 256379 CASAVA_Build 11 130546346 2D TGTAAATGAC AG/-- GGGGAATTTC 3070 het 3070 ref 42 20 17 8 AG 1 0 256380 CASAVA_Build 11 130548422 2D TTTTTTTTTT AA/-- TTATACTTTA 153 het 13 hom 6 0 3 4 A 2 0 256381 CASAVA_Build 11 130551427 2D TTTGATATGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 GA 6 5 256382 CASAVA_Build 11 130552528 1D TACTTAGAGC A/- AATACATATT 3070 hom 114 het 46 0 36 10 A 3 2 256383 CASAVA_Build 11 130568680 1I CTTTCTCTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 T 9 10 256384 CASAVA_Build 11 130574757 1I TTTGTTCATG -/T TTATCACGTG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 2 3 256385 CASAVA_Build 11 130577573 1D GGATTTCCTA C/- TTTTTAAAGG 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 C 1 0 256386 CASAVA_Build 11 130590685 1D TGCTGCACAC T/- CCCCGTAGCT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 1 0 256387 CASAVA_Build 11 130593397 1I AGGAAAATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 9 10 256388 CASAVA_Build 11 130593981 1I TCAGAGTGGG -/A ATATTGAAAT 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 A 1 2 256389 CASAVA_Build 11 130597081 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAAGTCA 2419 het 950 hom 10 4 6 0 A 6 7 256390 CASAVA_Build 11 130598474 2D AATTGAAAAC AT/-- GTGGTTTCCT 3070 het 3070 hom 35 15 19 2 AT 1 0 256391 CASAVA_Build 11 130609975 1D AGTGTGCATG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 A 8 7 256392 CASAVA_Build 11 130611388 1I ACGCATTGGA -/G GGGCCACACG 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 G 3 4 256393 CASAVA_Build 11 130615809 2D TCTTGCAGAG CC/-- CCCATTTTCT 3070 het 3070 ref 36 23 10 5 C 5 3 256394 CASAVA_Build 11 130631649 1I TGTGATTTTT -/G AGGGCCTCTA 2197 hom 12 het 7 0 5 2 G 0 1 256395 CASAVA_Build 11 130635644 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTGG 2953 het 2953 ref 28 14 9 5 T 9 8 256396 CASAVA_Build 11 130638210 1I AGTTCTAAAA -/C TTTTTGGTCT 3070 het 3070 ref 46 26 13 7 C 0 1 256397 CASAVA_Build 11 130642338 1D AAAGCCTATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 8 A 10 9 256398 CASAVA_Build 11 130643729 4D TTCTTGTAAA TTTG/---- TTTAAGTTCC 1433 het 1433 ref 15 10 3 2 TTTG 1 0 256399 CASAVA_Build 11 130650395 3I ACGTATTATC ---/ATT ATTATTATTG 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 ATT 3 4 256400 CASAVA_Build 11 130659654 1D TAACTCCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 11 9 A 11 10 256401 CASAVA_Build 11 130663312 1D TGAGAGGAAA C/- CCCTTAAGGG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 C 4 3 256402 CASAVA_Build 11 130665742 1I AAATTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 749 hom 36 3 23 10 T 10 11 256403 CASAVA_Build 11 130706264 1D CCAACCAGCA T/- TTAGCAGAGA 3070 hom 120 het 45 0 40 6 T 3 2 256404 CASAVA_Build 11 130711347 1I CTGTTCACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 16 13 14 A 14 15 256405 CASAVA_Build 11 130715507 4D GTAAACAATT CAGA/---- CAACAGAGAC 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 CAGA 1 0 256406 CASAVA_Build 11 130732043 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2621 het 996 hom 16 6 9 1 T 11 10 256407 CASAVA_Build 11 130735894 2I GCGGAGACAC --/AT ATACTGGGGG 3070 het 3070 hom 88 26 49 14 AT 1 2 256408 CASAVA_Build 11 130736011 1I TTTGTTAATA -/T CTTTTATCAT 3070 het 3070 ref 49 29 17 3 T 0 1 256409 CASAVA_Build 11 130762979 1D AATTAGCCTT C/- CTGGGGACCC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 C 2 1 256410 CASAVA_Build 11 130771939 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 12 13 256411 CASAVA_Build 11 130777502 1D ACTAAGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1300 hom 40 3 26 11 A 13 12 256412 CASAVA_Build 11 130780536 1D CTTATTGCCC A/- AACCAAAACC 3070 hom 118 het 45 0 38 7 A 3 2 256413 CASAVA_Build 11 130785707 1I TCTTCTTCCT -/G GGACACTTCC 3070 hom 89 het 37 0 30 7 G 2 3 256414 CASAVA_Build 11 130787910 4I CTTACGGGGC ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 hom 91 het 46 0 29 17 GT 7 9 256415 CASAVA_Build 11 130797314 1D ATCTGAGAAC A/- GTCACATTTG 3070 hom 111 het 46 0 37 10 A 1 0 256416 CASAVA_Build 11 130800395 1D GTTTCTGTGC A/- ATCTCTGGCC 3070 hom 54 het 22 0 18 6 A 2 1 256417 CASAVA_Build 11 130822140 3I CAAAGCTGGA ---/AAT AATTATTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 AAT 1 2 256418 CASAVA_Build 11 130828919 1D TGTGATAACT C/- CAACATCCAC 3070 het 3070 ref 48 20 17 13 C 2 1 256419 CASAVA_Build 11 130829289 1I TTACAGACTA -/T TGTTATAATC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 1 2 256420 CASAVA_Build 11 130836809 1D TTTTTACCAC A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 7 6 256421 CASAVA_Build 11 130866237 4D GTTTTTCAAG ACCA/---- ACATCCTAAG 3070 het 3070 ref 58 29 27 2 ACCA 1 0 256422 CASAVA_Build 11 130867512 6I GTTATCTTCA ------/GTTTCT AAGACATCTT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 GTTTCT 0 1 256423 CASAVA_Build 11 130873230 1I CCTTGCTGAT -/A AAACTTTTGC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 3 4 256424 CASAVA_Build 11 130878803 1I ATTGTTTCTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 8 9 256425 CASAVA_Build 11 130897458 1D GCAGAACAAC A/- AGAAAAAAAA 3070 het 247 hom 40 1 30 10 A 2 1 256426 CASAVA_Build 11 130927922 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 24 2 18 4 A 14 15 256427 CASAVA_Build 11 130939549 15D GTGGGTAGGG GGAGAGAGAGAGGGA/--------------- GGGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 35 23 16 2 GGAGAGAGAGAGGGA 1 0 256428 CASAVA_Build 11 130950298 1D AGCATACAAA G/- GCTCTGAGAA 3070 hom 99 het 37 0 32 5 G 2 1 256429 CASAVA_Build 11 130957662 2I GCTTTGTTAA --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 23 0 16 7 T 8 10 256430 CASAVA_Build 11 130957700 1D GTTCTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 23 0 11 13 A 12 11 256431 CASAVA_Build 11 130962551 1D GACTCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 6 A 13 12 256432 CASAVA_Build 11 130963230 4I ACCGAGGCAC ----/AGAG AGATTATTGT 3070 hom 128 het 51 0 41 10 AG 1 3 256433 CASAVA_Build 11 130967629 1D TAGGTCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 36 2 16 18 A 17 16 256434 CASAVA_Build 11 130969669 1I CAGCTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 13 2 A 13 14 256435 CASAVA_Build 11 130973297 1D TGGGAGAATT C/- CCCCTGAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 5 4 256436 CASAVA_Build 11 130974499 7I GAGCTAGTCA -------/CATGGCC CATGGCCCTG 3070 hom 42 het 20 0 14 6 CATGGCC 1 2 256437 CASAVA_Build 11 130979748 1D TTCTAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 16 15 256438 CASAVA_Build 11 130980001 5D TTTTCTGGAC TCTAT/----- TCTATTTCAT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TCTAT 2 1 256439 CASAVA_Build 11 130982994 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 34 0 30 4 T 10 9 256440 CASAVA_Build 11 130983733 13I CTTGCTCCTG -------------/GGAACATGTCCAT GGAACATGTC 3070 hom 81 het 38 0 25 13 GGAACATGTCCAT 1 2 256441 CASAVA_Build 11 131004345 1D ACATTAAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 T 10 9 256442 CASAVA_Build 11 131005563 1I TCAGTGTTTC -/T TTTTTTGCAT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 6 7 256443 CASAVA_Build 11 131009502 1D AGCCCCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2626 hom 31 9 16 6 A 13 12 256444 CASAVA_Build 11 131009746 1I AACCCACTAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 782 hom 28 3 15 10 A 6 7 256445 CASAVA_Build 11 131014385 4D GGATCTGTTT TTTG/---- TTTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 20 22 6 TTTG 2 1 256446 CASAVA_Build 11 131016834 2D ATAGTCTAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2517 hom 6 het 19 0 8 11 T 18 16 256447 CASAVA_Build 11 131027202 3I CTTATGAGTT ---/AAC AACTTGTGAC 3070 hom 126 het 48 0 41 7 AAC 1 2 256448 CASAVA_Build 11 131028391 2D GCTGTCTCTC TT/-- AGCCTTCAGA 3070 hom 75 het 28 0 24 5 T 2 0 256449 CASAVA_Build 11 131052121 4D GATGACAGAC TGAT/---- TGGTAGTGTT 3070 hom 101 het 40 0 33 8 TGAT 1 0 256450 CASAVA_Build 11 131127905 1I GAAGAAAACC -/T GCGCATTACC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 0 1 256451 CASAVA_Build 11 131131802 1I TCTCACACAC -/A AAAAAATTGC 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 6 7 256452 CASAVA_Build 11 131164905 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAATTAG 1158 hom 7 het 3 0 3 0 A 6 8 256453 CASAVA_Build 11 131177118 1D CCTTGTATAA T/- TTTTTTAGGT 3070 het 3070 hom 38 15 22 1 T 7 6 256454 CASAVA_Build 11 131181265 1D ATTACCTGCT A/- AATTCCATGC 3070 het 3070 hom 36 7 24 5 A 3 2 256455 CASAVA_Build 11 131187362 1D CTTATTTTCT C/- CTCTAATGAG 3070 het 1525 hom 29 5 18 6 C 2 1 256456 CASAVA_Build 11 131191652 1D TTAAAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 13 12 256457 CASAVA_Build 11 131191959 2I AGCCTAAAAC --/AT ACTGGGCACT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 AT 0 1 256458 CASAVA_Build 11 131193347 1I GCTCCCACCA -/C CCCAGGCCTG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 C 3 4 256459 CASAVA_Build 11 131196130 1D CTCCAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 1150 het 1150 ref 42 20 4 18 T 13 12 256460 CASAVA_Build 11 131197943 1I TTTGCTTCTC -/A AAAAAAAGCG 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 A 7 8 256461 CASAVA_Build 11 131201669 3I GTAATATTCT ---/AAA AAAAAAAAAA 2981 het 2981 ref 40 15 13 12 A 12 15 256462 CASAVA_Build 11 131205683 1D GCCCTGTAGT A/- TGGTTTGAAG 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 A 1 0 256463 CASAVA_Build 11 131210041 4D TAAAATCCTC AGAG/---- AGAGGTCACC 3070 het 3070 ref 47 24 22 1 AG 4 2 256464 CASAVA_Build 11 131213827 2I GATAAAACAA --/AG AGGGGGTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 AG 1 2 256465 CASAVA_Build 11 131219737 1D CTAGGTTTCA C/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 C 1 0 256466 CASAVA_Build 11 131231274 4D CCTCATCATC CTTT/---- CTTTCACTCT 3070 het 3070 ref 40 19 16 9 CTTT 2 1 256467 CASAVA_Build 11 131240843 2I GCTCTCACAC --/AT GTTGCACACA 3070 het 3070 hom 65 18 29 18 AT 0 1 256468 CASAVA_Build 11 131241395 5I GGGAATAAAT -----/AAAAC AAAAAACAAA 3070 hom 105 het 39 0 33 6 AAAAC 0 1 256469 CASAVA_Build 11 131244201 1D CACCCCCCAG C/- CCCCCGCAAT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 C 6 5 256470 CASAVA_Build 11 131254854 1I CTTCCAAAAA -/G ATCCTTGGCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 256471 CASAVA_Build 11 131258610 1I AGGGAGAGAG -/A AAAAAACAGC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 6 7 256472 CASAVA_Build 11 131274280 1D GGCAGTGTAC A/- AAAAACAAGT 3070 het 2892 hom 37 8 23 7 A 6 5 256473 CASAVA_Build 11 131278237 1D TGAAGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 A 11 10 256474 CASAVA_Build 11 131287519 3D AGGCACTGGG GGA/--- GGAGAAGAAG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 GGA 2 1 256475 CASAVA_Build 11 131294220 1I AAACGCTTCC -/T TTTTTTTTTT 2281 het 87 hom 28 1 13 14 T 13 14 256476 CASAVA_Build 11 131294269 1I GGAATCTTGT -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 56 het 29 0 20 9 A 7 8 256477 CASAVA_Build 11 131294851 4I TATGAATATA ----/TATG TATGTACATA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 TATG 1 2 256478 CASAVA_Build 11 131298166 1I TACCCCGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 10 11 256479 CASAVA_Build 11 131299766 1I CCTGTTTGGC -/A GAGCTCCATC 3070 het 3070 hom 48 14 24 10 A 0 1 256480 CASAVA_Build 11 131301217 1D TATGGATTAG A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 166 het 58 0 56 2 A 8 7 256481 CASAVA_Build 11 131304554 1D ATGTTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 1508 het 1508 ref 20 10 4 7 T 12 11 256482 CASAVA_Build 11 131308974 2D ATTTACTGAA CT/-- CTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CT 2 1 256483 CASAVA_Build 11 131318050 3D ACCCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 21 1 13 8 A 15 12 256484 CASAVA_Build 11 131319027 1D TTCTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 11 10 256485 CASAVA_Build 11 131325009 5D ACTCACACTT TTCTC/----- TTCTGACACT 3070 het 3070 ref 41 22 17 4 TTCTC 1 0 256486 CASAVA_Build 11 131329734 1I TATAGAATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 10 23 4 T 9 10 256487 CASAVA_Build 11 131335649 1I CCCTAATGTT -/C CATATAAACT 3070 hom 183 het 68 0 60 8 C 1 2 256488 CASAVA_Build 11 131346855 2D CAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 1920 hom 23 7 16 0 A 11 9 256489 CASAVA_Build 11 131349171 5D CTTAATAACA TTTTC/----- TTTTCTCTAG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 TTTTC 2 1 256490 CASAVA_Build 11 131352124 1D ACCAGCCCCA C/- CAGTCCTAGA 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 C 2 1 256491 CASAVA_Build 11 131352899 1D GAAGAAAAGG A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 48 21 24 5 A 8 7 256492 CASAVA_Build 11 131378352 1I ACCCTTAGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1287 hom 34 8 17 9 T 9 10 256493 CASAVA_Build 11 131386310 6D AAAATTCTAC TTGATA/------ TTGATACTAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 8 TTGATA 2 1 256494 CASAVA_Build 11 131387546 1D TTTAAATTAG C/- ACAGTCTGAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 C 1 0 256495 CASAVA_Build 11 131391562 5D TGCATCTGAC TTCTT/----- TTCATGTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 TTCTT 1 0 256496 CASAVA_Build 11 131394375 2D ATCTTTTGCC TT/-- TTTTTAACAT 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 T 7 5 256497 CASAVA_Build 11 131395544 4D TATTTTGTAT TAAA/---- TAAATATAGA 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 TAAA 2 1 256498 CASAVA_Build 11 131395736 1I CTCATATTTG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 8 9 256499 CASAVA_Build 11 131398134 2D CCATGTGAAG CT/-- CATGGGAAGA 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 CT 1 0 256500 CASAVA_Build 11 131404167 2D TTGGTGTGGG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 20 15 8 T 11 9 256501 CASAVA_Build 11 131414937 3D GTTTCCGCAC CAG/--- TAAATCACCA 3070 het 3070 ref 49 24 22 4 CAG 1 0 256502 CASAVA_Build 11 131416575 1D GTATTCAGAA T/- TAACCTTAAG 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 2 1 256503 CASAVA_Build 11 131419165 20D TGTGTGTATG TGTGTGTATGTGTATGTGTT/-------------------- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 54 33 21 11 TGTGTGTATGTGTATGTGTT 1 0 256504 CASAVA_Build 11 131421275 5D TAAATAAGAT AAGTA/----- AAGTAATATG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 AAGTA 2 1 256505 CASAVA_Build 11 131421491 1D AAAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 11 10 256506 CASAVA_Build 11 131423923 9D TTCTTTTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 23 17 12 T 19 10 256507 CASAVA_Build 11 131430788 4D AGAGAGAGAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 164 het 63 0 53 16 AG 8 6 256508 CASAVA_Build 11 131432381 1D GTATTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 63 15 36 12 T 12 11 256509 CASAVA_Build 11 131437601 1D AGAGATAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 12 11 256510 CASAVA_Build 11 131455295 1D AAGAATGCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 10 9 256511 CASAVA_Build 11 131464015 1D CCTTTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 12 11 256512 CASAVA_Build 11 131473383 1I TTAGTATATT -/C CCCCCAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 5 6 256513 CASAVA_Build 11 131474242 1D TGTAGCAACA C/- CTGTAACATC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 C 2 1 256514 CASAVA_Build 11 131482647 1D TTTAAAAAAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 8 7 256515 CASAVA_Build 11 131484300 3I GTAGAATGAT ---/CTA TTATCTTTTA 2956 hom 18 het 7 0 7 0 CTA 0 1 256516 CASAVA_Build 11 131484767 3I CTGTGTCCCA ---/CTG CTGGGCCTCT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 CTG 1 2 256517 CASAVA_Build 11 131487360 1D TCCTGTCCAC T/- ATAAGGCATT 3070 het 3070 hom 49 16 26 7 T 1 0 256518 CASAVA_Build 11 131494458 8I GTACTCCTGG --------/TATCTGAA AATGGGGACA 3070 hom 153 het 61 0 47 14 TATCTGAA 0 1 256519 CASAVA_Build 11 131495228 1D CGGCTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 24 11 T 12 11 256520 CASAVA_Build 11 131500476 7I TGTATGATGT -------/GTGTGTG GTGTGTGGTG 3070 het 3070 hom 76 31 25 20 GTGTGTG 1 2 256521 CASAVA_Build 11 131507211 2I AGTTCAAGTG --/CC CCCGAGGATA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 C 3 5 256522 CASAVA_Build 11 131522665 1I CTTTCTTTTC -/T TCTTTTTTAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 256523 CASAVA_Build 11 131531793 1D AAATGATTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 T 9 8 256524 CASAVA_Build 11 131537293 12I TTTGGGGGGA ------------/GTGTGTATGTGG GTGTGTATGT 3070 het 3070 hom 59 23 27 10 GTGTGTATGTGG 1 2 256525 CASAVA_Build 11 131537886 2D TTGTGGGACC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 57 19 18 20 TG 8 7 256526 CASAVA_Build 11 131538105 1D AACTCTCCCC T/- GGTCCACCCC 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 1 0 256527 CASAVA_Build 11 131544114 15I AACTGATTTT ---------------/AGAGTCAGACATCAC AGAGCTCTCT 3070 het 3070 ref 31 13 10 9 AGAGTCAGACATCAC 0 1 256528 CASAVA_Build 11 131551473 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 10 9 256529 CASAVA_Build 11 131579029 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 9 256530 CASAVA_Build 11 131584539 1D GCATATGCAG A/- GACACACACG 3070 hom 30 het 34 1 21 12 A 1 0 256531 CASAVA_Build 11 131592929 3I CGGATAAGAG ---/TTC TTCTCCTGGC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTC 1 2 256532 CASAVA_Build 11 131605893 2D AATAGGAGAC TG/-- AGGGAGGAGG 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 TG 1 0 256533 CASAVA_Build 11 131606967 1I55M1I TCATTTGATA -TTAAACATCAGCTCTGACGCTGTTTTCATGCACTTTTCAAATGAAAGTTCTCCCC-/TTTAAACATCAGCTCTGACGCTGTTTTCATGCACTTTTCAAATGAAAGTTCTCCCCT CTGCCTAGCT 3070 hom 52 het 47 1 67 6 N/A 0 0 256534 CASAVA_Build 11 131608326 1I TTCAAGACCA -/G CCTGGCCAAC 3070 hom 105 het 39 0 34 5 G 0 1 256535 CASAVA_Build 11 131627287 1D CCTCATCTTT A/- TCTTAGCATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 1 0 256536 CASAVA_Build 11 131628555 1D AATGGGGCAG A/- TTTCAAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 6 A 1 0 256537 CASAVA_Build 11 131635361 1I TCACCCAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 23 1 17 5 T 11 12 256538 CASAVA_Build 11 131642584 1D TCTTGGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 35 1 26 8 T 15 14 256539 CASAVA_Build 11 131650851 2D TATATATATA TG/-- TGTATATATA 1620 hom 15 het 6 0 6 0 TG 2 1 256540 CASAVA_Build 11 131674243 1I ACTGAAAATA -/C AAAAAAATTA 3070 het 2040 hom 18 5 10 3 C 0 1 256541 CASAVA_Build 11 131687080 4D TTTGTTTCTG TCTT/---- TCTTTCAGTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 TCTT 2 1 256542 CASAVA_Build 11 131688276 1D ACTCTATGCC A/- AAAAACACTG 3070 hom 111 het 43 0 38 7 A 6 5 256543 CASAVA_Build 11 131689283 6D TCACCATCAC CATCAT/------ CATCATCAGG 3070 het 3070 ref 36 15 15 8 CAT 4 2 256544 CASAVA_Build 11 131705339 1I TGGGGTATGT -/A AAAACTCTTC 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 A 4 5 256545 CASAVA_Build 11 131722473 1D TCAATAAAAT G/- GGGGTACCAG 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 G 5 4 256546 CASAVA_Build 11 131765120 1I CTCAAAAAAT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 6 7 256547 CASAVA_Build 11 131766220 1D TATCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1814 het 1814 ref 23 9 6 8 T 15 14 256548 CASAVA_Build 11 131766431 1I40M1D TATTATCCTT -GCATTCATAGAGATTTTTGGATTTCCACATATACAATTTTC/GGCATTCATAGAGATTTTTGGATTTCCACATATACAATTTT- CCACAAATTT 3070 hom 36 het 19 0 13 16 N/A 0 0 256549 CASAVA_Build 11 131774416 1D TTACCACAAA C/- TTGGTCACTT 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 C 1 0 256550 CASAVA_Build 11 131775244 2I TAATGGGGGG --/AA AAAAAAGCCC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 6 8 256551 CASAVA_Build 11 131787118 2I TTCATGGAGA --/GG TAAAACTAAG 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 G 0 2 256552 CASAVA_Build 11 131790279 1D AAAATAAAAG A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 A 7 6 256553 CASAVA_Build 11 131796090 2D TTTTCTAGCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 48 17 18 15 TC 9 8 256554 CASAVA_Build 11 131799229 1D CTAGAGGCAG T/- TTTTTTTTTT 1953 het 1332 hom 20 7 7 6 T 14 13 256555 CASAVA_Build 11 131834846 1D TACGAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 A 10 9 256556 CASAVA_Build 11 131844937 1I GTATGTGTGT -/G GGGGGGCTGT 3070 het 3070 ref 52 30 10 12 G 6 7 256557 CASAVA_Build 11 131844987 2D ATGTGTGGGA GG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 62 23 14 26 G 2 0 256558 CASAVA_Build 11 131849388 2D TTACCCTGTT TA/-- TAATTTGCAA 3070 het 3070 ref 45 24 14 8 TA 2 1 256559 CASAVA_Build 11 131865649 1D CGGCCTGACC T/- TTGCTTTGAA 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 3 2 256560 CASAVA_Build 11 131880352 1I AAAATACTGT -/A GGAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 A 0 1 256561 CASAVA_Build 11 131880608 3D TCAGGAAAAG GCT/--- GCTTAAGGGG 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 GCT 2 1 256562 CASAVA_Build 11 131880994 1I ACTTTCTGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2784 hom 40 7 18 15 A 14 15 256563 CASAVA_Build 11 131882698 1D TAAAAACAAC A/- AAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 5 4 256564 CASAVA_Build 11 131882795 1I AGGAATATAA -/T TTTTTAATTA 3070 het 3070 hom 28 8 19 1 T 5 6 256565 CASAVA_Build 11 131882954 1I AGTAAATATG -/A GAGTAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 0 1 256566 CASAVA_Build 11 131883574 2I25M2D CCAAAAAAAA --CATTGGACAAAATGGAAGATCTAGTCA/AGCATTGGACAAAATGGAAGATCTATT-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 40 28 18 3 N/A 0 0 256567 CASAVA_Build 11 131884450 1D TACGTGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 A 11 10 256568 CASAVA_Build 11 131885678 1D TTTGATAGTG A/- TATTAAGTCT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 1 0 256569 CASAVA_Build 11 131886757 1D ATTAGAAAAA G/- GATTATGTTT 3070 het 3070 ref 36 20 16 1 G 2 1 256570 CASAVA_Build 11 131886915 2D46M1I GAAAAAAAAC ATAGAATATAACGTTTTTAACCTCCATTAAGTGTGAAATATTGATAAA-/--AGAATATAATGTTTTTAACCTCCATTAAGTGTGAAATATTGATAAAT TTGGACTTCA 3070 het 3070 ref 46 36 18 11 N/A 0 0 256571 CASAVA_Build 11 131887860 2D TATACATGTA AT/-- ATATATATAT 2753 het 2753 ref 30 16 7 9 AT 6 5 256572 CASAVA_Build 11 131891814 2D TGATCATGAC AG/-- AGAGGCTGAG 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 AG 3 2 256573 CASAVA_Build 11 131898538 40D CCCTATACTC AGAGAAGGCCCTTTCCCACCACTAGTTCTTATTTAGGACT/---------------------------------------- AATCAACTTA 3070 hom 81 het 27 0 27 5 AGAGAAGGCCCTTTCCCACCACTAGTTCTTATTTAGGACT 1 0 256574 CASAVA_Build 11 131900807 1I AGAGCTTTTC -/T TTTTTTATTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 6 7 256575 CASAVA_Build 11 131903033 3I GAGATCAGGG ---/TAA TAATATATTT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 TAA 1 2 256576 CASAVA_Build 11 131905418 1I TCAACTTAAA -/C GGTCAGTATT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 C 0 1 256577 CASAVA_Build 11 131915689 1D TATGGTTTTA T/- TTTTGTGCTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 5 4 256578 CASAVA_Build 11 131919326 1I AAAGCACGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 10 11 256579 CASAVA_Build 11 131932924 1D GCAGGGGTGG A/- TGGGCACCAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 0 256580 CASAVA_Build 11 131942057 6D CATACGGCAA CAACAT/------ CAACATCAGT 3070 hom 90 het 46 0 31 19 CAACAT 2 1 256581 CASAVA_Build 11 131951370 4D TTCTCTCTTC TTCT/---- TTAACACCCA 3070 hom 51 het 20 0 18 4 TTCT 1 0 256582 CASAVA_Build 11 131981780 9D GCCAATGGGA CCGTGACTG/--------- CCGTGACTGC 3070 hom 64 het 28 0 17 11 CCGTGACTG 2 1 256583 CASAVA_Build 11 131987718 1I TGCTAGCAAG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 7 8 256584 CASAVA_Build 11 132001801 1D ATGAGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 26 1 18 8 A 12 11 256585 CASAVA_Build 11 132002668 3D TCTAACAAAA CAT/--- CATGAATTTG 3070 het 3070 ref 65 31 25 12 CAT 2 1 256586 CASAVA_Build 11 132009001 1D GTAAGAAATC G/- GGGGTGGGAG 3070 het 3070 ref 40 13 12 15 G 5 4 256587 CASAVA_Build 11 132044509 7D TGGGCACCAT GGAAAAG/------- GGAAAAGGGA 3070 hom 151 het 59 0 51 9 GGAAAAG 2 1 256588 CASAVA_Build 11 132062137 1I GAAGTCACAC -/A AATATTGTAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 3 256589 CASAVA_Build 11 132067338 1D ATGCTACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 41 0 33 8 A 14 13 256590 CASAVA_Build 11 132070006 5I GGCAAGACTT -----/AGAAG AGAAACTATA 3070 hom 132 het 51 0 43 8 AGAAG 0 1 256591 CASAVA_Build 11 132075119 1I TGATTCAATC -/T CTTGTAATTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 0 1 256592 CASAVA_Build 11 132085794 3D TAAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 16 4 A 17 14 256593 CASAVA_Build 11 132089694 1I AAATCTTGAC -/T TTTGGGCTCT 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 T 3 4 256594 CASAVA_Build 11 132098661 1I ATTTTAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 9 10 256595 CASAVA_Build 11 132180452 3D ATTGGTGCCT AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 AAG 4 3 256596 CASAVA_Build 11 132194767 2D TTTTGTTATG AC/-- ACAATATATT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 AC 2 1 256597 CASAVA_Build 11 132203656 1D14M1D CAGCTCTTTT AAAAAAAAAAGTCTAT/-AAAAAAAAAGTCTA- TTATTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 7 N/A 0 0 256598 CASAVA_Build 11 132207354 1I TATTTTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 12 14 11 A 11 12 256599 CASAVA_Build 11 132233695 1I CTTTCTTCCC -/G GGGGGGTGAG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 G 6 7 256600 CASAVA_Build 11 132239046 4D ATTTTATTTA TTTG/---- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 TTTG 1 0 256601 CASAVA_Build 11 132243609 1D TAAATAATTG A/- AAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 7 6 256602 CASAVA_Build 11 132253287 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2682 hom 24 9 8 7 A 13 14 256603 CASAVA_Build 11 132263964 1D ATTTTACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 A 12 11 256604 CASAVA_Build 11 132267079 2D CACCCTTGCT TC/-- TCTCCTCAAG 3070 hom 55 het 29 0 24 7 TC 3 2 256605 CASAVA_Build 11 132279514 3I TCTCAATTGA ---/TTC TTTAGATGGA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 TTC 0 1 256606 CASAVA_Build 11 132280331 9D AAAGCAGTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3035 het 365 hom 19 2 10 7 T 25 16 256607 CASAVA_Build 11 132282903 1I TTGCTCTGTT -/A ACAGCACCAG 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 A 1 2 256608 CASAVA_Build 11 132283364 1D29M2D TTAGTCCCCT CCCCCAAAGAAACATAAGGTCTCTCTCTCTCA/-CCCCAAAGAAACATAAGGTCCCTCTCTCT-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 25 26 6 N/A 0 0 256609 CASAVA_Build 11 132299997 1I GTTTCTGATA -/T TCTCATTACA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 1 2 256610 CASAVA_Build 11 132306257 1I CACCATATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 A 10 11 256611 CASAVA_Build 11 132312584 4D ACAGGGGGAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 2817 het 2817 ref 30 12 10 8 AG 9 7 256612 CASAVA_Build 11 132317697 1D GCTCAGGCTA G/- CCCCCCAGTG 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 1 0 256613 CASAVA_Build 11 132330643 1I GATAAAGCAA -/T TATATAGAGA 3070 hom 102 het 36 0 35 3 T 1 2 256614 CASAVA_Build 11 132333930 1I AAAAAAAGAT -/A ACCTTTCCAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 1 2 256615 CASAVA_Build 11 132338857 6D CGTATTACGA TATTAT/------ TATTATTATT 3070 hom 63 het 25 0 22 5 TAT 6 4 256616 CASAVA_Build 11 132370585 4D CCTCTGTCTC TCCT/---- TCCTTCCTTC 1206 het 1206 ref 21 13 4 5 TCCT 5 4 256617 CASAVA_Build 11 132377884 1D AGGAAAGAGA G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 15 het 33 0 18 15 G 8 7 256618 CASAVA_Build 11 132404969 1I TCTAAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 43 0 33 10 A 9 10 256619 CASAVA_Build 11 132463345 3I AGTACTGAGA ---/CAT CAGAAAACTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CAT 0 1 256620 CASAVA_Build 11 132468882 1I TCTGTACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 44 1 34 9 T 11 12 256621 CASAVA_Build 11 132471236 6D TGTGCACAAA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 17 16 11 TG 12 9 256622 CASAVA_Build 11 132479967 1I GAAAAATATT -/A AAGGCCCAAT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 2 3 256623 CASAVA_Build 11 132481087 1D17M2D ACTCCATCTT AAAAATAAAAAAAAAAAGAA/-AAAATAAAAAAAAAAAG-- AAAAAGAATA 509 het 319 hom 18 2 5 13 N/A 0 0 256624 CASAVA_Build 11 132483913 1I TACAGGTGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 799 hom 43 2 31 10 A 9 10 256625 CASAVA_Build 11 132486291 1I TGTGAATGAG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 8 256626 CASAVA_Build 11 132488363 1D TCTGTTTTTT C/- CCCACACTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 8 C 4 3 256627 CASAVA_Build 11 132489828 1I ATCTTTAAGG -/C ATAGAATAGT 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 C 0 1 256628 CASAVA_Build 11 132494477 1D TTCAGAAGGG C/- CTTCTGTCCC 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 C 2 1 256629 CASAVA_Build 11 132499279 1D GGAAATTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 34 1 30 3 A 11 10 256630 CASAVA_Build 11 132511487 1D CAACTTTTTT C/- CCCACTTTCT 3070 hom 99 het 34 0 33 2 C 4 3 256631 CASAVA_Build 11 132528893 1D GCTATAGAAT A/- GACTGCCCCC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 1 0 256632 CASAVA_Build 11 132545098 1D TTAAAATAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 44 18 23 4 A 9 8 256633 CASAVA_Build 11 132577151 1I ATGAACACAC -/A ATAAAAAATA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 1 2 256634 CASAVA_Build 11 132592216 1D AACTCAGCCC T/- TTTCCTTCAG 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 4 3 256635 CASAVA_Build 11 132619807 4I TGCTCACTCA ----/CTCT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 57 27 24 6 CT 5 7 256636 CASAVA_Build 11 132678890 1I TTGTAGAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 A 9 10 256637 CASAVA_Build 11 132693610 1D CATCCACTGA C/- CCCCCACCCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 6 5 256638 CASAVA_Build 11 132726646 3D TAAGCCTCTC CTT/--- CTCTTTCTGA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 CTT 1 0 256639 CASAVA_Build 11 132729098 1D TTTTCCCACA T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 7 256640 CASAVA_Build 11 132743352 1D AAGGTGAGGT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 47 het 26 0 16 11 G 9 8 256641 CASAVA_Build 11 132780836 1I ACCCTTCTAC -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 A 6 7 256642 CASAVA_Build 11 132783257 1I TGCTGGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 27 9 6 A 10 11 256643 CASAVA_Build 11 132787752 1D CGTATGCCCC T/- ATCCTCTCTT 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 1 0 256644 CASAVA_Build 11 132792740 1D CCCTCCCCAC T/- CCCCCGACCC 3070 het 738 hom 15 2 10 4 T 1 0 256645 CASAVA_Build 11 132799620 1D TTGGAGAGAA T/- TTTTCCACAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 5 4 256646 CASAVA_Build 11 132802648 4D GTTTCCTGAA AACT/---- AACAGGATAA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 AACT 1 0 256647 CASAVA_Build 11 132806572 3I TGTTTTTTGT ---/TTG TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 TTG 1 2 256648 CASAVA_Build 11 132814775 5I GGTTTCACCG -----/TTTTT TTTTAGCCAG 855 het 94 hom 3 1 2 2 T 4 9 256649 CASAVA_Build 11 132826949 1D CTCCAACTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1808 hom 26 5 17 4 A 10 9 256650 CASAVA_Build 11 132827410 4D ATTAAAATGC ACAA/---- ACAGTGGTAG 3070 het 3070 hom 38 14 21 7 ACAA 1 0 256651 CASAVA_Build 11 132827560 1D CTTGGAGTTC A/- ATTAGTTTAT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 2 1 256652 CASAVA_Build 11 132828820 1D TTGAATCCTC A/- AAATGTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 4 3 256653 CASAVA_Build 11 132831886 1I CAATCAGACC -/A AAAAAAAAAA 3018 het 1182 hom 26 4 13 9 A 15 16 256654 CASAVA_Build 11 132833990 2I ATACACACAC --/AT ATGTGTGTGT 2038 het 2038 ref 25 17 5 3 AT 1 2 256655 CASAVA_Build 11 132839169 2D GAATATAGAT CC/-- CAACAGATAA 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 C 3 1 256656 CASAVA_Build 11 132839431 8I TTTCTTTTCA --------/CAGCTACT CATCAAGCAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 CAGCTACT 0 1 256657 CASAVA_Build 11 132844003 3I TATGGAAAAA ---/AAC AACAATTATT 3070 het 3070 ref 36 15 17 4 AAC 1 2 256658 CASAVA_Build 11 132850978 1I CAAGATACTG -/A AAATAAAAGG 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 3 4 256659 CASAVA_Build 11 132851498 1D CTGTTGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 10 21 8 T 12 11 256660 CASAVA_Build 11 132853938 1I GCTGTAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 12 30 8 T 11 12 256661 CASAVA_Build 11 132872702 1I TTTTGGTCAC -/T GTCGCTCTTG 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 0 1 256662 CASAVA_Build 11 132888277 2I CCAAACATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 A 10 12 256663 CASAVA_Build 11 132896927 1D TTCAGGAGAA C/- CAGGTTAGCT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 C 2 1 256664 CASAVA_Build 11 132903976 3D AGGATGGGCC AAG/--- AAGAAGGGGA 3070 het 3070 ref 45 23 17 6 AAG 3 2 256665 CASAVA_Build 11 132904428 1D CTGCTTCCTA C/- AGAGCCCCCA 3070 het 3044 hom 34 8 18 8 C 1 0 256666 CASAVA_Build 11 132915732 5D CTGATTGTTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 21 14 14 T 16 11 256667 CASAVA_Build 11 132916952 1I TCTGCCTCCA -/G ACCCCTCCAG 3070 het 2840 hom 30 11 12 7 G 0 1 256668 CASAVA_Build 11 132919540 2D TCATTAAGGC TT/-- TAGTAACCTC 3070 het 3070 ref 48 24 16 10 T 3 1 256669 CASAVA_Build 11 132938621 1I GAATACCAAC -/A GCAGAAAATT 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 A 0 1 256670 CASAVA_Build 11 132944145 1I CATATTCACA -/G ATAGATTTTG 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 G 0 1 256671 CASAVA_Build 11 132950556 4I GAACCAGACC ----/CATG CATGCCTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 CATG 1 2 256672 CASAVA_Build 11 132952374 1D AGACTCCCTC A/- AAAAAAAAAA 2741 het 1446 hom 28 11 10 7 A 15 14 256673 CASAVA_Build 11 132981209 1D GGACACACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 9 9 A 13 12 256674 CASAVA_Build 11 132982599 2D AAATAACAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 AG 6 5 256675 CASAVA_Build 11 132986609 1I TGGAGCCAGC -/A AAAAAGTCTC 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 A 5 6 256676 CASAVA_Build 11 132989270 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2021 het 109 hom 12 1 7 4 A 13 14 256677 CASAVA_Build 11 132996026 1I TCGTTCAGAT -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 0 1 256678 CASAVA_Build 11 132996125 1I TAGTGGCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 35 1 24 10 A 10 11 256679 CASAVA_Build 11 133001354 1I GAACGGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3045 het 3045 ref 41 12 12 17 T 15 16 256680 CASAVA_Build 11 133022055 1I GTGAAACTCT -/C ATCAACTGAG 3070 het 3070 hom 39 12 25 2 C 0 1 256681 CASAVA_Build 11 133023125 4D GCTTGTTTAA TTTG/---- TTTATTGTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 TTTG 1 0 256682 CASAVA_Build 11 133023306 5I CTGACCAACA -----/GAAAT TGGAGAAACC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 GAAAT 0 1 256683 CASAVA_Build 11 133039645 1D GATCTGCAGT G/- GGGGTACTGG 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 G 5 4 256684 CASAVA_Build 11 133057138 1D CTGGTGGGGG A/- GGCAGGAAGA 3070 het 3070 hom 41 18 14 9 A 1 0 256685 CASAVA_Build 11 133058837 1D CAAAATATTG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 9 8 256686 CASAVA_Build 11 133060463 4D TGGCAAAAAC ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 het 3070 ref 34 16 9 12 ATAA 6 5 256687 CASAVA_Build 11 133075203 1I GACTCAAATA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 T 6 7 256688 CASAVA_Build 11 133086690 3D ACAGACCTAG CTA/--- CTCTGCCTTC 3070 het 3070 ref 37 19 11 8 CTA 1 0 256689 CASAVA_Build 11 133097143 4I GACAGAGGGG ----/GAGA GAGAGAGCGA 3070 het 3070 ref 60 34 16 10 GA 3 5 256690 CASAVA_Build 11 133099588 3D TTCTCTGTTG CTT/--- CTTTTTTTTA 2195 het 2195 ref 19 9 9 1 CTT 2 1 256691 CASAVA_Build 11 133099737 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCGCCCC 3002 het 644 hom 10 2 8 0 C 6 5 256692 CASAVA_Build 11 133170950 5D TTTTTGTCAT AAAAG/----- AAATGAGACC 3070 hom 131 het 46 0 44 4 AAAAG 1 0 256693 CASAVA_Build 11 133181448 1D AGCAAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 21 0 17 4 A 13 12 256694 CASAVA_Build 11 133189106 1D CTTAAGCAAA T/- TAATGCAGAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 2 1 256695 CASAVA_Build 11 133215338 2I AAATAAAGAC --/TT TCTCCAACCA 3070 het 3070 ref 41 21 20 0 T 1 3 256696 CASAVA_Build 11 133222143 1I TCTCTTCCCC -/T ATACCTTCAA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 0 1 256697 CASAVA_Build 11 133222831 7D GCCTCCTCGA GCTTTGT/------- GCCCTTTCAT 3070 het 3070 hom 40 17 22 3 GCTTTGT 1 0 256698 CASAVA_Build 11 133233391 2I TATATATAAC --/TT ATATATATGT 2083 het 2083 ref 16 10 5 1 T 0 2 256699 CASAVA_Build 11 133236448 2D GTCCATTCAC AT/-- ATGTTATTAT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 AT 2 1 256700 CASAVA_Build 11 133246702 1D AAAGAGCTCT A/- AACCATGTGT 3070 het 3070 ref 67 32 30 6 A 3 2 256701 CASAVA_Build 11 133247995 4D CCAGTTCCAC TATG/---- TATAATTGGA 3070 het 3070 hom 50 21 26 3 TATG 1 0 256702 CASAVA_Build 11 133250851 5D ATTTCTGGAC TTTCT/----- TTTCTATTCT 3070 het 3070 ref 26 16 10 2 TTTCT 2 1 256703 CASAVA_Build 11 133251768 4D TATTATAGTG TTTC/---- TTTCTTGTTC 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 TTTC 2 1 256704 CASAVA_Build 11 133264106 13D TGAACTGAAT GATCCTCTGAAAA/------------- ACAGACACCA 3070 het 3070 ref 39 25 12 7 GATCCTCTGAAAA 1 0 256705 CASAVA_Build 11 133269616 4I CTGGTGTCCC ----/CTAA CTCTTTCTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CTAA 0 1 256706 CASAVA_Build 11 133272480 6D CACACGCACA CACACG/------ CACAGGTATG 3070 het 3070 ref 48 25 19 5 CACACG 1 0 256707 CASAVA_Build 11 133275206 1D TCAAGCTTTA C/- CCCAACCTAC 3070 het 3070 hom 56 24 23 10 C 4 3 256708 CASAVA_Build 11 133276474 1D AGCACAGGTA C/- AAAAATAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 C 1 0 256709 CASAVA_Build 11 133277108 1D12M1I CACACACACA CACACACCAGACA-/-ACACACCACACAC TACACACACC 1960 het 1960 ref 44 34 6 13 N/A 0 0 256710 CASAVA_Build 11 133364172 1D GCAGGCACTC A/- AGTGCAGGCC 3070 hom 56 het 21 0 17 5 A 2 1 256711 CASAVA_Build 11 133379579 1D GCCTTTCTTC A/- AAAAAAAAAA 1798 het 1798 ref 36 15 7 14 A 18 17 256712 CASAVA_Build 11 133405871 1I TTAGGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 17 4 T 10 11 256713 CASAVA_Build 11 133425632 1I CCCCCTCGCC -/A AAAAAAAAAA 2767 het 2767 ref 30 11 11 8 A 10 11 256714 CASAVA_Build 11 133439005 1D CACCACGCCC G/- GCCTTAACTA 2245 het 2148 hom 17 8 6 3 G 2 1 256715 CASAVA_Build 11 133442653 1I TCCCTAGCAG -/A GAAGACCATT 3070 het 3070 hom 49 15 27 7 A 0 1 256716 CASAVA_Build 11 133446943 5D TGTTTTAAAA AAAAC/----- AAAGAACACC 3070 het 3070 ref 38 16 18 8 AAAAC 1 0 256717 CASAVA_Build 11 133450623 1I GGGCTTCTAT -/G GACAGAATAC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 G 1 2 256718 CASAVA_Build 11 133451146 2I ATCAATACAC --/AG AGTTTTTCCA 3070 het 2556 hom 16 6 8 2 AG 1 2 256719 CASAVA_Build 11 133454139 2D AGCGAAACTC TG/-- TTACAAAACA 3070 het 3070 hom 28 8 18 4 TG 1 0 256720 CASAVA_Build 11 133461511 1I GTATCCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2584 hom 22 7 13 2 T 10 11 256721 CASAVA_Build 11 133463499 1D TTGGGCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 21 7 T 11 10 256722 CASAVA_Build 11 133463853 3I TTGGTCTGCA ---/CAT CATTAACACA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 CAT 1 2 256723 CASAVA_Build 11 133472063 2D TTTTGCTAAC AT/-- GTGGCACTTT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 AT 1 0 256724 CASAVA_Build 11 133485831 3I GGCTAGAAAC ---/CTT CTGGGAGTTG 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 CTT 0 1 256725 CASAVA_Build 11 133490532 3I CTGTTCTTTG ---/TTC TTCTTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 TTC 1 2 256726 CASAVA_Build 11 133492490 3I ATCTCAAAAA ---/AAG AAGAAAAACA 3070 het 2767 hom 26 7 15 4 AAG 1 2 256727 CASAVA_Build 11 133494874 1D TAATCTCATC T/- TAAAAACCCT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 T 2 1 256728 CASAVA_Build 11 133503838 3I TTTCCTGAGG ---/CCT CCTCAGCCAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 CCT 1 2 256729 CASAVA_Build 11 133511248 4I AGGCCAAAAT ----/AGAC AGGAAATTGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGAC 0 1 256730 CASAVA_Build 11 133519193 2D TCCTGTCCTC AA/-- GAGAGTTCAC 3070 het 3070 ref 39 26 11 3 A 2 0 256731 CASAVA_Build 11 133519884 2I ACACCACCCC --/CT TTTTTCCCCA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 CT 0 1 256732 CASAVA_Build 11 133521517 3I GAAAACTGAC ---/AAG AGTTTTAGCC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 AAG 0 1 256733 CASAVA_Build 11 133526950 4I TAAAAATGCT ----/ATCA ATCAATCACC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 ATCA 2 3 256734 CASAVA_Build 11 133537047 2I TCTGAAAGAC --/AA AGGCCTCTCC 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 A 1 3 256735 CASAVA_Build 11 133555571 1D ACTGCCATAC A/- TCTTATCCCC 3070 het 3070 hom 50 21 25 5 A 1 0 256736 CASAVA_Build 11 133562759 1D TGGGAAGCCA C/- CCTAAGCCAG 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 C 3 2 256737 CASAVA_Build 11 133570368 1D ACCATGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 9 8 256738 CASAVA_Build 11 133573500 1D CCCACCTTGT C/- CCTGCCTTTT 3070 hom 102 het 41 0 34 8 C 3 2 256739 CASAVA_Build 11 133582001 1I ACAATGAGCA -/G GGATACAATA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 G 2 3 256740 CASAVA_Build 11 133593215 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGGGGGG 1558 het 61 hom 28 2 6 20 G 12 11 256741 CASAVA_Build 11 133607302 5D15M2I GATTGGGAAG AATGAAAGATGACGCGTGGT--/-----ATGACCACCAGTCATCA TGCTTCTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 26 5 N/A 0 0 256742 CASAVA_Build 11 133608840 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 24 7 16 1 A 7 8 256743 CASAVA_Build 11 133631135 1D TCACCCTCCC A/- AAGTAGCTGG 2071 het 2071 ref 16 8 5 3 A 3 2 256744 CASAVA_Build 11 133650255 2D GAAAGAAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 12 10 256745 CASAVA_Build 11 133650502 3I ACTGTAAAAA ---/ATT ATTAACAGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ATT 1 2 256746 CASAVA_Build 11 133661623 1D CTCACGCCTG T/- TAATCCCAGC 2793 hom 21 het 9 0 7 2 T 2 1 256747 CASAVA_Build 11 133683658 3D TCACCATCAC CAT/--- CACCACCACC 1713 het 80 hom 25 1 12 12 CAT 1 0 256748 CASAVA_Build 11 133700607 2D TCAGTACACA TG/-- TGTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 43 29 13 4 TG 2 1 256749 CASAVA_Build 11 133704718 2I GCTAATTTTT --/TC TTTTTTTTTT 1560 het 20 hom 11 1 8 2 TC 0 1 256750 CASAVA_Build 11 133711860 1D GTGGTGGATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 9 8 256751 CASAVA_Build 11 133716487 8I TAACCCAAGG --------/CGACAGTT CGACAGTTCT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 CGACAGTT 1 2 256752 CASAVA_Build 11 133719618 1I GGTGGCTACT -/G GGGGTGGATT 1579 het 1579 ref 34 25 5 4 G 4 5 256753 CASAVA_Build 11 133720301 26D CTGGTTTGTT TCTGTGTTCCAGTTCCCATTCTGTAC/-------------------------- TGAATTGTGT 3070 het 3070 ref 31 24 14 7 TCTGTGTTCCAGTTCCCATTCTGTAC 1 0 256754 CASAVA_Build 11 133726450 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2268 het 2268 ref 32 14 6 12 T 17 16 256755 CASAVA_Build 11 133736255 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAC 1455 hom 12 het 5 0 5 1 A 10 9 256756 CASAVA_Build 11 133765192 2D AGGCACGTAG TT/-- CCCCTAGTGG 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 T 2 0 256757 CASAVA_Build 11 133770302 1I TGCTCTCTGC -/T TGGGGCACGC 1454 het 1454 ref 19 12 4 3 T 1 2 256758 CASAVA_Build 11 133780847 1D GACAGGAGCA G/- GGCTGCTCTG 3070 het 2009 hom 22 6 12 5 G 3 2 256759 CASAVA_Build 11 133783077 1I GGTGTCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 11 12 256760 CASAVA_Build 11 133789663 2D ACCCACATGA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 54 22 18 18 AC 7 6 256761 CASAVA_Build 11 133806651 1I TTTTAGCATA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 7 8 256762 CASAVA_Build 11 133817444 2D CAGCCCCACT CA/-- CAGGCTGGGC 1559 het 1559 ref 20 10 6 4 CA 2 1 256763 CASAVA_Build 11 133819203 4D AGGGCCTCTG TGTA/---- TGTAGGGTGC 3070 hom 77 het 33 0 23 12 TGTA 2 1 256764 CASAVA_Build 11 133821308 1I GTGCTTTGAG -/T CTGCACGAGT 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 T 0 1 256765 CASAVA_Build 11 133824859 3D GCTTTTGCAG CCC/--- CATGTGCAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 4 1 256766 CASAVA_Build 11 133825895 22D AAAGAGAAAG ACACACACACACACACACACAC/---------------------- ACACACACAC 3070 hom 30 het 18 0 10 9 AC 20 9 256767 CASAVA_Build 11 133844566 1I TTGGATATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 25 0 10 15 T 10 11 256768 CASAVA_Build 11 133844576 2I TTTTTTTTTT --/TA ATCCCCATTT 3070 hom 51 het 30 0 17 13 TA 0 1 256769 CASAVA_Build 11 133853703 3I CTGTGAAAAA ---/CTT CTTTTTTTTT 2801 het 2801 ref 20 9 9 2 CTT 1 2 256770 CASAVA_Build 11 133867361 2D TTTTTTTCTG TT/-- TTTTTTGTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 8 6 256771 CASAVA_Build 11 133878143 3D AAGACCAGGC ATG/--- AGACTGTGGA 3070 hom 79 het 31 0 22 9 ATG 1 0 256772 CASAVA_Build 11 133906129 2I ATGGCTGGGC --/CG GCATCTGGCA 2515 het 2515 ref 36 16 10 10 CG 0 1 256773 CASAVA_Build 11 133914546 1I CTTACTAAAG -/A AAAAAGCACA 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 A 5 6 256774 CASAVA_Build 11 133918367 1D CAGGGTGTTG C/- CCCCAGTCAA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 C 5 4 256775 CASAVA_Build 11 133936011 1D CAGCTTCGAT G/- GGGGGGGGCC 3070 hom 24 het 22 0 12 10 G 9 8 256776 CASAVA_Build 11 133958850 1I CTCTCCGTCA -/C CCCACAATGT 3070 hom 150 het 56 0 49 7 C 3 4 256777 CASAVA_Build 11 133965569 1D TGTCTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 13 12 256778 CASAVA_Build 11 133970227 1D AATTTGTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 32 het 29 1 21 7 T 10 9 256779 CASAVA_Build 11 133979117 1D AAATGCTTTT A/- AAAAATTGTG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 A 6 5 256780 CASAVA_Build 11 133988332 1D AGATTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 23 0 20 8 A 14 13 256781 CASAVA_Build 11 133989721 1D GGAGTGAAAC T/- GACAATTCTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 0 256782 CASAVA_Build 11 133990727 2D TGAGGTGCAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 135 het 48 0 43 6 TG 10 9 256783 CASAVA_Build 11 134004604 1D CACAAAAACC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 99 het 39 0 32 7 A 9 8 256784 CASAVA_Build 11 134005327 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 9 8 256785 CASAVA_Build 11 134021433 1D AATGTGCTTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 9 8 256786 CASAVA_Build 11 134046704 8D TGCTATAAAG GAATGCCT/-------- GAGGCAGGTA 3070 hom 99 het 34 0 32 5 GAATGCCT 1 0 256787 CASAVA_Build 11 134054953 1I AGGGAATAGT -/G GGGCAGATGG 3070 hom 159 het 64 0 51 13 G 3 4 256788 CASAVA_Build 11 134104139 1D GTTACGCAGC G/- CCCCCGCCCC 2225 hom 26 het 11 0 9 2 G 1 0 256789 CASAVA_Build 11 134114221 2D TGTGTATGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1806 het 1806 ref 60 46 6 8 TG 8 7 256790 CASAVA_Build 11 134119092 1D ACAGAAAGCA T/- TCAGCTTCAC 3070 het 3070 ref 51 25 20 8 T 2 1 256791 CASAVA_Build 11 134119898 2D GAGGGAATGG GA/-- GAGAGAGACA 3070 hom 91 het 35 0 28 8 GA 5 4 256792 CASAVA_Build 11 134120567 2I GTAGTGTGCA --/GC GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 GC 0 1 256793 CASAVA_Build 11 134120728 1D CCCTGTTAAA C/- CTCCCGTCCC 3070 hom 105 het 37 0 32 5 C 2 1 256794 CASAVA_Build 11 134121669 1D AGATAGAATA T/- TTTTTTGTGG 3070 hom 126 het 49 0 43 7 T 7 6 256795 CASAVA_Build 11 134122270 2D9M3D TTTGTCAGAA GGACTAGTCTGATA/--TCTAGTCTG--- TGTTACTCCG 3070 het 3070 hom 43 15 28 7 N/A 0 0 256796 CASAVA_Build 11 134129016 1D TCTCAAGGCA C/- CAGGAGCTGA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 C 2 1 256797 CASAVA_Build 11 134129253 14D CGGCCTCTGC CATCCCCTGGCCTG/-------------- CATCCCCACT 3070 hom 56 het 33 1 28 9 CATCCCCTGGCCTG 1 0 256798 CASAVA_Build 11 134131149 2I CCCAGAGAGC --/AG AGAGTTTCCT 3070 hom 124 het 45 0 41 4 AG 2 3 256799 CASAVA_Build 11 134136419 1D CCACTGGCAA T/- CAGAGTTGTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 1 0 256800 CASAVA_Build 11 134142091 5I ATAGCAAACA -----/TATCT TATAAAGAGA 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TATCT 0 1 256801 CASAVA_Build 11 134145708 5I TTAAAAAAAA -----/AAAAC AAATAGCCAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AAAAC 0 1 256802 CASAVA_Build 11 134148707 3D AAGAAGGAGT AGG/--- AGGAGGAGGA 181 het 181 ref 25 10 4 12 AGG 6 5 256803 CASAVA_Build 11 134154843 1I GGGAGTCAAA -/G TTTCCTGGAC 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 G 0 1 256804 CASAVA_Build 11 134157571 1D AAACCTGAAG T/- TAGGGGAGAC 3070 hom 105 het 37 0 34 3 T 2 1 256805 CASAVA_Build 11 134164309 6I AAGGACCACG ------/GCACAA GCACTGAGCC 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 GCACAA 0 1 256806 CASAVA_Build 11 134172287 1I ACATAGGGAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 41 hom 34 1 29 4 T 8 9 256807 CASAVA_Build 11 134172693 1I ACCTTAGTGA -/G CATCAGAAAC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 G 0 1 256808 CASAVA_Build 11 134175147 17D TATAAATATA TATGTATGTATATATAT/----------------- TATGTGTGTA 1325 het 1325 ref 7 3 3 3 TATGTATGTATATATAT 1 0 256809 CASAVA_Build 11 134175414 1I GTCTCTTGGA -/G TTGCAGTGCT 2450 het 1871 hom 18 7 7 4 G 0 1 256810 CASAVA_Build 11 134177125 1I ATACAAAGAG -/A AAATGCATGT 3070 het 3070 hom 53 18 22 13 A 3 4 256811 CASAVA_Build 11 134179475 6I GGTTGTGCTG ------/CAGAGC CAGGGTCACC 3070 het 3070 hom 51 18 19 14 CAGAGC 0 1 256812 CASAVA_Build 11 134190997 4D TTTTTCTTTT TTTC/---- TTTTTTTTTT 2690 het 1173 hom 26 8 13 7 TTTC 1 0 256813 CASAVA_Build 11 134192543 1D AACAAAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2722 hom 29 8 12 9 A 12 11 256814 CASAVA_Build 11 134193752 1I GAGAAGTTTC -/A AAAAAAAAAA 1594 het 1594 ref 26 11 5 10 A 13 14 256815 CASAVA_Build 11 134199092 2I TTTCGCTCTC --/TG TGCTCACAGA 3070 het 3070 ref 61 32 18 11 TG 1 2 256816 CASAVA_Build 11 134211581 1I CAAGTTAATC -/A GGGAGGGGTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 0 1 256817 CASAVA_Build 11 134237331 1D CTTAAGCAAC A/- AAAACAGTAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 A 5 4 256818 CASAVA_Build 11 134244241 1I AAAAATACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 29 2 20 7 T 11 12 256819 CASAVA_Build 11 134246304 1D TTTTTTTTTC T/- AATTTAGCTG 3070 het 3070 hom 26 9 13 5 T 1 0 256820 CASAVA_Build 11 134251251 1I CAGGCTTGCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 8 9 256821 CASAVA_Build 11 134253850 1D CCCATGCTCC T/- TTATTCTTTC 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 T 3 2 256822 CASAVA_Build 11 134268076 1D GATTATGAGG C/- CCCCCCCCGC 3070 hom 61 het 26 0 15 12 C 9 8 256823 CASAVA_Build 11 134269411 4I AAGGTATTTT ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 GA 7 9 256824 CASAVA_Build 11 134269892 3I40M2D AAATAATACC ---TATATGTGGTAAAAAATGTTATAAAACGACTAGTGGTAGTTA/TAATATATGTGGTAAAAAATGTTATAAAATGACTAGTGGTAGT-- TACCTTGGGA 3070 hom 105 het 30 0 36 3 N/A 0 0 256825 CASAVA_Build 11 134272069 1I TTGTGTGAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 10 256826 CASAVA_Build 11 134275808 4D TGACTTTATA CTTT/---- ATTTCGAGAA 3070 hom 87 het 34 0 29 7 CTTT 1 0 256827 CASAVA_Build 11 134278581 2I GAGGAATACA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 11 256828 CASAVA_Build 11 134281623 1D GAGAACGGGG C/- AGACAAGAGG 3070 hom 62 het 23 0 20 3 C 1 0 256829 CASAVA_Build 11 134283721 1I CTTCCGCAGT -/G GCAGGAGAGC 3070 hom 126 het 48 0 39 9 G 1 2 256830 CASAVA_Build 11 134286336 8D GGCCTGGTGA ATAACTAC/-------- ATATGCTTCT 3070 hom 144 het 51 0 46 11 ATAACTAC 1 0 256831 CASAVA_Build 11 134313481 1I AGATCTACCC -/T TATGACCCAA 3070 hom 96 het 34 0 31 3 T 1 2 256832 CASAVA_Build 11 134319901 3D AGGGAAAAAC AAG/--- AAGCGGGGAA 3070 het 3070 hom 29 11 17 2 AAG 2 1 256833 CASAVA_Build 11 134325448 1I CAGGAGTTTT -/G CCTCCATCAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 0 1 256834 CASAVA_Build 11 134325726 2D AGTGACAAAA AG/-- ATATTTTTTC 2957 het 2957 ref 24 14 8 2 AG 1 0 256835 CASAVA_Build 11 134328311 2D TATTTTCACT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 49 24 15 11 AC 10 9 256836 CASAVA_Build 11 134329223 2D TCCTTACCTC TT/-- TGTGTTTATG 3070 het 3070 ref 37 19 9 9 T 3 1 256837 CASAVA_Build 11 134329453 24I TACCCATGAC ------------------------/CACACACTCACACACGCACACAAT CACACACTCA 3070 het 3070 hom 43 19 15 11 CACACACTCACACACGCACACAAT 0 1 256838 CASAVA_Build 11 134333007 1D GCAGGGTGTC A/- AGCCGTCTCA 3070 het 3069 hom 32 9 10 13 A 2 1 256839 CASAVA_Build 11 134335321 4I GTTTGTAAGA ----/CACT CAGTCTATGG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 CACT 0 1 256840 CASAVA_Build 11 134335896 1I AAGTATTTGA -/T TTTTCCCAGC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 4 5 256841 CASAVA_Build 11 134338652 2I AAATATACAC --/AT GACATTAGAA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 AT 0 1 256842 CASAVA_Build 11 134338898 1I AAAACTTGAG -/T TTTTTTTTTT 2546 het 2546 ref 25 13 9 3 T 10 11 256843 CASAVA_Build 11 134340764 1D GCTCTGTATC A/- AAAAAAAAAA 130 het 130 ref 22 12 3 7 A 11 10 256844 CASAVA_Build 11 134341594 1I TAACTATAAG -/A GATAATTGCT 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 0 1 256845 CASAVA_Build 11 134343701 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 T 10 9 256846 CASAVA_Build 11 134349842 1I CGAGCTCACC -/A ACCAGCCACC 2577 het 2577 ref 27 13 8 6 A 1 2 256847 CASAVA_Build 11 134358260 23D CTCCATGTGC CATTAGAATTAACACTGCACAGT/----------------------- CATTAGAATT 3070 het 3070 ref 29 24 10 5 CATTAGAATTAACACTGCACAGT 2 1 256848 CASAVA_Build 11 134364141 1I ATTTGATGTC -/T TCTTTTTTTT 3070 het 321 hom 24 1 21 2 T 1 2 256849 CASAVA_Build 11 134372441 1I AGAAAGGAAG -/A AAAAAAAAAA 2857 het 1677 hom 12 4 7 1 A 10 11 256850 CASAVA_Build 11 134380463 1I TTGGGACCAC -/G CTTCTTCCCT 3070 het 2767 hom 27 8 15 4 G 0 1 256851 CASAVA_Build 11 134383995 1I CATCTCTATT -/A AAAAACAAAA 2522 het 2184 hom 13 7 6 0 A 5 6 256852 CASAVA_Build 11 134384260 1D AATTTTCTCA T/- TTTTAAAAGG 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 5 4 256853 CASAVA_Build 11 134384331 1D ATTTTGCAAA G/- CACCTAGAAA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 G 1 0 256854 CASAVA_Build 11 134405265 4D CTATCATCTA ATCT/---- ATCTATTACC 3070 het 3070 ref 41 22 14 7 ATCT 2 1 256855 CASAVA_Build 11 134419413 2D TGTACAGAAT TC/-- TCTCTTAATT 2633 het 2633 ref 27 14 7 7 TC 3 2 256856 CASAVA_Build 11 134427836 1D TCTTTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 9 4 T 12 11 256857 CASAVA_Build 11 134449960 2D GACAGTACTG AA/-- AATACTGTAG 3070 hom 187 het 69 0 62 8 A 4 2 256858 CASAVA_Build 19 23475 14D CTGTGTCTCC CTCTCTCTCTCTCT/-------------- CTCTCTCTCT 1824 het 1824 ref 40 35 4 2 CT 13 6 256859 CASAVA_Build 19 32518 4D CTGTCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3047 het 1119 hom 12 4 7 5 AAAT 3 2 256860 CASAVA_Build 19 43094 6D TCTCTAACTG GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 565 hom 22 4 11 7 GT 13 10 256861 CASAVA_Build 19 50006 2D AAGGGGAAAT TG/-- TGTGACTCAG 1353 het 1353 ref 13 9 4 0 TG 3 2 256862 CASAVA_Build 19 93644 1I AAATTCACCA -/T GCTTAAGTGG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 0 1 256863 CASAVA_Build 19 109604 3I GCTATGCTGA ---/CAT CATACTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 CAT 1 2 256864 CASAVA_Build 19 111646 1D TTCTATTATC T/- GCCCTTTTGG 1332 het 1332 ref 19 14 3 2 T 1 0 256865 CASAVA_Build 19 169199 1I AAGCAACCAC -/A TTTTTTTTTT 1664 het 1327 hom 11 4 6 1 A 0 1 256866 CASAVA_Build 19 197248 1D CCGTCGATGC G/- GCCCCGAGTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 2 1 256867 CASAVA_Build 19 199069 2D TTTTTATTGC AG/-- AGTGAATGAT 2606 het 2606 ref 56 46 6 4 AG 2 1 256868 CASAVA_Build 19 200035 1D AATTATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 A 11 10 256869 CASAVA_Build 19 202056 2I CAGGAGTTTG --/TA TAAAAGCCTA 3070 het 3070 hom 43 22 18 3 TA 1 2 256870 CASAVA_Build 19 202490 4I CAAACCTCTG ----/CTGA CTATGTGTTC 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 CTGA 0 1 256871 CASAVA_Build 19 202694 10I TGCCTTGGAG ----------/TGCTCTCCAT GCTCTCAATG 1892 het 1892 ref 19 11 4 4 TGCTCTCCAT 0 1 256872 CASAVA_Build 19 203490 3D GGCAGCAACA AGG/--- AGAAGTGCTG 2038 het 2038 ref 60 49 6 9 AGG 1 0 256873 CASAVA_Build 19 211239 1D AGGATATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 A 11 10 256874 CASAVA_Build 19 213553 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 1006 hom 13 3 9 3 T 9 8 256875 CASAVA_Build 19 217075 1D GTATCCAAGA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 3 2 256876 CASAVA_Build 19 217760 5I TGCCTTTGTT -----/GAAAG GAAAGAATAA 3070 het 3070 ref 62 31 23 8 GAAAG 1 2 256877 CASAVA_Build 19 220381 4I TTAATTAATT ----/AATA CTCAACAAAC 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 AATA 0 1 256878 CASAVA_Build 19 221224 4D TTCATGAGAG AGAA/---- AGAAAGGCAT 602 het 602 ref 34 26 3 5 AGAA 2 1 256879 CASAVA_Build 19 230061 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 17 0 14 3 A 13 14 256880 CASAVA_Build 19 237165 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1556 het 1019 hom 17 8 6 3 A 12 11 256881 CASAVA_Build 19 239330 1I CCTTTCGCAT -/C CCCCTCAGAC 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 C 4 5 256882 CASAVA_Build 19 245745 3D CAGCGGAGGG CAA/--- CAGTGCGTTC 3070 hom 81 het 30 0 23 7 CAA 1 0 256883 CASAVA_Build 19 266180 1D GCCTGGCAAA C/- ATGGCGAAAC 2210 het 329 hom 7 1 6 1 C 1 0 256884 CASAVA_Build 19 267298 2I GATATGTAGA --/TT TTTTTTTTTT 2991 het 2454 hom 31 10 11 10 T 12 14 256885 CASAVA_Build 19 289582 1I AGCCGATTTC -/A AAAAGCATAT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 4 5 256886 CASAVA_Build 19 299405 1D TTTTCCCTAG A/- AAAAAGAGGC 1937 het 1937 ref 31 13 10 8 A 6 5 256887 CASAVA_Build 19 306623 1D TTCTCCTGCC T/- CACCCTCCCG 2627 het 234 hom 11 1 7 3 T 1 0 256888 CASAVA_Build 19 317140 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1253 het 1253 ref 22 12 3 8 A 12 11 256889 CASAVA_Build 19 321867 1D AAAAGGTACA G/- GGCGTAGAGC 3070 hom 51 het 21 0 16 5 G 3 2 256890 CASAVA_Build 19 336779 2D TTGCGTAAAG CC/-- CCCCCTTATA 3070 het 3070 ref 50 36 10 4 C 7 5 256891 CASAVA_Build 19 338441 2I CCCCCTCTTC --/GA AAGAAACACG 1135 het 1135 ref 12 7 3 2 GA 0 1 256892 CASAVA_Build 19 339481 1D AGTTACAAAT G/- GAAGAAATAC 2499 het 2499 ref 30 19 6 6 G 2 1 256893 CASAVA_Build 19 350201 1I GGTTTATGCG -/A TGAGTGCTTT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 0 1 256894 CASAVA_Build 19 372398 2D68M4I AGACTCCATC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAGAGAAAAAAAGGAAAGGAGGGAGGGAGAGAGGG----/--AAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAGAGAAAAAAAGGAAAGGAGGGAGGGAGAGAGGGAGGA AGGAAGAAGG 3070 hom 65 het 18 0 23 8 N/A 0 0 256895 CASAVA_Build 19 413992 2D TTCGGGTCTC TT/-- TTCTGTGACA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 4 2 256896 CASAVA_Build 19 414811 1D GGCCCGCCAG C/- CCCCCGTTCA 1311 hom 21 het 18 0 6 12 C 6 5 256897 CASAVA_Build 19 416428 4I GATGGGTAGG ----/TGAA TGAGTAGATG 3070 hom 83 het 40 0 17 23 TGAA 0 1 256898 CASAVA_Build 19 421374 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1585 hom 12 het 5 0 5 0 T 13 12 256899 CASAVA_Build 19 422741 1D TATTGTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 13 12 256900 CASAVA_Build 19 426777 1D TGCAGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 25 0 12 13 T 15 14 256901 CASAVA_Build 19 433599 1D GGGTGAGATC G/- GCAGGGCGTC 3070 het 3070 hom 47 17 22 9 G 2 1 256902 CASAVA_Build 19 471116 7I CCAGAACGCA -------/CAGGGCC GCCCACTCGC 3070 het 2115 hom 28 9 12 7 CAGGGCC 0 1 256903 CASAVA_Build 19 473048 5D CGGGAACAGA ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 ATTTT 3 2 256904 CASAVA_Build 19 477595 1D GTTTTTCCCC T/- TTTTTTTTTT 752 het 752 ref 22 9 4 9 T 13 12 256905 CASAVA_Build 19 489536 1D TTCCTATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 30 1 17 12 T 12 11 256906 CASAVA_Build 19 497866 1D AGTTTTTTTT A/- AGAGACTGGG 2763 het 443 hom 9 1 8 0 A 2 1 256907 CASAVA_Build 19 506206 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1714 hom 25 het 18 0 8 10 T 14 13 256908 CASAVA_Build 19 513825 1D GTTCGCATTC T/- TTTTTTTTTT 2394 het 1605 hom 22 7 8 7 T 13 12 256909 CASAVA_Build 19 520755 1I CTCATGTTTT -/C TTAGGTCACA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 C 0 1 256910 CASAVA_Build 19 529719 1I AGCCTTGGCC -/A GGGGGTGCTG 2000 het 2000 ref 31 10 7 14 A 0 1 256911 CASAVA_Build 19 531164 1D AGTCGGGGAG A/- AGGGGGTCTG 3070 het 2482 hom 18 6 12 0 A 2 1 256912 CASAVA_Build 19 544620 1I ACTTGGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3037 het 2844 hom 21 7 9 5 A 9 10 256913 CASAVA_Build 19 574081 1I AGAGACCTCA -/T TGGCCCTCAA 1267 het 1267 ref 24 13 6 5 T 1 2 256914 CASAVA_Build 19 577899 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 1560 het 631 hom 11 2 5 4 AT 8 7 256915 CASAVA_Build 19 634384 4I ATAAAGACTC ----/AAAG AAGCCATTTT 3070 hom 61 het 22 0 19 3 AAAG 0 1 256916 CASAVA_Build 19 641286 1I ACTCCAGCCT -/G GGGGACACAG 1731 hom 15 het 6 0 6 0 G 4 5 256917 CASAVA_Build 19 661693 1D ACCTGGGGCC G/- GGGGGCCTCG 2152 hom 20 het 8 0 6 2 G 6 5 256918 CASAVA_Build 19 674650 1I GGAGTGCAGC -/G GCGTGATCTC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 1 2 256919 CASAVA_Build 19 700827 11D TCCGTCTCAA AAAAAAAACAC/----------- AAAAAAAGCA 1838 het 1564 hom 13 5 6 4 AAAAAAAACAC 1 0 256920 CASAVA_Build 19 703694 1D ACCCAACCCC G/- ACCCCACTGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 1 0 256921 CASAVA_Build 19 718340 1D ACAGCCCGGA T/- GGTCCTGCTC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 1 0 256922 CASAVA_Build 19 758114 1D CAAGGCGGTG C/- CCAGCCTGGC 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 C 3 2 256923 CASAVA_Build 19 763299 3D TTCGAATAAA TCT/--- TCTGTATCCT 3070 het 1947 hom 25 7 13 5 TCT 2 1 256924 CASAVA_Build 19 767806 4D CCAACAGTAC CCAT/---- CCATCCATCC 2631 het 1582 hom 33 7 10 16 CCAT 5 4 256925 CASAVA_Build 19 787289 18I ACACAGAGAC ------------------/AGAGAGAGACAAAGACAG AGAGAGAGAC 3070 het 3070 hom 32 16 11 5 AGAGAGAGACAAAGACAG 0 1 256926 CASAVA_Build 19 797748 4I GCTCACACTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 61 het 26 0 20 6 TTTG 2 3 256927 CASAVA_Build 19 810068 1D CTGAAGGCGG A/- CATCCCTGAA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 1 0 256928 CASAVA_Build 19 814751 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2235 het 2235 ref 15 9 6 0 A 9 10 256929 CASAVA_Build 19 815503 2I TCGTAGAAAA --/AG AGACTGATGG 3070 hom 59 het 23 0 16 7 AG 1 2 256930 CASAVA_Build 19 815638 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2012 het 486 hom 8 1 6 1 A 7 6 256931 CASAVA_Build 19 816120 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2207 het 1136 hom 24 4 14 6 A 14 15 256932 CASAVA_Build 19 828296 2I GCGCACGCCC --/CT GTGTGTGGGC 2460 het 1462 hom 28 7 11 10 CT 0 1 256933 CASAVA_Build 19 833387 10D GGTGGTGATG CACGCCTGCA/---------- CACGCCTGTA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 CACGCCTGCA 1 0 256934 CASAVA_Build 19 854229 1D GATGCCTCAG C/- CCCCCCCGCA 1473 het 9 hom 8 0 5 3 C 8 7 256935 CASAVA_Build 19 866656 1I AATGTCTTGG -/A ACTCTGTTGC 3070 hom 57 het 23 0 18 5 A 1 2 256936 CASAVA_Build 19 867263 2D GCATGGTGGC AG/-- GCACCTGTAA 1207 het 1207 ref 10 4 3 4 AG 1 0 256937 CASAVA_Build 19 917967 1I AAATCAATAA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 25 1 20 4 G 1 2 256938 CASAVA_Build 19 920671 2D ATCTACATAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AT 7 6 256939 CASAVA_Build 19 939151 2I TTTCTGACCC --/GT GTGAGCTGTG 3070 hom 46 het 19 0 17 2 GT 1 2 256940 CASAVA_Build 19 944375 1I CCAGGCCATG -/C CCTCCGGTAA 3070 hom 43 het 19 0 13 6 C 2 3 256941 CASAVA_Build 19 944731 1I CTGGCCCAGG -/C CCCCTGTCTG 3070 hom 69 het 26 0 21 5 C 4 5 256942 CASAVA_Build 19 953825 3D GTGTAGGAGT TGG/--- TGGGCATAGA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TGG 2 1 256943 CASAVA_Build 19 960551 27D GGCCAGAGCG GCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT/--------------------------- GGCCGACCGG 2295 hom 29 het 10 0 8 4 GCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT 1 0 256944 CASAVA_Build 19 971212 9I AGCGGGGAAC ---------/GGGGTGGGG GCAGCTGAAA 3070 hom 30 het 14 0 9 5 GGGGTGGGG 0 1 256945 CASAVA_Build 19 973890 1I ATATTTTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 110 het 45 0 37 8 T 9 10 256946 CASAVA_Build 19 977958 1I GTGACCCATT -/C CCCCCCCCCA 1442 het 340 hom 14 1 6 7 C 9 10 256947 CASAVA_Build 19 990147 1D CTTGGGGGAT G/- GGGGGATCAA 3070 hom 69 het 28 0 20 8 G 6 5 256948 CASAVA_Build 19 996974 4D CCACTGCACT CCAG/---- CCTGGGCGAT 3070 hom 30 het 12 0 9 3 CCAG 1 0 256949 CASAVA_Build 19 1002371 49D GAAGCCGGGT ACTGAGGTCCACGTGGGTAGGCAACCTTGCCCAAGGCTGGGTGTGACAC/------------------------------------------------- ACTGAGGTCC 3070 hom 64 het 17 0 22 2 ACTGAGGTCCACGTGGGTAGGCAACCTTGCCCAAGGCTGGGTGTGACAC 1 0 256950 CASAVA_Build 19 1011208 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 0 1 256951 CASAVA_Build 19 1012532 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 9 10 256952 CASAVA_Build 19 1017626 14D TGGGGACCCA GACGGACAGGGCCC/-------------- GGTAACCTGG 2219 het 2219 ref 23 8 8 11 GACGGACAGGGCCC 1 0 256953 CASAVA_Build 19 1023058 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- CTTTCCTTTC 3070 het 2396 hom 21 6 14 1 T 4 0 256954 CASAVA_Build 19 1037993 1D TGGAACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 600 hom 38 3 21 14 T 15 14 256955 CASAVA_Build 19 1038705 1D GGAAGCACTG T/- CCCCATCACA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 1 0 256956 CASAVA_Build 19 1051134 1D AGAGACAGGA G/- GGGATGTGTG 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 G 4 3 256957 CASAVA_Build 19 1054376 1D ATCCCAGCAC T/- TTTGGGAAGC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 4 3 256958 CASAVA_Build 19 1082417 14D GAGGTGGGGA GCTGGGAGGACCTG/-------------- GCTGGGAGGA 1219 het 1219 ref 20 11 4 5 GCTGGGAGGACCTG 2 1 256959 CASAVA_Build 19 1115198 1D GCCAAGGGGC T/- GGTGCCATGG 1652 het 467 hom 13 1 6 6 T 1 0 256960 CASAVA_Build 19 1121931 5I GGCAACACAC -----/ACATA ACATGAGCAC 3070 hom 191 het 71 0 55 16 ACATA 0 1 256961 CASAVA_Build 19 1143379 2I GTTTTTGTTT --/TG TTTTTTTTCT 3070 het 1668 hom 26 5 11 10 TG 0 1 256962 CASAVA_Build 19 1162460 1D GTGGGGTTCT G/- GGGGGGGGGG 2411 hom 28 het 27 0 14 13 G 11 10 256963 CASAVA_Build 19 1173639 1I ACTGGGGCTG -/C CCCCCCGATA 2331 het 2331 ref 28 10 9 9 C 6 7 256964 CASAVA_Build 19 1208902 1I TTTCTTGATC -/T TTTTTTTTGC 1767 het 1767 ref 16 8 5 3 T 8 9 256965 CASAVA_Build 19 1221232 1D TGACAGCCAG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 59 het 29 0 18 11 C 10 9 256966 CASAVA_Build 19 1244474 4I GCCGGGAGGA ----/CCAT CCATCCCCTT 2548 het 2548 ref 32 12 11 9 CCAT 1 2 256967 CASAVA_Build 19 1249419 2D GATGTACGAT TA/-- GGAGTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 6 TA 1 0 256968 CASAVA_Build 19 1251971 1I TTATTTTGGT -/G GGGGGGGTGG 3070 het 2134 hom 22 8 11 3 G 7 8 256969 CASAVA_Build 19 1259829 1D GTGGGGCGAG T/- TTATCTCTCA 3070 hom 63 het 25 0 20 6 T 3 2 256970 CASAVA_Build 19 1273726 4D CAGACGCAGG CAGA/---- CAGAGTCAGA 3070 hom 130 het 46 0 40 9 CAGA 2 1 256971 CASAVA_Build 19 1273852 2D12M4I AGACAAAAAC AGAGAGACAAAGAC----/--AGAGACAAAGACAGAG AGAGACAGAG 3070 hom 67 het 25 0 22 5 N/A 0 0 256972 CASAVA_Build 19 1280730 4I TGAGACAGAG ----/GCTT GCTCTATCGT 3070 hom 75 het 30 0 23 7 GCTT 0 1 256973 CASAVA_Build 19 1286038 1I GGGTTTCACC -/A TGTTGGCCAG 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 0 1 256974 CASAVA_Build 19 1307656 1I TTTTCACACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 35 2 20 13 A 13 14 256975 CASAVA_Build 19 1309189 1D TCTTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 A 15 14 256976 CASAVA_Build 19 1317180 18D GGGAGACTTC GCTGGGGTCACCCCCAGA/------------------ GCTGGGGTCA 3070 hom 75 het 25 0 25 3 GCTGGGGTCACCCCCAGA 1 0 256977 CASAVA_Build 19 1332624 1D GACTGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 759 hom 25 2 18 5 A 12 11 256978 CASAVA_Build 19 1340325 2D CACATGCACA CT/-- CACACACATG 3070 hom 147 het 72 0 44 30 CT 1 0 256979 CASAVA_Build 19 1428001 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 12 11 256980 CASAVA_Build 19 1431633 3I AGAAAGAAAA ---/AAG AAAAGAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AAG 0 1 256981 CASAVA_Build 19 1444599 3I GTTTTGGCTG ---/ATT TTGAATAATT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 ATT 0 1 256982 CASAVA_Build 19 1456369 1I TCTACCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 51 3 33 15 A 13 14 256983 CASAVA_Build 19 1457711 1D CCCCACTCAT C/- CCCCACCCTG 2431 hom 33 het 14 0 12 2 C 5 4 256984 CASAVA_Build 19 1462185 4I TTGTTAGTTA ----/GTTT GTTTGTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 GTTT 2 3 256985 CASAVA_Build 19 1482426 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAACAAAAAC 218 het 218 ref 12 8 2 2 AAAC 2 1 256986 CASAVA_Build 19 1493229 3D TCTTTCTTCC CTT/--- CTTCTTCCTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CTT 3 2 256987 CASAVA_Build 19 1499267 1I TTAAAAACAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 1871 hom 16 5 8 3 A 6 7 256988 CASAVA_Build 19 1500045 1I ACATGCTGGT -/G TTGGTTTTTT 3070 het 2142 hom 29 9 17 3 G 0 1 256989 CASAVA_Build 19 1582273 1D GTCTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 19 0 13 6 T 13 12 256990 CASAVA_Build 19 1595396 1D TGAACGGGGA G/- GGGGTCACCC 3070 hom 29 het 23 0 12 11 G 5 4 256991 CASAVA_Build 19 1599817 1D CACTGGGCAT G/- GGGGGGGGGG 2704 hom 24 het 12 0 9 3 G 14 13 256992 CASAVA_Build 19 1600424 3D CCTTTACTTC TTT/--- GAGGAAGGAT 3070 hom 94 het 36 0 27 16 T 3 0 256993 CASAVA_Build 19 1613212 1I AATCAATAAG -/A AAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 6 7 256994 CASAVA_Build 19 1619263 4I TGTTTCTCTT ----/TCTC TATCTCTTTC 3070 hom 141 het 54 0 45 9 TC 0 2 256995 CASAVA_Build 19 1622661 1D AAGAATATCA C/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 C 1 0 256996 CASAVA_Build 19 1622895 8I TCACCATTGG --------/TGCCTTTT TGCCTTTTCC 1023 het 504 hom 7 2 3 2 TGCCTTTT 1 2 256997 CASAVA_Build 19 1651392 1I TCCCACCCCC -/T GGCCCTGGAA 2685 het 2685 ref 27 14 8 5 T 0 1 256998 CASAVA_Build 19 1658141 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1965 het 723 hom 12 2 5 5 A 13 12 256999 CASAVA_Build 19 1668269 1D6M6D9M2D10M3D AGGTGGGTGG ATGGATGAGAGGATGGGTGGGTGGGTGGATGGATGAG/-TGGATG------TATGTACGT--ATGAATGGAT--- AGGATGGATG 3070 het 3070 ref 58 44 11 24 N/A 0 0 257000 CASAVA_Build 19 1673169 19I GTCTGGAGAG -------------------/CAGTGGTGTGTTCTCGGCT CTCTGCAGCC 1714 het 1714 ref 25 11 5 10 CAGTGGTGTGTTCTCGGCT 0 1 257001 CASAVA_Build 19 1673236 11D16M2D GCTGGGATTA CAGGTATCCACCACCATGCCGGGCTAATT/-----------CACCATGCCGGGCTAA-- TTTTTTTTTT 823 het 823 ref 10 8 2 2 N/A 0 0 257002 CASAVA_Build 19 1676172 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 104 het 37 0 35 2 T 7 8 257003 CASAVA_Build 19 1680071 2D GTGCGTGTTC GT/-- GTGTGTTTGT 3070 het 3070 ref 62 29 24 10 GT 4 3 257004 CASAVA_Build 19 1680367 4D GCATACCTAC GTGT/---- GTGTTCCTGT 3070 het 3070 ref 75 37 26 16 GT 4 2 257005 CASAVA_Build 19 1684506 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 8 9 257006 CASAVA_Build 19 1686073 13D TGGGGGAGAG AGTCTGAACCCCA/------------- CCCGGGGAGG 971 het 971 ref 21 10 5 8 AGTCTGAACCCCA 1 0 257007 CASAVA_Build 19 1704089 1D TGTAGGGAAC G/- GGGGGGGGGG 1862 hom 4 het 15 0 7 8 G 14 13 257008 CASAVA_Build 19 1704177 1I GTGCCAGGCA -/G GAAAGCCACA 2615 hom 15 het 6 0 6 0 G 1 2 257009 CASAVA_Build 19 1720592 1D TGGGGGTGAA C/- CTGATGTTGG 1325 het 1325 ref 14 6 4 4 C 2 1 257010 CASAVA_Build 19 1724813 1I CCAGCTCCTA -/G GTGGGGGAAG 1856 het 1856 ref 48 20 13 15 G 1 2 257011 CASAVA_Build 19 1725417 2D TCCCCTCCGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 22 2 11 10 A 12 10 257012 CASAVA_Build 19 1728438 10D51M2D CAGGCACACG CAGACGCACACAGAGACACACATGCAGATACACATGCACACACACATACACACACTGGCCCCT/----------CAGAGACACACATGCAGATACACATGCACACACACATACACACACTGGCCC-- GTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 59 46 26 15 N/A 0 0 257013 CASAVA_Build 19 1743914 3D ATTCTGTTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1533 hom 26 8 10 9 A 15 12 257014 CASAVA_Build 19 1750764 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 554 het 554 ref 24 13 2 9 A 15 14 257015 CASAVA_Build 19 1770235 2D TCTGCCTCAA CT/-- CCCCCTTTCT 1849 hom 15 het 7 0 5 2 CT 1 0 257016 CASAVA_Build 19 1775794 4I TTTATGTATT ----/TATC TATCTTTTTG 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TATC 1 2 257017 CASAVA_Build 19 1782856 12D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAG/------------ AAAGAAAAAG 2320 hom 37 het 12 0 13 4 AAAAAAAAAAAG 1 0 257018 CASAVA_Build 19 1792197 1D CTGACAGTCT C/- CCTTCTACCC 3070 hom 27 het 13 0 10 3 C 3 2 257019 CASAVA_Build 19 1805254 1I CAGACACAAG -/C CCCCCGTCAC 3070 hom 45 het 17 0 13 4 C 5 6 257020 CASAVA_Build 19 1838243 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2837 het 1519 hom 21 6 9 6 A 13 12 257021 CASAVA_Build 19 1841928 2D CCAATTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1510 het 1299 hom 14 6 4 4 T 14 12 257022 CASAVA_Build 19 1849199 3I CAAAACAAAA ---/AAC ACACCAAGGC 3070 het 6 hom 20 1 17 2 AAC 0 1 257023 CASAVA_Build 19 1855828 18D ACCCAGGAGG TGGAGGTTGCAGTGAGCC/------------------ TAGCACTGCA 3070 hom 92 het 34 0 29 8 TGGAGGTTGCAGTGAGCC 1 0 257024 CASAVA_Build 19 1855890 1D GCTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 631 het 631 ref 37 17 4 16 A 17 16 257025 CASAVA_Build 19 1857360 1D CTCACTCTCC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 8 7 257026 CASAVA_Build 19 1866944 1D ACTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1021 hom 10 het 4 0 3 2 A 12 11 257027 CASAVA_Build 19 1869761 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2621 hom 15 het 13 0 9 4 A 15 14 257028 CASAVA_Build 19 1876119 1D CTTTTGAGAC A/- AGAGTTTCAC 3070 hom 43 het 21 0 15 7 A 2 1 257029 CASAVA_Build 19 1880049 1D AGAGCAAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2824 hom 31 10 14 7 A 10 9 257030 CASAVA_Build 19 1880811 1D TCAGGGTCAC A/- GGGGCGATCC 2404 het 1788 hom 20 6 9 6 A 1 0 257031 CASAVA_Build 19 1902688 1D TTCTCTGCTG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 2347 hom 22 7 11 4 T 9 8 257032 CASAVA_Build 19 1905127 1I CACCTGATGC -/A GTTAAACCCA 3070 het 2287 hom 20 7 12 1 A 0 1 257033 CASAVA_Build 19 1918050 4I AAGTGTGTCC ----/TTTG TTTGATTAGA 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 TTTG 1 2 257034 CASAVA_Build 19 1918525 1I AGGCAGGTGG -/C CTGCGGTGGC 2736 hom 39 het 19 0 10 9 C 1 2 257035 CASAVA_Build 19 1940549 2I GAGCAGCCAC --/AT GAGGGCAGGA 3070 het 2706 hom 29 9 14 6 AT 0 1 257036 CASAVA_Build 19 1947093 1D GCACCCTTGC A/- AAAAATTATT 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 6 5 257037 CASAVA_Build 19 1949093 2D CTCACCCATT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 56 22 22 15 CA 7 6 257038 CASAVA_Build 19 1954790 10D AAAAAAAGAG AAAGAAAAGA/---------- AAAGAAAAGA 2591 het 2591 ref 19 12 6 7 AAAGA 4 2 257039 CASAVA_Build 19 1955178 1I TGTCTCATGT -/C CCCCTAACAT 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 C 4 5 257040 CASAVA_Build 19 1958831 6I TGTCTCAAAA ------/AATAAT AATAATAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 AAT 2 4 257041 CASAVA_Build 19 1960020 1I CACACTGTTC -/T TTTTTTTTTT 1340 het 1340 ref 27 10 7 10 T 14 15 257042 CASAVA_Build 19 1960195 5D TTTTTGTGGT TTTTC/----- TTTTTTCTTC 2504 het 2504 ref 18 10 6 2 TTTTC 1 0 257043 CASAVA_Build 19 1960998 4I ACTAAAAAAT ----/ACAA ACAATTAGCC 1465 het 763 hom 9 3 5 1 ACAA 1 2 257044 CASAVA_Build 19 1973903 2D CCGGCCTCAC AT/-- GTTAAGTCCT 2949 het 1962 hom 15 7 7 2 AT 1 0 257045 CASAVA_Build 19 1982785 1I2M18I TGTTGTCTAG -GC------------------/AGCAACAAGACAACAAGTCTG TGGAGTGCAG 2390 het 2390 ref 18 9 7 3 N/A 0 0 257046 CASAVA_Build 19 1988207 5I3M13I8M2D TCATCATGTT -----GGC-------------CAGACCTCGA/TATTAGGCTGGTCTAGAACTGCTGACCTC-- GTGATCCACC 2765 het 989 hom 11 4 8 4 N/A 0 0 257047 CASAVA_Build 19 1990435 1I TGGAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 1846 het 1487 hom 17 7 5 5 A 10 11 257048 CASAVA_Build 19 1999041 1I CTGGGGGCTC -/A ACGGGAGAGG 2336 het 1861 hom 20 7 8 5 A 1 2 257049 CASAVA_Build 19 2003454 10D GTGCATGTGG GTGCGTGTGT/---------- GTGCGTGTGA 3070 het 3070 ref 26 15 10 6 GTGCGTGTGT 1 0 257050 CASAVA_Build 19 2028788 1D AATGGAATCC T/- TTTTTTTTTT 710 het 710 ref 19 9 3 7 T 13 12 257051 CASAVA_Build 19 2073228 1D GCAGATACCC T/- TGGCCCAAGG 2778 het 2778 ref 29 14 10 5 T 2 1 257052 CASAVA_Build 19 2090691 1D CTAATGCACA G/- GAGCCCCTCT 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 G 2 1 257053 CASAVA_Build 19 2091480 1I CTTGCTTGAC -/T TTTTTTTTTT 1966 het 1966 ref 29 11 11 7 T 13 14 257054 CASAVA_Build 19 2110000 1D TCTGTTATAA T/- TTTTTTTTTT 2851 het 2595 hom 20 7 8 6 T 11 10 257055 CASAVA_Build 19 2113682 1D CCCCCCACTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2533 hom 25 8 17 0 A 10 9 257056 CASAVA_Build 19 2117516 1I GTTCAAGCGA -/T TTCTCCTGCC 3051 het 1834 hom 16 5 8 3 T 2 3 257057 CASAVA_Build 19 2129755 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 2654 het 935 hom 16 3 6 7 G 4 5 257058 CASAVA_Build 19 2134932 1D CCTTTGGTGC T/- TTTTTATGTG 3070 het 2373 hom 23 6 12 6 T 6 5 257059 CASAVA_Build 19 2137498 2I TTCAGCTCTT --/GA GAGTCTGAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 GA 1 2 257060 CASAVA_Build 19 2138923 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 904 hom 30 het 13 0 8 5 A 15 16 257061 CASAVA_Build 19 2239964 1D CTGGGTGTGA G/- GGTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 49 18 18 15 G 3 2 257062 CASAVA_Build 19 2240360 1D GCCCTGCCTG C/- CCCCTGCGGT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 C 5 4 257063 CASAVA_Build 19 2254356 2D AGGGAGCTGT GG/-- GGGGGGGGGT 2078 het 91 hom 16 2 7 7 G 11 9 257064 CASAVA_Build 19 2276659 1I GCGGTGGTGC -/A GGGGGAGGGT 3070 hom 52 het 22 0 13 9 A 0 1 257065 CASAVA_Build 19 2289035 2I CGTGCTCGCC --/TG TGTGGTCCTA 3070 hom 58 het 22 0 16 6 TG 2 3 257066 CASAVA_Build 19 2303157 1I GCTCTTGTGA -/T TTTTTTGTGA 2961 het 2961 ref 24 9 7 8 T 6 7 257067 CASAVA_Build 19 2306464 1I GTGTTGTTCT -/A AGTCTCACAA 3070 het 1691 hom 23 6 12 5 A 1 2 257068 CASAVA_Build 19 2313935 27D GTGGTTGTGT GTTGTGTGTGTGTTGTGTGAGGTTGTG/--------------------------- GTTGTGTGTG 3070 hom 98 het 36 0 32 13 GTTGTGTGTGTGTTGTGTGAGGTTGTG 1 0 257069 CASAVA_Build 19 2318560 4D GACTGGCTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1474 het 17 hom 15 1 7 7 T 20 16 257070 CASAVA_Build 19 2328745 2I CAAGGTCTCA --/CT CTGTCACCCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 CT 1 2 257071 CASAVA_Build 19 2331977 2D AAACCCTCCC CT/-- GACGGCGTGT 3070 het 3070 ref 37 26 9 3 CT 1 0 257072 CASAVA_Build 19 2333306 1I AATTTTTTTA -/T TTTTGGTAGA 3070 hom 69 het 24 0 24 7 T 4 5 257073 CASAVA_Build 19 2333604 4I ACACACACAG ----/ACAC ACACATGCAC 3070 hom 135 het 47 0 44 3 AC 2 4 257074 CASAVA_Build 19 2345598 6I CTCGTGTTTC ------/TTTATT TTTAGTTTCT 3070 hom 96 het 37 0 29 8 TTTATT 0 1 257075 CASAVA_Build 19 2345785 1I ATTACGGCCA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 800 hom 43 2 38 3 T 8 9 257076 CASAVA_Build 19 2347912 1D CATTTAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1436 hom 28 10 10 8 T 13 12 257077 CASAVA_Build 19 2350577 4D TTCGTTTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAAC 4 3 257078 CASAVA_Build 19 2357492 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1049 hom 15 het 11 0 3 9 T 13 12 257079 CASAVA_Build 19 2359818 2D ACTAAAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 51 het 27 0 17 10 AC 8 7 257080 CASAVA_Build 19 2363228 6D TTTTGTCTCT ACAAAA/------ ACAAAAACAA 3070 hom 54 het 27 0 19 9 ACAAAA 4 3 257081 CASAVA_Build 19 2371167 3I CTCAAAAAAC ---/AAA GAAGGGCGGG 3070 hom 97 het 38 0 30 8 A 0 3 257082 CASAVA_Build 19 2374059 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2460 het 2423 hom 28 12 9 7 A 17 16 257083 CASAVA_Build 19 2394507 1I CCACCCCTCC -/T TGCCAGCAGA 3070 hom 97 het 38 0 28 10 T 1 2 257084 CASAVA_Build 19 2402835 1I ACACCGGCTT -/G GGGGTCACTT 3070 hom 62 het 24 0 19 5 G 4 5 257085 CASAVA_Build 19 2418141 11D CTCAGCATGC AAAAAAACAAA/----------- AAAAAAACAA 3070 hom 42 het 14 0 15 3 AAAAAAACAAA 3 2 257086 CASAVA_Build 19 2418455 1D GAAAAACCCC T/- AACCTAGGCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 1 0 257087 CASAVA_Build 19 2420441 2D TCTTGCTGTG CA/-- CAGTTTCCCT 3070 hom 91 het 39 0 25 15 CA 2 1 257088 CASAVA_Build 19 2422078 1I CCCCACTTGG -/C CCCCCAAGGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 5 6 257089 CASAVA_Build 19 2422271 1I CACTTCAAAG -/C CCCCCCCGCA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 C 7 8 257090 CASAVA_Build 19 2425141 1D CCTCCTGAGT A/- AGCTGGGATT 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 2 1 257091 CASAVA_Build 19 2428666 1I AATATTTGAA -/C CCCCCTCCCC 1321 hom 10 het 5 0 4 1 C 5 6 257092 CASAVA_Build 19 2429371 2D ACTTAAGCCC CT/-- GTTAGCAGCT 1689 hom 15 het 7 0 6 2 CT 1 0 257093 CASAVA_Build 19 2436601 2D TTAGAAAAAC AA/-- GAGAGAACGA 3070 het 3070 ref 55 24 22 9 A 2 0 257094 CASAVA_Build 19 2444351 14D TATTTATTCC ATTTCATTTCATTT/-------------- ATTTCATTTC 3070 het 3070 hom 26 12 13 6 ATTTCATTTCATTT 2 1 257095 CASAVA_Build 19 2450966 1I GAGGGGTCGT -/G GGGACAGGAG 3070 het 2658 hom 27 9 12 6 G 3 4 257096 CASAVA_Build 19 2453914 1D AAAGACGGGG T/- TTCACCGTGT 2634 het 1261 hom 14 5 7 2 T 3 2 257097 CASAVA_Build 19 2456886 1I ATCTTTAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2776 hom 36 10 15 11 T 9 10 257098 CASAVA_Build 19 2457361 1D TGGGCGTGGT G/- GGTGCATGCC 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 G 3 2 257099 CASAVA_Build 19 2471221 2I CACAGAAGTG --/AA AAAAGTAGAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 4 6 257100 CASAVA_Build 19 2504806 5I TCATGTGTAA -----/TATAT TATATCACAT 1369 het 1369 ref 44 33 4 7 TATAT 1 2 257101 CASAVA_Build 19 2508626 2D AACTCTGAGT CA/-- AAGTGCGATG 3070 het 3070 ref 46 20 20 9 CA 1 0 257102 CASAVA_Build 19 2519301 4I ACACACGCAC ----/ACAT ACACATACAC 3070 het 3070 hom 79 34 36 9 ACAT 0 1 257103 CASAVA_Build 19 2519975 2I GTGCACAAAA --/AC ACATACACAT 3070 het 3070 hom 56 25 26 5 AC 1 2 257104 CASAVA_Build 19 2520262 4D TCATCTCCAT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 2626 hom 26 10 13 3 TC 8 6 257105 CASAVA_Build 19 2521059 1D GGAGGGGGGT C/- CCTCATGGCT 3070 het 1602 hom 23 6 9 8 C 3 2 257106 CASAVA_Build 19 2547369 1I AAATTAAAAT -/A AAAAAATAGT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 6 7 257107 CASAVA_Build 19 2547664 1I GAGACCCTGT -/C CCCCCCCCCA 2801 het 33 hom 25 1 15 9 C 9 10 257108 CASAVA_Build 19 2548196 3D GGAGTTGGAA GCT/--- GCTGCAGGGA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 GCT 2 1 257109 CASAVA_Build 19 2551117 3I GTAATAAAAA ---/ATT ATTAAGGCCC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 ATT 1 2 257110 CASAVA_Build 19 2551467 1D TATCTTGGCA T/- TTTTTTTTTT 756 het 313 hom 16 3 4 9 T 19 18 257111 CASAVA_Build 19 2558561 3D CTAAAATGGT AAA/--- AAAAAAAAAA 968 hom 15 het 12 0 5 8 A 17 14 257112 CASAVA_Build 19 2592827 1I ACCTGGCTGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1360 hom 19 6 8 5 T 8 9 257113 CASAVA_Build 19 2595326 42D GCCTACACTT TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------------------ TATATATATA 2272 het 59 hom 8 1 5 4 TA 27 6 257114 CASAVA_Build 19 2595457 4D AAATGCATAA TTCT/---- TTCTGAGTAT 3070 het 3070 ref 28 17 10 2 TTCT 2 1 257115 CASAVA_Build 19 2596561 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 T 4 5 257116 CASAVA_Build 19 2607028 1D GATTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 315 het 315 ref 16 12 3 1 A 14 13 257117 CASAVA_Build 19 2609971 1D AGCGTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 1152 het 1152 ref 22 9 3 10 T 15 14 257118 CASAVA_Build 19 2619219 1D AAAGTTTATC A/- AAAAAAAAAA 1240 het 1240 ref 35 26 3 7 A 12 11 257119 CASAVA_Build 19 2628252 1D GAGAATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 12 14 T 13 12 257120 CASAVA_Build 19 2640197 1D AAAATAATGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 23 12 10 1 A 9 8 257121 CASAVA_Build 19 2644967 4D AATATCAGAC ACTT/---- AATATTGTGT 3070 het 3070 ref 44 22 21 4 ACTT 1 0 257122 CASAVA_Build 19 2646953 24D GGTCAGGAGT TCGAGACCAGCCTGGGCAACATGG/------------------------ TGAAACCCTG 1929 het 651 hom 7 2 4 2 TCGAGACCAGCCTGGGCAACATGG 1 0 257123 CASAVA_Build 19 2655392 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2605 het 1241 hom 31 7 10 14 A 17 18 257124 CASAVA_Build 19 2779676 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 330 hom 21 2 13 6 A 15 14 257125 CASAVA_Build 19 2784145 1I AATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 9 10 257126 CASAVA_Build 19 2790513 1I ACCAAAAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 0 1 257127 CASAVA_Build 19 2799151 4D TTTGTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 15 het 15 ref 17 9 1 7 TTTC 1 0 257128 CASAVA_Build 19 2802297 1D CCTGGCCGTG A/- ATTTTTTTTT 3070 het 1716 hom 26 7 13 7 A 2 1 257129 CASAVA_Build 19 2803146 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 17 0 12 5 A 13 12 257130 CASAVA_Build 19 2811019 1I GCAAACAAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 163 het 58 0 55 3 A 8 9 257131 CASAVA_Build 19 2817171 2D ATAGGTACAC AG/-- ATATTCGTGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AG 1 0 257132 CASAVA_Build 19 2817831 1I TTTTTTCTAC -/A GGTGGATACC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 257133 CASAVA_Build 19 2820370 1D TTTTTTTAAA T/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 6 5 257134 CASAVA_Build 19 2830873 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 470 hom 5 het 2 0 2 2 A 6 7 257135 CASAVA_Build 19 2839583 1D AGTGAGACCA C/- CCCCCCCATC 3070 hom 73 het 30 0 25 5 C 8 7 257136 CASAVA_Build 19 2841307 1D39M6D AAGGAAGTGG AAAAAAATTGGTTTTGCTTATCTAAAAAGGTTCAGGTGAGTTTATT/-AAAAAATTGGTTTTGCTTATCTAAAAAGGTTCAGGTGAG------ TTTATTATTT 3070 hom 71 het 21 0 25 4 N/A 0 0 257137 CASAVA_Build 19 2844720 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2000 hom 20 het 10 0 7 3 A 17 16 257138 CASAVA_Build 19 2847123 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 29 0 27 10 A 8 7 257139 CASAVA_Build 19 2847286 15D TCTCAAAAAA AAAAAACAAAAAAAC/--------------- AAAAAAAACG 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AAAAAACAAAAAAAC 1 0 257140 CASAVA_Build 19 2848837 1D GAAAGGAACA C/- CCATTTTCAC 3070 hom 81 het 34 0 28 8 C 3 2 257141 CASAVA_Build 19 2849354 2D TACAAAAAAT AA/-- AAAGAGTTAA 3070 hom 72 het 26 0 23 3 A 5 3 257142 CASAVA_Build 19 2849422 2I TGTTTTTTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 14 4 T 11 13 257143 CASAVA_Build 19 2850767 1I CAGTGTGAGA -/C CTCCGTCTCA 2214 hom 18 het 8 0 6 2 C 1 2 257144 CASAVA_Build 19 2852524 2I TATTTTTTTA --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 8 10 257145 CASAVA_Build 19 2859903 1I GTTGTTTCTC -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 7 8 257146 CASAVA_Build 19 2862064 4I GCCCTAGAGA ----/TATT TATTTATTTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TATT 4 5 257147 CASAVA_Build 19 2863195 3D GTTCTTCCTT CTC/--- CTCTCACTTG 3070 het 3070 ref 36 21 13 3 CTC 2 1 257148 CASAVA_Build 19 2867359 1I AATTTTAACC -/A AAAAAAAAAA 2022 het 2022 ref 24 13 5 6 A 11 12 257149 CASAVA_Build 19 2871362 4I AGTTTAGGCA ----/CTAT CTATCTATTA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 CTAT 2 3 257150 CASAVA_Build 19 2871458 2D ACATAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 20 10 T 14 12 257151 CASAVA_Build 19 2871874 2I CAATAAACAC --/AG GGGTATGCTT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AG 0 1 257152 CASAVA_Build 19 2876224 4D GACCCTTGTC TCAA/---- TCAATCAATA 3070 het 3070 ref 49 24 21 9 TCAA 3 2 257153 CASAVA_Build 19 2877703 1D ACCTGCACCC A/- ACTGCCCCTC 1204 hom 24 het 9 0 7 3 A 2 1 257154 CASAVA_Build 19 2888752 5D TGTTTCTTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 73 het 33 0 24 12 TTTTG 3 2 257155 CASAVA_Build 19 2893048 1D TAAGGACAAG A/- AAAAAAAGGC 3070 het 487 hom 30 4 16 10 A 8 7 257156 CASAVA_Build 19 2896815 1D ACTGAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 A 13 12 257157 CASAVA_Build 19 2898172 4D AAGGTCTCTC TAAA/---- TAGACAGTGG 3070 het 3070 hom 47 18 28 5 TAAA 1 0 257158 CASAVA_Build 19 2902237 1D ATTTTGTTTT A/- GTTGCTTTAG 3070 hom 93 het 38 0 31 8 A 1 0 257159 CASAVA_Build 19 2903358 1I AGGAGGTGGA -/G GTTGCCGTGA 3070 hom 33 het 15 0 11 4 G 1 2 257160 CASAVA_Build 19 2905179 2D CACTCCATCC TG/-- TGGGCAACAG 3070 hom 35 het 14 0 11 3 TG 2 1 257161 CASAVA_Build 19 2909673 1I AGATCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 19 1 15 3 T 12 13 257162 CASAVA_Build 19 2921189 3I CTCAAAAAAT ---/AAA AAAAAATTAA 2528 het 2528 ref 13 7 6 0 A 6 9 257163 CASAVA_Build 19 2937415 1D TCTTATCTGC A/- AAAAAGTAGA 2638 het 2638 ref 19 10 7 2 A 6 5 257164 CASAVA_Build 19 2947155 1I GGTGATTCTG -/C CCCCCCGGGG 3070 hom 79 het 36 0 26 10 C 6 7 257165 CASAVA_Build 19 2952271 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 18 1 14 5 A 15 14 257166 CASAVA_Build 19 2957237 2I AGATTGGCCA --/AT GAGCCCCACC 3070 hom 51 het 20 0 17 3 AT 0 1 257167 CASAVA_Build 19 2960884 1I TTTCTCTCTC -/T TCTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 1 2 257168 CASAVA_Build 19 2968240 1I GGTCCAAGTG -/A ATTCTCCTGC 3070 het 1945 hom 20 5 9 6 A 1 2 257169 CASAVA_Build 19 3003857 1D TTGGAAGGAA C/- CCCGTCCTCC 1312 het 1312 ref 23 11 5 7 C 4 3 257170 CASAVA_Build 19 3015699 2I GGCGCCCACC --/GT ACCACGCCCG 1410 hom 10 het 4 0 4 0 GT 0 1 257171 CASAVA_Build 19 3021777 2D24M2D TTTTTCTTTT TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAG/--TTCTTTCTTTTTTTTTTTTGAGAC-- AGTCTTGCTC 3070 hom 57 het 21 0 20 3 N/A 0 0 257172 CASAVA_Build 19 3022648 1I GCTGGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 778 hom 21 2 14 5 T 13 14 257173 CASAVA_Build 19 3047280 1D CATCTTTCCA G/- GGGGCCGCGG 3070 hom 86 het 34 0 27 9 G 5 4 257174 CASAVA_Build 19 3047706 1I TGCAGTCCCA -/C CCCCCTCCCA 2470 hom 37 het 19 0 9 10 C 5 6 257175 CASAVA_Build 19 3048204 3D CTGTTGGGCT GCA/--- GCAGGTGGCT 581 het 581 ref 23 9 5 9 GCA 2 1 257176 CASAVA_Build 19 3048953 1D ATTGTCCCTT G/- GGGGGCACGT 2997 het 2997 ref 30 12 8 10 G 6 5 257177 CASAVA_Build 19 3052565 1I GGGGCCTGGG -/C CTCCGGACTC 3070 hom 69 het 29 0 22 7 C 1 2 257178 CASAVA_Build 19 3052637 1D GAGCTGGGCA G/- GGGCGGGGGT 3070 het 1458 hom 25 7 14 4 G 4 3 257179 CASAVA_Build 19 3053128 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 988 het 988 ref 36 27 3 6 A 10 11 257180 CASAVA_Build 19 3057652 1D GGTTAACATG C/- CAGCCACCCA 3070 hom 112 het 44 0 34 10 C 2 1 257181 CASAVA_Build 19 3068540 1D CCACCACGCC T/- GGCTAATTTT 1179 hom 7 het 3 0 3 0 T 1 0 257182 CASAVA_Build 19 3072300 1I CGGGAGGAGA -/T TTTTTTTTTT 1115 het 1115 ref 19 7 3 9 T 11 12 257183 CASAVA_Build 19 3076533 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2599 het 2402 hom 39 11 9 19 T 15 14 257184 CASAVA_Build 19 3089369 1I GCCTAAGCCC -/G GGGATGCTAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 3 4 257185 CASAVA_Build 19 3092042 1I CAAAAGCTGT -/A TTTTTTTTTA 2224 het 2224 ref 34 16 9 9 A 0 1 257186 CASAVA_Build 19 3092101 1D GGACCAGGGT G/- GGGGTGGGTC 2991 het 2197 hom 26 9 8 9 G 5 4 257187 CASAVA_Build 19 3093519 1I TTCTCTGCAC -/T TTTGGGGCAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 3 4 257188 CASAVA_Build 19 3094955 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAACA 2794 hom 27 het 10 0 10 0 A 9 8 257189 CASAVA_Build 19 3100037 4I AAGGACACAC ----/ACAT ACGTACATGC 3070 hom 193 het 71 0 65 6 ACAT 0 1 257190 CASAVA_Build 19 3104256 1D GGGAATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 33 2 20 12 A 15 14 257191 CASAVA_Build 19 3121465 10D TCATCTATAC AACAAAACAA/---------- AACAAAACAA 1777 het 1777 ref 28 18 5 7 AACAA 5 3 257192 CASAVA_Build 19 3169850 1D GGGAAGACGA G/- AAAAATTCAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 G 1 0 257193 CASAVA_Build 19 3186520 4D GGATGGATGG ATGA/---- ATAGGTGGGT 3070 het 1400 hom 37 8 19 11 ATGA 1 0 257194 CASAVA_Build 19 3227858 1I AGGGGCGTGG -/C CTTGTGATGG 2623 hom 24 het 13 0 8 5 C 1 2 257195 CASAVA_Build 19 3230686 1I ATGGCCTCCT -/G GGCCCCTGCC 633 hom 21 het 20 0 7 13 G 2 3 257196 CASAVA_Build 19 3235136 1I GTGAGCCACC -/A ACACCCAGCT 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 A 1 2 257197 CASAVA_Build 19 3238761 3I AAAACAACAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 AAC 3 4 257198 CASAVA_Build 19 3242931 1D AACCAGACTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 9 8 257199 CASAVA_Build 19 3246269 1D TGTTCACACG C/- CCCCCCTGCT 929 het 929 ref 7 3 4 0 C 7 6 257200 CASAVA_Build 19 3247163 5D CTAGTTGGGA GTGGG/----- GTGGGGTGGG 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 GTGGG 3 2 257201 CASAVA_Build 19 3248370 1I AAAAAAAAAA -/C AATAACAAAA 2378 het 2378 ref 23 12 7 4 C 0 1 257202 CASAVA_Build 19 3254821 1D TGTTATGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1616 hom 31 4 17 10 T 12 11 257203 CASAVA_Build 19 3259758 1D CTTGCTTTTC T/- TTTTTTACAA 3070 hom 88 het 35 0 29 6 T 7 6 257204 CASAVA_Build 19 3276482 1D ACTCCCATCT A/- AAAAAAAAAA 716 het 716 ref 32 22 3 7 A 12 11 257205 CASAVA_Build 19 3289381 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2971 het 8 hom 14 0 8 6 A 16 15 257206 CASAVA_Build 19 3292473 4D TTTGAAGAAC AAGT/---- AATGTGTCCA 3070 het 3070 ref 20 9 10 1 AAGT 1 0 257207 CASAVA_Build 19 3295920 3I GCACCTGATG ---/TGC TGGAGGAACA 3070 hom 51 het 21 0 17 5 TGC 0 1 257208 CASAVA_Build 19 3319065 1D GAGCAGCTTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 1099 hom 26 6 12 10 G 10 9 257209 CASAVA_Build 19 3321695 4I TCTCTGTCTG ----/TCTC TCTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 TC 2 4 257210 CASAVA_Build 19 3339835 1I CTAAAAACCG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 8 9 257211 CASAVA_Build 19 3348672 11D GCCCGGAGGT GGCGGCAACGG/----------- GGCAGCTGAA 2434 het 1407 hom 25 6 10 11 GGCGGCAACGG 1 0 257212 CASAVA_Build 19 3352732 1I TTTTTTTCTC -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 11 het 22 1 15 6 T 7 8 257213 CASAVA_Build 19 3357394 1D GCCCTGCCTA T/- TTTTTTTTTT 1907 het 216 hom 10 1 7 2 T 13 12 257214 CASAVA_Build 19 3362017 3I GCTGTTTTTG ---/TTT TTGTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 5 257215 CASAVA_Build 19 3368941 24I CGGCCACCTC ------------------------/TTTTTCTTTTCTTCCAGTTTTTCA TGGAAGCAGC 2276 hom 12 het 5 0 5 0 TTTTTCTTTTCTTCCAGTTTTTCA 0 1 257216 CASAVA_Build 19 3374022 1D TGGTGAAACT C/- CCGTCTCTAC 3070 hom 49 het 19 0 15 4 C 3 2 257217 CASAVA_Build 19 3379170 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1030 het 143 hom 9 3 4 2 A 14 13 257218 CASAVA_Build 19 3398189 1D CCCAGCTACT C/- GGGAGGCTGA 1840 het 443 hom 7 1 5 1 C 1 0 257219 CASAVA_Build 19 3420152 5D AATAAAAGAC AAACA/----- AAAAAAAAAG 3070 het 1976 hom 13 5 8 0 AAACA 1 0 257220 CASAVA_Build 19 3486269 1I GGGCCTGAGA -/C CCCCGGTTGC 3070 het 1924 hom 27 7 13 7 C 4 5 257221 CASAVA_Build 19 3489648 11I GTTCCAGCAC -----------/GTGGGTGCGTG GGTGGCGGCG 3070 het 3070 ref 39 14 14 11 GTGGGTGCGTG 0 1 257222 CASAVA_Build 19 3510709 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 2213 het 203 hom 17 2 7 8 T 15 14 257223 CASAVA_Build 19 3513415 4D ACCTGAGTGT GGAG/---- GAACAGGTGC 3070 het 3070 ref 37 15 13 12 GGAG 1 0 257224 CASAVA_Build 19 3527315 3D GGTAAGCGAC CTT/--- CTTCCTCTCA 2314 het 2314 ref 23 10 8 6 CTT 2 1 257225 CASAVA_Build 19 3543544 1D AGCTCCAGAA C/- CCAGTCCAGT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 3 2 257226 CASAVA_Build 19 3548420 4D ATTAAAATAC TTTG/---- TTTGAGATCA 3070 hom 27 het 10 0 10 1 TTTG 2 1 257227 CASAVA_Build 19 3556813 16D CAACAGACAC ACAGACACACGCAGAT/---------------- AGACACACAC 2505 het 2505 ref 35 20 11 9 ACAGACACACGCAGAT 1 0 257228 CASAVA_Build 19 3568121 4I CCTTCTCAAA ----/AAAT AAATAAAATA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AAAT 1 2 257229 CASAVA_Build 19 3599017 1D ACTCCTTGGA T/- TTTCTTTTTT 3070 hom 79 het 32 0 24 8 T 4 3 257230 CASAVA_Build 19 3612318 1D AGGCACATGG C/- CGCCAAGAAC 3070 hom 78 het 28 0 21 7 C 2 1 257231 CASAVA_Build 19 3641481 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 1945 het 1945 ref 40 26 5 9 A 15 16 257232 CASAVA_Build 19 3657424 4D GGCATTTTAA TATT/---- TATTTATTTA 2203 het 2203 ref 22 10 6 6 TATT 4 3 257233 CASAVA_Build 19 3661286 3I CGAATCGGAG ---/TCC TCTGGTCTCA 2637 het 2637 ref 26 14 10 2 TCC 0 1 257234 CASAVA_Build 19 3682668 3D AAATTGAAAC AAT/--- GATGATGTTA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 AAT 1 0 257235 CASAVA_Build 19 3689042 19D3M15D TGGCTGTGTC TGTATATTGCTGTCCATGTCATGACCCGGAGAGCAGA/-------------------CAT--------------- TGGCTGTGTC 3070 het 3070 ref 61 60 9 17 N/A 0 0 257236 CASAVA_Build 19 3711592 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 6 7 257237 CASAVA_Build 19 3716912 2D AAAAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 17 2 11 4 AT 1 0 257238 CASAVA_Build 19 3722165 10D TCACTCCCCT CCTTGGCCTC/---------- CCTTGGCCCT 3070 hom 108 het 41 0 31 12 CCTTGGCCTC 1 0 257239 CASAVA_Build 19 3727195 5I TGGCTTTGTT -----/AAGTG AAGAGGAGAG 3070 hom 108 het 41 0 31 10 AAGTG 0 1 257240 CASAVA_Build 19 3736431 1I CCTCTCTGAT -/C CCCCCCCCAA 1627 het 1627 ref 12 7 4 1 C 8 9 257241 CASAVA_Build 19 3738808 2D CCCAAAAGGC TG/-- TGTGTCTGGA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 TG 3 2 257242 CASAVA_Build 19 3781761 3D CTAGGGTCTA ATT/--- ATCTTTCCAG 3070 het 3070 ref 48 22 18 9 ATT 1 0 257243 CASAVA_Build 19 3785331 1I CCCAGGTGCA -/C CCCCACACAC 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 C 4 5 257244 CASAVA_Build 19 3796016 2I ACTTATTTAT --/TC TCTCACAGTT 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 TC 2 3 257245 CASAVA_Build 19 3818303 2I ATCAACTGTT --/GG GGGGGGGGAA 2876 het 2876 ref 40 15 11 14 G 8 10 257246 CASAVA_Build 19 3819071 3D CTGCCCTTCC CCT/--- CCTCCTGCCC 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 CCT 3 2 257247 CASAVA_Build 19 3826291 1I TGGAGCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2189 het 411 hom 22 3 8 11 T 15 16 257248 CASAVA_Build 19 3830334 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1193 het 771 hom 8 3 3 2 A 10 11 257249 CASAVA_Build 19 3832898 1D CCAGGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 1445 het 1445 ref 19 9 4 6 T 12 11 257250 CASAVA_Build 19 3839112 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2243 het 1529 hom 14 5 6 3 A 13 14 257251 CASAVA_Build 19 3844074 1I ACCAGGCACT -/G GGGACTTAAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 G 3 4 257252 CASAVA_Build 19 3858130 1D AGACTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 23 1 15 7 A 12 11 257253 CASAVA_Build 19 3858147 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2510 het 162 hom 22 2 12 8 A 11 10 257254 CASAVA_Build 19 3866338 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 913 het 81 hom 10 1 5 4 T 17 16 257255 CASAVA_Build 19 3904643 2D GCAGGGGGGC GG/-- GGGGGGGGAC 1488 hom 29 het 13 0 8 6 G 10 8 257256 CASAVA_Build 19 3914447 1D TGAGTGTCCT G/- CCTTCAGAAC 1947 het 1334 hom 26 8 5 13 G 1 0 257257 CASAVA_Build 19 3916657 4I ATCCGCTTTT ----/TTTG TTTGTTTTTG 3070 hom 87 het 30 0 28 2 TTTG 1 2 257258 CASAVA_Build 19 3935982 1I CGTTCTGCCA -/T TTCCCTGCCG 3070 hom 78 het 29 0 23 6 T 2 3 257259 CASAVA_Build 19 3937246 2D TATTAATAAA AC/-- AGTTATTTAT 3070 het 3070 hom 49 20 24 6 AC 1 0 257260 CASAVA_Build 19 3957567 1D AAGCCTGGCC A/- AAAAAAAAAT 1721 het 1721 ref 19 7 6 6 A 10 9 257261 CASAVA_Build 19 3964651 1I CATGAGGCTC -/A AGTCAGGCTG 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 1 2 257262 CASAVA_Build 19 3972470 1D TTTAAACCGG T/- CTTGGATTTC 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 T 1 0 257263 CASAVA_Build 19 3975761 2D TGTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 35 0 26 9 T 12 10 257264 CASAVA_Build 19 3977572 4I CATGTCCATC ----/CCCA CCCAGCAGCT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 CCCA 1 2 257265 CASAVA_Build 19 3978013 1I GCCTGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 13 1 10 2 T 11 12 257266 CASAVA_Build 19 4004511 4D GTGTGCGTGT GTGC/---- GTGCGTGCGT 3070 hom 142 het 64 0 44 22 GTGC 5 4 257267 CASAVA_Build 19 4009447 1I TCCCTTTTTT -/C CCGCCTTCCC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 2 3 257268 CASAVA_Build 19 4029973 1D GGTAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 35 1 24 10 T 15 14 257269 CASAVA_Build 19 4073684 1I CCCATCTTTT -/C CCCAAAGGGA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 3 4 257270 CASAVA_Build 19 4075627 4D TTTAATTGAC AAAT/---- AAAATTGCAT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 AAAT 1 0 257271 CASAVA_Build 19 4080392 1D TTGTGGAGAT G/- GGGGGGTCTC 2911 het 2911 ref 26 14 9 3 G 7 6 257272 CASAVA_Build 19 4083887 1I GAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 A 9 10 257273 CASAVA_Build 19 4088135 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2370 hom 17 het 15 0 9 6 T 17 16 257274 CASAVA_Build 19 4096502 5I GAGGAGGAGG -----/GAGAA GAGGAGGCTG 1673 het 1673 ref 16 8 5 3 GAGAA 0 1 257275 CASAVA_Build 19 4097512 1I CCATGTAGAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2273 hom 22 7 9 6 T 8 9 257276 CASAVA_Build 19 4104350 1D AGCTTGGGCC A/- CAGAGCGAGA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 1 0 257277 CASAVA_Build 19 4112628 4D GCAGATGAGA AGGT/---- AGGTCAAGGC 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 AGGT 2 1 257278 CASAVA_Build 19 4142315 3D AGGGGCCAGG CCC/--- CCCCCTCCTG 3070 hom 34 het 16 0 10 6 C 8 5 257279 CASAVA_Build 19 4144495 3D TTTGAAGGAC AAG/--- AAGGAGGCTA 3070 het 3070 hom 30 12 10 11 AAG 2 1 257280 CASAVA_Build 19 4145046 9D ATAGCCTTTG ACTGTCTAC/--------- ACTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 20 9 11 2 ACTGTCTAC 1 0 257281 CASAVA_Build 19 4148363 4D ATGAGTGTGG GAAT/---- GAATGAATGA 3070 het 3070 ref 55 28 16 11 GAAT 5 4 257282 CASAVA_Build 19 4148563 4D GGTCATATAA GAAT/---- GAATGAATGA 3070 het 3070 hom 73 31 32 15 GAAT 3 2 257283 CASAVA_Build 19 4150810 1I AGCCCCTGTC -/A GGGGGCGTGG 1392 het 1392 ref 21 7 8 6 A 0 1 257284 CASAVA_Build 19 4160930 3D GGAGGCAGGG GCT/--- GCTGGTTCCA 3070 hom 52 het 20 0 14 6 GCT 2 1 257285 CASAVA_Build 19 4161402 1I GGCGTGGGCC -/A AGCCTGGGTG 3070 hom 66 het 29 0 21 8 A 1 2 257286 CASAVA_Build 19 4165170 1D CAAATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 17 14 22 T 12 11 257287 CASAVA_Build 19 4166773 1I CCCTGGCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1338 hom 33 5 18 10 A 13 14 257288 CASAVA_Build 19 4167162 1I TACTCATCCG -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 T 6 7 257289 CASAVA_Build 19 4169660 4D GTGTTTTCTC TCTT/---- TCTTTCTCTT 2846 het 2846 ref 26 10 11 6 TCTT 2 1 257290 CASAVA_Build 19 4170283 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2613 hom 17 7 10 0 A 9 10 257291 CASAVA_Build 19 4175951 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2413 het 33 hom 12 1 7 4 T 18 17 257292 CASAVA_Build 19 4178950 4D TCTCTCTTCC TCTG/---- TCTGTCTGCT 3070 hom 99 het 39 0 34 8 TCTG 3 2 257293 CASAVA_Build 19 4193446 1I AAACCTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 753 hom 31 2 20 9 T 12 13 257294 CASAVA_Build 19 4226548 1I ACAGAGCAAG -/A CTCCGTCTCA 3070 hom 33 het 33 0 12 21 A 0 1 257295 CASAVA_Build 19 4278890 1D GCCCCCAGGG C/- TGGCTCCGCC 3070 hom 70 het 28 0 23 6 C 1 0 257296 CASAVA_Build 19 4282941 4D AAAAAGAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 AAAG 3 2 257297 CASAVA_Build 19 4283194 10D CTTTTTCTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2440 het 366 hom 34 5 13 16 T 26 16 257298 CASAVA_Build 19 4303838 1I TAGCAGGGAG -/A CGGGGGGGCA 1992 hom 27 het 15 0 7 8 A 0 1 257299 CASAVA_Build 19 4304560 8D CCACTGTACC TGTTTTTT/-------- TGTTTTTTTG 3070 hom 30 het 14 0 10 6 TGTTTTTT 2 1 257300 CASAVA_Build 19 4306855 2D GCGCCCGGCC TT/-- TTTTTTTTTT 1956 hom 24 het 10 0 8 2 T 14 12 257301 CASAVA_Build 19 4312992 2D AGAAGCTTGG TT/-- TAAGTGGTCA 3070 hom 44 het 17 0 15 3 T 3 1 257302 CASAVA_Build 19 4314565 2D CAAGGGGGCT GA/-- GAGGGGACAG 3070 hom 53 het 22 0 15 8 GA 2 1 257303 CASAVA_Build 19 4321036 2D TCCACACCAG CA/-- CACTGCTGAG 2812 hom 39 het 17 0 12 6 CA 2 1 257304 CASAVA_Build 19 4324127 1D AGCAGTGGGA G/- GGGGGGCCAC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 G 7 6 257305 CASAVA_Build 19 4346161 1D GTAAATGGTG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 9 8 257306 CASAVA_Build 19 4350647 2D AATCCAGCCC CA/-- GATGTCAACA 3070 hom 53 het 22 0 17 5 CA 1 0 257307 CASAVA_Build 19 4355816 1D TTATGATCAC T/- GCTGCATCTG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 1 0 257308 CASAVA_Build 19 4358245 1D CACCCCCCCC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 9 8 257309 CASAVA_Build 19 4358459 1I GAGGCCAGGA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 30 0 24 6 G 1 2 257310 CASAVA_Build 19 4367652 1I CTTTGGGAGG -/C CGAGGCGGGT 2666 het 2666 ref 24 9 10 5 C 1 2 257311 CASAVA_Build 19 4371243 1D CAGGTGAGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 22 2 15 6 T 12 11 257312 CASAVA_Build 19 4372875 4I ACTGAGTCTC ----/ACTT AGTTGCCCAG 3070 hom 57 het 21 0 18 3 ACTT 0 1 257313 CASAVA_Build 19 4415407 1I CTACCCCCAA -/C CCCTGATAAC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 C 3 4 257314 CASAVA_Build 19 4417008 12D CTCTGTCTCA AAATAAATAAAT/------------ AAATAAATAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AAAT 7 4 257315 CASAVA_Build 19 4417173 1D TGGGTGACAT A/- AGTGAGACGC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 1 257316 CASAVA_Build 19 4417304 1I CTAAAGGATC -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 65 het 28 0 22 6 T 5 6 257317 CASAVA_Build 19 4417763 1I TGGGATTACA -/G GCGTGCGCCA 1650 hom 10 het 4 0 4 0 G 1 2 257318 CASAVA_Build 19 4431020 1D GAGTATAGCA G/- TGACAGTTGG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 G 1 0 257319 CASAVA_Build 19 4435505 1D GGATATTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 9 8 257320 CASAVA_Build 19 4441805 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2465 het 2324 hom 29 11 10 8 T 12 11 257321 CASAVA_Build 19 4443338 2D ATGTCGTGCC TG/-- TGTGTGTGTT 3070 het 3070 ref 77 37 26 18 TG 5 4 257322 CASAVA_Build 19 4468335 1D GGGACTGAGT G/- GGGGGGCATT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 G 7 6 257323 CASAVA_Build 19 4525188 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTGTAGG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 T 6 5 257324 CASAVA_Build 19 4564438 1D CTTTCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 T 11 10 257325 CASAVA_Build 19 4589499 1I GTTGGGCTGC -/A AGGGCGGAAA 2905 hom 36 het 15 0 11 4 A 1 2 257326 CASAVA_Build 19 4589818 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 18 1 13 4 T 17 14 257327 CASAVA_Build 19 4671032 3I21M1I CCCTTCGCCC ---CCTCCTCATTGCTCCAGGCAG-/CCTCCTCCTCATTTCTCCAGGCAGC CCCCCCAAGC 3070 hom 58 het 25 0 19 7 N/A 0 0 257328 CASAVA_Build 19 4696233 1D AAGGGTTCCC T/- TTTCTCCACA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 4 3 257329 CASAVA_Build 19 4731857 2D CAACATCAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 35 1 25 11 A 14 12 257330 CASAVA_Build 19 4737175 3D GCTGAAAGGA TCG/--- TCGTTCCACC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TCG 2 1 257331 CASAVA_Build 19 4745949 8I CTGCCTTGCA --------/AACCTCAC GTGGCCTCTG 3070 hom 63 het 25 0 20 5 AACCTCAC 0 1 257332 CASAVA_Build 19 4758246 1I TGCTGGGATT -/A ACAGACGTCA 3070 hom 53 het 19 0 13 6 A 1 2 257333 CASAVA_Build 19 4795666 1D ACCCCCCAGT C/- CCCTCATGGG 3070 hom 60 het 24 0 18 6 C 4 3 257334 CASAVA_Build 19 4801693 1D TGATCCGCCC G/- GCCTTGGCCT 2243 het 89 hom 6 1 5 0 G 2 1 257335 CASAVA_Build 19 4804133 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 19 0 16 3 T 11 10 257336 CASAVA_Build 19 4805426 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 212 hom 23 1 15 7 T 9 10 257337 CASAVA_Build 19 4824789 3D TTGTTTTGTT TTC/--- TTTTCTTTTG 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 TTC 1 0 257338 CASAVA_Build 19 4837389 1I GGCCTCCCAA -/T AGTGCTGGGA 3070 hom 80 het 28 0 21 7 T 0 1 257339 CASAVA_Build 19 4846130 1I AGCTATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 33 1 27 5 T 10 11 257340 CASAVA_Build 19 4854032 14I CCTGTAGTCC --------------/TCACTGGTTCTTTT TCACTGGTTC 3070 het 2133 hom 30 9 12 9 TCACTGGTTCTTTT 1 2 257341 CASAVA_Build 19 4874990 4D TTGACTTCTC TCTT/---- TTTAAGACGG 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 TCTT 1 0 257342 CASAVA_Build 19 4885993 1D GGTGACTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 9 5 T 11 10 257343 CASAVA_Build 19 4888049 1I CAAGCAATAA -/T TTTTTTTTTT 2699 het 1844 hom 24 7 9 8 T 11 12 257344 CASAVA_Build 19 4890394 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 22 10 9 T 9 10 257345 CASAVA_Build 19 4900134 1D GTGACAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1863 hom 19 6 10 4 A 13 12 257346 CASAVA_Build 19 4905680 1I CCGAGCAGGG -/C CGGGTCCCCG 3070 hom 56 het 22 0 15 7 C 1 2 257347 CASAVA_Build 19 4918779 5I AGGTGTGAGT -----/CACCG CGCCCGAGCC 3070 hom 83 het 32 0 22 10 CACCG 0 1 257348 CASAVA_Build 19 4922453 2I TTTCCTGCCC --/CT GTTTGTCCTA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 CT 0 1 257349 CASAVA_Build 19 4923323 1I TGCTTTCTTC -/A TCTGTAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 0 1 257350 CASAVA_Build 19 4931116 1D ACCTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2061 hom 22 7 9 6 A 11 10 257351 CASAVA_Build 19 4953012 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 9 10 257352 CASAVA_Build 19 5010794 7D AATAAATGTA AGCATAG/------- AGGCATCAGA 3070 het 3070 ref 31 14 12 10 AGCATAG 1 0 257353 CASAVA_Build 19 5030864 1I AGGTGTGAGC -/A ACCATGCCCG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 1 2 257354 CASAVA_Build 19 5040712 2D TTTTTGTACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 26 0 19 7 A 13 11 257355 CASAVA_Build 19 5043932 1D AGGAGGGATC A/- GGGGAGGCCG 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 1 0 257356 CASAVA_Build 19 5076838 3I ACAGAGACTC ---/CTT CTGGGAAGGA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 CTT 0 1 257357 CASAVA_Build 19 5078969 2I CTGTGGTCTC --/AT GTGAGGACAG 2760 hom 38 het 18 0 11 7 AT 0 1 257358 CASAVA_Build 19 5088200 1I CCCGGCCCCT -/C CCCCCTGAGT 1854 het 1854 ref 29 13 10 6 C 5 6 257359 CASAVA_Build 19 5091760 3D AAAAAAAGAT GAG/--- GAGAGCAAAA 1534 het 1534 ref 19 7 5 7 GAG 2 1 257360 CASAVA_Build 19 5103127 2I CCTCGGGGGG --/GA GGGGCAGGAC 1623 het 469 hom 16 3 8 5 GA 0 1 257361 CASAVA_Build 19 5133355 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 11 10 257362 CASAVA_Build 19 5144188 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2192 het 1023 hom 13 4 7 2 A 12 11 257363 CASAVA_Build 19 5146758 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTACAG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 7 6 257364 CASAVA_Build 19 5159515 1D TTTTTGAGAT G/- GAGTTTCACT 3070 het 1329 hom 23 4 14 5 G 2 1 257365 CASAVA_Build 19 5175189 6I GACTCCGTCT ------/TAAAAA TAAAAATAAA 3070 het 2955 hom 20 7 10 3 TAAAAA 1 2 257366 CASAVA_Build 19 5203012 1I GGGAACACCT -/G GGGGTCACAT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 G 4 5 257367 CASAVA_Build 19 5206993 1I CATTTTTCTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 8 9 257368 CASAVA_Build 19 5207252 1I TAGTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 2663 het 2663 ref 25 10 8 7 T 10 11 257369 CASAVA_Build 19 5211880 1D AAGGCGGTTG T/- TGGGGGGCCG 1351 het 1036 hom 18 5 5 8 T 2 1 257370 CASAVA_Build 19 5215179 24I CGCCATCACC ------------------------/TCTCTTGTCTTTGTCCCATGATGT TCTTACTGCT 3070 het 3070 hom 44 19 16 10 TCTCTTGTCTTTGTCCCATGATGT 0 1 257371 CASAVA_Build 19 5217270 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAATCA 1450 het 1450 ref 15 7 4 4 A 8 7 257372 CASAVA_Build 19 5229060 1I TTCCTCCAAG -/A AAACGCAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 A 3 4 257373 CASAVA_Build 19 5234588 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2120 hom 23 5 14 4 A 10 11 257374 CASAVA_Build 19 5251252 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 21 1 14 6 A 14 13 257375 CASAVA_Build 19 5251337 7D ATTTCCAGTG TGGCTCA/------- TGGTCAGAGT 3070 het 3070 ref 23 14 8 2 TGGCTCA 1 0 257376 CASAVA_Build 19 5255314 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAATA 1633 het 1633 ref 16 6 5 5 A 8 9 257377 CASAVA_Build 19 5258406 24D GAGATTAGTA TCTTAGTGTTATGAGATCAGTATC/------------------------ TCTTAGTGTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 13 TCTTAGTGTTATGAGATCAGTATC 2 1 257378 CASAVA_Build 19 5277801 4D AAGGAAGGAA GGAG/---- GGAGGGAGGG 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 GGAG 5 4 257379 CASAVA_Build 19 5282309 1I CCTCGGCTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 9 10 257380 CASAVA_Build 19 5299292 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAATA 3054 het 2203 hom 14 6 8 0 A 9 8 257381 CASAVA_Build 19 5302350 1I GTGCCTCCCA -/C GACAAATTGG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 0 1 257382 CASAVA_Build 19 5307922 1D AGGAAGAGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 18 20 9 A 10 9 257383 CASAVA_Build 19 5314973 1D CTTGAAAGGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 A 9 8 257384 CASAVA_Build 19 5322719 1I CTCTGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 10 11 257385 CASAVA_Build 19 5326726 3I AGAGGAAGAG ---/GAA GAAGGAGAAG 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 GAA 1 2 257386 CASAVA_Build 19 5335803 1D ACCTGGCTAG T/- TTTTTTTTTT 1456 het 1300 hom 18 6 5 7 T 13 12 257387 CASAVA_Build 19 5340484 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1182 hom 30 9 11 10 A 11 10 257388 CASAVA_Build 19 5343125 1I ACTCTGTTCC -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 7 8 257389 CASAVA_Build 19 5343204 2D AACTCAGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 17 1 14 3 T 14 12 257390 CASAVA_Build 19 5347445 5I GGTTCCAGGA -----/GCAGG GTACAGTATA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 GCAGG 0 1 257391 CASAVA_Build 19 5347950 1D GACATGGGCA G/- GGTACCTGTG 3070 het 3070 hom 61 25 24 12 G 3 2 257392 CASAVA_Build 19 5353078 1D GGAAGGAAGG A/- AAAAAGAACC 3070 het 3068 hom 27 8 11 10 A 6 5 257393 CASAVA_Build 19 5363036 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 21 het 9 0 8 2 A 10 9 257394 CASAVA_Build 19 5384947 3I GAGAGAAGAA ---/AAG AAGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 AAG 2 3 257395 CASAVA_Build 19 5389188 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 16 het 19 1 15 3 T 9 8 257396 CASAVA_Build 19 5391556 4I GGAAAGAAAG ----/AAAA AGAAAGAAAG 2919 het 2010 hom 31 12 10 9 A 1 5 257397 CASAVA_Build 19 5391609 5D AAAAAAAGAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 hom 54 het 20 0 19 3 AAAAG 4 3 257398 CASAVA_Build 19 5392013 5I AGAGAAGAGA -----/AGAAG AGAAGAGAAG 3070 het 3070 ref 47 22 12 13 AGAAG 2 3 257399 CASAVA_Build 19 5411695 1D AGACAATCTC A/- AAAAAAAAAA 2113 het 2113 ref 25 10 7 8 A 17 16 257400 CASAVA_Build 19 5427335 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 9 8 257401 CASAVA_Build 19 5430582 1I ATTATTATTA -/T TTATTATTTT 1798 het 1798 ref 17 9 4 4 T 2 3 257402 CASAVA_Build 19 5432422 1I TAATTAATTT -/A AATGTAAACA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 A 2 3 257403 CASAVA_Build 19 5467654 9D TCTTCTTCTC CTTCTTCTT/--------- CTTCTTCTCC 3070 het 3070 ref 47 19 13 20 CTT 5 2 257404 CASAVA_Build 19 5486211 2I TTTTTTTCCA --/AC AGACTTAGTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 AC 0 1 257405 CASAVA_Build 19 5499103 18I TGACGATCAG ------------------/TCCTTTGTGGTTGTTGTC TTAGATCAGT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 TCCTTTGTGGTTGTTGTC 0 1 257406 CASAVA_Build 19 5505903 5D GAAAAAAAAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 23 11 12 1 AAAGA 3 2 257407 CASAVA_Build 19 5515526 1D GTGTGTGTGG T/- CAGGGATGGG 3070 het 3070 hom 42 12 20 10 T 1 0 257408 CASAVA_Build 19 5550785 1I ATAATGTGGG -/A AAAACTTTAC 3070 het 3070 hom 57 18 36 3 A 4 5 257409 CASAVA_Build 19 5593484 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 C 0 1 257410 CASAVA_Build 19 5594870 1I TGAGACTCTC -/A AAAAAAAAAA 2814 het 518 hom 31 7 11 13 A 15 16 257411 CASAVA_Build 19 5636758 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1560 het 1082 hom 11 4 4 3 A 11 10 257412 CASAVA_Build 19 5657102 2D CCCAGGACTC AG/-- AGAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 AG 3 2 257413 CASAVA_Build 19 5673742 1D TTTATCAAGA C/- CCCCCCCCCC 2375 het 208 hom 28 1 6 22 C 11 10 257414 CASAVA_Build 19 5678415 1I AGATTTGCCC -/T CATTCATTCG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 0 1 257415 CASAVA_Build 19 5679717 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 701 hom 20 5 13 2 T 11 12 257416 CASAVA_Build 19 5682342 8D AATTAGCCGA GTGTGGTG/-------- GTGTGGTGGT 2568 het 2568 ref 30 11 8 14 GTGTGGTG 3 2 257417 CASAVA_Build 19 5685650 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1364 het 157 hom 6 1 3 2 A 13 14 257418 CASAVA_Build 19 5692054 34D TGAGACAACG CCATTGCACTGCAGTCTGGATGACAGAGTGAGAC/---------------------------------- CCTGTCTTAA 2783 het 2783 ref 20 24 7 3 CCATTGCACTGCAGTCTGGATGACAGAGTGAGAC 1 0 257419 CASAVA_Build 19 5693179 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTATGT 3070 het 171 hom 52 4 40 10 GT 4 3 257420 CASAVA_Build 19 5697122 1I GGCCTCCTCC -/A AGAGGGGCCG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 1 2 257421 CASAVA_Build 19 5697448 1I TTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1531 hom 21 4 11 6 T 10 11 257422 CASAVA_Build 19 5697823 1I CCTGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 31 1 27 3 T 10 11 257423 CASAVA_Build 19 5712054 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2551 het 2550 ref 22 9 8 5 T 11 10 257424 CASAVA_Build 19 5717591 1D CTTTCGATTA T/- TTAGTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 T 3 2 257425 CASAVA_Build 19 5768642 8D AAAAAGAAGA AGGCAGGC/-------- AGGCAGGCAG 1927 het 1927 ref 25 13 8 8 AGGC 6 4 257426 CASAVA_Build 19 5779940 26D GAATCAGTTC CCCAGCGTCTCCCTGTCCGCACTGAT/-------------------------- CCCGCTATGT 3070 het 3070 ref 28 16 12 6 CCCAGCGTCTCCCTGTCCGCACTGAT 1 0 257427 CASAVA_Build 19 5785149 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2988 hom 19 7 10 2 A 10 9 257428 CASAVA_Build 19 5785251 32D GGTGGGGACA GATAGGAGGGAGAATAGGCAGGCGTGGGGACC/-------------------------------- GATAGGAGGG 2555 hom 41 het 20 0 10 13 GATAGGAGGGAGAATAGGCAGGCGTGGGGACC 1 0 257429 CASAVA_Build 19 5785826 1I CAGCAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 8 9 257430 CASAVA_Build 19 5803944 1I GCCTTGCTCA -/T TCACCCACAT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 1 2 257431 CASAVA_Build 19 5817486 16D GCAGGTGAGA CCCCAGGCAGCCGAGG/---------------- CCCCAGGCAG 2384 het 1151 hom 22 5 8 10 CCCCAGGCAGCCGAGG 2 1 257432 CASAVA_Build 19 5821180 3D TCTTTTTAAA ATT/--- ATTATTATTT 3070 het 3070 ref 27 15 8 5 ATT 4 3 257433 CASAVA_Build 19 5824398 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 669 het 458 hom 5 1 3 1 A 11 10 257434 CASAVA_Build 19 5824906 1I GAGAGCACCT -/C CCCAGGAGGC 3070 het 2766 hom 36 7 23 6 C 3 4 257435 CASAVA_Build 19 5850644 1D ATTATTATTA T/- TTTTTGTATT 1381 het 629 hom 5 2 3 0 T 6 5 257436 CASAVA_Build 19 5857147 1I TGGCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 26 0 23 3 A 11 12 257437 CASAVA_Build 19 5860496 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 34 1 24 9 T 13 12 257438 CASAVA_Build 19 5861016 1I TCCTCACTCA -/G GGAACTGTCA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 2 3 257439 CASAVA_Build 19 5873165 2D TGTCTGACTC TG/-- TGAATATACT 3070 het 3070 ref 52 30 13 9 TG 2 1 257440 CASAVA_Build 19 5879782 2D TAGGCATGAC TT/-- TTTTGTAACT 3070 hom 150 het 55 0 50 5 T 6 4 257441 CASAVA_Build 19 5888785 2I TGCCCTGCTC --/CA GAGGCTGGAG 3070 hom 67 het 27 0 20 7 CA 0 1 257442 CASAVA_Build 19 5890775 2I AACCCCAAGA --/CT CTCTTTACAG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 CT 2 3 257443 CASAVA_Build 19 5945824 3D TTGGAACCTC GAG/--- GAGGCGCCGG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 GAG 2 1 257444 CASAVA_Build 19 5947278 2D AACACCCGCC CA/-- CACACGCCCA 2293 het 620 hom 20 6 7 8 CA 3 2 257445 CASAVA_Build 19 5977289 1D AACAAAATGG A/- AAAAAAAAAA 1475 het 1475 ref 30 16 6 8 A 13 12 257446 CASAVA_Build 19 6012406 1D GGGTTCCAGA C/- CATTTCGATG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 1 257447 CASAVA_Build 19 6022760 1D TTTTTAAACT A/- AATTAGTCCC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 3 2 257448 CASAVA_Build 19 6081135 1I AAACAATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 13 12 T 13 14 257449 CASAVA_Build 19 6106801 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2050 het 1469 hom 30 9 6 15 A 19 18 257450 CASAVA_Build 19 6112111 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1199 het 1199 ref 18 10 5 3 A 13 14 257451 CASAVA_Build 19 6135626 1I TATCTCTAGG -/A AAAAAAAAAA 2831 het 2671 hom 30 8 12 10 A 15 16 257452 CASAVA_Build 19 6146660 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1325 het 133 hom 12 2 8 2 A 17 18 257453 CASAVA_Build 19 6151350 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1377 het 1377 ref 19 12 3 5 A 17 16 257454 CASAVA_Build 19 6192433 1I ACAAACAGTC -/A GGAAAGATGG 2116 het 2116 ref 26 13 7 6 A 0 1 257455 CASAVA_Build 19 6192494 1I AGATAGGAAA -/T TTGGGGAACA 3005 het 3005 ref 23 12 7 4 T 2 3 257456 CASAVA_Build 19 6194675 1I CTCGCCCCAG -/C CCCCGCTTCA 2826 het 2779 hom 26 10 9 7 C 4 5 257457 CASAVA_Build 19 6202781 1D ACCTCCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3054 hom 29 10 15 4 A 13 12 257458 CASAVA_Build 19 6205993 1D TCAACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2572 hom 35 15 11 9 A 12 11 257459 CASAVA_Build 19 6219407 3D ATCAAGAAAT AAG/--- AAGCAAATGA 3070 het 3070 hom 48 16 20 13 AAG 2 1 257460 CASAVA_Build 19 6229450 4D AGGTTGGGGA ACCC/---- ACCCACCCAC 3070 hom 57 het 22 0 18 6 ACCC 4 3 257461 CASAVA_Build 19 6234278 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 27 2 20 5 A 16 15 257462 CASAVA_Build 19 6234566 1D ATGTTGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 247 hom 31 2 13 16 T 17 16 257463 CASAVA_Build 19 6235761 1I TTTTTTTTTT -/C TCTTTTTTTT 2706 het 122 hom 30 2 18 10 C 0 1 257464 CASAVA_Build 19 6236427 3I CAAACAAACA ---/AAC AAAAAAAAAC 3070 het 28 hom 15 1 12 2 AAC 0 1 257465 CASAVA_Build 19 6249167 1D CTCCAGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 32 2 14 16 T 15 14 257466 CASAVA_Build 19 6250823 1I AATTTTTAAA -/T ATTTTTTTTT 1727 het 26 hom 11 1 6 4 T 0 1 257467 CASAVA_Build 19 6272612 4D TATTTTTTTC TTTG/---- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 TTTG 2 1 257468 CASAVA_Build 19 6274430 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2675 het 1001 hom 15 5 9 1 A 12 13 257469 CASAVA_Build 19 6277873 1I GCGAACCGTT -/A ACGTCTTCAT 3070 het 3070 hom 53 23 25 5 A 1 2 257470 CASAVA_Build 19 6288656 1D TTTTCTTTTC T/- TTTCTTTCTT 343 het 216 hom 8 1 3 4 T 4 3 257471 CASAVA_Build 19 6292698 3D GTACAATGGT GCA/--- GCAGCCTCCA 1685 het 1685 ref 21 13 7 2 GCA 2 1 257472 CASAVA_Build 19 6298393 1D CACACTCAGC T/- AATGTTTCTG 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 T 1 0 257473 CASAVA_Build 19 6301692 3D GAAGGAAGGA AGG/--- AGAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 AGG 1 0 257474 CASAVA_Build 19 6304538 5I CACTATCCAC -----/TTTAA TTTAAGTCGT 3070 hom 78 het 31 0 26 6 TTTAA 1 2 257475 CASAVA_Build 19 6314229 1D CTCTGCCTCC T/- TGGGTTCAAG 1411 het 1411 ref 17 11 4 2 T 2 1 257476 CASAVA_Build 19 6338209 1D AGCACCCTCT G/- GGGTGCCCCA 3070 hom 63 het 24 0 18 6 G 4 3 257477 CASAVA_Build 19 6360549 1D TCCTTGTTTC T/- TTTTTTACAG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 7 6 257478 CASAVA_Build 19 6362150 4I ATGTCCTGTC ----/CTCT CTCTCCAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 CT 2 4 257479 CASAVA_Build 19 6385925 3D ATCTCAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 24 10 13 2 AAC 5 4 257480 CASAVA_Build 19 6400869 12D CTCACAACTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2535 het 1035 hom 12 5 6 2 T 22 10 257481 CASAVA_Build 19 6420043 1D TTAGTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1746 hom 20 8 8 4 T 13 12 257482 CASAVA_Build 19 6435642 1I GGGAGGCTGA -/G GGGGGGTGGA 3069 het 3069 ref 26 16 7 3 G 6 7 257483 CASAVA_Build 19 6442955 1D TGTTTGCTCT G/- GGGGAACCTG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 G 5 4 257484 CASAVA_Build 19 6456277 1D TAGCAAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 38 0 30 9 T 11 10 257485 CASAVA_Build 19 6475614 2D TCTCTTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 2293 het 559 hom 23 3 7 13 T 20 18 257486 CASAVA_Build 19 6478292 1D ATTTTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 13 0 10 3 T 13 12 257487 CASAVA_Build 19 6496129 1D CCTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 34 1 27 8 T 12 11 257488 CASAVA_Build 19 6498322 4I GCAGGAAGGG ----/AGGT AGGTAGGCAC 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 AGGT 1 2 257489 CASAVA_Build 19 6506439 1I CCCACACATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 428 hom 31 1 25 5 A 9 10 257490 CASAVA_Build 19 6512121 1I TTGTTAAAAA -/T TTTTTGTAGA 3070 hom 101 het 42 0 34 8 T 5 6 257491 CASAVA_Build 19 6512252 1I GCCAGGAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 T 9 10 257492 CASAVA_Build 19 6513250 1I CAGTCATTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 27 0 17 10 T 8 9 257493 CASAVA_Build 19 6519534 1I ATCGTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1262 hom 32 4 21 7 A 14 15 257494 CASAVA_Build 19 6519884 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2751 hom 16 6 9 1 A 8 9 257495 CASAVA_Build 19 6523522 1D GGTTGCTGCT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 87 het 35 0 25 11 G 8 7 257496 CASAVA_Build 19 6523810 1I GTGGATAGGT -/G TCTACCCCAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 G 0 1 257497 CASAVA_Build 19 6524076 2D GCCTAAAAAG AT/-- ATTTTAATTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AT 2 1 257498 CASAVA_Build 19 6528194 1I GCCCCACCCC -/T ATCTCCCTTT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 0 1 257499 CASAVA_Build 19 6531377 2D TGCCTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1076 hom 22 5 12 5 T 14 12 257500 CASAVA_Build 19 6534565 12D AATTGTAGTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 23 0 21 4 T 24 12 257501 CASAVA_Build 19 6535517 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 9 8 257502 CASAVA_Build 19 6540862 1I TTCTCCTGTC -/T CCGTCTGTCC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 0 1 257503 CASAVA_Build 19 6540945 4D CTCTCTGTCT TCTC/---- TCTGTCTCCC 3070 het 130 hom 27 1 12 15 TC 3 1 257504 CASAVA_Build 19 6540961 1D TGTCTCCCCC T/- CTCCGTTTCC 1907 het 923 hom 26 5 7 15 T 1 0 257505 CASAVA_Build 19 6557965 1D GCCCGACTAA T/- TTTTTTTTTT 2579 het 2579 ref 27 11 7 9 T 12 11 257506 CASAVA_Build 19 6561637 1I GCCCCCTGCT -/C CCACAAACAA 2437 het 2437 ref 25 15 6 4 C 2 3 257507 CASAVA_Build 19 6583281 1D CAAGAGACTT A/- AAGTGTTAGA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 3 2 257508 CASAVA_Build 19 6584036 4I AGCCGAGGCG ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 31 14 8 9 GA 7 9 257509 CASAVA_Build 19 6587336 1I AGGAGAAACA -/T TGTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 T 1 2 257510 CASAVA_Build 19 6590658 4I CATCGCAGGG ----/TGTT GTTAAGATGA 3070 het 3070 ref 60 33 21 6 TGTT 0 1 257511 CASAVA_Build 19 6633534 1I TCTAGAAAAC -/A AAGGCAAGAA 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 2 3 257512 CASAVA_Build 19 6633661 1D TATAAACTTT G/- TTGCTAACTC 3070 het 3070 ref 60 29 24 7 G 1 0 257513 CASAVA_Build 19 6638236 1D ACTCCCACCA G/- GGGCCAATTT 3070 hom 160 het 58 0 54 5 G 4 3 257514 CASAVA_Build 19 6648215 1D GCTTCTGAAA T/- TCTGGGACTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 1 257515 CASAVA_Build 19 6650659 2D CTCCTGTATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 23 1 20 3 A 12 10 257516 CASAVA_Build 19 6659145 4D CTCTTTCTCA CTCT/---- CTCTCTTTCT 3070 het 91 hom 16 2 12 3 CT 5 3 257517 CASAVA_Build 19 6659701 1I CTTTCCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 16 2 9 5 T 15 16 257518 CASAVA_Build 19 6673988 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 10 9 257519 CASAVA_Build 19 6696158 5I GAAGGAAGGC -----/GGGCA GGCCGATTGG 1524 hom 21 het 8 0 6 2 GGGCA 0 1 257520 CASAVA_Build 19 6698998 1D TTTAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 13 12 257521 CASAVA_Build 19 6702030 1D AAATAATAAA T/- TTTGCCTAAA 2945 het 2945 ref 23 12 7 4 T 4 3 257522 CASAVA_Build 19 6703034 1D GGCCAGGACA C/- CCAAGTTTCA 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 C 3 2 257523 CASAVA_Build 19 6717386 1I ACTAAGCCAT -/C CTCCTGCCTC 3070 het 3070 ref 54 28 16 10 C 1 2 257524 CASAVA_Build 19 6751865 1D CTTGAACCCC T/- GACCTCAAGT 3070 hom 44 het 19 0 14 5 T 1 0 257525 CASAVA_Build 19 6753045 1D CCGTCCTCAT A/- ATGCCTCTCC 3070 hom 77 het 33 0 22 13 A 2 1 257526 CASAVA_Build 19 6760089 2D TCTACCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 43 0 33 10 T 21 19 257527 CASAVA_Build 19 6766740 2D TGTCTCACCT CA/-- GTTTCCTTCT 3070 het 3070 hom 46 19 25 4 CA 1 0 257528 CASAVA_Build 19 6783665 3I CTCCCCTTCT ---/TCC TCCTCCTCCT 3070 het 1420 hom 40 7 13 20 TCC 5 6 257529 CASAVA_Build 19 6789226 4I ACCCATCTAT ----/TATC TATCTATCTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TATC 2 3 257530 CASAVA_Build 19 6791315 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 481 hom 26 2 12 12 T 17 16 257531 CASAVA_Build 19 6821872 2D TGGTTAATTT TA/-- TATGTCAACT 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 TA 2 1 257532 CASAVA_Build 19 6825515 1I AGTGTGGGTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 T 7 8 257533 CASAVA_Build 19 6826611 1D TCTAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 A 11 10 257534 CASAVA_Build 19 6828278 1I CTATTTTTTT -/G GGGGGGGAGG 2183 het 2183 ref 17 8 6 3 G 7 8 257535 CASAVA_Build 19 6828949 2D TGAGAGAGCA AG/-- AGAGAGGGAA 3070 het 3070 hom 48 23 18 7 AG 4 3 257536 CASAVA_Build 19 6833917 1I GATCCTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 T 10 11 257537 CASAVA_Build 19 6859676 1I ACAAATGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 630 hom 35 2 25 8 T 13 14 257538 CASAVA_Build 19 6860595 14D CTTCTTTCTT TTCCTTCCTTTTTA/-------------- CTGTTAATGA 3070 hom 100 het 35 0 31 6 TTCCTTCCTTTTTA 1 0 257539 CASAVA_Build 19 6862025 3I TTCCCTAGCT ---/AAG AAGAATAAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAG 1 2 257540 CASAVA_Build 19 6862642 2D ATACAAATAA AC/-- ACACACACAT 3070 hom 159 het 60 0 52 10 AC 5 4 257541 CASAVA_Build 19 6864430 3D TGACCTCATG ATC/--- CACCCACCTC 3070 hom 54 het 19 0 18 3 ATC 1 0 257542 CASAVA_Build 19 6866022 1I GGAGTTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 36 1 27 8 T 10 11 257543 CASAVA_Build 19 6886122 2I CCCCTCTTTT --/AA AATTTCCTCT 3070 hom 92 het 37 0 29 8 A 2 4 257544 CASAVA_Build 19 6889356 4I CTCAAAAAAA ----/AATT AATTAAATAA 3070 hom 27 het 13 0 10 5 AATT 1 2 257545 CASAVA_Build 19 6889481 1D ATGCAAATGG A/- GGCAAAGCTG 3070 hom 78 het 34 0 24 11 A 1 0 257546 CASAVA_Build 19 6889785 4D TATTTTCTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TTTC 5 4 257547 CASAVA_Build 19 6893240 1D TTAGCCACAT C/- CCTTTCCTGT 3070 hom 150 het 57 0 50 7 C 3 2 257548 CASAVA_Build 19 6896198 1I TAAAAATACA -/G AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 7 G 0 1 257549 CASAVA_Build 19 6897071 7D TTTCTTTTTC TTTATTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 TTTATTT 1 0 257550 CASAVA_Build 19 6897238 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 10 11 257551 CASAVA_Build 19 6897392 2D ATTTTAAAAC TT/-- TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 10 8 257552 CASAVA_Build 19 6905926 3I GGACTCAATA ---/GAT GATGATGATG 3070 hom 149 het 60 0 49 11 GAT 5 6 257553 CASAVA_Build 19 6910817 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 29 1 21 7 T 12 11 257554 CASAVA_Build 19 6912413 1D ATCCGTTTGT C/- CAATATCCAC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 2 1 257555 CASAVA_Build 19 6913710 1I AAAAAAAAAA -/C CCACCAAATT 1038 het 1038 ref 13 6 4 3 C 2 3 257556 CASAVA_Build 19 6914215 4D GGGACAACAG TAAC/---- TAACATACAT 3070 hom 24 het 40 1 21 18 TAAC 2 1 257557 CASAVA_Build 19 6917044 1I AGGCAGGCAC -/G AATAATCCCA 2021 het 2021 ref 16 6 5 5 G 0 1 257558 CASAVA_Build 19 6926507 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 2796 hom 26 12 10 5 A 8 7 257559 CASAVA_Build 19 6927993 1I CACTGTGCCC -/G GCCCAGCCAG 3070 het 2269 hom 26 10 10 6 G 1 2 257560 CASAVA_Build 19 6928716 1D AATGTTTTCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 432 hom 41 1 17 23 A 10 9 257561 CASAVA_Build 19 6929321 4D AAATAGACCA TCAG/---- TCAAGTCTCA 3070 het 3070 ref 57 29 27 1 TCAG 1 0 257562 CASAVA_Build 19 6937778 2D ATTATTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 83 hom 22 2 13 7 A 12 10 257563 CASAVA_Build 19 6941419 1D CCCGGCTAAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 1357 hom 15 4 8 4 T 9 8 257564 CASAVA_Build 19 6958135 2D TGGGGAATGT AG/-- GTGTTTTTCA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AG 1 0 257565 CASAVA_Build 19 6966426 2D TATCTTTGAG AC/-- AGAGTCTCGC 2721 het 2721 ref 16 9 6 1 AC 1 0 257566 CASAVA_Build 19 6969249 1D TTGTAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 10 9 257567 CASAVA_Build 19 6969839 5D CAAAAAAAAC AAGAA/----- AAGAAAAGAA 3070 hom 63 het 27 0 21 7 AAGAA 5 4 257568 CASAVA_Build 19 6982005 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 877 hom 11 2 9 0 A 8 9 257569 CASAVA_Build 19 6990765 1I AGAGAACTAA -/T TTTTTTTTGT 1757 het 1450 hom 8 3 4 1 T 8 9 257570 CASAVA_Build 19 6990900 1D TTGGATTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 24 het 15 0 8 7 A 9 8 257571 CASAVA_Build 19 7015918 1I TGGATTGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 694 hom 34 3 21 10 T 14 15 257572 CASAVA_Build 19 7021778 1D AGTGAGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 30 2 12 17 T 17 16 257573 CASAVA_Build 19 7030233 4D ATAATGCAGT TTCA/---- TTCATTTTTT 2070 hom 36 het 17 0 13 4 TTCA 2 1 257574 CASAVA_Build 19 7030446 1I TAGAGACAGG -/A GTTCACCGTG 1365 hom 7 het 4 0 3 1 A 0 1 257575 CASAVA_Build 19 7033210 5D TTGGATCATG AGGTC/----- AGGTCAGGAG 3070 hom 59 het 23 0 18 5 AGGTC 2 1 257576 CASAVA_Build 19 7038079 4D CCTGAAGCTT AGAC/---- AGGCTTTATC 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 AGAC 1 0 257577 CASAVA_Build 19 7038549 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 31 0 16 15 A 15 14 257578 CASAVA_Build 19 7039657 10I TGGTGGTGCG ----------/CGCCTGTAAT CTCAGCTAAT 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 CGCCTGTAAT 0 1 257579 CASAVA_Build 19 7043168 3I TATGAAACAC ---/GTG GTGGAAATTT 3070 het 3070 ref 56 27 22 7 GTG 1 2 257580 CASAVA_Build 19 7047179 1D CCAGCCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 25 2 16 7 T 14 13 257581 CASAVA_Build 19 7051517 6I AGAGACAAGT ------/TAAGAG TAAAGGTGGG 3070 hom 90 het 35 0 27 8 TAAGAG 0 1 257582 CASAVA_Build 19 7053097 1I CTCCCTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 995 hom 37 4 23 10 T 13 14 257583 CASAVA_Build 19 7054197 2I CTTTAACCTC --/TT TTCCAAATGA 3070 hom 101 het 38 0 31 7 T 2 4 257584 CASAVA_Build 19 7067779 1D GGGGGCGGGT G/- GGGGGAACGA 3070 het 2574 hom 25 10 11 4 G 6 5 257585 CASAVA_Build 19 7070835 6D25M2D ACATATACAC ACACAAACACACACACCCAAACACACACACGCA/------ACACACACACCCAAACACACACACG-- CACACATGCA 3070 het 3070 ref 45 23 19 18 N/A 0 0 257586 CASAVA_Build 19 7070909 12D GCACACACAT ACACACACAAAC/------------ ACACACACAA 3070 het 3070 ref 49 22 17 18 ACACACACAAAC 2 1 257587 CASAVA_Build 19 7073496 1D AAAACCCCAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 303 hom 20 2 15 4 A 10 9 257588 CASAVA_Build 19 7073512 1D AAAAGAAGTA T/- CTTGCCCCTT 3070 het 268 hom 20 1 16 3 T 1 0 257589 CASAVA_Build 19 7081050 1I TCATCTAGCC -/A AAAAAACTCT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 6 7 257590 CASAVA_Build 19 7083637 1D AGTTTCACTC T/- TGTTGCCCAG 2394 het 1960 hom 17 6 6 5 T 2 1 257591 CASAVA_Build 19 7085992 1D AAGCATCGAG C/- CCAAAACTCT 3070 hom 93 het 36 0 30 9 C 3 2 257592 CASAVA_Build 19 7102074 2D CTCTTTCTTT TC/-- TTTCTTTTCC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TC 1 0 257593 CASAVA_Build 19 7102454 2D TGTCTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 24 0 12 13 T 16 14 257594 CASAVA_Build 19 7103390 3D AGACTCTGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 16 13 257595 CASAVA_Build 19 7108002 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTGGG 2518 hom 23 het 10 0 8 2 T 7 8 257596 CASAVA_Build 19 7117948 8I AAATAAATAA --------/ATAAATAG ATAAATAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATAAATAG 0 1 257597 CASAVA_Build 19 7120073 1D GCCAAAACCT G/- ACTCTCCCTG 3070 hom 94 het 37 0 30 8 G 1 0 257598 CASAVA_Build 19 7132572 1D TGGTGAGACC T/- TTTTTTTTTT 2057 het 216 hom 34 4 10 20 T 17 16 257599 CASAVA_Build 19 7135822 2D CATTACCCAC AT/-- GTCAGACACA 3070 het 3070 ref 29 14 10 8 AT 1 0 257600 CASAVA_Build 19 7136274 1I AATGGCTCAC -/A AAATTGCCTG 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 A 3 4 257601 CASAVA_Build 19 7136491 1D CACTGTGGGG A/- AAAAAGTGGC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 6 5 257602 CASAVA_Build 19 7140185 2D TCTGGCAAGG AA/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 A 3 1 257603 CASAVA_Build 19 7142841 16D CCCTATCTTT AAAAAGAAGAGAGAGA/---------------- GAAAAGAAAG 1717 het 1717 ref 17 8 5 6 AAAAAGAAGAGAGAGA 1 0 257604 CASAVA_Build 19 7143184 2D AAAGAAAGAC AG/-- AGAAAGAAAA 3070 het 2642 hom 19 6 12 1 AG 2 1 257605 CASAVA_Build 19 7144979 3I2M2I TCCCAAACTG ---GG--/CTTGGAT CATAGGCGTA 3070 het 3070 hom 29 12 11 8 N/A 0 0 257606 CASAVA_Build 19 7148333 4I TTCGGAGAGA ----/GAGT GAGTGAGTGA 1326 het 719 hom 16 6 5 5 GAGT 4 5 257607 CASAVA_Build 19 7149910 2D ACACTTTTTT TG/-- GGGGGGGGGT 3070 het 1598 hom 29 11 12 6 TG 1 0 257608 CASAVA_Build 19 7153653 1D TAGGATTACA G/- GGTATGCGCC 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 G 3 2 257609 CASAVA_Build 19 7159833 1I TGGCCAACAT -/G GCGAAACCCC 2174 hom 18 het 9 0 6 3 G 1 2 257610 CASAVA_Build 19 7160596 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 26 1 20 5 T 12 11 257611 CASAVA_Build 19 7170937 4I GAAAAATCTC ----/TCTT TCTATCACTC 3070 hom 147 het 52 0 48 4 TCTT 0 1 257612 CASAVA_Build 19 7173040 2I TCCTCCTAGC --/AA AATTTTTTCA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 2 4 257613 CASAVA_Build 19 7174962 3D CAAAAAAAAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2423 hom 22 9 11 3 T 14 11 257614 CASAVA_Build 19 7176711 1I GTTTCCATTT -/C CCCCCCCCTC 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 C 8 9 257615 CASAVA_Build 19 7178288 1I ATTTGCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 476 hom 31 3 11 17 T 13 14 257616 CASAVA_Build 19 7182787 1I TTTCTGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2811 hom 35 10 19 6 T 13 14 257617 CASAVA_Build 19 7182992 4D TTGCATGAGG CTAA/---- CTATTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 CTAA 1 0 257618 CASAVA_Build 19 7187187 1I TGGCCAGGCT -/G GGTCTTGAAC 3070 hom 18 het 13 0 10 4 G 2 3 257619 CASAVA_Build 19 7190306 1I AAAGGCCCAG -/C CCCCCCCACC 1934 het 1934 ref 22 10 7 5 C 7 8 257620 CASAVA_Build 19 7190836 1D GTGGCTGAGA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 7 G 2 1 257621 CASAVA_Build 19 7192876 1D CATTAAATTT A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 60 het 27 0 20 7 A 7 6 257622 CASAVA_Build 19 7201009 4D TCTCAAAAAA AAAT/---- AAAATAAAAT 387 het 387 ref 14 7 3 7 AAAT 1 0 257623 CASAVA_Build 19 7201403 1D51M2D GAAGGGAGAG AAGGAAGGGAGGTAAGAAATAAAAAGAAAGCAAGGAAGAAAGAAGAAAAGAAAG/-AGGAAGGGAGGTAAGAAATAAAAAGAAAGCAAGGAAGAAAGAAGAAAAGAA-- AAGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 21 15 9 2 N/A 0 0 257624 CASAVA_Build 19 7210830 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 20 0 17 3 A 14 12 257625 CASAVA_Build 19 7215527 1I CAAACAAGCA -/C CTACATTTGG 3070 het 3070 ref 44 27 15 2 C 1 2 257626 CASAVA_Build 19 7217395 1D AGAAATTATC T/- TTTTTTTTTT 1470 het 645 hom 23 5 6 12 T 19 18 257627 CASAVA_Build 19 7220883 1D CAATAATACC T/- TTTTGAGGAT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 T 5 4 257628 CASAVA_Build 19 7227466 4D TAACAGCATT CTTA/---- AAATGCTCCC 3070 het 3070 hom 38 14 21 6 CTTA 1 0 257629 CASAVA_Build 19 7232349 2D CAACAAACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 20 16 6 AC 9 8 257630 CASAVA_Build 19 7232523 1I CTGTCTCTGC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 6 7 257631 CASAVA_Build 19 7239206 1D CTGTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 963 het 963 ref 27 15 4 8 A 15 14 257632 CASAVA_Build 19 7247020 1D CAATTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 18 1 15 2 T 12 11 257633 CASAVA_Build 19 7310808 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 29 1 19 9 T 11 12 257634 CASAVA_Build 19 7334928 4D AGGATGGATA AATG/---- AATGAATGAA 3070 hom 132 het 51 0 45 10 AATG 3 2 257635 CASAVA_Build 19 7361414 5D AAAAAAAGAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 2113 het 2113 ref 23 9 11 6 AAAAG 4 3 257636 CASAVA_Build 19 7381774 1I ATAATTGTTT -/A AAAAAATGCC 3070 hom 35 het 17 0 12 5 A 6 7 257637 CASAVA_Build 19 7382922 2D TTTTGTTTGG TT/-- TTTCTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 5 T 5 3 257638 CASAVA_Build 19 7383628 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1647 het 469 hom 16 1 11 4 A 15 16 257639 CASAVA_Build 19 7384486 1I TGCGCCCGGC -/A AAAAAAATCT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 7 8 257640 CASAVA_Build 19 7385141 1D GAATCACCCC T/- GGTAGAGAAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 1 0 257641 CASAVA_Build 19 7385692 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 9 11 257642 CASAVA_Build 19 7387123 1D CCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 24 0 16 8 A 10 9 257643 CASAVA_Build 19 7392037 1D GGCTGGTCTC A/- AAACTCCTGG 3070 hom 105 het 39 0 34 5 A 4 3 257644 CASAVA_Build 19 7394961 2D CCCAGGCTGG AC/-- AGTGCAATGG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AC 1 0 257645 CASAVA_Build 19 7400015 3D CTCTGAGGCT CCC/--- CCCTGGTATG 3070 hom 43 het 18 0 12 6 C 6 3 257646 CASAVA_Build 19 7404052 1D GTCTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2691 hom 24 het 11 0 8 3 A 12 11 257647 CASAVA_Build 19 7407081 12D TCAGCATTTC TTCTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 8 TTCTTTTTTTTT 1 0 257648 CASAVA_Build 19 7408209 6I AGCTACTCGG ------/GAGGCT GAGGCAGGAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 GAGGCT 0 1 257649 CASAVA_Build 19 7418371 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 51 het 33 1 27 5 CT 2 1 257650 CASAVA_Build 19 7421130 1D AGATGTTAAT A/- CAGGCTCTTG 1033 het 1033 ref 66 49 3 14 A 1 0 257651 CASAVA_Build 19 7431521 2I TAAATGGAGT --/CA CACACCGCGC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CA 2 3 257652 CASAVA_Build 19 7433345 1D GCTTCTATGT G/- GGGGGGGCCC 2817 hom 47 het 18 0 12 6 G 8 7 257653 CASAVA_Build 19 7441403 1I TCTGAATCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2293 hom 26 8 10 8 T 13 14 257654 CASAVA_Build 19 7443693 3D TCAAGCACTT CTC/--- CTGCCTCAGC 2204 het 404 hom 6 1 5 1 CTC 1 0 257655 CASAVA_Build 19 7446433 4D CACACACAAC CACA/---- CACACACACA 2955 het 2955 ref 29 12 9 9 CA 7 5 257656 CASAVA_Build 19 7452682 1D CCTTCAGAAT C/- CTAAGATAAG 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 C 2 1 257657 CASAVA_Build 19 7530784 1D CCAGCATTTT G/- GGAGGCCGAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 3 2 257658 CASAVA_Build 19 7531865 1I ACTCTGTGGG -/C CCCCCCCTAA 2349 hom 29 het 11 0 10 1 C 7 8 257659 CASAVA_Build 19 7533960 1D AGCCCCCCCA C/- CCCCGCCGAT 3070 hom 69 het 25 0 19 6 C 5 4 257660 CASAVA_Build 19 7590451 7D GGGTGGGGAG GGGGGAT/------- GGGGGAGGGA 1940 het 373 hom 12 1 8 4 GGGGGAT 1 0 257661 CASAVA_Build 19 7604227 4I CCCTACAAAC ----/TAAT TAGTCTTGTC 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 TAAT 0 1 257662 CASAVA_Build 19 7610816 10D GTCCATGTGT ATGTGTGTGC/---------- ATGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 68 22 31 28 ATGTGTGTGC 2 1 257663 CASAVA_Build 19 7616478 7I TGCTAGAGGC -------/AGGGAGT AGGGAGTAGG 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 AGGGAGT 1 2 257664 CASAVA_Build 19 7616787 1D CCCTCTCCGT C/- CCCCTTCTGT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 C 5 4 257665 CASAVA_Build 19 7619213 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2028 het 1831 hom 16 8 6 2 A 13 14 257666 CASAVA_Build 19 7630216 1I GGGTGCCTGT -/A AGTCCTAGCT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 A 1 2 257667 CASAVA_Build 19 7631535 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1950 het 315 hom 14 4 6 4 A 15 16 257668 CASAVA_Build 19 7636043 1I TGTCTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 2682 het 2682 ref 18 10 7 1 A 10 11 257669 CASAVA_Build 19 7661242 1I GGGTGGGGGT -/C CCCCCCACCC 2955 het 2225 hom 31 11 15 5 C 6 7 257670 CASAVA_Build 19 7662336 4I CGACAGCTCA ----/TAGT TAGAAGTGCC 3070 het 3070 ref 69 35 28 8 TAGT 0 1 257671 CASAVA_Build 19 7663517 6D GTCACTAACA CCATCG/------ CCATCAGCAC 3070 het 3070 ref 75 41 25 13 CCATCG 1 0 257672 CASAVA_Build 19 7665724 1D CGTACAGTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 10 9 257673 CASAVA_Build 19 7666506 1I TACAAAAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 25 10 9 8 A 7 8 257674 CASAVA_Build 19 7667495 2D CATCAGAAAC TT/-- AGTCCTATTT 3070 het 3070 ref 34 16 17 2 T 2 0 257675 CASAVA_Build 19 7668381 9D CTCGCTTTTT CCCCTGCAA/--------- CCCCAACTCC 3070 het 2936 hom 32 11 14 7 CCCCTGCAA 1 0 257676 CASAVA_Build 19 7668654 2D TATAATGAAC TA/-- CTGTGTACCT 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 TA 1 0 257677 CASAVA_Build 19 7670546 1I GACTGGGGAG -/C CCCCGCTTCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 C 4 5 257678 CASAVA_Build 19 7685485 2D AAACAAAACC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 11 9 257679 CASAVA_Build 19 7687959 2I CCCTCACAAG --/AC ACAGAGTCTG 3070 hom 82 het 31 0 26 5 AC 1 2 257680 CASAVA_Build 19 7692572 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 16 0 12 4 T 10 11 257681 CASAVA_Build 19 7704845 2I ACTCCAGCCT --/GG GTGACAGAGT 3070 hom 41 het 19 0 15 4 G 1 3 257682 CASAVA_Build 19 7707176 1D CAAGATCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 26 1 21 4 T 14 13 257683 CASAVA_Build 19 7709502 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 CT 2 1 257684 CASAVA_Build 19 7712230 1D GTGGTGCACG C/- CCAGCTAATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 3 2 257685 CASAVA_Build 19 7726660 2D TCTATATGTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 11 9 257686 CASAVA_Build 19 7730331 2D AAATAACTTC TA/-- TCTCTTTGGT 3070 het 3070 ref 32 22 8 2 TA 1 0 257687 CASAVA_Build 19 7756588 2D GCATTTTTTT TA/-- TTTTTATTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 TA 1 0 257688 CASAVA_Build 19 7765769 1D TATGGGTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 28 0 24 5 T 10 9 257689 CASAVA_Build 19 7773252 2I AAGACGCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 25 0 14 11 T 12 14 257690 CASAVA_Build 19 7777178 1D TTTTTATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 11 10 257691 CASAVA_Build 19 7788293 1I GCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 33 0 23 10 A 10 11 257692 CASAVA_Build 19 7807762 1D AAGTGATCTG C/- CCCCCCTCAG 2674 het 1687 hom 13 4 6 3 C 7 6 257693 CASAVA_Build 19 7810647 2I CCAAGTCTCC --/AA AAAATTAGAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 4 6 257694 CASAVA_Build 19 7811558 4D TTCTGTCTCT ATGG/---- ATTGCCTATT 2615 het 2615 ref 37 25 8 6 ATGG 1 0 257695 CASAVA_Build 19 7813078 3D TGGGTGTGTG TGT/--- TGTGTGTGCA 3070 het 3070 ref 80 20 15 47 TGT 2 1 257696 CASAVA_Build 19 7814541 2D AGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGTATA 3070 het 3070 ref 81 35 29 18 TG 4 3 257697 CASAVA_Build 19 7815218 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1350 het 247 hom 23 3 8 14 A 19 14 257698 CASAVA_Build 19 7818482 1I AAAGAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1826 hom 20 5 10 5 A 10 11 257699 CASAVA_Build 19 7823605 1I GTCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 26 1 18 7 T 11 12 257700 CASAVA_Build 19 7829566 13D AGGCTCTTGC CTGTCCCCAGGGT/------------- CTGAAGGATT 2289 het 2289 ref 26 12 9 6 CTGTCCCCAGGGT 1 0 257701 CASAVA_Build 19 7844307 1I TGGGGTACCA -/G GGTTTCGGGA 3070 hom 35 het 16 0 11 5 G 2 3 257702 CASAVA_Build 19 7850349 1D AGCAACTTCT C/- CAAGAAATTC 3070 hom 63 het 23 0 20 3 C 2 1 257703 CASAVA_Build 19 7857179 1D ATGTCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 2653 het 1346 hom 23 5 7 11 T 12 11 257704 CASAVA_Build 19 7859028 1I CCAAAGTGTT -/G GGATTACAGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 2 3 257705 CASAVA_Build 19 7860327 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1654 het 1654 ref 13 6 6 1 A 13 12 257706 CASAVA_Build 19 7868585 6D CTTCTGTCTT TGTGTC/------ TGTCTCTGTG 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 TGTGTC 1 0 257707 CASAVA_Build 19 7898250 1D AGGCAGCTCT G/- GGGGGGGGCC 2053 het 1330 hom 19 5 8 7 G 9 8 257708 CASAVA_Build 19 7909896 1D26M1D TTGCCAGGGG TTTGGTAGGAAGAGGGTGAGATGAGTAG/-TTGGTAGGAAGAGGGTGAGATGAGTA- GGGGGAACAC 3070 hom 49 het 46 1 51 7 N/A 0 0 257709 CASAVA_Build 19 7923467 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAGA 3018 het 247 hom 15 3 10 2 C 0 1 257710 CASAVA_Build 19 7929389 1I AGGTCCCCAT -/C CCCTGGCACT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 3 4 257711 CASAVA_Build 19 7929942 1D CACAAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 12 11 257712 CASAVA_Build 19 7943518 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2362 hom 20 8 8 5 T 9 8 257713 CASAVA_Build 19 7945097 1D GCCGGTGCCA G/- AGAGGTCCTG 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 G 1 0 257714 CASAVA_Build 19 7966668 1D CCACTTCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1187 hom 22 6 11 5 A 15 14 257715 CASAVA_Build 19 7972533 1I TTTTTTTTTT -/A AGAGATGGGA 3070 het 1359 hom 24 9 11 4 A 1 2 257716 CASAVA_Build 19 7978956 1I ATTTAAATTG -/A GTACATTGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 0 1 257717 CASAVA_Build 19 8005619 12I AGGTGTCCAT ------------/CGCCACACCTGG ATAGGTGTTC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 CGCCACACCTGG 0 1 257718 CASAVA_Build 19 8007808 4I CTTTATTTCC ----/TCCT TCCTTCCTTC 3070 hom 79 het 37 0 25 12 TCCT 3 4 257719 CASAVA_Build 19 8009433 1D GGGAGGCTGA G/- GACTTGATGA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 2 1 257720 CASAVA_Build 19 8011144 5D GTTTTTTTTA ATTTT/----- ATTTTTATTT 2360 hom 15 het 6 0 6 0 ATTTT 2 1 257721 CASAVA_Build 19 8016702 1D AACATCATCA T/- TTTTTTTTTT 1751 het 1751 ref 27 14 5 8 T 15 14 257722 CASAVA_Build 19 8016868 2D CTGGCTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 337 het 337 ref 20 7 1 13 A 12 10 257723 CASAVA_Build 19 8022529 1D ATTACAGGTG C/- CCCCCCACCA 2181 het 876 hom 8 2 6 0 C 7 6 257724 CASAVA_Build 19 8031570 1I TTACCAGGGA -/T TTTTTTTTTT 865 het 865 ref 23 10 5 9 T 13 14 257725 CASAVA_Build 19 8032297 1I CCAAAGTTCT -/G GGGATGACAG 3070 het 1941 hom 19 6 10 3 G 3 4 257726 CASAVA_Build 19 8042519 1I AATCCCAAAA -/G GGTCCCAAGG 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 G 2 3 257727 CASAVA_Build 19 8042735 1D CCCCCAGAGA C/- CCCCCCCAAG 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 C 8 7 257728 CASAVA_Build 19 8048864 1I GGGAAGCTGA -/G GGCAGGAGGA 2716 het 1781 hom 12 4 7 1 G 2 3 257729 CASAVA_Build 19 8053019 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 1032 hom 15 4 10 1 T 7 6 257730 CASAVA_Build 19 8053774 2I TGGCACAATC --/AT AGCTCACTGC 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 AT 0 1 257731 CASAVA_Build 19 8063961 1D GAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 10 9 257732 CASAVA_Build 19 8064678 3D AACAAAACAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 42 21 18 7 AAC 3 2 257733 CASAVA_Build 19 8066128 1D GTGCTGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 33 0 24 9 T 11 10 257734 CASAVA_Build 19 8075356 1D CACTGGCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1289 hom 31 4 15 13 A 17 16 257735 CASAVA_Build 19 8078599 8D GGATGGTTGA ATGGAAGT/-------- ATGGAAGTAT 3070 het 3070 ref 71 32 20 23 ATGGAAGT 2 1 257736 CASAVA_Build 19 8083375 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 10 9 257737 CASAVA_Build 19 8089499 2I CCTTGTACAG --/AC ACACACAGTC 3070 het 3070 hom 62 21 22 19 AC 3 4 257738 CASAVA_Build 19 8091361 8D GCTTTTTCCT CTTCCTTC/-------- CTTCCTTCCT 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 CTTC 5 3 257739 CASAVA_Build 19 8092282 1I TGTGGGGAGA -/G GGGGGCAGAG 1667 het 1667 ref 24 8 6 10 G 5 6 257740 CASAVA_Build 19 8104145 1I AGCTTGTATA -/T TTAGTCCGTC 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 T 2 3 257741 CASAVA_Build 19 8104955 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAG 1533 hom 12 het 6 0 5 2 A 11 9 257742 CASAVA_Build 19 8113794 1D CGCCTCCAAC A/- AGCCCATGTT 3070 hom 37 het 17 0 12 5 A 2 1 257743 CASAVA_Build 19 8128453 4D AGATAGAGAA AGAG/---- AGAGAAGAAA 3070 het 2664 hom 27 9 15 3 AG 4 2 257744 CASAVA_Build 19 8130330 1I TACAAGTGCC -/T GCCACCACAC 3070 hom 44 het 17 0 14 3 T 0 1 257745 CASAVA_Build 19 8137618 1I GGGTCTTACT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 15 1 13 2 G 0 1 257746 CASAVA_Build 19 8138485 1D CTGGACTAGT G/- GCACACACCT 3070 hom 70 het 30 0 22 8 G 2 1 257747 CASAVA_Build 19 8145680 1D TATGTACTCA T/- GATGAATTCT 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 T 1 0 257748 CASAVA_Build 19 8154095 1D ACCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 20 0 11 10 A 12 11 257749 CASAVA_Build 19 8154571 3D GTGGTTGTCA AGG/--- AGAAGGAAGG 3070 hom 57 het 22 0 20 4 AGG 1 0 257750 CASAVA_Build 19 8154644 4D AGTTGTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 TTTC 5 4 257751 CASAVA_Build 19 8155473 1D GATTTAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 22 1 17 4 A 12 11 257752 CASAVA_Build 19 8162380 1I TCTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 10 11 257753 CASAVA_Build 19 8162918 3I GAAGGAAGGA ---/AGG CCCACACAGT 2585 hom 27 het 11 0 8 4 AGG 0 1 257754 CASAVA_Build 19 8164677 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2260 het 1295 hom 17 5 7 6 T 14 12 257755 CASAVA_Build 19 8169946 4D AAACAACAAC AACA/---- AAAAAAAAAA 2564 het 1292 hom 14 5 8 2 AACA 1 0 257756 CASAVA_Build 19 8172812 2D TTCTGTGAGC TA/-- TGATTGTGCC 3070 het 3041 hom 19 7 11 3 TA 1 0 257757 CASAVA_Build 19 8173425 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 2935 het 728 hom 10 2 7 1 A 8 7 257758 CASAVA_Build 19 8178795 3D CCGTCTCTCC AAA/--- AAAAAAAATA 1132 hom 12 het 5 0 5 2 A 11 8 257759 CASAVA_Build 19 8180907 23I TTTTTAGGCC -----------------------/CAGGAAACAGCAAGATTGTGTGG CAGGGCCTAG 3070 hom 30 het 12 0 9 3 CAGGAAACAGCAAGATTGTGTGG 0 1 257760 CASAVA_Build 19 8185049 2D CCCATGACAC TG/-- TGTCTGAAGA 3070 hom 98 het 35 0 31 4 TG 2 1 257761 CASAVA_Build 19 8190547 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 7 8 257762 CASAVA_Build 19 8190872 2I GTTGTCTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 22 1 15 6 A 12 14 257763 CASAVA_Build 19 8196737 1D TATGTGACCC T/- GTGTAGGTGA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 1 0 257764 CASAVA_Build 19 8200303 3D TTCTTCTTTT TTC/--- TTCTTCTTCT 1180 hom 9 het 23 0 7 16 TTC 6 5 257765 CASAVA_Build 19 8205605 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTGCATT 3070 hom 54 het 21 0 19 5 T 5 6 257766 CASAVA_Build 19 8210633 1D CTGTTAAGGG T/- GGGTTATTTT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 1 0 257767 CASAVA_Build 19 8213866 4D GGAGCTGGGG GTCT/---- GGATGCCTGG 3070 hom 105 het 38 0 34 4 GTCT 1 0 257768 CASAVA_Build 19 8222949 2D CATCTCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 620 hom 18 3 8 8 A 13 11 257769 CASAVA_Build 19 8227329 2I GGCCAGAAAA --/CT CCAAGCAGGA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 CT 0 1 257770 CASAVA_Build 19 8249359 6I CAGCTATTTT ------/TTTTTG TTTTGTTTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TTTTTG 0 1 257771 CASAVA_Build 19 8278235 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 45 het 37 0 22 16 A 9 8 257772 CASAVA_Build 19 8290445 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1650 het 19 hom 13 1 8 5 A 20 18 257773 CASAVA_Build 19 8293500 2D AAGAAGTTTC AG/-- AGAGTGGGTG 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 AG 3 2 257774 CASAVA_Build 19 8293810 2D ACTCGCTCTG GA/-- GAGAGGGGAA 2142 het 2142 ref 29 13 8 10 GA 3 2 257775 CASAVA_Build 19 8295893 3D CACAGCCATG TCC/--- TCCTCTTCCT 3070 het 2191 hom 33 8 19 7 TCC 2 1 257776 CASAVA_Build 19 8307927 1I TGTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 T 8 9 257777 CASAVA_Build 19 8317979 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2806 het 1392 hom 23 4 10 9 A 14 15 257778 CASAVA_Build 19 8329032 8I CGAGGAGCTG --------/AGTTTACA AGTTTACAGG 1938 het 1585 hom 18 7 7 4 AGTTTACA 1 2 257779 CASAVA_Build 19 8334639 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 1453 het 1252 hom 9 4 4 1 T 9 8 257780 CASAVA_Build 19 8351767 3D GGTCATCTTT GTG/--- GTCTAGGAGG 3070 het 3070 ref 45 27 14 6 GTG 1 0 257781 CASAVA_Build 19 8356259 1D AAGGAAACTC T/- TGTAGATGCA 3070 het 2705 hom 21 6 15 0 T 2 1 257782 CASAVA_Build 19 8358251 1D AAGTAACTTT G/- GGCTGAGTGC 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 G 3 2 257783 CASAVA_Build 19 8364619 1D GGGGAGGGAT G/- GGGGCACTGC 3070 het 1956 hom 30 9 12 9 G 5 4 257784 CASAVA_Build 19 8371475 1D CCTCCTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 23 1 12 10 T 13 12 257785 CASAVA_Build 19 8381257 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 1628 het 558 hom 7 2 4 1 A 9 10 257786 CASAVA_Build 19 8381449 7D CATTTGGTTG CTATTAT/------- GGTAATAACT 2115 het 2115 ref 19 13 5 1 CTATTAT 1 0 257787 CASAVA_Build 19 8405357 1I GGTGTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 11 12 257788 CASAVA_Build 19 8406575 17D AGGTGCCCAC TACCACACCTGGCTAGT/----------------- TTTTGTATTT 3070 hom 72 het 25 0 23 5 TACCACACCTGGCTAGT 1 0 257789 CASAVA_Build 19 8409865 1D CAAAAACCCA C/- CCCTGAATGA 3070 het 2980 hom 26 8 11 7 C 4 3 257790 CASAVA_Build 19 8422412 6D AATATGTCCC TCCCCT/------ TCCCCTTCCC 3070 het 3070 ref 37 17 14 8 TCCCCT 3 2 257791 CASAVA_Build 19 8425318 1D CTGAATAATA T/- CCCATTGCAT 3070 het 3070 ref 46 24 18 6 T 1 0 257792 CASAVA_Build 19 8432637 6D AGGTTTAGAA AGCGGC/------ AAGAATGAAG 3070 het 3070 ref 28 15 13 2 AGCGGC 1 0 257793 CASAVA_Build 19 8435133 1D TCTAAAAAAT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 74 het 30 0 25 5 A 7 6 257794 CASAVA_Build 19 8437961 1D ATCATTTTGG A/- AGAGGCCACT 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 A 2 1 257795 CASAVA_Build 19 8447451 1D GATTAATGTT A/- AAAAAAAAAA 322 het 100 hom 35 2 4 29 A 13 12 257796 CASAVA_Build 19 8447462 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AGAGATTGTT 3070 hom 38 het 38 1 21 19 AAG 1 0 257797 CASAVA_Build 19 8452385 1D GAGAATTCCG C/- CATTCTCTGC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 C 2 1 257798 CASAVA_Build 19 8457534 4D CTCCAGTTTC TGAT/---- TGGTTGGCTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TGAT 1 0 257799 CASAVA_Build 19 8458943 1D CGTGTGAGCC A/- ATTACTGGCA 3070 hom 123 het 43 0 41 4 A 2 1 257800 CASAVA_Build 19 8485320 2D ATATTTTTTA TT/-- TTTTTTTGAG 3021 het 3021 ref 22 8 11 3 T 9 7 257801 CASAVA_Build 19 8486064 4I17M1D ATGGGGAAAT ----AGTAAATCAACAAGTGCA/AGACAGTAAATCAACAAGTGC- AAAACAATCT 3070 het 3070 ref 24 12 10 8 N/A 0 0 257802 CASAVA_Build 19 8487290 4I ATCCGGCTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 14 10 11 TTTG 2 3 257803 CASAVA_Build 19 8488358 1D11M3D CAAATTAAAA TTTTTTCTTTTAATT/-TTTTTCTTTTA--- ATTATTCATT 1781 het 1781 ref 18 12 6 2 N/A 0 0 257804 CASAVA_Build 19 8488666 1D36M1I TAGGAGATGA TTATCTTTTAGCATATGCTAAACGTTTAAGATAATGG-/-TATCTTTTAGCATATGCTAAACCTTTAAGATAATGGC CCATGGTGCC 3070 het 3070 hom 49 26 26 10 N/A 0 0 257805 CASAVA_Build 19 8510480 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1959 hom 21 7 11 3 A 11 12 257806 CASAVA_Build 19 8525303 3I CTGGGGGTGG ---/TGA TGATGTTTCA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 TGA 1 2 257807 CASAVA_Build 19 8530215 7D ATGTTCTTGA GGGGGTG/------- GGGGGTGGGG 1215 hom 16 het 11 0 3 8 GGGGGTG 3 2 257808 CASAVA_Build 19 8531379 1I TAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 25 0 19 6 A 12 13 257809 CASAVA_Build 19 8568348 3D GGTTTTTTGT TGC/--- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 51 25 18 8 TGC 1 0 257810 CASAVA_Build 19 8574886 1D TTGCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2360 hom 34 10 15 11 T 14 13 257811 CASAVA_Build 19 8579255 3I TCCTCTTAGA ---/CTT CTTCTTTCTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CTT 2 3 257812 CASAVA_Build 19 8581221 4D CACTGTCCAA ACAC/---- ACAGACACAC 3070 hom 139 het 51 0 43 8 AC 3 1 257813 CASAVA_Build 19 8585789 2I GGCGTGATCT --/CA GTGGAGTGCA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CA 0 1 257814 CASAVA_Build 19 8587548 5D CATCTCTCTC TCTTT/----- TTTTTTTTTT 2109 hom 22 het 18 0 10 10 TCTTT 1 0 257815 CASAVA_Build 19 8588216 7D CCTGGACGTG GGAGAGA/------- GGGAAGGGCA 1307 het 1307 ref 21 16 3 3 GGAGAGA 1 0 257816 CASAVA_Build 19 8600887 1D TAGTACAGAC G/- GGGTTTTACT 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 G 4 3 257817 CASAVA_Build 19 8605779 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2362 het 671 hom 21 3 14 4 A 15 14 257818 CASAVA_Build 19 8610054 1D TAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 723 hom 24 3 13 8 A 17 16 257819 CASAVA_Build 19 8612290 1D AAATGATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 978 hom 48 3 20 25 T 12 11 257820 CASAVA_Build 19 8612630 1D CACCGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 11 6 T 15 14 257821 CASAVA_Build 19 8619323 1D GACTCTGCTT A/- AAAAAAAAAA 2665 het 4 hom 16 0 8 8 A 15 14 257822 CASAVA_Build 19 8619746 1D AATTAAGCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 10 9 257823 CASAVA_Build 19 8626353 1I CTCTGGTTCA -/G GGGGGGTCTC 3070 hom 89 het 33 0 25 8 G 6 7 257824 CASAVA_Build 19 8631107 4I CCTCCCTCCC ----/TCCT TCCCTCCTTC 3070 het 6 hom 25 1 15 9 TCCT 0 1 257825 CASAVA_Build 19 8649218 4D CGTCCGTCCG TCCA/---- TCCATCCATC 1590 het 1590 ref 62 28 11 26 TCCA 6 5 257826 CASAVA_Build 19 8650329 1I TCTTGGATCA -/G GGCCTTGAGC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 2 3 257827 CASAVA_Build 19 8654096 4I ACTCTCTCAT ----/TCAC TCACTCACTC 3070 het 3070 hom 65 23 32 10 TCAC 3 4 257828 CASAVA_Build 19 8672004 15D AACAACCAGA AATACACTAAGTGAT/--------------- AACACTTTAT 3070 het 3070 ref 26 16 8 4 AATACACTAAGTGAT 1 0 257829 CASAVA_Build 19 8673447 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1878 het 147 hom 6 1 5 0 A 15 14 257830 CASAVA_Build 19 8675334 6I CACACACACA ------/CAAAAC AAACAACAAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 CAAAAC 0 1 257831 CASAVA_Build 19 8675903 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 10 9 257832 CASAVA_Build 19 8689988 1I AGTCAATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 10 11 257833 CASAVA_Build 19 8697327 1D TGCTACACAC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 9 8 257834 CASAVA_Build 19 8700453 1I ATGTGGGATC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 8 9 257835 CASAVA_Build 19 8703694 1I ATTCAGCATA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 7 8 257836 CASAVA_Build 19 8741569 1I TGCATTTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 25 18 13 A 0 1 257837 CASAVA_Build 19 8746197 1D ATATTTTCTC T/- CTTTCTTTCG 2225 het 2225 ref 78 65 5 8 T 1 0 257838 CASAVA_Build 19 8747611 1I CATGGAGAAA -/C CCCGACTCTA 2104 het 767 hom 17 5 6 6 C 3 4 257839 CASAVA_Build 19 8760562 1D CTGAATAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 13 9 A 10 9 257840 CASAVA_Build 19 8762826 1D AACAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 2846 het 1468 hom 28 7 13 8 T 17 16 257841 CASAVA_Build 19 8764249 1I CTATTCACCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 9 10 257842 CASAVA_Build 19 8765453 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1214 het 450 hom 17 3 7 8 A 15 14 257843 CASAVA_Build 19 8765517 8I TTGAATCAAT --------/ATTCAAAA TTCTATATTT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 ATTCAAAA 0 1 257844 CASAVA_Build 19 8765885 2D TTTTTTTTTT TG/-- AGACGGAGTT 1029 het 643 hom 17 6 4 7 TG 1 0 257845 CASAVA_Build 19 8775795 4I TCAACCCATC ----/TTTT TTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 3 7 257846 CASAVA_Build 19 8780085 5I AGGAATACAG -----/AAGAA AATACCTAAT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 AAGAA 0 1 257847 CASAVA_Build 19 8786732 1D ATTCCAAATA C/- CCTAGTTTCA 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 C 3 2 257848 CASAVA_Build 19 8789213 1D CATTTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 21 5 T 12 11 257849 CASAVA_Build 19 8792291 1D CTGACTAGCT G/- GGGATAGGTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 4 3 257850 CASAVA_Build 19 8794976 1D CTTTTTTCTC T/- CACCGCATGT 3070 het 1306 hom 23 4 14 5 T 1 0 257851 CASAVA_Build 19 8803081 1I TTCTCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 844 hom 32 2 13 17 A 13 14 257852 CASAVA_Build 19 8805666 5D TCCATCTCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 24 12 8 6 AAAAC 3 2 257853 CASAVA_Build 19 8807374 2D AAATGAAAAC AT/-- GTGTTCACAT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 AT 1 0 257854 CASAVA_Build 19 8818614 1D CTGCTGGGTG C/- ACTCAAACCC 3070 hom 110 het 41 0 37 4 C 1 0 257855 CASAVA_Build 19 8821842 1D AAGAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 64 het 29 0 26 3 A 10 9 257856 CASAVA_Build 19 8836263 1I GGATGTACCT -/G GGGGGGGGTT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 G 8 9 257857 CASAVA_Build 19 8838078 1I CTGATTAGCA -/C CCTGGCAGAC 3070 het 3070 ref 47 24 22 1 C 2 3 257858 CASAVA_Build 19 8842455 1D TCCTGGTATA G/- GGGGCCTCAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 5 4 257859 CASAVA_Build 19 8844546 1I AAGCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 33 1 26 6 A 11 12 257860 CASAVA_Build 19 8846269 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1765 hom 23 6 11 6 A 12 13 257861 CASAVA_Build 19 8846663 3D GGGTACAAAC ATG/--- ATAACTATGT 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 ATG 1 0 257862 CASAVA_Build 19 8847064 1I TCGTTATATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 9 10 257863 CASAVA_Build 19 8849042 1D TGAGTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 11 10 257864 CASAVA_Build 19 8849929 1I TTCCTCCTCC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 T 6 7 257865 CASAVA_Build 19 8852655 1D AGCGACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 45 0 35 10 T 12 11 257866 CASAVA_Build 19 8855844 3I TTATTGTCAT ---/CAC CACCACCACC 3070 hom 169 het 64 0 57 7 CAC 3 4 257867 CASAVA_Build 19 8861065 1I ATTCCACCTG -/T GCTGCGGACA 3070 hom 135 het 52 0 43 9 T 0 1 257868 CASAVA_Build 19 8862277 3D CCCTATCATT ATC/--- ATCATCATCA 3070 hom 114 het 46 0 38 11 ATC 4 3 257869 CASAVA_Build 19 8864218 1D GGATGGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 22 18 10 A 11 10 257870 CASAVA_Build 19 8869844 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 26 2 20 4 A 14 15 257871 CASAVA_Build 19 8876437 1I GTGTGTGTGT -/G TAGGGGCAGA 3070 hom 96 het 37 0 30 7 G 0 1 257872 CASAVA_Build 19 8887782 3I TGTCACTAGC ---/ATA ATAATAATCA 3070 het 3070 ref 73 32 27 14 ATA 2 3 257873 CASAVA_Build 19 8892982 2D AAAGTTATAC AT/-- ATGTTATATA 2613 het 2609 hom 14 7 7 0 AT 2 1 257874 CASAVA_Build 19 8901350 3D GCACAATTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2288 hom 25 8 12 5 T 15 12 257875 CASAVA_Build 19 8904535 1I AGAGGAAGGA -/G GGGGTAGAAC 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 G 4 5 257876 CASAVA_Build 19 8906421 1I TTGGGGTGAT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 2996 hom 31 9 16 6 A 7 8 257877 CASAVA_Build 19 8939568 1D TCTTCCGTAG T/- AACAAACGCA 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 T 1 0 257878 CASAVA_Build 19 8954576 1I ACAGAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 7 7 A 10 11 257879 CASAVA_Build 19 8966901 15D GTTTTTTTTG TTTTTTGGTTTTTTT/--------------- TTTTTGATAC 1501 het 1501 ref 24 17 6 1 TTTTTTGGTTTTTTT 1 0 257880 CASAVA_Build 19 8974526 2I AAAGAAACAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AC 0 1 257881 CASAVA_Build 19 8976720 1I AATCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 17 8 A 15 16 257882 CASAVA_Build 19 8981808 6D GCATTTACAG AAAAGC/------ AAAAGCAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 AAAAGC 3 2 257883 CASAVA_Build 19 8986548 1I GCCTGCCCCT -/C TGTGGGAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 C 0 1 257884 CASAVA_Build 19 8996775 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1872 het 1872 ref 27 9 6 12 A 10 11 257885 CASAVA_Build 19 8999011 1I TCCAAATAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 T 8 9 257886 CASAVA_Build 19 9000531 1D TAATCTACTT A/- AAAAAAAAGG 1247 het 1247 ref 50 41 3 7 A 9 8 257887 CASAVA_Build 19 9001607 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 23 0 18 5 A 11 10 257888 CASAVA_Build 19 9018135 1D TTCCTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 2664 het 1951 hom 22 5 8 9 T 12 11 257889 CASAVA_Build 19 9024177 1D TCACAACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1276 hom 20 6 9 5 T 12 11 257890 CASAVA_Build 19 9027536 2D TCTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1211 het 1211 ref 27 15 5 8 T 12 10 257891 CASAVA_Build 19 9028588 1I CTAGTTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 27 0 20 7 T 9 10 257892 CASAVA_Build 19 9037880 1I CTAATTTTTG -/T TATTTTTTAG 3070 het 986 hom 19 3 11 6 T 1 2 257893 CASAVA_Build 19 9039754 1D TGAAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2395 hom 20 8 7 6 A 12 11 257894 CASAVA_Build 19 9046308 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 599 hom 16 4 10 2 T 9 8 257895 CASAVA_Build 19 9055406 1I CTTCTTTTTT -/G GGGGGTGGAG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 G 5 6 257896 CASAVA_Build 19 9056361 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 21 0 18 5 A 9 8 257897 CASAVA_Build 19 9057562 2D GAGGCATACC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 37 1 31 6 A 11 9 257898 CASAVA_Build 19 9060565 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 23 10 A 14 12 257899 CASAVA_Build 19 9062999 1D ACCCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 21 0 14 7 T 13 12 257900 CASAVA_Build 19 9068827 1D CTTAAAAAAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 9 8 257901 CASAVA_Build 19 9069428 1I AGAAAAGGCC -/G GGTGCAGTGG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 G 2 3 257902 CASAVA_Build 19 9070424 1D AGCTCATTGC A/- AACCTCCGTC 3017 het 3017 ref 18 8 7 5 A 3 2 257903 CASAVA_Build 19 9077573 1I TATGATTCAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 8 9 9 A 8 9 257904 CASAVA_Build 19 9077940 1I CTACAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 7 8 257905 CASAVA_Build 19 9078715 1I CTGTGTCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 8 9 257906 CASAVA_Build 19 9152347 1D TTATATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 28 0 17 11 T 15 14 257907 CASAVA_Build 19 9174936 3I AATGTGAAAA ---/TGT TGTCTGCTTA 3070 het 3070 ref 57 30 23 4 TGT 1 2 257908 CASAVA_Build 19 9211384 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1039 het 604 hom 18 3 5 10 T 19 18 257909 CASAVA_Build 19 9241619 1D AAAAAATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 13 12 257910 CASAVA_Build 19 9269812 1D AATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2822 hom 26 10 12 4 T 11 10 257911 CASAVA_Build 19 9291379 1D GTCCCTGCAG A/- AAAAAAAACC 2808 hom 21 het 11 0 8 3 A 9 8 257912 CASAVA_Build 19 9296321 1D TCTCTAATGG A/- AAAAAAAAAA 906 het 600 hom 18 3 4 11 A 14 13 257913 CASAVA_Build 19 9299427 1D CTTATTCTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 13 22 6 T 9 8 257914 CASAVA_Build 19 9300763 1I TTTTTGGGCT -/A GGGGGTTTGA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 0 1 257915 CASAVA_Build 19 9305428 1D TGTAACTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 11 10 257916 CASAVA_Build 19 9305661 5I CAAAAAGAGT -----/TACAA TACGAGATGT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 TACAA 0 1 257917 CASAVA_Build 19 9311365 1D AGTTATATCT G/- AGAGGGTTCA 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 G 1 0 257918 CASAVA_Build 19 9313027 2D TTGACAAACA CT/-- CTAAACATCC 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 CT 2 1 257919 CASAVA_Build 19 9316325 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2742 het 2681 hom 28 9 12 7 A 10 11 257920 CASAVA_Build 19 9317334 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTTTA 2693 het 2693 ref 16 8 7 1 T 9 10 257921 CASAVA_Build 19 9322420 1D ATCTATTCCG T/- TTCAGCTAAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 3 2 257922 CASAVA_Build 19 9333962 3I ATCTCAAAAC ---/AAT AATAATTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 AAT 2 3 257923 CASAVA_Build 19 9337087 1I AGAGAAGGGA -/C CCGGGGGGTT 1420 het 1420 ref 19 8 6 5 C 2 3 257924 CASAVA_Build 19 9340022 4I AATTTCTACA ----/CAGT CAGTTTTGGT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 CAGT 1 2 257925 CASAVA_Build 19 9341334 1I47M1I ATTTGACCTA -TTTTTTTTGTTTCATTTCCCTTATTTTTCTTACCTTTGGAATTGAGA-/TTTTTTTTTGTTTCATTTCCCTTATTTTTCTTACCTTTGGAATTGAGAT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 34 26 5 N/A 0 0 257926 CASAVA_Build 19 9346380 1D TGTATGTTGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 50 16 25 9 T 9 8 257927 CASAVA_Build 19 9346769 3D ATCTATTCTA ATG/--- ATGATATAGT 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 ATG 2 1 257928 CASAVA_Build 19 9349374 5I AGATTTTGAT -----/ACTTC ACATATACAG 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 ACTTC 0 1 257929 CASAVA_Build 19 9351505 18I ATGCTTTTTG ------------------/TTTAGTTCTCCCTATTTT CCAGATAATA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TTTAGTTCTCCCTATTTT 0 1 257930 CASAVA_Build 19 9359134 1D AGACTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 A 16 15 257931 CASAVA_Build 19 9359475 1D TCAATCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 34 1 26 7 A 13 12 257932 CASAVA_Build 19 9359619 1I TATGCTTTGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 8 9 257933 CASAVA_Build 19 9376327 2D CCATCTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 A 12 10 257934 CASAVA_Build 19 9380644 52D3M3D TGAGATGTGC AGAATTTGAACATGAACATGAACATGTTCCTTGAACATGTTCCTTGATCATGAACATG/----------------------------------------------------TAC--- AACATGAACC 2928 het 2928 ref 37 40 8 9 N/A 0 0 257935 CASAVA_Build 19 9388042 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1026 het 1026 ref 30 13 3 14 T 15 14 257936 CASAVA_Build 19 9391688 1D CATACTGTGT G/- GGGGGGGACA 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 G 8 7 257937 CASAVA_Build 19 9392703 5D CAGAATGTAT TTTAA/----- TTTAATAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 6 TTTAA 2 1 257938 CASAVA_Build 19 9393837 4D CAACAAAACC TTTT/---- TTTTATCATA 3070 het 2437 hom 25 8 15 3 T 8 4 257939 CASAVA_Build 19 9394457 1I TCCGAGTGGC -/A AGAACTTCAG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 1 2 257940 CASAVA_Build 19 9398167 1I AGTCTAAGAC -/A CAAAAAAAAA 3070 het 1741 hom 25 7 17 1 A 0 1 257941 CASAVA_Build 19 9400582 1D GTCAATTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 10 9 257942 CASAVA_Build 19 9402047 5I CTTTTAAAGA -----/CTCAC CCTTTCCTGA 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 CTCAC 0 1 257943 CASAVA_Build 19 9404468 3I GGTGGGTTAA ---/ATC AACAAATAAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 ATC 0 1 257944 CASAVA_Build 19 9405465 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2978 het 999 hom 18 3 12 3 A 14 13 257945 CASAVA_Build 19 9406507 2I CTAAAAGCCC --/CT GTTTTGAAGC 3070 het 3070 hom 41 21 18 2 CT 0 1 257946 CASAVA_Build 19 9406833 2I GATGAAGGAC --/CA CAGTCAACCT 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 CA 1 2 257947 CASAVA_Build 19 9412893 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1423 het 1423 ref 13 7 4 2 T 11 10 257948 CASAVA_Build 19 9415568 4I TTTTTTGTTT ----/TTTG TTTGAGACAG 3070 het 2502 hom 27 8 15 4 TTTG 1 2 257949 CASAVA_Build 19 9416371 4I GAGGAAAGAA ----/AAAG AAAGAAAGAG 2767 het 2767 ref 26 11 7 8 AAAG 2 3 257950 CASAVA_Build 19 9416418 3I AAAGAAAAAA ---/AAG AAAAAGGAAG 3070 het 1547 hom 22 5 14 3 AAG 0 1 257951 CASAVA_Build 19 9425101 8I AAGTAAATTC --------/TAGCAACA TAGCAACATT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 TAGCAACA 1 2 257952 CASAVA_Build 19 9429954 1D ACTGTTTCAA T/- TTTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 T 6 5 257953 CASAVA_Build 19 9443093 4D TTTTTTTTTT AAAA/---- AAAAAGGTAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 A 9 5 257954 CASAVA_Build 19 9443165 1I TAAACATAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 29 8 15 6 A 6 7 257955 CASAVA_Build 19 9450165 1I GCACGTAGCT -/A AATTCAGAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 3 257956 CASAVA_Build 19 9452079 1D CAAAGGATTT A/- AAGAGGGCAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 A 3 2 257957 CASAVA_Build 19 9463682 1I GGGGGGGACA -/G GGTCTCACTC 3070 hom 59 het 24 0 19 5 G 2 3 257958 CASAVA_Build 19 9464924 1I GAGCTGCTGA -/G TTCTGGCTGA 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 G 0 1 257959 CASAVA_Build 19 9468022 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 A 6 7 257960 CASAVA_Build 19 9487523 3D TGCATTACGA AAG/--- AAGAAGGAAC 3070 het 3070 ref 52 31 17 4 AAG 3 2 257961 CASAVA_Build 19 9508500 1I ATCTGGTTAA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 T 7 8 257962 CASAVA_Build 19 9509128 7D TATTTAACTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2606 het 2606 ref 31 14 8 11 T 19 12 257963 CASAVA_Build 19 9530937 1I ATCCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 1300 het 1300 ref 33 18 3 12 A 15 16 257964 CASAVA_Build 19 9534272 3D TCTCTCCTCC TCT/--- TCCCAGGCCT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 TCT 1 0 257965 CASAVA_Build 19 9542420 1D TTTTTTGCGA G/- GGGGGGGGGT 1672 het 1672 ref 19 6 7 6 G 10 9 257966 CASAVA_Build 19 9547577 3D TGCAGTGCAG TAA/--- TAATAGTAGG 3070 het 3070 hom 51 22 27 4 TAA 2 1 257967 CASAVA_Build 19 9561734 1D GCTGACAGTT G/- GGGGGGGCTG 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 G 8 7 257968 CASAVA_Build 19 9613964 1I TTTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1317 het 1203 hom 28 5 8 15 A 17 18 257969 CASAVA_Build 19 9733025 1D AAACATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 11 10 257970 CASAVA_Build 19 9777646 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1338 het 1338 ref 32 22 3 7 A 15 14 257971 CASAVA_Build 19 9792368 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 667 het 667 ref 19 6 2 12 A 15 14 257972 CASAVA_Build 19 9798508 19I GGCATATCAT -------------------/GCATGTACTTAAAATTATG GAATGGAGGC 3070 hom 60 het 21 0 20 2 GCATGTACTTAAAATTATG 0 1 257973 CASAVA_Build 19 9819382 2D GTGTGTGTGC AT/-- GTGTGTGTGC 2290 het 2290 ref 32 7 10 15 AT 1 0 257974 CASAVA_Build 19 9823412 5I TTGTGCTGCT -----/TTTCA TTTCATTTCT 3070 hom 97 het 41 0 33 8 TTTCA 1 2 257975 CASAVA_Build 19 9826900 1D GCTATTGGTC T/- TTTTTTTTTT 1777 het 518 hom 18 4 9 5 T 12 11 257976 CASAVA_Build 19 9834588 16D CGGGGTGGGG GCAGCGAGCCGAGGTT/---------------- GCAGTGAGCC 3070 het 1892 hom 21 7 11 4 GCAGCGAGCCGAGGTT 1 0 257977 CASAVA_Build 19 9836845 1D TCTTCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 2538 het 2316 hom 38 13 8 17 T 13 12 257978 CASAVA_Build 19 9842946 1I GATCCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 2250 het 2250 ref 16 7 6 3 A 11 12 257979 CASAVA_Build 19 9844208 1I AAAAAAAAAA -/G ATATTAGTTC 3070 het 127 hom 22 1 16 5 G 0 1 257980 CASAVA_Build 19 9844471 4I TCTGTTTACC ----/CATT CATTCATTCA 3070 het 3070 hom 52 19 22 11 CATT 3 4 257981 CASAVA_Build 19 9849508 1D GAAAAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 T 11 10 257982 CASAVA_Build 19 9851458 4I TCTTGAACTC ----/TCTT TTTTTTGTCT 2679 hom 18 het 8 0 7 1 TCTT 0 1 257983 CASAVA_Build 19 9853342 1I19M1I TAATTTTTAA -TTTTTTTTTTTTTACAGTT-/TTTTTTTTTTTTTTACAGTTG GGGGGGTCTT 2149 hom 17 het 13 0 6 12 N/A 0 0 257984 CASAVA_Build 19 9854214 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 8 9 257985 CASAVA_Build 19 9857780 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 17 1 11 5 A 11 12 257986 CASAVA_Build 19 9860125 1I GCTTGAGCCT -/G GGGGGGCGGA 2983 het 104 hom 11 2 9 0 G 6 7 257987 CASAVA_Build 19 9861597 1I TAAATTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2378 hom 32 8 11 13 T 13 14 257988 CASAVA_Build 19 9864848 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2529 het 1027 hom 23 5 10 8 T 11 12 257989 CASAVA_Build 19 9865203 1I CTTGAGTGAA -/C CCCCCCGTCT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 C 6 7 257990 CASAVA_Build 19 9881257 1I GCTCACCGCC -/A CCACACCACT 3070 het 3070 hom 49 16 19 14 A 0 1 257991 CASAVA_Build 19 9881652 1I TGTAGGCCTA -/C TGTGCGCCAC 3070 het 3070 hom 54 19 25 10 C 0 1 257992 CASAVA_Build 19 9889070 1I CCATGCCCTG -/C CCCTTCCCCC 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 C 3 4 257993 CASAVA_Build 19 9889429 5I TCTGAAACAC -----/GTAGA GTAGTTTGTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 GTAGA 0 1 257994 CASAVA_Build 19 9890853 4I TTTCTCTCTC ----/TTTT TTTTTTTTGA 3019 hom 34 het 21 0 11 10 T 8 12 257995 CASAVA_Build 19 9893950 2D AAATCTAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 96 het 43 0 32 12 AC 10 9 257996 CASAVA_Build 19 9918880 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 84 hom 29 1 22 6 A 9 10 257997 CASAVA_Build 19 9928795 1I CAACAGCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 9 10 257998 CASAVA_Build 19 9930143 1D CCAAACCAAA T/- TTTTTTTTTT 716 het 716 ref 32 23 2 7 T 15 14 257999 CASAVA_Build 19 9935237 2D CTGTTTTTTT TG/-- GGGGGGGGGG 822 het 661 hom 15 5 4 7 TG 1 0 258000 CASAVA_Build 19 9941620 1I AAGACAGTGA -/G GGGGGGTCTA 1545 het 1545 ref 14 8 4 2 G 6 7 258001 CASAVA_Build 19 9968456 2I TGAGTCAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 AG 6 7 258002 CASAVA_Build 19 9970717 8I TCTTTTTCTT --------/TCTTTCTA TCTCTTTCTT 2557 het 2557 ref 25 15 8 2 TCTTTCTA 0 1 258003 CASAVA_Build 19 9971308 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 939 het 939 ref 9 5 3 1 T 7 6 258004 CASAVA_Build 19 9976675 2I ACTGCAACGG --/CA CACACACAAG 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 CA 4 5 258005 CASAVA_Build 19 9993738 2D CCTTGAAGGA AG/-- AGACAGACTC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AG 2 1 258006 CASAVA_Build 19 9995024 3D AAAATGGTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1464 hom 25 5 9 11 T 15 12 258007 CASAVA_Build 19 9998723 1D GTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 17 19 10 T 10 9 258008 CASAVA_Build 19 9999700 1D CTCCCTTTTC T/- TATCCGGGTT 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 T 2 1 258009 CASAVA_Build 19 9999971 4I44M8D TTGTTCTTTC ----TCTTCTTTTCTTTTTCTTTTTCTCTTCTTTCTCTCTCTTCTTTCTCTTTCTT/TCTTTCTTCTTTTCTTTTTCTTTTTCTCTTCTTTCTCTCTCTTCTTTC-------- TCTTTCTTTC 3070 het 1422 hom 19 4 20 1 N/A 0 0 258010 CASAVA_Build 19 10002148 1D GGGCAAAGGT G/- GGGGGTCACT 3070 hom 58 het 22 0 18 4 G 6 5 258011 CASAVA_Build 19 10004598 1I ATCATAGTGT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 7 8 258012 CASAVA_Build 19 10005027 2D TGAAAGAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 35 11 22 2 AG 6 5 258013 CASAVA_Build 19 10013011 1I CCATATCCTC -/T TCCTCTATCT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 1 2 258014 CASAVA_Build 19 10035280 4D TGTGACTTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 12 12 TTTC 4 3 258015 CASAVA_Build 19 10036841 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2820 hom 20 8 9 3 A 13 12 258016 CASAVA_Build 19 10047334 2D TCCAGCTTCA GT/-- GTGACAATGA 3070 het 3070 hom 39 16 16 10 GT 2 1 258017 CASAVA_Build 19 10047716 1I ACCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1873 het 1248 hom 16 5 8 3 A 13 14 258018 CASAVA_Build 19 10048316 3D49M5D AGGGAAGGGG AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAGAGAAGAGAAAAGAG/---AGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAGAGAAGAGAA----- AAGAGAAGAG 3070 het 3070 ref 27 18 9 15 N/A 0 0 258019 CASAVA_Build 19 10062593 4D CTAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3003 het 3003 ref 25 11 10 7 AAAG 3 2 258020 CASAVA_Build 19 10087341 4D AGCCCCACCG TGCC/---- TGCCTGCCTG 1698 het 1698 ref 25 8 9 8 TGCC 4 3 258021 CASAVA_Build 19 10090099 1I AAAATTAGCT -/G GGCGTGGTGG 1876 het 1276 hom 12 3 5 4 G 2 3 258022 CASAVA_Build 19 10117159 1D AACGTTGGCT G/- TAATTCCAAC 3070 het 3070 hom 51 17 25 10 G 1 0 258023 CASAVA_Build 19 10154802 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 1270 het 489 hom 7 2 5 0 T 12 11 258024 CASAVA_Build 19 10169730 1D AAGAGACAGG A/- AAAAAAAAAA 859 het 859 ref 34 23 5 6 A 15 14 258025 CASAVA_Build 19 10180373 4I GAGACAGGGT ----/CTCA CTGTCTCCCA 3070 het 2662 hom 29 9 8 12 CTCA 0 1 258026 CASAVA_Build 19 10181937 4I ATCTTAGAAA ----/AAAC AAACAGACAA 3070 het 2209 hom 27 9 13 5 AAAC 1 2 258027 CASAVA_Build 19 10182109 1I AGGCCACTTA -/C CACCCTGCCT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 C 1 2 258028 CASAVA_Build 19 10189324 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 10 5 4 1 T 11 10 258029 CASAVA_Build 19 10197722 1D CAGAAACCTT G/- CCCACCTACC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 1 0 258030 CASAVA_Build 19 10199986 10D GAGACTGTCT CAAAACAAAA/---------- CAAAACAAAA 2971 het 2571 hom 17 9 7 2 CAAAA 6 4 258031 CASAVA_Build 19 10206959 1D CACTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 1058 het 1058 ref 36 27 3 6 A 12 11 258032 CASAVA_Build 19 10210626 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 14 13 258033 CASAVA_Build 19 10222931 5D ACACAAATAC CTAAT/----- CTGAGGGGTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CTAAT 1 0 258034 CASAVA_Build 19 10225468 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 20 0 16 4 A 11 12 258035 CASAVA_Build 19 10233347 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 23 1 19 3 A 11 12 258036 CASAVA_Build 19 10251542 1D CACTGCCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 550 hom 35 2 15 18 A 16 15 258037 CASAVA_Build 19 10254606 4I GGAGAATTGC ----/TTGA TTGAACCCAG 2902 het 636 hom 11 2 7 2 TTGA 1 2 258038 CASAVA_Build 19 10266907 1I GGCAGGATCC -/T TCTTCTGCCC 2631 het 2631 ref 21 12 7 2 T 1 2 258039 CASAVA_Build 19 10270923 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2783 het 637 hom 14 4 6 4 T 16 14 258040 CASAVA_Build 19 10275113 1D CCCACCCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 43 2 26 15 T 12 11 258041 CASAVA_Build 19 10307901 1I ATGGCACAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 9 10 258042 CASAVA_Build 19 10309134 14I AAAAAGTAGC --------------/CAGGTACAGTGGCT CAGGCCTGCA 3070 hom 30 het 12 0 10 3 CAGGTACAGTGGCT 0 1 258043 CASAVA_Build 19 10310080 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1888 het 1888 ref 27 9 9 9 A 16 17 258044 CASAVA_Build 19 10342187 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2287 het 995 hom 19 5 7 7 A 17 16 258045 CASAVA_Build 19 10458343 3D AGGTACAGTT CTG/--- CTGGTCAATC 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 CTG 2 1 258046 CASAVA_Build 19 10484842 1I CTCAGTGCAG -/C CCCCCCTTCA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 C 6 7 258047 CASAVA_Build 19 10487295 1I TCTCAAAACA -/C CCCCCCCTCC 2179 het 2179 ref 16 8 8 0 C 7 8 258048 CASAVA_Build 19 10498697 4D ATAAATAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 6 AAAC 4 3 258049 CASAVA_Build 19 10510211 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1969 hom 19 6 9 4 T 13 14 258050 CASAVA_Build 19 10526536 1I TGCAACTTGA -/T TAAGGCAGAA 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 T 1 2 258051 CASAVA_Build 19 10536137 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2443 hom 24 8 10 6 A 13 12 258052 CASAVA_Build 19 10540068 3D GAAAGCCTAG AGA/--- AGAAGGACCG 2998 het 2856 hom 21 8 11 2 AGA 2 1 258053 CASAVA_Build 19 10542397 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 334 het 334 ref 14 6 3 5 A 16 12 258054 CASAVA_Build 19 10588846 1D TCCGCCCGCC T/- GGGGCTCCCA 3070 hom 41 het 17 0 14 4 T 1 0 258055 CASAVA_Build 19 10602682 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3043 het 414 hom 16 1 11 4 A 15 16 258056 CASAVA_Build 19 10604354 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 21 0 12 9 T 12 11 258057 CASAVA_Build 19 10611116 1D GGGCAGGTGT G/- GGGGGGGTCC 3070 hom 84 het 32 0 27 5 G 8 7 258058 CASAVA_Build 19 10612770 1I CTCAGGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 10 11 258059 CASAVA_Build 19 10616417 2I CAGATTTCCC --/CT GATTAGGCTC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 CT 0 1 258060 CASAVA_Build 19 10617069 2I GATCTCACTC --/TG TGGCTGAAGC 3070 hom 26 het 13 0 10 3 TG 1 2 258061 CASAVA_Build 19 10617232 1D TGCCCATGCT G/- GTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 2 1 258062 CASAVA_Build 19 10620010 1D TGTCCACCCT G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 76 het 35 0 25 10 G 9 8 258063 CASAVA_Build 19 10620502 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 16 7 T 15 14 258064 CASAVA_Build 19 10637291 2I TTTTTTTTTT --/TC CTTTTTTTTT 1349 hom 7 het 3 0 3 0 TC 0 1 258065 CASAVA_Build 19 10647623 1I TTGCCATTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 333 hom 37 1 29 7 T 9 10 258066 CASAVA_Build 19 10671329 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 126 hom 20 1 15 4 A 12 13 258067 CASAVA_Build 19 10676900 1D CCCATATTTA T/- TTTTTCGTCT 3055 hom 18 het 8 0 7 1 T 6 5 258068 CASAVA_Build 19 10697907 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 22 1 20 1 T 13 12 258069 CASAVA_Build 19 10727143 1I TGCATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 32 0 19 13 T 14 15 258070 CASAVA_Build 19 10743216 1D TCCCTCTACC T/- TGTGGGCTCC 3070 hom 123 het 43 0 38 5 T 2 1 258071 CASAVA_Build 19 10753151 1D ACATGCACAA C/- CCCACTACAA 3070 hom 108 het 42 0 34 8 C 4 3 258072 CASAVA_Build 19 10913607 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 433 het 433 ref 12 7 1 4 T 15 16 258073 CASAVA_Build 19 10922261 1D TAATTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 895 het 895 ref 23 13 3 7 T 14 13 258074 CASAVA_Build 19 10944786 1I GTCCATCTAC -/A AAAAAAAAAA 1286 het 1286 ref 26 10 8 8 A 15 16 258075 CASAVA_Build 19 11016995 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 1796 het 1558 hom 24 5 9 10 A 11 12 258076 CASAVA_Build 19 11047449 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1675 het 24 hom 11 0 6 5 A 15 14 258077 CASAVA_Build 19 11079975 3I GTCTTGAGGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TTG 3 4 258078 CASAVA_Build 19 11081732 4I ACACTCACTC ----/TCCA TCCATCCCCT 3070 hom 84 het 34 0 27 7 TCCA 1 2 258079 CASAVA_Build 19 11091520 2I GGTATGTTGG --/CA CACACCTGTA 3070 hom 62 het 24 0 21 3 CA 2 3 258080 CASAVA_Build 19 11091651 4D ACTCTGTCTG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 72 het 28 0 23 6 AAAC 6 5 258081 CASAVA_Build 19 11094654 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 946 het 946 ref 21 5 9 7 T 17 16 258082 CASAVA_Build 19 11104208 1I CCTGGCTAAC -/A ACGTGAAACC 2380 hom 15 het 7 0 6 1 A 1 2 258083 CASAVA_Build 19 11110709 5D CGTCCCTCCC CTGGG/----- CTGGGCTGCT 3070 hom 55 het 23 0 18 5 CTGGG 2 1 258084 CASAVA_Build 19 11111335 4D TTCTTTCTTC CTTT/---- GTTTCTCTCT 3070 hom 38 het 24 0 18 7 CTTT 1 0 258085 CASAVA_Build 19 11114887 1D AGACGTGCCC A/- ATCCCCCCAT 3070 hom 71 het 25 0 20 5 A 2 1 258086 CASAVA_Build 19 11119594 14D CAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAG/-------------- AAAGTTACCC 3070 het 2522 hom 26 13 11 13 AAAAAAAAAAAAAG 1 0 258087 CASAVA_Build 19 11125754 1D CGTCTCAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 10 9 258088 CASAVA_Build 19 11126364 1I ACAATTCCTC -/T GTAAGGTTCC 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 0 1 258089 CASAVA_Build 19 11128486 1I AGATGGCATC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 7 8 258090 CASAVA_Build 19 11130159 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1896 hom 22 7 13 2 A 12 11 258091 CASAVA_Build 19 11131313 1D TGGGCGACAA G/- GAGCAAAACT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 2 1 258092 CASAVA_Build 19 11136387 28D TCTATCTATT CATCCATCCATCCATCCATCCATCCATC/---------------------------- CATCCATCCA 3070 het 2629 hom 40 12 12 27 CATC 12 5 258093 CASAVA_Build 19 11136812 2D TGAAGGAAAC TG/-- TGAGTGTCTC 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 TG 2 1 258094 CASAVA_Build 19 11151325 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1639 het 1639 ref 22 15 4 3 A 12 11 258095 CASAVA_Build 19 11155332 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2367 het 2367 ref 27 10 9 8 T 14 13 258096 CASAVA_Build 19 11158802 1D CGTGGTAGCA G/- GGCATCTGTA 3070 het 110 hom 16 1 12 5 G 3 2 258097 CASAVA_Build 19 11158948 1I AAAAAAGGAA -/G GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 G 1 2 258098 CASAVA_Build 19 11159017 1I AAAAATAGTG -/T TAAGGAGAGG 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 1 2 258099 CASAVA_Build 19 11159883 1I GCCAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 18 10 T 14 15 258100 CASAVA_Build 19 11175808 13D AGCAGATCCC TGGGGATGAGGAG/------------- TGGGGATGAG 2404 het 1749 hom 19 8 7 6 TGGGGATGAGGAG 2 1 258101 CASAVA_Build 19 11178510 3D ATTTGTGGTG GTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 20 14 6 GTT 1 0 258102 CASAVA_Build 19 11195879 1D TCTTTCTTTC T/- TTCTTTCTTT 169 het 169 ref 12 5 2 5 T 3 2 258103 CASAVA_Build 19 11228518 1D CATGCCCGGC T/- AATTTTTTGT 3070 het 953 hom 11 2 9 0 T 1 0 258104 CASAVA_Build 19 11230434 2D AACTTTTCTT TC/-- TCTCTCTTTT 2086 het 1565 hom 13 5 7 1 TC 4 3 258105 CASAVA_Build 19 11239356 2D TTTTGGAGAC AG/-- GGTCTTGCTC 3070 het 3070 ref 52 23 25 8 AG 1 0 258106 CASAVA_Build 19 11241443 1I AGTGCATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 17 7 T 11 12 258107 CASAVA_Build 19 11243411 1D CCTGGCCCAC T/- TTTTTTTTTT 1103 het 21 hom 8 0 3 5 T 13 12 258108 CASAVA_Build 19 11244673 1D AAACACAACA G/- GTAGCTGGGT 1759 het 1759 ref 17 10 5 2 G 2 1 258109 CASAVA_Build 19 11245382 8I TCTCTTTCTT --------/TCTTTCTC TCTTTCTCTC 1784 hom 12 het 6 0 5 1 TCTTTCTC 1 2 258110 CASAVA_Build 19 11250228 1I CCCTGTCTAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 22 8 11 4 A 8 9 258111 CASAVA_Build 19 11250812 1D AAATAAAAAT A/- AATTGAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 3 2 258112 CASAVA_Build 19 11252303 5D GTTGGATGCA ACCTG/----- GTGGTATGAT 2762 hom 24 het 12 0 6 6 ACCTG 1 0 258113 CASAVA_Build 19 11252529 1D AGGTTTACTC T/- TTTTTTTTTT 2931 het 2863 hom 18 8 8 2 T 11 10 258114 CASAVA_Build 19 11254197 1I TGCTCTTACG -/A CCATTTGAGT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 0 1 258115 CASAVA_Build 19 11254304 1I ACTTTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 13 15 12 T 11 12 258116 CASAVA_Build 19 11257146 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTT 1743 het 999 hom 19 5 7 7 AG 2 1 258117 CASAVA_Build 19 11257723 2D ATTTCAGCTC TT/-- TGCATCCTCT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 3 1 258118 CASAVA_Build 19 11258029 1I AAAGGGACCA -/G GGGTGGTGGC 2974 hom 24 het 12 0 9 3 G 3 4 258119 CASAVA_Build 19 11269631 1I CTACTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 526 hom 42 2 30 10 T 10 11 258120 CASAVA_Build 19 11271662 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 17 0 15 2 A 15 14 258121 CASAVA_Build 19 11273505 1I TCGTTTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 23 1 17 5 T 13 14 258122 CASAVA_Build 19 11273647 3D TTAGAGGCGC CCA/--- CCACCACACC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 CCA 3 2 258123 CASAVA_Build 19 11279967 3I19M1I AGTCCCCATC ---ACAACAACAACAAATTTTG-/ACAACAACAACAACAAATTTTGT TTTTTTTGAG 3070 hom 63 het 24 0 21 5 N/A 0 0 258124 CASAVA_Build 19 11280767 1D AACCTGTAGT C/- CCAGCTAACT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 C 3 2 258125 CASAVA_Build 19 11282192 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2872 het 46 hom 26 2 11 13 A 18 16 258126 CASAVA_Build 19 11282557 4D TCACTCAGGC TGGA/---- TGGAGTACAG 3070 hom 89 het 36 0 27 11 TGGA 2 1 258127 CASAVA_Build 19 11285203 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3004 hom 29 het 15 0 9 6 A 16 15 258128 CASAVA_Build 19 11288654 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1711 het 1711 ref 15 5 4 6 T 6 7 258129 CASAVA_Build 19 11290145 3D CAGATCCTGA TCT/--- TCTAATTTAA 3070 hom 39 het 14 0 14 2 TCT 2 1 258130 CASAVA_Build 19 11296171 8D25M6D AAAACACAAC CAGCTAAACAGCTAAACAGGGCCTGGGAGGGAGGCCCCA/--------CAGCTAAACAGGGCCTGGGAGGGAG------ GCCCCAGGCT 2904 het 2904 ref 23 16 8 10 N/A 0 0 258131 CASAVA_Build 19 11297303 1I AGACCCCTGA -/G GGGCAGAGTC 3070 hom 132 het 50 0 43 7 G 3 4 258132 CASAVA_Build 19 11303069 1I TGTCATATTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 8 9 258133 CASAVA_Build 19 11306463 1I AGCTGGGCAT -/G GTGGCACGCG 1750 het 1750 ref 17 9 5 3 G 1 2 258134 CASAVA_Build 19 11320666 1I AAGGCTCTGG -/A AGCGTACAGC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 1 2 258135 CASAVA_Build 19 11381159 5D TCCATCTCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 54 het 29 0 19 10 AAAAC 4 3 258136 CASAVA_Build 19 11383030 1I TCACGGCAGC -/T TTTGATTTCC 3070 hom 69 het 26 0 22 4 T 3 4 258137 CASAVA_Build 19 11397492 1D ATATATATGC A/- AAAAAAAACC 2200 hom 15 het 17 0 6 11 A 9 8 258138 CASAVA_Build 19 11406357 1I AGATTCTGCC -/A AAAAAAAAAA 1935 het 653 hom 25 5 12 8 A 16 17 258139 CASAVA_Build 19 11412129 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2169 hom 16 het 11 0 6 5 T 12 11 258140 CASAVA_Build 19 11436062 1I CTGTAGCCTC -/G GCCGCCTCAG 2702 hom 21 het 11 0 9 2 G 1 2 258141 CASAVA_Build 19 11534825 1D CATGGTTCAC T/- GTAGCCTCAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 1 0 258142 CASAVA_Build 19 11536167 5D AATTTACTAC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 22 0 14 8 T 19 14 258143 CASAVA_Build 19 11536425 1D TTGGCCTCCC A/- AAAGTGTTGG 3070 hom 74 het 27 0 23 4 A 4 3 258144 CASAVA_Build 19 11593532 2D GCTGTTTGAT CC/-- CATATAGACT 1360 het 1360 ref 42 34 3 6 C 3 1 258145 CASAVA_Build 19 11632208 4D AGAAATACAC ATTT/---- AGTCTGTCTT 3070 het 3070 hom 50 23 23 6 ATTT 1 0 258146 CASAVA_Build 19 11633861 2I TGAATAGGTA --/CT GTTTCTTGCC 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 CT 0 1 258147 CASAVA_Build 19 11636607 3D CAGATGAGTC AAT/--- AACCCTGGCT 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 AAT 1 0 258148 CASAVA_Build 19 11666944 1I CACAGCCCTT -/G GGCAGGGCGG 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 G 2 3 258149 CASAVA_Build 19 11673631 2I ACTCTGTCTT --/AA AAAAAAAAAA 838 het 781 hom 14 5 7 2 A 15 17 258150 CASAVA_Build 19 11701741 1D GTAAAGAATC T/- TTTTTTTTTT 1267 het 1267 ref 35 21 4 10 T 15 14 258151 CASAVA_Build 19 11719073 1D ATGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2271 hom 39 12 15 12 A 17 16 258152 CASAVA_Build 19 11721983 1I AAAATATTGA -/T TTTTTCCAAT 3070 het 3070 ref 37 26 9 2 T 5 6 258153 CASAVA_Build 19 11733011 1D AATTTTTTTT G/- TTGTTTTTTG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 G 1 0 258154 CASAVA_Build 19 11734550 4I CTCCCAAATT ----/AGTC AGCCATGGTG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AGTC 0 1 258155 CASAVA_Build 19 11735036 1I CAGAGGTCAA -/T TTTTTTGCTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 6 7 258156 CASAVA_Build 19 11736496 2D CTTTTGTATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 39 0 12 27 T 15 13 258157 CASAVA_Build 19 11741485 1D TAAAGGACTC T/- TTTTTTTTTT 2783 het 2783 ref 25 12 10 3 T 11 10 258158 CASAVA_Build 19 11743005 2D TCAGAAGAAA GG/-- GGGGTTATGA 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 G 6 4 258159 CASAVA_Build 19 11756810 1I CCGTAGATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 55 het 24 0 19 5 A 9 10 258160 CASAVA_Build 19 11757114 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1593 hom 23 6 14 3 A 10 11 258161 CASAVA_Build 19 11761112 1I TCACTGGGAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 A 8 9 258162 CASAVA_Build 19 11767689 1D TTTTTGTATG T/- TTGGTATAAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 3 2 258163 CASAVA_Build 19 11779094 1D AGAAATGCTA T/- TTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 49 14 32 3 T 6 5 258164 CASAVA_Build 19 11789504 4D AAAAAAAAAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 GAAA 4 3 258165 CASAVA_Build 19 11800118 1I7M2I AAATGATTCT -CCACGTC--/CCCACGTCAG CCAGTCAAGT 3070 hom 79 het 25 0 25 3 N/A 0 0 258166 CASAVA_Build 19 11800503 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1107 het 1107 ref 29 15 5 9 T 15 14 258167 CASAVA_Build 19 11810472 1I CTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 14 11 T 13 14 258168 CASAVA_Build 19 11812218 2D GTCTCAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 1102 het 1102 ref 30 12 8 10 A 16 14 258169 CASAVA_Build 19 11813764 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 9 8 258170 CASAVA_Build 19 11817967 2D TGGTGGGATC AT/-- ATAGCTCACT 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 AT 2 1 258171 CASAVA_Build 19 11830299 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGTCTATT 831 het 558 hom 17 8 4 5 G 5 4 258172 CASAVA_Build 19 11844909 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 803 het 803 ref 33 20 4 9 A 13 14 258173 CASAVA_Build 19 11845197 1D GAGGTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2245 hom 29 7 15 7 A 11 10 258174 CASAVA_Build 19 11854953 1I CAGTTACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 13 14 258175 CASAVA_Build 19 11855762 1I AGGTGAAAGG -/C CCCCCCCTAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 C 7 8 258176 CASAVA_Build 19 11892470 1D TGGGAGGCTG A/- GGGGGGTGCA 3070 hom 54 het 21 0 17 5 A 1 0 258177 CASAVA_Build 19 11894486 1I AGGAGGTCAT -/C CCGCCTGGTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 2 3 258178 CASAVA_Build 19 11913798 1I GCTTATTACA -/C CCTGGTATCT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 2 3 258179 CASAVA_Build 19 11934416 1D GCTCAAGTGA C/- CCCCCCCCAC 768 het 768 ref 40 30 2 8 C 9 8 258180 CASAVA_Build 19 11947490 1D AGCCACCGCA C/- CCCGGCCTTT 3070 hom 42 het 19 0 14 5 C 4 3 258181 CASAVA_Build 19 11993103 3D GCCAGGACTC CTT/--- CTTTGACCAA 3070 het 2346 hom 26 7 15 6 CTT 2 1 258182 CASAVA_Build 19 12049646 1D TTATTCTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2040 hom 40 8 22 10 T 10 9 258183 CASAVA_Build 19 12073251 1D31M2I GGCCACCATC AAAAATAATACCCTAATCTTTGGCAGGAACTT--/-AAAATGATATCCTAATCTTTGGCGGGAATTTTG TCTTTCTGCT 1379 het 1379 ref 27 22 3 3 N/A 0 0 258184 CASAVA_Build 19 12101161 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 810 hom 20 4 10 6 A 18 17 258185 CASAVA_Build 19 12102385 1D CTCAAGGTGA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 T 7 6 258186 CASAVA_Build 19 12121193 2I ATGTGATAGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 TA 7 8 258187 CASAVA_Build 19 12182859 1I GTTGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2088 het 1431 hom 19 6 6 7 T 11 12 258188 CASAVA_Build 19 12212930 3D CATTTGTACA AAG/--- ATATATAAAT 3070 het 3070 ref 49 27 20 2 AAG 1 0 258189 CASAVA_Build 19 12215562 2D ACCTCCATAT TG/-- TTTTTCACAA 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 TG 1 0 258190 CASAVA_Build 19 12225991 1D ACAGCAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 A 12 11 258191 CASAVA_Build 19 12235956 3D GCCCAAGGAA ACT/--- ACAATTACAA 3070 het 3070 hom 54 26 27 5 ACT 1 0 258192 CASAVA_Build 19 12240968 3I CTGCCCAGCA ---/AGG AGGAGAGTGA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AGG 1 2 258193 CASAVA_Build 19 12243775 1I ATCTTCTTGC -/A ATATAGCAGG 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 A 1 2 258194 CASAVA_Build 19 12243978 3D TGCCTGGCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2531 hom 22 9 9 5 T 13 10 258195 CASAVA_Build 19 12250544 1D TATTTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 A 12 11 258196 CASAVA_Build 19 12251383 5I TTGAGATAAA -----/TCACC TCTGAGAAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TCACC 0 1 258197 CASAVA_Build 19 12257790 3D GCCGAGATCA CGC/--- CACTGCACTC 3066 het 1069 hom 11 3 7 1 CGC 1 0 258198 CASAVA_Build 19 12264682 2I TTTTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 218 hom 23 2 15 6 TG 0 1 258199 CASAVA_Build 19 12267525 4I CTCTATACTA ----/TATT TAAGGGAGGA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 TATT 0 1 258200 CASAVA_Build 19 12268412 1D TCAGACATGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1736 hom 19 9 10 1 A 10 9 258201 CASAVA_Build 19 12269135 1D TTACCTCAGG T/- TTATTTGCTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 3 2 258202 CASAVA_Build 19 12271178 1I CTGTCAGTGG -/A AAAGTCACAA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 3 4 258203 CASAVA_Build 19 12276669 1I TACCATGATG -/A AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 6 7 258204 CASAVA_Build 19 12281286 1I CTCACATCAA -/T TTTTGTATGA 3070 hom 104 het 39 0 34 5 T 4 5 258205 CASAVA_Build 19 12284026 5I TTTCCATGTT -----/ATATC ATATATTTCC 3070 het 3070 hom 54 20 25 9 ATATC 0 1 258206 CASAVA_Build 19 12285089 2D TTGTTTTGGT AG/-- AGACAGGCTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 AG 2 1 258207 CASAVA_Build 19 12287519 1I TAAATAAATA -/G AAGAGGCAGT 89 het 89 ref 26 11 1 14 G 0 1 258208 CASAVA_Build 19 12288208 1D ATCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2475 het 2412 hom 34 11 12 11 A 15 14 258209 CASAVA_Build 19 12290210 1I CAATGGTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 A 9 10 258210 CASAVA_Build 19 12296180 1D CTCAAAAAAA T/- AAATAAAATT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 1 0 258211 CASAVA_Build 19 12299274 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2501 het 339 hom 14 2 7 5 A 16 15 258212 CASAVA_Build 19 12337579 1I CCAAATTCCG -/C CCCCCCCAGG 1880 het 1880 ref 26 13 6 7 C 7 8 258213 CASAVA_Build 19 12352303 3D TTCATAGAGT TTC/--- TTCTCTCCAG 3070 hom 77 het 29 0 25 4 TTC 2 1 258214 CASAVA_Build 19 12354773 1D TTTTCTTTTC T/- TTTCTTTTTT 179 het 179 ref 14 8 4 2 T 4 3 258215 CASAVA_Build 19 12357180 11D AAAAATGTCT AAAAATGCTTA/----------- AAACTTCTCA 3070 het 3070 ref 27 15 7 5 AAAAATGCTTA 1 0 258216 CASAVA_Build 19 12359184 1D TGGCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 753 het 753 ref 16 5 3 8 T 17 16 258217 CASAVA_Build 19 12361748 3I AATCATCATC ---/ATT GTTATAATCA 2079 het 2079 ref 27 17 6 4 ATT 0 1 258218 CASAVA_Build 19 12368044 2D CCTCAGACAC TG/-- CACTCACTGA 1628 het 1628 ref 43 33 4 6 TG 1 0 258219 CASAVA_Build 19 12374432 1D CTATACCCAG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 13 9 9 T 9 8 258220 CASAVA_Build 19 12377034 2D AACTCCCATT TA/-- TATATATATA 1354 het 1354 ref 21 15 3 3 TA 8 7 258221 CASAVA_Build 19 12378714 1I ACTTCTTCTC -/A AAAAAAAATA 2445 het 1814 hom 13 5 6 2 A 8 9 258222 CASAVA_Build 19 12381025 1D CAACCTAGAT C/- CCCTTGCATG 3070 het 3070 ref 34 14 8 12 C 4 3 258223 CASAVA_Build 19 12382066 24D AATGTCTGTG TGCATATATATATATATATATATA/------------------------ TATATATATA 3038 het 147 hom 10 1 8 2 TGCATATATATATATATATATATA 1 0 258224 CASAVA_Build 19 12383433 1I TTCGTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 8 9 258225 CASAVA_Build 19 12384359 2D AATTTGTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 A 12 10 258226 CASAVA_Build 19 12387368 4I CTTAAAAAAT ----/GACA GACATACACA 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 GACA 1 2 258227 CASAVA_Build 19 12387479 5I TGCTGCTAGC -----/ATATT ATATTTATTT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 ATATT 1 2 258228 CASAVA_Build 19 12388201 1I AGCATGATGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 9 10 258229 CASAVA_Build 19 12390783 4D TATGCAATAT TTTC/---- TTTCTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 TTTC 2 1 258230 CASAVA_Build 19 12391210 2D GCCTCTACTG AC/-- ACAGACTGCA 3070 het 3070 hom 45 19 23 4 AC 2 1 258231 CASAVA_Build 19 12395511 1D AGGAGAATGG C/- GGGAACCCGG 865 het 430 hom 9 3 5 1 C 1 0 258232 CASAVA_Build 19 12396452 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 7 8 258233 CASAVA_Build 19 12396794 12D AAAATTAGCT GGGCGTGGTGGC/------------ GGGCACCTGT 3070 het 3070 hom 23 11 10 5 GGGCGTGGTGGC 1 0 258234 CASAVA_Build 19 12398702 3D21M2D TTGTTCTGGC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAG/---TTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC-- AGTCTCGCCC 3070 het 129 hom 19 3 8 10 N/A 0 0 258235 CASAVA_Build 19 12400383 3I TAGATCAAGG ---/CAT CATCAAGTGC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 CAT 1 2 258236 CASAVA_Build 19 12400937 1D CACCACAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 10 10 T 11 10 258237 CASAVA_Build 19 12401128 1I CACCACAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 T 10 11 258238 CASAVA_Build 19 12404766 1I CTAAACCCTG -/T TTTTTTTTTT 2590 het 2590 ref 32 11 7 14 T 11 12 258239 CASAVA_Build 19 12405200 2I ACAGTTAAAC --/AT GTTTGGTAAA 1317 het 1317 ref 50 40 3 7 AT 0 1 258240 CASAVA_Build 19 12407356 20D ACACATTTTC ACAAAAGACACCGGAGAAAA/-------------------- ACATTCATTT 1950 het 1950 ref 25 19 5 3 ACAAAAGACACCGGAGAAAA 1 0 258241 CASAVA_Build 19 12408714 3I AAAAAATAAT ---/ATC AACAATGTAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 ATC 0 1 258242 CASAVA_Build 19 12409063 1D TTAAATAAAT A/- AAAAAAAAAT 2590 het 2590 ref 24 12 7 6 A 10 9 258243 CASAVA_Build 19 12410401 1D ACTTTCTTGT A/- AAAATGTATT 3070 het 2995 hom 24 10 12 2 A 5 4 258244 CASAVA_Build 19 12415164 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 T 13 12 258245 CASAVA_Build 19 12416728 4D AGTAAGTGAG AACT/---- TACTCCTGCC 3070 hom 102 het 38 0 34 6 AACT 1 0 258246 CASAVA_Build 19 12418307 1I AGGATAAAAG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 7 8 258247 CASAVA_Build 19 12421272 1I CCTACCCCAC -/T TGTGGACAAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 1 2 258248 CASAVA_Build 19 12422911 6I GGACCCACCT ------/TATGCA TATGCACTCT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 TATGCA 1 2 258249 CASAVA_Build 19 12426897 1I AAACAATGTA -/G GCCCCCTGGC 3070 hom 157 het 58 0 53 5 G 1 2 258250 CASAVA_Build 19 12429554 1I AGACAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 511 hom 17 2 12 3 A 13 14 258251 CASAVA_Build 19 12451361 1I TAAATTTTGA -/T TTAAAATTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 2 3 258252 CASAVA_Build 19 12455706 2D AAAAAGGAGA CT/-- CAACCCAAAG 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 CT 1 0 258253 CASAVA_Build 19 12457019 2D CATTCATGGA TT/-- TCTGACTCTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 T 3 1 258254 CASAVA_Build 19 12458063 1D CATAGTGAGG C/- CCCCCCCTCC 3070 hom 49 het 20 0 18 2 C 8 7 258255 CASAVA_Build 19 12464747 2D TGAAACAGAC CT/-- CTCTCTCTCA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CT 5 4 258256 CASAVA_Build 19 12467347 1I GTTAGGGGGT -/G GGGGACACCG 2877 het 2877 ref 25 13 7 5 G 4 5 258257 CASAVA_Build 19 12468138 4D CCAACATGAT AAAG/---- AAAGTCCCCT 3070 hom 99 het 35 0 34 3 AAAG 2 1 258258 CASAVA_Build 19 12468894 1I TCCTGGACAT -/G GGTGTTAATG 3070 hom 123 het 45 0 41 4 G 2 3 258259 CASAVA_Build 19 12470092 1D CTTAAAATTT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 8 7 258260 CASAVA_Build 19 12472044 12I GCTAAAGGAG ------------/TAAAGCTGTGTC TAAACATTTG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TAAAGCTGTGTC 0 1 258261 CASAVA_Build 19 12475808 14D ACCCTGTCAC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 2109 het 26 hom 15 0 8 9 A 26 12 258262 CASAVA_Build 19 12478124 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 29 0 24 8 T 9 8 258263 CASAVA_Build 19 12480811 6I ATTGTAATAG ------/TAATAC TAATACTAAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TAATAC 1 2 258264 CASAVA_Build 19 12481019 1D TTATAATTTC T/- TTTTTTTTTT 2578 het 233 hom 15 1 12 2 T 15 14 258265 CASAVA_Build 19 12482532 1D TAGATGATGT C/- CCTGTCTACC 3070 hom 107 het 41 0 35 6 C 3 2 258266 CASAVA_Build 19 12484575 5D CCACAAAGAG AAAAC/----- AAATCTCTTA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 AAAAC 1 0 258267 CASAVA_Build 19 12495659 1I ATATGCTGCT -/A ATTTCTTCTC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 1 2 258268 CASAVA_Build 19 12507826 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 832 het 517 hom 16 3 3 10 A 17 18 258269 CASAVA_Build 19 12514464 4I AAGGGAAAGG ----/AAGA AAGAAAGAAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AAGA 2 3 258270 CASAVA_Build 19 12520876 4I AGAAACCTAC ----/CATA CATACATGTT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 CATA 1 2 258271 CASAVA_Build 19 12523319 1I TTGAACATTG -/C CCCCTGTCCC 3070 hom 61 het 24 0 18 6 C 4 5 258272 CASAVA_Build 19 12536316 1D GCTCAGAACA T/- TTTTTTTTTT 700 het 700 ref 40 21 3 16 T 12 11 258273 CASAVA_Build 19 12570065 2D AAAAAATAGC TA/-- TTGCAACAGA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 TA 1 0 258274 CASAVA_Build 19 12575603 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 770 hom 34 5 16 13 A 15 16 258275 CASAVA_Build 19 12575790 1I CTAGTTGCCA -/G GGGAACCAAC 3070 hom 150 het 56 0 50 6 G 3 4 258276 CASAVA_Build 19 12580272 8D TTTATTTATG TATTTATT/-------- TATTTATTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TATT 7 5 258277 CASAVA_Build 19 12582021 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2413 hom 23 het 12 0 8 5 T 13 12 258278 CASAVA_Build 19 12593280 1I TGGTCGCTCA -/T TGCCTGTAAT 3070 hom 33 het 25 0 13 16 T 1 2 258279 CASAVA_Build 19 12594201 1D ATAAAAAAAA T/- AATAAAAAAA 10 het 10 ref 6 2 1 4 T 1 0 258280 CASAVA_Build 19 12594730 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAACC 1618 het 216 hom 12 1 9 2 A 8 9 258281 CASAVA_Build 19 12606844 1I CCTGTCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 32 4 22 6 T 15 16 258282 CASAVA_Build 19 12612917 8D AACACCAAAA AAAAAAAT/-------- AAATAAAAAA 273 het 120 hom 23 2 4 19 AAAAAAAT 1 0 258283 CASAVA_Build 19 12613031 8D AAGAAAGAAA GGAGGGAG/-------- GGAGTGAGGG 3070 hom 71 het 28 0 22 7 GGAG 3 1 258284 CASAVA_Build 19 12624351 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 19 1 12 6 T 13 14 258285 CASAVA_Build 19 12624655 1D CGGATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 5 T 12 11 258286 CASAVA_Build 19 12631627 1D AGCAAGACTC T/- TGTCTCAATA 3070 het 2189 hom 13 5 8 0 T 2 1 258287 CASAVA_Build 19 12639648 1D CTTAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2256 het 2256 ref 33 17 6 11 A 12 11 258288 CASAVA_Build 19 12648003 4I CAGTCACAGG ----/AGAC AGACAGACAC 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 AGAC 2 3 258289 CASAVA_Build 19 12672103 1I GAGAAGGGGG -/C TTTCAGAAGC 3070 het 1972 hom 30 6 14 10 C 0 1 258290 CASAVA_Build 19 12676496 1D TTCTATTTTC T/- TTTCTTTCTT 3070 hom 50 het 21 0 17 4 T 4 3 258291 CASAVA_Build 19 12745897 6D CATCAAAAGT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 2949 het 2949 ref 25 9 10 6 TTTTTC 4 3 258292 CASAVA_Build 19 12754700 1D GGAGCTGAGA C/- CCCCCCCCCA 786 het 130 hom 13 2 3 8 C 10 9 258293 CASAVA_Build 19 12796663 2I ATTATTATTA --/TT TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 8 10 258294 CASAVA_Build 19 12796868 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 999 het 999 ref 25 16 3 6 T 11 12 258295 CASAVA_Build 19 12835739 1D TACAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 969 het 406 hom 23 4 6 13 T 18 17 258296 CASAVA_Build 19 12931728 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1629 hom 18 het 16 0 7 9 T 13 12 258297 CASAVA_Build 19 12956293 2D TGCATGTCTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 66 19 21 26 GT 10 9 258298 CASAVA_Build 19 12991527 1D CTGTTGCTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1620 hom 23 7 11 5 T 10 9 258299 CASAVA_Build 19 13013879 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2478 hom 9 het 13 0 9 4 T 15 14 258300 CASAVA_Build 19 13029624 2I GGAAGGCAGC --/CT CCCTCCCTTC 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 CT 0 1 258301 CASAVA_Build 19 13035297 1D CCTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2733 het 2733 ref 32 14 9 10 T 11 10 258302 CASAVA_Build 19 13035889 1D TGGGATGGGA C/- CCCCCCCCTC 2869 hom 43 het 18 0 14 4 C 9 8 258303 CASAVA_Build 19 13036861 1I GATGTGAATT -/C GGGGGAGCCT 3070 hom 115 het 44 0 36 8 C 0 1 258304 CASAVA_Build 19 13078109 2I GGCTGGTTTC --/AA ATTCCTGGGC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 1 3 258305 CASAVA_Build 19 13099508 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2318 het 986 hom 13 4 8 1 A 11 10 258306 CASAVA_Build 19 13111637 1I GTGAAGGCAG -/T TTTTTTTTCT 2672 het 2672 ref 22 10 9 3 T 8 9 258307 CASAVA_Build 19 13129713 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 10 11 258308 CASAVA_Build 19 13136173 3D AGTTTTACTT AAG/--- AACCCCAAAT 2786 het 2717 hom 18 8 7 3 AAG 1 0 258309 CASAVA_Build 19 13142909 1I CAAAAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 910 het 910 ref 17 10 3 4 T 11 12 258310 CASAVA_Build 19 13148414 4D ATTCAACAGA CTGT/---- CTGGCCCTCG 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 CTGT 1 0 258311 CASAVA_Build 19 13159327 25I ATGCTATGTG -------------------------/AATTTCACCTCAACTAAAAAAACTT AATTTCACCT 3070 het 3070 hom 43 15 24 6 AATTTCACCTCAACTAAAAAAACTT 0 1 258312 CASAVA_Build 19 13160457 3D CTTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2310 hom 25 het 12 0 10 2 T 19 16 258313 CASAVA_Build 19 13165708 4D CCCGGGTTCA GAAC/---- AGCAATTTTC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 GAAC 1 0 258314 CASAVA_Build 19 13168531 4D AGGCTTCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 20 11 9 1 TTTG 3 2 258315 CASAVA_Build 19 13178491 3D TTGTTTATTG TTA/--- TTATTATTTT 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 TTA 3 2 258316 CASAVA_Build 19 13183823 1D GAGTCCGGCA G/- GGAGGGGATG 2937 het 1500 hom 20 5 8 8 G 3 2 258317 CASAVA_Build 19 13188257 1I GTTCAAGCGA -/T TTCTCCTACC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 2 3 258318 CASAVA_Build 19 13189049 2D TGGACAGGGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 108 het 37 0 36 1 AG 7 6 258319 CASAVA_Build 19 13192079 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 586 hom 31 2 27 2 A 12 11 258320 CASAVA_Build 19 13200877 1D CTACAGGGGT G/- GGGGGGGGCT 1829 het 1829 ref 21 8 7 6 G 9 8 258321 CASAVA_Build 19 13202992 1I GCTAATTCAA -/T TTTTTTTTTT 2307 het 721 hom 17 4 9 4 T 17 18 258322 CASAVA_Build 19 13210921 11D CATGACCAGT CGCGCCTCCCC/----------- TGCTTCCTAT 2265 het 2265 ref 22 10 6 9 CGCGCCTCCCC 1 0 258323 CASAVA_Build 19 13236692 1D CCCTTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 21 1 13 7 T 15 14 258324 CASAVA_Build 19 13240950 11D AGCTGGGACT ACAGGTGAGAG/----------- ACACCACACC 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 ACAGGTGAGAG 1 0 258325 CASAVA_Build 19 13242942 1I TGTAGGCCAA -/T TTTGAATGCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 3 4 258326 CASAVA_Build 19 13245730 1D TGGCTAATTG T/- TTTTTTTTTT 1737 het 1737 ref 24 9 6 9 T 15 14 258327 CASAVA_Build 19 13289942 1I TAAATAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 13 10 2 T 10 11 258328 CASAVA_Build 19 13292397 1D TGAAGACACA T/- TCCCCACGAC 3070 het 3070 ref 45 26 15 5 T 2 1 258329 CASAVA_Build 19 13294411 1D ATGATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2215 het 2215 ref 28 14 8 10 T 12 11 258330 CASAVA_Build 19 13295084 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 6 7 258331 CASAVA_Build 19 13296524 3I TCAACAACAA ---/CAC CATCAACAAC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 CAC 0 1 258332 CASAVA_Build 19 13301986 1I GCAAGCCCTC -/T TGCCCCCACC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 1 2 258333 CASAVA_Build 19 13303488 1I CTCTAAATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 9 10 258334 CASAVA_Build 19 13303645 2I TCTGGCTAAG --/TT TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 3 5 258335 CASAVA_Build 19 13306847 1I ACACCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 2805 het 1420 hom 26 4 13 9 A 9 10 258336 CASAVA_Build 19 13309517 4I TCTATGCTAA ----/AATT AATTAAGTCA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 AATT 1 2 258337 CASAVA_Build 19 13310381 4I TGCAATGAAC ----/AATG AATGCCACAG 3070 het 3070 ref 58 27 24 7 AATG 1 2 258338 CASAVA_Build 19 13311978 1I CAGGACTGAA -/C AGGGAAAAAC 3070 het 2752 hom 33 9 15 9 C 0 1 258339 CASAVA_Build 19 13313124 25D CAGCTGACAT CTTGATGGTCTGTGGCCCAGCTGAC/------------------------- CTTGATGGTC 3070 het 3070 ref 48 28 18 11 CTTGATGGTCTGTGGCCCAGCTGAC 1 0 258340 CASAVA_Build 19 13320226 2D CAAGAATAAA AG/-- AGACAAAGGC 2943 het 2943 ref 22 8 8 6 AG 2 1 258341 CASAVA_Build 19 13337485 1I ACTTCCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 10 11 258342 CASAVA_Build 19 13338558 1I ATTTTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 2746 het 1522 hom 23 7 8 8 T 10 11 258343 CASAVA_Build 19 13339425 4D ACCTGTAGTC CTGG/---- CTACTCGGGA 2620 het 421 hom 8 1 7 1 CTGG 1 0 258344 CASAVA_Build 19 13357983 1D AAAAAAAAAA G/- AAGAAGAAGA 1341 het 1341 ref 27 10 6 11 G 1 0 258345 CASAVA_Build 19 13359980 2D CTCCTAGGTT GA/-- GGACTGAGTG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 GA 1 0 258346 CASAVA_Build 19 13381191 2D TTGACAATCC TG/-- TGTGTGTGTG 1114 het 1114 ref 52 31 3 20 TG 10 9 258347 CASAVA_Build 19 13384915 1D AAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2163 hom 28 het 16 0 12 4 T 12 11 258348 CASAVA_Build 19 13388092 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTATAG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 6 7 258349 CASAVA_Build 19 13409925 1I TTTGCTGACA -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 6 7 258350 CASAVA_Build 19 13418575 1D CCAGCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1899 hom 31 8 11 13 T 14 13 258351 CASAVA_Build 19 13438491 3I GCTGCTGCTG ---/CTA CTACTTTCTT 3070 het 2882 hom 30 11 16 3 CTA 1 2 258352 CASAVA_Build 19 13439102 1D AAACAACAAG C/- CCATATTCTT 3070 het 3070 ref 40 16 18 6 C 3 2 258353 CASAVA_Build 19 13445570 1D CTCCCCCCCA C/- CCCCCTGCCT 3070 het 3070 ref 34 13 10 13 C 6 5 258354 CASAVA_Build 19 13451305 2D AGCTGGGTGA GT/-- GAGGCCAGAG 2457 het 2457 ref 28 16 6 7 GT 1 0 258355 CASAVA_Build 19 13454297 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1542 hom 24 6 14 4 A 13 14 258356 CASAVA_Build 19 13458507 2D CTTCTTTCTG TC/-- TCTCTTTCTC 3070 hom 144 het 54 0 48 6 TC 3 2 258357 CASAVA_Build 19 13459489 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 13 12 258358 CASAVA_Build 19 13473012 1I AATAAATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 10 11 258359 CASAVA_Build 19 13482117 1I GTCAAGTCTC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 6 7 258360 CASAVA_Build 19 13483907 1I GTGCATTATC -/T TTATAGATTC 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 T 2 3 258361 CASAVA_Build 19 13492197 5D ATGATGTAAG TTAGT/----- TTAGGTCTAT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 TTAGT 1 0 258362 CASAVA_Build 19 13498716 1D CTTGGGAGTT G/- GGGGGCGGGA 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 G 6 5 258363 CASAVA_Build 19 13498855 4D TCCTTTCATT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 97 het 41 0 31 11 TTCC 6 5 258364 CASAVA_Build 19 13509687 4D CTCTCACACA AGAG/---- AGAGAGTTAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 AG 5 3 258365 CASAVA_Build 19 13512250 2I TTTCTTTCTT --/TA TTTATATATA 1961 het 1934 hom 15 5 6 4 TA 0 1 258366 CASAVA_Build 19 13513641 1I AGAAAAGGAA -/G GGAAGGAAAG 3070 hom 99 het 37 0 31 6 G 2 3 258367 CASAVA_Build 19 13531124 2I CCTGGCTAAT --/TC TTTTTTTTTG 2992 het 1512 hom 13 4 8 1 TC 0 1 258368 CASAVA_Build 19 13534605 1D AGTTCTTTGG T/- GGGGGTGATA 3070 het 3070 ref 57 25 23 9 T 1 0 258369 CASAVA_Build 19 13546241 4D GGAAGCCCCT TCTC/---- TCTCTCTCTC 2860 het 2860 ref 40 14 12 14 TC 11 9 258370 CASAVA_Build 19 13547539 1D GGTGAGACCC T/- CCCCCCCATC 1042 het 86 hom 9 1 3 5 T 1 0 258371 CASAVA_Build 19 13547738 10D AGGGAAGGGA AGGGGAGGGG/---------- AGGGGAGGGG 3070 het 1827 hom 16 5 8 5 AGGGG 5 3 258372 CASAVA_Build 19 13550897 31I AATGGTGGAC -------------------------------/AGAGTGAGACCCTATCTCTAAGAAGAAAAAA AGACCTCCAA 3013 het 3013 ref 24 13 9 3 AGAGTGAGACCCTATCTCTAAGAAGAAAAAA 0 1 258373 CASAVA_Build 19 13564258 2D GGTTTTTGAG AC/-- AGAGTCTCAC 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 AC 1 0 258374 CASAVA_Build 19 13570201 2I GAAAGAGAGA --/GG GGAAGGAAGG 2949 hom 15 het 7 0 6 1 G 2 4 258375 CASAVA_Build 19 13617421 1I ATAGTGACCG -/T TCCCAACACA 3070 het 3070 hom 22 8 9 5 T 1 2 258376 CASAVA_Build 19 13620103 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 671 het 671 ref 27 11 4 13 A 17 16 258377 CASAVA_Build 19 13631774 1D TGTTTGTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 9 8 258378 CASAVA_Build 19 13693053 1D ATATTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 7 6 258379 CASAVA_Build 19 13703236 1D AAGAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 11 10 258380 CASAVA_Build 19 13711285 5D TATTCCTTCA ACTCT/----- ACTCTATGGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 8 ACTCT 2 1 258381 CASAVA_Build 19 13713918 1I TGAAGTTCTG -/C CCCTCACCTT 3070 het 3070 ref 48 31 10 7 C 3 4 258382 CASAVA_Build 19 13727274 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 679 hom 14 6 8 0 A 19 18 258383 CASAVA_Build 19 13730255 12D GAACTAGTGG ACAAATGAATGA/------------ ACAAATGAAT 3070 het 3070 hom 41 13 20 11 ACAAATGAATGA 2 1 258384 CASAVA_Build 19 13733541 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 T 15 14 258385 CASAVA_Build 19 13762786 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1177 hom 10 het 4 0 4 0 A 15 14 258386 CASAVA_Build 19 13766524 1I CAAAAATGGT -/A AAAAAAAAAT 2509 het 2509 ref 24 9 6 9 A 9 10 258387 CASAVA_Build 19 13769461 4D AAAATCTTTG TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 1569 hom 23 5 10 9 TATT 5 4 258388 CASAVA_Build 19 13774856 2D GCCAGAAAAC AA/-- AAGTGAGGCC 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 4 2 258389 CASAVA_Build 19 13776146 3I TAGCCGGGCA ---/TGG TGGTGGCGCA 1309 hom 12 het 5 0 3 2 TGG 2 3 258390 CASAVA_Build 19 13786815 1D TACAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1716 het 1716 ref 21 12 5 4 A 12 11 258391 CASAVA_Build 19 13821012 1D GGCAGCTGGT C/- CATCTCCGTG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 C 2 1 258392 CASAVA_Build 19 13825480 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 869 het 869 ref 31 21 3 7 T 12 11 258393 CASAVA_Build 19 13832193 1I GAACCCGGGA -/G GCGGAGGTTG 1998 hom 18 het 7 0 6 1 G 1 2 258394 CASAVA_Build 19 13839305 1D CTCAAACTCG T/- TGAGCTCTAG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 2 1 258395 CASAVA_Build 19 13848123 10D CAGCTAATTT TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 1098 hom 15 3 9 7 TG 12 7 258396 CASAVA_Build 19 13848507 2I TCCCGCCTGG --/AC ACACACACAC 3070 het 1785 hom 25 6 13 6 AC 7 8 258397 CASAVA_Build 19 13852578 1I AACAGACAAG -/C CCTGGTCTTG 3070 hom 147 het 53 0 48 5 C 2 3 258398 CASAVA_Build 19 13852915 3I AGAGCCCCCC ---/CCA CCCCCGACAT 3070 het 56 hom 27 2 17 8 CCA 0 1 258399 CASAVA_Build 19 13865730 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1135 hom 31 5 13 14 A 13 12 258400 CASAVA_Build 19 13869343 1I TTACAGAAGT -/A ACCTTGAGCA 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 A 1 2 258401 CASAVA_Build 19 13875417 7D ACCCAGGAGG TGGAGGC/------- TGCAGTGAGC 1844 het 1844 ref 20 13 4 5 TGGAGGC 1 0 258402 CASAVA_Build 19 13914164 1I AAGCATTCTT -/C CCTGGCTTTA 3070 hom 151 het 58 0 51 7 C 2 3 258403 CASAVA_Build 19 13921903 1D GATGGTCTCA G/- TCTCATGACC 3070 het 3070 ref 27 13 9 7 G 1 0 258404 CASAVA_Build 19 13961675 1D TGGAAGAGGC G/- GGGGGGGTTC 3070 hom 58 het 26 0 18 8 G 8 7 258405 CASAVA_Build 19 13979038 1I AAAGGTCAGC -/T CCCGACCCAG 1817 het 1817 ref 18 5 4 9 T 0 1 258406 CASAVA_Build 19 13994077 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1348 het 1348 ref 22 14 3 5 T 12 11 258407 CASAVA_Build 19 13996323 1D TATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1602 het 335 hom 13 3 4 6 T 17 16 258408 CASAVA_Build 19 14008302 1I CAGGATTTCC -/T TTTTTTTTTT 1595 het 237 hom 19 2 9 8 T 17 18 258409 CASAVA_Build 19 14017841 4D CCGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 27 11 11 7 AAAC 5 4 258410 CASAVA_Build 19 14028730 4I CACAACCAGT ----/TAGA TGCGACATAC 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 TAGA 0 1 258411 CASAVA_Build 19 14035017 1D ACTCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 6 A 11 10 258412 CASAVA_Build 19 14045714 1I TAGCAACGCC -/G GGGACCCCCA 2081 hom 41 het 17 0 10 7 G 3 4 258413 CASAVA_Build 19 14048848 1I GTAACCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 923 hom 23 2 16 5 A 12 13 258414 CASAVA_Build 19 14050297 1I AGTCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 541 hom 32 2 26 4 A 12 13 258415 CASAVA_Build 19 14059098 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 1870 het 1194 hom 8 4 4 0 T 9 10 258416 CASAVA_Build 19 14059966 1I CCACATTTCA -/T TTTTTTTTTT 891 het 891 ref 27 18 3 6 T 10 11 258417 CASAVA_Build 19 14072117 1I ACAACTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 11 12 258418 CASAVA_Build 19 14091066 3I CGATGTTAAT ---/TTC TTCCTGTGGG 3070 het 3070 ref 34 16 17 1 TTC 1 2 258419 CASAVA_Build 19 14113647 4I CCCTGTCTAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 AAAC 2 3 258420 CASAVA_Build 19 14121496 12I CAGGAAAGGA ------------/GGGGACAGAAAC GGGTGCCAGG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 GGGGACAGAAAC 0 1 258421 CASAVA_Build 19 14147416 4D ACACACTCAT ACAG/---- ACACACTCAG 3070 het 3070 hom 57 25 26 10 ACAG 1 0 258422 CASAVA_Build 19 14155289 1D ATTTTATCTG C/- CCCCCCCAGA 3069 hom 35 het 14 0 11 3 C 8 7 258423 CASAVA_Build 19 14159380 1D TTCAGTAAAT C/- CCCCCCAGCT 1385 het 1215 hom 11 4 4 4 C 7 6 258424 CASAVA_Build 19 14182825 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2357 het 1972 hom 24 10 8 6 T 13 12 258425 CASAVA_Build 19 14193497 1D GCGGGAAAGT G/- GGGGTGCTCA 1606 het 1606 ref 17 8 5 4 G 5 4 258426 CASAVA_Build 19 14204431 2I AAAATAAATG --/TC TGTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TC 0 1 258427 CASAVA_Build 19 14221768 1D CCAGCCTGGA C/- CCCCCACTCC 3070 het 3070 ref 49 30 14 5 C 6 5 258428 CASAVA_Build 19 14221893 4D ACCTTAGGCA AATT/---- ACTTAACCTC 1359 het 1359 ref 41 35 3 4 AATT 1 0 258429 CASAVA_Build 19 14228282 2I TCCTCACTTC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 1417 hom 22 7 11 4 CT 5 6 258430 CASAVA_Build 19 14237444 1I GTGGGTTCCC -/T CCCCCACCCA 2651 het 1100 hom 22 4 10 8 T 0 1 258431 CASAVA_Build 19 14241574 6D TCTCTCTTTT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 27 het 11 0 10 2 TC 8 5 258432 CASAVA_Build 19 14252703 2I TCCCTCCCTT --/TC TCTCTCTTTC 3070 hom 29 het 15 0 11 4 TC 3 4 258433 CASAVA_Build 19 14263304 1D TGACTCCTCC T/- TGCCTGCTTC 3057 het 2961 hom 19 8 8 3 T 2 1 258434 CASAVA_Build 19 14264029 1I CGCCCAGCCA -/G GGTGTTTATT 3070 hom 36 het 15 0 11 4 G 2 3 258435 CASAVA_Build 19 14265766 1I CCCCCAAGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 40 hom 20 1 14 5 T 9 10 258436 CASAVA_Build 19 14266433 3D GCAGAAAGAA CTT/--- CTACAGAGGG 2824 hom 21 het 10 0 8 2 CTT 1 0 258437 CASAVA_Build 19 14267473 4I CCGCCACCAC ----/GACT GACTAATTTT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 GACT 1 2 258438 CASAVA_Build 19 14275130 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2187 het 2187 ref 21 8 6 7 A 10 11 258439 CASAVA_Build 19 14280845 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 31 1 25 5 T 9 10 258440 CASAVA_Build 19 14281892 5D CTAAAAACAA AAAAC/----- AAAAAAAACC 416 het 416 ref 27 6 5 17 AAAAC 1 0 258441 CASAVA_Build 19 14285678 13D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAG/------------- GGAATTTGGG 2419 het 57 hom 17 2 10 12 AAAAAAAAAAAAG 1 0 258442 CASAVA_Build 19 14285728 3I CTGGTGTGAA ---/GTG GTGTGAAAGG 3070 hom 53 het 24 0 19 6 GTG 1 2 258443 CASAVA_Build 19 14285816 1I TCAGCAAACA -/G GGGGCCCTGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 4 5 258444 CASAVA_Build 19 14285925 4I4M1D5M8D CTCATCCTCA ----CACAGCCCCACAGCCTTG/CATTCACA-CCCCA-------- CACACTCCCA 3070 het 326 hom 13 3 10 4 N/A 0 0 258445 CASAVA_Build 19 14288798 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1741 het 689 hom 15 3 7 5 A 15 16 258446 CASAVA_Build 19 14292177 3I TTGTGGGGAG ---/AGA AGAAGAGGAT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 AGA 2 3 258447 CASAVA_Build 19 14294628 6I TCTTTCTTTC ------/TCTCTG TCTCTGTCTC 2442 het 1757 hom 15 5 6 4 TCTCTG 1 2 258448 CASAVA_Build 19 14306846 1D ATTGGTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2624 hom 23 7 14 2 T 10 9 258449 CASAVA_Build 19 14314199 1D TCAACATATC T/- TTTTTTTTTT 1172 het 1172 ref 21 11 3 7 T 13 12 258450 CASAVA_Build 19 14323892 16D AATGATTCTC AGGCCTCAGCCTCCCG/---------------- AGTAGCTGGG 1483 het 1483 ref 9 5 4 0 AGGCCTCAGCCTCCCG 1 0 258451 CASAVA_Build 19 14325610 13I AGATTAAATT -------------/AGAGATAGAGGCC AGGCGCGCTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AGAGATAGAGGCC 0 1 258452 CASAVA_Build 19 14334158 2I CTGATACAAT --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 33 het 16 0 12 4 AG 6 7 258453 CASAVA_Build 19 14338958 1I TTTTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 56 hom 28 1 24 3 T 10 11 258454 CASAVA_Build 19 14350752 5D TAACATAAAG TAAAA/----- TAAAATAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 6 TAAAA 5 4 258455 CASAVA_Build 19 14364114 4I TTTTATTTGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 TTTG 3 4 258456 CASAVA_Build 19 14370327 1D CTAACAATAC A/- AAAAAAAAAA 1518 het 1518 ref 16 8 6 2 A 11 10 258457 CASAVA_Build 19 14383435 5D AAGAAGAGGG CCTTA/----- CCTTAGGCAG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 CCTTA 2 1 258458 CASAVA_Build 19 14408641 4D GATCACAGGC AGAG/---- AGAGCCACCA 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 AG 4 2 258459 CASAVA_Build 19 14430200 1D ATAGCCCACA C/- CTGACCCTGA 3070 hom 62 het 27 0 20 7 C 2 1 258460 CASAVA_Build 19 14457161 1I CACCCGACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 18 0 13 5 T 10 11 258461 CASAVA_Build 19 14466200 1D CACCGCGCCC G/- GGCCCCCTTG 3070 hom 3 het 13 0 10 3 G 3 2 258462 CASAVA_Build 19 14475599 1I ACTCAGCTAA -/T TTTTTAATTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 5 6 258463 CASAVA_Build 19 14476396 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2611 hom 21 het 11 0 7 4 T 13 11 258464 CASAVA_Build 19 14483088 1D TGAGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 95 hom 20 1 14 5 A 17 16 258465 CASAVA_Build 19 14484277 1D AAAAGAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 31 0 24 9 A 10 9 258466 CASAVA_Build 19 14494846 8I TCCAACGTGG --------/TGAAACCC TGTCTCTACT 3070 hom 60 het 21 0 21 2 TGAAACCC 0 1 258467 CASAVA_Build 19 14497146 1D ACTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 34 2 24 8 T 11 10 258468 CASAVA_Build 19 14510349 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 604 hom 26 3 13 10 T 15 14 258469 CASAVA_Build 19 14511693 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3068 het 293 hom 25 3 11 11 T 15 14 258470 CASAVA_Build 19 14520829 1D GTTTCTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 10 9 258471 CASAVA_Build 19 14531599 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 176 hom 24 1 14 9 A 15 14 258472 CASAVA_Build 19 14531794 1D GCCTTGGGCA T/- TTCTTGTCTG 3070 hom 49 het 20 0 15 6 T 3 2 258473 CASAVA_Build 19 14539220 2I GCGGCGTGGC --/CT CTCTCTCTCA 2473 hom 44 het 23 0 12 11 CT 4 5 258474 CASAVA_Build 19 14543415 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2789 het 2044 hom 28 10 8 10 A 12 11 258475 CASAVA_Build 19 14558412 1I TTTTTCTAAA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 26 10 13 3 T 8 9 258476 CASAVA_Build 19 14561411 2D TGTAAAGCCT CA/-- CATGTGAAGC 3070 hom 48 het 20 0 17 4 CA 2 1 258477 CASAVA_Build 19 14576915 1I CCTCCCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 T 11 12 258478 CASAVA_Build 19 14579183 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1756 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 7 258479 CASAVA_Build 19 14584745 1I CAATTTATTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 2062 hom 24 10 11 3 A 0 1 258480 CASAVA_Build 19 14585208 1I CTAATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1582 het 1154 hom 27 8 6 13 T 15 16 258481 CASAVA_Build 19 14595111 1D AAAAAAAAAA T/- AAAAAAAAAA 2692 het 3 hom 12 1 10 1 T 1 0 258482 CASAVA_Build 19 14600743 1I TCTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 2486 het 2255 hom 20 6 8 6 T 10 11 258483 CASAVA_Build 19 14625763 1I GTGTGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 24 3 16 6 G 0 1 258484 CASAVA_Build 19 14626074 1D CCAAAACCTG T/- TTTTTTTTTT 3025 het 1071 hom 24 7 10 7 T 16 15 258485 CASAVA_Build 19 14628188 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1527 het 115 hom 16 1 10 5 A 12 11 258486 CASAVA_Build 19 14629558 1I TATATATATA -/T TTTTTTTGTT 1793 hom 10 het 5 0 4 1 T 7 8 258487 CASAVA_Build 19 14631015 1D CCTGGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 986 hom 17 3 9 5 T 12 11 258488 CASAVA_Build 19 14634132 6I GAGACGAGAA ------/TATAAG TATAAGTACT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 TATAAG 1 2 258489 CASAVA_Build 19 14638191 1D TCTTGGCCTA T/- TTTTTTTTTT 2368 het 448 hom 21 1 9 11 T 15 14 258490 CASAVA_Build 19 14663946 1I AAATAGTTAC -/A AGTGCTTGCC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 1 2 258491 CASAVA_Build 19 14664330 2D TCTTTTTATT TA/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 TA 1 0 258492 CASAVA_Build 19 14666551 5D TCCAAATGTT AAAAG/----- AAAGTAAACA 3070 het 3070 ref 50 27 18 8 AAAAG 1 0 258493 CASAVA_Build 19 14680311 2I CTCAGGGGAC --/AG GGGAGAGTTC 3070 het 3070 hom 58 24 26 8 AG 0 1 258494 CASAVA_Build 19 14716058 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 A 13 12 258495 CASAVA_Build 19 14718603 5D TAACCCAACC CATGA/----- CAACCCAGGG 3070 het 3070 ref 23 13 10 1 CATGA 1 0 258496 CASAVA_Build 19 14718792 1I AAGAGAGATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 8 9 258497 CASAVA_Build 19 14720125 10I CATGATCTTG ----------/TTATTTTATT TTATTTTATT 3070 het 2731 hom 22 6 13 3 TTATT 2 4 258498 CASAVA_Build 19 14724595 1I GCCCTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 10 18 13 T 11 12 258499 CASAVA_Build 19 14726096 10D CCTTTATATA TATCTATATC/---------- TATCTATATA 3070 het 3070 ref 19 12 9 3 TATCTATATC 1 0 258500 CASAVA_Build 19 14726685 1I AATGCATATA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 T 7 8 258501 CASAVA_Build 19 14734439 5I AAATTTTTTC -----/TTATT TTATTTTTAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTATT 1 2 258502 CASAVA_Build 19 14736049 3D ATTTAAAAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 3 T 13 10 258503 CASAVA_Build 19 14741029 2D TGGTGAGACA CC/-- CCCCCCCCAT 2224 het 39 hom 18 1 7 10 C 10 8 258504 CASAVA_Build 19 14761197 4I AACATCTCTC ----/TCAA TCTATATACA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 TCAA 0 1 258505 CASAVA_Build 19 14766625 1D GCCCACCCCC T/- AACGCTGACC 2345 het 2345 ref 32 17 8 8 T 1 0 258506 CASAVA_Build 19 14819934 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 2843 het 2843 ref 32 15 10 7 A 13 14 258507 CASAVA_Build 19 14823256 2D CTCACTGTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 26 0 14 12 T 12 10 258508 CASAVA_Build 19 14826980 1D ACTGAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 11 10 258509 CASAVA_Build 19 14832477 3I GTTAGAGTCA ---/GAT ATTAGTACTT 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 GAT 0 1 258510 CASAVA_Build 19 14842635 2D ACACACACAC AT/-- AGACACATAC 3070 het 3070 hom 51 22 21 8 AT 1 0 258511 CASAVA_Build 19 14843474 1I TAAAATACGC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 T 7 8 258512 CASAVA_Build 19 14847665 4D ATACAAAACA AAAC/---- AAAAAAAACG 1989 het 1989 ref 31 18 6 7 AAAC 1 0 258513 CASAVA_Build 19 14850805 1I TTACTCCATC -/T TTTTTTTCTT 2700 het 2451 hom 17 7 6 4 T 7 8 258514 CASAVA_Build 19 14858080 1D GTCATTGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 10 9 258515 CASAVA_Build 19 14875162 2I GTGTACATCA --/CT GAGGCTGTTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CT 0 1 258516 CASAVA_Build 19 14879067 1D GGCATTAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 23 0 19 4 A 12 11 258517 CASAVA_Build 19 14891973 1D TGCAGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 40 0 35 5 T 17 16 258518 CASAVA_Build 19 14895392 5D TTTTTCTTAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 22 6 T 16 11 258519 CASAVA_Build 19 14898821 4I TCATGTATTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 69 het 29 0 22 7 TC 6 8 258520 CASAVA_Build 19 14901459 14D AGTTCATAGA TTATTTCTTCTGCT/-------------- TTATTTCTTC 3070 hom 39 het 21 0 14 8 TTATTTCTTCTGCT 2 1 258521 CASAVA_Build 19 14902011 3I ATCCCCTGCA ---/AAT AATAAGGAAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AAT 1 2 258522 CASAVA_Build 19 14913984 3I TCCTAAGAGT ---/ATC ATCTGCCAGA 3070 hom 104 het 41 0 35 6 ATC 1 2 258523 CASAVA_Build 19 14920076 1D TTTTAAACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 10 9 258524 CASAVA_Build 19 14920484 1I GAGGCCAGGG -/C CTGCGGATCA 1728 hom 10 het 5 0 4 1 C 1 2 258525 CASAVA_Build 19 14962602 1I ACAAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 26 1 24 1 C 0 1 258526 CASAVA_Build 19 14972995 1I3M2D GCTGGGAACT -TAGTT/GTAG-- ATTCAGTAAT 3070 hom 129 het 46 0 42 8 N/A 0 0 258527 CASAVA_Build 19 14979366 1I TTCATCTCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 373 hom 44 1 32 11 A 9 10 258528 CASAVA_Build 19 14979843 2D GCCCCCCCCC CA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 57 het 22 0 19 5 CA 1 0 258529 CASAVA_Build 19 14981828 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 12 11 258530 CASAVA_Build 19 14988240 1I GACCTCGTGA -/C CCACCTGCCT 3070 hom 38 het 18 0 13 5 C 2 3 258531 CASAVA_Build 19 14992120 1I ATTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 549 hom 35 2 20 13 A 15 16 258532 CASAVA_Build 19 14994128 6I TGCCCAGCTG ------/TTATTA TTATTATTAA 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TTA 3 5 258533 CASAVA_Build 19 14995694 3D ACCTGAGCTG TTA/--- TTATTGGCAT 3070 hom 142 het 53 0 46 8 TTA 2 1 258534 CASAVA_Build 19 14997037 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 A 20 18 258535 CASAVA_Build 19 14997585 1D ATAAGGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 42 2 25 16 T 15 14 258536 CASAVA_Build 19 14999347 1I GATTCTATCT -/A AAAAAAAAAA 1851 het 715 hom 22 4 7 11 A 16 17 258537 CASAVA_Build 19 14999433 1I CCAGGTTCCA -/G GGTCACACTC 3070 hom 41 het 18 0 14 4 G 2 3 258538 CASAVA_Build 19 15003170 4D CTGCCATGAC AAAG/---- AAGTCTTCAG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 AAAG 1 0 258539 CASAVA_Build 19 15004695 4D CAGTTACATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 957 het 69 hom 17 1 8 8 TG 11 9 258540 CASAVA_Build 19 15006093 1D TCCATCTCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 10 9 258541 CASAVA_Build 19 15008046 4D GAAGGAAAGA AGGG/---- AGGGAGGGAG 2907 hom 44 het 27 0 14 14 AGGG 5 4 258542 CASAVA_Build 19 15018101 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 16 0 13 3 A 13 14 258543 CASAVA_Build 19 15018233 2I TGACCCAGAC --/AT ATAATTCGGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AT 1 2 258544 CASAVA_Build 19 15019488 1I AATCTTGAGG -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 90 het 32 0 31 5 A 6 7 258545 CASAVA_Build 19 15023009 1I ATCTAGATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 25 0 19 6 A 11 12 258546 CASAVA_Build 19 15033611 1I AGAAAAAAGG -/T TGAAGGCAGG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 1 2 258547 CASAVA_Build 19 15045408 1I TTATCTAAAG -/A ACCTGGAATC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 1 2 258548 CASAVA_Build 19 15054584 1D GTTTGGGAGC G/- GGGGGGAGGG 1815 hom 7 het 8 0 6 2 G 7 6 258549 CASAVA_Build 19 15055407 1D AAAAAGCCTC A/- AAAAGTTAAC 3070 hom 105 het 38 0 34 5 A 5 4 258550 CASAVA_Build 19 15067333 2D ATTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1641 het 50 hom 11 1 5 5 A 20 18 258551 CASAVA_Build 19 15068674 4D CTGGGTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 TTTG 3 2 258552 CASAVA_Build 19 15069252 1I GTGGCGGGCG -/C CTGTAGTCCC 2683 hom 24 het 10 0 8 2 C 1 2 258553 CASAVA_Build 19 15069809 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 7 8 258554 CASAVA_Build 19 15071575 1D TAAAAATCGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 10 9 258555 CASAVA_Build 19 15093876 2D GCCCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 14 0 13 1 T 14 12 258556 CASAVA_Build 19 15098396 1I GCTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 49 14 27 8 A 9 10 258557 CASAVA_Build 19 15098773 8D TCTCTCCAAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 1900 hom 17 4 12 1 AAAC 5 3 258558 CASAVA_Build 19 15110415 1D GCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 10 7 A 14 13 258559 CASAVA_Build 19 15114774 3I TCAAAGTCTG ---/GCT GCTCAGCAAG 3070 hom 108 het 40 0 35 5 GCT 1 2 258560 CASAVA_Build 19 15117720 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2047 het 1062 hom 15 5 6 4 A 13 14 258561 CASAVA_Build 19 15121112 4D TCTAACTACA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 T 15 11 258562 CASAVA_Build 19 15128143 3D TCAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAAG 3070 hom 57 het 20 0 19 4 AAG 3 2 258563 CASAVA_Build 19 15136034 7D CAATAAAGCA GTTTTTT/------- GTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 31 0 23 9 GTTTTTT 3 2 258564 CASAVA_Build 19 15136607 1D CTGGAGACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 573 hom 26 2 13 11 T 12 11 258565 CASAVA_Build 19 15138318 1D TGTTTTAAAA G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 78 het 31 0 25 7 G 9 8 258566 CASAVA_Build 19 15138766 1I TGAGACTTTT -/G CTGGAGCATT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 0 1 258567 CASAVA_Build 19 15139374 4I TGGTGTTTTA ----/TTTG TTTGTTTTTG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 TTTG 1 2 258568 CASAVA_Build 19 15146383 4D CACTGGATAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 14 15 T 18 14 258569 CASAVA_Build 19 15148259 1I CAGGCGTGAG -/C CACTGTGCCC 3070 hom 57 het 22 0 16 6 C 1 2 258570 CASAVA_Build 19 15166769 1D ACTCGATCTC A/- AAAAAAAAAA 2286 het 240 hom 27 3 12 12 A 17 16 258571 CASAVA_Build 19 15176479 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 8 9 258572 CASAVA_Build 19 15197393 4D ACTCCATCTC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 ACAA 4 3 258573 CASAVA_Build 19 15207378 1D AGAACTGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2114 hom 31 11 16 5 A 15 14 258574 CASAVA_Build 19 15233112 1I CCTGACCAAT -/A CGGCAAAACC 2470 het 2443 hom 14 6 7 1 A 0 1 258575 CASAVA_Build 19 15239435 4D GCACCCCATG CCAC/---- CCACCCCCTG 3070 het 942 hom 23 3 10 10 CCAC 2 1 258576 CASAVA_Build 19 15250417 1I TATATTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 10 11 T 11 12 258577 CASAVA_Build 19 15268736 1I ACGGCAGAAG -/C CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 C 8 9 258578 CASAVA_Build 19 15272454 1I AATATATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 11 12 258579 CASAVA_Build 19 15293051 9D ATGGGAAAGG GAAAGGAAA/--------- GAAAGGAAAG 3070 het 3070 ref 22 10 9 4 GAAAGGAAA 2 1 258580 CASAVA_Build 19 15308836 1I CTCCATCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 11 12 258581 CASAVA_Build 19 15325238 2D TTTTTGCCTT AA/-- GAGAACAAGC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 2 0 258582 CASAVA_Build 19 15325740 2D TATTTCATTT TA/-- TATATATATA 2023 het 985 hom 11 3 5 5 TA 9 8 258583 CASAVA_Build 19 15325833 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 9 10 258584 CASAVA_Build 19 15333080 4I CATCCGAAGG ----/TTTC TTTCTTTCCA 3070 het 3070 hom 56 23 24 9 TTTC 2 3 258585 CASAVA_Build 19 15333161 1D TTCATGCCAC T/- TTTTTTTTTT 943 het 642 hom 32 8 5 19 T 19 18 258586 CASAVA_Build 19 15360163 2D CCAAAGGAAA CT/-- CTGACCCAGG 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 CT 2 1 258587 CASAVA_Build 19 15361736 1I ATATTAGGTT -/A AAAGCCGACT 2188 het 2188 ref 21 12 5 4 A 3 4 258588 CASAVA_Build 19 15372206 1I AACAGGTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1376 hom 26 5 11 10 T 15 16 258589 CASAVA_Build 19 15391802 4D GTTTTAAAAC TTTT/---- TTTAAGGTAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 3 T 7 3 258590 CASAVA_Build 19 15402564 1I TGGGTCTGAG -/T TATGAGCTCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 1 2 258591 CASAVA_Build 19 15440222 1D AATTTGAAAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 9 8 258592 CASAVA_Build 19 15446792 1D AGAGAGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 721 hom 17 4 11 3 A 15 14 258593 CASAVA_Build 19 15452561 1D CATCAATAAC T/- TTTTTTTTTT 1614 het 1614 ref 29 10 5 14 T 13 12 258594 CASAVA_Build 19 15457299 1I TCATGGCGCT -/G GGGGAGTGTA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 G 4 5 258595 CASAVA_Build 19 15478943 1I TAAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 1790 het 1790 ref 18 9 5 4 A 11 12 258596 CASAVA_Build 19 15488973 1I GGCTGCACTA -/T TTTTTTTTTG 2798 het 2798 ref 21 11 9 1 T 9 10 258597 CASAVA_Build 19 15514558 1I GTTGTTTCCC -/T CCCTGTGTCC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 0 1 258598 CASAVA_Build 19 15517382 1D ACTGCTTGAA C/- CCAGGAGGTG 3070 het 3070 ref 21 11 10 0 C 3 2 258599 CASAVA_Build 19 15529694 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 937 hom 14 3 9 2 T 10 9 258600 CASAVA_Build 19 15538986 4D35M4I TTCTTTTCTT TCTCTCTATCTCTTTCTTTCTCCCTTCCTTCCTTCTTTC----/----TCTATCTCTTTCTCTCTCCCTTCCTTCTTTCTCTCTCTT TCTTTCTTTC 3068 hom 11 het 8 0 8 2 N/A 0 0 258601 CASAVA_Build 19 15541824 1D AGCCTGGTCT G/- GGGGTGGTGC 3070 het 2872 hom 21 8 8 6 G 5 4 258602 CASAVA_Build 19 15542566 4I ATCCTGTTAT ----/CTAC CTACCTACCT 3070 het 3070 hom 52 21 25 6 CTAC 4 5 258603 CASAVA_Build 19 15542879 3D AGTAGAGACA GGG/--- GGGTTTCACC 2543 het 2543 ref 17 11 6 1 G 6 3 258604 CASAVA_Build 19 15549627 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 10 7 T 15 14 258605 CASAVA_Build 19 15550959 1D CATGTTTTTG T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 18 10 8 0 T 7 6 258606 CASAVA_Build 19 15555899 1D TCCTGAGAGA C/- CCCCACCCAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 C 5 4 258607 CASAVA_Build 19 15560381 4I CTGCGATCTT ----/AGTC AGGGTTCTCC 3070 het 3070 hom 52 24 27 1 AGTC 0 1 258608 CASAVA_Build 19 15561518 3I AACAACAACG ---/ACA ACAACAACAA 3070 hom 52 het 21 0 16 5 ACA 5 6 258609 CASAVA_Build 19 15561683 4D TTTGTCTCTG TGTT/---- TGTTTGTGTG 3070 het 1986 hom 35 11 19 7 TGTT 2 1 258610 CASAVA_Build 19 15561826 1D42M2I TAATTGTGTG CATGGGTGGCTGTGATCACATGTGCATATGTCTGTATTACACC--/-ATGGGTGGCTGTGATCACATATGCATATGTCTGTATTACACCCT GTGTTGGCGA 3070 het 3070 ref 59 53 30 13 N/A 0 0 258611 CASAVA_Build 19 15574914 1I GAAATCTTTG -/C CAGTCCTATT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 1 2 258612 CASAVA_Build 19 15577084 1D AAGTGGGCAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 54 het 24 0 19 7 A 9 8 258613 CASAVA_Build 19 15585307 1I TTTTGCGCAG -/C CTGGGTGCCG 3070 hom 105 het 39 0 34 5 C 1 2 258614 CASAVA_Build 19 15588751 1D ATGTGCAAAA G/- GTGCTCCCTG 3070 het 3070 ref 47 23 15 10 G 2 1 258615 CASAVA_Build 19 15591499 1I CCGTCGCTTG -/C TGACGCCTGC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 0 1 258616 CASAVA_Build 19 15591745 3D TAGGAGCATG TAA/--- TGGACTCATG 3070 het 3070 ref 55 28 23 5 TAA 1 0 258617 CASAVA_Build 19 15595327 62D CAGATAAATT TTAGAGGTGATTGCATAGAAAGCTTCCTGGGAAGAACAAACAGGAGGTCGGAAGGAAGCATG/-------------------------------------------------------------- TGGGGGTAGA 3070 het 3070 ref 26 29 11 2 TTAGAGGTGATTGCATAGAAAGCTTCCTGGGAAGAACAAACAGGAGGTCGGAAGGAAGCATG 1 0 258618 CASAVA_Build 19 15603941 4I TGAAAGTCAA ----/TTTG TTTTTCTTCC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTG 0 1 258619 CASAVA_Build 19 15606053 1I ATTATTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 24 0 15 9 T 13 14 258620 CASAVA_Build 19 15606289 2D AGCAATCCAC CT/-- GCCTCGGCAA 3070 het 3070 hom 31 13 12 8 CT 1 0 258621 CASAVA_Build 19 15616403 3I TTAGAACAAT ---/GAG GAGGACTTGT 3070 het 3070 ref 48 19 18 11 GAG 1 2 258622 CASAVA_Build 19 15623183 1D TATCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2352 het 354 hom 24 4 9 11 T 13 12 258623 CASAVA_Build 19 15623502 3D TGTTTTTGTC TGT/--- CCATGTTTAT 3070 het 1669 hom 46 6 24 17 TGT 1 0 258624 CASAVA_Build 19 15624094 1D TTGCCAGTGA T/- TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 T 7 6 258625 CASAVA_Build 19 15625769 1I TGTTTGAACA -/G GGGAGGGACA 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 G 3 4 258626 CASAVA_Build 19 15629471 3D AGTACTATTG TAT/--- TATTGAATTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 6 TAT 2 1 258627 CASAVA_Build 19 15630843 1D GGTCTAGGCT G/- GGGGGTTGGA 3070 het 2160 hom 25 10 10 5 G 6 5 258628 CASAVA_Build 19 15632025 1D ATTTAAAAGG T/- TTTGTTTCAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 4 3 258629 CASAVA_Build 19 15632369 2I AAGGTCACTC --/TG TGAGTGGAAG 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 TG 1 2 258630 CASAVA_Build 19 15634305 1I TTCAACTACA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 6 7 258631 CASAVA_Build 19 15636329 3I TTTTGTTTTG ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 20 0 T 9 12 258632 CASAVA_Build 19 15637029 1I GTGAAGTCTC -/T CAGGTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 0 1 258633 CASAVA_Build 19 15639750 6D TCTCTTTGTC TATGTG/------ TATGTGTATG 2731 het 2731 ref 50 29 11 11 TATGTG 4 3 258634 CASAVA_Build 19 15642642 1D CCTTCAAGCG C/- CCCCCTCACC 3070 hom 42 het 21 0 15 7 C 6 5 258635 CASAVA_Build 19 15651287 3D CCCATAAATA GCC/--- GCCTATAGTT 3070 het 3070 hom 38 15 20 5 GCC 2 1 258636 CASAVA_Build 19 15657802 1I TCTGTTCCCA -/G CACCTTTCTG 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 G 0 1 258637 CASAVA_Build 19 15658782 2D CTTTGTAAAC AA/-- AAAAAAGTGT 3070 het 2727 hom 28 6 19 3 A 8 6 258638 CASAVA_Build 19 15659463 2I AATCCTCAGA --/GT GTAAGAGGGG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 GT 1 2 258639 CASAVA_Build 19 15660178 3D AAACAGTTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 21 20 7 A 13 10 258640 CASAVA_Build 19 15663518 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 37 19 15 3 T 7 6 258641 CASAVA_Build 19 15664984 1D AGCATACATT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 A 8 7 258642 CASAVA_Build 19 15665347 4I TTTGATGGAG ----/TTGT TTGTTTTTTT 3070 het 335 hom 12 2 8 2 TTGT 1 2 258643 CASAVA_Build 19 15667320 5I TAATAAAAAA -----/AAAAC AAAAAAACAA 3070 het 1165 hom 21 5 14 2 AAAAC 0 1 258644 CASAVA_Build 19 15672257 4D AAAAAAAAAT AGAA/---- AGACATTCCA 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 AGAA 1 0 258645 CASAVA_Build 19 15675065 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1598 hom 33 8 11 14 T 15 14 258646 CASAVA_Build 19 15690452 1I CTTGCAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 A 9 10 258647 CASAVA_Build 19 15694385 9I ATACATACAC ---------/ATTTTGCCA ATTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 ATTTTGCCA 0 1 258648 CASAVA_Build 19 15699140 7D TCCTTGTTCC AAACTAT/------- AAACTATAAA 3070 het 3070 ref 37 21 11 6 AAACTAT 3 2 258649 CASAVA_Build 19 15701288 1I ACACAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 10 11 258650 CASAVA_Build 19 15703592 1D CCAATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 11 10 258651 CASAVA_Build 19 15714649 16I TCTGTTTTTG ----------------/TTTTGTTTCGTTTTGT TTTTGATGGA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 TTTTGTTTCGTTTTGT 0 1 258652 CASAVA_Build 19 15718099 1D ATCTGAACAA T/- TTTTTTTTTT 767 het 767 ref 31 21 3 8 T 13 12 258653 CASAVA_Build 19 15720649 3I TTTAAGAGTG ---/GAA GAAGGAGAAG 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 GAA 1 2 258654 CASAVA_Build 19 15724111 2I TGGTTCCCAC --/AT ATGAGTGAGA 3070 het 3070 hom 57 23 27 7 AT 1 2 258655 CASAVA_Build 19 15724442 2D ATTTTTAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1782 hom 33 8 13 12 T 16 14 258656 CASAVA_Build 19 15729548 1D TCTTATAGTT C/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 C 1 0 258657 CASAVA_Build 19 15749343 1D CACCTGGGAG A/- ACCCCCCCTT 2287 het 2287 ref 45 32 7 6 A 2 1 258658 CASAVA_Build 19 15756894 1D CCCACAACAG T/- CCCTGGTGTG 3070 het 1108 hom 13 4 8 1 T 1 0 258659 CASAVA_Build 19 15763837 1D ACTTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 13 12 258660 CASAVA_Build 19 15772877 4I ATATATATAC ----/ATAT ATATATATAT 1545 het 709 hom 11 3 4 4 AT 5 7 258661 CASAVA_Build 19 15777663 2D TTCGGTATCT CA/-- CAGTGTGACT 3070 het 3070 ref 53 30 21 4 CA 2 1 258662 CASAVA_Build 19 15781626 1D ATATATTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 T 12 11 258663 CASAVA_Build 19 15784590 19D TTGAGAGGAC AGGAGCCGATCACGTCTGT/------------------- AGGAGGTAGC 3070 het 3070 ref 41 28 14 4 AGGAGCCGATCACGTCTGT 1 0 258664 CASAVA_Build 19 15787911 10I CGTATTTGTT ----------/TTTATTTTTA TTTATTTTTA 3070 het 2151 hom 14 6 7 1 TTTATTTTTA 1 2 258665 CASAVA_Build 19 15794156 1I TTATTAAGTA -/T TTTTTATAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 T 5 6 258666 CASAVA_Build 19 15794768 1D ACCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1813 hom 20 8 9 3 T 15 14 258667 CASAVA_Build 19 15798389 3D GAGGCAGTGA CGT/--- CGTGATCTCA 2046 het 1617 hom 15 6 5 5 CGT 2 1 258668 CASAVA_Build 19 15838527 6D GGCTAGACCA ATTTAC/------ ATTCTCACCA 3070 het 3070 ref 32 16 11 7 ATTTAC 1 0 258669 CASAVA_Build 19 15849042 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2202 het 1805 hom 27 9 8 10 A 12 13 258670 CASAVA_Build 19 15857483 1I CTGAACACGT -/G CTAAGTGGCG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 G 0 1 258671 CASAVA_Build 19 15859832 6D ACATAGACAC AGATAT/------ AGATATAGAC 3070 het 3070 ref 51 29 19 4 AGATAT 2 1 258672 CASAVA_Build 19 15869690 2D CCTGAATCAC TG/-- TGAGGTTGCC 2805 het 2805 ref 26 15 8 4 TG 2 1 258673 CASAVA_Build 19 15875176 2D AAATACAGAC AA/-- AGACATGACA 3070 het 3070 hom 28 9 12 9 A 3 1 258674 CASAVA_Build 19 15875492 2D TTTGAGGTGG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 11 9 258675 CASAVA_Build 19 15876455 1I51M2D GTCTAGTTTC -TTCTTCTAAATATGAAGATCCAGTTTTTTCAGCACCATTTATTGAAGAGACTG/ATTCTTCTAAATATGAAGATCCAGTTTTTTCAGCACCATTTATTGAAGAGAC-- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 29 27 14 8 N/A 0 0 258676 CASAVA_Build 19 15877814 1D TTTTCTTTGA T/- TTTTTGGAAC 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 T 6 5 258677 CASAVA_Build 19 15880938 1I TATAGCACTG -/C CCCGTCCCCA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 C 3 4 258678 CASAVA_Build 19 15882543 1I GGTAGACAAC -/T TTTTTCCAGT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 5 6 258679 CASAVA_Build 19 15888574 1I CTAAAAAGTC -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 6 7 258680 CASAVA_Build 19 15894702 1I CGTCCCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 A 10 11 258681 CASAVA_Build 19 15898661 13I3M1I AGAACCAGCC -------------AAC-/TCTTCTGGTTATTAACA TGTCTCACAC 3070 het 3070 ref 41 25 15 6 N/A 0 0 258682 CASAVA_Build 19 15901920 1I CGGGAAGATA -/T TCCTGTCAAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 1 2 258683 CASAVA_Build 19 15930797 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAGGAAAA 2305 het 2305 ref 23 14 8 1 A 5 4 258684 CASAVA_Build 19 15934985 1D AAAAAAAAAA T/- TTTGAGACAG 2844 het 2844 ref 23 10 9 4 T 4 3 258685 CASAVA_Build 19 15941619 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 9 8 258686 CASAVA_Build 19 15941934 1D TTTTCTTTTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 258687 CASAVA_Build 19 15951938 3D TGTTGTCACC ATT/--- ATATGGTTGG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 ATT 1 0 258688 CASAVA_Build 19 15957559 6D ATATATGTAT ATACAC/------ ATATATACAT 2844 hom 21 het 10 0 8 2 ATACAC 1 0 258689 CASAVA_Build 19 15959138 1I GCAGGAGATG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 7 8 258690 CASAVA_Build 19 15971348 3D AAAAATTATC GTA/--- TTTGACACCG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 GTA 1 0 258691 CASAVA_Build 19 15979131 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2597 hom 35 12 11 13 A 15 13 258692 CASAVA_Build 19 15983836 1D CTCCTCTCTC A/- AAAAATAATA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 6 5 258693 CASAVA_Build 19 15993388 1I ACGCAGCTGT -/A AATCCCAGCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 2 3 258694 CASAVA_Build 19 16000420 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 399 hom 33 1 26 7 A 10 9 258695 CASAVA_Build 19 16011891 5D TTGCCAGACT TTTCA/----- TTTATGTTGG 3070 het 3070 hom 38 18 18 4 TTTCA 1 0 258696 CASAVA_Build 19 16013411 1D TTCTGGCTAA C/- CTCAGCCAGT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 C 2 1 258697 CASAVA_Build 19 16016520 2I CAGAGTGAGA --/CT CTATCTCAAA 281 het 281 ref 22 10 3 9 CT 1 2 258698 CASAVA_Build 19 16020279 2D CCAAAAAACA AT/-- ATATATATAT 2041 het 1888 hom 16 6 5 6 AT 8 7 258699 CASAVA_Build 19 16029896 1I GGCAGGAGAA -/T TCACTTGAAC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 1 2 258700 CASAVA_Build 19 16033055 1D GGACTTAGAG C/- CCTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 C 3 2 258701 CASAVA_Build 19 16045818 1D AGATCAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1744 hom 36 7 15 14 A 12 11 258702 CASAVA_Build 19 16049521 1I TCCCAGGAGT -/A AAATCTCAGG 3070 hom 60 het 22 0 20 6 A 3 4 258703 CASAVA_Build 19 16087099 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2524 het 1810 hom 27 8 11 8 A 11 12 258704 CASAVA_Build 19 16089299 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1775 het 1653 hom 17 5 5 7 A 13 14 258705 CASAVA_Build 19 16089525 1D AGGGGGCCTT A/- AAGGAGGAGA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 3 2 258706 CASAVA_Build 19 16093381 1D GACCCCTCCA G/- GCCACAGTGT 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 G 2 1 258707 CASAVA_Build 19 16096522 1D TTGGAGTTAG C/- CCCCCCCCGC 3070 het 2178 hom 32 11 11 10 C 9 8 258708 CASAVA_Build 19 16100968 3I CTGGGCACTC ---/CTT CTAGATCCTT 3070 het 3070 ref 57 24 20 13 CTT 0 1 258709 CASAVA_Build 19 16107659 8I TCCATGAGGA --------/CCTGTCCT CAGGGACTTC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 CCTGTCCT 0 1 258710 CASAVA_Build 19 16122513 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAATTAG 2339 hom 40 het 19 0 11 8 A 7 6 258711 CASAVA_Build 19 16129208 1D GGCAGCAGCT A/- AAAAAGCCAC 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 6 5 258712 CASAVA_Build 19 16130891 2I AGTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1443 hom 27 het 11 0 10 1 A 12 14 258713 CASAVA_Build 19 16147554 2I GTTGGCTGGG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 8 10 258714 CASAVA_Build 19 16150533 2I CACTTACATA --/CT GTTGGTGGGA 3070 hom 75 het 36 0 25 11 CT 0 1 258715 CASAVA_Build 19 16153637 2D CCTCTAATGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 21 0 15 6 T 12 10 258716 CASAVA_Build 19 16154849 1D GCCAGCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 4 A 11 10 258717 CASAVA_Build 19 16158461 7I ATTTTTTCTT -------/GATATTA AACACCATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GATATTA 0 1 258718 CASAVA_Build 19 16163872 1I GAGTGTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 30 1 23 7 T 11 12 258719 CASAVA_Build 19 16165706 2D AAGTGGTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 27 0 18 9 T 16 14 258720 CASAVA_Build 19 16166802 1D ACCAAGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 19 1 9 9 T 15 14 258721 CASAVA_Build 19 16176767 2I TCAGCCTCCC --/GA GAGTAGCTGG 1110 hom 10 het 4 0 4 0 GA 1 2 258722 CASAVA_Build 19 16178420 1I CCCCTACCGT -/G GGGGAAGAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 G 4 5 258723 CASAVA_Build 19 16181431 1D CCATGCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 22 0 16 6 A 12 11 258724 CASAVA_Build 19 16182971 2I AAGTGGCATG --/AT CTTGGCTCAG 3070 hom 36 het 18 0 13 5 AT 0 1 258725 CASAVA_Build 19 16190876 1D TTGCTAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 13 12 T 15 14 258726 CASAVA_Build 19 16196777 4D CCCCAGCAGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 1175 hom 21 3 11 11 GA 8 6 258727 CASAVA_Build 19 16197215 1D GTGGTGGCCA G/- GGCTGCAGCC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 G 3 2 258728 CASAVA_Build 19 16197949 1D2M1D CCTGAGGCCT AGAG/-GA- GGCAGGACCC 3070 hom 81 het 30 0 25 6 N/A 0 0 258729 CASAVA_Build 19 16199125 1D GATGGCCGCT G/- GGGACTCAGC 3070 hom 75 het 28 0 22 6 G 4 3 258730 CASAVA_Build 19 16203442 1D GGTTTCGCTA T/- TGTTGCTCAG 3070 hom 48 het 24 0 17 9 T 2 1 258731 CASAVA_Build 19 16210120 1I AGTTACACTT -/A ACAGCAGCAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 1 2 258732 CASAVA_Build 19 16213467 1D GAAAGAAAAC T/- TTTAACAGAT 3070 hom 27 het 23 1 18 4 T 4 3 258733 CASAVA_Build 19 16214121 2D ACCCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 12 10 258734 CASAVA_Build 19 16218560 1D AAACCCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1132 hom 27 5 12 10 A 12 11 258735 CASAVA_Build 19 16222430 1I CTCTTTAGGA -/G GCCGAGGCAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 1 2 258736 CASAVA_Build 19 16225284 5D ACACAGACAC ACAAA/----- ACAAAACTAC 3070 hom 182 het 69 0 58 15 ACAAA 2 1 258737 CASAVA_Build 19 16228099 1D CTCCCCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 24 1 13 10 T 12 11 258738 CASAVA_Build 19 16228544 2I CCCATCTCTT --/AA AAAAAAATAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 7 9 258739 CASAVA_Build 19 16229153 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 473 hom 18 3 13 2 A 16 17 258740 CASAVA_Build 19 16232922 1I CTCTCTTTTC -/T TTTTTTGGTA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 6 7 258741 CASAVA_Build 19 16240988 1D CACTGTCCAT C/- CCCCCCCCCT 3070 hom 41 het 27 0 14 13 C 10 9 258742 CASAVA_Build 19 16253671 1I ACGCCATCTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 7 8 258743 CASAVA_Build 19 16254859 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1708 het 1708 ref 33 12 8 14 A 15 14 258744 CASAVA_Build 19 16254896 1D AAAAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 11 11 A 11 10 258745 CASAVA_Build 19 16279742 1I AAGGCTGACA -/G GGTGAGTTTC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 G 2 3 258746 CASAVA_Build 19 16280511 6D2M3D GGAGTTTGAG ACCAGCCTGGG/------CT--- CAACATGGTG 3070 het 2169 hom 21 5 16 6 N/A 0 0 258747 CASAVA_Build 19 16280636 6D TTGAGCCTGG GAGGTC/------ GAGGCGAGCT 2147 het 2147 ref 23 14 7 2 GAGGTC 1 0 258748 CASAVA_Build 19 16283393 4D TTGATTGTTC GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 31 11 10 11 GTTT 4 3 258749 CASAVA_Build 19 16286511 1I ATGTAAAGAA -/T TTACACTATT 3029 het 3029 ref 26 17 7 2 T 2 3 258750 CASAVA_Build 19 16287751 1D ATCCCAGTGC T/- TTGATAGGCA 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 T 3 2 258751 CASAVA_Build 19 16299429 1I TGGAGGGCAG -/C CCCCACTAAA 3070 hom 65 het 25 0 21 4 C 4 5 258752 CASAVA_Build 19 16301925 15D AAAGGGTGAA GGTTTTATTTTGTTT/--------------- GGTTTGAGAT 3070 hom 74 het 27 0 23 6 GGTTTTATTTTGTTT 1 0 258753 CASAVA_Build 19 16304719 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2164 het 122 hom 12 1 9 2 A 16 15 258754 CASAVA_Build 19 16304892 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 1801 het 810 hom 18 6 8 4 A 16 17 258755 CASAVA_Build 19 16311754 1D TCTCTAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 62 het 23 0 19 4 A 10 9 258756 CASAVA_Build 19 16333070 1I TAAAAGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 20 1 14 5 A 12 13 258757 CASAVA_Build 19 16374536 1I CAAACCAAGA -/C CCCATCTCTG 3070 hom 84 het 30 0 24 6 C 3 4 258758 CASAVA_Build 19 16416539 1D TCCAGACAAG T/- TTTTTTTTTT 2232 het 1822 hom 26 11 7 8 T 17 16 258759 CASAVA_Build 19 16441398 1D TTGATATTCA G/- GGTCAGAAAA 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 G 3 2 258760 CASAVA_Build 19 16446879 2I GATTCATTTC --/AA AAGACTAAAT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 2 4 258761 CASAVA_Build 19 16449221 1I AGCTAATTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 12 13 13 A 8 9 258762 CASAVA_Build 19 16454190 5D ACCCTGTCTC AACAA/----- AACAAAACAA 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 AACAA 5 4 258763 CASAVA_Build 19 16457660 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTTGCCA 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 G 2 3 258764 CASAVA_Build 19 16462575 1D TTCTATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1329 hom 24 5 13 6 T 12 11 258765 CASAVA_Build 19 16534437 4I ATTATAGTAT ----/TTTG TTTGTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 TTTG 1 2 258766 CASAVA_Build 19 16538999 1I TTAAGAGCAA -/T TTTTTTTTTT 1009 het 1009 ref 40 34 3 3 T 11 12 258767 CASAVA_Build 19 16553026 1D GCAATGTTCT C/- CATTCAGGGC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 C 2 1 258768 CASAVA_Build 19 16597354 1D ACTGTCCCCG T/- TTTTTTTTTT 1725 het 1725 ref 52 30 6 17 T 13 12 258769 CASAVA_Build 19 16609907 1I CACCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2454 het 2454 ref 19 11 7 1 A 13 14 258770 CASAVA_Build 19 16611765 1I CGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2195 het 1082 hom 19 4 6 9 T 13 14 258771 CASAVA_Build 19 16617041 2I CTGGAGAAAA --/AG AGAGGACTAT 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 AG 2 3 258772 CASAVA_Build 19 16633580 2I GCGGAGTGTC --/TA TATAAGGGCC 2489 het 2489 ref 29 11 10 8 TA 2 3 258773 CASAVA_Build 19 16636073 1D CTACAAATGC A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 28 12 10 7 A 7 6 258774 CASAVA_Build 19 16662810 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 26 1 19 6 A 14 13 258775 CASAVA_Build 19 16664075 1I AGATAAGGCC -/T TTTTTTTTTT 2079 het 1998 hom 23 5 9 9 T 13 14 258776 CASAVA_Build 19 16665988 8I CTCTGTCTTT --------/AAAAAAAC AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 29 11 9 9 AAAAAAAC 1 2 258777 CASAVA_Build 19 16669081 2D AATTCACCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 30 0 17 15 T 14 12 258778 CASAVA_Build 19 16670139 1D TGAGCCTGGG A/- GGCAGAGGTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 1 0 258779 CASAVA_Build 19 16676704 1D TGCTAGTCAG A/- ATATGAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 2 1 258780 CASAVA_Build 19 16687687 3D ATAATCACGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 30 4 14 12 T 17 14 258781 CASAVA_Build 19 16696819 1D ATTTTTATTT A/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 A 1 0 258782 CASAVA_Build 19 16697783 1D TTTTTTTTGC T/- TTTTTTTTAG 1052 het 1052 ref 24 8 4 12 T 9 8 258783 CASAVA_Build 19 16705614 1D GGGAGACGGC G/- GTCCCTCCAG 3070 het 3070 ref 47 28 16 5 G 2 1 258784 CASAVA_Build 19 16711002 1I AGTTTCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1154 hom 27 3 21 4 A 11 12 258785 CASAVA_Build 19 16738403 1D GTCTTAACCA T/- TTTTTTTTTT 2254 het 2254 ref 38 28 5 5 T 12 11 258786 CASAVA_Build 19 16740413 10I CCTGTGAATT ----------/AAACTAACAA AAGACAGCTT 3070 hom 90 het 37 0 30 8 AAACTAACAA 0 1 258787 CASAVA_Build 19 16750306 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 29 1 16 12 T 14 13 258788 CASAVA_Build 19 16751970 1I GCAAGGTTTC -/T TTTTTTTTTT 679 het 679 ref 25 7 3 15 T 15 16 258789 CASAVA_Build 19 16815658 1D14M1D GGCACAGTTT CTTTTTTTGTTTTTAT/-TTTTGCTGTTTTTA- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 33 15 16 6 N/A 0 0 258790 CASAVA_Build 19 16822900 1I CCCCACCAGT -/G GGCCGCCACA 2678 het 2678 ref 26 11 9 6 G 2 3 258791 CASAVA_Build 19 16836303 3I CCATGCCCAA ---/GTT GTTGTTTTTT 2094 het 2094 ref 16 7 5 4 GTT 2 3 258792 CASAVA_Build 19 16871710 1I CAGCCTGGGA -/T TTTTTTTTTT 1424 het 1424 ref 23 10 9 4 T 15 16 258793 CASAVA_Build 19 16872951 1I GCCAGCCTGA -/C CCTGGGTGCC 3070 hom 30 het 13 0 10 3 C 2 3 258794 CASAVA_Build 19 16890229 1D TTTCGTTTTT G/- GAACTTTGTG 2403 het 1062 hom 13 3 7 3 G 2 1 258795 CASAVA_Build 19 16891021 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 A 11 10 258796 CASAVA_Build 19 16893493 3D ACTGTGGTAA CAG/--- CAGCAGAAAC 3070 het 3053 hom 27 9 10 10 CAG 3 2 258797 CASAVA_Build 19 16912275 1D TCTCTAAGAT G/- GGGGTTAAAG 3070 hom 101 het 37 0 35 3 G 5 4 258798 CASAVA_Build 19 16913178 2I CAAGCACGTA --/TC TCTATGCTGC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TC 1 2 258799 CASAVA_Build 19 16916531 24D CTACAGCGGT GACCTGTCCACTGTCACCGCTCCG/------------------------ GAGTTCTGCC 845 het 845 ref 23 21 3 5 GACCTGTCCACTGTCACCGCTCCG 1 0 258800 CASAVA_Build 19 16916699 3I GCTGTTAGGG ---/GCT GCTGTTGGTG 2714 het 2714 ref 33 13 9 11 GCT 1 2 258801 CASAVA_Build 19 16917984 1I GTGTGTGTAT -/G GATTTGTGTG 3070 het 3070 ref 77 37 32 8 G 1 2 258802 CASAVA_Build 19 16919528 1D ATGCATGTGT C/- CCCTGGGTGC 3070 hom 198 het 70 0 64 6 C 4 3 258803 CASAVA_Build 19 16927107 2D CCATCTCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2195 het 595 hom 24 4 8 14 A 14 12 258804 CASAVA_Build 19 16932264 2D ATATATTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 12 10 258805 CASAVA_Build 19 16932378 1D TCTTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1718 hom 24 5 17 2 T 11 10 258806 CASAVA_Build 19 16962917 2D AGGCCCCCAC AA/-- AAAACTTTGG 3070 het 3070 ref 42 23 15 6 A 6 4 258807 CASAVA_Build 19 16966499 1D GGCTAATTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 53 het 22 0 17 6 A 9 8 258808 CASAVA_Build 19 16971395 4D ACTCCATCTC CAAA/---- AAAAAAAAAA 19 het 19 ref 11 4 1 6 CAAA 1 0 258809 CASAVA_Build 19 16974383 1I CAAGGGGCCT -/C CCCCTGTCAC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 4 5 258810 CASAVA_Build 19 16977775 1I TCCCAAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2121 hom 29 8 12 9 T 10 11 258811 CASAVA_Build 19 16980907 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 A 11 10 258812 CASAVA_Build 19 16991376 1D TATTCTCTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 T 9 8 258813 CASAVA_Build 19 17014094 1I TGCGTGGAGC -/G GGGGTGTGGG 2692 het 2692 ref 25 10 11 4 G 4 5 258814 CASAVA_Build 19 17017771 2D AAATCATCAC AT/-- GTCTATGAGC 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 AT 1 0 258815 CASAVA_Build 19 17018214 1D GCAGATCCAT G/- TGGGATTTGG 3070 het 3070 hom 56 21 22 13 G 1 0 258816 CASAVA_Build 19 17023200 1D GGGGGAGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1825 hom 27 9 12 7 A 10 9 258817 CASAVA_Build 19 17026302 1D TCGTCTCTAC A/- AAAAAAAATA 2453 het 2448 hom 16 6 6 4 A 9 8 258818 CASAVA_Build 19 17032944 1D GGAAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 26 0 15 11 T 15 14 258819 CASAVA_Build 19 17041417 14D CTAGTGACAG CCCAACCCCAGGTC/-------------- CCCTTCCAGG 1909 het 1909 ref 17 12 6 1 CCCAACCCCAGGTC 1 0 258820 CASAVA_Build 19 17058690 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1369 hom 23 5 11 7 A 13 14 258821 CASAVA_Build 19 17065143 1I CTCCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 2234 het 2234 ref 28 10 9 9 A 13 14 258822 CASAVA_Build 19 17076546 7I CCGCTTAAAA -------/AAAAAAC AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 AAAAAAC 1 2 258823 CASAVA_Build 19 17078865 1I AAGAGCGAAA -/C TCTGTCTCAA 3070 het 2102 hom 17 5 10 2 C 0 1 258824 CASAVA_Build 19 17080187 1I TTTCTCAACC -/T TGGCTCTGCT 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 T 1 2 258825 CASAVA_Build 19 17087840 4I TCTCTGCCCC ----/ACAG ACAGCTGGGA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 ACAG 1 2 258826 CASAVA_Build 19 17097108 2D AAAACCCCAT CC/-- CCCCCCCCCC 54 het 54 ref 18 4 3 12 C 12 10 258827 CASAVA_Build 19 17100026 1I ATCTATACTG -/A AAAAAAAAAA 2323 het 2323 ref 33 19 7 7 A 11 12 258828 CASAVA_Build 19 17112305 1D GTTAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3004 het 1637 hom 29 9 12 8 T 12 11 258829 CASAVA_Build 19 17113478 1D AGTTCCCCCA G/- GGGCTCCGTC 3070 hom 72 het 28 0 21 8 G 4 3 258830 CASAVA_Build 19 17123100 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAGAA 2261 het 1547 hom 17 5 10 3 G 1 0 258831 CASAVA_Build 19 17124263 1D CAACCAACCA C/- TGTGGGGGCC 2749 het 2749 ref 23 14 7 2 C 1 0 258832 CASAVA_Build 19 17125506 6D ACCGTATCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAG 2799 het 1511 hom 17 5 7 9 A 15 9 258833 CASAVA_Build 19 17139010 1D AAGTTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 2217 het 1447 hom 34 13 7 14 T 17 16 258834 CASAVA_Build 19 17144384 1I CGAGGTTCCA -/G GGTGCTCAGA 3070 hom 48 het 22 0 15 7 G 2 3 258835 CASAVA_Build 19 17192678 1D CATGGCAGCA T/- TGACGGCATT 3070 het 3070 hom 36 12 18 7 T 2 1 258836 CASAVA_Build 19 17202518 3I TTTCTCTCTG ---/CCC CCCTACAGCT 3070 hom 72 het 27 0 22 5 C 3 6 258837 CASAVA_Build 19 17212051 1I CAAATCAAAT -/A AAAAAAAAAA 2223 het 2204 hom 21 7 8 6 A 11 12 258838 CASAVA_Build 19 17213142 4D ATGAGGAAGT AAAC/---- AAAGTCACTC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AAAC 1 0 258839 CASAVA_Build 19 17227111 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 25 0 17 9 A 11 10 258840 CASAVA_Build 19 17235508 6I GCTAATGTGG ------/CAAGAC CCTGTCTCAC 3070 hom 102 het 37 0 33 4 CAAGAC 0 1 258841 CASAVA_Build 19 17246678 1D CCCCTGGCTC T/- TTTCATTTTG 3070 hom 86 het 33 0 27 7 T 4 3 258842 CASAVA_Build 19 17256193 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 9 8 258843 CASAVA_Build 19 17263096 1D GCTCATCTCG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 132 het 47 0 41 6 T 9 8 258844 CASAVA_Build 19 17264908 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 10 13 T 15 14 258845 CASAVA_Build 19 17277591 1D CAACGGCCTC T/- TTTTTGCACG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 6 5 258846 CASAVA_Build 19 17286931 2I TACACACACG --/TA TATATATACA 1920 hom 21 het 12 0 8 4 TA 4 5 258847 CASAVA_Build 19 17295879 1I CTGGGCACGG -/C CCCTGCCGGT 960 hom 20 het 8 0 6 2 C 3 4 258848 CASAVA_Build 19 17304071 5I TATTTATTTG -----/TTTAT TTTGAGACAG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TTTAT 0 1 258849 CASAVA_Build 19 17311722 2D CGCCGAACTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 22 0 13 10 T 16 14 258850 CASAVA_Build 19 17315870 4D CAAAACAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 72 het 28 0 25 6 AAAC 3 2 258851 CASAVA_Build 19 17316658 1D TCAGCTCACT G/- GCAACCTCTG 3070 hom 27 het 12 0 8 4 G 2 1 258852 CASAVA_Build 19 17318397 2I ATACAAACTC --/TG TGATTTCAGT 3070 hom 53 het 24 0 15 9 TG 1 2 258853 CASAVA_Build 19 17325741 1D ATCAGAGGCG T/- TAACAGTGAA 3070 hom 76 het 31 0 25 6 T 2 1 258854 CASAVA_Build 19 17335385 7D CCATTTTGGA ACCCCAG/------- ATGTCTGTTG 3070 het 281 hom 25 2 9 15 ACCCCAG 1 0 258855 CASAVA_Build 19 17354731 1D CCACTATTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 2450 hom 27 8 16 3 G 1 0 258856 CASAVA_Build 19 17362263 1D TCCCCGCAGA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 42 het 20 0 13 7 C 10 9 258857 CASAVA_Build 19 17373365 1D CCTGGCCAGA G/- GGTTTTTTTT 2763 het 227 hom 21 1 15 5 G 3 2 258858 CASAVA_Build 19 17375647 3I CGGTACAGAT ---/GGG GGCAAATCAG 3070 hom 24 het 9 0 8 1 G 2 5 258859 CASAVA_Build 19 17377401 8I CTCCCCTTTA --------/GCTGAAAG GAGTCTGGCC 3070 hom 99 het 37 0 31 6 GCTGAAAG 0 1 258860 CASAVA_Build 19 17377587 1I GGAGGTGGGC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 8 9 258861 CASAVA_Build 19 17405901 1D AGTAGAGACA G/- GGTTTCACCA 2224 hom 18 het 8 0 6 2 G 3 2 258862 CASAVA_Build 19 17417738 1I CCACCATCCA -/C CTATCTGATA 3070 het 3070 ref 59 31 20 8 C 1 2 258863 CASAVA_Build 19 17421851 1D TTTAAAAAAA T/- CGAGATGAAA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 1 0 258864 CASAVA_Build 19 17426086 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1170 het 8 hom 8 0 4 4 A 13 12 258865 CASAVA_Build 19 17431071 2D GGAATTACCT AC/-- AGTCTCCCTG 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 AC 1 0 258866 CASAVA_Build 19 17439959 4D TCTTTCTTCC TTCT/---- TTCTTTGTTT 3070 hom 71 het 29 0 23 8 TTCT 2 1 258867 CASAVA_Build 19 17446737 1D CTGCGCCCTG T/- TTTTTTTTTG 2882 het 193 hom 11 1 7 3 T 10 9 258868 CASAVA_Build 19 17448693 2D TGATCATCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 118 het 44 0 38 8 T 23 21 258869 CASAVA_Build 19 17451453 2D TTCTTTCTCC CT/-- CTCTCTCTCA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 CT 5 4 258870 CASAVA_Build 19 17452722 2I TAACGAAAAC --/AT GTGGTATTTG 3070 hom 8 het 21 1 14 6 AT 0 1 258871 CASAVA_Build 19 17461307 2I ATCCTATAAC --/TG TTTGGAGGGT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 TG 0 1 258872 CASAVA_Build 19 17468213 2D GGCTTGAGAA TG/-- TGTGGCAGGG 3070 hom 90 het 36 0 26 11 TG 3 2 258873 CASAVA_Build 19 17471461 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 18 1 15 2 A 14 15 258874 CASAVA_Build 19 17496256 1I CACAACGCCC -/G GCTATTTTTT 2705 het 1817 hom 13 5 6 2 G 1 2 258875 CASAVA_Build 19 17506614 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAAGA 2737 het 8 hom 10 1 9 0 G 0 1 258876 CASAVA_Build 19 17510556 4D AGAAAGAAAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 1517 het 1517 ref 31 13 11 8 AGAA 3 2 258877 CASAVA_Build 19 17524055 3D GCCTGGTTAA TTT/--- TTGTGTTTTT 2106 het 1517 hom 10 4 5 1 T 5 2 258878 CASAVA_Build 19 17534471 1I ACTATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 11 12 258879 CASAVA_Build 19 17536972 2I GCTGTTGAGA --/CT CTTTTTTTTT 3070 hom 119 het 45 0 39 6 CT 1 2 258880 CASAVA_Build 19 17557311 1D GGATTTTTTG T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 T 7 6 258881 CASAVA_Build 19 17557838 4D GAGGCAGAGT CTCA/---- CTCTGTCGCC 3017 het 3017 ref 26 12 7 7 CTCA 1 0 258882 CASAVA_Build 19 17561823 1D CATGTTTTCT A/- AAAAAGCCTA 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 6 5 258883 CASAVA_Build 19 17563815 2D GACATCTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2042 hom 33 10 16 7 T 14 12 258884 CASAVA_Build 19 17571288 7I ACTGAAGGAC -------/AAGATCA AAGACTTGAG 3070 het 3070 hom 55 25 23 7 AAGATCA 0 1 258885 CASAVA_Build 19 17587783 3I CTTGTCTCTA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 AAT 3 4 258886 CASAVA_Build 19 17590673 1I ACATGAGTTT -/G GGGGGGCAGT 3070 het 3070 hom 47 17 19 11 G 6 7 258887 CASAVA_Build 19 17590974 1D TGAGGATAGT C/- CCCCACCCTC 2427 het 2427 ref 25 12 10 3 C 5 4 258888 CASAVA_Build 19 17591180 1I TCCTCCTCAA -/G GGAGCATCCC 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 G 2 3 258889 CASAVA_Build 19 17593906 4D GAGACAGGAA AGAG/---- AGAGAAAGAT 3070 het 3070 ref 43 23 16 7 AG 4 2 258890 CASAVA_Build 19 17598206 2D CCCATCCCTC AT/-- GTCACCTATT 3070 het 3070 hom 38 14 15 12 AT 1 0 258891 CASAVA_Build 19 17598974 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1751 hom 39 8 18 13 A 13 12 258892 CASAVA_Build 19 17604407 2I TGCTGTTGAC --/TG TGAATTTTCT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TG 1 2 258893 CASAVA_Build 19 17605076 1I TCCTTCCCTG -/C CCCCACAGAG 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 C 4 5 258894 CASAVA_Build 19 17612690 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2905 het 308 hom 25 2 11 13 T 16 12 258895 CASAVA_Build 19 17616311 1D CTGGATTCCA T/- TTTTTTTTTC 2650 hom 26 het 22 0 16 6 T 10 9 258896 CASAVA_Build 19 17630884 2D GTACCTTCTG AA/-- AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 8 6 258897 CASAVA_Build 19 17717227 2I CCTGGCCAAC --/AG AGTGAGACTC 1952 hom 12 het 6 0 5 1 AG 1 2 258898 CASAVA_Build 19 17723268 1D AGCTTCCTGT C/- CCCCCCCCAA 1740 het 1461 hom 22 9 6 8 C 9 8 258899 CASAVA_Build 19 17724318 24D ATCCACCCAC CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT/------------------------ TACAGGCGTG 1336 het 431 hom 4 1 5 2 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 1 0 258900 CASAVA_Build 19 17731622 1D CACGCCTGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 A 10 9 258901 CASAVA_Build 19 17735854 1I CTTCTTCATC -/T TTTTTTTTTT 2958 het 1402 hom 27 4 9 15 T 13 14 258902 CASAVA_Build 19 17736471 2D AGCACCAGCA GC/-- AACCCAGACA 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 GC 1 0 258903 CASAVA_Build 19 17739565 1D CCTGTCATCT G/- TGGCTGTTTG 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 G 1 0 258904 CASAVA_Build 19 17740794 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 1849 het 1849 ref 18 11 5 2 A 10 11 258905 CASAVA_Build 19 17741649 1I TAAATAGTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 8 9 258906 CASAVA_Build 19 17760709 4D ATGGAAGGTT GTTA/---- GTTCAATGAG 3070 het 3070 hom 53 24 25 5 GTTA 1 0 258907 CASAVA_Build 19 17771576 19D GAGCCAGCGA CCAGGCTGGTTAGGGGTAT/------------------- CCAGGCCGGT 3070 hom 54 het 20 0 17 5 CCAGGCTGGTTAGGGGTAT 1 0 258908 CASAVA_Build 19 17782754 1D TGGTGGCTCA T/- TGCTTGTAAT 2886 het 2886 ref 18 9 7 2 T 2 1 258909 CASAVA_Build 19 17784555 1D AGGCAAGTGT C/- CTTTGAAAGT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 C 2 1 258910 CASAVA_Build 19 17785818 1D CCTCCTGCTT C/- CAGCAAGGCC 3070 hom 91 het 35 0 25 10 C 2 1 258911 CASAVA_Build 19 17786571 1D GTCTCTACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 10 9 258912 CASAVA_Build 19 17787029 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 11 10 258913 CASAVA_Build 19 17796587 2I TCCAGCACAA --/AC AATCTTTTCC 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 AC 0 1 258914 CASAVA_Build 19 17799712 1D ACCACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1897 het 1897 ref 19 9 5 5 A 13 12 258915 CASAVA_Build 19 17847397 1D CATAGTGAGA C/- CCCCCCCCGC 1881 hom 4 het 10 0 6 4 C 9 8 258916 CASAVA_Build 19 17898527 1D CGCCAGCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 T 10 9 258917 CASAVA_Build 19 17912935 1I GTTTGTCAAC -/G CCCTGCTCTC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 G 0 1 258918 CASAVA_Build 19 17917760 1D CACACTGCTT C/- CTGTTCAACG 3070 het 3070 hom 56 23 28 5 C 2 1 258919 CASAVA_Build 19 17954823 1D CACTCCAGTC A/- AAAAAAAAAA 1868 het 1868 ref 19 7 5 8 A 12 11 258920 CASAVA_Build 19 17956839 2D TCCCCCTGTC TG/-- TGTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 TG 4 3 258921 CASAVA_Build 19 18001772 2I GGTCATGGAT --/AA GTCACACTGT 3070 het 3070 ref 52 30 15 7 A 0 2 258922 CASAVA_Build 19 18002242 1I TACTTATACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 9 10 258923 CASAVA_Build 19 18003012 1D ATCAGCCGAA C/- CCAAGTACTG 3070 hom 179 het 65 0 57 8 C 3 2 258924 CASAVA_Build 19 18005962 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2493 het 505 hom 17 2 10 5 A 13 14 258925 CASAVA_Build 19 18019748 4I CAAACAAAAC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 33 12 10 11 TTAT 2 3 258926 CASAVA_Build 19 18021247 1D TTTATATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 13 12 258927 CASAVA_Build 19 18025863 1I CTGATGGCAC -/A AGGTTTTCTT 3070 hom 49 het 21 0 15 6 A 1 2 258928 CASAVA_Build 19 18026627 1I CTACTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 10 11 258929 CASAVA_Build 19 18027845 1I GGTCCATATG -/C CCCCCAGCCT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 C 5 6 258930 CASAVA_Build 19 18028625 1D CAGGCCAGGG C/- CCAGCTAAGC 3070 het 2662 hom 34 12 11 12 C 3 2 258931 CASAVA_Build 19 18031266 1I ATCTAGGGTT -/C CCCCCGCAGG 3070 hom 89 het 31 0 23 8 C 5 6 258932 CASAVA_Build 19 18034519 24D GAGGCGGAGG TTGCAGTGAGCCGAGATCGCATCA/------------------------ TTGCATTCCA 3070 het 3070 ref 16 12 10 5 TTGCAGTGAGCCGAGATCGCATCA 1 0 258933 CASAVA_Build 19 18034809 3D GTTGTTCTCT TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 71 hom 26 3 17 6 TCC 8 7 258934 CASAVA_Build 19 18043438 4I CTCTTAAAAA ----/AAAC AAACAAACCA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 AAAC 2 3 258935 CASAVA_Build 19 18047825 1I GGCCAGGCCC -/T TGTCCTCTTA 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 1 2 258936 CASAVA_Build 19 18070185 1I GGGATTCGAT -/C CTGCGCCCTC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 C 1 2 258937 CASAVA_Build 19 18081036 3I GTGGCAGGAC ---/AGG AGAAGGAGGA 2968 het 2968 ref 30 19 8 3 AGG 0 1 258938 CASAVA_Build 19 18088793 15D TGGGTCCCAA AGTGTCCTGTGGCCC/--------------- AGGAAGGGGC 3070 het 3070 ref 28 19 10 2 AGTGTCCTGTGGCCC 1 0 258939 CASAVA_Build 19 18093955 1D CAACCAGCCC A/- GGGGGTGGGG 3070 het 2532 hom 20 8 9 3 A 1 0 258940 CASAVA_Build 19 18097869 1I CCTACATTTC -/A AAAAAAAAAA 2481 het 2481 ref 20 8 7 5 A 11 12 258941 CASAVA_Build 19 18098040 1I TCAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 11 12 258942 CASAVA_Build 19 18106028 1I AAAGTACACT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 7 8 258943 CASAVA_Build 19 18110131 2D CCACAACCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 16 0 9 7 T 14 12 258944 CASAVA_Build 19 18110507 1D TGGGGTTTCA C/- CATGTTGGCC 3070 het 1257 hom 10 3 7 0 C 2 1 258945 CASAVA_Build 19 18112051 2I59M1D TTAGCCAGGC --GGTGGTGGGTGCCTGTAACCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGTATTGCCTGAAC/GTGGTGGTGGGTGCCTGTAACCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGTATTGCCTGAA- CCCCAGAGGT 3070 hom 30 het 11 0 11 6 N/A 0 0 258946 CASAVA_Build 19 18117419 1D AGTAGGAGTT C/- CCCCAGGATC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 5 4 258947 CASAVA_Build 19 18121710 2I GGTGTCAATC --/AG GGGGCTGGAT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 AG 0 1 258948 CASAVA_Build 19 18121939 3D TGGGATTACA GGC/--- GCCCACCACT 2793 het 366 hom 11 2 8 1 GGC 1 0 258949 CASAVA_Build 19 18130301 3I ACTCCATCTC ---/AAA AAAAAAACAA 2082 hom 24 het 10 0 9 1 A 7 10 258950 CASAVA_Build 19 18135632 10I ACCTTGTCTC ----------/TAAAAACAAA TAAAAACAGA 3070 hom 41 het 17 0 14 3 TAAAAACAAA 0 1 258951 CASAVA_Build 19 18162451 4D AGGGTGTCCT CTGA/---- CTGGGCAAAT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 CTGA 1 0 258952 CASAVA_Build 19 18169577 37D AGTGCCAAGC AACTTATTGAAGGTACTGACAAATCCCACAGAGAAGA/------------------------------------- AACTTATTGA 2726 hom 28 het 23 0 9 18 AACTTATTGAAGGTACTGACAAATCCCACAGAGAAGA 1 0 258953 CASAVA_Build 19 18183996 1D CCCTCTCCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 22 2 12 8 T 13 12 258954 CASAVA_Build 19 18189292 1D CTCTAGGTCC T/- TTTGAGTGAG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 4 3 258955 CASAVA_Build 19 18192358 1D GCCTGCCCAA C/- CCCCCCGCTC 3070 hom 40 het 20 0 13 7 C 7 6 258956 CASAVA_Build 19 18194417 5D21M1D AATCACCCTA TTTCTTTTATTTTTTTTCTCTCTTTCT/-----TTTATTTTTTTTCTCTCTTTC- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 23 0 19 7 N/A 0 0 258957 CASAVA_Build 19 18201396 1D CATTTGAATG T/- TCCCTTCTCT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 2 1 258958 CASAVA_Build 19 18204509 4D CGCGCGCGCG CACA/---- CACACACACA 3070 het 1811 hom 37 8 14 19 CA 7 5 258959 CASAVA_Build 19 18205274 1D GCTGAAGAGA C/- CCCCCCCCAA 2983 het 2618 hom 38 10 15 13 C 9 8 258960 CASAVA_Build 19 18214438 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3002 hom 17 7 8 2 A 9 8 258961 CASAVA_Build 19 18215319 1I GGGGAAAATT -/G GGGGGAAGCA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 G 5 6 258962 CASAVA_Build 19 18220679 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 1145 het 404 hom 8 2 3 3 A 7 6 258963 CASAVA_Build 19 18227675 1D TCTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 2298 het 1758 hom 19 6 8 5 T 12 11 258964 CASAVA_Build 19 18231064 1I TCCCCAGCCA -/G GGCTTTGAGG 3070 hom 96 het 36 0 29 7 G 2 3 258965 CASAVA_Build 19 18231161 1I CACAGAACCA -/G GGGGGACAAC 3070 hom 99 het 36 0 29 7 G 5 6 258966 CASAVA_Build 19 18239762 4D GCCACCATGC CTGG/---- CTGGCTACTT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 CTGG 2 1 258967 CASAVA_Build 19 18247814 15I AGGGCTGGCC ---------------/TCCAGGGAGTATGCA TCAACTAGGT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 TCCAGGGAGTATGCA 0 1 258968 CASAVA_Build 19 18249339 1D CCTGGGCGAC A/- AGAGGAAGAC 935 het 935 ref 22 13 3 6 A 2 1 258969 CASAVA_Build 19 18255550 3I TATTGAAAAT ---/AAA AAAAATTAGG 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 A 5 8 258970 CASAVA_Build 19 18258214 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 77 het 30 0 24 6 T 6 7 258971 CASAVA_Build 19 18284239 1D AGGGCACACT G/- GGAGACTTGG 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 G 3 2 258972 CASAVA_Build 19 18295875 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 20 11 T 12 11 258973 CASAVA_Build 19 18297368 4I CACTGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 63 het 28 0 21 8 AAAC 3 4 258974 CASAVA_Build 19 18304700 3D GTGTTTAAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 108 het 40 0 37 10 AAC 7 6 258975 CASAVA_Build 19 18315971 3D TATCTTGACC TTG/--- TAGGAAGGGG 2197 het 2197 ref 27 19 6 3 TTG 1 0 258976 CASAVA_Build 19 18317836 1D GCACCCCCAA G/- GGCCAGGTCA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 G 3 2 258977 CASAVA_Build 19 18336748 22D TTAGCGGGGT GGCGCGGGGGGCTCAAAACGGG/---------------------- GGCGCGGGGG 2669 het 397 hom 10 2 9 3 GGCGCGGGGGGCTCAAAACGGG 1 0 258978 CASAVA_Build 19 18337736 1D CCATGCCAGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 404 hom 41 1 29 11 T 10 9 258979 CASAVA_Build 19 18353259 1D TGCCCAGCCT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 8 7 258980 CASAVA_Build 19 18353428 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1834 hom 14 het 8 0 6 2 A 10 11 258981 CASAVA_Build 19 18354621 1I ACTCCAATCC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 9 258982 CASAVA_Build 19 18402580 1I TGCAGAGAGG -/A GGGGGCACAC 3070 hom 78 het 31 0 24 7 A 0 1 258983 CASAVA_Build 19 18413851 3D19M4I17M1D AACACACACA CCCCCAACACACACCACACCCT----CACACCACACACACACCT/---CCAACACACACCACACCCTAACACATACCACACCCACACC- ACACACCCCA 119 het 119 ref 36 39 2 12 N/A 0 0 258984 CASAVA_Build 19 18531801 4I CTTCCTTCCT ----/TCCC TCCCTCCCTC 1865 het 63 hom 13 1 6 6 TCCC 4 5 258985 CASAVA_Build 19 18532525 1D CTACTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 2934 het 1577 hom 29 7 11 11 T 12 11 258986 CASAVA_Build 19 18536855 3I GCCACCCCAG ---/GGC CCCAGCTGAC 2733 het 2733 ref 31 18 8 5 GGC 0 1 258987 CASAVA_Build 19 18542009 1I TACTCAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2794 hom 45 14 12 19 T 11 12 258988 CASAVA_Build 19 18545799 2D CGTTTCTATT AA/-- AAATACAAAA 3070 het 2595 hom 21 7 9 6 A 5 3 258989 CASAVA_Build 19 18556494 11I TTCAGAAGGA -----------/AAAACCACAGG AAATTAATCA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 AAAACCACAGG 0 1 258990 CASAVA_Build 19 18556648 5D ATTATTATTA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 57 het 57 ref 8 1 1 6 T 18 13 258991 CASAVA_Build 19 18559407 5I AAAAAAAAAA -----/CAAAC AAAAAAAAAA 174 het 174 ref 15 6 3 6 CAAAC 0 1 258992 CASAVA_Build 19 18561867 1D GGCCACGCCT C/- CTCCGTATTA 3070 het 2275 hom 20 8 10 2 C 2 1 258993 CASAVA_Build 19 18569012 4D GGATTACACG ATAT/---- ATAATATTGG 3039 het 3006 hom 17 7 7 4 AT 3 1 258994 CASAVA_Build 19 18581844 1D GTATTAGGTT G/- GGGGGGGGGC 443 het 443 ref 19 5 3 11 G 10 9 258995 CASAVA_Build 19 18614649 1I ACACACCTAA -/T TTTTTTTTTT 2435 het 2012 hom 17 5 7 5 T 13 14 258996 CASAVA_Build 19 18628243 3I GCCGTCACTT ---/GGG GGCTGTCTGG 2959 het 2400 hom 23 8 10 5 G 2 5 258997 CASAVA_Build 19 18642167 1D GGGGCAACTT A/- AAGTGTCTCT 3070 het 3070 hom 45 12 25 10 A 3 2 258998 CASAVA_Build 19 18647022 1D CCCGTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2646 hom 27 10 11 6 T 12 11 258999 CASAVA_Build 19 18656695 5I GCCTCAGTTT -----/CTTCC CTTGTCAGGC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 CTTCC 0 1 259000 CASAVA_Build 19 18677141 1I GTATGTTTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 T 8 9 259001 CASAVA_Build 19 18677608 1D AATCCTAATA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 T 10 9 259002 CASAVA_Build 19 18679426 1I TTAGGGTGGA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 7 8 259003 CASAVA_Build 19 18692679 4I TGGGGCCCTC ----/TCTG TCTGCCCGAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TCTG 1 2 259004 CASAVA_Build 19 18697340 1D GGCCCCTGGG T/- TCAGCGTTGG 1623 het 919 hom 14 5 7 2 T 2 1 259005 CASAVA_Build 19 18699059 4D GACCCTGTCT CAAA/---- CAAACAAGGC 2869 het 2869 ref 27 13 8 7 CAAA 2 1 259006 CASAVA_Build 19 18700626 1I TCACCTGGCC -/T TTTTTTTTTT 872 het 124 hom 9 1 3 5 T 15 16 259007 CASAVA_Build 19 18702770 8D CTTCCCTCCC TCCCTCCT/-------- TCCCTCCTTC 1631 het 1631 ref 23 12 5 7 TCCCTCCT 3 2 259008 CASAVA_Build 19 18716302 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 712 het 712 ref 33 18 4 11 AC 10 9 259009 CASAVA_Build 19 18743063 1I GCTCCCCGGA -/G GGCTCAGGTA 3070 hom 84 het 30 0 26 4 G 2 3 259010 CASAVA_Build 19 18758527 1I ATTAGGATGA -/G GCCAGCCTGA 3070 hom 38 het 18 0 13 5 G 1 2 259011 CASAVA_Build 19 18795731 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGTCTCAC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 G 5 4 259012 CASAVA_Build 19 18800668 1I CGTCTCAGGG -/A AAAAAAAAAA 2588 het 2588 ref 29 10 11 8 A 13 14 259013 CASAVA_Build 19 18801323 4I TATACGCGCA ----/CTAT CTCTCTCTAT 3070 het 3070 hom 22 7 11 4 CTAT 0 1 259014 CASAVA_Build 19 18834650 1I TCTCCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2522 het 2320 hom 24 6 10 8 A 11 12 259015 CASAVA_Build 19 18856227 1D CCCAATTCTA T/- TTTTTTTTTT 910 het 910 ref 28 16 6 6 T 15 14 259016 CASAVA_Build 19 18885426 1I TGGGACCGCT -/C CTCCAGAACA 3070 hom 69 het 26 0 21 5 C 1 2 259017 CASAVA_Build 19 18889051 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1153 het 787 hom 15 4 5 6 T 19 18 259018 CASAVA_Build 19 18896160 1D CTGGGATACC T/- TCCCCGCCTC 3070 hom 78 het 30 0 23 7 T 2 1 259019 CASAVA_Build 19 18911309 5D TATTATAGAT AACTC/----- AGAGCAAGCA 3070 het 3070 ref 24 11 9 7 AACTC 1 0 259020 CASAVA_Build 19 18927596 4I CTCCAGCGAC ----/AGAT AGATATATCT 3070 hom 95 het 41 0 32 9 AGAT 1 2 259021 CASAVA_Build 19 18927935 1I AGACCAGCCT -/G GCCAACATAG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 1 2 259022 CASAVA_Build 19 18930360 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAGTT 3070 het 2882 hom 26 8 11 8 A 8 7 259023 CASAVA_Build 19 18951755 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 21 1 15 5 T 13 12 259024 CASAVA_Build 19 18952884 1D ATGGAGTCTA G/- GTCTGTTGCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 2 1 259025 CASAVA_Build 19 19080361 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 475 hom 29 3 19 7 A 13 12 259026 CASAVA_Build 19 19099305 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 1235 het 315 hom 5 1 3 1 T 8 9 259027 CASAVA_Build 19 19113515 1D CATAGTGAAA C/- CCCGTCTCCA 3070 het 1498 hom 12 4 8 0 C 4 3 259028 CASAVA_Build 19 19116302 1I CACCTGTAGT -/C CCAGCTACTC 2060 het 2060 ref 21 13 6 2 C 2 3 259029 CASAVA_Build 19 19121587 1I ATAAATGAAT -/A AATGATCATG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 2 3 259030 CASAVA_Build 19 19130405 1D TGTCTGTAGG A/- AAAAAAAAAA 1539 het 648 hom 10 3 6 1 A 15 14 259031 CASAVA_Build 19 19138390 1I CATAGGGAGA -/C CCCCCCCATC 313 het 313 ref 21 12 2 7 C 7 8 259032 CASAVA_Build 19 19141161 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 2762 het 1478 hom 21 4 9 8 A 10 9 259033 CASAVA_Build 19 19145856 1D TAGGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2030 het 1095 hom 21 4 7 11 A 15 14 259034 CASAVA_Build 19 19203789 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1249 hom 21 5 13 5 A 11 10 259035 CASAVA_Build 19 19205147 1I AGGATGAGGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 8 9 259036 CASAVA_Build 19 19217595 1I CCTTGATTCA -/T TTTTTTTTTT 1151 het 1151 ref 27 18 3 6 T 11 12 259037 CASAVA_Build 19 19292421 1D AACGACTGGG T/- TTTTTTTTTT 1004 het 1004 ref 48 27 3 18 T 13 12 259038 CASAVA_Build 19 19299111 20D TTTCTACTTG TATTTATTTATTTATTTATT/-------------------- TATTTATTTA 1138 hom 7 het 4 0 3 1 TATT 10 5 259039 CASAVA_Build 19 19303311 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2093 het 450 hom 20 1 10 9 A 13 14 259040 CASAVA_Build 19 19304407 3I GCTAGTGGAC ---/AAG GCCTTCCACA 3070 hom 123 het 43 0 38 5 AAG 0 1 259041 CASAVA_Build 19 19308934 1I TGCCGCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 33 1 22 10 T 12 13 259042 CASAVA_Build 19 19322709 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2329 hom 4 het 12 0 8 4 A 15 14 259043 CASAVA_Build 19 19323300 1I CCAACATAGT -/G AGATCTGAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 259044 CASAVA_Build 19 19331920 1I CTCTACCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1301 hom 28 3 21 4 A 11 12 259045 CASAVA_Build 19 19334995 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 15 14 259046 CASAVA_Build 19 19343866 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 10 9 259047 CASAVA_Build 19 19350129 4I CAGCTAATTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TTTG 2 3 259048 CASAVA_Build 19 19372068 6D GCAGGACAGT GCCAGG/------ GCCACACAGA 3070 het 3070 hom 43 19 22 4 GCCAGG 1 0 259049 CASAVA_Build 19 19429550 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1154 het 1154 ref 27 19 4 4 A 15 14 259050 CASAVA_Build 19 19447300 1I AGCCCCCCCC -/T CCTCCACTGC 3070 hom 40 het 16 0 10 6 T 0 1 259051 CASAVA_Build 19 19545546 1I CCTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 10 259052 CASAVA_Build 19 19547103 3D TGCCAGCACC CAT/--- GAGCGAGGAC 2650 het 2650 ref 18 10 6 3 CAT 1 0 259053 CASAVA_Build 19 19547902 8D TCATTCATTC ATTTATGT/-------- ATTTAGGGGC 3070 het 3070 ref 27 16 10 3 ATTTATGT 1 0 259054 CASAVA_Build 19 19549997 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2119 het 2119 ref 30 12 5 14 A 17 16 259055 CASAVA_Build 19 19552043 3D GAATCGACAT GAA/--- GGAGAAAACA 3070 het 3070 ref 29 14 9 9 GAA 1 0 259056 CASAVA_Build 19 19555370 2I TGCAGTGAGC --/TG TGACTGCGCC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 TG 1 2 259057 CASAVA_Build 19 19574547 1I ATTAATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 T 10 11 259058 CASAVA_Build 19 19576386 1I37M1I CCCAAAATCT -AACCTGAACATTAGTCTTTCTTTATTTTTAATTTTTA-/AAACCTGAACATTAGTCTTTCTTTATTTTTTATTTTTAT TTTTTGAGAT 3070 hom 63 het 21 0 21 3 N/A 0 0 259059 CASAVA_Build 19 19584648 1D ATTTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1878 hom 26 7 13 7 T 12 11 259060 CASAVA_Build 19 19585124 2D AAAAAATACC AA/-- AATTAGCCGG 1625 het 980 hom 8 3 4 1 A 4 2 259061 CASAVA_Build 19 19591942 1D GCAGGGAGTG A/- AAAATGAAAG 2747 het 2747 ref 31 12 8 12 A 5 4 259062 CASAVA_Build 19 19611825 1D TGGGAAACGA G/- GGGATCAGGC 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 G 4 3 259063 CASAVA_Build 19 19649540 4I GCGTGTAGAT ----/AGAG AGGAGGAGGC 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 AG 1 3 259064 CASAVA_Build 19 19655396 1D GATGATCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2472 hom 30 9 14 7 T 13 12 259065 CASAVA_Build 19 19730711 2I TTGATGTGTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 55 het 22 0 18 4 T 9 11 259066 CASAVA_Build 19 19736687 3I TTTTCTTTCT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 21 0 17 4 TTC 0 1 259067 CASAVA_Build 19 19740657 16D CGTGAAGATG ACAGACGATGTTACAC/---------------- ACAGACGATG 3070 het 3070 ref 30 19 10 7 ACAGACGATGTTACAC 1 0 259068 CASAVA_Build 19 19744871 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 31 het 15 0 11 4 T 10 9 259069 CASAVA_Build 19 19755190 2D CATTATATTA GT/-- GTGTTATTAA 2398 het 2398 ref 19 11 6 2 GT 3 2 259070 CASAVA_Build 19 19758162 1I CGAGATTGTA -/C CCATTGCACT 3070 het 2882 hom 34 7 20 7 C 2 3 259071 CASAVA_Build 19 19758678 1I TCCATGCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 10 8 8 A 9 10 259072 CASAVA_Build 19 19764567 1I ATAATTTTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 259073 CASAVA_Build 19 19771682 1D AACAGTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 18 1 11 8 A 15 14 259074 CASAVA_Build 19 19773728 4D ACATTGTTAG GCCA/---- GCCAGGCGCA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 GCCA 2 1 259075 CASAVA_Build 19 19778502 1D TTATGCCACT A/- AATTTTTGGA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 3 2 259076 CASAVA_Build 19 19780410 1I ATCCCAGCAC -/T TTTGGGAGGC 2654 het 2103 hom 19 5 6 8 T 3 4 259077 CASAVA_Build 19 19781263 1D9M1I TTTACCTGAA GGGGAAGTTA-/-GGGAAGTTAT TTTTTTTTCT 3070 hom 98 het 37 0 31 9 N/A 0 0 259078 CASAVA_Build 19 19789242 1D ACGTAAATCT G/- ATTTTTTTTT 3070 het 150 hom 46 1 39 7 G 1 0 259079 CASAVA_Build 19 19804475 2I AAGAGATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 43 17 13 13 TA 7 8 259080 CASAVA_Build 19 19805741 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1470 het 1470 ref 14 4 6 4 T 15 14 259081 CASAVA_Build 19 19808027 4D TTAAAATTTT TTTA/---- TTTATTTTTT 2486 het 2429 hom 17 7 6 4 TTTA 2 1 259082 CASAVA_Build 19 19809382 1I ATTGAACACA -/T TTTGTACTAG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 3 4 259083 CASAVA_Build 19 19831039 1I TTAGCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 642 hom 34 4 20 10 A 12 13 259084 CASAVA_Build 19 19836491 4I TTTACAAGGT ----/TTTA TTTATTTATG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTTA 2 3 259085 CASAVA_Build 19 19844385 5D TATATATATA TATAT/----- TATTATATAT 1415 het 887 hom 9 3 4 2 TATAT 1 0 259086 CASAVA_Build 19 19849883 1I CTTCCGGAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 201 hom 31 1 21 9 A 9 10 259087 CASAVA_Build 19 19850125 1D CAGAGTTAGA G/- GATACATTAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 1 259088 CASAVA_Build 19 19851319 11I3M2I AACATTAAGT -----------TTG--/CATAGGCTAGGATGAT AGAAATGAGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 N/A 0 0 259089 CASAVA_Build 19 19854002 1D CCGTCTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1053 hom 25 3 18 4 A 14 13 259090 CASAVA_Build 19 19855703 1I TGTCTGTACT -/A AAAATACAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 4 5 259091 CASAVA_Build 19 19858980 1I GGAATATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 56 het 21 0 19 2 T 9 10 259092 CASAVA_Build 19 19864795 3I TCTCAATTCC ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 41 0 26 15 T 9 12 259093 CASAVA_Build 19 19871233 1D ATTAAAACTC A/- AATGTTGTAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 3 2 259094 CASAVA_Build 19 19871910 1D AAAAAAAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2300 hom 23 6 13 5 T 9 8 259095 CASAVA_Build 19 19876025 2I AAGGGAAAGA --/GT GTTTTTCTAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 GT 1 2 259096 CASAVA_Build 19 19877991 1I CTTTCTCTGC -/A ACCTTGCCAG 3070 het 3070 ref 33 18 7 8 A 1 2 259097 CASAVA_Build 19 19879359 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 41 2 18 21 T 15 14 259098 CASAVA_Build 19 19881888 2D CTGAGTAGAC AT/-- AGAGACATGA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 AT 1 0 259099 CASAVA_Build 19 19882033 1D GATTTGGGGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 9 8 259100 CASAVA_Build 19 19885842 2D CCCACAGACT TC/-- TCTACATTCT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 TC 2 1 259101 CASAVA_Build 19 19889146 1I ATACTTATTC -/T TTCAAGTTAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 2 3 259102 CASAVA_Build 19 19889230 1D TCTTAGTTAA T/- TTTTTTCCCA 1575 het 1575 ref 20 16 4 0 T 7 6 259103 CASAVA_Build 19 19889727 4D GTGACTTTCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 63 het 30 0 21 9 TTCC 5 4 259104 CASAVA_Build 19 19897549 1I ATCTAAATAA -/T TAATATACTT 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 T 1 2 259105 CASAVA_Build 19 19900341 3I TTAAATTGAT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 TTG 3 4 259106 CASAVA_Build 19 19909803 2D TAACTATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 12 10 259107 CASAVA_Build 19 19915282 1D ACTCTGCTAC A/- AAAATGGTTG 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 A 5 4 259108 CASAVA_Build 19 19926983 2I CCAGGAAGTT --/AA GTCTTTGAAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 2 259109 CASAVA_Build 19 19928365 3D AAGCTGGGCA AGG/--- AGAACTCGGG 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 AGG 1 0 259110 CASAVA_Build 19 19930871 1I CTTTCACTAA -/T TTTGCTACTG 3070 het 2204 hom 15 5 8 2 T 3 4 259111 CASAVA_Build 19 19931277 2D TCAGCTCCTA TC/-- TCTGTATGGC 3070 het 1816 hom 13 5 7 1 TC 2 1 259112 CASAVA_Build 19 19933712 1D CAGGGACCTC A/- TGCCCAAGAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 1 0 259113 CASAVA_Build 19 19935139 3D CAGTAGGGCC ACA/--- ACAACAACAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 ACA 5 4 259114 CASAVA_Build 19 19943403 1I TCACACCCTA -/C CCCACCAACA 3070 het 3070 ref 60 42 13 5 C 3 4 259115 CASAVA_Build 19 19957757 2I AAGGAAAGAT --/AC AGTCTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 AC 0 1 259116 CASAVA_Build 19 19958230 1I AAAGAGGGAC -/A AAAAAAAAAA 3019 het 3019 ref 31 12 7 12 A 11 12 259117 CASAVA_Build 19 19961492 4D ATTGAAAGAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 50 24 21 6 AAAC 4 3 259118 CASAVA_Build 19 19963190 1D CAAATTTAAT A/- TTTAACATGT 3070 het 3070 hom 52 23 27 2 A 1 0 259119 CASAVA_Build 19 19964738 3D ACCATACATT ATA/--- ATGCCTCTCA 2352 het 2352 ref 46 38 6 4 ATA 1 0 259120 CASAVA_Build 19 19967298 1I GGTCAACTTG -/T TTTTTGTGCT 3070 het 3070 ref 46 38 8 0 T 5 6 259121 CASAVA_Build 19 19971230 1D GCTTAAGAGA T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 6 5 259122 CASAVA_Build 19 19976648 2I CAATGCAAAA --/AC AGTGTACTTT 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AC 0 1 259123 CASAVA_Build 19 19992772 1D CTGAAATGAA T/- TAAGTTTTGG 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 T 2 1 259124 CASAVA_Build 19 19992871 3I GGCCACAGTG ---/GAA GAAGAATTGT 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 GAA 2 3 259125 CASAVA_Build 19 19993292 1I GACTCGTCTC -/A AAAAAGAAAG 3070 het 2689 hom 26 7 16 3 A 5 6 259126 CASAVA_Build 19 19995518 1D AGGCTGGGTA G/- GGTAGTTCAC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 G 3 2 259127 CASAVA_Build 19 19996617 1D ATGGCACTCC T/- TGCCTGGGCG 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 T 2 1 259128 CASAVA_Build 19 19997496 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 547 het 547 ref 27 14 3 10 A 13 14 259129 CASAVA_Build 19 20003669 1D GAGAATGGCT A/- AAAAAAGGGG 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 7 6 259130 CASAVA_Build 19 20006817 2D AGGTATGAGA AT/-- ATCGCTTGAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 AT 2 1 259131 CASAVA_Build 19 20007526 2I18M4D CTGTTATATT --CACTATTGTACAAAATACTGTT/CACACTATTGTACAAAATAC---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 27 16 12 4 N/A 0 0 259132 CASAVA_Build 19 20008204 3D ACCTGAGGTC AGG/--- AGTTCAGGAC 3070 het 2451 hom 25 6 16 4 AGG 1 0 259133 CASAVA_Build 19 20010423 2I TTCCTACATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 A 14 16 259134 CASAVA_Build 19 20014676 3I TACTCCACTT ---/AAC AATCATTAAT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 AAC 0 1 259135 CASAVA_Build 19 20016925 21D CTAGCATAAA GAGGCATTCAACCATAACGGT/--------------------- GATCAGGAGA 3070 het 3070 ref 36 20 20 6 GAGGCATTCAACCATAACGGT 1 0 259136 CASAVA_Build 19 20017400 1I ATTTTAGCAA -/C CTAGGGCCTT 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 C 1 2 259137 CASAVA_Build 19 20019008 32D24M1I CCGTCTCAAA AAAATAAAATAAAATAAAACAAATAATAAAATAAAATAAAAAGTATTTGGGTATTT-/--------------------------------AAAATAAAAAGTATTTGGGTATTTG TTTTTTTGGT 1822 het 997 hom 3 3 5 1 N/A 0 0 259138 CASAVA_Build 19 20022097 4D ATGCTGGGGG CTGT/---- CTAAGATTCC 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 CTGT 1 0 259139 CASAVA_Build 19 20022772 2I CCTACATCAC --/AG AGAGACAGAA 3070 het 3070 hom 46 20 15 11 AG 2 3 259140 CASAVA_Build 19 20023925 1I GATCAGGGAC -/T TGTGCGCATC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 1 2 259141 CASAVA_Build 19 20030256 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3039 het 3039 ref 25 14 8 3 A 13 12 259142 CASAVA_Build 19 20032217 1I CTACACTTTC -/A TTTTAACTCT 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 A 0 1 259143 CASAVA_Build 19 20033171 16D CATATATCAT ATATATATCATATATC/---------------- ATATATATAT 2527 het 2527 ref 12 6 6 1 ATATATATCATATATC 1 0 259144 CASAVA_Build 19 20034335 1D TGAAGGTAGG C/- TTTCACTCTG 3070 het 3070 hom 41 11 22 8 C 1 0 259145 CASAVA_Build 19 20035471 1D AGGCAGAGGA C/- CCTGCGGCCT 2434 het 239 hom 7 1 6 0 C 3 2 259146 CASAVA_Build 19 20044821 4D CATATATATA CACT/---- CACCAGACTA 2960 het 2960 ref 18 8 8 4 CACT 1 0 259147 CASAVA_Build 19 20051699 2I CTGCTCCTTC --/GG GGGAGACTGC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 G 3 5 259148 CASAVA_Build 19 20055879 5I CATATTTTCT -----/TTTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 TTTTC 0 1 259149 CASAVA_Build 19 20058982 1I GAGAGTAGCT -/G TGCACTTTGG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 0 1 259150 CASAVA_Build 19 20065696 1D TCAATCTTCA G/- TTGCTAAGCC 3070 het 3070 hom 21 10 10 2 G 1 0 259151 CASAVA_Build 19 20079952 1I ACAAATCTAG -/T TTTTAAATGC 2890 het 2890 ref 24 15 7 2 T 4 5 259152 CASAVA_Build 19 20081519 1D CCATTTCTGT A/- AAAAAAAAAA 2584 het 2584 ref 25 15 8 2 A 13 12 259153 CASAVA_Build 19 20083675 1I TTTATGCAGA -/T TTTTTTTTTT 2479 het 2479 ref 20 9 8 3 T 11 12 259154 CASAVA_Build 19 20093178 1D ATGCCCGGCT A/- ATTGTTTCAC 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 A 2 1 259155 CASAVA_Build 19 20094802 1D AACTGGTGGG A/- AAATCACTCA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 4 3 259156 CASAVA_Build 19 20096542 4I TATATGAAAT ----/AAAA TTTTAATTAA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 0 4 259157 CASAVA_Build 19 20098465 1I TTTTCCATTT -/C ACCTATTGAT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 C 0 1 259158 CASAVA_Build 19 20100318 1I AAATATTAGG -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 6 7 259159 CASAVA_Build 19 20103475 1D TTCTGGGTTC A/- AAGCGATTCT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 3 2 259160 CASAVA_Build 19 20104659 2I AGGCATAAAC --/AT GTACATTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 AT 0 1 259161 CASAVA_Build 19 20112424 5D TAAATCCCTT AAGAA/----- AAGAGAGAAT 3070 het 3070 ref 25 12 12 2 AAGAA 1 0 259162 CASAVA_Build 19 20113159 1I CAAGCATATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 9 10 259163 CASAVA_Build 19 20114924 1I AAGCTAAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 A 8 9 259164 CASAVA_Build 19 20118157 2I AAATGTAAAT --/GA GAGTTATTAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 GA 1 2 259165 CASAVA_Build 19 20123461 1I TGCCATCTTA -/G GGGCTGAAGG 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 G 3 4 259166 CASAVA_Build 19 20128527 1I CCTCCAGCCC -/T TAAGGTGGTT 2401 het 1127 hom 11 3 6 2 T 1 2 259167 CASAVA_Build 19 20129850 1I GAAGCCCCCT -/A AGACCATCAC 2779 het 1619 hom 13 6 7 0 A 1 2 259168 CASAVA_Build 19 20137207 1D AGAGACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2350 hom 25 8 13 5 A 12 11 259169 CASAVA_Build 19 20144121 1I TTTTGCCTAC -/T TTTTTTTTTT 2879 het 2879 ref 37 17 7 13 T 11 12 259170 CASAVA_Build 19 20145773 1I ACCTTTTGTC -/T TTTTTTCTGA 3070 het 2806 hom 23 8 12 3 T 6 7 259171 CASAVA_Build 19 20149912 1D TTTTTTTTGT A/- TTTTTAGTAG 1248 het 529 hom 9 2 5 2 A 1 0 259172 CASAVA_Build 19 20155509 4I TCTATTCATT ----/ATTA ATTATGTTTA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 ATTA 1 2 259173 CASAVA_Build 19 20155753 1I GATCTTTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 9 10 259174 CASAVA_Build 19 20163402 1D GACGGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 1678 het 1678 ref 14 8 4 2 C 4 3 259175 CASAVA_Build 19 20176388 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2485 het 1027 hom 14 3 6 5 A 15 14 259176 CASAVA_Build 19 20176781 2I ATATAGTAAT --/AA GAGTGGACTG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 0 2 259177 CASAVA_Build 19 20188221 1I TTTTCTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 10 11 259178 CASAVA_Build 19 20192171 8D AGTGGAGTAC AATCAGAG/-------- AAGAGATCCC 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 AATCAGAG 1 0 259179 CASAVA_Build 19 20193295 3I GTCCACAAGT ---/AGA AGAATTTCCA 3070 het 3070 ref 61 41 12 8 AGA 1 2 259180 CASAVA_Build 19 20194258 3D TGACAACTTC CAA/--- CAACACTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 CAA 2 1 259181 CASAVA_Build 19 20202574 7I AGGACAGAAA -------/ACCAAAC ACCACATGTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 ACCAAAC 0 1 259182 CASAVA_Build 19 20202833 1D ATTAATAAGT A/- AAAAAAAAAT 2325 het 1701 hom 12 4 6 2 A 10 9 259183 CASAVA_Build 19 20207590 1D CAGGCGCCTG C/- CACCATGCCC 3070 het 917 hom 12 2 9 1 C 2 1 259184 CASAVA_Build 19 20208806 4I TAATTGTACA ----/AATT AAGAAACTAC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 AATT 0 1 259185 CASAVA_Build 19 20224285 1I GAATTTGTAG -/T TGAAGAGGGG 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 1 2 259186 CASAVA_Build 19 20229727 4D CCAGACAAAC TCCA/---- TCTTGGCTCT 3070 het 3070 ref 31 14 16 1 TCCA 1 0 259187 CASAVA_Build 19 20232977 2I TAATCATAAC --/TG TTAATTTTCA 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 TG 0 1 259188 CASAVA_Build 19 20235967 1D ATCCCAGCTA C/- TCAGGAGGCT 1642 het 1642 ref 21 15 4 2 C 1 0 259189 CASAVA_Build 19 20243716 1I TTTTTAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2695 hom 31 8 13 10 T 11 12 259190 CASAVA_Build 19 20246258 4I ATTTTACTTT ----/GTAA GTTTTTATGC 3042 het 2332 hom 19 6 8 5 GTAA 0 1 259191 CASAVA_Build 19 20246711 1I CCAGGCCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 10 10 A 10 11 259192 CASAVA_Build 19 20246904 1D CAGAAAAAAA T/- CTCTTCAATA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 T 1 0 259193 CASAVA_Build 19 20249711 1I GCAAAGAATT -/A AAACAAGCAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 3 4 259194 CASAVA_Build 19 20255650 15D TGGGTACATG GCCCTACAGATGATC/--------------- GTTGCCCTGC 3070 het 3070 ref 43 25 17 6 GCCCTACAGATGATC 1 0 259195 CASAVA_Build 19 20258023 1D GGAAGGCCTC T/- TTGCAGTTGA 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 T 3 2 259196 CASAVA_Build 19 20271872 1I TTTATGTCTT -/A GTATTTAGTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 0 1 259197 CASAVA_Build 19 20278903 3I CAGAAAAAAA ---/AAT AATAATTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 AAT 2 3 259198 CASAVA_Build 19 20279268 1I ATTACAGTCC -/T GTGCCATCAT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 T 0 1 259199 CASAVA_Build 19 20282836 5I GACACTTAGA -----/TTGAT TTAATACCTT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 TTGAT 0 1 259200 CASAVA_Build 19 20290920 4D GTCTCTACCC CATA/---- CATAGATTGA 3070 het 3070 hom 40 17 17 8 CATA 2 1 259201 CASAVA_Build 19 20316735 2D AGATTAAAAC AT/-- ATGTTTTAAC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AT 2 1 259202 CASAVA_Build 19 20317246 1D TACAACTTCA T/- TTTTTTTTTT 2299 het 2299 ref 22 10 6 6 T 13 12 259203 CASAVA_Build 19 20321826 1D GTCTAAATGG A/- AAAAAAAAAA 826 het 826 ref 36 24 3 9 A 11 10 259204 CASAVA_Build 19 20322763 5D AACAATAATT AAAAG/----- AAAAGTTTTC 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AAAAG 2 1 259205 CASAVA_Build 19 20322921 3I GTCCACAAGT ---/AGA AGAATTTACA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AGA 1 2 259206 CASAVA_Build 19 20326057 1I GTTTATGGGG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 8 9 259207 CASAVA_Build 19 20333083 2I CAGAGGGGAA --/AG AGAGAGAGAA 3070 hom 120 het 44 0 39 5 AG 4 5 259208 CASAVA_Build 19 20336111 1D AATTGCCTTC A/- AAAAAAAAAA 1701 het 828 hom 27 8 7 12 A 19 18 259209 CASAVA_Build 19 20340175 10D TGTTGGAGCA AATAAAAATC/---------- AGGAAGGTTG 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 AATAAAAATC 1 0 259210 CASAVA_Build 19 20341939 1I TCTCATGGAG -/C CTCCCCCAAG 2814 het 2814 ref 21 10 7 4 C 1 2 259211 CASAVA_Build 19 20344264 1D GTTAACAGTG T/- TAACATGTAT 3070 het 3070 hom 48 23 21 4 T 2 1 259212 CASAVA_Build 19 20346749 1I CTCCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 1617 het 908 hom 13 4 6 3 A 15 16 259213 CASAVA_Build 19 20348540 22D GCAGTGAGCC GAGATGGCACCACTGCACTGCA/---------------------- GAGATGGCAC 3070 het 3070 ref 27 15 9 14 GAGATGGCACCACTGCACTGCA 2 1 259214 CASAVA_Build 19 20351448 2D TGTTAGCCAC AT/-- GTTTGTCATC 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 AT 1 0 259215 CASAVA_Build 19 20353739 1D CGATGCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2169 hom 31 13 13 5 T 15 14 259216 CASAVA_Build 19 20356420 1D TTGTGTCAGC T/- TTTTTTTTTT 2123 het 2123 ref 21 12 7 2 T 12 11 259217 CASAVA_Build 19 20357458 3D TGTCTTTATA TTG/--- TTGTGACTTC 3070 het 3070 ref 44 28 13 4 TTG 2 1 259218 CASAVA_Build 19 20366321 1I TTTCTGCTAC -/T TTTGTTATCC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 3 4 259219 CASAVA_Build 19 20383813 2D AATTTATAAC AG/-- AAATTTCTAA 3070 het 3070 hom 30 15 14 4 AG 1 0 259220 CASAVA_Build 19 20385305 1D CTTATGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1971 hom 14 7 7 0 T 13 12 259221 CASAVA_Build 19 20386658 1D AAGAGAAGCC T/- TTTTTTTTTT 2816 het 2816 ref 34 13 11 10 T 13 12 259222 CASAVA_Build 19 20411146 4I TGGGGTTTCT ----/CCCA CCAGACAATT 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 CCCA 0 1 259223 CASAVA_Build 19 20419629 4D TATCAAACTC AGAG/---- AGACATTAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AG 3 1 259224 CASAVA_Build 19 20420249 1D ACCTGGCTGC T/- TTTTTTTTTT 2587 hom 24 het 13 0 9 4 T 12 11 259225 CASAVA_Build 19 20422519 1I CTGGTTTTTT -/C CCCCTGCAGA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 4 5 259226 CASAVA_Build 19 20424867 1D TGCTGACAGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 9 8 259227 CASAVA_Build 19 20425278 3I AAAAAAAAAA ---/AAT AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 13 0 10 3 AAT 0 1 259228 CASAVA_Build 19 20427804 1I ATTTCAATGG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 8 9 259229 CASAVA_Build 19 20434236 1D TGTGGATGGC T/- TATTTTATTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 2 1 259230 CASAVA_Build 19 20436396 5I GCTTGCAAAA -----/TTCTC TTCTTATCTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TTCTC 0 1 259231 CASAVA_Build 19 20479145 1I GGAACCACAA -/T TAGATTTGGA 1396 het 1396 ref 25 19 3 3 T 1 2 259232 CASAVA_Build 19 20513777 6I TCCCATCTCT ------/ACTAAA ACTACAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 ACTAAA 0 1 259233 CASAVA_Build 19 20515962 2D CTTCAGAGTA AT/-- ATGTGTATAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 AT 2 1 259234 CASAVA_Build 19 20517851 1I AGTTTCTGGG -/A GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 0 1 259235 CASAVA_Build 19 20522359 1I TACAGAAATT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 7 8 259236 CASAVA_Build 19 20522616 1D GGCCAACACA C/- CATTTCTACT 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 C 2 1 259237 CASAVA_Build 19 20526611 1D AGCAATCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 11 10 259238 CASAVA_Build 19 20535071 1D TGTGGCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 35 1 27 7 A 11 10 259239 CASAVA_Build 19 20539488 2D ATCTAAGCTC AT/-- GTGCATTTTT 3070 hom 49 het 27 0 17 10 AT 1 0 259240 CASAVA_Build 19 20540064 2I CAGGCCAGAG --/CA CAGTCACTAC 2927 het 2057 hom 22 7 10 5 CA 1 2 259241 CASAVA_Build 19 20545903 4D ATTCCTATAC ATTA/---- GTTATTGAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 5 ATTA 1 0 259242 CASAVA_Build 19 20547141 19I GTCGAGTTAG -------------------/CTTAGATTGTGCGGTCTGA CTCCAGCCAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 CTTAGATTGTGCGGTCTGA 0 1 259243 CASAVA_Build 19 20547268 5D AGAAGTAAAT TTGCC/----- TTGCCTTGCC 3070 hom 100 het 37 0 33 6 TTGCC 3 2 259244 CASAVA_Build 19 20549844 1I TTTTTAAATT -/A CTTTTTTGTC 3070 het 509 hom 20 2 18 0 A 0 1 259245 CASAVA_Build 19 20551524 1I TCACACCCTA -/C CCCACCAACA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 3 4 259246 CASAVA_Build 19 20553459 1D AGATGAAACC A/- AATACATGTG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 3 2 259247 CASAVA_Build 19 20556789 1D ATTGCCTTGT A/- TACTACATCA 3070 hom 88 het 36 0 30 6 A 1 0 259248 CASAVA_Build 19 20559738 2D AAATAATATA TC/-- TCTCTCTATA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TC 4 3 259249 CASAVA_Build 19 20560395 1D GAATGGAAAA C/- GAATGTCAGG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 1 0 259250 CASAVA_Build 19 20560489 1I TTTTTATGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 9 10 259251 CASAVA_Build 19 20560586 1I GAAAAAAAAA -/T AGCGATATTT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 0 1 259252 CASAVA_Build 19 20563024 1I AAGTAAAAAT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 A 6 7 259253 CASAVA_Build 19 20564509 2D TCTTGTCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 8 A 16 14 259254 CASAVA_Build 19 20569716 1D CAACTTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3026 hom 19 8 8 3 A 13 12 259255 CASAVA_Build 19 20571191 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 17 1 11 5 A 15 14 259256 CASAVA_Build 19 20571825 1D TTTTAATTAC T/- TTTTTTGATA 2644 het 2644 ref 20 10 7 3 T 7 6 259257 CASAVA_Build 19 20575272 1D CCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 11 10 259258 CASAVA_Build 19 20582431 4I AGAAGACAAA ----/AACC CACATAGAGA 1305 het 1305 ref 33 25 3 5 AACC 0 1 259259 CASAVA_Build 19 20586627 1D CTCATCGATT C/- GGATGAAACT 3070 het 3070 ref 45 27 15 4 C 1 0 259260 CASAVA_Build 19 20587333 2I AACTATAGAC --/AG GGAAAAATTG 3070 hom 58 het 22 0 20 2 AG 0 1 259261 CASAVA_Build 19 20588593 3D GGAGAAGAGC GAA/--- GGAGAAGGTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 GAA 1 0 259262 CASAVA_Build 19 20591029 4D TAACTTTACT CTGA/---- CTGACTCTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CTGA 2 1 259263 CASAVA_Build 19 20592667 4I AAAACCCCAC ----/TCTG TCTGTGTTCA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TCTG 1 2 259264 CASAVA_Build 19 20592726 1I CAACTAAAAT -/A AAAAAATCCT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 6 7 259265 CASAVA_Build 19 20592879 7I TGGGATTTCA -------/TTGACAT TTAAGTGTCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTGACAT 0 1 259266 CASAVA_Build 19 20594099 1I33M1D TGAGAGGTGA -TTATTTCTTGCATGAATGAGATTCCCTTTTTTTC/TTTATTTCTTGCATGAATGAGATTCCCTTTTTTT- CCCTCTGCCA 3070 het 1430 hom 31 5 16 13 N/A 0 0 259267 CASAVA_Build 19 20595771 1I AAGCCACTGT -/C CCTGGCTTTT 944 hom 5 het 4 0 2 3 C 2 3 259268 CASAVA_Build 19 20597234 3I GTATTACATC ---/ATT ATTCACTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ATT 1 2 259269 CASAVA_Build 19 20598611 2I TATCAATTCT --/CA TAGTTAGAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CA 0 1 259270 CASAVA_Build 19 20599018 1I CTCCAGTATG -/A ATTCTCTCAT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 1 2 259271 CASAVA_Build 19 20600493 1I AAAAACTTAT -/A AATAAGTTGT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 2 3 259272 CASAVA_Build 19 20600753 1I CTAAAATTAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 81 het 28 0 28 2 A 6 7 259273 CASAVA_Build 19 20601973 3D ATGTAATGAT GAA/--- GAATTTTTGT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 GAA 2 1 259274 CASAVA_Build 19 20614992 1I TGACACTGGT -/C TTGGCACAAT 2936 het 2936 ref 17 11 6 0 C 0 1 259275 CASAVA_Build 19 20615238 2D AATTTTTATT AG/-- AAAAGTACAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 AG 1 0 259276 CASAVA_Build 19 20615305 1I TAGAGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 11 12 259277 CASAVA_Build 19 20615782 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1675 het 1098 hom 20 12 6 3 A 17 14 259278 CASAVA_Build 19 20618018 2I AAATAAACTC --/TT ATTATTTATA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 0 2 259279 CASAVA_Build 19 20619947 2I GATCTGATGC --/AA AAAGAGAACT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 3 5 259280 CASAVA_Build 19 20620251 3I CCAAATCACA ---/AAG CTTTAAGGAC 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 AAG 0 1 259281 CASAVA_Build 19 20621674 3I TTTCGTAGTT ---/TAC TTAGTAGAGA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TAC 0 1 259282 CASAVA_Build 19 20624467 1D TGATGTTGCT C/- CCCCCGCCCC 972 het 972 ref 31 15 5 11 C 6 5 259283 CASAVA_Build 19 20628308 6D AGAAAAAGAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAG 1918 het 1918 ref 30 11 14 9 AAAAAG 2 1 259284 CASAVA_Build 19 20629756 2D AGACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 8 11 A 14 12 259285 CASAVA_Build 19 20634367 1I TAGGAATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2964 hom 29 8 14 7 T 10 11 259286 CASAVA_Build 19 20634983 2I TGTCCACATC --/CG AGTTATTCAC 3070 het 3070 hom 20 8 8 4 CG 0 1 259287 CASAVA_Build 19 20636181 4I CCTTTAGGAG ----/AAGT AAGAACCAGA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AAGT 0 1 259288 CASAVA_Build 19 20637461 2I AGCCAATCGC --/AA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 8 10 259289 CASAVA_Build 19 20655806 1D TGTAAGGCTG T/- TTTTTGCTTC 3070 het 3070 ref 19 11 8 1 T 6 5 259290 CASAVA_Build 19 20663829 7I ATATCCACAA -------/TTTTTGG TTTTTGGTAT 3070 hom 30 het 20 0 11 9 TTTTTGG 1 2 259291 CASAVA_Build 19 20675553 3D AGTTGTAAAT GTA/--- GTCTCAATTT 3070 het 3070 ref 60 34 23 4 GTA 1 0 259292 CASAVA_Build 19 20681794 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 558 hom 29 3 16 10 A 14 13 259293 CASAVA_Build 19 20683275 27D CCATAGAGGT ATAAAATTTTCTGCCGTATGAAATATA/--------------------------- CCTAGAATGC 3070 het 3070 ref 27 18 13 2 ATAAAATTTTCTGCCGTATGAAATATA 1 0 259294 CASAVA_Build 19 20685066 1D TCTGCAGACT A/- AAAGAAGACA 3070 het 3070 ref 37 19 10 9 A 4 3 259295 CASAVA_Build 19 20692315 1D TCCCACACAC A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 8 7 259296 CASAVA_Build 19 20699615 2D TGAAAAAAAG CC/-- CCCCAAAAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 C 6 4 259297 CASAVA_Build 19 20701235 3D GCATTCCTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 2084 het 40 hom 30 1 12 17 T 21 18 259298 CASAVA_Build 19 20701446 1D ATAGAAATTA C/- CTTTTACCAA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 C 2 1 259299 CASAVA_Build 19 20705217 1D GGTTTTTGTC T/- ACAAATACTG 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 1 0 259300 CASAVA_Build 19 20705266 1D AAGATTTCAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 A 8 7 259301 CASAVA_Build 19 20705347 4I ACTTCCACAT ----/AGAG AGTGAGCAAA 3070 het 3070 hom 24 11 8 5 AG 1 3 259302 CASAVA_Build 19 20705380 3D TACTTTCAAT GAA/--- GAAAGCCAAA 3070 het 894 hom 20 3 8 9 GAA 2 1 259303 CASAVA_Build 19 20707608 2I CTACTTGAGA --/GG CTGAGGCAGG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 0 2 259304 CASAVA_Build 19 20707726 1D AAAACAAAAC A/- AAACAAAATG 1327 het 992 hom 44 8 7 29 A 4 3 259305 CASAVA_Build 19 20708577 1D ATATTAAAAG T/- TTATGTATGT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 T 3 2 259306 CASAVA_Build 19 20716844 3I CCAGAAAATT ---/CAC CAACTGAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CAC 0 1 259307 CASAVA_Build 19 20718390 6D TGGATCATAA TATAAT/------ TATATGTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TATAAT 1 0 259308 CASAVA_Build 19 20718883 1D CTACTCAAGG T/- TTTTTTTTTT 1463 het 1463 ref 33 15 5 13 T 17 16 259309 CASAVA_Build 19 20734816 1D GGTGTGGAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 8 15 6 T 9 8 259310 CASAVA_Build 19 20736243 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAAAA 3070 het 1079 hom 29 8 14 7 G 0 1 259311 CASAVA_Build 19 20740640 1I ACTGAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 2343 het 2343 ref 27 13 8 6 T 10 11 259312 CASAVA_Build 19 20740702 1I TAGCATAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2512 hom 14 6 7 1 A 9 10 259313 CASAVA_Build 19 20753533 4D TTTCAAAAAC TAAG/---- TGAGTAATTC 3070 hom 78 het 28 0 27 4 TAAG 1 0 259314 CASAVA_Build 19 20753858 1D AGATTTATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 10 9 259315 CASAVA_Build 19 20756160 1D TTATTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 12 14 T 12 11 259316 CASAVA_Build 19 20757468 2D GTAGGTTGTC TT/-- TTTCCTCTGT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 5 3 259317 CASAVA_Build 19 20760670 6D AGCCTCCCAG AGTCCT/------ AGTCCTGGGA 3070 hom 105 het 42 0 35 8 AGTCCT 2 1 259318 CASAVA_Build 19 20761316 3I TACATCTTTA ---/TCC TCCTATTAAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TCC 1 2 259319 CASAVA_Build 19 20765401 3D TCAGAAAGAG AAA/--- AAAAAAGGGC 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 A 9 6 259320 CASAVA_Build 19 20766200 1I AGAAATTCTG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 7 8 259321 CASAVA_Build 19 20772202 1I TATTAGTGTG -/T TTTTTCAGTG 2878 hom 27 het 12 0 9 3 T 5 6 259322 CASAVA_Build 19 20772697 1I AATTTTAGTT -/A ATGGCTTATC 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 A 1 2 259323 CASAVA_Build 19 20774151 2D TTGTTGGTAT TG/-- TGTTTTTTGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TG 2 1 259324 CASAVA_Build 19 20776440 1I CCCAGCTAGC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 72 het 28 0 23 5 T 7 8 259325 CASAVA_Build 19 20777958 1I TCTTTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 10 5 T 10 11 259326 CASAVA_Build 19 20782229 1D CAATCAATTC T/- TTTTTTTTTT 2746 het 2746 ref 29 14 7 8 T 15 14 259327 CASAVA_Build 19 20782613 2D AGTCAAAGAA AG/-- GGGTGACAGA 3070 het 2300 hom 19 6 8 5 AG 1 0 259328 CASAVA_Build 19 20790090 9D CATCTCTACT AAAAATACA/--------- AAAAATACAA 3070 hom 48 het 18 0 17 4 AAAAATACA 2 1 259329 CASAVA_Build 19 20792177 2I TAGGTTACTC --/AT GTGTTGCCTT 3070 hom 112 het 41 0 35 6 AT 0 1 259330 CASAVA_Build 19 20794273 1I AGTACATTGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 T 7 8 259331 CASAVA_Build 19 20799522 3I ATGTATACAT ---/TAA TATTTACATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAA 0 1 259332 CASAVA_Build 19 20799610 2I GTATATATAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 20 0 12 8 AT 5 6 259333 CASAVA_Build 19 20801159 4I TTCCTATGTA ----/TATT TATATGTAGA 3070 hom 81 het 37 0 27 10 TATT 0 1 259334 CASAVA_Build 19 20806047 1I GCCTGATTGG -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 7 8 259335 CASAVA_Build 19 20807390 2D TATTCAAAAC TA/-- TGTGAATATG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TA 1 0 259336 CASAVA_Build 19 20815792 14I GGGGAGTGCT --------------/GGACAGTGGGTGCA GGACAGTGGG 3070 hom 56 het 20 0 16 6 GGACAGTGGGTGCA 1 2 259337 CASAVA_Build 19 20829952 1I AAGTGATAGA -/C CACTAGCAAG 3070 hom 21 het 10 0 8 2 C 1 2 259338 CASAVA_Build 19 20833141 1I AGGAGAGAAA -/C TGCAGGGGTG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 0 1 259339 CASAVA_Build 19 20842981 4D TCACTGTCAC CACT/---- CACTCACTCA 3070 het 3070 hom 51 22 24 6 CACT 4 3 259340 CASAVA_Build 19 20845094 2I AACTTGTCCC --/CT GTCACCCACT 3070 het 3070 ref 66 37 24 5 CT 0 1 259341 CASAVA_Build 19 20848912 4I ACTTTCACTT ----/ACTC AATCATTACA 3070 het 3070 hom 56 24 30 2 ACTC 0 1 259342 CASAVA_Build 19 20866282 3I TCGTTCACCA ---/TAG TAGTAGAAAC 3070 het 3070 hom 75 28 30 17 TAG 2 3 259343 CASAVA_Build 19 20887286 1I CAATGAGAAC -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 71 32 26 13 T 7 8 259344 CASAVA_Build 19 20893764 4D TTCTCTGAAG TTAT/---- TTTTCTTTTA 3070 het 2205 hom 15 6 8 1 TTAT 1 0 259345 CASAVA_Build 19 20901231 1I TTGAGCCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 A 10 11 259346 CASAVA_Build 19 20903749 1D TAGCTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 1457 het 1457 ref 32 17 4 13 T 13 12 259347 CASAVA_Build 19 20907033 1D CTGAAAAGTA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 8 7 259348 CASAVA_Build 19 20915184 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 10 11 259349 CASAVA_Build 19 20916467 1I AATTTTACTG -/T TCTTTTCTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 2 259350 CASAVA_Build 19 20920690 3I TGCCTCAAAC ---/ATT GTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 39 0 27 12 ATT 0 1 259351 CASAVA_Build 19 20925124 4D GCAAAGTCTT TAAA/---- TGGTTGTCAC 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 TAAA 1 0 259352 CASAVA_Build 19 20926689 5I TTTTTTTTTC -----/TTTTA TTTATTTATT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TTTTA 0 1 259353 CASAVA_Build 19 20933121 1I GTTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 11 259354 CASAVA_Build 19 20937275 1I CAACATCCAT -/G GGCTTTGCAA 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 G 2 3 259355 CASAVA_Build 19 20938321 1D ATCAGTGCCA T/- TTTTATAGAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 5 4 259356 CASAVA_Build 19 20941387 5D TTTTATTTTA TTTTG/----- TTTTATTTAT 2417 het 2417 ref 17 7 7 5 TTTTG 1 0 259357 CASAVA_Build 19 20943410 27D GGGACCTTAT GCACAAAAGATTGTGACATATTTCTGG/--------------------------- GCACAGTACA 3070 het 3070 ref 37 22 18 4 GCACAAAAGATTGTGACATATTTCTGG 1 0 259358 CASAVA_Build 19 20952630 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTTTTGCTC 3070 hom 14 het 26 1 23 2 AG 1 2 259359 CASAVA_Build 19 20954250 4I CTGACGAGAA ----/CTTT CTATTATTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CTTT 0 1 259360 CASAVA_Build 19 20962940 1I GCTGCAGGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 9 10 259361 CASAVA_Build 19 20977510 1I TGACTGGGAA -/G TGAGGTGATT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 G 0 1 259362 CASAVA_Build 19 20985778 4D AAAAAATAAT AATA/---- AATAAAAATA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AATA 2 1 259363 CASAVA_Build 19 20991505 2I TCTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 10 12 259364 CASAVA_Build 19 20991666 1I ACGCCCGGCT -/C AATTTTGTAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 0 1 259365 CASAVA_Build 19 21005516 1D CCCCGTCTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 42 het 44 2 40 2 T 8 7 259366 CASAVA_Build 19 21016368 3I GTTTTTGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 87 het 39 0 26 13 TTG 4 5 259367 CASAVA_Build 19 21017708 1I CTCCGATTCT -/G TAGGTTGTCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 0 1 259368 CASAVA_Build 19 21018165 1D TTGGTTACTA T/- AGCCTTGTGG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 0 259369 CASAVA_Build 19 21018632 1D GCTGAAGAAG C/- TTTTGGGCTG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 C 1 0 259370 CASAVA_Build 19 21024642 40I TCGATCTCAG ----------------------------------------/CTCACTGTAAGCTCTGCCTCCCATTCACACCATTCTTCTA CCTCAGCCTC 2925 hom 18 het 6 0 6 3 CTCACTGTAAGCTCTGCCTCCCATTCACACCATTCTTCTA 0 1 259371 CASAVA_Build 19 21024838 3I CCCCCCTATA ---/TTC TTCTTCTAAG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TTC 2 3 259372 CASAVA_Build 19 21025249 2D ATATTATTTT TG/-- TGTGGAAGAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 TG 3 2 259373 CASAVA_Build 19 21039695 1D TTTCTTTTTT G/- TTGTAGTCAT 3070 hom 66 het 25 0 23 4 G 1 0 259374 CASAVA_Build 19 21040248 1I ATATCTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 11 12 259375 CASAVA_Build 19 21042579 1I AATTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 464 hom 19 1 14 4 A 11 12 259376 CASAVA_Build 19 21046338 1D CCATCTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 36 3 32 4 A 13 12 259377 CASAVA_Build 19 21047330 1I16M2I GTGCTGCCCA -TCATCCTCATGGAAAC--/CTCATCCTCATGGAAACTG TGAAGCTGGG 3070 hom 42 het 16 0 15 4 N/A 0 0 259378 CASAVA_Build 19 21049157 1D CTAAAAGTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 8 7 259379 CASAVA_Build 19 21049756 1D TATTTTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 26 6 T 11 10 259380 CASAVA_Build 19 21054921 8D GGCTAATTAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1351 hom 21 het 14 0 7 7 T 24 16 259381 CASAVA_Build 19 21057341 11I TTTATGAATG -----------/GGAAGAGCTTT GGTCCGTGGG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 GGAAGAGCTTT 0 1 259382 CASAVA_Build 19 21060016 4D TGTTCCCATA TGAC/---- TAATTGTTTA 1291 het 1291 ref 49 43 3 6 TGAC 1 0 259383 CASAVA_Build 19 21060528 1I AGGTTTATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 29 2 19 8 A 14 15 259384 CASAVA_Build 19 21070117 1I CCATCTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 10 11 259385 CASAVA_Build 19 21070945 3I CTAGTAGGTA ---/AGC AGCAGGTGGT 3070 hom 97 het 38 0 33 5 AGC 1 2 259386 CASAVA_Build 19 21074108 5D TTACAAGTGT GAGCC/----- ACCGTGCCCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 GAGCC 1 0 259387 CASAVA_Build 19 21078890 5I TTTCTGTGAT -----/ATTTC ATTGGATGTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 ATTTC 0 1 259388 CASAVA_Build 19 21083746 1D TGGAATATAG T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 89 het 35 0 29 6 T 8 7 259389 CASAVA_Build 19 21084442 1I CCCCATATGT -/C CATGTGTTCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 1 2 259390 CASAVA_Build 19 21088159 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 18 1 9 8 T 12 11 259391 CASAVA_Build 19 21091615 3I AAAAAAGGTT ---/ATA ATGAACTAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATA 0 1 259392 CASAVA_Build 19 21095187 3I AAAATTTAGT ---/ATA TTATCATACT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATA 0 1 259393 CASAVA_Build 19 21095411 1I TCTCTAGTAA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 8 9 259394 CASAVA_Build 19 21099583 2D AATTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 15 0 14 1 T 18 16 259395 CASAVA_Build 19 21100961 4I TTTGTAGTGT ----/AGGA ATTTCAAAGT 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 AGGA 0 1 259396 CASAVA_Build 19 21102052 1D AATTTTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 11 10 259397 CASAVA_Build 19 21103744 7I ATTTCTGTAA -------/GCCTGCT GCCTGCTTCC 3070 hom 103 het 47 0 34 13 GCCTGCT 1 2 259398 CASAVA_Build 19 21105368 1D6M2D AGACTATAGC ATAGCCTGC/-TGGTCT-- CTTTGCTGGT 3070 het 3070 ref 31 16 11 8 N/A 0 0 259399 CASAVA_Build 19 21106686 3D AGGAGCTGCA AAG/--- AAGAAGGTCG 3070 het 3070 hom 55 22 28 7 AAG 3 2 259400 CASAVA_Build 19 21107004 4I GCAAAACAAT ----/TTGG TTGATAAGGC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TTGG 0 1 259401 CASAVA_Build 19 21114687 1I CACAAATCTG -/A AAGGAATCTG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 2 3 259402 CASAVA_Build 19 21122249 2D AGTCACAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 34 0 22 13 A 14 12 259403 CASAVA_Build 19 21124224 1I AATTTCTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 259404 CASAVA_Build 19 21126415 1D GACAAATTTA T/- TAGCTCAAAG 3070 het 3070 ref 55 39 15 2 T 2 1 259405 CASAVA_Build 19 21131337 4D TAACTTAATC TTGT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 34 1 15 18 TTGT 1 0 259406 CASAVA_Build 19 21131766 5D GGCAGTTAGG TTTGT/----- TTTGTTTTAT 3070 hom 103 het 38 0 33 7 TTTGT 2 1 259407 CASAVA_Build 19 21134014 3D ACTATTCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TTG 7 6 259408 CASAVA_Build 19 21146782 2I TGTTGTAAAA --/AC ACATAACAGG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 AC 1 2 259409 CASAVA_Build 19 21159403 1I TTACTCAACA -/C CAGAGAGTTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 1 2 259410 CASAVA_Build 19 21162959 4D TAATTAAATT AGTC/---- AGCTTTGTTT 3070 hom 86 het 32 0 27 6 AGTC 1 0 259411 CASAVA_Build 19 21168632 12D ACAATTCTAT TTAACATAGTTC/------------ TGGAAGTGCT 3070 hom 102 het 35 0 35 1 TTAACATAGTTC 1 0 259412 CASAVA_Build 19 21174820 3D1M2I21M9I CACATGTGCA TGGC--AAACCTTCCTCTGGGCATAGA---------/---CAAAAACTTTCCTCTGGGCATAGACATTTGCAG TATTTGCTGT 3070 het 3070 ref 71 52 22 16 N/A 0 0 259413 CASAVA_Build 19 21176898 1I ACAGGCAGCA -/G GGTAGCTGGG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 G 2 3 259414 CASAVA_Build 19 21182023 3I TTCTGGAAAA ---/ATG ATAATTTTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 ATG 0 1 259415 CASAVA_Build 19 21184532 1I ATTCTCCATA -/C ATTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 259416 CASAVA_Build 19 21186606 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTTTAG 757 het 565 hom 7 4 3 0 T 9 8 259417 CASAVA_Build 19 21188582 1I ACAAATCAAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 9 259418 CASAVA_Build 19 21190031 7D ATTTTGCACC TAATTTT/------- TAAAATAGTA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 TAATTTT 1 0 259419 CASAVA_Build 19 21190612 1D CCATCTCACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 38 het 14 0 13 1 A 10 9 259420 CASAVA_Build 19 21195227 6D AAGAAATGAT CACAAA/------ CTTTCACAAG 3070 hom 72 het 27 0 24 6 CACAAA 1 0 259421 CASAVA_Build 19 21207167 1I CTTATCAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 25 0 16 9 C 0 1 259422 CASAVA_Build 19 21207625 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1308 hom 13 3 9 1 A 10 9 259423 CASAVA_Build 19 21210873 15D TTCTCCTCCA CCTACTGCTTTGCCG/--------------- CTAGAGTGGC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 CCTACTGCTTTGCCG 1 0 259424 CASAVA_Build 19 21213427 3I ACACAAAAAT ---/AAC AATGAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AAC 0 1 259425 CASAVA_Build 19 21217689 3I TGAAAATATA ---/AGG AGTTGTTTGC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AGG 0 1 259426 CASAVA_Build 19 21223259 1D AATTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 32 1 19 12 T 13 12 259427 CASAVA_Build 19 21238772 7D TCTCCCCCCA CTCCACC/------- CCCATGAAAT 2304 het 2304 ref 38 32 5 4 CTCCACC 1 0 259428 CASAVA_Build 19 21245459 1D ATAAAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 13 12 259429 CASAVA_Build 19 21251634 1I CAGGCTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 786 hom 24 4 12 8 T 13 14 259430 CASAVA_Build 19 21254366 2D ACTCTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 A 18 16 259431 CASAVA_Build 19 21255162 1D AATTTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 28 1 12 15 T 17 16 259432 CASAVA_Build 19 21256319 4I ATCTAGAAAG ----/TATT TATTAATTCA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TATT 1 2 259433 CASAVA_Build 19 21257551 1D AATAATCCCA T/- TACCTAAGTG 3070 hom 144 het 53 0 48 6 T 2 1 259434 CASAVA_Build 19 21257867 2I AGTTTAATTC --/TA TGTCTTTGCT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 TA 0 1 259435 CASAVA_Build 19 21263136 1I AAAGCAAAGG -/A AAAAATAGAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 5 6 259436 CASAVA_Build 19 21263468 2I AAAAAGAAAT --/AA GTGTTGATAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 2 259437 CASAVA_Build 19 21264240 2D TTTCAAATAT TG/-- TGTCTTCATC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TG 2 1 259438 CASAVA_Build 19 21264923 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 84 het 30 0 29 5 A 9 8 259439 CASAVA_Build 19 21265860 3I TAAAATAACG ---/TAC TACTAATTTT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TAC 1 2 259440 CASAVA_Build 19 21276492 1D GATAAAAAAA T/- ATTTCTAACC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 0 259441 CASAVA_Build 19 21286026 1D TTATTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 11 10 259442 CASAVA_Build 19 21286936 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 22 0 18 5 A 12 11 259443 CASAVA_Build 19 21291760 1I CTACAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 19 2 9 8 A 13 14 259444 CASAVA_Build 19 21298726 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2422 het 265 hom 12 1 9 2 A 11 12 259445 CASAVA_Build 19 21308075 1D CTCCACCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 488 hom 25 2 15 8 A 15 14 259446 CASAVA_Build 19 21311457 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1004 het 1004 ref 16 10 3 3 T 13 12 259447 CASAVA_Build 19 21319538 5I CTCACAGCCT -----/TCAGA GCTGAGAGCC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 TCAGA 0 1 259448 CASAVA_Build 19 21321113 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 8 A 10 9 259449 CASAVA_Build 19 21322890 5I TTTTATATTC -----/TATTT TGTCTCTATT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 TATTT 0 1 259450 CASAVA_Build 19 21324596 1I TTTCTTAAAC -/A AAAAAAATGC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 259451 CASAVA_Build 19 21325086 3D AAGTTTCATT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TTG 4 3 259452 CASAVA_Build 19 21330389 1D TCCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 11 10 259453 CASAVA_Build 19 21330696 1D CTTCTGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 31 0 19 12 T 15 14 259454 CASAVA_Build 19 21331394 1D CCCTAGATCT G/- GCTGGCCTTA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 G 2 1 259455 CASAVA_Build 19 21334917 1I AGGGAACTGA -/T TTTTCTGCTG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 4 5 259456 CASAVA_Build 19 21335479 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 23 1 15 7 T 10 11 259457 CASAVA_Build 19 21338513 2I ACTGGGTGAC --/AG AGTGAGACTC 582 het 37 hom 11 1 2 8 AG 1 2 259458 CASAVA_Build 19 21340599 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 12 14 259459 CASAVA_Build 19 21346411 3I GGACTGAAGA ---/GTT GTTATTATTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 GTT 1 2 259460 CASAVA_Build 19 21349856 2I CTTGTAAATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 76 het 34 0 26 8 TG 8 9 259461 CASAVA_Build 19 21353703 1D ATTTTTTATA T/- TTTTTTACCT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 7 6 259462 CASAVA_Build 19 21368431 4D GCAAGTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 110 het 49 0 37 14 TTTG 5 4 259463 CASAVA_Build 19 21378155 4I TCTGCAGTTC ----/TTAG TTCTTTTTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TTAG 0 1 259464 CASAVA_Build 19 21380865 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 308 hom 35 1 33 1 A 10 9 259465 CASAVA_Build 19 21383524 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 465 het 465 ref 21 7 2 12 T 19 16 259466 CASAVA_Build 19 21385124 1D ATTTCAAATG C/- TCTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 49 35 9 5 C 1 0 259467 CASAVA_Build 19 21388659 4D GTGTTTAATA TTCC/---- ACACAGAGAA 3070 hom 33 het 12 0 12 2 TTCC 1 0 259468 CASAVA_Build 19 21395176 1I ATTTTTGAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 9 10 259469 CASAVA_Build 19 21407366 4I GGTCTCCCAT ----/GTTA GTTCCTCTGT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 GTTA 0 1 259470 CASAVA_Build 19 21421732 3D CTGTTCACTC TGA/--- TGAGTTTCTT 3070 hom 57 het 21 0 20 3 TGA 2 1 259471 CASAVA_Build 19 21427295 4I CATATATTGC ----/ATAA ATAGATACTC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 ATAA 0 1 259472 CASAVA_Build 19 21428732 2I ATACTCAGCA --/CT CTGATTTAGA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 CT 1 2 259473 CASAVA_Build 19 21429938 1I CAGGAGTTTG -/A GACCAGCCTG 3070 hom 55 het 29 0 24 5 A 0 1 259474 CASAVA_Build 19 21446593 1D CCAGCTACTT G/- GGAGGCGGAG 3070 hom 83 het 31 0 27 4 G 3 2 259475 CASAVA_Build 19 21447191 1D GGTCTTTCAC T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 24 het 11 0 8 3 T 7 6 259476 CASAVA_Build 19 21455659 4I CTCTCTCTTC ----/TTCT TTATTAGTCT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TTCT 0 1 259477 CASAVA_Build 19 21469784 4D GTGATAATGA CACT/---- CATACTGACA 3070 hom 138 het 51 0 47 6 CACT 1 0 259478 CASAVA_Build 19 21474851 1D AGAAAATATG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 8 259479 CASAVA_Build 19 21483342 1D TTTCTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 12 11 259480 CASAVA_Build 19 21493041 3D GGAGAGATTC TGG/--- TGGTGTGTTG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 TGG 2 1 259481 CASAVA_Build 19 21506889 1D AATTTCAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 42 0 32 10 T 10 9 259482 CASAVA_Build 19 21509435 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 283 hom 21 1 12 8 T 13 12 259483 CASAVA_Build 19 21510770 6D TATGTCTTTG TTATAT/------ TTATATGTTT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 TTATAT 2 1 259484 CASAVA_Build 19 21515956 4D AAGTAAATTT ATTA/---- ATTGAGTCAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 ATTA 1 0 259485 CASAVA_Build 19 21517543 1D TGAAGTTATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 26 6 T 11 10 259486 CASAVA_Build 19 21519587 3D TTTCTACAAA TAT/--- TATTCTGGAC 3070 hom 72 het 27 0 25 3 TAT 2 1 259487 CASAVA_Build 19 21521994 2I TGCAATAAAC --/AT ATGTGTGCAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 1 2 259488 CASAVA_Build 19 21524198 1I TAAATAGCTC -/T TATTATTTTG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 1 2 259489 CASAVA_Build 19 21524305 2D GAGATAATCA TG/-- TGTTTTTTGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TG 2 1 259490 CASAVA_Build 19 21525123 4D TATAGTTCTT TTAA/---- TTGTGATGTT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 TTAA 1 0 259491 CASAVA_Build 19 21525303 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2824 hom 22 het 15 0 8 7 T 15 14 259492 CASAVA_Build 19 21526644 1I CCGGCACCTC -/G GGGGGGCTGA 2060 het 54 hom 10 1 8 1 G 6 7 259493 CASAVA_Build 19 21527564 2D AAAATTAATA TT/-- GTTATGCGTG 3070 hom 48 het 18 0 17 2 T 2 0 259494 CASAVA_Build 19 21529354 3D GATCATTTGA AGG/--- AGAAGAGGCA 3070 hom 117 het 42 0 40 3 AGG 1 0 259495 CASAVA_Build 19 21533575 2D CTTCCTGAGG AT/-- ATATTGTAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AT 3 2 259496 CASAVA_Build 19 21536950 5I AGAAAACATG -----/GACAC AGGCCAGGTG 2642 het 2642 ref 28 19 6 3 GACAC 0 1 259497 CASAVA_Build 19 21538255 1D AGCAGAGCCT C/- CCATTCCCAG 1106 het 1106 ref 46 38 3 5 C 3 2 259498 CASAVA_Build 19 21539398 1D CCTCCCTATG A/- AAGAAAGCCC 2218 het 2218 ref 45 33 6 7 A 3 2 259499 CASAVA_Build 19 21540699 1I GATATTAATA -/T TTTTTTGAAA 2711 het 2711 ref 55 36 7 12 T 6 7 259500 CASAVA_Build 19 21541478 3I TCCCCCCGCC ---/AAA AAAAAAAAAC 1683 het 1683 ref 43 18 7 18 A 9 12 259501 CASAVA_Build 19 21541514 2I TCTGGTAAGA --/TC TCTCTGCCTA 3070 hom 111 het 49 0 37 12 TC 2 3 259502 CASAVA_Build 19 21541662 7I TTTGTAAAAA -------/AATAATT AAAATACAGT 3070 het 3070 ref 51 30 14 7 AATAATT 0 1 259503 CASAVA_Build 19 21541904 1D CAAACATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 52 1 32 19 T 12 11 259504 CASAVA_Build 19 21544180 1D AAATGAAAAG A/- ATATAATAAT 3070 het 3070 ref 55 27 25 3 A 2 1 259505 CASAVA_Build 19 21544617 4D24M2I ATGTATAATT ATGAATGAGATATATATTTATATATAAC--/----ATGAGATATATATTTGTATATAACAT ATAATTATGT 3070 het 3070 ref 39 24 18 2 N/A 0 0 259506 CASAVA_Build 19 21545493 1D AGTGGTCATA G/- AAAGAGCAGA 3070 het 3070 hom 76 35 38 4 G 1 0 259507 CASAVA_Build 19 21549557 5D AGAATAAATA GAATG/----- TTTCCCTTCT 1751 het 1751 ref 33 28 5 3 GAATG 1 0 259508 CASAVA_Build 19 21549787 3I TGTGTGCTTC ---/AGT AGTTTGTTTC 3070 het 3070 ref 50 33 12 5 AGT 1 2 259509 CASAVA_Build 19 21550182 5I11M4I CAATACTTAC -----AATTTCTCCTT----/ATTATAACTTTTCCTTTAAA TAGTCATAAG 1834 het 1834 ref 35 29 4 5 N/A 0 0 259510 CASAVA_Build 19 21550775 1I7M1D TCTTTCCTTT -TTTCTTAT/ATTTCTCA- TATATTTTGT 2767 het 2767 ref 31 17 14 7 N/A 0 0 259511 CASAVA_Build 19 21551170 2D TTAATATACA CT/-- CACATATAAA 701 het 701 ref 39 29 2 10 CT 1 0 259512 CASAVA_Build 19 21554517 1I AAGTTTCTGG -/A TTAGATAAAT 3070 het 3070 ref 57 30 18 10 A 0 1 259513 CASAVA_Build 19 21555185 1D CAAAATCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 576 hom 28 2 19 7 T 13 12 259514 CASAVA_Build 19 21559828 1I CTCCATCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 52 3 27 22 A 14 15 259515 CASAVA_Build 19 21560035 1I CAGATGTGGG -/T AACCCCACCT 3070 het 3070 ref 70 37 31 2 T 0 1 259516 CASAVA_Build 19 21560124 2I GACTTAGCCA --/AG CTTTTCACTA 3070 het 3070 ref 66 46 15 5 AG 0 1 259517 CASAVA_Build 19 21578882 3D CGATAAAGAA TTT/--- TTTTAAAAAA 2542 het 2542 ref 47 38 6 4 T 7 4 259518 CASAVA_Build 19 21579241 1D AAGTGAAAGT A/- AAAATCAGCC 324 het 324 ref 32 27 1 4 A 5 4 259519 CASAVA_Build 19 21579759 1I TGAGGCTGCT -/C GAAAATCAGT 3070 het 3070 ref 59 48 8 3 C 0 1 259520 CASAVA_Build 19 21580482 1I CCATGGTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2572 hom 20 8 10 2 A 11 12 259521 CASAVA_Build 19 21582990 1D28M9D AAGGGGAACC AAAAAAGGAAGAACACTAAAGGCTAAAAAAATAAAAAT/-AAAAAGCAAGAACACTAAGGGCTAAAAA--------- AAAAAAGCAG 1937 het 1937 ref 34 45 5 3 N/A 0 0 259522 CASAVA_Build 19 21584895 2I4M3D CAGAGGAAGG --TTTGCCA/TTTTTG--- TGCCCATGTG 2115 het 2115 ref 67 61 5 7 N/A 0 0 259523 CASAVA_Build 19 21585834 29I AACTCTATGG -----------------------------/AGAAATGCCCAGACTGACTCCTACTTATC AGATCCAAAC 3070 het 3070 ref 38 20 9 9 AGAAATGCCCAGACTGACTCCTACTTATC 0 1 259524 CASAVA_Build 19 21586560 1D TCTCAACCTT A/- AAAAAAAAAA 2271 het 2271 ref 31 12 6 15 A 13 12 259525 CASAVA_Build 19 21586923 1D AAAAATTAAC T/- GCCTGTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 22 2 T 1 0 259526 CASAVA_Build 19 21590143 16I TGCCAAATCC ----------------/CCCTCTCCGACAAACA CCCAAGAATG 3070 het 1848 hom 24 6 9 9 CCCTCTCCGACAAACA 0 1 259527 CASAVA_Build 19 21594630 1I TCTGTGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 A 11 12 259528 CASAVA_Build 19 21598011 2D GTAACTCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 34 0 26 9 A 16 14 259529 CASAVA_Build 19 21604510 7D GGAGCAAGGA CCCCCCC/------- CCCCCCGGCA 2233 het 870 hom 19 7 8 6 C 13 6 259530 CASAVA_Build 19 21605474 1D TCTTATCCAT G/- ACCCTATAAC 3070 het 3070 ref 34 22 7 5 G 1 0 259531 CASAVA_Build 19 21605942 2D TGAGAAAAAA AT/-- AAAAAAGGGT 2920 het 2920 ref 30 17 11 4 AT 1 0 259532 CASAVA_Build 19 21606852 1D CCGACTCCTT C/- CCCAACTAAT 2405 het 2405 ref 25 12 7 6 C 4 3 259533 CASAVA_Build 19 21608497 12I CTAAAAGCCC ------------/AAGGCCTGGTAA AACCATGCAA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 AAGGCCTGGTAA 0 1 259534 CASAVA_Build 19 21609255 1I CTAATTAGGC -/A AAAAACAGGA 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 A 5 6 259535 CASAVA_Build 19 21609785 1I ACCCACATCT -/G CGTAAATGTC 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 G 0 1 259536 CASAVA_Build 19 21610115 1D TGTTCAAATC A/- TGATTAAATA 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 A 1 0 259537 CASAVA_Build 19 21610575 2D CTCCATCTTT AA/-- AAAAAAAAAT 1707 het 1707 ref 24 17 4 6 A 11 9 259538 CASAVA_Build 19 21611053 1I GAGCTCACAT -/A CATCTCCCAT 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 A 0 1 259539 CASAVA_Build 19 21611846 1D TGATCATTTC A/- ATTATGAACT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 2 1 259540 CASAVA_Build 19 21613435 4I TAGAAATTTC ----/ATTA ATTAGTATTT 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 ATTA 1 2 259541 CASAVA_Build 19 21614313 4D ATAATATGAC ACTT/---- TAACAATATT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 ACTT 1 0 259542 CASAVA_Build 19 21617046 4I TTGAATATAG ----/ATTC ATTAATGGAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 ATTC 0 1 259543 CASAVA_Build 19 21617228 1D GAGGTGATTT C/- ATTTTTTTCA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 1 0 259544 CASAVA_Build 19 21617620 13I TTGTGTATCT -------------/TTTTTGATAAAAA TTTAGTTCAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TTTTTGATAAAAA 0 1 259545 CASAVA_Build 19 21618026 1I GCAAATATTT -/C CCCCCATTTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 5 6 259546 CASAVA_Build 19 21618115 2I AATCTTTCTG --/TT TTTTTTTGTT 3070 hom 51 het 28 0 26 3 T 7 9 259547 CASAVA_Build 19 21618584 2I CTGTAATAAC --/TG TGCTATTTAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TG 1 2 259548 CASAVA_Build 19 21619787 1D TTTATATCAT G/- GGGGGCAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 6 5 259549 CASAVA_Build 19 21619899 1D GCTTTTTCTC T/- TTTTTGTGAT 3070 hom 54 het 21 0 19 4 T 6 5 259550 CASAVA_Build 19 21620129 1D CTTCATCGAC T/- TCCCAAAGTT 3070 hom 68 het 26 0 21 6 T 2 1 259551 CASAVA_Build 19 21620394 2I TGTCTGTTTT --/TA TACCAGTGCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TA 1 2 259552 CASAVA_Build 19 21620579 4I TCTTTCTTTT ----/TTTC TTTTTGACAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TTTC 0 1 259553 CASAVA_Build 19 21621669 4I TAGCTAGTGG ----/TCTA TCTATTTTAT 3070 hom 65 het 27 0 21 8 TCTA 1 2 259554 CASAVA_Build 19 21622832 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTCTGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 6 7 259555 CASAVA_Build 19 21623142 3D TGGTAGTGGT TTC/--- TTCTTTTCAT 3070 hom 66 het 24 0 22 7 TTC 2 1 259556 CASAVA_Build 19 21623663 1I TTCTCAGAGA -/T TTTTTTCATT 3070 het 358 hom 26 1 21 10 T 6 7 259557 CASAVA_Build 19 21624429 1I7M4D ATGCCTGTTG -GGGGGGTGGTC/TGGGGGGT---- CTCACTCAGT 3070 het 912 hom 15 4 11 0 N/A 0 0 259558 CASAVA_Build 19 21624562 2D CAGATTTTTC AG/-- AGCCAGCAGG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AG 2 1 259559 CASAVA_Build 19 21624786 8I14M2I GAAGAACAGA --------TTACATAAAACATC--/AAACATCTTTACATAAAACATCTT TTAAAGTTAA 3070 het 871 hom 21 4 13 6 N/A 0 0 259560 CASAVA_Build 19 21625666 2I TTTAAGACAG --/TC TCTAGCAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TC 1 2 259561 CASAVA_Build 19 21625975 1D AAATATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 5 T 11 10 259562 CASAVA_Build 19 21627224 3I TATTTTTGGA ---/GTT GTTGTTTCTA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 GTT 2 3 259563 CASAVA_Build 19 21627764 6D AATGTGAGAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 68 het 33 0 23 12 AC 11 8 259564 CASAVA_Build 19 21628816 1D GATCGCTGTA T/- TTTTCAGGAG 3070 hom 86 het 32 0 28 4 T 5 4 259565 CASAVA_Build 19 21629954 3I ACACAAAGAA ---/GAT GATAACAAAC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 GAT 1 2 259566 CASAVA_Build 19 21631105 2D ATATAAAGAC TG/-- TGAAAAAGCC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TG 2 1 259567 CASAVA_Build 19 21631835 1I TGAGAGATTC -/T TTTTTTATTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 6 7 259568 CASAVA_Build 19 21633473 1I TGACTACTAG -/A AAAACTAAAA 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 A 4 5 259569 CASAVA_Build 19 21634637 7D AAAGTTCGCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2452 hom 28 het 19 0 8 11 T 21 14 259570 CASAVA_Build 19 21635110 3D TTGTAAAACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 15 12 259571 CASAVA_Build 19 21635245 1D TAATTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 21 0 19 5 T 10 9 259572 CASAVA_Build 19 21638616 1D TCAAAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 8 259573 CASAVA_Build 19 21643786 38I ACAAGCTCTG --------------------------------------/CTTTTTGAGCTGAAGTATAGGATGTCTGGAAAACTTCA CTTTTTGAGC 2467 hom 12 het 9 0 5 6 CTTTTTGAGCTGAAGTATAGGATGTCTGGAAAACTTCA 0 1 259574 CASAVA_Build 19 21644399 1I AGAGCAGGTC -/A TATCCAATTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 0 1 259575 CASAVA_Build 19 21648137 1I TTGATGGCTG -/T TGTGAGACCT 3070 het 379 hom 25 1 20 4 T 1 2 259576 CASAVA_Build 19 21649436 1I ATTTATACAC -/A AAACAGAGTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 4 259577 CASAVA_Build 19 21651324 1D TAATATGATT A/- AAACAAGACT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 4 3 259578 CASAVA_Build 19 21657613 1D AATCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 13 1 9 4 A 12 11 259579 CASAVA_Build 19 21658605 5D TCAGGACTTT GAAGA/----- GAAAAGTGAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 GAAGA 1 0 259580 CASAVA_Build 19 21664737 2D ACACGGTCTA GG/-- ACGGGAATTG 3070 het 3070 ref 39 20 18 2 G 2 0 259581 CASAVA_Build 19 21665837 1I TGCTGACCGA -/C TAAGCTATGG 2573 het 2573 ref 40 21 13 6 C 0 1 259582 CASAVA_Build 19 21675728 7D GATCATATAT ATCATAC/------- ATCATACATA 3070 het 3070 hom 24 10 11 7 ATCATAC 2 1 259583 CASAVA_Build 19 21700639 2D ATTACATTCG CA/-- CAGTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CA 2 1 259584 CASAVA_Build 19 21701109 5I30M1I AACACTATGA -----TTTATGTTTTGAAAAGTTTGAGGTGTTTTC-/TTTCTTTTATGTTTAGAAAAGTTTGAGGTGTTTTCA AAAGCACTGT 1758 het 1758 ref 45 42 4 14 N/A 0 0 259585 CASAVA_Build 19 21701188 5D CTAGTATGAA TTATC/----- TTATGTCTGT 3070 het 3070 ref 47 25 21 4 TTATC 1 0 259586 CASAVA_Build 19 21708401 1D4M1D5M1D GACTGAGTGA GGACCACCCCAC/-GACC-CCCCA- CAACAGGCAT 3070 het 3070 ref 57 40 19 8 N/A 0 0 259587 CASAVA_Build 19 21714130 1I TCAAGCAGGC -/T TGAGGTTGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 259588 CASAVA_Build 19 21722620 1I TTGATTTTTT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 A 7 8 259589 CASAVA_Build 19 21727218 1I GTATCAGTTA -/T TGATATCTAC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 1 2 259590 CASAVA_Build 19 21729968 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 23 0 17 6 A 12 11 259591 CASAVA_Build 19 21736312 1D AGACTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 54 1 45 8 T 11 10 259592 CASAVA_Build 19 21737942 1I TTTTCTCATG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 8 9 259593 CASAVA_Build 19 21741059 1I GTTCCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 24 1 15 8 A 14 15 259594 CASAVA_Build 19 21744225 16I TTGTGCTCAT ----------------/AGAGTACTTTTTATCA TTGGGAATAA 3019 hom 24 het 10 0 8 3 AGAGTACTTTTTATCA 0 1 259595 CASAVA_Build 19 21746379 8D GGGGAATAAA TTTCTTTT/-------- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 11 10 TTTCTTTT 3 2 259596 CASAVA_Build 19 21747192 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 25 1 17 8 A 15 14 259597 CASAVA_Build 19 21760512 1D CTTTATTCTA T/- TTTTTTTTTT 2225 het 2225 ref 24 16 5 3 T 11 10 259598 CASAVA_Build 19 21770875 1I AAAAACTTGA -/T TTCACATGCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 3 259599 CASAVA_Build 19 21778264 2I TGAAGCCTCA --/CT CTGTCGCCCA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 CT 1 2 259600 CASAVA_Build 19 21780511 2D ACATACACTC TT/-- GAGTAAGGTG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 T 2 0 259601 CASAVA_Build 19 21787575 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 A 9 10 259602 CASAVA_Build 19 21788411 1I TGAAAAGTAC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 0 1 259603 CASAVA_Build 19 21801471 2D AGTGAGACTC TT/-- TGTCTCCAAA 2171 het 566 hom 21 5 9 7 T 3 1 259604 CASAVA_Build 19 21807261 17I CGCAGTGGCT -----------------/CATGCCTGTAATCCCAG CACTTTAGGA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 CATGCCTGTAATCCCAG 0 1 259605 CASAVA_Build 19 21813042 1D CCATTCTAAA T/- TTTTTTTTTT 1029 het 1029 ref 17 7 5 5 T 17 16 259606 CASAVA_Build 19 21822341 1D TCCGTCTCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 A 11 10 259607 CASAVA_Build 19 21823527 2I GCCCAGGTAT --/GA GAGTCAACAT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 GA 1 2 259608 CASAVA_Build 19 21824209 1D CCCAACACCT G/- GGGAGGCCGA 1451 het 1451 ref 17 11 4 2 G 4 3 259609 CASAVA_Build 19 21825537 2I GCCAAGGCAG --/GA GAGTCAAATC 3070 het 3070 hom 53 22 20 11 GA 1 2 259610 CASAVA_Build 19 21832491 1I TTACTGTTTG -/C TTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 C 0 1 259611 CASAVA_Build 19 21857100 4I TAATCTAAGG ----/AATA AATAAACTCC 3070 hom 77 het 31 0 26 5 AATA 1 2 259612 CASAVA_Build 19 21858921 5I TGAAAAAGAA -----/AGAAT AGGTTATCAT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 AGAAT 0 1 259613 CASAVA_Build 19 21861222 3D CCGACACTGC CAG/--- TCGGCAAGGG 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 CAG 1 0 259614 CASAVA_Build 19 21861538 1D GTTTCCCCGA T/- TTTTAAAAGG 2333 het 2333 ref 22 11 7 4 T 5 4 259615 CASAVA_Build 19 21875493 2D TAGGCCCAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 180 hom 34 4 15 15 T 17 15 259616 CASAVA_Build 19 21879282 2I TTGTGTCTCA --/CT GTCTCCCAAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 CT 0 1 259617 CASAVA_Build 19 21917966 1I GTAAATAAAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 7 8 259618 CASAVA_Build 19 21941861 1D TATTGAGTTG T/- TTTTTTTTTA 1218 het 1218 ref 33 27 3 3 T 10 9 259619 CASAVA_Build 19 21985611 4I GAAGCCGACC ----/GACA TGTCCCCTCC 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 GACA 0 1 259620 CASAVA_Build 19 22014342 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 788 hom 23 3 13 7 A 15 16 259621 CASAVA_Build 19 22032774 1D TGTGATGGGC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 62 het 22 0 21 1 A 8 7 259622 CASAVA_Build 19 22033543 1I TATCCTAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 34 1 31 2 T 9 10 259623 CASAVA_Build 19 22035553 1I CTCTTGTCAG -/C TTTGTCAAAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 0 1 259624 CASAVA_Build 19 22037127 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3016 hom 27 het 19 0 9 10 T 15 14 259625 CASAVA_Build 19 22040279 4I AATGCTTATT ----/AATC TATCTAATAG 3070 hom 42 het 20 0 15 5 AATC 0 1 259626 CASAVA_Build 19 22042799 1D TCTGTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 150 hom 38 4 14 20 T 19 18 259627 CASAVA_Build 19 22059379 1D AATTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 838 hom 34 2 21 11 T 15 14 259628 CASAVA_Build 19 22067603 4D TCAGTTTTGT CTTA/---- CTTAGTGTAT 3070 hom 105 het 39 0 36 7 CTTA 2 1 259629 CASAVA_Build 19 22067874 1D TTTTCTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 42 1 37 5 A 11 10 259630 CASAVA_Build 19 22068897 1D TTAGCACTTT G/- GGAGGCCAAG 3070 hom 51 het 20 0 16 4 G 3 2 259631 CASAVA_Build 19 22072819 5I TTAAACACCT -----/TAATA TGAGTATTTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TAATA 0 1 259632 CASAVA_Build 19 22075033 1D TAAATATATT A/- TTTCTTCAGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 1 0 259633 CASAVA_Build 19 22075208 1I ATGCCCAGCT -/A TTTTTTTGTA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 0 1 259634 CASAVA_Build 19 22092028 1I AATAGAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 662 hom 37 2 23 12 T 15 16 259635 CASAVA_Build 19 22093186 1I AACCACTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 38 2 24 12 T 13 14 259636 CASAVA_Build 19 22102318 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2657 het 242 hom 23 2 12 9 A 17 16 259637 CASAVA_Build 19 22103364 1I CTGTATTTAC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 8 9 259638 CASAVA_Build 19 22106378 2I GCCCGGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 2901 hom 34 het 20 0 12 10 T 14 16 259639 CASAVA_Build 19 22117446 4D TTTCAATGTT TGAG/---- TATTTGGACT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TGAG 1 0 259640 CASAVA_Build 19 22121855 2D TATGGGGGAC AG/-- AGTCTCACTC 3068 het 3068 ref 18 10 7 1 AG 2 1 259641 CASAVA_Build 19 22142461 1I GTATATTAAA -/T TTTTTATATT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 5 6 259642 CASAVA_Build 19 22145751 1D GTATTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 40 0 27 14 T 12 11 259643 CASAVA_Build 19 22146999 1I ACAAAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 10 het 20 0 10 10 A 9 10 259644 CASAVA_Build 19 22153670 2D TTTTTCCCAG TC/-- TCTCTGTTGC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TC 3 2 259645 CASAVA_Build 19 22156571 1D CCATTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 30 1 25 4 T 15 14 259646 CASAVA_Build 19 22157311 1D TGCCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 13 6 A 13 12 259647 CASAVA_Build 19 22171961 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2687 het 363 hom 21 3 10 8 A 17 16 259648 CASAVA_Build 19 22182922 1I AAAGAAGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 36 1 28 7 A 10 11 259649 CASAVA_Build 19 22196391 1D AGACTGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 37 0 33 4 A 12 11 259650 CASAVA_Build 19 22220147 3D TGTCACAATG CCC/--- CCCCCCCCAC 3070 hom 85 het 31 0 27 4 C 11 8 259651 CASAVA_Build 19 22222724 1I GAACTCATCA -/T TTTTTTTATG 2602 hom 15 het 8 0 6 2 T 7 8 259652 CASAVA_Build 19 22227079 1D GAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 19 0 14 5 A 12 11 259653 CASAVA_Build 19 22228128 2I65M1I GATAATTTGC --ATATATATATGATAATGTGTATATATATGTATATATACACATTAAAGTCACAGTATGCTCTGAGA-/ATATATATATATGATAATGTGTATATATATGTATATATACACATTAAAGTCACAGTATGCTCTGAGAC CTTTGTGCAT 1471 hom 7 het 4 0 3 16 N/A 0 0 259654 CASAVA_Build 19 22233700 3I AGTCACCAAC ---/TCA TCATCCTATT 3070 het 3070 ref 63 33 23 7 TCA 1 2 259655 CASAVA_Build 19 22246424 1D AATTTTCAGC G/- GTTAATGTTA 1769 het 1738 hom 18 7 5 6 G 2 1 259656 CASAVA_Build 19 22262314 1I GGAGGACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 10 7 T 13 14 259657 CASAVA_Build 19 22263742 1I TTGACCTCAG -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 6 7 259658 CASAVA_Build 19 22268811 1I AGGGGTCCAG -/T TTTCAATTTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 3 4 259659 CASAVA_Build 19 22271133 2D TCATTAACTG TT/-- TATTTGAATC 3070 het 3070 hom 39 17 19 5 T 3 1 259660 CASAVA_Build 19 22271576 2I TTTTGTCAAG --/CT CTGTGGTCTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 CT 1 2 259661 CASAVA_Build 19 22271930 1D TTCTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 T 12 11 259662 CASAVA_Build 19 22276398 1D AGGCATCTTA G/- GAGTGAGAGA 3070 het 3070 ref 63 44 12 8 G 2 1 259663 CASAVA_Build 19 22293159 1I AATACTAAAG -/A GAAACCCTAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 0 1 259664 CASAVA_Build 19 22300902 2I TATGACACTC --/AT ATGCATACTC 3070 het 3070 hom 58 25 23 10 AT 1 2 259665 CASAVA_Build 19 22327347 1I TCAAAATAAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 7 8 259666 CASAVA_Build 19 22328192 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 7 6 259667 CASAVA_Build 19 22333982 1D AGGCTGGCTC A/- AGTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 A 2 1 259668 CASAVA_Build 19 22335718 4I TCTTTGATTT ----/TCTC TCTCTCTCTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 TC 4 6 259669 CASAVA_Build 19 22360429 3I TTTTTGACTT ---/ATG ATAACAGCCA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 ATG 0 1 259670 CASAVA_Build 19 22362269 1D TTGCAGCCTG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 8 7 259671 CASAVA_Build 19 22370519 1I GAGGGGGGGG -/A AAAAAAAAAA 1149 het 1149 ref 13 5 4 4 A 10 11 259672 CASAVA_Build 19 22371009 1I CCCCAAGGTG -/C CCACCAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 C 2 3 259673 CASAVA_Build 19 22371774 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 14 het 16 0 11 5 A 9 10 259674 CASAVA_Build 19 22373377 3I AAGAATAACT ---/GAA GAAGATCCAG 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 GAA 1 2 259675 CASAVA_Build 19 22376128 1I ATTGAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2752 hom 28 7 9 12 T 15 16 259676 CASAVA_Build 19 22377011 1I TAGCAATAAA -/G AAACCAATGG 3070 het 3070 ref 54 42 7 5 G 0 1 259677 CASAVA_Build 19 22377143 3D ACAATGAAAA AGC/--- AGTCAGATTT 1825 het 1825 ref 35 30 4 1 AGC 1 0 259678 CASAVA_Build 19 22377915 1I AAAAAAAACA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1636 hom 23 7 10 6 C 0 1 259679 CASAVA_Build 19 22381459 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2744 hom 16 7 7 2 A 10 9 259680 CASAVA_Build 19 22385875 2D GCCAGGATCT CA/-- CCATGTTGGT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 CA 1 0 259681 CASAVA_Build 19 22386609 3D ATACTGACAC AAT/--- AATAGTGGGA 3070 het 3070 hom 52 16 32 5 AAT 2 1 259682 CASAVA_Build 19 22387896 1I TAGGCAAGAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 7 8 259683 CASAVA_Build 19 22399264 4I AAAAATCACC ----/CTGG TGGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 CTGG 0 1 259684 CASAVA_Build 19 22404698 1D TTGAAATCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 10 9 259685 CASAVA_Build 19 22406033 1D AAAAAATAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 10 9 259686 CASAVA_Build 19 22415225 1I ACTCCAGCTC -/A AAAAAAAAAA 2551 het 796 hom 19 4 8 7 A 11 12 259687 CASAVA_Build 19 22417358 1D AGTGTTTTTT A/- GTTCTATTAA 3070 het 1408 hom 26 4 14 8 A 1 0 259688 CASAVA_Build 19 22430655 1D ATCTTTGTGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 56 29 21 6 T 9 8 259689 CASAVA_Build 19 22431039 1D ATTTTCTCTG T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 8 7 259690 CASAVA_Build 19 22439066 1D TCCCTGTTAG A/- AATCAGTATT 3070 het 3070 hom 44 17 26 2 A 3 2 259691 CASAVA_Build 19 22454519 3I ATGTTTAGTA ---/TGT TGTTAACTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TGT 1 2 259692 CASAVA_Build 19 22454833 3I CAAAAATGTG ---/TAA TAATAATATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAA 2 3 259693 CASAVA_Build 19 22455732 3D ACAATCAAAA AAT/--- AATATCTAGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AAT 2 1 259694 CASAVA_Build 19 22458184 1I TTATATTTTT -/G TTTCTTACAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 0 1 259695 CASAVA_Build 19 22458591 1I TGGAACTCCC -/G GACCTCAGGT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 1 2 259696 CASAVA_Build 19 22459244 1I TCTACTTCAT -/C CCCCCCCTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 7 8 259697 CASAVA_Build 19 22461258 1D TTTATAGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 34 0 28 7 T 10 9 259698 CASAVA_Build 19 22468276 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 44 0 34 11 T 11 10 259699 CASAVA_Build 19 22474364 2I CCAGAACATT --/TC TGTTTTTTAC 3070 hom 77 het 33 0 26 7 TC 0 1 259700 CASAVA_Build 19 22605209 3D GTTAACTTTA AGT/--- AGATTGTAAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 AGT 1 0 259701 CASAVA_Build 19 22610704 1D TTGTTCCCTC T/- TTGTGTTTAC 2300 het 2300 ref 22 15 6 2 T 3 2 259702 CASAVA_Build 19 22622250 3I GATTCATTGA ---/TTT TTTTTTTTTG 2536 het 2536 ref 19 12 6 1 T 9 12 259703 CASAVA_Build 19 22622374 9I TTTTAGTTTT ---------/TTTTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 1120 hom 35 11 18 6 TTTTTTTTG 0 1 259704 CASAVA_Build 19 22624258 10D CTCGGAGGCT TTGTTCATTC/---------- TTGTTCATTC 3070 het 3070 ref 40 17 12 14 TTGTTCATTC 2 1 259705 CASAVA_Build 19 22626490 6I AAAGTTTAAA ------/AATAAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 AAT 4 6 259706 CASAVA_Build 19 22630004 1I TCTTCTCCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2378 hom 17 6 9 2 T 9 10 259707 CASAVA_Build 19 22632288 3D ATGAGTAAAC ATT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 ATT 1 0 259708 CASAVA_Build 19 22632790 3D ATGGCCAGTC ATG/--- GTGGTGGTTC 1039 het 1039 ref 50 40 3 7 ATG 1 0 259709 CASAVA_Build 19 22634823 3D ACTCTTGTAG AAA/--- AAAAAGTTGG 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 A 8 5 259710 CASAVA_Build 19 22635570 1I TTTTTTTTTT -/C TCCCCTCAGG 2945 het 2017 hom 17 6 9 2 C 0 1 259711 CASAVA_Build 19 22635853 1I CACCAAATTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 T 8 9 259712 CASAVA_Build 19 22636246 1I GTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2159 hom 22 6 8 9 T 10 11 259713 CASAVA_Build 19 22640143 1I AGAGTTTATA -/C TTAATAGCAT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 C 0 1 259714 CASAVA_Build 19 22640693 1D AGATTACAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 9 20 5 T 8 7 259715 CASAVA_Build 19 22644621 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACCAG 3070 het 784 hom 34 13 15 6 C 0 1 259716 CASAVA_Build 19 22647574 1I AGAAGACCTT -/A AATGACCTGA 2353 het 2353 ref 14 7 5 2 A 2 3 259717 CASAVA_Build 19 22650777 1I ATGATTATCT -/C AATACATGCA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 C 0 1 259718 CASAVA_Build 19 22652965 3D AATTTAAAAT ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 1763 hom 14 5 8 1 ATA 5 4 259719 CASAVA_Build 19 22653801 16I CTACCATTTG ----------------/ACCCAGCCATCCCATT ACTAGGTATA 1893 het 1893 ref 33 24 4 5 ACCCAGCCATCCCATT 0 1 259720 CASAVA_Build 19 22656307 1D GTAAGATGAC T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 8 7 259721 CASAVA_Build 19 22657844 3D TCATAATTTG TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 12 9 259722 CASAVA_Build 19 22658220 1I TACCTACAAA -/T TTTAAAAAAA 3009 het 856 hom 13 3 8 2 T 3 4 259723 CASAVA_Build 19 22661968 2I ATCCAAAATT --/AA GTCTATGTAA 2887 het 2887 ref 17 11 6 0 A 0 2 259724 CASAVA_Build 19 22662930 3I GTGTGAAAAT ---/TTC TTAATTGAAC 2746 het 2746 ref 20 13 6 1 TTC 0 1 259725 CASAVA_Build 19 22664459 1D AATCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 10 9 259726 CASAVA_Build 19 22665880 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 8 7 259727 CASAVA_Build 19 22667147 1D CATCCGGCCC T/- TTTTTTTTTT 1241 het 1241 ref 19 9 5 5 T 12 11 259728 CASAVA_Build 19 22667337 1I ACCAGCCTGG -/C CAACATGGTG 1822 het 1822 ref 16 10 5 1 C 1 2 259729 CASAVA_Build 19 22667953 3D TTTTTGATAT TAA/--- TAATGCCTTG 3070 het 3070 ref 33 21 11 2 TAA 2 1 259730 CASAVA_Build 19 22671162 2I TTTAATATTA --/AT ATGTCTTGAA 3070 het 3070 hom 37 16 21 0 AT 1 2 259731 CASAVA_Build 19 22674386 1D TTTGAGAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 9 8 259732 CASAVA_Build 19 22676206 1D TTTTCATATC T/- TTTTTTTTTT 2720 het 2720 ref 28 14 7 7 T 11 10 259733 CASAVA_Build 19 22679328 2D TGTATTTGAC TA/-- TGTGTCAAAT 3070 het 3070 ref 45 20 22 3 TA 1 0 259734 CASAVA_Build 19 22682704 1I TTGAAACACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3005 hom 25 8 13 5 T 9 10 259735 CASAVA_Build 19 22684483 3D CTGTAGTAAG TAA/--- TAATAATAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 4 TAA 4 3 259736 CASAVA_Build 19 22685156 3I ATGTGTGCCT ---/TGC TTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 TGC 0 1 259737 CASAVA_Build 19 22687037 1D ACCACAAATA T/- AATTAAAATA 3070 het 3070 hom 18 9 9 2 T 1 0 259738 CASAVA_Build 19 22688283 1I CATTTGCATC -/T GTATAAGATA 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 T 0 1 259739 CASAVA_Build 19 22691941 1I TAATACCCCC -/T GAGGGAATGA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 T 0 1 259740 CASAVA_Build 19 22694881 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2782 het 757 hom 15 5 8 3 A 17 16 259741 CASAVA_Build 19 22705354 1D TTTCTGTTGA G/- GGGGGGGATT 3070 het 3070 hom 50 20 19 12 G 8 7 259742 CASAVA_Build 19 22713332 2D CGCTTCCGTT CA/-- CTTTCTTCTG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 CA 1 0 259743 CASAVA_Build 19 22713788 6I CCCAAGTTAA ------/AAGGTC ACACCGTGCA 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 AAGGTC 0 1 259744 CASAVA_Build 19 22713915 2I CTGCTTTATG --/TC TCTCCTGCTT 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 TC 2 3 259745 CASAVA_Build 19 22715806 1I GACCTGTCTC -/A GATACTTTGG 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 0 1 259746 CASAVA_Build 19 22716666 1D AATATTTTTC A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 A 7 6 259747 CASAVA_Build 19 22716794 1D TATTAAAAAG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 8 7 259748 CASAVA_Build 19 22717851 2I AGGTGTTGTT --/TA TGTTCTCAAG 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 TA 0 1 259749 CASAVA_Build 19 22719245 4I TCAGTAAATA ----/AATT AACTTATGAC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 AATT 0 1 259750 CASAVA_Build 19 22725254 1I AACTGTCAAC -/A GGTGATTGCT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 0 1 259751 CASAVA_Build 19 22727781 2I TTTGCTTTTC --/AA AGAGTCTGTA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 A 1 3 259752 CASAVA_Build 19 22732033 1I TTTCTCTCCA -/G TATGAATTAC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 G 0 1 259753 CASAVA_Build 19 22736762 1I CCAGAAGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 9 10 259754 CASAVA_Build 19 22737315 1I AACCAGAAAA -/G GGCATTAATC 2944 het 2944 ref 30 19 8 3 G 2 3 259755 CASAVA_Build 19 22745584 1D TTTTCAGAAC T/- TTTTTTTTTT 1778 het 1778 ref 19 8 5 6 T 15 14 259756 CASAVA_Build 19 22748092 1I TAACAAGTAG -/A AAAATTTATA 3070 het 3070 ref 44 29 11 4 A 4 5 259757 CASAVA_Build 19 22752798 1D AGAACTTAAA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 1691 hom 18 5 13 0 T 2 1 259758 CASAVA_Build 19 22753650 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2991 het 2747 hom 23 6 10 7 A 12 13 259759 CASAVA_Build 19 22756997 1I TGATATCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 10 11 259760 CASAVA_Build 19 22757960 1D ATTCAAGTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 T 10 9 259761 CASAVA_Build 19 22759561 1I ACTTTAAAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 1898 hom 23 7 13 3 T 2 3 259762 CASAVA_Build 19 22783906 1I ATTATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 T 10 11 259763 CASAVA_Build 19 22803871 2D GTTTCTACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 A 14 12 259764 CASAVA_Build 19 22804374 1D TTTTTTGATA G/- GTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 13 13 3 G 2 1 259765 CASAVA_Build 19 22804684 1D TTCTCTAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 9 259766 CASAVA_Build 19 22805167 1D GCACAAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 A 12 11 259767 CASAVA_Build 19 22810705 2I GAGTAAATAA --/CT CTGACATAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 CT 1 2 259768 CASAVA_Build 19 22814638 1D TATTTAAGTA T/- TTTATGGATT 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 T 4 3 259769 CASAVA_Build 19 22817339 13D AAGCAGCCTC TATAAGGTGATCT/------------- TTCCTTTGAT 3070 het 3070 ref 40 30 11 4 TATAAGGTGATCT 1 0 259770 CASAVA_Build 19 22818925 1I CTAGTCACAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 20 19 1 A 8 9 259771 CASAVA_Build 19 22821899 1I TGTAAAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1164 hom 23 5 14 4 T 11 12 259772 CASAVA_Build 19 22823942 1D CCAGGTAGGT G/- GAGAGTGAAC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 G 2 1 259773 CASAVA_Build 19 22824754 1I TCCTGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 10 11 259774 CASAVA_Build 19 22828797 6D AATGTGAGAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 AC 10 7 259775 CASAVA_Build 19 22829168 4D TGAAACAAAA ACTT/---- AATAATGTTT 3070 het 3070 ref 22 11 11 2 ACTT 1 0 259776 CASAVA_Build 19 22834371 2I TTATTTTAAA --/AT AAAATTTTTA 3070 het 2052 hom 16 5 10 1 AT 0 1 259777 CASAVA_Build 19 22835876 1D TTTGATGTAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 9 8 259778 CASAVA_Build 19 22838645 6D ATGCCAACAC TTTATT/------ TTTATTTTTA 2085 het 2085 ref 20 6 7 7 TTTATT 3 2 259779 CASAVA_Build 19 22842796 1D AGAGCAATGG A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 A 7 6 259780 CASAVA_Build 19 22843241 2I AATCTATAAG --/AA ATTTAATAAG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 1 3 259781 CASAVA_Build 19 22845228 1D GATCCCCTGA G/- GTCAGGAGTT 1801 het 973 hom 11 2 5 4 G 2 1 259782 CASAVA_Build 19 22848734 4I CCTTTCTTTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 2198 het 2198 ref 21 10 6 5 TCTT 4 5 259783 CASAVA_Build 19 22849519 1I CAAATTTTTT -/A AAAAAATTAA 1739 het 1609 hom 15 5 5 5 A 6 7 259784 CASAVA_Build 19 22853601 1D AAAACACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1944 hom 26 7 15 4 A 10 9 259785 CASAVA_Build 19 22854524 1D AACCATCTGA G/- GGATCCCCCT 3070 het 3070 hom 47 18 24 6 G 3 2 259786 CASAVA_Build 19 22857201 5D GGATCAGGAT CAGAA/----- CAGAAGATAG 3070 het 3070 hom 36 15 20 5 CAGAA 2 1 259787 CASAVA_Build 19 22859178 1I AAAGGACAAG -/T TTTGTTACAC 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 T 3 4 259788 CASAVA_Build 19 22866564 6D ACCTCTCCTT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 TC 11 8 259789 CASAVA_Build 19 22869521 2D GTTATTGTTA CT/-- GTTTATTTAC 3070 hom 81 het 28 0 28 2 CT 1 0 259790 CASAVA_Build 19 22870621 2D45M1I TATTTTACTC TGTGCACTGAAGATTTTTTCTAGTTCTGGAATACAGATAAATCTAGA-/--TGCACTGAAGATTTTTTCTAGTTCTGGAATACAGATAAATCTAGAC GTCTGTTCTT 3070 hom 60 het 27 0 21 19 N/A 0 0 259791 CASAVA_Build 19 22873226 1I GCCTGAATTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 8 9 259792 CASAVA_Build 19 22879318 1D TAGTTAGATC T/- GCACATAGAT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 1 0 259793 CASAVA_Build 19 22885655 2D TATTTTGGGG TT/-- TTTTTTTACA 3070 hom 129 het 53 0 44 12 T 9 7 259794 CASAVA_Build 19 22892295 3D GATGACTCTT CTC/--- CTGCCTTGGC 3070 het 3070 ref 58 28 27 5 CTC 1 0 259795 CASAVA_Build 19 22907485 1D GATGAGATTG T/- GACTCTCCTA 3070 het 3070 ref 47 22 21 5 T 1 0 259796 CASAVA_Build 19 22912384 1D TTGGGAGGCC A/- GGGGGAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 17 4 A 1 0 259797 CASAVA_Build 19 22915239 2D AGAGTGAGAC TT/-- TATCTAAAAA 1276 het 1276 ref 24 6 8 11 T 3 1 259798 CASAVA_Build 19 22920194 2I GGGATTCTGA --/TC TCTTCCTGGG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 TC 1 2 259799 CASAVA_Build 19 22925611 1D AAAGTTAGAG A/- AAAAAAGAGT 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 A 7 6 259800 CASAVA_Build 19 22935980 1D AAGAAGAAAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 7 6 259801 CASAVA_Build 19 22938173 2D CAGAGAAAAA TG/-- TGTTTGTTCA 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 TG 2 1 259802 CASAVA_Build 19 22941902 1I TTTCTAGGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 T 9 10 259803 CASAVA_Build 19 22942209 1D AATGCATCCA G/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 G 1 0 259804 CASAVA_Build 19 22943300 3D TACTAAAAAT TAG/--- TAGGACTAAT 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 TAG 2 1 259805 CASAVA_Build 19 22943408 4I AAATTAAAGA ----/AATT AATACACAAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 AATT 0 1 259806 CASAVA_Build 19 22944204 4D ATATCAAAAC CATA/---- TAACAAACTC 3070 het 3070 hom 28 13 15 2 CATA 1 0 259807 CASAVA_Build 19 22944954 2D TGGATAAAAG AA/-- ATAATTTCAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 3 1 259808 CASAVA_Build 19 22946973 1I AACTTGGTCT -/A AAAAAAAAAA 2356 het 2356 ref 24 14 8 2 A 13 14 259809 CASAVA_Build 19 22948991 2D AAATAATTTT TC/-- TTTTTACCAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TC 1 0 259810 CASAVA_Build 19 22953483 1I TTTACTCAGA -/G ACCCCATCTG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 G 0 1 259811 CASAVA_Build 19 22958887 3I ATGCAAGTAT ---/ACA ACAATAATAG 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 ACA 1 2 259812 CASAVA_Build 19 22963860 1I CAGATTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 11 12 259813 CASAVA_Build 19 22964901 1D CATTTAGCTG A/- AAAAAAAAAA 1065 het 1065 ref 44 32 3 10 A 11 10 259814 CASAVA_Build 19 22967196 1D GCTTCATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 T 10 9 259815 CASAVA_Build 19 22970895 1I TCAATCAAAG -/T TAAATATTGT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 1 2 259816 CASAVA_Build 19 22971257 1I AAAGAAAGAT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 7 8 259817 CASAVA_Build 19 22971401 6D CAGAAGAAAT ATATAC/------ ATATAATCTA 3070 het 3070 hom 35 12 21 3 ATATAC 1 0 259818 CASAVA_Build 19 22975712 2I CTATGCCCCA --/GT GAGTGCCCCA 2255 het 2255 ref 19 13 5 1 GT 0 1 259819 CASAVA_Build 19 22979124 1I AGTTTGGGGG -/T TTTTATTTTT 2943 het 2215 hom 16 6 6 4 T 4 5 259820 CASAVA_Build 19 22980002 4I TTTTTTTCTA ----/TGTT TGTTGGCTAT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 TGTT 1 2 259821 CASAVA_Build 19 22980961 2I TGCTACCCAT --/GC CCATAAGCAT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 GC 0 1 259822 CASAVA_Build 19 22990819 1D AGCTTCAGGT A/- AAAAGCGTCA 3070 het 3070 hom 45 22 18 8 A 5 4 259823 CASAVA_Build 19 22998993 3D TGTCACAATG CCC/--- CCCCCCCCCC 3053 hom 21 het 11 0 7 4 C 14 11 259824 CASAVA_Build 19 23007513 3D AGAACAAAAC ATT/--- ATCATCGTCA 3070 het 3070 hom 33 11 15 9 ATT 1 0 259825 CASAVA_Build 19 23008953 2I AAGGAAGAAG --/AA AAAACAACTC 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 A 4 6 259826 CASAVA_Build 19 23009266 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 10 11 259827 CASAVA_Build 19 23010391 1I AAAACACAAC -/A AAAAAAAAAG 2999 hom 21 het 9 0 8 1 A 9 10 259828 CASAVA_Build 19 23011749 1I AAAGTATCAC -/T GAAAAATGCA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 0 1 259829 CASAVA_Build 19 23014000 1I AAAAAGCTGG -/T CGGGGGGATT 3070 hom 46 het 20 0 16 4 T 0 1 259830 CASAVA_Build 19 23016631 1D GCATTTTAAG A/- AGACAAATTA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 2 1 259831 CASAVA_Build 19 23018198 1I TTAAGTGATG -/A AAAAATATGT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 A 5 6 259832 CASAVA_Build 19 23021919 2D CCACTCTGGT GA/-- GCTGGGCCTA 3070 het 3070 ref 57 32 21 5 GA 1 0 259833 CASAVA_Build 19 23024047 1D ACCAACCCCC G/- TTGTGGAACA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 G 1 0 259834 CASAVA_Build 19 23028685 1I GTTCATAGCC -/A GGTGAGAATT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 0 1 259835 CASAVA_Build 19 23031088 1I TTCCAACCCC -/T TAGGTATTTG 3070 het 3070 hom 52 24 26 2 T 1 2 259836 CASAVA_Build 19 23048522 1D TCGCTCTGTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 1949 hom 22 6 12 4 A 9 8 259837 CASAVA_Build 19 23050705 3I GGGCTCTAAT ---/CCA CCACTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 CCA 1 2 259838 CASAVA_Build 19 23056993 1I AATAGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 2828 het 1038 hom 25 4 9 12 T 14 15 259839 CASAVA_Build 19 23060001 1D TCTTTTTTTG C/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 C 1 0 259840 CASAVA_Build 19 23061676 2D CTAGGCATTT TA/-- TCTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 TA 1 0 259841 CASAVA_Build 19 23075870 16I TTCTCCCATA ----------------/TAAACACATCTCACTG TTGAGGTTCT 3070 hom 141 het 50 0 48 3 TAAACACATCTCACTG 0 1 259842 CASAVA_Build 19 23083380 1D ACAAATTGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 10 9 259843 CASAVA_Build 19 23084059 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1965 het 1965 ref 15 9 5 1 T 10 11 259844 CASAVA_Build 19 23087378 1D AAAATAGAAG A/- AAAAAAAAAA 2979 het 1382 hom 19 6 9 4 A 15 14 259845 CASAVA_Build 19 23090330 20D GCAGAAGCTC ACCCCCAGAAGCAGAAGCTT/-------------------- ACCCCCAGAA 3070 het 3070 ref 36 17 18 7 ACCCCCAGAAGCAGAAGCTT 1 0 259846 CASAVA_Build 19 23095980 2D CTAAGAACTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 24 8 15 2 TG 9 8 259847 CASAVA_Build 19 23098295 8I TCATGTTTCT --------/CATGCTGA CATGCTGAGA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 CATGCTGA 1 2 259848 CASAVA_Build 19 23108474 4D GTGTTCATGT CTTA/---- CTTCATCATC 3070 het 3070 ref 50 26 20 6 CTTA 1 0 259849 CASAVA_Build 19 23111743 3I ATCTGGGAAA ---/TGG TGGAGGTTGC 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 TGG 1 2 259850 CASAVA_Build 19 23139598 4I TTTTAAGGTA ----/TTAT TTAGATCATT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 TTAT 0 1 259851 CASAVA_Build 19 23141961 1D ATGACAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1978 hom 35 14 9 13 A 11 10 259852 CASAVA_Build 19 23145269 5D GTTAAAAGGA AAAAG/----- AAAAGAACAA 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 AAAAG 2 1 259853 CASAVA_Build 19 23159087 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAGGCAA 3070 het 2058 hom 34 8 16 10 A 5 6 259854 CASAVA_Build 19 23160379 1I TTTATAACAA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 31 10 11 10 T 7 8 259855 CASAVA_Build 19 23161870 3D ATACTTTCTG CCC/--- CCCCCCCACC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 C 10 7 259856 CASAVA_Build 19 23163920 1D TCTAAAAAAA T/- ATTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 1 0 259857 CASAVA_Build 19 23165121 2D AGCTACAGAA AG/-- AGGGGTGACA 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 AG 2 1 259858 CASAVA_Build 19 23172551 1D ATAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 11 10 259859 CASAVA_Build 19 23175674 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 22 2 13 7 A 13 14 259860 CASAVA_Build 19 23176101 1I GCCTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 10 11 259861 CASAVA_Build 19 23181898 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 A 9 8 259862 CASAVA_Build 19 23183714 4D CAAATGAAAT AGAA/---- GGAAGAAAGT 3070 het 3070 hom 29 12 17 1 AGAA 1 0 259863 CASAVA_Build 19 23184328 1I CGAATGGATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 483 hom 36 3 32 1 A 9 10 259864 CASAVA_Build 19 23184659 1D TTATATCACC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 10 9 259865 CASAVA_Build 19 23186266 4D ACTCTGTCTC AAAT/---- AAATTTTCAT 1630 het 1630 ref 14 8 4 3 AAAT 2 1 259866 CASAVA_Build 19 23192600 1I GAGGCAGAAT -/G GGCGTGAACC 3070 het 2562 hom 25 6 15 4 G 2 3 259867 CASAVA_Build 19 23193343 6D GTCATCTATA AAAAGT/------ AAAAGGACAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 6 AAAAGT 1 0 259868 CASAVA_Build 19 23196527 5D CTTACACTCT TGATA/----- TTTTAATGCT 3070 het 3070 ref 43 23 15 7 TGATA 1 0 259869 CASAVA_Build 19 23199365 1I TGGCGTGCCG -/A GGTGGGCCGA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 0 1 259870 CASAVA_Build 19 23201637 2D CTCAAACTCT GG/-- TAAGCAACAT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 G 2 0 259871 CASAVA_Build 19 23203710 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 22 2 9 11 A 11 10 259872 CASAVA_Build 19 23204433 19D TTTATAAAAA CTTGAAGAGGTGTTTGTTT/------------------- CTTGAAATTC 3070 het 3070 ref 48 21 19 14 CTTGAAGAGGTGTTTGTTT 1 0 259873 CASAVA_Build 19 23205139 1I AGACTATAGT -/A ATAAAAACAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 259874 CASAVA_Build 19 23207326 1D CTTGTTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 36 1 26 9 T 13 12 259875 CASAVA_Build 19 23207457 1I AAATAACCTG -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 5 6 259876 CASAVA_Build 19 23208440 1I TGTTTAGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 13 14 259877 CASAVA_Build 19 23218595 1D TTAAATAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 13 12 259878 CASAVA_Build 19 23223663 3D AAAAAAAACT AAG/--- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 AAG 3 2 259879 CASAVA_Build 19 23228238 3I TGGTTTTATG ---/ATT ATTCCTCCAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATT 1 2 259880 CASAVA_Build 19 23230702 3D GGGACCAGGC AGA/--- AGAAGACAGT 3070 het 3070 ref 43 22 19 5 AGA 3 2 259881 CASAVA_Build 19 23234084 2D AGATCCACAC AT/-- GAGAGGCAAT 3070 het 3070 ref 53 27 21 6 AT 1 0 259882 CASAVA_Build 19 23234196 2D GTGTGCATTC GA/-- GAGACACTCT 3070 het 3070 ref 48 21 21 8 GA 3 2 259883 CASAVA_Build 19 23237925 2I TACAATATAT --/GA GAGAGTGGTG 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 GA 2 3 259884 CASAVA_Build 19 23246327 4I GAACATGCGG ----/TATT TAGTTTTCTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TATT 0 1 259885 CASAVA_Build 19 23252385 1I ACAAAGAGAT -/A AATGCAGGGG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 2 3 259886 CASAVA_Build 19 23254100 6D GCCCGGCTAA TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 2343 het 1187 hom 15 4 6 5 TTTTTG 4 3 259887 CASAVA_Build 19 23256685 2I AATTAGTTGT --/TC TCTCTCTCTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TC 4 5 259888 CASAVA_Build 19 23259630 1D7M1D AAATGAAAGT GGGGGTAGA/-GGGGTAG- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 14 28 4 N/A 0 0 259889 CASAVA_Build 19 23261562 2D TTAAGATTTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 CT 9 8 259890 CASAVA_Build 19 23275180 2D22M1D TGTCTTGAAG ACAGCATACCAGTGGGTCTTGGTTC/--AGCATACCAATGGGTCTTGGTT- TTTATCCACT 1021 het 1021 ref 43 52 3 7 N/A 0 0 259891 CASAVA_Build 19 23275731 2I ATCTGATTTT --/TA TATATGTCTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TA 2 3 259892 CASAVA_Build 19 23281140 5I TGTGAATCTT -----/CTCTC CTGCTTTGTC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 CTCTC 0 1 259893 CASAVA_Build 19 23281398 1I GACATATCAC -/T GGGCCAAGTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 259894 CASAVA_Build 19 23284841 1D CTTGGGTGAT A/- ACAGAACATG 3070 het 3070 ref 53 27 25 1 A 2 1 259895 CASAVA_Build 19 23293312 2I AGATTATCAC --/AT GTCTCTGATT 3070 het 3070 ref 49 30 17 2 AT 0 1 259896 CASAVA_Build 19 23294212 2D GCCTTGTGAC AT/-- ATATCTGCAT 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 AT 3 2 259897 CASAVA_Build 19 23297372 3D TCTCCTCATC TCT/--- TCTTCCTCCC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 TCT 2 1 259898 CASAVA_Build 19 23297798 5I TTCGCCTCTC -----/CTCCT CTCCTCTCCA 2176 het 2176 ref 29 10 9 10 CTCCT 1 2 259899 CASAVA_Build 19 23298054 3I TTTTCTTTGT ---/TCC TCCTACTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 TCC 1 2 259900 CASAVA_Build 19 23298353 2I19M6D CTCTCCTCCT --TCTTTTCTTCTACGCCTTCTCCTCA/TCTCTTTTCTTCTACGCCTTC------ TTCTCCTCTC 994 het 994 ref 26 15 5 14 N/A 0 0 259901 CASAVA_Build 19 23298510 3D41M4D ATTCTTCTCC TCTTCGTTTCCTATTTTTTCTCCTCCTCTCCTCTTTCTCCACTCCTTT/---TCGTTTCCTATTTTTTCTCCTCCTCTCCTCTTTCTCCACTC---- CTTTTCTCCT 3070 het 3070 hom 29 17 18 11 N/A 0 0 259902 CASAVA_Build 19 23299142 4D CTAATCCGGC CTAA/---- CTCAGGCGGC 541 het 541 ref 14 4 3 8 CTAA 1 0 259903 CASAVA_Build 19 23300644 2D TTGGCTCTTG TC/-- TCTGTCTTCC 3070 het 3070 hom 30 13 16 2 TC 2 1 259904 CASAVA_Build 19 23313303 3I AAAGACAGAT ---/AAA AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 7 10 259905 CASAVA_Build 19 23317235 5D AGGTTCCTAT TAAGA/----- TAAAACATCT 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 TAAGA 1 0 259906 CASAVA_Build 19 23328289 1I AAATACAAAA -/G GTAAATGAAA 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 G 1 2 259907 CASAVA_Build 19 23333869 2D ATGAATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1301 het 559 hom 11 3 3 5 T 14 12 259908 CASAVA_Build 19 23338507 5I GTAAAAATAT -----/TTAAA AAAAACTGAT 2223 het 2223 ref 29 23 5 1 TTAAA 0 1 259909 CASAVA_Build 19 23339226 1D GTAAATTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2615 hom 17 7 7 4 T 10 9 259910 CASAVA_Build 19 23339574 4D TGACATGCAC AATT/---- ATTATACTAA 3070 het 3070 hom 32 11 20 3 AATT 1 0 259911 CASAVA_Build 19 23339940 2D ACAGTTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1675 hom 27 6 11 10 A 15 13 259912 CASAVA_Build 19 23342019 4I ACCAAAACTC ----/AATT AAACTGGAGA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AATT 0 1 259913 CASAVA_Build 19 23343514 1I AAACACAAAT -/A AAAAAAACAT 2638 het 2638 ref 15 7 7 1 A 7 8 259914 CASAVA_Build 19 23351022 1D TATCATAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 12 11 259915 CASAVA_Build 19 23352597 2I CTTCTGTTTT --/TC TGTCACTCAT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 TC 0 1 259916 CASAVA_Build 19 23355519 1D CACTTTTTGA T/- TAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 T 2 1 259917 CASAVA_Build 19 23363041 2D TAAAACCACA AC/-- AGAGGCTGAA 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 AC 1 0 259918 CASAVA_Build 19 23363491 1I ACTCCAGCCT -/G GGTGACAAGA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 G 2 3 259919 CASAVA_Build 19 23376050 3I AATGTCAAAA ---/CCT CAGCTGTACA 3070 het 3070 ref 52 26 19 7 CCT 0 1 259920 CASAVA_Build 19 23385254 1D ACCCTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 2372 het 2210 hom 15 7 7 1 A 15 14 259921 CASAVA_Build 19 23385853 19D GGCACGAGAT TCCCTTAAACCTGGGAGGC/------------------- TCCCTTAAAC 2466 het 2466 ref 14 10 6 2 TCCCTTAAACCTGGGAGGC 2 1 259922 CASAVA_Build 19 23386442 4D CTATTTCCAT GATA/---- GATAATTTAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 GATA 2 1 259923 CASAVA_Build 19 23386735 1I CAAAGCAAAG -/C CCTGGGGTTC 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 C 2 3 259924 CASAVA_Build 19 23387630 1I TACCAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 10 11 259925 CASAVA_Build 19 23389217 2I AAAAAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2171 hom 25 7 10 8 A 10 12 259926 CASAVA_Build 19 23389719 1D GTGACTACAT A/- AACTGTAACC 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 A 3 2 259927 CASAVA_Build 19 23389952 2D GGCCGCGGCG GT/-- GGGGGGATCA 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 GT 1 0 259928 CASAVA_Build 19 23390714 1D AAGCCCCGCC A/- AATGCCGGAT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 3 2 259929 CASAVA_Build 19 23395863 1D GTTCATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2987 hom 39 14 10 15 A 13 12 259930 CASAVA_Build 19 23402383 4D GCGTAAAAAA AAAT/---- AAAATAAGAG 2389 het 2389 ref 20 11 7 5 AAAT 1 0 259931 CASAVA_Build 19 23404176 2D TCTCTCTCTC TG/-- ATTGTCACAC 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 TG 1 0 259932 CASAVA_Build 19 23411370 1D AGTGGGAGCG A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 A 8 7 259933 CASAVA_Build 19 23412945 3D GAAAATAAAT AAG/--- GAGGAGTGAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 AAG 1 0 259934 CASAVA_Build 19 23413191 4D GTTGAGAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 41 19 13 11 AAAC 4 3 259935 CASAVA_Build 19 23416633 2I TTGTGGCACC --/AA AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 8 10 259936 CASAVA_Build 19 23425537 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2317 hom 28 7 10 11 T 15 14 259937 CASAVA_Build 19 23426850 4I AGTGCTGCAG ----/TATA TATATGTGTG 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 TA 2 4 259938 CASAVA_Build 19 23427875 1D ATGTGGGATC T/- TTTTTTGGTT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 7 6 259939 CASAVA_Build 19 23431667 1I CTGTTTTCCT -/G GGTATCAGCA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 G 2 3 259940 CASAVA_Build 19 23433684 4I GTGATATGAG ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 het 2662 hom 44 11 17 16 TC 7 9 259941 CASAVA_Build 19 23434532 1I TCATTTGCTA -/C AGTTGGGATG 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 C 0 1 259942 CASAVA_Build 19 23437195 1D ACAGATGGAA T/- TGTGTCAGTC 3070 het 3070 ref 48 30 16 2 T 2 1 259943 CASAVA_Build 19 23440940 3I TCCTCTCCTC ---/CTT ATCTCCTCCT 3070 hom 36 het 30 0 14 16 CTT 0 1 259944 CASAVA_Build 19 23443829 3D CTTCTCCTCC TCT/--- TCTAATTCTC 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 TCT 2 1 259945 CASAVA_Build 19 23444159 3I TCCTTCTTCT ---/CTC CTATTTCTCC 3070 hom 90 het 35 0 28 7 CTC 0 1 259946 CASAVA_Build 19 23461046 1D AACACCTTTA C/- AAAAGAACTA 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 C 1 0 259947 CASAVA_Build 19 23463498 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 79 het 33 0 27 6 TA 7 6 259948 CASAVA_Build 19 23476056 1I TTTTACAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2385 hom 26 8 13 5 T 11 12 259949 CASAVA_Build 19 23480213 1D ACTGCTGAAT A/- AAAAAATTGG 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 7 6 259950 CASAVA_Build 19 23483314 1D TAAAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 1 0 259951 CASAVA_Build 19 23484797 1I GTTAACTTTG -/A AAAAAAAAAA 1489 het 1489 ref 47 32 5 10 A 13 14 259952 CASAVA_Build 19 23485040 1D TAATGTTTCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 10 9 259953 CASAVA_Build 19 23490704 1I AGTTTCTGGC -/T TTTTTTTTTT 2483 het 2483 ref 22 8 9 5 T 13 14 259954 CASAVA_Build 19 23492622 1D CATTCAGAGA C/- CCCCTGTGCA 3070 het 3070 hom 42 20 17 5 C 5 4 259955 CASAVA_Build 19 23503416 17D GGCAGGATGT TCTTTTAAGAAACACAA/----------------- TCTTGGGCTG 3070 het 3070 hom 28 12 16 5 TCTTTTAAGAAACACAA 1 0 259956 CASAVA_Build 19 23505389 1D CAGGTCCAAG A/- AAAAAAAAAG 1394 het 1394 ref 37 30 4 3 A 10 9 259957 CASAVA_Build 19 23509717 1D GGGGAAATTC A/- AAATGTTATA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 4 3 259958 CASAVA_Build 19 23521053 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 A 11 12 259959 CASAVA_Build 19 23551063 1D GGGGCAACTA C/- TTTTTGCCCA 1731 het 1731 ref 17 10 5 2 C 1 0 259960 CASAVA_Build 19 23551945 8I AGATTTTGGG --------/GCCTGTTT GGGCCTGTTC 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 GCCTGTTT 0 1 259961 CASAVA_Build 19 23553543 1I TTTATGAGGC -/A AAAAAAAAAA 2977 het 2977 ref 35 12 10 13 A 13 14 259962 CASAVA_Build 19 23554446 1I TCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 620 hom 17 2 12 3 T 8 9 259963 CASAVA_Build 19 23555927 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2715 hom 29 7 15 8 T 11 10 259964 CASAVA_Build 19 23560227 2I TGAGATGGGG --/TC TCTCGCTCTA 2828 hom 29 het 18 0 9 9 TC 2 3 259965 CASAVA_Build 19 23574214 5D AAGTTTTAGT TAAAA/----- TTAATTAAAT 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 TAAAA 1 0 259966 CASAVA_Build 19 23575036 1D AAACAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2330 hom 21 8 9 4 T 15 14 259967 CASAVA_Build 19 23575337 1D CAGCCATAAA T/- TTTTTTATTA 3070 het 2849 hom 20 9 11 0 T 7 6 259968 CASAVA_Build 19 23584783 1D CCAGATCATC A/- GGACACTTCA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 1 0 259969 CASAVA_Build 19 23594659 1I AAAAACATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 9 10 259970 CASAVA_Build 19 23600670 10D TGTCAAAAAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAG 3070 hom 71 het 34 0 24 13 AAAAG 5 3 259971 CASAVA_Build 19 23602128 4D ATATTCTAAT TGAG/---- TGGGTATATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TGAG 1 0 259972 CASAVA_Build 19 23604048 1D GGAAGCAACT G/- GATAAATGTG 3070 hom 96 het 38 0 33 7 G 2 1 259973 CASAVA_Build 19 23605232 1D ATCTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 6 A 13 12 259974 CASAVA_Build 19 23605534 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 35 4 18 13 A 16 15 259975 CASAVA_Build 19 23613964 2D GTGCACCAGA CT/-- CTCACAAATC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 CT 2 1 259976 CASAVA_Build 19 23614283 4D GAAGCCGAGG CGAA/---- CGGATCACGA 2898 hom 22 het 12 0 8 4 CGAA 1 0 259977 CASAVA_Build 19 23616202 1D ATTTTTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 324 hom 28 1 22 6 A 11 10 259978 CASAVA_Build 19 23617468 2I ATAATAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 14 0 13 1 A 10 12 259979 CASAVA_Build 19 23618080 1I AATTTCCAAG -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 65 het 25 0 22 3 T 6 7 259980 CASAVA_Build 19 23620482 1I GCTATTTATG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 7 8 259981 CASAVA_Build 19 23621334 2D ATATCTAAAA TT/-- TTATATATAT 2847 hom 21 het 9 0 8 1 T 4 2 259982 CASAVA_Build 19 23621733 1I GAATTACTAC -/A AAAAAAATAT 3070 het 402 hom 32 1 28 3 A 7 8 259983 CASAVA_Build 19 23622177 1I GCACACTGTT -/G GGGTGAATAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 3 4 259984 CASAVA_Build 19 23622501 3D AAGGCATAGA TAT/--- TATTACTTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 TAT 2 1 259985 CASAVA_Build 19 23623725 5D AATGGAAAAT AAAAC/----- AAGCAGAATT 3070 hom 120 het 43 0 40 7 AAAAC 1 0 259986 CASAVA_Build 19 23623919 1D CACTGTCACG T/- TTTTTTGCTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 6 259987 CASAVA_Build 19 23624325 2I GGGGTCGGGC --/AA AAAGAGCCAT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 3 5 259988 CASAVA_Build 19 23625578 4D AATTTATACT CACA/---- CAAACATGCT 3070 hom 114 het 41 0 39 3 CA 3 1 259989 CASAVA_Build 19 23626208 3I TTTATTAAAT ---/GCA GTTTTATAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GCA 0 1 259990 CASAVA_Build 19 23626634 1D67M4I TTTTTTAAGG AAAAAAGTATACTTTCAATGTAATTATAACTTTTCAAAAAATTTTCTACACCTTTTAAAGTTATACAC----/-AAAAAGTATACTTTCAATGTAATTATAACTTTTCAAAAAATTTTCTACACCTTTTAAAGTTATACACAAAT AATTTATCTA 3070 hom 123 het 29 0 42 0 N/A 0 0 259991 CASAVA_Build 19 23630687 10I GGCTGCAGTG ----------/AGCCAAAATT GAGCCACTGC 3070 hom 87 het 35 0 26 9 AGCCAAAATT 0 1 259992 CASAVA_Build 19 23631385 3I35M4D CAGTAACAAA ---ATGGATACTATATGATTCCACTTATGTGAGATATCTTAA/ATGATGTATACTATATGATTCCACTTATGTGAGATATC---- TTAGTCACAC 3070 hom 69 het 29 0 24 16 N/A 0 0 259993 CASAVA_Build 19 23633010 2D TCTCAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 22 0 14 9 A 14 12 259994 CASAVA_Build 19 23636050 1I AAAAAAAAAA -/G GGGCGGGGAA 3070 het 148 hom 24 1 16 7 G 3 4 259995 CASAVA_Build 19 23637636 1D AAAGAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 32 0 26 6 A 11 10 259996 CASAVA_Build 19 23643961 1I CCAGGGTGAA -/C TCACATGTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 0 1 259997 CASAVA_Build 19 23644135 1D GTGGGGGGGT G/- GGGGGAGCTT 3070 hom 63 het 27 0 22 6 G 6 5 259998 CASAVA_Build 19 23644506 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 20 10 5 5 A 12 11 259999 CASAVA_Build 19 23645129 3I TATAGATAAC ---/CTT CTTTTACAGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CTT 1 2 260000 CASAVA_Build 19 23646898 3D AAAAAAGGAC AAG/--- AATACTCTAC 1986 hom 37 het 28 0 13 17 AAG 1 0 260001 CASAVA_Build 19 23649614 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 732 het 310 hom 21 3 6 12 A 14 13 260002 CASAVA_Build 19 23650608 1D TAGATTAATG A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 38 het 33 0 13 22 A 7 6 260003 CASAVA_Build 19 23651043 4I AAACAAACAC ----/ACAA ACAAACAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 ACAA 2 3 260004 CASAVA_Build 19 23651916 1D CTCTACATCT A/- AAAAAAACCT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 A 8 7 260005 CASAVA_Build 19 23653212 1I TTCTTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 23 0 16 7 A 14 15 260006 CASAVA_Build 19 23656662 2D TTAGATGGTG CT/-- CTCTCTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 CT 4 3 260007 CASAVA_Build 19 23659642 1D TTCATGTCTC A/- AAGGCTTAGT 3070 hom 57 het 22 0 19 4 A 3 2 260008 CASAVA_Build 19 23661921 15D CGTTTAAGGT CCTGACCCTTCAGGC/--------------- CCTGAGTGAC 3070 hom 63 het 22 0 20 8 CCTGACCCTTCAGGC 1 0 260009 CASAVA_Build 19 23663239 1D TAAAATGGGA G/- GCCCTTGCCT 3070 hom 78 het 30 0 26 6 G 2 1 260010 CASAVA_Build 19 23663505 8I AACATATTCC --------/TGACTGAG TATTTAGGTG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 TGACTGAG 0 1 260011 CASAVA_Build 19 23666562 10D TGTGTGCGTT TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 hom 24 het 16 0 8 8 TG 16 11 260012 CASAVA_Build 19 23666774 2I TGCTGCAAAC --/AT GTGTGTGCAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AT 0 1 260013 CASAVA_Build 19 23669043 1I AATTTTAGGA -/T TTTCTTTTCC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 3 4 260014 CASAVA_Build 19 23672679 1D GTGTTTTTTG A/- GCTTCTTGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 0 260015 CASAVA_Build 19 23678215 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAAAGAAAA 3070 hom 40 het 16 0 13 3 AAAG 0 1 260016 CASAVA_Build 19 23683518 5D GTTGCACAAT AATAA/----- AATGAGCTCT 3070 hom 45 het 17 0 16 3 AATAA 1 0 260017 CASAVA_Build 19 23684043 1I TCTAAGGGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 9 10 260018 CASAVA_Build 19 23687880 5D AACTCATGTT ATGAA/----- ATAATATTTC 3070 hom 96 het 33 0 33 1 ATGAA 1 0 260019 CASAVA_Build 19 23689221 1I ATATATTTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 24 het 15 0 9 6 T 8 9 260020 CASAVA_Build 19 23690371 8D CTCCATCTCA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 75 het 32 0 26 7 AAAC 5 3 260021 CASAVA_Build 19 23692796 3I GCAAAACTAA ---/ACT ACAACACATA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 ACT 0 1 260022 CASAVA_Build 19 23699305 1D CTTATGGAAG A/- AAAACTGAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 4 260023 CASAVA_Build 19 23701839 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2854 het 136 hom 19 1 9 9 A 15 14 260024 CASAVA_Build 19 23704883 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 19 8 A 11 10 260025 CASAVA_Build 19 23705808 1I GAATAAAACA -/T TTTTTCGGGC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 5 6 260026 CASAVA_Build 19 23706232 1I TCCCGGGTAC -/A AAGTGATTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 2 3 260027 CASAVA_Build 19 23706751 1I GCCACTTTTT -/G ACTTTTTAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 0 1 260028 CASAVA_Build 19 23706989 1D CTGTAGGTTG T/- TTTTTTTACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 7 260029 CASAVA_Build 19 23710945 1D ATAGCTGTAG T/- TAACTATACT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 1 260030 CASAVA_Build 19 23711224 2D TCCTGGGTTC AA/-- GAGATTCTCC 3070 hom 66 het 27 0 23 9 A 2 0 260031 CASAVA_Build 19 23716178 2I CGTAGTGAAA --/CT CTGTTTCTAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CT 1 2 260032 CASAVA_Build 19 23717134 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 914 het 914 ref 26 16 2 9 A 13 12 260033 CASAVA_Build 19 23717385 1D AGCAACAATT A/- AGTCACATGC 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 2 1 260034 CASAVA_Build 19 23719582 2D AAGGCTTTTC CA/-- CAGTCTTCAC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 CA 2 1 260035 CASAVA_Build 19 23720962 2D TCTCAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 45 1 40 5 A 13 11 260036 CASAVA_Build 19 23723979 1D GAGAGAGGGT A/- AAATGTTCAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 4 3 260037 CASAVA_Build 19 23724453 1I AATTTTTCTC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 42 het 21 0 15 6 A 8 9 260038 CASAVA_Build 19 23724947 4D AAAAAAAAAC CAAA/---- AAACAACTAA 712 het 248 hom 9 1 5 6 CAAA 1 0 260039 CASAVA_Build 19 23725684 4D GGCAGGAGAA TTGC/---- TTGAACCTGG 3070 hom 39 het 15 0 11 4 TTGC 1 0 260040 CASAVA_Build 19 23727161 2D TCAACCATAT AC/-- ACAGACCTGA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 AC 2 1 260041 CASAVA_Build 19 23727220 1D AAGTCTTGAG A/- GAAATTCAGT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 1 0 260042 CASAVA_Build 19 23727904 1I AGCCAGGCAT -/G GGTGGCATGT 3070 het 2933 hom 21 6 13 3 G 2 3 260043 CASAVA_Build 19 23729135 2I TAGTGAAACC --/CT GTCTCTACTA 3070 hom 99 het 37 0 31 7 CT 0 1 260044 CASAVA_Build 19 23735312 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 107 het 27 hom 7 0 1 6 T 13 12 260045 CASAVA_Build 19 23739387 2D CTCCCAAGTC TG/-- TAAACATTTT 3070 hom 72 het 25 0 22 3 TG 1 0 260046 CASAVA_Build 19 23740100 1D GTGCATCTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 31 het 34 1 29 4 A 10 9 260047 CASAVA_Build 19 23740627 2I ATAAAAAGAC --/TT ATAAGGTATT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 0 2 260048 CASAVA_Build 19 23741401 3D GGGCCAAATG TTT/--- TTTTTTTTTT 2041 hom 24 het 9 0 9 0 T 17 14 260049 CASAVA_Build 19 23742813 20D AATCTAGTGA TATGTTTTATTTGTTAAATT/-------------------- TATGTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 5 TATGTTTTATTTGTTAAATT 1 0 260050 CASAVA_Build 19 23744826 1I TCCCCATAAA -/G GGTAGTGTGA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 G 2 3 260051 CASAVA_Build 19 23747189 1I ATCCTTGGTC -/T TCTCTTTTTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 1 2 260052 CASAVA_Build 19 23747724 8D CCTGTGTGTA TGTGTGTG/-------- TATATATATA 597 hom 10 het 8 0 3 5 TG 4 0 260053 CASAVA_Build 19 23747910 4D20M1I GGCTAATTTG ATATATATATATATATATATCAAA-/----GTATATATATATATATCAAAT TTTTTTTTTT 2654 hom 21 het 8 0 8 1 N/A 0 0 260054 CASAVA_Build 19 23748639 2I AGTGATCTGA --/CT CTCTTGCCTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CT 2 3 260055 CASAVA_Build 19 23751137 2D TCATTGTGAC AG/-- TGTGACATAC 3070 hom 90 het 32 0 29 5 AG 1 0 260056 CASAVA_Build 19 23752262 6D TTACCTAGAA AGATGT/------ AGATGTGACT 3070 hom 140 het 53 0 44 11 AGATGT 2 1 260057 CASAVA_Build 19 23760329 1I ATTCTTGGCC -/A AAAAACCCAG 3070 hom 148 het 54 0 50 5 A 5 6 260058 CASAVA_Build 19 23762081 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 345 hom 27 2 22 3 A 7 8 260059 CASAVA_Build 19 23762891 1I AGCTCCTATG -/T TATCTGACTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 2 260060 CASAVA_Build 19 23766429 2D TCTCTGAGAC TG/-- GAGTGCAGTG 3070 hom 57 het 26 0 19 8 TG 1 0 260061 CASAVA_Build 19 23767210 2I24M1I AAGTAGCAAC --TAAGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTG-/TATAAGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 15 5 N/A 0 0 260062 CASAVA_Build 19 23768007 2D GGGTTATATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 22 5 T 13 11 260063 CASAVA_Build 19 23769832 2D TTTACAATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 26 1 12 14 T 16 14 260064 CASAVA_Build 19 23771063 1I ATTGGCCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1419 hom 33 4 24 5 T 13 14 260065 CASAVA_Build 19 23771501 1I4M4D AGTGGTTTAT -TTATCTTA/CTTAT---- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 26 0 26 3 N/A 0 0 260066 CASAVA_Build 19 23771690 1I TTTCCCTTTT -/A AACACTACTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 2 3 260067 CASAVA_Build 19 23773495 4D AAAACTGTAG TAGC/---- TCTCCAGTTA 3070 hom 87 het 32 0 29 5 TAGC 1 0 260068 CASAVA_Build 19 23775258 2D TTCTACAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 37 1 27 9 T 13 11 260069 CASAVA_Build 19 23775895 1I28M1D TAGGGGAGGG -TTGGGGGGGATGGAGTCTTGCTCTGTCAC/TTTGGGGGGGATGGAGTCTTGCTCTGTCA- CAGGCTGGAG 3070 het 60 hom 21 1 17 4 N/A 0 0 260070 CASAVA_Build 19 23777341 4I TCAAACAGAT ----/AAAC AAATTGATTC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AAAC 0 1 260071 CASAVA_Build 19 23777738 1I TGAGATTTAA -/G TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 21 1 18 2 G 0 1 260072 CASAVA_Build 19 23778234 1D TACATTTTTT A/- AAAAAAATCA 1424 hom 10 het 5 0 4 1 A 8 7 260073 CASAVA_Build 19 23779106 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 het 24 hom 11 1 10 2 T 5 6 260074 CASAVA_Build 19 23780213 2D AGAGATGAAC AT/-- GTGGTGCTCA 3070 hom 78 het 31 0 26 6 AT 1 0 260075 CASAVA_Build 19 23782291 2D CTCTTTTCTC AG/-- AGTTAGAGAA 3070 het 3070 ref 45 20 20 7 AG 2 1 260076 CASAVA_Build 19 23784381 1D ACTGTTTATG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 10 9 260077 CASAVA_Build 19 23784631 1D TTTTGTTTGG C/- CCCCCCAATG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 7 6 260078 CASAVA_Build 19 23786159 2D ATAGGATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 12 10 260079 CASAVA_Build 19 23786342 3D AAAATTTTCA ACC/--- ACTTTTGTCA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 ACC 1 0 260080 CASAVA_Build 19 23786483 5I ATATTTGGAT -----/TACAG TAGTTTTATT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TACAG 0 1 260081 CASAVA_Build 19 23788859 2I ATTTCAAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 14 8 A 14 16 260082 CASAVA_Build 19 23790034 15I CATAAATAGC ---------------/TTGGCACCATCCTCT TGGTAATCAA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTGGCACCATCCTCT 0 1 260083 CASAVA_Build 19 23790633 1D CATAAAATGT A/- GTTGTTTTTT 3070 het 827 hom 31 4 20 7 A 1 0 260084 CASAVA_Build 19 23791666 5I AACAATATAC -----/TTTAA TTTAATGACA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TTTAA 1 2 260085 CASAVA_Build 19 23792317 4D CCTTGGACTA AGAC/---- AGGGCTTGTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AGAC 1 0 260086 CASAVA_Build 19 23795337 4I GTTAAAACTC ----/CTCT CTCCTTATAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 1 3 260087 CASAVA_Build 19 23799014 3D AGAAACTGGA GTT/--- GTTGTGAAGT 3070 hom 114 het 40 0 38 5 GTT 2 1 260088 CASAVA_Build 19 23799470 2I TGGTTAGAAA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 9 11 260089 CASAVA_Build 19 23801534 1D GGGTTCACCA T/- TGTTGGTCTG 3070 hom 36 het 16 0 13 4 T 2 1 260090 CASAVA_Build 19 23802769 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAAAAAAAT 3070 hom 9 het 27 0 16 11 AAAG 0 1 260091 CASAVA_Build 19 23802966 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2882 hom 29 11 15 5 T 13 12 260092 CASAVA_Build 19 23803201 1D AATTTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 12 11 260093 CASAVA_Build 19 23805226 4I ATCATATTTT ----/CTTA CTTTTAGGAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 CTTA 0 1 260094 CASAVA_Build 19 23807887 1I ATTTGGCAAA -/G CCTTTAATCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 0 1 260095 CASAVA_Build 19 23808969 1I GCTCTTCCAT -/C ATTCCTGGTT 3070 hom 63 het 31 0 22 9 C 0 1 260096 CASAVA_Build 19 23809860 1I TTTTAATATA -/T TTTTTCTTTG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 5 6 260097 CASAVA_Build 19 23809991 4D GGAGTAAGTC TGTT/---- TGTGTGAGTA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 TGTT 1 0 260098 CASAVA_Build 19 23810258 4D TGTTTAATAG TTTT/---- TTTTTTTGTT 1842 hom 37 het 24 0 9 16 T 11 7 260099 CASAVA_Build 19 23812019 2D TTTTGGTGAC TT/-- ATAGTATACT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 2 0 260100 CASAVA_Build 19 23812944 3I CACTTGATCA ---/TGG TGGATTATCT 3070 hom 126 het 50 0 42 8 TGG 1 2 260101 CASAVA_Build 19 23813404 2I CCTTGAATGA --/TT TTTTTTGTAT 3070 hom 9 het 32 1 14 17 T 6 8 260102 CASAVA_Build 19 23814747 1D GAGAAAAAAT G/- GTTGATTCTC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 G 2 1 260103 CASAVA_Build 19 23815445 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1340 hom 10 het 6 0 4 2 A 10 11 260104 CASAVA_Build 19 23817173 3D TAAATATGTG TGT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 30 0 27 3 TGT 1 0 260105 CASAVA_Build 19 23819344 5D TCCATTTTTT TATAA/----- TATAATAATA 117 het 117 ref 7 1 1 5 TATAA 2 1 260106 CASAVA_Build 19 23819916 2D TTCTGATTTA TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 3 TG 1 0 260107 CASAVA_Build 19 23820971 1I ATATTAATAT -/G TAAGGCTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 260108 CASAVA_Build 19 23823147 1I TCTAATGTAT -/C AACTCCAGGC 3070 hom 67 het 27 0 23 4 C 0 1 260109 CASAVA_Build 19 23823338 1I TACTGCATTT -/A GCATGTGATG 3070 het 3070 hom 55 27 23 5 A 0 1 260110 CASAVA_Build 19 23823976 6D2M2D CCAAAGAGGT AGAGGGGCAT/------GC-- ACCTGGATTG 3070 hom 87 het 28 0 30 0 N/A 0 0 260111 CASAVA_Build 19 23825863 1D AGGAGTTAGG C/- CCTCTGGGAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 3 2 260112 CASAVA_Build 19 23826988 4D GGAATTAAAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 62 het 28 0 24 6 AC 10 8 260113 CASAVA_Build 19 23828017 2D TTTACTAGAA AC/-- ACATGAGAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 AC 2 1 260114 CASAVA_Build 19 23832748 2I GTATAAGCAA --/AT ATATATATAT 3070 het 1966 hom 26 6 14 6 AT 7 8 260115 CASAVA_Build 19 23834270 1D GTTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 12 11 260116 CASAVA_Build 19 23835659 1D CCTCCTGCTT A/- AAAAAGCAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 6 5 260117 CASAVA_Build 19 23841156 1I CAATGTGGTG -/C CCCCCCCCCG 2800 het 2800 ref 34 13 10 11 C 9 10 260118 CASAVA_Build 19 23844064 1D CAATTGCCCC A/- ACTGTGCTGA 3070 het 3070 ref 46 24 14 9 A 2 1 260119 CASAVA_Build 19 23845048 5I GCACTGTCAT -----/TTTAA TCACACTCAT 3070 hom 86 het 35 0 29 6 TTTAA 0 1 260120 CASAVA_Build 19 23845168 1I GGTGAATTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 98 het 38 0 34 4 A 8 9 260121 CASAVA_Build 19 23851292 5I GAGAAGAGAC -----/AAGTT AAGAGTGCAA 3070 hom 58 het 37 1 31 5 AAGTT 0 1 260122 CASAVA_Build 19 23852944 1D AGGAGTGGAG A/- AAAAGGAGGA 3070 hom 47 het 20 0 14 7 A 5 4 260123 CASAVA_Build 19 23853072 1I GAAAGTGGTG -/A AAAAAACCGG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 6 7 260124 CASAVA_Build 19 23853189 3D AAAGGTGAGG AGA/--- AGAAGGAGGA 3070 hom 56 het 20 0 18 3 AGA 2 1 260125 CASAVA_Build 19 23853321 5D GGGAGGAGAA GAGAT/----- GAATGAGGAG 3070 hom 60 het 25 0 19 6 GAGAT 1 0 260126 CASAVA_Build 19 23853381 3D AAAAGGAGAA GAG/--- GAGGAGAGGA 3070 hom 51 het 24 0 15 9 GAG 3 2 260127 CASAVA_Build 19 23853538 3I AGGAGGAAAA ---/AGG AGAAAAAAGG 3070 hom 35 het 15 0 12 3 AGG 0 1 260128 CASAVA_Build 19 23853599 3D AGAGAAAAAA GAG/--- GAGAGGAGGA 117 hom 3 het 18 0 1 18 GAG 2 1 260129 CASAVA_Build 19 23853660 3D GAATGGAGAA AGG/--- AGGAGGAGAG 2396 het 482 hom 23 2 10 12 AGG 3 2 260130 CASAVA_Build 19 23853786 1D GAAGGAAGAC A/- AAAAAAGGAG 3070 hom 60 het 28 0 19 9 A 7 6 260131 CASAVA_Build 19 23853871 2D GTGGAGAGAA AG/-- AGAAAGCAGG 3070 het 3070 hom 38 14 19 7 AG 2 1 260132 CASAVA_Build 19 23854108 3D GAAGGAGCAT AGG/--- AGGAGGAGGA 580 hom 14 het 16 0 6 10 AGG 5 4 260133 CASAVA_Build 19 23854318 7D GAGAAAGGAG AAAAAGA/------- AAAAAGAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 1 AAAAAGA 2 1 260134 CASAVA_Build 19 23854421 3D GAAAGAAAAA AGG/--- AGGAGAGGAG 3070 hom 58 het 25 0 18 8 AGG 2 1 260135 CASAVA_Build 19 23854618 3D AAGGAAAAAG AGA/--- AGAAGGAGAG 3070 hom 69 het 25 0 23 5 AGA 2 1 260136 CASAVA_Build 19 23854853 5I GAAGAGAAAA -----/AGAAG AGGAGAAAGA 2813 hom 4 het 19 0 8 11 AGAAG 0 1 260137 CASAVA_Build 19 23863891 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAACAA 2975 het 2975 ref 20 9 8 4 A 8 7 260138 CASAVA_Build 19 23873015 1D AGAACTGAGA C/- CTGTGCAGGA 3070 het 3070 ref 51 22 23 9 C 2 1 260139 CASAVA_Build 19 23873346 1I GTGATGTAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 51 39 7 5 T 8 9 260140 CASAVA_Build 19 23874537 1I AAAGATATTA -/C TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 60 22 34 4 C 0 1 260141 CASAVA_Build 19 23875739 1I CTCTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1880 het 1880 ref 30 11 12 7 T 15 16 260142 CASAVA_Build 19 23877654 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 T 8 7 260143 CASAVA_Build 19 23886085 1D TAAAAATACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2767 hom 17 7 9 2 A 12 11 260144 CASAVA_Build 19 23888730 2D ACTCCGTTTT GA/-- GAGAGAGCTA 3070 het 3070 ref 39 18 15 8 GA 4 3 260145 CASAVA_Build 19 23891444 1D TGGGTCAAGA T/- TTTTTTTTTT 1466 het 1466 ref 39 31 4 4 T 13 12 260146 CASAVA_Build 19 23895929 4I CAGAGCAAGA ----/CTCT CTCTCTCTCG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 CT 4 6 260147 CASAVA_Build 19 23897565 1I ATAGGTCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2939 hom 26 9 11 6 T 13 14 260148 CASAVA_Build 19 23898860 1I TAATTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1833 het 212 hom 11 1 7 3 T 16 17 260149 CASAVA_Build 19 23921009 1D ATTCAAGGTT A/- ATATTAATAT 1853 het 1853 ref 44 36 4 5 A 2 1 260150 CASAVA_Build 19 23939763 1I ATGATCAATT -/A AAAAAAAAAA 2519 het 2519 ref 23 8 7 8 A 13 14 260151 CASAVA_Build 19 23946733 1D CGGGAGTAGG C/- CCCCCCCGCA 1223 het 1223 ref 25 6 6 13 C 8 7 260152 CASAVA_Build 19 23948551 1I GGAAGAGGAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 7 8 260153 CASAVA_Build 19 23974330 3I CTGTTTCACA ---/ATG ATAGGAAGAT 3070 het 3070 ref 68 39 24 5 ATG 0 1 260154 CASAVA_Build 19 23975710 5I TGCTCTTCAC -----/AAAGA AAAAAGAACT 293 het 293 ref 37 25 3 9 AAAGA 0 1 260155 CASAVA_Build 19 23976167 1D20M6I GTACCATCCA TTTTTCAGGGCGAGTTGATTC------/-TTTTCAGGGCTAGTTGATTCGGCAGG TTTGTTGTTA 1537 het 1537 ref 51 50 5 4 N/A 0 0 260156 CASAVA_Build 19 23977483 66D AAGGAGGAGG AGGGGTGGCCGAGGAGGGAGGGCGGTTGGAGGGGTCGGGAGGAACGGGAGGCAGGAAAGATCCGCC/------------------------------------------------------------------ AGACCACTGG 2448 het 2448 ref 22 18 10 9 AGGGGTGGCCGAGGAGGGAGGGCGGTTGGAGGGGTCGGGAGGAACGGGAGGCAGGAAAGATCCGCC 1 0 260157 CASAVA_Build 19 23979865 2I TCCAGCACTA --/TT TACAATAGCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 1 3 260158 CASAVA_Build 19 23980853 1I ATTTACCTGA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 18 7 8 3 T 6 7 260159 CASAVA_Build 19 23993117 2D GTTTTGTCTA CC/-- TTTGGTCTTT 2092 het 2092 ref 15 9 5 1 C 2 0 260160 CASAVA_Build 19 24004801 1I ATACATATTT -/G GGGGGGCACC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 G 6 7 260161 CASAVA_Build 19 24006032 1D GCTTCTGGCC A/- AAAAAAAACC 3070 het 2460 hom 23 6 14 4 A 9 8 260162 CASAVA_Build 19 24006140 1D ATTTTTAAAA G/- GTCTCAGTGG 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 G 2 1 260163 CASAVA_Build 19 24006387 26D TTATTTTGAG TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 3070 het 631 hom 17 2 15 4 TA 19 6 260164 CASAVA_Build 19 24006874 1D AAAGCAAAAC A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 A 8 7 260165 CASAVA_Build 19 24008010 1I GAGTGCCGGT -/G CCTTATCCAA 2479 het 1803 hom 15 5 7 3 G 0 1 260166 CASAVA_Build 19 24008176 2D CCCCTGGGGA CT/-- CTGTGACGGC 2885 het 2885 ref 26 13 8 5 CT 2 1 260167 CASAVA_Build 19 24008920 7D GCCTCTCCTG CAGATGT/------- CCCAGCCTGC 2715 het 2715 ref 20 12 8 1 CAGATGT 1 0 260168 CASAVA_Build 19 24009428 4D AAGAAGTTAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1664 het 769 hom 21 6 5 10 T 16 12 260169 CASAVA_Build 19 24009583 2I CTGCCGTCAT --/GC GCGCAGCATG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 GC 2 3 260170 CASAVA_Build 19 24013820 1D CCACACATAA G/- GGCTGAAATC 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 G 3 2 260171 CASAVA_Build 19 24014053 3D GAAAGTTTTT TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 TTG 3 2 260172 CASAVA_Build 19 24018377 3D CAGAAATGTT CTA/--- CTCTCCAACT 3070 het 3070 ref 43 25 16 4 CTA 1 0 260173 CASAVA_Build 19 24019298 5I GTGGATCTTA -----/TATTC TATTTCCACA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TATTC 0 1 260174 CASAVA_Build 19 24020699 6D GCTGGTAGGA AACAGT/------ ATTTTGGGGA 3070 het 3070 ref 28 16 13 1 AACAGT 1 0 260175 CASAVA_Build 19 24021682 1D ATTCTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 9 8 260176 CASAVA_Build 19 24023342 1I GTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 46 21 15 10 T 8 9 260177 CASAVA_Build 19 24023699 4D TGGTTCTATC TCTG/---- TCTGTCTGTC 625 het 625 ref 21 9 5 8 TCTG 3 2 260178 CASAVA_Build 19 24025511 1I TGGCAAATTT -/A TTTTTATGTT 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 0 1 260179 CASAVA_Build 19 24026248 2D GATGAGGTGA CT/-- CTCCTCTCCA 3070 het 3070 ref 46 24 19 5 CT 2 1 260180 CASAVA_Build 19 24026399 5D TGCGACACTC CTCTT/----- CTACCTGGGA 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 CTCTT 1 0 260181 CASAVA_Build 19 24028413 2D ATAACATATC TT/-- TTTATTCATC 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 T 5 3 260182 CASAVA_Build 19 24028608 1I CTGGGCTCTG -/C CCCACAGGGA 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 C 3 4 260183 CASAVA_Build 19 24031605 4I GGAGATTGTG ----/ACAT ACATCTTTTT 3070 het 3070 ref 52 28 20 4 ACAT 1 2 260184 CASAVA_Build 19 24034281 5I TGTATTTTGG -----/CACAT CACTGGGGCC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 CACAT 0 1 260185 CASAVA_Build 19 24037240 2I CAGGTGAGAC --/TG TGAAATTTAT 3070 het 3070 ref 74 37 30 7 TG 1 2 260186 CASAVA_Build 19 24037665 2I CTGGTCTTGA --/AC ACTCCTGACC 3070 het 3070 hom 31 12 15 6 AC 1 2 260187 CASAVA_Build 19 24040341 1I TTTGACTCTC -/T CCTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 53 24 27 2 T 0 1 260188 CASAVA_Build 19 24048873 1D TGACTCTCTT A/- TTCTACCAGG 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 A 1 0 260189 CASAVA_Build 19 24075325 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 13 12 260190 CASAVA_Build 19 24076872 1D ACAAAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1044 hom 20 4 10 6 T 15 14 260191 CASAVA_Build 19 24077032 1D GAGATTTAAG T/- TTTTTTTTTT 1473 het 1473 ref 21 11 4 6 T 12 11 260192 CASAVA_Build 19 24106367 1D CTAATTAGAT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 3070 ref 34 15 11 9 G 10 9 260193 CASAVA_Build 19 24113947 1D TAGACTCCAT C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 C 9 8 260194 CASAVA_Build 19 24116859 1I TATTTTTCTA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 6 7 260195 CASAVA_Build 19 24120721 1I GAAACATCTC -/A AAAGTTTTCG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 3 4 260196 CASAVA_Build 19 24200549 1I AGATATTTCG -/T TTTTTCACCG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 5 6 260197 CASAVA_Build 19 24215530 1I TATCAGGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 44 0 36 8 T 9 10 260198 CASAVA_Build 19 24222278 1D GAAGATTGTG T/- TAACTCACAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 2 1 260199 CASAVA_Build 19 24251727 1D TTCACTGATA C/- TTTCTCTCTG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 C 1 0 260200 CASAVA_Build 19 24281337 1I GAGTATGGTG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 7 8 260201 CASAVA_Build 19 24290889 1I GGAAAAACTA -/T TTTTTGTCCA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 5 6 260202 CASAVA_Build 19 24293035 1I ATATTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 T 11 12 260203 CASAVA_Build 19 24301043 1I GCCTACAGTG -/A AAAAAATCTT 3070 hom 70 het 32 0 24 8 A 6 7 260204 CASAVA_Build 19 24317258 3I AAAAGGAAAT ---/ATC ATCTTCAGAT 3070 het 3070 ref 50 36 11 4 ATC 1 2 260205 CASAVA_Build 19 24329224 1D AAAGCAGATA T/- CTTCAGATGA 3070 het 3070 ref 62 42 14 6 T 1 0 260206 CASAVA_Build 19 24330075 4I TTGAAAAAGG ----/AAAT AAATATCTTC 3070 het 3070 ref 63 47 12 4 AAAT 1 2 260207 CASAVA_Build 19 24330694 1I AGCAGTTTGG -/A AAACACTGTT 3070 het 3070 ref 75 51 18 6 A 3 4 260208 CASAVA_Build 19 24335855 1D ATAAAAATTA G/- AAAGAATCTT 3070 het 3070 hom 64 27 31 6 G 1 0 260209 CASAVA_Build 19 24335914 2D ACAGTTAAAA CT/-- CTCTTTTGAT 3070 het 3070 ref 67 37 13 18 CT 3 2 260210 CASAVA_Build 19 24336459 1I GGAAACACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 64 44 12 8 T 9 10 260211 CASAVA_Build 19 24339552 1D ATATCTTTGG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 58 34 13 13 A 8 7 260212 CASAVA_Build 19 24340405 1D GAAAAAAATG A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 74 49 15 12 A 8 7 260213 CASAVA_Build 19 24340807 4D AACCTTTCCT TTGA/---- TTGAGCTGTT 3070 het 3070 hom 66 26 35 8 TTGA 2 1 260214 CASAVA_Build 19 24341003 1I GGAAACACTG -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 72 30 33 9 T 7 8 260215 CASAVA_Build 19 24341588 5I GAATCTTTCT -----/GAGAA GAGAAACTGC 3070 het 3070 hom 69 28 34 7 GAGAA 1 2 260216 CASAVA_Build 19 24348848 1D CTTTTGATTG A/- GAAGTTTGGA 2498 het 2498 ref 81 67 6 8 A 1 0 260217 CASAVA_Build 19 24349582 2I AATAAATAAA --/AT ATATCTTCAG 3070 het 3070 hom 62 23 32 7 AT 2 3 260218 CASAVA_Build 19 24352066 1D CTTTTCTTTT G/- ACTGAGCAGT 3070 het 3070 ref 74 50 18 8 G 1 0 260219 CASAVA_Build 19 24354654 12D TTTAAACTTT TCTTTTGATTGA/------------ TCAGTTTGGA 3070 het 3070 ref 77 49 28 10 TCTTTTGATTGA 1 0 260220 CASAVA_Build 19 24356686 1D GAGTTAAAAC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 71 51 11 9 T 8 7 260221 CASAVA_Build 19 24358771 4D AAACTTTTCT TTGA/---- TTGATCAGTT 3070 het 3070 ref 80 47 15 21 TTGA 2 1 260222 CASAVA_Build 19 24358824 10D TGTGACATTG GAGAGTGCAT/---------- GAGGCCTATG 3070 het 3070 hom 80 34 40 10 GAGAGTGCAT 1 0 260223 CASAVA_Build 19 24362840 1I TGTGGAGTTG -/T TTTGTGGCTA 3070 het 3070 ref 64 37 18 12 T 3 4 260224 CASAVA_Build 19 24363112 5I CACAGAGTTG -----/GACCT AACATTTCTC 1287 het 1287 ref 70 61 4 5 GACCT 0 1 260225 CASAVA_Build 19 24363994 1I TATGAACCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 64 24 26 14 T 9 10 260226 CASAVA_Build 19 24367036 4I GAAACTTTCT ----/TTGA TTGAGCAGTT 3070 het 3070 hom 61 26 26 9 TTGA 1 2 260227 CASAVA_Build 19 24374593 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2459 hom 26 7 11 8 A 10 9 260228 CASAVA_Build 19 24375172 1I TGAACCTATC -/T TTTGATTGAG 1065 het 1065 ref 78 65 3 10 T 3 4 260229 CASAVA_Build 19 24376842 1D AACTACTTTG T/- GATGTGTGCA 3070 het 3070 ref 78 54 17 8 T 1 0 260230 CASAVA_Build 19 24379562 1I GTAAACACTA -/T ATTTGTAGAA 3070 het 3070 ref 55 28 19 9 T 0 1 260231 CASAVA_Build 19 24386799 1D AACTTCTTTG T/- TATGTGTGCA 3070 het 3070 ref 46 37 7 2 T 2 1 260232 CASAVA_Build 19 24388053 2I AGTTCTGAAA --/CT CTCTTTTAGT 3070 het 3070 hom 72 32 36 5 CT 2 3 260233 CASAVA_Build 19 24388371 1D TGAACATGTC T/- TTTTTTTTTA 1787 het 1787 ref 20 9 5 6 T 10 9 260234 CASAVA_Build 19 24390621 1D GTTTTGAAAC A/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 1 0 260235 CASAVA_Build 19 24390732 1D CACTTCCTAG T/- GATTTGTGCA 1219 het 1219 ref 36 29 4 4 T 1 0 260236 CASAVA_Build 19 24410941 1D ACATTGAGGG C/- TATGGTGGAG 2816 het 2816 ref 28 20 7 1 C 1 0 260237 CASAVA_Build 19 24412502 1I TATCTTCACA -/T AAAAACCAGA 3070 het 3070 ref 67 44 15 8 T 0 1 260238 CASAVA_Build 19 32445483 4D3M3I GGGGATATTT GGGCTGA---/----TGACCC TTAGGGGCCT 180 het 180 ref 38 34 3 3 N/A 0 0 260239 CASAVA_Build 19 32473446 1I TGAAACACTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 8 9 260240 CASAVA_Build 19 32485474 1D TTTTGAAAAA C/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 43 27 10 6 C 1 0 260241 CASAVA_Build 19 32521816 1D CTTCTGTCTA T/- TTTTTATGTA 3070 het 3070 ref 75 36 32 8 T 6 5 260242 CASAVA_Build 19 32529457 1D TTTCCATTTG T/- TTGGTAGATC 1211 het 1211 ref 30 18 4 8 T 3 2 260243 CASAVA_Build 19 32529594 1D AATTGGAACA T/- TTAGCCCATT 3070 het 3070 ref 44 24 15 7 T 3 2 260244 CASAVA_Build 19 32532056 1D TGCAGATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1764 hom 69 10 17 42 A 16 15 260245 CASAVA_Build 19 32538605 1I AAAAGTTCAA -/T CGTGTGAGAC 3070 het 3070 hom 63 24 29 10 T 0 1 260246 CASAVA_Build 19 32541909 3I ACAAATCACA ---/AAG AAGGAGTTTC 3070 het 3070 ref 61 44 12 5 AAG 1 2 260247 CASAVA_Build 19 32544932 1D AACTGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2488 hom 32 6 13 13 T 12 11 260248 CASAVA_Build 19 32545754 1D ATTTTTAATC A/- TAGGCCTCAA 3070 het 3070 hom 73 28 38 12 A 1 0 260249 CASAVA_Build 19 32546324 1I AGACTGTTTC -/A CAACTGCTCA 1124 het 1124 ref 50 39 4 8 A 0 1 260250 CASAVA_Build 19 32548088 2I CACACATCAC --/AA AAAGTTTCCC 3070 het 3070 ref 59 29 26 8 A 3 5 260251 CASAVA_Build 19 32554140 3D AGGAGCAATA TCG/--- TGAAAATGGC 2317 het 2317 ref 30 20 5 7 TCG 1 0 260252 CASAVA_Build 19 32556421 1D AATACCTTCA T/- CCAAAAACTA 3070 het 3070 hom 38 14 19 8 T 1 0 260253 CASAVA_Build 19 32557098 12D AAGGAAATAT CTTCACATAAAA/------------ ACTAGACAGA 3070 het 3070 hom 74 37 35 11 CTTCACATAAAA 1 0 260254 CASAVA_Build 19 32557346 2D GTTGAACGTA TC/-- TTTTTTTTTT 2648 het 2648 ref 74 27 8 42 TC 1 0 260255 CASAVA_Build 19 32557738 2I TAATCCAGTC --/TA TGATTGTTGG 1818 het 1818 ref 26 20 4 2 TA 0 1 260256 CASAVA_Build 19 32558211 1I CTGTAAATTT -/G TTTGAGTTCA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 G 0 1 260257 CASAVA_Build 19 32558925 2D TAAGTTACTT GG/-- GGGGCAGTAT 3070 het 3070 ref 58 26 28 6 G 6 4 260258 CASAVA_Build 19 32567661 2D GAGGTGAAAC AT/-- ATTTTTGGTG 3070 het 3070 ref 81 50 22 12 AT 2 1 260259 CASAVA_Build 19 32570849 2I CAAAAAAACT --/AC ACAGAAGCAT 3070 het 3070 ref 71 37 25 9 AC 1 2 260260 CASAVA_Build 19 32573614 1D AACTTCTTTG T/- GAGGTGTGCA 934 het 934 ref 38 32 3 3 T 1 0 260261 CASAVA_Build 19 32574146 2I33M2I ACTTTCATCT --CAGAGTTGAAATTTTCTTTTTTTTGAGCAGTTT--/CACAGATTTGAGACTTTCTTTTAATTGAGCAGTTTTC GGAAATGTCT 1361 het 1361 ref 42 34 3 7 N/A 0 0 260262 CASAVA_Build 19 32574430 1D ATCTTCACAT A/- AAAATTAGAC 3070 het 3070 ref 64 32 14 18 A 5 4 260263 CASAVA_Build 19 32575150 2D GTGGACACAA AG/-- AGAGTGAGCA 3070 het 3070 hom 76 28 44 7 AG 3 2 260264 CASAVA_Build 19 32576846 1D AAATCAAAAG A/- AAGTTTCAAC 3070 het 3070 ref 77 39 30 12 A 3 2 260265 CASAVA_Build 19 32578880 1I AGAGTGTTTC -/A AAACTGCTCT 2150 het 2150 ref 80 60 8 12 A 3 4 260266 CASAVA_Build 19 32579122 1D TAATGAGAAT G/- CTTCTGTCTA 3070 het 3070 ref 61 41 13 7 G 1 0 260267 CASAVA_Build 19 32580070 2I TACTACAAAA --/AG AGTGTTTCAA 3070 het 3070 ref 71 33 31 7 AG 1 2 260268 CASAVA_Build 19 32580575 1D AAGATACTAC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 39 17 15 13 A 8 7 260269 CASAVA_Build 19 32581797 4D TCCAAACTGC TCAA/---- TCAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 42 25 12 8 TCAA 2 1 260270 CASAVA_Build 19 32584010 1I TACTATAAAA -/G GATTGTTTCC 1919 het 1919 ref 23 12 4 7 G 1 2 260271 CASAVA_Build 19 32589028 1I TGCACACATC -/A AAAAAGTAGT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 5 6 260272 CASAVA_Build 19 32606855 1D TGATGTGTGC T/- TTATTATCAC 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 3 2 260273 CASAVA_Build 19 32627048 15I ATTTCTTTTC ---------------/AATGAGCAGATTGGA AACTCTCTTC 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 AATGAGCAGATTGGA 0 1 260274 CASAVA_Build 19 32640087 3I TTCTGAGAAA ---/CTT CTTTGTGATG 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 CTT 1 2 260275 CASAVA_Build 19 32655086 1D GAAGATATTT C/- CTTTTACACC 1292 hom 8 het 13 0 5 8 C 2 1 260276 CASAVA_Build 19 32660125 1D CTACTCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 A 13 12 260277 CASAVA_Build 19 32660959 1I CAGATTCTAT -/A AAAAGACTGT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 4 5 260278 CASAVA_Build 19 32665186 1I CTATGGTGAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 42 12 23 7 A 7 8 260279 CASAVA_Build 19 32675146 1D AAACACTGTT C/- TTTTTTTTTA 3070 het 41 hom 26 1 23 3 C 1 0 260280 CASAVA_Build 19 32684853 1I AGAATATACA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 7 8 260281 CASAVA_Build 19 32715553 1I GAATTAAACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 T 9 10 260282 CASAVA_Build 19 32725871 1D GACCTATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 725 hom 36 2 26 8 A 13 12 260283 CASAVA_Build 19 32727362 10D TTTCTTTTAA TTCAGCAGGT/---------- TGCAAGCTGT 3070 het 3070 hom 35 15 18 4 TTCAGCAGGT 1 0 260284 CASAVA_Build 19 32742229 1I TGCTTTGTGA -/T GAGTACATTC 3070 hom 115 het 48 0 39 9 T 0 1 260285 CASAVA_Build 19 32745364 3D TTTACACTGT TGG/--- TGGCACTGTA 2761 het 2761 ref 15 9 6 1 TGG 2 1 260286 CASAVA_Build 19 32754900 1D GCCTATGGTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 9 8 260287 CASAVA_Build 19 32771535 1D GTGAAACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 51 1 34 16 T 13 12 260288 CASAVA_Build 19 32775017 1I GGTGTGCGCA -/T TTTTCTCACA 3070 hom 65 het 27 0 22 5 T 4 5 260289 CASAVA_Build 19 32777745 1I TGTGTGCATT -/C TTCTCACAGA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 C 0 1 260290 CASAVA_Build 19 32783540 1D AACCCCTCCC T/- TTTTTTTTGT 2415 het 2415 ref 19 9 5 5 T 9 8 260291 CASAVA_Build 19 32794635 2D TATCTGAGAA AC/-- TGCTTTGTGA 3070 het 3070 hom 33 12 18 5 AC 1 0 260292 CASAVA_Build 19 32800890 1D GGAAACACTG T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 8 7 260293 CASAVA_Build 19 32821204 27D GAATCTCAAG GCAGAAGAATTTTTCTTAGTACATAAC/--------------------------- GCAGAAGAAT 954 het 954 ref 13 11 3 1 GCAGAAGAATTTTTCTTAGTACATAAC 2 1 260294 CASAVA_Build 19 32839531 1D CTGCCATTAG A/- ATACCCGGGG 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 2 1 260295 CASAVA_Build 19 32845427 1I TTAATAGATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 13 14 260296 CASAVA_Build 19 32863199 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1393 het 1393 ref 27 18 4 5 A 12 11 260297 CASAVA_Build 19 32892781 3I GTGAGACAGA ---/AGG AGAAGCTGGG 3070 hom 93 het 40 0 31 9 AGG 0 1 260298 CASAVA_Build 19 32909889 2D TAGATTCTAC AA/-- AAAGAGTGTT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 5 3 260299 CASAVA_Build 19 32914529 1I TATGGTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 28 0 22 6 A 13 14 260300 CASAVA_Build 19 32915038 1D TCAATCAAAG C/- AGAGGTTTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 0 260301 CASAVA_Build 19 32916421 2D TAGGAGTCTC TT/-- TTTAGAATGC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 5 3 260302 CASAVA_Build 19 32926382 7D AGAATGCCTG CGGTCAC/------- CGGTCACCAA 3070 hom 12 het 17 1 15 2 CGGTCAC 2 1 260303 CASAVA_Build 19 32946234 2D CGCATGAGAG TC/-- TCTCCCATTA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 TC 3 2 260304 CASAVA_Build 19 32946772 2I TCTCTCCCAT --/TA GAATACCTGA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 TA 0 1 260305 CASAVA_Build 19 32953009 1I CCCAGGTGTC -/T TCTATCTTTA 3070 het 3070 ref 39 23 9 7 T 1 2 260306 CASAVA_Build 19 32956285 3I TGTCTGAGGT ---/CAA CAAGATGCCT 3070 hom 187 het 70 0 62 8 CAA 1 2 260307 CASAVA_Build 19 32957968 2D TGACTTGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 43 0 32 12 T 14 12 260308 CASAVA_Build 19 32959616 1I GGTCTTCCCA -/T CTTGGCTTCC 3070 hom 148 het 54 0 50 4 T 0 1 260309 CASAVA_Build 19 32961093 2D CCAGCCTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 21 13 T 15 13 260310 CASAVA_Build 19 32961860 4I TACCTTTTAC ----/CTTT CTTCATTCCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTTT 0 1 260311 CASAVA_Build 19 32962472 4I TATTGTTATG ----/TTTA TTGTTTGTTT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 TTTA 0 1 260312 CASAVA_Build 19 32963163 3D TTATTGTTTG TTA/--- TTATTTCTTT 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 TTA 2 1 260313 CASAVA_Build 19 32963494 5D TCTCTCTCTC TGTTT/----- TAAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 16 4 TGTTT 1 0 260314 CASAVA_Build 19 32963683 6D CACAAAGATC GAGAGA/------ GAGAGAGAGA 3070 hom 64 het 38 1 32 6 GA 10 7 260315 CASAVA_Build 19 32963845 1D TTTTATTTTT A/- TTTTTTATGT 3070 het 259 hom 32 1 30 2 A 1 0 260316 CASAVA_Build 19 32964099 3I ATCTCCTGGG ---/CTC CAGCAATTCT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 CTC 0 1 260317 CASAVA_Build 19 32975383 1D AATGAAAAGA G/- GCCTAAGAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 G 2 1 260318 CASAVA_Build 19 32981374 2D AAAATAAAAC AA/-- AGTGTTATTT 3070 het 3070 ref 22 15 7 0 A 3 1 260319 CASAVA_Build 19 32983357 3I GTCTCATCAG ---/AGA AGGAGGCCAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AGA 0 1 260320 CASAVA_Build 19 32985336 2D GTCTTCTGGT CA/-- CACTCCTCAC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CA 2 1 260321 CASAVA_Build 19 32989783 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 40 1 28 11 A 14 13 260322 CASAVA_Build 19 32989797 1D AAAAAAAAAA C/- ATAGTTAGTA 3070 het 403 hom 31 1 25 5 C 1 0 260323 CASAVA_Build 19 32989847 5I AGAGCAGAAA -----/AAAAT AAAATAAAAC 3070 hom 51 het 25 0 18 7 AAAAT 1 2 260324 CASAVA_Build 19 32989935 1D AGACTAAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 10 9 260325 CASAVA_Build 19 32998583 5D TTTTTTTAAC TTTTA/----- TTTTAAGTTT 3070 hom 114 het 39 0 39 0 TTTTA 2 1 260326 CASAVA_Build 19 32999552 25D CACTGTTGAT AGTTTATTTTGCTGTGCAGAACATC/------------------------- AGTTTATTTT 3070 hom 81 het 27 0 27 4 AGTTTATTTTGCTGTGCAGAACATC 2 1 260327 CASAVA_Build 19 33001215 14I TGTTTCTCTT --------------/GCCTGATTGCTCTG GCCAGTAAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 GCCTGATTGCTCTG 0 1 260328 CASAVA_Build 19 33003489 3D TAATTTTTTT TTA/--- AAAAAAAAAG 2380 hom 18 het 7 0 7 1 TTA 1 0 260329 CASAVA_Build 19 33006248 1I TGTGTATGGT -/A AAGTTGCTGT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 2 3 260330 CASAVA_Build 19 33007972 1D AATAAAGTAC T/- TTAAGAAATA 3070 het 1295 hom 79 18 49 15 T 3 2 260331 CASAVA_Build 19 33008553 6I GAAAGCTTTA ------/TTTTTC TTAACTTGGC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 TTTTTC 0 1 260332 CASAVA_Build 19 33010404 11D CAAAGACAGT AACTGGTAGAC/----------- AGACCTGGAA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 AACTGGTAGAC 1 0 260333 CASAVA_Build 19 33017545 1D CATGGTGAAA C/- CCTGTCTCTA 3070 hom 42 het 15 0 15 2 C 3 2 260334 CASAVA_Build 19 33019923 1D AATTTCCAAA T/- GACGACAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 T 1 0 260335 CASAVA_Build 19 33022283 3D6M2I AAGCCATCTG CTCCATGAA--/---TGTGAAAC ATGCTTTGTT 1277 het 1277 ref 63 55 3 11 N/A 0 0 260336 CASAVA_Build 19 33023562 3D GTGTTTCTTT TTC/--- CTTTTTTTTT 1919 hom 30 het 12 0 10 3 TTC 1 0 260337 CASAVA_Build 19 33024369 1I CAAATAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 33 0 22 11 T 11 12 260338 CASAVA_Build 19 33025603 1I ATTTTGGCTG -/A ATGTTAGTTT 3070 hom 138 het 53 0 46 7 A 1 2 260339 CASAVA_Build 19 33025903 1I TGTTTGTTGA -/G GGGGTCTTTG 3070 hom 71 het 26 0 23 3 G 4 5 260340 CASAVA_Build 19 33027792 1I CTTTGGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 40 2 29 9 T 11 12 260341 CASAVA_Build 19 33054717 1D CTATTTGAAA G/- GGGGAAAAAG 3070 hom 60 het 23 0 20 4 G 5 4 260342 CASAVA_Build 19 33061531 1D GAAAAAAAAT A/- AGAGTTGAGC 3070 hom 129 het 53 0 43 10 A 2 1 260343 CASAVA_Build 19 33074213 1D ATCTCCAGAT A/- AGGGCGCTGA 3070 hom 129 het 46 0 43 5 A 2 1 260344 CASAVA_Build 19 33078518 1I GAACCCAAAG -/C CCTACTCTAT 3070 hom 102 het 38 0 32 6 C 2 3 260345 CASAVA_Build 19 33083310 1D TGCTGGGGAC A/- AAAAGGCTGT 3070 hom 108 het 37 0 33 4 A 5 4 260346 CASAVA_Build 19 33083838 3I GGACTAAAAC ---/CAA CAAGATCCTC 3070 hom 150 het 55 0 49 6 CAA 1 2 260347 CASAVA_Build 19 33097263 1D GTTACAGTTT A/- AAAAAAAATG 2052 het 2052 ref 14 7 5 4 A 9 8 260348 CASAVA_Build 19 33097456 3D AGGATTATTG TTA/--- TTATTATTAT 2534 het 2534 ref 27 16 7 4 TTA 7 6 260349 CASAVA_Build 19 33097833 3I TTCTTTCATG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 2645 hom 27 7 14 7 T 11 14 260350 CASAVA_Build 19 33101843 3I CTCAGGAGAC ---/AAG AAGGGTATTG 3070 het 3070 ref 59 27 25 7 AAG 1 2 260351 CASAVA_Build 19 33135553 1I GTGATTTCTC -/A GACTCTCCTT 3070 het 3070 hom 38 19 18 1 A 0 1 260352 CASAVA_Build 19 33142937 1D TTCTTGGATA T/- TTTTTTACTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 260353 CASAVA_Build 19 33143901 1D CTTTTTATTT C/- TGAGACAAGG 3047 hom 18 het 11 0 7 7 C 1 0 260354 CASAVA_Build 19 33144502 2D GACTCTGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 12 10 260355 CASAVA_Build 19 33149708 1D ATGGGTCTTT C/- CCCCATGCTT 3070 het 3070 ref 41 19 19 4 C 5 4 260356 CASAVA_Build 19 33151420 4D AAACTACTTA AAAT/---- AAATAAATAT 2925 het 2869 hom 15 7 6 3 AAAT 3 2 260357 CASAVA_Build 19 33154202 4D TTCTATTCAA ATTG/---- TTGAAATTGT 3070 het 3070 ref 46 25 20 2 ATTG 1 0 260358 CASAVA_Build 19 33156209 13D41M2D CTGTGAGCAC CAATGAGATGACACAGCTGGAGGAGTAGTGGGGAGTGAGATGGGAACAAAGGAAAC/-------------CAGCTGGAGGAGTAGTGGGGAGTGAGATGGGAACAAAGGAA-- ACAGTTAGAT 3070 hom 99 het 33 0 34 21 N/A 0 0 260359 CASAVA_Build 19 33158281 1D ACACTCAAGA G/- GCTCCTGGGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 2 1 260360 CASAVA_Build 19 33166000 1I TTATTACATA -/T ATAGGGTTTC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 0 1 260361 CASAVA_Build 19 33170237 1I TGACATATAT -/G AGTGGTCAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 260362 CASAVA_Build 19 33176428 1I GGGTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1266 hom 33 5 22 6 A 13 14 260363 CASAVA_Build 19 33176736 1I GGATGGAAAT -/A GGGGGTGGCT 3070 hom 96 het 39 0 31 8 A 0 1 260364 CASAVA_Build 19 33184697 3D TGCAGACAAA TGT/--- TGTTAGTGAC 3070 het 3070 ref 41 18 15 10 TGT 2 1 260365 CASAVA_Build 19 33194978 1D GCAAGATACT C/- CCTTGGATCT 3070 het 3070 hom 44 15 25 5 C 3 2 260366 CASAVA_Build 19 33209710 13I ATCCTCCTGG -------------/CCAACAGGGGGAT CTGTTTAGTC 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 CCAACAGGGGGAT 0 1 260367 CASAVA_Build 19 33254323 1D TTTTTTTCTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 113 het 44 0 37 7 A 9 8 260368 CASAVA_Build 19 33267318 1D CCCAGCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 14 5 T 12 11 260369 CASAVA_Build 19 33268015 1I AGTATATATT -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 7 8 260370 CASAVA_Build 19 33279877 5D ACCTCCACAT AAAAC/----- AGAAGCTATA 3070 het 3070 hom 46 16 25 6 AAAAC 1 0 260371 CASAVA_Build 19 33280873 1I CACAACTGCC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 7 8 260372 CASAVA_Build 19 33294535 1I TTAAAAAGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 9 10 260373 CASAVA_Build 19 33304306 1I ACTACAGGTG -/C CCACCACCAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 2 3 260374 CASAVA_Build 19 33311579 1D ACTATAATTT C/- ACCTCTCATG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 1 0 260375 CASAVA_Build 19 33311913 4D TTCTCTTGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 hom 126 het 46 0 43 4 AGTG 2 1 260376 CASAVA_Build 19 33312630 1D ATTGACTTTA G/- AAGAAAGCTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 G 1 0 260377 CASAVA_Build 19 33314173 1D AATGATCAAT A/- AATACTAAGG 3070 het 3070 ref 23 13 10 1 A 3 2 260378 CASAVA_Build 19 33317766 2D GTGTTGCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 29 3 11 17 A 16 14 260379 CASAVA_Build 19 33332322 2D CAGACCTACG GA/-- GAGGATTCTC 3070 het 3070 ref 36 19 9 11 GA 2 1 260380 CASAVA_Build 19 33336875 2I TTTTCAGGGC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 15 15 14 T 9 11 260381 CASAVA_Build 19 33337528 1I CTGGGTGATG -/T GGATCCATCA 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 T 0 1 260382 CASAVA_Build 19 33339431 1I CTGTTCTAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 8 9 260383 CASAVA_Build 19 33340019 2I GAAATTTAAC --/AA AGAGGCTACT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 1 3 260384 CASAVA_Build 19 33347475 1I GCTCCTGCTC -/T TTTGATTGCT 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 T 3 4 260385 CASAVA_Build 19 33347926 1D AGGGAACATG T/- TTTTTAAAAA 2132 het 2132 ref 17 9 5 3 T 6 5 260386 CASAVA_Build 19 33348084 1D ATGTAATCAA G/- GCACTAATAC 3070 het 2289 hom 15 6 8 1 G 2 1 260387 CASAVA_Build 19 33350148 5D ACAAACTCTA TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 49 25 14 13 TTTGT 4 3 260388 CASAVA_Build 19 33366666 1D AGATAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 A 12 11 260389 CASAVA_Build 19 33374381 1I TTTTAGGCTC -/A AAGGGTACAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 2 3 260390 CASAVA_Build 19 33394026 1I12M1I AGGGTCTGAA -TTTTTTTTATTA-/TTTTTTTTTATTAT ACTATAAGTT 3070 het 3070 hom 26 12 14 1 N/A 0 0 260391 CASAVA_Build 19 33398023 1I GCTGATTATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 381 hom 47 1 40 6 T 9 10 260392 CASAVA_Build 19 33413244 1I GTAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 384 hom 35 1 27 7 A 9 10 260393 CASAVA_Build 19 33415948 1D GGCACCAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 10 9 260394 CASAVA_Build 19 33429228 3D GCCCCACATC CTT/--- CTTATCTTTT 3070 hom 114 het 43 0 38 6 CTT 2 1 260395 CASAVA_Build 19 33438379 2D AGACAGGGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 27 0 18 9 A 13 11 260396 CASAVA_Build 19 33444052 1D GGCAGAAAGC A/- AAAAAAAATG 876 het 876 ref 35 30 2 5 A 9 8 260397 CASAVA_Build 19 33444183 1I ATTTTATGAA -/T TTATTATTTA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 2 3 260398 CASAVA_Build 19 33444539 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 27 1 16 10 A 15 14 260399 CASAVA_Build 19 33451004 4D ACTTTAAAAT TGTC/---- TGTCTGTAGT 3070 hom 102 het 41 0 35 9 TGTC 2 1 260400 CASAVA_Build 19 33458324 1I TTGTGGAGTA -/G GGGGAGGGGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 4 5 260401 CASAVA_Build 19 33459442 4I ACAAAATGTA ----/TGTT TATTACTGTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 TGTT 0 1 260402 CASAVA_Build 19 33461434 3I CGAGCTTAAT ---/ATC ATACTAATAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATC 0 1 260403 CASAVA_Build 19 33463320 1I GTAGCTTTGC -/A AAAAATAAGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 5 6 260404 CASAVA_Build 19 33465302 5D CTGTCTTCTT CCCAA/----- CATTTTCTCC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 CCCAA 1 0 260405 CASAVA_Build 19 33465499 2I CCCTCTCCCC --/AA AGTCTTCTCT 3070 hom 44 het 21 0 14 7 A 1 3 260406 CASAVA_Build 19 33471154 4I ACAAATATAT ----/ACAC ACAAATACAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AC 1 3 260407 CASAVA_Build 19 33473276 1I ATCAGATCAC -/T TATGACTATG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 1 2 260408 CASAVA_Build 19 33473549 14D AAAAATTAAC TCAAAAAAATTAAT/-------------- TGCAGTCATG 3070 hom 78 het 28 0 27 4 TCAAAAAAATTAAT 1 0 260409 CASAVA_Build 19 33489592 1I TTTGTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 2421 het 2421 ref 27 11 9 7 T 15 16 260410 CASAVA_Build 19 33489911 1I TAAGGTCAAC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 7 8 260411 CASAVA_Build 19 33492451 1I GGGGAAATGA -/G GTCCTGCAAA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 G 1 2 260412 CASAVA_Build 19 33494289 1D TAGTCTCAAA G/- GCCTCATAAT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 G 2 1 260413 CASAVA_Build 19 33502710 1I TTTTTTAATG -/T TTTTTTTTTA 2203 het 2203 ref 30 18 8 4 T 9 10 260414 CASAVA_Build 19 33506593 8D TGATAAGTAA AGGTAAAG/-------- AGGTAAAGAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 9 AGGTAAAG 2 1 260415 CASAVA_Build 19 33508854 1I CAACACGTGC -/T GCTTGCATGA 3070 hom 105 het 41 0 33 8 T 0 1 260416 CASAVA_Build 19 33513859 1I CCTGAGTCAT -/A AAAAAATAGG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 6 7 260417 CASAVA_Build 19 33518859 1I CACATCCTAG -/C CAAAAGCCAG 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 C 1 2 260418 CASAVA_Build 19 33522376 1D GGATTGTTTA T/- GTTATTTGGG 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 1 0 260419 CASAVA_Build 19 33527362 1I ACTTCAATAA -/T TTCTGTTCAA 3070 hom 116 het 43 0 38 5 T 2 3 260420 CASAVA_Build 19 33530756 6I GATCCGCCCA ------/CCTTGG CCTTGGCCTT 3070 hom 33 het 15 0 12 4 CCTTGG 1 2 260421 CASAVA_Build 19 33531522 1D ATTATAGCTT A/- AAAAATGTTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 6 5 260422 CASAVA_Build 19 33532341 4D TGTTCTTGCT AAAA/---- AAAAAATACA 3070 het 251 hom 51 7 23 21 A 10 6 260423 CASAVA_Build 19 33532852 3I AAAGATGCAT ---/GAA GAAGGTGAGA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 GAA 1 2 260424 CASAVA_Build 19 33538472 1D CCTACTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 18 8 A 13 12 260425 CASAVA_Build 19 33538593 1I GAGTTTCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 12 13 260426 CASAVA_Build 19 33553102 1D GTTTGTTCTT A/- GAGCCAAAAG 3070 het 3070 ref 44 21 21 4 A 1 0 260427 CASAVA_Build 19 33558778 1I CAGAGTGAGA -/T TCCCCCCTCA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 1 2 260428 CASAVA_Build 19 33564698 1D GATCCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 31 0 27 4 A 12 11 260429 CASAVA_Build 19 33574698 1D TAGTAGAGAT G/- GGGTTTCACC 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 G 4 3 260430 CASAVA_Build 19 33579763 10D AGTTGGAAGT CTACACTACA/---------- CTACACTACA 3070 hom 72 het 27 0 25 5 CTACA 4 2 260431 CASAVA_Build 19 33582511 12I ATTTGTATGC ------------/ACACACACACAG ACACACACAC 3070 hom 58 het 41 1 30 10 ACACACACACAG 0 1 260432 CASAVA_Build 19 33587472 4D AATAGTCAAT CATG/---- CATCCTTCCT 3070 het 3070 hom 33 15 17 4 CATG 1 0 260433 CASAVA_Build 19 33591294 1D TCATCGGGGG C/- ATCGGGGGCT 3070 het 3070 hom 33 16 14 4 C 1 0 260434 CASAVA_Build 19 33592179 1D ACACAGATCA C/- CCCATCCCTA 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 C 4 3 260435 CASAVA_Build 19 33592330 1D CTTTTCTAGT G/- CTGCTAGCCT 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 G 1 0 260436 CASAVA_Build 19 33598278 1D GTGAAAGTGA T/- TTTTCTCTAG 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 5 4 260437 CASAVA_Build 19 33598387 1D ATCTTATGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 10 9 260438 CASAVA_Build 19 33601858 2D ACCCACCTCT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 108 het 44 0 37 8 AC 9 8 260439 CASAVA_Build 19 33607092 2D CATGCACACG CA/-- CACACACACA 1280 het 1280 ref 38 23 4 12 CA 10 9 260440 CASAVA_Build 19 33623326 1I GAAAGCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 34 1 17 16 T 15 16 260441 CASAVA_Build 19 33626757 1I GCGTGGTGGC -/A ACACGCCTGT 3070 hom 54 het 22 0 17 5 A 1 2 260442 CASAVA_Build 19 33632395 1I CAGAAAAGTG -/A AAAATATAAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 4 5 260443 CASAVA_Build 19 33650811 4I CTGTACTCTC ----/TCTG TCTTTCTTTG 3070 hom 58 het 25 0 19 6 TCTG 0 1 260444 CASAVA_Build 19 33651180 3D GAAGGAGGGG AGA/--- AGGAGGAGAA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AGA 1 0 260445 CASAVA_Build 19 33654840 1I TTACCACAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 8 9 260446 CASAVA_Build 19 33656055 1D TGCACAACGC A/- AAAAAAAAAA 1372 het 1372 ref 31 22 3 7 A 12 11 260447 CASAVA_Build 19 33660736 1D TAGGGTCCTC T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 91 het 36 0 30 6 T 7 6 260448 CASAVA_Build 19 33660894 1D AATATTCCAA G/- TTTTTTCTCC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 G 1 0 260449 CASAVA_Build 19 33665762 2I TTGAAGGATG --/CT CTGTTTGGAC 3070 hom 106 het 41 0 34 7 CT 1 2 260450 CASAVA_Build 19 33668645 3D AAGCCCACTA GCT/--- GCTAGGGTAA 3070 hom 41 het 22 0 14 10 GCT 2 1 260451 CASAVA_Build 19 33671181 4I TTAGAACACA ----/CTTT CTTTCCTTTT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 CTTT 1 2 260452 CASAVA_Build 19 33675773 1I GTGATTTGCT -/A AACCAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 2 3 260453 CASAVA_Build 19 33679688 1D AGACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 548 hom 33 3 14 17 A 15 14 260454 CASAVA_Build 19 33680986 4I ATCAATGGAC ----/AAAT AAATAAAGAA 3070 hom 109 het 43 0 34 9 AAAT 1 2 260455 CASAVA_Build 19 33685402 5D GACATTATTG AAGAA/----- AAGACACAGG 3070 hom 108 het 41 0 37 6 AAGAA 1 0 260456 CASAVA_Build 19 33697854 5D20M1D AAAAAAAAAA AAGAGAGAGAGGAAAATTTGAAAATA/-----AGAGAGGAAAATTTGAAAAT- AAAAAATAAA 3070 het 72 hom 22 2 17 7 N/A 0 0 260457 CASAVA_Build 19 33704804 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAACG 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 8 9 260458 CASAVA_Build 19 33708618 4I CAAAAAAAAT ----/ATAA ATAAATAAAT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 ATAA 4 5 260459 CASAVA_Build 19 33710132 2I TTTCAGAGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 40 0 30 10 A 10 12 260460 CASAVA_Build 19 33715751 1D GAGAATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 13 12 260461 CASAVA_Build 19 33716396 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 485 hom 15 2 11 2 A 17 18 260462 CASAVA_Build 19 33717125 2D CAATTATATA CT/-- CTCTATAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 7 CT 3 2 260463 CASAVA_Build 19 33720993 1D GTTTTATTAA T/- GAAATCTATC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 1 0 260464 CASAVA_Build 19 33729582 2I CCTCTCACGG --/CA CACACACCCT 3070 hom 87 het 36 0 27 9 CA 3 4 260465 CASAVA_Build 19 33731785 2D TCTCTACAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 12 10 260466 CASAVA_Build 19 33752265 1D AGAAAATTCC T/- TTTTTTTTTT 1554 het 1554 ref 27 14 4 9 T 13 12 260467 CASAVA_Build 19 33785878 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 32 1 24 8 T 11 12 260468 CASAVA_Build 19 33792651 1D GGTTGCTGCC A/- GCTGAGGACA 3070 hom 147 het 53 0 47 6 A 1 0 260469 CASAVA_Build 19 33808862 1I AAGAAAAAAA -/C AACTGCATCA 3070 het 257 hom 9 1 8 0 C 0 1 260470 CASAVA_Build 19 33836835 1D GACTGTCTTC A/- AAAAAAAAAA 1281 het 1281 ref 41 27 4 10 A 13 12 260471 CASAVA_Build 19 33844501 1D CACCTACATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 30 1 23 6 A 12 11 260472 CASAVA_Build 19 33847964 1I ACTCAACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 11 12 260473 CASAVA_Build 19 33853346 1D GTGTTATCTG A/- AAAAAAAAAA 1045 het 1045 ref 25 16 4 5 A 14 13 260474 CASAVA_Build 19 33862493 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 15 14 260475 CASAVA_Build 19 33924129 2I AATTTGCTCT --/AA AAAAAAAAGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 10 260476 CASAVA_Build 19 33925031 1I TGTTTGTAAC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 6 7 260477 CASAVA_Build 19 33932412 7I AGAAATTGGC -------/AAAAACA AAGGGGATGC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 AAAAACA 0 1 260478 CASAVA_Build 19 33934851 1I CATAAAAAAA -/T AAGCTTACAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 0 1 260479 CASAVA_Build 19 33943118 1I CCTACCAACC -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 8 260480 CASAVA_Build 19 33946318 1I TAAAAGTTGG -/A AAAAAAACCT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 7 8 260481 CASAVA_Build 19 33947575 1D AAAAAAAAAA C/- CCCAGGATTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 4 3 260482 CASAVA_Build 19 33947810 4D AGAACTTCTG CAAT/---- CAAAGACACT 3070 hom 69 het 26 0 24 6 CAAT 1 0 260483 CASAVA_Build 19 33951675 1D AAGTCTTTAA T/- CCATCTTGAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 1 0 260484 CASAVA_Build 19 33957382 1I CACCTACAAA -/G GGAACCCAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 2 3 260485 CASAVA_Build 19 33959038 44D CCTGGGCAAC AAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAACAAAAACAAACCAACAAAA/-------------------------------------------- AAGAAATAAC 3070 hom 24 het 6 0 9 1 AAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAACAAAAACAAACCAACAAAA 1 0 260486 CASAVA_Build 19 33960799 1I ACAGCAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 757 hom 37 2 30 5 A 10 11 260487 CASAVA_Build 19 33962480 1D TTTATCAGAT A/- AAAGAGACTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 4 3 260488 CASAVA_Build 19 33962725 5D CAAAAACCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 AAAAC 3 2 260489 CASAVA_Build 19 33981186 2D TCTCTCTCTC TA/-- TATATATATA 3070 het 111 hom 31 3 24 4 TA 9 8 260490 CASAVA_Build 19 33981787 1I GTTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 37 1 31 5 A 9 10 260491 CASAVA_Build 19 33991572 4D34M1D AAAAACTAAA AAATAAATAAATAAAATAAGTTATTAGAAGAAAAAAGCA/----AAATAAATAAAATAAGTTATTAGAAGAAAAAAGC- AAAAAAAAAA 3043 hom 18 het 8 0 7 6 N/A 0 0 260492 CASAVA_Build 19 33994784 9I TTTGAGTGGG ---------/AAATAAACC TTTATTGTGT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AAATAAACC 0 1 260493 CASAVA_Build 19 33995264 2I GAATCACAAG --/AT ATATATTACT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 3 4 260494 CASAVA_Build 19 33995745 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 22 0 15 7 A 11 10 260495 CASAVA_Build 19 33996025 2D ACTACATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 23 1 16 6 A 13 11 260496 CASAVA_Build 19 33996705 12D TAGTATTTAA ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 2543 hom 21 het 8 0 8 1 AT 11 5 260497 CASAVA_Build 19 33997245 1D ATCATGAGGG C/- CCCCACACAC 3070 hom 63 het 26 0 21 6 C 5 4 260498 CASAVA_Build 19 34000960 1I GCAAGAGGAC -/A AAGAGACACA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 2 3 260499 CASAVA_Build 19 34001140 1I CAGTTGGGAA -/G GAGACCACAG 3070 hom 135 het 51 0 39 12 G 1 2 260500 CASAVA_Build 19 34004492 3D TTCCTTACAT CTC/--- CTTGATTGTC 3070 hom 141 het 55 0 46 10 CTC 1 0 260501 CASAVA_Build 19 34007829 6D CAAAAAAAAA AAAAAG/------ AAAGAAAGAA 3070 hom 45 het 20 0 15 6 AAAAAG 1 0 260502 CASAVA_Build 19 34008180 8D ATATATATAT ATACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 30 het 10 0 11 1 ATACACAC 1 0 260503 CASAVA_Build 19 34029059 4D14M2I TGTATCTATC TGAATGGGTGTGTGTGTC--/----TGGGTGTGTGTGTCTG TGTGTGTTGT 3070 hom 212 het 73 0 71 9 N/A 0 0 260504 CASAVA_Build 19 34030140 2D GTAACTGCTT TA/-- TATGTTTTCC 3070 hom 117 het 44 0 39 6 TA 2 1 260505 CASAVA_Build 19 34030959 9D AAAATTCTGC TGTTGCTGT/--------- TGTTGCTGTT 3070 hom 72 het 26 0 25 4 TGTTGCTGT 2 1 260506 CASAVA_Build 19 34042926 1D AGTTTCTCAA G/- GATAGTTCAG 3070 het 3070 hom 44 16 19 10 G 2 1 260507 CASAVA_Build 19 34047746 1D TGCAGGACGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 26 1 23 2 A 12 11 260508 CASAVA_Build 19 34053326 20I GGTGAGGAGC --------------------/ATTTTTTAGGATTTACCCCT CTTTTTTAGG 3070 hom 122 het 47 0 38 9 ATTTTTTAGGATTTACCCCT 0 1 260509 CASAVA_Build 19 34053656 10D AGTTGGCACG CTAAAGAAAT/---------- CTAAAGAAAT 3070 hom 41 het 18 0 14 6 CTAAAGAAAT 2 1 260510 CASAVA_Build 19 34058981 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 8 9 260511 CASAVA_Build 19 34059894 1D TACTCCCCCC G/- CTTGTACTAG 3070 hom 108 het 44 0 37 8 G 1 0 260512 CASAVA_Build 19 34061062 1I TTCTCTGCCC -/A TTAACTTCTT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 A 0 1 260513 CASAVA_Build 19 34062516 2D ACACATATAC AT/-- ATACATACAT 510 hom 12 het 6 0 5 1 AT 2 1 260514 CASAVA_Build 19 34064505 1D AATGATTAAT G/- TTCAACTTAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 1 0 260515 CASAVA_Build 19 34067520 1I CTTTGGGAAT -/A TACCCAGTAA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 0 1 260516 CASAVA_Build 19 34067923 1D CAGTCGAGGG A/- TCCTTTCTCC 3070 hom 128 het 47 0 42 6 A 1 0 260517 CASAVA_Build 19 34068774 1D TTTAAAAAAA C/- ATATAAGAAC 3070 hom 84 het 37 0 29 9 C 1 0 260518 CASAVA_Build 19 34069599 1D AGAGGAAATG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 105 het 41 0 32 9 A 8 7 260519 CASAVA_Build 19 34070578 7D AACCGAGGCC CTGAGAT/------- CTGAGATGCT 3070 hom 90 het 31 0 31 2 CTGAGAT 2 1 260520 CASAVA_Build 19 34078920 2D ATGGGCTGAG GT/-- GTGGTGCTTC 3070 hom 84 het 33 0 28 8 GT 2 1 260521 CASAVA_Build 19 34079059 1D GGTTTATGGC A/- ACTTGACGTA 3070 hom 138 het 52 0 45 8 A 2 1 260522 CASAVA_Build 19 34082774 4I TCATTCTCTT ----/ACTA ACTTTCACCC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 ACTA 0 1 260523 CASAVA_Build 19 34088321 1I GGAGTATCTG -/T TAAGTGTGGC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 1 2 260524 CASAVA_Build 19 34089078 1I TTGGGGATAG -/A ATACTAGACT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 A 1 2 260525 CASAVA_Build 19 34089824 1D AGACGATCCA C/- CCCCCCTTGG 3070 hom 72 het 30 0 21 9 C 7 6 260526 CASAVA_Build 19 34092251 1D AACTGAAGTT C/- AGGGAATTCG 3070 hom 87 het 37 0 30 8 C 1 0 260527 CASAVA_Build 19 34093521 1D CCAGGTGTGG C/- CCCCAGTGCA 3070 hom 60 het 26 0 19 7 C 5 4 260528 CASAVA_Build 19 34098698 1D CACCACTAAC A/- AAGGGGGGGG 3070 hom 114 het 39 0 35 5 A 3 2 260529 CASAVA_Build 19 34102216 3I CTGTCTTTAC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 10 13 260530 CASAVA_Build 19 34113379 2D TTACTTTGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 27 1 21 6 A 16 14 260531 CASAVA_Build 19 34119089 1I TATATATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 644 hom 36 2 27 7 T 10 11 260532 CASAVA_Build 19 34132842 1D GCTTGCATTT G/- GGGGCTGCAA 3070 het 2062 hom 24 5 10 9 G 5 4 260533 CASAVA_Build 19 34136682 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 25 1 14 10 T 15 14 260534 CASAVA_Build 19 34174879 1D TCCATTTGAG T/- TTTTTAGGCC 3070 hom 99 het 36 0 33 4 T 6 5 260535 CASAVA_Build 19 34176622 14I CAATCATTTG --------------/ATTTTTAAATAAAC ATTTTTACAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 ATTTTTAAATAAAC 0 1 260536 CASAVA_Build 19 34184684 17D AGTTCTGGGT GACTGATTCACTGATCA/----------------- GCTTGGTTTG 3070 het 3070 hom 28 9 14 7 GACTGATTCACTGATCA 1 0 260537 CASAVA_Build 19 34187272 1D AGGAAGCCAG C/- AGCCTGCTGG 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 C 1 0 260538 CASAVA_Build 19 34195206 1I CACACCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2350 hom 25 7 11 7 T 12 13 260539 CASAVA_Build 19 34195880 23D AGCATCATTC CATTCTCTGAGCTTCCCCGCAGA/----------------------- CTTCAGTTGC 3070 het 3070 ref 48 28 21 7 CATTCTCTGAGCTTCCCCGCAGA 1 0 260540 CASAVA_Build 19 34199117 2D TCTCTCTCCT TC/-- TCTCTCTCTT 1999 het 1999 ref 23 11 6 7 TC 5 4 260541 CASAVA_Build 19 34199306 2D TCCTCCTCTT TC/-- TCTCTCTCCC 635 het 635 ref 25 8 4 14 TC 5 4 260542 CASAVA_Build 19 34207851 1D TGCGTGCCTG A/- GTCCCAGCTA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 1 0 260543 CASAVA_Build 19 34215009 2D AAGAAGATAT AC/-- ACACACGGCC 3070 hom 70 het 28 0 24 5 AC 4 3 260544 CASAVA_Build 19 34219025 3I CCAAGTGGGC ---/TCT TCTTGCTCAT 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 TCT 1 2 260545 CASAVA_Build 19 34225316 1I CAAAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 30 0 22 8 A 11 12 260546 CASAVA_Build 19 34228232 1I TTTACCAAGA -/C CCCCTGCCTT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 C 4 5 260547 CASAVA_Build 19 34235777 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 hom 52 23 23 6 A 7 6 260548 CASAVA_Build 19 34243995 1I CCAGGGGACA -/C CCCCCCCTCC 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 C 7 8 260549 CASAVA_Build 19 34245411 1I CTGATTGCAC -/A GGGGGGGAAG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 0 1 260550 CASAVA_Build 19 34246673 1D GATTTTACAT A/- AAAATTTTGA 3070 hom 109 het 41 0 37 4 A 5 4 260551 CASAVA_Build 19 34248515 13D ATTGTAAACT TACTCTCCTCATC/------------- ATCATGAGCT 3070 het 3070 ref 46 31 17 3 TACTCTCCTCATC 1 0 260552 CASAVA_Build 19 34251148 1D GGCTGTTAGT A/- AAAAAAACTC 3070 hom 75 het 30 0 24 7 A 8 7 260553 CASAVA_Build 19 34253358 1I AATAAAAAAA -/T AAATATATAT 2448 het 2448 ref 28 19 7 2 T 0 1 260554 CASAVA_Build 19 34261064 30I TCAGAAGAGT ------------------------------/AAGCTTATAAAGTAATGGTGTAAGTTCATA AAGCTTCTTC 3070 hom 16 het 29 1 22 6 AAGCTTATAAAGTAATGGTGTAAGTTCATA 0 1 260555 CASAVA_Build 19 34267101 1I GCTGATAACA -/G GTGCCTTCAG 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 G 1 2 260556 CASAVA_Build 19 34313765 1I AGAAAGCCCT -/C AGGAAGGGCC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 C 0 1 260557 CASAVA_Build 19 34362934 1D GATGATACCC A/- ATTTCCATAA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 2 1 260558 CASAVA_Build 19 34379866 1I AAACAATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 13 0 11 2 T 11 12 260559 CASAVA_Build 19 34385510 1D AAGCCAGATG A/- CGGTTAAGTT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 1 0 260560 CASAVA_Build 19 34387476 1I CACGGTGACA -/C CCCCGTCTCT 3070 hom 123 het 42 0 41 1 C 4 5 260561 CASAVA_Build 19 34388971 2D ATTATCACAC AT/-- GCTAATTTCA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 AT 1 0 260562 CASAVA_Build 19 34391868 2D24M14D6M1D CAAAAACAAG ACACAGTTACATCCCTCTCTCCAATACTATTTTTAAATATCTGACCA/--ACAGTTACATCCCTCTCTCCAATA--------------CTGACC- AAAAAAAATT 3070 het 1219 hom 17 5 16 8 N/A 0 0 260563 CASAVA_Build 19 34393111 1I AAACCTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 11 260564 CASAVA_Build 19 34393931 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 7 8 260565 CASAVA_Build 19 34400774 5I TAGGGAGGAG -----/AAGAA ATTAGCCAGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAGAA 0 1 260566 CASAVA_Build 19 34414540 8D TAAAGTATAA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 1216 het 1216 ref 13 10 3 4 AAAT 5 3 260567 CASAVA_Build 19 34415805 2D TGTTTTTCTC TT/-- TCTCTTTTTC 3070 hom 123 het 45 0 41 5 T 3 1 260568 CASAVA_Build 19 34417792 1D CTTAAAAAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 41 18 15 9 A 8 7 260569 CASAVA_Build 19 34448595 2I CTCAGCACCA --/CT CTCCAGATTG 3070 hom 146 het 54 0 49 5 CT 1 2 260570 CASAVA_Build 19 34461593 1I TCTACATAAG -/A ATTCAGACTG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 1 2 260571 CASAVA_Build 19 34466306 2I ACTGAGAAAC --/AG GGAGCCCCAG 3070 het 3070 hom 45 20 18 7 AG 0 1 260572 CASAVA_Build 19 34475648 1D GAATGATGAG A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 46 16 19 13 A 7 6 260573 CASAVA_Build 19 34476541 11D AGCAACTCTC CAGCTAGGAGT/----------- CTATGCTTGA 3070 het 3070 hom 44 22 22 5 CAGCTAGGAGT 1 0 260574 CASAVA_Build 19 34487934 4D ACAGAAAGAT GATA/---- GATAGATAAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 GATA 3 2 260575 CASAVA_Build 19 34502637 1D TCTTCCCCCC T/- CTTCCTGCCC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 1 0 260576 CASAVA_Build 19 34504155 1D TCTATGCAGG T/- TTTTTCACAG 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 6 5 260577 CASAVA_Build 19 34505482 1I GCCTCAGCCT -/C CCCGAGTAGC 3070 het 2416 hom 21 6 12 3 C 3 4 260578 CASAVA_Build 19 34505670 1I CCCTAATTGA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 7 8 260579 CASAVA_Build 19 34505940 4D AGTTCTGACA TAGT/---- TAGTTCAGTT 3070 het 3070 hom 40 12 16 14 TAGT 2 1 260580 CASAVA_Build 19 34513297 15I GGCACCTGGC ---------------/CAGGCCCGGTCAATG CAGGCATGAC 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 CAGGCCCGGTCAATG 0 1 260581 CASAVA_Build 19 34513667 1D GCTTCTGGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 10 9 260582 CASAVA_Build 19 34516331 3I TATGTGTCAG ---/CAA CAACAATAAA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 CAA 2 3 260583 CASAVA_Build 19 34518875 2D28M1I AGACAGGAGG AAAGAGTTTTAGTGATCTATAGCACAGCAA-/--AGAGTTTTAGTGATCTATAGCACAACAAG GTGATGATAG 3070 het 3070 hom 42 20 25 7 N/A 0 0 260584 CASAVA_Build 19 34520589 3D GATGCTTGGG ACC/--- CATATTGGAG 3070 het 3070 ref 56 28 20 12 ACC 1 0 260585 CASAVA_Build 19 34524943 1I AAAAAAAAAA -/G CAATCAACAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 G 0 1 260586 CASAVA_Build 19 34526531 1D TTAAGACATT C/- CCAGATGACC 3070 het 3070 hom 41 16 19 8 C 3 2 260587 CASAVA_Build 19 34531282 3D AGCAGGGCGA GGT/--- ATCACCTCAC 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 GGT 1 0 260588 CASAVA_Build 19 34537411 2D16M2D AGGGAATATT TATATATATATATAAATCAT/--TATATATATATAAATC-- ATATATATAT 2992 het 1851 hom 10 5 7 1 N/A 0 0 260589 CASAVA_Build 19 34539963 1D CTGCCTACCA G/- GGGTTGTCAC 1878 het 1878 ref 34 19 7 8 G 4 3 260590 CASAVA_Build 19 34542225 1D CTGGTCAGTG A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 30 12 14 4 A 7 6 260591 CASAVA_Build 19 34554143 4D AGGAAATATC TGAT/---- TGATTGATCA 3070 het 3070 hom 39 16 18 8 TGAT 3 2 260592 CASAVA_Build 19 34554973 1D CAACACTTCA C/- CCCCCACTGA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 C 6 5 260593 CASAVA_Build 19 34556259 1D TGGCTGCACG C/- CAAGGGGCAG 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 C 2 1 260594 CASAVA_Build 19 34558173 3I TTATATTCAA ---/AGG ATAATTACTG 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 AGG 0 1 260595 CASAVA_Build 19 34558730 11I TCGCAACAAG -----------/CAGTCTGGAAC CTTGGCCACA 3070 het 3070 ref 42 23 11 8 CAGTCTGGAAC 0 1 260596 CASAVA_Build 19 34559478 1D ACTTTCTTTC T/- GAGAGTGGTC 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 T 1 0 260597 CASAVA_Build 19 34563215 1D CATCTTGATT C/- CTATCCTGGG 3070 het 3070 hom 57 22 30 5 C 2 1 260598 CASAVA_Build 19 34579123 20I TAGAATTTCA --------------------/CAGGCAAACTCATAGGTGTC CAGCCACTGA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 CAGGCAAACTCATAGGTGTC 0 1 260599 CASAVA_Build 19 34587629 1D CTGGGAGGCA G/- GTCCGGCCTG 2052 het 1250 hom 19 6 7 7 G 2 1 260600 CASAVA_Build 19 34589025 1I AAAAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2533 het 2533 ref 32 14 11 7 T 11 12 260601 CASAVA_Build 19 34589545 1D TAATAAATGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 9 11 11 A 9 8 260602 CASAVA_Build 19 34594339 1D CTTGAAGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 304 hom 33 1 28 4 A 10 9 260603 CASAVA_Build 19 34607611 1I AAACAACACC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 7 8 260604 CASAVA_Build 19 34610566 8D GCCACCAGTA ACGGTCAC/-------- ACGGTCACAG 3070 het 3070 ref 59 29 21 15 ACGGTCAC 2 1 260605 CASAVA_Build 19 34610842 1D CTCACTCCTT C/- CCCCCAACCG 1751 het 1410 hom 18 7 8 3 C 6 5 260606 CASAVA_Build 19 34629720 1I TCAATAAATG -/T TTGTGACCAG 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 T 2 3 260607 CASAVA_Build 19 34658054 1D ATTTTCCCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 143 hom 34 2 19 13 T 13 12 260608 CASAVA_Build 19 34666132 1I GGGTGGATGT -/G GAGAGGGACT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 G 1 2 260609 CASAVA_Build 19 34676258 4D GGAAAAAAAA AAAC/---- AAAAAACTCC 3070 het 58 hom 38 3 14 23 AAAC 1 0 260610 CASAVA_Build 19 34754606 1D GGGGAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2489 hom 35 11 19 6 A 13 12 260611 CASAVA_Build 19 34757944 7I TTCTCTGTGA -------/TGAACAT TTATTACTTC 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 TGAACAT 0 1 260612 CASAVA_Build 19 34767878 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTGAATT 2096 het 2096 ref 21 11 6 6 T 6 5 260613 CASAVA_Build 19 34772562 3I CAAACATGTC ---/CTT CTTCACATGG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 CTT 1 2 260614 CASAVA_Build 19 34797971 1D TTCTCCTGCC T/- TTTTTTTTTT 2219 het 1531 hom 28 9 10 9 T 17 16 260615 CASAVA_Build 19 34799693 1I TCAAGGGTAG -/A ATTGAGATTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 1 2 260616 CASAVA_Build 19 34802853 1I ACCCTATCTC -/T TAAAAAAAAA 1901 het 1901 ref 30 16 6 8 T 1 2 260617 CASAVA_Build 19 34803904 2I AACATGACTC --/AG GGGGTGCCTC 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 AG 0 1 260618 CASAVA_Build 19 34804260 1D TTCCTTTTCC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 9 8 260619 CASAVA_Build 19 34805496 1D TGCTTTGTAT A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 7 6 260620 CASAVA_Build 19 34832535 1I CGATTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 10 11 260621 CASAVA_Build 19 34848937 2D GTGGGAAAGC AG/-- AGAGGTTCCG 3070 het 3070 ref 31 14 13 7 AG 3 2 260622 CASAVA_Build 19 34867064 2D TTGTTTTGTT TG/-- TTTTTTTTTT 427 het 427 ref 28 18 3 7 TG 1 0 260623 CASAVA_Build 19 34882363 1I TTTCATTATA -/C TTTTCTGGGT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 C 0 1 260624 CASAVA_Build 19 34896005 2D GTGGCTCCCC CT/-- CCCCCACTGT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 CT 1 0 260625 CASAVA_Build 19 34896286 7I AAGTACCCTT -------/TAACAAG TTCTTTAACA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TAACAAG 0 1 260626 CASAVA_Build 19 34900405 9I ACTCAGACGG ---------/GGCCCCTGA GGCCAGCGTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 GGCCCCTGA 0 1 260627 CASAVA_Build 19 34901905 1I CTCAAAAAAA -/T ATATATATAT 2750 hom 15 het 6 0 6 0 T 0 1 260628 CASAVA_Build 19 34904025 6D AAGCCACAGC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2714 het 2714 ref 25 13 6 7 A 17 11 260629 CASAVA_Build 19 34908712 2I AGAGACTGGT --/TA TACCATGAGT 3070 hom 104 het 39 0 34 6 TA 1 2 260630 CASAVA_Build 19 34908764 3D GCAAGTGCCT GGA/--- GGAGGAGAGT 3070 hom 72 het 37 0 25 14 GGA 3 2 260631 CASAVA_Build 19 34922855 1D CGTCTCTACT A/- AAAATACAAA 2360 hom 15 het 7 0 6 1 A 5 4 260632 CASAVA_Build 19 34925479 6I GGGGTGTGGC ------/CAGCTA CAGGCCCCGT 3070 hom 65 het 29 0 20 9 CAGCTA 0 1 260633 CASAVA_Build 19 34942634 1D TCCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 A 10 9 260634 CASAVA_Build 19 34944434 1D TATCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1890 hom 27 10 12 5 A 13 12 260635 CASAVA_Build 19 34950900 4D GGGATTATAG GTGT/---- GAGCCACCAC 3070 het 3070 ref 34 14 13 8 GT 2 0 260636 CASAVA_Build 19 34956442 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1353 hom 7 het 3 0 3 0 T 11 10 260637 CASAVA_Build 19 34959001 3D CAGAACACCA GGT/--- GGTATGGCTG 3070 hom 89 het 35 0 24 11 GGT 2 1 260638 CASAVA_Build 19 34962526 4D CTCAAAAAAA AAAG/---- AAAAAGAAAA 3070 hom 63 het 23 0 20 5 AAAG 1 0 260639 CASAVA_Build 19 34972730 1D CCATTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2410 het 656 hom 17 4 8 5 A 14 13 260640 CASAVA_Build 19 34995555 1I TGGGGAGCAT -/C CCCCCCCATC 1763 het 1763 ref 23 6 7 10 C 7 8 260641 CASAVA_Build 19 34996427 1I TCTCAATACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 9 10 260642 CASAVA_Build 19 35013705 1I ATAAACAGCA -/T TCCCCCACCT 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 T 1 2 260643 CASAVA_Build 19 35014920 6D GAGCATTCTC TTTTCT/------ TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 10 10 TTTTCT 3 2 260644 CASAVA_Build 19 35023798 1I GATTTTTTGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 T 8 9 260645 CASAVA_Build 19 35028724 2D CTTACTACTC TT/-- AAGTCTCGCC 3070 het 3070 hom 40 14 18 9 T 2 0 260646 CASAVA_Build 19 35047056 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 19 3 A 13 12 260647 CASAVA_Build 19 35047561 1I TCTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 833 hom 33 4 23 6 T 11 12 260648 CASAVA_Build 19 35048225 2D ATTATTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 29 1 21 9 T 16 14 260649 CASAVA_Build 19 35054094 1D TGATAGAGAG C/- CCCCCCCCCT 3070 hom 92 het 36 0 27 9 C 10 9 260650 CASAVA_Build 19 35061537 4I CAGTCTACAT ----/ATAC ATATATATTT 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 ATAC 0 1 260651 CASAVA_Build 19 35063078 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 A 10 11 260652 CASAVA_Build 19 35080640 1I TTAATTTTTA -/T TTTTTATTTT 383 hom 15 het 9 0 6 3 T 5 6 260653 CASAVA_Build 19 35087659 4D TCTCAATATA TATC/---- TCTCTCTCTT 3070 hom 42 het 18 0 15 5 TATC 1 0 260654 CASAVA_Build 19 35089494 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1631 hom 12 het 7 0 5 2 T 11 12 260655 CASAVA_Build 19 35094865 4I GAGATCTATC ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 81 het 36 0 27 10 TTTA 3 4 260656 CASAVA_Build 19 35104886 5I CTGGATTGTA -----/GAGTC AAGTTTATGA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 GAGTC 0 1 260657 CASAVA_Build 19 35116572 1D CGATCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 18 1 13 4 A 12 11 260658 CASAVA_Build 19 35117564 1I TGGCTTCCCA -/G GGGATTGGTA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 G 3 4 260659 CASAVA_Build 19 35118510 5D CCTCTGGTTC CTTTT/----- CTTTTCTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 5 CTTTT 5 4 260660 CASAVA_Build 19 35124787 3D ACGTAATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 12 5 A 13 10 260661 CASAVA_Build 19 35128815 1D TGATTTCCTT C/- CCCCCCCCAA 3070 het 68 hom 26 1 23 2 C 9 8 260662 CASAVA_Build 19 35132950 1I AAAAAACCCA -/T TTTCATTGTT 3070 hom 120 het 51 0 37 14 T 3 4 260663 CASAVA_Build 19 35138409 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 29 1 20 8 T 11 10 260664 CASAVA_Build 19 35141703 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 19 0 16 3 A 10 11 260665 CASAVA_Build 19 35142552 1I TTGCCTTTGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 191 hom 28 1 21 6 T 7 8 260666 CASAVA_Build 19 35163842 1D GGATGTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3062 het 3062 ref 21 10 7 4 T 11 10 260667 CASAVA_Build 19 35172517 1D GTTTTGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 25 1 20 4 T 13 12 260668 CASAVA_Build 19 35178300 1I TGTCTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 11 12 260669 CASAVA_Build 19 35182728 1I TGTTTACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 115 het 46 0 39 7 T 10 11 260670 CASAVA_Build 19 35220917 3I GCGTGAAGAA ---/GAT GATGATTATG 3070 hom 135 het 52 0 46 6 GAT 2 3 260671 CASAVA_Build 19 35231847 1D GCTCTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 39 0 28 11 T 13 12 260672 CASAVA_Build 19 35233196 4I TTCCTTCCTT ----/CCTC CCTCCCTCCT 3070 hom 94 het 39 0 27 12 CCTC 2 3 260673 CASAVA_Build 19 35233318 4I CCCTCCCTCC ----/CTTA CTTTCTTTCT 3070 hom 64 het 25 0 21 4 CTTA 0 1 260674 CASAVA_Build 19 35261772 2I ACATGGAGTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 10 12 260675 CASAVA_Build 19 35264081 1I GCAAAACAGC -/A AAAAAGGCCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 6 260676 CASAVA_Build 19 35293725 1D GAGAAAGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 T 10 9 260677 CASAVA_Build 19 35298230 1D TCTTTCCCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1612 hom 21 7 10 4 T 13 12 260678 CASAVA_Build 19 35300871 2D GGGGCCTCCA CT/-- GTTTGGTGGC 2292 hom 26 het 11 0 7 4 CT 1 0 260679 CASAVA_Build 19 35310840 1I CCTCAAAAAT -/C TTTTTTTATA 2555 het 2555 ref 15 7 7 1 C 0 1 260680 CASAVA_Build 19 35332122 1D ACAAAGTGAT A/- AGTGCCTGTG 3070 hom 165 het 66 0 51 15 A 2 1 260681 CASAVA_Build 19 35338203 1D TTTTCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1480 het 1480 ref 32 20 5 7 T 14 13 260682 CASAVA_Build 19 35353817 4I GTGTGTGAGT ----/GAAA GTGTGTGGTG 3070 hom 211 het 78 0 71 7 GAAA 0 1 260683 CASAVA_Build 19 35415178 1I CTTCTGCCCC -/T GCCTTTCTCC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 0 1 260684 CASAVA_Build 19 35420523 1I CTATAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 912 hom 43 3 33 7 T 11 12 260685 CASAVA_Build 19 35448629 5I TTTTTGTTTC -----/TCTTT TCTTTTCTTT 3070 het 2849 hom 34 8 17 9 TCTTT 2 3 260686 CASAVA_Build 19 35459603 1D TGTCTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 12 13 T 12 11 260687 CASAVA_Build 19 35464262 6I ACGATGGGTG ------/GTTTCT GTATCTGATG 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 GTTTCT 0 1 260688 CASAVA_Build 19 35465161 1D CGGTGCCAAC T/- GCAGGAGACG 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 1 0 260689 CASAVA_Build 19 35527424 1I AGGCAGGCCA -/T TTTTTTTTTA 2748 het 1569 hom 27 7 9 11 T 9 10 260690 CASAVA_Build 19 35527991 1I CCCGGGGGCT -/C CCCCCCAGCA 2342 het 2342 ref 28 14 11 3 C 6 7 260691 CASAVA_Build 19 35544779 5D CTGCTGGTCC TACTG/----- TACTGCGGGT 3070 hom 87 het 32 0 29 5 TACTG 2 1 260692 CASAVA_Build 19 35552290 1D CGGGGTGTGG T/- TTTTGACTGG 3070 hom 120 het 44 0 36 8 T 5 4 260693 CASAVA_Build 19 35554306 1D TCTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 43 1 24 19 T 13 12 260694 CASAVA_Build 19 35557247 1D AAATATAGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 9 8 260695 CASAVA_Build 19 35557438 1I CTGAGTGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 20 het 22 0 14 8 T 9 10 260696 CASAVA_Build 19 35565317 1I GGGCAGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2885 hom 32 8 16 8 T 12 13 260697 CASAVA_Build 19 35566059 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 A 8 9 260698 CASAVA_Build 19 35566288 1I ATGCCTGTGG -/C CCCAGGGCCT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 C 3 4 260699 CASAVA_Build 19 35574453 2D ACCAAGAGAA AG/-- AGAGAAAAAG 3070 het 3070 ref 54 28 22 6 AG 3 2 260700 CASAVA_Build 19 35581136 2I TTTCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 12 14 260701 CASAVA_Build 19 35591595 26D CTATATATTC ATCCATCCTCCATCCATCGATCTTCT/-------------------------- ATCCATCCTT 3070 het 3070 ref 44 26 19 11 ATCCATCCTCCATCCATCGATCTTCT 1 0 260702 CASAVA_Build 19 35595163 5D GATGTTGTTG ATATA/----- ATATGATTAT 3070 het 3070 hom 22 9 13 1 ATATA 1 0 260703 CASAVA_Build 19 35619220 1D GTAAGAGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 34 1 30 4 A 12 11 260704 CASAVA_Build 19 35632768 6D CACCCAAAAG AAGAAA/------ AAGAAAAAGA 3029 hom 21 het 13 0 8 6 AAGAAA 4 3 260705 CASAVA_Build 19 35633329 1D TGCTTAAAAA T/- TTTTTTAGCC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 6 260706 CASAVA_Build 19 35663760 4I TGGGCAACAG ----/AGTT AGTTAGACCC 1325 het 1325 ref 29 6 4 21 AGTT 1 2 260707 CASAVA_Build 19 35681781 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2244 hom 26 8 14 4 T 13 12 260708 CASAVA_Build 19 35714193 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 T 13 12 260709 CASAVA_Build 19 35782872 1I AGTTTCTCTC -/T GTCTGTTGCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 0 1 260710 CASAVA_Build 19 35796592 4D AGTTCTAGAC TTTG/---- TTTGGTTCTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTTG 2 1 260711 CASAVA_Build 19 35803619 1D CAATTCTGGC A/- AAAAAAAAAA 1099 het 1099 ref 31 21 3 7 A 13 12 260712 CASAVA_Build 19 35805768 1D AAATCTTGTG T/- TTTTTTTTTT 2743 het 30 hom 26 1 18 8 T 11 10 260713 CASAVA_Build 19 35822976 6D CCTGGGCAAC AGAGTG/------ AGAGTGAGAC 3070 hom 56 het 20 0 18 3 AGAGTG 2 1 260714 CASAVA_Build 19 35849470 4D TTTTAATTGC TTTA/---- TTTGTTTTCT 1644 het 1644 ref 21 11 5 5 TTTA 1 0 260715 CASAVA_Build 19 35893909 1D TATATATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1865 hom 21 6 10 5 A 12 11 260716 CASAVA_Build 19 35894810 1I TTAAAATATG -/A ATCTAAACAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 2 260717 CASAVA_Build 19 35895682 1D ATAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 74 het 29 0 25 4 A 10 9 260718 CASAVA_Build 19 35944160 1I TTTCTCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3006 het 3006 ref 28 13 8 7 T 13 14 260719 CASAVA_Build 19 35945945 1I AAGTTACCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 27 12 5 T 11 12 260720 CASAVA_Build 19 35950755 1I TGCCTTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 10 11 260721 CASAVA_Build 19 35957679 1I TTAGGTACAT -/C AATAAATTAT 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 C 0 1 260722 CASAVA_Build 19 35958710 1D TGATCATCTT G/- AGATAAGTAT 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 G 1 0 260723 CASAVA_Build 19 35962531 1I CTGTTTTATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 A 8 9 260724 CASAVA_Build 19 35965633 3D GAAAGAAGAC AGG/--- AGTTCTCAGG 3070 het 3070 ref 40 21 15 7 AGG 1 0 260725 CASAVA_Build 19 35969561 7D CTTTTTCTAC TAGACTG/------- TAGACTCCAT 3070 het 3070 ref 33 14 15 7 TAGACTG 1 0 260726 CASAVA_Build 19 35970943 1I AAGCAGAGGC -/T TTAAACGATG 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 T 2 3 260727 CASAVA_Build 19 35976496 1D CAAACTTATA G/- GGGGGAACAT 3070 het 3070 ref 36 22 12 3 G 6 5 260728 CASAVA_Build 19 35979874 8I ATTCTGATTA --------/CCAGTCCT CCCAGAGTGC 3070 hom 35 het 15 0 11 4 CCAGTCCT 0 1 260729 CASAVA_Build 19 35982284 1I ACCAGCCAGT -/G GGTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 G 2 3 260730 CASAVA_Build 19 35983639 4I TTTTGGTAAC ----/ACTT AATCGCAGTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 ACTT 0 1 260731 CASAVA_Build 19 35990461 1I ATTCTTTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 A 9 10 260732 CASAVA_Build 19 35993460 2I GCTCTTTGTT --/CA CAGTTATCTC 3070 hom 144 het 51 0 47 4 CA 1 2 260733 CASAVA_Build 19 35993969 1I GTTGCACAGC -/A AAAGGCAGCT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 3 4 260734 CASAVA_Build 19 35998451 1I AGGGAACAAA -/G GGGGGAGACT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 G 5 6 260735 CASAVA_Build 19 36000378 1I ACTATTAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 10 11 260736 CASAVA_Build 19 36006080 1D AAACCATATA C/- AACACATAGT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 C 1 0 260737 CASAVA_Build 19 36007814 12D ATGATGGTGA TGATGATGGTGG/------------ TGATGATGGT 3070 het 3070 ref 65 26 27 19 TGATGATGGTGG 1 0 260738 CASAVA_Build 19 36008249 1I CGTGGTGAAA -/C CCTGTGTCTA 3070 het 2130 hom 14 6 7 1 C 2 3 260739 CASAVA_Build 19 36014025 1I TTTTGGCTGT -/G GGGGGCATGA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 G 5 6 260740 CASAVA_Build 19 36016817 1I ATAGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 16 14 15 T 12 13 260741 CASAVA_Build 19 36029736 1I CTGGTGCTGT -/A ATAAAGACTT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 A 1 2 260742 CASAVA_Build 19 36029867 2D ACACACACAC AT/-- ATACACACAC 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 AT 2 1 260743 CASAVA_Build 19 36035385 1I AGTGTGGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 A 13 14 260744 CASAVA_Build 19 36037605 1D CCCAGGCAGA C/- CCCCCAGTGC 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 C 6 5 260745 CASAVA_Build 19 36050298 1D ATTACTCTTT A/- TAGAAGTATG 3070 het 3070 hom 42 17 23 3 A 1 0 260746 CASAVA_Build 19 36051451 1I ACAACTTTAA -/G TAAAGTCCTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 0 1 260747 CASAVA_Build 19 36084964 1D TGGATTGAGC A/- AGGACTCTCA 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 A 2 1 260748 CASAVA_Build 19 36090865 1D ATACATCCCG A/- AAATGAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 A 4 3 260749 CASAVA_Build 19 36093360 1D TGCGCCACCA G/- GGGCCTCCCT 3070 hom 107 het 44 0 30 14 G 4 3 260750 CASAVA_Build 19 36100148 3D GATTTGCAGG TCT/--- TCTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 TCT 2 1 260751 CASAVA_Build 19 36103790 2D TTATTTTGTT AA/-- TTTTTTTTTT 336 het 336 ref 19 12 3 5 A 2 0 260752 CASAVA_Build 19 36111969 1I ACCAGAGTCA -/G GGTCTAGTAC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 G 2 3 260753 CASAVA_Build 19 36113195 1I AGAAGCGTGT -/C CCCCTGGGGA 3070 hom 104 het 47 0 33 14 C 4 5 260754 CASAVA_Build 19 36115022 1D CCCCGTGGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1435 hom 39 9 10 20 T 12 11 260755 CASAVA_Build 19 36122130 2I TCTATTGGTC --/TA TGTGTCTGTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 TA 0 1 260756 CASAVA_Build 19 36123662 1I GTGAAGGTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 7 8 260757 CASAVA_Build 19 36127003 2I ATGTAATCAC --/AT GAGTCCTTAA 3070 het 2922 hom 24 8 14 2 AT 0 1 260758 CASAVA_Build 19 36152265 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 47 20 18 10 AC 10 9 260759 CASAVA_Build 19 36158172 1D TTTTTTTTGA C/- CAAGCCAATG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 C 2 1 260760 CASAVA_Build 19 36162464 1D ATTGAGTCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1916 hom 20 5 13 2 A 10 9 260761 CASAVA_Build 19 36168890 1I TTTGATAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 10 11 260762 CASAVA_Build 19 36174985 1I GTGTGTAGAT -/A ATCATTTGTC 3070 hom 60 het 35 0 21 14 A 1 2 260763 CASAVA_Build 19 36178112 1I GTATTTTTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 1241 hom 17 5 11 1 T 7 8 260764 CASAVA_Build 19 36181671 2D ACACATATAT AC/-- ACACACACAA 3070 het 1406 hom 15 4 8 3 AC 5 4 260765 CASAVA_Build 19 36195592 1D GTCTCGCTAT G/- TTTCCCAGGC 3070 het 3070 hom 25 10 13 4 G 1 0 260766 CASAVA_Build 19 36198414 11I CAGGACCAGA -----------/AAGGCAGGGCT AAGGCAGGGC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 AAGGCAGGGCT 1 2 260767 CASAVA_Build 19 36199642 1D GTGCTCCCGT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 7 260768 CASAVA_Build 19 36200137 1D TTTATAAAGG A/- AAGAGATTTA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 3 2 260769 CASAVA_Build 19 36215516 1I TGGAGCTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 11 12 260770 CASAVA_Build 19 36216123 1D AAGAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 18 11 A 12 11 260771 CASAVA_Build 19 36217626 1D TCTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1354 het 1354 ref 32 13 5 14 T 17 16 260772 CASAVA_Build 19 36217751 1D CATTGCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 12 11 260773 CASAVA_Build 19 36235239 3D TGCCAAAGTC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 57 21 16 22 TTG 7 6 260774 CASAVA_Build 19 36248636 1D ATCAAATTAA T/- TTTTTTTTTT 1782 het 1782 ref 26 20 4 2 T 13 12 260775 CASAVA_Build 19 36257910 1D TTTATCCACC A/- AAAAAAAAAA 1346 het 1346 ref 40 33 3 4 A 11 10 260776 CASAVA_Build 19 36332882 1I CAAAATGTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 7 8 260777 CASAVA_Build 19 36358187 1D TTTGTTTGTG T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 T 8 7 260778 CASAVA_Build 19 36370146 1D TTTAATCGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 T 11 10 260779 CASAVA_Build 19 36372803 5I TAGTATAAAG -----/GAAAA GAAGAGTGTT 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 GAAAA 0 1 260780 CASAVA_Build 19 36373390 1D GCACACAGTT A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 7 6 260781 CASAVA_Build 19 36373641 1D ATTCTAGAAT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 21 7 13 1 A 8 7 260782 CASAVA_Build 19 36376827 1I AACTTACTAG -/A ATAGAAATTC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 1 2 260783 CASAVA_Build 19 36377970 1I GTCACACACC -/A AACCACAGAT 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 2 3 260784 CASAVA_Build 19 36378303 4D TAGGGATTCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2510 hom 26 6 14 7 TTTA 5 4 260785 CASAVA_Build 19 36383253 2I ATTTCAACTC --/TT TGACATTCTG 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 T 1 3 260786 CASAVA_Build 19 36383753 1D GTGTCAGGGG A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 A 7 6 260787 CASAVA_Build 19 36401042 4D ATGTCATATG TCCT/---- ATGTCCTATG 3070 hom 123 het 43 0 41 6 TCCT 1 0 260788 CASAVA_Build 19 36419824 1I GAACCCGGGA -/G GCAGAGGCTG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 1 2 260789 CASAVA_Build 19 36422495 1I CCAGCTAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 9 10 260790 CASAVA_Build 19 36446191 1D CCCACGGCTG C/- CCCCCAGCAG 2104 het 1121 hom 30 6 8 17 C 6 5 260791 CASAVA_Build 19 36458176 1I GTACAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2842 hom 29 11 8 10 T 13 14 260792 CASAVA_Build 19 36462701 1I TCTTTGGAGC -/A AAAAAAAAAA 1771 het 1771 ref 28 12 4 12 A 15 16 260793 CASAVA_Build 19 36480169 1I TTCCTGTCTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 T 8 9 260794 CASAVA_Build 19 36486727 2D TTTATTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 2355 het 2355 ref 19 10 7 2 T 12 10 260795 CASAVA_Build 19 36487258 1D ACAACAACAA C/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 C 1 0 260796 CASAVA_Build 19 36491242 3D CAATTGTTTG TCA/--- TCGTCTCCAG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 TCA 1 0 260797 CASAVA_Build 19 36492136 1D TATCTTCTGC A/- AAAAAAAAAG 2766 het 2766 ref 37 20 8 10 A 10 9 260798 CASAVA_Build 19 36495771 1D GAGTTAAAAC G/- TGTGTAAACA 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 G 1 0 260799 CASAVA_Build 19 36502633 1D GCAGCCCCCC T/- GAGAAAGTAG 3070 het 3070 hom 40 17 23 0 T 1 0 260800 CASAVA_Build 19 36513455 1D AATCCTTGGG C/- GGGGGGAGGA 3070 het 108 hom 36 1 30 5 C 1 0 260801 CASAVA_Build 19 36522543 1I GGCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1578 het 1522 hom 30 7 7 16 A 10 11 260802 CASAVA_Build 19 36543110 1I ATTTTCCCTG -/T TTAGTAGCGA 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 T 2 3 260803 CASAVA_Build 19 36545075 2I CACCTGAAAC --/CT CCCCCGACAC 3070 het 3070 ref 56 28 20 8 CT 0 1 260804 CASAVA_Build 19 36562592 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 100 het 100 ref 15 3 2 10 T 17 16 260805 CASAVA_Build 19 36582928 1D GATAGGAAAG A/- AAGGAAGTGA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 3 2 260806 CASAVA_Build 19 36583445 1I TGGGTCTAGT -/A ATATGGACTG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 1 2 260807 CASAVA_Build 19 36584657 2I CTCTCTATAC --/AT ATATATATAT 2818 het 468 hom 15 2 10 3 AT 7 8 260808 CASAVA_Build 19 36592857 8D CTCTGTCTCA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 42 het 19 0 14 6 AAAC 6 4 260809 CASAVA_Build 19 36598025 2D AATATTCCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 84 het 37 0 28 9 TC 8 7 260810 CASAVA_Build 19 36605530 1D AGTAATATTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 9 8 260811 CASAVA_Build 19 36606931 2D AGTGGAGAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 20 9 T 15 13 260812 CASAVA_Build 19 36610617 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 8 9 260813 CASAVA_Build 19 36614467 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 887 hom 43 2 24 17 T 12 11 260814 CASAVA_Build 19 36615061 1D GTAAGATAAG C/- CCAGGGTCAC 3070 hom 96 het 35 0 30 6 C 3 2 260815 CASAVA_Build 19 36615160 1D CTTGGGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2529 hom 48 12 14 22 T 13 12 260816 CASAVA_Build 19 36622423 2D GAGCAAGAGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 43 21 12 11 GA 6 5 260817 CASAVA_Build 19 36638906 3I CAAAACAAAA ---/ATC AAACAAGAGG 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 ATC 0 1 260818 CASAVA_Build 19 36639945 2I TTCTTTTGAT --/TA TATATATATA 2999 het 1518 hom 24 5 7 12 TA 6 7 260819 CASAVA_Build 19 36697985 1D ACTTATTGGG T/- TTTTTTCCCT 1745 het 1745 ref 34 17 9 8 T 7 6 260820 CASAVA_Build 19 36716043 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 9 10 T 10 9 260821 CASAVA_Build 19 36830756 3D CTTTTTAAAT ATC/--- AGGAGAATCA 3070 het 3070 hom 36 14 19 5 ATC 1 0 260822 CASAVA_Build 19 36865869 6I ACATATCAGA ------/CTAGTT CTCCCCATTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 CTAGTT 0 1 260823 CASAVA_Build 19 36937980 1I ATGAGCTTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 8 260824 CASAVA_Build 19 36950130 1I TCTGAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 36 0 26 10 A 10 11 260825 CASAVA_Build 19 36953183 1D ACATTTATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 38 hom 29 1 21 7 A 10 9 260826 CASAVA_Build 19 36965706 1D TCTCCACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 19 1 12 6 T 14 13 260827 CASAVA_Build 19 36966138 21I CCAGACCACA ---------------------/GAGCTTGCACAGAGCTCTTGC ACAGAGCAAG 2963 het 2963 ref 24 10 8 6 GAGCTTGCACAGAGCTCTTGC 0 1 260828 CASAVA_Build 19 36987512 1D GAGAAAAGCT G/- GGGTATCTCC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 G 4 3 260829 CASAVA_Build 19 37036043 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 936 het 936 ref 28 16 5 7 T 13 14 260830 CASAVA_Build 19 37126356 1I GCCCGGCAGA -/G GGGAAGGTGG 3070 hom 87 het 33 0 26 7 G 3 4 260831 CASAVA_Build 19 37143920 8D ACTGTTGTTT TGCAAGAA/-------- TGCTTCTCCT 3070 hom 99 het 40 0 29 12 TGCAAGAA 1 0 260832 CASAVA_Build 19 37157373 15I GCCTCCATCT ---------------/CCCAAGAGCACTCCA CCAGCCTGCT 3070 hom 64 het 24 0 17 7 CCCAAGAGCACTCCA 0 1 260833 CASAVA_Build 19 37159212 1D TGGAGGGGGG A/- AAAAACATCC 3070 het 3070 ref 50 25 13 13 A 6 5 260834 CASAVA_Build 19 37170025 4I GAGAGAGAAC ----/AGTG AGAAAGAGAG 3070 hom 79 het 36 0 21 15 AGTG 0 1 260835 CASAVA_Build 19 37178454 1D ACTCAGGGAG A/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 A 7 6 260836 CASAVA_Build 19 37180266 1I GAGAGCTAAC -/A AAAAACAATC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 5 6 260837 CASAVA_Build 19 37182650 1I CTTCTCACAA -/G AACAGCGCAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 G 0 1 260838 CASAVA_Build 19 37182856 1D ATGAAGATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 10 9 260839 CASAVA_Build 19 37184800 1D GTGGATATTT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 7 A 8 7 260840 CASAVA_Build 19 37186154 5D ATAAAATAAA ATAAT/----- AAGCTAACAG 3070 het 3070 hom 45 17 26 5 ATAAT 1 0 260841 CASAVA_Build 19 37187925 2I TTTTTTAAAC --/AA AGAAAATAGA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 1 3 260842 CASAVA_Build 19 37191685 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2852 het 828 hom 26 12 9 5 T 17 16 260843 CASAVA_Build 19 37207501 1D AGTTGCCAAG A/- CCTCCTGGGA 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 A 1 0 260844 CASAVA_Build 19 37223282 1D TCTCCAGGCA C/- CCCCCAACCG 3023 het 2886 hom 23 8 7 8 C 6 5 260845 CASAVA_Build 19 37224698 1I ATGTTAGTAT -/A AAAGTTAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 3 4 260846 CASAVA_Build 19 37238367 1I AAGAGCTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 9 10 260847 CASAVA_Build 19 37240534 1D GTTTCCTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 51 24 18 9 T 9 8 260848 CASAVA_Build 19 37249649 1D AAATGGATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 53 33 17 3 A 10 9 260849 CASAVA_Build 19 37256397 1D AGAGGGCAGA G/- AAAGTGGCAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 G 1 0 260850 CASAVA_Build 19 37339390 2I TTGGGCAAAC --/TT ATCATATTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 2 260851 CASAVA_Build 19 37348520 1I CCACTACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 28 2 20 6 A 10 11 260852 CASAVA_Build 19 37352726 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 8 9 260853 CASAVA_Build 19 37354574 1D AGGGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2037 het 2037 ref 36 15 6 16 A 17 16 260854 CASAVA_Build 19 37356889 1I CTTGACTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 T 10 11 260855 CASAVA_Build 19 37472992 1I CCCCCGACCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 A 9 10 260856 CASAVA_Build 19 37481773 1D ATAAAAGGAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 T 8 7 260857 CASAVA_Build 19 37482821 2I TCCCTTGAGA --/TG TAAAGTTAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TG 0 1 260858 CASAVA_Build 19 37483978 1I TAATTAAATC -/T TTTTTTTTTT 2940 het 2940 ref 26 12 9 5 T 13 14 260859 CASAVA_Build 19 37531050 1D TATAGCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 22 1 15 6 T 13 12 260860 CASAVA_Build 19 37561397 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAGG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 10 8 260861 CASAVA_Build 19 37567454 1I CATTTTCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 9 10 260862 CASAVA_Build 19 37586770 1I AACTTGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1570 hom 37 4 31 2 A 11 12 260863 CASAVA_Build 19 37595119 2D CTTTTAATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 22 0 13 9 TA 8 7 260864 CASAVA_Build 19 37596191 1I AGAATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 11 12 260865 CASAVA_Build 19 37607067 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 729 hom 17 2 10 5 A 12 13 260866 CASAVA_Build 19 37620532 1D GGGTTTTTTT C/- TTGCTGTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 1 0 260867 CASAVA_Build 19 37626923 4D CAGCCATCAT AAAA/---- AAAAAGCTTC 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 A 9 5 260868 CASAVA_Build 19 37632770 1D ATCAGGAACT C/- CCAGAATATA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 C 3 2 260869 CASAVA_Build 19 37635607 1D GCCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 17 1 13 3 T 17 16 260870 CASAVA_Build 19 37640726 1I CATTTACTGA -/T TTTTGTACAC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 4 5 260871 CASAVA_Build 19 37645829 1I AAAATTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 11 12 260872 CASAVA_Build 19 37657346 1I AGCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 130 hom 30 1 25 4 T 9 10 260873 CASAVA_Build 19 37668914 1D TCTGTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 11 10 260874 CASAVA_Build 19 37706089 1I CTCAGGCGGG -/T TTTTTTTTGT 2282 het 2282 ref 20 7 9 4 T 8 9 260875 CASAVA_Build 19 37717912 1D ACCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 40 0 30 10 A 11 10 260876 CASAVA_Build 19 37755915 1I GTCTCCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 31 1 28 2 A 13 14 260877 CASAVA_Build 19 37756944 1I AGACCCCATC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 82 het 34 0 28 6 T 6 7 260878 CASAVA_Build 19 37760106 1I TCAGAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 615 hom 34 2 26 6 A 12 13 260879 CASAVA_Build 19 37762485 1D TCAGGATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 A 11 10 260880 CASAVA_Build 19 37790752 1I AACAACTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 32 1 24 7 T 13 14 260881 CASAVA_Build 19 37790917 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 18 0 16 2 T 21 19 260882 CASAVA_Build 19 37792583 2D TAAATTATAA TG/-- TATATAATTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TG 1 0 260883 CASAVA_Build 19 37795813 12I TAGAATATAT ------------/AAAGAACCCTCA AAATTCAACG 3070 hom 96 het 37 0 33 5 AAAGAACCCTCA 0 1 260884 CASAVA_Build 19 37800899 1D TTTAGGGAAT A/- ATAAACTGTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 2 1 260885 CASAVA_Build 19 37801140 8D TGCAGGGAGC TATGACTG/-------- TACCACTGCA 3070 hom 43 het 17 0 13 4 TATGACTG 1 0 260886 CASAVA_Build 19 37803919 1I TAAAAGGGAG -/C CAGTAAAACA 3070 hom 132 het 46 0 40 6 C 1 2 260887 CASAVA_Build 19 37805922 2D TGTACAGAAC AG/-- AGTTACTACA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 AG 2 1 260888 CASAVA_Build 19 37808182 1D AAACATTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 15 14 260889 CASAVA_Build 19 37825777 1D TCAAACCAGC G/- TGTCACCTCT 3070 hom 86 het 33 0 25 8 G 1 0 260890 CASAVA_Build 19 37833660 1I ATGACCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 10 11 260891 CASAVA_Build 19 37837406 1I TCCCTGATTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 4 hom 29 1 26 2 T 7 8 260892 CASAVA_Build 19 37839358 1I CATAGTGAGA -/C CCCCATCTCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 4 5 260893 CASAVA_Build 19 37839536 1I ACCTTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 500 hom 27 3 17 7 A 15 16 260894 CASAVA_Build 19 37843485 1D ATAGTCTATG A/- GTATAAAGCC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 0 260895 CASAVA_Build 19 37848208 1D GCTAATTTTT G/- TTTGTTTGTT 1951 hom 15 het 7 0 6 2 G 1 0 260896 CASAVA_Build 19 37851222 2D TATCTTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 2506 het 920 hom 33 14 8 11 T 16 14 260897 CASAVA_Build 19 37854035 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 25 0 17 8 A 11 12 260898 CASAVA_Build 19 37857318 1D AATGCAGAGA C/- CCCCCCGCCC 2161 hom 17 het 11 0 7 4 C 7 6 260899 CASAVA_Build 19 37879135 4I TATCAGTTTC ----/CTTA CTTAGGTATG 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 CTTA 1 2 260900 CASAVA_Build 19 37885150 11D TGCCTTCAGC CAGATCTGTTA/----------- CCGAAGTTAT 3070 het 3070 ref 39 28 10 6 CAGATCTGTTA 1 0 260901 CASAVA_Build 19 37892571 1I AATCTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2446 het 2446 ref 24 13 7 4 T 10 11 260902 CASAVA_Build 19 37893640 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2033 hom 24 5 16 3 A 12 13 260903 CASAVA_Build 19 37918021 1I CACACAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 A 10 11 260904 CASAVA_Build 19 37919757 1D CAGGACACTT A/- ACATTAGCTT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 2 1 260905 CASAVA_Build 19 37932095 1D CACTGTACTT A/- ACCTTGAAGG 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 2 1 260906 CASAVA_Build 19 37944813 1D TTAGGAGTCC T/- TTGTACATTT 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 T 3 2 260907 CASAVA_Build 19 37949368 1I TTAGCCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 11 12 260908 CASAVA_Build 19 37951132 1D GTCTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 1713 het 1713 ref 44 29 5 10 T 15 14 260909 CASAVA_Build 19 37951966 4D ATCTTTGCTT TCTC/---- TATATTTTCT 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 TC 2 0 260910 CASAVA_Build 19 37964718 2I ATATTTTTCT --/TC TTTTTTTTTA 2336 het 2336 ref 12 7 5 0 TC 0 1 260911 CASAVA_Build 19 37971856 1D GTGATGCAGA G/- GTTCCCCCCT 3070 het 2506 hom 37 10 20 7 G 2 1 260912 CASAVA_Build 19 37972749 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1427 het 1427 ref 31 19 5 7 A 10 11 260913 CASAVA_Build 19 37979917 14D AGTAGAGATG GGGTTTCACCATAT/-------------- TGGTCAGGCT 3070 het 2740 hom 14 6 9 2 GGGTTTCACCATAT 1 0 260914 CASAVA_Build 19 38009425 2D GTTCTCTTGA AC/-- AGAACCCCAA 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 AC 1 0 260915 CASAVA_Build 19 38013558 2I CCTGTGCTCA --/GG GGATGGCCAG 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 G 2 4 260916 CASAVA_Build 19 38015502 1I TACAAAAAGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 11 9 11 A 8 9 260917 CASAVA_Build 19 38019801 1D ATATAATGAT A/- AGTCTGGTCT 3070 het 3070 ref 42 25 12 6 A 2 1 260918 CASAVA_Build 19 38021276 5I TTTAATGCTA -----/TATAT TATATATTTG 3070 het 2720 hom 15 6 9 0 TATAT 1 2 260919 CASAVA_Build 19 38021552 4D TATACATATA TATC/---- TATTATACAC 3070 het 3070 ref 31 20 9 4 TATC 1 0 260920 CASAVA_Build 19 38038448 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 12 1 9 2 A 11 12 260921 CASAVA_Build 19 38040230 1D TAAAATTTAT A/- AAGAAATACA 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 A 3 2 260922 CASAVA_Build 19 38043217 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2298 het 1538 hom 27 8 11 8 A 15 16 260923 CASAVA_Build 19 38048698 2I GACAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 1418 het 90 hom 20 1 7 12 CT 1 2 260924 CASAVA_Build 19 38061123 1D CAGCACCTTG T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 8 7 260925 CASAVA_Build 19 38078497 1D TAGATCTGAT A/- AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 23 12 5 6 A 13 12 260926 CASAVA_Build 19 38100889 1D TCAACTGGGG C/- CCCCGGCAGG 3070 het 3070 ref 46 24 16 7 C 5 4 260927 CASAVA_Build 19 38108007 1D ATCTACAACA C/- CTACACAGGC 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 C 2 1 260928 CASAVA_Build 19 38113633 1I ACTTTTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 10 11 260929 CASAVA_Build 19 38115810 1D TAAAATACTA T/- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 6 T 3 2 260930 CASAVA_Build 19 38116933 1D CCCAGGTCTG T/- GTCTGGCAGA 3070 het 3070 ref 37 13 13 11 T 1 0 260931 CASAVA_Build 19 38129680 1I TATTTATGTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 1972 hom 22 4 12 6 T 8 9 260932 CASAVA_Build 19 38130173 1D TTAACATGGC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 45 26 11 9 A 9 8 260933 CASAVA_Build 19 38132131 1D GAAGCAGGTC T/- TTTTTTTTTT 1325 het 1325 ref 35 23 4 8 T 11 10 260934 CASAVA_Build 19 38135665 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAGAAA 2188 het 161 hom 22 5 7 10 G 0 1 260935 CASAVA_Build 19 38136032 13D13M2D5M3I6M4D6M2D7M9I8M8D AATTTAAAGA AAGGCTGCAGTGTGCAAAATGATACCATAAAAG---TGATAGGAAATTTAGCTTCCAAGGT---------CAAAGAAAAGAACGAG/-------------TTAAAATAACTCC--TAAAGCCTGGATAG----TTGAGC--CCATTGTGCTCTTCTGCCCATAAA-------- ATTGCTAAGC 1753 het 1753 ref 39 62 4 16 N/A 0 0 260936 CASAVA_Build 19 38137460 3I ACCCAGGATG ---/GGT GAGTATAGTA 3070 het 1833 hom 14 5 8 1 GGT 0 1 260937 CASAVA_Build 19 38138796 10D AATTTGGTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 906 hom 25 4 11 10 T 24 14 260938 CASAVA_Build 19 38140164 1I CTATAATCCC -/A GCACTTTGGG 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 0 1 260939 CASAVA_Build 19 38141225 1I GAGGTCAGGA -/G TTACAGACCG 3070 het 3052 hom 19 8 10 1 G 0 1 260940 CASAVA_Build 19 38144796 1D TTCCATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 12 10 15 A 15 14 260941 CASAVA_Build 19 38157617 1D CTTGTGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 12 11 260942 CASAVA_Build 19 38162648 4D GGATTTGAGA ACAG/---- ATAGATAGAT 1744 het 1744 ref 42 35 4 5 ACAG 1 0 260943 CASAVA_Build 19 38171359 31D CCCATGGCTC CCTTCCTTGTCCTGGTGCTCTTGCCAAAAGG/------------------------------- CCTTCTTTTT 1396 het 1396 ref 24 18 4 6 CCTTCCTTGTCCTGGTGCTCTTGCCAAAAGG 1 0 260944 CASAVA_Build 19 38174396 11D AAAAAACTAA AAACATAAAAC/----------- AAACAAAAGA 2621 het 2621 ref 40 36 6 4 AAACATAAAAC 1 0 260945 CASAVA_Build 19 38177143 1D CTCCGGGGGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 9 8 260946 CASAVA_Build 19 38188940 1D TCATTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2699 hom 23 9 12 2 A 12 11 260947 CASAVA_Build 19 38191776 3I CCTACTGTAT ---/AGC ACGCTGTGTG 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 AGC 0 1 260948 CASAVA_Build 19 38200121 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 6 A 11 10 260949 CASAVA_Build 19 38204874 1D TTTTTTTAGT A/- GCAATGGGGT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 1 0 260950 CASAVA_Build 19 38249642 6D GCACTTTGGA AGGCCG/------ AGGCCGAGGC 3070 hom 24 het 12 0 9 3 AGGCCG 3 2 260951 CASAVA_Build 19 38268947 1I GTGCATATAT -/A GTAATGTAGT 3070 hom 125 het 47 0 41 6 A 0 1 260952 CASAVA_Build 19 38294722 1I AGTTTTTTCC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 T 8 9 260953 CASAVA_Build 19 38323536 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2448 het 1994 hom 14 6 6 2 A 11 10 260954 CASAVA_Build 19 38326391 1D ACCCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1708 het 777 hom 16 4 5 7 A 17 16 260955 CASAVA_Build 19 38343928 1D CTAACAAAAC A/- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 4 3 260956 CASAVA_Build 19 38345114 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1488 het 763 hom 7 2 4 2 T 12 11 260957 CASAVA_Build 19 38349510 1I ATACAAAAAA -/T TAGCTAGGAG 3070 hom 78 het 33 0 25 8 T 1 2 260958 CASAVA_Build 19 38354518 4D GTCATATAGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 TTTG 4 3 260959 CASAVA_Build 19 38357995 4D ACAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 AAAC 4 3 260960 CASAVA_Build 19 38364829 1D TGGCCAGGCT G/- GTCTCAAACT 3070 het 919 hom 18 2 11 5 G 2 1 260961 CASAVA_Build 19 38368189 1D TGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 2643 het 1404 hom 22 7 8 7 T 13 12 260962 CASAVA_Build 19 38369649 1D GGACTGACTC T/- TCCCCCAAAT 3070 het 3070 hom 22 7 11 5 T 2 1 260963 CASAVA_Build 19 38374616 1I CATGTCTGAG -/C CCCTCTGCCC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 C 3 4 260964 CASAVA_Build 19 38383145 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTATACTT 3070 hom 38 het 14 0 11 3 T 4 5 260965 CASAVA_Build 19 38391505 1I GGGCTTCCTT -/A AAACAGGCTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 3 4 260966 CASAVA_Build 19 38408837 1I ACAAGACAAT -/C CCCTGCTCTC 3070 hom 54 het 21 0 14 7 C 3 4 260967 CASAVA_Build 19 38413137 2D TACTGCTCGC TT/-- TTTTTTTTTT 2339 het 68 hom 28 2 10 16 T 16 14 260968 CASAVA_Build 19 38415021 2I GGTGCATGTT --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 46 19 16 11 TG 4 5 260969 CASAVA_Build 19 38423521 4I GGGAAGGCAC ----/AGGA AGGAGGTAGA 3070 het 2007 hom 21 9 9 3 AGGA 1 2 260970 CASAVA_Build 19 38425990 5I ATCCCTGCCA -----/CAGGG CAGTGGAGCC 3070 hom 85 het 37 0 26 11 CAGGG 0 1 260971 CASAVA_Build 19 38427340 1I TTTCTTAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 T 9 10 260972 CASAVA_Build 19 38427585 1D CCACTACCCA C/- ACTAGGCTGC 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 C 1 0 260973 CASAVA_Build 19 38429359 2I CACACAAATA --/AC ACATGCACAT 3070 het 3070 ref 59 28 27 4 AC 1 2 260974 CASAVA_Build 19 38433113 2D CACAGACATG CA/-- TAGACAGATA 186 het 186 ref 41 18 3 20 CA 1 0 260975 CASAVA_Build 19 38435015 1I AAGTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 4 5 260976 CASAVA_Build 19 38441003 7I AATTTGCTAT -------/ATAACCC ATTCGCTGAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 ATAACCC 0 1 260977 CASAVA_Build 19 38441136 37D TTAATTATTT TAAGTATACTTATTATTATGTAAGTATACTTATTATG/------------------------------------- TAAGTATACT 3070 hom 72 het 25 0 25 5 TAAGTATACTTATTATTATGTAAGTATACTTATTATG 1 0 260978 CASAVA_Build 19 38442967 1I AAGAGATCCT -/C CCCGTCTCTG 3070 het 2311 hom 28 9 12 7 C 3 4 260979 CASAVA_Build 19 38444499 2I CAGCACTGCG --/GT GTTCCAGCTC 3070 het 1858 hom 34 10 10 14 GT 1 2 260980 CASAVA_Build 19 38445825 5I TTTAAAAAAA -----/TTATT TTATTTTAAG 3070 hom 42 het 16 0 15 2 TTATT 1 2 260981 CASAVA_Build 19 38449577 1D AGTATTTGTA T/- TTTTTGTAGA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 T 6 5 260982 CASAVA_Build 19 38450929 2D GCCCCGGGGA AC/-- AGAGTCCAGG 2687 het 2687 ref 29 10 13 6 AC 1 0 260983 CASAVA_Build 19 38454556 2I TGAGAATTAA --/AT ATATGTTTTC 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 AT 2 3 260984 CASAVA_Build 19 38461667 1I CCAGGGCAAG -/C CCCCCCCCAC 2563 het 924 hom 23 3 9 11 C 8 9 260985 CASAVA_Build 19 38466537 4D GCCCCCAAAC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 8 het 37 1 17 20 TG 11 9 260986 CASAVA_Build 19 38504895 1I CCTGTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 29 0 21 8 A 13 14 260987 CASAVA_Build 19 38514521 1I CTGAGTAGCT -/A GGACCACAAG 3070 hom 40 het 19 0 14 5 A 0 1 260988 CASAVA_Build 19 38602956 2I CCGTCCCCAA --/AG GCCTGGCTCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AG 0 1 260989 CASAVA_Build 19 38616744 1D TGGGTGAAGA C/- CCCAGGACAT 3070 hom 131 het 51 0 43 9 C 4 3 260990 CASAVA_Build 19 38632503 7D CCACCCCAGG CGGTGTC/------- CCAATGTGCA 3070 het 3070 hom 39 20 17 3 CGGTGTC 1 0 260991 CASAVA_Build 19 38641298 29D TGTGGTGTGG GGTGTGTGTGTGGTATGTGGAACGAGTGT/----------------------------- GGTGTGTGTG 2995 het 2995 ref 47 39 9 17 GGTGTGTGTGTGGTATGTGGAACGAGTGT 1 0 260992 CASAVA_Build 19 38642420 1I GCTCGCTCAC -/T TTTTTTTTTT 2329 het 2329 ref 24 7 7 10 T 11 12 260993 CASAVA_Build 19 38649903 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2466 het 864 hom 14 2 8 4 A 15 13 260994 CASAVA_Build 19 38649996 1I CCCTGGGCTT -/G GTGACATCCG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 G 1 2 260995 CASAVA_Build 19 38657728 10D CCTGTCTCTT AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 39 20 16 6 A 17 7 260996 CASAVA_Build 19 38660655 1D AGCAAAACAG A/- AAAGGCTATG 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 A 4 3 260997 CASAVA_Build 19 38664149 1I CCCATCTCTA -/C CGAAAATACA 2567 het 2567 ref 18 10 6 3 C 1 2 260998 CASAVA_Build 19 38668012 1D GGCCGAGGCA G/- GTGAATCACC 2242 het 2242 ref 20 10 6 4 G 2 1 260999 CASAVA_Build 19 38668664 4D GGGTACAGCT TCTG/---- TCTGTCTGGG 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 TCTG 3 2 261000 CASAVA_Build 19 38675496 1I GAGTGGGTGT -/G GGCGCCAGGC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 G 2 3 261001 CASAVA_Build 19 38693107 2D GACAGAGGGA GG/-- GGGGCTCCAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 6 G 6 4 261002 CASAVA_Build 19 38699751 1D CATGGCAAAA C/- CCCCATCTCT 3070 hom 118 het 42 0 38 5 C 5 4 261003 CASAVA_Build 19 38708892 1I CAATTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 2458 het 1985 hom 21 6 7 8 T 11 12 261004 CASAVA_Build 19 38711244 2D GAGAACCTGG AC/-- ACAGTGGTTA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 AC 2 1 261005 CASAVA_Build 19 38712175 4I CTGGTCAACA ----/GCCT GCTAACCAGC 3070 hom 99 het 38 0 32 6 GCCT 0 1 261006 CASAVA_Build 19 38719181 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1376 hom 24 4 17 4 T 11 10 261007 CASAVA_Build 19 38750828 1D CTCACTCCTC T/- CTGGATCCAG 3070 hom 101 het 39 0 32 7 T 1 0 261008 CASAVA_Build 19 38763456 1I GACTGGACTC -/T TCCCCAGATC 3070 hom 84 het 31 0 27 4 T 1 2 261009 CASAVA_Build 19 38765169 1D CTCCTCTCCA G/- GGGCTGATGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 4 3 261010 CASAVA_Build 19 38765510 2I GAATTGTCTC --/AT GTGGTTATGG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 AT 0 1 261011 CASAVA_Build 19 38767635 4I TAATAAGCTC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 TTAT 4 5 261012 CASAVA_Build 19 38771892 2D ATATATATAT AC/-- ACATATATAT 3070 hom 48 het 26 0 16 10 AC 2 1 261013 CASAVA_Build 19 38781640 1D ATCTCAGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 11 10 261014 CASAVA_Build 19 38786489 4D GAGGTAAATG TGTC/---- TGTCGGTGGA 3070 het 3070 ref 51 34 13 6 TGTC 2 1 261015 CASAVA_Build 19 38786760 3D AATGCTTTTT TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 TTG 3 2 261016 CASAVA_Build 19 38787879 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAATAGCT 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 A 6 5 261017 CASAVA_Build 19 38794748 2D ATGTTAGCTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 TA 7 6 261018 CASAVA_Build 19 38794835 2I ATATATGTGC --/AT ATATATATAT 2295 het 2295 ref 20 10 7 3 AT 6 7 261019 CASAVA_Build 19 38812802 1I GAGGCTGCCT -/C TTTTGGGGGC 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 C 0 1 261020 CASAVA_Build 19 38816330 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGGGGTCT 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 G 7 8 261021 CASAVA_Build 19 38823365 2D AATTAGACTC TT/-- AACTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 19 5 T 2 0 261022 CASAVA_Build 19 38828874 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 26 0 23 4 A 9 8 261023 CASAVA_Build 19 38831580 1D ATGAATGGAT A/- AAATATAATA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 4 3 261024 CASAVA_Build 19 38874341 1I27M1I CATTAGTTAC -ATTTTCTTCTGATCTTTCAAGTGAAAC-/AATTTTCTTCTGATCTTTCAAGTGAAACA ATCCCATCCT 3070 hom 178 het 47 0 60 5 N/A 0 0 261025 CASAVA_Build 19 38902492 1D TGTGAGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 37 1 27 9 A 15 14 261026 CASAVA_Build 19 38904961 1D TAGACAGTCT G/- GATGAGCTGA 3070 hom 112 het 41 0 32 9 G 2 1 261027 CASAVA_Build 19 38928540 18I GCAGGCAGCC ------------------/CCAGGGGAGAAGGTGCAA CCTTGGGTGA 2493 het 2493 ref 30 15 6 9 CCAGGGGAGAAGGTGCAA 0 1 261028 CASAVA_Build 19 38935157 3I GATCCGCCAC ---/ATA ATAAGATTCC 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 ATA 1 2 261029 CASAVA_Build 19 38945488 2D TGCAAGATGC AT/-- ATGTTTGGCA 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 AT 2 1 261030 CASAVA_Build 19 38981030 1I AGCGACTTCA -/C GAAGAAGCGA 2048 het 984 hom 14 5 7 2 C 0 1 261031 CASAVA_Build 19 38987254 1I AGAGTTCCCA -/G GGAGGCTGAG 3070 hom 117 het 47 0 39 8 G 2 3 261032 CASAVA_Build 19 38993555 1I GGAGAAGAAC -/T TTTTTTTGCT 2067 het 2067 ref 26 15 7 4 T 7 8 261033 CASAVA_Build 19 38996101 1I AGATGGCTTA -/T TTTTCTACAG 3070 hom 63 het 26 0 20 6 T 4 5 261034 CASAVA_Build 19 39004965 1D AGCCTCAACT G/- GCTCCAGAGC 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 G 2 1 261035 CASAVA_Build 19 39014272 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1940 hom 22 7 9 6 A 11 12 261036 CASAVA_Build 19 39015537 4D AGCCTGACCC ACCT/---- GCAATCACAG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 ACCT 1 0 261037 CASAVA_Build 19 39018913 1I GCTAAAGAAG -/A AAAATCATAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 4 5 261038 CASAVA_Build 19 39025157 2D CAGGCCTAAC AT/-- GTGGATTTTC 3070 hom 123 het 45 0 42 5 AT 1 0 261039 CASAVA_Build 19 39026013 1D TGAATTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 12 11 261040 CASAVA_Build 19 39026669 1I6M1I TGCAGAGCCA -GGGCCA-/GGGGCCAG GGGCTGGGGG 3070 hom 68 het 23 0 22 3 N/A 0 0 261041 CASAVA_Build 19 39029342 1I TGGAATAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 A 9 10 261042 CASAVA_Build 19 39031359 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 8 16 2 A 10 9 261043 CASAVA_Build 19 39034189 22I ACAATTCAAA ----------------------/AACATCTTCTCCACGTACCATT ATAGTCAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 AACATCTTCTCCACGTACCATT 0 1 261044 CASAVA_Build 19 39036496 1I CAAACTAATC -/A AAAAAAATTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 7 8 261045 CASAVA_Build 19 39038797 1I AAAGACAGAT -/A ATTCTGAGCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 1 2 261046 CASAVA_Build 19 39039737 4I AAAAAACAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAC 2 3 261047 CASAVA_Build 19 39041607 38D ATGAACACGG TGAGATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 57 het 16 0 18 3 TGAGATATATATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 261048 CASAVA_Build 19 39042179 1D TCCTTATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 29 2 19 8 A 15 14 261049 CASAVA_Build 19 39052626 1D TGGGATGGGG A/- ATGTATACAG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 2 1 261050 CASAVA_Build 19 39056880 14D TCTCAAAAAA AAAAAAAGAAAAAG/-------------- AAAAAAGAAA 2455 het 2455 ref 21 14 11 6 AAAAAAAGAAAAAG 1 0 261051 CASAVA_Build 19 39059883 4D ATTTGTATTT TTAG/---- TAGAGATGAG 3070 het 3070 ref 29 18 11 0 TTAG 1 0 261052 CASAVA_Build 19 39064069 1D TCCTTTCCCC T/- AATCCAATTT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 1 0 261053 CASAVA_Build 19 39067483 1I ACTTTGGAAT -/A TTTTTTTTCA 3070 het 2679 hom 37 10 17 10 A 0 1 261054 CASAVA_Build 19 39068457 2D GTTTGTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 28 0 12 16 A 13 11 261055 CASAVA_Build 19 39086337 11D GGCGACACCT CCTCCCCCGGC/----------- CCTCAGCTTC 3017 het 3017 ref 19 12 8 1 CCTCCCCCGGC 1 0 261056 CASAVA_Build 19 39094833 1D TTTTTTTAAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 2926 hom 32 8 18 6 A 8 7 261057 CASAVA_Build 19 39111479 8I ATTTTGCAAG --------/TGTGCAGT TGTGCAGTTG 3070 het 3070 hom 75 30 31 14 TGTGCAGT 1 2 261058 CASAVA_Build 19 39116090 1D AGATAGAGTC T/- TGCTCCTTTG 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 2 1 261059 CASAVA_Build 19 39144017 1I CCCCCCCTCC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 236 hom 33 1 25 7 T 7 8 261060 CASAVA_Build 19 39151874 1D CTGAATAATA T/- TCCATTGTGT 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 2 1 261061 CASAVA_Build 19 39153379 3I TATTATTTCT ---/ATC ATCATATTAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 ATC 1 2 261062 CASAVA_Build 19 39158784 1I AATTAGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1049 hom 43 4 28 11 T 10 11 261063 CASAVA_Build 19 39171744 1I TGGTAATAGG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 49 20 19 10 A 7 8 261064 CASAVA_Build 19 39183361 1I AGGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 11 12 261065 CASAVA_Build 19 39193832 1I TTTCAATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 10 11 261066 CASAVA_Build 19 39198823 1I ACGCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1001 hom 23 6 12 5 A 13 14 261067 CASAVA_Build 19 39199446 1D TGCCCAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 21 2 12 7 T 15 14 261068 CASAVA_Build 19 39212323 2D GACATGGTGG AC/-- ACACAGATCA 3070 het 3070 ref 44 29 14 1 AC 3 2 261069 CASAVA_Build 19 39213628 16I AGATGTGGAT ----------------/AGGGATGCTACCACTC AGGCAGCCGA 2565 het 1944 hom 30 6 13 12 AGGGATGCTACCACTC 0 1 261070 CASAVA_Build 19 39226970 1I TAGTACAAGG -/C CCCCCGCCAT 3070 hom 111 het 47 0 32 15 C 5 6 261071 CASAVA_Build 19 39228391 1D TTAAATAAGA T/- TCCATCTTGC 3070 hom 156 het 57 0 51 6 T 2 1 261072 CASAVA_Build 19 39232167 5I24M4I GCAACAAAGC -----AAGAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAA----/AAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAAAAG AAAGAAAGAA 3070 het 2684 hom 13 7 8 3 N/A 0 0 261073 CASAVA_Build 19 39239607 1I TTGGAGGTAT -/C AGTGTGACTC 3070 hom 147 het 54 0 49 5 C 0 1 261074 CASAVA_Build 19 39255309 2D ATTTTATGTT TA/-- TATATATATA 2177 het 1435 hom 12 4 6 2 TA 7 6 261075 CASAVA_Build 19 39256430 4D ATACACTAAT ATAA/---- ATAAATAAAC 3070 het 3070 hom 32 13 17 4 ATAA 3 2 261076 CASAVA_Build 19 39259430 4I CTTTATTTAG ----/AAAT AAGTTCTGTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAAT 0 1 261077 CASAVA_Build 19 39277467 1D ACTTGCTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 T 10 9 261078 CASAVA_Build 19 39277980 1D TGTTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 283 hom 39 4 11 24 T 13 12 261079 CASAVA_Build 19 39280824 3I AATAGCTGTT ---/CTA CTGTGTTGCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CTA 0 1 261080 CASAVA_Build 19 39299916 2D AGAAAAAGAA AG/-- AGAGATACAC 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 AG 3 2 261081 CASAVA_Build 19 39301020 3D GAGGAGAAGG AGA/--- AGGAGAAGAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 AGA 1 0 261082 CASAVA_Build 19 39303530 1I CTGGCCATTC -/A AAAAGGTTAA 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 A 4 5 261083 CASAVA_Build 19 39310535 5D ATTTTTCTTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1628 hom 18 5 10 3 A 15 10 261084 CASAVA_Build 19 39314639 6D TATATTTTAG CTCCCT/------ CTCCCTCTCC 2079 het 2079 ref 21 11 9 2 CTCCCT 3 2 261085 CASAVA_Build 19 39321944 1D TCTCTTGAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 22 0 15 7 T 10 9 261086 CASAVA_Build 19 39328728 3I CTAAAGTGAC ---/AGG AGATTTTTTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AGG 0 1 261087 CASAVA_Build 19 39374759 1D AAATTTCTCT G/- GGGGGCAGGA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 G 6 5 261088 CASAVA_Build 19 39385238 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1599 het 1599 ref 29 14 4 12 A 17 16 261089 CASAVA_Build 19 39397562 1D CTGGCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 992 hom 33 3 12 18 T 17 16 261090 CASAVA_Build 19 39424580 4D AAAAACAAAC AAAA/---- GAAAGAGTCT 3070 het 3070 ref 34 14 15 6 A 4 0 261091 CASAVA_Build 19 39437927 1D TTGGGCCCGA G/- GGGAGGGTCC 1543 hom 18 het 12 0 4 9 G 4 3 261092 CASAVA_Build 19 39439906 2D TTAAGCATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 14 12 261093 CASAVA_Build 19 39440253 4I TGGCTAATCA ----/CTCT CTCTTTTTTC 3070 hom 93 het 39 0 31 8 CT 2 4 261094 CASAVA_Build 19 39441535 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 11 12 261095 CASAVA_Build 19 39449557 3D TTATATAATC CTT/--- CTCCATAGTG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CTT 1 0 261096 CASAVA_Build 19 39465004 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGCCTTGGC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 CTC 1 0 261097 CASAVA_Build 19 39468966 3D TGCCTTTCTG TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 45 het 23 0 15 8 TAT 4 3 261098 CASAVA_Build 19 39476149 1I TCTTGGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 39 2 27 10 T 13 14 261099 CASAVA_Build 19 39477375 1I TCTATTGTTG -/T TTTTTTCCCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 7 261100 CASAVA_Build 19 39491823 1I CTCCCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 109 het 43 0 36 7 A 11 12 261101 CASAVA_Build 19 39501760 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 10 11 261102 CASAVA_Build 19 39513168 2D GTGCAGACAC AT/-- GTGTGAAAAT 3070 het 3070 ref 47 22 16 10 AT 1 0 261103 CASAVA_Build 19 39516028 1I CTCAAGTGAT -/C CACTTGCCTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 1 2 261104 CASAVA_Build 19 39517792 1I CGTCTCCAAG -/A AAAAAAAAAA 1660 het 1660 ref 26 12 5 9 A 13 14 261105 CASAVA_Build 19 39519215 1D TGTTCCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 29 2 13 14 T 17 16 261106 CASAVA_Build 19 39586837 1D ATCGCTTGAA C/- CCCAGGAGTT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 C 4 3 261107 CASAVA_Build 19 39603536 1D GGCTTTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 36 3 23 11 A 18 17 261108 CASAVA_Build 19 39614706 7I TTGCAAAGTT -------/GTATAAA GTATAAGGGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 GTATAAA 0 1 261109 CASAVA_Build 19 39615306 1I CCGGATTGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 106 het 46 0 41 5 T 8 9 261110 CASAVA_Build 19 39618847 2I CCTGGGCAAC --/AA GAGCGAAACT 3070 hom 33 het 15 0 11 4 A 0 2 261111 CASAVA_Build 19 39619475 2D AACTATAGAA AG/-- AGAATTATAA 3070 hom 57 het 23 0 20 5 AG 2 1 261112 CASAVA_Build 19 39629354 12D TTTTTTTTTC TTTCTTTTTTTT/------------ TTTTTTTGAG 3070 hom 84 het 30 0 28 6 TTTCTTTTTTTT 1 0 261113 CASAVA_Build 19 39632081 1I CCAAAGTGCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 78 het 27 0 26 1 G 2 3 261114 CASAVA_Build 19 39632187 2D GCTTATTCTC TA/-- TAAAGATTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TA 2 1 261115 CASAVA_Build 19 39654794 1D TTTTTAAAAC T/- TCTTTTGTGG 3070 hom 42 het 21 0 14 7 T 2 1 261116 CASAVA_Build 19 39668868 2I GGGCCACACC --/CT GTTTTCCCTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 CT 0 1 261117 CASAVA_Build 19 39704606 17D TCTCTTTCTC CTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 98 het 29 0 31 5 CTTTTTTTTTTTTTTTT 1 0 261118 CASAVA_Build 19 39709641 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAATAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 8 7 261119 CASAVA_Build 19 39711300 1D CCAGCACTTT G/- GGAGGCCAAG 3070 hom 54 het 21 0 18 4 G 3 2 261120 CASAVA_Build 19 39771592 15I TTCACTCTTG ---------------/ACTTGGAGAAGGAGA ACTTGGAGAA 3070 hom 96 het 40 0 33 9 ACTTGGAGAAGGAGA 1 2 261121 CASAVA_Build 19 39773496 2I TTAAAGTAAA --/CT CTCACAGGAC 3070 hom 129 het 52 0 44 8 CT 1 2 261122 CASAVA_Build 19 39780121 1D TTTTAGCCCT G/- GGGACATTGG 3070 hom 63 het 26 0 19 8 G 4 3 261123 CASAVA_Build 19 39780197 1D CCCTAGAGGG T/- TTGATATCAG 3070 hom 98 het 34 0 32 2 T 3 2 261124 CASAVA_Build 19 39787682 1D GACAGTTGTG A/- AAAACCAGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 5 4 261125 CASAVA_Build 19 39789562 1D GATGCATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 40 0 30 11 A 12 11 261126 CASAVA_Build 19 39791406 14D GTCTCATTGC ATATATATATATAT/-------------- ATATATATAT 3070 hom 68 het 31 0 22 15 AT 12 5 261127 CASAVA_Build 19 39793953 3D TGTGCCTTTT TTC/--- TTGTTTCATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTC 1 0 261128 CASAVA_Build 19 39794175 1I AATCTTTCTG -/T TTTTTTTGAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 7 8 261129 CASAVA_Build 19 39795848 3D TTTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 20 10 T 14 11 261130 CASAVA_Build 19 39796861 1D CAGCTGAATC T/- TTTTTGGGGC 3070 hom 110 het 41 0 37 4 T 6 5 261131 CASAVA_Build 19 39798185 1D AGGTCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 857 hom 41 4 24 13 T 15 14 261132 CASAVA_Build 19 39802162 1D GGCTTTTGAA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 7 261133 CASAVA_Build 19 39803263 1I TCACACACCA -/G GGGTGGGGGG 1889 hom 15 het 7 0 6 1 G 3 4 261134 CASAVA_Build 19 39804300 1D GTCAACTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 11 10 261135 CASAVA_Build 19 39805664 1D TTCATCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 686 hom 37 5 24 8 T 15 14 261136 CASAVA_Build 19 39814329 1I ATATACACTG -/A AAACTATAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 3 4 261137 CASAVA_Build 19 39816536 1I ATAGAGCTTT -/A AAAAAATGGC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 6 7 261138 CASAVA_Build 19 39817300 1I ACTACACAAA -/G GCTACTTTCA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 261139 CASAVA_Build 19 39820876 1D TCTGGAAAGG T/- CAAAAGGACA 3070 het 3070 hom 50 17 25 8 T 1 0 261140 CASAVA_Build 19 39824741 1I GCTAAGAGCC -/T TTGTCCCCAC 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 2 3 261141 CASAVA_Build 19 39830330 1D GTCCCCAGAA T/- TGCCTTCACT 3070 hom 105 het 42 0 32 10 T 2 1 261142 CASAVA_Build 19 39836726 2I ACGAGGCAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 9 11 261143 CASAVA_Build 19 39838055 1D AAACATTTAC A/- AATCTATTCG 3070 hom 90 het 35 0 31 7 A 3 2 261144 CASAVA_Build 19 39844575 1D TTTTCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1937 hom 20 4 10 6 T 11 10 261145 CASAVA_Build 19 39848355 4I GTGGGATGGA ----/TGTG TGTGTGTGAC 666 het 124 hom 41 1 8 32 TG 4 6 261146 CASAVA_Build 19 39854189 1D CATCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 T 10 9 261147 CASAVA_Build 19 39865732 1D AATGGCTGAA T/- TTCTGTACCA 1257 het 1257 ref 47 42 3 2 T 3 2 261148 CASAVA_Build 19 39869157 4D TCTCTGTGAC TGTT/---- TGCGACAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 16 8 TGTT 1 0 261149 CASAVA_Build 19 39872040 3D TAAATGTAGC TAT/--- TATTGTTATT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 TAT 2 1 261150 CASAVA_Build 19 39872184 1D AGCAAGGCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1368 hom 24 6 11 7 A 15 14 261151 CASAVA_Build 19 39875058 2D TTCCGGAGAC AG/-- GGTCTCAGTC 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 AG 1 0 261152 CASAVA_Build 19 39879902 1D GCTTATAAAT A/- AAAACTCCCA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 A 5 4 261153 CASAVA_Build 19 39881667 1D AATGGAACTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 296 hom 30 1 27 2 A 10 9 261154 CASAVA_Build 19 39891766 1D AACAGGGAAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 8 7 261155 CASAVA_Build 19 39895074 1D ATTCGCGTCC T/- GAATTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 26 1 T 1 0 261156 CASAVA_Build 19 39896906 3I CCATTGACTC ---/TTT TTTTTCTTTT 3070 hom 41 het 17 0 14 4 T 5 8 261157 CASAVA_Build 19 39907782 1I AGAAGCTAAC -/T TGTTACAGTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 2 261158 CASAVA_Build 19 39908724 1D TTCACCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 39 2 25 12 A 13 12 261159 CASAVA_Build 19 39923313 1I TCAAATAGTT -/A AAAAAAAAAC 2635 het 2635 ref 24 14 8 2 A 9 10 261160 CASAVA_Build 19 39929337 2I GTGACCTGAG --/TC TCTCTCTCAG 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 TC 4 5 261161 CASAVA_Build 19 39961204 1I GCTTGAGATC -/A ATGAAACTGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 1 2 261162 CASAVA_Build 19 39975607 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 270 hom 22 1 17 4 A 13 12 261163 CASAVA_Build 19 40022738 1D TTTTTGCTTC A/- AACTCAGATC 3070 het 3070 hom 40 15 19 7 A 3 2 261164 CASAVA_Build 19 40034433 1D CTGGCCAGGT G/- TGTCCCAGGT 3070 het 3070 ref 52 28 16 8 G 1 0 261165 CASAVA_Build 19 40034613 1D CAATAGTAAC A/- GGTATGCTTT 3070 het 3070 hom 54 20 24 10 A 1 0 261166 CASAVA_Build 19 40039118 1I CCTATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2625 het 2625 ref 34 15 12 7 A 13 14 261167 CASAVA_Build 19 40039545 5D CATACATTGG GGAAA/----- GGACAATGTC 3070 het 3070 ref 43 26 17 2 GGAAA 1 0 261168 CASAVA_Build 19 40057590 7I CTGGAAGGCC -------/ACTCCAG TGGTTGAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 ACTCCAG 0 1 261169 CASAVA_Build 19 40060525 1I TTTTTTTACG -/A AGTTAATACT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 1 2 261170 CASAVA_Build 19 40060606 1I TCCTAGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 11 24 4 T 10 11 261171 CASAVA_Build 19 40125822 1D TCTGCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 18 10 T 13 12 261172 CASAVA_Build 19 40132733 1D GATGAAAGAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 9 8 261173 CASAVA_Build 19 40132992 7D GAAGGCAGAA GGCAGTG/------- GGCTGACATG 3070 het 3070 ref 54 24 28 3 GGCAGTG 1 0 261174 CASAVA_Build 19 40134936 2I AAAAAAAAAC --/AA AAAACAAAAA 1885 het 1574 hom 14 6 5 3 A 4 6 261175 CASAVA_Build 19 40136792 12I GATTTAATGG ------------/AATCCCTACTAA AATCCCAATA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 AATCCCTACTAA 0 1 261176 CASAVA_Build 19 40149344 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 7 8 261177 CASAVA_Build 19 40171386 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1013 het 1013 ref 25 11 5 9 T 12 13 261178 CASAVA_Build 19 40188056 1I GGGATCGGGA -/G GGCGGGGTAG 2218 hom 21 het 8 0 8 0 G 2 3 261179 CASAVA_Build 19 40191112 3D GTCTTTGAGA GCT/--- CGCTATGTGC 2811 het 2811 ref 21 14 6 1 GCT 1 0 261180 CASAVA_Build 19 40195108 1I TTTTGAAGAT -/A ACAGTGAGTT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 A 1 2 261181 CASAVA_Build 19 40197624 4I AGAAAAAAAA ----/AAAG GAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 AAAG 0 1 261182 CASAVA_Build 19 40199064 1I AGGCGGGGCT -/G GGTGCGGTGG 2910 het 2910 ref 34 13 11 10 G 2 3 261183 CASAVA_Build 19 40200438 1I TCTGCCCCGA -/C CCCCTTCCTT 3070 het 1995 hom 30 9 13 8 C 4 5 261184 CASAVA_Build 19 40225391 1I TGCATCCCCA -/C CCCCTGTTAG 3070 hom 53 het 20 0 17 3 C 4 5 261185 CASAVA_Build 19 40230381 4I AACCTAGAAA ----/CCTG GGTGCCAGGC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 CCTG 0 1 261186 CASAVA_Build 19 40233171 1D TGTCCCTGGT A/- ATTAGCTCCA 3070 hom 60 het 21 0 19 4 A 2 1 261187 CASAVA_Build 19 40238148 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 37 0 29 8 A 10 11 261188 CASAVA_Build 19 40239637 4D GCATTATTGT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 43 16 18 9 TTTC 4 3 261189 CASAVA_Build 19 40241242 3D TCTGTTTGAT ATA/--- ATAATAATAA 1957 het 1281 hom 11 3 4 4 ATA 5 4 261190 CASAVA_Build 19 40244804 1D CTTGTCTGTT A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 63 het 38 0 28 13 A 7 6 261191 CASAVA_Build 19 40245163 1I AAAATGTGTT -/A AAAAATGAAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 5 6 261192 CASAVA_Build 19 40245641 9D CATAATAATA ATAACGGTG/--------- ATAATGATGA 3070 hom 135 het 47 0 45 4 ATAACGGTG 1 0 261193 CASAVA_Build 19 40246894 7D GTGATGTCAT CAGCAGG/------- CAGCAGGCAG 3070 hom 66 het 27 0 22 10 CAGCAGG 3 2 261194 CASAVA_Build 19 40247063 2D GATAGGAGTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 323 hom 30 3 12 15 TC 10 9 261195 CASAVA_Build 19 40247563 4D TTGTGGCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2579 hom 38 7 19 12 TTTG 4 3 261196 CASAVA_Build 19 40248556 1D CATCCCGGGG T/- GGGCCTCCTG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 1 0 261197 CASAVA_Build 19 40251532 1D TGGGAAGTCT G/- GGGGGGATGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 7 6 261198 CASAVA_Build 19 40265953 1I ATGAAATTGA -/T TTTTTTTTTT 2159 het 2159 ref 33 17 7 9 T 10 11 261199 CASAVA_Build 19 40270842 1I ATCAAAAAAA -/T ATCAACATTT 3070 hom 126 het 46 0 41 5 T 0 1 261200 CASAVA_Build 19 40272775 1I AAAATTAGCC -/G GGCGTGGTGC 3070 hom 41 het 16 0 14 2 G 2 3 261201 CASAVA_Build 19 40273362 1I GGGGTGGAGT -/G GGGGGGGAGG 2593 het 2593 ref 23 9 6 8 G 7 8 261202 CASAVA_Build 19 40285386 1D ATCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 22 1 14 7 A 13 12 261203 CASAVA_Build 19 40286790 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 8 7 261204 CASAVA_Build 19 40300598 1I CCTGGGGTGC -/G CAGGCAGAGG 3070 hom 62 het 22 0 19 3 G 0 1 261205 CASAVA_Build 19 40330064 1I TCAGGCATCA -/C CCTGGCACCC 3070 hom 141 het 51 0 46 5 C 2 3 261206 CASAVA_Build 19 40390704 13I GTATTAGTCC -------------/CAGGGCGATAAAG CAGAATCACA 3070 hom 117 het 43 0 39 5 CAGGGCGATAAAG 0 1 261207 CASAVA_Build 19 40394394 1D CCTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 24 1 13 10 A 15 14 261208 CASAVA_Build 19 40403688 1I TCCACCCCCT -/G AACCTTTCCT 3070 hom 108 het 41 0 34 7 G 0 1 261209 CASAVA_Build 19 40403995 1D GCCAAGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 11 10 261210 CASAVA_Build 19 40413709 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 10 9 261211 CASAVA_Build 19 40419043 1D GAGACTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2711 het 2657 hom 38 13 13 12 T 15 14 261212 CASAVA_Build 19 40436727 1D GTGTAAACAT C/- CATTGTGTGT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 C 2 1 261213 CASAVA_Build 19 40441199 1I CGATTCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 14 15 261214 CASAVA_Build 19 40447683 2D TGGTGCACAC AG/-- AGTGACCCCA 3070 het 3070 hom 55 21 31 4 AG 2 1 261215 CASAVA_Build 19 40448563 1I GTGACCAGGT -/G GGGCAGGACC 3070 hom 74 het 28 0 21 7 G 3 4 261216 CASAVA_Build 19 40476861 1D CACAATGGGA G/- GGCCACATGG 3070 hom 63 het 25 0 20 5 G 3 2 261217 CASAVA_Build 19 40484648 1D CCCCGGCATT C/- CCCACGGCTG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 C 4 3 261218 CASAVA_Build 19 40493776 1D CATCTGGGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 13 8 A 10 9 261219 CASAVA_Build 19 40507503 1I CTCGGTCTCG -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 7 8 261220 CASAVA_Build 19 40510791 8I ACAAGATATC --------/TTTTTTGT TTTTTTGTTT 3070 hom 42 het 26 0 15 11 TTTTTTGT 1 2 261221 CASAVA_Build 19 40517980 1D GATTTCGGGT G/- AGCAAAAGTG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 G 1 0 261222 CASAVA_Build 19 40526937 4D AGACTCTGTC TCAA/---- TCAATCAATC 3070 het 2553 hom 23 8 12 5 TCAA 3 2 261223 CASAVA_Build 19 40530700 1I CTGTTCACTG -/A ATTCAGACTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 1 2 261224 CASAVA_Build 19 40535824 1I GGGTGCCGAA -/C CCCCACGCAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 4 5 261225 CASAVA_Build 19 40536520 1I CTTCTTGGAA -/G CAGCTCTGGC 3070 hom 97 het 39 0 31 8 G 0 1 261226 CASAVA_Build 19 40544883 13D CCTGGTGACC GGAGCTGCCAGGA/------------- GGCCACACAG 3070 hom 101 het 36 0 28 9 GGAGCTGCCAGGA 1 0 261227 CASAVA_Build 19 40551032 17I AATAAAAATA -----------------/GAAATCAATACCAAAAG GAATTCTCAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 GAAATCAATACCAAAAG 0 1 261228 CASAVA_Build 19 40551471 2D TTAACAAAGG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 A 11 9 261229 CASAVA_Build 19 40552784 1D AAATTATCAA T/- GTCATTTTTC 3070 het 3070 ref 51 22 22 8 T 1 0 261230 CASAVA_Build 19 40553492 2I CGGAGTCCAG --/TC TCTGTCACTG 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 TC 1 2 261231 CASAVA_Build 19 40555459 1I GCAGTGCCCA -/G GGTCTGAGGG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 2 3 261232 CASAVA_Build 19 40562091 1D AGACTATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 8 A 13 12 261233 CASAVA_Build 19 40578994 4I ATTCTGTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 AAAC 2 3 261234 CASAVA_Build 19 40583348 4I GAAAGAGAGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 1358 het 1358 ref 18 9 6 3 AAGG 3 4 261235 CASAVA_Build 19 40590909 3D TGCAGTGGTG TGA/--- TGATCTTGGC 2646 het 2646 ref 20 12 8 0 TGA 2 1 261236 CASAVA_Build 19 40591810 1D CCCTCCTGGG C/- CTCCCCAAGT 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 C 2 1 261237 CASAVA_Build 19 40627334 1I GCGCCACTAT -/G CCCGGCTAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 0 1 261238 CASAVA_Build 19 40676579 1D TGCTGTAAGC G/- GCCAACTTTA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 2 1 261239 CASAVA_Build 19 40680686 2I TTTCCCTCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 TC 7 8 261240 CASAVA_Build 19 40691805 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 2472 het 1172 hom 19 4 8 7 A 9 10 261241 CASAVA_Build 19 40692012 1D TGGGAAGAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 T 9 8 261242 CASAVA_Build 19 40699585 3D TCCGTCTCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 AAC 5 4 261243 CASAVA_Build 19 40699752 3I CTCTCTAATT ---/CAC CACATCATTC 3070 hom 97 het 40 0 32 8 CAC 1 2 261244 CASAVA_Build 19 40707127 3I ATCGAGGAAT ---/GAG GACAAGGAGA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 GAG 0 1 261245 CASAVA_Build 19 40737476 4I GTGCATGGCT ----/GTAG GTATGTCCAT 3070 het 3070 hom 46 17 19 10 GTAG 0 1 261246 CASAVA_Build 19 40738729 6I CTTGAGGAGC ------/TGACAT TCTAGTGAGG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 TGACAT 0 1 261247 CASAVA_Build 19 40764914 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1586 hom 33 10 17 7 TCTT 1 0 261248 CASAVA_Build 19 40765365 2D TCAGAGCCTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 AT 7 6 261249 CASAVA_Build 19 40791659 1I GATCTAAGAA -/G AGCAGGAAGG 3070 het 3070 ref 38 15 17 6 G 0 1 261250 CASAVA_Build 19 40807186 6I TCTTAGGTGC ------/TTTTCT TTTTCTTTTT 2998 het 2998 ref 29 11 9 9 TTTTCT 2 3 261251 CASAVA_Build 19 40811186 1D GGGCTACGGG A/- AAAAAAAAAG 1567 het 1567 ref 46 32 5 10 A 10 9 261252 CASAVA_Build 19 40820848 1I AAGGTCCAGT -/G GCAGAAAATA 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 G 1 2 261253 CASAVA_Build 19 40827120 1I AGCCAAATCC -/T GCCCCGTCTC 1843 het 1696 hom 18 8 7 3 T 0 1 261254 CASAVA_Build 19 40832748 1D CAAAATTGTA T/- TTTTTTTTTT 2808 het 2808 ref 30 11 7 12 T 15 14 261255 CASAVA_Build 19 40837250 1D ACCCTACCTC A/- AAAAAAAAAA 1429 het 1429 ref 28 14 5 10 A 15 14 261256 CASAVA_Build 19 40843628 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1004 het 1004 ref 19 7 5 7 A 13 14 261257 CASAVA_Build 19 40861566 2I CTCCAAAAAC --/AA AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 8 10 261258 CASAVA_Build 19 40863708 2I TATACAGTAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2754 hom 32 11 14 7 T 13 15 261259 CASAVA_Build 19 40863892 1I ACTGGAGACA -/G GGCTTCGCCA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 G 2 3 261260 CASAVA_Build 19 40889177 1D ATCACCCAGG T/- TTTTGGCAGG 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 5 4 261261 CASAVA_Build 19 40906473 1I TGTTCCCGCA -/G GCCGGACGAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 2 261262 CASAVA_Build 19 40911242 1I GGGGCCCGGA -/G GGGGTACCTG 3070 hom 52 het 20 0 16 4 G 4 5 261263 CASAVA_Build 19 40918853 3D TTAGCCGGGC GTG/--- GTGGTGGGCG 1943 het 1943 ref 10 5 5 0 GTG 3 2 261264 CASAVA_Build 19 40923536 1D CCCACCCTTT C/- CACGCGGCCC 1221 het 1221 ref 19 5 5 9 C 2 1 261265 CASAVA_Build 19 40924980 2I ATACTGGCTG --/GA GAGACCACCT 3070 het 3070 ref 38 22 8 8 GA 2 3 261266 CASAVA_Build 19 40932558 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAG AAAGAAAGGA 2094 het 1315 hom 16 6 6 4 AAAAG 0 1 261267 CASAVA_Build 19 40933451 1I TGCCTGTAAT -/C CCAGCACTTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 2 3 261268 CASAVA_Build 19 40949773 2D ACCCTCCACC CT/-- CTCTCTCTCT 2971 het 2971 ref 30 17 7 6 CT 6 5 261269 CASAVA_Build 19 40953183 1D TGGAAAACTT A/- ACGGTTTTTA 3070 hom 83 het 31 0 27 5 A 2 1 261270 CASAVA_Build 19 40962482 1I CTGGCTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2413 hom 18 7 7 4 A 9 10 261271 CASAVA_Build 19 40971703 1D TCTGCAGAGA G/- GGGAACCATG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 4 3 261272 CASAVA_Build 19 40975580 1D TTTAGGGAAT G/- GAGGATCACT 3070 hom 99 het 36 0 33 4 G 2 1 261273 CASAVA_Build 19 40979710 1D GGATCCGCTA G/- GGGGGTCTCA 3051 het 3050 ref 23 9 10 6 G 6 5 261274 CASAVA_Build 19 40986690 1D TTCCCTATCG C/- CCCCCAGACC 3070 hom 149 het 56 0 46 10 C 6 5 261275 CASAVA_Build 19 40999861 2I CCGGCTAATT --/TG TGTGTGTGTG 2882 het 2196 hom 35 13 11 11 TG 8 9 261276 CASAVA_Build 19 41005021 1D GCTCACGCCT G/- GTAATCCCAG 3070 hom 53 het 22 0 16 6 G 2 1 261277 CASAVA_Build 19 41073612 4I TCTCAAAATT ----/AATA AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 AATA 4 5 261278 CASAVA_Build 19 41080006 1I AGGGTATTTT -/C TTTTTTTCGG 2479 het 2479 ref 20 8 7 5 C 0 1 261279 CASAVA_Build 19 41087705 5D CAGCCACTGT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1624 hom 26 8 12 9 A 16 11 261280 CASAVA_Build 19 41137738 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGCGCCT 3070 hom 63 het 23 0 20 3 C 1 2 261281 CASAVA_Build 19 41138342 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3061 het 2705 hom 14 7 7 0 A 10 11 261282 CASAVA_Build 19 41174528 1I CAGGCGTGAG -/C CAATACGCTC 3070 hom 87 het 35 0 27 8 C 1 2 261283 CASAVA_Build 19 41232424 1I CTCCTTATTA -/T TACATACAAA 3070 hom 72 het 30 0 23 7 T 1 2 261284 CASAVA_Build 19 41318955 1I ACAAATAATT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 6 7 261285 CASAVA_Build 19 41323427 2D GCGCCCAGAC AT/-- GTCGGGAACG 2151 het 881 hom 15 3 8 5 AT 1 0 261286 CASAVA_Build 19 41385149 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 151 hom 44 1 39 4 A 9 8 261287 CASAVA_Build 19 41393744 1D TAATTTGAGC A/- AAAAAAAAAA 1016 het 1016 ref 28 14 3 11 A 12 11 261288 CASAVA_Build 19 41395820 1I TGTCACTCAG -/A AAGGCTGAGG 3070 hom 156 het 57 0 50 7 A 2 3 261289 CASAVA_Build 19 41395922 4D GCTGCACATA CAGT/---- CAGTGTCACA 3070 hom 144 het 50 0 48 2 CAGT 2 1 261290 CASAVA_Build 19 41396672 2D CCACTGTGAT AC/-- AGTTACTCCC 3070 hom 114 het 47 0 39 9 AC 1 0 261291 CASAVA_Build 19 41399944 2I AGCTGGGATT --/AG AGTTGCCTGC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AG 1 2 261292 CASAVA_Build 19 41405640 1I TAATAGTTTC -/T TTTTTTTACA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 7 8 261293 CASAVA_Build 19 41406429 7I TTATGGTTAT -------/AGTCTGA CAGACTTTTC 3070 hom 30 het 12 0 10 3 AGTCTGA 0 1 261294 CASAVA_Build 19 41411014 1I AGAACAACTT -/C CTTCACATTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 1 2 261295 CASAVA_Build 19 41417063 15D ATCTCTCTTT CTTTTCCCCACACAG/--------------- CCTGGGCGAC 3070 hom 60 het 19 0 21 0 CTTTTCCCCACACAG 1 0 261296 CASAVA_Build 19 41426882 1I TCTGTGTGTC -/T TGAGTGGCTG 3070 hom 39 het 15 0 12 3 T 1 2 261297 CASAVA_Build 19 41430785 1D GCTCAGTCTG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 9 8 261298 CASAVA_Build 19 41432793 1D TTATATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 11 10 261299 CASAVA_Build 19 41492864 1I CGCGTCTACT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 8 9 261300 CASAVA_Build 19 41499161 2D CTCCTCAAAC AT/-- AAAAGCCTTC 3070 het 3070 ref 56 38 15 5 AT 1 0 261301 CASAVA_Build 19 41499462 2I GGAGGGGGAA --/AG AGAGAAAGGG 690 het 690 ref 39 28 5 6 AG 2 3 261302 CASAVA_Build 19 41530365 4I AAAACAAAGA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 AAAG 2 3 261303 CASAVA_Build 19 41592751 2D ACACATAGGC AG/-- AGAGAGAGAG 1100 het 1100 ref 38 26 4 9 AG 7 6 261304 CASAVA_Build 19 41602181 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 892 het 699 hom 22 5 4 14 T 18 17 261305 CASAVA_Build 19 41615853 1D CCTGAGTACT G/- GGATTACAGG 3070 het 1528 hom 17 4 12 1 G 3 2 261306 CASAVA_Build 19 41616431 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 13 2 9 2 A 11 10 261307 CASAVA_Build 19 41625640 1D GTCTTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 22 1 20 1 T 12 11 261308 CASAVA_Build 19 41628870 5D GTAAAAACAT AATAA/----- AATAATTGTG 3070 het 3070 hom 45 20 23 3 AATAA 2 1 261309 CASAVA_Build 19 41640642 4D TCAAAAAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2169 hom 23 7 15 2 AAAC 3 2 261310 CASAVA_Build 19 41640985 2D ATATATGTAT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 57 30 22 6 AC 5 4 261311 CASAVA_Build 19 41643281 1D GATGGAAAAT G/- CAAAAAGAAC 3070 het 3070 hom 41 13 21 8 G 1 0 261312 CASAVA_Build 19 41644733 1I GAACTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 1909 het 1725 hom 26 4 8 14 T 15 16 261313 CASAVA_Build 19 41648226 1I TTATAAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 34 1 27 6 T 10 11 261314 CASAVA_Build 19 41649097 3I TGGCAGACAC ---/CAA AATCTGCGGA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 CAA 0 1 261315 CASAVA_Build 19 41652665 1I GCACTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 25 18 8 A 10 11 261316 CASAVA_Build 19 41659100 1I TAATCAATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 T 9 10 261317 CASAVA_Build 19 41659193 4I AGGTGTTGTT ----/TTTC TTTCTAACAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTTC 1 2 261318 CASAVA_Build 19 41662561 4D GTTTTGTTTC TTTG/---- TTTGTTTGCG 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 TTTG 3 2 261319 CASAVA_Build 19 41663398 1I ACCCAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1414 hom 13 4 9 0 A 11 12 261320 CASAVA_Build 19 41665144 1D ACTGTCCCCT G/- CGAATGTTTT 2794 het 2794 ref 20 10 7 3 G 1 0 261321 CASAVA_Build 19 41668816 5D AGAGAGAAAG AGAAA/----- AGAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 7 AGAAA 3 2 261322 CASAVA_Build 19 41675894 2D GAGTAGAGTC TT/-- CTCTAAACTC 2678 het 2678 ref 30 19 7 4 T 2 0 261323 CASAVA_Build 19 41681442 4D CTGTCCATCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 77 het 39 0 25 15 TTTC 5 4 261324 CASAVA_Build 19 41682615 1D GGCTCACTGC A/- AACCTCTGCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 3 2 261325 CASAVA_Build 19 41691173 1I CCTAAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 T 11 12 261326 CASAVA_Build 19 41695379 3D TGGTTAGTGT TGA/--- TTTTATTCAA 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 TGA 1 0 261327 CASAVA_Build 19 41712677 1D GCCCGGCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 28 0 23 5 T 10 9 261328 CASAVA_Build 19 41718679 1D GACAAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 25 2 20 3 A 12 11 261329 CASAVA_Build 19 41725293 1I CAGATGGATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 A 8 9 261330 CASAVA_Build 19 41725597 1D AGTTGCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 11 10 261331 CASAVA_Build 19 41726150 1I AGTGGTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 929 hom 29 2 22 5 T 12 13 261332 CASAVA_Build 19 41726736 1D GAATTCCTTC A/- AGGACATATA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 2 1 261333 CASAVA_Build 19 41728804 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1208 hom 31 5 22 4 TA 10 9 261334 CASAVA_Build 19 41741679 1I ACTCAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 A 11 12 261335 CASAVA_Build 19 41751173 8D GTGGGCTCCT TGAGGTAC/-------- TGAGGTACTG 2791 het 2791 ref 33 12 8 14 TGAGGTAC 2 1 261336 CASAVA_Build 19 41763005 1D TTACAGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 11 10 261337 CASAVA_Build 19 41765799 4D CTGTATCTAA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 TTGT 5 4 261338 CASAVA_Build 19 41783776 1D TGTAACTTGG A/- AAAAAAAAAA 840 het 840 ref 34 24 3 7 A 11 10 261339 CASAVA_Build 19 41787347 1I TCAGAGTCTT -/C CACAGACACA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 C 1 2 261340 CASAVA_Build 19 41798017 1D TGAGCCACTG C/- CCCCCGACTA 2564 het 2564 ref 25 14 7 4 C 6 5 261341 CASAVA_Build 19 41801431 1I AATAAGTGGG -/T TTTTTTTTTT 2825 het 2825 ref 34 19 7 8 T 10 11 261342 CASAVA_Build 19 41813104 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2457 het 1484 hom 24 7 9 8 T 15 14 261343 CASAVA_Build 19 41816762 2D ATAAAAAATC TA/-- TGCATGTGTA 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 TA 1 0 261344 CASAVA_Build 19 41829568 1D TTTGGAAAAT A/- TAACTTATTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 2 A 1 0 261345 CASAVA_Build 19 41832081 1D TTTATTTATG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 9 8 261346 CASAVA_Build 19 41843444 1I TGATTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 11 12 261347 CASAVA_Build 19 41844274 2D AAAACCTAAC TA/-- TATTGCTAAT 3070 het 3070 hom 48 17 24 9 TA 2 1 261348 CASAVA_Build 19 41848509 1I CAAATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 A 10 11 261349 CASAVA_Build 19 41849397 1I TATAGACATT -/C CCCTTCCGCG 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 C 3 4 261350 CASAVA_Build 19 41864337 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 6 5 261351 CASAVA_Build 19 41869276 1D AAAATTCACG T/- TAAGTCTCCT 3070 het 3070 hom 32 9 19 6 T 2 1 261352 CASAVA_Build 19 41880357 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 970 het 970 ref 34 22 4 8 T 13 12 261353 CASAVA_Build 19 41906747 12D TCTGTATTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTG 3070 het 672 hom 20 4 12 4 T 21 9 261354 CASAVA_Build 19 41907932 5I ATTTTTTGTC -----/TTTAG TTTAATTTTA 2599 het 2599 ref 22 12 7 3 TTTAG 0 1 261355 CASAVA_Build 19 41908715 4D TTTCATGTTA TTTT/---- TTTCAGTGTA 3070 het 3070 ref 42 26 12 5 T 7 3 261356 CASAVA_Build 19 41913709 4D AAGAAACCAG TAAC/---- TAACTCATCC 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 TAAC 2 1 261357 CASAVA_Build 19 41920767 4D GCAAAGGAAA CAAT/---- CAATAACATG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 CAAT 2 1 261358 CASAVA_Build 19 41925111 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGCAGA 3070 het 2230 hom 40 13 14 15 AAG 3 2 261359 CASAVA_Build 19 41927922 2D TTAAAAGATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 24 10 10 5 TG 9 8 261360 CASAVA_Build 19 41928940 6D GTGCTCACTT TGTATC/------ TGTGTCATAT 3070 het 3070 ref 58 30 22 10 TGTATC 1 0 261361 CASAVA_Build 19 41934019 1I CTCCAAAACT -/A ATTGAGATAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 1 2 261362 CASAVA_Build 19 41934869 2D TTGGCAGTAT AA/-- GAGTGCAATC 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 A 2 0 261363 CASAVA_Build 19 41941665 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 21 0 19 2 A 11 10 261364 CASAVA_Build 19 41950948 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2673 het 1819 hom 19 9 6 4 A 14 12 261365 CASAVA_Build 19 41958530 13I GGGTTCCAAG -------------/GACAGGGTCAAAA GACAGGGTCA 3070 hom 57 het 25 0 14 11 GACAGGGTCAAAA 1 2 261366 CASAVA_Build 19 41973753 1I AGCTACCCGG -/A AGGCTGAGGC 1198 het 1198 ref 11 5 5 1 A 1 2 261367 CASAVA_Build 19 41976714 18I TACAAAAATT ------------------/AGCCTGGAGGTTGCAGTG AGCCAAGATT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AGCCTGGAGGTTGCAGTG 0 1 261368 CASAVA_Build 19 41980904 1D AATTTCTGTG A/- AAGGCGCAGC 3070 het 3070 ref 34 17 13 6 A 3 2 261369 CASAVA_Build 19 41988583 1I GGTAGAACTT -/G TTTTTTAACT 2786 het 2786 ref 23 13 6 4 G 0 1 261370 CASAVA_Build 19 41995069 1I TTTAGTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 11 12 261371 CASAVA_Build 19 41995636 1D CAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 13 12 261372 CASAVA_Build 19 42000404 1D GATACTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 A 12 11 261373 CASAVA_Build 19 42005263 4D TAAAGTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 78 het 36 0 26 11 TTTG 5 4 261374 CASAVA_Build 19 42013882 3D TCCATCTCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAC 7 6 261375 CASAVA_Build 19 42019748 15D GGGTAAGTTT GTTTCTCACACTCAA/--------------- GAAATCATCT 3070 het 3070 ref 39 24 16 3 GTTTCTCACACTCAA 1 0 261376 CASAVA_Build 19 42031548 1I TTTTTGGGGG -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 86 het 31 0 27 4 T 6 7 261377 CASAVA_Build 19 42038502 1I CCCATGTTTC -/T TTTTTAACTA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 T 5 6 261378 CASAVA_Build 19 42041106 1I AGATGACTCT -/A ATGCACTGCC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 2 261379 CASAVA_Build 19 42064794 1I ATTTTACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1967 hom 25 6 13 6 T 10 11 261380 CASAVA_Build 19 42065204 1I AGAGACGGGG -/T TTTTACCATG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 4 5 261381 CASAVA_Build 19 42065574 1D ATAATATATA T/- TCTCTATAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 2 1 261382 CASAVA_Build 19 42070086 2I CATTTGGAAT --/AA AAAGTGTAAG 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 3 5 261383 CASAVA_Build 19 42082501 1I TACCCTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 11 12 261384 CASAVA_Build 19 42086607 1D AACTGTCTCG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 306 hom 19 1 14 5 A 10 9 261385 CASAVA_Build 19 42102955 3I TTAAAAAGTT ---/AAA AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 6 9 261386 CASAVA_Build 19 42103534 4I GTTCACTCGC ----/CACT CACTCACTCA 2865 het 2865 ref 20 13 6 1 CACT 2 3 261387 CASAVA_Build 19 42105786 1I TTTATTTCTT -/G AAGAGTATGT 3070 het 3070 hom 47 16 27 4 G 0 1 261388 CASAVA_Build 19 42109589 3I CACAGAGGTT ---/AAG AAGCTTACAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 AAG 1 2 261389 CASAVA_Build 19 42111650 11D TAAATTAATA TAAATTGTCTT/----------- TAACCTACAT 3070 het 3070 ref 27 14 13 1 TAAATTGTCTT 1 0 261390 CASAVA_Build 19 42111866 1D AACTTTAGGG A/- AAAAAAAATT 2202 het 2202 ref 18 7 6 5 A 9 8 261391 CASAVA_Build 19 42112688 3D CGTGTTCATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2289 hom 43 15 13 15 T 15 12 261392 CASAVA_Build 19 42126073 1I TTATTTTATT -/A GAGCGTCTTT 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 0 1 261393 CASAVA_Build 19 42144019 1D CTTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2282 hom 30 8 13 9 T 15 14 261394 CASAVA_Build 19 42145988 1D AGGTAGTATA T/- GGAGATACGA 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 T 1 0 261395 CASAVA_Build 19 42151604 1I GAATGAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 T 11 12 261396 CASAVA_Build 19 42154349 1I TATAACTTTG -/T TTTTTTTTCT 2508 het 2508 ref 24 10 9 5 T 8 9 261397 CASAVA_Build 19 42164683 1D TTGCCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 11 10 261398 CASAVA_Build 19 42167708 6I ATCTGAATAA ------/TGCCTT TGCCAATTCT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 TGCCTT 0 1 261399 CASAVA_Build 19 42180518 1I ACTGATTTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 A 9 10 261400 CASAVA_Build 19 42186945 1D AGGGTCATTC G/- AGTTCTGTTT 3070 het 3070 ref 36 22 8 6 G 1 0 261401 CASAVA_Build 19 42202512 1I CATCTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 9 13 6 A 13 14 261402 CASAVA_Build 19 42205890 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2761 hom 29 8 15 6 A 10 11 261403 CASAVA_Build 19 42211690 1I TGTTTTGTTC -/A AAATCATCGA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 3 4 261404 CASAVA_Build 19 42212616 2I ATGTTATAGG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 AT 5 6 261405 CASAVA_Build 19 42217756 3D52M1I CTGATACAGA GAGAAGGTGTAAAATAACTTAATGGGAGACCATTAGGCTGCGATAGTTCCCATGG-/---AAGCTGTAAAATAACATAATAGGAGAGCATTAGGCTGAGATAGCTCCCATGGC CTGGGTTCCT 1113 het 1113 ref 40 56 4 6 N/A 0 0 261406 CASAVA_Build 19 42218564 3I GCTATCATTC ---/AAT AATAATCATA 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 AAT 2 3 261407 CASAVA_Build 19 42219892 2I TTGGACAAGC --/AG AGTTTGCGCT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 AG 1 2 261408 CASAVA_Build 19 42220872 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3026 het 2848 hom 27 10 8 9 A 13 12 261409 CASAVA_Build 19 42230896 2I TCTGTGGTGC --/AA AAGAGCAGAC 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 2 4 261410 CASAVA_Build 19 42240174 4D CACTGCTGTA TGTC/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 36 14 16 9 TGTC 1 0 261411 CASAVA_Build 19 42241435 1I TCATCTGTGT -/C CCCCCCGCAT 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 C 6 7 261412 CASAVA_Build 19 42254547 4I CATCTCAAAA ----/AAAT AAATAAATAT 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 AAAT 2 3 261413 CASAVA_Build 19 42258750 1D GGTCTTAACC T/- TTTTTAGCTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 6 5 261414 CASAVA_Build 19 42265792 2D TAGTAGAGAC AG/-- GGTTTCACCA 3070 het 1155 hom 17 3 12 2 AG 1 0 261415 CASAVA_Build 19 42273110 16D ACAGTGGCAT GTACTGTGAGTGGCAC/---------------- GTACTGTGGT 3070 het 3070 ref 51 28 22 6 GTACTGTGAGTGGCAC 1 0 261416 CASAVA_Build 19 42278986 1D TTTTTTTTAA G/- CTCATCCCTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 0 261417 CASAVA_Build 19 42283737 2D AATTTATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2602 hom 32 10 14 9 T 16 14 261418 CASAVA_Build 19 42285737 1D CATTTTCTGA T/- TTTTTATCTC 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 6 5 261419 CASAVA_Build 19 42286724 1I TTTTTTGTCT -/C TTTTTTTTTT 2312 het 149 hom 9 2 7 0 C 0 1 261420 CASAVA_Build 19 42288243 1D TGGTTCCATA T/- TGAACTTTAG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 2 1 261421 CASAVA_Build 19 42290590 1I TTTAATGGGC -/T TTTGATCCTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 3 4 261422 CASAVA_Build 19 42293965 1I ATTCTATTTA -/T TTGCACTGAC 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 T 2 3 261423 CASAVA_Build 19 42295697 3D GTACACAAAT CTA/--- CTGCTGCACT 3070 het 3070 ref 26 9 11 7 CTA 1 0 261424 CASAVA_Build 19 42297167 2D GTGACAGAGA CT/-- CTATCTTTCC 3070 het 3070 hom 30 9 14 8 CT 2 1 261425 CASAVA_Build 19 42307401 1D TGGATAATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 T 10 9 261426 CASAVA_Build 19 42308543 1D CAAATTTTTG A/- AATTTGAGCT 3070 hom 144 het 53 0 49 6 A 3 2 261427 CASAVA_Build 19 42309733 3I GAAAGGTAGG ---/TAT TATTATATGT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 TAT 2 3 261428 CASAVA_Build 19 42315559 3D GAGCTGGTGC CAG/--- AAAAAGAGCT 3070 het 3070 ref 48 25 17 8 CAG 1 0 261429 CASAVA_Build 19 42319746 5I7M3I TGACCAACTC -----CTTTCCC---/CTCTTCTTTCCCCCT CCTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 21 12 6 N/A 0 0 261430 CASAVA_Build 19 42321636 5D TCACAGAAAT AAAAG/----- AAACTACTCT 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 AAAAG 1 0 261431 CASAVA_Build 19 42321808 4D AACAAATAAA AAAT/---- AAATAAAACA 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 AAAT 2 1 261432 CASAVA_Build 19 42329692 2D TCCCCACACA TG/-- TTACCAATCT 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 TG 1 0 261433 CASAVA_Build 19 42337416 1D AGTGACCCCC A/- AAGTCATCAG 3070 het 3070 hom 30 15 14 2 A 3 2 261434 CASAVA_Build 19 42343923 1D ACACAGTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 6 A 11 10 261435 CASAVA_Build 19 42343934 1D AAAAAAAAAA C/- TACAGGCCAA 3070 het 16 hom 29 2 23 5 C 1 0 261436 CASAVA_Build 19 42346188 1I GTAAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 2470 het 2470 ref 30 13 9 8 A 13 14 261437 CASAVA_Build 19 42347150 1I GTCTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 10 11 261438 CASAVA_Build 19 42348310 1D CATAGCAGTT G/- TTTCACTAAT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 1 0 261439 CASAVA_Build 19 42356602 1I TGGGAAATTA -/T CTACCCAATG 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 0 1 261440 CASAVA_Build 19 42366296 14D GTAAGGGGCT GGAATTTTAAACCA/-------------- GGCAGGCAGG 3070 het 3070 ref 43 21 21 9 GGAATTTTAAACCA 1 0 261441 CASAVA_Build 19 42377050 3I TTCCACATGG ---/TGT TGTACATATT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 TGT 1 2 261442 CASAVA_Build 19 42391336 1D AAAAAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 11 10 261443 CASAVA_Build 19 42444629 2I TCCTTCCCTT --/TC TCTCTTTCCC 3070 hom 43 het 19 0 14 5 TC 2 3 261444 CASAVA_Build 19 42453815 4D GCGCACACAC ACAG/---- ACAAACACAC 1906 het 1906 ref 18 12 5 3 ACAG 1 0 261445 CASAVA_Build 19 42476584 2D CATCCCCCCA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 58 26 14 21 AC 9 8 261446 CASAVA_Build 19 42476601 2D CACACACACA CC/-- CATAACGAAC 2288 het 2288 ref 52 24 6 22 C 3 1 261447 CASAVA_Build 19 42525152 6D TCCAACTGAA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1951 het 718 hom 20 4 7 9 T 20 14 261448 CASAVA_Build 19 42529608 1D CCTCTCATTC T/- TTTTTTTTTT 2332 het 1973 hom 25 8 7 10 T 15 14 261449 CASAVA_Build 19 42544668 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAACAAA 2327 het 2327 ref 19 9 8 2 A 7 6 261450 CASAVA_Build 19 42548452 9I ATAATGTTAT ---------/TATCAAAGC CGAGACCTCG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 TATCAAAGC 0 1 261451 CASAVA_Build 19 42549253 1I GTAACATGTC -/T TTGTTCATAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 2 3 261452 CASAVA_Build 19 42556766 1I CACCCCGCCA -/C CCCTGGCCAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 3 4 261453 CASAVA_Build 19 42639812 1I TATATTCAGC -/A ATTGCCACAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 1 2 261454 CASAVA_Build 19 42643278 1D GAGTGCATTT A/- AAAAAAAAAA 1275 het 1275 ref 41 25 3 13 A 13 12 261455 CASAVA_Build 19 42650814 1D GCCTTTCGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2432 hom 33 12 13 8 T 13 12 261456 CASAVA_Build 19 42677371 1I TTGTGGTCAA -/T TATAACTTAG 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 1 2 261457 CASAVA_Build 19 42680022 1I AACCCCTCAA -/C CCTGTTTCTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 2 3 261458 CASAVA_Build 19 42685682 1I CCTTGGAGCT -/A AGTCTGCCTA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 A 1 2 261459 CASAVA_Build 19 42687903 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 567 hom 35 2 26 7 A 15 14 261460 CASAVA_Build 19 42701537 1I AGAAATAGAT -/A AATGAAAAAA 3070 het 311 hom 23 1 20 2 A 2 3 261461 CASAVA_Build 19 42712200 1D GTAGGCAGCA T/- TTTTTTTTTT 2306 het 2306 ref 48 36 5 7 T 11 10 261462 CASAVA_Build 19 42713914 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 9 10 261463 CASAVA_Build 19 42723300 3D GGTTTTTCTT AAA/--- AAAAATTTTT 1169 het 1169 ref 16 7 4 5 A 8 5 261464 CASAVA_Build 19 42723938 1I ATTCTGGAAC -/A AGAACCTTTT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 1 2 261465 CASAVA_Build 19 42728812 1I CCAAACTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 34 2 22 10 T 10 11 261466 CASAVA_Build 19 42734567 2I GTTGCATGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 86 het 33 0 27 6 TG 5 6 261467 CASAVA_Build 19 42736471 1I47M1I CTATCGTATA -TTTGCTGGGATCTCACACAAATAATACTTCCATTCCACCTTCTCACC-/TTTTGCTGGGATCTCACACAAATAATACTTCCATTCCACCTTCTCACCT TTTGAGCCAT 3070 hom 151 het 39 0 51 7 N/A 0 0 261468 CASAVA_Build 19 42736963 6D GTTTAGCTTC TACTTA/------ TAAGTGAGAA 3070 hom 117 het 41 0 38 4 TACTTA 1 0 261469 CASAVA_Build 19 42745120 1I CGAAACTCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 34 0 28 6 T 10 11 261470 CASAVA_Build 19 42754745 9I4M2I10M10D4M1D ATCCAAATAG ---------ACTA--TATGGCCATAATTAGTACATTAGTC/GACTAATGTACTAATTATGGCCATA----------TAGT- CTATCTATCA 3070 hom 99 het 25 0 34 1 N/A 0 0 261471 CASAVA_Build 19 42754966 1I GTTGTCAATC -/T TATATAGAAG 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 1 2 261472 CASAVA_Build 19 42755669 1I TTGAATGACT -/A TTCAAACTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 0 1 261473 CASAVA_Build 19 42755878 1I CTTCCAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 36 1 31 4 T 10 11 261474 CASAVA_Build 19 42770334 1D AGCACTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1150 hom 44 3 28 13 T 14 13 261475 CASAVA_Build 19 42772847 1D23M2D GATAAGGGGC AAAAAAAGGCTATAAGGAGCTGGGCA/-AAAAAAGGCTATAAGGAGCTGGG-- TGCGGTGGCT 3070 hom 69 het 23 0 24 1 N/A 0 0 261476 CASAVA_Build 19 42773173 1D AAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 66 het 24 0 22 3 A 9 8 261477 CASAVA_Build 19 42781550 1I GTCTGTAGAT -/A AAATGCAGTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 3 4 261478 CASAVA_Build 19 42786409 6D AATCAGGAGT TAATAA/------ TAATAACAGT 3070 hom 96 het 34 0 33 3 TAA 4 2 261479 CASAVA_Build 19 42791388 1D TAGGCCTTTA G/- GAGTGCAGTG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 G 2 1 261480 CASAVA_Build 19 42793937 1D CAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 11 10 261481 CASAVA_Build 19 42810520 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 65 het 24 0 22 2 AC 10 8 261482 CASAVA_Build 19 42811311 1I AATAAAATGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 T 8 9 261483 CASAVA_Build 19 42822540 1I AGGTTTTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 13 14 261484 CASAVA_Build 19 42827285 6I GGAAAAAAAC ------/AAAAAG AAAGACAGCC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AAAAAG 0 1 261485 CASAVA_Build 19 42832585 1D GAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 9 261486 CASAVA_Build 19 42843200 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1448 het 1448 ref 35 19 6 10 A 15 14 261487 CASAVA_Build 19 42854049 2I CACACCAAAA --/TG TATGTTATAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TG 0 1 261488 CASAVA_Build 19 42866797 1D CGGTTGAGGC T/- AGGGGAATTG 3070 hom 41 het 19 0 12 7 T 1 0 261489 CASAVA_Build 19 42870779 7I AAACACTGCG -------/GAAGGCC GAAGGCCGCA 3070 hom 33 het 14 0 11 3 GAAGGCC 1 2 261490 CASAVA_Build 19 42877265 1I TGCCTACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 27 2 16 9 T 13 14 261491 CASAVA_Build 19 42877717 2D CAAAGAAAAG AA/-- AAGAGTCCAA 3070 hom 33 het 14 0 10 4 A 4 2 261492 CASAVA_Build 19 42882686 1D AATGTCAATG T/- TATTGTAGAA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 2 1 261493 CASAVA_Build 19 42887577 6I GGGCGCCTGT ------/AGTCCC AGCTATTCAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AGTCCC 0 1 261494 CASAVA_Build 19 42889420 1I CGCGTTGTAA -/C CTTGACAAGA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 1 2 261495 CASAVA_Build 19 42897643 8D GCTTCCTGTT TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TTTC 4 2 261496 CASAVA_Build 19 42900383 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 1237 hom 7 het 3 0 3 0 A 16 14 261497 CASAVA_Build 19 42907202 1D CCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 11 10 261498 CASAVA_Build 19 42921042 2D TTTTTTTTTT TC/-- TTAATTTACC 3070 het 77 hom 24 2 18 5 TC 1 0 261499 CASAVA_Build 19 42930002 1D CCTGCTCCCA G/- GGGTGGGCTA 3070 hom 105 het 40 0 35 6 G 4 3 261500 CASAVA_Build 19 42933312 1I ACCCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 683 hom 27 4 16 7 A 17 18 261501 CASAVA_Build 19 42938315 1D GGTTCTTCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 40 1 25 15 A 15 14 261502 CASAVA_Build 19 42957484 2D TACTGCTAAA CT/-- CTCTCTCTTT 1094 het 1094 ref 29 9 10 10 CT 5 4 261503 CASAVA_Build 19 42968952 2I ACTTGAAAAC --/TT ATATCTACTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 2 261504 CASAVA_Build 19 42969425 3D GCCGTGAACT TAA/--- TAATATCCAT 3070 hom 160 het 56 0 54 2 TAA 2 1 261505 CASAVA_Build 19 42976540 1I AAGATCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1482 hom 30 4 20 6 A 13 14 261506 CASAVA_Build 19 43006096 1I TACTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 13 14 261507 CASAVA_Build 19 43041338 4D TAGATAAGCG TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 TATT 4 3 261508 CASAVA_Build 19 43046458 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2796 het 14 hom 16 1 8 7 T 15 14 261509 CASAVA_Build 19 43048235 1D TAGTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 20 2 12 6 T 14 13 261510 CASAVA_Build 19 43058492 1D AAAAAAAAAA T/- GATTTTCTTC 2883 het 514 hom 19 5 8 7 T 1 0 261511 CASAVA_Build 19 43072894 1I AAAAAAAAAA -/C AGCATTCTCT 3070 het 334 hom 40 1 37 2 C 0 1 261512 CASAVA_Build 19 43081300 2D TTTTCAGCTG CT/-- CTGGAAACAT 3070 hom 120 het 44 0 40 6 CT 2 1 261513 CASAVA_Build 19 43108625 1D CTAACAGCTT C/- CTTTCAGGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 C 2 1 261514 CASAVA_Build 19 43109491 1D GGTGGCATGA T/- TTTTTTTTTT 1017 het 1017 ref 52 30 5 17 T 13 12 261515 CASAVA_Build 19 43109626 2I TTTCTTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 178 hom 34 1 19 14 T 16 18 261516 CASAVA_Build 19 43145444 5I TGGTATAGAC -----/TCTTT TCTTTTCTCT 3070 hom 112 het 44 0 37 7 TCTTT 1 2 261517 CASAVA_Build 19 43150443 1I CCAGCCACTT -/A ACGTTATTGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 1 2 261518 CASAVA_Build 19 43150544 4D TGGCCTCATC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 42 het 23 0 15 8 TCTT 6 5 261519 CASAVA_Build 19 43154051 1D TTTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 37 0 28 9 T 10 9 261520 CASAVA_Build 19 43158596 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAAGA 2767 hom 42 het 18 0 13 7 AAAG 2 1 261521 CASAVA_Build 19 43187348 1I ATTCATTCTC -/T TTATATTCAG 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 2 3 261522 CASAVA_Build 19 43197153 1D CCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1099 het 317 hom 10 3 4 3 T 15 14 261523 CASAVA_Build 19 43200420 1D ACTAAAAAGC A/- TGTGGCTGAC 3070 het 3070 ref 39 18 12 10 A 1 0 261524 CASAVA_Build 19 43202579 4D TCTCTCTCTC TCTA/---- TATATAAATA 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 TCTA 1 0 261525 CASAVA_Build 19 43213084 33D ACACATATTT TATATATATATATGTGGCAAATATATATATATA/--------------------------------- TATATATATA 3070 hom 48 het 18 0 17 7 TATATATATATATGTGGCAAATATATATATATA 1 0 261526 CASAVA_Build 19 43222847 1D CATTAGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 46 0 36 11 T 11 10 261527 CASAVA_Build 19 43227858 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2748 het 620 hom 16 5 8 3 A 13 12 261528 CASAVA_Build 19 43232872 20D GGAGGCAAAG GTTGAAGTGAGCCAAGATCA/-------------------- CACCACTGCA 3070 het 3070 ref 19 12 9 3 GTTGAAGTGAGCCAAGATCA 1 0 261529 CASAVA_Build 19 43237116 1D AGTTTAGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 9 8 261530 CASAVA_Build 19 43287295 1D AGGTGATCCA C/- CCACCTCGGC 3070 het 27 hom 14 1 13 1 C 3 2 261531 CASAVA_Build 19 43344357 1D GCAAGACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 32 3 20 9 A 16 15 261532 CASAVA_Build 19 43353451 2D ATATATATAG AC/-- ACACACACTT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AC 5 4 261533 CASAVA_Build 19 43359841 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2186 het 431 hom 15 1 10 4 A 17 18 261534 CASAVA_Build 19 43363018 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 31 2 21 8 T 17 16 261535 CASAVA_Build 19 43364967 1D ATGGATTTGG T/- TTTTTTTATC 2767 het 2767 ref 27 12 7 9 T 8 7 261536 CASAVA_Build 19 43374220 1I TGAACCCAGG -/A GGCAGAGGTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 0 1 261537 CASAVA_Build 19 43383408 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 2726 het 2308 hom 19 10 7 2 A 15 14 261538 CASAVA_Build 19 43387778 1I CGTCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 hom 42 het 15 0 14 1 A 4 5 261539 CASAVA_Build 19 43403103 6D CTCAAAAAAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 het 2088 hom 22 8 11 5 AAAAAG 3 2 261540 CASAVA_Build 19 43409447 12I TCTATTTTTC ------------/TTTCTTTTCTTT TTTCTTTTCT 3070 het 1024 hom 21 9 9 3 TTTCTTTTCTTT 1 2 261541 CASAVA_Build 19 43409460 1D11M1D15M14D CTTTTCTTTT CTTCTTTTATTTCTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC/-TTCTTTTCTTT-TCTTCTTTTATTTCT-------------- CTTCCTTCCT 3070 het 1896 hom 23 8 10 12 N/A 0 0 261542 CASAVA_Build 19 43423772 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 T 8 9 261543 CASAVA_Build 19 43426881 1I GACAGGGTCT -/C CCCCTGGGCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 4 5 261544 CASAVA_Build 19 43440525 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 14 0 10 4 A 17 16 261545 CASAVA_Build 19 43461687 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTG 1671 het 1310 hom 16 6 6 4 T 10 9 261546 CASAVA_Build 19 43463208 3D GATACTGTGG GTC/--- ACCCTGCTTC 3070 het 3070 ref 36 24 11 1 GTC 1 0 261547 CASAVA_Build 19 43465485 2D TTTTGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 36 3 13 21 T 13 11 261548 CASAVA_Build 19 43480171 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 13 14 261549 CASAVA_Build 19 43484320 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 8 9 261550 CASAVA_Build 19 43488419 1I TGCGTTGGCT -/C CACGCCTGTA 2606 het 2606 ref 21 12 7 2 C 1 2 261551 CASAVA_Build 19 43495430 3D CTTTCCCCTA CTT/--- CTTCTTCTTT 2390 het 2390 ref 30 12 12 6 CTT 4 3 261552 CASAVA_Build 19 43507601 2D TCTCTAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2096 het 2096 ref 25 11 7 7 T 14 12 261553 CASAVA_Build 19 43511731 1D AGAAAGAAAG A/- AAAGAAAAGA 197 het 197 ref 14 6 2 6 A 4 3 261554 CASAVA_Build 19 43514696 1D ACAATAGGTC T/- TTTTTTTTTT 1181 het 1181 ref 20 6 5 9 T 15 14 261555 CASAVA_Build 19 43521747 7I GCAAGGAGCA -------/AGGAGCC AGCAAGTCTA 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 AGGAGCC 0 1 261556 CASAVA_Build 19 43523376 1D TTAGAAAGGA G/- GGGGGGGCAC 3070 het 1125 hom 26 4 12 10 G 8 7 261557 CASAVA_Build 19 43573805 1D GCTCATCTGG A/- AAAAAAAAAA 1467 het 1467 ref 25 11 4 10 A 17 16 261558 CASAVA_Build 19 43620868 2I AGGGCCGTGA --/TT TTTTTTTTTT 2360 het 2360 ref 38 16 12 10 T 12 14 261559 CASAVA_Build 19 43627191 1I AAATGGAGAT -/C CCCCCCAAAA 3070 het 1908 hom 28 8 15 5 C 6 7 261560 CASAVA_Build 19 43628376 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGTATTGCTT 1557 het 1557 ref 23 11 4 8 AGG 0 1 261561 CASAVA_Build 19 43637269 1I ATTAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 A 11 12 261562 CASAVA_Build 19 43641091 8D ATTTATTTAT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 384 het 384 ref 22 14 3 5 TTTG 6 4 261563 CASAVA_Build 19 43642147 3I CTCCAGAATC ---/TGA TGATGATCTC 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 TGA 2 3 261564 CASAVA_Build 19 43643635 4D CTTCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 AAAC 4 3 261565 CASAVA_Build 19 43652391 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 11 10 261566 CASAVA_Build 19 43658499 1I CATAGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 10 11 261567 CASAVA_Build 19 43706799 1I CCTCGCCGTG -/C GATGGTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 0 1 261568 CASAVA_Build 19 43736839 1I GGCTGAGGCA -/G GAGAATTGCT 2770 het 956 hom 12 2 6 4 G 1 2 261569 CASAVA_Build 19 43824116 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2026 hom 25 het 11 0 7 4 A 14 15 261570 CASAVA_Build 19 43848704 1I TCGCCCCTGT -/C CCCCCCCAAA 3070 het 2361 hom 26 7 12 7 C 7 8 261571 CASAVA_Build 19 43851224 2I GGAAGTGAAC --/AG AGTGTTAGGG 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 AG 1 2 261572 CASAVA_Build 19 43859851 4D AGATAGCCAA ACAG/---- ACAGAATGGA 3070 het 3070 hom 48 20 24 5 ACAG 2 1 261573 CASAVA_Build 19 43860092 19I CCATCTAAAA -------------------/GCTGACCCTACACTAAGCT GTGTGCTCTG 3070 het 3070 hom 40 19 21 2 GCTGACCCTACACTAAGCT 0 1 261574 CASAVA_Build 19 43877221 1I AAATGGAGAT -/A ATATCGCATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 261575 CASAVA_Build 19 43904958 1D CTGAGTCCAA G/- GCCCAGCCCT 2618 het 2618 ref 30 13 6 11 G 2 1 261576 CASAVA_Build 19 43912611 1I AACAAAAACC -/A AAAAAAAAAA 1659 het 718 hom 14 3 5 6 A 14 15 261577 CASAVA_Build 19 43915576 1I ACCACCCTGT -/G GTACTAGCTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 G 1 2 261578 CASAVA_Build 19 43920709 2I AACCCCTTGG --/CA CAGAGACCCT 2360 het 2360 ref 34 16 8 10 CA 1 2 261579 CASAVA_Build 19 43937600 3I CCCTCCAGAG ---/AAC AACCCCCCTT 2124 het 2124 ref 22 12 5 5 AAC 1 2 261580 CASAVA_Build 19 43947747 3D GGCTAACCAC AGA/--- AGGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 22 9 8 6 AGA 1 0 261581 CASAVA_Build 19 43948790 4D TACTAAAAAT ACAA/---- ACAATTAGTC 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 ACAA 2 1 261582 CASAVA_Build 19 43964502 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1893 het 1893 ref 23 10 5 8 A 11 12 261583 CASAVA_Build 19 43978072 2D CTCAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 1475 het 1475 ref 19 8 6 5 A 13 11 261584 CASAVA_Build 19 43989672 1I CATAGCAAGA -/C CCCCGTCTTT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 C 4 5 261585 CASAVA_Build 19 43994499 1D ATCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1862 hom 25 4 18 3 A 11 10 261586 CASAVA_Build 19 44014602 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 11 10 261587 CASAVA_Build 19 44014892 1D AGGAAACTGG C/- CCAGGCACGG 3070 het 3070 ref 31 11 11 9 C 3 2 261588 CASAVA_Build 19 44014933 13D CGGTGGGCTT CAGAAGGGCTAAA/------------- GCAGGATTAC 3070 het 3070 ref 31 15 11 7 CAGAAGGGCTAAA 1 0 261589 CASAVA_Build 19 44018386 1D GCTGGAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 8 T 11 10 261590 CASAVA_Build 19 44024563 1I GTTTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 1942 het 1942 ref 25 9 7 9 T 10 11 261591 CASAVA_Build 19 44027583 1D CTCATATTTG A/- ACTTAGAATA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 2 1 261592 CASAVA_Build 19 44027696 23I TCGAAACCAG -----------------------/CCTGGCCAACAACCTGAAACCAC ATCTCTACTA 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 CCTGGCCAACAACCTGAAACCAC 0 1 261593 CASAVA_Build 19 44036928 1D CATACCCTAA T/- TTTTTTTTTT 1705 het 940 hom 22 10 5 7 T 19 18 261594 CASAVA_Build 19 44055362 4D GTACGATAAA AAAT/---- AAATAAATAA 2891 het 2891 ref 20 9 7 4 AAAT 3 2 261595 CASAVA_Build 19 44055447 2D TTGGGAGGCT GA/-- GAGGCATGAG 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 GA 2 1 261596 CASAVA_Build 19 44056758 2D TTCCACAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1792 hom 20 5 10 5 T 13 11 261597 CASAVA_Build 19 44065193 1I GCTCAACTGT -/C CCATTCATTC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 2 3 261598 CASAVA_Build 19 44075219 1D TATCTGACTA T/- TTTTTTTTTT 2803 het 2803 ref 25 9 12 4 T 11 10 261599 CASAVA_Build 19 44083487 1D TCAGAGGTAG T/- TAAGTACTTT 3070 het 3070 ref 34 23 9 3 T 2 1 261600 CASAVA_Build 19 44086960 4I TTGGCAACTC ----/TCTT TGTTTTGTAC 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 TCTT 0 1 261601 CASAVA_Build 19 44091895 1I CGGTTCTCAT -/A AGTGGCATCC 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 1 2 261602 CASAVA_Build 19 44104597 1I ATAGAGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 T 10 11 261603 CASAVA_Build 19 44106454 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 9 10 261604 CASAVA_Build 19 44110896 1D ACACCCCTGG C/- CCCCCCCCCC 564 het 525 hom 20 5 6 9 C 11 10 261605 CASAVA_Build 19 44123215 7D GATTAATAGC TTGTTTA/------- AATTCTTTGA 3070 het 2409 hom 22 5 16 1 TTGTTTA 1 0 261606 CASAVA_Build 19 44125338 1D CCTGCGCTAG T/- TTGCTGGGGA 2317 het 2317 ref 19 10 7 2 T 3 2 261607 CASAVA_Build 19 44125695 1D GGACTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2168 hom 26 8 12 6 T 13 12 261608 CASAVA_Build 19 44127129 4D CATAACCTCC CTGT/---- CTGTGCCTCT 3070 het 3070 hom 54 26 25 3 CTGT 2 1 261609 CASAVA_Build 19 44129099 2D GCATTCAAGT CA/-- CAGTCAGAAG 3070 het 3070 hom 43 19 19 7 CA 2 1 261610 CASAVA_Build 19 44142772 1D CCATTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 28 1 21 6 T 12 11 261611 CASAVA_Build 19 44147815 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1621 het 572 hom 15 4 6 5 T 12 13 261612 CASAVA_Build 19 44150800 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1652 het 979 hom 12 3 8 1 A 10 11 261613 CASAVA_Build 19 44162662 1I CCTTCCCTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 49 het 24 0 16 8 T 9 10 261614 CASAVA_Build 19 44167124 1D ATCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 27 0 21 6 A 10 9 261615 CASAVA_Build 19 44186181 2D CATGTCTGTA AC/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 20 0 18 3 AC 1 0 261616 CASAVA_Build 19 44195110 6I ATTCTAAATT ------/TTCTTC TTCTTCTTTT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 TTC 2 4 261617 CASAVA_Build 19 44199428 1D AGCTGGGTGT G/- GTGGCATGTG 3070 hom 78 het 28 0 25 3 G 2 1 261618 CASAVA_Build 19 44213097 4I TTCAGTTTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 102 het 48 0 33 15 TTTC 2 3 261619 CASAVA_Build 19 44218281 1I AAATTTGTCT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 45 het 18 0 15 4 A 8 9 261620 CASAVA_Build 19 44219862 4D TTGCTACAAT GTCC/---- ATCCAGTCTC 3070 hom 84 het 30 0 28 5 GTCC 1 0 261621 CASAVA_Build 19 44220483 5D ACGCCACCAG GCTCT/----- GCTAACTTAA 3070 hom 120 het 43 0 40 4 GCTCT 1 0 261622 CASAVA_Build 19 44222218 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 12 11 261623 CASAVA_Build 19 44222485 3I CAATTATGTA ---/CTC CTCCTCATTT 3070 hom 74 het 30 0 24 6 CTC 2 3 261624 CASAVA_Build 19 44228049 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 22 1 16 7 A 17 16 261625 CASAVA_Build 19 44234867 1D CCTGTGCCCA G/- GGTACGTCCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 3 2 261626 CASAVA_Build 19 44244744 1I TTAAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 462 hom 24 3 18 3 T 12 13 261627 CASAVA_Build 19 44250141 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1477 het 909 hom 14 4 5 5 T 13 14 261628 CASAVA_Build 19 44267017 1D GGGAAGGGCA G/- GGACGCTGGG 1885 het 1520 hom 18 6 7 5 G 3 2 261629 CASAVA_Build 19 44296254 4I AAATCAAAAC ----/AATT GATGTCATGG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 AATT 0 1 261630 CASAVA_Build 19 44303877 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1414 hom 18 4 10 4 T 12 11 261631 CASAVA_Build 19 44307651 3D AAAATTTTTA AAG/--- AAGATGTCTG 3070 het 502 hom 17 2 13 3 AAG 2 1 261632 CASAVA_Build 19 44319641 1D GTGATTGTTT A/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 1 0 261633 CASAVA_Build 19 44327260 2I ATGTGTGTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 41 14 14 13 GT 7 8 261634 CASAVA_Build 19 44329543 2D9M39D4M2D CTGTCATTGT CAATTGACAATTGTCATTGTCAATTGTCAATGACAATGTCATTGACATTGACATTG/--ATAGAGCAT---------------------------------------CCAT-- TCAGTCACAA 3070 het 3070 ref 46 44 14 6 N/A 0 0 261635 CASAVA_Build 19 44335261 1D TTTCAGGCAT C/- CCATTGGGGG 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 C 3 2 261636 CASAVA_Build 19 44371511 1I CCTCAAGGCC -/T TTTGCACTGA 3070 hom 79 het 32 0 26 6 T 3 4 261637 CASAVA_Build 19 44375729 1D TCCTTTATTA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 9 8 261638 CASAVA_Build 19 44378618 1I CCCAGTTGGG -/A ATCACTGCTT 3070 hom 74 het 29 0 23 6 A 1 2 261639 CASAVA_Build 19 44400973 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 472 hom 25 3 9 13 A 17 16 261640 CASAVA_Build 19 44404562 1D GCAGCCTCCC A/- AAAGTGCTGG 3070 hom 75 het 27 0 24 3 A 4 3 261641 CASAVA_Build 19 44425696 1D GCTGTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 2530 het 2530 ref 25 9 7 9 T 12 11 261642 CASAVA_Build 19 44435943 2I GATGGGAGAG --/GA GAGTGGACGT 3070 het 3070 ref 46 27 18 1 GA 1 2 261643 CASAVA_Build 19 44436647 2D GTACAGTAAG AC/-- ACACAGTCAT 3070 het 3070 ref 31 16 9 7 AC 3 2 261644 CASAVA_Build 19 44443515 2D TTTTGAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 1750 het 1115 hom 28 7 5 16 T 20 18 261645 CASAVA_Build 19 44455107 2D TTTTGGTAAC AA/-- AGTCACAAGT 2146 het 2146 ref 59 50 5 4 A 3 1 261646 CASAVA_Build 19 44474527 1D CCAGCCCTTA T/- TTTTTTTTTT 1691 het 277 hom 13 1 9 4 T 15 14 261647 CASAVA_Build 19 44522913 1D AGTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 10 9 261648 CASAVA_Build 19 44537086 2I AGAGAGAAAC --/AT AAATAAGATG 3070 hom 81 het 31 0 26 5 AT 0 1 261649 CASAVA_Build 19 44562842 1I AAATGTCTCC -/T TTTGAGAATT 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 T 3 4 261650 CASAVA_Build 19 44572856 3I TTCAAAAGGT ---/AGA AGGAGGGGTG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 AGA 0 1 261651 CASAVA_Build 19 44577459 7I TCCCACCTCA -------/ACCTCCC AAGTAGCTGG 1171 het 1171 ref 13 4 6 3 ACCTCCC 0 1 261652 CASAVA_Build 19 44579518 4I CAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGTA 2896 het 1604 hom 20 4 10 6 AAAG 2 3 261653 CASAVA_Build 19 44591757 2D TTTTTCTTCC TT/-- TTTTTGTAAT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 7 5 261654 CASAVA_Build 19 44594636 1D AAAAACTGAT G/- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 G 4 3 261655 CASAVA_Build 19 44599691 1D GGAGTACAGT G/- GTGCGATCTT 2973 het 2945 hom 20 9 9 2 G 2 1 261656 CASAVA_Build 19 44602381 4I AGAAAAAGAA ----/AAAG AAATTAGCTG 2073 het 627 hom 13 3 6 4 AAAG 0 1 261657 CASAVA_Build 19 44607951 3D GATGGGGAAG GGA/--- GGAATGTCAT 3070 het 3070 hom 45 19 19 12 GGA 2 1 261658 CASAVA_Build 19 44615215 1I CTACAAAAAC -/A AAAAATTCAG 877 het 877 ref 22 12 3 8 A 5 6 261659 CASAVA_Build 19 44621181 1D GTACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1985 het 1006 hom 15 5 5 5 T 13 12 261660 CASAVA_Build 19 44633574 1D AGATTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 T 13 12 261661 CASAVA_Build 19 44636442 1D ACATAGGATT C/- CAAAGAGGAC 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 C 2 1 261662 CASAVA_Build 19 44667604 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 911 het 909 ref 12 5 3 4 T 15 14 261663 CASAVA_Build 19 44670451 4D TGTGATGCTG TGTA/---- TGTATGTATG 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 TGTA 3 2 261664 CASAVA_Build 19 44682333 3D ATCTTCTCTC TCT/--- TTTTTTTTTT 2476 het 622 hom 18 5 10 4 TCT 1 0 261665 CASAVA_Build 19 44683334 4I GGATGTAGCA ----/GTCT GTGGTTCTGG 1984 het 1984 ref 35 15 5 15 GTCT 0 1 261666 CASAVA_Build 19 44683378 1I TCTTACTATC -/A AAGGCTCCAG 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 A 2 3 261667 CASAVA_Build 19 44683861 1I CAAGGCGAAT -/A ATTGAGCAGA 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 1 2 261668 CASAVA_Build 19 44691685 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 8 9 261669 CASAVA_Build 19 44708968 1I AACACACTTC -/T TTTTTTTTTT 2947 het 2137 hom 23 9 9 5 T 13 14 261670 CASAVA_Build 19 44713159 1D TTGTAGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2850 hom 25 9 7 9 A 11 10 261671 CASAVA_Build 19 44716337 2D CGTGAAAGTC TA/-- TGTTCCATTT 3070 het 3070 ref 35 20 11 7 TA 1 0 261672 CASAVA_Build 19 44761006 1D TCTTCCAGGG T/- TTTTTTTTTT 2901 het 2439 hom 20 7 6 8 T 11 10 261673 CASAVA_Build 19 44788335 1I TTTTTGTTTG -/T TTTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 3 4 261674 CASAVA_Build 19 44793233 1D TCTTTTCCTA C/- CCCTCCACTC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 4 3 261675 CASAVA_Build 19 44799028 2D TCGATTATTT TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 32 14 9 11 TG 5 4 261676 CASAVA_Build 19 44806808 1D GGGTTATGGC A/- AAAAAAAAAA 2682 het 460 hom 24 1 10 13 A 11 10 261677 CASAVA_Build 19 44808377 1D TTTCTATGAC T/- TTTTTCTGGC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 6 5 261678 CASAVA_Build 19 44808854 1D AAAAAGCGTC A/- AAAATATCAT 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 A 5 4 261679 CASAVA_Build 19 44810121 1I CTTTCCTTTT -/A AAATGGCAGC 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 3 4 261680 CASAVA_Build 19 44813037 1I TGGTTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 1268 het 1268 ref 29 16 6 7 T 10 11 261681 CASAVA_Build 19 44827016 1D AGCCACCCAC A/- AAAAAATCAG 2743 het 2743 ref 54 43 6 6 A 7 6 261682 CASAVA_Build 19 44845005 1D AATATTTGAA T/- TTTTTATTGA 3070 het 3070 ref 25 16 9 0 T 6 5 261683 CASAVA_Build 19 44865726 1D CAGGTGCACA C/- CCACCACGCC 2027 het 2027 ref 18 10 7 1 C 3 2 261684 CASAVA_Build 19 44874640 2I AAAGGGTGAC --/TG TGTTTTGTCT 3070 hom 132 het 52 0 44 8 TG 1 2 261685 CASAVA_Build 19 44876330 1D ACACCTGGCC G/- GGCCCCTCTC 3070 het 3070 hom 28 13 10 5 G 3 2 261686 CASAVA_Build 19 44880386 1I AAAGCAAGAT -/G GGTCACCAAT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 G 2 3 261687 CASAVA_Build 19 44884633 1I TTACCGCAAA -/C CCCCATGACA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 4 5 261688 CASAVA_Build 19 44895629 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2808 hom 39 12 14 13 TA 7 6 261689 CASAVA_Build 19 44903576 1I TCTATTCAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2538 hom 17 6 8 3 T 7 8 261690 CASAVA_Build 19 44912915 2D GTGAGGGGAG GC/-- AGTGGAAATG 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 GC 1 0 261691 CASAVA_Build 19 44916258 4I59M3I TAAGGATAGA ----CTATGGAAGAAGAGTAGAGAAGCTAGTAATATTGTTCTGAGGATTGGGATTGAGGAGTG---/CTATCTATGGAAGAAGAGTAGAGAAGCTAGTAATATTGTTCTGAGGATTGGGATTGAGGAGTGAGA AGAAGTCTTC 3070 hom 160 het 35 0 54 7 N/A 0 0 261692 CASAVA_Build 19 44919255 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1849 hom 30 het 16 0 9 8 A 18 16 261693 CASAVA_Build 19 44923486 1I CCATAAACGT -/G TGTGTGCAAG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 G 0 1 261694 CASAVA_Build 19 44927916 1I ATCTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 11 12 261695 CASAVA_Build 19 44936117 1D TTAAACATAG A/- GCTCCCCTTC 3070 het 3070 ref 27 14 13 2 A 1 0 261696 CASAVA_Build 19 44953818 1D CTCGGCATCC A/- AAGTGCTGGG 3070 het 2261 hom 22 6 14 2 A 3 2 261697 CASAVA_Build 19 44955120 1D GTAATTTTGT C/- TTTCAACATG 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 C 1 0 261698 CASAVA_Build 19 44969741 1I TAGCTCACAG -/A AGAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 A 1 2 261699 CASAVA_Build 19 44971407 3I TCCATCTAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 AAC 3 4 261700 CASAVA_Build 19 44972658 4D ACTCCGTCTC AATA/---- AATAAATAAA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 AATA 6 5 261701 CASAVA_Build 19 44980002 1D GGATGGATGC T/- TTTTTTTTTT 2433 het 2433 ref 37 11 10 17 T 17 16 261702 CASAVA_Build 19 44987771 2D CCTCACACAC AT/-- GTCTGGCAGT 3070 het 3070 hom 47 16 24 10 AT 1 0 261703 CASAVA_Build 19 44989234 1D CGCCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 C 3 2 261704 CASAVA_Build 19 44990446 3D TATGATCCTG GCA/--- GAATCCCACT 3070 het 3070 ref 30 14 8 11 GCA 1 0 261705 CASAVA_Build 19 44991648 1D AGTGACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2198 hom 24 7 11 6 A 12 11 261706 CASAVA_Build 19 44992800 12I AAAAAAAAAA ------------/CCAAAAGGGGTT AAACCAAAAG 3070 het 990 hom 20 6 9 5 CCAAAAGGGGTT 0 1 261707 CASAVA_Build 19 44994638 1D ATCTCTGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 10 9 261708 CASAVA_Build 19 44999453 1D75M1D GGTGTTGGAG AAAAAAAAAAGAGTAAAGAACACAGGAGCCAACCTGAAAGATAAACGCTGATGGCCAAGGCTAAAACAACTTGAGCA/-AAAAAAAAAGAGTAAAGAACACAGGAGCCAACCTGAAAGATAAACGCTGATGGCCAAGGCTAAAACAACTTGAGC- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 25 13 33 N/A 0 0 261709 CASAVA_Build 19 45003525 1I TTGCACGCCT -/G GCACATCAGC 3070 hom 93 het 38 0 30 8 G 1 2 261710 CASAVA_Build 19 45013803 1D CTCTAGCCTT G/- GGAGAGCTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 3 2 261711 CASAVA_Build 19 45013912 1I TTTTCTTAGT -/G AGCATTTATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 261712 CASAVA_Build 19 45014588 1D GATAGCAATG A/- AGAGAAGGGG 3070 hom 21 het 20 0 12 10 A 2 1 261713 CASAVA_Build 19 45014619 1I GTAGCCAGGT -/G GGGGGGGGAT 3070 het 403 hom 29 2 14 13 G 8 9 261714 CASAVA_Build 19 45026959 1I TTTGGGGGGA -/G GGGGGGTCCA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 G 6 7 261715 CASAVA_Build 19 45032350 1I CATGAGTGTA -/G AACCCTCATT 3070 hom 72 het 27 0 22 5 G 0 1 261716 CASAVA_Build 19 45040789 1D ATGAAGATCA C/- CCCCAGAACA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 5 4 261717 CASAVA_Build 19 45041092 1D CTCCACAGGG T/- GGGAGCAGGC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 1 0 261718 CASAVA_Build 19 45041863 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 25 0 17 9 A 13 12 261719 CASAVA_Build 19 45041875 2D AAAAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 459 hom 35 9 14 13 AT 1 0 261720 CASAVA_Build 19 45042824 6D TTCTTTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 23 1 15 7 T 18 12 261721 CASAVA_Build 19 45044399 4I CTCGGCCTCC ----/TGAG TAACTGTGAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TGAG 0 1 261722 CASAVA_Build 19 45052287 17I AAAACAATTG -----------------/TAGAGATGGGGTCTCAT TATGTTGCCC 2499 het 2499 ref 17 8 6 3 TAGAGATGGGGTCTCAT 0 1 261723 CASAVA_Build 19 45058821 2D CCTGGGCAAC AG/-- AGTCAGGCTA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 AG 2 1 261724 CASAVA_Build 19 45067570 1D ACCAAAATAC A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 37 28 7 3 A 7 6 261725 CASAVA_Build 19 45076161 4D GAGGACACAG AGAA/---- AGAAATGGGA 1637 het 1637 ref 33 25 4 5 AGAA 2 1 261726 CASAVA_Build 19 45077210 2I CCCTCCCCTG --/TC TCTCTGTCTC 3070 het 587 hom 21 4 14 3 TC 2 3 261727 CASAVA_Build 19 45089779 2D GACCCTACTA TG/-- TGGACCATGC 2946 het 2946 ref 32 15 8 9 TG 2 1 261728 CASAVA_Build 19 45094443 1D CCAGAGTCCT C/- ATGTCTAGGA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 C 1 0 261729 CASAVA_Build 19 45095473 1D TTTGAGACCA G/- GCCTGGGCAA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 G 2 1 261730 CASAVA_Build 19 45096528 4D CTTATTTATG TTTA/---- TTTATTTATT 2287 het 2287 ref 21 11 8 2 TTTA 3 2 261731 CASAVA_Build 19 45098236 1D GACTCTGGGC A/- AGTTACCTCA 3070 het 3070 ref 31 18 10 5 A 2 1 261732 CASAVA_Build 19 45120106 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 8 9 A 13 12 261733 CASAVA_Build 19 45124046 4I TCTCTAAAAC ----/AAAA AAAGTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 3 7 261734 CASAVA_Build 19 45177309 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1042 het 1042 ref 21 12 3 6 A 15 14 261735 CASAVA_Build 19 45354639 1I AAGAAGATTA -/G GACGGGGGCA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 1 2 261736 CASAVA_Build 19 45378949 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 24 2 16 6 A 14 13 261737 CASAVA_Build 19 45392512 1I TGCCTACTCT -/G TACTAGGCAC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 G 0 1 261738 CASAVA_Build 19 45395587 2D GGCTGTTGTT TC/-- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 16 13 9 TC 1 0 261739 CASAVA_Build 19 45425088 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1211 hom 19 7 8 6 A 13 12 261740 CASAVA_Build 19 45426428 1D TAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 2495 het 1060 hom 14 5 8 1 T 1 0 261741 CASAVA_Build 19 45427764 4D AATATTATGC TATT/---- TATTTTGTTG 3070 het 3070 hom 55 24 27 6 TATT 2 1 261742 CASAVA_Build 19 45450348 2D CCTGTGGGGA TC/-- TCCACCTGGA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TC 2 1 261743 CASAVA_Build 19 45451207 4I ACAGAAAAAT ----/AGAC AGACAATATA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AGAC 1 2 261744 CASAVA_Build 19 45451926 1D TTACTAAATT G/- ATCTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 G 1 0 261745 CASAVA_Build 19 45456404 1D CCTAGCTCTT A/- AAAAAAAAAA 909 het 909 ref 24 14 4 6 A 17 16 261746 CASAVA_Build 19 45465700 1I GAGCTGTGTA -/G ACACATGAGG 3070 hom 108 het 45 0 36 9 G 0 1 261747 CASAVA_Build 19 45496656 28D GACCAAAATT GAGTGAATTTATTATGTCTTAAAAATGA/---------------------------- GAGTGAATTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 9 GAGTGAATTTATTATGTCTTAAAAATGA 2 1 261748 CASAVA_Build 19 45517073 2I TAAATTTCAC --/AT GAGGTATATT 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 AT 0 1 261749 CASAVA_Build 19 45520341 1D AGGGAGGGCG C/- CCTGAGAGGG 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 C 3 2 261750 CASAVA_Build 19 45529365 2D AGCCTGGGCA AC/-- AGAGTGAGAC 3070 het 2208 hom 20 5 14 2 AC 1 0 261751 CASAVA_Build 19 45544668 2I GTGCGATGTT --/CG AAGTGTGCAT 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 CG 0 1 261752 CASAVA_Build 19 45574111 4I TCAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 51 het 19 0 15 4 AAAG 2 3 261753 CASAVA_Build 19 45586913 1I TGATAAGTAC -/A AAAAAAAAAA 1446 het 1446 ref 14 8 4 2 A 10 11 261754 CASAVA_Build 19 45599035 3D ATTCTACTGT TTG/--- TTGTTGTTGG 3070 het 3070 ref 46 18 18 10 TTG 4 3 261755 CASAVA_Build 19 45632957 1I GTTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2802 het 2802 ref 22 10 7 5 T 10 11 261756 CASAVA_Build 19 45637627 1I TCTCTATTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 2742 hom 21 9 11 1 A 8 9 261757 CASAVA_Build 19 45639214 4D CATGAGGAAG GATC/---- GATCCCCTCT 3070 hom 98 het 34 0 31 5 GATC 2 1 261758 CASAVA_Build 19 45652765 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 19 0 14 5 T 10 9 261759 CASAVA_Build 19 45655636 1I CTGCCTGCCT -/C CCCGATCCCA 3070 hom 90 het 32 0 27 5 C 3 4 261760 CASAVA_Build 19 45656311 2I AAAGAGGAGC --/AG AGAGAGCCTG 2885 het 2885 ref 32 12 10 10 AG 3 4 261761 CASAVA_Build 19 45660950 1D GGCAACCGGG C/- CAGGATCACA 3070 het 3070 ref 54 34 13 7 C 2 1 261762 CASAVA_Build 19 45662156 1I TTCCCTTTGC -/T TGAGGGGGAC 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 T 1 2 261763 CASAVA_Build 19 45678169 4D CATCTCTAAA AAAC/---- AAACAAACAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 8 AAAC 3 2 261764 CASAVA_Build 19 45702790 2I AATCAATTTA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 407 hom 41 1 32 8 AG 8 9 261765 CASAVA_Build 19 45708997 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 471 hom 15 1 11 5 A 9 8 261766 CASAVA_Build 19 45730036 1D AGCTTGTTTT G/- GGGGGGGTGA 3070 hom 73 het 31 0 25 6 G 8 7 261767 CASAVA_Build 19 45732651 1I CAGCGTCTGC -/T TTGTATCTGC 3070 hom 105 het 44 0 35 9 T 2 3 261768 CASAVA_Build 19 45735938 9D AATTCAAGAC CAACCTGGG/--------- CAACATGGCA 3070 het 2390 hom 22 7 13 3 CAACCTGGG 1 0 261769 CASAVA_Build 19 45741874 2D CTTCTTCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 151 hom 28 2 14 12 T 18 16 261770 CASAVA_Build 19 45743972 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2241 het 237 hom 12 3 6 3 A 16 15 261771 CASAVA_Build 19 45749146 4D CTCTCTCTCT CACA/---- CACACACACA 3070 het 394 hom 41 5 20 18 CA 10 8 261772 CASAVA_Build 19 45753664 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAG 2859 het 1452 hom 20 5 11 4 A 9 10 261773 CASAVA_Build 19 45776312 1I ATGGAATGGA -/G GGGGCGCGGA 3070 hom 100 het 37 0 32 5 G 4 5 261774 CASAVA_Build 19 45779279 1I CAAAAAAAAA -/C AAAAAAACAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 0 1 261775 CASAVA_Build 19 45782019 1D AATCTTTGTG T/- TTCTTTCCCA 3070 het 3070 hom 47 24 19 4 T 3 2 261776 CASAVA_Build 19 45788452 1D TCTTGCCCCC T/- GACCCTGCTT 3070 het 2258 hom 30 7 12 12 T 1 0 261777 CASAVA_Build 19 45791449 1I ATTAGAGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 9 10 261778 CASAVA_Build 19 45793202 1I TCTGCTCCCA -/G GGGGGTCCTG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 5 6 261779 CASAVA_Build 19 45801098 1D TTAGCTGGGA G/- GGGAGGGGAT 3070 het 3070 ref 45 21 13 11 G 4 3 261780 CASAVA_Build 19 45814934 1I TCTGTGACCA -/G GGTTACGAGG 3070 hom 62 het 24 0 19 5 G 2 3 261781 CASAVA_Build 19 45818203 1D GGCTGCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 17 0 10 7 T 13 12 261782 CASAVA_Build 19 45831238 1D ACCCAGCCTT G/- GGGGGTGGTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 G 6 5 261783 CASAVA_Build 19 45837676 1D TCAGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 187 hom 21 1 14 6 T 15 14 261784 CASAVA_Build 19 45838975 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 11 12 261785 CASAVA_Build 19 45841281 1D CCAAAAAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 53 het 25 0 18 7 A 9 8 261786 CASAVA_Build 19 45842252 1D GCCTGGCCAA T/- TTTTTTTTTT 2830 het 14 hom 12 1 7 4 T 15 14 261787 CASAVA_Build 19 45843291 9D TCTCAAAAAA AAAAAAAAG/--------- AAAAAGAAAA 2454 hom 14 het 10 0 7 4 AAAAAAAAG 1 0 261788 CASAVA_Build 19 45859296 1D AGATCGGGGT G/- GGGGGGGGGG 2688 hom 33 het 17 0 14 3 G 11 10 261789 CASAVA_Build 19 45863885 19D TTAGAAGTAG TTTTTTTTTTTTTGTTTTT/------------------- TTTTTTTGAG 3070 hom 51 het 21 0 17 4 TTTTTTTTTTTTTGTTTTT 1 0 261790 CASAVA_Build 19 45876240 2D AAAAAGAGAC AA/-- GAGATCTCCC 3070 hom 92 het 36 0 30 7 A 2 0 261791 CASAVA_Build 19 45876464 1D CGCTTTGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 10 9 261792 CASAVA_Build 19 45878202 1D GCCAATACTC T/- TTTTTTTTTG 2711 hom 18 het 9 0 7 2 T 10 9 261793 CASAVA_Build 19 45884122 8D TGGTCTCGAA CTCCTGAC/-------- CTCCTGACCT 3070 hom 27 het 12 0 8 7 CTCCTGAC 2 1 261794 CASAVA_Build 19 45884296 2I TGTCTAGGAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 135 het 52 0 45 7 TG 6 7 261795 CASAVA_Build 19 45884451 4I TGTGAGTGTT ----/TGAG TGTGACTCTG 3070 hom 150 het 59 0 48 11 TGAG 0 1 261796 CASAVA_Build 19 45891618 1I GAGTGGAACC -/T GGGTCACACC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 0 1 261797 CASAVA_Build 19 45900071 4D TGTCATTGTG TAAT/---- TAATTAAGTG 3070 hom 115 het 48 0 35 13 TAAT 2 1 261798 CASAVA_Build 19 45922693 1I TGTCTCAATT -/G AAAAAAAAAA 407 het 407 ref 30 12 5 13 G 0 1 261799 CASAVA_Build 19 45932527 1D CTAATTGTTG T/- TTTTTTTTTT 325 het 325 ref 24 8 3 13 T 17 16 261800 CASAVA_Build 19 45950502 1D TGAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 39 2 31 6 A 11 10 261801 CASAVA_Build 19 45971659 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1092 hom 25 4 17 5 A 13 12 261802 CASAVA_Build 19 45982242 3I TGTCTCCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 118 het 54 0 38 16 AAC 5 6 261803 CASAVA_Build 19 45996436 4I CTTATGTAAA ----/TTAC TTACTGACGT 3070 hom 89 het 37 0 29 8 TTAC 1 2 261804 CASAVA_Build 19 46001921 1D GCAGTGCACT C/- CAGTCTGCAG 3070 hom 108 het 39 0 34 6 C 2 1 261805 CASAVA_Build 19 46016193 1I AATCTATTAC -/A AATGTACTAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 2 3 261806 CASAVA_Build 19 46019669 1I TTTAGGCCCA -/G GGGATCCTCC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 G 3 4 261807 CASAVA_Build 19 46021679 4D GTGGGGCTTC AGGG/---- AGGGAGGCCT 3070 hom 65 het 25 0 21 4 AGGG 2 1 261808 CASAVA_Build 19 46031263 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 14 12 261809 CASAVA_Build 19 46036122 2D AAGCTATAAC TA/-- TGAATTCTTC 3070 het 3070 ref 46 32 10 5 TA 1 0 261810 CASAVA_Build 19 46036423 5D12M1I CTTTCTTTCC TTTCTTTCTTTCTTTTC-/-----TTCTTTCTTTTCT TTCCTTCCTT 1285 het 1285 ref 27 11 4 17 N/A 0 0 261811 CASAVA_Build 19 46053413 1I AACATACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 28 0 22 6 T 10 11 261812 CASAVA_Build 19 46054632 1I ACTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2258 het 124 hom 25 1 12 12 T 15 16 261813 CASAVA_Build 19 46059856 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 11 het 28 1 21 6 A 9 8 261814 CASAVA_Build 19 46066399 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 375 hom 19 1 16 2 A 14 15 261815 CASAVA_Build 19 46085920 3I GAAAAAAAAA ---/AAC AAAAAACCAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AAC 0 1 261816 CASAVA_Build 19 46092537 1I GTATTGTGGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 8 9 261817 CASAVA_Build 19 46095823 1I AAAACACCTG -/T TTTTATTTTG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 4 5 261818 CASAVA_Build 19 46101228 8D GACTGTCTCA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 AAAC 5 3 261819 CASAVA_Build 19 46105109 1D TGGATTGTGC T/- TTTGGTGTTG 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 T 4 3 261820 CASAVA_Build 19 46113659 3I AAATTGATAG ---/ACA ACTAGCAAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 ACA 0 1 261821 CASAVA_Build 19 46117325 4D CATATTTTTC TTCT/---- TTCTTTCTTC 3070 hom 108 het 40 0 37 5 TTCT 3 2 261822 CASAVA_Build 19 46117885 1I GAGACGCAGG -/T TGAGCATCAT 2438 het 1440 hom 10 3 5 2 T 1 2 261823 CASAVA_Build 19 46121663 4D ACGGAAGCAT AAAC/---- AAACAGACAA 3070 het 3070 hom 50 22 22 8 AAAC 2 1 261824 CASAVA_Build 19 46139453 2I GGAAGTGGGG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 343 hom 20 1 15 4 GA 6 7 261825 CASAVA_Build 19 46147869 1I CAATATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 13 16 10 T 10 11 261826 CASAVA_Build 19 46154242 8I AGAGAGTGTA --------/CAAAGAGC CAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 CAAAGAGC 0 1 261827 CASAVA_Build 19 46157661 4D CCTGGTGCTC TCTG/---- TCTGTCTCTC 3070 het 3070 ref 30 12 10 9 TCTG 2 1 261828 CASAVA_Build 19 46157906 4I TGTCTCTTTT ----/TCTC TCTATCTGTC 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 TC 1 3 261829 CASAVA_Build 19 46161841 1I GCTAATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 11 12 261830 CASAVA_Build 19 46169149 1I TCACAAAAAT -/C CCCCAACTGC 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 C 4 5 261831 CASAVA_Build 19 46199687 1I GACTGTCTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 53 21 22 10 T 9 10 261832 CASAVA_Build 19 46205370 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1191 het 1191 ref 10 7 3 0 T 13 12 261833 CASAVA_Build 19 46208791 1D TTTATTTGGA T/- TACTTGATCC 3070 het 3070 ref 46 29 12 6 T 2 1 261834 CASAVA_Build 19 46214145 22D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/---------------------- AAAAAAAAAA 487 het 487 ref 22 9 4 11 A 35 13 261835 CASAVA_Build 19 46254334 4I TAATGCTTGT ----/TTGG TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 TTGG 0 1 261836 CASAVA_Build 19 46326096 1I TCTTAGTACA -/T TTGTAATAGA 2467 het 2467 ref 28 20 6 2 T 2 3 261837 CASAVA_Build 19 46326859 4D GGAGGTTTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 2404 hom 27 6 14 8 TTTC 5 4 261838 CASAVA_Build 19 46370753 4D CCTCCCTGAT ACTC/---- ACCACTCTCC 3070 het 2405 hom 24 9 13 2 ACTC 1 0 261839 CASAVA_Build 19 46374396 1D CATAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 32 2 21 9 T 15 14 261840 CASAVA_Build 19 46427899 2D TGTGTCTGTT TC/-- TGTGTCTGTG 1773 het 1773 ref 73 47 12 15 TC 1 0 261841 CASAVA_Build 19 46429691 2I AAAGAAACAA --/AC CAACAAAAAA 2265 het 1944 hom 11 5 5 1 AC 0 1 261842 CASAVA_Build 19 46434693 1D TTGTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 1200 het 1200 ref 47 40 4 3 T 11 10 261843 CASAVA_Build 19 46533645 1I CCCCAGGGGA -/G GCCCAGAGGC 3070 hom 56 het 25 0 19 6 G 1 2 261844 CASAVA_Build 19 46536242 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1669 hom 26 6 9 11 A 13 14 261845 CASAVA_Build 19 46536715 2I TGGGGGGTAC --/GT GTGTGTGTGT 2260 het 2260 ref 38 20 8 10 GT 8 9 261846 CASAVA_Build 19 46540262 2D GCATGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2547 het 668 hom 11 2 6 3 T 16 14 261847 CASAVA_Build 19 46541664 4D AGATCAAATG AGTT/---- AGTTAGGCTC 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 AGTT 2 1 261848 CASAVA_Build 19 46541949 1D GGCTGCTCTC A/- AAACTCCTGA 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 A 4 3 261849 CASAVA_Build 19 46549550 17I TGCGGGGAAT -----------------/GGGGGGGCTCGCTGCTC GCAGCGTGGA 3070 het 1714 hom 25 7 12 7 GGGGGGGCTCGCTGCTC 0 1 261850 CASAVA_Build 19 46553178 3I TCCTGCCTTC ---/CCT CCTCATGTCC 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 CCT 1 2 261851 CASAVA_Build 19 46554597 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 A 11 10 261852 CASAVA_Build 19 46557926 1I TTCTTTTTTT -/G GGGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 G 7 8 261853 CASAVA_Build 19 46561328 1I TCCATTTGAC -/A GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 0 1 261854 CASAVA_Build 19 46570266 1D TTTATTGTTA T/- TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 5 T 3 2 261855 CASAVA_Build 19 46571475 1I CTAAAAGTAC -/A AAAAATTAGC 1315 het 1257 hom 6 3 3 0 A 5 6 261856 CASAVA_Build 19 46573885 4D22M3D CAAAACAAAC AAAAAAACCAAAGTAAAATAGCAGCGACA/----AAACCAAAGTAAAATAGCAGCG--- ACAACAACAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 8 N/A 0 0 261857 CASAVA_Build 19 46580691 11D GGGACTTGGA GGGGACTGGGC/----------- ATAAAAGAGA 2371 het 2371 ref 30 20 9 7 GGGGACTGGGC 1 0 261858 CASAVA_Build 19 46588503 4D GCCTAGCAGC CAGA/---- CAAAGACCAC 3070 het 3070 ref 52 27 16 10 CAGA 1 0 261859 CASAVA_Build 19 46594403 1D AATCTTAGGG A/- TATTTACTTG 2425 het 2266 hom 30 6 6 18 A 1 0 261860 CASAVA_Build 19 46595414 1D GGTAGATAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 9 18 9 T 9 8 261861 CASAVA_Build 19 46596581 1D GTAGCCTTGG C/- CAACGGACTG 3070 het 3070 ref 42 22 14 7 C 2 1 261862 CASAVA_Build 19 46605994 7I AAGCCACTGC -------/CCAGCAT CCAGCATCCC 1885 het 1885 ref 30 14 7 9 CCAGCAT 1 2 261863 CASAVA_Build 19 46609259 1I ATCCAGGGGG -/C TCTTCCAGGC 3070 het 3070 ref 40 15 15 10 C 0 1 261864 CASAVA_Build 19 46613584 1I TAGTAGAGGC -/G GGGTTTCACC 3070 hom 24 het 9 0 8 1 G 3 4 261865 CASAVA_Build 19 46616280 1I ATAATGATGA -/T TTTTTTTTTT 2806 het 1814 hom 35 9 12 14 T 14 15 261866 CASAVA_Build 19 46619203 1I GAGGATGTGA -/G GGGGGGAGCT 1889 het 1889 ref 25 17 6 2 G 6 7 261867 CASAVA_Build 19 46619383 1I AGATGGTGCA -/G GGTTGGGTGG 1928 het 1928 ref 29 16 6 7 G 2 3 261868 CASAVA_Build 19 46620708 1I CTCCAGGGAG -/C CCCACACTGA 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 C 3 4 261869 CASAVA_Build 19 46623295 12I CAGAGGCCCA ------------/GGCCAGGGCCGG GGCCAGGTCA 2947 hom 41 het 17 0 11 6 GGCCAGGGCCGG 0 1 261870 CASAVA_Build 19 46635446 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1205 het 1205 ref 27 20 4 3 A 14 13 261871 CASAVA_Build 19 46636963 1D AACCAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 11 10 261872 CASAVA_Build 19 46640569 3I GGCTGGAGAA ---/GTG GTGGTGGTGG 3070 hom 78 het 33 0 19 14 GTG 3 4 261873 CASAVA_Build 19 46646915 1D TCCCCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2713 hom 5 het 19 0 8 11 T 13 12 261874 CASAVA_Build 19 46673006 1D TACTATTTCA C/- CCCCCCCCCG 2956 hom 25 het 26 0 14 13 C 10 9 261875 CASAVA_Build 19 46712849 1I TATTATCATA -/T TTTTTTCCTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 6 7 261876 CASAVA_Build 19 46717161 16D3M14D TTTCCCCCTG AGTATTAGGAACAATACCACATGGGGTGTGTAC/----------------CCA-------------- TATTGGGAGT 2453 het 2453 ref 34 11 13 19 N/A 0 0 261877 CASAVA_Build 19 46731366 2D ACCTTTCCCC CT/-- GAGTCCCCAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 CT 1 0 261878 CASAVA_Build 19 46741230 1I TGTATTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 29 0 23 6 T 10 11 261879 CASAVA_Build 19 46745174 1I TCCATCATTT -/A AAAAAAAAAA 1248 het 1248 ref 19 6 4 9 A 17 18 261880 CASAVA_Build 19 46745441 1D CATGAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 39 0 28 11 T 11 10 261881 CASAVA_Build 19 46749369 3D TTCCTTTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 2444 het 133 hom 35 2 14 20 T 19 16 261882 CASAVA_Build 19 46751561 1D TGATCTGCCC A/- CCTCAGCCTC 3070 hom 48 het 20 0 15 6 A 1 0 261883 CASAVA_Build 19 46752156 3D AGTTTCCAAA TTC/--- TGGGGAAATC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TTC 1 0 261884 CASAVA_Build 19 46763758 4D CTTGTTTTTC ACAG/---- ACAGACAGGC 2267 het 4 hom 14 0 7 7 ACAG 3 2 261885 CASAVA_Build 19 46769440 5I CTTGGGAGAA -----/GAATC GCATGTGTGG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 GAATC 0 1 261886 CASAVA_Build 19 46805905 1I AATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 927 het 927 ref 27 14 4 9 T 15 16 261887 CASAVA_Build 19 46807780 1D CATGTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 37 1 32 5 T 11 10 261888 CASAVA_Build 19 46810105 4I CTCAGTACTT ----/AAAG TTTAAAGTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAG 0 1 261889 CASAVA_Build 19 46816185 29D AGGACGAACA ACCTGTGGCAGTGGCAGAACACTCTTGGG/----------------------------- ACCTGTGGCA 3070 hom 61 het 35 0 19 19 ACCTGTGGCAGTGGCAGAACACTCTTGGG 2 1 261890 CASAVA_Build 19 46830099 1I GTGATCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 877 hom 38 3 26 10 T 15 16 261891 CASAVA_Build 19 46830568 2D AATGATATGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 28 0 25 5 TA 7 6 261892 CASAVA_Build 19 46831995 1D GACCTAGCTC T/- TTTTTTTTTT 1765 het 1679 hom 25 11 6 8 T 17 16 261893 CASAVA_Build 19 46849314 2D ACCCCCCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 33 0 20 14 A 14 12 261894 CASAVA_Build 19 46850308 1D AAATACAGTT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 8 7 261895 CASAVA_Build 19 46851244 6D TCCTAGCTTA AATTAG/------ AAAGAGTTAG 3070 het 3070 ref 26 13 10 6 AATTAG 1 0 261896 CASAVA_Build 19 46875398 4D TAAAATTAAC TTTG/---- TTTGCAGATG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTTG 2 1 261897 CASAVA_Build 19 46879873 1D CCCTGTGTGG C/- CCCCTTGGTT 3070 hom 71 het 26 0 22 4 C 5 4 261898 CASAVA_Build 19 46971641 1D CCTGGCTACA T/- TTTTTTTTTT 2410 het 1687 hom 21 5 10 6 T 13 12 261899 CASAVA_Build 19 46998841 1I AGGCAAAAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 8 9 261900 CASAVA_Build 19 47002901 3I GAGTTGGCCA ---/AAG AATAGGAGAT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 AAG 0 1 261901 CASAVA_Build 19 47010310 1D GTGGAAGGGT C/- CACTCAGGTC 3070 het 3070 hom 53 22 22 11 C 2 1 261902 CASAVA_Build 19 47011681 1D AGTATGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 26 6 T 11 10 261903 CASAVA_Build 19 47018900 1D CCACAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 2165 het 2165 ref 18 8 7 3 A 12 11 261904 CASAVA_Build 19 47031986 4D AACTCTGTCT CACA/---- CACACACACA 3070 het 155 hom 44 4 18 24 CA 11 9 261905 CASAVA_Build 19 47051348 3D GTATTTTTGT TTC/--- TTCTTATTAT 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 TTC 2 1 261906 CASAVA_Build 19 47056835 1I GTTTGCCGGT -/C CCTGGCAGGG 3070 het 2193 hom 39 12 17 10 C 2 3 261907 CASAVA_Build 19 47057945 4D ACCGACCTTC ACTA/---- ACTAAGGGGC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 ACTA 2 1 261908 CASAVA_Build 19 47110072 1I GCCCCGCCTA -/C CCCCTGGACA 2366 hom 45 het 17 0 12 5 C 4 5 261909 CASAVA_Build 19 47117487 6D GAGAGAAGAG AGAGAC/------ AGAGACAGAG 2366 het 2366 ref 26 11 9 6 AGAGAC 2 1 261910 CASAVA_Build 19 47128078 1D TCACCCCCAC T/- TTTACTGATG 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 T 4 3 261911 CASAVA_Build 19 47130324 2I ACACACACAC --/AA AATCTGTTTG 3070 het 3070 ref 55 27 18 10 A 2 4 261912 CASAVA_Build 19 47131104 6I GCCAGAGGCG ------/CTGACC CTGACCCAAG 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 CTGACC 1 2 261913 CASAVA_Build 19 47132822 4D CTGTGTGCCG TGTC/---- TGTCTGTCTG 3070 het 3070 hom 49 17 20 14 TGTC 4 3 261914 CASAVA_Build 19 47137577 1D TAACCACAAG C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 C 8 7 261915 CASAVA_Build 19 47147070 1D CTGGATAATA T/- TTTTTTTTTT 1550 het 1405 hom 17 9 6 2 T 18 17 261916 CASAVA_Build 19 47156608 19D TCTCAAACTC CTGGACTCAAGCGATCCTT/------------------- CTGCCTGGCC 1934 het 1934 ref 20 14 6 1 CTGGACTCAAGCGATCCTT 1 0 261917 CASAVA_Build 19 47161394 1I CAGATGCAAC -/T TTTTTTTTTT 399 het 399 ref 29 13 2 15 T 15 16 261918 CASAVA_Build 19 47171047 1D GGCTTGAGAA T/- TTTTTTTTTT 1323 het 1323 ref 16 8 4 4 T 15 14 261919 CASAVA_Build 19 47183311 2D CCTGCATTGC TG/-- TGTGTGTGTG 1300 het 1300 ref 55 39 3 15 TG 7 6 261920 CASAVA_Build 19 47206059 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 274 hom 21 1 11 9 A 17 16 261921 CASAVA_Build 19 47322435 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1138 het 1138 ref 18 7 4 7 A 15 16 261922 CASAVA_Build 19 47342651 1D TAAGGGAAGG C/- CCCCCCATTC 3070 hom 110 het 40 0 35 6 C 7 6 261923 CASAVA_Build 19 47534960 1I CCGAGTAGAT -/A GGATTACAGG 2452 hom 15 het 6 0 6 0 A 0 1 261924 CASAVA_Build 19 47599615 1I AATTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 1590 het 1590 ref 16 6 5 5 T 10 11 261925 CASAVA_Build 19 47627607 1I CTCTACATCA -/T TTTTTTTTTC 1535 het 1535 ref 18 12 4 2 T 9 10 261926 CASAVA_Build 19 47679570 1I TTCATGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3059 hom 29 9 13 7 A 12 13 261927 CASAVA_Build 19 47811866 2I CTACCCATTT --/TC TCTAAAACTC 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 TC 1 2 261928 CASAVA_Build 19 47823113 2D GCCCTCCTAG GT/-- GTGTTTTCTC 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 GT 3 2 261929 CASAVA_Build 19 47838614 1I AGAAATTTTC -/A GGCACTATCC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 0 1 261930 CASAVA_Build 19 47839054 7D TCCAGTGACT TCTCTTA/------- TCTACAGGAT 3070 het 3070 ref 38 18 16 8 TCTCTTA 1 0 261931 CASAVA_Build 19 47839736 2D TCCATCTCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 13 11 261932 CASAVA_Build 19 47856179 1D TTTCCTCCAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 9 8 261933 CASAVA_Build 19 47858709 1D TACCAACACA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 9 8 261934 CASAVA_Build 19 47861979 1D AATTTGAATC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 T 8 7 261935 CASAVA_Build 19 47879394 1D AATCTGGCCG C/- CCCCACCCTA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 C 5 4 261936 CASAVA_Build 19 47887038 2I GCAAATATTA --/TG TCTCATTCTG 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 TG 0 1 261937 CASAVA_Build 19 47896698 1D15M2D ACTCCCTCTC AAAAAAAAAATAAAATAA/-AAAAAAAAATAAAAT-- AAAAAAAAAA 2248 het 2210 hom 16 10 5 7 N/A 0 0 261938 CASAVA_Build 19 47897411 1D ACTTTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 11 10 261939 CASAVA_Build 19 47919789 1D GGAGAAAGGG A/- ACTGCAGGAA 3070 het 3070 ref 46 29 12 5 A 2 1 261940 CASAVA_Build 19 47922310 3D AATTTAAAAA AAG/--- ACGTTAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 9 6 AAG 1 0 261941 CASAVA_Build 19 47947477 6D GAGAGGAGAA AGAGAG/------ AGAGAGCTTA 1867 het 1867 ref 25 16 6 4 AG 6 3 261942 CASAVA_Build 19 47948934 10D TGAGATGTTA TGTAAAAGTT/---------- TGGGTTGAGA 501 het 501 ref 39 24 3 16 TGTAAAAGTT 1 0 261943 CASAVA_Build 19 47959981 1D GTAAGGTGTA G/- GATCCTGCGT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 2 1 261944 CASAVA_Build 19 47961055 1I ATTCTGGTTC -/A CTGTGACTTT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 0 1 261945 CASAVA_Build 19 47978271 1I ATGTGTTACC -/T CTTTTTTCAT 3070 het 1769 hom 12 4 7 1 T 0 1 261946 CASAVA_Build 19 47995488 1D GATGTATTTG T/- TTATGTGCAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 3 2 261947 CASAVA_Build 19 48008793 3D TGGCTGCGTT GTG/--- GTATATAATC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 GTG 1 0 261948 CASAVA_Build 19 48093641 1I CATGCCTTAT -/C CCCTTTAATC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 C 3 4 261949 CASAVA_Build 19 48138691 1D TGTATAGCCT G/- GCTTTTCCTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 2 1 261950 CASAVA_Build 19 48143201 1I CACCATATAC -/A AAAAAATGAA 2322 het 2322 ref 36 26 6 4 A 6 7 261951 CASAVA_Build 19 48168539 1I GCCACAATGC -/G GAGCCTCCAT 2327 het 2327 ref 31 16 8 7 G 1 2 261952 CASAVA_Build 19 48170245 1D AAAGGTTGAC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 T 8 7 261953 CASAVA_Build 19 48207896 1I TCTCTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 1979 het 1979 ref 19 7 6 6 A 13 14 261954 CASAVA_Build 19 48222481 1D CTCTTCCCGG T/- GGAAGGAGCA 3070 hom 48 het 18 0 16 3 T 1 0 261955 CASAVA_Build 19 48236012 4D ACACACAGAC ACAG/---- ACACACACAA 2130 het 2130 ref 29 20 8 1 ACAG 1 0 261956 CASAVA_Build 19 48251489 1I ATTGGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 12 13 261957 CASAVA_Build 19 48253319 2I TTGATGGGCT --/TG TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 TG 0 1 261958 CASAVA_Build 19 48255364 1D TCTGCCTCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 10 9 261959 CASAVA_Build 19 48259098 1I ACCTGAGGTC -/G GGAGTTCAAG 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 G 2 3 261960 CASAVA_Build 19 48267339 1D TAGGTACAAG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 2719 hom 28 8 15 6 A 8 7 261961 CASAVA_Build 19 48272819 1I GGATTTCTAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 7 8 261962 CASAVA_Build 19 48272950 1I GTTGAGTTTT -/G GAGCATTTCA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 G 1 2 261963 CASAVA_Build 19 48277830 1D ACCCTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 1499 het 1499 ref 16 8 4 4 T 11 10 261964 CASAVA_Build 19 48284047 2D CTAGGTTATG AT/-- TATAGACCAA 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 AT 1 0 261965 CASAVA_Build 19 48285712 1D TCAGATTAAA C/- ATTTACAAAC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 C 1 0 261966 CASAVA_Build 19 48290299 2I GCAACAAAAA --/AG GATAAATTGG 3070 het 3070 ref 29 20 7 2 AG 0 1 261967 CASAVA_Build 19 48292088 4D ACACACAGAC ACAG/---- ACACACACAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 6 ACAG 1 0 261968 CASAVA_Build 19 48308470 1D CTAAGCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2153 hom 23 5 9 9 T 12 11 261969 CASAVA_Build 19 48312162 1I ATGCTAACCC -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 22 11 10 2 A 6 7 261970 CASAVA_Build 19 48312475 1D GCACCCAGCC A/- AAAAAAATTT 2745 het 2745 ref 19 9 8 3 A 8 7 261971 CASAVA_Build 19 48314039 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 A 7 8 261972 CASAVA_Build 19 48317126 3D TGGTAGTGGG GGT/--- GGGGGGTGTA 3070 het 3070 ref 31 13 11 9 GGT 1 0 261973 CASAVA_Build 19 48326323 10I TTTAGGGAAA ----------/CATGAAAGGG AAGGTAGGCA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 CATGAAAGGG 0 1 261974 CASAVA_Build 19 48330323 5D AGCCAATCTT AAATG/----- AATCCTCAGA 3070 het 3070 ref 27 13 14 3 AAATG 1 0 261975 CASAVA_Build 19 48336670 1I GCCTCCTAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 9 10 261976 CASAVA_Build 19 48349974 1D CCACATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 13 12 261977 CASAVA_Build 19 48358885 1D TCTGCCTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 11 10 261978 CASAVA_Build 19 48366246 1D AAGTACTACA T/- TATTCCTCTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 2 1 261979 CASAVA_Build 19 48373933 1D TGACCTTTTT G/- GTTAAACTTA 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 G 2 1 261980 CASAVA_Build 19 48374821 1I CCTCTGGCCA -/T TGTGTATTTG 884 het 884 ref 40 32 3 5 T 1 2 261981 CASAVA_Build 19 48376798 2I CTCCTTAAGT --/AG AGAGAGTCCC 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 AG 3 4 261982 CASAVA_Build 19 48379919 1I TTTCATGCTA -/T CTGTGAATAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 0 1 261983 CASAVA_Build 19 48385163 8D ACATTGTGGT TGTATTGC/-------- TGTTGCCTCA 1167 het 1167 ref 20 15 3 4 TGTATTGC 1 0 261984 CASAVA_Build 19 48386354 4D TTCTGTGCCT ATTA/---- ATTATTTTCT 3070 het 3070 hom 43 16 21 7 ATTA 2 1 261985 CASAVA_Build 19 48396380 8D CAAAATTTAA AAATTGCT/-------- ATTGTCAAAA 1374 het 1374 ref 22 15 3 5 AAATTGCT 1 0 261986 CASAVA_Build 19 48396576 1I TCTAACAGCA -/T TTTTTTTTCT 1334 het 1334 ref 14 7 3 5 T 8 9 261987 CASAVA_Build 19 48400819 1D CTGGATGTTT C/- TTTTTCCCCC 1452 het 1452 ref 22 15 4 5 C 1 0 261988 CASAVA_Build 19 48405725 3I TGGTTATCTA ---/GTT GTTTCTGCAC 1575 het 1575 ref 18 14 4 0 GTT 1 2 261989 CASAVA_Build 19 48406238 1I CAATGTTGTT -/G GGGGAGTTGT 3070 het 1964 hom 23 7 12 4 G 4 5 261990 CASAVA_Build 19 48408707 1D TCTTTTAAAA T/- TTTTCTTTGC 3020 het 2585 hom 20 8 7 5 T 5 4 261991 CASAVA_Build 19 48414028 1D AGAACCCAAT A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 7 6 261992 CASAVA_Build 19 48415070 1D ATAGTAGGAT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 35 10 19 7 A 8 7 261993 CASAVA_Build 19 48415629 12I CTCATGGAGT ------------/ACACACACACAG ACACACACAC 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 ACACACACACAG 0 1 261994 CASAVA_Build 19 48422363 4D TGTGTATGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 718 hom 22 4 12 6 TA 8 6 261995 CASAVA_Build 19 48427888 1D ACCTTGGCAT C/- TTTTTAATCT 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 C 1 0 261996 CASAVA_Build 19 48433846 1D CATAATGAAA G/- GTTTGCCTTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 G 2 1 261997 CASAVA_Build 19 48435209 13I TCTTTTTGTG -------------/ACTGGTTTATTTT ACTTAGCATA 3070 het 3070 ref 24 16 9 1 ACTGGTTTATTTT 0 1 261998 CASAVA_Build 19 48436906 3D TCATGTTCTG TTC/--- TTCTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 16 8 2 TTC 2 1 261999 CASAVA_Build 19 48450925 1D ACAAAAAAAT A/- AAAAAAAATT 2329 het 1621 hom 17 7 8 2 A 9 8 262000 CASAVA_Build 19 48457271 1I CAGACATAGA -/C CCCTCTATAT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 C 3 4 262001 CASAVA_Build 19 48462943 2D TTAAATGATT CA/-- CAGTCACCTG 2140 het 2140 ref 41 33 5 5 CA 2 1 262002 CASAVA_Build 19 48476248 4I TGTCACTGCC ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 CCTT 2 3 262003 CASAVA_Build 19 48479070 2I GAGTACACAC --/AG ACACAGACAC 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 AG 0 1 262004 CASAVA_Build 19 48481270 1I CTGCATTATT -/A TTTTTTTTTT 1744 het 1744 ref 43 21 7 15 A 0 1 262005 CASAVA_Build 19 48482680 1D AGTCATGTGG C/- CCCCCACTCA 3062 het 3062 ref 28 17 8 3 C 6 5 262006 CASAVA_Build 19 48484176 2D ATATACACAC AT/-- ATATATGTGT 3070 het 3070 ref 37 15 20 3 AT 4 3 262007 CASAVA_Build 19 48484387 5I GCTACATGTG -----/TCAAT TCCTGTTGGA 3070 hom 65 het 26 0 22 4 TCAAT 0 1 262008 CASAVA_Build 19 48488933 1D AAAGAGTTGC T/- TGTGTATATA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 2 1 262009 CASAVA_Build 19 48491747 18D AATCTAGCAA TTTTAACCAAGTAGTATG/------------------ TTTGGTAACT 3070 het 3070 ref 34 22 11 5 TTTTAACCAAGTAGTATG 1 0 262010 CASAVA_Build 19 48492495 1D ATAAAAACTC A/- AAAACAATGA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 5 4 262011 CASAVA_Build 19 48502212 1I GTGAACATGG -/A GGGAAATTTG 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 A 0 1 262012 CASAVA_Build 19 48503120 1D TGTAAATAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 5 A 10 9 262013 CASAVA_Build 19 48528100 2I CACAAAAAAC --/AG AGGGCCACTC 3070 hom 58 het 22 0 18 4 AG 1 2 262014 CASAVA_Build 19 48542314 1I CCACATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 10 11 262015 CASAVA_Build 19 48546460 1I CAGCTTCCAG -/T TTTTTTTTTT 2062 het 2062 ref 38 23 7 8 T 12 13 262016 CASAVA_Build 19 48548120 1D CTCTGTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 32 0 25 8 A 15 14 262017 CASAVA_Build 19 48561850 1D CACTTGCTGG C/- CTCAGACCTG 3070 het 3070 ref 48 26 18 5 C 2 1 262018 CASAVA_Build 19 48563933 2D TTTTCATCTC TG/-- TGTCTCCCTG 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 TG 2 1 262019 CASAVA_Build 19 48568820 1D AGGCCCCCAG C/- CCCACCTCCC 1912 het 767 hom 19 5 8 8 C 4 3 262020 CASAVA_Build 19 48586794 1I CAGTGGCAGG -/A AGTACATTTA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 1 2 262021 CASAVA_Build 19 48593448 4D ACACATCATC CTTT/---- GTTTTCAACT 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 CTTT 1 0 262022 CASAVA_Build 19 48593571 1D TTTCCTCTGG T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 T 7 6 262023 CASAVA_Build 19 48603476 1D AAACTTCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1652 hom 22 7 10 7 A 14 13 262024 CASAVA_Build 19 48616204 2D ATTTTCTTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2348 het 2071 hom 33 13 10 11 A 17 15 262025 CASAVA_Build 19 48617043 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 11 12 262026 CASAVA_Build 19 48623252 1D TCAGGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2922 het 2922 ref 38 21 8 9 A 15 14 262027 CASAVA_Build 19 48637738 1D ACTACATCTC A/- AAAAAAAAAA 596 het 596 ref 40 30 4 6 A 15 14 262028 CASAVA_Build 19 48653460 1D ACAAAAAAAA G/- CATTGGAAGC 2879 het 1456 hom 12 5 6 1 G 1 0 262029 CASAVA_Build 19 48653926 1D TCACCTTCCT G/- GGGGGAGATA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 G 6 5 262030 CASAVA_Build 19 48678095 2D GAACCCATTA AT/-- GTTCCTGCTA 3070 het 3070 ref 46 21 15 11 AT 1 0 262031 CASAVA_Build 19 48694437 4D AGAGAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAAGG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AAAG 2 1 262032 CASAVA_Build 19 48698995 8D CACTAGATCT GTCCACTA/-------- GAATCACTAG 3070 het 3070 ref 41 22 16 6 GTCCACTA 1 0 262033 CASAVA_Build 19 48708741 1I TGATAGAAAA -/G AAAAACCCAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 G 0 1 262034 CASAVA_Build 19 48723877 1I ACCTTGTCCT -/A CCCAAAGTGC 2678 het 1715 hom 16 5 9 2 A 0 1 262035 CASAVA_Build 19 48739154 7D GAGGGTCAGA TTCCCAG/------- TTCCCTGCCT 3070 het 3070 ref 28 13 10 7 TTCCCAG 1 0 262036 CASAVA_Build 19 48743188 1D CCCCTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1324 hom 24 6 10 8 T 11 10 262037 CASAVA_Build 19 48746277 1D TTAAGGGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 27 0 18 10 A 12 11 262038 CASAVA_Build 19 48750443 1I TTCCTAGATT -/C CCTCCGGGAG 3070 hom 90 het 39 0 30 9 C 2 3 262039 CASAVA_Build 19 48754327 1D ACCTCGTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 317 hom 19 1 13 5 A 10 9 262040 CASAVA_Build 19 48760789 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 10 11 262041 CASAVA_Build 19 48764970 1I CAAAAAGCTT -/A AAAAAAAAAA 975 het 450 hom 20 3 5 12 A 17 18 262042 CASAVA_Build 19 48766837 1D AATGTCTGCC T/- TTATCAGTTA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 3 2 262043 CASAVA_Build 19 48772900 4I AACAACAATG ----/GGCC GGCCGTGGGA 3070 hom 77 het 31 0 23 8 GGCC 1 2 262044 CASAVA_Build 19 48780215 11I ATCACATGCT -----------/GTGACCCAGAA GTGACATAAT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 GTGACCCAGAA 0 1 262045 CASAVA_Build 19 48795482 1D ATCTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 1194 het 1194 ref 29 21 3 6 A 12 11 262046 CASAVA_Build 19 48805353 18I GTGGCCATGG ------------------/AGAGAGAGAGAGAGAGAA AGAGAGAGAG 3070 hom 39 het 29 0 17 12 AGAGAGAGAGAGAGAGAA 0 1 262047 CASAVA_Build 19 48824427 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2402 hom 23 5 13 7 A 11 12 262048 CASAVA_Build 19 48845616 4D AAGGGAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAG 1244 het 1244 ref 15 9 5 1 AAAG 3 2 262049 CASAVA_Build 19 48846011 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2277 het 1313 hom 13 5 6 2 T 11 10 262050 CASAVA_Build 19 48851093 1I CATGGTGAAA -/C CCCCCATCTC 3070 het 2312 hom 18 7 11 0 C 5 6 262051 CASAVA_Build 19 48865108 1I AACACCCTGT -/G GGCCACCCGC 1073 het 683 hom 9 4 4 1 G 2 3 262052 CASAVA_Build 19 48872123 10D CACATGTGTT TGTGTGCATG/---------- TGTGTGCATG 3070 hom 96 het 58 0 30 34 TGTGTGCATG 2 1 262053 CASAVA_Build 19 48874394 1I GTCTCTACTT -/A TAAAAAAATA 2539 het 1205 hom 9 3 6 0 A 0 1 262054 CASAVA_Build 19 48881190 1I CCAGGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 1421 het 14 hom 10 1 6 3 T 15 16 262055 CASAVA_Build 19 48887474 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 22 10 A 12 10 262056 CASAVA_Build 19 48896180 3D AAGAGGGCTG TTC/--- TTCTTCCTCA 3070 het 3070 ref 34 14 13 8 TTC 3 2 262057 CASAVA_Build 19 48900185 3D ACCTTGACCT CAG/--- CTTTCCCATT 3070 het 3070 ref 59 34 18 8 CAG 1 0 262058 CASAVA_Build 19 48905573 28D TATTCTTTTG TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA/---------------------------- TTTATTTATT 3070 het 1014 hom 13 3 10 1 TTTA 10 3 262059 CASAVA_Build 19 48907615 1D CACTGAAGTC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 8 7 262060 CASAVA_Build 19 48910947 3I CTCTCTCCTT ---/CTC AGTTGTTCTC 3070 hom 96 het 39 0 31 8 CTC 0 1 262061 CASAVA_Build 19 48974239 1D CTATTGTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 11 10 262062 CASAVA_Build 19 48979075 2I GGCACACACA --/TG ATTACCCACT 3070 hom 73 het 30 0 15 15 TG 0 1 262063 CASAVA_Build 19 48980164 4I GCCACTAAAT ----/AGAG AGCGCTCCAG 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 AG 1 3 262064 CASAVA_Build 19 48980467 2D CAGTGATGGG GT/-- TACAGTGGGA 3070 het 3070 ref 49 26 22 1 GT 1 0 262065 CASAVA_Build 19 48981835 1D ATTAAAAAAC A/- TTTTTTTGGT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 1 0 262066 CASAVA_Build 19 48982283 4D CACTGACTTT ATTC/---- ATTCATTCAT 3070 hom 96 het 48 0 33 15 ATTC 6 5 262067 CASAVA_Build 19 48982743 1I GAGGCTTAGG -/T TGAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 1 2 262068 CASAVA_Build 19 48984110 1I TCATATAATA -/T TATAAATATA 1129 hom 10 het 6 0 4 2 T 1 2 262069 CASAVA_Build 19 48985994 16I2M5I TGACCTAAGA ----------------CA-----/TTGTTTTCTTTTTGTTCAGGTAT GACTTACACA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 N/A 0 0 262070 CASAVA_Build 19 48996956 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1588 het 28 hom 14 1 6 7 A 16 14 262071 CASAVA_Build 19 48999603 4I AGGTTTCTTC ----/CTGA CTCTCGGCCC 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 CTGA 0 1 262072 CASAVA_Build 19 49000356 35D GCAGACTCAG GAATAACTCCATGTGATGGACACATCCCATTGACA/----------------------------------- GAATAACTCC 2931 het 2931 ref 41 24 10 13 GAATAACTCCATGTGATGGACACATCCCATTGACA 1 0 262073 CASAVA_Build 19 49001906 1I TGTATTCATG -/T TTTTGTACAA 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 T 4 5 262074 CASAVA_Build 19 49007275 1I AGATTGAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 9 10 262075 CASAVA_Build 19 49019570 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 217 hom 21 2 15 4 A 18 17 262076 CASAVA_Build 19 49022491 2I27M4D CTCACACACC --CACACACACACACACGCAAACACACAGGAGA/CACACACACACACACACGCAAACACACAG---- GAGAGAGAGG 3070 het 3070 hom 42 24 20 7 N/A 0 0 262077 CASAVA_Build 19 49035227 1D TGGTTGACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 10 9 262078 CASAVA_Build 19 49048314 3I ATCTGTTGCA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 40 0 30 10 T 9 12 262079 CASAVA_Build 19 49056077 3I CAAATAGAAT ---/ACA ACAATACATC 3070 het 3070 hom 43 18 24 1 ACA 1 2 262080 CASAVA_Build 19 49057571 2D TTTATCTAAC AG/-- GGGATTAATA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 AG 1 0 262081 CASAVA_Build 19 49067792 4D TGATATATGT AATA/---- TATACATATA 3070 het 3070 hom 41 17 21 6 AATA 1 0 262082 CASAVA_Build 19 49070454 2I CTCTATATAA --/TT TTGTCAGTGG 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 2 4 262083 CASAVA_Build 19 49086566 8D ACTGGTCAAA TAATAAAT/-------- CAATGGAAGC 3070 het 3070 ref 42 21 18 8 TAATAAAT 1 0 262084 CASAVA_Build 19 49090377 1D GATTTCATTC T/- TTTTTATGGT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 6 5 262085 CASAVA_Build 19 49094842 2I AGGTGAATTC --/AT AGAGACAGAA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AT 0 1 262086 CASAVA_Build 19 49100990 1D ACTAAATAAC T/- TTTTTTTTTT 2223 het 311 hom 32 5 8 19 T 17 16 262087 CASAVA_Build 19 49103723 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAACT 458 het 458 ref 32 19 2 11 AC 1 0 262088 CASAVA_Build 19 49107897 1I TCCACTCCTA -/G ATATTTACTA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 0 1 262089 CASAVA_Build 19 49113487 2D TTTTTATTTA TT/-- TTTTTTGAGA 3070 het 3007 hom 19 7 12 0 T 8 6 262090 CASAVA_Build 19 49120884 4D CTGGCAGCTT AAAC/---- AATCAATAGA 3070 het 3070 hom 45 17 23 7 AAAC 1 0 262091 CASAVA_Build 19 49127545 2I AAATGTATAC --/AT ATATATATAT 1765 het 1765 ref 22 12 7 3 AT 6 7 262092 CASAVA_Build 19 49130513 1D TTCCTCCTCT C/- CCGCAGCATT 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 C 3 2 262093 CASAVA_Build 19 49131709 2D TGCGAATATG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 100 hom 31 2 15 15 A 11 9 262094 CASAVA_Build 19 49134932 1D TGACACAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 18 2 9 7 T 13 12 262095 CASAVA_Build 19 49138354 2I ATGTTATCAC --/AT GTGTCAGAAT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 AT 0 1 262096 CASAVA_Build 19 49139183 5I CTTTATGTAG -----/TTAAA TTAGACACTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TTAAA 0 1 262097 CASAVA_Build 19 49139337 1D TTTTATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 295 hom 33 1 20 12 T 15 14 262098 CASAVA_Build 19 49141640 1I AAGGGCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 A 10 11 262099 CASAVA_Build 19 49143535 1I ATTTTGATCC -/T GTGGGTGTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 1 262100 CASAVA_Build 19 49144555 2D ATCATTTTAT TG/-- TGATTCTTAG 3070 het 3070 ref 40 19 13 9 TG 2 1 262101 CASAVA_Build 19 49152508 2D53M2I TTATCCTCTC TTATGCGAAACACTGAGAGTCAGCAGGAGGGGATTGAGCCAAAGGACCCTGGCTC--/--ATGCGAAACACTGAGAGTCAGCAGGAGGGGATTGAGCCAAAGGACCCTGGCTCTT TTGTCAATCT 3070 hom 132 het 38 0 44 8 N/A 0 0 262102 CASAVA_Build 19 49154982 1D TTTTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 41 3 12 26 T 12 11 262103 CASAVA_Build 19 49160617 3D GGGCAATTGG CAA/--- CAACACACTA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 CAA 2 1 262104 CASAVA_Build 19 49166195 5I CTTGACTGTT -----/AAAAG AAAAACAGGC 3070 hom 45 het 27 0 19 8 AAAAG 0 1 262105 CASAVA_Build 19 49167638 4D CAACAAAGAT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 25 2 20 5 A 15 11 262106 CASAVA_Build 19 49170224 2D CCTTCCTTAC AA/-- ACATTATACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 1 262107 CASAVA_Build 19 49170622 2D GACAAACATG AA/-- AAAAAAGCTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 8 6 262108 CASAVA_Build 19 49170722 4D AAAAAGTAAA AAAG/---- AAGCCATTTG 3070 hom 66 het 24 0 23 4 AAAG 1 0 262109 CASAVA_Build 19 49174167 3D TCCCAACTCT AAG/--- AAGAAGAGCA 3070 hom 133 het 54 0 44 12 AAG 3 2 262110 CASAVA_Build 19 49180444 1D TCGGGGGTTC G/- GGGGGGGCGG 2456 het 118 hom 16 2 10 4 G 8 7 262111 CASAVA_Build 19 49194384 7D ATAAGAGAGA CTGTTAC/------- AGAGAGACTG 3070 hom 105 het 38 0 36 4 CTGTTAC 1 0 262112 CASAVA_Build 19 49195382 1D GACAGACCTT A/- AGAGTTCATT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 2 1 262113 CASAVA_Build 19 49195970 2I TATATATGTG --/TA TATATATATG 1356 hom 12 het 7 0 5 2 TA 4 5 262114 CASAVA_Build 19 49197757 2D GAAGAAACTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 A 11 9 262115 CASAVA_Build 19 49201114 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 735 hom 19 2 10 7 A 13 14 262116 CASAVA_Build 19 49202043 1I AACATGGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 33 2 23 8 T 10 11 262117 CASAVA_Build 19 49205495 1D CTGCCTCTTG A/- CTACATCTGT 3070 hom 95 het 37 0 29 9 A 1 0 262118 CASAVA_Build 19 49205629 2D TAAACAACAC TT/-- TTGTTCTTTC 3070 het 3070 hom 53 20 24 9 T 4 2 262119 CASAVA_Build 19 49211409 1I TCAAAAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 91 het 38 0 32 6 A 9 10 262120 CASAVA_Build 19 49213141 1D ACGGGGTTTC T/- ACTATGTTGG 633 hom 7 het 11 0 3 8 T 1 0 262121 CASAVA_Build 19 49213231 1D AGGTGTGAGC T/- CACTGCACCC 3070 hom 48 het 21 0 17 5 T 1 0 262122 CASAVA_Build 19 49213547 1D GCATGGTGTG A/- TAATATGCCA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 1 0 262123 CASAVA_Build 19 49222285 2D TGGGCGTGAG AC/-- ACAGGTGGAG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 AC 2 1 262124 CASAVA_Build 19 49222521 2D CTATTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 2825 hom 39 het 15 0 12 3 TC 7 6 262125 CASAVA_Build 19 49224402 1D CTGCCTCCGA C/- GCCCTCACTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 0 262126 CASAVA_Build 19 49230580 1I TTGATCATAT -/A AGCCTCACTG 3070 hom 135 het 49 0 44 5 A 1 2 262127 CASAVA_Build 19 49238902 2I GAGAAACCCC --/CT GAGTCTTCCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CT 0 1 262128 CASAVA_Build 19 49239363 1I CATCATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 498 hom 41 2 21 18 T 13 14 262129 CASAVA_Build 19 49240063 1D TTGCTGGCCA G/- GGTGTGGTGG 3070 hom 41 het 16 0 14 2 G 3 2 262130 CASAVA_Build 19 49241797 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 19 0 13 6 A 18 16 262131 CASAVA_Build 19 49243974 4I TGATTGACAT ----/ACTC AATAATATAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 ACTC 0 1 262132 CASAVA_Build 19 49245856 1I ACTCTGTATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 365 hom 20 1 18 1 A 9 10 262133 CASAVA_Build 19 49265540 1D TGTAATGTCC T/- TCCAATTCCA 3070 hom 114 het 48 0 39 9 T 2 1 262134 CASAVA_Build 19 49272812 1D TTGATGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 41 2 28 11 T 15 14 262135 CASAVA_Build 19 49276296 1D GGCAGATATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 34 0 25 10 A 10 9 262136 CASAVA_Build 19 49281840 3D GCTCTCAGTT CTC/--- CACACAAGGT 3070 hom 150 het 56 0 50 7 CTC 1 0 262137 CASAVA_Build 19 49283869 1D CAAACGATTC T/- TCCCTGCCTT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 T 2 1 262138 CASAVA_Build 19 49284262 2D GTGTGAAAAC AT/-- GTGGTATTTA 3070 hom 72 het 29 0 25 7 AT 1 0 262139 CASAVA_Build 19 49287000 1D CCAAACAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 12 11 262140 CASAVA_Build 19 49287107 3I GCTCCCACTT ---/CCC CATTTCGAAA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 1 4 262141 CASAVA_Build 19 49287525 15I AGAGCATGAA ---------------/AACACCATACAGCAT TTCTTCTAGT 3070 hom 108 het 34 0 35 3 AACACCATACAGCAT 0 1 262142 CASAVA_Build 19 49287697 1D AACAAACAAA C/- AAAAAACAAC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 1 0 262143 CASAVA_Build 19 49289704 1D TAAAAAAAAA C/- GTTTTTGTTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 0 262144 CASAVA_Build 19 49301528 5I AGTAGTCTTT -----/TTTTA TTTTATTAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 TTTTA 1 2 262145 CASAVA_Build 19 49302120 3D ACATTCACAC CAG/--- CAGCAGTGTA 3070 hom 123 het 43 0 42 4 CAG 3 2 262146 CASAVA_Build 19 49306754 1D ATTGCAGGTG C/- CCCGCCACCG 2784 hom 27 het 11 0 10 1 C 4 3 262147 CASAVA_Build 19 49312964 1D ACCCAAAATG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 48 het 21 0 17 6 T 9 8 262148 CASAVA_Build 19 49316897 1D CATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1765 hom 27 het 14 0 7 7 T 12 11 262149 CASAVA_Build 19 49335210 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 1797 het 1001 hom 21 7 6 8 T 9 10 262150 CASAVA_Build 19 49364241 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 13 8 T 11 10 262151 CASAVA_Build 19 49369316 4D GCCACATTGT CCTC/---- CCTCTTGCTT 3070 het 3070 ref 38 23 15 0 CCTC 2 1 262152 CASAVA_Build 19 49380573 1I AGACTCCATT -/A AAAAAAAAAA 2908 het 1431 hom 21 6 10 5 A 13 14 262153 CASAVA_Build 19 49382881 2I TTTTTTTTTT --/TA AATCATGAAA 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 TA 0 1 262154 CASAVA_Build 19 49403434 1I CGGTTTCCCC -/G TGGGGCATTC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 G 0 1 262155 CASAVA_Build 19 49407195 15D AACTCTGTCT AACAACAACAACAAC/--------------- AACAACAACA 2784 het 2784 ref 32 13 9 13 AAC 9 4 262156 CASAVA_Build 19 49411448 1I ATATGTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 13 14 262157 CASAVA_Build 19 49412680 1I TTCGTTTGTG -/T CTTTATCTTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 0 1 262158 CASAVA_Build 19 49437269 1D AAATGTTATT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 2453 hom 37 12 17 9 G 2 1 262159 CASAVA_Build 19 49463542 1I TATATACATG -/T TTTTTTTTTT 2728 het 1045 hom 19 3 8 8 T 13 14 262160 CASAVA_Build 19 49476470 1I AGAAAAAAAA -/G GGGGGGGTGG 2299 het 1960 hom 24 10 7 7 G 7 8 262161 CASAVA_Build 19 49478079 2D GGGAAATAAC TT/-- TAAATAATCA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 3 1 262162 CASAVA_Build 19 49489944 1D TGTCTACACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 A 13 12 262163 CASAVA_Build 19 49491441 1I TAGATGACAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 8 9 262164 CASAVA_Build 19 49509168 1D CACGGTGAAA C/- CCCATCTGTA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 4 3 262165 CASAVA_Build 19 49513391 10I TGGATTTCTC ----------/TGATGATTAG TGATATTGAT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 TGATGATTAG 0 1 262166 CASAVA_Build 19 49514201 10D TTTTCTTTTT TTAAATTAAA/---------- TTAAATTAAA 2124 het 2124 ref 18 6 5 8 TTAAA 6 4 262167 CASAVA_Build 19 49514846 2D ATCCTGCAAC AT/-- TACTCAATTT 3070 het 3070 hom 30 15 14 2 AT 1 0 262168 CASAVA_Build 19 49517772 3D TGGATGATAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1639 hom 46 12 14 23 T 15 12 262169 CASAVA_Build 19 49536092 1D AAATATAATG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 7 6 262170 CASAVA_Build 19 49539321 1D GGGTAATACG A/- AAGAAGCCAT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 3 2 262171 CASAVA_Build 19 49540308 5D TCAAGGTTTG TTACT/----- TTACTTTACT 3070 het 3070 hom 40 9 21 11 TTACT 3 2 262172 CASAVA_Build 19 49549628 1D AAACAATAAC A/- AAAAAAGAAA 1844 het 1844 ref 37 29 5 4 A 7 6 262173 CASAVA_Build 19 49549708 2D TGGCTAAAAT AA/-- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 51 32 14 5 A 9 7 262174 CASAVA_Build 19 49549892 1D AAATAAGCAC A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 8 7 262175 CASAVA_Build 19 49553826 5D TGTCTTATGG AGGAC/----- AGGATGATTC 2294 het 2294 ref 42 35 5 5 AGGAC 1 0 262176 CASAVA_Build 19 49558015 1I GGCATAGAAC -/T TTTTTCAGAA 2827 het 2827 ref 30 23 6 1 T 5 6 262177 CASAVA_Build 19 49558333 1I ACATTGAGAA -/T ATTTTTTAAT 1809 het 1809 ref 41 31 4 6 T 0 1 262178 CASAVA_Build 19 49562334 1D ATATTGCTCC T/- TTTTTTTCCA 1327 het 1327 ref 31 28 3 0 T 8 7 262179 CASAVA_Build 19 49565073 3D GTAGCATCAC CTT/--- CTCCTTAGTG 1701 het 1701 ref 62 52 4 7 CTT 1 0 262180 CASAVA_Build 19 49565853 1D CCTGATTTCT C/- CCTAAAATGT 2488 het 2488 ref 56 43 6 7 C 3 2 262181 CASAVA_Build 19 49573609 1D TGGGATAGGC A/- AAAAAAAGAT 2450 het 2450 ref 39 28 6 5 A 8 7 262182 CASAVA_Build 19 49574750 3D TGGGTATGGT GGC/--- GGCTCACGCC 1291 het 1291 ref 30 22 3 6 GGC 2 1 262183 CASAVA_Build 19 49577172 4D GTTCCCTAAC GCGT/---- ACGCACCTTT 960 het 960 ref 44 39 3 4 GCGT 1 0 262184 CASAVA_Build 19 49577751 1I ACAAGGGAAA -/T TTTTGGGGTA 3070 het 3070 ref 46 29 10 7 T 4 5 262185 CASAVA_Build 19 49577909 2I GCTGTTATTA --/TG TGCTTCTATG 1526 het 1526 ref 39 29 4 6 TG 1 2 262186 CASAVA_Build 19 49584718 2D ATTTTATGTA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 44 11 25 9 GT 6 5 262187 CASAVA_Build 19 49584817 3D34M1I CAGAAACAAG CAACAAGTCCTATCTCCTGATGGCTTCCCTTCCTTCA-/---TAAGTCCTATCTCCTGATGGCTTCCCTTCCTTCAC ATCACTGTCA 3070 het 3070 hom 59 14 12 41 N/A 0 0 262188 CASAVA_Build 19 49584960 1I GGATTGAAAT -/A GGGGTAAACA 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 0 1 262189 CASAVA_Build 19 49586204 1D CTGACAGCTT G/- CACTGGGTGC 3070 hom 77 het 32 0 23 9 G 1 0 262190 CASAVA_Build 19 49590416 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 10 262191 CASAVA_Build 19 49592897 2D AAATTTCCGT AA/-- AAGTTTCTGA 3070 het 596 hom 39 3 30 6 A 4 2 262192 CASAVA_Build 19 49593084 1I CATTATGAGC -/A AGATAAAGTA 2980 het 2980 ref 53 43 7 4 A 1 2 262193 CASAVA_Build 19 49597980 1I CCCGCCCCCC -/A CCATGTTTTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 0 1 262194 CASAVA_Build 19 49600342 1I CTCTTTATTA -/T TATAGTTATT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 1 2 262195 CASAVA_Build 19 49600808 1D TCATCCATTC A/- AAATACCCAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 4 3 262196 CASAVA_Build 19 49601915 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 14 1 A 14 12 262197 CASAVA_Build 19 49605443 4D GCCAGGCTGC GCCA/---- GCCCGAGGCT 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 GCCA 1 0 262198 CASAVA_Build 19 49606922 3D CATGTCTTCA CCC/--- CCAGCCCTTA 837 het 837 ref 75 51 9 16 C 5 2 262199 CASAVA_Build 19 49611190 1I CAAAAGAATG -/T TTCCTACAAC 2588 het 2588 ref 41 29 7 7 T 2 3 262200 CASAVA_Build 19 49611751 12I TCTCTGTCTG ------------/TCTGTCTGTCTC TCTGTCTCAT 1813 het 1813 ref 58 30 6 22 TCTGTCTGTCTC 0 1 262201 CASAVA_Build 19 49613850 1D CGGCCTAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1885 hom 16 5 9 3 T 9 8 262202 CASAVA_Build 19 49619074 1D GTTTATTGAG A/- TTTTTTTTTA 3070 het 4 hom 30 2 23 5 A 1 0 262203 CASAVA_Build 19 49619123 4D GGCCTTTCTT CATC/---- TATTGAGATA 3070 het 3070 ref 26 10 8 8 CATC 1 0 262204 CASAVA_Build 19 49623251 1D GTTTCTACAA C/- CCCCCCCCCC 2043 het 61 hom 25 2 7 16 C 11 10 262205 CASAVA_Build 19 49623511 2D TATCAGTGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 32 3 14 18 A 12 10 262206 CASAVA_Build 19 49636751 1D ACCAACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2305 hom 41 10 16 15 T 14 13 262207 CASAVA_Build 19 49637952 3I GCTGTCTGCT ---/AGA AGAATAATCA 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 AGA 1 2 262208 CASAVA_Build 19 49638149 1D27M1I ATATGTTTTT CCTTTTTTTAACTTTGTGCATGGTATAC-/-CTTTTTTTAACTTTGTGCATGGTATACT TTTTGGTAGG 3070 het 3070 ref 42 28 17 10 N/A 0 0 262209 CASAVA_Build 19 49642891 1D CTATCAGGTG A/- AACATACGTG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 3 2 262210 CASAVA_Build 19 49643305 3D GCGTTTCTTC CCT/--- AGCATGGCGC 3070 het 3070 hom 42 20 22 1 CCT 1 0 262211 CASAVA_Build 19 49650874 1D ACATAATTAT G/- CACAACACTA 3070 het 3070 ref 52 34 11 8 G 1 0 262212 CASAVA_Build 19 49653485 3I CCTAAGGGCT ---/GGC GGTGAAGACA 1076 het 1076 ref 79 66 5 8 GGC 0 1 262213 CASAVA_Build 19 49655526 1D GCCCTCCCCC T/- GACCCTGATG 3070 het 405 hom 35 2 29 4 T 1 0 262214 CASAVA_Build 19 49656750 2D CGTCTCTACT AA/-- AAAAAAAAAA 2133 hom 18 het 8 0 7 1 A 13 11 262215 CASAVA_Build 19 49656922 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 49 het 19 0 17 2 A 9 8 262216 CASAVA_Build 19 49657823 1D ACTTGATACA G/- GCAGGTAGTG 3070 het 908 hom 39 8 24 7 G 2 1 262217 CASAVA_Build 19 49658315 1D GAAAAAGAGT C/- CAAGGATTTA 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 C 2 1 262218 CASAVA_Build 19 49659030 1D GAGGCCATGA C/- CTTTGGTCAA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 C 2 1 262219 CASAVA_Build 19 49660749 1I AGCAAGACAG -/A ACCAATAGGA 2622 het 2622 ref 44 33 6 5 A 1 2 262220 CASAVA_Build 19 49667031 2D GTATTATTTA TT/-- TACACACACA 2980 het 2980 ref 39 28 7 4 T 3 1 262221 CASAVA_Build 19 49675569 1D TTGGTGACCT G/- GGGAGTTGTC 3070 het 3070 hom 46 13 28 5 G 4 3 262222 CASAVA_Build 19 49679742 1I CCTCAACCTC -/A CTGTTCCTAT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 0 1 262223 CASAVA_Build 19 49682258 1I GAAGAACATT -/A TACAGAAGAT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 0 1 262224 CASAVA_Build 19 49698597 3I ACAAAAAAGC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 31 0 23 8 A 11 14 262225 CASAVA_Build 19 49698965 1I GGCAAAACTC -/T TGTGTCTACT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 2 262226 CASAVA_Build 19 49699139 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 5 A 12 11 262227 CASAVA_Build 19 49705254 2D CAACGAAATT AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 10 8 262228 CASAVA_Build 19 49708831 1D ACTGGGGTCC T/- TCTGTTGTTT 3070 hom 96 het 36 0 30 6 T 2 1 262229 CASAVA_Build 19 49713318 1D ACAAGGGCCA G/- GGCATGGTGG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 G 3 2 262230 CASAVA_Build 19 49717307 4D ATATGTGATC TTGT/---- TTGTTGTGTA 3070 het 3070 hom 62 27 30 6 TTGT 2 1 262231 CASAVA_Build 19 49726145 1I ATTCTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 1309 het 1309 ref 28 10 3 15 T 13 14 262232 CASAVA_Build 19 49727221 3D ATTAAAATAA AAT/--- AATAAAGCAG 3070 het 3070 hom 45 17 25 5 AAT 2 1 262233 CASAVA_Build 19 49728201 1I AAATTAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 9 262234 CASAVA_Build 19 49729764 1D ATCTCTACAT A/- AGATCAAAGT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 2 1 262235 CASAVA_Build 19 49730492 1D TTCACTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1920 hom 23 6 12 5 A 12 11 262236 CASAVA_Build 19 49732401 2I AAGAACCCCT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 AC 8 9 262237 CASAVA_Build 19 49743415 1D AAAAAAAGAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 6 A 8 7 262238 CASAVA_Build 19 49753027 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 12 11 262239 CASAVA_Build 19 49753960 1D AATAAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 11 10 A 11 10 262240 CASAVA_Build 19 49774806 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 9 A 11 10 262241 CASAVA_Build 19 49792515 4D CTTTTTCTTC CTAT/---- CTATCTCTCT 3070 het 139 hom 24 1 13 10 CTAT 2 1 262242 CASAVA_Build 19 49792921 1I CAACTATTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 8 9 262243 CASAVA_Build 19 49799111 1I TGCAGAGAGA -/G GGGGGTCCCA 2328 het 2328 ref 20 10 8 2 G 5 6 262244 CASAVA_Build 19 49811062 1I TCCTGGGGGC -/G GGGAGGGTGG 1769 het 456 hom 7 1 6 0 G 3 4 262245 CASAVA_Build 19 49811846 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1257 het 347 hom 13 4 3 8 A 17 15 262246 CASAVA_Build 19 49819361 3D CTCCTTCTTT TCC/--- TCCTCCTCCT 1220 het 1220 ref 24 10 5 11 TCC 6 5 262247 CASAVA_Build 19 49827983 1I GTCCCATAAT -/C CCTGTTTCTC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 2 3 262248 CASAVA_Build 19 49839359 1I TCTGGCTCCC -/A GCTCCGCATC 3070 hom 42 het 16 0 14 5 A 0 1 262249 CASAVA_Build 19 49839860 1D33M1D TCTTTCATTC TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTCACTCCAT/-TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTCACTCCA- TCACCCAGGC 3070 het 10 hom 28 1 15 15 N/A 0 0 262250 CASAVA_Build 19 49841726 1D AAACAAAAAT A/- ACAAAAAATT 3070 hom 45 het 19 0 14 5 A 2 1 262251 CASAVA_Build 19 49841958 1D TGAAATGTAC T/- ATAGTGCCAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 1 0 262252 CASAVA_Build 19 49842058 1D GATGTTGAGA T/- TTCAGGGAAA 3070 hom 60 het 24 0 20 6 T 3 2 262253 CASAVA_Build 19 49845674 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1889 het 990 hom 23 7 7 9 T 19 18 262254 CASAVA_Build 19 49847000 2I AGGCACGGTG --/GC TCACGCCTGT 3070 hom 60 het 26 0 19 7 GC 0 1 262255 CASAVA_Build 19 49848954 1I ATCCCGCGTA -/G CCCCAGGCCC 3070 hom 66 het 26 0 20 6 G 0 1 262256 CASAVA_Build 19 49855281 1I CATGACTGTG -/T CCCCAGGACC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 0 1 262257 CASAVA_Build 19 49861750 1D TGCACTCCAG A/- CTTGGGCGAC 3070 hom 87 het 30 0 30 1 A 1 0 262258 CASAVA_Build 19 49862413 1I CCTGGCACCG -/C CTGCCTCAGA 3070 hom 114 het 41 0 37 4 C 1 2 262259 CASAVA_Build 19 49880461 2I TGAGTGTGAG --/AA AGAGTCCATG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 1 3 262260 CASAVA_Build 19 49899885 1D AACAACAAAC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 A 8 7 262261 CASAVA_Build 19 49900402 1D GCTTTGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 11 10 262262 CASAVA_Build 19 49907830 1I TTTGAAAATG -/T CAATGAAATA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 0 1 262263 CASAVA_Build 19 49909966 1I GGAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 15 22 12 A 9 10 262264 CASAVA_Build 19 49940487 1I GCAAGGAGCC -/G GGGGGAGGGT 1899 het 747 hom 16 3 6 7 G 5 6 262265 CASAVA_Build 19 49945383 4I TCCCCTCGCC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 TTTG 2 3 262266 CASAVA_Build 19 49945452 5D CTGGAGTGCA TTGGC/----- GTGATCTCGG 2621 het 1733 hom 14 4 6 4 TTGGC 1 0 262267 CASAVA_Build 19 49951646 1I AGGAGGGCTG -/C GGTCCTGGGC 2137 het 1034 hom 14 4 8 2 C 0 1 262268 CASAVA_Build 19 49954805 4D TCTCACTCTG CCCC/---- CCCCCCCCAT 3070 het 181 hom 19 2 10 7 C 12 8 262269 CASAVA_Build 19 49957622 1D ATCAAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2994 hom 27 10 8 9 T 13 12 262270 CASAVA_Build 19 49959291 1D GAGGGAGGGA G/- AGATTATTTC 3070 het 160 hom 27 2 19 7 G 1 0 262271 CASAVA_Build 19 49992852 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1274 het 1274 ref 17 7 3 7 A 12 11 262272 CASAVA_Build 19 49993020 1I AAATTTTTTG -/C AGCAGTGAGG 3070 het 2971 hom 29 13 10 6 C 0 1 262273 CASAVA_Build 19 49993295 4D GCTGGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 18 14 11 TTTG 5 4 262274 CASAVA_Build 19 50015011 17D AATCCACAGC CATCCCCAACTCATCCT/----------------- CATCCCCAAC 3070 hom 48 het 18 0 15 5 CATCCCCAACTCATCCT 1 0 262275 CASAVA_Build 19 50020248 2D CAGTCAAGTG AC/-- ACACACAAAG 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 AC 4 3 262276 CASAVA_Build 19 50030091 1D ATTTTTTATA T/- TTTTAGTAGA 1929 het 452 hom 7 1 5 1 T 5 4 262277 CASAVA_Build 19 50059110 1I TCAGAGGATT -/C CCCCCCCCCC 1600 het 15 hom 15 0 6 9 C 10 11 262278 CASAVA_Build 19 50063300 1D TCTCTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2433 hom 25 7 14 4 A 11 10 262279 CASAVA_Build 19 50073146 8D CCCCACCCCC CTCCTCCT/-------- CCTCCTCCAT 1865 het 1865 ref 17 7 6 5 CTCCTCCT 1 0 262280 CASAVA_Build 19 50092325 1I TAGAGAAACT -/G GGGGGGGTGG 1162 het 1162 ref 29 18 5 6 G 7 8 262281 CASAVA_Build 19 50096646 24D ATCCTGGCTA ACACGGTGAAACTCCGTCTCTACT/------------------------ AAAAATACAA 3022 het 2876 hom 14 8 9 1 ACACGGTGAAACTCCGTCTCTACT 1 0 262282 CASAVA_Build 19 50104763 1D CACCACCACA C/- CCGGCTAATT 3070 het 2258 hom 16 7 9 0 C 3 2 262283 CASAVA_Build 19 50105065 2D GGATTAATTT GG/-- GGGGGGGGGT 1420 het 548 hom 21 5 5 12 G 11 9 262284 CASAVA_Build 19 50112066 1D GTCTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 1229 het 1229 ref 25 12 5 8 A 17 16 262285 CASAVA_Build 19 50131986 2D GTGATCTGCC TG/-- TGTCAGCCTC 3070 het 2618 hom 22 9 10 4 TG 2 1 262286 CASAVA_Build 19 50135758 5I GTTGTTGTTA -----/TTGTT TTGTTTTTGA 3070 het 2280 hom 20 5 8 7 TTGTT 1 2 262287 CASAVA_Build 19 50136468 3D TCACGCCATT CTC/--- CTGCCTCAGC 2588 het 461 hom 7 1 6 0 CTC 1 0 262288 CASAVA_Build 19 50137701 3D GTATGCAGTC GTG/--- GTAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 54 27 22 7 GTG 1 0 262289 CASAVA_Build 19 50144535 1I GGACTCAAGG -/T GCCAAGATGG 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 0 1 262290 CASAVA_Build 19 50144698 5D CGGCTTTCTC TCTTT/----- TATTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 TCTTT 1 0 262291 CASAVA_Build 19 50146126 1D CTCCGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 16 7 A 12 11 262292 CASAVA_Build 19 50147524 1I CATTTTGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 33 0 27 11 T 11 12 262293 CASAVA_Build 19 50152390 4D AAGCCCTCTT TGAC/---- TGTCTGGGCT 3070 het 3070 hom 34 12 13 12 TGAC 1 0 262294 CASAVA_Build 19 50157204 1D TTGTTCACCG A/- AAACATTCAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 4 3 262295 CASAVA_Build 19 50159629 5D GCTGGTCTCT AACTC/----- CTGACCTCAG 2393 hom 7 het 10 0 6 5 AACTC 1 0 262296 CASAVA_Build 19 50161517 4I CAAAAATAAA ----/AAAT AAAGTGTAAT 3070 hom 93 het 32 0 30 2 AAAT 0 1 262297 CASAVA_Build 19 50161764 1D CTCACAGACA G/- GGAATCTTGA 3070 hom 89 het 35 0 29 6 G 3 2 262298 CASAVA_Build 19 50163734 1D GATACACACA G/- GACGTTCTTC 3070 hom 108 het 41 0 33 9 G 2 1 262299 CASAVA_Build 19 50165553 11D CTGGAGTGCA GTGGCATGATC/----------- GTGGTTCACT 2140 het 2140 ref 17 10 5 4 GTGGCATGATC 1 0 262300 CASAVA_Build 19 50169069 1I ACCTTTTTGG -/C TACGCTGGTC 2923 hom 24 het 10 0 7 5 C 0 1 262301 CASAVA_Build 19 50169751 1D CTGAAGGACC T/- TTTCCTCCAG 3070 hom 79 het 33 0 23 11 T 4 3 262302 CASAVA_Build 19 50170155 4I GAGGAAACTG ----/AGAC AGAGAGAAGG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AGAC 0 1 262303 CASAVA_Build 19 50179745 1D GCTGCGGGAT G/- GCCATGATCA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 2 1 262304 CASAVA_Build 19 50181389 1I CTTGAGCCCA -/G GAATTCGAGA 3070 hom 72 het 26 0 23 3 G 1 2 262305 CASAVA_Build 19 50186088 1I TCTCCAGGTA -/C CCACGTATCC 3070 hom 74 het 30 0 23 7 C 2 3 262306 CASAVA_Build 19 50186190 1D ATAACTGCTT C/- CCTGGGCGAG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 3 2 262307 CASAVA_Build 19 50188539 1D GAGTGACCTG A/- CACGGTACGG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 1 0 262308 CASAVA_Build 19 50190757 4D GCCTGCGTAA TTAT/---- TTATTTATTT 1774 het 1774 ref 10 5 4 1 TTAT 4 3 262309 CASAVA_Build 19 50221652 1I AAAAAACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 44 het 20 0 14 6 A 9 10 262310 CASAVA_Build 19 50251242 4D CTCCAGAAAC AGTG/---- AGAATGGTGG 3070 het 3070 hom 41 18 20 7 AGTG 1 0 262311 CASAVA_Build 19 50255055 12D AGTGCAGAGG CCTGGGCCAGCC/------------ CCTGGGCCAC 3070 hom 93 het 32 0 32 3 CCTGGGCCAGCC 1 0 262312 CASAVA_Build 19 50263741 2I AGCTCCGCTG --/CC CCGCTATGCT 3070 het 3070 hom 35 15 11 9 C 2 4 262313 CASAVA_Build 19 50287312 1D GGGGGGGGGG A/- ACGGAGTCTT 400 het 58 hom 20 1 7 12 A 2 1 262314 CASAVA_Build 19 50295887 1D GGGCCCAGCC T/- TGGTGGGCAC 3070 hom 70 het 31 0 14 18 T 2 1 262315 CASAVA_Build 19 50296821 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAGGAGG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 5 6 262316 CASAVA_Build 19 50299770 1I CACATCACAC -/T TTGTGACCTC 3070 hom 105 het 39 0 34 5 T 2 3 262317 CASAVA_Build 19 50309869 1D ACAAGTGAGA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 22 het 20 0 12 8 C 11 10 262318 CASAVA_Build 19 50324248 1I TTTTATTTTG -/T TTTTTCCCAC 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 5 6 262319 CASAVA_Build 19 50346187 1D GAGGGAAAGT G/- GGGGAGCCCT 3070 het 3070 ref 33 14 12 8 G 5 4 262320 CASAVA_Build 19 50357089 2I CTGGGACCCC --/CT GTCTCCTCCC 1959 hom 35 het 15 0 9 6 CT 0 1 262321 CASAVA_Build 19 50373748 3I ACGCTCACTC ---/AAA AAAGCTGATG 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 3 6 262322 CASAVA_Build 19 50383130 2I CAATTACACA --/TT TTTTTTTTTG 1370 het 1370 ref 21 9 4 9 T 9 11 262323 CASAVA_Build 19 50385673 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 2392 hom 23 8 12 3 T 8 7 262324 CASAVA_Build 19 50388109 1I CACACGCGTG -/T TAATCCCAGC 3070 het 3070 hom 24 13 11 0 T 1 2 262325 CASAVA_Build 19 50391299 1D TAATTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3008 hom 22 7 13 2 T 9 8 262326 CASAVA_Build 19 50392598 2I AACAACCACC --/AA AAAAAAAAAG 2445 het 2445 ref 23 11 7 5 A 9 11 262327 CASAVA_Build 19 50394408 18D TGCCTTATTC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTGAG 1615 het 1615 ref 20 11 5 4 T 25 7 262328 CASAVA_Build 19 50403288 2D GCCAAGCTGG TC/-- TCGAACTCCT 2636 het 1558 hom 11 4 7 0 TC 2 1 262329 CASAVA_Build 19 50404144 1D TACAGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 10 9 262330 CASAVA_Build 19 50405329 4D GAGTATGAGG TTTC/---- TTTATTTAAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 TTTC 1 0 262331 CASAVA_Build 19 50436893 2I CTCAGGCTCC --/CA CAGTCCCTGG 3070 hom 96 het 36 0 29 7 CA 1 2 262332 CASAVA_Build 19 50442845 1I TAGCTGGGAC -/T GCAGGCGCTT 2169 hom 12 het 5 0 5 0 T 0 1 262333 CASAVA_Build 19 50450996 2I TGAAAGGGAG --/AC ACAGTCCCTG 3070 hom 74 het 29 0 22 7 AC 1 2 262334 CASAVA_Build 19 50457032 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 26 1 16 11 A 13 12 262335 CASAVA_Build 19 50468232 1D TGTTGCTTGC T/- TTTTTTTTTT 1856 het 1856 ref 39 26 4 10 T 11 10 262336 CASAVA_Build 19 50493420 11D TGGATGTGAG GGTCTGTGCGT/----------- GGGGTCTGGT 3070 hom 75 het 26 0 25 4 GGTCTGTGCGT 1 0 262337 CASAVA_Build 19 50498003 1D GGGGCTCAGC G/- GGGGGAGCTG 3070 hom 47 het 22 0 13 9 G 6 5 262338 CASAVA_Build 19 50531094 13I CTCCAGCAAT -------------/CCTCCTGCCTCAG CCTCCTGAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CCTCCTGCCTCAG 0 1 262339 CASAVA_Build 19 50533527 1D AGACTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 24 0 18 6 A 13 12 262340 CASAVA_Build 19 50538939 4D TTATGCTGTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 120 het 47 0 40 7 CTTT 4 3 262341 CASAVA_Build 19 50546344 5D AACACTTGCC CCTCA/----- CCTCCCCTCC 3070 hom 63 het 22 0 17 8 CCTCA 1 0 262342 CASAVA_Build 19 50550913 1D TGTTCTAAGC T/- TTTTTTTTTT 1235 het 661 hom 24 5 8 11 T 19 18 262343 CASAVA_Build 19 50560889 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 6 A 11 10 262344 CASAVA_Build 19 50561246 5I CCAAAACTAA -----/TATTT TATTTTATTT 1894 hom 15 het 8 0 6 2 TATTT 2 3 262345 CASAVA_Build 19 50565964 4D CTGCCAAGAT TGTC/---- TGAGTATTGA 3070 hom 57 het 20 0 20 1 TGTC 1 0 262346 CASAVA_Build 19 50570812 2D TGCTCGGCTA TT/-- TTTTTTTTTA 1480 hom 12 het 6 0 5 1 T 11 9 262347 CASAVA_Build 19 50572021 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2952 het 184 hom 23 2 12 9 A 19 18 262348 CASAVA_Build 19 50596899 1D GTCAGACTTC A/- AAAATTCAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 5 4 262349 CASAVA_Build 19 50603160 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 10 9 262350 CASAVA_Build 19 50606442 1D GAACCTCAAC T/- TTTCAGTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 4 3 262351 CASAVA_Build 19 50606545 21D CACATCCTCG CCACCATTTGTTATTGCCTGT/--------------------- CCACCATTTG 3070 hom 51 het 22 0 18 7 CCACCATTTGTTATTGCCTGT 2 1 262352 CASAVA_Build 19 50621052 1I TTTTACTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 31 0 26 5 T 10 11 262353 CASAVA_Build 19 50629427 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1062 hom 27 3 17 7 A 14 15 262354 CASAVA_Build 19 50637433 2D AAAAAGAAAA AG/-- AAAAAAAGTT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 AG 1 0 262355 CASAVA_Build 19 50646480 4I CCACCAGGGG ----/AGAC AGACAGACAG 3070 hom 54 het 30 0 16 14 AGAC 3 4 262356 CASAVA_Build 19 50648415 7D GTCTCAAAAG AAAAACA/------- AAAAACAAAA 3070 het 3 hom 16 1 13 3 AAAAACA 2 1 262357 CASAVA_Build 19 50650169 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 13 1 12 0 T 10 11 262358 CASAVA_Build 19 50657425 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 55 het 23 0 18 5 T 8 9 262359 CASAVA_Build 19 50658489 2I CTGTGAGTGC --/GG AGGTGTGTGT 3070 het 58 hom 31 1 22 8 G 0 2 262360 CASAVA_Build 19 50659364 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 28 1 17 11 A 18 16 262361 CASAVA_Build 19 50659817 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 120 het 51 0 41 10 TA 6 5 262362 CASAVA_Build 19 50661382 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACGTC 3070 het 333 hom 22 1 17 4 C 0 1 262363 CASAVA_Build 19 50663198 1I TTCATTAATC -/T TTTTTTTTTC 2333 hom 21 het 11 0 8 3 T 9 10 262364 CASAVA_Build 19 50668687 1D CAGAAGTGAG C/- CCCCCCCTTA 3070 hom 53 het 20 0 16 4 C 8 7 262365 CASAVA_Build 19 50671472 1I TAATTCACTC -/A AAAAAAATGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 262366 CASAVA_Build 19 50671957 2D CTACTAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 13 0 11 3 AT 8 7 262367 CASAVA_Build 19 50672143 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAAAGAA 2263 hom 35 het 21 0 13 8 AG 0 1 262368 CASAVA_Build 19 50675023 2I CCTTCCCTGA --/CC TCCCAGTTTA 3070 hom 47 het 22 0 16 6 C 0 2 262369 CASAVA_Build 19 50691182 6I AGAGATTGTG ------/AGGATC AGGCTAGGCG 3070 hom 119 het 45 0 39 6 AGGATC 0 1 262370 CASAVA_Build 19 50698467 1D ATTTCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 1092 het 176 hom 26 4 6 16 T 17 16 262371 CASAVA_Build 19 50701079 1D TCCCAGCTAC T/- TTAGGAGGGT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 T 3 2 262372 CASAVA_Build 19 50728155 1I ATGCCCGGAT -/A ATTTTTGTAT 2582 hom 18 het 7 0 7 0 A 1 2 262373 CASAVA_Build 19 50737366 3I ATGACTGTGT ---/GGA GGAGGAGGGC 3070 hom 147 het 54 0 45 9 GGA 2 3 262374 CASAVA_Build 19 50761483 3D CCTGACCTCA GAT/--- GATAATACCC 2467 het 1411 hom 15 5 7 3 GAT 2 1 262375 CASAVA_Build 19 50766418 2D ATTTTTTGTA TT/-- TTTTTAGTAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 5 262376 CASAVA_Build 19 50767608 2D GATATATATC AT/-- ATATGAGATA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 AT 3 2 262377 CASAVA_Build 19 50807987 1I AACGTCCAGC -/T TTTTTTTTTT 2235 het 2235 ref 35 18 8 9 T 10 11 262378 CASAVA_Build 19 50846743 1I4M1I ATTAATACGG -TACC-/CTACCT CCTTGGAGTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 N/A 0 0 262379 CASAVA_Build 19 50849679 1I GGGAGGCTGA -/G GCAGGAGAAT 2938 hom 24 het 9 0 7 4 G 1 2 262380 CASAVA_Build 19 50849769 8D ACCCTGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAG 1678 hom 10 het 4 0 4 3 A 17 9 262381 CASAVA_Build 19 50855788 8I GTTTTGCTAA --------/ACATGGAG ACAAGACTAG 3070 hom 120 het 41 0 40 1 ACATGGAG 0 1 262382 CASAVA_Build 19 50863337 1D GACAAGGCAG T/- TGGAGGCAGC 1497 hom 21 het 9 0 5 4 T 2 1 262383 CASAVA_Build 19 50864237 1I GTCCAGACTT -/G CGGTGACACT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 G 0 1 262384 CASAVA_Build 19 50874872 1I ACTTGACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1264 hom 31 6 12 13 T 13 14 262385 CASAVA_Build 19 50884208 1I CTACAGCGTT -/C CCCCATCTGC 3070 het 3070 ref 48 24 13 11 C 4 5 262386 CASAVA_Build 19 50906131 1D CTTTTTTTTT G/- TCTGCCCCCC 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 G 1 0 262387 CASAVA_Build 19 50911799 1D TCACAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 43 2 34 8 A 12 11 262388 CASAVA_Build 19 50943055 2D AAAATTAGCC AG/-- CCATGGTCCC 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 AG 1 0 262389 CASAVA_Build 19 50946833 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 25 1 19 5 T 13 12 262390 CASAVA_Build 19 50947719 1D CCAAAGTGCT G/- GGATTATAGG 3070 het 3070 hom 40 10 21 9 G 3 2 262391 CASAVA_Build 19 50949143 5I TACAGTGACA -----/CATCT CAGCTCACTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CATCT 0 1 262392 CASAVA_Build 19 50983864 1D CCGCCTCTAC A/- AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 A 6 5 262393 CASAVA_Build 19 50997602 5D ACTCATTGAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1802 het 614 hom 24 5 6 13 T 21 16 262394 CASAVA_Build 19 51000800 4D AAAAAAAAAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 hom 94 het 36 0 32 5 AGAA 5 4 262395 CASAVA_Build 19 51005244 18D CCCATCTCAA TTATTTTTATTTATTTAT/------------------ TTATTTTTAT 2872 het 356 hom 20 1 10 10 TTATTTTTATTTATTTAT 2 1 262396 CASAVA_Build 19 51005346 1D CGGCTCACTG C/- CAAGCTCCGC 3070 hom 27 het 13 0 10 3 C 2 1 262397 CASAVA_Build 19 51014103 1I GTCTCTAAGG -/C GGGGGGGCGT 2601 het 26 hom 18 1 9 8 C 0 1 262398 CASAVA_Build 19 51019050 1D GCAGGGTGGC T/- TGCGGGGCAT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 2 1 262399 CASAVA_Build 19 51026985 1I AGGCTGGAGT -/A ACGGTGGTGC 3070 het 2923 hom 26 8 14 4 A 1 2 262400 CASAVA_Build 19 51040214 1I ATACTGGATC -/T TTTTTTTTTT 2749 het 2749 ref 26 14 8 4 T 11 12 262401 CASAVA_Build 19 51055593 4I CCACACACAC ----/ACAT AGAGAGAGAA 3070 hom 76 het 28 0 26 2 ACAT 0 1 262402 CASAVA_Build 19 51069511 1I CTTGTGTATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 9 10 262403 CASAVA_Build 19 51084235 2D TCAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 12 10 262404 CASAVA_Build 19 51088218 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 6 7 262405 CASAVA_Build 19 51092336 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 2904 hom 23 7 14 2 T 5 6 262406 CASAVA_Build 19 51100966 1I GAGAGCCACA -/G GCAGTGGGGT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 G 1 2 262407 CASAVA_Build 19 51101265 1I CTAATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2411 hom 30 8 13 9 T 10 11 262408 CASAVA_Build 19 51108106 2D CTGGGCGACA AC/-- AGCAAAACTC 582 het 582 ref 11 5 2 4 AC 1 0 262409 CASAVA_Build 19 51119528 1D TCTCTTGTTT A/- AAGTCACCCA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 3 2 262410 CASAVA_Build 19 51119802 1D TCGCTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1412 het 979 hom 22 7 5 10 T 17 16 262411 CASAVA_Build 19 51122797 1D GCAAGTGAGA T/- TATACATGCA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 2 1 262412 CASAVA_Build 19 51124555 2I ACAGAGGGAC --/AG AGGGGGGACA 3070 hom 49 het 36 0 14 22 AG 1 2 262413 CASAVA_Build 19 51125853 13I CAACTTCTCT -------------/GTCTTCTTTCTCC GTCTTCTTTC 2819 het 2819 ref 25 11 7 7 GTCTTCTTTCTCC 1 2 262414 CASAVA_Build 19 51146719 18D TCCGTTTCAA AAAAAAAAAAAAGAAAAG/------------------ AAAAAAAAAT 1935 het 496 hom 15 3 6 6 AAAAAAAAAAAAGAAAAG 1 0 262415 CASAVA_Build 19 51163048 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2592 het 2592 ref 28 17 10 1 A 12 11 262416 CASAVA_Build 19 51166217 2I CCTCATCTGT --/AA AAAGATGCTC 3070 het 3070 hom 58 22 28 8 A 3 5 262417 CASAVA_Build 19 51182762 1D GATTTTCTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 T 10 9 262418 CASAVA_Build 19 51188469 1D CCATGTTTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2265 hom 25 7 12 6 T 9 8 262419 CASAVA_Build 19 51188952 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 A 9 10 262420 CASAVA_Build 19 51200365 1I GCCTCGGCCT -/C CCCAAAGTGC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 3 4 262421 CASAVA_Build 19 51202152 1D ATGTGTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 9 11 T 13 12 262422 CASAVA_Build 19 51219422 1D TAAGGACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 25 6 A 11 10 262423 CASAVA_Build 19 51225206 1I ATTATATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 32 2 23 7 T 10 11 262424 CASAVA_Build 19 51232331 2I AGAAGGAAAA --/AG AAAAAAAAAG 3070 het 514 hom 39 2 27 10 AG 0 1 262425 CASAVA_Build 19 51236936 1D CCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1795 het 1052 hom 34 7 7 20 T 19 18 262426 CASAVA_Build 19 51237199 17D8M4I7M2I CCCAAAGTGC ATTGATTTTGTTGTTGTTGTGCTTA----TTTGCAC--/-----------------TGGGATTACAAGTGTGAACCA TCCAGCCTGG 3070 hom 96 het 28 0 30 7 N/A 0 0 262427 CASAVA_Build 19 51239991 4D GAATAGTGGC CTGA/---- CTGTTAAAAG 3070 het 3070 ref 39 15 14 12 CTGA 1 0 262428 CASAVA_Build 19 51242531 3D AGCAATAACT GAA/--- GGAGATAGAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 GAA 1 0 262429 CASAVA_Build 19 51259263 6I ATATTTATTC ------/TTATTT TTAATTTTAA 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 TTATTT 0 1 262430 CASAVA_Build 19 51260335 3I CATCATATGG ---/GTA GTTTGCAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 GTA 0 1 262431 CASAVA_Build 19 51270177 7D TTCAATAGTT TAAAGAA/------- TAATTTATTT 3070 het 3070 ref 27 11 9 11 TAAAGAA 1 0 262432 CASAVA_Build 19 51313994 1I TCAGGCTGTG -/C CCTGCCCTTG 3070 hom 123 het 47 0 37 10 C 2 3 262433 CASAVA_Build 19 51325177 3D ATAGTTAGGC CTT/--- CTTGTTGAAT 3070 het 3070 ref 48 23 19 9 CTT 2 1 262434 CASAVA_Build 19 51334441 1I TCAAAACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 12 13 262435 CASAVA_Build 19 51341252 1D AGAAGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 747 het 747 ref 46 36 3 7 T 11 10 262436 CASAVA_Build 19 51344237 12D GGGCAACCAT CTCTCTCTCTCC/------------ CTCTCTCTCT 1292 het 1292 ref 27 14 4 11 CTCTCTCTCTCC 1 0 262437 CASAVA_Build 19 51347364 1D CTTCCTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1570 hom 25 7 12 6 T 15 14 262438 CASAVA_Build 19 51356519 2I CAAAAGGCTG --/GA GAGAGTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 GA 2 3 262439 CASAVA_Build 19 51373380 1I CCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2814 hom 22 9 10 3 A 10 11 262440 CASAVA_Build 19 51376295 8D TGTTTTCTGT TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 30 8 17 7 TTTA 6 4 262441 CASAVA_Build 19 51383012 24D AGACGGTGAG CATTAACCCATTTATACCTGAGAT/------------------------ CGTGTTGCTG 3070 het 3070 ref 55 42 12 9 CATTAACCCATTTATACCTGAGAT 1 0 262442 CASAVA_Build 19 51397004 9D AGAGGAAATT GTTGGGCAG/--------- GTTGGGGAGG 3070 het 3070 ref 23 10 11 3 GTTGGGCAG 1 0 262443 CASAVA_Build 19 51404205 1I AGACTATAAG -/A ACCCAGAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 A 1 2 262444 CASAVA_Build 19 51404654 4I TTTATTAATC ----/CTTT CTTTCACTGC 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 CTTT 1 2 262445 CASAVA_Build 19 51407150 1D TCTTAATCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 T 10 9 262446 CASAVA_Build 19 51407729 3D TGGAATTTCT CCA/--- CCACCAGAAC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 CCA 3 2 262447 CASAVA_Build 19 51415064 1I TGGCAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 11 12 262448 CASAVA_Build 19 51419652 16D ATTATCCAGT TTCAGGTCATTCTTTA/---------------- TAGCACCATG 3070 het 3070 ref 47 26 22 3 TTCAGGTCATTCTTTA 1 0 262449 CASAVA_Build 19 51420583 1I GCAGAGGAGG -/A AAAAACCTTT 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 A 5 6 262450 CASAVA_Build 19 51470238 2D TGAGAACCAT AG/-- AGAGTGAGAT 2071 het 2071 ref 13 6 6 2 AG 3 2 262451 CASAVA_Build 19 51478586 1D ATTTTTTTTT C/- TTCTTCTTCT 3070 hom 40 het 15 0 14 1 C 1 0 262452 CASAVA_Build 19 51481187 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 6 7 262453 CASAVA_Build 19 51482791 3I ATCAGGTCTC ---/GTT GTCTTTATTG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 GTT 0 1 262454 CASAVA_Build 19 51485175 1D AAAAAGGGTT G/- GGGGGGTGCA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 7 6 262455 CASAVA_Build 19 51485424 1D AGCTGATAGG C/- AGCATCAACT 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 C 1 0 262456 CASAVA_Build 19 51486744 1D GAAGATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 18 11 A 11 10 262457 CASAVA_Build 19 51486977 12D CTATACATTT ATCCATCCCTCC/------------ ATCCATCCCT 3070 het 3070 ref 56 28 17 15 ATCCATCCCTCC 2 1 262458 CASAVA_Build 19 51487629 1D CAATACTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 16 24 11 T 10 9 262459 CASAVA_Build 19 51499308 1D CCTGGTGTCG T/- TTTTTTCGGC 1511 hom 17 het 8 0 5 3 T 7 6 262460 CASAVA_Build 19 51502197 1I TGTTCAGCAG -/T CTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 T 0 1 262461 CASAVA_Build 19 51509193 1D GGGTGATTAC A/- AAAAAACAGC 3070 het 3051 hom 29 8 18 3 A 7 6 262462 CASAVA_Build 19 51518141 1D GGGACAGTGG T/- TTTTTTTTTG 2858 het 2858 ref 25 12 9 4 T 10 9 262463 CASAVA_Build 19 51543038 1I ACCAGACATG -/A AAAAAAAAAA 1007 het 1007 ref 28 15 3 10 A 13 14 262464 CASAVA_Build 19 51545846 2D AGGCTCGGAG AA/-- GTGAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 8 21 7 A 2 0 262465 CASAVA_Build 19 51547917 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1396 het 56 hom 16 1 7 8 A 17 16 262466 CASAVA_Build 19 51550379 1D CCTGCCCCCC G/- ACACAGACAC 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 G 1 0 262467 CASAVA_Build 19 51566199 2I TCATGATGGA --/TC TGTCCCTCAC 3070 hom 120 het 41 0 38 3 TC 0 1 262468 CASAVA_Build 19 51567465 1I ACCTGGCTAG -/T CTTTTTGTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 4 T 0 1 262469 CASAVA_Build 19 51573987 1I AATCTTTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 32 1 22 9 T 11 12 262470 CASAVA_Build 19 51581071 1D TAAGAAACTT G/- GAAGTAGAGC 3070 het 58 hom 20 1 15 4 G 2 1 262471 CASAVA_Build 19 51587327 1I AACACCCTAA -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 44 het 18 0 15 3 C 8 9 262472 CASAVA_Build 19 51587458 1D TGGGGCTGGA G/- GCATCTGAAG 3070 het 3070 ref 30 11 10 11 G 2 1 262473 CASAVA_Build 19 51590908 1I TCCCCATATA -/T TTTTTCTAAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 5 6 262474 CASAVA_Build 19 51592599 1I GACAATAAAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 8 9 262475 CASAVA_Build 19 51594212 4D6M2D TGGACATATG CTGTCTGTGGTT/----CTGTGG-- TTTTTTTTTT 398 het 398 ref 16 8 2 7 N/A 0 0 262476 CASAVA_Build 19 51597296 28D GAAGGGAGGA AGGGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGG/---------------------------- AGGGAGGAAG 1988 het 1988 ref 20 6 5 11 AGGGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGG 1 0 262477 CASAVA_Build 19 51598091 1I TTCTTCAAAT -/A GTCACATTCC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 0 1 262478 CASAVA_Build 19 51598810 1I GCTCTGATTG -/C CCCTGGTTCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 3 4 262479 CASAVA_Build 19 51602970 2I CTTTTGAGTT --/TC TGTGTGATAA 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 TC 0 1 262480 CASAVA_Build 19 51605742 3I GTTGGCTCAA ---/GCC CTCTTTTTAA 3070 het 3070 hom 54 21 26 7 GCC 0 1 262481 CASAVA_Build 19 51612583 2D AAAAACGAGA AC/-- TGTAGCCTCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AC 1 0 262482 CASAVA_Build 19 51613194 3D TATTAATTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 10 0 8 2 T 13 10 262483 CASAVA_Build 19 51618251 4I ATGAGGATTA ----/AATT AATTGTTTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AATT 1 2 262484 CASAVA_Build 19 51619655 6D AAATAAGTAC ATAAAA/------ ATAAAAATAA 3070 hom 47 het 21 0 16 6 ATAAAA 2 1 262485 CASAVA_Build 19 51624290 1D GGAAGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 30 0 25 6 A 12 11 262486 CASAVA_Build 19 51630046 2I CTCAAAAAAA --/AG AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 27 1 23 3 AG 0 1 262487 CASAVA_Build 19 51631451 2D TTTTTTTAGT AG/-- AGACGGGGTT 1709 hom 10 het 4 0 4 0 AG 2 1 262488 CASAVA_Build 19 51632068 1D TGTTGGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 28 1 22 5 T 13 12 262489 CASAVA_Build 19 51638534 1D TGACTGTCCC A/- AGTCCTCATT 3070 hom 105 het 38 0 33 5 A 2 1 262490 CASAVA_Build 19 51640881 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 1038 het 179 hom 9 1 7 1 A 15 16 262491 CASAVA_Build 19 51641718 1D30M1D ATAACACTGT AAAAAAAAATAAAGAGAGAGAGAAAAATTCCT/-AAAAAAAATAAAGAGAGAGAGAAAAATTCC- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 30 0 28 6 N/A 0 0 262492 CASAVA_Build 19 51642434 20D CTGTGCTTGA CCTCCTGGGGCTCAAGCAAT/-------------------- CCTCCTGGGC 3070 hom 102 het 38 0 34 7 CCTCCTGGGGCTCAAGCAAT 1 0 262493 CASAVA_Build 19 51645259 2D AGCGAGACTC TG/-- TCTGAAAAAA 3070 het 122 hom 19 2 15 4 TG 1 0 262494 CASAVA_Build 19 51646542 4I ATTCATAGCC ----/CTAT CTGCCGATCC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CTAT 0 1 262495 CASAVA_Build 19 51648645 1D GCAACCTCCG C/- CTCCTGGGTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 2 1 262496 CASAVA_Build 19 51649511 2D TTCATAAAAT CC/-- CTCTCCCTCT 1589 het 247 hom 18 4 10 4 C 3 1 262497 CASAVA_Build 19 51651324 1I GTTTTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 36 1 34 1 T 10 11 262498 CASAVA_Build 19 51654287 1D TCCATCGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 10 7 T 12 11 262499 CASAVA_Build 19 51660363 1I CCCAATAAAT -/A AGAGCTTCAT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 1 2 262500 CASAVA_Build 19 51663082 6D TTCTTTTTCC CTAAAA/------ CTAACTCTTG 3070 het 3070 ref 47 26 18 6 CTAAAA 1 0 262501 CASAVA_Build 19 51669079 1D ACTGGAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1124 hom 30 6 12 12 T 11 10 262502 CASAVA_Build 19 51670711 1I TCTCACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 20 2 16 2 A 11 12 262503 CASAVA_Build 19 51674644 1I TACTAAAAAA -/C AAAATACAAA 2952 het 34 hom 11 1 8 2 C 0 1 262504 CASAVA_Build 19 51675917 2D TTTTTCTGAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 25 12 11 4 AC 6 5 262505 CASAVA_Build 19 51678406 2D AAAATATGTC TG/-- TTCATTCAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 TG 1 0 262506 CASAVA_Build 19 51679764 1D CCACCAATCA C/- GCCAACTCTG 2991 het 2991 ref 20 7 9 5 C 1 0 262507 CASAVA_Build 19 51680526 6D TCCGTCTCAA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 2412 hom 14 6 9 3 AAT 5 3 262508 CASAVA_Build 19 51682035 2I GAACAGAGGC --/GT GTCAATATTT 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 GT 1 2 262509 CASAVA_Build 19 51723777 1I TCCCAGGGCT -/C CCCAGAGCCT 2366 het 2366 ref 30 15 7 8 C 3 4 262510 CASAVA_Build 19 51738910 1I AGGCCAAGGC -/G GGCGGATCAC 1875 het 58 hom 7 2 5 0 G 2 3 262511 CASAVA_Build 19 51754941 1I ATGCTCAGCC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 95 het 39 0 30 9 A 8 9 262512 CASAVA_Build 19 51766012 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 12 4 A 12 11 262513 CASAVA_Build 19 51768902 1I TGGCCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 367 hom 24 1 20 3 A 9 10 262514 CASAVA_Build 19 51802960 1D TCATCATTTC A/- AGGGAGAAGT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 A 2 1 262515 CASAVA_Build 19 51810172 1I TATAATCTCA -/G GCTAGTCGAG 1568 het 1568 ref 15 7 4 4 G 1 2 262516 CASAVA_Build 19 51815709 1I ACCACCTGCA -/C CCCCCCCAGT 2200 het 2200 ref 24 8 8 8 C 7 8 262517 CASAVA_Build 19 51818078 1D TTTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 1695 het 955 hom 20 4 9 8 T 19 18 262518 CASAVA_Build 19 51821499 3I GTCCAAGGCC ---/AGG AGGAGGGATG 2366 het 2366 ref 22 9 8 5 AGG 2 3 262519 CASAVA_Build 19 51823219 2I TTCTCAGCAT --/TG TGATTGTGTT 3070 hom 135 het 51 0 44 7 TG 1 2 262520 CASAVA_Build 19 51833037 4I CCAACACAGA ----/CTGT CTGACACTCA 3070 het 3070 ref 55 30 19 6 CTGT 0 1 262521 CASAVA_Build 19 51836469 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1764 hom 18 5 12 1 A 12 11 262522 CASAVA_Build 19 51841976 4D ATAAACACTG CATA/---- CATATAGTTC 3070 het 3070 hom 25 8 17 2 CATA 2 1 262523 CASAVA_Build 19 51864669 3I ATCCTTTATC ---/ATT GAGACTGTTA 3070 hom 86 het 34 0 29 5 ATT 0 1 262524 CASAVA_Build 19 51865138 1D GTAATTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 15 0 10 5 A 13 12 262525 CASAVA_Build 19 51865834 4I TCCATCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAAC 3 4 262526 CASAVA_Build 19 51879127 6I ACCAGAAGCA ------/TAGAGT ATTGTACAAC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TAGAGT 0 1 262527 CASAVA_Build 19 51880060 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1635 hom 12 het 6 0 5 1 A 12 13 262528 CASAVA_Build 19 51895199 2I GCTGGGCCTG --/GT GGCGGGTGCC 1392 hom 18 het 7 0 5 2 GT 0 1 262529 CASAVA_Build 19 51900884 1I ACTCAGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2599 hom 20 het 11 0 7 5 A 13 14 262530 CASAVA_Build 19 51917631 1I GTTTTGGGGC -/T GGGGGAAGAG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 0 1 262531 CASAVA_Build 19 51922234 1I ATTTCAGCCC -/T AGCTGCCCAT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 T 0 1 262532 CASAVA_Build 19 51954819 1I ATCCCCCCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 79 het 33 0 25 8 A 9 10 262533 CASAVA_Build 19 51955819 1I GGGAGGCTGA -/G GGCGGGCAGA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 2 3 262534 CASAVA_Build 19 51964593 1I ATTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2007 het 52 hom 10 1 5 4 A 10 11 262535 CASAVA_Build 19 51965286 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTGAG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 1 0 262536 CASAVA_Build 19 51966136 4D GGGTATAACT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 87 het 36 0 29 12 AAAC 4 3 262537 CASAVA_Build 19 51967666 3D GTGATTCTCT CGC/--- CGCCTCAGCC 3070 hom 102 het 38 0 34 5 CGC 2 1 262538 CASAVA_Build 19 51967897 1I CAATATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 33 1 27 5 T 10 11 262539 CASAVA_Build 19 51968573 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 1452 hom 10 het 4 0 4 0 T 15 14 262540 CASAVA_Build 19 51971295 3D AATTCCAGAA TTT/--- TTTTTTTTTT 887 het 6 hom 16 0 6 10 T 21 18 262541 CASAVA_Build 19 51979027 3D GGTGGGAAAA GAG/--- GGGACAAAGT 3015 het 3015 ref 22 11 8 4 GAG 1 0 262542 CASAVA_Build 19 52000329 2D GCCTCCTGAG TA/-- TAGCTGTAAT 2647 hom 25 het 12 0 7 5 TA 2 1 262543 CASAVA_Build 19 52004601 1I ACGCTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 607 hom 22 2 16 4 A 10 11 262544 CASAVA_Build 19 52021834 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAGCA 2619 het 2619 ref 21 12 7 2 A 7 8 262545 CASAVA_Build 19 52023562 2D TATAGATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 12 16 7 TA 6 5 262546 CASAVA_Build 19 52023883 1D TATTTCTTCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 10 9 262547 CASAVA_Build 19 52026958 24I GCCAGGCTGG ------------------------/TCTTGAACTCCTGACCTTAGGTGA TCCACCCACC 3070 hom 66 het 26 0 18 8 TCTTGAACTCCTGACCTTAGGTGA 0 1 262548 CASAVA_Build 19 52044501 2D CCTTCCAAGA AC/-- TCCTGCTGAG 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 AC 1 0 262549 CASAVA_Build 19 52050686 1I ATAAAACTAC -/A AAAAAATCAG 1633 het 1633 ref 14 7 5 2 A 6 7 262550 CASAVA_Build 19 52057025 1D CCCGCATTTC T/- TGTCTGCCCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 1 262551 CASAVA_Build 19 52065680 1D AGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 A 12 11 262552 CASAVA_Build 19 52066270 2I TTTTAACAAC --/AG ATCTTTTCTA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 AG 0 1 262553 CASAVA_Build 19 52067071 2D AGTGAGACTC TT/-- TGTCTCACAC 3070 het 2507 hom 27 9 15 3 T 3 1 262554 CASAVA_Build 19 52082883 1D CATAAAGATC A/- CCTAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 1 0 262555 CASAVA_Build 19 52099461 1D ATCTTAGGAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 T 8 7 262556 CASAVA_Build 19 52103628 4D ATGCTAAATC AGTG/---- AGAAAGACTT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 AGTG 1 0 262557 CASAVA_Build 19 52121727 1D TTTTGGTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 10 13 A 11 10 262558 CASAVA_Build 19 52124105 3I TCCATTATTT ---/AAG AAGATTAGGG 3070 hom 119 het 46 0 38 8 AAG 1 2 262559 CASAVA_Build 19 52136917 1D TTGGCCTCCC A/- AAGTGCTGGG 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 3 2 262560 CASAVA_Build 19 52146548 1I TTTGATGGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 9 10 262561 CASAVA_Build 19 52148980 3D CCTCTGCGTC GTT/--- GTTAAACACT 3070 het 3070 hom 60 23 25 17 GTT 2 1 262562 CASAVA_Build 19 52154128 4I CGAAGTACAG ----/TTGT TTAAGTAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TTGT 0 1 262563 CASAVA_Build 19 52168119 1I TACCTGAGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 8 9 262564 CASAVA_Build 19 52170729 3I GGCCGTTCAC ---/AGA AGCCCATCAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AGA 0 1 262565 CASAVA_Build 19 52177574 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1997 hom 19 6 10 3 A 15 14 262566 CASAVA_Build 19 52180991 1D AAGTCTGGGA C/- CCCCAGAAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 5 4 262567 CASAVA_Build 19 52197805 1D AATTGGGGGT G/- GAGGGAAAGC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 G 2 1 262568 CASAVA_Build 19 52200302 1D CCAGCACGAG C/- CCCCCCTCCC 2733 het 1677 hom 21 6 9 6 C 7 6 262569 CASAVA_Build 19 52206484 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2249 het 2249 ref 16 7 6 3 A 11 12 262570 CASAVA_Build 19 52208080 4D ATACGACAGT GTGA/---- GTATCTGATT 3070 het 3070 ref 39 19 15 7 GTGA 1 0 262571 CASAVA_Build 19 52209001 1I GACCCTGCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 13 14 262572 CASAVA_Build 19 52219597 3I AAAAAGGAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AAC 5 6 262573 CASAVA_Build 19 52219907 1D TCCCTATTGC T/- TTTTTTTTTT 948 het 948 ref 32 11 3 18 T 17 16 262574 CASAVA_Build 19 52220014 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGACTCAGC 3070 hom 61 het 22 0 19 3 CTC 1 0 262575 CASAVA_Build 19 52223301 1D ATGACAGGGG A/- AAAATTGCGA 3070 hom 60 het 24 0 19 5 A 5 4 262576 CASAVA_Build 19 52239485 2I AAAACAAAAC --/AA AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 A 6 8 262577 CASAVA_Build 19 52248312 1I GTAGCAAGTT -/C CCTGGGGGAG 549 het 549 ref 12 4 2 6 C 2 3 262578 CASAVA_Build 19 52251531 1I AAAAAGAAAA -/G GAAAAAAAAC 3070 het 428 hom 14 3 8 3 G 1 2 262579 CASAVA_Build 19 52253657 1I ACAGCTGCCG -/T GCTCCCGGTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 0 1 262580 CASAVA_Build 19 52254882 5D CACCCTGCCG TTTTA/----- TTTTTTTAAT 2863 het 2863 ref 29 9 9 13 TTTTA 1 0 262581 CASAVA_Build 19 52271423 2D CGCGCGCGCG CA/-- CACACACACA 3070 hom 88 het 42 0 27 15 CA 10 9 262582 CASAVA_Build 19 52284803 1I GTTCCCTTCT -/C CCCCCCACAG 3070 het 2996 hom 30 10 11 9 C 6 7 262583 CASAVA_Build 19 52306741 1I AGTCTTCTCT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 7 8 262584 CASAVA_Build 19 52325464 1D CATCTCTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 31 3 12 17 A 17 16 262585 CASAVA_Build 19 52337618 3D TTTGAGCCAC CAT/--- CATCCTCCCT 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 CAT 2 1 262586 CASAVA_Build 19 52341147 1I ACAAGGAGGG -/T TTGTCAAGAT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 T 2 3 262587 CASAVA_Build 19 52356280 1I TTTTTTCGGG -/T TTTTTTTTTT 1452 het 1452 ref 26 7 7 12 T 15 16 262588 CASAVA_Build 19 52373308 1D CCACTGCACT C/- CAGCCTGACG 3070 het 2419 hom 25 6 12 8 C 2 1 262589 CASAVA_Build 19 52383447 1D GCCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 12 11 262590 CASAVA_Build 19 52390834 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1014 het 196 hom 25 2 3 20 T 19 18 262591 CASAVA_Build 19 52411511 1I AAGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1690 het 1690 ref 23 9 8 6 T 10 11 262592 CASAVA_Build 19 52428183 1I CTTTTTTTTT -/C TTTTTTTGAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 0 1 262593 CASAVA_Build 19 52428725 2I TCCTCGGCCT --/CC CCCAAAGTGC 1176 het 513 hom 11 1 3 7 C 3 5 262594 CASAVA_Build 19 52428772 1D TGGCCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 928 het 928 ref 13 6 5 2 T 12 11 262595 CASAVA_Build 19 52432244 2I ACCTCAGTTT --/CC CCCGAGTAGC 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 C 3 5 262596 CASAVA_Build 19 52432922 2I ATAAATAAAC --/AA AAAAAAAAAT 2483 het 2483 ref 19 12 6 1 A 9 11 262597 CASAVA_Build 19 52437267 3D TGTGTGTGAC ATT/--- ATGACTGTGT 3070 het 3070 ref 79 36 35 10 ATT 1 0 262598 CASAVA_Build 19 52441785 1I TTGCCCAAGC -/T GGAGCAGTGG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 0 1 262599 CASAVA_Build 19 52442631 2D AATATGCGTG TC/-- TGTTTGTCTC 3070 het 3070 ref 37 19 12 7 TC 1 0 262600 CASAVA_Build 19 52448962 4I AATACCTTTA ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 TTAT 4 5 262601 CASAVA_Build 19 52458148 2D TGAGCTGTGA AC/-- ACACACCACT 3070 het 3070 ref 36 18 11 8 AC 4 3 262602 CASAVA_Build 19 52475119 6D TTTGAGACAG TCTTAC/------ TCTGTCACCT 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 TCTTAC 1 0 262603 CASAVA_Build 19 52476079 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2760 hom 24 6 10 8 A 12 11 262604 CASAVA_Build 19 52481091 3I CGCCCGGCCT ---/GTG GTGGTATTAT 3005 het 3005 ref 26 15 9 2 GTG 1 2 262605 CASAVA_Build 19 52482216 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 664 hom 25 4 11 10 A 17 16 262606 CASAVA_Build 19 52488225 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2758 het 2600 hom 27 10 7 11 T 12 10 262607 CASAVA_Build 19 52499307 2D CAGGAAAAAC AT/-- AAGTAGACAT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 AT 1 0 262608 CASAVA_Build 19 52501365 1I GGGAGGGCTC -/T TGAGCTGTGG 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 1 2 262609 CASAVA_Build 19 52512112 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 185 het 185 ref 31 19 2 10 A 12 11 262610 CASAVA_Build 19 52516292 1D ATTCTCGCTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 51 het 22 0 16 6 A 8 7 262611 CASAVA_Build 19 52516629 1I ATTGCTCGAA -/C CTTGGAGGTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 2 262612 CASAVA_Build 19 52522345 5D AACAAAAACA AAAAC/----- AAAAAAAACG 2226 het 1174 hom 43 11 10 25 AAAAC 1 0 262613 CASAVA_Build 19 52522515 4D AGCAGTCACT CCCC/---- CCCCATTCTT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 C 8 4 262614 CASAVA_Build 19 52523889 1D GCCTGACTAA T/- TTTTTTTTTT 2898 het 359 hom 16 1 14 2 T 15 14 262615 CASAVA_Build 19 52524565 1D AAAACAAATT C/- TAGGGGGGCA 3070 hom 32 het 22 0 18 4 C 1 0 262616 CASAVA_Build 19 52525286 1D CCAGCTACTC G/- GGGGGGCTGA 2240 hom 18 het 7 0 7 5 G 7 6 262617 CASAVA_Build 19 52525394 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 10 7 A 17 16 262618 CASAVA_Build 19 52529566 2I GTCCATACAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 16 8 A 15 17 262619 CASAVA_Build 19 52529823 1D CATAGCCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 19 13 T 11 10 262620 CASAVA_Build 19 52533373 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAATAT 1289 hom 15 het 15 0 5 10 A 8 7 262621 CASAVA_Build 19 52533544 1D ATCTGTCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 23 1 14 8 A 15 14 262622 CASAVA_Build 19 52543027 1I AGAGTCCTTC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 2279 hom 18 5 9 4 T 8 9 262623 CASAVA_Build 19 52552851 2I CCCGTTGCAC --/TG TGTCTTCTCC 3070 hom 80 het 31 0 24 7 TG 1 2 262624 CASAVA_Build 19 52567718 12I GGTGGGAGCA ------------/GGAGGGCAGGCG GGAGGGCAGG 3070 hom 69 het 30 0 19 11 GGAGGGCAGGCG 0 1 262625 CASAVA_Build 19 52568014 14I GTGGTGGGGG --------------/CCCTCTGTCTGTCA CCCTGCTCAG 3070 hom 33 het 12 0 9 3 CCCTCTGTCTGTCA 0 1 262626 CASAVA_Build 19 52570823 1I GGCCTCTCCT -/G GGGGGGTCCC 3070 hom 40 het 15 0 12 3 G 6 7 262627 CASAVA_Build 19 52572853 3D GGGGACTTCT CAG/--- CAGAGCTGGG 3070 hom 51 het 19 0 15 4 CAG 2 1 262628 CASAVA_Build 19 52573392 7I AGGCACTGTT -------/AGTGTTC AGTGTTCTGG 3070 hom 83 het 35 0 26 10 AGTGTTC 1 2 262629 CASAVA_Build 19 52577373 3D TGATACACAC TGT/--- TGTTAGGCCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TGT 2 1 262630 CASAVA_Build 19 52578343 3D TCTAAAAGAA AAG/--- AAAAAGAAAA 3070 hom 75 het 28 0 24 7 AAG 1 0 262631 CASAVA_Build 19 52579325 1D AAGCCCTCTT C/- CTTGGCAATA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 C 2 1 262632 CASAVA_Build 19 52584136 16I CGCCCAGCTA ----------------/ATTTTTTATTTTTATT ATTTTTTATT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 ATTTTTTATTTTTATT 0 1 262633 CASAVA_Build 19 52594033 15I AGGCCCAGAG ---------------/GACACACAGGGGTCA GACACACACC 3070 hom 72 het 27 0 22 5 GACACACAGGGGTCA 0 1 262634 CASAVA_Build 19 52624753 1D GGGGTGAAGT G/- GGGGGGGGGT 1538 hom 12 het 10 0 5 5 G 10 9 262635 CASAVA_Build 19 52625003 1I ACACAGAACA -/G GGGCAATCAA 3070 hom 47 het 19 0 13 6 G 3 4 262636 CASAVA_Build 19 52641923 1I CGTGTGTGTC -/T TATGTGTGTG 3070 hom 97 het 38 0 32 6 T 1 2 262637 CASAVA_Build 19 52661657 2D AGAGACCCAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 16 12 10 AG 7 6 262638 CASAVA_Build 19 52685378 2D GGGGTGTGTC GT/-- GTGTGTGTAG 3070 het 3070 hom 55 16 23 20 GT 5 4 262639 CASAVA_Build 19 52685574 3D TGTGTGTGGT GTG/--- GTGTGTGTAG 2154 het 15 hom 12 0 6 9 GTG 2 1 262640 CASAVA_Build 19 52691884 3D CCAACCCCTC CTT/--- CTGACATGTA 3070 het 3070 hom 32 12 13 8 CTT 1 0 262641 CASAVA_Build 19 52709011 1I CTCTACCTCC -/T GGGTTCAAGT 1911 hom 18 het 8 0 5 3 T 0 1 262642 CASAVA_Build 19 52718159 1D AGCGAGTATC T/- TTTTTTTTTT 1633 het 1633 ref 26 19 4 3 T 12 11 262643 CASAVA_Build 19 52726302 4D AATTGTGAGC GGGG/---- GGGGGGGGGG 3070 hom 48 het 21 0 15 7 G 17 13 262644 CASAVA_Build 19 52775333 1D AAACAAAAAA G/- AAAAGAAAAG 3070 het 1531 hom 21 4 13 6 G 1 0 262645 CASAVA_Build 19 52777470 3I CCTCTTCATT ---/TCC TCCTCCTCTT 1546 het 1546 ref 21 7 6 8 TCC 2 3 262646 CASAVA_Build 19 52810660 9D3M2I ATTAAGTGGG TTCATATCAGTA--/---------GAAAG CCTACTTGGT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 N/A 0 0 262647 CASAVA_Build 19 52812160 5D GCTTCCCAAA GTGCT/----- GGGATTACAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 GTGCT 1 0 262648 CASAVA_Build 19 52812847 1I TGATCTGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 T 10 11 262649 CASAVA_Build 19 52814303 1I TCCCAACCCC -/T TTTTTTTTTT 1294 hom 13 het 10 0 5 5 T 10 11 262650 CASAVA_Build 19 52841508 2D ATGCACACAG AC/-- ACACGTGTGC 3070 hom 72 het 30 0 24 8 AC 3 2 262651 CASAVA_Build 19 52856736 1I GGTGATGAGA -/G AAATACATTT 3070 hom 86 het 34 0 28 6 G 0 1 262652 CASAVA_Build 19 52861367 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 11 10 262653 CASAVA_Build 19 52873806 1I TGAACAGTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 8 9 262654 CASAVA_Build 19 52876455 1D TGTGGCAGCT G/- GGGGGGGAAG 3070 hom 58 het 27 0 19 8 G 8 7 262655 CASAVA_Build 19 52884751 3D AAGTACTGGG ATT/--- ATTATAGGCG 3070 hom 72 het 26 0 24 3 ATT 2 1 262656 CASAVA_Build 19 52892081 1I TTTTGTTTTA -/G GGGGGGGTTC 3070 hom 53 het 21 0 11 10 G 7 8 262657 CASAVA_Build 19 52895420 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 10 262658 CASAVA_Build 19 52896005 1I ATTTTATTTA -/T TTGTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 2 3 262659 CASAVA_Build 19 52899370 4D CCTCAGCTGG GAAC/---- GAACGTCTGT 3070 hom 120 het 42 0 39 5 GAAC 2 1 262660 CASAVA_Build 19 52900219 1I CCTGATTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 22 0 19 4 T 10 11 262661 CASAVA_Build 19 52901346 3D AGACTCCATC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1726 hom 19 6 10 4 A 14 11 262662 CASAVA_Build 19 52901408 7I5M4I AGTTGCAATG -------GGCAA----/TGCCCATTGCAACTCC CACAGCCAGG 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 N/A 0 0 262663 CASAVA_Build 19 52916241 1D GGGGTGTGTG T/- GTGTGTGTGT 1352 het 1352 ref 42 10 9 23 T 1 0 262664 CASAVA_Build 19 52935858 1I AGCTACCCCC -/T GAGCTTCTCC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 0 1 262665 CASAVA_Build 19 52936505 1I CGAGTGAGCC -/G GGCCCCCCTC 3070 hom 30 het 19 0 13 6 G 2 3 262666 CASAVA_Build 19 52941441 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1641 het 1252 hom 13 3 7 3 T 10 11 262667 CASAVA_Build 19 52944702 4D GGGAGGAAAA AGAC/---- AGTAAAAACC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AGAC 1 0 262668 CASAVA_Build 19 52947017 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 10 9 262669 CASAVA_Build 19 52948598 1D AGATGCAGGA C/- CGCTTGTCCG 3070 hom 150 het 54 0 48 6 C 2 1 262670 CASAVA_Build 19 52955453 1I GTGACTCTGC -/T CAGGGGTGAC 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 0 1 262671 CASAVA_Build 19 52955666 1I TGTGTGAAAT -/G GGGGGGTCCA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 G 6 7 262672 CASAVA_Build 19 52956567 5D CTGTAATCCC GGCTA/----- GGCTACTTGG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 GGCTA 2 1 262673 CASAVA_Build 19 52956702 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 27 2 22 3 A 10 11 262674 CASAVA_Build 19 52957711 6D TGTCTCTTTA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 AAAAAC 4 3 262675 CASAVA_Build 19 52960511 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1564 hom 22 6 13 3 A 11 10 262676 CASAVA_Build 19 52962426 1D TACAGCTTCT C/- CTCTGACATC 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 C 2 1 262677 CASAVA_Build 19 52967127 1D AGCTGAGATT G/- TGCCACTACA 3070 het 2147 hom 21 7 13 1 G 1 0 262678 CASAVA_Build 19 52969461 3D TTGAGGATAA TGT/--- TGTTACAAGA 3070 het 3070 hom 34 15 13 7 TGT 2 1 262679 CASAVA_Build 19 52974697 1D CCCAGGGAGA C/- CCCCCCCTCG 3070 hom 50 het 22 0 16 6 C 8 7 262680 CASAVA_Build 19 52975838 1I GTGGATGCCC -/G GGGGGGCATT 1436 het 1206 hom 20 5 6 9 G 6 7 262681 CASAVA_Build 19 52977618 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2654 hom 24 8 12 4 T 10 11 262682 CASAVA_Build 19 53008786 3D TCTGACAAGC AGA/--- AGGAGTTTTC 3070 hom 29 het 14 0 9 6 AGA 1 0 262683 CASAVA_Build 19 53011777 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 761 het 397 hom 7 1 2 5 T 6 5 262684 CASAVA_Build 19 53018052 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGGTCTCT 3070 hom 69 het 26 0 21 5 G 6 5 262685 CASAVA_Build 19 53021384 1D TCTAAACTGT A/- AGCATCAGGC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 2 1 262686 CASAVA_Build 19 53025213 1I ATTAAATGGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 7 8 262687 CASAVA_Build 19 53032700 2D17M4D TAATTGTATA TTTGTATGTTTGTATAATCAGAT/--TATATGTTTGTATAATC---- GGATGGATGA 3070 het 3070 ref 51 33 26 12 N/A 0 0 262688 CASAVA_Build 19 53033297 1D21M4I ATGTGTGTAT GGTGTATGCATGTATAATTGTA----/-GTGTATGCATGTATAATTGTATGTG TGTATGTTTG 3070 het 3070 ref 78 52 36 7 N/A 0 0 262689 CASAVA_Build 19 53033914 4D ATGTTTGTAT TAGA/---- TGGATGGATG 3070 het 3070 ref 74 38 30 9 TAGA 1 0 262690 CASAVA_Build 19 53035344 3D AACTTGCTCC AAG/--- AAGAAGTCAA 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 AAG 3 2 262691 CASAVA_Build 19 53036927 1D GGCAAGGTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 14 10 4 A 10 9 262692 CASAVA_Build 19 53039267 2D TTCCCTCTTG TC/-- TCTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 26 9 9 9 TC 2 1 262693 CASAVA_Build 19 53041135 1D TTTATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 502 hom 32 6 23 3 T 17 16 262694 CASAVA_Build 19 53044437 2D TTTATTTATT TA/-- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 TA 1 0 262695 CASAVA_Build 19 53046012 1I AGCTTATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 8 9 262696 CASAVA_Build 19 53048105 2I TCTCTTATTT --/TC TGTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 TC 0 1 262697 CASAVA_Build 19 53050448 2D AGCATAAATA CT/-- CTCTAGGTTC 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 CT 3 2 262698 CASAVA_Build 19 53057141 1I ATGTTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 34 0 18 16 T 12 13 262699 CASAVA_Build 19 53061541 3D GCCCAGCTCA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 hom 32 het 14 0 12 2 T 12 9 262700 CASAVA_Build 19 53062295 1I ATGATGAAAC -/T CCCCTCTCTA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 0 1 262701 CASAVA_Build 19 53080446 1D TCATTTAGCA T/- AATGTCCTTG 3070 het 3070 hom 47 15 31 1 T 1 0 262702 CASAVA_Build 19 53083435 26D ATATATATGT ATATATATATGCATATATATATGCGC/-------------------------- ATATATATAT 3070 hom 27 het 7 0 10 5 ATATATATATGCATATATATATGCGC 1 0 262703 CASAVA_Build 19 53084362 2D ACTTTCCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 2467 hom 30 het 17 0 10 7 T 14 12 262704 CASAVA_Build 19 53085122 2D CTGCAAGCTC TA/-- TACCTCCTGG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TA 2 1 262705 CASAVA_Build 19 53090547 1D TATTAATGTT C/- TGTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 C 1 0 262706 CASAVA_Build 19 53097621 2D AGACTCTGTT AC/-- ACACACAAAA 3070 het 3070 hom 27 14 12 1 AC 4 3 262707 CASAVA_Build 19 53122115 1D GCGCAAAAAA C/- CTTAGACTAG 1783 het 1783 ref 55 45 4 6 C 2 1 262708 CASAVA_Build 19 53134722 1D GAAAAAAAAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 79 21 54 4 T 8 7 262709 CASAVA_Build 19 53161300 2I ACAAAACAAA --/AC ATAAACAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AC 0 1 262710 CASAVA_Build 19 53161954 1I AGAAAAAAAA -/G AGAAAAAAAA 3070 het 291 hom 19 1 15 3 G 0 1 262711 CASAVA_Build 19 53163433 7D CTCTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 40 0 35 7 T 16 9 262712 CASAVA_Build 19 53167079 3I AGAAAAAGTT ---/ATC ATTCTGACTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATC 0 1 262713 CASAVA_Build 19 53174380 1I TTATTGGATG -/T TTTTTCTATA 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 T 5 6 262714 CASAVA_Build 19 53175273 4I5M1I TTAGATTAAA ----AATAA-/AAATAATAAT TAATTAAAAA 2844 het 2844 ref 18 9 7 2 N/A 0 0 262715 CASAVA_Build 19 53175547 1D TTCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1257 het 996 hom 18 6 7 5 T 21 20 262716 CASAVA_Build 19 53176330 1I TTTCTGATAT -/G GAACACTATA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 G 1 2 262717 CASAVA_Build 19 53176842 1D ATAGCTTTAC T/- TTTTTTTTTT 2917 het 2917 ref 34 20 8 6 T 11 10 262718 CASAVA_Build 19 53179221 5D TGGCTTGAAG AAAAA/----- AAAAAAAATA 1350 het 319 hom 7 1 3 3 A 13 8 262719 CASAVA_Build 19 53201654 8D29M1D CTGCACTCCA GTCTGGGCGTCTGGGCGACAGAGTGAGACCCTGTCTCA/--------GTCTGGGCGACAGAGTGAGACCCTGTCTC- AAAAAAAAAA 2890 het 2890 ref 24 17 7 4 N/A 0 0 262720 CASAVA_Build 19 53204773 1I TTTACGTTTT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 53 30 18 5 A 7 8 262721 CASAVA_Build 19 53204858 1D CACAATAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 9 11 T 10 9 262722 CASAVA_Build 19 53205790 1D TCTCAAAGAC G/- AGAAAGAACA 3070 het 3070 hom 55 24 29 4 G 1 0 262723 CASAVA_Build 19 53206193 3D ATGGTGACAG TGA/--- TGATGATGAC 3070 het 3070 ref 73 37 28 11 TGA 4 3 262724 CASAVA_Build 19 53206263 3I37M3D GATTACAATA ---ATGATGACAATGATGATGAGAATGACAATAATGGGGTTGA/ATGATGATGACAATGATGATGAGAATGACAATAATGGGGT--- TGATGATGAT 3070 het 3070 ref 70 54 21 28 N/A 0 0 262725 CASAVA_Build 19 53206988 1I CTGAGAAACA -/G AGGTGAAAAA 3070 het 3070 ref 51 27 21 5 G 0 1 262726 CASAVA_Build 19 53207373 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTGTAG 1970 het 1970 ref 25 16 6 4 T 7 6 262727 CASAVA_Build 19 53209646 1I TAATGCTAAA -/G GACGAGTTAA 2237 het 1070 hom 8 3 5 0 G 1 2 262728 CASAVA_Build 19 53213476 1I GACACTAGGC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 60 23 31 6 A 7 8 262729 CASAVA_Build 19 53216031 1D TAAATAAAAT A/- AATTATTTCT 3070 het 3070 ref 26 13 13 0 A 3 2 262730 CASAVA_Build 19 53236090 1D TACTAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 6 262731 CASAVA_Build 19 53238245 1I TGCTGAGCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 7 8 262732 CASAVA_Build 19 53241850 1I GTCTTTAAAT -/C CCCCCCCCCT 940 het 940 ref 20 4 5 11 C 9 10 262733 CASAVA_Build 19 53244569 1I TGTCATGTTG -/C CCCCCCGGGA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 C 6 7 262734 CASAVA_Build 19 53246640 2I GAGAGAGATC --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 102 het 45 0 33 12 GA 6 7 262735 CASAVA_Build 19 53250155 13D TGCAAGACCT CTCCAGAAGACCC/------------- CTCCAGAAGA 3070 hom 63 het 24 0 22 5 CTCCAGAAGACCC 2 1 262736 CASAVA_Build 19 53250708 5I CGTGAAGGTA -----/CTTTT CTTTTCTTTT 3070 hom 66 het 28 0 22 8 CTTTT 2 3 262737 CASAVA_Build 19 53266004 1I CTCGGTTTCC -/G GCCTGTTGGC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 1 2 262738 CASAVA_Build 19 53275199 3I AGAAATCAGC ---/AAG AAGAAAACGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 AAG 1 2 262739 CASAVA_Build 19 53277297 1I GTAAAAATTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 29 0 20 9 A 9 10 262740 CASAVA_Build 19 53306685 2D GGGTTTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 702 het 702 ref 26 14 4 8 T 18 16 262741 CASAVA_Build 19 53375824 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1791 het 1791 ref 20 12 5 3 T 15 14 262742 CASAVA_Build 19 53381292 2D AATTTTTAAC TT/-- TATTTCCTCT 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 T 3 1 262743 CASAVA_Build 19 53382452 4I GTATAATGTA ----/ATAG ATAATTAATA 2825 hom 18 het 10 0 7 3 ATAG 0 1 262744 CASAVA_Build 19 53389621 2D ATGAATGGGT GG/-- TCCCATTTCC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 2 0 262745 CASAVA_Build 19 53393010 4I GGTGGGAGGC ----/TTCT TTTTTTATTT 3070 het 2406 hom 32 8 17 7 TTCT 0 1 262746 CASAVA_Build 19 53393158 2D ACTAGGAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 2095 het 537 hom 18 2 9 7 T 18 16 262747 CASAVA_Build 19 53396548 1D TGCCCATCTC T/- TTTTTTTTTT 2567 het 2272 hom 23 8 9 6 T 12 11 262748 CASAVA_Build 19 53396867 2D AATAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 10 4 A 13 11 262749 CASAVA_Build 19 53401783 2I ACTCCGACTC --/TG TGGAGTGTAC 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 TG 1 2 262750 CASAVA_Build 19 53402572 2I ATGGCTTTTA --/AT ATGAGGTTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AT 1 2 262751 CASAVA_Build 19 53403188 2I CATTAACCTA --/TT TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 7 9 262752 CASAVA_Build 19 53403744 3D TAAAAGAGAC ATT/--- ATAAAAATAC 3070 het 3070 hom 35 9 23 3 ATT 1 0 262753 CASAVA_Build 19 53403895 1D AAATATTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 12 0 10 3 A 9 8 262754 CASAVA_Build 19 53405168 6I AACTAAAGAT ------/AAAGAA AAATACCTTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 AAAGAA 0 1 262755 CASAVA_Build 19 53411765 1D ATTCAGTGGA G/- GAAGGAAGAT 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 G 2 1 262756 CASAVA_Build 19 53412688 5I TCCTATGCAA -----/ATGTT ATGTTAATAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ATGTT 1 2 262757 CASAVA_Build 19 53413228 1I TAGATTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 13 7 T 10 11 262758 CASAVA_Build 19 53420207 4I GAAGCAGATC ----/ATAA ATAAATAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 ATAA 2 3 262759 CASAVA_Build 19 53435838 1D ACTCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1925 hom 32 9 13 10 A 15 14 262760 CASAVA_Build 19 53439030 2D GTCTACAGTC TT/-- CTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 22 9 0 T 2 0 262761 CASAVA_Build 19 53445069 3I GGGACAGTCT ---/TAA TAATCTCTCC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TAA 1 2 262762 CASAVA_Build 19 53453253 4D TAAAATAATA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AAAT 3 2 262763 CASAVA_Build 19 53454111 2D TGAAAAAAAG AA/-- GACTGTAGAC 2970 het 2970 ref 35 24 7 5 A 2 0 262764 CASAVA_Build 19 53455681 1D TGGCTTTCCG C/- CCCACAACTC 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 C 4 3 262765 CASAVA_Build 19 53456296 4D AGATGCAAAC AAAG/---- AACAAAAACT 3070 het 3070 ref 35 22 13 3 AAAG 1 0 262766 CASAVA_Build 19 53459700 1I CAGGAAGTCA -/G GGGAACAGAT 3070 het 3070 hom 61 26 27 8 G 3 4 262767 CASAVA_Build 19 53462446 1D AGAAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2081 het 2081 ref 18 7 5 6 T 12 11 262768 CASAVA_Build 19 53463580 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAATAGC 3070 het 1157 hom 12 3 9 0 A 8 6 262769 CASAVA_Build 19 53464775 1D AGAGGATCAC T/- TTAAGCCCAG 3070 het 3070 hom 24 11 11 3 T 3 2 262770 CASAVA_Build 19 53478804 1I GGGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2529 hom 27 8 15 4 T 10 11 262771 CASAVA_Build 19 53479087 6D ACAGGCATGA GCCACT/------ GCTCTCATTT 3070 het 2833 hom 20 9 11 1 GCCACT 1 0 262772 CASAVA_Build 19 53480717 8D GGGAGGGAGG GAAAGAAA/-------- GAAAGAAAGA 3070 het 2949 hom 36 12 17 11 GAAA 5 3 262773 CASAVA_Build 19 53483077 1I TTTCCTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 902 hom 36 2 28 6 A 11 12 262774 CASAVA_Build 19 53489395 1D CACGGTGAAA C/- CCCCATCTCA 2454 het 1885 hom 17 5 8 4 C 5 4 262775 CASAVA_Build 19 53489574 4D TCCGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 1482 hom 17 4 11 2 AAAT 6 5 262776 CASAVA_Build 19 53499962 1D TGGCAGGTAG T/- TTTCCTTTTG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 4 3 262777 CASAVA_Build 19 53503579 2D GCGATCTTAT AA/-- ATGTGGGAGA 3070 het 3070 ref 36 19 16 3 A 3 1 262778 CASAVA_Build 19 53505985 1I GTCCCTACTT -/A AAAAAAAAAA 772 het 772 ref 11 6 3 2 A 13 14 262779 CASAVA_Build 19 53508000 3I CCAATCTGTC ---/CTT CTCATTTCTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CTT 0 1 262780 CASAVA_Build 19 53514089 1D GAACTCAGGG T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 94 het 36 0 29 7 T 7 6 262781 CASAVA_Build 19 53521563 1D TTATGCCAAA T/- TTTTTTTTTT 1326 het 1326 ref 20 13 4 3 T 15 14 262782 CASAVA_Build 19 53560347 1I ATTCCTGGGA -/C ACCCCCAGCA 3070 hom 28 het 15 0 9 6 C 0 1 262783 CASAVA_Build 19 53564375 1D TTAAGAGGGA T/- AGGGTCCCTC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 1 0 262784 CASAVA_Build 19 53565195 1I GAGTCAAGAC -/A AAGCCAAAGC 3070 hom 122 het 46 0 41 5 A 2 3 262785 CASAVA_Build 19 53574646 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1840 hom 16 5 10 1 T 11 10 262786 CASAVA_Build 19 53576293 1I GTCCCTTGAC -/T TTAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 2 3 262787 CASAVA_Build 19 53594814 2I TCTAAGTGGA --/AG AGTCGGAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AG 1 2 262788 CASAVA_Build 19 53596151 1D GACTGTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 18 1 12 5 A 16 15 262789 CASAVA_Build 19 53600444 1D TGGAATGGGA G/- GGGTGTGGGA 3070 het 2965 hom 24 7 11 6 G 4 3 262790 CASAVA_Build 19 53602055 1I TTCCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2269 het 2269 ref 21 7 7 7 T 11 12 262791 CASAVA_Build 19 53603889 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 24 0 16 8 A 15 14 262792 CASAVA_Build 19 53616497 1I GACTCCGTTT -/A AAAAAAAAAA 2108 het 2108 ref 27 17 6 4 A 12 13 262793 CASAVA_Build 19 53622458 1I TACACTCTCA -/T TCAGCAATGC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 1 2 262794 CASAVA_Build 19 53633085 2I TGCTTCAGCT --/AG AGAGACATTC 3070 hom 79 het 34 0 27 7 AG 2 3 262795 CASAVA_Build 19 53635748 18I TATTTTTTTC ------------------/CCCATTTCCCCTTCTAAG CCTCAATCTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 CCCATTTCCCCTTCTAAG 0 1 262796 CASAVA_Build 19 53637152 1I GGCCTACATT -/C CCCACATCAC 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 C 3 4 262797 CASAVA_Build 19 53640203 1D TGGGGCAGAT A/- AGAGACCCCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 2 1 262798 CASAVA_Build 19 53647159 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 28 1 24 4 T 17 16 262799 CASAVA_Build 19 53656435 1I GAAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 322 hom 15 1 11 3 A 10 11 262800 CASAVA_Build 19 53676548 1I ACGCTTCTGA -/T TTTTTTTTGT 1087 hom 22 het 16 0 5 11 T 8 9 262801 CASAVA_Build 19 53676991 1D GGGGCCTCAT A/- AGGAGCTGTG 3070 hom 72 het 30 0 22 9 A 2 1 262802 CASAVA_Build 19 53679216 5D AATATAAAAA TTACC/----- TGGGCCTGGA 3070 hom 83 het 30 0 26 5 TTACC 1 0 262803 CASAVA_Build 19 53765788 4I12M1D TTGTTTTCCG ----TTTTTGTTTTTGT/TTTCTTTTTGTTGTTG- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 N/A 0 0 262804 CASAVA_Build 19 53773121 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2495 het 1016 hom 16 4 7 6 A 12 11 262805 CASAVA_Build 19 53775170 1I TTAAAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 1945 het 1054 hom 17 6 5 6 T 13 14 262806 CASAVA_Build 19 53777457 2D TTTGCCTATG TA/-- TATACAATGT 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 TA 3 2 262807 CASAVA_Build 19 53778246 5I AAGAAAAAAC -----/AGAAT AGAAGAAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AGAAT 0 1 262808 CASAVA_Build 19 53779602 1D CCAATATCAC A/- AAAACGGCAG 3070 het 3070 hom 39 15 18 8 A 5 4 262809 CASAVA_Build 19 53782181 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2938 hom 17 6 9 3 A 9 8 262810 CASAVA_Build 19 53786955 3I GGTGGCCAGG ---/AGA AGAAGAGACG 3070 hom 36 het 18 0 12 6 AGA 2 3 262811 CASAVA_Build 19 53789972 3D CCTATAATCC CAG/--- CAGCTACTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 CAG 2 1 262812 CASAVA_Build 19 53790351 1D23M1D AACTCCGTCT AAAAAAAAAAAGGCAGAGGGGCACA/-AAAAAAAAAAGGCAGAGGGGCAC- GGGGAGGACT 3070 hom 73 het 21 0 22 5 N/A 0 0 262813 CASAVA_Build 19 53800089 10D ACTCTGACTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 20 1 14 7 A 24 14 262814 CASAVA_Build 19 53801523 5I GGATACATCA -----/CTTTC CTTTCCCCAG 3070 hom 105 het 46 0 34 12 CTTTC 1 2 262815 CASAVA_Build 19 53806193 2I AATCATAAAT --/CA CATGTTTGCT 3070 hom 73 het 27 0 22 5 CA 1 2 262816 CASAVA_Build 19 53807731 2D TCGGCCTCCC AA/-- AGTGCTGGAA 2484 hom 29 het 11 0 8 3 A 3 1 262817 CASAVA_Build 19 53815194 1D CTGGCACACA G/- GGGTGTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 4 3 262818 CASAVA_Build 19 53817328 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 14 13 262819 CASAVA_Build 19 53823577 2I AGCAAATGAA --/AG AGATGACCAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AG 1 2 262820 CASAVA_Build 19 53829710 1D CCCGGCCCCG C/- CCCCCTCGCG 1091 hom 15 het 13 0 4 9 C 6 5 262821 CASAVA_Build 19 53853577 1D CAGGGACTTT G/- GGTTTTATTT 3070 hom 78 het 31 0 24 7 G 3 2 262822 CASAVA_Build 19 53854583 2D TCCATCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2621 het 87 hom 12 1 7 4 A 16 14 262823 CASAVA_Build 19 53869509 1D GTGATGCGGA G/- GGGCATTTGT 1858 hom 20 het 9 0 6 4 G 4 3 262824 CASAVA_Build 19 53900181 10D TTTTCTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTGAG 3070 het 2484 hom 28 9 16 3 T 17 7 262825 CASAVA_Build 19 53927134 1D TTTTAATCTC T/- TTTTTTTTTT 1536 het 1536 ref 45 34 5 6 T 12 11 262826 CASAVA_Build 19 53928875 1I AATCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2410 het 719 hom 23 2 11 10 A 12 13 262827 CASAVA_Build 19 53939811 1I GGCTGGAGTG -/C TGTGGTGTAA 3070 hom 75 het 26 0 25 2 C 0 1 262828 CASAVA_Build 19 53959054 1D GACTCCACCT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 49 het 19 0 15 4 A 8 7 262829 CASAVA_Build 19 53962128 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 23 0 13 10 T 17 16 262830 CASAVA_Build 19 53962321 1I GACAGGGTTT -/C CTCCATGTTG 3070 het 395 hom 11 1 10 0 C 1 2 262831 CASAVA_Build 19 53981018 4I TCTTTTGTGT ----/ATTG ATTGTCAGTC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 ATTG 1 2 262832 CASAVA_Build 19 53985022 1D TTGTAGAGGA G/- GGGGGGTCTC 2045 het 2045 ref 22 12 5 5 G 7 6 262833 CASAVA_Build 19 54008069 1I GGAAATAAAT -/A ATAACGATAT 3070 hom 48 het 21 0 14 7 A 1 2 262834 CASAVA_Build 19 54027827 1D ATGTCCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1513 hom 29 8 10 12 T 12 11 262835 CASAVA_Build 19 54048572 1D TGTCCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 2259 het 801 hom 21 8 7 6 A 13 12 262836 CASAVA_Build 19 54062314 3D GCAGCCACTA CTT/--- CTCAGAACTC 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 CTT 1 0 262837 CASAVA_Build 19 54081837 1I GTCCAGACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1351 hom 30 4 14 12 T 13 14 262838 CASAVA_Build 19 54086626 1D TTAAACCCAG C/- CAGGCAGAGG 2811 hom 33 het 13 0 10 3 C 2 1 262839 CASAVA_Build 19 54087574 1D ACAGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 719 het 719 ref 21 15 2 4 T 11 10 262840 CASAVA_Build 19 54088442 1D CTGCCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2614 het 184 hom 20 1 11 8 A 15 14 262841 CASAVA_Build 19 54088627 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 1339 het 1339 ref 54 40 3 11 T 10 9 262842 CASAVA_Build 19 54094765 1I ACAGAACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 20 0 14 6 A 13 14 262843 CASAVA_Build 19 54096180 6D CTGGAGGTCC CTGACT/------ CTGAGGTGTG 3070 hom 92 het 32 0 29 6 CTGACT 1 0 262844 CASAVA_Build 19 54102049 1I AATATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 25 1 18 6 T 13 14 262845 CASAVA_Build 19 54105452 1D GCCTTGTTTG T/- TTTTTTTAAA 882 het 6 hom 7 0 3 4 T 8 7 262846 CASAVA_Build 19 54106475 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2364 het 168 hom 18 2 10 6 T 17 16 262847 CASAVA_Build 19 54108367 1D CCCTTGAGGC A/- AAAAAACTCC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 7 6 262848 CASAVA_Build 19 54110410 3I TAAAAAACAA ---/AAC AACAAAAATT 3070 hom 24 het 21 0 9 12 AAC 1 2 262849 CASAVA_Build 19 54112568 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2984 hom 31 11 11 9 T 10 9 262850 CASAVA_Build 19 54112949 5I TGTGCTCAAA -----/TGATC TGATCTTGCC 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 TGATC 1 2 262851 CASAVA_Build 19 54115177 1I CAGGGTTTTG -/C CATGTTGGCC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 C 1 2 262852 CASAVA_Build 19 54122011 4I CCCTGTCTGG ----/AAAA AAAAAAAAAA 2445 het 1791 hom 27 7 12 8 A 14 18 262853 CASAVA_Build 19 54138136 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 72 het 72 ref 15 5 1 9 T 1 0 262854 CASAVA_Build 19 54153165 1I GGGGGGGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 23 1 17 5 T 11 12 262855 CASAVA_Build 19 54155258 1D TACAATTTTA T/- TTTTTTTATT 2744 het 2744 ref 17 8 7 2 T 8 7 262856 CASAVA_Build 19 54165299 1I GCTCAAGCGA -/C CCCTACCACC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 3 4 262857 CASAVA_Build 19 54168397 1I CAGTCTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 T 10 11 262858 CASAVA_Build 19 54169984 5D AAAGGTTTTC TTTCT/----- TTTCTTTTAA 3070 het 2989 hom 19 7 8 5 TTTCT 2 1 262859 CASAVA_Build 19 54211598 1D CATCTGCCCC T/- GGCCCCAGGC 1565 het 1565 ref 24 12 5 7 T 1 0 262860 CASAVA_Build 19 54214369 2I GTTCCGCTCT --/CG GTCTTAAACC 1514 het 1514 ref 32 20 4 8 CG 0 1 262861 CASAVA_Build 19 54217449 1D AACTGGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1997 hom 28 6 8 14 T 15 14 262862 CASAVA_Build 19 54241647 1D ATTTTGTTTG T/- TTTGTTTTGT 248 het 248 ref 25 13 2 10 T 4 3 262863 CASAVA_Build 19 54246224 1D AGTTCGAGAG C/- AGCCTGGCCA 3070 het 3070 hom 27 8 9 10 C 1 0 262864 CASAVA_Build 19 54252733 1D CTCCTCCCCA C/- CCACAGCCCG 3070 hom 50 het 21 0 15 6 C 3 2 262865 CASAVA_Build 19 54261317 2I TATTGGGGGT --/GG GGGGGGAAGG 3070 hom 52 het 24 0 15 9 G 6 8 262866 CASAVA_Build 19 54271269 4I1M10D TAGTAGAGAC ----TAAAATACATG/GGGGT---------- TTCTCCATGT 2892 hom 18 het 7 0 7 1 N/A 0 0 262867 CASAVA_Build 19 54273388 1I ATAAAAAATC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 49 het 22 0 16 6 A 9 10 262868 CASAVA_Build 19 54281951 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 22 0 19 3 T 10 11 262869 CASAVA_Build 19 54288162 7D AGTGTTTTTC ATTTTTT/------- GTTTTTTGTT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 ATTTTTT 1 0 262870 CASAVA_Build 19 54308724 3D CCGTCTCAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 26 het 12 0 9 3 AAT 6 5 262871 CASAVA_Build 19 54309305 1I GAGGGCAGGG -/C CGCGGCTGGC 1890 hom 30 het 11 0 11 0 C 1 2 262872 CASAVA_Build 19 54337007 2I CGTATGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 2915 hom 29 het 17 0 7 10 TG 7 8 262873 CASAVA_Build 19 54339097 1D TTTTCGAGAT G/- GGAGTCTTGC 3070 hom 30 het 12 0 10 2 G 3 2 262874 CASAVA_Build 19 54343941 1D ACCATAACCG T/- GGGGGTGGAG 3070 hom 55 het 24 0 19 5 T 1 0 262875 CASAVA_Build 19 54348171 3I CTCCCAGCCT ---/TCA TCAGTCTGTC 3070 hom 48 het 17 0 15 2 TCA 1 2 262876 CASAVA_Build 19 54389731 4I TCTCTCTCTG ----/TCCC TCCCTCCCTC 3070 hom 41 het 22 0 11 11 TCCC 3 4 262877 CASAVA_Build 19 54403381 2I GTGGTGGAGC --/AG AGTCTTCTCT 3070 hom 36 het 16 0 11 5 AG 1 2 262878 CASAVA_Build 19 54446503 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2037 het 2037 ref 16 7 6 3 A 10 11 262879 CASAVA_Build 19 54459329 1D ACAAAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 32 1 27 4 A 11 10 262880 CASAVA_Build 19 54459969 2D CATAATTATC GT/-- GTGTGTGCGC 3070 hom 114 het 44 0 37 7 GT 4 3 262881 CASAVA_Build 19 54460287 2I TGGAGCGAGA --/CT CTGTCTCAAA 967 het 490 hom 19 3 7 10 CT 1 2 262882 CASAVA_Build 19 54461377 1D TAAAATATGT A/- AAAACAACAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 5 4 262883 CASAVA_Build 19 54463590 9D ACTCTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 27 0 25 7 A 17 8 262884 CASAVA_Build 19 54475656 4D TCCATCTCAA AAAG/---- AAAGAAAGGA 3070 hom 75 het 26 0 25 2 AAAG 3 2 262885 CASAVA_Build 19 54489700 1D TCTTCAAGAT A/- AAAAAGGCTA 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 6 5 262886 CASAVA_Build 19 54494969 1D GTGGGCACCT G/- TAATCCCAGC 3070 hom 56 het 23 0 19 4 G 1 0 262887 CASAVA_Build 19 54496422 1D ACATTTCCGT G/- GGGACTGGCA 3070 het 3070 ref 49 19 17 13 G 4 3 262888 CASAVA_Build 19 54502748 1D AATTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 2857 hom 18 het 9 0 7 2 A 12 11 262889 CASAVA_Build 19 54510867 1I GGTGTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 10 11 262890 CASAVA_Build 19 54514510 6D ATACATATAA ATACAT/------ ATACATATAC 3070 het 3070 hom 25 13 9 4 ATACAT 3 2 262891 CASAVA_Build 19 54516389 3D CTTTCATGAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 25 0 16 9 A 17 14 262892 CASAVA_Build 19 54529190 1I AGCACCTGGG -/T TGCTCCCTGG 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 1 2 262893 CASAVA_Build 19 54529736 1D CCTATCTCTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 76 het 29 0 26 3 T 9 8 262894 CASAVA_Build 19 54537297 11I GACATCCCCA -----------/CCACATCAGTT CCCTGGGTGA 3070 het 1628 hom 17 6 8 3 CCACATCAGTT 0 1 262895 CASAVA_Build 19 54543241 1D CCCAAATCAC T/- TGAGTCCAAG 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 T 2 1 262896 CASAVA_Build 19 54543559 9D GTCCCCAGAC CAGCTGCAT/--------- CAACGCACCT 3070 het 3070 ref 47 30 14 7 CAGCTGCAT 1 0 262897 CASAVA_Build 19 54549027 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1388 het 994 hom 15 5 5 5 T 13 12 262898 CASAVA_Build 19 54561505 1D AGTGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 12 11 262899 CASAVA_Build 19 54561783 1I GTTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2462 het 2462 ref 25 10 8 7 T 11 12 262900 CASAVA_Build 19 54585840 1I GGACACCATT -/C TCCTGCTTCT 3070 het 2104 hom 28 6 12 10 C 0 1 262901 CASAVA_Build 19 54587414 4D GGAGAAAGAT AGAG/---- AGAAAGAGCC 3070 het 3070 hom 48 18 22 13 AG 3 1 262902 CASAVA_Build 19 54593762 2I TATTCTTTAA --/CT CTCTCTGATT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 CT 3 4 262903 CASAVA_Build 19 54598410 1I CCACTGCACT -/C CAGCTTGGGC 655 het 655 ref 10 3 3 4 C 1 2 262904 CASAVA_Build 19 54626852 2D GAGTTTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 14 12 262905 CASAVA_Build 19 54627740 1I CAGGTGTACA -/G GGGACACTAG 1130 hom 18 het 9 0 5 4 G 3 4 262906 CASAVA_Build 19 54639196 3I TCCTTCATTC ---/CTT CTTCTTTCTC 3070 hom 48 het 24 0 15 9 CTT 2 3 262907 CASAVA_Build 19 54641217 1I GAGGATTAAC -/T AAGGGAGACT 3070 hom 63 het 25 0 19 6 T 0 1 262908 CASAVA_Build 19 54645475 3D CTTCCTATCT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 30 15 9 8 TTG 4 3 262909 CASAVA_Build 19 54647428 4I ATATAATTAG ----/AACT AAAAGCTGCA 3070 hom 73 het 31 0 23 8 AACT 0 1 262910 CASAVA_Build 19 54647783 1I AGGACGACCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 9 10 262911 CASAVA_Build 19 54653288 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 25 1 22 2 A 12 11 262912 CASAVA_Build 19 54657303 3D6M1I CCAGGTTCAG CCTGGGAGT-/---GTGATTC AGCTGCCTCA 2480 hom 18 het 7 0 7 1 N/A 0 0 262913 CASAVA_Build 19 54697487 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 421 het 421 ref 20 8 2 10 A 17 16 262914 CASAVA_Build 19 54725396 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1407 het 238 hom 10 1 4 5 T 17 18 262915 CASAVA_Build 19 54734680 1I ATGGGATGTT -/G GGGGGATCCT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 G 5 6 262916 CASAVA_Build 19 54737129 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1495 het 1495 ref 24 12 5 7 A 17 16 262917 CASAVA_Build 19 54787340 2I AAGCTGGGGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 32 het 15 0 9 6 TG 5 6 262918 CASAVA_Build 19 54897711 2I AGAAAAGAAA --/AC AAAAAAAAGA 2746 het 1894 hom 17 7 8 2 AC 0 1 262919 CASAVA_Build 19 54907931 1I GAGTGGAGCT -/G GGGCGCGCTG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 G 3 4 262920 CASAVA_Build 19 54957495 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1501 het 93 hom 13 2 5 6 T 16 14 262921 CASAVA_Build 19 54964328 1D CTCCAAAAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 9 8 262922 CASAVA_Build 19 54966518 2D TCTTTTTTTT TG/-- TGACAGTCAC 3070 het 3070 hom 21 8 11 4 TG 2 1 262923 CASAVA_Build 19 54969096 1D AGCCATGGAA G/- GGGTTTGGAG 3070 hom 105 het 37 0 34 5 G 4 3 262924 CASAVA_Build 19 54971701 2D CTCATTCCCC CT/-- GTTGCTGGCC 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 CT 1 0 262925 CASAVA_Build 19 54972903 1D AGGCTGAGAT G/- GGAGGGTCAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 3 2 262926 CASAVA_Build 19 54973972 2D TGACAAAACC AT/-- ATATATATAG 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 AT 5 4 262927 CASAVA_Build 19 54992921 3D AGGCTGAGGC AGA/--- AGGATCGCTT 3070 het 1934 hom 24 6 11 7 AGA 1 0 262928 CASAVA_Build 19 54992983 1D CCCTGTTTCC A/- AAAAATAGGA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 6 5 262929 CASAVA_Build 19 55001428 3D CCACTTTGAC CCT/--- CCTCCTCTCA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 CCT 3 2 262930 CASAVA_Build 19 55001673 1D ATCCTTCCTT C/- CTTCTATCTC 1961 het 1961 ref 22 15 6 1 C 2 1 262931 CASAVA_Build 19 55009782 1I CCTATTGATA -/T TTTTTTTTCC 2731 het 2731 ref 35 16 11 8 T 8 9 262932 CASAVA_Build 19 55023491 1D ATGGCAACCC T/- GGGGGCTGAC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 1 0 262933 CASAVA_Build 19 55036061 2D GAGCAATCGA CT/-- CTGTCAGAAG 3070 het 3070 ref 42 21 14 9 CT 2 1 262934 CASAVA_Build 19 55036849 1D CCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1165 hom 24 8 11 6 A 13 12 262935 CASAVA_Build 19 55048685 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 8 9 6 A 10 11 262936 CASAVA_Build 19 55062906 1D GAAACCTCCG C/- CCCCGACAGC 3070 het 2208 hom 23 7 10 6 C 5 4 262937 CASAVA_Build 19 55063460 1D CCTCCAGCCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 9 8 262938 CASAVA_Build 19 55082225 1I AATTTTTGCT -/A ACAGCGTATC 3070 het 2050 hom 22 6 14 2 A 1 2 262939 CASAVA_Build 19 55090394 1I CCTTCTGTAT -/G GGAGGTGGGG 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 G 2 3 262940 CASAVA_Build 19 55091197 1I TGTTCCAGAG -/C CCCCTCCCCT 3070 het 1875 hom 25 6 11 8 C 4 5 262941 CASAVA_Build 19 55092545 7D CTGTCAAATG ACGTCTA/------- CAGACGTCAC 2922 het 2922 ref 25 13 7 6 ACGTCTA 1 0 262942 CASAVA_Build 19 55101279 2D ATGACTTAAC AT/-- GTGTGTATAT 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 AT 1 0 262943 CASAVA_Build 19 55108077 2D CCAGAGTCAA AT/-- GTCAGCTCTA 3070 het 2422 hom 34 8 16 11 AT 1 0 262944 CASAVA_Build 19 55114879 5I TTAATATAAA -----/AGAAT AGGACTGGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AGAAT 0 1 262945 CASAVA_Build 19 55135380 1I ACTGCCACCA -/C TCATGCCATG 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 C 0 1 262946 CASAVA_Build 19 55163522 1D AGTGAGACTC A/- AAAAAAAAAA 1744 het 1744 ref 43 26 4 13 A 14 13 262947 CASAVA_Build 19 55188094 2I GCAGACCAGG --/AC AGGGAGCCCC 3070 het 3070 ref 45 18 15 12 AC 0 1 262948 CASAVA_Build 19 55202398 4I AGGGCACATG ----/CCTT CCAACTGGCC 1810 het 1810 ref 28 7 6 15 CCTT 0 1 262949 CASAVA_Build 19 55231039 1I TTTGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3009 hom 40 11 19 10 T 10 11 262950 CASAVA_Build 19 55243944 7I TGGTGGCGAT -------/CATTGCC CAGTAAGAGG 3070 hom 108 het 39 0 33 6 CATTGCC 0 1 262951 CASAVA_Build 19 55285644 10I AGGCAGAGGT ----------/TACAGTGAGA CGAGATCATA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 TACAGTGAGA 0 1 262952 CASAVA_Build 19 55345611 1I TGCTATTATT -/A AAAAAACGCG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 6 7 262953 CASAVA_Build 19 55349599 1D GACCCATCCA G/- GGGAGTCGCC 3070 hom 80 het 28 0 23 5 G 4 3 262954 CASAVA_Build 19 55352757 1I CACTTTGGGA -/G GCCGAGTGGA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 G 1 2 262955 CASAVA_Build 19 55356196 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1349 het 1349 ref 21 9 7 5 T 15 14 262956 CASAVA_Build 19 55362932 1D ACACCCGCCA G/- GGGCACGCAG 3070 hom 83 het 33 0 26 7 G 4 3 262957 CASAVA_Build 19 55389816 1D TGAATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2524 het 794 hom 32 8 9 15 T 17 16 262958 CASAVA_Build 19 55412044 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 8 9 262959 CASAVA_Build 19 55414081 1D GTATATATAT A/- TTTTTTATAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 1 0 262960 CASAVA_Build 19 55426804 4I AAAAAAAAAT ----/AGAG AGAGACAGAG 3070 hom 43 het 22 0 15 7 AG 2 4 262961 CASAVA_Build 19 55427507 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAGTTA 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 A 6 7 262962 CASAVA_Build 19 55433018 3I CATGGTGGAA ---/ACC ACGTCTGACC 3070 hom 78 het 35 0 26 9 ACC 0 1 262963 CASAVA_Build 19 55451907 4D ATCACTGTTT TCTC/---- TCTCTATGCC 3070 het 3070 ref 50 30 16 5 TC 4 2 262964 CASAVA_Build 19 55455818 2I GCGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 106 het 46 0 34 12 GT 6 7 262965 CASAVA_Build 19 55455830 2I GTGTGTGTGT --/GC GCGTGCATGA 3070 hom 111 het 39 0 34 5 GC 1 2 262966 CASAVA_Build 19 55459657 2I ACAGTGACGT --/CA CAGTATGCAG 3070 het 3070 hom 52 22 26 4 CA 1 2 262967 CASAVA_Build 19 55489806 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 10 11 262968 CASAVA_Build 19 55491949 1I GCAACGTTTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 7 8 262969 CASAVA_Build 19 55505914 1I ACTCTTAAGT -/G TTTGCAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 G 0 1 262970 CASAVA_Build 19 55521992 1I TTTGCACGGC -/G GGGGGGGGAG 3070 hom 54 het 25 0 16 9 G 8 9 262971 CASAVA_Build 19 55533170 4I TTAATTTCAC ----/TCTT TTTTTTTTCC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TCTT 0 1 262972 CASAVA_Build 19 55541571 1D CTTCAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 211 hom 24 3 11 10 T 17 16 262973 CASAVA_Build 19 55548376 24D CTCTGTCTCA AAATAAATAAATAAATAAATAAAT/------------------------ AAATAAATAA 3070 hom 32 het 14 0 11 7 AAAT 11 5 262974 CASAVA_Build 19 55552046 3D ACAATAATAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 1762 hom 21 5 13 3 AAT 6 5 262975 CASAVA_Build 19 55552169 1I CCCCGCTTTG -/T TTTTCTCAGT 2596 het 2354 hom 20 8 7 5 T 4 5 262976 CASAVA_Build 19 55573633 3I AAGATTCGGA ---/AAC AACAGCAGCA 3070 hom 62 het 23 0 20 3 AAC 1 2 262977 CASAVA_Build 19 55578003 1I CGGGAGACCA -/G GGGCCTTCCT 3070 hom 51 het 19 0 15 4 G 3 4 262978 CASAVA_Build 19 55623608 1I TGCCTGGGGT -/C CCTCTGGGAT 3070 hom 57 het 23 0 18 5 C 2 3 262979 CASAVA_Build 19 55657939 2D TCTTTGTCCC CT/-- GACTGCCAGG 3070 het 3070 ref 20 9 10 1 CT 1 0 262980 CASAVA_Build 19 55661797 3D ACTGGACAAA CTC/--- CTGCCAGGCA 2981 het 2981 ref 27 14 8 7 CTC 1 0 262981 CASAVA_Build 19 55669252 1D TTATTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2095 hom 25 5 12 8 T 11 10 262982 CASAVA_Build 19 55685192 1D GTCTTAACAA T/- TTTTTTTTTG 1537 het 1537 ref 15 5 5 5 T 10 9 262983 CASAVA_Build 19 55688296 1I GTAGAAGGAG -/A AATGGGGAGG 3070 hom 90 het 34 0 26 8 A 2 3 262984 CASAVA_Build 19 55688752 1D GAGAGTCGCC T/- TGGTACACAG 3070 hom 28 het 16 0 10 7 T 2 1 262985 CASAVA_Build 19 55711497 4D CTCAATTAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 982 hom 24 4 15 5 AAAT 3 2 262986 CASAVA_Build 19 55711741 3I CCTTTGTTAT ---/AAG AAGTCTCCAC 2686 het 2435 hom 19 8 8 3 AAG 1 2 262987 CASAVA_Build 19 55760911 4D GCTCCCCGAC TCTT/---- TCTTTCGGAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 TCTT 2 1 262988 CASAVA_Build 19 55761648 1I GGCGAAGGGG -/T TGGAGGGGTG 2497 het 2159 hom 17 8 7 2 T 1 2 262989 CASAVA_Build 19 55764453 1I AGTCTTGGGC -/T TGGGGGTACC 3070 hom 83 het 34 0 27 7 T 1 2 262990 CASAVA_Build 19 55766724 1D AAAAACAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 10 9 262991 CASAVA_Build 19 55783197 1D CCTCATATGT A/- AAAACGGGGA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 5 4 262992 CASAVA_Build 19 55787852 4D TTCCTTCCTT CCTC/---- CCTCCCTCCC 3070 hom 46 het 24 0 15 9 CCTC 4 3 262993 CASAVA_Build 19 55793117 1D AAGTGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1929 het 1929 ref 38 19 6 13 T 13 12 262994 CASAVA_Build 19 55795573 1D GTTCCTTGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 9 262995 CASAVA_Build 19 55810667 1D CATAACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 29 1 18 10 T 12 11 262996 CASAVA_Build 19 55817119 1D GCCAGACGCA G/- GGGTGTGGCG 3070 hom 34 het 14 0 11 3 G 4 3 262997 CASAVA_Build 19 55822796 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1084 het 36 hom 15 1 8 6 A 19 18 262998 CASAVA_Build 19 55828268 1I CCCAGGCTGG -/T CTCGAACTCC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 0 1 262999 CASAVA_Build 19 55855792 1D TGAAAATGCT G/- GGGGGGGGGG 1802 het 198 hom 19 1 5 13 G 11 10 263000 CASAVA_Build 19 55856809 2D CTCCCCGCTT CA/-- CACACACACA 3070 hom 51 het 23 0 19 5 CA 8 7 263001 CASAVA_Build 19 55857881 2I AGAGACGGAG --/GA GAGAGACGGG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 GA 3 4 263002 CASAVA_Build 19 55858352 2I CAGGGGACAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 49 16 15 18 AG 6 7 263003 CASAVA_Build 19 55858832 2D AAAAGAAAAG AA/-- AAAAAAAATC 1562 het 1562 ref 27 14 4 9 A 10 8 263004 CASAVA_Build 19 55859192 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2850 het 182 hom 15 1 8 6 T 15 14 263005 CASAVA_Build 19 55861094 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 945 het 945 ref 14 5 4 6 A 13 12 263006 CASAVA_Build 19 55865721 1D CTTGGCCCCT G/- CTACACAGGC 3070 het 3070 hom 40 17 14 9 G 1 0 263007 CASAVA_Build 19 55866557 1I CGGCCCACTC -/T TTTTTTTTGT 2116 het 1865 hom 15 6 6 3 T 8 9 263008 CASAVA_Build 19 55871209 1D TCACCCCCAA T/- TTTTTTTTTT 2528 het 2528 ref 28 12 6 10 T 12 11 263009 CASAVA_Build 19 55881118 1I GATTTGAGGG -/A AAAGGGGATA 3070 het 3070 ref 51 22 19 10 A 3 4 263010 CASAVA_Build 19 55888707 1D TGCTGTGCAC G/- GGCGCACCCC 3070 hom 60 het 25 0 16 9 G 3 2 263011 CASAVA_Build 19 55892103 1I CGTTCACACG -/C CCCCCCAGGC 3070 het 2184 hom 28 10 11 7 C 6 7 263012 CASAVA_Build 19 55902634 1D TTCTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2559 het 723 hom 22 4 10 8 T 15 14 263013 CASAVA_Build 19 55931880 6D GGTGTTGTTG GTTTTT/------ GTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 14 11 12 GTTTTT 3 2 263014 CASAVA_Build 19 55937644 1D TACGGTGAAA C/- CCCCGTCTCT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 C 5 4 263015 CASAVA_Build 19 55960487 1D TTGAACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 692 hom 28 2 18 8 T 13 12 263016 CASAVA_Build 19 55969019 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2895 hom 19 het 17 0 10 7 A 17 16 263017 CASAVA_Build 19 55969498 2D TCTCTCTCTC TG/-- TCACACACAC 581 het 53 hom 21 1 9 11 TG 1 0 263018 CASAVA_Build 19 55971358 1I CCTCATTAAA -/T TTTTTTTTTG 2912 het 2912 ref 25 14 8 3 T 9 10 263019 CASAVA_Build 19 55980781 1D GGGCAGTGGG T/- CGGCGGAGCA 2416 het 2416 ref 28 15 9 4 T 1 0 263020 CASAVA_Build 19 56007297 1I GATTATTCCA -/G GGCAGTGAGG 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 2 3 263021 CASAVA_Build 19 56017732 1I GAGGGAGGCG -/T TGAGTGGCAG 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 1 2 263022 CASAVA_Build 19 56023017 1D CCCTGTTTTT G/- TTTGTTGTTG 3055 hom 32 het 34 0 11 24 G 1 0 263023 CASAVA_Build 19 56041297 1I CGTTTCTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 18 4 10 4 A 11 12 263024 CASAVA_Build 19 56041763 2D ATTAAGAATC TT/-- TTATTCTTTT 2806 het 2806 ref 28 17 7 4 T 4 2 263025 CASAVA_Build 19 56042745 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2778 hom 22 9 8 5 T 11 10 263026 CASAVA_Build 19 56045713 1I GTACACCTTG -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 113 het 43 0 35 8 C 8 9 263027 CASAVA_Build 19 56062249 1I AGAGGGGTCC -/A ACCATCTTGT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 1 2 263028 CASAVA_Build 19 56066892 1I TGAAATCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 T 10 11 263029 CASAVA_Build 19 56077088 1I AATGACAAAA -/T TGGGAAGAGA 3070 hom 88 het 35 0 30 5 T 1 2 263030 CASAVA_Build 19 56078847 4I TCTCTATAGG ----/TTAC TTGTTTTTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTAC 0 1 263031 CASAVA_Build 19 56085309 1I TCCAAAGCAA -/T TTTTTTTTTC 3034 het 3034 ref 30 15 8 7 T 9 10 263032 CASAVA_Build 19 56086593 2I AAGCTCTGTG --/TA TGTGTGTGTG 3070 het 116 hom 37 5 21 11 TA 0 1 263033 CASAVA_Build 19 56086647 1I CACCTATGTC -/T TTTTTTTTTT 2562 het 2562 ref 36 8 7 21 T 10 11 263034 CASAVA_Build 19 56096149 1D TGCCTGTGAA T/- TTTTTTTTTT 2589 het 2589 ref 18 9 7 2 T 15 14 263035 CASAVA_Build 19 56099095 1I GCGAAGGAGG -/A AAAATGACCT 3070 hom 33 het 15 0 11 4 A 4 5 263036 CASAVA_Build 19 56104178 1D CCTTCCCTCT G/- GGGCTCCCCG 3070 hom 39 het 14 0 11 3 G 4 3 263037 CASAVA_Build 19 56107927 4I AGGACTGCCG ----/AGAC AGAAACAGCG 1853 het 1853 ref 24 10 7 7 AGAC 0 1 263038 CASAVA_Build 19 56108863 2D CATCTTTCTC TG/-- TGTCTCTCTC 1416 het 1416 ref 53 37 4 12 TG 2 1 263039 CASAVA_Build 19 56113916 1D CTCTTACTGA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 9 8 263040 CASAVA_Build 19 56114450 2I AGCTTTAAGA --/TG TGTCACCTGC 3070 het 3070 hom 53 18 22 13 TG 1 2 263041 CASAVA_Build 19 56117340 10I TTTAATCTCC ----------/TGAACATCCT ATGAGGTGGG 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 TGAACATCCT 0 1 263042 CASAVA_Build 19 56126325 1I TTCAGTCTCT -/C TCTCTCTCTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 0 1 263043 CASAVA_Build 19 56133794 3I TAAGATTAAG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 10 13 263044 CASAVA_Build 19 56140171 1D CCTTCGTCTC T/- TTTTTTTTTC 1259 het 1259 ref 32 22 3 8 T 10 9 263045 CASAVA_Build 19 56142727 2D AAATACCTAC CA/-- GATTTCTCTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 4 CA 1 0 263046 CASAVA_Build 19 56147980 1D ACCTCTCCTT C/- CCTGCCTGCT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 3 2 263047 CASAVA_Build 19 56157013 1I TCCCCAGTCA -/C CCCCCCAACC 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 C 6 7 263048 CASAVA_Build 19 56162773 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2575 het 2575 ref 21 11 6 5 A 11 10 263049 CASAVA_Build 19 56163627 1I GGCCTCCGGG -/C CTCCGGGGAT 2446 hom 26 het 11 0 9 2 C 1 2 263050 CASAVA_Build 19 56166008 1D CAGGTAACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 10 10 12 A 10 9 263051 CASAVA_Build 19 56166709 1I ATCACCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 25 4 T 10 11 263052 CASAVA_Build 19 56169813 1I TTTGACATTC -/T TTAAACTTGA 1170 het 521 hom 12 2 3 7 T 2 3 263053 CASAVA_Build 19 56172484 4D CAGGGCATGA GGTT/---- GGTTTAAATA 3070 het 3070 hom 36 16 18 4 GGTT 2 1 263054 CASAVA_Build 19 56176437 1D ACCCAGAGAG A/- GGGGGACAGA 3070 het 2368 hom 24 10 8 6 A 1 0 263055 CASAVA_Build 19 56189529 1I TATTTTCTAA -/G AGATCCTAGT 3070 het 3070 hom 54 24 23 7 G 0 1 263056 CASAVA_Build 19 56196574 2D GCCTGATGTC TG/-- TATCTGAGTA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 TG 1 0 263057 CASAVA_Build 19 56207838 1D AGGTGCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 11 10 263058 CASAVA_Build 19 56209131 11I AGCCTAGCTC -----------/GTGCCAAGGCA GGAGGAACTG 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 GTGCCAAGGCA 0 1 263059 CASAVA_Build 19 56209404 1D ATGACAATCA C/- CATGAAGATT 3070 het 3070 ref 63 34 24 5 C 2 1 263060 CASAVA_Build 19 56213280 1I AGAGAGAAAG -/A AAAAAAACAA 1211 het 1211 ref 26 10 4 12 A 7 8 263061 CASAVA_Build 19 56227273 2I CACGGACACT --/CC CAGGCGCTCC 1272 het 1272 ref 34 13 8 13 C 1 3 263062 CASAVA_Build 19 56230671 1I CCACAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 10 11 263063 CASAVA_Build 19 56231161 1D AACAAACCAA G/- GAGAAAAGCA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 G 2 1 263064 CASAVA_Build 19 56232964 3D ACTAGGCCGA GGT/--- GGGCAGATCA 2740 het 1062 hom 20 5 10 5 GGT 1 0 263065 CASAVA_Build 19 56232984 1D TCACTTGAGA C/- CAGGAGTTCG 2710 het 195 hom 16 1 9 7 C 2 1 263066 CASAVA_Build 19 56233333 1D CGTATCCTAT G/- GGCTTCCTTT 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 G 3 2 263067 CASAVA_Build 19 56236809 1I TCTCTGGAGG -/A AAAAAAAAAA 2592 het 2592 ref 30 19 8 3 A 14 15 263068 CASAVA_Build 19 56237373 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 8 16 2 A 10 9 263069 CASAVA_Build 19 56241462 4D TCTTTCTTTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 2674 hom 22 10 12 0 CTTT 3 2 263070 CASAVA_Build 19 56246216 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAATAGG 2536 het 2536 ref 16 7 7 2 A 6 7 263071 CASAVA_Build 19 56252203 9I GGTACTAAAT ---------/CCCACCTTG CACCCCCTGC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 CCCACCTTG 0 1 263072 CASAVA_Build 19 56258057 1I GAGATTTAAG -/T TAACGTTAAA 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 T 1 2 263073 CASAVA_Build 19 56258452 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAGCTA 3070 het 3070 ref 47 26 18 5 A 7 6 263074 CASAVA_Build 19 56263675 3I GAAAATTCAG ---/AGA AGGACAGAGG 3070 het 3070 ref 41 15 17 9 AGA 0 1 263075 CASAVA_Build 19 56270437 1D TGGATAAAGG A/- AATGTAATAT 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 A 3 2 263076 CASAVA_Build 19 56276459 1I CTGTGTTTTT -/G GTTCCAGGCT 2888 het 2888 ref 31 12 13 6 G 1 2 263077 CASAVA_Build 19 56281198 4I ATAAATAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 1655 het 1655 ref 23 15 6 2 AAAC 2 3 263078 CASAVA_Build 19 56282164 1I AGTTGAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2626 hom 29 9 13 7 T 10 11 263079 CASAVA_Build 19 56283289 1I GTGGCGCACG -/C CTGTCGTCCC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 C 1 2 263080 CASAVA_Build 19 56292160 1D50M7I TCTCTCATCA TTTTTTTTTTAATTTGTAGCATTCATCACTACCTGACATTACATATTGATG-------/-TTTTTTTTTAATTTGTAGCATTCATCACTACCTGACATTACATATTGATGTGCTTAC TGCTTGCTGT 3070 het 3070 hom 43 26 28 7 N/A 0 0 263081 CASAVA_Build 19 56292584 2D CGGGAAGTTT GA/-- GATTCTCACA 3070 het 1619 hom 17 5 10 2 GA 2 1 263082 CASAVA_Build 19 56297907 1I TCTTACCCGC -/T TTTACCTCTT 3070 het 3070 hom 48 20 26 2 T 3 4 263083 CASAVA_Build 19 56322596 1I GGATGGGGCC -/T GGACAGGTGT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 0 1 263084 CASAVA_Build 19 56364441 1I TCCCCCAGGG -/A AAACGGAGAC 3070 het 3070 ref 41 19 9 13 A 3 4 263085 CASAVA_Build 19 56368497 1I CCGTATGTGC -/A AGAAGTTCAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 2 263086 CASAVA_Build 19 56398591 1D ATTACACAGG A/- AAAAAAAAAG 1852 het 1852 ref 42 33 4 5 A 10 9 263087 CASAVA_Build 19 56402467 1D TCTTATTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 714 hom 36 3 18 15 T 17 16 263088 CASAVA_Build 19 56422286 14D GATTTCCTTT CCTTTCTATAAATG/-------------- CCCAGTAGTG 3070 het 3070 hom 46 19 25 5 CCTTTCTATAAATG 1 0 263089 CASAVA_Build 19 56425245 1I62M1I TATAGTTTGC -ATGTTTCCCTTGGTATTGATTTTTAGTTTTATTCAATTGTAGTCAAATAAGATACTTGATAC-/AATGTTTCCCTTGGTATTGATTTTTAGTTTTATTCAATTGTAGTCAAATAAGATACTTGATACA ATTTTGGTTT 3070 hom 78 het 39 0 31 26 N/A 0 0 263090 CASAVA_Build 19 56425393 1I78M1I TGATGAAACC -ATGTGTATTCTGCAGCTGTCGGTTGAAATGTTCTGTAAATATCTTAGGTTCATTTGGTATATGGTGCAGTTTAAATCC-/AATGTGTATTCTGCAGCTGTCGGTTGAAATGTTCTGTAAATATCTTAGGTTCATTTGGTATATGGTGCAGTTTAAATCCA ACGTTTATTT 3070 hom 24 het 23 1 37 8 N/A 0 0 263091 CASAVA_Build 19 56442493 1I GCCCAATTTC -/T TTTTTTTTTT 1685 het 1685 ref 26 17 4 5 T 11 12 263092 CASAVA_Build 19 56444531 1D CTGTCACATT A/- AAAAAAAAAA 855 het 855 ref 43 32 4 7 A 12 11 263093 CASAVA_Build 19 56445805 1I CCACAAACTA -/C CCTGGCACCG 3070 hom 86 het 36 0 23 13 C 2 3 263094 CASAVA_Build 19 56454203 1I4M1I5M1I AGTCTTATAC -CTGC-ATTCC-/ACTGCAATTCCA AAAAGGTTGG 3070 hom 96 het 33 0 33 3 N/A 0 0 263095 CASAVA_Build 19 56454270 1I ATAGGATTAC -/A AAAGTGGATG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 3 4 263096 CASAVA_Build 19 56473477 13D TTTATTTCTC AAATATCTCTCTT/------------- AAATATATCA 3070 hom 53 het 21 0 18 6 AAATATCTCTCTT 1 0 263097 CASAVA_Build 19 56507799 1I GGTTAAAGCA -/G GGTTGAAGGG 3070 hom 57 het 23 0 15 8 G 2 3 263098 CASAVA_Build 19 56509291 1I ACTCTTGCTG -/C CCAGGCTGGA 2588 hom 23 het 11 0 7 4 C 2 3 263099 CASAVA_Build 19 56510220 1I ATTTATTTAC -/A AAAGCAGCTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 3 4 263100 CASAVA_Build 19 56511249 2D CCATATCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 2192 hom 29 het 15 0 10 5 A 16 14 263101 CASAVA_Build 19 56513792 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 68 het 27 0 22 7 CT 2 1 263102 CASAVA_Build 19 56520909 2D ACATCTCTGC CT/-- CTCTCTTCTG 3070 het 1563 hom 36 10 16 10 CT 4 3 263103 CASAVA_Build 19 56527705 1I TGGGGTCTGT -/G GCCTGGAAGA 3070 hom 89 het 34 0 28 6 G 1 2 263104 CASAVA_Build 19 56539051 1I GATCTGAGTA -/G GCTGTGTGAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 2 263105 CASAVA_Build 19 56541520 1I GCGAACCCAT -/C CTACTGGCCA 3070 hom 113 het 40 0 35 5 C 1 2 263106 CASAVA_Build 19 56543735 5D GTAGGTAAAT AACTC/----- AACGAAGCTG 3070 hom 40 het 28 0 14 14 AACTC 1 0 263107 CASAVA_Build 19 56543766 4D AAAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 504 hom 10 het 22 0 4 18 AAAC 5 4 263108 CASAVA_Build 19 56544923 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTCCCTCAGC 3070 hom 42 het 16 0 13 3 CTC 1 2 263109 CASAVA_Build 19 56555833 4D TTTCTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 57 het 29 0 20 10 TC 11 9 263110 CASAVA_Build 19 56560706 2I GCCAGGCGCT --/CA GAGAGCACCC 3070 hom 78 het 33 0 25 8 CA 0 1 263111 CASAVA_Build 19 56565313 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1045 hom 33 3 27 3 A 12 11 263112 CASAVA_Build 19 56585050 1D TTTCTAGCTC T/- TTTTTTTTTT 1379 het 1379 ref 29 19 3 7 T 12 11 263113 CASAVA_Build 19 56614423 1I TAATTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 T 11 12 263114 CASAVA_Build 19 56618871 1I TAGAGAGAAG -/A AAAATCAGAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 4 5 263115 CASAVA_Build 19 56629154 4I CCTTGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TTTG 2 3 263116 CASAVA_Build 19 56635362 1D TGCAGAGCTG T/- TGCTTCTCCA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 2 1 263117 CASAVA_Build 19 56672051 4D ACATAAATAT GTAA/---- GTATGTAAAT 3040 het 3040 ref 17 9 7 2 GTAA 1 0 263118 CASAVA_Build 19 56688260 6D TCTTGGACTT CACAGC/------ AGCAGAGGAC 3070 het 3070 ref 52 29 22 4 CACAGC 1 0 263119 CASAVA_Build 19 56696604 1I TGGTCCCCTG -/C CCCGGAACCA 3070 hom 94 het 38 0 24 14 C 3 4 263120 CASAVA_Build 19 56699433 1D ACAGAAAGAT G/- AAGGAAAGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 1 0 263121 CASAVA_Build 19 56700162 1I AGGAAGACCA -/G GGCTGGGGCT 3070 hom 45 het 21 0 14 7 G 2 3 263122 CASAVA_Build 19 56705071 1D TGTATTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 22 2 12 8 A 15 14 263123 CASAVA_Build 19 56706770 2D TCAGTTAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 42 3 22 17 T 12 10 263124 CASAVA_Build 19 56715666 1I TGGTCTTGAA -/C CCCTGGGCTC 3070 hom 69 het 25 0 20 5 C 3 4 263125 CASAVA_Build 19 56716134 1D AAAGCAGGGG C/- AGGAGTGGCA 3070 hom 114 het 44 0 39 6 C 1 0 263126 CASAVA_Build 19 56722571 1I AGCATAAATA -/C CCCCCAGCAA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 C 5 6 263127 CASAVA_Build 19 56728083 1I GTCCTCCCCC -/T ATCTGACCCT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 0 1 263128 CASAVA_Build 19 56729028 1D CTTGTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 323 hom 44 2 37 6 T 12 11 263129 CASAVA_Build 19 56733280 1I CCCCCCCTCA -/C CCTGGTTGCT 3070 hom 86 het 36 0 27 9 C 2 3 263130 CASAVA_Build 19 56741036 3I ACTGCAGCTG ---/GAA TTCCAGAACC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 GAA 0 1 263131 CASAVA_Build 19 56741130 1D CCGCAGCCTA T/- GCAGGGTCAG 3070 het 3070 ref 32 14 12 7 T 1 0 263132 CASAVA_Build 19 56749807 1I CAAATTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 11 19 13 T 14 15 263133 CASAVA_Build 19 56757554 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 859 hom 19 2 8 9 A 13 12 263134 CASAVA_Build 19 56758995 1I GGGAGCATCC -/T TTTGGTCCCT 3070 hom 123 het 47 0 40 7 T 3 4 263135 CASAVA_Build 19 56763622 1I GATTTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 A 10 11 263136 CASAVA_Build 19 56768341 1I TCTGGCTCCT -/G GGGAAAAGTG 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 G 3 4 263137 CASAVA_Build 19 56768472 6D GCGAGGTAAA CAGGGG/------ CAGCCCTGGG 3070 het 3070 ref 36 19 17 0 CAGGGG 1 0 263138 CASAVA_Build 19 56768843 8D CTTGGTCCAT GGGGTTTG/-------- GCCCGTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 GGGGTTTG 1 0 263139 CASAVA_Build 19 56771218 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2275 het 763 hom 16 4 8 4 T 15 14 263140 CASAVA_Build 19 56771845 12D GTTCCTTGTG TCTTGAATCCTT/------------ TCTTGAATCC 3070 het 3070 ref 37 24 15 1 TCTTGAATCCTT 2 1 263141 CASAVA_Build 19 56772535 1I TTACTGCCTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 6 7 263142 CASAVA_Build 19 56780546 6D TTGCTACAAT AAGAAA/------ AAGTTAACAA 3070 het 3070 hom 43 19 25 0 AAGAAA 1 0 263143 CASAVA_Build 19 56789373 1I AGAAAATCTG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 A 8 9 263144 CASAVA_Build 19 56790784 4D CCTCCCTGTT CCCC/---- CCCCCCCAGT 3070 het 416 hom 29 7 13 10 C 11 7 263145 CASAVA_Build 19 56794045 2D TCATCTTAGT GA/-- GAGATGAAGC 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 GA 3 2 263146 CASAVA_Build 19 56795896 1I GGTCCGGTTT -/C CCCCATCAGT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 C 4 5 263147 CASAVA_Build 19 56807156 19I TCTAATTCCA -------------------/TCATCTGTTTTCTTTCTGC TCTGCTTGGA 3070 hom 151 het 51 0 51 6 TCATCTGTTTTCTTTCTGC 0 1 263148 CASAVA_Build 19 56817532 1I CATTAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 11 12 263149 CASAVA_Build 19 56820030 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 50 het 18 0 17 1 A 7 6 263150 CASAVA_Build 19 56837009 1I44M6D CTTAAAAGTT -AAAAAAAATCATATCAAGCATGTGTATTTATTAAAATGGAACTTAAAAAG/AAAAAAAAATCATATCAAGCATGTGTATTTATTAAAATGGAACTT------ AAAGTAGTAA 3070 hom 84 het 26 0 29 10 N/A 0 0 263151 CASAVA_Build 19 56837571 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 12 13 263152 CASAVA_Build 19 56848020 1D CAGAGAAATA C/- AAATCAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 C 1 0 263153 CASAVA_Build 19 56851217 2D ATTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 18 1 10 7 A 13 11 263154 CASAVA_Build 19 56851797 6D AGAAAGAAAG AAAAGA/------ AAAAGAAAAA 3070 het 2748 hom 20 7 10 6 AAAAGA 3 2 263155 CASAVA_Build 19 56853008 3D TCTCAAAAAA AAG/--- AAGGAGAAGG 3070 het 1116 hom 27 4 19 6 AAG 2 1 263156 CASAVA_Build 19 56856534 3I ATAATTAAGG ---/AGA AGATGATGAC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AGA 1 2 263157 CASAVA_Build 19 56858295 1I ATTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2354 het 2160 hom 18 6 7 5 T 10 11 263158 CASAVA_Build 19 56858381 8D CCGCCTCTCA GGTTCAGC/-------- GATTCTCCTG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 GGTTCAGC 1 0 263159 CASAVA_Build 19 56867087 5I GGTTATGTCC -----/TTTAT TTTATTTCTG 3070 hom 94 het 36 0 32 4 TTTAT 1 2 263160 CASAVA_Build 19 56869604 2I ACTTTTTTCA --/TC TGTTTAATTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TC 0 1 263161 CASAVA_Build 19 56872010 8D AACTCTGGAC ACATCTGA/-------- ACATCTGAAG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 ACATCTGA 2 1 263162 CASAVA_Build 19 56872771 3D TTTTCATGGC TGT/--- TGTTACAATT 3070 hom 175 het 63 0 59 5 TGT 2 1 263163 CASAVA_Build 19 56873752 1I GATCAAAGTA -/C CATCCATGAA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 1 2 263164 CASAVA_Build 19 56879011 1D GAAACTAAAA C/- AATATATATG 3070 het 3070 ref 56 30 19 7 C 1 0 263165 CASAVA_Build 19 56879130 1I GCTCACAGAC -/G AATGAATGAT 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 G 0 1 263166 CASAVA_Build 19 56889799 1I AAGGCAGCTC -/T TAAGAGCCAG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 1 2 263167 CASAVA_Build 19 56896302 5D TAAAATAAAG GAAAT/----- GAAAGGTGGG 3070 hom 69 het 26 0 21 7 GAAAT 1 0 263168 CASAVA_Build 19 56897643 1D AGCATCGGGC A/- AGGGTTCTTC 3070 hom 65 het 26 0 19 7 A 2 1 263169 CASAVA_Build 19 56900090 1I GGTGTCCAGG -/C CTCCGGGACC 3070 hom 69 het 24 0 20 4 C 1 2 263170 CASAVA_Build 19 56901736 1I ATGTTAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2110 hom 35 9 15 11 T 12 13 263171 CASAVA_Build 19 56902296 2D TCTCTCTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 33 1 17 15 T 16 14 263172 CASAVA_Build 19 56903423 2I ATAAGAAAAC --/AA AGTAAAATAC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 1 3 263173 CASAVA_Build 19 56906844 1I AGGAAGTCAC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 8 9 263174 CASAVA_Build 19 56907618 2D AGAACTGCTG GA/-- GTGAAGTCTT 3070 hom 96 het 38 0 34 4 GA 1 0 263175 CASAVA_Build 19 56913302 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 13 12 263176 CASAVA_Build 19 56923968 1D CCTGACCCCC T/- TTACTCTCTT 3070 het 3070 hom 43 15 20 9 T 3 2 263177 CASAVA_Build 19 56924539 1I TGTCTGGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 56 het 23 0 19 4 A 9 10 263178 CASAVA_Build 19 56932174 1D TCTGATTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 A 10 9 263179 CASAVA_Build 19 56933038 3D TGATAGACAG TTC/--- TTCTACTGTA 3070 het 3070 hom 35 11 23 1 TTC 2 1 263180 CASAVA_Build 19 56933303 1D ATTCTGGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 33 0 28 5 T 10 9 263181 CASAVA_Build 19 56942287 1D AGATTACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 13 17 T 15 14 263182 CASAVA_Build 19 56959897 1D TGCATCAACA T/- TTTTTTTTTT 1530 het 1530 ref 42 30 4 8 T 11 10 263183 CASAVA_Build 19 56961448 1D ACATCCTACT G/- TGTCCAGAAC 3070 hom 94 het 35 0 29 6 G 1 0 263184 CASAVA_Build 19 56973540 4D ATTGGGGAGG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 hom 78 het 37 0 26 12 TGTT 6 5 263185 CASAVA_Build 19 56976618 1I AGCAGGACTG -/C TAATGCCCCA 3070 het 3070 hom 50 20 28 2 C 0 1 263186 CASAVA_Build 19 56977309 3D GAGAAGGAGG AGA/--- AGAAGAAACA 3070 het 3070 ref 51 28 15 9 AGA 3 2 263187 CASAVA_Build 19 56978469 1I AAAAAAAAAA -/C ACTCTGTAGC 3070 het 199 hom 19 1 10 8 C 0 1 263188 CASAVA_Build 19 56985952 4I TCTAGCACTC ----/ACAT ACAAACTCTT 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 ACAT 0 1 263189 CASAVA_Build 19 56986427 1D ACTTTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 9 A 11 10 263190 CASAVA_Build 19 56990034 1D TCATCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 1693 het 1693 ref 41 25 6 10 A 15 14 263191 CASAVA_Build 19 56990118 1D CCTGCTGCAC A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 8 7 263192 CASAVA_Build 19 56992375 2D AGACATTCTC TT/-- TGGATGTTTG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 3 1 263193 CASAVA_Build 19 57006158 4D TTTTTAGATT CAGC/---- CTGTTGTCCC 3070 het 3070 ref 29 12 12 8 CAGC 1 0 263194 CASAVA_Build 19 57009552 4I GTTTTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 TTTG 2 3 263195 CASAVA_Build 19 57014563 1D TATGATATGG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 48 22 20 6 A 8 7 263196 CASAVA_Build 19 57023020 1I CCTAAAGTTA -/T TTGCATTTCC 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 2 3 263197 CASAVA_Build 19 57027508 1D GCAGCCTCTG C/- CCCCTGGGCT 3070 het 2574 hom 23 7 13 3 C 5 4 263198 CASAVA_Build 19 57027891 1D TTTTTACGTA T/- GTCAAAAGTC 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 T 1 0 263199 CASAVA_Build 19 57028249 11I TTATCTTCTT -----------/ATTTCAAACTC ATTTCAAAGA 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 ATTTCAAACTC 0 1 263200 CASAVA_Build 19 57028347 14D CGGGAATCAT CTTATTTGTTTCCC/-------------- CTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 40 25 14 2 CTTATTTGTTTCCC 1 0 263201 CASAVA_Build 19 57028504 4D AGTAGTTATG TTGA/---- TTGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 16 6 TTGA 1 0 263202 CASAVA_Build 19 57029125 1D ACACAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 15 5 T 11 10 263203 CASAVA_Build 19 57029756 1D GTGCACACGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 11 10 263204 CASAVA_Build 19 57031433 1I TTCAAATAAA -/T TGTACTTATG 3070 het 3070 hom 48 16 23 9 T 1 2 263205 CASAVA_Build 19 57032292 15D CCCAGGTTCC CTATCACCTATGTTG/--------------- CTATCACCTA 2692 het 2692 ref 34 24 9 7 CTATCACCTATGTTG 2 1 263206 CASAVA_Build 19 57033425 2I AATGAAAGAC --/TT TGTCATTAGC 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 1 3 263207 CASAVA_Build 19 57047669 2I TACCTCTAAC --/AA AGAGGTAAGC 3070 hom 156 het 58 0 51 7 A 1 3 263208 CASAVA_Build 19 57048436 3D CCCAATAGGG ACA/--- ACAAGTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 ACA 2 1 263209 CASAVA_Build 19 57052006 1I GTAGGAGCTG -/C CTGAGGGTGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 263210 CASAVA_Build 19 57054657 2D TGGATGTTTC AG/-- AGTTATAAGG 3070 het 3070 ref 50 28 17 6 AG 2 1 263211 CASAVA_Build 19 57056334 1I CAGGTGTGCA -/C CACCACACCT 2198 het 1123 hom 13 5 6 2 C 1 2 263212 CASAVA_Build 19 57060459 1D ACCATGCCCG C/- GCCTTCCCAA 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 C 1 0 263213 CASAVA_Build 19 57062064 5I AGAGAAAAGG -----/AAGGA AAGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 AAGGA 0 1 263214 CASAVA_Build 19 57063768 2D GAATTCACTC AT/-- GTGTGTGGGG 3070 het 3070 hom 51 20 26 8 AT 1 0 263215 CASAVA_Build 19 57069553 1I TAGGTGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 13 14 263216 CASAVA_Build 19 57075890 8I CTTCCCCAGC --------/TTCCATTA CTGGAAGCTC 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 TTCCATTA 0 1 263217 CASAVA_Build 19 57077402 2I GGCAATGATA --/CC CCACCCTGAC 3070 het 3070 ref 48 22 22 4 C 2 4 263218 CASAVA_Build 19 57083415 1I GAAACCATGT -/G GGCGCGGCAG 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 G 2 3 263219 CASAVA_Build 19 57109145 1I TATTTATTTA -/T TTTATTTTTT 3070 hom 11 het 23 0 15 8 T 3 4 263220 CASAVA_Build 19 57120131 6D TGTGTCGACT CATGTC/------ CAAGGTCTAA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 CATGTC 1 0 263221 CASAVA_Build 19 57121369 6D AAAACTCTGT TATAAA/------ TATAAACACT 3070 het 3070 ref 38 21 16 5 TATAAA 2 1 263222 CASAVA_Build 19 57123075 12D28M1D5M3D CGCCACCACG CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTAATCTGTCTAATCTAATCTATCT/------------CTATCTATCTATCTAATCTGTCTAATCT-ATCTA--- ATCTATCTAT 3070 het 786 hom 19 6 7 13 N/A 0 0 263223 CASAVA_Build 19 57127748 1I TGACATTTTC -/T TTTTTTTTTT 2114 het 2114 ref 24 15 6 3 T 11 12 263224 CASAVA_Build 19 57133251 1I TGGTAGGGTC -/A ATCCAGGAAT 3070 het 3070 hom 36 12 11 13 A 1 2 263225 CASAVA_Build 19 57136527 1I ATAATGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 12 11 T 10 11 263226 CASAVA_Build 19 57138850 3I ATTTATAAAA ---/GAG GACATAAGGA 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 GAG 0 1 263227 CASAVA_Build 19 57140885 2I AGGAACAAAC --/TG TGATATATTC 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 TG 1 2 263228 CASAVA_Build 19 57141648 1D CTTTATAAAT A/- ATCACCCCAG 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 A 2 1 263229 CASAVA_Build 19 57142489 2D AACCCTTAAA TT/-- TATCTACAGA 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 T 3 1 263230 CASAVA_Build 19 57145165 1D TTTAGGAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 12 8 T 10 9 263231 CASAVA_Build 19 57145252 4D30M2I CTCATCACAA ACATACATACATGTATGTATATATAGTATATATA--/----ACATACATGTATGTATATATAGTATATATATC TCTATATTTC 3070 het 3070 ref 38 21 19 9 N/A 0 0 263232 CASAVA_Build 19 57147383 2D ATATATAAAT TA/-- TATATATATA 1496 het 452 hom 8 3 4 1 TA 6 5 263233 CASAVA_Build 19 57147728 3D ACTAAAAAAT GAG/--- GTAGCTGCAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 GAG 1 0 263234 CASAVA_Build 19 57149339 5I GTCAAGAGAC -----/TCTTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 TCTTT 0 1 263235 CASAVA_Build 19 57154332 2D CCCAGTGCTC AG/-- AACAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 11 15 4 AG 1 0 263236 CASAVA_Build 19 57154607 4I AAATACAAAA ----/GAAT TAGTTGGCTG 2971 het 943 hom 14 3 7 4 GAAT 0 1 263237 CASAVA_Build 19 57157648 3I AAGCTCACAG ---/ACA ACAATTACAA 3070 het 3070 ref 38 25 11 2 ACA 1 2 263238 CASAVA_Build 19 57161538 1I TACTACAGAC -/G GGGGTCTCAC 3070 het 2942 hom 22 7 13 2 G 4 5 263239 CASAVA_Build 19 57179926 1D GAAAATATAC T/- CAGATGCAAC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 1 0 263240 CASAVA_Build 19 57186971 4I GGGTTAAGGG ----/CATT CAAGAACTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CATT 0 1 263241 CASAVA_Build 19 57187093 2D AAACTTAAAC AT/-- ATTCAAGTAT 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 AT 2 1 263242 CASAVA_Build 19 57187499 1I TTTTCATAAG -/T TTTTTTCTGC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 6 7 263243 CASAVA_Build 19 57187562 4D2M3I CCCTGCCACA GGGGTT---/----TTCAC TGCCAGAGGA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 N/A 0 0 263244 CASAVA_Build 19 57192582 2D CTGGATCATA CT/-- ATCCCGTGTT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 CT 1 0 263245 CASAVA_Build 19 57193032 1I CTTTCTATAC -/T TTTTTATCTT 3070 hom 150 het 53 0 50 3 T 5 6 263246 CASAVA_Build 19 57196682 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 25 1 19 5 A 19 17 263247 CASAVA_Build 19 57197454 1D GCTGGTGGGG T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 T 7 6 263248 CASAVA_Build 19 57198210 1I GCAAATTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 A 9 10 263249 CASAVA_Build 19 57199453 1D ACTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 10 9 263250 CASAVA_Build 19 57200326 3D TCTATCTCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 2845 hom 26 9 14 4 AAC 4 3 263251 CASAVA_Build 19 57205144 1I CTCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1846 het 1614 hom 12 5 5 2 A 11 12 263252 CASAVA_Build 19 57208928 2I ATAAGATTAG --/TT TACTTTATAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 1 3 263253 CASAVA_Build 19 57209130 5I CCAAATATGT -----/TGTTA TGTTAATATA 3070 het 3070 hom 37 13 23 1 TGTTA 1 2 263254 CASAVA_Build 19 57210239 3D TCATCATTTT CAC/--- CACATTTCAT 3070 het 3070 ref 53 32 19 3 CAC 2 1 263255 CASAVA_Build 19 57216208 4D ACAAACAGAC AGGT/---- AGAAACTGAG 3070 het 3070 hom 52 25 25 3 AGGT 1 0 263256 CASAVA_Build 19 57216432 1I AAGTGTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 11 12 263257 CASAVA_Build 19 57223416 1I GAAGCTGAGC -/G GGTAAAGACC 1414 het 1414 ref 31 13 8 10 G 2 3 263258 CASAVA_Build 19 57224768 3D ATGATGATGT ATA/--- ATAAGTTCAT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 ATA 2 1 263259 CASAVA_Build 19 57233320 1D CTTTTGATAG T/- CAGGCCCATG 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 1 0 263260 CASAVA_Build 19 57236005 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2796 het 1786 hom 27 7 9 12 A 15 14 263261 CASAVA_Build 19 57244397 1I ATAAGCGAGC -/G GGTGCGTTGC 3070 het 3070 hom 45 10 26 9 G 2 3 263262 CASAVA_Build 19 57244713 2D AACCACTGAC TA/-- TTGCTGCTGC 3070 het 3070 hom 20 7 11 2 TA 1 0 263263 CASAVA_Build 19 57269638 1I GCTAGAGTGC -/A ATGGCGCAAT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 1 2 263264 CASAVA_Build 19 57274116 24D ATTTACTTTG TACTTAGTACTTCATTTACTTATT/------------------------ TACTTAGTAC 3070 het 3070 ref 35 18 18 8 TACTTAGTACTTCATTTACTTATT 2 1 263265 CASAVA_Build 19 57283105 1D AAAATACTCC A/- AAAAAAAAAA 1712 het 1712 ref 34 12 8 14 A 17 16 263266 CASAVA_Build 19 57298558 2D TTTTTAAATT AA/-- GTTTATTATG 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 A 2 0 263267 CASAVA_Build 19 57338451 2I TAAAAAATAC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 9 11 263268 CASAVA_Build 19 57338774 1I TGTAATATAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 8 9 263269 CASAVA_Build 19 57341566 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2963 hom 31 9 18 4 A 14 15 263270 CASAVA_Build 19 57343719 1I AATTAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 T 9 10 263271 CASAVA_Build 19 57346223 1D CCTGTCTTGG A/- AAAAAAAAAA 1190 het 1190 ref 40 27 4 9 A 13 12 263272 CASAVA_Build 19 57356514 1D ACGAATGCTG T/- TGTCCCCACA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 2 1 263273 CASAVA_Build 19 57363608 3I AGCCGAGATC ---/ATG ATGCCACTGT 3070 het 479 hom 11 1 8 2 ATG 1 2 263274 CASAVA_Build 19 57384762 1I AAGCCTTCCC -/G GGGGACTCAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 4 5 263275 CASAVA_Build 19 57441432 1D TCTACCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 33 1 20 12 T 17 16 263276 CASAVA_Build 19 57452586 1D TTCGGCTCCC A/- AACAGTACCA 3070 hom 92 het 34 0 31 3 A 3 2 263277 CASAVA_Build 19 57453836 1I ATTTTCTTTG -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 6 7 263278 CASAVA_Build 19 57454584 2D TAAATTTTAT AC/-- ACACACACAC 246 hom 10 het 6 0 4 2 AC 7 6 263279 CASAVA_Build 19 57455719 1I TTTGGTAATT -/G GCAACTGGAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 1 2 263280 CASAVA_Build 19 57459749 1D ATCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 39 0 22 19 A 14 13 263281 CASAVA_Build 19 57495482 2D AGAGTCATGC TG/-- TGTGATGAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 5 TG 3 2 263282 CASAVA_Build 19 57502732 7D GCAAGCCAGT GATAAGC/------- ATTGTTTCTA 3070 hom 117 het 44 0 40 6 GATAAGC 1 0 263283 CASAVA_Build 19 57503867 1D44M3D TTGGAGCAGA TTTTTTTTTTTGTCAGAGAGGAGGAAATCATATTCTTGTCCACGAATT/-TTTTTTTTTTGTCAGAGAGGAGGAAATCATATTCTTGTCCACGA--- ATTATTATCA 3070 hom 120 het 37 0 40 8 N/A 0 0 263284 CASAVA_Build 19 57507893 1D TTTATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 875 hom 29 2 25 2 T 11 10 263285 CASAVA_Build 19 57514890 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 599 hom 31 3 22 6 G 0 1 263286 CASAVA_Build 19 57523396 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2697 het 2697 ref 26 10 11 5 A 11 12 263287 CASAVA_Build 19 57538559 2I GCTTGGACCT --/GA GAGGCAGAGG 3070 hom 71 het 25 0 23 2 GA 1 2 263288 CASAVA_Build 19 57538630 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 11 10 263289 CASAVA_Build 19 57562179 1I AAGTTTAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 346 hom 28 1 23 4 T 9 10 263290 CASAVA_Build 19 57562674 1D TTCTGGGTGC A/- ATATACTTAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 2 1 263291 CASAVA_Build 19 57562778 3I CAAAATCACT ---/TTG TTAATAGTAC 3070 hom 148 het 55 0 50 5 TTG 0 1 263292 CASAVA_Build 19 57574175 5I AAATAAATGA -----/ACTTG ACTTATTTGT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 ACTTG 0 1 263293 CASAVA_Build 19 57574968 1I ATTTTTTTTT -/A TTATTATTAT 3070 het 1814 hom 21 6 15 0 A 0 1 263294 CASAVA_Build 19 57575368 1I GTCTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 10 11 263295 CASAVA_Build 19 57575583 2I AATGAAATCT --/TC TTTTATTTGT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 TC 0 1 263296 CASAVA_Build 19 57576714 1I ATCTTGTAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 8 263297 CASAVA_Build 19 57576898 4I CAGTGTAACT ----/TTAA TTAGGTACAG 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 TTAA 0 1 263298 CASAVA_Build 19 57578489 3I AGCGTTGTGC ---/AGG AGGATACCTT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 AGG 1 2 263299 CASAVA_Build 19 57578958 1D CAAGTCTCTT A/- AAAATCAACT 3070 het 3070 ref 57 26 23 9 A 5 4 263300 CASAVA_Build 19 57579059 3I AAAAACCTAT ---/CAA CAACAATTCC 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 CAA 2 3 263301 CASAVA_Build 19 57584511 7I CAGGGCAGTC -------/AAATCTT AAAGCTCCAA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 AAATCTT 0 1 263302 CASAVA_Build 19 57587358 4I TTCCTCCCTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 het 2718 hom 34 12 16 6 TC 5 7 263303 CASAVA_Build 19 57587899 1I TATATATATA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 T 6 7 263304 CASAVA_Build 19 57588133 1D ATCCTGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 129 hom 26 2 20 4 T 16 15 263305 CASAVA_Build 19 57589926 1D TAAAGGTGAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 116 het 43 0 39 4 A 8 7 263306 CASAVA_Build 19 57592219 2I AGTTACTGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 11 13 263307 CASAVA_Build 19 57599038 1D TATGCAGATA T/- AATGACCTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 1 0 263308 CASAVA_Build 19 57600732 1I CCTGGATTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 8 9 263309 CASAVA_Build 19 57607777 1D GCTGGGTGTT G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 90 het 34 0 30 6 G 9 8 263310 CASAVA_Build 19 57611819 2I CCCTACAAAC --/TG TGTATGGCAA 3070 hom 183 het 70 0 61 9 TG 1 2 263311 CASAVA_Build 19 57614445 1I ACAAAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 922 hom 30 3 25 2 T 13 14 263312 CASAVA_Build 19 57615861 3D AGACTAAATA CTT/--- CTTCTTGAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 6 CTT 3 2 263313 CASAVA_Build 19 57628434 2I TTTCTTTCTC --/TT TTTTTGGGGG 3070 hom 43 het 17 0 15 2 T 5 7 263314 CASAVA_Build 19 57634653 8D CTAAAAATAC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 1601 hom 12 het 7 0 5 2 A 22 14 263315 CASAVA_Build 19 57634830 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1323 hom 15 het 6 0 6 1 A 12 11 263316 CASAVA_Build 19 57635126 4D GGAGCAAAAC TCTT/---- TCTTTAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TCTT 2 1 263317 CASAVA_Build 19 57635761 4D CAGGAGAATC ACTT/---- AAACCCAGGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 ACTT 1 0 263318 CASAVA_Build 19 57637123 1I AAATATACTT -/C TTGGATAAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 C 0 1 263319 CASAVA_Build 19 57638815 1I ACTCCATCTC -/A AAAAACAAAC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 5 6 263320 CASAVA_Build 19 57639195 2I TTTGGGTAGG --/CT CTGTCAGAGG 3070 hom 138 het 48 0 47 1 CT 1 2 263321 CASAVA_Build 19 57640782 106D TGGCTTCCTA ATTTACTCTTGCAGTCATTCTGGAGCAAAAATTCATGATGCAGGACTCCACACACTACTGTCCATCTGAGTGGAAGCTGCAAGTTAGTCCTGCCCTGCCATCTGCC/---------------------------------------------------------------------------------------------------------- ATGATCCTCT 3070 hom 39 het 13 0 14 3 ATTTACTCTTGCAGTCATTCTGGAGCAAAAATTCATGATGCAGGACTCCACACACTACTGTCCATCTGAGTGGAAGCTGCAAGTTAGTCCTGCCCTGCCATCTGCC 1 0 263322 CASAVA_Build 19 57641621 2I TGAGTGCTTT --/AA AAAAAAAATC 3070 hom 102 het 40 0 33 8 A 8 10 263323 CASAVA_Build 19 57642948 1D GTTTTTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 31 1 24 7 T 12 11 263324 CASAVA_Build 19 57643463 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 285 hom 29 1 24 4 A 12 11 263325 CASAVA_Build 19 57644605 1D GCATTTGTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 116 het 43 0 39 5 T 9 8 263326 CASAVA_Build 19 57646162 1D ACAATATTAA T/- TTTTTCCCAC 3070 hom 82 het 40 0 34 7 T 6 5 263327 CASAVA_Build 19 57647396 1I GTGTGTTTTC -/T TTTTTTTTGT 2673 het 1503 hom 15 4 8 3 T 8 9 263328 CASAVA_Build 19 57648886 1D CGCTTTTCGT C/- CCGTTTACCT 3070 hom 87 het 35 0 27 9 C 3 2 263329 CASAVA_Build 19 57649677 4I GGTTGCAGAT ----/AAAC AGACAGATGG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 AAAC 0 1 263330 CASAVA_Build 19 57652676 3I GGGATCTGAC ---/ACT GTCTCCAGTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ACT 0 1 263331 CASAVA_Build 19 57655380 1D TCTCCAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 49 2 33 14 T 13 12 263332 CASAVA_Build 19 57657796 1D TTGAGCCATC A/- AGGTGTGCTT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 2 1 263333 CASAVA_Build 19 57658622 7I GTGCTAGGAC -------/ATGAGTT ATGAGTTATA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 ATGAGTT 1 2 263334 CASAVA_Build 19 57667011 7I TGTCACTAAT -------/CACAAGG ACGAAAAAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CACAAGG 0 1 263335 CASAVA_Build 19 57679010 5D AAGTATAGAG AAAGA/----- AAAGCGGGCC 3070 het 185 hom 25 1 16 8 AAAGA 1 0 263336 CASAVA_Build 19 57686311 1D GTATTTTTTT G/- TGTGTCATAT 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 G 1 0 263337 CASAVA_Build 19 57689055 1I AACTCCGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 24 1 18 5 A 11 12 263338 CASAVA_Build 19 57690949 1D GGAGTGGGGG A/- AGAGAAGTAG 1183 het 1183 ref 38 25 3 10 A 2 1 263339 CASAVA_Build 19 57695474 2D TTGAGTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2500 het 94 hom 17 1 9 7 T 16 14 263340 CASAVA_Build 19 57696786 1I TGGGCAGTGG -/C GGGGGGCTTC 2999 het 2999 ref 24 12 10 2 C 0 1 263341 CASAVA_Build 19 57697646 1I TACTAAAAAT -/A ACAAAAATTA 3070 het 3070 hom 28 10 14 6 A 1 2 263342 CASAVA_Build 19 57699242 3I TGCGGCCTCC ---/AAG ATCTCCTGAC 2023 het 1977 hom 19 8 5 6 AAG 0 1 263343 CASAVA_Build 19 57699390 1D TCTTGAACTC A/- AATAATCTGC 3070 het 3070 ref 23 12 9 3 A 3 2 263344 CASAVA_Build 19 57699950 8I CGTGGTTTTT --------/TTGTTTGA TTGTTTGATT 3070 hom 78 het 35 0 25 10 TTGTTTGA 1 2 263345 CASAVA_Build 19 57700474 4D TTGTTCATTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2986 het 2986 ref 34 22 8 4 TTTG 4 3 263346 CASAVA_Build 19 57703418 2I CAAAAGAAAT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 AG 6 7 263347 CASAVA_Build 19 57707300 1D AAAAGACATA G/- GAGAATTCAT 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 G 2 1 263348 CASAVA_Build 19 57711172 11D TCAAAACCCT TCCTGTCTCAG/----------- GTCATTGTCC 3070 het 3070 ref 24 14 8 4 TCCTGTCTCAG 1 0 263349 CASAVA_Build 19 57715761 2D TCCCCCTCGG AA/-- AAAAAACAAA 110 het 91 hom 33 1 1 33 A 8 6 263350 CASAVA_Build 19 57716778 4D CAGCTTGCAC TATT/---- TATTCCCTTA 3070 hom 42 het 19 0 15 5 TATT 2 1 263351 CASAVA_Build 19 57718380 6D TATTATACAC CTATTA/------ TAAAGGTGGA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 CTATTA 1 0 263352 CASAVA_Build 19 57718555 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 10 11 263353 CASAVA_Build 19 57718763 1D CTAAAAACAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 2642 hom 16 6 9 1 A 7 6 263354 CASAVA_Build 19 57719166 1I TGTAAATGAA -/T TTTTCTCTGT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 4 5 263355 CASAVA_Build 19 57725730 2I TCCATCTGAC --/AA AAAAAAAAAG 3049 het 24 hom 17 1 9 7 A 9 11 263356 CASAVA_Build 19 57726630 4D AAATTCTCTC ACAG/---- GCACCATCTG 2126 het 2126 ref 15 6 8 2 ACAG 1 0 263357 CASAVA_Build 19 57726831 1I TTACACACAG -/T TAACTAGATA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 263358 CASAVA_Build 19 57727801 5D GTACACGTAA AGTAT/----- TTATTAAGTA 3070 het 3070 ref 28 14 14 2 AGTAT 1 0 263359 CASAVA_Build 19 57729748 1I TGAAGTCAGG -/A GTTCTAGACC 3070 hom 57 het 22 0 17 5 A 0 1 263360 CASAVA_Build 19 57732068 4I CCTGACCAAC ----/ATGG ATGGAGAAAC 2623 het 2623 ref 22 13 8 1 ATGG 1 2 263361 CASAVA_Build 19 57732252 1I ACTCTTTCTC -/A AAAAAAAAAG 1407 het 992 hom 12 2 4 6 A 9 10 263362 CASAVA_Build 19 57733042 1I31M4D AAGTGGTGGG -AAAAAAAAATCGCTGTTATTACATAATACTTTTAA/AAAAAAAAAATCGCTGTTATTACATAATACTT---- TTAATTAATT 3070 het 3070 ref 26 17 16 3 N/A 0 0 263363 CASAVA_Build 19 57734127 1I GGAGTGGGGG -/A AGAGAAGTAG 2796 het 2796 ref 45 32 7 6 A 1 2 263364 CASAVA_Build 19 57737663 1I GATCTCAGTT -/A ATTTAGAGAG 3070 hom 27 het 16 0 10 6 A 1 2 263365 CASAVA_Build 19 57738024 2D TCTTTTTTTT GG/-- GGGGGGGGTG 3070 het 1088 hom 22 6 13 3 G 10 8 263366 CASAVA_Build 19 57740846 1D CTCCATCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 A 13 12 263367 CASAVA_Build 19 57741258 9I TAACAGTTTT ---------/TGGTTTTTG TTTTTTTTTT 2452 het 2452 ref 51 25 8 18 TGGTTTTTG 0 1 263368 CASAVA_Build 19 57745597 1D GTCCGGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1895 het 1895 ref 25 11 7 7 T 13 12 263369 CASAVA_Build 19 57747769 1I TGTTGTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 33 1 20 12 T 15 16 263370 CASAVA_Build 19 57762023 1D AGGATAGGTG T/- TTTTTTTTTT 2277 het 2277 ref 53 33 6 14 T 13 12 263371 CASAVA_Build 19 57797123 2I ATAAGAAAAG --/AA AGCAGGAGGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 3 263372 CASAVA_Build 19 57802626 1I AGGTATTTTA -/T TTTTTTATTA 2463 het 1772 hom 16 7 6 3 T 6 7 263373 CASAVA_Build 19 57805351 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 30 2 19 9 T 15 14 263374 CASAVA_Build 19 57810408 8D TAGGCCATGA GGAGGAAG/-------- GGAGGAAGCT 3070 hom 108 het 41 0 36 8 GGAGGAAG 2 1 263375 CASAVA_Build 19 57822264 1I GCCCCACCCC -/T ATCTCCTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 0 1 263376 CASAVA_Build 19 57827039 1D CGAGGATTTG C/- CCCCACCCAG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 C 5 4 263377 CASAVA_Build 19 57827732 1D CTGGCAAGGC T/- ATGCTGAACC 3070 hom 72 het 25 0 23 2 T 1 0 263378 CASAVA_Build 19 57830040 3D AGGCAGGACA CTT/--- CTTGAGACCC 3070 hom 30 het 14 0 10 4 CTT 2 1 263379 CASAVA_Build 19 57831427 1I CAGAAAGGGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 64 het 25 0 22 3 T 7 8 263380 CASAVA_Build 19 57831745 1D TTTTGAGACA G/- GGTCTTGCTC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 3 2 263381 CASAVA_Build 19 57838235 1D GAGTGAGACT C/- AAAAATACAA 3070 hom 64 het 25 0 22 4 C 1 0 263382 CASAVA_Build 19 57838522 14D ATCCTAGCAC GTTGGGAGGCTGAG/-------------- GTGGGTGGAT 3070 hom 30 het 11 0 11 2 GTTGGGAGGCTGAG 1 0 263383 CASAVA_Build 19 57839245 1D TCCATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2661 het 101 hom 19 1 9 9 T 13 12 263384 CASAVA_Build 19 57840868 1I TGAGATTCTG -/C CCCCCCCCCA 2793 het 2774 hom 25 9 10 6 C 9 10 263385 CASAVA_Build 19 57843211 3D TCCTCCTGCT TTC/--- TTATCTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 TTC 1 0 263386 CASAVA_Build 19 57850988 2D AATACAAAAA AT/-- ATATGTCTGG 3070 hom 112 het 42 0 37 5 AT 3 2 263387 CASAVA_Build 19 57851292 2D TCTCTCTCTC TA/-- TATATATATA 3070 het 23 hom 30 2 17 11 TA 7 6 263388 CASAVA_Build 19 57851930 14D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 18 0 20 3 A 22 8 263389 CASAVA_Build 19 57855184 15D GTGGTAAGAC CATGGTGGTAAGAAT/--------------- CATGGTGGTA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 CATGGTGGTAAGAAT 1 0 263390 CASAVA_Build 19 57857117 4I TCAGGGAGGT ----/CCTG CCTGGGAGCA 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 CCTG 1 2 263391 CASAVA_Build 19 57859250 2D ACCAGGCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 2618 hom 17 het 20 0 10 10 T 18 16 263392 CASAVA_Build 19 57872774 1I GAAGAATGAT -/C CCCTAGCTGA 3070 hom 83 het 33 0 28 5 C 3 4 263393 CASAVA_Build 19 57880963 8D TAACTGTCAC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 2844 hom 22 10 11 1 A 29 21 263394 CASAVA_Build 19 57881525 8D AAAAAATTAC ATATATAT/-------- ATATATATAT 1330 het 1330 ref 13 5 5 5 AT 11 7 263395 CASAVA_Build 19 57891075 4I TGTGTGTGTG ----/TGTA TATATATATA 1983 het 630 hom 15 4 8 3 TGTA 0 1 263396 CASAVA_Build 19 57891891 15I TTGATACCGG ---------------/TGTGATAAAATAATC TGTACAACAA 2327 het 2327 ref 23 12 5 6 TGTGATAAAATAATC 0 1 263397 CASAVA_Build 19 57896865 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 16 9 A 12 11 263398 CASAVA_Build 19 57897367 1D33M1D ACTCCATCTC AAAAAAAAACCCCCAAAAAAACAAAAAGAAAAACA/-AAAAAAAACCCCCCAAAAAACAAAAAGAAAAAC- AAAAAAAAAC 3070 het 2106 hom 21 9 13 7 N/A 0 0 263399 CASAVA_Build 19 57898131 3D ACAGAAACGA ATG/--- ATGTGAGCTG 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 ATG 2 1 263400 CASAVA_Build 19 57906098 1D AACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 746 het 746 ref 20 12 2 6 A 17 16 263401 CASAVA_Build 19 57907714 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAACTG 10 het 10 ref 22 10 1 13 AAG 1 0 263402 CASAVA_Build 19 57915128 2I GACACAGCAC --/AT GTTTCAGAGA 3070 het 1773 hom 20 5 8 7 AT 0 1 263403 CASAVA_Build 19 57928636 7D TAAAGTGTGG AGACTAC/------- AGACTACAGG 3070 het 3070 ref 39 20 13 10 AGACTAC 2 1 263404 CASAVA_Build 19 57929031 1I CTCCCCAGAT -/C CCCAGCTGTC 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 C 3 4 263405 CASAVA_Build 19 57929195 4D CTCTCTGTAC ATCT/---- ATCTAGCCTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 8 ATCT 2 1 263406 CASAVA_Build 19 57929253 2D CTTTCTTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2135 hom 27 11 10 7 T 17 15 263407 CASAVA_Build 19 57933804 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 10 11 A 13 14 263408 CASAVA_Build 19 57943679 1I TTTTAAGTAG -/T TTTTTTAACT 2806 het 2806 ref 26 12 9 5 T 6 7 263409 CASAVA_Build 19 57947404 2D GCAAACCATT CA/-- CAGTCTTGTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 CA 2 1 263410 CASAVA_Build 19 57949056 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2774 het 2774 ref 30 18 7 5 A 11 10 263411 CASAVA_Build 19 57952058 11D GGTGGAGGAC GTGACAGGGAA/----------- GTGACAGGGA 2683 het 2683 ref 38 21 9 15 GTGACAGGGAA 2 1 263412 CASAVA_Build 19 57952974 2I CTGCCTCAGC --/CA CAGAGTAGCT 3070 het 3070 hom 21 10 8 3 CA 1 2 263413 CASAVA_Build 19 57978008 1I GAGGAACTAG -/A AAAAAAAAAT 3048 het 3048 ref 23 15 8 0 A 9 10 263414 CASAVA_Build 19 57978080 2D AGTAACAGAG AC/-- TCAGTCACTT 1055 het 1055 ref 22 15 3 4 AC 1 0 263415 CASAVA_Build 19 57986653 1I CCTGAATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 11 21 15 A 10 11 263416 CASAVA_Build 19 57990507 2D TACAGTGGTT AA/-- AAAAATATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 7 5 263417 CASAVA_Build 19 57993689 3D CCTGTATGAA TCC/--- TCCTATGTTT 3070 het 3070 ref 41 22 16 5 TCC 2 1 263418 CASAVA_Build 19 57997453 1I AAAAACAAAC -/A AACAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 23 9 A 2 3 263419 CASAVA_Build 19 58001259 1D GGTTACAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 42 0 34 9 T 10 9 263420 CASAVA_Build 19 58002313 1D ATGCTGGAGC T/- TTTCTAGAGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 4 3 263421 CASAVA_Build 19 58011286 3D11M1D CATTTATATT CAATAATAATTGTTG/---TAATAATTGTT- GGGCTGGGCA 3070 het 3070 ref 26 15 13 0 N/A 0 0 263422 CASAVA_Build 19 58011738 2D TCAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 18 11 7 1 A 10 8 263423 CASAVA_Build 19 58013775 2I CAAAAATAAA --/AT AAAATACAAA 2869 het 2869 ref 19 10 6 3 AT 0 1 263424 CASAVA_Build 19 58016998 1I AAAAAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 18 9 9 0 A 10 11 263425 CASAVA_Build 19 58041029 1I GATCGCAGCA -/T TTGTACTTCA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 2 3 263426 CASAVA_Build 19 58042495 5D TGGCCTCATG GGAAA/----- GGAAAGACCT 3070 het 2797 hom 20 7 12 4 GGAAA 2 1 263427 CASAVA_Build 19 58044051 27D AAATCAATAT GGCTTCCATTTTAGTCAAGGAACAATG/--------------------------- GGGTTCCTAA 2400 het 2400 ref 24 20 6 8 GGCTTCCATTTTAGTCAAGGAACAATG 1 0 263428 CASAVA_Build 19 58095774 1D TTAATTTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 10 9 263429 CASAVA_Build 19 58110242 5I AACATCCCCA -----/CTTCT GGAAGGAAGT 1891 het 1891 ref 23 17 4 2 CTTCT 0 1 263430 CASAVA_Build 19 58112476 2D TTACCTAAAA AT/-- GTAGTTTAAT 3070 het 3070 ref 31 18 9 6 AT 1 0 263431 CASAVA_Build 19 58112623 1I CCAGATGCGG -/C CCCTGAACAA 3070 hom 59 het 23 0 17 6 C 3 4 263432 CASAVA_Build 19 58117334 6I TCTCCCATCT ------/CTGTGC CTCCTGAGCT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 CTGTGC 0 1 263433 CASAVA_Build 19 58142346 1I TCTAGGTAGC -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 7 8 263434 CASAVA_Build 19 58144288 4I AAGTGATCTA ----/CCTG CCTGCCTTGG 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 CCTG 1 2 263435 CASAVA_Build 19 58146288 3I AGGAAGCACC ---/ACT GATAGACTTG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 ACT 0 1 263436 CASAVA_Build 19 58158919 4D GGCATTAGAC ATCA/---- ATCAAATACA 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 ATCA 2 1 263437 CASAVA_Build 19 58159368 2I TCTTTGTCAC --/AT GTTATTCCAG 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 AT 0 1 263438 CASAVA_Build 19 58159494 1I TGGGCAAGAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 A 7 8 263439 CASAVA_Build 19 58160740 1I CAGCCCAGGC -/A ACATGGTGAA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 1 2 263440 CASAVA_Build 19 58164491 4D GGCTCTGTCA CACT/---- CATCACACTT 3070 het 3070 hom 49 23 23 6 CACT 1 0 263441 CASAVA_Build 19 58166579 1I AAAAAAAAAA -/G GCAGGGCATG 1087 het 1087 ref 27 10 6 11 G 1 2 263442 CASAVA_Build 19 58169232 4D GAAATAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2300 het 2300 ref 28 16 9 4 AAAG 5 4 263443 CASAVA_Build 19 58174206 2I CATCCTCCAA --/AG AGGGGAGACA 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 AG 1 2 263444 CASAVA_Build 19 58190828 1I TTCCAGACCA -/C CCTGGCCAAT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 C 2 3 263445 CASAVA_Build 19 58191919 1D GCGGGCGGAT G/- CACGAGGTCA 3070 hom 35 het 14 0 9 5 G 1 0 263446 CASAVA_Build 19 58195193 1D GAGACAGAGC A/- AAAAAAAAAA 820 het 586 hom 23 5 4 15 A 19 18 263447 CASAVA_Build 19 58196656 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 456 het 456 ref 18 9 3 6 A 17 16 263448 CASAVA_Build 19 58216128 1I CCTGTAACCC -/T CAGCACTTTG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 T 0 1 263449 CASAVA_Build 19 58221457 2D CTTCAAACAA CT/-- CTCTCCCACA 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 CT 3 2 263450 CASAVA_Build 19 58254424 2I GGCTAATTTT --/TG TGTTTTTAGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TG 1 2 263451 CASAVA_Build 19 58257063 1D TGCAGGACAG C/- CAGGGGCTCC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 2 1 263452 CASAVA_Build 19 58274726 1I CAATAGCAGC -/A AAAAAAAAAA 1179 het 1179 ref 43 16 5 22 A 15 16 263453 CASAVA_Build 19 58277958 4D GCTTTTGACA GACT/---- GACTATTAAT 3070 het 3070 hom 41 17 18 7 GACT 2 1 263454 CASAVA_Build 19 58288511 1D CTAAAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 2740 het 2740 ref 22 8 7 8 A 9 8 263455 CASAVA_Build 19 58290346 1I ACCCTCCCCA -/C CCTGGCCTCT 1762 hom 26 het 11 0 8 3 C 2 3 263456 CASAVA_Build 19 58292464 1I CCCGTTGCCC -/T TCTGGACTCA 3070 het 3070 hom 34 12 11 11 T 1 2 263457 CASAVA_Build 19 58311157 1I TTTCATGGAT -/A ACTTCAGCTC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 1 2 263458 CASAVA_Build 19 58315063 7I TCCTCAAACT -------/ATTTTAC AAAATTGAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 ATTTTAC 0 1 263459 CASAVA_Build 19 58320115 1D TTATGTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 948 hom 21 3 15 4 T 13 12 263460 CASAVA_Build 19 58325132 1D TCCAGCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 23 2 18 3 A 15 14 263461 CASAVA_Build 19 58339166 1I GTTTAAGTGA -/T TTTCTCTGGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 3 4 263462 CASAVA_Build 19 58343658 2I AATTCAAACT --/TC TGTTTTCCCA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 TC 0 1 263463 CASAVA_Build 19 58351360 1D GCTACTTGGG A/- GGCTGAGGCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 1 0 263464 CASAVA_Build 19 58355191 1D TATTGGGTCT A/- TTTTTTTGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 0 263465 CASAVA_Build 19 58356625 1D ATCTGCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 11 10 263466 CASAVA_Build 19 58361926 3D CTGAAAAAAC GAG/--- GAGGAATTCA 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 GAG 2 1 263467 CASAVA_Build 19 58377279 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 9 8 263468 CASAVA_Build 19 58389270 14D TTTGTTGTTG TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 36 1 24 13 T 25 11 263469 CASAVA_Build 19 58391823 5D GACATTAACT TAAAA/----- TAAGCAGAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAAAA 1 0 263470 CASAVA_Build 19 58393602 1D CACAAGACCA C/- CCCCCTGCCC 2468 hom 50 het 26 0 13 13 C 6 5 263471 CASAVA_Build 19 58394624 3I ATCCAGGAGC ---/CCA CCAAGACTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CCA 1 2 263472 CASAVA_Build 19 58394965 1I AGTGATGTTA -/C CCCCAGCTGA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 C 4 5 263473 CASAVA_Build 19 58397570 1I TTCATTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 T 9 10 263474 CASAVA_Build 19 58399750 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2481 het 139 hom 13 3 7 3 A 16 15 263475 CASAVA_Build 19 58411859 3D AGGCCTACTC AGG/--- AGCTGAGCAG 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 AGG 1 0 263476 CASAVA_Build 19 58418913 2I GTATTGGTTT --/TA TGTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 TA 0 1 263477 CASAVA_Build 19 58419722 2D AATTCCTCAC AT/-- GTCTTCCGGT 3070 het 2842 hom 26 7 16 3 AT 1 0 263478 CASAVA_Build 19 58424608 1D TTTGAGATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 9 8 263479 CASAVA_Build 19 58437048 10D CCAGGCTGGA GTGCAATGGC/---------- GTGATCTCGG 868 hom 12 het 12 0 3 9 GTGCAATGGC 1 0 263480 CASAVA_Build 19 58438419 1D ATGGGTCTGC A/- AAACTATTTC 3070 hom 129 het 51 0 44 8 A 4 3 263481 CASAVA_Build 19 58442453 1I TGATGACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 13 14 263482 CASAVA_Build 19 58452822 1I GCAATTACTC -/T TTATTCCAAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 2 3 263483 CASAVA_Build 19 58496941 1D11M1I2M2D8M1D GGCCAATCTG CCAAGACAGGAG-GCTGACCGATGTG/-CTAGGGAGGAGAGC--ACAGACCT- GTCAGACTGA 1951 het 1951 ref 10 6 5 0 N/A 0 0 263484 CASAVA_Build 19 58497404 8D GTTGTGCTAT TTTGTGAC/-------- TCTCTCCCAT 1964 het 1964 ref 24 18 7 4 TTTGTGAC 1 0 263485 CASAVA_Build 19 58498305 1D CATTTCATTG T/- TTTTTTTTTC 2778 het 2778 ref 27 14 8 5 T 10 9 263486 CASAVA_Build 19 58501814 1D ACTATGTGTC G/- GGGGAATAGA 3070 het 3070 hom 38 11 20 8 G 5 4 263487 CASAVA_Build 19 58505287 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 1694 het 1694 ref 20 12 4 4 A 13 12 263488 CASAVA_Build 19 58510968 1I TCCAAGTTTG -/T ATGGCTCTTT 1831 het 1831 ref 48 36 4 8 T 0 1 263489 CASAVA_Build 19 58517272 1D CATAGGTTTT G/- TTCATTCTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 0 263490 CASAVA_Build 19 58527179 4I TGTCTCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AAAC 3 4 263491 CASAVA_Build 19 58541445 1I GCCGGCTTCG -/C CTCTCGTGCT 3070 hom 75 het 27 0 23 4 C 1 2 263492 CASAVA_Build 19 58542508 1D CACCTGGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 677 hom 18 3 11 4 T 17 16 263493 CASAVA_Build 19 58545233 5I AGATGGACTC -----/TTACT TTGTCACCCA 2421 het 2421 ref 28 19 5 4 TTACT 0 1 263494 CASAVA_Build 19 58552450 1D ATAATCCTAC T/- TTTTTTTTTT 1718 het 1718 ref 26 15 5 6 T 15 14 263495 CASAVA_Build 19 58552756 3D CAGCCTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 32 0 23 10 T 14 11 263496 CASAVA_Build 19 58562380 1I ATGAATACAT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 30 1 24 5 G 0 1 263497 CASAVA_Build 19 58568721 1I AATTACAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 T 10 11 263498 CASAVA_Build 19 58571374 3D TCTTCTGTGG ACA/--- ACAAGTAGTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 ACA 2 1 263499 CASAVA_Build 19 58572547 4D GGCCTATCTG TCTT/---- TTTATTTACC 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 TCTT 1 0 263500 CASAVA_Build 19 58581222 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 13 14 263501 CASAVA_Build 19 58582903 1D TCTGTCACGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 550 hom 23 3 16 5 A 15 14 263502 CASAVA_Build 19 58586615 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 26 0 14 12 A 11 10 263503 CASAVA_Build 19 58587346 3I GTCTCTGAAG ---/AGA AGGAGGAAGT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 AGA 0 1 263504 CASAVA_Build 19 58587439 4D AAAAGATTAA CTGC/---- CCCCCAACTC 3070 het 3070 ref 28 16 10 4 CTGC 1 0 263505 CASAVA_Build 19 58590150 1I CTCGCCCAAG -/C CCCGCCCACC 1561 het 1077 hom 14 3 6 5 C 3 4 263506 CASAVA_Build 19 58591064 2D AATGTGGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 2456 het 2235 hom 19 9 8 2 A 13 11 263507 CASAVA_Build 19 58598907 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 30 0 22 8 A 13 12 263508 CASAVA_Build 19 58599685 2D ACCTGGCTAA TG/-- TGTGTGTGTG 1901 het 1901 ref 34 25 5 5 TG 9 8 263509 CASAVA_Build 19 58608182 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2136 hom 23 7 12 4 A 11 12 263510 CASAVA_Build 19 58610646 2I TAACTTTCTA --/TT ATGAATTACC 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 0 2 263511 CASAVA_Build 19 58611014 2I TTTTGTTTTG --/TT TTTTGTTTTT 71 het 71 ref 37 23 1 13 T 4 6 263512 CASAVA_Build 19 58612932 1D AATCTACTTT G/- GGTGGAAAGA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 G 3 2 263513 CASAVA_Build 19 58620382 1I AAAGTCCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 31 1 19 11 T 10 11 263514 CASAVA_Build 19 58621787 1I TCTTTATGAG -/A ATCAAACTAA 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 A 1 2 263515 CASAVA_Build 19 58622606 2D TACTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 TG 1 0 263516 CASAVA_Build 19 58632392 3I CAAAAAAAAA ---/AAG AAAAGAAAAA 2207 het 1745 hom 25 8 8 9 AAG 0 1 263517 CASAVA_Build 19 58635772 1I TGAGACAGGG -/C CTGGCTCTAT 2366 het 1752 hom 19 7 7 5 C 1 2 263518 CASAVA_Build 19 58637945 1D TCATGTTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 10 9 263519 CASAVA_Build 19 58644698 1D AACCTGGTCT C/- CCCTGGGTGA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 C 4 3 263520 CASAVA_Build 19 58661582 2I GCTGTTTGTC --/TG TATTTCGCAT 3070 hom 135 het 47 0 45 2 TG 0 1 263521 CASAVA_Build 19 58664804 3I GCTGGTGGCA ---/AGG AGAACAGAGG 3070 hom 77 het 32 0 22 10 AGG 0 1 263522 CASAVA_Build 19 58665041 4I ATTTCAACAA ----/AGAC AGAGTGGGGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AGAC 0 1 263523 CASAVA_Build 19 58670173 1D TTCTTTGTAC T/- TTATTTCTTG 3070 het 3070 hom 26 11 14 2 T 3 2 263524 CASAVA_Build 19 58672722 4I ATCTCTGCCA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 AAAT 3 4 263525 CASAVA_Build 19 58673958 1D TCTTCATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 12 5 T 13 12 263526 CASAVA_Build 19 58675431 1D GTTGTGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 17 16 263527 CASAVA_Build 19 58685364 2I GAGTATTTTT --/TG TGTGTCACAT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 TG 2 3 263528 CASAVA_Build 19 58690090 1D ATACTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 A 11 10 263529 CASAVA_Build 19 58704499 1D GGGGTCTCTC A/- GAACAGATTG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 1 0 263530 CASAVA_Build 19 58705498 2D AAACTTGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2977 hom 36 het 30 0 12 19 T 18 16 263531 CASAVA_Build 19 58707441 4D TGCTGAATCT GCAA/---- GCACCTGAGC 1448 het 1448 ref 41 34 4 4 GCAA 1 0 263532 CASAVA_Build 19 58710509 2I ATTTTAACAT --/GG GGGCATTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 3 5 263533 CASAVA_Build 19 58718161 2D TATATGTTTT TA/-- TATATATGTA 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 TA 4 3 263534 CASAVA_Build 19 58718982 1D CCTCCCCCAG C/- CCCCCAACTC 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 C 6 5 263535 CASAVA_Build 19 58722930 4I TTATCAAGAA ----/AGAG AGCCTTTCAG 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 AG 1 3 263536 CASAVA_Build 19 58729361 1I CCCATCCTAC -/T TTTTTTTTTT 1163 het 1163 ref 35 21 4 10 T 11 12 263537 CASAVA_Build 19 58731378 4D CATTGTACTA TCTT/---- TCTTGTGGTT 3070 het 3070 ref 48 31 15 2 TCTT 2 1 263538 CASAVA_Build 19 58734359 1D GTGAGTATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 T 10 9 263539 CASAVA_Build 19 58735770 1I CCCAAAGTGC -/T GGGATTACAG 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 0 1 263540 CASAVA_Build 19 58735849 1D CTAGACACTG C/- CCCACATGCC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 C 4 3 263541 CASAVA_Build 19 58752038 17D CACCTGGCTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 1941 het 1941 ref 19 11 5 6 T 28 11 263542 CASAVA_Build 19 58769614 2I CTTTAGTAGC --/AG GGGTAGAGGT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 AG 0 1 263543 CASAVA_Build 19 58781907 5D TGTCTCAAAA AAAAT/----- AAAAAGAAAA 226 het 226 ref 20 11 2 9 AAAAT 1 0 263544 CASAVA_Build 19 58783498 7D GGTGGATCAC TTGAGGT/------- TAGGAGTTCG 3070 het 631 hom 9 2 7 0 TTGAGGT 1 0 263545 CASAVA_Build 19 58785058 1D CCCTCCAGGA G/- GCATCCAAGT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 G 2 1 263546 CASAVA_Build 19 58787481 1D GCTTATGCAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 9 8 263547 CASAVA_Build 19 58789519 4D AATGCATGGA TGAG/---- TGAGTCCCAT 2819 het 2819 ref 31 17 8 6 TGAG 2 1 263548 CASAVA_Build 19 58794562 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 15 5 A 12 13 263549 CASAVA_Build 19 58803351 1I GTCGTTGGAC -/A CACCCCAGCT 1677 hom 18 het 9 0 7 2 A 0 1 263550 CASAVA_Build 19 58803392 1D CTGTGAGCTG C/- CAGTTGTGCA 2392 het 11 hom 12 0 6 6 C 2 1 263551 CASAVA_Build 19 58805391 10D GTCTCGAAAA AAGAAAAAAG/---------- AAGAAGGAAA 3070 het 3070 ref 32 13 15 8 AAGAAAAAAG 1 0 263552 CASAVA_Build 19 58810350 1I ATCTGTCTAA -/T TTTTTTTTTT 2237 het 2237 ref 30 15 8 7 T 11 12 263553 CASAVA_Build 19 58813165 1D CCTAGATCGC T/- GCCACTGCAC 3070 het 373 hom 12 1 8 3 T 1 0 263554 CASAVA_Build 19 58813209 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 1211 het 894 hom 11 3 6 2 A 13 14 263555 CASAVA_Build 19 58817370 1D TGGGCATGAG C/- CACTGGAAAA 3070 het 3070 hom 48 18 24 7 C 2 1 263556 CASAVA_Build 19 58819418 1D GCCTCCCAAA G/- GGCTGGGATT 3070 hom 58 het 23 0 19 4 G 3 2 263557 CASAVA_Build 19 58827534 2D ACCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2664 hom 24 het 9 0 9 0 T 14 12 263558 CASAVA_Build 19 58838313 2D ACTGGTCTTG CT/-- CTGTCACCCA 2949 het 2949 ref 24 12 7 5 CT 2 1 263559 CASAVA_Build 19 58844426 8D GCGGAGGTTG CAGTGAGC/-------- CAGTGAGCCG 3070 hom 69 het 24 0 21 6 CAGTGAGC 2 1 263560 CASAVA_Build 19 58857379 1D ACGTGACTTT A/- AAATTGTGAG 3070 hom 96 het 35 0 30 6 A 4 3 263561 CASAVA_Build 19 58857624 1I ACGAGGAGAT -/C CTAAAATTGA 3070 hom 108 het 43 0 34 9 C 1 2 263562 CASAVA_Build 19 58858897 2D GGAGGCGGAG CT/-- TGCAGTGAGC 3070 hom 24 het 16 0 13 3 CT 1 0 263563 CASAVA_Build 19 58859987 1D CTCCATCTGT G/- GGGTGGTCCC 3070 hom 63 het 28 0 20 9 G 4 3 263564 CASAVA_Build 19 58860216 1D TCTCTGCCCC T/- AATACTCTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 1 0 263565 CASAVA_Build 19 58861059 1D TTGTAGAGAA G/- GGGGCCTCAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 5 4 263566 CASAVA_Build 19 58862848 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 63 het 24 0 21 4 A 7 6 263567 CASAVA_Build 19 58866693 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 595 hom 24 2 17 6 A 15 14 263568 CASAVA_Build 19 58868006 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1608 het 1608 ref 24 15 4 5 T 13 12 263569 CASAVA_Build 19 58874460 3D CAGGCACATG CCA/--- CCACGCCTGG 3070 het 3038 hom 28 9 16 3 CCA 2 1 263570 CASAVA_Build 19 58878476 3I GCCTGGACTT ---/TTG GGGATCTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 TTG 0 1 263571 CASAVA_Build 19 58886692 1I GCGATCCTAC -/A AGGTGTGAGC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 1 2 263572 CASAVA_Build 19 58891418 1D AGCAATTCTC T/- TTTTTTTTTT 2890 het 2293 hom 33 9 10 14 T 14 13 263573 CASAVA_Build 19 58894299 6D TTTGTTTGTT TGTGTG/------ TGTGTGAGTG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TG 6 3 263574 CASAVA_Build 19 58899051 6I GACTGAGCTG ------/GACTCT GACTTAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 GACTCT 0 1 263575 CASAVA_Build 19 58902149 2D TCAACATCTT AG/-- ATTCCATTTC 3070 het 3070 hom 40 14 24 3 AG 1 0 263576 CASAVA_Build 19 58916098 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 76 het 40 1 34 5 A 8 7 263577 CASAVA_Build 19 58923786 1I TGGGGTGTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2135 hom 27 6 18 3 G 0 1 263578 CASAVA_Build 19 58936563 1I GTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 485 het 485 ref 49 35 3 11 T 10 11 263579 CASAVA_Build 19 58937947 8I CCTCAGCTTC --------/CTGAGTAG CTGGGATTAC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 CTGAGTAG 0 1 263580 CASAVA_Build 19 58941142 1D GGACAGGGGG C/- CCCTTCCCTA 3048 het 3048 ref 29 14 11 5 C 4 3 263581 CASAVA_Build 19 58949949 1D CCTCCCACCT A/- AAGTCCCCTG 3070 het 3070 hom 48 18 21 12 A 3 2 263582 CASAVA_Build 19 58957592 1D TTTTGCTTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 113 het 48 0 39 10 T 9 8 263583 CASAVA_Build 19 58961530 2D2M5I CAGATTAACA GCAT-----/--ATCTGAA ATCTAGAATC 3070 hom 81 het 28 0 28 2 N/A 0 0 263584 CASAVA_Build 19 58962882 5D ACTCTGTTTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 20 0 12 9 A 21 16 263585 CASAVA_Build 19 58969981 1D TGATTAAAGG A/- AAAGGGAGAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 4 3 263586 CASAVA_Build 19 58971359 10D TTCTCTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTG 2310 hom 21 het 10 0 7 3 T 19 9 263587 CASAVA_Build 19 58974740 1D AGGCTGAGGC G/- GGAGGATCGC 3070 hom 75 het 26 0 26 1 G 3 2 263588 CASAVA_Build 19 58977899 1I GGCTGTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 45 2 35 8 A 11 12 263589 CASAVA_Build 19 58980956 1D TCTCCCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 710 hom 22 3 15 4 T 11 10 263590 CASAVA_Build 19 58984554 1I CATCTCTACT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 6 7 263591 CASAVA_Build 19 58985678 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTTTTTTTTT 2593 hom 7 het 21 0 10 11 TG 1 0 263592 CASAVA_Build 19 58986650 2D TAGATCTCCA GT/-- GTGTGGGCTG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 GT 3 2 263593 CASAVA_Build 19 58988791 1D GCTGGGACTA C/- AGGTGCCCGC 3070 hom 33 het 14 0 11 3 C 1 0 263594 CASAVA_Build 19 58989585 1D CAAGGTTTCA C/- CCGTGTTAGC 2500 hom 15 het 6 0 6 0 C 3 2 263595 CASAVA_Build 19 58989695 1D37M1I CAATTCATAA TTTATCATAGCCTTATGAAGATGCAACTATGTTCTCCA-/-TTATCATAGCCTTATGAAGATGCAACTATGTTCTCCAT TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 14 1 12 4 N/A 0 0 263596 CASAVA_Build 19 58990166 10D ACCATACCTG GTGTGTGCGT/---------- GTGTGTGTGT 3070 hom 70 het 26 0 22 8 GTGTGTGCGT 1 0 263597 CASAVA_Build 19 58990329 1I GATCCTGTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 728 hom 24 2 18 4 A 9 10 263598 CASAVA_Build 19 58991493 3I AATTGTTGTA ---/TTT TTAGTAGAGA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 T 2 5 263599 CASAVA_Build 19 58991954 36D CAGCTACTCG GGAGGCTGAGGCAGGAATTGCTTGAACCCGGGAGGT/------------------------------------ GGAGGTTGCA 2869 hom 15 het 8 0 6 3 GGAGGCTGAGGCAGGAATTGCTTGAACCCGGGAGGT 1 0 263600 CASAVA_Build 19 58992197 3I ACCAGATTGA ---/ATT ATTATTATTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 ATT 3 4 263601 CASAVA_Build 19 58995654 1D AACCCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 16 5 T 12 11 263602 CASAVA_Build 19 59001932 1I TCAAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2953 hom 32 11 14 7 A 13 14 263603 CASAVA_Build 19 59011443 1I ACACAGCCCG -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 43 het 17 0 13 4 C 8 9 263604 CASAVA_Build 19 59012079 1D TAAGAGGGCC A/- GGGCGCGGTG 3070 hom 30 het 13 0 10 3 A 1 0 263605 CASAVA_Build 19 59024179 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 7 8 263606 CASAVA_Build 19 59024384 1I TGTGTTGGTC -/A AGGCTGGTCT 3070 het 1420 hom 17 4 11 4 A 1 2 263607 CASAVA_Build 19 59031026 2D CCTGTCAGAC AT/-- AATTCCTCAG 3055 het 1646 hom 14 5 8 1 AT 1 0 263608 CASAVA_Build 19 59031145 1I TTTATATCCC -/T TACGGTCCTC 2603 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 2 263609 CASAVA_Build 19 59041291 3D CCTGTAATCC TGT/--- AATCACTTTG 2485 hom 27 het 10 0 9 1 TGT 1 0 263610 CASAVA_Build 19 59045065 1D GCTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 1224 het 846 hom 25 6 7 12 A 19 18 263611 CASAVA_Build 19 59045126 1I GGATGAACCT -/G GAGGACATAC 3070 het 3070 hom 28 8 13 7 G 1 2 263612 CASAVA_Build 19 59047265 1D CTCCTATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 8 9 T 11 10 263613 CASAVA_Build 19 59059254 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 5 A 8 5 263614 CASAVA_Build 19 59068438 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1859 het 1238 hom 20 5 11 4 A 13 14 263615 CASAVA_Build 19 59075875 4I24M2D CCGGAGACAC ----AGATTCAGAGTCAGAGAGACATAGAC/AGAGAGATTCAGAGTCAGAGAGACATAG-- ATTCATAGAG 3070 hom 60 het 19 0 20 10 N/A 0 0 263616 CASAVA_Build 19 59076152 2D AGAGAAGAGG GA/-- GAGAGAGACT 276 het 12 hom 17 0 2 17 GA 5 4 263617 CASAVA_Build 19 59076198 2I CCCTAGCATC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 1007 hom 30 3 22 5 AG 8 9 263618 CASAVA_Build 19 59109345 10D ATCTCAAAAA AAAAAAAAAG/---------- AAAAAAAGAA 29 het 29 ref 16 9 2 11 AAAAAAAAAG 1 0 263619 CASAVA_Build 19 59111409 38D TAACATGGGG GTACCAAGGCCCAGAATTGCATAGAGAGTTGCCCATAA/-------------------------------------- GTACCAAGGC 3070 het 3070 ref 29 21 11 9 GTACCAAGGCCCAGAATTGCATAGAGAGTTGCCCATAA 1 0 263620 CASAVA_Build 19 59134014 5D ACCCTGTCTT CAAAA/----- CAAAACAAAA 2595 het 2595 ref 21 8 7 6 CAAAA 5 4 263621 CASAVA_Build 19 59136128 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 2903 het 474 hom 17 1 8 9 A 13 12 263622 CASAVA_Build 19 59137407 1D CCTCGTCTTA G/- GGGGGTCTCC 3070 hom 36 het 13 0 12 1 G 6 5 263623 CASAVA_Build 19 59141500 2I TGTATACCTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1660 hom 25 5 14 6 TG 8 9 263624 CASAVA_Build 19 59155675 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1957 hom 26 7 15 5 T 9 8 263625 CASAVA_Build 19 59180393 13I CTTCTCTTGA -------------/GCATATGGGGCTG CGGAAGGGTA 3070 het 2964 hom 32 9 14 9 GCATATGGGGCTG 0 1 263626 CASAVA_Build 19 59182647 1I GTGAACTGGA -/T TGTCATAGAG 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 T 1 2 263627 CASAVA_Build 19 59183121 3D TTTGTGTTTC AAG/--- AAGGAGAGGA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 AAG 2 1 263628 CASAVA_Build 19 59202838 1I CAGCTTGCGA -/C TGTAGTCCCA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 C 0 1 263629 CASAVA_Build 19 59204849 1I TTGCTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 1508 het 1508 ref 13 6 7 0 A 0 1 263630 CASAVA_Build 19 59206828 1D TTGTGTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 11 10 263631 CASAVA_Build 19 59208357 2D AGGGTCCAAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AT 8 7 263632 CASAVA_Build 19 59209314 4D TCTCTACTAA AAAC/---- AAACAAACAA 2464 het 2360 hom 15 7 7 5 AAAC 4 3 263633 CASAVA_Build 19 59209411 4I CCTTCGGAAA ----/TGCC TGCCTGTTCT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 TGCC 1 2 263634 CASAVA_Build 19 59210299 1D GAGTCCACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 10 9 263635 CASAVA_Build 19 59210535 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 608 het 608 ref 15 4 2 9 T 13 14 263636 CASAVA_Build 19 59212695 1D CCCATCTCTC A/- TCTCTCTCTC 3070 hom 54 het 28 0 17 11 A 1 0 263637 CASAVA_Build 19 59213059 1D AGTTCCCTAT A/- AAAAAAAAAT 1625 het 1625 ref 15 7 4 4 A 10 9 263638 CASAVA_Build 19 59213533 3I ACTCCGTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 2901 hom 21 het 20 0 8 12 A 14 17 263639 CASAVA_Build 19 59214466 1D CCACAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 T 11 10 263640 CASAVA_Build 19 59214926 2I ACCCTGCCTC --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 29 9 10 10 A 8 10 263641 CASAVA_Build 19 59227391 2I ATAATGACTG --/TT TTTTGTACCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 4 6 263642 CASAVA_Build 19 59227832 2D AGAAAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 19 0 13 6 T 13 11 263643 CASAVA_Build 19 59231314 12D GACTGAGTAA TTTATTTTTATT/------------ TTTATTTTTA 2576 het 2487 hom 17 5 7 5 TTTATT 4 2 263644 CASAVA_Build 19 59232786 5I18M1I AAGCCCCATA -----GGACCCTGCAGGAATCCA-/GGGCTGGACCCTGCAGGAATCCAC CCCCCATGAT 3070 het 3070 ref 25 16 10 2 N/A 0 0 263645 CASAVA_Build 19 59237203 1I GACATGGGAA -/C TAAGTGGAGC 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 C 0 1 263646 CASAVA_Build 19 59240687 4I TTATCTATCA ----/TCTC TCTATCATCT 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 TC 1 3 263647 CASAVA_Build 19 59253306 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 12 13 263648 CASAVA_Build 19 59257224 1D CCGCCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2723 hom 25 10 9 6 A 12 11 263649 CASAVA_Build 19 59277905 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1758 het 1758 ref 14 6 5 4 A 17 16 263650 CASAVA_Build 19 59285865 1D TCCAACTCGG A/- AAAAAAAAAA 2293 het 1121 hom 12 4 6 2 A 13 12 263651 CASAVA_Build 19 59289158 1I TTCGAGACCA -/C CCTGGCCAAT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 C 2 3 263652 CASAVA_Build 19 59297119 1D AGGTCAGTTT C/- CTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 16 0 11 5 C 2 1 263653 CASAVA_Build 19 59314691 1D ATTCCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2214 hom 31 9 13 9 T 12 11 263654 CASAVA_Build 19 59328243 1D CAGGCGCCCG C/- CACCACGCCT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 2 1 263655 CASAVA_Build 19 59331197 1I GGCGCAGTCG -/C TCACGCCTGT 1768 hom 12 het 7 0 5 2 C 0 1 263656 CASAVA_Build 19 59331950 1I CAGTGTCTAG -/T TAAGTTTTCA 3070 het 3070 ref 55 26 23 6 T 1 2 263657 CASAVA_Build 19 59342572 1I TGCAGGGCCA -/G GGGCCCAACT 3070 hom 141 het 51 0 46 5 G 3 4 263658 CASAVA_Build 19 59345811 1I CCCAGGAAGG -/C TCTGAGAGGG 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 C 0 1 263659 CASAVA_Build 19 59355709 1I CCGAGAGTCA -/G GGACGTGGCG 3070 hom 62 het 25 0 21 4 G 2 3 263660 CASAVA_Build 19 59362492 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 18 0 10 8 A 13 14 263661 CASAVA_Build 19 59369342 4D GGACAATACT TTGA/---- TTTTGTAGGA 3070 hom 79 het 32 0 25 7 TTGA 1 0 263662 CASAVA_Build 19 59381398 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1871 het 1871 ref 17 5 5 7 T 10 11 263663 CASAVA_Build 19 59391065 5D TCAAAAAAAT AAAAA/----- GAAAAGAAAA 2237 hom 28 het 13 0 9 5 A 5 0 263664 CASAVA_Build 19 59423175 1D AATATCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 686 hom 37 3 20 14 T 15 14 263665 CASAVA_Build 19 59425443 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTCAGTAG 1877 het 768 hom 10 3 5 2 T 4 5 263666 CASAVA_Build 19 59440657 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2655 het 1429 hom 12 5 6 2 A 21 10 263667 CASAVA_Build 19 59450836 2I CCATCCCCTG --/TC TCTCTGTCTG 1696 het 1696 ref 17 11 4 2 TC 2 3 263668 CASAVA_Build 19 59458171 2D GGCGTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 82 het 41 0 25 17 TG 10 9 263669 CASAVA_Build 19 59459027 2I AATTAGCCTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 40 het 23 0 16 7 GT 7 8 263670 CASAVA_Build 19 59464572 2I TGCAAACCTT --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 8 10 263671 CASAVA_Build 19 59469992 1I CATTTCCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 23 15 13 T 11 12 263672 CASAVA_Build 19 59474378 1D TCCCTCCCTT G/- GGGACCACCC 3070 hom 29 het 12 0 8 4 G 4 3 263673 CASAVA_Build 19 59478735 1I ATTAATCAAA -/C CCGAAGAGTG 3070 hom 54 het 22 0 17 5 C 2 3 263674 CASAVA_Build 19 59480107 1I94M1D TTGTGATGTG -AAAATAGTAAATTATATTAACACATTTAGAAATAATTTCATCCAGAACAAGACACAGCTGAAATGATAAACATTGTATTGGTGTAGAATATTTAC/AAAAATAGTAAATCATATCAACACATTTAGAAATAATTGCATCAAGAACAAGACACAGCTGAAATGATGAGCATAGTATTGGTGTGGAATATCTA- TAAAATTTTT 1815 het 1815 ref 36 50 4 7 N/A 0 0 263675 CASAVA_Build 19 59481340 1I GGGCCCCAGT -/G CACCCGTCCT 1891 het 1891 ref 37 25 6 6 G 0 1 263676 CASAVA_Build 19 59484178 1D ACATGACTGT G/- GGGGGCTATA 2401 het 2401 ref 19 14 5 0 G 6 5 263677 CASAVA_Build 19 59485179 1D GTCCGCCCCC G/- GTCTCCCTGG 3070 hom 52 het 25 0 20 5 G 2 1 263678 CASAVA_Build 19 59486153 2I AAACTGAAAA --/AT AGGAGTAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 0 1 263679 CASAVA_Build 19 59491505 1I TTGAAGTGAG -/A AATATTGGCA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 2 3 263680 CASAVA_Build 19 59492623 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 2951 hom 30 het 14 0 10 4 A 9 10 263681 CASAVA_Build 19 59499500 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2199 het 2199 ref 30 17 7 7 A 15 14 263682 CASAVA_Build 19 59512606 4D CACTTAAGAA TAAT/---- TAAAGTAGTT 3070 het 3070 hom 26 12 14 2 TAAT 1 0 263683 CASAVA_Build 19 59514037 5D CTGTTTTTCT TTTTC/----- TTTTTTTTTT 536 het 536 ref 22 13 3 6 TTTTC 1 0 263684 CASAVA_Build 19 59521755 1D TATTAAAAAT A/- TAAAAATTAG 2390 het 955 hom 9 2 7 1 A 1 0 263685 CASAVA_Build 19 59543852 1D TACCTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2597 hom 22 6 13 3 A 11 10 263686 CASAVA_Build 19 59544327 1I TTCTTGCACA -/C CCTGTACCTG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 C 2 3 263687 CASAVA_Build 19 59546740 2D TTGCCCTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 1045 het 531 hom 23 5 3 15 A 18 16 263688 CASAVA_Build 19 59546985 4I ACAAACAAAC ----/AAAA AAAAGCAGTG 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 A 4 8 263689 CASAVA_Build 19 59564216 1D GAGGGCTTGG C/- GGTCAGGAGG 1827 het 1827 ref 27 15 7 5 C 1 0 263690 CASAVA_Build 19 59566588 1I CAGCAGTGGC -/A ATGGACAGGC 1530 het 1530 ref 28 10 9 9 A 1 2 263691 CASAVA_Build 19 59568764 2I TTAAGGAGAC --/AG TATTGGTGAG 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 AG 0 1 263692 CASAVA_Build 19 59581055 2I TCCTGACCTC --/AG ATGATCCACC 3070 het 1343 hom 14 3 8 3 AG 0 1 263693 CASAVA_Build 19 59581684 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1242 hom 27 4 19 4 A 10 9 263694 CASAVA_Build 19 59588437 1I TCCCCGTCCA -/C CCACCTGAAC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 C 2 3 263695 CASAVA_Build 19 59590431 1D CCTGGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 2411 het 904 hom 18 5 6 7 T 15 14 263696 CASAVA_Build 19 59594335 2D ACCTTCTCAC TT/-- AATGTACACA 3070 het 3070 ref 54 30 23 1 T 2 0 263697 CASAVA_Build 19 59599941 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAGT 3070 het 1770 hom 14 5 11 1 A 21 8 263698 CASAVA_Build 19 59604361 1I CCATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 860 hom 29 4 15 10 A 12 13 263699 CASAVA_Build 19 59608395 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 20 0 12 8 A 13 12 263700 CASAVA_Build 19 59609083 2D ACTCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 31 2 20 9 A 16 14 263701 CASAVA_Build 19 59612379 4I GAATTCCTTC ----/ACTT ACTTTGCTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 ACTT 1 2 263702 CASAVA_Build 19 59617204 3I TCACCACCAC ---/CAT CATCATCATC 3070 het 103 hom 65 3 45 17 CAT 4 5 263703 CASAVA_Build 19 59626150 1D ACTCACTCAG T/- TCGTTCATCC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 2 1 263704 CASAVA_Build 19 59688728 1D GTCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 1990 hom 22 6 11 5 T 7 6 263705 CASAVA_Build 19 59689615 1I AACTTCTGTG -/T TTTTTTTTTT 968 het 968 ref 40 31 3 6 T 11 12 263706 CASAVA_Build 19 59692942 4I ATGCTAATCA ----/AATT AATTAACTCC 3070 het 3070 hom 50 22 19 9 AATT 1 2 263707 CASAVA_Build 19 59693301 11I TCCACTCGAC -----------/TCCAGGCAAAT TTACAACAGG 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 TCCAGGCAAAT 0 1 263708 CASAVA_Build 19 59706487 3I ACTCCGTCTC ---/CAA CAACAACACC 3070 hom 63 het 25 0 20 5 CAA 2 3 263709 CASAVA_Build 19 59707538 1D TCCTGTTTAA C/- CGAAACTTTG 3070 hom 111 het 41 0 37 9 C 2 1 263710 CASAVA_Build 19 59710304 1I TAGAAACTAT -/A GAGGAAAACC 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 0 1 263711 CASAVA_Build 19 59711339 5I TGACCCCAAG -----/CCCTC CCCTCCCCTT 3070 het 2485 hom 25 7 14 4 CCCTC 1 2 263712 CASAVA_Build 19 59715664 1D GACCCTGAGG T/- GGACAGGTGG 3070 het 3070 hom 35 15 12 8 T 1 0 263713 CASAVA_Build 19 59716694 4I GACGTATTTC ----/TTTT TTTCTTTTCT 3070 hom 52 het 21 0 18 3 T 3 7 263714 CASAVA_Build 19 59720348 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 19 0 17 2 A 13 12 263715 CASAVA_Build 19 59722478 1I GTGGATCATG -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 6 7 263716 CASAVA_Build 19 59729446 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 9 263717 CASAVA_Build 19 59736041 2D AAGCTATTTT TC/-- TCTCTCCTCT 3070 hom 49 het 46 1 34 11 TC 4 3 263718 CASAVA_Build 19 59750312 1I AAAGTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 743 hom 36 2 21 13 T 11 12 263719 CASAVA_Build 19 59792496 2I TTTGCAAAGA --/CT CTATTTCCAA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 CT 1 2 263720 CASAVA_Build 19 59810881 2D ACCCTTCCTT TG/-- TGTGTGTGTT 3070 het 2424 hom 40 9 20 11 TG 5 4 263721 CASAVA_Build 19 59813615 1I CTTGTACCCC -/A AAATCTATTG 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 A 3 4 263722 CASAVA_Build 19 59824525 4D CTATTTTTAG TTCT/---- TTGAGATAGC 3070 het 3070 hom 49 20 24 7 TTCT 1 0 263723 CASAVA_Build 19 59829876 1I TCTTGTTCTT -/G ATGCAATTAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 G 0 1 263724 CASAVA_Build 19 59841680 1I TCAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2820 hom 27 10 13 4 A 13 14 263725 CASAVA_Build 19 59865921 1D AGGTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1935 het 1896 hom 37 12 8 17 T 15 14 263726 CASAVA_Build 19 59867409 7I TGGGGATGAT -------/GTGGGAG GTGGGAGCCC 3070 hom 71 het 29 0 21 8 GTGGGAG 1 2 263727 CASAVA_Build 19 59895518 1I TGGAATATTA -/C CCAGTCGTTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 2 3 263728 CASAVA_Build 19 59898467 1I AGCAGAGATA -/T TTCCAGCGCC 3070 het 3070 hom 53 22 20 11 T 2 3 263729 CASAVA_Build 19 59899241 15D AAGACGGAGG GAAGGAAGGAGGGAA/--------------- GAAGGAAGGA 3070 hom 86 het 33 0 26 9 GAAGGAAGGAGGGAA 1 0 263730 CASAVA_Build 19 59901667 1D GACAGGGGAT G/- GGGGGGAGGG 3070 hom 27 het 17 0 13 4 G 7 6 263731 CASAVA_Build 19 59903324 2I CTGCACATAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 56 20 15 21 GT 8 9 263732 CASAVA_Build 19 59908241 1I TTATCATGCC -/G GGGGGGGGAG 3070 hom 72 het 30 0 19 11 G 8 9 263733 CASAVA_Build 19 59911616 1I CCCCTGCACT -/G GGGGGGGGAA 1770 het 1770 ref 28 7 7 14 G 8 9 263734 CASAVA_Build 19 59912698 1I GAGAACGTGA -/C CCATCCAGTG 3070 het 3070 ref 30 11 12 7 C 2 3 263735 CASAVA_Build 19 59913687 3D CTCACCCATC CTT/--- CTTCTCTCCA 1982 het 1982 ref 19 10 6 3 CTT 2 1 263736 CASAVA_Build 19 59917958 1D CGCCTGCCTG T/- TAATCCCAGC 3070 het 2705 hom 17 7 8 2 T 2 1 263737 CASAVA_Build 19 59918920 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1853 hom 13 het 8 0 5 3 A 13 14 263738 CASAVA_Build 19 59922005 1I AACATAGACA -/C TAAAATCCTC 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 C 0 1 263739 CASAVA_Build 19 59922923 1D ATTTGGCACC A/- AAAAAAGAGC 3070 het 3070 hom 42 20 20 4 A 7 6 263740 CASAVA_Build 19 59930580 7D ATGCAGCCTG TCGTGGT/------- TCCTCTTCCA 1436 het 1436 ref 64 53 4 8 TCGTGGT 1 0 263741 CASAVA_Build 19 59935537 1D TTTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 T 12 11 263742 CASAVA_Build 19 59936801 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 6 7 263743 CASAVA_Build 19 59937441 1D GAGAATGTAA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 77 het 29 0 25 4 T 8 7 263744 CASAVA_Build 19 59945968 2D GCACCTACAG AT/-- GCCATGTTTA 3070 het 1197 hom 44 4 35 6 AT 1 0 263745 CASAVA_Build 19 59946937 2D GGTGGAGGGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 63 het 32 0 15 18 GA 10 9 263746 CASAVA_Build 19 59959850 1I CATTCTCAAA -/G GACATGCCCT 2661 het 2661 ref 43 31 6 6 G 1 2 263747 CASAVA_Build 19 59963577 2D GGTGGAGGGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 157 hom 32 6 24 2 GA 10 9 263748 CASAVA_Build 19 59971186 3I AAGACTTCCA ---/GTG TTATCATTAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 GTG 0 1 263749 CASAVA_Build 19 59975973 4D CTGTCGCCAA AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 46 29 11 9 AATT 4 3 263750 CASAVA_Build 19 59977618 3D GGGCAGAGGA GTG/--- GTGAGAATGA 3070 het 2595 hom 47 6 33 9 GTG 2 1 263751 CASAVA_Build 19 59985479 3I CTGCATGACG ---/CCT TCCTCCAGGA 1022 het 1022 ref 38 31 3 4 CCT 0 1 263752 CASAVA_Build 19 59998834 2D ATTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 32 3 10 19 T 14 12 263753 CASAVA_Build 19 60002989 1I96M11D ATAGCCCAGG -AAAAAAATGCATGCATTTAGGGTCAAACAATTTTTGGGATGTGTCAAGAACACACAATGGAGAAGGAACAGTCTCTTTAATAAATGGGATTGGGAGACTGCATGTCC/AAAAAAAATGCACGCATTTAGGGTCAAACAATTTTTGGGATGTATCAAGAACACACAATGGAGAAGGAACAGTCTCTTTAATAAATGGGATTGGGAG----------- ACATGCAGAA 3070 het 3070 ref 43 44 23 21 N/A 0 0 263754 CASAVA_Build 19 60003591 1I TTCTGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 22 2 A 10 11 263755 CASAVA_Build 19 60004910 1D AAAATAAATA T/- GATAAAGAGG 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 T 1 0 263756 CASAVA_Build 19 60006614 1I AAAATACATC -/A AAATTTCCTC 3070 hom 129 het 51 0 43 8 A 3 4 263757 CASAVA_Build 19 60009208 3D ACTGCCTCTT CTC/--- CTTCCAGGTC 1797 het 1797 ref 53 41 5 12 CTC 1 0 263758 CASAVA_Build 19 60012857 1D GAATCTGCTT C/- CTCACTTTTC 1137 het 1137 ref 55 43 3 10 C 2 1 263759 CASAVA_Build 19 60013566 1I TTTTTTGGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2238 hom 21 8 7 6 T 9 10 263760 CASAVA_Build 19 60016131 1I ATAGGCACAA -/C CTCCCACACT 3070 hom 96 het 35 0 31 4 C 1 2 263761 CASAVA_Build 19 60019226 1D AATTTACATG T/- TGTGATTTTT 2885 het 2885 ref 46 35 7 4 T 2 1 263762 CASAVA_Build 19 60019361 1I ATGGTTTATT -/A GTCACAATTG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 0 1 263763 CASAVA_Build 19 60021385 1D CTTCTCCAGC A/- ACTTGCTCAA 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 A 2 1 263764 CASAVA_Build 19 60024271 9I GATACATAGA ---------/GATGATGAT GATGACGATG 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 GAT 1 4 263765 CASAVA_Build 19 60024492 19I AAAATAGATA -------------------/AATAGATAGATCGATAGAT AATAGATAGA 3070 het 3070 ref 31 16 11 6 AATAGATAGATCGATAGAT 0 1 263766 CASAVA_Build 19 60026016 1D TCCTGCATGT G/- GGTGAGAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 G 3 2 263767 CASAVA_Build 19 60026736 1I TGTCTTGCAG -/A TAAAAGCCAT 2439 het 2439 ref 18 8 7 3 A 0 1 263768 CASAVA_Build 19 60027211 1I CTCGTTTTTT -/G AATTAAATTG 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 G 0 1 263769 CASAVA_Build 19 60027603 2D CCATTTATTG AA/-- AAGACTGTCC 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 4 2 263770 CASAVA_Build 19 60028698 1D GATGAGGGCG A/- GGTGTTTTAG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 1 0 263771 CASAVA_Build 19 60030251 1D ATGATTAATA G/- TGACTGACAT 3070 het 3070 ref 48 29 10 9 G 1 0 263772 CASAVA_Build 19 60033969 4I98M2D CCAGCCTTCT ----GTCAGCAGTGAAACTTATAAAATTTTTTGTGATTTCAATGTAGCTGTCTCCTCTTCAAATAAACATGTCTGCCCTCATTGCTTCAGGTAATGTGACACTG/GTCAGTCAGCAGTGAAACTTATAAAATTTTTTGTGATTTCAATGTAGCTGTCTCCTTTTCAAATAAACATGTCTGCCCTCATTGCTTTAGGTAATGTGACAC-- TATTCGCTGA 3070 het 3070 ref 33 44 14 12 N/A 0 0 263773 CASAVA_Build 19 60034754 2D13M1D AAAATGTACA ATAACTAGATAAAAAG/--AACTAGATAAAAA- TAAGAAGTGT 1958 het 1958 ref 29 29 5 6 N/A 0 0 263774 CASAVA_Build 19 60043411 1D ACTTTTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 11 0 8 3 T 13 12 263775 CASAVA_Build 19 60050549 1I GTGCTCCGAC -/A AAAAAAAGTA 2313 het 2313 ref 62 48 6 8 A 7 8 263776 CASAVA_Build 19 60051056 2D AGGGAACAGA AC/-- AGTGAACAGC 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 AC 1 0 263777 CASAVA_Build 19 60051779 1I CTTATAAATT -/G TTTTAAATAA 1873 het 1873 ref 41 29 4 8 G 0 1 263778 CASAVA_Build 19 60052406 4D TGCTATGCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 790 hom 21 3 16 2 T 16 12 263779 CASAVA_Build 19 60056639 1I AGTTGATACC -/A TCTGCCAGAG 3070 het 3070 ref 76 49 13 14 A 0 1 263780 CASAVA_Build 19 60059300 1D CTGGGTGTGA G/- GGGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 G 8 7 263781 CASAVA_Build 19 60060072 1I TCCTGCATGT -/G GGTGAGAAAT 1592 het 1592 ref 66 54 4 8 G 2 3 263782 CASAVA_Build 19 60060354 1D GAAAGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 20 18 15 T 13 12 263783 CASAVA_Build 19 60061657 2I CCATTTATTG --/AA AAGACTGTCC 1205 het 1205 ref 40 32 3 5 A 2 4 263784 CASAVA_Build 19 60064487 1I TGCTGGGTTT -/G AATTTTTCCT 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 G 0 1 263785 CASAVA_Build 19 60077968 5D AATATGGTTA CTAGT/----- ATTTTGTTGA 3070 het 3070 hom 34 17 15 5 CTAGT 1 0 263786 CASAVA_Build 19 60082313 1D CGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 12 11 263787 CASAVA_Build 19 60083344 2I AGGGGTTCTC --/TT TGTTTCCTGC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 1 3 263788 CASAVA_Build 19 60083532 1I TTATTCTTTT -/G TCTTCATTTT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 G 0 1 263789 CASAVA_Build 19 60088029 1D CTTTTTTTAA T/- TTTTTTTGTT 2855 het 2855 ref 24 10 8 6 T 8 7 263790 CASAVA_Build 19 60116068 1I ACCATGAGAC -/A ACAGTGGCCA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 1 2 263791 CASAVA_Build 19 60125971 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 889 het 889 ref 34 9 5 20 A 12 11 263792 CASAVA_Build 19 60127080 1D CACAAATGTT C/- CCAGAAATTC 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 C 3 2 263793 CASAVA_Build 19 60130753 4D CAAAAACAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 AAAC 1 0 263794 CASAVA_Build 19 60131992 1I TTTGGTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3056 hom 28 8 14 6 T 8 9 263795 CASAVA_Build 19 60132588 5D TTTTTTTCTT TACTC/----- TACAGCAAAG 3070 het 3070 ref 33 20 12 5 TACTC 1 0 263796 CASAVA_Build 19 60134847 3I CAGCCTGGGC ---/AAG AAGAGCGAAA 892 het 892 ref 19 12 3 4 AAG 1 2 263797 CASAVA_Build 19 60135022 2I GAGAGAGACT --/CA GTTAAAAAAA 753 het 753 ref 29 6 5 18 CA 0 1 263798 CASAVA_Build 19 60138408 2D TTGCAGGGGG GA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 GA 1 0 263799 CASAVA_Build 19 60138782 3I AAGCTGAGGC ---/AGG AGAACTGCTT 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 AGG 0 1 263800 CASAVA_Build 19 60144388 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 826 het 387 hom 11 1 5 5 A 13 12 263801 CASAVA_Build 19 60170591 1I GAACCCGGGA -/G AGCGGAGGTT 3070 het 1704 hom 24 7 14 3 G 0 1 263802 CASAVA_Build 19 60171399 3I CACCCGGCCC ---/TGT TGTTGTTTTT 2954 het 2923 hom 26 9 8 9 TGT 2 3 263803 CASAVA_Build 19 60172479 1I CTTGGTGAAA -/C CCCCCCATCT 3070 het 1916 hom 14 4 9 1 C 6 7 263804 CASAVA_Build 19 60176532 2I GGGTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 31 2 20 9 TG 0 1 263805 CASAVA_Build 19 60179237 1D CCATGAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 11 10 263806 CASAVA_Build 19 60180155 1D CACCACCATG C/- CCGGCTAATT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 C 3 2 263807 CASAVA_Build 19 60187291 1I GCCTCAGCCT -/C CCAAAGTGGG 3038 het 3038 ref 19 10 8 1 C 2 3 263808 CASAVA_Build 19 60190932 1I AAAAAAAAAA -/T AAAAATCTTG 1853 het 205 hom 9 1 5 3 T 0 1 263809 CASAVA_Build 19 60194081 1I GGTTTTCGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 10 11 263810 CASAVA_Build 19 60194307 1D GTAAATGGAA T/- TCATTTACTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 2 1 263811 CASAVA_Build 19 60195031 1I AGATTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2277 het 550 hom 16 3 7 6 A 15 16 263812 CASAVA_Build 19 60196455 1D TGGGGGTGTG T/- TTTCACTTCT 3070 het 3070 ref 32 13 10 11 T 4 3 263813 CASAVA_Build 19 60201048 3I GCTCAAGCAA ---/TCC TCCTGCCTCA 3070 hom 52 het 22 0 14 8 TCC 1 2 263814 CASAVA_Build 19 60202832 3I GTTTTTCTCT ---/ATC ATCAGATCAA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 ATC 1 2 263815 CASAVA_Build 19 60204965 1D TTTTGTGGGA T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 8 7 263816 CASAVA_Build 19 60205820 4I CATGTTTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 TTTG 2 3 263817 CASAVA_Build 19 60206666 1I TCCCTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 2487 het 2388 hom 39 8 16 15 T 15 16 263818 CASAVA_Build 19 60206971 1D GAAGGTTGGT A/- AAAAGAGAGG 3070 het 3070 hom 39 12 20 9 A 5 4 263819 CASAVA_Build 19 60207155 2D CTCACAGTTA AC/-- AGTGATCAAA 3070 het 3070 ref 54 27 21 8 AC 1 0 263820 CASAVA_Build 19 60207740 3I GAGCAAAAAA ---/AAT AAGAGCCAGA 3070 het 3070 ref 43 27 14 2 AAT 0 1 263821 CASAVA_Build 19 60208351 1I CGGGGGACAG -/A AAAAAAAAAT 2870 het 2870 ref 21 9 10 2 A 9 10 263822 CASAVA_Build 19 60209284 4D ACAGGAAGTG AAGT/---- AAGAAGACAG 3070 het 3070 ref 63 37 23 5 AAGT 1 0 263823 CASAVA_Build 19 60209621 6I ATTGAATGAC ------/TTGAAT TACTATGGAA 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 TTGAAT 0 1 263824 CASAVA_Build 19 60218745 5D ATTCTGCCTT TACTC/----- TACACACTGG 3070 het 3070 hom 45 21 21 5 TACTC 1 0 263825 CASAVA_Build 19 60221087 1I CGTCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 4 5 263826 CASAVA_Build 19 60223385 4D ATTAATAAAC CTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 198 hom 33 4 11 18 CTTT 1 0 263827 CASAVA_Build 19 60227132 2D14M1D AAGGAGAAGG GTGTAGGTGTGAATATA/--GTAGATGTGAATAT- AAAGGGTAGC 3070 hom 114 het 42 0 38 7 N/A 0 0 263828 CASAVA_Build 19 60229627 4I TGTCCTTTTG ----/TGAC TGACTGACTT 3070 hom 166 het 58 0 56 2 TGAC 2 3 263829 CASAVA_Build 19 60233035 2I GGCTGGTCCA --/TT TTCTAGTAGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 4 263830 CASAVA_Build 19 60238422 1I TTGGGAACTT -/A ACAGGAGTAG 3070 hom 104 het 40 0 34 6 A 1 2 263831 CASAVA_Build 19 60240516 3D AATTCCACAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2563 het 117 hom 26 3 10 13 T 19 16 263832 CASAVA_Build 19 60240889 1I TCAGCTCACT -/G GCAACTTCTG 3070 hom 24 het 10 0 8 2 G 1 2 263833 CASAVA_Build 19 60244722 3D AAGAAAATGG TAT/--- TATTCTTAGG 3070 hom 108 het 41 0 35 7 TAT 2 1 263834 CASAVA_Build 19 60246691 2I18M3D TGGTGATACC --GTCTTTAATTAGCCAGGTGTG/CTGTCTTTAATTAGCCAGGT--- GTGGTGGGCG 3070 hom 117 het 33 0 36 10 N/A 0 0 263835 CASAVA_Build 19 60253305 2D TTTTTTTTTT TG/-- GGGGGGGGAG 2075 hom 23 het 10 0 7 4 TG 1 0 263836 CASAVA_Build 19 60254718 7I TCAGGCGATT -------/CTGCTGC CTGCTGCCTC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 CTGCTGC 1 2 263837 CASAVA_Build 19 60255244 11D CTGCCTCAAC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1550 hom 28 het 12 0 7 5 T 23 12 263838 CASAVA_Build 19 60256126 8I ACAGGCGTGA --------/GCCACCAC GCCTGCACGC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 GCCACCAC 0 1 263839 CASAVA_Build 19 60257916 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1475 hom 33 4 20 9 T 15 16 263840 CASAVA_Build 19 60261866 5D TTTGTTTTGC TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 2372 hom 35 8 16 11 TTTGT 3 2 263841 CASAVA_Build 19 60265399 3I ACCCCTCTAC ---/GGT GGAGTCACGA 3070 het 3070 ref 48 21 16 11 GGT 0 1 263842 CASAVA_Build 19 60267598 1I AAATTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2626 het 2626 ref 25 10 8 7 A 13 14 263843 CASAVA_Build 19 60269618 10D CTCTCTGTCT TCTCTCCCTC/---------- TCTCTCCCTC 3070 het 3070 ref 43 18 12 18 TCTCTCCCTC 2 1 263844 CASAVA_Build 19 60269685 4D44M2I CTCTCTCTCC CTCTCTCTCACATCTCTCTTTCCCTTCCTTTCTCTTTCCTCTCTCTTC--/----CTCTCACATCTCTCTTTCCCTTCCTTTCTCTTTCCTCTCTCTTCCT CTCTCTCCCT 3070 het 3070 ref 43 32 11 13 N/A 0 0 263845 CASAVA_Build 19 60270702 1D GGGTATGGGA G/- GGGGTGGAAG 2409 het 2409 ref 28 12 10 6 G 5 4 263846 CASAVA_Build 19 60342985 1I TATCTCAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1890 hom 15 4 8 3 A 9 10 263847 CASAVA_Build 19 60360535 4I GGGCTGTGTC ----/CTGT CTGTCTCCTA 2624 het 2624 ref 22 10 8 4 CTGT 1 2 263848 CASAVA_Build 19 60362903 1D TCTGGGTCCT G/- GGGAAAGAAG 1741 het 1741 ref 18 9 6 3 G 4 3 263849 CASAVA_Build 19 60396558 1I CTGTGGTGGG -/C CATGATCGTA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 C 1 2 263850 CASAVA_Build 19 60424387 2I ACACACACAT --/AC ACACACAAAT 3070 hom 132 het 54 0 45 9 AC 3 4 263851 CASAVA_Build 19 60427073 4D CAAATGTGCA CACG/---- CACGCACGCG 3070 hom 123 het 48 0 42 7 CACG 3 2 263852 CASAVA_Build 19 60435797 1D CCCTCTGGAC A/- GAGGCTTCAC 3070 hom 84 het 31 0 27 4 A 1 0 263853 CASAVA_Build 19 60438391 1D GTATTAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 37 2 30 5 A 12 11 263854 CASAVA_Build 19 60480674 1I GCAGAGCCTT -/G GCTCCTTATG 3070 hom 111 het 40 0 35 5 G 1 2 263855 CASAVA_Build 19 60486842 4D TCTCCCTGTC TGTT/---- TTCCCGGCTT 3070 hom 84 het 31 0 24 8 TGTT 1 0 263856 CASAVA_Build 19 60494187 1I TAAGGTCTTC -/T TGTATATTTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 1 2 263857 CASAVA_Build 19 60500829 1D CCCTTCTTCA C/- TTGGTGGCTA 3070 het 3070 hom 32 9 16 8 C 1 0 263858 CASAVA_Build 19 60513763 1I TCTGGAGACA -/T TTTTTCCTCC 3070 het 3070 ref 36 14 16 6 T 5 6 263859 CASAVA_Build 19 60516630 2D AGCCTCGGAC TG/-- TGTTTTGCAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 TG 2 1 263860 CASAVA_Build 19 60517867 1I TAGAAGATCT -/G GGGCTGGATC 3070 het 2388 hom 26 6 19 1 G 3 4 263861 CASAVA_Build 19 60519194 1I AGAGTGACCT -/G GACCCATCTA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 G 1 2 263862 CASAVA_Build 19 60532227 8I CTGATGGTAA --------/TCATTCTG TCATTCTGGA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 TCATTCTG 1 2 263863 CASAVA_Build 19 60537521 1I CTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 T 9 10 263864 CASAVA_Build 19 60574095 4I GGAAGGGAAG ----/GAGA GAGAGAGAGA 3070 hom 97 het 45 0 30 15 GA 7 9 263865 CASAVA_Build 19 60577156 2D AACAAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 41 het 24 0 15 9 AG 8 7 263866 CASAVA_Build 19 60587792 14D CCCGAAGCCT GTGCAGATCAGACA/-------------- GTGCAGATCA 3070 hom 58 het 29 0 16 14 GTGCAGATCAGACA 2 1 263867 CASAVA_Build 19 60592535 4D CATGACACAC AGTG/---- AGGCCTGGAT 3070 hom 96 het 38 0 30 10 AGTG 1 0 263868 CASAVA_Build 19 60594971 2I AGATGGACTC --/AG ATGATCACAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AG 0 1 263869 CASAVA_Build 19 60605099 1I CATCTTTGCT -/C CCTGTCTCCC 3070 hom 87 het 36 0 27 9 C 2 3 263870 CASAVA_Build 19 60619380 1I CATTTCCGAA -/G GACAAAGTCT 3070 hom 104 het 40 0 33 7 G 1 2 263871 CASAVA_Build 19 60621075 1D GACTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2460 hom 38 10 15 13 A 15 14 263872 CASAVA_Build 19 60633005 1I CACCCCTGGT -/C CCCGCAGATG 2459 het 2459 ref 28 14 6 8 C 3 4 263873 CASAVA_Build 19 60642050 2I GTTCTTAGCA --/GC CCCCCCCCCC 3070 het 1340 hom 29 7 14 8 GC 0 1 263874 CASAVA_Build 19 60647023 4D ATCTTAGGTG CCCT/---- CCCTCCCTCC 3070 het 1852 hom 35 6 13 17 CCCT 4 3 263875 CASAVA_Build 19 60656359 1I CAGCACCCTG -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 56 het 26 0 16 10 C 8 9 263876 CASAVA_Build 19 60658708 1D AGGTCAGGAT G/- GGGGTCCTGC 2578 het 2578 ref 23 8 8 7 G 5 4 263877 CASAVA_Build 19 60660159 16D CCGGTTACTG TCAGCCCTGGTTACCA/---------------- TCAGCCCCAA 2657 het 2657 ref 35 17 8 14 TCAGCCCTGGTTACCA 1 0 263878 CASAVA_Build 19 60661239 1I TACCACAATT -/A AAAAAAAAAA 2622 het 2298 hom 26 8 12 6 A 12 13 263879 CASAVA_Build 19 60689170 1I CCCCAGCACC -/A AACGCCCTCC 2125 het 2125 ref 28 13 7 8 A 2 3 263880 CASAVA_Build 19 60696557 1I AGCGTCCCCA -/G GCCCCCACCG 2623 het 2623 ref 32 11 8 13 G 1 2 263881 CASAVA_Build 19 60701004 1D GGATGAAGAG T/- CAGGAGGCTG 2375 het 2375 ref 27 14 8 5 T 1 0 263882 CASAVA_Build 19 60706998 1D CTTTCCCGCC T/- TTTTTTTTTC 3023 hom 37 het 15 0 11 4 T 10 9 263883 CASAVA_Build 19 60715379 2D ACTTGGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 23 1 17 5 A 15 13 263884 CASAVA_Build 19 60718919 4D TCAAAAAAAA AAAT/---- AAAATAAAAT 763 het 595 hom 21 5 6 10 AAAT 1 0 263885 CASAVA_Build 19 60721429 3I ACCCCTCACC ---/CCA CCACAACTCC 1331 het 1331 ref 26 14 5 7 CCA 1 2 263886 CASAVA_Build 19 60723910 4I CTTTATTAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 2203 het 2203 ref 34 23 5 6 AAAG 3 4 263887 CASAVA_Build 19 60725662 1I AAATTCTGCC -/T TTTTTTTTTT 2301 het 669 hom 21 5 8 8 T 10 11 263888 CASAVA_Build 19 60730471 2I CACGCACAGT --/CA CACTGGCGTA 3070 het 2112 hom 64 19 34 11 CA 1 2 263889 CASAVA_Build 19 60730662 2I TACACTCAAT --/CG CGCACACACA 3070 hom 153 het 76 1 65 10 CG 1 2 263890 CASAVA_Build 19 60731517 4I TGTTTCTCTT ----/TCTC TCTATCTCTG 3070 hom 121 het 45 0 40 5 TC 1 3 263891 CASAVA_Build 19 60732775 7D TGCAGCCTGC AGAGAGG/------- AGAGAGGAGG 2376 hom 36 het 17 0 12 5 AGAGAGG 2 1 263892 CASAVA_Build 19 60735146 1I GGACAGAGTG -/A AAAAAAAAAT 2657 het 1158 hom 13 3 7 3 A 9 10 263893 CASAVA_Build 19 60736803 7D CTGCAGTCCA CAGTCCG/------- GCCTGGGCGA 1294 hom 9 het 4 0 3 1 CAGTCCG 1 0 263894 CASAVA_Build 19 60744150 1I CTCCCCAAAA -/C CCCAGGTCCC 3070 hom 73 het 27 0 21 6 C 3 4 263895 CASAVA_Build 19 60751024 4D AACAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 45 26 17 3 AAAC 3 2 263896 CASAVA_Build 19 60756439 4D AAAGAAGGAA GGAG/---- GGAGGGAGGG 1954 het 1835 hom 24 6 10 9 GGAG 5 4 263897 CASAVA_Build 19 60761687 1D TATTTATGTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 T 9 8 263898 CASAVA_Build 19 60765781 1D CTTCTGTGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 9 8 263899 CASAVA_Build 19 60766712 2I GCGCTCCGGG --/TC TCTGTCTGCC 2287 het 2287 ref 31 16 9 6 TC 1 2 263900 CASAVA_Build 19 60790078 4I TTTTGCCTGT ----/TTGC TTAACGGCTC 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 TTGC 0 1 263901 CASAVA_Build 19 60799791 1I ACCTTCCCCA -/C CCTGTCTGAA 3070 hom 120 het 44 0 38 6 C 2 3 263902 CASAVA_Build 19 60804913 1D40M1I GATCACAATA CTGGTCTGCACTCTCAGTTGGACTCTATCCTCTCTGGAAGG-/-TGGTCTGCACTCTCAGTTGGACTCTATCCTCTCTGGAAGGT TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 26 0 28 14 N/A 0 0 263903 CASAVA_Build 19 60822400 1D AATAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 1850 het 14 hom 11 1 8 2 A 17 16 263904 CASAVA_Build 19 60831535 1D TGGTGGAAGG A/- GGGATGAATG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 1 0 263905 CASAVA_Build 19 60846331 3D TGGGCCTCAG TTT/--- CCCCACCTTC 3070 hom 105 het 38 0 33 6 T 3 0 263906 CASAVA_Build 19 60846690 1I GTTGGGTGCT -/G GGGGGGTGGA 3070 hom 49 het 21 0 17 4 G 6 7 263907 CASAVA_Build 19 60952920 2D TATTTTAATT TC/-- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 TC 1 0 263908 CASAVA_Build 19 60953843 1D TTAGAATAAT A/- ATCTCGAATC 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 A 2 1 263909 CASAVA_Build 19 60964956 1I TCTGTGTTCA -/T TTTTTTTTCT 2913 het 2913 ref 35 14 8 13 T 8 9 263910 CASAVA_Build 19 60974959 1D TCCGTGTTCA T/- TTTTTTTTCT 2123 het 2123 ref 25 17 6 2 T 9 8 263911 CASAVA_Build 19 60978732 1I GACCCCCCCC -/T TCTCCAAAAC 3070 het 3070 ref 39 21 10 8 T 1 2 263912 CASAVA_Build 19 60979198 1I TTCTTTTTTT -/G GGGGGGAGAC 3070 hom 75 het 28 0 23 5 G 6 7 263913 CASAVA_Build 19 60987493 2D AAGGCAGAAC AT/-- AAAGATCTCA 3070 het 3070 ref 60 28 29 5 AT 1 0 263914 CASAVA_Build 19 60995213 1I ATGTCCACCC -/G GGGGCAGGGG 3070 het 2271 hom 30 9 15 6 G 4 5 263915 CASAVA_Build 19 61000223 1I TCACTCTCCC -/T TCAAGTCCAC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 1 2 263916 CASAVA_Build 19 61001180 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTTT 2955 het 1431 hom 16 6 9 1 A 0 1 263917 CASAVA_Build 19 61001914 2D TTTGCTTCAA AC/-- ACACACACAC 1803 het 1803 ref 58 47 5 6 AC 8 7 263918 CASAVA_Build 19 61007984 1D GGCTCACCCC T/- GTAATCTCAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 1 0 263919 CASAVA_Build 19 61008199 1I TGAGATCACG -/C CACTGCACTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 2 263920 CASAVA_Build 19 61014706 1I CACACTGGCT -/C CCCCCCCAGT 2474 het 2474 ref 21 9 8 4 C 7 8 263921 CASAVA_Build 19 61017760 1I CCATGCAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 11 263922 CASAVA_Build 19 61018269 4D TAGAGAACAT AGAC/---- AGAAAGATCA 2354 het 2354 ref 39 20 10 12 AGAC 1 0 263923 CASAVA_Build 19 61018593 12D CTTAATCCCA GCTACTCAGGAG/------------ GCTAAGTCAG 3070 het 3070 ref 24 13 13 2 GCTACTCAGGAG 1 0 263924 CASAVA_Build 19 61020344 1I TGGCCATGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 A 9 10 263925 CASAVA_Build 19 61024160 1I GTGGAAGGCA -/C CCCCCCACCC 2754 het 2754 ref 39 18 9 12 C 6 7 263926 CASAVA_Build 19 61025452 2I AAAAAGAAAT --/AA AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 A 7 9 263927 CASAVA_Build 19 61031598 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2402 hom 21 6 13 2 A 8 9 263928 CASAVA_Build 19 61032093 4I AAGATAACAT ----/AGAA AGAGAAGATT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AGAA 0 1 263929 CASAVA_Build 19 61032379 2D CAATATTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 33 0 20 13 T 14 12 263930 CASAVA_Build 19 61034933 1D TAAGTTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 13 12 263931 CASAVA_Build 19 61037128 2I TATTTAAATG --/AA AAAAAAAAAA 2492 het 2492 ref 29 17 7 5 A 12 14 263932 CASAVA_Build 19 61039955 2I TGCCTCCCAG --/TT GAGCCTGAGA 3070 het 3070 ref 32 11 9 12 T 0 2 263933 CASAVA_Build 19 61067893 1I TCTTTGCTTA -/T TTTTTTACTT 2806 het 2806 ref 21 9 6 6 T 6 7 263934 CASAVA_Build 19 61068318 1I CTTCTTCCCA -/C CCCTCTGCTC 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 C 3 4 263935 CASAVA_Build 19 61072562 1D AAAATAAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2439 hom 24 6 13 5 A 10 9 263936 CASAVA_Build 19 61072963 1I ATGGATCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 12 13 263937 CASAVA_Build 19 61077342 1I TTTCAAGTAG -/C CCATATTAAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 C 2 3 263938 CASAVA_Build 19 61083104 1I TTATAAATAG -/A AAACTTATAT 1746 het 1746 ref 14 6 7 1 A 3 4 263939 CASAVA_Build 19 61083350 1D CATTCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 5 T 11 10 263940 CASAVA_Build 19 61087496 4I GAAAAATAAC ----/AAAG AAACAGGAAA 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 AAAG 0 1 263941 CASAVA_Build 19 61087558 5D ATTAAGGACT ATCTA/----- TTGCACCTGG 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 ATCTA 1 0 263942 CASAVA_Build 19 61088292 2I ATATTTTATA --/TG TGTTATTTCA 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 TG 1 2 263943 CASAVA_Build 19 61089962 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2464 het 809 hom 14 4 9 1 T 10 11 263944 CASAVA_Build 19 61092914 1I AGTCCTTGGC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 7 8 263945 CASAVA_Build 19 61093917 1D CCAAAGTCTG A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 7 6 263946 CASAVA_Build 19 61095567 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 191 hom 45 1 32 13 AC 5 6 263947 CASAVA_Build 19 61106128 2I AAATTATAAC --/TT AACTAATTGT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 0 2 263948 CASAVA_Build 19 61109933 1D TGTTTACAGA C/- CCCCCCCTGC 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 C 8 7 263949 CASAVA_Build 19 61110145 1D TGTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 11 10 263950 CASAVA_Build 19 61111771 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 48 15 27 7 A 7 6 263951 CASAVA_Build 19 61112719 1I GATCTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 13 14 263952 CASAVA_Build 19 61121432 1D GTGATACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1822 hom 31 8 14 10 A 15 14 263953 CASAVA_Build 19 61130635 1D CTAATTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 29 1 22 6 A 15 14 263954 CASAVA_Build 19 61134903 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAGAAAGAA 1177 het 100 hom 13 2 6 7 AG 1 0 263955 CASAVA_Build 19 61135677 6I GTACACTTTT ------/TTTTTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 TTTTTG 0 1 263956 CASAVA_Build 19 61136184 5D AAGAACATTG AAGTT/----- AATTAGTCAC 3070 hom 99 het 35 0 33 5 AAGTT 1 0 263957 CASAVA_Build 19 61137210 2I TCGAAACAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 12 263958 CASAVA_Build 19 61137790 2D ATCCACAAAT AA/-- AGAGGATGAA 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 A 3 1 263959 CASAVA_Build 19 61140393 1D GCCCAACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 24 4 T 13 12 263960 CASAVA_Build 19 61145305 9I TTGAAATACA ---------/CAACAAATT CAACAAATTA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 CAACAAATT 1 2 263961 CASAVA_Build 19 61147418 1I GTGCCAAAAA -/C TAGAGAGTTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 C 0 1 263962 CASAVA_Build 19 61162698 2I CCAGGGTGTA --/TT TTTTTTTAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 7 9 263963 CASAVA_Build 19 61168634 1I ATCTCACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1925 hom 16 7 8 1 A 11 12 263964 CASAVA_Build 19 61168839 1I TTTTTTTAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 8 9 263965 CASAVA_Build 19 61170800 1D GTTGTTTCTG A/- ATCTTAGCTA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 2 1 263966 CASAVA_Build 19 61180941 1D CAAATTTTTT G/- CTCTCCATTA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 G 1 0 263967 CASAVA_Build 19 61184407 1D CCTCTGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1185 hom 42 5 17 20 T 12 11 263968 CASAVA_Build 19 61185088 2D TTGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 T 11 9 263969 CASAVA_Build 19 61187269 15D GTAACAGGGC AACAAGAGGAATAAT/--------------- AAACACAACA 3070 hom 78 het 26 0 27 4 AACAAGAGGAATAAT 1 0 263970 CASAVA_Build 19 61195117 4D TGTCATGGGG GTTT/---- GTTATACATA 3070 het 3070 hom 30 14 15 3 GTTT 1 0 263971 CASAVA_Build 19 61196034 1D TTATGGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 28 0 15 14 T 11 10 263972 CASAVA_Build 19 61199209 4D TTATCAGTTC TCTG/---- TCTTTTGGTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 TCTG 1 0 263973 CASAVA_Build 19 61203540 1D TCACCTCATG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2514 hom 22 7 12 3 T 9 8 263974 CASAVA_Build 19 61204617 16D TCTTCTGACT CTCCTAATTACTTGAA/---------------- ATTTTATAAT 3070 het 3070 ref 18 11 8 3 CTCCTAATTACTTGAA 1 0 263975 CASAVA_Build 19 61213968 1D ATAAATGCAG T/- TTTTTTTTTA 2862 het 2862 ref 31 11 8 12 T 10 9 263976 CASAVA_Build 19 61214345 10I AAATATATAT ----------/ATATATATAC ACACACATAC 2207 het 2207 ref 30 21 5 4 ATATATATAC 0 1 263977 CASAVA_Build 19 61215627 1D CGCCTTGGCC T/- TTTTTTTTTT 2413 het 335 hom 23 4 11 8 T 17 16 263978 CASAVA_Build 19 61220559 5D AGGTGGGAAG TTATA/----- TTATATTTCA 3070 het 3070 ref 44 19 21 6 TTATA 2 1 263979 CASAVA_Build 19 61225585 1D GTTATAGAAA G/- GAGGGGGCAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 G 2 1 263980 CASAVA_Build 19 61228229 3I GGGTTGCGTG ---/CTT CTTATGAGAA 3070 hom 138 het 55 0 47 8 CTT 1 2 263981 CASAVA_Build 19 61228752 1I TCTGGCTAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 9 10 263982 CASAVA_Build 19 61232405 2D TGAGTGAGAC TG/-- TGGAGGTGAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 TG 2 1 263983 CASAVA_Build 19 61234246 24D CTGTTCACAA ACGTGGGAAGGTATACACTCAGAC/------------------------ ACGTGGGAAG 3070 het 3070 ref 46 22 22 12 ACGTGGGAAGGTATACACTCAGAC 1 0 263984 CASAVA_Build 19 61246715 4I6M34D GTTTACTCTG ----CTATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/CTGACTATTC---------------------------------- TTTTTTTGAG 1547 het 1547 ref 10 6 4 3 N/A 0 0 263985 CASAVA_Build 19 61250247 1I GATCTTTTGT -/A TTTCAGTGAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 0 1 263986 CASAVA_Build 19 61250650 5I AATTTCTGTA -----/TTGAT TTCATTTTTG 3070 hom 77 het 31 0 25 6 TTGAT 0 1 263987 CASAVA_Build 19 61251713 3I14M1D GTTCAAGGAA ---CAAACAAGGGCCCCA/GCTGAAGATAGGGCCCC- AATCCCTTCT 3070 het 3070 ref 23 15 10 2 N/A 0 0 263988 CASAVA_Build 19 61254749 1D AGTCTCACCA C/- CCCCCCATCA 3070 het 3070 hom 30 13 10 7 C 7 6 263989 CASAVA_Build 19 61256575 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 2321 hom 24 7 12 5 A 8 9 263990 CASAVA_Build 19 61264197 4D CATGCATAAT TATC/---- TATTCATGCT 3070 het 3070 ref 41 22 16 6 TATC 1 0 263991 CASAVA_Build 19 61265476 2I CCAAAGGATG --/GT GTGTTACTGT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 GT 2 3 263992 CASAVA_Build 19 61272745 50D GGGCCATTTA GTCTATTGTAACTGCTCAGCTCTGCTGATACAGGGTAAAAACAAGCATAG/-------------------------------------------------- GTCTATTGTA 3070 het 3070 ref 26 31 10 6 GTCTATTGTAACTGCTCAGCTCTGCTGATACAGGGTAAAAACAAGCATAG 1 0 263993 CASAVA_Build 19 61273244 3I CCCCATCTCT ---/TAA AAAAAAAAAA 1501 het 1501 ref 33 12 11 10 TAA 0 1 263994 CASAVA_Build 19 61285820 4D GATACATAAA TGAT/---- AGCTACATAT 3070 hom 123 het 44 0 42 4 TGAT 1 0 263995 CASAVA_Build 19 61297207 4D CTTTTTTCAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2839 hom 31 8 16 8 TTTA 3 2 263996 CASAVA_Build 19 61303499 1I TGCTCAGGCT -/G GACACCTCCT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 1 2 263997 CASAVA_Build 19 61314378 11D TGCACACTTT CCAGGCCACAG/----------- CCAGGCCAAG 3020 het 3020 ref 30 10 10 12 CCAGGCCACAG 1 0 263998 CASAVA_Build 19 61330426 1I ATTGGAGGTT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 7 8 263999 CASAVA_Build 19 61330542 1D CGGGAGCACA G/- GGGCCCCAGG 2350 het 2320 hom 20 9 6 5 G 4 3 264000 CASAVA_Build 19 61330614 2D TGTGGGGAAT AA/-- AGGCCACTGC 2990 het 2990 ref 17 8 9 0 A 3 1 264001 CASAVA_Build 19 61343510 1I CTGTCTAGAT -/A AAAAACTTCA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 5 6 264002 CASAVA_Build 19 61351227 2I GAGTCCTGTC --/AG GGGGGATGTG 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 AG 0 1 264003 CASAVA_Build 19 61365655 1I GAGGCATGAG -/A AGGGAGTATG 3070 het 3070 ref 42 15 14 13 A 1 2 264004 CASAVA_Build 19 61368062 1D16M5I ACTCCATCTC AAAAAAAAAATAAATAA-----/-AAAAAAAAATAAATAAAAAAT AAAATAAATA 3070 het 3070 ref 36 20 14 6 N/A 0 0 264005 CASAVA_Build 19 61369828 4I ATGCAAACAA ----/ACAG ACAAACCCAA 3070 het 3070 hom 24 13 11 0 ACAG 0 1 264006 CASAVA_Build 19 61370677 1I TTTGTACACG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 8 9 264007 CASAVA_Build 19 61373340 1D GTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1948 hom 21 7 11 4 A 13 12 264008 CASAVA_Build 19 61377923 1D AGGTGACGTC A/- GGGCAAAGAG 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 A 1 0 264009 CASAVA_Build 19 61399032 1D ATTTTTTTTT A/- AAGTTATCTA 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 A 3 2 264010 CASAVA_Build 19 61399679 4D ATGATAAGAC AGTG/---- AGGTAGAGCC 3070 het 3070 hom 47 23 21 5 AGTG 1 0 264011 CASAVA_Build 19 61401468 3I GTGGACACTC ---/ATT GTTGATATGT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 ATT 0 1 264012 CASAVA_Build 19 61401707 1I TAGTTCTCAG -/T CCCCCTCAGT 2715 het 2715 ref 32 22 7 3 T 0 1 264013 CASAVA_Build 19 61403771 4D AGCCAAGGTG ACAC/---- AGTGAGACCT 2399 het 2399 ref 46 36 7 4 AC 2 0 264014 CASAVA_Build 19 61412867 1D TTCTTTTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 9 8 264015 CASAVA_Build 19 61413572 1D ATTTTCACTG C/- CCCCCCCGAA 1312 het 1226 hom 16 5 3 9 C 8 7 264016 CASAVA_Build 19 61416549 3D GCACCAACCA ACC/--- ACCTGGCCCA 3070 het 3070 ref 34 15 12 8 ACC 2 1 264017 CASAVA_Build 19 61416994 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 2315 het 2315 ref 24 11 11 2 T 9 8 264018 CASAVA_Build 19 61418824 5D TATTTTGTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2486 het 605 hom 27 8 12 7 T 19 14 264019 CASAVA_Build 19 61428364 1I TCTGGGGGGG -/A AAAAGTATGA 3070 hom 109 het 42 0 37 5 A 4 5 264020 CASAVA_Build 19 61435849 12D TATAGGCTAA TTTTTTTTTCTT/------------ TTTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 17 8 5 TTTTTTTTTCTT 1 0 264021 CASAVA_Build 19 61436901 1D ACAAAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 12 11 264022 CASAVA_Build 19 61437894 2D CATGCAGCCC CT/-- GTCACGTACC 2951 hom 18 het 8 0 7 1 CT 1 0 264023 CASAVA_Build 19 61442992 5I TTAACATGTC -----/CTTTA CTTTATTTGT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 CTTTA 1 2 264024 CASAVA_Build 19 61443361 3I CCAAAAGAAG ---/AAA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 A 9 12 264025 CASAVA_Build 19 61443444 3D CAATATGACA AAT/--- AATTCAGTAG 3070 het 3070 ref 30 15 15 2 AAT 2 1 264026 CASAVA_Build 19 61443831 1D CCTTGTGAAA G/- CATCGGGTCT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 G 1 0 264027 CASAVA_Build 19 61445970 1I TTCTCTCTTT -/A TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 0 1 264028 CASAVA_Build 19 61446608 2I TTGAATTCTC --/AT ATGATTACTT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 AT 1 2 264029 CASAVA_Build 19 61447025 6D GTGGCGTCCA GGATTT/------ GGATGAGGGT 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 GGATTT 1 0 264030 CASAVA_Build 19 61447779 5D TTTGTTGTCA CAAGG/----- GGGAGGACAG 3070 het 221 hom 25 1 22 2 CAAGG 1 0 264031 CASAVA_Build 19 61448305 4I AGATTTGAAC ----/ATTA ATTACAGTAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 ATTA 1 2 264032 CASAVA_Build 19 61448387 1I TCTGATTGTC -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 6 7 264033 CASAVA_Build 19 61450880 5I CTTTCTTTTA -----/TTTAT TTATTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTTAT 0 1 264034 CASAVA_Build 19 61451342 1D AAATAAACAA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 8 264035 CASAVA_Build 19 61457241 1I AATGAGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 15 16 264036 CASAVA_Build 19 61457423 6I AAAGTATTAC ------/ATAAAG ATAAACTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 ATAAAG 0 1 264037 CASAVA_Build 19 61461249 2D CGCCGGGAGA CT/-- CTGCAAGCCT 1893 het 1893 ref 30 12 7 11 CT 2 1 264038 CASAVA_Build 19 61470231 4D AGCTGTTCCC TCTG/---- TCTAAGCTAC 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 TCTG 1 0 264039 CASAVA_Build 19 61476648 13I ATAGTGATGA -------------/AAAAGACAGACAG AAATAGTTCT 3070 het 3070 hom 60 27 29 5 AAAAGACAGACAG 0 1 264040 CASAVA_Build 19 61477649 2D AGAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1856 hom 24 6 14 4 A 13 11 264041 CASAVA_Build 19 61484539 4I AACGGTGTGT ----/GTGA GTATGTACAC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 GTGA 0 1 264042 CASAVA_Build 19 61499604 1I CAGGTACTGG -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 T 6 7 264043 CASAVA_Build 19 61500251 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1490 hom 20 4 12 4 A 11 12 264044 CASAVA_Build 19 61502626 1I GTTCATGATT -/A AAAAAAAAAA 2697 het 2697 ref 38 20 9 9 A 14 15 264045 CASAVA_Build 19 61505745 1I TCCCTCCCCC -/T CTTCCTTTTC 685 hom 5 het 6 0 3 3 T 0 1 264046 CASAVA_Build 19 61507010 1D GTCTGGACAT A/- AGAGATGAGA 3070 hom 114 het 41 0 37 5 A 2 1 264047 CASAVA_Build 19 61508437 2D TCTCTTCCCC CT/-- GTTCCTGGCA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 CT 1 0 264048 CASAVA_Build 19 61512505 2D GAGTGACTGC TT/-- TTAATGGATT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 4 2 264049 CASAVA_Build 19 61518226 1I AGTGCAGGCA -/T TTTTATTCTA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 4 5 264050 CASAVA_Build 19 61521413 1I CTTCACCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 10 11 264051 CASAVA_Build 19 61524725 1I TCTGGGTGTC -/T TGTCTTCTTA 3070 het 3070 ref 53 26 18 9 T 1 2 264052 CASAVA_Build 19 61524822 1D CCATGCATCG T/- TATGTCGTCC 3070 het 3070 ref 69 32 23 16 T 2 1 264053 CASAVA_Build 19 61528912 3D ACTGGTTATC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 12 TGT 6 5 264054 CASAVA_Build 19 61529121 1I TATATTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2126 hom 20 7 9 4 T 11 12 264055 CASAVA_Build 19 61530243 1D GCTACAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 12 11 264056 CASAVA_Build 19 61531130 6I GTATACATGA ------/TATATT TATATTCACA 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 TATATT 1 2 264057 CASAVA_Build 19 61534013 1I CAATTTGTCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 49 28 19 2 T 7 8 264058 CASAVA_Build 19 61538426 1D ACAAGGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 35 2 33 0 A 12 11 264059 CASAVA_Build 19 61544081 2I AAGTGAAAAG --/AA ATCTTCTTGT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 1 3 264060 CASAVA_Build 19 61545491 1I GCTGTCTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 10 11 264061 CASAVA_Build 19 61558271 24D5M1D16M5D9M4I14M17I11M1I6M3D TGAAACCCAA CGTGGTTTTTCTATTGAGGATAGTAATCATGATGTGGGGCATTTTGTTCCCAATTGACAG----CTCCACGGGTCTCC-----------------CATACATAATT-TCAGAAGCT/------------------------ACTCA-GCCCTGGATCAACTGG-----ACCTGACAGAGATCTACATAAGTCTCCACCCAAAACCAACAGAACATACATTTTTCTCAGTA--- CCACATGAAG 2193 het 2193 ref 29 43 6 3 N/A 0 0 264062 CASAVA_Build 19 61568371 3D GACTTGACTA ATT/--- ATTGTTGATC 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 ATT 2 1 264063 CASAVA_Build 19 61571932 2I CACGCTAAAC --/AG TGTTTTCTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 AG 0 1 264064 CASAVA_Build 19 61581086 8I CAATGCGGGA --------/AGTCCTTT AGTCCTTTAG 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 AGTCCTTT 1 2 264065 CASAVA_Build 19 61583136 1D ATTTCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1319 het 792 hom 19 5 8 6 T 12 11 264066 CASAVA_Build 19 61583700 1I TTGCTCAAAT -/C CCCAGATTTC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 C 3 4 264067 CASAVA_Build 19 61588400 1I GTTTGGCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 9 10 264068 CASAVA_Build 19 61596322 1I CTCTCAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 29 2 17 10 A 13 14 264069 CASAVA_Build 19 61597388 2D TAATTCTCTC TT/-- GTTTTTAGGC 3070 hom 75 het 30 0 22 9 T 2 0 264070 CASAVA_Build 19 61601045 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1017 het 1017 ref 34 21 3 10 T 11 12 264071 CASAVA_Build 19 61606722 1I GAGATAATAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 189 hom 35 1 28 6 A 7 8 264072 CASAVA_Build 19 61621896 1I ACAAATACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 40 het 34 1 27 6 T 9 10 264073 CASAVA_Build 19 61624476 22I TGAGAATTAG ----------------------/TATTCATCAATGACTATACCTA TGTTTTTACT 3070 hom 108 het 37 0 37 3 TATTCATCAATGACTATACCTA 0 1 264074 CASAVA_Build 19 61630916 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1765 hom 16 het 13 0 8 5 A 15 17 264075 CASAVA_Build 19 61631292 5I GAAGAAACAC -----/ATAAT ATAACGGACA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATAAT 0 1 264076 CASAVA_Build 19 61635710 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2134 het 2134 ref 42 20 5 17 A 13 12 264077 CASAVA_Build 19 61638184 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 11 264078 CASAVA_Build 19 61639550 4D CATCTCTTCA TTTC/---- TTTATGTATC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TTTC 1 0 264079 CASAVA_Build 19 61651820 1I CAACCACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1096 hom 52 4 30 18 A 12 13 264080 CASAVA_Build 19 61683529 3D TTAATTTGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 2607 het 644 hom 14 4 7 7 A 25 22 264081 CASAVA_Build 19 61688733 7D AAAAGAGTGT GGCCAGA/------- GGCCAGATGG 1754 het 1754 ref 15 8 6 2 GGCCAGA 2 1 264082 CASAVA_Build 19 61691515 1I TTCATTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 26 15 9 T 10 11 264083 CASAVA_Build 19 61696084 2I CTGTAATACC --/TT TTTTTTTTTT 2896 het 2896 ref 37 12 13 13 T 14 16 264084 CASAVA_Build 19 61703285 2I AGTTTGACTC --/TT TTCGTCAACA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 2 4 264085 CASAVA_Build 19 61735379 1D GCTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 136 hom 37 2 27 8 T 11 10 264086 CASAVA_Build 19 61744099 4I CACAGTTCTT ----/ACTC ACCTCCGTGA 3070 hom 90 het 31 0 29 2 ACTC 0 1 264087 CASAVA_Build 19 61744516 1I TTTGCAAATT -/A ATGTGCAGAA 3070 hom 150 het 59 0 50 9 A 1 2 264088 CASAVA_Build 19 61745947 4D ATTTTTTTAT TTTG/---- TTTTTTTGCT 3070 hom 108 het 40 0 36 5 TTTG 1 0 264089 CASAVA_Build 19 61765903 1I GTCCCCACCT -/C CCCAGTGATT 3070 het 8 hom 48 1 41 6 C 3 4 264090 CASAVA_Build 19 61773185 2I AAAAAAATGT --/AC ACACACACAC 3070 hom 90 het 40 0 30 10 AC 5 6 264091 CASAVA_Build 19 61779116 1I TATATGTAGT -/G ATTTATACGT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 G 0 1 264092 CASAVA_Build 19 61783779 2D GGAAGAGTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 44 1 31 12 T 14 12 264093 CASAVA_Build 19 61788196 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 17 1 10 6 A 15 14 264094 CASAVA_Build 19 61788918 1I TAGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 27 1 24 2 A 13 14 264095 CASAVA_Build 19 61795779 1I GGCTATTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 10 264096 CASAVA_Build 19 61800905 1D GTTTTCAGGG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 9 8 264097 CASAVA_Build 19 61801990 1D TATATATATG C/- CCCCCTACAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 C 6 5 264098 CASAVA_Build 19 61802511 1D GGCTCACTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 10 9 264099 CASAVA_Build 19 61802877 1D TAGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1287 het 656 hom 23 6 5 12 T 15 14 264100 CASAVA_Build 19 61807039 8I TGGTTTCAGC --------/TCTTCAGA GTTTTCCCTG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 TCTTCAGA 0 1 264101 CASAVA_Build 19 61807265 3I CAGTGAATAG ---/TTA TTGAGTGAAT 3070 hom 99 het 36 0 32 4 TTA 0 1 264102 CASAVA_Build 19 61810874 4D GTCTTTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 12 AAAC 4 3 264103 CASAVA_Build 19 61811269 1D CCTTTTTGTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 9 8 264104 CASAVA_Build 19 61817182 1D CAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 2339 het 2339 ref 31 12 8 11 A 13 12 264105 CASAVA_Build 19 61819255 1D AGTTTATCAA T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 8 het 24 1 17 6 T 8 7 264106 CASAVA_Build 19 61838623 1I TTATTACCGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 11 12 264107 CASAVA_Build 19 61847959 4D TGATTGACTC ATTG/---- ATTGATTTTT 2867 het 2867 ref 30 17 10 3 ATTG 2 1 264108 CASAVA_Build 19 61848386 2D TGAATGTGGA TG/-- TGTGTGTGTT 3070 hom 180 het 76 0 59 20 TG 5 4 264109 CASAVA_Build 19 61854146 1I GGAGCACACA -/C CCAGGGGGCT 3070 het 3070 hom 47 15 19 13 C 2 3 264110 CASAVA_Build 19 61862924 2I CTTTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 2083 het 585 hom 19 7 6 6 TG 0 1 264111 CASAVA_Build 19 61864459 1I AGGGCTGGTG -/C TGGGATGTTC 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 C 0 1 264112 CASAVA_Build 19 61871911 5I GTGGGGCTGG -----/ACAGA ACAGAGCAAC 3070 het 2955 hom 35 13 15 7 ACAGA 1 2 264113 CASAVA_Build 19 61876256 1I AAAAAAATTG -/T TTTTTACGTT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 5 6 264114 CASAVA_Build 19 61878537 12D GCCTACACTT TAAAGCACTTTG/------------ CCTCTTTAAA 3070 hom 102 het 38 0 34 7 TAAAGCACTTTG 1 0 264115 CASAVA_Build 19 61888577 3D GTATCACACC ACT/--- AAGAACAGCC 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 ACT 1 0 264116 CASAVA_Build 19 61892643 3D ATAGGCTCTA ATT/--- ATTATTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 ATT 3 2 264117 CASAVA_Build 19 61896557 1D CTCCCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2295 het 2015 hom 26 9 10 8 A 12 11 264118 CASAVA_Build 19 61901063 4I CCTCTCTCCC ----/TTCT TTGGCTGTCC 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 TTCT 0 1 264119 CASAVA_Build 19 61906169 4D TTTGGTTCTC TGTT/---- TGTCTGTTGT 3070 het 483 hom 8 1 7 0 TGTT 1 0 264120 CASAVA_Build 19 61908740 2I AATGTGGTAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 AT 6 7 264121 CASAVA_Build 19 61920512 1D CCTCATTTTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 8 7 264122 CASAVA_Build 19 61934233 6D AGATTCTGTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1966 het 1966 ref 20 9 7 7 A 17 11 264123 CASAVA_Build 19 61938167 1I CAGATGGGAA -/G GGGGGGGTCC 3070 het 3070 ref 42 19 10 13 G 7 8 264124 CASAVA_Build 19 61938944 2I4M5D CTACCCAGGG --GATGTCAAT/ATGCTG----- AGTTCTCTTC 3070 hom 141 het 47 0 45 4 N/A 0 0 264125 CASAVA_Build 19 61944832 1I GTGATATTAT -/A AATATTTGAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 2 3 264126 CASAVA_Build 19 61946445 1I AAGAAAGAAA -/G AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 0 1 264127 CASAVA_Build 19 61946661 3I CGTGTTGCTC ---/CTT CTGCCATCAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CTT 0 1 264128 CASAVA_Build 19 61983426 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1551 het 1551 ref 29 13 5 11 T 15 14 264129 CASAVA_Build 19 62011945 1I GTAAAAGAAA -/C CCAAGGGCAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 2 3 264130 CASAVA_Build 19 62025677 1D AAACTTCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 521 hom 34 2 20 12 T 13 12 264131 CASAVA_Build 19 62028748 1I CAATCTCTCC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 8 9 264132 CASAVA_Build 19 62045680 2D CATCATCCCC CT/-- GTCTCCTCAA 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 CT 1 0 264133 CASAVA_Build 19 62046471 1I ACAAAAAAAA -/C CCCTCACGAT 3070 hom 77 het 29 0 25 4 C 3 4 264134 CASAVA_Build 19 62049197 1D AAACGTCTTT A/- GGGGTCAAAG 3070 hom 96 het 40 0 32 9 A 1 0 264135 CASAVA_Build 19 62087623 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2972 het 1563 hom 19 5 8 6 A 15 14 264136 CASAVA_Build 19 62101633 1D TTTTTTTTTT C/- CTTGAGACGG 3070 het 196 hom 17 3 11 3 C 2 1 264137 CASAVA_Build 19 62108078 1D CCTGAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 T 15 14 264138 CASAVA_Build 19 62113940 1I AGAATGACAG -/A AAGCACCGAT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 2 3 264139 CASAVA_Build 19 62115308 1D AAGCAGTAGA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 T 8 7 264140 CASAVA_Build 19 62117074 1D15M1D GACCTGTATC AAAAAAAAATAAAAATA/-AAAAAAAATAAAAAT- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 22 13 8 6 N/A 0 0 264141 CASAVA_Build 19 62119185 2I GGCCACATTC --/TG TGTTCTGAGT 3070 het 3070 hom 44 14 20 10 TG 1 2 264142 CASAVA_Build 19 62126405 1D AAAAAAAAAA C/- CCCACACATT 3070 het 561 hom 40 2 33 6 C 4 3 264143 CASAVA_Build 19 62126565 15I ACCCAAACTT ---------------/CAGTGACTTAAATCA CATTGATTTC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 CAGTGACTTAAATCA 0 1 264144 CASAVA_Build 19 62149152 1I AGTGGGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 A 10 11 264145 CASAVA_Build 19 62149874 1D CACAATCAAT A/- AGCAGAGCAT 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 A 2 1 264146 CASAVA_Build 19 62150491 1D AGGAAGAGAT G/- GGGGGATGTG 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 G 6 5 264147 CASAVA_Build 19 62151497 7D GCCCTTACTC TTTTTCT/------- TTTTTCTTTT 3070 het 1792 hom 31 6 13 12 TTTTTCT 2 1 264148 CASAVA_Build 19 62152761 3D GCCTTGTGCT GAA/--- GAAGAAGATG 3070 het 3070 hom 32 11 15 8 GAA 3 2 264149 CASAVA_Build 19 62153537 1I GCAGTTTTTT -/G TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 G 0 1 264150 CASAVA_Build 19 62155915 1I ATATGCTTAT -/C CCCCCCCCAC 3070 het 10 hom 16 0 9 7 C 8 9 264151 CASAVA_Build 19 62158447 5I GTCTGGCTGG -----/TATTC TGCCTAGTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TATTC 0 1 264152 CASAVA_Build 19 62159509 2D ATATACCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 A 13 11 264153 CASAVA_Build 19 62161164 4D49M10I GGAGGGAGGG AGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGGAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGAGGAAAGG----------/----AGGAAGGAAGGAAGGAAGGGGAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGAGGAAAGGAAAGGAAAGA AAAGAAAAGG 3070 het 18 hom 19 1 20 13 N/A 0 0 264154 CASAVA_Build 19 62162303 4D AAGGAAGGAC GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 hom 72 het 29 0 23 7 GGAA 4 3 264155 CASAVA_Build 19 62172554 4D TGTGGGAGGG AGGA/---- AGGAAGGAAG 3070 hom 102 het 44 0 34 10 AGGA 5 4 264156 CASAVA_Build 19 62192467 1I ACATACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 24 2 18 4 A 10 11 264157 CASAVA_Build 19 62194911 2D CAGCCTAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 37 0 14 25 T 16 14 264158 CASAVA_Build 19 62204214 4I TAAAGACACG ----/AGAA TATTCCTGCC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 AGAA 0 1 264159 CASAVA_Build 19 62204965 1D CACCCAGCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 53 het 21 0 17 4 T 10 9 264160 CASAVA_Build 19 62213888 1D CGGTGCTCCC A/- ACCTTCTAGC 3070 het 3070 hom 42 18 20 6 A 2 1 264161 CASAVA_Build 19 62222073 2D CTCCCAGAAA CT/-- CTGTGTTTCA 3070 het 3070 ref 55 26 21 8 CT 2 1 264162 CASAVA_Build 19 62224692 1D CTTCTTGGGG T/- TCCTGCAGCT 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 T 2 1 264163 CASAVA_Build 19 62233234 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2985 het 1638 hom 24 6 10 8 A 12 13 264164 CASAVA_Build 19 62238748 2D AGACCTTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 29 2 18 9 A 14 12 264165 CASAVA_Build 19 62242434 3I CAACAAAAAA ---/AAC ACAAACTGAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAC 0 1 264166 CASAVA_Build 19 62242854 2D GAGTATAAAT TA/-- GTCCAGTCAC 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 TA 1 0 264167 CASAVA_Build 19 62252693 8D50M1D TTGATGCTCC AGAAGGGTAGAAGGGTGTCTGTCTCCCATGTTTCCTGGCTCTGGCCTGGCTCTGCAACT/--------AGAAGGGTGTCTGTCTCCCATGTTTCCTGGCTCTGGCCTGGCTCTGCAAC- TTTTTTTTTT 2767 het 2767 ref 16 9 6 7 N/A 0 0 264168 CASAVA_Build 19 62253569 1D TACCTCCACC A/- AAAAAAAACT 3070 het 2938 hom 21 8 11 3 A 9 8 264169 CASAVA_Build 19 62261853 1D AACTCCAGAA T/- TTTTTTTTTT 788 het 204 hom 23 3 3 18 T 17 16 264170 CASAVA_Build 19 62268518 1D CATAAGATGC A/- AAAAAAAAAA 1252 het 464 hom 27 5 5 18 A 19 18 264171 CASAVA_Build 19 62273995 1D TCGAGACCTG A/- CCTGGCCAAC 3065 het 3065 ref 21 10 7 5 A 1 0 264172 CASAVA_Build 19 62276178 1D CGCCTGCCTC G/- GCCTCCCAAA 3070 het 1931 hom 20 5 11 4 G 2 1 264173 CASAVA_Build 19 62277594 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2764 het 337 hom 11 1 7 3 A 13 12 264174 CASAVA_Build 19 62278594 1I CTACAGATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 11 12 264175 CASAVA_Build 19 62295472 1D CATCTTAACT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 8 7 264176 CASAVA_Build 19 62295935 1I CCTGGGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 32 0 22 10 A 10 11 264177 CASAVA_Build 19 62296646 4D TCTCAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 547 het 547 ref 32 12 5 16 AAAG 1 0 264178 CASAVA_Build 19 62297855 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 168 hom 35 2 21 14 A 17 16 264179 CASAVA_Build 19 62298298 2D CTCAAAAAAA AT/-- AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 5 AT 1 0 264180 CASAVA_Build 19 62301926 1I CCCTGACTCT -/A AAAAAACCGT 3070 het 3070 hom 22 8 9 5 A 6 7 264181 CASAVA_Build 19 62304096 1D AACTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 723 hom 25 2 20 3 T 14 13 264182 CASAVA_Build 19 62327648 2D TTTTGTGGGG TT/-- TTTTTTTTGG 3024 het 7 hom 18 1 12 5 T 10 8 264183 CASAVA_Build 19 62331239 1I TGAGGCAATG -/C CCCCACCCTG 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 C 4 5 264184 CASAVA_Build 19 62357067 1D AACTTAAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 9 8 264185 CASAVA_Build 19 62361176 1D CCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 A 12 11 264186 CASAVA_Build 19 62366628 1I ATCCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 42 2 30 10 T 10 11 264187 CASAVA_Build 19 62367827 1D GAAACAAAAA T/- TTTTTTTAAG 2328 het 2328 ref 22 13 5 4 T 8 7 264188 CASAVA_Build 19 62372168 1D GATTCAATTA C/- CATAATCAAA 2356 het 2356 ref 19 13 6 0 C 2 1 264189 CASAVA_Build 19 62372975 2I TTTTAAATAT --/AC AGTTTGAATT 2605 het 2605 ref 20 12 6 2 AC 0 1 264190 CASAVA_Build 19 62373744 1D CAATTTAAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 9 8 264191 CASAVA_Build 19 62391646 1I TCTATGAAAC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 6 7 264192 CASAVA_Build 19 62395917 1I GTTCACATAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 8 9 264193 CASAVA_Build 19 62396087 1I GATTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 T 4 5 264194 CASAVA_Build 19 62408343 4D TAATATTTAA ATAC/---- ATCAGTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 7 ATAC 1 0 264195 CASAVA_Build 19 62425697 8D TCTCTCTCTC TCTCTCTA/-------- TATATATATA 2073 het 2073 ref 26 18 6 4 TCTCTCTA 1 0 264196 CASAVA_Build 19 62426848 1I CAGCTGATTC -/T TTTTTTTTTT 2400 het 1711 hom 29 9 12 8 T 15 16 264197 CASAVA_Build 19 62432884 2I CCTAGGAGGC --/CT GGAGGTTGCA 3070 het 2733 hom 26 7 16 3 CT 0 1 264198 CASAVA_Build 19 62434306 14D TGAGGCTGCA GGACGAGCAGGATT/-------------- GGAAGCGCCC 1941 het 1941 ref 15 8 6 5 GGACGAGCAGGATT 1 0 264199 CASAVA_Build 19 62461709 1I TTTGTATTAA -/T TTTTTTAGTG 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 T 6 7 264200 CASAVA_Build 19 62469212 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 10 9 264201 CASAVA_Build 19 62474762 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 11 10 2 A 10 9 264202 CASAVA_Build 19 62482653 1D TCATGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 A 11 10 264203 CASAVA_Build 19 62506801 4D ATTCTGTAAA TAAC/---- TAGGAGTAGA 3070 het 3070 hom 50 21 27 7 TAAC 1 0 264204 CASAVA_Build 19 62507632 4I CTTTGTTATC ----/CTGT CTATTTTTGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CTGT 0 1 264205 CASAVA_Build 19 62510822 4D GTATACATAT TTCA/---- TTCTTCTATT 3070 het 3070 ref 28 15 13 1 TTCA 1 0 264206 CASAVA_Build 19 62515439 1I CAACAGAAAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 7 8 264207 CASAVA_Build 19 62517791 1D AGGGTTGGAA G/- GGTTGTTAAA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 G 3 2 264208 CASAVA_Build 19 62518321 8I TCTTAGGAGG --------/TTGTATGT TTGTATGTTT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 TTGTATGT 1 2 264209 CASAVA_Build 19 62518484 1I TCTTTTTTCC -/T TTATTAATCT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 2 3 264210 CASAVA_Build 19 62527993 1D CTTAGAATGT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 A 9 8 264211 CASAVA_Build 19 62530212 1D ATGCCTGGCT G/- AGTTTTTAAA 2564 het 2564 ref 18 9 6 4 G 1 0 264212 CASAVA_Build 19 62535982 1I TTACTTCTAC -/T TTTTTTTTTT 1688 het 595 hom 17 3 4 10 T 17 18 264213 CASAVA_Build 19 62537440 1D GACAGCAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 10 9 264214 CASAVA_Build 19 62537655 4I AGACATGCAC ----/TTGG TTGGTCCAGG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TTGG 1 2 264215 CASAVA_Build 19 62539534 2D ACTTTGAAAA TC/-- TCTCTTAGTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 TC 3 2 264216 CASAVA_Build 19 62539994 1D TTTTCTTGCC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 9 8 264217 CASAVA_Build 19 62545166 2I CCAAAATGAC --/TG TATCATTTTG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 TG 0 1 264218 CASAVA_Build 19 62545687 1I TTGCAAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 10 11 264219 CASAVA_Build 19 62553637 1D GTTTGTTTTT G/- TTTTGTTTTG 480 het 480 ref 47 26 3 18 G 1 0 264220 CASAVA_Build 19 62583703 1D CTAAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 A 11 10 264221 CASAVA_Build 19 62584156 1I CACTCTCTAA -/T TTTTTTTTTT 1157 het 1157 ref 43 26 3 14 T 13 14 264222 CASAVA_Build 19 62585334 4I TCTATTTACC ----/TTTG TTTGTTTGAG 3070 hom 78 het 29 0 26 4 TTTG 2 3 264223 CASAVA_Build 19 62619689 4D AGGTGTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 638 het 480 hom 36 1 7 28 TTTG 1 0 264224 CASAVA_Build 19 62629099 1D CCATACATAA T/- TTTTTTTTTT 1171 het 1171 ref 22 10 6 6 T 17 16 264225 CASAVA_Build 19 62630582 1D CACTTTCTGA C/- CCTGCCTGGG 3070 hom 126 het 44 0 42 2 C 3 2 264226 CASAVA_Build 19 62640904 2D ACACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 550 het 550 ref 22 11 4 7 A 18 16 264227 CASAVA_Build 19 62652399 1D TTTTTTTTTT G/- CACAGGAGTT 3070 het 278 hom 35 6 15 14 G 1 0 264228 CASAVA_Build 19 62653656 1D ACCTTTATCT G/- GAGTTATTGA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 G 2 1 264229 CASAVA_Build 19 62654048 2D TAGCAAAAAC AA/-- AAAAACCAAA 3070 het 2121 hom 34 13 15 6 A 7 5 264230 CASAVA_Build 19 62655525 4D ATAAGAGTGG GTTT/---- GTTAACCCGA 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 GTTT 1 0 264231 CASAVA_Build 19 62655908 3I TTGTCTCCAG ---/TTC TTCTTCTTCC 3070 het 3070 ref 44 17 17 10 TTC 3 4 264232 CASAVA_Build 19 62656339 4D TTCTTTTTCC TTTT/---- TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 6 2 264233 CASAVA_Build 19 62657161 1I CCCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 9 10 264234 CASAVA_Build 19 62657577 1D TGATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 23 11 T 13 12 264235 CASAVA_Build 19 62662050 1D CAGATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1018 het 1018 ref 13 6 3 4 T 11 10 264236 CASAVA_Build 19 62662390 5I GCCACCGCGC -----/CCAGT CAATTTAATT 2667 het 2625 hom 18 8 6 4 CCAGT 0 1 264237 CASAVA_Build 19 62663636 3I CTCAAAAAAA ---/AAG AAAAAAAAAG 3070 het 4 hom 16 1 11 4 AAG 0 1 264238 CASAVA_Build 19 62667891 4D TCAATTTGTC TGTG/---- TATTTACTTT 3070 het 3070 ref 53 24 21 9 TG 2 0 264239 CASAVA_Build 19 62671703 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 10 6 A 14 12 264240 CASAVA_Build 19 62674151 1I CCAGAGTGAC -/A AGACAGACAA 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 A 1 2 264241 CASAVA_Build 19 62674756 2D AGTTCTCTTC CA/-- CTTTTAACCA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 CA 1 0 264242 CASAVA_Build 19 62677762 1D TATACGGTAG T/- TGGCATCTAA 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 T 2 1 264243 CASAVA_Build 19 62684887 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 18 0 14 4 A 11 12 264244 CASAVA_Build 19 62687107 7D CTAAGGCAAA TATACAG/------- TGGTTTTATT 3070 het 3070 ref 35 22 12 5 TATACAG 1 0 264245 CASAVA_Build 19 62687630 3D CTCCTTCTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1934 hom 46 15 17 15 T 17 14 264246 CASAVA_Build 19 62688759 10D TATAGACATG TAAATATTCC/---------- TAAAGGTTGG 3070 het 3070 ref 40 21 20 6 TAAATATTCC 1 0 264247 CASAVA_Build 19 62689159 1D AGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 11 10 264248 CASAVA_Build 19 62690135 2I GGGTTGACAT --/CA CTTTTTTTTA 3070 het 91 hom 47 2 24 21 CA 0 1 264249 CASAVA_Build 19 62691711 3I ACTGAAAGAA ---/AGT AGGGAATGAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AGT 0 1 264250 CASAVA_Build 19 62700184 1D ACTTCTCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 7 A 10 9 264251 CASAVA_Build 19 62700756 4I TTAGCTAAAG ----/GACA GACAGAGATG 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 GACA 1 2 264252 CASAVA_Build 19 62701029 12I TGTTTTTAAA ------------/ACACACACACAT ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 ACACACACACAT 0 1 264253 CASAVA_Build 19 62701602 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2499 het 2499 ref 27 19 6 2 T 9 10 264254 CASAVA_Build 19 62703883 4I TATTTGTATT ----/TTTG TTTGTTTGTT 2695 het 2695 ref 38 26 6 6 TTTG 2 3 264255 CASAVA_Build 19 62704619 4D TGACAGAAGC ATTA/---- ATTATGTGTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 ATTA 2 1 264256 CASAVA_Build 19 62709472 2I TGTCAGACAC --/AT GTGTGAGAGT 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 AT 0 1 264257 CASAVA_Build 19 62711327 13D TCTCAAAAAA AAAAAAAAAAAAC/------------- AAAAAAAACC 1429 het 923 hom 16 5 8 3 AAAAAAAAAAAAC 1 0 264258 CASAVA_Build 19 62711892 9D ATAGGCCATT CATTTTAAC/--------- CATTTTACTA 3070 het 3070 ref 51 26 25 5 CATTTTAAC 1 0 264259 CASAVA_Build 19 62714084 1D TGTCAGTTTT C/- CTTTAACTGT 2658 het 2658 ref 17 10 6 1 C 2 1 264260 CASAVA_Build 19 62715050 1D CAGCATAGAT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 8 7 264261 CASAVA_Build 19 62715759 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 het 3070 hom 42 12 26 4 T 6 5 264262 CASAVA_Build 19 62724827 2D11M1D TTTTTTGAGA AGGAGTTTTGCTCT/--GAGTCTCACTC- TGTTGCCCAG 36 het 36 ref 24 6 1 20 N/A 0 0 264263 CASAVA_Build 19 62725246 5I AGACATTAGA -----/TATAT TATATATCTT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 TATAT 1 2 264264 CASAVA_Build 19 62746118 2D ATCTTTTTTG GA/-- GACACAAACA 3070 het 3070 hom 56 24 27 6 GA 2 1 264265 CASAVA_Build 19 62754661 1D TAGGAGATAT G/- GATCATTTAA 3070 het 3070 hom 54 23 26 6 G 2 1 264266 CASAVA_Build 19 62818045 1D ACTACAGTGA G/- GTAGAAACGA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 G 2 1 264267 CASAVA_Build 19 62843151 1D AGTGCCCTCT G/- TTCTTCACAG 3070 hom 129 het 48 0 42 7 G 1 0 264268 CASAVA_Build 19 62849749 43D CCTGTAATCC CAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTGCA/------------------------------------------- CATCATCTGG 3070 hom 87 het 28 0 29 3 CAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTGCA 1 0 264269 CASAVA_Build 19 62850073 12I GATTCCTTCA ------------/TGGTAGAAGCTC TGGTGGACTA 3070 hom 126 het 44 0 40 4 TGGTAGAAGCTC 0 1 264270 CASAVA_Build 19 62863436 1D TTATATAGCA G/- GAAGGTCATT 3070 het 3070 hom 60 22 32 8 G 2 1 264271 CASAVA_Build 19 62865261 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2938 hom 37 het 17 0 10 7 A 13 14 264272 CASAVA_Build 19 62872605 4D TTTTTGTGTG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 2017 hom 23 8 11 7 TGTT 4 3 264273 CASAVA_Build 19 62880600 1D TAGTGGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 10 T 11 10 264274 CASAVA_Build 19 62883615 1I CGGGCATGGT -/G GCTGGCGCCT 2248 hom 24 het 9 0 7 2 G 1 2 264275 CASAVA_Build 19 62893638 6D TATGTGTGTG TGTATA/------ TATATATACT 3070 het 3070 hom 34 17 18 0 TGTATA 1 0 264276 CASAVA_Build 19 62893829 5D AATACTTGAA TTCAT/----- TTCTTTATAT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 TTCAT 1 0 264277 CASAVA_Build 19 62895190 3I TTATCATTTT ---/GTG GTCATTCTCT 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 GTG 0 1 264278 CASAVA_Build 19 62898892 1I TAATTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 2067 het 2067 ref 11 6 5 0 T 4 5 264279 CASAVA_Build 19 62904343 1I ATCAGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 A 12 13 264280 CASAVA_Build 19 62906389 14D AAGAATGGGC CGGGTGCGGTGGCT/-------------- CACATCTGTA 3070 het 1611 hom 26 8 14 4 CGGGTGCGGTGGCT 1 0 264281 CASAVA_Build 19 62929114 1D ACTCGTCTCC A/- AAAAAAAAAT 2078 het 1807 hom 15 7 5 3 A 10 9 264282 CASAVA_Build 19 62948477 1D CCAATTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 22 2 16 4 A 15 14 264283 CASAVA_Build 19 62953613 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 29 3 23 3 A 13 14 264284 CASAVA_Build 19 62954267 1I CTGCCCTCTC -/T TCTCCTTGAG 3070 hom 129 het 47 0 42 5 T 1 2 264285 CASAVA_Build 19 62954546 3D TTGTTTTGTT TTG/--- TTCTGTTTTG 3070 hom 121 het 45 0 41 4 TTG 1 0 264286 CASAVA_Build 19 62959244 1D GAACTTTTTT A/- AAAAATCACA 3070 hom 62 het 28 0 20 8 A 6 5 264287 CASAVA_Build 19 62959457 1D TTCCAGCCTC T/- TAACTCACCA 3070 hom 126 het 43 0 43 0 T 2 1 264288 CASAVA_Build 19 62975680 1I CCCCAGGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 155 hom 30 1 18 11 T 13 14 264289 CASAVA_Build 19 62977838 1D GGTTCTTTTT G/- TCTGTGGATT 3070 hom 75 het 26 0 25 1 G 1 0 264290 CASAVA_Build 19 62990116 1I GAGTGTAAGG -/A CGGTGATGAG 3070 het 3070 hom 47 16 28 3 A 0 1 264291 CASAVA_Build 19 62993415 2D TCTTCAGCAC AG/-- GGGCCATTTA 3070 hom 123 het 51 0 42 12 AG 1 0 264292 CASAVA_Build 19 62993579 1D TATCCTCCCT G/- GGTAAGGTAC 3070 hom 166 het 59 0 54 7 G 3 2 264293 CASAVA_Build 19 62994496 1I CACAGGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 28 1 18 10 T 15 16 264294 CASAVA_Build 19 62997449 1D ATGGATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 20 1 11 9 T 13 12 264295 CASAVA_Build 19 63007547 1D TGCTGGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 21 1 11 9 T 14 13 264296 CASAVA_Build 19 63010107 1I AAAAAAACAC -/A AAAAAAACAC 3070 hom 54 het 24 0 18 6 A 7 8 264297 CASAVA_Build 19 63025761 1D TGGTATTGAC A/- ACAATATTCA 3070 hom 54 het 24 0 19 6 A 2 1 264298 CASAVA_Build 19 63036321 4D ACGGTGAGTT CCCC/---- AGGCCTCAGG 3070 het 3070 ref 37 15 11 11 C 4 0 264299 CASAVA_Build 19 63041348 3D TTAGCCAGGT GTG/--- GTGGTGCACA 3070 het 3070 ref 22 11 9 3 GTG 3 2 264300 CASAVA_Build 19 63050178 1I TTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 35 1 29 5 A 11 12 264301 CASAVA_Build 19 63055324 1D TTAAGTGCCA T/- TTTTTTCAGT 3070 hom 39 het 17 0 14 4 T 7 6 264302 CASAVA_Build 19 63055402 1D GTTATATGGA G/- GTATTCCCAT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 G 2 1 264303 CASAVA_Build 19 63069068 4D TATATACATA TATG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 103 hom 19 2 14 4 TATG 1 0 264304 CASAVA_Build 19 63083473 1D TGTCTTCCTT C/- CTCCTCCCTT 2348 het 2348 ref 17 8 6 3 C 2 1 264305 CASAVA_Build 19 63093471 3I GGAGTCTTAC ---/TAG TAGTATTACT 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 TAG 1 2 264306 CASAVA_Build 19 63094173 3D AGGATGAGAT AGG/--- AGGTCAGCAC 3070 het 3070 hom 33 12 20 2 AGG 2 1 264307 CASAVA_Build 19 63104884 1I TGGCACAGAT -/G GCAGAGGACA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 G 1 2 264308 CASAVA_Build 19 63109449 1D GAGAAGGATG A/- AAAATATTAC 3070 het 3070 ref 58 40 14 4 A 5 4 264309 CASAVA_Build 19 63110913 5D CCTGAAAAAA GATTC/----- TGGATTCCAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 GATTC 1 0 264310 CASAVA_Build 19 63122489 1I TTATGTTCAA -/G TGCTATTTCT 3070 hom 37 het 17 0 13 4 G 0 1 264311 CASAVA_Build 19 63127323 1D CTTGTCTTAG A/- AAAAAAAAAA 2433 het 2433 ref 54 34 8 12 A 13 12 264312 CASAVA_Build 19 63137689 1D AGCCACCTTG C/- CCGACCCCCT 2747 het 1904 hom 18 5 8 5 C 3 2 264313 CASAVA_Build 19 63154927 13D TTTAGAGTTG CAGTGTGTCCTGT/------------- CAGCAGCCAT 3070 het 3070 ref 41 25 15 9 CAGTGTGTCCTGT 1 0 264314 CASAVA_Build 19 63157950 1D TTGAACGTAT C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 120 het 44 0 38 6 C 8 7 264315 CASAVA_Build 19 63160287 4D TTCTTTTTCT TTTC/---- TTTTTCTTTT 1358 het 1258 hom 21 7 9 5 TTTC 1 0 264316 CASAVA_Build 19 63161950 1I GAATAAAAAT -/G GGAGACAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 G 2 3 264317 CASAVA_Build 19 63162628 1I CATGGTGAGA -/C CCCCCCATCT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 C 6 7 264318 CASAVA_Build 19 63163289 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 10 9 264319 CASAVA_Build 19 63164761 2D AATTTAGAAG CA/-- CAGTTTTCAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CA 2 1 264320 CASAVA_Build 19 63165314 6D GGGTTCAAAC AGTCTT/------ ACCTGCTCAG 3070 hom 45 het 17 0 16 3 AGTCTT 1 0 264321 CASAVA_Build 19 63169944 1D GCTTGTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 9 8 264322 CASAVA_Build 19 63170290 1I AAGAAAACTG -/A AAACAGACCA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 A 3 4 264323 CASAVA_Build 19 63174658 1D GAATAAAGTT G/- TTTTTTTTAA 1362 het 1362 ref 19 9 7 3 G 1 0 264324 CASAVA_Build 19 63177071 4I GTGAAATGAA ----/AAAG AAAGAGAAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AAAG 1 2 264325 CASAVA_Build 19 63179110 1D AAAAAAACTC T/- TATCTGTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 2 1 264326 CASAVA_Build 19 63186160 3I TCTACTCTGC ---/ACA ACAACTGGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACA 1 2 264327 CASAVA_Build 19 63186759 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1720 het 309 hom 7 1 6 0 A 13 12 264328 CASAVA_Build 19 63187014 1D CCTGCTGAAT A/- AAACTCCAGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 4 3 264329 CASAVA_Build 19 63189253 1I AAAGAAAGAC -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 29 19 10 0 A 7 8 264330 CASAVA_Build 19 63194069 1I CCTGCTCAAG -/A ACCCCCCAGG 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 A 1 2 264331 CASAVA_Build 19 63201883 5D GGATAAACTT TATAA/----- TATGTCAGTA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TATAA 1 0 264332 CASAVA_Build 19 63203271 1D CTCTCATTGG C/- CCCCCCTGTG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 C 7 6 264333 CASAVA_Build 19 63205139 1I TGGAGGACTT -/A AGAGATGGGC 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 A 1 2 264334 CASAVA_Build 19 63211214 1I CATCTCTACT -/A AAAATCCAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 4 5 264335 CASAVA_Build 19 63211613 2D CAGTAGAGTC AT/-- GTGTGAAACC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 AT 1 0 264336 CASAVA_Build 19 63212465 1I GTGAGTAATG -/T TAAGTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 1 2 264337 CASAVA_Build 19 63215492 2D TATTTTGAGT AC/-- AGACAGGGTT 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 AC 1 0 264338 CASAVA_Build 19 63217003 2D CAAAGGACTC TG/-- TGTCATAAAT 3070 hom 71 het 31 0 21 10 TG 2 1 264339 CASAVA_Build 19 63217235 1D TAAAGCAGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 10 9 264340 CASAVA_Build 19 63224090 4D ACAGAGGAAG AGAC/---- AGACAGAGAC 3022 het 2805 hom 20 7 9 4 AGAC 2 1 264341 CASAVA_Build 19 63227927 1I AAATAAACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 22 0 21 1 A 9 10 264342 CASAVA_Build 19 63229202 10I AGGCTATGGC ----------/TTATGCAGGG TTATGCACAC 3070 hom 95 het 35 0 29 6 TTATGCAGGG 0 1 264343 CASAVA_Build 19 63233531 4D TTAGTCTCCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 AAAC 5 4 264344 CASAVA_Build 19 63244898 1D CCCATGTCTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 8 264345 CASAVA_Build 19 63246832 1D TTGCTTTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 80 hom 27 1 20 6 T 10 9 264346 CASAVA_Build 19 63247499 4I TAAAATAAAT ----/AAAC AAATGATACA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AAAC 0 1 264347 CASAVA_Build 19 63249832 3D CTGGTGGACA AAG/--- AAGATGTTCA 3070 hom 106 het 41 0 32 12 AAG 2 1 264348 CASAVA_Build 19 63256142 1D AACATGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 31 1 14 16 T 15 14 264349 CASAVA_Build 19 63263428 17D GCCTCTACTG GTGCCCGGCCTCTACTC/----------------- GTGCCCGGCC 2631 hom 35 het 12 0 10 4 GTGCCCGGCCTCTACTC 1 0 264350 CASAVA_Build 19 63264313 1I GTCTCGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 21 1 16 4 A 10 11 264351 CASAVA_Build 19 63266448 14D GGTAGGGTCA GGGACTGAGAGTAG/-------------- GGGAATGAGT 3070 hom 129 het 44 0 40 8 GGGACTGAGAGTAG 1 0 264352 CASAVA_Build 19 63280101 1I GAGCAGATTT -/C CCTGGCAGTT 3070 hom 96 het 40 0 29 11 C 2 3 264353 CASAVA_Build 19 63284411 1D AATAAGTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 116 het 48 0 37 11 A 12 11 264354 CASAVA_Build 19 63285269 1D TATTTATTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 10 9 264355 CASAVA_Build 19 63288975 1D TAAGGCCAAA C/- CCCCCAGCGA 3070 hom 80 het 31 0 23 9 C 6 5 264356 CASAVA_Build 19 63290816 1D CATGGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 25 1 19 5 T 12 11 264357 CASAVA_Build 19 63302326 5D AAATTTACAT ACACC/----- ACACATTTTG 3070 hom 93 het 34 0 31 4 ACACC 1 0 264358 CASAVA_Build 19 63303874 23I ATCACGAGGT -----------------------/CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGC CAACATGGTG 3070 hom 24 het 11 0 8 3 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGC 0 1 264359 CASAVA_Build 19 63305881 1D TCTCAGCAAC A/- AGATTTTTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 2 1 264360 CASAVA_Build 19 63306300 1I59M4D GACTCTCTCT -AAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAAGGCTGCCAATTAAACCATATCACTGATTAACCTGGTTT/AAAAAAAAAATAAAAAAATAAAAAAAGGCTGCCAATTAAACCATATCACTGATTAACCTG---- GTTTTCAGAT 3070 het 157 hom 28 3 22 22 N/A 0 0 264361 CASAVA_Build 19 63306980 5I GGAAGGCGTG -----/TCAAA TCAAAGACAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TCAAA 1 2 264362 CASAVA_Build 19 63312022 2D ACATTTTGAA GG/-- CTCATCTCCT 3070 hom 135 het 51 0 46 7 G 2 0 264363 CASAVA_Build 19 63312976 1I ACATCCTACC -/A AAATAAATTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 3 4 264364 CASAVA_Build 19 63314961 1D CAAAGCCAGG C/- AAGCACACTA 3070 hom 117 het 41 0 40 2 C 1 0 264365 CASAVA_Build 19 63315821 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 48 het 17 0 14 3 CT 1 2 264366 CASAVA_Build 19 63317623 1D ACATATTTAT G/- AGTAAAGTGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 1 0 264367 CASAVA_Build 19 63324674 1I TGTATCCCCC -/T TGGATTTGGT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 1 2 264368 CASAVA_Build 19 63325241 3I TAAGACTTTT ---/CCC CCCCAATAAT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 C 4 7 264369 CASAVA_Build 19 63327092 4D GGCATTTTGC TCAT/---- TATCTTGCCT 3070 hom 93 het 34 0 31 5 TCAT 1 0 264370 CASAVA_Build 19 63346385 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 11 12 12 A 8 9 264371 CASAVA_Build 19 63346480 2D CATTTGAGTA AG/-- AGAGGAGCTA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 AG 3 2 264372 CASAVA_Build 19 63357186 1D ACATATGTGA T/- TTTTTTTTTT 2780 het 339 hom 26 3 10 13 T 15 14 264373 CASAVA_Build 19 63358699 1D TCTTGCCAGG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 50 het 21 0 17 4 T 8 7 264374 CASAVA_Build 19 63364069 1D TTTTAGGTTT G/- GGGGACTATA 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 G 5 4 264375 CASAVA_Build 19 63367654 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2498 het 515 hom 13 5 7 1 A 15 14 264376 CASAVA_Build 19 63371360 1I CACATGTAAA -/T TTTTTTTTTT 2765 het 2765 ref 28 14 10 4 T 13 14 264377 CASAVA_Build 19 63379323 4D ACTTAATGAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AAAC 4 3 264378 CASAVA_Build 19 63387461 5D TTGACAGGTC TTTTG/----- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 TTTTG 1 0 264379 CASAVA_Build 19 63387637 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2420 het 1994 hom 17 6 7 4 T 10 11 264380 CASAVA_Build 19 63392064 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 27 1 20 6 A 12 11 264381 CASAVA_Build 19 63398708 2D2M5D CAGTTTCTCC CAACAGTGG/--AC----- CATAGCTGTG 3070 het 3070 ref 51 28 21 4 N/A 0 0 264382 CASAVA_Build 19 63401649 2I GGAACAGTAC --/AG AGAAGATGAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AG 1 2 264383 CASAVA_Build 19 63409260 1D TTAGCAGTCT C/- CCACCAATCC 3070 het 3070 hom 42 14 27 3 C 3 2 264384 CASAVA_Build 19 63410173 1I GTCCCCGGGA -/G GCCCTGGACC 3070 hom 58 het 21 0 19 2 G 1 2 264385 CASAVA_Build 19 63412013 1I CAAGGAGACA -/C GTTGTGGGGT 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 C 0 1 264386 CASAVA_Build 19 63412800 1I GCTTTGACTC -/T TAAGGAGGGG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 1 2 264387 CASAVA_Build 19 63418558 3D GATTGTCAGA AAG/--- AAGATTAATG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 AAG 2 1 264388 CASAVA_Build 19 63427643 1I AGCAAGACTC -/A AAAAAAAAAA 2930 het 2930 ref 26 12 7 7 A 11 12 264389 CASAVA_Build 19 63432836 2D CAGGGGTAAC TG/-- GGGTGTTGGG 3070 het 3070 ref 43 21 15 14 TG 1 0 264390 CASAVA_Build 19 63442565 1I AAACATGGCC -/A AATGTTCCCG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 2 3 264391 CASAVA_Build 19 63446652 1D GGCATGCCCT G/- GCAGTAGGCA 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 G 2 1 264392 CASAVA_Build 19 63457402 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1643 het 1643 ref 33 23 4 6 A 11 12 264393 CASAVA_Build 19 63458798 4I TCAGACAGTC ----/AAAT AAATCGAGTA 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 AAAT 1 2 264394 CASAVA_Build 19 63466471 2D AAATCCTGTC TT/-- TACAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 13 12 2 T 3 1 264395 CASAVA_Build 19 63469924 1I TGGCTGTGGG -/T TAGCAAAAAT 2105 het 2105 ref 24 14 5 5 T 1 2 264396 CASAVA_Build 19 63472627 1D AAAAAACAAA C/- AAAAAAAATG 1197 het 1197 ref 11 4 4 3 C 1 0 264397 CASAVA_Build 19 63485331 5I AGTATATGTG -----/GTTTT GTTTTGTTTT 3070 hom 78 het 39 0 27 12 GTTTT 3 4 264398 CASAVA_Build 19 63489396 1I GAGAACCCAC -/T TATGTGGGAG 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 1 2 264399 CASAVA_Build 19 63500413 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 10 9 264400 CASAVA_Build 19 63500597 1I AGATAATCCT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 125 hom 37 1 24 12 G 0 1 264401 CASAVA_Build 19 63549372 1I CCTCAAGCAA -/C CTGCCCATAC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 C 1 2 264402 CASAVA_Build 19 63550044 1D TTAAACAGAG C/- CTCTCTTCAC 3070 hom 76 het 28 0 25 4 C 2 1 264403 CASAVA_Build 19 63556692 1I GGAGGGCGGT -/G GGGGTGGCTC 2457 hom 41 het 20 0 11 9 G 4 5 264404 CASAVA_Build 19 63561328 5D CCCTGGGTAG TCCCC/----- TCCACACAGT 3070 het 3070 hom 52 23 22 7 TCCCC 1 0 264405 CASAVA_Build 19 63561816 3I TAGCAGATCT ---/GAG GAGAAAACAA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 GAG 1 2 264406 CASAVA_Build 19 63561900 1D ACACAGGTGT G/- GACTGGAGAT 2533 het 2533 ref 26 14 10 2 G 2 1 264407 CASAVA_Build 19 63563150 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 17 1 14 2 A 14 13 264408 CASAVA_Build 19 63566262 1D GTCTTTACCA C/- CCCTGGAACC 3070 hom 40 het 16 0 13 4 C 4 3 264409 CASAVA_Build 19 63575613 1I TGGGGAGTCC -/G GGGGGGGGCG 1702 het 1343 hom 20 6 7 7 G 8 9 264410 CASAVA_Build 19 63580659 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3034 hom 25 9 9 7 A 10 11 264411 CASAVA_Build 19 63588251 1I TGGCGGGGGT -/G GGGGGGTGCA 3070 het 2180 hom 31 7 16 8 G 6 7 264412 CASAVA_Build 19 63596902 2I ATTTTTACAC --/TG TGTGTGTATA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 TG 3 4 264413 CASAVA_Build 19 63601559 1I CTGCACACCA -/C CCCCCCCAAT 2862 het 2862 ref 31 10 11 10 C 7 8 264414 CASAVA_Build 19 63605452 1D GCCCTAGGTT G/- GGGTTTCCTC 2635 het 1851 hom 21 6 6 9 G 4 3 264415 CASAVA_Build 19 63607409 1D GAGGAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3004 het 2498 hom 31 11 12 8 T 12 11 264416 CASAVA_Build 19 63617165 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2417 het 320 hom 8 1 7 0 T 9 10 264417 CASAVA_Build 19 63618239 1D ATCCGCCTGA T/- TTTTTTGTAT 2208 het 2208 ref 19 13 5 1 T 7 6 264418 CASAVA_Build 19 63627233 1I AGCTTGACTC -/A ACATGGTGAA 1811 het 1811 ref 15 8 4 3 A 1 2 264419 CASAVA_Build 19 63655527 1I GGAGACATAG -/A AAGTTTTGAA 1850 het 1850 ref 28 12 5 11 A 2 3 264420 CASAVA_Build 19 63655558 4D CATCCTCTGA GTTG/---- GGACTTTAAA 1887 het 1887 ref 31 18 4 10 GTTG 1 0 264421 CASAVA_Build 19 63671049 1I31M4I GGAGACATAG -AAGTTTTGAACAGAATCAGGACATCCTCTGA----/AAATTTTTGAACAGAATCAGGACATCCTCTGAGTTG GGACTTTAAA 2744 het 2744 ref 35 34 6 2 N/A 0 0 264422 CASAVA_Build 19 63672212 1I GCAATTTTTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 T 8 9 264423 CASAVA_Build 19 63690198 9I CCAGGATGGT ---------/CTCGATCTC CTGACCTTGT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 CTCGATCTC 0 1 264424 CASAVA_Build 19 63704197 4D AAATTTAATT TTAA/---- TTAATTAATT 3070 hom 75 het 31 0 25 7 TTAA 3 2 264425 CASAVA_Build 19 63718505 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1326 het 1144 hom 14 5 6 3 A 13 14 264426 CASAVA_Build 19 63728062 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1953 het 294 hom 11 4 5 2 A 12 11 264427 CASAVA_Build 19 63741039 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACTC 2588 het 1247 hom 14 3 9 3 AG 2 1 264428 CASAVA_Build 19 63780575 1D TGGGGGACGG C/- CCCTGTCTCA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 4 3 264429 CASAVA_Build 19 63788082 1I AAGAGAAGGG -/C CCCCTGTCCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 4 5 264430 CASAVA_Build 19 63794672 3I GAGCTTTGTT ---/CTC CTCAGGACCC 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 CTC 1 2 264431 CASAVA_Build 19 63795759 1I GATTTTGATT -/C CCCAAGATTT 1321 het 1321 ref 43 35 3 5 C 3 4 264432 CASAVA_Build 19 63805850 2D TTTAGGCTTT TA/-- TACAAACTCC 1533 het 1533 ref 56 51 4 3 TA 2 1 264433 CASAVA_Build 7 146070 1I AGTCATCTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 9 10 264434 CASAVA_Build 7 169850 1D CCTCTACACC A/- AAAATTATCT 3070 het 3070 hom 15 7 8 0 A 5 4 264435 CASAVA_Build 7 171498 2D GCAGGCGGAA AG/-- AGGCTGACAA 3070 het 2004 hom 26 8 11 8 AG 2 1 264436 CASAVA_Build 7 171874 1D TCCTCCTCCT A/- CTCCCTCCTC 1869 hom 19 het 10 0 5 5 A 1 0 264437 CASAVA_Build 7 180473 4D45M4D TGTGTGTGCC TGTGTGTGTGTGTGTCCATGAGTGTGTGAATGTGTACCTGTGTCAGTGTGTGA/----TGTGTGTGTGTCCATGAGTGTGTGAATGTGTACCTGTGTCAGTGT---- GTGTGTCAAT 3070 het 3070 ref 49 32 29 15 N/A 0 0 264438 CASAVA_Build 7 184371 1I TCTACATATG -/T TGTCTCCATG 3070 hom 190 het 71 0 64 7 T 1 2 264439 CASAVA_Build 7 186109 4D TGTCTCTGCA TGTG/---- TGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 83 41 36 9 TG 4 2 264440 CASAVA_Build 7 186582 3I GGTCCAAAAC ---/CTT CTCAGTTGTA 3070 hom 108 het 42 0 31 11 CTT 0 1 264441 CASAVA_Build 7 190139 1I ACTTATGAAC -/A AAAATGAGAT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 4 5 264442 CASAVA_Build 7 194727 1D AAATGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 23 11 A 11 10 264443 CASAVA_Build 7 197942 3D AAGATCAACA AAG/--- AAATGTCAGA 3070 het 3070 ref 34 19 13 4 AAG 1 0 264444 CASAVA_Build 7 201487 1I AAGTACTTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 9 10 264445 CASAVA_Build 7 209561 3D TGGCAACAAA GGT/--- AGAAACAGGG 3070 het 3070 hom 42 20 21 3 GGT 1 0 264446 CASAVA_Build 7 215056 1D GGCCGGCCCA C/- ACCCAGGTCT 2311 hom 34 het 18 0 9 10 C 1 0 264447 CASAVA_Build 7 223809 16I CAGCCAAGCA ----------------/TCAGCCAGGTGGTAAG TCTGGGATCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TCAGCCAGGTGGTAAG 0 1 264448 CASAVA_Build 7 224030 1D CGTGGGGCTC A/- ACTCAGTTAA 3070 hom 56 het 24 0 16 8 A 2 1 264449 CASAVA_Build 7 243961 1D GAAGGTTAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 20 18 0 T 10 9 264450 CASAVA_Build 7 252086 1I GGCTGCCTCT -/G GCATAGAGCC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 G 1 2 264451 CASAVA_Build 7 271315 4I GGCAAGTGTG ----/TGCA TGCATGCATA 3070 het 3070 ref 78 38 30 10 TGCA 2 3 264452 CASAVA_Build 7 279519 1I ACAAGAGGAC -/T CAGAGCCCCA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 0 1 264453 CASAVA_Build 7 281947 2I CAGGTGCCAG --/GC GCCTGAGCTG 2481 het 2481 ref 22 9 7 6 GC 1 2 264454 CASAVA_Build 7 282757 2I GGAAATCGCA --/GT GTGTCCTCTG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 GT 2 3 264455 CASAVA_Build 7 303479 4I TGTACATGAC ----/TGTG TGTGGGGTGT 3070 het 3070 ref 58 26 21 11 TG 2 4 264456 CASAVA_Build 7 308064 1D CCGCCTCCAG C/- CCCCGTCAAG 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 C 5 4 264457 CASAVA_Build 7 315511 2I GTCAACGCAC --/AT GTGAACAAAT 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 AT 0 1 264458 CASAVA_Build 7 317966 2I TGCGTGTGTG --/GC ACGTGTACAT 3070 het 3070 hom 70 28 33 9 GC 0 1 264459 CASAVA_Build 7 318128 2I ATGTGAGGGC --/AT GTGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 55 20 22 13 AT 0 1 264460 CASAVA_Build 7 322653 1I TAGTAGCAGC -/T TTACCCTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 T 2 3 264461 CASAVA_Build 7 508455 1D CCTAGCCCAA G/- GTTGCTGTGG 3070 het 1745 hom 17 4 10 4 G 2 1 264462 CASAVA_Build 7 508526 1I CCTCCCCGCC -/G GGCCCCAGGC 1140 het 451 hom 13 4 4 5 G 2 3 264463 CASAVA_Build 7 519582 2D CTGCCCATGG AC/-- ACACTGCCCG 3070 hom 48 het 17 0 14 3 AC 3 2 264464 CASAVA_Build 7 521929 1I GGCATCCTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 2576 hom 29 7 16 6 T 7 8 264465 CASAVA_Build 7 527424 1I CACCTGCAGG -/C CCCCCTCCCC 2190 hom 25 het 12 0 8 4 C 5 6 264466 CASAVA_Build 7 533812 1D AAGCTGTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 13 12 264467 CASAVA_Build 7 534522 3D TGAAGGAATA GAT/--- GATGGACAGA 3070 het 3070 ref 60 23 13 26 GAT 2 1 264468 CASAVA_Build 7 535021 15D ATGGGTGGAG GGATTGATAGATGAT/--------------- GGATGGATAG 3070 het 3070 ref 67 44 21 10 GGATTGATAGATGAT 1 0 264469 CASAVA_Build 7 538552 2D CCAGACAGGA AG/-- AGAGAAAGCC 3070 het 2861 hom 28 8 10 10 AG 3 2 264470 CASAVA_Build 7 539326 11D GCGAGGATTC GGGTGAGCAGT/----------- GGGTGAGCTC 3070 het 3070 hom 28 12 17 3 GGGTGAGCAGT 1 0 264471 CASAVA_Build 7 540708 2D CTCAGCCCAA AC/-- ACAGTCAGGG 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 AC 2 1 264472 CASAVA_Build 7 543833 1D CCTGAAGAGT C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 9 8 264473 CASAVA_Build 7 551262 2I TTTTAAACAA --/TT TTTTTTGGGG 3070 hom 45 het 17 0 14 3 T 6 8 264474 CASAVA_Build 7 572543 5D ATTTCATCAC CTCAT/----- CACCACCATC 2836 het 2836 ref 93 27 19 57 CTCAT 1 0 264475 CASAVA_Build 7 583633 2I AGGGCCGGAG --/AC ACATGGGGAA 2669 het 2669 ref 39 17 6 16 AC 1 2 264476 CASAVA_Build 7 584421 2D AATTCCTGCC GT/-- GTCCTCAGGA 3070 het 3070 ref 26 13 9 5 GT 2 1 264477 CASAVA_Build 7 586562 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 8 9 264478 CASAVA_Build 7 587466 6D ACTCTGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2434 hom 35 het 14 0 11 4 A 23 17 264479 CASAVA_Build 7 588333 1I CCCAGGGGGG -/A AACCCATCGT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 2 3 264480 CASAVA_Build 7 589542 2D11M3D CCACTCACAC ATGTGCACACTCACAC/--GTGTATACTCA--- CCCCCACACG 3070 hom 98 het 38 0 31 8 N/A 0 0 264481 CASAVA_Build 7 589768 1I TGCACACACA -/C CCCCCTCACA 3070 hom 51 het 23 0 17 7 C 5 6 264482 CASAVA_Build 7 589838 2I24M2D CACCCACACA --CAACCCACACGGTGCACTCACACCCT/CTCAACCCACACAGTGCACTCACACC-- CACACACGTG 3070 hom 90 het 33 0 30 5 N/A 0 0 264483 CASAVA_Build 7 589938 2I32M2D CATGCACACT --CACGTGTACACCCATGTGCACTCACATGCACACT/CACACGTGTACACCCATGTGCACTCACATGCACA-- CATGCACACA 3070 hom 111 het 30 0 33 19 N/A 0 0 264484 CASAVA_Build 7 595119 6D7M3D TGGTGATGGT GGTGAGGATAGTGACA/------GATAATG--- GTGGTGATGA 3070 het 1466 hom 32 7 20 11 N/A 0 0 264485 CASAVA_Build 7 639015 6I TGTGCCCAGC ------/CACAGG CACAGCCTCA 2766 het 1827 hom 31 10 12 9 CACAGG 0 1 264486 CASAVA_Build 7 696962 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 7 8 264487 CASAVA_Build 7 712529 1D TAATCTTCGG A/- AAGATCACAT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 3 2 264488 CASAVA_Build 7 722402 1D TTTTTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 2449 het 677 hom 22 5 10 7 A 12 11 264489 CASAVA_Build 7 724528 1D TGCTTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 1433 het 1215 hom 11 6 4 1 T 13 12 264490 CASAVA_Build 7 727812 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 A 14 13 264491 CASAVA_Build 7 736974 1D CCTTTGTTCA C/- CCCCCTTGGT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 C 6 5 264492 CASAVA_Build 7 743011 2I ATTTCTTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 11 13 13 TG 6 7 264493 CASAVA_Build 7 744746 1I TGCTTTTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 10 264494 CASAVA_Build 7 749538 4D ACCCCGTTTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 AAAC 4 3 264495 CASAVA_Build 7 749721 4I TGTACAGGGA ----/AAGC AAGCACACAT 3070 hom 78 het 30 0 24 6 AAGC 1 2 264496 CASAVA_Build 7 751593 4I34M2D ACACGCATAC ----ACACACACACACATATTCACATGCATGCACATGTAC/ACAAACACACATACACATATTCACATGCATGCACATGT-- ACACACACCT 3070 het 3070 ref 63 46 22 21 N/A 0 0 264497 CASAVA_Build 7 763477 2I TTGGCCACAC --/TG ACCACAGTTC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 TG 0 1 264498 CASAVA_Build 7 767416 1I TCCAGCGCCT -/G GGGGGCTCTC 3070 hom 76 het 29 0 20 9 G 5 6 264499 CASAVA_Build 7 768161 24I CCTCTGTGCT ------------------------/TGAGCCCCAGGCCTCAAACATGTC TGACCAGCAA 3070 hom 81 het 32 0 27 6 TGAGCCCCAGGCCTCAAACATGTC 0 1 264500 CASAVA_Build 7 773463 4I TAAGTGAAAT ----/AAAC AGCTGCTGCC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AAAC 0 1 264501 CASAVA_Build 7 778118 1D ATAGGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2267 hom 31 7 16 8 T 11 10 264502 CASAVA_Build 7 787086 1I TGGGTACACA -/G TAGGTGTATA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 G 0 1 264503 CASAVA_Build 7 787728 1I TATGGGGCTC -/T TATTTTTAGT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 1 2 264504 CASAVA_Build 7 790182 9D CTGTACGCCG CCCCCACCT/--------- CCCCCACCTC 2690 hom 36 het 16 0 9 7 CCCCCACCT 2 1 264505 CASAVA_Build 7 831226 1D ATTACGATAA T/- TTTTTTTTTT 2306 het 1691 hom 15 5 8 2 T 15 14 264506 CASAVA_Build 7 832061 1I TTAGTACTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 11 12 264507 CASAVA_Build 7 834418 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTGTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 5 6 264508 CASAVA_Build 7 835712 1I AAATAACTGG -/T TTTTTTTTTT 2325 hom 30 het 18 0 13 5 T 11 12 264509 CASAVA_Build 7 836755 1I ATCCTCACTT -/C CCTCAGCACC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 C 2 3 264510 CASAVA_Build 7 857711 3I ACCTGCACTC ---/GAT GATTTACCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GAT 1 2 264511 CASAVA_Build 7 864554 1D CTTTAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 23 0 16 7 T 13 12 264512 CASAVA_Build 7 881125 1I CCTGGGATGT -/G GGGAGGGACT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 3 4 264513 CASAVA_Build 7 898795 24D GGTAGCTGTG TGGGTGTATGTGCAAGTGTAGACA/------------------------ TGGCGTGGGG 3070 hom 84 het 22 0 23 10 TGGGTGTATGTGCAAGTGTAGACA 1 0 264514 CASAVA_Build 7 908603 1D CCTGGGTGAC A/- AGGGCGAAAC 3070 het 22 hom 12 1 10 2 A 2 1 264515 CASAVA_Build 7 919541 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 5 4 264516 CASAVA_Build 7 921393 13I TGCACTCACA -------------/CCTGCACACCTCG CCTGCACACC 3070 het 3070 ref 35 10 10 15 CCTGCACACCTCG 1 2 264517 CASAVA_Build 7 925722 4D GGAGAGACAG AGAT/---- AGAGAGAGGA 2471 het 2106 hom 16 8 6 2 AGAT 1 0 264518 CASAVA_Build 7 925843 2D CAGAAGGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 1354 het 743 hom 8 2 4 2 GA 7 6 264519 CASAVA_Build 7 928234 1I CCCAGCGGAG -/C CCTCCGGAAG 3070 hom 77 het 28 0 20 8 C 2 3 264520 CASAVA_Build 7 928852 1D TTGCCTCTTG C/- GAAAGTGACC 1692 het 1692 ref 13 6 5 2 C 1 0 264521 CASAVA_Build 7 980828 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2964 het 2964 ref 31 13 9 9 T 11 12 264522 CASAVA_Build 7 1015066 8I GCACACACGT --------/ACACACGC ACACAACACA 3070 het 3070 ref 66 30 21 15 ACACACGC 0 1 264523 CASAVA_Build 7 1020998 1D GTTGGTGTCA C/- CCTGTCCCGG 1578 het 1578 ref 23 11 5 7 C 3 2 264524 CASAVA_Build 7 1040555 1D AATTTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 11 10 264525 CASAVA_Build 7 1054203 1D TTAACCCAGC A/- AAGACTGGCG 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 3 2 264526 CASAVA_Build 7 1070262 4D ATACACACAC ACAT/---- ACATGCGTGC 3070 het 3070 hom 42 19 20 5 ACAT 2 1 264527 CASAVA_Build 7 1077713 16D AAAGCAGGCA GGAGAGGGAGGAAAGG/---------------- GGAGAGGGAG 2799 het 2799 ref 23 14 7 7 GGAGAGGGAGGAAAGG 1 0 264528 CASAVA_Build 7 1097133 2I TCTGGACCCA --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 CT 6 7 264529 CASAVA_Build 7 1103682 2D ATGAATGGGA AG/-- AGTCTCGTTT 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 AG 2 1 264530 CASAVA_Build 7 1154694 1D TTTTGGATAC T/- TTTTTTTTTT 2755 het 2755 ref 35 15 10 10 T 12 11 264531 CASAVA_Build 7 1163274 3D TCTGAAAAGT CAA/--- CAACAAGTCT 3070 het 3070 ref 43 19 17 8 CAA 3 2 264532 CASAVA_Build 7 1172246 1I ATTTGCTCAA -/T TTTTTTTGTT 457 het 457 ref 25 16 4 5 T 7 8 264533 CASAVA_Build 7 1172977 1D CTAAAAATAC A/- AAAACTTAGC 940 het 352 hom 5 1 4 0 A 5 4 264534 CASAVA_Build 7 1174006 3D GTCCACTTAA CAG/--- TGACAGTGAC 3070 het 3070 ref 36 21 15 3 CAG 1 0 264535 CASAVA_Build 7 1174442 4I ACTGTCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 2732 het 2732 ref 27 11 7 9 AAAC 2 3 264536 CASAVA_Build 7 1174986 8D TTTGTTTTGC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 2189 hom 23 8 9 6 T 19 11 264537 CASAVA_Build 7 1178012 1I CAACCACCCC -/A CGCCCCCCCC 708 hom 12 het 7 0 4 3 A 0 1 264538 CASAVA_Build 7 1178768 1D CCCCGGAGGG T/- TCCCCCCCTC 1970 het 1970 ref 36 14 9 13 T 2 1 264539 CASAVA_Build 7 1180251 4D GTGGGCACAT AAAG/---- AACCCAGCGA 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 AAAG 1 0 264540 CASAVA_Build 7 1180774 1I TTTAAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2341 hom 20 6 13 1 T 11 12 264541 CASAVA_Build 7 1183255 1I TTTTTTTAAA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 6 7 264542 CASAVA_Build 7 1188293 5I AGGAATTCAA -----/GACTG GACTGGGCTG 1401 het 1401 ref 14 7 4 3 GACTG 1 2 264543 CASAVA_Build 7 1207318 1D GCAACAACAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 81 hom 29 3 19 7 A 9 8 264544 CASAVA_Build 7 1210874 8D GCGTGCGTGT GTGTGTGC/-------- GTGTGCGTGC 3070 hom 53 het 19 0 16 5 GTGTGTGC 1 0 264545 CASAVA_Build 7 1212755 1I GATAAACAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 395 hom 45 1 37 7 A 9 10 264546 CASAVA_Build 7 1214663 1D TACCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 4 T 12 11 264547 CASAVA_Build 7 1216312 1I GTAAAATAAA -/C AAAAATATCA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 0 1 264548 CASAVA_Build 7 1224705 2I TAATAACAAA --/TT TTTTTTTAAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 7 9 264549 CASAVA_Build 7 1225782 3D GACTCCATCT CAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 24 0 20 5 CAA 1 0 264550 CASAVA_Build 7 1227874 3I AGGATGGATG ---/TGA TGATGGTGCC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TGA 1 2 264551 CASAVA_Build 7 1235196 2I CACGTCCCTG --/CC CCCCCCCCAC 3070 hom 33 het 17 0 11 6 C 8 10 264552 CASAVA_Build 7 1237760 1D TGGTGGTGGC T/- CCGCAGACTG 2956 hom 36 het 13 0 11 2 T 1 0 264553 CASAVA_Build 7 1238286 1D GCCTCCGCAG C/- CCCCCCCACC 3070 hom 39 het 17 0 13 4 C 8 7 264554 CASAVA_Build 7 1246209 1I TTTGCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 127 hom 19 1 13 5 A 11 12 264555 CASAVA_Build 7 1264320 19D GTCGGGAGAT GGGGTCTGTGCACTGAGGC/------------------- GGGGTCTGTG 2086 hom 31 het 11 0 8 5 GGGGTCTGTGCACTGAGGC 2 1 264556 CASAVA_Build 7 1280886 2I CCGCTCTGTG --/GT GTGTGTGTGG 1935 hom 37 het 17 0 8 9 GT 4 5 264557 CASAVA_Build 7 1284217 1I ACCGATGGGT -/G GGGCCAGGCG 3070 hom 65 het 28 0 20 8 G 3 4 264558 CASAVA_Build 7 1301557 2I TCTATGGGTG --/TA TGTGTGTGTG 196 het 139 hom 9 2 2 6 TA 0 1 264559 CASAVA_Build 7 1302323 42D GGCTGGGCAG TCCTCCCCGGTGCCGGCCCATCGGGGTGCGTTAGGTAGGCTC/------------------------------------------ ACGGGGACCA 2219 het 2219 ref 13 11 7 1 TCCTCCCCGGTGCCGGCCCATCGGGGTGCGTTAGGTAGGCTC 1 0 264560 CASAVA_Build 7 1313611 1D AGGACAGAAA C/- CTGGGAATTG 3070 het 3070 hom 30 12 10 9 C 2 1 264561 CASAVA_Build 7 1315516 3D ATGATGATGG TGA/--- TGATGGTGAT 3070 het 3070 ref 88 45 25 20 TGA 2 1 264562 CASAVA_Build 7 1316634 1D AAATATATAT A/- TATTTTTTTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 1 0 264563 CASAVA_Build 7 1324623 4I GTAAAGTGAC ----/TCTT TCCCCGTTGA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 TCTT 0 1 264564 CASAVA_Build 7 1326902 2D GTGTCTGTGT GA/-- GAGAGGCATG 3070 hom 181 het 70 0 56 15 GA 3 2 264565 CASAVA_Build 7 1329148 1D CAAGCAACAC G/- CCAAAGCCTT 2118 het 2118 ref 31 20 6 5 G 1 0 264566 CASAVA_Build 7 1335923 2D AGGGGTGTCC GG/-- GGGCCTGGAG 3070 het 3070 ref 29 13 13 6 G 5 3 264567 CASAVA_Build 7 1341591 1D GTACATCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 T 12 11 264568 CASAVA_Build 7 1342925 1D ATTTCCACTG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 A 8 7 264569 CASAVA_Build 7 1380050 3I TGAGATGGGG ---/TAA TTAATAAAGA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TAA 0 1 264570 CASAVA_Build 7 1384528 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 11 12 264571 CASAVA_Build 7 1386004 1I AATGAATGGA -/T GGATGGATGA 3070 het 177 hom 65 1 59 5 T 0 1 264572 CASAVA_Build 7 1406075 1D ATCTTAACCA T/- TTTTTTTTTT 1288 het 1288 ref 28 21 3 4 T 11 10 264573 CASAVA_Build 7 1426816 1I AGGTGAGTGG -/A TCACTTGAGG 1649 hom 10 het 5 0 4 1 A 0 1 264574 CASAVA_Build 7 1456118 1D CTGAGCCCCC T/- TGCAGTGAAG 3070 hom 59 het 27 0 18 9 T 2 1 264575 CASAVA_Build 7 1517826 1D TCTCCTGTGA C/- CTGCTTCGGA 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 C 2 1 264576 CASAVA_Build 7 1523531 3D ACACTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2696 het 1486 hom 23 6 7 10 A 17 14 264577 CASAVA_Build 7 1525802 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 2481 het 2481 ref 27 13 9 5 T 13 12 264578 CASAVA_Build 7 1534349 1D AAAAATGGTT A/- AAATGGTAAA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 A 4 3 264579 CASAVA_Build 7 1554440 1D AGGAAACACC T/- GGTGTGGCCT 3070 het 408 hom 16 3 8 5 T 1 0 264580 CASAVA_Build 7 1559299 1I CACGTTTTTA -/T TTTTTTTTAA 2802 hom 18 het 10 0 7 3 T 8 9 264581 CASAVA_Build 7 1562836 1D CATCTGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 22 het 21 0 16 5 A 10 9 264582 CASAVA_Build 7 1596255 1I AGGCAGGTGA -/C TCCCCCCCGC 2589 hom 27 het 10 0 8 2 C 0 1 264583 CASAVA_Build 7 1601488 4I CCATCCTCCT ----/ATCC ATCCATCCAT 3016 het 3016 ref 53 14 11 28 ATCC 4 5 264584 CASAVA_Build 7 1606224 1D GGAAGACAAG C/- CCCTCAGGGT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 C 4 3 264585 CASAVA_Build 7 1606418 1D GCCGAGTCCT C/- CGTGGCTCAC 3070 het 3070 ref 34 12 10 13 C 2 1 264586 CASAVA_Build 7 1615862 1D ATCTCAAAAC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 8 7 264587 CASAVA_Build 7 1624587 2D GTGTGTAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 49 het 30 0 14 18 GT 8 7 264588 CASAVA_Build 7 1625322 12D43M2I GTGTGTAGGG GTGTGTGTAGGTGTGTGTGTATGTAGGGGTGTGTGTTATGTAGGGGTGTGTGGCG--/------------GTGTGTGTATGTAGGGGTGTGTGTTATGTAGGGGTGTGTGGAGGT GTGTGTGTAT 2602 het 727 hom 27 5 15 17 N/A 0 0 264589 CASAVA_Build 7 1636991 12D TCCATACACT CATCCATCTCTC/------------ CATCCATTCA 3070 het 3070 hom 39 16 22 8 CATCCATCTCTC 1 0 264590 CASAVA_Build 7 1643907 1I CCATCTTTAT -/A AAAAAAATAC 3070 het 2329 hom 26 7 16 3 A 7 8 264591 CASAVA_Build 7 1645984 7D GGGAAGGGGG GCTGGGA/------- GCTGAGAGGA 3031 het 1361 hom 22 7 12 4 GCTGGGA 1 0 264592 CASAVA_Build 7 1653880 1D GGAGTTTGTG C/- CTTACCTGGG 3070 het 2013 hom 27 8 9 10 C 2 1 264593 CASAVA_Build 7 1669609 1I GCTATGGGGT -/G GGGGGGGGTT 3003 het 3003 ref 30 11 10 9 G 8 9 264594 CASAVA_Build 7 1734332 2I GGCGCCAAAC --/AG GGGTGAGAAC 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 AG 0 1 264595 CASAVA_Build 7 1792905 1I TTTCTGGTAG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 7 8 264596 CASAVA_Build 7 1807498 4D CATTGAGAAC TTTG/---- TTTATCAAGA 3070 hom 144 het 52 0 48 5 TTTG 1 0 264597 CASAVA_Build 7 1808788 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 A 12 10 264598 CASAVA_Build 7 1813779 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 12 11 264599 CASAVA_Build 7 1826659 1I GCCAGGAGCA -/G GGGCTCACAC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 3 4 264600 CASAVA_Build 7 1828351 4D AACAAGTGAA AAAC/---- AAAATTAAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AAAC 1 0 264601 CASAVA_Build 7 1830518 2D CACACCTCTC TT/-- GAGCCTGGTC 3070 hom 57 het 27 0 16 11 T 2 0 264602 CASAVA_Build 7 1831170 3I CTCTTAGAAA ---/ATC ATCAAAATGT 3070 hom 47 het 21 0 15 6 ATC 1 2 264603 CASAVA_Build 7 1917245 1I TGCCTCATGT -/C CTAAGTGCTA 3070 hom 51 het 24 0 16 8 C 1 2 264604 CASAVA_Build 7 1919606 15I GCCTGGAGAA ---------------/GGGAGCGAAGGGAGT GGGAACCGTC 3070 hom 42 het 15 0 14 2 GGGAGCGAAGGGAGT 0 1 264605 CASAVA_Build 7 1926161 18D GCCAACAGCT CCAGTGACACGGAGGTCC/------------------ CCAGTGACAC 3070 hom 45 het 24 0 14 12 CCAGTGACACGGAGGTCC 2 1 264606 CASAVA_Build 7 1932687 2D CCATAACCAA GG/-- GGGGGGTTTA 3070 hom 148 het 55 0 50 8 G 8 6 264607 CASAVA_Build 7 1947439 1I GAGAGCCAGA -/G GCACAGCCCC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 G 1 2 264608 CASAVA_Build 7 1948047 2D GCTAGGGCTC TG/-- TGCAGATGGC 3070 hom 85 het 32 0 27 7 TG 2 1 264609 CASAVA_Build 7 1956250 1I ACGATCTCTA -/G GACAAAGGAC 3070 hom 57 het 20 0 18 2 G 1 2 264610 CASAVA_Build 7 1958741 3I GCCTGGCACA ---/GAG GAGGTGCGTG 3070 hom 65 het 27 0 18 9 GAG 1 2 264611 CASAVA_Build 7 1962806 2I ACACTGCCAG --/CC CCACTCCTCA 3070 hom 126 het 47 0 38 9 C 2 4 264612 CASAVA_Build 7 1978766 1I TTTTATTGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 8 9 264613 CASAVA_Build 7 1991623 2I CTCACAGTCA --/CT CTCTCTCGGG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 CT 3 4 264614 CASAVA_Build 7 1991946 10D TTCCTTCCTG TACTGCCCCC/---------- TACTGCCCCC 3070 hom 65 het 25 0 20 6 TACTGCCCCC 2 1 264615 CASAVA_Build 7 1992431 11D TTCAAGTACG TGTGATGCACC/----------- TGTGTGACCC 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 TGTGATGCACC 1 0 264616 CASAVA_Build 7 2004139 3I GGCAATCCTC ---/CCA CCACCAAATT 3070 hom 70 het 25 0 23 2 CCA 2 3 264617 CASAVA_Build 7 2009716 1D GTCAAACCCA G/- GCTCCAGGTG 3070 hom 42 het 17 0 13 4 G 2 1 264618 CASAVA_Build 7 2022848 4D CTCTCCTGCC GTCT/---- GTCTCTTGAG 3070 hom 72 het 29 0 25 5 GTCT 2 1 264619 CASAVA_Build 7 2054047 2D GCTCACCAGT AC/-- AGATACATGC 3070 het 3070 hom 82 34 35 14 AC 1 0 264620 CASAVA_Build 7 2097937 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2632 het 2286 hom 23 7 8 8 A 15 16 264621 CASAVA_Build 7 2105761 25D GGACGGAAGT GAGCGCATCGGGCTGGGAGACAGCC/------------------------- GAATCTCAGA 3070 het 3070 ref 20 14 11 2 GAGCGCATCGGGCTGGGAGACAGCC 1 0 264622 CASAVA_Build 7 2108355 3D CAACCACCAT CAC/--- CACCGTCACC 2391 het 2391 ref 37 14 10 13 CAC 2 1 264623 CASAVA_Build 7 2122142 1I AGACGGTGGA -/G GGGGGGATAA 2512 het 1176 hom 25 5 10 10 G 6 7 264624 CASAVA_Build 7 2162983 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2695 het 1260 hom 18 6 7 6 A 15 14 264625 CASAVA_Build 7 2166226 1I CCGTCTCTGC -/A AAAAAAAATA 2553 het 2553 ref 22 10 7 5 A 8 9 264626 CASAVA_Build 7 2172641 1D TGTTCAAGCT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 48 14 31 4 A 8 7 264627 CASAVA_Build 7 2183238 1D CAATGCCTTC A/- CATTCCATAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 A 1 0 264628 CASAVA_Build 7 2187974 2I ATGTGGTCTC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 55 23 12 20 TA 8 9 264629 CASAVA_Build 7 2191372 1D TCTCTTGCCT C/- CCCCCTAGTC 3070 hom 75 het 30 0 24 6 C 6 5 264630 CASAVA_Build 7 2230006 1I TTAAGTCTCG -/C CCCCTAATAG 3070 hom 108 het 41 0 33 8 C 4 5 264631 CASAVA_Build 7 2234186 4D GGCTCAGCAG GAGA/---- GAGAGAACCA 3070 het 2896 hom 31 12 12 7 GA 5 3 264632 CASAVA_Build 7 2234824 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 70 het 27 0 24 3 AT 7 6 264633 CASAVA_Build 7 2234907 1D ACTAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2853 hom 27 10 12 5 T 13 12 264634 CASAVA_Build 7 2247158 2I CACCCAGGCA --/TT TTTCTTTCTT 3070 hom 36 het 15 0 11 4 T 3 5 264635 CASAVA_Build 7 2253178 1I CTGGTGCTTA -/G GGGGTCCCAG 2019 het 773 hom 20 4 9 7 G 4 5 264636 CASAVA_Build 7 2256598 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAACAT 3070 het 2746 hom 28 7 15 6 A 7 8 264637 CASAVA_Build 7 2259408 2I CCTTGGGGGC --/TG TGTCAGGAGC 3070 hom 50 het 20 0 15 5 TG 1 2 264638 CASAVA_Build 7 2262329 1D GCGGCTGTCT A/- CCGCCTCTCC 531 het 531 ref 17 4 5 8 A 1 0 264639 CASAVA_Build 7 2272513 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1933 het 298 hom 9 2 6 1 T 10 11 264640 CASAVA_Build 7 2281154 1D GCTGGAGTTT C/- CCCCGCAGCC 3070 hom 60 het 27 0 19 8 C 5 4 264641 CASAVA_Build 7 2283048 2D TGAGGCTGTA GT/-- GAGCTATGAT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 GT 1 0 264642 CASAVA_Build 7 2283798 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 11 10 264643 CASAVA_Build 7 2283972 1D CACATCGGGG A/- AAAAAAAAAA 2207 het 272 hom 14 4 8 2 A 12 11 264644 CASAVA_Build 7 2292683 1I CTATTTTATA -/T ATTTTTTTTT 3070 het 1999 hom 18 6 9 3 T 0 1 264645 CASAVA_Build 7 2313145 3I GGTTAATCAA ---/ATT ACTTTGTGTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 ATT 0 1 264646 CASAVA_Build 7 2313435 1D GGTTATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 97 hom 29 2 23 4 T 13 12 264647 CASAVA_Build 7 2318101 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 15 8 4 3 A 13 12 264648 CASAVA_Build 7 2329022 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 10 9 264649 CASAVA_Build 7 2341369 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 24 0 17 8 A 10 9 264650 CASAVA_Build 7 2343608 5I AGACCCTGTC -----/ACAAA ACAAAACAAA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 ACAAA 3 4 264651 CASAVA_Build 7 2352413 10I AGAAGTTTGA ----------/GGGCAGCCTG GCTCACATAG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 GGGCAGCCTG 0 1 264652 CASAVA_Build 7 2354064 2I TTCGGCCTCC --/CA CAGTGTTGAG 3070 hom 54 het 20 0 17 3 CA 1 2 264653 CASAVA_Build 7 2364177 1D CCTTTTTCCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 77 het 31 0 26 6 T 9 8 264654 CASAVA_Build 7 2364666 1D CGGACATCTG C/- ATATTTAGTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 0 264655 CASAVA_Build 7 2373264 1D ACACAATACC A/- AAAAAAAAAA 2859 het 199 hom 28 2 13 14 A 17 16 264656 CASAVA_Build 7 2389838 3I CTGCTGTGAT ---/AGC AGGGAGCGCA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AGC 0 1 264657 CASAVA_Build 7 2405301 5I TTCTCTTGGA -----/TTTAT TTTATTTTAT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 TTTAT 2 3 264658 CASAVA_Build 7 2415787 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 28 2 21 5 A 15 14 264659 CASAVA_Build 7 2448163 1I TCTCCATTTA -/G CAAAACTGAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 0 1 264660 CASAVA_Build 7 2463123 1I TTTTGGAATA -/G GGGATCATAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 G 3 4 264661 CASAVA_Build 7 2469520 1I CCTCATCTCT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 A 8 9 264662 CASAVA_Build 7 2476022 2I AAAAAAGGGA --/AG AGAGGGGAGG 1466 het 1466 ref 14 5 4 5 AG 2 3 264663 CASAVA_Build 7 2480725 3D CCGTATGCAG GCC/--- GCCGTATGCG 1326 het 1326 ref 17 7 5 5 GCC 2 1 264664 CASAVA_Build 7 2481706 1I GCCAGGGAGG -/C CCACCCAGAC 3070 hom 49 het 19 0 14 5 C 2 3 264665 CASAVA_Build 7 2481909 1I GAAGGCATTG -/C CCACCACAGT 3070 hom 38 het 15 0 12 3 C 2 3 264666 CASAVA_Build 7 2485334 1D GATGTGGGGG A/- AAAAATCCTG 3070 hom 86 het 33 0 24 9 A 6 5 264667 CASAVA_Build 7 2493897 2I TTCTGCAGAG --/AC ACATGCAGCT 3070 het 2323 hom 24 9 9 6 AC 1 2 264668 CASAVA_Build 7 2505871 1I TGCCCTACGC -/T TGTGGCCCAC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 1 2 264669 CASAVA_Build 7 2537396 19I TGACCCCCTG -------------------/CTTCTGAGCCCAGCCCCAC CTTCTGAGCC 3070 het 3070 ref 42 15 14 13 CTTCTGAGCCCAGCCCCAC 0 1 264670 CASAVA_Build 7 2542764 1D GACAGAAGTC A/- AGGGCCAGTC 3070 het 3070 ref 66 39 20 7 A 2 1 264671 CASAVA_Build 7 2571294 2D ATGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 1274 het 1274 ref 72 47 3 23 GT 10 9 264672 CASAVA_Build 7 2592184 1D ATTTTGGGTG C/- TAACATTTTG 3070 hom 126 het 46 0 43 5 C 1 0 264673 CASAVA_Build 7 2592565 10D GGAGGGAGGC CAGGGAATGG/---------- CAGGGAATGG 3070 hom 76 het 35 0 22 16 CAGGGAATGG 2 1 264674 CASAVA_Build 7 2600529 1D CAGAAATGAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 14 8 11 T 9 8 264675 CASAVA_Build 7 2610150 1D CTTCCCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 24 1 15 8 T 17 16 264676 CASAVA_Build 7 2610299 1I CAGGCATGCG -/C CGCCACGTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 1 2 264677 CASAVA_Build 7 2613840 1I12M1D TGCCCCAGCA -GGCCCTGCCTTTC/GGGCCCTGCCTTT- TCTGGCCGTC 3070 hom 97 het 33 0 26 10 N/A 0 0 264678 CASAVA_Build 7 2617036 6I ATTCCCAATT ------/ATAATC ACAAAAGCAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATAATC 0 1 264679 CASAVA_Build 7 2617835 1I CCAGTCACTC -/A AGGGATGGGG 3070 hom 61 het 22 0 13 9 A 1 2 264680 CASAVA_Build 7 2621848 3I AGGCTGAGGC ---/AGA AGAATTGCTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AGA 1 2 264681 CASAVA_Build 7 2623715 4D CTATGCTCAC CGCT/---- CCTGCTACCC 1443 het 1443 ref 23 10 6 8 CGCT 1 0 264682 CASAVA_Build 7 2625218 1I ACTCTGTCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2207 hom 25 7 13 5 A 11 12 264683 CASAVA_Build 7 2633473 3I AGTGAGGAAG ---/AGA AGGAGGGAGG 3070 hom 57 het 21 0 16 5 AGA 0 1 264684 CASAVA_Build 7 2633736 1I GGAAGGTGGG -/A GGGAGGGAGA 2654 hom 27 het 16 0 9 7 A 0 1 264685 CASAVA_Build 7 2636257 1I TTAGGGGGTT -/A GGGGGGGGCT 3070 hom 41 het 20 0 12 8 A 0 1 264686 CASAVA_Build 7 2643366 1I CCCCTGGGCA -/G GGCCCTGCCA 2613 hom 48 het 18 0 14 4 G 2 3 264687 CASAVA_Build 7 2646167 1I TGGCCTGCCA -/G GCTCACCCGC 3070 hom 71 het 29 0 18 11 G 1 2 264688 CASAVA_Build 7 2646564 1I GTGTGTGTGT -/G GGGGGGGGAC 2774 het 1723 hom 29 6 13 10 G 8 9 264689 CASAVA_Build 7 2646947 5I TCTGCTCAAG -----/TGTCC TGCCCCGTGG 1241 het 1241 ref 24 12 5 7 TGTCC 0 1 264690 CASAVA_Build 7 2651288 1I ACACCCCCCA -/G GGGCACCCCC 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 3 4 264691 CASAVA_Build 7 2666214 1I CTGACCCACC -/G GGTCCCCCAT 2476 hom 34 het 13 0 9 4 G 2 3 264692 CASAVA_Build 7 2667238 1I CCCACGGGAG -/T GGGGGGCTGC 3070 hom 48 het 20 0 14 6 T 0 1 264693 CASAVA_Build 7 2681225 8I TGGCACAATC --------/TTGGCTCA TTGGCTCATG 1357 hom 7 het 6 0 3 4 TTGGCTCA 1 2 264694 CASAVA_Build 7 2681510 1D CTGGAGGTTG C/- TCCTGTCATT 3070 hom 58 het 30 0 22 8 C 1 0 264695 CASAVA_Build 7 2681643 6D GGCCAGTGTC AGTCAT/------ AGTCATAGCA 3070 hom 119 het 44 0 37 10 AGTCAT 2 1 264696 CASAVA_Build 7 2688097 1I CCCCAGCCTT -/G GCTGAGCCCA 639 hom 25 het 19 0 4 15 G 1 2 264697 CASAVA_Build 7 2693874 1I TGGGGCTTCG -/C CTGATAAGCC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 1 2 264698 CASAVA_Build 7 2701729 2D AAAAATTGAC TG/-- GGCGTGTTGG 2757 het 2097 hom 22 9 10 4 TG 1 0 264699 CASAVA_Build 7 2709674 3I ACACGTGCCT ---/AGA AGATCTCAAC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 AGA 1 2 264700 CASAVA_Build 7 2710644 1D CCCGATCATT A/- AAAAAAAATC 2907 het 2907 ref 22 12 6 5 A 9 8 264701 CASAVA_Build 7 2713437 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 12 11 264702 CASAVA_Build 7 2718215 6I TTAAAAAAAT ------/AAAAAA CGAAAAATGT 3070 het 3070 hom 21 7 12 2 A 0 6 264703 CASAVA_Build 7 2722079 2D ACGGTTCTTT CA/-- GTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 CA 1 0 264704 CASAVA_Build 7 2722667 4I CCAAAAGCCT ----/TAAA TAAACATAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 TAAA 1 2 264705 CASAVA_Build 7 2725826 1I CAAAATTAAT -/A AAATGCTATC 2455 het 2455 ref 27 13 8 7 A 3 4 264706 CASAVA_Build 7 2727876 1D ACTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 778 het 577 hom 13 3 4 6 A 15 14 264707 CASAVA_Build 7 2729291 3D CATTTTATAA AAG/--- AAGAAAAAAA 2989 het 2989 ref 29 20 9 2 AAG 2 1 264708 CASAVA_Build 7 2731143 1I CACTGTGGTC -/A TATTTCTGAG 2150 het 2150 ref 30 19 8 3 A 0 1 264709 CASAVA_Build 7 2732098 2D CCCCCACCGA CT/-- CTCAGGTCTG 3070 het 3070 ref 30 13 11 8 CT 2 1 264710 CASAVA_Build 7 2737019 4D CACGGTCCTC AATT/---- AAACTGCGTC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AATT 1 0 264711 CASAVA_Build 7 2739562 2I CTCTGGACAC --/AT GTTTTCTAAC 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 AT 0 1 264712 CASAVA_Build 7 2741276 1I TGCACTCACT -/C CCCTGATTTA 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 C 3 4 264713 CASAVA_Build 7 2744444 1D GGCTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2869 het 2869 ref 29 12 11 7 A 15 14 264714 CASAVA_Build 7 2745656 1D TATATGTATA T/- TACATGCCAT 3070 het 3070 ref 32 19 8 6 T 2 1 264715 CASAVA_Build 7 2753632 1I AATTCAACAA -/C CCTTCATGCT 867 het 867 ref 12 9 2 2 C 2 3 264716 CASAVA_Build 7 2759552 13I CTCAAGCCAT -------------/CCTCCTGCTTTGG CCTCCCAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 CCTCCTGCTTTGG 0 1 264717 CASAVA_Build 7 2768524 1I ACCGAATCCA -/G GACACGGTAT 2654 het 2654 ref 33 13 9 11 G 1 2 264718 CASAVA_Build 7 2772548 1D TGCTTCCGCC T/- TTTTTTTTTT 1085 het 595 hom 24 6 6 12 T 17 16 264719 CASAVA_Build 7 2773775 1I CTTCTTATTT -/A AAAATCAACT 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 A 4 5 264720 CASAVA_Build 7 2778720 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1034 het 1034 ref 11 7 3 1 A 13 12 264721 CASAVA_Build 7 2783117 3D ATAATAAAAT AAG/--- AATAAACCTT 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 AAG 1 0 264722 CASAVA_Build 7 2809259 1I ACGAATGGGG -/A AAAACCCAAA 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 A 4 5 264723 CASAVA_Build 7 2811067 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 1988 het 1988 ref 22 12 6 4 A 11 12 264724 CASAVA_Build 7 2834084 1I TTATTTAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 8 9 264725 CASAVA_Build 7 2837114 1D AAAATTAATG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 A 9 8 264726 CASAVA_Build 7 2837614 5D CCCAGGCTGG AGTGC/----- AGTGGCGCGA 1408 het 1298 hom 11 3 5 3 AGTGC 1 0 264727 CASAVA_Build 7 2839900 2D AAAACCAAAC TG/-- TGCTTCCAGA 1871 het 1871 ref 27 7 7 13 TG 2 1 264728 CASAVA_Build 7 2842280 1I CAATCTTTAC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 7 8 264729 CASAVA_Build 7 2848177 12D GGGAGGGAGA AAGGAAGGGAGG/------------ AAGGAAGAAA 3070 het 1001 hom 27 6 17 5 AAGGAAGGGAGG 1 0 264730 CASAVA_Build 7 2848266 6D AGGAAAGGAA GGAAGG/------ GAAGGGAGGA 517 het 517 ref 37 20 3 15 GGAAGG 1 0 264731 CASAVA_Build 7 2851252 1D GCTTTCCCCA C/- CCCCCCCAAC 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 C 8 7 264732 CASAVA_Build 7 2856472 6D CACCATCACT ATCACC/------ ATCACCATCA 3070 het 3070 ref 84 44 28 22 ATCACC 2 1 264733 CASAVA_Build 7 2857473 1D ACCTAGAAGA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3061 hom 32 12 16 5 T 2 1 264734 CASAVA_Build 7 2867409 3D CGTCTCTACT AAA/--- AAAAAAAAAA 1794 het 657 hom 11 4 5 4 A 18 15 264735 CASAVA_Build 7 2891476 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 23 3 A 14 13 264736 CASAVA_Build 7 2895979 2I GCGTTTTCTC --/AT ATGTTTTTTC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AT 1 2 264737 CASAVA_Build 7 2898354 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1180 hom 19 3 11 5 A 10 11 264738 CASAVA_Build 7 2903214 3D TATTGTGTTT TCC/--- TCCTCAGCGT 1811 het 1811 ref 22 14 6 5 TCC 2 1 264739 CASAVA_Build 7 2907776 1D CTCACAGGAT G/- GGGGGGTGGG 3070 het 3019 hom 26 11 10 5 G 7 6 264740 CASAVA_Build 7 2915150 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2061 hom 17 6 9 2 T 8 9 264741 CASAVA_Build 7 2937576 1I GCGGCTTCTG -/C CCTGTGCACC 3070 hom 76 het 28 0 24 4 C 2 3 264742 CASAVA_Build 7 2938504 1I TTCAGCAGTT -/G GGGCTCCTGC 3070 hom 67 het 24 0 15 9 G 3 4 264743 CASAVA_Build 7 2941177 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 C 1 0 264744 CASAVA_Build 7 2948654 4D TCTCTCTCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 1723 het 1723 ref 21 10 4 8 CCTT 6 5 264745 CASAVA_Build 7 2986359 1D ACATGACAAC G/- GGAGCATCCT 3070 het 2440 hom 33 10 20 3 G 3 2 264746 CASAVA_Build 7 2986884 1I TACTTCCCTC -/T TTTTTTTTTT 2115 het 7 hom 18 1 11 6 T 13 14 264747 CASAVA_Build 7 2989408 2D CCTCTTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 693 hom 29 6 11 12 T 13 11 264748 CASAVA_Build 7 2990614 2D TAGCTTTCTT TC/-- TTTTTCTCTC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TC 1 0 264749 CASAVA_Build 7 2991308 4I CCAGCCTGGG ----/CAAC ATAGTCAGAC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CAAC 0 1 264750 CASAVA_Build 7 2993183 1I AAAATCTGTT -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 7 8 264751 CASAVA_Build 7 2993927 1D ATACATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 34 1 19 14 T 12 11 264752 CASAVA_Build 7 3011840 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 A 1 0 264753 CASAVA_Build 7 3014989 2I AACAGGAAGG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 9 11 264754 CASAVA_Build 7 3016499 1I AACGAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 A 12 13 264755 CASAVA_Build 7 3028526 1I GTTTTTAAAG -/T AATAACAGTA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 0 1 264756 CASAVA_Build 7 3029844 1I CCGCGTTCAA -/G CAATTCTCCT 609 het 609 ref 17 12 3 2 G 0 1 264757 CASAVA_Build 7 3035733 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAG 1368 het 1368 ref 16 6 6 4 A 10 9 264758 CASAVA_Build 7 3036732 1D TCATCACGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 17 1 T 13 12 264759 CASAVA_Build 7 3071919 2I TTGAGGAATT --/AA GTCTATTCCT 3070 het 3070 hom 54 18 23 13 A 0 2 264760 CASAVA_Build 7 3078230 1D CTGGTAAGTA C/- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 C 2 1 264761 CASAVA_Build 7 3080531 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2648 hom 31 13 11 8 T 14 13 264762 CASAVA_Build 7 3082904 2D TACATATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 TG 7 6 264763 CASAVA_Build 7 3095081 6D ACGAATTATT TTTGAC/------ TACAGTCACC 3070 het 1817 hom 17 5 11 3 TTTGAC 1 0 264764 CASAVA_Build 7 3096560 1I TTAAAAAAAA -/C AAAAAACAAA 3070 het 262 hom 38 2 31 5 C 0 1 264765 CASAVA_Build 7 3096888 2D AAGAAGAGTT AC/-- ACAGTGTTCT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 AC 2 1 264766 CASAVA_Build 7 3099583 1I AAAAAAACCC -/A AAACCCCCCC 3070 het 340 hom 22 7 10 5 A 3 4 264767 CASAVA_Build 7 3101909 4D AAACAAACAA ACAG/---- AAACGCCTGG 3070 het 2017 hom 20 7 11 2 ACAG 1 0 264768 CASAVA_Build 7 3102563 1I ATGTGTTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 18 20 13 A 10 11 264769 CASAVA_Build 7 3111735 1I CACGTCCAGG -/T TTTTTTTTTT 343 het 176 hom 10 1 2 7 T 15 16 264770 CASAVA_Build 7 3113421 1D ACTTCACTGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 10 9 264771 CASAVA_Build 7 3122181 6D4M6I TTAGTTCAAC TTCCCTCTTG------/------CAAGAGGGAA GTTCAACTAA 3070 het 3070 ref 53 27 27 2 N/A 0 0 264772 CASAVA_Build 7 3126374 3I18M2D CCATCATCAC ---CATCATCTTCATCACCATTC/TATCATCACCTTCATCACCAT-- CCTCTTCATC 101 het 101 ref 52 44 3 9 N/A 0 0 264773 CASAVA_Build 7 3126433 6I8M3I TCACCATCAT ------GATCATCA---/CTTCACTATCATCACCT TTATCATCGT 3070 het 3070 ref 47 29 11 10 N/A 0 0 264774 CASAVA_Build 7 3139959 1D TGTAGGAGGA T/- TTTTTTTTTT 1610 het 1610 ref 47 39 4 4 T 11 10 264775 CASAVA_Build 7 3151940 1D GCTACTTTTT G/- TATTTTTTAG 2044 het 2044 ref 15 7 6 2 G 1 0 264776 CASAVA_Build 7 3154944 3D GCTCAAGCAA TCC/--- TCCTGCCTCA 3070 het 1902 hom 21 6 11 5 TCC 2 1 264777 CASAVA_Build 7 3156429 1I GAAAACCGGA -/G GCAGCCCCCG 3070 hom 83 het 31 0 26 5 G 1 2 264778 CASAVA_Build 7 3175229 1D CCACTTCCTC T/- GTAGGGCTCT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 0 264779 CASAVA_Build 7 3180686 1D AGAGGACTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 412 hom 31 2 28 1 A 9 8 264780 CASAVA_Build 7 3183720 1D GTTAAGTAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 10 9 264781 CASAVA_Build 7 3187196 7D TAGTTACCTT TTTTTTG/------- TTTTTTGTTT 2900 het 2900 ref 23 12 9 5 TTTTTTG 3 2 264782 CASAVA_Build 7 3194905 1I GGAGGAACGG -/C CCACTGCCAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 C 2 3 264783 CASAVA_Build 7 3197212 1D TCTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 13 12 264784 CASAVA_Build 7 3208496 1I ACTCACTGTA -/G GGGGGTGGGG 3070 hom 55 het 25 0 20 5 G 5 6 264785 CASAVA_Build 7 3214079 1D15M1D CAACGACAAC AAAAAAAAAAAAACAGA/-AAAAAAAAAAAACAG- AAAAAAAAGT 3070 het 692 hom 27 5 17 8 N/A 0 0 264786 CASAVA_Build 7 3215800 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAGCC 3070 het 108 hom 25 1 24 1 A 8 7 264787 CASAVA_Build 7 3228522 1I TGAGCAAAGT -/A AAAATCAAAG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 4 5 264788 CASAVA_Build 7 3228805 1D CCCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 7 6 264789 CASAVA_Build 7 3231185 1D CATTCTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 17 8 T 11 10 264790 CASAVA_Build 7 3243632 33D TTTGGCTTGC AAAGGATATACTTTTTCATTTGGGGTAAAATGA/--------------------------------- AAAGGATATA 3070 het 3070 ref 40 17 9 20 AAAGGATATACTTTTTCATTTGGGGTAAAATGA 1 0 264791 CASAVA_Build 7 3243736 3D5M5D CCATTCGTAC ATGAATGTACATG/---AAAGT----- TAATACATGA 3070 het 3070 ref 42 26 18 2 N/A 0 0 264792 CASAVA_Build 7 3249715 1I AAAGTGCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 10 11 264793 CASAVA_Build 7 3251644 11D GCAATCATAG CTCACTGAAGC/----------- CTTGCTCAAG 3070 het 3070 hom 23 9 14 4 CTCACTGAAGC 1 0 264794 CASAVA_Build 7 3253915 1D TGCAGTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 T 13 12 264795 CASAVA_Build 7 3271074 3I AAAAGCTAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 AAC 5 6 264796 CASAVA_Build 7 3279916 1D TGGAGCCCAT G/- GGGGATGCTG 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 G 5 4 264797 CASAVA_Build 7 3281388 9I TTCCCAGGAC ---------/ATGTGGGAA CTGTGGGAGC 3070 het 1871 hom 29 8 15 6 ATGTGGGAA 0 1 264798 CASAVA_Build 7 3290892 1D AAAAAAAAAA T/- GAAAGAATCT 2973 het 2973 ref 22 11 9 2 T 1 0 264799 CASAVA_Build 7 3291249 1D GAGTTAAGCA G/- GACGTTAACT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 G 2 1 264800 CASAVA_Build 7 3296896 1I GCCCCAACTC -/T TCCCTTCCAA 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 T 1 2 264801 CASAVA_Build 7 3297002 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2800 het 2252 hom 44 14 17 13 T 17 18 264802 CASAVA_Build 7 3298191 1D AAACCTCTTG A/- AAATGTCATG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 4 3 264803 CASAVA_Build 7 3301649 1D CAAAAAAAAA G/- ACATAAATGA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 G 1 0 264804 CASAVA_Build 7 3309736 4I GAACTTTGTT ----/AGGG AGGAATATTT 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 AGGG 0 1 264805 CASAVA_Build 7 3314707 4D TCTTGAAAAC AGAT/---- AGTCAGGTAA 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 AGAT 1 0 264806 CASAVA_Build 7 3318728 1D TCATTAAGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 9 8 264807 CASAVA_Build 7 3321056 1I CAACAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 T 12 13 264808 CASAVA_Build 7 3321562 4D AACTGATCTT TGAG/---- TGCACCCCTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 10 TGAG 1 0 264809 CASAVA_Build 7 3323734 1I ATTCCTCTCT -/C CCATTCATTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 2 3 264810 CASAVA_Build 7 3326439 1I TTTTTTTCTA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 232 hom 34 3 17 14 T 7 8 264811 CASAVA_Build 7 3327056 2D AATGTGGGTT AA/-- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 11 18 5 A 10 8 264812 CASAVA_Build 7 3332066 1D CAAACATCCT C/- CCCTTTGAGA 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 C 4 3 264813 CASAVA_Build 7 3341934 2I AAGTAGAAAC --/TG TGCAAGATAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TG 1 2 264814 CASAVA_Build 7 3345334 4I ATAATTTCAG ----/AATA AATAAATTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AATA 1 2 264815 CASAVA_Build 7 3345804 4D CATTTATAAA TAAT/---- TCATACGTCA 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 TAAT 1 0 264816 CASAVA_Build 7 3348756 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 16 16 0 A 10 11 264817 CASAVA_Build 7 3349882 5I TAATAAAAAG -----/TTTAA TTAAATATGA 3070 hom 184 het 67 0 62 5 TTTAA 0 1 264818 CASAVA_Build 7 3352825 1D ATTTAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 17 2 10 6 T 13 12 264819 CASAVA_Build 7 3354051 3D ATTAAATATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 34 4 19 13 T 13 10 264820 CASAVA_Build 7 3354642 10D TTCTCGTAAG GGAGAACTAA/---------- ACATCGAGTG 3070 het 3070 hom 52 24 25 7 GGAGAACTAA 1 0 264821 CASAVA_Build 7 3355347 1I GTTGCAGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 70 het 30 0 24 6 A 9 10 264822 CASAVA_Build 7 3356461 1D TTATTTATTT G/- GGGACAGCAT 3070 het 3070 ref 55 24 24 7 G 4 3 264823 CASAVA_Build 7 3359340 1I AGTGGTGTAA -/T GTAATGGCAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 T 0 1 264824 CASAVA_Build 7 3359972 3D CACTAGAAAA AGC/--- AGCCTCCCAT 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 AGC 2 1 264825 CASAVA_Build 7 3360053 1I CCTCCTCATC -/T CATGAGGTTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 0 1 264826 CASAVA_Build 7 3364588 1D CATTACAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1847 hom 30 10 12 8 T 14 13 264827 CASAVA_Build 7 3367050 2I CCTATGTGTC --/AT ATGATGCATT 3070 het 3070 ref 53 33 17 3 AT 1 2 264828 CASAVA_Build 7 3377443 1D CATCTGTGCA G/- GAACATTAGA 3070 het 3070 ref 65 32 27 6 G 2 1 264829 CASAVA_Build 7 3379795 1I TGTTCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 T 11 12 264830 CASAVA_Build 7 3381339 2D GTTAATTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 17 16 A 15 13 264831 CASAVA_Build 7 3385976 1D ACTTCTTGAG C/- CACCTACATG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 C 2 1 264832 CASAVA_Build 7 3390757 1I CCTCGAACAT -/C CGAAGGACTT 3070 het 3070 ref 61 31 25 5 C 1 2 264833 CASAVA_Build 7 3391193 1D AGAGACACCT G/- AAACATCAAA 3070 het 3070 ref 36 16 17 5 G 1 0 264834 CASAVA_Build 7 3395913 5I CAACAGAAAT -----/AAAAC AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 AAAAC 0 1 264835 CASAVA_Build 7 3413138 2I TGAATAAACT --/AC AGAGTGGATG 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 AC 0 1 264836 CASAVA_Build 7 3429731 1D AAACAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 1079 het 1079 ref 27 19 3 5 T 12 11 264837 CASAVA_Build 7 3435400 4I TATGATAAAA ----/AAAG GGCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 AAAG 0 1 264838 CASAVA_Build 7 3438024 1I TCAGGAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 10 11 264839 CASAVA_Build 7 3441333 3I TTTTTTTTTT ---/GAA TGAAATCTTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 GAA 0 1 264840 CASAVA_Build 7 3473691 1D TCTGAATAGA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 T 8 7 264841 CASAVA_Build 7 3474136 1I TGTTGTCATG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 7 8 264842 CASAVA_Build 7 3474802 4D AAGGAAGGAG TATT/---- GAATACATGC 3070 het 3070 ref 55 31 22 3 TATT 1 0 264843 CASAVA_Build 7 3487312 1I TATTTTACTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 6 7 264844 CASAVA_Build 7 3488185 1I CAAAACATAT -/A AAAAATGTCA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 5 6 264845 CASAVA_Build 7 3517958 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 30 14 9 T 9 10 264846 CASAVA_Build 7 3524646 1I ATCTGAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 20 11 A 10 11 264847 CASAVA_Build 7 3525123 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 11 10 264848 CASAVA_Build 7 3525745 1I AAATCCTGTG -/A AGTAGGTACT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 1 2 264849 CASAVA_Build 7 3526822 1D TCTTCTCCTT A/- AATAAAAACT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 3 2 264850 CASAVA_Build 7 3527579 4I CAGTGAGCCT ----/GTTA GTTCTCATGT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 GTTA 0 1 264851 CASAVA_Build 7 3528290 1I CCTTACTATC -/T TTTGGTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 3 4 264852 CASAVA_Build 7 3562374 3I ACATATACAC ---/GAT GATGGAGTAT 3070 het 3070 ref 60 34 16 10 GAT 1 2 264853 CASAVA_Build 7 3563187 5D ATCAATAATC TAAGT/----- TAATACCTCA 3070 het 3070 hom 36 16 20 2 TAAGT 1 0 264854 CASAVA_Build 7 3565916 2D GTATTTTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2612 hom 34 12 12 11 A 16 14 264855 CASAVA_Build 7 3626459 2D GCTTACAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1746 hom 23 6 13 4 T 14 12 264856 CASAVA_Build 7 3646264 4D ATCCTCCTGC TCCA/---- TCCAGCCTTC 3070 het 3070 ref 34 21 11 5 TCCA 2 1 264857 CASAVA_Build 7 3652499 1D TTTTCAAGGG A/- AACAGTAAGT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 3 2 264858 CASAVA_Build 7 3656173 1I TTTTGTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 28 1 19 8 A 13 14 264859 CASAVA_Build 7 3656984 2D TGGGGATTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3037 hom 47 17 17 13 T 16 14 264860 CASAVA_Build 7 3663760 1I GGGACTCGGG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 7 8 264861 CASAVA_Build 7 3670200 1D CTTCACTCTA G/- TTTATTTTCC 3070 het 3070 hom 45 18 25 2 G 1 0 264862 CASAVA_Build 7 3671619 1D TAGGGATTGA T/- TTTTGTTCAC 3070 het 3070 ref 55 31 18 7 T 5 4 264863 CASAVA_Build 7 3672852 1D AAATTAATTG T/- TTTATGCCTA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 4 3 264864 CASAVA_Build 7 3675685 1D AATTCAATAA C/- ACAACACACT 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 C 1 0 264865 CASAVA_Build 7 3677903 1I ACCTAATGCA -/T TTTTTTGGTG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 6 7 264866 CASAVA_Build 7 3686172 1I TGAGATTAGT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 7 8 264867 CASAVA_Build 7 3687361 1I TATAGTTTAG -/T TTTTTTGACT 3070 hom 95 het 37 0 32 5 T 6 7 264868 CASAVA_Build 7 3688881 2D GGATTTACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 28 0 22 6 T 14 12 264869 CASAVA_Build 7 3690921 1D GAAATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 32 1 25 6 A 11 10 264870 CASAVA_Build 7 3692231 1I TGAGGCAAAC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 8 9 264871 CASAVA_Build 7 3692790 4D AATTGAAAGA TTGG/---- TTGGGTGACA 3070 hom 151 het 53 0 51 4 TTGG 2 1 264872 CASAVA_Build 7 3697349 3D TACGAAAAGC AAT/--- AGAGAATTCT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AAT 1 0 264873 CASAVA_Build 7 3697798 3D TGTGAACTGA TAT/--- TATTGATTTT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TAT 2 1 264874 CASAVA_Build 7 3700736 1I TTATGTTGGT -/G GGGGGGGGAA 3070 hom 65 het 30 0 22 9 G 8 9 264875 CASAVA_Build 7 3706159 3D AATGTCATCA GAT/--- GATCTCTCAT 3070 hom 105 het 38 0 35 5 GAT 2 1 264876 CASAVA_Build 7 3876728 1D TGTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 10 9 264877 CASAVA_Build 7 3877309 3D ATTTCTTGAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1883 hom 29 6 21 5 T 13 10 264878 CASAVA_Build 7 3877589 2D CTGAATAGAC TG/-- TAGTACAGGG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 TG 1 0 264879 CASAVA_Build 7 3878219 1I ATTTGTTTTG -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 6 7 264880 CASAVA_Build 7 3878668 1I TTTTGTAGCC -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 T 6 7 264881 CASAVA_Build 7 3881374 1I TTAGTTTTTT -/C CCCTGTACCC 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 C 3 4 264882 CASAVA_Build 7 3889852 4D CGCTCCCTCG CTCC/---- CTCCCTCCCT 1685 het 1685 ref 26 10 8 8 CTCC 6 5 264883 CASAVA_Build 7 3900710 1I TGAGCCTCAG -/T TTTGCAGCCC 3056 het 2847 hom 20 9 8 3 T 3 4 264884 CASAVA_Build 7 3901805 5D CTTCTTCCTC TTCTT/----- TTCAAGTTGC 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 TTCTT 1 0 264885 CASAVA_Build 7 3903904 10D TTTTTACAGC TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 47 15 25 11 TG 10 5 264886 CASAVA_Build 7 3909018 1I AGAATGACAG -/A AAAAAATTGC 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 A 6 7 264887 CASAVA_Build 7 3911151 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 137 het 137 ref 10 7 1 3 A 17 12 264888 CASAVA_Build 7 3913274 1I ATATTCTCTC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 26 7 13 6 T 7 8 264889 CASAVA_Build 7 3942743 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 22 2 12 8 A 15 16 264890 CASAVA_Build 7 3948751 1I TGTGTGTTTT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 85 het 35 0 29 6 A 7 8 264891 CASAVA_Build 7 3959329 1I CAAAATAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1214 hom 32 3 20 9 A 14 15 264892 CASAVA_Build 7 3960274 1I GGGCTGTTTG -/C CCCACCTGCC 2724 hom 42 het 20 0 14 6 C 3 4 264893 CASAVA_Build 7 3971927 1I ATATTGAGCC -/G GGGGCCTCCC 3070 hom 57 het 23 0 15 8 G 4 5 264894 CASAVA_Build 7 3987098 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 12 11 264895 CASAVA_Build 7 3987631 10D CTGGAAATGA TGAAGCTTAG/---------- TAAGGAAGGC 3070 hom 126 het 43 0 43 4 TGAAGCTTAG 1 0 264896 CASAVA_Build 7 3989654 5I TGAAGTATCT -----/TTAAA TTAAGGTGTG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 TTAAA 0 1 264897 CASAVA_Build 7 3992357 1D CAGTAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 38 1 29 9 T 13 12 264898 CASAVA_Build 7 4000800 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1635 het 1635 ref 28 10 6 12 A 17 18 264899 CASAVA_Build 7 4001978 1D GCCTTAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 31 1 24 6 T 12 11 264900 CASAVA_Build 7 4008408 1I TGGGCTCCAG -/C CCGGAGGGGT 3070 hom 92 het 36 0 28 8 C 2 3 264901 CASAVA_Build 7 4008710 1D ACAAGAACTG C/- AGTATGGACC 3070 hom 117 het 45 0 40 6 C 1 0 264902 CASAVA_Build 7 4011039 6D TCCATCCATC GTACTG/------ GTTGTTTTGT 3070 hom 105 het 38 0 34 5 GTACTG 1 0 264903 CASAVA_Build 7 4012126 1I AGAACATGAC -/T TAAGGCAGGA 3070 hom 44 het 16 0 15 1 T 1 2 264904 CASAVA_Build 7 4020435 1D CTGCACATTT C/- TCTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 1 0 264905 CASAVA_Build 7 4030542 2D AAGCCCTACA AG/-- ACTTTCTAGA 3070 hom 120 het 46 0 40 7 AG 1 0 264906 CASAVA_Build 7 4031058 1I ACAGCCGCAT -/G TATGTGGAAT 3070 hom 84 het 37 0 27 10 G 0 1 264907 CASAVA_Build 7 4038778 1D AAGAATTTAG C/- AAACTAGCAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 1 0 264908 CASAVA_Build 7 4043539 1D TACTTTGGGA G/- GATGAGGTGG 3070 hom 123 het 46 0 40 6 G 2 1 264909 CASAVA_Build 7 4044540 1D AGACAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 32 0 25 7 T 11 10 264910 CASAVA_Build 7 4050615 1D CTTTGCTTTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 246 hom 41 2 32 7 T 9 8 264911 CASAVA_Build 7 4051437 2D GGTCTCACTC TG/-- TGCCCAGGCT 3070 het 3070 hom 28 12 16 2 TG 2 1 264912 CASAVA_Build 7 4052979 1D CTAGCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 30 1 24 7 T 12 11 264913 CASAVA_Build 7 4053570 1D TTGTTGAGGA T/- TTTTTTGAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 7 6 264914 CASAVA_Build 7 4059521 1D TTGCCTCTCT C/- CCCTTTCCTC 3070 hom 102 het 40 0 32 9 C 4 3 264915 CASAVA_Build 7 4061709 12D GTTGTTGTTG TTGTTTTTGTTT/------------ TTTGTTTTTT 3070 hom 92 het 29 0 30 7 TTGTTT 2 0 264916 CASAVA_Build 7 4062312 1I ATAATCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 468 hom 33 2 23 8 T 16 17 264917 CASAVA_Build 7 4063025 2D GGGTCCCGAC AG/-- ACCATTCCGC 3070 hom 78 het 29 0 24 5 AG 1 0 264918 CASAVA_Build 7 4071616 4I AAGCAGAAAC ----/ACTG ATAATATAAA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 ACTG 0 1 264919 CASAVA_Build 7 4071853 15D GTGGTTGTTG TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 26 1 21 7 T 35 20 264920 CASAVA_Build 7 4080120 1I TGAGCACTAT -/G GGGGTGGGGC 3070 hom 56 het 21 0 15 6 G 4 5 264921 CASAVA_Build 7 4082718 4I AAATAGATAG ----/ATAC ATACATACAT 3070 het 2798 hom 36 12 14 10 ATAC 3 4 264922 CASAVA_Build 7 4085505 1I GAGCAAATCC -/T TTTTTTGGTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 6 7 264923 CASAVA_Build 7 4087685 1D TCAAGTGATT C/- CCCCTGCCTC 3070 hom 68 het 24 0 23 1 C 5 4 264924 CASAVA_Build 7 4094714 1D TAGGAGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 31 1 23 9 T 12 11 264925 CASAVA_Build 7 4097054 1I ATGTGAGCTT -/C CCCTTTTCTA 3070 hom 163 het 61 0 54 7 C 3 4 264926 CASAVA_Build 7 4102530 1D AACTTTAGGC A/- CCTTAGCAAC 3070 het 3070 hom 39 17 16 9 A 1 0 264927 CASAVA_Build 7 4126282 2I GATTGAAAAT --/AA AGAGATTAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 1 3 264928 CASAVA_Build 7 4138004 2D GAGGATACAC AT/-- GTTATTTCAT 3070 het 3070 hom 43 15 24 5 AT 1 0 264929 CASAVA_Build 7 4145343 1I TCTCTACCCA -/C CCCCCCATTT 3070 hom 45 het 17 0 13 4 C 6 7 264930 CASAVA_Build 7 4150603 25D TGTCTGTGTG GCGGTGATGACGGTGCTGATGGTGA/------------------------- GCGGTGATGC 3070 hom 75 het 26 0 21 9 GCGGTGATGACGGTGCTGATGGTGA 1 0 264931 CASAVA_Build 7 4160009 1D TAATGTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 30 0 23 7 T 13 12 264932 CASAVA_Build 7 4163585 12D GGAGGGAAGG AAGGCAAGAGAA/------------ AAGGAGGGAA 1342 hom 10 het 18 0 5 15 AAGGCAAGAGAA 1 0 264933 CASAVA_Build 7 4163633 17I AGAAGGAAGG -----------------/AGAGAAGGAAGGAAGGA AGGGAAGGAA 2174 het 278 hom 24 4 9 12 AGAGAAGGAAGGAAGGA 0 1 264934 CASAVA_Build 7 4173583 3I ACAACAACAG ---/CAA CAACAAAAAA 3070 het 1256 hom 29 5 14 10 CAA 2 3 264935 CASAVA_Build 7 4201535 1D GAACACTCTG C/- CCTGGCTGCT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 C 3 2 264936 CASAVA_Build 7 4202816 1I CCCACAGTGC -/T TCTGGGCTCA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 1 2 264937 CASAVA_Build 7 4215811 2D CAGAGCTCCG TC/-- TCTCCGGCAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 TC 3 2 264938 CASAVA_Build 7 4232104 1D AGCAGGCCGC G/- GGACCCGTGT 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 G 3 2 264939 CASAVA_Build 7 4233095 1D TTGTATTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 24 8 T 14 13 264940 CASAVA_Build 7 4237732 1I GCCCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1781 het 697 hom 20 2 8 10 A 12 13 264941 CASAVA_Build 7 4272732 1D GAAATGTTTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 8 7 264942 CASAVA_Build 7 4289531 3D TTGGCCGGGC GTG/--- GTGGTGCGTG 1586 het 325 hom 6 2 4 1 GTG 3 2 264943 CASAVA_Build 7 4293811 1D CATACACGTG T/- GGGGCTATTT 2945 het 2945 ref 20 11 7 2 T 1 0 264944 CASAVA_Build 7 4299906 11I ATATGCACAC -----------/CAGTGTGTGTG AATCTCACAA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 CAGTGTGTGTG 0 1 264945 CASAVA_Build 7 4304706 1I TTCTCCGTCT -/G GTACAAATTC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 1 2 264946 CASAVA_Build 7 4325748 1D TGCCAGAGAC T/- TGGACATCAC 3070 hom 151 het 54 0 51 5 T 2 1 264947 CASAVA_Build 7 4327310 1D TTTCATGTAC T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 46 24 16 8 T 7 6 264948 CASAVA_Build 7 4329716 1I AAGTTATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 11 12 264949 CASAVA_Build 7 4330873 1D CTCTTCCCCC T/- ATCCTCCCCG 3070 het 1405 hom 22 3 13 6 T 1 0 264950 CASAVA_Build 7 4331550 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 14 0 9 5 A 11 10 264951 CASAVA_Build 7 4340791 1D TCCCAGATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 38 het 16 0 14 2 T 10 9 264952 CASAVA_Build 7 4350321 10D TTGGAGTCTC CACTGTTTTT/---------- CACTGTTTTT 3070 het 3070 hom 35 17 17 5 CACTGTTTTT 2 1 264953 CASAVA_Build 7 4362285 1I CATACATAGA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 6 7 264954 CASAVA_Build 7 4366072 1I AGGGAAAAAA -/G AAAAAAGGAA 3070 het 1268 hom 19 4 13 3 G 0 1 264955 CASAVA_Build 7 4369307 2D CTTACTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 10 T 12 10 264956 CASAVA_Build 7 4372014 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 T 8 7 264957 CASAVA_Build 7 4377681 1D AATTAAAACT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 12 13 7 A 9 8 264958 CASAVA_Build 7 4384456 4I ATTTATTTAT ----/TCTC TCTCATGGTT 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 TC 2 4 264959 CASAVA_Build 7 4389521 1D GTAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 39 1 32 7 A 11 10 264960 CASAVA_Build 7 4391500 1I ACTACAAATT -/G TGTGCGATAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 0 1 264961 CASAVA_Build 7 4391728 1I AGGATTCCCA -/C CCAATTTTCT 3070 hom 68 het 27 0 22 5 C 2 3 264962 CASAVA_Build 7 4413392 5D CTATTTTAAT TATTA/----- TATTATATGT 1583 het 1495 hom 8 3 4 2 TATTA 2 1 264963 CASAVA_Build 7 4415668 1D CCAAAAGTCA C/- CCCCCCAAAA 3070 het 1073 hom 18 5 12 1 C 7 6 264964 CASAVA_Build 7 4421135 4D CCATCTCTAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 17 1 11 7 A 18 14 264965 CASAVA_Build 7 4430576 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 27 0 21 6 A 11 10 264966 CASAVA_Build 7 4441201 2D TAAAACACTC TA/-- ATACTAAAAC 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 TA 1 0 264967 CASAVA_Build 7 4449408 2D AGTATACTAT AA/-- ATTATCATTC 3070 hom 66 het 25 0 23 4 A 3 1 264968 CASAVA_Build 7 4452154 8D ACATATGCAT GCATACAC/-------- ACATACATGC 3070 het 3070 ref 76 33 33 12 GCATACAC 1 0 264969 CASAVA_Build 7 4452234 4D ATGTGCACAC ACAT/---- ACATGCACAC 3070 het 3070 hom 64 31 29 8 ACAT 2 1 264970 CASAVA_Build 7 4463762 2D TCTGCAACAG AA/-- AAAAAAAAAA 1650 het 92 hom 13 1 6 7 A 18 16 264971 CASAVA_Build 7 4471284 1D GCTCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 8 7 264972 CASAVA_Build 7 4472506 2D CAAAAAAAAA AT/-- ATATATATGC 2767 het 1544 hom 19 6 8 7 AT 5 4 264973 CASAVA_Build 7 4486961 1D GATCTCATTC T/- TTTTTTATGG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 7 6 264974 CASAVA_Build 7 4490954 3D AGGAAGAGAA AGG/--- AGGGAGAGGG 3050 het 1213 hom 20 4 7 10 AGG 2 1 264975 CASAVA_Build 7 4496601 1I TAAAAACTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 8 9 264976 CASAVA_Build 7 4497378 1D AAACAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2884 hom 28 10 15 3 A 11 10 264977 CASAVA_Build 7 4503994 1D GGTAAAAGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 39 hom 42 2 34 6 A 10 9 264978 CASAVA_Build 7 4526840 1I TCATCTCTGC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 8 9 264979 CASAVA_Build 7 4533070 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1155 het 1155 ref 26 14 3 10 A 15 14 264980 CASAVA_Build 7 4535135 1D AGTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 975 hom 23 4 15 4 A 15 14 264981 CASAVA_Build 7 4538057 1D AGACACGGCT G/- GGTGCGGTGG 1979 hom 26 het 10 0 8 2 G 3 2 264982 CASAVA_Build 7 4538725 1D GACAATGGGG A/- AAAAAAAAAA 1767 het 1767 ref 36 27 4 6 A 12 11 264983 CASAVA_Build 7 4555881 1I AAAAAAAAAA -/C AACTCACCCT 3070 het 453 hom 30 2 20 8 C 0 1 264984 CASAVA_Build 7 4556779 1I AGAACAAAAT -/C CATGTCCCTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 2 264985 CASAVA_Build 7 4565865 1I GTACAGCTAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 415 hom 31 1 19 11 A 7 8 264986 CASAVA_Build 7 4569086 1D AGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 17 0 9 9 T 12 11 264987 CASAVA_Build 7 4571372 20I TCTAGCCTGG --------------------/GCAACAGAGCAAGACTCCGT CACAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 GCAACAGAGCAAGACTCCGT 0 1 264988 CASAVA_Build 7 4576159 1D CTATGGTGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 48 0 39 9 A 10 9 264989 CASAVA_Build 7 4610867 1I AACGAGAGCA -/C CCTGAGGAAG 3070 hom 74 het 28 0 20 8 C 2 3 264990 CASAVA_Build 7 4612003 2I GTTTGTCTGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 275 hom 38 1 30 7 TG 6 7 264991 CASAVA_Build 7 4618301 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1161 het 1025 hom 15 5 3 7 A 15 14 264992 CASAVA_Build 7 4633002 4I AAAAATTAAT ----/TAAC TAATTAATTA 3070 hom 75 het 26 0 25 1 TAAC 0 1 264993 CASAVA_Build 7 4838064 4D ACAAACAAAA AAAG/---- AAGACCTCAC 3070 het 3070 ref 29 12 14 4 AAAG 1 0 264994 CASAVA_Build 7 4872612 1D AAATGAGAAC A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 8 7 264995 CASAVA_Build 7 4884448 2I TGCCCGTCAT --/CC CCCAGCGCTT 2543 het 2543 ref 28 11 8 9 C 3 5 264996 CASAVA_Build 7 4893149 1D GAGATGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 T 13 12 264997 CASAVA_Build 7 4903920 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCACTC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 AG 1 2 264998 CASAVA_Build 7 4948775 1D TCTATACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 14 1 11 2 T 12 11 264999 CASAVA_Build 7 4959633 1D ATTCAGTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 504 hom 31 2 19 10 T 13 12 265000 CASAVA_Build 7 4960576 1I AGAAACTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 9 10 265001 CASAVA_Build 7 4963629 1D CGCGGTGAAA C/- CCCAGTCTCT 3070 hom 36 het 13 0 11 2 C 4 3 265002 CASAVA_Build 7 4974040 2D TATATATACG TA/-- TATATATATA 1045 hom 7 het 3 0 3 0 TA 7 6 265003 CASAVA_Build 7 4981066 1D AACGTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 10 6 T 13 12 265004 CASAVA_Build 7 4982314 1D GTTTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 41 32 4 5 T 13 12 265005 CASAVA_Build 7 4992697 1D TTTTTTTTTT A/- AATCTCCTTG 3070 hom 48 het 20 0 17 4 A 3 2 265006 CASAVA_Build 7 4994435 2I GCAACCCTGC --/CT CTCAGGCTCA 2132 het 2132 ref 49 37 6 6 CT 1 2 265007 CASAVA_Build 7 5094643 16D TCTGTCTCCG AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 23 0 20 6 A 26 10 265008 CASAVA_Build 7 5110376 1D TCCCCCCGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 462 hom 29 1 21 8 A 11 10 265009 CASAVA_Build 7 5114352 1I CAGTGGCTCA -/C GCCTGTAATC 3070 hom 54 het 23 0 18 5 C 0 1 265010 CASAVA_Build 7 5116835 1I ATAACTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1184 hom 20 3 11 6 T 11 12 265011 CASAVA_Build 7 5124726 8D CCTGTAGTCC CAGCTAAG/-------- TGGGAGGCTG 3070 hom 54 het 19 0 17 6 CAGCTAAG 1 0 265012 CASAVA_Build 7 5128385 1D CTTCTTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 29 2 21 6 A 12 11 265013 CASAVA_Build 7 5131753 1D TCGATTTTTG T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 7 6 265014 CASAVA_Build 7 5141676 1D CTGTAATCCC A/- ACACTTTGGG 2438 het 860 hom 14 4 6 4 A 2 1 265015 CASAVA_Build 7 5143532 2I TGCAAACCCC --/CT GAATGCACTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CT 0 1 265016 CASAVA_Build 7 5147590 4D CAGCCTGGCT GGTC/---- TTGATGGTGA 2386 het 2386 ref 14 9 5 2 GGTC 1 0 265017 CASAVA_Build 7 5153972 1D CAGCCCTGAG C/- CCACAGTGTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 3 2 265018 CASAVA_Build 7 5161891 4D ACACCTCAAG ACTC/---- ACTCACTATC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 ACTC 2 1 265019 CASAVA_Build 7 5163177 8D AGCCATCTAC CCATCAGA/-------- CCATCAGGCC 3070 hom 21 het 10 0 8 2 CCATCAGA 1 0 265020 CASAVA_Build 7 5165247 2D CAGCATCTAG CA/-- CAGTTTCCAG 3070 het 3070 ref 27 19 8 0 CA 2 1 265021 CASAVA_Build 7 5183995 1D GAAAAAATCT G/- AGCAGGGACA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 G 1 0 265022 CASAVA_Build 7 5184300 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATCAG 2575 het 445 hom 10 2 7 1 A 6 7 265023 CASAVA_Build 7 5193686 2I AGGCATTCTC --/TT GTTTCCTTCT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 0 2 265024 CASAVA_Build 7 5209947 1I TGATTTTTTT -/G TGTGTGTGTA 3070 het 1374 hom 16 5 9 2 G 0 1 265025 CASAVA_Build 7 5212040 1D GCTGCCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 30 1 15 14 T 14 13 265026 CASAVA_Build 7 5221426 3I CAAGGTCATG ---/TCA TCATTGCACT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 TCA 1 2 265027 CASAVA_Build 7 5225611 1D TAAAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 44 0 36 8 T 11 10 265028 CASAVA_Build 7 5226401 1D TGCTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 27 2 15 10 T 15 14 265029 CASAVA_Build 7 5237222 1D AGACTTTATT A/- AAAAAAAAAA 1513 het 1513 ref 26 15 4 7 A 13 12 265030 CASAVA_Build 7 5238183 5D ATTTGCCTCG CTTCC/----- CTTCCCTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 8 CTTCC 2 1 265031 CASAVA_Build 7 5242665 4I TATTTTTTTG ----/TTCA TTGCCTACTC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TTCA 0 1 265032 CASAVA_Build 7 5243930 1I TCTGATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 43 2 34 7 T 10 11 265033 CASAVA_Build 7 5261077 2D ACTTGGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 14 0 13 1 A 16 14 265034 CASAVA_Build 7 5263279 1I CATGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 3070 het 2691 hom 19 8 9 3 C 4 5 265035 CASAVA_Build 7 5263455 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 7 4 A 13 12 265036 CASAVA_Build 7 5268918 1D GACCCCCTCC A/- CCCCACCACC 308 het 308 ref 22 17 2 4 A 1 0 265037 CASAVA_Build 7 5270072 8D GAGTAAACTT GGGGTACA/-------- GGCAAGGCCC 3070 het 2784 hom 24 10 11 5 GGGGTACA 1 0 265038 CASAVA_Build 7 5277649 1D GCTTGTCTCT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 8 7 265039 CASAVA_Build 7 5291994 1D CACAGTGAGA C/- CCCCATCTCT 2939 het 2939 ref 35 27 7 1 C 5 4 265040 CASAVA_Build 7 5313035 1I AAAGAAACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2254 hom 22 6 14 2 A 11 12 265041 CASAVA_Build 7 5332409 1D ACAGTATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 12 11 265042 CASAVA_Build 7 5335933 6D ACTGGGGACG TAGCTT/------ TAGCTTCAGT 2326 het 2326 ref 26 15 7 6 TAGCTT 2 1 265043 CASAVA_Build 7 5343639 1D AGACTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1072 het 1072 ref 24 17 4 3 A 12 11 265044 CASAVA_Build 7 5346904 1D CATCTCAGAG A/- AAAAAAAAAA 2828 het 1902 hom 21 6 8 7 A 13 12 265045 CASAVA_Build 7 5359216 2I AGCAAGACCC --/CA CAACCTCAGG 2887 het 2887 ref 33 15 8 10 CA 1 2 265046 CASAVA_Build 7 5364973 4D TGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 AAAC 3 2 265047 CASAVA_Build 7 5370016 1D AGAAAGGTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 9 265048 CASAVA_Build 7 5389234 1D TTTTATTTTT A/- TTTTTGTAGA 2353 het 2353 ref 31 14 9 8 A 1 0 265049 CASAVA_Build 7 5397074 2D AACATGACCA AG/-- AGCTTTGCCA 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 AG 2 1 265050 CASAVA_Build 7 5397993 1D ATCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 1809 het 711 hom 16 4 6 6 A 18 17 265051 CASAVA_Build 7 5406220 1I CTCATTTTTA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 2792 hom 26 8 16 2 T 6 7 265052 CASAVA_Build 7 5415321 3D CTTTTTCTTA AAG/--- AAGGGGCACC 3070 hom 71 het 28 0 23 7 AAG 2 1 265053 CASAVA_Build 7 5423134 28D GTAAAACCCT GTCTCTTAAAAAAAAAATTTTTTTTTAA/---------------------------- GTAACAAAAT 3070 hom 45 het 16 0 12 8 GTCTCTTAAAAAAAAAATTTTTTTTTAA 1 0 265054 CASAVA_Build 7 5442701 1I CCATCTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1342 hom 28 3 19 6 A 10 11 265055 CASAVA_Build 7 5459063 2D ATATAGAGAC AG/-- AGTCTTGCTG 2173 het 2173 ref 27 18 5 4 AG 2 1 265056 CASAVA_Build 7 5464232 1I TCACTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 A 12 13 265057 CASAVA_Build 7 5475153 4I GTGTGTGAAT ----/TTAG TGAGAGTGTG 3070 het 3070 ref 47 32 13 2 TTAG 0 1 265058 CASAVA_Build 7 5479800 1I ATGCCTCTTA -/T CCCAGCTACT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 0 1 265059 CASAVA_Build 7 5489913 1D AAAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1931 hom 22 7 12 3 A 10 9 265060 CASAVA_Build 7 5502637 7I ATCCATAGGT -------/GGCTAAA GGCTAAAGGC 1948 het 1755 hom 20 6 5 9 GGCTAAA 1 2 265061 CASAVA_Build 7 5505209 4D GCCCTGGACA CTGT/---- CTGGTGTGGA 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 CTGT 1 0 265062 CASAVA_Build 7 5505487 32D GCCCTGGACC CTCTGAACCGACTGCTCTCTGAAACGACTGCT/-------------------------------- CTCTGAACCG 3051 hom 42 het 22 0 12 12 CTCTGAACCGACTGCTCTCTGAAACGACTGCT 1 0 265063 CASAVA_Build 7 5505889 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1434 het 145 hom 13 1 7 5 A 13 12 265064 CASAVA_Build 7 5509686 1D CATTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 26 1 18 7 T 12 11 265065 CASAVA_Build 7 5610678 1I CTGGCTGGAC -/T TGCAGTGGCG 1722 het 1722 ref 14 5 6 3 T 1 2 265066 CASAVA_Build 7 5629758 1I ACTTAGCCTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 8 9 265067 CASAVA_Build 7 5655544 1D TCTCCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2333 het 2333 ref 43 20 11 12 A 12 11 265068 CASAVA_Build 7 5703243 1I ATTTATCTTC -/A AAAGTCCTGC 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 A 3 4 265069 CASAVA_Build 7 5715903 1D GCCCTCAGGC T/- TTTATTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 24 3 T 4 3 265070 CASAVA_Build 7 5721767 1I TGAATGGGTC -/G TATCGAGGTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 0 1 265071 CASAVA_Build 7 5721894 7D CAACTCATTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2318 het 68 hom 16 2 7 7 T 23 16 265072 CASAVA_Build 7 5725212 3D ATGTTATTAA TAT/--- TATTAAGAAC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TAT 2 1 265073 CASAVA_Build 7 5728527 1I CATTCTCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 17 0 12 5 T 11 12 265074 CASAVA_Build 7 5755307 1D TGCCCATGTA T/- TTTTTTTTTT 2681 het 631 hom 25 4 9 12 T 19 18 265075 CASAVA_Build 7 5757093 1D CGCTTCTTGC T/- TGCACACAGA 3070 hom 163 het 61 0 55 7 T 2 1 265076 CASAVA_Build 7 5762137 2I GTCTATAGAT --/TC TGATATGGTT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 TC 0 1 265077 CASAVA_Build 7 5762270 4D CTCTCGTGAT AGTG/---- AGTGAGTCTT 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 AGTG 2 1 265078 CASAVA_Build 7 5763570 2I CAGCTCTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 65 het 34 0 25 9 TG 7 8 265079 CASAVA_Build 7 5770805 1D ACACCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 13 12 265080 CASAVA_Build 7 5776063 15D GCTTGGTGGC GAGTGCTTGTAGCCA/--------------- GGAGGCTGAG 3070 het 3070 ref 18 11 8 1 GAGTGCTTGTAGCCA 1 0 265081 CASAVA_Build 7 5780349 1I TCTTGGTTTC -/A CCATTTAGTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 265082 CASAVA_Build 7 5780886 1I TCAAGGGGGG -/A AAAAAATCTT 3070 het 2750 hom 31 11 13 7 A 6 7 265083 CASAVA_Build 7 5780917 3D TCCAAGTTAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 540 hom 31 2 22 8 T 13 10 265084 CASAVA_Build 7 5791159 1I ACTTCGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 21 2 12 7 A 15 16 265085 CASAVA_Build 7 5796434 1I ATTCTTTCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 42 het 19 0 14 5 T 7 8 265086 CASAVA_Build 7 5797437 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 44 het 17 0 14 3 T 7 8 265087 CASAVA_Build 7 5803052 2D CGTTGGTATA TG/-- TGGTACCCTG 3070 het 3070 ref 48 28 15 6 TG 2 1 265088 CASAVA_Build 7 5803367 1I GAGGCAGGAG -/A AATCGCTTGA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 2 3 265089 CASAVA_Build 7 5803456 1D ACTCTGTCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 41 het 16 0 14 2 A 10 9 265090 CASAVA_Build 7 5804710 1I CAGCCTGGGC -/A ACAAAGTGAC 3070 hom 36 het 18 0 10 8 A 1 2 265091 CASAVA_Build 7 5805051 4D ATTTTTTTAT AATA/---- AATAGGAAGC 3070 hom 21 het 9 0 8 2 AATA 2 1 265092 CASAVA_Build 7 5805418 1I ATTTTTGTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 9 10 265093 CASAVA_Build 7 5811380 5D ATGGTTTTGA ACTTT/----- ACATTTAGGT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 ACTTT 1 0 265094 CASAVA_Build 7 5817806 8D TCGCAGGGGC CTGATGGT/-------- CTGATGGGTA 1813 het 1813 ref 26 21 4 5 CTGATGGT 1 0 265095 CASAVA_Build 7 5827080 1D GGGATTATAA T/- TTTTTTTTTT 2496 het 1250 hom 25 7 9 9 T 17 16 265096 CASAVA_Build 7 5834306 6D AGGATTTGTT AAAAAC/------ AAACAAAAAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AAAAAC 1 0 265097 CASAVA_Build 7 5835891 10I TTATTTTTAG ----------/CATTTTTTTT CATATATTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 CATTTTTTTT 0 1 265098 CASAVA_Build 7 5837266 28D TGATGCTGAC CTGAGATGGAATTAATATCTGTTTGTTG/---------------------------- CTGAGATGGA 3070 hom 78 het 36 0 27 14 CTGAGATGGAATTAATATCTGTTTGTTG 2 1 265099 CASAVA_Build 7 5855992 2I ACTGAAAAAC --/AG AAAGTCTGTG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 AG 0 1 265100 CASAVA_Build 7 5877051 1I GATGAGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 11 12 265101 CASAVA_Build 7 5888627 1I AAGCGTCAGA -/T ATAACCAATT 3070 het 2777 hom 17 7 9 1 T 0 1 265102 CASAVA_Build 7 5890872 2I GATGCTTATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 20 9 A 13 15 265103 CASAVA_Build 7 5891283 2I ATCTCAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 11 13 265104 CASAVA_Build 7 5896468 1D TGGGGTTGAG T/- GGGATTTATT 3070 het 2840 hom 16 7 7 2 T 1 0 265105 CASAVA_Build 7 5909412 1I TTGAATTTTG -/C CATGTTTCAC 3052 het 3052 ref 25 15 8 2 C 1 2 265106 CASAVA_Build 7 5909711 3I TTACTTTTCT ---/TTG TTGTTTTGTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTG 1 2 265107 CASAVA_Build 7 5913975 13I TCAAGCAAAA -------------/CAGCCTCTTACTC CAGGCGCCAA 3070 hom 30 het 14 0 10 4 CAGCCTCTTACTC 0 1 265108 CASAVA_Build 7 5914098 1D CAAAAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 23 1 21 1 A 13 12 265109 CASAVA_Build 7 5914538 1D ATTGCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 24 13 3 9 T 12 11 265110 CASAVA_Build 7 5915264 1I CCCTTGTGAC -/T TTTTTTTTTT 2090 het 2090 ref 26 9 8 9 T 15 16 265111 CASAVA_Build 7 5917627 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAG 2529 het 2529 ref 22 8 8 6 T 6 7 265112 CASAVA_Build 7 5922656 12D TTTTGTTTTG TTTTTTGTTTTT/------------ TTTTTTTTTG 3070 het 698 hom 19 2 16 2 TTTTTTGTTTTT 1 0 265113 CASAVA_Build 7 5964502 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2390 het 1651 hom 10 5 5 0 A 11 10 265114 CASAVA_Build 7 5999587 3I TGAGGTACAA ---/TGT TGTGTTGCTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TGT 1 2 265115 CASAVA_Build 7 6005794 1I CAAAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 A 10 11 265116 CASAVA_Build 7 6009464 2D AAAAAAAAAG AT/-- ATATATATAT 2688 hom 21 het 10 0 7 3 AT 9 8 265117 CASAVA_Build 7 6010491 2D AAAAAAAATC TG/-- TAACTGGTGG 3070 hom 54 het 19 0 18 2 TG 1 0 265118 CASAVA_Build 7 6016965 1I TGTCTGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 26 2 16 8 T 13 14 265119 CASAVA_Build 7 6020668 1D ACCTGCCCTC A/- AGCCTCCCAA 3070 hom 78 het 28 0 24 4 A 2 1 265120 CASAVA_Build 7 6030534 3I TTTCTGCGGT ---/AGA ACCTTCTAGA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 AGA 0 1 265121 CASAVA_Build 7 6031551 1D ACTCCTGACC T/- CATGATCCGC 3070 het 841 hom 15 3 8 4 T 1 0 265122 CASAVA_Build 7 6032584 1I CCCCAGGAAG -/C TTTCCTACCG 1694 het 1694 ref 24 10 8 6 C 0 1 265123 CASAVA_Build 7 6047380 1D TTGCTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2383 hom 21 7 12 2 A 13 12 265124 CASAVA_Build 7 6048105 2I CAGGAGTTCA --/AC ACACTAGCCT 2356 het 1703 hom 18 4 6 8 AC 2 3 265125 CASAVA_Build 7 6055404 4I CCCATCTTAC ----/TAAG TAAAAACCAT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 TAAG 0 1 265126 CASAVA_Build 7 6058329 1D ACTCCTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1112 hom 26 5 14 7 A 19 18 265127 CASAVA_Build 7 6059999 1I TAGTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 1602 het 1602 ref 13 8 5 0 T 10 11 265128 CASAVA_Build 7 6060365 4I TTTTACAAGC ----/TTTA TTTATTTATT 2190 het 1413 hom 16 5 5 6 TTTA 3 4 265129 CASAVA_Build 7 6071785 1I CAAAGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 926 hom 25 3 11 11 T 11 12 265130 CASAVA_Build 7 6080123 5D AACTACGTCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 315 hom 35 3 14 19 CAAAA 5 4 265131 CASAVA_Build 7 6091444 1I GCCCGACTAA -/T TTTTTTTTTT 2185 het 1382 hom 20 6 8 6 T 13 14 265132 CASAVA_Build 7 6134414 1D CTGGCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 1122 het 1122 ref 20 9 6 5 T 17 16 265133 CASAVA_Build 7 6199534 1D CTCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1641 het 1641 ref 29 19 4 6 A 17 16 265134 CASAVA_Build 7 6227861 1I AAATGAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 A 9 10 265135 CASAVA_Build 7 6240077 2D AGCTGCCTTT TC/-- TCTGTGTCCT 3070 het 3070 hom 42 17 18 9 TC 2 1 265136 CASAVA_Build 7 6259373 2D ACGAAAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 1994 het 1994 ref 37 17 5 15 T 18 16 265137 CASAVA_Build 7 6268172 1I TGGAATCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 8 9 265138 CASAVA_Build 7 6271399 1D AAAGGTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 14 8 A 11 10 265139 CASAVA_Build 7 6275745 8I TACCCTCCAA --------/GTAGAGAC TTAGCTCAAG 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 GTAGAGAC 0 1 265140 CASAVA_Build 7 6277257 4I CTCATGGCTC ----/CAGA CAGACAGCCT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 CAGA 1 2 265141 CASAVA_Build 7 6296028 1D TACATAACTA T/- TTTTTTTTTT 2882 het 1851 hom 18 6 6 6 T 12 11 265142 CASAVA_Build 7 6298714 4D TATAAAACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 2381 hom 34 8 17 9 AC 11 9 265143 CASAVA_Build 7 6303910 1I ACAAGTTGGT -/A AATGTCGTTT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 2 3 265144 CASAVA_Build 7 6307059 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2797 het 2797 ref 17 8 6 3 A 11 10 265145 CASAVA_Build 7 6314519 12D ACTTTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAG 3070 het 2789 hom 19 9 9 5 A 21 9 265146 CASAVA_Build 7 6318589 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 11 10 265147 CASAVA_Build 7 6318665 1I TTGTTTTGGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 17 8 7 2 T 7 8 265148 CASAVA_Build 7 6339325 1D TAAAAAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2342 hom 18 8 9 1 A 13 12 265149 CASAVA_Build 7 6341385 5D TGCCCAGCTA TTTTT/----- TTTTTTTAAA 2438 het 1307 hom 12 5 6 1 T 12 7 265150 CASAVA_Build 7 6341690 3I AGCCTAGCCG ---/TTA TTAATATGTG 2893 het 2893 ref 23 9 10 4 TTA 1 2 265151 CASAVA_Build 7 6353674 2D TGTCTCAGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2185 hom 18 6 10 2 A 12 10 265152 CASAVA_Build 7 6361834 1D TTTTTGTAGA G/- GGGGGGGGTC 3070 het 1582 hom 18 7 9 2 G 9 8 265153 CASAVA_Build 7 6382936 3D CCTCGGCCTG TTT/--- TTTTTTTTTT 2469 het 453 hom 18 4 7 8 T 21 18 265154 CASAVA_Build 7 6386535 2D TTATACATAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 48 20 19 10 TG 9 8 265155 CASAVA_Build 7 6387750 2D GGGGTTTCAC TG/-- TGCTGCCCAG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TG 2 1 265156 CASAVA_Build 7 6392945 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1809 het 1363 hom 19 9 8 2 A 16 15 265157 CASAVA_Build 7 6409869 2D GCCCACGCGG AC/-- ACACGCCTCC 3070 het 3070 ref 27 16 10 3 AC 3 2 265158 CASAVA_Build 7 6418621 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1167 het 1167 ref 35 20 3 12 T 13 12 265159 CASAVA_Build 7 6447423 1D ATTTTTTGTA C/- TTTTTAGTAG 3070 hom 24 het 9 0 8 1 C 1 0 265160 CASAVA_Build 7 6455762 1D TCTACTAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 2121 hom 25 7 15 3 T 3 2 265161 CASAVA_Build 7 6464939 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2071 het 1194 hom 15 7 6 3 A 17 16 265162 CASAVA_Build 7 6468356 4D AAAAAAACTG TAAT/---- TAAATCATCT 3070 hom 111 het 43 0 38 7 TAAT 1 0 265163 CASAVA_Build 7 6471641 2I CCTGGCATAA --/AT ATGTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 AT 1 2 265164 CASAVA_Build 7 6478061 1D TAAGTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 29 1 17 11 T 15 14 265165 CASAVA_Build 7 6482467 3I TGAATCTGCT ---/CTG CTTAGTCTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 CTG 0 1 265166 CASAVA_Build 7 6489162 1I CCCTGCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1124 hom 30 3 12 15 A 13 14 265167 CASAVA_Build 7 6489519 7D CTGGACCCAA GGGCTTG/------- GGTGATGCCC 3070 hom 65 het 25 0 22 4 GGGCTTG 1 0 265168 CASAVA_Build 7 6525066 1D TCAAGCACAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 165 hom 27 1 23 3 T 9 8 265169 CASAVA_Build 7 6539690 1I AATTTTTTAA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 7 8 265170 CASAVA_Build 7 6550445 1I TTTCTTTCTG -/T TTTTTTTTGA 2224 het 2224 ref 20 6 6 8 T 8 9 265171 CASAVA_Build 7 6556205 1I GGAATGCAGT -/G GGTGCAGTCA 3070 het 2754 hom 24 6 14 4 G 2 3 265172 CASAVA_Build 7 6567108 1D TGTCTCTGCT A/- AAAAAAAATA 830 het 830 ref 13 10 2 1 A 9 8 265173 CASAVA_Build 7 6603887 2I GATCTGAAAC --/AG TGTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 52 21 21 10 AG 0 1 265174 CASAVA_Build 7 6612542 4D GGGAGTAGAC AGAG/---- AGCAGGCAGG 3070 het 2641 hom 26 10 11 5 AG 3 1 265175 CASAVA_Build 7 6666523 2I GAGCTATCAC --/AT GTTTGAAAAA 3070 het 3070 ref 19 8 7 4 AT 0 1 265176 CASAVA_Build 7 6671463 1D CAGATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2793 het 2214 hom 24 9 7 8 T 11 10 265177 CASAVA_Build 7 6672295 1D AGCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1423 hom 21 8 9 5 T 15 14 265178 CASAVA_Build 7 6672964 1I CCTCAGCCCC -/T GGTAACATGT 3070 het 3070 ref 41 24 10 7 T 0 1 265179 CASAVA_Build 7 6673717 2D AGCCTGACAC TG/-- TGGTCGAAAG 1835 het 1835 ref 17 10 6 1 TG 2 1 265180 CASAVA_Build 7 6690101 2D CATTGGTTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 17 12 T 13 11 265181 CASAVA_Build 7 6696162 1I TTAAATTACC -/T AAGCAAAGTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 0 1 265182 CASAVA_Build 7 6696388 4I TGAATTACAA ----/AATT AATAAGGATA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AATT 0 1 265183 CASAVA_Build 7 6702468 3D GGACCACTAT AGA/--- AGAAGAAGAG 3070 het 3070 hom 53 22 21 13 AGA 4 3 265184 CASAVA_Build 7 6702686 1D AACAAAGCCT A/- AAGACTTGGC 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 A 3 2 265185 CASAVA_Build 7 6704435 1I ATGTTGTGGG -/C CCTACGGCTG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 C 2 3 265186 CASAVA_Build 7 6726920 1D AGGGAGCACG A/- GGTGACACTC 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 1 0 265187 CASAVA_Build 7 6758744 1D GCACTGTGCT G/- GCGTGGTCTG 2390 het 1516 hom 14 5 5 4 G 2 1 265188 CASAVA_Build 7 6774249 7I TTGGGAGGCT -------/GAGGTGG GAGGATCACT 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 GAGGTGG 0 1 265189 CASAVA_Build 7 6780912 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 223 het 223 ref 16 6 3 9 T 13 12 265190 CASAVA_Build 7 6783210 5I TTTTTGTTTT -----/GTTTC GTTTTGTTTT 1473 het 1473 ref 10 4 4 2 GTTTC 0 1 265191 CASAVA_Build 7 6799998 1I ACTCCATATC -/A AAAAAAAAAA 1705 het 1705 ref 34 19 5 10 A 13 14 265192 CASAVA_Build 7 6802089 1D GCTTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1041 het 1041 ref 17 8 3 6 A 11 10 265193 CASAVA_Build 7 6813710 4D AACAAGAAAC AAAG/---- AGAGAAGACT 3070 het 3070 ref 74 58 12 4 AAAG 1 0 265194 CASAVA_Build 7 6820013 1D TAAAATCCAA T/- TTTTTTGGCC 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 T 7 6 265195 CASAVA_Build 7 6826298 1I AAGTTCAAAC -/A TATCTACTTA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 0 1 265196 CASAVA_Build 7 6828892 2I TGGAATCTCG --/CT CTGTTGCCCA 3070 het 1095 hom 23 5 12 6 CT 1 2 265197 CASAVA_Build 7 6837457 5I AACCAATCTT -----/TTCTC AGTGGATTTA 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 TTCTC 0 1 265198 CASAVA_Build 7 6841641 2D TAGGAGATGA CT/-- CTGCTGTGAG 3070 het 3070 ref 33 22 9 3 CT 2 1 265199 CASAVA_Build 7 6846492 1D CCGTGAGTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 9 8 265200 CASAVA_Build 7 6851152 5D CGGCTCAGTT CAGAA/----- AAGTCTCCAT 3070 het 3070 hom 19 9 8 3 CAGAA 1 0 265201 CASAVA_Build 7 6852878 1D CTGAACACTA T/- TTTTAACAAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 5 4 265202 CASAVA_Build 7 6853834 1I TGGACACGCT -/C CCGGTGATAT 3070 het 2807 hom 28 8 16 4 C 2 3 265203 CASAVA_Build 7 6856401 2D TAAAAACCAG GA/-- GGGGGGAAGA 3070 hom 46 het 20 0 11 9 GA 1 0 265204 CASAVA_Build 7 6859225 1D GAGCGAGGGT G/- GCAATCAGAC 1249 het 1249 ref 30 23 5 2 G 2 1 265205 CASAVA_Build 7 6889384 1I32M2I ATTTCTGAGA -CCCCCAGCACATCCAAGAACAGAAACTGCACA--/CCCCCCAGCACAACAAAGAACAGAAACTCCACAGT CTGCTGAGCG 1269 het 1269 ref 29 37 3 6 N/A 0 0 265206 CASAVA_Build 7 6905442 1D TCTCTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 22 10 4 8 A 12 11 265207 CASAVA_Build 7 6909566 1I GCTCTGAGAA -/G GTCTGAGGCC 1518 het 1518 ref 23 12 4 7 G 1 2 265208 CASAVA_Build 7 6911483 2I CCCTTCCTAG --/TC TCTGTGCCCA 2981 het 2981 ref 23 13 7 3 TC 1 2 265209 CASAVA_Build 7 6911885 1D ATCCAGCCCA G/- TTCCCGGCTT 2010 het 2010 ref 18 12 5 2 G 1 0 265210 CASAVA_Build 7 6917838 2I CAAAAAAACC --/AA AAAAAAAAAG 2900 het 2900 ref 30 15 10 5 A 9 11 265211 CASAVA_Build 7 6926165 1I34M1D TGTCATTGGG -TGACAGGAAAGTTCTAGGCTGGGGACTTTCTGAGC/TTGACAGGAAAGTTCTAGGCTGGGGACTTTCTGAG- CCCCCATGTC 3070 het 3070 ref 47 51 14 9 N/A 0 0 265212 CASAVA_Build 7 6937907 1D GTCATGACGA G/- GGTTCCACTT 663 hom 17 het 18 0 3 16 G 3 2 265213 CASAVA_Build 7 6937933 1I CTGATCCTGG -/C CCTGCCTGGA 2525 hom 19 het 18 0 8 10 C 2 3 265214 CASAVA_Build 7 6939466 1I GAGCTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 2816 het 2816 ref 22 10 8 4 A 9 10 265215 CASAVA_Build 7 6940318 14I TCCCAAGTAG --------------/CTGGGACTACAGGT TTGCGCAACC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 CTGGGACTACAGGT 0 1 265216 CASAVA_Build 7 6941693 1I GAAGCAAAAG -/A AAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 48 31 8 9 A 6 7 265217 CASAVA_Build 7 6943165 1D TTTTATCTTA T/- TTTTTTTGAG 1521 het 1521 ref 25 15 5 5 T 8 7 265218 CASAVA_Build 7 6955544 1D GTCTGTTCTA C/- CTTTCCTGAG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 C 2 1 265219 CASAVA_Build 7 6956566 4I AGAGCTAGAG ----/TAGC TAGCAGGACG 3070 het 2704 hom 34 9 18 7 TAGC 1 2 265220 CASAVA_Build 7 6957337 1D TAAAGACTCA G/- GGTTAAACTC 3070 het 3070 ref 37 22 8 9 G 3 2 265221 CASAVA_Build 7 6957397 7D GTCCCTGACT ATCCTTG/------- ATCATTTTAA 2772 het 2772 ref 40 36 6 4 ATCCTTG 1 0 265222 CASAVA_Build 7 6958497 1I CGGGGATCTA -/G GGGAATGGTA 3059 het 3059 ref 37 29 7 1 G 3 4 265223 CASAVA_Build 7 6959193 2I GCAGGGCTTG --/TC TCGTCTTCTT 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 TC 1 2 265224 CASAVA_Build 7 6960224 21D CAGTACAACT GCAGCTCCTGGCAGCTGTGGC/--------------------- GCAGCTACTC 3070 het 1437 hom 24 6 18 5 GCAGCTCCTGGCAGCTGTGGC 1 0 265225 CASAVA_Build 7 6963236 2I CCATAGGCCT --/CA CACAGTCTCT 2614 het 2614 ref 49 35 7 7 CA 2 3 265226 CASAVA_Build 7 6967279 1I CACAGGCTAA -/G GGAGAAGAAA 1307 het 1307 ref 29 23 4 2 G 2 3 265227 CASAVA_Build 7 6970267 1D37M1I CTAGGATTAC GGGCATGAGCAATCGTGCCCGGCCTTAATTTTGTTTAA-/-AGCATGAGCCATCGTGCCCGGCCTTAATTTTGTTTAAT TTTTTTTCTT 2581 het 2581 ref 24 21 7 4 N/A 0 0 265228 CASAVA_Build 7 6970802 1D CATCTTTTAA C/- CTCAGTTTAA 3070 het 3070 ref 59 40 14 5 C 2 1 265229 CASAVA_Build 7 6975333 2D CTGCTAAATT TG/-- TGTTGATTTG 2410 het 2410 ref 27 18 5 6 TG 2 1 265230 CASAVA_Build 7 6976900 1I ATGATGAGCA -/T TTTTTTGACG 2844 hom 15 het 9 0 6 3 T 6 7 265231 CASAVA_Build 7 6984644 4D AAGTGAAGGA GAGG/---- GAGAGAGATG 3050 het 3050 ref 42 24 13 6 GAGG 1 0 265232 CASAVA_Build 7 6986174 1D ATGGGTAGAT C/- ATTTGAGGTC 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 C 1 0 265233 CASAVA_Build 7 6987746 1D ATCTAAAAAG A/- AAAAAAAATT 1907 het 1907 ref 21 11 4 6 A 9 8 265234 CASAVA_Build 7 6989176 4D GGGAACATAA ATGC/---- TTTTACTATC 3070 hom 39 het 14 0 13 1 ATGC 1 0 265235 CASAVA_Build 7 6990547 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 24 1 17 6 T 11 10 265236 CASAVA_Build 7 6996619 1D TAATTTACAC T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 8 7 265237 CASAVA_Build 7 6996854 1D CTGTGTTGGT G/- GTTTCGTTTT 3070 het 1622 hom 18 5 7 6 G 2 1 265238 CASAVA_Build 7 6999500 3I GACTTTATAA ---/TCC TCTGAGAAAC 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 TCC 0 1 265239 CASAVA_Build 7 7000884 1D TATATAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 913 hom 27 5 13 9 T 12 11 265240 CASAVA_Build 7 7002816 3D GCCCTCTAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1555 hom 30 7 10 16 T 15 12 265241 CASAVA_Build 7 7005249 2D TTCTTCTTGC AG/-- AGAGTCTATA 2868 het 2868 ref 40 33 6 2 AG 3 2 265242 CASAVA_Build 7 7005806 1I CTGAGACTCA -/G GGGGGCATCA 2672 het 2572 hom 19 7 7 5 G 5 6 265243 CASAVA_Build 7 7005884 4D GTAGTGTCTC TCTT/---- TATTTCTCAG 3070 het 3070 hom 23 10 12 4 TCTT 1 0 265244 CASAVA_Build 7 7036193 1D AATACATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 12 11 265245 CASAVA_Build 7 7063412 2D CTAACATCCG GT/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 85 het 32 0 27 5 GT 1 0 265246 CASAVA_Build 7 7063526 3D CCCATATTGC TGG/--- TGGTGGTATT 3070 hom 101 het 42 0 34 11 TGG 3 2 265247 CASAVA_Build 7 7066071 1D TATGACAGGC G/- GGGTGGACAC 3070 hom 82 het 33 0 18 15 G 4 3 265248 CASAVA_Build 7 7067286 4I TTAATATGAA ----/TTGT TTTTTTCTAA 3070 hom 44 het 23 0 15 9 TTGT 0 1 265249 CASAVA_Build 7 7067707 5I AGGGGAGAGC -----/ATAAT ATTACTCTCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ATAAT 0 1 265250 CASAVA_Build 7 7068780 1I GAGGTGTACA -/C CCCCCCCGTG 3070 hom 51 het 23 0 16 7 C 7 8 265251 CASAVA_Build 7 7074697 1I CAATGTCACA -/G GGTGTGTATA 3070 hom 75 het 38 0 26 12 G 2 3 265252 CASAVA_Build 7 7076599 2D CACATAATGT AA/-- ATGACGAGTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 3 1 265253 CASAVA_Build 7 7080657 1D42M3I CCAGTATCGC AGGGGGTGTACACTCTCTGTGATACTCTTTGTAATATCCAAAT---/-GGGGGTGTACACTCTCTGTGATACTCTTTGTAATATCCAAATGAG GAGATGATAT 3070 hom 59 het 47 1 52 4 N/A 0 0 265254 CASAVA_Build 7 7113864 1I TTGCTTAGGG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 37 18 14 5 A 7 8 265255 CASAVA_Build 7 7121248 3D GGAATGCCTG TTT/--- TTCCTAGGTC 3070 het 3070 ref 56 29 22 8 T 5 2 265256 CASAVA_Build 7 7122669 4I AGGTTTTAGA ----/GTAT GTGAGTTGGG 3070 hom 159 het 55 0 53 2 GTAT 0 1 265257 CASAVA_Build 7 7126416 1D TTTGTTCTTA T/- TCTTTATATA 2490 het 2490 ref 12 6 6 1 T 2 1 265258 CASAVA_Build 7 7131955 1I GGAGGGGGGA -/G GGATAGCATT 722 hom 10 het 4 0 4 0 G 2 3 265259 CASAVA_Build 7 7133049 1D GGTATCTGGG A/- CCACCATGTA 3070 het 3070 hom 51 17 26 10 A 1 0 265260 CASAVA_Build 7 7144127 1I TTCATTGACT -/A AAATGATGGG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 3 4 265261 CASAVA_Build 7 7158344 1D CTCTCACCTT G/- GCCTCCCAAA 3070 het 2628 hom 18 6 11 1 G 2 1 265262 CASAVA_Build 7 7177270 2D CTATATACAC AT/-- GTTAGGTCTA 3070 hom 102 het 39 0 35 6 AT 1 0 265263 CASAVA_Build 7 7180744 1D GTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 28 1 24 3 A 11 10 265264 CASAVA_Build 7 7187067 3I ATATCTCTTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 21 0 16 5 A 14 17 265265 CASAVA_Build 7 7222689 1D GGCTGTCACC T/- TTCGGGCAAG 3070 hom 65 het 27 0 18 9 T 3 2 265266 CASAVA_Build 7 7225572 1D GAATGTTGAT A/- ACAGGAAGCT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 A 2 1 265267 CASAVA_Build 7 7227152 4I CTCTCTCTGA ----/AAGT AAGTTTGCAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AAGT 1 2 265268 CASAVA_Build 7 7227356 1I TTTTTTCTTA -/T TTTTCCATCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 4 5 265269 CASAVA_Build 7 7227633 4D TAAATGTGAC TGTT/---- TGTCTTTTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 6 TGTT 1 0 265270 CASAVA_Build 7 7229067 4I TTTTTTTTTG ----/TTTT GTTTTATGCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 4 265271 CASAVA_Build 7 7231197 7I GTTTAGTTAC -------/CACTTAT AAGTGAGAAC 3070 hom 101 het 40 0 31 9 CACTTAT 0 1 265272 CASAVA_Build 7 7232392 2I TATCAAAAAT --/TA TATTTTAATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TA 1 2 265273 CASAVA_Build 7 7232552 1I AATTTCAGGG -/A CTTTATTGTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 0 1 265274 CASAVA_Build 7 7235133 2D78M6D TGTCCTTGGA ATATGATTGAGTAGCATGTTAGTATTCATAGTTGATGGAGCTGGGTTAGCACTTCTTTAACTTCAGATATCCATATGATGATAGAA/--ATGATTGAGTAGCATGTTAGTATTCATAGTTGATGGAGCTGGGTTAGCACTTCTTTAACTTCAGATATCCATATGATG------ ATAGGAATTT 3070 hom 162 het 55 1 77 24 N/A 0 0 265275 CASAVA_Build 7 7247266 2I TACATATATA --/TC TCTCTCTACA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TC 3 4 265276 CASAVA_Build 7 7248367 2D GAAATTTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 44 2 27 16 T 18 16 265277 CASAVA_Build 7 7258171 1D GAAAGGGGCC A/- ATTTAAATCA 3070 hom 108 het 38 0 34 5 A 2 1 265278 CASAVA_Build 7 7272792 1I4M3I AGAACCAAGA -TGAC---/TTGACCAG GACAAGAGTG 3070 het 3070 ref 44 28 10 8 N/A 0 0 265279 CASAVA_Build 7 7275052 1D GCAAAAAGAA T/- TGGCATTTCA 3070 het 3070 hom 35 14 20 2 T 2 1 265280 CASAVA_Build 7 7277014 1D ATTATGCAGG A/- AAAAAAAAAG 1150 het 1150 ref 41 34 3 6 A 10 9 265281 CASAVA_Build 7 7292599 5D TAAACAAGTT CAGTA/----- AAGTAGCAGG 3070 het 3070 hom 46 19 27 1 CAGTA 1 0 265282 CASAVA_Build 7 7310402 1D GCAGAAGTTC A/- ACAACGCGAG 3070 hom 38 het 35 1 32 2 A 2 1 265283 CASAVA_Build 7 7313411 1D TGAGATCAGC T/- TTTTTAGATT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 6 5 265284 CASAVA_Build 7 7317877 1D41M2I TAATTTATCA TTTTTTTTCTTTAATAGATCTTAGTTTTTGTATCCTATCTAA--/-TTTTTTTCTTTAATAGATCTTAGTTTTTGTATCCTATCTAAGC GAAATCTTTG 3070 het 3070 hom 38 21 27 6 N/A 0 0 265285 CASAVA_Build 7 7323095 1D TCCTGAAGTA T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 T 7 6 265286 CASAVA_Build 7 7327848 2I GTCATCTACA --/TT AACACTGATA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 0 2 265287 CASAVA_Build 7 7332194 1I GAGTTCCATC -/A TTTTTTTTCC 3070 hom 134 het 51 0 45 6 A 0 1 265288 CASAVA_Build 7 7333494 3D TTTAGATTAC AAG/--- AAGAATTCAT 3070 hom 132 het 49 0 42 11 AAG 2 1 265289 CASAVA_Build 7 7339769 1D CAAACATTTC T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 8 7 265290 CASAVA_Build 7 7341838 2I GGACATAGAC --/AT GTGTGTGTAC 3070 hom 117 het 46 0 39 7 AT 0 1 265291 CASAVA_Build 7 7354800 3D TAGTTTCTGC TCT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TCT 1 0 265292 CASAVA_Build 7 7363919 2D ATAAAATGAC AG/-- AGTCAATTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 6 AG 2 1 265293 CASAVA_Build 7 7365163 4D GCTACTAGAT ATTA/---- ATTCTTTTGA 3070 hom 83 het 32 0 28 5 ATTA 1 0 265294 CASAVA_Build 7 7365447 1D TTTAAGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 13 12 265295 CASAVA_Build 7 7367267 4I5M4I GACACCTTTG ----CCTGC----/CAAACCTGCTCTT TCTATTATCA 3070 hom 84 het 32 0 28 6 N/A 0 0 265296 CASAVA_Build 7 7367437 4I ATAACGAAAC ----/AAGA AAGAAAGGCA 2920 hom 21 het 17 0 8 9 AAGA 1 2 265297 CASAVA_Build 7 7367929 1I GCAAAGACTT -/G GAACCAACCC 2176 hom 12 het 6 0 5 1 G 1 2 265298 CASAVA_Build 7 7368010 2I ATGCAGCCAT --/AA AAAAACATGA 1916 hom 15 het 6 0 6 0 A 5 7 265299 CASAVA_Build 7 7368407 7I100M4I AATAATTATA -------TTCTTTTGCAAATTTTTCCTTGGATTCCAGCTGTATGCAATTGAATCAGTCATTCACCTGAGTCCTGACACTTGGTTATTTATCCTTGCAAGAGTTTCTC----/TTCTTTTTTCTTTTTCAAATTTTTCCTTGGATTCCAGCTGTATGCAATTGAATCAGTCATTCACCTGAGTCCTGACACTGGGTTATTTATCCTTGCAAGAGTTTCTCTTGT TTATTTGTTT 3070 het 1656 hom 24 5 39 17 N/A 0 0 265300 CASAVA_Build 7 7368770 2I AGAGCAAAGA --/TT TTTTTCCATT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 5 7 265301 CASAVA_Build 7 7373119 8D GTATATACTA TGTGTGTG/-------- TGTGTGCGCG 435 het 435 ref 45 31 7 8 TG 7 3 265302 CASAVA_Build 7 7374546 2I TTGCCTACTG --/TT TTTTTTTTGT 3070 hom 76 het 29 0 26 3 T 8 10 265303 CASAVA_Build 7 7379862 1I TTCTGGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 25 1 18 6 T 11 12 265304 CASAVA_Build 7 7382884 5I AACGGAGAAA -----/ATACT ATACACCAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ATACT 0 1 265305 CASAVA_Build 7 7394773 3D ATTTACACTC CCA/--- CCAACACTGT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CCA 2 1 265306 CASAVA_Build 7 7400134 1D CTGGGGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 21 1 16 5 A 11 10 265307 CASAVA_Build 7 7436304 2D TTTTTTTGAA AT/-- GGAGTTTCGC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 AT 1 0 265308 CASAVA_Build 7 7439123 2I TGGGATAACT --/AC AGTTTCCTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AC 0 1 265309 CASAVA_Build 7 7447681 1I TCAACAAACG -/A AAAAAAAAAA 2474 het 1426 hom 34 7 16 11 A 16 17 265310 CASAVA_Build 7 7466544 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 922 het 922 ref 19 12 3 5 T 11 10 265311 CASAVA_Build 7 7500006 2D GCCCTTAGCA AC/-- ACACACACAC 1841 het 1841 ref 33 22 4 8 AC 9 8 265312 CASAVA_Build 7 7512266 1D GTGTACAAAA G/- GCCAGCAGGA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 G 2 1 265313 CASAVA_Build 7 7528963 14D GCTGAAGAGC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 255 hom 36 4 18 16 A 30 16 265314 CASAVA_Build 7 7529339 1D TTTTTTAAAC G/- GGAGTCTCAC 3070 hom 49 het 21 0 18 3 G 3 2 265315 CASAVA_Build 7 7536163 1D ATCCCCAAGG A/- AAAAAAGGCT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 7 6 265316 CASAVA_Build 7 7547065 16I CTTCAATAAC ----------------/TGACAGCCCATGTTTT TGATCCCTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 5 TGACAGCCCATGTTTT 0 1 265317 CASAVA_Build 7 7590835 1D CACTGCTTTA T/- TTGGAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 17 10 5 T 3 2 265318 CASAVA_Build 7 7593145 5D TTTCTTTCCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 34 8 11 16 T 20 15 265319 CASAVA_Build 7 7606357 1I AAGCAAATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 9 10 265320 CASAVA_Build 7 7607227 1I CAAAGCAGTG -/T TTTAGAGGGA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 3 4 265321 CASAVA_Build 7 7614322 1I ATTTAAAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 9 10 265322 CASAVA_Build 7 7618200 4I CATGCATCTC ----/TCTG TCTGTCTCAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TCTG 1 2 265323 CASAVA_Build 7 7623736 1I AAAAATTGGG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 6 7 265324 CASAVA_Build 7 7627912 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 786 hom 20 3 12 5 A 15 16 265325 CASAVA_Build 7 7638376 1D TGGGAGCCCA C/- CCCCTTACAT 3070 hom 118 het 49 0 39 11 C 5 4 265326 CASAVA_Build 7 7645490 1D ACACAGTTAA T/- TTCTGAATTT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 3 2 265327 CASAVA_Build 7 7648626 2D GTAATAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 668 hom 29 5 14 11 T 14 12 265328 CASAVA_Build 7 7652464 1I TTTGGCTGTG -/T CCCCACTCAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 0 1 265329 CASAVA_Build 7 7655843 1D TTCTTGTTGG T/- GGGGGGGCCC 2539 het 2539 ref 30 15 8 8 T 1 0 265330 CASAVA_Build 7 7667166 1D CTTTTGATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 400 hom 26 1 20 5 T 10 9 265331 CASAVA_Build 7 7669170 1D TTTGAAAAAG C/- CTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 C 2 1 265332 CASAVA_Build 7 7669455 10I TTTGTTTTTC ----------/TTTGTTTTTG TTTCATTTTT 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 TTTGTTTTTG 0 1 265333 CASAVA_Build 7 7669513 4I TTTATGTTAA ----/TGCT TCAATTTAAT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 TGCT 0 1 265334 CASAVA_Build 7 7671159 2I TGATATATAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 13 10 2 AT 6 7 265335 CASAVA_Build 7 7675241 1D GGGAATCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 13 12 265336 CASAVA_Build 7 7679861 1D ACTTCTTTTT C/- CCCCCCTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 C 7 6 265337 CASAVA_Build 7 7684300 1D CTGTTTTTAG T/- TTTTTTGAGG 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 7 6 265338 CASAVA_Build 7 7684417 1D ATTGCTTATC T/- TTTGGATTAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 4 3 265339 CASAVA_Build 7 7686845 1D TATCTTTCCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 9 8 265340 CASAVA_Build 7 7702997 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1316 het 1316 ref 50 40 4 7 T 11 10 265341 CASAVA_Build 7 7715938 1D CCTTTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 11 10 265342 CASAVA_Build 7 7719555 1D ATAGACAGAG T/- TTTTTTTTTT 1310 het 1310 ref 29 21 3 6 T 14 13 265343 CASAVA_Build 7 7725248 1I TTAAGAACTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 7 8 265344 CASAVA_Build 7 7729203 1I CCTCCCCTGA -/G GCAGTTGCCA 2830 hom 35 het 17 0 7 10 G 1 2 265345 CASAVA_Build 7 7749173 2I GTTTGGTCTC --/TA TGTGTATATA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 TA 0 1 265346 CASAVA_Build 7 7749843 19D CATATATGTG TATATGTATATGTATAATA/------------------- TATATTATAC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TATATGTATATGTATAATA 1 0 265347 CASAVA_Build 7 7751715 2D TTGGGAATAA AT/-- ATAAGATGGA 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 AT 2 1 265348 CASAVA_Build 7 7755085 1I TAATTCCCTC -/T TTTTATCCCT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 4 5 265349 CASAVA_Build 7 7764699 2I AAGCTGCCTC --/TG TGCACCTTCA 3070 hom 67 het 24 0 23 1 TG 1 2 265350 CASAVA_Build 7 7773532 2D CCGCCTGCCT CG/-- GTCTCCCAAA 1958 het 363 hom 10 1 5 4 CG 1 0 265351 CASAVA_Build 7 7779097 1I AATTTATTCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 7 8 265352 CASAVA_Build 7 7782211 4I TGTTATACAC ----/TAAT TATACCAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 TAAT 0 1 265353 CASAVA_Build 7 7784593 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3002 het 3002 ref 32 14 9 9 T 10 11 265354 CASAVA_Build 7 7785440 1I AAGAAAAATC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 8 9 265355 CASAVA_Build 7 7788031 1I CCTTGAAAAA -/T ATTAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 1 265356 CASAVA_Build 7 7788341 3I63M1I TTTTAAGAAT ---ACAATAGCTTGGGAATAATTTTTTTAAATACTAATGGAAAATAAACTTTAGGATAAATAAGGG-/ATAACAATAGCTTGGGAATAATTTTTTTAAATACTAATGGAAAATAAACTTTAGGATAAATAAGGGA AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 24 9 14 15 N/A 0 0 265357 CASAVA_Build 7 7795780 1I CCTTCTCCCC -/A TCCCCACAGA 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 A 0 1 265358 CASAVA_Build 7 7806692 1I TGGTGCACCC -/A ATCACCTGAG 3070 het 2003 hom 29 5 19 5 A 1 2 265359 CASAVA_Build 7 7811508 1D TTAGAACCAA T/- TCCCCCTGAG 3070 hom 48 het 32 1 29 2 T 2 1 265360 CASAVA_Build 7 7812400 1I AACAGCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 22 1 14 7 T 13 14 265361 CASAVA_Build 7 7818052 4I AATTAAAAAT ----/ACTC ACGTTGTTAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ACTC 0 1 265362 CASAVA_Build 7 7819759 1I CATTTACATT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 51 31 8 12 A 8 9 265363 CASAVA_Build 7 7820808 5D AGAGTGTACT TTTTA/----- TTTTAATAGG 3070 het 3070 ref 35 25 9 1 TTTTA 2 1 265364 CASAVA_Build 7 7822346 1D CCAAGGTCAC A/- AAAAAAACAG 3070 hom 117 het 43 0 37 7 A 8 7 265365 CASAVA_Build 7 7824783 1D GACCTAAAGA C/- AGAAATACCA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 C 1 0 265366 CASAVA_Build 7 7825467 1I ATTACTTCTC -/A AAAATTTTAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 4 5 265367 CASAVA_Build 7 7826352 23I TACAGGAGAG -----------------------/TATGAGATCTGAGGAAGATATAT TATGAGAATT 3070 hom 108 het 39 0 37 7 TATGAGATCTGAGGAAGATATAT 0 1 265368 CASAVA_Build 7 7835683 1I ATAAATGGAC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 7 8 265369 CASAVA_Build 7 7875394 14I TCACCCCACA --------------/GTCAAGAAGCTGAT GTAATGCAAG 3070 het 3070 ref 44 27 15 2 GTCAAGAAGCTGAT 0 1 265370 CASAVA_Build 7 7878003 1D GAGAATTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 A 12 11 265371 CASAVA_Build 7 7889153 6I AAGAAGAAGA ------/AGGAGG AGGAGGAGGA 3070 het 1914 hom 21 6 9 6 AGG 3 5 265372 CASAVA_Build 7 7894570 1I GAATACCTGA -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 6 7 265373 CASAVA_Build 7 7895656 1D TAAGCAACTC T/- TAAGTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 2 1 265374 CASAVA_Build 7 7901383 2D AAGCAGAAAC TG/-- TGGTTGATTT 3070 het 3070 ref 53 27 19 9 TG 2 1 265375 CASAVA_Build 7 7902792 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 11 12 265376 CASAVA_Build 7 7920662 1D GTATTGTCAC A/- AAAAAGGACC 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 A 6 5 265377 CASAVA_Build 7 7936704 1D GTAAATGAGC T/- TATATGGAGC 3070 het 3070 ref 52 26 19 8 T 2 1 265378 CASAVA_Build 7 7937059 1D ATTTTAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1239 hom 28 3 13 13 A 12 11 265379 CASAVA_Build 7 7940992 2D7M1D TCCTGTTTTG TTTTTTAAGA/--TTTTAAG- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 14 15 9 N/A 0 0 265380 CASAVA_Build 7 7951528 1I TTTTTTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 T 10 11 265381 CASAVA_Build 7 7952083 7I CCTTCCCAAG -------/GGATGAT GCTGTACAGC 3070 het 3070 hom 54 23 24 7 GGATGAT 0 1 265382 CASAVA_Build 7 7955173 1I TAGATGCCAG -/A CCTAAGTCAC 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 A 0 1 265383 CASAVA_Build 7 7957487 14D CTCAGCCTTC TGAGTAGCTGGGAT/-------------- TACAGGCACT 2441 het 2441 ref 14 11 6 2 TGAGTAGCTGGGAT 1 0 265384 CASAVA_Build 7 7959876 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 7 8 265385 CASAVA_Build 7 7966733 1I ACACCAAACC -/T TTTTTTTTTT 2289 het 2289 ref 32 10 9 13 T 13 14 265386 CASAVA_Build 7 7969378 1D TCTCTAATTC A/- ATGCTTTAAG 3070 het 3070 ref 57 26 27 5 A 2 1 265387 CASAVA_Build 7 7970139 1D AACTCTCAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 9 8 265388 CASAVA_Build 7 7977090 1I GTATGTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 48 1 40 7 T 11 12 265389 CASAVA_Build 7 7981968 4D TTTCTGAGAT AGAG/---- AGAGAAATTC 3070 het 3070 hom 50 22 23 7 AG 4 2 265390 CASAVA_Build 7 7983078 1I GTGTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2168 het 2168 ref 37 16 11 10 A 15 16 265391 CASAVA_Build 7 7989368 5I TGACTATAAC -----/AGAGA CATGTAAGAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AGAGA 0 1 265392 CASAVA_Build 7 7991343 1D TAATTTGTTG T/- TTTCGTATAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 4 3 265393 CASAVA_Build 7 7991696 5I GAACTTTAAG -----/TTAAA TTAAAAAAAA 3070 het 2406 hom 31 6 21 4 TTAAA 1 2 265394 CASAVA_Build 7 7992538 1D AGCAGGGGGA G/- GGGGGGGTGG 2851 hom 29 het 14 0 11 3 G 8 7 265395 CASAVA_Build 7 7995413 5D GATGCTATTG GAGCC/----- ACCTTGAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 GAGCC 1 0 265396 CASAVA_Build 7 7999945 1I TTACATCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1979 hom 48 7 31 10 A 11 12 265397 CASAVA_Build 7 8006887 1I AATTATAATA -/G TGATGCATAT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 G 0 1 265398 CASAVA_Build 7 8008429 5D CTATATTCTA TAATT/----- TAATTCAATT 3070 het 3070 hom 28 11 14 6 TAATT 2 1 265399 CASAVA_Build 7 8009478 1I GAGAGTTCTA -/G GCTCAGGAAG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 1 2 265400 CASAVA_Build 7 8014264 2D ATCTACTCTC TT/-- AGCAATTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 T 2 0 265401 CASAVA_Build 7 8017079 1D CCCTACCTCA T/- TTTTTTTTTC 3009 het 3009 ref 27 17 7 3 T 10 9 265402 CASAVA_Build 7 8034882 1D GGTAACCAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 45 27 9 9 A 9 8 265403 CASAVA_Build 7 8035852 4I TAAAACTGAT ----/AAAC AAATTCAGTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AAAC 0 1 265404 CASAVA_Build 7 8043256 5I GTCTTCAGAC -----/TATCT AAAGTCAGTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TATCT 0 1 265405 CASAVA_Build 7 8050101 1D AAGCACTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 636 hom 23 3 11 9 T 17 16 265406 CASAVA_Build 7 8052329 6I ATCAGCTGGG ------/AATTGA AATTGAAAGT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 AATTGA 1 2 265407 CASAVA_Build 7 8071612 2I CAGGAGTGGT --/GA GAGAGGGCAT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 GA 2 3 265408 CASAVA_Build 7 8080395 12D TACACTATTA TAAATACACTAT/------------ TATACAGTGA 3070 hom 75 het 27 0 26 4 TAAATACACTAT 1 0 265409 CASAVA_Build 7 8083794 6I GTTCAGGTGA ------/TTTTAT TTTTATTATT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TTTTAT 1 2 265410 CASAVA_Build 7 8085429 1I GAACAATATG -/T TTCTGTTTTT 3070 hom 89 het 32 0 29 3 T 2 3 265411 CASAVA_Build 7 8089816 3I ATACATAATA ---/ATG ATGATAGAGA 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 ATG 1 2 265412 CASAVA_Build 7 8091892 2I ACCACTGAAA --/CT CTCCCCTCCC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 CT 1 2 265413 CASAVA_Build 7 8103226 4D GAAGGAAAAG AAAC/---- AAACAGAAAG 2622 het 2622 ref 25 13 8 5 AAAC 2 1 265414 CASAVA_Build 7 8109558 1D CTACTTCCTT C/- CTCTGTTGTC 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 C 2 1 265415 CASAVA_Build 7 8116521 4D TCTGCCTATG ACTC/---- GAGTAGCCAT 1378 hom 10 het 12 0 4 9 ACTC 1 0 265416 CASAVA_Build 7 8117451 24D GACATGTGGG AGTGTACAGGAAGAGGGTACAGGA/------------------------ AGTGTACAGG 3070 hom 78 het 28 0 24 9 AGTGTACAGGAAGAGGGTACAGGA 1 0 265417 CASAVA_Build 7 8118832 12D CGTTCCTGTA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTTAC 3070 het 1209 hom 34 6 13 16 TG 9 3 265418 CASAVA_Build 7 8119268 6I CTGTCCCACT ------/CCAGCC CCCACACCCA 3070 hom 54 het 27 0 18 9 CCAGCC 0 1 265419 CASAVA_Build 7 8134805 1I GGATGTCCAG -/A AGCTCAACAA 3070 hom 93 het 33 0 29 4 A 1 2 265420 CASAVA_Build 7 8136126 1D TTTTGTCCTT G/- GCGATAGTTT 1852 hom 12 het 5 0 5 0 G 2 1 265421 CASAVA_Build 7 8141191 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 8 265422 CASAVA_Build 7 8148081 2I ACACATACAC --/CA CACACACACG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 CA 4 5 265423 CASAVA_Build 7 8148656 1D ACAAATCAAG A/- AAAATCCCAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 5 4 265424 CASAVA_Build 7 8152874 2I AGTCAGGCAC --/GT GTGTGTGCGT 2198 het 252 hom 36 2 22 12 GT 3 4 265425 CASAVA_Build 7 8159044 3D CTCCACCACC ACT/--- ACCACCATTA 3070 het 261 hom 75 9 31 35 ACT 1 0 265426 CASAVA_Build 7 8163093 18D GTAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAG/------------------ AAAGAAAGAA 3070 hom 81 het 26 0 25 5 AAAAAAAAAAAAAAAAAG 1 0 265427 CASAVA_Build 7 8171853 1D AATCAATTAT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 8 7 265428 CASAVA_Build 7 8173057 1I TCACTAATCA -/T TAGAGAAATG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 1 2 265429 CASAVA_Build 7 8177382 1I GATATTATTT -/C CTTCCGTATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 265430 CASAVA_Build 7 8177751 3D TTGATTTCTC TAT/--- TGTTTTCTGT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TAT 1 0 265431 CASAVA_Build 7 8177863 5D ATTTATATTA TTGAT/----- TTGAGAACTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTGAT 1 0 265432 CASAVA_Build 7 8191236 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1160 het 1160 ref 21 14 3 4 A 11 10 265433 CASAVA_Build 7 8198856 1D ATTTTCAACA T/- TCTACATTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 1 265434 CASAVA_Build 7 8206590 1I GTGGAAGTTT -/G GGATTTTATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 2 3 265435 CASAVA_Build 7 8209024 4I ATAGACACAC ----/CGCA CGCACGAATG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 CGCA 1 2 265436 CASAVA_Build 7 8209394 1D AACATGCATG T/- AAGTACTAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 0 265437 CASAVA_Build 7 8212889 12D GTTTAAAATG AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 22 5 A 22 10 265438 CASAVA_Build 7 8214565 6D ACCATATTTT AAAATA/------ AAAATAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAATA 3 2 265439 CASAVA_Build 7 8215904 1I AAGGCTCCCT -/G GAGGGTCACG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 1 2 265440 CASAVA_Build 7 8216805 1I CACAGAGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 28 hom 36 3 28 5 A 9 10 265441 CASAVA_Build 7 8217109 1I ATCCTGGGTT -/G GGCGGGACTC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 G 2 3 265442 CASAVA_Build 7 8217698 1I GGAGGAATGA -/G GTGGTTTACA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 2 265443 CASAVA_Build 7 8218663 1I GAGGTTGCAG -/T TGAGCTGAGA 3070 hom 80 het 29 0 26 3 T 1 2 265444 CASAVA_Build 7 8261853 3I GCACTCTCAA ---/CTT ATTCTTCTTT 3070 hom 11 het 37 2 30 5 CTT 0 1 265445 CASAVA_Build 7 8294966 1I TTAAAAAACA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 9 17 7 T 7 8 265446 CASAVA_Build 7 8304249 2I TTTTTCCTTT --/TA TTTTTTATTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TA 0 1 265447 CASAVA_Build 7 8372402 1I CTTTAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 28 0 24 4 T 10 11 265448 CASAVA_Build 7 8389939 1D TTTTTTTTTT C/- TTCTTAAAAG 3070 hom 78 het 29 0 25 4 C 1 0 265449 CASAVA_Build 7 8405988 1D GTACTCATGC A/- AAAAAAAAAA 1296 het 1296 ref 36 20 4 12 A 15 14 265450 CASAVA_Build 7 8414873 3I AACACAAGCT ---/GAA GAAGAACTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 GAA 2 3 265451 CASAVA_Build 7 8415517 1I AAAGCTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 26 0 21 5 T 12 13 265452 CASAVA_Build 7 8453065 1D19M1D AGTAATATTC TTTTTTTTTTTTCTTATAAGA/-TTTTTTTTTTTCTTATAAG- ATGACCACTG 3070 hom 111 het 41 0 37 10 N/A 0 0 265453 CASAVA_Build 7 8460255 1I AGGGTGGAGT -/G GGGGAGGAGA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 4 5 265454 CASAVA_Build 7 8468226 2I ATTTTTTGAG --/AC AGAGTCTCAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AC 0 1 265455 CASAVA_Build 7 8470911 1I GCGTGTAGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 9 10 265456 CASAVA_Build 7 8479893 1I GCTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 T 13 14 265457 CASAVA_Build 7 8482862 1D TAATAAAGAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 8 7 265458 CASAVA_Build 7 8504307 3D CACACGCAAG TTA/--- TTATTATTAC 3070 het 3070 hom 40 19 16 6 TTA 4 3 265459 CASAVA_Build 7 8521745 1D TGCACCAAAA G/- TAGTTTGCTT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 G 1 0 265460 CASAVA_Build 7 8533205 1D GCCCCTTACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 A 10 9 265461 CASAVA_Build 7 8540109 1D GGTGATCAGA G/- GACTAAGCCC 3070 het 3070 ref 54 26 21 9 G 2 1 265462 CASAVA_Build 7 8542849 3D AGGGGCCCAG AGA/--- AGAAGAAGAG 3070 het 3070 hom 45 16 25 5 AGA 4 3 265463 CASAVA_Build 7 8550398 1I TGTGGATAAC -/T TTAGATTCAA 3070 hom 173 het 60 0 58 2 T 2 3 265464 CASAVA_Build 7 8571660 6I AGTTTGACAT ------/ACATTC AAATATAAAG 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 ACATTC 0 1 265465 CASAVA_Build 7 8598982 1I TGAAATAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 14 14 T 15 16 265466 CASAVA_Build 7 8629888 1I TTATTGTCAA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 T 7 8 265467 CASAVA_Build 7 8634526 1D TGCATAGGTG T/- TTTTTTTTTT 2488 het 2488 ref 33 16 8 9 T 15 14 265468 CASAVA_Build 7 8649332 1D ATACACTTTT A/- TAAGTGAAGG 3070 hom 57 het 20 0 20 1 A 1 0 265469 CASAVA_Build 7 8651770 3D TCTCTTTTTA CTT/--- CTTCTAATGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CTT 2 1 265470 CASAVA_Build 7 8653019 1D GTTTCTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 11 10 265471 CASAVA_Build 7 8655146 2D43M1D AAAAATCTGC TTTTTTTTTTTAAGATTGCTATTTTACTCTCCATTACTTTTTTAGT/--TTTTTTTTTAAGATTGCTATTTTACTCTCCATTACTTTTTTAG- TTTTTTTGTA 3070 hom 123 het 36 0 42 10 N/A 0 0 265472 CASAVA_Build 7 8655478 1I ATTTCTTTCC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 7 8 265473 CASAVA_Build 7 8656191 4I TGGAGGTCTG ----/TCTT TATCACTCAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TCTT 0 1 265474 CASAVA_Build 7 8659096 1I20M1D TGATTTTTTT -AATATATTTTGTTAACACAGA/AAATATATTTTGTTGACACAG- AAAATATAGG 3070 hom 63 het 23 0 22 4 N/A 0 0 265475 CASAVA_Build 7 8661724 8D24M2I TGTAAATGCA TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTTA--/--------TGTGTGTGTGTGTGTGTATGTTTATG TGTGTGTGTG 3070 hom 92 het 29 0 30 8 N/A 0 0 265476 CASAVA_Build 7 8662663 3D AGAGTTAATG TTT/--- TTTTTTTTTT 2188 het 24 hom 14 1 5 9 T 18 15 265477 CASAVA_Build 7 8667141 8I AGTGGCTAAC --------/ACCATTAT ACATTGCCTT 3070 hom 96 het 41 0 32 9 ACCATTAT 0 1 265478 CASAVA_Build 7 8668341 6I ATATATATAT ------/ACACAC ATATACACAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AC 0 3 265479 CASAVA_Build 7 8668562 1I CTTAAACTAT -/G GGGGATAAGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 4 5 265480 CASAVA_Build 7 8671235 1I GGGGTCATAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 8 9 265481 CASAVA_Build 7 8671940 1D ATAAAAGGGA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 74 het 31 0 25 6 T 9 8 265482 CASAVA_Build 7 8672209 1D CTTTTGTCTA T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 65 het 25 0 21 4 T 7 6 265483 CASAVA_Build 7 8673526 10D TTTCCCAAAT ATTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 ATTTGTTTTG 1 0 265484 CASAVA_Build 7 8673617 1D TGGTTGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 920 hom 41 3 33 6 T 13 12 265485 CASAVA_Build 7 8674218 10I AAAAATTATT ----------/TTAATCTATG TTAAATTTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TTAATCTATG 0 1 265486 CASAVA_Build 7 8682644 1D GAATTTTCTG T/- TTGTATATTA 3070 hom 81 het 32 0 27 6 T 3 2 265487 CASAVA_Build 7 8683988 1D TGAAACTTAT A/- AAATGACTTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 4 3 265488 CASAVA_Build 7 8691594 1I CTGGATCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 11 12 265489 CASAVA_Build 7 8691977 1I TTAATAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 10 11 265490 CASAVA_Build 7 8695474 2D AGATGAAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 545 hom 39 3 17 19 A 13 11 265491 CASAVA_Build 7 8703143 2D CAAAACCCTG TC/-- TCTACTAAAA 3056 het 2557 hom 15 6 7 2 TC 2 1 265492 CASAVA_Build 7 8704766 1I ACTATACTGA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 T 6 7 265493 CASAVA_Build 7 8705588 3D ATGTTTTATC TCA/--- TCAAGTACCA 3070 het 3070 ref 40 22 15 6 TCA 2 1 265494 CASAVA_Build 7 8708195 2D CCAATTAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2778 hom 22 10 11 1 A 12 10 265495 CASAVA_Build 7 8709708 1D GCAGTACTGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 9 8 265496 CASAVA_Build 7 8725625 1D TGGTATTTTT C/- CTCCATATGT 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 C 2 1 265497 CASAVA_Build 7 8726287 20I AAGGATTGGG --------------------/CTTCCAGGATTGAAACCTGA GAATGCCTCT 3070 hom 99 het 36 0 33 5 CTTCCAGGATTGAAACCTGA 0 1 265498 CASAVA_Build 7 8753020 1I CACAGCATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 T 10 11 265499 CASAVA_Build 7 8760480 4I CAGAACACAG ----/CTAA CTAACTAACA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 CTAA 2 3 265500 CASAVA_Build 7 8766652 1D TATTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 32 3 26 3 T 16 15 265501 CASAVA_Build 7 8769875 2D AACTCTGCAT TA/-- TGTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 TA 1 0 265502 CASAVA_Build 7 8775883 1D AAAGGGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 11 10 265503 CASAVA_Build 7 8780577 1D TTTAGAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 13 12 265504 CASAVA_Build 7 8782319 1I TTTCAAATAA -/T TTTTTGATTG 3070 het 3070 ref 37 22 8 7 T 5 6 265505 CASAVA_Build 7 8782702 1I TCCCCGCTAC -/T ATTGTGTGGC 3070 het 3070 hom 43 12 27 4 T 0 1 265506 CASAVA_Build 7 8791883 4I AACCTAAGTT ----/CTAA CTAACTCTTT 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 CTAA 1 2 265507 CASAVA_Build 7 8802320 4D GCACCTTTCT CTAA/---- CTTTGTATTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 CTAA 1 0 265508 CASAVA_Build 7 8837678 2I TGGTTTGCAG --/GT GTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 GT 1 2 265509 CASAVA_Build 7 8840736 1D CAGACCACCA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 8 7 265510 CASAVA_Build 7 8845669 1D TCCAGAAGAG T/- TTTTTTAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 6 265511 CASAVA_Build 7 8855070 3D CCCAAAATAA TTC/--- TTCTTGCCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 4 TTC 2 1 265512 CASAVA_Build 7 8886984 1I GATTTATGAA -/T TTCAGGGTTT 3070 het 3070 hom 52 20 24 8 T 2 3 265513 CASAVA_Build 7 8887113 2I CATATATTCA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 53 25 15 13 TC 6 7 265514 CASAVA_Build 7 8888717 2I ATCTTTAAAA --/AG AGATAGTTCG 3070 het 3070 hom 33 8 22 3 AG 1 2 265515 CASAVA_Build 7 8897813 10I TTACACTTAA ----------/GTGTGTGATC GTCTGTGATC 3070 het 3070 ref 47 26 18 4 GTGTGTGATC 0 1 265516 CASAVA_Build 7 8915935 1D GCTAATTTTT C/- TATTGAAATA 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 C 1 0 265517 CASAVA_Build 7 8924550 5D AAAGGATGAT ATTTA/----- ATTTAAGGAT 3070 hom 114 het 43 0 39 6 ATTTA 2 1 265518 CASAVA_Build 7 8926671 1I CCCTGGAAAA -/C CCACTGGTGT 3070 hom 122 het 46 0 41 5 C 2 3 265519 CASAVA_Build 7 8928435 2I ACAAACCAAA --/AT ATGTTTTCTG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AT 1 2 265520 CASAVA_Build 7 8929631 1D ATGCAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 21 13 A 18 17 265521 CASAVA_Build 7 8931611 10I13M10D TTATAGATAT ----------ACATTATATGATGTTTGTGTGTA/ATACACACAAACATCATATAATG---------- TATATGTATC 3070 hom 33 het 13 0 12 2 N/A 0 0 265522 CASAVA_Build 7 8935805 1D GGCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 21 9 A 13 12 265523 CASAVA_Build 7 8939402 4D AAATTGACAG TGAT/---- TGATTTTGAG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TGAT 2 1 265524 CASAVA_Build 7 8952911 1I TTCCTTTCTA -/C CCCTGCTCTA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 3 4 265525 CASAVA_Build 7 8965675 1I ACTTAAATTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 T 8 9 265526 CASAVA_Build 7 8966389 2I ATATTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 10 12 265527 CASAVA_Build 7 8974123 1I AGAAAATATG -/T TTTTTGAGTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 5 6 265528 CASAVA_Build 7 8974825 3I AGACATTTTC ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 TAA 3 4 265529 CASAVA_Build 7 8979742 1D CTGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1528 het 1528 ref 18 5 4 10 T 14 13 265530 CASAVA_Build 7 8980076 2I26M2I ATATACACAC --ACATATATATATACACGTATATATAC--/ATATATATATATATACACGTATATATACAT ATATATACAC 1800 het 798 hom 11 3 6 3 N/A 0 0 265531 CASAVA_Build 7 8981378 5D GTATCATTTT TTCTA/----- ATCTAATGCT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TTCTA 1 0 265532 CASAVA_Build 7 8982111 1I TACCTGTTAT -/G GGGGGGGTTC 3070 het 5 hom 29 1 14 14 G 7 8 265533 CASAVA_Build 7 8983776 1I GATTTGTTGG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 7 8 265534 CASAVA_Build 7 8984470 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 11 10 265535 CASAVA_Build 7 8986072 1I GATATATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 9 10 265536 CASAVA_Build 7 8987405 1I AATTATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 A 11 12 265537 CASAVA_Build 7 8987922 1D TTTATATGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 8 7 265538 CASAVA_Build 7 8992344 1D AAACTTTTTA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 8 7 265539 CASAVA_Build 7 8994481 1D AGGTAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 12 11 265540 CASAVA_Build 7 8998343 1D TTATGGAACA C/- TTGTCCCATT 3070 hom 47 het 34 1 29 4 C 1 0 265541 CASAVA_Build 7 9023396 2I CTTGGAAGAA --/CG GGGGGCGGGG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 CG 0 1 265542 CASAVA_Build 7 9024539 1D TGCTGGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 27 1 20 6 T 15 14 265543 CASAVA_Build 7 9027674 9I TAGACAGATT ---------/ATTCTTGTA ATTCTTTAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATTCTTGTA 0 1 265544 CASAVA_Build 7 9032885 2D ATGTACATAT AC/-- ACACACACAC 3024 het 3024 ref 27 15 9 3 AC 6 5 265545 CASAVA_Build 7 9034524 7D ATGATTCATA ACTGGAG/------- ACCAAAATAA 3070 het 3070 ref 47 23 20 6 ACTGGAG 1 0 265546 CASAVA_Build 7 9036890 2D ACTTTCTAAT AC/-- ACATTCTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 AC 2 1 265547 CASAVA_Build 7 9039800 2I TATAAATGTG --/TA TATGTATATC 3070 het 29 hom 40 1 36 3 TA 1 2 265548 CASAVA_Build 7 9041962 3D ATTGTCAGCC ACT/--- ACTATCTTCC 3070 hom 135 het 46 0 45 1 ACT 2 1 265549 CASAVA_Build 7 9045169 1D39M1D ATTTCTCTCC TTTACATTGTATATTGGGTCAATCTCTCAATTCTGAGTAGA/-TTACATTGTATATTGGGTCAATCTCTCAATTCTGAGTAG- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 18 N/A 0 0 265550 CASAVA_Build 7 9062998 3D ATAAGTAGAC TTA/--- TTATGTTGAG 3070 hom 95 het 37 0 32 7 TTA 2 1 265551 CASAVA_Build 7 9067926 3I TTAATTTTTA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 9 12 265552 CASAVA_Build 7 9090245 1I ATTTGCCGCT -/G GCAGCTGCCG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 G 1 2 265553 CASAVA_Build 7 9091901 4D AAAACTATTC TCTA/---- TATTACAGTG 3070 het 3070 ref 44 21 18 8 TCTA 1 0 265554 CASAVA_Build 7 9092178 2I18M2D TTAAAATTGA --TTATGTTAGCATGACATATC/AGATATGTCATGCTAACATA-- TTTAAAGAAA 3070 het 3070 ref 36 20 19 3 N/A 0 0 265555 CASAVA_Build 7 9095147 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2161 hom 15 het 8 0 6 2 A 10 11 265556 CASAVA_Build 7 9095205 1D TAGAATCAAC T/- TTAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 3 2 265557 CASAVA_Build 7 9096414 1I AAAAGTGGCC -/A AGACTCTCTT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 A 1 2 265558 CASAVA_Build 7 9107286 1I ATCATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 A 11 12 265559 CASAVA_Build 7 9109816 1D ATTTAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 11 10 265560 CASAVA_Build 7 9111951 1D CAGTTGTAAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 10 26 3 A 9 8 265561 CASAVA_Build 7 9112310 1I ACTGAAGAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2879 hom 37 12 19 6 A 9 10 265562 CASAVA_Build 7 9115303 7I CTCTTATCCT -------/AAGTAGA AAGACTAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAGTAGA 0 1 265563 CASAVA_Build 7 9116595 2D ATAAAAAAAT AA/-- AAAAAAAACT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 10 8 265564 CASAVA_Build 7 9129568 1I ACATCCAGCA -/T TTTCAGCTAC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 3 4 265565 CASAVA_Build 7 9135528 2D ACAGAATGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 TA 6 5 265566 CASAVA_Build 7 9135895 1I TCTCTTTTTT -/A ATCTTCCACA 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 A 1 2 265567 CASAVA_Build 7 9140948 4D TGCCTTCTCT GATA/---- GATACAGTAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 GATA 2 1 265568 CASAVA_Build 7 9150653 1D ATGGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1316 het 1316 ref 47 33 4 11 T 11 10 265569 CASAVA_Build 7 9154309 3D AAGTGCTATG ATT/--- ATTATGTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 13 5 ATT 2 1 265570 CASAVA_Build 7 9155832 1D TGGATCTCCT G/- GACAATGGGA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 G 2 1 265571 CASAVA_Build 7 9167088 1D TCTAGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 2097 het 2097 ref 32 17 5 10 T 15 14 265572 CASAVA_Build 7 9174910 1I TCGTCCCAGA -/G GGGCACTCAC 3070 hom 58 het 23 0 19 4 G 3 4 265573 CASAVA_Build 7 9175602 1I GAAAAAACAA -/C AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 0 1 265574 CASAVA_Build 7 9178330 1I ACCAATTGCA -/T TTTTTCAGCT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 5 6 265575 CASAVA_Build 7 9179443 1D AATGCCATCC A/- AGGGTCAAGT 3070 het 3070 ref 40 18 12 12 A 2 1 265576 CASAVA_Build 7 9182493 1D AGTTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 11 10 265577 CASAVA_Build 7 9187900 1D CTTTTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 17 9 T 11 10 265578 CASAVA_Build 7 9244371 2D ATATGATTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2901 hom 24 8 15 2 AT 8 7 265579 CASAVA_Build 7 9245962 3D AAGAGTAAAA AAG/--- AAAATTTTAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 4 AAG 1 0 265580 CASAVA_Build 7 9246616 1D TTCCAACATG T/- GGATATTCAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 T 1 0 265581 CASAVA_Build 7 9248372 1D CTCATAACTT G/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 G 1 0 265582 CASAVA_Build 7 9253787 1I ATTTGTGGTG -/T TTTAACTTGC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 3 4 265583 CASAVA_Build 7 9264291 3I TTTAAAAGAC ---/ATT ATCAATAAAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 ATT 0 1 265584 CASAVA_Build 7 9279076 1I GCTTTCAGTG -/A AAAATCAATG 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 A 4 5 265585 CASAVA_Build 7 9282170 4D TCATCAGCTC AGAA/---- AGAAACTTCC 3070 het 3070 hom 54 19 33 6 AGAA 2 1 265586 CASAVA_Build 7 9282626 1D GCCAGAGTGG T/- TCTTGAACTC 3070 het 3070 ref 29 17 9 7 T 2 1 265587 CASAVA_Build 7 9282696 3D CAGGCGTGAG CTA/--- CTACTGCACC 3070 het 3070 hom 23 9 9 6 CTA 2 1 265588 CASAVA_Build 7 9284200 1I CTGTTTGATG -/T TTTACATACC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 3 4 265589 CASAVA_Build 7 9286175 5I TTTTCTAGAC -----/AAGTT AAGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 AAGTT 1 2 265590 CASAVA_Build 7 9291854 10D TATATTTGGC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 het 2611 hom 19 7 9 4 AT 12 7 265591 CASAVA_Build 7 9305065 2D AAATGGCCAA AC/-- ACACAAAATT 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 AC 3 2 265592 CASAVA_Build 7 9305537 1D TACAAAGTTG T/- CTCTTTCAGC 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 1 0 265593 CASAVA_Build 7 9307401 1D TACAATCTGC A/- GCCTTCCAAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 A 1 0 265594 CASAVA_Build 7 9309762 1I TGCAACACTT -/C CGAGCATCAT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 C 1 2 265595 CASAVA_Build 7 9310244 3D GTAGAGAGGC TTA/--- TTATTAACAG 2635 het 2635 ref 31 20 6 5 TTA 3 2 265596 CASAVA_Build 7 9311738 2I TGACCAAGAA --/AG AGAAACTTAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 AG 1 2 265597 CASAVA_Build 7 9314572 1I ATTATGCGTA -/C TCATTAATAC 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 C 0 1 265598 CASAVA_Build 7 9316569 1I GGAAGTGTGC -/A TTGTCCAACC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 0 1 265599 CASAVA_Build 7 9319715 5D GCAGGAAAGA AAGAG/----- AAGAGAATTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 5 AAGAG 2 1 265600 CASAVA_Build 7 9322254 1D AATAATTGAT A/- AAAAATGTAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 6 5 265601 CASAVA_Build 7 9323732 2I GAGTCAAAAC --/AT ATATATATAT 2345 het 2345 ref 24 11 6 7 AT 6 7 265602 CASAVA_Build 7 9329253 17I TCCCAGAAGG -----------------/AGGGCAGCATGCCTTAC AGGGCCATGG 3070 het 3070 ref 43 17 18 8 AGGGCAGCATGCCTTAC 0 1 265603 CASAVA_Build 7 9344254 1D TAATAAATAT G/- TATATATATA 40 het 40 ref 6 2 1 3 G 1 0 265604 CASAVA_Build 7 9347621 1I AGATTTATTA -/T TTTTATTCTT 3067 het 3042 hom 20 8 9 3 T 4 5 265605 CASAVA_Build 7 9349334 1D TAAACATATA T/- TTTTGATATG 3070 het 3070 ref 25 11 8 7 T 5 4 265606 CASAVA_Build 7 9358095 2D ATTATTTGAA TT/-- TTTTTACATA 3070 het 3070 ref 41 22 19 1 T 7 5 265607 CASAVA_Build 7 9359615 4D GTAACATGGC TGTT/---- TATTTCACCT 3070 het 1855 hom 27 7 17 4 TGTT 1 0 265608 CASAVA_Build 7 9371734 1I CTGTATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 A 10 11 265609 CASAVA_Build 7 9377201 1D GTGTACGTCC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 9 8 265610 CASAVA_Build 7 9385842 3D ATTATACTTC AAG/--- AAGAAGCAGA 3070 het 3070 ref 38 21 15 4 AAG 3 2 265611 CASAVA_Build 7 9404422 1I TCTGAGTAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 A 9 10 265612 CASAVA_Build 7 9448849 1D AAATCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2380 hom 47 12 22 13 T 15 14 265613 CASAVA_Build 7 9459722 2D ATTTTCCGAT GG/-- GTATACATCC 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 G 3 1 265614 CASAVA_Build 7 9462907 1D TGGTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 11 8 T 11 10 265615 CASAVA_Build 7 9463387 1D TAAGTCTAGA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 T 8 7 265616 CASAVA_Build 7 9477272 1D GGGTTTGGAG C/- CCCCCCCCCA 2019 hom 32 het 13 0 10 3 C 10 9 265617 CASAVA_Build 7 9481683 1I TGCAATGAAT -/A AAAAGGCAAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 4 5 265618 CASAVA_Build 7 9485532 1I TTTTTAAATG -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 6 7 265619 CASAVA_Build 7 9495235 1D GAGACTTCAT A/- AAAAAATATG 3070 hom 91 het 38 0 31 7 A 7 6 265620 CASAVA_Build 7 9500554 1D CTTTTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 13 10 T 12 11 265621 CASAVA_Build 7 9512314 2I GCCATATGAA --/TT TGTTTCTACA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 3 265622 CASAVA_Build 7 9515268 6D TACATTTGAC AATATT/------ AATCAGATTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AATATT 1 0 265623 CASAVA_Build 7 9518489 2D GTTAGGATGA TG/-- TGTCAGGTAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 TG 2 1 265624 CASAVA_Build 7 9526611 1I ATAAAAGTTT -/A AAAAAGTTTA 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 A 5 6 265625 CASAVA_Build 7 9529145 4D TGTGTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 49 13 24 12 TG 11 9 265626 CASAVA_Build 7 9530136 1I TCCCTCCCCC -/T ATCCCACCCC 2725 het 2725 ref 22 11 7 4 T 0 1 265627 CASAVA_Build 7 9533094 2D TAACCTGTGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1069 hom 21 3 11 7 AT 10 9 265628 CASAVA_Build 7 9537180 1D CTTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1247 het 1247 ref 27 8 3 16 T 17 16 265629 CASAVA_Build 7 9538601 1D GCTTTTAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 10 9 265630 CASAVA_Build 7 9538848 1D TATAATAAGT G/- GGGTAAGGAT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 G 4 3 265631 CASAVA_Build 7 9544539 1D CTGCCTATCA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 30 13 15 3 T 7 6 265632 CASAVA_Build 7 9551430 4D TAGGGTTGAT AAAC/---- AAATCAGTAA 3070 het 3070 ref 24 16 7 2 AAAC 1 0 265633 CASAVA_Build 7 9551514 8D ACTAGCTGAA AAAGAAAT/-------- AAAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 37 24 13 3 AAAGAAAT 1 0 265634 CASAVA_Build 7 9554417 1I AGAGCACAAA -/T TTTTTTAATA 3070 het 2708 hom 26 8 16 2 T 6 7 265635 CASAVA_Build 7 9557519 1I TCTAAAATCC -/T TTTTTTTTTG 2520 het 2520 ref 20 10 6 4 T 9 10 265636 CASAVA_Build 7 9559357 4I CTTATACAAT ----/AAAC AGACAAAATA 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 AAAC 0 1 265637 CASAVA_Build 7 9559564 1I TGACCCATTA -/C ATATATACAC 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 C 0 1 265638 CASAVA_Build 7 9563002 1D ATTTTGAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 10 9 265639 CASAVA_Build 7 9563087 1I ATTTAAAACC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 17 8 8 2 A 8 9 265640 CASAVA_Build 7 9576317 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2558 hom 29 11 8 10 A 15 14 265641 CASAVA_Build 7 9577034 1D AGAGCGAACC A/- AATCATGCTC 3070 het 3070 ref 35 18 13 6 A 3 2 265642 CASAVA_Build 7 9580304 1D AGAGATGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 12 12 T 13 12 265643 CASAVA_Build 7 9583365 1D TTCCTGTAGC G/- GATAATTATG 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 G 2 1 265644 CASAVA_Build 7 9583455 1I TGAGATTTCA -/T TTGTCTATAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 2 3 265645 CASAVA_Build 7 9590721 1I AGATAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 11 12 265646 CASAVA_Build 7 9591755 1D TAGGAAAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 25 0 16 9 A 10 9 265647 CASAVA_Build 7 9592231 7D TGGTACCATC CACCATT/------- CATTCAGGAA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 CACCATT 1 0 265648 CASAVA_Build 7 9593779 9I TTGTCAATGA ---------/TAATGTGAC TAATGTGACT 3070 hom 93 het 40 0 32 9 TAATGTGAC 1 2 265649 CASAVA_Build 7 9593960 2D CCACATATGA TC/-- TCTGTTTCAT 3070 hom 69 het 24 0 23 2 TC 2 1 265650 CASAVA_Build 7 9595215 4I GAGAGAGAGA ----/AAGC AAGCAAGCAA 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 AAGC 2 3 265651 CASAVA_Build 7 9596422 2D ATCAAATTAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 11 9 265652 CASAVA_Build 7 9596636 21D ACCATAATCT CTGGGACACAGCTAAATTTAG/--------------------- CTGGGACACA 3070 hom 78 het 28 0 27 12 CTGGGACACAGCTAAATTTAG 1 0 265653 CASAVA_Build 7 9599478 4D TCCAAATTAA TACT/---- TAATAATCAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TACT 1 0 265654 CASAVA_Build 7 9600234 5D CCTTTTGTAC ATTTT/----- ATTTTAATTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATTTT 2 1 265655 CASAVA_Build 7 9600718 3I TTTTTTTTTT ---/GGG TTTGGTTTAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 0 3 265656 CASAVA_Build 7 9603125 1D GTCCTTCAGA C/- CCCAGAATGG 3070 hom 42 het 43 1 37 5 C 4 3 265657 CASAVA_Build 7 9620710 2D AAAAGAAGAG AT/-- AAACAAGAAT 3070 het 3070 ref 29 19 10 0 AT 1 0 265658 CASAVA_Build 7 9629686 1D AAATATAAGA T/- TAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 6 T 2 1 265659 CASAVA_Build 7 9636512 2I ATATGGACTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 13 15 265660 CASAVA_Build 7 9639473 4I CTTCATAGAC ----/AGAT AGGTAAACTG 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 AGAT 0 1 265661 CASAVA_Build 7 9640411 2D AGCACAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 A 14 12 265662 CASAVA_Build 7 9656779 3I TGTGATTTTT ---/TTG TGTAGAGACA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 TTG 0 1 265663 CASAVA_Build 7 9657938 1D ACAGAACTAG A/- AAAAACTACT 1335 het 1335 ref 21 18 3 1 A 6 5 265664 CASAVA_Build 7 9658490 1D CTGTATTCCC A/- AGCTACTTGG 2107 het 1228 hom 11 4 6 1 A 2 1 265665 CASAVA_Build 7 9660004 1D TGAGAACAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1640 hom 21 4 13 4 T 9 8 265666 CASAVA_Build 7 9667273 2I GCCATAGCTG --/GA GAGAGACTAC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 GA 3 4 265667 CASAVA_Build 7 9667528 4I TTAAATCATA ----/TTGT TTGTTTTCCT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 TTGT 1 2 265668 CASAVA_Build 7 9667749 1D AATTCTATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 T 10 9 265669 CASAVA_Build 7 9671102 1I TTAGATCCAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 T 8 9 265670 CASAVA_Build 7 9674759 1I CAAAAGAGCT -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 7 8 265671 CASAVA_Build 7 9697505 1I CCACAGCGCA -/G CAAAGTGGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 265672 CASAVA_Build 7 9704774 2D GCAACAGCAG AT/-- ATAACCTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 7 AT 2 1 265673 CASAVA_Build 7 9709567 2I TTATGTATAT --/TA TATATATCAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TA 3 4 265674 CASAVA_Build 7 9709729 5D TACATCAAAA TTAAT/----- TTAATCATCT 3070 hom 69 het 24 0 24 2 TTAAT 2 1 265675 CASAVA_Build 7 9720017 1D TCATACCGAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 8 265676 CASAVA_Build 7 9737509 5I TCAAAGAAAA -----/TATAT TAGAAGTCCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TATAT 0 1 265677 CASAVA_Build 7 9749822 1I CCTTTTAACA -/T TTTTTTCATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 7 265678 CASAVA_Build 7 9770934 2I ACATATATAG --/TA TATATATGTA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TA 3 4 265679 CASAVA_Build 7 9771008 20D TATATGCATG TATATGTATATATACATGCA/-------------------- TATATGTATA 3070 hom 22 het 10 0 8 4 TATATGTATATATACATGCA 2 1 265680 CASAVA_Build 7 9773875 1D CTTAACAGAC A/- AAAAAAAAAA 1605 het 1605 ref 29 15 4 10 A 12 11 265681 CASAVA_Build 7 9776941 3I CATGGATTTT ---/AAA AGTACATGAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 4 265682 CASAVA_Build 7 9817181 1D TCAAAAAAAA T/- AAAATAAAAT 657 het 657 ref 28 22 4 2 T 1 0 265683 CASAVA_Build 7 9833736 1I TGAAATTGTC -/T TTTTTTTGTT 2422 het 2422 ref 18 10 5 3 T 7 8 265684 CASAVA_Build 7 9840573 2I TTTATCAATG --/AT AGCTTCTACT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 AT 0 1 265685 CASAVA_Build 7 9846707 25D TTTATACATG TATAAAATATATATAATCATATATA/------------------------- TATCACATAT 3070 het 3070 ref 21 9 13 1 TATAAAATATATATAATCATATATA 1 0 265686 CASAVA_Build 7 9855245 4I TATTAAACTT ----/AGAA AGGGTGTTCA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 AGAA 0 1 265687 CASAVA_Build 7 9860046 1D TATGAAACAA G/- GGTAAGAAGC 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 G 3 2 265688 CASAVA_Build 7 9860338 1I AAGGGAAAGG -/T TATTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 22 14 1 T 1 2 265689 CASAVA_Build 7 9862871 4I41M4I ACTTAAAGAG ----AGGCTTTGTTCTAGATTATGCTTTTGCTTAAGGGAATGTTG----/AGTTAGGCTTTGTTCTAGATTATGCTTTTGCTTACGGGAATGTTGTGGT TGGTTTTGAT 3070 het 3070 ref 36 24 15 9 N/A 0 0 265690 CASAVA_Build 7 9864039 5I AGTTCACTGA -----/TTAAT TTCTTAGTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTAAT 0 1 265691 CASAVA_Build 7 9864134 2D TATGATTCTT TC/-- TCATAGTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 15 7 TC 2 1 265692 CASAVA_Build 7 9864337 1D TGTCTTGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 11 10 265693 CASAVA_Build 7 9893540 2I GATATGTGAC --/AT ATACTATATA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 AT 1 2 265694 CASAVA_Build 7 9895404 1I TAACAACTAC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 A 7 8 265695 CASAVA_Build 7 9895751 10D3M1D AACTTCAGTT CCTGCAAGCCTTGC/----------TTG- CACTGTGGGC 3070 het 3070 ref 36 24 10 8 N/A 0 0 265696 CASAVA_Build 7 9896364 1D CTCCTTGAGG A/- AAAAAAAAAA 1365 het 1365 ref 32 20 4 8 A 13 12 265697 CASAVA_Build 7 9900068 1D ATTAAAAAAG A/- AAAAAAAATT 1147 het 1147 ref 25 9 5 12 A 9 8 265698 CASAVA_Build 7 9904121 1D TGTCAGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 T 11 10 265699 CASAVA_Build 7 9905350 1I GCCAAAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 25 1 20 4 T 10 11 265700 CASAVA_Build 7 9906277 1I ACAGGTATAC -/A AAAAATGCTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 5 6 265701 CASAVA_Build 7 9913953 1I TTGTGGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 T 11 12 265702 CASAVA_Build 7 9915879 1D GTTTCATCAA T/- TTTTTGTATT 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 T 6 5 265703 CASAVA_Build 7 9916633 5D TGAATTGTTC CTTTT/----- ATCTTTAGTG 3070 het 3070 hom 26 11 12 6 CTTTT 1 0 265704 CASAVA_Build 7 9921095 4D TTTTTGTCTT TCTC/---- TCAATGCACA 3070 het 3070 hom 42 15 20 9 TC 3 1 265705 CASAVA_Build 7 9921497 1D GCCAATACTC A/- TGTGCTGTTT 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 A 1 0 265706 CASAVA_Build 7 9922934 4I ACAACATAAA ----/ATTT ATTTTCTTAC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 ATTT 1 2 265707 CASAVA_Build 7 9923272 1D ACTTAATTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 0 265708 CASAVA_Build 7 9924385 1I TAGGAAGCTA -/G GAAGTAGGCT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 G 1 2 265709 CASAVA_Build 7 9924831 1D TTGTGTTTTC T/- AATTTTGTTT 3070 het 3070 hom 42 13 24 8 T 1 0 265710 CASAVA_Build 7 9926418 1I CTATTAAAAC -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 6 7 265711 CASAVA_Build 7 9933676 1D TAAGTTTTCA T/- TTTTTTAATC 3070 het 3070 hom 36 15 18 6 T 7 6 265712 CASAVA_Build 7 9933875 1I ACTCTAATTG -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 6 7 265713 CASAVA_Build 7 9935410 2I TGGGTGAAAC --/TG AGAGTATTCA 3070 het 3070 hom 51 17 28 6 TG 0 1 265714 CASAVA_Build 7 9935861 4I ATCTTCCTTC ----/CTTT GTTTCATCTC 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 CTTT 0 1 265715 CASAVA_Build 7 9958876 1I TCTTTCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 T 10 11 265716 CASAVA_Build 7 9959244 4D TGAATATCAT TTTA/---- TTTGTTTCTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TTTA 1 0 265717 CASAVA_Build 7 9961972 1D TTTTAATGAA T/- CATCTGTTTT 3070 het 3070 hom 49 18 24 8 T 1 0 265718 CASAVA_Build 7 9965813 6I ACAAACAACA ------/ACAACC ACAACAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 ACAACC 0 1 265719 CASAVA_Build 7 9965905 1D TTGATAAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 11 10 265720 CASAVA_Build 7 9969375 1D AGCCCACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 40 1 35 5 A 11 10 265721 CASAVA_Build 7 9973111 1I TTTTCATGGC -/T ATGGATAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 T 0 1 265722 CASAVA_Build 7 9976591 4D TGTAAAAATG AACT/---- AATACGTGAA 3070 het 3070 ref 32 18 13 4 AACT 1 0 265723 CASAVA_Build 7 9998112 1I GTTTCTGTCC -/A AAAAAAAAAA 1606 het 1606 ref 42 24 5 13 A 13 14 265724 CASAVA_Build 7 9999360 1D CCTGTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2454 het 196 hom 20 1 11 8 A 15 14 265725 CASAVA_Build 7 10062498 2I TAATTGAATC --/AT GGGTGCAGTT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 AT 0 1 265726 CASAVA_Build 7 10065004 2D CTCTGTTCAA CT/-- CTCTGTGACA 3070 het 3070 hom 44 21 22 1 CT 3 2 265727 CASAVA_Build 7 10102707 1D TTTTACGATT C/- CCAACTCATC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 C 3 2 265728 CASAVA_Build 7 10103019 5D ACAAAATAAT ATGCA/----- ATGCAGAAAG 3070 het 3070 ref 20 11 8 3 ATGCA 2 1 265729 CASAVA_Build 7 10153858 1D TGTTGGAGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 10 9 265730 CASAVA_Build 7 10155370 2I GTAATGAGGT --/TA TGTTTTCAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TA 0 1 265731 CASAVA_Build 7 10156071 1I ACTTGTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 746 hom 32 2 24 6 T 11 12 265732 CASAVA_Build 7 10160864 1I CCAAAACTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 9 10 265733 CASAVA_Build 7 10179547 1D TAGGTAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 T 12 11 265734 CASAVA_Build 7 10197269 4D ATCAAAGACG CTAT/---- CTATATAAGC 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 CTAT 2 1 265735 CASAVA_Build 7 10200959 1I CTATTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 25 21 10 T 10 11 265736 CASAVA_Build 7 10202971 1D AGAAAGCTTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 9 8 265737 CASAVA_Build 7 10206791 1D TATTAGTTGT A/- GGTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 1 0 265738 CASAVA_Build 7 10207341 1D TGCTAAAACA T/- TTTGTATCTA 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 T 4 3 265739 CASAVA_Build 7 10208933 4I TGACACTTGG ----/GGTA GGTAGGGGGT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 GGTA 1 2 265740 CASAVA_Build 7 10209157 1I TGGGGGAAAT -/G GGGGGGCGTT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 G 6 7 265741 CASAVA_Build 7 10214042 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 11 10 265742 CASAVA_Build 7 10214744 1D AGTGTGAAAA C/- ACTGAGGTCA 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 C 1 0 265743 CASAVA_Build 7 10219514 1I CTTCCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1532 hom 28 6 18 4 A 11 12 265744 CASAVA_Build 7 10226915 1D TATCTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 12 11 265745 CASAVA_Build 7 10229549 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1368 het 1368 ref 28 16 4 8 T 13 12 265746 CASAVA_Build 7 10233954 1I TTTTCTTTTT -/G GGGGGGTGAA 3070 hom 32 het 39 1 34 5 G 6 7 265747 CASAVA_Build 7 10237619 1D GTATGTGGGG T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 8 7 265748 CASAVA_Build 7 10237860 1D TAAACATTCG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1039 hom 20 5 12 3 T 9 8 265749 CASAVA_Build 7 10239260 4D ATGGCATCTG TAAA/---- TAGTGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 TAAA 1 0 265750 CASAVA_Build 7 10243268 1D AAGGGGTAAG C/- CCAATCCCTG 3070 het 3070 ref 22 11 8 4 C 3 2 265751 CASAVA_Build 7 10256300 1I TGGAAAGCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 11 8 5 A 8 9 265752 CASAVA_Build 7 10257163 1I GCAGAGACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 A 10 11 265753 CASAVA_Build 7 10259310 1I AGAAAAAAAA -/C AACCCCATTA 3070 hom 24 het 17 0 14 3 C 0 1 265754 CASAVA_Build 7 10262774 1I GATACAAAAT -/G CCTGTGAAAG 3070 het 3070 ref 52 27 18 7 G 0 1 265755 CASAVA_Build 7 10263164 1I TCTAGATTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2633 hom 22 6 11 5 A 9 10 265756 CASAVA_Build 7 10265343 2I CTTTGCTTCT --/TC TCTTTGGAAA 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 TC 1 2 265757 CASAVA_Build 7 10275520 1I TAGCACAGAA -/G AATTATGGTA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 G 0 1 265758 CASAVA_Build 7 10285895 1D GAGTGAAGGA G/- GAAGTGCTGT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 G 2 1 265759 CASAVA_Build 7 10297114 1I15M2D ATAGTTTTTC -TTTTTTTTTTCTTTCTT/TTTTTTTTTTTCTTTC-- TTTTTTTTTT 1436 het 727 hom 20 7 7 6 N/A 0 0 265760 CASAVA_Build 7 10305468 1D TGCAGTTAGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 9 8 265761 CASAVA_Build 7 10317103 1D ATAACAAATG C/- CCCCAGGATC 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 C 5 4 265762 CASAVA_Build 7 10319307 1I CACAATCAAT -/G GGTGGAACTG 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 G 2 3 265763 CASAVA_Build 7 10322453 1I AGTAGAGAAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 7 8 265764 CASAVA_Build 7 10354872 1D AGGCAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 29 0 17 12 T 13 12 265765 CASAVA_Build 7 10356469 2D3M2D TAAATCAATT TACATGA/--CAT-- GTAAATCTGA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 N/A 0 0 265766 CASAVA_Build 7 10361164 2D TTTAAGGCTA TT/-- AACTCTTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 T 2 0 265767 CASAVA_Build 7 10375303 4I GTTACAAAAC ----/AAAA AGAGGGACAT 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 A 1 5 265768 CASAVA_Build 7 10377551 3D ACTGAACTAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 15 12 A 14 11 265769 CASAVA_Build 7 10391566 8I ACTCCGTGTC --------/AAAAAAAA AAAAAATAAA 3009 het 3009 ref 20 9 9 2 A 6 14 265770 CASAVA_Build 7 10392304 1I ATTTCAAATA -/G CTCTGAGAAA 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 G 0 1 265771 CASAVA_Build 7 10400270 1I AACTGACAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 12 13 265772 CASAVA_Build 7 10401123 2D TTTTCTTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 10 4 T 14 12 265773 CASAVA_Build 7 10413235 1I TAACTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 14 17 4 A 9 10 265774 CASAVA_Build 7 10425036 1I AAAAAAAAAA -/T TAGGAGAGAT 2404 het 2052 hom 27 10 7 10 T 1 2 265775 CASAVA_Build 7 10438131 1I CTTATATTAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 7 8 265776 CASAVA_Build 7 10441291 1I TGCCTAATCA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 7 8 265777 CASAVA_Build 7 10441523 2D AAAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 30 0 23 7 A 12 10 265778 CASAVA_Build 7 10442181 1D GCTAACAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 332 hom 32 1 27 4 T 11 10 265779 CASAVA_Build 7 10443084 4D CCATCTTCAC TCCA/---- TCTATACTCT 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 TCCA 1 0 265780 CASAVA_Build 7 10449971 2D TAACAACAAC AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 819 hom 21 4 11 6 A 10 8 265781 CASAVA_Build 7 10450597 1I CATAACAAAG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 8 265782 CASAVA_Build 7 10451796 1I CAAAACTAAC -/A TTTTTTTTGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 0 1 265783 CASAVA_Build 7 10452074 1I TCAGTAATTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 24 het 18 0 9 9 A 8 9 265784 CASAVA_Build 7 10454581 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAGGAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 7 6 265785 CASAVA_Build 7 10455106 1I12M1I AGAAGCTCCT -AAAAAAAAAGAG-/AAAAAAAAAAGAGC AAAAGTTCTT 3070 het 36 hom 32 1 21 11 N/A 0 0 265786 CASAVA_Build 7 10455434 2D AATGGCAAAC AG/-- ATATTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 AG 1 0 265787 CASAVA_Build 7 10455567 3D TGACAAAGAT GAG/--- GAGTAAAGGA 3070 hom 162 het 61 0 54 7 GAG 2 1 265788 CASAVA_Build 7 10456121 10D ACTGAGGAAA ATGGGAAGAT/---------- ATGGGAAGAT 3070 hom 87 het 30 0 30 3 ATGGGAAGAT 2 1 265789 CASAVA_Build 7 10461011 1D CTGCAACTGA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 8 7 265790 CASAVA_Build 7 10463394 1D ACTTATCAAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 8 7 265791 CASAVA_Build 7 10463476 1D GATACAGGAG A/- CCTCAAAGGA 2297 het 2297 ref 26 17 5 6 A 1 0 265792 CASAVA_Build 7 10466643 2D TCACAGAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 12 10 265793 CASAVA_Build 7 10467112 1D AAGCGCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1642 hom 24 7 13 6 A 13 12 265794 CASAVA_Build 7 10477495 1D AGTTAGATTT A/- AAAAAAAAAA 2728 het 2728 ref 30 15 9 6 A 17 16 265795 CASAVA_Build 7 10485939 1D TGTTCATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 10 9 265796 CASAVA_Build 7 10488304 1D TTTCTCTCTC T/- CTCTCTCTGT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 1 0 265797 CASAVA_Build 7 10494593 6D ATAAATTGCA TTGGTT/------ TCAGTTCTCT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TTGGTT 1 0 265798 CASAVA_Build 7 10496211 1D CAGGCATGAG C/- CCACCATGCC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 C 3 2 265799 CASAVA_Build 7 10499014 2I ATATGGAAAC --/TG TACTACACTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TG 0 1 265800 CASAVA_Build 7 10529795 5D TTAGCATAAA ATAAC/----- ATATTGTACT 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 ATAAC 1 0 265801 CASAVA_Build 7 10542828 2I CCCTACTCTC --/TT GTTTCCTTAT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 T 0 2 265802 CASAVA_Build 7 10550604 1I GGCATTCTGC -/A GGAGGAATCT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 0 1 265803 CASAVA_Build 7 10561525 1I AGGAAAAGAC -/A AAAATCTACG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 4 5 265804 CASAVA_Build 7 10565689 2I GGAGGTAGAG --/AA AGAGATGGGG 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 A 1 3 265805 CASAVA_Build 7 10568305 2I CTGAGGACTC --/TT TTACCCTCAC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 2 4 265806 CASAVA_Build 7 10576378 4D CTACTACAAA TTTG/---- TTTATTTAGT 3070 het 3070 hom 47 21 21 6 TTTG 1 0 265807 CASAVA_Build 7 10578196 1D AAAATAAAAT A/- AAAAAACTAT 3070 het 2475 hom 20 6 13 1 A 7 6 265808 CASAVA_Build 7 10584128 1D4M1D CTCATCTTCT CCAACT/-CAAC- TTTCTTCAAT 3070 het 3070 ref 50 28 21 4 N/A 0 0 265809 CASAVA_Build 7 10591268 1I GAAGATTGCC -/A CTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 0 1 265810 CASAVA_Build 7 10595040 1I ATTTTTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 10 11 265811 CASAVA_Build 7 10607212 2D ATTTTGAAAA AG/-- AGTCTTTGTA 3070 het 3070 ref 50 29 19 3 AG 2 1 265812 CASAVA_Build 7 10607618 5D AATCAATACA ATAAT/----- ATATTTGTTG 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 ATAAT 1 0 265813 CASAVA_Build 7 10619847 2D TGTTAATAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 112 hom 23 2 14 8 A 11 9 265814 CASAVA_Build 7 10620919 2I TGTTTAACAG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 9 11 265815 CASAVA_Build 7 10622979 1I ACTATTATAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 62 28 29 5 A 7 8 265816 CASAVA_Build 7 10623716 2D ATTTCAAAAC AT/-- GTGTATCGAA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 AT 1 0 265817 CASAVA_Build 7 10624223 2D TCTTCATTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 T 13 11 265818 CASAVA_Build 7 10624480 5D GATTGTGAAG GGTCT/----- GGTCTCTAAG 3070 hom 105 het 36 0 33 3 GGTCT 2 1 265819 CASAVA_Build 7 10633008 1D AACAAAAAAG A/- AAAAAGAAGG 1321 het 162 hom 18 2 5 11 A 6 5 265820 CASAVA_Build 7 10639223 1I CTGGGTTGAC -/T TGTTAGACAG 3070 het 3070 hom 57 17 32 8 T 1 2 265821 CASAVA_Build 7 10647087 1D CTTACTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 11 20 14 A 11 10 265822 CASAVA_Build 7 10650829 1I CTAGTAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 9 10 265823 CASAVA_Build 7 10651328 1D AAGTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 11 10 265824 CASAVA_Build 7 10678019 1I TTGGAGGGTC -/A CGTCCAGTTG 3070 het 3070 ref 39 17 10 12 A 0 1 265825 CASAVA_Build 7 10689991 1D TTGCTAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 10 9 265826 CASAVA_Build 7 10707412 3D GAAAAAATGC TCA/--- TCATCACTGG 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 TCA 3 2 265827 CASAVA_Build 7 10739175 1D GTTTCATCAC A/- TTTCTACTTA 3070 het 3070 hom 54 19 29 6 A 1 0 265828 CASAVA_Build 7 10751531 1I CAGAATAGAC -/A AAATAACAAC 3070 het 3070 ref 31 21 9 1 A 3 4 265829 CASAVA_Build 7 10759373 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 8 9 265830 CASAVA_Build 7 10776250 1I ATTATGTCCT -/A AAAATAGAAA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 A 4 5 265831 CASAVA_Build 7 10807181 1I CTATTTCGGG -/T TTTTTTTTTT 1729 het 1729 ref 34 11 8 15 T 15 16 265832 CASAVA_Build 7 10810553 1D CTTTCCCTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 A 10 9 265833 CASAVA_Build 7 10826257 1I CGACAAAGTG -/T TTTATAGTAT 3070 het 3070 ref 47 20 21 6 T 3 4 265834 CASAVA_Build 7 10832443 2I GAGATGGGGG --/AA AAAAATCTGT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 5 7 265835 CASAVA_Build 7 10847329 1I AAATAAAAAA -/C GTCAAGATGC 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 C 0 1 265836 CASAVA_Build 7 10896493 1D GCTAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1947 hom 38 13 13 12 A 15 14 265837 CASAVA_Build 7 10909587 1I GTCCTACAAT -/A ACAGTAATAC 3070 hom 153 het 57 0 50 7 A 1 2 265838 CASAVA_Build 7 10913154 1I GGCACCACCT -/G GTCACCTCTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 1 2 265839 CASAVA_Build 7 10914520 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 9 10 265840 CASAVA_Build 7 10914970 1I CCAGTCCCCT -/G GGCCCCATGT 3070 hom 84 het 34 0 27 7 G 2 3 265841 CASAVA_Build 7 10921145 1I TAAGGAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 46 1 36 10 T 11 12 265842 CASAVA_Build 7 10922591 1I AAAACTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 31 1 21 9 A 12 13 265843 CASAVA_Build 7 10985602 1D TAAAGATATA T/- TTTTTTCAAA 3070 het 2815 hom 20 6 12 3 T 7 6 265844 CASAVA_Build 7 11007761 21I TTGGCAATAT ---------------------/TTTGTTAGATTTATATCTAAG TATTTTATTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 TTTGTTAGATTTATATCTAAG 0 1 265845 CASAVA_Build 7 11008610 3D TTATTTTTGA GAC/--- GGAGTTTTGC 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 GAC 1 0 265846 CASAVA_Build 7 11010504 1D TCTTCCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 11 5 T 15 14 265847 CASAVA_Build 7 11033872 4D GTCTTAAAGA TATT/---- TAAAACATGC 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 TATT 1 0 265848 CASAVA_Build 7 11038700 1D GGCATCTAGA G/- GACCACAAGC 3070 het 3070 hom 31 11 15 7 G 2 1 265849 CASAVA_Build 7 11039613 11D TTCCTTTCAA GGGCATGGTCT/----------- GGGCATTTCA 3070 het 3070 ref 49 23 23 4 GGGCATGGTCT 1 0 265850 CASAVA_Build 7 11040501 1D ATTGTAAATT A/- CTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 36 22 14 0 A 1 0 265851 CASAVA_Build 7 11049130 1I CTATAACAGC -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 T 6 7 265852 CASAVA_Build 7 11052798 1I TTAAAGTTTT -/A TACAGGTATT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 0 1 265853 CASAVA_Build 7 11055047 1D TTGAGTTGTT C/- CGTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 C 2 1 265854 CASAVA_Build 7 11062001 4D TTTTTTAGAT GTTA/---- GTTTAGGAAA 3070 het 3070 ref 46 32 12 2 GTTA 1 0 265855 CASAVA_Build 7 11062553 4D AGACCCATAG TTAT/---- TTCAGTTTAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 TTAT 1 0 265856 CASAVA_Build 7 11064029 1I TCAAGTTCTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 8 9 265857 CASAVA_Build 7 11067065 3I TGTACTTGAT ---/ATC ATGAAGAATT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 ATC 0 1 265858 CASAVA_Build 7 11069206 1I TGATTTAATC -/T TATTTTGGTC 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 T 1 2 265859 CASAVA_Build 7 11078852 4I ACATTGCTAT ----/AAAG AAATACCTGA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AAAG 0 1 265860 CASAVA_Build 7 11090648 1D TACTCTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1104 hom 37 4 23 10 T 15 14 265861 CASAVA_Build 7 11098253 1I CTGTGTATAA -/T ATAATACTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 0 1 265862 CASAVA_Build 7 11098712 1I TGAAGATTCC -/A AATCAGTAGG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 2 3 265863 CASAVA_Build 7 11116824 1I AGTGACAGGT -/A AATTTGTGAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 2 3 265864 CASAVA_Build 7 11118061 1I CTGTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 23 1 21 1 A 10 11 265865 CASAVA_Build 7 11126202 1D ATAATAGTTA T/- TTTTTCCCAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 6 5 265866 CASAVA_Build 7 11130183 40D CTCTCACTGT TTTTCTCCTTACTTTTTCCTTTTCTTTTTTCTAACTCCAC/---------------------------------------- TTTTCTGAAG 3070 het 3070 ref 19 16 11 2 TTTTCTCCTTACTTTTTCCTTTTCTTTTTTCTAACTCCAC 1 0 265867 CASAVA_Build 7 11133397 2I TTGCCCCTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 26 9 T 12 14 265868 CASAVA_Build 7 11148043 4I CACAATTGAA ----/AATT AATACTGCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AATT 0 1 265869 CASAVA_Build 7 11151448 3I TTTTTCTCTC ---/TTA TTTTTTAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTA 0 1 265870 CASAVA_Build 7 11155358 1I CAGTTGTTTT -/A AAAAGATGTA 3070 het 3070 ref 47 21 22 4 A 4 5 265871 CASAVA_Build 7 11155963 1I TTTCAGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 T 9 10 265872 CASAVA_Build 7 11163542 1I ATGGGTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 19 17 13 A 12 13 265873 CASAVA_Build 7 11177441 1I CTGCTTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 T 11 12 265874 CASAVA_Build 7 11178500 1D ACAAACCACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 10 9 265875 CASAVA_Build 7 11179973 1D ACTGGAACTC G/- TCATACATTG 3070 het 3070 hom 20 8 8 5 G 1 0 265876 CASAVA_Build 7 11180977 1D ATGGTCTTTG A/- ATGACCCTTG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 2 1 265877 CASAVA_Build 7 11189308 3I AGCCTATCTC ---/TAT TATTATTATT 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 TAT 4 5 265878 CASAVA_Build 7 11195550 1I AGTGCAGTGG -/C TGGATCTCGG 1731 het 1454 hom 9 3 4 2 C 0 1 265879 CASAVA_Build 7 11198314 1I CCTTTTTTTT -/C CCCTTTTCAC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 C 3 4 265880 CASAVA_Build 7 11202104 1D CCTATGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 11 10 265881 CASAVA_Build 7 11208159 6D CCTCCCAAAC AGGGAG/------ GATGAAACAG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AGGGAG 1 0 265882 CASAVA_Build 7 11217735 2I AAAAAAACAT --/AG AGAATGTCAT 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AG 1 2 265883 CASAVA_Build 7 11218289 1I TGTTGAACTG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 8 9 265884 CASAVA_Build 7 11267513 1D ACAGAAAAAA G/- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 G 1 0 265885 CASAVA_Build 7 11271652 1D AAAATAAGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 T 9 8 265886 CASAVA_Build 7 11271950 1D AATTCAGCGT G/- CATTTCACAC 3070 het 3070 ref 40 24 13 5 G 1 0 265887 CASAVA_Build 7 11278496 1D GAGAGTTTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 48 16 24 9 T 9 8 265888 CASAVA_Build 7 11285648 4D TAAATTATTC TTTG/---- TTTGGTGTTA 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 TTTG 2 1 265889 CASAVA_Build 7 11286603 1D AATTTAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 13 12 265890 CASAVA_Build 7 11293380 16I CTTTACAAAC ----------------/CAGTCTTTACAGAACA CTATTAAATC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 CAGTCTTTACAGAACA 0 1 265891 CASAVA_Build 7 11294262 1D TCCATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 12 11 265892 CASAVA_Build 7 11295223 1D TGCCTCAGTT A/- TTTTCTTCTG 3070 het 3070 ref 48 27 17 6 A 1 0 265893 CASAVA_Build 7 11299520 1D GGCTCCAATT A/- AACTTCAGCT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 3 2 265894 CASAVA_Build 7 11310863 1D CCCATCTGTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 9 8 265895 CASAVA_Build 7 11316679 4D CGGCATCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 1653 het 1653 ref 20 6 7 9 TTTG 5 4 265896 CASAVA_Build 7 11323366 1I TGTTTACCAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 7 8 265897 CASAVA_Build 7 11340885 1I TCAATTCTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 T 9 10 265898 CASAVA_Build 7 11341997 1I GTACTCAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 11 12 13 T 13 14 265899 CASAVA_Build 7 11350694 1D AATTCACTCA T/- TTTTTTGCAT 3070 hom 126 het 45 0 43 3 T 7 6 265900 CASAVA_Build 7 11371869 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 590 hom 29 3 17 9 A 15 14 265901 CASAVA_Build 7 11380116 4D AAGTCTGCTG AGTT/---- AGTTAAATAT 3070 het 3070 hom 49 23 25 2 AGTT 2 1 265902 CASAVA_Build 7 11416409 5I AGATGTAAGA -----/AAGTT AAGTTAAGTT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 AAGTT 2 3 265903 CASAVA_Build 7 11432211 1D15M1I AGAGTATAAT AAAAAAAAAAAACATT-/-AAAAAAAAAAACATTA AAAAAAAAAA 2712 het 547 hom 22 4 19 4 N/A 0 0 265904 CASAVA_Build 7 11440916 1D GAAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 13 12 8 A 10 9 265905 CASAVA_Build 7 11441263 1I GTATGAATGG -/C CTGTGAGGTT 3070 het 2274 hom 24 5 14 5 C 1 2 265906 CASAVA_Build 7 11457860 5D GATAACACTG GCTGA/----- GCTAAGAGGA 3070 het 3070 hom 51 19 29 7 GCTGA 1 0 265907 CASAVA_Build 7 11459479 1D TTCTTTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 13 12 265908 CASAVA_Build 7 11460718 1D TGGTTATCTC T/- TTTTTTTTTT 1374 het 1374 ref 31 24 3 5 T 12 11 265909 CASAVA_Build 7 11474541 1D TATTCAGCTT A/- AAAAAAAAAA 1202 het 1202 ref 36 27 4 5 A 13 12 265910 CASAVA_Build 7 11486022 10I TATGGCTTCC ----------/ATTTAAAATT ATGTTTTACA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 ATTTAAAATT 0 1 265911 CASAVA_Build 7 11487080 2D AAATGTGAAC AA/-- AGAGTCATTT 3070 hom 154 het 54 0 52 2 A 3 1 265912 CASAVA_Build 7 11492752 4D CCAACGCAAC TTGT/---- TTTTCTTCTT 3070 hom 141 het 49 0 48 2 TTGT 1 0 265913 CASAVA_Build 7 11497573 2I GTCCCCTTTC --/TT TCTCTGGACT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 3 265914 CASAVA_Build 7 11513781 1D TTTAACTGCT G/- GAGTTGTTAC 3070 het 3070 ref 40 21 14 6 G 2 1 265915 CASAVA_Build 7 11522263 5D TGTGTGCATC TTTAT/----- TTTAAGTTGT 3070 het 3070 hom 38 13 22 5 TTTAT 1 0 265916 CASAVA_Build 7 11528775 5I ATCACTAATT -----/ATAAA ATAAAAGGTA 1774 het 1774 ref 32 25 6 1 ATAAA 1 2 265917 CASAVA_Build 7 11548094 2I TAGGGTGGGA --/AG ACAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 AG 0 1 265918 CASAVA_Build 7 11555002 1D GAAAATACCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 530 hom 30 3 13 14 A 10 9 265919 CASAVA_Build 7 11565133 1I GAGATGGAAG -/A AAAAAGGAGT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 A 5 6 265920 CASAVA_Build 7 11569350 1I CATCATACTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 8 9 265921 CASAVA_Build 7 11571773 2D TGTGGGGGTT AG/-- AGAGAGAAGA 3070 het 3070 hom 34 11 16 8 AG 4 3 265922 CASAVA_Build 7 11572200 1I AAGGCTCCTT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 7 8 265923 CASAVA_Build 7 11573118 3I GTGGGAGAGT ---/AGG GGGGGGGGGA 3070 hom 44 het 19 0 15 4 AGG 0 1 265924 CASAVA_Build 7 11580401 5I TATTTATTTT -----/ATTTC TTGGTATATA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 ATTTC 0 1 265925 CASAVA_Build 7 11585164 5D CATTTTTTTC TTAAA/----- TTAATTTCCC 3070 het 3070 hom 62 27 32 5 TTAAA 1 0 265926 CASAVA_Build 7 11612813 1D ATTTAATAAT A/- CTTTTTTATA 3070 het 2385 hom 26 6 16 5 A 1 0 265927 CASAVA_Build 7 11615284 1I TTATATTAAT -/C CCTGCTCAAG 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 C 2 3 265928 CASAVA_Build 7 11631858 4D ATTAGGTTAT ACAA/---- ACAAACAATG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 ACAA 3 2 265929 CASAVA_Build 7 11640745 2D AATCAGAGGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 126 het 48 0 41 8 AC 9 8 265930 CASAVA_Build 7 11643694 1I46M1D ACTAAGAAGC -AAAAATCTTCATTTACACACATTCTGCCTTTAAATTTACCAAATTTC/AAAAAATCTTCATTTACACACATTCTGCCTTTAAATTTACCAAATTT- CCCCCCATTT 3070 het 2319 hom 38 6 26 26 N/A 0 0 265931 CASAVA_Build 7 11650201 1D TCCTTTGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2255 hom 36 8 16 12 A 15 14 265932 CASAVA_Build 7 11672587 3I GTGGCATTAT ---/GTC AGCACTCAAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 GTC 0 1 265933 CASAVA_Build 7 11674281 1I AAATCTATTA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 T 7 8 265934 CASAVA_Build 7 11676124 2D GTTGCATTCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 TG 10 9 265935 CASAVA_Build 7 11678520 1D TTACTGCATT A/- AAAAATTGTC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 6 5 265936 CASAVA_Build 7 11689273 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2441 het 2441 ref 22 10 8 5 A 17 16 265937 CASAVA_Build 7 11690550 1D23M1I ATGAGGCATG AAAAAAAAAAAGACATTGAAATAG-/-AAAAAAAAAAGACATTGAAATAGA AAAAAAAAAA 2053 het 2053 ref 40 20 10 18 N/A 0 0 265938 CASAVA_Build 7 11716422 1D ACTTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 16 2 A 11 10 265939 CASAVA_Build 7 11722777 1I TAGACTATAC -/A AGTAGGGGTT 3070 het 3070 hom 39 10 22 7 A 1 2 265940 CASAVA_Build 7 11723244 3D AAAGCTAACA TTT/--- TTTATTAACA 3070 het 3070 hom 53 24 27 4 T 6 3 265941 CASAVA_Build 7 11726118 3D AGATTAGATT TCA/--- TGCTCAAAGA 3070 het 3070 ref 45 22 20 5 TCA 1 0 265942 CASAVA_Build 7 11732699 1D CCAGAATTGA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 T 8 7 265943 CASAVA_Build 7 11738042 4D TCTGCTGATT TTAA/---- TTGTTATCAA 3070 het 3070 hom 54 25 29 2 TTAA 1 0 265944 CASAVA_Build 7 11741716 4I TTATGTATAT ----/GTAA GTATTTCAAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 GTAA 0 1 265945 CASAVA_Build 7 11742686 4D TATAGAACTC AATT/---- AGGCTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 AATT 1 0 265946 CASAVA_Build 7 11749849 1I GACAATACTC -/T TAAGTTGTGT 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 T 1 2 265947 CASAVA_Build 7 11755283 1I GCCCATATGG -/C CTTGCTTATT 3070 hom 120 het 50 0 41 9 C 1 2 265948 CASAVA_Build 7 11756170 1D GTGGCCAGAA T/- TTTTTTTTTT 1792 het 1792 ref 24 14 5 5 T 17 16 265949 CASAVA_Build 7 11768957 4I AAATTATAGA ----/CTAT TGACACAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 CTAT 0 1 265950 CASAVA_Build 7 11784431 11D TCCTATTTCT AAATGATAAAA/----------- AAATGATAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 8 AAATGATAAAA 2 1 265951 CASAVA_Build 7 11793426 1D AATGGACCAC A/- AGACCTAAGC 3070 het 1483 hom 15 4 8 3 A 2 1 265952 CASAVA_Build 7 11795712 1D TTTATTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 T 11 10 265953 CASAVA_Build 7 11799700 1D GGTTAAAATG A/- AAAAAGTCAA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 6 5 265954 CASAVA_Build 7 11802788 2I AGTATTTCAC --/AT GTTTATTACT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AT 0 1 265955 CASAVA_Build 7 11805082 1D TGAACAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2545 hom 26 7 16 3 T 11 10 265956 CASAVA_Build 7 11814306 2D AGAAAGAGAC CA/-- CACACACACA 3070 het 310 hom 40 4 12 25 CA 9 8 265957 CASAVA_Build 7 11821235 1I CCTAAAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 11 12 265958 CASAVA_Build 7 11822887 1I TATTTTAGTG -/A AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 6 7 265959 CASAVA_Build 7 11839162 12I AGTTGTGAGT ------------/CAAACTGAAGGC CAAACTGAGT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 CAAACTGAAGGC 0 1 265960 CASAVA_Build 7 11840875 1D TCCTATCAAT A/- AAACTGATAG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 4 3 265961 CASAVA_Build 7 11841136 1D TGCAAAGCAT A/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 1 0 265962 CASAVA_Build 7 11854477 1D GCATGTTTTC T/- CTGTGTAAAT 3070 het 3070 hom 43 15 25 4 T 1 0 265963 CASAVA_Build 7 11885966 2D TACCTGTGCT TG/-- TGGTGTGTCA 3070 het 3070 ref 49 38 10 2 TG 2 1 265964 CASAVA_Build 7 11895473 2I TTTATGGTTT --/AA AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 8 10 265965 CASAVA_Build 7 11896393 1D GGATCTTTTT A/- ATAGTAAAGA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 2 1 265966 CASAVA_Build 7 11899777 1D GCTAAAAAAA T/- ATTTATGTAC 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 1 0 265967 CASAVA_Build 7 11902784 1D TGTTGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 6 A 12 11 265968 CASAVA_Build 7 11919956 1D TTCAAAATAC A/- AAAAATAATT 1945 het 1945 ref 25 14 6 6 A 6 5 265969 CASAVA_Build 7 11928409 1D AGATTTCACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 A 10 9 265970 CASAVA_Build 7 11929236 1D CTCAGATGTC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 1695 hom 29 6 16 7 T 9 8 265971 CASAVA_Build 7 11930497 1D ATTTCAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 13 11 A 12 11 265972 CASAVA_Build 7 11955071 1D GAGATTTTCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 8 7 265973 CASAVA_Build 7 11973821 1D ACTGCAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 19 11 A 12 11 265974 CASAVA_Build 7 11978417 3D TAGTAAAAGA AAC/--- AACAAAGAAT 2084 het 2084 ref 26 14 6 6 AAC 2 1 265975 CASAVA_Build 7 11979642 3I CAACTACTTC ---/TGA TATTTCTTCT 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 TGA 0 1 265976 CASAVA_Build 7 11980361 1I AACTATTTCA -/T GTACACAATT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 0 1 265977 CASAVA_Build 7 11980601 14I TAGTTTGACA --------------/TTTCAATATCTCAT TTTCAATATT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 TTTCAATATCTCAT 0 1 265978 CASAVA_Build 7 11983328 1D GTCAGATGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 9 8 265979 CASAVA_Build 7 11983413 26D GAATTAAATA TCAGGTATTGGAATTAACTCCAATAT/-------------------------- TCAGGTATTG 3070 het 3070 hom 37 22 18 7 TCAGGTATTGGAATTAACTCCAATAT 2 1 265980 CASAVA_Build 7 11985443 1D AAATTAATAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 A 8 7 265981 CASAVA_Build 7 11985565 1I CTAGGCTAAG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 7 8 265982 CASAVA_Build 7 11987455 1D AAGGCATCCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 10 9 265983 CASAVA_Build 7 11992137 1I AAAAGACACC -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 53 27 22 4 A 6 7 265984 CASAVA_Build 7 12001957 1D TTTTAGAATC A/- GGGGGCACAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 A 1 0 265985 CASAVA_Build 7 12002508 8D TTGAGAGATC TCCAAACT/-------- TCCAAACTGC 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 TCCAAACT 2 1 265986 CASAVA_Build 7 12003200 1I TCCCCATTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 9 10 265987 CASAVA_Build 7 12003736 3D CAGCTTTTTG GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 GTT 5 4 265988 CASAVA_Build 7 12004340 2I TGCCCAATTG --/CT CTCTGGCTAG 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 CT 2 3 265989 CASAVA_Build 7 12005112 1I TTAGTTAATA -/T TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 T 6 7 265990 CASAVA_Build 7 12006096 2I AAGAACTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 12 14 265991 CASAVA_Build 7 12017982 5I ATTTTTATTG -----/TATTT TATTGTATTT 3070 het 1694 hom 24 9 12 3 TATTT 0 1 265992 CASAVA_Build 7 12020323 1I TGTAAAAGAT -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 ref 50 29 19 2 A 6 7 265993 CASAVA_Build 7 12021913 1I TCAGAATCAC -/T ATACAATTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 1 265994 CASAVA_Build 7 12028186 1D AATTAACAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 A 8 7 265995 CASAVA_Build 7 12030408 1D GATATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2630 het 367 hom 24 1 7 16 A 17 16 265996 CASAVA_Build 7 12032456 1D TCCAAAAGGG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 7 6 265997 CASAVA_Build 7 12036937 17D ATATAGATGC TAAAGTATATATCTATA/----------------- TAAAGTATAA 3070 het 3070 hom 23 12 10 6 TAAAGTATATATCTATA 1 0 265998 CASAVA_Build 7 12043458 1I ATTCCAAAAA -/C CTTTTAACAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 265999 CASAVA_Build 7 12043551 3I TGGCACTATA ---/TGT TGTTATATGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TGT 1 2 266000 CASAVA_Build 7 12044860 13D TCTATTTTTA TTCAAATATTGTT/------------- TTTCAGATTT 3070 het 3070 ref 39 27 11 5 TTCAAATATTGTT 1 0 266001 CASAVA_Build 7 12052688 1D CAAGTCAATG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 8 7 266002 CASAVA_Build 7 12060968 1I TTATAAGTGA -/G AACATGAAAG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 G 0 1 266003 CASAVA_Build 7 12072457 1I AACTAGGGAC -/A AAGAGACGTA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 2 3 266004 CASAVA_Build 7 12076724 1I CAGACAAGTG -/A AAAAATAGGG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 5 6 266005 CASAVA_Build 7 12081013 1I AAGACATGTT -/A AAAAAGGTTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 5 6 266006 CASAVA_Build 7 12084259 1I TGGGGATTTA -/G GGTTGCTTTG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 G 2 3 266007 CASAVA_Build 7 12084638 2D TTAAAAACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 T 12 10 266008 CASAVA_Build 7 12085066 4I AACTATTAGG ----/TACA TACAAGGCAG 3070 het 3070 hom 55 23 24 8 TACA 1 2 266009 CASAVA_Build 7 12091979 21D CAAAGACCAG AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/--------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1371 hom 21 6 9 8 A 34 13 266010 CASAVA_Build 7 12102503 3D TTTCAATAAA CAC/--- CACATTAGAA 3070 het 3070 hom 22 10 9 4 CAC 2 1 266011 CASAVA_Build 7 12139612 1I ATGACTTCTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 441 hom 24 1 21 2 A 9 10 266012 CASAVA_Build 7 12191922 1D TCATGACGAA C/- AAAAATATCT 3070 hom 57 het 25 0 19 7 C 1 0 266013 CASAVA_Build 7 12192665 2I AAATTAACAC --/AT CTTTCCCTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 0 1 266014 CASAVA_Build 7 12199492 1D CATTGACAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 10 9 266015 CASAVA_Build 7 12200374 2D CAAACATGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 25 0 17 9 A 17 15 266016 CASAVA_Build 7 12205074 2I ACACTCTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 42 0 31 11 A 10 12 266017 CASAVA_Build 7 12207640 1D TTGTTTGCAC A/- AAAAAAGTTC 3070 hom 69 het 27 0 23 7 A 7 6 266018 CASAVA_Build 7 12209816 2D ATATATATAT AA/-- AAATATGTAT 1046 hom 12 het 6 0 5 1 A 5 3 266019 CASAVA_Build 7 12211865 1I CCATCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 210 hom 35 1 27 7 A 12 13 266020 CASAVA_Build 7 12213835 1D AAAAATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 27 8 A 13 12 266021 CASAVA_Build 7 12219428 2I ATAATTTTAA --/CT CTGTCAACTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CT 1 2 266022 CASAVA_Build 7 12222532 1D ATTAAAATTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 10 9 266023 CASAVA_Build 7 12223178 2D AGGAGAGGGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 59 hom 34 2 19 14 T 11 9 266024 CASAVA_Build 7 12225191 1I TGCATGCTCT -/A AGCTTGGAGA 3070 hom 151 het 56 0 51 5 A 1 2 266025 CASAVA_Build 7 12229494 1D GGTTGTGTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 9 8 266026 CASAVA_Build 7 12229709 1D GGCAAAACTT A/- ACATGTGAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 1 266027 CASAVA_Build 7 12230787 1I AAAATAAACT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 266028 CASAVA_Build 7 12232126 1D TCTTCTAGGG T/- TTTTATGGTT 2605 het 2605 ref 15 9 6 0 T 5 4 266029 CASAVA_Build 7 12232293 1I CCTTTCCCCA -/T TTCTTGTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 2 3 266030 CASAVA_Build 7 12232846 1I AATTACAGAG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 6 7 266031 CASAVA_Build 7 12233077 1D TACACTGTTT A/- AAACATTGGC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 4 3 266032 CASAVA_Build 7 12234608 4D ATTATCTGAC TTAA/---- TTGATTCTTT 3070 hom 45 het 23 0 16 11 TTAA 1 0 266033 CASAVA_Build 7 12235786 4I CATATTTGTA ----/TGTT TATTTTTAGC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TGTT 0 1 266034 CASAVA_Build 7 12237091 1I GTATAGAAAA -/T TTCTCAACCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 2 3 266035 CASAVA_Build 7 12239388 3I CATTTTTCAT ---/TTG TTTTTTTTTT 2660 hom 36 het 30 0 14 16 TTG 0 1 266036 CASAVA_Build 7 12240939 1I ACATTGGCCC -/T TTTTTAGAGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 5 6 266037 CASAVA_Build 7 12242150 5I TCTTAGACTA -----/TTTTC TTTTAGGGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTTTC 0 1 266038 CASAVA_Build 7 12243275 3I AAACATGCTT ---/ATG ATAATAGCAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 ATG 0 1 266039 CASAVA_Build 7 12243521 5D ACCTGAACTC TACTT/----- TAGCATTATC 3070 het 3070 ref 36 17 14 8 TACTT 1 0 266040 CASAVA_Build 7 12246210 1I TTTTTTACTG -/A AAAAAGCCCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 6 266041 CASAVA_Build 7 12250956 1I GCATGATTTT -/A AGGTGCTGGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 266042 CASAVA_Build 7 12253273 3I TCAAATGACC ---/AAG AAGGTTACAT 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 AAG 1 2 266043 CASAVA_Build 7 12254178 1I CATCTCTACT -/A AAAAAATACA 3070 het 571 hom 14 2 10 2 A 6 7 266044 CASAVA_Build 7 12254525 1I GGATGTGGGG -/C CCTTGGCGGG 3070 hom 57 het 23 0 18 5 C 2 3 266045 CASAVA_Build 7 12258742 5D GAAATAACTA AGATC/----- AGAGCAGAAC 2806 het 2806 ref 14 6 6 2 AGATC 1 0 266046 CASAVA_Build 7 12267941 1I TTGGGTGGGG -/T GGGGGGAGGG 3059 het 113 hom 16 2 8 6 T 0 1 266047 CASAVA_Build 7 12271069 1I CCATGTCCTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 A 8 9 266048 CASAVA_Build 7 12271405 1D24M4D3M31D TCCTGGCTAA TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTAA/-TTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGG----CAC------------------------------- CTCAGCCTCC 3070 het 3070 ref 15 15 9 3 N/A 0 0 266049 CASAVA_Build 7 12274409 1D ATCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 A 11 10 266050 CASAVA_Build 7 12278564 2D TTTATAAAAT CA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 4 CA 1 0 266051 CASAVA_Build 7 12279455 1I TACATATAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 8 9 266052 CASAVA_Build 7 12285786 2D AGAATGACTC TT/-- TACAACGGTG 3070 het 3070 ref 41 24 14 5 T 3 1 266053 CASAVA_Build 7 12288520 1I TGAGAAGTTT -/G TTTTCCCTCT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 G 0 1 266054 CASAVA_Build 7 12292986 1I TTTCTTATGA -/C CAATATGAAT 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 C 1 2 266055 CASAVA_Build 7 12294748 1I TAACCTCTAA -/G CTGTCCTTGT 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 G 0 1 266056 CASAVA_Build 7 12297789 1D GAAAGGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 11 10 266057 CASAVA_Build 7 12299453 1I ACGATTTATA -/C CCCACGTAAT 3070 het 3070 ref 57 26 20 11 C 3 4 266058 CASAVA_Build 7 12301747 1I CAAAACAATG -/C CCCCTGTCAG 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 C 4 5 266059 CASAVA_Build 7 12303500 1I CTTAACTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 9 10 266060 CASAVA_Build 7 12331737 1D TCAAAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 11 10 266061 CASAVA_Build 7 12336555 1D TTGTAAGGCT G/- GGAATTACAT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 G 3 2 266062 CASAVA_Build 7 12338350 4I AGAAAAAAAA ----/AAAT GACACCAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 AAAT 0 1 266063 CASAVA_Build 7 12339117 4I TTGCTGCATT ----/TGTG TGTCTGTATG 2585 het 2585 ref 28 16 8 4 TG 1 3 266064 CASAVA_Build 7 12340618 1I GTTTTCATCA -/G GGCTGCTGTA 3070 hom 42 het 27 0 15 12 G 2 3 266065 CASAVA_Build 7 12342193 1I CATGCTGGAG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 25 8 17 0 T 6 7 266066 CASAVA_Build 7 12347787 1I TGTCTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 10 11 266067 CASAVA_Build 7 12356828 2I CTCAGGCTCA --/TC ACTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 TC 0 1 266068 CASAVA_Build 7 12359572 1I TATAAATTTT -/G GGGGGGACGC 3070 hom 132 het 48 0 44 4 G 6 7 266069 CASAVA_Build 7 12359793 1D ATTTGAAGTA T/- TTTCTTAACT 3070 hom 89 het 42 0 28 15 T 4 3 266070 CASAVA_Build 7 12360036 4D CTATTCACAG TGGC/---- TGGCTGCCCA 3070 hom 112 het 43 0 33 12 TGGC 2 1 266071 CASAVA_Build 7 12361567 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 631 hom 21 5 14 2 A 14 15 266072 CASAVA_Build 7 12362611 2D TGATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 AC 6 5 266073 CASAVA_Build 7 12363798 1D GCTGCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1264 het 1264 ref 48 41 3 5 T 11 10 266074 CASAVA_Build 7 12382470 1D GTTCCCTATG A/- AAGTAAAGAT 3070 het 3070 ref 33 23 8 2 A 3 2 266075 CASAVA_Build 7 12385565 2D ATGGACAGAT CA/-- CAGTTTGGGA 3070 hom 92 het 35 0 31 8 CA 2 1 266076 CASAVA_Build 7 12391311 2D ATAGATTGTG TA/-- AATATATACA 3070 het 3070 hom 33 10 20 4 TA 1 0 266077 CASAVA_Build 7 12391955 1D CATTAAGAGT A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 A 7 6 266078 CASAVA_Build 7 12394035 1D TGAGATTCAC A/- AAAAGGTCGC 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 A 5 4 266079 CASAVA_Build 7 12402506 3D AGAGATAAAC ATG/--- CATAACCCTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 ATG 1 0 266080 CASAVA_Build 7 12406840 1D ACACTTTCCA C/- CTCATTGTAC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 2 1 266081 CASAVA_Build 7 12410464 1I CAGGAGGAGG -/A AGTAGACACT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 1 2 266082 CASAVA_Build 7 12415293 1I GAATTAAAGC -/A AATCACTTAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 2 3 266083 CASAVA_Build 7 12415537 1I GGTCAAGCCT -/C CCCCATGACT 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 C 4 5 266084 CASAVA_Build 7 12416056 4D TGTCTGTTTT TTTG/---- TTTTTGTTTT 620 het 620 ref 47 30 6 12 TTTG 1 0 266085 CASAVA_Build 7 12426143 1I ATAAAAATAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 8 9 266086 CASAVA_Build 7 12426862 1D ATGTGTAGTC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 26 14 8 5 T 7 6 266087 CASAVA_Build 7 12427860 1I TGCAATTAAG -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 6 7 266088 CASAVA_Build 7 12430389 1I TGTAGCCAGC -/A AAAAAGCTGG 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 5 6 266089 CASAVA_Build 7 12431051 1D ATGTAACTGG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 9 8 266090 CASAVA_Build 7 12440986 5D ATTTTTCCAC TTAAG/----- TTATCAAATA 3070 het 3070 ref 29 16 11 4 TTAAG 1 0 266091 CASAVA_Build 7 12441386 4D TAAGTATACC TTAA/---- TTAATTTCTA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 TTAA 2 1 266092 CASAVA_Build 7 12446339 1I ATCAAAGTTA -/T TAGTTATGCC 3070 het 3070 ref 65 33 27 5 T 1 2 266093 CASAVA_Build 7 12447895 14I AGAAAAGGGC --------------/TCTTCTTTTGTTTT TCTTCTTTTG 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 TCTTCTTTTGTTTT 0 1 266094 CASAVA_Build 7 12450433 1D TAAACAAGTT C/- CCAAGAATTT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 C 3 2 266095 CASAVA_Build 7 12453432 5I AAGTAATATT -----/AAAAG AAAAGTTTAT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 AAAAG 1 2 266096 CASAVA_Build 7 12456984 16D GGTACAGCTT GACCCAGGTACAGCTC/---------------- GACCCAGGTA 3070 het 3070 hom 39 17 17 8 GACCCAGGTACAGCTC 2 1 266097 CASAVA_Build 7 12460333 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 A 12 11 266098 CASAVA_Build 7 12461976 6I AGAAAATGGG ------/AATAAT ACACAATTTT 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 AAT 0 2 266099 CASAVA_Build 7 12463311 8D AATAATTTTA AAAAAAAG/-------- AAAAAAAGAA 2932 het 2932 ref 19 8 7 4 AAAAAAAG 2 1 266100 CASAVA_Build 7 12465633 10I GTATTCCACA ----------/ATGTGGACAT ACCACAATCC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 ATGTGGACAT 0 1 266101 CASAVA_Build 7 12465867 3D TCTGGAATGC AAT/--- AATAATTAAT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 AAT 3 2 266102 CASAVA_Build 7 12466324 3D ATATCAATAA ACG/--- ACGAAAATCA 3070 het 3070 ref 36 20 13 5 ACG 2 1 266103 CASAVA_Build 7 12470992 1I TTGAATTCTT -/C CCCTGGGAGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 3 4 266104 CASAVA_Build 7 12479533 1D TTAATAAATT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 C 1 0 266105 CASAVA_Build 7 12484344 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 11 10 266106 CASAVA_Build 7 12485652 2D CCTGGTTTTC AT/-- AACACTGGTA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 AT 1 0 266107 CASAVA_Build 7 12490030 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 29 1 16 13 A 17 14 266108 CASAVA_Build 7 12491004 1D GTTGCAATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 10 9 266109 CASAVA_Build 7 12493104 1I ATACACCTCC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 T 8 9 266110 CASAVA_Build 7 12495065 1I GTTTGATTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 13 14 266111 CASAVA_Build 7 12495434 1I TATTTATATG -/C CATTGTTTCC 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 C 1 2 266112 CASAVA_Build 7 12496855 1D AGCATTTAGC A/- TTAGGAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 22 5 A 1 0 266113 CASAVA_Build 7 12497692 2I CATCTGTGTG --/TA TCGAGGTAGA 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 TA 0 1 266114 CASAVA_Build 7 12500786 1I TAAACAAATC -/T ACTGTGAATT 3070 het 3070 ref 51 25 24 2 T 0 1 266115 CASAVA_Build 7 12501083 1D GATAGACAAC T/- TTTCCCAAAC 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 T 4 3 266116 CASAVA_Build 7 12503090 1I AATAATACAG -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 A 6 7 266117 CASAVA_Build 7 12509388 4D GTATAATAAT AAAC/---- AAATAAATAA 3070 het 12 hom 11 1 8 7 AAAC 1 0 266118 CASAVA_Build 7 12511854 4D CCTTAATTTC TCAG/---- TCATATATTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 TCAG 1 0 266119 CASAVA_Build 7 12512522 1I TATTCACAAT -/A GCAAAGACTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 0 1 266120 CASAVA_Build 7 12515403 1D ACTAATGTTT A/- GGTGTGACAT 3070 het 3070 ref 41 23 10 9 A 1 0 266121 CASAVA_Build 7 12516332 1D TTGGGAGGGT G/- GGGGGGTTTC 3070 hom 40 het 15 0 13 2 G 7 6 266122 CASAVA_Build 7 12519206 5I TTAGAGTCTT -----/TTCTC TTTTATTCTT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 TTCTC 0 1 266123 CASAVA_Build 7 12536164 19I GCCACAGCAA -------------------/TGGTATACTGTCATGACAC TGGTGGGGCT 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 TGGTATACTGTCATGACAC 0 1 266124 CASAVA_Build 7 12558202 1D CTTATTTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 10 9 266125 CASAVA_Build 7 12559247 7I CCAAAGGAAA -------/ATTAACC CCCTGAAGAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 ATTAACC 0 1 266126 CASAVA_Build 7 12559519 1D GTACATAATC A/- ATTAGTTTAA 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 A 2 1 266127 CASAVA_Build 7 12561805 1D TCTCATCTGG C/- CCCACCCACA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 C 4 3 266128 CASAVA_Build 7 12563010 2I CATATACCAC --/AT GTTACTCATA 3070 het 3070 ref 69 33 26 10 AT 0 1 266129 CASAVA_Build 7 12602837 1D GACTGTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 39 1 29 9 T 12 11 266130 CASAVA_Build 7 12610060 1D ATATGTGTGG T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 7 6 266131 CASAVA_Build 7 12616026 1I TTTTTGACCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 124 hom 40 1 31 8 A 9 10 266132 CASAVA_Build 7 12618080 1D CTCTTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 7 A 13 12 266133 CASAVA_Build 7 12640116 1I TGTGTGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 16 17 T 14 15 266134 CASAVA_Build 7 12640637 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1495 hom 19 5 10 4 A 15 14 266135 CASAVA_Build 7 12644013 2I ATCTAGAGAC --/AG AGATTAAGAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AG 1 2 266136 CASAVA_Build 7 12653170 7I TATTGTTTTG -------/ACTGGTA ACTTGATATT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 ACTGGTA 0 1 266137 CASAVA_Build 7 12673353 1I TGTTCGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 28 2 20 6 A 13 14 266138 CASAVA_Build 7 12678234 1D TAAATGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 13 12 266139 CASAVA_Build 7 12678396 1I ACTGGGATAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 7 8 266140 CASAVA_Build 7 12690068 2D CAAGCTACAG GC/-- CCTAAAGGGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 GC 1 0 266141 CASAVA_Build 7 12696451 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 47 1 33 14 T 14 13 266142 CASAVA_Build 7 12696776 1I TTGAAGGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 42 3 29 10 T 13 14 266143 CASAVA_Build 7 12698089 1D TATATGATGT A/- AAAACTCAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 5 4 266144 CASAVA_Build 7 12699113 20D CAAGATTGTT ATCTATAATTCACAAATTTG/-------------------- ATCGAATGAT 3070 hom 96 het 31 0 33 4 ATCTATAATTCACAAATTTG 1 0 266145 CASAVA_Build 7 12711085 3I CAAAATCTCT ---/CTC TTTTTTTTTT 2841 hom 23 het 27 1 17 9 CTC 0 1 266146 CASAVA_Build 7 12713762 1I ACTTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 13 6 T 10 11 266147 CASAVA_Build 7 12715629 1I AGACTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 794 hom 20 3 9 8 A 15 16 266148 CASAVA_Build 7 12721134 1I TAGTGAATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 9 10 266149 CASAVA_Build 7 12724800 2D AGAAACACTA CT/-- CTCTCGGCTT 3070 het 3070 ref 27 15 12 1 CT 3 2 266150 CASAVA_Build 7 12727121 1D AATAAAAAAA C/- AGGATGAATC 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 C 1 0 266151 CASAVA_Build 7 12732350 8D AGAGACAGAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAAGA 3070 hom 69 het 27 0 24 7 AAAG 3 1 266152 CASAVA_Build 7 12736232 1D CATTCATAGA C/- CCCCCCCTGG 3070 hom 111 het 40 0 38 6 C 8 7 266153 CASAVA_Build 7 12736644 4D CTGGGCTGGA AAAG/---- AGAGTTAGCT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 AAAG 1 0 266154 CASAVA_Build 7 12736857 2D GTTCTCACTC TA/-- TGTGTAATCT 3070 hom 165 het 60 0 54 7 TA 1 0 266155 CASAVA_Build 7 12737567 2I AAACACCCAT --/TC TCTAGGTTAT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 TC 1 2 266156 CASAVA_Build 7 12737785 1I TAAGGAGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 9 10 266157 CASAVA_Build 7 12738467 1D GTAATTATTC A/- AACAAGTATT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 3 2 266158 CASAVA_Build 7 12738779 1D GGCCAGTGTT C/- CAATAGTGCA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 C 2 1 266159 CASAVA_Build 7 12740621 1I TTGACTTCCA -/T TTTTCTCTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 4 5 266160 CASAVA_Build 7 12741038 1D TGAGTGAATT G/- GGGGTGTAGA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 5 4 266161 CASAVA_Build 7 12742366 1D GTTTTTTTTT G/- ATTTTAACAC 3070 hom 41 het 15 0 14 1 G 1 0 266162 CASAVA_Build 7 12750467 1I ACAGCCTTCT -/G TTGGAAAAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 266163 CASAVA_Build 7 12758739 1I GCTTTCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2649 hom 26 9 10 7 A 14 15 266164 CASAVA_Build 7 12763446 3D TTAATAAAAC TAT/--- TATTATCAAA 3070 het 2924 hom 22 7 10 5 TAT 3 2 266165 CASAVA_Build 7 12767455 5D AGATGATACA AAACT/----- AAAGAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 21 22 1 AAACT 1 0 266166 CASAVA_Build 7 12785506 1D AGTTAATGGG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 38 15 22 2 A 7 6 266167 CASAVA_Build 7 12785668 1D TATCTGGCCA C/- CAGTTTCTCA 3070 het 3070 hom 47 21 25 1 C 2 1 266168 CASAVA_Build 7 12789333 1D TGGAAAACAG T/- TTTGGCAGCT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 T 4 3 266169 CASAVA_Build 7 12790149 1I AGTGGGCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 11 12 266170 CASAVA_Build 7 12791702 5I TGAATTGCTC -----/TAATT TAAAGACTCG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 TAATT 0 1 266171 CASAVA_Build 7 12792277 2I23M1D TGTCGTTTTG --TTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGT/TTTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTG- TTTTTGAGAC 3070 het 3070 ref 27 16 13 4 N/A 0 0 266172 CASAVA_Build 7 12794200 1D CCTACTGTCA T/- CATAGCCATG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 1 0 266173 CASAVA_Build 7 12797515 8I CACTTTGGGA --------/GGCCAAGG GGGGGCGGAT 2802 het 489 hom 11 2 7 2 GGCCAAGG 0 1 266174 CASAVA_Build 7 12797975 4I TTTTGTAGAC ----/TTTA TTTATTTAGG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 TTTA 2 3 266175 CASAVA_Build 7 12814092 1I TTTCAGAACA -/T TTTATTTGTT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 3 4 266176 CASAVA_Build 7 12814406 3I TGTGTTGTTG ---/TGT TGTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 19 8 TGT 2 3 266177 CASAVA_Build 7 12822562 1I TAAATTCTCC -/T TTAAATTTTT 3070 het 2743 hom 32 8 19 5 T 2 3 266178 CASAVA_Build 7 12827797 1D TAGGGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2222 hom 36 7 12 17 A 14 13 266179 CASAVA_Build 7 12835751 2I CACACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 CA 8 9 266180 CASAVA_Build 7 12840088 1I CTAGGCAGTG -/C CCCAGTGGGG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 3 4 266181 CASAVA_Build 7 12893470 2I TAGTACAAAC --/TA TATAACATTA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 TA 2 3 266182 CASAVA_Build 7 12897735 1D TTACAATGTA G/- GCCCAAGGGA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 2 1 266183 CASAVA_Build 7 12912829 1I TGGCGTGAGG -/C CCCACGTAAC 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 C 3 4 266184 CASAVA_Build 7 12918108 2I AAATAAAAAA --/AT AAAAAACAAA 3070 hom 38 het 29 0 21 8 AT 0 1 266185 CASAVA_Build 7 12919495 6I CGCTGAACTC ------/TATGTT TATAAGTTCT 3070 het 3070 ref 40 23 9 8 TATGTT 0 1 266186 CASAVA_Build 7 12923015 1I AAGTTTATTA -/T TTTCTTCTCT 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 3 4 266187 CASAVA_Build 7 12927246 3D GAAATGCCAG GCT/--- GCTGCTTTGA 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 GCT 3 2 266188 CASAVA_Build 7 12941138 2I AATTTTGAAT --/GA GAGAGAAAAA 3070 hom 126 het 50 0 42 8 GA 3 4 266189 CASAVA_Build 7 13078747 1D ATTGATCTTT A/- CAGAAAGCCA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 A 1 0 266190 CASAVA_Build 7 13104897 1I TACTGAAGAC -/A AAGTGCCTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 266191 CASAVA_Build 7 13113488 4D AAATGTTAAC ATTT/---- ATAGGATTAT 3070 hom 66 het 23 0 23 1 ATTT 1 0 266192 CASAVA_Build 7 13116897 1D ACTCGAGTTT A/- AAAAAACTCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 6 266193 CASAVA_Build 7 13151716 1D31M1D TGAACTTAAA TTTTTTTTTTTTTCAGAAAATTCCCCCCCACCT/-TTTTTTTTTTTTCAGAAAATTCCCCCCCACC- TTTTTTTTAA 3070 hom 64 het 20 0 22 5 N/A 0 0 266194 CASAVA_Build 7 13154985 3D CCCCCACCCC CAA/--- AAAAAATTCA 2439 hom 50 het 19 0 14 5 CAA 1 0 266195 CASAVA_Build 7 13167346 1I TGGTGAGATC -/A AAGGGTAAGA 3070 het 173 hom 55 1 51 3 A 2 3 266196 CASAVA_Build 7 13170309 1I ATATTTAATT -/A CTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 0 1 266197 CASAVA_Build 7 13179246 1I CTAGCAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 435 hom 28 1 23 4 A 9 10 266198 CASAVA_Build 7 13182856 1D CTTAGTTTGC A/- AAAAAAAAAA 1954 het 1954 ref 40 30 5 6 A 13 12 266199 CASAVA_Build 7 13194654 1I TGGGACAGGC -/T TTAGCTATTG 3070 hom 99 het 39 0 32 7 T 2 3 266200 CASAVA_Build 7 13196981 1I GGCTGTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 13 14 266201 CASAVA_Build 7 13198632 1D GAATACTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 31 0 26 5 T 10 9 266202 CASAVA_Build 7 13200151 2D22M2I AGAGAGAGAG ACACACACACACACAGAAAATCTC--/--ACACACACACACAGAAAATCTCTT TATTGATATT 3070 hom 154 het 51 0 52 6 N/A 0 0 266203 CASAVA_Build 7 13202091 1I CTAGAAACTC -/T TTAAGATGAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 3 266204 CASAVA_Build 7 13202757 1I GACTAGATCC -/T AAATTATTCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 266205 CASAVA_Build 7 13210637 1D CCAGAACTTC T/- TTTTTTTTTT 2200 het 2200 ref 50 25 8 18 T 17 16 266206 CASAVA_Build 7 13240904 1D TTTTTCAGCC T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 16 7 7 2 T 8 7 266207 CASAVA_Build 7 13241739 1D AAAAAAAAAG A/- AAGCTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 14 8 A 3 2 266208 CASAVA_Build 7 13245655 1D CTCTCATTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 10 9 266209 CASAVA_Build 7 13253245 1D ATATTCATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 A 10 9 266210 CASAVA_Build 7 13255292 1I GTATATCGTC -/T TTTGGAAAAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 3 4 266211 CASAVA_Build 7 13256171 1I AGATTGCTTT -/G GGAGGCATGG 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 G 2 3 266212 CASAVA_Build 7 13269909 11D TCTTTTCCCC TGCTTTTCCCT/----------- TTATCGTCAA 3070 hom 105 het 35 0 36 2 TGCTTTTCCCT 1 0 266213 CASAVA_Build 7 13271869 2D TATAAAACAT TA/-- TATATATATA 3070 het 155 hom 30 1 28 2 TA 6 5 266214 CASAVA_Build 7 13272851 3D AAGCAATAAA TAT/--- TATAGACCTA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TAT 2 1 266215 CASAVA_Build 7 13273656 1I CATCTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 29 1 19 9 A 13 14 266216 CASAVA_Build 7 13286615 11D CTTGATTTCC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 15 16 A 27 16 266217 CASAVA_Build 7 13292297 1D ATACATACCC A/- AAAACAGTTG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 5 4 266218 CASAVA_Build 7 13296723 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 1798 het 1798 ref 41 28 5 10 T 10 9 266219 CASAVA_Build 7 13324270 3D AAAATCCTTC AAT/--- AATAATAAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 5 AAT 3 2 266220 CASAVA_Build 7 13334269 1I CATCCTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 9 10 266221 CASAVA_Build 7 13339404 1I GTCAAATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 302 hom 32 1 23 8 A 14 15 266222 CASAVA_Build 7 13342743 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2667 hom 25 9 9 7 T 11 12 266223 CASAVA_Build 7 13351021 1D TTATTGTGTT G/- TTATCTCATT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 G 1 0 266224 CASAVA_Build 7 13355435 2D TTAATCTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 14 12 266225 CASAVA_Build 7 13359374 2D TGTATATGTG TA/-- TATATATGTG 3070 hom 143 het 55 0 47 8 TA 4 3 266226 CASAVA_Build 7 13365495 1I AATTCCCAAA -/T TGTTTTTGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 2 266227 CASAVA_Build 7 13366165 10D TCAGGCTGGT CTCAAACTCC/---------- TGAGGTCAAG 3070 hom 99 het 32 0 32 5 CTCAAACTCC 1 0 266228 CASAVA_Build 7 13366999 1D TAAATCCCCC T/- GATTCATTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 T 1 0 266229 CASAVA_Build 7 13369452 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 8 9 266230 CASAVA_Build 7 13369581 1D AGTGATAGAA C/- ATGCCATGTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 1 0 266231 CASAVA_Build 7 13369655 8D43M3I AATTTAATAT ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAATTAAAATCACTGAGAACACCAA---/--------ATAGATAGATAGATAGATAAATTAAAATCACTGAGAACACCAAGTT GTTTTTGAAC 3070 hom 18 het 10 0 7 11 N/A 0 0 266232 CASAVA_Build 7 13385637 3D AAAGTACAAT AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 hom 30 het 12 0 11 2 A 12 9 266233 CASAVA_Build 7 13394992 1I GAGACTCTGT -/A GTTATAAAAT 3070 hom 71 het 38 0 31 7 A 0 1 266234 CASAVA_Build 7 13396622 1D CAAACCTGAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 9 8 266235 CASAVA_Build 7 13397918 1I GATTCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 10 266236 CASAVA_Build 7 13399927 1I TTTCTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 14 1 12 1 C 0 1 266237 CASAVA_Build 7 13415898 2D ATAAACTCTA TC/-- TCTATGTAAT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 TC 2 1 266238 CASAVA_Build 7 13419821 1D AAAGCAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2864 hom 28 13 13 3 T 11 10 266239 CASAVA_Build 7 13429744 3I AGTGTGTATC ---/ATA GTACTGTAGT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 ATA 0 1 266240 CASAVA_Build 7 13439615 1D CCTGAGGTGA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 7 6 266241 CASAVA_Build 7 13440903 1I CTCCATGCTA -/C TGAAATGTAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 0 1 266242 CASAVA_Build 7 13442805 1D TAAAATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 33 0 17 16 T 15 14 266243 CASAVA_Build 7 13446817 1I GTGAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 13 14 266244 CASAVA_Build 7 13453228 9D TGAGAACAAA ATAAAAGCC/--------- TCCCAATTTG 3070 hom 123 het 44 0 40 7 ATAAAAGCC 1 0 266245 CASAVA_Build 7 13460910 1I CTTTAGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 721 hom 45 3 35 7 T 12 13 266246 CASAVA_Build 7 13461821 4D TCTTAAAAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 1314 het 1277 hom 46 11 12 24 AAAC 1 0 266247 CASAVA_Build 7 13466564 1D AGATATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 34 1 30 4 T 11 10 266248 CASAVA_Build 7 13467508 1D TGCAACTAGT A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 8 7 266249 CASAVA_Build 7 13467813 6I TGCCTCTCTG ------/TCTGTC TCTGTCTCTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 TCTGTC 1 2 266250 CASAVA_Build 7 13469191 4D ACAAAGATAT ATAG/---- ATAGACAGAA 3070 hom 99 het 38 0 33 7 ATAG 2 1 266251 CASAVA_Build 7 13470512 1D AAAATAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 12 16 A 13 12 266252 CASAVA_Build 7 13480045 1D GTGAAAGCTG A/- AAAATTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 5 4 266253 CASAVA_Build 7 13484805 2I TGGGGGACTC --/AG GGCACAGAAC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 AG 0 1 266254 CASAVA_Build 7 13500104 1I CAAAGCAAAC -/A AAAAACATAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 5 6 266255 CASAVA_Build 7 13502774 1D TTATCACCTC T/- CATAAATATA 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 1 0 266256 CASAVA_Build 7 13504410 1I CATGTATATG -/T TTTTGTTGTT 3070 het 3070 hom 29 13 16 0 T 4 5 266257 CASAVA_Build 7 13508064 1I TCCTTGGTAG -/A AGAATTTGTC 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 A 1 2 266258 CASAVA_Build 7 13514864 1I CTTCCATCTG -/T TTGAAATGCA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 T 2 3 266259 CASAVA_Build 7 13519681 2I ATAACAAGTC --/TG GAATTGAATC 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 TG 0 1 266260 CASAVA_Build 7 13520917 1D GCATCACGTT A/- CCCGACTTTA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 1 0 266261 CASAVA_Build 7 13523823 1I CCTAAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 12 13 266262 CASAVA_Build 7 13524042 4D CTTTCTTGTT AGTG/---- AGGCTTTTGC 3070 het 3070 hom 38 11 26 2 AGTG 1 0 266263 CASAVA_Build 7 13527726 1D GGATTGGAAA T/- AATACTGACA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 1 0 266264 CASAVA_Build 7 13532437 1D TCATTGACGG C/- CAAGTACCTC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 C 2 1 266265 CASAVA_Build 7 13535768 4I38M4D TTTGAGTAAT ----CTAACAAAAAATGAGAATATATTCAAACAGATGGCTATAATA/CTGACTAACAAAAAATGAGAATATATTCAAACAGATGGCTAT---- AATTATATAA 3070 het 3070 hom 32 16 21 6 N/A 0 0 266266 CASAVA_Build 7 13536765 3D TGCTAATTGC TCT/--- TCTTCATGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 TCT 2 1 266267 CASAVA_Build 7 13542255 1D ATCTCTCTGC A/- AAAATAGTTG 3070 het 3070 ref 30 19 9 3 A 5 4 266268 CASAVA_Build 7 13545694 2D AGAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 53 22 21 11 AG 7 6 266269 CASAVA_Build 7 13559672 2I TATAATTAAC --/CT ATGAGTGCAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CT 0 1 266270 CASAVA_Build 7 13559865 1I CTCCCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 10 11 266271 CASAVA_Build 7 13571713 1D CTTTTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 11 10 266272 CASAVA_Build 7 13575304 1D TCCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 22 0 20 3 A 11 10 266273 CASAVA_Build 7 13580937 1D GCCTTAGCAG A/- GCCCCCAAAG 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 A 1 0 266274 CASAVA_Build 7 13581178 1D CATCATTTTC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 8 7 266275 CASAVA_Build 7 13587484 1D TCTTTTACTC T/- TTCCAGCTCT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 3 2 266276 CASAVA_Build 7 13589579 3I CCCACATCCC ---/CTT CTTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 CTT 1 2 266277 CASAVA_Build 7 13596805 1D AGTCTGGCTG C/- CCCTTTCTGG 1925 het 1925 ref 37 19 9 9 C 4 3 266278 CASAVA_Build 7 13598180 4D GGTTTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 864 het 582 hom 35 2 8 25 TTTG 1 0 266279 CASAVA_Build 7 13601191 5I37M1I CTTTCAAGCA -----ATATTATATATGATATAAGCCCCTTAAAATGACATTA-/ATATTATATTATATATGATATAAGCCCCTTAAAATGACATAAT TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 35 15 19 13 N/A 0 0 266280 CASAVA_Build 7 13612254 1D GGGGACTCTT A/- ACGCATAACG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 2 1 266281 CASAVA_Build 7 13618394 2I GTTATGAAAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 AT 5 6 266282 CASAVA_Build 7 13619727 2D AGTGGGTGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 38 0 25 13 A 14 12 266283 CASAVA_Build 7 13624470 1I CAATATCCAC -/A AAAAAAAAAA 1952 het 1952 ref 35 18 7 10 A 10 11 266284 CASAVA_Build 7 13625645 3D GATCAAAGAC ATT/--- GTTGTTGTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 ATT 1 0 266285 CASAVA_Build 7 13626074 1D TTTAAAATGT A/- AAAAACTATT 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 A 6 5 266286 CASAVA_Build 7 13626356 1I CTGAACTGGG -/T TATTCAAGAG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 1 2 266287 CASAVA_Build 7 13628144 2I AATAAAAAAA --/AG AGAAGAAATA 3070 het 1463 hom 14 5 8 1 AG 1 2 266288 CASAVA_Build 7 13632775 1I CATGCAAGTT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 51 het 29 0 18 11 A 7 8 266289 CASAVA_Build 7 13633108 4D ACAGACAGAT AGAC/---- AGACAGAAAG 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 AGAC 2 1 266290 CASAVA_Build 7 13636819 2I CTGCATTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2042 het 20 hom 14 1 8 5 T 10 12 266291 CASAVA_Build 7 13638384 1I TACAAATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 9 10 266292 CASAVA_Build 7 13643478 2D GCTATTAAAC TG/-- TATAATACAG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 TG 1 0 266293 CASAVA_Build 7 13643558 2D GCTATTAAAC TG/-- TATAATACAG 2686 het 2686 ref 26 14 9 3 TG 1 0 266294 CASAVA_Build 7 13649785 1D AAAATTAATG T/- TAATGATATG 3070 hom 42 het 24 0 15 9 T 2 1 266295 CASAVA_Build 7 13650248 1D TCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 20 0 15 7 A 15 14 266296 CASAVA_Build 7 13650460 2I AAAAAAAGTA --/GT CTCATTTTTT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 GT 0 1 266297 CASAVA_Build 7 13660457 7D GACTGTGGTG GTGATCA/------- TACATATCTG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GTGATCA 1 0 266298 CASAVA_Build 7 13660698 2D TGTGTCCGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CA 6 5 266299 CASAVA_Build 7 13664105 1I TGGATATAAC -/T TTTTTTCTCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 6 7 266300 CASAVA_Build 7 13665687 1I ACACTGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 481 hom 22 2 13 7 A 13 14 266301 CASAVA_Build 7 13667819 19I ACAGTAGCTA -------------------/AAATGTGAAAGTCACCCCC AGGTGTTTAT 3070 hom 30 het 15 0 10 5 AAATGTGAAAGTCACCCCC 0 1 266302 CASAVA_Build 7 13668715 1I GAATTTACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 9 10 266303 CASAVA_Build 7 13673293 2D CATTGATGGG CA/-- CACTTGTGTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 CA 2 1 266304 CASAVA_Build 7 13677151 1D GTTTATCTTT A/- AAAAAAATCA 2900 het 2900 ref 17 10 7 0 A 8 7 266305 CASAVA_Build 7 13687260 1D AAAGAAACTG A/- TACGGTTTGG 2903 het 2903 ref 20 11 6 3 A 1 0 266306 CASAVA_Build 7 13689645 12D TGTTTGTTTG TTTTGTTTTTGT/------------ TTTTGTTTTT 2735 het 2735 ref 30 14 6 10 TTTTGT 4 2 266307 CASAVA_Build 7 13690966 1I GAAGAGCTCT -/C CCCTACAGCC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 C 3 4 266308 CASAVA_Build 7 13695395 2D CTGAAGGAAC TA/-- TATACATTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TA 3 2 266309 CASAVA_Build 7 13696843 1I AAAAAACTGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 9 10 266310 CASAVA_Build 7 13699866 4D AGTGAACAGA AACT/---- AACTAATTTC 3070 het 3070 ref 47 26 17 5 AACT 2 1 266311 CASAVA_Build 7 13703251 1D TTAAAAAAAA C/- ACACATATTA 3070 het 3070 hom 45 14 22 9 C 1 0 266312 CASAVA_Build 7 13705071 5I CTGGGGACTC -----/CAAAT CAGGGAGGGA 1682 het 1682 ref 24 16 5 3 CAAAT 0 1 266313 CASAVA_Build 7 13708952 6D TGTGTGAGAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 31 11 15 6 AC 11 8 266314 CASAVA_Build 7 13709434 41D ATTGAAAGAA CCTATGCTGGTATTCCTGCTTAGAAAAGAATAAAACACGCT/----------------------------------------- CCTATGCTGG 3070 hom 36 het 29 0 12 25 CCTATGCTGGTATTCCTGCTTAGAAAAGAATAAAACACGCT 2 1 266315 CASAVA_Build 7 13711703 1I CCAGTAACAC -/T TTAAACTGTC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 2 3 266316 CASAVA_Build 7 13712356 3I ATTGTTTCCA ---/GTT GTTAGAAAAT 3070 het 3070 ref 45 22 21 2 GTT 1 2 266317 CASAVA_Build 7 13713174 1I TTTTAAAATA -/T TTTTCCCATC 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 4 5 266318 CASAVA_Build 7 13719394 4D AACTTAGGCC ATTT/---- ATTTATTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 6 ATTT 3 2 266319 CASAVA_Build 7 13719585 4D GGATAGAAAT AGAG/---- AGAGAGAGAC 2123 het 2104 hom 19 7 8 4 AG 6 4 266320 CASAVA_Build 7 13721049 5D ATGACATGAA TAGAG/----- TAAAGAGGTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 TAGAG 1 0 266321 CASAVA_Build 7 13723432 1I GCATCCAGGT -/C CCCCCTCTAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 5 6 266322 CASAVA_Build 7 13725715 1I CACTGGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2589 hom 33 11 11 11 T 13 14 266323 CASAVA_Build 7 13729823 4D TGAAAAAAGA AAGT/---- AAGGAGAGGA 3047 het 2941 hom 18 6 9 3 AAGT 1 0 266324 CASAVA_Build 7 13731407 1I CTTAGCCTTT -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 7 8 266325 CASAVA_Build 7 13732162 5D TTTCACGGTA CATTC/----- CATTCATTTT 3070 het 3070 hom 30 15 14 4 CATTC 2 1 266326 CASAVA_Build 7 13740254 1I AAACTTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 21 2 17 2 A 10 11 266327 CASAVA_Build 7 13740506 4D TGCAATGCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 13 9 T 20 16 266328 CASAVA_Build 7 13741728 4D ACTTAGATCT TCTC/---- TCTCTCTATA 3070 hom 79 het 32 0 27 5 TC 5 3 266329 CASAVA_Build 7 13751725 2I GTCCTTTTAC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 25 8 10 7 TG 5 6 266330 CASAVA_Build 7 13757204 5D TTTCATTAAA TTACT/----- TTAAGAGATC 3070 het 3070 ref 40 25 15 1 TTACT 1 0 266331 CASAVA_Build 7 13760093 6D ACATTGGGAC ATTAAT/------ ATTAACATTA 3070 het 3070 ref 35 14 17 4 ATTAAT 1 0 266332 CASAVA_Build 7 13761540 1I TTAAAGAGAT -/G GGGGGTCCTG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 G 5 6 266333 CASAVA_Build 7 13777989 5D TGTCCATTCA GTTTT/----- ATCTATATCA 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 GTTTT 1 0 266334 CASAVA_Build 7 13790484 4D TACATAATAT ACAG/---- ACAGACTAAA 3070 het 3070 hom 31 11 17 5 ACAG 2 1 266335 CASAVA_Build 7 13822099 5D GACTCCGTCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 4 CAAAA 3 2 266336 CASAVA_Build 7 13834386 4D TTTATTTCTT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 29 10 10 10 TTTA 5 4 266337 CASAVA_Build 7 13856086 12D TTTGTGGTGC TTGTGGTGGTGG/------------ TTGTTGTTTG 3070 het 3070 ref 31 19 12 6 TTGTGGTGGTGG 1 0 266338 CASAVA_Build 7 13856453 2I GAGACAGTGC --/CT CTGTTTGAGG 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 CT 1 2 266339 CASAVA_Build 7 13860286 1I TACTCCACTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 9 10 266340 CASAVA_Build 7 13861044 1D AGCGATTCTC T/- TGTCTTAGCC 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 T 2 1 266341 CASAVA_Build 7 13862125 1D CAGTTTACAG T/- TTTTTTTTCT 2317 het 2317 ref 29 14 6 9 T 9 8 266342 CASAVA_Build 7 13862784 1D TAGGGTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 11 10 266343 CASAVA_Build 7 13871403 2D ATAATTAATC CA/-- AAAATTTGCA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 CA 1 0 266344 CASAVA_Build 7 13882611 1I AACTGGCTCA -/C AGTTTTGCAG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 C 0 1 266345 CASAVA_Build 7 13890316 1D GTAATTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 11 10 266346 CASAVA_Build 7 13915287 1D TTCCCCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2563 hom 51 20 21 10 A 17 16 266347 CASAVA_Build 7 13943192 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 A 9 8 266348 CASAVA_Build 7 13948508 1D ATTATTTATT A/- CATCTTTGAA 2807 het 2807 ref 22 16 6 0 A 1 0 266349 CASAVA_Build 7 13951594 1D TTGAAACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 T 12 11 266350 CASAVA_Build 7 13967235 1I GGTTGAGGCT -/G GCAGTGAGCC 3070 het 2610 hom 22 6 11 5 G 1 2 266351 CASAVA_Build 7 13983652 1I AAAGAAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 A 8 9 266352 CASAVA_Build 7 13992964 1D ACATAAAAAT A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 21 8 11 3 A 8 7 266353 CASAVA_Build 7 13995233 1D TCAGCTCAGT A/- TTTTATATTT 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 A 1 0 266354 CASAVA_Build 7 13995320 2I TTTTAGGCTT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 2098 hom 21 6 10 5 A 9 11 266355 CASAVA_Build 7 13995386 1D TCCCATTCAC A/- AAAATAACCC 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 5 4 266356 CASAVA_Build 7 14071489 1D ATTTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 7 T 13 12 266357 CASAVA_Build 7 14107438 2D TGAATTTTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 109 het 43 0 37 6 GT 10 9 266358 CASAVA_Build 7 14123658 2I CCAGGAGTGA --/GT GGGGTTGATA 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 GT 0 1 266359 CASAVA_Build 7 14151616 1I TACATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2317 het 1263 hom 25 5 10 11 T 11 12 266360 CASAVA_Build 7 14175353 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1573 hom 18 het 10 0 6 4 A 13 14 266361 CASAVA_Build 7 14199327 1D AGAGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 16 5 A 13 12 266362 CASAVA_Build 7 14211103 1D ATGTGTCCAC A/- ACTGTAGCTA 3070 het 3070 ref 34 21 10 4 A 2 1 266363 CASAVA_Build 7 14215036 1D AAATAGCTAG T/- TTTTTTTTTT 1306 het 1306 ref 42 32 3 7 T 13 12 266364 CASAVA_Build 7 14250657 1D GTACAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 9 8 266365 CASAVA_Build 7 14262607 4D TTCCATTCTA AAAT/---- AAATATTTTA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 AAAT 2 1 266366 CASAVA_Build 7 14265476 4D AGTTAACCTC AATT/---- AAATCTTTCG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AATT 1 0 266367 CASAVA_Build 7 14265910 7D ATTGTCATTG CGTTTGC/------- CTTGTAACTA 3070 hom 49 het 18 0 15 4 CGTTTGC 1 0 266368 CASAVA_Build 7 14267397 1I CATTTCAGTG -/A AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 29 18 3 8 A 11 12 266369 CASAVA_Build 7 14269936 1D TCCCTTAGGC A/- AATCATTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 3 2 266370 CASAVA_Build 7 14273159 1D AACAAGTTGG T/- TTCCCCCTAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 3 2 266371 CASAVA_Build 7 14283331 1I GTTTATTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 8 9 266372 CASAVA_Build 7 14291184 1D AAAAAATAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 1145 hom 16 3 11 2 A 8 7 266373 CASAVA_Build 7 14306075 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 hom 39 11 23 5 A 6 7 266374 CASAVA_Build 7 14312696 1I GTCACTGAAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 2403 hom 24 7 13 4 T 8 9 266375 CASAVA_Build 7 14314118 1D TCAGTAAGAA C/- CTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 C 2 1 266376 CASAVA_Build 7 14325441 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAT 2507 het 2507 ref 19 10 7 2 A 9 10 266377 CASAVA_Build 7 14350860 1I CTACAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 662 hom 34 3 25 6 T 10 11 266378 CASAVA_Build 7 14357221 13I TGGCATAGCC -------------/TTGAAGCATAGCA GGAATTTGGA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 TTGAAGCATAGCA 0 1 266379 CASAVA_Build 7 14358656 1I CAGAGTCATA -/C CAAAAACGTA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 C 1 2 266380 CASAVA_Build 7 14359102 1D CCAAACAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 A 8 7 266381 CASAVA_Build 7 14385194 2I AAAAATCTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 10 12 266382 CASAVA_Build 7 14388256 1I TTGTCTCAGG -/T TTCACCTCTG 3070 hom 114 het 44 0 37 7 T 2 3 266383 CASAVA_Build 7 14388530 2D AAATACATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 T 13 11 266384 CASAVA_Build 7 14388542 2D TTTTTTTTTT TG/-- CATTTCCAAT 3070 hom 58 het 34 1 29 4 TG 1 0 266385 CASAVA_Build 7 14388602 2D GCATGCCTGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AC 8 7 266386 CASAVA_Build 7 14394417 1D ATGTGAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 11 10 266387 CASAVA_Build 7 14400817 1I TCAATGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 36 1 29 6 T 10 11 266388 CASAVA_Build 7 14404944 1I GTCTATGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1154 hom 45 4 27 14 A 11 12 266389 CASAVA_Build 7 14406915 1D GAAATTTATT A/- ATCCTGAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 1 266390 CASAVA_Build 7 14409674 1I TTTCCATTTT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 97 het 45 0 33 12 A 8 9 266391 CASAVA_Build 7 14411268 1I CATTTCAAAT -/C TATTCTGCCT 3070 hom 78 het 27 0 26 1 C 0 1 266392 CASAVA_Build 7 14416952 5D AAAATGATAA AAGAT/----- AAGACTAGAT 3070 hom 96 het 39 0 33 8 AAGAT 1 0 266393 CASAVA_Build 7 14421171 1I AAAACCCTCC -/T TATAGAGTCT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 1 2 266394 CASAVA_Build 7 14421441 2D ATTATACTTT AA/-- AAGCTTTAGT 1439 het 620 hom 6 2 3 1 A 4 2 266395 CASAVA_Build 7 14423852 1I GATTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 11 266396 CASAVA_Build 7 14424276 1I TAGAGTTTTT -/A AAAAATATAT 1784 het 1083 hom 9 4 4 1 A 5 6 266397 CASAVA_Build 7 14433043 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2668 het 2101 hom 14 6 7 1 A 10 11 266398 CASAVA_Build 7 14436079 1I TCTGTCCCCC -/G CCCCCAAAAA 3070 het 182 hom 36 3 18 15 G 0 1 266399 CASAVA_Build 7 14438121 1D TGTCTTGACA T/- TTGTTAGCTG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 3 2 266400 CASAVA_Build 7 14439956 2I TAATATTTGC --/AT ATATATACAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 AT 3 4 266401 CASAVA_Build 7 14447058 8I CCATTTTTAG --------/TATTCTGA TATTCTGATA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 TATTCTGA 1 2 266402 CASAVA_Build 7 14453374 5I ACATGAAAGA -----/AATAG AATAGAACTC 3041 het 3041 ref 28 15 9 4 AATAG 1 2 266403 CASAVA_Build 7 14482906 1D ACTAAAAACA T/- TTTTTTTTTT 2919 het 704 hom 23 6 10 7 T 17 16 266404 CASAVA_Build 7 14489060 1D GCTGGGTTGA T/- TAAATAGAGC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 2 1 266405 CASAVA_Build 7 14491136 1D AAAGTAACAG A/- AAAATAATAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 5 4 266406 CASAVA_Build 7 14491883 3D AAAAATACAG AAA/--- AAAAAAAATA 1488 het 1488 ref 10 4 5 2 A 11 8 266407 CASAVA_Build 7 14494999 4I AAACAAAAAA ----/AAAC AAACAAAAAA 1301 het 1301 ref 25 15 4 6 AAAC 1 2 266408 CASAVA_Build 7 14495175 1I CATCTGTGTC -/T TTAACATAGA 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 2 3 266409 CASAVA_Build 7 14504062 1D TGACACTCAT G/- GAAGGACAGC 3070 het 3070 hom 47 21 25 1 G 2 1 266410 CASAVA_Build 7 14505566 4D AGAAATATGG GTGA/---- GTATTTGCTA 3070 het 3070 hom 48 20 23 7 GTGA 1 0 266411 CASAVA_Build 7 14506003 8D AATATTTTCC AAATGTGG/-------- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 AAATGTGG 1 0 266412 CASAVA_Build 7 14506625 1D AGTTTCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 11 10 266413 CASAVA_Build 7 14507532 1I TGATTGAGCA -/G ACTTATAATT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 0 1 266414 CASAVA_Build 7 14531143 1D ATAAAATTGA C/- ACACTGTTGA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 C 1 0 266415 CASAVA_Build 7 14555608 1D CACCAAATAA C/- CTATATAGTT 3001 het 2748 hom 15 7 7 3 C 2 1 266416 CASAVA_Build 7 14556434 4D GTTTAGTGTG ACTT/---- ACTTAATAAA 3070 het 3070 hom 36 18 17 1 ACTT 2 1 266417 CASAVA_Build 7 14557218 1D CTGTTAACTA T/- TTCCACTAAC 3070 het 3070 ref 47 23 18 8 T 3 2 266418 CASAVA_Build 7 14564350 3D CTTCTGTATA GAG/--- GATGACTATA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 GAG 1 0 266419 CASAVA_Build 7 14592517 1D ATTGTATGAA G/- GCTGAGAGAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 2 1 266420 CASAVA_Build 7 14593006 1I CATATTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1589 hom 29 6 16 7 A 13 14 266421 CASAVA_Build 7 14596306 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 5 ATA 3 2 266422 CASAVA_Build 7 14598446 2D TGTCATCAAT TC/-- TCTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 6 TC 2 1 266423 CASAVA_Build 7 14601685 1D AAAATTGAGG C/- CCCCCTTTAA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 C 6 5 266424 CASAVA_Build 7 14613992 2I AATAAATGTA --/TT TTTTTTTAAT 3070 het 2327 hom 21 5 15 1 T 7 9 266425 CASAVA_Build 7 14631668 1I GAAGTTATTG -/A AAAGTTTCAG 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 3 4 266426 CASAVA_Build 7 14649508 1D GTATTGTTCC A/- GAGAGGAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 1 0 266427 CASAVA_Build 7 14650267 1I GATTACAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 16 11 A 14 15 266428 CASAVA_Build 7 14652922 1I AGAAGAAAGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 8 9 266429 CASAVA_Build 7 14653780 1I AGATAATTCA -/C TGGGGGAGGA 2891 het 2891 ref 33 18 10 6 C 0 1 266430 CASAVA_Build 7 14663451 1D AATAAAAGGC A/- GCTATCCTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 1 0 266431 CASAVA_Build 7 14669965 1D ACCAGTGTGC A/- AAAAAAAACA 1594 het 1594 ref 26 18 4 4 A 9 8 266432 CASAVA_Build 7 14706053 1D GGGCAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 1230 het 1230 ref 35 25 4 6 A 11 10 266433 CASAVA_Build 7 14709209 5I TACAGTCAAT -----/AAATG AAATAAAATG 3070 hom 129 het 49 0 44 6 AAATG 0 1 266434 CASAVA_Build 7 14735449 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 2843 hom 24 het 9 0 9 0 T 5 6 266435 CASAVA_Build 7 14738348 1I GTGAGCATAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 9 266436 CASAVA_Build 7 14739963 4D AGGGAAGGAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 1914 het 1162 hom 28 6 8 15 GGAA 3 2 266437 CASAVA_Build 7 14740352 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2470 hom 15 het 6 0 6 0 T 11 10 266438 CASAVA_Build 7 14742347 1D TCTATTGTCT G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 5 G 2 1 266439 CASAVA_Build 7 14742625 1I GAAAAATGTA -/C CTGTTTGAAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 C 1 2 266440 CASAVA_Build 7 14746388 2D CGCTTAAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 39 1 25 13 T 16 14 266441 CASAVA_Build 7 14751953 1I TTCAATGTGT -/C CGCATGCTTA 3070 hom 102 het 40 0 32 8 C 1 2 266442 CASAVA_Build 7 14815764 1D TGGGACAATA T/- TTTTTTTTTG 1915 het 1915 ref 38 28 5 5 T 10 9 266443 CASAVA_Build 7 14834070 1D AATATGAACT C/- CGAAATGAAT 3070 het 2987 hom 36 8 24 5 C 2 1 266444 CASAVA_Build 7 14836301 1I AGTACTTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 8 9 266445 CASAVA_Build 7 14836521 1I19M1I AGAGAAATAA -TTTAATAGGCAGAAATTTC-/TTTTATTAGGCAGAAATTTCA AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 17 15 4 N/A 0 0 266446 CASAVA_Build 7 14837012 16D TAAAGTACTG AAAATAACTTAATGAT/---------------- AACTAATATT 3070 het 3070 ref 34 20 17 3 AAAATAACTTAATGAT 1 0 266447 CASAVA_Build 7 14839551 2I GATTTATGTT --/TA TGTTTTTATG 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 TA 0 1 266448 CASAVA_Build 7 14847605 1D AAAGAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 12 11 266449 CASAVA_Build 7 14848906 1D CACATTACAC A/- CCTGTCTCCC 3070 het 3070 hom 55 24 28 5 A 1 0 266450 CASAVA_Build 7 14850021 1D CTTACAGTTA C/- ACGAAAGGCA 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 C 1 0 266451 CASAVA_Build 7 14851786 23D TCTCAGGTCA ATGAATATTTCTTGAATGAATTC/----------------------- ACTTATTTCC 3070 het 3070 ref 34 26 13 6 ATGAATATTTCTTGAATGAATTC 1 0 266452 CASAVA_Build 7 14855467 1I TTTGTCCCCC -/A TCACTGCTGC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 0 1 266453 CASAVA_Build 7 14856491 1D ATCGAGAGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 9 8 266454 CASAVA_Build 7 14867478 2I TATTAAAATA --/TT TGACTTTCAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 1 3 266455 CASAVA_Build 7 14869271 5I TTTTATGTGG -----/TAGTT TAAAGTGCCA 1296 het 1296 ref 16 12 3 1 TAGTT 0 1 266456 CASAVA_Build 7 14870252 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2120 het 2120 ref 28 11 8 9 A 17 16 266457 CASAVA_Build 7 14870945 1I AGATGATGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 A 13 14 266458 CASAVA_Build 7 14871249 1I ATTGGTGAAC -/T AAAATGTGAT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 0 1 266459 CASAVA_Build 7 14874491 1I TTCCTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 13 11 T 13 14 266460 CASAVA_Build 7 14886395 1I CGGATCACAA -/G GCCAGGAGTT 3070 hom 75 het 32 0 24 8 G 1 2 266461 CASAVA_Build 7 14897023 1D GCCACAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1671 hom 41 8 22 11 A 13 12 266462 CASAVA_Build 7 14912598 8D TTTTTCTGTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1512 het 645 hom 19 3 7 9 T 24 16 266463 CASAVA_Build 7 14920994 1D TAGAAATTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 10 9 266464 CASAVA_Build 7 14922267 1I TTGAAACAGT -/A ATACTATACT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 1 2 266465 CASAVA_Build 7 14922437 4I AGGGAACGAC ----/TTTT TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 3 7 266466 CASAVA_Build 7 14927019 1I CTTACATGTA -/T TTTTTCTGAG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 5 6 266467 CASAVA_Build 7 14941430 5I GAGAAAAACA -----/TTTCT TTTATAGCAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TTTCT 0 1 266468 CASAVA_Build 7 14949485 1I ATGCCATAAG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 7 8 266469 CASAVA_Build 7 14950833 11D ATGACTGTGT GTGTGAGGAAG/----------- TTGCTACTCA 3070 het 3070 ref 41 25 17 3 GTGTGAGGAAG 1 0 266470 CASAVA_Build 7 14950965 1I AGACTGATGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 8 9 266471 CASAVA_Build 7 14953702 39D ACAATAGGAT ATATTAAATGATACTCATAGGAGAAAAATGTTCTTCCTC/--------------------------------------- ATATAGATAT 3070 het 3070 hom 29 18 17 6 ATATTAAATGATACTCATAGGAGAAAAATGTTCTTCCTC 1 0 266472 CASAVA_Build 7 14956256 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2348 hom 18 7 10 1 A 9 8 266473 CASAVA_Build 7 14956353 11D GAAAAACATG ACTCATCCCTT/----------- ACTCATCTCT 2947 het 2947 ref 28 18 7 6 ACTCATCCCTT 1 0 266474 CASAVA_Build 7 14957011 2D ACTAGCAAAT CA/-- AATCCAGTAA 3070 het 3070 ref 30 16 14 2 CA 1 0 266475 CASAVA_Build 7 14970285 3D AGTTATGAGT AAG/--- AAGAAGGAAT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 AAG 3 2 266476 CASAVA_Build 7 14977913 1D ATTGAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 1486 het 1486 ref 28 12 5 11 T 17 16 266477 CASAVA_Build 7 14994133 1D GGATCTGGGG A/- ACTTGAAGTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 A 2 1 266478 CASAVA_Build 7 15001722 4D TTCCTTTTAG TCTC/---- TCTAAGTGGC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 TC 3 1 266479 CASAVA_Build 7 15005958 1D AAACTTCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 28 8 A 10 9 266480 CASAVA_Build 7 15007764 1I TAACACTAAC -/A AATATCTGAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 3 266481 CASAVA_Build 7 15010545 3D ATACTTTCTG TTC/--- TTCTTCCTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 TTC 3 2 266482 CASAVA_Build 7 15011032 1D CATCATTCAG A/- AAAAAATGTA 3070 hom 76 het 31 0 24 7 A 7 6 266483 CASAVA_Build 7 15012578 1I CCTGTCAAAC -/T CTTTTTTTTT 3070 het 2865 hom 27 11 10 6 T 0 1 266484 CASAVA_Build 7 15015157 2D TTTTAAAATA TT/-- TAACATCTTC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 3 1 266485 CASAVA_Build 7 15017791 3D CTTTCTCAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 37 1 27 10 T 16 13 266486 CASAVA_Build 7 15018705 13D TGTGTTCATA AGGGGACAAAGCC/------------- AGGGGACAAA 3070 het 3070 ref 40 22 19 7 AGGGGACAAAGCC 2 1 266487 CASAVA_Build 7 15019746 3I TGACTTCTTC ---/TTA TTATTTTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTA 1 2 266488 CASAVA_Build 7 15021387 2I TATAATAAAT --/TA TATATATATA 1254 het 1068 hom 10 3 4 3 TA 5 6 266489 CASAVA_Build 7 15023525 5I TTCCTTACTG -----/AAACA AAATTTGGAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAACA 0 1 266490 CASAVA_Build 7 15031409 7D AGGGAACCAA GAAAGAG/------- GAGTTTGGGG 3070 het 3070 ref 29 16 12 4 GAAAGAG 1 0 266491 CASAVA_Build 7 15032509 1I30M1I AAAATAAAAA -GATAATTGTGTCTACTGAACATGCACAGAC-/GGATAATTGTGTCTACTGAACATGCACAGACT TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 28 17 13 11 N/A 0 0 266492 CASAVA_Build 7 15038683 2D AGCCATCTGT TG/-- TGTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 18 7 TG 2 1 266493 CASAVA_Build 7 15041770 4D CAAAAACTGC TTAA/---- TTATTATTTT 3070 het 3070 ref 34 22 10 4 TTAA 1 0 266494 CASAVA_Build 7 15047934 1I TTACTAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 36 2 31 3 A 10 11 266495 CASAVA_Build 7 15051142 2D CTAATTATTT TC/-- TCTTTATTAC 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 TC 2 1 266496 CASAVA_Build 7 15055277 3I GTGAAAATTA ---/CTG CTAAGATATT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 CTG 0 1 266497 CASAVA_Build 7 15056107 7I CACAGAAAGC -------/GTGAAAG GTGAAAGGTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 GTGAAAG 1 2 266498 CASAVA_Build 7 15056380 1I TTATAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 31 1 25 5 A 12 13 266499 CASAVA_Build 7 15056868 2I GCTGCTGAAG --/AC ACAGTTTCTA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 AC 1 2 266500 CASAVA_Build 7 15062205 5D CTTGTTTTTC TCTTT/----- TAAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 14 2 TCTTT 1 0 266501 CASAVA_Build 7 15064714 1I GTTTGTTTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 T 9 10 266502 CASAVA_Build 7 15075739 1D AAAGGCCCCA C/- TTCCTAATAC 3070 het 3070 hom 34 13 21 0 C 1 0 266503 CASAVA_Build 7 15082126 5D GCAATAGCAT AGATA/----- AATTTCCCAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 6 AGATA 1 0 266504 CASAVA_Build 7 15088610 1D CTTGGAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 A 9 8 266505 CASAVA_Build 7 15094711 10I TGTGTACATA ----------/TTTCTTTCCT TTTTTTTTTT 3070 het 561 hom 20 5 11 5 TTTCTTTCCT 0 1 266506 CASAVA_Build 7 15095695 17I TCTCTATAGA -----------------/GAGATGCATTATATAGG GAGATGATAT 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 GAGATGCATTATATAGG 0 1 266507 CASAVA_Build 7 15096418 1D ATTTTAAAAT A/- AAATTTGCCT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 4 3 266508 CASAVA_Build 7 15098846 2D TTATTTGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 13 11 266509 CASAVA_Build 7 15100420 1I ATGTAAGAGG -/A ATGGGTGAAA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 1 2 266510 CASAVA_Build 7 15126902 4D AGATAATATA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 102 het 38 0 34 6 TTTC 3 2 266511 CASAVA_Build 7 15144764 1I TGCAGCACAT -/A ACAATCAAGA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 1 2 266512 CASAVA_Build 7 15144988 1D TAAAATTCTC A/- AAAAATTGTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 6 5 266513 CASAVA_Build 7 15159335 1D GATAGGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 25 1 18 6 T 11 10 266514 CASAVA_Build 7 15167786 2D ATATTCATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 AT 6 5 266515 CASAVA_Build 7 15169931 1I TACAGTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 10 266516 CASAVA_Build 7 15176514 4D AATTTTGTAG TTGT/---- TTATTTTTAT 3070 hom 69 het 26 0 23 4 TTGT 1 0 266517 CASAVA_Build 7 15180911 9D TGGAAAAAGA CTAGCTAAT/--------- ACATTCCAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CTAGCTAAT 1 0 266518 CASAVA_Build 7 15183260 2D AGGAAAAAAC AT/-- GATTTAAAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AT 1 0 266519 CASAVA_Build 7 15189280 1I TCAAGTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 11 12 266520 CASAVA_Build 7 15194050 1I AGGATTAACT -/C CCCCCCCGAC 3070 het 52 hom 39 1 33 5 C 7 8 266521 CASAVA_Build 7 15194927 4I CAGTGTGGTT ----/AGTA AGTGTCAGAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AGTA 0 1 266522 CASAVA_Build 7 15243131 4D AAATAGTACT CAAA/---- CAAACATAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 CAAA 2 1 266523 CASAVA_Build 7 15247872 1D ATGTAATGGC T/- TAAAAAATTC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 2 1 266524 CASAVA_Build 7 15250334 4I GTACAATAAA ----/TAGT TAGAAGGATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TAGT 0 1 266525 CASAVA_Build 7 15269562 1I TGGGCATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 8 9 266526 CASAVA_Build 7 15283042 1D CCATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 15 14 266527 CASAVA_Build 7 15293935 1I CGTAGCTAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 33 0 25 8 T 9 10 266528 CASAVA_Build 7 15295434 2I GAATGTTAAT --/TC TGTTTCTTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TC 0 1 266529 CASAVA_Build 7 15298225 1D GAGTCAAAGA T/- TTTTTTACAA 3070 hom 123 het 50 0 41 9 T 7 6 266530 CASAVA_Build 7 15301088 11D ACGTCATAAA CCTAAATAATG/----------- CCTAAATAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 6 CCTAAATAATG 1 0 266531 CASAVA_Build 7 15312722 1I ATGACTGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 795 hom 40 2 31 7 A 12 13 266532 CASAVA_Build 7 15322760 2D CAACAAATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 36 0 31 6 AC 8 7 266533 CASAVA_Build 7 15324161 1D TATACATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 13 12 266534 CASAVA_Build 7 15326274 1I GGGGTGGGGG -/A AGGGGGAAGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 1 2 266535 CASAVA_Build 7 15329106 2I ATATATATAT --/AA AACACGTGTG 1214 hom 12 het 8 0 5 3 A 2 4 266536 CASAVA_Build 7 15329168 2D AGAAAGGAAA TT/-- TTGTAGGTCG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 4 2 266537 CASAVA_Build 7 15331600 1I AAAAAGCTTA -/T TTTTTAATTA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 5 6 266538 CASAVA_Build 7 15336208 7D TATAGAATTA TTTTCTT/------- TTTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 20 10 10 2 TTTTCTT 2 1 266539 CASAVA_Build 7 15340462 2D CCTTGGTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 16 6 T 14 12 266540 CASAVA_Build 7 15344616 3I GATGCTCTGA ---/TCT TCTTATTTAA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 TCT 1 2 266541 CASAVA_Build 7 15353003 4D TTAAATTAGT AGTA/---- AGTAACTATT 3070 het 3070 hom 25 9 11 7 AGTA 2 1 266542 CASAVA_Build 7 15353765 1I CTGATTTCCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 8 9 266543 CASAVA_Build 7 15362130 4D ACATAATGAT CCAC/---- CCACTTCAAT 3070 het 3070 hom 44 17 24 4 CCAC 2 1 266544 CASAVA_Build 7 15373406 1D ATAATTTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 8 7 266545 CASAVA_Build 7 15374431 1I GAATGAGACC -/A AAAAAAAAAA 2704 het 1976 hom 27 8 10 9 A 15 16 266546 CASAVA_Build 7 15377497 1D AGCCTCCAGA G/- GTAGCTGGGA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 G 2 1 266547 CASAVA_Build 7 15377865 1D GATTTTTGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 44 het 23 0 14 10 T 9 8 266548 CASAVA_Build 7 15378068 4D ATTAAATTAT TAAG/---- TGTTTCTAAA 3070 hom 24 het 15 0 9 6 TAAG 1 0 266549 CASAVA_Build 7 15378313 1I CTAAAGTCTA -/C ACATGCGGCT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 C 0 1 266550 CASAVA_Build 7 15382536 3I ATTTTTTTAC ---/AGA AGGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 AGA 0 1 266551 CASAVA_Build 7 15389640 3D TTTCAAGAAA CCT/--- CCTTTCCTTA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 CCT 2 1 266552 CASAVA_Build 7 15392342 2D AGAAAAGAAA AG/-- AAAAAAAAGG 2076 het 371 hom 28 2 9 17 AG 1 0 266553 CASAVA_Build 7 15393801 2I TATTTAAAAC --/AT GTTATGCCTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 0 1 266554 CASAVA_Build 7 15439929 2I TTAATATATG --/TA TATATGTTAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TA 2 3 266555 CASAVA_Build 7 15441465 2I TGGCTGTGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 34 1 21 12 T 13 15 266556 CASAVA_Build 7 15442477 2I GGTTAGAGTT --/CA GTTTCTGTGC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 CA 0 1 266557 CASAVA_Build 7 15467638 1D AAAAACTAAA G/- GAAAAGGTGG 3070 hom 54 het 23 0 19 5 G 2 1 266558 CASAVA_Build 7 15468214 1I TGGAAAAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 10 266559 CASAVA_Build 7 15481001 1I AAATTTACAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 8 9 266560 CASAVA_Build 7 15502701 1I CTGAGGAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 620 hom 40 2 33 5 A 10 11 266561 CASAVA_Build 7 15512429 1D TTACTATTAC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 9 8 266562 CASAVA_Build 7 15516963 2I ATAAGGAAAC --/TT ATTTTATTAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 0 2 266563 CASAVA_Build 7 15519448 9I AACTTTAAAC ---------/TACATTCCT CACAAAATGT 3070 hom 102 het 40 0 35 7 TACATTCCT 0 1 266564 CASAVA_Build 7 15522910 1D AGTTACATCC T/- TTTTTTTTTT 858 het 858 ref 41 32 3 7 T 11 10 266565 CASAVA_Build 7 15526135 1D ATGGGAAGCC A/- AAAAAAAAAA 2530 het 93 hom 22 1 9 13 A 14 13 266566 CASAVA_Build 7 15530879 1I CAGGCATGGT -/G GCACATGCCT 3070 hom 66 het 24 0 23 3 G 1 2 266567 CASAVA_Build 7 15538862 9D CTTCCTAGGC TGGGTGCGG/--------- TGGTTCATGC 3070 hom 72 het 28 0 24 8 TGGGTGCGG 1 0 266568 CASAVA_Build 7 15542094 1I TATAATATAC -/A GTGGGTACTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 0 1 266569 CASAVA_Build 7 15564148 4D TTTTTTTCCT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 92 het 45 0 30 17 TC 11 9 266570 CASAVA_Build 7 15572019 1D AATCTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 9 11 T 12 11 266571 CASAVA_Build 7 15585684 1I GCCTCAGCCT -/C CCGAGTAGCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 2 3 266572 CASAVA_Build 7 15588478 5I GGGAAAATAA -----/TAATT TATTGTTTTA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TAATT 0 1 266573 CASAVA_Build 7 15593327 1D ATTTTAGAGG C/- CCCCTCCCTG 3070 hom 59 het 25 0 18 7 C 5 4 266574 CASAVA_Build 7 15602189 1I AATCTCCTAT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 8 266575 CASAVA_Build 7 15603395 1I CTAGCAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 272 hom 37 1 31 5 T 9 10 266576 CASAVA_Build 7 15607117 1D GCATCTCTAG C/- AAGTTCCCAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 0 266577 CASAVA_Build 7 15607867 3I TGTTCTAATT ---/GTA GTAGCAATAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 GTA 1 2 266578 CASAVA_Build 7 15608373 1I TGTAACACCC -/A AAAAAATGGA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 6 7 266579 CASAVA_Build 7 15619546 1I TATTAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 9 266580 CASAVA_Build 7 15620205 1D TTTATCTATT G/- TTTCTTTTAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 1 0 266581 CASAVA_Build 7 15620570 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 91 het 39 0 30 9 A 9 10 266582 CASAVA_Build 7 15621331 1D ATTGGTGCTG T/- TTATACAGTA 3070 hom 69 het 31 0 24 9 T 3 2 266583 CASAVA_Build 7 15621580 1D CATTTGTAAT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 266584 CASAVA_Build 7 15666604 4I CTTTGGCACT ----/ATGG ATGGACCTTC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 ATGG 1 2 266585 CASAVA_Build 7 15669658 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 20 4 T 12 11 266586 CASAVA_Build 7 15679043 5D TTCTGTCTTG AAAAA/----- AAAAAAAAGA 3070 het 1377 hom 20 4 14 2 A 13 8 266587 CASAVA_Build 7 15681140 1D TTTCCTGGTG T/- TCTGCTTGTA 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 T 2 1 266588 CASAVA_Build 7 15692643 2I AACCGTGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 23 8 T 10 12 266589 CASAVA_Build 7 15698309 3D AGAATGGGCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 22 10 A 16 13 266590 CASAVA_Build 7 15709886 1D CCAATAAATG T/- TTTTTTTTTT 1417 het 1417 ref 38 25 4 9 T 12 11 266591 CASAVA_Build 7 15718335 1I GACAAGGGGG -/A AAAAAGCATG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 5 6 266592 CASAVA_Build 7 15722594 2D TTGAGAGAAA AC/-- ACACACACAC 1036 het 1036 ref 34 24 3 8 AC 10 9 266593 CASAVA_Build 7 15724050 1D TGACGGAACA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 19 het 35 1 20 14 T 8 7 266594 CASAVA_Build 7 15746378 1D CAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 10 9 266595 CASAVA_Build 7 15748479 2D CCTCTCCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 129 het 56 0 44 12 TC 8 7 266596 CASAVA_Build 7 15770670 2I AAACTAAATT --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 9 11 266597 CASAVA_Build 7 15790047 1D TCAAGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 1968 het 1968 ref 37 18 8 11 A 15 14 266598 CASAVA_Build 7 15809291 1D GTCATTATCC T/- TTTTTTTTTG 940 het 940 ref 46 35 3 8 T 10 9 266599 CASAVA_Build 7 15822497 1I TGGGCATGGT -/G GCGGGCGCCT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 G 1 2 266600 CASAVA_Build 7 15858921 1I GAAAAAACTT -/A AAAATTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 A 4 5 266601 CASAVA_Build 7 15866592 5D GATCCTAATC TAATT/----- ATCACATTAT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 TAATT 1 0 266602 CASAVA_Build 7 15869125 1D GTCACTGAGA G/- GTTGGGCCCA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 G 2 1 266603 CASAVA_Build 7 15870537 1D GCAGGCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 39 0 29 10 T 13 12 266604 CASAVA_Build 7 15873212 1I GAGAATATGC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 7 8 266605 CASAVA_Build 7 15877032 1I AAACAAAGCC -/T CTTTTTCCCC 3070 het 282 hom 47 1 39 7 T 0 1 266606 CASAVA_Build 7 15877836 4D TCTGCTTTGG TTTT/---- TTTATTCCCA 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 T 7 3 266607 CASAVA_Build 7 15882123 3D ATGACAATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2677 het 281 hom 30 4 10 16 T 21 18 266608 CASAVA_Build 7 15884161 1I GTGGTTCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 9 10 266609 CASAVA_Build 7 15886674 1D CCTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 2477 het 2477 ref 31 19 6 6 A 15 14 266610 CASAVA_Build 7 15888524 12I TGAGACGGTA ------------/TCTCATTGTGGT TCTGATTTGC 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TCTCATTGTGGT 0 1 266611 CASAVA_Build 7 15888570 2D GCTTTTGTTC AT/-- ATGTTTCTTG 1237 het 1237 ref 20 7 3 10 AT 2 1 266612 CASAVA_Build 7 15890019 1D TAAGCATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 23 1 20 2 A 11 10 266613 CASAVA_Build 7 15905831 1D AATGGAAAAA G/- AAAATGGGCC 2998 het 2596 hom 30 10 9 11 G 1 0 266614 CASAVA_Build 7 15908745 3D GTTTTTATTG TCT/--- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 52 26 21 6 TCT 1 0 266615 CASAVA_Build 7 15909188 1D CAGAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 10 266616 CASAVA_Build 7 15918707 1I CAGCATAAGG -/A TTGGGCAGAT 3070 het 3070 hom 55 25 21 9 A 0 1 266617 CASAVA_Build 7 15920448 1I ACTCAGCCAT -/A AAAAGGAACG 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 A 4 5 266618 CASAVA_Build 7 15952897 1D ATTTCTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1702 hom 49 6 26 17 T 17 16 266619 CASAVA_Build 7 15953672 2D CATAAATATA TG/-- TGTAATATGT 3070 het 3070 ref 53 30 20 3 TG 2 1 266620 CASAVA_Build 7 15970989 3I ACACTGCAAT ---/AGC AGCTTAGTTA 3070 het 3070 hom 58 26 28 4 AGC 1 2 266621 CASAVA_Build 7 15986220 4D TAACGAATGG AAAT/---- AAATAAAATG 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 AAAT 2 1 266622 CASAVA_Build 7 15997534 3I CTATTACTAC ---/AAA AAAAAAAAAA 1715 het 1715 ref 22 10 7 5 A 10 13 266623 CASAVA_Build 7 15998896 4I CTCTCTTTTC ----/TTCT TTATTAGTCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTCT 0 1 266624 CASAVA_Build 7 15999780 1I GTTTAAAGTC -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 T 6 7 266625 CASAVA_Build 7 16002519 1I TGAAATAAAA -/C CTAAGGGAAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 C 1 2 266626 CASAVA_Build 7 16010471 1D AGGCGGGGGG A/- AGTTACCTTT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 2 1 266627 CASAVA_Build 7 16022940 2I TACGTATACG --/TA TATATATATA 1808 het 1808 ref 12 5 5 2 TA 5 6 266628 CASAVA_Build 7 16023061 2D CATACATATT TA/-- TATATATATA 2151 het 1073 hom 11 4 6 1 TA 7 6 266629 CASAVA_Build 7 16024918 1D CTACTGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 22 12 9 A 10 9 266630 CASAVA_Build 7 16026485 1I AAAAACTTTG -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 7 8 266631 CASAVA_Build 7 16036122 1I AAAATGAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 9 10 266632 CASAVA_Build 7 16040374 1I TTCCTACTGT -/C CATACACTGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 266633 CASAVA_Build 7 16042783 1D ACTGGGATGA T/- TTTTTTCACA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 7 6 266634 CASAVA_Build 7 16043577 3D CTCCTAATAC CTT/--- CTTAATTTAA 3070 het 3070 hom 48 20 25 5 CTT 2 1 266635 CASAVA_Build 7 16050608 1D GCCGTAAAGC A/- ATGCCTGGGA 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 A 2 1 266636 CASAVA_Build 7 16057262 1D ATTAAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 12 11 266637 CASAVA_Build 7 16060941 3D TCCAGCCAGT ACA/--- ACAACACATA 3070 het 3070 ref 32 17 12 5 ACA 3 2 266638 CASAVA_Build 7 16065165 1I GAGTTTTTTT -/A TAAAAAAATA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 0 1 266639 CASAVA_Build 7 16071054 5I GAAAATACCT -----/CAAGA CAAGAGGTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CAAGA 1 2 266640 CASAVA_Build 7 16078618 3I CCAGCTACTC ---/AGT GGGGGAACTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AGT 0 1 266641 CASAVA_Build 7 16095521 4I TACATGCATG ----/TACA TACATATATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TACA 1 2 266642 CASAVA_Build 7 16122810 1D GACTCGGTCG A/- AAAAAAAAAA 1363 het 68 hom 23 1 8 14 A 16 15 266643 CASAVA_Build 7 16161124 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1565 hom 16 het 18 0 6 12 T 17 16 266644 CASAVA_Build 7 16162266 3D ATTCAAAAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 36 5 14 19 A 19 16 266645 CASAVA_Build 7 16163334 1D AATGCTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 11 13 T 16 15 266646 CASAVA_Build 7 16171377 1D CTCCTCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 6 A 12 11 266647 CASAVA_Build 7 16182412 1D GTCAGTTTAA T/- ATCCTAGAGG 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 1 0 266648 CASAVA_Build 7 16182904 1I ATTATTCTCC -/A TAAAGTTAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 0 1 266649 CASAVA_Build 7 16184212 1D AAAAGAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 46 2 36 9 A 13 12 266650 CASAVA_Build 7 16184954 1I AGCATTTTTT -/A AAAAGATAAA 3070 hom 141 het 53 0 47 6 A 4 5 266651 CASAVA_Build 7 16192959 2D CAGATATAAC AG/-- AGCAAAATCT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 AG 2 1 266652 CASAVA_Build 7 16200999 1I GGTCTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 44 1 33 10 T 11 12 266653 CASAVA_Build 7 16205815 1D AAGTTCACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 52 het 22 0 18 4 A 10 9 266654 CASAVA_Build 7 16219560 2D TTTGGGGACT TA/-- TTTATAATAA 3070 hom 47 het 18 0 16 3 TA 1 0 266655 CASAVA_Build 7 16230031 1I ATCAAGTAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 T 9 10 266656 CASAVA_Build 7 16287461 1D TTGACACCAC T/- TATAAATTGA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 2 1 266657 CASAVA_Build 7 16292701 12D CAACTTATAC CTTACTCATCAA/------------ TTCCTACCAA 1606 het 1606 ref 50 29 5 19 CTTACTCATCAA 1 0 266658 CASAVA_Build 7 16299498 1I CAAGTTGTAA -/T CCATTCAAAG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 0 1 266659 CASAVA_Build 7 16300621 1D TCCAATTTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 10 9 266660 CASAVA_Build 7 16308985 1D ACAGGACTGA T/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 7 6 266661 CASAVA_Build 7 16315268 1D ATTATTTACA T/- TTTGTTTATA 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 T 4 3 266662 CASAVA_Build 7 16333042 3I GCCTAAATAC ---/TTG TATCAAATCA 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 TTG 0 1 266663 CASAVA_Build 7 16334639 4I AGATAAATAG ----/CTCT CTATCTCCAG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 CT 1 3 266664 CASAVA_Build 7 16335531 1D TATTAAAATT G/- TAAGTGAAGT 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 G 1 0 266665 CASAVA_Build 7 16344686 1I CCTGGCTAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 7 8 266666 CASAVA_Build 7 16349765 22D ATTGTTTAAC ATCACAGTTGCATTAGATGGTG/---------------------- ATCACAGTTG 3070 het 3070 hom 34 19 19 5 ATCACAGTTGCATTAGATGGTG 1 0 266667 CASAVA_Build 7 16351897 2I TAAAATGTCA --/CT CTCTCAGTCC 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 CT 2 3 266668 CASAVA_Build 7 16352672 1I ATAGCAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 A 9 10 266669 CASAVA_Build 7 16354883 3D GAAGACAAAC AGT/--- AGCCTCTCAG 3070 het 3070 ref 46 24 18 8 AGT 1 0 266670 CASAVA_Build 7 16356263 1D TCAAGAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 11 10 266671 CASAVA_Build 7 16358571 1D CAACAAAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 T 3 2 266672 CASAVA_Build 7 16360002 1D TCCATCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 11 10 266673 CASAVA_Build 7 16360644 2D GTGGTAGGGA AC/-- ACACAGACTG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 AC 3 2 266674 CASAVA_Build 7 16362204 1D GTGGAACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 7 A 11 10 266675 CASAVA_Build 7 16373325 1I GTCAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 10 11 266676 CASAVA_Build 7 16392333 3I GGGAAGATGA ---/TCT TCTCCTGGAG 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 TCT 1 2 266677 CASAVA_Build 7 16404376 11D ACATGTAATA ACGTGACTGAC/----------- ACGTGACCAA 3070 het 3070 ref 98 51 43 12 ACGTGACTGAC 1 0 266678 CASAVA_Build 7 16404535 2D CATGATTGAC AT/-- GTGACTGACA 3070 het 3070 ref 91 44 37 16 AT 1 0 266679 CASAVA_Build 7 16408247 6D TAAGACCCAT AAAAGG/------ GAAAGTCCCT 3070 het 3070 ref 40 25 15 2 AAAAGG 1 0 266680 CASAVA_Build 7 16408850 1D AGACAGAGCT A/- AAAAAAAAAA 2979 het 2979 ref 35 18 8 9 A 13 12 266681 CASAVA_Build 7 16410004 3D CTAGCCTTGA GCT/--- GCTCTTTTAC 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 GCT 2 1 266682 CASAVA_Build 7 16422832 1I AAACAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1737 hom 25 8 8 9 A 11 12 266683 CASAVA_Build 7 16428710 3D ATTAATAAAA AAT/--- AATCTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 23 18 4 AAT 2 1 266684 CASAVA_Build 7 16448740 1D TCAACAAGCG A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 A 8 7 266685 CASAVA_Build 7 16453001 1D TTACCTCCTT A/- AAAGGACTGA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 A 4 3 266686 CASAVA_Build 7 16454956 3D CACCAGTATC ATT/--- ATTATTTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 ATT 3 2 266687 CASAVA_Build 7 16466058 1D ATTTTTAGTA T/- TTTAAAATAA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 T 4 3 266688 CASAVA_Build 7 16471580 1D ACCAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 44 0 36 8 A 11 10 266689 CASAVA_Build 7 16479258 1I TCTTTCCTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 9 10 266690 CASAVA_Build 7 16482687 4I TACTGAACAA ----/TACT TAAACTTATT 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 TACT 0 1 266691 CASAVA_Build 7 16490070 3D AAAATAAAAA AAT/--- AAATAAATAA 27 het 27 ref 14 5 1 8 AAT 1 0 266692 CASAVA_Build 7 16491549 2D TTCTTCACAC AT/-- GTTATGATTA 3070 het 3070 ref 45 22 21 2 AT 1 0 266693 CASAVA_Build 7 16492223 12I AGGAAACAAC ------------/AGATGCTGGAGA GGATGTGGAG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AGATGCTGGAGA 0 1 266694 CASAVA_Build 7 16503332 2D AGTTACCATT TG/-- TGTGTGTGTG 1450 het 1450 ref 50 39 4 7 TG 10 9 266695 CASAVA_Build 7 16510654 1I AATGAGGGGG -/A AAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 5 6 266696 CASAVA_Build 7 16519227 1I AATTGGTAAC -/A ATACCTTTAC 3070 het 3070 ref 51 32 17 2 A 1 2 266697 CASAVA_Build 7 16526771 1I CTCTTATGGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 8 9 266698 CASAVA_Build 7 16529826 1I TTATGTAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 22 11 8 3 A 8 9 266699 CASAVA_Build 7 16530303 4D AATTAGAAAG AATT/---- ATTTAAATTA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AATT 1 0 266700 CASAVA_Build 7 16532528 2D ATGCAATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 A 13 11 266701 CASAVA_Build 7 16538902 1D GAAATTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 13 12 266702 CASAVA_Build 7 16556023 6I TAAAAGGAAA ------/CGTACT TATATCTGCA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 CGTACT 0 1 266703 CASAVA_Build 7 16558556 2D AGGAAATGAA GT/-- GTGTGCAGAA 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 GT 3 2 266704 CASAVA_Build 7 16561925 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 36 1 28 8 A 12 11 266705 CASAVA_Build 7 16564152 4D ATGCACCGCT AAGA/---- AAGAACATCT 3070 hom 129 het 47 0 44 5 AAGA 2 1 266706 CASAVA_Build 7 16572387 1I AATCTCTTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 6 7 266707 CASAVA_Build 7 16593358 1I CTCTATTCCA -/C CAGTGCTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 2 266708 CASAVA_Build 7 16594689 2I AGAGAGAGTA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 44 0 30 14 AG 7 8 266709 CASAVA_Build 7 16595650 3D CAATAACAAA AAT/--- AATAATAACA 3070 hom 87 het 31 0 30 3 AAT 3 2 266710 CASAVA_Build 7 16595776 2D TGTCTGTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 96 het 44 0 32 12 TC 7 6 266711 CASAVA_Build 7 16597268 4D AGTCAAATCG CTAA/---- CTAAGAATAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CTAA 2 1 266712 CASAVA_Build 7 16597471 1D GAAAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 32 0 16 16 T 15 14 266713 CASAVA_Build 7 16612580 1I CCTTGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 461 hom 26 1 19 6 A 13 14 266714 CASAVA_Build 7 16622722 1D CTCCTGCGGC G/- CCCCCCCCTC 3070 hom 46 het 22 0 13 9 G 1 0 266715 CASAVA_Build 7 16637318 3I TCTGTTGTGG ---/TGA TGATCCTATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TGA 1 2 266716 CASAVA_Build 7 16642608 1I GACAGTACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 25 1 21 3 A 14 15 266717 CASAVA_Build 7 16645015 1I CTAGCACCCC -/T ATTGTTCAGG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 0 1 266718 CASAVA_Build 7 16648212 2I GTATCTCAAT --/AA AGTTGGTAAG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 1 3 266719 CASAVA_Build 7 16675772 1D TCAGTGACAT C/- CAGAAAGGGA 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 C 2 1 266720 CASAVA_Build 7 16680112 1D TGCAATGGCA C/- TGTCTCTGCT 3070 het 3019 hom 16 8 7 1 C 1 0 266721 CASAVA_Build 7 16680459 1I GCTCTGTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 93 hom 20 1 17 2 T 9 10 266722 CASAVA_Build 7 16681180 1D ATCATTTAAA T/- TTTAAGTAAG 3070 het 3070 hom 29 11 18 0 T 4 3 266723 CASAVA_Build 7 16702695 1I TTAGGGATGG -/A GATAAAAGTT 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 A 0 1 266724 CASAVA_Build 7 16711458 2D CAGTGAGCCA AG/-- ATTGCGCCAC 3070 het 2542 hom 21 7 8 6 AG 1 0 266725 CASAVA_Build 7 16716058 1D ACACAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 2267 het 2267 ref 26 11 8 7 A 15 14 266726 CASAVA_Build 7 16718790 1D TCCTCATCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 A 12 11 266727 CASAVA_Build 7 16721387 1I AAAGCTGATT -/A AAAACTGGCA 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 A 4 5 266728 CASAVA_Build 7 16721536 1I AGTGAAAAGT -/A ATAGTCCTAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 A 1 2 266729 CASAVA_Build 7 16726574 1D GAGGTAGGTA G/- GAAAAGCTCA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 G 2 1 266730 CASAVA_Build 7 16727441 5I TTTTCTCTGA -----/CATAT CATATCTCTC 3070 het 3070 hom 29 11 15 4 CATAT 1 2 266731 CASAVA_Build 7 16737164 1I CTTCAGCACC -/T TATGTTGAAA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 1 2 266732 CASAVA_Build 7 16739889 1D AAACCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 18 3 13 2 A 15 14 266733 CASAVA_Build 7 16744158 2I CTCTGTGATC --/TT TTTTTTTTTT 2723 het 2723 ref 32 14 11 7 T 10 12 266734 CASAVA_Build 7 16744984 1D GACTGATGGT C/- CCCTGGGTAG 3070 het 3070 hom 33 10 18 6 C 4 3 266735 CASAVA_Build 7 16748306 9I TACCACAGAG ---------/TGACCCTGT TGACACCATA 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 TGACCCTGT 0 1 266736 CASAVA_Build 7 16756937 2I AAATAGTTGC --/AG AGTCATTCTG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 AG 1 2 266737 CASAVA_Build 7 16761692 1I TTCTCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 1486 het 1015 hom 28 5 11 12 T 17 18 266738 CASAVA_Build 7 16763658 1D ACAAACAACC A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 8 7 266739 CASAVA_Build 7 16771417 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTATT 3036 het 3036 ref 31 19 9 5 T 8 7 266740 CASAVA_Build 7 16775688 2I CTTATATTTT --/GG GGGGGTATAT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 G 5 7 266741 CASAVA_Build 7 16779315 1I AAAAAATCTT -/G GGGGGGGGGC 433 het 433 ref 13 6 3 4 G 9 10 266742 CASAVA_Build 7 16780982 1D TATTCTCAAG T/- TTTGTCTCTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 4 3 266743 CASAVA_Build 7 16790133 1I TAGGAAAGAT -/G TGTTGTGGTA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 G 0 1 266744 CASAVA_Build 7 16792229 1I AGGGCCACTG -/C CCAAGGGCAC 3070 hom 126 het 49 0 41 8 C 2 3 266745 CASAVA_Build 7 16793698 1D TTAATTAGGC A/- TGTTGACCGT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 A 1 0 266746 CASAVA_Build 7 16794784 1D GTATCTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 14 8 T 15 14 266747 CASAVA_Build 7 16800391 5D ATTTCTAACT TTAAC/----- TTAAGTAGCA 3070 hom 147 het 55 0 45 12 TTAAC 1 0 266748 CASAVA_Build 7 16802251 1I TCCCACCCCC -/A AGAGATTCTG 3070 hom 57 het 21 0 18 3 A 1 2 266749 CASAVA_Build 7 16803077 1D CTCATATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 30 1 17 12 T 12 11 266750 CASAVA_Build 7 16803238 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 20 0 17 3 T 10 9 266751 CASAVA_Build 7 16811716 2D AAGTATTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 42 17 12 13 A 18 16 266752 CASAVA_Build 7 16815280 1I AATTCTCCCT -/A AACTCTAGCT 3070 het 3070 hom 38 18 20 0 A 2 3 266753 CASAVA_Build 7 16827844 1D TTTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 12 11 266754 CASAVA_Build 7 16828241 1I AATGAACTAC -/G GTTGGGTTGC 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 G 1 2 266755 CASAVA_Build 7 16829864 1D GAGGAGAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 8 7 266756 CASAVA_Build 7 16833960 4D TATTGGCCTT AAGG/---- AGGAGGCAGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 6 AAGG 1 0 266757 CASAVA_Build 7 16834756 1D TCATCAGTTT A/- AAAATAATGA 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 A 5 4 266758 CASAVA_Build 7 16837460 1I TCTCTCTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 9 10 266759 CASAVA_Build 7 16837842 1D TAATAGTGAA C/- ACTCTGAGAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 C 1 0 266760 CASAVA_Build 7 16841260 1D GATTTAGTGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 T 8 7 266761 CASAVA_Build 7 16841816 1I CTGGGCTGTG -/C CTCTCTTGTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 1 2 266762 CASAVA_Build 7 16853920 1D TGAATGAATA G/- GTCATTTGGC 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 G 2 1 266763 CASAVA_Build 7 16855958 8D AAAAAAATAC ATATTTAT/-------- TTATTTATTT 3070 het 14 hom 11 1 10 0 ATATTTAT 1 0 266764 CASAVA_Build 7 16857956 3I TTTGGTAGAT ---/AGA AGAAGTGATT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 AGA 1 2 266765 CASAVA_Build 7 16860282 2I CAAGCTCTGC --/CT CTCTCGTTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 9 CT 2 3 266766 CASAVA_Build 7 16860585 9I GATTAACTTA ---------/AACAATGAC ATAAAACTCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AACAATGAC 0 1 266767 CASAVA_Build 7 16861539 7I10M1D9M5D AGTAATCACT -------AAACTTCTAGAATTCATTCCAGAAA/ACTTAGCAAAAATCTAG-TTGCATTCC----- AGTGAATTCA 3070 hom 126 het 40 0 42 4 N/A 0 0 266768 CASAVA_Build 7 16864141 1I AAACATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 34 2 22 10 T 13 14 266769 CASAVA_Build 7 16878247 1D AAACAGAAAG A/- AAAAAATCTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 7 6 266770 CASAVA_Build 7 16883448 1I3M1I TATATAATAT -ATA-/AATAT GTATATATAA 2698 hom 15 het 6 0 6 0 N/A 0 0 266771 CASAVA_Build 7 16895941 1D TGAATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 T 12 11 266772 CASAVA_Build 7 16899815 13D AATTTCACAG TGTATAGTTAGAT/------------- TGTAGTCTTG 3070 hom 117 het 41 0 39 11 TGTATAGTTAGAT 1 0 266773 CASAVA_Build 7 16903744 1I GGTCCTGGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 8 het 21 1 17 3 T 9 10 266774 CASAVA_Build 7 16957809 2D AATAATGGTC AT/-- GTGTGTATGT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 AT 1 0 266775 CASAVA_Build 7 16981275 3D GATTATATTC TTA/--- TTAGGGGGAA 3070 het 2986 hom 34 7 23 4 TTA 2 1 266776 CASAVA_Build 7 16983153 5D TGACGCTTTA CCCTC/----- CCTAGCTTGA 3070 het 3070 ref 45 24 16 8 CCCTC 1 0 266777 CASAVA_Build 7 16983961 1I ATTAATTACC -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 47 22 23 2 T 6 7 266778 CASAVA_Build 7 17019317 1D CCTAATAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 38 0 29 12 A 10 9 266779 CASAVA_Build 7 17022492 2I AAAATATATG --/TA TATATATATA 1934 het 1934 ref 11 5 4 2 TA 5 6 266780 CASAVA_Build 7 17027901 1D TAAAACTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 T 12 11 266781 CASAVA_Build 7 17032710 3I AACCTCTCTC ---/ATT AGTTGCTATC 3070 het 3070 hom 43 13 27 3 ATT 0 1 266782 CASAVA_Build 7 17037980 1I ACAATATGTG -/C CCCCCCCATA 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 C 7 8 266783 CASAVA_Build 7 17046864 1I GGTTAATAGG -/T TTTTAGGAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 4 5 266784 CASAVA_Build 7 17047210 2I TTTTTAAAAG --/TT CAATTCCTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 2 266785 CASAVA_Build 7 17047436 1D GATAAGAACT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 36 12 20 6 A 8 7 266786 CASAVA_Build 7 17049401 2I TCCAAATACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 26 12 15 T 10 12 266787 CASAVA_Build 7 17050381 3D TTCAGTACTC CTT/--- CTACTGAGAA 3070 het 3070 hom 42 11 26 5 CTT 1 0 266788 CASAVA_Build 7 17053082 1D TGAGGACGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 23 0 12 11 T 11 10 266789 CASAVA_Build 7 17066014 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3008 het 160 hom 26 1 11 15 A 14 16 266790 CASAVA_Build 7 17085212 1I TTGCTTTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 A 9 10 266791 CASAVA_Build 7 17085598 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1843 hom 20 5 8 7 T 13 12 266792 CASAVA_Build 7 17087689 2D TAGTTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 123 hom 29 3 16 11 T 11 9 266793 CASAVA_Build 7 17087906 1I TTCGTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 T 10 11 266794 CASAVA_Build 7 17096684 4D ACACACATGC ATAT/---- ATATATATAT 2825 het 2825 ref 23 10 8 6 AT 8 6 266795 CASAVA_Build 7 17119072 8D AGATCTATAT GATATATA/-------- GATATACATA 1538 het 83 hom 10 2 4 5 GATATATA 1 0 266796 CASAVA_Build 7 17147622 4I GTTCAATAAA ----/TAAT TAATAAGAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TAAT 1 2 266797 CASAVA_Build 7 17147954 1I AGTCTGTCTC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 8 266798 CASAVA_Build 7 17148293 4D GTTTAATAAA TACT/---- TAATAAGAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TACT 1 0 266799 CASAVA_Build 7 17163758 1D TAGCCAGCCC T/- TGTGTTTTAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 1 266800 CASAVA_Build 7 17163995 1I GAGCAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 10 11 266801 CASAVA_Build 7 17165505 1D TATTAGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 11 10 266802 CASAVA_Build 7 17177971 1D TAATAATAAA G/- GGGTGAATTT 2281 het 2281 ref 23 14 7 2 G 4 3 266803 CASAVA_Build 7 17184969 2I CGTAAAAGGA --/GC ACTTTGTGCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GC 0 1 266804 CASAVA_Build 7 17185493 1I CCCACCCCCC -/G ACACACACCA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 G 0 1 266805 CASAVA_Build 7 17196397 1I TTTTTTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1582 hom 31 6 18 7 T 15 16 266806 CASAVA_Build 7 17202240 1D AGTAATTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 201 hom 40 1 29 10 A 11 10 266807 CASAVA_Build 7 17203436 1D ACATCAACAG C/- CAGTCAACCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 2 1 266808 CASAVA_Build 7 17208290 1I GATGTTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 983 hom 39 3 27 9 T 10 11 266809 CASAVA_Build 7 17212970 1D AGAGGCCAGT C/- ATAGTCTAGT 3070 hom 132 het 48 0 44 7 C 1 0 266810 CASAVA_Build 7 17217237 1I AACCATTTTT -/A TTAGCTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 266811 CASAVA_Build 7 17227563 1I AGTTTTACTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 450 hom 22 1 17 4 A 8 9 266812 CASAVA_Build 7 17256490 1I TCTAGAAGAG -/T TTTTTCGATG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 5 6 266813 CASAVA_Build 7 17275866 1D TTCTCTTTTA T/- TTTTTTACAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 6 266814 CASAVA_Build 7 17344424 2I TATGCCAATC --/TT TGTCTTTATA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 T 1 3 266815 CASAVA_Build 7 17352032 1I ATGTGTCTAA -/T TTTAGTCTTT 3070 hom 117 het 45 0 38 7 T 3 4 266816 CASAVA_Build 7 17363272 6I TTGATAAAAG ------/TTAACA TTAACAGACC 3070 hom 151 het 55 0 51 4 TTAACA 1 2 266817 CASAVA_Build 7 17389996 1I TGACTTGGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 50 het 30 1 26 3 A 9 10 266818 CASAVA_Build 7 17399232 1I ACACCATAAG -/T TATTACACTA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 1 2 266819 CASAVA_Build 7 17401981 1I ACATATTGAA -/C AATAATAATT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 266820 CASAVA_Build 7 17403671 1I GAGAAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 575 hom 28 2 19 7 A 13 14 266821 CASAVA_Build 7 17416266 2D TCCAGAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 39 1 26 12 A 12 10 266822 CASAVA_Build 7 17419399 10D ATATTTAATT CATAAGGAAA/---------- CATATATATA 3070 hom 126 het 47 0 43 9 CATAAGGAAA 1 0 266823 CASAVA_Build 7 17433884 8I17M4D TCAAGATACA --------CACTATTTGAACAAAATACAC/TACTATATCTCTATTTGAACAAAAT---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 19 7 9 7 N/A 0 0 266824 CASAVA_Build 7 17437504 5D TGTCAGACCT TTTAA/----- TTTTAGTTAT 3070 het 3070 ref 42 25 15 5 TTTAA 1 0 266825 CASAVA_Build 7 17439096 2I AAATGTACAC --/AT GTGATATGTT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 AT 0 1 266826 CASAVA_Build 7 17442905 1D GGCTGAGTAC A/- AAACAATTCT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 4 3 266827 CASAVA_Build 7 17446246 1D AGACTTGGGG C/- TTGCACCCTC 2727 het 2727 ref 27 13 7 7 C 1 0 266828 CASAVA_Build 7 17449663 1D GAGTACTGCC T/- TTAGTTTCCA 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 T 3 2 266829 CASAVA_Build 7 17452133 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 32 het 23 0 18 5 T 10 9 266830 CASAVA_Build 7 17456771 3I AGTTTTCCTT ---/CAA CAACTGTGCA 2954 het 2954 ref 31 17 8 6 CAA 1 2 266831 CASAVA_Build 7 17459763 7I TATCAGAAAT -------/TAGATCC TAGATCCCAC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 TAGATCC 1 2 266832 CASAVA_Build 7 17461216 1I ATACTTACAG -/C CCAACTGATC 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 C 2 3 266833 CASAVA_Build 7 17464003 12I AGGGCATATG ------------/GAAAGGGGATGT GAAAGGGGAT 3070 het 3070 ref 46 18 16 12 GAAAGGGGATGT 1 2 266834 CASAVA_Build 7 17465263 1D TTTATAGACC T/- TCCCCCCAGG 3070 het 2848 hom 20 10 8 3 T 2 1 266835 CASAVA_Build 7 17467778 3I CATAGGTTTC ---/ACA ACAACTTTCT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 ACA 1 2 266836 CASAVA_Build 7 17468991 1D GTATCAGTTA T/- TTTCCTACAT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 T 4 3 266837 CASAVA_Build 7 17470481 1I TGGATAGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 9 10 266838 CASAVA_Build 7 17473912 5I TTTCTACGTT -----/GTCAA GTCAAGTCCA 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 GTCAA 1 2 266839 CASAVA_Build 7 17488129 1D AATCAGCTCT C/- AAACAATAAA 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 C 1 0 266840 CASAVA_Build 7 17490861 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2624 het 2624 ref 25 9 8 8 A 11 12 266841 CASAVA_Build 7 17495194 2D TCACGGTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2789 hom 40 17 11 13 A 19 17 266842 CASAVA_Build 7 17505062 1D CAAGAAGGGT G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 8 7 266843 CASAVA_Build 7 17505741 43I AAGAAACTGG -------------------------------------------/AGCTTTCATGTAATAACCCACGATTTCTGGTTCCTTTGTAGTA AGCTAGACTG 3070 het 3070 ref 36 21 10 8 AGCTTTCATGTAATAACCCACGATTTCTGGTTCCTTTGTAGTA 0 1 266844 CASAVA_Build 7 17516201 1I TATCATTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 12 13 266845 CASAVA_Build 7 17533456 23I TGCAATATCC -----------------------/TCTCAAATTTTTATGCAATATCG TCTCAAATTT 3070 het 3070 hom 42 12 23 7 TCTCAAATTTTTATGCAATATCG 0 1 266846 CASAVA_Build 7 17535767 41D GGAGTTAAAT TGCTGGGCCATGTGGTAATTCTATCTTTAACTTTAAGAAAA/----------------------------------------- ATTTTTAAAG 2295 het 2295 ref 27 30 5 5 TGCTGGGCCATGTGGTAATTCTATCTTTAACTTTAAGAAAA 1 0 266847 CASAVA_Build 7 17535951 1D GTTTACTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 11 10 266848 CASAVA_Build 7 17536817 1D TTTATAGTTT A/- AAAAAAAAAA 2474 het 2474 ref 27 17 6 4 A 11 10 266849 CASAVA_Build 7 17537166 1D ATTTGCAGAC T/- TTACTGTGAA 3070 het 3070 ref 45 25 13 9 T 3 2 266850 CASAVA_Build 7 17538566 1I AATATATTGC -/A GGGGGGGAGG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 0 1 266851 CASAVA_Build 7 17542688 2D TAAATAAAAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3055 hom 16 8 7 1 A 11 9 266852 CASAVA_Build 7 17550621 1D ATAAAGGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 10 9 266853 CASAVA_Build 7 17554332 1D GTGCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 1061 het 1061 ref 33 20 3 10 A 11 10 266854 CASAVA_Build 7 17557705 1D GTTCAATATT G/- GGGGGGGAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 8 7 266855 CASAVA_Build 7 17558205 1D TGCAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 9 266856 CASAVA_Build 7 17566160 1I CTAACCCAGA -/T CTTTGTACTA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 0 1 266857 CASAVA_Build 7 17568527 1I ACCCTCACAC -/T TTCATTCCTT 3070 hom 126 het 51 0 42 9 T 2 3 266858 CASAVA_Build 7 17572176 5D GCAAAGTATA GTTTT/----- ATTTTTCTTT 3070 het 3052 hom 28 10 17 1 GTTTT 1 0 266859 CASAVA_Build 7 17578263 1I AATCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 2481 het 2481 ref 24 14 6 4 A 10 11 266860 CASAVA_Build 7 17579312 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 13 12 266861 CASAVA_Build 7 17604347 4D GTTACCCATC TAAG/---- TGTCAACTCC 3070 het 3070 hom 37 10 26 3 TAAG 1 0 266862 CASAVA_Build 7 17620836 4D CTTTAATTAG ACTA/---- ACTATGAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 ACTA 2 1 266863 CASAVA_Build 7 17631172 1I GCCAAATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 10 11 266864 CASAVA_Build 7 17681487 1D CCAGGTATGC T/- TTTCCAGAAG 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 4 3 266865 CASAVA_Build 7 17685243 2D TGTTAAACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 AT 7 6 266866 CASAVA_Build 7 17695149 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2159 hom 30 7 19 5 T 12 11 266867 CASAVA_Build 7 17695246 1D CAGGAGTCTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 A 9 8 266868 CASAVA_Build 7 17701512 1I ATTGTTCAAA -/G GAACAGCAAC 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 G 1 2 266869 CASAVA_Build 7 17703374 2D AGGGGTGCGT GA/-- GAGGCAGAGG 3070 het 3070 ref 38 19 12 8 GA 2 1 266870 CASAVA_Build 7 17708187 1D CTGAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 T 12 11 266871 CASAVA_Build 7 17710552 2I AAAAAATATA --/TG TATATATATT 3070 het 2913 hom 31 9 16 6 TG 0 1 266872 CASAVA_Build 7 17710680 1I CCTGGGTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 A 13 14 266873 CASAVA_Build 7 17714208 1D GACCTATTTA T/- TATAGGAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 2 1 266874 CASAVA_Build 7 17722806 2D CAATAATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1715 hom 29 9 14 6 A 14 12 266875 CASAVA_Build 7 17726562 1D AGCCCACCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 22 21 6 A 12 11 266876 CASAVA_Build 7 17736919 1D AAATCAAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 A 8 7 266877 CASAVA_Build 7 17738995 18D5M2D2M1D AAATAAACTT GTGGAACAAATGGAACAATAAATGATGT/------------------TAACT--TG- TTCCATTTAC 3070 het 3070 ref 41 29 14 4 N/A 0 0 266878 CASAVA_Build 7 17749599 1D CAACAAAAGT A/- AAAAAAGGAC 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 A 7 6 266879 CASAVA_Build 7 17755266 1D CATAATTGTG T/- GATTTGTCTA 3070 hom 102 het 43 0 35 9 T 1 0 266880 CASAVA_Build 7 17755674 1D CATATTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 T 12 11 266881 CASAVA_Build 7 17781170 1D CAGAAACTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 9 8 266882 CASAVA_Build 7 17785155 1D ATTAGGAAAC A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 7 6 266883 CASAVA_Build 7 17786014 5D ACCAAACATT AAAAG/----- AAAACAAGTG 3070 het 3070 hom 41 19 22 0 AAAAG 1 0 266884 CASAVA_Build 7 17786724 9D AGAATCTTCA AGTGAGTTT/--------- AGCAAGGTCA 3070 het 3070 ref 32 17 14 6 AGTGAGTTT 1 0 266885 CASAVA_Build 7 17787357 1I GGGGATTCAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 9 10 266886 CASAVA_Build 7 17789879 3D AGTATTCACT TTG/--- TTTAGTAATA 3070 het 3070 ref 32 13 15 5 TTG 1 0 266887 CASAVA_Build 7 17790025 4I GTAATATCAG ----/GTCA GTATTTGGAC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 GTCA 0 1 266888 CASAVA_Build 7 17790726 4D TCTGTCATTT TCTG/---- TCTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 48 31 15 4 TCTG 1 0 266889 CASAVA_Build 7 17791805 1D TTTTATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2731 hom 27 8 11 8 T 13 12 266890 CASAVA_Build 7 17792245 5D AGCTTTTACA AGGAG/----- AGGTCTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 AGGAG 1 0 266891 CASAVA_Build 7 17794347 3I GTAAACCATG ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 9 12 266892 CASAVA_Build 7 17801650 1I GTGAGGCCTG -/C CCTGGCCACC 3070 hom 96 het 40 0 31 9 C 2 3 266893 CASAVA_Build 7 17806479 1D GAGATAATTA C/- AACTTAAAAT 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 C 1 0 266894 CASAVA_Build 7 17812368 1D TCACCATGAT A/- ACAAAACTGG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 2 1 266895 CASAVA_Build 7 17812790 1D ATTATTAATT A/- AAAAAAAAAA 1449 het 1449 ref 32 22 4 6 A 11 10 266896 CASAVA_Build 7 17835709 1I GTGTAGACTT -/A AAAGAAATAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 3 4 266897 CASAVA_Build 7 17850895 1I TTGAACATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 12 7 A 13 14 266898 CASAVA_Build 7 17852394 1D CCTACATATG A/- AAAAAAAAAA 1694 het 1694 ref 33 24 4 8 A 11 10 266899 CASAVA_Build 7 17853141 1D ATTAAAAAAT A/- AAGCTTGTAT 2913 het 2913 ref 28 16 6 6 A 3 2 266900 CASAVA_Build 7 17856939 1D ATAATACTTC A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 7 6 266901 CASAVA_Build 7 17869347 1I TGGCTTCACT -/A TGCGCTGACT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 0 1 266902 CASAVA_Build 7 17870978 3D GGAAGAGGAA GAG/--- GAGGAGGAGG 1957 het 1375 hom 26 8 10 10 GAG 6 5 266903 CASAVA_Build 7 17879609 1I GGTCTTAAGA -/C CAAAAATTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 2 266904 CASAVA_Build 7 17892738 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1253 het 1253 ref 29 19 3 8 A 11 10 266905 CASAVA_Build 7 17904084 3I AGGTAAGAAA ---/TTC TTATCTCATT 3070 het 3070 ref 43 26 11 6 TTC 0 1 266906 CASAVA_Build 7 17915808 22D GAAGCTGAAT GATGAGAACATATGGACACACA/---------------------- GATGGGAAAA 3070 het 3070 ref 51 28 18 9 GATGAGAACATATGGACACACA 1 0 266907 CASAVA_Build 7 17920276 2I CAAGCAGAAG --/AA AGAGTTTCAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 1 3 266908 CASAVA_Build 7 17921758 4D GAGGTGTGTC TCTG/---- TCTGTCTGTC 3070 het 3070 hom 52 16 22 14 TCTG 5 4 266909 CASAVA_Build 7 17922340 4I CCAAGGAGAT ----/AGAC AGACGTCCAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 AGAC 1 2 266910 CASAVA_Build 7 17928908 1I AACTACTGGG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 A 7 8 266911 CASAVA_Build 7 17932285 1I ATAGAGCTAA -/G GGTAACAGAA 3070 het 3070 hom 47 18 27 2 G 2 3 266912 CASAVA_Build 7 17935146 4I TTTCAAACCT ----/ATAA ATAAAGTATA 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 ATAA 1 2 266913 CASAVA_Build 7 17936225 66D AATAAAGAAT AAGAAAAAGAATAAAGAATAAGAATAAGAATAAAGAATAAAGAATAAGAATAAAGAAATAAGAATA/------------------------------------------------------------------ AAGATTTATT 3070 het 3070 ref 24 31 9 3 AAGAAAAAGAATAAAGAATAAGAATAAGAATAAAGAATAAAGAATAAGAATAAAGAAATAAGAATA 1 0 266914 CASAVA_Build 7 17937502 1D AACATTATTT C/- CTAATATTTA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 C 2 1 266915 CASAVA_Build 7 17949557 1I CAGCTAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 A 11 12 266916 CASAVA_Build 7 17950789 11I AGATCTAAAT -----------/TTATAATGTGC AGAAAGAACC 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 TTATAATGTGC 0 1 266917 CASAVA_Build 7 17952830 1D TTCATTTTTT A/- ATGTGAATCA 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 A 2 1 266918 CASAVA_Build 7 17967767 1D TGTCTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 13 12 266919 CASAVA_Build 7 17972453 1D ATCTCAGGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 10 9 266920 CASAVA_Build 7 17974177 2I AACCTATATC --/AT ATATATATAT 2020 het 2020 ref 20 12 5 3 AT 7 8 266921 CASAVA_Build 7 17977551 1D AATAAAAACC T/- TTTTTTTTTT 1602 het 1237 hom 36 11 6 19 T 19 18 266922 CASAVA_Build 7 17982946 37D TGAAGGTTTA AAGCGTTTCCCTAACAACTCACAGATACACTGTTGGG/------------------------------------- AAGCAAAGGC 3070 het 3070 ref 31 27 15 1 AAGCGTTTCCCTAACAACTCACAGATACACTGTTGGG 1 0 266923 CASAVA_Build 7 18004805 8D ATGTGATAGG AATAACAA/-------- AATAAACAGA 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 AATAACAA 1 0 266924 CASAVA_Build 7 18006647 3I AACCAAGGCC ---/TTT TTTTTTTCTT 1261 het 1261 ref 32 20 5 7 T 7 10 266925 CASAVA_Build 7 18019474 1D CAATGCAAAG A/- AAAAGATTTG 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 A 5 4 266926 CASAVA_Build 7 18029801 1D GTTTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 30 0 25 6 A 11 10 266927 CASAVA_Build 7 18056529 4D CCACTCCCAG AACC/---- TCTACACTGC 3070 het 3070 ref 33 19 13 3 AACC 1 0 266928 CASAVA_Build 7 18063279 1I TTCTACTTTT -/G TAAGTCATGT 3070 hom 138 het 54 0 47 7 G 0 1 266929 CASAVA_Build 7 18084739 1I CTATAGTTTT -/C TTTTATTGTA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 C 0 1 266930 CASAVA_Build 7 18095358 1I AGGAGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 19 14 T 11 12 266931 CASAVA_Build 7 18096072 4D TTGGTTTTTT TTTG/---- TTTGTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 15 27 2 TTTG 2 1 266932 CASAVA_Build 7 18110001 2I TATACATACA --/TT TAAGAAAGAT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 1 3 266933 CASAVA_Build 7 18110394 2D CATAATTGTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 11 9 266934 CASAVA_Build 7 18113655 4D CTCTTTCTTG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 36 16 11 10 CT 9 7 266935 CASAVA_Build 7 18139040 1I ATAAAGTGAC -/T TTATTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 2 3 266936 CASAVA_Build 7 18150954 1I GATCATCCTC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 56 34 17 5 T 7 8 266937 CASAVA_Build 7 18156226 1I TTTATTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 957 hom 27 5 17 5 T 15 16 266938 CASAVA_Build 7 18159504 1I TTTTCTGGGG -/T TCAAATACCC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 1 2 266939 CASAVA_Build 7 18171947 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3015 het 974 hom 21 4 7 10 A 15 14 266940 CASAVA_Build 7 18194992 1D AGGAAACAAT A/- AGATGCTGGC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 2 1 266941 CASAVA_Build 7 18195605 8D GTATCCTGTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 6 TTTG 5 3 266942 CASAVA_Build 7 18197425 1I TTATTAGCTG -/T TGTGGGTGAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 1 2 266943 CASAVA_Build 7 18215856 1D TACTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1259 het 1259 ref 16 9 3 4 T 11 10 266944 CASAVA_Build 7 18249197 4I TATTAACTGA ----/TTGT TTGAGAATGT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TTGT 0 1 266945 CASAVA_Build 7 18258865 1I AATCACATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 10 11 266946 CASAVA_Build 7 18259507 1I AACTAATTTA -/C CACTCCTACC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 C 1 2 266947 CASAVA_Build 7 18262219 2D TATCTAGGAC TT/-- TTCTTCTCTC 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 T 4 2 266948 CASAVA_Build 7 18263403 22D TGGGTGGATT GCTTGAGCTCAGGAGGAGGATC/---------------------- GCTTGAGCTC 2436 het 2436 ref 24 13 9 7 GCTTGAGCTCAGGAGGAGGATC 1 0 266949 CASAVA_Build 7 18267296 1D ACAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 6 A 11 10 266950 CASAVA_Build 7 18269084 4D GCAATAATAG AGAA/---- AGAGAGGACA 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 AGAA 1 0 266951 CASAVA_Build 7 18271770 4D TAAAGGTATT TAAA/---- TAAATAAATA 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 TAAA 4 3 266952 CASAVA_Build 7 18272564 1D AGTAAAAATG T/- TTTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 6 5 266953 CASAVA_Build 7 18273112 1D TCAAACTGAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 9 8 266954 CASAVA_Build 7 18274642 1D GAACCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 A 12 11 266955 CASAVA_Build 7 18283231 1I TTACATTGTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 7 8 266956 CASAVA_Build 7 18283341 1D GAAGGAGATA G/- GAAACAATGA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 G 2 1 266957 CASAVA_Build 7 18286736 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 18 2 13 3 A 12 11 266958 CASAVA_Build 7 18286911 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 2176 hom 30 8 18 4 A 8 9 266959 CASAVA_Build 7 18299143 1D GTGTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 7 T 11 10 266960 CASAVA_Build 7 18299457 1D TCTTAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 12 11 266961 CASAVA_Build 7 18325875 12I CATCCAACTT ------------/TGGAAGGTAAAG ATGTATTTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TGGAAGGTAAAG 0 1 266962 CASAVA_Build 7 18327728 4I GGGAAAGTGG ----/TTGA TTTAGTTCAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTGA 0 1 266963 CASAVA_Build 7 18337774 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 7 6 266964 CASAVA_Build 7 18346859 1I AGTTATAAAT -/C CCCATGCTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 3 4 266965 CASAVA_Build 7 18351721 2D AACAGAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 13 11 A 16 14 266966 CASAVA_Build 7 18354949 2I TAAAATTACA --/GC GCTACTATTT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 GC 1 2 266967 CASAVA_Build 7 18359417 1I AATATTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 12 14 T 11 12 266968 CASAVA_Build 7 18369797 1D AATGGAGATG T/- TTTCTGTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 4 3 266969 CASAVA_Build 7 18371788 1I TCTTTATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1414 hom 39 3 31 5 T 10 11 266970 CASAVA_Build 7 18372240 4I TTTATTTGAA ----/AAAT AAAATTCCCC 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 AAAT 0 1 266971 CASAVA_Build 7 18373045 1D GTTTAGTAAG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 40 15 22 4 A 7 6 266972 CASAVA_Build 7 18374705 1D TTTATTTTCT G/- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 13 1 G 3 2 266973 CASAVA_Build 7 18374925 4D TACAGAAATT CCTA/---- CCTAAGTAGT 3070 het 3070 ref 44 22 21 3 CCTA 2 1 266974 CASAVA_Build 7 18391058 3I TGATTAGATA ---/GAC GACACATTTC 3070 het 3070 hom 58 25 25 8 GAC 1 2 266975 CASAVA_Build 7 18394092 1I CTGTGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 10 11 266976 CASAVA_Build 7 18399274 1D ATAAAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3021 hom 33 9 18 6 T 12 11 266977 CASAVA_Build 7 18401684 1D CTAAGGCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 A 17 16 266978 CASAVA_Build 7 18411660 1D GGAATAGCCA T/- TTTGGTTCCT 3070 het 3070 ref 31 17 14 0 T 4 3 266979 CASAVA_Build 7 18436875 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 38 1 22 15 A 12 11 266980 CASAVA_Build 7 18484225 1D CAAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 1076 het 1076 ref 23 18 4 1 T 13 12 266981 CASAVA_Build 7 18510789 1I TGTAAGCATA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 T 7 8 266982 CASAVA_Build 7 18514778 1D AATTGTGCTT A/- ACATTTCTTA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 A 2 1 266983 CASAVA_Build 7 18538970 1D CTTTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 11 10 266984 CASAVA_Build 7 18567810 2D AATGTGCCCA TT/-- TTTTGGACAT 3070 het 3070 ref 43 20 19 6 T 6 4 266985 CASAVA_Build 7 18569874 1I AACCACCCAA -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 C 8 9 266986 CASAVA_Build 7 18591081 1D CATAATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 607 hom 47 2 33 12 T 11 10 266987 CASAVA_Build 7 18597005 1D ATTGCTCTCT A/- AGTAAAGCCT 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 A 2 1 266988 CASAVA_Build 7 18601493 2D TCTGCAAATC AG/-- AGTGTCTTAT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 AG 2 1 266989 CASAVA_Build 7 18606123 1I GTATTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 601 hom 42 2 32 8 T 12 13 266990 CASAVA_Build 7 18613956 1D GAGGTGTGAT A/- AAAATATATT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 5 4 266991 CASAVA_Build 7 18618816 1I AACATTTTAA -/T TCCTTTCCAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 2 266992 CASAVA_Build 7 18622439 1I ATTCTGCCTA -/C CCCCAAGTGC 3070 het 3070 ref 44 28 13 3 C 4 5 266993 CASAVA_Build 7 18643025 1D TTGGTTACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 10 9 266994 CASAVA_Build 7 18647572 4D TTCTGTGCAC CTAA/---- CTACCATGTG 3070 het 3070 ref 43 22 20 3 CTAA 1 0 266995 CASAVA_Build 7 18695304 1D TTGCTAGAGA C/- TGGCCTAACC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 C 1 0 266996 CASAVA_Build 7 18703948 1D AAACAGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 9 22 7 T 11 10 266997 CASAVA_Build 7 18707301 1D ACTTGTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 12 11 266998 CASAVA_Build 7 18715221 1D ACTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 33 10 18 6 T 11 10 266999 CASAVA_Build 7 18722694 2D ACTAGTTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AT 7 6 267000 CASAVA_Build 7 18781833 1I TTATGTTGTG -/T TTTTTTTTTT 1314 het 1314 ref 43 33 3 7 T 11 12 267001 CASAVA_Build 7 18783489 4D TTTGCAAGTG GGTT/---- GGTTTTTTTC 3070 hom 122 het 42 0 41 4 GGTT 2 1 267002 CASAVA_Build 7 18788852 1I AATGCGGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 554 hom 49 2 40 7 T 9 10 267003 CASAVA_Build 7 18790796 1I GTTTTTATCA -/T TTTAATTCAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 3 4 267004 CASAVA_Build 7 18796574 2I GATGTAGCAG --/AA ATGTGGCCAT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 1 3 267005 CASAVA_Build 7 18800477 2D CAAGATAAAA TG/-- TAATTAGGAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 TG 1 0 267006 CASAVA_Build 7 18808780 1D TCATGATAGA T/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 T 7 6 267007 CASAVA_Build 7 18812280 1I ATACATCAGA -/T TAAAAACTAA 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 1 2 267008 CASAVA_Build 7 18886992 1D AATAGTTGCC G/- GGGGGGGGGG 1686 hom 29 het 15 0 5 12 G 11 10 267009 CASAVA_Build 7 18903966 1D ATGGTTACTT A/- AAAAAAAAAA 1247 het 1247 ref 21 13 4 4 A 17 16 267010 CASAVA_Build 7 18911760 1I AAACCCTTTT -/A AAAATGTTTT 3070 het 3070 ref 50 30 15 5 A 4 5 267011 CASAVA_Build 7 18915445 4I ATATTCTGGA ----/AATT AATTAATTAA 2746 het 2746 ref 33 14 8 11 AATT 3 4 267012 CASAVA_Build 7 18919886 4I TTAAAAAGAT ----/AATC AATATATTGA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 AATC 0 1 267013 CASAVA_Build 7 18921796 1D TGCCATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 38 0 23 15 A 13 12 267014 CASAVA_Build 7 18923614 4D AGACAGTATC TGAT/---- TGAGCAAATT 3070 het 3070 hom 54 22 30 2 TGAT 1 0 267015 CASAVA_Build 7 18931794 1I TAAATACATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 9 10 267016 CASAVA_Build 7 18932067 12D TTCTTTACTT TTCCTCAAAAAA/------------ TTGCTCTCTG 3070 het 3070 ref 31 19 12 2 TTCCTCAAAAAA 1 0 267017 CASAVA_Build 7 18934975 4D GATCATTTAT TTTA/---- TTTATTTATC 2483 het 2483 ref 23 15 6 2 TTTA 3 2 267018 CASAVA_Build 7 18939792 1I TTAATAAAAG -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 5 6 267019 CASAVA_Build 7 18999294 17I CATATTTTTT -----------------/AGTGACCTAGGGACAGG GATTATATGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AGTGACCTAGGGACAGG 0 1 267020 CASAVA_Build 7 19003448 2D CCTTCTTGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 30 1 19 10 A 14 12 267021 CASAVA_Build 7 19010111 1I ATTTTTTTCC -/A AAAAAAGTAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 6 7 267022 CASAVA_Build 7 19018047 20D CTCCAAAGAA ACATGCATCAGGGTTCCTAG/-------------------- ACAAAGACTT 3070 hom 132 het 42 0 45 1 ACATGCATCAGGGTTCCTAG 1 0 267023 CASAVA_Build 7 19018478 1D AATAATTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 8 7 267024 CASAVA_Build 7 19037594 1I ATTTCAAATA -/T TTTTTATCAT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 5 6 267025 CASAVA_Build 7 19040390 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTATTAT 3070 het 1692 hom 22 6 11 6 T 6 5 267026 CASAVA_Build 7 19041057 3D CTCCGGCATC TGT/--- TGTTTCCTGA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TGT 2 1 267027 CASAVA_Build 7 19044365 9I TTAATTGGGG ---------/CATTTAGCC CATTTACATT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 CATTTAGCC 0 1 267028 CASAVA_Build 7 19047744 1D GCTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 22 1 20 2 T 11 10 267029 CASAVA_Build 7 19050578 2D TGGTGTATGA CT/-- CTAGTCCCAG 3070 het 2887 hom 16 7 7 4 CT 2 1 267030 CASAVA_Build 7 19055583 1D GAAACACAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 9 8 267031 CASAVA_Build 7 19058760 2D AGAAAAAAGA AT/-- TTTAAAGAAT 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 AT 1 0 267032 CASAVA_Build 7 19059155 1D CATTTTAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 17 13 8 A 9 8 267033 CASAVA_Build 7 19064511 1D GATTCTTGTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 9 8 267034 CASAVA_Build 7 19066428 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2110 hom 21 7 11 3 A 12 11 267035 CASAVA_Build 7 19067220 1I TCTCCACATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 A 8 9 267036 CASAVA_Build 7 19070322 2D TCTATCTCTT TA/-- TCTTATATGA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 TA 1 0 267037 CASAVA_Build 7 19080904 1D TGAAATATAC A/- AAAAAAAAAC 2823 het 2173 hom 19 5 7 7 A 10 9 267038 CASAVA_Build 7 19084621 1D GTAGCAGCAT G/- GGATGGAATT 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 G 3 2 267039 CASAVA_Build 7 19091622 1I20M1D GGATTAAATT -GAAGTCAATTACAGATATTTA/AGAAGTCAATTACAGATATTT- AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 37 21 22 6 N/A 0 0 267040 CASAVA_Build 7 19092633 1I CCAGGCCCAT -/G TGGCTTCACA 3070 het 2655 hom 27 8 14 5 G 0 1 267041 CASAVA_Build 7 19103172 1D GTGTATTATG T/- AATAATTAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 T 1 0 267042 CASAVA_Build 7 19103330 2D TTTCAATTTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 24 0 14 11 TA 7 6 267043 CASAVA_Build 7 19107264 10D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 2418 het 897 hom 9 4 7 6 A 21 11 267044 CASAVA_Build 7 19193319 1I CAAATGCTAC -/A AAAAAAAAAA 2737 het 2737 ref 28 13 9 6 A 11 12 267045 CASAVA_Build 7 19235343 1D GGAAACAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 9 8 267046 CASAVA_Build 7 19326123 2D GGCCTGAAAC TG/-- TATTCAGTGA 3070 hom 135 het 52 0 45 12 TG 1 0 267047 CASAVA_Build 7 19326675 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 35 1 24 10 A 12 11 267048 CASAVA_Build 7 19330158 1I AAGGAAGGAA -/G GGTAGAAGGG 3070 hom 41 het 15 0 13 2 G 2 3 267049 CASAVA_Build 7 19337343 1I TTTCTCTACC -/T GTAACTTGGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 1 267050 CASAVA_Build 7 19339954 1D TCTGGGACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 10 9 267051 CASAVA_Build 7 19344657 1I AGGTTCAAGT -/G ATTCTCCTGC 3070 hom 54 het 19 0 19 1 G 0 1 267052 CASAVA_Build 7 19351939 1I ATTCTGTTCA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 8 9 267053 CASAVA_Build 7 19362807 3I AATAAATAAA ---/GTT GTACAGAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GTT 0 1 267054 CASAVA_Build 7 19365725 1I GAATTCTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 11 12 267055 CASAVA_Build 7 19377341 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 T 12 11 267056 CASAVA_Build 7 19386511 3D TGGATCACTT GAG/--- GAGTTTGAGA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 GAG 2 1 267057 CASAVA_Build 7 19389600 1D CTAGATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 190 hom 43 2 23 18 T 17 16 267058 CASAVA_Build 7 19392225 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 6 A 12 11 267059 CASAVA_Build 7 19396526 32I GATATATCCA --------------------------------/CACATATCCACACATATAGCACAACAAATGAT TTGTATTAGA 3070 hom 81 het 22 0 28 1 CACATATCCACACATATAGCACAACAAATGAT 0 1 267060 CASAVA_Build 7 19402329 7D TTATTTCTTC TAGCATT/------- TATATAGTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TAGCATT 1 0 267061 CASAVA_Build 7 19406258 1D TAGTTGTTTG A/- AAAAAAGCTA 3070 hom 79 het 31 0 26 6 A 7 6 267062 CASAVA_Build 7 19410586 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2271 het 1251 hom 18 7 6 5 T 12 11 267063 CASAVA_Build 7 19416342 1D GCCTGTCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 A 12 11 267064 CASAVA_Build 7 19417264 1I GGCAAACAGA -/T TTTAGCTTAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 3 4 267065 CASAVA_Build 7 19434595 1I ATTGCAGCTG -/A AAAAAATCTG 3070 hom 132 het 46 0 44 2 A 6 7 267066 CASAVA_Build 7 19445371 1D AAATAGAGTC A/- GCATTCCTAG 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 A 1 0 267067 CASAVA_Build 7 19448927 1D GTGTACATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 53 0 38 15 A 11 10 267068 CASAVA_Build 7 19456287 6I TCCTGTTCAC ------/TTTTGG TTTTGGTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTTTGG 1 2 267069 CASAVA_Build 7 19467191 2I GAAACGCATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 10 12 267070 CASAVA_Build 7 19480333 1I ATTAATGTCT -/C TTAAAAATGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 1 267071 CASAVA_Build 7 19483721 3I TTTAAAACTC ---/AGA AGGAGAATAT 3070 hom 66 het 24 0 21 3 AGA 0 1 267072 CASAVA_Build 7 19491251 1D GTCTATGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 32 2 24 6 A 17 16 267073 CASAVA_Build 7 19492194 1D TGTGTTTGTG T/- TTTCCCACTG 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 4 3 267074 CASAVA_Build 7 19517504 1I ACAACCCAAA -/G GGCAGTCACT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 2 3 267075 CASAVA_Build 7 19532163 16I TATCTACATT ----------------/TCTGTTTCAAAATTTA TCTAAAATAA 3070 hom 66 het 21 0 23 1 TCTGTTTCAAAATTTA 0 1 267076 CASAVA_Build 7 19534608 1I CTCCAACTAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 440 hom 23 1 21 1 A 8 9 267077 CASAVA_Build 7 19536087 1D ATGACAGAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 8 267078 CASAVA_Build 7 19540809 2D GTGCACACAC AT/-- ATAAAATAAT 3070 hom 105 het 41 0 35 7 AT 2 1 267079 CASAVA_Build 7 19543040 7D AAATTGATAC TTATTTG/------- TTATTTGTTG 3070 hom 66 het 28 0 22 8 TTATTTG 2 1 267080 CASAVA_Build 7 19543690 1D38M4I AGACTGTCTC AAAAAAAAAACAAAAAAACAAAAACCAAATAAAACAAAC----/-AAAAAAAAACAAAAAAACAAAAACCAAATAAAACAAACAAAA AAAAAGCCAA 3070 hom 87 het 26 0 30 8 N/A 0 0 267081 CASAVA_Build 7 19556081 1D TTTAGCTAGA C/- ACAGAGTGCT 3070 hom 48 het 17 0 17 1 C 1 0 267082 CASAVA_Build 7 19556463 1D CTGAGGACTA T/- TTTATTTGTC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 4 3 267083 CASAVA_Build 7 19571417 1D TTTGTGTTGC T/- TTTATTATTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 4 3 267084 CASAVA_Build 7 19607816 1I CTCCAATTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 8 9 267085 CASAVA_Build 7 19621002 1I ATAATATCTA -/G TATTTATAGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 0 1 267086 CASAVA_Build 7 19623412 1D TATCTTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 21 0 11 13 T 11 10 267087 CASAVA_Build 7 19655797 1I AACCATGGAC -/A AAAAAAAAAA 1246 het 1246 ref 30 19 3 8 A 11 12 267088 CASAVA_Build 7 19701540 1D CATATAGGCC A/- AAAAAAAAAA 1738 het 1738 ref 31 17 5 10 A 15 14 267089 CASAVA_Build 7 19707864 1I AGTCAGATGG -/C CCTCTGGGGG 3070 hom 39 het 20 0 14 6 C 2 3 267090 CASAVA_Build 7 19738771 1D ATTTTTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3068 het 3068 ref 27 12 7 10 T 12 11 267091 CASAVA_Build 7 19739809 1D ATCCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 2584 het 2584 ref 45 31 8 6 A 15 14 267092 CASAVA_Build 7 19762236 2D TCTTTTGATC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 11 9 267093 CASAVA_Build 7 19883162 5D AATCTCATTC TTCTT/----- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 TTCTT 2 1 267094 CASAVA_Build 7 19924843 2D TGATGGGAAA GT/-- AGATCAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 GT 1 0 267095 CASAVA_Build 7 19929150 1D TGAGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 514 hom 28 2 17 9 T 15 14 267096 CASAVA_Build 7 19947448 1I ATGATGCCTG -/T CCATGAATAA 3070 het 3070 hom 55 24 23 8 T 0 1 267097 CASAVA_Build 7 19949250 22D TTGTCTAGTG GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/---------------------- GTGTGTGTGT 3070 het 2580 hom 42 11 14 24 GT 19 8 267098 CASAVA_Build 7 19954007 30D TCTCTCTATC GATAGATAGATATCTTTCTATCTATCGATA/------------------------------ GATAGATAGA 3070 het 3070 ref 32 20 12 3 GATAGATAGATATCTTTCTATCTATCGATA 1 0 267099 CASAVA_Build 7 19954868 2D AGAAGTACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2461 hom 36 12 10 14 T 14 12 267100 CASAVA_Build 7 19962851 3I CTGCTCCCCC ---/TCT TCTGCCTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 TCT 1 2 267101 CASAVA_Build 7 19963867 16D AATTGTGTGC GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 24 13 13 3 GT 14 6 267102 CASAVA_Build 7 19967146 1I TGCTTATCTG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 49 28 14 7 A 7 8 267103 CASAVA_Build 7 19973352 1I GAACAACAAC -/A AACAGAAATA 2368 het 2368 ref 32 15 6 11 A 2 3 267104 CASAVA_Build 7 19974894 6D TATACATATA TATGTG/------ TATGTGTATG 3070 het 3070 ref 47 21 24 3 TATGTG 3 2 267105 CASAVA_Build 7 19979474 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1849 het 1849 ref 24 14 6 4 T 11 10 267106 CASAVA_Build 7 19981656 3D TTTTGTTTTG TTA/--- TTATTTTGTT 3070 het 3070 ref 50 27 19 7 TTA 2 1 267107 CASAVA_Build 7 20021209 4D ATGTGTGTGT GAGA/---- GAGAGAGAGA 2945 het 2945 ref 28 11 11 8 GA 8 6 267108 CASAVA_Build 7 20021366 4I CTTTTGTGAA ----/TGTT TGTTTGAAAA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 TGTT 1 2 267109 CASAVA_Build 7 20025051 1I ACTTACCTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 8 9 267110 CASAVA_Build 7 20035206 1I TTAAGAACCA -/T CAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 T 0 1 267111 CASAVA_Build 7 20040951 1D CTCCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 13 14 A 15 14 267112 CASAVA_Build 7 20047891 1I ATCAAATGGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 A 9 10 267113 CASAVA_Build 7 20050397 1D AAAACAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 28 1 23 4 A 13 12 267114 CASAVA_Build 7 20052530 1D TGCTAGACTA C/- CCCCACTGGG 3070 hom 126 het 47 0 43 5 C 5 4 267115 CASAVA_Build 7 20054304 8I AGTAGTGCTG --------/TATATCAC TATATCACTA 3070 hom 96 het 42 0 32 10 TATATCAC 1 2 267116 CASAVA_Build 7 20066727 4I ATTAGGAAAT ----/AAAG AAAGAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 AAAG 1 2 267117 CASAVA_Build 7 20068719 1D CTATCAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1493 hom 35 6 15 15 A 15 14 267118 CASAVA_Build 7 20073714 2D CCAGCACTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 9 T 12 10 267119 CASAVA_Build 7 20089759 2D TGTACATATA TT/-- TTATATATAT 3070 het 2887 hom 22 10 12 0 T 4 2 267120 CASAVA_Build 7 20091985 2D AATCTGAAAC AG/-- AGAGTATATA 3070 het 3070 hom 43 13 21 10 AG 3 2 267121 CASAVA_Build 7 20094873 1I TCTTTAACAC -/A ATAGGGAAGT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 1 2 267122 CASAVA_Build 7 20101605 1I TTAAATATTT -/A AAAAAATAGC 3070 het 3033 hom 23 9 10 4 A 6 7 267123 CASAVA_Build 7 20102871 2I TAGTGAACTC --/AA AGACAGGTCA 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 A 1 3 267124 CASAVA_Build 7 20104997 1D ATACAATGTA T/- TTTTTTACTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 7 6 267125 CASAVA_Build 7 20110866 1I TATATTATTA -/T TAGTAAATAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 2 267126 CASAVA_Build 7 20111170 1D ATTTTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 T 11 10 267127 CASAVA_Build 7 20112543 3D TCTCAACTCT TTC/--- TTCTTCTTAC 3070 het 3070 ref 32 17 12 6 TTC 3 2 267128 CASAVA_Build 7 20114632 1I AATTTGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 A 10 11 267129 CASAVA_Build 7 20125479 2I AATGAAAATT --/TC TCTGTGCCTG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 TC 1 2 267130 CASAVA_Build 7 20147703 2D TGGTGAGTTT TA/-- TGACACCAAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 2 TA 1 0 267131 CASAVA_Build 7 20154320 1I GGCAAATGAG -/A AAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 6 7 267132 CASAVA_Build 7 20171042 2I ACCTAAACTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 18 8 T 11 13 267133 CASAVA_Build 7 20171686 1I GGTATAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 A 11 12 267134 CASAVA_Build 7 20174411 1D ATTCTTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 8 A 13 12 267135 CASAVA_Build 7 20177404 2D TTTTATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2582 het 1054 hom 20 4 7 9 T 14 12 267136 CASAVA_Build 7 20191627 1I ACAAAGTTTA -/T TTTAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 3 4 267137 CASAVA_Build 7 20192196 1D GCCTTGAGTA G/- GCTCTTCTGA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 G 2 1 267138 CASAVA_Build 7 20224910 3I AAAACACTCT ---/TCA TCAAGATGTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TCA 1 2 267139 CASAVA_Build 7 20239728 1D GCCCTCTGGG A/- AAAAAAGATG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 7 6 267140 CASAVA_Build 7 20245882 1D TTTTTCTATG A/- TTTTATTTTA 3070 het 3070 ref 27 11 9 8 A 1 0 267141 CASAVA_Build 7 20252801 1D TTTATTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 41 1 33 8 T 11 10 267142 CASAVA_Build 7 20254471 1I CAGGGGAGTT -/G GGTGTCAGGA 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 G 2 3 267143 CASAVA_Build 7 20256752 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 2886 hom 18 het 7 0 7 0 A 8 7 267144 CASAVA_Build 7 20260211 1I CACAATAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 643 hom 52 2 46 4 T 8 9 267145 CASAVA_Build 7 20262893 1D CAAATAAGAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 A 9 8 267146 CASAVA_Build 7 20266262 1D TTTATCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 14 13 267147 CASAVA_Build 7 20272760 1D ACTTTTTGAT G/- TTTTTTTTTG 2870 het 2267 hom 18 7 6 5 G 1 0 267148 CASAVA_Build 7 20278605 3I TGATGACGGG ---/CAT CATCATAGTT 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 CAT 2 3 267149 CASAVA_Build 7 20282918 5D TGTGTACAAC TATGA/----- TATGTCAATT 3070 het 3070 hom 54 21 29 5 TATGA 1 0 267150 CASAVA_Build 7 20286197 4D TTATATATAT AAAG/---- AAACTGTGTG 3070 het 3070 hom 20 10 10 2 AAAG 1 0 267151 CASAVA_Build 7 20290820 3D TCTCTTTTTT CTC/--- CTTTCTCTCC 3070 het 3070 ref 27 17 9 2 CTC 1 0 267152 CASAVA_Build 7 20295415 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 12 11 267153 CASAVA_Build 7 20299899 1D AGGTCATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 600 hom 32 2 22 9 A 13 12 267154 CASAVA_Build 7 20309823 1I AAGAAATCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 8 9 267155 CASAVA_Build 7 20310204 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2129 hom 15 5 9 1 A 13 14 267156 CASAVA_Build 7 20315880 13D CATGTAGGTT GAGCACTGCCAGG/------------- GAGCCCTTCT 3070 het 3070 hom 44 23 22 3 GAGCACTGCCAGG 1 0 267157 CASAVA_Build 7 20318073 1D TTATGTATCA C/- CCCCCACACC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 6 5 267158 CASAVA_Build 7 20335013 2I ACCTAAAAAC --/AT AGAGTTACAA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 AT 0 1 267159 CASAVA_Build 7 20339752 3D TGTGCTTATA AAC/--- ATTAGTCAGG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 AAC 1 0 267160 CASAVA_Build 7 20340054 2D AGTCTCAAAT TA/-- TATGTCTTTA 3070 hom 132 het 49 0 44 7 TA 2 1 267161 CASAVA_Build 7 20341667 3I TCAAGGATCT ---/GCC GCCTGCCCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 GCC 1 2 267162 CASAVA_Build 7 20345036 13D ATTTCCCTCT ATTATTTTAAAAA/------------- ATATCTTAGA 3070 hom 63 het 25 0 20 5 ATTATTTTAAAAA 1 0 267163 CASAVA_Build 7 20351541 1I CAGACAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 835 hom 35 2 25 8 A 9 10 267164 CASAVA_Build 7 20358032 1D ATAACAGTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 23 7 T 10 9 267165 CASAVA_Build 7 20363026 4I ACTGTCCTTT ----/TTAG TTAGTTTTGG 3070 hom 108 het 46 0 37 9 TTAG 1 2 267166 CASAVA_Build 7 20365825 2I AGGAGAGAGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 40 hom 43 1 30 12 GT 7 8 267167 CASAVA_Build 7 20366613 2I TTGTGTACAT --/TG TACACAATAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 0 1 267168 CASAVA_Build 7 20369879 1D AGGTGTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 41 0 34 7 T 11 10 267169 CASAVA_Build 7 20381508 1I TTCAAATTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1181 hom 33 3 24 6 A 10 11 267170 CASAVA_Build 7 20385675 2I TTTTATCACC --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 8 10 267171 CASAVA_Build 7 20390449 13I GATTCAAGAG -------------/TCTGAACCAAGAT TCTTGGGGTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TCTGAACCAAGAT 0 1 267172 CASAVA_Build 7 20391081 1I GTGCCAGAAT -/A AAAAAACTGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 7 267173 CASAVA_Build 7 20391954 5D CTTTGCTACC TGAGT/----- TAACAAACGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TGAGT 1 0 267174 CASAVA_Build 7 20395987 1I GTTTTTGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 11 12 267175 CASAVA_Build 7 20409936 2I GGAAGGAAGG --/GA GAGAGGGAGA 3070 hom 82 het 33 0 29 4 GA 2 3 267176 CASAVA_Build 7 20413395 17I CAAGCATACT -----------------/CAGTGGTTATAGGGTAC CATCTCTGGG 3070 hom 135 het 49 0 46 4 CAGTGGTTATAGGGTAC 0 1 267177 CASAVA_Build 7 20441066 1I TCTATTCAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 160 hom 33 1 28 4 A 9 10 267178 CASAVA_Build 7 20453337 2I GAATTTACCC --/CT GTTTGCAGTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 CT 0 1 267179 CASAVA_Build 7 20459511 1I CTTTGTTTAT -/A AAGCCAAATA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 2 3 267180 CASAVA_Build 7 20471989 1I CAAAAAAATT -/A TAAAAAAAAA 2500 het 2068 hom 21 7 10 4 A 0 1 267181 CASAVA_Build 7 20472255 5D TATGTCTTGC TTTCT/----- TTTCAACAGG 3070 het 3070 hom 40 12 25 6 TTTCT 1 0 267182 CASAVA_Build 7 20473338 1D CAAAAAGAAC A/- GTAGCAAAGT 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 A 1 0 267183 CASAVA_Build 7 20473686 4D TACCTGATAG AAGT/---- AATATATGAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 7 AAGT 1 0 267184 CASAVA_Build 7 20475137 1D AGATATTTTA T/- TTGCCTTTTG 3070 het 3070 ref 25 12 12 2 T 3 2 267185 CASAVA_Build 7 20476486 4I ATTATTAATC ----/GTTA GTTAATTACA 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 GTTA 1 2 267186 CASAVA_Build 7 20476612 1D TTTTTATAGG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 9 8 267187 CASAVA_Build 7 20477190 3I30M4D CTTTCTTTCT ---TTTTTTTCTTTTCCTTCTTTCTCTTTCTTTTTTC/TTCTTTTTTTCTTTTCCTTCTTTCTCTTTCTTT---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 44 32 19 8 N/A 0 0 267188 CASAVA_Build 7 20477286 4D TTCTTTTTCT TTCC/---- TTATTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 TTCC 1 0 267189 CASAVA_Build 7 20480004 1D TAAAGGCATT A/- AATGAACTTG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 3 2 267190 CASAVA_Build 7 20484995 1I TTTTTCATTC -/T TTACCATTTG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 2 3 267191 CASAVA_Build 7 20486044 1D CTGAGAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 43 2 34 7 A 12 11 267192 CASAVA_Build 7 20488334 1D TATTAGCCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 10 9 267193 CASAVA_Build 7 20488932 3D TCAAAAGACT CTC/--- CTCAGTTTTT 3070 het 1779 hom 25 4 18 4 CTC 2 1 267194 CASAVA_Build 7 20489995 1D GGGATGGTTT C/- AGACAGAATC 3070 het 3070 hom 47 18 23 7 C 1 0 267195 CASAVA_Build 7 20494356 1I TTGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 T 9 10 267196 CASAVA_Build 7 20496000 2D ACTATACTTT AA/-- AAACCATATG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 A 5 3 267197 CASAVA_Build 7 20496503 1I TGTCAAAGTA -/T TTTTTATACA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 5 6 267198 CASAVA_Build 7 20505237 1D GATTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 1457 het 1457 ref 37 32 4 1 A 12 11 267199 CASAVA_Build 7 20506292 1D AATAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 28 0 23 6 A 12 11 267200 CASAVA_Build 7 20509830 1I AAACAAATAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 85 het 33 0 29 4 A 8 9 267201 CASAVA_Build 7 20523960 2I ATGTACCAGT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 TA 7 8 267202 CASAVA_Build 7 20531449 3D TCCCTTCCTT TAA/--- TAATAATAAT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 TAA 5 4 267203 CASAVA_Build 7 20532846 1I ACAGCTAGAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 38 0 22 16 A 8 9 267204 CASAVA_Build 7 20536285 1D GTATGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 488 hom 34 3 22 9 T 15 14 267205 CASAVA_Build 7 20538083 4I TACCAATGAT ----/TAAC TATTTTCTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TAAC 0 1 267206 CASAVA_Build 7 20542181 5I TCAAGAAACT -----/CTTAA CTTAAGAATC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 CTTAA 1 2 267207 CASAVA_Build 7 20549681 3D TCCCTTTTCA TCT/--- TCCTCTTCCC 3070 het 3070 ref 56 31 23 3 TCT 1 0 267208 CASAVA_Build 7 20551306 1D AACCAGAAGG A/- AAAAGCTAGA 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 A 5 4 267209 CASAVA_Build 7 20552042 1D TTTCTTTAAG A/- AAACAGTGGA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 4 3 267210 CASAVA_Build 7 20552167 1I GTCCACATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 A 12 13 267211 CASAVA_Build 7 20589811 1D TATTTAAAGT A/- AAATGCTCAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 4 3 267212 CASAVA_Build 7 20617179 2I CATAGAAAAT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 9 11 267213 CASAVA_Build 7 20633838 1I TTAAATATCC -/T TATTTACAGG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 1 2 267214 CASAVA_Build 7 20647498 1D TTATTATTGC A/- AAACACACAC 1707 het 1707 ref 33 16 6 12 A 4 3 267215 CASAVA_Build 7 20659088 1I TTTTTAATTT -/A AAAAAATTTG 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 A 6 7 267216 CASAVA_Build 7 20660328 1D ATCAGCACTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 10 9 267217 CASAVA_Build 7 20660601 3I ACAAGCAGGT ---/TTC GGAATATCAG 3070 het 3070 ref 28 14 14 0 TTC 0 1 267218 CASAVA_Build 7 20662841 1D TAGAAAGCAA T/- TTGGCAGTTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 T 3 2 267219 CASAVA_Build 7 20665543 1D GAGTTAAGCG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 9 8 267220 CASAVA_Build 7 20670170 1D AGTCAGGCAA T/- TTTTTTTTTT 2693 het 2693 ref 25 10 8 7 T 14 13 267221 CASAVA_Build 7 20675750 1I GAAGGCCGCA -/G GGTCCTCTGC 1661 het 1459 hom 9 4 4 1 G 2 3 267222 CASAVA_Build 7 20675931 1I AGAATAAATA -/G GAGATTTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 2 267223 CASAVA_Build 7 20676029 1I CAACAACAGT -/G TTCTGGGACT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 G 0 1 267224 CASAVA_Build 7 20677170 4D ATCAGAAAAT AAAG/---- AAAGCACTAA 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 AAAG 2 1 267225 CASAVA_Build 7 20689707 4I TTATAGGTCT ----/TAAG TAAGTTAAAT 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 TAAG 1 2 267226 CASAVA_Build 7 20690089 1I26M1I11M1I7M1I GATGAACTCT -TGGTCACTACAAGTTGACTCTACCAC-TAATAGTTTTA-GTCCTTG-/GTGGTCACTACAAGTTGACTCTACCACTTAATAGTTTTAGGTCCTTGA GCAAGTTATT 3070 hom 154 het 47 0 52 9 N/A 0 0 267227 CASAVA_Build 7 20690753 1D GTAAATAAAT A/- AATAAAAACA 2233 het 2233 ref 16 9 6 1 A 3 2 267228 CASAVA_Build 7 20705448 2I TACATAGTTT --/AA GAGAATTAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 0 2 267229 CASAVA_Build 7 20706300 1D GATAAGTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 76 het 35 0 25 10 T 10 9 267230 CASAVA_Build 7 20709764 1I TAAGCCAAGA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 T 7 8 267231 CASAVA_Build 7 20722653 1D CAAAGACCAA T/- TTTTTTTTTA 1105 het 1105 ref 28 24 3 1 T 10 9 267232 CASAVA_Build 7 20729510 2D TGATATGTAT AG/-- AGAGAGAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AG 4 3 267233 CASAVA_Build 7 20734009 1I TTAGTGATGC -/T TTTTTATATT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 5 6 267234 CASAVA_Build 7 20734307 1D TCTCAGTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 13 12 267235 CASAVA_Build 7 20737206 1D TCACACCTAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 28 0 25 4 A 9 8 267236 CASAVA_Build 7 20743004 2D CTTGGCCTAC CT/-- TTATACAGAA 3070 hom 99 het 37 0 33 8 CT 1 0 267237 CASAVA_Build 7 20745370 1I GAGGGAGAGA -/G GGGGCAAGGG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 4 5 267238 CASAVA_Build 7 20747718 1D TCCTTCCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 79 het 34 0 26 8 T 10 9 267239 CASAVA_Build 7 20766533 1D ACTCTACCTC A/- AAAAAAAAAA 2567 het 453 hom 16 3 10 4 A 18 17 267240 CASAVA_Build 7 20768338 1I AAAAAAAAGA -/T TCTTAAACTT 3070 het 285 hom 32 1 28 3 T 1 2 267241 CASAVA_Build 7 20768674 1I TCTTGTGCTA -/C CAAATTCCTC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 1 2 267242 CASAVA_Build 7 20768949 1I GATGGGGTTT -/C CCCATGTTGG 3070 hom 35 het 14 0 12 2 C 3 4 267243 CASAVA_Build 7 20769148 1I GTATATGAGC -/T TTCACAAACT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 2 3 267244 CASAVA_Build 7 20769633 1I GTCTGTTTTT -/C CTTTAGTGTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 C 1 2 267245 CASAVA_Build 7 20770071 1I TTTAAATGAT -/G GAATGCCATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 2 267246 CASAVA_Build 7 20770472 1I TTAGATGGAG -/T TTCACTCTTG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 2 3 267247 CASAVA_Build 7 20770578 1I21M1I2M1I CTAAGTAGCT -GGATTACAGGTGCATGCCACC-TG-/GGGATTACAGGTGCATGCCACCATGC CCGGCTAATT 3070 hom 75 het 20 0 26 1 N/A 0 0 267248 CASAVA_Build 7 20770893 1I CAAATTAGCC -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 80 het 32 0 27 5 A 7 8 267249 CASAVA_Build 7 20770991 1I53M1I18M1I TGGTCAACAT -GTTCCCAAAGATGCCAAAGAAGAAACTTCCAAAGTAACAAAGAGAAGATAAAT-TGTTCAATTAATAACTCT-/GGTTCCCAAAGATGCCAAAGAAGAAACTTCCAAAGTAACAAAGAGAAGATAAATGTGTTCAATTAATAACTCTG GGAAATCCAC 3070 hom 132 het 40 0 42 21 N/A 0 0 267250 CASAVA_Build 7 20771207 1I AGGCCGAGGT -/G GGCTGATCAC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 G 2 3 267251 CASAVA_Build 7 20771925 1I CGAAACTAGA -/T TTTTTTCTGC 3070 hom 131 het 50 0 44 6 T 6 7 267252 CASAVA_Build 7 20772276 1I7M1I GCAGACTTAC -AATATTG-/AAATATTGA AACTGAAAAA 3070 hom 96 het 33 0 32 3 N/A 0 0 267253 CASAVA_Build 7 20772989 1I TTGTATTTCA -/G GTTGCTCCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 1 2 267254 CASAVA_Build 7 20774796 1I27M1I12M1I17M1I CTCATCATCC -TTTTCCCTTCTCTCCCCTCAACAACTC-AAGATTGAAGAC-TTTTGGTGTTGATATGT-/TTTTTCCCTTCTCTCCCCTCAACAACTCAAAGATTGAAGACTTTTTGGTGTTGATATGTA AACATTTCTT 3070 hom 54 het 19 0 19 9 N/A 0 0 267255 CASAVA_Build 7 20775315 1I TAGGCATGAG -/C CACTGTGCCC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 1 2 267256 CASAVA_Build 7 20776068 1I42M1I CAATGGGTTG -TCCCGCAAAATTCCTTTGTGAATAACATAAAGTTGCATTTTG-/TTCCCGCAAAATTCCTTTGTGAATAACATAAAGTTGCATTTTGC CTACTTACTG 3070 hom 196 het 42 0 66 5 N/A 0 0 267257 CASAVA_Build 7 20776447 1I AATTCAGGGC -/T GATTCTCTAA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 0 1 267258 CASAVA_Build 7 20778122 1I TTAGATGCCA -/G GGTCACTCTC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 2 3 267259 CASAVA_Build 7 20778337 1I11M1I4M1I ACTGTTATTA -CTTTATTTCCT-AAGC-/CCTTTATTTCCTAAAGCA ATACTTCAAC 3070 hom 123 het 45 0 42 6 N/A 0 0 267260 CASAVA_Build 7 20778638 1I AGATATGAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 T 9 10 267261 CASAVA_Build 7 20779489 1I CTGGGTTCAA -/G GGATTCTCCT 3070 hom 66 het 23 0 22 1 G 2 3 267262 CASAVA_Build 7 20779577 1I AGTAGATAGA -/G GGTTTCACCA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 2 3 267263 CASAVA_Build 7 20780613 1I TAAAACACTT -/A AGTGAACACA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 2 267264 CASAVA_Build 7 20780711 1I CTATACAGTA -/T TTTGTAGCCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 3 4 267265 CASAVA_Build 7 20780880 1I GTTATTTACT -/G GGAGAAACAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 2 3 267266 CASAVA_Build 7 20781189 1I AAGGGGAAAG -/A ACCTGCTTAG 3070 hom 111 het 41 0 34 7 A 1 2 267267 CASAVA_Build 7 20781292 1I22M1I CTGAAATGAT -GGAAACCTGATGATAGGGTGCC-/GGGAAACCTGATGATAGGGTGCCT ACATAATTAG 3070 hom 114 het 38 0 38 9 N/A 0 0 267268 CASAVA_Build 7 20781490 1I AGGATTGGTT -/C CCCCCAAAGA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 C 5 6 267269 CASAVA_Build 7 20781786 1I28M1I GTATAGAGGA -TTTTTTAAAAAAACAAAACAATAAAGAG-/TTTTTTTAAAAAAACAAAACAATAAAGAGT TCCATTGTGC 3070 hom 106 het 38 0 36 15 N/A 0 0 267270 CASAVA_Build 7 20782077 1I TCTCAACTGC -/A AACTAGATAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 3 267271 CASAVA_Build 7 20782941 1I CTGCAGGGGC -/T TTGCAAGCGA 3070 hom 60 het 24 0 16 8 T 2 3 267272 CASAVA_Build 7 20783236 1I TGTGCGATGA -/G CTTCCAAGAC 3070 hom 89 het 34 0 28 6 G 0 1 267273 CASAVA_Build 7 20783636 1I TTCTGTTAGT -/C CCCAGGGTAG 3070 hom 117 het 43 0 38 5 C 3 4 267274 CASAVA_Build 7 20784018 1I CAGAAAGATC -/A AAGCGCGGCA 3070 hom 80 het 30 0 24 6 A 2 3 267275 CASAVA_Build 7 20784920 1I CATGGTGAAA -/C CCGGTCTCTA 2326 hom 24 het 13 0 7 6 C 2 3 267276 CASAVA_Build 7 20784940 1I CTGAAAATGC -/A ACAATTAGCC 635 hom 4 het 10 0 2 8 A 1 2 267277 CASAVA_Build 7 20785984 1I30M1I TCTTAAATTC -TTCATGATAATATTTATCTTTACCATCTTA-/TTTCATGATAATATTTATCTTTACCATCTTAG GCAAACAGAT 3070 hom 126 het 33 0 43 0 N/A 0 0 267278 CASAVA_Build 7 20786100 1I ACCTTTGAGC -/T AATCCTCTAC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 0 1 267279 CASAVA_Build 7 20787229 1I CTGCTTGTTA -/T TCCTAGGAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 267280 CASAVA_Build 7 20787729 1I15M1I AGTATGGCTC -AGGAACACCCATTGC-/AAGGAACACCCATTGCT TAAATGCACT 3070 hom 123 het 38 0 42 4 N/A 0 0 267281 CASAVA_Build 7 20788070 1I TTTAAATACT -/A AATGCAATCA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 2 3 267282 CASAVA_Build 7 20788446 1I TGAGTTTATT -/A ATACCATTTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 1 2 267283 CASAVA_Build 7 20788722 1I TTTTGGCAGA -/C CCACTTATTA 3070 hom 89 het 32 0 29 3 C 2 3 267284 CASAVA_Build 7 20788830 1I AACATTTATC -/A AATATTGTCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 2 3 267285 CASAVA_Build 7 20789309 1I19M1I16M1I TACGATCTTC -ATGAATTGAGAGAATTTAC-GAAATTGGTACTATAC-/AATGAATTGAGAGAATTTACAGAAATTGGTACTATACA AATTGACGGC 3070 hom 51 het 19 0 18 8 N/A 0 0 267286 CASAVA_Build 7 20789570 1I GAGAGAAAGA -/G TTGCTCCCCG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 G 0 1 267287 CASAVA_Build 7 20789763 1I AAGAGGCAGA -/G CTGACATTGG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 0 1 267288 CASAVA_Build 7 20790022 1I55M1I CCTGCCCGCG -CGAGGCCCGCTGTCTACCAGGCACTGGATTAGTCCAGCTCTACCTCCAGTGGCCG-/CCGAGGCCCGCTGTCTACCAGGCACTGGATTAGTCCAGCTCTACCTCCAGTGGCCGC TTCCCTCTAA 1514 het 277 hom 6 3 5 10 N/A 0 0 267289 CASAVA_Build 7 20817819 2I AAGCTTAAAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 77 het 45 1 35 9 TG 8 9 267290 CASAVA_Build 7 20898317 1D TTCAATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 11 10 267291 CASAVA_Build 7 20901310 1I AATTTAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 27 1 17 9 T 14 15 267292 CASAVA_Build 7 20905341 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2035 hom 15 het 8 0 6 2 A 14 13 267293 CASAVA_Build 7 20909355 1I CAATGTGTGA -/T TTTTTTTTTT 1249 het 1249 ref 41 30 3 8 T 10 11 267294 CASAVA_Build 7 20933850 1D TAAAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 28 1 21 6 A 13 12 267295 CASAVA_Build 7 20946772 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1500 het 57 hom 13 1 5 7 A 17 16 267296 CASAVA_Build 7 20948916 9I TGAAAGCAGT ---------/ATATTGAAG ATATTTGTGC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATATTGAAG 0 1 267297 CASAVA_Build 7 20950897 1I CGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2104 hom 25 het 23 0 9 14 T 10 11 267298 CASAVA_Build 7 20963478 1D TAAGTCTTCT G/- GTGAAAATAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 G 2 1 267299 CASAVA_Build 7 20981420 1D TTCAGACAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 18 25 6 T 9 8 267300 CASAVA_Build 7 21005017 1I CTGGGCTGGG -/C CGCAGTGGCT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 C 1 2 267301 CASAVA_Build 7 21035951 1D ACAGTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2408 hom 29 11 10 9 T 14 13 267302 CASAVA_Build 7 21045153 1D CTGATAATTG T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 32 8 14 11 T 8 7 267303 CASAVA_Build 7 21047043 5I TTTGCCCTAC -----/TACGA TACAGTCTAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 TACGA 0 1 267304 CASAVA_Build 7 21057427 1I TCAATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 32 0 19 13 T 14 15 267305 CASAVA_Build 7 21061631 7D GTGTGATCAA CTTGTCC/------- TATTGAAGTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 CTTGTCC 1 0 267306 CASAVA_Build 7 21063986 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 958 het 543 hom 19 10 4 5 C 1 0 267307 CASAVA_Build 7 21070417 1I ATTTAAATTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 8 9 267308 CASAVA_Build 7 21076281 1I TTTGCTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 853 hom 22 2 16 4 A 12 13 267309 CASAVA_Build 7 21079633 1D TGAACAACAA C/- CCTTAATCCA 3070 hom 100 het 41 0 31 10 C 3 2 267310 CASAVA_Build 7 21081827 2D ACAGAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 784 het 784 ref 30 18 3 10 AG 9 8 267311 CASAVA_Build 7 21083691 1I GATAGTCTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 267312 CASAVA_Build 7 21084495 1D CCTGTTGGAA T/- TGGATGTGTC 3070 het 3070 hom 47 16 28 3 T 2 1 267313 CASAVA_Build 7 21097198 1D14M1D ACATGTACCC TAGAACTTAAAGTATA/-AAAACTTAAAGTAT- AAAAAAAAAA 3070 het 144 hom 17 2 13 7 N/A 0 0 267314 CASAVA_Build 7 21099168 3D CATCAGGTTG CCA/--- CCACAAGATG 3070 het 3070 ref 51 25 22 6 CCA 2 1 267315 CASAVA_Build 7 21101071 1I TCTTTTGAGA -/C AAATTTCCAT 3070 hom 157 het 60 0 53 7 C 0 1 267316 CASAVA_Build 7 21106438 3I ACTTGACACA ---/CAG AAGATATTCA 3070 hom 148 het 52 0 50 2 CAG 0 1 267317 CASAVA_Build 7 21113928 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 2601 hom 27 9 18 1 T 8 7 267318 CASAVA_Build 7 21117187 2I AGGAATATGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 A 13 15 267319 CASAVA_Build 7 21145928 1D TTGACTTCCA T/- TTTTATCTTC 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 5 4 267320 CASAVA_Build 7 21152530 1D AGCCCACGGA G/- GGGGGGGAGC 2510 hom 41 het 19 0 11 8 G 8 7 267321 CASAVA_Build 7 21168209 1D ACCACAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 11 10 267322 CASAVA_Build 7 21169996 1I GCATTTTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 25 15 1 A 9 10 267323 CASAVA_Build 7 21180109 5I TCAAGTTCAT -----/ATAAG ATGAGTTTCT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 ATAAG 0 1 267324 CASAVA_Build 7 21189963 1D AGACCAGCCT G/- GCCAATATGG 1139 het 868 hom 9 3 3 3 G 2 1 267325 CASAVA_Build 7 21191040 1D TGTATATTAA G/- GACAGAAATC 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 G 2 1 267326 CASAVA_Build 7 21191092 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2520 het 2520 ref 37 22 6 9 T 13 12 267327 CASAVA_Build 7 21202282 1I AAGCTAAAAG -/A AAAAACCTTG 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 5 6 267328 CASAVA_Build 7 21220197 3D AACATAATCC TAT/--- TATTATAATG 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 TAT 3 2 267329 CASAVA_Build 7 21233663 1D AAAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 A 11 10 267330 CASAVA_Build 7 21238186 2D AATGCATATC TT/-- TTTTATATAT 2760 het 2760 ref 22 10 9 4 T 6 4 267331 CASAVA_Build 7 21253678 2D ACCACAACTC CT/-- CTACCTACTA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 CT 2 1 267332 CASAVA_Build 7 21263302 3D CTAAAGATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 760 het 18 hom 9 1 5 3 A 17 14 267333 CASAVA_Build 7 21267359 1D ATTTAGGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 23 1 13 10 A 12 11 267334 CASAVA_Build 7 21269779 1I AATAAATGCT -/A AAAAAAATGT 3070 het 2128 hom 21 7 9 5 A 7 8 267335 CASAVA_Build 7 21273121 4D ACTATAGCAA TGGT/---- TGGTTTGTTT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 TGGT 2 1 267336 CASAVA_Build 7 21284213 4I GAGTTATGGT ----/ACTA ACTAAGTCTC 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 ACTA 1 2 267337 CASAVA_Build 7 21284495 1I TTGAGAACTC -/A AAATGTTACC 3070 hom 144 het 51 0 48 3 A 3 4 267338 CASAVA_Build 7 21294919 1D TGTGGAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 13 12 267339 CASAVA_Build 7 21302571 1I GGGTAGGCAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 8 9 267340 CASAVA_Build 7 21303338 1D AGAAAAGGGT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 14 hom 24 1 18 5 G 8 7 267341 CASAVA_Build 7 21307263 1I ATTAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 A 10 11 267342 CASAVA_Build 7 21311792 1D TTCCTTGGGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 61 15 38 9 A 9 8 267343 CASAVA_Build 7 21320313 4I AAAATTATAA ----/ATGT ATGTGTGCCT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 ATGT 1 2 267344 CASAVA_Build 7 21322543 4I TTAATCTACA ----/ACTT ACTTATGCTT 3004 het 3004 ref 29 17 7 5 ACTT 1 2 267345 CASAVA_Build 7 21329987 1D TTATTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1321 hom 25 8 11 6 T 15 14 267346 CASAVA_Build 7 21381335 1I AGCTTTCTTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 8 9 267347 CASAVA_Build 7 21398511 2D ATGCAAAAAC AT/-- GTGACTTTAC 3070 het 2755 hom 17 7 9 1 AT 1 0 267348 CASAVA_Build 7 21403257 1D GTCATTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 33 2 18 13 T 17 16 267349 CASAVA_Build 7 21403666 1I AGATTCATAG -/A AAAAATAGAT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 5 6 267350 CASAVA_Build 7 21405281 1D TGAGACATGA T/- CACACCACTG 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 T 1 0 267351 CASAVA_Build 7 21406496 6D AAGAGGAAAC AGACTT/------ AGAACAACTC 3070 het 3070 ref 27 15 9 5 AGACTT 1 0 267352 CASAVA_Build 7 21410869 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 1760 hom 18 5 11 2 T 6 7 267353 CASAVA_Build 7 21417057 1D GTGATATAAC A/- GTTAAACTCT 3070 het 3070 ref 59 32 18 9 A 1 0 267354 CASAVA_Build 7 21421871 8D AAAAAAAAAG AAAAAAAA/-------- AAGAAGAATT 3070 hom 84 het 28 0 28 4 A 10 2 267355 CASAVA_Build 7 21429475 1D GGGTGCTAGG A/- AAAAAAAAAA 1008 het 1008 ref 34 18 3 13 A 13 12 267356 CASAVA_Build 7 21435395 2D CACTTTTTTT CC/-- CCCCCCCCTC 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 C 10 8 267357 CASAVA_Build 7 21445461 1D TCTGTATGCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 9 8 267358 CASAVA_Build 7 21460499 2I TTTTACTAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 T 13 15 267359 CASAVA_Build 7 21463175 1I CCTAAGAAGG -/C AAGGCATAGA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 C 0 1 267360 CASAVA_Build 7 21475377 2D AATAAGTAAA AG/-- AGGATAATAC 3070 het 3070 ref 23 13 7 4 AG 2 1 267361 CASAVA_Build 7 21475523 4D TTTCATTTCC TCAT/---- TCATAGTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 14 2 TCAT 2 1 267362 CASAVA_Build 7 21483153 1D TGCACATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 11 10 267363 CASAVA_Build 7 21484651 2D AAGGTTCCAG TC/-- TCTCTAGATC 3070 het 3070 hom 46 14 25 7 TC 3 2 267364 CASAVA_Build 7 21498037 1I TCTTCAAGGT -/A AAAATTAATT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 A 4 5 267365 CASAVA_Build 7 21499343 1I ATTCCATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 13 14 267366 CASAVA_Build 7 21499857 1D AACTTTTGAC A/- AAAGAAAACT 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 A 4 3 267367 CASAVA_Build 7 21503429 20D TCCACCCCCT CTAGTGGCTGCCAGATGGTG/-------------------- CCAAGAATTC 3070 het 3070 ref 30 17 14 5 CTAGTGGCTGCCAGATGGTG 1 0 267368 CASAVA_Build 7 21511824 16D AAGAGGGTGT AGTGTTTAGTCACCAC/---------------- AGGGTGGTAG 3070 het 3070 ref 40 26 18 4 AGTGTTTAGTCACCAC 1 0 267369 CASAVA_Build 7 21515615 1I AATATTTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 10 267370 CASAVA_Build 7 21522062 1I CTCTTGTCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 8 9 267371 CASAVA_Build 7 21530086 6D ATATATATAT ATATAG/------ AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 6 ATATAG 1 0 267372 CASAVA_Build 7 21538020 1D TTCTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 2383 het 2383 ref 24 14 5 5 T 11 10 267373 CASAVA_Build 7 21547137 1D TCATCTACCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 T 10 9 267374 CASAVA_Build 7 21550827 1D GATTGAAACA T/- TTCTACATGC 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 3 2 267375 CASAVA_Build 7 21555527 12I ATTCCCATAC ------------/TCTGTCTGGATT TCTAAGGTTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 TCTGTCTGGATT 0 1 267376 CASAVA_Build 7 21556271 1I TACATTCGTC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 7 8 267377 CASAVA_Build 7 21560055 1I TCCTTTGTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 9 10 267378 CASAVA_Build 7 21564838 3I GATATCATTG ---/GAT GATATTTATG 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 GAT 1 2 267379 CASAVA_Build 7 21567591 1D ATTCGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 13 6 A 12 11 267380 CASAVA_Build 7 21568185 4I ACAGCAGGGG ----/CTCT CTCTGTAAGA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 CT 2 4 267381 CASAVA_Build 7 21571422 1D TAAGACCACA G/- GTCCTGTCGG 3070 het 3070 hom 43 10 27 8 G 2 1 267382 CASAVA_Build 7 21584917 1D CTTCTGTGTA C/- CCACAGAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 C 3 2 267383 CASAVA_Build 7 21599714 1D CCATTGAGGG A/- AATGGGATTT 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 A 3 2 267384 CASAVA_Build 7 21603277 11I GAATATTGGG -----------/CCTGGAAGGGA CCTGAGTGAT 3070 hom 137 het 51 0 45 6 CCTGGAAGGGA 0 1 267385 CASAVA_Build 7 21614983 2I2M1D AAGTCAGAGA --CTG/TGCT- TACGCTTATA 3070 hom 114 het 42 0 39 6 N/A 0 0 267386 CASAVA_Build 7 21615713 1D AAGTGATAGG A/- AAAAAAACGA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 A 8 7 267387 CASAVA_Build 7 21626080 5I TGCACATTAA -----/TTAAT TTATATTGTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTAAT 0 1 267388 CASAVA_Build 7 21645485 1I GTCGCCAAAT -/C CCCCCAGAAT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 C 5 6 267389 CASAVA_Build 7 21657098 1D CTGTTATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 14 0 12 3 A 15 14 267390 CASAVA_Build 7 21684471 5I TAAGAGTCTT -----/CTATC CTTTCTTCAC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTATC 0 1 267391 CASAVA_Build 7 21702361 2D TTTCCAACTT AA/-- AGTTTGCTTG 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 A 3 1 267392 CASAVA_Build 7 21705887 1D AAGTCAGAAG A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 32 16 16 0 A 7 6 267393 CASAVA_Build 7 21710844 1D AATTGATACT A/- AAGCAAGATG 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 A 3 2 267394 CASAVA_Build 7 21722005 1D GATTTCCCCC T/- CCCACCCCCA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 1 0 267395 CASAVA_Build 7 21722241 1I TTCTGGGCTA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 7 8 267396 CASAVA_Build 7 21732615 1D AAAAAAAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 67 het 27 0 25 2 T 10 9 267397 CASAVA_Build 7 21735849 4D2M1D CAAGTAACAC TGAGGTC/----GT- TCACCAGAAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 N/A 0 0 267398 CASAVA_Build 7 21767010 1I CCTAAGGTGT -/A AAATAAAATG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 3 4 267399 CASAVA_Build 7 21769933 6D AATGTGCTAT ATATAC/------ ATATACATAT 3070 hom 54 het 28 0 19 11 ATATAC 4 3 267400 CASAVA_Build 7 21770426 5D AACACTTGTT AAATG/----- AGATATGGGT 3070 hom 105 het 39 0 36 5 AAATG 1 0 267401 CASAVA_Build 7 21770639 2D TTAGACCTTA CT/-- CCCTGATTGA 3070 hom 123 het 47 0 41 7 CT 1 0 267402 CASAVA_Build 7 21777995 1D CGCCCCCCAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 411 hom 27 1 19 7 A 9 8 267403 CASAVA_Build 7 21779844 1I ATTTACTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 267404 CASAVA_Build 7 21786169 1D GTTGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 11 10 267405 CASAVA_Build 7 21786283 1I GATTATGGCA -/T TTAAAATTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 3 267406 CASAVA_Build 7 21789062 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAGAA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 AAAAG 1 0 267407 CASAVA_Build 7 21789154 1D TTTAAAATGA T/- TTTTTTAATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 6 267408 CASAVA_Build 7 21823984 1D AAAATAAAAG T/- TTGATCAAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 3 2 267409 CASAVA_Build 7 21830187 1D TAAGGGTAAA T/- TTGTTAAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 T 3 2 267410 CASAVA_Build 7 21831760 1I TCCTGCCTCC -/T TTTTTTTTTT 2686 het 2686 ref 32 14 9 9 T 11 12 267411 CASAVA_Build 7 21833813 4I TTACAGAAAT ----/AGTA AGAGGGAGAT 2769 het 2769 ref 23 15 6 2 AGTA 0 1 267412 CASAVA_Build 7 21834882 1I TACTTATGAC -/T TTTTTTTTTT 3026 het 3026 ref 42 16 15 11 T 10 11 267413 CASAVA_Build 7 21836420 1I TTGTAAAAAA -/T ATTATGAATT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 0 1 267414 CASAVA_Build 7 21836825 1I TTAGGTCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 10 11 267415 CASAVA_Build 7 21856123 1I ATTTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 11 12 267416 CASAVA_Build 7 21862929 1D CAAATGAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 67 het 40 1 34 5 A 10 9 267417 CASAVA_Build 7 21863678 1D TTTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 34 1 28 6 A 11 10 267418 CASAVA_Build 7 21866431 1I GGCTACTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 43 0 33 10 A 10 11 267419 CASAVA_Build 7 21868266 1I TATAATAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 27 1 16 10 T 14 15 267420 CASAVA_Build 7 21873978 1I ACTGATCATG -/T TTTTTATATT 3070 hom 82 het 32 0 28 4 T 5 6 267421 CASAVA_Build 7 21874644 1D AGATCCATTC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 91 het 36 0 31 6 A 8 7 267422 CASAVA_Build 7 21875504 1I GACAGAACTC -/T TTTTTTAATG 3070 het 154 hom 46 1 39 6 T 6 7 267423 CASAVA_Build 7 21877963 18D CATCAGTCAT ATTGGTTTAAGACCCTTC/------------------ ATTGGCAGGA 3070 hom 45 het 19 0 14 5 ATTGGTTTAAGACCCTTC 1 0 267424 CASAVA_Build 7 21880367 1I GTTTTAGCCC -/T GGTTTGATAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 0 1 267425 CASAVA_Build 7 21888086 3I TTATAGAATT ---/AAA AAGTAATTCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 2 5 267426 CASAVA_Build 7 21890192 1I TCTCTTAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 A 8 9 267427 CASAVA_Build 7 21891242 2D ACAAGATAGT AA/-- AAAAAAAGAT 3070 het 84 hom 32 3 14 16 A 9 7 267428 CASAVA_Build 7 21892806 16I CCGCGAGGAG ----------------/CTCCCGCAGACAGTCC CTCCCCTAGC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CTCCCGCAGACAGTCC 0 1 267429 CASAVA_Build 7 21903583 3I AGCTAGCATA ---/CTT CTTCTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 CTT 2 3 267430 CASAVA_Build 7 21903770 1D AGAATTACAC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 9 8 267431 CASAVA_Build 7 21906884 5I TGTATGTGAA -----/TTCTC TTCTCTTAGA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 TTCTC 1 2 267432 CASAVA_Build 7 21907083 4D GCATCAAACA ACTT/---- ACTTGATCAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ACTT 2 1 267433 CASAVA_Build 7 21907901 7D CTGTAAGGCC TCCAGTG/------- TCCAGTGTCT 3070 hom 66 het 25 0 22 7 TCCAGTG 2 1 267434 CASAVA_Build 7 21908111 4D GGGAAGCCAA AGAT/---- AGATAGATCA 3070 hom 84 het 34 0 28 7 AGAT 3 2 267435 CASAVA_Build 7 21908387 4D TGTAAAAAAA TCTT/---- TCTTAGGCAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TCTT 2 1 267436 CASAVA_Build 7 21908837 4D TCAGCCTGCC TTGT/---- TTGTTTGTTC 3070 het 3070 hom 53 13 25 16 TTGT 3 2 267437 CASAVA_Build 7 21910040 3D TGGAAAATCT AAC/--- AACATTAATT 3070 het 3070 ref 52 28 19 5 AAC 2 1 267438 CASAVA_Build 7 21911375 1D GCTTAAACCA T/- TAACAGTTAC 3070 hom 110 het 40 0 37 5 T 2 1 267439 CASAVA_Build 7 21921595 1D TGAAGACAAA C/- CCTTAGAGAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 3 2 267440 CASAVA_Build 7 21941087 2D GAATGAAGAA AT/-- AGACTGTTCT 3070 hom 132 het 47 0 45 3 AT 1 0 267441 CASAVA_Build 7 21941742 1I TTATTCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 607 hom 28 2 20 6 A 10 11 267442 CASAVA_Build 7 21957964 1D CTGAAATTTA C/- AAACCTCTGT 3070 het 2932 hom 21 8 10 4 C 1 0 267443 CASAVA_Build 7 21958614 2I AATACCATCC --/TT TTTATTTTTG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 3 5 267444 CASAVA_Build 7 21962558 1D GCCCAGCTGA T/- TTTTTTCTGT 2084 hom 25 het 11 0 8 3 T 7 6 267445 CASAVA_Build 7 21963238 5D AGATTTTCTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 19 0 11 8 T 19 14 267446 CASAVA_Build 7 21963636 1D TGCTACACAC T/- TTTTTTTTTT 2690 het 476 hom 13 1 9 4 T 12 11 267447 CASAVA_Build 7 21970200 1D AAATTCAGTA G/- GAATAAAGGA 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 G 2 1 267448 CASAVA_Build 7 21971896 2D ATTGGTAAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 GT 9 8 267449 CASAVA_Build 7 21976100 2D TTCTTTTTTA AT/-- AGTTACAAGC 3070 het 3070 hom 39 12 21 11 AT 1 0 267450 CASAVA_Build 7 21982163 2I CAAAAAAATG --/TA TATATATATA 2945 het 2945 ref 21 10 7 4 TA 6 7 267451 CASAVA_Build 7 21984825 1D GAGCTTATAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 8 7 267452 CASAVA_Build 7 21984955 1I CCAGAGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 35 1 26 8 T 12 13 267453 CASAVA_Build 7 21991941 1I AAAAGGATCA -/T TTTTACAAAG 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 4 5 267454 CASAVA_Build 7 21994691 1D CAGGATGACA G/- GGGACCATCT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 G 4 3 267455 CASAVA_Build 7 22000035 1D CACTGCAACC T/- CTGCCTTCCG 3070 het 2282 hom 13 5 8 0 T 1 0 267456 CASAVA_Build 7 22002038 3D TACTTGTGCT AGA/--- AGAACATATT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AGA 2 1 267457 CASAVA_Build 7 22002121 1D GCAATATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 24 1 21 2 A 11 10 267458 CASAVA_Build 7 22007334 1D AACATTTAAC A/- AAAAAGGGTG 3070 het 3070 hom 44 14 19 13 A 6 5 267459 CASAVA_Build 7 22012483 1D CTTAAAAAAA T/- GTTTAAATGA 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 T 1 0 267460 CASAVA_Build 7 22019028 3I AAGGGTTGTT ---/ACA AGTACAATTG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 ACA 0 1 267461 CASAVA_Build 7 22038341 2D TGTTTACAAA CC/-- CCTTGAGCTA 3070 hom 39 het 16 0 12 4 C 4 2 267462 CASAVA_Build 7 22042545 1D TTTCACCATG T/- TGGCCAGGCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 1 267463 CASAVA_Build 7 22043238 1D ACTAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 44 1 31 12 T 13 12 267464 CASAVA_Build 7 22043251 1D TTTTTTTTTT C/- TTTAGAAGGC 3070 het 445 hom 38 2 30 6 C 1 0 267465 CASAVA_Build 7 22046855 1D CTACATCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 19 1 15 3 T 12 11 267466 CASAVA_Build 7 22052006 4D CTAGACAATC CTGA/---- CTAATACACA 3070 hom 111 het 39 0 37 3 CTGA 1 0 267467 CASAVA_Build 7 22058126 1D AAATAGAGGA G/- GGGGGGGAAC 3070 hom 85 het 34 0 28 6 G 8 7 267468 CASAVA_Build 7 22070661 1D TTTATAGGTT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 8 7 267469 CASAVA_Build 7 22075351 1I CGCCGTCTAT -/A AAAAAAAAAA 1196 het 1196 ref 20 9 4 7 A 13 14 267470 CASAVA_Build 7 22077734 2D36M2I CGTATGTGTG TATATATATATACACACATGTATGTGTGTGTGTGTGTG--/--TATATATATACACACATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTA TATATATATA 2188 het 2188 ref 28 22 8 6 N/A 0 0 267471 CASAVA_Build 7 22083730 1I TAACTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 13 12 T 10 11 267472 CASAVA_Build 7 22084364 3I AACACTTCCA ---/CAG CAGGTTCAGA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 CAG 1 2 267473 CASAVA_Build 7 22086258 4D AAAAATAAAA AAAT/---- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 AAAT 1 0 267474 CASAVA_Build 7 22099564 1D CTATTACCTT A/- AATTTTATCT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 3 2 267475 CASAVA_Build 7 22119231 1I GAACCATCCC -/T TTTTTTGGCC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 T 6 7 267476 CASAVA_Build 7 22121862 1D CTTTAATTGC T/- TTTGAGACTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 T 4 3 267477 CASAVA_Build 7 22127370 1D TCAGATTTTG A/- AAAAAAAAAA 2508 het 598 hom 27 5 10 12 A 17 16 267478 CASAVA_Build 7 22132907 1I CTGGCATATG -/C CATCATACCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 1 2 267479 CASAVA_Build 7 22138522 2D CTTTCCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1726 hom 40 10 13 19 T 13 11 267480 CASAVA_Build 7 22140630 4I GAGCTAAAAT ----/GTAA GTGTGAGACA 3070 hom 90 het 33 0 28 5 GTAA 0 1 267481 CASAVA_Build 7 22144642 5I TCATCCAGTC -----/ACCAG ACCAGACCTG 3070 het 3070 ref 51 22 18 11 ACCAG 1 2 267482 CASAVA_Build 7 22156085 8D GCTCAACCCC TTTTTGAT/-------- TTTTTGATTT 3070 hom 72 het 30 0 25 7 TTTTTGAT 2 1 267483 CASAVA_Build 7 22156657 1D TCTTTATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 781 hom 35 3 17 15 A 18 17 267484 CASAVA_Build 7 22160889 1I CAGAGTTAGA -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 T 6 7 267485 CASAVA_Build 7 22164850 1D TTCACTGCAG C/- CTTGACCTCC 3070 hom 82 het 31 0 26 6 C 2 1 267486 CASAVA_Build 7 22165980 1D GGCCGGGTGT G/- GTGACTCACA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 G 2 1 267487 CASAVA_Build 7 22168359 1D TTTCCATGAC T/- TTTTAGATAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 5 4 267488 CASAVA_Build 7 22170557 4D TAATATAAAG AAAA/---- GAAATCAAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 6 A 4 0 267489 CASAVA_Build 7 22174218 3D ACAGTAATAA ATT/--- ATTAGAGTAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 ATT 2 1 267490 CASAVA_Build 7 22179994 1I GTTGTTACAT -/C CCCAATCAGC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 C 3 4 267491 CASAVA_Build 7 22187677 6D GACAAGAACG CCAAGT/------ CCAAGTCTGA 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 CCAAGT 2 1 267492 CASAVA_Build 7 22200695 1D AGGCGGCAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 A 10 9 267493 CASAVA_Build 7 22216418 1D CACTTTGGGA T/- TTTTATTATG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 5 4 267494 CASAVA_Build 7 22216598 1D AAAAATTTTA C/- CTTGACACAT 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 C 2 1 267495 CASAVA_Build 7 22217247 3D ATTTTCAGCA ATC/--- TTCTATTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 ATC 1 0 267496 CASAVA_Build 7 22217885 4D CTAATCATTT TTCC/---- TTCCTTCTTG 3070 het 3070 hom 50 20 26 6 TTCC 2 1 267497 CASAVA_Build 7 22218719 3D TCTTGATATC TCT/--- TCTTTTTATT 3070 het 3070 ref 43 25 15 5 TCT 2 1 267498 CASAVA_Build 7 22226861 1I TTGAAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 10 12 A 13 14 267499 CASAVA_Build 7 22229120 1D GAGTTGTCAT G/- GGGGGAGGCA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 G 6 5 267500 CASAVA_Build 7 22243617 1D TAGGCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1162 hom 16 5 8 3 A 17 16 267501 CASAVA_Build 7 22267997 1D TTCATAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 36 0 26 11 A 11 10 267502 CASAVA_Build 7 22270291 1I ACTTTCTGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 8 9 267503 CASAVA_Build 7 22271389 4I TGTACCCATT ----/AACC AACCAACTCT 3070 het 3070 hom 47 13 25 9 AACC 1 2 267504 CASAVA_Build 7 22271826 1D GTACTAATTT A/- ACATTCCCAC 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 2 1 267505 CASAVA_Build 7 22294389 1I CCCCAGACTC -/T TATCTTCTAC 3070 het 3070 ref 52 20 16 16 T 1 2 267506 CASAVA_Build 7 22299087 2D TATACGAGAC TG/-- GTAACTAACG 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TG 1 0 267507 CASAVA_Build 7 22302735 1I AAAGCCCAAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 8 9 267508 CASAVA_Build 7 22316807 1I TTGTATAGAG -/T TTTGTTTGCT 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 T 3 4 267509 CASAVA_Build 7 22359019 1I CACCATTTTG -/T CAACCCCTAA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 T 0 1 267510 CASAVA_Build 7 22360221 4D CTCAGAAAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 430 het 430 ref 42 21 3 18 AAAC 1 0 267511 CASAVA_Build 7 22366226 2D TCTAGAACAC AT/-- GAGTTGAATA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 AT 1 0 267512 CASAVA_Build 7 22372829 1D GCTAATATCA C/- TTTTATCCTG 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 C 1 0 267513 CASAVA_Build 7 22380868 1D AGTAACTGAA T/- TGTTTAGGTC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 2 1 267514 CASAVA_Build 7 22383629 1D ACTTTGTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 T 10 9 267515 CASAVA_Build 7 22384856 1D AGCCTGCTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 T 10 9 267516 CASAVA_Build 7 22385254 14D CAATGCTTGC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 11 het 21 1 16 4 T 23 9 267517 CASAVA_Build 7 22386555 1D GCCTACCTCC A/- AAAAGACAAG 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 A 5 4 267518 CASAVA_Build 7 22388230 2D GTCAAATGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 34 2 16 16 T 12 10 267519 CASAVA_Build 7 22393570 1D TTAAATTTAA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 7 6 267520 CASAVA_Build 7 22394983 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 340 hom 29 1 19 9 A 17 16 267521 CASAVA_Build 7 22408379 1D TCTCAAAAAG A/- AAAACAAAAA 3070 het 2472 hom 22 7 14 2 A 5 4 267522 CASAVA_Build 7 22409763 1I AGGGTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 11 12 267523 CASAVA_Build 7 22412081 7D GTTGTTGTTG TTGTTGT/------- TTGTTTGTTT 2337 het 2337 ref 33 21 8 6 TTGTTGT 1 0 267524 CASAVA_Build 7 22414590 1D ACAGAAACAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 9 8 267525 CASAVA_Build 7 22417847 1D AAAAATAAAC A/- AGAATAGTTT 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 A 2 1 267526 CASAVA_Build 7 22431040 1I TTGTTAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 898 hom 28 2 20 6 A 12 13 267527 CASAVA_Build 7 22431902 4I GGAAATGGCC ----/TCCT TCCTGCCTTA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 TCCT 1 2 267528 CASAVA_Build 7 22432337 1D GGCACTGCAT A/- AAAAAATGAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 7 6 267529 CASAVA_Build 7 22434673 1I GAGGAAAGAT -/G GAACGGTCCA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 G 1 2 267530 CASAVA_Build 7 22439283 1D TTATTTCACC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 9 8 267531 CASAVA_Build 7 22440670 1I AAGAATAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 9 10 267532 CASAVA_Build 7 22442345 1D CTTTTCATAC T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 8 T 6 5 267533 CASAVA_Build 7 22442570 7I TTTTTTTAAA -------/TTTAACT TTTAAGTTCA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 TTTAACT 0 1 267534 CASAVA_Build 7 22442688 7I CTTCCTCCTC -------/CCACCCT CCACCCTCCA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 CCACCCT 2 3 267535 CASAVA_Build 7 22446096 17D GTTGCTCATC AGTAATCTGATTTTAGA/----------------- AACATTTGAG 3070 het 3070 ref 35 24 13 4 AGTAATCTGATTTTAGA 1 0 267536 CASAVA_Build 7 22450569 1I TCCCTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 11 12 267537 CASAVA_Build 7 22457337 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 26 1 20 5 A 12 11 267538 CASAVA_Build 7 22457443 1D GTTTTAATAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 T 10 9 267539 CASAVA_Build 7 22459553 1I TACAGAGACC -/T CCTTTGCAGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 267540 CASAVA_Build 7 22474830 2D TTGTATACCT GA/-- GAGGAATAAA 3070 het 3070 ref 54 29 18 7 GA 2 1 267541 CASAVA_Build 7 22484630 4D CTGTCACAGG AATA/---- AGTAGTCTCT 3070 het 3070 hom 39 15 20 6 AATA 1 0 267542 CASAVA_Build 7 22489347 1D CTCACACTGA G/- GATACAGGAC 2694 het 2694 ref 27 15 7 5 G 2 1 267543 CASAVA_Build 7 22501631 1D AACCCTGTGG A/- AAAACAACTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 A 5 4 267544 CASAVA_Build 7 22502333 1I GTCTAAAAAG -/A AAAAAAAATT 2703 het 2703 ref 24 13 7 4 A 8 9 267545 CASAVA_Build 7 22507528 1D CTAAGCTGAG T/- AGAAAACACA 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 1 0 267546 CASAVA_Build 7 22511336 1I TTTTGGTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 10 11 267547 CASAVA_Build 7 22555884 20I CCGTGGGGTG --------------------/AGGAAAATGTATTTTCCTGC AGGAAAATAT 3070 het 3070 hom 27 11 11 6 AGGAAAATGTATTTTCCTGC 0 1 267548 CASAVA_Build 7 22559939 2D TTGAGTCCGA GG/-- GGTGATGGAG 3070 het 3070 hom 39 15 15 12 G 4 2 267549 CASAVA_Build 7 22567383 3D ATTTCACCTG CTT/--- CTTTTCATGT 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 CTT 2 1 267550 CASAVA_Build 7 22572394 1I CAATGGTCTA -/G AAGGCACTAC 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 G 0 1 267551 CASAVA_Build 7 22573053 1I CCTGCCGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 13 12 T 11 12 267552 CASAVA_Build 7 22576472 1D TTTTTATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2157 hom 33 9 15 9 T 13 12 267553 CASAVA_Build 7 22599034 22D GTATTTGGAT AGGAAAGAATGTTGCCCTGTAG/---------------------- AGGAAAGAAT 3070 het 3070 ref 49 25 10 19 AGGAAAGAATGTTGCCCTGTAG 2 1 267554 CASAVA_Build 7 22608574 1D ACAGGGAAGT G/- GGGGGATGGT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 G 6 5 267555 CASAVA_Build 7 22611350 1D AAAAATTCTC A/- ATAGAAATGT 3070 het 3070 ref 45 22 22 2 A 2 1 267556 CASAVA_Build 7 22625004 4I ATGAATTTTT ----/AACC AACAGATCTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 AACC 0 1 267557 CASAVA_Build 7 22632374 1D TACACACACA C/- CACCACCATA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 C 2 1 267558 CASAVA_Build 7 22639208 1I CAGGAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2064 het 2064 ref 32 13 7 13 A 16 17 267559 CASAVA_Build 7 22651412 3D AAATATCAAA TAT/--- TATACTATAA 3070 het 2222 hom 15 5 7 3 TAT 2 1 267560 CASAVA_Build 7 22672874 2D TGTGTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 14 15 8 TG 6 5 267561 CASAVA_Build 7 22678330 21I AAACCTGCCT ---------------------/TTGCACATTTAAATGTACCCC TTGCACATTT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 TTGCACATTTAAATGTACCCC 0 1 267562 CASAVA_Build 7 22686766 4I GATTATGCCT ----/GTCA GTCAGTGAGC 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 GTCA 1 2 267563 CASAVA_Build 7 22696172 2D GTCTGGGGTA GT/-- GTGGAGGGGA 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 GT 2 1 267564 CASAVA_Build 7 22698434 2D GGTCCTGCTA TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 10 8 267565 CASAVA_Build 7 22699604 1I AACAATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 12 13 267566 CASAVA_Build 7 22708188 1D TCTTCCCCTC T/- TTTCTTCCAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 4 3 267567 CASAVA_Build 7 22724203 1I CTTCGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 11 12 267568 CASAVA_Build 7 22731862 2I AGGACCACCG --/TC TCTCTGTTTA 3070 hom 113 het 43 0 35 8 TC 2 3 267569 CASAVA_Build 7 22732950 1I CTGGTCACTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 8 9 267570 CASAVA_Build 7 22745368 1D ACAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 23 1 17 5 A 12 11 267571 CASAVA_Build 7 22747866 2D CCTGCATTCC TA/-- TGTTTGCTGC 3070 hom 31 het 30 1 28 2 TA 1 0 267572 CASAVA_Build 7 22762277 4D TTTTGGGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2554 het 2554 ref 23 12 6 7 TTTG 3 2 267573 CASAVA_Build 7 22763543 2I CAACTTGTGC --/AA AGTCACAAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 3 267574 CASAVA_Build 7 22771340 1D CTCAAAGGCT G/- TTCCTGGGGG 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 G 1 0 267575 CASAVA_Build 7 22775977 17D TGAAAGAAAT AAAACTTTATTACAAAA/----------------- AAAAAAAAAG 5 het 5 ref 20 9 1 12 AAAACTTTATTACAAAA 1 0 267576 CASAVA_Build 7 22776875 2I TGAGATGTAG --/TC TCTCTCTCTC 1259 het 1180 hom 16 4 4 8 TC 5 6 267577 CASAVA_Build 7 22779465 1D TGGAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2353 hom 25 9 8 8 A 13 12 267578 CASAVA_Build 7 22779703 1I CCTAGATAAG -/C CCCCTACACT 493 het 493 ref 21 14 3 4 C 4 5 267579 CASAVA_Build 7 22785052 2D CTTTTAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 14 12 267580 CASAVA_Build 7 22785548 1D AATATTCTGA C/- CCCCCCCCAG 3070 het 2715 hom 25 13 9 3 C 9 8 267581 CASAVA_Build 7 22786366 8D TCAAAAAAAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 3070 het 2699 hom 23 7 13 6 AAAG 5 3 267582 CASAVA_Build 7 22794053 3D TATAAATAAT AAC/--- AATAAACAAT 3070 het 3070 hom 19 10 9 1 AAC 1 0 267583 CASAVA_Build 7 22808802 1I CCCCTGGCCA -/G GGGGTCCAGC 3070 het 3070 ref 39 11 15 13 G 4 5 267584 CASAVA_Build 7 22813471 2I CTAGGCCCCC --/CT GTTAACATGG 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 CT 0 1 267585 CASAVA_Build 7 22815513 1D TTGCCAGGGG T/- TAGCGGTAGG 2984 het 2984 ref 35 24 7 4 T 2 1 267586 CASAVA_Build 7 22818087 7I AATTTTAATA -------/CTGTGCT CAGTTTTCAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CTGTGCT 0 1 267587 CASAVA_Build 7 22820315 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2121 het 45 hom 23 1 7 15 A 14 13 267588 CASAVA_Build 7 22821677 1D TTCTTGCTAC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 8 7 267589 CASAVA_Build 7 22825016 1I TCAGCCTCTC -/A AAAGTGCTGG 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 A 3 4 267590 CASAVA_Build 7 22830709 1I TGGAAAGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 8 12 A 13 14 267591 CASAVA_Build 7 22835248 6D TGCTTTACTT TATATA/------ TATACACTTA 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 TA 5 2 267592 CASAVA_Build 7 22838808 1I CCATATGACT -/A ATCTTTGGAA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 A 1 2 267593 CASAVA_Build 7 22846342 2I CACAGGACAG --/CT CTCTCTCTCA 3070 het 3070 ref 62 26 23 13 CT 4 5 267594 CASAVA_Build 7 22846843 1D TGCTGGGTTC T/- CAGAGCAGGA 3070 hom 45 het 19 0 16 5 T 1 0 267595 CASAVA_Build 7 22848630 2D TACAGAGTAA CT/-- CTGTTCTCAA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 CT 2 1 267596 CASAVA_Build 7 22848973 5D TTCCAGGCTC CCACA/----- CCACATGTGG 3070 het 3070 hom 39 14 19 8 CCACA 2 1 267597 CASAVA_Build 7 22853640 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 A 11 12 267598 CASAVA_Build 7 22866371 2D GGGCAAACTG AA/-- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 14 12 6 A 10 8 267599 CASAVA_Build 7 22868332 1I AGTGCTGGGA -/T TTACAGGTTT 3070 het 2148 hom 25 6 16 3 T 2 3 267600 CASAVA_Build 7 22870471 4D CTTGGATATG TCTT/---- TCTTAGCATG 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 TCTT 2 1 267601 CASAVA_Build 7 22871433 4I GCGTTTTGTT ----/CCTC CCAGGCTGCT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 CCTC 0 1 267602 CASAVA_Build 7 22878258 1D GGAGTAATCG C/- CCCCCAGGAC 3070 het 3070 ref 52 30 17 5 C 6 5 267603 CASAVA_Build 7 22886812 4I TCCTCCCTTC ----/CTTT CTTTCTTTTC 3070 het 2207 hom 37 9 14 14 CTTT 2 3 267604 CASAVA_Build 7 22888583 2D AAAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 A 13 11 267605 CASAVA_Build 7 22892610 1I CTTTTTTCTC -/T TAAGTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 1 2 267606 CASAVA_Build 7 22908506 1I TTAAGAAGCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 9 10 267607 CASAVA_Build 7 22912270 1I AATGCGGCAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 8 9 267608 CASAVA_Build 7 22917019 1D ATGTTCACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 11 10 267609 CASAVA_Build 7 22919271 1I TCCATCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 A 12 13 267610 CASAVA_Build 7 22943413 1I TCTAGGATAC -/A AAAAGTTAAA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 A 4 5 267611 CASAVA_Build 7 22953886 2I TAAAATTCTA --/GT TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 GT 0 1 267612 CASAVA_Build 7 22967309 4I CTATGAATGG ----/CTCT CTCTCAATTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 CT 2 4 267613 CASAVA_Build 7 22967839 2D CTGTAACTCC CA/-- CAGTTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 CA 2 1 267614 CASAVA_Build 7 22975670 1D TTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2628 het 1958 hom 27 12 10 5 T 13 12 267615 CASAVA_Build 7 22988990 1I ACCTAGCTTT -/C CTAGCTTCAG 3070 het 3070 ref 53 27 24 2 C 1 2 267616 CASAVA_Build 7 22995375 1I TCAATCTGCC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 8 9 267617 CASAVA_Build 7 22995671 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2783 hom 29 7 16 7 T 12 11 267618 CASAVA_Build 7 23007065 1D GTTAAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 19 12 T 14 13 267619 CASAVA_Build 7 23008040 1D ATGGCAAACA T/- TTTTTTTTTT 1265 het 1265 ref 26 17 4 6 T 12 11 267620 CASAVA_Build 7 23020956 1D CTGCAGACAG T/- ACTGCTGTTT 3070 het 3070 ref 36 19 11 7 T 1 0 267621 CASAVA_Build 7 23021756 4D GAGCTCAATG TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 30 7 14 9 TATT 6 5 267622 CASAVA_Build 7 23024564 1I AATTTTGTTT -/A AAAAAAACAT 3070 het 2610 hom 23 7 14 2 A 7 8 267623 CASAVA_Build 7 23056830 3I CCAGGCTGCT ---/TTC TTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 27 7 15 6 TTC 0 1 267624 CASAVA_Build 7 23062492 52D TAGAATGGCT AAAATTCAAAATGTTAACATAACCAAATGCTGGTGAGGATTTGGTGGAGCAA/---------------------------------------------------- AAGGAACTTT 3070 het 3070 ref 32 23 15 3 AAAATTCAAAATGTTAACATAACCAAATGCTGGTGAGGATTTGGTGGAGCAA 1 0 267625 CASAVA_Build 7 23065980 1I TGTCTGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 11 12 267626 CASAVA_Build 7 23084897 1D TAAATAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 11 10 267627 CASAVA_Build 7 23091307 3D CTTAAAAAAA AAC/--- AACACAAAAC 3070 het 3070 ref 37 18 15 7 AAC 2 1 267628 CASAVA_Build 7 23092028 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 A 12 11 267629 CASAVA_Build 7 23096122 1I ATGCCAGGGC -/A AAAAAAGAGT 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 A 6 7 267630 CASAVA_Build 7 23097007 1I TCCCATCCTT -/A AAAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 A 4 5 267631 CASAVA_Build 7 23097383 1D TTTATTGCCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 10 9 267632 CASAVA_Build 7 23099741 2I ATTCCTTTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 9 9 A 10 12 267633 CASAVA_Build 7 23102209 1D CCAGAAGACA T/- TAAGCATTTG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 2 1 267634 CASAVA_Build 7 23107858 1I AACTTTAAAT -/A AAATAGCTAG 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 3 4 267635 CASAVA_Build 7 23109001 2D AGAAATTTGG AA/-- GTTGATTCCA 3070 het 3070 ref 49 25 20 5 A 2 0 267636 CASAVA_Build 7 23112992 1D ACAAAGAGGC T/- TTTTTTTTTT 947 het 947 ref 35 22 5 8 T 13 12 267637 CASAVA_Build 7 23119277 1D TCTTTTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 13 11 A 12 11 267638 CASAVA_Build 7 23123548 5D TGAATTCTTA CTTCT/----- CTTCTTCTAT 2896 het 2896 ref 34 23 8 4 CTTCT 2 1 267639 CASAVA_Build 7 23127615 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 1992 het 1992 ref 19 12 6 1 T 10 9 267640 CASAVA_Build 7 23134280 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 1776 het 1776 ref 35 19 6 10 A 13 14 267641 CASAVA_Build 7 23134567 15D CTTTGGGTTT AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 32 0 20 15 A 29 14 267642 CASAVA_Build 7 23146723 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1254 hom 15 4 9 2 A 10 11 267643 CASAVA_Build 7 23149731 1I GGAAGCTATC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 8 9 267644 CASAVA_Build 7 23154049 11D GCTGCTGCTT CTGCCATTGGG/----------- CAGGTATTTT 3070 het 3070 ref 49 28 18 4 CTGCCATTGGG 1 0 267645 CASAVA_Build 7 23154555 9D AAAAAAAAAA CAGCAGCCC/--------- CAAAGCTACT 3070 het 3070 ref 33 15 15 4 CAGCAGCCC 1 0 267646 CASAVA_Build 7 23157303 9I CCTGTTTTGT ---------/TTTTGTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 3042 hom 32 12 10 10 TTTTGTTTG 0 1 267647 CASAVA_Build 7 23157675 1D GTCTGGGATA G/- GGGCCTGGGA 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 G 4 3 267648 CASAVA_Build 7 23158020 1D TGCTGAGAAT A/- AATGAATTGG 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 3 2 267649 CASAVA_Build 7 23158647 3I TCATTACAGT ---/TTC TTCTTCCTTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TTC 2 3 267650 CASAVA_Build 7 23159367 2D TCCTGAGGCG GC/-- GGGGGGGCTA 3070 hom 110 het 40 0 32 9 GC 1 0 267651 CASAVA_Build 7 23162081 5D CTCTTAGCAC TTTAT/----- TTTTAGTCTG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 TTTAT 1 0 267652 CASAVA_Build 7 23163067 5I GGCTCTAAAT -----/AAAAG AAAAGAAGAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAAAG 1 2 267653 CASAVA_Build 7 23163750 8I TTCCAAAATA --------/GAAATATT GAGAGTCTCA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 GAAATATT 0 1 267654 CASAVA_Build 7 23167265 1I GTTATTTTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 7 8 267655 CASAVA_Build 7 23225740 7I ACTCCATCTC -------/AAAACAA AAAACAAAAA 2810 het 1294 hom 15 4 10 1 AAAACAA 2 3 267656 CASAVA_Build 7 23256712 1I CCATCTCTTC -/A AAAAAAAAAA 2641 het 2641 ref 26 11 8 7 A 13 14 267657 CASAVA_Build 7 23270013 1I TTGTTTGGCC -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 56 27 21 8 A 6 7 267658 CASAVA_Build 7 23274160 4D GACAGAGGCA TGGG/---- TGGGTCAACT 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 TGGG 2 1 267659 CASAVA_Build 7 23286643 1D ACATTTCTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 9 8 267660 CASAVA_Build 7 23287895 1D CTACTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2957 hom 19 8 9 2 A 12 11 267661 CASAVA_Build 7 23294666 6D TCTCTACAAA AAACTT/------ AAACTAGTCA 3070 het 3070 hom 26 12 14 1 AAACTT 1 0 267662 CASAVA_Build 7 23317872 3D GACTTCTATC ATT/--- ATAAAGTATA 3070 het 1315 hom 23 4 18 2 ATT 1 0 267663 CASAVA_Build 7 23341433 1I CAACTCATAA -/T TTTTTTTTTT 2237 het 2237 ref 20 9 6 6 T 13 14 267664 CASAVA_Build 7 23347429 2D AACATGGAAA AC/-- ACACAGAGTC 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 AC 3 2 267665 CASAVA_Build 7 23362078 1D CTTTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2576 het 2576 ref 35 16 10 9 A 17 16 267666 CASAVA_Build 7 23391032 5D GAGACTATCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CAAAA 5 4 267667 CASAVA_Build 7 23395303 4D AATTATTCCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1099 hom 25 8 14 3 T 16 12 267668 CASAVA_Build 7 23398547 1I CATTTGGAAG -/A AAAAAAAAAA 1118 het 1118 ref 22 13 3 6 A 11 12 267669 CASAVA_Build 7 23412212 1D TTTTCTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 15 14 267670 CASAVA_Build 7 23413326 1D TGTAGTTATT A/- AAAAAAAAAA 2263 het 2263 ref 33 18 6 9 A 15 14 267671 CASAVA_Build 7 23427511 1I ATAATTCATA -/C GATTTCACAA 3070 het 3070 ref 14 7 7 0 C 0 1 267672 CASAVA_Build 7 23432123 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 A 7 8 267673 CASAVA_Build 7 23434948 6D TGACATTGCC CAAAGA/------ CAATCAAATA 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 CAAAGA 1 0 267674 CASAVA_Build 7 23438802 2D TTTTTTGGTG GA/-- GAGAGGGTCT 3070 het 3070 ref 36 13 11 14 GA 3 2 267675 CASAVA_Build 7 23444683 3I ACTAACTGAC ---/AAT AAAAGATCCA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 AAT 0 1 267676 CASAVA_Build 7 23444978 1I TAGCAATAAT -/G GTAAAATCTA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 G 1 2 267677 CASAVA_Build 7 23448553 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 8 9 267678 CASAVA_Build 7 23450808 2D AATCGCTTGA AC/-- CTGGGAGGTG 1619 het 1619 ref 16 11 4 4 AC 1 0 267679 CASAVA_Build 7 23455264 1D ATTTATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 41 1 28 12 T 12 11 267680 CASAVA_Build 7 23461839 3I GGTCTTACTA ---/CTT TTTTTTTTGG 3070 het 2416 hom 25 7 12 6 CTT 0 1 267681 CASAVA_Build 7 23462364 1D AACCAGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 12 11 267682 CASAVA_Build 7 23462875 5D TGTCAAACTT ATAAC/----- TAATTATGTC 3070 het 3070 hom 32 10 17 7 ATAAC 1 0 267683 CASAVA_Build 7 23466248 10D GAGGAGGCAT GTGCCTGTAG/---------- GTGCCTGTAG 3070 het 3070 ref 39 22 12 8 GTGCCTGTAG 2 1 267684 CASAVA_Build 7 23471668 1I CTGAAAGGGT -/C CCCCCCCCAA 1610 het 1610 ref 38 15 5 18 C 8 9 267685 CASAVA_Build 7 23482713 3D GGCATTTGTT TAA/--- TAGGGGTAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 TAA 1 0 267686 CASAVA_Build 7 23485351 1I ATGTCTCTAT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 7 8 267687 CASAVA_Build 7 23489624 1I CCCAGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 11 12 267688 CASAVA_Build 7 23498988 1D TACTAAAAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 65 het 43 1 36 7 A 9 8 267689 CASAVA_Build 7 23504620 4I CAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AAAC 1 2 267690 CASAVA_Build 7 23506208 1D TATATGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 21 9 T 11 10 267691 CASAVA_Build 7 23507133 1D GTTACACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 T 13 12 267692 CASAVA_Build 7 23509619 2I AAACAGTAAA --/TT TTTTTTTTTT 2746 het 2086 hom 24 7 10 7 T 16 18 267693 CASAVA_Build 7 23537054 1I GAAAGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 13 14 267694 CASAVA_Build 7 23541055 1D TCCATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2862 hom 4 het 23 0 11 12 T 13 12 267695 CASAVA_Build 7 23546023 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 T 4 5 267696 CASAVA_Build 7 23558186 1I GCCGTCATAA -/T TTTTTTTTTT 2148 het 2148 ref 20 11 6 3 T 11 12 267697 CASAVA_Build 7 23559718 1I AGACTCTAAC -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 1 2 267698 CASAVA_Build 7 23561935 5D TTAGCATCTA TCCTT/----- TCCTTTCCTT 1930 het 1149 hom 26 6 12 8 TCCTT 4 3 267699 CASAVA_Build 7 23578002 4I GTCTCTGACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 AAAC 3 4 267700 CASAVA_Build 7 23581797 1D TACACTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 13 12 267701 CASAVA_Build 7 23582446 1I TGAGAAAATA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 T 6 7 267702 CASAVA_Build 7 23600301 1I TGCCTACTTT -/A AATATTTTGT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 2 3 267703 CASAVA_Build 7 23600640 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 11 12 267704 CASAVA_Build 7 23635869 2I TGGAGGGGAC --/AG AGGAAAGAAT 3070 het 3070 hom 30 9 20 1 AG 1 2 267705 CASAVA_Build 7 23645946 1D CGACCACTAC G/- GTAGTACTAC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 G 2 1 267706 CASAVA_Build 7 23660139 1I CGGGTCAGCT -/C CAGATTATGC 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 C 1 2 267707 CASAVA_Build 7 23661025 1D CCACAGCAAG C/- CCCCCGCTAG 3070 het 3070 hom 35 11 18 7 C 6 5 267708 CASAVA_Build 7 23662321 6D CTAGAAAAAT AAAGTC/------ TAAGTGTTTA 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 AAAGTC 1 0 267709 CASAVA_Build 7 23680610 1D CAGGATTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 T 10 9 267710 CASAVA_Build 7 23685053 2D TACTAAAAAT AC/-- ACACACACAC 2783 het 1627 hom 15 5 9 1 AC 10 9 267711 CASAVA_Build 7 23697328 1I TGTTTTGCAG -/T TTTTTTTTTT 1422 het 1422 ref 40 23 5 12 T 12 13 267712 CASAVA_Build 7 23698407 1D GGTGTGTAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 10 9 267713 CASAVA_Build 7 23702407 1D AAATATGGCA T/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 5 T 1 0 267714 CASAVA_Build 7 23705444 1I AACTTTTTTT -/G TTGCAGCAGC 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 G 0 1 267715 CASAVA_Build 7 23708815 1D ATATTACTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 9 14 7 T 10 9 267716 CASAVA_Build 7 23711485 1D AATAGTCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 T 10 9 267717 CASAVA_Build 7 23712464 4I AGGGAGAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AG 4 6 267718 CASAVA_Build 7 23718081 4D CTCAAAAGAA TTAG/---- TTAGTGAAGG 3070 het 3070 ref 25 13 12 1 TTAG 2 1 267719 CASAVA_Build 7 23721352 1D GTATTCTCCA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 9 8 267720 CASAVA_Build 7 23723537 6D CCTAAAATCT TTTAAG/------ TTTATCATGC 3070 het 3070 ref 35 17 17 2 TTTAAG 1 0 267721 CASAVA_Build 7 23727592 3I TTCTTTGTTA ---/TCT TCTTCCATTT 3070 het 3070 hom 57 10 35 12 TCT 1 2 267722 CASAVA_Build 7 23744549 10D TTTGAGACAG TCTTGCAACA/---------- TCTTGCTCTG 3070 hom 99 het 38 0 34 6 TCTTGCAACA 1 0 267723 CASAVA_Build 7 23746791 1I CTTCACCACT -/C CCCCCCACCC 3070 het 1615 hom 19 4 11 4 C 6 7 267724 CASAVA_Build 7 23750439 1D CTAGGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 T 13 12 267725 CASAVA_Build 7 23766437 4D TTATACCCTG TAAA/---- TCTTACTCCC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 TAAA 1 0 267726 CASAVA_Build 7 23766948 1D GACTACAGGC G/- GTGTACTACC 3070 hom 55 het 26 0 23 3 G 2 1 267727 CASAVA_Build 7 23771103 5I TAGATTTTAA -----/AAAAT AAAATAAAAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 AAAAT 1 2 267728 CASAVA_Build 7 23788484 1D GTCATGGTGT C/- ATGTACCTGT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 C 1 0 267729 CASAVA_Build 7 23803083 1D AATGGAAAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 22 0 21 1 A 10 9 267730 CASAVA_Build 7 23809414 1D GGCTGTGCTT A/- AAAAGGTAAT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 A 5 4 267731 CASAVA_Build 7 23811226 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 11 9 T 12 11 267732 CASAVA_Build 7 23815983 1I GTAGGCTACA -/C TGTATAGCCT 3070 het 3070 ref 53 25 23 5 C 0 1 267733 CASAVA_Build 7 23818558 1D ATTCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1775 hom 33 7 12 14 T 17 16 267734 CASAVA_Build 7 23824764 2D TTGTTTTGTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 11 9 267735 CASAVA_Build 7 23825565 1D ATTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 38 1 24 13 T 15 14 267736 CASAVA_Build 7 23825924 11I CTAAGGTGTC -----------/TCTGCAGGTGG AAATAATGGA 3070 het 3070 ref 50 27 21 2 TCTGCAGGTGG 0 1 267737 CASAVA_Build 7 23838550 4I TTTTAAAAAC ----/TTTG TTTGGTTTGG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 TTTG 1 2 267738 CASAVA_Build 7 23842725 1D GATAAACTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 13 12 267739 CASAVA_Build 7 23858695 1I CACAAAAAAC -/T TTTGGAACTC 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 T 3 4 267740 CASAVA_Build 7 23872191 3I ATATCTGTGG ---/AAA GAAAAAAAAA 2881 het 2881 ref 30 12 11 7 A 0 3 267741 CASAVA_Build 7 23872246 2D CCTAAAATGG TA/-- TATCTTCCAG 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 TA 2 1 267742 CASAVA_Build 7 23873261 3I CTAATATACC ---/TTG TTGTAGCAGT 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 TTG 1 2 267743 CASAVA_Build 7 23874163 1I GATTTTTTTC -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 7 8 267744 CASAVA_Build 7 23878313 1I GAGTAGATAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 6 7 267745 CASAVA_Build 7 23878680 3D AGGGTCTTGC TAT/--- ATTGCTGAGG 3070 het 3070 ref 39 24 12 7 TAT 1 0 267746 CASAVA_Build 7 23880272 1I GTCTATCTTC -/T GAATTCTTGT 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 T 0 1 267747 CASAVA_Build 7 23881834 5D TCATGGAAAT GAAAA/----- GAAAGGGACA 3070 het 3070 hom 43 18 20 7 GAAAA 1 0 267748 CASAVA_Build 7 23882502 3I TGGCTTTTTT ---/TAA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 16 14 1 TAA 0 1 267749 CASAVA_Build 7 23883782 1D TGGAATTAAA G/- GGGGAGAGTA 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 G 5 4 267750 CASAVA_Build 7 23886745 1D ACTTTTTTTT C/- CCTCTCTACA 3070 het 3070 ref 53 29 17 7 C 3 2 267751 CASAVA_Build 7 23899306 2I AAGAAGAGAG --/AC ACAGGCTGCA 3070 het 3070 ref 58 30 25 3 AC 1 2 267752 CASAVA_Build 7 23901326 1I GAAAAAATTT -/A AAAAAATCCA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 6 7 267753 CASAVA_Build 7 23902191 12I GTTTGGAGGC ------------/GTGAGGATTTGT GTGTGGGTTT 3070 hom 86 het 31 0 27 4 GTGAGGATTTGT 0 1 267754 CASAVA_Build 7 23908984 4I AAGAAAAGGC ----/CTCT AGAGGTCTTA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 CT 0 2 267755 CASAVA_Build 7 23923771 1I ATCCCCTGAA -/C AACAGAGTTC 3070 hom 110 het 45 0 36 9 C 0 1 267756 CASAVA_Build 7 23928325 4I TTAAAATTTT ----/CTAC CTTGATGAAA 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 CTAC 0 1 267757 CASAVA_Build 7 23932670 1D GCATTTTATC T/- TTTTTTTTTT 2068 het 2068 ref 36 29 5 2 T 13 12 267758 CASAVA_Build 7 23933253 1I TGCATGAAAG -/C CAAGACTAGG 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 C 1 2 267759 CASAVA_Build 7 23938902 1D GCTAGACCCT G/- GGGGTCTCTG 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 G 5 4 267760 CASAVA_Build 7 23963055 1D CTATTTTTAG A/- AAAACGGACA 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 A 5 4 267761 CASAVA_Build 7 23965209 1D ATGTGCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 12 14 T 15 14 267762 CASAVA_Build 7 23966422 1I AATGCACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 A 10 11 267763 CASAVA_Build 7 23972783 4D TGTGTAATGA TGCC/---- ATTCATTAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 TGCC 1 0 267764 CASAVA_Build 7 23972979 1D19M2D ATATAAACCA CCCTTGGGAGGTGTGGGGAGCA/-CCTTGGGAGGTGTGGGGAG-- CAGTTTTCTA 3070 hom 96 het 31 0 33 4 N/A 0 0 267765 CASAVA_Build 7 23976454 3I TTCTTTCCTC ---/CTT CTTTTTTTTG 3070 hom 100 het 37 0 34 3 CTT 1 2 267766 CASAVA_Build 7 23980582 1D CGTTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 508 hom 36 3 25 8 T 13 12 267767 CASAVA_Build 7 23980686 4D ACAATATTAA TTCT/---- TTCAATTCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 6 TTCT 1 0 267768 CASAVA_Build 7 23984206 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 11 10 267769 CASAVA_Build 7 23987398 1D CTGCTAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 37 1 30 6 T 11 10 267770 CASAVA_Build 7 23989854 1D CATGGGGGGT G/- GGGGGGGGTG 2774 hom 20 het 10 0 7 3 G 9 8 267771 CASAVA_Build 7 23991104 1I ACCTCATCAA -/G GGAGCACCCC 3070 hom 120 het 48 0 39 9 G 2 3 267772 CASAVA_Build 7 23992906 4I AGACAAAAAT ----/AAAG AAAAAAGAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAAG 0 1 267773 CASAVA_Build 7 23993576 1D ATCAACATGA G/- GAGTGGAACA 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 G 2 1 267774 CASAVA_Build 7 23994398 1I TAATGATAAC -/A AATGACACAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 3 267775 CASAVA_Build 7 23994693 3I TAGATTAACT ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAG 3 4 267776 CASAVA_Build 7 23995815 4D CAACAGCTGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 110 het 100 hom 24 2 3 19 A 17 13 267777 CASAVA_Build 7 23995839 2D AAAGAGAGAG AC/-- AGACAGACAG 1521 het 279 hom 22 5 9 9 AC 1 0 267778 CASAVA_Build 7 23997042 4I CAAAAAGTAG ----/ATCT ATCATTTGAT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 ATCT 0 1 267779 CASAVA_Build 7 23999368 8I TGAGATCTTC --------/CCTCTTAA TATATTTTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 CCTCTTAA 0 1 267780 CASAVA_Build 7 23999987 1I AACTTGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 533 hom 29 2 23 4 T 11 12 267781 CASAVA_Build 7 24001757 2D TCCTTGGATG AA/-- AAAAAAAAAA 2197 het 939 hom 37 13 6 18 A 16 14 267782 CASAVA_Build 7 24003648 4D TATAATAAAA AAAT/---- AAAATAAAAT 2327 hom 14 het 6 0 5 1 AAAT 1 0 267783 CASAVA_Build 7 24004367 1D GAAGCAGATG C/- CCCCATGCTT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 C 5 4 267784 CASAVA_Build 7 24007186 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTCTACG 3070 het 3070 hom 42 21 19 2 TG 3 2 267785 CASAVA_Build 7 24007496 1D TGTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 24 0 17 7 T 12 11 267786 CASAVA_Build 7 24011550 1D TTAAACTCTT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 A 8 7 267787 CASAVA_Build 7 24012146 1I TCCACTTTTT -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 0 1 267788 CASAVA_Build 7 24012299 4I CTACATTTTC ----/TTTA TTCATTCATC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TTTA 0 1 267789 CASAVA_Build 7 24013795 2D TTCTAACAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 33 3 16 15 T 16 14 267790 CASAVA_Build 7 24015017 1I CTCTCTTGAA -/C AAACATATCT 3070 hom 72 het 36 0 25 11 C 0 1 267791 CASAVA_Build 7 24015255 1D CTAATGCTAT C/- CCCCCCCACC 3070 hom 24 het 10 0 9 2 C 8 7 267792 CASAVA_Build 7 24016488 1I AATATCTCTG -/A TAAATTTCTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 0 1 267793 CASAVA_Build 7 24029433 1I TTATGTATGC -/T TTTTTTTTTT 2950 het 2093 hom 22 8 9 5 T 12 13 267794 CASAVA_Build 7 24031085 1D CTCTGCAGTG C/- CCCCAGTTAT 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 C 5 4 267795 CASAVA_Build 7 24041604 2D GTAGTAAGAC AT/-- GTGGAGTGGA 3070 het 3070 ref 46 28 16 3 AT 1 0 267796 CASAVA_Build 7 24045867 1D ATGAAATCCC T/- TTTTAACTGT 3070 hom 92 het 35 0 31 4 T 5 4 267797 CASAVA_Build 7 24046147 1I CCCCTAATTT -/G GGGGGGAGAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 G 6 7 267798 CASAVA_Build 7 24064436 1I CATGTTTGAG -/T TTTTTTTTTT 1353 het 1353 ref 52 35 6 11 T 13 14 267799 CASAVA_Build 7 24073123 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2955 hom 29 12 10 7 A 14 13 267800 CASAVA_Build 7 24078356 1I CTTATAGTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 8 9 267801 CASAVA_Build 7 24080558 1D AGCATTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 11 10 267802 CASAVA_Build 7 24097126 1I TTAAATTAAA -/C TAGGAAATGA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 0 1 267803 CASAVA_Build 7 24099917 1I AAGTATCTTA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 8 267804 CASAVA_Build 7 24110390 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 20 0 17 3 A 11 12 267805 CASAVA_Build 7 24112237 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 1837 het 1837 ref 27 18 4 5 A 13 12 267806 CASAVA_Build 7 24112573 2I TGTGTATGGG --/TA TATGTTTTCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TA 1 2 267807 CASAVA_Build 7 24112768 2I CATTAAAAAA --/AC AAACAGCTTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AC 0 1 267808 CASAVA_Build 7 24114503 6D TTTTGTTAAA CTTATT/------ CTTAAATATG 3070 hom 87 het 30 0 30 2 CTTATT 1 0 267809 CASAVA_Build 7 24120157 27I GCTGCCCTCT ---------------------------/GATGCTTTGAGTGAGTGATCTGTGTCC CTGCTGCCCT 3070 hom 119 het 39 0 38 5 GATGCTTTGAGTGAGTGATCTGTGTCC 0 1 267810 CASAVA_Build 7 24125816 1I AAAAAGAAGT -/G GATTTTTCTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 1 2 267811 CASAVA_Build 7 24137653 1D TCAGAAAATG A/- AAAAATAACT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 6 5 267812 CASAVA_Build 7 24138142 4D AAGTTTATCT GTAA/---- GTGTCATCCA 3070 hom 99 het 38 0 34 8 GTAA 1 0 267813 CASAVA_Build 7 24156790 1D TGTTTCATGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 37 0 33 6 T 9 8 267814 CASAVA_Build 7 24156885 4D CTGTAGTTTT CTTA/---- CTTTGCAACG 3070 hom 111 het 42 0 38 6 CTTA 1 0 267815 CASAVA_Build 7 24157767 3I TTCACCTGAG ---/TTC TTCTTACTTG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 TTC 1 2 267816 CASAVA_Build 7 24159682 1I TTGGGCAATG -/C CAGCGGCCAT 3070 hom 113 het 43 0 34 9 C 1 2 267817 CASAVA_Build 7 24166962 1I TGTTTATGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 8 9 267818 CASAVA_Build 7 24169691 3D CATAAGTAAC AAG/--- GAGCTGAAAG 3070 het 3070 ref 26 15 8 6 AAG 1 0 267819 CASAVA_Build 7 24173203 3I TTAAAAAATA ---/AAC AACAACACTG 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 AAC 2 3 267820 CASAVA_Build 7 24179500 4D TCTTGAACGG CAGA/---- CAGACAAGAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 CAGA 2 1 267821 CASAVA_Build 7 24188148 27D GAGGTGGAAT TCAATGGGCCAATGTCAACTAAGATCA/--------------------------- TCACTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 16 18 6 TCAATGGGCCAATGTCAACTAAGATCA 1 0 267822 CASAVA_Build 7 24191145 1I TAACAGGCTT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 A 7 8 267823 CASAVA_Build 7 24196359 4I TTATTTGAAT ----/AATA AATAATCTTT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 AATA 1 2 267824 CASAVA_Build 7 24224171 1I TGTTTGCAGC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 7 8 267825 CASAVA_Build 7 24230290 1I TCTTTCCACA -/T TATGTGTGGA 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 T 1 2 267826 CASAVA_Build 7 24233866 1I CAGAGTAGGG -/A AAAAATCTGT 3070 hom 95 het 36 0 32 4 A 5 6 267827 CASAVA_Build 7 24234530 2I TGTGCATTCA --/CC CCCAGGCTGG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 C 3 5 267828 CASAVA_Build 7 24240753 1D AAATACACTA G/- TGGGGGATCT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 G 1 0 267829 CASAVA_Build 7 24246791 2D AAATAACCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 184 hom 30 4 14 13 T 13 11 267830 CASAVA_Build 7 24248169 1D TTATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 24 5 T 11 10 267831 CASAVA_Build 7 24251022 4D TAGATAGATA ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 hom 50 18 26 8 ATAG 4 3 267832 CASAVA_Build 7 24258005 4I AAAAAAAAAT ----/AAAG AAATCTTGTG 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 AAAG 0 1 267833 CASAVA_Build 7 24262765 1D AGAGAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 35 0 18 17 A 13 12 267834 CASAVA_Build 7 24265191 3D AACATAAAAC ATG/--- ATGACAAATA 2865 het 2865 ref 29 19 8 4 ATG 2 1 267835 CASAVA_Build 7 24268422 2D TTAAAATTTT CC/-- CTTTCATTTG 3070 het 3070 hom 30 9 21 1 C 3 1 267836 CASAVA_Build 7 24268584 1D CTTTTTCACT A/- AAAAAAAAAA 1347 het 1347 ref 29 22 3 5 A 12 11 267837 CASAVA_Build 7 24268973 4D AGTTAGAAGG AGTT/---- AGTTCTAGTA 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 AGTT 2 1 267838 CASAVA_Build 7 24270350 1I CCTCATATCA -/G AGCCTGAAAC 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 G 0 1 267839 CASAVA_Build 7 24273074 4I AACACTGAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 39 16 12 11 AAAG 4 5 267840 CASAVA_Build 7 24273414 4I GTAAAAAAAG ----/CAAA AAAAAGCAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 CAAA 0 1 267841 CASAVA_Build 7 24274004 3D GTAAGGCAAA AAC/--- AACACATTAA 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 AAC 2 1 267842 CASAVA_Build 7 24279124 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 12 13 267843 CASAVA_Build 7 24289451 2D AGACAGAAAC TG/-- TTGTTCATTT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 TG 1 0 267844 CASAVA_Build 7 24295527 1D TTGTTACAGA T/- GAACACCTGA 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 T 1 0 267845 CASAVA_Build 7 24299458 1D GAAAGCCATA C/- CCATCCAGGT 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 C 3 2 267846 CASAVA_Build 7 24302519 1I AAATGTTGTA -/G GGGTGGTTCC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 G 3 4 267847 CASAVA_Build 7 24306865 1D TTTGCCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 11 10 267848 CASAVA_Build 7 24307416 1D ATTTTCTATC T/- TTTTTTATCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 6 267849 CASAVA_Build 7 24310625 1D CATGTTGCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 9 8 267850 CASAVA_Build 7 24316450 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 19 0 13 6 A 13 12 267851 CASAVA_Build 7 24333050 1D GTCAAAACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 10 9 267852 CASAVA_Build 7 24385680 5I GCATAACATT -----/AAATG AAAGAGGCAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 AAATG 0 1 267853 CASAVA_Build 7 24391595 2D GAGTTTTATT TA/-- TATATATATA 3070 het 2459 hom 21 6 9 6 TA 9 8 267854 CASAVA_Build 7 24408862 3D TCAAACAATT AAC/--- AAATAATATT 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 AAC 1 0 267855 CASAVA_Build 7 24410460 4D GAGATGAAGT ACCC/---- ACCCTCTGCA 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 ACCC 2 1 267856 CASAVA_Build 7 24411735 1D ATGAAGTTTG A/- AAACTCTACT 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 4 3 267857 CASAVA_Build 7 24419803 3I TGGAGGAAAT ---/AAG AACCCTTAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAG 0 1 267858 CASAVA_Build 7 24445410 3I TTTGATGAGC ---/ATT ATTACATTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 ATT 1 2 267859 CASAVA_Build 7 24463841 1D CACTAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 209 hom 26 3 13 10 A 12 11 267860 CASAVA_Build 7 24470343 2D CTTACATGGC AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 6 AG 5 4 267861 CASAVA_Build 7 24475915 2D GCCCTAAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3050 het 1620 hom 37 6 10 21 T 16 14 267862 CASAVA_Build 7 24476228 1I TTTCTGAGAG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 7 8 267863 CASAVA_Build 7 24487447 1I GGAGAATAGC -/T GGCTTCCTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 267864 CASAVA_Build 7 24495949 1I AAAAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3058 hom 28 13 13 2 C 0 1 267865 CASAVA_Build 7 24499698 2I TCTTTCTCTC --/TT TCTCTCTCTC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 1 3 267866 CASAVA_Build 7 24508740 4D GACGGCTAAT CTAA/---- CTGTTTAACT 3070 het 3070 ref 40 21 19 0 CTAA 1 0 267867 CASAVA_Build 7 24510300 1D CTTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 13 12 267868 CASAVA_Build 7 24512387 1D TCAGTAGTGG T/- TAAGGCTGGG 3070 hom 120 het 50 0 39 11 T 2 1 267869 CASAVA_Build 7 24518771 1I ACAGTTTAAA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 17 1 14 2 T 1 2 267870 CASAVA_Build 7 24521009 10I CTAGGGATTC ----------/AAACGCTGAA TAAGATATAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAACGCTGAA 0 1 267871 CASAVA_Build 7 24524417 2D GAATCACTGA AC/-- AGTTTCCAGC 3070 het 3070 ref 50 22 23 5 AC 1 0 267872 CASAVA_Build 7 24536279 1D TCATCACCTT G/- GGGGTTAGGA 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 G 5 4 267873 CASAVA_Build 7 24546458 1D TTTTAGGTGG T/- TTTTTTTTTT 2221 het 2221 ref 26 13 5 8 T 11 10 267874 CASAVA_Build 7 24568963 1D TTTTTTTTTT C/- ATTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 C 1 0 267875 CASAVA_Build 7 24572473 1D TTGAAAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 10 9 267876 CASAVA_Build 7 24577709 6D AAGGGGATGT GTTAAG/------ GTTAAGAGTC 3070 het 3070 hom 40 12 16 17 GTTAAG 2 1 267877 CASAVA_Build 7 24589807 2I ATTTATTTAA --/TT TTTTTTTTTT 2444 het 1635 hom 13 5 7 2 T 11 13 267878 CASAVA_Build 7 24596990 1D TCTTGGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2418 hom 31 8 15 8 T 15 14 267879 CASAVA_Build 7 24651145 2I AAGAACTTGT --/AA ATTTGTTTAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 1 3 267880 CASAVA_Build 7 24659538 2D ATTTTATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 10 9 A 12 10 267881 CASAVA_Build 7 24666412 1I CAAAAAATGT -/A AATATGTATT 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 A 2 3 267882 CASAVA_Build 7 24668913 15D ACTCCATCTG AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 2376 het 1485 hom 10 4 6 2 A 28 13 267883 CASAVA_Build 7 24685876 3I ACTATTCATT ---/TTA TTGTCACTCT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 TTA 0 1 267884 CASAVA_Build 7 24713828 2D AAAGGAGAAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 13 16 13 AC 8 7 267885 CASAVA_Build 7 24716281 1D ACTGAGGGGT C/- ACTGATGCTG 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 C 1 0 267886 CASAVA_Build 7 24724964 2D AGCAGCTCCC TA/-- TATATCCTCA 3070 het 3070 ref 35 13 11 12 TA 3 2 267887 CASAVA_Build 7 24743838 1D AAGACACATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 11 10 267888 CASAVA_Build 7 24757423 1D TAAGTTACCA C/- ATACAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 13 29 3 C 1 0 267889 CASAVA_Build 7 24773638 1I ACTGCAAAAG -/A AAACCTCTAT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 3 4 267890 CASAVA_Build 7 24773764 1I TTGTAGAACC -/T TTTTTTTTTT 1570 het 1570 ref 19 8 6 5 T 11 12 267891 CASAVA_Build 7 24783801 2I GCTCTGATGT --/GA GAGTGGTGTC 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 GA 1 2 267892 CASAVA_Build 7 24794560 1D TCCAGCTACT G/- GCTGGGCAGT 3070 hom 39 het 18 0 11 8 G 2 1 267893 CASAVA_Build 7 24800437 1I7M1I CTCTCTCTCT -TTCTCTC-/CTCCTCTCT CTCTCTCTCT 2260 het 2260 ref 24 14 6 6 N/A 0 0 267894 CASAVA_Build 7 24813446 1I AGACCAGCCT -/A GGCCAACATG 3070 het 856 hom 11 2 8 1 A 0 1 267895 CASAVA_Build 7 24820437 2D GGCGTGTGTG TA/-- TATGGGTGTA 3070 het 3070 ref 56 25 19 12 TA 2 1 267896 CASAVA_Build 7 24826962 1I TGTTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 14 11 A 12 13 267897 CASAVA_Build 7 24900650 1D TTTGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 14 7 A 12 11 267898 CASAVA_Build 7 24901638 2D TCACATTTCT CA/-- CAGTGCTTCC 3070 het 3070 hom 39 13 24 2 CA 2 1 267899 CASAVA_Build 7 24912607 1I AGGCTCTGAG -/C CTGCTCTTCC 3070 hom 108 het 45 0 33 12 C 1 2 267900 CASAVA_Build 7 24942172 1D AGCTATCCCT C/- CCCCCTCCCC 3070 hom 68 het 25 0 23 3 C 6 5 267901 CASAVA_Build 7 24948301 1D CTCAAGATGC T/- TTTTTTTTTT 1772 het 1772 ref 43 29 4 10 T 13 12 267902 CASAVA_Build 7 24948607 2I TCTTCTCTGT --/CC CATGGTAATC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 3 267903 CASAVA_Build 7 24954533 1I ATTTACCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 10 11 267904 CASAVA_Build 7 24977898 21D ATAAGATCTA ACGAGGTAGCGTAAGTAAAGC/--------------------- ACTTAGCCTG 3070 hom 117 het 39 0 39 6 ACGAGGTAGCGTAAGTAAAGC 1 0 267905 CASAVA_Build 7 24982687 1D TTGGAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 28 1 24 3 A 12 11 267906 CASAVA_Build 7 24983711 1I GTGAAAATTA -/C AGCTTACGGG 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 0 1 267907 CASAVA_Build 7 24989487 4D15M1D CTCAAAAGAC TCAAAAGCTTCTGGTCTCAT/----GAGCTTCTGGTCTCA- TTTTTTTCCT 3070 hom 154 het 50 0 52 4 N/A 0 0 267908 CASAVA_Build 7 24993227 1D AGTTGTGTGT G/- TTTTTTGGAG 3070 hom 112 het 44 0 38 6 G 1 0 267909 CASAVA_Build 7 24998420 5D GGTGCTCTTC TTCAT/----- TTATCATTTT 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 TTCAT 1 0 267910 CASAVA_Build 7 25013297 1I AGCTTTTCCT -/G TACTTGTATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 267911 CASAVA_Build 7 25015486 4D GCAAGAGAGT GAGA/---- GAGAGTACAC 3070 hom 159 het 57 0 53 5 GA 4 2 267912 CASAVA_Build 7 25015998 2I TCTTAACTCT --/AG ATTTGTGCTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AG 0 1 267913 CASAVA_Build 7 25017972 1D AGACAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 24 1 15 9 A 12 11 267914 CASAVA_Build 7 25018501 1D CCTTGGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 275 hom 33 1 27 5 A 14 13 267915 CASAVA_Build 7 25018902 1I AGGCATGGTG -/C CTCATGCCTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 C 1 2 267916 CASAVA_Build 7 25023197 1I TTTGTAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 26 1 23 2 A 11 12 267917 CASAVA_Build 7 25036322 1D GAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 11 10 267918 CASAVA_Build 7 25039719 1D CTCTGCATGG C/- CCCCCAAGGC 3070 hom 132 het 50 0 39 12 C 6 5 267919 CASAVA_Build 7 25040158 1I ATCTAATTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 7 8 267920 CASAVA_Build 7 25073450 1I TATCTCCACA -/G GGTGATAGGC 3070 hom 33 het 15 0 11 4 G 2 3 267921 CASAVA_Build 7 25073977 6I GACATAAGAT ------/AATGAA AAGTGAAGAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AATGAA 0 1 267922 CASAVA_Build 7 25075908 4I CTTAAACAAA ----/AAAC AAACAAACAG 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 AAAC 2 3 267923 CASAVA_Build 7 25087101 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 20 1 12 7 T 15 14 267924 CASAVA_Build 7 25089723 1D GATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 485 hom 26 3 14 9 T 15 14 267925 CASAVA_Build 7 25099243 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 29 1 14 14 A 17 16 267926 CASAVA_Build 7 25104978 4I CAAGAACACT ----/TTAA TTTTTATTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TTAA 0 1 267927 CASAVA_Build 7 25108377 1D AACACCCACA T/- TGGAGGTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 T 2 1 267928 CASAVA_Build 7 25124211 1D TAGATATGAA C/- AAATTTTTCT 3070 het 3070 hom 60 23 33 4 C 1 0 267929 CASAVA_Build 7 25132199 2D AAGTAGGTAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AT 6 5 267930 CASAVA_Build 7 25143446 1D CTGAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 27 1 17 9 T 18 17 267931 CASAVA_Build 7 25147854 2D AAAATCTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 12 10 267932 CASAVA_Build 7 25151377 8D CAAAATGCTG GGATTACA/-------- GGCATGAGTC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 GGATTACA 1 0 267933 CASAVA_Build 7 25152992 8D TATATCTCAT CTTATCAA/-------- AAAATGATTA 3070 hom 75 het 26 0 26 3 CTTATCAA 1 0 267934 CASAVA_Build 7 25155440 1I TAGATTACCT -/C CCCCAATTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 4 5 267935 CASAVA_Build 7 25166134 1D ATTCGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 10 6 A 11 10 267936 CASAVA_Build 7 25167943 21I TTCATTTGAA ---------------------/AAATAATCCATCTCTATTTAC ATTATTCAGA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AAATAATCCATCTCTATTTAC 0 1 267937 CASAVA_Build 7 25168414 3D AACTCTGTCT CAA/--- AAAAAAAAAA 2936 het 184 hom 10 1 7 2 CAA 1 0 267938 CASAVA_Build 7 25180482 4D ACATCTCTAT AACA/---- AAGAGAATAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 AACA 1 0 267939 CASAVA_Build 7 25181302 1D TGGGAATCTG T/- TTTTCTAGAA 3070 het 3070 hom 31 10 12 10 T 5 4 267940 CASAVA_Build 7 25183533 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATTGCTT 3042 het 1453 hom 13 5 7 1 AGG 1 0 267941 CASAVA_Build 7 25187059 1D AGGGATGTCA C/- CCCCCCCTCG 3070 het 3070 hom 49 24 20 5 C 8 7 267942 CASAVA_Build 7 25208859 1D TCCTATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 22 1 13 8 T 15 14 267943 CASAVA_Build 7 25218016 1I AAAATATATC -/T TTTTTTTTTT 2317 het 2317 ref 24 8 8 8 T 11 12 267944 CASAVA_Build 7 25220252 1D GGCAGAAAAA G/- AAGTCCATCT 3070 het 3070 hom 37 11 25 2 G 1 0 267945 CASAVA_Build 7 25220708 1I CAAAATGCAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 8 9 267946 CASAVA_Build 7 25221568 1I TCTCCAGAAT -/G GTGAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 1 2 267947 CASAVA_Build 7 25223340 1I TTTAAGATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 T 9 10 267948 CASAVA_Build 7 25223773 3D GGAGGAGCCC AGA/--- AGGTCAAAGA 3070 het 3070 hom 49 22 26 2 AGA 1 0 267949 CASAVA_Build 7 25224022 1I GAGAAAAAAA -/G ATTAGCAACA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 G 0 1 267950 CASAVA_Build 7 25232054 1I TATGTCAGAT -/G GGGATAAGTA 3070 hom 154 het 54 0 52 2 G 3 4 267951 CASAVA_Build 7 25233095 3D GTACTCATCT TAA/--- TAACATTTTT 3070 het 3070 hom 59 22 33 4 TAA 2 1 267952 CASAVA_Build 7 25235009 1D GCTAGCTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 13 12 267953 CASAVA_Build 7 25240114 1I ATGGTAGTAC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 7 8 267954 CASAVA_Build 7 25240790 1I TTCCCTCGTA -/T TTTTTTTTTC 2034 het 2034 ref 22 10 5 7 T 9 10 267955 CASAVA_Build 7 25250785 11I CTTTCAGGGT -----------/AAGTGTGGGGA AAGTGTGGGG 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 AAGTGTGGGGA 1 2 267956 CASAVA_Build 7 25264604 2I GCTGGCTAAC --/TT TGAGTTATAG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 1 3 267957 CASAVA_Build 7 25266491 1I TTAGTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 11 12 267958 CASAVA_Build 7 25266708 1I TTTCCTCCAA -/C CCCCCAAGTT 3016 het 3016 ref 23 11 10 2 C 5 6 267959 CASAVA_Build 7 25267024 2D ATTCCCTATT CC/-- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 45 21 16 9 C 10 8 267960 CASAVA_Build 7 25270313 31D GAAGTGTGTT CCAGGAAAAGAAATATTTCAGGAAGTGTATC/------------------------------- CCAGGAAAAG 2040 het 2040 ref 30 14 8 16 CCAGGAAAAGAAATATTTCAGGAAGTGTATC 2 1 267961 CASAVA_Build 7 25280646 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 26 1 19 6 T 12 13 267962 CASAVA_Build 7 25286934 1D TTCTGAGGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 A 10 9 267963 CASAVA_Build 7 25300158 1D TATCTGTACT G/- GGGTAGGTTC 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 G 4 3 267964 CASAVA_Build 7 25304502 1D TTCTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 871 hom 27 5 12 11 T 16 15 267965 CASAVA_Build 7 25313965 4I AAATAATAAG ----/TTAA TAATAATATG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTAA 0 1 267966 CASAVA_Build 7 25315768 3I TCATCCTACT ---/GCC GCCCCCCATG 3070 het 3070 hom 45 15 19 11 GCC 1 2 267967 CASAVA_Build 7 25316083 1I TGTGTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1216 hom 35 3 19 13 T 13 14 267968 CASAVA_Build 7 25317112 2I GCTGCAATTC --/CT CTGTGTTGGT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 CT 1 2 267969 CASAVA_Build 7 25320774 1D TTTCTATGGC T/- TTTTTTTTTC 1110 het 1110 ref 37 28 3 7 T 10 9 267970 CASAVA_Build 7 25327025 1I TATAAACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 13 14 T 10 11 267971 CASAVA_Build 7 25330774 1D GGTTACATGG A/- TAAACTGTAG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 1 0 267972 CASAVA_Build 7 25333281 1D TCCACATCCA C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 105 het 44 0 35 11 C 9 8 267973 CASAVA_Build 7 25338626 1I TCTTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 470 het 373 hom 23 4 6 13 C 0 1 267974 CASAVA_Build 7 25344867 1D GAAATGATTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 T 9 8 267975 CASAVA_Build 7 25345658 16D AAATACTTTT TGGAAAAAGCCAGATA/---------------- TGTTAAACTG 3070 het 3070 hom 27 14 14 5 TGGAAAAAGCCAGATA 1 0 267976 CASAVA_Build 7 25350084 1D GTAATAGAGA C/- CCCTAAAATA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 C 4 3 267977 CASAVA_Build 7 25355426 11D CTTGAAGAAA AAATATGTAAT/----------- AAAGGGATGA 3070 het 3070 ref 62 35 26 3 AAATATGTAAT 1 0 267978 CASAVA_Build 7 25356248 1D ATTTTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 13 12 T 12 11 267979 CASAVA_Build 7 25356712 1I ATGAGAGGAT -/C ACCTGAGGTC 2765 het 2765 ref 17 9 6 2 C 0 1 267980 CASAVA_Build 7 25369065 11I GTGGCTTCTA -----------/CATGTAGAAGC CCATGGGGTA 3070 hom 60 het 24 0 18 6 CATGTAGAAGC 0 1 267981 CASAVA_Build 7 25370447 1I CTCCCCTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 11 12 267982 CASAVA_Build 7 25371856 1D TTCCAATGAT C/- CTGTACTTCT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 C 2 1 267983 CASAVA_Build 7 25374674 1D AAGGAAAATG T/- CTGTTCTCCA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 1 0 267984 CASAVA_Build 7 25394310 2D GAACACTAAC AT/-- ATATAAAGAC 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 AT 3 2 267985 CASAVA_Build 7 25401140 1D CTCATATCTT A/- AAAAAAAAAA 2337 het 2337 ref 25 14 6 5 A 13 12 267986 CASAVA_Build 7 25410219 5D4M1I TGGCAGGTGA CACAGCTCT-/-----CTATC ATATCAGACA 3070 het 3070 ref 52 32 17 11 N/A 0 0 267987 CASAVA_Build 7 25412536 1D CGTTTTAACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 47 24 17 7 A 10 9 267988 CASAVA_Build 7 25412746 1I CATTTTTTTT -/C TGCATTTTTA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 0 1 267989 CASAVA_Build 7 25420701 3I TAGTGATAAA ---/GAC GACGATGATG 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 GAC 1 2 267990 CASAVA_Build 7 25422777 1D GAATAATCAC T/- TTTTTTTAAA 1235 het 1235 ref 29 17 6 7 T 8 7 267991 CASAVA_Build 7 25433432 1I TTACTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 26 6 T 11 12 267992 CASAVA_Build 7 25450354 2I TGGAAGAGCT --/GA GTCTACTGAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 GA 0 1 267993 CASAVA_Build 7 25460712 10I CTTGGTGCCT ----------/GTACAATTAG GTGGCCCAGC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 GTACAATTAG 0 1 267994 CASAVA_Build 7 25462367 1D AGGAGCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 35 2 20 13 T 13 12 267995 CASAVA_Build 7 25465608 1D GAATTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1647 hom 52 11 13 30 A 19 18 267996 CASAVA_Build 7 25465753 4I AAAGCACCTG ----/TTTC TTTATTCATC 3070 het 3070 hom 42 17 24 1 TTTC 0 1 267997 CASAVA_Build 7 25471509 9I CCTGGCTTGG ---------/GACCCTTCC AAGAGATGGG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 GACCCTTCC 0 1 267998 CASAVA_Build 7 25476519 1I AGAACTTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 11 267999 CASAVA_Build 7 25476931 1D CTGCAAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 10 9 268000 CASAVA_Build 7 25478881 3D GTTTTTATTA GGG/--- GGGGATCCTG 3070 het 3070 ref 53 23 20 13 G 7 4 268001 CASAVA_Build 7 25485924 1I ATATCCATAG -/T TTTAATAGCT 3070 hom 108 het 37 0 36 1 T 3 4 268002 CASAVA_Build 7 25517132 18I ATAATGCAGT ------------------/GCAGAATTCAAATGCAGC GCAGTATTCA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 GCAGAATTCAAATGCAGC 0 1 268003 CASAVA_Build 7 25522567 1D TGGATGTTGT A/- ATTAATATTT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 2 1 268004 CASAVA_Build 7 25529369 1D GGGTTGGGAC T/- TTCAGCCCCC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 3 2 268005 CASAVA_Build 7 25557115 1I GCCTGGGAGA -/T TTCCTGGGAA 3070 hom 126 het 48 0 41 7 T 2 3 268006 CASAVA_Build 7 25564187 1I ATCTAATAAA -/G ACAAGAGTGA 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 G 0 1 268007 CASAVA_Build 7 25569625 1D TACTCAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 11 10 268008 CASAVA_Build 7 25578994 1I TTCTTGAAGG -/A AATTTCAGTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 2 3 268009 CASAVA_Build 7 25587785 17I GATCCATCCA -----------------/CCACCTGCCCCCCGGAT CCATCTTCTA 3070 hom 72 het 30 0 23 8 CCACCTGCCCCCCGGAT 0 1 268010 CASAVA_Build 7 25594075 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 21 1 15 6 T 15 14 268011 CASAVA_Build 7 25597073 9I CAGCACTTTG ---------/GGAGGCCGA GGCGGGCAGC 3070 hom 59 het 22 0 18 5 GGAGGCCGA 0 1 268012 CASAVA_Build 7 25623200 1I CCACTGGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1290 hom 33 3 17 13 T 15 16 268013 CASAVA_Build 7 25627898 1D TGGTTAATTC T/- CAGATGTTGC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 1 0 268014 CASAVA_Build 7 25659033 1I ATGGTAAACC -/T GGGAGACCTT 3070 hom 154 het 60 0 52 8 T 0 1 268015 CASAVA_Build 7 25659170 12D CAGATTTGCC AATCCAAATGGG/------------ ATTTTCGGCC 3070 hom 138 het 48 0 46 6 AATCCAAATGGG 1 0 268016 CASAVA_Build 7 25666850 1I TTTTAAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 367 hom 33 1 31 1 T 9 10 268017 CASAVA_Build 7 25677122 3I CTTTCCCCTT ---/CTC CTCTAGCCAG 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 CTC 1 2 268018 CASAVA_Build 7 25681081 1D TCTTGGAAGC A/- GAGTTTACAC 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 A 1 0 268019 CASAVA_Build 7 25681501 1D GTGGTTGTCA G/- CAATTACAGG 3070 het 3070 ref 54 26 24 6 G 1 0 268020 CASAVA_Build 7 25681845 1D AATTTTAAAA G/- GTTACTGGAC 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 G 2 1 268021 CASAVA_Build 7 25686655 1D TTTTTTATGG T/- TTTTTTTTTT 2542 het 2542 ref 22 13 7 2 T 11 10 268022 CASAVA_Build 7 25692284 1I CTTTCACCCC -/T GACACCTTGG 3064 het 3064 ref 33 19 9 5 T 0 1 268023 CASAVA_Build 7 25693302 5D CACGGCTTGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1802 hom 29 10 13 8 T 17 12 268024 CASAVA_Build 7 25694597 1D CAGAACTGTG A/- AAAAGTACGT 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 A 5 4 268025 CASAVA_Build 7 25698688 1I TTACCACAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 42 12 21 9 T 7 8 268026 CASAVA_Build 7 25702696 1I CCCTACTAAT -/G GGCACCAACT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 G 2 3 268027 CASAVA_Build 7 25707233 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTGTTAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TGTT 1 0 268028 CASAVA_Build 7 25714956 1D ATCCAAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2513 hom 30 9 16 6 A 12 11 268029 CASAVA_Build 7 25716713 1I GGATATTGCC -/T GCGGTAATCA 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 0 1 268030 CASAVA_Build 7 25717440 1I ATGGACTTTC -/T TTTATTTTGC 3070 het 3070 hom 48 14 27 7 T 3 4 268031 CASAVA_Build 7 25721422 1I AGCTTTGTGC -/T TTTCCAACCC 3070 het 3070 hom 55 18 32 5 T 3 4 268032 CASAVA_Build 7 25727457 1I GAAGCCCGCT -/A ATGACCCAGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 1 2 268033 CASAVA_Build 7 25731291 1I ATGCAGAGAA -/G GGGCAGCCCA 3070 hom 87 het 36 0 32 4 G 3 4 268034 CASAVA_Build 7 25755997 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1622 hom 17 6 8 3 A 13 12 268035 CASAVA_Build 7 25757806 4I TCACAGAACC ----/TGAT TGATTATCAT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 TGAT 1 2 268036 CASAVA_Build 7 25769584 1D GCTGGGGGAG C/- CAAGCTTCTA 3070 het 3070 hom 52 20 24 8 C 2 1 268037 CASAVA_Build 7 25773911 1I CTCTCTAATT -/A AAAAAAAAAA 2834 het 2834 ref 24 8 8 8 A 13 14 268038 CASAVA_Build 7 25774553 1I AAAATATAGT -/A ATACAATTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 268039 CASAVA_Build 7 25791106 1I GGGTGACCAA -/C TTTTTCCGGT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 C 0 1 268040 CASAVA_Build 7 25792605 1D GTTTTTCTTT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 7 6 268041 CASAVA_Build 7 25800218 3I TTTTTCATAT ---/AAA ATGTTGTCAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 1 4 268042 CASAVA_Build 7 25802353 1D GGGAGGCCAC A/- GGGGGAGGGA 2089 het 2089 ref 41 22 9 10 A 1 0 268043 CASAVA_Build 7 25808261 1D TACTGTAGAG T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 45 0 38 8 T 2 1 268044 CASAVA_Build 7 25822594 1D ATTAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 2076 het 375 hom 18 4 9 6 A 14 13 268045 CASAVA_Build 7 25853485 7D CAAATTCTTC AATTTCA/------- AATTCAGGAA 3070 hom 114 het 43 0 38 6 AATTTCA 1 0 268046 CASAVA_Build 7 25899854 1D TGCCCTTCAG A/- AAAATTTTTT 3070 het 72 hom 43 1 34 9 A 5 4 268047 CASAVA_Build 7 25906547 1I TATTTTCTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 9 10 268048 CASAVA_Build 7 25909338 2D GCATGTAATA CT/-- CTAGATGTCA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 CT 2 1 268049 CASAVA_Build 7 25910471 1D GTTTTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 22 5 A 13 12 268050 CASAVA_Build 7 25911547 1I AGCCAAGGGT -/A AGTGGGATTT 3070 hom 70 het 29 0 24 5 A 1 2 268051 CASAVA_Build 7 25912774 1I ATTCTATGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 380 hom 36 1 30 5 T 9 10 268052 CASAVA_Build 7 25917826 1D ATAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 10 9 268053 CASAVA_Build 7 25926066 16D CCAATGGAAT AAGATAAACGGCCCAA/---------------- AAATAAACCT 3070 hom 63 het 23 0 22 7 AAGATAAACGGCCCAA 1 0 268054 CASAVA_Build 7 25928657 2D TGTATCCTCA GG/-- ACACAGCGTT 3070 hom 138 het 58 0 46 14 G 2 0 268055 CASAVA_Build 7 25929470 1D TCTTTCTAGC A/- TTAGGCATTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 268056 CASAVA_Build 7 25930806 1D TTCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 10 9 268057 CASAVA_Build 7 25933930 1D TACCCCTAGA T/- TCTCTTTTGG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 2 1 268058 CASAVA_Build 7 25940120 1I TCATATCCAG -/C CAAACTACGC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 C 1 2 268059 CASAVA_Build 7 25949411 1D ATGCAATTGG T/- GGTTCAAAGC 3070 hom 138 het 54 0 47 9 T 1 0 268060 CASAVA_Build 7 25953382 2I TCTGCACGCC --/CA CCCCCATATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CA 0 1 268061 CASAVA_Build 7 25955137 4I TCCCAGAGAC ----/ACAA ACAAGCAACC 3070 hom 121 het 44 0 39 5 ACAA 1 2 268062 CASAVA_Build 7 25956258 1D CCGATAATGG A/- ACGGGTCATT 3070 hom 120 het 46 0 40 7 A 2 1 268063 CASAVA_Build 7 25958849 5I TCCTCGGTCA -----/AGGCC AGGCCCGGCG 1852 het 1629 hom 29 7 8 14 AGGCC 1 2 268064 CASAVA_Build 7 25961853 1I AAAAGAGTGG -/A AAAAGGCATA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 4 5 268065 CASAVA_Build 7 25982141 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 11 10 268066 CASAVA_Build 7 25988166 1I TATCTGTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 56 het 26 0 20 6 T 9 10 268067 CASAVA_Build 7 25988450 1D TGAGATAGGG A/- GGGACATTCC 3070 hom 135 het 48 0 45 3 A 1 0 268068 CASAVA_Build 7 25992103 1D GATAACTGGA T/- GTCCTGTATT 3070 hom 126 het 44 0 43 2 T 1 0 268069 CASAVA_Build 7 26017347 1I AAAAGAGTGT -/C CCGCCACCGG 3070 hom 105 het 42 0 33 9 C 2 3 268070 CASAVA_Build 7 26019770 1I TGGCTCTTAG -/C CAAGGCTTTG 3070 hom 126 het 44 0 42 2 C 1 2 268071 CASAVA_Build 7 26047524 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1245 het 1245 ref 23 12 4 7 A 15 14 268072 CASAVA_Build 7 26053781 1I TTATGGGGCA -/C CCATGCAAAT 3070 hom 55 het 22 0 18 4 C 2 3 268073 CASAVA_Build 7 26054143 1I AAGCTACCAC -/G CCCAGCTAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 0 1 268074 CASAVA_Build 7 26106980 2I CCCCCCTCCC --/CG CCCACCCGCA 3070 hom 25 het 10 0 9 1 CG 0 1 268075 CASAVA_Build 7 26116275 1D TTGATAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 12 11 268076 CASAVA_Build 7 26116760 1D AGCCACCGAG C/- CCCTGCCTAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 C 4 3 268077 CASAVA_Build 7 26145842 7I CTGGAATGCC -------/ATAACAA ATAACAAATG 3070 hom 68 het 26 0 23 3 ATAACAA 1 2 268078 CASAVA_Build 7 26156740 2I GTCTCACAAA --/TT TTTTTATCTC 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 5 7 268079 CASAVA_Build 7 26209462 1I TGCAGCGTTG -/A AAAAATGTTA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 A 5 6 268080 CASAVA_Build 7 26239073 5D TACAGTTTGA TTTAT/----- ACAACACAGT 3070 hom 118 het 43 0 37 8 TTTAT 1 0 268081 CASAVA_Build 7 26303250 3I AAAGAGCTTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTG 2 3 268082 CASAVA_Build 7 26378304 4D ATAATGAAAA AATT/---- AATTGACTGA 3070 hom 57 het 21 0 19 4 AATT 2 1 268083 CASAVA_Build 7 26384843 2D GAATTTCATC TG/-- TGTGCACATA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TG 3 2 268084 CASAVA_Build 7 26385144 1I GTAAATAAAC -/T TCAGTAAAAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 2 268085 CASAVA_Build 7 26402005 1D TCCACTCTTA A/- AAAATTTGAG 3070 het 1167 hom 42 5 32 5 A 6 5 268086 CASAVA_Build 7 26406701 1D TGAGTTAGCA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 129 het 45 0 44 2 T 7 6 268087 CASAVA_Build 7 26423063 10D CCATCTCAAG AAAACCCAAA/---------- AAAACCCAAA 2987 het 2987 ref 25 14 9 7 AAAACCCAAA 2 1 268088 CASAVA_Build 7 26433806 1I TGTTTATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 T 12 13 268089 CASAVA_Build 7 26441855 4D GATTGTGGCA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 TC 9 7 268090 CASAVA_Build 7 26458406 1I TAGTGCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 10 11 268091 CASAVA_Build 7 26469833 1I CTGGGGGAGA -/C CCCATTTTCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 3 4 268092 CASAVA_Build 7 26482812 1I CCCTCCCCCC -/T TTTTTTTTTC 2349 het 381 hom 23 2 6 15 T 9 10 268093 CASAVA_Build 7 26490388 1I GGTATTTCCT -/A ATTCCTCACT 3070 het 3070 ref 58 30 22 6 A 1 2 268094 CASAVA_Build 7 26508567 1D ACTTCATTTC T/- ACCTTCGCCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 0 268095 CASAVA_Build 7 26512489 1I CTGCTGGTGA -/G GGCTCCCTGG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 2 3 268096 CASAVA_Build 7 26563724 1I AGTGGTGGGG -/T GGTGGGGTGG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 0 1 268097 CASAVA_Build 7 26565743 4I CATTTTGTTT ----/ATTC ATTCATCCAT 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 ATTC 1 2 268098 CASAVA_Build 7 26571514 2I TGACGGGCTT --/AA GAGTGTGGAA 3070 hom 146 het 53 0 46 7 A 0 2 268099 CASAVA_Build 7 26573556 1D ACGGATTCCT A/- CAGGAGGTTC 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 A 1 0 268100 CASAVA_Build 7 26575663 1D GCTTAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 10 9 268101 CASAVA_Build 7 26583651 1I CATGTCTGGT -/G TCTCTCTGTG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 G 0 1 268102 CASAVA_Build 7 26599262 1D GACATTGAGG C/- CCCTATCACG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 4 3 268103 CASAVA_Build 7 26601202 1D AACCTCCAAG A/- AAAAAATCAG 2236 het 2236 ref 34 18 7 9 A 7 6 268104 CASAVA_Build 7 26604730 2D AGATCGTGTA TC/-- TCAGGTATAT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 TC 2 1 268105 CASAVA_Build 7 26608023 1I TAGGATTTCA -/G TCATTAAATT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 G 0 1 268106 CASAVA_Build 7 26608649 8I TCAAAGCAGA --------/GCCTGGAG GCCTCAGGGG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 GCCTGGAG 0 1 268107 CASAVA_Build 7 26615279 1D TGGGCTGATC A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 8 7 268108 CASAVA_Build 7 26615408 3I TTGATCATCG ---/TCA TCATCATCAC 3070 het 3070 hom 36 13 13 10 TCA 3 4 268109 CASAVA_Build 7 26619270 2D TGCAGCATCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 81 hom 43 2 27 15 TG 12 11 268110 CASAVA_Build 7 26621487 1I GTGTGTTTGT -/G GGGGGTATGT 3070 het 839 hom 36 4 17 15 G 5 6 268111 CASAVA_Build 7 26621505 2D GTGTGTAAAC AT/-- GTGTGTATAT 3070 het 1483 hom 33 6 14 13 AT 1 0 268112 CASAVA_Build 7 26649322 4D GAAGGATCTG GACA/---- GACAGGCCCT 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 GACA 2 1 268113 CASAVA_Build 7 26651882 3I TCTTGCTGGT ---/GAC GACTGTGGCA 3070 het 3070 ref 52 28 17 7 GAC 1 2 268114 CASAVA_Build 7 26653775 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1439 hom 30 7 14 9 A 15 14 268115 CASAVA_Build 7 26654288 4I ATCATCTGAA ----/AGAT TATCTTATGC 964 het 964 ref 46 23 5 18 AGAT 0 1 268116 CASAVA_Build 7 26685151 1D TTAAAAAAAA T/- ATCAACGTAG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 1 0 268117 CASAVA_Build 7 26698338 1D GGAGGAATGA G/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 60 24 30 6 G 8 7 268118 CASAVA_Build 7 26700605 1D CATCAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 2953 het 2953 ref 37 11 8 18 T 17 16 268119 CASAVA_Build 7 26702867 1I ACTACCCTTC -/A AAAAGCAAAA 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 A 4 5 268120 CASAVA_Build 7 26722504 1I TGTAGTGTCA -/T TCTGTAGTCC 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 1 2 268121 CASAVA_Build 7 26729847 1I TCCTGATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 10 11 268122 CASAVA_Build 7 26742582 1D GGCTTAAAAA G/- GGGGAGAAAC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 G 5 4 268123 CASAVA_Build 7 26751264 2D AGTTGGCATT TA/-- TATAGTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 TA 3 2 268124 CASAVA_Build 7 26766112 1I GCTTTGAGTG -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 7 8 268125 CASAVA_Build 7 26769957 1I GCCTATTGCT -/C CCTAGGCTAC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 2 3 268126 CASAVA_Build 7 26771293 4D CTGTTGTTTC CTGA/---- CTTTTTAATG 2424 hom 12 het 5 0 5 1 CTGA 1 0 268127 CASAVA_Build 7 26775983 1I TTGTCCCAGA -/G GGGCACCCGC 2507 het 240 hom 15 3 7 5 G 3 4 268128 CASAVA_Build 7 26780644 2D AAGATCAAGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 79 het 39 0 27 13 TG 9 8 268129 CASAVA_Build 7 26784264 1D AGAATTGTAA T/- GACAAGTCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 0 268130 CASAVA_Build 7 26814020 1I TTGTTAGCAC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 7 8 268131 CASAVA_Build 7 26814791 1I TTACCATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 9 10 268132 CASAVA_Build 7 26837076 1I TGCATTTTAG -/T TTATGTGTAC 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 2 3 268133 CASAVA_Build 7 26867377 1I CTGTCTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 A 11 12 268134 CASAVA_Build 7 26920794 1D CTCAAAAAAA G/- AAAAAAAAGA 2348 het 2348 ref 23 11 9 3 G 1 0 268135 CASAVA_Build 7 26954850 1I GTGGGAGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 T 10 11 268136 CASAVA_Build 7 26961386 2D TGGCAAAGAC TT/-- AAATTGTGAC 3070 het 3070 ref 60 27 27 8 T 2 0 268137 CASAVA_Build 7 26963868 2I ATATATGTGG --/AC ACACATACAT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AC 2 3 268138 CASAVA_Build 7 26969405 1D ATAAACTACC A/- GGGGATAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 1 0 268139 CASAVA_Build 7 26982737 1D GATTCCTTCT A/- AAAAAAAAAT 1924 het 1199 hom 11 3 4 4 A 10 9 268140 CASAVA_Build 7 26986189 15D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAG 3070 het 966 hom 11 3 8 2 A 24 9 268141 CASAVA_Build 7 27022440 1I TTCAGCATTG -/A ATAGATCTTC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 1 2 268142 CASAVA_Build 7 27031654 1I ACAACAACAA -/C AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 C 0 1 268143 CASAVA_Build 7 27036634 1I GGGCGGAGGG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 1515 hom 24 5 15 4 A 7 8 268144 CASAVA_Build 7 27045987 4D CATACCTTGT TCCA/---- TCCAACAAGC 3070 het 3070 hom 51 24 23 6 TCCA 2 1 268145 CASAVA_Build 7 27053425 1D GTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2401 het 351 hom 18 4 8 6 T 12 11 268146 CASAVA_Build 7 27055987 1I ACTCCGTGTC -/A AAAAAAAAAA 2484 het 2204 hom 19 7 7 5 A 14 15 268147 CASAVA_Build 7 27077172 4I AGAAGAAAGA ----/AAAG AAAGAAAGAT 1876 het 684 hom 10 3 5 2 AAAG 2 3 268148 CASAVA_Build 7 27097849 4I AGACCAAAGC ----/AGAA AGAGAGACCT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 AGAA 0 1 268149 CASAVA_Build 7 27110680 1D TCAAAGAGGG T/- TTGGGGTGGA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 3 2 268150 CASAVA_Build 7 27111677 29D TCTGCATTTC TGAGGTGCGCCATATTTTGGCGCAGAGGT/----------------------------- TGAGGTGCGG 3070 het 3070 ref 35 33 7 9 TGAGGTGCGCCATATTTTGGCGCAGAGGT 1 0 268151 CASAVA_Build 7 27112074 4D GAGAATAGGG ATTT/---- ATTTCTCACA 3070 het 3070 hom 41 16 19 8 ATTT 2 1 268152 CASAVA_Build 7 27113651 1I AAGTGCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 10 11 268153 CASAVA_Build 7 27118924 8D ATTAGATAAA ACAAAATT/-------- AAGCTGATTT 3070 het 3070 ref 37 22 14 4 ACAAAATT 1 0 268154 CASAVA_Build 7 27121199 2I TGTGGCAAAA --/AG AGAGAAATGG 3070 hom 46 het 21 0 16 5 AG 2 3 268155 CASAVA_Build 7 27129060 1D TTTTTTTTGG C/- GGGGGAGTGG 3070 het 3070 ref 45 20 14 11 C 1 0 268156 CASAVA_Build 7 27146905 3D TGGGTTTTTT CTC/--- CTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 CTC 1 0 268157 CASAVA_Build 7 27147671 1I TTTTTGTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 53 21 23 9 T 9 10 268158 CASAVA_Build 7 27176954 1I TGTATTTATA -/G GTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 G 1 2 268159 CASAVA_Build 7 27177107 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 10 11 268160 CASAVA_Build 7 27186797 1I ATCGGCATCC -/T TTTTTTTTTC 1677 het 1677 ref 27 10 6 11 T 9 10 268161 CASAVA_Build 7 27187312 4D CAAATTTCCA CCGT/---- CTTTATTTTC 3070 het 2611 hom 31 8 22 2 CCGT 1 0 268162 CASAVA_Build 7 27187591 1D TTCCACCCCC T/- CCAACACCCT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 1 0 268163 CASAVA_Build 7 27195191 1D GAGGTGGCCG C/- CCGGAGAGGA 3070 hom 48 het 20 0 13 7 C 3 2 268164 CASAVA_Build 7 27203083 1D GGTCTAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 11 10 268165 CASAVA_Build 7 27208404 2D TCGCCTCTGA CT/-- CTGTTCGGCT 3070 hom 78 het 31 0 25 7 CT 2 1 268166 CASAVA_Build 7 27210832 5D CTGTAGAGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 81 het 35 0 28 10 TTTTG 3 2 268167 CASAVA_Build 7 27212518 2D AATGAAAAGG GA/-- GCAAGGTCGT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 GA 1 0 268168 CASAVA_Build 7 27221426 2I GTAATTTTTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 312 hom 47 1 39 7 TC 6 7 268169 CASAVA_Build 7 27240838 1I CAAATAACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 11 12 268170 CASAVA_Build 7 27243438 1D4M4I CCCTGGTAAA GGGTA----/-GCTACACT CTCTATGAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 N/A 0 0 268171 CASAVA_Build 7 27246371 4I TAAGACTGGC ----/CAAA CAGTCAGCTT 3070 hom 85 het 34 0 23 11 CAAA 0 1 268172 CASAVA_Build 7 27260559 1I GCCTGGATAA -/T TTTTTTTTTT 2294 het 2294 ref 26 12 7 7 T 11 12 268173 CASAVA_Build 7 27267706 1D ATAAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 2082 hom 10 het 21 0 8 13 T 17 16 268174 CASAVA_Build 7 27278609 1I GGATATAATA -/G AAGAAGAAAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 268175 CASAVA_Build 7 27279477 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1076 het 995 hom 5 2 3 0 A 11 12 268176 CASAVA_Build 7 27283700 11I CAAAAAAAAA -----------/AACAAACAAAC AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 18 0 13 5 AACAAACAAAC 0 1 268177 CASAVA_Build 7 27303999 4D ATTGTATAGG CTTA/---- CTGTTGTTTC 3070 het 3070 hom 38 19 17 2 CTTA 1 0 268178 CASAVA_Build 7 27305065 1D AAATTGTAAT C/- ATGGAGGTAA 3070 het 3070 ref 42 28 12 4 C 1 0 268179 CASAVA_Build 7 27309500 1I TGAAAGTATC -/T TTTTTTTTTT 2989 het 998 hom 19 3 10 6 T 13 14 268180 CASAVA_Build 7 27314425 1D CCTCCCACCT C/- CCCCCATCCC 1571 het 1571 ref 11 7 4 0 C 6 5 268181 CASAVA_Build 7 27318425 2D GTCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 11 7 A 12 10 268182 CASAVA_Build 7 27318755 2I TTCTCCATTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 9 11 268183 CASAVA_Build 7 27319796 1I TTTCCACCCC -/T ATCACCTCCC 3070 het 3070 hom 50 19 27 4 T 0 1 268184 CASAVA_Build 7 27321902 3D TTCTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2173 het 880 hom 21 5 8 8 T 17 14 268185 CASAVA_Build 7 27331715 10D GGTTTTAGGT TTTTCTTTTC/---------- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 TTTTC 5 3 268186 CASAVA_Build 7 27337232 2I GGTTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 952 hom 23 8 13 2 TG 0 1 268187 CASAVA_Build 7 27337727 1D ATGAAATTTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 A 9 8 268188 CASAVA_Build 7 27346434 1D CTTATTCTAA T/- TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 40 25 5 10 T 15 14 268189 CASAVA_Build 7 27353353 1D TGTATTTGTT G/- GGGCCTCTTC 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 G 4 3 268190 CASAVA_Build 7 27360568 2D ATCCCTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2432 hom 24 13 10 1 T 15 13 268191 CASAVA_Build 7 27363112 1I CATGCTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 11 12 268192 CASAVA_Build 7 27366534 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 het 876 hom 29 12 14 3 G 0 1 268193 CASAVA_Build 7 27368947 4I AAGTCAGGAC ----/TCAT TCATTTATGG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 TCAT 1 2 268194 CASAVA_Build 7 27374408 8I GCTCACCCAC --------/CACATACT CACAGACTCA 3070 hom 151 het 66 0 47 19 CACATACT 0 1 268195 CASAVA_Build 7 27391513 1I TTTTATTGTG -/T TTTTTTTTTT 2553 het 2553 ref 34 21 8 5 T 10 11 268196 CASAVA_Build 7 27391646 4D GACTGTTCCT ATTA/---- ATTATTTTCA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 ATTA 2 1 268197 CASAVA_Build 7 27410287 1D CTTAGTCTGT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 48 19 20 9 A 9 8 268198 CASAVA_Build 7 27412482 1I CTTCCTGATA -/T TTAAGCAGTT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 2 3 268199 CASAVA_Build 7 27413091 5I GGAGTCCAGG -----/GATGT GAGCAGCCTC 3070 hom 22 het 58 2 47 9 GATGT 0 1 268200 CASAVA_Build 7 27414538 1I TCCCTTTAAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 7 8 268201 CASAVA_Build 7 27418774 1I TTCCATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 11 12 268202 CASAVA_Build 7 27421197 1D AGTTAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 14 9 T 12 11 268203 CASAVA_Build 7 27435247 1D ATAATGACTG A/- AAAATCATGC 3070 hom 119 het 48 0 40 10 A 5 4 268204 CASAVA_Build 7 27437892 1I AGGAAACTGA -/C ATCTGGAATG 3070 hom 114 het 46 0 38 8 C 0 1 268205 CASAVA_Build 7 27440435 2D AGACCACAGC AG/-- AGTCACGGAC 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 AG 2 1 268206 CASAVA_Build 7 27444058 1D CCTATGAAAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 8 7 268207 CASAVA_Build 7 27444861 1D ATTTTAAAAA G/- CAGGGCCAGT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 G 1 0 268208 CASAVA_Build 7 27455661 1I TGAGGCGATG -/C CCCGCCCTGC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 3 4 268209 CASAVA_Build 7 27476782 1D AAGTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1557 het 1557 ref 20 11 6 4 A 11 10 268210 CASAVA_Build 7 27497067 4D AATCACAATG TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 TTAT 3 2 268211 CASAVA_Build 7 27500105 21D ATTCCACACA CCAAAAGCCTGGGAAGCAAAG/--------------------- CCAAAGCATC 3070 het 3070 hom 40 23 19 10 CCAAAAGCCTGGGAAGCAAAG 1 0 268212 CASAVA_Build 7 27506980 1I CAACATGGTG -/A AACCCCATCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 3 268213 CASAVA_Build 7 27508266 1D CCACGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 31 2 13 16 T 17 16 268214 CASAVA_Build 7 27528916 4I TATTTTTTTC ----/CTTT CTTATGCATC 3070 hom 123 het 49 0 42 12 CTTT 0 1 268215 CASAVA_Build 7 27530953 1D CTCAGATACC T/- GCATTGCTTA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 1 0 268216 CASAVA_Build 7 27533203 3D5M11D CCTGGCAGAC AATGTGACAGCAAATGTGA/---GGGAC----------- AGCAAATGTG 3070 hom 87 het 33 0 30 6 N/A 0 0 268217 CASAVA_Build 7 27536351 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 20 7 T 11 10 268218 CASAVA_Build 7 27538056 1I AAAAGAAGAC -/A TTTTTGCTGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 0 1 268219 CASAVA_Build 7 27540456 1I GGGATGTTTG -/T TATCACAGGA 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 T 1 2 268220 CASAVA_Build 7 27547277 2D TCGAGCATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 11 12 T 16 14 268221 CASAVA_Build 7 27556669 1D AATGATTTTT C/- ATGCACCCAT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 C 1 0 268222 CASAVA_Build 7 27557144 6D CACCAAACAC ACACAT/------ ACACATACAC 3070 het 3070 ref 47 25 17 8 ACACAT 2 1 268223 CASAVA_Build 7 27557311 3D TTCTTTACAT GTG/--- GTAATGGCAT 3070 het 3070 hom 49 21 23 7 GTG 1 0 268224 CASAVA_Build 7 27557740 4D3M7D TGCAGGTGCT GATAACTTAGACGA/----ACT------- ACTACTCCCA 3070 het 3070 ref 41 22 16 6 N/A 0 0 268225 CASAVA_Build 7 27562286 5I CTCACTTGTT -----/AAAAG AATAATATCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AAAAG 0 1 268226 CASAVA_Build 7 27562593 1I GATCTGTTAA -/T TTTTTTAATG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 6 7 268227 CASAVA_Build 7 27563290 1I TCTAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2541 het 2541 ref 27 12 6 9 A 13 14 268228 CASAVA_Build 7 27573841 1D AATATACATA C/- TAAAGTTTTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 1 0 268229 CASAVA_Build 7 27576959 1I TGGTACTGCG -/C TAGTTTTACT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 C 0 1 268230 CASAVA_Build 7 27577375 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 63 het 22 0 22 4 T 9 8 268231 CASAVA_Build 7 27579001 1D ACTGCATTAT A/- AAATTAACTT 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 A 4 3 268232 CASAVA_Build 7 27580347 5I AATCTCTTTA -----/GAAAT GAAATTAGAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 GAAAT 1 2 268233 CASAVA_Build 7 27580444 1I TAGCAGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 10 11 268234 CASAVA_Build 7 27583220 3D CATCTCTTAA ATT/--- TTTCTTAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 ATT 1 0 268235 CASAVA_Build 7 27583475 1I ACCTGACTTA -/T TTTTTTATTT 3070 het 1654 hom 17 6 10 1 T 6 7 268236 CASAVA_Build 7 27584466 1D AATGTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 36 0 28 8 T 14 13 268237 CASAVA_Build 7 27586145 2D CAAAATACAT GA/-- GAGTCTGTTT 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 GA 2 1 268238 CASAVA_Build 7 27589578 11D CTGTTATGAC AACTTCAAAAA/----------- AACTTTTTCT 3070 hom 120 het 44 0 41 5 AACTTCAAAAA 1 0 268239 CASAVA_Build 7 27591406 4D TACACACGTG TGTA/---- TGTATGTGTA 3070 het 3070 hom 38 13 21 7 TGTA 2 1 268240 CASAVA_Build 7 27592867 1D GAAATCACTC T/- TGTGAGGCGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 1 268241 CASAVA_Build 7 27598972 10I ACTTTCAATG ----------/GCTTCCCACT GTTTTTAGCA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 GCTTCCCACT 0 1 268242 CASAVA_Build 7 27603591 1D TAGACTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 42 2 26 15 A 13 12 268243 CASAVA_Build 7 27606422 1D AGAATTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 12 11 268244 CASAVA_Build 7 27608316 1D TTCCTCACTG A/- AAAAAAAAAA 1816 het 1816 ref 29 15 5 10 A 13 12 268245 CASAVA_Build 7 27610572 1D TCAAATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 27 1 20 6 T 13 12 268246 CASAVA_Build 7 27612245 5I TAAACATCAT -----/AAAAC AAAACATTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAAC 1 2 268247 CASAVA_Build 7 27613406 1D ATCCCGACAC T/- TTTGAGAGAC 3070 hom 62 het 27 0 20 7 T 4 3 268248 CASAVA_Build 7 27613889 1D AGAATGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 A 12 11 268249 CASAVA_Build 7 27619523 4I TTAGATAGAT ----/AGAC AGACAGATAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AGAC 1 2 268250 CASAVA_Build 7 27619811 3I TTTTTTTTGT ---/TTG TTTTTTTTTT 2709 hom 11 het 15 0 10 5 TTG 0 1 268251 CASAVA_Build 7 27622942 1D GTTAAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 2986 hom 18 het 9 0 6 3 A 13 12 268252 CASAVA_Build 7 27623231 11I TTCACTCACC -----------/ACTCACTCACT GACTCATCCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ACTCACTCACT 0 1 268253 CASAVA_Build 7 27624844 1I ATAAAAGAAG -/T TTAATTGGCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 2 3 268254 CASAVA_Build 7 27627259 2I AAAGAACAAT --/AA AAAAAGACAA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 5 7 268255 CASAVA_Build 7 27630339 1D ACAATATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 33 1 27 7 A 11 10 268256 CASAVA_Build 7 27636103 4D CACAATGAAG AATA/---- AACATAAGCA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AATA 1 0 268257 CASAVA_Build 7 27641921 12D TCTGCTCTGA TTGTCAAGGCTG/------------ CCCCAGACAG 3070 het 3070 ref 33 21 13 2 TTGTCAAGGCTG 1 0 268258 CASAVA_Build 7 27645880 1D TTTTTAAATT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 8 7 268259 CASAVA_Build 7 27647354 1D TTTTGCTTTC A/- AAAAAAACAA 3070 het 385 hom 40 1 35 7 A 8 7 268260 CASAVA_Build 7 27648094 3D GAAGAGAGGC AAG/--- AAGATTCTGT 3070 hom 77 het 49 1 44 6 AAG 2 1 268261 CASAVA_Build 7 27648376 1I TCCTTCATGA -/C TTTCATTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 0 1 268262 CASAVA_Build 7 27656424 1I CCAATGATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 199 hom 16 1 7 8 A 13 14 268263 CASAVA_Build 7 27658547 1D AAACAGTGGG C/- AAGAGAAATG 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 C 1 0 268264 CASAVA_Build 7 27661894 1I ATGTAAATTA -/C CCCCCCAGAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 6 7 268265 CASAVA_Build 7 27666809 1I ACTCCGAGGG -/A AAAAAAAAAA 2701 het 2701 ref 17 9 7 1 A 11 12 268266 CASAVA_Build 7 27684925 2I ATGACATGGC --/AA AGATTCCTCA 2227 hom 12 het 5 0 5 0 A 1 3 268267 CASAVA_Build 7 27705992 4D ACTACATTAC ATAA/---- ATAAAGCAAA 3070 het 3070 ref 45 21 18 8 ATAA 2 1 268268 CASAVA_Build 7 27730353 2I GCATATATAT --/AA AATATATAAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 2 4 268269 CASAVA_Build 7 27751873 2D TGTGAAATTC AG/-- GGGAGGGTTT 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 AG 1 0 268270 CASAVA_Build 7 27758329 4D GTGGAGAAGG AAGT/---- AAGTTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 22 20 3 AAGT 2 1 268271 CASAVA_Build 7 27768637 1D ACCAGGAGTT A/- AGAGACCAGT 3070 het 3070 hom 28 13 12 4 A 2 1 268272 CASAVA_Build 7 27780343 6D CCTCTTAAGC TATCTT/------ TATCTTTTTG 3070 het 3070 ref 61 28 28 6 TATCTT 2 1 268273 CASAVA_Build 7 27795842 4D ACCTTGATTG ATTC/---- ATTATTTCTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 ATTC 1 0 268274 CASAVA_Build 7 27803786 1I TTAAAATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2869 hom 30 7 12 11 T 11 12 268275 CASAVA_Build 7 27815217 3I ATATATATGA ---/TAG TAGAGTATGT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 TAG 1 2 268276 CASAVA_Build 7 27818724 3D TGAAGATATT CTC/--- CTATTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 CTC 1 0 268277 CASAVA_Build 7 27820888 1I ATTTTTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 10 11 268278 CASAVA_Build 7 27831285 20D ATTCTTTTAA GATGTATAGTAAGGCTGTGT/-------------------- GATCTATTAC 3070 het 3070 ref 30 18 15 4 GATGTATAGTAAGGCTGTGT 1 0 268279 CASAVA_Build 7 27858275 1D TAAACAGGAC T/- TTTTTTTTTT 1751 het 1751 ref 21 10 4 7 T 15 14 268280 CASAVA_Build 7 27880860 3I ACCTTTAATC ---/TCG GAGATCCTTA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 TCG 0 1 268281 CASAVA_Build 7 27903662 2I CTGCTAAAAG --/AC AGTGTGTCAA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AC 0 1 268282 CASAVA_Build 7 27907119 1D GTGTAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 1340 het 1340 ref 36 20 3 13 T 15 14 268283 CASAVA_Build 7 27910806 1I ACTTTTGCAG -/T TATCACCGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 2 268284 CASAVA_Build 7 27910885 1D CAGCACCAGG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 7 268285 CASAVA_Build 7 27911062 2D TACTGCATTA AG/-- AGAGACGTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 AG 3 2 268286 CASAVA_Build 7 27911281 1D ATCCAAGGCT A/- AATTTTTGTA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 3 2 268287 CASAVA_Build 7 27911477 2I TCTTTGGAGA --/AT ATTCTAATCT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 AT 1 2 268288 CASAVA_Build 7 27911580 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 24 1 17 6 T 12 11 268289 CASAVA_Build 7 27912404 1I GGATGCCCCC -/T GTTCCCTGGC 3070 hom 129 het 49 0 42 7 T 0 1 268290 CASAVA_Build 7 27913209 1I TGCACTAAGG -/T CTCTTAGAGT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 1 268291 CASAVA_Build 7 27928819 1I TAATAATGGG -/T TTTTTTTTTG 2896 het 2896 ref 22 10 9 3 T 9 10 268292 CASAVA_Build 7 27935405 1I TGGGCAGGCA -/G GCATTGCCCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 1 2 268293 CASAVA_Build 7 27946443 1D GTGTGGTGGT G/- GGGGGTGCTC 3070 hom 84 het 39 0 27 12 G 6 5 268294 CASAVA_Build 7 27960904 3D CGAACAGGAC TTA/--- TTATTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 TTA 2 1 268295 CASAVA_Build 7 27975944 1D GGCAAGACAA T/- GGAGTTGGAG 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 T 1 0 268296 CASAVA_Build 7 27978985 4I GGGGGGAATG ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 AT 7 9 268297 CASAVA_Build 7 27979097 2I GTGTATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 2573 hom 30 9 13 8 AC 7 8 268298 CASAVA_Build 7 27996575 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 12 1 11 1 A 12 11 268299 CASAVA_Build 7 27996587 1D AAAAAAAAAA G/- GAACTCCTAT 3070 het 122 hom 21 2 18 2 G 2 1 268300 CASAVA_Build 7 28000607 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 252 hom 24 3 18 3 A 9 8 268301 CASAVA_Build 7 28017548 3D AGGTAGTGAT AAC/--- AAGGAGACAT 3070 het 3070 hom 42 17 23 4 AAC 1 0 268302 CASAVA_Build 7 28028889 1D ATATTTCACT G/- TTGTTGTTGT 2740 het 7 hom 22 1 10 11 G 1 0 268303 CASAVA_Build 7 28031637 2D3M5I GAGCATAAGC AGTCT-----/--TCTTGGAG TCAAACCCAG 3070 hom 117 het 41 0 39 5 N/A 0 0 268304 CASAVA_Build 7 28062900 2D ATTCCTGATG CA/-- CACACTCCTG 3070 hom 106 het 41 0 35 7 CA 3 2 268305 CASAVA_Build 7 28080124 1D TTACTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 A 13 12 268306 CASAVA_Build 7 28108743 1I TCATTTTTTG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 8 9 268307 CASAVA_Build 7 28126321 1D TGTTTGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 44 1 35 8 T 12 11 268308 CASAVA_Build 7 28140611 1D CATGCCTAGC T/- TTTTTTTTTT 2539 het 387 hom 27 4 10 13 T 19 18 268309 CASAVA_Build 7 28140794 2I TTTGTCTTTT --/AC TGAAGAAATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AC 0 1 268310 CASAVA_Build 7 28145151 1D GACCTGAAGT G/- GAGGGGCTGA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 G 2 1 268311 CASAVA_Build 7 28147041 1I AGTTCCGTAA -/G GAGCCATATA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 1 2 268312 CASAVA_Build 7 28147344 1D CAACTCAGAG A/- ACATGTGACT 3070 hom 162 het 58 0 54 4 A 2 1 268313 CASAVA_Build 7 28153301 1I AGAATTCTGA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 76 het 30 0 26 4 T 8 9 268314 CASAVA_Build 7 28157256 3D TATATATATA TTT/--- TTTTTTTGAG 3070 hom 44 het 20 0 14 6 T 10 7 268315 CASAVA_Build 7 28209772 8D ATGGTTGTCA GGGACTGG/-------- GGGACTGGGG 3070 hom 129 het 48 0 43 9 GGGACTGG 2 1 268316 CASAVA_Build 7 28214037 1I ATTTGTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1081 hom 38 4 22 12 A 15 16 268317 CASAVA_Build 7 28229478 4I60M2I TCTCAATCCT ----CTGTCATCTGCTGAGCAGTCTGAGTTCTTATTGATCTCTGGTCATTGGTCTCTCAGGTGA--/CTAACTGTCATCTGCTGAGCAGTCTGAGTTCTTATTGATCTCTGGTCATTGGTCTCTCAGGTGACT CTATCTTCTG 3070 hom 198 het 51 0 64 11 N/A 0 0 268318 CASAVA_Build 7 28231358 2I GCACACACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 365 hom 45 2 27 16 AC 7 8 268319 CASAVA_Build 7 28236324 1D AAATTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 47 0 36 11 A 11 10 268320 CASAVA_Build 7 28252546 1D ATAGGAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2404 hom 25 6 15 4 A 12 11 268321 CASAVA_Build 7 28258924 12I CACCTGGATC ------------/CTCAAGGAGCCT CTCAATGCAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 CTCAAGGAGCCT 0 1 268322 CASAVA_Build 7 28260719 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAACAT 3070 het 24 hom 41 1 37 3 A 8 7 268323 CASAVA_Build 7 28278380 2D TGTGAGCTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 11 11 A 15 13 268324 CASAVA_Build 7 28290506 10D CCCGTGGCTT CTTTCAGTTC/---------- CTTTGTGGAG 2553 het 2553 ref 32 18 8 9 CTTTCAGTTC 1 0 268325 CASAVA_Build 7 28336770 1I GTGAAGCAGC -/A AAAAAAAAAA 2490 het 2490 ref 24 9 7 8 A 11 12 268326 CASAVA_Build 7 28343667 1D TATCCTGCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 9 8 268327 CASAVA_Build 7 28352980 15I CATCCACCAC ---------------/AGTGGATCTACCGCA AGCTACAACT 3070 hom 98 het 40 0 31 10 AGTGGATCTACCGCA 0 1 268328 CASAVA_Build 7 28357914 1I TATGGTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 A 10 11 268329 CASAVA_Build 7 28365779 1I AAACATAGCA -/G GGAAAACCAC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 G 2 3 268330 CASAVA_Build 7 28377985 1D CCACCTGAGC G/- CTTGTGACTG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 G 1 0 268331 CASAVA_Build 7 28379590 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 31 1 25 5 T 13 12 268332 CASAVA_Build 7 28384442 1D ACTCCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 266 hom 28 1 20 7 T 11 10 268333 CASAVA_Build 7 28396189 1I AGTAGGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 13 14 268334 CASAVA_Build 7 28405425 1D GACAAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 11 10 268335 CASAVA_Build 7 28413068 1D TTAAGTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1118 hom 25 3 22 1 A 13 12 268336 CASAVA_Build 7 28413203 1I TTTCCTTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 1648 hom 17 4 8 5 T 8 9 268337 CASAVA_Build 7 28420432 1I ATTTAAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 954 hom 50 3 37 10 T 12 13 268338 CASAVA_Build 7 28426244 2D CAAAGTACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 33 1 23 11 T 15 13 268339 CASAVA_Build 7 28428106 1I GAGATCAACG -/A AAAAAGTCAG 3070 hom 54 het 29 0 18 11 A 5 6 268340 CASAVA_Build 7 28442264 1I ACAAAGTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 85 het 32 0 29 3 T 9 10 268341 CASAVA_Build 7 28450847 1I TGCTGGTCTG -/C CCCTGTCGGC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 3 4 268342 CASAVA_Build 7 28462389 1I ATTGATTTTT -/C CCCCCAAAGA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 C 5 6 268343 CASAVA_Build 7 28467375 1D TCTGCCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1602 hom 36 6 16 14 A 14 13 268344 CASAVA_Build 7 28467559 1I GATGGGTATC -/T TTTTTTAGCA 3070 het 3070 ref 53 24 17 12 T 6 7 268345 CASAVA_Build 7 28470849 1I TTTCAAGTTA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 T 5 6 268346 CASAVA_Build 7 28477919 13D TTGTTTTATC TTACATTGAGTTT/------------- TTAATTTATC 3070 het 3070 ref 32 19 13 2 TTACATTGAGTTT 1 0 268347 CASAVA_Build 7 28478107 1I ATTATTAAAG -/T TTTTGACCAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 4 5 268348 CASAVA_Build 7 28481623 3I AGAGAAAGAA ---/AAG AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 AAG 0 1 268349 CASAVA_Build 7 28483029 1D CTGAACTCTC A/- AAAGCACTTT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 A 4 3 268350 CASAVA_Build 7 28486169 1D TCCAAAACCT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 6 het 24 1 18 5 C 10 9 268351 CASAVA_Build 7 28497044 1I ACCCTTCTTC -/T TTTTTGGCAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 5 6 268352 CASAVA_Build 7 28499083 1I AACCAGTAGC -/A AAAAAATCAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 6 7 268353 CASAVA_Build 7 28501027 1I CTCCCCTCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 897 hom 42 3 29 10 T 9 10 268354 CASAVA_Build 7 28501683 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 A 14 15 268355 CASAVA_Build 7 28502189 1I TGACCTTGAG -/C TACTTATTGA 3070 hom 108 het 41 0 34 7 C 0 1 268356 CASAVA_Build 7 28502942 3D TTTGTTATTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 606 hom 25 4 13 9 T 13 10 268357 CASAVA_Build 7 28509567 1D AATACCTGAG A/- AAAATCACAT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 5 4 268358 CASAVA_Build 7 28511348 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 48 21 14 14 CA 7 6 268359 CASAVA_Build 7 28517351 9D TGCTGCGGGT GGTCAGGCA/--------- GGCATTGATG 3070 het 3070 hom 40 18 20 5 GGTCAGGCA 1 0 268360 CASAVA_Build 7 28518799 1I ACTGTGTGTG -/T TGTGTGTGTG 3070 het 1340 hom 36 5 20 11 T 1 2 268361 CASAVA_Build 7 28519590 2I GATCTTTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 12 14 268362 CASAVA_Build 7 28519695 5D ACCCTAAGGC TTATA/----- TTATAAGGAT 3070 het 3070 ref 40 21 18 4 TTATA 2 1 268363 CASAVA_Build 7 28521119 1I GGAAAGACTA -/T TTGTGTTGGA 3070 hom 165 het 58 0 54 4 T 2 3 268364 CASAVA_Build 7 28522014 1D19M2D GAATGCATTT AAAAAAAAACAAAAACTAACAG/-AAAAAAAACAAAAACTAAC-- AAATGTTTAA 3070 hom 78 het 27 0 27 4 N/A 0 0 268365 CASAVA_Build 7 28525677 1I CCCTTGGTGG -/T TAATGGGTTT 3070 het 3070 ref 53 22 23 8 T 1 2 268366 CASAVA_Build 7 28527321 2D GTGTGTATAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 33 10 17 7 GT 7 6 268367 CASAVA_Build 7 28532499 1D TCCAGGTCAG A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 7 6 268368 CASAVA_Build 7 28534926 1I AAAAAAAAAA -/G AAGGCTTGCC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 G 0 1 268369 CASAVA_Build 7 28541672 1I TCCTTCACTT -/A ATGCTTGTTT 2548 het 2548 ref 28 18 6 4 A 1 2 268370 CASAVA_Build 7 28543523 1I ACTTAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 10 11 268371 CASAVA_Build 7 28543609 2D CACCTGATGC AA/-- ATGCCTCAGA 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 A 3 1 268372 CASAVA_Build 7 28544555 1I CTTTATTCGC -/T TTAAAGTCTT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 2 3 268373 CASAVA_Build 7 28557315 2D TTGGGATAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 A 14 12 268374 CASAVA_Build 7 28565718 1I TCAGCCTCCC -/A AAAAAGCTGG 3070 het 1985 hom 21 6 10 5 A 5 6 268375 CASAVA_Build 7 28569966 1I GTTTCTTACC -/T TGCCCTGTGT 3070 het 3070 ref 53 29 16 8 T 1 2 268376 CASAVA_Build 7 28572810 1I AAGCTTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 A 9 10 268377 CASAVA_Build 7 28595939 1D TTTCTCTGCA T/- TAGGAGTATT 3070 het 3070 ref 46 23 19 6 T 2 1 268378 CASAVA_Build 7 28604156 4I AACTAGGATG ----/TATT TATTTATGAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TATT 1 2 268379 CASAVA_Build 7 28605727 1I CACAGCATAG -/C CTCCGGAAAC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 1 2 268380 CASAVA_Build 7 28606525 4I TCACGAAGCT ----/CAGA CAGTGAACCT 3070 hom 126 het 54 0 42 12 CAGA 0 1 268381 CASAVA_Build 7 28611928 1I CACAAGAGTG -/C CTTCGGTCCT 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 1 2 268382 CASAVA_Build 7 28630819 1D AACAGACGTG A/- AAAAAAAAAA 3016 het 3016 ref 42 17 10 15 A 17 16 268383 CASAVA_Build 7 28644485 15I GGTTTGCATA ---------------/TTCTTTTTTCTTTTT TTCTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 8 12 7 TTCTTTTTTCTTTTT 1 2 268384 CASAVA_Build 7 28645504 1I AGAAAAGGGA -/T TTAGGCATTT 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 2 3 268385 CASAVA_Build 7 28670908 1I TGCATTTTGG -/A TAACAAAATG 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 A 0 1 268386 CASAVA_Build 7 28672692 1D AAATATATAT A/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 A 1 0 268387 CASAVA_Build 7 28673746 2D GAGAGAAAAG AA/-- AAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 8 6 268388 CASAVA_Build 7 28687258 2D AAGAGGAATC TG/-- AGGCCCTCCA 3070 hom 84 het 29 0 27 5 TG 1 0 268389 CASAVA_Build 7 28690885 1I TTGGAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 9 10 268390 CASAVA_Build 7 28693527 1I ACAGGGAGAG -/A GGGGCAAAGG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 0 1 268391 CASAVA_Build 7 28700595 1I AAGCAGGAAG -/C CTCCCTGTGA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 1 2 268392 CASAVA_Build 7 28702084 1D TATGATTCTG A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 105 het 39 0 35 5 A 8 7 268393 CASAVA_Build 7 28707102 1D CCAGGGATTT A/- AAAAAAAAAA 2135 het 1002 hom 23 4 11 8 A 17 16 268394 CASAVA_Build 7 28711529 5I AAAAAGAAAG -----/AAAGA AAAGAAAAGA 3070 hom 37 het 17 0 12 5 AAAGA 2 3 268395 CASAVA_Build 7 28735879 3I GCAATGAATG ---/AAT AATAGGCTGT 3070 hom 126 het 50 0 42 8 AAT 1 2 268396 CASAVA_Build 7 28747141 1I CATGCAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2792 hom 42 8 16 18 T 15 16 268397 CASAVA_Build 7 28748708 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 9 10 268398 CASAVA_Build 7 28756745 2I AAATATATCA --/TT CTTTTTTTAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 0 2 268399 CASAVA_Build 7 28765036 2D TTACAGAAAA GT/-- GTATTTAAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GT 2 1 268400 CASAVA_Build 7 28765154 1D TAATTTGTAT G/- GGGGTGATTA 3070 hom 141 het 52 0 48 5 G 5 4 268401 CASAVA_Build 7 28768868 1D TTGGCTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 669 hom 38 2 31 5 T 12 11 268402 CASAVA_Build 7 28769301 1D GAGTTTCTCC T/- GATTTTCTAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 1 0 268403 CASAVA_Build 7 28772229 1I CACATCAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 45 1 32 12 A 10 11 268404 CASAVA_Build 7 28779667 4D AGGCTTTGTG AGTC/---- AGTCATATGA 3070 hom 78 het 30 0 23 10 AGTC 2 1 268405 CASAVA_Build 7 28787035 1D TAGTTTTGCA T/- TTAAGATGAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 3 2 268406 CASAVA_Build 7 28787917 1I CAAAAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 39 3 31 5 T 11 12 268407 CASAVA_Build 7 28788078 1D ACAATGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 13 12 268408 CASAVA_Build 7 28788275 1D AACTTCTCAA C/- CCAAAAATGG 3070 hom 66 het 28 0 22 7 C 3 2 268409 CASAVA_Build 7 28788505 3D GATACATTGT CAG/--- CAGCAGAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 CAG 3 2 268410 CASAVA_Build 7 28804103 1I TTGGAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 23 1 14 8 A 10 11 268411 CASAVA_Build 7 28816840 4I TGTCTCAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 AAAT 2 3 268412 CASAVA_Build 7 28826557 1I CTAAGATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1287 hom 27 4 18 5 T 13 14 268413 CASAVA_Build 7 28826837 1D GCAGCATCCT C/- CGAGTTCAAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 2 1 268414 CASAVA_Build 7 28859184 1D TTGAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 16 9 A 10 9 268415 CASAVA_Build 7 28861902 2D GTTAGTGAAG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 53 20 14 19 CT 10 9 268416 CASAVA_Build 7 28870780 7I AAGTATATCT -------/TAAATTC TGATCACTCT 1716 het 1716 ref 25 12 5 8 TAAATTC 0 1 268417 CASAVA_Build 7 28882778 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1898 het 1813 hom 18 9 5 4 A 17 16 268418 CASAVA_Build 7 28890166 1I TTGAAATAAA -/T GGTGTATTAG 3070 hom 144 het 49 0 47 2 T 0 1 268419 CASAVA_Build 7 28891158 9I GATAACAATA ---------/GTTCTTAGT GTTCTTAGTG 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 GTTCTTAGT 1 2 268420 CASAVA_Build 7 28892274 1D ATACAAAGAG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 A 8 7 268421 CASAVA_Build 7 28895352 5D TGGGGTGAGG AAGGA/----- GTAACACTTT 3070 het 3070 ref 41 26 14 2 AAGGA 1 0 268422 CASAVA_Build 7 28905263 1D ATGCATCCAC T/- TTGTTAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 3 2 268423 CASAVA_Build 7 28906245 1D ACCATGACAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 42 0 34 9 T 8 7 268424 CASAVA_Build 7 28908250 4D ATAATTTGTT ATTA/---- ATTAATAGGC 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 ATTA 2 1 268425 CASAVA_Build 7 28912290 6D GAAAGAAAAA AGAAAT/------ ATATATATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 4 AGAAAT 1 0 268426 CASAVA_Build 7 28927117 1I GGAAAAGACA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 T 7 8 268427 CASAVA_Build 7 28931238 1I CCACCATTAC -/A AAGCGCCTCT 3070 het 199 hom 41 3 29 9 A 2 3 268428 CASAVA_Build 7 28937494 1D ATATGTACCA C/- ATTTTCTTTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 1 0 268429 CASAVA_Build 7 28940702 1I CACTGCCTTG -/T TGGGGGAGTG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 1 2 268430 CASAVA_Build 7 28942152 8D TCTGTTAATT AGCCAGGA/-------- AGCCATGCTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AGCCAGGA 1 0 268431 CASAVA_Build 7 28946571 1I ATCGTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 A 10 11 268432 CASAVA_Build 7 28949920 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 64 het 28 0 21 7 TA 7 6 268433 CASAVA_Build 7 28956055 1I GCTGTTTAAA -/G GGTTCCCCAA 3070 hom 125 het 47 0 39 8 G 2 3 268434 CASAVA_Build 7 28961156 1D CACATTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 395 hom 41 1 33 7 A 11 10 268435 CASAVA_Build 7 28964023 1D GGGGGCTCGG C/- CAGCGAGCTG 3070 hom 54 het 27 0 17 10 C 2 1 268436 CASAVA_Build 7 28972099 1I ACAATCAAAA -/T TTTTTTACAG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 6 7 268437 CASAVA_Build 7 28997481 2I GTGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTCT 3070 hom 50 het 20 0 16 4 GT 4 5 268438 CASAVA_Build 7 29007167 12D TACTGGTACA AGGAGGCAAATT/------------ AGGAGACTAC 3070 hom 111 het 43 0 37 8 AGGAGGCAAATT 1 0 268439 CASAVA_Build 7 29010553 1D CGTGTCTATT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 67 het 28 0 23 5 A 9 8 268440 CASAVA_Build 7 29011205 1D ATCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 8 7 268441 CASAVA_Build 7 29013067 4I TATTTCTTGC ----/TTTG TTTAACATCC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 TTTG 0 1 268442 CASAVA_Build 7 29026827 4D AAACAATAGT CACA/---- CACAATGAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CA 4 2 268443 CASAVA_Build 7 29055052 10I TTAAATAACC ----------/TGCTCCTGAA TGATCATTGG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TGCTCCTGAA 0 1 268444 CASAVA_Build 7 29056548 1D CGATAGCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 12 11 268445 CASAVA_Build 7 29058089 2I ATATATATGA --/AT ATATATATAT 2408 hom 12 het 9 0 5 4 AT 6 7 268446 CASAVA_Build 7 29066340 1D CTAACCATCA G/- GCACTCTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 2 1 268447 CASAVA_Build 7 29070470 1I ACATACAACA -/T TGGAGAAACG 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 T 1 2 268448 CASAVA_Build 7 29071071 1I ATTAAAAAAT -/A AAAAAAAACC 2943 het 33 hom 14 1 8 5 A 8 9 268449 CASAVA_Build 7 29071081 1D AAAAAAAACC G/- CACACACACA 2601 hom 24 het 13 0 9 4 G 1 0 268450 CASAVA_Build 7 29071198 1D GAAGCTTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 10 9 268451 CASAVA_Build 7 29071263 1D TAAATGCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 307 hom 30 2 12 16 A 10 9 268452 CASAVA_Build 7 29071613 1D AATTCTACAC A/- AAAGATATCA 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 A 4 3 268453 CASAVA_Build 7 29073711 1D CTGCAGCATC A/- GGGGAGAGCC 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 A 1 0 268454 CASAVA_Build 7 29075582 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1861 hom 17 het 9 0 7 2 A 20 18 268455 CASAVA_Build 7 29081886 3D TGATCTTAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2597 hom 30 9 13 10 T 14 11 268456 CASAVA_Build 7 29082564 1D GAGCAATACC A/- AAGCAATTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 3 2 268457 CASAVA_Build 7 29083442 1D AGTTTAGTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 10 9 268458 CASAVA_Build 7 29084801 1D CTATGCTGCC T/- GCTCCAGCAT 3070 het 3070 hom 61 29 28 5 T 1 0 268459 CASAVA_Build 7 29089302 3I GAAGAAAGAG ---/AGA AGAAGTTGCT 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 AGA 1 2 268460 CASAVA_Build 7 29092443 1D TAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 0 268461 CASAVA_Build 7 29094603 2I AAACTGGCTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 11 268462 CASAVA_Build 7 29121783 1D CCTGCCTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 27 0 24 3 A 11 10 268463 CASAVA_Build 7 29124766 1D CACTTACACA T/- ACCCTTAAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 0 268464 CASAVA_Build 7 29125627 14D ATTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 18 0 13 7 A 24 10 268465 CASAVA_Build 7 29128837 22I GAAAGTAGAG ----------------------/AAACCAGGACTTGACTCCACTC AAGGCCAGGA 3070 hom 84 het 29 0 28 3 AAACCAGGACTTGACTCCACTC 0 1 268466 CASAVA_Build 7 29129861 1D TTTTTTTTTT C/- CCCTGGGGAC 3070 hom 39 het 14 0 13 1 C 4 3 268467 CASAVA_Build 7 29134856 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2463 hom 25 het 13 0 9 4 A 16 14 268468 CASAVA_Build 7 29143988 6D GGAGAAAAGC ATAAGT/------ AGGAAGTGGA 3070 het 3070 ref 34 14 15 8 ATAAGT 1 0 268469 CASAVA_Build 7 29145673 1I GGCTATTCTT -/G GGGGGGGCAG 3070 het 3041 hom 28 10 11 7 G 7 8 268470 CASAVA_Build 7 29149807 1D GTAAACAATT C/- TAAGCAATTT 3070 het 3070 hom 24 12 12 1 C 1 0 268471 CASAVA_Build 7 29150483 1D GGGAGGATCA C/- TTGAGGTCAG 2843 het 2362 hom 17 7 6 4 C 1 0 268472 CASAVA_Build 7 29162969 1I AAACTGACAG -/T TGGATTATGC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 1 2 268473 CASAVA_Build 7 29163598 2I AGCTGGAAAC --/TG TTTAAAGTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TG 0 1 268474 CASAVA_Build 7 29163978 1I GGAGGATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 129 hom 45 1 35 9 A 10 11 268475 CASAVA_Build 7 29163988 1I AAAAAAAAAA -/T TCCTTCTATG 3070 het 174 hom 45 1 36 8 T 1 2 268476 CASAVA_Build 7 29164655 26D TTTATTGTGT AGCCTAGTCTTTATGTGATAATATTG/-------------------------- ATACTTAAGT 3070 het 3070 ref 60 41 24 2 AGCCTAGTCTTTATGTGATAATATTG 1 0 268477 CASAVA_Build 7 29179272 1D ACTCTGTATC A/- AAAAAAAAAA 1788 het 1216 hom 14 4 6 4 A 17 16 268478 CASAVA_Build 7 29183164 2D AAAGCAAGAA AG/-- AGAGGGGAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 AG 3 2 268479 CASAVA_Build 7 29243642 1I CAAAACTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 9 10 268480 CASAVA_Build 7 29265165 1D TATGTAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3053 het 867 hom 34 6 15 13 A 17 16 268481 CASAVA_Build 7 29265468 4I ACCTTGTCTC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 10 14 268482 CASAVA_Build 7 29267652 2D TTCTCTAGCC CA/-- CACACGTTGT 3070 hom 134 het 51 0 43 8 CA 3 2 268483 CASAVA_Build 7 29270962 1D CTAAAAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 18 0 15 3 A 13 12 268484 CASAVA_Build 7 29271066 3D GACTTTTTAA AGG/--- AGATCTGTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AGG 1 0 268485 CASAVA_Build 7 29273088 3D GGCCCTTCTC CCT/--- CCTCAAGGTG 3070 hom 96 het 35 0 33 8 CCT 2 1 268486 CASAVA_Build 7 29276816 5D AAAAAATAAT AATAA/----- AATAAAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 13 4 AATAA 2 1 268487 CASAVA_Build 7 29277006 1I AAAAGATGGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 143 hom 23 1 19 3 T 8 9 268488 CASAVA_Build 7 29280811 1D AGCCAGTGAG T/- TCTGCGGCCA 3070 hom 102 het 37 0 32 5 T 2 1 268489 CASAVA_Build 7 29282308 6I GATCAGATGC ------/AAGACT AAGAGCTTTC 3070 hom 105 het 36 0 35 1 AAGACT 0 1 268490 CASAVA_Build 7 29305016 1D CATTTTTGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 A 10 9 268491 CASAVA_Build 7 29305772 3D GGATGTAATG TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 52 21 24 10 TAT 4 3 268492 CASAVA_Build 7 29308415 3I TCCCTCTTCT ---/TCC TCCTCCTCTT 2980 het 2256 hom 34 11 12 11 TCC 2 3 268493 CASAVA_Build 7 29318376 1D TCTTTTCCAC T/- TTTTTTCTGC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 6 268494 CASAVA_Build 7 29329979 6D TCTACTAAAA ATACAG/------ ATACAGAAAA 1494 hom 10 het 4 0 4 0 ATACAG 2 1 268495 CASAVA_Build 7 29383795 2D CAGGTGGTTT GG/-- GCAAGGCCCA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 G 3 1 268496 CASAVA_Build 7 29386428 2D GGTTCTTACC AA/-- AAAAAAAACC 3070 het 673 hom 25 3 9 13 A 10 8 268497 CASAVA_Build 7 29393369 1D TCTCACATGT G/- GGTATCTCAT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 G 3 2 268498 CASAVA_Build 7 29394638 1I TATTCATTTA -/G CTCTTACAAC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 0 1 268499 CASAVA_Build 7 29409072 2D TAATAATCAC TT/-- TGAATGAGCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 3 1 268500 CASAVA_Build 7 29425254 1D47M4D TGTGTATAAA GTTTCTAGCAAACTTAGAGTCAACTTTCTGGGGTAGACACCTCAAGGCTTTG/-TTTCTAGCAAACTTAGAGTCAACTTTCTGGGGTAGACACCTCAAGGC---- TTTAATTGTT 3070 het 3070 ref 38 31 20 5 N/A 0 0 268501 CASAVA_Build 7 29428189 2I AATAGAAAAA --/TG TGTAACATTC 3070 het 3070 hom 58 25 28 5 TG 1 2 268502 CASAVA_Build 7 29432463 3I TTTATATGGT ---/TAA TAATAATAAA 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 TAA 3 4 268503 CASAVA_Build 7 29485214 1D TTAATTTTAC T/- GTCTGGCATT 3070 het 3070 hom 51 20 23 9 T 1 0 268504 CASAVA_Build 7 29507261 1I AACTACCCCA -/T TTTTTCCAAA 3070 hom 50 het 22 0 17 5 T 5 6 268505 CASAVA_Build 7 29513289 1I CATCGCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2264 hom 42 6 28 8 T 14 15 268506 CASAVA_Build 7 29513885 4D GGAAGAAGAA TGAT/---- TGTCTTGGGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TGAT 1 0 268507 CASAVA_Build 7 29514560 1D GTTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 909 hom 27 5 14 8 A 16 15 268508 CASAVA_Build 7 29515986 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2618 het 44 hom 18 1 8 9 A 16 14 268509 CASAVA_Build 7 29517093 4D AAACCTTGTG TCTC/---- TCTCTTTCAC 3070 hom 102 het 38 0 34 7 TC 4 2 268510 CASAVA_Build 7 29531277 6D TTTCCCTTCC TTTCTT/------ TTTATCTTCC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 TTTCTT 1 0 268511 CASAVA_Build 7 29560223 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 15 14 268512 CASAVA_Build 7 29571222 1I CGAATCCTGC -/G CGTTGCTGGT 3070 hom 35 het 16 0 11 5 G 0 1 268513 CASAVA_Build 7 29573123 1D GGCATAATTA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 40 het 27 1 22 4 T 9 8 268514 CASAVA_Build 7 29579490 3I ATGACATCTC ---/CTT CTTCTATTTA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CTT 1 2 268515 CASAVA_Build 7 29592644 2D GAATGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 105 het 45 0 35 11 GT 7 6 268516 CASAVA_Build 7 29601329 1D GGGGAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 7 A 11 10 268517 CASAVA_Build 7 29603304 1D TTAAGTAACA T/- TTTTCATGTT 3070 hom 114 het 44 0 39 8 T 5 4 268518 CASAVA_Build 7 29624140 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 46 14 26 7 A 9 8 268519 CASAVA_Build 7 29642139 11D GATGACAGAT TAGATAGATAA/----------- TAGATAGATA 3070 het 3070 ref 35 19 12 8 TAGATAGATAA 1 0 268520 CASAVA_Build 7 29642397 4D24M4D GACAGTTGAT ATAGATAATTGATAGATAATAGATGATTGATA/----ATAATTGATAGATAATAGATGATT---- GATGGATAGA 3070 het 3070 ref 33 27 9 7 N/A 0 0 268521 CASAVA_Build 7 29659081 1I TTGGTCATTT -/A AAAAAAAAAA 2521 het 2521 ref 28 17 7 4 A 11 12 268522 CASAVA_Build 7 29664304 1I AATTTCTAAT -/A AAAAAATTTC 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 A 6 7 268523 CASAVA_Build 7 29666029 3I ATGGGAAAAA ---/AAG AAGTAATTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 AAG 1 2 268524 CASAVA_Build 7 29666350 2D ATTATTGACC TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 T 10 8 268525 CASAVA_Build 7 29666433 3I AATATGTGCC ---/TTT TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 21 7 0 T 3 6 268526 CASAVA_Build 7 29667580 2I GAACTTTCTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 TA 5 6 268527 CASAVA_Build 7 29668661 1D TATTTTAAAA T/- TTTTTTATTT 2893 het 2893 ref 23 11 9 3 T 7 6 268528 CASAVA_Build 7 29675082 2D GTGATAGCCC CT/-- GTTTCATTGA 3070 het 3070 ref 51 30 17 5 CT 1 0 268529 CASAVA_Build 7 29680348 3D AATAATTCTG ATA/--- ATAATCATCT 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 ATA 2 1 268530 CASAVA_Build 7 29682280 1I AAAGAACTAA -/G AAGCTAGGAG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 G 0 1 268531 CASAVA_Build 7 29687008 1I TCTCAGATCA -/G GTGATGCCCT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 G 1 2 268532 CASAVA_Build 7 29688297 1D AAAAATAAAA G/- GGGGGGACTG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 G 7 6 268533 CASAVA_Build 7 29704046 1I AGAAATGAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 18 8 7 3 A 8 9 268534 CASAVA_Build 7 29712928 1I TTCTTCAAAT -/A TTTTTCTGCC 3070 het 2884 hom 20 9 8 3 A 0 1 268535 CASAVA_Build 7 29745716 2I AGGAAGAATT --/AA AAGATAAACC 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 2 4 268536 CASAVA_Build 7 29748715 1D TATAAAAGAA C/- AATGAATTTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 C 1 0 268537 CASAVA_Build 7 29751747 14I CCAAATGGAC --------------/CCTTTGTCTCACAA GGAAGAAAAT 2984 het 2984 ref 25 16 7 2 CCTTTGTCTCACAA 0 1 268538 CASAVA_Build 7 29755570 1I CTTCCTCCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 20 10 12 T 9 10 268539 CASAVA_Build 7 29759732 7I TCCTGACCCT -------/GGGAGAC GTTTTTCACA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 GGGAGAC 0 1 268540 CASAVA_Build 7 29775644 1I ACACCATACA -/C TTAAATCAAC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 C 0 1 268541 CASAVA_Build 7 29780648 3D TCTTTTAGTG TAA/--- TAATTTTTCT 3070 het 3070 ref 55 26 24 7 TAA 2 1 268542 CASAVA_Build 7 29782775 3I TTGGGTTTTT ---/TTA TTATTATTAT 3070 het 2760 hom 27 7 11 9 TTA 3 4 268543 CASAVA_Build 7 29790802 5D AAAAAAAAAA ATAGT/----- CAGCTGTCGT 1735 het 1735 ref 18 11 6 1 ATAGT 1 0 268544 CASAVA_Build 7 29795610 5D TACAGGGTAC AGTCG/----- ATTTGAACTT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 AGTCG 1 0 268545 CASAVA_Build 7 29799615 1I ACAGCTAACA -/T AATATTTCTC 3070 het 3070 hom 50 17 27 6 T 0 1 268546 CASAVA_Build 7 29822629 1I TTTATTTTTA -/T TTTTATTTTA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 T 4 5 268547 CASAVA_Build 7 29836243 1I TTGTATCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 31 1 27 3 A 10 11 268548 CASAVA_Build 7 29838500 1I ACCAGCCTGT -/A AAAATGCTAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 4 5 268549 CASAVA_Build 7 29854032 2I AGCCTTGGGG --/GA GAGAATGGGA 3070 het 3070 hom 44 19 17 8 GA 2 3 268550 CASAVA_Build 7 29875324 1I GCATGTGCCA -/C CACACCTGGC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 1 2 268551 CASAVA_Build 7 29877099 1D CCCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 1437 het 1437 ref 33 15 5 13 A 15 14 268552 CASAVA_Build 7 29924034 1D GACCACACTT C/- ACTAACTCTG 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 C 1 0 268553 CASAVA_Build 7 29958836 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 394 hom 38 1 24 13 AG 8 9 268554 CASAVA_Build 7 29969799 3I CATCCAATGG ---/CTA TATCTACACA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 CTA 0 1 268555 CASAVA_Build 7 30086040 1D TGATATGTCC T/- TTTTTTTTTT 2390 het 2390 ref 40 28 6 6 T 13 12 268556 CASAVA_Build 7 30142171 1I GCGCACACGC -/G GGCACGCCTC 2104 hom 26 het 13 0 7 6 G 2 3 268557 CASAVA_Build 7 30142270 1I CCGAGGCGGT -/G GCCCTGGCCC 1676 hom 12 het 6 0 5 1 G 1 2 268558 CASAVA_Build 7 30152691 1I AATCCCTGAT -/G GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 G 8 9 268559 CASAVA_Build 7 30153776 1D GTTTGGCTTA C/- CCTCTCCTGG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 C 3 2 268560 CASAVA_Build 7 30162446 1D TCACAATCTT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 24 7 9 8 A 8 7 268561 CASAVA_Build 7 30162965 3I ACTCCCTCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 2744 het 2744 ref 26 14 9 3 A 12 15 268562 CASAVA_Build 7 30182522 3D AAAAGAAAAT ACA/--- ACAACAACAG 3070 het 3070 ref 41 17 15 10 ACA 4 3 268563 CASAVA_Build 7 30183301 4I TAAATGGAGG ----/AACA AACAGTGTTC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 AACA 1 2 268564 CASAVA_Build 7 30185656 5D AACATGGAAT GGAAC/----- GGAACGGAAG 3012 het 3012 ref 41 28 8 7 GGAAC 2 1 268565 CASAVA_Build 7 30190217 1I CATAAAATAG -/T TGTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 1 2 268566 CASAVA_Build 7 30200459 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 49 15 27 8 TA 7 6 268567 CASAVA_Build 7 30261149 1D TGTGAAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 48 0 40 9 T 13 12 268568 CASAVA_Build 7 30300103 4D GGAAAAAAAG AAGA/---- ATGAAGCCAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 AAGA 1 0 268569 CASAVA_Build 7 30349827 1D GCCTGATAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 10 9 268570 CASAVA_Build 7 30437371 4I GAATGGGATC ----/AAAT AAATAATTCT 3070 het 3070 ref 42 16 18 8 AAAT 1 2 268571 CASAVA_Build 7 30469090 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1877 het 1294 hom 22 9 7 8 A 17 16 268572 CASAVA_Build 7 30469848 1D TGCTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2899 hom 27 10 12 6 A 13 12 268573 CASAVA_Build 7 30471246 1D AGAGAGAGAC A/- GGGGGGTGCC 3035 het 3035 ref 47 18 10 19 A 1 0 268574 CASAVA_Build 7 30471513 4I CCATGAACAT ----/AGAG AGCCTCAGTG 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 AG 1 3 268575 CASAVA_Build 7 30471799 1I TTATTCGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 11 12 268576 CASAVA_Build 7 30473486 1I ATTCGTAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 11 12 268577 CASAVA_Build 7 30477710 1D AAGTGCACAC A/- AATGATGAAT 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 A 3 2 268578 CASAVA_Build 7 30495013 4D GAGCAAAGGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 19 12 13 TTTG 4 3 268579 CASAVA_Build 7 30501317 1I ATTTTTTAAC -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 6 7 268580 CASAVA_Build 7 30503679 1I ACCTTTTAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 8 9 268581 CASAVA_Build 7 30504324 4D TTGCCAGGCA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2545 het 1378 hom 10 3 6 2 AAAG 4 3 268582 CASAVA_Build 7 30505980 1I ATATAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 10 11 268583 CASAVA_Build 7 30509048 1I ATAGAAATCT -/G ATCTTTCATG 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 G 0 1 268584 CASAVA_Build 7 30513054 1I GGTGAGTGTT -/A ACAGTTCATA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 1 2 268585 CASAVA_Build 7 30537881 1I CCATTCATAG -/T TTTTTTTTTT 2075 het 2075 ref 34 18 8 8 T 14 15 268586 CASAVA_Build 7 30552252 1D CTCTTTCAAA C/- CTATTTCTCA 2946 het 2946 ref 20 10 7 3 C 2 1 268587 CASAVA_Build 7 30555043 2I CCAGGGAGTG --/TC TCTCAGCGCT 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 TC 2 3 268588 CASAVA_Build 7 30558541 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1174 hom 23 5 13 7 TA 8 7 268589 CASAVA_Build 7 30567948 19D AAGGGACTCT TGCATGGGAACACTGTCTA/------------------- AAAGCACTTT 3070 het 3070 ref 41 28 16 4 TGCATGGGAACACTGTCTA 1 0 268590 CASAVA_Build 7 30569379 16D AGGAGCCAAT GGCTAAGGGCAGAGGG/---------------- AGCAGAGGGG 3070 het 3070 ref 37 23 17 4 GGCTAAGGGCAGAGGG 1 0 268591 CASAVA_Build 7 30572530 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1874 het 1042 hom 15 3 5 7 T 15 14 268592 CASAVA_Build 7 30591624 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1920 het 1256 hom 19 7 5 7 A 15 14 268593 CASAVA_Build 7 30640038 1D TTGCGCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 A 15 14 268594 CASAVA_Build 7 30650706 4D ACTAATTGAT AGAG/---- AGATTAAGTA 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 AG 3 1 268595 CASAVA_Build 7 30676268 2D ATAATCCAGT AC/-- ACACACACAC 1157 het 1157 ref 47 33 3 11 AC 8 7 268596 CASAVA_Build 7 30684800 1D TTGAGCTTTT C/- CCCCACCCAA 3070 het 3070 ref 55 26 23 7 C 5 4 268597 CASAVA_Build 7 30696563 2D TATGGTCAGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 54 23 17 15 GT 6 5 268598 CASAVA_Build 7 30696836 1D GCATGCTCAG C/- CCTCACCACG 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 C 3 2 268599 CASAVA_Build 7 30755408 2I CATGAACAAA --/GT GTTGTCACAT 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 GT 1 2 268600 CASAVA_Build 7 30764788 4I CTCCGGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 2472 het 2472 ref 32 15 9 8 TTTG 3 4 268601 CASAVA_Build 7 30783109 17I CCCAATGGTA -----------------/TTTCTTTTCTTTTCTTT TTTCTTTTCT 3070 het 2122 hom 34 7 16 12 TTTCTTTTCTTTTCTTT 1 2 268602 CASAVA_Build 7 30790303 3D GCTATGAAGA AGC/--- TCTTCCTCCG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AGC 1 0 268603 CASAVA_Build 7 30795309 10D TCTGAGGACC GGTGAACCAG/---------- AGAGGAGCGC 3070 het 3070 hom 51 23 29 4 GGTGAACCAG 1 0 268604 CASAVA_Build 7 30802263 2D AGCACTGTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 13 11 268605 CASAVA_Build 7 30808187 1I GAAGTTGTTG -/A GGCTCTGAGA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 A 0 1 268606 CASAVA_Build 7 30812627 1D ACACCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 11 10 268607 CASAVA_Build 7 30818420 1I TGAGGGGGGG -/C GGGGTATGTA 3070 het 2332 hom 34 10 11 13 C 0 1 268608 CASAVA_Build 7 30827912 1I TCTCTCCTGA -/T TGGTGATATT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 1 2 268609 CASAVA_Build 7 30828300 4D ACCCACAAAA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 2045 hom 29 8 13 8 TTTC 5 4 268610 CASAVA_Build 7 30831130 1I CTCTGGGGGG -/T CATGAGAGGA 2337 het 2337 ref 37 17 13 7 T 0 1 268611 CASAVA_Build 7 30864794 2D TGTTTTAAAA AT/-- ATATATATAT 1529 het 1529 ref 17 7 5 5 AT 9 8 268612 CASAVA_Build 7 30870106 1I GGGGTCAGGA -/C CAGCTCTGAA 3070 hom 120 het 47 0 39 8 C 1 2 268613 CASAVA_Build 7 30919985 1D TCAAGCTCTG C/- CCCCCCAGGC 2356 het 2356 ref 32 15 9 8 C 7 6 268614 CASAVA_Build 7 30924141 1D ATAGATTTTT A/- TTTTTTTTTT 1922 het 1922 ref 22 7 6 9 A 1 0 268615 CASAVA_Build 7 30935063 2I CAGAGAGACC --/TA TATGGCAAAG 2541 het 2541 ref 37 24 9 4 TA 1 2 268616 CASAVA_Build 7 30936571 1D CATATGAGTG T/- TTTTTTTTTA 1151 het 1151 ref 31 21 3 7 T 10 9 268617 CASAVA_Build 7 30944385 3I TTAATTAATT ---/AAA AATTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 2 5 268618 CASAVA_Build 7 30953068 1I CTGATATAAT -/C CCATTATTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 2 3 268619 CASAVA_Build 7 30960049 11D AGTGCTCTTT ATATATCCTGG/----------- ATATTAATGC 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 ATATATCCTGG 1 0 268620 CASAVA_Build 7 30961860 2D TTTTTTTTTT TG/-- CCTAATTACT 3070 hom 56 het 27 0 21 6 TG 1 0 268621 CASAVA_Build 7 30968942 1I TTTCGAAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 T 9 10 268622 CASAVA_Build 7 30970554 1I CCTGGCTGTG -/C CCTCTGGGGG 3070 hom 92 het 33 0 25 8 C 2 3 268623 CASAVA_Build 7 30971563 2D CGATGTGTGT GG/-- GGGGGTGACT 1802 het 1369 hom 18 7 7 5 G 7 5 268624 CASAVA_Build 7 30973826 8D TCCTTCTTTT CTGCCTTC/-------- CTGCCTTCCT 3070 het 3070 hom 38 12 19 10 CTGCCTTC 3 2 268625 CASAVA_Build 7 30985879 3I CTCACAGGCA ---/AAC AAGAGAGCAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AAC 0 1 268626 CASAVA_Build 7 30998559 4D CTTCCCCGTG GTAA/---- GTGTCACCAG 3070 het 3070 hom 41 14 23 6 GTAA 1 0 268627 CASAVA_Build 7 31004149 1D TGTGTGTAAC T/- TTTCCCCCCT 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 T 4 3 268628 CASAVA_Build 7 31007589 1D GAACTAGACA G/- GGTGATCTTT 3070 het 3070 ref 45 24 19 3 G 3 2 268629 CASAVA_Build 7 31009027 1D23M1I TCTCAGGGGG AAAAAAAAAATAGAAAGAAAAAAG-/-AAAAAAAAATAGAAAGAAAAAAGA AAAAAAAAAA 3070 het 1791 hom 23 9 16 5 N/A 0 0 268630 CASAVA_Build 7 31009968 1D TTTCCACTCG C/- TAGAGAAGTG 3070 het 3070 ref 52 25 22 6 C 1 0 268631 CASAVA_Build 7 31016803 1D CTCTAGGTTA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 8 7 268632 CASAVA_Build 7 31030143 2D CATTGGTGAC TG/-- TGTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 49 20 23 7 TG 2 1 268633 CASAVA_Build 7 31046688 2D GGTTGTGGAA GG/-- GGGACATATA 3070 het 3070 ref 59 30 23 7 G 5 3 268634 CASAVA_Build 7 31054578 1D CAGGGTCCAT G/- GGGTGACTGA 3070 het 3070 hom 54 23 23 9 G 4 3 268635 CASAVA_Build 7 31060128 1D TCTCAGGAGA C/- CCCCAATTAA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 C 5 4 268636 CASAVA_Build 7 31063780 3I TCAGCTCTGG ---/TCT TCTTGAGGAG 3070 hom 101 het 37 0 31 6 TCT 1 2 268637 CASAVA_Build 7 31072225 1I AGGCAGGGGG -/C CCAGAAGGGC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 C 2 3 268638 CASAVA_Build 7 31075050 1I CTTAGGGGTA -/C CCTGGCTGGA 3070 hom 66 het 30 0 21 9 C 2 3 268639 CASAVA_Build 7 31083621 2D GGTGTGTGTA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 178 het 66 0 53 16 GT 7 6 268640 CASAVA_Build 7 31091608 1I AGACCCATTA -/G GGCTCTGCCG 3070 hom 147 het 59 0 48 11 G 2 3 268641 CASAVA_Build 7 31101006 1I TTCTGGCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 62 het 30 0 26 4 A 9 10 268642 CASAVA_Build 7 31102989 3I TCTGTGGACC ---/TGG GCCAAGTGGC 3070 hom 111 het 39 0 34 5 TGG 0 1 268643 CASAVA_Build 7 31118787 1I AGAGGCTGTG -/C CCGCTCCTCT 3070 hom 132 het 51 0 43 8 C 2 3 268644 CASAVA_Build 7 31156430 1I TTTCTAATTG -/T TTTTTTTTTT 1297 het 1297 ref 38 28 3 7 T 10 11 268645 CASAVA_Build 7 31177905 1I ACAGTGTAAG -/A AATACTGACT 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 A 2 3 268646 CASAVA_Build 7 31178557 2I TCTTTGGCAG --/AA AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 A 6 8 268647 CASAVA_Build 7 31182033 4I AGTTTCTCTC ----/TCTT TCTAGGCCCC 3070 hom 93 het 32 0 30 2 TCTT 0 1 268648 CASAVA_Build 7 31182413 4I ACTATTGTGT ----/TCAA TATCTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 TCAA 0 1 268649 CASAVA_Build 7 31191317 3I ATAGAAGAAG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 11 14 268650 CASAVA_Build 7 31193359 1I TCCTTGACCA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 T 6 7 268651 CASAVA_Build 7 31198090 1I CCATGAGAAA -/C CCTTGACTTT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 C 2 3 268652 CASAVA_Build 7 31202640 1I ATCATGCGGA -/T TGTTATGCTG 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 T 1 2 268653 CASAVA_Build 7 31203297 1D CACTTTTCAG A/- AAAGCTTCAG 3070 hom 117 het 44 0 40 5 A 4 3 268654 CASAVA_Build 7 31203641 1I ACCTATGGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 T 9 10 268655 CASAVA_Build 7 31211853 1D TTATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 751 hom 19 6 10 4 T 13 12 268656 CASAVA_Build 7 31228493 1D GTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 14 10 T 13 12 268657 CASAVA_Build 7 31229590 1D TTATTATGAA G/- GGATGTTGCG 3070 hom 120 het 46 0 41 7 G 3 2 268658 CASAVA_Build 7 31229925 1I TTCCTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 19 11 T 11 12 268659 CASAVA_Build 7 31235084 1D CAGGTAGGTG C/- CAGCTATGGT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 C 2 1 268660 CASAVA_Build 7 31242033 1D AATAATTTGA C/- CAAGGCGTTT 3070 het 3070 hom 32 12 19 2 C 2 1 268661 CASAVA_Build 7 31243156 1D GTGGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 116 hom 30 3 18 10 T 13 12 268662 CASAVA_Build 7 31250240 1I TTACCCCCAC -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 22 12 8 6 A 6 7 268663 CASAVA_Build 7 31250339 5I ATAGAATCTA -----/ATAAT ATAAAGAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ATAAT 0 1 268664 CASAVA_Build 7 31251155 4I TGTCCTTTCT ----/CTAA CTGTTTTCAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CTAA 0 1 268665 CASAVA_Build 7 31264556 1I ATTATTTGAC -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 37 16 19 2 T 6 7 268666 CASAVA_Build 7 31271757 4D TTGTGCCTTT TCTC/---- TCTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 TC 4 2 268667 CASAVA_Build 7 31276001 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2051 het 2051 ref 15 5 5 5 T 11 10 268668 CASAVA_Build 7 31276468 1D TTTTTAAAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 9 8 268669 CASAVA_Build 7 31292042 1I GCATTAATGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 9 268670 CASAVA_Build 7 31292163 1I ACCTTCGTTA -/T AGTTTAGAAC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 0 1 268671 CASAVA_Build 7 31293353 5I TATTCATGAA -----/TCTTT TCTTTTATAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCTTT 1 2 268672 CASAVA_Build 7 31298279 2I TCAGGCAGCT --/CA CAGTCTATAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 CA 1 2 268673 CASAVA_Build 7 31300086 1I TGTTAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 13 9 T 10 11 268674 CASAVA_Build 7 31305461 2D CAATGAGATA TT/-- GTTACCAACT 3070 het 3070 hom 61 25 30 6 T 2 0 268675 CASAVA_Build 7 31311030 4D TTATTTCCCA ATAT/---- ATATATCAGC 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 AT 5 3 268676 CASAVA_Build 7 31339068 1D CAACACCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 8 6 A 11 10 268677 CASAVA_Build 7 31341527 1I AGGACTAAGC -/T GCGAGGATCA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 0 1 268678 CASAVA_Build 7 31347807 1I CCTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 9 10 268679 CASAVA_Build 7 31348036 1D AGCTGGCAAA G/- CCTTATAGAT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 G 1 0 268680 CASAVA_Build 7 31361322 1I TCTAAAAAAT -/A ATGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 A 1 2 268681 CASAVA_Build 7 31394537 9I TGTTAAATAG ---------/AAGTGGTCA AAGTGGGCAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AAGTGGTCA 0 1 268682 CASAVA_Build 7 31398499 1I ATAGTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 892 het 892 ref 46 24 2 20 T 15 16 268683 CASAVA_Build 7 31401707 1I TTTTTTGTGT -/G TTTTAGGAGA 3070 het 1018 hom 15 3 11 1 G 0 1 268684 CASAVA_Build 7 31405374 1D TTTAGGCATT G/- CCTGTTTATG 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 G 1 0 268685 CASAVA_Build 7 31405513 1I GCGATCTTCC -/T TACCTCAGCC 3070 het 3059 hom 24 8 14 2 T 1 2 268686 CASAVA_Build 7 31405684 3D GCACGAACCA GCG/--- CACCCAGACT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 GCG 1 0 268687 CASAVA_Build 7 31409367 2I CACTTGTCAG --/AT ATATGATTTG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 AT 2 3 268688 CASAVA_Build 7 31412743 3D AATTACCCCT GGA/--- TACCTAGATA 3070 het 3070 hom 53 21 23 9 GGA 1 0 268689 CASAVA_Build 7 31430647 1D CAATCTCAAA C/- CCCAAGTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 C 4 3 268690 CASAVA_Build 7 31435182 3I AATGAAACAT ---/AAC AATTACTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AAC 0 1 268691 CASAVA_Build 7 31438908 1D TTGATTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 T 11 10 268692 CASAVA_Build 7 31442075 1D CAGTAGTCAG A/- AGCCAATGAG 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 2 1 268693 CASAVA_Build 7 31442494 1D TTAATGAGCT A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 A 7 6 268694 CASAVA_Build 7 31450734 1D TTTCTTTTTA T/- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 7 6 268695 CASAVA_Build 7 31452892 1I AGTTTTTCAA -/T TCTTTCTTAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 1 2 268696 CASAVA_Build 7 31456506 1D ACTTCCCCCC T/- CTTCCCTGGA 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 T 1 0 268697 CASAVA_Build 7 31457926 1I ATCCCTTGGA -/T TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 3 4 268698 CASAVA_Build 7 31458332 4D TGTGTGTATA TGTG/---- TGTATGTATG 3070 het 3070 ref 50 21 22 8 TG 3 1 268699 CASAVA_Build 7 31463853 1D CAGCAGGAGC A/- AAGGGTAGGA 3070 het 3070 hom 49 22 26 2 A 3 2 268700 CASAVA_Build 7 31488203 2I CGGTGGAGGG --/GT GGGACTAGAG 3070 het 3070 ref 59 30 22 7 GT 0 1 268701 CASAVA_Build 7 31498924 1D CATAATCTAT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 A 8 7 268702 CASAVA_Build 7 31505443 16I ATTAGCATAG ----------------/TGAAAATCCTAAGAGT TCCTGCTACC 3070 het 3070 hom 62 28 26 8 TGAAAATCCTAAGAGT 0 1 268703 CASAVA_Build 7 31516083 1I ATTTGAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 T 9 10 268704 CASAVA_Build 7 31522770 1D TTATAAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 10 9 268705 CASAVA_Build 7 31527215 1I ATTTAATTGA -/T TTCTACTCTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 3 268706 CASAVA_Build 7 31531074 1I GATGAAATAC -/A AAAAGGTAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 4 5 268707 CASAVA_Build 7 31544379 2D GTCTGTCTCT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 AC 7 6 268708 CASAVA_Build 7 31549638 3D CTAGTGTCTC ATT/--- GTTGTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 9 ATT 1 0 268709 CASAVA_Build 7 31556340 1D TTGCATCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 15 14 268710 CASAVA_Build 7 31561684 5D TACCATTTAG AAAAA/----- AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 4 A 10 5 268711 CASAVA_Build 7 31577163 1I CCAGCTATTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 9 10 268712 CASAVA_Build 7 31580308 1D TTTTGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 564 hom 38 7 13 18 T 13 12 268713 CASAVA_Build 7 31582025 1I AGGAATGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 11 268714 CASAVA_Build 7 31583061 1D TATTTTCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 15 13 15 T 13 12 268715 CASAVA_Build 7 31602539 1D AATTCTGACT A/- AAAATCTCAG 3070 hom 93 het 32 0 31 1 A 5 4 268716 CASAVA_Build 7 31611277 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 21 0 16 5 A 11 12 268717 CASAVA_Build 7 31612598 2D AAAAGAAAAC GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 GA 7 6 268718 CASAVA_Build 7 31621892 1D CTGAGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 8 T 17 16 268719 CASAVA_Build 7 31622567 1I TTAGGTTGGA -/T TTCCCAGAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 3 268720 CASAVA_Build 7 31623406 11I AACAATTTAA -----------/AAATGATAGAT CTTTGCAAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAATGATAGAT 0 1 268721 CASAVA_Build 7 31623791 1D ATCTTTTAAA G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 32 0 27 5 G 2 1 268722 CASAVA_Build 7 31625685 4D AAAATTTACC TCAT/---- TCATCTATGC 3070 hom 78 het 27 0 26 3 TCAT 2 1 268723 CASAVA_Build 7 31631959 1I TTAGAATGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 9 10 268724 CASAVA_Build 7 31635429 2D ACACAATCTT TA/-- TATAGATTCA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 TA 3 2 268725 CASAVA_Build 7 31645545 3I TACTGGAGAC ---/ATT GTTGTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 15 9 13 ATT 0 1 268726 CASAVA_Build 7 31647617 1I TAAAGAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 10 268727 CASAVA_Build 7 31650434 2D GCTGAGAAGT TC/-- TGTGTCTTAA 3070 het 3070 ref 42 23 14 6 TC 1 0 268728 CASAVA_Build 7 31662671 2I TTGAAAAGAA --/CT CTGTTAGCAA 3070 het 3070 ref 58 32 20 6 CT 1 2 268729 CASAVA_Build 7 31663037 1I CTCTATCCCA -/C CCAGGACCTT 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 C 2 3 268730 CASAVA_Build 7 31666655 1D TCCTCTCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 11 10 268731 CASAVA_Build 7 31667253 1I TCAGTACCAC -/A AGAGAGGTAT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 1 2 268732 CASAVA_Build 7 31673781 1D AACAAATATG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 51 22 25 4 A 9 8 268733 CASAVA_Build 7 31674634 1D CTTCAGCAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 43 13 26 5 A 10 9 268734 CASAVA_Build 7 31674950 1I TGTTCCCTTT -/A AATTGTATTG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 2 3 268735 CASAVA_Build 7 31675164 1D AGTTCAGCCT G/- GGTCTGTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 G 3 2 268736 CASAVA_Build 7 31678663 1D ATGGTAATGA G/- GTTATACATT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 G 2 1 268737 CASAVA_Build 7 31679852 1D TAGAAACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 T 13 12 268738 CASAVA_Build 7 31686863 1I GACCTCATGG -/T TCTGAGTCTC 3070 het 3070 ref 46 18 19 9 T 1 2 268739 CASAVA_Build 7 31689565 1I ATATTTTCTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 8 9 268740 CASAVA_Build 7 31691263 1D ATGCTGAGTG A/- AAAAAAAAAA 1206 het 1206 ref 53 41 5 7 A 11 10 268741 CASAVA_Build 7 31699171 1D ACCAGAAACA T/- TTCTGCCGCT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 T 3 2 268742 CASAVA_Build 7 31701290 1I AACCTATTCT -/C CCCATCAGAA 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 C 3 4 268743 CASAVA_Build 7 31701969 1D TAAAAGTTTA T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 T 8 7 268744 CASAVA_Build 7 31705313 12D AGAAAGAGGA AAGGTTCTGAGG/------------ ACTGCCTTTA 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 AAGGTTCTGAGG 1 0 268745 CASAVA_Build 7 31708347 2I CCCTTATTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 T 11 13 268746 CASAVA_Build 7 31711611 4D AAATATCTCC CACT/---- GTGTTTCATA 3070 het 3070 hom 45 15 27 5 CACT 1 0 268747 CASAVA_Build 7 31730099 1I GATTCTTCCA -/C CTCCTTCTTA 3070 het 3070 ref 32 23 7 2 C 1 2 268748 CASAVA_Build 7 31732370 1D AACATGATCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 T 10 9 268749 CASAVA_Build 7 31737932 1I CTTGCCGTCA -/G GCCAATGTGG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 G 1 2 268750 CASAVA_Build 7 31740147 1D TGTTTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 A 10 9 268751 CASAVA_Build 7 31752170 14I CAGTGACTGA --------------/GAGAAGCCCTCTGT GAGAAGCCCT 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 GAGAAGCCCTCTGT 0 1 268752 CASAVA_Build 7 31756444 1D AGGCCAAGGG C/- GTGGGGATAC 3070 hom 107 het 40 0 32 8 C 1 0 268753 CASAVA_Build 7 31787558 1D TCAACTTATT G/- GCCATTTTCA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 G 2 1 268754 CASAVA_Build 7 31788416 4D AATTCAAAAT TAAC/---- TATACTATAT 3070 het 3070 ref 37 21 16 0 TAAC 1 0 268755 CASAVA_Build 7 31790361 1D CTCAAGGTGA G/- TAGGGTGTCT 3070 het 3070 hom 42 19 18 6 G 1 0 268756 CASAVA_Build 7 31837638 2D CACATGCACG CA/-- CACACACACA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 CA 10 9 268757 CASAVA_Build 7 31843085 1D AAGGAAATAC T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 76 het 29 0 25 4 T 7 6 268758 CASAVA_Build 7 31858995 1I ACATATGCAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 356 hom 54 1 49 4 T 8 9 268759 CASAVA_Build 7 31859818 1I AAGGGAGATA -/T AAAAGCAGGG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 0 1 268760 CASAVA_Build 7 31865259 2I ATGTATTGAC --/TA TATATATATA 3070 het 2562 hom 25 8 10 7 TA 6 7 268761 CASAVA_Build 7 31865587 9D CTATAACTTT AATAATATA/--------- AATAATATAA 3070 het 2911 hom 18 7 10 3 AATAATATA 2 1 268762 CASAVA_Build 7 31873642 1I ACTGATGCTG -/C CATCACAGCT 3070 hom 118 het 45 0 37 8 C 1 2 268763 CASAVA_Build 7 31878191 1I CATAAAAAAG -/A ATGAAATCAT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 1 2 268764 CASAVA_Build 7 31907274 1D CATTATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 979 hom 25 3 13 9 A 15 14 268765 CASAVA_Build 7 31907539 2I ACAGCCAAAG --/TA TATATATCTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TA 3 4 268766 CASAVA_Build 7 31910619 1D CCACTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 6 A 11 10 268767 CASAVA_Build 7 31916034 2D TAGATAACTC TT/-- TGTTGTGGGG 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 3 1 268768 CASAVA_Build 7 31930716 7I CTACAGGCAC -------/CTGTTTT CTCGAAAGAG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 CTGTTTT 0 1 268769 CASAVA_Build 7 31931614 1D AAAAACTCTT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 8 7 268770 CASAVA_Build 7 31932958 1I TGGTCTCATG -/T TGCCTACACC 3051 het 3051 ref 36 20 9 7 T 1 2 268771 CASAVA_Build 7 31933304 2D GTAGGTGGTT AA/-- ACCCCTCACA 3070 het 3070 ref 25 16 8 2 A 3 1 268772 CASAVA_Build 7 31941199 3D TGTTTTTATC TTA/--- TAACCTTCCA 3070 hom 154 het 56 0 52 6 TTA 1 0 268773 CASAVA_Build 7 31947792 4I TCCACTTCCC ----/GTTA GTTATTCCTA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 GTTA 1 2 268774 CASAVA_Build 7 31950378 1I GTCTGGTTTT -/C CCTCCCGGTT 3070 hom 150 het 56 0 50 6 C 2 3 268775 CASAVA_Build 7 31966169 1I CGCACAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 10 11 268776 CASAVA_Build 7 32007677 1I AACAGCGTAC -/A ACACCAGCTC 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 A 1 2 268777 CASAVA_Build 7 32008712 1D ATAAAAAGCA C/- TTAACAAATG 3070 het 3070 hom 33 11 13 10 C 1 0 268778 CASAVA_Build 7 32010392 1I AAAAAACCTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 9 10 268779 CASAVA_Build 7 32015073 1I ATCATAAGAC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 106 het 48 0 37 11 A 8 9 268780 CASAVA_Build 7 32020438 1D CTATAACGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 A 11 10 268781 CASAVA_Build 7 32024053 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAATAAGA 3070 het 3070 ref 27 17 10 1 A 6 5 268782 CASAVA_Build 7 32035389 5D AATGTAAATT AGTAC/----- AGTACAGCCA 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 AGTAC 2 1 268783 CASAVA_Build 7 32052343 1I GCCATTTGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 8 9 268784 CASAVA_Build 7 32060255 1I TATATTTTAG -/A AAAAGATGAT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 4 5 268785 CASAVA_Build 7 32094864 21D TGTCTTTAGT GACAGGCTCACTCCAGTGAGC/--------------------- CACCCGTGAA 3070 het 3070 ref 42 27 20 8 GACAGGCTCACTCCAGTGAGC 1 0 268786 CASAVA_Build 7 32096321 2I TAACATAAAT --/TA AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 TA 0 1 268787 CASAVA_Build 7 32099016 1D GCATTATTAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 9 8 268788 CASAVA_Build 7 32111565 3D GGTAAAAATC TGA/--- TGAAGAATCA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 TGA 2 1 268789 CASAVA_Build 7 32112944 1D GCTAAAAGAC A/- AAAACATAAT 3070 het 3070 hom 20 7 11 2 A 5 4 268790 CASAVA_Build 7 32113122 1D AAACTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 13 12 268791 CASAVA_Build 7 32113287 1D AAATGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 11 10 268792 CASAVA_Build 7 32113396 4I AGACAAAGAG ----/AGAA AGACAGGTAG 2948 het 2948 ref 29 11 9 9 AGAA 0 1 268793 CASAVA_Build 7 32118761 1D ATCTAGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 27 0 12 15 T 14 13 268794 CASAVA_Build 7 32120962 1D GACACTTCTC A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 8 7 268795 CASAVA_Build 7 32129547 1I CACAATAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 A 9 10 268796 CASAVA_Build 7 32134324 1I TTTAGTGCCT -/A ATTGTATGTA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 1 2 268797 CASAVA_Build 7 32142668 2D TGTGCCCAGA GT/-- GTCTAGCACA 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 GT 2 1 268798 CASAVA_Build 7 32146058 1I TAAGGCCTAA -/C CCATCATGCT 3070 hom 134 het 48 0 43 5 C 2 3 268799 CASAVA_Build 7 32147948 1D TTCTTGTTTT G/- ACAAAGATAC 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 G 1 0 268800 CASAVA_Build 7 32149020 2I CCAACACAAA --/AT ATATATATAT 1923 het 1923 ref 32 17 4 11 AT 6 7 268801 CASAVA_Build 7 32161221 1I GTGCAGAGGC -/A AGGCAGGAAG 3070 het 3070 ref 61 31 25 5 A 1 2 268802 CASAVA_Build 7 32163684 4I GTGGAGCCAG ----/GATC CCAAAAAATA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 GATC 0 1 268803 CASAVA_Build 7 32167722 15D8M7D TTCACACTTC CTTCAAAGGAAGGAACTTCCTTTGTTTAGA/---------------CTTCCTTT------- GTTTAGAGAG 3070 hom 123 het 36 0 42 4 N/A 0 0 268804 CASAVA_Build 7 32168711 1I CTGCAGCTCT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 51 17 20 14 A 7 8 268805 CASAVA_Build 7 32192142 4I TTTCTAATTC ----/ATTT GTCTTTGCTT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 ATTT 0 1 268806 CASAVA_Build 7 32194352 1I ATATGAAATT -/G GGGGGGGGAT 3070 hom 64 het 31 0 21 10 G 8 9 268807 CASAVA_Build 7 32197484 5I3M7I ACAAAGATCC -----CTC-------/TGAGGATCCATGAGG ATGTTATCCT 3070 het 3070 hom 48 22 23 4 N/A 0 0 268808 CASAVA_Build 7 32202663 1D CTGTCTTCTT C/- TTTTTGCCTT 3070 het 3070 ref 41 19 20 2 C 1 0 268809 CASAVA_Build 7 32213759 1I TTCGTTCTCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 55 22 25 8 T 8 9 268810 CASAVA_Build 7 32214385 1I TTAGAAGAAG -/C CCTGTAAATA 3070 hom 90 het 31 0 30 1 C 2 3 268811 CASAVA_Build 7 32227877 1I TTCAGCAATG -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 7 8 268812 CASAVA_Build 7 32231158 4D CCTTTCTTAT TTAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 27 1 24 4 TTAA 1 0 268813 CASAVA_Build 7 32232498 1D AAAGGGACTT C/- CTGACACACT 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 C 2 1 268814 CASAVA_Build 7 32288801 1I TCACTGCAAG -/C TCCGCCTCCT 2177 hom 14 het 7 0 5 2 C 0 1 268815 CASAVA_Build 7 32325594 4I GCCATCACCG ----/GAGA GAGAACCAGC 3070 hom 48 het 18 0 15 3 GA 2 4 268816 CASAVA_Build 7 32333943 16D TCATGTAGTG TGGCTTCTTTTGTGTC/---------------- TGGCTTCTTT 3070 hom 44 het 22 0 13 11 TGGCTTCTTTTGTGTC 1 0 268817 CASAVA_Build 7 32340853 4I TTTAAACAGC ----/ACAA ACAAAGGCTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ACAA 1 2 268818 CASAVA_Build 7 32343866 1I AGGGAAAGGA -/G GGGGGGAGAA 3070 hom 78 het 33 0 25 8 G 6 7 268819 CASAVA_Build 7 32348198 1D GTAATAATTT A/- TATATTAAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 1 0 268820 CASAVA_Build 7 32348545 2D ATATAAAATC AA/-- AGTCATGTAT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 3 1 268821 CASAVA_Build 7 32349963 1D TAGGCCAGTA T/- TTTTATCTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 5 4 268822 CASAVA_Build 7 32364994 1D TCCATAGCAT A/- CCTCATCATC 3070 hom 87 het 40 0 30 10 A 1 0 268823 CASAVA_Build 7 32366621 1D AAAGGGAAGC G/- GTGGAGAGTG 3070 hom 96 het 37 0 32 6 G 2 1 268824 CASAVA_Build 7 32402012 1I TCTAAAAAAA -/T ATATTTTACT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 0 1 268825 CASAVA_Build 7 32409337 1D CTAACAGGGC A/- ACTAAATTAA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 A 2 1 268826 CASAVA_Build 7 32410631 1D GCTGGGACCA C/- AGGTGCATGC 3070 hom 78 het 28 0 27 7 C 1 0 268827 CASAVA_Build 7 32418846 1I TTGCCCGAAA -/C TTCGTTATGC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 C 0 1 268828 CASAVA_Build 7 32426691 2I GCTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 2289 het 669 hom 20 4 9 7 A 10 12 268829 CASAVA_Build 7 32426861 1D GGTTAAAATA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 T 8 7 268830 CASAVA_Build 7 32427224 4D ATTAAAACTA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 1317 hom 44 8 13 24 AC 12 10 268831 CASAVA_Build 7 32431665 4D TCAAAAAGTT AAAG/---- TTAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AAAG 1 0 268832 CASAVA_Build 7 32441130 1I AATATAATCA -/T TTTCTGACTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 4 268833 CASAVA_Build 7 32441995 4D AAATAACATT ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ATAA 3 2 268834 CASAVA_Build 7 32447905 1D TAAACATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 26 3 11 12 T 17 16 268835 CASAVA_Build 7 32455234 1I ACTAAAAATA -/C TAAAAAAAAT 3070 hom 32 het 16 0 13 3 C 0 1 268836 CASAVA_Build 7 32456878 1D ATGCTACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 19 0 17 2 A 11 10 268837 CASAVA_Build 7 32457790 5I TCTCTCTCTC -----/TCTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TCTCT 0 1 268838 CASAVA_Build 7 32467317 2I GACTCCGTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 11 13 268839 CASAVA_Build 7 32468259 4D CTCCCCAACT TCTG/---- TACCTTCAAC 3070 hom 108 het 39 0 36 4 TCTG 1 0 268840 CASAVA_Build 7 32470012 2I ATTATACATA --/AT ATATATATAT 2532 hom 27 het 12 0 10 2 AT 6 7 268841 CASAVA_Build 7 32470107 11D AGGCCATGGT GCAGAATAGTG/----------- GTTAATATAT 2479 hom 12 het 5 0 5 0 GCAGAATAGTG 1 0 268842 CASAVA_Build 7 32470573 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 17 0 12 6 A 12 11 268843 CASAVA_Build 7 32479574 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2655 het 1257 hom 17 5 7 5 T 12 11 268844 CASAVA_Build 7 32482102 1D ATTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 28 1 21 6 A 12 11 268845 CASAVA_Build 7 32487667 2I AAAGAAGCAT --/TC TTCCCTTACA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TC 0 1 268846 CASAVA_Build 7 32488764 3I CAAAGAGAAC ---/AAA AACACAGAAA 3070 hom 162 het 61 0 54 7 A 2 5 268847 CASAVA_Build 7 32490494 8I CAAGTTTTTG --------/TGCAGACA TGCAGACATG 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 TGCAGACA 1 2 268848 CASAVA_Build 7 32492080 2D GAGACTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 1843 hom 8 het 19 1 12 7 A 25 23 268849 CASAVA_Build 7 32494186 1I GTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 29 2 21 6 T 13 14 268850 CASAVA_Build 7 32498087 2D ACACTGTAGG GC/-- GCCTAATGAA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 GC 2 1 268851 CASAVA_Build 7 32498222 1D TCTCTTTCTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 7 6 268852 CASAVA_Build 7 32498671 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAACA 695 het 695 ref 22 8 4 11 A 10 8 268853 CASAVA_Build 7 32499679 4D CTCTCTCTCC CTTT/---- CTTTATTTTT 2205 het 2205 ref 21 11 8 2 CTTT 2 1 268854 CASAVA_Build 7 32500499 5D TTTGTAATAC AGAAA/----- AGAAATGTAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 10 AGAAA 2 1 268855 CASAVA_Build 7 32503248 2D ATCCCAGCAC TT/-- TGGGAGGCCG 2981 het 2688 hom 20 7 9 4 T 3 1 268856 CASAVA_Build 7 32505496 1D ATTAACTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 35 1 31 3 T 11 10 268857 CASAVA_Build 7 32505717 1D AGAATAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 11 10 268858 CASAVA_Build 7 32506074 1D CATTCTTTTT C/- ATGGCTGCAT 1919 het 1312 hom 10 3 5 2 C 1 0 268859 CASAVA_Build 7 32508201 2I CATTTATGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 10 12 268860 CASAVA_Build 7 32509822 1D TACAAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2396 hom 35 9 19 7 T 11 10 268861 CASAVA_Build 7 32511022 1I ATTTTATTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 2909 hom 18 6 8 4 T 7 8 268862 CASAVA_Build 7 32511661 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 24 1 20 4 A 12 11 268863 CASAVA_Build 7 32518539 1I ATGTTACGTT -/C ATTTTATCGA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 C 0 1 268864 CASAVA_Build 7 32522026 1I GCTGCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 9 10 268865 CASAVA_Build 7 32522488 2D TGCATTCTAC AG/-- AGTCTTCTCC 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 AG 2 1 268866 CASAVA_Build 7 32529407 1I GATTAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 10 13 9 A 10 11 268867 CASAVA_Build 7 32530728 24I ATATCTAACT ------------------------/AGATATAATTATATCTAAACTAGA GAGGGATGTT 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 AGATATAATTATATCTAAACTAGA 0 1 268868 CASAVA_Build 7 32533682 1I CTTTCTACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 A 9 10 268869 CASAVA_Build 7 32538638 1D38M5D CAAAATGTCA TTTTATATAATAGAGTCCTGATATTCTGTTTCACTGTGGTGGGA/-TTTATATAATAGAGTCCTGATATTCTGTTTCACTGTGG----- TTCTCATAAT 3070 het 3070 ref 39 27 23 4 N/A 0 0 268870 CASAVA_Build 7 32540526 1D ACCAGACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 43 0 35 8 T 12 11 268871 CASAVA_Build 7 32542675 1D AATAACATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 T 10 9 268872 CASAVA_Build 7 32545121 1I CAGGCGCAGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 2 268873 CASAVA_Build 7 32547476 4D AAATTCATTT TAAA/---- TAAATATCTG 3070 het 3070 ref 33 21 11 2 TAAA 2 1 268874 CASAVA_Build 7 32550031 4D TGCTATTGAT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2548 het 2548 ref 40 25 11 5 TTTC 5 4 268875 CASAVA_Build 7 32551244 1I TATAACTTAG -/A AAAAATTGAG 3070 het 3070 hom 41 11 25 5 A 5 6 268876 CASAVA_Build 7 32555910 4D AAAAAAAATT AGCC/---- AGGCACGGTG 2769 het 1055 hom 17 4 9 4 AGCC 1 0 268877 CASAVA_Build 7 32556454 2I GGCATATCTC --/AG AGAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 AG 1 2 268878 CASAVA_Build 7 32558156 1D TTTCATACTC A/- ACTGCCCACG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 2 1 268879 CASAVA_Build 7 32563281 1I ATCTGACATA -/C AGTCCATTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 C 0 1 268880 CASAVA_Build 7 32565730 1I GTAAAGTACA -/T ACCAAATACA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 0 1 268881 CASAVA_Build 7 32566402 3D ATTTTAAAAA AAC/--- AACAAAGTGA 1947 het 1947 ref 11 6 4 1 AAC 2 1 268882 CASAVA_Build 7 32568420 1I GTTTTAAAAG -/A AAAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 6 7 268883 CASAVA_Build 7 32568907 1I AAAAGTAAAA -/T AAATTATCTG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 0 1 268884 CASAVA_Build 7 32572678 1D5M1D17M1D6M1D2M1D GTATATAAAT ACTAATATTTTAAAAAAGTTACCTACAATCTAGTA/-TTAAT-TTTTAAAAAAGTTACCT-CAATCT-GT- GGCCAAACAA 1311 hom 7 het 3 0 3 1 N/A 0 0 268885 CASAVA_Build 7 32572860 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAGAA 1240 het 1240 ref 8 4 4 0 A 7 8 268886 CASAVA_Build 7 32577823 4I GAAGAAAAAG ----/TATA TACATTTTCC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TA 1 3 268887 CASAVA_Build 7 32580381 6I TTTTAATCAA ------/CACCAC CACCACCACC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 CAC 4 6 268888 CASAVA_Build 7 32580859 21I TCACAGAGGT ---------------------/TAAATAGCTTGCTTATCCATC TCATAAGAGG 3070 het 3070 ref 51 26 22 4 TAAATAGCTTGCTTATCCATC 0 1 268889 CASAVA_Build 7 32581675 1D GAAAAATGAC A/- TTTATAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 1 0 268890 CASAVA_Build 7 32586851 2I GAGTGACTAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 TG 5 6 268891 CASAVA_Build 7 32587215 2I CAAACTCCAT --/TA TATCTAATAG 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 TA 1 2 268892 CASAVA_Build 7 32594870 3I TTGACCTGTC ---/CTT CTAGAAGTAC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 CTT 0 1 268893 CASAVA_Build 7 32598690 4D CCTTTTTTGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 24 8 T 14 10 268894 CASAVA_Build 7 32598930 1D GTAATTCATA G/- GGAACTCAAA 3070 het 3070 hom 48 18 23 8 G 3 2 268895 CASAVA_Build 7 32601573 1D GCTATTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2716 hom 30 9 12 9 T 13 12 268896 CASAVA_Build 7 32608496 2D CTCTAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 1273 het 1273 ref 37 18 6 13 A 16 14 268897 CASAVA_Build 7 32613398 1I CTATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 A 10 11 268898 CASAVA_Build 7 32614545 1I GTTGAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2577 hom 38 10 19 9 A 11 12 268899 CASAVA_Build 7 32620427 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1813 het 1455 hom 10 3 6 1 A 11 12 268900 CASAVA_Build 7 32623910 1I40M1I ATTAAACTTT -TAAAAAAATCTTTTCCAAGTTGCCAGGAAGTAGGAAAAAT-/CAAAAAAAATCTTTTCCAAGTTGCCAGAAAGTAGGAAAAATA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 21 17 4 N/A 0 0 268901 CASAVA_Build 7 32627613 10D TAAATACTTC TCTTGTCAAA/---------- TCTTAAGTAT 2656 het 2656 ref 34 26 6 6 TCTTGTCAAA 1 0 268902 CASAVA_Build 7 32627830 2I TATATGCAAA --/TG TATGTTTATA 1462 het 1462 ref 37 25 4 8 TG 0 1 268903 CASAVA_Build 7 32632057 1D AAACAATGAT A/- TTTTTACATT 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 1 0 268904 CASAVA_Build 7 32637239 1D AGTAATCCAC A/- TATGGTAAAG 2103 het 2103 ref 20 10 6 4 A 1 0 268905 CASAVA_Build 7 32641598 1D GTTATAACAC A/- AACCTAAACA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 3 2 268906 CASAVA_Build 7 32650031 1D ATGCCAATGC T/- TTTTAAAGGC 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 T 5 4 268907 CASAVA_Build 7 32655993 2D AAAAATGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3035 het 3035 ref 27 12 10 5 A 13 11 268908 CASAVA_Build 7 32660672 1D AAGCCAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 7 6 T 17 16 268909 CASAVA_Build 7 32663061 4D CTTCTTTTCC TCTA/---- TCTACCTTCC 3070 het 3070 hom 31 9 17 6 TCTA 2 1 268910 CASAVA_Build 7 32666296 1I AAATAATAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 9 10 268911 CASAVA_Build 7 32670622 1I AGAAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 24 3 10 11 A 10 11 268912 CASAVA_Build 7 32680245 12I CTATAGTGCA ------------/CTGTGATCACAT CTGTGAATAG 2963 het 2963 ref 27 15 8 5 CTGTGATCACAT 0 1 268913 CASAVA_Build 7 32698095 1D TAATACATGT C/- CCTTGAGTTC 3070 het 3070 ref 53 29 17 8 C 3 2 268914 CASAVA_Build 7 32703256 11D CTGATGCTCT CCCTCCCCATA/----------- CCCTCCCCTG 3070 het 3070 ref 39 20 11 9 CCCTCCCCATA 1 0 268915 CASAVA_Build 7 32703791 4D TTTTGTTTGC TTGT/---- TTGTTATTAT 3070 het 2629 hom 17 7 7 3 TTGT 2 1 268916 CASAVA_Build 7 32711713 2D AAATATGTTT TC/-- TGTTTGTTGC 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 TC 1 0 268917 CASAVA_Build 7 32720889 4D AATGTTCATA TTGT/---- TTATTAATGT 3070 het 3070 ref 27 16 11 1 TTGT 1 0 268918 CASAVA_Build 7 32723722 4I ATGATACATA ----/AAAG AAAGTCAACT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 AAAG 1 2 268919 CASAVA_Build 7 32728685 4D GAGTAAAGCT ATTA/---- ATTAATTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 ATTA 2 1 268920 CASAVA_Build 7 32730938 6D CAATTACCAA GACAGG/------ GTCTTGTCCA 3004 het 3004 ref 32 19 9 5 GACAGG 1 0 268921 CASAVA_Build 7 32733095 3I AAGAAAAAAT ---/AAC AACAGAAAAA 2925 het 2925 ref 19 12 6 1 AAC 1 2 268922 CASAVA_Build 7 32733223 4D TGAAAAGAGA AAGT/---- AAGCACCTCT 3070 het 3070 hom 20 9 10 2 AAGT 1 0 268923 CASAVA_Build 7 32741320 1I TTTTAAAACC -/T TTTTTTTTTT 2797 het 2449 hom 18 8 6 4 T 10 11 268924 CASAVA_Build 7 32743867 2I15M1D CGTTTAAGGC --TGTTTACTTCTCGTTA/TGTGTTTACTTCTCGTT- ACATGTAGTC 1428 het 1428 ref 14 12 3 0 N/A 0 0 268925 CASAVA_Build 7 32747154 1D TGCCTTGTTG C/- CTTCTGGCTT 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 C 2 1 268926 CASAVA_Build 7 32748382 1I TCACGGCTTC -/T CACACAGACT 3070 het 3070 ref 35 26 8 1 T 0 1 268927 CASAVA_Build 7 32750044 2I TCTACTTTTC --/AG AGTCTTCTTA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 AG 1 2 268928 CASAVA_Build 7 32751955 6D TTGCGTGATA AAAGAT/------ AAACATAAAA 3070 het 3070 ref 28 18 10 3 AAAGAT 1 0 268929 CASAVA_Build 7 32752660 3D CAGTCTAAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 AAC 5 4 268930 CASAVA_Build 7 32755644 1D AACATTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 12 11 268931 CASAVA_Build 7 32763497 4D AAATAAGCGA TAAG/---- TAAGAAAGCC 3070 het 3070 ref 45 28 15 3 TAAG 2 1 268932 CASAVA_Build 7 32765052 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 222 hom 25 2 13 13 A 16 15 268933 CASAVA_Build 7 32765728 4D ACCTTTTTTG TTTT/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 T 9 5 268934 CASAVA_Build 7 32776836 1I ACTCTCCCCA -/C CCCCCATCCT 2060 het 2060 ref 22 14 7 1 C 5 6 268935 CASAVA_Build 7 32785307 1D AACAAAACAA T/- TCAAGGTTGG 3070 het 3070 hom 44 22 17 5 T 2 1 268936 CASAVA_Build 7 32785481 4I CAGTAGTCTT ----/CTGA CTGTCAACAG 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 CTGA 0 1 268937 CASAVA_Build 7 32786158 3I GGAGAGCAGA ---/CTC CTCCTCCCTC 3027 het 3027 ref 27 16 7 4 CTC 2 3 268938 CASAVA_Build 7 32790984 3I CTGGGAAGTA ---/CTT CTTCTAGCAC 3070 hom 82 het 31 0 27 4 CTT 1 2 268939 CASAVA_Build 7 32795134 1I ATGTTTCAAC -/T CCCCAGACAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 0 1 268940 CASAVA_Build 7 32795988 1I GCGTGAGTGC -/T TTCACACTGG 3070 het 1932 hom 30 5 22 3 T 2 3 268941 CASAVA_Build 7 32796295 1D CCATTGAGAC A/- AATATTTGTT 3070 hom 45 het 16 0 16 1 A 3 2 268942 CASAVA_Build 7 32797305 1I GAGTTCCACA -/G GCTGACATGA 3070 hom 89 het 34 0 29 5 G 1 2 268943 CASAVA_Build 7 32797651 1I TCCAGCTCTT -/C CAATTCTCCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 2 268944 CASAVA_Build 7 32800425 1D GCAAATGTGA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 8 268945 CASAVA_Build 7 32803431 2D TTCTTTTCAT AC/-- AGTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 25 19 5 AC 1 0 268946 CASAVA_Build 7 32803759 1D TTATCTTCAA C/- ACCTAAAAGT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 C 1 0 268947 CASAVA_Build 7 32805672 2D AAAAAAATTA AC/-- AGTGTCATTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 AC 1 0 268948 CASAVA_Build 7 32820667 4D TGTGAGAAAC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 293 hom 28 2 14 14 TG 11 9 268949 CASAVA_Build 7 32832227 4I CTGTGAAATA ----/ATTG ATTTACACTT 3070 het 3070 hom 47 17 22 8 ATTG 0 1 268950 CASAVA_Build 7 32833104 1D TAAAATCTAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 9 8 268951 CASAVA_Build 7 32850191 5I CTCTCGCTCT -----/CTCTC CTCTCCTCTC 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 CTCTC 2 3 268952 CASAVA_Build 7 32855824 2D ATAAGCAAAA AG/-- ATCAGTAAGG 3070 het 3070 ref 54 40 11 6 AG 1 0 268953 CASAVA_Build 7 32856498 3D TTCATAATTT ATG/--- ATGAAAATTT 3070 het 3070 ref 22 13 7 3 ATG 2 1 268954 CASAVA_Build 7 32856900 4D GTCAGCAGAC AGAG/---- AGCTTGTGCA 3070 hom 9 het 21 1 16 4 AG 3 1 268955 CASAVA_Build 7 32891088 2D ATATTTCTTT TA/-- TATATATATG 1520 hom 24 het 15 0 9 7 TA 5 4 268956 CASAVA_Build 7 32894077 3I GACACACAGC ---/ACT ACTACACAGA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 ACT 1 2 268957 CASAVA_Build 7 32901876 1I AGCACATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 897 hom 39 2 29 8 T 11 12 268958 CASAVA_Build 7 32919906 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 32 1 22 9 T 12 11 268959 CASAVA_Build 7 32922677 1I AGCAAGATCC -/G GCTTCACTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 1 2 268960 CASAVA_Build 7 32926501 1D ATTACAGGCG T/- TGAGCCACTG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 2 1 268961 CASAVA_Build 7 32947233 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 487 hom 31 3 19 9 A 13 12 268962 CASAVA_Build 7 32947409 4D TAACCTATGC CTTT/---- CTTTGTCTCA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CTTT 2 1 268963 CASAVA_Build 7 32950328 1D GCAAGCTCTG C/- CCCCCGGGGT 2173 hom 18 het 8 0 6 2 C 6 5 268964 CASAVA_Build 7 32962061 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 11 268965 CASAVA_Build 7 32969426 1D TGTGGGAGAA C/- CCAGTCCTTG 3070 hom 36 het 20 0 16 4 C 3 2 268966 CASAVA_Build 7 32978150 1I TGAAAAAAAT -/A ATTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 A 1 2 268967 CASAVA_Build 7 32997064 1D TGGAGAAATA T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 93 het 33 0 31 3 T 7 6 268968 CASAVA_Build 7 33007673 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 11 10 268969 CASAVA_Build 7 33014098 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 2123 hom 37 het 17 0 11 6 T 14 13 268970 CASAVA_Build 7 33016678 1I TGGGACCTTC -/G CACACCCTGT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 0 1 268971 CASAVA_Build 7 33020643 4I TTTTAGCTTT ----/AAGA TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAGA 0 1 268972 CASAVA_Build 7 33027001 1D TGATCTGCCT G/- GAACACTGCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 2 1 268973 CASAVA_Build 7 33027129 2D ACGTTTTGTT CA/-- TATACTTAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 CA 1 0 268974 CASAVA_Build 7 33028571 2D AATATAAGAA AC/-- ACATATGGGA 3070 hom 93 het 34 0 32 4 AC 2 1 268975 CASAVA_Build 7 33030577 14D TCTTAAGTGA AATAAGACAGGCAC/-------------- AGAAAGACAA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 AATAAGACAGGCAC 1 0 268976 CASAVA_Build 7 33035382 1I CTGGTTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 105 hom 42 1 34 7 T 11 12 268977 CASAVA_Build 7 33038140 1I CACATGCCTG -/T TAATCCCAGC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 1 2 268978 CASAVA_Build 7 33041166 1I CTAACGTAAT -/A AGAGTAGATC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 1 2 268979 CASAVA_Build 7 33043512 1D TTTGTTCCAT A/- ATGACTTTAC 3070 het 3070 hom 29 11 14 6 A 2 1 268980 CASAVA_Build 7 33050531 1I CTTAAAAAAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 94 hom 30 1 26 3 T 8 9 268981 CASAVA_Build 7 33052669 1D AGGTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 35 1 25 9 A 13 12 268982 CASAVA_Build 7 33054134 2D TATATGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 18 het 26 0 10 16 TG 10 9 268983 CASAVA_Build 7 33058525 3D GTGGCTGAGG CAC/--- CACGAGTATC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 CAC 2 1 268984 CASAVA_Build 7 33059701 1I GGGAGGCTGA -/G GGGGGGAAGA 3070 hom 38 het 20 0 12 8 G 6 7 268985 CASAVA_Build 7 33060201 2I TGATAATGTT --/AA GAGTTTAATG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 0 2 268986 CASAVA_Build 7 33060491 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1858 hom 34 9 12 13 A 15 14 268987 CASAVA_Build 7 33077956 1I CATGCAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 296 hom 48 3 35 10 T 12 13 268988 CASAVA_Build 7 33080225 2I ATAAATATAT --/AA AGTTTGTGCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 3 268989 CASAVA_Build 7 33081977 1I AGATGTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 35 1 26 8 T 10 11 268990 CASAVA_Build 7 33089449 1I TTGAAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 10 11 268991 CASAVA_Build 7 33096573 1D TGCAACCTCC A/- ACTCCCAGGT 3070 het 3070 hom 20 7 13 0 A 2 1 268992 CASAVA_Build 7 33098598 6D GACTCTCTTA CTTTCT/------ CTTTGATTAT 3070 het 3070 ref 47 25 13 11 CTTTCT 1 0 268993 CASAVA_Build 7 33100086 2I GGAAGAAAGG --/GA GAGAGAGATT 3070 het 3070 ref 48 26 13 9 GA 4 5 268994 CASAVA_Build 7 33100411 1D TTCAAAAAAA T/- AAATGGATGG 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 1 0 268995 CASAVA_Build 7 33102976 1I CCTCAAAAAC -/A AAAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 3 4 268996 CASAVA_Build 7 33123890 14D TCTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 1851 het 579 hom 17 5 7 5 T 28 14 268997 CASAVA_Build 7 33129856 1I TGGGTGTGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 73 het 28 0 25 3 G 1 2 268998 CASAVA_Build 7 33134128 4I TACGTGAGTT ----/TAAA TAACTAATGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 TAAA 0 1 268999 CASAVA_Build 7 33144434 1D TGAAAAATGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 52 26 18 8 T 8 7 269000 CASAVA_Build 7 33155578 3D AGTAAAACAC AGA/--- AGGATTCCTT 3070 het 3070 ref 42 17 17 9 AGA 1 0 269001 CASAVA_Build 7 33163997 1D TAATATAGAG A/- AAAAAACAGG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 7 6 269002 CASAVA_Build 7 33167263 1I TAATTAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 10 11 269003 CASAVA_Build 7 33173450 1D AAAATCTGAC A/- AAGTATTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 A 3 2 269004 CASAVA_Build 7 33178156 1I TAGGCAAGCA -/G GGAAAGCAGG 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 G 2 3 269005 CASAVA_Build 7 33190583 2I ATTTTTAACC --/AA AAGAGATTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 4 269006 CASAVA_Build 7 33198086 1D ATGTACCGGT A/- AAAAAAAAAA 1644 het 1644 ref 31 21 4 7 A 13 12 269007 CASAVA_Build 7 33201870 5I TGTAACACTT -----/TTATC TTCTCTCTGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TTATC 0 1 269008 CASAVA_Build 7 33205726 1D CAGCAATCTA T/- TTTTTTTTTA 1342 het 1342 ref 45 33 3 9 T 10 9 269009 CASAVA_Build 7 33210307 1D TTGGGAGGCC A/- AAGGCAGGTG 3070 hom 36 het 15 0 11 4 A 3 2 269010 CASAVA_Build 7 33210398 3D AAAATTAGCC GGT/--- GGTGGTGGTG 3070 hom 30 het 11 0 11 2 GGT 4 3 269011 CASAVA_Build 7 33210544 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 21 7 A 15 17 269012 CASAVA_Build 7 33213952 1I TAGATATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 11 12 269013 CASAVA_Build 7 33214937 1D GAAAATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 9 T 11 10 269014 CASAVA_Build 7 33216326 1D TTTCCATGTA T/- TTGTATAGTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 3 2 269015 CASAVA_Build 7 33217617 4D CCTGCTTTTT TTTG/---- TTTATTTTTG 3070 het 3070 ref 34 19 15 1 TTTG 1 0 269016 CASAVA_Build 7 33218052 1I TGGCCTGTAA -/G GTTTCCACTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 1 2 269017 CASAVA_Build 7 33222133 3I ATGCTGATTC ---/TTG CATTCAGCAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TTG 0 1 269018 CASAVA_Build 7 33235486 6D2M2D TGTATACTTC TAATTTCTAA/------CT-- TTGTGTATTC 3070 hom 84 het 30 0 29 4 N/A 0 0 269019 CASAVA_Build 7 33237316 1I TCTGTCACCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 12 26 8 T 9 10 269020 CASAVA_Build 7 33247253 1D AAGTCAAGAT C/- TCGAAGTTGA 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 C 1 0 269021 CASAVA_Build 7 33251382 1I ATTTCCTATA -/T TTTTTTATAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 269022 CASAVA_Build 7 33262620 5D GTTCTCTCTC TTTTT/----- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 T 7 2 269023 CASAVA_Build 7 33263634 2D GCTTCAATAT CA/-- CAAATGAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 19 5 CA 2 1 269024 CASAVA_Build 7 33269243 3I TTTCATATTA ---/ATG ATAAGATCTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 ATG 0 1 269025 CASAVA_Build 7 33273607 1D ATTTATCCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 9 269026 CASAVA_Build 7 33276159 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1705 het 284 hom 15 3 6 6 A 15 16 269027 CASAVA_Build 7 33286559 1D TTCATTGATC T/- AATATTGTTG 3070 hom 114 het 40 0 39 2 T 1 0 269028 CASAVA_Build 7 33298366 1D CTTAAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 15 18 16 T 11 10 269029 CASAVA_Build 7 33301567 1I ATAATTTTTT -/A AAGAAACCAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 2 3 269030 CASAVA_Build 7 33311275 2D AATAAATATT AA/-- AAAAAAAAAA 2828 het 734 hom 17 5 6 6 A 16 14 269031 CASAVA_Build 7 33313629 1D AACTATTGCA T/- TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 38 28 3 7 T 12 11 269032 CASAVA_Build 7 33323592 1I AATCAACATC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 37 0 27 10 T 9 10 269033 CASAVA_Build 7 33330738 1D TTAACATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2411 hom 46 9 25 15 T 16 15 269034 CASAVA_Build 7 33347777 3I CATTATAATA ---/ATC ATCAACATCA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 ATC 1 2 269035 CASAVA_Build 7 33356502 1D TTGAACTTTT G/- CTTGCATTTC 3070 het 3070 ref 35 16 14 8 G 1 0 269036 CASAVA_Build 7 33391977 4D TTTTAAAAAC TTTA/---- TTTAAAAATA 3070 het 1492 hom 15 4 10 1 TTTA 2 1 269037 CASAVA_Build 7 33406370 1D TTTGATCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 A 10 9 269038 CASAVA_Build 7 33417026 2I TTTCACACAC --/AT GTCTCGTAAG 3070 hom 72 het 31 0 23 8 AT 0 1 269039 CASAVA_Build 7 33420997 1I AATACAAATG -/T TTCACTTCAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 3 269040 CASAVA_Build 7 33441665 19I GACCAAGGAC -------------------/TCTATTGAAAGGAACTAAA TCTATTAAGT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 TCTATTGAAAGGAACTAAA 0 1 269041 CASAVA_Build 7 33461380 4I GTGATGGTGG ----/TACT TACCTCAGAG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 TACT 0 1 269042 CASAVA_Build 7 33472545 4D GTCTTTCTGG GCCC/---- GCCCGGTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 GCCC 2 1 269043 CASAVA_Build 7 33475137 2D TACTGATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 T 14 12 269044 CASAVA_Build 7 33475293 1D GTCGAATCTG A/- GGGAGAATAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 8 A 1 0 269045 CASAVA_Build 7 33476427 1I ACCAGCATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 9 10 269046 CASAVA_Build 7 33486931 1D AATTGTATTT A/- CCCACATGTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 0 269047 CASAVA_Build 7 33494482 1I TTCCCTGTAA -/C CTTGACATTT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 C 1 2 269048 CASAVA_Build 7 33496501 3D TTTGATTTTC TTT/--- TTATTTGTGT 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 T 5 2 269049 CASAVA_Build 7 33509682 4I ACTGATTTTC ----/CTTT CTATTACAAA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 CTTT 0 1 269050 CASAVA_Build 7 33511415 1I ACTGTGGGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 267 hom 48 2 39 7 T 9 10 269051 CASAVA_Build 7 33525718 1I AGCATTGTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 48 23 21 4 T 9 10 269052 CASAVA_Build 7 33527780 1I TATAAAAACA -/T TGAATATGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 269053 CASAVA_Build 7 33535639 1D AAATCCCCAC A/- AAACCCAATG 3070 hom 92 het 36 0 29 9 A 4 3 269054 CASAVA_Build 7 33542903 5D TCACACAGTC TCTTT/----- TCTTTTCTTT 2429 het 1035 hom 9 3 5 1 TCTTT 3 2 269055 CASAVA_Build 7 33544700 1D AACTGAATTT A/- AATTTAATTC 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 3 2 269056 CASAVA_Build 7 33548093 3I CTTGTTTAAA ---/AAC AACATTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 AAC 1 2 269057 CASAVA_Build 7 33556193 1D CATATAACAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 31 11 12 9 T 9 8 269058 CASAVA_Build 7 33563683 1I GTTTCATTCC -/T TTTGCAATTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 3 4 269059 CASAVA_Build 7 33572436 1I4M1I TTGAAAGATA -TGCA-/TTGCAT TGTAATATAT 3070 het 21 hom 25 1 22 6 N/A 0 0 269060 CASAVA_Build 7 33600574 1I AGCATTGTTT -/C TGCAAAAACA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 C 0 1 269061 CASAVA_Build 7 33629741 1I AAGAAAAACC -/A AAACCCCCAA 3070 hom 131 het 48 0 44 4 A 3 4 269062 CASAVA_Build 7 33636940 4D CTGCCTTCTG CACT/---- CACTCATTTA 3070 hom 155 het 57 0 52 7 CACT 2 1 269063 CASAVA_Build 7 33641365 1D ATACCCCACT C/- CCTGAGCCAG 3070 hom 107 het 42 0 34 8 C 3 2 269064 CASAVA_Build 7 33643798 1D AATCTAGTTC T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 8 7 269065 CASAVA_Build 7 33647643 2D ACTCTATCTG AA/-- AAAAAAAAAG 1569 het 182 hom 34 4 4 26 A 11 9 269066 CASAVA_Build 7 33649328 1I54M3I TCCTGTATAA -CCCCAATACCATTATCACCCTCATAAAATTAATCATTGATGAAGCAATGCAGTT---/CCCCCAATACCATTATCACCCTCATAAAATTAATCATTGATGAAGCAATGCAGTTATA ATAATGGTCA 3070 hom 156 het 36 0 52 9 N/A 0 0 269067 CASAVA_Build 7 33658997 1I TTCTTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 300 hom 37 1 24 12 T 11 12 269068 CASAVA_Build 7 33665291 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 488 hom 33 2 21 10 A 14 15 269069 CASAVA_Build 7 33670858 3D AATCTTTTCT ATC/--- ATCACTCTCG 3070 hom 90 het 31 0 31 2 ATC 2 1 269070 CASAVA_Build 7 33672817 1D ATTTCTTGTC T/- TTTTTGACAG 3070 hom 87 het 36 0 30 9 T 6 5 269071 CASAVA_Build 7 33680814 1I AATTTATGTT -/G GGGGGGGAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 7 8 269072 CASAVA_Build 7 33681786 5D TTGGAGGTGA CCATG/----- TTTGTTTAAC 3070 hom 129 het 47 0 43 6 CCATG 1 0 269073 CASAVA_Build 7 33683348 27I GTCATTTCAG ---------------------------/TATTCAAGTTGAATACTATCAATTCAA TATTCAAGTT 3070 hom 102 het 47 0 35 12 TATTCAAGTTGAATACTATCAATTCAA 0 1 269074 CASAVA_Build 7 33685344 1D GGTAACATTT G/- GGGAAAAAAA 3070 hom 76 het 30 0 25 5 G 4 3 269075 CASAVA_Build 7 33685819 1D ATTATGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 11 10 269076 CASAVA_Build 7 33700469 1D AGATACACAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 7 T 10 9 269077 CASAVA_Build 7 33701713 5I TGTTAGAGTC -----/CTTAT CTTATCCCAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CTTAT 1 2 269078 CASAVA_Build 7 33705558 4I TCTTGTTCTT ----/AGTC TGTCTTATGT 3070 hom 91 het 37 0 29 8 AGTC 0 1 269079 CASAVA_Build 7 33717355 1I TTCTAAACTC -/T TGCTAAATTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 1 2 269080 CASAVA_Build 7 33754721 13D ATGCCTCCAT TCCCTGTACTCTC/------------- TCTAAAAGTT 3070 hom 108 het 39 0 33 8 TCCCTGTACTCTC 1 0 269081 CASAVA_Build 7 33757109 2I AGCCCTTTAG --/TA TATAATTAGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TA 2 3 269082 CASAVA_Build 7 33766291 1D TAGTGCACTG T/- GCTACGTTGT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 T 1 0 269083 CASAVA_Build 7 33785975 6D GAGAAAAAAA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 28 12 13 6 AG 9 6 269084 CASAVA_Build 7 33788005 1I ACCTTACCTC -/T TGAAAGGTAT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 T 1 2 269085 CASAVA_Build 7 33800357 1D TCCCTGTCTC T/- TAAAATATCA 3070 hom 110 het 39 0 34 6 T 2 1 269086 CASAVA_Build 7 33832509 4I TGTCTCTCAG ----/ATTT CAACAGGTAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 ATTT 0 1 269087 CASAVA_Build 7 33849784 2I3M7I TGTATGCAAA --CAA-------/GCCTAGAGGTGG ACTTTTCCAT 3070 hom 117 het 45 0 40 6 N/A 0 0 269088 CASAVA_Build 7 33851953 1D TGTAATGCCT C/- CTTTATGTAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 2 1 269089 CASAVA_Build 7 33854083 1I AGGAGATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 26 0 22 4 A 10 11 269090 CASAVA_Build 7 33876710 1I AGCTTTCAAC -/T TGAAAATTGA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 1 2 269091 CASAVA_Build 7 33883371 3D AAGTTTGCTA TTG/--- TTGTTGCTGT 3070 het 3070 ref 52 30 16 6 TTG 3 2 269092 CASAVA_Build 7 33891902 13D AAAAGAAGCT GGAGGAAGAAATA/------------- GGAGGGAGGA 3070 het 3070 ref 31 16 16 5 GGAGGAAGAAATA 1 0 269093 CASAVA_Build 7 33897074 3D GTCTCACCAT CAG/--- CAGCATCAGC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 CAG 2 1 269094 CASAVA_Build 7 33908056 5I TTGGTCACCC -----/TTGAA GGGAGTGAAT 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 TTGAA 0 1 269095 CASAVA_Build 7 33909060 1I CTATCACTTG -/A AGGGGTGATG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 1 2 269096 CASAVA_Build 7 33912608 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 26 11 15 0 T 7 6 269097 CASAVA_Build 7 33915831 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGAAAGAA 3070 het 2835 hom 42 17 18 7 AAG 0 1 269098 CASAVA_Build 7 33920098 1D TTTAGCACAA T/- TTTTTTTTTT 468 het 18 hom 12 0 2 10 T 19 18 269099 CASAVA_Build 7 33923003 1I TGGGATAGCT -/C CCCCCCAGAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 C 6 7 269100 CASAVA_Build 7 33943849 2D ACACACACAC AT/-- GAGCATATTT 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 AT 1 0 269101 CASAVA_Build 7 33972008 5D AATCCATACT TTAGA/----- TGGGTAGTTT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 TTAGA 1 0 269102 CASAVA_Build 7 33979997 2D TGACATGGGG TT/-- CCTGTCTGGT 3070 hom 162 het 59 0 54 5 T 2 0 269103 CASAVA_Build 7 34074709 5I AGCTCACTGA -----/CAAAT CAAACTGGCT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 CAAAT 0 1 269104 CASAVA_Build 7 34077790 1D TGAGAGTGGC A/- AAAATGCATC 3070 het 3070 hom 48 16 22 11 A 5 4 269105 CASAVA_Build 7 34078574 1I AGAGAATCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 21 18 12 T 13 14 269106 CASAVA_Build 7 34081148 1I GTTTCTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 10 11 269107 CASAVA_Build 7 34101882 1I CCAGGCATGA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 8 9 269108 CASAVA_Build 7 34106032 1D TCACAGTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 137 het 53 0 46 7 T 10 9 269109 CASAVA_Build 7 34108284 1I CTTTTCTCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 200 hom 43 1 34 8 T 9 10 269110 CASAVA_Build 7 34119758 6D ACTTTGGGCT TAATAA/------ TAATAAGTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TAA 4 2 269111 CASAVA_Build 7 34123129 1D CCTGTCTCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 12 11 269112 CASAVA_Build 7 34126545 1I TTGTTTGTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 8 9 269113 CASAVA_Build 7 34130587 2D CATTGTAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 36 0 27 9 T 14 12 269114 CASAVA_Build 7 34130939 2D TTGAGACAGA CT/-- CTTCACACTG 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 CT 2 1 269115 CASAVA_Build 7 34146791 3D CAACAGTCTC AAT/--- GATTGGATTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAT 1 0 269116 CASAVA_Build 7 34147372 7I GTGTAAAGAC -------/AGTACTG TGTGTTTAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AGTACTG 0 1 269117 CASAVA_Build 7 34150742 1D AGAAATTTGC A/- ATTTTACAAT 3070 hom 123 het 47 0 40 7 A 2 1 269118 CASAVA_Build 7 34154668 1D GATACTCAGC A/- GATGTTTATT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 1 0 269119 CASAVA_Build 7 34155975 1D GGAAGATGAG C/- CTGTCAACAT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 C 2 1 269120 CASAVA_Build 7 34160877 1D TAACTTGGAA T/- TTTTTTTTTT 2495 het 2495 ref 38 22 8 8 T 17 16 269121 CASAVA_Build 7 34172091 1D GCTGACTGCC T/- TTTTTTTTTT 1419 het 1419 ref 33 25 5 3 T 11 10 269122 CASAVA_Build 7 34183030 1D AGAGGGGGGG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 39 het 32 1 22 9 A 9 8 269123 CASAVA_Build 7 34190518 1I CTTAGCATAG -/T GGCCAGCACA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 0 1 269124 CASAVA_Build 7 34193018 1I ACATCCCTGG -/T ATGTTAAATA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 0 1 269125 CASAVA_Build 7 34248779 1D TACTGGCAGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 118 hom 35 1 30 4 A 9 8 269126 CASAVA_Build 7 34264779 1I CAATCTCCAA -/C CCCCCCCCTT 3070 hom 87 het 39 0 28 11 C 8 9 269127 CASAVA_Build 7 34266085 1D TTCTTTTGAG A/- TGATCTAAGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 0 269128 CASAVA_Build 7 34286672 3I TTACATTAAC ---/ATT ATATTATATT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 ATT 0 1 269129 CASAVA_Build 7 34287319 4D27M1D GTGTTAAGCT TTTGTTTAATTCACTTTTTTAACAAAATAATA/----TTTAATTCACTTTTTTAACAAAATAAT- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 29 0 36 5 N/A 0 0 269130 CASAVA_Build 7 34414312 1I AACTGCTGGC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 A 8 9 269131 CASAVA_Build 7 34445495 1I ATCTCTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1036 hom 19 4 10 5 A 14 15 269132 CASAVA_Build 7 34453165 6I ATAAAAAAAA ------/AAAGTC AAGGAAAGAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AAAGTC 0 1 269133 CASAVA_Build 7 34460407 1D CAATATGTAA T/- TTTTTTATAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 6 269134 CASAVA_Build 7 34461264 2D CAAATAGTCA TT/-- CTTTTTCCTG 3070 hom 126 het 44 0 42 3 T 2 0 269135 CASAVA_Build 7 34462514 2D TTTTTGTAAC TT/-- TTTTATACAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 4 269136 CASAVA_Build 7 34466123 4I CGAAAATCAT ----/AACA AACAAACAGT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AACA 2 3 269137 CASAVA_Build 7 34479622 1D TTGTTATTTT C/- CCCCCGCATC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 6 5 269138 CASAVA_Build 7 34479969 2D TGATATATTT AA/-- AAAAGTACTT 3070 hom 93 het 37 0 31 7 A 6 4 269139 CASAVA_Build 7 34483266 1D TATGTACAGC A/- AAAAAATTGT 3070 hom 178 het 65 0 60 6 A 7 6 269140 CASAVA_Build 7 34488469 3D AGATGATGGA AAT/--- AATAGTAGAT 3070 hom 80 het 32 0 25 7 AAT 2 1 269141 CASAVA_Build 7 34498479 4D TGGGGTAGAG ATTT/---- ATTTATTACT 3070 het 3070 ref 28 11 11 8 ATTT 2 1 269142 CASAVA_Build 7 34504925 6D TCCAACCACA TTTAGT/------ TCAAAGACCT 3070 het 3070 ref 42 26 16 2 TTTAGT 1 0 269143 CASAVA_Build 7 34505020 9I GATATTAGCA ---------/AAAATTAGC AAAATTAGTA 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 AAAATTAGC 0 1 269144 CASAVA_Build 7 34532848 1I TATTTACATT -/C AATATTATTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 0 1 269145 CASAVA_Build 7 34533548 1D TATTTAAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 56 27 22 7 T 10 9 269146 CASAVA_Build 7 34536267 2D TTTTTTTTTT GA/-- GAGAGAGAAG 3070 het 3070 hom 31 12 11 9 GA 5 4 269147 CASAVA_Build 7 34536846 1D CTTTAAATGT A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 8 7 269148 CASAVA_Build 7 34538392 1I AAAGTCTATT -/A AAAAATTTCA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 A 5 6 269149 CASAVA_Build 7 34547699 1D TGCACATTGA T/- TTTTGTATCC 3070 het 3070 hom 33 16 12 5 T 5 4 269150 CASAVA_Build 7 34553697 3I GTAAAAGAAA ---/GAT GATGGCATTC 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 GAT 1 2 269151 CASAVA_Build 7 34555970 1I16M1I TTCCACTTTG -AAAAAATTATTAAAGG-/AAAAAAATTATTAAAGGT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 12 10 8 N/A 0 0 269152 CASAVA_Build 7 34564119 1D CACTAATCAG A/- ATGGCTATTA 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 A 2 1 269153 CASAVA_Build 7 34568645 3I AAGACTTCAA ---/GGT GGTAAGGGAT 2664 het 2664 ref 36 22 7 7 GGT 1 2 269154 CASAVA_Build 7 34571308 1I GCAGAATCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 9 10 269155 CASAVA_Build 7 34577857 8I TACATGTCTC --------/TCTCTCTG TCTATTTAAT 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 TCTCTCTG 0 1 269156 CASAVA_Build 7 34578732 1I TTAAGTTCTA -/G GGTACATGTG 2577 het 2577 ref 16 8 6 2 G 2 3 269157 CASAVA_Build 7 34580424 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 1964 het 1778 hom 12 5 5 2 T 10 11 269158 CASAVA_Build 7 34595810 1I TTCTTCTTAG -/T TTTTATGCTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 4 5 269159 CASAVA_Build 7 34612729 4I TGGATGTGGA ----/GGTT GGTTGGGACT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 GGTT 1 2 269160 CASAVA_Build 7 34623961 1I TGGCTACTAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 8 9 269161 CASAVA_Build 7 34629674 1I GAGAAGGTCA -/C ATGGGGCCAT 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 C 0 1 269162 CASAVA_Build 7 34637853 2D AATATCCTGC AG/-- AGTGTTTTCC 2908 het 2908 ref 17 11 6 0 AG 2 1 269163 CASAVA_Build 7 34650543 1I GAGAAGGAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 A 8 9 269164 CASAVA_Build 7 34657805 1D TTTTACACAG T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 T 8 7 269165 CASAVA_Build 7 34658503 4D GGCTGGGTGC GGTG/---- GGTGGCTCAC 2482 het 2482 ref 22 12 7 5 GGTG 2 1 269166 CASAVA_Build 7 34666352 1D CACTGGACAA G/- GAGAAAAGCA 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 G 2 1 269167 CASAVA_Build 7 34666674 1D CCAGATGTAT C/- CCCTTTAATC 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 C 4 3 269168 CASAVA_Build 7 34668540 8I TTCAACTCAA --------/CGCATGTC CGCATGTCCC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 CGCATGTC 1 2 269169 CASAVA_Build 7 34669232 1D GTGTGTGTGG C/- GGGGGGGAGT 2191 het 2191 ref 24 8 7 9 C 1 0 269170 CASAVA_Build 7 34670746 4I GTTTCTTTTC ----/TTTT TTTTTTTTAA 507 het 507 ref 30 14 6 10 T 8 12 269171 CASAVA_Build 7 34677326 3D TTAAAAGCAC AAT/--- AAATATAATA 3070 het 3070 hom 31 8 18 5 AAT 1 0 269172 CASAVA_Build 7 34678036 1D AAGTGGGCCC T/- CCAGGGGAAA 1409 het 1409 ref 17 9 4 4 T 1 0 269173 CASAVA_Build 7 34678670 1I GAGATTAACA -/T TTGTTAATAA 3070 het 3070 hom 55 18 31 6 T 2 3 269174 CASAVA_Build 7 34684283 1D GGACAAGTGC A/- AGAAATAAAC 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 2 1 269175 CASAVA_Build 7 34685268 2D AGAGAATAAC TG/-- TTTCAAATTA 3070 het 3070 ref 28 13 13 3 TG 1 0 269176 CASAVA_Build 7 34689269 1I TGTAGGACTC -/A ATGAAGATGC 2582 het 2582 ref 19 12 6 1 A 1 2 269177 CASAVA_Build 7 34690228 5I CCCACTTACC -----/ATTAT ATTATAGGTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 ATTAT 1 2 269178 CASAVA_Build 7 34690899 1D GAATTTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 13 10 A 13 12 269179 CASAVA_Build 7 34691637 1D CAGACTATAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 A 9 8 269180 CASAVA_Build 7 34692325 5I AAGTTGTATG -----/TTCTA TTCTAATTCA 3070 het 3070 ref 29 16 13 1 TTCTA 1 2 269181 CASAVA_Build 7 34697953 1I GGAAATCAAC -/A AAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 6 7 269182 CASAVA_Build 7 34699471 1D CTATAGAAAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 9 8 269183 CASAVA_Build 7 34702910 6I AAACAACACT ------/TAAAGA TATAGTGGCC 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 TAAAGA 0 1 269184 CASAVA_Build 7 34709547 1D AAATAAAGCA T/- TTTTTTTTTC 1687 het 1352 hom 12 5 4 4 T 10 9 269185 CASAVA_Build 7 34709966 4D CATCTTTAAG ACTT/---- ACTTGTCTGT 3070 het 3070 ref 40 25 10 7 ACTT 2 1 269186 CASAVA_Build 7 34710029 3D AACTCCCGAT GAG/--- TGTTCAACAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 GAG 1 0 269187 CASAVA_Build 7 34710492 1D TCTTTCACCC A/- AAAAAACTAA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 A 7 6 269188 CASAVA_Build 7 34712072 1I TTGGGTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 15 14 13 T 10 11 269189 CASAVA_Build 7 34712502 4D GGAACTCTAA CTGT/---- CTGTCTATAT 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 CTGT 2 1 269190 CASAVA_Build 7 34724848 2D GCTGAGCCTC TG/-- TGTTTGTGAG 3070 het 3070 ref 38 17 14 8 TG 2 1 269191 CASAVA_Build 7 34726415 1I AGATTCCGAG -/A AAAAAAAAAA 2623 het 1167 hom 25 8 12 5 A 13 14 269192 CASAVA_Build 7 34755013 2I CATTCATCTT --/CC CCCCCCAGTA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 C 6 8 269193 CASAVA_Build 7 34761114 8I TTTTATGGCT --------/AAATAATA AAATAATATT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 AAATAATA 1 2 269194 CASAVA_Build 7 34769654 1I AAAGAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 52 29 19 4 A 9 10 269195 CASAVA_Build 7 34791664 6I AACTTAAAGT ------/ATAATA ATAATAAAAA 3070 het 2882 hom 19 9 9 1 ATA 2 4 269196 CASAVA_Build 7 34809894 1D GCATGAGTAG A/- AAAAAAAAAA 1666 het 1666 ref 12 5 4 3 A 12 11 269197 CASAVA_Build 7 34811160 1I AAACTGATGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 8 9 269198 CASAVA_Build 7 34846615 8D CACAGCACAG AGGAGAGA/-------- GGCCATTCCC 3070 het 3070 hom 41 17 22 5 AGGAGAGA 1 0 269199 CASAVA_Build 7 34853539 2D AGAGGAAAAT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 48 17 14 18 GA 9 8 269200 CASAVA_Build 7 34857323 1D AGCTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 10 9 T 15 14 269201 CASAVA_Build 7 34860105 1I CTCTGCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 12 13 269202 CASAVA_Build 7 34866218 1I TTTAAATGCA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 T 7 8 269203 CASAVA_Build 7 34872887 1I ACTCTAGGGA -/G AAAGGAGAGT 1209 het 1209 ref 33 29 3 1 G 0 1 269204 CASAVA_Build 7 34881119 5I ACTTCCTCTA -----/GCACT TCACTTATCT 1869 het 1869 ref 37 31 4 2 GCACT 0 1 269205 CASAVA_Build 7 34885732 1I GTGTGAGTGC -/T TTCACACTGG 1846 het 1846 ref 45 24 6 15 T 2 3 269206 CASAVA_Build 7 34893617 1D CGGGCAGATT A/- ACCTGAGGCC 3070 het 3070 hom 32 10 17 7 A 2 1 269207 CASAVA_Build 7 34894082 3I GGCAAAAGAA ---/GAC GAGCTTTCTG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 GAC 0 1 269208 CASAVA_Build 7 34895553 5I TTGAGACAGA -----/GTCTC GTCTCGCTCT 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 GTCTC 1 2 269209 CASAVA_Build 7 34895901 14D AGAGTTATAC AGATATATATATAT/-------------- ATATATATAT 2452 hom 24 het 11 0 8 7 AGATATATATATAT 1 0 269210 CASAVA_Build 7 34899728 1I GCCAATGGAT -/C ATTTTTGGGT 3070 het 3070 ref 31 19 7 5 C 0 1 269211 CASAVA_Build 7 34903909 2D TGAAGGAGAA AG/-- GGGATGTCAC 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 AG 1 0 269212 CASAVA_Build 7 34905563 4I TTTGTGTTTG ----/CTTC CTTCCTTTCT 3070 het 3070 ref 56 27 25 4 CTTC 1 2 269213 CASAVA_Build 7 34909870 1D GATTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 2337 het 727 hom 33 5 11 17 T 17 16 269214 CASAVA_Build 7 34926358 2D TCTCTCCCCA TT/-- TGAAACGAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 3 T 3 1 269215 CASAVA_Build 7 34927642 1I GTTTTTATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 9 10 269216 CASAVA_Build 7 34933534 1D TCTCTTTGCC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 9 8 269217 CASAVA_Build 7 34950503 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1493 het 121 hom 13 1 6 6 A 19 18 269218 CASAVA_Build 7 34954308 1D TTAGTAGCAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 8 7 269219 CASAVA_Build 7 34958189 3I TGGTTAACAT ---/TGA TGAATTACTA 2270 hom 24 het 17 0 9 8 TGA 1 2 269220 CASAVA_Build 7 34958263 1I AAAAAAAAGA -/C CCACAAAAAA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 C 2 3 269221 CASAVA_Build 7 34959862 4D TGAATGAATG AATA/---- AATACATTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AATA 2 1 269222 CASAVA_Build 7 34962105 2I TTCAAAGTGA --/TT AATTATAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 0 2 269223 CASAVA_Build 7 34969746 4D AAGCAAAATC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 90 het 35 0 27 9 GT 8 6 269224 CASAVA_Build 7 34983088 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 10 9 269225 CASAVA_Build 7 34989813 1D GAATAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 25 0 20 5 A 11 10 269226 CASAVA_Build 7 34995782 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 782 hom 37 3 21 13 A 12 13 269227 CASAVA_Build 7 34999578 1D TAATTCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 11 10 269228 CASAVA_Build 7 35000941 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1826 het 1826 ref 20 9 5 6 A 15 16 269229 CASAVA_Build 7 35008786 4D CCATAGAGAC AAAG/---- AAGATATTCT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AAAG 1 0 269230 CASAVA_Build 7 35011948 1D ATTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 133 hom 26 1 18 8 A 13 12 269231 CASAVA_Build 7 35018880 3D3M1I AAAAATACAT AGACAT-/---CATA CATACACAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 1 N/A 0 0 269232 CASAVA_Build 7 35019041 6D41M2I AAAAATGCAT TATGTATATATGTATGTGTGTTATATATACATATATAGAGAACACTG--/------TATATGTATGTGTGTTATATATACATATATAGAGAACACTGAT ATATATATAT 3070 hom 60 het 20 0 21 7 N/A 0 0 269233 CASAVA_Build 7 35020010 2D GTGAAAAAAC TA/-- TGTATTTTCA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 TA 1 0 269234 CASAVA_Build 7 35020536 1I TATGTGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 20 0 17 3 A 10 11 269235 CASAVA_Build 7 35022205 1D TTTTCTCTTT A/- AAAAAATTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 6 269236 CASAVA_Build 7 35024247 1D AGTATCTATA T/- TTTTTTCACT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 7 6 269237 CASAVA_Build 7 35028231 1D TCTTGCCTAC A/- AAAAAATAAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 7 6 269238 CASAVA_Build 7 35028928 1I CACACACACA -/T CATCATCCTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 0 1 269239 CASAVA_Build 7 35037655 2D AATATACCTA AC/-- ACACTCATTA 3070 hom 87 het 31 0 30 3 AC 3 2 269240 CASAVA_Build 7 35042045 1D CTACTGAGAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 7 hom 31 1 17 13 A 9 8 269241 CASAVA_Build 7 35045506 5I ATAATACAAA -----/TAACT TGATGGATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 7 TAACT 0 1 269242 CASAVA_Build 7 35049730 5D CAGACTTCTG TTAAC/----- TTGAGTGTGA 3070 hom 81 het 30 0 25 7 TTAAC 1 0 269243 CASAVA_Build 7 35060232 1I TTAGCCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 9 10 269244 CASAVA_Build 7 35131161 3D GAGGCTTCTG TGT/--- TGTTGTTGTT 1612 het 1612 ref 41 27 5 9 TGT 4 3 269245 CASAVA_Build 7 35135349 2D ATTATTTCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AC 6 5 269246 CASAVA_Build 7 35140432 1D20M4I ATGAAAACAC AAAAAAAACTCAACAGATCTA----/-AAAAAAACTCAACAGATCTATAAC TAATAAGGAG 1249 het 1249 ref 28 34 3 3 N/A 0 0 269247 CASAVA_Build 7 35175282 1D AATCGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 11 10 269248 CASAVA_Build 7 35181356 1D AACATTTAGG T/- TTTTTTTTTT 1544 het 1544 ref 37 25 4 8 T 11 10 269249 CASAVA_Build 7 35183286 1I TCACAGCAGG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 8 9 269250 CASAVA_Build 7 35185294 1D ATAAAGTCCC T/- TTTTAAAAAA 3070 het 1659 hom 21 4 15 2 T 5 4 269251 CASAVA_Build 7 35187227 2D ATCTCCTAAC TG/-- TAGCCAAAGA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TG 1 0 269252 CASAVA_Build 7 35188137 2D GAGGACTCTA TC/-- TCAAAAAAAC 3070 hom 60 het 25 0 21 6 TC 2 1 269253 CASAVA_Build 7 35192724 1D GCTTGCAGCA C/- CCCCCAGTGC 1514 hom 24 het 11 0 6 5 C 6 5 269254 CASAVA_Build 7 35196597 2D ATTTCAAAAC TT/-- AGTTACTTAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 2 0 269255 CASAVA_Build 7 35197906 1I AAGACATGCC -/T TATAAAGGCG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 1 2 269256 CASAVA_Build 7 35201430 1I TTTAAGTTAA -/T TTTTGCAAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 4 5 269257 CASAVA_Build 7 35204468 43I TCTGTACATT -------------------------------------------/CTAAAATAACATAAAAACGTGTATAAAACCCATCATCCAGCCA GGCACAGCTC 2432 hom 15 het 8 0 6 2 CTAAAATAACATAAAAACGTGTATAAAACCCATCATCCAGCCA 0 1 269258 CASAVA_Build 7 35208046 1D CTTCCCCAGC A/- GACTAACATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 0 269259 CASAVA_Build 7 35227299 4D AAAAAATGAT AAGA/---- AAGACCAATG 2923 het 2923 ref 26 15 6 8 AAGA 2 1 269260 CASAVA_Build 7 35229257 1I GATGAGTTAA -/T TGTTTGGATG 3070 hom 39 het 19 0 13 6 T 1 2 269261 CASAVA_Build 7 35230809 1D AACTCTGTTT C/- CAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 10 0 7 3 C 2 1 269262 CASAVA_Build 7 35234233 1D ATACTATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 15 1 12 2 A 11 10 269263 CASAVA_Build 7 35241441 2D AAAAAAAAAA AC/-- AACACTGAGA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AC 1 0 269264 CASAVA_Build 7 35243076 1I GAAATAAACC -/T TTGCCAAAGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 3 269265 CASAVA_Build 7 35243178 3I TGTCAGTGGT ---/CAC CACTTCCTTG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 CAC 1 2 269266 CASAVA_Build 7 35243747 1I AATTTGGGGG -/A AAAGCAAATT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 3 4 269267 CASAVA_Build 7 35244004 1D ACATTTGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 10 9 269268 CASAVA_Build 7 35245013 4I TCTATCTCAT ----/TAAC TAATACACCA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TAAC 0 1 269269 CASAVA_Build 7 35246871 1I ACACACTCTT -/A AGAGTTCCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 2 269270 CASAVA_Build 7 35247631 1D AGACAGACTT G/- GGTAAAAATT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 G 3 2 269271 CASAVA_Build 7 35248218 2D AGCAATGGCA CT/-- CTCTGCTGGT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 CT 3 2 269272 CASAVA_Build 7 35249835 1I GAAGCATGTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 394 hom 27 1 22 4 A 8 9 269273 CASAVA_Build 7 35250560 2D GAAACTCTCC AA/-- AAAAAAATGG 3070 hom 108 het 43 0 37 8 A 9 7 269274 CASAVA_Build 7 35256415 1I52M1I CAGCATAACC -AAATGGTCACTTGGATTTGACTCAGGAAAAGTTAAGCTCAGAAACTCCAGGC-/AAAATGGTCACTTGGATTTGACTCAGGAAAAGTTAAGCTCAGAAACTCCAGGCA AGGCTGTAGG 3070 hom 199 het 49 0 67 7 N/A 0 0 269275 CASAVA_Build 7 35256768 1I CAACGGAGAC -/A AAGGGAGTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 2 3 269276 CASAVA_Build 7 35258517 1D AGAGGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 751 hom 38 3 21 14 T 15 14 269277 CASAVA_Build 7 35258693 1I ATGTTAAGTG -/T TGGGAAGGAC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 1 2 269278 CASAVA_Build 7 35259259 3I TTAGCGTCTC ---/CTT CGTTTCAAAC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CTT 0 1 269279 CASAVA_Build 7 35266175 1I CATTACATTT -/C CCCTCAATAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 3 4 269280 CASAVA_Build 7 35280737 1D CATAATAACC A/- AAAGCAGCAT 3070 hom 27 het 13 0 9 4 A 4 3 269281 CASAVA_Build 7 35281108 1I14M1I5M1I8M1I CTAAGACCTC -AAAGCATAGGCAAC-ACAAC-AAATAGAC-/AAAAGCATAGGCAACAACAACAAAATAGACA ATTGAAACTA 3070 hom 123 het 34 0 41 5 N/A 0 0 269282 CASAVA_Build 7 35294438 1I AAACAAAACC -/A AAAGTTTGCT 2322 hom 18 het 10 0 7 3 A 3 4 269283 CASAVA_Build 7 35294499 1I8M1I3M1I AAAACTGATC -AGAAAAAC-AGC-/AAGAAAAACAAGCA AGGTTGCTCT 3070 hom 36 het 14 0 13 7 N/A 0 0 269284 CASAVA_Build 7 35295814 1D TGGGAGAGAG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 8 7 269285 CASAVA_Build 7 35308913 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 56 hom 39 1 31 7 T 10 9 269286 CASAVA_Build 7 35316696 1I AGCAGGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 20 0 16 4 T 10 11 269287 CASAVA_Build 7 35320465 1I TCCCAAATAC -/A ATACAATTTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 2 269288 CASAVA_Build 7 35321485 1I TGGTGGTGAC -/A ATGATGGTAA 3070 hom 177 het 69 0 54 15 A 1 2 269289 CASAVA_Build 7 35324015 1I TGGAAATGTA -/C CCCCCTAAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 5 6 269290 CASAVA_Build 7 35329360 1D ATTTTAAGCA T/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 6 5 269291 CASAVA_Build 7 35330372 1I AACATACAAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 8 9 269292 CASAVA_Build 7 35331547 1D CTGTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 15 14 269293 CASAVA_Build 7 35336593 1D CTATTTATCA G/- AAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 50 25 24 2 G 1 0 269294 CASAVA_Build 7 35338660 5D TGACTATTGC GAATA/----- GAATATTCTG 3070 hom 57 het 23 0 19 7 GAATA 2 1 269295 CASAVA_Build 7 35359218 2D TTATAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 8 A 12 10 269296 CASAVA_Build 7 35359787 3D TCTGTCTCTG CTC/--- CTGCGTGGGC 3070 hom 129 het 47 0 43 4 CTC 1 0 269297 CASAVA_Build 7 35363685 1I ATTAATAGAT -/A AAAGTCTCCT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 3 4 269298 CASAVA_Build 7 35363932 1I ATGGTTTAAC -/A AAAAATTCAT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 5 6 269299 CASAVA_Build 7 35365919 1I AAGCAAGTTT -/A TTGAATTTGT 3070 hom 70 het 37 0 22 15 A 0 1 269300 CASAVA_Build 7 35370133 1D AAATTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2381 hom 36 9 18 9 A 11 10 269301 CASAVA_Build 7 35370689 1D CAGCATAAAT G/- GGGGTGGCTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 G 5 4 269302 CASAVA_Build 7 35379680 1D GTGCTATAAC A/- AAAATACCAG 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 5 4 269303 CASAVA_Build 7 35382494 1I ATTTAGTTAG -/A GCTAGGGGCT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 0 1 269304 CASAVA_Build 7 35403458 1I GCACTGCCCC -/T CACCATCCTC 3070 het 3070 hom 45 22 18 5 T 0 1 269305 CASAVA_Build 7 35406513 2D GATGAAAATA TT/-- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 5 3 269306 CASAVA_Build 7 35415142 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1148 hom 21 5 14 2 A 13 14 269307 CASAVA_Build 7 35416345 1D CAACCTCACA G/- GGTTGCTTTA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 G 3 2 269308 CASAVA_Build 7 35417621 12D GTGGAGATCA TTGAATTCTTAC/------------ TCGAGGCTGA 3070 hom 78 het 29 0 26 8 TTGAATTCTTAC 1 0 269309 CASAVA_Build 7 35418324 1D AACTGTAGAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 108 het 38 0 36 3 A 9 8 269310 CASAVA_Build 7 35424480 1D TTTGGTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 11 10 269311 CASAVA_Build 7 35424663 4I TACAAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 AAAC 3 4 269312 CASAVA_Build 7 35428156 1I TAACCCCCCA -/C CCCCCCAAGT 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 C 6 7 269313 CASAVA_Build 7 35433184 1I TGAAAAATAA -/C CTACCCATAA 3070 het 3070 hom 53 20 27 6 C 1 2 269314 CASAVA_Build 7 35453566 1D CATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 19 2 11 6 T 15 14 269315 CASAVA_Build 7 35463581 1I ATTCCGCCCC -/T GACCTCTCCC 3070 het 288 hom 24 2 17 5 T 0 1 269316 CASAVA_Build 7 35464424 1D AGAAGCTGGG A/- ACACAGGGCA 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 A 2 1 269317 CASAVA_Build 7 35473144 4I CTCATCCATG ----/GGCT GGCTCCTGCC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 GGCT 1 2 269318 CASAVA_Build 7 35475021 4I CATTCTGAGG ----/CTGT CTGTCAAGTC 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 CTGT 1 2 269319 CASAVA_Build 7 35475355 1I CTGGCAGAGA -/G AAGGCATCAA 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 G 0 1 269320 CASAVA_Build 7 35477679 1I CCCTACCCCA -/C CCCCCCGACA 2721 het 1478 hom 20 5 7 8 C 6 7 269321 CASAVA_Build 7 35479510 1I CCTGATCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 9 10 269322 CASAVA_Build 7 35479587 1D CCCCAGCATT G/- GTGCAGTCTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 2 1 269323 CASAVA_Build 7 35480791 3D TCTAAAATAT ATA/--- ATAACTGAAT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 ATA 2 1 269324 CASAVA_Build 7 35500787 2I ACCTAGAAAC --/TG TGGGAGCATG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 TG 1 2 269325 CASAVA_Build 7 35506013 3I CCACAGCTTT ---/ACA ACCTTTTGAT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 ACA 0 1 269326 CASAVA_Build 7 35517302 1I CAGGCGCGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 1 2 269327 CASAVA_Build 7 35522521 1D TTTCTATTGC T/- TTTTTTTTTT 1070 het 1070 ref 33 20 3 11 T 12 11 269328 CASAVA_Build 7 35530667 1I CATAAAAGAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 A 8 9 269329 CASAVA_Build 7 35535010 4D GTGGGGGAGG AAGA/---- AAGAAACCAT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AAGA 2 1 269330 CASAVA_Build 7 35539974 1I AGCATAGTAT -/C CAATGGGTTG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 C 1 2 269331 CASAVA_Build 7 35540111 1I AAATTGTAAT -/C CCCACGTGTC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 C 3 4 269332 CASAVA_Build 7 35546956 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAGAAAA 2957 het 2957 ref 24 9 10 5 A 5 6 269333 CASAVA_Build 7 35549508 3I ACCATCTCTC ---/CTT CTAGGCAGCA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 CTT 0 1 269334 CASAVA_Build 7 35550202 1I TCTTCTTAAC -/A AGGTCTGGTA 3070 het 3070 hom 39 10 23 6 A 1 2 269335 CASAVA_Build 7 35552962 1D ATCTGCCCAC T/- GTTAAAGCCC 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 1 0 269336 CASAVA_Build 7 35557337 5I TTGCTGTTTG -----/TTTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 11 16 269337 CASAVA_Build 7 35558003 1D TCCCATGCAA G/- GGGGGGACAC 3070 hom 90 het 36 0 28 8 G 7 6 269338 CASAVA_Build 7 35574042 1D TGAAAATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 47 1 42 4 A 11 10 269339 CASAVA_Build 7 35576076 3D GAAGCCAGTT CTC/--- CTTTTGGCAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 6 CTC 1 0 269340 CASAVA_Build 7 35577423 9I3M2I CATTGAAAAG ---------CAC--/TGTGCTTTTCACGT AACGTCTGTG 3070 het 3070 hom 48 22 25 4 N/A 0 0 269341 CASAVA_Build 7 35581756 1D TCTGGAAATT A/- AAATGTCATG 3070 het 3070 hom 50 20 23 9 A 4 3 269342 CASAVA_Build 7 35589648 1I TAACTCTTTA -/T TGCTAAATCT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 1 2 269343 CASAVA_Build 7 35590974 2D AAAAGAAAAC AG/-- AGAATAAGTT 2553 het 2553 ref 19 9 6 4 AG 2 1 269344 CASAVA_Build 7 35591671 1I GCAGGACTGG -/C GGGACACCTT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 C 0 1 269345 CASAVA_Build 7 35595360 4D CCCAACAACT TCTC/---- TCTCTTTCTC 1727 het 1727 ref 28 16 8 6 TC 4 2 269346 CASAVA_Build 7 35602066 1D TTTTCATAGC T/- TTTTTTTTTT 2190 het 2190 ref 24 11 6 7 T 11 10 269347 CASAVA_Build 7 35603119 1I TCAGCAATAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 8 9 269348 CASAVA_Build 7 35604358 1I TCTTAAGTAC -/A AACTACCTCT 3070 hom 68 het 29 0 24 5 A 2 3 269349 CASAVA_Build 7 35607173 1I ATAAAAGTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 9 10 269350 CASAVA_Build 7 35611116 1D CTGAGAGGAG C/- CCCCCCAGTG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 C 7 6 269351 CASAVA_Build 7 35621924 1D CAAATGTGTT C/- AATTGTTCCA 3070 het 3070 hom 38 16 16 7 C 1 0 269352 CASAVA_Build 7 35625074 8D CACACACACG CACACACA/-------- CACACACACA 3070 het 522 hom 35 6 23 8 CA 11 7 269353 CASAVA_Build 7 35631550 4D CAATAATGTC GTAA/---- GTGTGAGCTA 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 GTAA 1 0 269354 CASAVA_Build 7 35635960 3I CTCTCACTGT ---/AGA AGGTCTAGTC 3070 hom 135 het 51 0 44 7 AGA 0 1 269355 CASAVA_Build 7 35637179 1I CAGTGAATGA -/T TCTGTGCACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 1 2 269356 CASAVA_Build 7 35653120 1D GAAAAAAAAA C/- CAAGAAGGAG 3070 het 3070 hom 46 14 25 7 C 2 1 269357 CASAVA_Build 7 35657948 1D TAAACAATAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 9 8 269358 CASAVA_Build 7 35659658 2D TCATCTAGAG AA/-- ACACTGGATT 3070 het 3070 ref 41 21 12 11 A 3 1 269359 CASAVA_Build 7 35674205 9D GAGAAACAGG CTAGAAATC/--------- CTAGAAATCA 3070 het 3070 hom 38 18 19 6 CTAGAAATC 2 1 269360 CASAVA_Build 7 35684375 1D TCACATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 A 13 12 269361 CASAVA_Build 7 35688961 1I CAACAGCTGC -/A AAAAAAAAAA 2517 het 2517 ref 32 15 9 8 A 15 16 269362 CASAVA_Build 7 35692442 1I TCCTGCGTCA -/G CGTCCCAAGT 2540 hom 15 het 7 0 6 1 G 0 1 269363 CASAVA_Build 7 35696945 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 12 11 269364 CASAVA_Build 7 35697527 1D GGACAATCTC A/- AATTTCCATT 3070 het 3070 hom 56 22 26 8 A 3 2 269365 CASAVA_Build 7 35698445 1D TCTCAGGTAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 91 het 37 0 31 7 T 8 7 269366 CASAVA_Build 7 35701117 1I GCTGACCGAA -/G GGCGCGGCCC 1622 hom 21 het 8 0 8 0 G 2 3 269367 CASAVA_Build 7 35705958 4D AAAAAAAAAA ATTG/---- ATTCATTCAG 3070 het 3070 hom 33 11 15 9 ATTG 1 0 269368 CASAVA_Build 7 35711321 1I CTTCATCTAC -/T TTTTTTTTTT 2929 het 1116 hom 21 4 10 7 T 13 14 269369 CASAVA_Build 7 35714265 2I TCCCACCATT --/TA TATATATATA 3070 het 2974 hom 23 8 10 5 TA 5 6 269370 CASAVA_Build 7 35715190 1I TATTTTGATT -/A AAAAAAAAAA 2675 het 2675 ref 26 17 8 1 A 10 11 269371 CASAVA_Build 7 35720189 1D AGCTATAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 30 2 18 10 T 13 12 269372 CASAVA_Build 7 35721000 1I AGTGCCAGCA -/G GTGAGCTGAG 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 G 1 2 269373 CASAVA_Build 7 35721537 2I AATTTTGGTC --/AA TGGATATGTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 0 2 269374 CASAVA_Build 7 35730478 1D AAGAATCGTG T/- TTTTTTTTTA 980 het 980 ref 37 28 3 6 T 10 9 269375 CASAVA_Build 7 35731809 1D TCTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 2445 het 2236 hom 15 5 7 3 T 10 9 269376 CASAVA_Build 7 35738173 1D GAATACACTT A/- AGGAGGGTAA 3070 hom 165 het 63 0 55 8 A 2 1 269377 CASAVA_Build 7 35743593 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAACAAA 3022 het 2220 hom 14 6 7 1 A 7 6 269378 CASAVA_Build 7 35759820 1I GAAACAATCT -/A AAAATCTTAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 A 4 5 269379 CASAVA_Build 7 35775472 1I TTCTGTATAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 7 8 269380 CASAVA_Build 7 35807424 1I CAGCTTCGGG -/C TGCCGCGACT 1798 hom 36 het 15 0 9 6 C 0 1 269381 CASAVA_Build 7 35820623 1I ATTGTAAGGG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 7 8 269382 CASAVA_Build 7 35827202 1I GATTGTTCTG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 8 269383 CASAVA_Build 7 35833457 1I ATAAATAATG -/T TTCCTTATCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 3 269384 CASAVA_Build 7 35850743 1D TTACCTAGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 10 9 269385 CASAVA_Build 7 35853668 4D TTGCCTTTGA TTAT/---- TTATTTGAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 TTAT 2 1 269386 CASAVA_Build 7 35870800 3I TTAAAAGTGG ---/CTA CTAAGAAAAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 CTA 1 2 269387 CASAVA_Build 7 35885626 1D AAAATTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 A 13 12 269388 CASAVA_Build 7 35892569 1I GACCAGGACT -/G GTAAAGAGGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 1 2 269389 CASAVA_Build 7 35898899 1I ATCCCAGGTG -/A AAAACATAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 4 5 269390 CASAVA_Build 7 35899370 2I ATGTGACTCT --/CC ATAGCAACGT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 0 2 269391 CASAVA_Build 7 35904119 1I ATTTTGGGAA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 7 8 269392 CASAVA_Build 7 35908976 1D AGTTTGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 19 1 13 5 T 13 12 269393 CASAVA_Build 7 35910941 1D ATACACATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 24 1 16 7 A 12 11 269394 CASAVA_Build 7 35911658 1D TCTGAGAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 10 9 269395 CASAVA_Build 7 35917581 1D ACCTGGCCAG A/- AAAAAATGAA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 A 7 6 269396 CASAVA_Build 7 35933224 1D TCTGAAAACC A/- AACTCCTGGA 1955 het 1955 ref 35 24 6 5 A 3 2 269397 CASAVA_Build 7 35934671 1D TAAACCTTCA C/- CTAGAGTATA 3070 het 3070 ref 37 24 9 4 C 2 1 269398 CASAVA_Build 7 35935562 1D CTTTTGTTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 10 9 269399 CASAVA_Build 7 35968878 1D TTTAATAAAA G/- GTTTTACTTG 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 G 2 1 269400 CASAVA_Build 7 35980353 1D CACCTAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2889 hom 22 8 10 4 T 11 10 269401 CASAVA_Build 7 36018549 1D AGTAGAGACA G/- GGTTTCACTG 3070 hom 61 het 22 0 21 1 G 3 2 269402 CASAVA_Build 7 36035415 4D AAGACGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 29 0 17 13 A 16 12 269403 CASAVA_Build 7 36037586 18I GTTGAGACCA ------------------/GCAAGAGTGCATCGCATG GCTAAAGCAC 3070 hom 128 het 44 0 42 7 GCAAGAGTGCATCGCATG 0 1 269404 CASAVA_Build 7 36039726 9D CATTGCACAT AGTGGGGAG/--------- AGTAATACAC 3070 het 3070 ref 39 25 10 12 AGTGGGGAG 1 0 269405 CASAVA_Build 7 36040556 1D CGGGAGCCCA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 148 hom 36 3 18 15 C 11 10 269406 CASAVA_Build 7 36044041 1I32M1I CAGCCTGGCC -ATATGGTGAAACTTCATCTCTACTAAAAATAC-/AATATGGTGAAACTTCATCTCTACTAAAAATACA AAAATTAGCT 3070 het 139 hom 15 1 15 0 N/A 0 0 269407 CASAVA_Build 7 36053023 9D AACGATGAAT TTTATTATG/--------- TAATTATTAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 5 TTTATTATG 1 0 269408 CASAVA_Build 7 36054662 1I GGGGGTGGTG -/T TGGGGGAGGG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 1 2 269409 CASAVA_Build 7 36056165 1D ACAAAGGGCA T/- TGTGGAAAGG 3070 het 3070 ref 41 23 9 9 T 2 1 269410 CASAVA_Build 7 36065078 1D GCAACCTTAA T/- TTTTTTTTTT 2663 het 2322 hom 25 11 6 8 T 17 16 269411 CASAVA_Build 7 36066528 1D ATAAGACCTA C/- TATTGGCCGG 2761 het 1475 hom 14 4 7 3 C 1 0 269412 CASAVA_Build 7 36068436 1I TCCTTCCAGC -/A AAGCTGGCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 3 269413 CASAVA_Build 7 36070689 1I GAGGGTTCCT -/C CCCTTTTTAG 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 C 3 4 269414 CASAVA_Build 7 36071394 2D GGGTTCTTGG TC/-- TGGCTGACTT 3070 het 3070 hom 48 20 20 8 TC 1 0 269415 CASAVA_Build 7 36072847 4I GCTAACAAAC ----/ACTT ACAGCCTGAC 2995 het 2995 ref 30 17 7 6 ACTT 0 1 269416 CASAVA_Build 7 36073766 1I15M1I CTTGATTCTC -TTTGCAAGTGCTATC-/TTTTGCAAGTGCTATCT TTGTGTTCCT 3070 het 105 hom 41 1 34 15 N/A 0 0 269417 CASAVA_Build 7 36086679 1I ATATCTTTTT -/G GGGGGGCACC 3070 het 3070 hom 41 10 24 7 G 6 7 269418 CASAVA_Build 7 36089068 1I GGCGAAACAT -/A ATGGCACCGA 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 A 1 2 269419 CASAVA_Build 7 36090757 1I CTGAGAGCAG -/T TAAGTGGCTG 3070 het 3070 hom 35 10 12 13 T 1 2 269420 CASAVA_Build 7 36092408 4I GTTTATTTAC ----/TTAT TTGTTTATGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TTAT 0 1 269421 CASAVA_Build 7 36097435 3D ACATTCTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 33 0 22 11 T 17 14 269422 CASAVA_Build 7 36100624 1D GAGGTTTGAA C/- GATGTGGCCT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 C 1 0 269423 CASAVA_Build 7 36105219 1D TTCCCTCCAC T/- AGAGAAGCTG 3070 hom 92 het 33 0 29 4 T 1 0 269424 CASAVA_Build 7 36112912 2D TACATGTGCG CA/-- CACACACACA 3070 hom 96 het 40 0 31 11 CA 8 7 269425 CASAVA_Build 7 36115925 1D CTGTGTTGTT C/- CTTCGACTAT 3070 hom 85 het 33 0 27 6 C 2 1 269426 CASAVA_Build 7 36117295 1D CTGTCTCTGC A/- AAAAAAAAAA 2121 het 1899 hom 14 6 5 3 A 11 10 269427 CASAVA_Build 7 36140523 2D TGAGGGAATC AT/-- ATGTTTTCCT 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 AT 2 1 269428 CASAVA_Build 7 36142042 1D GCAGCCTCCC G/- GGGTAGCCCG 1687 het 1687 ref 21 10 6 5 G 4 3 269429 CASAVA_Build 7 36150219 1I ATTTAAGGTG -/T TTGGGAAATG 3070 hom 137 het 53 0 45 8 T 2 3 269430 CASAVA_Build 7 36155789 2I CGGGAATAGA --/AG AGTCAGGAGT 3070 het 3070 ref 50 37 10 3 AG 1 2 269431 CASAVA_Build 7 36156658 1I TTTTTGAAGA -/T TTTTTCCAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 5 6 269432 CASAVA_Build 7 36163114 1I AATATTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 21 21 9 A 10 11 269433 CASAVA_Build 7 36164458 20D CCCTCATCAG GCGCACTTGCTAAATTGTGA/-------------------- GCCAGTCACA 3070 het 3070 ref 35 14 10 20 GCGCACTTGCTAAATTGTGA 1 0 269434 CASAVA_Build 7 36164493 5D TCACAGTGTC TTAAA/----- TTAAATCCAT 3070 het 1279 hom 30 3 22 7 TTAAA 2 1 269435 CASAVA_Build 7 36166811 4I GGGAGGTGGT ----/GGTG GGGGGGCGGG 2547 het 2443 hom 16 8 6 2 GGTG 0 1 269436 CASAVA_Build 7 36167590 4I GTCAGGTGGA ----/TGGG TGGGTGGTTG 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 TGGG 1 2 269437 CASAVA_Build 7 36168032 1D TGTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2525 het 121 hom 29 2 7 20 A 19 18 269438 CASAVA_Build 7 36169235 1D TTCAGTCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 35 2 32 2 T 10 9 269439 CASAVA_Build 7 36171188 5D AGAAAAAACT TTTAA/----- TTTAGTGTAG 3070 hom 75 het 27 0 26 3 TTTAA 1 0 269440 CASAVA_Build 7 36176701 3D TAAAAGTGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 35 2 20 15 T 16 13 269441 CASAVA_Build 7 36177229 1I CTAATTATTA -/T TTTTTTTATG 3070 het 2871 hom 24 11 10 3 T 7 8 269442 CASAVA_Build 7 36178943 1D AACCAAACCC A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 36 het 19 0 11 8 A 8 7 269443 CASAVA_Build 7 36183373 1D TTACTTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 36 1 31 4 T 12 11 269444 CASAVA_Build 7 36191725 3I GGCAGACGTG ---/ATT TACCAGTGAT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 ATT 0 1 269445 CASAVA_Build 7 36193193 2D CTTGGTTTGC AT/-- TGGCCGTGGC 3070 hom 81 het 31 0 28 5 AT 1 0 269446 CASAVA_Build 7 36195334 2D GGGAGGGTAC TA/-- TCCAGCGCCT 3070 hom 69 het 25 0 22 4 TA 1 0 269447 CASAVA_Build 7 36196462 3D GCTATGATTG CAC/--- CACTGCACTC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 CAC 2 1 269448 CASAVA_Build 7 36206235 2D TACCCAATAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 26 1 13 12 T 12 10 269449 CASAVA_Build 7 36215770 14D GAGTCATGTG GGCTGCACATGTTT/-------------- GGCTGCACAT 3070 hom 90 het 35 0 31 12 GGCTGCACATGTTT 2 1 269450 CASAVA_Build 7 36220803 1I TAGGAACATT -/C CCCGGGTGAT 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 C 3 4 269451 CASAVA_Build 7 36224534 1I GGAAAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 10 11 269452 CASAVA_Build 7 36235854 4D TCTTGCAGCA CTCT/---- CCCCCTATGG 3070 hom 65 het 26 0 19 8 CT 2 0 269453 CASAVA_Build 7 36236091 14D ACTTGCTGAG GTACAGCCAGTTAC/-------------- CTCCTCAAAC 3070 het 3070 hom 32 12 17 6 GTACAGCCAGTTAC 1 0 269454 CASAVA_Build 7 36249443 1D TTAAGCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 884 hom 34 8 9 17 T 13 12 269455 CASAVA_Build 7 36253257 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 19 0 9 10 A 17 16 269456 CASAVA_Build 7 36258762 2D AGGGAAAATG CA/-- CACGTGTATT 3070 het 3070 ref 52 23 22 7 CA 2 1 269457 CASAVA_Build 7 36271047 2D GCCCACACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 13 11 269458 CASAVA_Build 7 36278331 1D ATTTAAAGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 55 het 25 0 19 6 A 10 9 269459 CASAVA_Build 7 36283995 1D AGAGGTTATT A/- AAGGACAGGG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 3 2 269460 CASAVA_Build 7 36285228 1D CACCCCGACT C/- CCCCGCATCC 3070 hom 50 het 19 0 17 2 C 5 4 269461 CASAVA_Build 7 36286863 1I TGTATCCATC -/T TTGTTACCTT 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 T 2 3 269462 CASAVA_Build 7 36299123 1I ACCTAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 34 1 30 3 A 10 11 269463 CASAVA_Build 7 36301311 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAGAAAA 3070 het 876 hom 22 3 14 5 A 5 6 269464 CASAVA_Build 7 36302671 2D GGTTTCAGTA TG/-- TGTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 TG 3 2 269465 CASAVA_Build 7 36308045 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 9 8 269466 CASAVA_Build 7 36311283 1D AAAATTAGGA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 9 8 269467 CASAVA_Build 7 36314160 4I TGGGCCAGGG ----/AGAC AGACAGACAG 3070 hom 88 het 41 0 27 14 AGAC 3 4 269468 CASAVA_Build 7 36317169 1I CTGGTCTGGG -/T TATACGGTCT 3070 hom 65 het 26 0 18 8 T 1 2 269469 CASAVA_Build 7 36341913 3D ACAGAAAAGA ACT/--- ACGACTAGGC 2457 het 2457 ref 22 11 8 3 ACT 1 0 269470 CASAVA_Build 7 36349786 4I AAAAGAAAAG ----/AGAA AGAAGGAAGG 2088 hom 18 het 15 0 7 8 AGAA 1 2 269471 CASAVA_Build 7 36378212 1I CTTGCAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 11 12 269472 CASAVA_Build 7 36403288 4D AATGTTTTTT TAAA/---- AAAAAAGAAA 3070 het 95 hom 24 1 12 11 TAAA 1 0 269473 CASAVA_Build 7 36404306 2I TTCTGATAGA --/TT TTTTTTTTTT 1833 het 1833 ref 33 14 7 12 T 12 14 269474 CASAVA_Build 7 36413875 3I CAGAAAGCTA ---/CTT CTTCTCCAGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 CTT 1 2 269475 CASAVA_Build 7 36419256 4I ACTTGTATTT ----/GAAG GAAGGAAGAA 3070 hom 95 het 40 0 30 10 GAAG 2 3 269476 CASAVA_Build 7 36420128 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2000 hom 26 9 12 5 A 12 11 269477 CASAVA_Build 7 36423139 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACAAGA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 C 1 0 269478 CASAVA_Build 7 36433513 1I TTGTTTTTTT -/G GTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 19 13 4 G 1 2 269479 CASAVA_Build 7 36449077 1I TTGTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 2435 het 2435 ref 24 10 7 7 T 11 12 269480 CASAVA_Build 7 36462512 1D TTGGTAACTT A/- AACAGGAATC 3070 het 3070 ref 45 26 18 1 A 3 2 269481 CASAVA_Build 7 36463105 7D GTTTTTATCT ATCTATC/------- ATCTATCTAT 1867 het 1867 ref 39 18 9 15 ATCTATC 2 1 269482 CASAVA_Build 7 36464517 1I ATGCTACTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 45 0 35 10 A 11 12 269483 CASAVA_Build 7 36468511 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 6 7 269484 CASAVA_Build 7 36470476 2I CTTTACAAAC --/TG TGCATTCTTT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TG 1 2 269485 CASAVA_Build 7 36470982 1D TTGAAGTATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 9 8 269486 CASAVA_Build 7 36492924 2D GGAACCTAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 7 6 269487 CASAVA_Build 7 36494349 1I CCAAAACCAG -/T TGCTTCTTCT 3070 het 49 hom 26 1 23 2 T 1 2 269488 CASAVA_Build 7 36499184 1I CAGCAACATA -/T TGTTTTCTTT 2709 het 13 hom 21 1 9 11 T 1 2 269489 CASAVA_Build 7 36503240 1I AAAAACTGAA -/T TGTTAGCTTT 3070 het 1607 hom 32 11 20 1 T 1 2 269490 CASAVA_Build 7 36511847 2I ATTTTATAAC --/AA AGAGCAGCCT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 1 3 269491 CASAVA_Build 7 36512322 1I ATGAATGCCA -/G GGTATATACC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 2 3 269492 CASAVA_Build 7 36514866 1I TTGGCCTCCC -/A AAATGCTGAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 3 4 269493 CASAVA_Build 7 36515811 3D AAGTTTTGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 42 3 26 13 T 15 12 269494 CASAVA_Build 7 36519255 1I GAGAAAGACA -/T TTTGCAAAGA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 3 4 269495 CASAVA_Build 7 36519316 1I CCCCATAGGG -/T TTGTGGAATG 3070 hom 62 het 31 0 20 11 T 2 3 269496 CASAVA_Build 7 36524319 1D GGTAGATCTC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 172 het 60 0 58 2 T 8 7 269497 CASAVA_Build 7 36526840 2D CTGTCTCGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 28 2 16 10 A 18 16 269498 CASAVA_Build 7 36535711 1I TGCTGCGGAT -/G GGGGGCACTG 3070 hom 75 het 37 0 26 11 G 5 6 269499 CASAVA_Build 7 36541228 2D TGTGTGTGTG TT/-- TGTGTGTGTC 3070 hom 39 het 26 0 18 8 T 3 1 269500 CASAVA_Build 7 36541890 1I AGGACACAGA -/T TGCATCTTAT 3070 hom 112 het 40 0 38 2 T 1 2 269501 CASAVA_Build 7 36543368 1I CTTGATTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1847 hom 34 6 22 6 T 15 16 269502 CASAVA_Build 7 36547661 1I AAAATACTAC -/A AAGACATCAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 2 3 269503 CASAVA_Build 7 36571400 1I37M1I GTCCTCATTG -TTTGTTATACATAATTTTTGTCATTATCCTCTCAAGG-/TTTTGTTATACATAATTTTTGTCATTATCCTCTCAAGGT TTTGGGTTGA 3070 hom 151 het 44 0 51 7 N/A 0 0 269504 CASAVA_Build 7 36618306 1I GAAAAGTGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 A 9 10 269505 CASAVA_Build 7 36620580 4D TTTGAATTTG TGTT/---- TGTTATGTGA 3070 het 3070 hom 28 13 12 4 TGTT 2 1 269506 CASAVA_Build 7 36621417 1D TAAAAATTTA T/- TTTTTTAGAA 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 T 7 6 269507 CASAVA_Build 7 36637482 1I CCATCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2294 het 1369 hom 22 8 9 5 A 15 16 269508 CASAVA_Build 7 36661474 1D TTTTGTTGGG A/- TAGTTAGGAA 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 A 1 0 269509 CASAVA_Build 7 36666436 4D GGGAACAGAG TCTT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TCTT 1 0 269510 CASAVA_Build 7 36669209 1D GCAAACTCAT A/- GGAACAATTC 3070 het 3070 hom 41 20 19 3 A 1 0 269511 CASAVA_Build 7 36670178 1D TTTAGGTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 10 9 269512 CASAVA_Build 7 36671332 5D TTATCTAGTT ATTTA/----- ATTTATTTCA 3070 het 3070 ref 50 23 23 6 ATTTA 2 1 269513 CASAVA_Build 7 36676989 4D TGCAGTGATG AGTA/---- TTGTGTCTGT 3070 het 3070 hom 33 14 15 7 AGTA 1 0 269514 CASAVA_Build 7 36679542 3D TGGCACATGC CCG/--- CCGTAATCCC 3070 het 1137 hom 22 3 16 3 CCG 2 1 269515 CASAVA_Build 7 36689854 6D GGTTCTGAAC TTGAAT/------ TTGAAGTGTC 2731 het 2731 ref 29 22 7 2 TTGAAT 1 0 269516 CASAVA_Build 7 36696348 1I AAAAAGAAGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 8 9 269517 CASAVA_Build 7 36698585 1D ACTTGAAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 26 18 7 T 10 9 269518 CASAVA_Build 7 36699109 1I TCCTACTCTT -/A AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 6 7 269519 CASAVA_Build 7 36699663 1D AGTTGAAATT A/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 A 1 0 269520 CASAVA_Build 7 36701079 2I AGGGAGAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 AG 5 6 269521 CASAVA_Build 7 36702065 1I CTATATTCTA -/T TTTTGAGTTC 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 T 4 5 269522 CASAVA_Build 7 36705148 2I ATGAGATCCA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 9 11 269523 CASAVA_Build 7 36705761 4D TTAAATTGGA TTAT/---- TTGTTTTTTT 259 het 259 ref 39 15 4 22 TTAT 1 0 269524 CASAVA_Build 7 36708299 5D TTTTATTTTG AAGTA/----- AAGTAAGAGA 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 AAGTA 2 1 269525 CASAVA_Build 7 36713215 7I CTGTTTGGCA -------/TGAGGCC TATCTTGGCT 2898 het 2898 ref 30 12 8 10 TGAGGCC 0 1 269526 CASAVA_Build 7 36714278 13I CTTTTTGCTC -------------/CTCCCTTTGCTCT CTCCTCTCCC 3070 hom 87 het 30 0 30 1 CTCCCTTTGCTCT 0 1 269527 CASAVA_Build 7 36715821 1I AAAAGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 10 11 269528 CASAVA_Build 7 36717031 3I ACCAAGCACA ---/GTT GTTCTAAGTG 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 GTT 1 2 269529 CASAVA_Build 7 36726469 2D TATATTTACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2543 hom 30 12 13 5 T 14 12 269530 CASAVA_Build 7 36726928 14I GTGTATCCCT --------------/GGCTCTGAGAGCAG GCTCTCGCAT 3070 hom 93 het 35 0 31 6 GGCTCTGAGAGCAG 0 1 269531 CASAVA_Build 7 36731457 1D GTTAGCAATT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 8 7 269532 CASAVA_Build 7 36740243 3I TACATTAAAT ---/AGA AGTTCTTTTG 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 AGA 0 1 269533 CASAVA_Build 7 36750728 1D CACTTATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 A 11 10 269534 CASAVA_Build 7 36752089 3D CGCAGCCTGT AGA/--- AGAAGCAGAA 3070 het 3070 hom 36 12 18 8 AGA 2 1 269535 CASAVA_Build 7 36762327 1D AGAAATTCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 91 het 35 0 31 6 A 10 9 269536 CASAVA_Build 7 36766003 3I CTTGCCACTC ---/CTT CTCATACTGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CTT 0 1 269537 CASAVA_Build 7 36767645 4D AAGGTTACAG AAAT/---- AAAAATAGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 6 AAAT 1 0 269538 CASAVA_Build 7 36786260 2D AATGTAAGAC AG/-- AGTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 AG 2 1 269539 CASAVA_Build 7 36796467 1I AGCTGAGATG -/C CCCCCCCAGG 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 C 7 8 269540 CASAVA_Build 7 36799972 4D ATTTTTTATT TTTA/---- TTTGAGATGG 1689 het 1689 ref 19 11 5 4 TTTA 1 0 269541 CASAVA_Build 7 36800745 12D GGAAAACAAA AAACAAACAAAC/------------ AAACAAACAA 3070 hom 90 het 34 0 31 6 AAAC 7 4 269542 CASAVA_Build 7 36802886 3D TGTTATTAAT ATC/--- CCTTAATAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 5 ATC 1 0 269543 CASAVA_Build 7 36804199 1I GCCTCTCAGG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 8 269544 CASAVA_Build 7 36805862 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 A 10 11 269545 CASAVA_Build 7 36810001 1D AAGTAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 23 0 9 14 A 12 11 269546 CASAVA_Build 7 36810192 9D4M9D TAGAGATACA ATTATACCTAGCTAGAGATACA/---------AGCT--------- AATTAATTAT 3070 hom 63 het 22 0 22 1 N/A 0 0 269547 CASAVA_Build 7 36813433 5D TTTTTCATAT TCAAG/----- TCATCTTTTC 3070 het 3070 ref 46 30 15 5 TCAAG 1 0 269548 CASAVA_Build 7 36813815 1D39M1D GGATTGCAGC TTGAGAAAGTGAGGCGTTAATTGCAGGGCAGCTCATGCTTA/-TGAGAAAGTGAGGTGTTAATTGCAGGGCAGCTCATGCTT- AGACCCAACC 3070 het 3070 ref 44 30 19 12 N/A 0 0 269549 CASAVA_Build 7 36816586 1D CCTGAGCTAC T/- TTGGGGAGTG 3070 het 3070 ref 43 19 18 7 T 3 2 269550 CASAVA_Build 7 36829358 2D AAACTCATAA AC/-- ACAATTAACA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 AC 2 1 269551 CASAVA_Build 7 36845648 20D CTTATCTTCT CTGAGACTCAGTTTTCTCAC/-------------------- CTGTTAAATG 3070 het 3070 ref 40 26 13 3 CTGAGACTCAGTTTTCTCAC 1 0 269552 CASAVA_Build 7 36854649 1I TTCTTTTTCC -/G CCCCGCATCT 3070 het 217 hom 36 4 27 5 G 0 1 269553 CASAVA_Build 7 36860247 2D CTGATTTTCT CA/-- GTGAGTCGAG 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 CA 1 0 269554 CASAVA_Build 7 36875377 3I GGGCTCAACA ---/AAG AAGGAGTTCC 3070 het 3070 ref 52 28 19 5 AAG 1 2 269555 CASAVA_Build 7 36881397 1I TAGGCCGGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 T 9 10 269556 CASAVA_Build 7 36884607 1D GGAGATATAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 A 9 8 269557 CASAVA_Build 7 36898565 1D CTATGGTAAA T/- CCCCCACCCC 3070 het 3070 hom 42 15 19 10 T 1 0 269558 CASAVA_Build 7 36902811 2D TTTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 12 10 269559 CASAVA_Build 7 36907146 1I GGCTACACTC -/T TAAGGGTACA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 1 2 269560 CASAVA_Build 7 36921028 8D AATGCAAGAT TTCAGAAA/-------- TTCAGAAATT 3070 het 3070 hom 27 11 13 6 TTCAGAAA 2 1 269561 CASAVA_Build 7 36940631 1D CATGGCTAGG T/- AAGGGCTCAC 3070 hom 90 het 37 0 25 12 T 1 0 269562 CASAVA_Build 7 36956153 1D GCTGTGTTCG C/- CCCCATGCTC 3070 hom 159 het 57 0 53 4 C 5 4 269563 CASAVA_Build 7 36956263 7D ACAGACACAG AAAACAA/------- GAAACAATGT 3070 het 3070 ref 46 22 21 6 AAAACAA 1 0 269564 CASAVA_Build 7 36964831 1I GTGGCACTAC -/A AAACGCCACA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 A 3 4 269565 CASAVA_Build 7 37013171 2I ACAGACACAC --/AT ATATGAAACT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 AT 2 3 269566 CASAVA_Build 7 37088429 1I AACAGAGGGA -/T TTTTTTTTTT 2624 het 2028 hom 16 6 7 3 T 11 12 269567 CASAVA_Build 7 37110440 1D TCTCAGAATG A/- AAAAAAAAAA 1320 het 1320 ref 45 38 3 4 A 12 11 269568 CASAVA_Build 7 37121688 1I CATTCATGAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 A 9 10 269569 CASAVA_Build 7 37128780 1I TCCTTAGAGA -/C CTACAAAGAG 2903 het 2903 ref 27 20 6 1 C 1 2 269570 CASAVA_Build 7 37134673 1D CCCGTCCAAG T/- TTTGGGGTAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 4 3 269571 CASAVA_Build 7 37135386 2I CTCGGAACTC --/TG TTTAGGAAGA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 TG 0 1 269572 CASAVA_Build 7 37136888 2D TACATGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 48 22 20 7 TG 9 8 269573 CASAVA_Build 7 37144429 1I TTGAAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 674 hom 28 2 20 6 A 11 12 269574 CASAVA_Build 7 37146906 1I AAGCATACGG -/A AAAAAATGCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 7 269575 CASAVA_Build 7 37147654 1I GAAATAAACC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 8 9 269576 CASAVA_Build 7 37147938 1D ACTTGTTTGA G/- GATCAAACAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 G 2 1 269577 CASAVA_Build 7 37150302 1I CAATGACGTG -/C CCTAAATTAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 2 3 269578 CASAVA_Build 7 37155628 1D TAATCAAAAG A/- AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 33 24 9 0 A 7 6 269579 CASAVA_Build 7 37156408 1D TGCGGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 42 2 25 15 T 13 12 269580 CASAVA_Build 7 37160547 1I AAAAACCCTG -/A AAAAAAGGTT 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 A 6 7 269581 CASAVA_Build 7 37169474 3I GTTCTTTTTT ---/TTG TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TTG 0 1 269582 CASAVA_Build 7 37169678 1I CTGTGTCCAT -/G TGATCTCATT 2418 hom 12 het 5 0 5 0 G 0 1 269583 CASAVA_Build 7 37176699 4D TATTTCCTTC TTTG/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 15 10 TTTG 1 0 269584 CASAVA_Build 7 37184752 1I TTTTAATTAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 459 hom 22 1 16 5 A 8 9 269585 CASAVA_Build 7 37186941 4D CACACATATG CGCA/---- CACACACACA 3070 hom 156 het 55 0 51 4 CGCA 1 0 269586 CASAVA_Build 7 37188154 1I CTCAAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 41 1 35 5 A 10 11 269587 CASAVA_Build 7 37189692 1I ACCCAGAAGA -/G GAGAGAGAGA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 1 2 269588 CASAVA_Build 7 37189851 1I TATTCCAGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 872 hom 38 2 31 5 T 9 10 269589 CASAVA_Build 7 37195054 2D TTCATGTGTT TC/-- TGAGATTTTC 3070 hom 90 het 35 0 31 6 TC 1 0 269590 CASAVA_Build 7 37199139 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 1442 hom 12 het 5 0 4 1 AC 6 5 269591 CASAVA_Build 7 37220805 1I GCTAGATAAC -/A GGATGGTTAG 3070 het 3070 hom 55 19 29 7 A 0 1 269592 CASAVA_Build 7 37222123 1D CCTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 18 9 T 13 12 269593 CASAVA_Build 7 37222266 1D CACTTAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 12 11 269594 CASAVA_Build 7 37223632 4D TGTTGCTACT CTTA/---- CTGAGTAGAG 3070 het 3070 hom 26 13 12 2 CTTA 1 0 269595 CASAVA_Build 7 37230103 7D ACCTAATGGA CCAGGGG/------- CAACAGTTAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 CCAGGGG 1 0 269596 CASAVA_Build 7 37239854 1I GAATTAGTAC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 7 8 269597 CASAVA_Build 7 37261920 17I CATTGTCCTT -----------------/GACATATCAATGGCTGG GACTTAGCTT 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 GACATATCAATGGCTGG 0 1 269598 CASAVA_Build 7 37262009 2D CCAGGCCCCA CT/-- CTCTCACCAG 3070 het 3070 ref 41 18 15 13 CT 3 2 269599 CASAVA_Build 7 37264580 1D TAAAAAAAAA T/- AAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 41 25 15 2 T 1 0 269600 CASAVA_Build 7 37267264 2I AAAATAGCCA --/AC AGTTTCCTAG 3070 het 3070 hom 34 8 18 8 AC 0 1 269601 CASAVA_Build 7 37270435 2D GCATAAATGA AT/-- ATATATATGA 3070 het 3070 hom 45 16 19 11 AT 5 4 269602 CASAVA_Build 7 37287092 1I AATGCCCATC -/A ATCAACGAAT 3070 hom 24 het 13 0 8 5 A 1 2 269603 CASAVA_Build 7 37288164 1I TCCATGTGGA -/T TGGGTAATAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 1 2 269604 CASAVA_Build 7 37288745 1D CCAGACACCA C/- CCCCCAAAAA 3070 hom 34 het 33 1 23 10 C 6 5 269605 CASAVA_Build 7 37290906 2I CGGTTTAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 47 0 35 12 A 10 12 269606 CASAVA_Build 7 37295905 1I CTATTTTCTC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 8 9 269607 CASAVA_Build 7 37296980 3D AGGGTGATTT TGA/--- TGATGATGAT 3070 hom 81 het 37 0 28 10 TGA 7 6 269608 CASAVA_Build 7 37299869 5D TAATAATAAT AAAAA/----- AAAAGAGTGA 871 hom 5 het 6 0 4 3 A 9 4 269609 CASAVA_Build 7 37300485 1D GAAGCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 34 2 24 9 A 16 15 269610 CASAVA_Build 7 37302792 5D TTCCACTTAC CATAT/----- CATACACAAG 3070 hom 102 het 36 0 35 3 CATAT 1 0 269611 CASAVA_Build 7 37303194 3D CATATTTTAT AAG/--- AAGTGTAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AAG 2 1 269612 CASAVA_Build 7 37307463 2D AATATATCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 25 4 A 12 10 269613 CASAVA_Build 7 37317136 2D TATTCTCTCC CT/-- CTCTCTCTCT 1171 het 1171 ref 44 30 3 12 CT 6 5 269614 CASAVA_Build 7 37320648 1D GGCTACTTTG A/- AAAAAACAAA 3070 hom 121 het 49 0 41 9 A 7 6 269615 CASAVA_Build 7 37322116 1I AAGGAAATAC -/T TTGTTAGTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 2 3 269616 CASAVA_Build 7 37323062 1I GTTCAAATCC -/A AGCTCTATCA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 1 2 269617 CASAVA_Build 7 37337211 1I AACTTATGAG -/T TGTTTACTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 2 269618 CASAVA_Build 7 37338048 1I ACAAGGACCG -/T TTTGAATATG 3070 hom 147 het 53 0 48 5 T 3 4 269619 CASAVA_Build 7 37347265 1D ATGTGCTTTC G/- GGTGATGCCC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 G 3 2 269620 CASAVA_Build 7 37353561 3D AATTTTCACA TGT/--- TGTAGAAGGG 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TGT 2 1 269621 CASAVA_Build 7 37353645 6D ATTCTTATGG TATTCT/------ TATTCTTATT 3070 hom 81 het 32 0 28 7 TATTCT 4 3 269622 CASAVA_Build 7 37364412 1I TTTCAAATGC -/T TTGTATCTGC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 2 3 269623 CASAVA_Build 7 37366550 1D TTAACTGAAA T/- TTTAAAAAAA 3070 hom 36 het 31 1 23 7 T 4 3 269624 CASAVA_Build 7 37367074 2I TATTCACAAC --/AT ATTTTCAATG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 1 2 269625 CASAVA_Build 7 37368346 2D AATGTATATG AT/-- ATATATATAT 2069 het 2069 ref 30 21 5 4 AT 8 7 269626 CASAVA_Build 7 37371714 1I TGACCAAAAC -/T TTGATTTCAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 3 269627 CASAVA_Build 7 37385175 1D ATTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 23 0 16 7 T 12 11 269628 CASAVA_Build 7 37394543 2I ATGTAACTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 11 13 269629 CASAVA_Build 7 37412396 1I TACTCTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 12 13 269630 CASAVA_Build 7 37418729 1I TTTTCAAGAA -/C TGTATTGGTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 269631 CASAVA_Build 7 37419268 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 8 9 269632 CASAVA_Build 7 37426340 1D ATGTGAAAAT A/- AGCTGCCCTG 3070 het 3070 hom 38 13 22 4 A 2 1 269633 CASAVA_Build 7 37437471 2I TCTCTAAAAT --/AA AAAAAAAAAT 2225 het 224 hom 15 1 7 7 A 9 11 269634 CASAVA_Build 7 37444728 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 22 1 20 2 A 11 10 269635 CASAVA_Build 7 37447383 1I ATAACCCAGC -/A ATATTTCTAC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 1 2 269636 CASAVA_Build 7 37450808 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 1527 het 1527 ref 17 8 5 4 T 8 7 269637 CASAVA_Build 7 37453767 1I ACCCACAACA -/C CCCCCCCCAC 2057 het 665 hom 17 3 8 6 C 8 9 269638 CASAVA_Build 7 37459340 2I GGGAAGCCAA --/AC CATTGGACAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AC 0 1 269639 CASAVA_Build 7 37461023 2D TTTTAAATAA AT/-- ATATGTCCAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AT 3 2 269640 CASAVA_Build 7 37461934 1D TTCCAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 31 0 25 6 T 12 11 269641 CASAVA_Build 7 37467085 1I AGTTTCTGTA -/T TTTTTTTTTT 1953 het 1953 ref 26 8 8 10 T 13 14 269642 CASAVA_Build 7 37469577 2D TGAAGCAAAC TG/-- TGGTGCATTC 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 TG 2 1 269643 CASAVA_Build 7 37469705 1I TCACATGCTA -/T TGTGATTCCA 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 1 2 269644 CASAVA_Build 7 37477168 3I AAGCGTTGTC ---/ATA ATGACTGTGC 3070 het 3070 hom 43 11 21 11 ATA 0 1 269645 CASAVA_Build 7 37498591 1I ATCAGCACTC -/T TGTGAAAATG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 1 2 269646 CASAVA_Build 7 37498955 1I TAAAAGTCAC -/T TGCGAGGGTC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 1 2 269647 CASAVA_Build 7 37532236 1D TTTCTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1531 hom 25 6 12 7 T 14 13 269648 CASAVA_Build 7 37545913 1D GTGCTTTCTG A/- AGCAGAAGTG 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 A 2 1 269649 CASAVA_Build 7 37550954 1I TTTACAGAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 9 269650 CASAVA_Build 7 37566662 1D GAATGAATGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 T 10 9 269651 CASAVA_Build 7 37572904 1I ATTGCCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 11 12 269652 CASAVA_Build 7 37573654 1D ACTGATTGAC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 42 23 13 7 T 8 7 269653 CASAVA_Build 7 37577365 1D AGTGTGCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2141 hom 28 8 12 8 T 12 11 269654 CASAVA_Build 7 37584729 4D TGGGTTGAAA TGCT/---- TGCTGCCCAC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 TGCT 2 1 269655 CASAVA_Build 7 37594879 1I CTTCCTTACA -/C CGTATACAAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 C 1 2 269656 CASAVA_Build 7 37616265 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1869 het 667 hom 10 3 5 2 A 11 12 269657 CASAVA_Build 7 37640094 1I TTTGTATAGC -/T TTTGTTCAGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 3 4 269658 CASAVA_Build 7 37640464 1D10M1D CTTTTTATTT AAAAAAAATGAT/-AAAAAAATGA- TTTTTTTTGT 3070 het 1150 hom 14 3 9 4 N/A 0 0 269659 CASAVA_Build 7 37643261 1D CTTTTTAATG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 T 9 8 269660 CASAVA_Build 7 37645062 2D TCCTAGAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 T 13 11 269661 CASAVA_Build 7 37645331 4D CTTTATTAGT CTAG/---- CTAGCTAGTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 CTAG 3 2 269662 CASAVA_Build 7 37656630 9D TATTATTAAT ATTATTAAC/--------- TATATGGGCA 3070 het 2431 hom 17 6 10 3 ATTATTAAC 1 0 269663 CASAVA_Build 7 37659992 1I GAAGTATTTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 8 9 269664 CASAVA_Build 7 37661048 1I AAATTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 933 het 933 ref 35 23 3 9 T 10 11 269665 CASAVA_Build 7 37666797 2D CGTGGCGCTG GT/-- GTGAGTGTCT 3070 het 3070 ref 43 27 11 7 GT 2 1 269666 CASAVA_Build 7 37671352 1I AATTGAATCC -/T TTGTTATGGC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 2 3 269667 CASAVA_Build 7 37671552 1I ATAGATGTGG -/T TTTTTGTTTG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 5 6 269668 CASAVA_Build 7 37676134 1D ATTCCTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 18 21 14 T 12 11 269669 CASAVA_Build 7 37687458 1I CTCTTCAAAC -/A ATTGATTACA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 2 269670 CASAVA_Build 7 37691949 1I TCCAAAATCC -/A ATTGTAGTTA 3070 hom 23 het 19 0 7 12 A 1 2 269671 CASAVA_Build 7 37703310 1D TATTTTACTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 9 8 269672 CASAVA_Build 7 37726446 1I CATCAATGGC -/T TTTACATGGC 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 3 4 269673 CASAVA_Build 7 37734397 3I CCTACCAAAC ---/AGA AGGAGATTTA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 AGA 0 1 269674 CASAVA_Build 7 37737744 1I CTAATTTTTC -/T TTTTTTTTTG 832 het 537 hom 5 2 3 0 T 9 10 269675 CASAVA_Build 7 37742623 1D TAAACAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 13 12 269676 CASAVA_Build 7 37743461 5D TTGGACTGTT TACTC/----- TATTTACATT 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 TACTC 1 0 269677 CASAVA_Build 7 37749359 2I TTTATTATCA --/CT CTGTGGATCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CT 1 2 269678 CASAVA_Build 7 37749679 1D ATAAATATGT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 8 7 269679 CASAVA_Build 7 37752448 2I ATATAACATT --/TA TATATATATA 2737 het 661 hom 10 2 6 2 TA 7 8 269680 CASAVA_Build 7 37753359 1I ATTTAACCTC -/T TGTTCTATAG 3070 hom 132 het 47 0 44 3 T 1 2 269681 CASAVA_Build 7 37754892 1I CCAGCCTGCC -/A AGGAGAGTCA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 1 2 269682 CASAVA_Build 7 37757551 2D41M1D TATACTATTT TATATATATATATATAATATATACATATACATATATATATATAT/--TATATATATATATAATATATACATATACATATATATATATA- TTTTTTTTTC 2737 hom 21 het 9 0 8 2 N/A 0 0 269683 CASAVA_Build 7 37761646 3D TTGAGTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 TTG 4 3 269684 CASAVA_Build 7 37762856 1D TCTGATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 463 hom 34 1 21 12 T 13 12 269685 CASAVA_Build 7 37770216 1D CCAGTCTCCT C/- GAGTGACATC 3070 het 3070 ref 44 20 13 12 C 1 0 269686 CASAVA_Build 7 37774385 1I AAAATGTACC -/T TTGCCAAAGA 3070 hom 74 het 31 0 24 7 T 2 3 269687 CASAVA_Build 7 37774569 1I TTTTGACATG -/T TGGCCAGGCT 3070 hom 71 het 31 0 24 7 T 1 2 269688 CASAVA_Build 7 37782064 1D TGCAGCCTGA C/- AATGCAATAG 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 C 1 0 269689 CASAVA_Build 7 37783175 1D TTTAGCTGTG T/- TCTCACCCAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 1 269690 CASAVA_Build 7 37785073 1D TTAAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 32 0 22 10 T 12 11 269691 CASAVA_Build 7 37786311 1I ATTTGAGGTT -/G CCATGAGGCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 269692 CASAVA_Build 7 37796936 1I AGGAGTAATA -/T CCCCCTAAGA 3070 hom 126 het 46 0 41 5 T 0 1 269693 CASAVA_Build 7 37800794 1D AGGAAGAGGC A/- AATAATGTCA 3070 het 3070 hom 31 13 13 7 A 3 2 269694 CASAVA_Build 7 37803497 2D CCTGGAAATA GG/-- AACAGTATAA 3070 het 3070 ref 49 24 18 8 G 2 0 269695 CASAVA_Build 7 37804257 9D AGAAGCAGAT CCTCTCCCA/--------- CCTCTCCCAT 3070 het 3070 ref 43 19 17 12 CCTCTCCCA 2 1 269696 CASAVA_Build 7 37816213 1D AAAAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1564 het 1564 ref 16 8 6 3 A 11 10 269697 CASAVA_Build 7 37816531 1D CTGGGAGAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 A 9 8 269698 CASAVA_Build 7 37819830 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2565 het 1547 hom 12 4 8 0 A 10 11 269699 CASAVA_Build 7 37827880 1I GAGCTTTATT -/G GGGGAAAAAA 3070 het 436 hom 29 1 22 6 G 4 5 269700 CASAVA_Build 7 37851699 1I GTAAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 7 8 269701 CASAVA_Build 7 37852973 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 24 1 19 4 A 13 14 269702 CASAVA_Build 7 37860226 1D TCCACCAAAA G/- CTTAACTACT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 G 1 0 269703 CASAVA_Build 7 37860932 1I AAACCTTTCA -/C CCCCCCACCT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 C 6 7 269704 CASAVA_Build 7 37861657 1I AAATCCCAAG -/T TTAGGGCACT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 2 3 269705 CASAVA_Build 7 37870591 3D ATTGCAAAAT AAC/--- AACCTCTTAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AAC 2 1 269706 CASAVA_Build 7 37874557 1D TACTTATAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 9 8 269707 CASAVA_Build 7 37876373 1I TGATGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 20 0 13 7 A 13 14 269708 CASAVA_Build 7 37878873 2D31M4D TAATGAGAAA CTCTGCACAGAGAAAGAACAGATGGACAAACTAACTC/--CTGCACAGAGAAAGAACAGATGGACAAACTA---- AACAAATAAT 3070 hom 101 het 24 0 34 6 N/A 0 0 269709 CASAVA_Build 7 37881599 4D AGCAGGAGAC AGAG/---- AGAACAAATA 3070 het 3070 ref 25 12 11 3 AG 3 1 269710 CASAVA_Build 7 37882357 12D ATATATATAT ATAGATAGATAG/------------ ATAGATAGAT 2416 het 2174 hom 12 5 6 3 ATAG 7 4 269711 CASAVA_Build 7 37886213 2D AGGTTTTTTT TG/-- TTTGTTTATT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 TG 1 0 269712 CASAVA_Build 7 37886930 1D AGATCTTTGA T/- TTTTTTTCGC 3070 het 3070 ref 39 17 16 7 T 8 7 269713 CASAVA_Build 7 37892990 1I GTGATAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 20 10 A 10 11 269714 CASAVA_Build 7 37902511 2I TGCAGACCAG --/AA ACAACAGCCT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 A 1 3 269715 CASAVA_Build 7 37914841 1D ATAACCAATC T/- TGCTAGAATT 3070 het 3070 hom 56 20 27 10 T 2 1 269716 CASAVA_Build 7 37915127 1I TTGCAAAGAA -/G GGATGCTTTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 2 3 269717 CASAVA_Build 7 37921791 2D GCTTTTTCAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 8 het 35 1 16 19 A 11 9 269718 CASAVA_Build 7 37922000 1D AAGCAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 30 0 27 3 T 11 10 269719 CASAVA_Build 7 37937183 1I AATTATTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 10 11 269720 CASAVA_Build 7 37938288 1D ACTTAATATG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 36 19 15 4 T 7 6 269721 CASAVA_Build 7 37941073 2D CTTTGTCTTT AA/-- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 A 9 7 269722 CASAVA_Build 7 37942281 1I ACAGCACATT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 18 het 22 1 19 2 A 7 8 269723 CASAVA_Build 7 37946934 1D TTTTTTTTTT C/- TAATTGGAAG 3070 het 3070 hom 33 9 17 8 C 1 0 269724 CASAVA_Build 7 37948910 1D CTGTTTTACT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 8 269725 CASAVA_Build 7 37957955 1D TTTAATTGCA T/- TTTAAAGCAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 4 3 269726 CASAVA_Build 7 37966793 1D CAGATGAGAC A/- AAACAGACAA 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 A 4 3 269727 CASAVA_Build 7 37978577 1I TCTGCGGGTA -/T TTTTTTTTTT 2411 het 2411 ref 25 13 7 5 T 10 11 269728 CASAVA_Build 7 37979550 1I GAAATAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 10 11 269729 CASAVA_Build 7 37983412 1I TTCTAAGTAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 105 het 45 0 36 9 A 8 9 269730 CASAVA_Build 7 37985694 2I TACATGTATG --/TA TATATATATA 3070 hom 66 het 31 0 22 9 TA 6 7 269731 CASAVA_Build 7 37988283 1D CACCCTTATC T/- TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 9 8 269732 CASAVA_Build 7 37991590 3I AACAGAACTA ---/TCT TCAAGTCAGT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 TCT 0 1 269733 CASAVA_Build 7 38009001 6D TATTTTTAAA GACTTT/------ GACTTTGTAG 3070 het 3070 ref 49 23 18 10 GACTTT 2 1 269734 CASAVA_Build 7 38017724 5D AGGAAGAGAA AGAAG/----- AGAAAACAGA 3070 het 3070 ref 31 16 11 6 AGAAG 1 0 269735 CASAVA_Build 7 38018798 1D TTCTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3049 het 3049 ref 23 9 7 7 A 11 10 269736 CASAVA_Build 7 38020780 1D AAGACAACTA T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 T 7 6 269737 CASAVA_Build 7 38026603 1D CAAAGCTTTC T/- TTGCTCATTC 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 T 3 2 269738 CASAVA_Build 7 38026941 1D TCTTTATACA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 T 8 7 269739 CASAVA_Build 7 38037451 1I TCAAATAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 10 11 269740 CASAVA_Build 7 38039616 1D AAATAAAATC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 9 8 269741 CASAVA_Build 7 38043867 2D CATATGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 2778 het 1174 hom 31 7 10 15 TG 8 7 269742 CASAVA_Build 7 38043883 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 643 hom 30 4 16 10 TA 6 7 269743 CASAVA_Build 7 38047028 10I TTCTCCATTT ----------/TCGTCCTGTG TCTGTGAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 TCGTCCTGTG 0 1 269744 CASAVA_Build 7 38055772 1I CTCTCTCTCA -/G GGCCTCCTTG 3070 hom 69 het 24 0 22 2 G 2 3 269745 CASAVA_Build 7 38061435 1D CAGGGTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2357 hom 23 6 12 6 T 10 9 269746 CASAVA_Build 7 38064523 8D AAAAAAAACA TCTATCTG/-------- TCTATCTGTC 3070 het 3070 hom 49 18 25 10 TCTATCTG 2 1 269747 CASAVA_Build 7 38066435 1I GTAATCATCC -/T TTCAAGCTTG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 2 3 269748 CASAVA_Build 7 38068673 1I GATTCCCCTC -/A TTCCTTCCTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 0 1 269749 CASAVA_Build 7 38078030 1I AATCATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 269 hom 27 1 20 6 T 12 13 269750 CASAVA_Build 7 38080810 1I TGTACATTGA -/T TTTTGTATCC 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 4 5 269751 CASAVA_Build 7 38083244 1I TTTGGTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 12 10 T 13 14 269752 CASAVA_Build 7 38083581 3D ATCAGAAAAA GAT/--- GATACTAGGA 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 GAT 2 1 269753 CASAVA_Build 7 38085862 1I TAAGCACATG -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 7 8 269754 CASAVA_Build 7 38097962 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 het 914 hom 23 9 11 3 AAG 5 6 269755 CASAVA_Build 7 38099439 2D AAATGAATAC AA/-- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 38 11 23 6 A 8 6 269756 CASAVA_Build 7 38105400 1I CATCTCTGCT -/A GAGCAGTGAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 0 1 269757 CASAVA_Build 7 38106652 4D TCTGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 3 AAAT 4 3 269758 CASAVA_Build 7 38113150 2D GAGTTTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 30 0 22 11 AT 7 6 269759 CASAVA_Build 7 38122786 1I AAGGATAACA -/T TTTTTTGCCT 3070 hom 132 het 50 0 43 7 T 6 7 269760 CASAVA_Build 7 38123066 1D CTTGATCAGT G/- GGGGGGGTCA 3070 hom 126 het 48 0 42 7 G 8 7 269761 CASAVA_Build 7 38126723 5I CCCCTGAACT -----/TAAAA TAAAAGTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 TAAAA 1 2 269762 CASAVA_Build 7 38141659 1D CTCAATGTGG T/- TAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 28 10 14 5 T 2 1 269763 CASAVA_Build 7 38142195 1D CAAAAAGAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 9 8 269764 CASAVA_Build 7 38147774 1D CCTCCTAAAC A/- AAAATGGAAA 3070 het 3070 ref 40 25 12 4 A 5 4 269765 CASAVA_Build 7 38148967 1I AGCTATTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 20 16 6 A 8 9 269766 CASAVA_Build 7 38156463 4D TTTTTTAAAG ATAA/---- ATAAAGTTGA 3070 het 3070 hom 23 9 10 7 ATAA 2 1 269767 CASAVA_Build 7 38165064 1D GGAAAAGAGG A/- TTAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 20 4 A 1 0 269768 CASAVA_Build 7 38165633 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1722 hom 22 5 12 5 A 11 12 269769 CASAVA_Build 7 38192381 1I CAAAATTGGC -/A AAAAATAATG 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 5 6 269770 CASAVA_Build 7 38193153 1I AGCAGCTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 A 12 13 269771 CASAVA_Build 7 38193762 1I AATTTATTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 15 21 11 T 9 10 269772 CASAVA_Build 7 38202132 1I ACTTGCAAGT -/G GCTTTGCCTT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 G 1 2 269773 CASAVA_Build 7 38206594 1I AGCCTGAGTT -/C CTTAAAAACA 3070 hom 86 het 32 0 28 4 C 1 2 269774 CASAVA_Build 7 38219728 2D AATCCAGGGG CT/-- CTGACAGTTA 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 CT 2 1 269775 CASAVA_Build 7 38227070 10D TCTCTATTAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 25 3 AAAAG 6 4 269776 CASAVA_Build 7 38231705 32D GCACAAGTTC TTGAAAAGACAACCTTTCCCCATTGTACTGAT/-------------------------------- TTGACACGTT 3070 het 3070 ref 35 29 15 5 TTGAAAAGACAACCTTTCCCCATTGTACTGAT 1 0 269777 CASAVA_Build 7 38232376 4I GTTCTTGCTC ----/TTTA TTTGTTTAGT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TTTA 0 1 269778 CASAVA_Build 7 38238428 1I ATCTCAACGA -/T TTGAGTTATA 3070 het 3070 ref 64 33 25 6 T 2 3 269779 CASAVA_Build 7 38249624 1I TTGCCATGCA -/T TTTTTTTGTT 1618 het 1618 ref 50 41 4 5 T 7 8 269780 CASAVA_Build 7 38261576 1I TGGTAAAAGG -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 7 8 269781 CASAVA_Build 7 38263500 1I ATGGCATAAC -/A CAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 0 1 269782 CASAVA_Build 7 38264859 4I CTTGAGGAAG ----/ATAA ATAAATGTGC 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 ATAA 1 2 269783 CASAVA_Build 7 38265289 1I CATGAGGAGA -/T TTATGGCACA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 T 2 3 269784 CASAVA_Build 7 38269342 2I TTCCCATGCA --/TT TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 26 8 1 T 6 8 269785 CASAVA_Build 7 38270716 1I AAACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2509 het 2197 hom 16 9 6 1 A 13 14 269786 CASAVA_Build 7 38273585 1I GAACAATTTC -/T TAAGAAAATA 2194 het 2194 ref 20 13 5 2 T 1 2 269787 CASAVA_Build 7 38279373 1D CTGATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1602 hom 17 4 10 3 T 13 12 269788 CASAVA_Build 7 38289277 2D GTTTTTTTTT TA/-- TGTCTTGCAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 3 TA 1 0 269789 CASAVA_Build 7 38290882 1D CCCAGCCCCT C/- CCCCCCCCCA 2352 het 139 hom 13 1 7 5 C 10 9 269790 CASAVA_Build 7 38295631 1D AGTTTTACAG T/- TTTATATTTT 2329 het 2082 hom 12 5 5 2 T 4 3 269791 CASAVA_Build 7 38306807 1D TTTGCTAGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 14 0 13 2 T 10 9 269792 CASAVA_Build 7 38310237 1I TGCGAATGAC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 7 8 269793 CASAVA_Build 7 38310723 1D CGCAGAGGGG A/- AATGTACACA 2667 het 2667 ref 26 15 7 6 A 3 2 269794 CASAVA_Build 7 38311631 1I AAAACTCTTT -/A AAAAAAAAAT 2910 het 2910 ref 20 10 8 2 A 9 10 269795 CASAVA_Build 7 38315253 1I AAATGTGTTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 8 9 269796 CASAVA_Build 7 38316222 1D TTGGCAAGAC T/- TTTACTTGAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 4 3 269797 CASAVA_Build 7 38317208 1I GCCGCAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1021 hom 16 3 8 5 A 12 13 269798 CASAVA_Build 7 38318742 3I TTAAACTTAG ---/TTA TTGTTGTAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTA 0 1 269799 CASAVA_Build 7 38323469 1I CACACTGGGG -/A AAAAAAATGG 2378 het 2378 ref 17 8 5 4 A 7 8 269800 CASAVA_Build 7 38325411 1I AGTGAATGCC -/T TTAATGTGTC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 2 3 269801 CASAVA_Build 7 38325903 1D AACTTGAAAA G/- TCTGGTGATG 3070 het 3070 ref 30 17 11 4 G 1 0 269802 CASAVA_Build 7 38326535 1D AGGCGTAGCG T/- TTTTTTTTTT 2833 het 2833 ref 23 11 9 3 T 12 11 269803 CASAVA_Build 7 38327420 1D ACAGGCTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 9 8 269804 CASAVA_Build 7 38330898 2D AATTTAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 12 10 269805 CASAVA_Build 7 38334760 1I3M17D ATATATATAT -ATATATATATATATATATAT/GAGA----------------- GAGAGAGATA 1818 hom 10 het 4 0 4 2 N/A 0 0 269806 CASAVA_Build 7 38338140 3I GGCTGCCAGG ---/GGA GGAGGAGCTC 2099 het 2099 ref 23 12 5 6 GGA 2 3 269807 CASAVA_Build 7 38340021 2D CATACTGCAC AT/-- ATATGACAAG 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 AT 3 2 269808 CASAVA_Build 7 38340621 4D CCAAGAAAGT AGAG/---- AGAGAGACAA 3070 het 3070 hom 20 10 10 1 AG 5 3 269809 CASAVA_Build 7 38352273 1I TGTGTGTGTT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 2449 hom 23 7 10 6 G 8 9 269810 CASAVA_Build 7 38352883 2D TTGGAGCGTG AA/-- AAAGTCTTGC 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 A 5 3 269811 CASAVA_Build 7 38364079 2I AAGTAAGAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 AG 5 6 269812 CASAVA_Build 7 38376033 1I GTGGAGGGGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 T 7 8 269813 CASAVA_Build 7 38376985 1I GCCCCCCGCC -/T TTTTTTTTTT 1706 het 1479 hom 29 6 10 13 T 13 14 269814 CASAVA_Build 7 38382389 2D ATCATAACAT CA/-- CAACACGACT 3070 het 3070 ref 28 12 10 7 CA 2 1 269815 CASAVA_Build 7 38387825 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 17 3 A 12 13 269816 CASAVA_Build 7 38396098 1D CTCTTACAAG T/- CACTCTCCAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 1 0 269817 CASAVA_Build 7 38397088 36D AGACAAAGAC AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG/------------------------------------ AGAGAGAGAG 3070 het 946 hom 17 5 8 9 AG 27 9 269818 CASAVA_Build 7 38398170 1I CGTGGCGATG -/C CCGGCAGGGC 3070 hom 84 het 30 0 27 3 C 2 3 269819 CASAVA_Build 7 38399769 3D28M1I AAATACTATT GAGTTCTCCCTGGGCTGAGTGCTCACTTCAT-/---TTCTCCCTGGGCTGAGTGCTCACTTCATC CACATTCTCT 3070 het 3070 hom 30 17 20 4 N/A 0 0 269820 CASAVA_Build 7 38400398 1D GCCAGGAGTC A/- AACTCAAGCC 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 A 3 2 269821 CASAVA_Build 7 38402329 1D TCTTGTAGGT C/- CCATAATTCC 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 C 3 2 269822 CASAVA_Build 7 38404232 3D GAGGTTCCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2737 hom 26 12 12 2 A 15 12 269823 CASAVA_Build 7 38404646 3D GACAGAGAGT AGA/--- AGGATGCTTA 3070 het 3070 ref 55 30 23 2 AGA 1 0 269824 CASAVA_Build 7 38404964 6D CCACAAAAGT TAAAAA/------ TAAACATAAA 3070 het 3070 ref 27 16 8 5 TAAAAA 1 0 269825 CASAVA_Build 7 38405111 6I GCACCTCAGC ------/AATTTA TGTGATTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 AATTTA 0 1 269826 CASAVA_Build 7 38405236 7D AGGAATTGGC ACTTTAG/------- ACTTTAAAGA 3070 het 3070 hom 46 22 23 3 ACTTTAG 1 0 269827 CASAVA_Build 7 38419497 1D TATCTGAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 9 269828 CASAVA_Build 7 38425516 1D TATTCTTTTC A/- AAAGGACATA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 4 3 269829 CASAVA_Build 7 38426816 4D GGGACAGCAG GGGC/---- AGAAGTCTAG 3070 het 3070 ref 47 23 20 9 GGGC 1 0 269830 CASAVA_Build 7 38433773 1D TGATGCTGCT G/- CTTTTTTTTT 3070 het 1871 hom 41 16 17 8 G 1 0 269831 CASAVA_Build 7 38444659 2I CTGCAAGTTC --/AT TCCATAAAAT 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 AT 0 1 269832 CASAVA_Build 7 38451116 4D ATATATATAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 39 het 21 0 14 7 AT 10 8 269833 CASAVA_Build 7 38461207 2I ATTAAAATTC --/TT TTTTTTTTTT 2203 het 2203 ref 25 12 7 6 T 12 14 269834 CASAVA_Build 7 38466028 2D GGGTGAAAAG AC/-- AACCTGTTGA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 AC 1 0 269835 CASAVA_Build 7 38495109 1I TAACAGAAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 8 9 269836 CASAVA_Build 7 38495532 1I GAAAAGTTGA -/G GGGGGGGGGA 2155 het 2155 ref 28 7 10 11 G 9 10 269837 CASAVA_Build 7 38497333 1I CCAAACTTCT -/A AAAAAAATCT 3070 het 2518 hom 21 6 10 5 A 7 8 269838 CASAVA_Build 7 38509176 1I ACAGGCTGAG -/C CCACCTCCCT 3070 hom 138 het 53 0 43 10 C 2 3 269839 CASAVA_Build 7 38516094 1D AGGCACAGAG A/- TGCACTGATG 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 1 0 269840 CASAVA_Build 7 38525594 6D ATTATCCCAT AAGAGA/------ ATAGTCTTAC 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 AAGAGA 1 0 269841 CASAVA_Build 7 38527252 17I GTGGGCACTG -----------------/AATACAGAAAAATTCCA AACAAGTAGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 AATACAGAAAAATTCCA 0 1 269842 CASAVA_Build 7 38529057 1I CATAGTGAAA -/C CCCCCATCTT 3045 het 1582 hom 11 4 7 0 C 5 6 269843 CASAVA_Build 7 38530061 2I TATTAATTTT --/AA GAGAGAAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 0 2 269844 CASAVA_Build 7 38540162 1I TGTTTCTCAA -/C CCTCTTTTTC 3070 het 3028 hom 24 9 11 4 C 2 3 269845 CASAVA_Build 7 38545552 4I GGAACTGATC ----/AAAG AAAGGAGGCA 3070 hom 90 het 31 0 30 1 AAAG 1 2 269846 CASAVA_Build 7 38547413 51D GGGGAGGTAA GTGCAGGGTAGCTGCTTGTCCTAAAGCTTCCTGCTGGGCACGTCCTACACT/--------------------------------------------------- GTTTCCCAAA 3070 het 3070 ref 41 30 21 7 GTGCAGGGTAGCTGCTTGTCCTAAAGCTTCCTGCTGGGCACGTCCTACACT 1 0 269847 CASAVA_Build 7 38569383 3D GTCTTCTGTA AGG/--- AGAAGACTCT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 AGG 1 0 269848 CASAVA_Build 7 38572434 1D TTGTTTATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 T 10 9 269849 CASAVA_Build 7 38575388 1D TCTACTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1291 het 1291 ref 50 37 3 10 A 12 11 269850 CASAVA_Build 7 38600858 1D TGTATAGTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 9 8 269851 CASAVA_Build 7 38611215 1I GAAGCCTTTT -/G GGGTACTGAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 3 4 269852 CASAVA_Build 7 38615884 1I TTGCAGGTGC -/T TGTGTTAATG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 1 2 269853 CASAVA_Build 7 38623975 1I TATGGAATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 10 269854 CASAVA_Build 7 38630672 1D CAGTCATGGT A/- AAAAAAAAAA 1101 het 1101 ref 20 9 4 8 A 17 16 269855 CASAVA_Build 7 38630796 3D TGGGCAAAAA AAT/--- AAATAAATAA 1102 het 445 hom 14 3 7 5 AAT 1 0 269856 CASAVA_Build 7 38640184 1I TTTACTTTTT -/C TCTGCTTCCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 269857 CASAVA_Build 7 38647432 1I TTTTCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 997 hom 33 3 23 7 T 10 11 269858 CASAVA_Build 7 38649491 1I CCTACTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 10 11 269859 CASAVA_Build 7 38650225 1I TCACAATTTT -/C CCTGGGTTGG 3070 hom 107 het 42 0 36 6 C 2 3 269860 CASAVA_Build 7 38656766 1D TAAGAAATGC A/- AATCAAAACC 3070 het 3070 ref 30 17 8 5 A 3 2 269861 CASAVA_Build 7 38665315 1D GAGGTGTCTG A/- AATACCTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 A 3 2 269862 CASAVA_Build 7 38669675 3I TGGCAAAGAC ---/ACA ACAAGAAAAG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 ACA 1 2 269863 CASAVA_Build 7 38671675 1D AACTCCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2556 hom 33 15 9 9 A 14 13 269864 CASAVA_Build 7 38677605 1D CCCAGCGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 37 het 44 1 33 10 T 9 8 269865 CASAVA_Build 7 38682681 2D ATGCTGTCTT TA/-- TATAGGCACT 3070 hom 120 het 43 0 41 4 TA 3 2 269866 CASAVA_Build 7 38707778 1D GGCCACTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1801 hom 19 6 8 5 T 12 11 269867 CASAVA_Build 7 38714275 1D TCAGCACTCA T/- TTTTTCTGCT 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 T 6 5 269868 CASAVA_Build 7 38716544 1I TTCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 2250 het 2250 ref 24 11 8 5 T 12 13 269869 CASAVA_Build 7 38723047 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2733 hom 21 8 9 4 T 9 8 269870 CASAVA_Build 7 38730784 2I AATGGCGCGA --/TC TCTCAGCTCA 2881 het 2881 ref 23 12 7 4 TC 2 3 269871 CASAVA_Build 7 38735537 2I TATGAATGTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 GT 8 9 269872 CASAVA_Build 7 38737910 1D ATGAAATATT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 A 9 8 269873 CASAVA_Build 7 38748888 1I TACCAAACTT -/A AAAAAAAAAA 2444 het 1829 hom 22 6 8 8 A 14 15 269874 CASAVA_Build 7 38749212 1D CAAAAAAAAA C/- CACACCAACA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 C 2 1 269875 CASAVA_Build 7 38756937 1I AAGGGCTGTT -/A AATCACCCAC 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 A 2 3 269876 CASAVA_Build 7 38771531 1I TCTTATATAT -/G TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 21 8 8 5 G 0 1 269877 CASAVA_Build 7 38777406 1I AGGATGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1766 hom 27 7 13 7 A 14 15 269878 CASAVA_Build 7 38779445 1D GATTGGACAC T/- TTTCAGTTGT 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 T 4 3 269879 CASAVA_Build 7 38783497 1I TCTTTCCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 9 10 269880 CASAVA_Build 7 38786561 1D TCAGGAGGAT A/- AAAGCATTCC 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 4 3 269881 CASAVA_Build 7 38796433 3I CCATTAATAA ---/TCT TCTTTTTTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TCT 1 2 269882 CASAVA_Build 7 38810301 1D CAACACAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 T 10 9 269883 CASAVA_Build 7 38813564 4D GCTTAAAGAC AAAT/---- AAAGGACTGT 3070 het 3070 ref 40 20 18 4 AAAT 1 0 269884 CASAVA_Build 7 38816528 1D TGTTGCATAC T/- TTGAAAAGTA 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 3 2 269885 CASAVA_Build 7 38822050 8D AATAAACTAC TATATATA/-------- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 9 18 5 TA 9 5 269886 CASAVA_Build 7 38828322 2D AAAACAAAAC TG/-- AAATATAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 6 TG 1 0 269887 CASAVA_Build 7 38834437 1D AAGTCATGAC A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 33 7 23 3 A 8 7 269888 CASAVA_Build 7 38842809 4D ACCAAGTAAA CAGT/---- CAATGTGCAT 3070 het 3070 hom 27 11 13 7 CAGT 1 0 269889 CASAVA_Build 7 38852523 1I TCTTCTGCAT -/G GAGTCATCAA 3070 het 3070 hom 62 24 31 7 G 1 2 269890 CASAVA_Build 7 38859748 14D TAATGGCCTT GAACCCCAAAGAAA/-------------- GAACCACCAG 2324 het 2324 ref 32 24 6 6 GAACCCCAAAGAAA 1 0 269891 CASAVA_Build 7 38860976 1I AAGAAGTGGA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 1965 hom 28 9 12 7 G 1 2 269892 CASAVA_Build 7 38871561 1I AAACACACAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 9 10 269893 CASAVA_Build 7 38879589 1D AGAAAAAAGG T/- TTTCATGCAG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 4 3 269894 CASAVA_Build 7 38889798 4I AATGATCAAC ----/CAGT CAATCTTGGA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 CAGT 0 1 269895 CASAVA_Build 7 38891116 1D TGTACTATAC T/- CTAAACTCTT 3070 het 3070 ref 42 24 14 5 T 1 0 269896 CASAVA_Build 7 38895316 4D GTTCCACAGG GAAA/---- GAGAGTGGGA 3070 het 3070 ref 21 14 7 1 GAAA 1 0 269897 CASAVA_Build 7 38897124 1D TCAAAATGAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 1276 hom 40 7 23 10 T 8 7 269898 CASAVA_Build 7 38897150 1D TATCTCAAGG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 2202 hom 38 7 20 11 A 8 7 269899 CASAVA_Build 7 38901593 3I TCTGACTTTC ---/TAT TTTCTTCCTA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 TAT 0 1 269900 CASAVA_Build 7 38905081 1D AAAGAACAAG A/- AAAAAATGGG 3070 het 3070 hom 41 19 16 7 A 7 6 269901 CASAVA_Build 7 38914339 1I CAGCCCTGTT -/A AACTTGTGAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 2 3 269902 CASAVA_Build 7 38917847 18I AATCACCTGC ------------------/TTTTTTTCTTGCACATGA TCAGTCCACC 3010 het 3010 ref 25 12 9 4 TTTTTTTCTTGCACATGA 0 1 269903 CASAVA_Build 7 38919176 3D CCCAATAACA ATC/--- TTGTAAAATA 3070 het 3070 hom 32 12 17 6 ATC 1 0 269904 CASAVA_Build 7 38919582 1I ATGTGATTGG -/T TAGGGGTGGA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 T 1 2 269905 CASAVA_Build 7 38920023 1I TTGTTTTAAC -/T TGTATGTCTT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 T 1 2 269906 CASAVA_Build 7 38921117 1D AAGATAGGCC G/- GGCGCAGTGG 3070 het 1827 hom 13 5 7 1 G 3 2 269907 CASAVA_Build 7 38928910 1I AGAGTGAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 12 2 A 11 12 269908 CASAVA_Build 7 38932722 1D ATCATGTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 10 9 269909 CASAVA_Build 7 38938603 1D CTTTAAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 23 1 15 9 A 14 13 269910 CASAVA_Build 7 38941505 19D AAAATTGTTT AATTTTTAAAAAATTGTTA/------------------- AATTGTAAAA 3070 hom 67 het 23 0 22 6 AATTTTTAAAAAATTGTTA 1 0 269911 CASAVA_Build 7 38946253 1D GGGAGGCTGA G/- GGGGGGAGGA 3070 hom 16 het 26 1 22 3 G 7 6 269912 CASAVA_Build 7 38960372 1I ATTTTTGTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 8 9 269913 CASAVA_Build 7 38969940 4I TTTCATTTTC ----/TTTT TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 13 269914 CASAVA_Build 7 38980280 1D CAGAGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 43 2 32 10 A 12 11 269915 CASAVA_Build 7 38985330 2D CTCCTAAAAG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 11 9 269916 CASAVA_Build 7 38985997 1D ATTTCTGGTG A/- AAAAATCAGG 3070 hom 97 het 36 0 33 3 A 6 5 269917 CASAVA_Build 7 38987648 1D TAGTTGTTAA T/- AAAAACAACA 3070 hom 109 het 38 0 36 3 T 1 0 269918 CASAVA_Build 7 38989521 1D CCCTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 231 hom 32 3 18 12 T 13 12 269919 CASAVA_Build 7 38996374 4D TGGAAAACTT AAAA/---- AAAATCCTGT 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 8 4 269920 CASAVA_Build 7 39003274 1D ATTTCCACCT G/- CTCTGTGTTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 1 0 269921 CASAVA_Build 7 39007791 6D ATAATGGTGG TGGTGA/------ TGGTGATGGT 3070 hom 190 het 72 0 57 22 TGGTGA 4 3 269922 CASAVA_Build 7 39011762 1I TTAGTTTTTG -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 7 8 269923 CASAVA_Build 7 39024587 1D ACCATTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 51 1 42 8 T 12 11 269924 CASAVA_Build 7 39026904 1D CTAGGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 35 1 28 7 T 12 11 269925 CASAVA_Build 7 39042047 1I CAAATAAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 30 0 25 5 T 9 10 269926 CASAVA_Build 7 39043626 3D ATGAAGGTTG TCT/--- TCTTTTTTGT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TCT 2 1 269927 CASAVA_Build 7 39046283 8I GACTGAGTTA --------/ATCCAGAT ATCCAGATAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 ATCCAGAT 2 3 269928 CASAVA_Build 7 39051671 1D CTTTAGCTTG T/- TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 49 38 3 8 T 11 10 269929 CASAVA_Build 7 39120513 2I CATGGGTCAA --/TG TGCATAGGTG 3070 hom 123 het 49 0 41 8 TG 1 2 269930 CASAVA_Build 7 39154231 1I CAACTAGGGT -/G GGCCCTTCTG 3070 hom 122 het 47 0 40 7 G 2 3 269931 CASAVA_Build 7 39248506 1D TTTGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 12 11 269932 CASAVA_Build 7 39253648 4D GCAAGCAAAC AAGT/---- AAGCGGAGGC 3070 het 3070 ref 40 24 13 6 AAGT 1 0 269933 CASAVA_Build 7 39262262 1D GATACACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 11 14 T 13 12 269934 CASAVA_Build 7 39263519 1D TTTTGAAGGG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 37 9 24 4 A 8 7 269935 CASAVA_Build 7 39265280 1I AGACTATAGA -/T TATTAAGAGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 2 269936 CASAVA_Build 7 39266121 5D ACCACAAGCA CACAC/----- CACACCACAC 3070 hom 197 het 75 0 66 10 CACAC 3 2 269937 CASAVA_Build 7 39267190 4D TACACACATG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 44 18 14 16 CA 13 11 269938 CASAVA_Build 7 39268861 3I TAGTTGTAGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 52 21 15 16 TTG 5 6 269939 CASAVA_Build 7 39269798 4D CACACACACG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 37 16 19 4 CA 8 6 269940 CASAVA_Build 7 39272898 4I TTGATATATA ----/TATC TATGTTGTAT 3070 hom 52 het 27 0 21 6 TATC 0 1 269941 CASAVA_Build 7 39283795 1I23M1I TGCTTTGGTT -AACTTTCCCTTAACAAACTTTCA-/AAATTTTCCCTTAACAAACTTTCAT GAGGTTGGGC 3070 het 635 hom 27 4 9 16 N/A 0 0 269942 CASAVA_Build 7 39285425 5D GACCTTCCCA GGTGT/----- CCTAAGCAGC 3070 het 3070 ref 29 18 11 2 GGTGT 1 0 269943 CASAVA_Build 7 39294006 1D ATACGCAGCA C/- CCAGCCCAGG 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 C 3 2 269944 CASAVA_Build 7 39298162 1D CAGAAGGGGG A/- AAAAAACTGA 3070 het 3070 ref 35 16 15 6 A 7 6 269945 CASAVA_Build 7 39306983 1D TGAGAGTCCT G/- GGGGTTAGGA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 G 5 4 269946 CASAVA_Build 7 39310669 1I AAGACAGGAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 8 9 269947 CASAVA_Build 7 39318314 1D TAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 10 9 269948 CASAVA_Build 7 39319181 1D ATCCACTCAG C/- AAACAGAGGA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 C 1 0 269949 CASAVA_Build 7 39322969 1D ACTTGATTTT G/- TTAACCACCT 3070 het 3070 hom 56 21 27 8 G 1 0 269950 CASAVA_Build 7 39325550 1I GGTATTGTGG -/T TTTTTGGAAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 5 6 269951 CASAVA_Build 7 39327223 5I TAGTACTATT -----/ATAAC ATAACAATAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 6 ATAAC 1 2 269952 CASAVA_Build 7 39345207 1I TTGAATTTTT -/A AAAAAAAAAA 2876 het 2876 ref 43 22 9 12 A 15 16 269953 CASAVA_Build 7 39346224 2D GCAGAGGGAC CA/-- CACAAAACTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 7 CA 3 2 269954 CASAVA_Build 7 39346868 65D GGAATGGATA GGTGCATTCATATATATATATATATATATATGACTTTAAACTTCAGAAAACCATTTTTAACTTAG/----------------------------------------------------------------- GTGTCTTTAA 3070 het 3070 ref 36 25 17 5 GGTGCATTCATATATATATATATATATATATGACTTTAAACTTCAGAAAACCATTTTTAACTTAG 1 0 269955 CASAVA_Build 7 39348312 10I CTGAGAAGAT ----------/ACAGAACTAA GTTAAACAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 ACAGAACTAA 0 1 269956 CASAVA_Build 7 39350776 1D CAAACCCCCT C/- CCCCCCCAGC 3070 het 2005 hom 28 7 13 8 C 8 7 269957 CASAVA_Build 7 39383848 2D GACCTGAAAC AT/-- GTAGGTTTAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 AT 1 0 269958 CASAVA_Build 7 39390692 1D AAAAAATGAC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 A 9 8 269959 CASAVA_Build 7 39394450 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 8 9 269960 CASAVA_Build 7 39435243 3D TAATAATAAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1575 hom 18 6 9 4 A 13 10 269961 CASAVA_Build 7 39442677 1D AAATATAAAA T/- CATGTCGTCT 3070 het 3070 hom 28 12 16 0 T 1 0 269962 CASAVA_Build 7 39444069 1D AGTGAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2668 hom 19 6 10 3 T 11 10 269963 CASAVA_Build 7 39445309 1I CAACCCCTGG -/T TTTTTTTTTT 1123 het 1123 ref 12 5 3 4 T 10 11 269964 CASAVA_Build 7 39447067 1D ATGGTCAAGT C/- CCTCTTCTGT 3070 het 3070 ref 46 23 15 9 C 3 2 269965 CASAVA_Build 7 39447490 7I TACTTGGAGT -------/TGAGTCG TGAGTACATG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 TGAGTCG 0 1 269966 CASAVA_Build 7 39450318 1D GTATTTTTTT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 8 7 269967 CASAVA_Build 7 39464509 1D TTAGCAAGTG C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 C 1 0 269968 CASAVA_Build 7 39471196 1D AAGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 278 hom 41 1 38 2 A 11 10 269969 CASAVA_Build 7 39475524 1I AAATACCAGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 A 8 9 269970 CASAVA_Build 7 39481592 4D GGGGATCAGC AGAG/---- AGAGCCCTGG 3070 het 3070 hom 36 18 16 5 AG 4 2 269971 CASAVA_Build 7 39485602 1I AATGTACAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2268 hom 17 8 7 2 A 9 10 269972 CASAVA_Build 7 39487197 1D TAACTGAGTT G/- AAGTACAATA 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 G 1 0 269973 CASAVA_Build 7 39487658 1I TCTTTTCTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 138 het 57 0 47 10 G 0 1 269974 CASAVA_Build 7 39493185 1I AGTGTTAGAA -/G TTGGATCCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 269975 CASAVA_Build 7 39506645 1D GAACCTTACA G/- AAGAAAACAG 3070 hom 117 het 42 0 40 3 G 1 0 269976 CASAVA_Build 7 39508105 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1758 het 1758 ref 21 10 5 6 A 17 16 269977 CASAVA_Build 7 39521889 3I ATCTCTGCAT ---/AAC AGGTTACCAC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 AAC 0 1 269978 CASAVA_Build 7 39528703 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1280 het 1280 ref 22 10 4 9 A 11 10 269979 CASAVA_Build 7 39532576 4I TCAGCTGATG ----/AATA GATAAGCAAA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 AATA 0 1 269980 CASAVA_Build 7 39532889 1I AATATACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 10 11 269981 CASAVA_Build 7 39567537 1I CCTAATCATG -/T TTCCTCCTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 3 269982 CASAVA_Build 7 39571569 4D GTTCTTACTG TGCT/---- TATTTAAAAA 3070 het 1589 hom 19 4 14 2 TGCT 1 0 269983 CASAVA_Build 7 39593926 5I TTGTCTATAA -----/ACTTC ACTTCAAGGC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 ACTTC 1 2 269984 CASAVA_Build 7 39594946 1I TAATTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 210 hom 19 1 15 3 T 10 11 269985 CASAVA_Build 7 39612058 1D ATCAGAGTTC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 8 7 269986 CASAVA_Build 7 39612834 1D AAAAAGCACT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 9 8 269987 CASAVA_Build 7 39627999 1I GGAGAAGTGG -/T TTTTGAAACT 3070 het 3070 ref 55 26 22 7 T 4 5 269988 CASAVA_Build 7 39633125 3I CTCTTCCCTC ---/CTT CTAAGCCTGT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 CTT 0 1 269989 CASAVA_Build 7 39649801 1D CCTACATATC A/- AAACCCCGTC 3070 het 2456 hom 22 7 12 3 A 4 3 269990 CASAVA_Build 7 39654540 1D ACTTAATAGC T/- TTTTTTTTTT 1113 het 1113 ref 31 21 3 7 T 12 11 269991 CASAVA_Build 7 39663891 1I ACAAAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 8 9 269992 CASAVA_Build 7 39666466 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2745 hom 30 11 13 6 A 15 14 269993 CASAVA_Build 7 39668038 1D CTGGACATCC A/- GGCGTTTCTA 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 1 0 269994 CASAVA_Build 7 39694521 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2975 hom 33 12 13 8 A 13 12 269995 CASAVA_Build 7 39743216 1D TTATTGAAAG A/- AAAAAAAAAG 818 het 818 ref 46 36 3 7 A 10 9 269996 CASAVA_Build 7 39743829 1D TGCCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 A 11 10 269997 CASAVA_Build 7 39745986 1D ATTTGACCCA G/- ATTAAGATAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 1 0 269998 CASAVA_Build 7 39749085 1D AATTCACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 13 12 269999 CASAVA_Build 7 39756752 1D TACCATTCAT A/- AAATAAGAGA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 4 3 270000 CASAVA_Build 7 39759682 2I TTAACTAGAT --/AA AGAGTGTCAA 2849 het 2849 ref 21 13 6 2 A 1 3 270001 CASAVA_Build 7 39767267 1D ACACTGCCCC T/- GATGGAACAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 T 1 0 270002 CASAVA_Build 7 39783879 1D TGTCTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 13 12 270003 CASAVA_Build 7 39793822 1I ACCTGTCTCA -/C AATACAAATA 2422 het 2422 ref 15 6 5 4 C 0 1 270004 CASAVA_Build 7 39800310 2I CCTCCTGCCT --/CC CAGTGGCCTC 1731 het 1524 hom 13 7 5 1 C 1 3 270005 CASAVA_Build 7 39802486 3D CCGTCCTCGG CTT/--- CTTCACCTGT 3070 het 1790 hom 23 10 9 6 CTT 2 1 270006 CASAVA_Build 7 39807123 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2501 het 2501 ref 30 16 8 6 A 11 12 270007 CASAVA_Build 7 39840952 1D38M3D GAGGGCATCT CCCTGCTCCCCTAAACCCCCTCCCACCCCATCCACGCCCCCT/-CTTGCTCCCTTCAACCCCCTCCCATCCCATCCACGCCC--- ACCTTTCCCA 2204 het 2204 ref 24 24 5 0 N/A 0 0 270008 CASAVA_Build 7 39842514 1D AAGTGTTTTT G/- TTATTACTTT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 G 1 0 270009 CASAVA_Build 7 39845239 2I CCTTGAAAAC --/AT ATAATTGTTT 1238 het 1238 ref 11 6 3 2 AT 1 2 270010 CASAVA_Build 7 39854729 5D AGGTTGCAGT GAGCC/----- GAGATTGTGC 3070 het 294 hom 14 1 11 2 GAGCC 1 0 270011 CASAVA_Build 7 39858811 1D TTTTTTTTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 17 16 2 G 2 1 270012 CASAVA_Build 7 39868537 1D AATTTCAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 40 hom 31 2 22 7 T 10 9 270013 CASAVA_Build 7 39872337 1D AATAGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3060 het 3060 ref 22 8 8 6 T 11 10 270014 CASAVA_Build 7 39876230 1I GGTGAAGGCC -/G GGTGGTTACC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 2 3 270015 CASAVA_Build 7 39877899 1D CAGTTATGGA C/- CTTTGGGTTG 2859 het 2859 ref 47 34 6 7 C 2 1 270016 CASAVA_Build 7 39881614 1D GCTGGTGTCC T/- TTGATACATT 3070 het 3070 hom 22 10 12 1 T 3 2 270017 CASAVA_Build 7 39900908 2D GGAACCAAAC AT/-- ACATCTGGCC 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 AT 1 0 270018 CASAVA_Build 7 39901569 2I CCACACTGTT --/TA TATTCTTGAT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 TA 1 2 270019 CASAVA_Build 7 39906203 1D GTTGGCCATG A/- GTGAGTCTCA 3070 het 3070 ref 56 29 24 4 A 1 0 270020 CASAVA_Build 7 39909339 1I TGAATATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2519 hom 31 7 15 9 A 11 12 270021 CASAVA_Build 7 39923524 2I GGCACTCAGC --/CA ATTGGTGGTA 3070 het 3070 hom 54 22 28 4 CA 0 1 270022 CASAVA_Build 7 39929113 1I CTTTGTCATC -/A AATGTTGATA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 2 3 270023 CASAVA_Build 7 39944937 23D CAGGGAAACC ATGTCTCTACTGAAAATACAAAA/----------------------- ATTAGCTGGG 3070 hom 39 het 14 0 12 5 ATGTCTCTACTGAAAATACAAAA 1 0 270024 CASAVA_Build 7 39945439 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 18 1 15 2 A 12 11 270025 CASAVA_Build 7 39955200 2D ACTCAGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1809 het 52 hom 31 1 9 21 A 20 18 270026 CASAVA_Build 7 39958954 4D CTTTCTTGCC TTTT/---- TTGTTATATA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 6 2 270027 CASAVA_Build 7 39965966 1D TACTAACTTG T/- TTTTTTTTTT 2573 het 2487 hom 28 12 9 7 T 15 14 270028 CASAVA_Build 7 39966340 1D CATTTGATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 29 2 21 6 T 11 10 270029 CASAVA_Build 7 39973307 1D ATCCCAGTAC T/- TTGGGAGCCT 3070 hom 63 het 22 0 22 1 T 3 2 270030 CASAVA_Build 7 39976589 3D ACTGTTGTCA TCT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 23 16 6 TCT 1 0 270031 CASAVA_Build 7 39996059 5D GGCGCCCGCC ACCAA/----- GCCCGGCTAA 2488 hom 18 het 7 0 7 0 ACCAA 1 0 270032 CASAVA_Build 7 40013060 3D CACATTAACA TTC/--- TTCTTTTTCC 3070 hom 60 het 23 0 21 4 TTC 2 1 270033 CASAVA_Build 7 40017830 1D GGAGTAAGAC T/- TTATGATCTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 3 2 270034 CASAVA_Build 7 40019036 1D ACTCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 2260 het 1846 hom 22 8 8 6 A 17 16 270035 CASAVA_Build 7 40027614 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 9 8 270036 CASAVA_Build 7 40031291 1I AGTATCTCTT -/C CTGATAGCTG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 C 1 2 270037 CASAVA_Build 7 40058300 4I TGACACTTTA ----/TTTG TTTGTTTATT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 TTTG 1 2 270038 CASAVA_Build 7 40083153 1I TGCCTATTTG -/T TTATAGCATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 3 270039 CASAVA_Build 7 40097637 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 953 het 953 ref 22 17 4 1 A 12 11 270040 CASAVA_Build 7 40101671 1I ACAGTTTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 32 1 21 10 A 11 12 270041 CASAVA_Build 7 40118788 1I TTAACCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 T 13 14 270042 CASAVA_Build 7 40128303 1I TGTCTCTATG -/A AAAAAAAAAA 804 het 804 ref 38 22 6 10 A 15 16 270043 CASAVA_Build 7 40144790 1D CATCCTGTGA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 92 het 35 0 31 4 T 8 7 270044 CASAVA_Build 7 40199095 1I GTAGTAGTGT -/A TTTTTTTTTT 2058 het 669 hom 24 9 10 5 A 0 1 270045 CASAVA_Build 7 40244777 4D AATTTTACTT ATTA/---- ATTAATTAAT 3070 het 3070 ref 28 11 9 12 ATTA 4 3 270046 CASAVA_Build 7 40248044 2I CTCTGTCTCC --/AA AAAAAAAAAA 629 het 629 ref 24 11 4 9 A 16 18 270047 CASAVA_Build 7 40256522 1D AGATCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2134 het 1550 hom 15 4 5 6 T 12 11 270048 CASAVA_Build 7 40258019 5D TTCTCCTTTC TTCGG/----- TTGTTAATAG 3070 het 3070 ref 29 14 13 4 TTCGG 1 0 270049 CASAVA_Build 7 40273150 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 45 het 24 0 16 8 AAAC 3 4 270050 CASAVA_Build 7 40273164 2I AAACAAACAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 het 861 hom 27 7 11 9 AC 0 1 270051 CASAVA_Build 7 40277020 1D ATTTTAAGAG T/- ATAAGTTTGT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 1 0 270052 CASAVA_Build 7 40279024 1I CTTCAGGTGA -/T TCTACTCGCC 2614 het 2087 hom 17 5 6 6 T 1 2 270053 CASAVA_Build 7 40284966 1I TTTTTTTTTT -/A AAAGAGATAC 3070 het 502 hom 36 2 26 8 A 3 4 270054 CASAVA_Build 7 40287361 1D TTGAGAAAAG C/- CCGTGAATGT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 C 3 2 270055 CASAVA_Build 7 40287953 1D TGTTTTAGAT G/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 36 10 23 4 G 1 0 270056 CASAVA_Build 7 40291616 1D TTTCTTTTTT C/- GGGGGGGGGC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 1 0 270057 CASAVA_Build 7 40294842 1D TGATTATATA T/- TTTATTCAAC 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 4 3 270058 CASAVA_Build 7 40297791 1D ATAATAAAAT A/- AAAAAATATA 2966 het 157 hom 7 1 6 0 A 7 6 270059 CASAVA_Build 7 40301719 4I ACAAACAAAC ----/AAAT AAATAAAAGA 3070 het 1879 hom 19 7 10 2 AAAT 1 2 270060 CASAVA_Build 7 40305773 1I TATGTAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 11 12 270061 CASAVA_Build 7 40312099 1D AGTTATTTTA T/- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 T 4 3 270062 CASAVA_Build 7 40313940 1I TCTGAAAAAA -/T CTGTTCACCT 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 0 1 270063 CASAVA_Build 7 40315425 1I GATATCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 T 10 11 270064 CASAVA_Build 7 40315914 18I CCCACACAGC ------------------/GATGTGTGGTGTGTGAGA GAGAGGGACA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 GATGTGTGGTGTGTGAGA 0 1 270065 CASAVA_Build 7 40316017 2D AAAAAGTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 26 1 21 4 A 15 13 270066 CASAVA_Build 7 40318585 1D TGGTGAAATT A/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 1 0 270067 CASAVA_Build 7 40319757 5D GTTTGTTTGT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 3070 het 2538 hom 19 8 10 2 TTTTG 1 0 270068 CASAVA_Build 7 40320898 4D ATGTTGGTCA GGCT/---- GGTCTCGAAC 2395 hom 7 het 7 0 5 2 GGCT 1 0 270069 CASAVA_Build 7 40321237 1D CTGCTTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 8 7 270070 CASAVA_Build 7 40323267 2D TTTTTTTTTT TC/-- CCACCTAAAA 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 TC 1 0 270071 CASAVA_Build 7 40324500 2I GTATTTTAAC --/AG AGAACAATGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 1 2 270072 CASAVA_Build 7 40326380 1I ACAGGCATAA -/G CAAAAACGCC 3070 het 1364 hom 17 3 14 1 G 0 1 270073 CASAVA_Build 7 40326892 1D ATATAGTGGG A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 A 7 6 270074 CASAVA_Build 7 40327257 1I CTGGAGTGTA -/G TGGTGCGATC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 G 0 1 270075 CASAVA_Build 7 40331357 1I ATGTTAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 9 10 270076 CASAVA_Build 7 40333401 1D GATCCTGGTT A/- AATTTGGAAC 3070 hom 93 het 32 0 30 3 A 3 2 270077 CASAVA_Build 7 40336607 1I GAAGATCCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 23 18 13 T 11 12 270078 CASAVA_Build 7 40336815 4D ATGGGGGGGC ATTT/---- ATTTACTTTA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 ATTT 2 1 270079 CASAVA_Build 7 40337728 3I GGCCTGCTGC ---/TGT TATCTTTATC 3070 het 3070 ref 61 26 26 9 TGT 0 1 270080 CASAVA_Build 7 40338568 1D CTGCATTGGA T/- TTTTTTTTTT 2380 het 158 hom 19 2 7 10 T 11 10 270081 CASAVA_Build 7 40348772 1D AAACGTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 21 0 11 10 T 13 12 270082 CASAVA_Build 7 40349674 1I AGAACAGAAT -/C CCTTTGGCCG 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 C 2 3 270083 CASAVA_Build 7 40360766 1D ATGGAGTTTA G/- GGGTATAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 G 4 3 270084 CASAVA_Build 7 40373575 1D AATTACCCAG A/- AAAAAAAAAT 2741 het 265 hom 10 1 7 2 A 10 9 270085 CASAVA_Build 7 40377851 4D CCTTATTGTC TTAA/---- TTGTCACTGT 2651 het 2651 ref 30 21 6 4 TTAA 1 0 270086 CASAVA_Build 7 40381843 5I CAATTTATAA -----/TTGTT TTGTCTTAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTGTT 0 1 270087 CASAVA_Build 7 40382871 1I ATAATCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 11 12 270088 CASAVA_Build 7 40384239 1D17M1D GTGTAGGATA TTTTTTTTTTCCAAAAAAG/-TTTTTTTTTCCAAAAAA- ATGGTACATT 3070 hom 111 het 37 0 38 5 N/A 0 0 270089 CASAVA_Build 7 40387599 2I AATCTTAAAA --/CT GTCTTCAGAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 0 1 270090 CASAVA_Build 7 40390882 6D TTGGCCAGGC TGGTTT/------ TGAATGCCTG 3070 hom 33 het 13 0 9 6 TGGTTT 1 0 270091 CASAVA_Build 7 40391850 1D GTTTCATTCC T/- TTCCTCAAAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 3 2 270092 CASAVA_Build 7 40397721 1D CCATCTCACA C/- CAGTTCGAAT 1915 het 1915 ref 20 16 4 0 C 2 1 270093 CASAVA_Build 7 40400310 1D TAAAAAAAAA T/- AATGATGCCG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 1 0 270094 CASAVA_Build 7 40415400 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTGAGAC 1698 het 1698 ref 20 14 4 2 T 6 5 270095 CASAVA_Build 7 40418075 1D AAGAACATAA T/- TTTTTTGATG 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 7 6 270096 CASAVA_Build 7 40423854 4I ATTATTCATG ----/TTTT CTATTAATTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 4 270097 CASAVA_Build 7 40424025 2I ACATTTAATT --/TC TGTTATTTTG 3070 het 3070 hom 29 8 12 9 TC 0 1 270098 CASAVA_Build 7 40435247 1D ATAATTACCG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 49 20 23 7 T 10 9 270099 CASAVA_Build 7 40460743 1I CCAGAGGGGG -/A AAAAAATGTA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 6 7 270100 CASAVA_Build 7 40475846 1I GTCATCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 35 0 27 8 T 10 11 270101 CASAVA_Build 7 40537725 4D TTCCTATCTA TCTT/---- CACAGCCATG 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 TCTT 1 0 270102 CASAVA_Build 7 40663634 1I GTGAGGTAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 9 10 270103 CASAVA_Build 7 40798171 1D GTTGGCCTAA G/- ATGAGTAAAT 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 G 1 0 270104 CASAVA_Build 7 40873256 3D TTATATATAT ATA/--- ATAAGATTAA 1246 het 997 hom 6 2 3 1 ATA 2 1 270105 CASAVA_Build 7 40904019 24D TGTAAAATGG ACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGA/------------------------ ACCAATCAGC 1822 het 1330 hom 17 8 7 15 ACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGA 1 0 270106 CASAVA_Build 7 40907638 3D TGCATCCAAT AAG/--- AAGGTCATCC 3070 het 3070 hom 48 21 20 9 AAG 2 1 270107 CASAVA_Build 7 40940802 1I CAGGCTGCAG -/C CTTGCAGGTC 2948 hom 41 het 20 0 12 8 C 1 2 270108 CASAVA_Build 7 40946023 1I GTTTTATGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 9 270109 CASAVA_Build 7 40948892 1D ATTCTCTGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 T 10 9 270110 CASAVA_Build 7 40950903 1I ACAGAATTGG -/A AAAAAACTAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 6 7 270111 CASAVA_Build 7 40953625 1I ACTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 T 11 12 270112 CASAVA_Build 7 40962806 4I TTTGTTTGCT ----/CTTG CTTCTCTAGT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CTTG 0 1 270113 CASAVA_Build 7 40969878 3I TGTTTCTGGC ---/AGA AGATGTGCCT 3070 hom 153 het 58 0 53 5 AGA 1 2 270114 CASAVA_Build 7 40978639 1I TGGGCCCAGA -/G GGACACTTTG 3070 hom 112 het 41 0 38 3 G 2 3 270115 CASAVA_Build 7 40988261 3D TTCAACGTAT ATA/--- AAGCACTTAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 ATA 1 0 270116 CASAVA_Build 7 40995018 1D ATTTTTGTAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 T 9 8 270117 CASAVA_Build 7 40998784 10D TAGGAGGTAT GTATGAAGTA/---------- GTTCTGGTTA 3070 het 3070 ref 41 19 17 8 GTATGAAGTA 1 0 270118 CASAVA_Build 7 41000532 1D CACCCCCCCA T/- TTTGGAAGCC 3070 het 3070 hom 44 17 24 4 T 4 3 270119 CASAVA_Build 7 41000632 2I GAGCACATGC --/TG TGTGCATCAG 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 TG 2 3 270120 CASAVA_Build 7 41006608 1I AACTTAGTTG -/T TTTTTTTTTT 2747 het 2336 hom 37 12 11 14 T 12 13 270121 CASAVA_Build 7 41012571 1I TACCTTGCCC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 8 9 270122 CASAVA_Build 7 41013223 1I AGAGATTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1916 hom 20 5 11 4 T 10 11 270123 CASAVA_Build 7 41019879 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 12 10 T 12 13 270124 CASAVA_Build 7 41029832 8D AATGCTGTGT AAGGAGCA/-------- AAGGAGCAAT 1774 het 1774 ref 32 21 6 11 AAGGAGCA 2 1 270125 CASAVA_Build 7 41029911 3D GTCCTTCACG CCT/--- CCTGTACTTC 3070 het 3070 ref 42 22 19 2 CCT 2 1 270126 CASAVA_Build 7 41043627 1D GTGCTCAGCC T/- TTTTTTTTTT 1261 het 1261 ref 35 27 4 4 T 13 12 270127 CASAVA_Build 7 41048190 5I5M5D AATGGTGAGA -----ATGTAAAATG/CCACTATGGA----- AGACACTATG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 N/A 0 0 270128 CASAVA_Build 7 41058026 1D TCCATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3059 hom 28 het 21 0 10 12 A 15 14 270129 CASAVA_Build 7 41078857 1D GTGGCGGGGC G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 11 10 270130 CASAVA_Build 7 41083063 2I GGTGAATTTG --/AT AGATTTGATG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AT 0 1 270131 CASAVA_Build 7 41083408 1D CATTTTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 A 12 11 270132 CASAVA_Build 7 41089106 2I TGAGGAAAAG --/AC AGGCTACTAT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AC 0 1 270133 CASAVA_Build 7 41089435 3D CCTCTCGCAC TAA/--- TAATCTTCGA 3070 hom 144 het 53 0 48 7 TAA 2 1 270134 CASAVA_Build 7 41100877 1I AGCTTGCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 9 10 270135 CASAVA_Build 7 41111514 1I TTTTTTTTTT -/A AAGATTTTAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 2 3 270136 CASAVA_Build 7 41113298 12D GGTGAGAGTA TTTGGCTAAAAC/------------ TTTGGCCCTT 3070 het 3070 ref 57 29 25 6 TTTGGCTAAAAC 1 0 270137 CASAVA_Build 7 41115500 3I CCTTATGCTA ---/TGT TAACACTGGA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 TGT 0 1 270138 CASAVA_Build 7 41130345 1D GGTTACGGCA T/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 hom 47 19 22 8 T 7 6 270139 CASAVA_Build 7 41132029 1D15M2I GGGACAGATG CCCAATAAGGGAGGCC--/-CCAATAAGGGAGGCCTA TGTGTCTGAA 3070 het 3070 ref 51 33 18 5 N/A 0 0 270140 CASAVA_Build 7 41159714 1D GGGTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2086 hom 27 10 12 5 T 17 16 270141 CASAVA_Build 7 41160263 1D TAAAATATCA G/- GACCCTTGTT 3070 het 3070 hom 65 29 32 4 G 2 1 270142 CASAVA_Build 7 41160545 1I ATCATCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 38 1 32 5 T 10 11 270143 CASAVA_Build 7 41176847 1D CTTTTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 877 het 877 ref 33 24 2 8 A 13 12 270144 CASAVA_Build 7 41179061 1D AGCTCACACA C/- CCCCCCAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 15 11 C 7 6 270145 CASAVA_Build 7 41179204 1I GTGGTCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 T 10 11 270146 CASAVA_Build 7 41193902 6I ATATGAATAC ------/TTTCTT TTTCTTTTTC 3070 het 1427 hom 21 6 10 5 TTTCTT 2 3 270147 CASAVA_Build 7 41195554 1I TCGTTCTTAG -/A AAAAAAAAAG 2836 het 2836 ref 26 16 8 2 A 9 10 270148 CASAVA_Build 7 41195881 2I TGAAAAAAAC --/AT AGAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 AT 0 1 270149 CASAVA_Build 7 41196793 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTGAGC 3070 het 3070 hom 48 24 22 2 T 7 6 270150 CASAVA_Build 7 41205919 1I GGTTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2677 het 2677 ref 22 11 7 4 T 11 12 270151 CASAVA_Build 7 41215935 1D TATTTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2530 hom 22 9 9 4 T 11 10 270152 CASAVA_Build 7 41234687 1I TCAAACAGTA -/G ATCTACTTTC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 G 0 1 270153 CASAVA_Build 7 41235438 4I TGTCTTGATG ----/ATCT ATCTGTCTAG 2698 het 2698 ref 18 12 6 0 ATCT 1 2 270154 CASAVA_Build 7 41237393 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2831 hom 27 9 9 9 T 12 11 270155 CASAVA_Build 7 41239391 2D TTGAAATCAC AT/-- GTCTGATGAA 3070 het 3070 hom 47 21 23 6 AT 1 0 270156 CASAVA_Build 7 41243664 1I TATATAAATG -/C CCCCCCCTAG 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 C 7 8 270157 CASAVA_Build 7 41244697 2D TTGTTAACTG AT/-- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 AT 2 1 270158 CASAVA_Build 7 41254153 2D AGGTAATTAT GG/-- GGGGGGGGAT 3070 het 3070 hom 40 9 25 7 G 10 8 270159 CASAVA_Build 7 41254318 1I ATCTTGGGTA -/G GGGCATGCCC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 3 4 270160 CASAVA_Build 7 41255444 2I AAATGTGTAA --/CT CTATGAATTG 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 CT 1 2 270161 CASAVA_Build 7 41258645 1I AATAAAAAGG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 A 6 7 270162 CASAVA_Build 7 41264541 1I AAGCAAACTA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 7 8 270163 CASAVA_Build 7 41270491 1I AAGCCACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 A 11 12 270164 CASAVA_Build 7 41274335 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 321 hom 40 3 13 24 T 18 16 270165 CASAVA_Build 7 41312638 1D TCATGGTTTG A/- AAAAAAAAAA 1149 het 1149 ref 35 27 3 5 A 12 11 270166 CASAVA_Build 7 41359736 3D AACCTCACTT AGA/--- AGAACAGTAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 AGA 2 1 270167 CASAVA_Build 7 41370523 5I GAAAACTGAA -----/ACAAG ACAAGACAAG 3070 hom 74 het 28 0 23 5 ACAAG 2 3 270168 CASAVA_Build 7 41398335 3I TTTAAGCTTA ---/TTT CTGTAATATG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 0 3 270169 CASAVA_Build 7 41398414 8D TGTGTGTGTA TGTGTATG/-------- TGTGTATGTG 3070 hom 84 het 34 0 29 7 TGTGTATG 2 1 270170 CASAVA_Build 7 41398859 1D AGTTCTTCTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 7 270171 CASAVA_Build 7 41399162 2D10M1D TTTTTCTTTT TCTTTTTTCTTTC/--CTTTTTCTTT- TTTCTTTCTT 2741 het 9 hom 11 1 10 0 N/A 0 0 270172 CASAVA_Build 7 41399856 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2865 het 305 hom 13 1 10 2 A 14 15 270173 CASAVA_Build 7 41399989 1I CTATCAACAA -/C CCCACAAGAG 3070 hom 122 het 46 0 37 9 C 3 4 270174 CASAVA_Build 7 41401970 1I TAGCATGCAA -/C CCCACTATAA 3070 hom 92 het 33 0 31 2 C 3 4 270175 CASAVA_Build 7 41411953 1D TCTTCTATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 192 hom 33 1 25 8 A 13 12 270176 CASAVA_Build 7 41438009 1D ACCCACGTAG C/- TTTTTCGTGT 3070 het 3070 hom 50 19 26 6 C 1 0 270177 CASAVA_Build 7 41462760 2I AAAGAATAAC --/AG AAATTAATGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AG 0 1 270178 CASAVA_Build 7 41463626 1I TCTTTATGGG -/A AATGGATAGA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 2 3 270179 CASAVA_Build 7 41465464 5D CCCATACCAG GCAGA/----- GCAGAACTGT 3070 hom 117 het 43 0 39 7 GCAGA 2 1 270180 CASAVA_Build 7 41466277 1D TGTCTACTAC T/- CCCCACTCAA 3070 hom 101 het 41 0 33 8 T 1 0 270181 CASAVA_Build 7 41470760 1I TTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 12 13 270182 CASAVA_Build 7 41471404 1I CCTTTCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 20 12 T 11 12 270183 CASAVA_Build 7 41474239 1I AATTGCTAAA -/G GAGTAGATTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 270184 CASAVA_Build 7 41505742 1I AACACTTTGC -/A TGAGGAAGAA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 0 1 270185 CASAVA_Build 7 41513627 1D TTCTGACCAC G/- GGGGGTTATT 3070 het 3070 ref 35 13 10 13 G 6 5 270186 CASAVA_Build 7 41528088 6D GAAGGGAAGG GAAGAA/------ GAAGAAGAAG 3070 hom 53 het 25 0 15 10 GAA 6 4 270187 CASAVA_Build 7 41528306 1D GGAAGGAAGG A/- AAAGAAGGAA 3070 hom 95 het 35 0 28 7 A 4 3 270188 CASAVA_Build 7 41542595 1I GTCAAAGGCG -/T TAAGTGAGAA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 1 2 270189 CASAVA_Build 7 41552031 1I AATTTTTATT -/G GGTTTTTCAA 3070 het 3033 hom 27 9 14 4 G 2 3 270190 CASAVA_Build 7 41552065 4D ATAAAAATCA TAAG/---- TAATAGTGCT 3070 het 2542 hom 25 7 11 9 TAAG 1 0 270191 CASAVA_Build 7 41558998 1I CTCCCTGCCA -/G GCTGCTGCCT 3070 hom 78 het 32 0 28 4 G 1 2 270192 CASAVA_Build 7 41581536 1D TAAATTTTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 9 8 270193 CASAVA_Build 7 41585705 1I TATTGATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1130 hom 38 4 30 4 T 10 11 270194 CASAVA_Build 7 41593090 1I AGTCCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 37 1 27 9 T 10 11 270195 CASAVA_Build 7 41594418 1I TACCATGCGA -/G GGGGGGTGAA 3070 hom 42 het 26 0 15 11 G 6 7 270196 CASAVA_Build 7 41613839 6I GTTGTACATT ------/CTTTTA CTTTTCATTT 3070 hom 97 het 38 0 32 6 CTTTTA 0 1 270197 CASAVA_Build 7 41626101 1I CTTTTGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 10 11 270198 CASAVA_Build 7 41629470 1I TCAAGGGGGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 88 het 34 0 30 4 A 7 8 270199 CASAVA_Build 7 41635532 1I TTAAATCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 41 1 36 4 T 10 11 270200 CASAVA_Build 7 41646347 1D AGGTTCATCC T/- TTTTTTTTTT 2716 het 1852 hom 25 10 8 7 T 15 14 270201 CASAVA_Build 7 41655400 7I GAGGATCTCC -------/CCAGGAT CCAGGATCTT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 CCAGGAT 1 2 270202 CASAVA_Build 7 41656020 1I TTTCCTTTCC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 7 8 270203 CASAVA_Build 7 41663793 2I CCAAGGGTAC --/CT ATATATCTAC 3070 hom 56 het 23 0 19 4 CT 0 1 270204 CASAVA_Build 7 41683761 1I AACAAAAAAA -/T ATCCAGGCAT 620 het 620 ref 8 4 3 1 T 0 1 270205 CASAVA_Build 7 41702172 1I TCCCATCTTT -/C CCCACCATTT 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 C 3 4 270206 CASAVA_Build 7 41706593 1I GATTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1499 hom 25 9 12 4 T 11 12 270207 CASAVA_Build 7 41707211 1I TTGTTCACTA -/T TTTTTTTTTC 3033 het 3033 ref 27 16 7 4 T 9 10 270208 CASAVA_Build 7 41713704 1D CTTGGAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1634 hom 38 7 18 13 A 15 14 270209 CASAVA_Build 7 41717123 1I ACCACAGGCT -/G GGCTATGCCT 3070 hom 144 het 55 0 48 7 G 2 3 270210 CASAVA_Build 7 41729764 1I TTCATTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 T 10 11 270211 CASAVA_Build 7 41730471 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1141 hom 18 4 8 6 T 10 11 270212 CASAVA_Build 7 41732990 1D ATGCAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 12 8 A 13 12 270213 CASAVA_Build 7 41735873 1I TTCAATAAAG -/T TAAAGCAGGC 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 T 1 2 270214 CASAVA_Build 7 41743904 1I ATAATTTTCT -/G GGGGGGGAGA 3070 het 2238 hom 19 7 9 3 G 7 8 270215 CASAVA_Build 7 41750175 1I ACATCACCTC -/G CTTTAAGCAT 3070 het 3070 hom 61 23 29 9 G 0 1 270216 CASAVA_Build 7 41754168 1D CTCTTAGCAA C/- TTTTACTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 C 1 0 270217 CASAVA_Build 7 41764654 1I CCATCACCCT -/G GGGGCCAAGC 3070 hom 36 het 18 0 12 6 G 4 5 270218 CASAVA_Build 7 41767577 3I ATTATTTATG ---/TTT GTGGAAAATA 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 T 0 3 270219 CASAVA_Build 7 41776471 1D GTCAGAGGAT G/- GGGGGAAAGG 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 G 6 5 270220 CASAVA_Build 7 41776979 2D GATTGGATAG AT/-- ATACTACAAC 3070 het 3070 hom 21 8 10 4 AT 2 1 270221 CASAVA_Build 7 41778761 1D27M4D AAAGACTTCG TTTTTTTTTTTGTTTGCTTGTTTTTAACCAGT/-TTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTAAC---- CAGTTAGATT 3070 het 3070 hom 36 18 17 10 N/A 0 0 270222 CASAVA_Build 7 41804965 2D ACACACACAC AT/-- ATATGTGCAT 3070 hom 157 het 57 0 53 6 AT 3 2 270223 CASAVA_Build 7 41811121 1D AAAACTTTAG A/- AACATAACAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 3 2 270224 CASAVA_Build 7 41823007 2D TGATTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1972 hom 43 10 16 17 T 16 14 270225 CASAVA_Build 7 41835250 13I TCCCTTAGGA -------------/ATTTCCCTTAGGC ATTTCCCTTA 3070 het 3070 hom 53 17 26 10 ATTTCCCTTAGGC 1 2 270226 CASAVA_Build 7 41850450 3I TCACCATGTT ---/GGC GGCCAGGATG 3070 het 1427 hom 14 4 8 2 GGC 1 2 270227 CASAVA_Build 7 41854259 2D GCTCTGTAGT AA/-- GTTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 43 27 13 5 A 2 0 270228 CASAVA_Build 7 41856044 1I CATAGGAATT -/A AAAAGTATTA 1909 het 1909 ref 28 18 4 6 A 4 5 270229 CASAVA_Build 7 41859724 1D CCTCAGGCTC T/- CTCTTGGGGT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 1 0 270230 CASAVA_Build 7 41866170 1D TCTAGATGTT A/- AAATTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 4 3 270231 CASAVA_Build 7 41878084 1I GCTGACCTAT -/A AAAAGGTCCT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 A 4 5 270232 CASAVA_Build 7 41884101 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2038 het 1705 hom 24 9 5 10 T 15 16 270233 CASAVA_Build 7 41897034 1D ATTGTTGGAC A/- AAAAAAAAAA 2335 het 2335 ref 39 20 9 10 A 14 13 270234 CASAVA_Build 7 41901438 1I CTATCTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 40 1 36 3 T 10 11 270235 CASAVA_Build 7 41903169 1I GCAGAAATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 7 8 270236 CASAVA_Build 7 41908943 1D CCTTAAGAAA C/- TTCACACCTG 3070 het 3070 hom 46 20 25 1 C 1 0 270237 CASAVA_Build 7 41922453 1D TAGAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 40 2 14 24 A 11 10 270238 CASAVA_Build 7 41926061 1D CCACCACACC A/- AGCTAATTTT 3070 het 1950 hom 20 5 10 5 A 2 1 270239 CASAVA_Build 7 41940151 1I AAGGCCTGGA -/G GTCACTCCAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 1 2 270240 CASAVA_Build 7 41941585 1D GCAACAGATA T/- TCCGGGTACA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 2 1 270241 CASAVA_Build 7 41958225 1I CATTTTTCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 A 9 10 270242 CASAVA_Build 7 41965813 1I CTGGGAGGGG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 0 1 270243 CASAVA_Build 7 41967112 1I GTAAGAAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 9 10 270244 CASAVA_Build 7 41973512 1I CACAGTCACA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 7 8 270245 CASAVA_Build 7 41974189 1D TGGTGAATGG A/- AGCTGGCCAC 3070 hom 137 het 52 0 43 9 A 2 1 270246 CASAVA_Build 7 42013347 1D GAGGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 1997 het 295 hom 31 4 14 13 A 19 18 270247 CASAVA_Build 7 42030564 1I GCCCGTGACA -/C CAATTTACTC 3070 hom 129 het 47 0 42 5 C 1 2 270248 CASAVA_Build 7 42099646 5D CAGCTGTTCC TATTA/----- TACTTAAATT 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 TATTA 1 0 270249 CASAVA_Build 7 42109248 1I TGGGGGAGAG -/T TATGTTTCCA 3070 het 3070 hom 45 18 16 11 T 1 2 270250 CASAVA_Build 7 42109590 1I GTATCTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 A 10 11 270251 CASAVA_Build 7 42109867 1I CACCTATCCA -/G AGAGCACCCA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 G 0 1 270252 CASAVA_Build 7 42128593 1I TTCATACCAA -/T TATGGGCTCT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 1 2 270253 CASAVA_Build 7 42134152 6I CAAAAAAAAA ------/AAAAAG AAAAAGAAAA 2012 het 997 hom 16 4 7 5 AAAAAG 2 3 270254 CASAVA_Build 7 42141993 4D TTTCTCTCTG TCTC/---- TCTCTCTCAC 3009 het 3009 ref 40 25 8 9 TC 6 4 270255 CASAVA_Build 7 42160217 1D CAGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1482 het 1482 ref 48 31 6 11 A 13 12 270256 CASAVA_Build 7 42175258 1D GTGTCAATTC A/- AAAAACTTCC 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 6 5 270257 CASAVA_Build 7 42175554 1I CATGATGCTA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 T 7 8 270258 CASAVA_Build 7 42175890 5I AAGAGAAGCA -----/AAGAG AAGAGAAAAG 3070 het 3070 ref 43 27 11 5 AAGAG 1 2 270259 CASAVA_Build 7 42196265 1D TCTTACTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 29 1 20 8 A 13 12 270260 CASAVA_Build 7 42197780 4D GTTTCAAAAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 48 het 21 0 17 5 AT 9 7 270261 CASAVA_Build 7 42198164 1I ACAATCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 36 1 28 7 A 10 11 270262 CASAVA_Build 7 42207331 4D ATGTGATATA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 34 16 11 9 TC 7 5 270263 CASAVA_Build 7 42215945 1I GTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1262 het 1262 ref 33 23 3 7 T 15 16 270264 CASAVA_Build 7 42236223 1D AGGGTTGGGC G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 33 het 14 0 11 4 G 14 13 270265 CASAVA_Build 7 42252031 1D AAAGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 32 1 23 8 A 12 11 270266 CASAVA_Build 7 42255897 2D ACATGCACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 AC 8 7 270267 CASAVA_Build 7 42258310 2I AGATCACGTC --/TT TTGTGAGAAC 3070 hom 126 het 43 0 41 2 T 2 4 270268 CASAVA_Build 7 42259170 4I GTCTTAAATA ----/GAGT ATTTCAAGAT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 GAGT 0 1 270269 CASAVA_Build 7 42267564 4D GATCACTCCT CATC/---- CATCCATCCA 3070 hom 97 het 43 0 28 17 CATC 5 4 270270 CASAVA_Build 7 42269076 1D ATATCTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 31 12 T 13 12 270271 CASAVA_Build 7 42269577 3I TTTTATTTAT ---/TTA TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TTA 0 1 270272 CASAVA_Build 7 42278712 1I AGCTGCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 T 10 11 270273 CASAVA_Build 7 42278927 1D TCACAAACTG T/- TAAGATTAGT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 2 1 270274 CASAVA_Build 7 42303744 5D AAAACCAAAT CAAAC/----- CAAACCAAAC 3070 hom 84 het 36 0 28 9 CAAAC 4 3 270275 CASAVA_Build 7 42307608 1D TTCTTATTGA T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 7 6 270276 CASAVA_Build 7 42313546 1I TCAGAATGGT -/A AGGACCCTCA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 1 2 270277 CASAVA_Build 7 42314296 1D GATGATTTTT G/- TAAATGGTGA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 G 1 0 270278 CASAVA_Build 7 42318513 4I TCGTGAGAAC ----/CCAA CCAACCCCTG 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 CCAA 1 2 270279 CASAVA_Build 7 42320723 1D GAATCATTAA G/- TCTATATTCC 3070 het 3070 hom 31 8 20 4 G 1 0 270280 CASAVA_Build 7 42321862 1I GTGGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 10 11 270281 CASAVA_Build 7 42322084 2D TGCAATGACT TC/-- TTTTTTTTTA 1888 het 490 hom 31 4 7 20 TC 1 0 270282 CASAVA_Build 7 42327895 1D ACCTTTTGTC T/- TTTTGATTAC 3070 het 3070 ref 44 24 14 8 T 5 4 270283 CASAVA_Build 7 42329225 23D ACATTTATTT TGAATTCTTTGTCAATCAGTTCA/----------------------- TGAATTCTTT 3070 het 3070 hom 44 21 21 11 TGAATTCTTTGTCAATCAGTTCA 1 0 270284 CASAVA_Build 7 42330260 1D TTTCTACATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 35 0 29 7 T 10 9 270285 CASAVA_Build 7 42330968 3D AAACCACAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 AAC 7 6 270286 CASAVA_Build 7 42338211 21D TTATTTTTAT TTTTTAGAGACTGGGTCCCAC/--------------------- TTTGTCACCC 3070 het 3070 hom 32 13 17 6 TTTTTAGAGACTGGGTCCCAC 1 0 270287 CASAVA_Build 7 42340045 1D AGTCATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 26 4 12 10 A 17 16 270288 CASAVA_Build 7 42342527 1I AAATCCATCA -/T TTGAGATGCA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 2 3 270289 CASAVA_Build 7 42344097 1D ACTTGAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1329 hom 39 7 17 15 A 17 16 270290 CASAVA_Build 7 42349720 1I CATGTGCGCA -/G GCACGCCACA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 G 1 2 270291 CASAVA_Build 7 42362217 1D ATAACTACGG A/- AAAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 6 5 270292 CASAVA_Build 7 42433776 1D AGCTCACTGT G/- GGGGGGTACA 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 G 7 6 270293 CASAVA_Build 7 42444299 1D TTTTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 25 3 12 10 T 11 10 270294 CASAVA_Build 7 42469453 1D CGGGCACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 T 13 12 270295 CASAVA_Build 7 42471304 1D CATTCTACCC T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 7 6 270296 CASAVA_Build 7 42474358 1I TGGCTCCTTA -/T TTGCGATAGA 3070 het 3070 ref 56 28 22 6 T 2 3 270297 CASAVA_Build 7 42483419 3I GGAAGGAGGG ---/AGA AGAAGAGAGG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 AGA 2 3 270298 CASAVA_Build 7 42489566 1D ATTTTCACTC T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 48 16 27 5 T 8 7 270299 CASAVA_Build 7 42495933 1D GACAAAAAAA T/- ATGGTCTCTT 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 T 1 0 270300 CASAVA_Build 7 42496586 8D GCTGATCTTG ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 20 16 1 AT 10 6 270301 CASAVA_Build 7 42497249 1I ATTTGCACAT -/C CCACTCCATG 3070 het 3070 ref 59 26 22 11 C 2 3 270302 CASAVA_Build 7 42498177 1I TTGGCTTTTC -/T TTTTTTTTTA 2660 het 2660 ref 33 12 9 12 T 9 10 270303 CASAVA_Build 7 42502071 1D TGATTACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 T 11 10 270304 CASAVA_Build 7 42504505 10D CAGTAAACAT GTATAGTGTA/---------- GTTTTAGAAT 3070 het 3070 hom 66 31 34 5 GTATAGTGTA 1 0 270305 CASAVA_Build 7 42507566 1D ACTCTTCCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 83 het 33 0 28 6 T 10 9 270306 CASAVA_Build 7 42512744 1D TGAAACTCAC T/- GCTGATCTAG 3070 het 3070 ref 54 27 22 6 T 1 0 270307 CASAVA_Build 7 42523217 1I ACCAAAAAAA -/C ATTTTTAAGG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 C 0 1 270308 CASAVA_Build 7 42523607 2D GTGTGTGTGT GA/-- GAGAGAGAGA 737 het 737 ref 35 18 5 13 GA 8 7 270309 CASAVA_Build 7 42528386 1I TAGCCAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1010 hom 26 4 11 11 A 15 16 270310 CASAVA_Build 7 42531630 1I ATAGTTCTAT -/G GAATAATTTC 3070 hom 102 het 42 0 34 8 G 1 2 270311 CASAVA_Build 7 42532055 1D AGTGATTACA G/- GGGGCAGAGT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 G 5 4 270312 CASAVA_Build 7 42532105 1D AAAGAAACCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 9 10 13 T 10 9 270313 CASAVA_Build 7 42533720 1D AAGGAAGGGT C/- CCTCACAATG 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 C 3 2 270314 CASAVA_Build 7 42536432 6D CTGCCACTTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1904 het 1904 ref 18 14 5 0 A 16 10 270315 CASAVA_Build 7 42538100 1I GCCTATCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 10 11 270316 CASAVA_Build 7 42540725 1I TATGGTACAT -/A ATACACCATG 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 1 2 270317 CASAVA_Build 7 42541158 5D TTCCTACGTG TTATA/----- TTAGAATATA 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 TTATA 1 0 270318 CASAVA_Build 7 42546338 2D TTAGTGCATT AA/-- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 9 7 270319 CASAVA_Build 7 42547645 1D83M1D ATACATTGGC TTCCGCCCAAAAAGATGGGCCATCTTGAAGCAGGGTCTTACAGGTCAAAGGTGGATTCAAAGATTTCTGATTGGCAATTTGTTGA/-TCTGCCCAAAAAGATGGGCCATCTTGAAGCAGGGTCTTACAGGTCAAAGGTGGATTCAAAGATTTCTGATTGGCAATTTGTTG- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 34 31 22 17 N/A 0 0 270320 CASAVA_Build 7 42555705 1I TATTTTAGTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 8 9 270321 CASAVA_Build 7 42555989 1D CAAATTGCTG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 8 7 270322 CASAVA_Build 7 42556223 1D TTACAGGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 10 9 270323 CASAVA_Build 7 42563092 2D CCAATAAAAC AT/-- AATTTTTGGA 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 AT 1 0 270324 CASAVA_Build 7 42564710 1D CTCTTTTAAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 7 6 270325 CASAVA_Build 7 42578245 6D CAGCACCCTT TTCTAA/------ TTCTCTTTTA 2062 het 2062 ref 26 12 6 10 TTCTAA 1 0 270326 CASAVA_Build 7 42578511 10D CTGTGGAGTG CTCTCTCTCT/---------- CTCTCTCTCT 3070 het 2824 hom 37 12 16 11 CT 14 9 270327 CASAVA_Build 7 42585480 1I TTTTTAACGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 T 10 11 270328 CASAVA_Build 7 42585911 2I TTAAGTTGTT --/AA GTTTATTTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 0 2 270329 CASAVA_Build 7 42595467 1I ATGTACCACG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 T 8 9 270330 CASAVA_Build 7 42600619 1I CTACTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 9 10 270331 CASAVA_Build 7 42660226 5I GGATGAAAAG -----/AAAAT AAAAGGACAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAAAT 0 1 270332 CASAVA_Build 7 42662094 1I CCAGACATGC -/A AATTAATGGG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 2 3 270333 CASAVA_Build 7 42670704 2D TCCTAAAGAC AT/-- AGGTTCAAAC 3070 hom 87 het 39 0 30 9 AT 1 0 270334 CASAVA_Build 7 42694592 1I ATATCAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1845 hom 46 4 35 7 T 13 14 270335 CASAVA_Build 7 42696054 2I CAATTAAAAA --/AC AGTTTTAAAG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 AC 0 1 270336 CASAVA_Build 7 42701150 1D TATAAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 40 1 28 11 A 13 12 270337 CASAVA_Build 7 42702184 1D AGCCTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 345 hom 32 2 15 15 A 19 18 270338 CASAVA_Build 7 42710914 2D TTTTTGAGAT AA/-- ATAATTTAGA 3070 het 3070 hom 59 26 26 8 A 3 1 270339 CASAVA_Build 7 42716494 1I CCACTATCTG -/A AGATTTCATA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 2 270340 CASAVA_Build 7 42717419 28I AGAATGTTAG ----------------------------/AGAACCTTCTCCCCATCATGACGCCTTA AGGTCATCTC 3070 hom 108 het 40 0 36 8 AGAACCTTCTCCCCATCATGACGCCTTA 0 1 270341 CASAVA_Build 7 42725549 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 9 0 7 4 A 12 11 270342 CASAVA_Build 7 42757805 1I AAAAGTTTTA -/T CCCCCAAAAT 3070 het 3070 hom 46 24 18 4 T 0 1 270343 CASAVA_Build 7 42758694 1D AAGTCCTGCT C/- CCCACACCCT 3070 het 3070 hom 58 26 24 8 C 4 3 270344 CASAVA_Build 7 42785277 1I AGGGCCCCAA -/T TGTTCTGTGC 3070 hom 87 het 30 0 27 3 T 1 2 270345 CASAVA_Build 7 42795059 3I AATATAAATT ---/ATA CAGGAAGAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 ATA 0 1 270346 CASAVA_Build 7 42802954 1D TGAACCAACC A/- TAGTTAAAGT 3070 het 3070 ref 52 30 18 4 A 1 0 270347 CASAVA_Build 7 42813065 1D CATCCTTAAA C/- AAAACATTTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 1 0 270348 CASAVA_Build 7 42814737 2I TAAATGAAAC --/AA AAAAACTGGT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 5 7 270349 CASAVA_Build 7 42816481 1I ACAGAACCAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 8 9 270350 CASAVA_Build 7 42816781 1D GATAATTGGC A/- AGCCACACGT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 2 1 270351 CASAVA_Build 7 42822160 1I TGATACTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 28 1 19 8 A 12 13 270352 CASAVA_Build 7 42823633 1I CATGATTTTT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 7 8 270353 CASAVA_Build 7 42823888 1I ATGATTGTCT -/A CCAAAAATCT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 0 1 270354 CASAVA_Build 7 42824405 1D GCCAATGAAC T/- AGAAGAGAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 0 270355 CASAVA_Build 7 42824860 7D AGGAGAAGGA GAAGAAG/------- GAAGAAGGAG 3070 hom 87 het 34 0 27 11 GAAGAAG 2 1 270356 CASAVA_Build 7 42825431 1I AAAAGTGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 37 1 32 4 T 10 11 270357 CASAVA_Build 7 42827610 5D CAGAACAATT AGAAA/----- AGAAAAGAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AGAAA 3 2 270358 CASAVA_Build 7 42828157 2D CTGGAAGCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 12 10 270359 CASAVA_Build 7 42832039 2D CAGAACAAAC AG/-- AGGATTATGG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AG 2 1 270360 CASAVA_Build 7 42838599 3D TAGTCATACA TAC/--- TACATACACA 3070 hom 205 het 75 0 68 7 TAC 2 1 270361 CASAVA_Build 7 42855553 1D ATGAAAGGAT A/- AAGAAAATGT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 3 2 270362 CASAVA_Build 7 42865269 3D TATTATATTA TAT/--- TATTATTATT 2014 hom 18 het 9 0 7 2 TAT 7 6 270363 CASAVA_Build 7 42879216 1I AGTAAAGAAA -/G CATGTTTGAG 3070 het 228 hom 10 1 8 1 G 0 1 270364 CASAVA_Build 7 42883890 1D TTCTACCCTG A/- AAAGAGGAGG 1883 het 992 hom 6 2 4 0 A 4 3 270365 CASAVA_Build 7 42893441 1I TCAAGCTACC -/A AAAAAAAAAA 1337 het 1337 ref 33 25 3 5 A 11 12 270366 CASAVA_Build 7 42895363 1I TACTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 10 11 270367 CASAVA_Build 7 42899044 3I2M2D GCTCCTGCAG ---CCGG/GATCC-- GGGAGACACC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 N/A 0 0 270368 CASAVA_Build 7 42900106 1D TCTGGAGCCA G/- GCAGACTCAC 3070 het 3070 ref 46 26 12 8 G 2 1 270369 CASAVA_Build 7 42900483 1I CAATGCAAGG -/A AATCCAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 2 3 270370 CASAVA_Build 7 42901515 6I AGGACTCACA ------/TAAACT TAAAGTAAAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TAAACT 0 1 270371 CASAVA_Build 7 42901948 1D GCACATGCAA C/- TTTCTCCAAG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 1 0 270372 CASAVA_Build 7 42903629 1D CAATAGCTGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 9 8 270373 CASAVA_Build 7 42903751 1D ACACATCCCA T/- TGCTCATAGA 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 T 2 1 270374 CASAVA_Build 7 42906383 1I CAGAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 987 hom 22 8 14 0 G 0 1 270375 CASAVA_Build 7 42909160 2I AAAATAATGA --/CT CTGTTTAAAC 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 CT 1 2 270376 CASAVA_Build 7 42910674 2D TTTTGTTTTT TG/-- TTTTTTTTTC 3070 het 43 hom 21 2 13 6 TG 1 0 270377 CASAVA_Build 7 42912206 9D GAGAAATTAC TTAACTTCT/--------- TTAACAATTT 3070 het 3070 ref 42 29 11 9 TTAACTTCT 1 0 270378 CASAVA_Build 7 42913628 1I GTCTTTGGCA -/G GGGCACAGCT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 3 4 270379 CASAVA_Build 7 42914096 2D TAGCTCCATC TT/-- GTTTTATAAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 4 T 2 0 270380 CASAVA_Build 7 42914247 12D CTCAAACAAC ACTTCCTCTCTG/------------ ACTTCCTGGC 3070 het 3070 ref 39 27 16 5 ACTTCCTCTCTG 1 0 270381 CASAVA_Build 7 42915064 4D ATGGGGGCTT TCTG/---- TATTGAATTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 TCTG 1 0 270382 CASAVA_Build 7 42920343 2D CCCAACACTT TG/-- TGAGTCCAGG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TG 2 1 270383 CASAVA_Build 7 42921799 1D AATGGGGGCA G/- GAGGTGGAAA 3070 het 3070 hom 43 13 24 6 G 2 1 270384 CASAVA_Build 7 42922534 2D AGAGCCCATA AG/-- AGAGATTATT 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 AG 3 2 270385 CASAVA_Build 7 42923991 2D ACTTATATCA TT/-- GTTTATATTC 3070 het 3070 ref 33 23 9 1 T 2 0 270386 CASAVA_Build 7 42931249 4I GCCCACACAC ----/ACAT ACAAGCACAC 3070 hom 72 het 34 0 23 11 ACAT 0 1 270387 CASAVA_Build 7 42933255 1D ACAAAAAAAG A/- ACTCAGTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 2 1 270388 CASAVA_Build 7 42937657 3D AACTTGCCTC GTT/--- GTTAGGGGTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 GTT 2 1 270389 CASAVA_Build 7 42938034 1D AAAACCGCAT C/- CCCCCGACCC 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 C 6 5 270390 CASAVA_Build 7 42938909 2D TAAATCATAG CC/-- AGCCAGTAAG 3070 het 3070 hom 37 12 15 11 C 2 0 270391 CASAVA_Build 7 42938963 1I TACTGCAGGT -/A AAAGAGCTGA 3070 het 2891 hom 31 7 20 4 A 3 4 270392 CASAVA_Build 7 42945042 10D ATTTTTTTTC TTTTTTTCTT/---------- TTTTTTTTTG 3070 het 1384 hom 29 7 15 7 TTTTTTTCTT 1 0 270393 CASAVA_Build 7 42954555 5D TATAAACAAG AACTT/----- AACTTTTAAC 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 AACTT 2 1 270394 CASAVA_Build 7 42955735 1I AAAAAAAAAA -/C CATATAATCT 2073 het 2073 ref 30 18 7 5 C 1 2 270395 CASAVA_Build 7 42959771 1I ACCCAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 10 11 270396 CASAVA_Build 7 42964772 2I TTAAACTTCG --/TT TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 33 7 8 18 T 7 9 270397 CASAVA_Build 7 42972584 1D ATTTATTTTC T/- TCTTTTGAAG 3070 het 3070 hom 35 16 14 5 T 2 1 270398 CASAVA_Build 7 42977182 1D GTTTCAGACA T/- TTTTTTTTTT 1733 het 1733 ref 34 18 5 11 T 16 15 270399 CASAVA_Build 7 42983497 3I GGAGTTATAA ---/GAG GAGGAGGTTG 3070 het 3070 ref 50 18 16 16 GAG 2 3 270400 CASAVA_Build 7 42996613 1I GGAAATAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 10 11 270401 CASAVA_Build 7 43005118 2D TGATGGCAGC TA/-- TATAGCCTTA 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 TA 3 2 270402 CASAVA_Build 7 43007723 2D CTATTTCAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2879 hom 34 11 13 10 T 14 12 270403 CASAVA_Build 7 43008732 1D GATTTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 35 1 29 7 T 12 11 270404 CASAVA_Build 7 43010137 1D TCTCTTTCCA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 55 21 23 11 T 8 7 270405 CASAVA_Build 7 43013430 1D GCTTATGCTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 9 8 270406 CASAVA_Build 7 43015393 2I GCATTTTTTC --/CT CTCTGCCTGA 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 CT 2 3 270407 CASAVA_Build 7 43026779 6D GTTAATTAAT AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 AAAAAG 2 1 270408 CASAVA_Build 7 43027469 1I CAGCAACACA -/T TTCTTGAAAA 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 T 2 3 270409 CASAVA_Build 7 43029484 1D AGTCATAAGG T/- TAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 2 1 270410 CASAVA_Build 7 43030213 2D GTATATATAT AG/-- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 40 20 17 6 AG 1 0 270411 CASAVA_Build 7 43039213 3I ATTAGAATTT ---/TTG TTAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 TTG 0 1 270412 CASAVA_Build 7 43046429 4I TTCAGCTGTT ----/TTTG TTTGTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 TTTG 1 2 270413 CASAVA_Build 7 43048239 2D TGATCCTCTC TT/-- TATTTAGAAT 3070 het 3070 hom 31 15 14 3 T 3 1 270414 CASAVA_Build 7 43049121 3D GAGCACTTAT AGG/--- AGGAGATGAA 3070 het 3070 hom 64 25 37 5 AGG 2 1 270415 CASAVA_Build 7 43055775 3D CTGAAAAATA GAG/--- GAGGAGGGAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 6 GAG 3 2 270416 CASAVA_Build 7 43082549 1D CCTAAGGGGA T/- TTTTTCCCCT 3070 hom 88 het 34 0 29 5 T 6 5 270417 CASAVA_Build 7 43099984 1I AGCAACAAAC -/T AATTAGACAT 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 T 0 1 270418 CASAVA_Build 7 43109148 1D AATAAGAGCA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 T 8 7 270419 CASAVA_Build 7 43109257 4D CTGCTATAAA TAAC/---- TAAGACTGGA 1935 het 1935 ref 14 10 4 0 TAAC 1 0 270420 CASAVA_Build 7 43115403 3I CAAGAAAGGA ---/TCG TCTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 TCG 0 1 270421 CASAVA_Build 7 43120855 1I GACAGTTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 T 9 10 270422 CASAVA_Build 7 43123653 1I CTTTTCCAAG -/T TTAAGACACA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 2 3 270423 CASAVA_Build 7 43125829 1I TCCCTAAACG -/T TGCTTCTCTT 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 T 1 2 270424 CASAVA_Build 7 43139736 4D ATTTTATATT TCTC/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 TC 3 1 270425 CASAVA_Build 7 43158328 1D AATTTCTGGG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 A 8 7 270426 CASAVA_Build 7 43164537 3D ATCAAGTAAT AAG/--- AACTTACCCA 3070 het 3070 ref 36 22 12 5 AAG 1 0 270427 CASAVA_Build 7 43167841 2D ACTTCCAAGG TC/-- TCTGTATCAC 3070 het 3070 ref 57 26 26 5 TC 2 1 270428 CASAVA_Build 7 43177359 3D TATATTCTGA GTG/--- GTGGGAAATG 3070 het 3070 ref 46 21 21 5 GTG 2 1 270429 CASAVA_Build 7 43178555 1I ATTTCTAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 9 10 270430 CASAVA_Build 7 43179399 1D TAAGCAGAGG A/- AGAATGGTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 7 A 2 1 270431 CASAVA_Build 7 43184439 1I CAGCAGGGTT -/C CTATCTAACT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 C 1 2 270432 CASAVA_Build 7 43188864 18D TCAATCTGTA GATCACTTTTGGTAGTAT/------------------ GATCACTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 13 11 GATCACTTTTGGTAGTAT 2 1 270433 CASAVA_Build 7 43189050 1D TAGAAATAGA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 9 8 270434 CASAVA_Build 7 43189927 4D CTTCTGGAAT GTGA/---- GTAACTATTT 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 GTGA 1 0 270435 CASAVA_Build 7 43190095 2I TTAAAAAAAA --/AC AATCAAGATG 3070 het 2764 hom 15 6 9 0 AC 0 1 270436 CASAVA_Build 7 43191539 2I GAACTGTCTC --/AG AATTATAGGT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 AG 0 1 270437 CASAVA_Build 7 43192793 9D ACTCCGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 1780 het 1311 hom 12 5 5 3 A 20 11 270438 CASAVA_Build 7 43193465 1I TTCAAGTGGA -/G GGAAATTGGG 3070 het 3070 hom 55 24 27 4 G 2 3 270439 CASAVA_Build 7 43195508 2D ATTGCTGGTC CA/-- CAGATTACAC 3070 het 3070 hom 37 11 24 2 CA 2 1 270440 CASAVA_Build 7 43204890 4D GATTTGCACA CTCT/---- CTCACACACA 3070 het 3070 ref 67 30 27 14 CT 3 1 270441 CASAVA_Build 7 43215309 1I CAGACCCACT -/G AGCCCCTCAC 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 G 0 1 270442 CASAVA_Build 7 43230792 4I GAAAATAAAA ----/AGTT AGCCGGCCAT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 AGTT 0 1 270443 CASAVA_Build 7 43234453 1D CTACAAAATC A/- AAAAAAAAAA 1215 het 1215 ref 25 14 4 7 A 12 11 270444 CASAVA_Build 7 43235759 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1694 hom 23 5 11 7 A 10 11 270445 CASAVA_Build 7 43237018 5D TTAAAAAAAA TAAAT/----- TAAAGCAGAA 3070 het 3070 hom 42 16 23 6 TAAAT 1 0 270446 CASAVA_Build 7 43249723 1D CTTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 11 10 270447 CASAVA_Build 7 43252265 1D TATGAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 A 13 12 270448 CASAVA_Build 7 43253886 2D AGGAAGGGAA AG/-- AGAGGAAAAA 3070 het 95 hom 15 1 10 5 AG 3 2 270449 CASAVA_Build 7 43256243 14D TTTAACCAAA ACACACACACACAC/-------------- ACGCGCACAC 3070 het 3070 ref 40 20 20 9 AC 8 1 270450 CASAVA_Build 7 43263972 3D AATTAGAAAT AAG/--- AAGAAGAATA 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 AAG 3 2 270451 CASAVA_Build 7 43264410 1D GAGGTTGCAG T/- GAGCCGAGAT 1994 het 989 hom 7 2 5 0 T 1 0 270452 CASAVA_Build 7 43311524 1D CAATTACTGC A/- ATTCTGTCCA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 2 1 270453 CASAVA_Build 7 43329997 1I CATCTCTGCT -/A AAAATACAAA 3070 het 2957 hom 18 7 11 0 A 4 5 270454 CASAVA_Build 7 43330166 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 9 10 270455 CASAVA_Build 7 43333308 10D TGAGGAGACT GAACCCCACC/---------- TGTGCAACGT 3070 het 3070 ref 38 23 18 5 GAACCCCACC 1 0 270456 CASAVA_Build 7 43335271 1D ACTCGGCCAG T/- TGGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 T 2 1 270457 CASAVA_Build 7 43337717 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 897 hom 19 4 10 5 A 14 15 270458 CASAVA_Build 7 43341908 4D TTCTTCCTTT CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 hom 69 het 27 0 23 6 CTTC 4 3 270459 CASAVA_Build 7 43348994 1D CTAAAGATAC A/- AAAAAATCAG 3070 het 1818 hom 17 5 8 5 A 7 6 270460 CASAVA_Build 7 43349154 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 11 10 270461 CASAVA_Build 7 43349236 6D TGCTGATCTA TCTCTG/------ TCTAATTCAT 2230 het 2230 ref 34 27 6 4 TCTCTG 1 0 270462 CASAVA_Build 7 43359753 4D TCCACAATGC CCCT/---- CCCTCCCCTC 3070 het 3070 ref 50 24 21 7 CCCT 2 1 270463 CASAVA_Build 7 43361155 1I TGCTGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 13 14 270464 CASAVA_Build 7 43371583 1I GACATTCCCA -/C CCCGTGTGGG 3070 hom 114 het 44 0 38 6 C 3 4 270465 CASAVA_Build 7 43375854 1I CTTCTTAAAC -/A AAAGGCTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 A 3 4 270466 CASAVA_Build 7 43378548 10D TTTGTTACAT ATGTATACAC/---------- ATGTATACAT 3070 het 2141 hom 15 6 8 2 ATGTATACAC 1 0 270467 CASAVA_Build 7 43382991 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2624 hom 21 7 9 5 A 10 11 270468 CASAVA_Build 7 43383081 1I CACTTTAGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 9 10 270469 CASAVA_Build 7 43384935 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAATAAAA 1747 het 1747 ref 35 23 7 5 A 5 6 270470 CASAVA_Build 7 43389952 4I CCTTGCCAGT ----/AACA AACAGTTGAT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 AACA 1 2 270471 CASAVA_Build 7 43401178 1I TGTTGATCTT -/G GTGGTGCCAG 3070 hom 57 het 20 0 18 2 G 1 2 270472 CASAVA_Build 7 43403978 10D TTGGGCTCAG ATGCCTGACA/---------- ACATCATATG 2659 het 2659 ref 36 27 6 5 ATGCCTGACA 1 0 270473 CASAVA_Build 7 43411378 2I ATGAATGTTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 TA 5 6 270474 CASAVA_Build 7 43417170 1D TTGCCTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 520 hom 25 2 9 14 T 13 12 270475 CASAVA_Build 7 43422994 1I TGAGGCAATG -/C CTCGCCCTGC 1661 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 2 270476 CASAVA_Build 7 43428493 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 1751 het 490 hom 22 5 6 11 T 15 14 270477 CASAVA_Build 7 43438004 4D CCGACACTTG CTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 30 0 23 7 CTTT 1 0 270478 CASAVA_Build 7 43446211 5I9M1I CCCACCGTGG -----TTAGGAGCA-/GACACCTGGGGGCAT GAGTGTTGGG 2937 het 2937 ref 39 17 11 14 N/A 0 0 270479 CASAVA_Build 7 43447010 1I TTTTTAAGTC -/A GGGGCTTGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 0 1 270480 CASAVA_Build 7 43447676 2D CTTTTTTTAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 TC 7 6 270481 CASAVA_Build 7 43452749 1I TGCCTACAAA -/T TTTTTTTTTT 2510 het 2510 ref 22 9 8 5 T 10 11 270482 CASAVA_Build 7 43453293 1I ACTAAAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 11 12 270483 CASAVA_Build 7 43455915 1D GAACCATCTG A/- AAAAAGGGCC 3070 het 160 hom 36 1 28 8 A 6 5 270484 CASAVA_Build 7 43461924 1I AGACCAGCCT -/G GCCAACCATG 3070 het 46 hom 24 1 19 4 G 1 2 270485 CASAVA_Build 7 43462404 1I TCTTTTTGCC -/T TTTTTATTAA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 5 6 270486 CASAVA_Build 7 43462757 5D GGCGAGAGAC AAGTT/----- AAGCTTGAGT 3070 het 3070 hom 41 13 26 4 AAGTT 1 0 270487 CASAVA_Build 7 43488013 11I GGGAGGCTGA -----------/GGCAGGAGAAT GGCGTGAACC 3070 het 2593 hom 19 9 7 3 GGCAGGAGAAT 0 1 270488 CASAVA_Build 7 43507308 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2077 het 2077 ref 50 21 9 21 T 20 18 270489 CASAVA_Build 7 43519781 1I AGTAAGCTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 9 10 270490 CASAVA_Build 7 43526745 1I TCTTGAATTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 7 8 270491 CASAVA_Build 7 43533508 1I GGGGAGACCC -/T TTTTTTTACC 3070 hom 94 het 38 0 31 7 T 7 8 270492 CASAVA_Build 7 43536978 1I TCCAAATCTG -/C CCCCCTCCTA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 5 6 270493 CASAVA_Build 7 43542920 1I ACTTCAAAAG -/C AGTCCCTGTA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 C 0 1 270494 CASAVA_Build 7 43545798 1I AAGTGCGGAA -/G CCACGGGCCC 3070 hom 99 het 42 0 33 9 G 0 1 270495 CASAVA_Build 7 43550721 2I CTCAGCACAC --/AT GTCTAGAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 AT 0 1 270496 CASAVA_Build 7 43551961 1I GAGGTGGAAG -/A GGGGGCAGGA 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 A 0 1 270497 CASAVA_Build 7 43552217 3D CTTCCCCTTC TGA/--- ACCTGGCACT 3070 het 3070 ref 28 15 10 5 TGA 1 0 270498 CASAVA_Build 7 43552741 3D GTCCAATATC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 A 13 10 270499 CASAVA_Build 7 43554369 1I CATTTCTAAC -/T TTTTTTTTTC 2874 het 2874 ref 22 13 7 2 T 9 10 270500 CASAVA_Build 7 43556237 2D CCAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 1283 het 1283 ref 28 10 6 12 AG 1 0 270501 CASAVA_Build 7 43557554 3I GGATGGAAAA ---/TAC TACAGTCGTT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 TAC 1 2 270502 CASAVA_Build 7 43558096 1D TATCTAAGCA C/- CCCCCCAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 C 7 6 270503 CASAVA_Build 7 43562040 1I GTTGAATGAT -/A GATTTCAAGA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 A 0 1 270504 CASAVA_Build 7 43563213 1I CAAAGAACCT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 7 8 270505 CASAVA_Build 7 43569118 1I AACTTTGATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 T 9 10 270506 CASAVA_Build 7 43569992 1D GACACCATCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2049 hom 22 5 15 2 A 10 9 270507 CASAVA_Build 7 43583000 1D CTTTTAGTTC T/- GTCATTTTGC 3070 het 3070 hom 49 16 29 4 T 1 0 270508 CASAVA_Build 7 43587778 1I TAAACTCCAA -/T TTTTTTTTTT 2955 het 2272 hom 19 6 10 3 T 10 11 270509 CASAVA_Build 7 43591409 1I TTACAAAACG -/A AATGTCTTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 2 3 270510 CASAVA_Build 7 43599821 1I CTGTTCATAT -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1891 hom 25 7 16 2 C 0 1 270511 CASAVA_Build 7 43600389 2I CTCTTAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 A 12 14 270512 CASAVA_Build 7 43601774 1I GTAACTCTGC -/A AAAAAAATGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 7 8 270513 CASAVA_Build 7 43603441 1I ATGGAAAAAA -/T AATCCTAAAA 3070 hom 68 het 25 0 23 2 T 0 1 270514 CASAVA_Build 7 43609018 10D CAGTATCAGT GCAGTCAATA/---------- GCAGTCAATA 3070 hom 100 het 37 0 33 5 GCAGTCAATA 2 1 270515 CASAVA_Build 7 43612142 1D CTTTCCAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 384 hom 29 1 25 7 T 10 9 270516 CASAVA_Build 7 43614978 3D TGAAGACATA GAT/--- GATTTTTGAG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 GAT 2 1 270517 CASAVA_Build 7 43634437 2D TTTTTATTGT TG/-- TGTCGTGCTA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TG 2 1 270518 CASAVA_Build 7 43639240 1I AGATGGCATC -/T TTTTTCCAAT 3070 hom 112 het 44 0 36 8 T 5 6 270519 CASAVA_Build 7 43639929 1D CTCTCAGCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 34 0 27 9 T 10 9 270520 CASAVA_Build 7 43641803 4I ATTTCGTGAA ----/AAAT AAATAATACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAAT 1 2 270521 CASAVA_Build 7 43641982 14D GGTAGCTCAA GTTAAAAGATAAGT/-------------- GTTAAAAGAT 3070 hom 57 het 27 0 20 9 GTTAAAAGATAAGT 2 1 270522 CASAVA_Build 7 43642491 1D CCTCCTGTGT A/- AAACAGCATC 3070 hom 75 het 32 0 24 9 A 4 3 270523 CASAVA_Build 7 43644349 2D TTTAAGCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 18 9 T 16 14 270524 CASAVA_Build 7 43653600 3D TTCCTCTGAT GGA/--- GGAGCAGGAG 3070 hom 75 het 28 0 23 5 GGA 2 1 270525 CASAVA_Build 7 43658843 1I GGAACAAGGT -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 7 8 270526 CASAVA_Build 7 43660706 1D GAAGTTATTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 43 0 38 6 A 9 8 270527 CASAVA_Build 7 43661155 1D CAACTTATTG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 60 het 23 0 21 4 A 8 7 270528 CASAVA_Build 7 43664201 1I TATTTTTTTT -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 6 7 270529 CASAVA_Build 7 43667147 1I CCTGGCACTT -/C CCTGTCCACC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 2 3 270530 CASAVA_Build 7 43667776 4I AAAAAAAAAG ----/AAAC AGACATTTCC 3019 hom 35 het 14 0 11 3 AAAC 0 1 270531 CASAVA_Build 7 43675896 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 18 0 17 1 A 12 11 270532 CASAVA_Build 7 43680084 1I GTATAGACAC -/A AAAGAAAGGC 3070 hom 111 het 44 0 36 8 A 3 4 270533 CASAVA_Build 7 43694476 1I TTTTTATGAT -/A AAAAAAACTT 3070 hom 47 het 23 0 16 7 A 7 8 270534 CASAVA_Build 7 43701581 4D CATGCTCTCT TCTC/---- TCTCTCTCTA 3070 hom 148 het 54 0 50 7 TC 6 4 270535 CASAVA_Build 7 43702824 2D TATATACATA TG/-- TGTGTGTATA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TG 4 3 270536 CASAVA_Build 7 43702952 1I CTTTCTTTAC -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 6 7 270537 CASAVA_Build 7 43706400 3D TTTTGATAGC TGT/--- TGAATACAGA 3070 hom 102 het 36 0 33 4 TGT 1 0 270538 CASAVA_Build 7 43707138 2D AAGTTTTTGT TA/-- AAACTTACAG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TA 1 0 270539 CASAVA_Build 7 43714584 1D GACCTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 11 0 9 3 A 15 14 270540 CASAVA_Build 7 43715152 1I TCCTATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 T 14 15 270541 CASAVA_Build 7 43717137 1D TTGTTGATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 42 1 33 8 T 11 10 270542 CASAVA_Build 7 43721131 13D CCTCTTGTCT AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 22 0 11 13 A 26 13 270543 CASAVA_Build 7 43725098 1D GGAATCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 318 hom 27 2 14 11 T 16 15 270544 CASAVA_Build 7 43728950 3D ATGCAAGTGA CAT/--- CAAAGTTCCA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 CAT 1 0 270545 CASAVA_Build 7 43731363 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 24 1 16 7 A 13 11 270546 CASAVA_Build 7 43735859 1D TGGTCCCCGC T/- TTTTTTTTTT 1644 het 648 hom 18 3 6 10 T 15 14 270547 CASAVA_Build 7 43740122 5I ATGCCAGTTC -----/ATAAA ATAAACATTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ATAAA 1 2 270548 CASAVA_Build 7 43742396 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 T 8 7 270549 CASAVA_Build 7 43753016 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1925 hom 15 het 13 0 6 7 A 12 11 270550 CASAVA_Build 7 43757691 1D AATCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2833 het 80 hom 10 1 6 3 A 13 12 270551 CASAVA_Build 7 43770933 3I TTAAAGTGAT ---/ATC ATGTTAGCAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATC 0 1 270552 CASAVA_Build 7 43787478 1D TGTGATATAC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 9 8 270553 CASAVA_Build 7 43790123 2I ACATTCCTAA --/CT CTATGAACTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 CT 1 2 270554 CASAVA_Build 7 43791457 1D AGAAATTACC A/- AAAAAAAAAA 2779 het 1243 hom 26 7 9 10 A 15 14 270555 CASAVA_Build 7 43793052 1I ATGGAGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 29 1 19 10 T 13 14 270556 CASAVA_Build 7 43807744 2D TACAAGAAAC TG/-- TGTTAAGTTA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TG 2 1 270557 CASAVA_Build 7 43810566 1D CTCCTTCTTG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 A 8 7 270558 CASAVA_Build 7 43843336 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 29 0 19 10 T 13 12 270559 CASAVA_Build 7 43868793 1D CATTTACCTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 8 7 270560 CASAVA_Build 7 43881967 2D TGCTGCTATC CT/-- CTTTGAGAAA 3070 het 3070 hom 59 25 27 9 CT 2 1 270561 CASAVA_Build 7 43882654 2I ACTCCAAACC --/CT CTGTCTTTTC 3070 hom 88 het 35 0 28 7 CT 1 2 270562 CASAVA_Build 7 43885899 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 8 9 270563 CASAVA_Build 7 43911401 1I GGAGGCTCTG -/C CCCACCCTTT 3070 hom 86 het 33 0 29 4 C 3 4 270564 CASAVA_Build 7 43913267 1I TGTTATTAAG -/T AAAAATAATG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 0 1 270565 CASAVA_Build 7 43918737 3I CAAAACCATC ---/ATT GAGATTTTGA 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 ATT 0 1 270566 CASAVA_Build 7 43918976 1D TCTCCTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1148 hom 23 3 13 7 T 11 10 270567 CASAVA_Build 7 43922839 1I CTACCCACCC -/T CCCCCCCCCA 1537 het 790 hom 20 4 8 8 T 0 1 270568 CASAVA_Build 7 43933424 2D TATTTATAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2991 het 1767 hom 34 11 10 13 T 19 17 270569 CASAVA_Build 7 43937735 1D AAACCGGGGT G/- GGGGGGCGGG 1630 het 91 hom 11 1 6 4 G 7 6 270570 CASAVA_Build 7 43943992 2I CTCACGTGCC --/AA AGTCTCCACA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 1 3 270571 CASAVA_Build 7 43950123 12D CGGACAGGTC CCCAGGAAACTG/------------ CCCCAGGGGA 2613 het 2613 ref 28 14 7 11 CCCAGGAAACTG 1 0 270572 CASAVA_Build 7 43957663 1I TGTTTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 10 11 270573 CASAVA_Build 7 43974641 1I TGAATGGCAG -/A GGCCAGAGAG 1651 het 693 hom 10 2 5 3 A 0 1 270574 CASAVA_Build 7 43985732 2I CTCCCAGTCC --/CT GAGATTGGGC 1583 het 1583 ref 17 8 5 4 CT 0 1 270575 CASAVA_Build 7 43987554 1I2M2D GGATCGCCTG -AGCC/TAG-- CAGGAGTTCA 3070 het 3070 hom 15 7 7 1 N/A 0 0 270576 CASAVA_Build 7 44001248 1I GACTGGGGAT -/G GGGGGGGAGG 859 het 859 ref 7 4 3 0 G 7 8 270577 CASAVA_Build 7 44002768 1I CTTAGTACCT -/G GGATTACAGG 1722 het 1722 ref 21 12 4 5 G 2 3 270578 CASAVA_Build 7 44015403 2I TTTCATTTTT --/AA GAGACAATTC 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 A 0 2 270579 CASAVA_Build 7 44032102 5I ACACTGGGGT -----/TTACA TTGCTGTGTA 2803 het 2803 ref 30 22 7 1 TTACA 0 1 270580 CASAVA_Build 7 44033812 1I AGGGCTGGGA -/C CACCTGGAGA 3070 hom 66 het 23 0 21 2 C 1 2 270581 CASAVA_Build 7 44075195 5I TAAAAGAATG -----/AAATA AAATAAAGAC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AAATA 1 2 270582 CASAVA_Build 7 44107569 1I GCACACTGGG -/C CCTGCTGGCA 3070 hom 73 het 30 0 21 9 C 2 3 270583 CASAVA_Build 7 44118645 1I AGTGGCCGGA -/G GCTGCAGCCC 3070 hom 62 het 24 0 20 4 G 1 2 270584 CASAVA_Build 7 44121391 1I CAGCAAATCA -/G GCCTGGGCCC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 G 1 2 270585 CASAVA_Build 7 44124296 1I AGGGCCCTGG -/C CCTTGCCAGG 3070 hom 56 het 25 0 18 7 C 2 3 270586 CASAVA_Build 7 44140815 1I GGCTCCCCTT -/G GGGGCCCCCA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 G 4 5 270587 CASAVA_Build 7 44146605 1I TCCCCCAGAA -/G GGCCCAGGCC 3070 hom 55 het 20 0 19 1 G 2 3 270588 CASAVA_Build 7 44148982 1I CTGCCCAGTG -/T TTTTTTTTTT 2659 het 2659 ref 28 13 7 8 T 10 11 270589 CASAVA_Build 7 44156668 2D CATATATAAC TG/-- TGTGTGTGTG 1313 het 1313 ref 61 48 5 9 TG 7 6 270590 CASAVA_Build 7 44165470 1I AGAGGCAGGG -/C CAGAAAGGGA 992 hom 28 het 24 0 6 18 C 1 2 270591 CASAVA_Build 7 44172660 1D ATCAAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 A 11 10 270592 CASAVA_Build 7 44172881 2D AGATATAAAG AT/-- AGAAGAATTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 AT 1 0 270593 CASAVA_Build 7 44172987 1I ATTTTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 34 1 29 4 A 10 11 270594 CASAVA_Build 7 44180682 3I TCTGCTTCTC ---/CTT CTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 42 12 19 11 CTT 2 3 270595 CASAVA_Build 7 44183742 1I TCTGAAATTC -/A AATTTAACTG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 2 3 270596 CASAVA_Build 7 44191824 1I GAGGCCTGGG -/C CACAGGCAGC 3070 hom 80 het 30 0 23 7 C 1 2 270597 CASAVA_Build 7 44194186 1I CCTGAAGGGG -/C CCCTTTGGGC 3070 hom 71 het 28 0 23 5 C 3 4 270598 CASAVA_Build 7 44197467 1I GCAAGGGAAT -/A CTCTAATATG 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 0 1 270599 CASAVA_Build 7 44199618 5D ACTTTGCTTC TCTTT/----- TCTTAAGAGT 3070 het 2292 hom 28 8 16 6 TCTTT 1 0 270600 CASAVA_Build 7 44199826 2I GTTCATGATG --/CA GTTTCCCTGT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 CA 0 1 270601 CASAVA_Build 7 44226080 1I7M1I TCCCAGGCAT -GGCTCTG-/GGGCTCTGC CACAGGCCCC 3070 hom 81 het 28 0 26 3 N/A 0 0 270602 CASAVA_Build 7 44228967 1I CCTGGCAGGT -/G GACTGAGTCC 3070 hom 57 het 24 0 18 6 G 1 2 270603 CASAVA_Build 7 44229712 1I TGACACTTGA -/G GGCCCGCCCC 2772 hom 61 het 25 0 14 11 G 2 3 270604 CASAVA_Build 7 44238328 1I GAGGCACTCT -/G GGGGCTCTGT 3070 hom 42 het 15 0 13 2 G 4 5 270605 CASAVA_Build 7 44238840 1I GCGGCCAGGG -/C CATGGGACAT 3070 hom 50 het 23 0 12 11 C 1 2 270606 CASAVA_Build 7 44245052 1I TTGGGCCTCT -/G GGCTCTGGCC 3070 hom 111 het 43 0 31 12 G 2 3 270607 CASAVA_Build 7 44245401 1I GGCTCCCTGT -/G GGGCCCAGGC 2023 hom 24 het 14 0 8 6 G 3 4 270608 CASAVA_Build 7 44250628 1I GCCCTCGGGT -/C CCCTTGGCCA 2670 hom 44 het 17 0 13 4 C 3 4 270609 CASAVA_Build 7 44262130 1I TGTCCAGGCT -/G GGGGCTGGGG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 4 5 270610 CASAVA_Build 7 44266329 2D GCACAAGCAG CC/-- CCCCTTCCTT 3070 hom 100 het 37 0 32 5 C 6 4 270611 CASAVA_Build 7 44279684 1D CACCTGGGGT C/- CCCCCACCCC 1461 het 904 hom 25 4 4 17 C 6 5 270612 CASAVA_Build 7 44280063 1I GCACTGCCAC -/A ATTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 A 1 2 270613 CASAVA_Build 7 44303432 3D AGAGAGGGAA AAG/--- AAGAAGAAGT 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 AAG 4 3 270614 CASAVA_Build 7 44323771 2D CACCTGTTTC TT/-- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 25 9 9 7 T 8 6 270615 CASAVA_Build 7 44330537 1D TGATTCTCAG A/- ACGGGAGACC 3070 hom 74 het 28 0 22 7 A 2 1 270616 CASAVA_Build 7 44334635 6D GTGGTGGTGG TGATAA/------ TGATAATGAT 3070 het 3070 ref 52 16 13 23 TGATAA 2 1 270617 CASAVA_Build 7 44334677 9D27M3D GTGGTGGTGG TAATAATGATAATGATGGTGTTGGTGACAATGATGGTGA/---------TAGTGATGGTGGTGATGATAGTGATGG--- TGGTCATGGT 2161 het 2161 ref 34 38 8 29 N/A 0 0 270618 CASAVA_Build 7 44343181 1I TAGTATTCAA -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 5 6 270619 CASAVA_Build 7 44410905 1I AGCTCATTTA -/G GTAAATCCAC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 G 1 2 270620 CASAVA_Build 7 44419051 1D ACGCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 560 het 207 hom 8 4 3 1 A 16 15 270621 CASAVA_Build 7 44495850 4I CTCTTTAACT ----/GTAA GTGTCACAAG 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 GTAA 0 1 270622 CASAVA_Build 7 44562519 7I GTTTTTTAAC -------/TTTGTTT TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 TTTGTTT 2 3 270623 CASAVA_Build 7 44570646 3D CCACCCCCCA AAG/--- AAGGAAATCA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 AAG 2 1 270624 CASAVA_Build 7 44580137 1D AAGTGCTGGC G/- GCCTAGGCTT 3070 het 2199 hom 33 11 13 9 G 2 1 270625 CASAVA_Build 7 44589079 1D CATGGTGAAA C/- CCCCGTCTCT 2860 het 2860 ref 25 14 8 4 C 5 4 270626 CASAVA_Build 7 44596193 1D CCGGTTTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 T 10 9 270627 CASAVA_Build 7 44597204 1D GGGGCTTAGG C/- CATAAGAGAC 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 C 2 1 270628 CASAVA_Build 7 44599363 8D GTCAAAAAAC AAAAAACA/-------- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 21 10 10 2 AAAAAACA 1 0 270629 CASAVA_Build 7 44611548 1I ATTTTCTTGA -/T TTTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 T 6 7 270630 CASAVA_Build 7 44611713 1D TAATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 4 A 12 11 270631 CASAVA_Build 7 44614123 1D CTGCGCCCGG C/- CCCTCATTAT 1452 het 1452 ref 14 8 4 3 C 4 3 270632 CASAVA_Build 7 44626879 1D GTTTTTGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 T 13 12 270633 CASAVA_Build 7 44634589 1D AATTAAAAAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 2587 hom 20 7 9 4 T 8 7 270634 CASAVA_Build 7 44641832 1D GACTTTATAA T/- TTTTTTTTTT 1700 het 1700 ref 26 13 5 8 T 15 14 270635 CASAVA_Build 7 44714635 1D TGGCGTGAAC T/- GAGGATGACC 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 1 0 270636 CASAVA_Build 7 44733385 5D CTCCATGTGA CATGG/----- CATGGCATGC 3070 het 3070 ref 32 14 13 7 CATGG 2 1 270637 CASAVA_Build 7 44736206 1D GAAGCCACAG T/- TGAGGCCAGG 2444 het 2187 hom 30 10 8 12 T 2 1 270638 CASAVA_Build 7 44742386 1I TATAGGTGAA -/T TTTTTTTTTT 1803 het 1803 ref 23 6 6 11 T 15 16 270639 CASAVA_Build 7 44744521 1I AAAGTAGTAG -/T TTTTTTTTTT 2045 het 2045 ref 44 28 6 10 T 11 12 270640 CASAVA_Build 7 44780754 1D CTTATCTAGC T/- GTAATTTTAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 1 0 270641 CASAVA_Build 7 44784887 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 9 1 8 0 A 10 11 270642 CASAVA_Build 7 44790023 1I CAGCCAGGCT -/G GAAGAATTTG 3070 hom 99 het 34 0 34 1 G 1 2 270643 CASAVA_Build 7 44801282 1I ACGGAGTCTC -/T TGTCTCTCAG 2480 het 2480 ref 17 10 6 1 T 1 2 270644 CASAVA_Build 7 44807771 2D GTTTGAGTTA AG/-- AGTGTTGATG 3070 hom 117 het 46 0 40 8 AG 2 1 270645 CASAVA_Build 7 44808958 2D CTAAGCTGAG AA/-- AACCCCTTCT 3070 het 3070 hom 61 24 32 5 A 4 2 270646 CASAVA_Build 7 44812720 4I AGTCTATAAA ----/ATAC ATACAGTTTA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 ATAC 1 2 270647 CASAVA_Build 7 44812842 1I ATGATTCCAA -/T TTTTTTTTTT 2691 het 467 hom 25 3 12 10 T 17 18 270648 CASAVA_Build 7 44816956 1I ACTAAAAAAT -/A AAAAAATTAG 1202 hom 7 het 4 0 3 1 A 6 7 270649 CASAVA_Build 7 44817763 1D TTTGCCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 15 14 270650 CASAVA_Build 7 44826387 2I TTCAAAATCC --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 35 het 13 0 12 1 A 9 11 270651 CASAVA_Build 7 44826991 5D TTGGCTAATT TTTTA/----- TTTTATCTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 6 TTTTA 2 1 270652 CASAVA_Build 7 44827909 1I AAGTGATCCT -/C CCACCTTGGC 3070 hom 92 het 33 0 28 5 C 2 3 270653 CASAVA_Build 7 44831308 2I CTCCTGATAA --/GT GAGAAAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 GT 0 1 270654 CASAVA_Build 7 44835725 2D ACTCTATTAA AG/-- GAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 31 1 24 6 AG 1 0 270655 CASAVA_Build 7 44843966 2D GGGGGGGGGG GC/-- TTAGATAGAT 3070 hom 41 het 29 0 19 10 GC 1 0 270656 CASAVA_Build 7 44847210 1D AAGGCTGAAC A/- ATGTAAGCAT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 2 1 270657 CASAVA_Build 7 44850168 1D ATGTTCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 692 hom 23 2 14 7 A 14 13 270658 CASAVA_Build 7 44855899 1D CACCACCATT C/- CCCGCTAGTT 3070 het 2717 hom 19 9 8 2 C 4 3 270659 CASAVA_Build 7 44859163 1I CAGCACTTTA -/G GAGGTTAAGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 2 270660 CASAVA_Build 7 44876378 3D TTTTTTTTTT TTA/--- AAAAAGAATG 3070 hom 51 het 19 0 18 2 TTA 1 0 270661 CASAVA_Build 7 44886337 4I CCGATCACTA ----/ACAT TATACCAAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ACAT 0 1 270662 CASAVA_Build 7 44894393 1I TGTTCATTTC -/T TTTTTTTTTT 1224 het 1224 ref 31 23 3 5 T 11 12 270663 CASAVA_Build 7 44912283 1I GAGGTAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 11 12 270664 CASAVA_Build 7 44913131 10D TTCCTCCTGC TTTACATTAT/---------- TGAGAAAACA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TTTACATTAT 1 0 270665 CASAVA_Build 7 44927682 4D GCTTAAAAAC AAAG/---- GAAGAGGAAA 2498 het 2498 ref 20 12 6 2 AAAG 1 0 270666 CASAVA_Build 7 44927770 1I AGGAGCAACT -/C CAAGGGCCAC 3070 het 2615 hom 24 10 12 2 C 1 2 270667 CASAVA_Build 7 44935057 1D ATAATTTATT A/- AATTCATTTT 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 A 3 2 270668 CASAVA_Build 7 44939788 2D GAGAATGCCT CA/-- CAGCTTTATT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 CA 2 1 270669 CASAVA_Build 7 44946375 3I GGGGGGGGGG ---/GGA AGGGGAAATA 2888 hom 39 het 20 0 14 6 GGA 0 1 270670 CASAVA_Build 7 44950145 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 13 12 270671 CASAVA_Build 7 44974629 2D AGGGAATGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 633 hom 43 9 9 26 T 18 16 270672 CASAVA_Build 7 44986415 1D ATTTTTTTCT C/- TCGAATACCT 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 C 1 0 270673 CASAVA_Build 7 44989869 17I AGGTCAAAAT -----------------/AAGGTGACGGTTTTTGA ACTTTTCATT 3070 hom 99 het 40 0 33 8 AAGGTGACGGTTTTTGA 0 1 270674 CASAVA_Build 7 45011677 2D TTGTTGTCAC TT/-- TGCAGTGTAA 3070 hom 77 het 30 0 25 7 T 3 1 270675 CASAVA_Build 7 45024188 2I GGGATGAAAC --/TG TTCCATATCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TG 0 1 270676 CASAVA_Build 7 45026984 2I AACTGTTATT --/AG AGTCTTTCAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AG 1 2 270677 CASAVA_Build 7 45039938 1I TGTGCCATCT -/G GTCACTTGAG 3070 hom 151 het 54 0 51 3 G 1 2 270678 CASAVA_Build 7 45051508 1I ATCACCGCTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 7 8 270679 CASAVA_Build 7 45071276 20D ACAATGGGAT AGAATTGGGCAGAATTGGGC/-------------------- AGAATTGGGC 3070 het 3070 ref 38 19 15 12 AGAATTGGGC 3 1 270680 CASAVA_Build 7 45073026 1D AACCAGTAAA T/- TTTTTTTTTT 1711 het 1585 hom 18 8 5 5 T 17 16 270681 CASAVA_Build 7 45083544 1I CTGGTCGGTG -/T TTTTTTTGTT 3036 het 3036 ref 24 9 9 6 T 7 8 270682 CASAVA_Build 7 45098220 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 10 A 12 11 270683 CASAVA_Build 7 45120937 28D AAATGAAGAC AGCTGCCCAGAAGACTCACATGCAAGTA/---------------------------- ACCTGGGATA 3070 het 3070 ref 26 16 12 6 AGCTGCCCAGAAGACTCACATGCAAGTA 1 0 270684 CASAVA_Build 7 45123173 1I TCCTTTTCTT -/G TAAGTCTTAG 3070 het 3070 hom 54 21 26 7 G 0 1 270685 CASAVA_Build 7 45126059 4I ATGTATGTAT ----/GTGC GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 60 22 27 11 GTGC 0 1 270686 CASAVA_Build 7 45144467 1D CGGGGTTTCA C/- CCGTGTTGGC 2564 het 1986 hom 16 6 6 4 C 3 2 270687 CASAVA_Build 7 45148885 1D GGTATTATGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 T 9 8 270688 CASAVA_Build 7 45160308 1I GGCCTGTAAT -/C CCCAGCTACT 2348 het 2348 ref 17 7 8 2 C 3 4 270689 CASAVA_Build 7 45164692 2D AGAAAAAGTA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 AG 10 9 270690 CASAVA_Build 7 45176293 1I TTTAATGAGC -/T TTTGATTTTG 3070 hom 52 het 26 0 18 8 T 3 4 270691 CASAVA_Build 7 45176443 3D TTTGAGATCT TTC/--- TTCTTTATTA 3070 het 1989 hom 19 8 9 2 TTC 2 1 270692 CASAVA_Build 7 45179809 1I ACTGCCCACT -/G GGGGAAAGCT 3070 hom 56 het 29 0 15 14 G 4 5 270693 CASAVA_Build 7 45185490 3D AGTCACGAGT CAC/--- TTCCAAGCAG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 CAC 1 0 270694 CASAVA_Build 7 45191501 1D AGCCCTGGAA G/- CTGCTCTGAG 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 G 1 0 270695 CASAVA_Build 7 45193094 4D ACTACTACTC GTAA/---- GTGAGAAGAG 3070 het 3070 ref 64 39 17 10 GTAA 1 0 270696 CASAVA_Build 7 45200816 2I GCGGGCAAGA --/TT TTTTTCTGGT 3070 het 2038 hom 18 7 9 2 T 5 7 270697 CASAVA_Build 7 45206764 1D CAAAGAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 25 1 13 11 T 15 14 270698 CASAVA_Build 7 45227285 2I TTAGGAAGGC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 9 11 270699 CASAVA_Build 7 45230131 2D TCCTCTGAGC AG/-- AGAGTCTGGG 3070 het 1716 hom 24 7 10 7 AG 3 2 270700 CASAVA_Build 7 45236236 2D TGTCACTAAA TT/-- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 8 6 270701 CASAVA_Build 7 45236657 1I TTCATTGTAT -/C CAACTATTGA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 1 2 270702 CASAVA_Build 7 45243536 1D AGAAAAAAAA T/- GTAAGCCATT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 1 0 270703 CASAVA_Build 7 45246654 1D CATTTAAGAG T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 T 7 6 270704 CASAVA_Build 7 45249306 5D GGCTCACAGG GCTGA/----- GCTAAGTGTT 3070 het 3070 ref 39 17 18 10 GCTGA 1 0 270705 CASAVA_Build 7 45249486 1I TGTCTCTGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 147 het 58 0 51 7 T 8 9 270706 CASAVA_Build 7 45254125 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2367 hom 27 14 11 2 A 14 13 270707 CASAVA_Build 7 45255768 1I AGTCATCTAC -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 7 8 270708 CASAVA_Build 7 45258451 1I ACCTGTGCCA -/G TCCCTGGCCT 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 G 0 1 270709 CASAVA_Build 7 45259476 4I ATCTTGTTTT ----/TCTG TCTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 TCTG 0 1 270710 CASAVA_Build 7 45259934 1I TCCCTAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 10 11 270711 CASAVA_Build 7 45269530 1I ATTTCACCTG -/A TATCTGGCTG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 0 1 270712 CASAVA_Build 7 45271578 7I TGCTGATCCA -------/CAGGCTG CAGTTTGAGC 3070 hom 78 het 29 0 22 7 CAGGCTG 0 1 270713 CASAVA_Build 7 45283297 6I AAATTTCCCA ------/TGGGAC TAGGCGGTAG 3070 hom 39 het 28 0 14 14 TGGGAC 0 1 270714 CASAVA_Build 7 45283318 1D ATATGCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 30 0 13 19 T 12 11 270715 CASAVA_Build 7 45316479 2I GTTGTTGAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 17 0 14 3 T 16 18 270716 CASAVA_Build 7 45319010 1D ATCAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 23 9 T 12 11 270717 CASAVA_Build 7 45319270 1D TTGAAAAAAA C/- TTTTTAAGCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 1 0 270718 CASAVA_Build 7 45336773 1I CATTTCTCAG -/T TTTTCTTTTT 3070 het 344 hom 34 1 33 0 T 4 5 270719 CASAVA_Build 7 45342264 1D AAATGATAAA G/- GGGGATATCA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 5 4 270720 CASAVA_Build 7 45349548 4I TGCACACAAA ----/TATT TATTTATAGC 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 TATT 1 2 270721 CASAVA_Build 7 45377244 21I ATCTATCCTG ---------------------/GAGAATTTTCTGTGTGCACTT GAGAAGAATG 3070 het 3070 hom 44 18 25 2 GAGAATTTTCTGTGTGCACTT 0 1 270722 CASAVA_Build 7 45418600 1I CAGGCACTTC -/T TTTTTTTTTT 2540 het 2540 ref 23 12 7 4 T 13 14 270723 CASAVA_Build 7 45424472 1D TCATCTTAAG T/- TTTTTTTTTT 952 het 952 ref 36 28 3 5 T 13 12 270724 CASAVA_Build 7 45426378 3D CCCACACCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 57 22 11 26 AAC 7 6 270725 CASAVA_Build 7 45457506 1I TTTTCTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 991 hom 35 5 18 12 C 0 1 270726 CASAVA_Build 7 45480973 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1892 het 1892 ref 22 10 7 5 A 11 12 270727 CASAVA_Build 7 45482580 1I TGTTGTTTTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 8 9 270728 CASAVA_Build 7 45487632 1D GCCTTCCCCA C/- CCCCTGCTCC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 C 5 4 270729 CASAVA_Build 7 45491959 1I5M2I TACTAAAAAC -AACAA--/AAACAAAC AAAAAAATAC 2205 het 2205 ref 13 7 5 1 N/A 0 0 270730 CASAVA_Build 7 45494329 1I CCTGTAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 14 15 270731 CASAVA_Build 7 45498494 4D CAGCTAGCAG TCTA/---- TCTATTTTAT 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 TCTA 2 1 270732 CASAVA_Build 7 45508192 4I TCTCTCAACC ----/AACT GTCAACTAAA 3070 hom 114 het 46 0 37 9 AACT 0 1 270733 CASAVA_Build 7 45524041 1D CAGAAATAAG T/- TGGAAAAACA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 1 270734 CASAVA_Build 7 45525460 1I GGAAGGCTGG -/A AAAGAATATC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 3 4 270735 CASAVA_Build 7 45535685 1I AGTTTTAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 T 10 11 270736 CASAVA_Build 7 45537227 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2211 het 1911 hom 14 6 7 1 A 10 11 270737 CASAVA_Build 7 45545925 1I CTAACACCTT -/A AAAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 A 5 6 270738 CASAVA_Build 7 45551158 1D CCAGGAATTG C/- CCAGGCATTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 C 3 2 270739 CASAVA_Build 7 45560786 1I TTGGCAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 11 12 270740 CASAVA_Build 7 45573624 1D ATCCTCTGTG A/- AGTTTGCTGT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 2 1 270741 CASAVA_Build 7 45631849 1D TGTATGTGCC T/- TGTGTGTCCC 3070 het 3070 ref 77 40 30 7 T 2 1 270742 CASAVA_Build 7 45638641 34D ATGTATAGAA AAAATTCTATACATTTCTCAGAAATGTATAGTTT/---------------------------------- TCAGTGTATA 3070 het 3070 ref 25 24 9 2 AAAATTCTATACATTTCTCAGAAATGTATAGTTT 1 0 270743 CASAVA_Build 7 45641263 2I GTGAGGTCAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 16 9 T 12 14 270744 CASAVA_Build 7 45641726 16D ATTTCTCTTG TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 8 T 28 12 270745 CASAVA_Build 7 45644606 1D AGTTTGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 13 16 14 T 17 16 270746 CASAVA_Build 7 45649395 1D TGAGATAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 10 9 270747 CASAVA_Build 7 45682173 1I CTCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 12 13 270748 CASAVA_Build 7 45683115 1I TCCAGTGGCA -/T TTTTTTGGCT 2748 het 2748 ref 28 14 7 7 T 6 7 270749 CASAVA_Build 7 45693332 1D CCATGGAGTA G/- CAAACATGTG 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 G 1 0 270750 CASAVA_Build 7 45715093 1D TGATTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 1157 het 1157 ref 32 23 3 6 T 11 10 270751 CASAVA_Build 7 45718357 2I19M1I AAATATATAA --ATATATATATACTTACACC-/ACATATATATATACTTACACCT TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 9 4 3 6 N/A 0 0 270752 CASAVA_Build 7 45757416 1D AAAAAAAAAA C/- AAAACTTAAA 1191 het 1191 ref 20 11 6 3 C 1 0 270753 CASAVA_Build 7 45764480 4I ATAAATCTTT ----/ATTC ATTATTTCAA 2840 het 2840 ref 22 14 6 2 ATTC 0 1 270754 CASAVA_Build 7 45768494 3D AAAGACAAAT ATC/--- ATCTTAAATA 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 ATC 2 1 270755 CASAVA_Build 7 45786456 1D AAGGTGCCCC T/- ATTGTCTCTA 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 T 1 0 270756 CASAVA_Build 7 45841960 1I ATCACATACA -/G GCTGGCCAGT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 G 1 2 270757 CASAVA_Build 7 45852958 1D11M2D ATTCCAGGAG TTTGGTTTTCAGAC/-TTGGTTTTCAG-- TTTGACCAAT 1643 het 1643 ref 36 29 5 8 N/A 0 0 270758 CASAVA_Build 7 45867504 1I TAAACTTTTT -/A AATAGCTTAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 2 3 270759 CASAVA_Build 7 45871767 2D CCCAAAGCTG AA/-- AGAGTCATCA 3070 het 3070 hom 36 15 15 8 A 3 1 270760 CASAVA_Build 7 45877499 1I AAATTACCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 11 21 7 A 9 10 270761 CASAVA_Build 7 45879509 1I AGGCAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 480 hom 31 2 16 13 A 13 14 270762 CASAVA_Build 7 45880045 4D ATTTACTTAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2595 het 325 hom 37 7 8 24 T 20 16 270763 CASAVA_Build 7 45881904 2D CCCTGCACTA TG/-- TGCCACCTGG 3070 hom 120 het 44 0 39 5 TG 2 1 270764 CASAVA_Build 7 45890235 4I CCTCTCTCTC ----/TCTT TTTCTCTTGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TCTT 0 1 270765 CASAVA_Build 7 45894054 5I TGAACTGTGT -----/TTTTG TTTTGTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 TTTTG 3 4 270766 CASAVA_Build 7 45923687 1D TCCAAGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 11 10 270767 CASAVA_Build 7 45926474 1D CCGCCTATAT C/- CCCCCCATCC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 C 7 6 270768 CASAVA_Build 7 45999890 17D TATTAACTTT GTTCTTTGACTTGCCAG/----------------- GTTCTTTTCA 3070 hom 141 het 48 0 47 4 GTTCTTTGACTTGCCAG 1 0 270769 CASAVA_Build 7 46008564 1D AATCCAACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 10 9 270770 CASAVA_Build 7 46026370 1D TCCCTGAAAG A/- AAAAAAAAAG 1259 het 1259 ref 34 29 3 2 A 10 9 270771 CASAVA_Build 7 46035646 1I CCTTGCCCTA -/G GCTTCCACAG 3070 hom 120 het 42 0 38 4 G 1 2 270772 CASAVA_Build 7 46038203 1I GAACAAATGA -/T TTTGTAGTCA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 3 4 270773 CASAVA_Build 7 46066540 1D AAACATTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 30 0 23 8 T 10 9 270774 CASAVA_Build 7 46092101 1D TTACACTCCC A/- ACCAACAGTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 2 1 270775 CASAVA_Build 7 46120538 1D TACTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1470 hom 55 5 37 13 T 15 14 270776 CASAVA_Build 7 46134573 9D CTGAGGAAAG CTCACATGA/--------- CTCACATGAC 3070 hom 87 het 31 0 29 5 CTCACATGA 2 1 270777 CASAVA_Build 7 46142284 1I AACATTCAGA -/C CCTAAGAGTT 3070 het 3070 hom 56 20 24 12 C 2 3 270778 CASAVA_Build 7 46150679 3D ACAAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 A 13 10 270779 CASAVA_Build 7 46162098 1D AAATATATTC T/- CAGAAATGTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 1 0 270780 CASAVA_Build 7 46163488 1I AAGAGTAGGT -/A AGTATGTGAG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 1 2 270781 CASAVA_Build 7 46166661 1D ATCATTGACT A/- AAAAAAAAAA 1356 het 1356 ref 46 28 4 14 A 11 10 270782 CASAVA_Build 7 46170542 11I GTGCTCCTGC -----------/GGGGCCTCCTG GGTGGCTGCT 3070 hom 89 het 36 0 28 8 GGGGCCTCCTG 0 1 270783 CASAVA_Build 7 46172912 1D TATCGATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 26 9 8 T 11 10 270784 CASAVA_Build 7 46173016 1D CATTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 16 12 T 14 13 270785 CASAVA_Build 7 46181002 1D GTTTACAGAA T/- CTTCAAGAAA 3070 het 3070 ref 41 22 19 0 T 1 0 270786 CASAVA_Build 7 46205996 1I TGTTTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 1263 het 1263 ref 39 24 8 7 T 11 12 270787 CASAVA_Build 7 46221104 2D AGCCTACATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 27 1 19 8 T 16 14 270788 CASAVA_Build 7 46222556 1D CCATTGTGGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 8 270789 CASAVA_Build 7 46233881 1D AGCATTCACC A/- AATAAACTTC 3070 hom 92 het 37 0 30 8 A 3 2 270790 CASAVA_Build 7 46238432 8I TAATGACAGA --------/CACCAAAC CACAGTTCCA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 CACCAAAC 0 1 270791 CASAVA_Build 7 46240610 1D30M1I AGAACAGGGG AAAAAAAAAACCCACTTGGTAAAACCCCCCC-/-AAAAAAAAACCCACTTGGTAAAACCCCCCCA AAAACTAAAT 3070 hom 99 het 33 0 34 8 N/A 0 0 270792 CASAVA_Build 7 46242175 5D ACATACTTGA AATAG/----- AATAGACTAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AATAG 2 1 270793 CASAVA_Build 7 46244292 1I TTTACATCGG -/T TAAGTGAATG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 1 2 270794 CASAVA_Build 7 46245789 1I AACGTCTATC -/A AAGGCCCAGC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 2 3 270795 CASAVA_Build 7 46246515 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 25 8 A 10 11 270796 CASAVA_Build 7 46246935 1I ACATAAAATT -/A AAAAAAACAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 7 8 270797 CASAVA_Build 7 46249026 1I GCTGTAAAGG -/A AAAAAACTGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 7 270798 CASAVA_Build 7 46250980 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 268 hom 20 3 14 3 T 13 14 270799 CASAVA_Build 7 46259749 2D GTCTCAAAGG AC/-- ACACACACAC 1367 het 1367 ref 43 32 3 8 AC 8 7 270800 CASAVA_Build 7 46265953 1I TCTTATTGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 10 270801 CASAVA_Build 7 46269187 1I AAGAAAAAAA -/T GTTTCTCATA 3070 het 300 hom 27 1 25 1 T 0 1 270802 CASAVA_Build 7 46280577 1D CAAGTGAGCC T/- TTTTTTTAAA 1510 het 1510 ref 31 15 7 9 T 8 7 270803 CASAVA_Build 7 46289511 18D AGCCAAGGAT GTGTGTGTGTATATGCAG/------------------ GTGTGTGTGT 3070 hom 88 het 34 0 29 6 GTGTGTGTGTATATGCAG 1 0 270804 CASAVA_Build 7 46304148 1I CTCAACGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 A 10 11 270805 CASAVA_Build 7 46304981 2D ACCAAGGTAG CA/-- CACACACACA 3070 hom 129 het 54 0 45 9 CA 7 6 270806 CASAVA_Build 7 46333314 1D CCGCGCCCGG C/- CCGGTGTTTG 2512 hom 18 het 9 0 6 3 C 3 2 270807 CASAVA_Build 7 46340818 1I GCAAATGGCA -/G GATCACCTCC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 1 2 270808 CASAVA_Build 7 46370987 1D CAAATTTTGT G/- GTGGTACAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 G 2 1 270809 CASAVA_Build 7 46381507 14D CCAAAAATAT TGTGTGTGTGTGTG/-------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 39 0 32 9 TG 15 8 270810 CASAVA_Build 7 46389452 1I GCTATCTTGA -/G GGTGTAGGCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 2 3 270811 CASAVA_Build 7 46390716 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 24 0 18 6 A 14 12 270812 CASAVA_Build 7 46422440 2D ACCCAGAAAC AG/-- ACTCAGGGCA 3070 hom 87 het 33 0 28 5 AG 1 0 270813 CASAVA_Build 7 46425005 1D TTCAGCAGCA T/- TCTACATATT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 2 1 270814 CASAVA_Build 7 46426625 2D CGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 39 0 29 11 TG 9 8 270815 CASAVA_Build 7 46449345 1I GAAATGAGAG -/A AAATATAACA 3070 hom 68 het 26 0 23 3 A 3 4 270816 CASAVA_Build 7 46504562 1I CCCATCCGAA -/G GTCACCAACA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 1 2 270817 CASAVA_Build 7 46577467 1D GGATGAGAAG A/- GGACAGAATG 3070 het 3070 ref 74 39 26 10 A 1 0 270818 CASAVA_Build 7 46577994 1D CGCCTGTAAT C/- CCAGCTACTC 3070 het 2327 hom 21 5 15 2 C 3 2 270819 CASAVA_Build 7 46578761 1I GTTTTGATGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 8 9 270820 CASAVA_Build 7 46580496 1D GTACTTGCAC A/- AAAAAACAGA 3070 hom 60 het 30 0 23 9 A 7 6 270821 CASAVA_Build 7 46585038 1D AAGAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 11 10 270822 CASAVA_Build 7 46589036 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTAA 3070 het 76 hom 19 1 16 2 A 0 1 270823 CASAVA_Build 7 46590313 4I ATTGAATTTT ----/CCCC CACAGATGTG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 C 1 5 270824 CASAVA_Build 7 46611860 21D AGCCTGGCCA ACATGATGAAACCCTGTCTCT/--------------------- ACTAAAAATA 659 het 659 ref 13 7 3 5 ACATGATGAAACCCTGTCTCT 1 0 270825 CASAVA_Build 7 46617962 2D CTGGTAATAC TT/-- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 30 12 13 7 T 9 7 270826 CASAVA_Build 7 46618407 2D TTAAAACAAG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 14 20 5 T 10 8 270827 CASAVA_Build 7 46619030 11D TGTATCTGCA TGTGTGTATAT/----------- TGTGTGAATG 3070 het 3070 hom 47 18 29 6 TGTGTGTATAT 1 0 270828 CASAVA_Build 7 46623437 1D AGATCAATAG T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 40 27 11 2 T 7 6 270829 CASAVA_Build 7 46640419 1I TTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 1455 het 1450 hom 25 8 6 11 G 0 1 270830 CASAVA_Build 7 46640444 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 26 0 12 14 T 11 10 270831 CASAVA_Build 7 46644009 1I CAAGCCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 A 10 11 270832 CASAVA_Build 7 46647141 1I TTTCCTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 T 9 10 270833 CASAVA_Build 7 46648745 1I ACCCTTTATC -/A AAAAAAAAAA 729 het 729 ref 28 10 4 14 A 17 18 270834 CASAVA_Build 7 46655835 1D AAAGTAAGCC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 A 9 8 270835 CASAVA_Build 7 46656888 4D AAAGAAAGAG AGGA/---- AGGAAGGAAG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 AGGA 4 3 270836 CASAVA_Build 7 46657504 1D AGTTTTGGTT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 6 het 23 1 14 8 G 12 11 270837 CASAVA_Build 7 46674151 1I CTCTCTAGGC -/T CCCCCACCCA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 0 1 270838 CASAVA_Build 7 46679862 3D GGTTTGATAT CAA/--- CAACAACATT 3070 het 3070 hom 39 16 19 7 CAA 3 2 270839 CASAVA_Build 7 46703259 1D TCAGAGGAGG A/- AAATGATGCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 4 3 270840 CASAVA_Build 7 46704795 1I TCTCAGGTAG -/T TTTTTTTATA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 7 8 270841 CASAVA_Build 7 46705474 1D AAAATAATGC A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 8 7 270842 CASAVA_Build 7 46708148 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2097 het 2097 ref 27 12 9 6 T 13 12 270843 CASAVA_Build 7 46717484 1I GTTGAACATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 A 10 11 270844 CASAVA_Build 7 46726245 1I ACAAATATTC -/T TTTTTTTTTT 2057 het 2057 ref 26 16 6 4 T 13 14 270845 CASAVA_Build 7 46733372 1D TACATTCCTC T/- CATTGTCACA 3070 het 3070 ref 38 26 11 2 T 1 0 270846 CASAVA_Build 7 46742103 1I TTTCAGAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 79 hom 35 1 28 6 A 9 10 270847 CASAVA_Build 7 46742856 1I AACAGTTACT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 8 9 270848 CASAVA_Build 7 46744771 2D ATAGGACCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 130 het 49 0 43 6 A 12 10 270849 CASAVA_Build 7 46757437 1I CTGAGCACAG -/A AAAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 A 5 6 270850 CASAVA_Build 7 46761776 1I GAAAAAAAAA -/G GAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 44 16 18 10 G 1 2 270851 CASAVA_Build 7 46769188 1I ATAAAGCAAG -/A AAAAAAATTT 2991 het 2709 hom 18 7 9 2 A 7 8 270852 CASAVA_Build 7 46782346 1D TTCTAAGTCT A/- AAAAAAAAAA 1756 het 1756 ref 49 37 5 9 A 12 11 270853 CASAVA_Build 7 46784506 1I GGCCTGTGGT -/G GCAACAGCCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 1 2 270854 CASAVA_Build 7 46826738 27I TGTTTATACT ---------------------------/AAACATTTATACACAACCAAAAAAGAG AATGATTGAT 3070 het 3070 hom 19 9 12 0 AAACATTTATACACAACCAAAAAAGAG 0 1 270855 CASAVA_Build 7 46845369 1I TGTTCAATCC -/A AAAATCTAAA 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 A 4 5 270856 CASAVA_Build 7 46846277 1I TTCCATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 11 12 270857 CASAVA_Build 7 46855405 2D CCTATTTATT CA/-- GTCTTTGGAT 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 CA 1 0 270858 CASAVA_Build 7 46879164 1D AGGGGCATTT G/- GTTTGTTTCC 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 G 2 1 270859 CASAVA_Build 7 46879711 1I AAAATCGACT -/C AAGATGGATT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 C 0 1 270860 CASAVA_Build 7 46887134 1I GTTAAATAGG -/T AAGTGAAAAT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 0 1 270861 CASAVA_Build 7 46899829 1D TATATTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 5 A 10 9 270862 CASAVA_Build 7 46899979 5D GACAGAGGGA GAAAT/----- GAAATGATCA 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 GAAAT 2 1 270863 CASAVA_Build 7 46909194 1D GAGAGAGGTA G/- GGGAAGTACC 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 G 4 3 270864 CASAVA_Build 7 46910207 1D TTATCATCAG A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 40 20 17 3 A 7 6 270865 CASAVA_Build 7 46920066 1D CCCTCTAAGC A/- ATACTTTGCT 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 A 2 1 270866 CASAVA_Build 7 46929031 1I AAATGGCAGA -/T TTTTTTTTTT 2820 het 2820 ref 34 12 11 11 T 11 12 270867 CASAVA_Build 7 46935745 1D TGTGATTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 12 10 6 T 10 9 270868 CASAVA_Build 7 47000652 2I ACTATGCCAG --/TC TCTACATTCA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 TC 1 2 270869 CASAVA_Build 7 47000866 2D TATTTGAGAA CC/-- CCCCCCCCCT 3070 het 3070 ref 49 27 11 11 C 11 9 270870 CASAVA_Build 7 47001934 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 G 0 1 270871 CASAVA_Build 7 47002607 4D TATTCTGAGA TTCT/---- TTCTTGTTTG 3070 het 3070 ref 42 20 20 3 TTCT 2 1 270872 CASAVA_Build 7 47002846 1D GAACCGATCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 14 15 12 A 10 9 270873 CASAVA_Build 7 47003656 1D GTGTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 26 1 17 8 A 12 11 270874 CASAVA_Build 7 47004222 1D ATTTTTATTG C/- CTGTATTATT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 C 2 1 270875 CASAVA_Build 7 47009040 1I TCTCTAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 10 11 270876 CASAVA_Build 7 47009978 5D CAATAAAAGA AATAT/----- AATATACTAT 3070 het 3070 hom 22 8 14 1 AATAT 2 1 270877 CASAVA_Build 7 47011790 1D CTGTATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 10 A 13 12 270878 CASAVA_Build 7 47014497 1I AAACTGCTCT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 7 8 270879 CASAVA_Build 7 47015375 1D TTTAAAAATA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 T 8 7 270880 CASAVA_Build 7 47016792 1I CTTTTATATG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 7 8 270881 CASAVA_Build 7 47018181 1D GAGTATCTAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 15 20 8 A 9 8 270882 CASAVA_Build 7 47020475 3I TTGTATCTAT ---/TCC TCCTCTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 TCC 1 2 270883 CASAVA_Build 7 47021680 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2739 hom 25 7 13 5 A 10 9 270884 CASAVA_Build 7 47026622 1I TCACGGGCCC -/T GCTTACAGAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 0 1 270885 CASAVA_Build 7 47028970 1I CTTGTCCCTT -/A ACGTCCCCAG 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 1 2 270886 CASAVA_Build 7 47036292 2D TGACAGATCT TC/-- TCACTCTGAG 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 TC 2 1 270887 CASAVA_Build 7 47061513 6D TCCTCCTTCT CCTTCC/------ CCTTCTCCTA 2290 het 2290 ref 22 13 6 5 CCTTCC 1 0 270888 CASAVA_Build 7 47062563 2D TGGAGTTTAG GT/-- GTGTGTGTGT 1287 het 1287 ref 49 39 3 7 GT 9 8 270889 CASAVA_Build 7 47062905 3D ACCTGGATCC TCT/--- TCTTCTGTTG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 TCT 3 2 270890 CASAVA_Build 7 47078583 2D CATGAGGTAT TC/-- ATTGATTCGG 3070 het 3070 ref 39 22 13 6 TC 1 0 270891 CASAVA_Build 7 47096915 1I TCCTCCAGAT -/C CCCCCCAGCT 3070 hom 57 het 22 0 18 4 C 6 7 270892 CASAVA_Build 7 47099031 1D ATAACGATAT G/- GAACTGGAAG 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 G 2 1 270893 CASAVA_Build 7 47099120 1D24M1I TGTGGAAGCT AAAAAAAAAATGATCTTATAGAAGT-/-AAAAAAAAATGATCTTATAGAAGTA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 21 15 8 N/A 0 0 270894 CASAVA_Build 7 47102850 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2467 hom 28 9 12 8 A 11 10 270895 CASAVA_Build 7 47111060 1I GCCCTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2065 het 221 hom 18 2 11 5 T 15 16 270896 CASAVA_Build 7 47111539 1D TATTTCAAAT A/- AAAATATAAA 3070 hom 129 het 46 0 44 3 A 5 4 270897 CASAVA_Build 7 47113235 1D CAATGCTTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 64 het 29 0 22 7 T 10 9 270898 CASAVA_Build 7 47114173 1D ACCATCCCTA T/- TTTGTTTAGT 3070 hom 132 het 49 0 45 5 T 4 3 270899 CASAVA_Build 7 47115513 1D CCTCACCACA C/- CCCCCCAGTC 3070 hom 126 het 46 0 40 6 C 7 6 270900 CASAVA_Build 7 47117649 1D AACTATAGAT A/- TATATGTATG 1400 het 1400 ref 9 6 3 0 A 1 0 270901 CASAVA_Build 7 47126731 1D GGACTCAGGC A/- GGGGGGGGCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 1 0 270902 CASAVA_Build 7 47132551 5I TCACCAGGGA -----/CCCAC CCTTCTCCTC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 CCCAC 0 1 270903 CASAVA_Build 7 47132643 5I CAGTAGCAGC -----/CAGCT CCAGCCACCA 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 CAGCT 0 1 270904 CASAVA_Build 7 47135296 4I TATTGAACTA ----/TAAC TAAGCCTTCA 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 TAAC 0 1 270905 CASAVA_Build 7 47135906 2I AAATATTATC --/AA AAGAGAATTT 2838 het 2838 ref 21 12 7 2 A 2 4 270906 CASAVA_Build 7 47140992 1D AGAGTCATAT A/- AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 6 A 7 6 270907 CASAVA_Build 7 47145227 1I AAACTATCTG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 7 8 270908 CASAVA_Build 7 47151607 2D ATATCATGAG AT/-- AGTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 50 24 21 6 AT 1 0 270909 CASAVA_Build 7 47160703 1I TTCAGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 12 13 270910 CASAVA_Build 7 47161853 1D GTATTCGTCA G/- GGTTCTCTAG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 G 3 2 270911 CASAVA_Build 7 47166438 1I AGAGAGTAGT -/G GTTCTCCCAG 1342 het 1342 ref 17 12 3 2 G 1 2 270912 CASAVA_Build 7 47174623 1I TATTCCCAAG -/A AATTCTTACC 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 A 2 3 270913 CASAVA_Build 7 47177564 1I GTAGTCCTAG -/C TACTCAGGAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 C 0 1 270914 CASAVA_Build 7 47202532 1I ACCCTTCCAT -/G GCAGTCTGCC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 270915 CASAVA_Build 7 47214214 2D GAAAGAGGGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 93 het 39 0 29 10 GT 10 9 270916 CASAVA_Build 7 47214906 1I GCTGCATGTG -/A GGACCACCCA 3070 hom 158 het 61 0 48 13 A 0 1 270917 CASAVA_Build 7 47248684 4D ACCAGACACT TCTC/---- TCTATCTCTC 3070 hom 63 het 22 0 22 3 TC 3 1 270918 CASAVA_Build 7 47249204 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 59 het 23 0 20 4 A 9 8 270919 CASAVA_Build 7 47303419 1I GTAGGTCCTC -/T TCCCCTTACT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 1 2 270920 CASAVA_Build 7 47325735 1D CATAAGGCCC A/- GGGGGAGAAA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 1 0 270921 CASAVA_Build 7 47344217 4D GGTACTACAA TTTG/---- TTTAACCACT 3070 het 3070 hom 58 27 28 4 TTTG 1 0 270922 CASAVA_Build 7 47350514 1I TGGCAGAGCT -/A GGGGCGCCCG 3070 het 1862 hom 25 5 14 6 A 0 1 270923 CASAVA_Build 7 47358212 2I ACCCACGTCA --/CT CACACACCTG 3070 het 3070 hom 69 17 28 24 CT 0 1 270924 CASAVA_Build 7 47358237 2I TTCACACTCT --/TA TAGTCTCTCA 3070 het 780 hom 61 5 34 22 TA 1 2 270925 CASAVA_Build 7 47364270 1D ACACTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2002 hom 30 5 13 13 T 11 10 270926 CASAVA_Build 7 47373764 1I TCCCCAGAGG -/C CCCCGCACCG 3070 hom 59 het 21 0 16 5 C 4 5 270927 CASAVA_Build 7 47385706 4I GCCCTTTTCC ----/TCTT TCTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 TCTT 1 2 270928 CASAVA_Build 7 47395731 1I TGCCACCCTC -/A CTCTTCTGAT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 0 1 270929 CASAVA_Build 7 47398320 1D CCCGCAGCCA C/- CACCTGCCAG 1146 het 1146 ref 18 8 6 5 C 2 1 270930 CASAVA_Build 7 47415678 1D GGGAGCACCC T/- GCCCTTGAGA 3070 hom 66 het 27 0 19 8 T 1 0 270931 CASAVA_Build 7 47422640 2D AGTGAGAAAC AG/-- GGCATGTCAG 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 AG 1 0 270932 CASAVA_Build 7 47423885 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 A 9 8 270933 CASAVA_Build 7 47428994 1D TAATGGTTCC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 32 0 28 7 A 9 8 270934 CASAVA_Build 7 47441239 2I GTGATAACTC --/TT TGTTTCCTTC 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 1 3 270935 CASAVA_Build 7 47450814 6I GGGATCTTCT ------/CAATCC CAATCCAATA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 CAATCC 1 2 270936 CASAVA_Build 7 47452168 2D GTTTAAAAAA CT/-- CTCTCTACTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 CT 4 3 270937 CASAVA_Build 7 47452812 15D CCAGGCTGCC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 8 T 25 10 270938 CASAVA_Build 7 47452989 1I CTAATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2977 het 2977 ref 33 15 10 8 T 10 11 270939 CASAVA_Build 7 47460733 1D GGGCTGCTCT G/- GGGGGGCAAC 3070 het 2211 hom 22 7 11 5 G 7 6 270940 CASAVA_Build 7 47477074 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 9 10 270941 CASAVA_Build 7 47477573 1I TGGAATGGAA -/G GGGGGTCTTC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 G 5 6 270942 CASAVA_Build 7 47480538 2D CATACACAAA AC/-- ACAACACAAA 3070 het 3070 ref 73 35 27 13 AC 2 1 270943 CASAVA_Build 7 47485062 2I CACACATAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 55 19 15 21 AC 8 9 270944 CASAVA_Build 7 47493421 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 19 6 A 12 13 270945 CASAVA_Build 7 47509720 4I CCCTGAAACT ----/TAAG TAAGTATTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAAG 1 2 270946 CASAVA_Build 7 47538641 1I TCCAGCTGCA -/G GAGAGGAACT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 G 1 2 270947 CASAVA_Build 7 47544090 1D CCTCACCGCA C/- CCCCCCCACC 1593 hom 28 het 13 0 9 4 C 8 7 270948 CASAVA_Build 7 47549791 2I TCATGAAAAT --/CA CACAGACACT 3070 hom 143 het 53 0 47 6 CA 2 3 270949 CASAVA_Build 7 47572150 1I CAGATTAGTA -/C TACATATTGG 3070 hom 61 het 28 0 19 9 C 0 1 270950 CASAVA_Build 7 47577634 9I CTGGTGTCCC ---------/CAGAGCTCA CAGAGCTGAC 3070 hom 86 het 36 0 29 7 CAGAGCTCA 0 1 270951 CASAVA_Build 7 47585094 1I GTCTCAGCGT -/G TTTAGGAGCA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 0 1 270952 CASAVA_Build 7 47586129 1I ACACTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 38 1 28 9 A 13 14 270953 CASAVA_Build 7 47598482 1I GATTATAAAG -/C CGCAAGGAAG 3070 het 2992 hom 28 10 12 6 C 1 2 270954 CASAVA_Build 7 47601688 1D CAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 12 11 270955 CASAVA_Build 7 47619153 1D AAGAGGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 15 14 270956 CASAVA_Build 7 47626808 1I TGACATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2364 hom 31 8 9 14 T 11 12 270957 CASAVA_Build 7 47643840 10I TTTAATAATA ----------/GCACAGCATG GCACAGCATG 3070 hom 48 het 21 0 16 5 GCACAGCATG 1 2 270958 CASAVA_Build 7 47643929 3I CTTTTTTCTT ---/CTC CTGAACTGCT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 CTC 0 1 270959 CASAVA_Build 7 47714811 1D TTGTAGAGTC A/- GGGGTCTTCC 2693 het 2693 ref 32 20 6 6 A 1 0 270960 CASAVA_Build 7 47717152 1D AACAGGGTTG A/- AAATTAAGTT 3070 het 3070 hom 33 17 16 0 A 4 3 270961 CASAVA_Build 7 47718612 8D CAGAAATGAA ATAGGAAT/-------- ATCTGTAACC 3070 het 3070 hom 32 13 18 3 ATAGGAAT 1 0 270962 CASAVA_Build 7 47719600 1D GCTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1160 het 1160 ref 10 6 4 0 T 12 11 270963 CASAVA_Build 7 47752298 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 9 8 270964 CASAVA_Build 7 47754834 2D GTCCATCCCT GA/-- GAGAGAGATG 3070 hom 99 het 39 0 32 8 GA 5 4 270965 CASAVA_Build 7 47756690 1I CCAGGGTGGA -/C CGGAGTGGTG 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 C 1 2 270966 CASAVA_Build 7 47758570 1D CTTTTTCTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 85 hom 31 1 24 7 T 9 8 270967 CASAVA_Build 7 47763376 2D ATATATATAT AA/-- AATGTATTTT 2368 het 2368 ref 20 9 8 3 A 4 2 270968 CASAVA_Build 7 47763763 1I AGCAGGTGAA -/G GCAAATGGTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 1 2 270969 CASAVA_Build 7 47775574 1D GTTGATTGCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 T 9 8 270970 CASAVA_Build 7 47797586 1D CAAAGAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 40 3 12 25 T 15 14 270971 CASAVA_Build 7 47815129 2D AACTTTTTGA CT/-- CTATGATAAC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 CT 2 1 270972 CASAVA_Build 7 47818447 1I GGAGGCCTCC -/A ATTTCCCACC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 1 2 270973 CASAVA_Build 7 47821978 1D ATGAAGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 61 20 29 12 A 11 10 270974 CASAVA_Build 7 47825767 1D TGCTCAGCAG A/- AAAAAAAAAA 1350 het 1350 ref 44 37 3 4 A 11 10 270975 CASAVA_Build 7 47827818 1D TTCCCAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 13 12 270976 CASAVA_Build 7 47840272 1D CCTGGGAAAC G/- GGACCTCCCT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 G 3 2 270977 CASAVA_Build 7 47844658 1D AGCCCTGAAA T/- GATGTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 4 T 1 0 270978 CASAVA_Build 7 47854097 1I CAATTCACAG -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 48 29 14 5 A 7 8 270979 CASAVA_Build 7 47855820 1D TAGATTTTGG T/- TGTGTATGTG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 2 1 270980 CASAVA_Build 7 47861478 1I GTGGTGCTGC -/T TATTACACTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 1 2 270981 CASAVA_Build 7 47863043 2I CTACAGAAAT --/AC AGAGAATCCT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 AC 0 1 270982 CASAVA_Build 7 47864492 1D CTCAAAAAAA C/- AGAAGGTATC 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 C 1 0 270983 CASAVA_Build 7 47864748 1I TTAACATCCT -/G GGGATATGGA 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 G 3 4 270984 CASAVA_Build 7 47866935 2I GAGATGCACA --/AG AGAGGGACAA 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 AG 2 3 270985 CASAVA_Build 7 47886072 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 11 12 270986 CASAVA_Build 7 47893170 2D CTAACCACTG TA/-- TGTGTTTCCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TA 1 0 270987 CASAVA_Build 7 47898483 1I GGCAGGAAGG -/C CAAACGGGCT 3070 hom 80 het 34 0 25 9 C 1 2 270988 CASAVA_Build 7 47903976 1D CCAATGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 26 8 T 13 12 270989 CASAVA_Build 7 47905539 1D ATGAGGATAT G/- GGGGGGAATA 3070 het 2910 hom 30 8 17 5 G 7 6 270990 CASAVA_Build 7 47908172 10D AAAAGAAAAG AAAAGAAAAA/---------- AAAGAAAAGA 2975 het 2975 ref 20 10 9 3 AAAAGAAAAA 1 0 270991 CASAVA_Build 7 47927797 2D AGAAACTGTG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 AT 8 7 270992 CASAVA_Build 7 47952623 2I CACCACACAA --/AC ACACACCATA 3070 hom 135 het 53 0 42 11 AC 3 4 270993 CASAVA_Build 7 47960730 2I ACTGTAATTA --/CT CTCTTTTCTT 3070 hom 156 het 60 0 51 9 CT 2 3 270994 CASAVA_Build 7 47962294 1D CATGAACAGA G/- GGTAAAGAGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 3 2 270995 CASAVA_Build 7 47967030 1I CCTTTCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1216 hom 32 5 17 10 A 15 16 270996 CASAVA_Build 7 47971040 1I GGGCAGGAGC -/A AGCGGGGTGA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 1 2 270997 CASAVA_Build 7 47972258 1I GACAAGCAGG -/A AGACAAACAT 3070 hom 147 het 56 0 49 7 A 1 2 270998 CASAVA_Build 7 47975013 1I CCATGCCAGG -/T TGAGAAATAG 3070 hom 135 het 51 0 45 6 T 1 2 270999 CASAVA_Build 7 47978818 46D GCACTGTTAT CCCCATTTGGGGTAGTATCCAGCACTAGGGTACTCACTGCACAGCG/---------------------------------------------- CAGCCTGGAG 3070 hom 45 het 14 0 16 3 CCCCATTTGGGGTAGTATCCAGCACTAGGGTACTCACTGCACAGCG 1 0 271000 CASAVA_Build 7 47980482 3I TCAGCTCCAT ---/GGA GGAGGAGCTT 3070 hom 102 het 40 0 30 10 GGA 2 3 271001 CASAVA_Build 7 47983170 1I AAGTGTGGTG -/A ATAAGACAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 271002 CASAVA_Build 7 47984247 2D GAAAATGGAT AG/-- AGAAACCATG 3070 hom 117 het 45 0 37 9 AG 2 1 271003 CASAVA_Build 7 47986362 2I TTTAAAGGAA --/AG AAATTTTAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AG 0 1 271004 CASAVA_Build 7 47990312 5D CCCTCCATAA ATGTT/----- ATACCTATTT 3070 hom 51 het 19 0 18 3 ATGTT 1 0 271005 CASAVA_Build 7 47992778 1D CTGTTTGGGA T/- TTTTTTCACA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 7 6 271006 CASAVA_Build 7 48000943 3D ATGATGGTGG TAA/--- TAATGGTGGC 3070 het 3070 ref 70 32 29 12 TAA 2 1 271007 CASAVA_Build 7 48009152 1D CAGGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 11 10 271008 CASAVA_Build 7 48013631 1D AAAAAAAAAA C/- AAGGACATCC 2743 het 2743 ref 46 24 15 9 C 1 0 271009 CASAVA_Build 7 48038944 1D AGGGCAAAAG T/- GGGAGAGATG 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 1 0 271010 CASAVA_Build 7 48039519 1I CATTGTCTCT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 8 9 271011 CASAVA_Build 7 48043054 2D GTCTTCTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 T 12 10 271012 CASAVA_Build 7 48043300 5D TGGAAAGGGG ACAGC/----- ACAGAAGGCC 3070 het 3070 ref 42 22 15 8 ACAGC 1 0 271013 CASAVA_Build 7 48051422 1I CCCTTTGTTG -/T TTTTCAATGC 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 T 4 5 271014 CASAVA_Build 7 48054912 3D GTCTTTATAG TTC/--- TTCTGGACAG 3070 het 3070 ref 45 21 19 7 TTC 2 1 271015 CASAVA_Build 7 48057242 1I CAAACCTGTG -/T TAAGAGAGTA 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 T 1 2 271016 CASAVA_Build 7 48058515 4D TTACTAATTC TTAA/---- TTGACTATCA 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 TTAA 1 0 271017 CASAVA_Build 7 48061439 5D TTAGTTTACT TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 28 14 12 5 TTTTA 3 2 271018 CASAVA_Build 7 48063188 1D CATATATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3017 hom 34 9 15 11 T 13 12 271019 CASAVA_Build 7 48063282 1I TATTTCTGTG -/A AAAAATGTCA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 5 6 271020 CASAVA_Build 7 48069705 1I ACAGTAAACC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 8 9 271021 CASAVA_Build 7 48082335 3I17M1D TCCTACAGCA ---ACCGGATATCCATAGGCA/TTTGCCGGATATCCATAGGC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 23 25 10 N/A 0 0 271022 CASAVA_Build 7 48082842 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1273 hom 24 7 10 7 A 16 15 271023 CASAVA_Build 7 48093544 1I GAGAGAATAG -/C CAACTTCCTA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 1 2 271024 CASAVA_Build 7 48118698 1D TTTCACATCA G/- GGCTTCTGGG 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 3 2 271025 CASAVA_Build 7 48123863 1I AAGAATCAGG -/A AAGATGGCCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 2 3 271026 CASAVA_Build 7 48160054 1D TTCTTTATTG T/- TTTTTTTTTT 1961 het 1961 ref 42 28 6 8 T 17 16 271027 CASAVA_Build 7 48167741 1I CTCAGATGGA -/C CCACATCTGA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 C 2 3 271028 CASAVA_Build 7 48216931 4I ATTTGTGTGA ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 14 17 7 GT 6 8 271029 CASAVA_Build 7 48237389 1I TTTTGGTGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 8 9 271030 CASAVA_Build 7 48256744 1D CAGTATTACC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 10 9 271031 CASAVA_Build 7 48271141 1I TTAAAATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 10 11 271032 CASAVA_Build 7 48281492 1D AGCACTGGAA T/- TTGCCTTCCA 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 3 2 271033 CASAVA_Build 7 48298784 1D CAAATCAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 9 271034 CASAVA_Build 7 48307930 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1340 het 1340 ref 38 21 3 14 T 13 12 271035 CASAVA_Build 7 48322590 1I TGAGAATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 17 14 A 11 12 271036 CASAVA_Build 7 48340028 1D ATTCATCTAT C/- CATCCATCCA 3070 hom 151 het 57 0 51 7 C 2 1 271037 CASAVA_Build 7 48353735 1I ATAGATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 10 11 271038 CASAVA_Build 7 48355661 1I AGTTTTTAAC -/A AAAAAATTTA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 6 7 271039 CASAVA_Build 7 48380049 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 10 11 271040 CASAVA_Build 7 48432381 1D ATACATTCAG T/- ATTTTGAGGA 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 T 1 0 271041 CASAVA_Build 7 48435863 5D GCAACAATCC TATAA/----- TATGTCTTAT 2689 het 2689 ref 26 13 8 5 TATAA 1 0 271042 CASAVA_Build 7 48437082 2I ATGCCTGCAG --/AC ACAGAGCCGG 3070 hom 108 het 40 0 35 5 AC 1 2 271043 CASAVA_Build 7 48438200 2D TCCTGGCTTG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 11 9 271044 CASAVA_Build 7 48446971 1D AATTTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 T 10 9 271045 CASAVA_Build 7 48448716 2D ATACTCAGCC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 T 11 9 271046 CASAVA_Build 7 48456849 1I GGGTGTCTCC -/T AGGCTTAACC 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 0 1 271047 CASAVA_Build 7 48466952 1D TATTTATTTG T/- TTTTTTTTTC 1395 het 1395 ref 32 23 3 6 T 10 9 271048 CASAVA_Build 7 48472639 1D TCTTTTTTTC A/- GTTCAGGGTA 1707 het 1707 ref 33 13 5 15 A 1 0 271049 CASAVA_Build 7 48475972 2I CCAACCTCTT --/TA TCTCTCCCCT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 TA 0 1 271050 CASAVA_Build 7 48493316 1I GGTAATCATA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 T 7 8 271051 CASAVA_Build 7 48496671 1I CAGGCTTCTC -/T AATTGTCTCT 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 T 0 1 271052 CASAVA_Build 7 48501546 1I AGAAGATCTT -/G GCACAGAGGC 3070 hom 123 het 49 0 40 9 G 1 2 271053 CASAVA_Build 7 48507895 10D ATTGTCTCTA AGTGAGTGGG/---------- GGAGTAGAGT 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 AGTGAGTGGG 1 0 271054 CASAVA_Build 7 48520326 1I ATACAGTTGG -/C CCATGACTGG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 C 2 3 271055 CASAVA_Build 7 48522903 2I GAATTCTCTT --/CA CATACATAAC 3070 hom 123 het 45 0 40 5 CA 1 2 271056 CASAVA_Build 7 48532120 1I TTCTTAGCAA -/G GCCCCCCTGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 1 2 271057 CASAVA_Build 7 48546402 2I TATTTATGAA --/AT ATGATGGATT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AT 1 2 271058 CASAVA_Build 7 48548893 1D ATTTAAATGA T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 52 21 25 7 T 8 7 271059 CASAVA_Build 7 48549403 1I GTGTAAAAAT -/A AATAAATATT 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 A 2 3 271060 CASAVA_Build 7 48551798 4I ATTAGAGAAA ----/ACCC ACAAAGTAGT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 ACCC 0 1 271061 CASAVA_Build 7 48552048 1I AAAAAAGGTA -/T TTTTTTTTTT 2963 het 2963 ref 25 13 8 4 T 11 12 271062 CASAVA_Build 7 48552840 1I TAATAAGATA -/T ATACCATGTT 3070 het 3070 ref 39 21 10 8 T 0 1 271063 CASAVA_Build 7 48554007 3I AATATAAATC ---/ATT ATAATTTTAC 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 ATT 0 1 271064 CASAVA_Build 7 48554681 1I ATCCCCCAAA -/G ACTGTGTTCA 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 G 0 1 271065 CASAVA_Build 7 48555895 1I AATAGATTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 9 10 271066 CASAVA_Build 7 48556604 1D GAATTATAGG T/- TAAGTTTTAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 T 2 1 271067 CASAVA_Build 7 48556714 2D CTCTTAAGAC AA/-- AAGCCTTTCT 3070 het 3070 ref 45 23 19 4 A 4 2 271068 CASAVA_Build 7 48557310 1D ACAGTGTATA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 45 20 25 0 T 7 6 271069 CASAVA_Build 7 48557971 1I CTGAGCACAC -/T TTAAGATAGG 3070 het 3070 ref 62 31 26 5 T 2 3 271070 CASAVA_Build 7 48558691 2D ATGTAACACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 14 12 271071 CASAVA_Build 7 48559785 1I ATCACCACAC -/T GTCTTCCACA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 0 1 271072 CASAVA_Build 7 48560644 1D AAGTGATCCG C/- CCCCCCTCAG 3070 het 1646 hom 16 5 10 1 C 7 6 271073 CASAVA_Build 7 48560871 4I TATCTTTTTA ----/ATCT ATCTATCCAT 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 ATCT 1 2 271074 CASAVA_Build 7 48561281 2D TTTTTGTTTG TT/-- TTTGTATTGT 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 T 5 3 271075 CASAVA_Build 7 48561408 2I GGCTTACTGA --/CT CTGTTCACTA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 CT 1 2 271076 CASAVA_Build 7 48561761 1D TATTGCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 12 11 271077 CASAVA_Build 7 48567438 1D AGTGAGCTTT A/- CACTTTCAGA 3070 het 3070 ref 26 15 8 4 A 1 0 271078 CASAVA_Build 7 48568786 1I ATTCTTTTGA -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 T 6 7 271079 CASAVA_Build 7 48571974 1I TTCTCCTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 9 10 271080 CASAVA_Build 7 48572253 3D GTATGGGGGG GGA/--- GGTGGATACA 3070 het 3070 ref 43 21 14 9 GGA 1 0 271081 CASAVA_Build 7 48572445 4I GGGCTGAGTT ----/TTTG TTTAATTCTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 TTTG 0 1 271082 CASAVA_Build 7 48572694 1I CCATAGAACC -/A TAACTCTTGA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 0 1 271083 CASAVA_Build 7 48573101 2D TGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 TA 7 6 271084 CASAVA_Build 7 48574414 1D TATCCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 7 T 11 10 271085 CASAVA_Build 7 48575412 2D GGGCAAGAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 12 10 271086 CASAVA_Build 7 48585202 1D CCAGTAGACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 10 hom 31 1 10 20 T 10 9 271087 CASAVA_Build 7 48587404 3D TAAAAAGGAA AAT/--- AATAAAGAAA 2773 het 2773 ref 20 8 8 5 AAT 2 1 271088 CASAVA_Build 7 48587861 2D TATGGTTAAC TG/-- TTTTTATGAG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 TG 1 0 271089 CASAVA_Build 7 48599693 1I ATAATTGCCA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 48 15 26 7 T 6 7 271090 CASAVA_Build 7 48601219 2D GGAGCTCTTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 T 11 9 271091 CASAVA_Build 7 48602342 1D GAAATCTTTC T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 7 6 271092 CASAVA_Build 7 48609243 4D TTTTGAAAAC AGTA/---- AGTGTTATTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AGTA 1 0 271093 CASAVA_Build 7 48610061 8D ATTGTATATA CAGCAAGT/-------- CAGCAAGTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 10 CAGCAAGT 2 1 271094 CASAVA_Build 7 48617571 1I GGAAATGCAG -/A AATCACCCAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 3 271095 CASAVA_Build 7 48625743 1I GACATTTTGC -/T TTTTCTCTTG 3070 het 3070 ref 52 22 23 7 T 4 5 271096 CASAVA_Build 7 48626221 1I CCTGTCATTC -/T TATGTAGAAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 1 2 271097 CASAVA_Build 7 48630330 1I60M1I TTAGACCTGG -AGTACAGGTAAAATTTGGTTAAAAGGGGATTTAATTCTGGATTGTATTTAGTAACAAAAA-/AAGTACAGGTAAAATTTGGTTAAAAGGGGATTTAATTCTGGATTGTATTTAGTAATAAAAAC ATCACTACAG 3070 het 3070 hom 42 12 21 25 N/A 0 0 271098 CASAVA_Build 7 48631334 1D TGGCTTTTTC A/- TTGCTTGGCA 3070 het 3070 hom 50 19 26 6 A 1 0 271099 CASAVA_Build 7 48637438 1D AGTCTCAACC A/- ACCTTATGTA 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 A 2 1 271100 CASAVA_Build 7 48645363 2D TTTTGTTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 585 hom 47 5 17 26 A 18 16 271101 CASAVA_Build 7 48658647 3I CATATGCACA ---/CAT CATGCACATA 3070 hom 181 het 65 0 61 4 CAT 1 2 271102 CASAVA_Build 7 48665576 1I CCAAATCCAC -/A AAAATCCCAC 3070 het 3070 ref 46 18 16 12 A 4 5 271103 CASAVA_Build 7 48678991 2D TAAAAATAAC CA/-- GTGTCTCTAA 3070 het 3070 hom 29 13 16 0 CA 1 0 271104 CASAVA_Build 7 48682109 1I ATGGAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 T 11 12 271105 CASAVA_Build 7 48686098 4I TACAAGGAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAAC 1 2 271106 CASAVA_Build 7 48687464 2D AAATACAGAA AC/-- AGTTTCCTTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 AC 1 0 271107 CASAVA_Build 7 48701222 1D TTCAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 20 2 A 11 10 271108 CASAVA_Build 7 48716903 1D TATTTTTTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 10 9 271109 CASAVA_Build 7 48722144 3I CATAAAGAAA ---/ATG ATAATATATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATG 0 1 271110 CASAVA_Build 7 48731978 1I GCATTGCTAT -/A AAGAAATACC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 3 271111 CASAVA_Build 7 48755404 10D CTAAAAGTAT TATTTAGTTG/---------- TATTAAATTT 3070 hom 36 het 15 0 13 3 TATTTAGTTG 1 0 271112 CASAVA_Build 7 48774092 1D GGATTTTTTT G/- GGGGGGGACG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 8 7 271113 CASAVA_Build 7 48815594 1I AGAGCTGCTC -/G GGGTTCCCAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 3 4 271114 CASAVA_Build 7 48825527 1I CCGTTGGCCA -/G GGGCAAGCCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 3 4 271115 CASAVA_Build 7 48830568 1D TTCATTGTGA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 8 7 271116 CASAVA_Build 7 48836188 4I ACATAGTTAT ----/CACC GGTGCTGAGT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 CACC 0 1 271117 CASAVA_Build 7 48850041 2I TCTTTCTTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1327 hom 31 4 12 15 A 12 14 271118 CASAVA_Build 7 48852339 3D TATACAATTT CCA/--- CTATTCGATG 3070 het 3070 ref 26 17 8 2 CCA 1 0 271119 CASAVA_Build 7 48854808 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTAGCAGC 2633 het 12 hom 17 1 8 8 C 0 1 271120 CASAVA_Build 7 48859150 4I TGTCCACAAG ----/GAGT GAGACCTAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 GAGT 0 1 271121 CASAVA_Build 7 48859953 1D CTGTTATCTA C/- CCTTTCAGCC 3070 het 3070 ref 66 42 19 5 C 3 2 271122 CASAVA_Build 7 48873324 1I TCACTGTGCA -/T TTTGTTGTGG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 3 4 271123 CASAVA_Build 7 48884207 1I GGAGAATAGT -/A AAAACATGAC 3070 hom 151 het 56 0 51 5 A 4 5 271124 CASAVA_Build 7 48884279 1D TCTTGTACAT G/- GATAGTGGAA 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 G 2 1 271125 CASAVA_Build 7 48894755 1D AATCATGTGG T/- TTTTTGTCTT 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 T 6 5 271126 CASAVA_Build 7 48901754 3I TAATTGACTT ---/AAA GAAGGGAATT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 0 3 271127 CASAVA_Build 7 48902490 1I ATTAAGGTTG -/T TATGTTAAGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 2 271128 CASAVA_Build 7 48904457 1I GACTCCTTTG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 97 het 40 0 33 7 A 8 9 271129 CASAVA_Build 7 48906462 2I ACCTGCAAAA --/AC AGATTGCCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AC 0 1 271130 CASAVA_Build 7 48906762 1D TTTCCCCACA T/- TTTTAACATC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 5 4 271131 CASAVA_Build 7 48907278 1D AGAGCAACAT G/- TTTTTTTTTC 3070 het 136 hom 56 1 46 9 G 1 0 271132 CASAVA_Build 7 48912540 3I AGTTAATACA ---/TGT TGTTAGAAAG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 TGT 1 2 271133 CASAVA_Build 7 48918380 16D17M3D AACATTAGCA TAGGTTTTGTACATCCTAGTTCCTCTCCCTCTCCTT/----------------TAGTTCCTCTCCCTCTC--- CTCTTTCTCT 3070 hom 36 het 8 0 13 5 N/A 0 0 271134 CASAVA_Build 7 48918889 4I TTTCTTTTCT ----/TTTC TTTTTTTTTT 2816 hom 33 het 18 0 11 7 TTTC 0 1 271135 CASAVA_Build 7 48922506 2I TTTGTCACTT --/TG AATGACTTTT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 TG 0 1 271136 CASAVA_Build 7 48923762 3D TCTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 29 3 14 12 T 17 14 271137 CASAVA_Build 7 48928016 1I GTCACCCTTG -/C CTTCTTCCCC 3070 hom 76 het 30 0 25 5 C 1 2 271138 CASAVA_Build 7 48928612 2D GAGGTGGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 42 het 17 0 15 3 GT 7 6 271139 CASAVA_Build 7 48936393 1I AAATGTCCAC -/T GGGGTTTCAG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 0 1 271140 CASAVA_Build 7 48937369 1D GAAAACCACA T/- TTTAAACACT 3070 hom 60 het 21 0 21 2 T 4 3 271141 CASAVA_Build 7 48937912 1D TTTCGCTGCT A/- AAAAAAAAAA 2974 het 26 hom 17 1 8 8 A 11 10 271142 CASAVA_Build 7 48941002 1D TACAGTTAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 41 0 34 7 T 9 8 271143 CASAVA_Build 7 48944567 1I CTTCCCTCTT -/C TAAACTCCCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 271144 CASAVA_Build 7 48948581 8D ACCCTATCTC TACAAAAA/-------- TACAAAAATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TACAAAAA 3 2 271145 CASAVA_Build 7 48949135 1D CATAGAAACA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 8 7 271146 CASAVA_Build 7 48951935 4D AAATGTTAAC AAGT/---- ATAATTTTTA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 AAGT 1 0 271147 CASAVA_Build 7 48952111 2D GTTTTATCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 13 11 271148 CASAVA_Build 7 48955841 1D GTAGATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 28 0 19 9 A 13 12 271149 CASAVA_Build 7 48958328 1D AGAAACTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 37 2 23 13 A 13 12 271150 CASAVA_Build 7 48971237 6D TCACATTTAT TAACCA/------ TAACCATTTC 3070 het 3070 ref 46 24 19 5 TAACCA 2 1 271151 CASAVA_Build 7 48988404 1I GAGATGATAG -/T TTTCACATGA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 3 4 271152 CASAVA_Build 7 48988658 1I TTTTTCCTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 9 10 271153 CASAVA_Build 7 48994919 1D TATTCACCAG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 7 6 271154 CASAVA_Build 7 48995677 2D CAATGAACAC AT/-- GTGTGCATAT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 AT 1 0 271155 CASAVA_Build 7 48998097 27I GAGCTGCCCG ---------------------------/AGGCCATGGGAGCCCACCCCTTCCGTC AGCGTTACCT 3070 hom 60 het 21 0 21 4 AGGCCATGGGAGCCCACCCCTTCCGTC 0 1 271156 CASAVA_Build 7 48998889 3D ATACATTCTC ATT/--- ATATAAGTTT 3070 het 3070 ref 37 23 11 4 ATT 1 0 271157 CASAVA_Build 7 49000629 5D TCTTGGAGAA TAGAG/----- TAATTTGTGG 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 TAGAG 1 0 271158 CASAVA_Build 7 49003512 1I ATAGGTAGCA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 6 7 271159 CASAVA_Build 7 49006279 2I CTTCTCTCTC --/TT GTTTCTCTCA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 T 0 2 271160 CASAVA_Build 7 49013756 2I AATCATACTC --/TT TTTTTATTAC 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 T 5 7 271161 CASAVA_Build 7 49025442 1I TATCCTGTTC -/T TTTTTTCAAG 2879 het 2879 ref 18 7 6 5 T 6 7 271162 CASAVA_Build 7 49030293 1I TAGACTGAAC -/T TGGAAACAAA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 1 2 271163 CASAVA_Build 7 49033906 1I TCTATATATC -/G ATTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 G 0 1 271164 CASAVA_Build 7 49036174 6D GTTTATCTTT ATAAGA/------ ATAAGTATGG 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 ATAAGA 1 0 271165 CASAVA_Build 7 49038104 2D GCTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 11 9 271166 CASAVA_Build 7 49039373 2I AAATGTGTGA --/TT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 57 34 22 1 T 8 10 271167 CASAVA_Build 7 49039980 1D2M1D TTGCACCCTA CATG/-AT- TCATTTATTG 3070 het 3070 ref 50 25 17 10 N/A 0 0 271168 CASAVA_Build 7 49042829 12D CTTTTGGTCA GAGGCACTACCT/------------ GAGATGGAGA 3070 het 3070 ref 31 18 12 4 GAGGCACTACCT 1 0 271169 CASAVA_Build 7 49053723 1I TATTAGATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 10 11 271170 CASAVA_Build 7 49060463 1I AATTGCTTTA -/T ATTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 T 0 1 271171 CASAVA_Build 7 49074935 1I GCATATACTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 8 9 271172 CASAVA_Build 7 49081168 2I TAAGAGTATA --/CT GTTTAATTTC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 CT 0 1 271173 CASAVA_Build 7 49081335 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 13 14 271174 CASAVA_Build 7 49082988 1I TAAATGAAAA -/G CAAATTAAGG 3070 het 3070 ref 38 18 19 1 G 0 1 271175 CASAVA_Build 7 49086167 1D TTTTGTTTCC A/- AATTCAAGCG 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 A 3 2 271176 CASAVA_Build 7 49086884 3I CCAAACAAAA ---/AAG AAGATCTTTC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 AAG 1 2 271177 CASAVA_Build 7 49087362 2D CAGCCTTGAA AT/-- ATAATGAGTA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 AT 2 1 271178 CASAVA_Build 7 49088186 1D AAGGAAGAGC A/- AAGACACATC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 3 2 271179 CASAVA_Build 7 49088487 1I GTCCCCCATA -/G TCTTAGCTCA 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 G 0 1 271180 CASAVA_Build 7 49095194 2I CATCAAAAGT --/AC CACAGACCAG 3070 het 3070 hom 47 23 22 2 AC 0 1 271181 CASAVA_Build 7 49098912 2I ATAATTTTTT --/AC ACACACTGAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AC 3 4 271182 CASAVA_Build 7 49111074 1D TTTTTGGGGT A/- GGGGTGGAAT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 1 0 271183 CASAVA_Build 7 49114352 1I ATTCACTGAT -/A GGGAATTTGT 1177 hom 12 het 7 0 4 3 A 0 1 271184 CASAVA_Build 7 49118801 1I CCTCATACTG -/T TTCTCCTGGT 3070 het 3070 ref 46 29 15 2 T 2 3 271185 CASAVA_Build 7 49122076 1D TTAATTTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 10 9 271186 CASAVA_Build 7 49130259 3D ACTTAGGCCC CTT/--- CCCCCACCCT 3070 het 3070 ref 38 15 17 9 CTT 1 0 271187 CASAVA_Build 7 49133548 4I TGGATGGGAC ----/TTAA TTAAACTAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTAA 1 2 271188 CASAVA_Build 7 49134661 4D TTTAAAAAAA AAAC/---- AGAGAGAGAC 3070 hom 63 het 26 0 20 9 AAAC 1 0 271189 CASAVA_Build 7 49137492 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 2 A 15 14 271190 CASAVA_Build 7 49139871 2I ACAATATGTG --/TA TATGTGTGTG 3070 het 230 hom 39 1 33 5 TA 1 2 271191 CASAVA_Build 7 49142311 3D TCCACTATTT AGG/--- AGGAGTCTGG 3070 hom 114 het 46 0 38 11 AGG 2 1 271192 CASAVA_Build 7 49154745 2I CAGTTTGACA --/CT CTGGTAAATG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 1 2 271193 CASAVA_Build 7 49156346 1D14M1D AATAACAGCT AAAAAAAAAAAAGACA/-AAAAAAAAAAAGAC- AAAAAAAGGC 3070 het 609 hom 37 5 26 11 N/A 0 0 271194 CASAVA_Build 7 49158932 1D TATGAAAATC A/- GCTCAAGATG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 1 0 271195 CASAVA_Build 7 49166765 3D TATATCAGTT ATC/--- ATCTGCCAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 4 ATC 2 1 271196 CASAVA_Build 7 49168833 22D AATAAAGAAA GAAAGAAAATAAAGAAATAAAG/---------------------- AGAGAGAGAG 3070 hom 114 het 32 0 38 4 GAAAGAAAATAAAGAAATAAAG 1 0 271197 CASAVA_Build 7 49180764 1D CCACAGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 15 25 11 T 12 11 271198 CASAVA_Build 7 49183757 1D CTCTAAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 31 2 23 7 A 15 14 271199 CASAVA_Build 7 49189249 4D TATCTATCTC ACTT/---- AATCCTCACA 3070 het 3070 hom 41 19 18 5 ACTT 1 0 271200 CASAVA_Build 7 49192697 2D AGACTCTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3015 het 865 hom 16 6 9 1 A 16 14 271201 CASAVA_Build 7 49197801 3D TTCGTCAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 A 15 12 271202 CASAVA_Build 7 49207121 1D AAGTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 13 12 271203 CASAVA_Build 7 49208251 2I AAGAGAAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 A 10 12 271204 CASAVA_Build 7 49210992 1D GTAATGATAG A/- AAAAAAATCA 2437 het 2437 ref 17 10 5 2 A 8 7 271205 CASAVA_Build 7 49217012 2I GGGCTGGCTC --/TA TATACTTACT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 TA 2 3 271206 CASAVA_Build 7 49230590 1D AATGAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 11 10 271207 CASAVA_Build 7 49233258 1D TGGAGACAAA G/- AAAATCATTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 0 271208 CASAVA_Build 7 49235205 1D ATCACAACTG C/- CCCAGTTTTG 3070 het 3070 hom 46 21 22 4 C 4 3 271209 CASAVA_Build 7 49235927 2D GAAGTTTTAC CT/-- CTCTCTCCTA 3070 het 3070 ref 52 31 17 5 CT 4 3 271210 CASAVA_Build 7 49244901 1I CCAGCATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 14 15 271211 CASAVA_Build 7 49249201 1D ATAATCCCCC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 187 hom 34 5 13 16 T 8 7 271212 CASAVA_Build 7 49261396 1D TAAGTTTATG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 8 7 271213 CASAVA_Build 7 49262799 2I CTTTGCTTTA --/TT TTTTGGGTAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 4 6 271214 CASAVA_Build 7 49266275 3D18M3I GAAATATTAT ATAATAACTAATAGCTATAAT---/---ATAACTAATAGCTATAATTTA TTATAATATT 2374 het 487 hom 13 2 5 6 N/A 0 0 271215 CASAVA_Build 7 49270671 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1465 hom 24 6 12 7 A 12 11 271216 CASAVA_Build 7 49270739 2I AGAAGGATCA --/AG AGAATTGTGG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 AG 1 2 271217 CASAVA_Build 7 49272855 1D AACTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 11 10 271218 CASAVA_Build 7 49275633 1I TAGGGATGAC -/T TTAGAAAAGA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 2 3 271219 CASAVA_Build 7 49276956 1I CTTCATTGAA -/G CCCTCCCTGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 0 1 271220 CASAVA_Build 7 49280828 3D TGTTTTTATT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 782 hom 54 8 16 30 TTG 7 6 271221 CASAVA_Build 7 49285606 1D GAAATACATA T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 T 7 6 271222 CASAVA_Build 7 49310108 1D CCCTTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 29 0 22 7 T 11 10 271223 CASAVA_Build 7 49328396 1D GAAAAGTTTA T/- TTTTTATATC 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 T 6 5 271224 CASAVA_Build 7 49329412 1D ATCTTTACAA T/- TTAGGCACAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 6 T 3 2 271225 CASAVA_Build 7 49332544 1I AACTAATATA -/T TTTATAAGTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 3 4 271226 CASAVA_Build 7 49344779 1D AACCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2999 hom 33 9 20 6 A 11 10 271227 CASAVA_Build 7 49345534 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 1594 het 1594 ref 30 19 4 8 A 12 11 271228 CASAVA_Build 7 49349725 1D CTGGGTCACA G/- GGGGGCAGCT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 G 6 5 271229 CASAVA_Build 7 49353869 1I TTCTCCAACT -/C AATGATTATT 3070 het 1953 hom 18 4 11 3 C 0 1 271230 CASAVA_Build 7 49381361 1I TCCTCAAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 T 10 11 271231 CASAVA_Build 7 49385995 4D TAGAAAACAC AGAA/---- AGAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 AGAA 3 2 271232 CASAVA_Build 7 49389771 1D AATATAGTTG T/- TTTTTTTTTT 2104 het 1811 hom 31 10 6 15 T 15 14 271233 CASAVA_Build 7 49396482 1I GCAACTGACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 T 9 10 271234 CASAVA_Build 7 49396571 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 544 hom 36 3 19 15 T 10 9 271235 CASAVA_Build 7 49397085 2I GTGTGCAAAC --/TT TAGCTATTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 3 271236 CASAVA_Build 7 49402225 3D TAGCACAAGA AGG/--- AGAAGGGAGT 3070 het 3070 ref 37 15 17 8 AGG 1 0 271237 CASAVA_Build 7 49423056 1D TATGGAGTCA T/- GGAGAAGATC 3070 hom 153 het 57 0 51 6 T 1 0 271238 CASAVA_Build 7 49429714 19D TACTATAAGG ATTTTACATTTTATGCAAA/------------------- ATGTTTACAA 3070 het 3070 ref 21 13 12 1 ATTTTACATTTTATGCAAA 1 0 271239 CASAVA_Build 7 49446240 1D CAATTGCTAC A/- AAAAAAAAAA 2685 het 1239 hom 15 4 6 6 A 12 11 271240 CASAVA_Build 7 49446640 1D GATATATAGA C/- CCAGTGGAAT 3070 het 3070 ref 29 20 8 1 C 3 2 271241 CASAVA_Build 7 49447194 1I GACACTTATC -/A AAAGAAGACA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 3 4 271242 CASAVA_Build 7 49451621 1D TTGTTGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 A 11 10 271243 CASAVA_Build 7 49456137 1I GGTTTGTAAA -/T TGCACCAATC 3070 het 3070 hom 24 7 10 7 T 1 2 271244 CASAVA_Build 7 49460307 1D GCTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 T 11 10 271245 CASAVA_Build 7 49461045 2D CCTTTCAATT TA/-- TATAATGTGA 3070 het 3070 hom 34 13 16 7 TA 3 2 271246 CASAVA_Build 7 49462723 2D GTCTTTTACC AT/-- TGAGCTTCCC 3070 het 3070 ref 51 26 19 6 AT 1 0 271247 CASAVA_Build 7 49466854 1D TAGTTCAATA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 9 8 271248 CASAVA_Build 7 49471371 1I CAAAGACTTT -/A AAAAAAAAAA 1909 het 1909 ref 14 6 5 3 A 11 12 271249 CASAVA_Build 7 49493528 1I ACACCCACTC -/A ACATCCTCCT 3070 hom 141 het 54 0 45 9 A 1 2 271250 CASAVA_Build 7 49508652 1I AATACTGTTA -/C TTTTCTTGTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 0 1 271251 CASAVA_Build 7 49514091 4I CTGAGTGTGT ----/CACA CACACACACA 3070 hom 138 het 60 0 46 14 CA 5 7 271252 CASAVA_Build 7 49515502 1I GTCACTTTGG -/T TTTTTTGGCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 7 271253 CASAVA_Build 7 49525357 4I TCTCTCTCTC ----/TCTT GGCTGCTGCT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 TCTT 0 1 271254 CASAVA_Build 7 49526365 3I ATTAGTTTAT ---/GAG GAGGGTTACA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GAG 1 2 271255 CASAVA_Build 7 49528166 1I TCTCTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 11 12 271256 CASAVA_Build 7 49528974 1D TTTTTACTGA T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 8 7 271257 CASAVA_Build 7 49536176 1D TGTCAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2932 hom 43 12 10 21 T 19 18 271258 CASAVA_Build 7 49542354 1I ATATAATCAG -/A AAAACAATAC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 4 5 271259 CASAVA_Build 7 49549769 1I AAGGAATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 41 0 31 10 T 13 14 271260 CASAVA_Build 7 49561600 2D ATTGTGGAAT AA/-- AAATTAGTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 5 3 271261 CASAVA_Build 7 49568175 2D ATACATTAGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 6 5 271262 CASAVA_Build 7 49575416 1D GATCAATAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 9 8 271263 CASAVA_Build 7 49581595 1D ATATAGGCAT A/- TGTAATACTC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 1 0 271264 CASAVA_Build 7 49596748 1I AAAATATTTA -/T TTTTATTAAG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 4 5 271265 CASAVA_Build 7 49604377 1I AAAATAATTG -/A AAAAATATGT 1790 het 1790 ref 25 15 6 4 A 5 6 271266 CASAVA_Build 7 49605197 1I ACCTGAAGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 A 8 9 271267 CASAVA_Build 7 49612284 1I GTCCATTTTT -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 A 7 8 271268 CASAVA_Build 7 49613770 1I GGTATTCATC -/T TAAGTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 16 14 10 T 1 2 271269 CASAVA_Build 7 49616804 1D AAAACACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 13 12 271270 CASAVA_Build 7 49616917 2I CACTTAAAAG --/AC ACAGAATGGT 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 AC 1 2 271271 CASAVA_Build 7 49636078 2D CTTCATTTCC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 1800 hom 23 6 13 4 T 11 9 271272 CASAVA_Build 7 49644824 1D TCCTCAAGCA T/- TATGTTCTGT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 2 1 271273 CASAVA_Build 7 49646074 1D AATGATACCA T/- TATGACACAA 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 T 2 1 271274 CASAVA_Build 7 49682795 4I ATTAAATAAA ----/TACT TAGTAGAGAT 1982 het 1982 ref 22 12 7 3 TACT 0 1 271275 CASAVA_Build 7 49683191 6D AGAGAAAAAG AAAAGA/------ AAAAGAAAAA 2657 het 1750 hom 13 4 8 3 AAAAGA 2 1 271276 CASAVA_Build 7 49685373 5I TTTTTTTAAC -----/TTTTA TTTTAAGTTC 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 TTTTA 1 2 271277 CASAVA_Build 7 49685526 2D CAATAAACCC CA/-- GTGTGTGTTG 3070 het 3070 hom 50 13 30 7 CA 1 0 271278 CASAVA_Build 7 49689557 5D CTCAAATTTC AAAAT/----- AATATAGATG 3070 het 3070 hom 54 27 26 5 AAAAT 1 0 271279 CASAVA_Build 7 49697063 1D AGAATCCAAG A/- AAAAAATGCC 3070 het 3070 hom 43 19 23 1 A 7 6 271280 CASAVA_Build 7 49717446 6D CTGTATGTCC TCACTT/------ TCACTTTACA 3070 het 3070 ref 53 26 22 7 TCACTT 2 1 271281 CASAVA_Build 7 49726640 2D GAACTAGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 T 14 12 271282 CASAVA_Build 7 49739361 5D GAAAGTCAAG AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 108 het 43 0 36 9 AAATA 4 3 271283 CASAVA_Build 7 49747559 1I ATTCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 A 15 16 271284 CASAVA_Build 7 49752400 4I TCATCATATC ----/AGTT ATTCACTTAC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AGTT 0 1 271285 CASAVA_Build 7 49764846 1D TGAAGGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 11 10 271286 CASAVA_Build 7 49765301 1D AAGGTTTCCC A/- GTTTCCATAG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 1 0 271287 CASAVA_Build 7 49767869 4D GAAAAATGGT GTGA/---- GTGTGTTAGT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 GTGA 1 0 271288 CASAVA_Build 7 49774969 5D GGACTAATGG GTAAA/----- GTAAATACCA 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 GTAAA 2 1 271289 CASAVA_Build 7 49779815 3I TCCCTTTCCT ---/TTC TTCTTCTCTT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TTC 2 3 271290 CASAVA_Build 7 49789198 2I AGAGAGAGAG --/AC AGAGACAGAG 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 AC 0 1 271291 CASAVA_Build 7 49789728 1I TATTGGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 T 11 12 271292 CASAVA_Build 7 49792685 1D TCTAGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 2618 het 2618 ref 31 16 8 8 A 12 11 271293 CASAVA_Build 7 49798980 4D GTGGGTATGA GTGT/---- GTGTGAGCAT 3070 het 3070 ref 49 26 15 8 GT 4 2 271294 CASAVA_Build 7 49799463 2I GTGGGTGTAG --/GT GTGTGTGTGG 3070 het 3070 hom 65 22 28 15 GT 4 5 271295 CASAVA_Build 7 49799562 3D ATTAACATTT CCC/--- CCCATTGGCC 3070 het 3070 ref 53 28 19 8 C 6 3 271296 CASAVA_Build 7 49830212 8D AACCTTCCTG TCATTACT/-------- TCATTACTTT 3070 het 3070 ref 43 22 19 4 TCATTACT 2 1 271297 CASAVA_Build 7 49849749 1D AACAAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 16 11 A 12 11 271298 CASAVA_Build 7 49875154 2D CTACTCTCAA TT/-- TTTTCTGATA 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 T 6 4 271299 CASAVA_Build 7 49884049 1D ATAATTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 A 12 11 271300 CASAVA_Build 7 49897677 3I CCATGCTGTA ---/TTC TTCTTAAATG 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 TTC 1 2 271301 CASAVA_Build 7 49900212 1D AGTTTGAGCA T/- TTCAAAGCCT 3070 het 3070 ref 32 14 16 3 T 3 2 271302 CASAVA_Build 7 49903098 4D AAGAATCCTC ACTT/---- AAGTTGTTTA 3070 het 3070 hom 43 18 20 8 ACTT 1 0 271303 CASAVA_Build 7 49904303 4I GGCTTTTTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 TTTC 3 4 271304 CASAVA_Build 7 49905874 3I TTTCTGCCTG ---/CAT CATATTTCTT 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 CAT 1 2 271305 CASAVA_Build 7 49919502 1D AGCTCGAGCC A/- AAATATGAGT 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 A 4 3 271306 CASAVA_Build 7 49920748 1D TTAATCTTTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 17 20 9 A 9 8 271307 CASAVA_Build 7 49930873 3I TAATTTGAAT ---/TAA TGTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TAA 0 1 271308 CASAVA_Build 7 49943437 2D ATATTTTCCC CT/-- GACTTCTAAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 CT 1 0 271309 CASAVA_Build 7 49948378 1D3M1I GGAAAGAGAC TGCA-/-GCAT TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 41 19 20 2 N/A 0 0 271310 CASAVA_Build 7 49952345 1D AATGATTTCT C/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 C 1 0 271311 CASAVA_Build 7 49952652 1D TCTTCAGATA T/- TTTTCTCTGC 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 T 5 4 271312 CASAVA_Build 7 49954989 6I TATTTTTTTT ------/ATTTCA ATTTCATTTA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 ATTTCA 1 2 271313 CASAVA_Build 7 49961682 1D ATGGTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 1471 het 1471 ref 36 19 5 12 T 17 16 271314 CASAVA_Build 7 49971035 1I ATTGCTGTAT -/A AACACAAGTT 3070 het 3070 ref 60 33 20 7 A 2 3 271315 CASAVA_Build 7 49973308 1D ATTAGGATGG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 8 7 271316 CASAVA_Build 7 49980169 1D TCCCAGCTAA T/- TTTTTGTATC 2999 het 2999 ref 20 9 7 4 T 6 5 271317 CASAVA_Build 7 49988224 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 13 12 271318 CASAVA_Build 7 49994087 1D AACAAAAAAA T/- ATATAACTTC 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 1 0 271319 CASAVA_Build 7 50000762 1I AAGTATATAT -/G GGGGGGGGAC 2386 het 2386 ref 23 14 6 3 G 8 9 271320 CASAVA_Build 7 50004005 2I GGGACATGAC --/TG TGGTAGCTGA 3070 het 3070 ref 54 24 18 12 TG 1 2 271321 CASAVA_Build 7 50009847 3I CAAATCCTCC ---/CTT CTTCTTCTAT 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 CTT 2 3 271322 CASAVA_Build 7 50015176 1D29M2D AACTGAATCA TTTTAAAAAAAAAAAAGGCAAGAGAAACTCTG/-TTTAAAAAAAAAAAAGGCAAGAGAAACTC-- TAAGATCATT 3070 het 3070 ref 30 23 10 5 N/A 0 0 271323 CASAVA_Build 7 50021916 1I AGAAGGGGCC -/A AGGTGTGGTG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 1 2 271324 CASAVA_Build 7 50025840 5I TGAAGTACTT -----/AAATC AACAAGCAAA 3070 het 3070 hom 20 10 8 2 AAATC 0 1 271325 CASAVA_Build 7 50034607 2D AATGCATTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 AC 7 6 271326 CASAVA_Build 7 50034687 1I TGAACCTGAA -/G GACATATGTT 3055 het 3055 ref 24 13 7 4 G 1 2 271327 CASAVA_Build 7 50036413 1D TATAGGCCTC T/- AACAACAGAG 3070 het 3070 hom 44 21 21 3 T 1 0 271328 CASAVA_Build 7 50037288 1I ATATGGACCC -/T TTCCCTTTGG 3070 het 3070 hom 49 16 23 10 T 2 3 271329 CASAVA_Build 7 50038427 2D GGTGAAAATT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 10 8 271330 CASAVA_Build 7 50038988 1D TACACAAGTT C/- TAAATAAATG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 C 1 0 271331 CASAVA_Build 7 50039988 6D TTGTTGTTGC TGTTGT/------ TGTTGTTGTT 3070 het 2391 hom 25 11 12 7 TGT 8 6 271332 CASAVA_Build 7 50040644 1I ATAATAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 10 13 6 A 9 10 271333 CASAVA_Build 7 50069014 1D GCATTGACAC T/- TGGGGTTTGA 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 2 1 271334 CASAVA_Build 7 50089062 3D CACTTCTCAA AAG/--- AAGTGAAACA 3070 het 3070 ref 55 28 24 7 AAG 2 1 271335 CASAVA_Build 7 50100618 4D TATTTATGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 15 8 4 TG 8 6 271336 CASAVA_Build 7 50100805 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 764 hom 29 4 17 8 AT 5 6 271337 CASAVA_Build 7 50105613 1I AGACTCCACC -/A AAAAAAAAAA 2761 het 2249 hom 21 5 9 7 A 12 13 271338 CASAVA_Build 7 50108284 1I TTAATTACAT -/C ACACACTGGT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 C 0 1 271339 CASAVA_Build 7 50108981 2I ACACGAATCT --/GG GGGGGGATAC 3070 het 3070 ref 46 29 12 5 G 6 8 271340 CASAVA_Build 7 50122665 1D AAAGAAAAAT A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 7 6 271341 CASAVA_Build 7 50123090 1D TACTGATCTA T/- GTAAACATAA 3070 het 3070 ref 41 24 15 3 T 1 0 271342 CASAVA_Build 7 50123492 2I AATATCACCC --/AT AGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 AT 0 1 271343 CASAVA_Build 7 50131977 1D TGTTTTTTTT C/- TTGTAGAGAT 2615 het 2615 ref 16 8 7 1 C 1 0 271344 CASAVA_Build 7 50132117 2I TAATAGTAAC --/AT ATTCACAGGT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 AT 1 2 271345 CASAVA_Build 7 50136365 1I TCATCAATAT -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 A 6 7 271346 CASAVA_Build 7 50136522 1D TATATATCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 10 9 271347 CASAVA_Build 7 50143378 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 15 19 8 TG 10 9 271348 CASAVA_Build 7 50146610 1I GAGGCAGAGA -/T TGCAGTGAGC 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 T 1 2 271349 CASAVA_Build 7 50148912 2I TGGGATTTTT --/TA TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 TA 0 1 271350 CASAVA_Build 7 50159286 2D GATTCCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 14 12 271351 CASAVA_Build 7 50161841 1D TCCGAAACAG A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 A 7 6 271352 CASAVA_Build 7 50168042 1I AAAGCTTTTT -/A TAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 0 1 271353 CASAVA_Build 7 50171791 1D AAAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 1979 het 1979 ref 25 8 12 5 T 1 0 271354 CASAVA_Build 7 50176392 2D TTATGGAAAC AG/-- AGGAGCATTC 3070 hom 84 het 29 0 28 2 AG 2 1 271355 CASAVA_Build 7 50192847 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2219 het 2219 ref 29 12 10 7 A 14 15 271356 CASAVA_Build 7 50201622 1I TTAAAACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1898 hom 28 7 14 7 A 13 14 271357 CASAVA_Build 7 50258952 1D AAGGAGAGTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 25 11 12 4 A 9 8 271358 CASAVA_Build 7 50259189 1D TAAACAGGTG A/- AAAAAAAAAA 1202 het 1202 ref 41 34 3 4 A 12 11 271359 CASAVA_Build 7 50265852 1D ATCTACTATC T/- TGCAATTCAT 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 T 2 1 271360 CASAVA_Build 7 50275559 1D GCTCAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 13 12 271361 CASAVA_Build 7 50286579 1D GTCTAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 13 12 271362 CASAVA_Build 7 50294003 1I ACCCGAGGCC -/T TTTCAGAAGT 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 T 3 4 271363 CASAVA_Build 7 50296110 4D TGCCTCTCTT TCTC/---- TCTCACACAC 3070 hom 78 het 31 0 23 8 TC 4 2 271364 CASAVA_Build 7 50298820 2D ACCACTTTAC AG/-- TCACTAGAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AG 1 0 271365 CASAVA_Build 7 50394049 1I GTCCTTGGAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 8 9 271366 CASAVA_Build 7 50422434 1I AAGGGTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 T 10 11 271367 CASAVA_Build 7 50429899 2D TCAGAGTGGC TA/-- TTATAGTTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 TA 1 0 271368 CASAVA_Build 7 50437873 1I CTTCGGTCTT -/C AAAAATATAT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 C 0 1 271369 CASAVA_Build 7 50442422 1D CAGGCCCCTC A/- AGCCCATTCT 3070 hom 96 het 42 0 27 16 A 2 1 271370 CASAVA_Build 7 50475486 1D TGCCTAAGCT A/- GGGGTACAGC 3070 het 3070 ref 44 23 11 10 A 1 0 271371 CASAVA_Build 7 50504322 1I TTTTTTAGTA -/G GAGACAAGGT 3070 het 1133 hom 16 4 11 1 G 1 2 271372 CASAVA_Build 7 50511764 1D CTGTGGCGTA G/- CCCCCCAGCA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 G 1 0 271373 CASAVA_Build 7 50513405 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 A 12 11 271374 CASAVA_Build 7 50514007 5I GTGCAGAGTT -----/AAAAC AAAGCGAACA 3070 het 3070 ref 53 30 21 2 AAAAC 0 1 271375 CASAVA_Build 7 50515156 5D CCTGCTCCCA GCCCT/----- GCCCTGAACA 3070 het 3070 hom 34 12 16 8 GCCCT 2 1 271376 CASAVA_Build 7 50527280 1D GGACAGGGAG A/- AGACAGCCAT 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 A 2 1 271377 CASAVA_Build 7 50527878 6I ACAAGGAAAT ------/AAACTC TTTCCAAATG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 AAACTC 0 1 271378 CASAVA_Build 7 50529009 1D GGTTAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 18 9 A 11 10 271379 CASAVA_Build 7 50532414 2I GGGCATGGAA --/AG AGAGTCGGGA 3070 het 3070 ref 56 28 20 8 AG 2 3 271380 CASAVA_Build 7 50546518 2D CTTTTATATA AT/-- ATATATAATG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AT 4 3 271381 CASAVA_Build 7 50554326 1D ACAAACATAT A/- AAAAAAATGC 2593 het 2593 ref 20 10 6 4 A 8 7 271382 CASAVA_Build 7 50555649 6I ATTTAAAAGT ------/ACTTCA ACTTCAATGA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 ACTTCA 1 2 271383 CASAVA_Build 7 50557174 1I GGAAGGAAAG -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 59 27 26 6 A 7 8 271384 CASAVA_Build 7 50557398 1I AAGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 10 11 271385 CASAVA_Build 7 50560956 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 7 8 271386 CASAVA_Build 7 50563058 1D TTGACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 44 0 32 12 A 11 10 271387 CASAVA_Build 7 50565862 1D GCGCTTTTTA G/- GGTGCCATGG 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 G 3 2 271388 CASAVA_Build 7 50568716 1I TTAAACTCCT -/G ACCTCAAATG 3070 hom 74 het 26 0 22 4 G 0 1 271389 CASAVA_Build 7 50569805 1D AAGACAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2871 het 353 hom 23 2 7 14 A 12 11 271390 CASAVA_Build 7 50575687 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAAAAA 2377 het 2377 ref 31 13 13 5 C 1 0 271391 CASAVA_Build 7 50589612 3D AAAAAATAAA ATT/--- ATTAACTGGG 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 ATT 2 1 271392 CASAVA_Build 7 50591263 1I TTCCACGGTG -/C CTTGTTTGCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 1 2 271393 CASAVA_Build 7 50593269 2D TCAGAAATCA CC/-- CCCCCCCTTA 3070 het 1956 hom 25 7 15 3 C 9 7 271394 CASAVA_Build 7 50596234 4D GCTCTCTGTC CTCT/---- CTCTCTCCTC 3070 het 3070 hom 35 13 17 7 CT 5 3 271395 CASAVA_Build 7 50602281 1D TACAGCTCAG A/- AAAAGAGGCC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 5 4 271396 CASAVA_Build 7 50603895 1I ATCTAGATTC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 A 0 1 271397 CASAVA_Build 7 50616745 1D CTTTCAATAT A/- AAACCTGCAG 3070 het 3070 hom 23 10 12 3 A 4 3 271398 CASAVA_Build 7 50620441 1D CTCTGGGCCT G/- AGGCCAGGAA 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 G 1 0 271399 CASAVA_Build 7 50622781 19I ATACTCAGCC -------------------/TTTGGACATAAGGGTTTAT TTACTTTTGT 3070 hom 123 het 41 0 41 5 TTTGGACATAAGGGTTTAT 0 1 271400 CASAVA_Build 7 50624974 1D CAGGCCAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 10 9 271401 CASAVA_Build 7 50629165 4D CGAAAGCCCC CTTT/---- CTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 8 CTTT 3 2 271402 CASAVA_Build 7 50632638 2D AAGACTTGTC AG/-- AGTCATGTCA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 AG 2 1 271403 CASAVA_Build 7 50637250 4I AAACAAAATC ----/CAAA CAAACTAACA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 CAAA 1 2 271404 CASAVA_Build 7 50637326 5D AAAAATTGAC AAGTA/----- AAGGGGAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 19 11 AAGTA 1 0 271405 CASAVA_Build 7 50640357 7I GCTGAGAACT -------/CAGAGGC CACCCCACCC 3070 hom 54 het 20 0 17 3 CAGAGGC 0 1 271406 CASAVA_Build 7 50646184 1D TTTCATTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 T 10 9 271407 CASAVA_Build 7 50649799 1I CTGATAGCAG -/C CAAGTGTACA 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 C 1 2 271408 CASAVA_Build 7 50655117 4D GTGGACACGT ACAC/---- ACACACACAT 3070 het 3070 hom 63 24 30 9 AC 6 4 271409 CASAVA_Build 7 50655665 10D ACTCATCTCA GATGAGCCCC/---------- GACCGGCATG 3070 het 3070 hom 37 14 20 6 GATGAGCCCC 1 0 271410 CASAVA_Build 7 50673071 1D TGGAATAGAG A/- ACACAGAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 A 2 1 271411 CASAVA_Build 7 50674078 1D GTAATATACA C/- CACAGAATAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 C 2 1 271412 CASAVA_Build 7 50674692 2I CGGTGAAACC --/CT GTCTCTACTA 1193 het 6 hom 5 0 4 1 CT 0 1 271413 CASAVA_Build 7 50676348 10D CTCTTCCTCA CTCTTGCTTG/---------- CTCTTGCTCA 3070 het 3070 hom 55 23 25 11 CTCTTGCTTG 1 0 271414 CASAVA_Build 7 50682360 1I ATCAGTGTCT -/A AAATAGAGAC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 3 4 271415 CASAVA_Build 7 50685640 3I CACAGAAGGG ---/CTT CTTCACTTAG 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 CTT 1 2 271416 CASAVA_Build 7 50694782 10D2M6D GCTGAGCTAA GCAGCTGTGCAATAGTGT/----------AA------ GTGTGCCCAC 3070 het 3070 ref 44 21 21 9 N/A 0 0 271417 CASAVA_Build 7 50696016 9I GATGGCGCAG ---------/CATCTTATC CATCTTATCC 2717 het 2717 ref 36 14 9 13 CATCTTATC 1 2 271418 CASAVA_Build 7 50703568 3I ATGACTTCTA ---/AAC AATATGCATT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AAC 0 1 271419 CASAVA_Build 7 50705456 1D GTGGCTGCCA G/- GGGACTAAGG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 G 4 3 271420 CASAVA_Build 7 50713733 1D TTTAGATAAT A/- AAATCAATTA 3070 het 3070 ref 26 13 8 6 A 4 3 271421 CASAVA_Build 7 50725881 2D GAACGAATGA AT/-- GAAAGACACA 3070 hom 114 het 40 0 38 3 AT 1 0 271422 CASAVA_Build 7 50730669 1I TTCTTAAGCA -/G GGGGCAAAGA 3070 hom 126 het 45 0 42 3 G 4 5 271423 CASAVA_Build 7 50733233 2I GTTGGTTTCC --/CT ATTTTTCTTG 3070 hom 138 het 48 0 47 1 CT 0 1 271424 CASAVA_Build 7 50739389 1D CAACTGCTCC A/- ATTTAGGCAG 3070 hom 153 het 53 0 51 3 A 2 1 271425 CASAVA_Build 7 50747725 1D TCTCCCAAAT G/- GTAAGAATGC 3070 hom 102 het 35 0 35 0 G 2 1 271426 CASAVA_Build 7 50752642 2D AGCTTGAAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 5 GT 8 7 271427 CASAVA_Build 7 50756187 5D CAGGTGCCAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 hom 72 het 32 0 25 8 AAAGA 3 2 271428 CASAVA_Build 7 50762922 1D CAAATCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 12 11 271429 CASAVA_Build 7 50763406 2D GCCAAAGTAT GG/-- GGGGGGGGTG 3070 hom 78 het 34 0 28 7 G 10 8 271430 CASAVA_Build 7 50769657 1I CACACCCCCC -/A ACGCACGCCG 3070 hom 89 het 35 0 28 7 A 1 2 271431 CASAVA_Build 7 50775887 3D ATTCTTTAAA CAT/--- CAAAGGGAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CAT 1 0 271432 CASAVA_Build 7 50793187 11D CTGTCAAACC CATCATCACTT/----------- CATCCATTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 7 CATCATCACTT 1 0 271433 CASAVA_Build 7 50794189 1I CAGTTATGGC -/A ATATAGCGTG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 1 2 271434 CASAVA_Build 7 50800945 4D ATAAGTACAC TTAA/---- TTAAATAAAT 3070 hom 123 het 47 0 42 8 TTAA 2 1 271435 CASAVA_Build 7 50801793 1D TGCGAGGAGT A/- AATAGTTTGG 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 3 2 271436 CASAVA_Build 7 50805953 1I ACTCTTCCCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 178 hom 40 1 32 7 T 8 9 271437 CASAVA_Build 7 50812234 4I AGTATCAATT ----/TCTG TCTGTCTGTG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 TCTG 2 3 271438 CASAVA_Build 7 50835724 1I CCAGCCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1196 hom 35 3 25 7 A 10 11 271439 CASAVA_Build 7 50837507 1I CGAGCACCCC -/T GTGACACTCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 271440 CASAVA_Build 7 50839272 2D AACTGAGACT AC/-- AGACACATGC 3070 hom 117 het 46 0 38 10 AC 1 0 271441 CASAVA_Build 7 50841205 1D GGGCAAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 451 hom 31 2 21 8 T 12 11 271442 CASAVA_Build 7 50842712 1I AGGCCGGGGG -/T CCTGAGGTGG 3070 hom 48 het 18 0 13 5 T 0 1 271443 CASAVA_Build 7 50843205 1I CTGATATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 38 1 26 11 T 10 11 271444 CASAVA_Build 7 50852452 1I GTTAACTAGC -/T TTTTTTTTTT 1541 het 1541 ref 26 11 5 10 T 15 16 271445 CASAVA_Build 7 50858938 1D AATTTTCGTA T/- TTTTAGTAGA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 T 5 4 271446 CASAVA_Build 7 50865446 3D GACCTGGATT TTA/--- TTTTTTTATT 3070 hom 36 het 14 0 13 2 TTA 1 0 271447 CASAVA_Build 7 50872472 1D TGCTTTATTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 104 het 42 0 36 7 T 9 8 271448 CASAVA_Build 7 50876115 1D CCTCAAACAC T/- TTTAGCCTAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 4 3 271449 CASAVA_Build 7 50892252 1D GGGCTGCGGG C/- CCCTTTCCAG 3070 hom 54 het 24 0 17 7 C 4 3 271450 CASAVA_Build 7 50909763 4I AATTGCAAGC ----/TGGA TGAAGAACTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TGGA 0 1 271451 CASAVA_Build 7 50916257 1I GTTTGATTTT -/G TAACTGGGTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 0 1 271452 CASAVA_Build 7 50933946 1D CAGTAACCAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 9 8 271453 CASAVA_Build 7 50943655 1I AATTTGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1415 hom 24 4 12 8 A 13 14 271454 CASAVA_Build 7 50947536 4D TCTATTTTAA TAAG/---- TGAGTGAATA 3070 hom 99 het 36 0 34 5 TAAG 1 0 271455 CASAVA_Build 7 50954300 1D GCTTGAGAGA T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 56 het 23 0 19 4 T 8 7 271456 CASAVA_Build 7 50955176 4D GAGTCTTCCC CAGG/---- GTATTAGTAG 3070 hom 120 het 44 0 41 4 CAGG 1 0 271457 CASAVA_Build 7 50956308 1D TGGGACTTAG T/- TTAAAATTTG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 3 2 271458 CASAVA_Build 7 50964386 26I TTTATGTGTG --------------------------/TGTGTGTGTGCGCGCGCACACATGCA TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 39 0 32 8 TGTGTGTGTGCGCGCGCACACATGCA 0 1 271459 CASAVA_Build 7 50971675 4I CTGCTCTAGG ----/GTCA GTCATATCCT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 GTCA 1 2 271460 CASAVA_Build 7 50972161 1I TTGTTCAGAA -/C CCTCCTGAAG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 2 3 271461 CASAVA_Build 7 50973804 1I TTTTGAATGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 9 10 271462 CASAVA_Build 7 50984074 1D TTAATGAAAT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 8 7 271463 CASAVA_Build 7 50985987 1D AAAAGTTGTG T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 8 7 271464 CASAVA_Build 7 50993683 1I CTTTTAGACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 424 hom 25 1 21 3 A 9 10 271465 CASAVA_Build 7 50999729 2I CTCTCTCTCC --/CT CTCTCTCTTT 3070 het 760 hom 28 2 19 7 CT 4 5 271466 CASAVA_Build 7 51004344 1I CTGGGAAAAC -/A AAGCTTCAGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 3 271467 CASAVA_Build 7 51004531 1I AAGGTTTTTA -/T GGTTTGGATC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 1 271468 CASAVA_Build 7 51005220 1D GACTCCGTGG T/- TTCCCCCTTT 3070 hom 69 het 25 0 22 4 T 3 2 271469 CASAVA_Build 7 51012003 2D CAACACAACA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AC 1 0 271470 CASAVA_Build 7 51015929 3I TGACTAAAAT ---/CTC CTCTATGGCT 3070 hom 120 het 45 0 37 8 CTC 1 2 271471 CASAVA_Build 7 51024960 1D AAAAAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 22 0 18 4 A 13 12 271472 CASAVA_Build 7 51030921 1D TTATCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 707 hom 27 4 14 9 T 15 14 271473 CASAVA_Build 7 51037776 1D AAAAAGCTAG A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 7 271474 CASAVA_Build 7 51048021 4D2M2D CTATGCTTGA TGTTCAGC/----CA-- CCCTTGGGAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 6 N/A 0 0 271475 CASAVA_Build 7 51052622 1I ACTGTGCGCA -/T TTTGGCCTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 3 4 271476 CASAVA_Build 7 51053457 6D GTGGTGGTGG TGGTGA/------ TGGTGATGGT 3070 het 3070 ref 58 22 12 27 TGGTGA 4 3 271477 CASAVA_Build 7 51070556 1D AGAATTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 12 21 13 A 13 12 271478 CASAVA_Build 7 51074189 1D ACCAGGTATA G/- GGGGTCATCC 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 G 5 4 271479 CASAVA_Build 7 51075384 2D AATTTCTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2795 hom 28 12 11 5 A 16 14 271480 CASAVA_Build 7 51081257 1D AGGTGGGGGT G/- GGGGGGCCTG 2409 het 2065 hom 18 9 7 3 G 7 6 271481 CASAVA_Build 7 51083073 1D ATAATTTTGT G/- GGGGCCAGGT 2815 het 2815 ref 20 12 6 2 G 5 4 271482 CASAVA_Build 7 51087055 4I CTTAGAATCA ----/TGAT GTTCAGCTAC 3070 het 3070 ref 56 24 21 11 TGAT 0 1 271483 CASAVA_Build 7 51092525 2D GCACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 14 24 11 AC 9 8 271484 CASAVA_Build 7 51095733 1I GCAGTACCTT -/A AGAGGGCTCG 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 A 1 2 271485 CASAVA_Build 7 51098330 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 36 0 16 20 T 15 14 271486 CASAVA_Build 7 51116103 5I TACAACAAAT -----/GAAAA GAAAAGATTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GAAAA 1 2 271487 CASAVA_Build 7 51120519 30D2M5D AGAAGGAAAG TACAATCAAAGTACTTTGTACCTATGAAGTACAAAGA/------------------------------AC----- AGGCAGTATT 3070 hom 66 het 20 0 22 2 N/A 0 0 271488 CASAVA_Build 7 51121821 2D CAATGAGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 92 het 39 0 30 9 GA 9 8 271489 CASAVA_Build 7 51122176 1I GCATTTCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 17 12 T 10 11 271490 CASAVA_Build 7 51123253 1I ATAGTATCTG -/C CTTTTCCTCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 2 271491 CASAVA_Build 7 51123540 1I52M1D TTTCCCCCCC -TCTTGGAAATTTTCTCCATTGTAAGACTCATGAATTTTTAAATTAGTTACTGT/TTCTTGGAAATTTTCTCCATTGTAAGACTCATGAATTTTTAAATTAGTTACTG- TTTTTTTTTG 3070 hom 80 het 33 1 45 11 N/A 0 0 271492 CASAVA_Build 7 51124706 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 22 het 32 1 27 4 A 9 8 271493 CASAVA_Build 7 51125020 1D ACCATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 11 10 271494 CASAVA_Build 7 51128146 1I ATTTTTCAGC -/A ATGCTATATA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 1 2 271495 CASAVA_Build 7 51136105 1D AATAAGAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 84 hom 29 1 22 6 A 10 9 271496 CASAVA_Build 7 51142063 1D GTTTAAGTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 40 0 33 9 T 9 8 271497 CASAVA_Build 7 51143506 2I CATCCGCTGC --/TG TGTGTGGCTC 3070 hom 139 het 52 0 39 13 TG 3 4 271498 CASAVA_Build 7 51148836 1D TAGATTTTGG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 A 8 7 271499 CASAVA_Build 7 51149562 1I CGTACTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 43 1 34 8 A 12 13 271500 CASAVA_Build 7 51152393 5D TTTCTTCTTA TTTAT/----- TTTGATTTGG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TTTAT 1 0 271501 CASAVA_Build 7 51158174 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 728 hom 19 2 13 4 A 16 15 271502 CASAVA_Build 7 51186382 1D GTACATAGGC G/- AAACATTTTC 3070 hom 111 het 42 0 36 7 G 1 0 271503 CASAVA_Build 7 51193675 1I TTTAAGATGC -/A AGAAATCAAG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 1 2 271504 CASAVA_Build 7 51259571 3I GAGATTGCAG ---/AAT AATAAATGTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 AAT 1 2 271505 CASAVA_Build 7 51270685 9I AAAACTGTGG ---------/TGGGAGTTT TGGGAGTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 TGGGAGTTT 1 2 271506 CASAVA_Build 7 51275732 1D ACTGAACATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 10 9 271507 CASAVA_Build 7 51275901 4I CCACTCCTGG ----/CTAA CTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 CTAA 0 1 271508 CASAVA_Build 7 51306031 1I AATCAAAACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2395 hom 29 10 16 3 A 9 10 271509 CASAVA_Build 7 51340997 1I AGGCCAAGGC -/A GGTGGATCAC 3070 het 1854 hom 20 8 9 3 A 0 1 271510 CASAVA_Build 7 51350762 1I GGGCTCACCC -/G CAACCCTCAT 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 G 0 1 271511 CASAVA_Build 7 51378738 4I GTTCTGGGTA ----/AAGG AAGGAAGATC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 AAGG 1 2 271512 CASAVA_Build 7 51383003 2I GTGTTGTTTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 AT 5 6 271513 CASAVA_Build 7 51386404 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 13 12 271514 CASAVA_Build 7 51391678 1I TTGCATCCCC -/A TGCTCTGGCT 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 A 0 1 271515 CASAVA_Build 7 51396934 1D CACAAACTTT C/- TTGAGAAAGT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 C 1 0 271516 CASAVA_Build 7 51398382 1D GCTTTAGTGG C/- CTGTGGGTGG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 C 2 1 271517 CASAVA_Build 7 51403988 3D TTGCTTCCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 36 0 24 12 T 15 12 271518 CASAVA_Build 7 51406068 1I TCAGTCAGAC -/A AAAATTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 14 5 A 4 5 271519 CASAVA_Build 7 51416525 1D AAATATATAT A/- ATCACAATAT 2900 het 2829 hom 15 7 6 3 A 2 1 271520 CASAVA_Build 7 51417325 1I ACTGCATCTC -/A AAAACAAAAA 1767 het 1767 ref 20 12 6 2 A 4 5 271521 CASAVA_Build 7 51419456 16D CCAGCTGCAG CCCAAAGCCCAACACC/---------------- CCCAAGTGTG 2076 hom 33 het 13 0 8 5 CCCAAAGCCCAACACC 1 0 271522 CASAVA_Build 7 51422891 1I CCTGGAGAGG -/C CCCTGGGAGG 1424 hom 10 het 4 0 4 0 C 3 4 271523 CASAVA_Build 7 51430028 1D GTATCCTACA G/- TGTAAAAACT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 G 1 0 271524 CASAVA_Build 7 51442132 1D TTTAATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 17 8 T 13 12 271525 CASAVA_Build 7 51447291 1D ACCAACATCA T/- TTTTCACAGA 3070 het 3070 ref 17 8 7 2 T 5 4 271526 CASAVA_Build 7 51449424 1D GAGATTGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 12 11 271527 CASAVA_Build 7 51455088 1I TTACTTTATA -/C CTTTTAACTT 3070 hom 55 het 32 0 28 4 C 1 2 271528 CASAVA_Build 7 51459615 4D AATTGACATA TATT/---- TATTTATTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TATT 3 2 271529 CASAVA_Build 7 51465217 1I TTATTAATTA -/C CCCCCCCATC 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 C 7 8 271530 CASAVA_Build 7 51469072 2D ATCTTTGTAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 GT 6 5 271531 CASAVA_Build 7 51471279 2I TGAAAAAAAA --/CC ACATTTTTAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 0 2 271532 CASAVA_Build 7 51472978 1I TTGAAATAAA -/T TTGTTGATTA 3070 hom 69 het 31 0 22 9 T 2 3 271533 CASAVA_Build 7 51474954 1I GCTAAGATGA -/G GGTCATTAGA 3070 het 3070 hom 50 17 23 10 G 2 3 271534 CASAVA_Build 7 51477022 3D GATTAATTTG AGA/--- AGCATAGCTA 3070 het 3070 hom 48 22 22 8 AGA 1 0 271535 CASAVA_Build 7 51478294 2I AAATGCATTC --/TG TCTTTCACCA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 TG 0 1 271536 CASAVA_Build 7 51478477 1D GCTTTGTTTT G/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 G 1 0 271537 CASAVA_Build 7 51479024 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 TA 7 8 271538 CASAVA_Build 7 51481994 1I TAGCCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 10 11 271539 CASAVA_Build 7 51482569 1D AAGGAGCCTT C/- TTTTTTCCTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 0 271540 CASAVA_Build 7 51492827 1D TCTCTCTTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 9 8 271541 CASAVA_Build 7 51507551 2I AATACATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 14 16 271542 CASAVA_Build 7 51512107 2I ACGGAATGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1997 hom 31 7 12 12 A 10 12 271543 CASAVA_Build 7 51512393 2I35M4D GTGTGAGAAA --GTAAATGTGTATGGTGTGTGATTGCGTGAGAATGAGTGT/GTGTAAATGTGTATGGTGTGTGATTGCGTGAGAATGA---- GTATTTGTGT 3070 het 3070 hom 83 49 54 7 N/A 0 0 271544 CASAVA_Build 7 51512733 2D GGGGGTGTGT GA/-- GTTTGTGTGG 3070 het 3070 ref 51 20 18 17 GA 1 0 271545 CASAVA_Build 7 51529018 1I CTTCTCTCTT -/A GTATTGCTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 1 271546 CASAVA_Build 7 51530555 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 7 271547 CASAVA_Build 7 51537967 1I TCTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 10 11 271548 CASAVA_Build 7 51542153 1I CTCCTGACTC -/A AGCCTCCTGA 2368 het 2368 ref 19 11 6 2 A 1 2 271549 CASAVA_Build 7 51543580 1I TTAAAATCTA -/T TTTTTTTATG 3070 hom 144 het 53 0 49 4 T 7 8 271550 CASAVA_Build 7 51544057 1D AAAAACAACC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 9 8 271551 CASAVA_Build 7 51546298 3I GAAGGGGTCT ---/CTC CTCATAGCCA 3070 hom 113 het 44 0 35 9 CTC 1 2 271552 CASAVA_Build 7 51548497 3D TATTTGTGTG CTC/--- CTCAATTTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 CTC 2 1 271553 CASAVA_Build 7 51549415 1D CCTCTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 12 11 271554 CASAVA_Build 7 51553712 1D CAATAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 8 15 8 T 12 11 271555 CASAVA_Build 7 51555178 1I CTTACAAGGG -/A GAAATTTGCA 3070 het 3070 hom 52 24 25 3 A 0 1 271556 CASAVA_Build 7 51556702 1D TCCCTGATGC T/- TTGAGTTGGT 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 T 3 2 271557 CASAVA_Build 7 51558687 21D TTCCCATTTA CTCCTTCCGCCTGTATTGGCT/--------------------- CATGTTAATG 3070 het 3070 hom 39 21 21 3 CTCCTTCCGCCTGTATTGGCT 1 0 271558 CASAVA_Build 7 51572400 14D TGCAGAATGG AGCTGTTCCTATTC/-------------- AGCCATCTTG 2905 het 2905 ref 21 16 8 3 AGCTGTTCCTATTC 1 0 271559 CASAVA_Build 7 51573813 1I CCAACCTCTA -/T TTTTTTTTTT 2533 het 2533 ref 28 12 11 5 T 10 11 271560 CASAVA_Build 7 51576043 1I GGATTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 2114 het 2114 ref 17 7 5 5 T 10 11 271561 CASAVA_Build 7 51577275 1D AGGATTGTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 10 9 271562 CASAVA_Build 7 51580530 3D TTCCTCTCTT CTC/--- CTCTTGGCCA 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 CTC 2 1 271563 CASAVA_Build 7 51595312 1D GGGAGGGGCC A/- GGGGCAGAAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 1 0 271564 CASAVA_Build 7 51597857 1I CTTCTGAGAA -/C CCTACGTCCA 3070 hom 105 het 39 0 33 6 C 2 3 271565 CASAVA_Build 7 51598036 4I TAAGTGTAGG ----/CCAT CCTACACTTA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 CCAT 0 1 271566 CASAVA_Build 7 51600625 1D GGAGCCCCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 9 8 271567 CASAVA_Build 7 51602572 5I TAAGTGATCT -----/TTTTA TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 TTTTA 1 2 271568 CASAVA_Build 7 51603053 1D CGGCGTGCCT G/- GACGTGCGCA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 2 1 271569 CASAVA_Build 7 51613965 1D TACTTTTTAC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 41 17 17 8 T 7 6 271570 CASAVA_Build 7 51617175 1D TTTTCTTTAG T/- TTTTTGAGCA 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 T 6 5 271571 CASAVA_Build 7 51619675 1I CTAAAGCCCT -/G GGCTGGGGCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 2 3 271572 CASAVA_Build 7 51623645 1I GCTATATAAA -/C CCCCCAATGT 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 C 5 6 271573 CASAVA_Build 7 51640436 3D GGTCCAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 1014 hom 31 6 13 14 A 12 9 271574 CASAVA_Build 7 51655891 1D GCTAATCCTG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 A 9 8 271575 CASAVA_Build 7 51658364 1D TAATTGAATC A/- GGGGGGCAAG 2557 het 2557 ref 27 15 7 5 A 1 0 271576 CASAVA_Build 7 51658574 1I ATTAAACCTC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 7 8 271577 CASAVA_Build 7 51663117 1I AGTAACATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 23 18 5 A 10 11 271578 CASAVA_Build 7 51665669 1D TCAAAAATAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 9 8 271579 CASAVA_Build 7 51667590 1D AACTCAAGGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 9 8 271580 CASAVA_Build 7 51673351 1D GCATTCTCCA C/- AAGCTCCCAG 3070 het 3070 hom 34 12 15 9 C 1 0 271581 CASAVA_Build 7 51676412 1I AGGGGCCAGG -/C CGGCGGCACA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 1 2 271582 CASAVA_Build 7 51695037 1D AGGAAAACTG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 45 15 21 10 A 8 7 271583 CASAVA_Build 7 51705040 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 24 het 14 0 9 5 T 9 10 271584 CASAVA_Build 7 51731633 1D TAATTCAGAC T/- TTTTTTTTTT 1519 het 1519 ref 34 23 4 7 T 12 11 271585 CASAVA_Build 7 51736712 6D AAATGGAATT AAAAAC/------ AGAAACACAA 3070 het 3070 hom 24 12 12 0 AAAAAC 1 0 271586 CASAVA_Build 7 51743988 1D TTTTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 8 T 13 12 271587 CASAVA_Build 7 51744695 1I CTCTTGCTTG -/A ATTCCTGTTA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 1 2 271588 CASAVA_Build 7 51746523 1D TTAAAGTAAT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 35 12 18 6 A 8 7 271589 CASAVA_Build 7 51747118 9D AGGTTATAAG GTTAGATAT/--------- GTTTAGGTAT 3070 het 3070 hom 38 18 19 5 GTTAGATAT 1 0 271590 CASAVA_Build 7 51758573 1D TCTTATAACC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 T 10 9 271591 CASAVA_Build 7 51763073 1I TTTTGTTTTG -/C CATCTATATT 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 C 1 2 271592 CASAVA_Build 7 51764740 2I GACCTCCAAG --/GT GTCAAATGCA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 GT 1 2 271593 CASAVA_Build 7 51770294 1I TTTAAAAGCA -/C CCCAGTCACC 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 C 3 4 271594 CASAVA_Build 7 51780115 1D GGTTGGAACT C/- CCATTGCCTT 3070 het 3070 hom 48 16 21 11 C 3 2 271595 CASAVA_Build 7 51825294 1I GTTAGAATGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 64 het 39 1 36 2 T 7 8 271596 CASAVA_Build 7 51835575 4I ATATTTTCTC ----/CATT CAATTGAGCG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 CATT 0 1 271597 CASAVA_Build 7 51845110 6D TTTTTTTTCT TTTTTC/------ TTTTTTTTTT 74 het 74 ref 32 23 2 7 TTTTTC 1 0 271598 CASAVA_Build 7 51848272 1D GAATGTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 14 13 271599 CASAVA_Build 7 51868488 6I AGAAAGAAAT ------/AATACA AATTTTATAC 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 AATACA 0 1 271600 CASAVA_Build 7 51874982 5I TGAGACCATC -----/TCAAT CTGGCTAACA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 TCAAT 0 1 271601 CASAVA_Build 7 51882096 1I TTTTTCTCAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 8 9 271602 CASAVA_Build 7 51913331 9D ATGCCATTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 2099 hom 39 10 17 13 T 23 14 271603 CASAVA_Build 7 51916597 1I CTGTAGCAAA -/C ATTCTAAGTA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 C 0 1 271604 CASAVA_Build 7 51918087 4I CAAATGACAT ----/ACAA ACACATGCAC 3070 het 3070 hom 61 20 40 1 ACAA 0 1 271605 CASAVA_Build 7 51934599 48I CATGAGGGTT ------------------------------------------------/CCACCCTTATGACCTGACTACCTTTGGAAGTTCCACCTCCTAATACCA TCACCCTGGG 3070 het 3070 ref 31 22 10 1 CCACCCTTATGACCTGACTACCTTTGGAAGTTCCACCTCCTAATACCA 0 1 271606 CASAVA_Build 7 51937948 1I CTCCTGGCCG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 A 8 9 271607 CASAVA_Build 7 51940063 1D CACTAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 169 hom 41 1 33 7 A 11 10 271608 CASAVA_Build 7 51940483 6I TCACAAGGTT ------/TTAGGA TCCTCTGTTG 3070 hom 144 het 54 0 48 6 TTAGGA 0 1 271609 CASAVA_Build 7 51944175 5I TTTTTTCCTT -----/TTTCA TTTAATTGAC 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 TTTCA 0 1 271610 CASAVA_Build 7 51956839 2D TATGAAACTC TT/-- AAGCATATAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 T 2 0 271611 CASAVA_Build 7 51958453 1I TTTATCACTG -/T TTAGCCTGTC 3070 het 3070 hom 53 22 22 9 T 2 3 271612 CASAVA_Build 7 51966802 2D TTTTTCTTCA TT/-- TTTTTTTTGC 3070 hom 81 het 34 0 28 8 T 10 8 271613 CASAVA_Build 7 51967161 1I TAGCAAAATT -/G TATATATTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 0 1 271614 CASAVA_Build 7 51967247 2I TACATTCTCT --/CA CAGTTATTAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 CA 1 2 271615 CASAVA_Build 7 51969859 7I GGGAGACTTT -------/TTAGTAA AGATTTGATC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TTAGTAA 0 1 271616 CASAVA_Build 7 51972206 1D TTGGTTGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 10 9 271617 CASAVA_Build 7 51975438 1I CTGGAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 A 10 11 271618 CASAVA_Build 7 51979851 12I AGGAGAATCA ------------/CTTGAAGTGATT CTTGAAGCTG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 CTTGAAGTGATT 0 1 271619 CASAVA_Build 7 51980490 1I GGCCCCAGTG -/T TGTGATGTTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 2 271620 CASAVA_Build 7 51986972 1I TATATAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 9 10 T 10 11 271621 CASAVA_Build 7 51988293 3D AAACAAACCA AAG/--- AAGAATTATA 3070 het 3070 hom 28 14 13 3 AAG 2 1 271622 CASAVA_Build 7 51988644 1D CTTTGGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1980 hom 28 12 11 5 T 17 16 271623 CASAVA_Build 7 51990182 13D CCTTAAAGAC TCAAATTCTAGTT/------------- TCAGGACGAC 3070 het 3070 ref 37 25 11 6 TCAAATTCTAGTT 1 0 271624 CASAVA_Build 7 51991573 2I TCATGGATGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 12 271625 CASAVA_Build 7 51992769 11D ACTTTAAATA TGTCACACTAC/----------- TGTCTCCTGG 3070 het 3070 ref 29 14 12 8 TGTCACACTAC 1 0 271626 CASAVA_Build 7 51993183 1D GCCTGTCTTC A/- AGCTCACTAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 2 1 271627 CASAVA_Build 7 52008895 1I TACTCCTGTG -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 C 8 9 271628 CASAVA_Build 7 52012217 3D AATTTTCGTT AGG/--- AGTTTTTCTT 3070 het 2906 hom 23 9 12 3 AGG 1 0 271629 CASAVA_Build 7 52012596 4I GTTGTCTCTA ----/AGTT AGTTAATTAT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AGTT 1 2 271630 CASAVA_Build 7 52012671 1D AAATAAGCAA G/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 G 1 0 271631 CASAVA_Build 7 52014592 1D TCTGATGTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 215 hom 37 6 13 18 A 10 9 271632 CASAVA_Build 7 52014967 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 547 hom 13 2 9 2 A 8 9 271633 CASAVA_Build 7 52016044 1I AAATAAAGTC -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 86 het 35 0 31 4 T 7 8 271634 CASAVA_Build 7 52021156 2I ACTCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 1407 het 1407 ref 14 5 5 4 T 10 12 271635 CASAVA_Build 7 52028298 1D TAATTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1915 hom 13 5 8 0 T 10 9 271636 CASAVA_Build 7 52035917 4D AGGAAAGCAA AAGT/---- AAGTTTACCA 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 AAGT 2 1 271637 CASAVA_Build 7 52036633 1I ATCAAGGTAG -/T CCAAAACACA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 0 1 271638 CASAVA_Build 7 52038294 1I GGGTATTGAT -/A AAAAGAAAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 4 5 271639 CASAVA_Build 7 52040701 1D AGGGTCTCAC T/- ATCATTCCCA 3070 het 3070 ref 30 14 14 4 T 1 0 271640 CASAVA_Build 7 52048922 1D ACATCTGAAA G/- GCTCTGAGCA 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 G 2 1 271641 CASAVA_Build 7 52050241 3I GACTCTGTCT ---/TAA AAAAAAAAAT 996 het 126 hom 6 1 3 2 TAA 0 1 271642 CASAVA_Build 7 52050460 1D TCTAACCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 10 9 271643 CASAVA_Build 7 52054138 1I ACTTCCATTC -/A TGGGTGGTTT 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 A 0 1 271644 CASAVA_Build 7 52054774 1D GTGTGGAGTG T/- TAAGGGCCAT 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 T 2 1 271645 CASAVA_Build 7 52055376 1I GTCATGCCCA -/T TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 57 28 24 5 T 6 7 271646 CASAVA_Build 7 52057876 24D CTACGTGTGA ATATATATGGCTGTAACTATCTAT/------------------------ ATCTATCTAA 1416 het 1416 ref 19 11 6 9 ATATATATGGCTGTAACTATCTAT 1 0 271647 CASAVA_Build 7 52058604 1D AGTGAGACTC A/- AAAAAAAAAA 2400 hom 23 het 14 0 7 7 A 16 15 271648 CASAVA_Build 7 52075897 6D AAAATAAAAC AATAGA/------ AAAAATCCAG 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 AATAGA 1 0 271649 CASAVA_Build 7 52085568 2I GCAAAACTAT --/AC ACCTCTCGGT 3070 het 3070 ref 50 22 17 11 AC 1 2 271650 CASAVA_Build 7 52098200 1D TATTTTAAGA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 T 8 7 271651 CASAVA_Build 7 52098767 3I CATTTTCTAC ---/AAA AAAAAAAAAA 1716 het 613 hom 21 4 7 10 A 13 16 271652 CASAVA_Build 7 52107718 3D AATCACAGGT AGC/--- AGCATTATTT 3070 het 3070 ref 56 26 25 5 AGC 2 1 271653 CASAVA_Build 7 52110603 1D TGGCAACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 13 12 271654 CASAVA_Build 7 52113540 1D GTGTAAACAA C/- CCTTACATCA 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 C 3 2 271655 CASAVA_Build 7 52122102 1D TTTCTTGATT A/- AACAAATATT 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 A 3 2 271656 CASAVA_Build 7 52122205 4I TTTAAAAGAT ----/TTTA TTTATTTTTC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 TTTA 1 2 271657 CASAVA_Build 7 52124467 1I ATCAATTGTT -/A AAAAAAATTA 2207 het 2207 ref 28 16 7 5 A 7 8 271658 CASAVA_Build 7 52124523 1I AAATAAGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 9 10 271659 CASAVA_Build 7 52157333 3I CTATTTATTT ---/CAA CAACAACAAT 3070 het 3070 ref 36 14 11 11 CAA 3 4 271660 CASAVA_Build 7 52159347 1D TGACCTTAAT C/- TACCCTATGT 3070 het 3070 ref 51 26 17 8 C 1 0 271661 CASAVA_Build 7 52165226 4D TGTGAACTTT AAAA/---- AACCCACTAA 3070 het 3070 hom 34 10 21 3 A 6 2 271662 CASAVA_Build 7 52178966 3D TTATAAAAAC ATT/--- ATATTAAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 ATT 1 0 271663 CASAVA_Build 7 52181449 1D CTTCACAATT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 6 271664 CASAVA_Build 7 52182891 1D TAAATCATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2644 hom 28 9 11 9 A 10 9 271665 CASAVA_Build 7 52189507 1D GTGTGCTAAG A/- AGGGTATCAG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 2 1 271666 CASAVA_Build 7 52191661 4I TAACTGCACC ----/CACT AACTTCATAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 CACT 0 1 271667 CASAVA_Build 7 52193519 1D TCATGTTTTC A/- TACAAGAATG 3070 het 3070 hom 35 16 15 5 A 1 0 271668 CASAVA_Build 7 52199253 1D AAGCCTTTAA G/- GTTATGACAT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 G 2 1 271669 CASAVA_Build 7 52201910 3I GAAATCTTAA ---/TTT TTTTTGTTCT 3070 het 2878 hom 26 8 16 2 T 5 8 271670 CASAVA_Build 7 52204963 1I CCAAGGCATT -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 45 21 13 11 A 6 7 271671 CASAVA_Build 7 52205181 1I TTTGCAAAAC -/A CCTACCTGGT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 0 1 271672 CASAVA_Build 7 52208681 4I TATGAGGGAA ----/TAGG TAGGGTGTTT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 TAGG 1 2 271673 CASAVA_Build 7 52209945 1I TAAAGCAAAG -/C CCCCTCATCT 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 C 4 5 271674 CASAVA_Build 7 52213960 1D TGGGATTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 47 1 41 5 A 10 9 271675 CASAVA_Build 7 52222415 2D GTATGTATAC AT/-- ATGTCTATGT 3070 het 3070 hom 42 17 21 6 AT 2 1 271676 CASAVA_Build 7 52233820 1D CCTTCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 11 10 271677 CASAVA_Build 7 52235052 1D ACATTTAATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 8 7 271678 CASAVA_Build 7 52235535 1I AGTTGGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1665 hom 33 6 20 7 A 13 14 271679 CASAVA_Build 7 52240244 1D TCACAAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 12 11 271680 CASAVA_Build 7 52243465 5I TCTGAAGTTT -----/TATTA TATTATTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 TATTA 1 2 271681 CASAVA_Build 7 52246632 1D GGAGAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 35 4 10 21 T 12 11 271682 CASAVA_Build 7 52253081 2I AAAAAAGCAC --/AT ATATTTAGCA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 AT 2 3 271683 CASAVA_Build 7 52253838 4D GGTAGGTAGG TAGA/---- TAGATAGATA 3070 het 3070 hom 39 16 15 10 TAGA 5 4 271684 CASAVA_Build 7 52256291 3D AAAATACAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 868 hom 30 7 14 9 T 13 10 271685 CASAVA_Build 7 52258830 1D CCAACAACAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 10 9 271686 CASAVA_Build 7 52263978 3I ATGAGATGAT ---/GGA GGAGTTTTTT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 GGA 1 2 271687 CASAVA_Build 7 52272955 2D TATGGGTTAA AT/-- ATGAGTTTTG 3070 het 3070 ref 40 27 13 2 AT 2 1 271688 CASAVA_Build 7 52280913 1D ACTTGCTCCC A/- AAAAATGCTG 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 A 6 5 271689 CASAVA_Build 7 52281554 3D TATAATTTAA TCT/--- TATTAATATA 2935 het 2019 hom 12 6 6 0 TCT 1 0 271690 CASAVA_Build 7 52282536 2D AAATGGAAAA CT/-- CTGATCATGG 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 CT 2 1 271691 CASAVA_Build 7 52284073 1D ATAACATGAT A/- ACGTAATCTA 3070 het 3070 hom 50 21 24 6 A 2 1 271692 CASAVA_Build 7 52287298 3D TTATCAGTGT TGA/--- TGAGATTTAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 TGA 2 1 271693 CASAVA_Build 7 52287600 4I GAAAAGAAGC ----/AAAT AAATAAGAAA 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 AAAT 1 2 271694 CASAVA_Build 7 52288984 4I ACAGTGCTGA ----/CAGG CAATCAAGGG 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 CAGG 0 1 271695 CASAVA_Build 7 52293608 1D GAACGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 T 12 11 271696 CASAVA_Build 7 52297160 5D GAAAATTTTC TCTTT/----- TCTTTTATCT 2375 het 2375 ref 19 12 6 1 TCTTT 2 1 271697 CASAVA_Build 7 52299754 6D CTTTTTCAAA GATAGT/------ GATACACACT 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 GATAGT 1 0 271698 CASAVA_Build 7 52301957 1D AGGAAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2698 hom 26 10 9 7 T 13 12 271699 CASAVA_Build 7 52310421 2D TTGCTTATGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1615 hom 25 6 13 6 T 14 12 271700 CASAVA_Build 7 52311328 3D GTAAATATTC TTG/--- TTATTATATT 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 TTG 1 0 271701 CASAVA_Build 7 52316747 12D9M9D TCTTGCATTC TGTTTACTCTGTTGTAGGTTGTCTGTTTAC/------------TGTAGGTTG--------- TCTGTTTACT 3070 het 3070 ref 32 22 17 2 N/A 0 0 271702 CASAVA_Build 7 52317826 1D GGAATGCTGT A/- AAAAACAGTA 1742 het 1742 ref 15 9 4 2 A 6 5 271703 CASAVA_Build 7 52348853 4D AATTACTAAT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 TTCC 5 4 271704 CASAVA_Build 7 52350631 4I GTTCTCACCT ----/GTAA GTGAGAGTTA 916 het 916 ref 24 14 3 7 GTAA 0 1 271705 CASAVA_Build 7 52356689 14I CTCCTCCATT --------------/CCTGTTTCAGCTGA CCTCTTAATC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 CCTGTTTCAGCTGA 0 1 271706 CASAVA_Build 7 52365108 1D38M1D GTTAGAGACA GAAAAAACCCTTCAAAAAATCAATGAATCCAGGAGCTGGT/-CAAAAACCCATCAAAAAATCAATGAATCCAGGAACTGG- TTTTTTGAAA 1238 het 1238 ref 16 20 3 1 N/A 0 0 271707 CASAVA_Build 7 52388240 1D TACCCAAGCT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 9 8 271708 CASAVA_Build 7 52389494 1I CTGCAGCACC -/T TTTTTTACCA 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 T 6 7 271709 CASAVA_Build 7 52399513 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 12 11 271710 CASAVA_Build 7 52402420 1D TCCATCTAGG T/- TTTTTTTTTT 2433 het 894 hom 14 5 6 3 T 13 12 271711 CASAVA_Build 7 52405487 1D ATAGAACTTG A/- AAAAACATCA 3070 het 3070 hom 42 19 20 4 A 6 5 271712 CASAVA_Build 7 52409450 4D TCTTATGAAA ACTC/---- ACTCACTATC 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 ACTC 2 1 271713 CASAVA_Build 7 52419023 1D CCCTGGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 17 6 A 11 10 271714 CASAVA_Build 7 52420993 4D TTTTCAAATT TATC/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 29 10 16 6 TATC 1 0 271715 CASAVA_Build 7 52432194 2D AATATCTCTC CT/-- GTTTCATTTC 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 CT 1 0 271716 CASAVA_Build 7 52433524 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 10 11 271717 CASAVA_Build 7 52435023 1D ACCAGTGGTT G/- GGGGGACCAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 G 6 5 271718 CASAVA_Build 7 52435616 1D CAGGAATGGG C/- TGCTTGGGGT 3070 het 3070 ref 22 11 9 3 C 1 0 271719 CASAVA_Build 7 52437089 2I TTTTTGAAAC --/AG AAATAGTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 AG 0 1 271720 CASAVA_Build 7 52437318 1I TTCACAGAAG -/A AAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 5 6 271721 CASAVA_Build 7 52437560 3I AGTACACCAA ---/AAG AAGAATTTTA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 AAG 1 2 271722 CASAVA_Build 7 52439426 1I TCCCAGAACC -/A GTAAGAAATC 2836 het 2836 ref 28 16 7 5 A 0 1 271723 CASAVA_Build 7 52439730 1D28M3I ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAATAAAAGAAATCAATTTC---/-AAAAAAAAAAATAAAAGAAATCAATTTCTGT TGTTTATAAG 3070 het 3070 hom 27 11 16 6 N/A 0 0 271724 CASAVA_Build 7 52440929 1D GAATTTTTAT C/- CACAGCTATG 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 C 2 1 271725 CASAVA_Build 7 52442142 1I TGGGGTATGT -/G GTTTGCATTG 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 G 1 2 271726 CASAVA_Build 7 52444726 1I AAGGCAGAAC -/T TTTTTTTTAA 2860 het 2860 ref 23 12 7 4 T 8 9 271727 CASAVA_Build 7 52445122 3D CAATTCTTAT AAC/--- AACTATAATG 3070 het 3070 ref 33 16 14 7 AAC 2 1 271728 CASAVA_Build 7 52447160 1I AAACATGTCA -/T TTTTCAATTA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 4 5 271729 CASAVA_Build 7 52448603 1I AAATGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 A 13 14 271730 CASAVA_Build 7 52450404 4D22M1I TCACTGTATA TTGTTTGTTTGGTTAGTAAATGTTCA-/----TTGTTTGGTTAGTAAATGTTCAT TTTTTTTTCA 3070 hom 102 het 33 0 35 4 N/A 0 0 271731 CASAVA_Build 7 52450583 1I TATGCTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 37 1 30 6 T 10 11 271732 CASAVA_Build 7 52456111 2D GCAATTTTTA CC/-- CCCCCCCCGT 3070 het 51 hom 21 1 12 8 C 10 8 271733 CASAVA_Build 7 52459893 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTGAGA 2661 het 2219 hom 13 5 6 2 T 7 6 271734 CASAVA_Build 7 52461670 1I AAATGGAAAC -/T TAAAACATTA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 1 2 271735 CASAVA_Build 7 52464689 2I TTGAATCCTG --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 58 hom 35 3 19 13 T 9 11 271736 CASAVA_Build 7 52464815 1D CCTTTTTGTG C/- AGAGACCCAT 3070 hom 100 het 40 0 34 6 C 1 0 271737 CASAVA_Build 7 52465078 2D AGATATTTAT AG/-- AGTCAATAAT 3070 het 3070 ref 38 18 18 5 AG 2 1 271738 CASAVA_Build 7 52465251 1I ACTCCACCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 45 0 36 9 T 9 10 271739 CASAVA_Build 7 52465337 1I GATTACAGTG -/T TTTTGCAAAG 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 4 5 271740 CASAVA_Build 7 52468232 3D GATCTGCAGA GAG/--- GAGTAGACTT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 GAG 2 1 271741 CASAVA_Build 7 52470591 1I TTAGAGTTCC -/A AAACTTTTAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 3 4 271742 CASAVA_Build 7 52471808 1I ATTTTTTTTT -/A AAATCTATTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 3 4 271743 CASAVA_Build 7 52475307 1D TGTTATCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 11 10 271744 CASAVA_Build 7 52478938 2D CATTTTTATT TA/-- TGTTTTCTGC 3070 hom 88 het 35 0 30 7 TA 1 0 271745 CASAVA_Build 7 52479410 1I TTTTCTCACA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 7 8 271746 CASAVA_Build 7 52479833 1I TTCATTATTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 8 9 271747 CASAVA_Build 7 52481677 1I TAATTATATA -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 7 271748 CASAVA_Build 7 52484098 1D CTTTTTCAGG T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 39 18 13 10 T 8 7 271749 CASAVA_Build 7 52486928 2D TGTTCATGTT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 10 8 271750 CASAVA_Build 7 52488213 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 19 0 17 6 T 9 10 271751 CASAVA_Build 7 52490228 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 8 9 271752 CASAVA_Build 7 52494543 1I GAAAGAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 42 1 32 9 T 10 11 271753 CASAVA_Build 7 52499485 1I GAATTTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 16 10 T 13 14 271754 CASAVA_Build 7 52505667 1I TAAATAGCCT -/G GTTATGTTCC 3070 hom 137 het 54 0 48 6 G 1 2 271755 CASAVA_Build 7 52512896 19D GGTGTAACGA AATCAGTTTAGCTGGTTAC/------------------- AATCAAGATT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 AATCAGTTTAGCTGGTTAC 1 0 271756 CASAVA_Build 7 52523589 1I AAAGAAGAAA -/C GTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 C 0 1 271757 CASAVA_Build 7 52528536 3D AAGTCGTTTC TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 8 TTG 3 2 271758 CASAVA_Build 7 52529221 1D CCTGCTGAGA T/- TTTTTTGGGA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 7 6 271759 CASAVA_Build 7 52531599 1I ATTCTATGAC -/G AGAATTTATG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 G 0 1 271760 CASAVA_Build 7 52533181 1D ATATATGACT G/- GATTCCTTGT 3070 hom 82 het 37 0 28 9 G 2 1 271761 CASAVA_Build 7 52536480 4D AAAAAAAACT CACA/---- CACAAAACCT 3070 het 3070 ref 45 23 18 6 CA 4 2 271762 CASAVA_Build 7 52536584 1I ATGACAATTA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 T 6 7 271763 CASAVA_Build 7 52543843 1I GAAAACAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 8 9 271764 CASAVA_Build 7 52546739 1D TGCCCAGCCT A/- TTTTTTTTTA 3070 hom 7 het 18 1 15 2 A 1 0 271765 CASAVA_Build 7 52552251 1D AATAAAAAAA T/- ATATATATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 1 0 271766 CASAVA_Build 7 52552677 1I AAAAATTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 A 9 10 271767 CASAVA_Build 7 52553839 29D AATGGTGGCT CTCTTCTCTTGGCTCCACTAGGTGGTACC/----------------------------- CCAGCAGGAA 3070 het 3070 ref 29 21 11 6 CTCTTCTCTTGGCTCCACTAGGTGGTACC 1 0 271768 CASAVA_Build 7 52556739 1D CTAAGTAAGG T/- TTTTTTTTTT 2705 het 2221 hom 22 7 9 6 T 13 12 271769 CASAVA_Build 7 52559332 3I ATAAATCCTG ---/TTA TTATTATTCA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 TTA 2 3 271770 CASAVA_Build 7 52584149 1D TTATCTTTAG A/- AAGTTCAACT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 3 2 271771 CASAVA_Build 7 52586515 2I TGTGTATGTG --/TA TATATATATG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 TA 4 5 271772 CASAVA_Build 7 52590969 3D TCTTTTCTTA TTC/--- TTCTGGTCTC 3070 hom 129 het 48 0 44 6 TTC 2 1 271773 CASAVA_Build 7 52595208 1I GGTTAGGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 14 15 271774 CASAVA_Build 7 52598799 3I AGTGTAAGGA ---/ATC ATAATTGGCA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 ATC 0 1 271775 CASAVA_Build 7 52601900 1I AACCAGATTT -/C CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 17 11 4 C 1 2 271776 CASAVA_Build 7 52607208 1D ATAAGACACT C/- CCAGTTCTAT 3070 hom 126 het 47 0 41 6 C 3 2 271777 CASAVA_Build 7 52609868 1D CCTAGATGAC A/- TTACCATATG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 1 0 271778 CASAVA_Build 7 52621583 3I TATTTTTCTT ---/ATC ATTTACAATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ATC 0 1 271779 CASAVA_Build 7 52632730 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1872 het 49 hom 16 2 8 7 A 14 12 271780 CASAVA_Build 7 52634694 3D ATAATATCTT TTA/--- TTATTATCAG 2712 het 2712 ref 26 16 9 2 TTA 3 2 271781 CASAVA_Build 7 52637121 1I AAACTTAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 A 10 11 271782 CASAVA_Build 7 52637240 3D TATGTCTCTA TTG/--- TTGTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 TTG 2 1 271783 CASAVA_Build 7 52643007 2I AACTTAAGAC --/TT AACGCACAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 0 2 271784 CASAVA_Build 7 52668827 1I ATACCATCTT -/A ATTTCCAAAG 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 1 2 271785 CASAVA_Build 7 52678394 6I TTATGTTAGA ------/TATTAT TATTTTAATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TAT 1 3 271786 CASAVA_Build 7 52678756 4D TTTATTTAAG TATC/---- TATCTATCTA 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 TATC 4 3 271787 CASAVA_Build 7 52679408 1D TGCTATCCCT C/- CCCCCTCCTC 2970 het 1650 hom 12 4 7 2 C 6 5 271788 CASAVA_Build 7 52693076 4D CTTGTTAAAT AAAC/---- AGTGAATAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AAAC 1 0 271789 CASAVA_Build 7 52695587 2D AGCACTTAAA AG/-- AAGTTGAATG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AG 1 0 271790 CASAVA_Build 7 52696859 1I AATTTAAAAG -/A AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 6 7 271791 CASAVA_Build 7 52697363 1D AATTTTTTTT A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 7 6 271792 CASAVA_Build 7 52697653 1D GGAATTCACT A/- AAAAATGTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 6 5 271793 CASAVA_Build 7 52698409 2D GCATAAAATT TC/-- TGTTTTATTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TC 1 0 271794 CASAVA_Build 7 52704371 1I GGGCAGGCGG -/C CCCGCCCAGG 2043 hom 45 het 16 0 11 5 C 3 4 271795 CASAVA_Build 7 52704882 1D TTATTGGCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 T 10 9 271796 CASAVA_Build 7 52707997 4D GCACAGAAAG TATA/---- TATATATATA 2958 het 1279 hom 22 3 8 11 TA 10 8 271797 CASAVA_Build 7 52708554 8I CAATAGGCAT --------/CTCAATTG CTCAATTGTT 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 CTCAATTG 1 2 271798 CASAVA_Build 7 52710662 3I AACAAGAAAT ---/AAC AACAACACAA 3070 hom 43 het 31 0 21 10 AAC 2 3 271799 CASAVA_Build 7 52713123 1I GGATGGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 10 11 271800 CASAVA_Build 7 52716421 3D CTGATATGTT ATC/--- ATAGTTTGGG 3070 het 3070 hom 31 14 15 4 ATC 1 0 271801 CASAVA_Build 7 52718509 1I AAAAAGGTTC -/T TTTTTCTAGT 3070 het 3070 ref 49 24 16 9 T 5 6 271802 CASAVA_Build 7 52720290 2D CTAAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 13 11 271803 CASAVA_Build 7 52720954 1D CCTTTATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 235 hom 50 1 37 13 A 13 12 271804 CASAVA_Build 7 52723322 5D CTACAAAGAT AAAAG/----- AAAACTAACA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AAAAG 1 0 271805 CASAVA_Build 7 52727707 1I ATACAATATA -/T TGTTATTAAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 1 2 271806 CASAVA_Build 7 52731194 2I AATTTTCACT --/GA GAGAGAGATT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 GA 4 5 271807 CASAVA_Build 7 52731596 1I TATGGGGGAT -/C CATGCAGCCA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 1 2 271808 CASAVA_Build 7 52732657 14D3M18D CCCTGGTCTC ACGACTTGTTTTGACCAACAGAACACAATAGAAGT/--------------CCA------------------ GCTATGTTGG 2584 het 2584 ref 34 37 9 6 N/A 0 0 271809 CASAVA_Build 7 52734954 7D TATTCATCAC CCCAATA/------- CCCAATACCC 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 CCCAATA 2 1 271810 CASAVA_Build 7 52736099 15D AAACCATCCT AGAGAAGCACCTGCC/--------------- AGCAGCAAAG 795 het 795 ref 38 21 3 15 AGAGAAGCACCTGCC 1 0 271811 CASAVA_Build 7 52737611 1D GACTTAAGTT A/- AAATAGATGG 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 A 4 3 271812 CASAVA_Build 7 52738966 11I21M7I15M2I6M1I3M5D4M1D3M11D7M9D TTAAAATAAA -----------GATTATAAAAGCAAAAAACAA-------GTGCTGCAAATAGAA--AACAAT-CATACACATGGTAGATACTAACCCAACTACATCAATAATTTTT/GTATTTTCATTGTTTATTTATCTAAAAGATAATTCTTTTGTTAAACTAATAGCAGTAACAATGCAT-----TGGT-GAT-----------GTCATCA--------- TAAATGTAAG 1799 het 1799 ref 26 42 4 6 N/A 0 0 271813 CASAVA_Build 7 52740024 4D AACTGATAAA TATC/---- TATCTAGGCT 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 TATC 2 1 271814 CASAVA_Build 7 52740149 2D CCACAAATAA CT/-- CTATTCCCAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 6 CT 2 1 271815 CASAVA_Build 7 52741432 13I TAATGTGCTA -------------/TCCTGGATGGGAT TCTGGACATT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 TCCTGGATGGGAT 0 1 271816 CASAVA_Build 7 52743242 12D TATTTCAAAG AACTCTTTGCCC/------------ AACTGGGCAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 AACTCTTTGCCC 1 0 271817 CASAVA_Build 7 52744713 1I GAAAGTTTGA -/T TTTTTTGCGT 3070 het 3070 ref 51 29 16 6 T 6 7 271818 CASAVA_Build 7 52745312 1D TGATTTCTAG T/- TTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 7 6 271819 CASAVA_Build 7 52749145 1D ATTAATCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 13 12 271820 CASAVA_Build 7 52754813 3I CTTCAAGCAA ---/TCC TCCTGCTTCA 1078 het 1078 ref 24 18 3 3 TCC 1 2 271821 CASAVA_Build 7 52755629 1D AGGGGCTACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2871 hom 27 8 14 5 A 12 11 271822 CASAVA_Build 7 52760105 1I ATTTGATTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 T 7 8 271823 CASAVA_Build 7 52764568 1I TATCTGTTAG -/C CTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 C 1 2 271824 CASAVA_Build 7 52777211 2I CAACAAAATA --/AC ACAGTCTCTC 3070 het 3070 hom 61 25 32 4 AC 1 2 271825 CASAVA_Build 7 52810798 4I CAAGACAGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 TTTG 2 3 271826 CASAVA_Build 7 52815232 4D CAGTAGAAAT AGAC/---- AGGCAGGGAA 3070 het 3070 ref 36 21 13 3 AGAC 1 0 271827 CASAVA_Build 7 52819918 1D TAAGTGGAAA G/- GGGGTGACTT 3070 het 3070 ref 51 24 20 8 G 5 4 271828 CASAVA_Build 7 52823163 1I TCATCCCTCT -/G GGATGCCTTA 3070 hom 161 het 62 0 53 9 G 2 3 271829 CASAVA_Build 7 52832161 2D ATATATATTC AT/-- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 AT 1 0 271830 CASAVA_Build 7 52832380 1I TATGAGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 10 11 271831 CASAVA_Build 7 52832806 1I TAACCAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 8 9 271832 CASAVA_Build 7 52844112 1D TAAAACCTAG A/- AAAAAACTGT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 7 6 271833 CASAVA_Build 7 52844757 1I ATGAGAACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 9 10 271834 CASAVA_Build 7 52846146 1D ATTACTAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 9 8 271835 CASAVA_Build 7 52848473 1D TTTAAGTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 10 9 271836 CASAVA_Build 7 52851795 7D AGCTCGGGTT AAGGACC/------- AGTATGGCCT 3070 het 3070 ref 40 18 16 7 AAGGACC 1 0 271837 CASAVA_Build 7 52854696 1I TACTAACCAA -/G CAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 G 0 1 271838 CASAVA_Build 7 52856318 1D GGAAAAGAAT A/- AATTTAGACC 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 A 3 2 271839 CASAVA_Build 7 52860566 1I TGTCAGGCTC -/T TTTTTAGGTG 3070 het 3070 ref 43 18 18 7 T 5 6 271840 CASAVA_Build 7 52861058 1D AGATAGCACC T/- TTTTTTTTTT 1331 het 1331 ref 35 27 3 6 T 11 10 271841 CASAVA_Build 7 52861667 1I CTTACAATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 9 10 271842 CASAVA_Build 7 52863645 1I TCAATTTTAC -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 6 7 271843 CASAVA_Build 7 52863910 1I ATATAGATGG -/T GTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 0 1 271844 CASAVA_Build 7 52864636 4D GTTAAGAAAT CAGA/---- CAGAACTGTG 3070 het 3070 ref 32 16 13 6 CAGA 2 1 271845 CASAVA_Build 7 52866386 1D TGGAAAAATT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 8 7 271846 CASAVA_Build 7 52868496 1D AATAAATGAA G/- TAAAGAAAAA 2446 het 2446 ref 22 15 7 1 G 1 0 271847 CASAVA_Build 7 52877048 22I CATCTCTAAT ----------------------/TTTAGGCCCATTCGTGCTCTAA TTTTCGTGAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 TTTAGGCCCATTCGTGCTCTAA 0 1 271848 CASAVA_Build 7 52888995 4D TATAACACTC TATT/---- TATGTATTTA 3070 het 3070 hom 37 16 17 6 TATT 1 0 271849 CASAVA_Build 7 52906832 1I TCATGCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 912 hom 30 2 17 11 A 13 14 271850 CASAVA_Build 7 52912525 1I TCTCTAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 9 10 271851 CASAVA_Build 7 52917227 1D AAAAGTGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2548 hom 29 8 17 4 A 11 10 271852 CASAVA_Build 7 52917840 4I TCTAGCTTAC ----/TACT TACTTGAAAG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TACT 1 2 271853 CASAVA_Build 7 52926844 1D TCAATATACA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 28 0 23 6 T 9 8 271854 CASAVA_Build 7 52943901 1I ATATCTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 10 11 271855 CASAVA_Build 7 52952259 1I TGCATTTATA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 T 8 9 271856 CASAVA_Build 7 52956849 1I CTAAAAGTAC -/A AAAAATTAGC 3070 het 801 hom 13 2 11 0 A 5 6 271857 CASAVA_Build 7 52956986 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 23 1 16 6 A 17 16 271858 CASAVA_Build 7 52958535 1I TCAGGTGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 38 0 31 7 T 10 11 271859 CASAVA_Build 7 52959343 5D ATATGTACTC TACTT/----- TACTAATCCA 3070 hom 123 het 46 0 42 7 TACTT 1 0 271860 CASAVA_Build 7 52960642 3I TTTTTCTCTC ---/TTG TTGTGTGTGT 3070 hom 105 het 38 0 33 5 TTG 1 2 271861 CASAVA_Build 7 52973922 7I5M1D TGGGTAGGCT -------CTTGCA/TGCCGGGGTTGC- TGGGGGCAAG 3070 hom 81 het 28 0 25 5 N/A 0 0 271862 CASAVA_Build 7 52974223 2I AATATAACAT --/AC ACACACACAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AC 4 5 271863 CASAVA_Build 7 52978673 1D TCAAAAAAAA T/- AATACTATGA 3070 het 257 hom 29 1 26 4 T 1 0 271864 CASAVA_Build 7 52980297 2D CCAACTGGTG AT/-- TCAGACAATG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AT 1 0 271865 CASAVA_Build 7 52981228 1I GGGCACATGT -/G AGGGAGCACA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 0 1 271866 CASAVA_Build 7 52984976 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 32 1 24 7 A 12 13 271867 CASAVA_Build 7 52987360 5I TGTTTGACAA -----/AAGAC AATAGGTGAT 3070 hom 175 het 64 0 59 5 AAGAC 0 1 271868 CASAVA_Build 7 52992258 1D CGATTTAAGA T/- TTTTACCTAT 3070 hom 127 het 45 0 41 4 T 5 4 271869 CASAVA_Build 7 52994539 1I GAGGAATTGC -/A ATAGAGAAAG 3070 hom 153 het 57 0 51 6 A 1 2 271870 CASAVA_Build 7 53001187 4I TTCATCTCTC ----/TCTT TCTTTCTCTC 3070 hom 69 het 29 0 22 7 TCTT 1 2 271871 CASAVA_Build 7 53003721 1I CTTTCTCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 21 1 16 4 A 10 11 271872 CASAVA_Build 7 53005928 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 752 hom 39 2 29 8 A 13 14 271873 CASAVA_Build 7 53009272 1I TTGCTAATTT -/C TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 C 0 1 271874 CASAVA_Build 7 53011354 1D TAGACTTGGT A/- AAAAAATTAC 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 7 6 271875 CASAVA_Build 7 53012923 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2294 het 320 hom 9 1 7 1 A 13 12 271876 CASAVA_Build 7 53016004 2I AGAAGAAAGA --/AG AGACAAGTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AG 1 2 271877 CASAVA_Build 7 53022445 1I ACATTTTCAT -/C GAGTTTTACC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 0 1 271878 CASAVA_Build 7 53036354 5I CTGCCATGTT -----/ATCTC AGCTCCAGAC 3070 hom 111 het 47 0 38 9 ATCTC 0 1 271879 CASAVA_Build 7 53043063 1I AAGCGTGGGA -/G GGAGGCTTGA 3070 hom 95 het 36 0 28 8 G 2 3 271880 CASAVA_Build 7 53049519 1D TATGTTGTTG T/- TTTTTTTTTA 1173 het 1173 ref 40 35 3 2 T 10 9 271881 CASAVA_Build 7 53061657 1I CCTCTCCCCT -/C CCCCCACCCC 1724 hom 10 het 5 0 4 1 C 5 6 271882 CASAVA_Build 7 53069110 4I CTGGAGGATT ----/CTTA CTTAAGGAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CTTA 1 2 271883 CASAVA_Build 7 53069960 1I25M2I TAGAGCAACA -TGCTGGTGAGGACACAACATGGTAC--/TTGCTGGTGAGGACACAACATGGTACAG AGGCTGAGGA 3070 hom 75 het 23 0 26 2 N/A 0 0 271884 CASAVA_Build 7 53076640 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TA 5 6 271885 CASAVA_Build 7 53078213 1D GATCAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 33 1 24 8 A 11 10 271886 CASAVA_Build 7 53084390 1I GATAATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 37 2 32 3 A 10 11 271887 CASAVA_Build 7 53087045 2I CAACTATATT --/TA TATATATATA 3070 hom 29 het 25 1 21 3 TA 6 7 271888 CASAVA_Build 7 53091167 8D TGTAAGGAAA TTTGGCTT/-------- TTTGGGATAA 3070 het 3070 ref 32 16 16 4 TTTGGCTT 1 0 271889 CASAVA_Build 7 53096900 1I GAAGAAGTAA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 T 6 7 271890 CASAVA_Build 7 53103012 1D TCTGTGAATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 8 271891 CASAVA_Build 7 53121650 4D ATTAAGAGAT TAAA/---- TAAAGTAAGA 2861 het 2861 ref 24 13 7 8 TAAA 2 1 271892 CASAVA_Build 7 53136114 1D AAAAAAACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 10 9 271893 CASAVA_Build 7 53144113 1I GCTTAACTTT -/A TTTTAATTAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 0 1 271894 CASAVA_Build 7 53149522 1D GCTGAAGGAG A/- AAAGAAGTGC 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 A 4 3 271895 CASAVA_Build 7 53157464 1D CAATATTTGT G/- GGACAACCAG 720 het 720 ref 39 33 3 3 G 3 2 271896 CASAVA_Build 7 53160347 1I AAATTGAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 8 9 271897 CASAVA_Build 7 53160399 3D GAAGGAGAGA AAG/--- AAGAAGAGAA 598 het 598 ref 37 16 3 19 AAG 3 2 271898 CASAVA_Build 7 53161009 4D AAATCAGACA CACC/---- CACCCCCCCC 3070 het 3070 ref 27 12 10 6 CACC 2 1 271899 CASAVA_Build 7 53161084 2I24M1D TTAAGGTATT --TTTTTAGTGAAATTTTCCAAAGTGT/TATTTTTAGTGAAATTTTCCAAAGTG- TTTTACAAAA 3070 het 3070 ref 39 27 9 5 N/A 0 0 271900 CASAVA_Build 7 53163000 3D TTTTTGTTGT TGA/--- TGTAAGTTTA 3070 het 3070 ref 35 22 10 4 TGA 1 0 271901 CASAVA_Build 7 53164220 1D TTCATTTTTG A/- AAAATAATTA 3070 het 3070 hom 22 10 10 4 A 5 4 271902 CASAVA_Build 7 53165124 1I TCAACTACAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 A 8 9 271903 CASAVA_Build 7 53165317 1I CATGACTTTA -/T TTTTTATAGC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 5 6 271904 CASAVA_Build 7 53166787 3D CTTTCAAGTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 14 14 A 13 10 271905 CASAVA_Build 7 53167953 3I AATAAAAAAA ---/ATT AGCTGGGTGT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 ATT 0 1 271906 CASAVA_Build 7 53175778 3I CTTAACTCAG ---/ATA ATAACAATAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ATA 1 2 271907 CASAVA_Build 7 53180524 1D TTCTTTCATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 41 het 16 0 14 2 A 9 8 271908 CASAVA_Build 7 53180994 3I65M3I ACCAGCTGTT ---TTCTTCTTAGATTTCAACATGTTAGATTATTACTGTATCTTTTATATTTTTTAAATGACCTTTCT---/TTCTTCTTCTTAGATTTCAACATGTTAGATTATTACTGTATCTTTTATATTTTTTAAATGACCTTTCTCTA CTTTTTATCT 3070 hom 69 het 24 0 24 24 N/A 0 0 271909 CASAVA_Build 7 53186013 2I CTTACTTGCA --/TT TGATAGTTCA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 1 3 271910 CASAVA_Build 7 53187623 15I TGGTTTTGGG ---------------/CATTGTCTCTAACTA CATTGCTTCC 2795 het 2795 ref 45 35 8 3 CATTGTCTCTAACTA 0 1 271911 CASAVA_Build 7 53189937 5D AGTGATATTT TATTG/----- TAAGTATTTG 3070 het 3070 hom 56 21 31 10 TATTG 1 0 271912 CASAVA_Build 7 53191191 1I TTACCACAAT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 85 50 20 15 A 6 7 271913 CASAVA_Build 7 53196358 2D22M4I28M3D TTATAAAGAA CTTTTTGTCATGTAATTTAATATT----TTTATTTAAAATCACCCAAATCAAAATAATT/--TTTTTTCAGGTAATTTAATATTTTTGTTTATTTAAAATCACCCTAATTAAAATA--- ATATCTTAAT 2829 het 2829 ref 40 39 6 13 N/A 0 0 271914 CASAVA_Build 7 53197206 3I AATTAATAAT ---/AAG AAGAAAAGCA 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 AAG 1 2 271915 CASAVA_Build 7 53198851 3I TACTTGAACT ---/ACA ACAAGTACCT 3070 het 3070 ref 43 25 10 8 ACA 1 2 271916 CASAVA_Build 7 53199050 2I AGATGATGGC --/AG ATAATACACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AG 0 1 271917 CASAVA_Build 7 53201342 4I AGATCTAAAT ----/AAAC AATTAGGTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAC 0 1 271918 CASAVA_Build 7 53203260 1I ACTCCATCTC -/G AAAAAAGAAA 3070 het 165 hom 26 1 20 5 G 0 1 271919 CASAVA_Build 7 53203486 1I TAAGGAGTGA -/T CTTTGAGTTC 848 het 848 ref 46 38 2 7 T 0 1 271920 CASAVA_Build 7 53203715 1D CGTGGGCACT G/- GCAATGCAAC 1557 het 1557 ref 64 53 4 7 G 2 1 271921 CASAVA_Build 7 53206108 2I GATGCCTATG --/AT ATATATATTA 3070 hom 65 het 27 0 22 5 AT 4 5 271922 CASAVA_Build 7 53206253 1D CAATCAATGT A/- AATGTATTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 2 271923 CASAVA_Build 7 53213280 1D GGGAAATTAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 A 9 8 271924 CASAVA_Build 7 53214305 1D CTAGGAAAAT A/- AGCTATTAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 1 271925 CASAVA_Build 7 53221719 1I TTGAATACAG -/A AAAACAATAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 4 5 271926 CASAVA_Build 7 53230718 1D AGCTGTGAGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 8 7 271927 CASAVA_Build 7 53231350 1I TATACTTAGG -/A AAGTGATGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 2 3 271928 CASAVA_Build 7 53233731 1I AAACATTGCA -/G GTCTTACCAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 1 2 271929 CASAVA_Build 7 53234169 2I TTCTTTTGTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 26 1 19 6 A 13 15 271930 CASAVA_Build 7 53234466 1D TATTTCAGTG T/- TTTTTTTAGG 3070 hom 114 het 43 0 38 6 T 8 7 271931 CASAVA_Build 7 53234851 9D4M4I10M2D9M4I9M4D5M4D13M4D9M2I4M7D ACCTTTTCCT CAGGTTAGATTCT----GCATTATCAGCTCCTTTCTCC----CTTATGTTTGGCCATAAACTCCTTACCTAAGGGCTCACCAGAAGTAAC--TTTAAGCTCCC/---------TTCTAAGGGCTTTCTAAG--CCTGACTTCAAGAATAAAATTT----ATAAA----TTAAAATATTGAT----ACATTTGACAATTTA------- AAATAATGTT 1438 hom 10 het 5 0 4 1 N/A 0 0 271932 CASAVA_Build 7 53235468 4D AAATGGGAAA AAAT/---- AAATAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAAT 2 1 271933 CASAVA_Build 7 53240812 1I GGAGTAGCTG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 7 8 271934 CASAVA_Build 7 53249640 1D AGAAAGCTTA T/- TTTAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 4 3 271935 CASAVA_Build 7 53250306 1I ACAACATAGA -/T TTTTATGTCA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 4 5 271936 CASAVA_Build 7 53251719 1D TCTGCAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 26 0 17 10 A 14 13 271937 CASAVA_Build 7 53251769 2I AGAAAATAGT --/TC TCAATCCTAA 3070 hom 72 het 33 0 23 10 TC 1 2 271938 CASAVA_Build 7 53264014 2D ATATTCTACA AC/-- ACAGTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 6 AC 2 1 271939 CASAVA_Build 7 53268336 1I TAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 114 het 41 0 39 3 A 9 10 271940 CASAVA_Build 7 53305305 1D CTTAATCCTT G/- AAAGCATAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 0 271941 CASAVA_Build 7 53309023 1I CCCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 22 18 5 A 10 11 271942 CASAVA_Build 7 53309994 4D GCCAGCAACC TATG/---- TCAAAGGTAG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 TATG 1 0 271943 CASAVA_Build 7 53314907 2I CTTGACACTC --/TT TAAATACACA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 1 3 271944 CASAVA_Build 7 53325189 2D ACTGGAAAAC AA/-- AGAAATCTTC 3070 het 3070 hom 46 18 24 6 A 3 1 271945 CASAVA_Build 7 53325894 1I ATAGCTATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 9 10 271946 CASAVA_Build 7 53329240 1D TTTCTTCGAG T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 8 7 271947 CASAVA_Build 7 53329452 1I ATAAAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2065 hom 32 7 14 11 T 10 11 271948 CASAVA_Build 7 53335135 1D AATCTAGCCC A/- AAACCCTGAA 3070 het 3070 hom 37 11 22 6 A 4 3 271949 CASAVA_Build 7 53338445 1D CAGGGCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 665 hom 34 2 18 14 T 13 12 271950 CASAVA_Build 7 53340192 2I ATGGAGTAGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 GT 8 9 271951 CASAVA_Build 7 53343220 2D CAGGTTGAAC AA/-- AGTGATTGGT 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 A 3 1 271952 CASAVA_Build 7 53343524 37D11M2D TTATGGTACA CTGGATATGTTAATTCTGCTCTTTATTTAAATGATGCATTAATTTTATGA/-------------------------------------ATCACTTCCCT-- GTAAACAATG 3070 hom 60 het 17 0 21 2 N/A 0 0 271953 CASAVA_Build 7 53344039 5D GTCAGTGCTT TTGTC/----- TTTACTGTCA 3070 het 3070 hom 28 13 13 5 TTGTC 1 0 271954 CASAVA_Build 7 53345954 2I GCCCTGACTA --/CT CTCTCTCATC 1851 het 1851 ref 25 15 5 5 CT 3 4 271955 CASAVA_Build 7 53347035 3D AAGAGGGACT AGA/--- AGTTGTAACT 2423 het 2423 ref 28 18 6 4 AGA 1 0 271956 CASAVA_Build 7 53347095 1I CTAATACAAG -/A AAAAAATAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 7 271957 CASAVA_Build 7 53349424 1I AGGAGAACTT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 59 het 36 1 34 1 A 7 8 271958 CASAVA_Build 7 53350596 1I AATAGATGGC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 T 7 8 271959 CASAVA_Build 7 53351063 1D AATATTTTGT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 9 8 271960 CASAVA_Build 7 53358426 1I TTAATGCCCG -/C CCACCTTGTG 3070 het 3070 hom 28 12 16 0 C 2 3 271961 CASAVA_Build 7 53360108 1I GGGGCTTTTT -/C CCCTTTTGCT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 C 3 4 271962 CASAVA_Build 7 53370670 1I AATAAGTTGT -/A AAAAAAAAAA 2626 het 2626 ref 30 17 7 6 A 10 11 271963 CASAVA_Build 7 53374503 2D GAAGGAAAAT AA/-- AAACACTTAA 3070 het 3070 ref 40 26 10 5 A 5 3 271964 CASAVA_Build 7 53374842 1D AGCTAAATCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 10 9 271965 CASAVA_Build 7 53375512 1I TATATGGGAA -/T TTAGTCTTAG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 2 3 271966 CASAVA_Build 7 53383440 1D CTTTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2872 hom 28 8 15 5 A 13 12 271967 CASAVA_Build 7 53398901 1I CTCAGCTCTA -/T TTTTTTTCCT 2006 het 2006 ref 23 14 6 3 T 7 8 271968 CASAVA_Build 7 53402380 1I CCCTAAATGC -/G GGGGGGGGAT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 G 8 9 271969 CASAVA_Build 7 53404174 1I GTGCCATTTG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 6 7 271970 CASAVA_Build 7 53413747 1I AGATAAAGTC -/A AAAAAAATCA 3070 het 328 hom 42 1 34 8 A 7 8 271971 CASAVA_Build 7 53419628 1D GACTAAGACT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 A 9 8 271972 CASAVA_Build 7 53428114 1I ATTATTTTTT -/A AAATCACATA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 3 4 271973 CASAVA_Build 7 53457802 22D CACAACAGTG TGATAGGAGGGGCAATAAACCT/---------------------- TGATTATCAC 3070 het 3070 ref 41 26 14 8 TGATAGGAGGGGCAATAAACCT 1 0 271974 CASAVA_Build 7 53477327 1D TTTTTTTTTT A/- ATTATTGTTA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 2 1 271975 CASAVA_Build 7 53500797 7D CAATGAGAGA CACCCCG/------- GAGGAAACCT 3070 het 3070 hom 50 23 24 5 CACCCCG 1 0 271976 CASAVA_Build 7 53504222 1I AAAGACAAAT -/A AAAAAAACAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 7 8 271977 CASAVA_Build 7 53505318 2I CTATGGAAAC --/AA GAAGCAAATT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 0 2 271978 CASAVA_Build 7 53510864 2D TTCTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 T 13 11 271979 CASAVA_Build 7 53514809 2D AAAATTCCAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AT 6 5 271980 CASAVA_Build 7 53522038 1D TGTATAACTC T/- GTATGCTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 1 0 271981 CASAVA_Build 7 53522824 4D TCCCTTCCTT CCTC/---- CCTCCCTCCC 3070 het 3070 ref 37 14 11 13 CCTC 3 2 271982 CASAVA_Build 7 53533217 4I GCTATAATAT ----/ATTA ATTAATTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 ATTA 1 2 271983 CASAVA_Build 7 53540542 14D TCATTTCACA GTGTCTATGGCAAT/-------------- GTTATGCTTA 3070 het 3070 ref 63 36 26 5 GTGTCTATGGCAAT 1 0 271984 CASAVA_Build 7 53546391 1I TTTTTTTTTT -/A TTAAAGTCTA 3070 het 2475 hom 23 6 15 2 A 0 1 271985 CASAVA_Build 7 53547347 3I ATACAGTTTA ---/ATG ATAAGTTATT 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 ATG 0 1 271986 CASAVA_Build 7 53549233 1D TTGACTCCCC A/- GGGCCTTAAG 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 1 0 271987 CASAVA_Build 7 53554676 1I AAAGGTGACC -/A AAAAAAAAAA 1928 het 1928 ref 20 9 5 6 A 15 16 271988 CASAVA_Build 7 53557881 2D AACAGGCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 21 13 16 A 14 12 271989 CASAVA_Build 7 53566221 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1195 het 1195 ref 36 24 5 7 T 13 14 271990 CASAVA_Build 7 53579300 2I CCTTCTGCCA --/CT CTCTACTCAG 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 CT 2 3 271991 CASAVA_Build 7 53587244 2I TTGGGACAAC --/AT GTGATTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 0 1 271992 CASAVA_Build 7 53594089 1D TGGGGGCACT G/- GGGGGGAGAC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 G 7 6 271993 CASAVA_Build 7 53604393 1D TTTATCCCAT A/- AAAAAATTGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 6 271994 CASAVA_Build 7 53604744 1D GGTAGCAAGC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 T 8 7 271995 CASAVA_Build 7 53618255 1I ATAACCCCCT -/A AAAAAATAAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 6 7 271996 CASAVA_Build 7 53623289 2D CAAAAAAAAA AC/-- CAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 8 AC 1 0 271997 CASAVA_Build 7 53624512 1I CTTTTTATGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 T 8 9 271998 CASAVA_Build 7 53626434 1I ATCCAGCCAC -/T TGTGTCTGTG 3070 hom 80 het 32 0 25 7 T 1 2 271999 CASAVA_Build 7 53628039 1D CTCATGGAAA C/- CCTGGTTTGT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 C 3 2 272000 CASAVA_Build 7 53636560 1D AGGAAGACTA T/- TTTTAAAGTA 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 T 5 4 272001 CASAVA_Build 7 53639984 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAGAAAAA 1703 het 530 hom 10 2 4 4 C 0 1 272002 CASAVA_Build 7 53644025 4I AAGAAAACAC ----/TCTA TCTATTGTGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TCTA 1 2 272003 CASAVA_Build 7 53646799 4I AATCGATTAA ----/AACT AATATATAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AACT 0 1 272004 CASAVA_Build 7 53653255 1I TTGCACATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 10 11 272005 CASAVA_Build 7 53655315 1I AGAACATTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 9 10 272006 CASAVA_Build 7 53661729 2I TGTGCCACAC --/AT GTGTGTTGTT 3070 het 3070 hom 57 20 23 14 AT 0 1 272007 CASAVA_Build 7 53662584 1D AAAAGGAAAT A/- AATATTCATT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 3 2 272008 CASAVA_Build 7 53666203 5I TAAAATATTG -----/TTTAT TTTATTGTTC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 TTTAT 1 2 272009 CASAVA_Build 7 53667293 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1695 hom 23 6 13 4 A 11 10 272010 CASAVA_Build 7 53673141 1I AGATTGTCTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 A 9 10 272011 CASAVA_Build 7 53673813 1D TTTTGCATTA T/- TTACTCACAT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 T 3 2 272012 CASAVA_Build 7 53685226 1I GCTAATCATA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 8 9 272013 CASAVA_Build 7 53715394 1D TTCTAAGTTT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 A 8 7 272014 CASAVA_Build 7 53734747 1D CATCATTGAG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 51 17 27 7 T 9 8 272015 CASAVA_Build 7 53739956 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1694 het 1694 ref 32 20 6 6 TA 9 8 272016 CASAVA_Build 7 53745566 4I AGTGTCCAAA ----/TTGT TTGACCATTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 TTGT 0 1 272017 CASAVA_Build 7 53763320 3I GCATTTTTAT ---/CAC CACATCAAAT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 CAC 1 2 272018 CASAVA_Build 7 53764679 2D CTCGTGTCAC AG/-- AGTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 34 21 11 4 AG 2 1 272019 CASAVA_Build 7 53766403 1D TTTTGGATAC T/- GTAGCCCTAC 3070 het 3070 hom 28 9 11 8 T 1 0 272020 CASAVA_Build 7 53769475 2I AGAAATAAGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 10 12 272021 CASAVA_Build 7 53784013 1I ACAGAATCAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 8 9 272022 CASAVA_Build 7 53794518 3D TTTCATCATC ATT/--- GTGTCTTGCA 2328 het 2328 ref 32 18 7 7 ATT 1 0 272023 CASAVA_Build 7 53794563 1I TATTGGAACT -/A AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 A 6 7 272024 CASAVA_Build 7 53797213 2I TTTTGTGGAT --/TA TATATATATA 2932 het 2932 ref 31 14 8 9 TA 8 9 272025 CASAVA_Build 7 53798418 1I ACTTTTACAT -/C TTTAAGGAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 0 1 272026 CASAVA_Build 7 53804012 1I CTCTAGCTGC -/T TTTTTAAGCC 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 T 5 6 272027 CASAVA_Build 7 53809269 1I TAATCAGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 10 11 272028 CASAVA_Build 7 53819615 1D ATCCGAAAAT A/- AACAAGCCCA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 3 2 272029 CASAVA_Build 7 53824016 10D AGAGAGAGAG ATAGATAGAT/---------- AGATAGATAG 3070 het 3070 hom 40 17 14 11 ATAGATAGAT 1 0 272030 CASAVA_Build 7 53826233 2D TGTGCCATGT TG/-- GTTTGCTGCA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 TG 1 0 272031 CASAVA_Build 7 53833839 1I AATGTAAAGA -/C CCCCCCCACA 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 C 7 8 272032 CASAVA_Build 7 53860783 1I CCAAGAGTAG -/C TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 C 0 1 272033 CASAVA_Build 7 53860845 4D ATAAAGAAGA AAAG/---- AGAGAAGAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AAAG 1 0 272034 CASAVA_Build 7 53864703 2I TAACATGCTT --/AA GTCTGTAAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 2 272035 CASAVA_Build 7 53864888 1D TAGATGTACA T/- ACTGATTTTG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 1 0 272036 CASAVA_Build 7 53868485 1D TTTTGTCTCC T/- TCTGTCAAAC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 2 1 272037 CASAVA_Build 7 53871641 2I CAAAGAAAAC --/AT TGACTGAATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 0 1 272038 CASAVA_Build 7 53872076 1I TATATCAGGC -/T TTTCTTGAAT 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 3 4 272039 CASAVA_Build 7 53900696 2I AAAGTTTTTG --/GC ATTCTTTCCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 GC 0 1 272040 CASAVA_Build 7 53907381 5D AAAATTTATC AAGAA/----- AAGAAGAGAG 3070 het 3070 ref 42 23 15 7 AAGAA 2 1 272041 CASAVA_Build 7 53920721 1D TGTTCATACT A/- AAAGTAGAAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 A 4 3 272042 CASAVA_Build 7 53921737 2I GATGTCAAAC --/CT CTCCTTTCAG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 CT 1 2 272043 CASAVA_Build 7 53929227 5I TTGACATATA -----/TTACT TTATTGTGCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTACT 0 1 272044 CASAVA_Build 7 53933934 3I7M4D TGTCTAGCTG ---AAACTTTGTAC/AAAAAAGTTT---- CATGTCACCA 3070 hom 96 het 36 0 33 6 N/A 0 0 272045 CASAVA_Build 7 53936959 2D GGATATGTTA AG/-- AGTCACAACA 3070 hom 126 het 51 0 43 9 AG 2 1 272046 CASAVA_Build 7 53937258 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 38 0 27 12 TA 8 7 272047 CASAVA_Build 7 53937827 4D ATTTACCCTC CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 129 het 55 0 44 11 CAAA 5 4 272048 CASAVA_Build 7 53950195 1D AGACACAGAC A/- TCAAAAAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 5 A 1 0 272049 CASAVA_Build 7 53955978 1D TTATTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 609 hom 20 2 15 3 A 12 11 272050 CASAVA_Build 7 53959180 1D GGCACTAAAC T/- TTCAAGTCTA 3070 het 3070 hom 52 23 25 4 T 3 2 272051 CASAVA_Build 7 53963317 2I TTATTGAGAT --/AC AGTTTGACTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AC 0 1 272052 CASAVA_Build 7 53973332 4I TCAGGAGTTT ----/AACC AGATTAATGA 3070 hom 87 het 42 0 29 13 AACC 0 1 272053 CASAVA_Build 7 53973362 1I TAACAAAACC -/A AAAAAAAAAA 2939 het 675 hom 32 2 9 21 A 13 14 272054 CASAVA_Build 7 53973531 1D TAGAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2983 hom 30 11 15 4 A 12 11 272055 CASAVA_Build 7 53976134 1I GATTGTCTTT -/C CCCAAATCAA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 C 3 4 272056 CASAVA_Build 7 53981677 5I AATACACTTG -----/GATCA GATGATAAAA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 GATCA 0 1 272057 CASAVA_Build 7 53984635 2I GAAGTGAACT --/AA GTTTTTCTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 0 2 272058 CASAVA_Build 7 53991588 4D GACCATTTCC AAGT/---- TGATCAAGTA 3070 hom 99 het 34 0 34 2 AAGT 1 0 272059 CASAVA_Build 7 54003253 1I TTCGTTACAG -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 6 7 272060 CASAVA_Build 7 54005037 2I TGTTACCATA --/GG GGGGCATTTT 2661 het 2038 hom 17 8 7 2 G 4 6 272061 CASAVA_Build 7 54009388 1I TACACATCAA -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 7 8 272062 CASAVA_Build 7 54013785 1I TTATAAATTG -/T TAATATGCTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 1 2 272063 CASAVA_Build 7 54052124 2I ATTTTTACTC --/TT AAGTTGACAG 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 0 2 272064 CASAVA_Build 7 54052947 1D ATGATGTTTA G/- GTCTAGAGTT 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 G 2 1 272065 CASAVA_Build 7 54056654 8I ATATTAGTCC --------/AGGATATT AGATATAGAT 3070 het 3070 ref 28 18 7 3 AGGATATT 0 1 272066 CASAVA_Build 7 54057782 1D TCCCTAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 11 10 272067 CASAVA_Build 7 54063583 1I TTTTAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 638 hom 26 2 16 9 T 14 15 272068 CASAVA_Build 7 54063754 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 14 9 4 1 T 11 12 272069 CASAVA_Build 7 54104290 11D GTAACAAAGG CTACCATTCAT/----------- GTACCCCCAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 5 CTACCATTCAT 1 0 272070 CASAVA_Build 7 54120729 1D ACTCCCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 708 hom 25 2 17 6 A 16 15 272071 CASAVA_Build 7 54127407 1D GGTAATTGAA C/- ATTTTGAGCT 3070 hom 144 het 50 0 49 1 C 1 0 272072 CASAVA_Build 7 54129348 2D ACTCATCTTA TC/-- AATTTCAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 TC 1 0 272073 CASAVA_Build 7 54131360 14I CTGCTCAGTC --------------/AGTAGTCAGTGACT ACTGACTCTG 3070 hom 99 het 35 0 31 5 AGTAGTCAGTGACT 0 1 272074 CASAVA_Build 7 54131825 2D CTTTCCACTC TT/-- TTCTTTATTG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 T 4 2 272075 CASAVA_Build 7 54133913 2D ACCAAGACTG TT/-- TATCAGAGAG 3070 hom 96 het 37 0 32 6 T 3 1 272076 CASAVA_Build 7 54135275 3I ATCTCTTGAG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 10 13 272077 CASAVA_Build 7 54135550 1I TATTTTTTTT -/A AAAAAAGGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 7 272078 CASAVA_Build 7 54136440 4D TTATCTGTCG TTAT/---- TTATGAACAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TTAT 2 1 272079 CASAVA_Build 7 54138545 1I TTTGATTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 41 2 33 6 A 11 12 272080 CASAVA_Build 7 54170757 1I CCCCCTCCCC -/G CCACCCCACA 2935 hom 21 het 8 0 8 0 G 0 1 272081 CASAVA_Build 7 54179581 10D ATGCATACAC TCCATGGGAT/---------- CACAGCCCAA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TCCATGGGAT 1 0 272082 CASAVA_Build 7 54182843 1D TGGGAAGAAA G/- GCTGTTTAGG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 2 1 272083 CASAVA_Build 7 54189926 1I AGGGAACTCA -/T TTATACAGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 2 3 272084 CASAVA_Build 7 54193031 1D GTGGGGAACT C/- CCCATATTAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 4 3 272085 CASAVA_Build 7 54196175 3I AGTTGCTGGG ---/GTA GTAGCATGGT 3070 hom 119 het 42 0 39 3 GTA 1 2 272086 CASAVA_Build 7 54202080 1I TGCACATCAT -/G GGGGGGTCAG 3070 hom 93 het 37 0 30 7 G 6 7 272087 CASAVA_Build 7 54202686 1D AAAAGAACAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 9 8 272088 CASAVA_Build 7 54205601 1D ACTAATTATG T/- TTGTTAAATT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 T 3 2 272089 CASAVA_Build 7 54210792 4I GCGTAACTCA ----/CTCT ATTAGTTAGG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CT 0 2 272090 CASAVA_Build 7 54217871 1I GGAGTCCAAG -/T CACGGGGGAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 0 1 272091 CASAVA_Build 7 54218621 2D13M2I ACTACAAGTG GAGACTAGAAGTTGG--/--GACTAGAAGTTGGTT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 33 0 32 3 N/A 0 0 272092 CASAVA_Build 7 54220524 36D TCAGAAAATG TTTTCTGAATACCTTGTTTAAGAAGTTCTTCTTGTT/------------------------------------ TTAGAGTTTT 3070 hom 105 het 32 0 36 2 TTTTCTGAATACCTTGTTTAAGAAGTTCTTCTTGTT 1 0 272093 CASAVA_Build 7 54222532 1I TCCAGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2561 hom 27 het 36 0 9 27 A 10 11 272094 CASAVA_Build 7 54228054 1I TCAAAACACA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 76 het 30 0 26 4 T 7 8 272095 CASAVA_Build 7 54232527 1I ATTTAGAGTA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 7 8 272096 CASAVA_Build 7 54234735 3I TCCTATAAAG ---/TAT TATTAATATT 3070 hom 77 het 28 0 26 2 TAT 1 2 272097 CASAVA_Build 7 54235457 1I ACTAAACATT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 7 8 272098 CASAVA_Build 7 54237774 1D ATTTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 11 10 272099 CASAVA_Build 7 54252467 1D GCAAATAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 8 7 272100 CASAVA_Build 7 54270411 6I TGGAAGTTGA ------/ACTATT ACTGTTTGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ACTATT 0 1 272101 CASAVA_Build 7 54272566 1D CAATTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 30 0 23 7 T 12 11 272102 CASAVA_Build 7 54272963 1D CAACCTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 106 hom 42 1 37 5 A 10 9 272103 CASAVA_Build 7 54273435 3D ATACACAATG ACA/--- ACAAGAAACT 3070 hom 99 het 36 0 33 6 ACA 2 1 272104 CASAVA_Build 7 54277029 2I AAACACAGCA --/AT CTGTATTTTC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AT 0 1 272105 CASAVA_Build 7 54278797 1D CTATTGCATA T/- TTTTTCTATT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 6 5 272106 CASAVA_Build 7 54279800 1D AAATGACATG A/- GTCAAGCTAT 3070 hom 117 het 40 0 40 0 A 1 0 272107 CASAVA_Build 7 54281455 1I AATAGCCTTT -/G TCTTCACTTG 3070 hom 75 het 27 0 24 3 G 0 1 272108 CASAVA_Build 7 54281729 1D CACAGAATTA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 9 8 272109 CASAVA_Build 7 54285781 4I AAAAGTAGAC ----/AGAA AGAACCCAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AGAA 1 2 272110 CASAVA_Build 7 54287578 1I TGGCAACTGG -/T TTTTTTTTTT 1013 het 1013 ref 39 24 4 11 T 13 14 272111 CASAVA_Build 7 54294088 1D TATAAAGCAC A/- AAAAAATAAT 3070 hom 99 het 41 0 33 9 A 7 6 272112 CASAVA_Build 7 54295687 1D GAAAATAAAC A/- CATTTTCTAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 1 0 272113 CASAVA_Build 7 54298290 1I GTCATCCAAA -/C ACCTCCCAAC 3070 hom 111 het 40 0 36 4 C 0 1 272114 CASAVA_Build 7 54299640 2I CAAACAAAAC --/AA AAAACAAAAC 3070 het 14 hom 21 1 18 2 A 4 6 272115 CASAVA_Build 7 54299973 6I TTAAAAAATC ------/ATTGTA ATTGTAGCTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ATTGTA 1 2 272116 CASAVA_Build 7 54302483 4I TCAAACATGA ----/TTCT TTCTACTGGA 3070 hom 116 het 45 0 35 10 TTCT 1 2 272117 CASAVA_Build 7 54304909 1I ACATTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 T 11 12 272118 CASAVA_Build 7 54324301 1I ACTCAACAGC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 6 7 272119 CASAVA_Build 7 54327954 1D CGTTCTAATC T/- TTCTGCCTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 2 272120 CASAVA_Build 7 54331887 4I AAATTATAAT ----/TGAC TGAGATCCCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TGAC 0 1 272121 CASAVA_Build 7 54339181 1I AAAAGGCTAC -/A TACTGTATAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 0 1 272122 CASAVA_Build 7 54360532 2D AATGTGAGGG AA/-- AAGAGTCAAG 3070 hom 93 het 38 0 32 7 A 4 2 272123 CASAVA_Build 7 54366715 4D CATTTGAACC AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 33 22 11 2 AACA 3 2 272124 CASAVA_Build 7 54367029 2D TTGTTAATAC AA/-- ATAGTTTGTG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 3 1 272125 CASAVA_Build 7 54370683 1D AAGTTCATCA G/- GGGGCATGTA 3070 hom 113 het 45 0 38 7 G 5 4 272126 CASAVA_Build 7 54373181 3D AGCTTTTCAC TTG/--- TTGTTAGGAT 3070 hom 78 het 29 0 26 4 TTG 2 1 272127 CASAVA_Build 7 54377893 1I ACACATTCAT -/A AAACAATGTT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 3 4 272128 CASAVA_Build 7 54378339 1I ATTCCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 172 hom 29 1 26 2 A 11 12 272129 CASAVA_Build 7 54379974 1D CAGTTCAACA G/- CTTTAGCAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 G 1 0 272130 CASAVA_Build 7 54382031 2D TAAACAACAC TT/-- CCTCTAGCAA 3070 hom 60 het 35 0 21 14 T 2 0 272131 CASAVA_Build 7 54382063 4I TTGGCTTCTC ----/TTAG TTAGGGCTTT 3070 hom 36 het 27 0 13 14 TTAG 1 2 272132 CASAVA_Build 7 54383069 4I70M12D46M4D TCTCTCTATC ----TCTATCTGTCTCTGTGTCTATTTGTCTATCTATATCTGTCTCTCTATCTCTATCTGTGTCTGTCTATCTATATCTATCTATCTATCTATCTCTATCTGTCTGTGTATCTGTCTGTGTCTCATTGTCTGTCTA/TCTATCTATCTGTCTCTGTGTCTATTTGTCTATCTATATCTGTCTCTCTATCTCTATCTGTGTCTATCTATCTA------------TATCTATCTCTATCTGTCTGTCTATCTGTCTGTGTCTCATTGTCTG---- TCTATCTATT 3070 het 136 hom 34 2 39 26 N/A 0 0 272133 CASAVA_Build 7 54383312 4I TCTATCTATC ----/TCTA TCTATCTGTC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 TCTA 1 2 272134 CASAVA_Build 7 54383360 4D TCTCTCTATT TCTA/---- TCTATCTATC 3070 hom 45 het 28 0 15 13 TCTA 6 5 272135 CASAVA_Build 7 54383733 1D TCTATTTCAA G/- GGCTATAGTG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 3 2 272136 CASAVA_Build 7 54385691 1D CTAAATATTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 10 9 272137 CASAVA_Build 7 54386146 1I GACTGACTAA -/T TGCCCCCATC 3070 hom 80 het 33 0 27 6 T 1 2 272138 CASAVA_Build 7 54393495 1D ATTTGTGACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 9 8 272139 CASAVA_Build 7 54397696 1I GCACTCCCCG -/C CTGAGGTGCT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 1 2 272140 CASAVA_Build 7 54399474 1D TTGTTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 11 10 272141 CASAVA_Build 7 54405568 1D AACTTATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 18 1 11 8 A 14 13 272142 CASAVA_Build 7 54408048 1I TAAATTTTTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 55 het 27 0 19 8 A 8 9 272143 CASAVA_Build 7 54411463 1D CTATTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 567 hom 26 2 18 6 A 15 14 272144 CASAVA_Build 7 54420377 4I ATAGCTAAAA ----/TAAT TAATAACACA 3070 hom 135 het 55 0 46 9 TAAT 1 2 272145 CASAVA_Build 7 54425149 1I AATTTACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 10 272146 CASAVA_Build 7 54433800 1D ATCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1882 het 1882 ref 28 19 4 5 A 13 12 272147 CASAVA_Build 7 54439098 1D TCAGCATCTG T/- TTTTTTTTTT 2166 het 2166 ref 46 31 7 8 T 12 11 272148 CASAVA_Build 7 54445554 1I TCCCATTACC -/T GAAGAACCAG 3070 hom 126 het 47 0 38 9 T 0 1 272149 CASAVA_Build 7 54464897 1I AATCAGAGGT -/A AATATCTCTT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 A 2 3 272150 CASAVA_Build 7 54468209 1I ATAAGCATAT -/A AAAATGTGTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 4 5 272151 CASAVA_Build 7 54471083 1D AAAAAAAAAA T/- ATAGAGATTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 1 0 272152 CASAVA_Build 7 54474023 1D AAAAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 757 hom 31 2 25 5 A 13 12 272153 CASAVA_Build 7 54492703 1D ACTTTGGAAC T/- TTCATAGAGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 3 2 272154 CASAVA_Build 7 54494552 1I TCTTGTGCTA -/T GCTAACCAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 1 272155 CASAVA_Build 7 54495804 1D TATATTCTCA T/- TTAAAAAATA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 3 2 272156 CASAVA_Build 7 54497577 3D AAGAAAAAAA GAT/--- GATCATTTGG 3070 hom 114 het 44 0 39 6 GAT 2 1 272157 CASAVA_Build 7 54497743 1D ACTCAAGGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 122 het 48 0 41 8 A 9 8 272158 CASAVA_Build 7 54504238 2I TTAGGCAAAA --/AG AGAGAAATTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AG 2 3 272159 CASAVA_Build 7 54504550 1I AGACTAATTT -/G GGGAAAAATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 3 4 272160 CASAVA_Build 7 54507434 20D AGAGAGCAAT CTGGCCATTTGCAGGGAGCA/-------------------- CTGGCCATTT 3070 hom 66 het 30 0 22 14 CTGGCCATTTGCAGGGAGCA 1 0 272161 CASAVA_Build 7 54507696 1D ATTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 27 0 24 3 T 11 10 272162 CASAVA_Build 7 54509016 1I AACTTAATAT -/G GGGAGATGCC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 3 4 272163 CASAVA_Build 7 54509593 1D ATATATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 3 A 11 10 272164 CASAVA_Build 7 54517689 1D GCACTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 13 12 272165 CASAVA_Build 7 54521019 1D AAATAAAATT A/- ATGGCCTGAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 1 272166 CASAVA_Build 7 54521696 1D GAAAGTAGAC A/- AAAAAACAGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 6 272167 CASAVA_Build 7 54523050 1I CTGGGATTAC -/A AGGTGCTCAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 1 2 272168 CASAVA_Build 7 54524788 5I TCATAAAGAT -----/TAATC TAATAAGATC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TAATC 0 1 272169 CASAVA_Build 7 54526374 3D ACTCTCATTT AAG/--- AATGGCAAGT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 AAG 1 0 272170 CASAVA_Build 7 54529317 2D ACTAGAAATT AA/-- AAGTGAAAAA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 4 2 272171 CASAVA_Build 7 54530170 1I ATGCTTCTTT -/C CAATTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 C 1 2 272172 CASAVA_Build 7 54530411 1I ACGTCAAGTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 8 9 272173 CASAVA_Build 7 54533677 1D GATAATTTGC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 62 het 25 0 21 5 T 8 7 272174 CASAVA_Build 7 54540203 4I TTTCTATAAC ----/TCTT TCATATAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TCTT 0 1 272175 CASAVA_Build 7 54541734 2I TTACTCCATC --/TT TTTTTTTGGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 7 9 272176 CASAVA_Build 7 54541830 1D GTATTAGTAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 9 8 272177 CASAVA_Build 7 54542821 1D AAGACAGATG C/- CTTTTCAGCT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 C 2 1 272178 CASAVA_Build 7 54551382 5D TATCAATGAA ATTAT/----- ATTATAGTAC 3070 hom 90 het 34 0 31 5 ATTAT 2 1 272179 CASAVA_Build 7 54555339 1I GTGACAAACT -/C CTTCAGCTTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 C 1 2 272180 CASAVA_Build 7 54559729 1D TCAGTTACCA G/- GGTGGGTGGG 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 3 2 272181 CASAVA_Build 7 54563039 1D CCCTAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 33 1 21 11 T 15 14 272182 CASAVA_Build 7 54566741 1D TTTGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 33 1 30 2 T 12 11 272183 CASAVA_Build 7 54567942 1D ACCGACCATC A/- TTTATAGAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 0 272184 CASAVA_Build 7 54569951 1D TGTGTGAGAG A/- GAGAGGAGAG 2268 hom 30 het 19 0 10 9 A 1 0 272185 CASAVA_Build 7 54570332 1I GAGACATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 25 6 A 9 10 272186 CASAVA_Build 7 54572991 2D TTAATGAGAA AC/-- ACATATATTG 3070 hom 51 het 23 0 17 7 AC 2 1 272187 CASAVA_Build 7 54575571 1I ATCTTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1114 hom 32 3 21 8 T 10 11 272188 CASAVA_Build 7 54582193 1I GCGTGAGTGC -/G GGGGCGCGCC 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 4 5 272189 CASAVA_Build 7 54600053 1I GTTCAAAATA -/T TGTTATATCG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 1 2 272190 CASAVA_Build 7 54600254 35D TGAAAAGATG AGTATACATTCAAATGATAGCTGCACATCTCAATT/----------------------------------- TAACAAATGT 3070 hom 129 het 36 0 44 1 AGTATACATTCAAATGATAGCTGCACATCTCAATT 1 0 272191 CASAVA_Build 7 54637993 1I TGCTTCCTCA -/C CCCCCCTCCC 3070 hom 71 het 26 0 24 2 C 6 7 272192 CASAVA_Build 7 54644793 2D AAGCTTGTTT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 34 16 11 9 CA 10 9 272193 CASAVA_Build 7 54646967 5D CTGAAAATGT CTTTA/----- CTTTACTCCA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 CTTTA 2 1 272194 CASAVA_Build 7 54649362 2I46M1D ATAAAAAAAA --AAATATATATATATACACATTTAAAAAATAAAGTGGGCAGGTTAGTA/ATATATATATATATATACACATTTAAAAAATAAAGTGGGCAGGTTAGT- AAAAAAAAAT 3070 het 33 hom 23 1 38 3 N/A 0 0 272195 CASAVA_Build 7 54657075 1D GAGACCAATA T/- TTTTCCAAAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 5 4 272196 CASAVA_Build 7 54662252 4I AAGCATGAGG ----/GAGA GAGAGAAAGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 GA 3 5 272197 CASAVA_Build 7 54662973 1I CATGCAGCCT -/C CCCCCAATGC 3070 hom 78 het 28 0 25 3 C 5 6 272198 CASAVA_Build 7 54664097 1I CCTAGCAATT -/A TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 0 1 272199 CASAVA_Build 7 54664275 1D TAAAAGACAG A/- AAAAAATTAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 7 6 272200 CASAVA_Build 7 54666741 1I TTGCCTAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 9 10 272201 CASAVA_Build 7 54666838 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 10 11 272202 CASAVA_Build 7 54666967 1D TATACCTAAG C/- CACTTTCATA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 2 1 272203 CASAVA_Build 7 54668010 2D TCTTGTGCTC AG/-- AGTTTCACAA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 AG 2 1 272204 CASAVA_Build 7 54669092 1D60M1D GGCAGAAGTT GCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACGCCACTCCAACCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCA/-CAGTGAGCCAAGATTGTGCCACGCCACTCCAACCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTC- AAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 15 1 16 13 N/A 0 0 272205 CASAVA_Build 7 54670212 2D ATTTTGCATT TA/-- TGTTTATTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TA 1 0 272206 CASAVA_Build 7 54670630 1D TCAGTCCTCA T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 94 het 34 0 31 4 T 7 6 272207 CASAVA_Build 7 54671248 2I GGTCAAATAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 10 12 272208 CASAVA_Build 7 54671778 1D GGGCTTCCAG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 68 het 29 0 19 10 A 8 7 272209 CASAVA_Build 7 54673520 1I ACGGGAGGGA -/G GGTGACAATC 3070 hom 145 het 54 0 47 7 G 2 3 272210 CASAVA_Build 7 54683832 1I TGTCTCAAAA -/T AAAAAGAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 1 272211 CASAVA_Build 7 54692490 3I GGATTGAGAT ---/GAA GAAGAAGTAA 3070 hom 117 het 44 0 37 7 GAA 2 3 272212 CASAVA_Build 7 54696856 1I GTGATCTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 34 1 25 8 A 10 11 272213 CASAVA_Build 7 54702362 2I CTGCGGCCTT --/CC CCGCAGTGTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 2 4 272214 CASAVA_Build 7 54706003 2D TGTGCATGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 111 het 47 0 36 12 CA 10 9 272215 CASAVA_Build 7 54707063 1D ACCTTTTTGC A/- ATTCAAAGTG 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 2 1 272216 CASAVA_Build 7 54707290 1D AATGGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 113 het 45 0 36 9 T 12 11 272217 CASAVA_Build 7 54709976 1D GGATACAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 48 0 42 6 A 11 10 272218 CASAVA_Build 7 54716075 14D CGCAGGCACT CTTTCTCCCTATTA/-------------- CTTTCTCCCT 3070 het 3070 hom 36 14 15 11 CTTTCTCCCTATTA 2 1 272219 CASAVA_Build 7 54722186 1D TTTGGGTGTG A/- AAAAAGTCAA 3070 hom 81 het 39 0 28 11 A 6 5 272220 CASAVA_Build 7 54728774 6D TGAGGCTATT TATGTC/------ TACCGCATTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TATGTC 1 0 272221 CASAVA_Build 7 54734279 2D GAAAGGAGAA AG/-- AGAGGTATTA 3070 hom 90 het 32 0 29 6 AG 3 2 272222 CASAVA_Build 7 54741405 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 943 hom 38 3 27 8 A 13 14 272223 CASAVA_Build 7 54760901 1D AAGGACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 29 2 17 10 A 15 14 272224 CASAVA_Build 7 54778856 1I GTCCATTGGC -/A ATAAGGAGGT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 1 2 272225 CASAVA_Build 7 54786549 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2841 hom 25 9 14 2 A 15 14 272226 CASAVA_Build 7 54795562 2D CCTTTTTCAC AA/-- TACCTTCTTC 3070 het 3070 ref 51 30 19 2 A 2 0 272227 CASAVA_Build 7 54799610 3D AGTACTATAT TAA/--- TAATAGGGAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 5 TAA 2 1 272228 CASAVA_Build 7 54799852 1D CAATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 9 T 11 10 272229 CASAVA_Build 7 54819486 1I CTGACACGGG -/C CCCTTCAAGG 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 C 3 4 272230 CASAVA_Build 7 54823582 1D CCTCCCCCCT C/- CCCCCACCCC 2464 het 935 hom 17 3 9 5 C 6 5 272231 CASAVA_Build 7 54824784 1D ATTTTTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 12 11 272232 CASAVA_Build 7 54825588 2D AAGTTCGTAC AT/-- ATATACCCAC 3070 het 3070 ref 52 23 23 6 AT 3 2 272233 CASAVA_Build 7 54834906 1I ACGCCTGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2575 hom 18 7 8 3 T 10 11 272234 CASAVA_Build 7 54843860 1D ATGGACATTG A/- TCACTTCCCC 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 1 0 272235 CASAVA_Build 7 54848512 1D AATTATTTAC A/- AAAAAAAAAA 2373 het 2373 ref 29 14 10 5 A 13 12 272236 CASAVA_Build 7 54849970 1I TTTAATTTTA -/T TTTTTTTTTA 2666 het 2666 ref 25 14 7 4 T 9 10 272237 CASAVA_Build 7 54852148 1I TTATCTTTTG -/T TTTTTTTTGT 2476 hom 11 het 17 0 5 12 T 8 9 272238 CASAVA_Build 7 54870371 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 T 11 10 272239 CASAVA_Build 7 54875900 1I GCTAAAAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 9 10 272240 CASAVA_Build 7 54877899 1I CAGGAGAAAT -/G GTGCTTTCTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 G 1 2 272241 CASAVA_Build 7 54886429 1D GTAGCTTGAT G/- GGAATAGCAT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 G 3 2 272242 CASAVA_Build 7 54901234 12D AATCTGTAGA GAGCAGGCTGGT/------------ GATTCTTACC 196 het 196 ref 32 21 2 13 GAGCAGGCTGGT 1 0 272243 CASAVA_Build 7 54901626 3I AATAATTCCC ---/AGA AGAAAATATC 3070 het 3070 ref 23 9 11 3 AGA 1 2 272244 CASAVA_Build 7 54912719 1D AGAGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 9 9 T 11 10 272245 CASAVA_Build 7 54912975 1D TATTCCATTG T/- TTTTGATGAT 3070 het 3070 hom 43 14 21 9 T 5 4 272246 CASAVA_Build 7 54925356 1I TTATTTTTAA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 6 7 272247 CASAVA_Build 7 54930220 1I AGGGTAATTC -/T TTTTTTTTTT 1691 het 1691 ref 26 10 6 10 T 12 13 272248 CASAVA_Build 7 54943664 1I GATGAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 9 10 272249 CASAVA_Build 7 54963624 8D GAATGGCATG ACATACTT/-------- ACATACTTAA 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 ACATACTT 2 1 272250 CASAVA_Build 7 54970331 1I TAAATAGTTG -/A AAAATCCAAA 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 A 4 5 272251 CASAVA_Build 7 54978057 1D TAAATGTAAG A/- AAAACATCAG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 5 4 272252 CASAVA_Build 7 55008202 4I GCAGAATAAA ----/TTTT TGAAGAGCAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 1 5 272253 CASAVA_Build 7 55009698 1D CTCTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2930 het 2197 hom 30 9 10 12 A 17 16 272254 CASAVA_Build 7 55020907 1I GGCCGAGCTC -/T TCCTATTCAG 3070 het 3070 hom 50 22 23 5 T 1 2 272255 CASAVA_Build 7 55028174 1I AAAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 A 11 12 272256 CASAVA_Build 7 55033064 1D TGCTAAGATT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 9 8 272257 CASAVA_Build 7 55037185 2D GGTACAGAAA AT/-- ATATTGTAAA 3070 het 3070 hom 38 17 20 3 AT 3 2 272258 CASAVA_Build 7 55042984 1D ATTCCTTGTG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 A 8 7 272259 CASAVA_Build 7 55043610 2D TATATGAGAT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 37 21 9 8 GA 6 5 272260 CASAVA_Build 7 55050776 1D TGCAAGAGAT G/- GGTCTCAACT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 3 2 272261 CASAVA_Build 7 55066706 2I TGGTGTCAGG --/GA GAGAGAGTTG 3070 het 3070 ref 52 25 18 9 GA 3 4 272262 CASAVA_Build 7 55086691 1D CTTCTGCCGT G/- GGGTGACACA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 4 3 272263 CASAVA_Build 7 55099213 1D ACATAATAGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 25 10 11 6 T 8 7 272264 CASAVA_Build 7 55101637 1I GAATTCCTCC -/T GGCCAGGGCT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 0 1 272265 CASAVA_Build 7 55103261 2D GTGTGCATAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 60 26 25 9 GT 6 5 272266 CASAVA_Build 7 55107370 1D GCAAACTTAA T/- TTTAAATGTA 3070 het 3070 hom 55 24 24 7 T 4 3 272267 CASAVA_Build 7 55115556 1I ATTCAGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 13 14 272268 CASAVA_Build 7 55116908 1I TTTAGACTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 T 13 14 272269 CASAVA_Build 7 55117016 1I TCACAAAAAG -/C CAGCACAGGA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 C 1 2 272270 CASAVA_Build 7 55121542 6D GTTATTTTGC TCCCTT/------ TCCCTTTGAA 3070 het 3070 hom 42 11 26 7 TCCCTT 2 1 272271 CASAVA_Build 7 55127210 1I CTATCTCCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 442 hom 25 1 20 4 A 9 10 272272 CASAVA_Build 7 55151724 2D AAAAACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 694 hom 28 4 14 12 AC 10 9 272273 CASAVA_Build 7 55165252 14D ATATGATGGG TGAAGCTGAAAACA/-------------- TTTACTCTCT 3070 het 3070 ref 55 34 19 6 TGAAGCTGAAAACA 1 0 272274 CASAVA_Build 7 55171082 1D TTTTTGTAAA T/- TTTTTACAGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 6 5 272275 CASAVA_Build 7 55187398 1D GCTGAATTGT G/- GGGGGGCTGT 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 G 7 6 272276 CASAVA_Build 7 55190105 1D TTCCGTATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 42 het 27 0 15 12 A 10 9 272277 CASAVA_Build 7 55222492 15I ATGGGTGCTA ---------------/TCTAAGTCAGTGCTG TCTCTACATA 3070 het 3070 hom 59 21 33 5 TCTAAGTCAGTGCTG 0 1 272278 CASAVA_Build 7 55224286 4D TCACACATAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 70 het 32 0 23 9 TG 10 8 272279 CASAVA_Build 7 55224613 4I AGTCATTCAA ----/TCAT TCATTCATTC 3070 hom 84 het 41 0 27 14 TCAT 3 4 272280 CASAVA_Build 7 55237170 2I ATCGCCTGGC --/AG CTTGTTAGAA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 AG 0 1 272281 CASAVA_Build 7 55238576 2D39M4I ACACATACAT ACAGACACACCACACACACGTACACACAACACACAACACAG----/--AGACACACCACACACACGTACACACAACACACAACACAGACAC ACACGTACAC 3070 het 3070 hom 71 27 30 46 N/A 0 0 272282 CASAVA_Build 7 55238909 9D ACACACGTAG ACACACCAC/--------- ACACACCACA 3070 het 3070 ref 52 29 17 8 ACACACCAC 2 1 272283 CASAVA_Build 7 55239687 2D ACAAAAACCC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 61 31 26 8 CA 6 5 272284 CASAVA_Build 7 55241086 1I GGTATATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3000 hom 38 9 12 17 A 13 14 272285 CASAVA_Build 7 55246960 1D GAGCCCCCCC T/- GTCGCTAACC 2973 het 2973 ref 23 12 9 2 T 1 0 272286 CASAVA_Build 7 55251631 1D ATCTCCAGAT G/- GGGGACATGA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 G 5 4 272287 CASAVA_Build 7 55260899 1I TTGTCTTGTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 52 het 35 1 30 4 T 8 9 272288 CASAVA_Build 7 55266343 1I CAGTCATTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 57 26 14 17 A 9 10 272289 CASAVA_Build 7 55267292 1D CCACTTGGCT C/- CCCTAGATTT 3070 het 3070 hom 49 19 19 11 C 4 3 272290 CASAVA_Build 7 55269866 7D ACCCAAGGTC CGCTGCT/------- CGCTGCTCGA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 CGCTGCT 2 1 272291 CASAVA_Build 7 55274633 1I AAAAACAAAG -/T TAACATTTAA 3070 het 3070 ref 54 28 17 9 T 1 2 272292 CASAVA_Build 7 55277135 1D GCCAAATTCG T/- AACAATCTGA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 1 0 272293 CASAVA_Build 7 55278170 1D CACTGATTCC A/- TTTCCTTTGG 3070 het 3070 hom 52 23 25 5 A 1 0 272294 CASAVA_Build 7 55292291 7I ACGTGTGATA -------/CTTCTAC CACCTGTGGT 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 CTTCTAC 0 1 272295 CASAVA_Build 7 55293400 2D TATAGATTTT AA/-- AAAATCATTT 2062 het 2062 ref 19 10 6 3 A 6 4 272296 CASAVA_Build 7 55293628 5D CATTGCATGT TTCTG/----- TTCTTACAGT 3070 het 3070 ref 29 15 14 2 TTCTG 1 0 272297 CASAVA_Build 7 55295518 3D GGAGCCTCCT CCG/--- CTGCTACTGC 3070 hom 67 het 33 0 21 12 CCG 1 0 272298 CASAVA_Build 7 55298667 1I GAAAAAAGAG -/A AAAAGACTCA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 4 5 272299 CASAVA_Build 7 55299356 1D TTTTTTTTTT C/- TTGAAATGGA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 C 1 0 272300 CASAVA_Build 7 55320707 1I ATTTATAGAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 8 9 272301 CASAVA_Build 7 55322294 1I CTAATAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2246 hom 22 7 10 5 A 13 14 272302 CASAVA_Build 7 55336615 1I GATCCTAGGG -/A AAAAAAGAGC 3070 hom 68 het 25 0 23 2 A 6 7 272303 CASAVA_Build 7 55339784 7I CTGGGTCATA -------/TGGTAAC TCCACAGGAA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TGGTAAC 0 1 272304 CASAVA_Build 7 55347425 2I TGGGGGGGTC --/AG CAAGGTAAGG 951 hom 10 het 5 0 4 1 AG 0 1 272305 CASAVA_Build 7 55355039 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 28 2 23 4 A 16 14 272306 CASAVA_Build 7 55356383 1D ATATGGACCT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 A 9 8 272307 CASAVA_Build 7 55357005 4D CAAGGAACTT AAAC/---- AAACGTATAA 3070 hom 32 het 14 0 10 7 AAAC 2 1 272308 CASAVA_Build 7 55359059 1D GGCTCACTGC A/- ACCTCTGCCT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 2 1 272309 CASAVA_Build 7 55364049 3I AATAAACATG ---/TTT GCTTATAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 4 T 0 3 272310 CASAVA_Build 7 55365981 12D ATCAATGCAA GCTGATCCACTT/------------ GTGAGTGATG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 GCTGATCCACTT 1 0 272311 CASAVA_Build 7 55367629 3D TAAAAGAACA TAT/--- TATAACATAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TAT 2 1 272312 CASAVA_Build 7 55368294 6I CTTGGAAAAC ------/ATTCTT ATTTGTAACT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ATTCTT 0 1 272313 CASAVA_Build 7 55369602 4D AGATTTACAG TCAT/---- TCATTAAACC 3070 hom 72 het 31 0 25 7 TCAT 2 1 272314 CASAVA_Build 7 55373223 16D CAGCACCTGA AAACATGGTGGCCTCC/---------------- ACCTCACTGT 3070 hom 129 het 42 0 43 4 AAACATGGTGGCCTCC 1 0 272315 CASAVA_Build 7 55374013 6D ACTCCGACTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 22 1 17 4 A 21 15 272316 CASAVA_Build 7 55374161 3I CTGCAGAGAT ---/TGG TGGTGTAGGC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TGG 1 2 272317 CASAVA_Build 7 55375459 3D TTAATTTTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 14 0 9 5 T 14 11 272318 CASAVA_Build 7 55378705 3I AGAGGATGAT ---/CTC ATCTTTCCAA 3070 hom 68 het 29 0 20 9 CTC 0 1 272319 CASAVA_Build 7 55384784 1I TGAGACAAGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 A 7 8 272320 CASAVA_Build 7 55393578 1I TAAGTCTCAT -/G GGGCCAAGTC 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 G 3 4 272321 CASAVA_Build 7 55393730 1D AGATCAGCCA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 7 6 272322 CASAVA_Build 7 55394283 1I CTACTACCTA -/G TTCCAGAACA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 0 1 272323 CASAVA_Build 7 55403976 4I GCAGATGTAA ----/TTAG TTAAGATGAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 TTAG 0 1 272324 CASAVA_Build 7 55407632 4D AATTGAAAGG CTAA/---- CTGAGGTTCT 3070 het 3070 ref 54 25 24 6 CTAA 1 0 272325 CASAVA_Build 7 55414344 5D CTCAAAAAAC ACAAA/----- ACAAAACAAA 2473 het 2473 ref 28 15 6 10 ACAAA 3 2 272326 CASAVA_Build 7 55415603 2D TACTGCATTG TT/-- TTTTTTTTTT 2526 het 2526 ref 21 12 7 2 T 14 12 272327 CASAVA_Build 7 55419028 2I CGTCTCTCTC --/TA TATATATATA 2700 het 2700 ref 25 13 7 5 TA 5 6 272328 CASAVA_Build 7 55425415 4D GAAAGCAAAA AGAG/---- AGAGAGAGTT 3070 het 3070 hom 37 19 18 1 AG 6 4 272329 CASAVA_Build 7 55426716 1D CCATTTTTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 10 9 272330 CASAVA_Build 7 55427737 2I39M3D GGAGTCTCAC --TGTTGCTGAGGTTGGTCTCAAATTCCTGGGCTCAAGCGATCC/TGTGTTGCTGAGGTTGGTCTCAAATTCCTGGGCTCAAGCGA--- TCCTGCTTCA 3070 het 3070 ref 23 15 8 6 N/A 0 0 272331 CASAVA_Build 7 55428749 1D ACCAAAAACC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 9 8 272332 CASAVA_Build 7 55431897 1D CATGATGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 137 het 50 0 46 4 T 11 10 272333 CASAVA_Build 7 55432700 3D CAGAGTAGGA TAT/--- TATTAGACAA 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 TAT 2 1 272334 CASAVA_Build 7 55440378 1D CAGGGGAGCC A/- AATCCCAGTC 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 A 3 2 272335 CASAVA_Build 7 55440678 2D GTTCAGGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 947 het 947 ref 28 13 5 11 T 20 18 272336 CASAVA_Build 7 55441094 1D TAGAGCCAGC A/- TGGGGAGCTG 3070 hom 87 het 31 0 29 4 A 1 0 272337 CASAVA_Build 7 55446135 3I AGGATGTCAT ---/GTG GTGGTGACAT 3070 hom 215 het 79 0 72 7 GTG 2 3 272338 CASAVA_Build 7 55452988 1D GCCTCAGCCT C/- CTGAGTAGCT 1882 het 614 hom 9 2 5 2 C 2 1 272339 CASAVA_Build 7 55453373 1I TACAATTGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 31 1 20 10 T 11 12 272340 CASAVA_Build 7 55453911 1D ACAATCATAG A/- AAAAAATATT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 7 6 272341 CASAVA_Build 7 55473085 1I CCTGTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1948 hom 26 7 9 10 T 13 14 272342 CASAVA_Build 7 55479731 1I AGGGCACAAA -/T TATCAGGAGG 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 T 1 2 272343 CASAVA_Build 7 55479903 1I GTAGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 20 1 15 4 T 13 14 272344 CASAVA_Build 7 55483506 1D CAAAATGAAA C/- AAAACACATG 3070 het 3070 hom 46 16 28 2 C 1 0 272345 CASAVA_Build 7 55483744 3D GGCAGTTGGC AGG/--- AGATCTCAGC 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 AGG 1 0 272346 CASAVA_Build 7 55485528 3I GCACTGGAAC ---/TTG TTGTGTAACC 3070 hom 84 het 32 0 27 5 TTG 1 2 272347 CASAVA_Build 7 55488241 2D ATGTAAACTC TG/-- TTGTCGAGTG 3070 het 3070 ref 45 19 18 9 TG 1 0 272348 CASAVA_Build 7 55492807 1I GTTGCCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 10 11 272349 CASAVA_Build 7 55494261 1I TTGTTGAGAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 9 10 272350 CASAVA_Build 7 55495262 5D6M2D CTATTTTCAT ATTAAATATTTAA/-----TTGTTT-- AAACATATTT 3070 hom 90 het 31 0 31 3 N/A 0 0 272351 CASAVA_Build 7 55516092 1I CTTGCAGTTT -/A AGAGAGACAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 1 2 272352 CASAVA_Build 7 55517670 8D ACCTGGCTAA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 1899 het 62 hom 14 2 8 4 T 22 14 272353 CASAVA_Build 7 55528455 1D CTGGCAAACT G/- GCAAACTCTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 G 2 1 272354 CASAVA_Build 7 55531500 1I AGGCTCCGGA -/G GCAAGGCCTG 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 1 2 272355 CASAVA_Build 7 55533632 2I GGCAGGTGAG --/CA GCACTCAGGT 3070 hom 60 het 21 0 17 4 CA 0 1 272356 CASAVA_Build 7 55541833 1D CACAAGCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 12 0 9 3 T 10 9 272357 CASAVA_Build 7 55563133 1D AGCATAAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 10 9 272358 CASAVA_Build 7 55574836 3I GGATCATCAG ---/CCC CCCCGCTGTG 3070 hom 99 het 38 0 32 6 C 4 7 272359 CASAVA_Build 7 55591824 1I GCTGTTGGAA -/C CCCCCCCCCA 3070 het 580 hom 28 2 20 6 C 9 10 272360 CASAVA_Build 7 55600952 10D GGGAGGACGC ACTAGTATAA/---------- ACTAGTATAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 ACTAGTATAA 2 1 272361 CASAVA_Build 7 55621232 4I AGCCCCCCCC ----/CCCG CCACAATGAA 1909 hom 49 het 21 0 10 11 CCCG 0 1 272362 CASAVA_Build 7 55623923 3D TCACTCTTAG GAA/--- GAAGGAGACT 3070 het 3070 ref 50 23 17 11 GAA 2 1 272363 CASAVA_Build 7 55627193 1D CTCAGCTGCA C/- CCCCCCTCTT 3070 hom 32 het 37 1 31 5 C 7 6 272364 CASAVA_Build 7 55630696 5D GCAAAAGATC AAAGA/----- AGAGAGTATG 3070 het 3070 hom 37 17 19 5 AAAGA 1 0 272365 CASAVA_Build 7 55645497 2I TTTTTGAAAC --/AT ATTTTCATTG 1717 het 1717 ref 37 31 4 2 AT 1 2 272366 CASAVA_Build 7 55646738 1I TTGACTTTTG -/C TCTTGGTGTA 1836 het 1836 ref 49 43 4 2 C 0 1 272367 CASAVA_Build 7 55664815 1D AATTTGGGAG A/- AAAAGCAACA 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 A 5 4 272368 CASAVA_Build 7 55666299 2I TGTTGCCTTA --/CT CTCATTAAGG 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 CT 1 2 272369 CASAVA_Build 7 55668932 1I ATCTTTAATC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 9 10 272370 CASAVA_Build 7 55671318 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 1635 het 178 hom 7 1 6 0 T 9 8 272371 CASAVA_Build 7 55672229 1D TCTTGTGGTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 17 9 9 A 9 8 272372 CASAVA_Build 7 55676941 2D CTTCTTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 1855 het 558 hom 39 7 7 25 T 20 18 272373 CASAVA_Build 7 55691073 1D AACTTAACTT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 8 7 272374 CASAVA_Build 7 55691576 2D GTTGAAACTC TG/-- TCTCTTTTAA 2453 het 1375 hom 10 4 5 2 TG 1 0 272375 CASAVA_Build 7 55691752 1I ATTTCGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 8 9 272376 CASAVA_Build 7 55701192 1D AATTTACAAG A/- AAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 30 13 11 7 A 7 6 272377 CASAVA_Build 7 55702913 5D CCAATGGAAC AGAAT/----- AGAGAACCCA 3070 het 3070 ref 23 15 8 4 AGAAT 1 0 272378 CASAVA_Build 7 55703212 1D GCTAAGACAT A/- AAAAAGACAG 3070 het 3070 hom 38 19 17 3 A 6 5 272379 CASAVA_Build 7 55712088 1D AGATCTTCTT A/- AAAAATCATG 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 6 5 272380 CASAVA_Build 7 55712318 3I CTTCAAAAGT ---/AAG AAGAATGACA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 AAG 1 2 272381 CASAVA_Build 7 55729036 1D GGAATTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 T 10 9 272382 CASAVA_Build 7 55733495 1I TTCTTTTCCT -/A AAGTCAACAT 2394 het 2394 ref 17 10 5 2 A 2 3 272383 CASAVA_Build 7 55738682 1D TAAAGAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 10 9 272384 CASAVA_Build 7 55744536 1I TTATATCTCA -/G TTGGGGGGGA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 G 0 1 272385 CASAVA_Build 7 55752310 1D TCTGTGGGGG A/- AAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 A 7 6 272386 CASAVA_Build 7 55754452 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3011 hom 30 het 12 0 9 3 A 13 14 272387 CASAVA_Build 7 55757980 1D AGAAAGAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 7 13 4 A 10 9 272388 CASAVA_Build 7 55759773 1D CCATGGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 16 9 A 12 11 272389 CASAVA_Build 7 55793319 1I CCCTGTGGTT -/G GGAGACTGCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 2 3 272390 CASAVA_Build 7 55837738 1I CCACATGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 9 10 272391 CASAVA_Build 7 55845409 1I AGAGATGCTA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 368 hom 35 1 29 5 T 7 8 272392 CASAVA_Build 7 55854932 1D GTCTACTGAG C/- CAGAGCCTAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 2 1 272393 CASAVA_Build 7 55859995 1I AAACAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 11 12 272394 CASAVA_Build 7 55876076 11D TTTGTTGTTG TTATTATTTAT/----------- TTATTATTTA 3070 hom 54 het 26 0 19 8 TTATTATTTAT 2 1 272395 CASAVA_Build 7 55880100 1I ACAAAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 32 1 23 9 T 13 14 272396 CASAVA_Build 7 55921555 1D AAAATAAAAC A/- AAAAAAACTA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 A 8 7 272397 CASAVA_Build 7 55923921 12I18M1D AATACATATA ------------CGTACATACATACATAGAT/CGTACATACATGCGTACATACATACATAGA- TTTTTTCATT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 N/A 0 0 272398 CASAVA_Build 7 55925638 2D CTCTGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 1343 het 182 hom 17 4 3 11 A 18 16 272399 CASAVA_Build 7 55931789 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 450 hom 24 1 18 5 TA 6 7 272400 CASAVA_Build 7 55955334 1I TCTTCACTAA -/T AAGGAACCAG 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 T 0 1 272401 CASAVA_Build 7 55982073 1D TATTTATAGC A/- GTGAGAAAAC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 1 0 272402 CASAVA_Build 7 56009455 5D CAAAAAAAAA GAAAG/----- AAAGAAAGAA 3070 hom 10 het 22 1 20 1 GAAAG 1 0 272403 CASAVA_Build 7 56012286 1D CAAATCTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 46 het 22 0 16 6 T 10 9 272404 CASAVA_Build 7 56019905 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2627 het 952 hom 19 5 8 9 A 18 17 272405 CASAVA_Build 7 56025419 1I GTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2863 hom 30 het 17 0 10 7 T 15 16 272406 CASAVA_Build 7 56036974 1D CTGGAGTGCA G/- TGGAACGATC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 1 0 272407 CASAVA_Build 7 56038851 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTCT 3070 hom 52 het 23 0 17 6 A 1 0 272408 CASAVA_Build 7 56048708 4I CTGTCTCAAA ----/AAAT AAATAAAACC 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 AAAT 1 2 272409 CASAVA_Build 7 56055813 1D CTCCGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2575 hom 28 9 14 5 A 13 12 272410 CASAVA_Build 7 56072361 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1616 het 1616 ref 31 15 6 10 A 17 16 272411 CASAVA_Build 7 56075566 4I AACATTATTC ----/ATTT ATTTATTTAC 3070 het 2131 hom 23 10 10 3 ATTT 2 3 272412 CASAVA_Build 7 56080099 1I CATCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 het 1603 hom 19 4 9 6 A 4 5 272413 CASAVA_Build 7 56107927 4D ATACACAAAT AAAC/---- AAACAAATAA 3070 het 2755 hom 26 8 18 1 AAAC 2 1 272414 CASAVA_Build 7 56125759 2I ATCCTGGTCC --/CT GCCTCTGGTG 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 CT 0 1 272415 CASAVA_Build 7 56131934 1I ATTGATGGCA -/G GGGGTGAACG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 4 5 272416 CASAVA_Build 7 56135666 1I TGAAACTCAG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 7 8 272417 CASAVA_Build 7 56141848 1D TTTAAAACCC G/- GAAGTTCCTG 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 G 2 1 272418 CASAVA_Build 7 56142046 2D TCTGAGCATT CA/-- GTTATAAGGG 3070 het 3070 hom 41 18 17 9 CA 1 0 272419 CASAVA_Build 7 56142630 1D TGTGAAATGC T/- TTTTTTTTTT 2077 het 346 hom 20 3 6 11 T 15 14 272420 CASAVA_Build 7 56145672 1D TATAAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 26 0 22 4 T 13 12 272421 CASAVA_Build 7 56147156 1D CTCAACAACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 9 8 272422 CASAVA_Build 7 56147713 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 10 272423 CASAVA_Build 7 56150813 4D TGGCTAATTT TATA/---- TATATATATA 2616 hom 15 het 6 0 6 0 TA 11 9 272424 CASAVA_Build 7 56164644 2D GTGGAGGAGT GA/-- GGGGCATGGG 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 GA 1 0 272425 CASAVA_Build 7 56173086 1D GTTGTGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 A 11 10 272426 CASAVA_Build 7 56175685 1I CTGCATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3026 het 3026 ref 33 11 10 12 T 12 13 272427 CASAVA_Build 7 56177422 3I CAGGTAACTC ---/ATG CATAAGACCT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 ATG 0 1 272428 CASAVA_Build 7 56188789 3D CCTGCCAGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 478 hom 34 6 12 16 T 14 11 272429 CASAVA_Build 7 56189388 1D GTTTCATTCA T/- TTTTTTTGCC 3070 het 1264 hom 28 5 15 8 T 8 7 272430 CASAVA_Build 7 56193215 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 T 11 10 272431 CASAVA_Build 7 56194959 1D ACTCAGAAAT C/- AGAGCTGTAG 3070 het 3070 hom 51 20 22 9 C 1 0 272432 CASAVA_Build 7 56197171 1I TCCCTGGCAA -/G GGCTCCACCC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 2 3 272433 CASAVA_Build 7 56208417 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTC 2408 het 1875 hom 15 5 7 3 T 9 10 272434 CASAVA_Build 7 56217642 25D TCTCACTCTA TCACCCAGGCTGGAGTCTCACTCTG/------------------------- TCACCCAGGC 3070 hom 56 het 18 0 14 11 TCACCCAGGCTGGAGTCTCACTCTG 1 0 272435 CASAVA_Build 7 56224707 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3 hom 35 1 25 11 T 9 8 272436 CASAVA_Build 7 56234410 1I AGCCATGATT -/A AAAATTGCCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 4 5 272437 CASAVA_Build 7 56234474 1D TAGTGAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 47 16 16 15 T 10 9 272438 CASAVA_Build 7 56235185 1I AGTTTCTTCC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 272439 CASAVA_Build 7 56237504 1D ACCTTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 799 hom 27 2 14 11 T 15 14 272440 CASAVA_Build 7 56244623 1D ACAGTGTCAC T/- AACACTGATT 3070 het 3070 hom 53 17 31 5 T 1 0 272441 CASAVA_Build 7 56255403 4I AGGAAAAGAG ----/AGAA AGAGAGAGCA 3070 het 3070 hom 61 28 26 7 AGAA 0 1 272442 CASAVA_Build 7 56256489 1D AGAAAACAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 20 5 C 1 0 272443 CASAVA_Build 7 56266788 2D TCGTTTATAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 22 3 10 9 A 14 12 272444 CASAVA_Build 7 56267492 1I TAAAATAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 11 12 272445 CASAVA_Build 7 56269659 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 7 6 272446 CASAVA_Build 7 56276404 1I TGTATTTTGG -/A AATAGCTCAA 3070 het 3070 hom 44 12 24 8 A 2 3 272447 CASAVA_Build 7 56276476 10D CAATTGAGCA TCTTTTTTTT/---------- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 TCTTTTTTTT 2 1 272448 CASAVA_Build 7 56283433 2I TGTGTTGGCG --/CA CACACCTGTA 3070 het 1546 hom 27 6 17 4 CA 2 3 272449 CASAVA_Build 7 56283847 1D TTGGTTGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 787 hom 19 3 12 4 A 13 12 272450 CASAVA_Build 7 56295558 12D CCCCATCAGC TTTGCAGAAACT/------------ TTTGCAGAAC 3070 het 3070 ref 33 19 15 2 TTTGCAGAAACT 1 0 272451 CASAVA_Build 7 56296131 2I AATTAGCTGG --/GT GTGGTGGTGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 GT 1 2 272452 CASAVA_Build 7 56303549 20D TCTTCCTTCC TCCTTCCTTCCTTCCTTCCA/-------------------- TCCTTCCTTC 3070 het 692 hom 22 6 10 13 TCCTTCCTTCCTTCCTTCCA 1 0 272453 CASAVA_Build 7 56307325 1I ACCAACATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 34 1 28 5 T 13 14 272454 CASAVA_Build 7 56308272 1I AAAATATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 628 hom 29 3 21 5 A 12 13 272455 CASAVA_Build 7 56310264 1D TCCTGTCTGT A/- AAAAAAAAAT 2907 het 942 hom 20 3 7 10 A 10 9 272456 CASAVA_Build 7 56310568 1D TAAATGAATC T/- TTTTTTTTTT 2876 het 1904 hom 27 8 9 10 T 15 14 272457 CASAVA_Build 7 56314861 2I ACTCTTTTTG --/CC CAGGCTGGAG 3070 hom 36 het 17 0 13 4 C 1 3 272458 CASAVA_Build 7 56316346 1I AAAATATTGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 8 9 272459 CASAVA_Build 7 56328321 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 718 het 718 ref 15 9 3 3 A 15 14 272460 CASAVA_Build 7 56331429 1D CTCATCTCTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 9 8 272461 CASAVA_Build 7 56333178 1D TTCTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 1249 het 1249 ref 32 22 5 5 T 13 12 272462 CASAVA_Build 7 56337883 1I TCTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 10 11 272463 CASAVA_Build 7 56337957 1D TTACTGCGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 T 11 10 272464 CASAVA_Build 7 56350694 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2697 hom 36 14 12 10 T 15 13 272465 CASAVA_Build 7 56356978 3I TAGATATAAT ---/AAG AAGTATGGCA 1303 het 1303 ref 45 41 3 1 AAG 1 2 272466 CASAVA_Build 7 56378315 1I AAAATTAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 8 9 272467 CASAVA_Build 7 56438401 2D GGAGGATCCC CT/-- GAGGCCAGGA 3070 het 2924 hom 23 8 14 2 CT 1 0 272468 CASAVA_Build 7 56447775 5I AAATAAAATG -----/GAAAA GAAGAGTAAA 3070 het 3070 ref 39 25 8 6 GAAAA 0 1 272469 CASAVA_Build 7 56451736 1D CTAAGACATC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 10 9 272470 CASAVA_Build 7 56455983 1D ACAACCCAAA G/- GTCCATAACT 1740 het 1740 ref 40 33 4 3 G 2 1 272471 CASAVA_Build 7 56458114 2I GGAAAAGTAT --/TA TGAGATACAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 0 1 272472 CASAVA_Build 7 56459131 3I TCTGTCCTCT ---/ATA ATAGATTCCT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 ATA 1 2 272473 CASAVA_Build 7 56474599 2D ACCTGTAAAG AC/-- ACACACAGTT 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 AC 4 3 272474 CASAVA_Build 7 56479134 1D ATAAAGAGTG T/- TAAGTGGATT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 2 1 272475 CASAVA_Build 7 56499698 1I GAGTCGTGTA -/T TTTTTTTTTT 2068 het 772 hom 21 3 9 9 T 15 16 272476 CASAVA_Build 7 56515712 1I TGTTAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 A 10 11 272477 CASAVA_Build 7 56526591 2D6M1D GGATGGTCAC TGTTGTGCA/--TTGTGC- GAGACAGCAG 1949 het 1949 ref 50 44 5 13 N/A 0 0 272478 CASAVA_Build 7 56526652 1D ATGGAAATGG C/- CACTGAGAAG 2875 het 2875 ref 54 38 9 7 C 2 1 272479 CASAVA_Build 7 56530292 2I TGCATGTTCA --/CT GAGGACATCT 3070 het 3070 ref 55 40 11 5 CT 0 1 272480 CASAVA_Build 7 56530425 5I13M1I CAGATACTTC -----ATTTCCAAAGCCA-/TCTTTATTTCCAAAGCCAG GGAAAGTCAT 3070 het 3070 ref 68 57 12 8 N/A 0 0 272481 CASAVA_Build 7 56533488 2D GATTGTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2157 hom 31 8 14 10 T 14 12 272482 CASAVA_Build 7 56539260 2I ATTTTAAAAA --/AT ATATTACTAA 3070 het 3070 hom 33 8 20 5 AT 2 3 272483 CASAVA_Build 7 56539449 4D ACAAAGTGAA AATT/---- AATTAGAGAC 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 AATT 2 1 272484 CASAVA_Build 7 56541051 2D GAGAACTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 A 14 12 272485 CASAVA_Build 7 56554248 3D TAGAAGACAG TTT/--- TTTTTTCCTT 3070 het 2414 hom 24 6 14 4 T 9 6 272486 CASAVA_Build 7 56554535 1I CGGAAGACAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 410 hom 12 1 8 3 T 8 9 272487 CASAVA_Build 7 56560258 1I TTTAATATTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 1168 hom 16 3 12 1 T 8 9 272488 CASAVA_Build 7 56565528 3I TTTGTGTATA ---/TTG TTGACACACT 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 TTG 1 2 272489 CASAVA_Build 7 56571183 1D TAACCACCAG A/- AACTCATAGA 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 A 3 2 272490 CASAVA_Build 7 56580154 5I CCCATAGACT -----/TAAAG TAAAGTGATG 3070 het 3070 ref 44 21 21 2 TAAAG 1 2 272491 CASAVA_Build 7 56582943 5D TAGGCAACAC AAGAA/----- AATACAAGTA 3070 het 3070 ref 46 25 19 5 AAGAA 1 0 272492 CASAVA_Build 7 56584702 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2335 het 2335 ref 23 10 7 6 A 11 12 272493 CASAVA_Build 7 56586323 3D CATGTGTATT TTA/--- TTTTTTTTCT 3070 het 1875 hom 13 4 9 0 TTA 1 0 272494 CASAVA_Build 7 56588432 1I CACAGAAGCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 8 9 272495 CASAVA_Build 7 56597167 1D CTTTTTTTTT C/- ATGTTGGTGT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 C 1 0 272496 CASAVA_Build 7 56598181 1I TTTTCATCTC -/T TTTTGACACA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 4 5 272497 CASAVA_Build 7 56598503 1D TTTCAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 11 10 272498 CASAVA_Build 7 56600804 1D GACAAAAATG A/- AAAAAATTCT 2999 het 2999 ref 21 14 7 0 A 7 6 272499 CASAVA_Build 7 56601938 1D CGACCGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 11 10 272500 CASAVA_Build 7 56602687 1D CCTAGAAGTC T/- TAATGGCTTT 3070 hom 132 het 48 0 44 4 T 2 1 272501 CASAVA_Build 7 56606439 12I GTAGCCTATT ------------/GCTAATGCAAAA GCTGCACATT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 GCTAATGCAAAA 0 1 272502 CASAVA_Build 7 56614684 1I CAGTTGGATT -/A TCATCATTAT 3070 het 2387 hom 23 6 16 1 A 0 1 272503 CASAVA_Build 7 56617880 3D AAGACTTTAT TTC/--- TTCTTCATTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 7 TTC 3 2 272504 CASAVA_Build 7 56618343 3I TTGTTCATTC ---/TCT TTTATTCTTT 3070 het 137 hom 23 3 11 9 TCT 0 1 272505 CASAVA_Build 7 56618607 1I CTTTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 2861 het 2861 ref 25 12 9 4 T 10 11 272506 CASAVA_Build 7 56626071 1I TATACAAGTA -/T TGACACCAAT 2896 het 2896 ref 18 10 7 1 T 1 2 272507 CASAVA_Build 7 56626689 6D TGTCCAAAAT TATATA/------ TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 11 9 11 TA 8 5 272508 CASAVA_Build 7 56628319 1D46M1I TTTGAAAGAC AAGGAGAGTCCCCCACTATCCACCACACAGAAGACCATTAGAATGTT-/-AGGAGAGTCCCCCACTATCCACCACACAGAAGACCATTAGAATGTTA AGAGTCCACG 3070 het 3070 ref 39 32 14 13 N/A 0 0 272509 CASAVA_Build 7 56628701 1I CAAATACTAG -/C TAGAATGTGC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 C 0 1 272510 CASAVA_Build 7 56629136 1D GTTTCTACAT A/- AAAAAAGCTA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 7 6 272511 CASAVA_Build 7 56629305 1D AGGTCTGGTT A/- AAAAATGCTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 6 5 272512 CASAVA_Build 7 56630137 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2651 het 2651 ref 21 13 6 3 A 13 10 272513 CASAVA_Build 7 56631726 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 99 het 99 ref 15 2 1 12 CT 2 1 272514 CASAVA_Build 7 56635740 1I AACAAAAGGC -/T ACATCTCCAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 0 1 272515 CASAVA_Build 7 56637628 1D GCCTCTCAAA G/- TGCTGGGATT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 G 1 0 272516 CASAVA_Build 7 56638207 1I ACTAATACGG -/T TAAGACTTAT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 1 2 272517 CASAVA_Build 7 56641119 1I TCCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2652 het 2652 ref 23 9 8 6 A 10 11 272518 CASAVA_Build 7 56649131 2I AGAGAGGAGA --/CT CACCTCACCT 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 CT 0 1 272519 CASAVA_Build 7 56656794 2D ACTGCCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 T 13 11 272520 CASAVA_Build 7 56656978 1D GACCTTTATG T/- TTTTTCTCTT 1596 het 1596 ref 17 13 4 0 T 6 5 272521 CASAVA_Build 7 56660431 1D AAAAGCACCT G/- GAAGCTTGAC 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 G 2 1 272522 CASAVA_Build 7 56661985 1I GTTGTGCTTA -/C CCATCTGTTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 C 2 3 272523 CASAVA_Build 7 56662248 10D TCATTTCAAA TTTTCTAGAT/---------- TTATCTTGCT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 TTTTCTAGAT 1 0 272524 CASAVA_Build 7 56662984 1I GAAAAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 19 1 14 4 T 11 12 272525 CASAVA_Build 7 56665180 7I TTCAAAAACC -------/ATAGGAT ATAGGATGTG 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 ATAGGAT 1 2 272526 CASAVA_Build 7 56666866 1I CTTCAATCTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 2968 hom 28 8 17 3 A 6 7 272527 CASAVA_Build 7 56669038 1I AAGATGAGAT -/A AATTAACATC 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 A 2 3 272528 CASAVA_Build 7 56671333 1D AAACCCTAAG T/- GCCTTATTCA 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 1 0 272529 CASAVA_Build 7 56673687 1D GCCACCACAT A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 7 6 272530 CASAVA_Build 7 56673972 1D AACACAGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 10 9 272531 CASAVA_Build 7 56675499 1I CAGCAAGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 878 hom 32 2 23 7 A 11 12 272532 CASAVA_Build 7 56677494 2I CTCTTCCCAC --/TT CGGCCTCCCA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 0 2 272533 CASAVA_Build 7 56678604 3D ATTGACTAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 45 22 17 9 AAC 4 3 272534 CASAVA_Build 7 56679182 1I AAACTTTGAT -/A TAAAAATATG 2204 het 2204 ref 25 16 6 3 A 0 1 272535 CASAVA_Build 7 56681974 1D GCCTTTACTG T/- GCTCTCTGAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 1 0 272536 CASAVA_Build 7 56682523 1I AAACAAAGCT -/A GGGGCATTAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 0 1 272537 CASAVA_Build 7 56683045 1I5M11D GGTGATGACT -CTTAACGAGTATGCTG/CCCTAA----------- CCTTCAAGCA 2270 het 2270 ref 14 11 5 6 N/A 0 0 272538 CASAVA_Build 7 56686859 1I TTGGTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 10 11 272539 CASAVA_Build 7 56687686 1D GATGGGGTTG T/- TTTTTTTTTC 1403 het 1236 hom 8 4 4 0 T 10 9 272540 CASAVA_Build 7 56692285 2I AAGGCCATAA --/CT CTCATATTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CT 1 2 272541 CASAVA_Build 7 56693343 1D ATCTCCCCCC A/- AAATAAAATT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 4 3 272542 CASAVA_Build 7 56696248 6D5M4I CATTCCTCAA CCTTCCCACAG----/------CAAAGTTAT GTGTGATTGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 N/A 0 0 272543 CASAVA_Build 7 56700372 1D CCAGCACCTA G/- TTGATACGAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 1 0 272544 CASAVA_Build 7 56700955 1D35M5I ACACACATGC ATATTGTGTAATGCCCTCAGATGGGACAGAGAGTGT-----/-TATTGTGTAATGCCCTCAGATGGGACAGAGAGTGTCATAA CAGAACCCAG 3070 hom 114 het 28 0 38 5 N/A 0 0 272545 CASAVA_Build 7 56702801 2I CCCTATCAAA --/AC ACAGTCTGTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 AC 1 2 272546 CASAVA_Build 7 56705039 4D AAATAAAATA AATT/---- TAGATGTAGG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AATT 1 0 272547 CASAVA_Build 7 56705928 1I CTTTTTTTTT -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 6 7 272548 CASAVA_Build 7 56706069 1I CTTTCTTTCA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 7 8 272549 CASAVA_Build 7 56706538 1D GGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 10 9 272550 CASAVA_Build 7 56707712 1I TATTTATTTG -/A AACAGAGTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 2 3 272551 CASAVA_Build 7 56709613 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 15 12 272552 CASAVA_Build 7 56709753 17D TATTTTTTCC TGCGTCTTTAATTTTAA/----------------- CAAATAAGTT 3070 hom 33 het 10 0 12 2 TGCGTCTTTAATTTTAA 1 0 272553 CASAVA_Build 7 56711086 4D TTTGCATGGC TAGA/---- TAGTTACTGA 3070 hom 102 het 38 0 35 5 TAGA 1 0 272554 CASAVA_Build 7 56712374 2I CACATTTTCT --/CA CACTCAAGAG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 CA 1 2 272555 CASAVA_Build 7 56715237 1D TTTTTTTCCA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 7 6 272556 CASAVA_Build 7 56718916 1I TAAAGCTGAT -/G GCAAATTAAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 1 2 272557 CASAVA_Build 7 56727464 2D CCTTCTGTAC TA/-- TGTTATTAAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TA 1 0 272558 CASAVA_Build 7 56729662 1D AAGACTACAG A/- ATCTGGAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 1 272559 CASAVA_Build 7 56730881 1I CAGCCCTTGT -/A AGCCACAGTC 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 A 1 2 272560 CASAVA_Build 7 56746154 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 13 12 272561 CASAVA_Build 7 56751564 1D CCGAAATTGT C/- ACCACTGCAC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 C 1 0 272562 CASAVA_Build 7 56762336 1D TCCTGGTAAG A/- TAAAGTTGTG 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 1 0 272563 CASAVA_Build 7 56770417 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2451 het 217 hom 21 2 9 10 A 15 14 272564 CASAVA_Build 7 56771286 2D AATTTTTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3026 hom 27 het 12 0 10 3 T 14 12 272565 CASAVA_Build 7 56772888 2D TACATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 28 0 19 10 TG 8 7 272566 CASAVA_Build 7 56773502 1I AATTCAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 195 hom 23 2 18 3 T 11 12 272567 CASAVA_Build 7 56777752 1I ACTGACCCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 102 hom 28 2 17 9 T 9 10 272568 CASAVA_Build 7 56778484 7D23M3D GGTTAGCCAA TTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTCGTT/-------TTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTTC--- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 N/A 0 0 272569 CASAVA_Build 7 56782532 4D GGTCCGGATC CATA/---- CATACCCCAA 3070 hom 50 het 20 0 16 5 CATA 2 1 272570 CASAVA_Build 7 56782612 1I TGAAAGCAAG -/T TTATTAAGGA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 2 3 272571 CASAVA_Build 7 56786421 3I CTGCATATGC ---/CAA CAATGTCAAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 CAA 1 2 272572 CASAVA_Build 7 56791019 1D ATTTTTATCC T/- CCCTCTTTGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 1 0 272573 CASAVA_Build 7 56793612 1I AGACAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2884 het 210 hom 19 2 8 9 A 11 12 272574 CASAVA_Build 7 56794419 25D TGTATGAGTG GCACCCCTGGATCCATCCATCCTGA/------------------------- GCTGGTAGCA 1388 het 944 hom 4 2 3 0 GCACCCCTGGATCCATCCATCCTGA 1 0 272575 CASAVA_Build 7 56795871 1I TCAGCCTCCC -/A AAAGTGCTGG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 3 4 272576 CASAVA_Build 7 56796864 1D ATGAAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 12 11 272577 CASAVA_Build 7 56797939 1D ACACAGATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 29 0 22 8 A 10 9 272578 CASAVA_Build 7 56800562 1I ATACTGACAT -/C TTATAAATGT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 0 1 272579 CASAVA_Build 7 56808901 1D TGCAACATTC T/- TTTTTTTTTT 2022 het 203 hom 23 1 8 14 T 15 14 272580 CASAVA_Build 7 56812376 8D ACTCTATCTT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 1667 het 1667 ref 16 11 5 1 A 22 14 272581 CASAVA_Build 7 56816274 1I AGAATTTAAA -/T TTTTTTTTTT 1474 het 1474 ref 31 13 6 12 T 17 18 272582 CASAVA_Build 7 56816733 1D TTCTAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 856 het 856 ref 26 10 4 12 T 17 16 272583 CASAVA_Build 7 56820514 1I GCAGGATGCA -/T TAACTATGAA 3070 het 3070 hom 56 25 24 7 T 1 2 272584 CASAVA_Build 7 56829618 1D TGTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1953 het 1953 ref 21 11 6 4 T 13 12 272585 CASAVA_Build 7 56831501 1I GTGCCAAGTA -/C TATATTAGGT 3070 het 3070 ref 41 28 7 6 C 0 1 272586 CASAVA_Build 7 56833106 3I GTTGAAAATT ---/CCA TCATGATTTA 2846 het 2846 ref 38 28 7 3 CCA 0 1 272587 CASAVA_Build 7 56835561 1D ACCTTGCCTC A/- AAAAAAGGGA 1802 het 1802 ref 35 26 4 5 A 7 6 272588 CASAVA_Build 7 56872967 4D TTCCCACAGC CTTT/---- CTAAAATGAG 2130 het 2130 ref 28 18 8 3 CTTT 1 0 272589 CASAVA_Build 7 56883132 2D TGACATAGAC AG/-- AGACGTAAGT 3070 het 3070 ref 47 38 7 4 AG 2 1 272590 CASAVA_Build 7 56902171 1D TACACTGCAC A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 71 35 28 11 A 8 7 272591 CASAVA_Build 7 56903713 1I GAAAAACATA -/C CAGCTAATAT 2913 hom 15 het 6 0 6 0 C 1 2 272592 CASAVA_Build 7 56914965 1D AATAGCTCCA T/- TTTTTTTGCT 1806 het 1806 ref 52 45 4 3 T 8 7 272593 CASAVA_Build 7 56922467 4D ATGTCTGTGA CACT/---- CACAGCCTCT 2218 het 2218 ref 28 17 5 9 CACT 1 0 272594 CASAVA_Build 7 56928816 1I ATGCTGGCCT -/C CCCCATGCCA 3070 hom 43 het 17 0 11 6 C 4 5 272595 CASAVA_Build 7 56929351 4I ATGATTAGAG ----/TGTC TGAGTGCTGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TGTC 0 1 272596 CASAVA_Build 7 56939398 1I AGACCGGGCA -/G GGCAGATGCC 3070 het 3070 hom 62 23 27 12 G 2 3 272597 CASAVA_Build 7 56945154 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 11 10 272598 CASAVA_Build 7 56952708 1D CCATCTGTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 8 272599 CASAVA_Build 7 57014267 1I GAAATGACCC -/G GGGTGGGTCT 3070 het 3070 hom 62 13 33 16 G 3 4 272600 CASAVA_Build 7 57019451 3I CTCAGTAGAG ---/GAA GAAGAAGGTG 2900 hom 27 het 10 0 8 2 GAA 2 3 272601 CASAVA_Build 7 57024229 6I CAATGCTTTT ------/TTTTTG TTGTTGTTGT 2779 het 2779 ref 24 14 6 4 TTTTTG 0 1 272602 CASAVA_Build 7 57024979 1D TGTGCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1914 het 223 hom 20 1 10 10 A 12 11 272603 CASAVA_Build 7 57025403 14D GACTCCGTCT CAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAGAAA 2056 het 1070 hom 11 5 5 4 CAAAAAAAAAAAAA 1 0 272604 CASAVA_Build 7 57030068 1D GCGGCCCAGG C/- CCTGCCAAGC 1668 het 397 hom 8 3 4 1 C 3 2 272605 CASAVA_Build 7 57052498 4D TCCATCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 1940 het 166 hom 10 2 4 6 AAAT 5 4 272606 CASAVA_Build 7 57061403 4D AAACACACAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 90 het 47 0 30 18 AC 11 9 272607 CASAVA_Build 7 57078394 1D CATGGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 3070 het 3070 ref 27 17 7 3 C 4 3 272608 CASAVA_Build 7 57087212 1D CAGGTTTGAG C/- CCCATTCTCA 1563 het 1563 ref 24 15 4 5 C 4 3 272609 CASAVA_Build 7 57088778 1I GGCTGAGTGA -/T TTTTTTTTGT 938 het 938 ref 10 7 3 0 T 8 9 272610 CASAVA_Build 7 57117094 4D AGGGTCAACT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 24 het 18 0 8 10 TG 11 9 272611 CASAVA_Build 7 57117844 3I CAGTTTACTA ---/CTG TTGTTTTTAC 3070 het 2912 hom 20 9 8 3 CTG 0 1 272612 CASAVA_Build 7 57129292 4D CTCCATCTAC AAAA/---- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 11 3 A 13 9 272613 CASAVA_Build 7 57129567 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 2766 het 2766 ref 28 12 11 5 A 10 9 272614 CASAVA_Build 7 57138401 2D ATGATCTTGA CT/-- CTGAGTAGGC 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 CT 2 1 272615 CASAVA_Build 7 57147197 1D AGAGGAATTC T/- TTTTATATTA 2661 het 2661 ref 42 31 6 5 T 5 4 272616 CASAVA_Build 7 57149832 2D AAAACCAAAC TG/-- TATTGTATTT 1431 het 1431 ref 15 11 3 1 TG 1 0 272617 CASAVA_Build 7 57154432 2I CTTTTACAAG --/AT ATATGATAAT 1249 het 1249 ref 32 25 3 4 AT 2 3 272618 CASAVA_Build 7 57170541 1I CCCTGTGCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 655 hom 25 6 13 6 A 15 16 272619 CASAVA_Build 7 57185815 2D GGCTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1467 het 1467 ref 23 11 4 9 T 14 12 272620 CASAVA_Build 7 57189562 1D AAACTACTTC T/- TTAACATGTA 3070 het 3070 ref 46 32 8 6 T 3 2 272621 CASAVA_Build 7 57190505 2D CAGTATAAAC TA/-- TCTTACCTAC 3025 het 3025 ref 31 20 7 5 TA 1 0 272622 CASAVA_Build 7 57191050 6I TGAGGTCAGG ------/AGTTCA AGTTCAAGAC 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 AGTTCA 1 2 272623 CASAVA_Build 7 57193998 5I ATAAATGCTG -----/GAAAA GCACATAATC 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 GAAAA 0 1 272624 CASAVA_Build 7 57197313 1I GACATGATGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 A 9 10 272625 CASAVA_Build 7 57205057 1D CAATTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 11 10 272626 CASAVA_Build 7 57212372 2I TTGCTGTTTC --/TG TGTGAGCTGG 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 TG 2 3 272627 CASAVA_Build 7 57214072 2D GGTTTATTCA AT/-- ATGCATGGGT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 AT 2 1 272628 CASAVA_Build 7 57216736 1D CCCCCATAGG T/- TTTTTTTTTT 2235 het 1215 hom 15 4 8 4 T 12 11 272629 CASAVA_Build 7 57217857 1D CTGACCAACA T/- TGGTGAAGCC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 2 1 272630 CASAVA_Build 7 57218719 2I AATAGGTAGT --/GA GAGACACACA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 GA 2 3 272631 CASAVA_Build 7 57219748 1D CTGGCAATTC T/- TGCTTCAGGC 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 T 2 1 272632 CASAVA_Build 7 57221810 1D CTCTGCTAAG A/- CAGGTTTTAG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 1 0 272633 CASAVA_Build 7 57223402 3I GATTTTACTC ---/TCT TCAATACATG 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 TCT 0 1 272634 CASAVA_Build 7 57224669 3D AGAAAAACAC TTG/--- TTATTTGAAG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 TTG 1 0 272635 CASAVA_Build 7 57225633 1I TACTAATCGT -/C TTACCTATAG 3070 het 3070 ref 25 16 7 2 C 0 1 272636 CASAVA_Build 7 57226824 5D ATTCTTCTCA CATTG/----- CATTGGACAC 3070 het 3070 ref 46 26 19 3 CATTG 2 1 272637 CASAVA_Build 7 57256853 1D GGTTAGGGAG A/- AAACTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 4 3 272638 CASAVA_Build 7 57269453 1D TAATCCAATA C/- ACCAGTCTTG 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 C 1 0 272639 CASAVA_Build 7 57278415 4D TTCCTTCCTC TCTT/---- TCTTTCTCCC 1927 het 1927 ref 18 9 6 3 TCTT 2 1 272640 CASAVA_Build 7 57282964 3I CTTGCTGGCT ---/GAC ATTTCCCTGC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 GAC 0 1 272641 CASAVA_Build 7 57285708 1D CTGTGTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2980 het 849 hom 20 5 10 5 A 15 14 272642 CASAVA_Build 7 57296216 9I TGAACCTTGA ---------/GGATTAGGC TTCTACCCTG 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 GGATTAGGC 0 1 272643 CASAVA_Build 7 57297140 4I GCATAAGTGT ----/GTAA GTGTGATCAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 GTAA 0 1 272644 CASAVA_Build 7 57300693 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1901 hom 17 7 9 2 A 11 10 272645 CASAVA_Build 7 57302895 4D GAAGAGAAGG GGTT/---- GGTCTTACTG 3000 het 3000 ref 43 26 11 7 GGTT 1 0 272646 CASAVA_Build 7 57321327 1I TTGAAACCTA -/T ATTAGCCACT 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 T 0 1 272647 CASAVA_Build 7 57321750 18D GAGCAAGACT CTGTCTCAAAACAAAACC/------------------ CCAAAAACAT 3070 het 3070 ref 34 23 15 2 CTGTCTCAAAACAAAACC 1 0 272648 CASAVA_Build 7 57327384 1D TGGTGGATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 10 9 272649 CASAVA_Build 7 57345855 14D GTCTAATAAG TTTATTTTTCTTTA/-------------- TTTATTTTTC 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 TTTATTTTTCTTTA 2 1 272650 CASAVA_Build 7 57348002 1D AATACTTTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 9 8 272651 CASAVA_Build 7 57354354 1I AGGTATTTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 9 10 272652 CASAVA_Build 7 57359938 1D AAAATCAAGC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 9 8 272653 CASAVA_Build 7 57363668 1D9M1D ATTATGAGAC TTTTTTTGCAT/-TTTTTTGCA- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 20 4 N/A 0 0 272654 CASAVA_Build 7 57364330 1I TGCATAGCTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 8 9 272655 CASAVA_Build 7 57369590 1I AATCTCGGCT -/C ACTGTAACCT 3070 het 2546 hom 25 9 13 4 C 0 1 272656 CASAVA_Build 7 57370548 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 2682 hom 29 8 14 8 A 8 7 272657 CASAVA_Build 7 57372783 1D ACATTAAAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 10 9 272658 CASAVA_Build 7 57373255 1I TTTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 10 11 272659 CASAVA_Build 7 57376048 1D TGTTAATGAC A/- AAGGTCGATT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 3 2 272660 CASAVA_Build 7 57388032 1I CTCAATCCCA -/T TTTTGGAAGG 3070 hom 83 het 37 0 27 10 T 4 5 272661 CASAVA_Build 7 57390422 2D AAAAAAAAAA AC/-- ACACACAATT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 AC 4 3 272662 CASAVA_Build 7 57391315 1D AAAATCCTGG A/- AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 45 29 14 3 A 7 6 272663 CASAVA_Build 7 57394004 2D AAACAACTAT AC/-- ACATCCACTT 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 AC 2 1 272664 CASAVA_Build 7 57396691 1D TCAGGGGCTG T/- TTCCCCAGAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 T 3 2 272665 CASAVA_Build 7 57401967 17I TGAGCCCAAG -----------------/GAGGTCAAGGCTGCAGT GAGCCATGAT 3070 hom 69 het 23 0 23 1 GAGGTCAAGGCTGCAGT 0 1 272666 CASAVA_Build 7 57403973 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3003 het 3003 ref 20 12 8 1 A 12 10 272667 CASAVA_Build 7 57407008 2D TACTAAAAAT AC/-- AAAAATTAGC 3070 het 1763 hom 26 4 20 2 AC 1 0 272668 CASAVA_Build 7 57409709 3D CACAGAAAAA ACC/--- AACAAACAAA 618 het 618 ref 26 12 6 8 ACC 1 0 272669 CASAVA_Build 7 57411992 1I TGATCCAGCA -/T CACCCAGCTA 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 T 0 1 272670 CASAVA_Build 7 57417167 2D GTGGAAATAG TA/-- TATAACATGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TA 3 2 272671 CASAVA_Build 7 57417326 1D GTAAACCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 792 hom 35 2 22 11 T 13 12 272672 CASAVA_Build 7 57417893 2D AGCAAGACTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 11 9 272673 CASAVA_Build 7 57418003 2D TGAGATGGGT AA/-- ATCATGGAAG 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 A 3 1 272674 CASAVA_Build 7 57425426 1D TGGTTCGTGA C/- TTTTGTTCAT 3070 hom 63 het 23 0 21 3 C 1 0 272675 CASAVA_Build 7 57443190 1I TCTGTCATTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 8 9 272676 CASAVA_Build 7 57451071 6I CTGAAAAATA ------/TAAAGC TAAAGCTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 TAAAGC 1 2 272677 CASAVA_Build 7 57468507 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2162 hom 21 7 12 2 T 11 12 272678 CASAVA_Build 7 57469430 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3069 het 3069 ref 34 19 10 6 A 12 11 272679 CASAVA_Build 7 57497745 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1679 hom 18 5 10 4 A 12 11 272680 CASAVA_Build 7 57498198 1I GCAACTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 15 0 9 6 A 10 11 272681 CASAVA_Build 7 57499223 2D CATGGAGGCG TT/-- CTCTCTATCT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 2 0 272682 CASAVA_Build 7 57514675 1D AAGAAATGCA T/- TTTTTTTTTT 1906 het 1906 ref 26 11 8 7 T 13 12 272683 CASAVA_Build 7 57522654 1I TAGTTTCAAA -/T ATTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 0 1 272684 CASAVA_Build 7 57522953 15I CAGTACCTGC ---------------/TTAATAAACATTTTA TTAGTACATG 3070 het 3070 ref 27 15 12 1 TTAATAAACATTTTA 0 1 272685 CASAVA_Build 7 57523039 1D AAAAGCCAAC A/- AAAAATATAA 1649 het 1649 ref 16 9 5 3 A 6 5 272686 CASAVA_Build 7 57524768 1I AAAAAAAAAA -/T ATACAAAAAT 2450 het 2450 ref 22 12 7 3 T 0 1 272687 CASAVA_Build 7 57525808 1I GCCTCGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2327 hom 32 8 14 11 A 15 16 272688 CASAVA_Build 7 57527285 1I GACATATAAA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 8 9 272689 CASAVA_Build 7 57527632 1I GGTAATTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 7 8 272690 CASAVA_Build 7 57528144 3D CAATATTAAG TGT/--- TGTTATCACA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TGT 2 1 272691 CASAVA_Build 7 57528363 1I GTTTCGTTAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 8 9 272692 CASAVA_Build 7 57529837 4D GTATAATAAT AATA/---- AATAAATTTT 3070 hom 18 het 7 0 7 1 AATA 2 1 272693 CASAVA_Build 7 57530744 1I ACCTCTTAAT -/G TTACAACAGT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 G 0 1 272694 CASAVA_Build 7 57531187 1I ATTTTGCACG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 7 8 272695 CASAVA_Build 7 57535467 2D GTGCTGAAAC TT/-- CAGACATTAC 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 T 2 0 272696 CASAVA_Build 7 57536102 1I TAGTAGTCTC -/T TTTTTTGCCA 3070 het 3070 hom 45 15 27 3 T 6 7 272697 CASAVA_Build 7 57538364 1D GATATTCAGT C/- AGAAGTCTTC 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 C 1 0 272698 CASAVA_Build 7 57539616 1I ATTTTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 15 12 2 T 10 11 272699 CASAVA_Build 7 57541304 5I CTCCGTCTCA -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 AAAAT 2 3 272700 CASAVA_Build 7 57542624 1D CACTTAAATG C/- TGAGTGTTTG 3070 het 3070 hom 26 9 15 5 C 1 0 272701 CASAVA_Build 7 57543390 1I CAAAAAAAAA -/C ATGTATTACT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 0 1 272702 CASAVA_Build 7 57543495 2D AAGTTAACTA AC/-- ACATCTATCA 3070 het 3070 ref 46 27 15 6 AC 2 1 272703 CASAVA_Build 7 57544499 1I ATTTACAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 8 9 272704 CASAVA_Build 7 57547961 2I CAGGCAAAAC --/AG AAAGTAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 AG 0 1 272705 CASAVA_Build 7 57548070 1D TTGTTGTCCA G/- GCTGGAGTGT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 G 2 1 272706 CASAVA_Build 7 57552925 10D TGGAATCATC ATCAAATGGA/---------- ATCAAATGGA 3070 het 3070 ref 75 33 22 25 ATCAAATGGA 2 1 272707 CASAVA_Build 7 57555334 1D TGACACAGTG A/- AAATACTCTT 3070 het 3070 ref 80 33 12 36 A 4 3 272708 CASAVA_Build 7 57561176 2I GTATCTACAC --/AT ATGTATATAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 AT 1 2 272709 CASAVA_Build 7 57564085 4I CTGGAGAGGC ----/TGAG TATTTTCAAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 3 TGAG 0 1 272710 CASAVA_Build 7 57567331 1I ATTGTATATA -/T TTTAAGATGT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 3 4 272711 CASAVA_Build 7 57571041 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2394 het 1674 hom 28 11 8 9 T 11 10 272712 CASAVA_Build 7 57581277 5I ATCAAACTGT -----/CTCAG ATGGTAATTA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 CTCAG 0 1 272713 CASAVA_Build 7 57582111 2I11M4I15M1I GTTAGTTGTC --TATAAGAACAA----TAGGATCCTCTATTA-/TATATAAGAACAATAGTTAGGATCCTCTATTAG TTAAAAAAGA 1336 het 1336 ref 32 38 3 3 N/A 0 0 272714 CASAVA_Build 7 57586253 4D ATAGATATAT AATA/---- TATATATTAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 3 AATA 1 0 272715 CASAVA_Build 7 57589624 1I CAGGGAATAC -/A AAAAAAAAAA 2260 het 2260 ref 22 13 7 2 A 11 12 272716 CASAVA_Build 7 57592323 2I AAAATTATGT --/AC AGTTTATCTG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AC 0 1 272717 CASAVA_Build 7 57593402 1I AATCCTTGTT -/A ATAAAGTGGC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 1 2 272718 CASAVA_Build 7 57595966 2I CATAATAAAT --/TG TGTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 TG 1 2 272719 CASAVA_Build 7 57599008 2D ATGGGTTTAT GA/-- GAGTAGACTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 GA 2 1 272720 CASAVA_Build 7 57599120 2I ACTATATTTT --/TA TATATATATA 2979 het 2979 ref 23 12 7 4 TA 5 6 272721 CASAVA_Build 7 57603750 1I ACCACACCTC -/A AGGAGGCCTG 1438 hom 18 het 8 0 5 3 A 1 2 272722 CASAVA_Build 7 57608883 1I TCTGTGAATA -/T ATATGATGGA 3068 het 3068 ref 26 16 7 3 T 0 1 272723 CASAVA_Build 7 57609181 1I TCAATTACAA -/G GTCCAGATGC 3070 het 3070 hom 54 19 31 4 G 1 2 272724 CASAVA_Build 7 57609530 1I GCTCAAACTG -/A ACTTCCTTCT 3070 het 3070 hom 54 19 26 10 A 1 2 272725 CASAVA_Build 7 57609657 2D AAACGTACAA TT/-- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 24 25 9 T 5 3 272726 CASAVA_Build 7 57609962 2I TGATAGTCTC --/TT AAACATATTT 3070 het 3070 ref 50 36 11 4 T 0 2 272727 CASAVA_Build 7 57610562 5D TTTCATCCTC CTTAT/----- TTTAAATTTA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 CTTAT 1 0 272728 CASAVA_Build 7 57610639 10I TGGAAAATAT ----------/ATGAAAGCCC ATGAAAGCCC 3070 het 3070 ref 50 37 10 3 ATGAAAGCCC 1 2 272729 CASAVA_Build 7 57610767 4D CTAATTGCTT TTCA/---- TTCATTGGAG 3070 het 3070 ref 70 59 9 7 TTCA 2 1 272730 CASAVA_Build 7 57610904 2D CAAGCGAAGA TC/-- TCTTAAAATC 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 TC 2 1 272731 CASAVA_Build 7 57610943 3I24M4D ATTAAAAAAA ---ATATATGTGGCAAGAACTCGATTGGATA/TATATATATGTGGCAAGAACTCAATTG---- GATAAATACA 3070 het 3070 ref 72 62 8 23 N/A 0 0 272732 CASAVA_Build 7 57611299 2I AAATCAAAAC --/AG ATTAAAATTC 3070 het 3070 ref 66 33 18 15 AG 0 1 272733 CASAVA_Build 7 57611382 1D GCAACAAGCA T/- TTTCCAGGAA 3070 het 3070 ref 90 65 17 9 T 4 3 272734 CASAVA_Build 7 57611462 6D CACCATTTTA TCTTAT/------ TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 79 40 17 29 TCTTAT 1 0 272735 CASAVA_Build 7 57611544 1D TTCATCTGCT C/- TTATTTCCTT 3070 het 3070 ref 89 41 37 13 C 1 0 272736 CASAVA_Build 7 57611852 1D TTTAACTCAT G/- CATATAACAA 3070 het 3070 ref 84 52 23 11 G 1 0 272737 CASAVA_Build 7 57611987 4I AATTCATGAA ----/GTGT CGTACAACAT 3070 het 3070 ref 64 45 12 7 GT 0 2 272738 CASAVA_Build 7 57612166 2D51M5D ATTTTTCTTC TTTTTTTTAAATAATAGGAGTAATGGGGCAAGATAAACTCGTATAGACTAAAGAAAAT/--TTTTTTAAATAATAGGAGTAATGGGACAAGATAAACTCGTGTAGACTAAAG----- AAACTTGTAT 3070 het 3070 ref 59 49 18 53 N/A 0 0 272739 CASAVA_Build 7 57612322 12D87M4D AGTATGATGA GTAATTACTCCTGTAATAACTATGTCTCCGAAAATCCTTCCTGGAAAATTGTTTCCTCCTAAATGTGCTGCTGCAATTAACTTGTATTTTCCTATTGAAACAC/------------GTAATAACTATGTCTCTGAAAATCCTTCCTGGAAAATTGTTTTCTCCTAAATATGCTGCTGCAGTTAACTTGTATTTTCCTATTAAA---- ACACTATTGC 3070 het 3070 ref 68 100 13 20 N/A 0 0 272740 CASAVA_Build 7 57612478 1I46M2D GTTATTTGAG -TAAACTTTGTGACAGCAGGGAGGGACCACACCTCTCTTTTTCTCATTC/TTAAACTTTGTGACAGCAGGGAGGGACCACACCTCTCTTTTTCTCAT-- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 71 80 18 22 N/A 0 0 272741 CASAVA_Build 7 57613145 1D GTAGTGGCAT A/- ATTTTGTCTT 3070 het 3070 ref 87 55 27 6 A 2 1 272742 CASAVA_Build 7 57613233 2I23M18D AAGTATATCA --TTCGTCTTAAGTACTACAAAATACCTTCCCCTTATGAGAGT/TTTTTGTCTTAAGTACTACAAAATA------------------ CAGTTAACTA 3070 het 3070 ref 46 50 10 12 N/A 0 0 272743 CASAVA_Build 7 57613611 1D ATGAATCTGA T/- TTTTTTCATA 2923 het 2923 ref 86 71 7 9 T 7 6 272744 CASAVA_Build 7 57614070 3I GTAGATAACG ---/TTA TTTTTATTTA 3070 het 3070 ref 63 28 21 19 TTA 0 1 272745 CASAVA_Build 7 57614159 1D TTATTATCTT G/- TATATCTTCT 3070 het 3070 ref 44 29 13 9 G 1 0 272746 CASAVA_Build 7 57614400 1D CCGCTATGCC T/- GCATCCTGTG 3070 het 3070 ref 64 33 23 8 T 1 0 272747 CASAVA_Build 7 57614806 1D AGCACCCTAT A/- AACACTCACC 3070 het 3070 ref 49 27 12 11 A 3 2 272748 CASAVA_Build 7 57615058 4I34M2I AATTTAATAG ----ATTATGGAGATTAATTGGAATAAAAAAATGCTTC--/ATTTATTACAGACATTAATTGGAATAAAAAAATGCCTCAA AAGTATAATC 2670 het 2670 ref 42 43 9 10 N/A 0 0 272749 CASAVA_Build 7 57615417 4D GTAAATTCAT ACAG/---- TCAAAGTTAC 3070 het 3070 ref 62 41 12 11 ACAG 1 0 272750 CASAVA_Build 7 57615437 3D TTACATACAT ATA/--- ATAATAGTTC 2870 het 2870 ref 49 25 8 16 ATA 3 2 272751 CASAVA_Build 7 57615562 1D TTTTTAATGA T/- TTTTTTAAAC 1330 het 1330 ref 60 35 5 20 T 7 6 272752 CASAVA_Build 7 57615763 3D CAGAATTTAA GAG/--- GACTTAATGA 2216 het 2216 ref 57 47 5 6 GAG 1 0 272753 CASAVA_Build 7 57615820 1D57M1D GGTAGAGGAA TTAATAAGAAATCAGTCACTATAATATACAGACATTGGTGAATAAAGAGTAATAGATTA/-TAATAAGAAATTAGTCACTGCAATATACAGACATTGGTGAATAAAGAGTAATAGATT- AGACCTATAT 3070 het 3070 ref 43 47 15 32 N/A 0 0 272754 CASAVA_Build 7 57616376 1I TCACATCTAG -/T TTAATCAGAT 3070 het 3070 ref 55 38 10 7 T 2 3 272755 CASAVA_Build 7 57616990 1D TGAAGAAATG A/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 69 32 35 3 A 1 0 272756 CASAVA_Build 7 57617056 3D TAAGAGTCCC TAT/--- GTATTTTCTA 3070 het 3070 ref 68 31 20 21 TAT 1 0 272757 CASAVA_Build 7 57617125 1I GTAAAAAGTA -/T TTTACATCCT 3070 het 3070 ref 75 35 25 16 T 3 4 272758 CASAVA_Build 7 57617397 2I TAAGTTTTTT --/TC TAAAAGTATT 2367 het 2367 ref 46 20 8 18 TC 0 1 272759 CASAVA_Build 7 57617419 1I19M3I GTCTACTATA -CATCTTATTTATGTTTTTT---/TCATTTTATTTATGTATTTTATA TTGGGATGAA 3070 het 3070 ref 48 25 16 21 N/A 0 0 272760 CASAVA_Build 7 57617595 1I37M1D104M4D ATGTATTATT -AAAGAAATAAAGAAAATCATTATTTAAAAGATGGAGTAAACTTTGCTCCCCCAGGCTCACTTCCGATGTCCTTGATTTTTTTTATACTTCCTATTTTAGATAATTTCATCTTCTTATTTTCTGTTCACAATATCTTATGCTTCTAA/AAAAGAAATAAAGAAAATTATTACTTAAAAGATAGAGT-AACTTTGCTCCCCCAGGCTCACTTCCAATGTCCTTGATTTTTTTTATACTTCCTATTTTAGATAATTTCATCTTCTTATTTTCTGTTCACAATATCTTCTGCTT---- CTATGTTGCT 3070 het 3070 ref 29 63 13 19 N/A 0 0 272761 CASAVA_Build 7 57618358 1D15M1D CATTTGCAAC TTTTTCTTTCAATAAGT/-TTTTCCTTCGGGAAG- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 49 51 9 6 N/A 0 0 272762 CASAVA_Build 7 57618473 2D AGTCAATCAC AT/-- GTTTTTGTCT 1589 het 1589 ref 57 32 4 22 AT 1 0 272763 CASAVA_Build 7 57619303 1I45M2D AGCTATTCCC -TAGATGAGAGAATTAAAATTCTGACCACATCATTTTATTTCCTGACT/TTAGATGAGAGAATTAAAATTCTGACCACATCATTTTATTTTCTGA-- CTAAAACTAG 3070 het 3070 ref 43 52 18 4 N/A 0 0 272764 CASAVA_Build 7 57619798 3D12M4I ATTTAATATT TTGTTGATTGTGTAG----/---TTGATTGTGTAGAATT AATAAAAGTA 1134 het 1134 ref 63 52 3 15 N/A 0 0 272765 CASAVA_Build 7 57619844 4I TAAAAATAAA ----/GAAT GAATAAAAGT 3070 het 3070 ref 53 34 11 8 GAAT 1 2 272766 CASAVA_Build 7 57619930 3D38M4I TACACGGACA TATTATCCTTGTATTAAAAAATTCTGATTCTCAGAAGAGTG----/---TATCCTTGTATTAAATATTCATGATTCTCAGAAAAGTGATTC TATCATTGGT 3070 het 3070 ref 69 65 21 11 N/A 0 0 272767 CASAVA_Build 7 57621281 2D TCAATAAATT AA/-- AAAAAAAATA 2627 het 2627 ref 43 31 7 5 A 10 8 272768 CASAVA_Build 7 57621758 14I TTAGACCACT --------------/AGCTAGATTAACAG AACAGAGGGA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AGCTAGATTAACAG 0 1 272769 CASAVA_Build 7 57623514 4D ATAAGATGTT CAAA/---- CAATGTTTGA 3070 het 3070 ref 43 24 16 6 CAAA 1 0 272770 CASAVA_Build 7 57623623 1D GAAGGGTTAA T/- TTACAAGTGG 3070 het 3070 ref 60 27 27 6 T 3 2 272771 CASAVA_Build 7 57624030 2I TCATAGGGAT --/AA CTTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 58 29 23 6 A 0 2 272772 CASAVA_Build 7 57625679 3D CTTAATTTGT CAG/--- CAGAATTTTC 3070 het 3070 ref 42 24 14 6 CAG 2 1 272773 CASAVA_Build 7 57625858 1I TATGACATGT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 A 7 8 272774 CASAVA_Build 7 57626539 3I ATAAGGCAAA ---/AAG AAGGAGAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 AAG 1 2 272775 CASAVA_Build 7 57627437 39D TGAAAATTTT ATAGAACATGCTGCCTGGGAAGAAGTAGGATCACTTGAC/--------------------------------------- ATTGTTAAAC 1221 het 1221 ref 37 44 3 10 ATAGAACATGCTGCCTGGGAAGAAGTAGGATCACTTGAC 1 0 272776 CASAVA_Build 7 57627945 1D CATCTTACTT A/- AGGGTTTTCT 1040 het 1040 ref 66 53 5 9 A 2 1 272777 CASAVA_Build 7 57628120 2D AAACAGGAAG AT/-- ATATGTACAG 3070 het 3070 ref 67 46 19 3 AT 3 2 272778 CASAVA_Build 7 57629152 4D AACTAAACTC CTAA/---- CTGTTGCTTA 3070 het 3070 ref 50 28 21 1 CTAA 1 0 272779 CASAVA_Build 7 57629322 1D TACTGCTGAG T/- TTTAACTACA 3070 het 3070 ref 55 30 14 12 T 4 3 272780 CASAVA_Build 7 57629541 4D18M1I30M4I AATATCTCTG TACATAACATCTTTACAAGATA-TTTAAAATATGACATATTTACAATCACTTA----/----TAACATCTTTACAAGATAGTTTTATATATGACATATTTACAATCACTTAAATG TTGTTTTTGC 3070 het 3070 ref 71 64 14 25 N/A 0 0 272781 CASAVA_Build 7 57629689 1I AGATTGCTCC -/A ACAATCCATT 2246 het 2246 ref 85 47 7 32 A 1 2 272782 CASAVA_Build 7 57629914 1D33M1D AAAACTTATA TTTTTTTATGTTTCTACACTCTAGTTTCGAGTTAC/-TTTTTTATGTTTATACACTCTAGTTTTGAGTTA- CTTTGTACCA 3070 het 3070 ref 61 67 12 4 N/A 0 0 272783 CASAVA_Build 7 57630609 2I TTTCAACCCC --/CT GACCCCAGAA 3070 het 3070 ref 61 35 15 13 CT 0 1 272784 CASAVA_Build 7 57630919 1I TGCTTTCAAC -/A CAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 67 44 10 22 A 0 1 272785 CASAVA_Build 7 57631131 1I TCATTTTTAT -/A AATACATGAC 3070 het 3070 ref 51 25 23 4 A 2 3 272786 CASAVA_Build 7 57631279 5I85M4I GTTTTTAATA -----AAGACCACAATACTGTGGGAATATAGAGCAGCAAAATTTGCCCTTGTCTCCTCGAAAATAAACCATTAAACTGATTCAAAGTAAT----/AAGAGAAGACCACAATACTATGGGAATATAGAGCAGCAAAATTTGCCCTTGTCTCCTCAAAAATAAACCATTAAGCTGATTCAAGATAATAGAC AGTGGCTAGT 3070 het 3070 ref 45 56 27 16 N/A 0 0 272787 CASAVA_Build 7 57631906 1D ATGATTTAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 32 hom 48 2 35 11 A 10 9 272788 CASAVA_Build 7 57632359 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAGAAGT 3070 het 3070 ref 70 48 14 8 A 5 6 272789 CASAVA_Build 7 57632401 2D CTTCTGCTCC CT/-- GTCTCGTAAA 3070 het 3070 ref 82 50 23 11 CT 1 0 272790 CASAVA_Build 7 57632539 5I TATTCTAACA -----/TATTT TATTTTCAGC 3070 het 3070 ref 53 25 18 10 TATTT 1 2 272791 CASAVA_Build 7 57632629 5D AGTTAAATGA AAGTT/----- AAGTATATTC 3070 het 3070 ref 64 36 20 9 AAGTT 1 0 272792 CASAVA_Build 7 57632712 2D TTAAAACACT TA/-- TAACTTTGAT 2417 het 2417 ref 30 20 6 4 TA 2 1 272793 CASAVA_Build 7 57632793 4D AATTTTCAAG TTAT/---- TTTTTTCAAA 2898 het 2898 ref 37 27 7 5 TTAT 1 0 272794 CASAVA_Build 7 57633164 2I AATTTTTCAC --/TT TGTTACAAAT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 T 1 3 272795 CASAVA_Build 7 57633261 2I TATAAATGAC --/TG TGCAAATAAG 3070 het 3070 ref 55 33 16 8 TG 1 2 272796 CASAVA_Build 7 57633350 4I TATCATGTGC ----/TTTT TTATCTGTCT 3070 het 3070 ref 62 30 28 4 T 2 6 272797 CASAVA_Build 7 57633493 4D CCTATTGTCT TTTG/---- TTTAACAACA 3070 het 3070 ref 51 41 8 4 TTTG 1 0 272798 CASAVA_Build 7 57633946 2I CGTAGCCAAG --/AA TGGGGTCTTT 1722 het 1722 ref 38 30 5 3 A 0 2 272799 CASAVA_Build 7 57634702 2I34M4D AAATTATGTC --GTGTGTTAGTCTGTTCATGCTGATATATATATATATAC/AAGTGTGTTAGTCTGTTCATGCTGATACATATATAT---- ACCAGAGACT 3070 het 3070 ref 34 25 16 8 N/A 0 0 272800 CASAVA_Build 7 57635088 2D2M1D TCAGGTAACA GTTAT/--TA- AACAATAAAT 2569 het 2569 ref 37 27 7 7 N/A 0 0 272801 CASAVA_Build 7 57635411 1I AGGTATACAG -/A AAACTGAAGT 1346 het 1346 ref 32 26 3 4 A 3 4 272802 CASAVA_Build 7 57636552 1I49M1I TTAAAGATAT -AAAAATTATTATAAAATTACCTATGAACAATTATATCTAAAATTTAGAT-/AAAAAATTATTATAAAAGTACCTATGAAAAAATATATCTAAAATTTAGATA TTTTTTAAGA 1386 het 1386 ref 28 26 3 19 N/A 0 0 272803 CASAVA_Build 7 57637277 2I TCATATATAT --/AC ACACACAAAT 3070 het 3070 ref 56 31 17 8 AC 3 4 272804 CASAVA_Build 7 57637353 4D AAATGATACC ATCA/---- ATCAAAAAGA 3070 het 3070 ref 48 31 13 9 ATCA 2 1 272805 CASAVA_Build 7 57637700 6I ATCTCCGTTA ------/GTTAAT GTTAGTATAC 3070 het 3070 hom 71 28 36 7 GTTAAT 0 1 272806 CASAVA_Build 7 57637835 2D ATTCATAGCT TC/-- TGTTTTACAA 3070 het 3070 ref 51 36 10 6 TC 1 0 272807 CASAVA_Build 7 57638025 2I AATTAAAAAA --/AC AAAATTACCA 3070 hom 117 het 55 0 39 16 AC 0 1 272808 CASAVA_Build 7 57638538 5I34M8D31M5D CCATTTGTGC -----TTTTATATTTATTCTGTATATTAAAAAGGGATATTAATTAACTAAAAGGGTTTTTGTGCTTATTTTAGACAATAAAGA/TATTTTCTTATATTTATTCTATGTATTAAAAGAGGATAT--------TAAAAGGATTTTTGTGCTTACTTTAGACAAT----- AATTTATTAT 2316 het 2316 ref 30 47 5 4 N/A 0 0 272809 CASAVA_Build 7 57638761 2I CTAAATAGAC --/TG TTTTGGTTAA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 TG 0 1 272810 CASAVA_Build 7 57638965 26D CTTGAAACTG TAATGTCAGAGATTATAGTATCTACT/-------------------------- TCCCTGTGCA 3070 het 3070 ref 49 44 12 7 TAATGTCAGAGATTATAGTATCTACT 1 0 272811 CASAVA_Build 7 57639065 1D TCAGATTTTT C/- AAGAGTTGGA 3070 het 3070 ref 43 29 12 3 C 1 0 272812 CASAVA_Build 7 57639282 3D13M4D CTGATAAAAC CTTCTTTTTATGGTTATAGT/---CTTTTTATGGTTA---- TAGTTCAAAT 1713 het 1713 ref 36 35 5 5 N/A 0 0 272813 CASAVA_Build 7 57639519 2I TAGATGTGTT --/AC ACCTTTTGAG 2688 het 2688 ref 80 52 6 22 AC 1 2 272814 CASAVA_Build 7 57639552 4D TTCCTATCTG GTGT/---- GTGTGTGGCT 3070 het 3070 hom 63 26 28 10 GT 5 3 272815 CASAVA_Build 7 57639761 6D TAGTGTTTAA TAAAGG/------ TAAAGGTAAA 1806 het 1806 ref 39 29 4 9 TAAAGG 2 1 272816 CASAVA_Build 7 57640107 1I CTTGCTCACG -/A AATCAGTGTT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 2 3 272817 CASAVA_Build 7 57640576 2I TTTAATGCAT --/TC TGTCTTTATA 3070 het 3070 ref 49 22 23 4 TC 0 1 272818 CASAVA_Build 7 57640729 3D GTAAAAGCTA AAG/--- AACATGCCAC 1682 het 1682 ref 22 15 5 5 AAG 1 0 272819 CASAVA_Build 7 57642474 2D ATTCACCTCC CT/-- GTTTCCCCCT 3070 het 2868 hom 23 9 8 7 CT 1 0 272820 CASAVA_Build 7 57644436 1I AGTGCTTTTG -/T GGGGGGGTAT 2267 het 2267 ref 28 15 8 5 T 0 1 272821 CASAVA_Build 7 57645785 2D TTCCATTGTG TA/-- TTTTCTTCTC 670 het 670 ref 28 20 3 5 TA 1 0 272822 CASAVA_Build 7 57647903 2D AAATAAAGAC TG/-- TGTTAAAATC 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 TG 2 1 272823 CASAVA_Build 7 57648486 1I TCTTTATGGA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 34 15 7 12 T 8 9 272824 CASAVA_Build 7 57648907 1I AAATTTATCC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 7 8 272825 CASAVA_Build 7 57648987 1I TGTATATTTT -/C TTATTCTGGA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 C 0 1 272826 CASAVA_Build 7 57650979 1I TCATTTTTAA -/C TACAATAACT 3070 het 3070 ref 56 31 19 6 C 0 1 272827 CASAVA_Build 7 57651230 13D TATACTGAAA TTGAAAGAACCAC/------------- TTCCTGGATG 3070 het 3070 ref 35 31 8 6 TTGAAAGAACCAC 1 0 272828 CASAVA_Build 7 57651718 2I10M2I AATGAGACTC --TTTCAAACAA--/TGTTTCAAACAAAC CAAAAAAGAA 2178 het 2178 ref 37 32 5 5 N/A 0 0 272829 CASAVA_Build 7 57651871 1I TTTTGTGTAC -/T TTGTACAAAC 2461 het 2461 ref 52 42 6 4 T 2 3 272830 CASAVA_Build 7 57652095 7D AAAAATGTGA TTCTGAT/------- TGGTGTTTTA 2808 het 2808 ref 48 39 8 4 TTCTGAT 1 0 272831 CASAVA_Build 7 57654068 2I TTCATTACTC --/TT TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 75 33 33 9 T 7 9 272832 CASAVA_Build 7 57654265 2I TAGATTTTTA --/TG TCTCTCAATA 2316 het 2316 ref 31 22 5 4 TG 0 1 272833 CASAVA_Build 7 57654370 4D ATGAATGGGA GTTT/---- GTTTGTTTAT 3070 het 3070 ref 38 27 9 5 GTTT 3 2 272834 CASAVA_Build 7 57654455 1D GAATATACTC A/- AATAAAATGA 3070 het 3070 ref 44 34 8 3 A 3 2 272835 CASAVA_Build 7 57654818 5D AGTAGTTGAG ACTTT/----- ATTTGCAGTG 3070 het 3070 ref 47 30 13 5 ACTTT 1 0 272836 CASAVA_Build 7 57655621 3D AATTTCTTTG TTC/--- TTCTTTTGTG 3070 het 3070 ref 89 48 36 6 TTC 2 1 272837 CASAVA_Build 7 57655693 1I ATGTTTGTTC -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 56 35 18 3 T 6 7 272838 CASAVA_Build 7 57656907 1D CTTTTTTCTT C/- AGCTTCCATT 3070 het 3070 hom 48 19 28 2 C 1 0 272839 CASAVA_Build 7 57657914 3I CCACCTTGAA ---/CAC CTTTGCATAA 3070 het 3070 ref 59 28 27 6 CAC 0 1 272840 CASAVA_Build 7 57657991 1D AAAATTGCTT C/- TTTTTTGGCA 340 het 340 ref 50 38 3 9 C 1 0 272841 CASAVA_Build 7 57658019 3D ATTTGAAATT TTG/--- TTGTTGCAAG 3070 het 3070 ref 52 27 9 19 TTG 3 2 272842 CASAVA_Build 7 57658877 1I ATAAAACTGA -/T CTTTTTTGTT 2324 het 2324 ref 39 26 6 7 T 0 1 272843 CASAVA_Build 7 57659308 1D TGCAATACTC T/- TGTGTTTGGA 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 T 2 1 272844 CASAVA_Build 7 57659387 1D AACCTCTGCC T/- CCCGGGTTCA 2423 het 2423 ref 19 10 5 4 T 1 0 272845 CASAVA_Build 7 57660356 1D AGCTCCTCCT C/- AGTTCACTAC 3070 het 3070 ref 70 38 24 9 C 1 0 272846 CASAVA_Build 7 57661881 2I54M1I TAAAATTATA --TGTTATATTTTTATGTATACAATTATATAATTTTCATCTTATATTTAAATTCTA-/TCTGTTATATTTTTATGTATGCAATTATATAGTTTTCATCTTATATTTAAATTCTAT TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 24 23 8 19 N/A 0 0 272847 CASAVA_Build 7 57662539 4D AGGATGGCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2419 het 1926 hom 24 7 9 8 TTTC 3 2 272848 CASAVA_Build 7 57663586 1D CATGTTTTTT G/- TGTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 75 48 10 17 G 1 0 272849 CASAVA_Build 7 57663645 1I CAAATTTACC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 73 43 17 14 T 7 8 272850 CASAVA_Build 7 57663761 1D CTTGTCTTTG C/- TTTTGATGAT 3070 het 3070 ref 93 58 27 8 C 1 0 272851 CASAVA_Build 7 57664375 1D TCTGTCATGA C/- TGGGTGTTGA 3070 het 3070 ref 48 35 9 5 C 1 0 272852 CASAVA_Build 7 57665159 1D TATTGTTGAG T/- ATGGGTATAC 2561 het 2561 ref 84 76 6 2 T 1 0 272853 CASAVA_Build 7 57665249 4D TATCTATATA TTTG/---- TTGTATCTAA 3070 het 3070 ref 85 42 37 8 TTTG 1 0 272854 CASAVA_Build 7 57667121 2D22M1I TCAGTGAAAC TGTTGGGCCCAGAATTTTTTTTGT-/--TTGGTCCCAGATTTTTTTTTCTG GGAAGAATTT 3070 het 3070 ref 42 32 13 6 N/A 0 0 272855 CASAVA_Build 7 57667194 4D TAATTCAGAT ACTC/---- AATTTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 29 13 4 ACTC 1 0 272856 CASAVA_Build 7 57667347 1D GTTTTTATTA T/- TTTTTTAATC 3070 het 3070 hom 79 34 32 13 T 7 6 272857 CASAVA_Build 7 57667460 1D ACTCTTTATT G/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 64 22 31 11 G 1 0 272858 CASAVA_Build 7 57668518 4I TTCAGATAAA ----/TAAG TACCCACACA 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 TAAG 0 1 272859 CASAVA_Build 7 57668981 1I ATAGAATTTC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 7 8 272860 CASAVA_Build 7 57669394 1I TTAATATTTT -/C ATGTTGATTC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 C 0 1 272861 CASAVA_Build 7 57669602 1D TTGCTTAAGT A/- ACGTGCTTAG 3070 het 3070 ref 52 33 10 11 A 2 1 272862 CASAVA_Build 7 57670164 1D TTTTAAGGTT C/- CCGTGGGTAT 2855 het 2855 ref 40 28 7 5 C 3 2 272863 CASAVA_Build 7 57670533 6D CTTTGTCTCA AAAAAT/------ AAAAAATAAA 1199 het 1199 ref 15 12 3 2 AAAAAT 1 0 272864 CASAVA_Build 7 57673936 1I TTATATGATT -/G TAGAGAGTGA 3070 het 3070 ref 49 26 10 13 G 0 1 272865 CASAVA_Build 7 57680691 3I AGGGTGAGAC ---/TGA TGACGATAAT 3070 het 3070 hom 99 18 65 17 TGA 1 2 272866 CASAVA_Build 7 57681949 4I AATAGAAAAA ----/TAAT TAAAGTGATT 2691 het 2691 ref 22 9 10 3 TAAT 0 1 272867 CASAVA_Build 7 57682414 8I TGGGGTGATA --------/ACAGGAGG ACAGGAGTAC 1047 het 187 hom 6 1 3 2 ACAGGAGG 0 1 272868 CASAVA_Build 7 57685998 2I TACAGTAGTG --/CA CAGTCATGCC 1934 hom 10 het 4 0 4 0 CA 1 2 272869 CASAVA_Build 7 57695206 2I AATTTCCAAA --/AC TAAAAAGATA 1470 hom 7 het 3 0 3 0 AC 0 1 272870 CASAVA_Build 7 57701418 1D TAATGTCCTC A/- AGGTTCATTC 2412 het 2412 ref 60 49 6 5 A 2 1 272871 CASAVA_Build 7 57702747 13D GGAACTTTGA GACTTATACCCAG/------------- GGCTGAGATG 3070 het 3070 ref 90 73 17 14 GACTTATACCCAG 1 0 272872 CASAVA_Build 7 57704584 4D CCTGTGCTCT GCTG/---- GCTAAGGCAG 3070 het 3070 ref 84 66 15 6 GCTG 1 0 272873 CASAVA_Build 7 57704712 1D29M1I TTTTCTTTTG TTTTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTG-/-TTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTGT TTTTTTTTTT 1180 het 678 hom 16 7 4 5 N/A 0 0 272874 CASAVA_Build 7 57705204 3D CATCCTGTGA ACC/--- ACAACTACAG 3070 het 3070 ref 75 54 13 10 ACC 1 0 272875 CASAVA_Build 7 57707396 1I GGCTGAATAA -/T TTTGCTCATC 3070 het 3070 ref 55 33 12 10 T 3 4 272876 CASAVA_Build 7 57707658 1I AGAGTCCTCA -/G GTCTGTGTTT 3070 het 3070 ref 64 28 28 8 G 1 2 272877 CASAVA_Build 7 57709215 1D AGTTGTGTCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 69 29 29 13 T 8 7 272878 CASAVA_Build 7 57709349 6I TCCTTGCCAC ------/ATTCCG GTCCCATCCT 3070 het 3070 hom 65 23 32 10 ATTCCG 0 1 272879 CASAVA_Build 7 57711064 1I GCGTACTGTC -/A GCTGAAAATG 3070 het 3070 ref 62 32 23 7 A 0 1 272880 CASAVA_Build 7 57712136 1I TTCTCAATGA -/G GGCAAAGGGC 2024 het 2024 ref 31 20 6 5 G 2 3 272881 CASAVA_Build 7 57717933 8D AATAAACGGT GGTGTTCA/-------- GGCTTGTGCC 3070 het 3070 ref 58 36 12 16 GGTGTTCA 1 0 272882 CASAVA_Build 7 57717973 1I GAACAAGTTA -/C CTTTTCATCA 3070 het 3070 ref 60 36 15 9 C 1 2 272883 CASAVA_Build 7 57718076 1I GGAGCAAAGA -/G GTTTCTGCAA 3070 het 3070 hom 39 19 20 7 G 1 2 272884 CASAVA_Build 7 57718370 1I TGAGGAGAAA -/G AACCATCTCC 3070 het 3070 ref 43 24 13 7 G 0 1 272885 CASAVA_Build 7 57721390 1I TTCAATTTTT -/A TAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 46 32 9 5 A 0 1 272886 CASAVA_Build 7 57721701 1D CCCTGCCTTT A/- AAAAAAATTG 2392 het 2392 ref 30 23 5 4 A 8 7 272887 CASAVA_Build 7 57724474 1I GGTTGAGAAA -/T TTTTTTACAT 2162 het 2162 ref 46 36 5 5 T 6 7 272888 CASAVA_Build 7 57726421 1D AATTGGCATC T/- TTGTTTTCCA 2449 het 2449 ref 37 24 6 7 T 3 2 272889 CASAVA_Build 7 57727318 1I37M2I TAGTTACTTA -TTTTATGACTTTATTGTTATAAAAATGCTAGCTTTCT--/TTTTTATGACTTTATTGTTATAAAAATGCTAGCTTTTTTA AAAAAATCAA 2306 het 2306 ref 43 39 5 17 N/A 0 0 272890 CASAVA_Build 7 57728930 1D TTATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 804 hom 54 9 35 11 A 11 10 272891 CASAVA_Build 7 57730682 1D TCCCATGCAC T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 T 8 7 272892 CASAVA_Build 7 57731508 1D GTATTTAGCT A/- TTTTTTAGCT 1659 het 1659 ref 70 61 4 6 A 1 0 272893 CASAVA_Build 7 57732081 1D96M1D GCATTTCCAT CACCTCAAACATTTATCATTTATTTGTGTTAGGAAAATTCCACATCTTTCCTCTAGCCATTTTGAAATGTATAATAAGTTATTGTTAACGATCATCAC/-ACCTCAAACACTTATCATTTATTTGTGTTAGGAAAATTCCACATCTTTCCTCTAGCCATTTTGAAATGTATAATAAGTTATTGTTAATGATCATCA- CCTACTGTGC 3070 het 3070 ref 68 167 15 18 N/A 0 0 272894 CASAVA_Build 7 57733512 3D TCCTATTTCC AAA/--- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 51 27 11 17 A 11 8 272895 CASAVA_Build 7 57733746 1D TCTTAAGCTA C/- TGAAGTTCTG 1329 het 1329 ref 55 45 3 7 C 1 0 272896 CASAVA_Build 7 57734538 1D ACATTTATTA T/- TTTTTACATA 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 T 6 5 272897 CASAVA_Build 7 57734915 1I CCTGTCTTGA -/G ATTGCACCGA 3070 het 3070 ref 52 23 23 6 G 0 1 272898 CASAVA_Build 7 57735262 1I TAAAAATGAG -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 57 34 8 15 A 6 7 272899 CASAVA_Build 7 57735643 1D TGGGGATCTT C/- CCCCACAAGG 3070 het 3070 ref 53 30 14 12 C 5 4 272900 CASAVA_Build 7 57736107 1I CATAAGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 29 0 11 18 A 10 11 272901 CASAVA_Build 7 57737235 1D GCAGATATAT A/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 47 24 22 3 A 1 0 272902 CASAVA_Build 7 57738085 1I TACTAAATGA -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 99 74 18 7 T 6 7 272903 CASAVA_Build 7 57738386 9I TCTTTAAGTT ---------/GCAACTTCA GCAAAGTATC 3070 het 3070 ref 62 39 13 10 GCAACTTCA 0 1 272904 CASAVA_Build 7 57738415 1I AATCAATGTG -/A AAAAAATCAC 2987 het 2987 ref 96 68 7 22 A 6 7 272905 CASAVA_Build 7 57738737 1D TTAGAAAAAA G/- CCACTTTAAA 1640 het 1640 ref 48 34 7 9 G 1 0 272906 CASAVA_Build 7 57741358 4D ATATTTTCAT CAAC/---- CAACTTTTCC 3070 het 3070 ref 70 38 27 8 CAAC 2 1 272907 CASAVA_Build 7 57741462 6D CAAATTACTC ATAATT/------ ATGAGATTTT 3070 het 3070 ref 53 38 12 10 ATAATT 1 0 272908 CASAVA_Build 7 57742070 2D ATATTTCTAT TC/-- TCTGTCATCT 2771 het 2771 ref 49 34 6 11 TC 2 1 272909 CASAVA_Build 7 57742473 1I ACAGTGATAA -/T TTTTTAATGA 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 T 5 6 272910 CASAVA_Build 7 57742943 2D CTGGAGACAT AA/-- ATAGAGGAAG 3070 het 3070 ref 56 35 17 6 A 3 1 272911 CASAVA_Build 7 57743748 1I AAAGTACACA -/T TTAAAAATTA 3070 het 3070 ref 36 25 8 10 T 2 3 272912 CASAVA_Build 7 57743824 2I TTAATATTTT --/AA GTCTTAATAA 3070 het 3070 ref 47 29 16 2 A 0 2 272913 CASAVA_Build 7 57743978 4I AATGTCAACA ----/AAAT AAATGTTCAA 2638 het 2638 ref 52 41 6 5 AAAT 1 2 272914 CASAVA_Build 7 57746216 1I37M1I GAAAAGAAAA -CCCCCATGATAGTAATACAATTCCAAAAGCAAAAGGA-/CCCCCCGTGATAGTAATACAATTCCAAAAGCAAAAGGAG AAATATTGTA 3070 het 3070 hom 95 35 58 14 N/A 0 0 272915 CASAVA_Build 7 57746409 1I AATGCTAATT -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 62 31 23 8 A 6 7 272916 CASAVA_Build 7 57746864 1I TGGGAAGTCC -/A AGATCAAGGT 3070 het 3070 ref 59 31 18 10 A 1 2 272917 CASAVA_Build 7 57747048 2D7M27D AATTCCTCCC TTCTTTCTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA/--CGGTGTT--------------------------- TTTATTTATT 1383 het 1383 ref 19 11 3 5 N/A 0 0 272918 CASAVA_Build 7 57748183 4D TAAATGGCCG TGTC/---- TAAGTGCTGC 3070 het 3070 ref 59 35 16 11 TGTC 1 0 272919 CASAVA_Build 7 57748520 2I AGGATTTATC --/AG GAGCTGGGCA 3070 het 3070 hom 90 30 45 15 AG 0 1 272920 CASAVA_Build 7 57750027 2I TAAAAAAAGG --/AA AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 78 20 20 38 A 7 9 272921 CASAVA_Build 7 57752199 1I AGGATGGGGA -/T GCTTGCTCTT 3070 het 3070 ref 58 37 14 7 T 0 1 272922 CASAVA_Build 7 57752817 1D CAGTGTCTTT A/- ATCCTTGTTA 3070 het 3070 ref 74 36 32 8 A 2 1 272923 CASAVA_Build 7 57753903 3I ACTTGCAATT ---/TTC TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 TTC 0 1 272924 CASAVA_Build 7 57754629 11D CTTTCTTTCT TTCATTCTTGC/----------- TTTTTGAGAT 201 het 201 ref 30 16 2 15 TTCATTCTTGC 1 0 272925 CASAVA_Build 7 57755472 1I ATCGTTAGGG -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 97 37 54 7 T 7 8 272926 CASAVA_Build 7 57755516 4I28M1D AGAAAAAATT ----TTACTTCTTCCTTTCCATTTTGGATCCCT/TTACTTACTTCTTCCTTTCCAATTTGGATGCC- TTTGTATCTT 3070 het 3070 ref 91 42 31 33 N/A 0 0 272927 CASAVA_Build 7 57756337 1I TCTTATAATC -/T TTTTTTTATT 1855 het 1855 ref 57 36 4 17 T 7 8 272928 CASAVA_Build 7 57756532 1D CTTTATTTGC A/- TTAATCTGTA 3070 het 3070 ref 66 38 13 15 A 1 0 272929 CASAVA_Build 7 57756581 1D CTTAGTTCTT C/- TGTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 50 35 10 5 C 1 0 272930 CASAVA_Build 7 57758345 1I TTAAAGTTTG -/T TTGAAGCACT 3070 het 3070 ref 77 55 14 8 T 2 3 272931 CASAVA_Build 7 57760917 1I CTTAATTTTT -/C TTCTCATATT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 C 0 1 272932 CASAVA_Build 7 57761063 4D CTTCTCTCCT CTTC/---- CTTTGTATTC 3070 het 3070 ref 58 39 10 9 CTTC 1 0 272933 CASAVA_Build 7 57762989 3I AATCTGTAAA ---/ATT ACGATATACT 2531 het 2531 ref 43 35 6 2 ATT 0 1 272934 CASAVA_Build 7 57763440 1I ATTAGATGAC -/A AAAAAGAGAG 3070 het 3070 ref 44 23 19 3 A 5 6 272935 CASAVA_Build 7 57763840 2I ATGTACGAAG --/AA AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 39 22 10 8 A 7 9 272936 CASAVA_Build 7 57763879 1D AAACACCATT A/- AAAATTATAA 2721 het 2721 ref 55 37 6 14 A 5 4 272937 CASAVA_Build 7 57765349 2D CCAACCAAAC TG/-- TAAATCAGGT 3070 het 3070 ref 66 36 26 18 TG 1 0 272938 CASAVA_Build 7 57765440 1D TCAGGAATTT A/- CTGGAGAAGA 3070 het 3070 ref 88 57 23 9 A 1 0 272939 CASAVA_Build 7 57765570 2I AGCTATCTAG --/AA AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 70 20 26 24 A 8 10 272940 CASAVA_Build 7 57765689 1I CATAGAAAAA -/T CAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 63 34 19 10 T 0 1 272941 CASAVA_Build 7 57766363 4D AAGGGGGACT TTGA/---- TTAATGTTTG 3070 het 3070 ref 96 77 14 10 TTGA 1 0 272942 CASAVA_Build 7 57767044 2D CATGCAATCC TT/-- GTTTTCTAGA 3070 het 3070 ref 59 38 18 4 T 2 0 272943 CASAVA_Build 7 57767584 1I CCACCCTCAA -/C CCTACCAGCC 1163 het 1163 ref 55 35 5 15 C 2 3 272944 CASAVA_Build 7 57767756 1D ATATGTGAAG A/- GACACTTAGA 3070 het 3070 ref 46 35 9 2 A 1 0 272945 CASAVA_Build 7 57767826 1D CCACCCTCCA T/- GGAACATCCA 3070 het 3070 ref 66 31 30 6 T 1 0 272946 CASAVA_Build 7 57769411 1I TTTTCAAGAA -/G AAATGTATCA 3070 het 3070 ref 53 30 19 4 G 0 1 272947 CASAVA_Build 7 57771146 1I AAAGGTAAAC -/T TAAAGCCTAA 3070 het 3070 hom 76 29 44 3 T 1 2 272948 CASAVA_Build 7 57771360 3I TTAACATAAT ---/GTG GTAATTTGTA 3070 het 3070 ref 44 32 7 6 GTG 0 1 272949 CASAVA_Build 7 57771580 1I GGCTTACAAC -/T TTCAACTAGG 3070 het 3070 hom 82 37 37 8 T 2 3 272950 CASAVA_Build 7 57773596 3I AAAATACAAC ---/AAT GAGAAAGTCA 3070 het 3070 ref 64 30 31 3 AAT 0 1 272951 CASAVA_Build 7 57774910 1D AATACAGATA C/- AATATTCTGT 1971 het 1971 ref 85 71 5 10 C 1 0 272952 CASAVA_Build 7 57776476 1I CAGTGAAACG -/A AATGTTGTAC 3070 het 3070 ref 76 42 20 14 A 2 3 272953 CASAVA_Build 7 57777339 1D ATGTCCTCTC T/- TTTATTAATT 2624 het 2624 ref 51 37 6 9 T 4 3 272954 CASAVA_Build 7 57778429 1D CTATCATGGG A/- ATAGCATGGA 3070 het 3070 ref 69 45 11 13 A 2 1 272955 CASAVA_Build 7 57778638 1I ATTATATATG -/A AAAACTGAAA 3070 het 3070 ref 70 34 31 6 A 4 5 272956 CASAVA_Build 7 57779211 2D91M7D GTGAGGACAG TTTTTTTTTTTTAATTCTCTTCTGCAACCTCTGGAGTTTTGTAACTTGCATTATTCTTGTTTTACCAAAATTTATGCCTTTTATTCTATAGTCTGCAAGA/--TTTTTTTTTAAATTCTCTTCTGCAACCTCTAGAGTTTTGTAACTTGCATTATTCTTGTTTTACCAAAATTTATGCCTTTTATTCTATAGTC------- AGTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 80 59 41 41 N/A 0 0 272957 CASAVA_Build 7 57780328 1I CCAAGCCACA -/T TGGAAGCATG 3070 het 3070 ref 47 32 9 6 T 1 2 272958 CASAVA_Build 7 57786890 2D AGGACATTCT TA/-- TAAATACCTG 3070 het 3070 ref 34 23 9 3 TA 2 1 272959 CASAVA_Build 7 57789056 1D CAACTGCCAC T/- TTCCTCTCTT 1781 het 1781 ref 50 39 4 7 T 3 2 272960 CASAVA_Build 7 57789209 4D TTAATAAATG AATT/---- GAGTCTCATA 3070 het 3070 ref 54 44 7 8 AATT 1 0 272961 CASAVA_Build 7 57795352 1D AAGAATGAAT G/- GTGAAGTCGG 3070 het 3070 ref 54 42 7 5 G 2 1 272962 CASAVA_Build 7 57800141 1D TTGACCTTCT A/- AAAAAAGGAC 2678 het 2678 ref 49 43 6 1 A 7 6 272963 CASAVA_Build 7 57800302 2D TGTTTAAAAA AT/-- ATTTGCATAA 3070 het 3070 ref 52 40 7 5 AT 2 1 272964 CASAVA_Build 7 57800595 5I ATTACTCATA -----/TTTTG TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 TTTTG 0 1 272965 CASAVA_Build 7 57800688 1I ATTTGTTCAT -/A ATATCCTTAA 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 A 1 2 272966 CASAVA_Build 7 57803337 1D26M2D GCCCAACTGA CTATTAAAATATAAATGAGATCATGCCAT/-TTTTAAAATATAAATAAGATCATGCC-- TTTTTTTTGC 1853 het 1853 ref 32 31 4 8 N/A 0 0 272967 CASAVA_Build 7 57815268 1D TTATCTTTTT G/- AGACAGGTTT 3070 het 3070 ref 53 36 12 6 G 1 0 272968 CASAVA_Build 7 57818857 1D TAAATTGTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2217 hom 44 9 26 9 A 10 9 272969 CASAVA_Build 7 57821375 1I TTGTTTCTAG -/T TTTTTATCAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 5 6 272970 CASAVA_Build 7 57839447 1I ATATGGCCTC -/A AGAGACACAC 3070 het 3070 ref 39 21 9 9 A 1 2 272971 CASAVA_Build 7 57847508 1D AAAAAAAAAA C/- GTTTGTGGGA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 C 1 0 272972 CASAVA_Build 7 57866119 1I AAATTGAGAT -/A GGATCTTCCT 2155 het 2155 ref 39 22 5 12 A 0 1 272973 CASAVA_Build 7 57880393 1D AATAAAACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 T 10 9 272974 CASAVA_Build 7 57884763 1I TGCACTGACT -/G CCCTTGATCT 1989 het 1989 ref 21 14 5 2 G 0 1 272975 CASAVA_Build 7 57890057 4I TCTTCTTCCT ----/CCTC CTTGGGCTTC 3070 het 3070 ref 74 27 27 21 CCTC 0 1 272976 CASAVA_Build 7 57890090 3I CCAAAGTCTC ---/CTT ATCCTCCTTT 3070 het 3070 ref 71 22 16 33 CTT 0 1 272977 CASAVA_Build 7 57892951 1D GCATCACTCC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 81 34 43 4 T 8 7 272978 CASAVA_Build 7 57893659 1I ATGGGTTTCC -/A ATATCCAGAC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 1 2 272979 CASAVA_Build 7 57897624 2I GAGTCCTATC --/CT TTTTTATTTG 3070 het 3070 ref 36 18 9 9 CT 0 1 272980 CASAVA_Build 7 57897824 2D GTATACATTC TA/-- TGTTACATCA 3070 het 3070 ref 70 52 17 2 TA 1 0 272981 CASAVA_Build 7 57900075 1I20M1I ATTAATATTC -CCAGTTGCTAGAGAAAAATG-/GCAAGTTGCTGAAGAAAAATGA AAACGACTAG 3070 het 1034 hom 35 3 31 2 N/A 0 0 272982 CASAVA_Build 7 57905995 1I AATCAATTGT -/G GGGCAAGAGA 3070 het 3070 ref 50 22 25 3 G 3 4 272983 CASAVA_Build 7 57906477 1I GTAATTTTTC -/T TTGTGCAAAC 3070 het 3070 ref 73 31 31 11 T 2 3 272984 CASAVA_Build 7 57909489 1D TGCAGATGGG C/- CAGGACCCCG 3070 het 3070 ref 49 35 11 3 C 2 1 272985 CASAVA_Build 7 57910396 8I CAGGCTTCCC --------/GTCCTCCT GTACTCCTGT 2060 het 831 hom 10 2 6 2 GTCCTCCT 0 1 272986 CASAVA_Build 7 57912121 3I CATCGTCATT ---/ATC ATCGTCAGTC 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 ATC 1 2 272987 CASAVA_Build 7 57916497 4D ATAAACTGTT AGAA/---- AGGTTTTGTA 2383 het 2383 ref 31 16 9 10 AGAA 1 0 272988 CASAVA_Build 7 57916599 1I ATTTAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 850 het 850 ref 51 32 2 18 A 9 10 272989 CASAVA_Build 7 57918704 1D TGCTGATAAA C/- AATCATGACT 3070 het 3070 ref 76 56 10 12 C 1 0 272990 CASAVA_Build 7 57918767 3D CAAATTTGCA TAT/--- TATTACTAAT 2654 het 2654 ref 91 69 6 16 TAT 2 1 272991 CASAVA_Build 7 57921124 5D AGTATCCTTT CTTTC/----- ACCACTAAGT 1105 het 1105 ref 71 66 3 5 CTTTC 1 0 272992 CASAVA_Build 7 57921684 2D TAGTTTGCTA TT/-- TTTTTTCCAG 1436 het 1436 ref 41 30 4 9 T 8 6 272993 CASAVA_Build 7 57922627 1D TATTTCACAG T/- TACAACAATT 3070 het 3070 ref 56 31 9 16 T 2 1 272994 CASAVA_Build 7 57922891 2I64M1D CACAGTGGTA --AGTTTCTGTATCTAAACATACTTAAACATAGAAAAGTATGTAAAAATATGTATTATAATCTCATG/AGAGTTTATGTATGTAAACATACTTAAACATAGAAAAGTATGTAAAAATATGTATTATAATCTCAT- GGACCACTTT 3070 het 3070 ref 75 66 27 17 N/A 0 0 272995 CASAVA_Build 7 57923599 2I AACATCGTCT --/CA GTCATTAATT 1007 het 1007 ref 34 25 3 7 CA 0 1 272996 CASAVA_Build 7 57923745 4I AAATATTGAC ----/ATTA ATTAATGTCA 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 ATTA 1 2 272997 CASAVA_Build 7 57924079 4D ATCTTGAGAT ACTG/---- ACTCAGTTTA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 ACTG 1 0 272998 CASAVA_Build 7 57924218 1I40M1D TGGAATAAAG -GATACAACCAGTGTAAAAATCATAAACATTTTATAAATAAC/TGATAAAACCAATGTAAAAATCATAAACATTTTATAAAGAA- TTTTTGTCAT 3070 het 3070 ref 61 25 25 16 N/A 0 0 272999 CASAVA_Build 7 57924388 4I TAAAAATTCT ----/TAAC TATATTTTTA 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 TAAC 0 1 273000 CASAVA_Build 7 57925088 3I GCAATGTAAT ---/TAA TAATAAGAAG 3070 het 3070 hom 47 11 30 6 TAA 2 3 273001 CASAVA_Build 7 57925254 2I TGCTGACAAG --/AA AAAAATTTAG 3070 het 3070 hom 67 11 41 15 A 5 7 273002 CASAVA_Build 7 57926558 5D AGGTTTAAAG ATTAA/----- ATTATTCTAT 3070 het 3070 ref 63 48 11 6 ATTAA 1 0 273003 CASAVA_Build 7 57926681 2D GTCAATTAGA AT/-- ATGTTTGCAT 3070 het 3070 ref 85 66 8 11 AT 2 1 273004 CASAVA_Build 7 57927364 1D ACAAGTAGTG A/- AAAATGATAG 1133 het 1133 ref 53 39 4 11 A 5 4 273005 CASAVA_Build 7 57927409 2I ATATCTGTAA --/TG TGTGAGAAGT 2711 het 2711 ref 56 18 6 32 TG 2 3 273006 CASAVA_Build 7 57927450 1I CTGGATTGGC -/A TCGATTTCTA 3070 het 3070 ref 70 29 15 26 A 0 1 273007 CASAVA_Build 7 57928786 3D GTGTTCTTAT AGA/--- AGAAGGGAAC 3045 het 3045 ref 37 24 8 8 AGA 2 1 273008 CASAVA_Build 7 57929185 2I TAAAGAGAAA --/CT CTGAAAACAT 3070 het 3070 ref 56 36 17 3 CT 1 2 273009 CASAVA_Build 7 57930184 3I TTAAGTTATT ---/AAG AAGATGTGAT 3070 het 3070 ref 90 51 26 14 AAG 1 2 273010 CASAVA_Build 7 57930248 4D ACACACCACA CACT/---- CTCTCTCTCA 3070 het 3070 ref 83 32 17 36 CACT 1 0 273011 CASAVA_Build 7 57930339 1D GCCCCCAAAT C/- ATTACAGACA 3070 het 3070 ref 62 33 15 15 C 1 0 273012 CASAVA_Build 7 57936882 3I AAGCTCATGA ---/CTT CTTCTGTGTG 3070 het 3070 ref 46 22 21 5 CTT 1 2 273013 CASAVA_Build 7 57937476 4D AATACAACAA AAAC/---- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 65 28 14 24 AAAC 1 0 273014 CASAVA_Build 7 57938153 3D CTTTCACTTG GTT/--- GTTGTAATCT 933 het 933 ref 57 50 3 5 GTT 2 1 273015 CASAVA_Build 7 57940144 1I14M1I CTGACAGTTT -TTTTTCTTTGCATC-/ATTTTCCTTTGCATCT TTTGAATACA 1642 het 1642 ref 28 15 7 9 N/A 0 0 273016 CASAVA_Build 7 57940917 1I CAAGCTACAA -/T TATGTAAACT 2533 het 2533 ref 30 16 7 7 T 1 2 273017 CASAVA_Build 7 57941197 1I CATGACTTTA -/T CTTTATGGCA 1975 het 1975 ref 37 30 5 2 T 0 1 273018 CASAVA_Build 7 57942811 1D TTTCTTTTTT G/- CTTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 G 1 0 273019 CASAVA_Build 7 57952787 1I GAAAAAAGTA -/T TTCAAAACAG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 2 3 273020 CASAVA_Build 7 57958141 1I GAGCAGTTTT -/G AAACACTGTT 730 het 730 ref 52 25 9 18 G 0 1 273021 CASAVA_Build 7 57961240 1D ATCTGTAAGT G/- GAAATTTGGA 3070 het 3070 ref 53 38 10 6 G 2 1 273022 CASAVA_Build 7 57984632 1D AGTTACTTTG T/- GATGTGTGCA 3070 het 3070 ref 28 19 9 0 T 1 0 273023 CASAVA_Build 7 57994784 1I TCTGTCTGGA -/T TTTATGTGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 4 273024 CASAVA_Build 7 57996936 2D4M3I GCTCAATAAA ACAAGA---/--AAGATAC GATCAACTCT 3070 het 3070 ref 48 39 7 4 N/A 0 0 273025 CASAVA_Build 7 57997451 1D AATCAAAAGA T/- AGCATCGACA 1248 het 1248 ref 52 39 3 11 T 1 0 273026 CASAVA_Build 7 57999886 1I9M7I GAAGAAGTTT -TGAGAATGC-------/CTCAGAATGCTTCTGTG TAGTTTTTAT 418 het 418 ref 40 31 6 9 N/A 0 0 273027 CASAVA_Build 7 58001026 1D CAAAAAAATG A/- ATAGGTTCAA 1846 het 1846 ref 36 26 5 7 A 2 1 273028 CASAVA_Build 7 58032350 1I AAGGTGCTCG -/A AAACGTCCAC 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 3 4 273029 CASAVA_Build 7 58042662 2D GGTTTAACTC TG/-- TGAGATGAAT 3070 het 3070 hom 35 18 13 4 TG 2 1 273030 CASAVA_Build 7 58043567 1I CTTCAATCTA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 T 7 8 273031 CASAVA_Build 7 58053709 1I47M1I ACATCACAAA -AAATTTGACAGAATGCCTCTGTCTAGTTTTTATGTGAAGATATTTCC-/GAAGTTTCTTAGAATGCTTCTGTCTCGTTTTTAAGTGAAGACATTTCCT TTTCCACCAT 2735 het 2735 ref 47 50 6 8 N/A 0 0 273032 CASAVA_Build 7 61063475 3D TAAATATGTG GAA/--- GAAGATAAGA 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 GAA 2 1 273033 CASAVA_Build 7 61063558 2D GAAAAAAAAA AC/-- AGTATGGCAT 1686 het 1686 ref 57 42 4 11 AC 1 0 273034 CASAVA_Build 7 61065832 5I AACCCAGTAC -----/GGTTT AGTTTGAGTC 3070 het 3070 ref 58 42 11 5 GGTTT 0 1 273035 CASAVA_Build 7 61069865 2I TGTTATATGT --/GG GTGTGTATAT 3070 het 3070 hom 52 25 20 7 G 1 3 273036 CASAVA_Build 7 61070081 1D TGTACCTGTT A/- AAAATATTTA 1577 het 1577 ref 23 16 4 3 A 5 4 273037 CASAVA_Build 7 61070767 3I GCTGTCTTGG ---/GGA GGAGATTTGC 1872 het 1872 ref 40 30 4 6 GGA 1 2 273038 CASAVA_Build 7 61072404 1I AGGGTGATAA -/T AAAATAAATA 1627 het 1627 ref 14 8 4 2 T 0 1 273039 CASAVA_Build 7 61074259 4I CCAGCCGTCT ----/GATA AAAATAATTA 1224 het 1224 ref 35 26 4 6 GATA 0 1 273040 CASAVA_Build 7 61075195 8D TTGTTTGTTG CAAAATGC/-------- CAAAATGCAG 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 CAAAATGC 2 1 273041 CASAVA_Build 7 61075913 2I GTACCTTGAC --/AT ATATATACGT 1121 het 1121 ref 14 9 3 2 AT 3 4 273042 CASAVA_Build 7 61076171 4I GATGAGTATT ----/TGTC TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 55 31 21 3 TGTC 0 1 273043 CASAVA_Build 7 61076281 1D AGTTGTCTTT A/- CTGAATATCC 3070 het 3070 ref 25 17 8 0 A 1 0 273044 CASAVA_Build 7 61076535 3I2M4I GTGCAGCTGT ---TA----/CCCTACCAT TGTTCTCCAT 3070 het 3070 ref 53 37 12 5 N/A 0 0 273045 CASAVA_Build 7 61077582 4I TTGATGTCTT ----/AATC AAGACTTCAT 2452 het 2452 ref 69 55 6 9 AATC 0 1 273046 CASAVA_Build 7 61080967 3D GAATATTTCT CTC/--- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 89 58 11 21 CTC 1 0 273047 CASAVA_Build 7 61082788 2I GAAAATATCA --/AT ATGTTATTAA 3070 het 2274 hom 28 7 15 6 AT 1 2 273048 CASAVA_Build 7 61085920 1D TCTCAGAAAA T/- TTTTTGTGAT 3070 het 3070 ref 81 43 17 22 T 6 5 273049 CASAVA_Build 7 61088210 2I ACACTCTTTT --/TG GTAGAATCTG 2383 het 2383 ref 47 26 5 16 TG 0 1 273050 CASAVA_Build 7 61097630 1D ATTCAACTCA C/- AGAGCTGGAC 3070 het 3070 ref 81 49 16 18 C 1 0 273051 CASAVA_Build 7 61098250 1I AGGGAATATC -/A GCACCTGAAA 3070 het 3070 ref 64 39 20 5 A 0 1 273052 CASAVA_Build 7 61099685 1D CACAGAGTTG A/- AACTTTCTTT 1830 het 1830 ref 35 29 4 2 A 3 2 273053 CASAVA_Build 7 61104482 1D TGAAACTTTC T/- TTTGATAGAG 2118 het 94 hom 14 1 6 7 T 4 3 273054 CASAVA_Build 7 61255625 16D TGGAATATCT TCACAGAAAAACTACA/---------------- GAGAAGCATT 3070 het 3070 ref 47 34 20 8 TCACAGAAAAACTACA 1 0 273055 CASAVA_Build 7 61258600 4D AATCTATACT TTGA/---- TTGAGCAGTT 3070 het 3070 ref 63 49 8 7 TTGA 2 1 273056 CASAVA_Build 7 61264497 1D TTTCTATTAA T/- TGAGCAGTTT 2723 het 2723 ref 64 45 7 12 T 2 1 273057 CASAVA_Build 7 61264790 3D TCTGAGAAAT TTC/--- TTTGTGGTGT 3070 het 3070 ref 82 55 22 6 TTC 1 0 273058 CASAVA_Build 7 61269968 2D GTTTTTGAAA CT/-- CTGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 69 51 12 8 CT 2 1 273059 CASAVA_Build 7 61278606 1D GAGTAGAATC T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 58 29 27 2 T 8 7 273060 CASAVA_Build 7 61279460 1D GAGTTAAAAC T/- TTCTTTTCAT 3070 het 3070 ref 53 34 11 9 T 3 2 273061 CASAVA_Build 7 61282999 2D AGTTTTGAAA CT/-- CTCTTTTTGT 1258 het 1258 ref 47 36 3 11 CT 3 2 273062 CASAVA_Build 7 61311420 3D GAGTTTTCCT AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 het 150 hom 44 2 21 23 A 12 9 273063 CASAVA_Build 7 61368545 6D36M1I TGTTATTTTC AAATAAAATTTTATTTCTTCCTATTCAATATGGGTGACTCTT-/------AGTTTTATTTCTTCCTGTTCAATATGGATGACTCTTA TTTTTTTAGT 1423 het 344 hom 4 1 3 0 N/A 0 0 273064 CASAVA_Build 7 61371079 2I TTGCTATAAA --/CT TTTGTTTCTT 3070 het 1400 hom 23 3 20 0 CT 0 1 273065 CASAVA_Build 7 61374374 1D GAAACTGATT A/- AAAGAATTAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 4 3 273066 CASAVA_Build 7 61374503 1D TTTGTTATAT A/- AAAATATACT 3070 het 1329 hom 50 5 40 6 A 5 4 273067 CASAVA_Build 7 61376983 1D TTTGCAACTC T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 88 25 36 27 T 6 5 273068 CASAVA_Build 7 61377261 20D AGTGGAATGG AATTGGATGTAATGGAAAGT/-------------------- AGTGGAATGG 1703 het 1703 ref 92 61 19 48 AATTGGATGTAATGGAAAGT 1 0 273069 CASAVA_Build 7 61379514 10D AGGAATCGTC ATGAAATATA/---------- ATTGAATGGA 1002 het 1002 ref 67 57 3 10 ATGAAATATA 1 0 273070 CASAVA_Build 7 61386098 1I TCGAATGGAG -/T CAAATGGAAT 3070 het 3070 ref 99 72 13 14 T 0 1 273071 CASAVA_Build 7 61387682 1I TGAATGGAAT -/C GAATGGAATC 3070 het 3070 ref 97 47 39 13 C 0 1 273072 CASAVA_Build 7 61388078 16I AAATCGAATT ----------------/GAATCGTCATCGAATG GAATCTAATG 3070 hom 116 het 62 0 43 19 GAATCGTCATCGAATG 0 1 273073 CASAVA_Build 7 61398129 3I CCCCTAACTC ---/CTT CTTTGCTCCT 3070 het 3070 hom 74 25 40 9 CTT 1 2 273074 CASAVA_Build 7 61398413 1I CTGATTTTTT -/G TGTGGTTATA 1764 het 1764 ref 65 50 5 10 G 0 1 273075 CASAVA_Build 7 61403012 1D CACACCTTTT A/- ACATAAAGCT 3070 het 3070 ref 51 33 13 5 A 2 1 273076 CASAVA_Build 7 61405141 1D GCTAAAAAGG A/- AGGGAAAACA 3070 het 3070 ref 66 41 18 8 A 2 1 273077 CASAVA_Build 7 61406244 1D GTGTAGCTGA G/- AAGAGGGTTT 2864 het 2864 ref 20 13 6 1 G 1 0 273078 CASAVA_Build 7 61408221 1D ACAAGCAAAT A/- TTTATACTAG 1937 het 1937 ref 30 23 5 2 A 1 0 273079 CASAVA_Build 7 61409237 1D TAACCTTCCT C/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 69 40 15 14 C 1 0 273080 CASAVA_Build 7 61411539 1I AGCATAATAA -/C ATGGAGAAAT 3070 het 3070 ref 46 28 13 5 C 0 1 273081 CASAVA_Build 7 61413313 1D CTGATTATTC T/- TTTTTTTTCT 2496 het 2496 ref 13 7 6 0 T 9 8 273082 CASAVA_Build 7 61415543 1D TCCGTTGTGT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 82 21 31 31 A 8 7 273083 CASAVA_Build 7 61415576 1I TGTGTCCAAC -/T TTTAAAATGT 1235 het 1235 ref 71 23 4 44 T 3 4 273084 CASAVA_Build 7 61415681 2I25M1I TGAATATAAA --ATAAAAACTTTAAGAGAGTCCATTT-/TTATAAAAACTTTAAGAGAGTCCATTTA AAATATCTGG 3070 het 3070 hom 68 25 45 8 N/A 0 0 273085 CASAVA_Build 7 61416028 1I TGTATCTTTG -/C TTTTGATGGA 3070 het 3070 ref 42 27 12 3 C 0 1 273086 CASAVA_Build 7 61416447 1D TTCTCTACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 10 9 273087 CASAVA_Build 7 61419667 26D GGAATCTTTG AATGGAACCGAAAGGAATCATCATCA/-------------------------- AATGGAACCG 3070 het 3070 ref 65 73 24 44 AATGGAACCGAAAGGAATCATCATCA 1 0 273088 CASAVA_Build 7 61425981 10I GAATGGAAGC ----------/ATTGAATGGA ATCGAATGGA 1247 het 1247 ref 93 42 9 42 ATTGAATGGA 0 1 273089 CASAVA_Build 7 61433906 1D GGACTCAAAA G/- AATCATCATC 736 het 736 ref 70 61 2 8 G 1 0 273090 CASAVA_Build 7 61442161 1D CATCTTAGTA T/- TTTTTTATAT 2285 het 2285 ref 49 33 6 10 T 7 6 273091 CASAVA_Build 7 61445210 2D ACCTGCTCAA AC/-- TTTCTCACAC 2456 hom 12 het 5 0 5 0 AC 1 0 273092 CASAVA_Build 7 61450173 4D GCTAATTGAG ATTA/---- ATTGCAATAC 1406 hom 7 het 3 0 3 0 ATTA 1 0 273093 CASAVA_Build 7 61452164 1D ATAATGGTGC A/- TGCAAACATG 3070 hom 135 het 51 0 44 10 A 1 0 273094 CASAVA_Build 7 61460851 2I AAAAAAAAAA --/AG GTTTGTGCAT 3070 het 3070 ref 68 29 13 26 AG 0 1 273095 CASAVA_Build 7 61463554 1I TGAGGGTCCT -/A TCTGTTAGAA 3070 het 3070 ref 59 40 15 5 A 0 1 273096 CASAVA_Build 7 61464579 4I AATAAAAAGA ----/AACG AACAAAGCCT 3070 het 3070 hom 95 21 73 1 AACG 0 1 273097 CASAVA_Build 7 61465855 1D GAAGTAAAGC T/- CTCCTCAGCA 2014 het 2014 ref 16 9 5 2 T 1 0 273098 CASAVA_Build 7 61468921 2I ATGCAGCTAC --/AA AAAATATGAT 2929 het 2929 ref 67 49 8 10 A 4 6 273099 CASAVA_Build 7 61469996 2I TATTGTCAAG --/TA TTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 77 39 7 32 TA 0 1 273100 CASAVA_Build 7 61470218 8D TATACTTATA TTCGCATT/-------- TTTAAAGTTG 3070 het 3070 ref 76 67 10 5 TTCGCATT 1 0 273101 CASAVA_Build 7 61470633 1D GATAAAAATC A/- AAAAAGGTTA 3070 het 3070 ref 74 52 11 14 A 6 5 273102 CASAVA_Build 7 61471090 1D CACCAAAATA C/- CCCCCAAAAA 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 C 6 5 273103 CASAVA_Build 7 61471102 1I CCCCAAAAAA -/G ACTCTGACAT 1952 het 1952 ref 53 25 6 22 G 0 1 273104 CASAVA_Build 7 61471186 3I TAAATGACAG ---/AGA AGAAGGAAAT 3070 het 2557 hom 47 9 25 13 AGA 1 2 273105 CASAVA_Build 7 61471223 2I AAATATATTT --/TA TAAATACATA 2277 het 1960 hom 27 6 5 16 TA 1 2 273106 CASAVA_Build 7 61471281 3D AATTGAACAT AGG/--- AGAAAAATAG 3070 het 3070 ref 50 37 10 3 AGG 1 0 273107 CASAVA_Build 7 61471455 1I AAACTAAAAT -/A AAGAAAGCCA 3070 het 3070 ref 72 53 8 11 A 2 3 273108 CASAVA_Build 7 61473934 2I AGATTGTGCC --/AT TGCACTCTAG 3070 het 3070 hom 49 11 17 21 AT 0 1 273109 CASAVA_Build 7 61473973 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 69 19 26 24 A 8 10 273110 CASAVA_Build 7 61476017 1I GAGAAATAGT -/A GAAAAGGTAA 2604 het 2604 ref 33 19 7 7 A 0 1 273111 CASAVA_Build 7 61476681 2D AGAAATTGGC AA/-- AAAAAAAAAT 2925 het 944 hom 28 8 6 14 A 11 9 273112 CASAVA_Build 7 61477402 2D ATATTTAGTC AG/-- TGATATAAAT 3070 het 3070 ref 40 25 12 4 AG 1 0 273113 CASAVA_Build 7 61479460 1D GCATCCACAA C/- CCCCTGACCA 3070 het 3070 ref 32 23 8 2 C 5 4 273114 CASAVA_Build 7 61483469 1I TAGAATCTGC -/A AAGCGATATT 3070 het 3070 ref 65 30 25 10 A 2 3 273115 CASAVA_Build 7 61485292 1I CACATTCTAC -/A AAAACACTGT 3070 het 3070 ref 85 60 16 9 A 4 5 273116 CASAVA_Build 7 61485979 1D AAAAAAAAAA C/- AGTGTTTCCA 2977 het 2977 ref 37 20 11 6 C 1 0 273117 CASAVA_Build 7 61486073 2D TTCTTTCTAG TT/-- TTTATCTGAA 3070 het 3070 ref 46 22 17 10 T 5 3 273118 CASAVA_Build 7 61495259 1I TCTTTTTACA -/C CATAGTCCTC 3070 het 3070 ref 34 24 8 2 C 1 2 273119 CASAVA_Build 7 61495974 1D GGTCGGTGGA G/- GGGGCAGGGA 3070 het 3070 ref 56 33 19 4 G 5 4 273120 CASAVA_Build 7 61496291 1D CTGCTGAATG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 8 273121 CASAVA_Build 7 61496362 1I TTCCTTCCAG -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 6 7 273122 CASAVA_Build 7 61496799 2I AATGGTTTAA --/CT CTGTGAGATG 3070 het 3070 ref 56 27 23 6 CT 1 2 273123 CASAVA_Build 7 61496972 2D GGTTTAACTC TG/-- TGAGATGAAG 3070 het 3070 ref 42 26 13 4 TG 2 1 273124 CASAVA_Build 7 61497088 1I CAGGTTTTAC -/A AAAACAGTGT 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 A 4 5 273125 CASAVA_Build 7 61497259 1I CAGAATGGAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 56 25 24 7 A 7 8 273126 CASAVA_Build 7 61498381 3I TGATATCTTC ---/CTT CTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 23 23 2 CTT 1 2 273127 CASAVA_Build 7 61499703 2D AGTTATTTAT CA/-- GATAGTTTCC 3070 het 3070 ref 80 48 26 8 CA 1 0 273128 CASAVA_Build 7 61502508 2I ATGGACAAAA --/AC AGTGTTTCCA 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 AC 0 1 273129 CASAVA_Build 7 61502677 2D CAGAAAAACA GT/-- GTTTCCAAAC 3070 het 3070 ref 36 24 9 4 GT 2 1 273130 CASAVA_Build 7 61503560 2I GAATCAAAGG --/AA AAAGGTTTAA 3070 het 3070 ref 43 34 8 1 A 3 5 273131 CASAVA_Build 7 61503782 1D AGCTTCATTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 59 25 26 8 T 9 8 273132 CASAVA_Build 7 61504317 1I TGGGATATTA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 53 27 16 10 T 7 8 273133 CASAVA_Build 7 61505101 2I TAAGGTTTAA --/CT CTGTGAGGTG 3070 het 3070 ref 60 34 19 7 CT 1 2 273134 CASAVA_Build 7 61506359 1D TCCAGTTTTT A/- ATCCTGAAAT 3070 het 3070 ref 85 58 18 9 A 2 1 273135 CASAVA_Build 7 61511617 1I CATATGGACA -/T TTTGGGAAAT 3070 het 3070 ref 95 64 23 8 T 3 4 273136 CASAVA_Build 7 61511986 1D GCCAATGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 13 18 19 A 13 12 273137 CASAVA_Build 7 61513319 2D GAATCAAAAG AA/-- AGTTTTAACT 3070 het 3070 ref 78 52 15 12 A 3 1 273138 CASAVA_Build 7 61515097 1D ATATCCCAGG A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 70 19 43 8 A 8 7 273139 CASAVA_Build 7 61515272 1D ATCATCAGAT A/- AAAACTCTAA 3070 het 3070 hom 78 29 38 11 A 5 4 273140 CASAVA_Build 7 61517279 1I TTGAAACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 75 1 64 10 A 10 11 273141 CASAVA_Build 7 61519781 1I TAGAATATGC -/A AAAAATGATA 3070 het 3070 ref 94 61 18 15 A 5 6 273142 CASAVA_Build 7 61522724 3I ATTTGGAAAC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 71 30 20 21 T 11 14 273143 CASAVA_Build 7 61523842 4D CGAAGGAATA TTTG/---- TTTGTGCTTT 3070 het 3070 hom 61 28 29 6 TTTG 2 1 273144 CASAVA_Build 7 61524403 1I TATCTTCACA -/T GAAAACTAGA 3070 het 3070 ref 79 41 30 9 T 0 1 273145 CASAVA_Build 7 61524683 1D TGCACATGTA C/- CCTAAATCTT 2507 het 2507 ref 32 20 6 7 C 3 2 273146 CASAVA_Build 7 61527245 1D GAGAAACTGG T/- TTTGTGATGT 3070 het 3070 ref 62 32 16 15 T 4 3 273147 CASAVA_Build 7 61527482 1D TTAGAAACAC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 75 35 34 6 T 8 7 273148 CASAVA_Build 7 61531417 1I GGCCAATGAC -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 60 23 32 5 A 6 7 273149 CASAVA_Build 7 61531591 1I CTATGGTGAC -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 54 30 18 6 A 7 8 273150 CASAVA_Build 7 61532446 1D TGGTGAAAAA G/- AAAATATCTT 3070 het 3070 hom 62 20 36 7 G 1 0 273151 CASAVA_Build 7 61534004 1I GGATAAAAAC -/T AGAAGGAAGA 3070 het 3070 ref 61 34 17 10 T 0 1 273152 CASAVA_Build 7 61534168 1I TATCCCAGGA -/T AAAAACTAGA 834 het 834 ref 43 36 2 5 T 0 1 273153 CASAVA_Build 7 61534847 3I AATTGAAAAA ---/CTC AGGATAAAAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CTC 0 1 273154 CASAVA_Build 7 61540539 1I GAAAATCTTC -/T GATAAAAATT 3070 het 3070 ref 70 42 17 11 T 0 1 273155 CASAVA_Build 7 61541142 13D TGATTGAGCA GTTTGGAAACAAT/------------- GTTTTGTAGA 3070 het 3070 ref 61 40 25 7 GTTTGGAAACAAT 1 0 273156 CASAVA_Build 7 61541399 1D ACCTTCAGAT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 73 28 32 14 A 8 7 273157 CASAVA_Build 7 61548756 3D AAAACTAGAG AGA/--- AGGTTTTTGA 3070 het 3070 ref 63 45 13 7 AGA 1 0 273158 CASAVA_Build 7 61549220 1D TAGGTTGCAC A/- AAAAAACCTA 3070 het 3070 ref 78 61 11 7 A 7 6 273159 CASAVA_Build 7 61551223 2D TTGGAAACAC TT/-- TTTTTGTAGA 3070 het 3070 hom 79 30 39 12 T 7 5 273160 CASAVA_Build 7 61612213 1D GGAAACGGGA T/- TTTTTCATAT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 T 6 5 273161 CASAVA_Build 7 61617072 4D TGAAACACTC TGTT/---- TGTTAATTCT 3070 het 3070 ref 52 35 7 12 TGTT 2 1 273162 CASAVA_Build 7 61620922 1D AAACTTCTTT G/- TGGCGTTTGC 3070 het 3070 ref 34 23 9 3 G 1 0 273163 CASAVA_Build 7 61621789 2I GTATTCAACT --/CA CAGAGTTTAA 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 CA 1 2 273164 CASAVA_Build 7 61624017 1I GTTGAACCTT -/C CTTTTGATAG 3070 het 3070 ref 36 16 11 10 C 1 2 273165 CASAVA_Build 7 61627765 1I TGTACCTTCC -/T TTTTCATAGA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 4 5 273166 CASAVA_Build 7 61628185 1D CCTATGGTGG A/- AAAGAAAATA 3070 het 3070 hom 82 39 29 15 A 4 3 273167 CASAVA_Build 7 61631342 2D GAATAGAACC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 4 hom 37 1 14 23 T 11 9 273168 CASAVA_Build 7 61654387 1D CATTTTCTAC A/- AAGGAGAGTC 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 A 3 2 273169 CASAVA_Build 7 61656988 1D TCAAAAGATC G/- GTTCAACTCT 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 G 2 1 273170 CASAVA_Build 7 61667377 1I AGCAGATAAT -/A TAAAAAGACT 1837 het 1837 ref 33 27 4 2 A 0 1 273171 CASAVA_Build 7 61672273 1I AAGTTTCTCA -/G GTTGGTTCTC 3070 hom 71 het 27 0 22 5 G 1 2 273172 CASAVA_Build 7 61676476 1D TCTACAAAAA G/- ACTGTTTCCA 3070 het 2924 hom 23 6 12 6 G 1 0 273173 CASAVA_Build 7 61680777 1I CTGCTCAATC -/A AAAGAAAGGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 3 4 273174 CASAVA_Build 7 61700260 1D TTTTTTAAGG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 8 7 273175 CASAVA_Build 7 61705317 1D AAACAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2301 het 665 hom 8 2 5 1 T 13 12 273176 CASAVA_Build 7 61733249 1D CACAAAATAT C/- CCTTTGTTGA 3070 het 3070 ref 42 23 13 7 C 3 2 273177 CASAVA_Build 7 61735589 1I TGCACAATAC -/A AAAAGCAGTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 4 5 273178 CASAVA_Build 7 61738015 1D ATAGAGACAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 9 8 273179 CASAVA_Build 7 61776852 1I GGCCAATGGC -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 6 7 273180 CASAVA_Build 7 61782530 4I AAAAAGGATA ----/TATC TATCTTCAGA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TATC 1 2 273181 CASAVA_Build 7 61793487 1I TTATTTTTTT -/A TTTTTTATTT 1425 hom 10 het 5 0 4 1 A 0 1 273182 CASAVA_Build 7 61830704 1I AGTCAATGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 9 10 273183 CASAVA_Build 7 61832787 6I ATCTTCAGAT ------/AAAAAC AAGAAAGAAG 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 AAAAAC 0 1 273184 CASAVA_Build 7 61851452 1I TGGAGTTAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 T 8 9 273185 CASAVA_Build 7 61853789 15I TTGGATAAAA ---------------/ACAAGAAATAAGCTT ACAGAGAAAT 3070 hom 84 het 29 0 29 5 ACAAGAAATAAGCTT 0 1 273186 CASAVA_Build 7 61871295 1I ACAAGGCGGC -/T TTTACAGATA 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 3 4 273187 CASAVA_Build 7 61881865 3I ATTTGGAAAC ---/TGT TGTTGTAGGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TGT 2 3 273188 CASAVA_Build 7 61882621 1I ATATCCCAGG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 A 7 8 273189 CASAVA_Build 7 61900616 1D GCCAAAGTTG A/- AAAAGTGAAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 5 4 273190 CASAVA_Build 7 61902642 1D TGGGGTTTTT G/- CTTTTGCACC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 G 1 0 273191 CASAVA_Build 7 61910840 1I TTCTTTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 26 1 18 7 T 11 12 273192 CASAVA_Build 7 61911109 1D CAAACTGCTG A/- AATCTCAAGA 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 A 3 2 273193 CASAVA_Build 7 61911285 2D TGGTTGAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1685 hom 38 7 15 16 A 12 10 273194 CASAVA_Build 7 61924388 1D TATCTTCAGA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 2 1 273195 CASAVA_Build 7 61968882 1D AGCCCATGGG T/- GGGGGAAGCA 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 T 1 0 273196 CASAVA_Build 7 61972676 1D ATATCCCAGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 38 hom 35 3 29 3 A 9 8 273197 CASAVA_Build 7 61980618 2D GAGTTAAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 T 12 10 273198 CASAVA_Build 7 61983493 1D CAAAAACTAG A/- AGGAAGCTTT 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 A 2 1 273199 CASAVA_Build 7 61986686 1I GCCTACGTTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 8 9 273200 CASAVA_Build 7 61988218 4I GATAAAAACT ----/AGAA AGAAACTTTC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AGAA 1 2 273201 CASAVA_Build 7 61991533 1D ATAGTTAAAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 40 17 18 7 T 8 7 273202 CASAVA_Build 7 62011578 1I ATTTGTCTAA -/T TTTTTTCCGT 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 T 6 7 273203 CASAVA_Build 7 62040989 1I GGCCAATGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 9 10 273204 CASAVA_Build 7 62046662 1D AACTATAGTG A/- AAAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 A 6 5 273205 CASAVA_Build 7 62060593 1D AAGGATATTT G/- GCTGCGCATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 G 2 1 273206 CASAVA_Build 7 62064546 1I GGCCAACCGC -/A AAAAAGCCAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 5 6 273207 CASAVA_Build 7 62071738 1I ACTGTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 9 10 273208 CASAVA_Build 7 62073446 1D74M5D CATTCAGCAG TTTGGAAACAATGTTTTTGTTGAATCTGTGAAGGGATATTTAGGAGAGCATTGGGGCTTATGGTGAAAAAGGAAATATCT/-TTGGAAACAATGTTTTTGTTGAATCTGTGAAGGGATATTTAGGAGAGCATTGGGGCTTATGGTGAAAAAGGAAA----- TAGGATATAA 3070 het 3070 ref 39 26 23 13 N/A 0 0 273209 CASAVA_Build 7 62083157 3D AAACTGATTT GTG/--- GTGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 GTG 2 1 273210 CASAVA_Build 7 62085641 2D AGAATGAAAC TT/-- TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 52 26 21 7 T 4 2 273211 CASAVA_Build 7 62088439 1D AGAATCTGAG A/- AGGGATATTT 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 A 2 1 273212 CASAVA_Build 7 62093073 1I GGAGTGGTGA -/G AGAGGGCATC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 0 1 273213 CASAVA_Build 7 62098948 1D GTCACAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 134 hom 29 1 17 11 A 11 10 273214 CASAVA_Build 7 62100732 1D TGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 26 1 20 5 A 14 13 273215 CASAVA_Build 7 62105338 5D TATATATCCA CTTCT/----- CTTCTACTTC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 CTTCT 2 1 273216 CASAVA_Build 7 62109044 23D7M1D AATTGTTGTA CTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAT/-----------------------TTTTTTA- TTATTTATTT 2050 het 2050 ref 24 14 5 7 N/A 0 0 273217 CASAVA_Build 7 62112403 2D GGGTGTGGTG GC/-- TTGTGCCTGT 390 het 390 ref 42 35 2 6 GC 1 0 273218 CASAVA_Build 7 62115521 1D ACTGAGGAGG C/- TCTTAGGCAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 C 1 0 273219 CASAVA_Build 7 62127648 1D TGGGGGGGTC G/- GGGGGTTAGC 3070 het 3070 hom 27 13 14 1 G 6 5 273220 CASAVA_Build 7 62128917 2D TTCATAGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 1430 het 737 hom 38 11 9 19 T 20 18 273221 CASAVA_Build 7 62144688 15D ATTATCAATG ATTATCAATGTCATC/--------------- ATTATCAATG 3070 het 3070 hom 44 17 20 12 ATTATCAATGTCATC 2 1 273222 CASAVA_Build 7 62148098 3D AAAGAAAGAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 AAG 7 6 273223 CASAVA_Build 7 62157970 6D TGTTGTTATG AAACTT/------ AAACAGTCAC 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 AAACTT 1 0 273224 CASAVA_Build 7 62174567 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2823 hom 28 11 11 6 A 12 11 273225 CASAVA_Build 7 62196840 5I TCCCCATGTC -----/ATTAA ATTATTCTAC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 ATTAA 0 1 273226 CASAVA_Build 7 62209224 1D CTTGGGAGGC T/- TGAGACAGGA 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 T 2 1 273227 CASAVA_Build 7 62218493 1D GACCCTGTAA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 T 9 8 273228 CASAVA_Build 7 62220847 1D GGCTATTACC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 52 18 29 6 A 8 7 273229 CASAVA_Build 7 62222617 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 10 9 273230 CASAVA_Build 7 62223074 1D CCTACTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 21 1 10 10 T 13 12 273231 CASAVA_Build 7 62227938 1I TGTAGAGCAC -/T TTGTGTAGTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 3 273232 CASAVA_Build 7 62232391 1I GAAAAATCTG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 8 273233 CASAVA_Build 7 62245280 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 22 10 9 4 A 8 9 273234 CASAVA_Build 7 62245831 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2535 hom 26 8 11 7 A 10 11 273235 CASAVA_Build 7 62257171 1D GACACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 971 het 971 ref 32 22 4 7 A 13 12 273236 CASAVA_Build 7 62257632 2I TTGTTTTTTC --/TG TGACTGGCTC 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 TG 1 2 273237 CASAVA_Build 7 62259690 8D AGGGCCAGTT TGGGATTA/-------- TGGGATTATG 3070 het 3070 ref 16 7 7 2 TGGGATTA 2 1 273238 CASAVA_Build 7 62264537 1D TCCCCCTTTT A/- AAAATCAGGA 3070 het 3070 ref 39 26 10 4 A 5 4 273239 CASAVA_Build 7 62267434 1I GAGGCAGAAG -/A ATCACTTGAA 2112 het 1150 hom 9 3 5 1 A 1 2 273240 CASAVA_Build 7 62269707 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 6 7 273241 CASAVA_Build 7 62272867 3D ATGAAAAAAA CTC/--- CTGCAGCTAG 2186 het 2186 ref 19 10 6 4 CTC 1 0 273242 CASAVA_Build 7 62276801 1I TAAATAATTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 8 9 273243 CASAVA_Build 7 62317816 1D GGAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 19 1 14 4 A 12 11 273244 CASAVA_Build 7 62341354 1D AAAGAAAAAA T/- AAAAGGACGA 2245 het 2245 ref 43 33 5 5 T 1 0 273245 CASAVA_Build 7 62343415 3I GAAAGAGTGT ---/TCA TCTTTATATT 3070 het 3070 ref 17 9 7 1 TCA 0 1 273246 CASAVA_Build 7 62345520 3D GTATTTAAAT AAC/--- AATAGCTTTT 3070 het 3070 ref 41 27 13 2 AAC 1 0 273247 CASAVA_Build 7 62345846 3I ATTAACTGTA ---/CTT CTTCTTTTTT 2870 het 2870 ref 45 32 6 7 CTT 2 3 273248 CASAVA_Build 7 62346334 3I TTCTAATTAT ---/ACC ACTTATATTC 1886 het 1886 ref 33 25 4 4 ACC 0 1 273249 CASAVA_Build 7 62347748 1D CCCAATTGAG A/- AAAAAAAAAA 2908 het 2908 ref 31 15 8 8 A 11 10 273250 CASAVA_Build 7 62350231 6D AATTGAGAAC TTTATA/------ TTTAATTCTT 3070 het 3070 ref 20 11 9 2 TTTATA 1 0 273251 CASAVA_Build 7 62353697 2D CCACTTAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1544 het 1463 hom 38 12 6 20 T 20 18 273252 CASAVA_Build 7 62378660 4D AAAACTGTAG TTAT/---- TTAAAGAATT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TTAT 1 0 273253 CASAVA_Build 7 62588875 4I CTTTTCATGG ----/ACCT CTTGTTAGCT 2562 het 2374 hom 15 8 6 1 ACCT 0 1 273254 CASAVA_Build 7 62601096 1I AAGGTGCAGT -/A AAAATACAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 4 5 273255 CASAVA_Build 7 62617676 1D CATTTTTTAG A/- GATGTAATAT 3070 het 3070 ref 51 31 17 3 A 1 0 273256 CASAVA_Build 7 62617799 4I TGTACTTACT ----/GACA TTGTTATTAA 3070 het 3070 ref 42 27 11 4 GACA 0 1 273257 CASAVA_Build 7 62620749 1D GCTCTCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 13 12 273258 CASAVA_Build 7 62623283 1D ACAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 26 21 16 A 11 10 273259 CASAVA_Build 7 62626254 1I ATTAACTAGA -/T TTTTTTTTTG 1884 het 1884 ref 25 20 4 1 T 9 10 273260 CASAVA_Build 7 62630650 1I AGACTGGACT -/A AAACGCCTAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 3 4 273261 CASAVA_Build 7 62653568 1I CATGACCACT -/G AGCTCACAGC 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 G 0 1 273262 CASAVA_Build 7 62655653 1I GCCAGAAACA -/C CATCCCCAGG 2440 het 2440 ref 19 12 6 1 C 1 2 273263 CASAVA_Build 7 62657380 1I TACAAAAATT -/A AATGGAAGTG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 2 3 273264 CASAVA_Build 7 62657545 1D GCAAGCAAAC A/- AAAAAAAATC 1765 het 1765 ref 25 19 5 1 A 9 8 273265 CASAVA_Build 7 62660551 1D GTCCAGCCAT C/- CCCCACCCTG 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 C 5 4 273266 CASAVA_Build 7 62661388 1I GGCGTTTCCA -/G GGGGGAGGAC 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 G 5 6 273267 CASAVA_Build 7 62664212 1D AAATCTTTTC T/- TTTTTTTTAA 2871 het 2871 ref 23 12 6 6 T 9 8 273268 CASAVA_Build 7 62693836 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 2356 het 285 hom 6 1 5 0 A 11 10 273269 CASAVA_Build 7 62694816 2D GTGGCCTGAC TT/-- TGCGTTTCAG 2142 het 2142 ref 25 18 5 4 T 3 1 273270 CASAVA_Build 7 62694899 1I GCTCACGTCT -/A GGGGGGGTAG 3070 hom 99 het 36 0 32 4 A 0 1 273271 CASAVA_Build 7 62726609 1I AGCTGCATGA -/C CCCCCCTACC 1215 het 227 hom 6 1 3 2 C 6 7 273272 CASAVA_Build 7 62738013 1I AAAGGTTAGC -/T GTCTTCTCTC 1961 het 469 hom 6 1 4 1 T 0 1 273273 CASAVA_Build 7 62741921 1I AAGTGAAAGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 102 hom 75 1 59 15 A 8 9 273274 CASAVA_Build 7 62743811 2I ACATACATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 63 32 17 14 AT 5 6 273275 CASAVA_Build 7 62743851 6D CCACAAAAAT TAAAAA/------ TAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 50 24 13 15 TAAAAA 2 1 273276 CASAVA_Build 7 62744550 1I AAAAGAGGGG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 60 37 21 2 A 8 9 273277 CASAVA_Build 7 62745349 1I TTTTTTGTAC -/T TTTTTTTTTT 2366 het 2366 ref 33 13 8 12 T 11 12 273278 CASAVA_Build 7 62746308 19D CCTCAGCTTC TCTCCCAACACTCAGCTTT/------------------- TCTCCCAACA 3070 het 3070 ref 51 21 14 21 TCTCCCAACACTCAGCTTT 1 0 273279 CASAVA_Build 7 62746394 1D CCTGGCCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 46 0 27 20 T 13 12 273280 CASAVA_Build 7 62748002 3I TTTTTCTTTC ---/TTT CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 T 0 3 273281 CASAVA_Build 7 62748496 4D GAAATTTCTC TGAG/---- TGAGTCTCTA 3070 het 3070 ref 83 38 36 12 TGAG 2 1 273282 CASAVA_Build 7 62751629 1D AACAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 26 13 1 A 10 9 273283 CASAVA_Build 7 62752229 1D GGGGGGAAGG T/- AAATTGGTAC 3070 het 3070 hom 67 28 31 9 T 1 0 273284 CASAVA_Build 7 62753956 6D CACATACACA CACACT/------ CACACACACA 3070 het 2173 hom 96 17 47 41 CACACT 1 0 273285 CASAVA_Build 7 62756857 2D CACCCAATAA AC/-- ACTTATTTAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AC 2 1 273286 CASAVA_Build 7 62763143 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2826 het 2733 hom 17 7 7 3 A 12 11 273287 CASAVA_Build 7 62767531 1D TCTAAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 20 1 13 6 A 11 10 273288 CASAVA_Build 7 62770887 1D CCTGCTCTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 10 9 273289 CASAVA_Build 7 62791085 1D AAGATGGAGG C/- CCTGCACGCT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 3 2 273290 CASAVA_Build 7 62793871 2I TTCATGAGTT --/AA AAATGCAGAT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 3 5 273291 CASAVA_Build 7 62794484 1D AATCTTCACA T/- TTTCATATTT 1856 hom 10 het 4 0 4 0 T 4 3 273292 CASAVA_Build 7 62795786 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 15 14 273293 CASAVA_Build 7 62796675 1I CATCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 2482 het 309 hom 16 1 8 7 A 10 11 273294 CASAVA_Build 7 62805072 1I TTGTGATCTG -/C CTGCCTTGGA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 C 1 2 273295 CASAVA_Build 7 62822243 1D TGTTATTATC T/- TTTTTTTTCT 2479 hom 12 het 5 0 5 0 T 9 8 273296 CASAVA_Build 7 62826819 2I GAATTTAGTT --/AA AGTTTCACAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 1 3 273297 CASAVA_Build 7 62827233 1I AGATGGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 31 1 25 5 T 10 11 273298 CASAVA_Build 7 62833518 3D CAAGACTAAT AAA/--- GAAGAAAAGA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 3 0 273299 CASAVA_Build 7 62836635 11I AGAAAAAGAA -----------/AGAAAAAAGAG AAAACATGAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AGAAAAAAGAG 0 1 273300 CASAVA_Build 7 62837017 4D TGCTCATTTT AGAA/---- AGGCTGTGGG 3070 het 458 hom 21 2 13 6 AGAA 1 0 273301 CASAVA_Build 7 62839396 1D ACCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTC 2982 het 1857 hom 18 6 7 5 T 10 9 273302 CASAVA_Build 7 62865757 1I AATACAAAAA -/T TTAGCCGGAC 1528 het 1528 ref 13 8 4 1 T 2 3 273303 CASAVA_Build 7 62884744 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1752 het 10 hom 19 1 9 9 A 15 14 273304 CASAVA_Build 7 62886821 2D ATTCATAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 1409 het 54 hom 15 2 5 8 T 18 16 273305 CASAVA_Build 7 62894907 12D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 13 0 14 0 A 23 11 273306 CASAVA_Build 7 62898606 1I TGTACTACTT -/A AAAAAACACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 7 273307 CASAVA_Build 7 62905227 12D CACTCTTTGT TTCCCACTTCTC/------------ TTCCCACTTC 3070 hom 42 het 19 0 15 6 TTCCCACTTCTC 1 0 273308 CASAVA_Build 7 62908846 3D TGCTATCTCA CTT/--- CTTCTTTTTT 3070 hom 64 het 28 0 22 7 CTT 3 2 273309 CASAVA_Build 7 62926424 2D CCCATTTAAC AT/-- ATGAGGATTT 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 AT 2 1 273310 CASAVA_Build 7 62927703 3I AAAGATTAAA ---/ATC ATGCACAGTA 3070 het 3070 ref 43 30 9 4 ATC 0 1 273311 CASAVA_Build 7 62929483 1I GGCAATGTCA -/T TTTTTTTAAT 1398 het 1398 ref 30 22 3 5 T 7 8 273312 CASAVA_Build 7 62930951 1I TCTCAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 2755 het 2755 ref 29 17 7 5 A 10 11 273313 CASAVA_Build 7 62932544 2I TTCTACCCAC --/AT GATTTATGGG 2229 het 2229 ref 45 26 7 12 AT 0 1 273314 CASAVA_Build 7 62934568 1D CCTTCCCTGC T/- TTTGGAGTCT 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 4 3 273315 CASAVA_Build 7 62946031 1D GTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 8 273316 CASAVA_Build 7 62947002 3I GAAAAAAAAA ---/AGC AGTGGTATAA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 AGC 0 1 273317 CASAVA_Build 7 62959256 2I TAGTAGAGAC --/AG AGAGTTTTAC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 AG 2 3 273318 CASAVA_Build 7 62973745 1D TGTGCCACTA T/- TTTTTTTTTT 1037 het 1037 ref 49 36 3 10 T 11 10 273319 CASAVA_Build 7 63006378 5I GGTCTTTCAC -----/TAAAG TAATCAATGT 1799 het 1799 ref 30 26 4 0 TAAAG 0 1 273320 CASAVA_Build 7 63017247 5D TCCTTGAAAG AAACA/----- AAACAACCTA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AAACA 2 1 273321 CASAVA_Build 7 63022330 3D AGAAATGGAA ATG/--- ATGAAAAGAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 ATG 2 1 273322 CASAVA_Build 7 63030490 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 1813 het 1813 ref 19 10 5 4 T 13 14 273323 CASAVA_Build 7 63057667 1I GTTCTCAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 56 het 30 0 23 7 T 9 10 273324 CASAVA_Build 7 63060947 1I TTGGTTATTA -/T TTTTTTTTTT 2006 het 2006 ref 24 11 9 4 T 13 14 273325 CASAVA_Build 7 63083015 14I ACCTTTCTAG --------------/ACACACACACATGC ACACACACAC 3070 hom 75 het 39 0 26 13 ACACACACACATGC 0 1 273326 CASAVA_Build 7 63089169 12D AAAGAAGTGT ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 60 het 22 0 20 5 AC 12 6 273327 CASAVA_Build 7 63094274 14I TAAAAATACG --------------/AAAATTAGCCGGGC ATGGTGGCGT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 AAAATTAGCCGGGC 0 1 273328 CASAVA_Build 7 63096734 1D CCTAGAGGCC A/- AGCCTCTGTG 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 2 1 273329 CASAVA_Build 7 63103235 5D TATGCTATTC TCTTT/----- TCTTAGAGTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TCTTT 1 0 273330 CASAVA_Build 7 63104647 4D TATATGTATG TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 TATT 4 3 273331 CASAVA_Build 7 63108884 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 9 10 273332 CASAVA_Build 7 63115164 1I GCTGCTACAC -/A TGCAGCCTGG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 0 1 273333 CASAVA_Build 7 63117096 1I AGAGCGAGAC -/A ACCATTTAAA 2690 het 2690 ref 20 7 7 6 A 1 2 273334 CASAVA_Build 7 63118284 1D CTCAAGCCTT G/- GGTGGCTTCC 3070 hom 42 het 18 0 13 5 G 3 2 273335 CASAVA_Build 7 63119321 4I AAAAAGAGCC ----/AGAG AGAGAAATAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AG 2 4 273336 CASAVA_Build 7 63121730 5D GTACAACTAT AGATA/----- AGATGACTAG 3070 het 3070 ref 35 22 9 7 AGATA 1 0 273337 CASAVA_Build 7 63140226 2I GAGAGGTAAC --/AG GGGCTGTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 AG 0 1 273338 CASAVA_Build 7 63145568 2D AAGATTTTTT TC/-- CCTCTCAACC 3070 het 3070 ref 30 18 11 2 TC 1 0 273339 CASAVA_Build 7 63150192 3D TTTCTCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2242 het 1071 hom 34 9 10 15 T 21 18 273340 CASAVA_Build 7 63153230 2I ACTTCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 A 11 13 273341 CASAVA_Build 7 63154447 1D AACTGAGTAA C/- AGTAATAAGA 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 C 1 0 273342 CASAVA_Build 7 63155543 1D TTAAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 12 11 273343 CASAVA_Build 7 63158652 3D TGCTATAAAC CTT/--- CTTAGTACTT 3070 het 3070 hom 31 15 14 3 CTT 2 1 273344 CASAVA_Build 7 63159851 6D TTGTCGTTTC TATTTA/------ TATCTTATTA 2304 het 2304 ref 20 12 7 1 TATTTA 1 0 273345 CASAVA_Build 7 63160911 2I CATATCTCTG --/TC TCTCAGGATT 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 TC 2 3 273346 CASAVA_Build 7 63161432 6I GCCCACAGTG ------/ACCACT ACCTAGCTAC 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 ACCACT 0 1 273347 CASAVA_Build 7 63163982 1D AAACAAATTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 10 15 2 A 9 8 273348 CASAVA_Build 7 63164281 26D AGACCAATGG AACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAAT/-------------------------- ACCGCATATC 3070 het 3070 ref 15 11 9 7 AACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAAT 1 0 273349 CASAVA_Build 7 63164953 1D AACAAACATG A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 35 17 15 4 A 8 7 273350 CASAVA_Build 7 63165717 1I TAAAGCTTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 16 hom 27 1 23 3 A 8 9 273351 CASAVA_Build 7 63168263 2D GTATATAAAC AT/-- GTGTATATAT 3070 het 3070 ref 32 14 12 7 AT 1 0 273352 CASAVA_Build 7 63171124 1I TTTTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 1931 het 1931 ref 17 10 5 2 G 0 1 273353 CASAVA_Build 7 63173847 1I42M2I AATTTTGTTT -ACTATTTTATATTTTAGTGGCTCATGTTTTAGTTGGCTATGT--/CACTATTTTATATTTTAGTGGCTCATGTTTTAGTTGGCTATGTCA CATTAATTAA 3070 het 3070 ref 39 34 14 8 N/A 0 0 273354 CASAVA_Build 7 63175074 1D TTTGTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 12 11 273355 CASAVA_Build 7 63182836 1I TTGCAAATTC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 7 8 273356 CASAVA_Build 7 63183944 1D GATTACAGGT G/- TGAGCCACTG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 G 1 0 273357 CASAVA_Build 7 63186634 2D TACGGGAAAC AA/-- AGGGATGGGC 3070 het 3070 ref 45 22 21 4 A 3 1 273358 CASAVA_Build 7 63192763 1D ACAAGCAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 10 9 273359 CASAVA_Build 7 63195266 1D TATTTTTGTA T/- TTTTATTAGA 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 T 5 4 273360 CASAVA_Build 7 63196108 2I TTTTTTTGGG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 9 11 273361 CASAVA_Build 7 63203823 3I CTTTTTCAGA ---/TGT TGTCAAAACT 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 TGT 1 2 273362 CASAVA_Build 7 63205450 5I GGTGTATGGT -----/AAATG AAATGAAATT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AAATG 1 2 273363 CASAVA_Build 7 63206057 2I ATGTACAGAA --/TG TACATAGGGA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 TG 0 1 273364 CASAVA_Build 7 63206323 5I GCTTAACCTA -----/TAACT TAACTTTGAC 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 TAACT 1 2 273365 CASAVA_Build 7 63211238 2I AGTTTTTGTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 9 11 273366 CASAVA_Build 7 63219565 1I TCTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 A 10 11 273367 CASAVA_Build 7 63221895 2I AAAAGAAAAA --/AG AGCACACAAA 3070 het 2595 hom 38 12 20 6 AG 1 2 273368 CASAVA_Build 7 63222679 1I ACCCTGTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 9 10 273369 CASAVA_Build 7 63222908 1I TGTAGCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 10 11 273370 CASAVA_Build 7 63224738 2D GCTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1385 het 1384 ref 19 11 4 6 A 18 16 273371 CASAVA_Build 7 63227396 6D TATTTTTTTA TTATAC/------ TTATAAGTTC 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 TTATAC 1 0 273372 CASAVA_Build 7 63229857 1I TTTCCTACTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 54 34 17 3 T 7 8 273373 CASAVA_Build 7 63229926 5D ATGGTATGAT CTTGG/----- CTCACTGTAG 3070 het 3070 ref 36 23 9 11 CTTGG 1 0 273374 CASAVA_Build 7 63238554 2I GGAAGGAAAC --/AG AATGAAATAG 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 AG 0 1 273375 CASAVA_Build 7 63240495 1I AGAGGTGGGG -/T CTTCCTCTGT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 0 1 273376 CASAVA_Build 7 63240710 2D CAAAAAGTGT GA/-- GAGAGAGCAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 GA 4 3 273377 CASAVA_Build 7 63240799 2D CGAAACTTAA AC/-- ACCTCCCATC 3070 het 3070 ref 39 17 19 4 AC 2 1 273378 CASAVA_Build 7 63242842 1I TTTTCTAAAA -/C CCCCCCTAGG 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 C 6 7 273379 CASAVA_Build 7 63244583 1D AGTTTTGTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 9 8 273380 CASAVA_Build 7 63245888 5I TCTTCTCTTC -----/TCTTT TCTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 TCTTT 3 4 273381 CASAVA_Build 7 63249178 1D AATACTACCA T/- TTTTTTTTTT 2991 het 2991 ref 22 9 9 4 T 13 12 273382 CASAVA_Build 7 63250846 1D AGATGGTGTA T/- TTTTTCCATT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 6 5 273383 CASAVA_Build 7 63257870 1D CAGACTTTTA T/- TGTCCACAAG 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 2 1 273384 CASAVA_Build 7 63259493 3I ACGAGTTGAG ---/AGA AGAAGGCTTC 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 AGA 1 2 273385 CASAVA_Build 7 63264979 3D GTCACAAAAT AAG/--- AAGCAGAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 AAG 2 1 273386 CASAVA_Build 7 63265208 2I TAAAATACAC --/AT GTGATATGTA 1719 hom 15 het 12 0 6 6 AT 0 1 273387 CASAVA_Build 7 63265841 1D GACCAGAAAA C/- AGTCAATTCC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 1 0 273388 CASAVA_Build 7 63269721 1I TTTTAATTTT -/C CCCCCATTTA 3070 het 3070 hom 31 11 20 0 C 5 6 273389 CASAVA_Build 7 63274044 2D GGGAGGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2564 hom 30 12 8 10 TG 10 9 273390 CASAVA_Build 7 63274548 2I ATTAGAAAAC --/TG TGTCATTAAA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 TG 1 2 273391 CASAVA_Build 7 63275782 1I AACCAAAAGA -/C CTGAATTTAT 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 C 1 2 273392 CASAVA_Build 7 63277093 5D CAAATATGAT TATAC/----- TATACATGTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 TATAC 2 1 273393 CASAVA_Build 7 63284481 3D TTCCTTACTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1330 hom 34 6 16 12 A 13 10 273394 CASAVA_Build 7 63287666 4D ACAGAAACTT ATAG/---- AGAGAAAATT 3070 het 3070 hom 21 7 11 3 ATAG 1 0 273395 CASAVA_Build 7 63288538 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3044 hom 20 7 11 2 A 9 10 273396 CASAVA_Build 7 63288918 2D AAATTAATAA TC/-- TGTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 TC 1 0 273397 CASAVA_Build 7 63291420 4I ATTGTCTTTG ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 TGTT 3 4 273398 CASAVA_Build 7 63292743 1D AAATTGGCTG C/- TGGAGGCTTC 3070 het 926 hom 21 6 10 5 C 1 0 273399 CASAVA_Build 7 63300923 6D CTTTGGTTTT TTTTTG/------ TTTGTTTGTT 2501 het 840 hom 22 8 7 8 TTTTTG 1 0 273400 CASAVA_Build 7 63301308 2D AGATAAGAAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 GA 8 7 273401 CASAVA_Build 7 63302657 1I TGTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 1924 het 1924 ref 17 10 4 3 A 9 10 273402 CASAVA_Build 7 63306435 1D TTATATAGGT A/- AAATCATATC 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 A 4 3 273403 CASAVA_Build 7 63307165 1D TTTGTTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 138 hom 20 2 13 5 T 15 14 273404 CASAVA_Build 7 63307398 1D TTGGCCTCTG A/- AAGTGCTGGG 2742 het 2587 hom 19 6 7 8 A 3 2 273405 CASAVA_Build 7 63308555 3D GAGAAGCTCA TTG/--- TTCTCTCATT 2873 het 2873 ref 16 9 6 1 TTG 1 0 273406 CASAVA_Build 7 63310605 1I CTTGGTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1852 hom 32 7 12 13 A 13 14 273407 CASAVA_Build 7 63313466 1D AAGAGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 11 10 273408 CASAVA_Build 7 63314109 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2119 het 2119 ref 16 7 6 3 A 13 14 273409 CASAVA_Build 7 63331914 2I GAACAGGGCT --/GA GTTCCAGATC 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 GA 0 1 273410 CASAVA_Build 7 63333122 3D AGAAAATAGA AAC/--- AACATACAAT 3070 het 1964 hom 34 5 14 16 AAC 2 1 273411 CASAVA_Build 7 63333309 1D TTAGCATAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 9 8 273412 CASAVA_Build 7 63340582 1D TCACCTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 272 hom 40 4 17 19 T 13 12 273413 CASAVA_Build 7 63345395 2I ATTTTGAGAC --/AG AGTCGCTCTG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 AG 1 2 273414 CASAVA_Build 7 63360864 1I TTTAGTTTTA -/T TCAGTTTTGG 2961 het 2961 ref 22 13 7 2 T 1 2 273415 CASAVA_Build 7 63362067 1I TTAAACTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 8 8 A 9 10 273416 CASAVA_Build 7 63366641 1I AACGAAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 11 12 273417 CASAVA_Build 7 63367952 1I GTTTTATATA -/T TTTTTTACAT 2388 het 2388 ref 37 26 5 6 T 6 7 273418 CASAVA_Build 7 63372102 2I AGAAAACAAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 9 11 273419 CASAVA_Build 7 63374713 1I AAGTTAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 A 9 10 273420 CASAVA_Build 7 63391264 1I AATCCCCACT -/G GGGCACGGCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 3 4 273421 CASAVA_Build 7 63393351 1D GGGTTCAAGT A/- AAGGAGTTAC 3070 het 3070 ref 52 28 21 3 A 3 2 273422 CASAVA_Build 7 63396071 1D CCAGAAGAGT A/- AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 A 7 6 273423 CASAVA_Build 7 63399680 3D ACCCATTCTG GTT/--- GTTGCCAATT 3070 het 3070 hom 46 22 22 4 GTT 2 1 273424 CASAVA_Build 7 63401063 2D CATCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1611 het 215 hom 18 2 7 9 A 20 18 273425 CASAVA_Build 7 63402130 1D GAATGAGCAT G/- GGGGCTCTAG 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 G 5 4 273426 CASAVA_Build 7 63403192 2D ATTTTTTTTG AT/-- AGTGTACCAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AT 1 0 273427 CASAVA_Build 7 63406740 4I TTTTCAGCTA ----/TTAG TTGTTACTTT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 TTAG 0 1 273428 CASAVA_Build 7 63409182 1I AGAAGAGAAT -/C CAGGACTACA 3070 hom 81 het 32 0 25 7 C 1 2 273429 CASAVA_Build 7 63419851 2I AACTACAGTC --/TA TGAATTTAGC 3070 hom 81 het 36 0 28 8 TA 0 1 273430 CASAVA_Build 7 63421257 1D AAAGTAAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 273431 CASAVA_Build 7 63421695 5I CCCCGGAACT -----/TCAAA TAAAAGTTGA 887 het 887 ref 30 25 2 4 TCAAA 0 1 273432 CASAVA_Build 7 63424470 1D TATTTGGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 38 het 32 1 27 5 T 10 9 273433 CASAVA_Build 7 63425910 4I ATTTTGTCTT ----/TGTC TGTGTCCTTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TGTC 0 1 273434 CASAVA_Build 7 63426973 1I CTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2947 het 2947 ref 32 17 9 6 T 10 11 273435 CASAVA_Build 7 63427968 1I GGGAAGTGGG -/T GTTTTTTTTG 1987 het 1987 ref 21 12 7 2 T 0 1 273436 CASAVA_Build 7 63431472 2I ACACAAATGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 10 12 273437 CASAVA_Build 7 63438831 3D TATTCCGTGT TGA/--- TGTTTTTCAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TGA 1 0 273438 CASAVA_Build 7 63439126 1D GTTTTCTGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 3 het 28 1 14 13 T 10 9 273439 CASAVA_Build 7 63441767 2D GTATATTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 30 2 14 14 T 13 11 273440 CASAVA_Build 7 63444152 1I TTTTTTTTTT -/A ATTAGATCTA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 A 1 2 273441 CASAVA_Build 7 63444235 1I TATAGTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 49 1 43 5 T 10 11 273442 CASAVA_Build 7 63447868 4D ACCTTCTCCT GGGG/---- TATCTTACTG 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 G 4 0 273443 CASAVA_Build 7 63451516 4I AGGCCACTTA ----/TTAG TTAGTTTACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTAG 1 2 273444 CASAVA_Build 7 63452366 2I TTGTGCAAAT --/TC TCTTTTTTTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TC 1 2 273445 CASAVA_Build 7 63455019 1D AAATCAGGAT G/- GCAACCGCCA 3070 het 3070 hom 38 14 13 12 G 2 1 273446 CASAVA_Build 7 63458588 4D AACAGGACAA ACTG/---- AAATAAAGAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 ACTG 1 0 273447 CASAVA_Build 7 63458868 3I AAAGAAAGTA ---/AAT AAAAAAGAAA 3070 hom 42 het 24 0 15 9 AAT 0 1 273448 CASAVA_Build 7 63460169 1I AGCAGTCTGA -/T TTTTTTAGTC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 6 7 273449 CASAVA_Build 7 63460301 1D AGATAAGGAC A/- AAAAACCATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 6 5 273450 CASAVA_Build 7 63462554 1D TTAAAAACGA T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 7 T 8 7 273451 CASAVA_Build 7 63464752 2I GTGAATAAAA --/GG GGGGGGGAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 7 9 273452 CASAVA_Build 7 63465706 1D TAGTAAGTGA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 6 273453 CASAVA_Build 7 63468908 1D GAACCTATCA C/- CTAGGTGATG 3070 het 3070 hom 62 24 32 6 C 2 1 273454 CASAVA_Build 7 63470583 3I GGTCAGAATC ---/ATA ATAATGTTAC 3070 het 3070 ref 61 30 25 6 ATA 1 2 273455 CASAVA_Build 7 63472780 3I TTAACAGGAG ---/TTA TTGTGACATA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TTA 0 1 273456 CASAVA_Build 7 63473697 1I TTTTTTGCCA -/G GGCCATGCCC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 2 3 273457 CASAVA_Build 7 63478833 2D GATTTCATGG AC/-- ACTTATCACT 3070 het 2967 hom 23 7 14 2 AC 2 1 273458 CASAVA_Build 7 63479027 1D ACAGGATAAC A/- AGCAATTGTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 2 1 273459 CASAVA_Build 7 63480268 1D CCACAAGAGG C/- ATTGTGCCAC 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 C 1 0 273460 CASAVA_Build 7 63490611 4I TACAGATAGA ----/TTGT TTGGGCTTTA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 TTGT 0 1 273461 CASAVA_Build 7 63494658 2D GAATAAAAAC AA/-- AGATTTCATT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 3 1 273462 CASAVA_Build 7 63495489 4I ACAAATAGAC ----/TGTT TGAAAGTTGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TGTT 0 1 273463 CASAVA_Build 7 63511225 1I GAATCAATTG -/A AACCTGGGAG 3070 het 2348 hom 21 6 11 4 A 2 3 273464 CASAVA_Build 7 63511307 5D TCCGTTCCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 16 3 AAAAC 5 4 273465 CASAVA_Build 7 63512874 1D AGCATCCTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 36 1 33 2 T 9 8 273466 CASAVA_Build 7 63515686 1D TTTTTCTACT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 10 9 273467 CASAVA_Build 7 63520067 1I AATGAAATTC -/T TTTTTTTTTT 1363 het 59 hom 15 1 6 8 T 17 18 273468 CASAVA_Build 7 63537424 4D AATTGGTGAT TAAA/---- TAGTTTCTAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 6 TAAA 1 0 273469 CASAVA_Build 7 63549357 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTATCTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 5 6 273470 CASAVA_Build 7 63561099 2I ATTTATTTCC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 AT 6 7 273471 CASAVA_Build 7 63561638 18D CAGGCACGTA GCTGGAGCGGACAGGACG/------------------ GCTTCCGGGA 2006 het 2006 ref 25 12 5 11 GCTGGAGCGGACAGGACG 1 0 273472 CASAVA_Build 7 63578082 1I ATCTTTTGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2321 hom 20 7 12 1 T 8 9 273473 CASAVA_Build 7 63578711 1D CCTCTCCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2928 hom 29 11 11 7 T 13 12 273474 CASAVA_Build 7 63591597 2D AATGATACAC TT/-- TTCTAATTCA 3070 het 2704 hom 21 6 9 6 T 4 2 273475 CASAVA_Build 7 63601097 2I GCACACATAT --/AC AGTTTTGTTC 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 AC 0 1 273476 CASAVA_Build 7 63605191 24D CAGCAGGGAC TATAGTAAACAATAATATATTGTG/------------------------ TATAGTAAAC 3070 het 3070 ref 26 21 10 5 TATAGTAAACAATAATATATTGTG 1 0 273477 CASAVA_Build 7 63608042 2D AATACGTAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 A 14 12 273478 CASAVA_Build 7 63609451 1D CACTTTCTTT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 68 het 25 0 22 3 A 8 7 273479 CASAVA_Build 7 63609561 1D TTTAATTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 11 10 273480 CASAVA_Build 7 63610577 1D CTACTAAATC T/- TTTTTTTTTC 1590 het 1590 ref 22 14 4 4 T 10 9 273481 CASAVA_Build 7 63617014 3D CAATTCTCAA AAG/--- AAGATATACG 3070 het 3070 ref 26 13 12 3 AAG 2 1 273482 CASAVA_Build 7 63642910 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1336 het 1336 ref 11 8 3 0 A 10 11 273483 CASAVA_Build 7 63650324 5D TCTAACTTAC TGAAA/----- TGAAAGACAC 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 TGAAA 2 1 273484 CASAVA_Build 7 63653159 1I ATTCAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 11 12 273485 CASAVA_Build 7 63653563 2D ATATATATAT AA/-- AATAAGATAA 2273 het 2061 hom 11 6 5 0 A 4 2 273486 CASAVA_Build 7 63653815 1I AGGCCAAATC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 8 9 273487 CASAVA_Build 7 63655384 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 8 273488 CASAVA_Build 7 63664248 4D TTTCAAAATT TCAG/---- TCAAATTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TCAG 1 0 273489 CASAVA_Build 7 63669202 2D CTCAATTAAA CT/-- CTGTAAAATT 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 CT 2 1 273490 CASAVA_Build 7 63683120 1D TCTTTTTTAT G/- GCCACACAGT 3070 het 3070 hom 30 9 10 11 G 2 1 273491 CASAVA_Build 7 63683174 4I TATTAAGCCT ----/TTTA TTTATTTTTG 3070 hom 96 het 38 0 33 10 TTTA 1 2 273492 CASAVA_Build 7 63687537 3I GATTTTTTCT ---/TTG TTGTTTTGAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTG 1 2 273493 CASAVA_Build 7 63690661 1D AATAGAGATA G/- GGTTTCACCA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 G 3 2 273494 CASAVA_Build 7 63691457 5I TCAGAAAAAA -----/AAAAG AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 21 1 16 4 AAAAG 0 1 273495 CASAVA_Build 7 63691937 1I TGCATGAAAG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 36 18 15 3 T 7 8 273496 CASAVA_Build 7 63692032 2D GCATATAAAC AT/-- ATTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 AT 2 1 273497 CASAVA_Build 7 63692845 9D TTATCTGTAA ATTCCAGAC/--------- ATTGTATGCA 1439 het 1439 ref 14 8 5 6 ATTCCAGAC 1 0 273498 CASAVA_Build 7 63694078 4D CTTAGTGCAT TTTC/---- TTTTTGTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 10 TTTC 1 0 273499 CASAVA_Build 7 63708301 1D ATTGACTTTA T/- TTTTTTTTTT 2354 het 2354 ref 32 12 8 12 T 17 16 273500 CASAVA_Build 7 63710045 2D AGGCTCTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 1124 het 674 hom 24 7 5 14 A 20 18 273501 CASAVA_Build 7 63712303 1I GTGACCTTTC -/T TTTTTTCAGA 3070 hom 157 het 62 0 53 9 T 6 7 273502 CASAVA_Build 7 63718437 1D AGATAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2445 hom 30 7 12 11 A 13 12 273503 CASAVA_Build 7 63728292 3D TTTTTAAAAA AAG/--- AGAGAGAGAG 3070 hom 72 het 27 0 25 4 AAG 1 0 273504 CASAVA_Build 7 63728595 1I ACATCTGGCC -/A CAGTTTGGAT 3070 hom 113 het 44 0 37 7 A 0 1 273505 CASAVA_Build 7 63732756 3D TGATGTGACT CTC/--- CTCCTTTGCT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 CTC 2 1 273506 CASAVA_Build 7 63734270 1I CCTGGCCACG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 64 het 26 0 20 6 A 9 10 273507 CASAVA_Build 7 63739022 1I TCTTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 2321 het 622 hom 21 2 8 11 T 14 15 273508 CASAVA_Build 7 63742814 2D GCTTTCTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 13 11 273509 CASAVA_Build 7 63761459 2I AGGAGGTCAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 AT 6 7 273510 CASAVA_Build 7 63763175 1D TCTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 15 1 10 4 T 21 20 273511 CASAVA_Build 7 63765278 1D ATCTTCCCTA G/- GCGCAGAGAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 2 1 273512 CASAVA_Build 7 63766596 1D CAAGGCTTAG T/- TTTTAGAGTG 3070 het 3070 hom 30 12 12 7 T 5 4 273513 CASAVA_Build 7 63772800 3D TTTTATGATG TGC/--- TGCTGGATTC 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 TGC 2 1 273514 CASAVA_Build 7 63775288 1D CCTCGCCGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 11 10 273515 CASAVA_Build 7 63779933 3I ATGTCGATGA ---/TCT TCTCTGCAGT 3070 hom 96 het 40 0 32 8 TCT 1 2 273516 CASAVA_Build 7 63787509 1I CCTTATCCTT -/G GGCCATCAGC 3070 hom 93 het 37 0 29 8 G 2 3 273517 CASAVA_Build 7 63790053 2I CACAATCTGA --/CT CTTTTTTATT 3070 hom 91 het 33 0 31 2 CT 1 2 273518 CASAVA_Build 7 63796089 5D TTATTGTTCA GTTTT/----- AAGAGTTGTT 2612 het 2612 ref 35 24 7 6 GTTTT 1 0 273519 CASAVA_Build 7 63801961 4I TTCCTGTGCT ----/TTTA TTTTTTACAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TTTA 0 1 273520 CASAVA_Build 7 63804078 1I GATTAGATTT -/G TAAAGTACAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 0 1 273521 CASAVA_Build 7 63807895 2D GAGCTGAAAT CA/-- CACCACTACA 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 CA 2 1 273522 CASAVA_Build 7 63808471 3I TTGAAAAGCA ---/AAT AATGATGTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAT 1 2 273523 CASAVA_Build 7 63809385 1I ATAAACATTT -/A AAAAAATGTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 6 7 273524 CASAVA_Build 7 63809571 2I TTCAGAAGAC --/AA GAGCAATATT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 0 2 273525 CASAVA_Build 7 63809768 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 5 6 273526 CASAVA_Build 7 63811197 2I TTAATAACTG --/AA GTTTAGTCTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 2 273527 CASAVA_Build 7 63817228 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AGG 0 1 273528 CASAVA_Build 7 63823265 1I AAGTGTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 9 10 273529 CASAVA_Build 7 63826829 1I AGCTAATGTG -/T TTTTTGGGGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 5 6 273530 CASAVA_Build 7 63831130 1D TGTTAAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 44 0 30 17 A 12 11 273531 CASAVA_Build 7 63848714 3I CAAAAATGTA ---/TGC TGGCAACTCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TGC 0 1 273532 CASAVA_Build 7 63849255 1D TAGACATATT A/- GCCATGCCAA 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 A 1 0 273533 CASAVA_Build 7 63849984 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 9 8 273534 CASAVA_Build 7 63852254 2I TGGAATGAGA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AT 7 8 273535 CASAVA_Build 7 63864468 1I GATAAATGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 8 9 273536 CASAVA_Build 7 63865748 12I TCACATGATT ------------/CTACAGTGAGGC CTACAGTGAG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 CTACAGTGAGGC 1 2 273537 CASAVA_Build 7 63869368 8I TGAATTGCAT --------/AAGTTTTG AAGTTTTGGA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 AAGTTTTG 1 2 273538 CASAVA_Build 7 63880598 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2926 het 2920 hom 19 9 8 2 A 14 15 273539 CASAVA_Build 7 63883321 8I TGAAGGCAGC --------/ATGCTCGT TAAGAGTCAT 3070 het 2362 hom 14 5 7 2 ATGCTCGT 0 1 273540 CASAVA_Build 7 63887584 3I TCACTCCAGC ---/TGG CTGGGCAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 TGG 0 1 273541 CASAVA_Build 7 63891017 1D TTTGCACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1820 hom 33 6 21 8 T 13 12 273542 CASAVA_Build 7 63897432 1I GGCAATTGTG -/A AATGGGATTG 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 A 2 3 273543 CASAVA_Build 7 63899515 8I TGAGTTTAGT --------/TCCTAATA TCTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 TCCTAATA 0 1 273544 CASAVA_Build 7 63900458 1D ATGACCCCTT A/- CAAACAATTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 1 0 273545 CASAVA_Build 7 63901613 4D ATACTAAGTG TATC/---- TAATCAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TATC 1 0 273546 CASAVA_Build 7 63902377 1I GGGTGGATCA -/T TTGCAGTCAG 3070 het 2081 hom 16 7 7 2 T 2 3 273547 CASAVA_Build 7 63904391 4I GATTTGGGGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 110 het 43 0 37 6 AAAC 3 4 273548 CASAVA_Build 7 63906399 2I TTCTGTTTCT --/TC TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TC 0 1 273549 CASAVA_Build 7 63908384 14I AATTGCTTAT --------------/ATAACATATGCTTA TAGTATATGT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 ATAACATATGCTTA 0 1 273550 CASAVA_Build 7 63909939 2D GAATCAAGTA AG/-- AGGGGTTCAA 3070 hom 66 het 31 0 20 12 AG 2 1 273551 CASAVA_Build 7 63910125 1I GTATTCACCA -/C CACGCCCGGC 3070 hom 71 het 26 0 23 3 C 1 2 273552 CASAVA_Build 7 63913686 4D TCAAGTTCAC AGTG/---- AGAGCCAACG 3070 het 3070 ref 34 25 9 0 AGTG 1 0 273553 CASAVA_Build 7 63914284 4D TTGTTTTCTT TCTC/---- TATTTTATCA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 TC 2 0 273554 CASAVA_Build 7 63915902 9I GTCTCCCAGG ---------/TTCAAGTGA TTCTCCTTCC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TTCAAGTGA 0 1 273555 CASAVA_Build 7 63917173 3D TTCAGGGTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 20 1 12 7 T 17 14 273556 CASAVA_Build 7 63917553 5D TGTAAAAACT CATAA/----- CATAAAATTT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 CATAA 2 1 273557 CASAVA_Build 7 63920688 1I GAAAAATTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 7 8 273558 CASAVA_Build 7 63922681 2D TATGAGTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 34 1 25 9 T 13 11 273559 CASAVA_Build 7 63924925 1D CATTTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 12 11 273560 CASAVA_Build 7 63925065 1I ACCATGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1022 hom 22 4 12 6 T 14 15 273561 CASAVA_Build 7 63925996 1I ATAATTCTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 10 273562 CASAVA_Build 7 63926597 1D ACATTGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 11 10 273563 CASAVA_Build 7 63931519 1I TTAGTGTGTG -/T GTTTGTTTGT 3070 hom 44 het 26 0 15 11 T 0 1 273564 CASAVA_Build 7 63931972 1I AGCAGTTGCT -/C CAAACTTCGT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 1 2 273565 CASAVA_Build 7 63932137 1I TAAGGCTACG -/T TAAGTATCAG 1765 het 1765 ref 27 18 4 5 T 1 2 273566 CASAVA_Build 7 63934681 2I CTAGTAGTCT --/AC AGGAGACTGC 3070 hom 42 het 18 0 14 4 AC 0 1 273567 CASAVA_Build 7 63938294 1D ATTTATGTCA T/- TATATGGCAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 2 1 273568 CASAVA_Build 7 63938537 1I TTAAACATTT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 A 7 8 273569 CASAVA_Build 7 63939296 4D TTCCTGCTAG AGTT/---- AGTTTGTAAG 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 AGTT 2 1 273570 CASAVA_Build 7 63940128 6D GCCCTCCTCT GCCTCC/------ CAAAGTGCTG 959 het 78 hom 5 1 2 4 GCCTCC 1 0 273571 CASAVA_Build 7 63941518 1D ATTTTCTCCA T/- TTTTTTAGTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 7 6 273572 CASAVA_Build 7 63942221 3I ATTTGATTCA ---/TTC TTCTTCTTTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TTC 2 3 273573 CASAVA_Build 7 63945982 6I TTAAAGAGAC ------/TAAAGA TAATGTCCCA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 TAAAGA 0 1 273574 CASAVA_Build 7 63947358 1D AGGGTGGGTA G/- GGAGGGAAGA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 G 3 2 273575 CASAVA_Build 7 63949538 2D GATAAAGAAA AC/-- AGTTAATGGT 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 AC 1 0 273576 CASAVA_Build 7 63951850 1D CTTTAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 27 1 25 1 A 11 10 273577 CASAVA_Build 7 63960167 1D AAATCACCCT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 9 23 2 A 9 8 273578 CASAVA_Build 7 63967268 1I CATGGGGGGG -/T GGTCCACAAT 3070 het 44 hom 24 2 9 13 T 0 1 273579 CASAVA_Build 7 63980149 1I CCACGGAGAC -/G GCCCCAGGAG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 G 1 2 273580 CASAVA_Build 7 63985163 3I TCATGATCAT ---/GAG CTCCTTCCAC 3070 het 3070 hom 57 22 23 12 GAG 0 1 273581 CASAVA_Build 7 63990926 1D GTTAGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 46 0 36 10 A 11 10 273582 CASAVA_Build 7 63992405 1D TCACAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 13 12 273583 CASAVA_Build 7 63995707 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTGTATT 2084 hom 12 het 5 0 5 0 T 6 5 273584 CASAVA_Build 7 64003391 1D CTGAATTCTC T/- TAACATTTGT 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 T 2 1 273585 CASAVA_Build 7 64004314 1I TTAAACACTT -/A ACTTTCAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 1 2 273586 CASAVA_Build 7 64009448 3I ATTTGAATCG ---/TCT TCATTAATCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TCT 0 1 273587 CASAVA_Build 7 64012665 2D CAAGATGCAG GT/-- GTGTAATTAG 3070 hom 89 het 32 0 28 4 GT 3 2 273588 CASAVA_Build 7 64013132 2I GGAATTAAAG --/AC ACACACACAG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AC 4 5 273589 CASAVA_Build 7 64014541 1I ATCATACAAA -/T TCTGTCCTGG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 1 2 273590 CASAVA_Build 7 64019932 1D TTCTATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2822 hom 24 9 11 4 T 15 14 273591 CASAVA_Build 7 64022328 2D ACTCACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 49 het 30 0 18 12 AC 10 9 273592 CASAVA_Build 7 64022617 1I ATTTTTCAAA -/T TTTTTTTTTT 2362 het 2362 ref 30 14 6 10 T 15 16 273593 CASAVA_Build 7 64023034 3I CATTTTATTA ---/GTT GTTTTATTTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 GTT 1 2 273594 CASAVA_Build 7 64023964 1D ACTTGGCAGC T/- TTTTTTTTTT 1691 het 1691 ref 38 26 5 7 T 15 14 273595 CASAVA_Build 7 64026941 1I2M5I2M9I3M14I CCCAGAAGTG -GA-----GT---------TTT--------------/TGACAAATGTGACAAAACATTTAATTAATTCTCATA CCTTATTGCA 3070 hom 75 het 23 0 26 6 N/A 0 0 273596 CASAVA_Build 7 64033677 1D AGTAACAGTT A/- AAACATTTGA 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 A 4 3 273597 CASAVA_Build 7 64035857 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- GAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 A 5 0 273598 CASAVA_Build 7 64038418 2I TACAGGCACA --/CT GACAGTGATT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 CT 0 1 273599 CASAVA_Build 7 64038508 1I CTGAAAGACA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 6 7 273600 CASAVA_Build 7 64039210 1I AAAACATAAC -/A GTTTTTTATG 3070 hom 83 het 35 0 26 9 A 0 1 273601 CASAVA_Build 7 64050618 1I CTCTGACTGT -/A AGCCATCCTG 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 1 2 273602 CASAVA_Build 7 64052627 2D CTCATAAGGC TG/-- ATACAAGAGT 3070 het 3070 hom 23 9 10 8 TG 1 0 273603 CASAVA_Build 7 64055406 1I AGGCGATGCA -/C CCCCCCTCGG 3070 het 3070 hom 26 10 8 8 C 6 7 273604 CASAVA_Build 7 64058903 1I AAAATACAAT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 A 7 8 273605 CASAVA_Build 7 64061199 1I AATTAGCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 10 11 273606 CASAVA_Build 7 64064582 1I TTAATTCTAC -/A AAAAAATTGC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 6 7 273607 CASAVA_Build 7 64070115 1I AATTTTACTG -/T TATATATCCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 273608 CASAVA_Build 7 64073114 2D ACATAAAAGT AC/-- AGTTAGTAAA 3070 het 1777 hom 22 5 7 10 AC 1 0 273609 CASAVA_Build 7 64073142 5D TACTACTAAT TTTAA/----- TTTAATTTTA 3070 het 1758 hom 26 5 15 9 TTTAA 2 1 273610 CASAVA_Build 7 64073262 2I TCTCCACTTA --/TC GATTTTTATC 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 TC 0 1 273611 CASAVA_Build 7 64073396 5D TTCACATGTG AATAC/----- AATAGAATGA 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 AATAC 1 0 273612 CASAVA_Build 7 64078788 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAACCA 3070 hom 75 het 38 0 26 12 A 7 8 273613 CASAVA_Build 7 64082566 2D TTCAATTAAA AC/-- AGTTTATATT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 AC 1 0 273614 CASAVA_Build 7 64083970 1D AAGGTGTTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 13 hom 26 2 23 1 A 10 9 273615 CASAVA_Build 7 64088363 1I AATCATACCG -/T TGACAGGTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 1 2 273616 CASAVA_Build 7 64097993 1D GATAAAGAAA G/- TATGGTATGG 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 G 1 0 273617 CASAVA_Build 7 64098226 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGTGTCAT 2124 hom 14 het 6 0 5 1 G 5 4 273618 CASAVA_Build 7 64100312 1I AATTTTTATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 9 10 273619 CASAVA_Build 7 64105817 1I CTTATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 19 8 A 10 11 273620 CASAVA_Build 7 64111832 1I ATCATCATCC -/T TTTTCATTGC 3070 het 3070 ref 59 34 13 12 T 4 5 273621 CASAVA_Build 7 64114130 1I ACAGGCTCTC -/A AGGCCATGTG 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 1 2 273622 CASAVA_Build 7 64120910 3D TGCTGGGATT ACA/--- GGCATGAGCC 1714 het 1714 ref 11 7 4 0 ACA 1 0 273623 CASAVA_Build 7 64122975 2D TCTCAGGAGA TC/-- TGTTAGTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 5 TC 1 0 273624 CASAVA_Build 7 64127835 7D ATGGCTGCAA TGTGGAC/------- TGTGGACTGT 3070 hom 43 het 19 0 14 7 TGTGGAC 2 1 273625 CASAVA_Build 7 64128624 3D AAGGAGTAGG AGA/--- AGAAGAAGAA 3070 het 3070 ref 41 14 13 14 AGA 6 5 273626 CASAVA_Build 7 64136924 2D GTCAGGCCTC TT/-- TGCACTCCAG 3070 het 2522 hom 25 8 11 6 T 3 1 273627 CASAVA_Build 7 64137373 1I GGGAATTTAC -/G TTTTAAAAGT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 G 0 1 273628 CASAVA_Build 7 64139448 1D GATACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 13 0 9 4 T 13 12 273629 CASAVA_Build 7 64141373 1D CAGAATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 10 8 T 12 11 273630 CASAVA_Build 7 64146548 6D AGTAAGACTG TATCTT/------ TATGTTGATA 3070 het 3070 ref 26 15 11 1 TATCTT 1 0 273631 CASAVA_Build 7 64152576 1D CAGGGGGGAG T/- TGACAACCTT 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 2 1 273632 CASAVA_Build 7 64153374 4I TTGTCCATGA ----/TTCT TTCTCTTCCT 2241 het 2241 ref 21 12 5 4 TTCT 1 2 273633 CASAVA_Build 7 64158627 3I TTAGCCAGGC ---/ATG GTGGTGGGCA 3070 hom 51 het 20 0 15 5 ATG 0 1 273634 CASAVA_Build 7 64159313 1I AGTCACGTAG -/T ACTTCTGCAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 0 1 273635 CASAVA_Build 7 64164310 5D TAGAAACGTG AATAT/----- AATTACCAAT 2308 het 2308 ref 28 19 5 4 AATAT 1 0 273636 CASAVA_Build 7 64166668 4D ATTGGGATTA TTTG/---- TTTTTCCTTA 2324 het 2324 ref 41 32 5 5 TTTG 1 0 273637 CASAVA_Build 7 64166799 2D AAACTGAAAC TG/-- TATACCCATT 1290 het 1290 ref 38 32 3 3 TG 1 0 273638 CASAVA_Build 7 64171642 2D CGAGCTGGAA TG/-- TCTTCTCTGA 2425 het 2425 ref 17 11 6 0 TG 1 0 273639 CASAVA_Build 7 64171804 8I TGGCATCTGT --------/TGAAATTC GGAAGTTCTG 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 TGAAATTC 0 1 273640 CASAVA_Build 7 64175825 1D TTCATACTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 10 9 273641 CASAVA_Build 7 64185675 6D AATACTTTGT TCATAA/------ GCATTTACAC 3070 het 3070 ref 40 30 11 2 TCATAA 1 0 273642 CASAVA_Build 7 64192892 1D ACCCAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 T 12 11 273643 CASAVA_Build 7 64197066 4I GTGGGATTGC ----/ATAG ATAGACTTGG 1333 het 1333 ref 46 39 3 4 ATAG 1 2 273644 CASAVA_Build 7 64198924 1D TTCTTTCTTT C/- TTTTTTTTTT 1945 het 1700 hom 25 6 14 5 C 1 0 273645 CASAVA_Build 7 64204838 3I TTAATATTAG ---/ATA ATATTTATAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 ATA 1 2 273646 CASAVA_Build 7 64207842 4I GCATTTTCTC ----/TATT TATTTTCCCA 2441 het 2441 ref 18 10 6 2 TATT 1 2 273647 CASAVA_Build 7 64211135 3I AGAAAGGAAG ---/GAA GAAGGCAAGG 3070 het 19 hom 16 1 11 4 GAA 1 2 273648 CASAVA_Build 7 64213956 1I TTGAATCCAC -/T ATTTTTAAAA 3070 het 848 hom 20 4 9 7 T 0 1 273649 CASAVA_Build 7 64218353 1I CGTTAGGCCA -/T GGATGTATTT 3070 het 3070 hom 84 39 45 0 T 0 1 273650 CASAVA_Build 7 64237917 4I CAGTTTATTC ----/TGTT TGTTTGTTTG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TGTT 3 4 273651 CASAVA_Build 7 64240729 2I10M1D ATGTTGAGAT --AAAAAAATTCG/AAAAAAAAATTC- TTGTCATTTA 2364 het 2364 ref 20 13 7 7 N/A 0 0 273652 CASAVA_Build 7 64243745 3D ATGATATGAA ATG/--- ATGAAATGAA 3070 hom 21 het 11 0 8 3 ATG 2 1 273653 CASAVA_Build 7 64245643 4D TAAATTTGCC TAAA/---- TATTCTTCAG 2367 het 2367 ref 20 13 7 1 TAAA 1 0 273654 CASAVA_Build 7 64259943 1I ATATTGATTT -/C TGTTGAATTT 2428 het 2428 ref 22 13 5 4 C 0 1 273655 CASAVA_Build 7 64277989 1I TTTTATAGAG -/A AAAAAATAAG 3050 het 3050 ref 26 14 7 5 A 6 7 273656 CASAVA_Build 7 64284268 13I AGCATTGTTC -------------/TCAGATCACACCG TCAGGCACTA 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 TCAGATCACACCG 0 1 273657 CASAVA_Build 7 64302184 1I TATATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 19 1 14 4 T 11 12 273658 CASAVA_Build 7 64306377 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 2969 het 2361 hom 20 7 9 4 T 11 12 273659 CASAVA_Build 7 64309259 1I CAGAAGGCGG -/A GGTTCCAGTG 2155 het 2155 ref 17 9 6 2 A 0 1 273660 CASAVA_Build 7 64314488 1D CTGTGGCCGT C/- CTGCGGTCAT 2808 het 2808 ref 25 12 9 4 C 2 1 273661 CASAVA_Build 7 64315503 1D ACATTCCCCC A/- GCAGGTTTGC 2836 het 2836 ref 31 18 10 3 A 1 0 273662 CASAVA_Build 7 64326862 5I TATATTATAC -----/ATAAT ATATTTATTA 1877 het 1335 hom 7 3 4 0 ATAAT 0 1 273663 CASAVA_Build 7 64330176 2I ATACAAAATT --/TA GTCTGCCTCA 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 TA 0 1 273664 CASAVA_Build 7 64332137 15D TTTGGCTAGG CACGGTGGCTAACGC/--------------- CACGGTGGCT 3070 het 3070 ref 28 12 9 11 CACGGTGGCTAACGC 1 0 273665 CASAVA_Build 7 64333137 4I TTCCTAAACT ----/TACA TACATACATA 3070 hom 105 het 47 0 35 12 TACA 2 3 273666 CASAVA_Build 7 64336492 2D GGAAGAAAAC TG/-- AGGTTCAAGG 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 TG 1 0 273667 CASAVA_Build 7 64338344 1I CTTTTGCTTG -/T TTTCTGTCTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 3 4 273668 CASAVA_Build 7 64340217 1I TATCTATATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 11 12 273669 CASAVA_Build 7 64371821 1D TGGAGGTACT G/- GGAAATGCAT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 G 3 2 273670 CASAVA_Build 7 64375992 1I TTGGTTCTTT -/A AAAACCTCAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 4 5 273671 CASAVA_Build 7 64379579 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 31 1 24 6 T 10 11 273672 CASAVA_Build 7 64380075 1D AGTTCTACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 293 hom 30 1 17 12 T 15 14 273673 CASAVA_Build 7 64391914 1D GACTCCGTCT C/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 20 1 14 6 C 1 0 273674 CASAVA_Build 7 64400127 2D CATAATAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2219 hom 18 het 20 0 8 12 T 16 14 273675 CASAVA_Build 7 64403328 2D AATGTAGAGT TA/-- AGTTAACTGA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 TA 1 0 273676 CASAVA_Build 7 64409042 4D AATACGCCTT AAAG/---- AAAGAGGCCC 3070 hom 141 het 53 0 48 6 AAAG 2 1 273677 CASAVA_Build 7 64409559 2I ACTGTAAAAA --/CT CTAAACCATT 3070 hom 122 het 46 0 40 6 CT 1 2 273678 CASAVA_Build 7 64412967 14I CATTAGCCAA --------------/CTTTACTCAGTGGG CTCTAAGTGA 3070 hom 108 het 47 0 36 12 CTTTACTCAGTGGG 0 1 273679 CASAVA_Build 7 64417825 1D AACAGAATCT G/- GTAGCAGAAT 3070 hom 126 het 45 0 43 3 G 2 1 273680 CASAVA_Build 7 64420623 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACAGAA 3070 het 339 hom 17 4 10 3 C 0 1 273681 CASAVA_Build 7 64425282 4I ATTATATATT ----/TTTC TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 TTTC 0 1 273682 CASAVA_Build 7 64433619 19D AAGTTGTACT TATTGTGTGTACACAATAA/------------------- TATTGTGTGT 3070 hom 84 het 35 0 28 11 TATTGTGTGTACACAATAA 2 1 273683 CASAVA_Build 7 64445067 1I GTGTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1602 hom 23 9 11 3 G 0 1 273684 CASAVA_Build 7 64445936 1D TCCAGAAACA C/- CAGGGACAGA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 C 2 1 273685 CASAVA_Build 7 64465995 4I AACAAAAATG ----/AGAA AGAGGAACAA 3070 hom 51 het 29 0 18 11 AGAA 0 1 273686 CASAVA_Build 7 64478024 1D GGTGAAAGCC G/- GTTTCTACTA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 G 2 1 273687 CASAVA_Build 7 64506810 1I CCAAGAGTTT -/A AAAAAAAAAA 2941 het 2147 hom 34 9 16 9 A 17 18 273688 CASAVA_Build 7 64526136 1D CTAATAAAAA C/- TTGCTGGTTT 2108 het 2108 ref 25 16 5 4 C 1 0 273689 CASAVA_Build 7 64526680 4D GCACACAAAG GAGA/---- GAAAGGATCA 3070 het 3070 ref 58 28 27 3 GA 3 1 273690 CASAVA_Build 7 64527803 1D ACAGAGTGGC A/- AGCCAAGACC 3070 het 3070 ref 40 24 12 5 A 2 1 273691 CASAVA_Build 7 64528890 2D AAATAATAGA GG/-- TTACCACTGA 1691 het 1691 ref 39 33 4 3 G 2 0 273692 CASAVA_Build 7 64532059 2D CATGTCACAC AT/-- GTGTCAGTCA 3070 het 3070 ref 84 38 41 6 AT 1 0 273693 CASAVA_Build 7 64532203 2D CATGACTGAC AT/-- GTGTGATGTG 3070 het 3070 ref 90 40 29 23 AT 1 0 273694 CASAVA_Build 7 64532255 14I ATGTGTGAAT --------------/GACACCTGTGTCAC GGGCTTGACA 3070 het 3070 ref 71 41 19 12 GACACCTGTGTCAC 0 1 273695 CASAVA_Build 7 64532533 2I ACCTGATTGA --/TG CGCGTGTGAC 3070 hom 85 het 65 1 42 22 TG 0 1 273696 CASAVA_Build 7 64532882 2I ATGTGATTGA --/TG TGTGACACGT 3070 het 2211 hom 86 8 51 27 TG 2 3 273697 CASAVA_Build 7 64532899 2D CGTGGCTGAC AT/-- GTGTGACACG 3070 het 2005 hom 75 6 30 43 AT 1 0 273698 CASAVA_Build 7 64532990 3D5M2I CACGTGAAAA ATTAACAC--/---AACACAT GACTGACACG 3070 het 3070 ref 79 40 34 15 N/A 0 0 273699 CASAVA_Build 7 64533100 4I CGTGACATGA ----/GTGT GTGACACTTG 3070 het 3070 hom 96 41 44 11 GT 1 3 273700 CASAVA_Build 7 64533191 4D TGTGTCACAC CTGA/---- CTGACACTTG 3070 het 3070 ref 96 52 36 13 CTGA 2 1 273701 CASAVA_Build 7 64533433 4I GACACATGAC ----/TAAG TGTGTGACAC 3070 hom 175 het 68 0 59 9 TAAG 0 1 273702 CASAVA_Build 7 64535760 1I GTTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1470 het 584 hom 22 4 6 12 A 17 18 273703 CASAVA_Build 7 64538791 4I AATTAATTAA ----/TAAT TAATTAAATA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TAAT 1 2 273704 CASAVA_Build 7 64543630 4I TTTGACAAAA ----/AGTT AGCTCCTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AGTT 0 1 273705 CASAVA_Build 7 64544325 1D TTTTGAAGTC T/- TAGTTGTAAG 3070 het 205 hom 35 2 30 3 T 2 1 273706 CASAVA_Build 7 64544841 7D ATATAGGAAG CCAAAGA/------- CCTTTTATAG 3070 het 3070 ref 39 20 18 3 CCAAAGA 1 0 273707 CASAVA_Build 7 64547974 1D ACTCCCCATT C/- CTTCCTCCCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 2 1 273708 CASAVA_Build 7 64559237 1I TAACAAGAGA -/T TCCCCCCTCT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 1 2 273709 CASAVA_Build 7 64562908 1D CGCATAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 8 7 273710 CASAVA_Build 7 64571917 1D GTTGCTCTGA T/- TTTTAGAGTG 3070 het 1874 hom 19 5 11 3 T 5 4 273711 CASAVA_Build 7 64573337 4I TAAGATATTA ----/TAAG TAATTTCAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TAAG 0 1 273712 CASAVA_Build 7 64579106 1D AAATTTGGCC A/- AAAAGGCTCA 3070 het 3070 hom 42 17 20 8 A 5 4 273713 CASAVA_Build 7 64580128 1D CATTGTTCTG T/- TTTTTTTTTA 1313 het 1313 ref 31 22 3 6 T 10 9 273714 CASAVA_Build 7 64588785 1D TAAAAAAAGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 9 8 273715 CASAVA_Build 7 64592106 32D TTCCATTCCA TTCCATTTGATTCCATTCAATTCCATTCTATT/-------------------------------- CCATTCTATT 461 het 461 ref 63 70 3 43 TTCCATTTGATTCCATTCAATTCCATTCTATT 1 0 273716 CASAVA_Build 7 64593919 2D CAATGGAAAC TT/-- AACATTCAAA 3070 het 3070 ref 69 45 13 12 T 2 0 273717 CASAVA_Build 7 64594108 1D AGTTGGTGTC T/- AAAAGTGAGA 1350 het 1350 ref 50 37 4 9 T 1 0 273718 CASAVA_Build 7 64595239 12I ATTTATTTAT ------------/GTGTGTATATTA AACATGTATA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 GTGTGTATATTA 0 1 273719 CASAVA_Build 7 64596315 4I45M4D12M1D8M1I ATGTAATTTT ----TTTATTTAAAATCACCCAAATCAAAATAATTTTATCTTAATTAACAAATAATCATCAGAAGTTTAACTAA-/TTTCTTTATTTAAAATCACCCAAATCAAAATAATTTTATCTTAATTAAC----AATCATCAGAAG-TTAACTAAT TTTTACTTTA 3070 het 3070 ref 60 25 16 70 N/A 0 0 273720 CASAVA_Build 7 64596673 1I AAATACTCAC -/T AATTTGTAAT 3070 het 3070 hom 62 25 35 2 T 0 1 273721 CASAVA_Build 7 64596916 1D ATGACATCTC A/- AGTCTTTCTA 2197 het 2197 ref 46 37 5 4 A 2 1 273722 CASAVA_Build 7 64598957 1D35M2D TTTGTTATAT AAAAAATACTAAGACGATGACAGATAATACACAGACTT/-AAAAATACAAAGACGATGACAGATAATACACAGAC-- TAATTAAAAT 507 het 507 ref 91 93 2 21 N/A 0 0 273723 CASAVA_Build 7 64600134 1D AAATGGCAAA T/- AAAAATGACT 3070 het 3070 ref 65 48 11 6 T 1 0 273724 CASAVA_Build 7 64600303 1D GTAGACTCAC A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 73 51 17 6 A 7 6 273725 CASAVA_Build 7 64601895 4I TAAAACAAAT ----/TAAG TAAGTATAAA 3003 het 3003 ref 31 22 7 2 TAAG 1 2 273726 CASAVA_Build 7 64603500 2I AGAAAAAAAG --/GA AAAAAAAACT 1776 het 1776 ref 34 9 4 22 GA 0 1 273727 CASAVA_Build 7 64604311 7I ACTTGAATTC -------/AAAGAGG AAATCTGAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAGAGG 0 1 273728 CASAVA_Build 7 64604496 1D AAAAATTTTT A/- AAATAATTTT 2344 het 2344 ref 25 17 5 3 A 4 3 273729 CASAVA_Build 7 64605203 5I35M4I ATGGTTTCAC -----TCCTTTGTAACATTTTTTCTAAGGTTGGAAAAGTA----/CCCTTTTCTTTGTAACATTTTTTCTAAGGTTGGAAAAGTATGGT AGGCTTTAGT 3070 het 3070 ref 39 26 17 7 N/A 0 0 273730 CASAVA_Build 7 64605477 3I CCCAAAACTT ---/AAC TACTAATAGC 3070 het 3070 ref 57 32 20 5 AAC 0 1 273731 CASAVA_Build 7 64605955 3D ATTCCATCTT ATC/--- ATTTCATCTC 3070 het 3070 ref 43 24 13 8 ATC 1 0 273732 CASAVA_Build 7 64606062 3D TGATTTCATC TCA/--- TCATTTCATC 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 TCA 2 1 273733 CASAVA_Build 7 64606694 18D TTCCATTTCA TCATTTCATCATTTCATC/------------------ TCATTTCATT 3070 het 3070 ref 37 22 16 6 TCATTTCATCATTTCATC 1 0 273734 CASAVA_Build 7 64607242 13D45M3D TTCATTTCCT CATTTCATTTCACCATTTCATTTCATTTCATTCCATTTCATCATTTCATCATTTCATCTCA/-------------CATTTCATTTCATTTCATTCCATTTCATCATTTCATCATTTCATC--- TCATTTCATC 3070 het 3070 ref 41 25 15 30 N/A 0 0 273735 CASAVA_Build 7 64607889 3I TTCATATCAT ---/TTC TTCATTTCAT 3070 het 34 hom 36 1 26 9 TTC 1 2 273736 CASAVA_Build 7 64608282 16D TTTGACCATT TCATTTCATCATTTCA/---------------- TCATTTCATC 3070 het 312 hom 31 1 9 21 TCATTTCA 4 2 273737 CASAVA_Build 7 64608869 1D TTCAGGTGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 10 9 273738 CASAVA_Build 7 64616220 6I TTTTCTTATC ------/TTCAAG TTCATGATTT 1137 het 1137 ref 16 11 3 2 TTCAAG 0 1 273739 CASAVA_Build 7 64616310 2I5M2I CTCCAGAATT --TGTTA--/TCTGTTATC TCTTTGTTGA 3070 hom 33 het 13 0 10 6 N/A 0 0 273740 CASAVA_Build 7 64617087 3I TACGTGAATG ---/ATT TTGAATGTCT 2427 het 2427 ref 40 29 7 4 ATT 0 1 273741 CASAVA_Build 7 64618202 2I TAGTCTATAT --/CG TGTGTTATGA 3070 het 3070 ref 43 29 12 2 CG 0 1 273742 CASAVA_Build 7 64619306 1I GTGCTTTTTT -/A AAAAATGTGG 1705 het 1705 ref 40 30 4 6 A 5 6 273743 CASAVA_Build 7 64619376 7D TGGTGTTTTT GTTTTTG/------- TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 47 35 3 11 GTTTTTG 1 0 273744 CASAVA_Build 7 64621961 3I GGAAGATAAG ---/AAC AACAATATCA 3070 het 3070 ref 50 26 8 16 AAC 1 2 273745 CASAVA_Build 7 64622291 3I TCTCACTTTC ---/TTG TTTTCTTTCC 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 TTG 0 1 273746 CASAVA_Build 7 64622462 4I TTCTTTCTCA ----/CTTT CTTTCTCTTC 1783 het 1703 hom 14 8 4 2 CTTT 1 2 273747 CASAVA_Build 7 64636026 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2967 hom 43 13 14 16 A 14 13 273748 CASAVA_Build 7 64650139 1I27M1I GTTAGGGTGG -AAAATTTTTAAAATAATTTTATAGTAA-/AAAAAAATTTAAAATTATTTTATAGTAAT TTTTTTCATC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 N/A 0 0 273749 CASAVA_Build 7 64652420 3D ATCATTTCAT ATC/--- ATTTCTTCAT 2078 het 2078 ref 42 33 5 4 ATC 1 0 273750 CASAVA_Build 7 64653021 3D AATCATTTCA CTT/--- CTTCATTTCA 3070 het 3070 ref 44 31 9 8 CTT 2 1 273751 CASAVA_Build 7 64653360 5D CATTTCATCT TTTCA/----- TTTCGTCATT 1412 het 1412 ref 15 12 3 2 TTTCA 1 0 273752 CASAVA_Build 7 64653469 3D TTCATATCAT TTC/--- TTCATCATTT 1607 het 1607 ref 40 29 5 7 TTC 2 1 273753 CASAVA_Build 7 64654662 1D TTCAGGTGGC T/- TTTTTTTTTT 2643 het 2643 ref 32 16 8 8 T 11 10 273754 CASAVA_Build 7 64674722 2I TTCAGTTAAC --/AT AACACATTGC 2743 het 2743 ref 33 23 6 4 AT 0 1 273755 CASAVA_Build 7 64678936 4I GGGAGGGAGG ----/AAGA AAGAAAGGTG 3070 hom 45 het 22 0 16 6 AAGA 1 2 273756 CASAVA_Build 7 64687846 4D TCTGTGTAAT TGAC/---- TGGTTAGTCT 2318 het 2318 ref 40 35 5 0 TGAC 1 0 273757 CASAVA_Build 7 64691417 1D TTATTTTATT G/- TTGAATTTAA 1285 het 1285 ref 17 8 3 7 G 1 0 273758 CASAVA_Build 7 64722890 1D TCATGCTCAC G/- GGGCTTACAT 1198 het 1198 ref 39 33 3 4 G 4 3 273759 CASAVA_Build 7 64723185 1D AAAGTAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 41 het 35 1 25 10 A 10 9 273760 CASAVA_Build 7 64724582 1I GCATGTTTTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 98 hom 37 1 31 5 A 8 9 273761 CASAVA_Build 7 64732281 1I TTTTGTTTGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1717 hom 15 6 8 1 T 8 9 273762 CASAVA_Build 7 64753654 5D ACATGAAATG ATGAA/----- ATGAAATGAC 3070 het 3070 ref 46 28 17 2 ATGAA 2 1 273763 CASAVA_Build 7 64754872 5D AAGTGAAATG ATGAA/----- ATGAAATGAA 3070 het 95 hom 25 2 7 17 ATGAA 4 3 273764 CASAVA_Build 7 64788149 1I ATACCATGAG -/A AAAATCTCTA 3070 hom 50 het 19 0 17 2 A 4 5 273765 CASAVA_Build 7 64801149 1I GTTCAACAAG -/A AAAATCCTAC 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 4 5 273766 CASAVA_Build 7 64808844 8I GGTAAGCTTA --------/TTCAGACC TTCCCTTCAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTCAGACC 0 1 273767 CASAVA_Build 7 64813332 1I TATTTTATTT -/A ATTTATGAGA 1591 het 1591 ref 13 8 4 1 A 1 2 273768 CASAVA_Build 7 64821252 6I TGAATCTCAA ------/CTACTG CTGAGTGTGG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CTACTG 0 1 273769 CASAVA_Build 7 64824682 1D ACTGGGGAGA T/- TTTTTTTTTA 2055 het 2055 ref 19 12 5 2 T 10 9 273770 CASAVA_Build 7 64834556 2D AATAGAGATT GG/-- GGGGGGGGGG 2492 hom 15 het 13 0 7 6 G 12 10 273771 CASAVA_Build 7 64841347 1D AACAAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2676 hom 34 12 12 10 T 15 14 273772 CASAVA_Build 7 64844168 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1787 het 616 hom 11 3 6 4 A 15 14 273773 CASAVA_Build 7 64846521 2I GTTTTATGGA --/TG TGTGGCCAAA 2336 het 2336 ref 19 10 7 2 TG 2 3 273774 CASAVA_Build 7 64861386 5I CCATCTTTAG -----/ATTTC ATTTGCTGAC 3070 het 2078 hom 18 6 9 3 ATTTC 0 1 273775 CASAVA_Build 7 64869951 4D TTTTTCATAC TTAT/---- TTTTCTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 TTAT 1 0 273776 CASAVA_Build 7 64870289 2D CCTGGGTGAC AG/-- AGTGAGATCC 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 AG 2 1 273777 CASAVA_Build 7 64882554 1D TTTATTCTCA C/- CTTGCAGACA 2132 het 2132 ref 27 19 5 3 C 2 1 273778 CASAVA_Build 7 64887393 5D GAGTTTCCTC ACTCT/----- TTTTTTTTTT 2917 het 2917 ref 30 14 10 8 ACTCT 1 0 273779 CASAVA_Build 7 64898383 5I TCATATTCTT -----/TTCTC TTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 TTCTC 0 1 273780 CASAVA_Build 7 64923731 1D TACAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 18 4 A 11 10 273781 CASAVA_Build 7 64928665 2I AAATGATGGT --/GA GAAGGAGCTA 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 GA 1 2 273782 CASAVA_Build 7 64929690 1D TTCACCCTAA T/- TCCCAGGCTG 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 T 2 1 273783 CASAVA_Build 7 64938941 9D ATAACTGTTT CTTACTTAA/--------- CTTAACCACT 3070 het 3070 ref 48 26 21 3 CTTACTTAA 1 0 273784 CASAVA_Build 7 64939253 1I CTTGGAAGAC -/T TATGTACAAT 1423 het 1423 ref 40 33 4 3 T 1 2 273785 CASAVA_Build 7 64946639 1I GGCTGCTGGG -/A AGGGGGCACT 1286 het 1286 ref 35 24 3 8 A 1 2 273786 CASAVA_Build 7 64947574 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2847 hom 22 8 8 8 A 17 16 273787 CASAVA_Build 7 64948887 4I CCTATGTTTC ----/TTCT TTCTTTCAAG 3070 hom 58 het 23 0 20 3 TTCT 1 2 273788 CASAVA_Build 7 64949538 1D CAGGGTTTCA C/- CCATGTTAGC 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 C 3 2 273789 CASAVA_Build 7 64955570 1D CCAGCTAAGT A/- AAAAAAAAAA 1561 het 1295 hom 31 9 8 14 A 19 18 273790 CASAVA_Build 7 64956584 1D TAGAGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 995 het 995 ref 43 32 3 8 T 11 10 273791 CASAVA_Build 7 64981473 2D GCTGTGAAAC TT/-- TTCAGAGCCG 3070 het 3070 ref 33 21 9 4 T 4 2 273792 CASAVA_Build 7 64986228 3I CCTAATCTGT ---/TTC TTATGTTATA 2617 het 2617 ref 18 11 6 1 TTC 0 1 273793 CASAVA_Build 7 64988621 1D TTATCATGAT A/- TATGGTATAT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 A 1 0 273794 CASAVA_Build 7 65006196 1D ACCGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2907 het 74 hom 24 1 13 10 A 19 18 273795 CASAVA_Build 7 65010307 1D CCCTCATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 T 11 10 273796 CASAVA_Build 7 65013097 1D ACTTTGCAAG T/- TTTTTTTTTT 1664 het 1664 ref 51 36 4 11 T 12 11 273797 CASAVA_Build 7 65018056 1D AAGAAACCAG T/- TTTTTTTTTT 2656 het 1904 hom 34 11 10 13 T 15 14 273798 CASAVA_Build 7 65021702 4D CTTGTTGATG TCAT/---- TCAGTCTCTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 7 TCAT 1 0 273799 CASAVA_Build 7 65023485 1D CTTTTACTTT G/- GGGGGGGTTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 G 8 7 273800 CASAVA_Build 7 65024611 4I TGTTTGACAT ----/AGTC AGTATTCATT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 AGTC 0 1 273801 CASAVA_Build 7 65039666 3I CCAGTTTTTA ---/CTC CTCTCCTCTA 3070 hom 123 het 44 0 40 4 CTC 1 2 273802 CASAVA_Build 7 65053505 2D TATTTATCAC AT/-- GTGTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 AT 1 0 273803 CASAVA_Build 7 65060331 15D TTGCAAAAGT ACAGAGTTATCTTCA/--------------- GCAATTACTT 3070 het 3070 ref 25 15 11 1 ACAGAGTTATCTTCA 1 0 273804 CASAVA_Build 7 65081795 2I GGGCCCCGCT --/GA GAGAGGATCC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 GA 2 3 273805 CASAVA_Build 7 65093859 1D AAAATGATTC A/- AGACTCACCT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 A 2 1 273806 CASAVA_Build 7 65098044 1D CATGAAATGC T/- TTTTTTTTTT 1634 het 1634 ref 17 6 6 5 T 13 12 273807 CASAVA_Build 7 65102024 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAT 2597 het 2257 hom 16 6 6 4 A 10 9 273808 CASAVA_Build 7 65113816 1D GAGCTGAGAT A/- CGCACCACTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 1 0 273809 CASAVA_Build 7 65121065 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 10 11 273810 CASAVA_Build 7 65131253 1I ATATGACATT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 7 8 273811 CASAVA_Build 7 65145586 1D TTACGTCAAT A/- AAAAAAAAAA 2583 het 1620 hom 23 7 6 11 A 12 11 273812 CASAVA_Build 7 65145931 1D AAATATAAAC A/- TCTGAAATGC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 1 0 273813 CASAVA_Build 7 65154905 5D CACTATGTCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 27 17 8 3 CAAAA 3 2 273814 CASAVA_Build 7 65156468 2D GAAATTCTCC TG/-- TCTCAGGGTC 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 TG 1 0 273815 CASAVA_Build 7 65176273 1D TAAATAAAAA T/- AAAATAAAAT 1910 het 1910 ref 16 6 6 4 T 1 0 273816 CASAVA_Build 7 65181138 1D CTCACCGCAA C/- CTCTACCTCC 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 C 2 1 273817 CASAVA_Build 7 65196723 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1012 hom 19 4 12 3 A 9 10 273818 CASAVA_Build 7 65202001 1D AGGGGGAGGA G/- GGAGGGGGAG 825 hom 10 het 12 0 5 7 G 3 2 273819 CASAVA_Build 7 65202873 11D AGGAGGAAAA AGAATGAGGAG/----------- GAGGAAAGAG 1118 het 1118 ref 17 5 4 9 AGAATGAGGAG 1 0 273820 CASAVA_Build 7 65225055 5D ATTTAGACAG TTGTT/----- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 21 21 8 TTGTT 2 1 273821 CASAVA_Build 7 65228790 2D TGCACATTAC AA/-- ATCAAGTGCA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 3 1 273822 CASAVA_Build 7 65230537 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2501 het 2501 ref 25 9 8 8 A 14 15 273823 CASAVA_Build 7 65236968 1D GGAACAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 201 hom 31 4 16 12 T 17 16 273824 CASAVA_Build 7 65241299 1I ATATTTCAGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 T 8 9 273825 CASAVA_Build 7 65242785 1D ATTTTTTTTG T/- TTTTTTGTCT 3070 het 115 hom 21 1 10 10 T 7 6 273826 CASAVA_Build 7 65246594 3D AGTTCTGTAG TCT/--- TTCAGAGTCC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TCT 1 0 273827 CASAVA_Build 7 65249764 1D CCATCTTGGG A/- AAAAAAAAAA 2669 hom 36 het 23 0 11 12 A 15 14 273828 CASAVA_Build 7 65254319 1I GCTTGGTTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2443 hom 24 6 13 5 T 8 9 273829 CASAVA_Build 7 65259855 1D TTAAAAAAAA G/- CACTCCTACT 3070 hom 89 het 32 0 28 5 G 1 0 273830 CASAVA_Build 7 65264820 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 9 10 273831 CASAVA_Build 7 65269139 1I CTGGCCAACA -/T TGGTGAAACC 1269 het 371 hom 7 2 3 2 T 1 2 273832 CASAVA_Build 7 65274488 22D AGTGAAATAA AATTCACACTTATGGATGCAGG/---------------------- AATTAACAGA 3070 het 3070 ref 32 23 9 6 AATTCACACTTATGGATGCAGG 1 0 273833 CASAVA_Build 7 65287711 1I AAGAGATGGG -/A GTGGGGGGGG 1657 het 1657 ref 19 7 8 4 A 0 1 273834 CASAVA_Build 7 65302920 3I CGGCTCACTG ---/CAA CAAGCTCCGC 3070 hom 41 het 18 0 14 4 CAA 1 2 273835 CASAVA_Build 7 65313479 2D TTCCTGGTAC TG/-- TGTACATTTA 3070 het 2835 hom 15 7 7 1 TG 2 1 273836 CASAVA_Build 7 65323183 3I TGGTGAGGAC ---/TTT TTAATTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 2 5 273837 CASAVA_Build 7 65328016 4I CCTGGGTGAC ----/AGAG AGAGACTCAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 2 4 273838 CASAVA_Build 7 65330029 1I GAATAGACTC -/T TAATGGGCAG 3070 het 3070 hom 28 8 15 5 T 1 2 273839 CASAVA_Build 7 65350412 15D CCCATAGGTG AATATATTTTTGAAA/--------------- AATATATTTT 3070 het 3070 ref 38 20 15 12 AATATATTTTTGAAA 2 1 273840 CASAVA_Build 7 65362115 1D CACACATGCA C/- TGCCTCCCCC 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 C 1 0 273841 CASAVA_Build 7 65367972 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1783 het 1783 ref 31 13 6 12 A 14 13 273842 CASAVA_Build 7 65371128 1D CTGTAAACGA T/- TTTTTTTTTT 1849 het 1849 ref 38 25 5 8 T 13 12 273843 CASAVA_Build 7 65372033 2I TAGTAAAGAC --/TG TGCACTCAAC 3070 hom 169 het 62 0 57 5 TG 1 2 273844 CASAVA_Build 7 65376217 1D TTTATCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 16 8 A 11 10 273845 CASAVA_Build 7 65381163 15D CGAGATCGCA CCACTGCACTCCAGC/--------------- CCACTGCACT 2857 het 589 hom 11 3 7 1 CCACTGCACTCCAGC 2 1 273846 CASAVA_Build 7 65386783 1I TTAATTTACA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 12 11 11 T 8 9 273847 CASAVA_Build 7 65397532 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 10 11 273848 CASAVA_Build 7 65412256 1D CATAAGGAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 297 hom 40 1 36 3 T 9 8 273849 CASAVA_Build 7 65417705 1D GGCAAAGGGA G/- GGCACATGGT 3070 het 3070 hom 51 15 30 8 G 3 2 273850 CASAVA_Build 7 65420894 1D TTCTTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 1556 het 1556 ref 34 18 5 11 T 15 14 273851 CASAVA_Build 7 65425272 19D CCTTCCAGTA GTGCACAAAGGTTCCAGTG/------------------- GTGCACAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 18 11 GTGCACAAAGGTTCCAGTG 1 0 273852 CASAVA_Build 7 65434007 1D AATTACTGAT C/- ATTATTTGAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 C 1 0 273853 CASAVA_Build 7 65434593 1I ACAAAACCGG -/C CCCAAAGTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 3 4 273854 CASAVA_Build 7 65448607 2D TGAATAGTAC AT/-- ATATATATAT 3001 het 3001 ref 18 7 9 2 AT 9 8 273855 CASAVA_Build 7 65454094 1D CCTCCCCTCC A/- AAAAAAAAAA 2070 het 2070 ref 26 15 5 6 A 15 14 273856 CASAVA_Build 7 65458463 1I CTTGTCTATT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 7 8 273857 CASAVA_Build 7 65462716 1D CGTGTGCCTG T/- TTAAGTGTAT 3070 het 3070 hom 38 10 25 4 T 3 2 273858 CASAVA_Build 7 65469790 4I CCCTTGATAC ----/TTAT TTATTTATTC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 TTAT 2 3 273859 CASAVA_Build 7 65479979 2I TCCAACACAC --/AT GTGCTGTTCC 3070 het 2513 hom 32 9 14 9 AT 0 1 273860 CASAVA_Build 7 65490762 4D TTATTTATTC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 ATTT 6 5 273861 CASAVA_Build 7 65497649 4I TTGGAACGAT ----/AGAG AGATTGGCAT 2817 het 2347 hom 15 5 6 4 AG 1 3 273862 CASAVA_Build 7 65523963 1D TGACCTTTTT A/- AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 30 12 17 2 A 7 6 273863 CASAVA_Build 7 65524951 2I TGGGTAAGAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 9 11 273864 CASAVA_Build 7 65525360 1D GACATCCTAG T/- TAACTCCACT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 T 2 1 273865 CASAVA_Build 7 65527519 1I CACTAGATGT -/A TAGTAGCACC 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 A 0 1 273866 CASAVA_Build 7 65552320 2D TTTCAACTAA AG/-- AGAGTATTGG 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 AG 3 2 273867 CASAVA_Build 7 65569888 3I TTTTCTAGTT ---/AAA GAAGCAAAGA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 A 0 3 273868 CASAVA_Build 7 65572516 5I AAATGGTGAA -----/TAAAT TAAATTCAGA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 TAAAT 1 2 273869 CASAVA_Build 7 65598667 1I CACCCAGGCT -/G GAGTGCAGTG 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 G 1 2 273870 CASAVA_Build 7 65604774 1D TTTGGGGGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 T 9 8 273871 CASAVA_Build 7 65606454 1I CCTCGGGGGC -/G GGCACAAGTG 3070 hom 49 het 23 0 14 9 G 2 3 273872 CASAVA_Build 7 65611606 1D TTTTTTCTTT C/- TTTTTTTTTT 1544 het 1544 ref 30 17 4 10 C 1 0 273873 CASAVA_Build 7 65633674 1I CTTGTCTTTC -/A AAAAAAAAAA 2967 het 2967 ref 25 8 7 10 A 13 14 273874 CASAVA_Build 7 65638972 1D CTGACCCCCC T/- TTTTTTTTTT 2781 het 667 hom 22 4 10 8 T 13 12 273875 CASAVA_Build 7 65650238 1I TGCATGTGTC -/A AAAAAAACCC 3070 het 2187 hom 21 8 9 4 A 7 8 273876 CASAVA_Build 7 65657535 1I TCTTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1230 hom 37 6 22 9 C 0 1 273877 CASAVA_Build 7 65662422 2D ACAAAAAAAA AC/-- AAAAAACAAA 2490 het 18 hom 14 1 8 6 AC 1 0 273878 CASAVA_Build 7 65664792 5I GGAGCGCAGT -----/GAGTG GAGTGATCTC 3070 hom 50 het 20 0 16 4 GAGTG 1 2 273879 CASAVA_Build 7 65665552 4D TTCACAAATT CTTG/---- CTTTTTACCC 3070 het 3070 ref 42 27 10 6 CTTG 1 0 273880 CASAVA_Build 7 65666671 2D CCCTACCACT AC/-- AGTTGACTGT 3070 het 3070 ref 61 29 25 9 AC 1 0 273881 CASAVA_Build 7 65676445 1I GTGGGGTCTT -/A AAAGGATAAA 3070 het 3070 ref 46 24 13 9 A 3 4 273882 CASAVA_Build 7 65678160 1I CTGACTGGAT -/G GAAAAAAAAA 2445 het 2445 ref 30 13 10 7 G 1 2 273883 CASAVA_Build 7 65682771 6I ATTAGACAGA ------/AACAAT AACAATAGCT 3070 het 3070 ref 47 25 11 11 AACAAT 1 2 273884 CASAVA_Build 7 65685326 1I TGGTGTAAGC -/A AGTTAACCCA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 1 2 273885 CASAVA_Build 7 65689143 1I CCCTGGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 13 14 273886 CASAVA_Build 7 65698741 2D ACCCAGCCAA TT/-- TTTTTTTTTT 2587 hom 10 het 25 0 10 15 T 18 16 273887 CASAVA_Build 7 65707331 1D TCTTTTCAGT C/- TGCACAGTAA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 C 1 0 273888 CASAVA_Build 7 65708105 1D TTCAGCCTAA T/- TTTTTTTTTT 1875 hom 11 het 11 0 5 6 T 15 14 273889 CASAVA_Build 7 65709490 3D GCAGCTCCTC CTT/--- CTTCCCGCGA 1279 het 1279 ref 24 13 5 6 CTT 2 1 273890 CASAVA_Build 7 65711905 1D GGGGTGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 206 hom 43 4 20 19 A 11 10 273891 CASAVA_Build 7 65713223 2I GTCTCAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 2944 het 2944 ref 22 11 9 2 A 10 12 273892 CASAVA_Build 7 65713487 2D CACTATTAAC CA/-- CAGTCTTCTA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 CA 2 1 273893 CASAVA_Build 7 65714367 4I TTTATTTGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 44 het 18 0 15 3 TTTG 3 4 273894 CASAVA_Build 7 65734129 1D GCAAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 16 19 19 A 12 11 273895 CASAVA_Build 7 65735308 2I TACTAAAAAA --/AT ATATATATAT 1576 het 891 hom 11 3 6 2 AT 7 8 273896 CASAVA_Build 7 65736015 2I AAAGAGATCA --/AT ATTTTTTTTT 2128 het 1449 hom 27 6 7 14 AT 1 2 273897 CASAVA_Build 7 65737184 3I CAGTGTTGTT ---/CTC CTTTAATTTT 3070 hom 56 het 21 0 18 3 CTC 0 1 273898 CASAVA_Build 7 65745588 3D GATGCCCCAC ACA/--- ACAAGACAGG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 ACA 2 1 273899 CASAVA_Build 7 65751287 15D ATCCCATGTG CATTCACGTGTCACC/--------------- CATTCAAAAT 3070 het 3070 ref 25 15 11 3 CATTCACGTGTCACC 1 0 273900 CASAVA_Build 7 65751492 2I TTCAAGAAAT --/AA AATAATAATA 1697 hom 15 het 19 0 6 13 A 2 4 273901 CASAVA_Build 7 65752567 5D CTCAAAAAAC AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 35 13 20 4 AAACA 4 3 273902 CASAVA_Build 7 65753218 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2880 het 702 hom 18 2 6 10 A 12 11 273903 CASAVA_Build 7 65762770 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2121 het 1016 hom 18 4 9 5 A 14 15 273904 CASAVA_Build 7 65765516 3D CACAAATAAT AAC/--- ATGAGCGCTC 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 AAC 1 0 273905 CASAVA_Build 7 65767575 1D AGAATTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 11 10 273906 CASAVA_Build 7 65773959 1D61M4I TTAAAGCAAT AAAAAAAAGATGAAAGACTGATATAGTGTTGTTCTCCTTTAATTTTGCCAAGGAAAGTCTTT----/-AAAAAGAGATGGAAGACTGATACAGTGTTGTTCTCCTTTAATTTTGCCAAGGAAAGTCTTTAAAA TTTAAAAAAC 2478 het 2478 ref 37 49 6 7 N/A 0 0 273907 CASAVA_Build 7 65783816 1D TCAGTTACGC T/- TTTTTTTTTT 2311 het 460 hom 28 4 13 11 T 17 16 273908 CASAVA_Build 7 65784013 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGCTCTCC 3070 hom 45 het 18 0 14 5 G 5 4 273909 CASAVA_Build 7 65789906 2D TGTTTAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 2443 het 1096 hom 26 6 10 10 A 16 14 273910 CASAVA_Build 7 65802114 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2682 hom 24 8 11 5 A 12 11 273911 CASAVA_Build 7 65813402 1I CTGTCACTAC -/A AAAAAAAAAA 2737 het 2641 hom 14 6 7 1 A 10 11 273912 CASAVA_Build 7 65822568 1D AAAAGAAGCA T/- TTGACAACAT 3070 het 1080 hom 16 4 8 5 T 3 2 273913 CASAVA_Build 7 65822601 1I CATTATTATT -/C ATTATTATTA 147 het 147 ref 18 3 1 14 C 0 1 273914 CASAVA_Build 7 65828388 1I ACTTAGAAAA -/G CCCCCATTCA 3070 het 3070 ref 44 17 14 13 G 0 1 273915 CASAVA_Build 7 65828522 4D AGCTGCTACT CAGA/---- CAGGGCCAGA 3070 het 3070 ref 44 21 18 7 CAGA 1 0 273916 CASAVA_Build 7 65836120 4D GCTCCATCTC AACA/---- AAACAAAACA 25 het 25 ref 23 14 1 11 AACA 1 0 273917 CASAVA_Build 7 65842399 2D GGATGTCGGT TA/-- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 TA 1 0 273918 CASAVA_Build 7 65859703 4D TAACTTGTTA TTGT/---- TTCTCTGTTA 3070 het 3070 ref 40 23 16 3 TTGT 1 0 273919 CASAVA_Build 7 65860343 1I GACCAAAACA -/T TTTTTTTTTG 2980 het 795 hom 12 4 7 1 T 9 10 273920 CASAVA_Build 7 65861128 1I CCTTCTACCG -/T TAACAGCTGT 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 T 1 2 273921 CASAVA_Build 7 65863194 1I AATGGCTAAT -/C ACTCACGAGG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 C 0 1 273922 CASAVA_Build 7 65866745 3I TTGTTAATTT ---/TTA TTATTGAGTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 TTA 1 2 273923 CASAVA_Build 7 65868727 1D CCTGTCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1725 hom 46 11 23 12 A 15 14 273924 CASAVA_Build 7 65882678 1I TCAGTTGTTA -/C ATAGTCAACA 3070 het 3070 hom 52 21 28 3 C 0 1 273925 CASAVA_Build 7 65885208 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1588 het 1588 ref 16 10 5 1 A 10 11 273926 CASAVA_Build 7 65890879 4D AAAAAACAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 394 het 394 ref 27 15 3 10 AAAC 1 0 273927 CASAVA_Build 7 65895420 2D GAGCATAAAC TG/-- CAGTAGAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 TG 1 0 273928 CASAVA_Build 7 65898671 1D AAAAAAAAAA G/- AGCTTCAAGT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 G 1 0 273929 CASAVA_Build 7 65908162 4I ATTTGCCCCC ----/TCAT TCATTCATTC 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 TCAT 2 3 273930 CASAVA_Build 7 65911811 2I TATAAATGTC --/AG AGCATTTTTT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 AG 1 2 273931 CASAVA_Build 7 65914946 4I TTTAGGGCTC ----/TGTA TGTAGCTGCC 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 TGTA 1 2 273932 CASAVA_Build 7 65918282 1I CAACAGACCT -/C CCCCCTGAGC 2769 het 2769 ref 23 13 9 1 C 5 6 273933 CASAVA_Build 7 65921745 1D CCTATTTTTC T/- TTTTTTTTAT 1140 het 1140 ref 15 9 4 2 T 9 8 273934 CASAVA_Build 7 65946489 2D TTAGACGGAG TC/-- TCTCTCTCTG 573 het 573 ref 18 8 2 8 TC 5 4 273935 CASAVA_Build 7 65947826 4D CTAAAAAAGT AAAA/---- AAACTATCCA 3070 het 3070 ref 27 13 10 6 A 7 3 273936 CASAVA_Build 7 65955765 2I GGGATTACAG --/GT GTGAGCGATC 2625 het 2625 ref 30 18 7 5 GT 1 2 273937 CASAVA_Build 7 65957574 1I TCTCTTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 10 11 273938 CASAVA_Build 7 65962338 1D AAGCTCAGAT C/- CTACCCCATC 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 C 2 1 273939 CASAVA_Build 7 65987504 2I TCAGATTCTC --/AT GTGAGCACGA 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 AT 0 1 273940 CASAVA_Build 7 65989685 1D CTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 12 11 273941 CASAVA_Build 7 66009491 2I AGGAAATGAA --/AT ATATTCTTAG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 AT 2 3 273942 CASAVA_Build 7 66019334 1D AATAAAAAAA C/- CCAAACAAAC 3070 het 3070 ref 37 24 9 4 C 3 2 273943 CASAVA_Build 7 66025126 9I AAAGGTAGAT ---------/CTAAGTGCA TATATATATA 3070 het 2780 hom 31 9 22 2 CTAAGTGCA 0 1 273944 CASAVA_Build 7 66030047 1I TTGGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1859 het 1291 hom 22 8 6 8 T 15 16 273945 CASAVA_Build 7 66052029 4I ATTTTCTGTT ----/AAAC AATTAACTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAAC 0 1 273946 CASAVA_Build 7 66059639 2I CTTTCCTTAA --/CT CTCTAGGTTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 CT 2 3 273947 CASAVA_Build 7 66062912 1I ATTTTTTACA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 8 9 273948 CASAVA_Build 7 66063559 1D GACCTTGCCT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 2627 hom 21 8 11 2 A 8 7 273949 CASAVA_Build 7 66092112 2D TAAAATGTTC TG/-- TGTTTAGTGT 2696 het 2696 ref 15 9 6 1 TG 2 1 273950 CASAVA_Build 7 66099743 1D TATCTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 27 1 19 7 A 13 12 273951 CASAVA_Build 7 66105072 1I TATACTTGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 8 9 273952 CASAVA_Build 7 66124534 2I GAGGTCCCAC --/TG TGTGTTGCCC 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 TG 2 3 273953 CASAVA_Build 7 66127789 2I CTGATGAGCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 A 12 14 273954 CASAVA_Build 7 66136532 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 1915 hom 18 het 9 0 7 2 T 12 11 273955 CASAVA_Build 7 66136700 1D TATTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 2722 het 2722 ref 18 8 8 4 T 8 7 273956 CASAVA_Build 7 66140443 1D AATGCTCGGG C/- CGAGCTTGGT 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 C 2 1 273957 CASAVA_Build 7 66143266 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1605 hom 20 6 8 6 A 11 12 273958 CASAVA_Build 7 66150512 26I GCCCAGCCAC --------------------------/GTGTTAAAATTTTTAATCTGTTTTAT ATATGGGGGA 2878 hom 18 het 8 0 7 1 GTGTTAAAATTTTTAATCTGTTTTAT 0 1 273959 CASAVA_Build 7 66156698 1D TAATGTACAG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 7 273960 CASAVA_Build 7 66157125 1D ATTTGCCTTA T/- TTGCCTGCAA 3070 het 3070 ref 49 29 16 4 T 3 2 273961 CASAVA_Build 7 66161469 2I ACAGGAAGAC --/AA AGTATACTTT 3070 het 3070 hom 16 8 8 0 A 1 3 273962 CASAVA_Build 7 66165955 4I AGGAAATGAC ----/AAAT AAATAAATTT 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 AAAT 2 3 273963 CASAVA_Build 7 66166292 1I CCAAAGTGCT -/G GGATTACAGG 3070 het 806 hom 15 3 11 1 G 2 3 273964 CASAVA_Build 7 66168024 1D TCCCTTCACA C/- CTTTTTTTCA 3070 het 2011 hom 22 7 9 6 C 2 1 273965 CASAVA_Build 7 66181912 1D TATTTGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 16 10 T 11 10 273966 CASAVA_Build 7 66183576 1D AATTCCCTCA G/- TTTTTACTTG 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 G 1 0 273967 CASAVA_Build 7 66183643 5D CTTGGTGGTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1084 het 1084 ref 29 15 4 11 T 19 14 273968 CASAVA_Build 7 66186683 1D TTCCTTATTT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 8 7 273969 CASAVA_Build 7 66199070 1D CTTGTGTCAT G/- GGGGTTTGTT 3070 het 2711 hom 15 6 9 1 G 5 4 273970 CASAVA_Build 7 66201378 1D AGAGAATGAA T/- TTTTTTTTTC 2762 het 2762 ref 19 9 7 3 T 10 9 273971 CASAVA_Build 7 66207009 1I CAGACTCTTT -/A CTGACAGTTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 0 1 273972 CASAVA_Build 7 66208875 1I CTCCACGCTG -/T TAATGCTGAC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 1 2 273973 CASAVA_Build 7 66211865 1D ACAAGCGACT G/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 G 1 0 273974 CASAVA_Build 7 66217246 2D CAAAAGTCTC TT/-- TGCTAATTTT 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 T 3 1 273975 CASAVA_Build 7 66217663 3D AAGACAGTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 2352 het 406 hom 20 4 7 9 T 19 16 273976 CASAVA_Build 7 66221542 4D CCATTAATCC TCCT/---- TCCTTCCTTC 3070 hom 97 het 42 0 31 11 TCCT 5 4 273977 CASAVA_Build 7 66222499 4I TGTTTCTTTT ----/TTTC TTTCTTCTTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 TTTC 1 2 273978 CASAVA_Build 7 66222724 1D GGCTGGTCTC A/- AAACTCCTGA 2672 het 651 hom 13 2 8 3 A 4 3 273979 CASAVA_Build 7 66224609 1I TCTTGAAACC -/T CATATTTAAA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 0 1 273980 CASAVA_Build 7 66227814 2D GGGGTCTGGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 11 9 273981 CASAVA_Build 7 66228982 2D ATCTAGACTT TC/-- TCCTGTGTTA 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 TC 2 1 273982 CASAVA_Build 7 66229457 3D CATACTTCAC TTG/--- TTGTTTTTTT 3070 het 2850 hom 27 8 15 4 TTG 2 1 273983 CASAVA_Build 7 66233500 2D TGGTGTATAT TC/-- TGTTATTTCC 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 TC 1 0 273984 CASAVA_Build 7 66234590 1D GGAGTGCCAC A/- AGTATGATCA 2573 het 2573 ref 36 29 7 0 A 2 1 273985 CASAVA_Build 7 66235679 1D CCACCTCAGT C/- CCCCCACGAA 2611 het 2611 ref 33 18 6 10 C 6 5 273986 CASAVA_Build 7 66236848 1I GCCTGTAATT -/C CAGCTACTCA 1742 het 891 hom 10 2 5 3 C 1 2 273987 CASAVA_Build 7 66237202 2D TGCCCATGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 146 hom 26 3 8 15 T 14 12 273988 CASAVA_Build 7 66237636 1D TTTTAGTATA T/- TCACAAGCTT 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 T 2 1 273989 CASAVA_Build 7 66240166 1I TTAAAAAAAA -/T ATTTGAGGTG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 0 1 273990 CASAVA_Build 7 66240755 1D TGTTTTTAAA T/- TTTAAGTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 4 3 273991 CASAVA_Build 7 66242498 1D GGTGGCAGGC A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 25 9 9 7 A 8 7 273992 CASAVA_Build 7 66242797 1D AATAATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2078 hom 18 5 8 5 A 11 10 273993 CASAVA_Build 7 66243040 1I TAGATAAAAA -/T ATTAGTGAAG 3070 het 3070 hom 28 11 9 8 T 0 1 273994 CASAVA_Build 7 66244524 3D ATGTCAGTGC TAT/--- TATTATTTAG 2799 het 2799 ref 18 10 8 2 TAT 3 2 273995 CASAVA_Build 7 66246905 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 7 8 273996 CASAVA_Build 7 66248187 1I TTTGTTTGGG -/T GTTTTTTTGA 3070 het 2681 hom 21 6 11 4 T 0 1 273997 CASAVA_Build 7 66249336 6I TGGTTGCTAG ------/AGCTCC AGCCATCATG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AGCTCC 0 1 273998 CASAVA_Build 7 66249846 2D ATGCTCTGTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 11 9 273999 CASAVA_Build 7 66250368 1D ATTAATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 4 A 11 10 274000 CASAVA_Build 7 66251992 1D ACACTGGGGG A/- AAAAATGTGT 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 A 6 5 274001 CASAVA_Build 7 66254473 3D GCTCAAGTGA TCT/--- TCTCACCTTG 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 TCT 2 1 274002 CASAVA_Build 7 66256893 9I12M1I TTTTGCTGGA ---------TTTGATAAGCAG-/TATAGTATTTTTGATAAGCAGT TTTTTTTCTT 2412 het 2412 ref 25 18 5 5 N/A 0 0 274003 CASAVA_Build 7 66257982 1D TTAGGTATTC T/- TTTTTTTTTT 2559 het 2559 ref 29 15 9 5 T 13 12 274004 CASAVA_Build 7 66267107 1I AACGAGGTAC -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 6 7 274005 CASAVA_Build 7 66267425 2I GATTTGAATA --/TT TTTTTCAGAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 5 7 274006 CASAVA_Build 7 66270543 4I CTTTATGTGA ----/CTAT CTATTATCAA 1378 het 1378 ref 17 14 3 0 CTAT 1 2 274007 CASAVA_Build 7 66271421 1D GGTGTGAGCA C/- TGTGGCCGGC 3070 het 1966 hom 16 5 8 3 C 1 0 274008 CASAVA_Build 7 66272404 1D CCATTGTATC T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 37 10 20 7 T 7 6 274009 CASAVA_Build 7 66273389 1I TCCTCTGCTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 8 9 274010 CASAVA_Build 7 66276061 1D GTCTTGTCTT A/- ACAACATTGA 2234 het 2234 ref 24 16 5 5 A 2 1 274011 CASAVA_Build 7 66277032 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAGAA 2316 het 1345 hom 15 5 6 4 A 8 7 274012 CASAVA_Build 7 66279083 1D GAATCATAAA G/- GGTTGTATAT 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 G 3 2 274013 CASAVA_Build 7 66280602 1D GAAAAAAAAA C/- AGGAGGTGGG 3070 het 2601 hom 30 13 11 6 C 1 0 274014 CASAVA_Build 7 66283774 4I GGAAGAATTA ----/TAAG TATGTAAAGG 3070 het 3070 hom 23 10 8 5 TAAG 0 1 274015 CASAVA_Build 7 66284100 1I AGCCTGAGTG -/T TTACCTGGGC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 2 3 274016 CASAVA_Build 7 66284963 5I TCCAGCCTGG -----/ACAAC AGGGCGAGAC 3070 het 2824 hom 23 8 12 3 ACAAC 0 1 274017 CASAVA_Build 7 66285170 2I AACTTGGGTG --/AT ATTATTACCT 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 AT 1 2 274018 CASAVA_Build 7 66286120 1I CCTTTACCCA -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 T 6 7 274019 CASAVA_Build 7 66289475 13D CACAATTAAA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 2004 het 639 hom 18 4 6 8 T 29 16 274020 CASAVA_Build 7 66291740 5D TGTGTGCATC TGTGT/----- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 61 34 19 11 TGTGT 2 1 274021 CASAVA_Build 7 66291825 4I TGTTGTGTGC ----/ATGT GTGTGTTGTG 3070 het 3070 ref 59 32 22 5 ATGT 0 1 274022 CASAVA_Build 7 66291954 5D CTAGAGTCTC ATGTG/----- GGGTGAGAGG 3070 het 3070 ref 49 30 13 10 ATGTG 1 0 274023 CASAVA_Build 7 66293202 1I TATTATGGGG -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 ref 30 19 7 4 A 6 7 274024 CASAVA_Build 7 66293381 1D GCCAGTGAGG A/- AGACTTTATG 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 A 2 1 274025 CASAVA_Build 7 66298223 1I TTCCATTTTT -/C CCCCTTTAGT 2668 het 2668 ref 17 8 7 2 C 4 5 274026 CASAVA_Build 7 66299072 2I ATCACAGCCT --/TC TCTCTCCCTC 3070 het 3070 ref 42 27 13 2 TC 3 4 274027 CASAVA_Build 7 66299749 1D GACCTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 2513 het 852 hom 25 4 11 11 T 17 16 274028 CASAVA_Build 7 66302341 8D AGAGAGAGAG AAAGAGAA/-------- GAAGAGAAGA 2137 het 2137 ref 20 9 9 4 AAAGAGAA 1 0 274029 CASAVA_Build 7 66304161 1D TCCAAAATGC T/- TTGAAATTAA 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 T 3 2 274030 CASAVA_Build 7 66304818 1I GCTCAATTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 8 9 274031 CASAVA_Build 7 66306987 1I35M1D TTCTTCTTTC -TTCTTCCTTCTTCCTTCTTTCTTCTTCTTCTTTTCT/TTTCTTTCTTCTTCCTTCTTTCTTCTTCTTCTTTTC- TTTTTTTTTT 3070 het 1249 hom 17 4 15 3 N/A 0 0 274032 CASAVA_Build 7 66308218 2I CTTGGGACTC --/TT TTTTTTTTTT 1751 het 1751 ref 22 12 6 4 T 10 12 274033 CASAVA_Build 7 66313109 24D13M4I TCTATCCATC CATTCGTCCATCCATCCATCCATTCATCATCTGTATG----/------------------------CATCATCTGTAGGTCCA TCCATCAGTC 3070 het 3070 ref 43 33 10 10 N/A 0 0 274034 CASAVA_Build 7 66314751 1D TGATAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 12 11 274035 CASAVA_Build 7 66315595 1D CGCCCGGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 19 0 11 8 T 11 10 274036 CASAVA_Build 7 66317187 1D GATCATGTGA T/- TTTTTTTTTT 2113 het 2113 ref 33 19 5 9 T 11 10 274037 CASAVA_Build 7 66319479 1D TGCTGAGCAC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 2948 hom 26 9 11 6 T 8 7 274038 CASAVA_Build 7 66320207 1I ACAAAAAATG -/T TTTTTGTTAT 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 T 5 6 274039 CASAVA_Build 7 66320782 2D TATTTATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 2236 het 2135 hom 14 7 5 2 T 12 10 274040 CASAVA_Build 7 66324284 1I AATACTTGTC -/T TTTTTTTTTT 1469 het 19 hom 15 1 8 6 T 15 16 274041 CASAVA_Build 7 66324897 1D CTGGTTGACA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 T 8 7 274042 CASAVA_Build 7 66324963 1D ATTAGAAATC T/- TCTATGACCT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 2 1 274043 CASAVA_Build 7 66328160 11I TTAGCTCCAC -----------/TCCAACAAAAT TGGAGATTAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 TCCAACAAAAT 0 1 274044 CASAVA_Build 7 66329688 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTGAG 3064 het 2030 hom 15 5 8 2 A 1 0 274045 CASAVA_Build 7 66331820 1D ATTAGCTGGG C/- CGTGGTGGGG 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 C 2 1 274046 CASAVA_Build 7 66332537 1I ATCTTGGCCC -/T TCTACTTCCT 3070 het 3070 ref 60 38 17 5 T 1 2 274047 CASAVA_Build 7 66332791 4I TTTCCTTTCT ----/TGGA TGGATACAGT 2971 hom 21 het 11 0 8 3 TGGA 1 2 274048 CASAVA_Build 7 66337067 1I TTCCAGTTAG -/T TTTTTTAGAC 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 6 7 274049 CASAVA_Build 7 66337203 3D CTTTTAGTGC AGA/--- AGCTTTCACA 3070 het 3070 hom 27 11 13 6 AGA 1 0 274050 CASAVA_Build 7 66337366 1I12M3D TATTTTTGAC -TGTAGGTATGGTAAA/TTGTAGGTATGGT--- AAAAAAAAAA 3070 het 1202 hom 16 6 11 3 N/A 0 0 274051 CASAVA_Build 7 66338388 3D TGATGGCATA TGT/--- TGTTAAGTTC 1163 het 1163 ref 23 15 4 4 TGT 2 1 274052 CASAVA_Build 7 66339251 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTGT 1974 het 1974 ref 28 15 8 5 T 8 9 274053 CASAVA_Build 7 66340035 1D AATAGCTTTG A/- ATTAAAAGCC 2013 het 2013 ref 18 11 6 1 A 2 1 274054 CASAVA_Build 7 66340674 1I AAAACATTCA -/T TTTTTTTTTT 2910 het 2910 ref 29 17 7 5 T 10 11 274055 CASAVA_Build 7 66350672 5D TAAAGCTGTT AAAAA/----- AGAATGAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 A 6 1 274056 CASAVA_Build 7 66354439 1D ATGCCTGGCC A/- AAAAAAAAAA 2116 het 1621 hom 18 6 6 6 A 15 14 274057 CASAVA_Build 7 66356126 2I TAATTCCCAC --/AT GTTTAGGGAG 1449 het 1449 ref 16 10 4 2 AT 0 1 274058 CASAVA_Build 7 66358144 3D TTAGTTTCTG TAA/--- TAATAGTGAT 3070 hom 72 het 26 0 24 3 TAA 2 1 274059 CASAVA_Build 7 66360001 4I AGAGCGAGAC ----/TCTG TCTGAAAAAA 599 hom 6 het 9 0 3 6 TCTG 1 2 274060 CASAVA_Build 7 66360908 7D GGGATAGAGA CGAGGGC/------- CCAGGAGTGT 3070 hom 48 het 22 0 17 6 CGAGGGC 1 0 274061 CASAVA_Build 7 66362663 5I CTCACTCTCT -----/CTTGA CCCTTCTACC 3070 hom 84 het 32 0 26 6 CTTGA 0 1 274062 CASAVA_Build 7 66364074 3I CAAAAAACAC ---/ACA ACAACAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 23 5 ACA 2 3 274063 CASAVA_Build 7 66372789 1I TGGGGACTTA -/C GAGTTTAAAG 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 C 0 1 274064 CASAVA_Build 7 66378441 1D GAGTGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 2760 het 2760 ref 38 25 8 5 T 11 10 274065 CASAVA_Build 7 66395622 1I GTCCTATTTA -/T TTAAATGGAT 2156 hom 24 het 10 0 6 4 T 2 3 274066 CASAVA_Build 7 66395921 1D CTGGTTCAAC T/- TTTTTTTTTT 2549 hom 23 het 12 0 8 4 T 17 16 274067 CASAVA_Build 7 66397785 1I GCCCAGTCAA -/T TTTTTTTTTT 1685 hom 10 het 4 0 4 0 T 10 11 274068 CASAVA_Build 7 66400703 1I TGTTATTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 9 10 274069 CASAVA_Build 7 66404269 1D ATAACCTCAA T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 6 5 274070 CASAVA_Build 7 66405059 1D TTTTTTTTTT C/- CCGAACGACC 3070 het 303 hom 25 2 14 10 C 3 2 274071 CASAVA_Build 7 66406114 2I TTTTTTTTTT --/TC ATATGGCTGC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TC 0 1 274072 CASAVA_Build 7 66406379 1I TTTTTATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 19 1 14 4 T 11 12 274073 CASAVA_Build 7 66407821 2I GTCTCAAAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 41 8 21 12 AC 0 1 274074 CASAVA_Build 7 66425613 7D TCACATATAT CTTTTTA/------- CTTTTTACTG 2431 het 2431 ref 19 9 7 4 CTTTTTA 2 1 274075 CASAVA_Build 7 66426639 2D AGTGAACTGC AG/-- AGATTCCAGC 2166 het 2166 ref 28 16 5 7 AG 2 1 274076 CASAVA_Build 7 66431748 1I GTTCCAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 9 13 5 A 13 14 274077 CASAVA_Build 7 66433204 1I GTTCTCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 10 11 274078 CASAVA_Build 7 66437909 1I GAATGGCAAA -/T TAACTTTTAT 2391 het 2391 ref 19 13 5 1 T 1 2 274079 CASAVA_Build 7 66438720 1I AATTTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 10 11 274080 CASAVA_Build 7 66439097 4I GTTTAATAAT ----/TAAA TAAAAGTAAA 3070 het 945 hom 12 2 9 1 TAAA 1 2 274081 CASAVA_Build 7 66444306 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1947 hom 30 9 15 6 A 13 12 274082 CASAVA_Build 7 66451983 2D AAAAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTAA 1749 het 563 hom 10 3 5 2 AT 1 0 274083 CASAVA_Build 7 66453310 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 10 9 274084 CASAVA_Build 7 66470035 3I ATCCCTGAAG ---/TGA TGATATGTGG 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 TGA 1 2 274085 CASAVA_Build 7 66478294 1I ATACCAGTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 T 9 10 274086 CASAVA_Build 7 66480528 1I20M1I9M1I GCCTTCTGAG -CCAAGGCAGGGCTTCCGAGA-GCCCCAGAG-/CCCAAGGCAGGGCTTCCGAGAGGCCCCAGAGC CCCTCCTGGT 3070 hom 59 het 17 0 17 5 N/A 0 0 274087 CASAVA_Build 7 66481534 1D AACTTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 11 10 274088 CASAVA_Build 7 66483123 2I TGTATGTGTG --/AT ATGTTTGTAC 3070 het 3070 ref 99 53 36 10 AT 1 2 274089 CASAVA_Build 7 66483581 2I GTGGCACATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 95 32 41 22 GT 7 8 274090 CASAVA_Build 7 66491422 1D AGTGCTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2307 hom 30 8 12 10 T 14 13 274091 CASAVA_Build 7 66495807 1D GCTGGATACA C/- CCTGAGGAGG 3070 het 3070 ref 51 26 13 13 C 3 2 274092 CASAVA_Build 7 66497013 1D CAGACTCTGG A/- AAATGCTGGT 3070 het 3070 ref 43 18 12 13 A 4 3 274093 CASAVA_Build 7 66497248 3I CCTTCTGAGC ---/TGG CCCTAACCAG 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 TGG 0 1 274094 CASAVA_Build 7 66498042 1I CCCCACCTCC -/A AACATTAGAG 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 2 3 274095 CASAVA_Build 7 66498503 4D CTCAAAAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 2278 het 2278 ref 21 13 7 2 AAAT 3 2 274096 CASAVA_Build 7 66499487 1I GACGCAGGAG -/A GTCGCTTGAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 0 1 274097 CASAVA_Build 7 66506436 1I GGATCTTTTC -/T TGCAATATCT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 2 274098 CASAVA_Build 7 66509882 1I TTATGAAAAT -/A ACGACTGTCG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 1 2 274099 CASAVA_Build 7 66523765 1D ACTCTTTCTC A/- AAAAAATTAA 2648 het 1798 hom 15 5 6 4 A 7 6 274100 CASAVA_Build 7 66524854 1I AGACAATTTT -/C CTACAGACTG 3070 het 3070 ref 43 26 16 1 C 1 2 274101 CASAVA_Build 7 66525712 11D CCTGTTTTCC GTGCCAGCGGG/----------- AGGCTTTGTG 3070 het 3070 ref 30 17 12 3 GTGCCAGCGGG 1 0 274102 CASAVA_Build 7 66526412 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 A 9 8 274103 CASAVA_Build 7 66532612 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAC 2752 het 1675 hom 11 4 7 0 A 9 10 274104 CASAVA_Build 7 66533656 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1945 het 1934 hom 11 5 5 2 A 11 10 274105 CASAVA_Build 7 66535816 2I CCAGTCACTC --/CT CTTTCCATCC 3070 hom 66 het 36 0 30 6 CT 1 2 274106 CASAVA_Build 7 66539279 1D CAAAAACAAA C/- AAAAAAAAGA 1930 het 1930 ref 21 12 5 4 C 1 0 274107 CASAVA_Build 7 66540866 1I TTTGCTTTGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 8 9 274108 CASAVA_Build 7 66545007 1D GAAATAAATT C/- CTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 C 2 1 274109 CASAVA_Build 7 66551222 3D TCAGCCTGTT GGA/--- GAAGAATCTG 3070 het 3070 ref 51 27 20 5 GGA 1 0 274110 CASAVA_Build 7 66568406 7I TTGGGTCAGA -------/GCTGGGG GATATAAGCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 GCTGGGG 0 1 274111 CASAVA_Build 7 66570576 7I ACTCCCACTG -------/ATTCTAC ATGATGGTGA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 ATTCTAC 0 1 274112 CASAVA_Build 7 66573627 1D GTGCTCGGCC T/- TTTTTTTTTT 1802 hom 9 het 14 0 5 9 T 17 16 274113 CASAVA_Build 7 66575293 1D TCTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 33 0 15 18 T 17 16 274114 CASAVA_Build 7 66577474 15D ATGATAGTGA TGGTGGTGATGGTAG/--------------- TGACGATGAT 3070 hom 24 het 33 1 17 21 TGGTGGTGATGGTAG 1 0 274115 CASAVA_Build 7 66577697 3D15M6D GTGGTAATGA TAGTGGTGGTGATGATGGTGGTGA/---TGGTGGTGATGATGG------ TGATGGTGAT 3070 het 3070 ref 98 56 26 35 N/A 0 0 274116 CASAVA_Build 7 66578951 1I AATCTCGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 41 0 31 10 T 14 15 274117 CASAVA_Build 7 66585730 1I TACTTACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 43 1 30 12 T 10 11 274118 CASAVA_Build 7 66598611 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 31 0 29 2 A 13 12 274119 CASAVA_Build 7 66607435 2D TTTCTAAGAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 41 0 29 15 TG 10 9 274120 CASAVA_Build 7 66611775 1I TGGAGGCCGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 37 het 16 0 13 4 T 9 10 274121 CASAVA_Build 7 66619011 1D TTTTTTCTCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 76 het 31 0 24 7 T 9 8 274122 CASAVA_Build 7 66630056 1D AAAGCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 224 hom 37 2 21 15 A 12 11 274123 CASAVA_Build 7 66633330 1I CTGTCCCCCC -/T CAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 0 1 274124 CASAVA_Build 7 66636681 1D CTGTTCTTGT G/- GTAGTAGATA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 G 2 1 274125 CASAVA_Build 7 66637047 1D TTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 16 8 T 12 11 274126 CASAVA_Build 7 66640691 3D TATTAAACTA TTG/--- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 TTG 1 0 274127 CASAVA_Build 7 66647211 1I CAATTATGAG -/T ATTTACCATG 3070 hom 111 het 39 0 37 2 T 0 1 274128 CASAVA_Build 7 66647596 1D TTAAAAAAAA T/- AATGTGGTAG 3070 het 3070 ref 48 29 18 2 T 1 0 274129 CASAVA_Build 7 66649794 1D CAAACAGTGA C/- CCTGCAGCAG 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 C 3 2 274130 CASAVA_Build 7 66672178 1D ACAAACTCAG T/- TTTTTTTTTT 1263 het 1263 ref 41 22 5 14 T 16 15 274131 CASAVA_Build 7 66680275 1D AATACCAATG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 38 16 19 5 A 9 8 274132 CASAVA_Build 7 66681768 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1521 het 1521 ref 24 14 4 6 A 15 14 274133 CASAVA_Build 7 66722259 3I ATCTTCTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 TTG 3 4 274134 CASAVA_Build 7 66726166 6D GCTGGGCAAC AAAATA/------ AAAATAAATA 3070 het 2737 hom 29 10 13 9 AAAATA 2 1 274135 CASAVA_Build 7 66732535 4I GAGAGAAAGA ----/GAAG GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 GAAG 3 4 274136 CASAVA_Build 7 66735172 1D CTGGAGTGCA G/- GGGCTGGATC 3070 het 3070 ref 30 17 9 5 G 4 3 274137 CASAVA_Build 7 66736614 1I CGATCTGGTT -/C CCCCCACCCC 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 C 5 6 274138 CASAVA_Build 7 66738196 2D GTACAAGTAG AC/-- ACACAGCTAC 3009 het 3009 ref 34 23 9 3 AC 3 2 274139 CASAVA_Build 7 66768541 1I TCTTAGGCCA -/G CGACACAGAT 965 het 965 ref 38 28 3 7 G 0 1 274140 CASAVA_Build 7 66771365 2I GATTTTATCT --/CA CAGTTTTAAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 CA 1 2 274141 CASAVA_Build 7 66772258 1D AATCACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 10 21 8 T 11 10 274142 CASAVA_Build 7 66789557 2D TCTGTCTCAC TG/-- TCTCCTCCTC 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 TG 1 0 274143 CASAVA_Build 7 66791140 1D CTTTTTTTTT G/- TTTTTGAGGC 2200 het 1737 hom 17 5 9 3 G 1 0 274144 CASAVA_Build 7 66791458 1I TCACTTTTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 9 10 274145 CASAVA_Build 7 66796191 1I GGACCCGGGA -/G GCAGAGGTTG 2297 hom 21 het 8 0 8 0 G 1 2 274146 CASAVA_Build 7 66796261 1D AATTCCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1584 hom 21 5 9 7 A 11 10 274147 CASAVA_Build 7 66796449 1I TCTCTTTCTC -/T GCCTGTCTAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 0 1 274148 CASAVA_Build 7 66801365 1D CAGTCGAATG C/- CCGGGCCCTG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 C 3 2 274149 CASAVA_Build 7 66819014 1I GACTCTGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 886 hom 21 4 12 5 A 10 11 274150 CASAVA_Build 7 66822136 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 228 hom 35 1 31 3 T 8 7 274151 CASAVA_Build 7 66838115 2D CTTTCTTCCT CC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 134 hom 28 4 12 12 C 2 0 274152 CASAVA_Build 7 66838287 1I TTAAAAAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 T 9 10 274153 CASAVA_Build 7 66841717 1I ATAAAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 8 9 274154 CASAVA_Build 7 66846479 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1959 hom 26 6 13 7 A 11 10 274155 CASAVA_Build 7 66850248 6D CTCTGTGAGA TTGATC/------ TCCCAGGCAG 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TTGATC 1 0 274156 CASAVA_Build 7 66859098 8I AAAATGTTTT --------/TGTACTGC TGTACAAAGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TGTACTGC 0 1 274157 CASAVA_Build 7 66859144 10D CAAAAAAACC AAAAAAACAA/---------- AAAAAAACAA 661 het 661 ref 16 6 4 8 AAAAAAACAA 2 1 274158 CASAVA_Build 7 66862691 1I TTCACGTGAT -/A AGAGTTCTCA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 1 2 274159 CASAVA_Build 7 66871187 2D GTCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTG 1069 het 597 hom 9 3 4 2 T 11 9 274160 CASAVA_Build 7 66876220 13D CTTTCTTTCT TTCTTTTCTTTCC/------------- TTTCTTTCCT 2209 het 2209 ref 16 9 5 3 TTCTTTTCTTTCC 1 0 274161 CASAVA_Build 7 66876504 2D CACAAAGCAG GT/-- GTGTGGGAGG 3070 hom 110 het 55 1 47 7 GT 3 2 274162 CASAVA_Build 7 66876798 14D TTGTTTTTTG TTTTTTTTGTTTTT/-------------- TTTTTTTTGT 2049 het 1085 hom 14 4 6 6 TTTTTTTTGTTTTT 2 1 274163 CASAVA_Build 7 66878068 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2238 hom 22 6 12 4 T 10 11 274164 CASAVA_Build 7 66881673 2D GTAAAACATA TG/-- GAATGACTGT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 TG 1 0 274165 CASAVA_Build 7 66883756 1I AAGTTGAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 9 10 274166 CASAVA_Build 7 66885436 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAACA 2635 het 1855 hom 15 8 7 0 A 9 8 274167 CASAVA_Build 7 66895508 1I GAGACAAACA -/T TTTTTGCTAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 5 6 274168 CASAVA_Build 7 66904176 6I TCTCTTTCTT ------/TCTTTC TTTTTTTTTT 2721 hom 42 het 18 0 14 4 TCTTTC 0 1 274169 CASAVA_Build 7 66916653 1I TAGGCATGAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 7 8 274170 CASAVA_Build 7 66930465 1D GGCAGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 2805 het 41 hom 23 1 9 13 T 19 18 274171 CASAVA_Build 7 66937937 2D TAAACATAAG AA/-- AAAAAAATGT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 9 7 274172 CASAVA_Build 7 66942453 1I TCCACTACTA -/G GTCACAACAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 G 1 2 274173 CASAVA_Build 7 66955270 9D GAAAGGAGGA GGAGGAGGG/--------- GAAGGGGGAC 2769 hom 49 het 20 0 12 12 GGAGGAGGG 1 0 274174 CASAVA_Build 7 66955374 3D GAGGAAGAGA AGG/--- AGGAGGAGGG 3070 hom 73 het 31 0 24 8 AGG 4 3 274175 CASAVA_Build 7 66955841 2I CCCATGGTAA --/CT CTCTCTATTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CT 3 4 274176 CASAVA_Build 7 66959192 4D AGACCCTGTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 25 1 18 7 A 19 15 274177 CASAVA_Build 7 66960621 1I GAAACTTGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 9 10 274178 CASAVA_Build 7 66975429 1I GAATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2560 hom 31 10 12 9 T 11 12 274179 CASAVA_Build 7 66977812 1I AATTAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1241 hom 35 4 19 12 T 13 14 274180 CASAVA_Build 7 66981546 1D CTGAAAAAAA C/- AACACTACTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 1 0 274181 CASAVA_Build 7 66984161 16D AGTGCAGTGG TGCAATCATAGCTCAC/---------------- TGCAGCCTCG 3070 het 3070 hom 20 9 9 5 TGCAATCATAGCTCAC 1 0 274182 CASAVA_Build 7 66987685 1D AGACTCCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 10 9 274183 CASAVA_Build 7 66988026 1I TTGATAGACA -/T TTTTTTCAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 6 7 274184 CASAVA_Build 7 66988115 33D ATAACAGCTA CCACTTTCTAAGTGAGATACCACTTTCTAAGTG/--------------------------------- CAATGAGATA 3070 hom 96 het 28 0 33 2 CCACTTTCTAAGTGAGATACCACTTTCTAAGTG 1 0 274185 CASAVA_Build 7 66989416 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 TC 0 1 274186 CASAVA_Build 7 66995581 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 8 9 274187 CASAVA_Build 7 67005815 12I TTGCCTTAGT ------------/CTGCACCATGAA GTGCTCTCCT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 CTGCACCATGAA 0 1 274188 CASAVA_Build 7 67010080 1D12M1D ATCCTCTATT AAAAAAAACAAACA/-AAAAAAACAAAC- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 17 4 N/A 0 0 274189 CASAVA_Build 7 67028989 12D TCTGTCTATG TATCTATGTATC/------------ TATCTATGTA 3070 het 3070 hom 63 26 26 16 TATCTATGTATC 2 1 274190 CASAVA_Build 7 67029417 2I TGTATGTGTC --/TA TTTGTGTATA 3070 het 3070 ref 63 33 22 8 TA 0 1 274191 CASAVA_Build 7 67044478 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2708 hom 27 7 13 8 A 10 9 274192 CASAVA_Build 7 67048459 2D GCTAATTTAC AT/-- ATATATATAT 2849 het 2849 ref 19 10 6 5 AT 7 6 274193 CASAVA_Build 7 67054295 1D CCTAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 31 1 27 3 A 12 11 274194 CASAVA_Build 7 67056180 1I CCATCTCTAT -/A AAAAAAAATT 1954 het 1954 ref 16 7 6 3 A 8 9 274195 CASAVA_Build 7 67057797 1D CCTGAGAGAG A/- AAGGGAGGAA 3070 hom 93 het 35 0 31 6 A 3 2 274196 CASAVA_Build 7 67062439 4D CCATCTCAAT ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 hom 75 het 26 0 24 2 ATAA 5 4 274197 CASAVA_Build 7 67064119 1D AAGCTGAGGT G/- GGCAGATCAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 3 2 274198 CASAVA_Build 7 67064358 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2607 het 1274 hom 29 6 16 7 A 17 18 274199 CASAVA_Build 7 67064967 2D TAAAAAATAA AG/-- AGAGTTAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AG 3 2 274200 CASAVA_Build 7 67065901 8D ACTTCGTCTC AACAAACA/-------- AACAAACAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AACA 6 4 274201 CASAVA_Build 7 67069698 1I TTAGATGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 27 1 23 3 T 11 12 274202 CASAVA_Build 7 67070299 5D AATCTGAAAC TTATT/----- TTATTTTATT 1783 hom 21 het 18 0 8 10 TTATT 4 3 274203 CASAVA_Build 7 67073598 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 21 het 9 0 8 2 T 7 6 274204 CASAVA_Build 7 67074486 1D ATCACTTGTG T/- TCAGGAGTTC 3070 hom 39 het 18 0 13 6 T 2 1 274205 CASAVA_Build 7 67085105 4I GTGACCTCCC ----/TACA TGTGTATCAG 3070 hom 129 het 48 0 42 6 TACA 0 1 274206 CASAVA_Build 7 67087593 1D ACGAAAAATT A/- AAAAAATTGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 7 6 274207 CASAVA_Build 7 67090924 1D TATGTATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 35 1 29 5 T 12 11 274208 CASAVA_Build 7 67093593 1I GGGGTGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 35 2 23 10 T 13 14 274209 CASAVA_Build 7 67102608 1D AGTGGGTACA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 6 274210 CASAVA_Build 7 67106871 3D TATAATTAAT ATG/--- ATACTTATTA 1376 hom 10 het 4 0 4 1 ATG 1 0 274211 CASAVA_Build 7 67110934 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 41 1 29 11 A 10 11 274212 CASAVA_Build 7 67113989 1I GAAGAAAAAG -/A AAAAAATGGC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 6 7 274213 CASAVA_Build 7 67115158 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 10 9 274214 CASAVA_Build 7 67118678 4I TCCCTCCCTC ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 hom 108 het 48 0 28 20 CCTT 3 4 274215 CASAVA_Build 7 67133971 1D TAAATACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 25 24 6 T 11 10 274216 CASAVA_Build 7 67142243 6I GCACAGGGAC ------/GTGTGT GTGTGTGTGT 3070 hom 75 het 37 0 23 14 GT 5 8 274217 CASAVA_Build 7 67143605 1D CCTGGTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 21 1 13 7 T 13 12 274218 CASAVA_Build 7 67160299 17D AGTCTTCATT GTCCTTTTACTCATTAA/----------------- GTGTCTTTCT 3070 het 3070 ref 49 27 21 6 GTCCTTTTACTCATTAA 1 0 274219 CASAVA_Build 7 67161290 3I TTGTTTTTTG ---/TTT TTTTTTTTTG 2794 hom 37 het 19 0 12 7 T 9 12 274220 CASAVA_Build 7 67162190 1D CAGTATAGCA T/- GGTGGTTGGG 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 T 1 0 274221 CASAVA_Build 7 67164849 4D AAAAAAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 33 19 13 3 AAAG 4 3 274222 CASAVA_Build 7 67165613 2D ACTCCACCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1273 het 661 hom 18 5 6 7 A 18 16 274223 CASAVA_Build 7 67173758 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 11 10 274224 CASAVA_Build 7 67194546 2D TATAAAAATT AA/-- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 23 9 12 4 A 8 6 274225 CASAVA_Build 7 67202526 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1757 hom 19 6 12 1 A 13 14 274226 CASAVA_Build 7 67203722 2I CCAGCTAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 10 12 274227 CASAVA_Build 7 67205687 2D GAGTACAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 19 3 T 12 10 274228 CASAVA_Build 7 67210388 1D AGTCCTCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 18 8 A 10 9 274229 CASAVA_Build 7 67232602 1I TTTATTGGCC -/G GGCGAGGTGG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 G 2 3 274230 CASAVA_Build 7 67236000 1D ATAGAGAGAA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 37 het 22 0 13 9 C 11 10 274231 CASAVA_Build 7 67236944 1I AACAGATATT -/G TTTATTTAGC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 G 0 1 274232 CASAVA_Build 7 67239014 3D AGGATGAGAA GAG/--- GAGGAGGAGG 2006 het 2006 ref 31 11 8 12 GAG 5 4 274233 CASAVA_Build 7 67239259 1I ACTCATAACT -/G GGGGTAATGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 4 5 274234 CASAVA_Build 7 67245407 1D CAGCTCCCCC T/- ACCCGAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 1 0 274235 CASAVA_Build 7 67256131 1I GATATGGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 A 9 10 274236 CASAVA_Build 7 67268448 1I GTTCTTTCCT -/C CACCAATCTT 1486 het 1486 ref 38 30 4 4 C 1 2 274237 CASAVA_Build 7 67268983 4D CTCTGCTGTC AGTT/---- AACTATATCC 3070 het 3070 ref 42 28 9 7 AGTT 1 0 274238 CASAVA_Build 7 67270880 4D52M4I AGAAAGTTTG ACATATTTCCTGTCATGAGGCTTTGCATGGGGTCATGGTCAGTGAAATGTCCCTCT----/----ATTTGCTGTCATGAGGCTTCACATGATGTCAAGGTCAGTGAAATATCCCTCTCTAA GTTTGGCAAG 1686 het 1686 ref 55 74 4 8 N/A 0 0 274239 CASAVA_Build 7 67271963 4D ATAAATAAAA AGAT/---- AGAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 27 18 9 2 AGAT 1 0 274240 CASAVA_Build 7 67272910 12D CCTCAGTGAG GTCTTCCTCTAT/------------ GTCTTCCTCT 1686 het 1686 ref 41 37 5 7 GTCTTCCTCTAT 1 0 274241 CASAVA_Build 7 67275266 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1411 hom 27 6 18 3 A 12 11 274242 CASAVA_Build 7 67283998 4D18M17D AAGGAAGGAA GGAGGGAGGGAGGGAGGGAAGAAAGGGAGGGAGGGAAAC/----GGAGGGAGGGAGGGAAGA----------------- AAGGGAGGGA 3070 hom 72 het 28 0 23 8 N/A 0 0 274243 CASAVA_Build 7 67284813 1D4M3D ATATACATCT CCCATTTC/-CCAT--- TGTCTGCTTA 3070 het 3070 ref 45 25 15 6 N/A 0 0 274244 CASAVA_Build 7 67299466 1D CAAAAAGGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 A 10 9 274245 CASAVA_Build 7 67300199 9D TTGTATTTTT AGTAAAGAC/--------- AAGATTTCAC 3070 het 2021 hom 17 5 12 1 AGTAAAGAC 1 0 274246 CASAVA_Build 7 67300777 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2127 het 2127 ref 24 12 7 5 T 17 16 274247 CASAVA_Build 7 67307242 1D AAAATAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2589 hom 28 9 13 7 A 13 12 274248 CASAVA_Build 7 67320117 3D AAGGATGAGA TAC/--- TACTACCTGC 3070 het 3070 ref 68 34 25 13 TAC 3 2 274249 CASAVA_Build 7 67320221 1I TCATATAAAT -/A AACTGACAGT 3070 het 3070 ref 60 30 18 12 A 2 3 274250 CASAVA_Build 7 67321544 1I GGAGGAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 12 13 274251 CASAVA_Build 7 67327217 1I TGGGGTTTTC -/T TTTTTACTTT 3070 het 2976 hom 21 10 10 1 T 5 6 274252 CASAVA_Build 7 67328818 1D GGCTGAGCTA G/- GAGACTGAAA 3000 het 3000 ref 30 17 8 5 G 2 1 274253 CASAVA_Build 7 67330902 9D CACTGGAAGT AAGATTTTC/--------- ATGCTTCACT 3070 het 3070 ref 46 31 13 8 AAGATTTTC 1 0 274254 CASAVA_Build 7 67331218 1D TAGGGTAGAT A/- AAAAACATTG 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 6 5 274255 CASAVA_Build 7 67332947 4I AGAAACTGAA ----/TCAC TCAGTCACTG 3070 het 3070 hom 55 23 28 5 TCAC 0 1 274256 CASAVA_Build 7 67333164 1D TTTCACCCAG T/- GAATGATTAC 3070 het 3070 ref 39 17 19 3 T 1 0 274257 CASAVA_Build 7 67333292 2I CTAATGAGAG --/GT GTGACAGCGT 3070 het 3012 hom 17 7 10 0 GT 1 2 274258 CASAVA_Build 7 67341359 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 6 7 274259 CASAVA_Build 7 67351943 4I TGAATGATGG ----/TGAC TGACTAACTG 3070 het 3070 ref 54 28 17 9 TGAC 1 2 274260 CASAVA_Build 7 67362066 1D CTAAAAAACG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 6 A 10 9 274261 CASAVA_Build 7 67367026 1I19M1D AGCCTGGGTG -AAAAAAGTGAAACTGTCTTA/AAAAAAAGTGAAACTGTCTT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 18 7 N/A 0 0 274262 CASAVA_Build 7 67385862 1I TAAAAAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 9 10 274263 CASAVA_Build 7 67389811 1D TTTTAAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 20 7 T 14 13 274264 CASAVA_Build 7 67394221 1D ACTATGTATC T/- TGACAAAGAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 2 1 274265 CASAVA_Build 7 67397567 1I AAAGAAATTC -/A GGGGCAAAGG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 0 1 274266 CASAVA_Build 7 67401125 1I GTGCCAGCCA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 T 8 9 274267 CASAVA_Build 7 67403141 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2682 hom 37 10 20 7 A 13 12 274268 CASAVA_Build 7 67414504 1I GGCTAAGGCA -/G GAGAATGGCT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 G 1 2 274269 CASAVA_Build 7 67416737 1I AATCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 30 1 27 2 A 10 11 274270 CASAVA_Build 7 67423470 5D TAGTAGATCA TATAT/----- TATATGAGGT 2480 hom 12 het 6 0 5 1 TATAT 2 1 274271 CASAVA_Build 7 67429538 1I AATTTAGCCA -/T TACCTCCCCT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 1 2 274272 CASAVA_Build 7 67432448 1I GAGAAGGAGG -/T TGCGGTGAGC 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 1 2 274273 CASAVA_Build 7 67445716 1I GTTGGTGACT -/C TTCTTTGCAT 3070 hom 126 het 44 0 41 3 C 0 1 274274 CASAVA_Build 7 67460656 1I GGTAGATTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 A 9 10 274275 CASAVA_Build 7 67467980 1D AAGAGATGGA G/- GGAGGGAGAC 3070 het 3070 ref 56 34 18 4 G 3 2 274276 CASAVA_Build 7 67468979 2D CACTGCATTC CA/-- CACAGAGTTT 3070 het 3070 hom 27 13 14 0 CA 3 2 274277 CASAVA_Build 7 67485157 2D AAAGAATATT TA/-- TATGAAAAAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TA 2 1 274278 CASAVA_Build 7 67489280 1D CACAGAAAAC A/- AAATTAAGTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 4 3 274279 CASAVA_Build 7 67500926 1D AATTGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 38 2 21 15 T 15 14 274280 CASAVA_Build 7 67501913 1I GCTCTATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 890 hom 35 4 17 14 T 13 14 274281 CASAVA_Build 7 67505819 6I AGCCACACTC ------/CTACTT CTCAATTCCA 3070 hom 74 het 27 0 25 2 CTACTT 0 1 274282 CASAVA_Build 7 67508971 1D CAGGGAAAAA G/- CAGGGGATGC 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 G 1 0 274283 CASAVA_Build 7 67509049 2I TTGGCACGCT --/AA GAGGTTGTGT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 0 2 274284 CASAVA_Build 7 67525813 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1324 het 1324 ref 15 9 4 2 A 13 14 274285 CASAVA_Build 7 67534558 1D TCTCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 19 6 T 11 10 274286 CASAVA_Build 7 67551876 4I GGACCATTGG ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 58 28 24 6 TC 5 7 274287 CASAVA_Build 7 67563468 1D TCTGTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 9 8 274288 CASAVA_Build 7 67563876 1I TTCTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2886 het 1362 hom 20 6 7 7 T 11 12 274289 CASAVA_Build 7 67568597 1D TCTCCTCTCC T/- CCTCCCTACT 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 T 1 0 274290 CASAVA_Build 7 67570574 3I GGTTTTGTTA ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TTG 3 4 274291 CASAVA_Build 7 67572346 1D CCCTAATTCA G/- GTGACTAGCT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 G 2 1 274292 CASAVA_Build 7 67572483 1I GGGGTGATGC -/A GTTGCAAAGC 3070 het 3070 ref 55 21 19 15 A 0 1 274293 CASAVA_Build 7 67587153 1I TGCCTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 12 13 274294 CASAVA_Build 7 67594878 3D CAATGAAAAA GAT/--- GATGATGACT 3070 het 3070 ref 83 38 33 15 GAT 3 2 274295 CASAVA_Build 7 67597676 1I GGATTTACTC -/T TTTTTTTTTT 2968 het 2968 ref 21 10 7 4 T 11 12 274296 CASAVA_Build 7 67605902 1I ATTTTTTATA -/T TTTTGGTAGA 2785 het 2785 ref 22 11 7 4 T 4 5 274297 CASAVA_Build 7 67618924 1D TTTCCTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 39 4 22 13 A 14 13 274298 CASAVA_Build 7 67620229 1D GGAGTCTCTC T/- TGAGTCTGCT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 2 1 274299 CASAVA_Build 7 67629920 10I4M4I TTTTTAGCTC ----------TTCC----/AGGAAGAGCTAACCAGGA TGGTTTTTTT 3070 het 1284 hom 28 3 12 15 N/A 0 0 274300 CASAVA_Build 7 67630480 1D GAAAGGGCCA C/- ATAGTCTCAT 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 C 1 0 274301 CASAVA_Build 7 67632598 1D CAAAAGTTGC T/- GCCTAGCACT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 1 0 274302 CASAVA_Build 7 67636286 3D AGTGAGAAAA AAC/--- AACAATAAAC 3070 het 3070 ref 48 22 19 8 AAC 2 1 274303 CASAVA_Build 7 67639942 2D AATATCAGGC TG/-- ATGCCTGCCG 3070 het 3070 hom 41 19 17 6 TG 1 0 274304 CASAVA_Build 7 67641641 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 10 9 274305 CASAVA_Build 7 67643859 1I CCACCTTCTC -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 109 het 40 0 36 4 T 7 8 274306 CASAVA_Build 7 67647728 1I TTTCTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 2533 het 2271 hom 24 9 9 6 T 15 16 274307 CASAVA_Build 7 67649627 5D TCTTTCTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 290 het 290 ref 31 13 3 16 T 17 12 274308 CASAVA_Build 7 67655184 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 20 1 13 6 T 11 10 274309 CASAVA_Build 7 67656777 1D CTCTCTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 32 0 27 5 A 11 10 274310 CASAVA_Build 7 67658494 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 56 het 23 0 18 5 A 9 8 274311 CASAVA_Build 7 67659107 4I AGCACGCAAG ----/GTTT GTTTGTTTGT 3070 hom 102 het 42 0 32 10 GTTT 4 5 274312 CASAVA_Build 7 67665293 1I TATTTAAGCG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 8 9 274313 CASAVA_Build 7 67665781 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2975 hom 25 9 11 5 A 13 14 274314 CASAVA_Build 7 67666274 1I TTGGTGAAGG -/C TTTATTCATC 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 C 0 1 274315 CASAVA_Build 7 67671563 1D AGCAAATCGA T/- GAGATGTACA 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 T 1 0 274316 CASAVA_Build 7 67672469 1D GTAAATACAG C/- GTTCTCCCCT 2568 het 2568 ref 44 20 8 16 C 1 0 274317 CASAVA_Build 7 67675253 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 1171 hom 7 het 4 0 3 1 T 10 9 274318 CASAVA_Build 7 67677005 1I TATGTCTACG -/T TTTTTGGTCT 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 T 5 6 274319 CASAVA_Build 7 67679692 1I GTTCTGTTTG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 7 8 274320 CASAVA_Build 7 67682816 2D GCAGTCAGGC AG/-- AGAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 28 3 AG 3 2 274321 CASAVA_Build 7 67683696 1I AAAGAGCCTG -/C CCCCCCCCAC 1085 het 1085 ref 17 10 3 4 C 8 9 274322 CASAVA_Build 7 67687878 2I TTTTATTTTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 19 0 13 6 T 9 11 274323 CASAVA_Build 7 67689796 1D CAGAAGCAGT G/- GGGAAAAACT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 G 4 3 274324 CASAVA_Build 7 67690150 1I CTCAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 631 hom 27 2 18 7 T 11 12 274325 CASAVA_Build 7 67700142 1D TTAATTTTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 T 9 8 274326 CASAVA_Build 7 67706128 1D CACCTGTAAT C/- CCAGCTATTC 3070 het 1394 hom 16 3 11 2 C 3 2 274327 CASAVA_Build 7 67723754 1D GGAACTCTGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 10 9 274328 CASAVA_Build 7 67768413 1I CTCCATACCA -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 8 9 274329 CASAVA_Build 7 67769817 1D TCAACATATT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 1 0 274330 CASAVA_Build 7 67774905 1D TAATAAAATA T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 T 8 7 274331 CASAVA_Build 7 67779541 1D AAAAAAAAAA T/- TTTGAAGATC 3070 het 1459 hom 28 9 16 4 T 4 3 274332 CASAVA_Build 7 67783357 4D AAGAAAGAAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 2374 het 1275 hom 19 7 7 6 GAAA 5 4 274333 CASAVA_Build 7 67789031 1D ATTGCTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 13 12 274334 CASAVA_Build 7 67807906 1I ATTCTCTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 12 13 A 14 15 274335 CASAVA_Build 7 67810803 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 2490 het 2490 ref 15 8 6 1 CTC 0 1 274336 CASAVA_Build 7 67814031 1D AGTCACACAA T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 8 7 274337 CASAVA_Build 7 67815000 3I TGCAGTTCCT ---/TCC TCCACTGAAG 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 TCC 1 2 274338 CASAVA_Build 7 67823269 1D TTAATTTTTC T/- TTTCTTTTTT 123 het 123 ref 16 7 2 7 T 4 3 274339 CASAVA_Build 7 67824032 5I TCATTAATTG -----/TTTTC TTTTGAGACA 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 TTTTC 0 1 274340 CASAVA_Build 7 67825098 2D CTTTGCTTCC AG/-- AGTTTTTACA 1334 het 1334 ref 19 12 4 4 AG 2 1 274341 CASAVA_Build 7 67825152 1I TCCACTGAGC -/A AACTGCTTCT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 2 3 274342 CASAVA_Build 7 67826141 4D17M10D GTATTCCAGC TCATTCATTCAAACAATATTTGTTCAGCATA/----GCATTCAAACAATATTT---------- GTTCAGCTCA 3070 het 3070 ref 38 30 15 4 N/A 0 0 274343 CASAVA_Build 7 67827347 1D CTTCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 23 2 14 14 A 11 10 274344 CASAVA_Build 7 67832044 1I GCCAGAGATC -/A GGGGGAGCCT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 0 1 274345 CASAVA_Build 7 67854282 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 A 12 11 274346 CASAVA_Build 7 67857210 4D AGGAAAGAAA AAGG/---- AAGGAAGGAA 2553 het 2315 hom 15 7 6 2 AAGG 4 3 274347 CASAVA_Build 7 67861239 4I AATTCTTCAC ----/TCTT TCCATTTTGC 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 TCTT 0 1 274348 CASAVA_Build 7 67870114 6D CTAAAATGCA GTATTG/------ GAAGGCATGA 3070 het 3070 ref 22 12 8 4 GTATTG 1 0 274349 CASAVA_Build 7 67871323 1D TTAAATTTAA T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 22 15 7 1 T 7 6 274350 CASAVA_Build 7 67878047 1D CAGAATGGAG A/- AAAAAAAAAG 2506 het 2506 ref 28 11 9 8 A 10 9 274351 CASAVA_Build 7 67883439 1I AACAAACAAA -/C AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 C 0 1 274352 CASAVA_Build 7 67898757 1D TTCTTCTTCT A/- GGGGGGGTCT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 A 1 0 274353 CASAVA_Build 7 67899360 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCATGC 3070 het 2350 hom 16 7 8 1 AG 1 2 274354 CASAVA_Build 7 67900131 1I GAGGAGATTT -/C CAGGGTAGAG 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 C 1 2 274355 CASAVA_Build 7 67900233 1I GCTTTATATA -/G GGTTGACTCT 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 G 2 3 274356 CASAVA_Build 7 67906265 1D TAAATGTGAT G/- GGGGGGTGGT 1664 het 1664 ref 22 13 5 4 G 7 6 274357 CASAVA_Build 7 67919157 2D AAGAGACAAA AG/-- AGAGAGAAAG 2430 het 1989 hom 12 6 5 1 AG 4 3 274358 CASAVA_Build 7 67919385 4D AAGGGAAAAA GGAG/---- GGAGGGAGGG 3070 het 2231 hom 29 6 16 9 GGAG 4 3 274359 CASAVA_Build 7 67920452 2D GCAAGCCTCT CA/-- CAGAGTCTAC 3070 het 3070 ref 50 26 19 6 CA 2 1 274360 CASAVA_Build 7 67938652 4D AAAAGAAAAC AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 19 7 10 3 AGAA 5 4 274361 CASAVA_Build 7 67945393 1D CAATACGCAT G/- TGTCAGGACC 3070 hom 117 het 44 0 36 8 G 1 0 274362 CASAVA_Build 7 67954417 1I TTATTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2037 hom 30 het 16 0 9 7 T 14 15 274363 CASAVA_Build 7 67962940 1D CCTTTATCTG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 T 9 8 274364 CASAVA_Build 7 67970799 2I GTGGGTCCAG --/GT GGAGACATTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 GT 0 1 274365 CASAVA_Build 7 67975989 5I TCAAATAAGC -----/CCAGT ATCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 CCAGT 0 1 274366 CASAVA_Build 7 67976404 1I CCTAACAGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 9 10 274367 CASAVA_Build 7 67977629 1D AAGGAACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 10 4 A 11 10 274368 CASAVA_Build 7 67983297 1D TTTTTGGCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 A 10 9 274369 CASAVA_Build 7 67988185 1D CAAGAACTAC A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 7 6 274370 CASAVA_Build 7 67995484 1D AAGATCGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2896 hom 38 13 14 11 T 12 11 274371 CASAVA_Build 7 68002237 7D CATGCTGCAG TGAGCTC/------- TGATCGCACC 2888 het 2888 ref 28 13 7 11 TGAGCTC 1 0 274372 CASAVA_Build 7 68027326 1D CTGTACTAGA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 C 9 8 274373 CASAVA_Build 7 68027474 1D GGAAAGTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 G 1 0 274374 CASAVA_Build 7 68034950 1D CAGTTATGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 10 9 274375 CASAVA_Build 7 68037293 1D GCAAGGAGTC A/- GGAACTACAG 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 1 0 274376 CASAVA_Build 7 68038335 1D CATTTTCAAG A/- AAGAAAATAA 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 A 3 2 274377 CASAVA_Build 7 68038909 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2344 het 1267 hom 16 6 7 3 A 12 11 274378 CASAVA_Build 7 68039151 1D ACCAGTCTGA C/- CAACCTGGCA 3070 het 1986 hom 22 5 14 3 C 2 1 274379 CASAVA_Build 7 68039501 2I AGTGCCATTT --/CA CAGAGTCAAG 3070 het 3070 hom 56 19 30 7 CA 1 2 274380 CASAVA_Build 7 68042595 2D TGATAGGCTA AG/-- TCTATTCTCA 3070 het 3070 hom 78 36 34 10 AG 1 0 274381 CASAVA_Build 7 68043214 1I CCGTCTCTAC -/T AAAAATACAA 3070 het 1737 hom 19 6 10 3 T 0 1 274382 CASAVA_Build 7 68044642 4D CGGAGGTTTC AGTG/---- AGTGAGTCGA 2464 het 2464 ref 20 12 6 6 AGTG 2 1 274383 CASAVA_Build 7 68045050 10I TGGTGGAGTT ----------/AGAATAATGC AGAGTACATG 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 AGAATAATGC 0 1 274384 CASAVA_Build 7 68051697 1D TTTCTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 532 het 418 hom 8 2 4 2 T 10 9 274385 CASAVA_Build 7 68052974 1D AGCTCTTGAG A/- AAGAAGTTGG 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 A 3 2 274386 CASAVA_Build 7 68054848 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 A 6 7 274387 CASAVA_Build 7 68055854 1D CAAAAATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 521 hom 33 5 17 11 T 14 13 274388 CASAVA_Build 7 68056742 1D CGACCCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1551 hom 20 7 12 1 T 11 10 274389 CASAVA_Build 7 68057579 2I GAGAGAGGGG --/GA GAGAGAGAGA 2505 het 72 hom 22 1 10 11 GA 5 6 274390 CASAVA_Build 7 68057735 2D GAGAGGAGAG AA/-- AGAGAGGGTG 2141 het 990 hom 15 4 7 5 A 3 1 274391 CASAVA_Build 7 68063619 3I CATCGCTCCT ---/AGG AGAAGTACAG 3070 hom 102 het 37 0 33 4 AGG 0 1 274392 CASAVA_Build 7 68069593 1D AACGCAGAGG A/- AAAAGCATCT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 5 4 274393 CASAVA_Build 7 68069726 1I TGTATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 11 12 274394 CASAVA_Build 7 68073382 1D CGAAGATCAC A/- AAAAAAGATG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 7 6 274395 CASAVA_Build 7 68074600 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 31 1 15 16 T 12 11 274396 CASAVA_Build 7 68079374 1I CCCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 11 274397 CASAVA_Build 7 68080101 1D TCTGTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 28 1 16 11 A 16 15 274398 CASAVA_Build 7 68081170 2I TTTTATCTTA --/TT TTTTTTTTTT 2993 hom 27 het 17 0 10 9 T 10 12 274399 CASAVA_Build 7 68083113 4D GGGCTCAAAC ACTT/---- ACAGAACTGA 3070 hom 120 het 42 0 41 3 ACTT 1 0 274400 CASAVA_Build 7 68103845 1I AATTTCTGAG -/T TTTCCAAATC 3070 hom 84 het 37 0 28 9 T 3 4 274401 CASAVA_Build 7 68107082 2I48M1I CCAAAAAAAA --AAACAAACAAACAAAAAACCATTTTATCCAACAGTTTAAAATAAATAC-/ACAAACAAACAAACAAAAAACCATTTTATCCAACAGTTTAAAATAAATACT TTTTTTTTTG 3070 hom 12 het 17 0 11 16 N/A 0 0 274402 CASAVA_Build 7 68111494 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 T 9 10 274403 CASAVA_Build 7 68112520 1D TCTGTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 817 hom 40 2 27 14 T 13 12 274404 CASAVA_Build 7 68116825 1I AGTTTTTTGG -/T TTTTGTTTTT 3070 het 510 hom 32 2 27 3 T 4 5 274405 CASAVA_Build 7 68127121 1D TACAAACAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 144 het 51 0 49 3 A 9 8 274406 CASAVA_Build 7 68128888 1D ATAAAATAAC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 8 7 274407 CASAVA_Build 7 68129621 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 1495 het 220 hom 27 2 14 11 A 16 17 274408 CASAVA_Build 7 68130575 1I GTTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 39 1 30 8 A 11 12 274409 CASAVA_Build 7 68134352 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 27 0 21 6 A 11 10 274410 CASAVA_Build 7 68134446 4I AATGAGTGAG ----/TGAA TGAATGAATA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 TGAA 2 3 274411 CASAVA_Build 7 68134652 2D CAAATTTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 A 14 12 274412 CASAVA_Build 7 68136877 1D3M3D GTATATATAA TACATAT/-ACA--- TATATGTATT 3070 hom 30 het 11 0 11 1 N/A 0 0 274413 CASAVA_Build 7 68138188 4I TATGTATGTG ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TTTA 2 3 274414 CASAVA_Build 7 68147710 1I CAGGTGTATT -/A AGTCCATTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 1 2 274415 CASAVA_Build 7 68148754 1D AAACAATATG T/- ATAACATATC 3070 hom 71 het 28 0 24 6 T 1 0 274416 CASAVA_Build 7 68152280 3D AGAGGGAATT CCC/--- CAGTGAGCCA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 4 1 274417 CASAVA_Build 7 68193084 1D ACCCCGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1078 het 1078 ref 26 22 3 1 T 13 12 274418 CASAVA_Build 7 68266635 5D TATCTTTGTT TTAAC/----- ATAACTTGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 8 TTAAC 1 0 274419 CASAVA_Build 7 68281514 4D TAAAAAGAAG AAAC/---- AAACAGACAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AAAC 2 1 274420 CASAVA_Build 7 68284368 1I AGAACACTGA -/T TTTTTTTTTT 2784 het 832 hom 22 3 12 7 T 15 16 274421 CASAVA_Build 7 68320233 8I AGTCAACCCC --------/AGGAAGGG AGGAAGGGAG 3070 het 3070 hom 46 15 16 15 AGGAAGGG 1 2 274422 CASAVA_Build 7 68330632 2D AAATAATAAC TG/-- TATATATTTA 3070 hom 126 het 45 0 42 3 TG 1 0 274423 CASAVA_Build 7 68331505 20D CCTTCCATTT TTCCTTTCATCCATCCTTCC/-------------------- TTCCTTTCAT 3070 hom 13 het 26 1 18 7 TTCCTTTCATCCATCCTTCC 1 0 274424 CASAVA_Build 7 68335234 1D CTTCTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 17 10 T 13 12 274425 CASAVA_Build 7 68338683 1I GGAAGGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 30 0 18 12 T 12 13 274426 CASAVA_Build 7 68341509 2D TATTTTTAGT AG/-- AGACAGTGTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AG 2 1 274427 CASAVA_Build 7 68346667 1I AGTTTTTCAA -/C CCCTTCCCCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 3 4 274428 CASAVA_Build 7 68362321 2D AGAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 84 het 35 0 29 7 AG 10 9 274429 CASAVA_Build 7 68363914 1D ACATTTCTAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 54 het 27 0 19 9 A 8 7 274430 CASAVA_Build 7 68381503 2I ATCCCAACAC --/TT TGGGAGGCCG 3070 hom 54 het 19 0 17 2 T 1 3 274431 CASAVA_Build 7 68382048 1I GGTCTAGAAG -/C CCCAGCTGGG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 3 4 274432 CASAVA_Build 7 68390583 4D CTTCCTTCCA TCCT/---- TCCTTCCTTC 3070 hom 103 het 42 0 33 12 TCCT 6 5 274433 CASAVA_Build 7 68392889 1D GGTGCTATGT A/- ATCATGCCTG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 274434 CASAVA_Build 7 68406204 1D GGACATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1043 hom 35 7 12 16 T 17 16 274435 CASAVA_Build 7 68407163 1D ACAGTAGGAT G/- TCCAGAACTC 3070 hom 77 het 32 0 23 9 G 1 0 274436 CASAVA_Build 7 68410455 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 9 274437 CASAVA_Build 7 68422372 2D CACAGAGCTC GG/-- GGGGGGGTGA 3070 hom 105 het 42 0 33 10 G 9 7 274438 CASAVA_Build 7 68427077 5D ACCATCTCAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 31 1 15 16 A 19 14 274439 CASAVA_Build 7 68428372 3D CAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 3070 hom 30 het 23 0 17 10 AAG 1 0 274440 CASAVA_Build 7 68428872 1D GCGTGGTGGC A/- AGGTACCTAT 3070 hom 45 het 18 0 17 1 A 2 1 274441 CASAVA_Build 7 68430672 1D CATAGTGAGA C/- CCCCCCCATC 3070 het 148 hom 15 1 13 1 C 8 7 274442 CASAVA_Build 7 68431131 12D ACCATTTCTT AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 31 1 25 9 A 26 14 274443 CASAVA_Build 7 68453065 3D AAAAAAAAAA TAG/--- AGAGAGAGAG 2673 het 908 hom 21 5 14 2 TAG 1 0 274444 CASAVA_Build 7 68462395 1I CTACACACAC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 7 8 274445 CASAVA_Build 7 68468726 4D AAAGCTGAGC TTAT/---- TTGAGAAACT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 TTAT 1 0 274446 CASAVA_Build 7 68471475 25D GGTGGTGCAT GACTGTAATCCCAGCTACTCGGGAG/------------------------- GCTGAGGCAG 3070 het 2853 hom 22 8 15 2 GACTGTAATCCCAGCTACTCGGGAG 1 0 274447 CASAVA_Build 7 68472090 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2526 hom 21 7 12 2 A 10 11 274448 CASAVA_Build 7 68476169 10D AGAAAGAAGA AAGAAGAAGG/---------- AGGAGGAGGA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 AAGAAGAAGG 1 0 274449 CASAVA_Build 7 68477807 2D GACAAGGCAG GC/-- GCGCAACCTT 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 GC 3 2 274450 CASAVA_Build 7 68479425 2D AATAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 1876 hom 17 5 9 4 A 11 9 274451 CASAVA_Build 7 68483411 1D CTTGTTTGGG T/- TTTTTTGTTT 2461 het 2461 ref 22 13 6 3 T 7 6 274452 CASAVA_Build 7 68492725 1I AAAATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 1906 het 1906 ref 16 8 6 2 A 11 12 274453 CASAVA_Build 7 68494741 3D CTGGCCCCAA TGT/--- TGTTATTTTA 3070 het 3070 ref 40 18 11 13 TGT 2 1 274454 CASAVA_Build 7 68497324 2I ATCGACACTC --/TG TATCTAGCTG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 TG 0 1 274455 CASAVA_Build 7 68498730 1I TTAAGAATTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 T 7 8 274456 CASAVA_Build 7 68504765 1D TGTCGATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1416 hom 32 6 17 9 A 17 16 274457 CASAVA_Build 7 68528682 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 A 7 6 274458 CASAVA_Build 7 68533282 1I GGTTGGGGGG -/T GCTCTATCCG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 0 1 274459 CASAVA_Build 7 68535672 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2756 hom 37 12 12 13 T 14 13 274460 CASAVA_Build 7 68538403 3D GGTGAGAGAA AGT/--- AGAATAGCGT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 AGT 1 0 274461 CASAVA_Build 7 68542104 1I AAAGGGCCTT -/G GCTCCCCAGC 3070 hom 70 het 28 0 18 10 G 1 2 274462 CASAVA_Build 7 68542402 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 A 6 5 274463 CASAVA_Build 7 68542666 1D GAAATGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2908 hom 38 9 21 8 T 12 11 274464 CASAVA_Build 7 68543934 1D TTTTTTTTTT A/- AATTGTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 21 7 A 3 2 274465 CASAVA_Build 7 68544898 1I TTTTGTGACT -/G GTTTATTTCA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 G 1 2 274466 CASAVA_Build 7 68546378 1D TAATTTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 T 11 10 274467 CASAVA_Build 7 68546941 1I TTACAGGCAT -/G GGCCACCTCA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 2 3 274468 CASAVA_Build 7 68547447 1I GGATCTCACT -/C CGTCACCCAG 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 C 1 2 274469 CASAVA_Build 7 68575428 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1309 het 598 hom 18 6 4 8 T 19 18 274470 CASAVA_Build 7 68586945 1I TTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTGA 2028 het 2028 ref 18 10 5 3 C 0 1 274471 CASAVA_Build 7 68591669 1D GTCATTTGCC A/- AAAAATTTAC 3070 het 3070 ref 37 16 20 1 A 6 5 274472 CASAVA_Build 7 68596561 1D AATTTTTGTG T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 8 7 274473 CASAVA_Build 7 68596902 1D CAAAGAGGCC A/- AAAAAAAAAA 1142 het 1142 ref 27 15 3 9 A 15 14 274474 CASAVA_Build 7 68598510 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2646 het 655 hom 15 5 9 1 A 14 15 274475 CASAVA_Build 7 68612688 1I GTGGCTTTTG -/C CTAAAATGCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 2 274476 CASAVA_Build 7 68633852 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1172 het 1170 ref 13 4 4 5 A 14 13 274477 CASAVA_Build 7 68636953 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2087 hom 25 7 12 6 T 12 11 274478 CASAVA_Build 7 68637812 1D GATCTAGTTG T/- TTAAAAAGTG 3070 hom 75 het 27 0 24 3 T 3 2 274479 CASAVA_Build 7 68638761 1D CCATCTCTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 10 9 274480 CASAVA_Build 7 68647798 15D CAGGCTAATT TTTGTATTTTTAGTA/--------------- GAGACCAGGT 3070 het 2662 hom 19 6 11 4 TTTGTATTTTTAGTA 1 0 274481 CASAVA_Build 7 68656216 2D TACCTTTGTA TC/-- TCTGTGTCTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 9 TC 2 1 274482 CASAVA_Build 7 68665237 1D TCAGGAGGCC A/- GGGTGGGAGG 2079 het 2079 ref 13 6 5 2 A 1 0 274483 CASAVA_Build 7 68666652 1D ACAGAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1800 het 1800 ref 21 12 5 4 A 11 10 274484 CASAVA_Build 7 68682950 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1377 hom 22 5 11 7 A 15 14 274485 CASAVA_Build 7 68709282 1I AATTTAGGTC -/T TAAGAGCTAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 1 2 274486 CASAVA_Build 7 68732743 4I TTTATTTTGT ----/GAAG GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 GAAG 3 4 274487 CASAVA_Build 7 68740619 1I TCAAAGCGAT -/A AGTAGATGGT 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 A 1 2 274488 CASAVA_Build 7 68743107 25D GAATTTGGAA AATGTCTGCAGACTTTACTGTGATC/------------------------- AGGCTGCTAG 3070 het 3070 ref 28 21 9 5 AATGTCTGCAGACTTTACTGTGATC 1 0 274489 CASAVA_Build 7 68751778 1D TCCTTGGGGG A/- AACTGTTACA 3070 het 3070 hom 47 18 24 6 A 3 2 274490 CASAVA_Build 7 68756811 3D TATGAAGAGA CCT/--- CCTTACTTCT 3070 het 3070 ref 48 20 21 8 CCT 2 1 274491 CASAVA_Build 7 68758308 3D TTCTAGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 36 14 9 13 TTG 7 6 274492 CASAVA_Build 7 68770273 2D TTTTGTTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 2582 het 469 hom 29 5 21 4 T 21 19 274493 CASAVA_Build 7 68770996 8I GTTTAAATGG --------/TGTATAGT TCAACAGATG 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 TGTATAGT 0 1 274494 CASAVA_Build 7 68777453 5D TGTAAACACT TAATA/----- TATGTTGGTT 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 TAATA 1 0 274495 CASAVA_Build 7 68779744 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 19 8 T 12 11 274496 CASAVA_Build 7 68811239 2D AGTCTCTCTC TT/-- CTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 T 2 0 274497 CASAVA_Build 7 68812824 1D AAACATGTCA C/- CCCCCCTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 C 7 6 274498 CASAVA_Build 7 68814303 1I ATAGTAGAAA -/G GTTGGGTCTT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 G 1 2 274499 CASAVA_Build 7 68815354 4D ATCATTGTAG ATTA/---- ATTGACACTT 3070 het 3070 ref 59 33 21 6 ATTA 1 0 274500 CASAVA_Build 7 68818150 2D AGGCATAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1626 hom 39 12 14 13 A 19 17 274501 CASAVA_Build 7 68824960 1D AAAGAGAGTG C/- TTAAGGATGG 3070 het 3070 ref 62 30 26 7 C 1 0 274502 CASAVA_Build 7 68837568 1I GCTTGTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 10 11 274503 CASAVA_Build 7 68843446 1I CAGAAATGTC -/T TTTTTTTTTT 2549 het 2549 ref 22 8 9 5 T 10 11 274504 CASAVA_Build 7 68856277 1D TGTTGATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 11 10 274505 CASAVA_Build 7 68859514 1I TTATTGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 10 11 274506 CASAVA_Build 7 68873717 1D TTCCGCTTGC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 44 15 15 14 T 7 6 274507 CASAVA_Build 7 68899446 1D CTCTGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 1546 het 1546 ref 35 12 9 15 A 15 14 274508 CASAVA_Build 7 68906450 1I CCATCTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 723 hom 30 2 24 4 A 11 12 274509 CASAVA_Build 7 68934547 1I CCTTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 1574 het 1574 ref 44 31 4 9 T 15 16 274510 CASAVA_Build 7 68949021 1I TTATTTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 16 20 16 T 12 13 274511 CASAVA_Build 7 68956232 1I TACAACTCCA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 46 14 27 5 T 7 8 274512 CASAVA_Build 7 68963592 1D TGTTGCTTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 T 9 8 274513 CASAVA_Build 7 68965982 5D GTCTTCCAAA GATAC/----- GAGGACTCGG 3070 het 3070 ref 44 23 13 12 GATAC 1 0 274514 CASAVA_Build 7 68970116 1D TGCTATTAAA G/- GGGAATTCTG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 G 4 3 274515 CASAVA_Build 7 68977149 1I ACCGTGTGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 54 22 22 10 A 9 10 274516 CASAVA_Build 7 68984294 1D AATAAACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2661 hom 26 7 14 5 T 12 11 274517 CASAVA_Build 7 68997268 1I AGGGAGGCAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2599 hom 30 8 13 9 T 8 9 274518 CASAVA_Build 7 69024987 7D ACTCTGTCTC AAAAAAA/------- GAAAAAAGAA 3070 het 1904 hom 21 5 16 2 A 7 0 274519 CASAVA_Build 7 69027094 1I GTCAAACACC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 8 9 274520 CASAVA_Build 7 69033442 11I GATTACTGTC -----------/ATTAGTTACTT ATTAGTTACT 3070 het 3070 hom 61 29 31 3 ATTAGTTACTT 1 2 274521 CASAVA_Build 7 69038103 2I CTGGGAAAAA --/AG AGGACGGAGG 3070 het 3070 hom 41 12 17 12 AG 1 2 274522 CASAVA_Build 7 69038591 1D TAGGGAAACA G/- GGAAGGTAGA 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 G 3 2 274523 CASAVA_Build 7 69044194 1D GCACAACAGT G/- GGAGGGACGG 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 G 3 2 274524 CASAVA_Build 7 69059836 3I CCAGGCTGTA ---/TGT ATGCAGTGGT 3070 het 3070 hom 43 21 21 1 TGT 0 1 274525 CASAVA_Build 7 69070243 1D GGAGGTACCA G/- GGGACATAGC 3070 het 3070 ref 50 24 21 6 G 4 3 274526 CASAVA_Build 7 69085392 1I CCTGAGGGGG -/A GAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 0 1 274527 CASAVA_Build 7 69086263 1D TTATATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 T 13 12 274528 CASAVA_Build 7 69086734 1D TTGAAATGAT A/- ACATGCATGA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 2 1 274529 CASAVA_Build 7 69091504 1D TATGCATTGC T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 T 8 7 274530 CASAVA_Build 7 69092459 3I GGAAGGAGAG ---/AGA AGGAGGAATG 3070 het 3070 ref 41 25 10 6 AGA 0 1 274531 CASAVA_Build 7 69108765 2D TGCATGTTCC AA/-- AGTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 51 28 19 4 A 3 1 274532 CASAVA_Build 7 69125782 1I ATTAAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 T 11 12 274533 CASAVA_Build 7 69129900 1D TGCAAAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 11 10 274534 CASAVA_Build 7 69130807 1D GCTTTAAGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 9 8 274535 CASAVA_Build 7 69174915 1I TACTGGCCTT -/G GCTGCGGCCC 3070 hom 65 het 26 0 20 6 G 1 2 274536 CASAVA_Build 7 69188847 1I AGGGTTGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 11 12 274537 CASAVA_Build 7 69190151 1D47M1I GAAATACTCA TTTTTTTATTTTTTAGTTTAATATGGCAAATTTAACTGATTTTCAAAT-/-TTTTTTATTTTTTAGTTTAATATGGCAAATTTAACTGATTTTCAAATG TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 28 19 21 4 N/A 0 0 274538 CASAVA_Build 7 69194991 22D9M19D3M2I CAGGTCTGTG ACTCCTAAGTATTATTTTTAATACTTAGGAGTATTTTAATACTCCTAAGATTA--/----------------------ACTTAGGAG-------------------GTAGC TATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 26 21 9 7 N/A 0 0 274539 CASAVA_Build 7 69198180 2D CATATTAAGA GT/-- GTGTGTGTGT 1925 het 1925 ref 54 34 5 16 GT 8 7 274540 CASAVA_Build 7 69199658 2I CCAACTGTGT --/TC TGTCTTAAAC 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 TC 0 1 274541 CASAVA_Build 7 69217342 1D TAGCTGGGAA T/- TTCAGGTGAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 5 T 3 2 274542 CASAVA_Build 7 69217726 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1341 het 1341 ref 23 17 3 3 A 12 11 274543 CASAVA_Build 7 69220031 1I CTTTTGTTTT -/G TTTTTTTTGT 1778 het 1778 ref 52 18 20 14 G 0 1 274544 CASAVA_Build 7 69233608 1D GTCAAATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 A 11 10 274545 CASAVA_Build 7 69249240 1D CATTGTGTTA T/- TTTTCTACTG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 T 5 4 274546 CASAVA_Build 7 69252040 12D ATTTCTAAGA TGTTATTACCAT/------------ GCAGTATGCT 3070 het 3070 hom 39 17 22 5 TGTTATTACCAT 1 0 274547 CASAVA_Build 7 69267777 1D CACGTAAGAT A/- AAAAAAAAAG 1336 het 1336 ref 39 32 3 5 A 10 9 274548 CASAVA_Build 7 69273012 1D TTTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 1271 het 1271 ref 33 26 3 4 A 11 10 274549 CASAVA_Build 7 69276747 1I ATAAACCTCG -/C CTATATAAGA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 C 1 2 274550 CASAVA_Build 7 69278371 2I GGCGGTATTT --/GA GAGGATTGAC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 GA 1 2 274551 CASAVA_Build 7 69280736 19I TGTTCTGCAT -------------------/TGGAATTATCCCCTCTCTC TCTCATTGTT 3070 het 3070 hom 25 12 13 4 TGGAATTATCCCCTCTCTC 0 1 274552 CASAVA_Build 7 69283343 4D TAAAATAAAC ACAT/---- ACACACACAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 ACAT 1 0 274553 CASAVA_Build 7 69283667 1I TTCCATACTA -/T TTGTATTTTC 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 2 3 274554 CASAVA_Build 7 69315614 1I CCCTTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 A 11 12 274555 CASAVA_Build 7 69330237 1I28M1I TCATGCATTT -AAAAAAAAAAAAACAACCTTTTTAAAGG-/AAAAAAAAAAAAAACAACCTTTTTAAAGGT TTTTAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 15 15 7 N/A 0 0 274556 CASAVA_Build 7 69333013 1I TATCTATTGA -/T CTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 T 0 1 274557 CASAVA_Build 7 69341587 1D ATTATTAGTG T/- TTTTTTTTTA 1181 het 1181 ref 39 29 4 6 T 10 9 274558 CASAVA_Build 7 69357343 9I TACAAATACC ---------/TTCTTGTTT TACAAAGACC 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 TTCTTGTTT 0 1 274559 CASAVA_Build 7 69370201 1I TAAATGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 10 9 14 T 13 14 274560 CASAVA_Build 7 69372325 1I TCCAAGAACT -/G GGGGGATGGG 3070 het 3070 ref 54 20 24 10 G 5 6 274561 CASAVA_Build 7 69375656 4D TTGCTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2629 hom 31 11 13 8 TTTG 5 4 274562 CASAVA_Build 7 69379300 1D ATTTTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 2393 het 328 hom 20 2 6 12 T 15 14 274563 CASAVA_Build 7 69402753 1I TTTTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 36 2 24 10 A 13 14 274564 CASAVA_Build 7 69404647 1D ACATACATTT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 A 8 7 274565 CASAVA_Build 7 69404860 1D TTTTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2897 hom 21 9 10 3 T 11 10 274566 CASAVA_Build 7 69405335 1D AAAAAAAAAA C/- AATGTAGTGA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 C 1 0 274567 CASAVA_Build 7 69405513 1D CTTCCTGTCC T/- TTTGCTCTTA 3070 het 3070 hom 44 14 26 4 T 4 3 274568 CASAVA_Build 7 69422779 1D TACCCTTATG A/- AGCTTACATT 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 A 2 1 274569 CASAVA_Build 7 69429031 1D CAGGATGAAC T/- TTTTTTTTTG 1842 het 1842 ref 24 9 6 9 T 10 9 274570 CASAVA_Build 7 69439219 2I CTCCACCCCA --/TC CCCATGTTTC 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 TC 0 1 274571 CASAVA_Build 7 69448894 1D AAGTCTATCA T/- TTTTTTTTTC 1125 het 1125 ref 52 41 3 8 T 10 9 274572 CASAVA_Build 7 69452272 1I TAAAGTAAAA -/G CCAGGATTTA 3070 het 3070 hom 46 16 25 5 G 0 1 274573 CASAVA_Build 7 69454700 1D CTCGGCTTAC T/- GCAAACTCCG 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 1 0 274574 CASAVA_Build 7 69459281 3D AGCCTCTAAT TTC/--- TTCTGTTTCT 3070 het 3070 hom 52 26 22 8 TTC 2 1 274575 CASAVA_Build 7 69460910 1I AGGTTGGCGA -/T GACCTAGAAT 3070 het 3070 ref 50 31 16 3 T 0 1 274576 CASAVA_Build 7 69497055 1D GATGCATGTG T/- TATGTGTATT 3070 het 3070 ref 49 30 14 5 T 2 1 274577 CASAVA_Build 7 69499990 1I TCTTTTATTA -/T TTTTTTTTTT 2023 het 2023 ref 30 17 5 8 T 13 14 274578 CASAVA_Build 7 69512252 2D GGTGTATTAG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 62 21 27 15 TA 7 6 274579 CASAVA_Build 7 69564141 1D GAACTCTTTA T/- TTTTCAAGTG 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 T 5 4 274580 CASAVA_Build 7 69580818 48I TCATCCGGGG ------------------------------------------------/AAAAGACTTTGTTCTTTCACAATCCTGCTGCTTTTCCACCATCCTCCA AACTGGACCA 3070 het 3070 hom 34 18 16 5 AAAAGACTTTGTTCTTTCACAATCCTGCTGCTTTTCCACCATCCTCCA 0 1 274581 CASAVA_Build 7 69582560 1D GTAGTACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 25 18 10 A 11 10 274582 CASAVA_Build 7 69586728 1I AAGGAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 10 11 274583 CASAVA_Build 7 69614321 1I ACCTCTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 10 11 274584 CASAVA_Build 7 69631775 1I GGGAACAGTG -/A AGCCCCAGGG 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 1 2 274585 CASAVA_Build 7 69637957 1D TCTATTTCAT A/- AAAAAAAAAA 1808 het 1808 ref 27 10 6 11 A 17 16 274586 CASAVA_Build 7 69673823 1I CCATCTTGTA -/G GTCTTGCCTC 3070 het 3070 ref 51 30 17 4 G 1 2 274587 CASAVA_Build 7 69676029 1I TGGTTTATTC -/A ATGGAAAACA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 1 2 274588 CASAVA_Build 7 69679693 3D CGTAATATAT TAA/--- TAGACGCCAC 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 TAA 1 0 274589 CASAVA_Build 7 69680731 1D TTTTATTGGG T/- TTTTTTTTAA 2356 het 2236 hom 16 6 10 0 T 9 8 274590 CASAVA_Build 7 69692196 1D CCTCCCATGT G/- GGGAACAAAC 2619 het 2619 ref 31 17 7 8 G 4 3 274591 CASAVA_Build 7 69692322 1D ACCCCCTGGG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 A 8 7 274592 CASAVA_Build 7 69695938 1D TGCTAGCTAC T/- TTTTTTTTTT 1088 het 1088 ref 28 19 4 5 T 13 12 274593 CASAVA_Build 7 69705100 3D AAACCTTTGC CAT/--- CATCCTCTCA 3070 het 3070 hom 44 18 24 6 CAT 2 1 274594 CASAVA_Build 7 69706141 4D CCATTTTCCT TTTC/---- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 23 3 TTTC 1 0 274595 CASAVA_Build 7 69706846 1D TCTGCCACTC A/- AAAAATCAAT 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 A 6 5 274596 CASAVA_Build 7 69709258 2I TTCTTAAAAG --/TT TTAATATTTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 2 4 274597 CASAVA_Build 7 69710162 2I AGAAAACCTT --/AA AGAGTGTAGT 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 A 1 3 274598 CASAVA_Build 7 69715715 1I CTTTTCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 10 11 274599 CASAVA_Build 7 69720589 2I TGTCTCAGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2306 hom 24 5 15 4 A 10 12 274600 CASAVA_Build 7 69721645 2D GGGGACAGAC AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 AG 5 4 274601 CASAVA_Build 7 69729169 5I TAGATGTCCA -----/GGTGT GGTATGGTGG 2402 het 2133 hom 14 6 6 2 GGTGT 0 1 274602 CASAVA_Build 7 69731483 1I CTATTAATAG -/T TATACCTACA 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 1 2 274603 CASAVA_Build 7 69732407 1D AAAAGGGAAG A/- AAAAAAAAAA 1107 het 1107 ref 20 10 3 9 A 11 10 274604 CASAVA_Build 7 69739572 1D CAAAAATACA T/- TTTTTTTTTT 2811 het 1101 hom 21 7 7 7 T 15 14 274605 CASAVA_Build 7 69745311 5D AAGTCTTTTT CTATC/----- CTTCGTGCAC 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 CTATC 1 0 274606 CASAVA_Build 7 69745448 14D ATTTCCAATT GTGTCCTCAACCAG/-------------- GTGTAAAGTC 3070 het 3070 hom 37 20 21 4 GTGTCCTCAACCAG 1 0 274607 CASAVA_Build 7 69745713 4I ATAAACATGC ----/GTAA GTGTCAACTC 3070 het 3070 ref 61 36 20 5 GTAA 0 1 274608 CASAVA_Build 7 69773593 1D CCATAAATAA G/- GGGACCTTCC 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 G 4 3 274609 CASAVA_Build 7 69776296 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1653 hom 31 7 16 8 T 11 10 274610 CASAVA_Build 7 69782524 1I CTTTCATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2312 hom 35 7 15 13 A 15 16 274611 CASAVA_Build 7 69784448 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 603 hom 23 2 10 11 T 10 9 274612 CASAVA_Build 7 69794343 2D TTTCTCAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 28 2 12 14 A 14 12 274613 CASAVA_Build 7 69795686 2D CACCCCCACC TT/-- TTTTTTTTTT 2665 het 49 hom 26 1 15 10 T 16 14 274614 CASAVA_Build 7 69798954 2I AATTTTTTTT --/AA AAAAAGCCAG 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 A 5 7 274615 CASAVA_Build 7 69803541 1D GTGGAGGGGG A/- AAGCATCGGG 3070 het 3070 hom 33 16 11 6 A 3 2 274616 CASAVA_Build 7 69811840 2D GTTTAAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 22 0 13 9 T 18 16 274617 CASAVA_Build 7 69814955 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 134 het 53 0 44 9 T 10 9 274618 CASAVA_Build 7 69829266 2I GGCATTTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 12 14 274619 CASAVA_Build 7 69831094 1D AGAAACAAAT A/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 7 6 274620 CASAVA_Build 7 69833140 1D GGACAACCAG T/- TTTTTTTTTT 1079 het 1079 ref 27 9 6 13 T 11 10 274621 CASAVA_Build 7 69833602 1D GTTGCTTCTA T/- TTTTTTGGCT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 7 6 274622 CASAVA_Build 7 69834669 2D CCAGATCTAA CT/-- CTTAATTTGT 3070 het 3062 hom 17 8 7 3 CT 2 1 274623 CASAVA_Build 7 69837362 1I AGTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1870 hom 18 4 11 3 A 10 11 274624 CASAVA_Build 7 69839286 1D GGAAAAATAC T/- TTTACTACCA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 4 3 274625 CASAVA_Build 7 69841345 1I TTTTTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 501 hom 42 5 29 8 G 0 1 274626 CASAVA_Build 7 69842418 1D TTTATCTGTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 9 8 274627 CASAVA_Build 7 69847959 1D TAATTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 9 T 11 10 274628 CASAVA_Build 7 69853881 1D AGACCCACCC A/- TTGGCCAACC 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 A 1 0 274629 CASAVA_Build 7 69854815 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1507 hom 17 5 10 2 T 12 11 274630 CASAVA_Build 7 69854983 1I GTGCTTGGGC -/G TGTGTATGTG 3070 het 2930 hom 27 11 11 5 G 0 1 274631 CASAVA_Build 7 69861833 5I ATGCCTGACG -----/CCTAA CCTGTGCCTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CCTAA 0 1 274632 CASAVA_Build 7 69869938 1I CAGTGAGGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 9 10 274633 CASAVA_Build 7 69881507 1D AAAAAAAAAA G/- AGTAAAAAAT 3070 het 139 hom 26 1 19 8 G 1 0 274634 CASAVA_Build 7 69895066 3I GCACGTTTCC ---/TGA TGATGTGACG 3070 het 3070 ref 53 25 16 12 TGA 1 2 274635 CASAVA_Build 7 69895565 1D GACAACAACT A/- AAAAAAATGC 2398 het 2398 ref 30 15 8 7 A 8 7 274636 CASAVA_Build 7 69896021 1I TTTTTGAGGA -/G GGGGGGGTTC 3070 hom 69 het 29 0 21 8 G 7 8 274637 CASAVA_Build 7 69909237 5D TATGTTTTTT AAATC/----- TTTTTTTTTT 215 het 215 ref 16 7 2 8 AAATC 1 0 274638 CASAVA_Build 7 69910457 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 987 hom 7 het 3 0 3 1 T 10 11 274639 CASAVA_Build 7 69912769 4D AATGGTAAAG AAAA/---- AAAAGTCTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 8 4 274640 CASAVA_Build 7 69913169 2D AACTCCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 19 0 13 7 A 12 10 274641 CASAVA_Build 7 69913358 2I CTGCAGCCTC --/AA AACTTCCTGG 2841 het 2841 ref 16 8 8 0 A 2 4 274642 CASAVA_Build 7 69917575 1I CAGAGACTAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 31 1 22 8 A 8 9 274643 CASAVA_Build 7 69919548 1D ATCAGTTAGG T/- TTCTCTACAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 3 2 274644 CASAVA_Build 7 69920049 5D TCTGTCTCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 2656 het 1370 hom 11 4 6 3 AAAAC 3 2 274645 CASAVA_Build 7 69930611 4I ACACATATAC ----/ACAT ACATATACAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ACAT 1 2 274646 CASAVA_Build 7 69930681 2D AGGCACACAC AT/-- GTGTATATCT 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 AT 1 0 274647 CASAVA_Build 7 69932239 8I CTGCTATTGC --------/GTGCAATG ACGGTCTGGA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 GTGCAATG 0 1 274648 CASAVA_Build 7 69933655 1I GTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 9 10 274649 CASAVA_Build 7 69935210 1I ATGTTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 17 7 T 10 11 274650 CASAVA_Build 7 69940462 1I TTTTCTGGCC -/A AAAGTTTGGG 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 A 3 4 274651 CASAVA_Build 7 69945276 2D TTCGATTAGG AA/-- AAGAGGAAGT 3070 het 3070 hom 21 7 14 0 A 4 2 274652 CASAVA_Build 7 69947225 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 19 2 11 6 A 13 12 274653 CASAVA_Build 7 69949066 2I GGCTGTACCT --/CC CCCTAAAATC 3070 het 2777 hom 24 8 11 5 C 3 5 274654 CASAVA_Build 7 69949553 2D AGAAAGATTG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 60 het 32 0 19 13 GA 9 8 274655 CASAVA_Build 7 69958243 3I TGCCATTCGT ---/AAG AAGGACAGTA 3070 hom 116 het 46 0 37 9 AAG 1 2 274656 CASAVA_Build 7 69958639 1D GTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 T 13 12 274657 CASAVA_Build 7 69960510 9D TAATATAAAA AGAGGAGTC/--------- AGAGGAGTCA 3070 hom 45 het 24 0 15 12 AGAGGAGTC 2 1 274658 CASAVA_Build 7 69967633 1I AACTGTTTGA -/G GAACTGCCAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 1 2 274659 CASAVA_Build 7 69969990 1I AAATACTAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 9 10 274660 CASAVA_Build 7 69972578 1D AATCTAATGA C/- CTGAACTCTC 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 C 2 1 274661 CASAVA_Build 7 69976960 5I ATGACATATT -----/TTATG TTATGAGTAT 2872 het 2872 ref 18 9 7 2 TTATG 1 2 274662 CASAVA_Build 7 69984319 2D GTCTCATTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 30 9 A 13 11 274663 CASAVA_Build 7 69986272 1I GGTACGGTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 389 hom 32 1 25 6 A 9 10 274664 CASAVA_Build 7 69999706 14D GAGTGCAGTG GTGACTTTTTGTAT/-------------- GTTTTTTGGT 3070 hom 117 het 39 0 39 3 GTGACTTTTTGTAT 1 0 274665 CASAVA_Build 7 70000957 6D ATGCATTGGT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 23 10 A 24 18 274666 CASAVA_Build 7 70002612 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 49 2 37 10 T 12 11 274667 CASAVA_Build 7 70004952 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 19 0 13 7 A 11 9 274668 CASAVA_Build 7 70005621 1D TGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 9 8 274669 CASAVA_Build 7 70006124 1D17M2I TGGTTTCTAT CTTTTTCTGATATCCTCA--/-TTTTTCTGATATCCTCATT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 N/A 0 0 274670 CASAVA_Build 7 70014419 4D TCTCTCTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 23 1 13 9 T 16 12 274671 CASAVA_Build 7 70016482 4D TCTTTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 1090 het 995 hom 25 7 9 9 TCTT 3 2 274672 CASAVA_Build 7 70016506 4D TCTGTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 48 het 23 0 17 6 TC 9 7 274673 CASAVA_Build 7 70025470 1I TGAGCTAGGG -/T GGCACCACTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 0 1 274674 CASAVA_Build 7 70025699 1D ACCTGGGGCT C/- CCCTGTTTCA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 C 4 3 274675 CASAVA_Build 7 70029301 1I TCCGTCCCCC -/G GGTTCAAGTG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 2 3 274676 CASAVA_Build 7 70035083 4I ATTTATTTAT ----/TTAC TTACTTATTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 TTAC 1 2 274677 CASAVA_Build 7 70036694 1D ATTGGAAAGA T/- CTTAGACTTC 3070 hom 147 het 52 0 49 4 T 1 0 274678 CASAVA_Build 7 70049760 6D TGAAATCGGG GTGGTT/------ GTACATACCT 3070 hom 137 het 49 0 45 6 GTGGTT 1 0 274679 CASAVA_Build 7 70056337 8D TCTAGAAACT GGAAATGG/-------- GGAAATGGCA 3070 hom 90 het 36 0 30 8 GGAAATGG 2 1 274680 CASAVA_Build 7 70062351 8D ACAGGTGCAC GCCACTAT/-------- GCCCAGCTAA 3070 hom 57 het 19 0 20 1 GCCACTAT 1 0 274681 CASAVA_Build 7 70070298 1D TAAGTTGTCC A/- AGGTGATACT 3070 hom 132 het 46 0 44 4 A 2 1 274682 CASAVA_Build 7 70076800 1D TCACTATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 33 0 29 5 T 13 12 274683 CASAVA_Build 7 70087390 3I TATTGATATG ---/AAT AATATTAATA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AAT 1 2 274684 CASAVA_Build 7 70096093 5I AATTGATACA -----/CATTC CATGCTAAAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 CATTC 0 1 274685 CASAVA_Build 7 70102687 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 26 2 18 7 T 15 14 274686 CASAVA_Build 7 70105626 1D GTGAGTTTTG A/- AAAAAAATAC 3070 hom 60 het 23 0 19 4 A 8 7 274687 CASAVA_Build 7 70109194 4D TTCTTGTGAT AGTG/---- AGTAAGTCTC 3070 hom 76 het 29 0 25 5 AGTG 1 0 274688 CASAVA_Build 7 70113376 3D TAGGTGAGGG ACA/--- GAAACACTTG 3070 het 3070 ref 44 30 14 1 ACA 1 0 274689 CASAVA_Build 7 70123187 1I GGTCTTCTGA -/C CCCGGAGAGA 3070 hom 59 het 22 0 19 3 C 3 4 274690 CASAVA_Build 7 70124490 4I ATTTGAACTC ----/TTAA AGGCCCACAT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TTAA 0 1 274691 CASAVA_Build 7 70131383 1D AAAATCCTCC T/- GGTGTTGAGA 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 T 1 0 274692 CASAVA_Build 7 70132564 4D23M4D CATAATGTTT TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGTTTTTG/----TGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGTT---- TTTGTTTGTT 3070 hom 24 het 14 0 9 6 N/A 0 0 274693 CASAVA_Build 7 70137028 2D AACTGAAAGT CA/-- CATAGTAACA 3070 het 3070 hom 38 16 19 6 CA 2 1 274694 CASAVA_Build 7 70138346 1D ATAACTTGAG T/- TAGACGTAAA 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 T 2 1 274695 CASAVA_Build 7 70147854 1I CTATCGAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 398 hom 28 1 20 7 A 9 10 274696 CASAVA_Build 7 70150266 1I TTTTTTTGGG -/T TTTTTGTTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 5 6 274697 CASAVA_Build 7 70150437 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1841 het 59 hom 12 1 6 5 T 12 11 274698 CASAVA_Build 7 70151214 1I TGGGAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 31 13 9 A 12 13 274699 CASAVA_Build 7 70154004 3D AACTATTAAA AAT/--- AATGATAGGT 3070 hom 151 het 52 0 51 4 AAT 2 1 274700 CASAVA_Build 7 70154859 2D TAAACTATTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 6 A 12 10 274701 CASAVA_Build 7 70160081 1D GCATTAGTCA G/- AGTTCTCTAA 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 G 1 0 274702 CASAVA_Build 7 70163071 1D TGTCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 28 0 22 8 A 12 11 274703 CASAVA_Build 7 70166982 1I TGGACAATAA -/C AAGTGTTGGC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 C 0 1 274704 CASAVA_Build 7 70172614 1D AGAGCACCCA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 85 het 37 0 29 9 T 8 7 274705 CASAVA_Build 7 70172770 1D GTAGTTTGTA T/- TTTTTTTGCG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 8 7 274706 CASAVA_Build 7 70175237 4I CAATTTATGT ----/CAAA CAAACTCCGA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 CAAA 1 2 274707 CASAVA_Build 7 70176655 1D TCATTTATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 410 hom 36 1 26 10 A 10 9 274708 CASAVA_Build 7 70180496 7D AAATTAGCCA GGCATGG/------- TGGCAGGCAC 3070 hom 51 het 18 0 17 1 GGCATGG 1 0 274709 CASAVA_Build 7 70188784 1I GCCAAAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 11 12 274710 CASAVA_Build 7 70194274 1I AGCAGGGAGG -/A AAAAAAAAAA 935 het 935 ref 37 30 3 4 A 10 11 274711 CASAVA_Build 7 70197300 1D TTCAGAAAAG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 A 8 7 274712 CASAVA_Build 7 70222151 4D TCCCTCCTTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 2261 het 2261 ref 43 18 14 13 CTTT 4 3 274713 CASAVA_Build 7 70226810 5D TCTTTCTTTA CTTTT/----- CTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 50 21 21 10 CTTTT 4 3 274714 CASAVA_Build 7 70231001 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 2929 het 1225 hom 13 4 7 2 A 13 12 274715 CASAVA_Build 7 70236328 1I GTGTAGGAGG -/A AAATAGTCTT 3070 hom 31 het 22 0 11 11 A 3 4 274716 CASAVA_Build 7 70241248 1I GGCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 85 het 36 0 26 10 A 9 10 274717 CASAVA_Build 7 70243948 1D CCCAAACTCT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 67 het 29 0 21 8 A 9 8 274718 CASAVA_Build 7 70245864 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1903 het 475 hom 23 1 10 12 A 17 16 274719 CASAVA_Build 7 70256072 1I TCTCAAACTT -/C CCTTTGGCTA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 C 2 3 274720 CASAVA_Build 7 70260586 1I TCTCAGAAAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 7 8 274721 CASAVA_Build 7 70261047 1D TGATTCCCCC T/- TTTTTTTTTT 1911 het 1911 ref 42 36 5 1 T 11 10 274722 CASAVA_Build 7 70262173 1D CAAATGTGCC T/- TTTCTTAGGA 3070 het 3070 ref 35 16 18 1 T 4 3 274723 CASAVA_Build 7 70265508 2I ATAGGGCTCC --/AT ATGTGACTGC 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 AT 1 2 274724 CASAVA_Build 7 70268873 1I AAAGCTGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 10 11 274725 CASAVA_Build 7 70273837 1I TGTTTAGTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 529 hom 34 4 28 2 T 8 9 274726 CASAVA_Build 7 70276724 2I AATAATAAAT --/AG AGAAGTAAGC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AG 1 2 274727 CASAVA_Build 7 70278072 5I CCATCCATTC -----/TTCCT TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 48 23 22 3 TTCCT 0 1 274728 CASAVA_Build 7 70280218 1I TCAATATCTC -/T TGTCTCCAGT 3070 het 3070 ref 53 27 20 6 T 1 2 274729 CASAVA_Build 7 70282137 1D TCTGATCGCC T/- CCTTTGGAAA 3070 het 3070 hom 52 23 29 0 T 1 0 274730 CASAVA_Build 7 70287310 1D AGTGCTGGGG C/- CAAATTACAC 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 C 2 1 274731 CASAVA_Build 7 70290384 16D AATTTCTTCT GAGTTACGCTCACTTC/---------------- TCTCTGCTTC 3070 het 3070 ref 31 19 10 6 GAGTTACGCTCACTTC 1 0 274732 CASAVA_Build 7 70294276 1I TCACTCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2683 hom 22 8 8 6 T 12 13 274733 CASAVA_Build 7 70295891 8I CTCAGGCACT --------/TAATAGCC TAATAGCCTC 3061 het 3061 ref 26 15 7 4 TAATAGCC 1 2 274734 CASAVA_Build 7 70301120 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1074 het 306 hom 14 3 3 9 A 19 18 274735 CASAVA_Build 7 70305254 2D AACTTTCACC CA/-- CAGTCATCCA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 CA 2 1 274736 CASAVA_Build 7 70311901 1I GGCTGGAGAG -/T TAAGTATTTT 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 T 1 2 274737 CASAVA_Build 7 70331826 1D TCGTTAGCCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 T 9 8 274738 CASAVA_Build 7 70336653 7D TCTGTGCTGA CCCACAG/------- CCCTTGGGAG 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 CCCACAG 1 0 274739 CASAVA_Build 7 70340191 1D ACTGTTTACT G/- TAGGTGTGAA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 G 1 0 274740 CASAVA_Build 7 70340681 3D GCCAGGGGCT TAA/--- TAAATAATTA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TAA 2 1 274741 CASAVA_Build 7 70342222 1I TCTGTACCCC -/A CCCCCAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 0 1 274742 CASAVA_Build 7 70353391 1I TACGATTGAT -/A ATCCTGGAGG 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 1 2 274743 CASAVA_Build 7 70361442 2D TAAATGAGAC AT/-- GTGTCCATCC 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 AT 1 0 274744 CASAVA_Build 7 70361820 1D GTGAAGGAGT G/- GGGAAGACAT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 G 4 3 274745 CASAVA_Build 7 70363534 1I TTTTTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2715 hom 28 8 10 10 T 11 12 274746 CASAVA_Build 7 70364349 2I AGCAAAGGTC --/TG TGTGTTTCAG 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 TG 2 3 274747 CASAVA_Build 7 70369127 1D CCGGCATAGT C/- CCCCCCATCT 3070 het 3070 hom 42 16 15 11 C 7 6 274748 CASAVA_Build 7 70373863 1I24M1I TTAATCAGAG -AAAAAAAAAAGAAGAAAAGAAAAG-/AAAAAAAAAAAGAAGAAAAGAAAAGA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 7 N/A 0 0 274749 CASAVA_Build 7 70375179 1D TTTCCAGTTT G/- GGGGAATCAT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 5 4 274750 CASAVA_Build 7 70386073 1D CCTGCCTCAG C/- CCCCCCCAAG 3070 het 6 hom 35 1 21 14 C 8 7 274751 CASAVA_Build 7 70387806 1D AGTTCTGAGC T/- TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 33 22 3 8 T 12 11 274752 CASAVA_Build 7 70389674 1D CTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1561 het 1561 ref 31 12 7 12 T 11 10 274753 CASAVA_Build 7 70389721 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 2231 hom 30 11 10 9 T 7 8 274754 CASAVA_Build 7 70394387 4I GTCTGTGAAA ----/ACTG ACTGTCTAAC 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 ACTG 1 2 274755 CASAVA_Build 7 70399627 4D AAGAACCAAG AAAA/---- AAAAAACGTG 3070 het 1125 hom 15 5 7 5 A 10 6 274756 CASAVA_Build 7 70400533 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 138 het 48 0 46 2 A 7 8 274757 CASAVA_Build 7 70401308 3I AAAAACAATC ---/AGG AGAACAGAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AGG 0 1 274758 CASAVA_Build 7 70404670 1D TTCTTACCAC A/- AAAAAAACTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 7 274759 CASAVA_Build 7 70406085 1D GCACCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 505 hom 18 2 15 1 T 12 11 274760 CASAVA_Build 7 70408148 2D CTTTGAGCAC AT/-- GTTAATTTTG 3070 het 3070 hom 41 17 15 11 AT 1 0 274761 CASAVA_Build 7 70409208 1D ATCTTAACAA T/- TTATATGTGC 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 3 2 274762 CASAVA_Build 7 70427682 2D TGCGTGCGTG TA/-- TATATATATA 2028 het 2028 ref 14 6 6 3 TA 6 5 274763 CASAVA_Build 7 70434637 1I ACCATCCCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 49 22 19 9 A 9 10 274764 CASAVA_Build 7 70447037 4D AGAGGGCCTT AGAA/---- AGTAAGACAA 3070 het 3070 ref 36 24 9 6 AGAA 1 0 274765 CASAVA_Build 7 70447949 1I CACAGGACAT -/G AATCTGTCTG 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 G 0 1 274766 CASAVA_Build 7 70449857 1I GCATACAGTA -/T TTTTTTTTTT 1549 het 1549 ref 21 13 4 4 T 11 12 274767 CASAVA_Build 7 70450555 1I TGTCCCCAAG -/T CAGCACAGAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 0 1 274768 CASAVA_Build 7 70467861 9I TTTTTTATTA ---------/TTTTTATTT TTTTTATTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTTTTATTT 1 2 274769 CASAVA_Build 7 70471844 1D CCTCGGGGGT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 83 het 36 0 24 12 G 9 8 274770 CASAVA_Build 7 70524044 1I GGCTGGTGAG -/C CCTGGCGGCC 3070 hom 80 het 31 0 23 8 C 2 3 274771 CASAVA_Build 7 70528148 1D GTCTTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 2025 het 2025 ref 34 18 7 9 T 15 14 274772 CASAVA_Build 7 70536875 2I AAAAGCAGGC --/AG AGGAATGTGG 3070 hom 120 het 44 0 39 5 AG 1 2 274773 CASAVA_Build 7 70543296 2D TCTTTCTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 22 0 9 13 T 18 16 274774 CASAVA_Build 7 70546650 1I GAGGTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 21 1 11 9 T 13 14 274775 CASAVA_Build 7 70567786 1D TTACAATTGC A/- GCTGAGTTCA 3070 hom 120 het 46 0 40 7 A 1 0 274776 CASAVA_Build 7 70574851 1I CTGTGTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 36 1 23 12 T 13 14 274777 CASAVA_Build 7 70579421 1I TATTTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 870 het 870 ref 37 20 4 13 A 15 16 274778 CASAVA_Build 7 70612871 1I AAGTGTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 10 11 274779 CASAVA_Build 7 70616616 1I CCCTTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 11 12 274780 CASAVA_Build 7 70654679 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1739 het 113 hom 17 2 5 11 A 16 15 274781 CASAVA_Build 7 70662822 2I TAAAAACAAA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 22 0 16 6 AC 0 1 274782 CASAVA_Build 7 70667518 1D GTTAGGACAA T/- TTTCCTGTGA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 T 4 3 274783 CASAVA_Build 7 70668191 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 23 0 19 4 A 10 11 274784 CASAVA_Build 7 70668942 12D TTTTGTGGGT TTTGTTTGTTTG/------------ TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TTTG 8 5 274785 CASAVA_Build 7 70686883 1D GTCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 1376 hom 10 het 6 0 4 2 A 12 11 274786 CASAVA_Build 7 70689601 1D CCTAGTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 37 0 28 9 T 12 11 274787 CASAVA_Build 7 70696944 1I AAAGCTATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 9 10 274788 CASAVA_Build 7 70701741 1I GCAAATCGGG -/A TAAATGATCA 3070 hom 95 het 37 0 28 9 A 0 1 274789 CASAVA_Build 7 70703320 1I AGGGTACATT -/G GGGAGGATCA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 3 4 274790 CASAVA_Build 7 70703685 2I TTTTTCACTC --/TT TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 8 10 274791 CASAVA_Build 7 70713910 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 2794 het 984 hom 28 4 16 8 A 17 18 274792 CASAVA_Build 7 70730995 1I38M1D TCTCAGGGGG -AAAAAAGTCTAAAAATGCCTCATAGAGAGGTGATAATGA/AAAAAAAGTCTAAAAATGCCTCATAGAGAGGTGATAATG- AAAAAAAAGG 3070 hom 135 het 39 0 46 4 N/A 0 0 274793 CASAVA_Build 7 70735023 4D AAAAAAAGAA AAAG/---- AAAAAAGACT 3070 hom 48 het 17 0 16 4 AAAG 1 0 274794 CASAVA_Build 7 70754230 1I CTTTTTAGGC -/T TTTTTTTTTT 2690 het 2109 hom 23 6 9 8 T 13 14 274795 CASAVA_Build 7 70755926 6D TTTGTTTGTT TGTTTG/------ TGTTTGTTTT 3070 hom 70 het 28 0 23 5 TGTTTG 2 1 274796 CASAVA_Build 7 70756511 2D TATTTTTAGT AG/-- AGACAGGGTT 3070 hom 29 het 13 0 10 3 AG 2 1 274797 CASAVA_Build 7 70757610 7D GTGGTGAAAT CTTTAAC/------- TTCAGGTATC 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 CTTTAAC 1 0 274798 CASAVA_Build 7 70758178 2I CTTGTCTCTC --/TT AAAAAAAGAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 0 2 274799 CASAVA_Build 7 70769728 1I TTTATTTGTA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 6 7 274800 CASAVA_Build 7 70775920 1D CACAGAGGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 9 8 274801 CASAVA_Build 7 70777266 1D TAGCTCTTCC T/- TTTTAAAAAA 1499 het 1499 ref 37 21 10 6 T 5 4 274802 CASAVA_Build 7 70785510 1I5M11D CTGTCACCCA -AGCTCGAGTCCAGTGG/TAGCTC----------- TGCAATCATA 3070 het 3070 hom 35 15 19 2 N/A 0 0 274803 CASAVA_Build 7 70787894 1D CACCACCTGC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 9 8 274804 CASAVA_Build 7 70789473 1I GGCTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 10 11 274805 CASAVA_Build 7 70791477 2I TGAGAAGTGG --/CT CTCTCGTGAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 CT 2 3 274806 CASAVA_Build 7 70794820 4D TTCCTTCCTT TCTC/---- TCTTTCTCTC 1092 het 1092 ref 22 9 9 5 TC 3 1 274807 CASAVA_Build 7 70795659 1D TTTTATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 18 1 11 6 T 13 12 274808 CASAVA_Build 7 70799201 5D GCCCAGCTAG TTTAT/----- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 13 9 TTTAT 2 1 274809 CASAVA_Build 7 70810081 1D ATGCAGAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 9 8 274810 CASAVA_Build 7 70811377 1I ACCTCCCACC -/G GGTCCCTCCC 3070 hom 83 het 32 0 26 6 G 2 3 274811 CASAVA_Build 7 70819364 1I ATATGGCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 36 0 25 11 A 9 10 274812 CASAVA_Build 7 70832755 1I CAACAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 10 11 274813 CASAVA_Build 7 70836969 5I TTTTCAAAAA -----/AAAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAAAG 0 1 274814 CASAVA_Build 7 70840441 11I GTTTCTTCCT -----------/TGGTGGGTTCG TGGTCTCGCT 1178 hom 7 het 4 0 3 1 TGGTGGGTTCG 0 1 274815 CASAVA_Build 7 70844256 1D45M3D AGAAAAAAAG AAAAAAAAAAAAGCCCTCACAATTTAGACAGCAAAAGGGCCTTGGAGAT/-AAAAAAAAAAAGCCCTCACAATTTAGACAGCAAAAGGGCCTTGGA--- GATTATCTAT 3070 het 3070 ref 29 19 12 12 N/A 0 0 274816 CASAVA_Build 7 70845685 3D GTGTATATGT ACC/--- ACATTTTCTT 3070 het 3070 ref 48 26 19 4 ACC 1 0 274817 CASAVA_Build 7 70848051 1I ACTCTTAGGT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 A 0 1 274818 CASAVA_Build 7 70868100 1I TGTAATTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 9 10 274819 CASAVA_Build 7 70890126 1I AAGACCGCCA -/G GGGCTGCACC 3070 hom 64 het 29 0 18 11 G 3 4 274820 CASAVA_Build 7 70916117 1I TAGGCATGTG -/C CACCACACCT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 1 2 274821 CASAVA_Build 7 70932955 1D AGTAAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 54 2 29 23 T 15 14 274822 CASAVA_Build 7 70936495 9D ATAACATGGT AAAGAAAAA/--------- AAAAAAAAAG 3070 het 2194 hom 41 12 16 13 AAAGAAAAA 1 0 274823 CASAVA_Build 7 70936564 3I CAGTGATGAA ---/TCC TGCCTGGAAT 3070 het 3070 ref 36 13 11 12 TCC 0 1 274824 CASAVA_Build 7 70943135 2D TGTAATCCCA AC/-- ACTTTGGGAG 3070 het 3070 ref 46 23 16 10 AC 2 1 274825 CASAVA_Build 7 70943879 1D TTTTCTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 12 11 274826 CASAVA_Build 7 70953312 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 2686 hom 22 6 15 1 T 7 8 274827 CASAVA_Build 7 70953797 2I TACATATTTG --/AT AAATGAATGA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AT 0 1 274828 CASAVA_Build 7 70954275 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAATA 1722 het 1722 ref 17 7 5 5 A 8 9 274829 CASAVA_Build 7 70958367 2D CCTTGGTAAG TA/-- TCCCCCACCT 3070 het 3070 ref 45 23 19 4 TA 1 0 274830 CASAVA_Build 7 70964100 2D GTGGTGTGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 GT 6 5 274831 CASAVA_Build 7 70965960 1D TGAGTGGATC T/- ACTTGAGGCT 2610 het 2610 ref 22 9 6 8 T 1 0 274832 CASAVA_Build 7 70974337 1I CAGACCTGCA -/C CCCACACAGC 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 C 3 4 274833 CASAVA_Build 7 70975534 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 23 13 9 2 T 7 6 274834 CASAVA_Build 7 71011246 1D CATGGGCTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 A 8 7 274835 CASAVA_Build 7 71012974 8D TAAAACCATC AGATCTCA/-------- AGAGACTTAT 3070 het 3070 hom 47 20 22 9 AGATCTCA 1 0 274836 CASAVA_Build 7 71018674 1D CCAACCAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 10 9 274837 CASAVA_Build 7 71019131 1I AAAGAGGATC -/T TGAGTATATA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 T 1 2 274838 CASAVA_Build 7 71020630 13D TGAGACTCAC TCATTTTTATGAG/------------- AACAGCATGG 3070 het 3070 ref 32 17 12 5 TCATTTTTATGAG 1 0 274839 CASAVA_Build 7 71026720 1D GACCACAGTG T/- TCCCCTCCCT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 2 1 274840 CASAVA_Build 7 71027357 1D ATGTTTATAT A/- TTACTTTCAA 3070 het 3070 ref 20 9 8 4 A 1 0 274841 CASAVA_Build 7 71028802 2D TGAAACGGAG TC/-- TCTCTCTGCG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 TC 4 3 274842 CASAVA_Build 7 71029202 1I GAAAGCCTTT -/G GCCCCTGCCA 3070 hom 108 het 41 0 35 6 G 1 2 274843 CASAVA_Build 7 71030152 2D TTTTTTTGAG AC/-- AGAGTCTCAC 3070 het 1353 hom 18 3 11 4 AC 1 0 274844 CASAVA_Build 7 71034191 1I AACCATTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3037 hom 24 8 15 1 T 10 11 274845 CASAVA_Build 7 71034783 1I AACTCATTTC -/T TTAGACTTCT 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 T 2 3 274846 CASAVA_Build 7 71036017 16D ACATGCAAGC TAGAAGCTTGCATGGG/---------------- TGAATGCCAT 3070 het 3070 ref 32 21 14 6 TAGAAGCTTGCATGGG 1 0 274847 CASAVA_Build 7 71046484 1D43M1D GCCTCAGCCT CCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCATGTGTTATCACATGGGCTAAT/-CCGAGTAGCTGAGACTACAGGCATGTGTTATCACATGGGCTAA- TTTTTTTATT 3070 het 2936 hom 25 10 10 14 N/A 0 0 274848 CASAVA_Build 7 71051158 1D TGTTCTGAGT G/- GGGGGGAAGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 7 6 274849 CASAVA_Build 7 71065011 3D GATAGGAAAG TTA/--- TTATAAGAAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 TTA 2 1 274850 CASAVA_Build 7 71066285 1D GGTTTCACCA T/- GTTGGCCAGG 1061 het 997 hom 9 2 3 4 T 1 0 274851 CASAVA_Build 7 71068961 1I TACTCAATAG -/A AAAAATCAGC 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 A 5 6 274852 CASAVA_Build 7 71129505 1I GACTCTGTCT -/G GGGGAAAAAA 1166 het 1166 ref 13 6 6 1 G 4 5 274853 CASAVA_Build 7 71136078 1D23M1D CTCGTGGTTT CCCCACTGCTATGTGAGTCAAAGTA/-CCCACTGCTATGTGAGTCAAAGT- ATGAACTTGA 3070 het 3070 hom 48 26 29 5 N/A 0 0 274854 CASAVA_Build 7 71136418 1I CCTAAAAGCA -/T TTGTGTTAAG 3070 het 3070 hom 53 15 33 5 T 2 3 274855 CASAVA_Build 7 71137399 1D CCTGACAGCT A/- AAAAAATGTG 3070 hom 104 het 40 0 33 7 A 7 6 274856 CASAVA_Build 7 71138322 1D TGCATAAAGT C/- CCTCAAGGTT 3070 hom 111 het 39 0 38 2 C 3 2 274857 CASAVA_Build 7 71140078 1D CTTTTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 19 0 16 4 T 12 11 274858 CASAVA_Build 7 71143245 1D AAATTACAAT A/- AAAAAAAAAA 2850 het 2059 hom 14 5 7 2 A 13 12 274859 CASAVA_Build 7 71155397 4D TGGTCTTGAC CTCA/---- CTGACTACTG 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 CTCA 1 0 274860 CASAVA_Build 7 71156561 1D AGTTTATCTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 7 274861 CASAVA_Build 7 71159071 1I ACTCTAACAA -/T TTTTATACTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 4 5 274862 CASAVA_Build 7 71160028 1D AGCCCACCTG T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 11 4 T 6 5 274863 CASAVA_Build 7 71162384 1D AAGTTTTCTG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 2857 hom 27 9 14 4 A 9 8 274864 CASAVA_Build 7 71162575 1D CAGCAAAAGA C/- TCATGACAGC 3070 het 3070 hom 39 20 18 1 C 1 0 274865 CASAVA_Build 7 71162883 3D GGTGATTTGG AGA/--- AGACCTGAAT 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 AGA 2 1 274866 CASAVA_Build 7 71165433 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1967 het 459 hom 25 3 9 13 A 19 18 274867 CASAVA_Build 7 71171412 4D GGCCTCCTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 8 TTTG 4 3 274868 CASAVA_Build 7 71174423 1D GAGAAATAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 9 8 274869 CASAVA_Build 7 71189494 1I AGCTGGGACT -/A ACCGGCCCGT 3070 het 1417 hom 17 4 10 3 A 1 2 274870 CASAVA_Build 7 71194340 1D TAACACAAAG A/- AATTGTGAGC 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 3 2 274871 CASAVA_Build 7 71195351 2D AAAATTTATA AC/-- ACACACACAC 1133 het 1133 ref 37 29 3 6 AC 7 6 274872 CASAVA_Build 7 71203086 1D AGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 274873 CASAVA_Build 7 71233812 3I TTGAATAAAC ---/AGA AGGTTATTTT 3070 het 3070 ref 60 28 21 11 AGA 0 1 274874 CASAVA_Build 7 71241482 2I GAGACGGGGA --/CT CTGCCCTTAG 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 CT 1 2 274875 CASAVA_Build 7 71247855 2D GAGAACAAAG AC/-- ACAACATACC 1949 het 1819 hom 10 5 4 1 AC 2 1 274876 CASAVA_Build 7 71266313 3D TATTGGAGAT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 TAA 1 0 274877 CASAVA_Build 7 71267865 8I ATCCTCCTGC --------/CTCAGTCT CTCAGTCTTC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 CTCAGTCT 1 2 274878 CASAVA_Build 7 71281259 3I AAGGCTGCAC ---/TTG TTGTGCAAGA 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 TTG 1 2 274879 CASAVA_Build 7 71281744 1D CAGATTTAGA C/- CCCATTGAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 C 4 3 274880 CASAVA_Build 7 71284423 4I TTTTTTTTTG ----/AGAC AGAGTCTTGC 3070 hom 35 het 26 1 18 7 AGAC 0 1 274881 CASAVA_Build 7 71289272 1D CCCTCCCTCA G/- ATAGGCAAGG 3070 het 3070 hom 37 10 23 4 G 1 0 274882 CASAVA_Build 7 71290876 1D GGCCATTATC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 7 6 274883 CASAVA_Build 7 71293767 1D ATTTATTATT A/- TTTTTTTTCA 3070 het 394 hom 25 1 22 2 A 1 0 274884 CASAVA_Build 7 71294474 12D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2221 het 2221 ref 28 13 9 8 A 26 14 274885 CASAVA_Build 7 71296114 5D ATCTCAAAAA AAAAG/----- AAAAGAGAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 5 AAAAG 2 1 274886 CASAVA_Build 7 71312448 23D TTCTTCCTTC CCTCCCTCTCTCCGCCCTCCGTT/----------------------- CCTCCCTCTC 3070 het 3070 ref 23 13 9 6 CCTCCCTCTCTCCGCCCTCCGTT 1 0 274887 CASAVA_Build 7 71319333 1D ACCCTATGTC T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 11 7 T 3 2 274888 CASAVA_Build 7 71319839 1D CACCCACTGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 2893 hom 25 7 13 5 T 8 7 274889 CASAVA_Build 7 71322602 8D ACACATGCAT ACACATGC/-------- ACACATGCAA 3070 het 3070 ref 51 28 17 7 ACACATGC 2 1 274890 CASAVA_Build 7 71322942 1I TTGGCAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 21 2 12 7 T 10 11 274891 CASAVA_Build 7 71325155 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2204 hom 30 11 16 3 A 11 10 274892 CASAVA_Build 7 71325786 1D GATCAAAACC A/- TACAAATTAT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 1 0 274893 CASAVA_Build 7 71335540 1I TGCCACCATG -/C CTGGCTAATT 3070 het 3055 hom 23 7 15 1 C 1 2 274894 CASAVA_Build 7 71339992 1D TGCAACCTCT G/- CCTCCTGGGT 3070 het 1362 hom 22 3 16 3 G 1 0 274895 CASAVA_Build 7 71341533 1D AATCACAGGG A/- GGGTTAGCTC 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 A 1 0 274896 CASAVA_Build 7 71342615 1D GATGCTACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 10 9 274897 CASAVA_Build 7 71345239 4D TGCACATATC TGTT/---- TGAGTCCCTG 3070 het 3070 ref 45 21 16 13 TGTT 1 0 274898 CASAVA_Build 7 71351743 1I TCGATCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 10 11 274899 CASAVA_Build 7 71359526 2I CAATCAATTA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 9 11 274900 CASAVA_Build 7 71361041 1I CTGAAATGAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 6 7 274901 CASAVA_Build 7 71377425 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1001 hom 23 8 10 5 A 17 16 274902 CASAVA_Build 7 71386450 1D AGCAAGACTC T/- TGACTCTAAA 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 2 1 274903 CASAVA_Build 7 71387438 1D TCCCCAGTGT G/- GGTGGGTCTC 3070 het 3070 ref 42 20 15 8 G 3 2 274904 CASAVA_Build 7 71393848 2D CTTTTAACCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2689 hom 38 10 19 9 T 14 12 274905 CASAVA_Build 7 71397970 1I AATGAAAGTC -/A AATACTTTCA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 2 3 274906 CASAVA_Build 7 71401725 1D TGATGGTTTT A/- AAAAAAAAAA 2033 het 105 hom 19 3 7 9 A 15 14 274907 CASAVA_Build 7 71402385 19I GTTAAGAGGC -------------------/AGAGTTTACGTAAAACAAA AGAAATTACA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AGAGTTTACGTAAAACAAA 0 1 274908 CASAVA_Build 7 71406479 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 1783 het 1783 ref 21 10 7 4 A 8 9 274909 CASAVA_Build 7 71408753 2D CTGATGAGGA CT/-- CTCTTCCTGG 3070 het 3070 ref 38 21 15 3 CT 3 2 274910 CASAVA_Build 7 71410818 1D AGGCAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 43 2 27 14 A 13 12 274911 CASAVA_Build 7 71416632 3D TTAAAAAATT TAA/--- TGATGGGACT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TAA 1 0 274912 CASAVA_Build 7 71417760 2D ACATTTTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 2396 het 1721 hom 14 6 6 2 A 13 11 274913 CASAVA_Build 7 71419085 1I AGAAAGAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 9 274914 CASAVA_Build 7 71421239 1I ACTTTCATTC -/T TTCTCCTACT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 2 3 274915 CASAVA_Build 7 71421761 1D GCATGTGTCA G/- GAATGGCTAT 3070 hom 64 het 25 0 19 6 G 2 1 274916 CASAVA_Build 7 71424103 4D TGAAAAAGCA CTGT/---- CTATTTGAGT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 CTGT 1 0 274917 CASAVA_Build 7 71444471 4D ACAAACAAAC AAAT/---- GCCTTGGTAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 AAAT 1 0 274918 CASAVA_Build 7 71448335 4I AAGAAAGAAG ----/AGAA AGAAAGGAAA 3070 hom 50 het 19 0 16 3 AGAA 1 2 274919 CASAVA_Build 7 71451268 1I CGTTTCTGTA -/T TCGCTGCAGA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 1 2 274920 CASAVA_Build 7 71453708 1D AGTAAAAGTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 9 8 274921 CASAVA_Build 7 71456176 2I GAGGCTACTG --/TC TCTCTCTGTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 TC 3 4 274922 CASAVA_Build 7 71459247 1D AAATGCTAAT A/- ATGTTTGGTA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 2 1 274923 CASAVA_Build 7 71464860 2D AGATCATATG AC/-- ACATTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 AC 2 1 274924 CASAVA_Build 7 71467219 4I TTCTAAAACT ----/TGTC TGTAAGATTC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TGTC 0 1 274925 CASAVA_Build 7 71469068 3D ATTTTTTATC TTT/--- TTTATTTTAT 2272 het 1844 hom 12 5 6 1 T 6 3 274926 CASAVA_Build 7 71469469 1I GATGAATTTT -/G TAGTGCTGAA 3070 het 3070 ref 24 14 7 3 G 0 1 274927 CASAVA_Build 7 71469751 1I TATAACCAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 9 10 274928 CASAVA_Build 7 71470031 1D TTTTAATAAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 A 9 8 274929 CASAVA_Build 7 71478490 1I TGCCTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 206 hom 33 3 18 12 A 14 15 274930 CASAVA_Build 7 71481609 1D ATCTGCCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 30 2 16 12 T 13 12 274931 CASAVA_Build 7 71494399 3D CCAGCATGAT GAA/--- GAAGAAGTGT 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 GAA 3 2 274932 CASAVA_Build 7 71495757 1I CTGTTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 A 10 11 274933 CASAVA_Build 7 71561916 1D ACTGCAACCT C/- CCGTTTCCTG 1684 het 1684 ref 14 7 5 2 C 3 2 274934 CASAVA_Build 7 71562009 8I AATTTTGTAT --------/TTTTAGTA GAGACGGGGT 3070 het 2077 hom 17 6 9 2 TTTTAGTA 0 1 274935 CASAVA_Build 7 71568241 1I AGATGGTAAA -/T TTCCAGTGCT 3070 het 3070 ref 67 33 26 8 T 2 3 274936 CASAVA_Build 7 71587192 1I GTATTCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 T 9 10 274937 CASAVA_Build 7 71592478 1I CGCAGAACTC -/A ATGTTGTTTC 3070 het 3070 hom 62 25 28 9 A 1 2 274938 CASAVA_Build 7 71595455 4I TGGAAGCAAG ----/GCCT GCCTTGCCAC 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 GCCT 1 2 274939 CASAVA_Build 7 71597903 9D CACCTGTAAG CTGCAACGC/--------- CTGCATGACC 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 CTGCAACGC 1 0 274940 CASAVA_Build 7 71606759 1I GAGGAGGATC -/T GCAGGAAATG 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 0 1 274941 CASAVA_Build 7 71611890 1D TCTCCAGGCA T/- GTGTTGCAAC 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 T 1 0 274942 CASAVA_Build 7 71623576 2I TTAGATATAT --/TA TATATATATA 2934 het 2934 ref 21 8 9 4 TA 6 7 274943 CASAVA_Build 7 71629571 3I ATATTGGCAA ---/AGT AGATTTCAGA 3070 hom 27 het 17 0 10 7 AGT 0 1 274944 CASAVA_Build 7 71641647 1I AAAAAAAAAA -/G AGGGGGGGAG 2361 het 1629 hom 24 7 8 9 G 0 1 274945 CASAVA_Build 7 71642696 1D ACTCCATCCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 9 8 274946 CASAVA_Build 7 71647989 3D GATTAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 1584 het 839 hom 18 4 6 9 AAG 6 5 274947 CASAVA_Build 7 71685082 1D CAGAAAGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 27 9 7 A 10 9 274948 CASAVA_Build 7 71711209 5D AATAAACTCT TCTTC/----- TCTTGAGTTT 2222 het 2222 ref 43 38 5 3 TCTTC 1 0 274949 CASAVA_Build 7 71718270 2I GGACTAGAGG --/GA GAGAGAAGGC 3070 het 3070 ref 52 36 10 6 GA 3 4 274950 CASAVA_Build 7 71719814 3I TGCATGTCAT ---/AGA AGAAGACTTT 3070 het 3070 ref 60 39 11 10 AGA 2 3 274951 CASAVA_Build 7 71740360 3I ATTCAAAATA ---/TCC TCCTATCTTT 1419 het 1419 ref 22 15 3 4 TCC 1 2 274952 CASAVA_Build 7 71740613 1I TTTTCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 1187 het 1128 hom 9 4 3 2 A 15 16 274953 CASAVA_Build 7 71744415 3D CAAACCAAAT ACA/--- ACATCATATT 3070 het 3070 ref 50 40 8 3 ACA 2 1 274954 CASAVA_Build 7 71744612 1I GTACAGGATT -/C TATGTTGGAG 3070 het 3070 ref 47 30 9 8 C 0 1 274955 CASAVA_Build 7 71744867 4I AAAAGAAGAA ----/AGTT AGAAGATTCA 3070 het 3070 ref 56 41 10 5 AGTT 0 1 274956 CASAVA_Build 7 71750232 2I AAAGAATCTG --/AA AAAAATATTC 2065 het 2065 ref 47 33 6 8 A 5 7 274957 CASAVA_Build 7 71750613 1D AAGGGGTAAC T/- TTTTTTTTTT 2022 het 2022 ref 53 38 5 10 T 13 12 274958 CASAVA_Build 7 71754401 3I TAGCTGGGCA ---/TGG TGGCGGGCAC 1346 het 1346 ref 14 9 3 2 TGG 1 2 274959 CASAVA_Build 7 71774573 4I CATTAAAGGA ----/TTTG TTTCTTTTCC 1844 het 1844 ref 32 26 4 2 TTTG 0 1 274960 CASAVA_Build 7 71775086 3D ACCATCCACG TAA/--- TAAGACGTGA 1324 het 1324 ref 42 32 4 6 TAA 2 1 274961 CASAVA_Build 7 71776869 7I AGAGTTATTA -------/TTATTAC TTTTTTTAAA 1738 het 1738 ref 38 29 4 5 TTATTAC 0 1 274962 CASAVA_Build 7 71784129 2D GGGAAATAAC AG/-- AATATACACC 1883 het 1883 ref 54 45 5 4 AG 1 0 274963 CASAVA_Build 7 71793033 1I GTCATTTTTC -/T TTTTTTAAAT 1790 het 1790 ref 31 21 4 6 T 6 7 274964 CASAVA_Build 7 71793231 1D CTCTTTTTTT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 43 28 12 3 A 8 7 274965 CASAVA_Build 7 71810487 4D CTCTGTTTTG ACAA/---- ACAAAAGCAT 1521 het 1521 ref 46 42 4 3 ACAA 2 1 274966 CASAVA_Build 7 71817356 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 18 1 13 4 A 13 14 274967 CASAVA_Build 7 71876059 5I AATCATCCTC -----/TATTA TATTAACTCT 1249 het 1249 ref 44 39 4 1 TATTA 1 2 274968 CASAVA_Build 7 71878677 1D TTTAAATTAG A/- AAAAAAAAAA 1462 het 1462 ref 34 22 4 8 A 12 11 274969 CASAVA_Build 7 71897572 1D AAAGAAAGAC A/- AAGTACACTT 1342 het 1342 ref 35 28 3 4 A 3 2 274970 CASAVA_Build 7 71904994 1D TATTTTGCGA T/- TTTTTTTTTT 2395 het 2395 ref 22 8 7 7 T 13 12 274971 CASAVA_Build 7 71930830 2I ATGAAAAGGG --/GA AAAAAAAATT 1827 het 1827 ref 22 18 4 0 GA 0 1 274972 CASAVA_Build 7 71939054 1D ATCTAAGGGC G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 15 het 28 1 20 9 G 9 8 274973 CASAVA_Build 7 71942407 1D CTGATCAAGG T/- CATAGAAAGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 1 0 274974 CASAVA_Build 7 71946395 2I CCTGGGTGAC --/AA GAGTGAAATT 2409 hom 17 het 11 0 9 2 A 0 2 274975 CASAVA_Build 7 71965275 1I CAGGAGAATA -/G CGTGAACCCA 3070 hom 27 het 12 0 9 3 G 0 1 274976 CASAVA_Build 7 71974405 1D TTTTTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 1342 het 826 hom 20 4 4 12 T 17 16 274977 CASAVA_Build 7 71989459 3D ACCTTGTATT TGA/--- TGATGATGGC 1261 het 1261 ref 14 10 3 1 TGA 3 2 274978 CASAVA_Build 7 71991253 1D ATACAAACAG T/- TACTCTCTTG 3070 het 3070 ref 52 33 11 8 T 2 1 274979 CASAVA_Build 7 71992313 2D AACTATTGAC TG/-- TTGATTATTG 2846 het 2846 ref 42 34 6 3 TG 1 0 274980 CASAVA_Build 7 72022863 1I CCCGGATGAT -/A AATGATTGTT 3070 het 2411 hom 41 8 30 3 A 2 3 274981 CASAVA_Build 7 72046838 1D GATTTTTCAG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 8 7 274982 CASAVA_Build 7 72053489 2D GAAGAGAAAC AG/-- TGTGGAAGCA 3070 het 946 hom 28 2 15 11 AG 1 0 274983 CASAVA_Build 7 72255493 1D CAGTGGCACA C/- ATGGCGTGCC 1796 het 1796 ref 52 40 5 9 C 1 0 274984 CASAVA_Build 7 72301952 1I TACCACCCCC -/G GGGGCATGCC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 4 5 274985 CASAVA_Build 7 72323829 2I TTTTAGAGAC --/AG GGTTTCACTC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AG 0 1 274986 CASAVA_Build 7 72359056 1D GAATGCAAGA G/- GGGAAGTCTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 4 3 274987 CASAVA_Build 7 72367283 1I TTATCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2049 het 914 hom 16 4 7 5 T 13 14 274988 CASAVA_Build 7 72376287 1I TGGTCCCCGC -/G GGCCTCTCCA 3070 hom 53 het 21 0 15 6 G 2 3 274989 CASAVA_Build 7 72392033 1I CTTTCAACAA -/C CATTTTGTAG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 C 1 2 274990 CASAVA_Build 7 72393568 4D TACCGCAAAT AAAC/---- AACCCCTAGA 2931 het 2931 ref 28 13 9 9 AAAC 1 0 274991 CASAVA_Build 7 72396530 1D ACCAGGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2256 hom 27 7 12 8 T 12 11 274992 CASAVA_Build 7 72400089 10D GTTGGACCTC CTTCAGGGAT/---------- CTTCTATTCT 3070 het 3070 ref 38 21 14 6 CTTCAGGGAT 1 0 274993 CASAVA_Build 7 72409502 1D ATGCGCCTGG C/- CACCACCTCA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 C 2 1 274994 CASAVA_Build 7 72440532 1D ATTTCCATTT G/- TTTTTTTTTA 2352 het 2352 ref 20 11 6 3 G 1 0 274995 CASAVA_Build 7 72458924 1D GTCAAATTGA T/- CACCCTTACC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 1 0 274996 CASAVA_Build 7 72484682 4I TGTCTCTACT ----/AGTA AAAAGTACAA 1909 het 1909 ref 10 6 4 0 AGTA 0 1 274997 CASAVA_Build 7 72492768 1D TGAAGACAAT A/- AAAAAAAAAA 1381 het 1381 ref 26 14 5 7 A 12 11 274998 CASAVA_Build 7 72495650 1D TAGCCATAAC A/- AAAGCTGTGA 2527 het 2527 ref 29 10 9 10 A 4 3 274999 CASAVA_Build 7 72497295 2D AAGAAAAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 102 het 45 0 32 15 AC 10 9 275000 CASAVA_Build 7 72507803 1I ATCTCAGCAC -/T TTTGGGAGGC 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 T 3 4 275001 CASAVA_Build 7 72549969 6D GTGCCATAAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 17 6 AAAAAG 2 1 275002 CASAVA_Build 7 72554624 1D TCATATCTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 T 10 9 275003 CASAVA_Build 7 72557898 1D CCTGAGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 19 15 15 A 12 11 275004 CASAVA_Build 7 72572060 1D CAGACCTGAG A/- AAGTATCATC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 3 2 275005 CASAVA_Build 7 72573221 1D GGCACCCATT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 A 8 7 275006 CASAVA_Build 7 72583838 3D CCAAAAAGCT GGG/--- GGGGGGGGGG 2173 het 543 hom 17 7 6 4 G 13 10 275007 CASAVA_Build 7 72616167 1D TTTTAGAGAT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 1530 hom 22 9 8 5 G 10 9 275008 CASAVA_Build 7 72628473 1D TGCTGGATCA T/- TTTTTTTTTT 2998 hom 28 het 13 0 9 4 T 12 11 275009 CASAVA_Build 7 72631486 21I ATGGGCTTTT ---------------------/ACTTTTACTGCTGGTGGAGAA AAGGAAGAGT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 ACTTTTACTGCTGGTGGAGAA 0 1 275010 CASAVA_Build 7 72660870 2D AAAGAAAAAA AG/-- AAAGTCCTGG 1736 het 1736 ref 27 10 9 9 AG 1 0 275011 CASAVA_Build 7 72662699 1D TCCCCCTCCT C/- CATGACTGGG 3070 het 3070 hom 42 11 22 11 C 2 1 275012 CASAVA_Build 7 72680239 4D AAACTCAGTG CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 46 24 15 8 CTTT 3 2 275013 CASAVA_Build 7 72689927 2I TGGCCCAAGG --/TA TTCTTACTGA 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 TA 0 1 275014 CASAVA_Build 7 72705568 1D GTGTGTACCA C/- CACCCGGCTA 1816 het 1816 ref 17 13 4 0 C 2 1 275015 CASAVA_Build 7 72721446 1D AAGGTGGATG T/- TTTTTAACTC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 6 5 275016 CASAVA_Build 7 72738202 1D CTGAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 1301 het 882 hom 12 4 4 4 A 11 10 275017 CASAVA_Build 7 72738365 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2698 het 981 hom 18 5 8 5 A 15 14 275018 CASAVA_Build 7 72743081 1D GGAGGAGGGG T/- TTCTCTTGGA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 3 2 275019 CASAVA_Build 7 72749994 1D CAGGGTGGGT G/- GGGGGTGGAT 1269 het 1269 ref 19 12 3 4 G 6 5 275020 CASAVA_Build 7 72767694 1I CTAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2201 hom 24 8 13 3 A 10 11 275021 CASAVA_Build 7 72782724 2I TGTATGTTTA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 49 23 21 5 TG 4 5 275022 CASAVA_Build 7 72784456 1D CGCCCGGACA G/- TTTTTTTTTT 1941 het 346 hom 15 3 6 6 G 1 0 275023 CASAVA_Build 7 72787169 2D GAAGGGGGCT GA/-- GTGTGCTCTG 3070 het 3070 hom 38 11 16 13 GA 1 0 275024 CASAVA_Build 7 72821208 1D AGGCCGCCCC G/- AGGGGGAGCT 1539 het 1539 ref 25 13 7 5 G 1 0 275025 CASAVA_Build 7 72827041 1D ACACCTGTAG T/- TCCCAGCTAC 3070 hom 69 het 28 0 23 6 T 2 1 275026 CASAVA_Build 7 72833292 1D CCAAAGTCCT G/- GGATTATAGG 3070 het 1025 hom 21 5 9 7 G 3 2 275027 CASAVA_Build 7 72835376 2I TTCTTCTTCT --/TC TTTTTTTTTT 1676 het 626 hom 16 7 8 1 TC 0 1 275028 CASAVA_Build 7 72835964 4D TTCCTGTTAT TTTC/---- TTTTCTTTTC 1083 het 1083 ref 15 5 7 3 TTTC 1 0 275029 CASAVA_Build 7 72842935 1I TCTTAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 11 12 275030 CASAVA_Build 7 72855958 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 1392 het 1137 hom 12 4 3 5 A 10 9 275031 CASAVA_Build 7 72857962 4I TTGAACTATT ----/TGTC TGAGAATGTG 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 TGTC 0 1 275032 CASAVA_Build 7 72859105 1I GTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 1841 hom 14 4 9 1 A 8 9 275033 CASAVA_Build 7 72861308 1I CTGGCGTTCG -/C CCCCTCCCCA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 4 5 275034 CASAVA_Build 7 72867095 1I TGCCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 2263 het 573 hom 20 4 10 6 A 17 18 275035 CASAVA_Build 7 72876969 1D CTGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2722 hom 34 8 22 4 A 11 10 275036 CASAVA_Build 7 72880845 1I CAAACATGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 9 10 275037 CASAVA_Build 7 72884616 1D CGGGTTTAGA G/- GGGAGGGGCG 1544 het 1544 ref 22 11 5 6 G 4 3 275038 CASAVA_Build 7 72885779 1I TTCTCCACCC -/T TCTGGATCCT 3070 hom 92 het 36 0 28 8 T 1 2 275039 CASAVA_Build 7 72891094 9I GCTGGGCCTG ---------/GCAAGGGGT GCAGAGACGG 2252 het 2252 ref 25 11 6 8 GCAAGGGGT 0 1 275040 CASAVA_Build 7 72903458 1D TGTGCAATAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 9 8 275041 CASAVA_Build 7 72904262 9D56M4I CCTTCCTCCC TTCCTTCCATCCTTCCTCCCTTCCTTCCTCCCTTCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCTCTCTC----/---------TCCCTGCTTCCCTCCTTCCTTCCTTCCTTCCCCCTTCCTCCTTCCCTTCCTCTCTCTCTT TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 45 47 8 10 N/A 0 0 275042 CASAVA_Build 7 72910191 1D CAAGTCTTCT G/- GGTTGGGGGT 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 G 3 2 275043 CASAVA_Build 7 72916525 1D TCCATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 760 het 760 ref 26 8 4 14 A 19 18 275044 CASAVA_Build 7 72950257 1D TTCATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1698 het 133 hom 27 2 7 18 T 17 16 275045 CASAVA_Build 7 72966119 2I AAAATTGGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 11 13 275046 CASAVA_Build 7 72966834 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1650 hom 19 6 10 4 T 12 11 275047 CASAVA_Build 7 72967660 4I10M2D CTCTTTTTTT ----TCTCTTTCTCCT/TCTCTCTCTTTCTC-- CTCTCTCTCT 1957 het 1957 ref 15 10 5 2 N/A 0 0 275048 CASAVA_Build 7 72977593 2D AGGGCAATTC TA/-- TGTTTAGCTT 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 TA 1 0 275049 CASAVA_Build 7 73054524 1D GTCTCCCAGG T/- TTGGAGTGCA 3070 hom 64 het 26 0 21 6 T 3 2 275050 CASAVA_Build 7 73064281 1D ATATTACTCC G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 24 het 17 0 10 7 G 8 7 275051 CASAVA_Build 7 73067107 16D GGGGTGTAGT GGGAAGGGGGTGTCTG/---------------- GGGAAGGGCG 3070 hom 67 het 29 0 20 11 GGGAAGGGGGTGTCTG 1 0 275052 CASAVA_Build 7 73067418 6D TTTTATTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2704 hom 38 het 19 0 13 6 T 21 15 275053 CASAVA_Build 7 73082732 1I GTATCAGGGA -/T TTTTTTTTTT 533 het 533 ref 29 11 4 14 T 17 18 275054 CASAVA_Build 7 73084692 1I AAGTGAGGAT -/G CGCCACGGGG 3070 hom 99 het 38 0 30 8 G 0 1 275055 CASAVA_Build 7 73094532 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 16 5 A 13 14 275056 CASAVA_Build 7 73110552 6I TCTTCCTCTG ------/CTCCTT CTTCTTTCTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 CTCCTT 0 1 275057 CASAVA_Build 7 73142642 1I CTCCATCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 20 0 18 2 A 10 11 275058 CASAVA_Build 7 73150999 1D AATCCCAGCT A/- CTCAGGAGGC 3070 het 70 hom 19 1 17 8 A 1 0 275059 CASAVA_Build 7 73157897 1I CATCTTGTGT -/G GGGTGGCCAG 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 G 3 4 275060 CASAVA_Build 7 73168536 18D GTGGTGGGTG TAATCCCAGTACTGTAGT/------------------ ACTGTAATCC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TAATCCCAGTACTGTAGT 1 0 275061 CASAVA_Build 7 73177095 1I ACTGCCTCTC -/A AAATAAAAGT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 3 4 275062 CASAVA_Build 7 73183760 1D GGTGGCACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 10 9 275063 CASAVA_Build 7 73187315 4I AGCGCAACAT ----/AGTG AGTGAGACCA 3070 hom 75 het 28 0 23 5 AGTG 1 2 275064 CASAVA_Build 7 73189724 1I TACCATCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 37 0 33 4 T 11 12 275065 CASAVA_Build 7 73190416 1I TAAAAATAAA -/G CATTGCTGGG 1755 hom 17 het 13 0 6 7 G 0 1 275066 CASAVA_Build 7 73196839 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 9 8 275067 CASAVA_Build 7 73199050 3I TTCTTTTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 2147 hom 34 het 15 0 11 4 TTC 0 1 275068 CASAVA_Build 7 73204320 6I ACTCTGTCTC ------/AAAAAA AAAAAAAAGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 8 14 275069 CASAVA_Build 7 73212928 8D CCAGCTACTC GCGGGGGG/-------- GGGGGGGGGG 3038 hom 45 het 19 0 12 8 GCGGGGGG 1 0 275070 CASAVA_Build 7 73220124 3D CTTTAAAAAA AAT/--- AATAATAATT 1911 het 1911 ref 15 11 4 1 AAT 4 3 275071 CASAVA_Build 7 73221774 4I TTATTATTTC ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TTTA 2 3 275072 CASAVA_Build 7 73327281 1I AAGTGATCTG -/C CCCCCTTGGC 2044 hom 22 het 10 0 7 3 C 5 6 275073 CASAVA_Build 7 73342913 1D TCTGGGATGA G/- GGGGTCTGCC 2670 het 2670 ref 30 12 9 9 G 5 4 275074 CASAVA_Build 7 73350087 1I CATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 10 11 275075 CASAVA_Build 7 73352110 1I ATTACAGGCA -/T TGTGCCCCCA 3070 hom 27 het 11 0 9 3 T 1 2 275076 CASAVA_Build 7 73354563 1D CTCACTGCAA C/- CTCCGCCTCC 2092 het 1511 hom 12 4 6 2 C 2 1 275077 CASAVA_Build 7 73365970 1I TGGCCCCTGC -/A AGCTTCTGGC 3070 hom 75 het 28 0 24 4 A 1 2 275078 CASAVA_Build 7 73373222 2D GGCGTGCAGC GA/-- GAGAGTCTTA 3070 hom 83 het 34 0 24 11 GA 3 2 275079 CASAVA_Build 7 73381977 1I CATCACACAT -/C TCACTTCATC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 C 0 1 275080 CASAVA_Build 7 73384267 1D TGGTAGATTA T/- TGTGGTGGGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 2 1 275081 CASAVA_Build 7 73387614 5D GCTATCTTAA TTATT/----- TTATTTTGTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 TTATT 2 1 275082 CASAVA_Build 7 73390483 2D GTAAATAAAC AG/-- GGGTTGGGTG 3070 hom 75 het 32 0 25 7 AG 1 0 275083 CASAVA_Build 7 73394653 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 25 0 20 6 A 9 8 275084 CASAVA_Build 7 73403348 8D AAAGAAAGAA AGAAAAAG/-------- AAGGAAGGGA 3070 hom 65 het 24 0 21 5 AGAAAAAG 1 0 275085 CASAVA_Build 7 73410835 1D CTCATCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 300 hom 23 1 20 2 T 12 11 275086 CASAVA_Build 7 73417920 1D GGCTGCAGAA T/- TCCCCATGCA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 2 1 275087 CASAVA_Build 7 73434357 1I TCTATTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 11 275088 CASAVA_Build 7 73442187 1D AATAATAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 12 11 275089 CASAVA_Build 7 73448727 4D TTTGGGGTTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 31 0 26 6 TG 10 8 275090 CASAVA_Build 7 73451039 1I CTAGCAGGGG -/T TTGGTGGCTG 3070 het 2058 hom 32 9 16 7 T 2 3 275091 CASAVA_Build 7 73460087 4I TAAAAAATAA ----/AAAT AAATAAATAA 1434 het 1434 ref 16 10 3 3 AAAT 2 3 275092 CASAVA_Build 7 73461840 1D CCCCCCCACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1640 hom 28 6 18 4 A 10 9 275093 CASAVA_Build 7 73462550 3D AACTTAAAAA AAG/--- AAGAAAAGGC 3070 het 3070 hom 31 15 15 3 AAG 2 1 275094 CASAVA_Build 7 73463162 8D AAGAAAGAAA GAGAGAAG/-------- GAGAGAAGGA 2568 het 2234 hom 29 6 7 19 GAGAGAAG 3 2 275095 CASAVA_Build 7 73470809 2D42M2I ATATATATAT ACACGCACACAGAGACACATATAAACATGCACACACGTACACAC--/--ACGCACACAGAGACACATATAAACATGCACACACGTACACACAT ATACATGTAC 3070 het 3070 ref 55 38 19 17 N/A 0 0 275096 CASAVA_Build 7 73471053 2D54M2I ATACACACAG ACACACATACATGTACACATATACACATGTACACAGGTACACACGCACATACACAC--/--ACACATACATGTACACATATACACATGTACACAGGTACACACGCACATACACACAT GTTACACACA 3070 het 3070 ref 85 70 31 27 N/A 0 0 275097 CASAVA_Build 7 73472437 4D TTCTTTCTTT TTTC/---- TTTCTTTTTC 2345 het 579 hom 14 5 9 0 TTTC 2 1 275098 CASAVA_Build 7 73478030 1D CGGCAACTTC T/- TTTTTTTTTT 2515 het 1522 hom 21 9 8 4 T 13 12 275099 CASAVA_Build 7 73479161 1I GCTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2543 het 2452 hom 22 9 8 5 T 11 12 275100 CASAVA_Build 7 73488371 1D GAATTATATT A/- AAAAAAACCC 1891 het 1162 hom 9 3 5 1 A 8 7 275101 CASAVA_Build 7 73511140 4D AGGCTGGTCT TGAA/---- TGAACCCCTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TGAA 2 1 275102 CASAVA_Build 7 73511204 1I GGATTACAGG -/T TGTGAGCCCC 2630 het 2630 ref 18 7 6 5 T 1 2 275103 CASAVA_Build 7 73516697 3D GGTTTTTACT TTG/--- TTGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 22 13 0 TTG 2 1 275104 CASAVA_Build 7 73524531 1I CCCCCTCTTT -/C CCCTTCCTTG 3070 hom 89 het 35 0 29 6 C 3 4 275105 CASAVA_Build 7 73535639 1I CCCCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 1694 het 1694 ref 25 6 6 13 A 13 14 275106 CASAVA_Build 7 73556518 1I GGAAGTTGAC -/T TTTTGAACCC 3070 hom 116 het 43 0 38 5 T 4 5 275107 CASAVA_Build 7 73556850 3D GACAGACAGC CTT/--- CTTCCCCGCT 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 CTT 2 1 275108 CASAVA_Build 7 73617332 1D GCAGAGGGAT G/- GGGGGGACTG 3070 hom 36 het 14 0 9 5 G 7 6 275109 CASAVA_Build 7 73627372 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 78 het 27 0 26 2 A 8 7 275110 CASAVA_Build 7 73629877 3D TCTATGCCTG TTC/--- TCCTCCATGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 TTC 1 0 275111 CASAVA_Build 7 73663428 2I GCACACACAC --/TT TTTAATTTTT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 T 3 5 275112 CASAVA_Build 7 73674486 15D AGGGGAGGGG AGGAGAGGGGAGGAA/--------------- AGGAGAGGGA 2736 het 1475 hom 15 7 10 2 AGGAGAGGGGAGGAA 1 0 275113 CASAVA_Build 7 73677605 1D ATCTCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 25 1 14 10 A 15 14 275114 CASAVA_Build 7 73683610 1I CATACAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 18 0 A 9 10 275115 CASAVA_Build 7 73684510 2D TGTGTGTGTC GA/-- GAGAGAGAGA 1371 het 1371 ref 32 22 4 7 GA 9 8 275116 CASAVA_Build 7 73707387 13I CCCAGGCATT -------------/TGGGAGGCTAAGG TGGGAGGATG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TGGGAGGCTAAGG 0 1 275117 CASAVA_Build 7 73711329 4D GCAGCTCTTG CTGA/---- CTGACTACTG 3070 hom 66 het 24 0 22 5 CTGA 2 1 275118 CASAVA_Build 7 73713950 6D GTGTCTCAAA AAAAAT/------ AAAAATAAAA 3070 het 2528 hom 21 6 13 2 AAAAAT 3 2 275119 CASAVA_Build 7 73718799 1D TTTCCCCCCC T/- GGTAAGCATT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 1 0 275120 CASAVA_Build 7 73733029 3D CAAAACCAAA TGT/--- TGTTGTGTGC 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 TGT 3 2 275121 CASAVA_Build 7 73735300 1I CTAAAAGGAT -/A AAGTGATGAC 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 2 3 275122 CASAVA_Build 7 73742832 1I23M1I GCACTAATTG -CCCAGGTGCCATGGCTGTTCGAG-/CCCCAGGTGCCATGGCTGTTCGAGC CACCTTGTAC 3070 hom 135 het 41 0 43 9 N/A 0 0 275123 CASAVA_Build 7 73755726 2I CTCACTGCAA --/CC TCTGCCTCCC 3070 het 29 hom 20 1 18 1 C 0 2 275124 CASAVA_Build 7 73765432 1D AATACCAACT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 A 8 7 275125 CASAVA_Build 7 73769587 1I TTTAATACTT -/C TAGTCTCTTA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 0 1 275126 CASAVA_Build 7 73789762 2D CTACGAACAC AG/-- AGGCAGTCAC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 AG 2 1 275127 CASAVA_Build 7 73803228 1D CAGCCTCTAA G/- CCCTCTGCTT 2610 het 1714 hom 14 5 8 1 G 1 0 275128 CASAVA_Build 7 73834028 1I TTGCCCAGGC -/T GGTCTTAAGC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 0 1 275129 CASAVA_Build 7 73844352 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 1674 het 65 hom 17 1 5 11 T 13 14 275130 CASAVA_Build 7 73866046 1D TATATAACCA T/- TTTTTTTTTT 2659 het 62 hom 9 1 7 1 T 13 12 275131 CASAVA_Build 7 73871123 1I CGCCATGTTG -/C CCAGGCTGGT 2060 het 1749 hom 12 5 6 1 C 2 3 275132 CASAVA_Build 7 73911889 5D TTCTTTCTTT CTTTC/----- TTTTTTTTTT 114 het 114 ref 14 6 2 7 CTTTC 1 0 275133 CASAVA_Build 7 73938493 8D CGGCCAGTGA AGAGCTCC/-------- AGGCGTGCGG 1490 het 116 hom 8 1 6 1 AGAGCTCC 1 0 275134 CASAVA_Build 7 73988543 1I CTGGGACTAC -/A AGCCTGCAAG 2768 hom 18 het 9 0 6 3 A 1 2 275135 CASAVA_Build 7 73989762 1D AAAACAAGAG A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 7 6 275136 CASAVA_Build 7 73996625 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 2660 het 2660 ref 19 10 6 4 A 10 9 275137 CASAVA_Build 7 74006199 1I GGGGACAAAT -/A TTCAGACTAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 0 1 275138 CASAVA_Build 7 74018368 1D AAAGTTCTTG C/- TTGGAAATCT 1984 het 787 hom 8 2 6 0 C 1 0 275139 CASAVA_Build 7 74119308 1I CGTCTCAGAT -/A AAAAAAAAGA 2665 het 2665 ref 19 11 6 2 A 8 9 275140 CASAVA_Build 7 74203440 1D GTTCTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 16 0 14 3 T 13 12 275141 CASAVA_Build 7 74246677 1I TAAATACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 21 21 10 T 13 14 275142 CASAVA_Build 7 74733704 13I CCCAGTTACT -------------/TGGGAGTCTGAGG TGGGAGAATT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 TGGGAGTCTGAGG 0 1 275143 CASAVA_Build 7 74876617 6I GGGACCTCAT ------/CAAAAG CAAAAACAAA 2385 hom 23 het 12 0 8 4 CAAAAG 0 1 275144 CASAVA_Build 7 74883433 1D GGGTCGTGGA G/- GGGGGGGATG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 8 7 275145 CASAVA_Build 7 74884276 4D AGGTAGAAGC TTGA/---- TTGATTGCTA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TTGA 2 1 275146 CASAVA_Build 7 74893149 1I AAACAAGCAC -/A AAACAATAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 4 275147 CASAVA_Build 7 74896170 1I CTCTTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 919 hom 28 3 13 12 A 15 16 275148 CASAVA_Build 7 74911308 1I TAGGGTGTTT -/A TGGGGATAGA 1461 het 1461 ref 9 5 3 1 A 0 1 275149 CASAVA_Build 7 74927543 1I AAAGAATAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 9 10 275150 CASAVA_Build 7 74952627 3I AGTCACCCAC ---/CTG CTAAGGCCCA 956 het 956 ref 31 21 3 7 CTG 0 1 275151 CASAVA_Build 7 74956343 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1676 het 1676 ref 22 12 4 6 T 6 7 275152 CASAVA_Build 7 74983203 1D ATTTTTTTTT A/- ACCTTATCAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 2 1 275153 CASAVA_Build 7 74984026 1D GCATGGCTGA G/- TTTTATCTCA 2196 het 2196 ref 42 30 5 9 G 1 0 275154 CASAVA_Build 7 74984411 3I GGCAACATAG ---/TAA TAAGAACCTC 3070 hom 56 het 23 0 19 4 TAA 1 2 275155 CASAVA_Build 7 74990529 1D TTAACTTCAC A/- AAAACAAAGA 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 A 5 4 275156 CASAVA_Build 7 75000285 1I TCTTTTTTTT -/C TTTCCTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 0 1 275157 CASAVA_Build 7 75008980 1D CAAGACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 29 1 18 10 A 13 12 275158 CASAVA_Build 7 75012236 1I AAGGGACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 9 10 275159 CASAVA_Build 7 75016368 1I CAGGGGTTGT -/G GGGGGGTCTT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 G 6 7 275160 CASAVA_Build 7 75019754 1I CTGTCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 10 11 275161 CASAVA_Build 7 75068871 6D CAACAACAAC AAAAAA/------ AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 32 20 10 5 A 11 5 275162 CASAVA_Build 7 75088567 6D AGTATGGCTA GAGCCG/------ GAAGTCAGGG 2057 het 2057 ref 28 13 8 11 GAGCCG 1 0 275163 CASAVA_Build 7 75089531 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 11 10 275164 CASAVA_Build 7 75095730 7D CCTGTACCTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1353 het 1168 hom 18 6 5 7 T 21 14 275165 CASAVA_Build 7 75098395 1I GTTTTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 1658 het 1658 ref 20 12 6 2 T 13 14 275166 CASAVA_Build 7 75103605 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 27 4 12 12 A 17 16 275167 CASAVA_Build 7 75105919 1I CACACATCTT -/C CCATCGATCT 1427 het 883 hom 13 3 4 6 C 2 3 275168 CASAVA_Build 7 75108747 1D TCCTTGTTTG C/- TTTTTTTTTT 2872 het 1351 hom 16 7 7 2 C 1 0 275169 CASAVA_Build 7 75119267 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 666 het 666 ref 6 3 2 2 A 11 10 275170 CASAVA_Build 7 75135359 6D CCATGACCTT TGCTAA/------ CTCGCAGCTA 3070 hom 108 het 37 0 34 3 TGCTAA 1 0 275171 CASAVA_Build 7 75137649 2D GAGCTCATGC TA/-- TATCTGCCTG 3070 hom 75 het 30 0 26 6 TA 2 1 275172 CASAVA_Build 7 75139580 1I TTTTACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1125 hom 37 5 26 6 T 13 14 275173 CASAVA_Build 7 75141755 9I GGCTTTTTGT ---------/TTTTTTTTG TTTTTTTTTT 2856 hom 22 het 10 0 8 2 TTTTTTTTG 0 1 275174 CASAVA_Build 7 75146356 1I CCAGCTATGA -/C CCCCCCTTCT 3070 hom 104 het 43 0 31 12 C 6 7 275175 CASAVA_Build 7 75146933 6I TATTAATTTT ------/CATTTC CTTGTTTGGC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CATTTC 0 1 275176 CASAVA_Build 7 75147870 2D AACTTTTTTT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TC 1 0 275177 CASAVA_Build 7 75149461 1I TCCACCCACC -/T TGGCCTCCCA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 1 2 275178 CASAVA_Build 7 75150700 2I ACTCGTTGGG --/GA AGTGCACAGG 3070 hom 111 het 39 0 36 3 GA 0 1 275179 CASAVA_Build 7 75159681 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 15 1 9 5 T 12 13 275180 CASAVA_Build 7 75162171 8I TGCATTCTGG --------/TGAAATTT TGAGTTCTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TGAAATTT 0 1 275181 CASAVA_Build 7 75162829 3I CCAGTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 62 het 33 0 21 12 TTG 3 4 275182 CASAVA_Build 7 75181256 1D GCCCAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 17 0 11 6 T 11 10 275183 CASAVA_Build 7 75197047 4D TCTCAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 123 het 43 0 42 3 AAAC 4 3 275184 CASAVA_Build 7 75200685 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 515 hom 32 2 15 15 T 16 15 275185 CASAVA_Build 7 75215685 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1118 het 1118 ref 17 8 4 5 A 17 16 275186 CASAVA_Build 7 75218301 1I CAGAGGTTGC -/A GTGAGCTGAG 2827 het 2827 ref 22 9 9 4 A 0 1 275187 CASAVA_Build 7 75228672 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 1926 het 1926 ref 22 12 4 7 A 9 8 275188 CASAVA_Build 7 75229248 1I CTTCTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 2344 het 1538 hom 24 6 10 8 T 14 15 275189 CASAVA_Build 7 75231052 1I GCCAATAATA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2173 hom 18 6 10 2 T 8 9 275190 CASAVA_Build 7 75232895 1I ACTACATCTT -/A AAAAAAAAAA 1592 het 1039 hom 19 5 8 6 A 15 16 275191 CASAVA_Build 7 75245667 6I GTGTGGTTTT ------/TTTTTG TTTTTTTTTT 1011 het 1011 ref 18 11 3 5 TTTTTG 0 1 275192 CASAVA_Build 7 75245813 1D ATGTTGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2217 hom 38 8 27 3 T 11 10 275193 CASAVA_Build 7 75254960 1D CTCTCAACTT A/- AAAAAAAAAA 2476 hom 18 het 13 0 7 6 A 11 10 275194 CASAVA_Build 7 75263992 1D GTCCTGATAA T/- TTTTTTTTTT 1866 het 1866 ref 16 8 5 3 T 11 10 275195 CASAVA_Build 7 75266455 1I CCTGGGTAAC -/T TTTTTTTTTT 562 het 562 ref 24 8 3 13 T 17 18 275196 CASAVA_Build 7 75268198 1D ATAGATATTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 8 19 4 C 1 0 275197 CASAVA_Build 7 75269054 1D AACTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2352 het 410 hom 22 2 11 9 A 15 14 275198 CASAVA_Build 7 75269577 2I CCTGGGCGAC --/AG AGTCAGATTC 2028 het 2028 ref 18 10 5 3 AG 1 2 275199 CASAVA_Build 7 75272352 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 64 het 64 ref 16 11 2 3 TTTC 1 0 275200 CASAVA_Build 7 75273703 12D25M2D AGACATGTCC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATGTGTTTTCAGACTT/------------AAAAAAAAAAGATATGTTTTCAGAC-- TTGCATTTCT 2976 het 2976 ref 19 13 9 9 N/A 0 0 275201 CASAVA_Build 7 75274885 1D TCTGGAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 9 A 13 12 275202 CASAVA_Build 7 75289877 3I ACCAGGGGTC ---/AGG AGTTCGAGAC 3070 het 1025 hom 17 5 8 4 AGG 0 1 275203 CASAVA_Build 7 75305599 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2138 hom 19 5 11 3 A 13 14 275204 CASAVA_Build 7 75309744 1I AGCCTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 1101 het 1101 ref 32 13 7 12 T 15 16 275205 CASAVA_Build 7 75316631 1D CAAAAAAGAG A/- AAAAAAAAGA 1925 het 1925 ref 14 7 6 2 A 9 8 275206 CASAVA_Build 7 75317266 2D AAAAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTTT 1276 het 1276 ref 21 9 5 7 AT 1 0 275207 CASAVA_Build 7 75317971 1I25M1I TTTTTTTTTC -TTTTTTTTGTCTGAGACAGAGTCTC-/TTTTTTTTTGTCTGAGACAGAGTCTCT ATTCTGTCGC 3070 het 3070 ref 25 16 9 2 N/A 0 0 275208 CASAVA_Build 7 75327211 1D CACTCTAATA T/- TTTTTTTTTT 2402 het 1648 hom 23 5 6 12 T 17 16 275209 CASAVA_Build 7 75350773 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 789 het 789 ref 23 14 2 7 A 11 10 275210 CASAVA_Build 7 75374170 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAATTAGC 1111 het 1111 ref 8 5 3 0 A 7 5 275211 CASAVA_Build 7 75424804 1D CCTGCGGAGC T/- TGCCACCAAG 3070 hom 78 het 30 0 25 5 T 2 1 275212 CASAVA_Build 7 75426064 1D GAGACCCCCA C/- CCCCCCGCCA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 C 7 6 275213 CASAVA_Build 7 75428529 3D CAGCTTCTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 17 14 275214 CASAVA_Build 7 75431260 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 31 0 24 7 T 12 11 275215 CASAVA_Build 7 75432293 1I AAATCAATTT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 77 het 27 0 24 5 A 7 8 275216 CASAVA_Build 7 75432559 2D TTTTGAAAAC AT/-- AATTCTGGGA 3070 hom 102 het 35 0 33 3 AT 1 0 275217 CASAVA_Build 7 75434899 1I CATGACTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 700 hom 35 2 24 9 T 11 12 275218 CASAVA_Build 7 75442412 1I TATTCCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 32 1 22 9 T 10 11 275219 CASAVA_Build 7 75450595 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 15 0 14 1 A 12 11 275220 CASAVA_Build 7 75454754 4D GCAGAGGACG GACA/---- GACAGACAGG 3070 hom 67 het 25 0 23 6 GACA 3 2 275221 CASAVA_Build 7 75456758 1D CCTCAGGGCA C/- CAAGAGAACC 3070 hom 52 het 23 0 17 6 C 2 1 275222 CASAVA_Build 7 75489751 1D CGACTCTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 26 1 18 7 A 13 12 275223 CASAVA_Build 7 75491881 14D AAAACAAAAC AACAAAACAAAAAA/-------------- AACAAAACAA 3070 hom 32 het 16 0 11 6 AACAAAACAAAAAA 2 1 275224 CASAVA_Build 7 75500541 1I CTGGGACTAC -/A AGCGTATGCC 3070 hom 49 het 20 0 16 4 A 1 2 275225 CASAVA_Build 7 75514352 2D CGTCTCTACT AA/-- AAAAAAAATA 2705 hom 16 het 8 0 6 3 A 10 8 275226 CASAVA_Build 7 75522992 1I CACTGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 1719 het 1719 ref 31 13 6 12 A 17 18 275227 CASAVA_Build 7 75532282 1D CAGGAGCTCT C/- CCTGGCCCTT 3070 hom 103 het 36 0 31 5 C 3 2 275228 CASAVA_Build 7 75544571 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 56 het 26 0 22 6 A 6 5 275229 CASAVA_Build 7 75545828 1D TACGTAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 24 0 18 6 T 15 14 275230 CASAVA_Build 7 75602275 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1568 het 1001 hom 21 11 7 3 A 17 16 275231 CASAVA_Build 7 75669533 1I ACAGTGGAGA -/C CCTTTGGGGT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 2 3 275232 CASAVA_Build 7 75752871 1I CCCGGCAGCG -/C CCGCAAGCGT 3070 hom 32 het 13 0 11 2 C 2 3 275233 CASAVA_Build 7 75757932 5I TAATTTTTGC -----/TTTTA TTTTTTGTTT 3070 hom 58 het 24 0 20 4 TTTTA 0 1 275234 CASAVA_Build 7 75764555 6I ACCTACTCAG ------/GAGGCT GAGGCAGGAG 3070 hom 109 het 39 0 34 6 GAGGCT 0 1 275235 CASAVA_Build 7 75771918 2D GCCCAGGAGT TG/-- TGAAGGGTAC 3070 het 2733 hom 20 8 12 0 TG 2 1 275236 CASAVA_Build 7 75775511 1I CCAGCACCTT -/G GGGGGGCCTA 3070 hom 36 het 14 0 11 3 G 6 7 275237 CASAVA_Build 7 75793240 5D CCCATCTGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TTTTG 3 2 275238 CASAVA_Build 7 75796080 21I CAGCCACCTG ---------------------/CCGAGCACCTATGAACCAAAA ACCTGAAGTC 3070 hom 57 het 22 0 19 4 CCGAGCACCTATGAACCAAAA 0 1 275239 CASAVA_Build 7 75814852 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 26 0 22 5 AAC 1 0 275240 CASAVA_Build 7 75816130 1D TTAGACTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 61 het 27 0 21 7 A 10 9 275241 CASAVA_Build 7 75818645 4I GAGTAGGGTC ----/ATTT TTTTCAACCT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 ATTT 0 1 275242 CASAVA_Build 7 75835598 2D GTGTATGTGG GT/-- GTGTGTGTGT 1296 het 1296 ref 51 28 3 23 GT 9 8 275243 CASAVA_Build 7 75846645 1D GGTTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 15 0 12 3 T 12 11 275244 CASAVA_Build 7 75861068 1I CGCAGACCCA -/G GGCACCGCCA 1501 hom 23 het 11 0 8 3 G 2 3 275245 CASAVA_Build 7 75880867 1D ACTTTTTTTT A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 8 7 275246 CASAVA_Build 7 75882033 2D CGGCTCACCG CC/-- CCACCTGCGC 1782 het 1782 ref 19 13 4 2 C 4 2 275247 CASAVA_Build 7 75895434 1I AAAAAAAAAA -/G GGCACGGTGG 1960 het 133 hom 19 2 11 6 G 2 3 275248 CASAVA_Build 7 75903088 3I GCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 CTC 0 1 275249 CASAVA_Build 7 75907597 3D TCCAACAGGT GAG/--- GAGGACAGGT 2889 het 2889 ref 26 17 7 2 GAG 2 1 275250 CASAVA_Build 7 75908029 1I36M1I TTAAGCAGGA -GGGGCTCTCAGCCTTCCACCTCGGTGGCAGCCAGGG-/GGGGGCTCTCAGCCTTCCACCTCGGTGGCAGCCAGGGT AGATCTGCTG 3070 het 3070 hom 49 13 19 33 N/A 0 0 275251 CASAVA_Build 7 75908901 2I TCAGCCTCCC --/AA AAAGTGCTGG 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 A 3 5 275252 CASAVA_Build 7 75908953 1D GAAAGCTGTG T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 41 22 12 9 T 8 7 275253 CASAVA_Build 7 75912261 1D TCTGCCACTC T/- TTTTTTTTTT 2038 het 1936 hom 43 13 7 23 T 13 12 275254 CASAVA_Build 7 75923623 1D GGAAGTTGCA G/- TGAGCCGGGA 2059 het 2059 ref 23 16 5 2 G 1 0 275255 CASAVA_Build 7 75931674 1D AGGAGATTTC T/- ATGAGGGTCA 1862 het 431 hom 5 1 4 0 T 1 0 275256 CASAVA_Build 7 75933796 1I CTTTCTTTCA -/T TTTTTTTCTT 1881 het 1881 ref 24 20 4 0 T 7 8 275257 CASAVA_Build 7 75942955 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 A 8 7 275258 CASAVA_Build 7 75944411 8I CCGCCCGCCC --------/GCCCGCCT GCCCGCCCGA 1449 hom 15 het 8 0 4 4 GCCCGCCT 0 1 275259 CASAVA_Build 7 75975687 1D TTTTATTATA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 T 8 7 275260 CASAVA_Build 7 76013288 1I AAAGAAGGAG -/T TTTGAGTCCA 3070 hom 24 het 11 0 8 3 T 3 4 275261 CASAVA_Build 7 76019650 4D ACCAGTTTTG TTAC/---- TTGTGGATTT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 TTAC 1 0 275262 CASAVA_Build 7 76020628 1I CTGAAATATC -/A AAACTATATT 3070 het 3070 ref 39 26 9 4 A 3 4 275263 CASAVA_Build 7 76026248 1D CAATATTATT A/- AAAGGATACA 2093 het 2093 ref 38 30 5 3 A 4 3 275264 CASAVA_Build 7 76027216 1I TTATCTCTCC -/T TTAACACCAT 3070 het 3070 hom 69 31 31 7 T 2 3 275265 CASAVA_Build 7 76028214 3D GTTTTATTTT TTA/--- TTTTTTTATT 359 het 250 hom 13 2 3 9 TTA 1 0 275266 CASAVA_Build 7 76034835 1D CCCCATCCAT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 30 20 7 3 A 8 7 275267 CASAVA_Build 7 76034920 2I ATATATATAT --/AA AACAGATGTG 3070 het 3070 ref 36 26 10 0 A 2 4 275268 CASAVA_Build 7 76035505 1I GTTGCCAGGG -/T TTAGGGGGAG 3070 het 3070 ref 37 28 7 2 T 2 3 275269 CASAVA_Build 7 76042779 1I GGGTGTCGCT -/G CTCTCAACAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 275270 CASAVA_Build 7 76051467 10I ACAAAACTCC ----------/AAGATATTAA AAGGAGAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AAGATATTAA 0 1 275271 CASAVA_Build 7 76051599 3D GAAAAAAGTT GTA/--- GTGGAGAGCT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 GTA 1 0 275272 CASAVA_Build 7 76054665 1I TTTTGTCCAC -/T TTTTTTAGTT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 6 7 275273 CASAVA_Build 7 76064986 1D AACGTTGCTC A/- AAAGAAATCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 4 3 275274 CASAVA_Build 7 76068645 1I TAAAAAATGG -/A AGTATATTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 1 2 275275 CASAVA_Build 7 76071361 5I TAGTAATTTG -----/GTAAA GTACTTTTGA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 GTAAA 0 1 275276 CASAVA_Build 7 76075207 1D GTATCTGGCG T/- TTTTTGAACC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 6 5 275277 CASAVA_Build 7 76075760 1D CCACACTTAG A/- GTATCAAAGG 3070 het 3070 ref 56 28 23 6 A 1 0 275278 CASAVA_Build 7 76076455 4D AGTCCCAGCA ACTC/---- ACTCAGGAAG 2833 hom 18 het 9 0 7 2 ACTC 2 1 275279 CASAVA_Build 7 76077440 1I AGATCAGTGG -/C CCCCACGGTG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 4 5 275280 CASAVA_Build 7 76078538 1D AGGCTGAGAG C/- CCCCTCCTGC 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 C 5 4 275281 CASAVA_Build 7 76078722 1D CTGCGGTTAC A/- GGGAAGCAGA 3070 hom 118 het 43 0 38 6 A 1 0 275282 CASAVA_Build 7 76078968 3I GGAGCACCTG ---/TCC TCCTCACCTG 2229 het 2229 ref 29 17 7 5 TCC 1 2 275283 CASAVA_Build 7 76083682 2I AGGTATGAGA --/CT CTCTACAATC 2851 hom 18 het 9 0 7 2 CT 2 3 275284 CASAVA_Build 7 76086641 5D ACTCTGTCTT TAAAA/----- TAAAATAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 6 TAAAA 5 4 275285 CASAVA_Build 7 76090522 2D CTTATGACTC TT/-- TAATGTCAGA 2709 het 2709 ref 34 25 6 3 T 3 1 275286 CASAVA_Build 7 76091397 3I AATATAAAAA ---/AAG AAGTATAGGA 1954 hom 10 het 4 0 4 0 AAG 1 2 275287 CASAVA_Build 7 76093791 4D CATCTCACAC CAAG/---- CAAGAGTCAG 3070 het 3070 ref 44 34 8 4 CAAG 2 1 275288 CASAVA_Build 7 76095884 1I TAGGGTGTTT -/A TGGGGATAGA 2976 het 998 hom 11 3 7 1 A 0 1 275289 CASAVA_Build 7 76105502 2I AGAAGTAAAG --/TC TGTTTCAGTT 2343 hom 17 het 8 0 5 3 TC 0 1 275290 CASAVA_Build 7 76113479 1I GGCTGGTCTC -/A AAACTCCTGA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 3 4 275291 CASAVA_Build 7 76121285 1I AATTTGAAGA -/T TTTTTTTCTG 1343 het 1343 ref 41 29 3 9 T 7 8 275292 CASAVA_Build 7 76122402 1D GAGCAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 11 10 275293 CASAVA_Build 7 76125402 1I ATATATTAAC -/A TGCGTTGATA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 0 1 275294 CASAVA_Build 7 76131062 12I GTCATTGTCT ------------/TACTTTGAAATC TACTTTGACT 3070 hom 97 het 33 0 32 3 TACTTTGAAATC 0 1 275295 CASAVA_Build 7 76134265 3D CAGAGTGCAT ATC/--- ATATTTGTCT 1353 het 1353 ref 42 37 3 2 ATC 1 0 275296 CASAVA_Build 7 76139585 1I TCACCCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 24 0 21 3 A 10 11 275297 CASAVA_Build 7 76142508 1I TAACATTAAT -/C ATCACAGGAC 3070 het 3070 ref 52 38 9 5 C 0 1 275298 CASAVA_Build 7 76143292 10D TTTGAACAAG GTTCTAACTT/---------- GATGTACCAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 GTTCTAACTT 1 0 275299 CASAVA_Build 7 76153255 1I CAAATACAGT -/C CATATTCTAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 C 1 2 275300 CASAVA_Build 7 76154985 5I TTTGAATATT -----/TACTC TACCACCTCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TACTC 0 1 275301 CASAVA_Build 7 76160008 2I TCTATTTCCT --/CA GAGAAAAATT 1696 het 1696 ref 33 25 4 4 CA 0 1 275302 CASAVA_Build 7 76172610 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAACA 2399 het 2399 ref 15 8 6 1 A 8 9 275303 CASAVA_Build 7 76177555 2I AAGCGCTGGA --/AG ACAGTCTCTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 AG 0 1 275304 CASAVA_Build 7 76180619 1I TTAACTTTAC -/T TTTGGTTTTG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 T 3 4 275305 CASAVA_Build 7 76186646 1I ATGTCTGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 25 0 18 7 T 11 12 275306 CASAVA_Build 7 76187170 5D CTCTGACTCC TTAAT/----- TTAGATGGTC 1659 het 1659 ref 45 38 4 6 TTAAT 1 0 275307 CASAVA_Build 7 76189972 1D CTCATGCCTG T/- AATCTCAGCA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 1 0 275308 CASAVA_Build 7 76207971 2D CTTTTATTAC AT/-- GTTTCTGGTC 3070 het 3070 ref 45 31 12 2 AT 1 0 275309 CASAVA_Build 7 76209227 1D TGGAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 29 1 14 14 T 13 12 275310 CASAVA_Build 7 76209580 5I GTAAGGGAAG -----/TAATA TAATGTAATG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TAATA 0 1 275311 CASAVA_Build 7 76210656 1D CTACTAAAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 20 9 9 T 9 8 275312 CASAVA_Build 7 76216534 2D ATATGTACAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 TA 9 8 275313 CASAVA_Build 7 76219599 5I TATCTTTTCT -----/TATAA TTTATTTAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TATAA 0 1 275314 CASAVA_Build 7 76220533 11I TTTGAACCAA -----------/ATACAGTATGG AGGTATGGAG 2798 het 2798 ref 36 28 6 2 ATACAGTATGG 0 1 275315 CASAVA_Build 7 76223800 1I AAGAGGGAAC -/T TTTCTTGCCT 3070 hom 62 het 23 0 20 3 T 3 4 275316 CASAVA_Build 7 76224158 4D TATAATGAGA TATT/---- TATTTATTTA 2912 hom 15 het 9 0 6 3 TATT 5 4 275317 CASAVA_Build 7 76227941 1D GATGTTCATA T/- TTTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 6 5 275318 CASAVA_Build 7 76253549 1D GAAAAAAAAA T/- AAAAAGAGTG 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 1 0 275319 CASAVA_Build 7 76255134 1D GAGAAACCTC T/- TTTTTTTTAA 1374 het 1374 ref 27 22 3 3 T 9 8 275320 CASAVA_Build 7 76258067 4D CATTCCTTTC CTGT/---- CTTTCAAAAA 3070 het 3070 ref 21 11 7 4 CTGT 1 0 275321 CASAVA_Build 7 76264660 1I CTGATATGTA -/T TTTTTTGTTG 2415 het 2181 hom 18 6 6 6 T 6 7 275322 CASAVA_Build 7 76271873 1D ACATAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1049 hom 23 5 12 6 T 13 12 275323 CASAVA_Build 7 76275870 1I ATCACAATGA -/T TTTTTTTTTT 1921 het 1921 ref 18 13 4 1 T 10 11 275324 CASAVA_Build 7 76282560 1D TTATTTTTTT C/- ATATCAGTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 1 0 275325 CASAVA_Build 7 76284588 1D GTGCAGTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 10 9 275326 CASAVA_Build 7 76290802 2D TACATTCACT TG/-- TGTGTGTGTG 1872 het 1872 ref 48 34 4 13 TG 6 5 275327 CASAVA_Build 7 76292460 4D CTGCTTTTTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 hom 69 het 32 0 24 10 TGTT 6 5 275328 CASAVA_Build 7 76314626 2D TTTCAGTCTC TG/-- TCTCCACTGA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TG 1 0 275329 CASAVA_Build 7 76319881 2D3M4I CCACAGAAAA TGAGT----/--AATAGCA GGTACCTATT 3070 het 3070 ref 27 13 12 4 N/A 0 0 275330 CASAVA_Build 7 76321294 1D TGATGACTGA T/- TTTTTTTTTA 2408 het 2408 ref 23 16 5 2 T 10 9 275331 CASAVA_Build 7 76328462 1D CTGCCATTAC T/- CTCTCCCTAT 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 1 0 275332 CASAVA_Build 7 76330842 29D GTCTATTCAT ATCAGCCTGCTGAAACATACAGCCAAGGG/----------------------------- AGAAAGCCCC 3070 het 3070 ref 19 13 12 2 ATCAGCCTGCTGAAACATACAGCCAAGGG 1 0 275333 CASAVA_Build 7 76333939 1I TGCTCTCCAA -/T TTAGCCCTAA 1361 het 1361 ref 43 34 3 6 T 2 3 275334 CASAVA_Build 7 76347314 4I TTCCTACTGC ----/GTTA GTTATTGTTT 3001 het 3001 ref 27 14 7 6 GTTA 1 2 275335 CASAVA_Build 7 76350165 1D AAAACATAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 9 8 275336 CASAVA_Build 7 76351359 1I CTTTTTATGC -/A AGAGGAAAAC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 1 2 275337 CASAVA_Build 7 76354375 2I CAGAATTTTG --/CA CAGAGTTCTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 CA 1 2 275338 CASAVA_Build 7 76357883 2D ATATCTATAT AA/-- GTGATAAACC 3070 het 3070 ref 22 10 7 7 A 2 0 275339 CASAVA_Build 7 76362043 1I AAATTTAAAA -/G GGAAGAATTC 3070 het 3070 hom 34 16 18 0 G 2 3 275340 CASAVA_Build 7 76370522 1I CAACCACATC -/A TAATAGCTAA 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 A 0 1 275341 CASAVA_Build 7 76379914 5D CTTTCCAACC TTTCT/----- AAATCTCAAG 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 TTTCT 1 0 275342 CASAVA_Build 7 76386016 1I ATTCTTCACA -/T TTTTGCTAGG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 4 5 275343 CASAVA_Build 7 76397448 1I TTTCTAAAAG -/A AAAAAATCTT 1910 het 1910 ref 22 18 4 0 A 6 7 275344 CASAVA_Build 7 76406944 1I TTCTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 10 11 275345 CASAVA_Build 7 76411383 1D CACTGAAGCA G/- TAAGTGCTCA 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 G 1 0 275346 CASAVA_Build 7 76448778 2I CACATGGAGC --/AG AGTTAAAGGC 3070 het 3070 hom 35 12 12 11 AG 1 2 275347 CASAVA_Build 7 76456997 1I GTAAAATATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 T 9 10 275348 CASAVA_Build 7 76465138 3I TATGTGGAGA ---/TGT TGGGGTGTGC 3070 het 3070 ref 62 17 12 33 TGT 0 1 275349 CASAVA_Build 7 76465168 2I AAGTGTGCAG --/GT GTGTGGAGGT 2083 het 2083 ref 51 13 10 28 GT 2 3 275350 CASAVA_Build 7 76465204 3D ATGTGCAGGT GTG/--- GGGTGTGTGG 457 het 457 ref 51 31 2 20 GTG 1 0 275351 CASAVA_Build 7 76469344 1D TGAAAGCCTC T/- TTTTTCCAAG 3070 het 3070 hom 26 13 11 5 T 6 5 275352 CASAVA_Build 7 76474112 1I TGCTCTTGAC -/G GGCACCCCCA 3070 hom 49 het 21 0 15 6 G 2 3 275353 CASAVA_Build 7 76501764 1D ATGGTACCAT A/- ATCCAAGTCA 3070 het 3070 ref 60 32 21 7 A 2 1 275354 CASAVA_Build 7 76505016 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 54 hom 14 1 11 2 A 11 12 275355 CASAVA_Build 7 76517316 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTCCAA 959 het 959 ref 18 5 3 10 CT 1 2 275356 CASAVA_Build 7 76521098 4I TCTCAATAAT ----/CAAA CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 CAAA 4 5 275357 CASAVA_Build 7 76534265 4I TCAGTTGGCT ----/GTAA GTGTTTGGGT 2927 het 2927 ref 26 13 6 7 GTAA 0 1 275358 CASAVA_Build 7 76543036 1I TTATCGACTC -/T CATCTTGATC 2907 het 2907 ref 21 11 6 4 T 0 1 275359 CASAVA_Build 7 76551767 1D AAGCCCATGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 T 10 9 275360 CASAVA_Build 7 76557693 2D CTGTCACCCC CT/-- TTCTTTGACT 1257 het 1257 ref 18 13 4 4 CT 1 0 275361 CASAVA_Build 7 76587874 2I GCAAGACCCG --/CC CCCCCCCGAC 1618 het 1618 ref 22 8 6 8 C 7 9 275362 CASAVA_Build 7 76590494 1I TTTTAGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 11 12 275363 CASAVA_Build 7 76602084 2I ACCCTGAACT --/AC ACAGTAAGTG 1333 het 1333 ref 49 39 3 7 AC 1 2 275364 CASAVA_Build 7 76602907 4I AACAACATTA ----/AGTG AGAACTTACT 1388 het 1388 ref 33 25 3 5 AGTG 0 1 275365 CASAVA_Build 7 76604316 1I CATTCATGAT -/A AAAAAACAAA 1863 het 1863 ref 42 34 4 4 A 6 7 275366 CASAVA_Build 7 76636551 1D CCTTGTCCCA T/- TTGCTAGACT 1893 het 1893 ref 31 23 4 4 T 3 2 275367 CASAVA_Build 7 76645872 1D AGTTAATACA G/- TTTTAATCAC 3070 het 3070 ref 50 34 8 8 G 1 0 275368 CASAVA_Build 7 76686594 7I TATACTTTGT -------/ATGTATG TATGTATGGT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 ATGTATG 0 1 275369 CASAVA_Build 7 76693197 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 A 11 10 275370 CASAVA_Build 7 76700768 1D AAATCAGCAG C/- CCCCCAACCT 3070 hom 41 het 17 0 13 4 C 6 5 275371 CASAVA_Build 7 76701161 1D TATTCTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 26 1 21 5 T 12 11 275372 CASAVA_Build 7 76701506 1I TTGTAAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2431 hom 33 9 15 9 T 13 14 275373 CASAVA_Build 7 76712060 1I TGACCTCCTT -/C CCCCTGGAAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 4 5 275374 CASAVA_Build 7 76714602 2D TTTGAAACTC AG/-- AAATACTCAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AG 1 0 275375 CASAVA_Build 7 76716854 4D TGAAGTTCGT TCTG/---- TCTGAAATTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TCTG 2 1 275376 CASAVA_Build 7 76728047 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 22 1 20 2 T 11 10 275377 CASAVA_Build 7 76732819 1D GACTACACAC A/- AAAAAACAGA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 7 6 275378 CASAVA_Build 7 76734779 2D AGACTTGATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 14 12 275379 CASAVA_Build 7 76742335 4I AAAAAAAAGA ----/AAAG AAAGCTATAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AAAG 1 2 275380 CASAVA_Build 7 76745100 1D CCTCTGGTTT A/- CTACCAGCAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 0 275381 CASAVA_Build 7 76783683 2D ACATCAAGGG TC/-- AGATGAAGTA 3070 het 3070 ref 48 21 16 12 TC 1 0 275382 CASAVA_Build 7 76787012 1I TCAGGTCATT -/A ACACTAAGTG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 1 2 275383 CASAVA_Build 7 76787279 5I GGTAGGTCTC -----/ATGTT AAGTGTTCTT 3070 het 3070 hom 55 23 27 5 ATGTT 0 1 275384 CASAVA_Build 7 76797040 1I TTCATGTCCC -/T ACAATGTACC 3070 het 3070 ref 47 19 17 11 T 0 1 275385 CASAVA_Build 7 76797313 3D TTTCCTCCCT AGG/--- AGAACAGAGA 3070 het 3070 ref 46 24 16 8 AGG 1 0 275386 CASAVA_Build 7 76811843 1I CCTGCTCTTG -/T TTACACTGCT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 2 3 275387 CASAVA_Build 7 76821931 1D GTCTAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 129 hom 51 2 20 29 T 15 14 275388 CASAVA_Build 7 76838685 3D ATCTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 24 1 17 6 T 21 18 275389 CASAVA_Build 7 76843097 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 20 0 13 7 A 15 14 275390 CASAVA_Build 7 76888679 4I ATGTCAGAGT ----/CTAA CTAAGTAGGG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 CTAA 1 2 275391 CASAVA_Build 7 76892437 2I TGTACATAGA --/TT TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 8 10 275392 CASAVA_Build 7 76894292 3I CCATTTGCTT ---/ATC AACAGTGCTG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ATC 0 1 275393 CASAVA_Build 7 76906093 2I GAGTGTGTGA --/GT GAGTGTGTGT 3070 het 279 hom 40 2 32 6 GT 0 1 275394 CASAVA_Build 7 76912106 7I GCACAAGATC -------/TAAAAAT TAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 TAAAAAT 1 2 275395 CASAVA_Build 7 76937425 2I AACTTGGAAA --/AT ACATGGCTCC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 AT 0 1 275396 CASAVA_Build 7 76947760 1I GCAATTCTCT -/G GCCTCAGCCT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 G 1 2 275397 CASAVA_Build 7 76971115 3I TGTTTGACAT ---/ATA ATGTTTGCTC 2542 het 2542 ref 32 21 6 5 ATA 0 1 275398 CASAVA_Build 7 76977842 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 615 hom 15 2 8 5 A 11 12 275399 CASAVA_Build 7 76989310 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1496 het 1496 ref 27 12 4 11 A 15 14 275400 CASAVA_Build 7 76993165 1D AATCGTAACT A/- GCTATTAACA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 1 0 275401 CASAVA_Build 7 77003134 5I GTAAAATAAC -----/TTCTA TTCTAGTTAC 3070 het 2572 hom 32 8 16 8 TTCTA 1 2 275402 CASAVA_Build 7 77009267 1D CCTAGGTTTT A/- ACTCCACACA 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 2 1 275403 CASAVA_Build 7 77010520 1I TGTCTTTCCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 8 9 275404 CASAVA_Build 7 77012427 3D AAATCAAGAT ATC/--- ATGTCATCGG 3070 het 3070 hom 49 20 27 2 ATC 1 0 275405 CASAVA_Build 7 77013404 1D AGGATGGTCT C/- CCCTTTTATT 3070 het 1910 hom 14 5 8 1 C 4 3 275406 CASAVA_Build 7 77021105 1I TTTGTTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 T 11 12 275407 CASAVA_Build 7 77021162 2D35M1D TCAAAATATC ATATGACTGTCCTTTCTTAGCATGTCAGTTTTACTTCT/--ATGACTGTCCTTTCTTAGCATGTCAGTTTTACTTC- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 30 12 4 N/A 0 0 275408 CASAVA_Build 7 77023303 12D AATCATAGGG TGTTTGTTTGTT/------------ TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 32 19 13 3 TGTT 6 3 275409 CASAVA_Build 7 77024232 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 13 8 T 10 9 275410 CASAVA_Build 7 77032000 18D TGTTGTCGTG TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 980 het 980 ref 23 14 7 10 T 30 12 275411 CASAVA_Build 7 77033959 2D CCTGGGCAAC AG/-- AGTGAGTCCC 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 AG 2 1 275412 CASAVA_Build 7 77038949 8D CTAATGATAT TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 3070 het 2255 hom 23 6 12 7 TTTA 6 4 275413 CASAVA_Build 7 77039795 3D CTTCATCCTT TTG/--- TTGTTCTACA 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 TTG 2 1 275414 CASAVA_Build 7 77042579 4D TCAACACACA CACG/---- CACGCACGCA 3070 het 3070 hom 37 11 19 8 CACG 4 3 275415 CASAVA_Build 7 77054639 1I TTGAAAGGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 9 10 275416 CASAVA_Build 7 77073819 2D CCAACCCCTT AA/-- AAATGAAATG 3070 het 3070 ref 40 26 10 6 A 5 3 275417 CASAVA_Build 7 77101434 2I GTTTGGTAAC --/AG AGTGAGACCC 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 AG 1 2 275418 CASAVA_Build 7 77129350 1D CCGCCAATAA T/- TTTTTTTTTT 3052 het 2700 hom 25 7 12 6 T 13 12 275419 CASAVA_Build 7 77131892 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2665 het 1903 hom 22 10 7 5 A 14 13 275420 CASAVA_Build 7 77139916 2I GGATGAATTG --/AA AAATAAGAGA 3070 het 3070 ref 52 22 23 7 A 3 5 275421 CASAVA_Build 7 77149586 1D TTGGCTTTGT C/- CCCACTCAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 C 4 3 275422 CASAVA_Build 7 77152557 2I TGGCCAGCTC --/AA GTTAGAAGGC 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 A 0 2 275423 CASAVA_Build 7 77156035 1D AGCCATTAAC A/- AAAAAAAAAA 1866 het 1866 ref 17 10 5 3 A 11 10 275424 CASAVA_Build 7 77168907 1D TGAATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1829 het 748 hom 17 3 7 7 T 16 15 275425 CASAVA_Build 7 77172245 2I AAAAAAAAGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2281 hom 32 8 13 11 TG 7 8 275426 CASAVA_Build 7 77174276 1D TTAAACTAGA T/- TTTTTTTTTT 1630 het 679 hom 26 9 5 12 T 19 18 275427 CASAVA_Build 7 77178576 3D TGCATATTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2226 het 968 hom 32 6 8 20 T 21 18 275428 CASAVA_Build 7 77179312 1D TAATTGTATG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 21 8 10 4 T 8 7 275429 CASAVA_Build 7 77180073 2I AAAATAAAAC --/TT AATGTGTAGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 0 2 275430 CASAVA_Build 7 77210716 2D AAGTTGGTTT TG/-- TTTTTTTTTT 2947 het 2947 ref 25 13 10 2 TG 1 0 275431 CASAVA_Build 7 77216150 4D CTCTATGCCC GTCT/---- GTCTGTCTGT 3070 het 3070 hom 39 12 18 10 GTCT 5 4 275432 CASAVA_Build 7 77218405 7D AATGTGGTGT TTTTTTG/------- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 6 TTTTTTG 3 2 275433 CASAVA_Build 7 77219669 3I TTCAGATCTT ---/ATC ATTCCTGTGA 3070 het 3070 hom 49 16 26 7 ATC 0 1 275434 CASAVA_Build 7 77222925 6D TCTCAAAAAC AAAACA/------ AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 4 AAAACA 2 1 275435 CASAVA_Build 7 77235843 3D AGGGGAACAA TAT/--- TATTATTAAC 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 TAT 3 2 275436 CASAVA_Build 7 77239080 1I TGATTCTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 9 10 275437 CASAVA_Build 7 77243310 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 7 13 A 10 11 275438 CASAVA_Build 7 77243504 2I TTTGCTCTAT --/TC TTTTGTGACA 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 TC 0 1 275439 CASAVA_Build 7 77252580 5D TCCTGTGTCC TTTTG/----- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 TTTTG 2 1 275440 CASAVA_Build 7 77257832 1I ATGAAATGTT -/A ACTAAGTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 1 2 275441 CASAVA_Build 7 77258108 1D AGATGATCCA C/- CCGCCTTGGC 2319 het 1784 hom 12 5 7 0 C 3 2 275442 CASAVA_Build 7 77260070 4D TTTGTTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 779 hom 33 6 12 16 T 14 10 275443 CASAVA_Build 7 77262768 1D ACCACTGTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2396 hom 22 9 8 5 A 10 9 275444 CASAVA_Build 7 77284858 1D TCAGTTACCT C/- CCACCAGGTC 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 C 3 2 275445 CASAVA_Build 7 77288380 2D TGGATGGCAG TT/-- TTTTTTTTTT 2643 het 2643 ref 23 12 9 2 T 12 10 275446 CASAVA_Build 7 77317255 2I TGTATTTCCT --/TC TCTTGTCTGA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 TC 1 2 275447 CASAVA_Build 7 77320652 1D AGCTCTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2912 hom 30 11 11 8 T 13 12 275448 CASAVA_Build 7 77338920 1D TTTGCCCCAG C/- CCTGCAAAGT 3070 het 3070 ref 49 25 20 6 C 3 2 275449 CASAVA_Build 7 77348774 1D GCTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1921 hom 32 9 12 11 T 12 11 275450 CASAVA_Build 7 77352153 8D CTTCGTCTCA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 2369 het 883 hom 12 2 6 7 AAAT 6 4 275451 CASAVA_Build 7 77397729 1I ATTTAAAATT -/C CCCCTCTTCT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 C 4 5 275452 CASAVA_Build 7 77402383 2D TCCCCCCCCC CA/-- CACACACACA 1783 het 927 hom 16 4 5 7 CA 7 6 275453 CASAVA_Build 7 77410366 3D TACTATTCTT TTC/--- TTTCTTTCTT 676 het 676 ref 24 14 3 7 TTC 1 0 275454 CASAVA_Build 7 77410761 4D GTGACCCAGC TTAG/---- TTAGGGAGTA 3070 het 3070 ref 26 15 7 5 TTAG 2 1 275455 CASAVA_Build 7 77431385 1I TGTCCCTATG -/A AAAAAATGTA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 A 6 7 275456 CASAVA_Build 7 77443139 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 28 het 27 1 24 2 A 9 10 275457 CASAVA_Build 7 77443219 1D TACTTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 265 hom 18 1 11 6 T 13 12 275458 CASAVA_Build 7 77448926 1I GTCTCAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 24 9 A 10 11 275459 CASAVA_Build 7 77449178 1D GTTTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 12 11 275460 CASAVA_Build 7 77449294 1I ACATGTTATG -/T TTAAAATGGT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 2 3 275461 CASAVA_Build 7 77453184 1I TTATTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 9 10 275462 CASAVA_Build 7 77467722 1D CATGCCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 20 3 11 6 T 22 21 275463 CASAVA_Build 7 77474091 1D TCTCAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 28 2 16 10 T 15 14 275464 CASAVA_Build 7 77492573 1I AGATACTACA -/C CCCCCTCAGC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 C 5 6 275465 CASAVA_Build 7 77500726 8D AGCTTGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 1633 hom 30 6 14 12 A 20 12 275466 CASAVA_Build 7 77516204 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2754 hom 21 het 9 0 8 2 A 8 9 275467 CASAVA_Build 7 77530489 10D GAAGGTATTT TTTTCTTTTC/---------- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 TTTTC 4 2 275468 CASAVA_Build 7 77533715 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2710 het 1529 hom 16 7 7 2 A 15 14 275469 CASAVA_Build 7 77572244 3I CTCCCACCTC ---/CTT ATCTCCCAGA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 CTT 0 1 275470 CASAVA_Build 7 77580381 28D GAGATGAGCT GGGAGGGGGACTGGGGATAGAACACGCA/---------------------------- GGGAGGGGGA 3070 het 3070 hom 27 11 12 11 GGGAGGGGGACTGGGGATAGAACACGCA 2 1 275471 CASAVA_Build 7 77582870 1I27M1D ATGAGAAGGA -TTGATTCACCTGGAAAATAAAAGAAATA/TTTGATTCACCTGGAAAATAAAAGAAAT- ACCTGAGTAC 3070 hom 96 het 31 0 33 5 N/A 0 0 275472 CASAVA_Build 7 77583612 1I CCAACTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1231 hom 35 3 27 5 A 12 13 275473 CASAVA_Build 7 77596589 1I ACATACTAAA -/T TTTTTTATGA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 6 7 275474 CASAVA_Build 7 77603003 1I TATGTGTTAA -/C ATGGGTAGTA 3070 hom 83 het 35 0 27 8 C 0 1 275475 CASAVA_Build 7 77605182 1D GCTAAGTGAT A/- ATATATGTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 2 1 275476 CASAVA_Build 7 77622189 2I CTAATCCATT --/CA GAGTCATAGG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CA 0 1 275477 CASAVA_Build 7 77629611 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 913 hom 7 het 3 0 3 0 A 17 16 275478 CASAVA_Build 7 77636732 30I TTCGGGCTTG ------------------------------/CATGTCTTCAGGCTTGGCAGCAGAACCATT CCTTTGTACT 3070 hom 123 het 39 0 41 6 CATGTCTTCAGGCTTGGCAGCAGAACCATT 0 1 275479 CASAVA_Build 7 77648004 1I CATGAGCAGG -/T AAACAGAGGC 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 0 1 275480 CASAVA_Build 7 77661003 2D CCGCTTCTTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 A 11 9 275481 CASAVA_Build 7 77665001 1I TGTAAAGCAG -/A AAAATCACTG 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 4 5 275482 CASAVA_Build 7 77674488 1I TAAATTATCC -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 T 6 7 275483 CASAVA_Build 7 77675946 2D ATGTATAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 481 hom 27 4 14 9 T 15 13 275484 CASAVA_Build 7 77678508 1I CCCATGGGGA -/G GGGATGGGAC 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 G 3 4 275485 CASAVA_Build 7 77680427 5D AGCAAGAGCA TTTGC/----- TTTGGGATTT 3070 het 3070 ref 50 27 21 3 TTTGC 1 0 275486 CASAVA_Build 7 77681913 1D TTCTTGTTTT G/- ACTAACCAGC 3070 het 3070 hom 49 22 26 1 G 1 0 275487 CASAVA_Build 7 77687890 1D AACGGAAGAT A/- AAACCAGCTT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 4 3 275488 CASAVA_Build 7 77699188 1I ACCAAGAGGG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 T 8 9 275489 CASAVA_Build 7 77701814 83D TAATATAATG AATATTTTTCATATTCATTATATTTCATATAATATAATGAATATATTTCATATTCATTATATTTCATATAATATAATGAATAT/----------------------------------------------------------------------------------- ATTTCATATT 3070 hom 99 het 34 0 34 5 AATATTTTTCATATTCATTATATTTCATATAATATAATGAATATATTTCATATTCATTATATTTCATATAATATAATGAATAT 1 0 275490 CASAVA_Build 7 77703004 1D TAATACTCTA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 99 het 34 0 33 1 T 8 7 275491 CASAVA_Build 7 77705788 2I AACCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 10 12 275492 CASAVA_Build 7 77706302 2D TCTATCCTGG AT/-- ATCTCTACAG 3070 hom 81 het 28 0 27 1 AT 2 1 275493 CASAVA_Build 7 77706801 4D TAAGGAACTC AAAT/---- AACTCAATAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAAT 1 0 275494 CASAVA_Build 7 77711312 2I CATGGTGGCT --/CA CACACCTGGA 3070 het 1901 hom 20 4 14 2 CA 2 3 275495 CASAVA_Build 7 77743897 4I ATTAACAGTC ----/AATT GAGTGAATAT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 AATT 0 1 275496 CASAVA_Build 7 77790316 1I TCTATGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1594 hom 29 5 19 5 A 11 12 275497 CASAVA_Build 7 77798585 1I TGTAACAAAC -/A CTGCACAGGT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 A 0 1 275498 CASAVA_Build 7 77801616 2D AAAGGGTAAC TA/-- AGATTTCAGA 3070 het 3070 ref 45 28 11 7 TA 1 0 275499 CASAVA_Build 7 77807537 1D TTACACTATA C/- CAAGAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 C 2 1 275500 CASAVA_Build 7 77833890 1D ATGGAAGATA T/- CCCCCATCTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 5 T 1 0 275501 CASAVA_Build 7 77837868 1I CCCAACTCAT -/A AAAAAAGTAC 3070 het 3070 hom 50 17 28 5 A 6 7 275502 CASAVA_Build 7 77839315 4I GTTTAAAAAG ----/GTAC TTGTATGTAT 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 GTAC 0 1 275503 CASAVA_Build 7 77840242 2I AATAACCTTA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 TG 4 5 275504 CASAVA_Build 7 77840801 11D GTCACTTACT CTTACTATTGG/----------- AGGGCTCCTA 3070 het 3070 ref 53 30 23 3 CTTACTATTGG 1 0 275505 CASAVA_Build 7 77843051 1D AAATTTTCTT G/- TAAAAGTTAT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 G 1 0 275506 CASAVA_Build 7 77843300 1D GAATATATTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 9 8 275507 CASAVA_Build 7 77844891 1I ACTACTCTGC -/A AAAAAATAAT 2452 het 2452 ref 16 6 6 4 A 6 7 275508 CASAVA_Build 7 77845084 2I CAAACTAAAC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 8 10 6 A 9 11 275509 CASAVA_Build 7 77849446 1D CAAATGTTCG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 T 8 7 275510 CASAVA_Build 7 77849607 4I CTTATTCAAA ----/AAAT AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 AAAT 0 1 275511 CASAVA_Build 7 77851333 1D TATTTGTGCT C/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 27 20 2 C 1 0 275512 CASAVA_Build 7 77853247 1I CAGAGCAAAA -/G CTTCCCCCCC 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 G 0 1 275513 CASAVA_Build 7 77856968 1D ATTTCAGGTA T/- TTTCCAAAGT 3070 het 3070 hom 33 10 15 9 T 4 3 275514 CASAVA_Build 7 77858637 1I ACTTTAAAAA -/T TTCTCTGGCA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 2 3 275515 CASAVA_Build 7 77867611 1D ACTTCAGTCA T/- TTTTAAGTAC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 5 4 275516 CASAVA_Build 7 77868321 2D CATTCCTTTG AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 10 8 275517 CASAVA_Build 7 77873179 1I GATAACAAAT -/G TACTATAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 0 1 275518 CASAVA_Build 7 77874908 4D CTTCTTCTAC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 6 T 15 11 275519 CASAVA_Build 7 77875109 23D AGGGCTGGTT TTCCTCTAGGATGCCAGAGATCA/----------------------- TTCCTCTAGG 3070 het 3070 ref 39 24 17 3 TTCCTCTAGGATGCCAGAGATCA 2 1 275520 CASAVA_Build 7 77886653 4I GCACCGAGCT ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 54 27 16 11 TG 7 9 275521 CASAVA_Build 7 77887805 1I TGAAATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 11 12 T 13 14 275522 CASAVA_Build 7 77896534 4I TTCTCTGGTC ----/CTTG TTTGGTGCTA 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 CTTG 0 1 275523 CASAVA_Build 7 77905527 1I TCATAAGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 899 hom 44 3 31 10 A 12 13 275524 CASAVA_Build 7 77908908 2I AATTTTAAGG --/AA AAAAAAAAAA 1692 het 620 hom 40 5 10 25 A 10 12 275525 CASAVA_Build 7 77910361 4I TGACAAATAC ----/TCTT TCTATCTAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TCTT 0 1 275526 CASAVA_Build 7 77911316 1I AATGGCCCAC -/T TTAGTATCGC 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 2 3 275527 CASAVA_Build 7 77912007 12D TCAATTTATA TGTATGTGTTTG/------------ TGTATGTGTA 2553 het 2553 ref 20 14 6 2 TGTATGTGTTTG 1 0 275528 CASAVA_Build 7 77913297 1D49M1D TTTTGTGTTT CTTTTGTCTTGTAATTTCGTCTTTAAAATCTAGTAGGTACTTTTTAAAGAT/-TTTTGTCTTGTAATTTCGTCTTTAAAATCTAGTAGGTACTTTTTAAAGA- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 24 12 6 N/A 0 0 275529 CASAVA_Build 7 77913418 3D CTTATTTTTT ATG/--- ATGGTACTTT 3070 het 3070 hom 23 9 10 7 ATG 2 1 275530 CASAVA_Build 7 77913969 1I AGGTTCATTA -/T ATACTCACAT 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 T 0 1 275531 CASAVA_Build 7 77914632 1D CCAGATGGCT A/- AAAAAAAAAA 1888 het 1888 ref 39 21 6 12 A 13 12 275532 CASAVA_Build 7 77917916 1I ACTTTTTTTT -/C CTTGCACTTT 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 C 1 2 275533 CASAVA_Build 7 77922443 2D GTATATGGAA CT/-- CTCTGCACTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 CT 3 2 275534 CASAVA_Build 7 77925893 1D TTTTGTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 13 12 275535 CASAVA_Build 7 77931987 1I AAGAACCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 T 15 16 275536 CASAVA_Build 7 77940940 1D CACAGACACA C/- CTGACATACA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 C 2 1 275537 CASAVA_Build 7 77944136 3D CTTCACTAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2879 hom 31 7 21 4 A 13 10 275538 CASAVA_Build 7 77944375 3I GAGAGAACTT ---/GTC TATATATTCA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 GTC 0 1 275539 CASAVA_Build 7 77945183 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTATT 2969 het 2969 ref 20 11 8 1 T 7 8 275540 CASAVA_Build 7 77948973 4I AAAAAAAAAT ----/AGAG AGAGAACCTT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 AG 2 4 275541 CASAVA_Build 7 77951671 1I GATTATGTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 8 9 275542 CASAVA_Build 7 77951938 1I CTATTCTGAA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 6 7 275543 CASAVA_Build 7 77952191 6D ATCTTAAACA ATTTCT/------ ATTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 41 22 18 5 ATTTCT 2 1 275544 CASAVA_Build 7 77960883 1I AGGTACAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 T 9 10 275545 CASAVA_Build 7 77966902 1I AATCACACAC -/A AAAAAAGGTT 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 A 6 7 275546 CASAVA_Build 7 77969836 5I ATGATTATTC -----/TATTT TATTATTTGT 3070 het 2960 hom 22 8 12 2 TATTT 0 1 275547 CASAVA_Build 7 77971213 2I GTATTTCTTC --/AT ATAGCAGTGT 3070 het 3070 hom 34 10 21 4 AT 1 2 275548 CASAVA_Build 7 77976142 1D AAAAATAGTC T/- TTTTTTTTTT 2815 het 2815 ref 25 9 8 8 T 15 14 275549 CASAVA_Build 7 77980770 1I CCAGGGACAC -/A AGGTGAAAAT 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 A 1 2 275550 CASAVA_Build 7 77988040 4I ATATGTGGTA ----/CAAT CAATGATCAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 CAAT 1 2 275551 CASAVA_Build 7 77992023 4D CACAGCTTTC AGTA/---- AGTATGTTGC 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 AGTA 2 1 275552 CASAVA_Build 7 77992204 1I CACTTCAGTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 8 9 275553 CASAVA_Build 7 77992677 1D TGACTCCCTG A/- ATATAAGTGT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 2 1 275554 CASAVA_Build 7 77995249 1D GTCCTTTTTT C/- CCCGTTTTGG 3070 het 3070 ref 53 27 16 10 C 4 3 275555 CASAVA_Build 7 78002842 1D ATCCAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 11 10 275556 CASAVA_Build 7 78005069 1I TCTGCTGATT -/A TTTATTTTGC 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 A 0 1 275557 CASAVA_Build 7 78025229 1D ATTGGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 T 12 11 275558 CASAVA_Build 7 78042398 4D TAAGGATATT AAAC/---- AAACAAACAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 8 AAAC 3 2 275559 CASAVA_Build 7 78043390 7I CTGTAAATTC -------/AGAAGGA AGGGCTTTAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 AGAAGGA 0 1 275560 CASAVA_Build 7 78059594 1D TAGTAGACTA T/- TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 31 13 4 15 T 13 12 275561 CASAVA_Build 7 78065124 2D TTTTTTTTTT TC/-- CCCATAGAGT 2966 het 2966 ref 28 16 9 4 TC 1 0 275562 CASAVA_Build 7 78069686 4I GTGCTGGGAT ----/TGTA TACAGGCATG 2819 het 1283 hom 16 4 9 3 TGTA 0 1 275563 CASAVA_Build 7 78074087 4D CTCCCACAAT TTTC/---- TTTATGTTTT 3070 het 3070 hom 37 18 17 4 TTTC 1 0 275564 CASAVA_Build 7 78075721 2D TATGTGTGTG TA/-- TGTATATATA 3070 het 778 hom 39 3 31 5 TA 1 0 275565 CASAVA_Build 7 78081407 1I TGAATGTGGG -/C CTTTCAGGGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 C 1 2 275566 CASAVA_Build 7 78083685 1I ATAGAACTTT -/G GGGGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 G 4 5 275567 CASAVA_Build 7 78090577 5D AGCATAATAC ATTAT/----- ATTAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 ATTAT 1 0 275568 CASAVA_Build 7 78091968 1D TGTAGGTGAT G/- GGGATGATCT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 G 4 3 275569 CASAVA_Build 7 78095542 10I ATACATGCAA ----------/AGAAGTATGC AGAAATATAT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 AGAAGTATGC 0 1 275570 CASAVA_Build 7 78095556 5D ATATATAGAA GCCAG/----- ATATATAAGG 567 het 567 ref 39 12 2 26 GCCAG 1 0 275571 CASAVA_Build 7 78096976 2D TGTCTTCTTG TC/-- TCTCTCTCTT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 TC 5 4 275572 CASAVA_Build 7 78100042 3D TTACACACTG TTA/--- TTAGAGTGTA 3070 het 3070 hom 31 16 13 2 TTA 2 1 275573 CASAVA_Build 7 78100531 1I GGACAGGAGC -/A AAAAAGATAA 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 5 6 275574 CASAVA_Build 7 78104684 1D ATAATATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 16 10 A 11 10 275575 CASAVA_Build 7 78104932 4D ACTCATAAAG CTCT/---- CTGTTATAAC 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 CT 3 1 275576 CASAVA_Build 7 78108918 1D GGTGTGGCCA G/- CATTAAGTGT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 G 1 0 275577 CASAVA_Build 7 78117120 1I GCATGAAAGT -/G GCTGAGGATT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 G 1 2 275578 CASAVA_Build 7 78117920 1D ATGAAAATAT A/- ATCATTACCA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 2 1 275579 CASAVA_Build 7 78118569 4I TCTGCCTTTG ----/TGCT TGCTTGTCTT 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 TGCT 1 2 275580 CASAVA_Build 7 78119222 1I TAAACACCAT -/C TGAAACATCA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 0 1 275581 CASAVA_Build 7 78124242 1D AACCCAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1642 hom 28 13 11 5 A 15 14 275582 CASAVA_Build 7 78124878 3D TGGCGACTTT AAG/--- AAGATCAGTG 3070 het 3070 ref 54 27 18 10 AAG 2 1 275583 CASAVA_Build 7 78125542 1I AGTGGTTTTT -/A AAAAAACGAC 3070 het 3070 hom 42 12 22 8 A 6 7 275584 CASAVA_Build 7 78127655 4I ACTTACTTGA ----/ACTG ACTATTTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 ACTG 0 1 275585 CASAVA_Build 7 78128495 5I TAGTCCTCAC -----/TTCTT TTCTTGCTAT 3070 het 3070 hom 39 10 27 2 TTCTT 1 2 275586 CASAVA_Build 7 78131976 5D AGATTCTCTT TATTC/----- TATTCTAACA 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 TATTC 2 1 275587 CASAVA_Build 7 78146798 2D CCTAATAGTG AC/-- ACATATGTAC 3070 het 3070 hom 44 18 22 5 AC 2 1 275588 CASAVA_Build 7 78181252 1D TGCCACATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 103 het 37 0 31 6 T 10 9 275589 CASAVA_Build 7 78181342 2I GAAAGAAAGA --/GG GGGGGGAAGA 3070 hom 82 het 34 0 20 14 G 6 8 275590 CASAVA_Build 7 78183018 1I AAGATAGTTT -/A AAAAATTCTC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 5 6 275591 CASAVA_Build 7 78205328 2I TGGTACCATA --/AC AGTTTATTAT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 AC 0 1 275592 CASAVA_Build 7 78215411 1I TTGAGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 749 hom 32 3 22 7 A 14 15 275593 CASAVA_Build 7 78215948 1I62M1D ACTCTGATGT -AAAAAAGATATCGATAGGACATAGTCTGGGTTCTGAATATAAAATGAAAGATTTCAAATACAT/AAAAAAAGATATCGATAGGACATAGTCTGGGTTCTGAATATAAAATGAAAGATATCAAATACA- TTTTTTTCTT 3070 hom 169 het 39 0 57 1 N/A 0 0 275594 CASAVA_Build 7 78224558 6D TCTCCCTCCT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 46 het 24 0 15 9 TC 11 8 275595 CASAVA_Build 7 78228719 1I TAGATTCTGA -/T TTTTTTTTTT 1228 het 1228 ref 30 7 7 17 T 17 18 275596 CASAVA_Build 7 78230984 1D TACAAAAAAA T/- AAGACATATA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 0 275597 CASAVA_Build 7 78234658 4D CTGAGATCTT AGAA/---- AGAGTGCCAC 2272 het 2272 ref 22 11 5 7 AGAA 1 0 275598 CASAVA_Build 7 78236765 1I CCCATTCAAG -/C CGAGATTTAA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 1 2 275599 CASAVA_Build 7 78262895 1I ACAGAAATAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 9 275600 CASAVA_Build 7 78268489 1D21M1I AGAAACAAGG AAACTGCAAATTGCCTGATTTG-/-AACTGCAAATTGCCTGATTTGA AATACAGACC 3070 hom 144 het 43 0 49 4 N/A 0 0 275601 CASAVA_Build 7 78268865 1I ATAAAAAGGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 266 hom 65 1 57 7 T 8 9 275602 CASAVA_Build 7 78291875 1D GATGGGGTTG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 8 7 275603 CASAVA_Build 7 78294705 1I TAATTTTGAA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 55 het 29 0 26 3 T 6 7 275604 CASAVA_Build 7 78298327 1I CTTATCAACA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 88 het 35 0 30 5 T 6 7 275605 CASAVA_Build 7 78304150 6D AGAAATTATA CTCAGC/------ CTCAGCTGTT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 CTCAGC 2 1 275606 CASAVA_Build 7 78308088 1I CTGAATCTCC -/T TTTGTTTTTT 3070 het 822 hom 38 2 31 5 T 3 4 275607 CASAVA_Build 7 78310123 1D TAAGTATCAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 275608 CASAVA_Build 7 78318502 1D CTCATTGTTA G/- TCCATTTAAC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 1 0 275609 CASAVA_Build 7 78322111 1I TGCATTACTC -/T TTTTATTTTT 3070 het 386 hom 28 1 23 4 T 4 5 275610 CASAVA_Build 7 78326947 1I TTTCAACTTT -/G GTTAATCTGA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 G 1 2 275611 CASAVA_Build 7 78348041 1D CAAGCTGGAT A/- AAAAATTAAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 6 5 275612 CASAVA_Build 7 78368925 1D TGAAATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 12 11 275613 CASAVA_Build 7 78372207 1D CTTTCTATGA T/- TTTTCTTCCT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 5 4 275614 CASAVA_Build 7 78378917 2D ATTATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TA 9 8 275615 CASAVA_Build 7 78429762 1I AATGCTTATG -/T TTTTTTTTTT 1625 het 1625 ref 38 22 5 11 T 13 14 275616 CASAVA_Build 7 78430091 2I TCAAATTAAA --/CT CTCTTTTAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 CT 2 3 275617 CASAVA_Build 7 78443966 1D AAAAAACTAC A/- AAAAAAAAAC 2730 het 2730 ref 25 14 9 2 A 10 9 275618 CASAVA_Build 7 78450007 5D AAGGGAAGGG AAGGT/----- ACTACTACAC 3070 het 3070 ref 42 20 20 5 AAGGT 1 0 275619 CASAVA_Build 7 78464220 1D TGCTTAAAAA G/- GTTGTAACAA 3070 het 3070 ref 48 24 21 4 G 2 1 275620 CASAVA_Build 7 78480041 17I TACCATAGAT -----------------/TAGGTGGCTTCAGCAAC TAATCTGTAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TAGGTGGCTTCAGCAAC 0 1 275621 CASAVA_Build 7 78480471 1D TATAGTTTAC A/- AATTAGCTAT 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 A 3 2 275622 CASAVA_Build 7 78482605 1I ATTTTTTTTC -/T AACCTGCTGA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 0 1 275623 CASAVA_Build 7 78489100 1I GCGTCTTTGT -/C CCCAACCAAA 2206 het 1469 hom 16 4 8 4 C 3 4 275624 CASAVA_Build 7 78490431 2I AGTTTTGTTC --/AA AATATACAAA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 2 4 275625 CASAVA_Build 7 78492096 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 A 10 9 275626 CASAVA_Build 7 78492427 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 41 21 19 1 A 7 8 275627 CASAVA_Build 7 78492907 1D AGAGGAAGGA C/- CATGGGAAGA 3070 het 3070 ref 47 29 16 2 C 2 1 275628 CASAVA_Build 7 78494135 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 A 9 10 275629 CASAVA_Build 7 78500748 1D AAACTTTAAT C/- TATACCTTAT 3070 het 3070 ref 47 22 14 11 C 1 0 275630 CASAVA_Build 7 78503914 1I TTTTCAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 9 10 275631 CASAVA_Build 7 78518153 1D ACTCACATCT A/- AAGACTTGTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 3 2 275632 CASAVA_Build 7 78522538 1I AGGGCATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 11 12 275633 CASAVA_Build 7 78536796 2I GTCTTGACTC --/TT TATCCAATTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 3 275634 CASAVA_Build 7 78538879 2D CTTCCTGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 16 14 275635 CASAVA_Build 7 78545550 1D CCATAGGTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 35 0 30 6 T 10 9 275636 CASAVA_Build 7 78550556 2D TATGATGTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 37 1 26 12 T 16 14 275637 CASAVA_Build 7 78558247 1I TTTAAGAGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 628 hom 45 2 33 10 T 9 10 275638 CASAVA_Build 7 78571119 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTATA 2515 hom 15 het 6 0 6 0 T 8 7 275639 CASAVA_Build 7 78602480 1I AAACTGTAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 8 9 275640 CASAVA_Build 7 78608422 1D CTCTTGACAG T/- TTTTCAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 16 10 T 5 4 275641 CASAVA_Build 7 78617945 1D CATATCAGGT G/- GGCCATAATT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 G 3 2 275642 CASAVA_Build 7 78618849 1D AAATACCCCC T/- GGACATTGAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 T 1 0 275643 CASAVA_Build 7 78619155 1I TAAAGTCCAG -/A AAATTATGGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 3 4 275644 CASAVA_Build 7 78622513 12I GAATAATCAA ------------/TTTCATATGATC TTTCACTTAT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 TTTCATATGATC 0 1 275645 CASAVA_Build 7 78634418 1I ATATAATTTT -/G GTGGGGGTTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 1 2 275646 CASAVA_Build 7 78636925 1D TCCATGTGTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 8 275647 CASAVA_Build 7 78644137 1I AAATAGTTGA -/T TCTGATCCAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 1 2 275648 CASAVA_Build 7 78644540 1D CTTCGTGTTT A/- AAAACACTAT 3070 het 3070 ref 44 20 18 7 A 5 4 275649 CASAVA_Build 7 78652166 1I ATAAAAAAAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 7 8 275650 CASAVA_Build 7 78652769 1D AATTTGGTCA T/- TTTTTTTTTT 2073 het 1709 hom 42 10 8 25 T 19 18 275651 CASAVA_Build 7 78653542 2I CTATATATAT --/AC AAAGTTTAAT 1675 het 1675 ref 12 5 5 2 AC 0 1 275652 CASAVA_Build 7 78663474 4I GTCAATTTAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 AAAT 2 3 275653 CASAVA_Build 7 78663550 1D ACAAATATTC T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 T 8 7 275654 CASAVA_Build 7 78665983 1I TACTGAAAAT -/A AAAAAAAATT 2560 het 1310 hom 14 3 6 5 A 8 9 275655 CASAVA_Build 7 78674776 1I AAGATCTCAA -/C ATCAAAAACT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 C 0 1 275656 CASAVA_Build 7 78678719 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2941 het 2941 ref 26 13 10 3 T 11 10 275657 CASAVA_Build 7 78682440 2I ATTAAAACGA --/AG AGTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 AG 1 2 275658 CASAVA_Build 7 78708045 1D CACAACTCTC T/- TTTTTCCAAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 6 5 275659 CASAVA_Build 7 78718697 1D GAGATTTCTC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 113 het 44 0 38 7 A 9 8 275660 CASAVA_Build 7 78721563 1I CCCCATTTTG -/T TGTTTGTCTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 1 2 275661 CASAVA_Build 7 78733268 1I AAAATAATGA -/T TTTTTTCTGC 2386 het 2386 ref 27 18 7 2 T 6 7 275662 CASAVA_Build 7 78737639 1D ATTACATATT C/- ACCTTGTTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 1 0 275663 CASAVA_Build 7 78737995 1D GTCTTAGTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 169 hom 38 3 16 21 T 9 8 275664 CASAVA_Build 7 78739975 4I AAGTTTAAAT ----/AAAG ATAGTATTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAAG 0 1 275665 CASAVA_Build 7 78740489 1I ATGGTAGGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 411 hom 36 1 31 4 A 9 10 275666 CASAVA_Build 7 78740909 3I GGGTGTTCGA ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 100 het 40 0 32 8 TTG 5 6 275667 CASAVA_Build 7 78741838 1I TATTATATAT -/A TTTTTTTCAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 0 1 275668 CASAVA_Build 7 78748789 1I AAGTTTAGAA -/G GAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 49 27 16 6 G 1 2 275669 CASAVA_Build 7 78750158 4I TTTGATATAT ----/AACA AACACTTTAC 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 AACA 1 2 275670 CASAVA_Build 7 78753851 4I GCTCAGAAAC ----/AGAT AGCCCAAAAT 3070 hom 165 het 61 0 55 6 AGAT 0 1 275671 CASAVA_Build 7 78755153 1D AATTTTAATC T/- TTTTTCTGAT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 6 5 275672 CASAVA_Build 7 78757126 1D TTAGAATTGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 2240 hom 27 7 17 3 A 9 8 275673 CASAVA_Build 7 78757651 1I TAATTTTAAA -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 27 het 23 0 10 13 T 7 8 275674 CASAVA_Build 7 78764260 3I AATATGTACA ---/ATT ATTATGTGTC 3070 hom 73 het 34 0 28 6 ATT 1 2 275675 CASAVA_Build 7 78769836 1D TAAATATTGC T/- TTTTCTCAGT 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 T 5 4 275676 CASAVA_Build 7 78770555 1D CCATTGAAAT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 38 0 29 10 A 9 8 275677 CASAVA_Build 7 78771680 1I TAGATACTCT -/G GGTGATGGGA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 G 2 3 275678 CASAVA_Build 7 78775633 1I CTCTTGGAGT -/G TTTCCCAGGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 0 1 275679 CASAVA_Build 7 78778201 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 66 het 29 0 23 9 CA 9 8 275680 CASAVA_Build 7 78785101 1D TTGTTTACTT A/- ACTGGAATGT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 2 1 275681 CASAVA_Build 7 78787678 1I ATTTCTCCAA -/T TTTGCCCTTC 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 3 4 275682 CASAVA_Build 7 78788722 2I ATCCAACCAC --/AT GTTAACATTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AT 0 1 275683 CASAVA_Build 7 78791411 8D TGTAAAGATC TTTTTCAA/-------- TTTTTCAAAT 3070 hom 90 het 33 0 30 4 TTTTTCAA 2 1 275684 CASAVA_Build 7 78791681 12D37M8D CTATAACCAT ATATATATAACCATATATATATGGTTATAGATAGATACGTTGTGTGTGTATATATAC/------------ATATATATATGGTTATAGATAGATACGTTGTGTGTGT-------- ATATATATAC 461 het 461 ref 12 6 3 6 N/A 0 0 275685 CASAVA_Build 7 78793913 1D CAGTGATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 40 1 35 4 T 13 12 275686 CASAVA_Build 7 78797917 1I TTAGCACTCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 25 7 15 3 T 8 9 275687 CASAVA_Build 7 78799199 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 11 10 275688 CASAVA_Build 7 78805334 1I TTTAAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 A 9 10 275689 CASAVA_Build 7 78809992 4I TTTATCTTAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 32 16 16 0 TTTA 3 4 275690 CASAVA_Build 7 78810801 2D TATTTTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1295 hom 18 4 10 4 A 12 10 275691 CASAVA_Build 7 78814714 1D TCTTAAGCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 10 9 275692 CASAVA_Build 7 78822601 4D ACAAACAAAA AAAC/---- AAACAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 AAAC 2 1 275693 CASAVA_Build 7 78823579 1D CGAATCTCTC A/- GCCCCCACAA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 A 1 0 275694 CASAVA_Build 7 78830481 1D TAGGTATACA G/- TTTAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 20 19 5 G 1 0 275695 CASAVA_Build 7 78830603 4D TTTGATTTAA AGAG/---- AGAGACATAC 3070 het 3067 hom 28 7 15 9 AG 4 2 275696 CASAVA_Build 7 78832171 1D AAAAAAAAAA T/- ACTTTTGCTC 3070 het 4 hom 28 1 25 2 T 1 0 275697 CASAVA_Build 7 78832661 1D ATGTTCACAC A/- AAAAAACTGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 6 275698 CASAVA_Build 7 78834641 1D AATAGTGAGA T/- AGTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 T 1 0 275699 CASAVA_Build 7 78837096 1D AATAAAGATG A/- AAAAACATCA 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 A 6 5 275700 CASAVA_Build 7 78837899 2I CCATTAGTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 10 12 275701 CASAVA_Build 7 78842842 6I ACACATTAGC ------/CCATTT CCATTTGGTC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 CCATTT 1 2 275702 CASAVA_Build 7 78848398 3I2M2I GCTCAGCTCA ---GA--/ATTGATG TTAAACTGTA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 N/A 0 0 275703 CASAVA_Build 7 78851369 4I ATATATGAAG ----/ATTA ATTACAGATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATTA 1 2 275704 CASAVA_Build 7 78851719 2I GTCAAATAAC --/TG TTAGATCATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TG 0 1 275705 CASAVA_Build 7 78852843 1D GTACTTTTAT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 7 275706 CASAVA_Build 7 78854265 2I ACACACACAC --/AT GTTATATATA 3070 het 366 hom 37 1 32 4 AT 0 1 275707 CASAVA_Build 7 78864144 1I TATATTAAGT -/G GAACACCTTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 1 2 275708 CASAVA_Build 7 78876495 4D TTTCAGAGAA TGTC/---- AGTAATCAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 TGTC 1 0 275709 CASAVA_Build 7 78886136 3D CACACACACA CAC/--- ATTTGTCAGA 1714 het 1714 ref 14 5 4 6 CAC 1 0 275710 CASAVA_Build 7 78887146 1D GTAGCATGGG A/- AATACATTAT 3070 het 3070 hom 42 21 20 2 A 3 2 275711 CASAVA_Build 7 78888556 1I CATTGTGTTA -/G TTGGTCTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 G 0 1 275712 CASAVA_Build 7 78890477 3I CATCATCAAT ---/AAA AAAAACTATA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 5 8 275713 CASAVA_Build 7 78890622 18D AAATCATCTG ATTTCAAAGTTCTCTTTT/------------------ CATTTAATAT 3070 het 3070 ref 24 13 12 1 ATTTCAAAGTTCTCTTTT 1 0 275714 CASAVA_Build 7 78891513 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2878 het 2878 ref 33 13 11 9 T 11 12 275715 CASAVA_Build 7 78892832 19D TAAGGGTTTT ATATATATATATATATATA/------------------- TGTATATATA 3070 het 686 hom 16 2 11 4 ATATATATATATATATATA 1 0 275716 CASAVA_Build 7 78893587 3D TTCCTTTCTC CTT/--- CTCCTACTTG 3070 het 3070 ref 28 16 9 5 CTT 1 0 275717 CASAVA_Build 7 78902873 1I AGGTACCTAT -/A AAAAAGTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 5 6 275718 CASAVA_Build 7 78924844 1D ATTGCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 24 1 19 4 T 12 11 275719 CASAVA_Build 7 78926283 4I TTTCATAGTT ----/TGTC TGTGGTCATT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 TGTC 0 1 275720 CASAVA_Build 7 78934493 2D TGCATATAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 AT 6 5 275721 CASAVA_Build 7 78936931 2D TAATTGAATT CA/-- CACAGCGTTT 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 CA 3 2 275722 CASAVA_Build 7 78937542 1D GACTCTAAAG C/- CACCATTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 C 2 1 275723 CASAVA_Build 7 78950024 1I AGATAAGTAC -/A AAAAAAATCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 8 275724 CASAVA_Build 7 78952589 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 21 0 19 4 A 10 9 275725 CASAVA_Build 7 78952746 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1633 het 333 hom 7 1 4 2 T 12 11 275726 CASAVA_Build 7 78954328 1I AGGATAAAAA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 1 2 275727 CASAVA_Build 7 78956492 2D AATCAAGGAC AG/-- ATCCTTGAAG 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 AG 1 0 275728 CASAVA_Build 7 78960855 1D CTTCCTTCAT C/- CCCCCCCCTT 3070 het 36 hom 26 1 15 10 C 9 8 275729 CASAVA_Build 7 78962009 1D AAAAACTGTT A/- AAAAAAAAAA 2654 het 2654 ref 20 8 6 6 A 12 11 275730 CASAVA_Build 7 78964947 2D CTCCTACACT TC/-- TCAGCCTCTA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 TC 2 1 275731 CASAVA_Build 7 78991899 1I ATTCTCTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 8 9 275732 CASAVA_Build 7 78993899 7D AGTTTGCTGA GAATGAT/------- GTTTTCCAGC 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 GAATGAT 1 0 275733 CASAVA_Build 7 79002259 1I GTCATATATA -/T TATTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 1 2 275734 CASAVA_Build 7 79002673 1I AAAACTAATG -/A AAAATAGAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 4 5 275735 CASAVA_Build 7 79004412 1I TTACAATGGC -/A AATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 A 2 3 275736 CASAVA_Build 7 79017483 1D ATATGGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2462 hom 26 6 11 10 T 11 10 275737 CASAVA_Build 7 79038054 1I ATTCTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 T 11 12 275738 CASAVA_Build 7 79060110 1D TTTTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 A 11 10 275739 CASAVA_Build 7 79070852 1I TTGCTATTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 9 10 275740 CASAVA_Build 7 79071054 1I TTTCTGATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 38 0 29 9 T 9 10 275741 CASAVA_Build 7 79071589 1D ATTAAACAAC A/- CACTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 1 0 275742 CASAVA_Build 7 79076065 1I TTAATGGCCA -/C CTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 C 1 2 275743 CASAVA_Build 7 79079616 3I GTCTACTTAT ---/ACA ACAAGAATTC 3070 het 3070 ref 54 29 20 5 ACA 1 2 275744 CASAVA_Build 7 79080305 1I ACACCCAAAA -/G TATGATTCAA 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 G 0 1 275745 CASAVA_Build 7 79082043 1D TATCAACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 11 10 275746 CASAVA_Build 7 79087458 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTATTT 2022 het 2022 ref 21 12 6 3 T 7 6 275747 CASAVA_Build 7 79088245 2I GTGAATGACA --/CT CTCTCAACAC 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 CT 2 3 275748 CASAVA_Build 7 79091554 3D9M1D ATGACTATAT ATAATATTATATA/---ATATAATAT- TATATATATA 1770 het 651 hom 9 2 5 3 N/A 0 0 275749 CASAVA_Build 7 79096299 1D CTTAACCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 A 11 10 275750 CASAVA_Build 7 79097639 2I ACTTCTTTCA --/GT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 GT 0 1 275751 CASAVA_Build 7 79099184 1D TTATTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 12 11 275752 CASAVA_Build 7 79100377 1D CAATTATCTC T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 T 8 7 275753 CASAVA_Build 7 79103478 1D TAACACACTC T/- TTTGTGTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 T 4 3 275754 CASAVA_Build 7 79105562 3D TAAAGCTCTA TTT/--- TATGTTTGCT 3070 het 3070 hom 35 16 19 0 T 4 1 275755 CASAVA_Build 7 79106366 1I TGTAAGACAA -/T TACCCCAATT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 T 1 2 275756 CASAVA_Build 7 79106651 1D31M1D TAAATAGATA TTAGTTATCTTTACTATTATTAAAATTATGACA/-TAGTTATCTTTACTATTATTAAAATTATGAC- ATTTTCTAAT 3070 het 3070 ref 35 23 17 5 N/A 0 0 275757 CASAVA_Build 7 79110395 1I GCCCAGCAAA -/T TTTTCTATTT 3070 hom 32 het 12 0 9 3 T 4 5 275758 CASAVA_Build 7 79133843 4D CTGGCTCCAT TGAC/---- TGGCTGGAGT 3070 het 3070 ref 34 21 10 4 TGAC 1 0 275759 CASAVA_Build 7 79143785 1I GACAATAGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 9 10 275760 CASAVA_Build 7 79149661 1I TTCTGTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 13 12 T 10 11 275761 CASAVA_Build 7 79159822 4D TGTCATGGGT CAGA/---- CAATTAGGTA 3070 hom 108 het 43 0 34 13 CAGA 1 0 275762 CASAVA_Build 7 79162788 1D AATTTTCTAA T/- TTTTGTCAGT 3070 hom 99 het 42 0 34 9 T 5 4 275763 CASAVA_Build 7 79166601 4D TTACTTTTAA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 2581 hom 27 10 11 6 TTTC 5 4 275764 CASAVA_Build 7 79166951 1D CAAAGTGTTG A/- AGAGATTACA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 2 1 275765 CASAVA_Build 7 79168166 2D ATACATTTTC AT/-- AGTCATTTCA 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 AT 1 0 275766 CASAVA_Build 7 79168458 2I ATGATTTATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TA 5 6 275767 CASAVA_Build 7 79172147 6D TATGCACAGA AATAAT/------ AATAATAAAG 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 AAT 4 2 275768 CASAVA_Build 7 79176626 4D TTATAGTTTG TTTC/---- TTTATTTCAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TTTC 1 0 275769 CASAVA_Build 7 79179076 1D TCACAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 11 10 275770 CASAVA_Build 7 79179970 1I CTTTGCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 T 9 10 275771 CASAVA_Build 7 79180271 1D TTGGATTGGA T/- TCTGTGAGAC 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 T 2 1 275772 CASAVA_Build 7 79183726 4I TGTTGATATA ----/CATT CATTCATTCA 3070 het 3070 hom 41 11 18 12 CATT 3 4 275773 CASAVA_Build 7 79187759 1D GTCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1309 hom 40 5 24 11 T 15 14 275774 CASAVA_Build 7 79190168 4I CTTAAATGCA ----/ATAT ATATATATAT 3068 hom 18 het 11 0 7 4 AT 7 9 275775 CASAVA_Build 7 79207169 2D ATCGACACTC TG/-- TATCTAGCTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TG 1 0 275776 CASAVA_Build 7 79211364 1D AATCTATCCT A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 8 7 275777 CASAVA_Build 7 79211513 1D TAATTTAATA T/- TTTTGCTTAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 5 4 275778 CASAVA_Build 7 79219884 1I ACGAGTTTAC -/A TTTCCACCAA 3070 het 44 hom 26 1 22 3 A 0 1 275779 CASAVA_Build 7 79224695 1D TCTCCCTCTC T/- TTTTCCCCCA 3070 hom 51 het 22 0 17 7 T 5 4 275780 CASAVA_Build 7 79225328 1D GATGTTAGGC T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 8 7 275781 CASAVA_Build 7 79249558 1I TAGTGTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1431 hom 35 3 26 6 A 11 12 275782 CASAVA_Build 7 79259420 1D ATTATATTGT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 8 275783 CASAVA_Build 7 79260335 1I TTCTGTATTA -/T TTTTTTTACC 3070 hom 92 het 37 0 31 6 T 7 8 275784 CASAVA_Build 7 79266506 44D AGCTACCTAC TTCCAAAATTCAGTGGTGAAACATGCATAGGATAAATAGTACCA/-------------------------------------------- TTCCAAAAGG 3070 hom 72 het 28 0 24 9 TTCCAAAATTCAGTGGTGAAACATGCATAGGATAAATAGTACCA 1 0 275785 CASAVA_Build 7 79273685 41D GATGATGCAG CCACGTTCAAAAGATGTGGAAAAGATGAGAAATACATTCTT/----------------------------------------- CCACGTTCAA 3070 hom 56 het 33 0 18 23 CCACGTTCAAAAGATGTGGAAAAGATGAGAAATACATTCTT 2 1 275786 CASAVA_Build 7 79274520 3I TGGAGGATTC ---/AGA AGAAGACAAG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AGA 2 3 275787 CASAVA_Build 7 79279805 1I CCTCTACTTA -/C TTGTTTGTTT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 C 0 1 275788 CASAVA_Build 7 79279949 1D TGTTATTTTT G/- GTTTTCTTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 2 1 275789 CASAVA_Build 7 79380984 3D ATATAAAGAG AGA/--- AGAAGAGATA 2887 het 2887 ref 29 16 9 4 AGA 3 2 275790 CASAVA_Build 7 79405622 1I AATGAGAAAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 7 8 275791 CASAVA_Build 7 79415122 1D GAAATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 25 0 18 7 T 11 10 275792 CASAVA_Build 7 79428614 1I CAATTCATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 224 hom 34 1 26 7 T 9 10 275793 CASAVA_Build 7 79429628 1I ACCACCCTTT -/A GGACTTAATA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 275794 CASAVA_Build 7 79479156 4D GTGGTCCCTG ACTA/---- ACTATGATTT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 ACTA 2 1 275795 CASAVA_Build 7 79563298 4I3M1I ACTGTATGTA ----ATA-/AACCATAC AGAGGGCTGC 3070 hom 75 het 26 0 26 1 N/A 0 0 275796 CASAVA_Build 7 79600418 5D CAAAGGATGG AAGTA/----- ATGTTACCTA 3070 het 3070 ref 42 23 14 7 AAGTA 1 0 275797 CASAVA_Build 7 79601206 1I CTCCGCCGAT -/C TGTTACAGCT 3070 hom 123 het 50 0 41 9 C 0 1 275798 CASAVA_Build 7 79607162 10D TGCCCTGCAA TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 607 hom 23 3 11 10 T 22 12 275799 CASAVA_Build 7 79610106 4I TCTTGGTAAA ----/TAAT TAAGTGGTAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TAAT 0 1 275800 CASAVA_Build 7 79614627 1D TATCCTTATT A/- AAAAAAAAAA 2596 het 2596 ref 27 14 6 7 A 15 14 275801 CASAVA_Build 7 79622983 1I GATGTTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 11 12 275802 CASAVA_Build 7 79627154 21D GAGGATTAGA GATATATGTTAAGTGTATTGG/--------------------- GATATATGTT 3070 het 3070 ref 35 28 14 5 GATATATGTTAAGTGTATTGG 2 1 275803 CASAVA_Build 7 79641708 1I TCTTCTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 T 13 14 275804 CASAVA_Build 7 79660262 1D TGTTTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 6 T 11 10 275805 CASAVA_Build 7 79664433 2D TTTCTGTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2439 hom 38 10 12 16 T 16 14 275806 CASAVA_Build 7 79672843 1D CAGTTTGTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 9 8 275807 CASAVA_Build 7 79673641 3D CGCTGCTGTC ATT/--- ATCTGTTACT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 ATT 1 0 275808 CASAVA_Build 7 79674955 1D CATTTTGTGG T/- TTTTTTCGTG 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 T 7 6 275809 CASAVA_Build 7 79683016 4I GGAGGAAAAA ----/GTTT GTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 GTTT 1 2 275810 CASAVA_Build 7 79687486 4D AAGTACTGTA TTAC/---- TTACTACATG 3070 het 3070 ref 49 23 24 3 TTAC 2 1 275811 CASAVA_Build 7 79693193 5D AGTGTGCATC AAATA/----- AAAGTTTACT 2975 het 2975 ref 29 18 9 4 AAATA 1 0 275812 CASAVA_Build 7 79704945 1I GGCTGAGAGG -/C CCCAGGATAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 3 4 275813 CASAVA_Build 7 79721026 4I AATCTATGAG ----/AGAT AGAGAGGTTA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 AGAT 0 1 275814 CASAVA_Build 7 79724849 1D AATTTTATAA C/- GTTCACTATT 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 C 1 0 275815 CASAVA_Build 7 79728650 1D TTAAGCATTG T/- TTTCACTCCT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 4 3 275816 CASAVA_Build 7 79731728 1D CATGCCCGTG A/- ATGACAGCAA 3070 het 3070 hom 63 26 33 5 A 2 1 275817 CASAVA_Build 7 79732551 2D ACTTCCTGAC AT/-- AAATTAGACC 3070 het 3070 ref 51 31 14 9 AT 1 0 275818 CASAVA_Build 7 79767970 1D GAAAGAGAAA G/- GGAAAAGATG 3070 het 3070 ref 50 27 16 8 G 3 2 275819 CASAVA_Build 7 79777059 1D AACTTACAGA T/- TTTTTTTTTT 2262 het 2262 ref 37 21 6 10 T 15 14 275820 CASAVA_Build 7 79806463 1D ATTATTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 11 10 275821 CASAVA_Build 7 79806657 2I TAAAAAAAAC --/TT AAATTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 T 0 2 275822 CASAVA_Build 7 79829142 1I TTCTAGATTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 7 8 275823 CASAVA_Build 7 79829961 1D TTATTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 15 14 275824 CASAVA_Build 7 79831559 1D CATTCTTATA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 T 8 7 275825 CASAVA_Build 7 79831846 1D AGAAATCGCC A/- AATCGCTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 8 12 A 3 2 275826 CASAVA_Build 7 79832428 1D ATGAGAAGTA C/- AAATATAGCT 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 C 1 0 275827 CASAVA_Build 7 79846629 1D ATTCATTGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 T 11 10 275828 CASAVA_Build 7 79857844 1D GAACTATTTG C/- ATTTCCTCAA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 C 1 0 275829 CASAVA_Build 7 79888212 1I TTTCCTCATT -/A CTTTCAATAG 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 A 0 1 275830 CASAVA_Build 7 79890446 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1811 het 397 hom 21 4 5 12 A 19 18 275831 CASAVA_Build 7 79895631 1I ATCCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 A 8 9 275832 CASAVA_Build 7 79899742 42D GGGTGTGGGA ATGTAAAATGGTACAGCCGCTTTGGGAAACAGTTTGACCATT/------------------------------------------ TCTTCAAAAG 3070 het 3070 ref 25 18 13 4 ATGTAAAATGGTACAGCCGCTTTGGGAAACAGTTTGACCATT 1 0 275833 CASAVA_Build 7 79902175 1D CAAAAGAAGA C/- CCCCCCCCAT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 C 9 8 275834 CASAVA_Build 7 79911843 1D ACAAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 2771 het 2771 ref 18 10 7 1 A 11 10 275835 CASAVA_Build 7 79912528 1I CCTATTTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 13 14 275836 CASAVA_Build 7 79913010 1D TTAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 11 10 275837 CASAVA_Build 7 79917111 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAAAAC 1197 het 1197 ref 44 23 6 15 AAAC 1 0 275838 CASAVA_Build 7 79942614 1D TCTTCATACT A/- AAAAAAAAAA 2148 het 2148 ref 36 18 9 9 A 17 16 275839 CASAVA_Build 7 79952423 2I ATATTGTGTG --/TT TTTTTTTTTT 1324 hom 6 het 38 0 7 31 T 12 14 275840 CASAVA_Build 7 80005128 3D AAGTCATTTG TGT/--- TGTTATTATT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 TGT 2 1 275841 CASAVA_Build 7 80008427 1D36M2D TATATATGTA TTTTTTTTTTCAGAATTCTATCGTATCTATTTTATTTTA/-TTTTTTTTTCAGAATTCTATCGTATCTATTTTATTT-- TATATATATA 3070 het 219 hom 27 1 24 4 N/A 0 0 275842 CASAVA_Build 7 80011989 2I AAGATGTGAC --/TT AGTCCTCCTT 3070 hom 9 het 26 1 23 2 T 0 2 275843 CASAVA_Build 7 80020437 1D TCACTAATGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 366 hom 21 1 18 5 T 10 9 275844 CASAVA_Build 7 80021898 1I TCCAGAAGCA -/T TTTTTTCTAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 6 7 275845 CASAVA_Build 7 80023136 1D ATAGCCACTT G/- GATCATGGTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 2 1 275846 CASAVA_Build 7 80028161 1D TTGAATGGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 5 T 10 9 275847 CASAVA_Build 7 80029198 1D TGCCCTTGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 27 0 23 4 T 10 9 275848 CASAVA_Build 7 80034676 1D CTTTAGAGTC T/- TTTTTATCAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 5 275849 CASAVA_Build 7 80043905 10D GTAGCGGGTC GTAGCGGGTT/---------- GTAGCGGAGG 3070 hom 30 het 11 0 11 1 GTAGCGGGTT 1 0 275850 CASAVA_Build 7 80050867 1D CTTGGATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 36 0 23 13 T 12 11 275851 CASAVA_Build 7 80051324 1I TACAGGCACT -/G GGCCATGCCA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 G 2 3 275852 CASAVA_Build 7 80063625 3I GTTGTAAAGC ---/AGT AAATATTAGT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 AGT 0 1 275853 CASAVA_Build 7 80068060 2D CTTATGGATC CT/-- CTCTCTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 CT 4 3 275854 CASAVA_Build 7 80070967 2D GGATAATAAA AC/-- AGTTTTCACC 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AC 1 0 275855 CASAVA_Build 7 80071022 1D ACAGTCAGGC A/- AAAAAAAAAA 2576 het 575 hom 24 3 8 16 A 17 16 275856 CASAVA_Build 7 80073384 18D ATTCATCTTC TACTAAGGACTATGACTA/------------------ AAATTTTAAG 3070 hom 72 het 25 0 25 5 TACTAAGGACTATGACTA 1 0 275857 CASAVA_Build 7 80086231 3D CATAGCTGGA GAG/--- GAGAAGTCAA 3070 hom 102 het 35 0 35 1 GAG 2 1 275858 CASAVA_Build 7 80090258 1D CTTGGTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 741 hom 38 3 27 8 T 15 14 275859 CASAVA_Build 7 80090604 2D TCTTCCACTT TG/-- TGGCAGAGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TG 2 1 275860 CASAVA_Build 7 80090756 4I TACTGTAATT ----/AATA CTTATTTTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AATA 0 1 275861 CASAVA_Build 7 80097151 2D AATAGTAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 13 11 275862 CASAVA_Build 7 80105161 1D AACATAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1043 hom 31 4 21 6 T 13 12 275863 CASAVA_Build 7 80109195 2D CCTGATAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 34 0 20 15 A 14 12 275864 CASAVA_Build 7 80112275 1D TCTTCCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 15 14 275865 CASAVA_Build 7 80113302 1I TTTCTGAGAA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 7 8 275866 CASAVA_Build 7 80116746 1D GAGTATATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 10 9 275867 CASAVA_Build 7 80125671 3D AAAGAAAATA GTT/--- GTTAGAATTT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 GTT 2 1 275868 CASAVA_Build 7 80126927 3D ACTGGTATAA TGT/--- TGTCAGTACA 3070 hom 102 het 39 0 35 6 TGT 2 1 275869 CASAVA_Build 7 80129838 1D GACTTATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 23 9 T 13 12 275870 CASAVA_Build 7 80134902 8I TTCGTATGCG --------/TACTTGAT TACTTGATTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TACTTGAT 1 2 275871 CASAVA_Build 7 80143215 9I TGCTTGTCTT ---------/GAGGGTTGA GAAGCACCCT 3070 hom 150 het 55 0 50 5 GAGGGTTGA 0 1 275872 CASAVA_Build 7 80180194 1I GATGATGACC -/A TTTTTTCATG 1417 hom 7 het 3 0 3 0 A 0 1 275873 CASAVA_Build 7 80193811 1I TGTAAGAATG -/A AAAAAAATAT 3070 het 353 hom 35 1 29 5 A 7 8 275874 CASAVA_Build 7 80196372 1I AAAGAAATTA -/T TTCTCTTTTC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 3 275875 CASAVA_Build 7 80198743 1I AGGGAGAGGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 8 9 275876 CASAVA_Build 7 80211387 5I GAGTCTAAAA -----/TAAAT TAAATAACTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TAAAT 1 2 275877 CASAVA_Build 7 80212726 1I TTCCATTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 894 hom 48 2 37 9 T 11 12 275878 CASAVA_Build 7 80213686 4D TTCAGAAATT AAAG/---- AAAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 34 19 15 1 AAAG 2 1 275879 CASAVA_Build 7 80214278 2I AGTGAGAAGC --/AT ATGTTTTCTT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 AT 1 2 275880 CASAVA_Build 7 80221771 1I AAGGAAAATG -/A AAAAACTCAT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 A 5 6 275881 CASAVA_Build 7 80233687 1I CCTCTCCGCA -/G GGCATACGCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 2 3 275882 CASAVA_Build 7 80233924 1I GCCAAGAACC -/T GGACACCCTC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 0 1 275883 CASAVA_Build 7 80245938 1D GTCTCAGGTC T/- TTCCATCTGG 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 T 3 2 275884 CASAVA_Build 7 80257660 5D ATTGGATGTG TTAAA/----- TTAAATCTGG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 TTAAA 2 1 275885 CASAVA_Build 7 80268983 1D AGCTCTCCCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2521 hom 35 7 21 7 A 10 9 275886 CASAVA_Build 7 80274884 1I CTTCATAAAG -/T TTATGTAGGC 3070 het 3070 ref 52 28 18 6 T 2 3 275887 CASAVA_Build 7 80275558 2I AAATGAAAAC --/TA TATATATATA 1948 het 1948 ref 24 14 5 5 TA 5 6 275888 CASAVA_Build 7 80281344 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2016 het 2016 ref 24 7 9 8 T 11 12 275889 CASAVA_Build 7 80283354 4D GGCTCTTTAG GTGA/---- GTGAGTACTG 3070 het 3070 ref 44 26 14 5 GTGA 2 1 275890 CASAVA_Build 7 80285918 1D AAAATAAAAA T/- AAAAATCCCC 3070 het 3070 ref 30 14 14 3 T 1 0 275891 CASAVA_Build 7 80295247 1I GCTAGTACTC -/T TAAGTAGTTG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 1 2 275892 CASAVA_Build 7 80301024 1D GAAACGACCA T/- TTTTTTTTTT 1232 het 1232 ref 29 21 4 4 T 12 11 275893 CASAVA_Build 7 80383118 2I AAGTTTATGC --/AG AGAGTTGAAA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 AG 2 3 275894 CASAVA_Build 7 80411314 1I GTTTCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 12 13 275895 CASAVA_Build 7 80430504 1D TACATGTATT A/- ATGGTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 A 2 1 275896 CASAVA_Build 7 80453173 1I CTATTCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 37 0 25 12 T 12 13 275897 CASAVA_Build 7 80466374 1I TATATCAAGG -/T TACCCATAAT 3070 het 3070 hom 52 17 25 10 T 1 2 275898 CASAVA_Build 7 80467288 1I CAGTATAACA -/T AATCTCTTTT 3070 het 3070 hom 58 26 25 7 T 0 1 275899 CASAVA_Build 7 80470370 1I TATAAATTAT -/A AAAAAAAAAC 2719 het 2719 ref 22 8 8 6 A 9 10 275900 CASAVA_Build 7 80482749 1D TTAGTCTGAA T/- TTTCCTTATG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 4 3 275901 CASAVA_Build 7 80483163 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2024 het 2024 ref 30 17 6 8 A 13 12 275902 CASAVA_Build 7 80491068 5I AACTGAATTG -----/TTTAT TTTATTTAAG 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 TTTAT 1 2 275903 CASAVA_Build 7 80498736 2D ACAATATAGG AA/-- AAAAAAAAAA 637 het 327 hom 32 4 2 27 A 12 10 275904 CASAVA_Build 7 80511874 1I TTGTAGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 649 hom 45 2 33 10 T 10 11 275905 CASAVA_Build 7 80516069 1I GTTGGAGAGA -/C TTCTTTCTCA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 C 0 1 275906 CASAVA_Build 7 80516550 1I6M22D AGAAGTCATG -ACATAATAACCAGCCACCAGGAGTCTTT/TACATCA---------------------- GGCTGTGTAC 3070 hom 123 het 37 0 40 6 N/A 0 0 275907 CASAVA_Build 7 80527078 2I ACACACACAC --/AT ACACACACAC 3070 hom 99 het 41 0 31 10 AT 0 1 275908 CASAVA_Build 7 80527290 1D ATTGGATTTT G/- GGGGCATAGT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 5 4 275909 CASAVA_Build 7 80534828 1I CCTTCATTTA -/C CCCCCCCCAC 2811 het 2811 ref 32 13 8 11 C 8 9 275910 CASAVA_Build 7 80569815 1I GCCATATCAG -/A ACCAAGTTCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 2 275911 CASAVA_Build 7 80576633 1I ATTCCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 31 0 23 8 T 13 14 275912 CASAVA_Build 7 80576835 1I TCTGTTTTTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 9 275913 CASAVA_Build 7 80617771 1I CATTCATATA -/T TTTGACATTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 3 4 275914 CASAVA_Build 7 80661030 1D AAGAGAAATA T/- TTGCCAACTT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 T 3 2 275915 CASAVA_Build 7 80667788 6I TTTTTCCATA ------/TTAGAG TTAATCTCAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TTAGAG 0 1 275916 CASAVA_Build 7 80670103 1D ATTTTATGCA G/- ATTCCTAAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 G 1 0 275917 CASAVA_Build 7 80701757 1D ATAAATTGAT A/- AAAATAATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 4 275918 CASAVA_Build 7 80706994 1I GTCAAGACAA -/G CTTATCCTCT 3070 hom 101 het 42 0 37 5 G 0 1 275919 CASAVA_Build 7 80717821 1I CTTTGTCTTG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 8 9 275920 CASAVA_Build 7 80718342 1I AATATCCTGG -/A AAAAATATTC 3070 hom 92 het 38 0 31 7 A 5 6 275921 CASAVA_Build 7 80721530 3D11M5I TATTTGATAA ATTTAAACAAATGA-----/---TATATATATGATATAT AGTAAAGATA 3070 hom 42 het 15 0 15 3 N/A 0 0 275922 CASAVA_Build 7 80722189 20D AGAGGGAGAA ACAGAGGGAGAGAGACAGAG/-------------------- ACAGAGGGAG 3070 hom 70 het 36 0 23 17 ACAGAGGGAGAGAGACAGAG 2 1 275923 CASAVA_Build 7 80734824 2D ATTCTCTCTC TG/-- GTCACAAGCT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 TG 1 0 275924 CASAVA_Build 7 80737736 1D AGATTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 11 10 275925 CASAVA_Build 7 80739958 22D TCAATTTGGT TAAATTGATTAAAAAATTTGAG/---------------------- GATTAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TAAATTGATTAAAAAATTTGAG 1 0 275926 CASAVA_Build 7 80740647 1D AAATATTGAT A/- TTTTTTAGAT 3070 hom 129 het 46 0 44 3 A 1 0 275927 CASAVA_Build 7 80743229 2D CGAACGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 49 0 41 9 A 12 10 275928 CASAVA_Build 7 80747607 1I ATAGGAGGAT -/A AAAAGTATTG 3070 hom 86 het 39 0 28 11 A 4 5 275929 CASAVA_Build 7 80775702 1D AATCTTGTGG A/- AGAACATTTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 2 1 275930 CASAVA_Build 7 80778435 1D CAGAGTTGAC A/- AAAACAAGTA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 5 4 275931 CASAVA_Build 7 80781795 5D TGATTATAAA TATCT/----- TATTTATTGA 3070 hom 72 het 25 0 25 2 TATCT 1 0 275932 CASAVA_Build 7 80784588 1D TTATTATAAA T/- TGATCTCATT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 2 1 275933 CASAVA_Build 7 80793615 1D TACATTTCTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 A 10 9 275934 CASAVA_Build 7 80794279 1I GAGAAAGTTT -/C ATTCTATTCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 0 1 275935 CASAVA_Build 7 80801601 1D ATAAAACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 12 11 275936 CASAVA_Build 7 80806299 5I AATGTGACTC -----/CTGTT CTAATTTAAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 CTGTT 0 1 275937 CASAVA_Build 7 80816990 1I GTTTTTTTGC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 T 7 8 275938 CASAVA_Build 7 80824458 4D TTTAATGTGG GAGA/---- GAGCCCTTCT 3070 het 3070 hom 49 24 24 3 GA 3 1 275939 CASAVA_Build 7 80847549 1I TTGATAGCAT -/A AAAAAAAAAA 2706 het 2706 ref 27 14 8 5 A 10 11 275940 CASAVA_Build 7 80906808 2I ATTTTTGACA --/TG TTTTTCTTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TG 0 1 275941 CASAVA_Build 7 80961245 1I ACGATTGAGA -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 6 7 275942 CASAVA_Build 7 80985971 2D TCACATACAA AC/-- ACACACACAC 1337 het 1337 ref 49 36 3 11 AC 7 6 275943 CASAVA_Build 7 80990101 1D ATTGTTCTAG A/- AATTGTGGGA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 3 2 275944 CASAVA_Build 7 81017484 1I AGGCCGAGGC -/G GATGGATCAT 3057 hom 33 het 14 0 12 2 G 1 2 275945 CASAVA_Build 7 81024831 1D TTCTGATTAT A/- AAAAACACTT 3070 hom 111 het 41 0 37 5 A 6 5 275946 CASAVA_Build 7 81031322 15D GTAGATAGAC AGATAGATGATAAAT/--------------- AGATAGATGA 3070 hom 129 het 40 0 44 9 AGATAGATGATAAAT 1 0 275947 CASAVA_Build 7 81033497 2I ACAACATAAC --/TG AGGAGGAATT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TG 0 1 275948 CASAVA_Build 7 81040866 1D GCATCATATG T/- TATGTGAGAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 2 1 275949 CASAVA_Build 7 81052978 1I TAAGGAAAGT -/A ACTTGAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 2 275950 CASAVA_Build 7 81122880 1I GTAAAAACTA -/T TTTTTTATAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 275951 CASAVA_Build 7 81127615 1D GATATCTTTT A/- AAAAAATCAG 3070 hom 68 het 28 0 23 6 A 7 6 275952 CASAVA_Build 7 81130758 1D AAAAAAAAAA C/- CTTTCCCTTC 3070 het 436 hom 36 2 25 10 C 2 1 275953 CASAVA_Build 7 81161494 1D TTTTTTAATC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 114 het 46 0 38 8 T 9 8 275954 CASAVA_Build 7 81162688 1D AACCTCACAC T/- TTTGTAAAGC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 4 3 275955 CASAVA_Build 7 81164790 3I GCTTTTTTGA ---/TGT TGTTATTATT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TGT 1 2 275956 CASAVA_Build 7 81180790 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 866 hom 23 4 16 3 A 15 16 275957 CASAVA_Build 7 81194834 1I TTACATTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 8 9 275958 CASAVA_Build 7 81197053 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 9 8 275959 CASAVA_Build 7 81197887 1D CTCAGTCACT A/- AGTAATAAAA 3070 hom 108 het 38 0 36 3 A 2 1 275960 CASAVA_Build 7 81206822 1D GGTTTTTAAA C/- CCCAGGGCAA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 C 4 3 275961 CASAVA_Build 7 81218071 1I AAAAGTAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 8 9 275962 CASAVA_Build 7 81218749 6D GACTTAAGGT CCATAG/------ ACATGCCTTC 3070 hom 141 het 51 0 48 5 CCATAG 1 0 275963 CASAVA_Build 7 81240471 2D ACATATTCTC TT/-- TGTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 3 1 275964 CASAVA_Build 7 81254245 1D GTAGGACCCA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 T 8 7 275965 CASAVA_Build 7 81254637 1I TTTTTTTTTT -/C CTGTGAAAGT 3070 het 2777 hom 36 8 24 4 C 1 2 275966 CASAVA_Build 7 81255583 1I18M1D CCTCCCAAAG -TGCTGGGATTACAGGGCTG/TTGCTGGGATTACAGGGCT- CGCCACTGCG 3070 het 1622 hom 22 7 9 8 N/A 0 0 275967 CASAVA_Build 7 81272710 2D AAAAAATGTT TC/-- TGTGTTTGCA 3056 het 3056 ref 25 12 9 4 TC 1 0 275968 CASAVA_Build 7 81283575 1I TATCCTCCAA -/G GTCCTAAAGT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 G 1 2 275969 CASAVA_Build 7 81285962 1I ATAATGAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 8 9 275970 CASAVA_Build 7 81295593 3D GAAAATTCTT TTC/--- TTTAAGAATG 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 TTC 1 0 275971 CASAVA_Build 7 81299364 1D AGAAAAGAGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 9 8 275972 CASAVA_Build 7 81306522 1D ACTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 126 het 48 0 43 6 T 10 9 275973 CASAVA_Build 7 81309708 2D GTCTTCATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1816 hom 37 8 17 13 T 18 16 275974 CASAVA_Build 7 81311642 1I TGATGGGGTT -/G TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 G 0 1 275975 CASAVA_Build 7 81317715 1I TGTATATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 A 11 12 275976 CASAVA_Build 7 81318993 1D AAATTTAATT A/- AAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 A 7 6 275977 CASAVA_Build 7 81322840 8D TGTGACATGA TCACATAT/-------- TCACATATTC 3070 hom 141 het 56 0 48 10 TCACATAT 2 1 275978 CASAVA_Build 7 81333921 3I ATATAATATA ---/TAC TACTGTTTGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TAC 1 2 275979 CASAVA_Build 7 81343092 2D CCTTCTCCCA CC/-- CCATCTCCTA 3070 het 3070 ref 42 18 18 7 C 4 2 275980 CASAVA_Build 7 81345497 5I AGCTTTCACC -----/AAGTA AAGTATCATC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAGTA 1 2 275981 CASAVA_Build 7 81350640 1D TTCAAAAAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 9 8 275982 CASAVA_Build 7 81355051 1D TGGGAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 1156 het 1156 ref 36 29 4 3 T 12 11 275983 CASAVA_Build 7 81358157 1I TGGGAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 504 hom 36 2 24 10 T 14 15 275984 CASAVA_Build 7 81361602 1D AATTTTAATA C/- TTTATCAATA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 1 0 275985 CASAVA_Build 7 81361959 8I TTCATTCTTC --------/TTTTATTA TTTTATTGTT 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 TTTTATTA 0 1 275986 CASAVA_Build 7 81364163 1I GGCCTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 T 10 11 275987 CASAVA_Build 7 81429051 29D GTTTTTTCTG TAATGATTATAACAGTATATACAATTTCT/----------------------------- TAATGATTAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 10 TAATGATTATAACAGTATATACAATTTCT 2 1 275988 CASAVA_Build 7 81433455 5I GTCCATGGTT -----/AAGAA AATACTTACT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 AAGAA 0 1 275989 CASAVA_Build 7 81441882 1D20M1D GAAAACACTA TTTTTTTTTTTTATTAGCCACA/-TTTTTTTTTTTATTAGCCAC- AGACTTTGCA 3070 het 3070 hom 37 15 21 9 N/A 0 0 275990 CASAVA_Build 7 81442039 7I TGCTCAATAA -------/GTATTAG GTTTTGGTGT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 GTATTAG 0 1 275991 CASAVA_Build 7 81443057 12I GAATGAATCA ------------/TGTACATAGTAG TGTATACAAC 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 TGTACATAGTAG 0 1 275992 CASAVA_Build 7 81443246 1D ATGTTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 21 7 A 12 11 275993 CASAVA_Build 7 81446003 6I TTTTTAAAAA ------/GTGTGC GTGTATATAT 1491 het 1085 hom 13 4 5 4 GTGTGC 0 1 275994 CASAVA_Build 7 81446250 1D ATTCAGCTAT A/- AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 7 6 275995 CASAVA_Build 7 81447867 2I ATTTTAGAAA --/CT CTCTCTGGTT 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 CT 3 4 275996 CASAVA_Build 7 81479507 1D TGTTTATGGG A/- AAAAAAAAAA 1446 het 1446 ref 31 20 4 7 A 13 12 275997 CASAVA_Build 7 81493593 3D TGTCTTATTT TTC/--- TTTTGTATTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 4 TTC 1 0 275998 CASAVA_Build 7 81502598 1I CTGCGAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 10 11 275999 CASAVA_Build 7 81508304 1D GCCTTGGGTT G/- GGGGGGTGGG 3070 het 2479 hom 27 8 12 7 G 7 6 276000 CASAVA_Build 7 81512375 1I AGATTAATAG -/A AAAAAAATGC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 7 8 276001 CASAVA_Build 7 81524819 1D GACCTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 31 0 27 6 A 12 11 276002 CASAVA_Build 7 81530810 1I GAGACAAAGA -/T TTTTTTTTTT 1704 het 1704 ref 27 14 6 7 T 15 16 276003 CASAVA_Build 7 81536966 1I GAAGTACCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1248 hom 47 5 38 4 T 10 11 276004 CASAVA_Build 7 81542472 2D CACCATAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 27 0 14 13 A 13 11 276005 CASAVA_Build 7 81547310 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 24 13 11 1 TA 5 6 276006 CASAVA_Build 7 81547403 6D ACCTATATAC CTATAT/------ ATGTATATAG 3030 het 3030 ref 25 16 9 1 CTATAT 1 0 276007 CASAVA_Build 7 81552939 1I TAAACAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 T 11 12 276008 CASAVA_Build 7 81563888 3I AACATGATGG ---/TAT TATGATCTAG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 TAT 1 2 276009 CASAVA_Build 7 81565155 1D CACTTGAGGT C/- AGGAGTTCAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 1 0 276010 CASAVA_Build 7 81566361 3D ATCCTTTACT TTC/--- TTGTCAGTTT 3070 hom 117 het 43 0 37 7 TTC 1 0 276011 CASAVA_Build 7 81568081 1D ACTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 21 8 T 13 12 276012 CASAVA_Build 7 81569682 5I TGGAAATACC -----/ATAAT ATATTTGTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATAAT 0 1 276013 CASAVA_Build 7 81570923 6I GTGTATATAC ------/ATATAT ATATTCAGAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AT 2 5 276014 CASAVA_Build 7 81582996 1D CAAAGTGAAT A/- AAAAAAAAAA 1374 het 1374 ref 39 30 3 6 A 11 10 276015 CASAVA_Build 7 81617675 1D GCTTTCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 220 hom 34 3 18 13 A 17 16 276016 CASAVA_Build 7 81621098 1I AGCAAACTAT -/A AAAAAAAAAA 1146 het 1146 ref 35 21 3 11 A 10 11 276017 CASAVA_Build 7 81623903 2I TTCTTTTAAT --/AA AAGAGAGATC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 2 4 276018 CASAVA_Build 7 81624610 3D AAAATGGCTT ATA/--- ATGTGATTTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 ATA 1 0 276019 CASAVA_Build 7 81625728 1D AAACCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 43 0 34 10 A 11 10 276020 CASAVA_Build 7 81635966 3D ATGAAACAAC AAT/--- GATATAGGCA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 AAT 1 0 276021 CASAVA_Build 7 81637105 1D TATTAAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 39 1 29 10 T 13 12 276022 CASAVA_Build 7 81641422 1D CTTACTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 41 1 35 6 A 11 10 276023 CASAVA_Build 7 81644859 1D ATTTCTAAGA T/- TTTTTTCAGC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 7 6 276024 CASAVA_Build 7 81647178 1I CACCTGAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 10 276025 CASAVA_Build 7 81652889 3D TAACTGTTAG TTC/--- TTCTGGAGAA 2532 het 2532 ref 23 15 7 1 TTC 2 1 276026 CASAVA_Build 7 81654809 1D AAACATTGCC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 9 8 276027 CASAVA_Build 7 81660437 1D TCAAGTAAAT A/- AGGCCAAACA 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 A 2 1 276028 CASAVA_Build 7 81663321 1I TTTACAACCA -/G CCTCTTTTGG 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 G 0 1 276029 CASAVA_Build 7 81669924 1I AGGTGCTGGT -/G GGGCACCTGG 3070 hom 51 het 25 0 15 10 G 3 4 276030 CASAVA_Build 7 81672805 1D TTACCTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 A 9 8 276031 CASAVA_Build 7 81684602 1D CTGCCTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 20 0 11 9 A 10 9 276032 CASAVA_Build 7 81688453 2D TGTATATTCT AC/-- ACACATGCAT 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 AC 3 2 276033 CASAVA_Build 7 81699613 1D AATGTTCGCC T/- TTTTGTACTG 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 T 5 4 276034 CASAVA_Build 7 81701847 2D TAGAAAAAAA AT/-- AGCTATTCTT 3070 het 2007 hom 29 6 20 5 AT 1 0 276035 CASAVA_Build 7 81703376 1I TTGTCGAGGG -/A AAACCAATAT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 A 3 4 276036 CASAVA_Build 7 81704516 2D CATTTTCCCC CT/-- GACATTTTCA 3070 het 3070 hom 40 18 17 7 CT 1 0 276037 CASAVA_Build 7 81710061 1D AGTCAGACTC A/- ATACTGAATT 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 A 2 1 276038 CASAVA_Build 7 81726478 4D AGAGATAAAT AGAC/---- AGACAGACAG 3070 het 3070 hom 35 18 15 4 AGAC 5 4 276039 CASAVA_Build 7 81731673 1D GGTCACAATG T/- TTTATATATT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 T 4 3 276040 CASAVA_Build 7 81739181 1I CACTTTCTTC -/T TTCCTGAATC 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 2 3 276041 CASAVA_Build 7 81742279 1I ATACTGAGTG -/A AAAATTATTT 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 A 4 5 276042 CASAVA_Build 7 81742434 11D CACTTAAATT TATTAGTGATA/----------- AAAGATCAAA 3070 het 3070 hom 48 22 26 3 TATTAGTGATA 1 0 276043 CASAVA_Build 7 81744964 1D AGATTGTCAT A/- AAAAAATGCA 2540 het 2540 ref 24 13 7 6 A 7 6 276044 CASAVA_Build 7 81749061 4I TAAAATATTA ----/TGTT TATTTAAAAC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TGTT 0 1 276045 CASAVA_Build 7 81749959 1I TAAAATGTGG -/A GGGGGGGAAT 2586 het 2586 ref 24 11 10 3 A 0 1 276046 CASAVA_Build 7 81750923 1I AGAATCTCTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 8 9 276047 CASAVA_Build 7 81754515 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 T 11 12 276048 CASAVA_Build 7 81766357 1D TACCAAGTCA T/- TTTTTACTCA 3070 het 3070 ref 24 12 7 5 T 6 5 276049 CASAVA_Build 7 81786131 3D AGGAAGAGGG AGA/--- AGAAGAAGAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 AGA 4 3 276050 CASAVA_Build 7 81791644 1I GAGTTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 1336 het 1336 ref 19 8 4 7 A 13 14 276051 CASAVA_Build 7 81797327 1D CACCCCCAAC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 A 9 8 276052 CASAVA_Build 7 81800745 1I CACAGCGACA -/G GCAAGAGAAC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 G 1 2 276053 CASAVA_Build 7 81809144 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 1101 het 624 hom 6 3 3 0 A 13 11 276054 CASAVA_Build 7 81826918 1D ACTATCATAA T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 6 5 276055 CASAVA_Build 7 81830960 1I GTAGTAATGA -/T TAATAAACAT 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 1 2 276056 CASAVA_Build 7 81833478 1D AATATAATGT C/- AACTTTTGTT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 C 1 0 276057 CASAVA_Build 7 81833845 4I TTCATGGCAG ----/GTGT GTATCACATT 3070 het 3070 hom 39 12 15 12 GT 1 3 276058 CASAVA_Build 7 81842039 2I CAAAAATGCC --/AA CCCCAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 A 0 2 276059 CASAVA_Build 7 81846568 1I TTCATAATTT -/G TTTTCACCTA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 G 0 1 276060 CASAVA_Build 7 81854842 12D TGTTCTAACA ATGAACAGTACC/------------ ATGAAAACAC 3070 het 3070 hom 36 16 18 6 ATGAACAGTACC 1 0 276061 CASAVA_Build 7 81855340 1I CAAAAACAAA -/C AACAAACAAC 3070 het 2266 hom 28 13 12 3 C 0 1 276062 CASAVA_Build 7 81856416 2I ATATATATAT --/AC ATACACACAC 1390 het 824 hom 9 4 5 0 AC 0 1 276063 CASAVA_Build 7 81865835 1D TTCTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 2239 het 2239 ref 36 25 6 6 T 13 12 276064 CASAVA_Build 7 81895608 1I CCATGACACA -/T AGCATAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 25 2 T 0 1 276065 CASAVA_Build 7 81904946 2D35M1I CATAACCTGT ACAAACAAGTGGCAAAATATAAAGGAGCAATGACCGC-/--AAACAACTGGCAAAATATAAAGGAGCAATGACCGCT TTTCTTTACT 3070 het 3070 ref 26 22 8 6 N/A 0 0 276066 CASAVA_Build 7 81985061 1I CATTCGACTT -/A ATTTGTAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 1 2 276067 CASAVA_Build 7 81986673 1I ACAAAACAAA -/C AAAAAACATT 3070 het 1554 hom 22 6 15 1 C 0 1 276068 CASAVA_Build 7 81999668 1D GGACAGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1416 hom 24 6 12 6 T 15 14 276069 CASAVA_Build 7 82002171 1D GGCAATCATA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 37 22 15 1 T 7 6 276070 CASAVA_Build 7 82022795 1D ACCCTGTTTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 A 9 8 276071 CASAVA_Build 7 82023401 1I TAAATAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 11 12 276072 CASAVA_Build 7 82025613 13I TGAGACGCCG -------------/CGCCCGGCTGCAT GTTTTCTTTC 2167 het 2167 ref 15 8 6 1 CGCCCGGCTGCAT 0 1 276073 CASAVA_Build 7 82029091 2I ATTGCTAAAA --/AT ATACAATCCA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 AT 1 2 276074 CASAVA_Build 7 82029494 1I AAATAAAAAC -/T TAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 1 2 276075 CASAVA_Build 7 82036190 1I ACATACTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 T 11 12 276076 CASAVA_Build 7 82059410 1I GTGGTGAGGG -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 6 7 276077 CASAVA_Build 7 82061353 4D TTTGGTTTAC TTTG/---- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 21 4 TTTG 1 0 276078 CASAVA_Build 7 82063272 4I CCTTCACTCT ----/TCTC TCTGTCTTTC 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 TC 1 3 276079 CASAVA_Build 7 82065438 2D GATGGTCATT TC/-- TCACCTCTGC 3070 het 3070 hom 45 17 20 9 TC 2 1 276080 CASAVA_Build 7 82068029 3I CAGACAGAGC ---/AGA AGATGATCCT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 AGA 1 2 276081 CASAVA_Build 7 82071151 4D AAACTGGGAT CAAA/---- CAGATTTTAA 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 CAAA 1 0 276082 CASAVA_Build 7 82084634 1D ACCTCAACCC T/- TGCTCTGCTA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 2 1 276083 CASAVA_Build 7 82085497 1I TAGGACATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 22 14 12 T 11 12 276084 CASAVA_Build 7 82086204 1D TTGCAACAGA T/- TTTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 6 5 276085 CASAVA_Build 7 82087915 4I CTGCTATGGA ----/AGGC ACAGCCTTAA 3070 het 3070 hom 57 23 27 7 AGGC 0 1 276086 CASAVA_Build 7 82090117 2D AGAGTGTTTG TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 ref 54 31 18 7 TA 5 4 276087 CASAVA_Build 7 82114138 3D AACCTCCTCA AGG/--- AGAACTACAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 5 AGG 1 0 276088 CASAVA_Build 7 82133334 3I CGATTTTCCC ---/TGT TGTTGGTAGG 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 TGT 1 2 276089 CASAVA_Build 7 82136070 1D TTCTGAATGC T/- TTTTTTTTTT 1699 het 1699 ref 35 24 5 6 T 12 11 276090 CASAVA_Build 7 82156217 1I GAAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 2321 het 2000 hom 30 9 11 10 A 13 14 276091 CASAVA_Build 7 82156403 4I TTATTTTTAC ----/CAAT CAATCAATTT 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 CAAT 2 3 276092 CASAVA_Build 7 82162415 5D AGATGAAGGC CTCAG/----- TTGGCCTACA 3070 het 3070 ref 33 15 14 7 CTCAG 1 0 276093 CASAVA_Build 7 82172279 4I ATAGTGGGGA ----/TCAT TCATTGCATC 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 TCAT 1 2 276094 CASAVA_Build 7 82179333 1I AATAGTAGCT -/G GGGGGGGTTC 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 G 7 8 276095 CASAVA_Build 7 82180078 1D ATACTTTAGG T/- TCATATTCTT 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 T 2 1 276096 CASAVA_Build 7 82248449 2D CAGGTAAGGT AA/-- AAAGATCATG 1850 het 1850 ref 9 5 4 0 A 5 3 276097 CASAVA_Build 7 82253584 4D TCCTCTAGCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 AAAC 3 2 276098 CASAVA_Build 7 82258508 2D ATTAGAATGA AT/-- ATAAATAATC 3070 het 3070 hom 53 21 28 6 AT 2 1 276099 CASAVA_Build 7 82258836 3D ATATTGATGA TTT/--- TAGAGATTAG 3070 het 3070 hom 38 13 23 3 T 4 1 276100 CASAVA_Build 7 82260259 1D TATTAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 11 10 276101 CASAVA_Build 7 82269521 2I TGAAAAAAAA --/AT CACATGAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AT 0 1 276102 CASAVA_Build 7 82286738 4I AGAATATTTA ----/AAGT AAGAACGTGA 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 AAGT 0 1 276103 CASAVA_Build 7 82326450 2I GAAGGGAAAG --/AC ACAGGCCTGG 3070 hom 85 het 36 0 26 10 AC 1 2 276104 CASAVA_Build 7 82363955 1D CTATCCACAT A/- GCTCTACTAC 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 1 0 276105 CASAVA_Build 7 82367807 1I TATGGACTAT -/C TGATTGTAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 276106 CASAVA_Build 7 82400873 1D TGCTCCAGAT A/- AAGGTTACAA 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 A 3 2 276107 CASAVA_Build 7 82403789 1I GTATTGGAAA -/G GATGTAGGGA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 G 1 2 276108 CASAVA_Build 7 82408344 1I ATCATTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 T 10 11 276109 CASAVA_Build 7 82419425 3I AACGGGTTTT ---/TCA TCATCTTCTA 3070 hom 153 het 56 0 51 5 TCA 1 2 276110 CASAVA_Build 7 82432535 1D TAGTTACGTC A/- TTTTTTTTTC 2921 het 2495 hom 27 11 12 4 A 1 0 276111 CASAVA_Build 7 82453606 2I TAGAAATATG --/CT CTCTTTTAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CT 2 3 276112 CASAVA_Build 7 82461870 4I TCATAGTAGG ----/TATA TATATATATA 1792 het 1792 ref 19 10 4 5 TA 6 8 276113 CASAVA_Build 7 82467309 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2147 hom 23 6 12 6 A 10 9 276114 CASAVA_Build 7 82471735 2D CGCTTACACA TG/-- TGTCTTACAC 3070 het 3070 ref 34 20 14 0 TG 2 1 276115 CASAVA_Build 7 82471893 1D CACTAAAAAA C/- ATAACACTAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 C 1 0 276116 CASAVA_Build 7 82472332 3I TAGTACAGAC ---/ATT AGAGAAAACA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 ATT 0 1 276117 CASAVA_Build 7 82474672 8I AAGGGCATAT --------/TAAAATCA TAAAATCATA 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 TAAAATCA 1 2 276118 CASAVA_Build 7 82475834 1D TCTTTCCACC A/- ATTCAATACC 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 A 2 1 276119 CASAVA_Build 7 82478857 1D TTTTAAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 14 8 A 11 10 276120 CASAVA_Build 7 82483237 1D CTATTTCCTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 A 9 8 276121 CASAVA_Build 7 82486686 1D CAATCATAAG T/- TTTTTTTTTA 2796 het 2689 hom 18 7 7 4 T 10 9 276122 CASAVA_Build 7 82487654 1I AGTAGTAAGA -/G GGGGGGGCCT 3070 hom 86 het 37 0 29 8 G 7 8 276123 CASAVA_Build 7 82511383 1D CTTATGTGGT G/- GCAGGGGAGA 3070 het 3070 ref 34 13 15 6 G 2 1 276124 CASAVA_Build 7 82532309 1D CTTGGGTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2551 hom 30 11 15 4 A 15 14 276125 CASAVA_Build 7 82535192 33I GAAACCAAGG ---------------------------------/TGTATTCCCCTTCTATGTTTTAATGAGATTATT TTTTGTTTAC 3033 het 3033 ref 41 24 8 9 TGTATTCCCCTTCTATGTTTTAATGAGATTATT 0 1 276126 CASAVA_Build 7 82538264 1D TCTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 11 10 276127 CASAVA_Build 7 82543277 1D AGAATGAATT A/- AAAATTGATG 3070 het 3070 hom 27 9 18 0 A 5 4 276128 CASAVA_Build 7 82544244 5I CAATTAAAAG -----/TATAA TATAATAATT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 TATAA 1 2 276129 CASAVA_Build 7 82546704 6D GGAGGAGAAG GAAGAA/------ GAAGAAGAAG 3070 het 3070 ref 21 10 8 6 GAA 6 4 276130 CASAVA_Build 7 82553370 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 2389 het 2389 ref 31 18 8 5 T 10 9 276131 CASAVA_Build 7 82553740 2D GCCAAGTTGG AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 10 8 276132 CASAVA_Build 7 82563149 2D ATGTAGACTC TT/-- GTGTTGTTGG 3070 het 3070 ref 35 21 13 2 T 2 0 276133 CASAVA_Build 7 82572217 3I GCAGAAATTC ---/AAG AAGATCAGAG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AAG 1 2 276134 CASAVA_Build 7 82576270 3I AAGTTTGGAC ---/TCT TCTTACCTAA 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 TCT 1 2 276135 CASAVA_Build 7 82583518 1I GGAGAAATGC -/A AATCAATTTA 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 2 3 276136 CASAVA_Build 7 82587076 1D ATCCTATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 9 10 A 11 10 276137 CASAVA_Build 7 82590966 4D ATTTTGCAAA CTAT/---- CTATCTGACA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 CTAT 2 1 276138 CASAVA_Build 7 82625774 2I GCAGAGTACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 10 12 276139 CASAVA_Build 7 82627806 1D ATTATTATTT A/- TTTTTTAGTA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 1 0 276140 CASAVA_Build 7 82628486 1D ACTAAGTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 10 9 276141 CASAVA_Build 7 82651041 1D AGTAATTTAT A/- AAAAAAAAAA 1418 het 1418 ref 26 14 3 9 A 13 12 276142 CASAVA_Build 7 82653345 1D GGTCATAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 132 hom 24 1 21 3 A 10 9 276143 CASAVA_Build 7 82655891 1D ATTTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2790 hom 21 7 10 4 A 12 11 276144 CASAVA_Build 7 82657418 1D TTAAATGCAA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 T 7 6 276145 CASAVA_Build 7 82671785 1I ATTTTCTCTC -/T TTTTCAAAAC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 4 5 276146 CASAVA_Build 7 82673234 2I ACTTTTTTTG --/TT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 8 10 276147 CASAVA_Build 7 82679656 3D TGCTTTATAT ATG/--- ATATTTTTAG 3070 het 3070 ref 17 10 7 0 ATG 1 0 276148 CASAVA_Build 7 82689619 3I CAGTGACAAA ---/AAG AAGTTCTCAC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AAG 1 2 276149 CASAVA_Build 7 82691513 1I TACAACGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 10 17 4 T 14 15 276150 CASAVA_Build 7 82692545 1D AAAAAGGTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 10 12 7 T 9 8 276151 CASAVA_Build 7 82694938 1D CTTTCTTCCA G/- GGCAGTGCCC 3070 het 3070 hom 54 23 27 5 G 3 2 276152 CASAVA_Build 7 82696658 6D ATATTTTAAT TAATAA/------ TTTGAGCACA 3070 het 2886 hom 15 6 8 2 TAA 2 0 276153 CASAVA_Build 7 82702513 2D GTTGCAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2211 het 40 hom 21 1 7 13 T 18 16 276154 CASAVA_Build 7 82704174 2D GGGCTGTCTC AG/-- TGCACAATAA 3070 het 3070 hom 50 19 28 3 AG 1 0 276155 CASAVA_Build 7 82705494 1D TCAGATTTTC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 37 17 17 5 T 9 8 276156 CASAVA_Build 7 82705861 1D CATCAATTTC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 9 8 276157 CASAVA_Build 7 82709692 1I TCATGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1130 hom 40 4 25 11 T 13 14 276158 CASAVA_Build 7 82711046 2D TATAGATTTC TT/-- TGAGTCATAT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 3 1 276159 CASAVA_Build 7 82712482 1D ATATTCTCTC T/- GCTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 T 1 0 276160 CASAVA_Build 7 82713187 1D GAACGATTCA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 105 het 41 0 35 7 T 8 7 276161 CASAVA_Build 7 82713812 3D TGCACACTGT GGG/--- GCTGAGGTTG 3070 het 3070 ref 49 23 24 3 G 4 1 276162 CASAVA_Build 7 82719460 1D CGCGCCTGTA G/- TCCCAGCTAC 3070 hom 47 het 18 0 16 2 G 1 0 276163 CASAVA_Build 7 82727354 2D TGTGTGCGTG TA/-- TATATATATA 2536 hom 15 het 8 0 6 2 TA 7 6 276164 CASAVA_Build 7 82732043 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 110 hom 20 1 11 8 T 15 14 276165 CASAVA_Build 7 82740146 1I TATTTCATTC -/T TTTTTATGGC 3070 het 3070 hom 51 19 27 5 T 5 6 276166 CASAVA_Build 7 82747936 2I ATAGACTCAG --/GA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 GA 0 1 276167 CASAVA_Build 7 82753983 1D TGGCATTAAA T/- TATCACCATT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 2 1 276168 CASAVA_Build 7 82756296 1D TTATTTCCTT C/- TAGCAGCAAA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 C 1 0 276169 CASAVA_Build 7 82760196 1D AATAATAAAA T/- TAAAAAAAAA 1731 het 938 hom 6 2 4 0 T 2 1 276170 CASAVA_Build 7 82762052 1I CAACCAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 10 11 276171 CASAVA_Build 7 82765126 4D AATGACTGTT TTTC/---- TTTCTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 22 17 2 TTTC 2 1 276172 CASAVA_Build 7 82768939 1D GAAAATACGC A/- AATAACAATC 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 A 3 2 276173 CASAVA_Build 7 82770003 2I CATTTGACAC --/AT GTTTCTACAG 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 AT 0 1 276174 CASAVA_Build 7 82778072 4D TCCTTCCCCC ATAA/---- ATAGATATTT 3070 hom 24 het 12 0 9 4 ATAA 1 0 276175 CASAVA_Build 7 82780524 4I AACTTTGAAA ----/TAAG TAAGAGTCTG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 TAAG 1 2 276176 CASAVA_Build 7 82784062 2D TCCTTTCAGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 408 hom 36 3 16 19 A 11 9 276177 CASAVA_Build 7 82784316 4I AAAAGCTAAT ----/AGAG AGGAAATCTT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 AG 1 3 276178 CASAVA_Build 7 82787294 1D AGTTATATAG A/- AAAACCAGTG 3070 het 2838 hom 21 6 13 2 A 5 4 276179 CASAVA_Build 7 82789114 1I ACCTCGCCAG -/C ATGGTGAGAC 3070 hom 53 het 20 0 18 2 C 0 1 276180 CASAVA_Build 7 82797318 1D GATCTCTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 T 10 9 276181 CASAVA_Build 7 82797996 4I TCTCCCTCCT ----/TCTC TATTTCTTCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TC 0 2 276182 CASAVA_Build 7 82802381 1I TTTGGTGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 10 11 276183 CASAVA_Build 7 82803639 1I GAAAAATAGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 8 9 276184 CASAVA_Build 7 82814425 1I TGTAAATTAG -/T CCAACCATTG 2796 het 2796 ref 40 28 6 6 T 0 1 276185 CASAVA_Build 7 82815093 2I CTCAAGAAAC --/TT TGAGAAACAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 3 276186 CASAVA_Build 7 82815769 3D TGGTATATTT AGA/--- AGAAGTCTAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 AGA 2 1 276187 CASAVA_Build 7 82819268 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 9 10 276188 CASAVA_Build 7 82819697 1I GATGATGTTT -/C CCAATTTTTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 2 3 276189 CASAVA_Build 7 82820421 2D TAATGATTTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 AT 7 6 276190 CASAVA_Build 7 82833710 1D AAGAGAGAAG A/- AAATTTGATA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 4 3 276191 CASAVA_Build 7 82838287 8D GGTGGAAGAG GTGCATTT/-------- GTGGGGATGT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 GTGCATTT 1 0 276192 CASAVA_Build 7 82840400 1D AATTTCTAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 10 9 276193 CASAVA_Build 7 82845409 1I GAAATATATA -/T TAGCCACTGA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 1 2 276194 CASAVA_Build 7 82847446 1I ATTGCTTCTC -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 50 23 26 1 T 6 7 276195 CASAVA_Build 7 82851748 1D AAAATATCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 95 het 36 0 32 4 T 9 8 276196 CASAVA_Build 7 82855610 5D AATATATAAT ATAAC/----- ATTATATATA 1963 het 294 hom 7 1 4 2 ATAAC 1 0 276197 CASAVA_Build 7 82858853 1I TATTATATCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 T 7 8 276198 CASAVA_Build 7 82861524 2D ACACACACCT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AC 8 7 276199 CASAVA_Build 7 82861835 6I GCTTACTGTT ------/TGTCTC TGGAATATGA 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 TGTCTC 0 1 276200 CASAVA_Build 7 82863026 5I GTTGAAAACT -----/CTTTC CTTAGATAAG 3070 het 3070 hom 56 22 30 4 CTTTC 0 1 276201 CASAVA_Build 7 82864037 2I TACGGTTTTC --/AA AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 7 9 276202 CASAVA_Build 7 82873829 3D TATTTTCGAA CAT/--- CTTCTTAAAT 3070 het 3070 ref 31 21 9 1 CAT 1 0 276203 CASAVA_Build 7 82881464 6D TTTGTAGAAC TTACCA/------ TTATAAAGAC 3070 het 3070 hom 25 10 13 4 TTACCA 1 0 276204 CASAVA_Build 7 82881611 3D AATGTTTTAA TAT/--- TATTAACAAC 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 TAT 2 1 276205 CASAVA_Build 7 82884365 2D ATTGTACCTC TT/-- TATTCAAGCC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 3 1 276206 CASAVA_Build 7 82886143 1I TTGATTTTTT -/C TATAAATTAG 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 C 0 1 276207 CASAVA_Build 7 82886370 2D CCTAATATTT AG/-- CTCTCACTTA 3070 het 3070 ref 43 26 15 3 AG 1 0 276208 CASAVA_Build 7 82888769 1D AAGTGACAAT A/- AAAATCAATA 3070 het 3070 hom 27 12 14 3 A 5 4 276209 CASAVA_Build 7 82893652 3I CAGTCATAAA ---/AAG AATAAAATAA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 AAG 0 1 276210 CASAVA_Build 7 82898356 3I GAAAAAAAAA ---/AAG AAAAGCCCAA 3070 hom 48 het 20 0 15 5 AAG 0 1 276211 CASAVA_Build 7 82898481 4D TATTTGGTAG ATAA/---- ATAATTTCAA 3070 hom 57 het 24 0 19 7 ATAA 2 1 276212 CASAVA_Build 7 82898936 6D AGTTACAAGC ATGAGT/------ ATGAGTCATT 3070 hom 120 het 41 0 40 2 ATGAGT 2 1 276213 CASAVA_Build 7 82903599 6I AGAAGAATAG ------/AAATAA AAATAAGAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAATAA 1 2 276214 CASAVA_Build 7 82917669 4I GTAAATAAAT ----/AAAA TACAGTAATG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 0 4 276215 CASAVA_Build 7 82917960 4D ATAGGTTATC TTTT/---- TTTGTCTGTA 3070 het 3070 hom 38 15 20 6 T 7 3 276216 CASAVA_Build 7 82919384 2D TGTGTATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 48 het 41 1 29 11 TG 8 7 276217 CASAVA_Build 7 82920674 1D CTCCCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 25 1 14 10 A 15 14 276218 CASAVA_Build 7 82920977 2I29M1I ATTGCAGGCC --AGTCATTCTTCACATCATGTGACCAAAAA-/AGAGTCATTCTTCACATCATGTGACCAAAAAG GTTTATAAAA 3070 het 3070 ref 26 21 8 5 N/A 0 0 276219 CASAVA_Build 7 82921193 6D TTATCTTTAA TATTTT/------ TATTTTTACC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TATTTT 2 1 276220 CASAVA_Build 7 82921597 2I ATAACAGAAA --/CT CTTTAAAATA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 CT 1 2 276221 CASAVA_Build 7 82922262 3D ATGTATAACC CTT/--- ATGATTTTGA 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 CTT 1 0 276222 CASAVA_Build 7 82924481 2D AGAGACAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 2923 het 2923 ref 31 12 9 13 AG 7 6 276223 CASAVA_Build 7 82932273 2I ACTGAAGAAT --/CA CAAAAGAAGT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 CA 1 2 276224 CASAVA_Build 7 82935171 1D TTACAATAGC T/- TTCAAAATCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 3 2 276225 CASAVA_Build 7 82937603 1D ACTTTATCAC T/- TTCTTTCCTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 3 2 276226 CASAVA_Build 7 82942902 2D TGCTGCCTGC TG/-- TGTGCCATGA 3070 hom 131 het 48 0 41 10 TG 3 2 276227 CASAVA_Build 7 82945179 1D TAATTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 T 11 10 276228 CASAVA_Build 7 82950175 10I ATGAAAAAGA ----------/GCAAATAGAC GAAATGGTCT 3070 hom 123 het 45 0 42 5 GCAAATAGAC 0 1 276229 CASAVA_Build 7 82956700 4I ATAAACATAA ----/AAAT AAATCAATTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AAAT 1 2 276230 CASAVA_Build 7 82956999 1D CCACATATTT A/- ACATTTCTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 1 276231 CASAVA_Build 7 82959980 2I ATATATATGT --/AC ACACACACAC 3070 hom 90 het 42 0 31 11 AC 8 9 276232 CASAVA_Build 7 82965756 1D TTTTGAAACA G/- AGTCACTCTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 G 1 0 276233 CASAVA_Build 7 82966281 4D TATAAACCTT TTTC/---- TTTACCTTTC 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TTTC 1 0 276234 CASAVA_Build 7 82969845 1D CAGTCTTAAG A/- AATAAATAAG 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 A 3 2 276235 CASAVA_Build 7 82985570 1I ATTAGCTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 9 10 276236 CASAVA_Build 7 82988315 1I GTCCCTGTTC -/T GAGAAGGACC 3070 hom 74 het 32 0 24 8 T 0 1 276237 CASAVA_Build 7 82992788 1I TTCTCATGTA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 2713 hom 23 7 15 1 T 7 8 276238 CASAVA_Build 7 82993037 3D TTTGTTTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 34 2 27 6 T 17 14 276239 CASAVA_Build 7 82994444 1I TGGGGGGGAA -/G AAAAAGGTTT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 G 0 1 276240 CASAVA_Build 7 82995030 1I AATTTTTGTG -/A ATTTTTTTTT 3070 hom 63 het 35 0 22 13 A 1 2 276241 CASAVA_Build 7 82998541 1I TCATAGTTTT -/G TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 0 1 276242 CASAVA_Build 7 82999955 3D ACCAAAAAAA AAG/--- GGCAGATAAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 AAG 1 0 276243 CASAVA_Build 7 83000333 1D CACTCTGTAA C/- CCTTCTTCTG 3070 het 3070 hom 39 20 17 2 C 3 2 276244 CASAVA_Build 7 83002656 1D AAAAAGTTAC T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 8 7 276245 CASAVA_Build 7 83006855 2I CTTACCAGTT --/TG TCTTTCAGCT 3070 hom 89 het 39 0 30 9 TG 0 1 276246 CASAVA_Build 7 83007086 6I12M3I AAGTTAACTT ------TTTTGTTTTGTT---/TTTTTGTTTTGTTTTGTTTTG TTGTTGTTTC 3070 het 167 hom 21 4 14 4 N/A 0 0 276247 CASAVA_Build 7 83008038 2I TAAATCTGAA --/AC ACAATTAAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AC 1 2 276248 CASAVA_Build 7 83008745 2I GGGAGCCTCA --/CT CTCTCTGTCA 3070 hom 120 het 51 0 40 11 CT 3 4 276249 CASAVA_Build 7 83009120 1I TCATGTTTCC -/A AAGAAGAGAA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 2 3 276250 CASAVA_Build 7 83009441 2D TAAAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 31 2 18 12 A 14 12 276251 CASAVA_Build 7 83010248 2I ATGTACAGAC --/TG TAAAAAAAGT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TG 0 1 276252 CASAVA_Build 7 83012821 3I35M1D AAAAAAAAAA ---AGAAATAGTGGAGAAAACAAACAGATGTGCCAGTCA/GAGAGAAATAGTGGAGAAAACAAACAGATGTGCCAGTC- AAACTAGGGA 3070 het 3070 hom 29 14 23 3 N/A 0 0 276253 CASAVA_Build 7 83017332 1D ATCAATCCAC A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 7 6 276254 CASAVA_Build 7 83021790 1I ATAGGGGCAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 8 9 276255 CASAVA_Build 7 83033327 1D GGGCTCACTG C/- CAATCTCCGC 3070 hom 42 het 19 0 15 4 C 2 1 276256 CASAVA_Build 7 83039450 1I ACCAACATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 9 10 276257 CASAVA_Build 7 83059729 1I TTTCCACCTA -/C CCTCTACCAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 2 3 276258 CASAVA_Build 7 83068685 1I TTACTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 11 12 276259 CASAVA_Build 7 83069738 1D TTAGAAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 27 2 14 11 T 13 12 276260 CASAVA_Build 7 83071377 2I ATAAGAAGAC --/TT TCTTTGTTTA 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 T 1 3 276261 CASAVA_Build 7 83071480 1D AAATTAGTTT A/- ATAAGTAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 2 1 276262 CASAVA_Build 7 83080186 2D TTCAAAACTC AT/-- ATCCATGATT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 AT 2 1 276263 CASAVA_Build 7 83083245 1D ATTAAGAAAA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 32 3 25 4 G 2 1 276264 CASAVA_Build 7 83087033 1I CATAAATTAG -/A AAAAAAAAAT 1109 het 1109 ref 60 49 3 8 A 9 10 276265 CASAVA_Build 7 83102816 1I GTATAGTACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 9 10 276266 CASAVA_Build 7 83111450 1D ACACTACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 12 11 276267 CASAVA_Build 7 83116522 5D TGGGGGAAAT GGGGA/----- GTTCGGGAGG 3070 het 3070 hom 50 20 26 6 GGGGA 1 0 276268 CASAVA_Build 7 83118795 1D AATAAAAAAA G/- AAAATTGGGT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 G 1 0 276269 CASAVA_Build 7 83121849 2D TATTCTTATT TC/-- TGGAAATATA 3070 het 3070 hom 37 10 25 3 TC 1 0 276270 CASAVA_Build 7 83165359 1I AGTTAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 2195 het 2195 ref 22 11 5 6 T 10 11 276271 CASAVA_Build 7 83165835 1D GTGGTGCAGG T/- TGTCTCTGTT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 T 2 1 276272 CASAVA_Build 7 83168452 1D TCTTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2375 hom 24 8 14 3 A 12 11 276273 CASAVA_Build 7 83170691 1D32M7I TTGGTATGTG TTTTTTTTTTAAAAAAAAGAAAGAAAAATACTA-------/-TTTTTTTTAAAAAAAAAGAAAGAAAAATACTAATATCAG ATATCAGTTT 3070 het 3070 ref 38 22 19 9 N/A 0 0 276274 CASAVA_Build 7 83191313 1D ATTTGGCTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 132 het 50 0 44 6 T 9 8 276275 CASAVA_Build 7 83191569 4I AAAAATGTGC ----/AAAA AGTAGAGGTA 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 A 1 5 276276 CASAVA_Build 7 83206511 1I CACGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 hom 35 het 13 0 12 1 C 3 4 276277 CASAVA_Build 7 83219281 2I CTCACTCCTA --/CC CATAACTTCT 3070 het 3070 hom 51 18 29 4 C 1 3 276278 CASAVA_Build 7 83228156 1I GTGCAGGTCC -/A ACTTATATGT 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 A 1 2 276279 CASAVA_Build 7 83235556 1I ATTAAATATC -/T TACAGAAAAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 1 2 276280 CASAVA_Build 7 83244042 1I CTACATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 11 12 276281 CASAVA_Build 7 83244790 4I GCTTCTATGC ----/TCTT TCTAAGTATA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 TCTT 0 1 276282 CASAVA_Build 7 83245118 4D ATGCTCACAA CTGT/---- CTGTCTCCAG 3070 het 3070 hom 50 19 26 7 CTGT 2 1 276283 CASAVA_Build 7 83251825 2D GACAGCAAAT TA/-- AAGTATTGTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 TA 1 0 276284 CASAVA_Build 7 83258672 1I TATTTAATTG -/C CTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 C 1 2 276285 CASAVA_Build 7 83260163 1I ACAGACTGTA -/T TTTTTTCTAG 3070 het 2760 hom 26 6 17 3 T 6 7 276286 CASAVA_Build 7 83261418 1I GCTGTAACCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 9 20 7 A 9 10 276287 CASAVA_Build 7 83275464 1I CAGCTCTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 34 2 13 19 A 10 11 276288 CASAVA_Build 7 83275475 2D AAAAAAAAAC AG/-- GGGTGACACC 3070 het 389 hom 30 5 12 13 AG 1 0 276289 CASAVA_Build 7 83282455 1D GGGAGGTGGA G/- GTTGCAATGA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 2 1 276290 CASAVA_Build 7 83282532 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 20 0 14 7 A 10 9 276291 CASAVA_Build 7 83283910 1D TTAACTTATG A/- AAAAAGTTGA 3070 het 3070 hom 30 14 13 4 A 6 5 276292 CASAVA_Build 7 83296291 4D AAACCTCTTC TCTT/---- TATTAGTTTC 3070 het 3070 ref 58 28 26 9 TCTT 1 0 276293 CASAVA_Build 7 83297427 1I AGAAAAATAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 A 8 9 276294 CASAVA_Build 7 83301124 1D AGGCAGGAGT G/- GGGGGGGGTC 2279 het 2279 ref 18 9 6 3 G 9 8 276295 CASAVA_Build 7 83304987 22D AGCTGAAATT CACATAAGTCCCAAATGGCCTC/---------------------- CACATAAGTC 3070 het 3070 ref 40 23 12 10 CACATAAGTCCCAAATGGCCTC 2 1 276296 CASAVA_Build 7 83314213 16D TGTAAGTTTT TGATGGCTTAAAGCCC/---------------- CATGGTAAGT 3070 het 3070 ref 45 24 18 5 TGATGGCTTAAAGCCC 1 0 276297 CASAVA_Build 7 83317677 1D TGAGGCAATC A/- AGAGTCAGGA 3070 het 3070 ref 56 32 21 3 A 2 1 276298 CASAVA_Build 7 83318618 1D GGCTTTGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 A 12 11 276299 CASAVA_Build 7 83319909 1D ATTGGCATGA T/- TTTTTTTTTT 1217 het 1217 ref 44 35 3 6 T 11 10 276300 CASAVA_Build 7 83327928 2I ACATGTACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 55 24 22 9 AC 8 9 276301 CASAVA_Build 7 83333739 2D ATTAGCAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 14 12 276302 CASAVA_Build 7 83340627 2D GGATCTCTGT AA/-- AGAGACTTAT 3070 het 3070 hom 43 18 20 7 A 3 1 276303 CASAVA_Build 7 83343241 2D AAATAATAAC AG/-- AATGGAAATC 3070 het 3070 ref 30 16 11 5 AG 1 0 276304 CASAVA_Build 7 83348902 1D ATGCACTCAA T/- AAATATGGGT 3070 het 3070 ref 43 26 13 5 T 1 0 276305 CASAVA_Build 7 83349175 6D AAAAACTACT TATAAA/------ TATATAAGTA 3070 het 3070 hom 27 13 14 2 TATAAA 1 0 276306 CASAVA_Build 7 83352681 1I ATAAAAGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 A 10 11 276307 CASAVA_Build 7 83354959 1D CCATAATGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 10 9 276308 CASAVA_Build 7 83362492 4I CCTCCTATAT ----/GTAA GTATTTACTC 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 GTAA 0 1 276309 CASAVA_Build 7 83368391 1I CAAAATAGTA -/T TTGGAAGTTC 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 2 3 276310 CASAVA_Build 7 83372584 1I TTCCTCTTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 9 10 276311 CASAVA_Build 7 83376659 2D TGATGTTTGG TT/-- TTCTGTTCCT 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 T 4 2 276312 CASAVA_Build 7 83379060 3D GGATTTTTAT TAC/--- AATTTAATAT 3070 het 3070 hom 23 11 11 3 TAC 1 0 276313 CASAVA_Build 7 83391505 1D GATATAATTA C/- CAGATAGTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 C 2 1 276314 CASAVA_Build 7 83392385 2I ATTTTATATA --/TT ATATAAATTA 2114 hom 18 het 8 0 7 1 T 0 2 276315 CASAVA_Build 7 83401637 1I AGAAAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 11 12 276316 CASAVA_Build 7 83402998 2I AATTTTTTTT --/TC TTTATTTTTA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TC 0 1 276317 CASAVA_Build 7 83404178 1D TGGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2643 het 2643 ref 31 15 8 8 T 11 10 276318 CASAVA_Build 7 83407153 1D GCACTTTTTT C/- AGCACTAAAG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 C 1 0 276319 CASAVA_Build 7 83408757 1D TACACTTTGA C/- ATTGCCTATT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 C 1 0 276320 CASAVA_Build 7 83410744 1D TTGCAAGTGC A/- AAGTTCTTAC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 3 2 276321 CASAVA_Build 7 83432352 1D CTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2561 het 2415 hom 20 11 7 2 T 13 12 276322 CASAVA_Build 7 83433970 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 11 10 276323 CASAVA_Build 7 83436609 1I CTATATTGCC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 8 9 276324 CASAVA_Build 7 83439238 2D TTGGCTAGTC TG/-- TGTGTGTGTG 2206 het 624 hom 34 4 10 20 TG 9 8 276325 CASAVA_Build 7 83444290 2I TAAGTATTCT --/GA GAGAGATGCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 GA 3 4 276326 CASAVA_Build 7 83449436 1I TAGGTCTCGC -/T TGCCCATTAA 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 T 1 2 276327 CASAVA_Build 7 83450654 6D AATCAAGATC TCTGTT/------ TCGCCAATAA 3070 het 3070 ref 32 18 13 3 TCTGTT 1 0 276328 CASAVA_Build 7 83454109 1I TACCTCTTAT -/A GGGGTGGTGA 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 A 0 1 276329 CASAVA_Build 7 83454219 6D ATCTCTCTCT CTTTCA/------ CACACACACA 2937 het 2937 ref 26 18 8 1 CTTTCA 1 0 276330 CASAVA_Build 7 83456709 4D CCCAATGCTA TCCC/---- TCCCCCCTCC 1409 het 490 hom 6 1 4 1 TCCC 2 1 276331 CASAVA_Build 7 83462974 2I AAATTAAAAC --/TT AGCATCTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 0 2 276332 CASAVA_Build 7 83463951 4D CAATTGACTT TAAC/---- TAACGTGTTG 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 TAAC 2 1 276333 CASAVA_Build 7 83465888 5D GCAAGTACTT TACAA/----- TATAAACTAT 3070 het 3070 hom 26 9 14 6 TACAA 1 0 276334 CASAVA_Build 7 83467218 1D CATGGTCTCC T/- TGAGGAAGGC 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 2 1 276335 CASAVA_Build 7 83468931 4I TGAGGTAACT ----/TACA TAAATAATAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 TACA 0 1 276336 CASAVA_Build 7 83469386 4D TTTGTCAGAC AAAG/---- AACCTTTGAT 3070 het 3070 hom 50 18 28 5 AAAG 1 0 276337 CASAVA_Build 7 83470055 4I TGCATTTTAT ----/ATAG AGAGATTTCA 3070 het 3070 hom 39 11 23 5 ATAG 0 1 276338 CASAVA_Build 7 83471112 1I CAATTCATTG -/A CCTTTATGAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 0 1 276339 CASAVA_Build 7 83471312 1I GTTAATGCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 8 9 276340 CASAVA_Build 7 83475883 1I TTAAACAAAC -/T TTCCCCCTTG 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 2 3 276341 CASAVA_Build 7 83477987 7D2M1D TTTACATTAT TATAATAATG/-------AT- TAAAAGGTTT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 N/A 0 0 276342 CASAVA_Build 7 83482517 1I ATTTGTTGTA -/T TTTTTTGTTG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 6 7 276343 CASAVA_Build 7 83486640 1I GAGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1145 het 1145 ref 36 23 5 8 A 11 12 276344 CASAVA_Build 7 83486982 1I ACTATCAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 8 9 276345 CASAVA_Build 7 83491639 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1351 hom 19 4 9 6 A 10 9 276346 CASAVA_Build 7 83491737 16D GGCGGAGGTT GCAGTGTGCTGAGACC/---------------- GCACCACTGC 3070 het 3070 hom 21 9 12 8 GCAGTGTGCTGAGACC 1 0 276347 CASAVA_Build 7 83492892 1I GATAGTTTAA -/C CCCAAGAAAA 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 C 3 4 276348 CASAVA_Build 7 83497779 2I ATGATTTAAA --/TC TCTCTGAGAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 TC 2 3 276349 CASAVA_Build 7 83501239 1D TTGTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2802 hom 28 8 16 4 T 13 12 276350 CASAVA_Build 7 83502042 1I TTTTTTTGTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 51 15 24 12 T 8 9 276351 CASAVA_Build 7 83511429 1I GTTAAGAGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 19 7 4 T 9 10 276352 CASAVA_Build 7 83526978 2D TGACCCAGAA TT/-- TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 T 7 5 276353 CASAVA_Build 7 83536982 3I AAGTTACAAC ---/ATT ATTACATAGA 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 ATT 1 2 276354 CASAVA_Build 7 83548276 2D CAACATAATT TG/-- TGTTACATTT 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 TG 2 1 276355 CASAVA_Build 7 83550684 1I GCATTCATCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 8 9 276356 CASAVA_Build 7 83551788 1I AGAATAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 A 9 10 276357 CASAVA_Build 7 83552324 2D GGTAAGAGAA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 10 8 276358 CASAVA_Build 7 83552494 2I TGGAATGAGA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 40 0 33 7 T 9 11 276359 CASAVA_Build 7 83554177 1I GTAATTCTCA -/G CAGCTCTCTC 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 G 0 1 276360 CASAVA_Build 7 83556772 2I CAACCATATA --/AC AGTCTGTAGC 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 AC 0 1 276361 CASAVA_Build 7 83557078 1I ACTGAAAAGG -/A AGCCTTTTGT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 1 2 276362 CASAVA_Build 7 83558479 1D GAAAAGAAAG A/- AAAGAAAGAA 1707 het 312 hom 7 1 4 2 A 4 3 276363 CASAVA_Build 7 83561583 1D AGTTTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 11 10 276364 CASAVA_Build 7 83563158 4D GAGGCAGTTG ATTC/---- ATTTTCAATA 3070 het 3070 hom 35 15 19 2 ATTC 1 0 276365 CASAVA_Build 7 83566190 2I TTTTGATAAA --/TG GCTATCAACC 3070 het 3070 ref 29 21 7 1 TG 0 1 276366 CASAVA_Build 7 83568531 1D GATAACAAGA G/- GGGGTTCCAT 3070 het 3070 ref 51 30 18 3 G 5 4 276367 CASAVA_Build 7 83569260 1D CCTGTGGTTA T/- TTTTATTCCT 3070 het 2217 hom 17 7 9 1 T 5 4 276368 CASAVA_Build 7 83572035 3D ACACTAGTGA GTT/--- GTTATCTCAG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 GTT 2 1 276369 CASAVA_Build 7 83575600 1I TTCTACAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 55 22 20 13 A 11 12 276370 CASAVA_Build 7 83581856 1D CTTAATTCCT G/- AAGTTAATCT 3070 hom 132 het 50 0 44 7 G 1 0 276371 CASAVA_Build 7 83582710 1I GATTATACAC -/A TAGGCACTAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 276372 CASAVA_Build 7 83586167 1D ACACAGTTGG T/- CTCTGGTAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 0 276373 CASAVA_Build 7 83588367 2I GAGGGAGACA --/CT CTCTGTTTCC 3070 hom 111 het 39 0 36 3 CT 2 3 276374 CASAVA_Build 7 83591018 2D TTATTGTTTA AT/-- ATATATTATC 2825 hom 18 het 7 0 7 1 AT 4 3 276375 CASAVA_Build 7 83594269 1D AAGAACACAC T/- TTTTTTTTTT 795 het 795 ref 42 37 3 3 T 12 11 276376 CASAVA_Build 7 83595134 6I ATTCTAAATC ------/CTAAGA CTTTTAAATA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CTAAGA 0 1 276377 CASAVA_Build 7 83599640 1I GGCTGTAGAA -/T TTTTCTTAGC 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 4 5 276378 CASAVA_Build 7 83610772 41D CAAGCTCTAG GAGTCTACACGACTGTAAGATTATTGGAACATGTCCATAAA/----------------------------------------- GAGTGGAGGT 3070 hom 85 het 29 0 28 6 GAGTCTACACGACTGTAAGATTATTGGAACATGTCCATAAA 1 0 276379 CASAVA_Build 7 83613713 1D TTTCTCCACA T/- TTTTTTGCTC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 7 6 276380 CASAVA_Build 7 83642987 1I TACAGCAACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 822 hom 42 2 36 4 T 9 10 276381 CASAVA_Build 7 83645754 1I AAATATTAAG -/T TTTAGTGGGT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 3 4 276382 CASAVA_Build 7 83661674 1D AAGGAATTAA G/- GGGGGGGGCG 3070 hom 59 het 24 0 19 5 G 9 8 276383 CASAVA_Build 7 83666687 2D TTAGTTAATC TG/-- TTCTTCTAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 TG 1 0 276384 CASAVA_Build 7 83668051 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 35 1 25 9 T 15 14 276385 CASAVA_Build 7 83674090 2D AGGATATGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 28 1 9 20 A 12 10 276386 CASAVA_Build 7 83675649 25D GCTTGCAGTG AGCCGAGATCCTGCCACTGCAGTCC/------------------------- AGCCTGGGTG 3070 hom 51 het 19 0 18 3 AGCCGAGATCCTGCCACTGCAGTCC 1 0 276387 CASAVA_Build 7 83679948 2D TTTTAACCTT CC/-- AGTGGATAGG 3070 hom 78 het 32 0 27 6 C 2 0 276388 CASAVA_Build 7 83682684 1D AGATGATCCG C/- CCCCCCCTTG 2631 hom 17 het 7 0 6 1 C 8 7 276389 CASAVA_Build 7 83683179 2D ACATATAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 AC 8 7 276390 CASAVA_Build 7 83685254 1I TCTGGTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 11 12 276391 CASAVA_Build 7 83699015 2D TTACTAAGCA AG/-- AGTGTGTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 14 8 AG 2 1 276392 CASAVA_Build 7 83715837 1D TAAACACTGC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 54 22 22 10 T 9 8 276393 CASAVA_Build 7 83719161 5D TCACAAAATA AAAAG/----- AAAACAATTG 3070 het 3070 hom 23 9 13 2 AAAAG 1 0 276394 CASAVA_Build 7 83725813 2D GCAGGATTTT AC/-- ACACATTTTC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AC 3 2 276395 CASAVA_Build 7 83729351 1D TTAATGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 22 6 T 12 11 276396 CASAVA_Build 7 83746706 1I CTATAATCTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 382 hom 48 1 40 7 A 8 9 276397 CASAVA_Build 7 83776077 3I TTTTTTTTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 13 276398 CASAVA_Build 7 83780599 4D TATATGTATA TGTG/---- TGTGTGTATA 349 hom 12 het 7 0 5 2 TG 5 3 276399 CASAVA_Build 7 83787908 4I AGAAATAAAT ----/TAAG TATTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TAAG 0 1 276400 CASAVA_Build 7 83816161 4D GCTTGAAACC GGGT/---- GGCGGAGGTT 3070 het 3070 ref 18 10 8 1 GGGT 1 0 276401 CASAVA_Build 7 83819294 1I CAGCCATAAG -/A AAAAAAAAAA 2100 het 2100 ref 28 11 8 9 A 13 14 276402 CASAVA_Build 7 83819623 1I TAAAAATAAC -/A AAAAAGAGTA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 5 6 276403 CASAVA_Build 7 83819731 1D TGTTGGTATC A/- AAATATCTCA 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 A 4 3 276404 CASAVA_Build 7 83823196 1D CTATTTTTGG A/- AAATAAATGG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 4 3 276405 CASAVA_Build 7 83824072 1D ATAAATACAG A/- AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 7 6 276406 CASAVA_Build 7 83824355 1D AACTAATTTC T/- TTTTTTTTCT 1996 het 1436 hom 10 3 5 2 T 9 8 276407 CASAVA_Build 7 83827775 1D GTTAAACTAA T/- TTCTAAACAG 3070 het 3070 ref 36 14 13 10 T 3 2 276408 CASAVA_Build 7 83831352 4I TTAACATATG ----/ATTT ATTTATTATA 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 ATTT 1 2 276409 CASAVA_Build 7 83832742 2D CTCATCTCTC TT/-- TGTCTCCAAA 3070 het 3070 hom 46 13 26 7 T 3 1 276410 CASAVA_Build 7 83854262 3D AAAAAAAGAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 AAT 6 5 276411 CASAVA_Build 7 83855263 5D AAACACAGAT ATAGG/----- ATAGAAGTCA 3070 het 3070 ref 44 23 18 5 ATAGG 1 0 276412 CASAVA_Build 7 83859212 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 A 13 14 276413 CASAVA_Build 7 83861429 1I AATAGGTATG -/C TTGTAGTTTT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 C 0 1 276414 CASAVA_Build 7 83862611 1D AACCCATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 12 11 276415 CASAVA_Build 7 83862854 4I TGGGGGGAGA ----/TAAT TAATTGAATC 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 TAAT 1 2 276416 CASAVA_Build 7 83883091 1D CGTTTTTGTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 T 8 7 276417 CASAVA_Build 7 83890490 1I AGATTTGCAA -/G TATTAGACTC 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 G 0 1 276418 CASAVA_Build 7 83901536 2D CTTCCTGGAA AC/-- ACACACGAAC 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 AC 4 3 276419 CASAVA_Build 7 83909915 1D AGTCAAAATT A/- AAAAGATAGC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 5 4 276420 CASAVA_Build 7 83920171 1I GGCCTTTTTT -/G GGGGGGGAAG 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 G 7 8 276421 CASAVA_Build 7 83920367 1I AATCTGGAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 A 8 9 276422 CASAVA_Build 7 83922038 4I AACTTAGACA ----/ATAT ATATTTAATC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 AT 2 4 276423 CASAVA_Build 7 83925702 1D TTTAAATCAT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 7 6 276424 CASAVA_Build 7 83928717 1I CTTGGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 7 6 T 11 12 276425 CASAVA_Build 7 83949390 3D TTTCAAACTT CTC/--- ATCGTATAAG 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 CTC 1 0 276426 CASAVA_Build 7 83957001 1I ATTGAACTCC -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 6 7 276427 CASAVA_Build 7 83957368 1D TAATTTTATA G/- GATATTTATT 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 G 2 1 276428 CASAVA_Build 7 83960183 4I AAACAACATT ----/GAGA GAGAGAGAGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 GA 4 6 276429 CASAVA_Build 7 83960980 1I TTATTATCAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 8 9 276430 CASAVA_Build 7 83974357 1I AGGAAACAGT -/A AATGACAAGG 3070 het 3070 hom 52 16 32 4 A 2 3 276431 CASAVA_Build 7 83975783 6I CCTAAAGGGA ------/GTTATG ACCATGACAG 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 GTTATG 0 1 276432 CASAVA_Build 7 83976359 2D CTCTAGTTTT CC/-- CCTTCATGAC 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 C 4 2 276433 CASAVA_Build 7 83978618 1D GGGAATTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 10 9 276434 CASAVA_Build 7 83978878 1D AAGACAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 A 11 10 276435 CASAVA_Build 7 83980844 1I CAGGTACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 25 13 12 T 11 12 276436 CASAVA_Build 7 83984676 1D CTTTTTCATG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 8 7 276437 CASAVA_Build 7 83993651 1D CATTTATTAT A/- AAAAAGTAAT 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 A 6 5 276438 CASAVA_Build 7 84012468 1D AGCAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 2582 het 2582 ref 19 10 6 3 A 12 11 276439 CASAVA_Build 7 84018483 1I TGTTAATGGA -/G GATAACAATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 1 2 276440 CASAVA_Build 7 84027372 3I TTGTCTTCAC ---/AGA AGTAGAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 AGA 0 1 276441 CASAVA_Build 7 84039836 1I TAAAAAAAAA -/G AAGAAGAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 0 1 276442 CASAVA_Build 7 84044926 2D TTCGGAAGAT AA/-- AGTCACTGAA 3070 het 3070 hom 44 18 23 6 A 3 1 276443 CASAVA_Build 7 84051117 1D ACATATAGAG A/- TATAGTAATT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 A 1 0 276444 CASAVA_Build 7 84054192 2D TAGATTTGAC AG/-- AGTTTTGCTG 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 AG 2 1 276445 CASAVA_Build 7 84058371 1D TATTGTTTCC T/- GACTTTTTAA 1810 het 1810 ref 11 6 4 1 T 1 0 276446 CASAVA_Build 7 84061323 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 2924 het 2338 hom 16 6 6 7 A 10 9 276447 CASAVA_Build 7 84101498 1D TTTCATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 19 7 T 11 10 276448 CASAVA_Build 7 84103588 2D TTTTTTTTTT TA/-- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 TA 1 0 276449 CASAVA_Build 7 84114879 1I GAATAAAGGG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 7 8 276450 CASAVA_Build 7 84121426 2I TAACATCATC --/AA TGTTAAAATC 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 0 2 276451 CASAVA_Build 7 84127820 3D ACAAAAACTC AGA/--- AGATTTATTA 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 AGA 2 1 276452 CASAVA_Build 7 84128104 4D TGGTCCACAG ATTT/---- ATTTGCTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 ATTT 2 1 276453 CASAVA_Build 7 84128750 1D AGACTTTTTT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 8 7 276454 CASAVA_Build 7 84132243 2I GGGCCTTAAA --/TC TCTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 TC 2 3 276455 CASAVA_Build 7 84136132 1D AGTGAAAAGG A/- TATATTTATT 2749 het 2749 ref 29 15 8 6 A 1 0 276456 CASAVA_Build 7 84137252 1D TAAAACAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 21 20 10 A 11 10 276457 CASAVA_Build 7 84152561 1I AAATGAGGAA -/T AAAAACAATA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 0 1 276458 CASAVA_Build 7 84154259 1D CAAAGGAGAG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 7 6 276459 CASAVA_Build 7 84154533 1D GAACAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2981 hom 30 9 12 10 T 13 12 276460 CASAVA_Build 7 84172068 1I TCTGTAAAGA -/C CCCCCCCACC 3070 hom 44 het 18 0 12 6 C 7 8 276461 CASAVA_Build 7 84187028 1D TTGAAAGGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 T 10 9 276462 CASAVA_Build 7 84192852 1D GCTAAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 2338 het 2338 ref 24 14 7 3 T 11 10 276463 CASAVA_Build 7 84204108 1D TAAAGTCCAT A/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 1 0 276464 CASAVA_Build 7 84204247 1D TCTTAGACTG T/- TTTCTTGGTT 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 T 4 3 276465 CASAVA_Build 7 84209266 1D TGTTTTCCTG C/- CCCCCCAGAC 3070 het 3070 hom 27 9 10 8 C 7 6 276466 CASAVA_Build 7 84209964 2D TTTGAATATT TA/-- TCTTTTAAAA 2454 het 2142 hom 14 5 6 3 TA 1 0 276467 CASAVA_Build 7 84210617 3D CATTAGACTA GTT/--- GTCTTATATA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 GTT 1 0 276468 CASAVA_Build 7 84212239 4I TCAGTTTTAC ----/ATTT GTTTATCAAA 3070 het 3070 hom 41 13 25 3 ATTT 0 1 276469 CASAVA_Build 7 84243224 1I ATTTTTCCTG -/T TTTTAAGATT 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 T 4 5 276470 CASAVA_Build 7 84246575 1I TATAGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3050 hom 33 9 18 6 A 11 12 276471 CASAVA_Build 7 84252865 1I GAGAAAACAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 7 8 276472 CASAVA_Build 7 84277074 1I TGAAAGATGC -/T GAGAGGCCTT 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 T 0 1 276473 CASAVA_Build 7 84278352 1I CTCTCTCCAT -/C CCCTTTCTGC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 C 3 4 276474 CASAVA_Build 7 84278541 1I GCCCTAAGGG -/A ACTATGAATA 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 A 1 2 276475 CASAVA_Build 7 84279392 4D AAAGTTTTGT TTTG/---- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 29 19 9 5 TTTG 1 0 276476 CASAVA_Build 7 84280031 4I GTTTTAAAAC ----/AATT AATGTGTCAA 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 AATT 0 1 276477 CASAVA_Build 7 84284575 1D TCTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1086 het 558 hom 13 4 6 3 T 14 13 276478 CASAVA_Build 7 84285846 1I CACACTGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 20 11 A 10 11 276479 CASAVA_Build 7 84293855 1I ACATGAGTCT -/G GGGATAGGAG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 G 3 4 276480 CASAVA_Build 7 84294132 1D TACAAAAAAA C/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 12 11 C 1 0 276481 CASAVA_Build 7 84295600 5D ATTTCTAAAG TAACT/----- TAATTATTTG 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 TAACT 1 0 276482 CASAVA_Build 7 84296703 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATAGC 1143 het 156 hom 6 1 4 1 A 6 7 276483 CASAVA_Build 7 84296871 1I AAAACCAACC -/A AAAAAAAAGA 2901 het 1482 hom 15 3 8 4 A 8 9 276484 CASAVA_Build 7 84297685 2I GAGGACTCTA --/TT CTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 0 2 276485 CASAVA_Build 7 84300540 3D42M4D TTTACCCTTC CTTCTTTTGTCAGAAAAATGGTATATCTACAAAATTTAACATGTCCATT/---CTTTTGTCAGAAAAATGGTATATCTACAAAATTTAACATGTC---- CAAAGACAAA 3070 het 3070 ref 33 27 20 1 N/A 0 0 276486 CASAVA_Build 7 84301568 1I TTTGTCTAAT -/G TACAATATTA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 0 1 276487 CASAVA_Build 7 84309473 1I CTTGAGTGTT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 7 8 276488 CASAVA_Build 7 84312445 1I AGAAGGTTGC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 7 8 276489 CASAVA_Build 7 84317507 4I TTGTTTGTTC ----/GTTT GTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 GTTT 2 3 276490 CASAVA_Build 7 84322293 1I AGTTCCCAAC -/A AATTTCTCAT 3070 het 3070 ref 50 34 11 5 A 2 3 276491 CASAVA_Build 7 84346461 3D CTTTTAGAAT ATA/--- ATATTTTAGA 3070 het 3070 ref 32 17 13 4 ATA 2 1 276492 CASAVA_Build 7 84348643 2I GGGCCAGATA --/AG AGAATAAAAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AG 1 2 276493 CASAVA_Build 7 84379290 6I ACATAAACTT ------/AAAGGA AAAGTTTCTA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 AAAGGA 0 1 276494 CASAVA_Build 7 84390441 1I TAAACAAATA -/T TTTGCTAAGA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 T 3 4 276495 CASAVA_Build 7 84404507 9D GAGAAGGAGA AGGAGGAGG/--------- AGGAGGAGGA 3070 het 2622 hom 26 9 13 6 AGG 9 6 276496 CASAVA_Build 7 84417846 1D GTAGTTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2471 hom 32 10 14 8 A 11 10 276497 CASAVA_Build 7 84428360 53I TGCCCCATTC -----------------------------------------------------/TTTCCAAATGAGACAGAAACAAACTTTAGCAAACAGACTTAAAGATGCTTTCA GTACCCTTTG 3070 het 3070 hom 25 12 13 7 TTTCCAAATGAGACAGAAACAAACTTTAGCAAACAGACTTAAAGATGCTTTCA 0 1 276498 CASAVA_Build 7 84430505 1I TTCTTCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2362 hom 27 5 16 6 T 11 12 276499 CASAVA_Build 7 84437137 1D GTTTTCCCTA G/- GGTTCTTCAA 3070 het 3070 hom 56 23 30 3 G 3 2 276500 CASAVA_Build 7 84445103 1D CTACTCTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 9 8 276501 CASAVA_Build 7 84470863 3I AAATAAATGT ---/ATA ATATGTATAA 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 ATA 1 2 276502 CASAVA_Build 7 84476838 1D ACTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 11 10 276503 CASAVA_Build 7 84483503 2D TTGTGATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 16 14 276504 CASAVA_Build 7 84497452 1D TCACCACCTA T/- TTTTTTTTTT 2190 het 2190 ref 26 13 6 7 T 12 11 276505 CASAVA_Build 7 84534795 1I TGAAGTCATG -/A ACCAAACCAA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 A 1 2 276506 CASAVA_Build 7 84538040 3D TGACTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 TTG 3 2 276507 CASAVA_Build 7 84581030 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 8 9 276508 CASAVA_Build 7 84589196 1I AAAAAAGAGT -/A AAAAAAAAAA 1216 het 1216 ref 36 24 5 7 A 13 14 276509 CASAVA_Build 7 84674340 1D CTTGTCCTAG A/- CAAGAGAACA 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 A 1 0 276510 CASAVA_Build 7 84727588 1I TGTGAACTGC -/A AAAATAAAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 4 5 276511 CASAVA_Build 7 84728224 1D TGGATTAGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 58 het 45 1 30 15 A 10 9 276512 CASAVA_Build 7 84736948 1I ATTTTTTCAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 8 9 276513 CASAVA_Build 7 84771340 28D AAAACTTTGA ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 3070 hom 60 het 22 0 21 8 AT 22 8 276514 CASAVA_Build 7 84781787 1D CTGAAGCTAA T/- TTTTGTCATC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 5 4 276515 CASAVA_Build 7 84782267 4D CTCTCTCGCT CTCG/---- CTCTCTCTCT 2520 het 6 hom 30 1 19 11 CTCG 1 0 276516 CASAVA_Build 7 84784208 10D ATCTGAAGAG TATATATATA/---------- TATATATATA 3070 hom 7 het 25 1 19 7 TA 14 9 276517 CASAVA_Build 7 84790825 1D ACACACATTG T/- TAACTAAAGA 3070 hom 111 het 45 0 38 9 T 2 1 276518 CASAVA_Build 7 84790982 10D AAATTTGAGA TATCTTTCTG/---------- TATCTTTCTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TATCTTTCTG 1 0 276519 CASAVA_Build 7 84792903 5I TTTTAGCATG -----/TTGTT TATACAGCCG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TTGTT 0 1 276520 CASAVA_Build 7 84804101 11I GTCTTCTGAG -----------/AAACAAAACAA AAACAAAACA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 AAACAAAACAA 1 2 276521 CASAVA_Build 7 84806279 1D AGTGGGAGGA T/- TTTTTTTTTT 947 het 947 ref 49 42 3 4 T 11 10 276522 CASAVA_Build 7 84846088 1I AGCATGCTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 8 9 276523 CASAVA_Build 7 84859187 1D CAATGCATAG A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 A 1 0 276524 CASAVA_Build 7 84864863 3D TAGTCTGTGT ATA/--- ATGTTTGCTG 3070 het 3070 hom 41 18 23 1 ATA 1 0 276525 CASAVA_Build 7 84866803 1D CACTCAGCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 8 6 A 10 9 276526 CASAVA_Build 7 84867877 2I TCATCCCCAC --/AT GTTACCTGTT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 AT 0 1 276527 CASAVA_Build 7 84868854 1D TTTCTCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2481 hom 32 10 10 12 T 15 14 276528 CASAVA_Build 7 84869296 1I TACAGGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 T 10 11 276529 CASAVA_Build 7 84871297 2I CTTTGATCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 27 8 A 11 13 276530 CASAVA_Build 7 84871668 1D AAAAAAAACT A/- TTTTAAAATT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 A 1 0 276531 CASAVA_Build 7 84871821 4D AAAAACAGAC AAAT/---- AGAGCAATGG 3070 het 3070 ref 37 20 15 5 AAAT 1 0 276532 CASAVA_Build 7 84883055 1D ACAACTGTTA T/- CAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 T 1 0 276533 CASAVA_Build 7 84892039 1I GCATCCACGA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 T 6 7 276534 CASAVA_Build 7 84896362 1D AATGAACAAG A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 A 8 7 276535 CASAVA_Build 7 84896904 1D AAACAACCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 15 17 8 A 10 9 276536 CASAVA_Build 7 84899274 1I TGAGAAGAAC -/T AGTTGAATTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 0 1 276537 CASAVA_Build 7 84901023 31D GACCTACAGA TTTGTAGAACTTTGAACTTGAGGGAGATGGT/------------------------------- TTTGTAGAAC 3070 hom 39 het 28 0 14 19 TTTGTAGAACTTTGAACTTGAGGGAGATGGT 2 1 276538 CASAVA_Build 7 84909167 1I TTCTATGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 11 12 276539 CASAVA_Build 7 84914253 1I TATTTGCCTT -/A TTCTGAACTA 3070 hom 160 het 64 0 54 10 A 0 1 276540 CASAVA_Build 7 84924205 15D CAGGAAATGT TTAATTATGGTCTGG/--------------- TAGGAGCTTT 3070 het 3070 ref 45 28 16 5 TTAATTATGGTCTGG 1 0 276541 CASAVA_Build 7 84929778 1I GTATAGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 A 10 11 276542 CASAVA_Build 7 84933373 2I TGAAAACGAT --/AG AGATTATGGC 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 AG 1 2 276543 CASAVA_Build 7 84936648 1I TGCCTGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 30 1 20 9 A 10 11 276544 CASAVA_Build 7 84943419 1I TAGAAAATTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 0 1 276545 CASAVA_Build 7 84949505 1D TCCTGTGCTC A/- AAAAAAACAG 3070 hom 182 het 75 0 60 16 A 8 7 276546 CASAVA_Build 7 84952720 1D TCCACTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 214 hom 50 1 36 13 T 12 11 276547 CASAVA_Build 7 84952732 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTTTAGTC 3070 het 407 hom 47 5 36 7 C 1 0 276548 CASAVA_Build 7 84956188 3I ATCAAGGCCC ---/TTA TTTCAGAGCT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TTA 0 1 276549 CASAVA_Build 7 84972585 1D GTGAGGATGT G/- TAGGAAAGGG 3070 hom 135 het 52 0 46 6 G 1 0 276550 CASAVA_Build 7 84985264 1I TAAAGATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 41 2 34 5 T 11 12 276551 CASAVA_Build 7 84987114 1I TAGTAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 51 3 38 10 A 13 14 276552 CASAVA_Build 7 85011441 1I AATAAGTAGC -/T TTTGGTTTTC 3070 hom 154 het 58 0 52 6 T 3 4 276553 CASAVA_Build 7 85011737 1D TTTAAAAAAA T/- ATAGAGATAT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 1 0 276554 CASAVA_Build 7 85014474 1I GTTTCTTCTT -/A ACCTCTTATG 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 A 1 2 276555 CASAVA_Build 7 85024477 1D ATTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 35 1 24 11 T 13 12 276556 CASAVA_Build 7 85031566 1D GAATAAATCT C/- CCCCCCCACC 3070 het 3006 hom 26 11 11 4 C 8 7 276557 CASAVA_Build 7 85032034 4I TTCTGTACAT ----/AGTC AGAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 AGTC 0 1 276558 CASAVA_Build 7 85032414 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1913 hom 27 9 17 2 A 12 10 276559 CASAVA_Build 7 85032575 1I GTAAGATGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 A 9 10 276560 CASAVA_Build 7 85037046 2D CATGAAAAAC AT/-- GTATATATAA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 AT 1 0 276561 CASAVA_Build 7 85038573 1I CGACTATATG -/A AAAAATGCTC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 5 6 276562 CASAVA_Build 7 85040605 1I AAAATAAATT -/G AATAGTTTAA 3070 het 3070 hom 28 11 17 0 G 0 1 276563 CASAVA_Build 7 85043487 1I CAGTGAGAAA -/G AGAATACACA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 G 0 1 276564 CASAVA_Build 7 85047312 1I CCGTTATTGG -/T TAAGTTTCTC 3070 het 3070 ref 54 28 18 8 T 1 2 276565 CASAVA_Build 7 85047385 1D TGTAAGTGAT A/- AAAAATTTTG 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 6 5 276566 CASAVA_Build 7 85048600 2D GCAGTGAGAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 121 het 50 0 39 12 TC 7 6 276567 CASAVA_Build 7 85052475 4I CCCATGTACG ----/TATC TATCTATTAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TATC 1 2 276568 CASAVA_Build 7 85053519 5D GCCCATCAAC AAAAG/----- AAAAGATAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 7 AAAAG 2 1 276569 CASAVA_Build 7 85053699 4I CTAAATACAA ----/ATAC AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATAC 0 1 276570 CASAVA_Build 7 85054780 1D TTAGCCTACC T/- TTTTTTCACT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 7 6 276571 CASAVA_Build 7 85060515 1D TCAGTCAGGA T/- TCTGGCCAGG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 2 1 276572 CASAVA_Build 7 85062395 1D AGAAACCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 40 2 31 8 A 11 10 276573 CASAVA_Build 7 85070052 1I GTTGAAAAGG -/T TTTTAAAACA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 4 5 276574 CASAVA_Build 7 85083574 1I AATCAACATG -/A AAAAAAAAAA 1618 het 1618 ref 30 16 7 7 A 10 11 276575 CASAVA_Build 7 85112839 2I ACTGAGCTGA --/TC TAGTCATCAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TC 0 1 276576 CASAVA_Build 7 85119315 1D ATTTAATCCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 402 hom 31 1 28 2 T 10 9 276577 CASAVA_Build 7 85121657 2I ATATACACGC --/AT ATATATATAT 3070 het 1139 hom 48 4 36 8 AT 6 7 276578 CASAVA_Build 7 85121890 1D TTCTTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 199 hom 26 1 20 5 T 12 11 276579 CASAVA_Build 7 85135797 1I AACATTTTAT -/A AGGAAATACT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 276580 CASAVA_Build 7 85139099 4D ACAGACAAAC AGAG/---- AGCCAAGTCA 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 AG 3 1 276581 CASAVA_Build 7 85141263 1D CCCCAGGACC A/- ATAAATTCCA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 2 1 276582 CASAVA_Build 7 85141721 1I ACTTTATATA -/T TTTTTCATTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 5 6 276583 CASAVA_Build 7 85148694 4I TGCTATTGTA ----/TTGT CACCTGTGGT 3070 hom 126 het 43 0 41 2 TTGT 0 1 276584 CASAVA_Build 7 85151806 2D ACTAACAGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 15 5 A 18 16 276585 CASAVA_Build 7 85156998 2D TCTTGAATTG TA/-- TATGAGATCA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 TA 2 1 276586 CASAVA_Build 7 85161555 1D ATTAAGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 12 11 276587 CASAVA_Build 7 85163925 4D GCTCATAAGG AAGA/---- TTCAATAATT 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AAGA 1 0 276588 CASAVA_Build 7 85165161 1D GTATGATACA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 7 6 276589 CASAVA_Build 7 85172662 1D ATACGTAGGG T/- TTTTTTTTTC 1279 het 1279 ref 42 31 3 8 T 10 9 276590 CASAVA_Build 7 85181879 1I TAGCTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 797 hom 42 4 31 7 T 12 13 276591 CASAVA_Build 7 85184501 1I TAACCATGTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 8 9 276592 CASAVA_Build 7 85184595 4I TTGACATTTA ----/ATGT ATATCAGAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATGT 0 1 276593 CASAVA_Build 7 85185900 1D CATCTTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 29 0 25 5 A 11 10 276594 CASAVA_Build 7 85187481 4I TGCTAAGATT ----/CAGA CAGTTTGCTT 3070 hom 135 het 50 0 44 6 CAGA 0 1 276595 CASAVA_Build 7 85188067 1D CATAGCACAG A/- AGAAAGAGTG 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 2 1 276596 CASAVA_Build 7 85189201 1D TAGAGTAGAG A/- AAATGTACAA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 4 3 276597 CASAVA_Build 7 85191687 1D TAAATTATGA T/- TTTTTAAGGG 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 T 6 5 276598 CASAVA_Build 7 85193008 1D AATCTAATCA T/- TTTTTGTGGT 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 T 6 5 276599 CASAVA_Build 7 85194337 7D TTTCTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTGA 3070 hom 58 het 25 0 20 6 T 15 8 276600 CASAVA_Build 7 85209324 1I ATTATTTACA -/T TAACAAAATG 3070 hom 66 het 28 0 21 7 T 1 2 276601 CASAVA_Build 7 85228505 1D ATTAATCCCC T/- AATGAAGAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 1 0 276602 CASAVA_Build 7 85232851 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 8 9 276603 CASAVA_Build 7 85236485 1D AAAATAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1272 hom 22 5 12 5 T 12 11 276604 CASAVA_Build 7 85254775 1D AACTTGGGGG A/- AAAAAAACAG 3070 het 2709 hom 23 6 17 0 A 8 7 276605 CASAVA_Build 7 85256292 1I ATGTTTCAGA -/T TTTTAAACTT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 4 5 276606 CASAVA_Build 7 85256832 1I AGATAAAGAC -/G GGAGCAAACA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 G 2 3 276607 CASAVA_Build 7 85262481 2I AATCAATCAA --/TG TGATACGTGA 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 TG 1 2 276608 CASAVA_Build 7 85264639 3I ATGGTTAATG ---/GAT GGTTCAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 GAT 0 1 276609 CASAVA_Build 7 85269935 1I TTATTTTTTT -/A AAAAATAAGT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 5 6 276610 CASAVA_Build 7 85296765 1D GTTTAATCTA T/- TTTTTTTTAA 2813 het 567 hom 11 2 6 3 T 9 8 276611 CASAVA_Build 7 85298039 1I CTATAATATT -/A AGAGCCAAGA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 1 2 276612 CASAVA_Build 7 85306641 2D TGTACATGAA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 43 22 15 8 TC 6 5 276613 CASAVA_Build 7 85314939 2D TGTGTGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 899 het 899 ref 32 22 5 6 AG 10 9 276614 CASAVA_Build 7 85319710 1I GCTAATACAG -/T TAAGTATTAA 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 T 1 2 276615 CASAVA_Build 7 85319948 1D TAAATAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 12 19 8 A 10 9 276616 CASAVA_Build 7 85327077 1D CCACAATAGT C/- CCCAGTGTGT 3070 het 2703 hom 15 7 8 0 C 4 3 276617 CASAVA_Build 7 85329138 1I TAATGCAGAC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 T 8 9 276618 CASAVA_Build 7 85329430 1I CAAACAAAAC -/A ATGAAAATGA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 2 276619 CASAVA_Build 7 85331604 1I ATTACTTAAA -/C AAAAAATGAA 3070 het 171 hom 47 1 41 5 C 0 1 276620 CASAVA_Build 7 85335709 1I TATGGAAAGG -/A AAAAACCATT 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 A 5 6 276621 CASAVA_Build 7 85336070 1D AACAAAGATC A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 8 7 276622 CASAVA_Build 7 85336869 1D AAAACACTTC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 7 6 276623 CASAVA_Build 7 85338998 2D AATTTACAAG AA/-- AAAAGTAACC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 6 4 276624 CASAVA_Build 7 85339995 3D AATGATAGAT ATG/--- ATAATAATTC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 ATG 1 0 276625 CASAVA_Build 7 85340336 1D68M1D GGTCTTAGAA GCATGATTACAGAAGTATCATATAAAATAAACATAATAAAATCAACTTGCCACCGTATCTTTAAGGTTTA/-CATGATTACGGAAGTATCATATAAAATAAACATAATAAAATCAACTTGCCACCGTATCTTTAAGGTTT- AATAAATTTA 3070 het 3070 hom 28 15 25 10 N/A 0 0 276626 CASAVA_Build 7 85341621 2D AAAAATAGAC AA/-- TACATGAAAA 3070 hom 57 het 35 0 20 18 A 2 0 276627 CASAVA_Build 7 85343716 2D TAACACAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 36 1 28 8 A 12 10 276628 CASAVA_Build 7 85344279 3I CCATAGAATA ---/AAT AATGGACTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAT 1 2 276629 CASAVA_Build 7 85344970 3D ACAGAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 12 9 276630 CASAVA_Build 7 85346055 1D CAAAAGCTGT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 7 276631 CASAVA_Build 7 85346144 1I AACACTAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 10 11 276632 CASAVA_Build 7 85346718 2I AATAACATTG --/AA AAAAAAACCA 3070 het 5 hom 33 2 27 4 A 7 9 276633 CASAVA_Build 7 85347451 4I GAATATATAT ----/ATAC ATATATATAT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 ATAC 0 1 276634 CASAVA_Build 7 85348351 2D ACTAAGAAGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AT 7 6 276635 CASAVA_Build 7 85350723 1D AATAGTTAAC A/- TTTACCTAGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 0 276636 CASAVA_Build 7 85350897 2D GAGTACATAG AC/-- ACAGCTTTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AC 2 1 276637 CASAVA_Build 7 85351683 1D TAAAATATAT A/- TATATATATA 3070 het 17 hom 21 1 14 6 A 1 0 276638 CASAVA_Build 7 85352097 1D ATTATATCAA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 9 8 276639 CASAVA_Build 7 85353369 1I GCTTATTGCT -/A AAAAAATACT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 6 7 276640 CASAVA_Build 7 85357829 1I AGTAAAACCT -/A AATATAGGTG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 3 276641 CASAVA_Build 7 85366348 1I TTGACAGGAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 441 hom 25 1 21 3 T 8 9 276642 CASAVA_Build 7 85370048 2I ATTTCTAACG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 TA 7 8 276643 CASAVA_Build 7 85372205 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 11 12 9 TA 6 5 276644 CASAVA_Build 7 85378096 2D CAATGAATAA CT/-- CTATGCACGC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 CT 2 1 276645 CASAVA_Build 7 85379125 1D CACAAAAAAA T/- ATAAGATAGC 3070 het 3070 ref 41 19 15 8 T 1 0 276646 CASAVA_Build 7 85396456 1I TAAAGGTTAC -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 T 6 7 276647 CASAVA_Build 7 85397094 2I CATATATGTG --/TA TGTACATATA 2603 het 2603 ref 16 9 6 1 TA 0 1 276648 CASAVA_Build 7 85397146 4D TGTGTGTCTG TATA/---- TATATATATA 2054 het 499 hom 13 3 6 4 TA 11 9 276649 CASAVA_Build 7 85401797 10I TATACATGTA ----------/ATTTTTGTAT ATTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 ATTTTTGTAT 0 1 276650 CASAVA_Build 7 85418880 6I TCATCATTGA ------/TAATAT TAATAGTTAT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 TAATAT 0 1 276651 CASAVA_Build 7 85426660 1D AATTTCTGTG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 T 7 6 276652 CASAVA_Build 7 85428942 4D GATTAAAATC TAAT/---- TAAACTTAAA 3070 het 3070 hom 34 17 17 1 TAAT 1 0 276653 CASAVA_Build 7 85437390 1I TCATAGATAA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 8 9 276654 CASAVA_Build 7 85441796 1D TGTAGATAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 9 8 276655 CASAVA_Build 7 85442064 1I CCTATTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 11 12 276656 CASAVA_Build 7 85445762 1D AACATGCTTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 20 12 2 A 10 9 276657 CASAVA_Build 7 85445953 4D TAAAGGATAT TGTC/---- TATTATCTTT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TGTC 1 0 276658 CASAVA_Build 7 85448670 2D TGCATTACAG TT/-- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 57 28 22 8 T 10 8 276659 CASAVA_Build 7 85448949 1I TTATTAGAGG -/T TTTAATAAGT 3070 het 3070 ref 52 26 18 8 T 3 4 276660 CASAVA_Build 7 85450217 1D TTCTATACAG A/- AAAACATTTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 5 4 276661 CASAVA_Build 7 85450391 1D ATTTTACTTT A/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 1 0 276662 CASAVA_Build 7 85451385 1I TCCATGAATT -/A AAAAAAAAAT 2620 het 2620 ref 24 14 8 2 A 9 10 276663 CASAVA_Build 7 85453033 3I CAAGGTTACT ---/ATA ATAATTATTT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 ATA 1 2 276664 CASAVA_Build 7 85468371 1D TCACCATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 13 12 276665 CASAVA_Build 7 85493727 1I CATATTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 T 12 13 276666 CASAVA_Build 7 85507715 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1878 hom 26 5 17 4 A 11 10 276667 CASAVA_Build 7 85532797 2D AACATCATTT CA/-- CACACTGTTG 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 CA 3 2 276668 CASAVA_Build 7 85539600 1I AGCTCATCAG -/T TTTTTCAGGT 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 T 5 6 276669 CASAVA_Build 7 85545691 1D TCGTAAACTT C/- CCGAATATCC 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 C 3 2 276670 CASAVA_Build 7 85546527 1D GGTAAGGCAA T/- ATATATATAT 883 het 385 hom 47 3 6 38 T 1 0 276671 CASAVA_Build 7 85549419 1D TCTCTTAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 9 8 276672 CASAVA_Build 7 85556404 1I TTTCTAATTT -/A TATAGGCAAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 0 1 276673 CASAVA_Build 7 85560807 1I TAATTCTTCC -/T TTTTTTTTTG 1261 het 1261 ref 43 32 3 8 T 9 10 276674 CASAVA_Build 7 85581858 1I AGTACAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 9 10 276675 CASAVA_Build 7 85596894 1D GCCTTGGTTC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 9 8 276676 CASAVA_Build 7 85605691 1D TTAGAATATC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 10 9 276677 CASAVA_Build 7 85629268 1I AGAATTAGGG -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 6 7 276678 CASAVA_Build 7 85650034 1D CTGAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3059 hom 27 10 11 6 A 15 14 276679 CASAVA_Build 7 85652838 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 11 10 276680 CASAVA_Build 7 85661534 1I CATTTTGATA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 6 7 276681 CASAVA_Build 7 85674638 1D TGAAAATCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 11 10 276682 CASAVA_Build 7 85682655 1I ACAGCTATGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 11 22 8 T 9 10 276683 CASAVA_Build 7 85692839 2D CAGGAGGTCA GG/-- GGGGACGTGT 3070 hom 108 het 40 0 35 7 G 6 4 276684 CASAVA_Build 7 85696714 1I GTGACAATTT -/G GGGAAGAAAA 3070 hom 126 het 47 0 40 7 G 3 4 276685 CASAVA_Build 7 85725163 1D CAAATGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 30 2 23 5 A 13 12 276686 CASAVA_Build 7 85731549 1D ATTAGTACCA T/- TTTTATTAAT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 5 4 276687 CASAVA_Build 7 85743095 4D CATACCTATG ACTC/---- TAATACAATT 3070 hom 81 het 28 0 27 4 ACTC 1 0 276688 CASAVA_Build 7 85755440 2I ATAAAGAAAC --/TG TGAGATAGAT 1091 hom 18 het 17 0 7 10 TG 1 2 276689 CASAVA_Build 7 85757502 2I ATTAACTGAC --/AT AAAAAATTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 0 1 276690 CASAVA_Build 7 85760951 1D ATTCAATGGT A/- AAACATTGAA 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 A 4 3 276691 CASAVA_Build 7 85764195 1D GAAAGTAGGG A/- AAAAAAAAAG 1951 het 1951 ref 40 31 5 4 A 10 9 276692 CASAVA_Build 7 85768294 1D TACTGTAGTG T/- TAAGTCATTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 1 276693 CASAVA_Build 7 85768485 1D GAAAAAAAAA G/- CATTCACTGC 3070 hom 79 het 33 0 29 4 G 1 0 276694 CASAVA_Build 7 85768859 1D TAGCTGATAC A/- GCAATAGGTA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 1 0 276695 CASAVA_Build 7 85776212 1I TTCTTTATTT -/A AAAAATGTAC 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 5 6 276696 CASAVA_Build 7 85776718 1I ATTTGAGAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 411 hom 39 1 30 8 T 9 10 276697 CASAVA_Build 7 85788386 1D TTATGTGAAC A/- AAAAAAACTC 3070 hom 108 het 44 0 36 8 A 8 7 276698 CASAVA_Build 7 85792340 9D AGAGTATAAT AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 2472 het 879 hom 31 10 8 14 A 25 16 276699 CASAVA_Build 7 85801333 2I CCCTTCCTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 34 0 25 9 T 10 12 276700 CASAVA_Build 7 85804782 1D ATAATCTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 420 hom 34 1 28 5 T 10 9 276701 CASAVA_Build 7 85805521 1D CCATATAAAA T/- ATTCTTAAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 0 276702 CASAVA_Build 7 85819482 1D AAAAAAAAAA G/- ATCTATTTAA 3070 hom 26 het 30 1 27 3 G 1 0 276703 CASAVA_Build 7 85820339 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 AT 6 7 276704 CASAVA_Build 7 85821781 1I CTTGCAAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 9 10 276705 CASAVA_Build 7 85825951 1I ACAGGCAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1519 hom 45 4 25 16 A 11 12 276706 CASAVA_Build 7 85833501 19I CTTAAGATGG -------------------/TCTTCTGGTTTATGATTAA TCTATCATCC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 TCTTCTGGTTTATGATTAA 0 1 276707 CASAVA_Build 7 85838627 1D CTTTGTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 24 2 12 10 A 15 14 276708 CASAVA_Build 7 85853910 5I AAGTAATAAC -----/ATGAT ATATTAGTTT 3070 het 1984 hom 14 4 8 2 ATGAT 0 1 276709 CASAVA_Build 7 85854765 2D TACATACTTT CC/-- CCTTCCTTTG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 C 4 2 276710 CASAVA_Build 7 85858053 8I CTGCTGATGA --------/AGACATAC AGACATACCT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 AGACATAC 1 2 276711 CASAVA_Build 7 85860679 1D ATTATTCTTC T/- GTGATTATTC 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 T 1 0 276712 CASAVA_Build 7 85868868 2I CTTTGAAGAC --/TA TATATATATA 3070 het 3005 hom 36 10 16 10 TA 7 8 276713 CASAVA_Build 7 85869565 1I CAGATTAATT -/A AAAAAAAAAA 1550 het 1550 ref 46 33 4 9 A 13 14 276714 CASAVA_Build 7 85874458 1I AAACTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 10 11 276715 CASAVA_Build 7 85875022 1D AAGTTTAAAG A/- AAACCTTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 4 3 276716 CASAVA_Build 7 85884989 1I CTTAGTATAC -/T TAGTTCTCCA 2484 het 2484 ref 19 11 6 2 T 1 2 276717 CASAVA_Build 7 85887719 1D CTAATTTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 36 1 27 8 A 11 10 276718 CASAVA_Build 7 85892795 1D AACATCACAC A/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 1 0 276719 CASAVA_Build 7 85903484 1I GAGGTCTGGT -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 50 21 19 10 A 7 8 276720 CASAVA_Build 7 85907509 3D ACTTGAGGTT TTG/--- TTATTGTTGT 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 TTG 1 0 276721 CASAVA_Build 7 85912157 1I TATTTTGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 10 11 276722 CASAVA_Build 7 85914376 1D AAAATAAAAT A/- AAATAAAATA 1450 het 1450 ref 15 8 5 2 A 4 3 276723 CASAVA_Build 7 85917714 2D GCTTTTGATA TG/-- TGTGGATGTA 3070 het 3070 hom 41 14 24 4 TG 3 2 276724 CASAVA_Build 7 85931194 1I AAGCTTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 9 10 276725 CASAVA_Build 7 85935503 1D GAAACAAGGA G/- AGAAGAGGAG 2538 het 2538 ref 25 16 6 3 G 1 0 276726 CASAVA_Build 7 85943217 2D CCAACTCCAC AT/-- GTCTGTTTAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 AT 1 0 276727 CASAVA_Build 7 85944503 1D ATTCATTATC T/- TTTTCCCTGG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 5 4 276728 CASAVA_Build 7 85949463 4D TTTTGTTGTG AAGA/---- CAGACAATAT 3070 het 3070 hom 50 18 26 8 AAGA 1 0 276729 CASAVA_Build 7 85951333 4I CAATGTGCAG ----/GTTA GTTACATATG 2656 hom 18 het 7 0 7 0 GTTA 1 2 276730 CASAVA_Build 7 85957695 1D TTCATCAGTC A/- AATATACAGC 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 A 3 2 276731 CASAVA_Build 7 85961678 16D ACAAAAGATT AAAATTCCTGAAGATC/---------------- AAAATTCCTA 3070 het 3070 hom 35 16 19 10 AAAATTCCTGAAGATC 1 0 276732 CASAVA_Build 7 85967681 5I ATAATTATTC -----/TTAAT TTAAGACCTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TTAAT 0 1 276733 CASAVA_Build 7 85969131 4I TGAGGCTGTC ----/TATT TATTATACCT 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 TATT 1 2 276734 CASAVA_Build 7 85973265 1I TTAAAATTTT -/A AAAATACTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 4 5 276735 CASAVA_Build 7 85973712 1I TAATCATCTG -/T TTTTTTTATA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 7 8 276736 CASAVA_Build 7 85983719 6I TAAATGTTAC ------/TACTAA TACTATTTCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TACTAA 0 1 276737 CASAVA_Build 7 85984986 1D TGCAGTGAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 10 9 276738 CASAVA_Build 7 85987264 1D AATGCATCAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 108 het 43 0 37 8 T 9 8 276739 CASAVA_Build 7 85989605 1D GGTTAAGCCT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 A 9 8 276740 CASAVA_Build 7 85990660 1D GTCCATAACA T/- TTTTTAGCAA 3070 het 3070 ref 28 17 9 3 T 6 5 276741 CASAVA_Build 7 85995873 1D CATGTATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 12 11 276742 CASAVA_Build 7 86004567 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 2737 het 2507 hom 20 10 7 3 TA 9 8 276743 CASAVA_Build 7 86005894 6D AGAAAAGAGA ACACTT/------ ACACACTGTT 3070 het 3070 ref 45 26 16 5 ACACTT 1 0 276744 CASAVA_Build 7 86009152 1D TAATCTCCTC T/- TTCCCAAACT 3070 het 3070 ref 41 18 20 3 T 3 2 276745 CASAVA_Build 7 86022746 32I CTCTTTTATC --------------------------------/AATATTTATTTATTGATAAAATTATTAGATAA AATATTTAAT 3017 het 3017 ref 19 8 7 5 AATATTTATTTATTGATAAAATTATTAGATAA 0 1 276746 CASAVA_Build 7 86026918 2D CACACACACA CG/-- CACACACCCC 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 CG 1 0 276747 CASAVA_Build 7 86027566 1D GCTAACAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 44 1 37 6 A 11 10 276748 CASAVA_Build 7 86029625 1I CCCTCCTGTC -/A GGGGTAGTGA 3070 het 3070 hom 31 8 19 4 A 0 1 276749 CASAVA_Build 7 86046716 1I CTAGGCAATA -/C CATTCAGGAC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 C 1 2 276750 CASAVA_Build 7 86049822 4D AAACAAAATC TGTT/---- TGATTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 19 3 TGTT 1 0 276751 CASAVA_Build 7 86061060 1I TCCATGCACA -/C TTGCTCCCAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 C 0 1 276752 CASAVA_Build 7 86072422 2D TTAAAAAGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 176 hom 24 2 10 13 A 14 12 276753 CASAVA_Build 7 86075796 1D TGACATCACT A/- AATTTTTTTT 3070 hom 14 het 35 2 31 2 A 3 2 276754 CASAVA_Build 7 86078409 1D AGAAACCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 8 9 A 11 10 276755 CASAVA_Build 7 86080030 1D TAGACATTTG T/- GGGGGGAAAT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 1 0 276756 CASAVA_Build 7 86082497 1D AGAAAAAAAA C/- ATTAGGAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 C 1 0 276757 CASAVA_Build 7 86083548 1I GTGGAATGGC -/T TTGACCAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 3 276758 CASAVA_Build 7 86092750 1I ACAGAAATCT -/G GGGGGGAAAT 3056 het 3056 ref 31 22 7 2 G 6 7 276759 CASAVA_Build 7 86099417 1D TGCATGAGCT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 9 8 276760 CASAVA_Build 7 86119480 1D CACCCTCTAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 80 het 42 1 38 3 T 9 8 276761 CASAVA_Build 7 86119564 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 6 7 276762 CASAVA_Build 7 86126170 3I CAAGGTTATT ---/AAC AATAATGTTA 3070 hom 53 het 23 0 18 5 AAC 0 1 276763 CASAVA_Build 7 86127891 8I ATTCATTAGT --------/TGCTTTGA TGATAAAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TGCTTTGA 0 1 276764 CASAVA_Build 7 86131105 5D TTGTGAGAAC ATAAA/----- ATAAGGAGTT 3070 het 3070 hom 48 24 23 3 ATAAA 1 0 276765 CASAVA_Build 7 86135522 1D AATGTCAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 18 8 T 12 11 276766 CASAVA_Build 7 86143690 1D GCAGCAGGAT A/- ATGGGGACTG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 276767 CASAVA_Build 7 86147637 1D ACTTTCAGAC A/- ATATGGCATA 3070 het 3070 hom 55 25 26 6 A 2 1 276768 CASAVA_Build 7 86154744 3D AAAAAAATAA TAT/--- TATCAACCTA 3070 het 3070 ref 30 17 13 1 TAT 2 1 276769 CASAVA_Build 7 86157322 1D ATAGAAGGAT A/- AAAAAGTTTC 3070 het 3070 hom 45 16 26 3 A 6 5 276770 CASAVA_Build 7 86163620 1I ATAGTAAAGA -/T TTGGGGGGAT 3070 het 3070 ref 55 23 23 9 T 2 3 276771 CASAVA_Build 7 86176199 2D ACATACATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 60 het 28 0 21 7 AC 7 6 276772 CASAVA_Build 7 86185198 1I TATCAGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 10 11 276773 CASAVA_Build 7 86192043 1D TATTCAGTTT A/- GCACTCACTT 3070 het 3070 hom 54 22 27 5 A 1 0 276774 CASAVA_Build 7 86199678 6D GGCTATAGAG GCAGTT/------ GTTAGTGTTC 3070 het 3070 hom 32 14 16 6 GCAGTT 1 0 276775 CASAVA_Build 7 86213206 1D ATGAGTTAAT G/- ATGGAGAGAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 G 1 0 276776 CASAVA_Build 7 86215779 1D AATAGAAATA C/- CTGAATAATC 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 C 2 1 276777 CASAVA_Build 7 86240842 1D AATCTTTTCA T/- TTATTTCCTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 10 T 3 2 276778 CASAVA_Build 7 86241934 4D GGGTTGAATT GTCA/---- GTGTGTTTAC 3070 het 3070 hom 29 11 16 4 GTCA 1 0 276779 CASAVA_Build 7 86243285 1D CTCATCCAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 10 9 276780 CASAVA_Build 7 86249473 1I TGGGAGTCCT -/C CCATTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 2 3 276781 CASAVA_Build 7 86250766 4D AAAATATGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 16 14 10 TG 9 7 276782 CASAVA_Build 7 86252762 1I TACCTTTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 T 8 9 276783 CASAVA_Build 7 86254809 2D AGTGGGTGAC AG/-- AGAGAGAGAG 1452 het 1452 ref 37 23 4 11 AG 10 9 276784 CASAVA_Build 7 86420346 1D AGCCTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1645 het 1325 hom 27 13 6 8 A 18 17 276785 CASAVA_Build 7 86460487 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2485 het 2485 ref 23 10 8 5 A 16 15 276786 CASAVA_Build 7 86516543 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 9 10 276787 CASAVA_Build 7 86518528 1D ACCAGGAGAG T/- TTGGGGTGCT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 3 2 276788 CASAVA_Build 7 86560587 1I TTCTAGAGGG -/A AAAACATGAT 3070 het 2012 hom 23 6 14 3 A 4 5 276789 CASAVA_Build 7 86565202 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAATGA 2058 het 851 hom 10 3 5 2 A 8 7 276790 CASAVA_Build 7 86585068 8I TACAGTAAAA --------/TCTCAGAT TCTTCACAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TCTCAGAT 0 1 276791 CASAVA_Build 7 86585659 1D AAAGTAGGAA C/- CCTTAGAAAC 3070 hom 83 het 32 0 28 4 C 3 2 276792 CASAVA_Build 7 86587829 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 39 0 28 12 A 13 11 276793 CASAVA_Build 7 86588997 1D GTATAAATAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 50 het 41 1 35 5 A 8 7 276794 CASAVA_Build 7 86589493 1I TTCAAAGCAG -/A TGATAATAGT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 0 1 276795 CASAVA_Build 7 86601340 1D TATAGAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 36 1 20 15 A 15 14 276796 CASAVA_Build 7 86619114 1I GATGGGTTTA -/T TACGGCTGCA 3070 hom 135 het 54 0 46 8 T 1 2 276797 CASAVA_Build 7 86626661 4I GTACACCAAT ----/AGAG AGAATTTTCA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AG 1 3 276798 CASAVA_Build 7 86630088 4D TTTAAGGTCT TTGG/---- TTGGCTTTTG 2008 hom 30 het 22 0 9 15 TTGG 2 1 276799 CASAVA_Build 7 86632534 3D ATAATATATA CTT/--- CTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 CTT 2 1 276800 CASAVA_Build 7 86633884 2D TAAGAGCCAT AG/-- AGTTCCCTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 AG 2 1 276801 CASAVA_Build 7 86639891 1D TTGCTTAGTC T/- TTTTTTAGCC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 6 276802 CASAVA_Build 7 86641602 1I GAGAGGTAAT -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 276803 CASAVA_Build 7 86646026 1D ATGTACCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1762 hom 41 6 27 8 T 14 13 276804 CASAVA_Build 7 86695098 5D AAAGAAAGAA AAGAC/----- AAGAAAAGAA 3070 hom 85 het 31 0 29 3 AAGAC 1 0 276805 CASAVA_Build 7 86695817 1D CTGTGCCCAG C/- CGTGAAATAG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 C 2 1 276806 CASAVA_Build 7 86724736 1D AAATAGATGC A/- AAAAAAAAAA 2970 het 24 hom 13 1 9 3 A 17 16 276807 CASAVA_Build 7 86774826 1I GTAAAGACAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 8 9 276808 CASAVA_Build 7 86781790 2I AGGCCAAGGC --/AT ATATATATAT 2777 het 540 hom 12 2 8 2 AT 7 8 276809 CASAVA_Build 7 86797912 1I TTTTAAAATG -/A GGGTGAAAAG 3070 hom 86 het 34 0 27 7 A 0 1 276810 CASAVA_Build 7 86812196 9I AGATAGGCCC ---------/CCAAGCTTG GGGGGTAAGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CCAAGCTTG 0 1 276811 CASAVA_Build 7 86836873 1D TAAAAAAAAA T/- CTATTTGTAT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 T 1 0 276812 CASAVA_Build 7 86843224 1I CTACCTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 8 15 9 T 11 12 276813 CASAVA_Build 7 86857080 7D GTTTTTGTTG TTGTTCC/------- TAGCATTAAG 1407 het 1407 ref 13 8 4 1 TTGTTCC 1 0 276814 CASAVA_Build 7 86862523 1I TCTTTTCAGG -/T TTTTTCTGCC 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 5 6 276815 CASAVA_Build 7 86864603 1I ACTCTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 29 1 23 5 A 13 14 276816 CASAVA_Build 7 86865356 1D CTTCTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 697 hom 31 6 7 18 T 13 12 276817 CASAVA_Build 7 86882601 4I CTTTTTAAAT ----/AAAC AGTGATTTGG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AAAC 0 1 276818 CASAVA_Build 7 86884833 1D CCAGCCTTAG C/- CTCTTGGTCA 3070 het 3070 ref 56 28 25 5 C 2 1 276819 CASAVA_Build 7 86893792 1D CATTTCTGGA T/- TTTTTTTCCC 2900 het 2900 ref 23 10 7 6 T 8 7 276820 CASAVA_Build 7 86894852 11D GCTTCCTCCA CTATTAAGATG/----------- TGTCCAACTA 3070 het 3070 ref 48 27 21 4 CTATTAAGATG 1 0 276821 CASAVA_Build 7 86897156 2D GTGTCAGGTC TT/-- TTTTTTTTTA 1755 het 1755 ref 26 11 9 6 T 11 9 276822 CASAVA_Build 7 86908661 4I GTATACATTT ----/ATAA ATAAAGTTGA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 ATAA 1 2 276823 CASAVA_Build 7 86910777 1D TTGAAATTTG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 8 7 276824 CASAVA_Build 7 86912873 1I CTTAACTGAG -/A AAAAACATAA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 5 6 276825 CASAVA_Build 7 86915534 1D TCTTTGTGAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 9 8 276826 CASAVA_Build 7 86919631 4D TGCTTTTCCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2177 het 2177 ref 43 20 8 15 T 20 16 276827 CASAVA_Build 7 86921197 1D GAAATATTTT A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 A 7 6 276828 CASAVA_Build 7 86957495 1I TGGGCAAAGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 8 9 276829 CASAVA_Build 7 86968181 1I GACATTTAGT -/G AGTGTCTACT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 G 0 1 276830 CASAVA_Build 7 86979443 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 38 0 35 4 T 12 11 276831 CASAVA_Build 7 86980496 5I AAATAGCCTC -----/CTTTT CTTTCACTCT 3070 hom 132 het 49 0 43 6 CTTTT 0 1 276832 CASAVA_Build 7 86985085 1D GCTCTCCATG T/- TCGTGCCTGG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 2 1 276833 CASAVA_Build 7 86987470 1I TCTACCATCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 8 9 276834 CASAVA_Build 7 86993782 1I AAAATTTATT -/A AAAAAAAAAA 1241 het 1241 ref 41 31 3 7 A 11 12 276835 CASAVA_Build 7 87002773 1I CTAAACCTTG -/A TTTTTATTGT 3070 hom 85 het 34 0 29 5 A 0 1 276836 CASAVA_Build 7 87020110 2D AACTAAGTGA CT/-- CTTCTAACAG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 CT 2 1 276837 CASAVA_Build 7 87039431 2I TCTTCTGTAT --/AG TTACCAGGAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AG 0 1 276838 CASAVA_Build 7 87043663 2D CTATATATAA GT/-- GTGTGTGTAA 1741 het 1741 ref 17 8 5 4 GT 5 4 276839 CASAVA_Build 7 87060181 1D ATATATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 44 3 22 19 T 17 16 276840 CASAVA_Build 7 87097941 1I TTGCTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 T 13 14 276841 CASAVA_Build 7 87207589 1I GGAGAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 11 12 276842 CASAVA_Build 7 87217112 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 9 10 276843 CASAVA_Build 7 87236164 1D GAATGAACTC T/- TTTTTTTTTT 1576 het 1576 ref 40 30 4 6 T 12 11 276844 CASAVA_Build 7 87252071 1I TTTGGGGGAA -/C CCCTCCTATC 3070 hom 95 het 41 0 30 11 C 3 4 276845 CASAVA_Build 7 87274495 1D CTTGCTGTAG T/- TCTGTTCACA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 2 1 276846 CASAVA_Build 7 87298150 4D ATCAGTAGGA TAGT/---- TATCATATTT 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 TAGT 1 0 276847 CASAVA_Build 7 87307873 12D AAAGAAGAAC GAAACAAAATAA/------------ TTTTGAACTG 3070 hom 105 het 35 0 35 3 GAAACAAAATAA 1 0 276848 CASAVA_Build 7 87364487 1I TAGTTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 34 2 21 11 A 12 13 276849 CASAVA_Build 7 87412152 3D CTCCTCCTTC CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 7 CTT 4 3 276850 CASAVA_Build 7 87412251 3I TTTCACCTCT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 TTC 3 4 276851 CASAVA_Build 7 87447736 2D TTCTTTAAAC TT/-- TTTTTTTCTT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 9 7 276852 CASAVA_Build 7 87449130 1I GATAATAATG -/A ATAACAATAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 1 2 276853 CASAVA_Build 7 87466667 2D ATCAAGAATC AG/-- GGAGACTCAT 3070 hom 156 het 59 0 52 7 AG 1 0 276854 CASAVA_Build 7 87477281 1D AATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1343 het 1343 ref 34 27 3 4 T 11 10 276855 CASAVA_Build 7 87478966 4D TCTTTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 2344 het 2344 ref 26 11 9 7 TC 9 7 276856 CASAVA_Build 7 87479290 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 T 12 11 276857 CASAVA_Build 7 87521408 5D TGGTGCTGTG ATGTC/----- ATGTACACAT 3070 het 3070 ref 34 22 10 6 ATGTC 1 0 276858 CASAVA_Build 7 87529460 3D CTAGATGACA TCT/--- TCTTCCAATA 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 TCT 2 1 276859 CASAVA_Build 7 87542736 4I TGTGAGTGTG ----/AGAA AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 AGAA 0 1 276860 CASAVA_Build 7 87560211 1I GATTTTTTTT -/C CCCCCAGTTA 3070 het 3070 hom 53 20 29 4 C 5 6 276861 CASAVA_Build 7 87560536 1D GGTTTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 12 11 276862 CASAVA_Build 7 87563726 1I TGCTACATAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 19 8 9 2 T 9 10 276863 CASAVA_Build 7 87564872 1D GTGTTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 10 13 A 15 14 276864 CASAVA_Build 7 87568469 1I TATGCTGCCA -/G GGTTGGCAAC 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 G 2 3 276865 CASAVA_Build 7 87574620 1I ATCCAGCTAA -/T TTTTGTATTT 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 4 5 276866 CASAVA_Build 7 87578621 1D GTGCGTACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 10 9 276867 CASAVA_Build 7 87582772 2D CTCACATGGC AG/-- AGAGAGAGAG 1950 het 1950 ref 42 31 5 6 AG 8 7 276868 CASAVA_Build 7 87597383 1D GGATTGGGTA T/- TTTTTACTTC 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 6 5 276869 CASAVA_Build 7 87671690 3I TGATGGCTTT ---/ATA ATAAGCATCT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 ATA 1 2 276870 CASAVA_Build 7 87674759 4D TACAAGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 13 20 9 TTTG 3 2 276871 CASAVA_Build 7 87704644 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3005 het 346 hom 24 2 14 8 T 17 16 276872 CASAVA_Build 7 87707385 1D ATTAAGAGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 9 8 276873 CASAVA_Build 7 87749399 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1176 het 1176 ref 24 13 4 7 T 13 12 276874 CASAVA_Build 7 87772723 1D ACTGTATCAG A/- AAAAAAAAAT 921 het 921 ref 46 33 3 10 A 10 9 276875 CASAVA_Build 7 87799009 5I TTGAGATCTT -----/AAGTA AATTATCCAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AAGTA 0 1 276876 CASAVA_Build 7 87803058 2D ATGAGAATAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 103 het 45 0 35 10 AG 8 7 276877 CASAVA_Build 7 87829080 1I AGTACAGAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 8 9 276878 CASAVA_Build 7 87829193 1D TATGTAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 11 10 276879 CASAVA_Build 7 87844299 1D GGAATTTCTC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 7 6 276880 CASAVA_Build 7 87845253 8D CCAAACACAT ACACAGAC/-------- ACACAGACAC 3070 het 3070 ref 33 12 8 14 ACACAGAC 3 2 276881 CASAVA_Build 7 87846420 2D ATATTACATA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 AT 6 5 276882 CASAVA_Build 7 87872956 1D GGTTGTACAC G/- TTTATCAAAA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 G 1 0 276883 CASAVA_Build 7 87877621 31D ACTTCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------------- AAAAATCCCA 3070 hom 47 het 15 0 16 2 A 36 5 276884 CASAVA_Build 7 87882371 5D CTTGGTTGAC TACTT/----- TACATTTGCT 3070 hom 169 het 64 0 57 9 TACTT 1 0 276885 CASAVA_Build 7 87886649 1I GAATTTATCC -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 68 27 38 3 T 6 7 276886 CASAVA_Build 7 87907737 1I ACTAAGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 29 1 21 7 T 10 11 276887 CASAVA_Build 7 87912558 1I TAATTCCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 439 hom 38 2 31 5 T 9 10 276888 CASAVA_Build 7 87915506 7D TCTTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 2538 hom 27 11 10 9 T 18 11 276889 CASAVA_Build 7 87915926 2I TTATTCAAAG --/AA AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 8 10 276890 CASAVA_Build 7 87925829 1D CACAGAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 31 1 25 5 T 12 11 276891 CASAVA_Build 7 87929997 3I TAATGGGGCA ---/TCT TCTTCTGTTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TCT 2 3 276892 CASAVA_Build 7 87932928 1I GCTTCAGCCT -/C CTAAAGTGCT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 C 1 2 276893 CASAVA_Build 7 87937341 4D GAGTGCAAGA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 66 het 29 0 23 8 TG 10 8 276894 CASAVA_Build 7 87956944 9I CCTCTTCCTT ---------/CTTCTCCTC CTTCTCCTCC 3070 hom 91 het 37 0 29 8 CTTCTCCTC 1 2 276895 CASAVA_Build 7 87971803 2D GTCTATGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 30 0 22 8 T 14 12 276896 CASAVA_Build 7 87972636 1D TTTTTGAAAG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 47 22 14 11 T 9 8 276897 CASAVA_Build 7 88005906 1I AGAAGTTGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 T 8 9 276898 CASAVA_Build 7 88015729 1I CAAAATATTA -/T TATTTTCTAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 1 2 276899 CASAVA_Build 7 88031363 1D TAAGTGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 11 10 276900 CASAVA_Build 7 88037687 1I ACCCTTGGGC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 8 9 276901 CASAVA_Build 7 88058813 1I TTCCATGAAG -/C CTGGGGCCCA 3070 hom 105 het 38 0 31 7 C 1 2 276902 CASAVA_Build 7 88062661 1D CAAGATAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 11 10 276903 CASAVA_Build 7 88064644 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3011 hom 18 het 7 0 7 0 A 9 8 276904 CASAVA_Build 7 88072008 1I ACTAATACGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 10 11 276905 CASAVA_Build 7 88076640 5D ACTGTATAAG AGTTC/----- TGAGGGATTG 3070 hom 108 het 43 0 37 8 AGTTC 1 0 276906 CASAVA_Build 7 88076776 1I TATATGTGGA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 7 8 276907 CASAVA_Build 7 88090287 2D GTGACAAAGG TC/-- TACTATAGAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TC 1 0 276908 CASAVA_Build 7 88109829 1I ATGCTCATTT -/A AAAAAGATAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 5 6 276909 CASAVA_Build 7 88115000 5I GCATTCAGTG -----/AAGTT GAGTATAAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AAGTT 0 1 276910 CASAVA_Build 7 88117634 1D CAAAAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 12 11 276911 CASAVA_Build 7 88123310 2D GACAATAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 1369 het 1369 ref 38 30 3 5 AG 9 8 276912 CASAVA_Build 7 88125383 1I TCCCAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 44 1 28 15 A 10 11 276913 CASAVA_Build 7 88129349 2D TTTTGGCAAC TG/-- TGAATGAAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TG 2 1 276914 CASAVA_Build 7 88131661 1D ATGAAGTATC A/- GGGGAAGAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 1 0 276915 CASAVA_Build 7 88132437 1I TTCCCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 826 hom 38 2 31 5 A 11 12 276916 CASAVA_Build 7 88146632 1I AAGGGAACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 9 10 276917 CASAVA_Build 7 88147052 1I TCATTATATG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 8 9 276918 CASAVA_Build 7 88152278 1D ACTCCCCCTC A/- AAAAAAAAAA 2922 het 707 hom 18 3 8 7 A 14 13 276919 CASAVA_Build 7 88178986 1I GAGTTGCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 387 hom 44 1 39 4 A 9 10 276920 CASAVA_Build 7 88262302 1I TTCTTCTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 10 12 5 A 11 12 276921 CASAVA_Build 7 88269971 1I AATGAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 A 11 12 276922 CASAVA_Build 7 88297593 1I GAAATTTAGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 8 9 276923 CASAVA_Build 7 88396595 1D TAAGGTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 A 12 11 276924 CASAVA_Build 7 88401182 2D GTATTAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2912 hom 33 12 15 6 A 15 13 276925 CASAVA_Build 7 88402620 1D AAAAGTAATT A/- AAAAAAAAAA 2465 het 2465 ref 30 12 13 5 A 17 16 276926 CASAVA_Build 7 88417734 4I ATTCATGAAA ----/ACAG ACAGATTATT 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 ACAG 1 2 276927 CASAVA_Build 7 88417913 1D AGAAAATATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 T 10 9 276928 CASAVA_Build 7 88418177 1D AGTGAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 T 12 11 276929 CASAVA_Build 7 88419730 1D ATTTGTGTTA T/- TTTTTGTCTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 6 5 276930 CASAVA_Build 7 88434495 1I GGCTGGGGGA -/C CCTCAGGAGA 3070 hom 119 het 46 0 36 10 C 2 3 276931 CASAVA_Build 7 88434861 1I AGAACAATAG -/T TAAAACACCG 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 T 1 2 276932 CASAVA_Build 7 88435404 7I TTCAAGAACT -------/AATTACA AAAATGGTGT 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 AATTACA 0 1 276933 CASAVA_Build 7 88437595 2D TATTCTGATG CC/-- CCCCCCCCAC 3070 het 2858 hom 22 10 12 0 C 10 8 276934 CASAVA_Build 7 88468039 3D ATTTCACTCA TGT/--- TGTTGCAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TGT 2 1 276935 CASAVA_Build 7 88470281 1D AGCTATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 T 13 12 276936 CASAVA_Build 7 88475592 1I GTGAGCACCC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 A 8 9 276937 CASAVA_Build 7 88478375 11D GTGGCAGGAG GGAGAATGAGT/----------- GGAGAATGAG 2673 het 2673 ref 30 13 7 11 GGAGAATGAGT 2 1 276938 CASAVA_Build 7 88480573 1D TACTCACTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 A 9 8 276939 CASAVA_Build 7 88485727 1I TTTTATGGAG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 7 8 276940 CASAVA_Build 7 88494495 4I AAAAAAAGCC ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 AG 7 9 276941 CASAVA_Build 7 88498448 2I TATATATATA --/TG TATGTGTGTG 1879 het 1879 ref 20 10 8 2 TG 0 1 276942 CASAVA_Build 7 88499218 1D GTGCAATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 T 11 10 276943 CASAVA_Build 7 88499503 5I TTTTGTGGCT -----/TTAGG TGTAGGAAAT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 TTAGG 0 1 276944 CASAVA_Build 7 88506902 1D TTCAAGTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 10 9 276945 CASAVA_Build 7 88514044 1I TTACTTATCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 9 10 276946 CASAVA_Build 7 88515144 2D GGCTAAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 20 22 7 T 12 10 276947 CASAVA_Build 7 88524761 1I TCATTTATTT -/A AAAAACTCAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 5 6 276948 CASAVA_Build 7 88525654 3D TTTATATTGA TAT/--- TATCACTATA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 TAT 2 1 276949 CASAVA_Build 7 88526216 1D AGTGCTAGGA T/- TTACAGGTGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 3 2 276950 CASAVA_Build 7 88527155 1I CTAATTGGCT -/G GGGCCTGGAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 3 4 276951 CASAVA_Build 7 88533502 1I GGCTAGCTGG -/T TGTAGTAATG 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 1 2 276952 CASAVA_Build 7 88544337 27I AGTGATGATG ---------------------------/AAGAGCTATCTACACAGCCAATGTAGA ATGTTCCCTT 3070 het 3070 ref 56 33 21 2 AAGAGCTATCTACACAGCCAATGTAGA 0 1 276953 CASAVA_Build 7 88545710 3D GAAAATAAAA TTC/--- TTCTTCATTT 3070 het 3070 hom 36 13 23 2 TTC 3 2 276954 CASAVA_Build 7 88550798 2D TCAGAAACAC AT/-- GTGTTTGAGG 3070 het 3070 ref 41 22 16 5 AT 1 0 276955 CASAVA_Build 7 88552392 1I AATATGCTCG -/T CCAAATCAAA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 0 1 276956 CASAVA_Build 7 88561925 1I TGTTTATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 9 10 276957 CASAVA_Build 7 88578695 3D TAGTATTGCC TTG/--- TTGTTTTAAT 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 TTG 2 1 276958 CASAVA_Build 7 88579386 2D TAAAATGGCA AC/-- ACTTTTATGT 1802 het 1802 ref 31 19 4 8 AC 2 1 276959 CASAVA_Build 7 88579973 3D ATTGACATCT TAA/--- TAATATTGAG 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 TAA 2 1 276960 CASAVA_Build 7 88587219 1D TATCTAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 11 10 276961 CASAVA_Build 7 88590408 2D CAAGTTCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 12 11 T 14 12 276962 CASAVA_Build 7 88590965 5I TTAACAGCAT -----/ATGAG ATAAGTATTA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 ATGAG 0 1 276963 CASAVA_Build 7 88591489 1I TATTCTTATC -/T TTGAAAAAGA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 2 3 276964 CASAVA_Build 7 88603088 1I AGCTTAGATG -/A ATGTTCTATA 2949 het 2949 ref 29 20 7 2 A 1 2 276965 CASAVA_Build 7 88618951 1I AGATCTCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 A 11 12 276966 CASAVA_Build 7 88619504 1I TGGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1838 hom 25 8 10 7 T 11 12 276967 CASAVA_Build 7 88621304 1D CTAATAATCC A/- ATCAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 A 2 1 276968 CASAVA_Build 7 88625832 1D CCACCAACTT A/- ATGGAATAGA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 2 1 276969 CASAVA_Build 7 88626657 1D TTGGCTTTAC T/- TTTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 7 6 276970 CASAVA_Build 7 88629382 1I TTTCAGGGGC -/G GGGGGGAAGT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 G 6 7 276971 CASAVA_Build 7 88630133 19D CAATTCCCAC CTATGAATTCTCATATTCA/------------------- CTATGAGTGA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CTATGAATTCTCATATTCA 1 0 276972 CASAVA_Build 7 88630917 2I CACTTTTAGC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 9 11 276973 CASAVA_Build 7 88635573 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 96 het 38 0 32 7 TA 6 5 276974 CASAVA_Build 7 88640996 12D CCATCCATTT ATCCATCCATCC/------------ ATCCATCCAT 3070 het 3070 ref 39 20 19 12 ATCC 5 2 276975 CASAVA_Build 7 88642385 14I GTTGCCTGTG --------------/CTTGTGGGGTATTA CTCAATAAAT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 CTTGTGGGGTATTA 0 1 276976 CASAVA_Build 7 88642555 1D GGATATCCAA T/- TTTCTCAGCA 3070 het 3070 hom 37 14 21 3 T 4 3 276977 CASAVA_Build 7 88642810 2D ATTCTAGCTC TG/-- TGATTCCATA 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 TG 2 1 276978 CASAVA_Build 7 88643837 5D TTCTTTCTTT CTTTC/----- TTTTTTTTTT 1860 het 182 hom 22 2 15 5 CTTTC 1 0 276979 CASAVA_Build 7 88645185 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1575 hom 14 4 8 3 A 12 11 276980 CASAVA_Build 7 88645555 1I ACTCCTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 842 hom 32 5 23 4 T 10 11 276981 CASAVA_Build 7 88645572 1I TTTCTGGTGG -/T TTTTGTGGTT 3070 het 940 hom 35 5 22 8 T 4 5 276982 CASAVA_Build 7 88648861 7I TGTCTTTCTT -------/CAGTGGC CAGTGGCTCT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 CAGTGGC 1 2 276983 CASAVA_Build 7 88651741 1D AACTTTAAAT G/- TCAGTTCTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 7 G 1 0 276984 CASAVA_Build 7 88652119 1D ATATTCCTAT G/- GGCAACTAGA 3070 het 3070 ref 34 19 8 8 G 3 2 276985 CASAVA_Build 7 88653862 1D TAAGTGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 T 11 10 276986 CASAVA_Build 7 88660524 1I AAAAGCTTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 20 0 10 10 T 12 13 276987 CASAVA_Build 7 88663144 1I ACTGCTCAAA -/G AAATCAGAGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 0 1 276988 CASAVA_Build 7 88666066 2D AATCCAAAAG AC/-- ACAGTAGCAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 AC 2 1 276989 CASAVA_Build 7 88675853 1D TTTCCTTTCT A/- ACTTGTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 2 1 276990 CASAVA_Build 7 88685387 1D ACCAACATTT A/- TGTATTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 0 276991 CASAVA_Build 7 88686986 4D GTTGGAATGT GTGG/---- GTAAGTCTTG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 GTGG 1 0 276992 CASAVA_Build 7 88693785 3D TAAAATTATT TAA/--- TAATAATTTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAA 3 2 276993 CASAVA_Build 7 88709053 1D GAGAATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 620 hom 43 4 30 9 T 13 12 276994 CASAVA_Build 7 88723787 2I AGAGCAAGAC --/TT TGTCAAAAAA 3070 hom 88 het 37 0 28 9 T 1 3 276995 CASAVA_Build 7 88730227 1I2M1I CTTTGTAGCT -TA-/GTAC GTTGTCCTGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 N/A 0 0 276996 CASAVA_Build 7 88730606 1I TTGATATGGC -/T TTTTTTCCGC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 6 7 276997 CASAVA_Build 7 88732516 2D GGTTAAGTCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 66 het 34 0 21 13 GT 14 13 276998 CASAVA_Build 7 88735823 1I TTTATTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 336 hom 45 1 42 2 T 9 10 276999 CASAVA_Build 7 88735937 1D ACCTGGCTTT A/- AAGCAAATCC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 3 2 277000 CASAVA_Build 7 88741178 1D CAATAAGAGA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 105 het 41 0 35 7 T 7 6 277001 CASAVA_Build 7 88755185 2I GATTTTCAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 10 12 277002 CASAVA_Build 7 88765377 2D TTTCATATAA AT/-- ATATATATAT 2261 hom 18 het 8 0 7 1 AT 8 7 277003 CASAVA_Build 7 88777336 1D TTTTTAAGGC A/- AAAAAAAAAA 1487 het 1487 ref 33 23 4 6 A 15 14 277004 CASAVA_Build 7 88827131 7D CTAATGCTAT CCCTCCC/------- CCCTCCCCCC 1249 hom 7 het 4 0 3 1 CCCTCCC 3 2 277005 CASAVA_Build 7 88845117 1I ATATCTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 T 10 11 277006 CASAVA_Build 7 88846236 17D ATTCCACAGT GGAATGTTTATAAGAAC/----------------- CATCTTATAA 3070 het 3070 ref 42 31 14 5 GGAATGTTTATAAGAAC 1 0 277007 CASAVA_Build 7 88859264 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATAATATAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 TA 3 2 277008 CASAVA_Build 7 88859404 44I TTTTAATTGT --------------------------------------------/TTAAAATTAAACAATTTAATTGTTTAATTTTATTAAAATTTAAA TTAAAATTGG 3070 het 3070 hom 22 12 12 1 TTAAAATTAAACAATTTAATTGTTTAATTTTATTAAAATTTAAA 0 1 277009 CASAVA_Build 7 88862371 3I CTTTCTCTAC ---/TAA TAATGCAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 TAA 1 2 277010 CASAVA_Build 7 88883439 5I TGATTAGTGT -----/TATGA TATAAATTTC 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 TATGA 0 1 277011 CASAVA_Build 7 88887447 2D ATCATCCTTG TC/-- TCTGTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TC 2 1 277012 CASAVA_Build 7 88887605 4I TATTAATCTC ----/AGTT AAGTTAGTTA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 AGTT 0 1 277013 CASAVA_Build 7 88890799 1D24M5I TGTAATATGC AAAAAAAAAAAGCATTTGAAAAGAT-----/-AAAAAAAAAAGCATTTGAAAAGATTATTC TATATCAGAG 3070 het 3070 hom 38 17 27 10 N/A 0 0 277014 CASAVA_Build 7 88891454 1I TTTTCTTTAT -/C CCCCTTTTTT 1952 het 1952 ref 29 13 11 5 C 4 5 277015 CASAVA_Build 7 88925424 4D AATGCTTGTG TGAT/---- TGATTTAGTC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 TGAT 2 1 277016 CASAVA_Build 7 88933793 1D TAATATTAAG T/- TTTTAACTTA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 5 4 277017 CASAVA_Build 7 88939375 1D TTTTCCATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 12 11 277018 CASAVA_Build 7 88946218 1D ACCCCTTGTA T/- TTTTTGTATA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 6 5 277019 CASAVA_Build 7 88951278 1D TTTACATAAA T/- TTTTTTGAGT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 7 6 277020 CASAVA_Build 7 88969265 5D CAAGACTAAT TTTTA/----- TTTTATTTTA 2878 het 2833 hom 18 8 6 4 TTTTA 3 2 277021 CASAVA_Build 7 89034227 2D AGACAACACA CC/-- CCAGAATCTT 3070 hom 78 het 31 0 26 6 C 4 2 277022 CASAVA_Build 7 89093545 4D AAAAACAGAA ACAG/---- AGAGAAAATG 3070 het 3070 ref 30 17 12 2 ACAG 1 0 277023 CASAVA_Build 7 89093643 2I AGAAAGAGAG --/AA AGACATAGAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 1 3 277024 CASAVA_Build 7 89094597 1I TCATCTTTGG -/A AAAAAAAAAA 2518 het 2518 ref 23 9 7 7 A 13 14 277025 CASAVA_Build 7 89169331 2D TTCTGTAGGG AA/-- GAGAGAGAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 0 277026 CASAVA_Build 7 89173243 2I CCCCCCCCCC --/CA AAAAAAAGTG 1813 het 3 hom 20 1 12 7 CA 0 1 277027 CASAVA_Build 7 89174490 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 344 hom 39 1 37 1 A 8 9 277028 CASAVA_Build 7 89175572 6D CATATGATTT AAACTA/------ AATTTTAGAT 3070 het 3070 ref 21 12 10 0 AAACTA 1 0 277029 CASAVA_Build 7 89175831 1I CGTGAAAAAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 2380 hom 29 10 15 4 A 7 8 277030 CASAVA_Build 7 89181161 3I TTACAGTATT ---/AAA AACCACGTGG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 2 5 277031 CASAVA_Build 7 89189149 1I CTTCCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2527 hom 27 7 13 7 A 13 14 277032 CASAVA_Build 7 89196182 7I33M1I TCTTTCACTG -------CCTTTATCTCTGATTTCTTATACAGTATAGTTC-/CCTTTATCCTTTATCTCTGATTTCTTATACAGTATAGTTCT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 21 6 N/A 0 0 277033 CASAVA_Build 7 89196743 1I CTCTGCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1933 hom 31 4 24 3 A 11 12 277034 CASAVA_Build 7 89196910 1I TTTATGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 10 11 277035 CASAVA_Build 7 89199752 2D CTTGGAGAAC AG/-- AGTCTAATAT 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 AG 2 1 277036 CASAVA_Build 7 89201242 1I CTAAGAGTGA -/G CCACCCACAA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 0 1 277037 CASAVA_Build 7 89201682 2I CCTGTAACAC --/AT ATACACCATG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AT 1 2 277038 CASAVA_Build 7 89202237 4D CCATACCCAG AGTA/---- AGTGTCTATT 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 AGTA 1 0 277039 CASAVA_Build 7 89203303 1I CTTCCTGCCA -/C CCCCCCGGCC 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 C 6 7 277040 CASAVA_Build 7 89206826 2D ACTCACTGAG AA/-- AAGTTTCCTT 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 A 4 2 277041 CASAVA_Build 7 89207570 5D TAGTTTTACA CTTAT/----- CTTAAGTTGT 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 CTTAT 1 0 277042 CASAVA_Build 7 89210268 2D ATGATAATGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 AT 6 5 277043 CASAVA_Build 7 89210350 1D CTCTCTCATT A/- AAAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 7 6 277044 CASAVA_Build 7 89213826 1D TGGAAAAAGG A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 41 het 32 1 26 5 A 8 7 277045 CASAVA_Build 7 89217065 1I CATTGCATTC -/T TTTTTTTTTC 2880 het 2880 ref 27 15 7 5 T 9 10 277046 CASAVA_Build 7 89217260 1I CAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 G 0 1 277047 CASAVA_Build 7 89220186 1D TTTCACGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 A 11 10 277048 CASAVA_Build 7 89227515 1I TTCACTTCTT -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3040 hom 18 9 8 1 C 7 8 277049 CASAVA_Build 7 89230420 1I AGAGTGGGTA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 6 7 277050 CASAVA_Build 7 89231160 2D AAACAATTTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 156 hom 35 1 29 6 AT 7 6 277051 CASAVA_Build 7 89241511 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACTT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 C 1 0 277052 CASAVA_Build 7 89241986 1I TGAGAATCCA -/T TTTAACGACT 3070 hom 163 het 61 0 55 6 T 3 4 277053 CASAVA_Build 7 89242458 2I TCACACAGAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 78 het 37 0 27 10 AG 8 9 277054 CASAVA_Build 7 89248600 1I TTTAAGCTTA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 6 7 277055 CASAVA_Build 7 89252158 1I AAAGAACTAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 8 9 277056 CASAVA_Build 7 89260862 12D TCTGATATCC CCAAGCTGAATT/------------ CCCCTTGGCA 3070 het 3070 ref 41 24 16 7 CCAAGCTGAATT 1 0 277057 CASAVA_Build 7 89273931 4D ACCAGATGAC TATG/---- TATGTACCTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 TATG 2 1 277058 CASAVA_Build 7 89274385 1I TTTTTTTTTT -/A AATTCTTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 2 3 277059 CASAVA_Build 7 89275385 1I CCATCCACAT -/A GAATCTACTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 0 1 277060 CASAVA_Build 7 89282177 3I ATTCAAAAAT ---/ATC ATAATAGTTT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 ATC 0 1 277061 CASAVA_Build 7 89284829 1I TAATCTGCTA -/T CATGAATATT 3070 het 1476 hom 15 3 10 2 T 0 1 277062 CASAVA_Build 7 89289674 4D TTTATATATA ATAT/---- ATAAATTTTA 1433 het 1433 ref 7 4 3 2 AT 3 1 277063 CASAVA_Build 7 89299744 1I GAAAGAAAAA -/G GTTTAATGAG 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 G 1 2 277064 CASAVA_Build 7 89302023 1I ATTCCGTGGG -/A AAAAAAAAAA 2143 het 2143 ref 21 9 8 4 A 15 16 277065 CASAVA_Build 7 89306547 1D TCTACCACTC A/- AAAAAAAAAA 1171 het 1015 hom 35 7 8 20 A 18 17 277066 CASAVA_Build 7 89312427 1D AAAAGCTAAA C/- AATGTTGGGA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 C 1 0 277067 CASAVA_Build 7 89319421 1D GTTAATCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 13 12 277068 CASAVA_Build 7 89320425 1D TAAACATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 42 2 33 7 T 11 10 277069 CASAVA_Build 7 89323354 1D TTAATGAAAA G/- CAGCCCCAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 G 1 0 277070 CASAVA_Build 7 89329563 1D ACTGGAAAGA G/- AAATTATGCA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 G 1 0 277071 CASAVA_Build 7 89331982 5D TATATAAGCA AATAT/----- AATATATATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AATAT 2 1 277072 CASAVA_Build 7 89333511 1I TGTCCGGGGT -/G GGGGGGGTGT 1835 het 1835 ref 15 8 5 2 G 7 8 277073 CASAVA_Build 7 89344353 1I AAGTTGGATT -/C CAGTTGACTG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 C 1 2 277074 CASAVA_Build 7 89349175 8D ACTCCAACTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3042 hom 36 het 16 0 12 5 A 22 14 277075 CASAVA_Build 7 89353139 10D CCATTTTTAC TGGGATGAGA/---------- TGAGATCTCA 3070 hom 103 het 37 0 35 5 TGGGATGAGA 1 0 277076 CASAVA_Build 7 89357212 1D TGTTTGTGGG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 7 6 277077 CASAVA_Build 7 89357892 2D AAACCACAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 42 1 35 7 A 13 11 277078 CASAVA_Build 7 89372233 2I GGGAGCTATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 A 12 14 277079 CASAVA_Build 7 89375341 2D GTAAATACAC AT/-- GCAGCAGAAA 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 AT 1 0 277080 CASAVA_Build 7 89375729 1I AACTAATTAC -/T TTGTAAAATG 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 2 3 277081 CASAVA_Build 7 89377604 1I ACCCACAAAG -/A AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 6 7 277082 CASAVA_Build 7 89377929 2I TATTTTTAAA --/AC ACACACACAC 2757 het 1563 hom 24 8 13 3 AC 6 7 277083 CASAVA_Build 7 89378239 1D ATTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 11 10 277084 CASAVA_Build 7 89378454 2I AAAAAAAAAC --/AT AAAGCAAAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AT 0 1 277085 CASAVA_Build 7 89379979 2I TAAAAGCGAA --/AG AGAGGATTCA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 AG 2 3 277086 CASAVA_Build 7 89380803 2D GAGAGAGAAT GA/-- GAGAGAATGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GA 4 3 277087 CASAVA_Build 7 89398716 1I CTTTTGTGTA -/G GCCAGAAGGC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 G 1 2 277088 CASAVA_Build 7 89415434 1I CTATCCAGTA -/T TGTTAACTGT 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 T 1 2 277089 CASAVA_Build 7 89425080 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 888 hom 27 3 13 11 A 13 12 277090 CASAVA_Build 7 89432456 4D TTGAAGTTGC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 46 20 18 9 TTGT 4 3 277091 CASAVA_Build 7 89432638 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 1948 het 1948 ref 22 11 5 6 T 9 8 277092 CASAVA_Build 7 89434015 1D TTGCCCTAAC A/- AAAATATGAC 3070 het 3070 hom 55 24 29 2 A 5 4 277093 CASAVA_Build 7 89434152 1I GATGGCCTTC -/T GGCTGTGTCC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 0 1 277094 CASAVA_Build 7 89434501 1D CTGAGGAATT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 8 7 277095 CASAVA_Build 7 89434766 1I32M1D TTGTTTAAAA -TCTGGAAACATATTTTCTGTACTCTTGCATCAT/TTCTGGAAACATATTTTCTGTACTCTTGCATCA- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 25 27 3 N/A 0 0 277096 CASAVA_Build 7 89435430 1D TTTAGAACAT A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 hom 26 7 14 5 A 7 6 277097 CASAVA_Build 7 89436108 4D CTGTTAAAAA AAAT/---- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 AAAT 1 0 277098 CASAVA_Build 7 89446972 1I TTAGACCTTC -/A AAGTGAAGAT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 2 3 277099 CASAVA_Build 7 89454271 6I TGACTACAGT ------/TAATAA TAATATATTG 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 TAA 1 3 277100 CASAVA_Build 7 89455593 10I TAAGTAAATT ----------/CTTTGCTAGC CTCCCATAAA 3070 het 3070 ref 42 20 21 1 CTTTGCTAGC 0 1 277101 CASAVA_Build 7 89455848 20D TGCCTTACTG CCTACCTGTTCCTCTTCCTA/-------------------- CCTACCTGTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 11 CCTACCTGTTCCTCTTCCTA 1 0 277102 CASAVA_Build 7 89458135 1I AAGTTAGAAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 7 8 277103 CASAVA_Build 7 89469094 1D CATGTTGACC A/- AGATAGTTAT 3070 het 3070 hom 46 18 27 2 A 2 1 277104 CASAVA_Build 7 89475193 3I AAGTCTGAGC ---/ATA ATAAGTCATT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 ATA 1 2 277105 CASAVA_Build 7 89479451 1D CTAAATATAC A/- AAAAAAAAAA 2903 het 2729 hom 22 8 10 4 A 12 11 277106 CASAVA_Build 7 89480416 1D ACGAAGAACA G/- GTTTGCTGAG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 G 2 1 277107 CASAVA_Build 7 89482910 2I AGAAAATATT --/CA CAGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 25 9 4 CA 1 2 277108 CASAVA_Build 7 89484367 2D AACGAAGAAT CA/-- CAGCTGATTT 3070 het 3070 hom 42 14 24 5 CA 2 1 277109 CASAVA_Build 7 89486381 4D TGGATTAAAT AAAG/---- AGTTTCAAGC 3070 het 3070 ref 35 18 13 6 AAAG 1 0 277110 CASAVA_Build 7 89512716 2D ATATAGTGTG TA/-- TATATATATA 1798 het 387 hom 6 2 4 0 TA 6 5 277111 CASAVA_Build 7 89516909 1D CACTTTTTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 9 8 277112 CASAVA_Build 7 89520615 1D GAAGTATTTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 9 8 277113 CASAVA_Build 7 89582374 1I7M1I TTATTATAAG -ACAGTGA-/AACAGTGAT TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 22 8 2 N/A 0 0 277114 CASAVA_Build 7 89602870 1D TCTCCAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 46 het 26 0 18 8 A 10 9 277115 CASAVA_Build 7 89616829 19D GCATAATACT TCAGCCCTGGGGGCCCCAC/------------------- TCACCTGGTA 3070 hom 36 het 10 0 12 4 TCAGCCCTGGGGGCCCCAC 1 0 277116 CASAVA_Build 7 89622510 1D CAGCCCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 503 hom 19 2 10 7 A 11 10 277117 CASAVA_Build 7 89627544 4I CCAAGAGATC ----/ATCT AGTAAATTGA 2456 het 2456 ref 40 30 6 4 ATCT 0 1 277118 CASAVA_Build 7 89641349 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 10 11 277119 CASAVA_Build 7 89654380 1D CAAAATGATT A/- GGGGGTATAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 0 277120 CASAVA_Build 7 89656146 1D CAGTGGTAAT A/- AATACATTCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 3 2 277121 CASAVA_Build 7 89663215 1D TTTGTTTTTG T/- TTTGAGATGG 3070 hom 75 het 26 0 26 1 T 4 3 277122 CASAVA_Build 7 89663552 1I TCCAACAGTT -/C CCCCTTCGCC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 4 5 277123 CASAVA_Build 7 89677939 1D GGACTACAAA G/- GGGAAAGTGC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 G 4 3 277124 CASAVA_Build 7 89695662 3I CCTGAAAAAA ---/AAC AACTTCTCTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 AAC 1 2 277125 CASAVA_Build 7 89702867 1I AATCCTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 26 1 20 5 A 11 12 277126 CASAVA_Build 7 89705383 3I TAAAGAGTTT ---/CTG CTGCTGCTGC 3070 het 277 hom 36 1 18 17 CTG 4 5 277127 CASAVA_Build 7 89736338 1I AAGACAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 32 1 24 7 A 12 13 277128 CASAVA_Build 7 89747452 4D TTTTATTTGC TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 18 11 8 TTTG 3 2 277129 CASAVA_Build 7 89749439 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 29 1 20 8 A 11 12 277130 CASAVA_Build 7 89767047 1I TGTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 24 1 20 3 T 10 11 277131 CASAVA_Build 7 89767551 1D TCTTTTAACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 A 10 9 277132 CASAVA_Build 7 89767887 11D CTATATTACA TTTTTTTCTTT/----------- TTTTTTTCTT 3070 hom 63 het 32 0 22 10 TTTTTTTCTTT 2 1 277133 CASAVA_Build 7 89772635 2I GAAGCCTAGC --/AA AAAAAAAAAA 2208 hom 29 het 11 0 9 2 A 14 16 277134 CASAVA_Build 7 89772983 2D TTATTAATAC TT/-- ATTAAAGTAT 3070 hom 39 het 16 0 14 3 T 2 0 277135 CASAVA_Build 7 89774964 1D GTTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 12 11 277136 CASAVA_Build 7 89777277 1D GTTGAAAATT G/- TGTAAATGGA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 G 1 0 277137 CASAVA_Build 7 89780958 1D ATGAAAGGAA G/- GGAAAAAAGG 3070 hom 115 het 43 0 37 6 G 3 2 277138 CASAVA_Build 7 89781945 1D AATTTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 15 14 277139 CASAVA_Build 7 89782210 2D GAACAGACAC TT/-- TTCAAAAGAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 4 2 277140 CASAVA_Build 7 89785595 4I AATGAAGTTT ----/CTTA CTGTCTTTGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 CTTA 0 1 277141 CASAVA_Build 7 89789308 1I GTGAGATGAG -/T TGCCAAACCA 3070 hom 125 het 51 0 39 12 T 1 2 277142 CASAVA_Build 7 89801981 1I GACCGAGCCT -/C CCCGACCAGC 1635 hom 30 het 12 0 8 4 C 3 4 277143 CASAVA_Build 7 89803813 1I TGATGAATGA -/G GGGCTTGAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 3 4 277144 CASAVA_Build 7 89808628 1D GCTTGGTGGC T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 6 5 277145 CASAVA_Build 7 89811183 3I GTAGTTTAGT ---/TAA TAATATTCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TAA 1 2 277146 CASAVA_Build 7 89814074 3D ACAGCTCTGG TTC/--- TTCTTTGCTC 3070 het 3070 ref 37 20 10 9 TTC 2 1 277147 CASAVA_Build 7 89815987 1D TTTTCTCTTT C/- CCCCAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 C 5 4 277148 CASAVA_Build 7 89817727 1I GGAATCTAGA -/C ACTGTCTTCC 3070 hom 51 het 18 0 17 2 C 0 1 277149 CASAVA_Build 7 89821058 1D26M1I GTGGATTTTC TTTTTTTTTTTATAGATTCATTTTTTC-/-TTTTTTTTTTATAGATTCATTTTTTCT TTTTTTTTTT 3070 het 682 hom 24 2 19 10 N/A 0 0 277150 CASAVA_Build 7 89822955 1I CCTCAGACTT -/A ACGCACTGTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 1 2 277151 CASAVA_Build 7 89828671 1D TTCTGTTTAT A/- TGCTGGATTA 2424 hom 12 het 5 0 5 0 A 1 0 277152 CASAVA_Build 7 89829348 1I GATTCATTGA -/T TTTTTTTTGA 1251 hom 7 het 5 0 3 2 T 8 9 277153 CASAVA_Build 7 89831115 4D AAATTCTCTT CTTG/---- CTTCATTTCA 2577 het 2577 ref 22 12 6 4 CTTG 1 0 277154 CASAVA_Build 7 89854594 4I CTCAAAAAAC ----/AAAA AAAATATTGT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 4 8 277155 CASAVA_Build 7 89855714 2I CATGAAATAT --/AA GTTTATACAG 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 A 0 2 277156 CASAVA_Build 7 89856638 1D AAAATTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 11 10 277157 CASAVA_Build 7 89861989 1I ATATGAGGGG -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 6 7 277158 CASAVA_Build 7 89870480 1D TCGTTTTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1317 hom 26 5 16 6 T 10 9 277159 CASAVA_Build 7 89878868 30D AATCTACATC TTGAATCAACAAGGAAGTAATTGGGTCATG/------------------------------ TTGAATCAAC 3070 het 3070 ref 40 24 15 10 TTGAATCAACAAGGAAGTAATTGGGTCATG 1 0 277160 CASAVA_Build 7 89886776 3I ACAAAGACAT ---/AAC GAGTTGTCTA 2599 het 2599 ref 30 20 6 4 AAC 0 1 277161 CASAVA_Build 7 89888989 1D TATGTTTATT A/- ATTTGTTTTG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 2 1 277162 CASAVA_Build 7 89899648 1I CTGGGAAATT -/C ATCATGAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 C 0 1 277163 CASAVA_Build 7 89900868 1D CAGGAAGAAT G/- AGGTTACATG 3070 het 3070 ref 50 21 16 13 G 1 0 277164 CASAVA_Build 7 89910161 2D5M3I4M1D8M5D TCTAGGTCAA CTCCCTA---TCATCAAACACATTAATA/--CACTAAATTCAT-AAGAACCT----- TTTTTGCAAT 3070 het 3070 ref 51 34 22 3 N/A 0 0 277165 CASAVA_Build 7 89910452 8D TGTGTGTGTA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 het 1314 hom 27 5 13 10 TG 12 8 277166 CASAVA_Build 7 89916214 1I AGCCACCAGG -/C CCACCTTCAT 3070 hom 27 het 12 0 9 3 C 2 3 277167 CASAVA_Build 7 89921691 1I ATTGAATTTC -/A GATGGAATTC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 0 1 277168 CASAVA_Build 7 89923827 1D TGGGGAAAAT G/- AGTCTGACTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 1 0 277169 CASAVA_Build 7 89926862 2I CATCTCCATT --/AA AAATACAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 3 5 277170 CASAVA_Build 7 89935031 10D TAATTTTTTG TGTTTTGTTT/---------- TGTTTTGTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 9 TGTTT 5 3 277171 CASAVA_Build 7 89943378 3I ACTCAATAAT ---/ATA ATCCAGCAAA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 ATA 0 1 277172 CASAVA_Build 7 89953630 2D AAGTGAGTGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 28 0 21 9 AT 6 5 277173 CASAVA_Build 7 89971571 1D ATGTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 26 1 23 2 A 11 10 277174 CASAVA_Build 7 90011671 1I CCTAAATATA -/T ACCCAAGTAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 0 1 277175 CASAVA_Build 7 90012986 1D TAACTCATCC T/- TTTTTATGGC 3050 hom 18 het 9 0 7 2 T 6 5 277176 CASAVA_Build 7 90031993 1D ATACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 19 2 9 8 A 15 14 277177 CASAVA_Build 7 90032384 1D ATCTCAAAAA C/- CAAACAAACA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 C 2 1 277178 CASAVA_Build 7 90051467 1I TATCTATTTA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 7 277179 CASAVA_Build 7 90061770 1D CCTGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 21 0 10 11 A 15 14 277180 CASAVA_Build 7 90070314 4I AAAGCTTTCC ----/AAGT AATAGCTACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAGT 0 1 277181 CASAVA_Build 7 90081693 2I CTTAAAGGAG --/CT CTTTCATCAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 CT 1 2 277182 CASAVA_Build 7 90089530 4I TTTATCCCTG ----/TTGT TTGTTTGGAA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 TTGT 1 2 277183 CASAVA_Build 7 90089998 2D CTACCCTGAC TG/-- TGTTTTTACT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TG 2 1 277184 CASAVA_Build 7 90099274 2D ACAATAGACC AA/-- AAAAAAATTA 3070 hom 135 het 51 0 45 9 A 9 7 277185 CASAVA_Build 7 90112615 4D GATTTCTCTT TAAA/---- TAACCTTAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 5 TAAA 1 0 277186 CASAVA_Build 7 90114761 1I TTTTTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 27 1 19 7 T 11 12 277187 CASAVA_Build 7 90123634 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2241 het 9 hom 21 1 10 10 T 14 15 277188 CASAVA_Build 7 90124291 1D AATATTTTCT A/- AAAAATATAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 6 5 277189 CASAVA_Build 7 90129132 2D GTAGCAAGGG TC/-- TCTGGAGCAA 3070 hom 144 het 51 0 46 6 TC 2 1 277190 CASAVA_Build 7 90133067 27D TGAAGTTTGA GTAATTACAAATGTAGACTGGGAAGTT/--------------------------- GCTTCATTTA 3070 hom 138 het 45 0 47 1 GTAATTACAAATGTAGACTGGGAAGTT 1 0 277191 CASAVA_Build 7 90135871 5I TCTTCTGAGA -----/GTTTT GTTTTATAGT 3070 hom 63 het 22 0 22 4 GTTTT 1 2 277192 CASAVA_Build 7 90136827 2D TATAGAACCA AC/-- ATGAAGAAAC 3070 hom 123 het 44 0 41 4 AC 1 0 277193 CASAVA_Build 7 90142651 1I GAATATAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 9 10 277194 CASAVA_Build 7 90143778 14D AGATGTTTCA TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 31 0 22 10 T 23 9 277195 CASAVA_Build 7 90144197 2I GTATATCAAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 199 hom 40 1 30 9 T 12 14 277196 CASAVA_Build 7 90144947 1D ACCAGCTGTG C/- CCGATGCATT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 C 3 2 277197 CASAVA_Build 7 90146792 1D TATATTCCTT C/- CAAGAACCTC 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 C 2 1 277198 CASAVA_Build 7 90147343 1I TTTATATATA -/T TTTTTCGTTT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 5 6 277199 CASAVA_Build 7 90157238 1I TAAGAGACTT -/A ACATTACGAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 1 2 277200 CASAVA_Build 7 90157983 4D CCGCAACATA CATT/---- AATTTAAAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 CATT 1 0 277201 CASAVA_Build 7 90158557 1D AGTACTGTGG A/- AAAAAAATAA 3070 het 41 hom 35 3 27 5 A 8 7 277202 CASAVA_Build 7 90180249 1D GCCATGGGCC T/- TCTTTTACTC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 2 1 277203 CASAVA_Build 7 90189870 1I CCTTGTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 24 1 22 1 T 10 11 277204 CASAVA_Build 7 90195418 1D CTTTATCTGC T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 6 277205 CASAVA_Build 7 90196288 1D TTTCTCATGA T/- TTTTTTTTTT 1218 het 1218 ref 38 33 3 2 T 13 12 277206 CASAVA_Build 7 90207385 1D TTAAATTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1991 hom 20 5 11 4 A 11 10 277207 CASAVA_Build 7 90219539 1I TCAGTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 11 12 277208 CASAVA_Build 7 90224618 1I GACTCATTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 10 277209 CASAVA_Build 7 90228583 1I CTCTTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 1847 het 1847 ref 29 14 8 7 T 13 14 277210 CASAVA_Build 7 90242700 1I TTTCTGTGGG -/A AAAAAAAAGC 2369 het 2369 ref 22 12 8 2 A 8 9 277211 CASAVA_Build 7 90254593 1I TAAGGAATAT -/A AAAAACTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 5 6 277212 CASAVA_Build 7 90257322 1I AGTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1443 hom 34 8 22 4 A 9 10 277213 CASAVA_Build 7 90259967 1I CTTCTTAATT -/A ATACACCTCA 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 A 1 2 277214 CASAVA_Build 7 90260096 5D ATATGACTGA TTTTC/----- TTCAAACATG 3070 het 3070 hom 44 16 26 4 TTTTC 1 0 277215 CASAVA_Build 7 90260363 4D ATATAATCTT AGTG/---- AGGTCAGAGA 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 AGTG 1 0 277216 CASAVA_Build 7 90260972 1D TGAGAAACTC T/- TAATACAGAG 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 2 1 277217 CASAVA_Build 7 90263917 1D GTCTAAGGAG C/- AGGATCTTGT 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 C 1 0 277218 CASAVA_Build 7 90265440 2D TTCTGAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 34 1 23 10 T 14 12 277219 CASAVA_Build 7 90267754 4D TTTTGGTGTT TGAC/---- TGATACTTGA 3070 het 3070 ref 34 19 13 4 TGAC 1 0 277220 CASAVA_Build 7 90270357 1I GAGTTAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1156 hom 36 3 15 18 T 11 12 277221 CASAVA_Build 7 90272687 2D AATTTTCTCA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 40 15 16 10 AC 9 8 277222 CASAVA_Build 7 90291510 1D CTGGGAAGAG T/- TAGCTGCCAG 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 T 2 1 277223 CASAVA_Build 7 90294219 4I ATGATGTATT ----/TATC TACATATCTA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TATC 0 1 277224 CASAVA_Build 7 90295772 1I TTGTTTAATA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 8 9 277225 CASAVA_Build 7 90298942 1D CACTTGACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 21 15 11 T 10 9 277226 CASAVA_Build 7 90308155 6D TTAACTTTTT CATTGA/------ CATTGTGTCT 3070 het 3070 ref 39 20 18 8 CATTGA 1 0 277227 CASAVA_Build 7 90319026 1I TGAATACCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 10 11 277228 CASAVA_Build 7 90319759 1D TTAAACAGTT A/- AAAATGAAAG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 5 4 277229 CASAVA_Build 7 90324367 1I ATGGTTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 A 10 11 277230 CASAVA_Build 7 90327471 1D CATTGTACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 8 T 9 8 277231 CASAVA_Build 7 90334201 6D CAAAGTCTGT AGATAC/------ TACGATCTGG 3070 het 3070 hom 47 22 25 1 AGATAC 1 0 277232 CASAVA_Build 7 90339951 5I TATATTCTAG -----/TTTTA TTTTATGTGA 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 TTTTA 1 2 277233 CASAVA_Build 7 90352695 1D GGTGGCGAGG C/- TGTGCAATAG 3070 het 3070 ref 44 24 20 0 C 1 0 277234 CASAVA_Build 7 90367471 2D CACTGTATAA TT/-- TTAAAATGTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 4 T 4 2 277235 CASAVA_Build 7 90371945 1D ACCATAATTC T/- TTCAAATGTA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 3 2 277236 CASAVA_Build 7 90379475 5D TTCAAATATA TTAAT/----- TTATCTAGTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 TTAAT 1 0 277237 CASAVA_Build 7 90395269 1I CTACTAAAGC -/T TTGTGCATGT 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 T 2 3 277238 CASAVA_Build 7 90399032 2D CTTTGGATTT TG/-- TGTGTGTGTG 1648 het 1648 ref 31 17 7 7 TG 10 9 277239 CASAVA_Build 7 90403293 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2089 hom 30 8 14 8 A 11 12 277240 CASAVA_Build 7 90408880 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTGTAGA 3070 het 3070 hom 32 13 10 9 T 6 5 277241 CASAVA_Build 7 90420450 4I GTTTTAATTG ----/ACTA ACTGTGTTCA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 ACTA 0 1 277242 CASAVA_Build 7 90429453 1I AAATCTAGTG -/T TGGGGCTGGG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 1 2 277243 CASAVA_Build 7 90436079 2I AACAGAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 16 6 A 10 12 277244 CASAVA_Build 7 90438403 1D GAGAACATGT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 9 8 G 2 1 277245 CASAVA_Build 7 90440978 1I AAACCAGCAA -/G TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 G 0 1 277246 CASAVA_Build 7 90444730 2I TAATGCTGTC --/AG AGTTCTGAGG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AG 1 2 277247 CASAVA_Build 7 90447211 1D TCTATAGCCA T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 7 6 277248 CASAVA_Build 7 90450931 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1649 het 989 hom 14 6 5 4 A 15 14 277249 CASAVA_Build 7 90454276 5D ATAACTGAGA TATAT/----- TATACAGCAA 3070 het 3070 hom 36 17 19 5 TATAT 1 0 277250 CASAVA_Build 7 90456006 2I CATGGCCCAT --/TG TGTGTGACAG 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 TG 3 4 277251 CASAVA_Build 7 90461450 2I GACACATGGT --/CG AGCTGGAGCT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 CG 0 1 277252 CASAVA_Build 7 90463039 10I AGGAGTATGT ----------/CTTAGAATGA CTTAGAGTTA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 CTTAGAATGA 0 1 277253 CASAVA_Build 7 90475041 1D AGGAGGGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 10 9 277254 CASAVA_Build 7 90485723 1D AAATAAAAAA T/- ATCTTCTTGC 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 T 1 0 277255 CASAVA_Build 7 90489666 3I TGGCATTCTT ---/CTC CTCCAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 CTC 1 2 277256 CASAVA_Build 7 90490267 1I AAGTATATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 1787 hom 33 4 21 8 A 0 1 277257 CASAVA_Build 7 90495273 1D CAATAGGTGA T/- TTTTTTTTAT 2911 het 1988 hom 14 5 8 1 T 9 8 277258 CASAVA_Build 7 90497098 1I ACAAGACCAT -/A ATCATTGACA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 1 2 277259 CASAVA_Build 7 90501590 2D GGGGATAGGT CA/-- CAGTCATTCG 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 CA 2 1 277260 CASAVA_Build 7 90516295 1I TGTCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 2637 het 2637 ref 23 13 7 3 T 11 12 277261 CASAVA_Build 7 90520255 1D GTAATGAGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 10 9 277262 CASAVA_Build 7 90533827 1D GTGTACACTG C/- ATGCTTATAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 C 1 0 277263 CASAVA_Build 7 90541041 1I GGGCCAAAAT -/A AAGGGATGGA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 2 3 277264 CASAVA_Build 7 90547509 2I CTGTTATCAC --/AT GTTTAATTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 0 1 277265 CASAVA_Build 7 90556822 1D CTCTGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2804 hom 36 10 14 12 A 15 14 277266 CASAVA_Build 7 90559051 1I ATCAGATGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 9 10 277267 CASAVA_Build 7 90564845 1I TCATAATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 10 11 277268 CASAVA_Build 7 90569116 1D AAAGTAAGTC A/- TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 A 1 0 277269 CASAVA_Build 7 90569869 1D ACTATAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 A 12 11 277270 CASAVA_Build 7 90592872 3D GTGAAGATAA CAT/--- CATAGATTAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 CAT 2 1 277271 CASAVA_Build 7 90608860 1I GTAAGGTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 349 hom 46 1 36 9 A 9 10 277272 CASAVA_Build 7 90610925 12D GATCATGCTA CTGTGTTCCAGC/------------ CTGTGTTACA 3070 hom 87 het 36 0 30 10 CTGTGTTCCAGC 1 0 277273 CASAVA_Build 7 90611769 2I CAGCTTTAGA --/CT CTGACCATTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 CT 1 2 277274 CASAVA_Build 7 90615607 1D CTGGGCAATC A/- AGCGAGACCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 1 277275 CASAVA_Build 7 90616535 1D GGAGCTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 16 26 7 A 12 11 277276 CASAVA_Build 7 90631287 1D AAATTATGAG T/- TGGATTTAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 1 277277 CASAVA_Build 7 90640429 1D AAAAGCCTCC A/- TGTAATCAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 1 0 277278 CASAVA_Build 7 90650380 1I TATGGCAAGG -/A AAAAAGCAGA 3070 hom 96 het 41 0 39 2 A 5 6 277279 CASAVA_Build 7 90652568 34D CCCTGCTTGG TCGATAGCCCCTATGCATCTCCTTTTCCAAAACT/---------------------------------- TCTATTTTTA 3070 hom 72 het 24 0 25 8 TCGATAGCCCCTATGCATCTCCTTTTCCAAAACT 1 0 277280 CASAVA_Build 7 90676645 2I AAGTTTGGTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TC 6 7 277281 CASAVA_Build 7 90677592 1I TTATCTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 399 hom 51 2 44 5 T 9 10 277282 CASAVA_Build 7 90680993 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 277283 CASAVA_Build 7 90702810 2D AACTCAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 1826 het 609 hom 25 9 7 10 T 18 16 277284 CASAVA_Build 7 90704697 1D TTTAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 27 1 18 8 T 12 11 277285 CASAVA_Build 7 90705370 1I TTCTAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 10 11 277286 CASAVA_Build 7 90720767 2I TTTTTTCACA --/TG TTTGATGGCT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TG 0 1 277287 CASAVA_Build 7 90726113 1D TTATATGCAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 10 9 277288 CASAVA_Build 7 90729725 2I GCTAGCAATC --/AG AAATACTTTA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 AG 0 1 277289 CASAVA_Build 7 90748732 1D CCAACTAATT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 7 277290 CASAVA_Build 7 90793525 1D ACATTCTTTT A/- CAACTTCGGT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 1 0 277291 CASAVA_Build 7 90809612 1D GACTCTCTCA T/- CAGCTGCAAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 1 0 277292 CASAVA_Build 7 90817798 1I CTCATATCTG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 9 277293 CASAVA_Build 7 90830554 4D AACCAATGAC AAAG/---- AAAAAAGAAT 3070 hom 132 het 46 0 45 3 AAAG 1 0 277294 CASAVA_Build 7 90831801 1I GTTGAAACTT -/A AAGGCTTGAA 3070 hom 138 het 55 0 47 8 A 2 3 277295 CASAVA_Build 7 90837020 1I TTATATCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 399 hom 19 1 11 7 A 8 9 277296 CASAVA_Build 7 90837670 1D CATTTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 25 0 17 8 T 12 11 277297 CASAVA_Build 7 90838070 1D ACTGTTTGAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 108 het 43 0 36 8 A 9 8 277298 CASAVA_Build 7 90854810 1I CTGATCAGGG -/T TTTGAGGTAG 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 T 3 4 277299 CASAVA_Build 7 90863281 1D CAATGGGTAG C/- CCCTATTTAT 3070 het 3070 ref 35 22 9 4 C 4 3 277300 CASAVA_Build 7 90871087 7D TTCACAAGGA CCTTCTT/------- CCTTCTTCCT 3070 hom 108 het 43 0 36 8 CCTTCTT 3 2 277301 CASAVA_Build 7 90875151 4D TCCTTTCTAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 32 0 25 9 TG 10 8 277302 CASAVA_Build 7 90878684 1I CCTGGGTTAT -/A AAAGGTCCCA 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 A 3 4 277303 CASAVA_Build 7 90879844 1D TCTGATATAT A/- AAAAAGTGCA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 6 5 277304 CASAVA_Build 7 90885559 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1773 hom 21 7 12 2 T 12 11 277305 CASAVA_Build 7 90886508 24D GGTTAGAGAC AAACTTTTCGAAGTGCTAATGAAT/------------------------ AAACTATCTC 3070 het 3070 hom 30 14 18 4 AAACTTTTCGAAGTGCTAATGAAT 1 0 277306 CASAVA_Build 7 90892751 3I GTCTCCCACA ---/TCT TCTCCTGATT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TCT 1 2 277307 CASAVA_Build 7 90896315 1D TCTCTATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 A 12 11 277308 CASAVA_Build 7 90925173 1D ATGGAAGACT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 34 17 17 0 A 8 7 277309 CASAVA_Build 7 90926015 1D ATTTAAAGCA G/- TGCTGATAAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 G 1 0 277310 CASAVA_Build 7 90940968 4I GAAGGCTTCA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 58 22 24 12 TTTG 2 3 277311 CASAVA_Build 7 90969931 1I AGAGAATTTT -/G GAATTTAGAA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 G 1 2 277312 CASAVA_Build 7 90983447 3D CCATGACATG CTC/--- CTCATTTTCC 3070 het 3070 ref 56 30 20 8 CTC 2 1 277313 CASAVA_Build 7 90991504 1D ATATTAGGGC T/- CACTCCTGGT 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 T 1 0 277314 CASAVA_Build 7 90993079 6D TGTTCTTACC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 2999 hom 31 12 12 8 A 16 10 277315 CASAVA_Build 7 91002440 2D TTTCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1314 het 1282 hom 16 6 4 6 T 17 15 277316 CASAVA_Build 7 91003892 1D TACTTAAGTT A/- AATCTAAGGC 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 A 3 2 277317 CASAVA_Build 7 91027744 4D TGTGTCCATT TCTC/---- TCTCTCATGA 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 TC 5 3 277318 CASAVA_Build 7 91032419 8I TTGAAGACAT --------/CTGAAACA CTGAAACAGC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 CTGAAACA 1 2 277319 CASAVA_Build 7 91038318 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 29 3 17 9 T 15 14 277320 CASAVA_Build 7 91040921 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2697 het 2457 hom 41 12 10 19 T 19 18 277321 CASAVA_Build 7 91131770 1I GTTTACCACC -/A AAAAAAAAAC 3022 het 3022 ref 19 8 8 3 A 9 10 277322 CASAVA_Build 7 91153662 1D GAGGATCTTC T/- GAAGATAGTC 3070 het 3070 ref 50 25 19 7 T 1 0 277323 CASAVA_Build 7 91156452 1D TTCTATAACC A/- AAAAAAAAAA 1852 het 1852 ref 30 20 5 5 A 13 12 277324 CASAVA_Build 7 91173673 1D AGTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 A 14 13 277325 CASAVA_Build 7 91180843 1D ATACAAAAAA C/- AACTCAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 6 C 1 0 277326 CASAVA_Build 7 91183164 1D CAAACAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 16 12 A 12 11 277327 CASAVA_Build 7 91213484 2D TAATATATCC TT/-- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 T 8 6 277328 CASAVA_Build 7 91235604 3I AACAAAAAAT ---/ATC ATAATATAGT 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 ATC 0 1 277329 CASAVA_Build 7 91245137 1D AACTTAACCC A/- TTCTTGTTAC 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 A 1 0 277330 CASAVA_Build 7 91248624 2I TATATATATG --/CA CACACACATA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 CA 4 5 277331 CASAVA_Build 7 91251752 1I AGGAAAAAAA -/T GTTAAGCCTC 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 T 0 1 277332 CASAVA_Build 7 91257337 1I TAGTTTGGTG -/T TCTATCACCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 1 2 277333 CASAVA_Build 7 91258479 1I CAGGTGGGTG -/C CCCTCTGGGA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 3 4 277334 CASAVA_Build 7 91269857 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1673 het 1177 hom 15 5 6 5 A 15 14 277335 CASAVA_Build 7 91272411 1D TACAAGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 12 11 277336 CASAVA_Build 7 91303341 1I TTTCCCCCCC -/G CATTATATAT 3070 het 2349 hom 26 6 16 4 G 0 1 277337 CASAVA_Build 7 91309825 1I GTAACACATG -/C CCTCTGGGGC 2899 hom 35 het 31 0 11 20 C 2 3 277338 CASAVA_Build 7 91317339 1D TGACAACCTT A/- AAAAAGTATT 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 A 6 5 277339 CASAVA_Build 7 91342507 1D ATTTCCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1296 het 1296 ref 35 24 3 8 T 11 10 277340 CASAVA_Build 7 91349766 1I TCTATTAAGT -/G AAACTACTTA 3070 het 3070 ref 32 19 7 6 G 0 1 277341 CASAVA_Build 7 91359689 2I GCCAAACGCG --/AA GTTTCCCCTT 3070 het 3070 ref 50 28 11 11 A 0 2 277342 CASAVA_Build 7 91360811 1D TTTTTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 T 13 12 277343 CASAVA_Build 7 91365042 1D AAGAAAAGAA T/- TCTCAACCAT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 2 1 277344 CASAVA_Build 7 91370914 2D17M1I GATCTCAGTC TTTTTTTTTTTTTAACTCA-/--TTTTTTTTTTTAACTCAT TTTTTTTTAT 3070 het 2105 hom 16 7 7 3 N/A 0 0 277345 CASAVA_Build 7 91380323 1D TTCTATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 12 11 277346 CASAVA_Build 7 91384562 1I TATTTAATCT -/C CCCCTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 C 4 5 277347 CASAVA_Build 7 91388594 1D AAAATTAGCT G/- GGTGTGGTGG 3070 het 1449 hom 13 3 9 2 G 3 2 277348 CASAVA_Build 7 91413646 1I ACCTTCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2512 hom 36 10 11 15 T 13 14 277349 CASAVA_Build 7 91415856 9D TGTAGATTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2611 het 1549 hom 21 7 8 6 T 23 14 277350 CASAVA_Build 7 91421069 1D CCCGCCCCCC A/- CCACACACAA 3070 het 2560 hom 22 7 10 7 A 1 0 277351 CASAVA_Build 7 91421961 1I GCTTTACAAA -/T TTTTTTGATG 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 6 7 277352 CASAVA_Build 7 91430087 2D TTAATCGAAC TG/-- TTTATGATGC 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 TG 1 0 277353 CASAVA_Build 7 91441583 1I TCCAACTTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 8 9 277354 CASAVA_Build 7 91443999 3I GCTGATTCTC ---/TCT TCTTCCTACT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 TCT 1 2 277355 CASAVA_Build 7 91456391 4D TGATTCCCTT AATA/---- AATTGTTCTC 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 AATA 1 0 277356 CASAVA_Build 7 91458556 1I TCTTTTAATT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 A 7 8 277357 CASAVA_Build 7 91473064 3D TACAGGCATG CAC/--- CACCACCACG 3070 het 1982 hom 19 6 12 3 CAC 4 3 277358 CASAVA_Build 7 91490115 3I GAAAAAACTA ---/AAC AACTTGAAGA 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AAC 1 2 277359 CASAVA_Build 7 91496478 4D ACTACACAAT ACAG/---- ATGTGAATAC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 ACAG 1 0 277360 CASAVA_Build 7 91498060 3D CTCAACATTG TAT/--- TATTCTAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 TAT 2 1 277361 CASAVA_Build 7 91508255 1D GTAGCCATAA T/- TTTTTTTTTT 1790 het 1790 ref 41 23 6 12 T 15 14 277362 CASAVA_Build 7 91512127 3I TGCTATTGGG ---/TAT TATTTTAATA 2965 het 2965 ref 34 24 8 2 TAT 1 2 277363 CASAVA_Build 7 91517314 1D TTCAGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1752 het 268 hom 25 4 5 16 T 19 18 277364 CASAVA_Build 7 91519534 1D CCCTCTGTAC A/- ATTTGAAATG 3070 het 3070 hom 56 22 28 8 A 2 1 277365 CASAVA_Build 7 91519726 1I TTTATCAAAG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 A 7 8 277366 CASAVA_Build 7 91523322 7D TGAACATGAA TTAATAT/------- TTAATATAAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 TTAATAT 2 1 277367 CASAVA_Build 7 91526964 2I AATGACAAAC --/AT GTGTAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 AT 0 1 277368 CASAVA_Build 7 91530337 1I ATGGAACTTT -/A AATCCTGTTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 A 2 3 277369 CASAVA_Build 7 91530683 2D TTGTTGTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2740 hom 44 13 22 9 T 15 13 277370 CASAVA_Build 7 91532187 1D TAAAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 1889 het 1889 ref 31 24 4 3 T 12 11 277371 CASAVA_Build 7 91534706 2I CTTGATTCTC --/CT CTTTCTCTCA 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 CT 1 2 277372 CASAVA_Build 7 91538578 2D ACAAAAGGCA AT/-- ATATCCCTTT 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 AT 3 2 277373 CASAVA_Build 7 91539222 1I TGACTTTTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 T 8 9 277374 CASAVA_Build 7 91542341 1D GTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3032 het 3032 ref 30 15 8 8 A 10 9 277375 CASAVA_Build 7 91547850 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1640 het 1640 ref 14 7 5 2 A 12 11 277376 CASAVA_Build 7 91550953 1D GTGGTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2899 hom 34 7 24 3 A 12 11 277377 CASAVA_Build 7 91557872 9D ACTCCATCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 1661 hom 24 7 12 8 A 20 11 277378 CASAVA_Build 7 91559139 2D AAGCTAATGT TA/-- TTTCTGTCTC 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 TA 1 0 277379 CASAVA_Build 7 91559758 1D CCATTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 11 10 277380 CASAVA_Build 7 91573622 1D46M10D CTTTTAGATG AAAAATCGAGGCATGGAAAACACAAGTCATTTGCCCCAGAATGGCCAGTAGGGAAGT/-AAAATCGAGGCATGGAAAACACAAGTCATTTGCCCCAGAATGGCCA---------- GATGGAACCA 3070 het 3070 ref 38 29 29 5 N/A 0 0 277381 CASAVA_Build 7 91579249 8I CTGCTAATAA --------/ATACTGCT AATGCTGCCC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 ATACTGCT 0 1 277382 CASAVA_Build 7 91598987 1I TCTCTAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 13 14 277383 CASAVA_Build 7 91599242 1D AAAAGTTACC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 8 277384 CASAVA_Build 7 91604694 1D TAATCCATTT A/- AAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 7 6 277385 CASAVA_Build 7 91604929 1D TGGGTGGGAG T/- TGGGGGGTAG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 2 1 277386 CASAVA_Build 7 91616301 1I CTGGCCAAAA -/G ATCCCTTTTT 2553 het 2553 ref 23 15 7 1 G 0 1 277387 CASAVA_Build 7 91637320 1I TGAGACCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 10 11 277388 CASAVA_Build 7 91639807 1D GAACAATCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 10 7 A 10 9 277389 CASAVA_Build 7 91643816 2D GATTCTCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2193 hom 31 9 9 13 T 16 14 277390 CASAVA_Build 7 91649769 1D TTTAATAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 34 0 24 10 T 11 10 277391 CASAVA_Build 7 91650766 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 13 12 277392 CASAVA_Build 7 91676139 1I AGGACACAAC -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 7 277393 CASAVA_Build 7 91710809 1I TGAGAGGCGA -/T TAGAGTAATT 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 T 1 2 277394 CASAVA_Build 7 91727933 4D ACCCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 7 A 15 11 277395 CASAVA_Build 7 91753730 1D ATTATCCGTA T/- TTTTTTTTTT 2072 het 957 hom 23 3 6 14 T 17 16 277396 CASAVA_Build 7 91764917 1D ATCTAAATGG T/- TTTTTTTTTT 1113 het 1113 ref 34 27 3 5 T 11 10 277397 CASAVA_Build 7 91783994 1I ATTTTTTTAA -/C CCCCCCAATG 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 C 6 7 277398 CASAVA_Build 7 91786857 3D AGTTTGTGTG TTC/--- TTCTTTACAG 3070 het 3070 hom 21 10 11 2 TTC 2 1 277399 CASAVA_Build 7 91799171 2I AGAATCTAAC --/TT AACCTATAAT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 0 2 277400 CASAVA_Build 7 91813113 2I TATGTGGGTA --/AG AGAGCGAGAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 AG 2 3 277401 CASAVA_Build 7 91814526 1I ACATTATGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 9 10 277402 CASAVA_Build 7 91822503 22D ATGACTTTTC CTCTTTTTTTTTCTTTTTAATT/---------------------- AAGTAAAATA 3070 het 3070 ref 39 26 19 3 CTCTTTTTTTTTCTTTTTAATT 1 0 277403 CASAVA_Build 7 91826014 4D ATTGATTGCA TTTG/---- TTTGTTTTAG 3070 het 2377 hom 22 7 12 3 TTTG 2 1 277404 CASAVA_Build 7 91828093 3D AGTTGGTGTG TCT/--- TCTTAACACA 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 TCT 2 1 277405 CASAVA_Build 7 91830159 1I TGAGGGGACT -/C CCTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 14 16 3 C 2 3 277406 CASAVA_Build 7 91838426 1D AATATGTTGC T/- TTTTTTTTTT 2617 het 2617 ref 25 11 7 8 T 12 11 277407 CASAVA_Build 7 91842129 1D CATAATCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 10 9 277408 CASAVA_Build 7 91854333 3I GATGAGGGTT ---/CTC CTCTTGGTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 CTC 1 2 277409 CASAVA_Build 7 91858746 1D TTTTTGGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 10 9 277410 CASAVA_Build 7 91870969 7D GGTAAGGAGT CAGCAAC/------- TCCTGTTACA 3070 het 3070 hom 49 22 25 5 CAGCAAC 1 0 277411 CASAVA_Build 7 91888109 1I GTTTAGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 24 2 13 9 T 11 12 277412 CASAVA_Build 7 91896790 1D ATGAAAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2959 hom 30 12 10 8 T 13 12 277413 CASAVA_Build 7 91900189 1D ATATTTCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 28 14 2 A 10 9 277414 CASAVA_Build 7 91925429 1I CCTTCTGTAG -/C AAACAGGCAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 C 0 1 277415 CASAVA_Build 7 91926458 2I TCTGGGTGAC --/AG GGCATGACTC 2101 het 1999 hom 16 6 6 4 AG 0 1 277416 CASAVA_Build 7 91958930 1D ACTATTAAAA T/- TATAAAGACA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 2 1 277417 CASAVA_Build 7 91967098 1D ACTGAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 22 9 A 12 11 277418 CASAVA_Build 7 91967943 1D CTTAACCCAG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 T 8 7 277419 CASAVA_Build 7 91968348 1D TCTTATCATC A/- AAGACTGCAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 3 2 277420 CASAVA_Build 7 91968621 1D AAATAGTGTT A/- AGACATTTAT 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 A 2 1 277421 CASAVA_Build 7 91973356 16I TAGAAAGCCA ----------------/AAGACTTAAAATTTCT AAGAAATTTT 3070 het 3070 hom 38 10 26 2 AAGACTTAAAATTTCT 0 1 277422 CASAVA_Build 7 91974436 1I ATTTAGCTAT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 7 8 277423 CASAVA_Build 7 91976386 1D AAATAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2441 hom 24 10 9 5 A 11 10 277424 CASAVA_Build 7 91978392 2D AGTTAAAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2223 hom 26 9 11 6 T 12 10 277425 CASAVA_Build 7 91982560 4D TCAAGTTTCC TGTT/---- TGTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 TGTT 3 2 277426 CASAVA_Build 7 91988234 5D CTACATCTTC TTCTT/----- TTAAGAGATA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 TTCTT 1 0 277427 CASAVA_Build 7 91989675 1D CAATGCTGGT G/- GATGCTAATG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 G 2 1 277428 CASAVA_Build 7 92017821 1I TTTCATCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2532 hom 30 11 15 4 T 13 14 277429 CASAVA_Build 7 92018877 1D TCCATCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1386 hom 24 5 13 7 A 13 12 277430 CASAVA_Build 7 92019346 2I GATACCCTGA --/TG CCTTGTTATC 2719 het 2719 ref 25 12 8 5 TG 0 1 277431 CASAVA_Build 7 92026113 1I CTAGAAAAAT -/G TAAAAACTCA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 G 0 1 277432 CASAVA_Build 7 92026406 1D TTATGCCTGT A/- ATCTCAGCAG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 2 1 277433 CASAVA_Build 7 92040715 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 12 11 277434 CASAVA_Build 7 92047493 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 2164 het 1717 hom 24 9 8 7 A 17 16 277435 CASAVA_Build 7 92071696 1I GAATGAGTTC -/T TTTTTTTTTT 2404 het 2404 ref 40 14 8 18 T 12 13 277436 CASAVA_Build 7 92082567 5D ATTGGTTGAT ATACA/----- ATACATCAAT 3070 het 3070 ref 43 20 19 5 ATACA 2 1 277437 CASAVA_Build 7 92095632 1D ATACTAAGGC A/- ACTCTATTAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 2 1 277438 CASAVA_Build 7 92096670 2D AGAGAAAGAA AG/-- AGAGGGAGAG 3070 het 5 hom 29 1 11 20 AG 3 2 277439 CASAVA_Build 7 92101726 1I TCTTCATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 T 11 12 277440 CASAVA_Build 7 92223421 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAAAAGAC 1157 het 1157 ref 38 21 9 8 G 1 0 277441 CASAVA_Build 7 92262142 5I GGTGTGATAA -----/TAAAG TAAAGATGTT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 TAAAG 1 2 277442 CASAVA_Build 7 92266748 1I TTCCATAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 11 12 277443 CASAVA_Build 7 92271980 4D CATTTTGAAA TTTG/---- TTTGTTGTGG 2696 het 2696 ref 38 26 7 6 TTTG 2 1 277444 CASAVA_Build 7 92282505 1I AGCCATTTTT -/C CCAGCCACCC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 C 2 3 277445 CASAVA_Build 7 92288161 1I GAGCTTTGCC -/T TTTTTATCAT 3070 het 2864 hom 23 8 12 3 T 5 6 277446 CASAVA_Build 7 92312372 1I TTGAGGTATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 8 9 277447 CASAVA_Build 7 92313789 9D CAGAGTATCA CCATGTTGC/--------- CCAAGCTGGT 3033 het 1133 hom 20 4 8 8 CCATGTTGC 1 0 277448 CASAVA_Build 7 92318608 1D AACCTCAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 10 9 277449 CASAVA_Build 7 92328609 1D TATATTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1067 het 1067 ref 31 20 3 8 T 11 10 277450 CASAVA_Build 7 92420872 1I CTCCTTTCCG -/T TTTTTTTTTT 1020 het 1020 ref 40 28 4 8 T 10 11 277451 CASAVA_Build 7 92436063 2D TCTCGGAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 40 11 18 12 AC 9 8 277452 CASAVA_Build 7 92444889 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2167 hom 23 7 13 3 A 12 11 277453 CASAVA_Build 7 92463432 2D TCTATTTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 38 4 19 15 T 18 16 277454 CASAVA_Build 7 92476410 1D AGTTAAGTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 A 10 9 277455 CASAVA_Build 7 92482560 1D CTTGGAATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 21 9 7 T 10 9 277456 CASAVA_Build 7 92483733 1D AGCCTGATTG T/- TTTTTAAAGA 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 T 6 5 277457 CASAVA_Build 7 92486860 1D CCATGTTGGT G/- CACTGCACCC 3070 het 259 hom 11 2 8 1 G 1 0 277458 CASAVA_Build 7 92492895 4I ACTGAGGCTT ----/AGAG AGGTTAATGT 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 AG 1 3 277459 CASAVA_Build 7 92503337 4D TTAGACAATC AATA/---- AGACCAATTC 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 AATA 1 0 277460 CASAVA_Build 7 92508301 2D CATTTCTAAC TT/-- TTTTTTTTAC 2829 het 2829 ref 23 13 6 5 T 10 8 277461 CASAVA_Build 7 92509213 3I CTAAATAAAA ---/CAC CATACACTGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 CAC 0 1 277462 CASAVA_Build 7 92512195 2I GTCCAGAAAC --/TT TGTATTTTGG 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 1 3 277463 CASAVA_Build 7 92518439 5D ATCTTTTTTA TTTAT/----- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 TTTAT 2 1 277464 CASAVA_Build 7 92520643 1I ATGACCCGAA -/G GATACACATT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 G 1 2 277465 CASAVA_Build 7 92529088 1I CTTATGTGAT -/A TTTTTTAATG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 0 1 277466 CASAVA_Build 7 92588727 11I TCTCCCCTGG -----------/AGCTTTGCAGA ACCTTCTGAC 3070 hom 97 het 36 0 30 6 AGCTTTGCAGA 0 1 277467 CASAVA_Build 7 92606071 1I ATTCCCATCT -/C CTCTGCCGAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 1 2 277468 CASAVA_Build 7 92630705 1D CCAGTTATGG T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 1 277469 CASAVA_Build 7 92642216 1I6M2I CTAGGCTGGG -CCAGGG--/CCCAGGGCC CTGCTGCTGC 3070 hom 99 het 33 0 32 3 N/A 0 0 277470 CASAVA_Build 7 92664275 1I GTTAAGAGTG -/C CTTCCAGGCC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 C 1 2 277471 CASAVA_Build 7 92723452 1I TTCCCTTAAA -/G ATGGTTACAC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 G 0 1 277472 CASAVA_Build 7 92781009 5D CAAGACCCTT TAAAG/----- TAAAGTAAAG 3070 hom 123 het 51 0 42 12 TAAAG 3 2 277473 CASAVA_Build 7 92827656 2D TTGAAAAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 266 hom 38 3 16 19 T 20 18 277474 CASAVA_Build 7 92869118 1D TCAACACATA T/- TTTTTTAGGG 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 T 7 6 277475 CASAVA_Build 7 92897102 1D AATCATGATT A/- AAAAAAAAAA 1770 het 1770 ref 24 14 5 5 A 13 12 277476 CASAVA_Build 7 92903605 3D TTTAATTTTA TGT/--- TCCCTCCAGC 3070 het 3070 ref 51 30 18 4 TGT 1 0 277477 CASAVA_Build 7 92904275 2I TTGTTGAATC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 9 11 277478 CASAVA_Build 7 92905271 1D ACTAAGAGAT A/- ATACTACTAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 A 2 1 277479 CASAVA_Build 7 92908807 1D GCTAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 11 10 277480 CASAVA_Build 7 92936576 1I TTGATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 40 2 30 8 T 11 12 277481 CASAVA_Build 7 92972411 1D AGCTAAGTGG A/- AAAAAAAAAG 1180 het 1180 ref 25 21 3 1 A 10 9 277482 CASAVA_Build 7 92973895 1D TTGATTGTGA T/- TTTTTTTTTT 1282 het 1282 ref 44 25 4 15 T 15 14 277483 CASAVA_Build 7 92992386 1I TCAGGGAAAC -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 6 7 277484 CASAVA_Build 7 92993770 1I TGCAATTTAT -/A ATGTATATTA 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 A 1 2 277485 CASAVA_Build 7 92994629 4D ATGGTGTATC TAAA/---- TATTGTCTAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 TAAA 1 0 277486 CASAVA_Build 7 93007921 7I TGACAGCTCT -------/AAGGAAA AAGTTATACA 1500 het 1500 ref 17 7 4 6 AAGGAAA 0 1 277487 CASAVA_Build 7 93009949 4I ACAAAAATAT ----/TTTA TTTATTTCTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 TTTA 1 2 277488 CASAVA_Build 7 93010210 1D AGTTCACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 12 11 277489 CASAVA_Build 7 93011467 3D AAAACAAAAT TTC/--- TTCTGATACC 3070 het 3070 hom 28 13 14 2 TTC 2 1 277490 CASAVA_Build 7 93013976 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2309 het 2309 ref 21 9 7 5 T 13 12 277491 CASAVA_Build 7 93015920 2I AGAAAAACAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2945 hom 30 10 15 5 A 10 12 277492 CASAVA_Build 7 93016528 1D CTTAGACCAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 9 8 277493 CASAVA_Build 7 93020731 3I AAACTTACCC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 T 10 13 277494 CASAVA_Build 7 93022018 4D CCAGGCCATG TATA/---- TATATATATA 3070 het 2329 hom 24 8 13 4 TA 11 9 277495 CASAVA_Build 7 93029369 3I TAAATTTAAC ---/TTA TTAACACTAT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 TTA 1 2 277496 CASAVA_Build 7 93032004 1I ACCCAGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3005 het 2235 hom 24 7 10 7 T 13 14 277497 CASAVA_Build 7 93034785 1I TCTATGCAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 766 hom 14 2 10 2 T 8 9 277498 CASAVA_Build 7 93036326 1I AATAATTTCG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 T 9 10 277499 CASAVA_Build 7 93062511 1D TTCTAGTTTG A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 A 7 6 277500 CASAVA_Build 7 93088418 1I TTCTGGTGAC -/T TTACTCATTT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 2 3 277501 CASAVA_Build 7 93117860 1D CCCAAGTTGT A/- GACATTTAAT 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 A 1 0 277502 CASAVA_Build 7 93122742 1D CTCTTTATAC T/- TTTTTTTTTT 799 het 799 ref 41 34 3 4 T 11 10 277503 CASAVA_Build 7 93188198 2I TCACTCCAAG --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 8 10 277504 CASAVA_Build 7 93188539 1I GCAAAGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 38 2 31 5 T 13 14 277505 CASAVA_Build 7 93188642 1D GGCCTGGTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 29 0 21 9 T 10 9 277506 CASAVA_Build 7 93189988 1D AGTTGGGGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 10 9 277507 CASAVA_Build 7 93190071 3D GTTATTTTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 31 1 29 3 A 13 10 277508 CASAVA_Build 7 93191624 1I TTTTACATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 9 10 277509 CASAVA_Build 7 93194042 1I GTTGACACAT -/G GCTTAACTTA 3070 hom 105 het 45 0 36 9 G 1 2 277510 CASAVA_Build 7 93195708 1I ATCTAAATGC -/A ATCTATTGTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 1 2 277511 CASAVA_Build 7 93196286 1I CCGTTTTTTT -/A TTTCCTTCTA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 0 1 277512 CASAVA_Build 7 93197757 1D ACTCCAAACC A/- TACAGAGGTC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 1 0 277513 CASAVA_Build 7 93200774 1D TTTGATAATA G/- TTTCTAAGAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 G 1 0 277514 CASAVA_Build 7 93200871 1I CTTAAAACTG -/A AAAAAATCTA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 7 277515 CASAVA_Build 7 93207120 2I AAAGAAACAC --/TT TGTAGAGAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 3 277516 CASAVA_Build 7 93213547 2D35M1I AGACAACAAG AAAAAGTGTGAGAAAATAAAGCTTCAAAGAAGGCTTA-/--AAAGTGTGAGAAAATAAAGCTTCAAAGAAGGCTTAT TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 35 11 12 19 N/A 0 0 277517 CASAVA_Build 7 93218022 2D AAGATGTATC AG/-- AGACTACATT 3070 het 3070 ref 41 18 16 9 AG 2 1 277518 CASAVA_Build 7 93225200 1D ATCGAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2961 hom 26 10 13 4 A 12 11 277519 CASAVA_Build 7 93226845 2D GATGCATGAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 93 het 40 0 31 9 AT 7 6 277520 CASAVA_Build 7 93230680 2D ACATAAATTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 128 het 49 0 41 9 A 12 10 277521 CASAVA_Build 7 93233681 1D AAAATAAAAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 8 7 277522 CASAVA_Build 7 93238588 2I TGTTTGAATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 CA 5 6 277523 CASAVA_Build 7 93239827 1D ATTACAAGTG A/- AAAAATCCTT 3070 het 3070 hom 45 19 22 5 A 6 5 277524 CASAVA_Build 7 93243321 2D ATTGGGATTC AA/-- AACAGTACTG 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 A 4 2 277525 CASAVA_Build 7 93243919 1I CCAATTAAAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 8 9 277526 CASAVA_Build 7 93247680 2I AAAGGGAAAC --/TT ATCAATATTT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 T 0 2 277527 CASAVA_Build 7 93250703 5I AACTCACGTA -----/TTGAG TTATTTTATT 3070 hom 59 het 22 0 19 3 TTGAG 0 1 277528 CASAVA_Build 7 93253297 2I GTATATAGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 TA 5 6 277529 CASAVA_Build 7 93279332 1I TATGGGCTGG -/C CCTGAAATCT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 2 3 277530 CASAVA_Build 7 93301577 2D TCAGAATCAG AT/-- ATATATATAT 2012 het 2012 ref 26 18 5 3 AT 8 7 277531 CASAVA_Build 7 93374235 4D GAAAATTGAT AATC/---- AATCATAACT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 AATC 2 1 277532 CASAVA_Build 7 93377095 1D ATTTCATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 29 1 22 6 A 13 12 277533 CASAVA_Build 7 93379306 1I GTCACACTTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 35 0 26 9 A 8 9 277534 CASAVA_Build 7 93384251 1I TTTGAATCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 183 hom 32 1 31 0 T 9 10 277535 CASAVA_Build 7 93427253 1D TCTATAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3067 hom 24 7 14 3 T 11 10 277536 CASAVA_Build 7 93439040 2D GATATGGATT CA/-- TTACTAATGA 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 CA 1 0 277537 CASAVA_Build 7 93445325 1D ACTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 10 15 T 12 11 277538 CASAVA_Build 7 93462128 1I AGTCTCGCTC -/T GTTGCCCAGG 3070 het 3043 hom 23 9 11 3 T 0 1 277539 CASAVA_Build 7 93464211 1I TAAACTGATT -/A TTTCCTTAGT 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 A 0 1 277540 CASAVA_Build 7 93466104 1I AGGCTAGATT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 7 8 277541 CASAVA_Build 7 93493166 1D CCCTTTTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2956 hom 34 13 10 11 A 15 14 277542 CASAVA_Build 7 93494589 1I TTTTTGATGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 9 10 277543 CASAVA_Build 7 93505221 1I AAAAAAAATA -/G TGTTAAACTT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 G 0 1 277544 CASAVA_Build 7 93509229 2I ATAAAAAGAG --/AT ATATGATCAG 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 AT 2 3 277545 CASAVA_Build 7 93514059 1I GGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 8 9 277546 CASAVA_Build 7 93536413 1I TTTAAAAAAA -/C AGTTTGTGTT 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 C 0 1 277547 CASAVA_Build 7 93538879 1I ACTGTAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2209 hom 33 9 16 8 A 11 12 277548 CASAVA_Build 7 93539784 1I GGTAAATCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 A 9 10 277549 CASAVA_Build 7 93542386 2D GTGTGTGCAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 51 15 26 13 GT 10 9 277550 CASAVA_Build 7 93553470 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 2196 het 2196 ref 30 12 8 10 TG 8 9 277551 CASAVA_Build 7 93608740 1D GTTATCCTAG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 7 6 277552 CASAVA_Build 7 93611326 1I ACAGAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 9 10 277553 CASAVA_Build 7 93650936 1D ACAATGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 9 A 11 10 277554 CASAVA_Build 7 93675187 1D GGAATACGCA T/- AATCCAATTT 3070 het 3070 ref 50 26 16 8 T 1 0 277555 CASAVA_Build 7 93690533 1D TTAACTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 11 10 277556 CASAVA_Build 7 93720099 1D6M4D GTATACATGT ATACATGTTAA/-GCCATG---- TTGGTGTGCT 2338 het 2019 hom 10 5 5 0 N/A 0 0 277557 CASAVA_Build 7 93721272 1I GTCAAAAAAA -/C ATATGTGTAC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 C 0 1 277558 CASAVA_Build 7 93729362 2D TTCTTTGTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1934 hom 37 8 18 11 T 16 14 277559 CASAVA_Build 7 93800340 1I ACAAAATTAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 7 8 277560 CASAVA_Build 7 93885840 1D CGTACTTGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 10 9 277561 CASAVA_Build 7 93886564 2D CCCTCCTTCT GA/-- GAGTGGCTTC 3070 het 3070 ref 42 20 19 4 GA 2 1 277562 CASAVA_Build 7 93889021 38D ATGAAGCTGC CTACCTCCTACTCCTTGGTCTATTCCTGGTCACATGTA/-------------------------------------- CTGATTTTCC 3070 hom 153 het 44 0 51 5 CTACCTCCTACTCCTTGGTCTATTCCTGGTCACATGTA 1 0 277563 CASAVA_Build 7 93889444 1D GGTCTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 31 1 22 8 A 12 11 277564 CASAVA_Build 7 93889821 1D GGCTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 42 1 31 11 A 15 14 277565 CASAVA_Build 7 93894188 2D TTCAATTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 48 0 39 10 A 14 12 277566 CASAVA_Build 7 93898296 7I TTTGCCCAAA -------/GTTGTCC TCTTCTTCAG 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 GTTGTCC 0 1 277567 CASAVA_Build 7 93898828 2I CTATAGAAAC --/TT TTGGTTTATT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 2 4 277568 CASAVA_Build 7 93914833 2D AAATTCTAAA AT/-- ATGTTTTAAT 3070 het 3070 ref 34 20 10 6 AT 2 1 277569 CASAVA_Build 7 93929190 1I AAGCCTAGTT -/C TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 C 0 1 277570 CASAVA_Build 7 93950773 1D ATTTCTGTAC T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 8 7 277571 CASAVA_Build 7 93952589 1D CCTCTGCCAC T/- TTTTTTTTTG 1360 het 1360 ref 39 33 3 3 T 10 9 277572 CASAVA_Build 7 93956909 1I AAAAATGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 T 9 10 277573 CASAVA_Build 7 93967434 1D AAAGAACCAG T/- AGACCTAAGG 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 T 1 0 277574 CASAVA_Build 7 93970250 1I AGATTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2818 het 2818 ref 33 14 6 13 A 11 12 277575 CASAVA_Build 7 93983402 1D TTTGAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 A 11 10 277576 CASAVA_Build 7 93995522 1D AAACATAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2577 hom 26 7 13 6 T 13 12 277577 CASAVA_Build 7 94009667 2D ATTCAAAAAC TT/-- TATATAAAAG 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 3 1 277578 CASAVA_Build 7 94031323 2I CTATTTTATG --/AC ACACAGCAAA 3070 het 3070 hom 59 27 26 6 AC 2 3 277579 CASAVA_Build 7 94033712 1I AGTCAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 A 10 11 277580 CASAVA_Build 7 94039119 5D CTAAAACCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 16 21 8 A 14 9 277581 CASAVA_Build 7 94058871 1I TAGTTGGATG -/C CCCCCCACTT 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 C 6 7 277582 CASAVA_Build 7 94085045 2I CTTTTACCTA --/CT CCCACAGACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CT 0 1 277583 CASAVA_Build 7 94089301 2I CTCCATACAC --/AT GTTTAATTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AT 0 1 277584 CASAVA_Build 7 94098397 6I GATTTGTTTT ------/GTACTA GTACTAGTAT 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 GTACTA 1 2 277585 CASAVA_Build 7 94109004 1I CCAACCCTTC -/A AAAATGAGAA 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 A 4 5 277586 CASAVA_Build 7 94113922 1D GAAAAGGATT A/- AAAAGCCAAG 3070 het 3070 hom 44 16 19 10 A 5 4 277587 CASAVA_Build 7 94117712 3D GAATCTTTCA TCT/--- TCTTCTCAGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 TCT 3 2 277588 CASAVA_Build 7 94117848 1I AGTTTATCAG -/A AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 5 6 277589 CASAVA_Build 7 94119181 2D TTTTCTTCTT TA/-- TTATTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 TA 1 0 277590 CASAVA_Build 7 94121882 4I GTGGGCATTT ----/TCTC TCTAATAAAA 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 TC 1 3 277591 CASAVA_Build 7 94135230 1D ATTCAAGTTG T/- TTTTTTGTCA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 7 6 277592 CASAVA_Build 7 94136174 4D CACATCAGAT ACAG/---- ACAGTTCCAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 ACAG 2 1 277593 CASAVA_Build 7 94159722 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 8 9 277594 CASAVA_Build 7 94163089 1I GCCAAAAGGC -/T TTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 T 5 6 277595 CASAVA_Build 7 94163821 5I GGTGAGACTC -----/ATAAG ATGAGAAATT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 ATAAG 0 1 277596 CASAVA_Build 7 94165963 2D TGCAGAAGAA AT/-- ATGTGTTCAC 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 AT 2 1 277597 CASAVA_Build 7 94167147 1D CCTCAGACTT A/- ACGTGCTTCA 3070 het 3070 hom 37 11 24 3 A 2 1 277598 CASAVA_Build 7 94170723 1I CAACAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2014 hom 24 5 12 7 A 10 11 277599 CASAVA_Build 7 94172385 1D CATATATTAC T/- TTTTAGAATC 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 T 5 4 277600 CASAVA_Build 7 94176069 1I TCTTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 12 13 277601 CASAVA_Build 7 94186433 1D TTTTTGTTGA T/- TTTTTTTTTC 2707 het 2707 ref 24 15 6 3 T 10 9 277602 CASAVA_Build 7 94202681 1I AATTTATAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 8 9 277603 CASAVA_Build 7 94215926 1D TGTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 1816 het 1816 ref 35 21 5 10 T 15 14 277604 CASAVA_Build 7 94218124 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 2132 het 672 hom 11 2 7 2 A 12 14 277605 CASAVA_Build 7 94226595 2D TTATATAATG AT/-- ATATATATAT 3070 het 1764 hom 15 4 7 4 AT 7 6 277606 CASAVA_Build 7 94242365 1I CACTTAAAAG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 7 8 277607 CASAVA_Build 7 94249648 3D CAATGGTCTC AAT/--- AAAAATTTAT 3070 het 3070 hom 26 7 19 3 AAT 1 0 277608 CASAVA_Build 7 94265622 1D AATGTATCTC A/- AAAATAATAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 A 5 4 277609 CASAVA_Build 7 94291293 1D TCCAGAAATG A/- AACAATTCAT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 A 3 2 277610 CASAVA_Build 7 94300376 2D AAAGAACAGC AT/-- ATATATATAG 3070 hom 90 het 38 0 31 9 AT 5 4 277611 CASAVA_Build 7 94300765 1D CTAGTTTCTT A/- AGGGTGTAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 2 1 277612 CASAVA_Build 7 94304524 12I CTTCTCTTTT ------------/TTTTAACTTTTA TTTTAAGTTC 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 TTTTAACTTTTA 0 1 277613 CASAVA_Build 7 94307536 1I GTTTTGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 11 12 277614 CASAVA_Build 7 94308028 1I TGCCTGCTAC -/A GGGCTATGTG 3070 het 3070 hom 61 22 31 8 A 0 1 277615 CASAVA_Build 7 94308469 1I GAAAAAAAAA -/T TTGTGAAAAT 3070 het 3070 ref 41 25 11 5 T 2 3 277616 CASAVA_Build 7 94317637 5I GACAGTCTCA -----/TAATT TTCCTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 TAATT 0 1 277617 CASAVA_Build 7 94324620 2D ATTCTGCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3062 het 2006 hom 30 12 14 5 T 16 14 277618 CASAVA_Build 7 94329854 1I TAAAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 10 11 277619 CASAVA_Build 7 94334507 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCACTC 3070 het 1181 hom 16 6 9 1 AG 1 2 277620 CASAVA_Build 7 94360449 1D ACAAGGCAAG A/- AAAAAAAAAA 792 het 792 ref 34 28 2 4 A 11 10 277621 CASAVA_Build 7 94367790 1D TAACTGTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 T 14 13 277622 CASAVA_Build 7 94370528 1I AGAATCTAAT -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 A 6 7 277623 CASAVA_Build 7 94388223 1I TAAAAATATG -/T TAAGTATACA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 1 2 277624 CASAVA_Build 7 94400284 2I ACATCTCTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AT 5 6 277625 CASAVA_Build 7 94401744 1D TTATAGAACA T/- TTTTTTTTTT 1613 het 1613 ref 44 36 4 4 T 12 11 277626 CASAVA_Build 7 94402044 3D TTTATCAAAT GTG/--- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 48 30 16 2 GTG 1 0 277627 CASAVA_Build 7 94410873 1D TGATTGCCTC T/- TAAGTCATCT 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 T 2 1 277628 CASAVA_Build 7 94462377 1I TAAGTTGATA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 8 9 277629 CASAVA_Build 7 94487066 1D CATTAAACAT C/- CCCCCTCGCC 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 C 6 5 277630 CASAVA_Build 7 94490773 3D TAGCTTTTGA ATT/--- ATTTATTTGC 3070 het 2356 hom 16 5 8 4 ATT 2 1 277631 CASAVA_Build 7 94493084 1D CTTCAATCTC T/- TGATACCCTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 2 1 277632 CASAVA_Build 7 94510167 1I TATTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 10 11 277633 CASAVA_Build 7 94511796 1D TTTTTCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 986 hom 26 5 11 10 T 17 16 277634 CASAVA_Build 7 94532664 1I TTTTTCTAGA -/T TAGCTAGTTC 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 T 1 2 277635 CASAVA_Build 7 94534952 1D TGGCAAAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 17 10 T 10 9 277636 CASAVA_Build 7 94556970 1I TAGAAGCTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2469 hom 28 9 13 6 T 11 12 277637 CASAVA_Build 7 94559075 1D TTAATAATGC T/- TTTTTTTTTT 3008 het 3008 ref 29 11 8 10 T 14 13 277638 CASAVA_Build 7 94564660 4D ATGGCTCAAA AGAG/---- AGAGAAAGTA 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 AG 4 2 277639 CASAVA_Build 7 94565649 1D AAATAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 12 11 277640 CASAVA_Build 7 94570474 2D TAGTATGTAT AA/-- AAAAAACACA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 8 6 277641 CASAVA_Build 7 94572227 1I GCACACTTTG -/C CTAGCCATCA 3070 het 3070 hom 55 23 24 8 C 1 2 277642 CASAVA_Build 7 94575513 6D TATTACATTA TTTTCT/------ TTTTCTTTTT 2073 het 2073 ref 26 13 7 6 TTTTCT 3 2 277643 CASAVA_Build 7 94582140 1D AGTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2998 het 1460 hom 32 10 10 12 A 17 16 277644 CASAVA_Build 7 94586234 1D TGTCTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 10 12 A 13 12 277645 CASAVA_Build 7 94669772 1I TGATCACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 11 277646 CASAVA_Build 7 94678392 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 13 12 277647 CASAVA_Build 7 94680569 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1153 het 1153 ref 35 19 5 12 T 17 16 277648 CASAVA_Build 7 94685109 4D TCTTCTCTCT TTTA/---- TTTGTTATTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TTTA 1 0 277649 CASAVA_Build 7 94697133 1I CAATAAAAAT -/A ACAACCAAGG 3070 hom 87 het 39 0 29 10 A 1 2 277650 CASAVA_Build 7 94708198 3I TCTTTTAGTA ---/ATT GGTTAGTCAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 ATT 0 1 277651 CASAVA_Build 7 94759162 2D TATTTTAATA AC/-- AGTGTGATTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 AC 1 0 277652 CASAVA_Build 7 94761440 1D TTTACTTTTT A/- TTAAGGATGT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 1 0 277653 CASAVA_Build 7 94768269 1D GCTTTAACAC T/- TTTTTTTTTC 1347 het 1347 ref 39 27 3 9 T 10 9 277654 CASAVA_Build 7 94769172 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1375 hom 17 het 7 0 6 1 A 15 16 277655 CASAVA_Build 7 94771502 3D ATCCTTTTGT TGC/--- TGGCTTATGT 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 TGC 1 0 277656 CASAVA_Build 7 94776114 1D ATGCTATGGC T/- TTTTTTTTTT 2076 het 2076 ref 42 34 5 3 T 11 10 277657 CASAVA_Build 7 94794923 3D GGCTGTGCTT ATC/--- ATCTGACCTA 3070 hom 156 het 57 0 49 8 ATC 2 1 277658 CASAVA_Build 7 94819803 1D GTATACTTTC T/- TTCCTTTCAC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 3 2 277659 CASAVA_Build 7 94822261 2I ACAGCTTGAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 29 0 22 7 T 14 16 277660 CASAVA_Build 7 94853157 12D GGAACACATT TAAAGCAGTGTG/------------ TAGAGGGGAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 TAAAGCAGTGTG 1 0 277661 CASAVA_Build 7 94861553 1I AAAGAAGAAA -/G GAAGCAAAAA 3070 hom 99 het 34 0 33 1 G 1 2 277662 CASAVA_Build 7 94869369 1I GAGGTTTTGT -/A AAAAGTAAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 4 5 277663 CASAVA_Build 7 94870375 3I GCAAACAAGC ---/ATA ATAATGTTCA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 ATA 1 2 277664 CASAVA_Build 7 94872189 3I TCAAAATACG ---/TTA TTATCAGTAG 3070 hom 126 het 48 0 40 8 TTA 1 2 277665 CASAVA_Build 7 94875008 2I ACTGGTTTGT --/AC ACACATTAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AC 2 3 277666 CASAVA_Build 7 94876127 4D AGAATCACAC TGTT/---- TGAGCAAATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TGTT 1 0 277667 CASAVA_Build 7 94885087 11I TTCCAAGTAT -----------/ACAATGCTTAC ACACGTGGAA 3070 hom 72 het 25 0 25 1 ACAATGCTTAC 0 1 277668 CASAVA_Build 7 94893512 4I ATTATAAAAC ----/AAAG AGAGAGAGAA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 AAAG 0 1 277669 CASAVA_Build 7 94899162 1D TGCTTATACT A/- AAAAAAAAAA 2968 het 710 hom 24 3 9 12 A 17 16 277670 CASAVA_Build 7 94900856 1D GAAAGTGGGG C/- CCCATTTTTC 2912 het 2912 ref 35 19 9 7 C 4 3 277671 CASAVA_Build 7 94904741 1I TAAAATTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 23 1 17 5 A 12 13 277672 CASAVA_Build 7 94915933 1D TCTAGCCCAA T/- TTTTTTTTTT 1590 het 1590 ref 30 21 4 5 T 13 12 277673 CASAVA_Build 7 94925347 1D CAGTGATGTA T/- TTGGGTGTTG 3070 het 3070 hom 54 23 28 3 T 3 2 277674 CASAVA_Build 7 94934293 4I ACCACAAAAT ----/AAAG AATGATTTTT 3070 het 2645 hom 19 7 9 3 AAAG 0 1 277675 CASAVA_Build 7 94935392 1D AAATTGGGTT G/- GGGGGGGCCC 3070 het 3005 hom 25 8 12 6 G 8 7 277676 CASAVA_Build 7 94939480 8I TTTCCCCAAA --------/GGCCATAT AATGTGTCCA 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 GGCCATAT 0 1 277677 CASAVA_Build 7 94944984 1D AACAAGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 15 14 277678 CASAVA_Build 7 94955595 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1966 hom 24 5 19 1 A 11 10 277679 CASAVA_Build 7 94962987 2D TTCCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1756 het 1756 ref 29 14 7 9 T 16 14 277680 CASAVA_Build 7 94969355 1D GCTAACAACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 10 9 277681 CASAVA_Build 7 94969639 1D TACCAGCCTG C/- GGGGGGGGGG 3070 hom 57 het 24 0 16 9 C 1 0 277682 CASAVA_Build 7 94978898 1D CAACAAGAGC A/- AAACTCCGTC 3070 het 2823 hom 21 7 12 2 A 4 3 277683 CASAVA_Build 7 94988935 1D AGTTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 A 13 12 277684 CASAVA_Build 7 94989649 3D GGCTTAAGCA AAT/--- AATATTTCAT 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 AAT 2 1 277685 CASAVA_Build 7 94991747 1D TACAATAATT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 8 7 277686 CASAVA_Build 7 94997354 1D AAAGCAGGGC A/- AAAAAAAAAA 1717 het 1717 ref 39 24 7 8 A 15 14 277687 CASAVA_Build 7 95006334 2D TTGTTCTTGC TA/-- TAATCACTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 TA 2 1 277688 CASAVA_Build 7 95010633 1D CCTTAATTAG T/- TTCTTTTCAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 3 2 277689 CASAVA_Build 7 95020714 2I TGTAAGTGGA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 9 11 277690 CASAVA_Build 7 95023957 1D GGAGTTACCC T/- TTTAGTCATT 3070 hom 75 het 30 0 25 6 T 4 3 277691 CASAVA_Build 7 95024322 1I AATATATGGT -/A AGAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 A 1 2 277692 CASAVA_Build 7 95031930 1I GTCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 24 het 10 0 9 3 T 6 7 277693 CASAVA_Build 7 95049430 2D GATAACTGTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 118 het 48 0 44 6 A 11 9 277694 CASAVA_Build 7 95050664 2D TTGTAGGCAA AC/-- ACACCATTGT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AC 3 2 277695 CASAVA_Build 7 95052545 1D AATATCAGTC T/- TAGTGAAACT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 2 1 277696 CASAVA_Build 7 95053254 1D ATACATTAAC T/- ATTTCAGATG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 0 277697 CASAVA_Build 7 95061679 1D TCCTAAGTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 10 9 277698 CASAVA_Build 7 95075390 1D AAGCGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 2127 het 2127 ref 31 10 6 15 T 17 16 277699 CASAVA_Build 7 95081230 1I GAGAAAAAAG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 7 8 277700 CASAVA_Build 7 95087280 4D CAGTGTATGA TAGT/---- TAGTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 7 21 11 TAGT 2 1 277701 CASAVA_Build 7 95095783 1D TCCAGCTCTT A/- ACACTTCACT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 2 1 277702 CASAVA_Build 7 95096001 1I ACCCTGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 A 10 11 277703 CASAVA_Build 7 95097919 1D CTGCTTTGAC A/- AGTCAACTTC 3070 hom 105 het 36 0 35 1 A 2 1 277704 CASAVA_Build 7 95116156 1D AATTTTCTTA T/- TTCTTTGATA 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 T 3 2 277705 CASAVA_Build 7 95119288 1D CCCTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 11 10 277706 CASAVA_Build 7 95121324 1I CAGAATCCTC -/T TTTTTTCCTA 3070 het 2265 hom 20 7 12 1 T 6 7 277707 CASAVA_Build 7 95121559 1I GAAGCTTGGC -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 6 7 277708 CASAVA_Build 7 95125420 4D TTGTTTGTGC TTTT/---- TTTTTTTGGG 72 het 72 ref 35 15 1 20 T 11 7 277709 CASAVA_Build 7 95130409 2I AAAGAAGGTA --/TC TCTATTTGAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 TC 1 2 277710 CASAVA_Build 7 95137344 1D AAAAACTCTA G/- GATCAAGTGC 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 G 2 1 277711 CASAVA_Build 7 95141435 1I ATTTATTAGG -/A AAAAAAGCAC 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 6 7 277712 CASAVA_Build 7 95141713 1I ATTGACAAAT -/C CTCGATTATA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 1 2 277713 CASAVA_Build 7 95149322 1D CTAACAAGCT C/- ACAAAACAGC 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 C 1 0 277714 CASAVA_Build 7 95153595 1I CTTATGTTTC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 T 7 8 277715 CASAVA_Build 7 95156766 1I TTGATACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 43 1 33 9 T 10 11 277716 CASAVA_Build 7 95157828 1D ACAGGCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2357 hom 38 9 19 10 A 13 12 277717 CASAVA_Build 7 95162820 2I AAATATACAC --/AG AGTTATGTTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 AG 1 2 277718 CASAVA_Build 7 95168081 3I TAATTGACAC ---/ATA ATAATTATAT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 ATA 1 2 277719 CASAVA_Build 7 95184701 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 1007 het 234 hom 14 5 3 6 T 16 14 277720 CASAVA_Build 7 95185586 1D AGTTTTTGTG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 T 8 7 277721 CASAVA_Build 7 95186510 1D ATTTCTGGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 10 9 277722 CASAVA_Build 7 95188047 1D AAAAGTGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 10 9 277723 CASAVA_Build 7 95192136 2I ATGAGAGAAG --/AC ACAGGGAGTT 3070 het 3070 ref 55 37 13 5 AC 1 2 277724 CASAVA_Build 7 95203278 1D TTTAGATAGA C/- AGATTTCCTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 C 1 0 277725 CASAVA_Build 7 95221457 4D TTATCTTTTG TGTA/---- TGTAATATAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 8 TGTA 2 1 277726 CASAVA_Build 7 95237622 1I AAGGCTACCC -/A CACAGGCAGA 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 A 0 1 277727 CASAVA_Build 7 95238365 1D GGTTATGGAA C/- TTGGGCAAGG 3070 het 3070 ref 46 21 18 8 C 1 0 277728 CASAVA_Build 7 95277943 1I TGGGAGGAAA -/G GTTGTAGAAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 G 1 2 277729 CASAVA_Build 7 95283902 2I AACATAAATG --/AA AAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 5 7 277730 CASAVA_Build 7 95297051 1I GAGAGAAGAT -/A GGAGACTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 0 1 277731 CASAVA_Build 7 95298913 3D CCTTCCAATA CTT/--- CTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 12 4 CTT 2 1 277732 CASAVA_Build 7 95307318 12D GGGATTATCT TATATGGTGTTC/------------ TTGGTGTTCT 3070 het 3070 ref 37 22 17 2 TATATGGTGTTC 1 0 277733 CASAVA_Build 7 95317347 1D TTTCTGAAGG T/- TTTTTAGTGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 5 277734 CASAVA_Build 7 95317759 2D TATGTGGAGG AT/-- ATGTTTCAAG 3070 het 3070 hom 46 21 23 4 AT 2 1 277735 CASAVA_Build 7 95318358 1I AATTTTTTGA -/T TTTTTTGAAC 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 6 7 277736 CASAVA_Build 7 95328866 1D CTTTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 31 1 24 6 T 12 11 277737 CASAVA_Build 7 95329603 1D CTCAACCATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 28 0 26 3 A 10 9 277738 CASAVA_Build 7 95330764 1I TTATTTTAAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 8 277739 CASAVA_Build 7 95331129 4I CTTTGCAAGA ----/ATTT ATTATTCATA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATTT 0 1 277740 CASAVA_Build 7 95337636 1D CTATAGCCCA C/- CCACCTGTTC 3070 hom 132 het 47 0 44 3 C 3 2 277741 CASAVA_Build 7 95341894 2D TAGAAAAAGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 60 het 44 0 23 22 AG 10 9 277742 CASAVA_Build 7 95346790 2D AAGAGTAAAA AG/-- AGTCATGCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AG 2 1 277743 CASAVA_Build 7 95348622 1D AAGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 10 9 277744 CASAVA_Build 7 95359218 1D TTTTTGTAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 10 9 277745 CASAVA_Build 7 95361707 1D ACCTGAATTT G/- GGGGGGGGAC 3070 hom 84 het 31 0 29 4 G 9 8 277746 CASAVA_Build 7 95364694 1D ATTGACCATG A/- TTTTTTTTTT 3070 het 2522 hom 35 11 16 8 A 1 0 277747 CASAVA_Build 7 95398766 1I TGACTTATTT -/C TCATCAGTTC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 0 1 277748 CASAVA_Build 7 95412949 2D AAAATATATG TA/-- TATATATCTT 3070 het 3070 ref 32 18 14 1 TA 4 3 277749 CASAVA_Build 7 95417223 1D CTCATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 11 10 277750 CASAVA_Build 7 95429846 1I GCCTTTTACC -/A CTGACAAAGC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 0 1 277751 CASAVA_Build 7 95438184 2I CTGTAAAGAC --/AG AGGCAGATTC 3070 het 3070 hom 56 20 25 11 AG 1 2 277752 CASAVA_Build 7 95439792 1I ACCAATCCGG -/A ATTGCTGCAA 3070 het 3070 ref 55 26 19 10 A 1 2 277753 CASAVA_Build 7 95440781 1I TGTTGTGAGT -/A GTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 0 1 277754 CASAVA_Build 7 95445905 4D AGTGTGGCAG ATGT/---- TCAGCACTGG 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 ATGT 1 0 277755 CASAVA_Build 7 95489700 6I TTTGCTCCAG ------/GGCACC GGCACCCCCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 GGCACC 1 2 277756 CASAVA_Build 7 95532176 1D GTCTTAAGGC A/- AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 52 35 4 14 A 11 10 277757 CASAVA_Build 7 95532627 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1409 het 1409 ref 25 14 5 6 T 17 16 277758 CASAVA_Build 7 95549163 2D AATTCTAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 12 10 277759 CASAVA_Build 7 95551568 2I GGCAAATCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2287 hom 23 9 8 6 A 13 15 277760 CASAVA_Build 7 95554342 1D TTTTAAGGGG A/- ATCACACTTA 3070 het 3070 ref 43 25 15 4 A 2 1 277761 CASAVA_Build 7 95556404 1D AGTATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 13 9 A 13 12 277762 CASAVA_Build 7 95556488 1I CCTCAGCTTC -/T TTTTTTAACC 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 6 7 277763 CASAVA_Build 7 95557770 1I GTGTTACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 10 11 277764 CASAVA_Build 7 95573861 2D TGCAATAGAC TT/-- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 T 3 1 277765 CASAVA_Build 7 95580265 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3039 het 2997 hom 23 10 11 2 A 9 8 277766 CASAVA_Build 7 95593106 3D ATTATGGCAG TTC/--- TTCTATTACT 3070 het 3070 ref 30 16 12 4 TTC 2 1 277767 CASAVA_Build 7 95636702 2I AAACCAGTAC --/AT GAGATAAAAC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 AT 0 1 277768 CASAVA_Build 7 95639287 2I TGTGTCATAC --/TT TGAGAGAGGT 3070 hom 144 het 55 0 48 7 T 1 3 277769 CASAVA_Build 7 95669802 1I AGAGCATTGC -/A AATTTCTGGA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 A 2 3 277770 CASAVA_Build 7 95671787 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAACAAAA 3070 hom 88 het 33 0 29 4 A 5 6 277771 CASAVA_Build 7 95678162 2D TGAAATAAAG TT/-- TTAACGTAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 4 2 277772 CASAVA_Build 7 95679348 1I GATCATGTGT -/A GACCTAGGTC 3070 hom 153 het 55 0 49 6 A 0 1 277773 CASAVA_Build 7 95707427 2D ATGGAAAAAG TA/-- GGTTAAGTAA 3070 het 3070 ref 47 25 20 3 TA 1 0 277774 CASAVA_Build 7 95730275 1D ACCATCTAGG A/- AAAAAAAAAA 2937 het 621 hom 20 4 11 6 A 19 18 277775 CASAVA_Build 7 95751355 1D TTACAAAAAT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 8 7 277776 CASAVA_Build 7 95766158 1I TAGGACGAAC -/A ACAAGAGAAG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 1 2 277777 CASAVA_Build 7 95774389 1I TTTGTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 11 12 277778 CASAVA_Build 7 95779878 4D GTAGGCACTG ACAA/---- ACAGTCGTCG 3070 het 3070 hom 44 22 21 5 ACAA 1 0 277779 CASAVA_Build 7 95793360 5I ATCACATGAC -----/CTCTT CTGTCTGTCT 3070 het 3070 hom 54 20 30 4 CTCTT 0 1 277780 CASAVA_Build 7 95796856 1D TCCTACAAAA T/- TTTTAAGAAA 3070 het 3070 hom 26 14 11 1 T 5 4 277781 CASAVA_Build 7 95806101 1I TGTAATCCTA -/G CACTTCGGGA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 G 0 1 277782 CASAVA_Build 7 95812672 1D AGAAAGAAAG A/- AAGAGAGAGA 1724 het 1525 hom 13 5 4 4 A 3 2 277783 CASAVA_Build 7 95814351 1I TGCTACCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 9 10 277784 CASAVA_Build 7 95833612 1I TGTTGCTTAA -/T CTCCAAGTAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 0 1 277785 CASAVA_Build 7 95833778 1I GTGAGCTTGC -/A AAAAAGTACA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 5 6 277786 CASAVA_Build 7 95834428 1D TGTGGTGGCA G/- TCACTTATAG 3070 het 2168 hom 14 5 8 1 G 1 0 277787 CASAVA_Build 7 95835523 1D GTTATACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 T 12 11 277788 CASAVA_Build 7 95836677 4I CCACTGTACT ----/CCAG CCTAGGCAAC 2142 het 2142 ref 24 12 6 6 CCAG 0 1 277789 CASAVA_Build 7 95840276 1D ATTTTTGTTA T/- TTTTTTTTTA 2229 hom 15 het 8 0 6 2 T 10 9 277790 CASAVA_Build 7 95882550 1I GAAGCACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 10 11 277791 CASAVA_Build 7 95887010 2I GTTAGCAGAG --/GA CTCAAGACTG 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 GA 0 1 277792 CASAVA_Build 7 95891694 4D ATATAAGTGA TATT/---- TATAGCACAG 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 TATT 1 0 277793 CASAVA_Build 7 95901374 1I CCATTCCTGT -/C CCCCCCACCA 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 C 6 7 277794 CASAVA_Build 7 95965626 2I CACGTGTGTC --/TG TGTGTAAGTG 3070 het 3070 hom 65 29 31 5 TG 2 3 277795 CASAVA_Build 7 95973228 6D AATTATGAGT TGTCAA/------ TGTCTTGCAT 3070 het 3070 ref 46 25 18 6 TGTCAA 1 0 277796 CASAVA_Build 7 95981778 1I AAGTAATTGA -/C CAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 C 1 2 277797 CASAVA_Build 7 95989981 2I CCCCCCCCCC --/AA AAAAAAAAAT 2395 hom 9 het 12 0 8 4 A 9 11 277798 CASAVA_Build 7 95992509 1D TCCTGACTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 484 hom 27 4 12 11 T 13 12 277799 CASAVA_Build 7 95996866 1I AGCTCTTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 10 11 277800 CASAVA_Build 7 96017389 4D TTTGAGAAAT AGTG/---- AGGGAAAGTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AGTG 1 0 277801 CASAVA_Build 7 96018978 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAGA 2715 het 377 hom 22 4 16 2 A 8 9 277802 CASAVA_Build 7 96019444 1I AGTTTCTCTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 9 277803 CASAVA_Build 7 96025771 1D CAGGCAGACA G/- GGGAGGAGCT 3070 hom 105 het 45 0 35 11 G 4 3 277804 CASAVA_Build 7 96031128 1I AAAATTCACA -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 7 277805 CASAVA_Build 7 96031664 1D GATGCCATCC A/- AAAAAAAAAT 1346 het 1346 ref 38 30 3 6 A 10 9 277806 CASAVA_Build 7 96034745 1I AACCTTTGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 408 hom 36 1 30 5 T 8 9 277807 CASAVA_Build 7 96044364 1D AAACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 22 0 19 5 A 13 12 277808 CASAVA_Build 7 96045533 1D AAGATAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 39 1 33 6 A 11 10 277809 CASAVA_Build 7 96047204 1I CACCTTTCAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 7 8 277810 CASAVA_Build 7 96054332 1I AGGTGGTCTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 7 8 277811 CASAVA_Build 7 96055431 2I AGCCTGGGCA --/AC ATAGTGAGAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AC 0 1 277812 CASAVA_Build 7 96055748 1D ATTTGATAAT A/- AAAGCTCATT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 4 3 277813 CASAVA_Build 7 96064925 2D AGTATATATG AT/-- ATATATATAT 3070 het 113 hom 20 1 15 4 AT 9 8 277814 CASAVA_Build 7 96071134 1D TACAGGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 31 1 23 7 T 13 12 277815 CASAVA_Build 7 96072146 2D CAGCCTGGGC GA/-- GACAGAGCAA 3070 hom 65 het 25 0 19 6 GA 2 1 277816 CASAVA_Build 7 96074866 1I TAGCCAGCCA -/C CCCCACCTCA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 4 5 277817 CASAVA_Build 7 96080217 2I AAATTAAAAC --/TG TTTTTTAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TG 0 1 277818 CASAVA_Build 7 96089517 1D AAGGACATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 10 9 277819 CASAVA_Build 7 96103582 1I AATAACTTGA -/C AAAGGGAAGG 3070 hom 129 het 52 0 43 9 C 0 1 277820 CASAVA_Build 7 96135999 1I CCCCTCTACC -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 A 7 8 277821 CASAVA_Build 7 96140283 4I AAAATTAATT ----/AATA GTTTGTCTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AATA 0 1 277822 CASAVA_Build 7 96167176 3I TCTCTCCCTT ---/GAC AACTACTACT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 GAC 0 1 277823 CASAVA_Build 7 96167450 4D AATCCTTTAT TACA/---- TACATGCTAA 3070 het 3070 hom 48 16 25 9 TACA 2 1 277824 CASAVA_Build 7 96170897 1D GCATATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 12 11 277825 CASAVA_Build 7 96179063 2I AAGTCTCTAA --/GT GTGTGTGTTT 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 GT 4 5 277826 CASAVA_Build 7 96183845 2D GTCCCCTAGT CC/-- CTGGCAACTA 3070 het 3070 hom 52 18 31 3 C 3 1 277827 CASAVA_Build 7 96185923 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1236 het 1236 ref 28 20 4 4 TA 7 6 277828 CASAVA_Build 7 96201234 2D TTAAATCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2445 het 829 hom 42 14 10 18 T 20 18 277829 CASAVA_Build 7 96209818 4I AACAGAACAC ----/AATT GAGCAATGTG 3070 het 2903 hom 21 7 12 2 AATT 0 1 277830 CASAVA_Build 7 96211389 1D AGAGTGCAAG A/- AAAAAAAAAG 1836 het 1836 ref 33 25 4 4 A 10 9 277831 CASAVA_Build 7 96228460 1I GTGATTTTTG -/T GGGGGGTGTT 3070 hom 56 het 25 0 20 5 T 0 1 277832 CASAVA_Build 7 96228540 1I GGCTCTGTCA -/G TGGGAAGATC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 G 0 1 277833 CASAVA_Build 7 96233246 1I CAAAAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 10 11 277834 CASAVA_Build 7 96234744 1I TAGATAATGC -/A ATTCTGAGAC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 1 2 277835 CASAVA_Build 7 96235203 1D ATTAAATATC T/- TTTTTTAGAC 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 T 7 6 277836 CASAVA_Build 7 96236081 4D AGTCACTCAG CTGA/---- CTGACTGTGA 3070 hom 93 het 33 0 31 3 CTGA 2 1 277837 CASAVA_Build 7 96243699 1D GTCTCAATCT C/- CTTGACCTTG 3070 het 19 hom 15 1 11 3 C 2 1 277838 CASAVA_Build 7 96246122 1I TCTATTGATA -/T TTTAAGGGCC 3070 het 3070 hom 37 10 20 7 T 3 4 277839 CASAVA_Build 7 96247664 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1915 het 1239 hom 16 4 7 5 A 15 16 277840 CASAVA_Build 7 96260745 1D TAGTTGGGGG A/- AAAACAGGAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 A 5 4 277841 CASAVA_Build 7 96275766 5D GCAAAATTGT GCTGA/----- CAGCCAACTA 3070 hom 86 het 32 0 28 7 GCTGA 1 0 277842 CASAVA_Build 7 96293783 1I TGAAGTAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 34 1 30 3 T 12 13 277843 CASAVA_Build 7 96308119 1D AAAGATAAAG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 8 7 277844 CASAVA_Build 7 96335328 1I CCAGGCCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 203 hom 22 1 12 9 T 13 14 277845 CASAVA_Build 7 96348095 1I GTCACTCCAC -/T CCAGCCTGGG 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 0 1 277846 CASAVA_Build 7 96348299 1I CTTCATGGGG -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 A 6 7 277847 CASAVA_Build 7 96359969 2I AGACAGAGAC --/AG ATAGAGACAC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 AG 0 1 277848 CASAVA_Build 7 96361574 1I36M2D TCTCTTGTTT -AAAAAAACTATAATTTTCACTTTCTTTAATTACTTATT/AAAAAAAACTATAATTTTCACTTTCTTTAATTACTTA-- AATGTTTAGA 3070 het 2537 hom 25 7 19 12 N/A 0 0 277849 CASAVA_Build 7 96361780 2D CACCTTGCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 TC 8 7 277850 CASAVA_Build 7 96363649 2D CCACTAGAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 17 13 A 13 11 277851 CASAVA_Build 7 96365082 1I AGCCTATGGA -/T TTGTTTCCCT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 2 3 277852 CASAVA_Build 7 96366807 3D GTATGAACAG GTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 GTT 1 0 277853 CASAVA_Build 7 96377434 1I ATTACTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 11 12 277854 CASAVA_Build 7 96382094 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 28 het 20 0 13 7 A 9 10 277855 CASAVA_Build 7 96384509 3D GTTCACGCCA TTC/--- TTCTGCCTCA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTC 2 1 277856 CASAVA_Build 7 96387583 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTCTCTTC 740 het 740 ref 41 19 6 16 T 5 4 277857 CASAVA_Build 7 96389464 1D GAATAAATAC A/- GGGGGCAAAT 3070 het 3070 ref 45 26 16 5 A 1 0 277858 CASAVA_Build 7 96390119 1I GCACAGCATT -/G GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 G 4 5 277859 CASAVA_Build 7 96391989 2D TGACACTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2095 het 918 hom 16 6 5 6 A 14 12 277860 CASAVA_Build 7 96399881 2D AGAAAGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 5 het 5 ref 20 7 1 13 A 13 11 277861 CASAVA_Build 7 96404627 1I GTCCTATCTG -/C CCGTCTGCAA 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 C 2 3 277862 CASAVA_Build 7 96420423 1D CCTTTCTGAT C/- TTTTAGGAAT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 1 0 277863 CASAVA_Build 7 96433666 2D TCAGAGATAT AC/-- ATCAAATAGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AC 1 0 277864 CASAVA_Build 7 96452156 1I CACTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3003 het 1148 hom 33 8 14 11 T 15 16 277865 CASAVA_Build 7 96456716 5I AACCTGTCCT -----/CGCTA CGCTACTCGG 3070 hom 80 het 32 0 24 8 CGCTA 1 2 277866 CASAVA_Build 7 96458181 4D ACATATATAT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 3 het 30 2 25 3 AG 10 8 277867 CASAVA_Build 7 96468774 1I GACTAGCAAG -/T TTTTTTTTTT 592 het 592 ref 46 34 3 9 T 10 11 277868 CASAVA_Build 7 96482296 1D AATTAACATT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1048 hom 17 7 8 2 C 11 10 277869 CASAVA_Build 7 96483031 1I CCCACTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 30 2 19 9 A 14 15 277870 CASAVA_Build 7 96487438 2I CCATATATAT --/TA TATATATATA 1415 het 1415 ref 24 15 4 5 TA 6 7 277871 CASAVA_Build 7 96532473 2I AACCCTTCCC --/AA AAAAGAGTGA 3070 het 3007 hom 25 8 11 6 A 4 6 277872 CASAVA_Build 7 96550848 1I TTAGAAAAGC -/T AATTGTCTCT 3070 het 3070 ref 57 27 25 5 T 0 1 277873 CASAVA_Build 7 96562131 1I ATTAAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 1936 het 1936 ref 27 12 6 9 A 10 11 277874 CASAVA_Build 7 96594094 1D TGGAGTACCG A/- AAAAAAAAAA 1187 het 911 hom 23 10 4 9 A 17 16 277875 CASAVA_Build 7 96606656 1D GTGAGTATGC A/- AAAAAGGCTA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 6 5 277876 CASAVA_Build 7 96618752 1I CCTTTAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 17 11 T 13 14 277877 CASAVA_Build 7 96623140 1I TCATTAATAA -/C AGTAGATATC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 C 0 1 277878 CASAVA_Build 7 96636617 2D CAAATTGAAC TG/-- TGTGAAAGTA 3070 hom 51 het 25 0 18 10 TG 3 2 277879 CASAVA_Build 7 96638454 4I AATGCTCCCA ----/ACTT ACTTAGGTTT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 ACTT 1 2 277880 CASAVA_Build 7 96640795 1D AAAATTAGAA T/- TTTTTTTTTT 2269 het 138 hom 17 2 8 7 T 17 16 277881 CASAVA_Build 7 96640827 2D GAGAGTCTCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 33 het 17 0 10 7 CT 6 5 277882 CASAVA_Build 7 96688406 1I TTGAGCAAAT -/G GGGGGGTCAC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 6 7 277883 CASAVA_Build 7 96697972 1D ATCTATCCCC T/- TTTTTTTTTT 1489 het 1489 ref 32 22 4 6 T 11 10 277884 CASAVA_Build 7 96761551 1D TGTGTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2250 hom 27 6 16 5 T 10 9 277885 CASAVA_Build 7 96761705 1I CTAATTTTTG -/T TATTTTTTGT 3070 het 1822 hom 22 7 15 0 T 1 2 277886 CASAVA_Build 7 96762270 1D ACTGTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 14 13 277887 CASAVA_Build 7 96768670 1D TCTAGGGGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 9 8 277888 CASAVA_Build 7 96778905 1I GCAGCAAGGT -/A AAAAACAGCC 3070 het 3070 hom 40 14 14 12 A 5 6 277889 CASAVA_Build 7 96780987 2I TGAAGTGTAG --/TA TACCTATCAT 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 TA 1 2 277890 CASAVA_Build 7 96782656 4D TGTAATAAGA AAAC/---- AAACATTCAG 3070 het 3070 hom 39 16 20 5 AAAC 2 1 277891 CASAVA_Build 7 96785814 1I AGAAAAAAAA -/C TGGTTTGCTT 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 C 0 1 277892 CASAVA_Build 7 96788588 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2832 hom 20 8 10 2 A 11 10 277893 CASAVA_Build 7 96790330 2D TCCTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2257 het 1599 hom 27 8 10 11 T 16 14 277894 CASAVA_Build 7 96790866 1I TTCTAGGAAG -/T TAAGTAATTT 3070 het 3070 hom 44 16 26 2 T 1 2 277895 CASAVA_Build 7 96804241 2I2M14I AGACACTCAG --AT--------------/GCATGAGTGTCTTAAAGA TATAAGGCTG 3070 het 3070 ref 44 24 21 1 N/A 0 0 277896 CASAVA_Build 7 96842769 11D GCTAGGCCTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2972 het 2132 hom 20 7 7 8 T 21 10 277897 CASAVA_Build 7 96912707 16D AAATACCAAA CTGGTACGAAAGAGAC/---------------- CTGGTTTTGA 3070 het 3070 ref 34 20 16 4 CTGGTACGAAAGAGAC 1 0 277898 CASAVA_Build 7 96926023 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 13 11 277899 CASAVA_Build 7 96926205 1I ATTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 15 16 14 A 10 11 277900 CASAVA_Build 7 96934693 1D ACCATCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 12 11 277901 CASAVA_Build 7 96937941 2I CAAGAGGAAT --/AA AAAGAGGAGA 3070 het 3070 ref 51 28 21 2 A 3 5 277902 CASAVA_Build 7 96942626 4I ATATTCTAAA ----/TCTC TCTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 13 26 3 TC 2 4 277903 CASAVA_Build 7 96945040 4D AGTTCCACAC ACTT/---- ACAGGGAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 22 4 ACTT 1 0 277904 CASAVA_Build 7 96954322 1D TATTCTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 A 11 10 277905 CASAVA_Build 7 96956426 1I CTTTGTATCC -/T TTTTCAATCG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 4 5 277906 CASAVA_Build 7 96960531 1I TAAGAAAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 9 10 277907 CASAVA_Build 7 96963601 1I GTAATATTCT -/A ACTCTAACTT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 1 2 277908 CASAVA_Build 7 96963719 2I CACATATAGC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TA 5 6 277909 CASAVA_Build 7 96963933 1D TTTTTCCCCC T/- GAATGTGATT 3070 het 3070 ref 32 20 12 0 T 1 0 277910 CASAVA_Build 7 96975590 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 903 hom 18 5 9 4 A 12 13 277911 CASAVA_Build 7 97021611 1I CCCTGGCTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2894 hom 30 13 15 2 T 9 10 277912 CASAVA_Build 7 97028466 1D GAGACATAAC A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 36 22 12 3 A 7 6 277913 CASAVA_Build 7 97037304 1I GCCTAGCATA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 8 9 277914 CASAVA_Build 7 97045385 1I CCTCAAATTA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 7 8 277915 CASAVA_Build 7 97045693 1I TCATGTGTGA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 57 32 18 7 T 7 8 277916 CASAVA_Build 7 97051512 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 6 7 277917 CASAVA_Build 7 97051887 1D AAGTCTCAGG A/- TACAAAATTA 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 1 0 277918 CASAVA_Build 7 97057634 2I ATTTGGATCT --/TC TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 TC 4 5 277919 CASAVA_Build 7 97072368 13I GCCCTGGTTG -------------/CCCACTAAAATCA CCTGGGGAGT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 CCCACTAAAATCA 0 1 277920 CASAVA_Build 7 97086925 1I AGAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 918 het 331 hom 4 2 2 0 A 12 13 277921 CASAVA_Build 7 97095844 1I CACTGATGAG -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 6 7 277922 CASAVA_Build 7 97109163 1D AATGGAAGAG A/- AAAAGAAAAC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 5 4 277923 CASAVA_Build 7 97122193 1D AGAGTGTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 24 21 9 A 11 10 277924 CASAVA_Build 7 97173502 1I TTGAAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 12 10 12 A 8 9 277925 CASAVA_Build 7 97175748 5I GAGTCAGCTA -----/TTAAT CACTCCAGCC 3070 hom 49 het 23 0 16 7 TTAAT 0 1 277926 CASAVA_Build 7 97176615 1I TAATACCCCC -/A AAAAAATCAC 3070 het 423 hom 28 1 27 0 A 6 7 277927 CASAVA_Build 7 97177094 1I AAACATAATT -/G GGGGAATAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 4 5 277928 CASAVA_Build 7 97178277 1D CCTACCAACC A/- AAAAAAGTCC 1109 hom 7 het 3 0 3 0 A 7 6 277929 CASAVA_Build 7 97178722 2D TTGCTAAAAA CT/-- CTCAATAAAC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 CT 2 1 277930 CASAVA_Build 7 97179867 1I AAATACCTAA -/T GTAAATGATG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 0 1 277931 CASAVA_Build 7 97179987 3I TATTTTTTAT ---/TAA AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TAA 0 1 277932 CASAVA_Build 7 97181802 1I AAAAGGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 26 0 21 5 A 10 11 277933 CASAVA_Build 7 97182959 1I27M4D CTAAAAAGAA -CCCACATAACCAGAGCAAGACTAAGAAAAAC/CCCCACATAACCAGAGCAAGACTAAGAA---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 26 0 28 7 N/A 0 0 277934 CASAVA_Build 7 97190497 1I TATTCTAGGA -/C CCCCCCCCCA 3070 het 910 hom 22 2 12 8 C 9 10 277935 CASAVA_Build 7 97202937 4I CATCTTTGAA ----/AAAT AAATAAATAG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AAAT 2 3 277936 CASAVA_Build 7 97205885 5D ATATGCAGCT TATTG/----- TTAACCGCAC 3070 hom 132 het 47 0 45 4 TATTG 1 0 277937 CASAVA_Build 7 97214893 1I ACAAAAGGGG -/A AAAAATATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 6 277938 CASAVA_Build 7 97215871 1D TCTCACACAC A/- ACAAAAGTTT 1340 het 1340 ref 34 30 3 1 A 2 1 277939 CASAVA_Build 7 97216085 1I ACAATAGGAC -/A AAAAAAAATG 2273 hom 21 het 17 0 8 9 A 8 9 277940 CASAVA_Build 7 97216114 11D ATTTTAAAGA GATAAACTTTG/----------- GAAAGCTATT 1924 hom 18 het 18 0 6 13 GATAAACTTTG 1 0 277941 CASAVA_Build 7 97217113 1I AAAACTGCAT -/A TTTATGGTTA 3070 hom 126 het 47 0 41 6 A 0 1 277942 CASAVA_Build 7 97234577 2D GAATTGGGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AT 9 8 277943 CASAVA_Build 7 97237134 1I AATATTTTTT -/A AAAACTTATT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 A 4 5 277944 CASAVA_Build 7 97238688 1I ATCACAGTGG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 277945 CASAVA_Build 7 97272794 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 196 het 6 hom 5 0 1 4 A 12 11 277946 CASAVA_Build 7 97326869 1D ATTACACTAA C/- TTTTCGTAAT 1803 het 1803 ref 47 35 4 9 C 1 0 277947 CASAVA_Build 7 97326964 2I ACTAAAGCAA --/AT ATACACAAAA 3070 het 3070 ref 56 32 15 9 AT 1 2 277948 CASAVA_Build 7 97328712 2D GTCAAAAATA AG/-- TTGATCATAT 2906 het 2906 ref 45 32 7 6 AG 1 0 277949 CASAVA_Build 7 97329141 4D56M2I TAAATTTATT TCTAAGTATTTTATTCTTTTTGATGCTATTATAAATGAAGTTGCTTTCTTAATTTCATTT--/----AGTATTTTATTCTTGTTGATGCTATGATAAATGAAGTTGCTTTCTTAATTTCATTTTC TGATTGCTCA 2508 het 2508 ref 43 53 6 4 N/A 0 0 277950 CASAVA_Build 7 97330868 3I GCACTGAGCT ---/ATG ATCAAACCAC 2293 het 2293 ref 54 40 6 9 ATG 0 1 277951 CASAVA_Build 7 97331373 1D CTGTTTTTTT A/- AAAAAAGGTA 529 het 529 ref 48 32 3 15 A 7 6 277952 CASAVA_Build 7 97332121 13I CAGAAGTGTT -------------/TAGGGTTTCGGAA TTGTGTTTTG 3070 het 3070 ref 68 43 20 5 TAGGGTTTCGGAA 0 1 277953 CASAVA_Build 7 97333757 21D CTCCACCATC AACGGCAAACTATGAGCCATT/--------------------- AATGGCAAAC 540 het 540 ref 48 46 4 7 AACGGCAAACTATGAGCCATT 1 0 277954 CASAVA_Build 7 97334405 1I TGGCTGCAGG -/C CCCTGATACT 3070 hom 162 het 57 0 50 7 C 3 4 277955 CASAVA_Build 7 97334871 1I GTATATGACA -/C TTATTTGACT 996 het 996 ref 55 31 6 18 C 0 1 277956 CASAVA_Build 7 97336040 4D CAAATGAGAT AACG/---- AACATAGAGT 3070 het 3070 ref 71 41 24 12 AACG 1 0 277957 CASAVA_Build 7 97337070 1D ATCTAAAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 23 12 11 0 A 10 9 277958 CASAVA_Build 7 97346910 4I AGGGAAGCAG ----/ATCA ATCACCAGTC 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 ATCA 1 2 277959 CASAVA_Build 7 97346993 1I CTGAGTCACG -/C CTGGATTCCT 3070 het 3070 ref 75 37 28 10 C 1 2 277960 CASAVA_Build 7 97350516 3I GTTGGCTGTT ---/AAA AAAAAAAATA 2734 het 2734 ref 46 37 7 2 A 8 11 277961 CASAVA_Build 7 97351930 2I24M1D7M1D CCTCTCCTTA --GGTCATCTCTTCAAGGAAGATTTTACTTTTTTA/AGTGTCATCTCTTCAAGGAAGATTTT-CTTTTTT- ATATAACTAT 3070 het 3070 ref 32 22 12 6 N/A 0 0 277962 CASAVA_Build 7 97356773 1D CAACAACCAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 49 28 13 8 A 9 8 277963 CASAVA_Build 7 97357791 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 A 7 8 277964 CASAVA_Build 7 97359052 9I CACTCCTGTG ---------/GCTTTGTAT GGTTTAAACC 3028 het 3028 ref 37 21 8 8 GCTTTGTAT 0 1 277965 CASAVA_Build 7 97359828 1D TTTGCTGCTT A/- GAAATTTCTT 3070 het 3070 ref 32 24 8 0 A 1 0 277966 CASAVA_Build 7 97361095 1I AAGAAACATT -/A GATTTAAGCT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 0 1 277967 CASAVA_Build 7 97364874 5D CAAGCATGTG AAGAA/----- AAGAAAATTA 3070 het 3070 ref 32 20 11 4 AAGAA 2 1 277968 CASAVA_Build 7 97365571 5D TATTTGCTAC TGTTT/----- TAAGTCTGAA 3070 het 3070 ref 47 31 13 6 TGTTT 1 0 277969 CASAVA_Build 7 97370491 1D AGATCCAGAG T/- TTTTTTTTTT 2754 het 714 hom 35 3 9 24 T 17 16 277970 CASAVA_Build 7 97371977 1I CATAAAAGAG -/A AAAAAATGCA 3070 het 371 hom 20 1 16 3 A 6 7 277971 CASAVA_Build 7 97375017 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2378 het 348 hom 9 1 8 0 A 13 14 277972 CASAVA_Build 7 97376763 1I CATCATGTCG -/T TGCAGGCTTG 3070 het 291 hom 12 1 8 3 T 1 2 277973 CASAVA_Build 7 97381778 4D CATGCTAGAC AGGT/---- AGAGCCATGG 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AGGT 1 0 277974 CASAVA_Build 7 97382248 1I GAAGAAGAGC -/A GGGGGGCATG 774 het 774 ref 30 25 2 4 A 0 1 277975 CASAVA_Build 7 97397489 1D AAGAAGCCTG C/- CACATTTTTA 3070 het 3070 ref 32 21 8 4 C 2 1 277976 CASAVA_Build 7 97405251 1I AAACTCTCCT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 9 277977 CASAVA_Build 7 97417845 1D CTAATATCCA G/- GGGGGAAGAG 2686 het 2686 ref 32 23 7 3 G 6 5 277978 CASAVA_Build 7 97419153 4I CATCACTTGT ----/CCTG CCCTCTACCT 1163 het 1163 ref 44 36 4 4 CCTG 0 1 277979 CASAVA_Build 7 97453571 2I TTTGAACAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 27 0 19 8 T 10 12 277980 CASAVA_Build 7 97473476 2I ACCATAGCAT --/CC CCCCCCCAAC 2646 het 2414 hom 24 9 9 6 C 7 9 277981 CASAVA_Build 7 97475182 2I TTTACATAAC --/AT AAAGTAAACA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 AT 0 1 277982 CASAVA_Build 7 97486401 1I GTATTTGCCA -/T TTTTTTTTTT 2722 hom 29 het 13 0 10 3 T 13 14 277983 CASAVA_Build 7 97504105 3D TGGTCTCGAT CTC/--- CTGACCTCGT 3070 hom 44 het 17 0 11 7 CTC 1 0 277984 CASAVA_Build 7 97506630 1D TTTAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 13 12 277985 CASAVA_Build 7 97514301 1I GATTCTGGCC -/A AAAAAAAAAA 1978 het 192 hom 27 3 14 10 A 12 13 277986 CASAVA_Build 7 97516341 1D CTTAGAAAAG C/- CCCCTGGCTG 3070 hom 99 het 35 0 32 3 C 5 4 277987 CASAVA_Build 7 97528438 1I ATGCCCCATG -/T TAAGTGAGAT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 1 2 277988 CASAVA_Build 7 97528510 1D TCCAGGTTCA C/- CCATGTTGTT 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 C 3 2 277989 CASAVA_Build 7 97543771 8I TCAACCTCCT --------/GGGCTCAA GGGCTCAAGG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 GGGCTCAA 1 2 277990 CASAVA_Build 7 97544244 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAC 2673 het 1463 hom 15 5 7 3 A 10 9 277991 CASAVA_Build 7 97558305 1D ATTATCTTTG T/- TTTTTTCAAT 3070 hom 77 het 29 0 26 3 T 7 6 277992 CASAVA_Build 7 97572669 1D AGCCGTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 15 1 10 4 T 12 11 277993 CASAVA_Build 7 97588720 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2408 hom 24 9 13 3 A 12 11 277994 CASAVA_Build 7 97600030 1D TGGCCTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 T 10 9 277995 CASAVA_Build 7 97611995 1I ATAGTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 2012 het 2012 ref 38 15 7 16 T 15 16 277996 CASAVA_Build 7 97612526 2D ATGGTACACT AA/-- AAAAAAAAAA 1654 het 397 hom 30 4 5 21 A 14 12 277997 CASAVA_Build 7 97617195 1I TAAGAAACAG -/C CCAATAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 2 3 277998 CASAVA_Build 7 97630540 1D ATTTTATGCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 9 8 277999 CASAVA_Build 7 97633849 2I TATATAGATT --/TA TAGTGTGGTC 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 TA 1 2 278000 CASAVA_Build 7 97658184 2D TGTCCCCAAA AC/-- ACAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 AC 2 1 278001 CASAVA_Build 7 97675186 2D AAAATACAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 AT 10 9 278002 CASAVA_Build 7 97680689 1I GAGCTGCCAG -/A AAACTCTAAT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 A 3 4 278003 CASAVA_Build 7 97684793 3D TCGGGGACTC GAG/--- GATCCTGGAG 3070 hom 45 het 17 0 13 4 GAG 1 0 278004 CASAVA_Build 7 97688733 3I AATTAAAGTT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 20 3 12 5 TTG 0 1 278005 CASAVA_Build 7 97697206 1D CAGCTCAGAT C/- CCCCCCCCAG 926 het 22 hom 16 0 4 13 C 9 8 278006 CASAVA_Build 7 97718560 1I TTCAGAGACC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 7 8 278007 CASAVA_Build 7 97738539 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 209 hom 27 2 20 5 T 12 11 278008 CASAVA_Build 7 97739899 5D TTTATTTATT TTTTA/----- TTTATTTTAT 2289 hom 21 het 9 0 8 1 TTTTA 1 0 278009 CASAVA_Build 7 97741011 1I AGCCACCGCA -/C CCTGGCTGCT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 C 2 3 278010 CASAVA_Build 7 97743719 1D ATTTGCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 9 19 10 T 11 10 278011 CASAVA_Build 7 97744517 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 32 het 13 0 10 3 A 8 7 278012 CASAVA_Build 7 97745547 1I GCGGGGGGCT -/G GGGGGGGGTC 1237 het 1237 ref 18 11 4 3 G 8 9 278013 CASAVA_Build 7 97755847 2D TCAGCCCCTC CA/-- CACAGACAGG 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 CA 3 2 278014 CASAVA_Build 7 97767510 1D CACAGCCATT C/- CCCCTGCTCC 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 C 5 4 278015 CASAVA_Build 7 97780007 2I GAAGAGGGAC --/TG TGGGTGAGTG 3070 het 2309 hom 25 9 11 5 TG 1 2 278016 CASAVA_Build 7 97784236 1I CTCAGCCTCC -/T GAGTAGCTGT 2040 het 2040 ref 17 9 6 2 T 0 1 278017 CASAVA_Build 7 97794121 1D TAGTCGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 22 10 A 11 10 278018 CASAVA_Build 7 97798083 2D GAGGGGTGCC CT/-- CTCTGTTAAG 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 CT 3 2 278019 CASAVA_Build 7 97805622 8I GTGAGCCGAG --------/ATTGCGCC ATTGCGCCAC 1383 het 150 hom 4 1 3 0 ATTGCGCC 1 2 278020 CASAVA_Build 7 97814425 3I CTAAGCCATG ---/AGA AGAAGGTGGT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 AGA 1 2 278021 CASAVA_Build 7 97822258 1D GATGACAAGT G/- GGGTTTATGT 3070 het 3070 hom 37 10 18 9 G 4 3 278022 CASAVA_Build 7 97824814 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1639 het 80 hom 9 1 5 3 A 17 18 278023 CASAVA_Build 7 97839046 1D TTTTAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1962 het 1377 hom 26 8 5 13 T 13 12 278024 CASAVA_Build 7 97845478 2I AAAATAACAC --/AT GACTGGAAAT 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 AT 0 1 278025 CASAVA_Build 7 97847327 1D TCAAAAATGC T/- TTTTTTTTTT 2715 het 2715 ref 35 14 9 13 T 15 14 278026 CASAVA_Build 7 97849177 1I AATCTAAGGG -/T TTTTTTTTTT 2025 het 1686 hom 27 8 8 11 T 15 16 278027 CASAVA_Build 7 97850438 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 8 9 278028 CASAVA_Build 7 97855129 3D AACAAAACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 43 18 15 11 AAC 4 3 278029 CASAVA_Build 7 97860416 2I CACATATATG --/TA TATATATATA 2258 het 1408 hom 15 6 6 3 TA 5 6 278030 CASAVA_Build 7 97864491 2D TCCCCTTTGA CT/-- CTGTTAGCAA 3070 het 3070 ref 42 30 9 3 CT 2 1 278031 CASAVA_Build 7 97870808 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAAAAAG 2063 het 2063 ref 23 14 7 2 AG 0 1 278032 CASAVA_Build 7 97878830 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1126 hom 34 4 22 8 T 12 13 278033 CASAVA_Build 7 97882384 2I AAAAAAAAAA --/GG AAGGAAAGAA 1055 het 1055 ref 26 7 5 14 G 0 2 278034 CASAVA_Build 7 97883510 3I ACATAAATGC ---/ATA ATAATAATAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 ATA 4 5 278035 CASAVA_Build 7 97888784 1D AATTAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 17 12 T 12 11 278036 CASAVA_Build 7 97901873 1D CCCGAGGGCG T/- TCATCACCCA 3070 hom 101 het 36 0 30 6 T 2 1 278037 CASAVA_Build 7 97905769 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 28 1 21 6 A 10 11 278038 CASAVA_Build 7 97919207 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 2510 het 520 hom 25 3 16 6 A 15 16 278039 CASAVA_Build 7 97956160 2D AAACAAACAA AC/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 AC 1 0 278040 CASAVA_Build 7 97995275 1I CATCTCACTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 278041 CASAVA_Build 7 98000715 1D GTAGGAGTGA G/- GGTGTGGGAT 3070 hom 110 het 43 0 37 7 G 3 2 278042 CASAVA_Build 7 98004916 1D AGGCCCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 490 hom 36 4 22 11 A 15 14 278043 CASAVA_Build 7 98008320 19D ATCAGCTGGT GACTGTGGCTGAGCCCCTG/------------------- GACTGTGGCT 3070 hom 71 het 31 0 21 17 GACTGTGGCTGAGCCCCTG 2 1 278044 CASAVA_Build 7 98019318 4I TGCCAGAAAG ----/ACCA ACCAAGTGAT 3070 hom 121 het 47 0 39 8 ACCA 1 2 278045 CASAVA_Build 7 98023580 1D AGACAGTTGG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 A 8 7 278046 CASAVA_Build 7 98034126 1D GGAAGGGTGA G/- CTACTCCCTA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 G 1 0 278047 CASAVA_Build 7 98036933 2I GGTAGCTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 11 9 17 TG 7 8 278048 CASAVA_Build 7 98094294 1I GCATGACCCC -/A GGTGACAGGA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 A 0 1 278049 CASAVA_Build 7 98107992 1D CCTGGAGCTC A/- CGACATCACT 2415 het 2415 ref 30 20 6 4 A 1 0 278050 CASAVA_Build 7 98113458 1D AACTCCCCAA C/- ACCTGGAGAC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 C 1 0 278051 CASAVA_Build 7 98113668 3I AAGATGAGAC ---/TGA TGATGCCAGC 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 TGA 1 2 278052 CASAVA_Build 7 98114131 1D CCACATTCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2673 hom 28 11 9 8 T 11 10 278053 CASAVA_Build 7 98115741 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2898 het 2898 ref 28 15 7 6 A 11 12 278054 CASAVA_Build 7 98121595 4D GTATCTATCT TCTA/---- TCTATCATCT 3070 het 3070 ref 37 22 13 3 TCTA 2 1 278055 CASAVA_Build 7 98121856 4I48M4I ATCTATCATA ----TATCTATCTATCTATCATCTGTCATCTGTCTGTCACCTATCTATTACT----/TGTCTATCTATCTATCTATCATCTGTCATCTGTCTGTCACCTATCTATTACTTATC TATCATCTAT 3070 het 3070 hom 41 15 45 4 N/A 0 0 278056 CASAVA_Build 7 98129289 1D ACTGCCCGAT A/- ACACTCCTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 2 1 278057 CASAVA_Build 7 98143585 1D GTTTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2425 hom 32 9 14 9 T 12 11 278058 CASAVA_Build 7 98155704 1I AGCACAAGCA -/T CAAGCACGCT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 0 1 278059 CASAVA_Build 7 98163705 3D ATCAAAATAG AGT/--- AGATTTCTCT 3070 het 3070 ref 48 25 22 2 AGT 1 0 278060 CASAVA_Build 7 98176843 1D19M4I ACTCTGGCTC AAAAAAACAAAACAAAACAA----/-AAAAAACAAAACAAAACAAAAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 27 14 16 4 N/A 0 0 278061 CASAVA_Build 7 98178363 1I AAAACAGAGA -/G GAAAAAAAAA 1813 het 1217 hom 25 11 8 6 G 1 2 278062 CASAVA_Build 7 98178602 1I AATTCATATG -/T TGAAGTTCTC 3070 het 3070 hom 49 19 16 14 T 1 2 278063 CASAVA_Build 7 98182511 1D GTTTGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 A 11 10 278064 CASAVA_Build 7 98183830 1I TTCAAAGTGT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 278065 CASAVA_Build 7 98186121 1D TTTTTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 11 3 A 11 10 278066 CASAVA_Build 7 98194282 3D GTGCAGGCAG GAC/--- GACAACTCCC 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 GAC 2 1 278067 CASAVA_Build 7 98196942 1D CTGCCTGATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 9 8 278068 CASAVA_Build 7 98198393 12D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 1503 het 654 hom 9 3 5 2 A 23 11 278069 CASAVA_Build 7 98211091 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 A 11 10 278070 CASAVA_Build 7 98229564 1I GAATAACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 25 1 17 7 T 11 12 278071 CASAVA_Build 7 98241296 4I GAGAACTAAG ----/AGAA AGGAAGATGA 3070 hom 86 het 32 0 26 6 AGAA 0 1 278072 CASAVA_Build 7 98243295 1I GCAGAACTTT -/A AAAAAAAAAA 2628 het 1741 hom 31 9 11 11 A 16 17 278073 CASAVA_Build 7 98251104 4I AGATAGATAC ----/ATAG ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 ATAG 2 3 278074 CASAVA_Build 7 98266168 2D CATAGCAAGA CC/-- CCCCCCACCC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 C 8 6 278075 CASAVA_Build 7 98266376 2I TTTTTTTTTT --/TA AAAAAAGAAC 2388 het 2054 hom 15 8 7 0 TA 0 1 278076 CASAVA_Build 7 98270926 1I CAGGGTATTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 8 9 278077 CASAVA_Build 7 98280049 4D CATCTCAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3064 het 985 hom 13 3 8 4 AAAT 5 4 278078 CASAVA_Build 7 98289959 1D TGCCCATGGT G/- AATACAGCCC 3070 hom 92 het 35 0 31 4 G 1 0 278079 CASAVA_Build 7 98293925 1D CATAGTGAGA C/- CCCATCTCTA 3070 hom 65 het 24 0 20 4 C 4 3 278080 CASAVA_Build 7 98309938 2D GGGGTCTCTT TA/-- TATGTTGCCC 3070 hom 75 het 27 0 25 4 TA 2 1 278081 CASAVA_Build 7 98310204 4D CTCAACACAT AATC/---- AACGTAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 4 AATC 1 0 278082 CASAVA_Build 7 98320814 1I GCTTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 38 1 27 10 T 13 14 278083 CASAVA_Build 7 98330183 1I TCTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 889 hom 31 2 24 5 T 9 10 278084 CASAVA_Build 7 98338152 6I ATGAAGAAAA ------/TGGAAC TGGAACATTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 TGGAAC 1 2 278085 CASAVA_Build 7 98338609 2I TTTTGGAGAC --/AA GAGTCTCACT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 0 2 278086 CASAVA_Build 7 98341644 1D ATATCAGACT G/- GCGGGCTGGC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 G 2 1 278087 CASAVA_Build 7 98344772 1D TAGTAGAGAC A/- GGGTTTTCCC 3070 het 3070 hom 20 9 7 4 A 1 0 278088 CASAVA_Build 7 98345352 4I AAATCGGCAC ----/CTTT CTTTTCCTTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 CTTT 1 2 278089 CASAVA_Build 7 98347947 1D TGTGCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 35 2 20 13 T 13 12 278090 CASAVA_Build 7 98370698 1D TCTGTACTTG A/- AAAAAAAAAG 901 het 901 ref 43 35 3 5 A 10 9 278091 CASAVA_Build 7 98374118 2I AGGGGGTACA --/AT ATATATATAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AT 5 6 278092 CASAVA_Build 7 98381839 2D AGAGGAAACT CA/-- CACAGAGTAT 3070 hom 155 het 60 0 52 9 CA 3 2 278093 CASAVA_Build 7 98388591 32D CATGTTACAT TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/-------------------------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 150 het 59 0 49 16 TG 24 8 278094 CASAVA_Build 7 98391676 1I CTCCCATGTT -/C CCGGCGTGAT 3070 hom 116 het 45 0 34 11 C 2 3 278095 CASAVA_Build 7 98403584 1D CCCATTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 15 11 T 12 11 278096 CASAVA_Build 7 98410445 1I GTGATGATGA -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 6 7 278097 CASAVA_Build 7 98418319 1D ACGGTGACTC A/- AAAATGTGTT 3070 hom 108 het 41 0 36 6 A 5 4 278098 CASAVA_Build 7 98496067 1D AAAGTCATCC T/- TTTTTTTTTT 2756 het 1641 hom 17 8 8 2 T 13 12 278099 CASAVA_Build 7 98497750 3D AACTCCTGGG TGA/--- TTCAAGCAAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 TGA 1 0 278100 CASAVA_Build 7 98504433 5D CTTGCTGGGC CCTAA/----- CCTACATTCA 3070 het 3070 hom 51 15 23 15 CCTAA 1 0 278101 CASAVA_Build 7 98505270 1I GCATTGAAGG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 A 7 8 278102 CASAVA_Build 7 98512891 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTTTAT 28 het 28 ref 16 8 1 7 T 9 8 278103 CASAVA_Build 7 98515556 1D ATTAGTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2504 hom 34 14 14 6 A 13 12 278104 CASAVA_Build 7 98529070 10D CAAAGCAACC ACTCTATAAT/---------- GACATTACAT 3070 het 3070 ref 46 34 9 6 ACTCTATAAT 1 0 278105 CASAVA_Build 7 98530220 1I CAAGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 875 hom 35 2 21 12 A 13 14 278106 CASAVA_Build 7 98535668 2D GGGAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 22 1 12 10 A 18 16 278107 CASAVA_Build 7 98551807 1I GATAAAAATA -/T TCAACATCCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 1 2 278108 CASAVA_Build 7 98556183 1D TCTAGAGCTG A/- AAAAAAAAAA 1706 het 1706 ref 36 27 5 5 A 14 13 278109 CASAVA_Build 7 98558667 1I CTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 32 1 26 5 T 10 11 278110 CASAVA_Build 7 98561908 1D CATATATTCC T/- TTTTTTTTTT 1990 het 1408 hom 21 6 5 10 T 15 14 278111 CASAVA_Build 7 98562534 1I AGCAGGGGCC -/A GGGGGGAAGG 3070 hom 98 het 39 0 33 6 A 0 1 278112 CASAVA_Build 7 98573667 1D GTTCAGTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 6 A 12 11 278113 CASAVA_Build 7 98583362 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 10 0 9 1 T 11 10 278114 CASAVA_Build 7 98587018 2I TTGTTTTTGG --/TT TTTTTTTTTT 2235 het 2235 ref 32 9 10 13 T 10 12 278115 CASAVA_Build 7 98587917 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 10 11 9 A 11 12 278116 CASAVA_Build 7 98592498 1I CTGAATTGAC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 T 7 8 278117 CASAVA_Build 7 98601552 2D CTGGTTGTTT AA/-- AAGTGTGCAG 3047 het 2893 hom 20 7 9 5 A 4 2 278118 CASAVA_Build 7 98603541 1I CCAAACCATT -/C CCCCCACCCC 3070 hom 44 het 16 0 15 1 C 5 6 278119 CASAVA_Build 7 98606994 3D CCCATGCCTA CCT/--- CCTCATGCGA 3070 hom 78 het 30 0 24 6 CCT 2 1 278120 CASAVA_Build 7 98616063 2I TCTCTGTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 47 16 16 15 TC 6 7 278121 CASAVA_Build 7 98616225 4D22M6D TCTCCCCATC TGTGTGTGTGTCTCTCTCCCCGTCTGTGTCTC/----TGTGTGTCTCTCTCCCCGTCTG------ TGTCTGTGTC 1172 het 1172 ref 37 18 9 15 N/A 0 0 278122 CASAVA_Build 7 98652125 2D TACCAACACC CT/-- CTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 37 0 31 7 CT 2 1 278123 CASAVA_Build 7 98676399 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2407 het 2407 ref 30 10 10 10 A 13 14 278124 CASAVA_Build 7 98681766 1D CTCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 2036 het 2036 ref 19 11 5 3 A 13 12 278125 CASAVA_Build 7 98705661 8I CTTGAACTCC --------/TGATCTCA TGATCTGCCC 3070 hom 42 het 18 0 13 5 TGATCTCA 0 1 278126 CASAVA_Build 7 98718389 1I ATCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 13 14 278127 CASAVA_Build 7 98751752 1D CAACATGGTG A/- AACCCCTGTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 3 2 278128 CASAVA_Build 7 98759023 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 976 het 976 ref 23 8 7 8 A 17 18 278129 CASAVA_Build 7 98776034 1D ACAGGGTCTT G/- GCTCTGTTGC 3070 hom 69 het 25 0 24 2 G 2 1 278130 CASAVA_Build 7 98781776 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 17 0 8 9 A 17 16 278131 CASAVA_Build 7 98794995 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2319 het 94 hom 27 2 13 12 A 18 17 278132 CASAVA_Build 7 98835030 1I TGCCCAGAAA -/G GGCACAGCCT 3070 hom 129 het 47 0 38 9 G 2 3 278133 CASAVA_Build 7 98858562 2D AGCTCTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 802 het 802 ref 32 24 3 5 T 13 11 278134 CASAVA_Build 7 98891245 2D GAGGCTGCCG TT/-- TTAGGAGTCA 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 T 4 2 278135 CASAVA_Build 7 98947293 21I TGAGCTACCG ---------------------/CCGCCTGGCCCTGAGAGAGTT TTTCAGTGTT 2862 hom 18 het 8 0 7 1 CCGCCTGGCCCTGAGAGAGTT 0 1 278136 CASAVA_Build 7 98958038 1D TTGTTTCCCC T/- TTTTTTTTTT 819 het 819 ref 26 12 3 11 T 13 12 278137 CASAVA_Build 7 98958448 1D ACAGGCTGGG C/- CGTGGTGTCT 3070 hom 38 het 16 0 13 3 C 2 1 278138 CASAVA_Build 7 99045005 1D TTGTTGTCTC T/- TTTTGTTCCC 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 T 5 4 278139 CASAVA_Build 7 99133640 4I AGCTCCCCTC ----/TGTT TGGTAGAGTA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TGTT 0 1 278140 CASAVA_Build 7 99137495 2D GCACAGAAAC TT/-- TTTAACTTGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 5 3 278141 CASAVA_Build 7 99145334 4I ATTATATATA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 92 het 43 0 31 12 TG 7 9 278142 CASAVA_Build 7 99155157 1I CACAATCCAT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 7 8 278143 CASAVA_Build 7 99158587 1I ACTGAAACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 9 10 278144 CASAVA_Build 7 99222576 14I TTTTTTAAAG --------------/CTGTGCTCTCAATA CTGTGCTCTC 3070 hom 144 het 56 0 48 8 CTGTGCTCTCAATA 0 1 278145 CASAVA_Build 7 99222914 1D CTGGTAGCCC A/- AGTGGTACCT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 2 1 278146 CASAVA_Build 7 99232333 1D TGGGGTATGG A/- AAAAAAAAAA 1791 het 281 hom 20 3 9 8 A 17 16 278147 CASAVA_Build 7 99242287 1I CAAAAAGATA -/T TTTTTAAGCC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 5 6 278148 CASAVA_Build 7 99300843 1I AGTGACTTGG -/T GAGAATGAGG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 0 1 278149 CASAVA_Build 7 99317770 1I CTTCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 1386 het 1386 ref 28 14 5 9 A 12 13 278150 CASAVA_Build 7 99318573 1D CTATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 27 1 20 6 T 13 12 278151 CASAVA_Build 7 99321668 2D ATTACAAATC TT/-- TATTACACAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 3 1 278152 CASAVA_Build 7 99325089 1I GTCAAGTGAT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 7 8 278153 CASAVA_Build 7 99328930 2I AAATTCTCAC --/AT GTTGAATCAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AT 0 1 278154 CASAVA_Build 7 99336269 1I TTGAAGGATA -/T TTTTTTGCCA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 6 7 278155 CASAVA_Build 7 99336490 4D TCATATTTCT CATA/---- CTCAGGGTTT 1815 hom 16 het 34 0 7 30 CATA 1 0 278156 CASAVA_Build 7 99340610 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 23 0 16 7 A 12 11 278157 CASAVA_Build 7 99393573 1I AGGGGATGGA -/C CCCCCCCGTG 3070 hom 90 het 37 0 23 14 C 7 8 278158 CASAVA_Build 7 99394609 2I AGGGGGCACA --/CC CCCCCCCGTG 3070 hom 94 het 38 0 26 12 C 7 9 278159 CASAVA_Build 7 99399502 3I TAGGATTAAT ---/ATC ATCCTCTCCC 3070 hom 115 het 42 0 39 3 ATC 1 2 278160 CASAVA_Build 7 99400761 1I GAGGGGTGTA -/C CCCCCGCTGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 5 6 278161 CASAVA_Build 7 99404968 1I ACTCAGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 32 4 22 6 A 16 17 278162 CASAVA_Build 7 99427165 2D GACATGTGGA TT/-- CCAGTGAGAG 3070 hom 60 het 21 0 19 2 T 2 0 278163 CASAVA_Build 7 99430680 1D CATAGCGAGA C/- CCCCCATCTC 3070 het 32 hom 24 1 18 5 C 6 5 278164 CASAVA_Build 7 99443803 2D TAAATTCATC TG/-- TGTCCAATGC 3070 hom 123 het 43 0 41 3 TG 2 1 278165 CASAVA_Build 7 99444073 1I CACAAGGCTA -/G GGGGCTGTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 4 5 278166 CASAVA_Build 7 99466278 2I CGGGGGAATA --/TC TCTTTCCTAG 3070 hom 143 het 53 0 48 5 TC 1 2 278167 CASAVA_Build 7 99613696 1I CCGGGCCGTG -/C CCCCAATGGC 3070 hom 63 het 24 0 16 8 C 4 5 278168 CASAVA_Build 7 99651925 2I AAAATGTAAC --/AG ATGAGTTGAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AG 0 1 278169 CASAVA_Build 7 99653089 2D GACACAAGAC AA/-- AGAGATAGAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 3 1 278170 CASAVA_Build 7 99653853 2D ATATTGGAAT AA/-- AGAGTTATGC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 3 1 278171 CASAVA_Build 7 99658700 1D TTCCATCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 17 8 T 13 12 278172 CASAVA_Build 7 99661173 1D GGAGGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 2313 hom 38 het 21 0 10 11 T 13 12 278173 CASAVA_Build 7 99662815 1I TGCCTGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 10 11 278174 CASAVA_Build 7 99754285 1D ATTCAATTGC T/- TTTTTTTTTT 2992 het 407 hom 12 1 7 4 T 15 14 278175 CASAVA_Build 7 99757454 4D GTTATTACTT TAAA/---- TATTATTTTA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TAAA 1 0 278176 CASAVA_Build 7 99846829 1D TCGCAATTAC T/- TTTTTTTTTT 2685 het 2685 ref 41 24 7 10 T 15 14 278177 CASAVA_Build 7 99852561 4D CAGATAGATA GACT/---- GACTGACCAT 3070 het 3070 hom 28 11 17 4 GACT 2 1 278178 CASAVA_Build 7 99888217 1D TTTATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1318 het 1318 ref 30 20 3 7 T 12 11 278179 CASAVA_Build 7 99892874 3D ATCAGTTCTA TTC/--- TTCTTTTTTT 3070 hom 100 het 39 0 33 6 TTC 2 1 278180 CASAVA_Build 7 99942840 1I GATTTCTTTC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 6 7 278181 CASAVA_Build 7 100004047 16D AGTTGCCGAG CCCCGCCCCACGGCCC/---------------- CCCCGCCCCA 3070 hom 71 het 29 0 19 15 CCCCGCCCCACGGCCC 1 0 278182 CASAVA_Build 7 100039167 1D TGCGAAGGGA C/- CCCCCCCCCG 1928 hom 16 het 12 0 5 8 C 10 9 278183 CASAVA_Build 7 100046248 1I CAAACAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 8 9 278184 CASAVA_Build 7 100047738 2D TAGAAAAGGA CT/-- CTCTGGAACA 3070 hom 115 het 45 0 36 10 CT 3 2 278185 CASAVA_Build 7 100050323 1I AAAGATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 23 0 16 7 A 11 12 278186 CASAVA_Build 7 100060994 2I AAGGTGGGTG --/TC TTTTTGTCTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 TC 0 1 278187 CASAVA_Build 7 100072961 1I TCTGTCTCAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 9 10 278188 CASAVA_Build 7 100073395 1I TGTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 2308 hom 16 het 13 0 8 5 T 13 14 278189 CASAVA_Build 7 100086774 1D TGAGACACAC A/- AAAGTCTCAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 4 3 278190 CASAVA_Build 7 100098080 1D ACCCAACTGG T/- TTTTTTTTTT 2714 het 1665 hom 31 5 7 19 T 12 11 278191 CASAVA_Build 7 100117064 1D GTTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 27 0 21 6 A 11 10 278192 CASAVA_Build 7 100128857 1D AATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 29 1 17 11 T 15 14 278193 CASAVA_Build 7 100132947 20I TGAGCCCAGA --------------------/AGGACAAGGTTGTGTACTCC AGCCTGGGCA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 AGGACAAGGTTGTGTACTCC 0 1 278194 CASAVA_Build 7 100136087 1I16M4I ACTCCATCTC -AAAAAAAAAAAAAGAA----/AAAAAAAAAAAAAAGAAAAAG AAAAAAAATG 3070 het 449 hom 26 8 12 11 N/A 0 0 278195 CASAVA_Build 7 100138300 4D ATAAACAAAC AAAA/---- AATTATTTTT 3070 het 2799 hom 21 8 11 3 A 6 2 278196 CASAVA_Build 7 100145430 5D CTTGTCTAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAA 2331 het 2331 ref 20 7 6 7 AAAAG 2 1 278197 CASAVA_Build 7 100150061 1D CTTCAGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 13 12 278198 CASAVA_Build 7 100153831 17D TGAGCCAACA GCCTGTGATGTGCTTCC/----------------- GCCTGCGGAG 3070 het 3070 ref 32 21 10 4 GCCTGTGATGTGCTTCC 1 0 278199 CASAVA_Build 7 100154491 1I GTGACCCCCC -/T GGACCAGCTT 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 T 0 1 278200 CASAVA_Build 7 100155731 1D ACATCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 144 hom 32 1 21 10 A 14 13 278201 CASAVA_Build 7 100167913 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 887 het 117 hom 10 1 4 5 A 15 14 278202 CASAVA_Build 7 100184435 1D GAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 9 8 278203 CASAVA_Build 7 100186928 3D GGAGCCCGAA TTC/--- TCACCCAGCT 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 TTC 1 0 278204 CASAVA_Build 7 100191988 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2091 hom 32 7 12 13 A 13 12 278205 CASAVA_Build 7 100194795 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2095 het 69 hom 12 1 8 3 A 13 14 278206 CASAVA_Build 7 100199328 1I TGGAAGCGAG -/C CTTTGTCTTT 3070 het 3070 hom 29 8 12 9 C 1 2 278207 CASAVA_Build 7 100199517 1D GGCGATGCTT G/- GCACCTGGGC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 G 2 1 278208 CASAVA_Build 7 100202042 1D AAAACAAAGC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 A 9 8 278209 CASAVA_Build 7 100209413 1I CTGCTCCGTT -/G TCGGGCCTCA 3070 het 2900 hom 32 10 9 13 G 0 1 278210 CASAVA_Build 7 100210390 1D TGTCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2345 hom 30 10 12 8 A 14 13 278211 CASAVA_Build 7 100211877 8D ACTTGAAGGA AGGGAGGG/-------- AGGGAGGGAG 2054 het 1312 hom 14 4 5 8 AGGG 6 4 278212 CASAVA_Build 7 100216211 4I AGAGTGAGAC ----/TCTA TCTCAGAAAA 3066 het 3066 ref 25 13 8 4 TCTA 0 1 278213 CASAVA_Build 7 100218241 1D GGTTTTTTTT G/- TGTGTGTGTG 108 het 108 ref 22 12 2 8 G 1 0 278214 CASAVA_Build 7 100221966 4D TTTTCTTTTC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 30 17 10 5 TTGT 3 2 278215 CASAVA_Build 7 100236934 1I GGGAAATTGA -/G GACAAGCCTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 1 2 278216 CASAVA_Build 7 100246684 1D GGTGCATGCC A/- TGCAATTCCA 3070 het 2595 hom 16 7 8 1 A 1 0 278217 CASAVA_Build 7 100254858 3I TTTTGTAGAG ---/AGA AGATCTTCCT 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 AGA 1 2 278218 CASAVA_Build 7 100287212 3I TTAGCCAGGC ---/ATG GTGGTGTGTG 3070 hom 74 het 26 0 24 2 ATG 0 1 278219 CASAVA_Build 7 100288217 1I TCCGGGCGCG -/C CCATGGGGCG 1528 hom 21 het 8 0 7 1 C 2 3 278220 CASAVA_Build 7 100290858 1I TTTTTAAATA -/T TTTGTAGAGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 3 4 278221 CASAVA_Build 7 100305912 2I GACCGAGCCC --/CT GATTCCCACC 3070 hom 36 het 17 0 10 7 CT 0 1 278222 CASAVA_Build 7 100322764 1I GAAGGTGAGC -/T TCCAGGTTCC 3070 het 2439 hom 27 7 13 7 T 1 2 278223 CASAVA_Build 7 100330172 1I CCACCCGACA -/G GGGCGCGGCC 2365 hom 27 het 14 0 9 5 G 3 4 278224 CASAVA_Build 7 100332159 1I CTGGGCGAGG -/C CGCACTCCGC 3070 hom 63 het 25 0 20 5 C 1 2 278225 CASAVA_Build 7 100339365 1D ACCCTGTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 20 1 12 7 A 18 17 278226 CASAVA_Build 7 100373785 1D ATCACAGTGA T/- TTTTTTTTTT 2852 het 2384 hom 18 6 8 4 T 12 11 278227 CASAVA_Build 7 100375647 1D ACTTTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 118 het 43 0 37 6 T 11 10 278228 CASAVA_Build 7 100380511 1D CCTAGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2348 het 86 hom 22 2 8 12 T 15 14 278229 CASAVA_Build 7 100385462 2D GCAGGGAAAA CC/-- CCGAGGTTGG 3070 hom 100 het 36 0 32 4 C 4 2 278230 CASAVA_Build 7 100387309 2D ATGCCCTGCC CT/-- CTGTGATGCT 3070 het 3070 ref 52 38 10 5 CT 2 1 278231 CASAVA_Build 7 100387969 3I ACAGTGACAC ---/CCT CCTCCTCTGT 3070 het 3070 ref 97 46 34 17 CCT 2 3 278232 CASAVA_Build 7 100389574 3I CCTGAAACCC ---/CAA CAACACAGAC 3070 het 3070 ref 92 48 28 16 CAA 1 2 278233 CASAVA_Build 7 100391729 12I TGTCTCTACT ------------/ATAAACACAAAA ATTAGTTGGG 2388 het 2388 ref 38 19 7 13 ATAAACACAAAA 0 1 278234 CASAVA_Build 7 100391757 1D CAGATGCCTA T/- AATCCTCACT 3070 het 3070 ref 46 26 12 9 T 1 0 278235 CASAVA_Build 7 100393284 1D CTCGAACTAC T/- GACTTTGTGA 1384 het 1384 ref 24 16 4 4 T 1 0 278236 CASAVA_Build 7 100393912 5I TTGATGCAAC -----/AAGAA GAGAACGTCA 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 AAGAA 0 1 278237 CASAVA_Build 7 100394364 1D ACCTCTGCCC T/- CTTTCCCCCT 3070 het 3070 ref 69 35 26 11 T 1 0 278238 CASAVA_Build 7 100394844 1I AGCATTTCCC -/G GATGGCTGAA 2096 het 2096 ref 41 31 6 4 G 1 2 278239 CASAVA_Build 7 100398237 1I CTCTGAGCCC -/T TGAAATCCTC 3047 het 3047 ref 44 27 12 5 T 1 2 278240 CASAVA_Build 7 100398348 4I GCAGCAGCTC ----/TCTG TCTGTCTCCT 2572 het 2572 ref 42 21 8 13 TCTG 1 2 278241 CASAVA_Build 7 100399676 3I GCGTCCGTTA ---/CTG CTACAGTGAC 3070 het 3070 ref 58 36 13 9 CTG 0 1 278242 CASAVA_Build 7 100400105 1D AGCCCTGGTC G/- GGAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 62 34 21 7 G 3 2 278243 CASAVA_Build 7 100401184 3I GAAACAAACA ---/AAC AAAAAAAAAC 3070 hom 58 het 26 0 15 11 AAC 0 1 278244 CASAVA_Build 7 100401563 1D ACCTCCTTTA C/- CCCCACCCGG 3070 het 3070 ref 45 17 16 12 C 5 4 278245 CASAVA_Build 7 100402098 1D GATCCAGAGA C/- CCCCTGCCCT 3070 het 3070 ref 57 30 17 11 C 5 4 278246 CASAVA_Build 7 100402215 2D7M2D TGAGGATATG TAGAGACTCAG/--GAGGCTC-- AGAGAGGATG 3070 het 3070 ref 48 34 12 4 N/A 0 0 278247 CASAVA_Build 7 100405519 4I TAATAAACTT ----/ATGC ATTCAGCAAA 3070 het 3070 ref 62 32 20 10 ATGC 0 1 278248 CASAVA_Build 7 100405625 1I GGGGCAGAAA -/T GGCCACAGCC 3070 het 3070 ref 74 34 20 21 T 0 1 278249 CASAVA_Build 7 100406450 1I ACTAAAAATA -/C AAAAAATTAG 3070 hom 45 het 16 0 16 2 C 0 1 278250 CASAVA_Build 7 100406604 1D GACTCTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 304 hom 29 1 20 8 A 13 12 278251 CASAVA_Build 7 100419700 1D TTCAAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 18 13 T 12 11 278252 CASAVA_Build 7 100435802 2D CTTCTCTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 38 0 10 28 T 15 13 278253 CASAVA_Build 7 100454401 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2667 hom 38 12 16 11 A 12 11 278254 CASAVA_Build 7 100458717 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 814 het 814 ref 34 23 3 8 A 12 11 278255 CASAVA_Build 7 100486848 1I TTTATTACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 T 9 10 278256 CASAVA_Build 7 100491680 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 1341 hom 25 4 13 8 A 8 9 278257 CASAVA_Build 7 100504488 1D TGAAATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 30 1 23 6 T 13 12 278258 CASAVA_Build 7 100524354 1D GAGATTGGGG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 8 7 278259 CASAVA_Build 7 100527656 10I ATTAGGAAGG ----------/AGGTTTGGGA AGGTTTGGGA 3070 hom 121 het 49 0 41 9 AGGTTTGGGA 1 2 278260 CASAVA_Build 7 100550875 1D CTCATCTCTG A/- AAAAAAAAAA 1094 het 1094 ref 18 9 4 5 A 12 11 278261 CASAVA_Build 7 100562726 12D AATTCCATTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2504 het 2504 ref 18 11 7 2 A 22 10 278262 CASAVA_Build 7 100564547 1D TCTCTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 1344 het 1344 ref 33 20 3 10 T 12 11 278263 CASAVA_Build 7 100576270 9D GAGTCCAGCT GACATGCCC/--------- ATGCTATGCC 3070 het 3070 ref 50 26 21 7 GACATGCCC 1 0 278264 CASAVA_Build 7 100577066 1I AAAAAAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 A 9 10 278265 CASAVA_Build 7 100581163 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2772 het 2772 ref 20 10 6 4 A 12 11 278266 CASAVA_Build 7 100581486 1D CATCTCTACT A/- AAAAAATAAA 3070 het 1611 hom 15 5 9 1 A 7 6 278267 CASAVA_Build 7 100584159 1I ATTCACCTCT -/C CACCCCTTTT 2547 het 2547 ref 18 9 7 2 C 1 2 278268 CASAVA_Build 7 100590961 6I CCCATAACCT ------/ACCTCC ACCTCCACCC 3070 het 1407 hom 29 5 13 11 ACCTCC 1 2 278269 CASAVA_Build 7 100601182 12D ACCACACACA CACCACCACCAC/------------ CACCACCACC 2775 het 1247 hom 27 6 14 9 CAC 7 3 278270 CASAVA_Build 7 100614376 1D CAAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2469 het 2149 hom 16 10 6 0 T 12 11 278271 CASAVA_Build 7 100620954 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 12 2 9 1 A 15 14 278272 CASAVA_Build 7 100621201 1I AGAAGATTCC -/A GTATATTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 1 278273 CASAVA_Build 7 100652441 1I TGTGGGCCCA -/G GGGCTTGGCC 3070 hom 67 het 27 0 17 10 G 3 4 278274 CASAVA_Build 7 100705909 1I TAGGCTGCAA -/G TAGCAGAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 G 0 1 278275 CASAVA_Build 7 100715216 1I TCCATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2114 het 2114 ref 18 9 5 4 A 13 14 278276 CASAVA_Build 7 100720531 1D9M1D CAGTAGCTGC GGGGGGCGTCT/-GGGGGCGTC- TGAGCTTCAG 2350 het 2350 ref 27 13 8 9 N/A 0 0 278277 CASAVA_Build 7 100724276 1I CACAATAGTG -/A ATGTCACCTT 2347 het 2347 ref 41 31 5 5 A 1 2 278278 CASAVA_Build 7 100724482 1D GCTAGTTCCG C/- CTACACCCAG 3070 het 3070 ref 44 32 10 2 C 2 1 278279 CASAVA_Build 7 100727138 3D TAAGAAAGAG AGA/--- AGAAGATCTG 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 AGA 3 2 278280 CASAVA_Build 7 100734225 1I TATACAGTTG -/A TGGGCATAAT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 0 1 278281 CASAVA_Build 7 100736842 1I CAAAAAAAAA -/T AAAATAAAAT 3070 het 726 hom 16 4 9 3 T 0 1 278282 CASAVA_Build 7 100743444 3I TCAGGCAATT ---/CTC CTGCCTCACC 1333 het 1333 ref 17 10 3 4 CTC 0 1 278283 CASAVA_Build 7 100754102 4D CCCTGTCTCT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 40 13 19 9 AC 11 9 278284 CASAVA_Build 7 100763280 3D TAAATCCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 712 hom 31 5 12 15 T 17 14 278285 CASAVA_Build 7 100771055 2I CTTCCTTCCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 39 15 12 12 TC 6 7 278286 CASAVA_Build 7 100778396 2D CCCTGCTGTT GA/-- GAGATGACAT 3070 het 2704 hom 21 8 9 5 GA 3 2 278287 CASAVA_Build 7 100781649 6D TCAAAAAGAC CAAAAA/------ CAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 30 18 9 5 CAAAAA 2 1 278288 CASAVA_Build 7 100783043 1I CTAATCTCCT -/G TCTACTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 G 0 1 278289 CASAVA_Build 7 100783428 2D TACAACAACA AC/-- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 AC 1 0 278290 CASAVA_Build 7 100787543 10I CTCATTATGC ----------/GTGGAAGGCA GGGGAAGGTG 2789 het 2789 ref 25 13 8 4 GTGGAAGGCA 0 1 278291 CASAVA_Build 7 100794246 1D TGAATTTAGC T/- TTTCTCATTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 4 3 278292 CASAVA_Build 7 100794344 1D TATATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 T 12 11 278293 CASAVA_Build 7 100795822 1D TGTGGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 11 10 278294 CASAVA_Build 7 100797988 1D CTCCTCCACT G/- TCTCCCTTCT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 G 1 0 278295 CASAVA_Build 7 100798894 5I7M5D GGTAGAAAAA -----ACTCACTCAAAA/TTTTGAGTGAGT----- TCTGGCTCTT 2341 het 2341 ref 35 25 7 8 N/A 0 0 278296 CASAVA_Build 7 100800967 1I AACTCACTTC -/G CCCAGTTTCC 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 G 0 1 278297 CASAVA_Build 7 100801484 2D ACCCTGTCTC TG/-- TAAAAAAAAA 2688 het 2688 ref 27 13 9 5 TG 1 0 278298 CASAVA_Build 7 100815188 5D TTGCATTCTT CAATC/----- CAATCAATTT 3070 hom 36 het 14 0 13 2 CAATC 2 1 278299 CASAVA_Build 7 100817376 1I CGACACACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 13 11 A 12 13 278300 CASAVA_Build 7 100823952 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 10 11 278301 CASAVA_Build 7 100829342 4I TTCTAATGAG ----/CTTT CTTTCTTTCC 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 CTTT 2 3 278302 CASAVA_Build 7 100831529 3I GGAGGACAAA ---/GAG GAGAAGGAGG 3070 het 2200 hom 30 12 9 9 GAG 1 2 278303 CASAVA_Build 7 100831655 9D GGAGGAGGTG GAGGAGGAA/--------- GAGGAGGAAG 3070 het 2366 hom 34 10 14 10 GAGGAGGAA 2 1 278304 CASAVA_Build 7 100831769 3I AGGAGGAGGG ---/AGA AGAAGAGGAG 3070 het 3070 ref 45 14 14 17 AGA 2 3 278305 CASAVA_Build 7 100832647 4D CCCCTCCCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 2585 het 349 hom 17 3 7 8 CCTT 4 3 278306 CASAVA_Build 7 100832743 8D TCCCTTCCTT CCTCCCTC/-------- CCTCCCTCCC 3019 het 450 hom 13 1 9 3 CCTC 5 3 278307 CASAVA_Build 7 100835145 1D ATGGCGTGAA C/- CCCGGGAGGC 904 het 10 hom 7 0 2 5 C 4 3 278308 CASAVA_Build 7 100836957 4D TCCCTGTAAA AAAC/---- AAACAAGAAA 3070 het 3070 hom 41 16 23 5 AAAC 2 1 278309 CASAVA_Build 7 100840435 3D TTCTTAAGAA AAG/--- AAGTTTATTA 3070 het 3070 ref 59 35 21 3 AAG 2 1 278310 CASAVA_Build 7 100847612 64D GGTATATCTA TATATCTAGACATAGATATAGAGATATATCTCTATATCTAGACATAGATATAGAGATATATCTC/---------------------------------------------------------------- TATATCTAGA 944 hom 12 het 12 0 5 11 TATATCTAGACATAGATATAGAGATATATCTC 2 0 278311 CASAVA_Build 7 100848309 4I TGTGCCCCCA ----/TGTG TGTGGCTCCT 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 TG 2 4 278312 CASAVA_Build 7 100850341 4D GTGGGTGTTT GACA/---- GACAGAAGAC 3070 het 3070 ref 47 22 18 9 GACA 2 1 278313 CASAVA_Build 7 100851653 1I TCCAGCCTGG -/A AAAAAAAAAA 2934 het 2934 ref 33 13 8 12 A 13 14 278314 CASAVA_Build 7 100852652 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 2744 hom 24 10 8 6 T 9 8 278315 CASAVA_Build 7 100855665 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 9 10 278316 CASAVA_Build 7 100857662 2I ACTGTTTCTT --/AA AAAAAAAAAA 2065 het 1740 hom 13 4 6 3 A 14 16 278317 CASAVA_Build 7 100858359 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 20 1 11 10 A 16 14 278318 CASAVA_Build 7 100864910 3I GAGGACATGT ---/TCA TCAAAGATTC 3070 het 3070 hom 62 21 27 14 TCA 1 2 278319 CASAVA_Build 7 100869342 1I GAGAGAGAGA -/G CAAGAAAGAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 0 1 278320 CASAVA_Build 7 100870305 1I AGGTGAAGGC -/T TGCAGGGAGC 2355 het 2355 ref 25 15 6 4 T 1 2 278321 CASAVA_Build 7 100872242 1I AAACAAAAGC -/T TCTCCTCTGT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 2 278322 CASAVA_Build 7 100872939 2D AGTGTGTGAC TG/-- TGTGAGGGTG 3070 het 3070 ref 75 37 32 7 TG 3 2 278323 CASAVA_Build 7 100873118 1D ATCATCGCAT A/- CCAGAGTCAC 3070 hom 199 het 72 0 67 5 A 1 0 278324 CASAVA_Build 7 100874419 1D TCCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1574 hom 30 8 12 10 T 15 14 278325 CASAVA_Build 7 100875577 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTGG 869 hom 7 het 5 0 3 2 A 7 6 278326 CASAVA_Build 7 100886636 1I TTGCACTCCA -/G CCTCGGCAAC 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 G 0 1 278327 CASAVA_Build 7 100888483 1D CTAAAAATCC A/- AAAAAACTAG 3070 het 1555 hom 16 5 10 1 A 7 6 278328 CASAVA_Build 7 100890805 2D AAAAAGAAAG AA/-- AAGAAAACAG 3070 het 3070 ref 31 13 10 11 A 4 2 278329 CASAVA_Build 7 100899497 1D GATTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2838 het 2838 ref 31 13 9 9 T 15 14 278330 CASAVA_Build 7 100902818 1I CCCCAGGGGA -/C CCTCCGGATC 3070 hom 86 het 34 0 27 7 C 2 3 278331 CASAVA_Build 7 100903484 1I CCCACCACCT -/C CTAGTTGTGA 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 C 1 2 278332 CASAVA_Build 7 100903858 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 11 10 278333 CASAVA_Build 7 100904433 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1848 hom 20 4 12 4 A 11 10 278334 CASAVA_Build 7 100942458 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAATAA 2531 het 2531 ref 29 14 9 6 A 7 8 278335 CASAVA_Build 7 100942829 1D CACCTCATTC A/- CAGATTAGAA 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 A 1 0 278336 CASAVA_Build 7 100957496 1I GTCCAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 13 14 278337 CASAVA_Build 7 100964290 10I ACGTGGCAGG ----------/GAGGCTGGGT GAGGACCAGG 3070 hom 89 het 36 0 25 11 GAGGCTGGGT 0 1 278338 CASAVA_Build 7 100964656 4D ACATACATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 141 het 61 0 45 18 AC 11 9 278339 CASAVA_Build 7 100972801 1I TCTGGCCCCC -/T GGCCTACCCC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 0 1 278340 CASAVA_Build 7 100973176 1D ATCAGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 689 hom 28 2 16 10 T 13 12 278341 CASAVA_Build 7 100976872 10D GGGGCATTGG AGAAGTGAGC/---------- AGGGCAGACC 3070 hom 101 het 36 0 30 10 AGAAGTGAGC 1 0 278342 CASAVA_Build 7 100983543 1I ACAGCCCCAT -/G GGGAACTCAG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 G 3 4 278343 CASAVA_Build 7 100987390 1I CCTCCCCAGA -/G GGAGGTTCTG 3070 hom 84 het 35 0 25 10 G 2 3 278344 CASAVA_Build 7 100989751 3D CCAGCTCTGC AAG/--- AAGGTGAGTT 3070 het 3070 hom 26 12 9 7 AAG 2 1 278345 CASAVA_Build 7 100999167 8D AGAACCAGAA GGGAGAAT/-------- GGGAGAATGT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 GGGAGAAT 2 1 278346 CASAVA_Build 7 100999514 1D AACTAATAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 8 278347 CASAVA_Build 7 101003015 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 28 3 14 12 A 15 14 278348 CASAVA_Build 7 101023129 4D CAACAACAAC AAAA/---- AAAAAAACAA 2304 het 6 hom 27 1 12 15 A 11 7 278349 CASAVA_Build 7 101032410 1D TTTGCTGCTA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 9 8 278350 CASAVA_Build 7 101045596 1I GAATGCTGTT -/C CCCCCCCTAG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 C 7 8 278351 CASAVA_Build 7 101051592 3D AGTTTTTATG GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 het 1972 hom 37 9 15 13 GTT 5 4 278352 CASAVA_Build 7 101058279 1I CATAGTGAGA -/C CCCCTATCTC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 C 4 5 278353 CASAVA_Build 7 101067543 1I CTTGAACGGC -/T TGTACATGTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 1 2 278354 CASAVA_Build 7 101072313 1I TCTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1692 hom 32 8 19 5 C 0 1 278355 CASAVA_Build 7 101072508 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGGGGTCT 3070 het 3070 hom 19 9 7 3 G 7 8 278356 CASAVA_Build 7 101074116 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAATGTA 3070 hom 47 het 19 0 16 5 A 7 6 278357 CASAVA_Build 7 101116148 1D AAATGGGGTT C/- TCACTCTGTG 2177 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 0 278358 CASAVA_Build 7 101117526 1D CTGCAGTATT G/- GGGGTTCCAC 3070 hom 144 het 51 0 49 3 G 5 4 278359 CASAVA_Build 7 101119801 1I CTATATTCAT -/A AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 44 23 18 3 A 4 5 278360 CASAVA_Build 7 101125425 1D CCAGCCAAAA C/- CCCCATCTCT 2979 het 1892 hom 15 5 7 3 C 5 4 278361 CASAVA_Build 7 101134781 1I AAGTTCTTAC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 7 8 278362 CASAVA_Build 7 101154903 1I GTCCCCCACC -/A AAAAAAAAAA 2142 het 2142 ref 32 14 8 10 A 11 12 278363 CASAVA_Build 7 101163984 5D GCTCTCTGCC GGCCG/----- GGCCGGCGCA 1863 het 1241 hom 13 7 6 1 GGCCG 2 1 278364 CASAVA_Build 7 101168033 3D ACAGGTGAAA TGG/--- TGGTGGCACC 3070 het 3070 hom 45 15 24 9 TGG 3 2 278365 CASAVA_Build 7 101226295 1I GAGCTGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 11 12 278366 CASAVA_Build 7 101235398 1D AGTTTCCCCC T/- GTGTAAAAGG 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 1 0 278367 CASAVA_Build 7 101258708 1I TAGGCTTTGT -/G GCCTCTTCAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 G 1 2 278368 CASAVA_Build 7 101281830 1I TTCTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 35 1 21 13 T 12 13 278369 CASAVA_Build 7 101287767 1I TTGCAGGGAA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 7 8 278370 CASAVA_Build 7 101301311 1I TCTAAAAAAT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 8 9 278371 CASAVA_Build 7 101327502 1D GTTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 22 0 16 7 A 12 11 278372 CASAVA_Build 7 101339430 1D GCTGGTGGGT G/- GGGCTTAGGC 3070 hom 45 het 28 0 15 13 G 4 3 278373 CASAVA_Build 7 101341373 6D ATGACCTGAA CCTTGG/------ CCTTGGCCTT 3070 het 2679 hom 49 11 17 23 CCTTGG 4 3 278374 CASAVA_Build 7 101388371 3D GCCTGAAGCT GCA/--- GCAGCAGCAG 3070 het 2587 hom 29 8 11 11 GCA 7 6 278375 CASAVA_Build 7 101391649 1I GGGAGGCCGA -/G GCAGGCAGAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 G 1 2 278376 CASAVA_Build 7 101413031 4D AAAGCACTAG TCAT/---- TCATTCATTC 2435 het 2435 ref 19 10 7 3 TCAT 3 2 278377 CASAVA_Build 7 101426112 1D AACTCCATCC A/- AAAAAAAAAA 1880 het 1880 ref 35 20 6 9 A 12 11 278378 CASAVA_Build 7 101430217 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 22 0 13 9 A 11 12 278379 CASAVA_Build 7 101438712 4I TGACCTTGAC ----/TAGG TAGGACAGGA 3070 hom 109 het 40 0 34 6 TAGG 1 2 278380 CASAVA_Build 7 101442706 1D GAGTGGGGGC G/- GGGGGAGGGG 1592 het 1592 ref 27 10 6 11 G 6 5 278381 CASAVA_Build 7 101447196 13I CCCAGCTACT -------------/CAGGAGATTGAGG CAGGAGAATT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 CAGGAGATTGAGG 0 1 278382 CASAVA_Build 7 101447473 7I CCATTCTCGC -------/TAGAACA TAAGCTCCCT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 TAGAACA 0 1 278383 CASAVA_Build 7 101448736 8D GAGAGCTTGA GTGCGTGC/-------- GTGCGTGCGT 3070 het 3070 hom 34 15 16 8 GTGC 5 3 278384 CASAVA_Build 7 101452614 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 817 hom 35 2 23 10 A 15 14 278385 CASAVA_Build 7 101455345 4I AGAGATTGGT ----/GGCC GGCCAGGCAT 3070 het 2123 hom 27 8 13 6 GGCC 1 2 278386 CASAVA_Build 7 101467194 4D GATCCTGTCT CAAA/---- CAGACAGGCA 2818 het 2818 ref 24 17 7 3 CAAA 1 0 278387 CASAVA_Build 7 101490122 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 7 8 278388 CASAVA_Build 7 101493134 2D ACACTACATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 17 0 15 2 A 13 11 278389 CASAVA_Build 7 101495898 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGTCTCAGC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 CTC 1 0 278390 CASAVA_Build 7 101497863 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 9 10 278391 CASAVA_Build 7 101498447 1I ATCGGGTTGA -/G GGGGGTGGAA 3070 hom 45 het 20 0 15 5 G 5 6 278392 CASAVA_Build 7 101500933 5D ATATCAGTTG TTTCT/----- TTTATTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTTCT 1 0 278393 CASAVA_Build 7 101541102 1D TTTGGAGGGG T/- TTTTTTTTTT 905 het 905 ref 27 21 3 3 T 11 10 278394 CASAVA_Build 7 101562328 1D CGCGCGCACG C/- CACGCACACA 3070 hom 51 het 19 0 15 6 C 2 1 278395 CASAVA_Build 7 101639477 1D CATGAGTAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 9 8 278396 CASAVA_Build 7 101646783 26D CACTCTCCCA CACACACACTCTCCCACACACACCCC/-------------------------- CACACACACT 3070 het 19 hom 27 1 22 9 CACACACACTCTCCCACACACACCCC 1 0 278397 CASAVA_Build 7 101646886 4D CACATTATCT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 90 het 36 0 30 8 CA 11 9 278398 CASAVA_Build 7 101661330 1D GCGCCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 T 13 12 278399 CASAVA_Build 7 101663206 1D TTTTTGAGAC A/- ACGGTCTCTC 1512 hom 15 het 14 0 8 6 A 2 1 278400 CASAVA_Build 7 101667907 1D CCACTGGACA G/- GGGGCCCTTC 3070 hom 63 het 25 0 21 4 G 5 4 278401 CASAVA_Build 7 101674235 2D TTTTACGTTC TT/-- TTCTCAGGGG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 T 4 2 278402 CASAVA_Build 7 101674331 1I TTGCCCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 27 1 24 2 A 10 11 278403 CASAVA_Build 7 101674528 2I TGAGACCACG --/TC TCTACAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 TC 1 2 278404 CASAVA_Build 7 101676575 1I AAAACCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 T 10 11 278405 CASAVA_Build 7 101677213 1D TAAGGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 10 8 A 13 12 278406 CASAVA_Build 7 101691557 1D GCAGAATCAA G/- TATGGATAAG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 G 1 0 278407 CASAVA_Build 7 101696204 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1185 het 800 hom 17 5 3 9 A 17 16 278408 CASAVA_Build 7 101697901 12D CACCTGAGCT CCAGCGATGCTA/------------ CCACCTCTGC 2586 het 2586 ref 26 13 9 5 CCAGCGATGCTA 1 0 278409 CASAVA_Build 7 101698941 2I GATTAATTAC --/TT TTTTTTTTTT 2116 het 778 hom 23 4 8 11 T 14 16 278410 CASAVA_Build 7 101699409 1I CCCCAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 1732 het 1732 ref 20 8 5 7 T 11 12 278411 CASAVA_Build 7 101720339 3D CCTGCAACCT CCA/--- CCACCTCTGG 3070 het 1776 hom 13 4 9 1 CCA 2 1 278412 CASAVA_Build 7 101737267 1I CGGGGAGGCA -/C CCCGGTGGGT 3070 hom 48 het 20 0 12 8 C 3 4 278413 CASAVA_Build 7 101751212 1D ACTGCCCCCC T/- CCCGGGCTCT 2989 hom 38 het 18 0 13 6 T 1 0 278414 CASAVA_Build 7 101751350 3D CAGACTCAGT GGG/--- GGCTCTGGCG 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 G 5 2 278415 CASAVA_Build 7 101754684 1I TTTTTCCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 10 11 278416 CASAVA_Build 7 101756494 2I GTGGGAAAAC --/GA GAGGGGGAAG 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 GA 1 2 278417 CASAVA_Build 7 101766439 1D AAGACTTAAC T/- TTAGGGTGAT 2490 het 2490 ref 22 14 6 2 T 3 2 278418 CASAVA_Build 7 101800188 1D ATACAACTAA T/- TTTTTTTTTT 1255 het 676 hom 9 4 3 2 T 17 16 278419 CASAVA_Build 7 101806156 1I TGGGTGTGGT -/G GCATGCACCT 3070 hom 21 het 8 0 8 1 G 1 2 278420 CASAVA_Build 7 101814805 3D GCTATCTTTT TTG/--- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 TTG 2 1 278421 CASAVA_Build 7 101819659 4I TGATTGAGTC ----/TTCA TTCATTCTTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TTCA 1 2 278422 CASAVA_Build 7 101823402 1D AGCTCAGTGA C/- ATGTTTGCGC 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 C 1 0 278423 CASAVA_Build 7 101839259 1D TTATTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 43 0 31 12 T 11 10 278424 CASAVA_Build 7 101839390 4D TTGTTGTTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 TTTG 5 4 278425 CASAVA_Build 7 101841690 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 9 10 278426 CASAVA_Build 7 101850369 9D CCAAAGTCTG GAAACATCC/--------- GAAACATCCG 3070 het 3070 ref 38 16 12 14 GAAACATCC 2 1 278427 CASAVA_Build 7 101854678 1I TCCCCCCGAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 8 9 278428 CASAVA_Build 7 101872752 1I GTTTTTTGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 28 7 16 5 G 0 1 278429 CASAVA_Build 7 101891491 1D GATCAGACCT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2325 hom 39 10 11 18 C 10 9 278430 CASAVA_Build 7 101893863 4D GATGTGCTAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 33 9 16 8 TTTA 4 3 278431 CASAVA_Build 7 101901995 1I TGTCTGAGGT -/C CAGGGACAGA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 C 1 2 278432 CASAVA_Build 7 101903390 4I ACAAACAAAC ----/AAAA AAACAGTGAA 3070 het 3070 hom 28 15 12 1 A 3 7 278433 CASAVA_Build 7 101919390 1I CATAGCAAGA -/C CCCCATCTCC 3070 het 3070 ref 62 40 15 7 C 4 5 278434 CASAVA_Build 7 101923531 2D CCCTCTGTCG CT/-- CTCTCTGAAG 2121 het 2121 ref 32 21 6 7 CT 4 3 278435 CASAVA_Build 7 101946822 1I CATAATGAGA -/C CCCCCCCCCC 2464 het 1522 hom 34 5 8 21 C 10 11 278436 CASAVA_Build 7 101958965 1I TTTTAGAAAT -/G GGGGGTCTCC 2184 het 2184 ref 21 12 7 2 G 5 6 278437 CASAVA_Build 7 101962764 1I GGAGTGCTTA -/G GGCCCCATTA 2571 het 2571 ref 20 11 6 3 G 2 3 278438 CASAVA_Build 7 101963660 1I GGGTCACTCA -/G CCCCAGGGTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 0 1 278439 CASAVA_Build 7 101974959 5I ATCCACCTAG -----/AATTT ATTTTTGGTG 2803 het 2803 ref 20 9 6 5 AATTT 0 1 278440 CASAVA_Build 7 101977573 4I TTTTCTTTTC ----/TTTT TTTTTTGAGA 2903 het 2429 hom 17 6 8 3 T 6 10 278441 CASAVA_Build 7 102039835 5I TCCCTCGCCC -----/CAGGA CAGGACGGGA 3070 het 2730 hom 63 10 24 29 CAGGA 1 2 278442 CASAVA_Build 7 102058298 2I TTTTTAAAAC --/TT TTTTAGAAAT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 T 4 6 278443 CASAVA_Build 7 102062101 1D GGAGTGCTTA G/- GGCCCCATTA 1533 het 1533 ref 49 34 4 11 G 3 2 278444 CASAVA_Build 7 102091471 1D TTTTCTTTTT G/- GGGGGGGATG 3070 hom 63 het 31 0 21 10 G 8 7 278445 CASAVA_Build 7 102092754 4I TTCTTTCTTT ----/CTTA CGAGACGGAG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 CTTA 0 1 278446 CASAVA_Build 7 102103719 1I CATCTCTACT -/A AAAAATACAA 3070 het 1404 hom 21 4 14 3 A 5 6 278447 CASAVA_Build 7 102119908 2I ATGTAATTAA --/AC ACACATGCAC 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 AC 2 3 278448 CASAVA_Build 7 102145374 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 G 0 1 278449 CASAVA_Build 7 102157125 2I GCCAACAAAC --/AT ATGAAAAAAA 3070 het 3032 hom 24 7 15 2 AT 1 2 278450 CASAVA_Build 7 102160412 1D GCATTTTACA T/- TTAGGTCAAA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 T 3 2 278451 CASAVA_Build 7 102160513 2D41M4I CCAATACCTC TTTTTTTTTTAACTGCCCCCTCCAGCACCATTTGTTGAAAATA----/--TTTTTTTTAACTGCCCCCTCCAGCACCATTTGTTGAAAATACTAT CTTTTACTCC 3070 het 3070 ref 26 20 11 11 N/A 0 0 278452 CASAVA_Build 7 102171494 1D GAAAATAAAA T/- GTAAAAATCC 3040 het 3040 ref 19 10 8 1 T 1 0 278453 CASAVA_Build 7 102185647 2D TGAAACTTTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 26 20 8 T 11 9 278454 CASAVA_Build 7 102186552 2I CTTTATTTTC --/AG AGAGTTGGTG 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 AG 2 3 278455 CASAVA_Build 7 102191027 1I TTCCTTAGCT -/G GGTTTAAATC 1637 het 1637 ref 17 9 5 3 G 2 3 278456 CASAVA_Build 7 102192511 1I GAGAGAGCAG -/A AAAAAAAAAA 2823 het 2823 ref 31 17 6 8 A 10 11 278457 CASAVA_Build 7 102205376 2D CCATACACTC TT/-- TTGGAAGCTT 2884 het 2884 ref 40 27 7 6 T 4 2 278458 CASAVA_Build 7 102220560 2I CATGGGTTGG --/AA AAGAGGTTGA 1367 het 1367 ref 38 27 3 8 A 2 4 278459 CASAVA_Build 7 102274432 19I TGTACTAAGG -------------------/AAGCTTAAGAATCGTTCCT AAGCTTAATG 3070 hom 125 het 45 0 41 4 AAGCTTAAGAATCGTTCCT 0 1 278460 CASAVA_Build 7 102362236 3D GTTGTGTAAT GAA/--- GAAGAAAAGG 3070 hom 75 het 26 0 25 3 GAA 3 2 278461 CASAVA_Build 7 102365029 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2298 het 53 hom 17 2 11 4 A 13 14 278462 CASAVA_Build 7 102371020 1D AGTAAATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 21 1 15 5 A 13 12 278463 CASAVA_Build 7 102374257 2I TACAGGAAAC --/AA AGAGAATGGG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 1 3 278464 CASAVA_Build 7 102375472 1D AAAATAAGTT A/- AAAAAAAAAA 847 het 847 ref 34 28 3 3 A 11 10 278465 CASAVA_Build 7 102408607 2I AATGAAAACC --/TT TTGTGTGTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 4 278466 CASAVA_Build 7 102409086 12I GCACACCTTT ------------/CCTGTGCAAATG CCCCCCCTTA 3070 hom 75 het 27 0 25 4 CCTGTGCAAATG 0 1 278467 CASAVA_Build 7 102414460 1I CTAGGGAGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 31 0 24 7 T 8 9 278468 CASAVA_Build 7 102422111 1I CTCCAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 11 278469 CASAVA_Build 7 102434569 1D AGAAGGGAAG T/- GGGATTTTAA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 T 1 0 278470 CASAVA_Build 7 102457475 1D AACAGAATGA T/- TTTTTTCAAG 3070 hom 117 het 47 0 39 9 T 7 6 278471 CASAVA_Build 7 102481838 14I3M7I GAGGCTGAGG --------------CAG-------/CTCACACCTGTAATCAGGCAATCT GTGGATTGCC 3070 hom 46 het 19 0 14 6 N/A 0 0 278472 CASAVA_Build 7 102485098 1I CATTGGGGTT -/G GGGGGGGGTT 3070 het 364 hom 40 1 33 6 G 8 9 278473 CASAVA_Build 7 102501181 3D AATAATGATG ATA/--- ATAATAATAT 3070 hom 102 het 37 0 34 6 ATA 4 3 278474 CASAVA_Build 7 102504528 4D AAAAAACAAA AAAC/---- AAACAAAAAG 3070 hom 78 het 27 0 26 2 AAAC 2 1 278475 CASAVA_Build 7 102504977 1I ATAATTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 31 1 26 4 T 11 12 278476 CASAVA_Build 7 102509394 5I GAGATAACAT -----/ATAAC AGAGTGGTAT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 ATAAC 0 1 278477 CASAVA_Build 7 102510089 1D TGTTTATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 37 3 22 13 A 14 13 278478 CASAVA_Build 7 102510191 1I TTTACTTATT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 44 het 34 1 30 3 A 0 1 278479 CASAVA_Build 7 102512842 6I GTTGTAGTCA ------/GAGTAG GAGTAGGCCA 3070 hom 68 het 25 0 22 3 GAGTAG 1 2 278480 CASAVA_Build 7 102513290 3D ATTTCTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2845 hom 25 het 29 1 20 9 T 20 17 278481 CASAVA_Build 7 102518666 1I ACATTTGGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 8 9 278482 CASAVA_Build 7 102519378 3D TGGCCTCACA TCT/--- TCTTCCCTGA 3070 hom 115 het 43 0 35 8 TCT 2 1 278483 CASAVA_Build 7 102520677 3D TTTGATTCAG TTA/--- TTTGTTGAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTA 1 0 278484 CASAVA_Build 7 102522646 4D TTCTAAAAAT AAAG/---- AAATATTTGA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AAAG 1 0 278485 CASAVA_Build 7 102523241 2I TCCCAGCTCT --/AA AGTGAAGAGC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 1 3 278486 CASAVA_Build 7 102529683 1I TCAACTGACT -/C CCCCCCCCGC 1553 hom 15 het 7 0 6 1 C 8 9 278487 CASAVA_Build 7 102534412 2I GGGCATCTCT --/AA AAAAAAAAAA 2832 hom 27 het 15 0 9 6 A 10 12 278488 CASAVA_Build 7 102535454 2I AAATCTACAC --/AT GATTGGTGTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AT 0 1 278489 CASAVA_Build 7 102538592 1I AATGTATCAC -/A AGCATTCCTA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 1 2 278490 CASAVA_Build 7 102542548 1D GGTTGTGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 10 9 278491 CASAVA_Build 7 102543748 2D TCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 7 T 13 11 278492 CASAVA_Build 7 102554288 4D TGCAATTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 684 hom 15 het 26 0 6 20 TTTG 1 0 278493 CASAVA_Build 7 102563427 2D CATATAAATC TA/-- TATATATATA 3070 hom 56 het 33 0 25 8 TA 8 7 278494 CASAVA_Build 7 102565668 1I GCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 19 0 14 5 T 11 12 278495 CASAVA_Build 7 102569168 1D CAGGAGCTTC T/- TGCGGGCCTT 3070 het 63 hom 33 1 28 4 T 2 1 278496 CASAVA_Build 7 102570749 1I11M1I TCTACAAAAA -AAAAAACAAAA-/CAAAAAACAAAAC AAACAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 2 N/A 0 0 278497 CASAVA_Build 7 102571064 1D ATGTATTTAG A/- AAAAAAAAAA 1090 het 1090 ref 45 38 3 6 A 12 11 278498 CASAVA_Build 7 102573571 1D CTTCAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 4 A 13 12 278499 CASAVA_Build 7 102618919 1D AAGTCTCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 12 7 A 13 12 278500 CASAVA_Build 7 102625778 3D GATCTTTTCC TTT/--- TTATGCCACA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 T 5 2 278501 CASAVA_Build 7 102627287 1I TTCTCAAAAG -/A AAAAACATCA 3070 hom 101 het 41 0 34 7 A 5 6 278502 CASAVA_Build 7 102642402 1I TTTTTCTACT -/G ATTATTTACA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 0 1 278503 CASAVA_Build 7 102656126 2I TAAAGAAAGC --/TA TATAGTAAGG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TA 2 3 278504 CASAVA_Build 7 102660447 2D ATTTCAAAAT AA/-- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 37 24 11 3 A 8 6 278505 CASAVA_Build 7 102663331 1D CAGAAGTCAT A/- AAAAAAAAAA 1016 het 1016 ref 24 17 3 4 A 12 11 278506 CASAVA_Build 7 102669602 1I CTCCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 2914 het 129 hom 16 1 9 6 A 13 14 278507 CASAVA_Build 7 102687270 2D TGCCCACTTC AA/-- AAAGTTAGAA 1313 het 1313 ref 46 38 3 5 A 5 3 278508 CASAVA_Build 7 102689586 1D CAGAATCCAT A/- AAGGAACAAA 1161 het 1161 ref 25 18 3 5 A 3 2 278509 CASAVA_Build 7 102706828 2D TCAAAATCTT TC/-- TGTCTCTCAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TC 1 0 278510 CASAVA_Build 7 102717225 4I AATCCCAGCT ----/ACTC ACTCGGGAGG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 ACTC 1 2 278511 CASAVA_Build 7 102717488 1D TTAAGTGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 12 11 278512 CASAVA_Build 7 102734066 1D TCCTGAGTTC T/- TTTTTTTTTT 1686 het 1686 ref 23 9 4 11 T 17 16 278513 CASAVA_Build 7 102745644 4D TGCAGATTCT TAAA/---- TAAATAAGAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAAA 2 1 278514 CASAVA_Build 7 102759691 1D AAATTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 1944 het 333 hom 17 2 7 8 T 15 14 278515 CASAVA_Build 7 102765052 1I AAAATAACGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 10 11 278516 CASAVA_Build 7 102788850 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 6 7 278517 CASAVA_Build 7 102796612 2I AATCCTCAAC --/AG ATCTCTTTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AG 0 1 278518 CASAVA_Build 7 102859007 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2934 het 2934 ref 27 12 12 3 T 11 12 278519 CASAVA_Build 7 102861373 1D TTTGTATTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 1209 hom 24 8 13 3 T 9 8 278520 CASAVA_Build 7 102869832 1D TTTTTTTTTT A/- ATTTTCTTTG 3070 het 2673 hom 29 11 13 5 A 2 1 278521 CASAVA_Build 7 102874794 1D TAAGAGCATC T/- TTTTTTTTTT 1427 het 1427 ref 48 24 4 20 T 15 14 278522 CASAVA_Build 7 102875819 1I CGGATAAAAG -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 6 7 278523 CASAVA_Build 7 102889941 3I TCTGTCCCTT ---/AGC AGAGCTCGAG 2580 het 2580 ref 28 20 6 2 AGC 0 1 278524 CASAVA_Build 7 102891398 1I GGGTCAAAAA -/G GTAAATGCGT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 G 1 2 278525 CASAVA_Build 7 102897285 4D TTCAATTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 ref 43 23 14 8 TA 7 5 278526 CASAVA_Build 7 102903575 1I TTAAATAACA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 7 8 278527 CASAVA_Build 7 102913726 2D GTTGTGAAAC AT/-- ATATGCTTCC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 AT 3 2 278528 CASAVA_Build 7 102915085 1I CTTAAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 2436 het 2221 hom 24 7 7 10 A 11 12 278529 CASAVA_Build 7 102915833 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 12 11 A 12 11 278530 CASAVA_Build 7 102918012 1D TTTGGGAAGG C/- AGAACACTGG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 C 1 0 278531 CASAVA_Build 7 102923854 17D GCTAGTCTAG GTAACCTAGCACCGAAA/----------------- AGTTCTTGAT 3070 het 3070 ref 40 22 17 6 GTAACCTAGCACCGAAA 1 0 278532 CASAVA_Build 7 102926182 1D ACTATATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 11 10 278533 CASAVA_Build 7 102926504 4D ATTTGTAAAA AGTT/---- AGTTAGTTAT 3070 het 3070 ref 26 12 12 4 AGTT 3 2 278534 CASAVA_Build 7 102936287 13D CAAGGATGCC CTCTCTTAGCTCT/------------- CTCTCTTATT 2303 het 2303 ref 24 19 5 1 CTCTCTTAGCTCT 1 0 278535 CASAVA_Build 7 102936544 4I TACACCAATA ----/ACAG ACAGAGAGTC 3070 het 3070 ref 31 22 8 1 ACAG 1 2 278536 CASAVA_Build 7 102938188 1I GGAGGAGGGA -/T TAGCATTAGG 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 T 1 2 278537 CASAVA_Build 7 102939383 1I CCTGACTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 A 10 11 278538 CASAVA_Build 7 102939842 3I GAAAAAGTAT ---/TCC TCATTTCCCC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TCC 0 1 278539 CASAVA_Build 7 102942341 1I AAACTGACTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 8 9 278540 CASAVA_Build 7 102942493 1I CAAAACACAA -/T TATTTGTCTT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 1 2 278541 CASAVA_Build 7 102943188 3I CTCTGAGTAA ---/AAG AAGATTTACA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AAG 1 2 278542 CASAVA_Build 7 102944861 1D TCCCTGCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2698 hom 37 8 17 12 T 12 11 278543 CASAVA_Build 7 102944960 1I CAGTTTCTGG -/A GGGACACACA 3070 het 3070 hom 41 16 18 11 A 0 1 278544 CASAVA_Build 7 102952021 1I47M11D TTGTACAGAG -AAAAAAAAGAGAGAGCATAATAAATGAGACCAGACTTATTTTACATTGATATAAAAGC/AAAAAAAAAGAGAGAGCATAATAAATGAGACCAGACTTATTTTACATT----------- GATATAAGTA 3070 het 3070 hom 30 21 28 6 N/A 0 0 278545 CASAVA_Build 7 102952223 4D ATCCAAGCAA TGCC/---- TGAGGCTCAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 6 TGCC 1 0 278546 CASAVA_Build 7 102953379 1D ATTCATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 14 13 278547 CASAVA_Build 7 102956818 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 154 hom 30 2 23 5 A 13 12 278548 CASAVA_Build 7 102959808 1D AAGGAATGAG A/- ATCATGTCCT 2573 het 2556 hom 17 8 8 1 A 2 1 278549 CASAVA_Build 7 102960147 1D GCTGGAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 10 9 278550 CASAVA_Build 7 102961146 11D TGAGACTGGC ATATTGTTCTA/----------- ATGATCTTTG 3070 het 3070 ref 50 26 22 8 ATATTGTTCTA 1 0 278551 CASAVA_Build 7 102961441 5D GAAATAATTA CTTTT/----- CTTGAGTAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 7 CTTTT 1 0 278552 CASAVA_Build 7 102961584 1D CTTAATGGAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 15 23 6 T 9 8 278553 CASAVA_Build 7 102962178 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 T 11 10 278554 CASAVA_Build 7 102963409 5D AAGTGAAACA TAAAG/----- TAAATGTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TAAAG 1 0 278555 CASAVA_Build 7 102963627 4D AATTAATATA GTTT/---- GTTTATTTAA 3070 hom 54 het 20 0 19 4 GTTT 2 1 278556 CASAVA_Build 7 102971425 1I CGTTTATTTA -/T TTTTTTCATT 3070 het 2054 hom 18 6 11 1 T 6 7 278557 CASAVA_Build 7 102976016 4I TGGATTTTTG ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TA 5 7 278558 CASAVA_Build 7 102981922 1I TTTCTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 230 hom 15 3 11 1 A 10 11 278559 CASAVA_Build 7 102984113 2D TATATACGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1534 hom 20 4 11 5 TA 8 7 278560 CASAVA_Build 7 102987256 1D AAGCCTTGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 T 10 9 278561 CASAVA_Build 7 102993238 1D GGTTTTCCTG A/- AAAAAAAAAA 1263 het 1263 ref 53 36 4 14 A 11 10 278562 CASAVA_Build 7 102993661 1I CTCTCATAGA -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 7 8 278563 CASAVA_Build 7 102994648 7I CCAGGAAATG -------/AAGGAAA AAATACATAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 AAGGAAA 0 1 278564 CASAVA_Build 7 103012882 1D AAAGAAATAA C/- AAAGATCAAA 3070 het 3070 hom 45 20 23 3 C 1 0 278565 CASAVA_Build 7 103016632 2I AAGGACTTTT --/AG AGAGTTATAA 3070 hom 78 het 40 0 27 13 AG 2 3 278566 CASAVA_Build 7 103021695 1D AGAATCTCTA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 8 278567 CASAVA_Build 7 103022222 1I AAAGCTGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 586 hom 35 2 24 9 T 11 12 278568 CASAVA_Build 7 103028798 2I CATGTTAAAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 45 19 13 13 TG 8 9 278569 CASAVA_Build 7 103028922 5I TTTCTGAACA -----/ATTAT ACAGGTGATC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 ATTAT 0 1 278570 CASAVA_Build 7 103034224 4I TCTCAAATAT ----/AATG AATGATTCCT 3070 het 3070 hom 45 20 18 7 AATG 1 2 278571 CASAVA_Build 7 103046797 1I CTCTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3041 hom 29 9 13 7 A 13 14 278572 CASAVA_Build 7 103050479 12D CTTATCACGG TCTGGAATATTA/------------ TCTGGAATAT 3070 het 3070 ref 40 21 19 4 TCTGGAATATTA 2 1 278573 CASAVA_Build 7 103058758 1D AAGTTATTTA G/- AAAAATAATT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 G 1 0 278574 CASAVA_Build 7 103061158 2D58M1I ACAGAGATAA ATATATATATATATATAGAAAATTAAGGCGTTTTTGCTACCATTACCACGTTCTCCTTTT-/--ATATATATATATATAGAAAATTAAGGCGTTTTTGCTACCATTACCACGTTCTCCTTTTA AAAAAAACTC 3070 het 2778 hom 22 9 12 13 N/A 0 0 278575 CASAVA_Build 7 103062553 1I CTTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 T 10 11 278576 CASAVA_Build 7 103072091 1D TAAGTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1180 hom 29 5 12 13 T 15 14 278577 CASAVA_Build 7 103075220 1I AACACTGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 33 0 18 15 A 12 13 278578 CASAVA_Build 7 103077419 4I ACTTGAAAAT ----/GAAA GAAAGATAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GAAA 1 2 278579 CASAVA_Build 7 103084144 4D GCTGAGCCAG GGAA/---- GGAGAGAGTT 3070 het 3070 ref 63 31 26 7 GGAA 1 0 278580 CASAVA_Build 7 103090717 2I ACTAAAACAT --/TC TCTGTCAGCC 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 TC 1 2 278581 CASAVA_Build 7 103091596 1D AGGACTGACC T/- CTATGGCCCC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 1 0 278582 CASAVA_Build 7 103093579 4D CTCATTAATC TTTA/---- TTTCTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 TTTA 1 0 278583 CASAVA_Build 7 103098223 1D GTTTTGCGGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 90 het 42 0 31 11 T 9 8 278584 CASAVA_Build 7 103101596 3I CTATACCTTT ---/CTC CTCCTCCTCT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 CTC 3 4 278585 CASAVA_Build 7 103101864 1I GATATTCAGG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 7 8 278586 CASAVA_Build 7 103102087 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 9 10 278587 CASAVA_Build 7 103111022 4D ATAGTTCAAC AAAT/---- GAATGAGGGA 3070 het 3070 hom 40 14 25 3 AAAT 1 0 278588 CASAVA_Build 7 103116999 1I TCTTAAAAAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 9 278589 CASAVA_Build 7 103121229 1D CCAGCAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 8 16 0 A 10 9 278590 CASAVA_Build 7 103139955 8D AGAGCCAGGA AGTTTCTG/-------- AAATTCACAA 3070 het 3070 ref 38 21 16 3 AGTTTCTG 1 0 278591 CASAVA_Build 7 103141344 1D GCATTTATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 33 2 17 14 T 15 14 278592 CASAVA_Build 7 103144143 3D AGCTTAAAGA TCT/--- TCTCTTTGAC 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 TCT 2 1 278593 CASAVA_Build 7 103147286 2D TTTTGTTAAG AC/-- TGTGTGGTAG 3070 hom 111 het 41 0 38 5 AC 1 0 278594 CASAVA_Build 7 103151856 1D CTTTTGCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 T 10 9 278595 CASAVA_Build 7 103155605 4D TTTATTACTG AATT/---- ATTTATTTTT 3070 het 3070 ref 38 23 12 4 AATT 1 0 278596 CASAVA_Build 7 103158170 1D GCAGGGATTT A/- AAAAAAAAAA 937 het 937 ref 35 27 3 5 A 11 10 278597 CASAVA_Build 7 103161624 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 2001 hom 17 5 9 3 A 9 8 278598 CASAVA_Build 7 103169346 8D AAGCAAGAGA AAGGGAAG/-------- AAGGGAAGGG 3070 het 3070 ref 22 11 9 5 AAGGGAAG 2 1 278599 CASAVA_Build 7 103175109 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAATAA 3070 het 995 hom 16 4 8 4 A 7 8 278600 CASAVA_Build 7 103177663 1I GAGATTTGAT -/G GGTTTTTTTT 3070 het 90 hom 24 4 19 1 G 2 3 278601 CASAVA_Build 7 103182293 1I CCTCGTCTCT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 29 0 28 1 A 8 9 278602 CASAVA_Build 7 103183434 1I GGGAAGCGGA -/G CTTGCAGTGA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 0 1 278603 CASAVA_Build 7 103188581 4I CCAGGAATAA ----/TTTC TTTATTACTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 TTTC 0 1 278604 CASAVA_Build 7 103198340 1I TTTAAAAATT -/G TTTTTTTTTA 3070 het 2972 hom 28 8 16 4 G 0 1 278605 CASAVA_Build 7 103199446 3I TTCTTTCTGG ---/CCT CCAAGATCTA 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 CCT 0 1 278606 CASAVA_Build 7 103217621 1D CAATCCAAAT G/- GCCCATTAAT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 2 1 278607 CASAVA_Build 7 103219463 4D TTAAAAAGTT TTTA/---- AAAAAAAAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 TTTA 1 0 278608 CASAVA_Build 7 103220226 3D GAACATAGAT TAG/--- TAGTGGTTTC 2125 hom 21 het 8 0 6 2 TAG 2 1 278609 CASAVA_Build 7 103232758 1D GGTTGAGTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 A 10 9 278610 CASAVA_Build 7 103233158 2D AAAATTTGAA CT/-- CTGTTTTCAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 CT 2 1 278611 CASAVA_Build 7 103238345 1D TCCTTGCAGG A/- AAAAAAAAAC 1259 het 1259 ref 49 36 4 9 A 10 9 278612 CASAVA_Build 7 103242453 2I GCTCTGTGAC --/AT AGAGCTCACC 3070 het 3070 ref 58 29 23 6 AT 0 1 278613 CASAVA_Build 7 103242891 1I TGCTATGGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 T 8 9 278614 CASAVA_Build 7 103249484 1D ATTAGAAGGC T/- TTTCACTGTT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 4 3 278615 CASAVA_Build 7 103250930 2D TATCTCTTAG AA/-- ACAGCATACT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 A 3 1 278616 CASAVA_Build 7 103251569 1D CTGCATTTTT A/- AAAAATTTAT 3070 het 3070 hom 22 8 14 1 A 6 5 278617 CASAVA_Build 7 103256079 4D TGATCCTCCT GTGA/---- GTGATCCTTC 3070 hom 117 het 43 0 39 7 GTGA 2 1 278618 CASAVA_Build 7 103273590 4D CACGCTCATG GATA/---- GAAAGAATCA 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 GATA 1 0 278619 CASAVA_Build 7 103274553 3I GCCACAGTGC ---/GAT GATGCCATCT 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 GAT 1 2 278620 CASAVA_Build 7 103275643 6D AAAGAAAAGA AAAGAC/------ AAAGAATAAA 3070 het 3070 ref 30 19 9 3 AAAGAC 1 0 278621 CASAVA_Build 7 103276997 1D TATCTTAAGA T/- TTTTTTCAAC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 7 6 278622 CASAVA_Build 7 103279973 1I GAACAAACTA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 8 278623 CASAVA_Build 7 103284595 2I ATACTTTAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 AT 5 6 278624 CASAVA_Build 7 103285686 1I TCTTCAATGG -/T TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 3 4 278625 CASAVA_Build 7 103292569 1I GAAATGAAAC -/G GGTAAGAGAC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 G 2 3 278626 CASAVA_Build 7 103293055 6I GCAATAAATT ------/GAAGAA GAAGGGATAC 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 GAA 1 3 278627 CASAVA_Build 7 103298950 1I TAAATGAATG -/A AAAGAAACCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 3 4 278628 CASAVA_Build 7 103299712 2I TATATATATA --/TT TATTTTTCTT 2193 het 104 hom 9 2 7 0 T 1 3 278629 CASAVA_Build 7 103304189 2I TATCAAATAT --/AA GTTATTACTA 3070 het 3070 hom 48 24 19 5 A 0 2 278630 CASAVA_Build 7 103304464 1I ATGTCTGCTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 8 9 278631 CASAVA_Build 7 103304523 1D TAGGCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 11 10 278632 CASAVA_Build 7 103315929 1D GAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 1 0 278633 CASAVA_Build 7 103318236 1D CTTGAATCAT C/- CCCCAAACCA 3070 hom 153 het 60 0 51 12 C 5 4 278634 CASAVA_Build 7 103328646 1D CTTTGGGGTG A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 A 8 7 278635 CASAVA_Build 7 103334218 2D AGCATTCTGA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 39 19 11 9 CT 6 5 278636 CASAVA_Build 7 103334994 6D AGCTTCTCGG GAGGCT/------ GAGGCAGGAG 2325 het 2325 ref 14 7 5 2 GAGGCT 1 0 278637 CASAVA_Build 7 103335456 2D16M2D TGTTTTTTTT TCTTTTTTAAAAAAAAACTT/--CTTTTTAAAAAAAAAC-- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 15 2 N/A 0 0 278638 CASAVA_Build 7 103336556 1I GCTCTTTGTA -/C CATTGGCTGG 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 C 1 2 278639 CASAVA_Build 7 103340602 2I GAGAGAATCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 T 9 11 278640 CASAVA_Build 7 103343156 1I TGTTGATTTC -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 6 7 278641 CASAVA_Build 7 103354576 1I TGATCCACCC -/G CCTTGGCCTC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 G 0 1 278642 CASAVA_Build 7 103355694 1I GATTTGTTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 8 9 278643 CASAVA_Build 7 103356522 2I TAAAGAGCAA --/TG TCACAGCCCT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 TG 0 1 278644 CASAVA_Build 7 103356863 1D TCTTTATTGC A/- GTACTTATCT 3070 het 3070 ref 46 24 17 9 A 1 0 278645 CASAVA_Build 7 103363783 5I CTTCAATGGC -----/TTTTT TTTTTTTTTT 2467 het 2467 ref 31 13 10 8 T 11 16 278646 CASAVA_Build 7 103377066 1I CTTTGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3029 het 3029 ref 25 10 7 8 A 11 12 278647 CASAVA_Build 7 103384894 2D GTCTCAAGTG AA/-- AAAAGACGAC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 6 4 278648 CASAVA_Build 7 103386462 1I AATCTGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 10 11 278649 CASAVA_Build 7 103386776 1D CAGGCACCTG C/- CATCACACCT 3029 het 1585 hom 13 4 7 2 C 2 1 278650 CASAVA_Build 7 103386805 3D TTCGTATTTT TAG/--- TAGAGACGGG 2359 het 364 hom 9 1 7 1 TAG 2 1 278651 CASAVA_Build 7 103387295 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 42 27 13 5 TCTT 1 0 278652 CASAVA_Build 7 103393906 14I ATTACCCGCT --------------/GGAAAATTACCAGA TTTTCCAGTT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 GGAAAATTACCAGA 0 1 278653 CASAVA_Build 7 103402169 8D39M1D GTGGAATTTT ATTTCTACATTATCTATAAGATTTGAGCTATTCTCACTAACAAGTCCT/--------ATTATCTATAAGATTTGAGCTATTCTCACTAACAAGTCC- TGGAAACATT 3070 hom 51 het 26 0 17 21 N/A 0 0 278654 CASAVA_Build 7 103421344 1I TAAAAATCCC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 7 8 278655 CASAVA_Build 7 103430318 1D TATTAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 13 9 A 12 11 278656 CASAVA_Build 7 103431371 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 10 9 278657 CASAVA_Build 7 103433070 4D CTAAAGCCTA GAGT/---- GAGTAAGTGT 3070 het 3070 ref 31 19 9 4 GAGT 2 1 278658 CASAVA_Build 7 103438092 1I AAAGGAAAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 7 8 278659 CASAVA_Build 7 103453700 1I TTCTTTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1456 hom 36 5 23 8 T 15 16 278660 CASAVA_Build 7 103455571 1D GTGTTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 39 2 26 11 A 11 10 278661 CASAVA_Build 7 103459075 1D CCAAGAGTTT A/- AGAGTGTCCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 1 278662 CASAVA_Build 7 103464082 1D TGGCTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 11 10 278663 CASAVA_Build 7 103464958 1I TTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 9 10 278664 CASAVA_Build 7 103475037 2I TTTGGGTACT --/TA TTTTCTAACG 3070 het 3070 ref 60 28 25 7 TA 0 1 278665 CASAVA_Build 7 103485092 4I TTAAGTAGTC ----/ATTG ATTAACACAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ATTG 0 1 278666 CASAVA_Build 7 103494351 1I AACCTTGACC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 8 9 278667 CASAVA_Build 7 103516798 6I ATATTTTCTA ------/TTCTAT TTCTTTCCTT 3070 hom 159 het 59 0 53 8 TTCTAT 0 1 278668 CASAVA_Build 7 103517665 1D GGAAGGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 12 11 278669 CASAVA_Build 7 103530190 1I CGGGCTTGGG -/T TTTTTTTTTT 2492 het 919 hom 32 8 11 13 T 15 16 278670 CASAVA_Build 7 103533867 1D GATATGTATC T/- TTTTTTTTTT 1270 het 1270 ref 49 34 4 11 T 11 10 278671 CASAVA_Build 7 103540977 1D TCTAGAGTTA T/- TTTTTTTGTA 2922 het 2922 ref 22 10 7 5 T 8 7 278672 CASAVA_Build 7 103543195 1D GGCAACAGCT G/- ATCTGTGTTC 3070 het 3070 ref 53 31 19 3 G 1 0 278673 CASAVA_Build 7 103545572 1I TTTAGTATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 9 10 278674 CASAVA_Build 7 103555232 3I ATTCAGACTT ---/GGA GGTTTATTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 GGA 0 1 278675 CASAVA_Build 7 103559535 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2599 het 1479 hom 16 5 6 5 A 13 12 278676 CASAVA_Build 7 103564865 1D AGTTCACTGG A/- AGTTTCAAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 2 1 278677 CASAVA_Build 7 103569116 1I AGTTTAAGAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 7 8 278678 CASAVA_Build 7 103574100 1D CCAGATGTCC T/- TCAACAGGTG 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 T 2 1 278679 CASAVA_Build 7 103574911 1I TCAAGGAGGA -/T TTTGTAGCTA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 3 4 278680 CASAVA_Build 7 103578230 1D TTTTCATTTC A/- AAAAAAAAAA 1522 het 1522 ref 45 32 4 9 A 13 12 278681 CASAVA_Build 7 103581175 3D CACAATCTCA GTT/--- GTTGTTAAGA 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 GTT 3 2 278682 CASAVA_Build 7 103583879 1D AATGACCCAA G/- ATAATGACTG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 1 0 278683 CASAVA_Build 7 103587281 4I AAGAAAAAAC ----/ATGT ATGTACTATC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 ATGT 1 2 278684 CASAVA_Build 7 103593724 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 9 10 278685 CASAVA_Build 7 103596993 5I TTGTAGGATG -----/CTTGC CTTGCAGAGT 3070 het 3070 hom 60 25 29 7 CTTGC 1 2 278686 CASAVA_Build 7 103604371 1I TTTAGTTGTT -/G GGGAGCTCAG 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 G 3 4 278687 CASAVA_Build 7 103608017 4I CATTTTATCA ----/AGAT AGATAACTTT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AGAT 1 2 278688 CASAVA_Build 7 103608286 2I TAGAACTAAC --/TT TTGGATTTTC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 2 4 278689 CASAVA_Build 7 103608833 3D AATAACTGAT GAG/--- GATGTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 GAG 1 0 278690 CASAVA_Build 7 103611961 1I AATTTTACTT -/A AACACATTTG 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 A 2 3 278691 CASAVA_Build 7 103626866 1I AGTCCCCACT -/G GGGCACTGCC 3070 hom 75 het 26 0 21 5 G 3 4 278692 CASAVA_Build 7 103629426 1D TTACTAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 24 12 5 A 11 10 278693 CASAVA_Build 7 103629599 2D CACAGTGAGA CT/-- CTGTCTTTAA 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 CT 2 1 278694 CASAVA_Build 7 103632274 3D TATATTACTC CTT/--- CTTAAAGACT 3070 het 3070 ref 30 14 15 2 CTT 2 1 278695 CASAVA_Build 7 103636618 1D TGCCCATAGA T/- TGTAGATCAG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 2 1 278696 CASAVA_Build 7 103644833 1D AAAAAAAAAA C/- ACGAATTTAC 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 C 1 0 278697 CASAVA_Build 7 103647631 1I CAGCCTCTTT -/C CCCCTTCCCC 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 C 4 5 278698 CASAVA_Build 7 103653126 4D CTAGCTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 333 hom 30 2 18 10 T 18 14 278699 CASAVA_Build 7 103653158 1I TGTTTTTACA -/T TTTTTTTTAG 2571 het 2218 hom 35 8 8 22 T 8 9 278700 CASAVA_Build 7 103657519 1I GGGAGCTTTT -/A ACTCATGTCA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 1 2 278701 CASAVA_Build 7 103658993 1D TCCCGCTCCA G/- GGGGGTCGCT 3070 het 2871 hom 29 11 13 6 G 6 5 278702 CASAVA_Build 7 103665216 1I GGAAGGAAGA -/C CCCTGGGGGA 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 C 3 4 278703 CASAVA_Build 7 103666667 1I AACTCTGAGG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 7 8 278704 CASAVA_Build 7 103667905 2D TATATAAAAC AT/-- ATTTATCTTG 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 AT 2 1 278705 CASAVA_Build 7 103670648 14D AAGTAGGTAG AATGGGGGAAGTAA/-------------- AATAGGATAC 3070 het 3070 ref 42 25 17 6 AATGGGGGAAGTAA 1 0 278706 CASAVA_Build 7 103673131 1D CAATTTTGGC T/- TTTGTTGCAA 3070 het 2676 hom 18 6 10 2 T 4 3 278707 CASAVA_Build 7 103673900 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTATTAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 TGTT 1 0 278708 CASAVA_Build 7 103674954 1D CCCTTTATCA T/- TTTTTTATTG 2570 het 2413 hom 11 5 6 0 T 7 6 278709 CASAVA_Build 7 103680600 1I GATTCCTCTT -/C CAATGAAGGA 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 C 1 2 278710 CASAVA_Build 7 103681661 2D GAAATGCAAG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 45 12 25 9 A 10 8 278711 CASAVA_Build 7 103685083 2D TTCTAAACTC TT/-- AGACTTGCTA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 2 0 278712 CASAVA_Build 7 103691174 1I CTTTTCATTC -/T TTTAACCATG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 3 4 278713 CASAVA_Build 7 103710315 1I ATACATATGT -/A ACTAACCTGC 847 het 847 ref 20 9 3 8 A 1 2 278714 CASAVA_Build 7 103720599 2I AAAATGAAAA --/AG AGAGACTCCT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 AG 2 3 278715 CASAVA_Build 7 103726714 1D AATTCACTCA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 7 6 278716 CASAVA_Build 7 103751337 8I GATCTGCAGT --------/CAGGTCCA CTATCTCTAG 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 CAGGTCCA 0 1 278717 CASAVA_Build 7 103759223 2I AAGGAATAAC --/AT ATAGAAGATA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AT 1 2 278718 CASAVA_Build 7 103760631 2D CTTCAGAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 792 hom 30 6 16 8 A 13 11 278719 CASAVA_Build 7 103764188 1D TTTTTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2741 hom 28 9 15 4 A 13 12 278720 CASAVA_Build 7 103766933 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1910 hom 19 4 14 1 A 10 11 278721 CASAVA_Build 7 103769584 1I GAAAAAGAAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 8 9 278722 CASAVA_Build 7 103771272 1D GAGAAGGTGA T/- TTAAATACCT 3070 het 2523 hom 18 7 8 4 T 3 2 278723 CASAVA_Build 7 103773725 1D TTATTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 2177 het 879 hom 29 6 8 15 T 15 14 278724 CASAVA_Build 7 103774366 3I TCTCTTAGTT ---/CTC CTATAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 16 28 5 CTC 0 1 278725 CASAVA_Build 7 103774733 2D TTTCCTCATC TG/-- TAAAATGAGG 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 TG 1 0 278726 CASAVA_Build 7 103776666 1D ACTCTTCTCC T/- TTTTTCTCCT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 6 5 278727 CASAVA_Build 7 103796460 1I TGCCCTATGA -/G GGCATGGCCA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 G 2 3 278728 CASAVA_Build 7 103800703 10D GCAGTTCCCT GGGCAAATAA/---------- GTTTGTGAAA 3070 het 3070 hom 44 17 22 7 GGGCAAATAA 1 0 278729 CASAVA_Build 7 103809267 1D TCCCACACGC A/- GTTATTAAAT 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 1 0 278730 CASAVA_Build 7 103809674 1I GAGATGTACA -/G GAGTATATTT 3070 hom 141 het 53 0 47 6 G 1 2 278731 CASAVA_Build 7 103810629 26I CCAGTCACTC --------------------------/TTAAAGGCCTTTAAATTACTTTACTG TTCACAGTAG 3070 hom 115 het 46 0 38 8 TTAAAGGCCTTTAAATTACTTTACTG 0 1 278732 CASAVA_Build 7 103813078 2D GCATTCTGAT TG/-- ATATCTGAGC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TG 1 0 278733 CASAVA_Build 7 103813597 1D AATAATTACT C/- CTCCATAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 2 1 278734 CASAVA_Build 7 103816520 1I TTTATGGTGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 130 hom 54 1 44 9 A 8 9 278735 CASAVA_Build 7 103825745 1D TGCATTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 643 hom 41 4 30 7 T 15 14 278736 CASAVA_Build 7 103826526 1I TTTCTGATGC -/T CCGCCCCCCG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 0 1 278737 CASAVA_Build 7 103827117 1I TGTTCTTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 9 10 278738 CASAVA_Build 7 103827321 1D AAGTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 465 het 465 ref 17 5 3 10 T 17 16 278739 CASAVA_Build 7 103836044 1I TGTGGCAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 31 1 22 8 T 11 12 278740 CASAVA_Build 7 103862809 1I TAGGATTAAA -/T TGTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 1 2 278741 CASAVA_Build 7 103866503 1I TTGATTTTTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 7 8 278742 CASAVA_Build 7 103867068 1I ATAAACATAG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 A 7 8 278743 CASAVA_Build 7 103869929 1D AAATCTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 11 10 278744 CASAVA_Build 7 103879300 3D ACATCCTTTT TTC/--- TTCTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 19 11 4 TTC 2 1 278745 CASAVA_Build 7 103883637 2D TGAAGATGAG TT/-- TTTAAAATTA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 5 3 278746 CASAVA_Build 7 103899861 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2638 hom 31 8 14 9 A 15 16 278747 CASAVA_Build 7 103903686 1I CTTCTTGCCT -/G GGGTGTAGCA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 G 3 4 278748 CASAVA_Build 7 103904136 1D AGCTTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2495 hom 31 12 11 8 T 13 12 278749 CASAVA_Build 7 103905439 2D AAAATAAGTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 13 het 38 1 17 22 A 11 9 278750 CASAVA_Build 7 103907081 1D CTTCCACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 30 3 12 15 T 13 12 278751 CASAVA_Build 7 103911803 1D TTGGAGACTT A/- TTACAATTCT 3070 het 3070 ref 38 21 12 6 A 1 0 278752 CASAVA_Build 7 103912971 1D AGTGTTCTTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 A 8 7 278753 CASAVA_Build 7 103918837 1I ATTAGACCAG -/A AGGCTGTAAC 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 A 1 2 278754 CASAVA_Build 7 103923061 1D CTGGCTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 A 10 9 278755 CASAVA_Build 7 103928784 1I AATATCTGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 A 9 10 278756 CASAVA_Build 7 103936302 2D ATAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 1545 het 1545 ref 12 7 4 2 AT 6 5 278757 CASAVA_Build 7 103936951 1D GGAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 11 10 278758 CASAVA_Build 7 103943310 1I GACTGGAATT -/A AAAAGGAATT 3070 hom 141 het 54 0 46 8 A 4 5 278759 CASAVA_Build 7 103946188 3D TGTTTAAATT CTA/--- CTACTGGACA 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 CTA 2 1 278760 CASAVA_Build 7 104016597 4I TTTGGCTCTC ----/TGTT TGTCTGTTAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TGTT 0 1 278761 CASAVA_Build 7 104020110 17I CAGCGGAGGC -----------------/TGCAGAACAGCAAATAT TGCAGAACAG 1522 hom 12 het 5 0 5 0 TGCAGAACAGCAAATAT 0 1 278762 CASAVA_Build 7 104048348 2I TAGCACTTTT --/CC CCCCCCAGTG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 6 8 278763 CASAVA_Build 7 104058983 1I TTTCATTTTC -/A AGTGTAAAAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 278764 CASAVA_Build 7 104072438 1I TTCCTCCCCC -/T TCCCTGCTGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 278765 CASAVA_Build 7 104080737 3I AAACAGTAAA ---/TTC TTCTGGCAGC 3070 hom 81 het 29 0 25 4 TTC 1 2 278766 CASAVA_Build 7 104085697 1I CCTTTGACAG -/A AAAAAAGATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 6 7 278767 CASAVA_Build 7 104092000 1I CAGCTTCTAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 8 9 278768 CASAVA_Build 7 104092624 2D TGTCCTTGAA AG/-- ACCTCTAGCC 3070 het 3070 hom 57 22 30 5 AG 1 0 278769 CASAVA_Build 7 104094948 4I CTGTTTTCTT ----/GTGG GGGGGGGGGA 2678 het 2678 ref 24 12 9 3 GTGG 0 1 278770 CASAVA_Build 7 104101962 1D ATTTAAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 9 278771 CASAVA_Build 7 104103534 1I AGGACTTCCC -/T TTTTAGATAT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 T 4 5 278772 CASAVA_Build 7 104105049 1I CAGTCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 13 14 278773 CASAVA_Build 7 104109305 1I ACTAAGGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 A 10 11 278774 CASAVA_Build 7 104129553 1I ATTCTTTTTT -/A AAAAAAATTT 3070 het 1611 hom 18 4 11 3 A 7 8 278775 CASAVA_Build 7 104142200 1D CAAGTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 940 het 940 ref 31 22 3 6 T 12 11 278776 CASAVA_Build 7 104149223 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 11 12 278777 CASAVA_Build 7 104152468 5D GAATATATCC AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 AAAAG 3 2 278778 CASAVA_Build 7 104164836 1D ATTTTGATGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 9 278779 CASAVA_Build 7 104165658 17D CTAGACCATC ACTGTTTATGCGGGTAA/----------------- ACTGTTTATG 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 ACTGTTTATGCGGGTAA 2 1 278780 CASAVA_Build 7 104171357 3D TGAGATGTTT ATC/--- ATTATCCCCA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 ATC 1 0 278781 CASAVA_Build 7 104172656 4D CTCCCAAGTT TAAG/---- TAAGCCTCCT 3070 het 3070 ref 44 25 13 8 TAAG 2 1 278782 CASAVA_Build 7 104178825 1I CGATTCAATC -/A CAGGCTTTTA 1466 hom 7 het 3 0 3 0 A 0 1 278783 CASAVA_Build 7 104188301 1I CCTAGTGTCA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 T 7 8 278784 CASAVA_Build 7 104188629 2I AAAAAAAAAC --/AG ATTACTTTGT 3070 hom 61 het 29 0 20 9 AG 0 1 278785 CASAVA_Build 7 104197537 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 hom 43 18 21 6 A 7 6 278786 CASAVA_Build 7 104201528 1D TCCCTTGCAG C/- CCTAAGGAGG 3070 het 3070 ref 58 26 16 16 C 3 2 278787 CASAVA_Build 7 104203536 1I CTTTTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 540 hom 27 2 18 7 T 12 13 278788 CASAVA_Build 7 104223661 1I ATATGGATCT -/A AAAAGCCCAC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 4 5 278789 CASAVA_Build 7 104225709 1I GGGTGGCAGT -/G GGGGGGGGCG 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 G 8 9 278790 CASAVA_Build 7 104240961 1D ATCCTGTCCC A/- AAAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 A 6 5 278791 CASAVA_Build 7 104256543 1D CATGGTGAAA C/- CCTGTCTCCA 3070 het 279 hom 16 2 9 5 C 3 2 278792 CASAVA_Build 7 104256714 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 92 het 34 0 26 8 A 10 9 278793 CASAVA_Build 7 104258913 3I TATTCTTAAT ---/AAA AAAATGTTAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 4 7 278794 CASAVA_Build 7 104259460 3D TTGTAGATAG TGT/--- TGTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TGT 2 1 278795 CASAVA_Build 7 104263145 1D GAGTGGCAGT C/- ACTCCTTCAT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 C 1 0 278796 CASAVA_Build 7 104263447 1D AATTATTATT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 1 0 278797 CASAVA_Build 7 104267378 5D GAAAGAAAAA AAATT/----- AAATTAACAT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 AAATT 2 1 278798 CASAVA_Build 7 104276339 1D AAAAGGAGAA G/- GGGAAAGGAG 2720 het 2720 ref 29 16 8 5 G 4 3 278799 CASAVA_Build 7 104281953 1D AAACAAGTGG A/- AGGTTTGTTA 3070 het 3070 hom 54 25 26 3 A 2 1 278800 CASAVA_Build 7 104282672 1D CAGTAAGCTC T/- TTAGTCTGGC 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 T 3 2 278801 CASAVA_Build 7 104284953 1I TAAGGCGGGG -/C CAGGAAATGA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 1 2 278802 CASAVA_Build 7 104285379 1D ATTTGAAACT G/- AATCCTCTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 G 1 0 278803 CASAVA_Build 7 104286644 2D AATTTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 20 2 10 8 A 14 12 278804 CASAVA_Build 7 104290321 1I TGGTCCCGCA -/G GTGCCCAAAC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 G 1 2 278805 CASAVA_Build 7 104302614 1I ATTGCCCCCT -/A AAATCTCCCA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 3 4 278806 CASAVA_Build 7 104302925 7D GATAAGGTAA GCCCCAT/------- GCATAATACT 3070 het 3070 ref 47 23 21 7 GCCCCAT 1 0 278807 CASAVA_Build 7 104304960 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1267 hom 15 3 11 1 A 10 11 278808 CASAVA_Build 7 104305522 1D TATAGCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 13 12 278809 CASAVA_Build 7 104305951 1I CAAATATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 T 10 11 278810 CASAVA_Build 7 104312246 1I TAGTAAGATC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 7 8 278811 CASAVA_Build 7 104337144 1I CTCTGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2038 hom 23 5 13 5 A 12 13 278812 CASAVA_Build 7 104344074 1I CTCCTCTTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 A 9 10 278813 CASAVA_Build 7 104345671 1D CAGCTGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 A 11 10 278814 CASAVA_Build 7 104356212 21D GGGAGAAAAC AGCCAAGGAGGGAGGCCTACA/--------------------- AGCCAAGGAG 3070 het 3070 ref 42 21 18 11 AGCCAAGGAGGGAGGCCTACA 1 0 278815 CASAVA_Build 7 104368024 1I CAGCAGTGCC -/G GCCCACCATC 2434 hom 24 het 12 0 9 3 G 1 2 278816 CASAVA_Build 7 104371627 3D GACAGAGGAG TCT/--- TCTTATCCTG 3070 het 3070 ref 53 23 21 9 TCT 2 1 278817 CASAVA_Build 7 104412790 1D GGGAACTTGT A/- AACAAAATGA 3070 het 3070 hom 55 23 28 5 A 3 2 278818 CASAVA_Build 7 104432433 2I CAAACTACCT --/AA AAGTCTTCCT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 2 4 278819 CASAVA_Build 7 104449383 1I GTTTCTCAGA -/T GTAAAGCAAG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 0 1 278820 CASAVA_Build 7 104455765 4D AATAAATAAA TATC/---- TACACTGTGT 3070 het 3070 ref 24 13 9 4 TATC 1 0 278821 CASAVA_Build 7 104457488 2D TAAATCAAAC AG/-- AAATGAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 10 9 AG 1 0 278822 CASAVA_Build 7 104465550 6I TATTTTTCAG ------/TTATTT TTAAACATTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 TTATTT 0 1 278823 CASAVA_Build 7 104467679 1I TGTAAATTTG -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 3 4 278824 CASAVA_Build 7 104478615 5D TCACCATGTT GGCCA/----- GGCTGGTCTC 2716 het 1757 hom 13 5 6 2 GGCCA 1 0 278825 CASAVA_Build 7 104490777 5I AACGTGAAGA -----/TATCT TATGATTTGG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 TATCT 0 1 278826 CASAVA_Build 7 104492464 4I ACTAAAAATA ----/ACTT CAGTGACACT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 ACTT 0 1 278827 CASAVA_Build 7 104513237 8D TCAAAAATAA AATAAAAT/-------- AATAATACAA 2305 het 2305 ref 16 9 7 0 AATAAAAT 1 0 278828 CASAVA_Build 7 104515043 6D ATGGCATCTC TTTATA/------ TTAATATTTT 1448 het 1448 ref 7 5 3 0 TTTATA 1 0 278829 CASAVA_Build 7 104555409 11I GTAGGGAACA -----------/CCATTTGTTCC CATTTCCCTT 3070 hom 99 het 39 0 31 8 CCATTTGTTCC 0 1 278830 CASAVA_Build 7 104557223 8I ATGCCCAGCT --------/AATTTTTA AATTTTTGTA 3070 het 408 hom 10 1 9 0 AATTTTTA 0 1 278831 CASAVA_Build 7 104595623 1I TATTACCCAG -/A AAAAATCTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 5 6 278832 CASAVA_Build 7 104603057 1I AAATGCTGTT -/A AAAGCAAACT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 3 4 278833 CASAVA_Build 7 104619734 2D CTGCTTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 28 1 15 12 T 16 14 278834 CASAVA_Build 7 104626025 1I GTGACACAGG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 8 9 278835 CASAVA_Build 7 104641212 3D AACAAGCCAC CAA/--- CATTATAATC 3070 het 3070 ref 43 19 19 6 CAA 1 0 278836 CASAVA_Build 7 104646587 1I CAAATAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 A 8 9 278837 CASAVA_Build 7 104652863 8D TCTCTCTTTA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 8 AAAC 6 4 278838 CASAVA_Build 7 104653481 1I ACTTACACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 41 1 34 6 A 10 11 278839 CASAVA_Build 7 104660299 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 9 8 278840 CASAVA_Build 7 104660401 1D CAATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 12 11 278841 CASAVA_Build 7 104666437 2D GAAAATTTGT TC/-- TGTGTTTTGA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TC 1 0 278842 CASAVA_Build 7 104675404 1D TATTTTTTTT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 8 7 278843 CASAVA_Build 7 104677895 4D GCACCTGTAA TCCC/---- TCCCAGCTAC 3070 hom 58 het 24 0 17 7 TCCC 2 1 278844 CASAVA_Build 7 104681596 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 8 278845 CASAVA_Build 7 104682548 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 2224 het 453 hom 6 1 5 0 T 5 6 278846 CASAVA_Build 7 104683624 3D AAAAAAAAAA GAG/--- AGAGAGCGAG 3069 het 3069 ref 34 17 10 8 GAG 1 0 278847 CASAVA_Build 7 104693943 1I TTTTGCTTTT -/C CCCATTTTAT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 C 3 4 278848 CASAVA_Build 7 104701115 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1937 hom 20 7 9 4 T 12 11 278849 CASAVA_Build 7 104702578 1D AGTGATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 9 18 9 T 12 11 278850 CASAVA_Build 7 104703116 1D ACTGTGATTT C/- CCCCATTCAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 5 4 278851 CASAVA_Build 7 104706982 10I CTGATTTAGA ----------/ACTTCCAAGG TAGCTGCTGC 3070 het 2605 hom 22 7 11 4 ACTTCCAAGG 0 1 278852 CASAVA_Build 7 104710579 1I CGTAACTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 A 11 12 278853 CASAVA_Build 7 104721136 1D TTCCTTTTTT G/- TGGGGGGGTG 1825 het 1825 ref 20 10 6 4 G 1 0 278854 CASAVA_Build 7 104723773 1D CCTACTAAAG A/- ATGGCTCTGA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 2 1 278855 CASAVA_Build 7 104748690 1I GTTTTTAAAA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 T 7 8 278856 CASAVA_Build 7 104750432 1D AACCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 13 12 278857 CASAVA_Build 7 104754909 1I TTTAATGGTT -/G GGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 4 5 278858 CASAVA_Build 7 104767960 1D CAAGAAAAAG C/- CAAGTGGGCA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 C 2 1 278859 CASAVA_Build 7 104771977 1D GGACATAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 8 20 12 T 10 9 278860 CASAVA_Build 7 104785460 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 8 9 278861 CASAVA_Build 7 104787925 1I GGTACATCTT -/C CCTCCATCCC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 2 3 278862 CASAVA_Build 7 104789647 1I AACAAAAGCC -/A AAATTGAAAA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 3 4 278863 CASAVA_Build 7 104826065 1D CCCAGCCTCC T/- TTTTTTTTTT 1061 het 1061 ref 31 13 3 15 T 19 18 278864 CASAVA_Build 7 104854348 1I TAAATTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 16 9 A 13 14 278865 CASAVA_Build 7 104856453 1D GTATTACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2662 hom 32 12 11 9 T 15 14 278866 CASAVA_Build 7 104856593 2D AGGACTACAG GT/-- GTACATGCCA 3070 hom 63 het 29 0 22 8 GT 2 1 278867 CASAVA_Build 7 104858902 1I TATTTATTTA -/T TTTATTTTTT 2604 het 1594 hom 12 4 7 1 T 3 4 278868 CASAVA_Build 7 104860984 1I ATTATCTTAC -/T TTGTCAAGAC 3070 het 3070 ref 37 24 12 1 T 2 3 278869 CASAVA_Build 7 104862884 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2189 hom 19 het 11 0 6 5 A 19 18 278870 CASAVA_Build 7 104864265 1D CAAAACCTTA G/- TTCATGAATA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 G 1 0 278871 CASAVA_Build 7 104866467 1I TTTGTGGTTG -/T TTTTTTTTTT 2268 het 2268 ref 27 12 9 6 T 11 12 278872 CASAVA_Build 7 104870443 2I GTGGATTTAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AC 5 6 278873 CASAVA_Build 7 104873346 1D AATTAAAGAT A/- AAAATCTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 5 4 278874 CASAVA_Build 7 104883040 1I GTACAAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 11 12 278875 CASAVA_Build 7 104883260 18D GTAAGACAAA ATATATATATATATATAT/------------------ ATATATATAT 3070 hom 43 het 19 0 15 5 AT 15 6 278876 CASAVA_Build 7 104889787 5D AAAAGAAAAG GAAAA/----- GAAAAGAAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 GAAAA 2 1 278877 CASAVA_Build 7 104891929 1D TCAACTTGAC T/- GGGGTAAGGG 3070 hom 129 het 46 0 44 3 T 1 0 278878 CASAVA_Build 7 104910878 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCTCTC 3070 hom 51 het 19 0 16 3 AG 1 2 278879 CASAVA_Build 7 104932085 1D ATAAAAAATG A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 A 7 6 278880 CASAVA_Build 7 104933830 1I GGAAATGCTA -/T TTTTTATACA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 5 6 278881 CASAVA_Build 7 104941294 1D CCAAGGCAGG C/- CGGATCACGA 2561 het 2561 ref 25 15 7 3 C 2 1 278882 CASAVA_Build 7 104944401 1D CCTCCCAAAG T/- TCCTGGGATT 3070 het 2741 hom 21 7 10 4 T 2 1 278883 CASAVA_Build 7 104948921 4D GGGGATGGGG GGGA/---- GGGAACCTTA 3070 het 3070 hom 34 12 16 8 GGGA 2 1 278884 CASAVA_Build 7 104949082 10D AGGACTCGAA TTTCAGCTTG/---------- CACAGCAGCA 3070 het 3070 ref 53 36 14 5 TTTCAGCTTG 1 0 278885 CASAVA_Build 7 104952519 2I CAGAGTAAGA --/CT CTGTCTAGAA 1391 het 1391 ref 16 5 4 7 CT 1 2 278886 CASAVA_Build 7 104953065 1I TAGTCTGAGG -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 A 6 7 278887 CASAVA_Build 7 104955229 1D TTTCCTATAT C/- CTATGTCATC 3070 het 3070 ref 51 27 24 1 C 2 1 278888 CASAVA_Build 7 104957749 4D TATTTTAAAA TAAC/---- TAAAAGAGTG 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 TAAC 1 0 278889 CASAVA_Build 7 104960318 1I ACACACCTCC -/T TGGGAAGGTG 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 1 2 278890 CASAVA_Build 7 104970575 3I AACTTTTAAG ---/TCT TTTTTTTTTT 2488 het 1875 hom 24 10 11 3 TCT 0 1 278891 CASAVA_Build 7 104984208 1I GAACTCTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 9 10 278892 CASAVA_Build 7 104984391 6I GATCTGCCTA ------/ATTATT ATTAAGTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATT 1 3 278893 CASAVA_Build 7 104986480 5I CTGTCTCTAC -----/ATAAA ATAAAATAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 ATAAA 3 4 278894 CASAVA_Build 7 104988784 5D AGTTTTAGAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2909 het 1020 hom 15 3 8 4 A 15 10 278895 CASAVA_Build 7 104990750 1I CTGGCAATGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 49 26 12 11 A 8 9 278896 CASAVA_Build 7 104993799 1D TAAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 13 0 10 3 A 13 12 278897 CASAVA_Build 7 104995257 2I TGTTGAAGAC --/AA GAGCAGAGAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 0 2 278898 CASAVA_Build 7 104999515 1D TCCTGATCTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 7 278899 CASAVA_Build 7 104999994 8I CTTCTGTGCG --------/TGATTTAC TGATTTACTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 TGATTTAC 1 2 278900 CASAVA_Build 7 105001879 2I ACACACACAC --/AT GTATATATAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AT 0 1 278901 CASAVA_Build 7 105005255 4I TGGAGGCCTC ----/TGTT TGTGTGTATT 3070 het 3070 ref 54 25 20 9 TGTT 0 1 278902 CASAVA_Build 7 105013239 5D TGTTTCAATA TATAC/----- TATATGAATC 3070 het 3070 hom 39 17 21 4 TATAC 1 0 278903 CASAVA_Build 7 105015257 1I CAGAATACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 759 hom 31 2 24 5 A 10 11 278904 CASAVA_Build 7 105027842 1I AGTTCTTTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 79 het 35 0 26 9 T 9 10 278905 CASAVA_Build 7 105028323 1I TCTCAAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 326 hom 30 1 19 10 T 10 11 278906 CASAVA_Build 7 105037580 1I TCAGCCTCCC -/A GAGTAGCTGG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 0 1 278907 CASAVA_Build 7 105049578 1I TTGGTGTTTT -/G GGGGGGTTTC 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 G 6 7 278908 CASAVA_Build 7 105056634 2D TTTTTTTTTT TC/-- CCATGGTGAG 3070 het 27 hom 11 1 8 3 TC 1 0 278909 CASAVA_Build 7 105062139 1I AGGCATGAAA -/T GTACATTTCT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 0 1 278910 CASAVA_Build 7 105072771 1I GCCAGGGGAT -/G GGGGAAGGGA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 4 5 278911 CASAVA_Build 7 105099284 1D GTAATAATAG T/- TTTAAGATTT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 4 3 278912 CASAVA_Build 7 105102841 1D TACTACAGTT A/- AAAAAAAAAA 2784 het 2784 ref 30 17 6 8 A 11 10 278913 CASAVA_Build 7 105109067 4D GATAGCTGTT AACA/---- AACAATGAAA 3070 het 3070 ref 44 24 15 7 AACA 2 1 278914 CASAVA_Build 7 105123065 1D TTTCATAGTG A/- ATGTGCCTAA 3070 het 3070 ref 26 12 12 3 A 2 1 278915 CASAVA_Build 7 105126604 2D AATTAAAAAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 21 7 10 6 AT 6 5 278916 CASAVA_Build 7 105129961 1I GGGCAACTTG -/C CCAAGGCCAC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 2 3 278917 CASAVA_Build 7 105130228 2D CAGACCCACA AC/-- ACACACACAC 2671 het 2671 ref 30 12 12 6 AC 9 8 278918 CASAVA_Build 7 105130988 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1821 het 1821 ref 23 11 7 5 A 15 16 278919 CASAVA_Build 7 105131714 2I AGCTGACCCT --/CA CACCACATCT 3070 het 3070 hom 53 19 26 8 CA 1 2 278920 CASAVA_Build 7 105133013 1I CGGCCGAGTA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3030 hom 26 7 13 6 T 6 7 278921 CASAVA_Build 7 105136378 1D GTATAATATC T/- TAAGACTGCT 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 T 2 1 278922 CASAVA_Build 7 105136780 1I CTTTGGGAGG -/C CAAGGTGGGT 2717 het 2717 ref 17 9 7 1 C 1 2 278923 CASAVA_Build 7 105141484 1D GGTAAGCCTT A/- AAGATCCATG 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 A 3 2 278924 CASAVA_Build 7 105169089 1I CCTCTCCCTA -/C AACATTATAC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 C 0 1 278925 CASAVA_Build 7 105171262 1D GAAAGCAGAT A/- TGATCGCTTT 3070 het 3070 ref 55 29 21 7 A 1 0 278926 CASAVA_Build 7 105175571 1I GGGAGGCTGA -/G GTGGGCGGAT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 G 1 2 278927 CASAVA_Build 7 105177430 1D AGCACCAGAT C/- ACTTGTGGGG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 C 1 0 278928 CASAVA_Build 7 105237456 1D TCCAGACTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 T 13 12 278929 CASAVA_Build 7 105246576 1D ACCCACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2353 hom 34 14 14 7 T 15 14 278930 CASAVA_Build 7 105261287 2D GATTTTGGTT TC/-- ATGAGAGTAT 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 TC 1 0 278931 CASAVA_Build 7 105263123 2I AGGCGTGAGC --/CA CAGTGTCCAG 2759 het 2759 ref 25 10 9 6 CA 1 2 278932 CASAVA_Build 7 105269879 1D AGTAGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1266 hom 28 7 11 11 T 12 11 278933 CASAVA_Build 7 105276205 1I GTTAAATAAA -/T TTATGAAATA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 2 3 278934 CASAVA_Build 7 105279128 4I ATCTCTGTCA ----/GTCT GTCTATCTCC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 GTCT 1 2 278935 CASAVA_Build 7 105282213 2D CTTATAGAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 30 0 23 9 A 13 11 278936 CASAVA_Build 7 105282641 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2672 het 19 hom 13 1 9 3 T 15 14 278937 CASAVA_Build 7 105291597 2D CCCAAAAGGT AC/-- CAGAAAAATA 3070 het 3070 hom 57 23 33 1 AC 1 0 278938 CASAVA_Build 7 105313821 1I TTAGGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 44 3 28 13 T 11 12 278939 CASAVA_Build 7 105315941 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 620 het 620 ref 20 8 2 11 T 15 14 278940 CASAVA_Build 7 105323902 2I ATACGGCACT --/GA GAGGGAATTA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 GA 1 2 278941 CASAVA_Build 7 105332383 7D CTAATTTTTC TTTTTTT/------- TTTCGTAGAG 3070 het 3070 ref 22 10 10 4 T 10 3 278942 CASAVA_Build 7 105335904 1D GAATAGGGCC A/- GGGGCACTGG 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 A 1 0 278943 CASAVA_Build 7 105349276 2I TAGTAAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 11 13 278944 CASAVA_Build 7 105367402 1D GAGTACAGCA T/- CTTTCTAGAA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 1 0 278945 CASAVA_Build 7 105375667 8D CAGAGGTGGC AGTTTGGA/-------- AGATTGATTG 3070 hom 120 het 42 0 41 3 AGTTTGGA 1 0 278946 CASAVA_Build 7 105381381 4D TCAGAGAGAA TCCT/---- TTCTAAGCAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TCCT 1 0 278947 CASAVA_Build 7 105384301 1D GCTTGGGGTA G/- GGGGCTCCAG 3070 hom 103 het 40 0 28 13 G 5 4 278948 CASAVA_Build 7 105387109 1D ATAACAGCTT A/- AAATACATTG 3070 het 3070 ref 28 16 10 4 A 4 3 278949 CASAVA_Build 7 105387177 1I TATTTTTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 10 278950 CASAVA_Build 7 105388996 1D CGTCCTCTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 26 0 25 1 A 10 9 278951 CASAVA_Build 7 105394635 1D CCACAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 960 hom 29 3 17 9 T 12 11 278952 CASAVA_Build 7 105397885 1I ACATTCTTGA -/C CCCGCATCTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 C 3 4 278953 CASAVA_Build 7 105402204 1D TCTCCTAAGG T/- GTCACAGTTC 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 T 1 0 278954 CASAVA_Build 7 105408102 4D ATTTTTATTT TTTA/---- TTTATTTTTG 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 TTTA 2 1 278955 CASAVA_Build 7 105462097 4I GACAGACTGG ----/ATCC ATCCAGCAAA 3070 hom 129 het 50 0 42 8 ATCC 1 2 278956 CASAVA_Build 7 105462765 2D CTGTGTCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 15 11 A 16 14 278957 CASAVA_Build 7 105489937 1I TTCACAGGGG -/A TGCAGTGTTG 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 0 1 278958 CASAVA_Build 7 105495813 1I ATGTGCGCTC -/A AAAATTGTGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 4 5 278959 CASAVA_Build 7 105507855 1D TCCAGACAAA T/- TGTACAGGGA 3070 hom 163 het 62 0 55 8 T 2 1 278960 CASAVA_Build 7 105512971 1D TTAATGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 936 hom 34 2 22 10 T 14 13 278961 CASAVA_Build 7 105513849 1D CAGTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 34 1 25 8 T 12 11 278962 CASAVA_Build 7 105529121 16D TTCCCATCCG CCCCCCCCCCCCCCCC/---------------- CCCCCCCCCC 3070 het 830 hom 36 14 28 24 C 29 13 278963 CASAVA_Build 7 105529779 1I AGATTACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 159 hom 32 3 23 6 T 14 15 278964 CASAVA_Build 7 105538451 1D AAAACTTGAC A/- AAAAATATAA 3070 het 360 hom 37 1 28 8 A 6 5 278965 CASAVA_Build 7 105541862 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCCC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AG 2 1 278966 CASAVA_Build 7 105544428 12I GGAAAGTTAT ------------/GGAGTTCTCTTA GTAGCTGATA 3070 hom 147 het 54 0 48 8 GGAGTTCTCTTA 0 1 278967 CASAVA_Build 7 105546553 1D CCCTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 12 11 278968 CASAVA_Build 7 105555103 1D GTCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 10 9 278969 CASAVA_Build 7 105572862 1I CAGGCCTGGG -/T TTTTTTTTTT 1104 het 1104 ref 30 13 3 14 T 15 16 278970 CASAVA_Build 7 105574951 1I TAAAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 11 12 278971 CASAVA_Build 7 105577487 1I TACAAGCGGA -/T TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 22 10 10 2 T 10 11 278972 CASAVA_Build 7 105582201 1I CTCAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 23 2 16 5 A 15 16 278973 CASAVA_Build 7 105583589 1D CAGAACTACT G/- GCCACTGGCC 3070 hom 55 het 26 0 17 11 G 2 1 278974 CASAVA_Build 7 105599469 1I TTTCTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 11 11 T 11 12 278975 CASAVA_Build 7 105602120 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1300 het 1300 ref 36 26 3 7 T 12 11 278976 CASAVA_Build 7 105611197 12D GCCTACAGGC GCCTGCTACCTT/------------ GCCTGGCTAA 2766 het 1723 hom 16 4 9 4 GCCTGCTACCTT 1 0 278977 CASAVA_Build 7 105613573 4I CTTGGTCATG ----/ACTA ACTGACAGCT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 ACTA 0 1 278978 CASAVA_Build 7 105625983 1D TTCCTGGATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 9 8 278979 CASAVA_Build 7 105650510 1D CAAGTTCTGA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 8 7 278980 CASAVA_Build 7 105653654 1D AAACTATAAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 9 8 278981 CASAVA_Build 7 105661847 3I CAAAGAAAGA ---/AAG AAGAAGAAAC 3070 het 3070 ref 42 22 20 0 AAG 2 3 278982 CASAVA_Build 7 105668899 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 10 10 9 T 11 12 278983 CASAVA_Build 7 105671199 1I ATAATTTCTG -/T ATTACAAGTT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 0 1 278984 CASAVA_Build 7 105686516 17D GGCTGCTGAC TGATCAGGGTTGCTGAA/----------------- GGTTTTGGGG 3070 het 3070 ref 54 31 16 16 TGATCAGGGTTGCTGAA 1 0 278985 CASAVA_Build 7 105694288 1I AATTACCAAC -/T TTTGAGCAAT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 3 4 278986 CASAVA_Build 7 105698773 4D ACAAGTTTTT TTTC/---- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 TTTC 1 0 278987 CASAVA_Build 7 105707112 3I TACTTATAGG ---/GGT GGTATATGTA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 GGT 1 2 278988 CASAVA_Build 7 105712066 2I GGCTGGCCCG --/GC GGGGAAAGCC 1660 hom 19 het 8 0 7 1 GC 0 1 278989 CASAVA_Build 7 105716697 29D GTACATGAAA TAACTATCAATGGTACTAAGATACATGTT/----------------------------- TTTGTCTTTA 3070 het 3070 ref 30 19 9 7 TAACTATCAATGGTACTAAGATACATGTT 1 0 278990 CASAVA_Build 7 105717176 1I GGTGAACTTT -/A CTATTTCTTT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 A 0 1 278991 CASAVA_Build 7 105728000 1D CCTAAATAGC T/- CTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 23 14 8 2 T 1 0 278992 CASAVA_Build 7 105732198 2D CCGGGGTATG AA/-- AAAAAAAAAA 2705 het 988 hom 20 8 8 4 A 19 17 278993 CASAVA_Build 7 105736747 4I TTTCTTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 AAAC 3 4 278994 CASAVA_Build 7 105739074 2I TATGGTTATG --/GT GCTGTCATAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GT 0 1 278995 CASAVA_Build 7 105745696 1I TCCTTCTTTT -/G GTACCAGAAT 3070 het 3070 ref 59 30 27 2 G 1 2 278996 CASAVA_Build 7 105762140 1D TTGCCTGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 T 12 11 278997 CASAVA_Build 7 105765562 1D AAAAAAGAGG T/- TTTTTTGATA 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 T 7 6 278998 CASAVA_Build 7 105774084 1D TGGCTCCAAT A/- AAAAAAAAAA 2736 het 2736 ref 25 13 7 7 A 13 12 278999 CASAVA_Build 7 105777766 2I AGGTGTGTTT --/CC CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 C 7 9 279000 CASAVA_Build 7 105782284 2I ATCACAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 2959 het 2959 ref 30 16 9 5 A 10 12 279001 CASAVA_Build 7 105805348 1I GTATGCTCTG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 7 8 279002 CASAVA_Build 7 105806161 6I CTCCTGCAGC ------/ACACTT ACCGAGGTCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 ACACTT 0 1 279003 CASAVA_Build 7 105818925 4D TTTTATTAAT TAAC/---- TGAGAAAATG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 TAAC 1 0 279004 CASAVA_Build 7 105839178 1D TAATTTGAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 113 het 42 0 37 5 T 10 9 279005 CASAVA_Build 7 105863654 2D GTTCATCATA TG/-- TGTTTATACA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TG 2 1 279006 CASAVA_Build 7 105876933 3D GTGGGGGAGG AAT/--- ACAGGGTGAA 3070 hom 80 het 30 0 24 7 AAT 1 0 279007 CASAVA_Build 7 105881097 4D AACATGAGGC CAAA/---- CAAAGTTGTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CAAA 2 1 279008 CASAVA_Build 7 105882684 1D TAGATAATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 10 9 279009 CASAVA_Build 7 105884024 1D TTCCACAACA G/- TAAAGCAAAA 3070 hom 126 het 49 0 43 7 G 1 0 279010 CASAVA_Build 7 105894357 3D ATCATTGATG TTC/--- TTTTCTTCTT 3070 hom 151 het 55 0 51 5 TTC 1 0 279011 CASAVA_Build 7 105897218 1I TAGCAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 49 2 35 13 T 11 12 279012 CASAVA_Build 7 105914849 2I ACAGTTTCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 263 hom 32 1 28 3 TC 7 8 279013 CASAVA_Build 7 105916422 2D CACAGAAGAA AG/-- ATAAAAGCCA 3070 hom 90 het 36 0 30 7 AG 1 0 279014 CASAVA_Build 7 105917564 1I ATCCTTCATG -/T TGGTTGCACT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 2 279015 CASAVA_Build 7 105918907 1I ATTCAACCTT -/A AGAGGACTAG 3070 hom 78 het 28 0 25 3 A 1 2 279016 CASAVA_Build 7 105919009 13I CAAATAGGAA -------------/CAGCTCCAGTCTG CAGCTCCCAG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 CAGCTCCAGTCTG 0 1 279017 CASAVA_Build 7 105923798 1I ACATCAAAAA -/G CTTATCCACC 3070 hom 36 het 17 0 13 4 G 0 1 279018 CASAVA_Build 7 105926444 1I TCCGTATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 674 hom 30 2 22 6 T 12 13 279019 CASAVA_Build 7 105950997 1D ATATCTATAC T/- TTTAAGTTTC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 4 3 279020 CASAVA_Build 7 105961226 1D GTGGAATGTC A/- ATCAGCTAAG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 A 2 1 279021 CASAVA_Build 7 105962753 2D CTTTTAGCTT TG/-- TGTGTGTGTG 3021 hom 31 het 15 0 9 6 TG 8 7 279022 CASAVA_Build 7 105963292 1D AGAGACTGAG T/- TGGCAAGGCT 3070 hom 166 het 63 0 56 8 T 2 1 279023 CASAVA_Build 7 105981067 12I ACCCCCAAAT ------------/CTTTCCAAGTAG CATTCCAAGA 3070 hom 120 het 42 0 36 6 CTTTCCAAGTAG 0 1 279024 CASAVA_Build 7 105994990 1I TCCCAAAAGA -/T TTTTAGCACA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 4 5 279025 CASAVA_Build 7 106002428 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 15 2 10 3 A 10 11 279026 CASAVA_Build 7 106018308 1I CAACAGGAAG -/A AAGCTGAAGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 3 279027 CASAVA_Build 7 106023187 4D ATTTGAATTT TCTC/---- TCTGTTTCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 3 TC 3 1 279028 CASAVA_Build 7 106024740 1I AACTACCTGG -/A AAAAAAGACA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 6 7 279029 CASAVA_Build 7 106047607 1I AACCTCTGTG -/C CCCCCTCATC 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 C 5 6 279030 CASAVA_Build 7 106079326 1I TATTTGAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 T 9 10 279031 CASAVA_Build 7 106084179 1D TTTTGATGCA T/- TTTTTTTTTG 1086 het 1086 ref 37 30 3 5 T 10 9 279032 CASAVA_Build 7 106094417 1D GACCTACGCT A/- AAGAATGACT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 2 279033 CASAVA_Build 7 106095296 1D TTTGCATAAA T/- ACTATATACT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 1 0 279034 CASAVA_Build 7 106099421 2D TCGCCCCATT TA/-- TAAAAGGAGG 3070 hom 93 het 38 0 32 7 TA 2 1 279035 CASAVA_Build 7 106111783 1D TTCTACTACA C/- CAAGTTATTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 2 1 279036 CASAVA_Build 7 106120158 4D CTGAAGTAGG TAGA/---- TTTACAGTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 TAGA 1 0 279037 CASAVA_Build 7 106127015 1D ACAGAGAGCC A/- ACTTTATTTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 1 279038 CASAVA_Build 7 106132525 2D CTTCCAAGTT TC/-- TTACATGCTA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TC 1 0 279039 CASAVA_Build 7 106134309 4D ATTATCTTTT CTTA/---- CTTCTCAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CTTA 1 0 279040 CASAVA_Build 7 106144550 2I CTTAGACTGT --/GA GAGGAGAAAA 3070 hom 144 het 60 0 49 11 GA 1 2 279041 CASAVA_Build 7 106155025 1D ACCCTAAAAC T/- TAGAGTATAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 2 1 279042 CASAVA_Build 7 106168050 1I AATACATTTA -/T TTTTTTCAAC 3070 het 76 hom 44 1 38 5 T 6 7 279043 CASAVA_Build 7 106170518 1D TCTTTTAACA T/- TTTGCTATTA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 4 3 279044 CASAVA_Build 7 106185664 1D ACCCTGCTTT C/- TAATTCACTG 3070 hom 84 het 32 0 27 6 C 1 0 279045 CASAVA_Build 7 106188884 1I GCTAGACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2184 hom 43 9 23 11 T 14 15 279046 CASAVA_Build 7 106193232 1I AAAAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 11 12 279047 CASAVA_Build 7 106193390 1D CCCTATCTTT A/- AAAAAAAAAA 1355 het 1355 ref 30 10 5 15 A 19 18 279048 CASAVA_Build 7 106194885 2I TGTTTGTGTC --/TT TCCACAATGT 3070 hom 134 het 53 0 45 8 T 1 3 279049 CASAVA_Build 7 106197652 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 23 2 10 12 A 17 16 279050 CASAVA_Build 7 106201543 1D AGCAGTATGC T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 T 6 5 279051 CASAVA_Build 7 106206405 1I TTTGGTTTGT -/G TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 G 0 1 279052 CASAVA_Build 7 106206945 1I TGTGAAATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 9 10 279053 CASAVA_Build 7 106212007 2D GTGCCCCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 1164 het 1164 ref 44 28 5 11 TC 9 8 279054 CASAVA_Build 7 106214114 22D ATATATATAT ATATATATATATATATATATAC/---------------------- ACACATATAT 1506 het 304 hom 10 2 6 4 ATATATATATATATATATATAC 1 0 279055 CASAVA_Build 7 106219940 1I CTCAGCATAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 9 10 279056 CASAVA_Build 7 106226308 1D TACAGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 2354 hom 21 het 14 0 8 6 T 12 11 279057 CASAVA_Build 7 106226499 4I ATGGGGTTTC ----/TACT ACCATGGTCT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 TACT 0 1 279058 CASAVA_Build 7 106254550 1I CACTTTTGCT -/G GCAACGCCCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 1 2 279059 CASAVA_Build 7 106257606 1D TTTTCCACTA C/- CTACCCAAAT 3070 hom 53 het 20 0 17 5 C 2 1 279060 CASAVA_Build 7 106272677 8I TGTTTGTTTA --------/CTGCCTAC CTTCCCCTAC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 CTGCCTAC 0 1 279061 CASAVA_Build 7 106299352 4I ATCTGAACAA ----/TGTT TGTTAGTGTT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 TGTT 1 2 279062 CASAVA_Build 7 106308111 11D AACAGGAATA CCTTTGCTTTG/----------- CCTTTGCTTT 3070 hom 96 het 51 0 33 21 CCTTTGCTTTG 3 2 279063 CASAVA_Build 7 106329929 2D GTTTCCTGTC TT/-- GTGTCAAGCA 2446 het 2446 ref 33 20 6 7 T 2 0 279064 CASAVA_Build 7 106339597 2I TCCCATCACC --/AG AGATGTGTAT 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 AG 1 2 279065 CASAVA_Build 7 106339924 3I TCAGCAGGTA ---/GAT GGATTTGATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GAT 0 1 279066 CASAVA_Build 7 106340047 1D CAATTCGGGG A/- TAATCTATTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 1 0 279067 CASAVA_Build 7 106348802 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 19 2 14 3 A 13 12 279068 CASAVA_Build 7 106353733 1I GGCCTTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 681 hom 36 3 26 7 A 11 12 279069 CASAVA_Build 7 106353911 1I AGATCACCTG -/A GGTCAGGACC 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 0 1 279070 CASAVA_Build 7 106360573 1D TGCCTTTGCA T/- TATGTATCTG 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 2 1 279071 CASAVA_Build 7 106369292 1I CACGGTGGTG -/C GTGCACGCCT 3070 hom 33 het 13 0 10 3 C 0 1 279072 CASAVA_Build 7 106373541 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTCTAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 279073 CASAVA_Build 7 106374033 1D AAAATCTCTC T/- TTCACATGAT 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 T 3 2 279074 CASAVA_Build 7 106377459 1D TTTTTTTTTT G/- GAGACTGAGT 2809 het 1942 hom 23 9 8 6 G 2 1 279075 CASAVA_Build 7 106379769 3D GTGCAGCTTA AAG/--- AAGAAGAGCC 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 AAG 3 2 279076 CASAVA_Build 7 106385545 2I AGAAGTCTCC --/CT CTCTGCAGCT 3070 het 3070 hom 57 20 28 9 CT 2 3 279077 CASAVA_Build 7 106393350 1D ATGACAGAGG A/- AGTCAGATAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 A 2 1 279078 CASAVA_Build 7 106400915 7D TGTTTTTTTG TTTTTGT/------- TTTTTGTTTT 2316 het 2316 ref 27 17 6 9 TTTTTGT 3 2 279079 CASAVA_Build 7 106403723 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 334 hom 27 1 20 6 A 16 15 279080 CASAVA_Build 7 106407553 5D CAGGGCCTCT CCCTC/----- CCCTCCCCTC 3070 het 2449 hom 31 9 14 8 CCCTC 3 2 279081 CASAVA_Build 7 106411033 2D CAGGAGCAGT AG/-- TACAGGATAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 7 AG 1 0 279082 CASAVA_Build 7 106432132 2I TAAAAAACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 AC 7 8 279083 CASAVA_Build 7 106441831 1I TATATTTTTG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 7 8 279084 CASAVA_Build 7 106448386 1I CACCTAGTTA -/C TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 13 2 C 0 1 279085 CASAVA_Build 7 106451641 1I AAGTCATCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 14 8 18 A 9 10 279086 CASAVA_Build 7 106453036 1D AATATCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 12 11 279087 CASAVA_Build 7 106458120 1D TTTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 24 2 15 7 T 14 13 279088 CASAVA_Build 7 106465924 1D TTTTCCTATT C/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 C 1 0 279089 CASAVA_Build 7 106476079 1I GGTTTTCCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 55 21 23 11 T 9 10 279090 CASAVA_Build 7 106486969 1I AAAAAAGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 9 10 279091 CASAVA_Build 7 106487742 1I GAAAATATAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 7 8 279092 CASAVA_Build 7 106501002 2D CGTCTTCCTC AT/-- GTGTTCAGTG 3070 het 3070 ref 22 9 8 6 AT 1 0 279093 CASAVA_Build 7 106509731 1I CAGCAGCTTA -/C CCAGACGTGC 3070 het 3070 hom 42 13 26 3 C 2 3 279094 CASAVA_Build 7 106514897 1D ACATTTAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 10 9 279095 CASAVA_Build 7 106521194 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1545 hom 20 5 11 4 T 12 11 279096 CASAVA_Build 7 106535624 1I GGCGTGAGAT -/G GCTGTGCCCG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 G 1 2 279097 CASAVA_Build 7 106546137 1D TCATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 18 16 14 A 13 12 279098 CASAVA_Build 7 106556076 2I TTGTAAGCTG --/AC ATCACCCTGG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AC 0 1 279099 CASAVA_Build 7 106563386 1D CTATCAAATT A/- TGAAGGAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 A 1 0 279100 CASAVA_Build 7 106574759 1D ACCTGGAGTA T/- TTTTTTAAAA 2728 het 1902 hom 16 6 7 3 T 7 6 279101 CASAVA_Build 7 106578268 2D GTAAAAGAAC AG/-- AGTGCTAGTA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 AG 2 1 279102 CASAVA_Build 7 106606106 2D AGGGTGAAAT AA/-- AAGAGACAAC 3070 het 3070 ref 39 19 19 1 A 4 2 279103 CASAVA_Build 7 106606913 1D GGTACAAGTG A/- AAAAAAGAGT 3070 het 3070 hom 45 19 25 1 A 7 6 279104 CASAVA_Build 7 106615320 8D TGCTTTACTC TTCACTTT/-------- AGTGAAGTTC 3070 het 3070 ref 41 21 18 5 TTCACTTT 1 0 279105 CASAVA_Build 7 106621404 1I TTAGTAAATG -/T TATACAGTAG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 1 2 279106 CASAVA_Build 7 106626365 4I TTCAATGAAT ----/AAAG AAATTCTCAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 AAAG 0 1 279107 CASAVA_Build 7 106629920 4I GTCATCATAA ----/TCTT TCTTTATGGT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 TCTT 1 2 279108 CASAVA_Build 7 106633636 1D AGTGTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 931 hom 32 5 17 10 T 16 15 279109 CASAVA_Build 7 106634420 2I CATGTAGAAG --/AA AGATCAGAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 1 3 279110 CASAVA_Build 7 106634674 4I ATTGAGAAAA ----/AAAC AAAACACGAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AAAC 0 1 279111 CASAVA_Build 7 106642178 1D AGGCTGCTAA T/- TTAATAAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 T 3 2 279112 CASAVA_Build 7 106646430 1D TTGAAACTGT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 8 7 279113 CASAVA_Build 7 106658597 1D TCATGAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 10 9 279114 CASAVA_Build 7 106659520 3I CAAATTTAAT ---/GAA GAAGGGGATA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 GAA 1 2 279115 CASAVA_Build 7 106666158 1I TGCGTATATC -/T TTTTGACATA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 4 5 279116 CASAVA_Build 7 106670694 1I GGAAAATATA -/C CCAAGCAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 C 2 3 279117 CASAVA_Build 7 106671416 2I TCATCACCAC --/AT GTCACATACA 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 AT 0 1 279118 CASAVA_Build 7 106702636 1D GAAAGCTATC T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 7 6 279119 CASAVA_Build 7 106715024 1I TGCAGTTGAG -/A AAAAATTTCT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 A 5 6 279120 CASAVA_Build 7 106718529 2I TAAAGACAGG --/GT GTCTCACTAT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 GT 1 2 279121 CASAVA_Build 7 106735492 3I ATTGGGTACA ---/GTG CCCACTGCTT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 GTG 0 1 279122 CASAVA_Build 7 106739858 2I TTTAGCTTAT --/AA GTCTGTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 0 2 279123 CASAVA_Build 7 106743247 2D CTAATAGAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2728 hom 40 9 21 11 T 13 11 279124 CASAVA_Build 7 106744467 1I CAATGGAGAT -/C GCACCACTGC 3070 het 1695 hom 17 5 10 2 C 0 1 279125 CASAVA_Build 7 106757067 1I AGGTGGATTT -/G GGGGTAAGAT 3070 het 3070 hom 50 15 28 7 G 4 5 279126 CASAVA_Build 7 106759858 1I GATCTATGCT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 7 8 279127 CASAVA_Build 7 106761964 5D TTATGTTAAG TAAGA/----- TAAGCCAGGA 3070 het 3070 ref 49 26 21 4 TAAGA 1 0 279128 CASAVA_Build 7 106774094 1I AAGGCAAGGA -/C TAGGTCACTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 C 0 1 279129 CASAVA_Build 7 106781550 1I TCATGTGGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 8 9 279130 CASAVA_Build 7 106794775 1I TCCTACATTT -/G TGTCTCATTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 G 0 1 279131 CASAVA_Build 7 106800619 4I ATTTTTAAAC ----/ATTA TTTATTTCAT 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 ATTA 0 1 279132 CASAVA_Build 7 106808814 2D CTTTAAAATT TC/-- TGAGTCATTT 3070 het 3070 hom 26 12 11 5 TC 1 0 279133 CASAVA_Build 7 106821650 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1163 hom 16 5 10 1 T 11 10 279134 CASAVA_Build 7 106831581 3D TAGGTGACTC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 TAT 7 6 279135 CASAVA_Build 7 106840394 1D ATAACTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2576 hom 41 9 19 13 A 12 11 279136 CASAVA_Build 7 106846295 1D CATGGCTTGC T/- TTTTTTTTTT 2042 het 2042 ref 23 14 6 3 T 15 14 279137 CASAVA_Build 7 106849447 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2135 het 2135 ref 27 12 7 8 A 15 14 279138 CASAVA_Build 7 106851594 2D TAATGAAAAG AA/-- TGCAGGAAAA 3070 het 3070 ref 45 25 15 6 A 2 0 279139 CASAVA_Build 7 106870174 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2675 hom 29 9 13 7 T 12 11 279140 CASAVA_Build 7 106881668 4I GAAATTTACT ----/CAAA CAGATAAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 CAAA 0 1 279141 CASAVA_Build 7 106884904 1I AACTTTCCAG -/A GCTGAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 0 1 279142 CASAVA_Build 7 106887481 1I TGGCTCAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 11 11 A 13 14 279143 CASAVA_Build 7 106901637 1I AATTGAAAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 279144 CASAVA_Build 7 106903865 10D GCAATGATTT TAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 2932 hom 35 12 17 7 TAAAAAAAAA 1 0 279145 CASAVA_Build 7 106903986 1I ACCAGGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 9 11 A 10 11 279146 CASAVA_Build 7 106909823 1D AAAAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 937 hom 18 5 9 4 T 11 10 279147 CASAVA_Build 7 106910286 1D TGCCTTCTTG A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 8 7 279148 CASAVA_Build 7 106911572 1I TGGTTATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 11 12 279149 CASAVA_Build 7 106915845 1I CCATTTATTT -/A AAAAAAATTT 2543 het 2543 ref 19 9 9 1 A 7 8 279150 CASAVA_Build 7 106923634 1I TTTTTAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 11 12 279151 CASAVA_Build 7 106928549 3D CTCCCTGCCC TGT/--- TGTTTATACA 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 TGT 2 1 279152 CASAVA_Build 7 106930618 3D AGTTTACAAG TCT/--- TATCTTCTCC 3070 het 3070 ref 41 25 12 6 TCT 1 0 279153 CASAVA_Build 7 106931638 1D TTTGACTTTC T/- TTTTCCAATT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 5 4 279154 CASAVA_Build 7 106959138 4I TGTCATTTTG ----/TCTT TATTTATAAG 3070 het 2522 hom 25 7 14 4 TCTT 0 1 279155 CASAVA_Build 7 106959237 4D TAAAAATAAA TACT/---- TAATCTTTCC 1650 het 1650 ref 29 24 4 1 TACT 1 0 279156 CASAVA_Build 7 106960921 1D TGAAAATGCC A/- AAAACCAGAA 3070 het 3070 ref 33 19 13 3 A 5 4 279157 CASAVA_Build 7 106997331 2D AGTTCTGCAC AT/-- GTTTTGTAAG 3070 het 3070 ref 58 31 18 9 AT 1 0 279158 CASAVA_Build 7 107004305 1D TCTTTTAATT G/- GGGGGGGAAG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 G 8 7 279159 CASAVA_Build 7 107007052 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1133 hom 26 4 14 8 A 16 17 279160 CASAVA_Build 7 107026388 2I AGTGAAATTC --/CT CTCTTATGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CT 2 3 279161 CASAVA_Build 7 107028775 1D CTTCTACATT A/- AAAAAAAAAG 1262 het 1262 ref 34 27 3 4 A 10 9 279162 CASAVA_Build 7 107031138 1D TTCTTAGGGC T/- TGCCAATCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 1 279163 CASAVA_Build 7 107057341 1D ACTTGATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 T 13 12 279164 CASAVA_Build 7 107106419 1D TGCTCTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 14 13 279165 CASAVA_Build 7 107112618 13D CATTAGTTGG TTTAGGGAACTCA/------------- TTTCTTCTGC 3070 het 3070 ref 42 28 16 4 TTTAGGGAACTCA 1 0 279166 CASAVA_Build 7 107133324 1I CCATGACTGG -/T TTAAATTAAA 3070 het 3070 ref 58 29 20 9 T 2 3 279167 CASAVA_Build 7 107141767 1D GTCCAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 30 0 23 7 T 12 11 279168 CASAVA_Build 7 107146066 1I TTAAAATCTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 49 27 16 6 T 8 9 279169 CASAVA_Build 7 107146676 1D GAGAAAAAGG T/- AAGAGAACCA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 1 0 279170 CASAVA_Build 7 107149520 1D AAGTATTAGA T/- TTTTCCATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 5 4 279171 CASAVA_Build 7 107151897 3I CTCTTTTCAA ---/CTT CTTCTACCCA 3070 hom 110 het 40 0 36 4 CTT 1 2 279172 CASAVA_Build 7 107159596 1I GGTTTGAAAT -/A ATTTGCCTTT 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 A 1 2 279173 CASAVA_Build 7 107165983 4I TCCTATTACC ----/TTTA TTTAAGTCAA 3070 het 3070 ref 26 18 8 0 TTTA 1 2 279174 CASAVA_Build 7 107167050 1I TATTTAAAGT -/C CCCTTTAATA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 3 4 279175 CASAVA_Build 7 107167851 29D TGGCATGGAG TGGCAGCTGAGGTTAGGGTCAGGGGCCCT/----------------------------- TGAACAAAAG 3070 hom 83 het 28 0 26 6 TGGCAGCTGAGGTTAGGGTCAGGGGCCCT 1 0 279176 CASAVA_Build 7 107168377 1D CCTGGATCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 33 2 27 4 T 13 12 279177 CASAVA_Build 7 107174092 1D ACCTATTTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 8 7 279178 CASAVA_Build 7 107174603 1I TATTCAAGAT -/A AAAAAATCCC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 6 7 279179 CASAVA_Build 7 107176189 3D TCTTTTTCTC CTT/--- CTTACTCTTT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 CTT 2 1 279180 CASAVA_Build 7 107178547 8D TTGTGATTGA GACCATAT/-------- GGTCCACAAA 3070 het 3070 hom 37 18 19 6 GACCATAT 1 0 279181 CASAVA_Build 7 107179090 1I TGTATTAAAA -/G GTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 G 1 2 279182 CASAVA_Build 7 107188585 5D TAATAAACTT TTTTG/----- TTTTAAGTCA 3070 het 3070 ref 50 22 22 11 TTTTG 1 0 279183 CASAVA_Build 7 107224467 3D ACCTTAGGAT GAA/--- GAAGACTTCA 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 GAA 2 1 279184 CASAVA_Build 7 107240298 1D TTACTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 13 12 279185 CASAVA_Build 7 107255134 1I TTCTCTTCTC -/T AACACCTCAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 0 1 279186 CASAVA_Build 7 107270253 4I CTTATTAATT ----/AATA ATTTACTGAC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AATA 0 1 279187 CASAVA_Build 7 107319069 1I CTGGCGGAGG -/C CGGGCGCCTG 3070 hom 45 het 18 0 12 6 C 1 2 279188 CASAVA_Build 7 107369337 1D CTTTCTCGGA T/- TTTTTTTTTT 912 het 912 ref 30 19 3 8 T 15 14 279189 CASAVA_Build 7 107375665 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1468 het 665 hom 25 5 4 16 T 19 18 279190 CASAVA_Build 7 107404874 1I CTTGACCACT -/C CCAGCTCTCA 3070 het 2523 hom 29 10 11 8 C 2 3 279191 CASAVA_Build 7 107406329 1I CTTATTTTAG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 8 9 279192 CASAVA_Build 7 107417708 1I AGTTTTTTGT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 G 1 2 279193 CASAVA_Build 7 107427377 3I TCTTTAGGCC ---/CTG CTATCTGTGA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 CTG 0 1 279194 CASAVA_Build 7 107427880 1I ACCAGAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 13 14 279195 CASAVA_Build 7 107433101 1D GAGGGAGATC T/- TGAAGCATAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 2 1 279196 CASAVA_Build 7 107442126 5D GTTTAGCTGT GTTGA/----- GTTGAGAAAG 3070 het 3070 hom 49 17 24 11 GTTGA 2 1 279197 CASAVA_Build 7 107449696 4D GATACAAGAC AGAG/---- AGACAGCTGC 3070 het 3070 ref 45 21 19 9 AG 3 1 279198 CASAVA_Build 7 107450987 4D CGTGCAAAAA TAGT/---- TAGTATGAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TAGT 2 1 279199 CASAVA_Build 7 107460079 1D CCAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2470 hom 17 8 8 1 A 12 11 279200 CASAVA_Build 7 107496202 4I TACCTACTAC ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 TTTA 1 2 279201 CASAVA_Build 7 107498808 1D AAATGTGCTC A/- AGTCTCTCCC 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 A 2 1 279202 CASAVA_Build 7 107499028 1D TCTCATCAGC A/- CCCCCCTAAC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 A 1 0 279203 CASAVA_Build 7 107515413 1I CTCCTCAGCA -/C TTTACCTCTC 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 C 0 1 279204 CASAVA_Build 7 107518780 1I TCGAATTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 35 1 26 8 T 10 11 279205 CASAVA_Build 7 107522259 1D ATTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 9 7 T 12 11 279206 CASAVA_Build 7 107531968 1I TTTCATTTTT -/A AAAGTTAAAC 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 3 4 279207 CASAVA_Build 7 107534102 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 12 11 279208 CASAVA_Build 7 107534318 1I AAACACACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 16 11 T 11 12 279209 CASAVA_Build 7 107538653 1I TCTAAAATCT -/C CTAAAGGAAA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 C 1 2 279210 CASAVA_Build 7 107540181 1I ACCATGTTGG -/C CAGGCTGGGT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 C 1 2 279211 CASAVA_Build 7 107552346 1I TTTAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 A 10 11 279212 CASAVA_Build 7 107570342 2I TTTACTCTAG --/AT ATGTTTCCTA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 AT 1 2 279213 CASAVA_Build 7 107570643 3D CTCTTGTGTG AAA/--- AAAAAAAAGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 11 8 279214 CASAVA_Build 7 107571492 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 24 1 15 8 A 15 14 279215 CASAVA_Build 7 107571750 2I TCCTGAGTCC --/CA CAGTTTCTCT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 CA 1 2 279216 CASAVA_Build 7 107580224 1I CCTGGGAGGG -/T TTTCAAAGAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 3 4 279217 CASAVA_Build 7 107598960 2D GAAACTACAA CT/-- CTTATCTAGC 3070 hom 72 het 27 0 23 4 CT 2 1 279218 CASAVA_Build 7 107606909 1I GTCTCCCTAA -/G GGACTACAGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 2 3 279219 CASAVA_Build 7 107608876 1I TGCTAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 35 1 28 6 A 11 12 279220 CASAVA_Build 7 107609785 1D TTGTGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 43 1 31 11 T 12 11 279221 CASAVA_Build 7 107610975 2I ATGGAAACTT --/AC AGACTGTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AC 0 1 279222 CASAVA_Build 7 107611091 4I CATGTATGGC ----/TCTA TCTAAAATAG 3070 hom 117 het 40 0 39 1 TCTA 1 2 279223 CASAVA_Build 7 107611793 2D TATGTATCTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TA 8 7 279224 CASAVA_Build 7 107614732 2D CAAGGAAGGT AC/-- CCTGTGAATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AC 1 0 279225 CASAVA_Build 7 107616060 2D CTGAGTCCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 53 het 27 0 19 8 TG 10 9 279226 CASAVA_Build 7 107616744 5D ATTGTCCTTC CTTAT/----- CTTATTTCCT 3070 hom 111 het 40 0 38 5 CTTAT 2 1 279227 CASAVA_Build 7 107618580 3D AATTTGTAGA ATG/--- ATATTAGAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 ATG 1 0 279228 CASAVA_Build 7 107622757 1D GCTTATAGAA C/- CCCCCCACTA 3070 hom 78 het 32 0 26 9 C 7 6 279229 CASAVA_Build 7 107623301 2I GTCTCACAAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 26 0 17 9 A 9 11 279230 CASAVA_Build 7 107626925 1D CTTTTAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 9 8 279231 CASAVA_Build 7 107637926 3D ACCCAATGTT TTG/--- TTTTGTTTTT 1161 het 1143 hom 22 4 12 6 TTG 1 0 279232 CASAVA_Build 7 107642177 1I CTCTTCTCTC -/T TTTCTTCTTT 2075 hom 18 het 8 0 7 1 T 3 4 279233 CASAVA_Build 7 107644725 7I TCCTCATCTT -------/AAAGACC TGTGGATTTA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 AAAGACC 0 1 279234 CASAVA_Build 7 107649623 1I TGGTTCAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 27 1 21 5 A 13 14 279235 CASAVA_Build 7 107651985 1I TGGGGACAAC -/A ATTATAGCCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 1 2 279236 CASAVA_Build 7 107656006 1I CATCTAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 11 12 279237 CASAVA_Build 7 107658406 1I AAAACTCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 36 2 28 6 T 11 12 279238 CASAVA_Build 7 107680331 4D TAGGAGATAG ATAA/---- ATCTCAGTGT 3070 hom 111 het 39 0 38 4 ATAA 1 0 279239 CASAVA_Build 7 107691848 1I AGTAGAGATA -/G GGTTTCACCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 2 3 279240 CASAVA_Build 7 107695696 23I AGGATTTTTA -----------------------/AACACTGAAGCTTATATTTAGCC ATTTTCTCAT 3070 hom 111 het 34 0 37 1 AACACTGAAGCTTATATTTAGCC 0 1 279241 CASAVA_Build 7 107707984 10I AGGAAGAGGC ----------/TTCCTGTTTA TTCATATGTG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 TTCCTGTTTA 0 1 279242 CASAVA_Build 7 107708519 1I AATATCAAGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 279243 CASAVA_Build 7 107710754 6D TTCTGTAATC AAAGTT/------ AAAACTGTCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAAGTT 1 0 279244 CASAVA_Build 7 107714315 4D AAATCCTGTG AAGT/---- AAGTGTTTCC 3070 het 3070 hom 46 20 26 3 AAGT 2 1 279245 CASAVA_Build 7 107715336 2D CCAATAACAC AT/-- GAGATACCAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AT 1 0 279246 CASAVA_Build 7 107751950 1I CATGATCCTG -/T GGGGTGCCAC 3070 hom 111 het 44 0 36 8 T 0 1 279247 CASAVA_Build 7 107752834 1I GCTAACCTAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 322 hom 37 1 29 7 A 8 9 279248 CASAVA_Build 7 107766232 4D AGAGGAAAGT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 GA 7 5 279249 CASAVA_Build 7 107766295 17D ACAGAGAGGA GAGAGACACAGAGAGGG/----------------- GAGAGACACA 3070 hom 45 het 22 0 16 10 GAGAGACACAGAGAGGG 1 0 279250 CASAVA_Build 7 107768069 1I TATATTGATG -/T TTTACAAGGG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 3 4 279251 CASAVA_Build 7 107774586 4I ATCATATGTT ----/TAAA TAACACTTTA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TAAA 0 1 279252 CASAVA_Build 7 107776420 1I ATGGTGAAAC -/T TTTATCTCCA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 3 4 279253 CASAVA_Build 7 107776586 1D CCATCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1404 het 358 hom 23 2 5 16 A 17 16 279254 CASAVA_Build 7 107778375 2D CAAATGCTCA TC/-- TCAGAGTTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TC 2 1 279255 CASAVA_Build 7 107781167 1I ACCCAGATAA -/T TTTTAAATTT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 T 4 5 279256 CASAVA_Build 7 107782575 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1099 het 1099 ref 18 14 3 1 A 12 11 279257 CASAVA_Build 7 107783624 1D TACAGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 766 hom 37 4 13 20 T 16 15 279258 CASAVA_Build 7 107785630 1I TATGGTAGGG -/A AGGGTGGGGA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 1 2 279259 CASAVA_Build 7 107786143 1D TTCCTACGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 833 hom 37 2 29 7 T 11 10 279260 CASAVA_Build 7 107789575 4D TCCTATTGGC CTTA/---- CTTCTCTGTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 CTTA 1 0 279261 CASAVA_Build 7 107798565 3D GCCGTCATAT TAA/--- TAATATTTCT 3070 het 3070 ref 34 20 13 4 TAA 2 1 279262 CASAVA_Build 7 107800054 1D ACAACAACAA C/- AAAAAATCTG 3070 het 535 hom 39 2 31 7 C 1 0 279263 CASAVA_Build 7 107802101 1I AAGCACCTAA -/G GGTTTAATGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 3 279264 CASAVA_Build 7 107804726 1D TACCTGTAGT C/- CTAGCTACTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 C 2 1 279265 CASAVA_Build 7 107808839 2I CGTATGTAGC --/TA TATATATGTG 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 TA 3 4 279266 CASAVA_Build 7 107810819 2I CACACGCTCT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 50 18 16 16 CA 8 9 279267 CASAVA_Build 7 107813587 4D TATGGAGAGA GAGG/---- GAGGGAGGGA 1379 het 1379 ref 25 8 5 12 GAGG 5 4 279268 CASAVA_Build 7 107831935 3I GGCTTGCTTC ---/CTT CTTCTCAGTT 3070 hom 117 het 44 0 38 6 CTT 1 2 279269 CASAVA_Build 7 107833651 2I TTTTTTTTTT --/TA AATTTAAAAA 1568 het 1568 ref 22 9 6 7 TA 0 1 279270 CASAVA_Build 7 107838689 1I CTGTTTTTTT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 7 8 279271 CASAVA_Build 7 107839939 1D TAAATTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 23 0 18 5 A 11 10 279272 CASAVA_Build 7 107840083 4I TCATAGTCAC ----/TTAT TTTATTGTAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TTAT 0 1 279273 CASAVA_Build 7 107840875 1I AATACTTCCT -/A ACCTTTCATC 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 A 1 2 279274 CASAVA_Build 7 107844267 1D ACAAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 11 10 279275 CASAVA_Build 7 107847232 6D GGCAGTATAT ATAGAG/------ TTTGAGGTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 6 ATAGAG 1 0 279276 CASAVA_Build 7 107852496 2D ACTATAGCTC TA/-- TGAGTCCAAT 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 TA 1 0 279277 CASAVA_Build 7 107856613 5D TGACCTAAAA TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 hom 66 het 28 0 22 6 TTTTC 3 2 279278 CASAVA_Build 7 107862715 1I ACATGGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 920 hom 32 2 25 5 A 10 11 279279 CASAVA_Build 7 107863915 2D TACAGAGATT AA/-- AAGATTCTTC 3070 het 3029 hom 22 9 10 3 A 4 2 279280 CASAVA_Build 7 107865712 1D TATAAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 A 14 13 279281 CASAVA_Build 7 107870643 6D AGATTCTCAT TAGTTG/------ TAGTTGCTCC 3070 het 3070 ref 32 15 16 1 TAGTTG 2 1 279282 CASAVA_Build 7 107870859 1I CAATTAGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 10 11 279283 CASAVA_Build 7 107872052 3I CTGTATTCTC ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 9 12 279284 CASAVA_Build 7 107877586 1I TAGAAATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 12 13 279285 CASAVA_Build 7 107877892 1I ACAGTATGTG -/C AGTACAGGAG 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 C 0 1 279286 CASAVA_Build 7 107878224 4I CATAAGAATA ----/TTTC TTTCTATTTT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 TTTC 1 2 279287 CASAVA_Build 7 107878295 1I TTTTGGCAGT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 A 7 8 279288 CASAVA_Build 7 107879091 1I ACGATGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 9 10 279289 CASAVA_Build 7 107880089 1I TTAATGCTGT -/A GGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 29 8 15 6 A 0 1 279290 CASAVA_Build 7 107884812 4D ATTATGGAGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1256 hom 31 7 11 14 T 18 14 279291 CASAVA_Build 7 107886778 2D TTAAGTAATT TG/-- GGGCTGGGTA 3070 het 3070 hom 37 17 20 0 TG 1 0 279292 CASAVA_Build 7 107893865 1D ATTCACGTTC T/- TTTTAAAATT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 5 4 279293 CASAVA_Build 7 107898067 8D AAAAAAAAAA AAAAAAAG/-------- AAAGAAAGAA 1133 het 1133 ref 29 13 7 12 AAAAAAAG 1 0 279294 CASAVA_Build 7 107908659 1D AATACAGTAT G/- GGACTTCTTT 3070 het 3070 ref 48 28 15 5 G 3 2 279295 CASAVA_Build 7 107924490 1I CCTTATGATG -/A TAAGATTTCC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 0 1 279296 CASAVA_Build 7 107925814 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 A 11 10 279297 CASAVA_Build 7 107926617 1I TCAAATTGTG -/C CTTGATAATG 3070 het 3070 ref 43 27 12 4 C 1 2 279298 CASAVA_Build 7 107932106 1D CCAATGGAAG A/- TGTAAAAGAC 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 A 1 0 279299 CASAVA_Build 7 107949223 4D TAAAACAAAT AATA/---- AACGTAATGT 3070 het 3070 hom 42 14 23 8 AATA 1 0 279300 CASAVA_Build 7 107958507 3D TGAGGAGTCC TGT/--- TGTTGTCATA 3070 het 3070 hom 34 13 16 9 TGT 3 2 279301 CASAVA_Build 7 107963440 14D TCTTTAACAT GTTTTCCTAACAGA/-------------- TAATAATCCC 3070 het 3070 ref 36 22 14 5 GTTTTCCTAACAGA 1 0 279302 CASAVA_Build 7 107978150 1I CTTTGCTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 T 9 10 279303 CASAVA_Build 7 107980485 2D GTCTCAGGGG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 17 16 6 A 11 9 279304 CASAVA_Build 7 107989960 5D TTTCATCTGT ATTAA/----- ATTAAGTATT 3070 het 3070 ref 28 18 8 4 ATTAA 2 1 279305 CASAVA_Build 7 107990692 6D CTACTAAGAA ACAGAT/------ ACAAACTGTA 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 ACAGAT 1 0 279306 CASAVA_Build 7 108004421 14D GTGAAAGACA GAGGAGAAAACTAT/-------------- GATTCTAAGC 3070 hom 104 het 37 0 35 3 GAGGAGAAAACTAT 1 0 279307 CASAVA_Build 7 108005754 4D GGGCTGTCAC CAGA/---- CAGTCAATCT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 CAGA 1 0 279308 CASAVA_Build 7 108033491 1I GATATTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 35 1 25 9 A 14 15 279309 CASAVA_Build 7 108036165 3D ATTTACCTTG TTC/--- TATTGTTTGG 3070 het 3070 ref 49 31 13 10 TTC 1 0 279310 CASAVA_Build 7 108039361 10I GGAGCGTTTA ----------/CAGATAAACT GTAAACTAAC 3070 het 3070 hom 52 21 25 6 CAGATAAACT 0 1 279311 CASAVA_Build 7 108053991 4D AGACCAATAG TTTA/---- TTTACTGTTT 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 TTTA 2 1 279312 CASAVA_Build 7 108090996 1D GATGTGGCTC T/- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 30 17 3 10 T 15 14 279313 CASAVA_Build 7 108166052 1D TTGCTCTTGA G/- GGCTACCTGA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 G 3 2 279314 CASAVA_Build 7 108168018 1D CTCATTGTGG T/- TTTTGATTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 5 4 279315 CASAVA_Build 7 108169825 1I ATTACTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 239 hom 41 1 31 9 T 11 12 279316 CASAVA_Build 7 108174086 1I TTGTCCTGCC -/T TGCTTTTCTC 3070 hom 84 het 34 0 27 7 T 1 2 279317 CASAVA_Build 7 108194068 3I TTCTATGTCT ---/ATG CCACCACAGA 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 ATG 0 1 279318 CASAVA_Build 7 108228766 1D TTAAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 2388 het 1913 hom 29 9 9 11 T 17 16 279319 CASAVA_Build 7 108251110 3I ACCAGGGCAT ---/AAG AAGATTTCCG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAG 1 2 279320 CASAVA_Build 7 108255871 3D TTGAGTAATT AGG/--- ATGTCATGGG 3070 hom 117 het 44 0 40 6 AGG 1 0 279321 CASAVA_Build 7 108256224 1D CCATGCCCGG C/- TAATTTATGA 3070 hom 59 het 32 0 25 9 C 1 0 279322 CASAVA_Build 7 108266214 1D AAATAGTGCA T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 T 7 6 279323 CASAVA_Build 7 108267443 23D TATATAAAAC ATATATATATATATAAAACATAT/----------------------- ATATATATAT 2995 hom 18 het 6 0 7 0 ATATATATATATATAAAACATAT 1 0 279324 CASAVA_Build 7 108272931 23I GTATTGTAAA -----------------------/ACATTTTATCATATTGGCTTATG GGATTCTGGA 3070 hom 72 het 25 0 25 2 ACATTTTATCATATTGGCTTATG 0 1 279325 CASAVA_Build 7 108281800 1I ATGCCCGTGG -/C CACTCCCTAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 1 2 279326 CASAVA_Build 7 108286568 3I CATTTCTTTT ---/TTC TTCTTCTTCA 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 TTC 3 4 279327 CASAVA_Build 7 108288681 101D ATCTATATGG CTTGATTTAATCTAGGTAATTCAGAAGTAATCTAGCCTCTGAATTTTTCTGTGTTTGTTTTGCTTCATTTGTTTACGAGGGAGTGAATCTTCATCCTAATC/----------------------------------------------------------------------------------------------------- CTGAGAGAGG 3070 hom 75 het 20 0 24 5 CTTGATTTAATCTAGGTAATTCAGAAGTAATCTAGCCTCTGAATTTTTCTGTGTTTGTTTTGCTTCATTTGTTTACGAGGGAGTGAATCTTCATCCTAATC 1 0 279328 CASAVA_Build 7 108292293 4I ACCCACAATG ----/GCTT GCTTCCTGTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GCTT 1 2 279329 CASAVA_Build 7 108295406 1D AAATGCTTGG A/- AAGCTTGTTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 3 2 279330 CASAVA_Build 7 108313414 2I AACACTCGAA --/AG AGAAAACACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AG 1 2 279331 CASAVA_Build 7 108318066 3I AAAATAAAAT ---/ATA ATAACAAAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATA 1 2 279332 CASAVA_Build 7 108319805 1I TGCCATACAC -/A AAATCTTCTC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 3 4 279333 CASAVA_Build 7 108322024 1D GCAGTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 23 0 20 3 T 11 10 279334 CASAVA_Build 7 108323531 4I GGGACAGAGA ----/AAGG AAGGAAGGAA 3070 hom 66 het 29 0 21 8 AAGG 2 3 279335 CASAVA_Build 7 108324722 1D TTTTTTACTC T/- TACTTGCAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 2 1 279336 CASAVA_Build 7 108325188 4I AATATAAAAC ----/AAGT AAGGAAAAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AAGT 0 1 279337 CASAVA_Build 7 108364193 1D CACTTATAGC T/- AATCTTTAAA 3070 hom 126 het 46 0 42 6 T 1 0 279338 CASAVA_Build 7 108375873 4I TTTCAATAAG ----/TAAC TGTCAAATAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 TAAC 0 1 279339 CASAVA_Build 7 108403518 3D AAGTTCAATC ATT/--- ATTATTATCA 3070 het 3070 ref 45 24 17 6 ATT 3 2 279340 CASAVA_Build 7 108426693 3I TTAATTTTTC ---/TCT TCTTGATTTT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 TCT 1 2 279341 CASAVA_Build 7 108433516 1I GGGGGAGCTA -/T TTTTTTGAAT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 T 6 7 279342 CASAVA_Build 7 108437943 1I TTAACATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 26 1 18 7 T 11 12 279343 CASAVA_Build 7 108451560 5D CAGCAAAGAG AAATT/----- AAACCAAATG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 AAATT 1 0 279344 CASAVA_Build 7 108463079 1D TGTGAGTGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 10 9 279345 CASAVA_Build 7 108471543 1I CAATTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 A 10 11 279346 CASAVA_Build 7 108472819 1I TTATCAGTGA -/G AATTTTTTTT 3070 hom 132 het 50 0 44 6 G 0 1 279347 CASAVA_Build 7 108474589 17I ATAAATAAAT -----------------/GCTCAATTTGTAAAAGA GCTTATACAC 3070 hom 99 het 37 0 33 6 GCTCAATTTGTAAAAGA 0 1 279348 CASAVA_Build 7 108483483 2I GCAAGAATAC --/CA CAGATTCCCA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 CA 1 2 279349 CASAVA_Build 7 108500225 2D TATATATTTT AC/-- ACACATATAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AC 3 2 279350 CASAVA_Build 7 108512809 9I ATCTGATCTT ---------/TGACAAACC TGACAAACAC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 TGACAAACC 0 1 279351 CASAVA_Build 7 108516028 1D ATTAAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 21 0 14 8 A 11 10 279352 CASAVA_Build 7 108518071 4I CCAACACCTT ----/TTTG TTTAAGCACT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TTTG 0 1 279353 CASAVA_Build 7 108518251 1D AAAAAACAAA T/- TTTTTTGAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 7 6 279354 CASAVA_Build 7 108526529 1D TGTGAGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 590 hom 33 2 26 6 T 13 12 279355 CASAVA_Build 7 108536090 1I TTCTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 10 11 279356 CASAVA_Build 7 108540417 1I AGAAAATTAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 8 9 279357 CASAVA_Build 7 108543076 2D TGGCCGGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 131 hom 46 2 22 22 T 17 15 279358 CASAVA_Build 7 108579888 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1929 het 931 hom 24 7 13 4 T 12 11 279359 CASAVA_Build 7 108580595 2D CTCCCTTCAC TG/-- TGCTGAAGAT 3070 het 3070 ref 37 21 13 5 TG 2 1 279360 CASAVA_Build 7 108586976 1I TATCAAAATT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 31 9 21 1 A 7 8 279361 CASAVA_Build 7 108589171 4D TTCTGTTGTG TGGC/---- TGGCTCCTTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 TGGC 2 1 279362 CASAVA_Build 7 108621461 1I AATAGATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 10 11 279363 CASAVA_Build 7 108623366 1I ACCTTTTTTG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 A 7 8 279364 CASAVA_Build 7 108629756 1D AAACTAAAAC A/- AAAATGACAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 5 4 279365 CASAVA_Build 7 108632182 1D GAGTACAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 10 9 279366 CASAVA_Build 7 108632954 1I GAATTTCAAG -/A AAGAGTGATT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 2 3 279367 CASAVA_Build 7 108634083 4I AAAAGAGAAA ----/TATT TATTTTTGTT 3070 hom 108 het 38 0 37 4 TATT 1 2 279368 CASAVA_Build 7 108634222 1D TGTACAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 12 11 279369 CASAVA_Build 7 108635924 2D CTTCTTAGAA AC/-- ATATAAGAGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AC 1 0 279370 CASAVA_Build 7 108636791 1D TCTTTTACCG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 15 7 7 T 9 8 279371 CASAVA_Build 7 108637468 7I GTTTCTCAAC -------/TTTTTAA TAATTGCCAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTTTTAA 0 1 279372 CASAVA_Build 7 108637804 1I CAATTTTTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 161 hom 25 2 14 9 T 9 10 279373 CASAVA_Build 7 108641756 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AATTGTAAGT 3070 het 1096 hom 24 8 13 5 AAAAG 1 0 279374 CASAVA_Build 7 108642303 1D29M5D ATAGGACTAG AAAAAAAAAATCTGCCAACCTATCAAAAGAAAAAC/-AAAAAAAAATCTGCCAACCTATCAAAAGA----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 29 20 14 2 N/A 0 0 279375 CASAVA_Build 7 108642431 1D GTTTTTTTTT G/- GTGTGTGTGA 3070 het 3070 hom 47 18 27 2 G 2 1 279376 CASAVA_Build 7 108643616 1I TGGAAGCTCC -/G CAAGTGGGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 0 1 279377 CASAVA_Build 7 108644880 4I TTAAAGAGTT ----/AAAG AAGTACAGAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 AAAG 0 1 279378 CASAVA_Build 7 108646366 4I TTACTATAAA ----/AGAC AGAAATTTAT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 AGAC 0 1 279379 CASAVA_Build 7 108646697 1D GAGGACTGAC A/- AGCTTCACCT 3070 hom 173 het 63 0 53 10 A 2 1 279380 CASAVA_Build 7 108646993 1I TACTAATGGC -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 T 6 7 279381 CASAVA_Build 7 108650615 2D4M3I TTAATATTTT TGAGTA---/--ACTATTT GCTATTACTT 3070 het 3070 ref 32 22 10 2 N/A 0 0 279382 CASAVA_Build 7 108653096 2D GTTTTTTTTT TG/-- TGTGCTAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 TG 3 2 279383 CASAVA_Build 7 108654058 1I GCTGACTTGG -/T AATGGTGCAT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 0 1 279384 CASAVA_Build 7 108654268 1D TGTAAAATCT A/- ATAGCTTGGT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 A 2 1 279385 CASAVA_Build 7 108655586 1D GAATTGCTCC T/- TTTTTTTTTT 2487 het 2487 ref 27 9 9 11 T 13 12 279386 CASAVA_Build 7 108657961 1D CCAACATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 44 0 32 13 T 11 10 279387 CASAVA_Build 7 108658545 5D AAAAATGGCA ATTAT/----- ATTATTTACA 3070 het 3070 ref 37 17 18 5 ATTAT 2 1 279388 CASAVA_Build 7 108662733 1D TATACTAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 24 17 8 A 10 9 279389 CASAVA_Build 7 108679644 1D TTAAATACGG T/- ATTCATACAA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 T 1 0 279390 CASAVA_Build 7 108682365 1D AAATATGTTA G/- CCTAATTTGT 3070 het 3070 ref 46 21 18 8 G 1 0 279391 CASAVA_Build 7 108682481 1D TTGAACTGTT C/- CAGCTCTAAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 C 2 1 279392 CASAVA_Build 7 108692448 1D GAGCTCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 11 10 279393 CASAVA_Build 7 108697084 1D CTTTGGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 14 13 279394 CASAVA_Build 7 108714381 1I GCTACTGTAA -/C AAACTACTTA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 C 0 1 279395 CASAVA_Build 7 108715939 2D CTTTAAATGC AG/-- AGTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 48 23 23 3 AG 2 1 279396 CASAVA_Build 7 108720857 2D GCTGGAAGTC TA/-- TTTTATGGGG 2480 het 2480 ref 22 12 6 6 TA 1 0 279397 CASAVA_Build 7 108731776 4D TAAAAGCTGT CCAC/---- CCACCCGAGC 1485 het 1485 ref 24 18 4 5 CCAC 2 1 279398 CASAVA_Build 7 108734919 2D GAAAGGAGGC AT/-- ATATTTGTCT 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 AT 3 2 279399 CASAVA_Build 7 108737113 1I CCTCTTCTGA -/G GCCACAGCCT 3070 hom 10 het 29 1 23 5 G 1 2 279400 CASAVA_Build 7 108758155 1D ATTAAATTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 44 13 26 6 T 8 7 279401 CASAVA_Build 7 108766281 2I ACTCCCTTTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 AT 6 7 279402 CASAVA_Build 7 108766620 1D CCTCTCCTGT C/- CCATCCTACT 3070 het 3070 hom 31 10 20 2 C 3 2 279403 CASAVA_Build 7 108768418 1D TTACTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 8 10 T 12 11 279404 CASAVA_Build 7 108768644 1I TTGTGGGGGA -/T TTTTACATCT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 4 5 279405 CASAVA_Build 7 108772124 2D CCACTATTAA CT/-- CTCTGTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 CT 3 2 279406 CASAVA_Build 7 108782962 1I TTTGTTGTGG -/T TTGGTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 17 17 0 T 2 3 279407 CASAVA_Build 7 108790275 5D ATCAAAAATA TTTTC/----- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 44 20 21 6 TTTTC 1 0 279408 CASAVA_Build 7 108791919 1I AACACTATAA -/C CTTTGACAAG 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 C 1 2 279409 CASAVA_Build 7 108793507 1D ATTTGAGGGA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 9 8 279410 CASAVA_Build 7 108793797 8I GATTTATCTG --------/ATTTATTT CTTTTATTTG 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 ATTT 0 2 279411 CASAVA_Build 7 108795522 1D CAGTCTCTTA T/- TTTTAATTTG 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 5 4 279412 CASAVA_Build 7 108796017 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1968 het 355 hom 11 1 7 3 A 12 13 279413 CASAVA_Build 7 108796846 1I ATTGTGGGGG -/A AAAAATTGCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 5 6 279414 CASAVA_Build 7 108803239 3D CACAGGGAAC ATA/--- ATAATACACC 3070 het 3070 ref 43 28 12 5 ATA 3 2 279415 CASAVA_Build 7 108823121 1D TAGTCAGGAC T/- TTCAAAGATG 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 3 2 279416 CASAVA_Build 7 108832509 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 42 hom 25 2 13 10 T 1 0 279417 CASAVA_Build 7 108833921 3D TCAAAATTAA AAT/--- AATAATAATA 2865 het 2865 ref 25 14 7 4 AAT 7 6 279418 CASAVA_Build 7 108849560 1I GTATGATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 26 0 19 7 T 11 12 279419 CASAVA_Build 7 108850727 1D GTATAATTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 17 22 5 T 9 8 279420 CASAVA_Build 7 108860116 1I ATTTGGGCTC -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3038 hom 29 8 17 4 T 6 7 279421 CASAVA_Build 7 108869653 16D CTTATTCTAA GTCAATGATCTACTTT/---------------- TCAACCACAT 3070 het 3070 ref 39 29 14 4 GTCAATGATCTACTTT 1 0 279422 CASAVA_Build 7 108869904 1I ATTGAAGAAG -/A AAATATAACC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 A 3 4 279423 CASAVA_Build 7 108888910 2D GTTGTATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 70 het 46 1 34 12 TA 6 5 279424 CASAVA_Build 7 108891836 2D TTTTGCAAAC TA/-- TGGCATTAAA 3070 het 3070 ref 30 21 8 2 TA 1 0 279425 CASAVA_Build 7 108893514 1D TTTTTGTACT A/- AAAAAACCTC 3070 hom 85 het 33 0 28 6 A 7 6 279426 CASAVA_Build 7 108908608 1D AAAGAGGTAC T/- TTTTTTCCTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 7 6 279427 CASAVA_Build 7 108913559 4I AGAACAAACA ----/AACT AACAAGACAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AACT 0 1 279428 CASAVA_Build 7 108917282 3I TATATATTGG ---/CTT TCACATTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTT 0 1 279429 CASAVA_Build 7 108920788 2D AGAGTAGCGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TG 9 8 279430 CASAVA_Build 7 108927620 1I TTTGTTCAGA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 T 6 7 279431 CASAVA_Build 7 108929225 1D CTCAGTGGTA T/- TGCCTAGGTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 2 1 279432 CASAVA_Build 7 108929850 1D AGTGGGAGGT G/- GGGCCACAGT 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 G 4 3 279433 CASAVA_Build 7 108934542 1I GACAGACATT -/A GAGATAATTT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 0 1 279434 CASAVA_Build 7 108937623 2D GATAAATAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 A 13 11 279435 CASAVA_Build 7 108940739 3D GTTGCCAAAT ATC/--- ATGTTACAGT 3070 het 3070 ref 43 21 20 5 ATC 1 0 279436 CASAVA_Build 7 108943976 1D GTAGAAAACT G/- AGATAATTTC 3070 het 3070 hom 32 15 16 2 G 1 0 279437 CASAVA_Build 7 108946120 8D TTATACAACT TTAACAAA/-------- TTTAAGTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 TTAACAAA 1 0 279438 CASAVA_Build 7 108953455 1I TGTGTGTGTG -/T TGTTTTTTTA 3070 het 361 hom 36 1 32 3 T 1 2 279439 CASAVA_Build 7 108955310 1D AGCTGAGTTT A/- AAAAATTATC 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 6 5 279440 CASAVA_Build 7 108970605 1D AGTACTTTTT C/- CACTTTACAA 3070 hom 169 het 60 0 57 6 C 2 1 279441 CASAVA_Build 7 108974774 1I GCCTAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 43 1 33 9 T 11 12 279442 CASAVA_Build 7 108975831 2I TGTGTATGAT --/AG AGTCTCTTAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AG 1 2 279443 CASAVA_Build 7 109000555 1D CTTCTATAAT C/- TCTAAAATCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 1 0 279444 CASAVA_Build 7 109002844 1D TTGCTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 35 1 25 9 T 13 12 279445 CASAVA_Build 7 109004119 1I AAGTGACTTG -/T TTTTTAAAGC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 5 6 279446 CASAVA_Build 7 109004841 1D48M4D TCATGGTTGA TTTTTTTTTTTTATGGGTTGGAATGAATACAATTGAATTGTTGGAAGAAATAG/-TTTTTTTTTTTATGGGTTGGAATGAATACAATTGAATTGTTGGAAGAA---- ATAGTAACAA 3070 het 419 hom 39 2 53 6 N/A 0 0 279447 CASAVA_Build 7 109006657 7D GTCATACAGC AATCCCT/------- GAGGTAGAAC 3070 hom 123 het 45 0 41 9 AATCCCT 1 0 279448 CASAVA_Build 7 109016241 1I ACAAAAAAAA -/T ATTCTAGAAG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 0 1 279449 CASAVA_Build 7 109017074 1I ATTACACACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 10 279450 CASAVA_Build 7 109030507 3I TGTTAAAATT ---/TTA AACTGCTTCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTA 0 1 279451 CASAVA_Build 7 109038944 1I CAAAATATCC -/T TTTAGGTAAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 3 4 279452 CASAVA_Build 7 109039574 3D ATTCTTGGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 1906 het 309 hom 27 4 5 19 T 15 12 279453 CASAVA_Build 7 109043105 1D TCCTCACCCC T/- TGCCCCATGC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 2 1 279454 CASAVA_Build 7 109043333 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGCGAAG 3070 het 308 hom 34 2 27 5 G 6 5 279455 CASAVA_Build 7 109045974 1I GAACTCAGAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 8 9 279456 CASAVA_Build 7 109046424 3D CAGATATTAA TAT/--- TGCAATTTCT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 TAT 1 0 279457 CASAVA_Build 7 109051348 5D TTTCCCAATA TTTTC/----- TTTTAAGTTT 3070 het 3070 ref 43 21 19 6 TTTTC 1 0 279458 CASAVA_Build 7 109062622 1I AAAAATATTT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 7 8 279459 CASAVA_Build 7 109064061 1I CTGACTTAGA -/T TTAGTAAAAC 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 T 2 3 279460 CASAVA_Build 7 109082251 1D TTTTTTTTTT G/- ATTTTCGCTC 3070 het 592 hom 25 3 16 8 G 1 0 279461 CASAVA_Build 7 109083599 4I ACCTGAATAA ----/GTAT GTATGTAAGA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 GTAT 1 2 279462 CASAVA_Build 7 109096447 1D ACTTGAGTTA T/- TTTTTTAAGT 3070 hom 144 het 53 0 49 5 T 7 6 279463 CASAVA_Build 7 109101341 3D TACCTCTTCA AGG/--- AGAACTACAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AGG 1 0 279464 CASAVA_Build 7 109108853 1I TCCTATTGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 9 10 279465 CASAVA_Build 7 109112098 1D AAGTGTCCTT C/- CCTTCTCCTT 3070 hom 148 het 55 0 50 6 C 3 2 279466 CASAVA_Build 7 109113563 2D ATATATATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 TA 6 5 279467 CASAVA_Build 7 109114120 2D GAAAACATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 A 12 10 279468 CASAVA_Build 7 109131957 1D ACAAAGTGAG T/- GTTGTTCATC 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 1 0 279469 CASAVA_Build 7 109140030 1D GTTAGTATGC T/- GTTCTTTAAT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 1 0 279470 CASAVA_Build 7 109143727 1D CTTACCTGTG A/- GTATAAGGCT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 1 0 279471 CASAVA_Build 7 109149617 1D CAGGAGCTGG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 2 T 8 7 279472 CASAVA_Build 7 109176838 1I TCTGTTTTGC -/A AAAACGTTAC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 A 4 5 279473 CASAVA_Build 7 109182050 2I CTTTTTTAGA --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 11 279474 CASAVA_Build 7 109191201 1D GCTCAAAACC A/- AAAAAATGCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 7 6 279475 CASAVA_Build 7 109207546 2I CAAAATGGCA --/TC TCTCTGGTTC 3070 hom 96 het 39 0 31 8 TC 2 3 279476 CASAVA_Build 7 109209135 1D CTTCAGTAGG T/- TTTTTTGAAG 3070 hom 113 het 46 0 37 9 T 7 6 279477 CASAVA_Build 7 109213639 1I TAAATAGTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 9 10 279478 CASAVA_Build 7 109214229 1I TTAAGTTTCT -/G GGAGACAATG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 2 3 279479 CASAVA_Build 7 109242592 1I TACTAGCTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 10 279480 CASAVA_Build 7 109244982 1I TATTTTAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 577 hom 35 2 28 5 A 9 10 279481 CASAVA_Build 7 109260108 4I TAGCTGAATA ----/AATT AATATATATT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AATT 0 1 279482 CASAVA_Build 7 109260197 6I AGGCACTGTG ------/ACAACA ACAACAACTA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 ACA 2 4 279483 CASAVA_Build 7 109261064 1D TCTTTCTTTG T/- TTTTGTGGCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 5 4 279484 CASAVA_Build 7 109262539 1D ATATACATAC A/- AATGTCTATT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 3 2 279485 CASAVA_Build 7 109273873 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 246 hom 32 3 21 8 T 15 16 279486 CASAVA_Build 7 109275182 1D AGGTATCAAT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 8 7 279487 CASAVA_Build 7 109282439 1D CTTATTTATC A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 A 8 7 279488 CASAVA_Build 7 109290935 1I AAAGTATATA -/T AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 0 1 279489 CASAVA_Build 7 109292562 4D AATGCTAAAT TAAA/---- TAGTTAAATT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TAAA 1 0 279490 CASAVA_Build 7 109302858 1I AAGACCAACA -/C AAAACTTGAC 3070 hom 69 het 33 0 23 10 C 0 1 279491 CASAVA_Build 7 109302896 1D GATTCCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 25 0 11 15 T 13 12 279492 CASAVA_Build 7 109307892 1D CCTTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 A 11 10 279493 CASAVA_Build 7 109318345 2D GATACATTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 42 0 27 17 TG 8 7 279494 CASAVA_Build 7 109324560 4I AAATTAATAG ----/TTAC TTATGTTCAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTAC 0 1 279495 CASAVA_Build 7 109329330 1I CATCAAATTA -/G GAAAAAGTGC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 1 2 279496 CASAVA_Build 7 109368953 4D AGATCACTTT AAGG/---- GAGGAGACCA 3070 het 3070 hom 35 18 17 4 AAGG 1 0 279497 CASAVA_Build 7 109369252 1D CCCAGCTGAA T/- AAAGCCCTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 1 0 279498 CASAVA_Build 7 109372169 4D CCTTATAGAG AAGT/---- AAATATTAAG 3070 het 3070 ref 52 27 22 4 AAGT 1 0 279499 CASAVA_Build 7 109383176 1D ATCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2784 het 1701 hom 22 7 8 9 A 14 13 279500 CASAVA_Build 7 109419871 2D ACTTAACAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 29 0 21 8 T 16 14 279501 CASAVA_Build 7 109435136 2D TATTTTGCCA CT/-- CTGGCGTTCT 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 CT 2 1 279502 CASAVA_Build 7 109442889 1D GGGCCCTGAC A/- AAAAAGCAGA 3070 hom 117 het 42 0 40 4 A 6 5 279503 CASAVA_Build 7 109445216 2I CGTCTATATG --/TA TATATATATA 3070 het 360 hom 21 1 15 5 TA 7 8 279504 CASAVA_Build 7 109446942 2I ATTTGTAGTT --/AA GAGACAATAG 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 0 2 279505 CASAVA_Build 7 109585803 3D TTAGAAATTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 14 11 279506 CASAVA_Build 7 109588398 2I ACAAATCTAT --/AC AGTCTTTATT 3070 het 946 hom 20 4 15 1 AC 0 1 279507 CASAVA_Build 7 109596785 1I TTTTCTAGGT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 6 7 279508 CASAVA_Build 7 109597948 3D AGCTGAAATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2454 hom 28 7 15 6 T 15 12 279509 CASAVA_Build 7 109603640 1D ATTATTTGAG A/- AAAATAAATG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 5 4 279510 CASAVA_Build 7 109607279 5D ATTTTTAATC TTCCT/----- TTCAATTTTG 3070 het 3070 ref 28 16 10 4 TTCCT 1 0 279511 CASAVA_Build 7 109611586 1I CAATAGGCAG -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 55 25 22 8 T 7 8 279512 CASAVA_Build 7 109613296 1D GGTTACTATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 9 8 279513 CASAVA_Build 7 109614520 1D AAAACCCATT C/- TTTTTCTGAA 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 C 1 0 279514 CASAVA_Build 7 109617281 1I ATGTGTCAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 9 10 279515 CASAVA_Build 7 109617825 1D TAAATACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 10 9 279516 CASAVA_Build 7 109620274 1I TTCCTCACTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 9 10 279517 CASAVA_Build 7 109624336 4D CTATGTAATC GTTT/---- GTTTATTGAT 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 GTTT 2 1 279518 CASAVA_Build 7 109624485 1I AATTTAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1553 hom 21 4 13 4 T 14 15 279519 CASAVA_Build 7 109625673 1D TCTCTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 1076 het 1076 ref 42 31 3 9 T 12 11 279520 CASAVA_Build 7 109625946 1I TCTTATTCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 432 hom 27 1 23 3 T 9 10 279521 CASAVA_Build 7 109631622 1D CCTGGAATGG T/- TAGCGTCATG 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 2 1 279522 CASAVA_Build 7 109633369 4I GCTGCAATGC ----/TTTA TTTACCTTGT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 TTTA 1 2 279523 CASAVA_Build 7 109646654 1I TTATTTTTTT -/A TAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 279524 CASAVA_Build 7 109654232 1D ACAAAGCTGC A/- AATAATAAAT 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 A 3 2 279525 CASAVA_Build 7 109677583 1D ATAGATTGTT A/- ACGCTAAAAT 3070 hom 157 het 60 0 53 8 A 2 1 279526 CASAVA_Build 7 109703878 1I ACTTTTAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 588 hom 32 2 25 5 T 10 11 279527 CASAVA_Build 7 109711277 4I GATTAATCTA ----/AGTC AGTCAGAATA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 AGTC 1 2 279528 CASAVA_Build 7 109714220 3D TCATCCAGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 27 1 13 13 T 14 11 279529 CASAVA_Build 7 109731701 21I GAAGCCTGCC ---------------------/AGCGTAGACTGGGGGCTATGG AGGAGCCCAT 3070 het 3070 ref 32 12 13 7 AGCGTAGACTGGGGGCTATGG 0 1 279530 CASAVA_Build 7 109732311 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2230 hom 20 5 11 4 A 10 11 279531 CASAVA_Build 7 109737357 1D TTAGTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 2081 het 2081 ref 21 9 6 6 A 17 16 279532 CASAVA_Build 7 109744481 6D GCATGAATTG GAGAGT/------ GTGATGGAAA 3070 het 3070 hom 44 19 24 4 GAGAGT 1 0 279533 CASAVA_Build 7 109749304 1D TATATCATTT G/- AACACAAATG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 1 0 279534 CASAVA_Build 7 109750859 2I CTAGCTAACT --/TC TTTTTTTTTT 2319 het 1825 hom 32 12 9 11 TC 0 1 279535 CASAVA_Build 7 109754964 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 579 het 409 hom 8 3 2 3 A 15 16 279536 CASAVA_Build 7 109755001 1I AGAAAAAGAG -/T AAAAGAAAGA 1898 het 1898 ref 20 13 4 3 T 0 1 279537 CASAVA_Build 7 109756152 1D GCCAGATTTT A/- GTTAGAGAAA 3070 het 3070 hom 37 12 22 6 A 1 0 279538 CASAVA_Build 7 109764671 1D TGTTTGTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 28 20 6 T 10 9 279539 CASAVA_Build 7 109766824 1D ATTGACACCT G/- TGTTAGTCAA 3070 het 3070 hom 46 14 14 18 G 1 0 279540 CASAVA_Build 7 109767450 1D ACAAGTGAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 A 10 9 279541 CASAVA_Build 7 109770763 1I ATTTTCTCAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 T 8 9 279542 CASAVA_Build 7 109773873 9D TCTTTACCTA TGTTTAAAC/--------- TGTTTAAACT 3070 het 3070 hom 32 14 15 7 TGTTTAAAC 2 1 279543 CASAVA_Build 7 109793077 1D GTTGTATATT A/- AAAAACATCT 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 A 6 5 279544 CASAVA_Build 7 109827157 6I TGAACATTGT ------/CATCCA CATCCACATT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 CATCCA 1 2 279545 CASAVA_Build 7 109835126 2D GGCCCATGAC TG/-- TTTGCTGAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 6 TG 1 0 279546 CASAVA_Build 7 109865201 1D CCTCTCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 25 5 14 6 A 17 16 279547 CASAVA_Build 7 109865325 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAATAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 7 279548 CASAVA_Build 7 109866175 1D ATGCTGCTAT A/- AAGACACATG 3070 hom 45 het 17 0 16 2 A 3 2 279549 CASAVA_Build 7 109907974 6I TGGGTTCCCA ------/TGGTCT TGGGCAGCTC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TGGTCT 0 1 279550 CASAVA_Build 7 109911504 1D GTGTTCTGAC G/- GGGGTACTGC 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 G 5 4 279551 CASAVA_Build 7 109915536 15D GTGGAAATTC TGTTTTGTTTTGTTT/--------------- TGTTTTGTTT 3070 het 231 hom 29 3 9 17 TGTTT 5 2 279552 CASAVA_Build 7 109917544 4I TAACATAAAT ----/AGTC AGGTCTTAAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AGTC 0 1 279553 CASAVA_Build 7 109924262 1D TCCTCCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 T 11 10 279554 CASAVA_Build 7 109929427 1D TTGATCCATT G/- GTTGTTTAAG 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 G 2 1 279555 CASAVA_Build 7 109931153 1D TTTTACTATA T/- TTTTTTAGTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 7 6 279556 CASAVA_Build 7 109935546 1I TCTTTACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 10 23 12 A 12 13 279557 CASAVA_Build 7 109939947 1D GATACCTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 39 2 15 22 T 15 14 279558 CASAVA_Build 7 109942303 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 9 8 279559 CASAVA_Build 7 109944966 3D TTATATCCTT GAA/--- GAATTTATAA 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 GAA 2 1 279560 CASAVA_Build 7 109947527 1I CAAGTGTTGG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 41 11 20 10 T 7 8 279561 CASAVA_Build 7 109949773 1I ATTGTCCTCA -/T TTTTTTTTCT 1620 het 1620 ref 30 11 5 14 T 8 9 279562 CASAVA_Build 7 109950591 1D31M1D TTAAAAGATT CCCCCCAAAGGAGAGGAAGGGAAATTCAGGGCA/-CCCCCAAAGGAGAGGAAGGGAAATTCAGGGC- AAAAGAATTC 3070 het 3070 ref 37 21 19 8 N/A 0 0 279563 CASAVA_Build 7 109956755 3D TGGTGGCTTC TGG/--- TGGTTGGTTC 3070 het 3070 ref 47 28 14 6 TGG 2 1 279564 CASAVA_Build 7 109963663 1D CGTACAGTGA T/- TTTTCTCAGT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 5 4 279565 CASAVA_Build 7 109964099 1D AGCCATAATA T/- AGTTGGGTCC 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 1 0 279566 CASAVA_Build 7 109976169 3D TTCCCATTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1427 hom 40 9 16 16 T 14 11 279567 CASAVA_Build 7 109994133 1I TCTACATACA -/T TTTTTAATCA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 5 6 279568 CASAVA_Build 7 110000866 1D CGAGAAACTG A/- AAAAAAAAAA 1185 het 1185 ref 44 33 5 6 A 11 10 279569 CASAVA_Build 7 110017584 1I GGGCAGGTAG -/C CTAAGGCTAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 1 2 279570 CASAVA_Build 7 110017695 1D ATCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2192 hom 38 9 20 10 A 13 12 279571 CASAVA_Build 7 110039507 1I GATAGCTGTG -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 T 7 8 279572 CASAVA_Build 7 110052580 1D GTGGAAGTTT C/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 C 1 0 279573 CASAVA_Build 7 110061083 4D TCTCCCTGCC AATG/---- AATGACTGGT 3070 hom 83 het 29 0 26 6 AATG 2 1 279574 CASAVA_Build 7 110073107 2D TTTTAAAGAC TT/-- TACTTAATCT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 3 1 279575 CASAVA_Build 7 110079445 2D AAACAAACAC AT/-- GAGAAATTCA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 AT 1 0 279576 CASAVA_Build 7 110088372 1I TGAGGCGATG -/C CCCGCCCTGC 3070 hom 64 het 25 0 20 5 C 3 4 279577 CASAVA_Build 7 110096094 2D TGAGAATAAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 AG 7 6 279578 CASAVA_Build 7 110099033 1D GCTTCAGGTA G/- TTTCACCCTC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 G 1 0 279579 CASAVA_Build 7 110105035 1D AGGATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 10 9 279580 CASAVA_Build 7 110119708 1I GCGGGTGACA -/G GTACACTAAA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 G 1 2 279581 CASAVA_Build 7 110121724 3I AAAAGAACTC ---/TAT TAATAGAGTC 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 TAT 0 1 279582 CASAVA_Build 7 110132409 1I TCATAAGAGA -/T TTAGTGATGG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 2 3 279583 CASAVA_Build 7 110140945 1D TTTTTAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 15 14 279584 CASAVA_Build 7 110148851 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 A 7 6 279585 CASAVA_Build 7 110150822 1I TTAGGCTTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 7 8 279586 CASAVA_Build 7 110156351 4D TAATTTTTGC ATTT/---- TTAGTATAGA 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 ATTT 1 0 279587 CASAVA_Build 7 110160831 3D AGAGAAAGAG AGA/--- AGGACAGATT 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 AGA 1 0 279588 CASAVA_Build 7 110163928 1I CAAGATTTAA -/T TGTTCTTTGC 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 T 1 2 279589 CASAVA_Build 7 110168218 1D ACTGTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 13 12 279590 CASAVA_Build 7 110177549 1I GCTGTAAGAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 T 8 9 279591 CASAVA_Build 7 110184614 1I AGCTTAATAA -/T TTTTTTAACA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 6 7 279592 CASAVA_Build 7 110195513 2I CAGCAGAAAC --/AT GTGAAAAACG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 AT 0 1 279593 CASAVA_Build 7 110203257 1I ACACACATGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 19 19 10 A 9 10 279594 CASAVA_Build 7 110208098 5I GCCTTTGCTA -----/AACCC CTCTACTTCC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 AACCC 0 1 279595 CASAVA_Build 7 110218811 1D ATCCTTTAGA T/- TTTTATCCTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 5 4 279596 CASAVA_Build 7 110233568 3I3M1D CATAATTTTG ---GACT/GGTGAC- TCACTTTAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 N/A 0 0 279597 CASAVA_Build 7 110259575 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 40 9 26 5 A 7 8 279598 CASAVA_Build 7 110260732 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1274 het 223 hom 19 1 5 13 A 17 16 279599 CASAVA_Build 7 110262815 1D TAAACCAGAG A/- AAACAACCAG 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 4 3 279600 CASAVA_Build 7 110262940 1D CTCAGTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 11 10 279601 CASAVA_Build 7 110268701 1I ATATTTAATG -/A AAAAATCTAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 5 6 279602 CASAVA_Build 7 110270404 3D TATGAGGAGT AAC/--- AACGACGACA 3070 het 3070 ref 45 26 19 1 AAC 2 1 279603 CASAVA_Build 7 110275482 1D CTAGAATATA C/- AAAAACTAAT 3070 het 3070 hom 30 9 14 8 C 1 0 279604 CASAVA_Build 7 110288284 1I TTTACTGATT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 7 8 279605 CASAVA_Build 7 110288733 1D TAATTTTTAT G/- TTTTTTGTAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 1 0 279606 CASAVA_Build 7 110305850 2D TTTCATTAAC AT/-- ATATTTAAAT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 AT 3 2 279607 CASAVA_Build 7 110329688 1D ATACTCCTTT A/- AAAAAAAAAG 2922 het 1959 hom 14 5 6 3 A 10 9 279608 CASAVA_Build 7 110331275 1D ACATTAAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 10 9 279609 CASAVA_Build 7 110334851 1I TGGGAAAACA -/G GGATGTAAGT 2810 het 2810 ref 30 20 8 2 G 2 3 279610 CASAVA_Build 7 110342082 1D AATATGTGCA T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 T 8 7 279611 CASAVA_Build 7 110342340 3D GAAAAAAATT AAC/--- AACAGAACTA 3070 het 3070 ref 38 23 12 4 AAC 2 1 279612 CASAVA_Build 7 110346510 5I TCACTACTTT -----/AAGTA AAGTGTTCAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 AAGTA 0 1 279613 CASAVA_Build 7 110357612 1D CATTAACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 19 7 T 11 10 279614 CASAVA_Build 7 110362722 1I GCCCTTTACA -/T TTTTCTCCTT 791 het 791 ref 13 9 2 2 T 4 5 279615 CASAVA_Build 7 110368142 1D TGGCTTGGGG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 8 7 279616 CASAVA_Build 7 110375320 1D TCAGCCCCCT A/- AATAAGGAAA 3070 het 3070 hom 41 13 25 4 A 3 2 279617 CASAVA_Build 7 110385889 14D TTATCTGTCA TACCAACAAGCCCT/-------------- TACCAACAGG 3070 het 3070 hom 59 26 25 14 TACCAACAAGCCCT 1 0 279618 CASAVA_Build 7 110389733 1D AAAATAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 T 12 11 279619 CASAVA_Build 7 110391279 15D ATGGGGTTGG ATTCCCTCATGTTGT/--------------- TCTCCCTCAT 3070 het 3070 hom 34 11 18 10 ATTCCCTCATGTTGT 1 0 279620 CASAVA_Build 7 110407429 1D TGTCTTCATG A/- AACCGTCCTT 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 A 3 2 279621 CASAVA_Build 7 110421466 1D ACACACTTGG C/- TTTCTATTGA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 C 1 0 279622 CASAVA_Build 7 110428139 1D CCTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2885 het 2337 hom 24 8 9 8 A 15 14 279623 CASAVA_Build 7 110431879 3D ATAGATCTTC TGA/--- TGAGAAACTC 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 TGA 2 1 279624 CASAVA_Build 7 110433260 1I AAAGGCCAGG -/T TTTTTTTTTT 793 het 793 ref 34 26 3 5 T 10 11 279625 CASAVA_Build 7 110438244 1D AAAAAAAAAA G/- GTCAAGATAC 3070 het 3070 hom 45 17 23 6 G 2 1 279626 CASAVA_Build 7 110450173 1D CTAACCTTTC T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 42 12 25 5 T 8 7 279627 CASAVA_Build 7 110458087 2I TATATATGTG --/TA TATGTGTGTA 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 TA 1 2 279628 CASAVA_Build 7 110481340 1D ACAGGAAAAT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 8 7 279629 CASAVA_Build 7 110483309 1D ATATTTTATC A/- ATTAAAGCCT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 2 1 279630 CASAVA_Build 7 110484710 1D GTCTAACACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 480 hom 22 2 14 6 A 12 11 279631 CASAVA_Build 7 110487216 1D CCTAATTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 36 0 32 6 A 12 11 279632 CASAVA_Build 7 110506577 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 21 het 8 0 8 1 T 6 7 279633 CASAVA_Build 7 110507321 1D AAAAAAAAAA T/- GTCATTTCTT 3070 het 46 hom 35 1 27 7 T 1 0 279634 CASAVA_Build 7 110513753 1D GAAAAAAAAA T/- TAAAATTAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 2 1 279635 CASAVA_Build 7 110517249 1I GAAGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1406 het 1406 ref 31 24 4 3 T 10 11 279636 CASAVA_Build 7 110534472 2I CCTTTCCCTC --/TG TCTCTCCTTC 3070 hom 69 het 28 0 21 7 TG 0 1 279637 CASAVA_Build 7 110598184 1I TTTCAACCTT -/C ATTCTCCTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 0 1 279638 CASAVA_Build 7 110598468 1D TTTCTAAAAG A/- AAAAGTATGC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 5 4 279639 CASAVA_Build 7 110599214 1I GATGTGGTTA -/G GGGGTGAAGA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 G 4 5 279640 CASAVA_Build 7 110612061 4I TGTTTAAAAA ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 hom 108 het 48 0 36 12 GT 7 9 279641 CASAVA_Build 7 110616666 2D TTTTTTAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 26 0 18 8 A 15 13 279642 CASAVA_Build 7 110627901 4I GCTGGAAAAA ----/AAAG AAAGAAACAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AAAG 1 2 279643 CASAVA_Build 7 110630862 1I ATACTGGTTC -/T TTTTTTTTTT 2372 het 1153 hom 20 5 11 4 T 17 18 279644 CASAVA_Build 7 110645751 1I GTTTTATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 30 1 23 6 T 10 11 279645 CASAVA_Build 7 110647070 1I ATTAATCATG -/T TTTTTTTACC 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 7 8 279646 CASAVA_Build 7 110719796 1D CTTGCCATGA T/- TTTTTTTTTG 1064 het 1064 ref 30 26 3 1 T 10 9 279647 CASAVA_Build 7 110830155 1I GCCTTCATAG -/T TCCACGAACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 2 279648 CASAVA_Build 7 110869013 1D TCAACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 504 hom 43 3 26 14 A 16 15 279649 CASAVA_Build 7 110888306 1I TAATCTTTTT -/C CCATGTTACC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 C 2 3 279650 CASAVA_Build 7 110906999 1I TACTTACTCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 T 7 8 279651 CASAVA_Build 7 110974798 1D AACTGTCATA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 74 hom 34 1 16 17 C 11 10 279652 CASAVA_Build 7 110975509 1I TGCTTGCTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 423 hom 34 1 27 6 A 9 10 279653 CASAVA_Build 7 110982752 1D CTTCATTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 820 hom 40 2 33 5 A 11 10 279654 CASAVA_Build 7 110983913 1D ATTGATGATT G/- TAACTTTACA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 0 279655 CASAVA_Build 7 110987332 2D TATGTTCCAC AT/-- ATGTTCCATA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 AT 2 1 279656 CASAVA_Build 7 111001346 1D GTACAGACAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 9 8 279657 CASAVA_Build 7 111013935 1D GTGTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 1108 het 1108 ref 45 35 3 8 T 12 11 279658 CASAVA_Build 7 111082282 1D AAATAAAAGG A/- AAGTAATTGA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 3 2 279659 CASAVA_Build 7 111084015 1I TTAGTTGTTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 8 9 279660 CASAVA_Build 7 111087635 1D GTGCCTGCCA C/- CAGGCCTGGC 2455 het 829 hom 10 3 6 2 C 2 1 279661 CASAVA_Build 7 111097936 1I CTCCAAAAAC -/T TTTTGTAACA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 T 4 5 279662 CASAVA_Build 7 111098097 3D CCTTGCCTGT TGA/--- TGATTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 6 TGA 2 1 279663 CASAVA_Build 7 111108107 1D CTCCCCTTTA G/- TAGGTTATAA 3070 het 2622 hom 33 10 17 6 G 1 0 279664 CASAVA_Build 7 111125853 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1628 hom 17 5 8 4 A 13 14 279665 CASAVA_Build 7 111143541 1D TAGTATAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1673 hom 25 6 13 7 A 15 14 279666 CASAVA_Build 7 111147063 12D TTTGCTTAGG ATTGCTTTGGCT/------------ ATTTGGGCTC 3070 het 3070 hom 25 10 15 6 ATTGCTTTGGCT 1 0 279667 CASAVA_Build 7 111158839 1I AATTTGGATA -/G AGACTAAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 279668 CASAVA_Build 7 111169849 1D GGCACCCTCT C/- CCCCCACATT 3070 hom 87 het 30 0 29 2 C 6 5 279669 CASAVA_Build 7 111173748 1I TTTAGTGGAG -/T TACAAGGCAA 3070 het 3070 hom 56 25 29 2 T 1 2 279670 CASAVA_Build 7 111175050 1D TTAAAACTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 39 0 29 10 T 10 9 279671 CASAVA_Build 7 111176000 2I ATATATATAC --/AT ATGTGTGTGT 3070 hom 150 het 57 0 50 7 AT 1 2 279672 CASAVA_Build 7 111183840 1I TATTTTAGAG -/C CCAGGGCTTC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 C 2 3 279673 CASAVA_Build 7 111191036 1I CTGCTGCTCT -/A GCTCAGAACC 3070 hom 105 het 39 0 31 8 A 0 1 279674 CASAVA_Build 7 111239516 15D GATGTTTTGT AATGTTTTTTGTTAA/--------------- TTTCCAAACA 3070 het 3070 ref 47 29 17 4 AATGTTTTTTGTTAA 1 0 279675 CASAVA_Build 7 111261986 1D CCCCTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1395 het 1395 ref 35 22 4 9 A 13 12 279676 CASAVA_Build 7 111267823 1I TGCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1250 het 1250 ref 27 22 3 2 T 10 11 279677 CASAVA_Build 7 111337693 1I CCACATGTGG -/C AATGGAGCCC 3070 hom 144 het 54 0 47 7 C 0 1 279678 CASAVA_Build 7 111352274 2D CTTGTACTAC AA/-- AAAATTACTA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 6 4 279679 CASAVA_Build 7 111371093 1I TTTTTATGAG -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 A 6 7 279680 CASAVA_Build 7 111374891 1I ATGACACCTA -/C TACTGAGGGT 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 C 0 1 279681 CASAVA_Build 7 111389934 1D33M4D TTCCATATTT AAAAAAATCTTTACCTCACCAATTGCATTCATTACTTT/-AAAAAATCTTTACCTCACCAATTGCATTCATTA---- CTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 35 23 18 6 N/A 0 0 279682 CASAVA_Build 7 111400968 2D TTAGAGTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 13 11 279683 CASAVA_Build 7 111414755 2I AAAATAATTC --/AG AGAGTCCTCA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 AG 2 3 279684 CASAVA_Build 7 111499524 2I TCACATGTGG --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 8 10 279685 CASAVA_Build 7 111503073 1D GTCCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 1139 het 1139 ref 46 38 3 5 A 12 11 279686 CASAVA_Build 7 111509346 1D GGAGAGGCGT G/- GGGAATTACA 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 G 4 3 279687 CASAVA_Build 7 111518365 1D ATAGAGCCCT C/- CAAGGTAAAG 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 C 2 1 279688 CASAVA_Build 7 111521522 1I AAAAAAAAAA -/T CTACAATGGT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 0 1 279689 CASAVA_Build 7 111522733 1D ATCTATTAAG A/- GAAAGAATAT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 1 0 279690 CASAVA_Build 7 111523083 3I TGGGTATAAT ---/AAG GTCTTTTAGG 2525 het 2525 ref 24 13 6 5 AAG 0 1 279691 CASAVA_Build 7 111523288 1I GGCTGAGGCA -/G GAGAATCACT 3070 het 2535 hom 25 7 14 4 G 1 2 279692 CASAVA_Build 7 111523477 1I TAGGGCATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2110 hom 24 8 12 4 T 9 10 279693 CASAVA_Build 7 111526418 1I TCGTCTCTAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 7 8 279694 CASAVA_Build 7 111529132 5D TTCTTTTTCT TTTTC/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2266 hom 23 11 12 5 TTTTC 1 0 279695 CASAVA_Build 7 111530150 2D TGCCAAACAC TT/-- TTTTTAAATG 3070 het 3070 hom 31 10 15 8 T 7 5 279696 CASAVA_Build 7 111551320 1D AACTAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 1032 het 1032 ref 35 19 4 12 T 13 12 279697 CASAVA_Build 7 111554858 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 9 8 279698 CASAVA_Build 7 111561855 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATCA 3070 het 2368 hom 16 6 7 3 A 8 7 279699 CASAVA_Build 7 111562707 1D GGTACTTGAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 14 15 7 A 9 8 279700 CASAVA_Build 7 111567965 1I TTAAATGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 10 11 279701 CASAVA_Build 7 111573114 1D TACTTGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 40 1 33 6 A 11 10 279702 CASAVA_Build 7 111576872 3D CAGAAAATAA AAG/--- AAGACTATCA 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 AAG 2 1 279703 CASAVA_Build 7 111579055 1I AGAGATGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 9 9 10 A 13 14 279704 CASAVA_Build 7 111584273 3I TTTAAAAGTT ---/AAA AACATACGTG 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 A 2 5 279705 CASAVA_Build 7 111592645 3D TCTATCTATC TTT/--- CCATGCTCTA 3070 het 3070 ref 51 30 20 2 T 3 0 279706 CASAVA_Build 7 111598738 1I TTCCTTTATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 9 10 279707 CASAVA_Build 7 111602817 4D70M1D ATATATAAGC CTAACTTACTAGAAATTGACATATGTATATAAATGTGAAGGTTTAGAAGGTTTTGTGGCCATAAAACTCTCATAT/----CTTACTAGAAATTGACATATGTATATAAATGTGAAGGTTTAGAAGGTTTTGTGGCCATAAAACTCTCATA- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 35 30 16 4 N/A 0 0 279708 CASAVA_Build 7 111603109 1I CCCCATCCCC -/T TTTTTAATCT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 5 6 279709 CASAVA_Build 7 111605021 1I AGACTACTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 16 18 4 T 9 10 279710 CASAVA_Build 7 111606673 1D CCTGTACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 25 0 16 9 A 12 11 279711 CASAVA_Build 7 111606818 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 12 11 279712 CASAVA_Build 7 111607394 1I AGTCAACTAC -/G GGTTTAGCTG 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 G 2 3 279713 CASAVA_Build 7 111610569 1D GGGAATAGGA G/- GGGGAGAACT 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 G 5 4 279714 CASAVA_Build 7 111610717 1D CATTCCAGGC T/- TTACTGATGG 3070 het 3070 ref 45 19 19 8 T 3 2 279715 CASAVA_Build 7 111612079 1D CCCCTACAAT C/- CCCCCCCCTT 3070 het 3070 ref 49 25 16 9 C 9 8 279716 CASAVA_Build 7 111616578 2D CTTATTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 1462 het 636 hom 39 9 4 26 A 12 10 279717 CASAVA_Build 7 111629818 1I AATAGCCTGA -/T TTAATCACTC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 2 3 279718 CASAVA_Build 7 111658504 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2818 het 555 hom 15 3 8 4 A 17 16 279719 CASAVA_Build 7 111675259 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 534 hom 31 3 21 8 A 13 12 279720 CASAVA_Build 7 111678476 1I CCAGAGTGAA -/T TTTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 42 26 15 1 T 5 6 279721 CASAVA_Build 7 111771226 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1961 het 1961 ref 36 20 5 11 A 17 16 279722 CASAVA_Build 7 111782743 3I CAAGGTGATC ---/AAG AAGAAGATTG 3070 hom 101 het 37 0 34 3 AAG 2 3 279723 CASAVA_Build 7 111855818 1I GGCATGGCTT -/G GGTGACTGAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 G 2 3 279724 CASAVA_Build 7 111861122 1I ATATAATTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 2906 hom 21 7 8 6 T 8 9 279725 CASAVA_Build 7 111861286 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1269 hom 17 4 10 3 T 10 9 279726 CASAVA_Build 7 111870635 13I CCCAGCACTT -------------/TGGGAGGCTGAGC TGGGAGGACT 3070 hom 72 het 24 0 25 1 TGGGAGGCTGAGC 0 1 279727 CASAVA_Build 7 111871800 3D AATCTAAAAC ACA/--- ACAAGTGATA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 ACA 2 1 279728 CASAVA_Build 7 111877118 4D CCCTTTTTTT GGGG/---- GGGGGGGGGG 3070 hom 27 het 26 1 21 4 G 14 10 279729 CASAVA_Build 7 111883866 1I TTATAGTTTT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 1986 hom 21 6 11 4 A 7 8 279730 CASAVA_Build 7 111886373 3D TGGTGCGCCT ATA/--- GTACTGTACC 3070 het 3070 hom 38 17 16 7 ATA 1 0 279731 CASAVA_Build 7 111886798 2D GAAAAATAAC AT/-- GTGATCCTAA 3070 het 3070 ref 46 23 16 9 AT 1 0 279732 CASAVA_Build 7 111887415 1I TGTATGTAAG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 42 16 20 6 T 7 8 279733 CASAVA_Build 7 111888065 1I ACTGGAACAG -/A ACTGGCTAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 279734 CASAVA_Build 7 111889144 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 11 6 T 11 10 279735 CASAVA_Build 7 111890127 1D ACTGCTCATT A/- AGACTGGGAC 3070 hom 150 het 57 0 50 7 A 2 1 279736 CASAVA_Build 7 111891066 4D ACATGTTGAA TTTG/---- TTTAAGTTTG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 TTTG 1 0 279737 CASAVA_Build 7 111891328 5D TTTTATTTGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 143 het 143 ref 30 18 3 9 T 17 12 279738 CASAVA_Build 7 111894792 2I4M4I TAATTTAATC --ACCT----/TTACCTTAAA GAATTATGTG 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 N/A 0 0 279739 CASAVA_Build 7 111895219 2D CTCTATATGA GG/-- TCAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 40 14 23 4 G 2 0 279740 CASAVA_Build 7 111897239 1D GTTGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 35 2 21 12 T 13 12 279741 CASAVA_Build 7 111899037 1D CTTGGAGCCC T/- TCTGGTTGCT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 2 1 279742 CASAVA_Build 7 111902143 2I TGGATGAAAC --/TA AATGTTGATG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TA 0 1 279743 CASAVA_Build 7 111904713 1D TGGTCTTGAA C/- TCCTGACCTC 3070 hom 42 het 16 0 14 2 C 1 0 279744 CASAVA_Build 7 111908574 4D ACAATTAGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 TTTG 3 2 279745 CASAVA_Build 7 111908940 2D CAAGCACCTG CC/-- TGGTTAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 2 0 279746 CASAVA_Build 7 111909476 1D ATTAAAAAAA T/- ATTGGAATAG 3070 het 3070 hom 32 14 15 5 T 1 0 279747 CASAVA_Build 7 111909935 7D AACACATCTA AAAGAAT/------- TGTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 39 19 20 1 AAAGAAT 1 0 279748 CASAVA_Build 7 111914467 13I TTACATTGAA -------------/AAAAGAAGGAATG AAAAGAAGGA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 AAAAGAAGGAATG 1 2 279749 CASAVA_Build 7 111918557 1D CAACTCTTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 10 9 279750 CASAVA_Build 7 111919240 1I GGACAAAACA -/T TTTTTTGTGG 3070 hom 99 het 41 0 32 9 T 6 7 279751 CASAVA_Build 7 111941384 6I TATTCATGGA ------/AGGATG AGGATGATGA 3070 het 3070 hom 64 23 35 6 AGGATG 1 2 279752 CASAVA_Build 7 111956320 1D TCAGAATGGG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 C 9 8 279753 CASAVA_Build 7 111961871 1D TTTGAGACTG T/- TTTTGGCCAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 T 5 4 279754 CASAVA_Build 7 111963716 2D AATACTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2603 hom 23 8 9 6 T 12 10 279755 CASAVA_Build 7 111963967 1I GTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 10 11 279756 CASAVA_Build 7 111968810 1D GTTTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 11 10 279757 CASAVA_Build 7 111981921 1I TCCTGGCAAA -/T TTCAATTATA 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 2 3 279758 CASAVA_Build 7 111991656 2D AGCCCTGATG GA/-- GAGTGCTTAC 3070 het 3070 hom 47 20 23 6 GA 2 1 279759 CASAVA_Build 7 111992309 1I GCATCTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2816 hom 40 12 15 13 T 13 14 279760 CASAVA_Build 7 111998222 1D TCTTTGCTGG T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 8 7 279761 CASAVA_Build 7 112002156 5D TTGAACAACA TTAAT/----- TTATTAAGTA 3070 het 3070 ref 42 17 18 8 TTAAT 1 0 279762 CASAVA_Build 7 112003657 4D TGTGGATGCA CAGG/---- CAGGCTTCTG 3070 het 2675 hom 26 10 12 6 CAGG 2 1 279763 CASAVA_Build 7 112009096 1D AAATTTAGAG T/- TTTTTTTTTT 1590 het 1590 ref 45 35 4 6 T 11 10 279764 CASAVA_Build 7 112009574 1I ACATGTGTTT -/G GGGGCAAGGA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 G 4 5 279765 CASAVA_Build 7 112014826 2D CTAGGATCAG GA/-- GAGATCCCCT 3070 het 3070 ref 38 20 14 7 GA 3 2 279766 CASAVA_Build 7 112021419 3D CTTATTTCTG TTC/--- TTCTCTCTCT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TTC 2 1 279767 CASAVA_Build 7 112023281 1I TTGCATTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 776 hom 35 3 23 9 T 12 13 279768 CASAVA_Build 7 112053980 16D CCACCCACCT TGGCCTCCCAGAGTGC/---------------- TGGGATTACA 2378 het 1704 hom 9 4 7 0 TGGCCTCCCAGAGTGC 1 0 279769 CASAVA_Build 7 112063027 1D GGATTACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 T 12 11 279770 CASAVA_Build 7 112073286 1I TTCCTCTAAC -/T TTTTTATCAG 3070 het 3070 hom 34 15 19 0 T 5 6 279771 CASAVA_Build 7 112077857 1D AAGTATAGAG T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 8 7 279772 CASAVA_Build 7 112078279 1I ATTAAAAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 8 9 279773 CASAVA_Build 7 112079050 3D AAACATCAAG GAA/--- GAAGAAGAAG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 GAA 5 4 279774 CASAVA_Build 7 112080040 1D ATGCCCACTC T/- TGCTCCTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 T 2 1 279775 CASAVA_Build 7 112098183 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 416 hom 26 2 20 4 TG 6 7 279776 CASAVA_Build 7 112103988 1D CAGAGAGATA G/- TAGGGATTTC 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 G 1 0 279777 CASAVA_Build 7 112108115 3D TACCTTAACC AAA/--- AAAAAAAAAA 1641 het 1641 ref 36 13 6 18 A 19 16 279778 CASAVA_Build 7 112112194 1D AAATTCTTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 T 9 8 279779 CASAVA_Build 7 112116842 1I TCATCCCAGA -/G GGGCACCCAC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 G 3 4 279780 CASAVA_Build 7 112121844 1D ACTGATTTTT G/- TATGTTGGTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 G 1 0 279781 CASAVA_Build 7 112123788 1I TCTCTTATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 9 10 279782 CASAVA_Build 7 112129760 2I TGATGATAAA --/CT CTCTCTCATC 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 CT 3 4 279783 CASAVA_Build 7 112141391 1D AGTTAAAAGT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 A 8 7 279784 CASAVA_Build 7 112153923 1D CAGTTTTTCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 A 9 8 279785 CASAVA_Build 7 112161887 1D TGGCTGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 11 10 279786 CASAVA_Build 7 112176300 3D AATAAATAAT AAA/--- AAAAACTATT 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 A 8 5 279787 CASAVA_Build 7 112176475 3I ATGCAAAATA ---/TTT TTAGTTACAA 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 2 5 279788 CASAVA_Build 7 112182650 1D ATTGCTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 7 13 3 A 11 10 279789 CASAVA_Build 7 112185377 1D CATAACCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2333 hom 36 9 17 10 A 17 16 279790 CASAVA_Build 7 112193219 1D CTGAGGCTAT A/- AAAAAATGGC 3070 het 3070 hom 37 14 21 3 A 7 6 279791 CASAVA_Build 7 112195174 1D TTAAATAAGC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 A 7 6 279792 CASAVA_Build 7 112196849 2I AGATATCAAC --/AA GAGACCTAAA 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 A 0 2 279793 CASAVA_Build 7 112197908 2I TATGTGTGTG --/TA TGTGTTTATC 2162 het 2162 ref 23 15 5 3 TA 0 1 279794 CASAVA_Build 7 112199148 1I ACTTTTATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 9 10 279795 CASAVA_Build 7 112244289 1I AGGACACTAC -/T GAATAGTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 0 1 279796 CASAVA_Build 7 112251353 4I TTGAGAGTTC ----/TTTA TTTATTCTTG 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 TTTA 1 2 279797 CASAVA_Build 7 112280516 12I TATAACTTAA ------------/GAATTTACAGCC CTTATAACTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 GAATTTACAGCC 0 1 279798 CASAVA_Build 7 112312459 1D GCACAGGGCA G/- GGGGGGCCCT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 G 7 6 279799 CASAVA_Build 7 112318394 1D CTATAAAAAA T/- ATATAGAAAT 3070 het 3070 hom 29 15 14 2 T 1 0 279800 CASAVA_Build 7 112349067 9I CCCCATCAAC ---------/AAGTGGGTG AAGGACATTA 1331 hom 7 het 3 0 3 0 AAGTGGGTG 0 1 279801 CASAVA_Build 7 112352111 1D GCCAATGTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 56 het 32 0 28 4 T 10 9 279802 CASAVA_Build 7 112357281 1D CTAAAAAAGC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 A 7 6 279803 CASAVA_Build 7 112358646 2D AAACTTAATA TC/-- TACAAACACT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 TC 1 0 279804 CASAVA_Build 7 112362878 1D ATACTTTTAC T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 7 279805 CASAVA_Build 7 112371068 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 2649 hom 26 7 13 6 A 8 7 279806 CASAVA_Build 7 112384953 1I TGCTCTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 10 11 279807 CASAVA_Build 7 112391098 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAAAGA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 C 0 1 279808 CASAVA_Build 7 112396296 1D AATAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 44 1 38 5 A 11 10 279809 CASAVA_Build 7 112399802 3D GTCAAAGTTA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 AAC 4 3 279810 CASAVA_Build 7 112404406 5D CGATTTAAAT AAGTC/----- AATTCTATTA 1440 het 1440 ref 12 8 3 5 AAGTC 1 0 279811 CASAVA_Build 7 112410433 1I ATTTTGGTCT -/C CTGTTGCCAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 C 1 2 279812 CASAVA_Build 7 112429419 3D AAAGCATCTG TTC/--- TTGATCCTGC 3070 het 3070 ref 51 20 19 13 TTC 1 0 279813 CASAVA_Build 7 112432014 2D GTGAAATTCT CA/-- CATCACTCAA 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 CA 2 1 279814 CASAVA_Build 7 112434251 1D CATAAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 8 T 11 10 279815 CASAVA_Build 7 112438613 1I ATTTTCTTCA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 7 8 279816 CASAVA_Build 7 112439858 3I ACACATGGAA ---/TAC TACTATTCAG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 TAC 1 2 279817 CASAVA_Build 7 112444137 2I GCAATCAAAT --/AA TATGAGTAGA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 0 2 279818 CASAVA_Build 7 112448964 1D GGATCTCATT C/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 C 1 0 279819 CASAVA_Build 7 112450479 1D TTGATGTTGA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 8 7 279820 CASAVA_Build 7 112451665 2D ACTAATTTTA GG/-- GTTGATTTAC 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 G 3 1 279821 CASAVA_Build 7 112451833 1D GCTGTATTCC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 T 9 8 279822 CASAVA_Build 7 112455843 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 23 1 17 5 T 13 12 279823 CASAVA_Build 7 112461674 1I CTCTATTTTT -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 A 6 7 279824 CASAVA_Build 7 112462049 1I AACAGTGTAA -/T TAAAGGCTGT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 1 2 279825 CASAVA_Build 7 112465872 1D TAGGTGACCC T/- ATCAATTTAA 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 T 1 0 279826 CASAVA_Build 7 112471796 2I AAAAAAGAAA --/AG AGAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 AG 2 3 279827 CASAVA_Build 7 112473249 5D TACAACTTTC TTGTT/----- TTGTTTTGAG 3070 het 3070 ref 44 27 15 6 TTGTT 2 1 279828 CASAVA_Build 7 112474863 4I ATTTCAACTA ----/ACTT ACTTGTTCAT 3070 het 3070 hom 61 26 27 8 ACTT 1 2 279829 CASAVA_Build 7 112480225 22I TATTCCTCCA ----------------------/TCCCTTTATTTTGAGTTTATGT TTGTCTTTGC 3070 hom 39 het 16 0 12 4 TCCCTTTATTTTGAGTTTATGT 0 1 279830 CASAVA_Build 7 112494661 1D AGAAGGCTTC T/- GCAGTGATTC 3070 het 3070 ref 58 33 21 5 T 1 0 279831 CASAVA_Build 7 112496645 1I AAATCTAGTT -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 6 7 279832 CASAVA_Build 7 112499178 3I GTGATTTTTA ---/TCT TCTTTAATGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TCT 1 2 279833 CASAVA_Build 7 112506983 1D ATTAAGGAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 16 15 11 A 10 9 279834 CASAVA_Build 7 112509515 1I TAAAAAAAAA -/C GTTGTTATGT 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 C 0 1 279835 CASAVA_Build 7 112520594 1D CAGCTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1246 het 1246 ref 43 28 3 12 T 12 11 279836 CASAVA_Build 7 112521128 1D ATTTCTCTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 80 het 33 0 27 6 T 9 8 279837 CASAVA_Build 7 112527619 2D GACGATAGCC AG/-- AGACTTTACA 3070 hom 112 het 45 0 35 12 AG 2 1 279838 CASAVA_Build 7 112531797 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2839 het 1531 hom 17 5 10 3 A 16 15 279839 CASAVA_Build 7 112535630 3I TTTTCTCTAA ---/GAC GACTATTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GAC 1 2 279840 CASAVA_Build 7 112613517 1I AAATATTCAA -/T TTTGGATGAG 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 T 3 4 279841 CASAVA_Build 7 112623733 1I TTATTTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 10 11 279842 CASAVA_Build 7 112625086 22D AATTAGATGG CTATATATATATATATATATAT/---------------------- ATATATATAT 3070 het 298 hom 16 1 13 3 CTATATATATATATATATATAT 1 0 279843 CASAVA_Build 7 112636107 4I AATAATTAGC ----/AAGT AAGTAATATG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 AAGT 1 2 279844 CASAVA_Build 7 112641531 5I TGATGGGAAA -----/TATAT TATGTATATG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TATAT 0 1 279845 CASAVA_Build 7 112644857 1D GCTGTTAGAA T/- TTTTTTTTTT 1606 het 1606 ref 39 26 5 10 T 13 12 279846 CASAVA_Build 7 112650191 3D TCAATTTTAG AAC/--- AACATCCCAC 3070 hom 107 het 43 0 36 8 AAC 2 1 279847 CASAVA_Build 7 112656253 4D AAAGAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAATC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 AAAG 1 0 279848 CASAVA_Build 7 112664158 3D CGCTAAGCCG AGA/--- AGGAGTCAGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AGA 1 0 279849 CASAVA_Build 7 112672080 1I TATGAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 15 1 T 10 11 279850 CASAVA_Build 7 112672447 1D GCTGTCCAAA T/- AAATGTTATA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 1 0 279851 CASAVA_Build 7 112675824 1D ATCTATCTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 10 9 279852 CASAVA_Build 7 112680060 2I GGAAAAAGCT --/AA AGACTCCACA 1362 het 1362 ref 34 28 3 3 A 1 3 279853 CASAVA_Build 7 112694704 7I GTGGGCAAGC -------/AGCCTCT AGCCTCTGGG 3070 hom 90 het 31 0 30 1 AGCCTCT 1 2 279854 CASAVA_Build 7 112709945 4I TCATCTGCTC ----/TTAA TTAATCTCAG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TTAA 1 2 279855 CASAVA_Build 7 112723969 4I GCAAAGGAAA ----/CAAT CAATAAAGTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CAAT 1 2 279856 CASAVA_Build 7 112728844 1D AACTTAAACA G/- CAATCATTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 G 1 0 279857 CASAVA_Build 7 112733962 4D CAGTTTTGTC TGTT/---- TGTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 TGTT 2 1 279858 CASAVA_Build 7 112755033 1I GTTTGTCATG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 20 8 10 2 T 8 9 279859 CASAVA_Build 7 112756463 1I ATCTTCCATG -/A TGCCTGGCAC 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 A 0 1 279860 CASAVA_Build 7 112757431 1D TCATATTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 10 9 279861 CASAVA_Build 7 112760594 6I5M9I GACCTAATAG ------ACAGA---------/ACATCTACAGAACTCTCCAC CCCAAATCAA 3070 het 3070 ref 20 12 7 3 N/A 0 0 279862 CASAVA_Build 7 112761666 1I GATGCAAAAA -/T CCTCAATAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 1 279863 CASAVA_Build 7 112765958 1I TGTGAAAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 9 10 279864 CASAVA_Build 7 112766106 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 AG 2 1 279865 CASAVA_Build 7 112767583 1D AGATTTTAGA T/- TTTTTCCCTT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 T 6 5 279866 CASAVA_Build 7 112772828 1I CAAAAACTGC -/A AATTGTTTTG 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 A 2 3 279867 CASAVA_Build 7 112777559 1I TTGAGAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 9 10 279868 CASAVA_Build 7 112785024 1I GTTCCCAGGG -/T TTTTTCGGAG 3070 hom 116 het 44 0 36 8 T 5 6 279869 CASAVA_Build 7 112787188 1I CCAGATTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 A 10 11 279870 CASAVA_Build 7 112795228 1D TGGAAATATA T/- TTTTGCTTGT 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 T 5 4 279871 CASAVA_Build 7 112812034 1I TTACTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 31 1 23 7 T 11 12 279872 CASAVA_Build 7 112821812 1D ATGTACAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 10 9 279873 CASAVA_Build 7 112828668 1I TTTATTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 25 1 17 7 T 11 12 279874 CASAVA_Build 7 112832597 5I TGATTTAATT -----/ATAAA ATAAAAATCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 ATAAA 1 2 279875 CASAVA_Build 7 112840958 3I GAAATAATGC ---/ATA ATACCTTAAC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 ATA 1 2 279876 CASAVA_Build 7 112846927 2I TAAATAAGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 12 14 279877 CASAVA_Build 7 112848352 1I TAAACTTTTT -/A AAAAGGTACT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 4 5 279878 CASAVA_Build 7 112850625 5D ATTTAAGGGG AAATA/----- AAATAAAATA 3070 het 3070 ref 29 13 11 7 AAATA 3 2 279879 CASAVA_Build 7 112858604 1I ATGAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1064 hom 37 4 23 10 A 11 12 279880 CASAVA_Build 7 112859980 1D TTATATTGTA T/- TAATATACAG 3070 hom 114 het 45 0 39 7 T 2 1 279881 CASAVA_Build 7 112872606 2I TTTATTTTTG --/AA AGTTATCATC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 1 3 279882 CASAVA_Build 7 112886998 4D TCATTTGTCT TCTG/---- TCTATTTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 TCTG 1 0 279883 CASAVA_Build 7 112887265 3D TATGGCCTCC TCT/--- TAATAAAGAG 3070 het 3070 hom 33 10 21 4 TCT 1 0 279884 CASAVA_Build 7 112893266 1I GTTTAAATGG -/A AAAAAAAAAA 2883 het 2883 ref 34 17 8 9 A 10 11 279885 CASAVA_Build 7 112894940 1D AGTTGAACTA C/- CTAACCAATG 3070 het 3070 hom 43 13 19 11 C 2 1 279886 CASAVA_Build 7 112899362 1I CCATCCTGTG -/T TGATAGTGGC 3070 het 3070 ref 35 23 12 0 T 1 2 279887 CASAVA_Build 7 112908947 39D GCACTTAATG TTGTCTTATGCTATTATTGATAATGTTAACTTTAATCAC/--------------------------------------- TTGGTAAAGG 3070 het 3070 ref 41 31 20 2 TTGTCTTATGCTATTATTGATAATGTTAACTTTAATCAC 1 0 279888 CASAVA_Build 7 112920312 1D AGGAACTCTG A/- AAAAAACTTG 2315 het 2315 ref 27 21 5 2 A 7 6 279889 CASAVA_Build 7 112922327 1D GTTTCTTTTT A/- ATCTGTCACG 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 A 2 1 279890 CASAVA_Build 7 112922756 1D AAAGCATGTG C/- CTTCCTTGGT 2271 het 2271 ref 46 39 5 2 C 2 1 279891 CASAVA_Build 7 112934743 2I AGATAATGCC --/AA GAGATAATGT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 0 2 279892 CASAVA_Build 7 112935304 2D AATTTTTTTC CT/-- GCTAAAGAGT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 CT 1 0 279893 CASAVA_Build 7 112938874 2D14M1I AACTGTCAAA TTTTTTTTTAATTTAA-/--ATTTTTTAATTTAAT TTTTTTTTTA 3070 het 464 hom 21 3 12 10 N/A 0 0 279894 CASAVA_Build 7 112945963 1D CTGTTAGGAG A/- AAAGTGTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 4 3 279895 CASAVA_Build 7 112947809 10I CAGCATTTAG ----------/TTGGTCTTGT TTTTTTAACC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 TTGGTCTTGT 0 1 279896 CASAVA_Build 7 112949059 1D GACGGCAAGT A/- AATGAAACTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 3 2 279897 CASAVA_Build 7 112951763 3D TTGTGATGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 22 2 T 13 10 279898 CASAVA_Build 7 112954479 1I TTCCTAAAAA -/T ATTACCTCCT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 0 1 279899 CASAVA_Build 7 112959139 12D AGTCAGGGAA GAAAAAAAGAAG/------------ GAAAAAAAGA 2472 het 2472 ref 24 11 8 6 GAAAAAAAGAAG 1 0 279900 CASAVA_Build 7 112959565 4I TGTATTCTTT ----/AATA AATCTCTTAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 AATA 0 1 279901 CASAVA_Build 7 112967925 5D GTGGATAATA AAAAT/----- AAAACTTGTA 3070 het 3070 hom 32 10 22 1 AAAAT 1 0 279902 CASAVA_Build 7 112969254 1I GATTCAAGAA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 T 7 8 279903 CASAVA_Build 7 112973455 2D AGAAGATAAC AA/-- AGAAAAATAA 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 A 3 1 279904 CASAVA_Build 7 112974009 4D GTATAAAGGA TACT/---- TAAAGATTAG 3070 het 3070 ref 45 24 19 3 TACT 1 0 279905 CASAVA_Build 7 112981821 3I TTACTGAAAG ---/ACA TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 ACA 0 1 279906 CASAVA_Build 7 112994327 4D CTAATATATG TTAA/---- TTAATTATTA 3070 het 3070 ref 23 13 10 1 TTAA 2 1 279907 CASAVA_Build 7 112995925 4D TTGTTTCTGA AAAT/---- AAATAATTTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 AAAT 2 1 279908 CASAVA_Build 7 112997764 2D TAAATACCTT TC/-- TGTTTTATTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 TC 1 0 279909 CASAVA_Build 7 113003211 1D CAGAAAATTA T/- TTTTCTCAAA 3070 het 3070 hom 22 8 9 5 T 5 4 279910 CASAVA_Build 7 113007110 1I TGTTGTATAC -/T TAAAAATTGC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 1 2 279911 CASAVA_Build 7 113010633 1I ATTTTACATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 8 9 279912 CASAVA_Build 7 113011972 2I GAATTCATGA --/AT ATGTTACTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 AT 1 2 279913 CASAVA_Build 7 113013094 1I ACAGCCTGCA -/T TATCTCCATA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 T 1 2 279914 CASAVA_Build 7 113037581 2D CGCTCTAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 A 14 12 279915 CASAVA_Build 7 113039237 1I ATCACACATG -/A AAAAGGAACT 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 A 4 5 279916 CASAVA_Build 7 113039503 2I TTCAATACAA --/TG TGCTGGAGGT 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 TG 1 2 279917 CASAVA_Build 7 113041471 1D GCATGTACAG A/- AAAAAAATCT 2660 het 2660 ref 29 14 10 5 A 8 7 279918 CASAVA_Build 7 113041592 1I ATAAAAACAG -/A GCTAAAATAC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 0 1 279919 CASAVA_Build 7 113045477 1I TAGGTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 27 1 21 5 T 10 11 279920 CASAVA_Build 7 113051491 1I AAGCAGGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 9 10 279921 CASAVA_Build 7 113053459 1I CCAAATTGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 9 10 279922 CASAVA_Build 7 113070172 1D TAAATCCATT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 8 7 279923 CASAVA_Build 7 113093270 3I ATTGATCAGC ---/TTA TTATATGTAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TTA 1 2 279924 CASAVA_Build 7 113094459 1D TAAATATCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 T 9 8 279925 CASAVA_Build 7 113107040 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTACTC 2639 het 1439 hom 13 3 9 1 AG 2 1 279926 CASAVA_Build 7 113114836 1I GAAACATAAT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 A 0 1 279927 CASAVA_Build 7 113120028 1I GATTTTTGAA -/G TTCCCTGTGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 0 1 279928 CASAVA_Build 7 113122815 3D TCTGGCAAGC AGA/--- AGAGCCCTTT 3070 het 3070 ref 41 23 16 4 AGA 2 1 279929 CASAVA_Build 7 113139793 1D CTTCTCTCTG T/- ATCTTTCTGT 3070 het 3070 hom 32 10 15 8 T 1 0 279930 CASAVA_Build 7 113149742 1D AACTTCTGTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 9 8 279931 CASAVA_Build 7 113155201 1I GCATGCCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 A 13 14 279932 CASAVA_Build 7 113158523 1D TCTCCTTGTT G/- GTCTCCTTCA 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 G 2 1 279933 CASAVA_Build 7 113170722 12I AGAGGCAGGC ------------/CTGCCTCTGTAG GCTCCACCTC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CTGCCTCTGTAG 0 1 279934 CASAVA_Build 7 113193421 1I AAAAGGGTTC -/T TTTTTTCACC 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 6 7 279935 CASAVA_Build 7 113196327 4D AGTCTCATAC TTAA/---- TTGATAGTTT 3070 het 3070 ref 48 23 21 8 TTAA 1 0 279936 CASAVA_Build 7 113198059 1I TTCCCAGCAC -/T TCCGTGTCAC 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 T 1 2 279937 CASAVA_Build 7 113202949 1D ATTCCTTAGA T/- TTTTTCCCTT 3070 hom 123 het 45 0 41 5 T 6 5 279938 CASAVA_Build 7 113224641 1I CCAGACATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 35 1 22 12 T 12 13 279939 CASAVA_Build 7 113228409 4D TATATATATG TATA/---- TATATATATA 1562 hom 12 het 11 0 5 6 TA 10 8 279940 CASAVA_Build 7 113232551 1D TTCTCACTCA T/- TTTGAAAGAT 3070 het 3070 ref 45 20 19 8 T 4 3 279941 CASAVA_Build 7 113234946 3I GGAAGAAAAA ---/GGT GGTGCCTCAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 GGT 1 2 279942 CASAVA_Build 7 113256620 1D AAAAACCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 11 10 279943 CASAVA_Build 7 113258797 5I AAAAAAAAGG -----/AAATA AACGCTTACT 3070 hom 61 het 28 0 18 10 AAATA 0 1 279944 CASAVA_Build 7 113260238 1D TCACACACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 15 11 A 10 9 279945 CASAVA_Build 7 113264343 5I AGAATAAATC -----/AAATA AAAGACAGAC 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 AAATA 0 1 279946 CASAVA_Build 7 113275915 1D AGCTCACTGG A/- AAAGAATCAT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 A 4 3 279947 CASAVA_Build 7 113280803 4D CCACAATTAT TTAA/---- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 4 TTAA 1 0 279948 CASAVA_Build 7 113293536 7I TATGTCTCTA -------/ATGCTGT CCTCCATTGC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 ATGCTGT 0 1 279949 CASAVA_Build 7 113294674 1D TTATTTGGTT A/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 1 0 279950 CASAVA_Build 7 113297293 1I AACAACTAGC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 A 7 8 279951 CASAVA_Build 7 113304547 6I5M3D TGATAAATGA ------TAAATTGA/TAGTGTTAAAT--- ACAAATTTCA 3070 hom 63 het 32 0 22 11 N/A 0 0 279952 CASAVA_Build 7 113308006 1D GATGCCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1340 hom 50 5 37 8 T 13 12 279953 CASAVA_Build 7 113317372 1I CTTTATCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 A 11 12 279954 CASAVA_Build 7 113321033 2D AAAACTGAGT TG/-- TTGCATTTCT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TG 1 0 279955 CASAVA_Build 7 113323410 1I GGGATTCATT -/A ACGTGCAGAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 2 279956 CASAVA_Build 7 113324857 1D CTCTTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 37 2 27 8 A 15 14 279957 CASAVA_Build 7 113327356 1I TTAAATTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 10 11 279958 CASAVA_Build 7 113331979 1D AAATACAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 A 9 8 279959 CASAVA_Build 7 113347280 1D AACTGTCACG T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 8 7 279960 CASAVA_Build 7 113366404 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2479 hom 30 8 14 8 A 11 12 279961 CASAVA_Build 7 113380962 1I TTTTTACCAT -/C CCCTTTATTT 3070 het 3070 hom 45 17 17 11 C 3 4 279962 CASAVA_Build 7 113386220 3D CAATTTAAAA AGT/--- AGTAGTCTGA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 AGT 3 2 279963 CASAVA_Build 7 113398863 1I TGCACCCAGG -/A ACAATACTTT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 A 1 2 279964 CASAVA_Build 7 113409201 1I TGTTTTGCTA -/T TTCTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 2 3 279965 CASAVA_Build 7 113411153 1D CATATCAGTG A/- AGAAGTTAAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 2 1 279966 CASAVA_Build 7 113422654 2I TCTTACAAAA --/CT CAACATACTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 CT 0 1 279967 CASAVA_Build 7 113424719 1I GAATGGCTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 A 9 10 279968 CASAVA_Build 7 113428643 1D CAGCTAATAC A/- AAAAACACAC 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 A 6 5 279969 CASAVA_Build 7 113440930 3I AAAGGAAAAG ---/GAA GAAGGGGAAG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 GAA 1 2 279970 CASAVA_Build 7 113441060 4D TTTTCTTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTT 3070 het 762 hom 29 7 10 15 TCTT 3 2 279971 CASAVA_Build 7 113445710 1I GAATCTATCT -/G GGGGAACTTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 G 4 5 279972 CASAVA_Build 7 113457321 1I TGATAACCCC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 T 8 9 279973 CASAVA_Build 7 113457776 2D TCATCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 A 12 10 279974 CASAVA_Build 7 113466242 23I AGAGAGAAAA -----------------------/AAAAAAGAATAGACTAATACCAG ATGCAACTGA 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 AAAAAAGAATAGACTAATACCAG 0 1 279975 CASAVA_Build 7 113466336 2I ACTAAAAAAA --/TC ATTTTACGTG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 TC 0 1 279976 CASAVA_Build 7 113489124 1I TATGATAGTG -/T TTTTTTAACC 3070 het 3070 ref 53 31 17 5 T 6 7 279977 CASAVA_Build 7 113492848 1D GGTTTTCTGG T/- TTTGTTTTGG 1121 het 1121 ref 27 19 4 6 T 4 3 279978 CASAVA_Build 7 113493624 2I GTGTGTATAC --/AT ATATATATAT 3035 het 2659 hom 26 9 13 4 AT 5 6 279979 CASAVA_Build 7 113494381 6I GGATAAAGGG ------/CCTTAA CCTTAACCTT 3070 het 3070 hom 47 22 19 6 CCTTAA 2 3 279980 CASAVA_Build 7 113497959 1I TGTATTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 9 10 279981 CASAVA_Build 7 113508018 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 153 het 153 ref 38 28 2 8 AAG 1 0 279982 CASAVA_Build 7 113553512 5D TGTAGATGGC ACTTG/----- ACTTGAGCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 ACTTG 2 1 279983 CASAVA_Build 7 113586794 2I AATGAAAAAG --/AA AAAAAAACAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 9 279984 CASAVA_Build 7 113586984 1I CGATCACTGG -/A ATTATAGTTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 1 2 279985 CASAVA_Build 7 113588829 1I CTCACAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 33 1 29 3 T 11 12 279986 CASAVA_Build 7 113596450 4I5M1I TGGTGCACTG ----GTGCA-/CCTAGTGGAG CTGTGAGAAG 3070 hom 43 het 17 0 13 7 N/A 0 0 279987 CASAVA_Build 7 113597029 1I GTCCTCACCC -/A AATCTTACCT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 2 3 279988 CASAVA_Build 7 113612518 1I TTTTAAACAG -/T TTTTTTGGCT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 6 7 279989 CASAVA_Build 7 113613830 1I CCTTAGGCAT -/C CCCTACCCCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 3 4 279990 CASAVA_Build 7 113621323 4I TAACCCTGTG ----/CTTT CTTTGGAAAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 CTTT 1 2 279991 CASAVA_Build 7 113660105 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2244 het 259 hom 23 3 12 8 A 15 16 279992 CASAVA_Build 7 113662384 2D TATTCATTGC TA/-- TGTCTCATGG 3070 het 3070 ref 45 20 18 8 TA 1 0 279993 CASAVA_Build 7 113666328 1I CACGTTTCAG -/T TTATAGCTTT 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 T 2 3 279994 CASAVA_Build 7 113669038 1I AAGCCACGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 10 11 279995 CASAVA_Build 7 113670554 1D CATGAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1797 hom 39 13 12 15 A 17 16 279996 CASAVA_Build 7 113671599 2D ATACTTTATT CA/-- CAGTTTGTTA 3070 het 3070 hom 53 19 30 6 CA 2 1 279997 CASAVA_Build 7 113672061 1I TAGTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 7 11 T 10 11 279998 CASAVA_Build 7 113673144 1D AGTTTTTTTT C/- CTTGCGTATT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 C 2 1 279999 CASAVA_Build 7 113674668 3D GTAAAAGTTA ATC/--- ATCATCTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 ATC 3 2 280000 CASAVA_Build 7 113680063 1I TTTTGAAGGG -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 17 8 8 1 T 6 7 280001 CASAVA_Build 7 113682496 1I TGCCCCTACT -/G GGCGATGCCT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 G 2 3 280002 CASAVA_Build 7 113684918 1D CTAGTTTTTT G/- TATTTTTAGT 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 G 1 0 280003 CASAVA_Build 7 113688190 1D GAAATTAACG A/- GTGGGTGGAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 1 0 280004 CASAVA_Build 7 113691604 1I AAAATAGAAG -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 6 7 280005 CASAVA_Build 7 113707055 1I GTTATATTAG -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 T 3 4 280006 CASAVA_Build 7 113711568 1D GCACATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 22 9 A 12 11 280007 CASAVA_Build 7 113723784 1D TCCTGTGGAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 T 10 9 280008 CASAVA_Build 7 113737122 1D CACTCAACTC T/- TTTTTTTTTT 1066 het 1066 ref 24 10 4 10 T 17 16 280009 CASAVA_Build 7 113737802 1I ATTAGCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1764 hom 41 10 19 12 T 14 15 280010 CASAVA_Build 7 113779397 1I CATCTCTAAC -/A AAAAAAAAAA 1097 het 1097 ref 30 20 3 7 A 13 14 280011 CASAVA_Build 7 113803223 1D AATAACAAAG T/- TACATTGCAA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 T 2 1 280012 CASAVA_Build 7 113815686 1D AACTTATCTC T/- TTTTTTTTTT 1275 het 1275 ref 26 17 4 5 T 13 12 280013 CASAVA_Build 7 113822290 1I GTGATGCAGG -/A AAAAAATTCT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 6 7 280014 CASAVA_Build 7 113826286 1D CACTGTTGTT C/- TCACTTTGCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 0 280015 CASAVA_Build 7 113827235 1I GCAACCTCCG -/C CCCCCCGAGT 1861 hom 12 het 5 0 5 0 C 6 7 280016 CASAVA_Build 7 113861730 1D TAATATATAT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 31 het 15 0 10 5 G 11 10 280017 CASAVA_Build 7 113869640 1D GCAAGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 33 3 21 9 T 15 14 280018 CASAVA_Build 7 113873334 1I36M2D GATTAACTAG -TTTTTTTGCTTTTTAATATTAAAAAGATATCATAAGTC/ATTTTTTTGCTTTTTAATATTAAAAAGATATCATAAG-- TGATATTTTT 3070 het 2061 hom 32 5 20 18 N/A 0 0 280019 CASAVA_Build 7 113882311 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1083 hom 13 4 9 1 A 10 9 280020 CASAVA_Build 7 113912817 1D AGGTATTTCA G/- GGTAAATGTT 3070 hom 114 het 42 0 38 5 G 3 2 280021 CASAVA_Build 7 113941769 1I CAACGTTTTT -/A GGTTTCACAT 3070 hom 80 het 31 0 26 5 A 0 1 280022 CASAVA_Build 7 113949053 4I TTAACTTGAT ----/AAAG GAAAAGAAAT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AAAG 0 1 280023 CASAVA_Build 7 113954283 1D CACTAATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 168 hom 29 2 12 15 T 17 16 280024 CASAVA_Build 7 113961598 1I CATTTTAGTT -/A AACACTCAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 2 3 280025 CASAVA_Build 7 113990066 1D CTTAACCCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 372 hom 51 1 44 6 T 10 9 280026 CASAVA_Build 7 113991535 1D TCCCTTTCTG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 114 het 44 0 40 4 T 9 8 280027 CASAVA_Build 7 114058453 1I ATTCAATTGG -/A AAAAAAAAAA 2033 het 2033 ref 41 26 5 10 A 13 14 280028 CASAVA_Build 7 114063916 1D TGAAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 28 2 16 11 T 15 14 280029 CASAVA_Build 7 114077720 1D GTTCATGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 14 9 A 13 12 280030 CASAVA_Build 7 114090728 1I TCTTTATATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 10 11 280031 CASAVA_Build 7 114090854 1D TGTTTAGGGC T/- TTTTTTTTTT 2035 het 2035 ref 30 12 9 10 T 15 14 280032 CASAVA_Build 7 114099911 1I ACTCCTTATT -/C CATCTAATGT 3070 het 16 hom 32 1 30 1 C 1 2 280033 CASAVA_Build 7 114111208 2I TTTCAACCCC --/CT GTGTCTCAGT 3070 hom 126 het 43 0 42 1 CT 0 1 280034 CASAVA_Build 7 114125114 1D ATGAGCTGGG A/- ATAATTTCAG 3070 het 3070 hom 43 12 23 8 A 2 1 280035 CASAVA_Build 7 114129936 1I ACTAAGACGA -/T TTTCTGGCCT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 T 3 4 280036 CASAVA_Build 7 114134704 1I TAAGAAATCT -/C CCCATTTATC 3070 hom 157 het 60 0 53 7 C 3 4 280037 CASAVA_Build 7 114138556 1I TGTTGGGTTT -/G TTTTTTGTTT 3070 het 286 hom 32 2 18 12 G 0 1 280038 CASAVA_Build 7 114140320 1D CTAAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 283 hom 35 1 24 10 T 13 12 280039 CASAVA_Build 7 114141813 1D TGATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 48 1 38 9 T 11 10 280040 CASAVA_Build 7 114142312 1I GCAAAAGCCA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 T 6 7 280041 CASAVA_Build 7 114145687 1D CTGAGTTGAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 A 9 8 280042 CASAVA_Build 7 114161299 1I TTCCAGCATT -/C TGTCTTAGAT 3070 het 3070 ref 54 24 19 11 C 0 1 280043 CASAVA_Build 7 114166783 1D GACTTTGCTC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 48 20 26 2 T 9 8 280044 CASAVA_Build 7 114171649 2I AAACTTAACT --/TG GGGGGGGAAT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 TG 0 1 280045 CASAVA_Build 7 114174754 2I CGCCAGGGAT --/GC GCGCTCACTG 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 GC 2 3 280046 CASAVA_Build 7 114178413 1D TGCTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 T 11 10 280047 CASAVA_Build 7 114178643 8D TCCTGACCTT GTGATCCA/-------- CCCACCTCAG 2076 het 2076 ref 25 10 7 12 GTGATCCA 1 0 280048 CASAVA_Build 7 114191258 1D TGTTGTTGGG A/- GTGTAAATTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 1 0 280049 CASAVA_Build 7 114191875 1I AGTAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 27 6 A 11 12 280050 CASAVA_Build 7 114204632 1D TTTTTGGCTA T/- TTTGTATCAT 3070 het 3070 ref 37 22 11 5 T 4 3 280051 CASAVA_Build 7 114212465 1D CCTACCTCTC T/- TTCCCCCACA 3070 hom 141 het 48 0 47 1 T 3 2 280052 CASAVA_Build 7 114220870 1D ATGTTATTTG A/- AAGGAAATTA 3070 hom 129 het 50 0 43 8 A 3 2 280053 CASAVA_Build 7 114222888 2I GAATCATCAT --/AG AGTCTTTCTG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 AG 1 2 280054 CASAVA_Build 7 114234446 1I AATGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 10 11 280055 CASAVA_Build 7 114238723 1D AAATCTAAAA G/- AAAAAAAACA 3070 hom 120 het 51 0 41 11 G 1 0 280056 CASAVA_Build 7 114244865 4D AAAGCAATTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 TTTG 5 4 280057 CASAVA_Build 7 114245873 1I CATGTTTATC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 T 8 9 280058 CASAVA_Build 7 114246478 2I GGAAATGCAC --/AT GAGTTCATAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AT 0 1 280059 CASAVA_Build 7 114247235 4D GCACCAAAAC AGTT/---- GGTTGGCTGC 3070 het 3070 ref 55 26 23 7 AGTT 1 0 280060 CASAVA_Build 7 114270488 2D TACATTTAAA CT/-- CTCTTTCCAA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 CT 3 2 280061 CASAVA_Build 7 114282506 1D TCTTTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 13 12 280062 CASAVA_Build 7 114297225 1D AACTTATAAA T/- TATTATGGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 1 280063 CASAVA_Build 7 114297772 1I ATATATGTTT -/C CAATGCTATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 1 2 280064 CASAVA_Build 7 114312032 4D CCAGCCATAG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 30 1 20 9 A 14 10 280065 CASAVA_Build 7 114317899 5I GTGGTCAAAG -----/AGAAA AGAAAACTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AGAAA 1 2 280066 CASAVA_Build 7 114322430 1D TAAATTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 29 0 13 16 T 15 14 280067 CASAVA_Build 7 114326869 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1381 het 831 hom 19 6 5 8 A 15 16 280068 CASAVA_Build 7 114343988 4D CTGCAGTATG GTAA/---- GTGTTTGTGA 3070 hom 135 het 49 0 46 5 GTAA 1 0 280069 CASAVA_Build 7 114345111 1I ATTTAAAAAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 8 9 280070 CASAVA_Build 7 114351879 3I GGCCTGAAGT ---/AGC ACATTTGTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AGC 0 1 280071 CASAVA_Build 7 114355276 1D GAAGGACAAG C/- TTAATTAGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 280072 CASAVA_Build 7 114362824 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 9 10 280073 CASAVA_Build 7 114366091 1D TTCAGGTCTA C/- CCTACTAGTT 3070 hom 114 het 42 0 38 6 C 3 2 280074 CASAVA_Build 7 114375514 1I CCATTTATTC -/T TTCTAACTCC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 2 3 280075 CASAVA_Build 7 114377082 1D CACAAACCCT A/- AATGTGGGGA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 3 2 280076 CASAVA_Build 7 114378540 1D TGGTCATCTC T/- GGTTCTTTGC 3070 hom 108 het 42 0 36 7 T 1 0 280077 CASAVA_Build 7 114395122 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 25 1 10 14 T 17 16 280078 CASAVA_Build 7 114401589 2D ATATGCATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 TA 7 6 280079 CASAVA_Build 7 114402853 1D ATTAGCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 39 1 28 11 T 13 12 280080 CASAVA_Build 7 114414050 1I GCCCCATTTT -/G GGCGAATTGC 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 2 3 280081 CASAVA_Build 7 114429437 8D AAAAAACAAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 42 24 13 12 AAAC 5 3 280082 CASAVA_Build 7 114434226 15I TAAAGTATAG ---------------/TTTTACTGTTTTTGC TTTCTAGCTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTTTACTGTTTTTGC 0 1 280083 CASAVA_Build 7 114434921 12D CGTGTGTGTG TATATATATATA/------------ TATATATATA 3070 hom 27 het 13 0 10 5 TA 13 7 280084 CASAVA_Build 7 114440635 1D CTAAGGCTGG A/- ACGAGACATT 3070 het 3070 ref 42 26 11 5 A 2 1 280085 CASAVA_Build 7 114462818 32D AAGTACAGAT TTTTATTATATGCTGGTGAGCTAAGTATATTA/-------------------------------- TTTTATTATA 3070 het 3070 ref 34 21 12 10 TTTTATTATATGCTGGTGAGCTAAGTATATTA 1 0 280086 CASAVA_Build 7 114463111 14I AGAACATTCT --------------/GAATATCTGATACG GAAGAAGTTC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 GAATATCTGATACG 0 1 280087 CASAVA_Build 7 114465550 1D TCTGAGCTAG A/- ACTCTTGATG 3070 het 3070 ref 50 25 19 7 A 2 1 280088 CASAVA_Build 7 114473073 1D GAGATAAAAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 7 6 280089 CASAVA_Build 7 114475148 1D AAAAGTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3003 hom 28 8 17 3 T 11 10 280090 CASAVA_Build 7 114477030 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2278 het 2278 ref 25 9 6 10 TA 8 9 280091 CASAVA_Build 7 114477992 1D CTAGTTGCTA C/- TATATTGGAC 3070 het 3070 ref 62 29 26 8 C 1 0 280092 CASAVA_Build 7 114479470 4I ACTCTGTATC ----/AAAA AAAAAACAAC 786 het 107 hom 19 1 7 11 A 6 10 280093 CASAVA_Build 7 114481855 2I TAATAGGTTG --/TT TTTGCTGCAC 3070 het 3070 ref 71 33 25 13 T 3 5 280094 CASAVA_Build 7 114484154 7I ATTTTGGAAC -------/AATATCT ATTCTTCTAA 3070 hom 60 het 21 0 20 1 AATATCT 0 1 280095 CASAVA_Build 7 114484737 26I GCCAGAGAAC --------------------------/TTTAAGCAAACTTATTGTGAGTAATT GATGAAGAGT 3070 het 3070 hom 43 21 22 2 TTTAAGCAAACTTATTGTGAGTAATT 0 1 280096 CASAVA_Build 7 114489674 1D CTTAGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 T 12 11 280097 CASAVA_Build 7 114489809 2D34M1I AAATAGAAAC AAGAGATTATAATCACTATAGCAATAAAAATGCTAG-/--GAGATTATAATCACTATAGCAATAAAAATGCTAGA AAAAAATAAT 3070 hom 51 het 20 0 18 8 N/A 0 0 280098 CASAVA_Build 7 114490380 1I AAAACACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 37 0 28 9 A 10 11 280099 CASAVA_Build 7 114492325 1D TTCTTGTTTA T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 7 6 280100 CASAVA_Build 7 114492722 1D GTTTAATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 45 0 36 9 T 11 10 280101 CASAVA_Build 7 114493675 1D CCAGTGGGAG C/- ACAGGCTCCA 3070 hom 70 het 36 0 22 15 C 1 0 280102 CASAVA_Build 7 114498175 1D TGGGGAGCTT G/- GGGGGGTGTC 2757 hom 24 het 10 0 9 1 G 7 6 280103 CASAVA_Build 7 114505727 1D GCCTGCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 8 10 T 11 10 280104 CASAVA_Build 7 114510245 1D GGATTTCACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 104 het 43 0 36 7 T 10 9 280105 CASAVA_Build 7 114518842 1D CATTTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 T 12 11 280106 CASAVA_Build 7 114523484 1I CCAAAGCCAC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 8 280107 CASAVA_Build 7 114541841 5I ATTTATGTTT -----/TAAAG TATTTTCTTG 3070 hom 126 het 44 0 43 1 TAAAG 0 1 280108 CASAVA_Build 7 114543125 1D GAAATGTATT C/- CCCCCCAGTT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 7 6 280109 CASAVA_Build 7 114551657 2I CTGATTTTTC --/AA AAGTTGGTGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 2 4 280110 CASAVA_Build 7 114562186 1I TCTTCTTAGC -/G GGGGGGGTTG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 7 8 280111 CASAVA_Build 7 114565354 1I TTCCCCAGGC -/T TTTTATTCAT 3070 hom 86 het 37 0 29 8 T 4 5 280112 CASAVA_Build 7 114602189 1I CTATAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 37 0 30 7 A 10 11 280113 CASAVA_Build 7 114606140 1I AGTCCTACTT -/C CAGAGAACTG 3070 hom 162 het 56 0 54 2 C 1 2 280114 CASAVA_Build 7 114615347 1I ATGGGGTTGA -/T TTTTTTTTTC 2401 hom 12 het 7 0 5 2 T 9 10 280115 CASAVA_Build 7 114615969 2I TTATTAATTA --/TT GTTTGTGATT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 2 280116 CASAVA_Build 7 114616157 1I TGTTACCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 41 2 34 5 A 14 15 280117 CASAVA_Build 7 114620509 4I ACATATACTC ----/ACAT ACATATATAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ACAT 1 2 280118 CASAVA_Build 7 114622026 1I AATTCATTAT -/G AAATATTGAT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 G 0 1 280119 CASAVA_Build 7 114624548 1D GTTGACTTTT G/- GGGGAATAGT 3070 hom 75 het 32 0 25 8 G 5 4 280120 CASAVA_Build 7 114626942 4I TTTTCGAGGC ----/TTTA TTTATTTTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTTA 1 2 280121 CASAVA_Build 7 114630495 2D CCACTTAGAG TC/-- ACCCCCACCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TC 1 0 280122 CASAVA_Build 7 114630701 3D TCAGATATTA TTG/--- TTATTTTAGT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTG 1 0 280123 CASAVA_Build 7 114630791 3D TCTTTTTAAT AAG/--- AAGATATTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AAG 2 1 280124 CASAVA_Build 7 114631083 1D GATTTAAGGG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 8 7 280125 CASAVA_Build 7 114633004 2I GGGGAAGCAA --/AC ACATTCTTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AC 1 2 280126 CASAVA_Build 7 114635956 1D AGAGAAGAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 107 het 44 0 36 8 A 9 8 280127 CASAVA_Build 7 114639274 2I AGCCTCTAAG --/TT TTTTTTGTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 6 8 280128 CASAVA_Build 7 114645493 2I TGAATAACTC --/AA AGACTCATAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 3 280129 CASAVA_Build 7 114646227 4I GAGATCTCTT ----/TCTC TCTCTTTCTC 3070 hom 151 het 57 0 51 6 TC 2 4 280130 CASAVA_Build 7 114647160 2D TTTTAGATGT GA/-- GAGTGTGTGA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 GA 2 1 280131 CASAVA_Build 7 114647351 3I TGGATTTCCC ---/AGA AGGTCATGCA 3070 hom 147 het 56 0 49 7 AGA 0 1 280132 CASAVA_Build 7 114652433 7D GGTGCAGCCC TATCAAG/------- TATCAGAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TATCAAG 1 0 280133 CASAVA_Build 7 114656178 1D TTGGGTTAAG A/- AAAAAAAAAA 1597 het 1597 ref 32 21 4 7 A 13 12 280134 CASAVA_Build 7 114657430 1I CTTATTTCCA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 8 9 280135 CASAVA_Build 7 114677982 1D TCACTAGAAC A/- TAGTCTGACA 3070 hom 126 het 44 0 39 5 A 1 0 280136 CASAVA_Build 7 114720133 2D GTAAGGAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 18 26 8 TG 9 8 280137 CASAVA_Build 7 114720627 2D AAATATAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2298 hom 30 11 12 7 AT 7 6 280138 CASAVA_Build 7 114732169 1I ATTAAACTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 9 280139 CASAVA_Build 7 114736601 16I6M1D GTTATTTGTC ----------------ACTTTAT/ACGAGGTAATATTATGACTTTA- GTGGGCGCTA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 N/A 0 0 280140 CASAVA_Build 7 114736920 2D GCTTCTCAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 30 7 11 12 T 18 16 280141 CASAVA_Build 7 114738667 3I CATAATAAAT ---/AAC AAGCAGATTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AAC 0 1 280142 CASAVA_Build 7 114739456 1D ATTAATGCTA G/- TATGTAGTAA 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 G 1 0 280143 CASAVA_Build 7 114742201 3I ATAACATTCT ---/TCC TCAAGTCACT 3070 hom 104 het 42 0 34 8 TCC 0 1 280144 CASAVA_Build 7 114743764 5D AATGATTATG TGGCT/----- AGTTAAGTGG 1292 hom 12 het 25 0 5 20 TGGCT 1 0 280145 CASAVA_Build 7 114744449 3I TGTTTTAATT ---/GAG GAGATTAATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GAG 1 2 280146 CASAVA_Build 7 114750299 1D AGCCAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 T 11 10 280147 CASAVA_Build 7 114751030 1I ATTTTGTGTA -/T TCTTCCATAT 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 T 1 2 280148 CASAVA_Build 7 114751289 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 A 9 8 280149 CASAVA_Build 7 114752116 1D TAGTAAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 A 10 9 280150 CASAVA_Build 7 114787791 3D AGTTTTTTTT TAG/--- TAGAAGAATA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 TAG 2 1 280151 CASAVA_Build 7 114791665 1D TTGGAATTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 958 hom 22 4 13 5 T 10 9 280152 CASAVA_Build 7 114797786 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 0 1 280153 CASAVA_Build 7 114807906 1D ATCAAAAGAC T/- TTATTAGACA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 T 3 2 280154 CASAVA_Build 7 114832244 1I AGGTTTGATG -/C AAAAGAAATT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 0 1 280155 CASAVA_Build 7 114833358 3D ATGGCAAAAA AAG/--- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 AAG 1 0 280156 CASAVA_Build 7 114836056 1I ATGATAAAGC -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 T 6 7 280157 CASAVA_Build 7 114853237 1D CCATTTTCTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 53 25 22 7 A 9 8 280158 CASAVA_Build 7 114860075 1D TATACATTGA T/- TGAGGAGGAG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 2 1 280159 CASAVA_Build 7 114891463 11I GGCTAGACTC -----------/TTGCTGGCTAA TTGCTCGCTA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 TTGCTGGCTAA 0 1 280160 CASAVA_Build 7 114901939 1D ATCAGTCCTT C/- CCAGTTGTCA 3070 het 3070 hom 45 16 24 6 C 3 2 280161 CASAVA_Build 7 114903717 1I AAAAAAAAAA -/T CTTGCTGATT 3070 het 360 hom 31 1 17 13 T 0 1 280162 CASAVA_Build 7 114906799 4D GTTCAAAGTT CTTC/---- CTTCCTTCCT 2100 het 2100 ref 47 17 14 17 CTTC 4 3 280163 CASAVA_Build 7 114906976 4D TTTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 47 18 18 12 TCTT 5 4 280164 CASAVA_Build 7 114909533 1D ATCAGGCTTG A/- TCAAGTGCAA 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 A 1 0 280165 CASAVA_Build 7 114911849 1D AAAGAATATG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 9 8 280166 CASAVA_Build 7 114913761 2D TTTTCTCAAG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 2425 hom 19 7 11 2 T 11 9 280167 CASAVA_Build 7 114913931 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 67 het 37 0 29 9 T 9 8 280168 CASAVA_Build 7 114916704 1D GAATATTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 10 9 280169 CASAVA_Build 7 114918847 1D TGATTTCTTT A/- ACTAATGAAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 2 1 280170 CASAVA_Build 7 114923198 6D TATGCATTTT CTTAAA/------ CTTAAATTAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 CTTAAA 2 1 280171 CASAVA_Build 7 114927099 1D CAATTGGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 12 11 280172 CASAVA_Build 7 114928116 1I ACCCAGAAAT -/A AAGCTGTGTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 2 3 280173 CASAVA_Build 7 114928891 2D ACTCAATGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 32 1 26 6 A 14 12 280174 CASAVA_Build 7 114930825 9I AAAAACACAA ---------/AAAAAACAC AAAAATTTAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 AAAAAACAC 0 1 280175 CASAVA_Build 7 114931466 1D TTTTTTTGCC G/- AAAACAGTTG 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 G 1 0 280176 CASAVA_Build 7 114932541 1D TTGGTCAAAG A/- GGGAAATAGG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 0 280177 CASAVA_Build 7 114933833 1D TTTTTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2963 hom 34 12 13 10 T 13 12 280178 CASAVA_Build 7 114935145 1D GGACAAAAAA T/- ATCTTTTCAT 3070 het 3070 ref 55 24 23 8 T 1 0 280179 CASAVA_Build 7 114936753 1I TTTATAAAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 T 9 10 280180 CASAVA_Build 7 114937776 1D TATAGCATTG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 7 6 280181 CASAVA_Build 7 114940571 1D AAGTTCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 T 11 10 280182 CASAVA_Build 7 114946623 1D ATAGCTTGTA T/- GAAGGAAGGC 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 1 0 280183 CASAVA_Build 7 114953407 2I AGCTACTTGC --/AT TCTATATTTC 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 AT 0 1 280184 CASAVA_Build 7 114957761 4I AGAATGTTTT ----/AAAC ATACCAATAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AAAC 0 1 280185 CASAVA_Build 7 114966023 1I GATGTTTTCC -/A AAATTACTTG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 3 4 280186 CASAVA_Build 7 114967194 1I GTTCTCAAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 280187 CASAVA_Build 7 114974365 2I GTTTTCTGTC --/TT TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 8 10 280188 CASAVA_Build 7 114995352 1D CATTTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 13 12 280189 CASAVA_Build 7 114999735 1D ATATTAGTTC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 48 21 19 8 A 9 8 280190 CASAVA_Build 7 115073165 1I GTTCAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 469 hom 31 3 21 7 A 12 13 280191 CASAVA_Build 7 115079073 1I GTTCTTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 10 280192 CASAVA_Build 7 115083225 1D CGATTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 34 2 23 9 T 15 14 280193 CASAVA_Build 7 115085193 1I CTTAGATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 T 10 11 280194 CASAVA_Build 7 115086858 2D GTCATCTCGA CT/-- CTAAGTGAAA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 CT 2 1 280195 CASAVA_Build 7 115090401 1I GTCTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 234 hom 31 4 19 8 C 0 1 280196 CASAVA_Build 7 115093304 1D CTTTTTAAAC T/- TTTTTCTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 6 5 280197 CASAVA_Build 7 115097262 1D CCAGTAAGCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 9 8 280198 CASAVA_Build 7 115229060 1D CCAAGAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 64 het 37 1 34 3 T 10 9 280199 CASAVA_Build 7 115246474 1I CCTCTTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 het 343 hom 28 4 19 5 C 0 1 280200 CASAVA_Build 7 115249255 1I TTTCTTATTT -/A TTTTTTTTTT 925 het 142 hom 31 3 6 22 A 0 1 280201 CASAVA_Build 7 115253605 1I TATGTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 9 10 280202 CASAVA_Build 7 115254947 1I TAGCAGAGGG -/A AAAAAACTCT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 6 7 280203 CASAVA_Build 7 115256077 1I TATCAAGTAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 8 9 280204 CASAVA_Build 7 115260813 1D TTAAGAGGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1144 hom 27 8 12 7 T 10 9 280205 CASAVA_Build 7 115265006 1D TGAATTCTCA T/- TTTTTTTTTT 1658 het 1477 hom 20 6 4 10 T 13 12 280206 CASAVA_Build 7 115265293 1D GCTGCACCCA T/- TAACTCGTCA 2279 het 1889 hom 10 5 5 0 T 2 1 280207 CASAVA_Build 7 115269075 15D TGGCCTCCCA AGGTGCTGGGATTAC/--------------- AGGTGTGAGC 3070 het 2271 hom 15 6 8 3 AGGTGCTGGGATTAC 1 0 280208 CASAVA_Build 7 115277664 1I TTTTCTCTAT -/G GGTCTTTTAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 2 3 280209 CASAVA_Build 7 115285460 1D AGCAAACATG T/- TTTTTTTTTT 2987 het 31 hom 26 1 10 15 T 17 16 280210 CASAVA_Build 7 115294877 1D TTCTGAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 218 hom 28 1 25 2 A 10 9 280211 CASAVA_Build 7 115297102 1D ATTACTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 36 1 29 8 A 14 13 280212 CASAVA_Build 7 115307787 5D TGCCTAGTGG TCTTT/----- TCTTTTTATC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TCTTT 2 1 280213 CASAVA_Build 7 115309953 1D CTTTTAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 25 0 20 5 A 12 11 280214 CASAVA_Build 7 115328037 1D CAAAAGTTGG A/- AAAAAAAAAA 2796 het 2796 ref 39 26 8 5 A 13 12 280215 CASAVA_Build 7 115334057 1I TTCTTTTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 414 hom 39 1 30 8 T 9 10 280216 CASAVA_Build 7 115335877 1D TCTTGGAAAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 46 10 29 7 A 8 7 280217 CASAVA_Build 7 115336010 1D TGAATTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 35 0 28 7 A 11 10 280218 CASAVA_Build 7 115337403 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1085 het 1085 ref 47 30 3 14 T 11 12 280219 CASAVA_Build 7 115347964 3D GGATAACACA AGT/--- AATTTCAGAA 3070 het 3070 hom 35 15 20 1 AGT 1 0 280220 CASAVA_Build 7 115350867 1I TAATTAATTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 19 15 11 T 9 10 280221 CASAVA_Build 7 115351239 1I TGAAAAAAAA -/T ATTTTATCTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 0 1 280222 CASAVA_Build 7 115351853 1I AGGATCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 876 hom 33 2 27 4 A 11 12 280223 CASAVA_Build 7 115359266 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 24 13 8 A 10 9 280224 CASAVA_Build 7 115372413 1D TAAACTCAAA C/- TAAAATCTTG 3070 het 1618 hom 31 5 15 11 C 1 0 280225 CASAVA_Build 7 115372431 1D TTGTATGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1763 hom 33 6 18 10 T 12 11 280226 CASAVA_Build 7 115375062 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTCTTG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 6 7 280227 CASAVA_Build 7 115400388 1D ATGAAAACTG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 8 7 280228 CASAVA_Build 7 115401878 4D TGGAAATCAG TATC/---- TACATAAATA 3070 het 3040 hom 20 8 10 3 TATC 1 0 280229 CASAVA_Build 7 115405201 1D TAGAAAAAAA C/- ATAATGATGA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 C 1 0 280230 CASAVA_Build 7 115409124 1I AAGCAGGAGG -/T TAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 1 2 280231 CASAVA_Build 7 115412312 1I64M1D ATGGGTAGTG -AAAATCTAGATGATTTTTTTCTACTTTTCTGTACTTCCCTATTTCTATCCTGAGCCCAGTTTTAT/AAAAATCTAGATGATTTTTTTCTACTTTTCTGTACTTCCCTATTTCTATCCTGAGCCCAGTTTTA- TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 34 26 20 4 N/A 0 0 280232 CASAVA_Build 7 115414209 1I AAGTATATAT -/A AAAAAAACAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 8 280233 CASAVA_Build 7 115426142 4D TTAGCGCTAA AGAG/---- AGAGAGAGCA 3070 het 3070 ref 30 12 10 10 AG 6 4 280234 CASAVA_Build 7 115430542 1D CTTTAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 17 0 13 4 A 11 10 280235 CASAVA_Build 7 115445272 12I TCCAGTGTTG ------------/TGCACAGTGTTT GGCAAATATT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TGCACAGTGTTT 0 1 280236 CASAVA_Build 7 115456223 2D TCCACTATAT AA/-- GTTAGTAGTA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 2 0 280237 CASAVA_Build 7 115460424 1D ATGATTCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 15 9 A 14 13 280238 CASAVA_Build 7 115466419 1I GAATATGTTA -/C TAGGACAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 C 0 1 280239 CASAVA_Build 7 115469356 1D AATTTTAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 50 20 21 10 A 9 8 280240 CASAVA_Build 7 115487489 3I AGATTTAAAA ---/ATG GTACTAAAGT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 ATG 0 1 280241 CASAVA_Build 7 115488972 1I CGAGACTAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 A 8 9 280242 CASAVA_Build 7 115489286 1D CTGGTAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 21 18 12 T 13 12 280243 CASAVA_Build 7 115501482 1I ACATTATATA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 T 6 7 280244 CASAVA_Build 7 115505619 3I GAAAAGAAAT ---/AAA GAAGATCAGA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 0 3 280245 CASAVA_Build 7 115518595 1I CTCATTTAGC -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 6 7 280246 CASAVA_Build 7 115519152 1D TAATTACGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 A 10 9 280247 CASAVA_Build 7 115532044 1D TGTATTTCAC A/- AAAAAAAAAA 1948 het 1948 ref 34 24 5 5 A 13 12 280248 CASAVA_Build 7 115541684 1D AAACAAAAAT A/- AAACAAAATA 3070 het 3070 ref 34 15 17 3 A 4 3 280249 CASAVA_Build 7 115544125 7D CAGTCACTTA TCACTAG/------- TCACAGGAAG 3070 het 3070 ref 46 28 18 1 TCACTAG 1 0 280250 CASAVA_Build 7 115556623 1D ACCCTTGTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 10 9 280251 CASAVA_Build 7 115560550 1I CCTTAATTAG -/A AAAAGTCTGG 3070 het 3070 hom 42 16 14 12 A 4 5 280252 CASAVA_Build 7 115560978 1I TGACTGAATT -/G TTCTTTGAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 0 1 280253 CASAVA_Build 7 115571504 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1166 hom 18 7 9 2 A 13 12 280254 CASAVA_Build 7 115577352 4D AAATTGAGAA GTTT/---- GTTTCTGTTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 GTTT 2 1 280255 CASAVA_Build 7 115588705 3I CAATAAAAAT ---/AAG AAGAAAATAA 3070 het 3061 hom 26 8 14 4 AAG 1 2 280256 CASAVA_Build 7 115606914 5D TCACCTCACT TTAAC/----- TTATCTCTTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 6 TTAAC 1 0 280257 CASAVA_Build 7 115610356 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 50 24 20 7 T 8 7 280258 CASAVA_Build 7 115611352 1I CTTAATTGGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 42 12 26 4 T 7 8 280259 CASAVA_Build 7 115616207 1D GTGACCTCTA G/- GATAACATCA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 G 2 1 280260 CASAVA_Build 7 115619217 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1829 hom 27 8 11 8 A 14 13 280261 CASAVA_Build 7 115619678 1I AAGTTGGGTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 7 8 280262 CASAVA_Build 7 115623557 1D GGATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 T 11 10 280263 CASAVA_Build 7 115629514 3D GTTTTAAAAA TAT/--- TATTATGAAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TAT 3 2 280264 CASAVA_Build 7 115635141 2D TCTCTGTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TC 6 5 280265 CASAVA_Build 7 115636230 1I GTTGACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 953 hom 23 2 17 4 A 11 12 280266 CASAVA_Build 7 115637421 4D ATCCCTACAA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 TC 7 5 280267 CASAVA_Build 7 115639100 1D TGGATTTTTG A/- AAATGGATAC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 4 3 280268 CASAVA_Build 7 115645602 1I CAGAAAAGAT -/G GGCATTCAGC 3070 hom 117 het 44 0 38 6 G 2 3 280269 CASAVA_Build 7 115645972 1D AAAATACCGA T/- GTCACCTTTG 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 T 1 0 280270 CASAVA_Build 7 115652161 1D GTTTGGAGGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 48 24 18 7 A 9 8 280271 CASAVA_Build 7 115658079 1D TTTGGCTCTT C/- CTTTGCCCTC 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 C 2 1 280272 CASAVA_Build 7 115658781 9I TACATATTAC ---------/AGAGATGCA AGACATCCGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AGAGATGCA 0 1 280273 CASAVA_Build 7 115659847 2I GAAAAAGAAA --/AC ACTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 AC 1 2 280274 CASAVA_Build 7 115662054 2D AATACAACAT AA/-- AAAGTGTTCT 3070 het 3070 ref 38 17 16 6 A 5 3 280275 CASAVA_Build 7 115662244 1I TATTTGTTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 9 10 280276 CASAVA_Build 7 115665770 2D GAATGATTTC TA/-- TGTGTCACAC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TA 1 0 280277 CASAVA_Build 7 115667176 1I TTATAGCCAG -/T TTATTTCACA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 2 3 280278 CASAVA_Build 7 115673344 1D AACTACGATT C/- AAGATGAAAT 3070 het 3070 hom 63 29 31 3 C 1 0 280279 CASAVA_Build 7 115674167 2I TCTGTGTATG --/TA TGTGTGTGTG 529 het 529 ref 44 18 8 18 TA 0 1 280280 CASAVA_Build 7 115681615 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 7 8 280281 CASAVA_Build 7 115682292 4I TTCATCTTAA ----/AGAG AGAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 AG 3 5 280282 CASAVA_Build 7 115683232 3I AGAAAATAAG ---/ACA ACATTCTAAA 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 ACA 1 2 280283 CASAVA_Build 7 115683365 4I TGTGTTGATC ----/AAAG AAAGAATTTT 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 AAAG 1 2 280284 CASAVA_Build 7 115684929 1D TCTTCATCAA T/- TTTTTTTCGG 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 T 8 7 280285 CASAVA_Build 7 115685029 2I GAAATCATTT --/AG TTGGAAGCTT 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 AG 0 1 280286 CASAVA_Build 7 115685481 3D TAGTTCTTTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 13 10 280287 CASAVA_Build 7 115685852 1D TTAGATAAGA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 26 8 13 6 T 8 7 280288 CASAVA_Build 7 115688055 1I AAGACACTTT -/C TTGCCACATC 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 C 0 1 280289 CASAVA_Build 7 115689842 10D34M1D21M1I AATTAAACTC ATTTTCTCCTATTTTCTCCTACTTCACTCTCAGCAACACATTTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTT-/----------ATTTTCTCCTACTTCACTCTCAGCAACACATTTC-TTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTC TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 13 14 7 N/A 0 0 280290 CASAVA_Build 7 115693974 1D TCTCCTTATC A/- AATGTGATAG 3070 het 3070 ref 41 19 19 4 A 3 2 280291 CASAVA_Build 7 115698796 1D GGTTGTATCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 9 10 11 T 9 8 280292 CASAVA_Build 7 115703837 1D ATAATTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 8 T 11 10 280293 CASAVA_Build 7 115708544 1I TGCTTTTAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 9 10 280294 CASAVA_Build 7 115715918 2I AATTTTTTTT --/TG TTTTTTATAT 1106 het 1027 hom 14 7 3 4 TG 0 1 280295 CASAVA_Build 7 115718558 3D TTCCACTTGA GAG/--- GAGAAGGGAG 3070 het 3070 ref 48 30 15 3 GAG 2 1 280296 CASAVA_Build 7 115761012 1D AACTATTTTT A/- ATATGTCTAA 3070 het 1069 hom 32 3 14 15 A 2 1 280297 CASAVA_Build 7 115761046 1I ATACCCAGAT -/G AAAGTAGGAA 3070 het 2643 hom 32 7 18 7 G 0 1 280298 CASAVA_Build 7 115766935 4I ATAAATTGTT ----/TCTC TCTGGTGAGG 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 TC 1 3 280299 CASAVA_Build 7 115771251 1I TCTCTACTTT -/A AAAAAAAAAA 1506 het 1506 ref 28 14 5 9 A 15 16 280300 CASAVA_Build 7 115773080 4D AGACAGAAAA TAAG/---- TAAGGAAACA 2550 het 2521 hom 13 6 6 1 TAAG 2 1 280301 CASAVA_Build 7 115787304 5D CTCACAGAAC TTTAT/----- TTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 18 9 9 2 TTTAT 1 0 280302 CASAVA_Build 7 115793619 1I TTCAAATTAA -/T TTTTTTTTAA 1798 het 1798 ref 17 8 6 3 T 8 9 280303 CASAVA_Build 7 115797803 3I ATGTCTTTAT ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 72 het 35 0 25 10 AAG 4 5 280304 CASAVA_Build 7 115804658 1I CCTAAAACTT -/A AAAGTATAAT 3070 het 412 hom 15 1 13 1 A 3 4 280305 CASAVA_Build 7 115806275 2I TAATGTGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 500 hom 36 3 22 11 AT 8 9 280306 CASAVA_Build 7 115806599 2I TATTCTATTG --/CT CTGTTTATTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CT 1 2 280307 CASAVA_Build 7 115806924 1I GAATAGAGAT -/A ACCAGGCAGG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 1 2 280308 CASAVA_Build 7 115807875 1D AAGCTTCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 15 7 A 10 9 280309 CASAVA_Build 7 115811398 5D AATCTGCTCA CTTAT/----- CTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 39 19 18 3 CTTAT 1 0 280310 CASAVA_Build 7 115818151 1D TAAAGTAATA T/- GCTATTCTAT 3070 het 3070 hom 42 15 23 4 T 1 0 280311 CASAVA_Build 7 115834893 1I TCTGGATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 10 11 280312 CASAVA_Build 7 115847956 2I GACCCAGAAT --/AG AGTTTAAGAC 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 AG 1 2 280313 CASAVA_Build 7 115851444 14D TTATTTCTCT GGTTTACACCAGCA/-------------- GTGTAGTGTT 3070 het 3070 ref 37 20 15 8 GGTTTACACCAGCA 1 0 280314 CASAVA_Build 7 115853434 5I TTCCAAAGTG -----/CTTAT ATTATTGTAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 CTTAT 0 1 280315 CASAVA_Build 7 115856418 2D GTGTGTAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AT 7 6 280316 CASAVA_Build 7 115859687 1I GACATCCTTT -/G TAATGATGTC 3070 het 3070 hom 60 27 30 3 G 0 1 280317 CASAVA_Build 7 115870325 1I CTTTAAATAG -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 T 6 7 280318 CASAVA_Build 7 115874714 2D AATTTTAAAA CT/-- CTTTTTAAAT 3070 het 431 hom 15 2 8 5 CT 2 1 280319 CASAVA_Build 7 115876484 10D TTTGTTTATC CTCTTTTCTT/---------- CTCTAGATCT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 CTCTTTTCTT 1 0 280320 CASAVA_Build 7 115876541 1I ATAGAATCAC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 30 8 12 10 A 6 7 280321 CASAVA_Build 7 115877681 2I TGAGTGCAAA --/TT TCTCTACAGC 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 T 1 3 280322 CASAVA_Build 7 115879261 1I GTCCTGCTTC -/T TTTTTTAGCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 6 7 280323 CASAVA_Build 7 115883264 2D ATGTGGCTGA CT/-- CTCTTTTCGG 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 CT 3 2 280324 CASAVA_Build 7 115890738 1D AACCCACTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 A 10 9 280325 CASAVA_Build 7 115897731 1D CTTCAAAATG T/- TTCCATTCAT 3070 het 3070 hom 54 20 32 2 T 3 2 280326 CASAVA_Build 7 115912644 4I CCCAGCATTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 18 9 9 TTTG 2 3 280327 CASAVA_Build 7 115916969 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 957 het 957 ref 9 5 4 0 A 17 18 280328 CASAVA_Build 7 115920504 2D CTTTTGAAAT AA/-- GACATTTATC 3070 het 3070 ref 40 19 19 3 A 2 0 280329 CASAVA_Build 7 115929769 1I AAAAGTTAGC -/T TATGCCTTGA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 T 1 2 280330 CASAVA_Build 7 115935644 1D ATTTCTGAAC A/- GTACTGGTTA 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 A 1 0 280331 CASAVA_Build 7 115955313 1I TAGAATTGCT -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 A 6 7 280332 CASAVA_Build 7 115958071 1I AAATGCGGAG -/T TCTGTAAATC 3070 het 3070 ref 52 31 16 5 T 1 2 280333 CASAVA_Build 7 115973988 1D ACTCTGTCAC A/- AAAAAAAAAA 1914 het 1231 hom 24 6 8 11 A 17 16 280334 CASAVA_Build 7 115984089 2I AAATGTGTGT --/AC CCATTTCAGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AC 0 1 280335 CASAVA_Build 7 115989134 4D AGATGGAGAT AGAG/---- AGATGAAAAT 3070 hom 45 het 29 0 16 14 AG 3 1 280336 CASAVA_Build 7 115993295 1D TGGTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 30 1 20 10 T 13 12 280337 CASAVA_Build 7 115996107 2D TACAGTATAT TA/-- TATATATATA 2859 hom 18 het 8 0 7 1 TA 10 9 280338 CASAVA_Build 7 116016532 2D ATAGAAATAA GT/-- GTATTTAATC 3070 het 3070 ref 44 19 19 9 GT 2 1 280339 CASAVA_Build 7 116061126 2D TTTTGCCAAA CT/-- TTATTAGTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CT 1 0 280340 CASAVA_Build 7 116092551 1I TACATTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 48 1 38 9 A 10 11 280341 CASAVA_Build 7 116098860 1D CCGGCTATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 20 1 12 9 A 13 12 280342 CASAVA_Build 7 116152060 1D CTCCCTTTAC A/- GGCAGAAAAT 3070 hom 130 het 47 0 43 4 A 1 0 280343 CASAVA_Build 7 116219376 1I TATCAATTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 8 9 280344 CASAVA_Build 7 116235268 1I AATTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 44 1 37 6 T 11 12 280345 CASAVA_Build 7 116240516 1D TTCCATCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 24 2 13 9 T 13 12 280346 CASAVA_Build 7 116241297 1I TTTTCCCCCC -/T GAGACTGAGT 3070 hom 66 het 31 0 21 10 T 0 1 280347 CASAVA_Build 7 116243580 1D CATTTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 35 1 25 11 A 13 12 280348 CASAVA_Build 7 116245474 1I ACCTGAGGTC -/G GGGAGTTCAA 3070 hom 44 het 16 0 14 2 G 3 4 280349 CASAVA_Build 7 116258126 10I CAAAAAAAAT ----------/AAATAAATAA AAATAAATAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 AAATAAATAA 1 2 280350 CASAVA_Build 7 116259303 1I TAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 211 hom 35 1 29 5 A 10 11 280351 CASAVA_Build 7 116261472 1I TGTAATTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 10 11 280352 CASAVA_Build 7 116268802 1D GAATGTTATG A/- AAAAACTGTG 3070 hom 99 het 37 0 33 5 A 6 5 280353 CASAVA_Build 7 116273057 1I TTAAAGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 11 12 280354 CASAVA_Build 7 116274323 1I ACTGAGACCC -/A CCCATCTTCC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 0 1 280355 CASAVA_Build 7 116277702 1D AAAAAAAAAC G/- GGGAAAGAGG 3070 het 987 hom 34 3 23 8 G 4 3 280356 CASAVA_Build 7 116286389 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 11 10 280357 CASAVA_Build 7 116303004 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 13 14 280358 CASAVA_Build 7 116326951 1I AAGATTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 12 13 280359 CASAVA_Build 7 116356373 4I TCCTTGGGGG ----/GGGA GGGGGTAAAT 3070 hom 59 het 26 0 21 5 GGGA 0 1 280360 CASAVA_Build 7 116362107 1D TCCCCCTTTC T/- TTTTTTTTTC 575 het 575 ref 48 29 2 17 T 10 9 280361 CASAVA_Build 7 116372054 2I GAGACAAAAT --/TG TACTGTAAAA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TG 0 1 280362 CASAVA_Build 7 116374175 8D TGGCTGGGGC AGGGTTTT/-------- AGGGTGGAGA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AGGGTTTT 1 0 280363 CASAVA_Build 7 116375577 1D AGAAACAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 18 2 12 4 T 15 14 280364 CASAVA_Build 7 116386113 1D CTTTATTGCT A/- AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 27 20 3 4 A 11 10 280365 CASAVA_Build 7 116428622 1D CTTTTGCCTG A/- AAAAAACATA 3070 hom 87 het 40 0 30 11 A 7 6 280366 CASAVA_Build 7 116441578 9I TATGCTCAAG ---------/ATTGAAACA ATTGGCAATG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 ATTGAAACA 0 1 280367 CASAVA_Build 7 116443795 4D TTGTTGTTCT TAAG/---- TAATACTTTA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TAAG 1 0 280368 CASAVA_Build 7 116447701 1D TTCAATCACA C/- CGGGAGAAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 C 2 1 280369 CASAVA_Build 7 116449345 1D TGCAGAAGTC T/- TTGGTTCTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 3 2 280370 CASAVA_Build 7 116451068 2I TTAATTTGAT --/TA TATATATATA 3070 het 66 hom 27 1 17 9 TA 8 9 280371 CASAVA_Build 7 116457047 1I TAAATGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1388 hom 42 3 31 8 T 12 13 280372 CASAVA_Build 7 116463110 1D AGAATCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 32 1 26 5 T 11 10 280373 CASAVA_Build 7 116478219 1D ACTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 27 3 12 12 A 17 16 280374 CASAVA_Build 7 116480396 4D AGCATTTAAG TTGT/---- TTGTTGTTCT 3070 het 3070 ref 26 11 12 6 TTGT 2 1 280375 CASAVA_Build 7 116618802 1I ATATTTCCAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 9 280376 CASAVA_Build 7 116623677 5D ACATTCCCAC CAACA/----- GTGCACAAGG 3070 hom 75 het 29 0 23 6 CAACA 1 0 280377 CASAVA_Build 7 116628851 1D TTGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 1361 het 1361 ref 29 17 3 9 T 12 11 280378 CASAVA_Build 7 116658053 2D TTACTTAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 1118 het 1118 ref 29 20 3 7 A 15 13 280379 CASAVA_Build 7 116670900 1D GCATTGGTGT G/- GTCAGTAGAT 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 G 2 1 280380 CASAVA_Build 7 116682491 1I AGAGTGTATT -/C CCCCCACAGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 5 6 280381 CASAVA_Build 7 116684280 4I TGGGACCCAG ----/TTTT TTTGTTTGTT 3070 hom 79 het 33 0 27 6 T 3 7 280382 CASAVA_Build 7 116728339 1I ACTTTCCTCC -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 T 7 8 280383 CASAVA_Build 7 116741982 5D ATGCTCTGGG TCTAA/----- TCTTTATATC 3070 het 3070 ref 56 33 19 5 TCTAA 1 0 280384 CASAVA_Build 7 116744800 1D CCATGTAGAT A/- ATAGCCCTAA 3070 het 3070 ref 32 20 8 5 A 2 1 280385 CASAVA_Build 7 116746813 1D CTTAGGAATT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 1748 hom 35 11 15 9 G 11 10 280386 CASAVA_Build 7 116750170 1I TCTCCAAAAT -/C CCCCCGCGCC 2530 het 2530 ref 21 9 8 4 C 5 6 280387 CASAVA_Build 7 116756416 1D CCACATATTC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 A 8 7 280388 CASAVA_Build 7 116762950 1D AAGAAAAAAA T/- ATTTATGAAT 3070 het 2920 hom 22 10 10 2 T 1 0 280389 CASAVA_Build 7 116766686 1I TCAGCCTCCC -/A AAAGTGCTGG 2738 het 470 hom 10 1 6 3 A 3 4 280390 CASAVA_Build 7 116817470 1I ACAGTGGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 10 11 280391 CASAVA_Build 7 116820446 1D TGGGTAGCAT A/- AAAAAAAAAA 2817 het 2817 ref 24 12 8 4 A 12 11 280392 CASAVA_Build 7 116825122 1D GAAAGTGCCA T/- GGATTGGCTG 3070 het 3070 ref 47 20 15 13 T 1 0 280393 CASAVA_Build 7 116828672 1D AGCAAAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 13 8 T 13 12 280394 CASAVA_Build 7 116830252 4I AGAAAAAGAC ----/TTAG TTAGCATGAT 3070 hom 118 het 42 0 39 3 TTAG 1 2 280395 CASAVA_Build 7 116834045 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2391 het 1417 hom 11 4 5 2 A 12 11 280396 CASAVA_Build 7 116845943 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2234 het 854 hom 9 4 5 1 A 15 14 280397 CASAVA_Build 7 116858606 2D CCTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 9 10 T 13 11 280398 CASAVA_Build 7 116866996 1D ATCCACGCTG T/- TTTTTTTTTC 2816 het 2816 ref 20 11 6 3 T 10 9 280399 CASAVA_Build 7 116874611 1D CCCTTGGTAA C/- CTCTACTCTC 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 C 2 1 280400 CASAVA_Build 7 116876230 2D TGGTGAAAGA CT/-- CTTTCTGTTT 3070 het 3070 hom 44 18 23 4 CT 2 1 280401 CASAVA_Build 7 116894617 1D CAGATTGAAT A/- TAATTATTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 1 0 280402 CASAVA_Build 7 116895180 1I ATAAAGTGTA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 23 7 10 6 T 7 8 280403 CASAVA_Build 7 116921729 1D ATTCCTGACT C/- CTATAACCCA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 C 2 1 280404 CASAVA_Build 7 116947556 1D TTCTAGTGAG T/- TTTTTTTTTT 2828 het 2614 hom 28 11 8 9 T 17 16 280405 CASAVA_Build 7 116951134 1D GTGGAAGAGA T/- TTTATTTCAC 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 T 4 3 280406 CASAVA_Build 7 116966044 1D AAGATGGCAT A/- AGCTGTAACT 3070 het 3070 hom 52 20 29 3 A 2 1 280407 CASAVA_Build 7 116966712 1D ACCACTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1001 het 1001 ref 28 21 4 4 T 11 10 280408 CASAVA_Build 7 116968941 1D AAGACATTCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 T 8 7 280409 CASAVA_Build 7 116976051 4D CCTGAAAGAT ATTA/---- ATTTCAAGAT 3070 het 3070 ref 67 39 13 17 ATTA 1 0 280410 CASAVA_Build 7 116976119 1I GCAAGGTAGT -/C TCTTTTGTTC 2719 het 2719 ref 40 23 7 10 C 0 1 280411 CASAVA_Build 7 116976308 1D CCTCATATTA T/- TTTCAGTGGC 3070 het 3070 ref 88 69 10 9 T 4 3 280412 CASAVA_Build 7 116988600 1D GAAGAACATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2587 hom 29 6 17 7 T 10 9 280413 CASAVA_Build 7 116999277 1I AGGAAAAACC -/T TTTTTTTATT 3070 het 2523 hom 25 8 15 2 T 7 8 280414 CASAVA_Build 7 117010933 1D ATGAGTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 T 11 10 280415 CASAVA_Build 7 117022433 2D ATGCACACAC AT/-- AAATATGTAT 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 AT 1 0 280416 CASAVA_Build 7 117023472 1I GCTGCGGGTG -/C CCTTGTGGGC 1563 hom 24 het 10 0 8 2 C 2 3 280417 CASAVA_Build 7 117029261 3D TCCTAGTACC AAT/--- AATATGTTTT 3070 het 3070 ref 40 23 15 4 AAT 2 1 280418 CASAVA_Build 7 117039299 46D GAAATCGGAT ATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATATATAC/---------------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 6 het 14 1 15 1 ATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATATATAC 1 0 280419 CASAVA_Build 7 117043526 1I TACCTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 37 1 24 12 T 10 11 280420 CASAVA_Build 7 117047365 1D ATTTCTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 17 17 12 T 11 10 280421 CASAVA_Build 7 117064513 1I TCAAATGGTG -/T TTTTTTTTTT 2422 het 2422 ref 32 10 10 12 T 13 14 280422 CASAVA_Build 7 117074970 1D AGCTAATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 756 hom 25 3 13 9 A 15 14 280423 CASAVA_Build 7 117087321 1D CTCTTAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 T 13 12 280424 CASAVA_Build 7 117094523 1D ATGAATTAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 9 8 280425 CASAVA_Build 7 117096641 3D GTAATAGATT AAC/--- AACAATAATC 3070 het 3070 ref 48 22 22 5 AAC 2 1 280426 CASAVA_Build 7 117098213 1I ACACATTATT -/A ATTGCCCAAA 3070 het 3070 hom 42 11 27 4 A 1 2 280427 CASAVA_Build 7 117138065 3I TGCTACTAGA ---/AAT AATATTGAAG 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 AAT 1 2 280428 CASAVA_Build 7 117144273 6D23M6I CAGGTCTTTG CCGTTCTCATCTACTCCCAAGGTGGCTTA------/------TAAGCCACCTTGGGAGTAGATGAGAACGG CAATCAATCA 3070 hom 108 het 32 0 36 1 N/A 0 0 280429 CASAVA_Build 7 117147476 2D TCATCTCCCT TC/-- TCTCTCTTTA 3070 het 3070 hom 53 16 24 14 TC 4 3 280430 CASAVA_Build 7 117148271 4I GTCATTCAAA ----/TAAT TGAGAACATG 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 TAAT 0 1 280431 CASAVA_Build 7 117152991 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 42 21 12 9 T 7 8 280432 CASAVA_Build 7 117158157 1D ATATTCAGAA T/- TAAATATAAT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 2 1 280433 CASAVA_Build 7 117168781 1D TCATTTGCAA T/- TTTAAAAAGT 3070 het 3070 hom 49 18 28 4 T 4 3 280434 CASAVA_Build 7 117202875 1D TTGTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1159 het 1159 ref 46 30 3 13 T 12 11 280435 CASAVA_Build 7 117222470 1I ACAGGCGTGA -/G CGACCGCGCC 3070 hom 33 het 13 0 10 3 G 0 1 280436 CASAVA_Build 7 117236479 1D AAGTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 A 12 11 280437 CASAVA_Build 7 117241538 1I CATTTAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1150 hom 38 3 28 7 T 11 12 280438 CASAVA_Build 7 117249522 1D TAATGCTAAT C/- CCCTTTTTCC 3070 hom 104 het 42 0 34 8 C 4 3 280439 CASAVA_Build 7 117251471 1I AACTTTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 33 1 29 3 T 11 12 280440 CASAVA_Build 7 117258974 3D CATGTTGGCT AGA/--- AGGAGCCTAT 3070 hom 121 het 46 0 39 8 AGA 1 0 280441 CASAVA_Build 7 117260210 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 41 het 16 0 13 3 T 9 8 280442 CASAVA_Build 7 117297087 1D ATTTAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 10 9 280443 CASAVA_Build 7 117306275 1I TTGAGACGGA -/G TCTCACTCGT 3070 hom 57 het 20 0 18 2 G 0 1 280444 CASAVA_Build 7 117311448 1I AGAGGTTTTT -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 6 7 280445 CASAVA_Build 7 117319247 1I AAGCAAATAA -/G GGTTAATTTT 3070 hom 177 het 72 0 58 14 G 2 3 280446 CASAVA_Build 7 117331744 1D CATTCATGCT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 128 het 46 0 43 3 A 9 8 280447 CASAVA_Build 7 117347150 4D ACTCCCCAAA AATC/---- ACACTAGCTC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 AATC 1 0 280448 CASAVA_Build 7 117349340 5I GTAACAATAA -----/AAAAT AAAATACAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AAAAT 1 2 280449 CASAVA_Build 7 117359353 3D GTGGCTCTAG ACA/--- ACAACAATGT 3070 het 3070 ref 48 24 18 7 ACA 3 2 280450 CASAVA_Build 7 117363293 1I CCATGCTCGA -/G TTTCCAGCCT 3070 hom 153 het 61 0 48 13 G 0 1 280451 CASAVA_Build 7 117377516 1I TTACGGTATT -/A AATTTTTTTT 3070 het 358 hom 39 3 32 4 A 2 3 280452 CASAVA_Build 7 117418529 1D ATTGTGCCTA T/- TTCACTTAGT 3070 het 3070 ref 61 26 25 10 T 3 2 280453 CASAVA_Build 7 117421510 1D CAATTAAACC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 8 7 280454 CASAVA_Build 7 117437481 1D TTTCTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2589 hom 30 10 16 4 T 11 10 280455 CASAVA_Build 7 117498944 1D TTAAAGTACC A/- AAAAAAAAAA 1407 het 1407 ref 45 30 6 9 A 13 12 280456 CASAVA_Build 7 117499514 1I ATCTGCAGTC -/A AATCCCAGTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 2 3 280457 CASAVA_Build 7 117509147 1I GCCAGAGTCA -/T TAACAGACAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 280458 CASAVA_Build 7 117524876 1D ATGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 154 hom 23 1 19 3 A 14 13 280459 CASAVA_Build 7 117540633 1I CAATTTTCAG -/A GAGAACTATA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 0 1 280460 CASAVA_Build 7 117555039 1D CACTGTTGGT G/- GGAGTGTAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 G 3 2 280461 CASAVA_Build 7 117570015 1I TACTTCTTTT -/A AAACAGTCAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 3 4 280462 CASAVA_Build 7 117572712 2I GCCCTAGTAG --/GT CAGCCCTACC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 GT 0 1 280463 CASAVA_Build 7 117604328 1D ATTTTTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2272 het 2272 ref 34 25 5 5 A 12 11 280464 CASAVA_Build 7 117610649 11D AAGTTTGGTG CCTTCCTGCAT/----------- CCTTCCTGCA 3070 hom 120 het 45 0 40 8 CCTTCCTGCAT 2 1 280465 CASAVA_Build 7 117611164 20D AACCCACTCT CCCCCAACTTCTGTCTCATA/-------------------- CCCCCAACTT 3070 hom 67 het 32 0 21 16 CCCCCAACTTCTGTCTCATA 2 1 280466 CASAVA_Build 7 117621654 1D CAAAAGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 12 11 280467 CASAVA_Build 7 117623699 1D TCCCCATCTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 8 7 280468 CASAVA_Build 7 117624724 2I ACAAGCTATC --/TT ATGTTTCATC 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 0 2 280469 CASAVA_Build 7 117630053 1I ACCAACAATG -/C CTGCCATTGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 1 2 280470 CASAVA_Build 7 117637606 1D CTGACATGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 10 9 280471 CASAVA_Build 7 117638559 2I GTAATTATAA --/TC TGTTAATTGA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TC 0 1 280472 CASAVA_Build 7 117641196 1I TCCCCACCCG -/C CCCCCAATCC 1932 hom 17 het 8 0 6 2 C 5 6 280473 CASAVA_Build 7 117644954 1I CTGCTAGAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 53 het 42 0 30 12 A 9 10 280474 CASAVA_Build 7 117651078 2D AAAGGTAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 51 3 13 35 T 20 18 280475 CASAVA_Build 7 117657813 1I AAGAATTGAC -/T TATAAATTGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 1 2 280476 CASAVA_Build 7 117695717 1D AACTGCTATG A/- TCGTATCTGT 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 A 1 0 280477 CASAVA_Build 7 117827628 2I TATCCTATTC --/AA AAAAACAAAC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 5 7 280478 CASAVA_Build 7 117833432 18D ATCTGGAAGC CGTGCCATAGGCTTAAGG/------------------ CGTGCCATAG 3070 hom 54 het 25 0 19 8 CGTGCCATAGGCTTAAGG 1 0 280479 CASAVA_Build 7 117835841 5I GGGACCACTG -----/TTATA TATGTGGTCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTATA 0 1 280480 CASAVA_Build 7 117853398 1D ATTTAAATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 9 8 280481 CASAVA_Build 7 117862663 1D ATACCTCCTC A/- AATGGGCAGG 3070 hom 70 het 35 0 19 17 A 3 2 280482 CASAVA_Build 7 117862888 18D CACAGAAAAG TGGCCAGACTGTTCTCCA/------------------ TGGCCAGACT 3070 hom 87 het 31 0 26 10 TGGCCAGACTGTTCTCCA 2 1 280483 CASAVA_Build 7 117865658 1D ATGAATGAAA G/- AAGTTAAAGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 1 0 280484 CASAVA_Build 7 117866355 1I AAAAAAACAA -/T TGAGCGAGAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 1 2 280485 CASAVA_Build 7 117894934 1D CATTGGTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 40 1 26 13 T 13 12 280486 CASAVA_Build 7 117905125 1I TCCATATCTA -/C TTTCAGACAC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 0 1 280487 CASAVA_Build 7 117907150 1I GGTTGACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 40 1 28 11 T 10 11 280488 CASAVA_Build 7 117908330 2I AATATGTGAC --/AT ATATATATAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AT 4 5 280489 CASAVA_Build 7 117912600 1I AGCTTTTTCA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 8 280490 CASAVA_Build 7 117914718 1I GTCATTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 883 hom 34 2 23 9 A 11 12 280491 CASAVA_Build 7 117915227 3I AAATAAGTTA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AAC 5 6 280492 CASAVA_Build 7 117920199 1I AATAAACTTC -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 6 7 280493 CASAVA_Build 7 117924864 1D CAGCCTTTTT G/- TCTGTTTCTC 3070 hom 114 het 44 0 37 8 G 1 0 280494 CASAVA_Build 7 117936077 8D AGTATTTCAG AAACAGTT/-------- AATATGTGTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AAACAGTT 1 0 280495 CASAVA_Build 7 117936803 1I ATGTTTAATA -/T TTTGTGAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 3 4 280496 CASAVA_Build 7 117938170 4D ATATATATAT ATAC/---- ACATACGTGT 1677 het 88 hom 14 2 7 5 ATAC 1 0 280497 CASAVA_Build 7 117948894 1D CATTTCCCAC A/- GCTAGCATCA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 1 0 280498 CASAVA_Build 7 117969676 1I TAGCAGAAAT -/A AACTACTAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 2 3 280499 CASAVA_Build 7 117985946 1D CCATCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 11 10 280500 CASAVA_Build 7 117993935 16D TCTACCCATA ATTTCATGTATGAAAT/---------------- ATTTCATGTA 3070 hom 27 het 15 0 10 5 ATTTCATGTATGAAAT 2 1 280501 CASAVA_Build 7 117996072 3D TTGATAATTC TTA/--- TTATTTCTTT 3070 hom 108 het 37 0 37 1 TTA 2 1 280502 CASAVA_Build 7 118026122 1I ACAAATAACA -/T AATTTATTCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 280503 CASAVA_Build 7 118030959 3D ACATAAAAAA AAC/--- AATTACTCTT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 AAC 1 0 280504 CASAVA_Build 7 118035926 12D TTCTGTAGTA CCCATTCTGTTG/------------ CCTGGGCATC 3070 hom 72 het 24 0 25 1 CCCATTCTGTTG 1 0 280505 CASAVA_Build 7 118036428 3I TGGAGTGAGG ---/CTC AATGGCAGTA 3070 hom 86 het 35 0 27 8 CTC 0 1 280506 CASAVA_Build 7 118039266 1I TTAAAAAAGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 8 9 280507 CASAVA_Build 7 118040428 1D TTCCAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 11 10 280508 CASAVA_Build 7 118041029 1D AATGTAAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 8 7 280509 CASAVA_Build 7 118042196 4I CCTTTGACAT ----/AGAG AGGACAATAG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 AG 1 3 280510 CASAVA_Build 7 118042787 1I AAATTCTGTG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 7 8 280511 CASAVA_Build 7 118043546 1D TGAAGACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 30 1 20 9 A 14 13 280512 CASAVA_Build 7 118056523 2D AAAACTCCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 26 0 21 7 TG 8 7 280513 CASAVA_Build 7 118059028 1I AGATTGTTGA -/G AAAAGCAGAA 3070 hom 84 het 32 0 30 2 G 0 1 280514 CASAVA_Build 7 118059991 4I ACACACACAG ----/ACAC ACACACACAC 3070 hom 21 het 30 1 22 7 AC 7 9 280515 CASAVA_Build 7 118060820 2I CTAATGTGTT --/CA GTTATGAATG 3070 hom 108 het 40 0 37 4 CA 0 1 280516 CASAVA_Build 7 118065739 1I CCATTAAATA -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 111 het 46 0 37 9 T 6 7 280517 CASAVA_Build 7 118071668 2D GCTTTGGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 12 10 280518 CASAVA_Build 7 118073358 1D ATTAAGCAAG A/- AAAAAAATTC 3070 hom 81 het 28 0 28 1 A 8 7 280519 CASAVA_Build 7 118080930 1D TCCTTCTGCC A/- TTTCTACTGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 1 0 280520 CASAVA_Build 7 118084676 1D GATTCTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 32 0 24 8 T 13 12 280521 CASAVA_Build 7 118086892 1I AGGGACTATT -/A AAGACTATAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 2 3 280522 CASAVA_Build 7 118089083 3I AATAGAAAAT ---/AAA ATATAACTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 4 280523 CASAVA_Build 7 118094716 4D TAATAAAATC AAGA/---- AAGAAAGAAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAGA 3 2 280524 CASAVA_Build 7 118095284 2I GATGAAAGTC --/AT ATGATTGTCT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AT 1 2 280525 CASAVA_Build 7 118096854 4I GAAATTATTT ----/TCAA TCAAACATAC 3070 hom 132 het 46 0 44 2 TCAA 1 2 280526 CASAVA_Build 7 118097728 1D AAGACGACTT C/- TAAGGTCTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 1 0 280527 CASAVA_Build 7 118097913 2I TAGGGGAATT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 TA 0 1 280528 CASAVA_Build 7 118101793 3D TTCCCCCTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 37 0 28 11 T 14 11 280529 CASAVA_Build 7 118105798 1D TATATTAATA C/- ATGGGGAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 0 280530 CASAVA_Build 7 118107183 1D CCGCGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 28 1 22 5 A 12 11 280531 CASAVA_Build 7 118110479 1I GAGACTGGAT -/A ACTTATAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 A 1 2 280532 CASAVA_Build 7 118119845 2D TTAATAGGAC TT/-- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 T 9 7 280533 CASAVA_Build 7 118121199 1D17M3D27M2D24M2D TTCCTTCCTT CCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT/-CTTTCTTTCTTTCTTTC---CTTTCTTGCTTGCTTGCTTCCTTTCTT--TTCCTTCCTTCGTTTCTTTCTTTC-- TCTTTCTTTC 1433 het 1433 ref 4 10 3 0 N/A 0 0 280534 CASAVA_Build 7 118125090 2D AATTAGGTTG AC/-- ACAGATTGAT 3070 het 3070 hom 22 10 12 1 AC 2 1 280535 CASAVA_Build 7 118130487 1D ATCATCAAAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 38 13 24 1 A 7 6 280536 CASAVA_Build 7 118132784 1I TTTCCTAACT -/A AAACCCTGAC 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 A 3 4 280537 CASAVA_Build 7 118143548 2D TCAGTTTCTT TA/-- TTTTAACTAT 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 TA 1 0 280538 CASAVA_Build 7 118147588 2I TGAAAGAGAC --/TA TGTCATATAA 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 TA 0 1 280539 CASAVA_Build 7 118147971 2I AGTACGACTC --/AT GTGAAGTTGT 3070 het 3070 hom 68 25 31 12 AT 0 1 280540 CASAVA_Build 7 118154841 3D ACAAGACACA TAT/--- TATTTCAGTT 3070 het 3070 ref 54 28 24 3 TAT 2 1 280541 CASAVA_Build 7 118159585 3I AAAACATGAG ---/AGA AGGAGTAGAC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 AGA 0 1 280542 CASAVA_Build 7 118160420 1D CCTTCACTCC T/- TTTTTTTTTT 1893 het 1893 ref 38 25 6 7 T 13 12 280543 CASAVA_Build 7 118161649 1I CAGGATGTCC -/A AAATATATGG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 3 4 280544 CASAVA_Build 7 118164465 2D TGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 2112 het 1772 hom 17 7 7 3 TA 9 8 280545 CASAVA_Build 7 118170179 1D AAATAAACAG C/- TAAATTCACA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 C 1 0 280546 CASAVA_Build 7 118179974 1D39M1I TATTGAAATA TTTTTTTTAGTATTAACTTTATTCTTGAAGACAAGTGGTT-/-TTTTTTTAGTATTAACTTTATTCTTGAAGACAAGTGGTTC TTGATATTGG 3070 het 3070 ref 29 27 7 11 N/A 0 0 280547 CASAVA_Build 7 118196608 5D TGATGCTTAT AAGAA/----- AAGACACGAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 AAGAA 1 0 280548 CASAVA_Build 7 118202741 1I AAGTATACTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 8 9 280549 CASAVA_Build 7 118234354 1I ATGTTCAAAT -/A ATTGTTATGT 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 A 1 2 280550 CASAVA_Build 7 118260042 1I GAAAAAATAT -/A TAATTAAAAT 2611 het 2611 ref 23 15 7 1 A 0 1 280551 CASAVA_Build 7 118261760 3D TTAGAAAAAA GCT/--- CAGGAGTAAA 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 GCT 1 0 280552 CASAVA_Build 7 118267413 2I TTGTTTTGAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 AT 7 8 280553 CASAVA_Build 7 118270627 4I CTCCTTTTAG ----/ATTT ATTAAATATT 3070 het 2662 hom 22 6 15 1 ATTT 0 1 280554 CASAVA_Build 7 118280755 1I TTTGACTGGA -/T TTATGGTAAT 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 T 2 3 280555 CASAVA_Build 7 118283333 1D TAAGTTTTGG T/- TTAAGCACAT 3070 het 3070 hom 43 16 23 5 T 3 2 280556 CASAVA_Build 7 118293651 1I AACAGGGGAC -/A AAAGCTGAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 4 280557 CASAVA_Build 7 118295995 7D TACCTTGAAA TCTATTC/------- TCTATAATTA 3070 het 2948 hom 25 7 17 3 TCTATTC 1 0 280558 CASAVA_Build 7 118297342 1D AAAAACAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 A 10 9 280559 CASAVA_Build 7 118301538 1I CAGCTGAGCT -/C CCTGACAGAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 C 2 3 280560 CASAVA_Build 7 118302621 1D AAAAAAAGAG T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 35 17 13 5 T 7 6 280561 CASAVA_Build 7 118304857 1D CTGAGTGTTT G/- GGGGTAGTTT 3070 het 3070 ref 34 18 16 0 G 5 4 280562 CASAVA_Build 7 118307064 1D CAGGCATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 T 13 12 280563 CASAVA_Build 7 118308260 1I CATATGTATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 T 11 12 280564 CASAVA_Build 7 118315554 1D TAGAAAAAAA T/- ATCTTAAATT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 1 0 280565 CASAVA_Build 7 118327077 2I ATGATATCTC --/TA TGTCTACTCC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 TA 0 1 280566 CASAVA_Build 7 118327290 1D TTTTTTTTTT C/- GTTGGCTGGG 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 C 1 0 280567 CASAVA_Build 7 118345347 5I ATACAAACAT -----/GAAAA GAAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 GAAAA 1 2 280568 CASAVA_Build 7 118352130 2D TAAAATTCTG AT/-- ATGTTTGAAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 AT 2 1 280569 CASAVA_Build 7 118360212 5I AACAGGACAA -----/AACAT AATAGATAAA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 AACAT 0 1 280570 CASAVA_Build 7 118360716 1D CTCCATACAA G/- TACAAACAAT 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 G 1 0 280571 CASAVA_Build 7 118362743 1D TACTTCTCCT G/- CTTACTACCA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 G 1 0 280572 CASAVA_Build 7 118365019 1D TTTGAAGTGT G/- GTGTTCCTGG 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 G 2 1 280573 CASAVA_Build 7 118366809 1D AAATACTACA C/- CATTTCATAC 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 C 2 1 280574 CASAVA_Build 7 118368552 1D AACTAATTGG C/- AATCACTTAT 3070 het 3070 ref 35 21 13 2 C 1 0 280575 CASAVA_Build 7 118376275 1I TCATTCACTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 7 8 280576 CASAVA_Build 7 118376772 2D TTCTTATTTT AA/-- ACTCTTTACC 3070 het 3070 ref 40 17 18 7 A 3 1 280577 CASAVA_Build 7 118379661 1D CTTTTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 26 2 11 13 T 15 14 280578 CASAVA_Build 7 118381421 1I TTTTACTTCT -/G ATAATGTGAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 0 1 280579 CASAVA_Build 7 118384562 1I GGCATTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 22 0 14 8 T 9 10 280580 CASAVA_Build 7 118385617 3I CTAATGGGGT ---/TAC TACGTTCCAG 3070 het 3070 ref 56 30 21 5 TAC 1 2 280581 CASAVA_Build 7 118393447 1I GTATCTACTT -/C TCATCTCAAT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 C 0 1 280582 CASAVA_Build 7 118395589 1D TACACAGGGG A/- CACTTTGGCA 3070 het 3070 ref 56 32 21 3 A 1 0 280583 CASAVA_Build 7 118397651 2D GTGTAGATAA CT/-- CTGTGTGTGA 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 CT 2 1 280584 CASAVA_Build 7 118399307 1D ATATATATTA T/- CCATATCTGC 3070 het 3070 hom 49 19 19 11 T 1 0 280585 CASAVA_Build 7 118399692 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1480 hom 18 5 10 3 T 10 9 280586 CASAVA_Build 7 118399929 1I TAAGTTTCTA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 6 7 280587 CASAVA_Build 7 118408484 1I ACCAAAGCAC -/T TAGAGTTGAC 3070 hom 96 het 45 0 32 13 T 1 2 280588 CASAVA_Build 7 118408750 1D TTCATAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 11 10 280589 CASAVA_Build 7 118410281 3I TAAAAAACAA ---/AAG AAATATATAG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AAG 0 1 280590 CASAVA_Build 7 118411010 1D AAGATACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1459 hom 16 3 10 3 T 11 10 280591 CASAVA_Build 7 118412757 1I TTCCAGTCAC -/T TTTACTAGTT 3070 het 3070 hom 40 21 18 1 T 3 4 280592 CASAVA_Build 7 118417101 1D TATGTTTTTC T/- TTTGTTTATG 3070 het 3070 hom 35 17 18 0 T 4 3 280593 CASAVA_Build 7 118417486 1I TGGAAAGCTT -/A AAAAATTACT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 5 6 280594 CASAVA_Build 7 118418821 4D CAAGTTTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 34 12 14 11 TG 11 9 280595 CASAVA_Build 7 118429785 3I ATGAAATTTT ---/TTA TTATTTCTTA 3070 het 2615 hom 25 8 13 4 TTA 1 2 280596 CASAVA_Build 7 118434857 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 A 8 7 280597 CASAVA_Build 7 118440843 1I TTGTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 11 13 T 12 13 280598 CASAVA_Build 7 118448361 1I TTGTGCACTA -/C CCTCCCAAAC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 C 2 3 280599 CASAVA_Build 7 118539668 1D ACAAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 29 1 20 9 A 13 12 280600 CASAVA_Build 7 118579604 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1131 het 1131 ref 30 22 3 5 TA 7 6 280601 CASAVA_Build 7 118589793 1I TTTCTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1682 het 1085 hom 24 4 9 11 T 17 18 280602 CASAVA_Build 7 118616176 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 9 10 280603 CASAVA_Build 7 118616195 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 1156 het 1156 ref 28 15 4 10 A 11 10 280604 CASAVA_Build 7 118620043 1I TCTATACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 21 1 17 3 A 11 12 280605 CASAVA_Build 7 118705746 1D ATTATAATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 29 0 24 5 T 10 9 280606 CASAVA_Build 7 118709825 1D TTTCTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 31 het 43 1 30 12 T 10 9 280607 CASAVA_Build 7 118716233 3D TCACAGTCCT TGG/--- TGGTTTGTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TGG 2 1 280608 CASAVA_Build 7 118717528 2D AACCTGTAAC AT/-- TTTTTTTATA 3070 hom 102 het 41 0 35 8 AT 1 0 280609 CASAVA_Build 7 118723501 1D ATATTTTCTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 8 7 280610 CASAVA_Build 7 118723646 3D CATATGATAA TTT/--- TTTTTAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 8 T 8 5 280611 CASAVA_Build 7 118727808 5I GTGTCTTTAT -----/AATAG AATTATTTAT 3070 hom 42 het 23 0 14 10 AATAG 0 1 280612 CASAVA_Build 7 118728171 1I GATGGGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 32 1 27 4 T 10 11 280613 CASAVA_Build 7 118729092 1D GGAACCTATG A/- AATCTTACTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 3 2 280614 CASAVA_Build 7 118731856 2I GCCTGGCTAA --/TT TTTTTTTTTG 2652 hom 18 het 7 0 7 0 T 9 11 280615 CASAVA_Build 7 118734531 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 270 hom 29 3 17 10 A 12 11 280616 CASAVA_Build 7 118735418 2I ATTTATTTGC --/AG AGTCTGAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AG 1 2 280617 CASAVA_Build 7 118736241 2D AAGCAGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 A 12 10 280618 CASAVA_Build 7 118749236 1D CTCCAATTAT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 8 7 280619 CASAVA_Build 7 118753557 1D CTAAAAAGTG A/- AAAAAACAAC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 7 6 280620 CASAVA_Build 7 118756751 2D AGCACTCTGG AT/-- ATATAACCAC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 AT 3 2 280621 CASAVA_Build 7 118765922 4D TATAAGACAT TCTG/---- TCTGAGTGTT 3070 hom 98 het 35 0 32 5 TCTG 2 1 280622 CASAVA_Build 7 118769587 1I AAGATCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1129 hom 32 3 21 8 T 15 16 280623 CASAVA_Build 7 118770092 1D AAGAGCCATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 10 9 280624 CASAVA_Build 7 118771481 2I ATTTTCTTGA --/CT CTATCCTCTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 1 2 280625 CASAVA_Build 7 118772162 2D GAGAACATAT CA/-- AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CA 1 0 280626 CASAVA_Build 7 118783955 1I ACAGAGGGGC -/T TACAGGCTCC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 1 2 280627 CASAVA_Build 7 118787902 1D GAAATCAGTT A/- AGTCTCCTGT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 2 1 280628 CASAVA_Build 7 118791006 1I CTACAAAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 T 9 10 280629 CASAVA_Build 7 118791838 1I CTTTTTATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 9 10 280630 CASAVA_Build 7 118800957 2I TAATTGATAT --/CA CACTCTCACT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CA 1 2 280631 CASAVA_Build 7 118839128 1D GAGTAGAATT A/- AAAAAAAAAA 2100 het 2100 ref 28 14 7 7 A 15 14 280632 CASAVA_Build 7 118844574 1I CAATATGAAG -/T AAAGCAGGAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 280633 CASAVA_Build 7 118860646 1I AAAAATCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 933 hom 36 3 26 7 A 11 12 280634 CASAVA_Build 7 118905028 1D TAAGCAAACA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 T 7 6 280635 CASAVA_Build 7 118914196 3D ACACAAATAC AGA/--- AGACATTTTC 3070 het 3070 ref 37 21 16 0 AGA 2 1 280636 CASAVA_Build 7 118920745 1D TTGTGAACTG T/- TTTGAGCCTC 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 4 3 280637 CASAVA_Build 7 118944256 1D GTTAAAATTT A/- AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 6 5 280638 CASAVA_Build 7 118958189 1D CATTCGGCCA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 9 8 280639 CASAVA_Build 7 118963280 1I TCTACTCCCT -/C CCTCCTAACC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 2 3 280640 CASAVA_Build 7 118964566 1D ATATAATTAG C/- TTTTTATTGG 3070 het 1717 hom 18 7 8 3 C 1 0 280641 CASAVA_Build 7 118970045 1D TGAAGGAGCA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 T 8 7 280642 CASAVA_Build 7 118993617 1D AACCTGGGTT G/- GGGACATTGG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 G 4 3 280643 CASAVA_Build 7 119006728 16I TTCTCTAAAC ----------------/TCATCCTAAACTCTTA ACTCTTAACA 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 TCATCCTAAACTCTTA 0 1 280644 CASAVA_Build 7 119013551 5D TTTTCAAATA ATATT/----- ATATTACTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 ATATT 2 1 280645 CASAVA_Build 7 119023152 1I CATTATGGTG -/C CCCCCCCCAC 2185 het 2185 ref 38 19 9 10 C 8 9 280646 CASAVA_Build 7 119031687 1D AAATAAATAA T/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 T 7 6 280647 CASAVA_Build 7 119044785 3D AAAACAAAAC AAA/--- AAAAACCGTT 407 het 407 ref 24 12 2 11 A 8 5 280648 CASAVA_Build 7 119046909 1D TTTCTTACAG T/- TCTAAACACT 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 T 2 1 280649 CASAVA_Build 7 119048847 1D TAGGGAATTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 A 9 8 280650 CASAVA_Build 7 119052730 1D CCAGAGGAAA T/- TATATCTGAG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 2 1 280651 CASAVA_Build 7 119054343 4I CTTTTCATGT ----/ATTA ATTAGTCATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATTA 1 2 280652 CASAVA_Build 7 119055367 1I GTTGTTTTTG -/T TCTTTCTTTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 1 2 280653 CASAVA_Build 7 119057825 2D TGTGGCACTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 2242 hom 53 11 27 18 TC 6 5 280654 CASAVA_Build 7 119061190 1I CTCTGAAAGG -/C CCCAGTGTGT 2976 het 2699 hom 15 7 7 1 C 3 4 280655 CASAVA_Build 7 119065218 1I ATCATTAAAA -/T TTTGGTAGAA 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 T 3 4 280656 CASAVA_Build 7 119079222 1I TAAAATTGAC -/A AAAAAAAGGA 2784 het 2784 ref 22 11 7 4 A 7 8 280657 CASAVA_Build 7 119080931 1I CCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 11 12 280658 CASAVA_Build 7 119093321 1I CTGGTCAGAC -/A TGAGTTGGGG 3070 het 3070 hom 58 23 31 4 A 0 1 280659 CASAVA_Build 7 119109396 2I11M3I AAAGATACTC --AAACACATTTT---/TTAAACACATTTTTTC TTCTTCTTCT 3070 het 1806 hom 36 6 18 16 N/A 0 0 280660 CASAVA_Build 7 119119996 1I GTGATTTAAG -/A CGTGTGTCTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 0 1 280661 CASAVA_Build 7 119120896 1D GTTTTCCAGA G/- TACCAGTAGG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 G 1 0 280662 CASAVA_Build 7 119121706 1D ATTAAATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 26 2 13 11 T 19 18 280663 CASAVA_Build 7 119123909 1D ACAAACTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 11 10 280664 CASAVA_Build 7 119127922 4D TTTATATATC TATT/---- TATTATATAT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 TATT 2 1 280665 CASAVA_Build 7 119138961 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAATTA 1615 het 1589 hom 11 4 6 1 A 7 8 280666 CASAVA_Build 7 119141346 3D TGACTCCCTC CTT/--- ATTAGTAATA 3070 het 3070 hom 42 15 24 4 CTT 1 0 280667 CASAVA_Build 7 119143523 2D CGCAAAGTCA AC/-- ACACACACAC 3070 het 193 hom 32 4 12 16 AC 13 12 280668 CASAVA_Build 7 119144584 1D AAAAAAAAAA T/- GTCTAATAAA 2466 het 207 hom 13 2 7 4 T 1 0 280669 CASAVA_Build 7 119147885 2D CATTATTTAT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 70 hom 34 2 17 17 A 11 9 280670 CASAVA_Build 7 119149422 1D GAGAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 11 10 280671 CASAVA_Build 7 119152699 1I GATTTAAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 9 10 280672 CASAVA_Build 7 119153188 1I GACAATGGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 8 9 280673 CASAVA_Build 7 119158768 48D AACCAATAGG ATATATATATAAATAAATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------------------ ATATATATAA 3070 hom 30 het 16 0 11 10 ATATATATATAAATAAATATATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 280674 CASAVA_Build 7 119161355 1D GTGCTGCTGT A/- AAGAAAAGCC 3070 hom 151 het 58 0 51 8 A 3 2 280675 CASAVA_Build 7 119162712 1I TTGTTTGTTT -/G GTTTGGTTTT 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 G 1 2 280676 CASAVA_Build 7 119165971 4I CGTGTGTGTG ----/TATA TGTATATATA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 TA 0 2 280677 CASAVA_Build 7 119167010 2D TAAAAAAAGA AG/-- AAAAAAAAAA 2459 hom 29 het 23 0 12 12 AG 1 0 280678 CASAVA_Build 7 119167391 2D ATGGTGCCTC TA/-- TGTTTTATAT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 TA 1 0 280679 CASAVA_Build 7 119168985 1D TGATTTTCTT A/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 1 0 280680 CASAVA_Build 7 119170122 1I ATATGACAGG -/A AAATTAGCGT 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 A 3 4 280681 CASAVA_Build 7 119170406 1D CTAGGGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 19 2 T 11 10 280682 CASAVA_Build 7 119174169 1I AAACAGCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 9 10 280683 CASAVA_Build 7 119176473 3D TCAATCAGAC ACT/--- AGAGATGGCT 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 ACT 1 0 280684 CASAVA_Build 7 119177758 2I CTTTACATTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 TA 5 6 280685 CASAVA_Build 7 119179471 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1979 hom 21 7 9 5 A 11 12 280686 CASAVA_Build 7 119180000 3I CTGCTTTTTC ---/AAA AGAAGCCAGA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 1 4 280687 CASAVA_Build 7 119182310 1I GCTCCGTCAG -/T TTTTTTCACA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 6 7 280688 CASAVA_Build 7 119193532 5I AAATGCCAAG -----/TTTTC TTTACCATTT 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 TTTTC 0 1 280689 CASAVA_Build 7 119196929 1D GGGGTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 11 10 280690 CASAVA_Build 7 119198787 4D TTTCCAAATC TTCT/---- TTCTATTAGA 3070 het 3070 ref 48 28 19 8 TTCT 2 1 280691 CASAVA_Build 7 119212662 5I GTTTGGACAA -----/TATAT TATATCTTGC 3070 het 2386 hom 20 6 9 5 TATAT 1 2 280692 CASAVA_Build 7 119221637 4D TTTTAGGATC CTTT/---- CTTTATCTTT 3070 het 3070 hom 39 12 21 7 CTTT 2 1 280693 CASAVA_Build 7 119225929 1D AGTTATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1496 hom 46 6 18 22 A 13 12 280694 CASAVA_Build 7 119237774 1D TTGTTATTTT G/- GCCTCCTCTC 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 G 2 1 280695 CASAVA_Build 7 119239548 1D AACATGAGCC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 40 14 18 9 A 9 8 280696 CASAVA_Build 7 119241835 13D AGGTTGCTGC CAAAGGAGATTAA/------------- CATTTGAGTC 3070 het 3070 hom 34 11 22 3 CAAAGGAGATTAA 1 0 280697 CASAVA_Build 7 119242209 4D CTAGAGAAAC CTGA/---- CTAATACACT 3070 het 3070 ref 29 16 11 4 CTGA 1 0 280698 CASAVA_Build 7 119246727 1I ATTGGTTTTG -/A AATGTGAGGA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 2 3 280699 CASAVA_Build 7 119248898 1D GCAGCAGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 A 10 9 280700 CASAVA_Build 7 119252145 1D ACACACTTTC T/- TTTAATCAAG 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 T 4 3 280701 CASAVA_Build 7 119252229 1I TGCAAAAAAA -/T AAAATCAATC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 0 1 280702 CASAVA_Build 7 119252342 7I TGTTTTGTTT -------/TCCTTTA TGTGAGCTGA 3070 hom 81 het 37 0 27 10 TCCTTTA 0 1 280703 CASAVA_Build 7 119253558 2D CCACCTAATC TG/-- TGAGATTAGA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 TG 2 1 280704 CASAVA_Build 7 119255473 1D GGATACAGGG T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 46 het 33 1 22 10 T 8 7 280705 CASAVA_Build 7 119266878 28I TTAAAGGAAC ----------------------------/AAGGTAAATGTCCATAAAATTAACCTAA ATAATTGAAT 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 AAGGTAAATGTCCATAAAATTAACCTAA 0 1 280706 CASAVA_Build 7 119271048 1I TACAGAAAGT -/A AAATAACTTG 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 3 4 280707 CASAVA_Build 7 119274351 4D TTACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 19 23 10 AC 11 9 280708 CASAVA_Build 7 119276522 1I ATATTCAAGA -/T TTTTTAATGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 5 6 280709 CASAVA_Build 7 119276943 1D AATTTTTGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 A 9 8 280710 CASAVA_Build 7 119308038 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 8 9 280711 CASAVA_Build 7 119314969 1I AGTGTCTTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 15 0 T 9 10 280712 CASAVA_Build 7 119340551 1D AAGAGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 750 hom 21 5 12 5 T 15 14 280713 CASAVA_Build 7 119346202 1D ATGGAAGATG A/- AAAAAAGGCT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 7 6 280714 CASAVA_Build 7 119349444 1D GATTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2662 het 2628 hom 19 7 9 3 A 13 12 280715 CASAVA_Build 7 119360716 1D TCTAAAAAAA T/- AATAAATACA 2821 het 2821 ref 20 9 9 2 T 1 0 280716 CASAVA_Build 7 119370393 1D TGAAATTATC T/- TTTTTTTTTT 1503 het 1503 ref 39 25 5 9 T 12 11 280717 CASAVA_Build 7 119429588 9I CTGTGTTCAA ---------/GTGATTCTC GTGCCTCAGT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 GTGATTCTC 0 1 280718 CASAVA_Build 7 119474659 4D CCCCTCCCTT TGTA/---- TGTATGGGAG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 TGTA 2 1 280719 CASAVA_Build 7 119484856 1I GTATGCCACT -/G GGCGATGCCA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 G 2 3 280720 CASAVA_Build 7 119523685 1D TCTCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 12 11 280721 CASAVA_Build 7 119533304 26D AGACTTGAGC TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 3070 hom 45 het 19 0 16 5 TA 20 7 280722 CASAVA_Build 7 119659412 2I CTCCAATCTA --/AG AGAGTAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AG 2 3 280723 CASAVA_Build 7 119740724 1I TGTTATTCAA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 T 7 8 280724 CASAVA_Build 7 119771226 1D TAGACATCAC T/- GATAGATCCA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 1 0 280725 CASAVA_Build 7 119783567 1D AATTACAACA T/- TTTTTACAAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 6 5 280726 CASAVA_Build 7 119799766 2I TTATTTACTC --/TT TGCAAATAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 3 280727 CASAVA_Build 7 119804854 1D TCACCCCAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 132 het 49 0 44 5 A 10 9 280728 CASAVA_Build 7 119832076 4I CCTTTGTGAA ----/TTTG TTTGTCTTTT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TTTG 1 2 280729 CASAVA_Build 7 119863023 2I TAACCAGTGG --/AT ATATATATAT 3070 het 2988 hom 29 9 10 10 AT 8 9 280730 CASAVA_Build 7 120003251 32I ACTCGCAATT --------------------------------/TTTTCCTTTGTATATGCATACAAAGGTATACA TTGCTGTGTT 3070 hom 108 het 33 0 37 4 TTTTCCTTTGTATATGCATACAAAGGTATACA 0 1 280731 CASAVA_Build 7 120003813 1I AGCATGAAAA -/T TTTTTAAAGT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 5 6 280732 CASAVA_Build 7 120009011 2D ATCTTAATAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 32 7 T 12 10 280733 CASAVA_Build 7 120011075 1D TAGGAATTGT G/- GGGGGGGGGA 1950 het 1950 ref 33 19 6 8 G 10 9 280734 CASAVA_Build 7 120024028 1I ATACTGTTAG -/T TTCCTGGGTA 3070 het 3070 hom 49 16 29 4 T 2 3 280735 CASAVA_Build 7 120034482 1D TTAAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 122 het 47 0 41 6 T 11 10 280736 CASAVA_Build 7 120035307 1D AATGTGACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 612 hom 40 2 32 8 T 12 11 280737 CASAVA_Build 7 120054499 3D GAGAATACAG AGA/--- AGGACAGCTC 3070 het 3070 hom 43 14 27 5 AGA 1 0 280738 CASAVA_Build 7 120069859 1D AAATAAAAAA T/- AAAAAAAAAT 2375 het 1474 hom 9 3 6 0 T 1 0 280739 CASAVA_Build 7 120079374 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 T 11 10 280740 CASAVA_Build 7 120086603 1D CAATAGGACT A/- AAGAGGGGAG 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 A 3 2 280741 CASAVA_Build 7 120088546 1I TGAACTGTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 38 23 8 7 T 7 8 280742 CASAVA_Build 7 120095706 5I GGTTTTCTGA -----/GAAAG GAAAGACTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 GAAAG 1 2 280743 CASAVA_Build 7 120104289 4I GAGTTCTGAT ----/TAAA TAAACATTCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TAAA 1 2 280744 CASAVA_Build 7 120108181 14I TAAGCCATCC --------------/AGATATATTTAGCT AATACCCAAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 AGATATATTTAGCT 0 1 280745 CASAVA_Build 7 120141603 1I AAGTTTTGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 9 10 280746 CASAVA_Build 7 120143307 2I AGCTAAGAGA --/AC GTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 AC 0 1 280747 CASAVA_Build 7 120179938 1D CTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 24 4 A 12 11 280748 CASAVA_Build 7 120188433 4D TAATTATAAT ACTC/---- ACAGGAAGAT 3070 het 3070 hom 48 15 30 5 ACTC 1 0 280749 CASAVA_Build 7 120190040 7I TTAATTTCCC -------/ATTTCTA TTTGCTTGTG 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 ATTTCTA 0 1 280750 CASAVA_Build 7 120197204 1D AAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2181 het 2181 ref 26 14 8 4 A 12 11 280751 CASAVA_Build 7 120202183 1D AAAAATTATT G/- TTTCAAGTAT 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 G 1 0 280752 CASAVA_Build 7 120218619 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1236 het 1236 ref 19 14 3 3 A 12 11 280753 CASAVA_Build 7 120222065 4I CTTGAGAGGA ----/CAGT CAGTATTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 CAGT 1 2 280754 CASAVA_Build 7 120223359 1D CATTTTTACC A/- AAAAAAATGT 3056 het 3056 ref 29 12 10 8 A 8 7 280755 CASAVA_Build 7 120243656 1I ATGCGCAGGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 9 10 280756 CASAVA_Build 7 120267795 1I AAAAGTCACA -/G AGTTAATTTA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 G 0 1 280757 CASAVA_Build 7 120268924 6I TGAGAATATA ------/TTAAGT TTATTTTTTA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TTAAGT 0 1 280758 CASAVA_Build 7 120297038 1D GCCAGTTACT A/- AAAAAAAAAA 2037 het 2037 ref 29 15 9 6 A 17 16 280759 CASAVA_Build 7 120390735 1I AATGTTTTTC -/A AAAAAAAAAA 1457 het 1457 ref 30 20 4 6 A 10 11 280760 CASAVA_Build 7 120432056 1D TATTTTCTGA G/- CGATAAACAG 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 G 1 0 280761 CASAVA_Build 7 120460442 1D GCCAACTACT G/- TGAGGTCCTC 3070 het 3070 ref 48 25 22 1 G 1 0 280762 CASAVA_Build 7 120463140 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 8 280763 CASAVA_Build 7 120468674 2D ATACAGAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 13 hom 23 1 18 4 AT 8 7 280764 CASAVA_Build 7 120469420 2D TTTAATTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 117 hom 21 3 8 10 A 14 12 280765 CASAVA_Build 7 120476282 2D CTATCCTACT CA/-- CAGTTTTGAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 CA 2 1 280766 CASAVA_Build 7 120478661 1I TGTAAATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 24 1 18 5 T 12 13 280767 CASAVA_Build 7 120481958 2I AGGGTTGAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 45 0 29 16 T 12 14 280768 CASAVA_Build 7 120484277 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 32 0 24 9 T 9 8 280769 CASAVA_Build 7 120486916 3D TAATAAATTC ATA/--- ATATTATTGT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 ATA 2 1 280770 CASAVA_Build 7 120489642 1I TTGTGAACTT -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 51 17 28 6 A 6 7 280771 CASAVA_Build 7 120489982 1D CTGGCTGTGT C/- CCCACCCAAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 C 4 3 280772 CASAVA_Build 7 120493904 1D GAAGATCTTA C/- CCCCTCTCAC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 C 5 4 280773 CASAVA_Build 7 120494408 1D TTTGCATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 10 9 280774 CASAVA_Build 7 120499763 1D AAGGCTGATG T/- TAACTAAATT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 2 1 280775 CASAVA_Build 7 120501098 3D CCTCTTCCCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1392 hom 32 10 11 11 T 19 16 280776 CASAVA_Build 7 120508001 2D CCTTCATTTT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 38 0 30 8 AC 9 8 280777 CASAVA_Build 7 120539001 4D CACTGAAAAT AAAA/---- AAGAAAAAAC 3070 hom 96 het 35 0 33 5 A 6 2 280778 CASAVA_Build 7 120539774 3I AATGCCAACA ---/ACC ACCAGAAGCG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 ACC 1 2 280779 CASAVA_Build 7 120545215 1D AACATTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 30 1 21 8 A 13 12 280780 CASAVA_Build 7 120559253 1D GGGGGTAATG T/- TTTTTTTTTT 1577 het 1577 ref 39 28 5 6 T 13 12 280781 CASAVA_Build 7 120572361 2I TTTAATTAAC --/TG TGCATTTAAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TG 1 2 280782 CASAVA_Build 7 120573039 1D GATATACATC A/- ATGAGATTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 1 280783 CASAVA_Build 7 120577042 1I TAGAAAGGAA -/C CCTGAGAGGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 2 3 280784 CASAVA_Build 7 120579157 10I TCCACATGCA ----------/TTTGACTAAC TGTGACATTT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 TTTGACTAAC 0 1 280785 CASAVA_Build 7 120581087 1D AGCGGATTTT A/- AAAAATAAAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 6 5 280786 CASAVA_Build 7 120583615 1I GATCCATCAG -/C CCCACTGTTG 3070 hom 61 het 28 0 20 8 C 3 4 280787 CASAVA_Build 7 120583996 1D GGATGGAAGG A/- AAAAAGAATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 6 5 280788 CASAVA_Build 7 120587397 1I CACCAAATTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 167 hom 29 1 25 3 T 9 10 280789 CASAVA_Build 7 120593427 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 117 het 45 0 38 7 A 10 9 280790 CASAVA_Build 7 120596552 2D TTCATAAGAC AG/-- TATTAAAATG 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AG 1 0 280791 CASAVA_Build 7 120598352 1D ATAAATACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 11 10 280792 CASAVA_Build 7 120611431 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 720 hom 25 4 12 9 A 13 14 280793 CASAVA_Build 7 120619940 1D CAGGCTTTGA G/- GGGTAAAGCA 3070 hom 110 het 46 0 37 9 G 4 3 280794 CASAVA_Build 7 120628242 2D GCAAATCAAA AG/-- AGAGAGCAGT 3070 het 3070 hom 52 22 25 6 AG 4 3 280795 CASAVA_Build 7 120633740 2D CATTTCTAAG AT/-- ATAAAACAGC 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AT 2 1 280796 CASAVA_Build 7 120638852 29I GATTGGGACA -----------------------------/GCAGGGTCCCAGAACAGCTATGGACCAAT GCAGACACGT 3070 hom 123 het 44 0 41 8 GCAGGGTCCCAGAACAGCTATGGACCAAT 0 1 280797 CASAVA_Build 7 120639987 1I AATTCATTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 9 10 280798 CASAVA_Build 7 120640466 1I GTACAGTGTG -/T TTTGTTCTAT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 3 4 280799 CASAVA_Build 7 120643563 1D TCTCTGGTCC A/- AAGTGTCTGC 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 A 3 2 280800 CASAVA_Build 7 120655732 1I GTGAGATATT -/A ACCTAACTCC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 1 2 280801 CASAVA_Build 7 120655877 2I GAGATTTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 31 2 22 7 A 14 16 280802 CASAVA_Build 7 120656798 5D TTTCGTAGTA GAAAT/----- GAAATGAAGG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 GAAAT 2 1 280803 CASAVA_Build 7 120758148 1D ATCTGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2232 hom 20 9 10 1 A 11 10 280804 CASAVA_Build 7 120766762 4I AACCTTGGAC ----/CTCT CTGAGAGTTT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 CT 1 3 280805 CASAVA_Build 7 120776126 1D CAGATAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 A 15 14 280806 CASAVA_Build 7 120779610 2I ACTCTTATGG --/TT TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 52 18 24 10 T 7 9 280807 CASAVA_Build 7 120783330 1D AGTGGTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 A 13 12 280808 CASAVA_Build 7 120783487 1I AAACATGGTA -/G GCTAGCATCT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 G 1 2 280809 CASAVA_Build 7 120785322 1I AAGCAAATAG -/C CAAGTTACCT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 C 1 2 280810 CASAVA_Build 7 120785873 1D CAGGTCAAGT G/- AATGGAACAG 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 G 1 0 280811 CASAVA_Build 7 120786418 1I TAAAATTGGT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 7 8 280812 CASAVA_Build 7 120787258 1I63M7I ATGTTACAGA -TTTTTTTTTAATGAAAATGTATTGCTTTTATAATTACAAATTATAGTTCCAAAAAGTTCTGTA-------/TTTTTTTTTTAATGAAAATGTATTGCTTTTATAATTACAAATTATAGTTCCAAAAAGTTCTGTAAAGTTTT AAGTTTACAT 3070 het 3070 hom 34 18 30 4 N/A 0 0 280813 CASAVA_Build 7 120797230 2I ACCTGCTAGT --/AA AAACAGTCTG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 3 5 280814 CASAVA_Build 7 120800467 22D GTACTTAAAG TCAGGATTTTAACTACTTAAAA/---------------------- TCAGGATTTT 3070 het 3070 ref 45 23 20 10 TCAGGATTTTAACTACTTAAAA 1 0 280815 CASAVA_Build 7 120801286 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1830 het 1173 hom 17 8 7 2 A 12 11 280816 CASAVA_Build 7 120806004 4I AATGTTGAAT ----/AGAA AGAAGATTCA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 AGAA 1 2 280817 CASAVA_Build 7 120810433 1D CATTGGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 22 15 10 A 14 13 280818 CASAVA_Build 7 120825059 1D TGAAAAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 10 9 280819 CASAVA_Build 7 120827035 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 671 het 272 hom 10 3 3 5 A 18 16 280820 CASAVA_Build 7 120827705 4I AACTACATGC ----/AGAA AGAGAGAGGC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AGAA 0 1 280821 CASAVA_Build 7 120827916 1I TAACATACTT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 280822 CASAVA_Build 7 120838414 1I AAAATATTTT -/C ACCTTGGTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 280823 CASAVA_Build 7 120838687 1I GTGGGTCACT -/G GGGAACCTCC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 G 3 4 280824 CASAVA_Build 7 120841000 7D TATATATATA TATATAT/------- ATAAAATGCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TATATAT 1 0 280825 CASAVA_Build 7 120847810 7D41M10I AGACTCTGAC AAAAAAAAAAAATATATATATATATATAGTTCTCTCACAAAAACAAAG----------/-------AAAAATATATATATATATATAGTTCTCTCACAAAAACAAAGATACCTCCTC ATTTATCCAT 3070 hom 69 het 15 0 24 8 N/A 0 0 280826 CASAVA_Build 7 120851267 4I TTGTGAAAAC ----/TTTG TTTTTCATAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TTTG 0 1 280827 CASAVA_Build 7 120852768 3D ATAGAAGAGG GTT/--- CTTTTGCTAG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 GTT 1 0 280828 CASAVA_Build 7 120856982 2I CCTAGATTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 47 0 33 14 T 12 14 280829 CASAVA_Build 7 120859117 2I AATACCAGTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 87 het 40 0 30 10 TC 7 8 280830 CASAVA_Build 7 120860463 1I TTTTTAATGC -/T GTTTATTGGG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 0 1 280831 CASAVA_Build 7 120868853 1I AAAATCATCA -/T GGATATGGCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 0 1 280832 CASAVA_Build 7 120872406 1D ATATTTGGTT G/- CCCCTAACTC 3070 hom 84 het 35 0 29 7 G 1 0 280833 CASAVA_Build 7 120874607 1I AATTGGGAAG -/A AAAAAATATG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 6 7 280834 CASAVA_Build 7 120875131 1D AAAAAATTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 10 9 280835 CASAVA_Build 7 120877471 23I CTGAGTCAGA -----------------------/TCCAGATTGGGAAGGCTCAGAGC TCCAGTTTGG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 TCCAGATTGGGAAGGCTCAGAGC 0 1 280836 CASAVA_Build 7 120882949 1D TTTCTCGTGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 T 7 6 280837 CASAVA_Build 7 120886065 1I ACAAGATTGC -/T TGTGGGTTGA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 1 2 280838 CASAVA_Build 7 120892162 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1110 het 513 hom 7 1 3 3 A 17 16 280839 CASAVA_Build 7 120899862 1I TGCATCTAGG -/T AGGGTTTTTG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 0 1 280840 CASAVA_Build 7 120901666 1I CCCAAAACAG -/A AAAAAACATG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 6 7 280841 CASAVA_Build 7 120902298 4D59M1I TTTTTACCCA AACTAACTATCAATCAAATATGAAGGTAGAATAAGGGCATTTTCAGACAATTAAATGTCACAG-/----AACTATCAATCAAATATGAAGGTAGAATAAGGGCATTTTCAGACAATTAAATGTCACAGT AAATTGGCTT 3070 hom 90 het 21 0 31 9 N/A 0 0 280842 CASAVA_Build 7 120902434 1D GAGTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 11 10 280843 CASAVA_Build 7 120903307 1I TTACGCCAGA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 149 het 55 0 49 6 T 6 7 280844 CASAVA_Build 7 120903637 1I TCCCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 874 hom 41 3 26 12 T 10 11 280845 CASAVA_Build 7 120923201 1I GATCCCCAGT -/A ACTAAATAAC 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 1 2 280846 CASAVA_Build 7 120925708 1I AAAAAAAACC -/A AAAAAAACAA 2957 het 2957 ref 22 13 8 1 A 7 8 280847 CASAVA_Build 7 120956873 4D TGTCAGAAAT CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 CTTC 5 4 280848 CASAVA_Build 7 120960434 1D TGGAAATATA T/- TTTTATGCTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 5 4 280849 CASAVA_Build 7 120968171 4D CAAAATTTTA TTTG/---- TTTGGCCATT 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 TTTG 2 1 280850 CASAVA_Build 7 120971477 2I AATCCAGCTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 10 12 4 TA 6 7 280851 CASAVA_Build 7 120973752 1D AAATTTCAGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 8 7 280852 CASAVA_Build 7 120983567 19D CAGAACATTT TGGGTAAAGTTCAGACCTC/------------------- TGAGTGGTGT 3070 het 3070 ref 31 21 14 4 TGGGTAAAGTTCAGACCTC 1 0 280853 CASAVA_Build 7 120986574 1D AGATGCTTCA C/- ATAGAAAGTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 0 280854 CASAVA_Build 7 120987863 1D AATTCAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 12 11 280855 CASAVA_Build 7 120994277 2D TAACTAAAAA AG/-- AGTGCATAAA 2567 het 2567 ref 23 13 7 3 AG 2 1 280856 CASAVA_Build 7 121003009 1D GTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 30 2 18 10 T 15 14 280857 CASAVA_Build 7 121004467 4D TGTTTCATTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 38 0 35 4 T 14 10 280858 CASAVA_Build 7 121007755 6I AGAGAGAAAA ------/AAAGAG AAAGAGAAAG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 AAAGAG 2 3 280859 CASAVA_Build 7 121010360 3I GAAAAGTAAG ---/TCT TCTCTCGATC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TCT 1 2 280860 CASAVA_Build 7 121015595 2D CCTATCTAAC TT/-- AATGCTAAAG 3070 het 3070 hom 37 14 23 1 T 2 0 280861 CASAVA_Build 7 121016827 10D TTCCCATAAA ACAAAAATAG/---------- AACTGCTAGT 572 het 572 ref 28 16 3 14 ACAAAAATAG 1 0 280862 CASAVA_Build 7 121024801 1D ATAACATATC T/- TTTTTTTTTT 2138 het 2138 ref 46 29 6 11 T 13 12 280863 CASAVA_Build 7 121030114 1I GGGGATTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 8 9 280864 CASAVA_Build 7 121031639 1D GGAGTGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 11 10 280865 CASAVA_Build 7 121046951 2I ATTTTCAAAT --/TA TCTTTAATAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 TA 0 1 280866 CASAVA_Build 7 121053375 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 A 1 0 280867 CASAVA_Build 7 121053684 5D TTTCACGTGC TTTTG/----- TTTTAAGTTG 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TTTTG 1 0 280868 CASAVA_Build 7 121055865 3I TGGTACAGAT ---/TTA TTATTATTTA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 TTA 2 3 280869 CASAVA_Build 7 121060796 1D GGAGTGGGAG T/- GATTCGTGAA 3070 het 3070 hom 49 23 21 5 T 1 0 280870 CASAVA_Build 7 121065303 5D AGCAACAAAA TTATT/----- TTATTTATTA 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 TTATT 2 1 280871 CASAVA_Build 7 121067860 1I AAATATTTAA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 T 7 8 280872 CASAVA_Build 7 121071902 2I23M1I AAAAAAAAAC --AAAATTTCTGAGTGGTAATGTAC-/AGAAAATTTCTGAGTGGTAATGTACT TTTTAAAAAA 3070 hom 81 het 26 0 28 10 N/A 0 0 280873 CASAVA_Build 7 121073808 1D TTCCTTATAC T/- TTCTTACTTG 3070 hom 54 het 25 0 18 8 T 3 2 280874 CASAVA_Build 7 121074560 1I GCATCTGCTA -/T TTTTTTGACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 6 7 280875 CASAVA_Build 7 121075676 2D CTAGCTTTGT TG/-- TTTTTACTTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TG 1 0 280876 CASAVA_Build 7 121075747 4I TAATAGGATA ----/ATAT ATATATAAAT 2429 hom 12 het 7 0 5 2 AT 3 5 280877 CASAVA_Build 7 121077501 2D CTATATATAG AT/-- ATATATATAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AT 5 4 280878 CASAVA_Build 7 121078113 3I ATTGAGTAAA ---/AGG AGATTATTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AGG 0 1 280879 CASAVA_Build 7 121080171 1D TGTTTTTTTT A/- ATCTCGGTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 1 280880 CASAVA_Build 7 121081583 2D CAATGTGCAT TC/-- TTTATGTTCT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 TC 1 0 280881 CASAVA_Build 7 121082605 1I TCATAAAATG -/A GATGAAAATT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 0 1 280882 CASAVA_Build 7 121082698 1I GCCTGGACTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 7 8 280883 CASAVA_Build 7 121083857 1I AAGCCTAAAA -/G AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 0 1 280884 CASAVA_Build 7 121087575 1I GTCTATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1228 hom 36 4 27 5 T 13 14 280885 CASAVA_Build 7 121091589 14I AAGTACATAA --------------/ATGTATATGAGTAT AAACAGTGTG 3070 hom 166 het 63 0 56 7 ATGTATATGAGTAT 0 1 280886 CASAVA_Build 7 121092848 1D AATAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 31 0 19 12 T 15 14 280887 CASAVA_Build 7 121140141 1I TTGTCCCAGA -/G GGGCACCCGC 3070 hom 44 het 17 0 14 3 G 3 4 280888 CASAVA_Build 7 121163448 1D ATGCCTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 11 10 280889 CASAVA_Build 7 121166583 1I AGTAAAGGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 A 13 14 280890 CASAVA_Build 7 121166941 6D CCAGCCACAG CCCAAC/------ TGTGATTGAC 3070 het 3070 hom 36 15 21 1 CCCAAC 1 0 280891 CASAVA_Build 7 121167497 1D TTGTGCAAAG T/- GGTGACTACA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 T 1 0 280892 CASAVA_Build 7 121170962 1D GCTTCTGTCT A/- AAGCCAGCTC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 3 2 280893 CASAVA_Build 7 121173803 1I TCTGTCATGA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 7 8 280894 CASAVA_Build 7 121178853 2I TCTAGGAAAC --/TG TTGGCTATCT 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 TG 0 1 280895 CASAVA_Build 7 121185836 5D TAATCAGCAC CTTTA/----- CTTTAATGTC 3070 het 3070 ref 31 18 13 3 CTTTA 2 1 280896 CASAVA_Build 7 121360444 1D CAGTTCAGTG A/- AAAAAAAAAA 1471 het 1471 ref 37 24 4 9 A 15 14 280897 CASAVA_Build 7 121371937 1I ACAGATTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 11 280898 CASAVA_Build 7 121375046 1D TATTTGAAGA T/- TTTTTTTTTA 1342 het 1342 ref 41 30 3 8 T 10 9 280899 CASAVA_Build 7 121379253 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 1 0 280900 CASAVA_Build 7 121393409 4D AGGATAACTT CTTA/---- CTTCAGGGGA 3070 hom 129 het 46 0 43 4 CTTA 1 0 280901 CASAVA_Build 7 121406361 1D GTAAGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 42 1 40 1 A 11 10 280902 CASAVA_Build 7 121416666 1I CCTATGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 198 hom 31 3 18 10 T 16 17 280903 CASAVA_Build 7 121420027 4D GGCTGAGACA CTAT/---- CTTCTTCTTC 3070 hom 83 het 35 0 27 9 CTAT 1 0 280904 CASAVA_Build 7 121562063 1I TCTCATTACT -/G GGTATATACC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 2 3 280905 CASAVA_Build 7 121595686 1D CCAGTTTTAC T/- TGACATAAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 2 1 280906 CASAVA_Build 7 121617063 1I CCCTGTCACA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 30 1 23 6 G 1 2 280907 CASAVA_Build 7 121628834 4D TGAAACAACA TAAG/---- TAATAAGTGA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 TAAG 1 0 280908 CASAVA_Build 7 121653459 1D CTAAATGTTA C/- TGACCAGTCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 0 280909 CASAVA_Build 7 121654490 1I TGGTTAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 550 hom 26 2 20 4 A 12 13 280910 CASAVA_Build 7 121655329 2I TATAGTAAAC --/AT ACACAGTCCC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 AT 0 1 280911 CASAVA_Build 7 121661416 1D ATACGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 24 2 19 4 A 13 12 280912 CASAVA_Build 7 121677688 1D AAAAAAAAGT C/- TTTACAAGGA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 C 1 0 280913 CASAVA_Build 7 121689604 1D TTTTTCTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 29 1 18 10 A 13 12 280914 CASAVA_Build 7 121725983 2I CTCCTTGATG --/TA TAAGCTCTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TA 1 2 280915 CASAVA_Build 7 121730069 3I ACCATGAGAG ---/ACA ACATTTCCTG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 ACA 1 2 280916 CASAVA_Build 7 121732082 1I ACAGGAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 449 hom 23 1 16 6 T 12 13 280917 CASAVA_Build 7 121736877 2D CCCACAGGCC TG/-- TGAGGTGTGT 3070 hom 120 het 43 0 38 6 TG 2 1 280918 CASAVA_Build 7 121737582 1D GCGCCCCCTG C/- CCCCGGCTGC 2763 hom 30 het 13 0 9 4 C 5 4 280919 CASAVA_Build 7 121738985 1I ATTTAGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2527 hom 24 6 15 3 T 10 11 280920 CASAVA_Build 7 121739421 1I TGAGGGGGTT -/G GGGGGGGACC 3070 het 2799 hom 26 9 10 7 G 7 8 280921 CASAVA_Build 7 121747241 4D TTCTCCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 9 AAAC 5 4 280922 CASAVA_Build 7 121749328 1I CCAGTGAGAT -/A AATTCTGAAA 3070 het 3070 hom 40 16 23 1 A 2 3 280923 CASAVA_Build 7 121751120 4D GTACAACTGT TATG/---- TATGTGTATA 3070 het 3070 hom 17 9 8 0 TATG 2 1 280924 CASAVA_Build 7 121758449 1D TTGTCTGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 10 9 280925 CASAVA_Build 7 121758931 5D TCTGTCTCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 28 15 12 3 AAAAC 3 2 280926 CASAVA_Build 7 121759701 1D TTTTTTTTTT C/- AATCAGAACA 2638 het 2638 ref 47 18 8 21 C 1 0 280927 CASAVA_Build 7 121761180 2D AATATAAATT TA/-- TATATATATA 2212 het 1115 hom 10 3 6 2 TA 7 6 280928 CASAVA_Build 7 121765125 1I GAAACAGGCT -/A TGACTATGAC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 0 1 280929 CASAVA_Build 7 121776376 1I TTTTGTGGGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 8 9 280930 CASAVA_Build 7 121790339 1D ACCCACAAAA T/- TGCGAATTGC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 2 1 280931 CASAVA_Build 7 121794667 1I TCCTAAATCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 9 10 280932 CASAVA_Build 7 121799280 3D TTAGAGGAAC AAT/--- AATAACAATA 3070 het 3070 ref 55 27 25 7 AAT 2 1 280933 CASAVA_Build 7 121815162 1I TAAAGACAGA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 6 7 280934 CASAVA_Build 7 121819680 1D CTCAATACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 T 12 11 280935 CASAVA_Build 7 121826003 1D AGTCTAGAAC A/- GCATTATGTA 2946 het 2944 ref 19 7 9 3 A 1 0 280936 CASAVA_Build 7 121832958 1I CAAACAAAAC -/A AAACAAAAAA 2524 het 2524 ref 27 18 6 3 A 3 4 280937 CASAVA_Build 7 121843587 1D TTATTTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 13 12 280938 CASAVA_Build 7 121852076 5I TAAGAAAAGC -----/TAAGA TCTCACAGGG 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 TAAGA 0 1 280939 CASAVA_Build 7 121853743 4I AAAATATAAA ----/TGTG TGTGTGTCTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TG 3 5 280940 CASAVA_Build 7 121862285 1I TAGCCTCAGG -/T TTTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 6 7 280941 CASAVA_Build 7 121865099 5D CTGAAGAAAG AAAAA/----- AAAAAAAAGC 2506 het 2506 ref 27 18 6 4 A 13 8 280942 CASAVA_Build 7 121866222 1D TTGAGCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 12 11 280943 CASAVA_Build 7 121866955 4D ACTTTATCAT TCTC/---- TCTCTATCAA 3070 het 3070 hom 39 18 21 0 TC 4 2 280944 CASAVA_Build 7 121870075 1D GTCACTCAAG T/- TTTTTTTTTA 1330 het 1330 ref 44 38 3 4 T 10 9 280945 CASAVA_Build 7 121870881 1D AAATACAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2448 hom 21 7 9 5 T 12 11 280946 CASAVA_Build 7 121875412 1I TAAAGTTTTG -/T TTCACTGTCT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 2 3 280947 CASAVA_Build 7 121881626 1I TAGGTTAATT -/C CCCAAGGTCA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 C 3 4 280948 CASAVA_Build 7 121889661 1D CTGTTAAGAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 A 9 8 280949 CASAVA_Build 7 121890615 1D TATTCTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2671 hom 30 8 10 12 T 13 12 280950 CASAVA_Build 7 121899603 1I TAAGAGAAAT -/A AAAGAATAAT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 3 4 280951 CASAVA_Build 7 121901348 1I CAGAGGTTTT -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 56 30 24 2 A 6 7 280952 CASAVA_Build 7 121907588 1I58M6I GATTTTATAA -TTTTTTTTTTATTTTTCCTAGTTATTGTTATGCTTAGTTTTTTAAAAAATAAGCTTCT------/TTTTTTTTTTTATTTTTCCTAGTTATTGTTATGCTTAGTTTTTTAAAAAATAAGCTTCTTTTTAA GATTTATACT 3070 het 3070 hom 25 17 18 13 N/A 0 0 280953 CASAVA_Build 7 121911957 1D TAAGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 14 13 T 13 12 280954 CASAVA_Build 7 121918004 5I ATTCTTTCAC -----/ATAAG ATAATATTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 ATAAG 0 1 280955 CASAVA_Build 7 121926726 3D TCTAAAGTTT TTC/--- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 46 22 20 6 TTC 1 0 280956 CASAVA_Build 7 121930434 1D CGATTCTCCT G/- CCTCAGTCTC 3070 het 1462 hom 13 4 9 0 G 1 0 280957 CASAVA_Build 7 121938564 4I AGTTTTACAA ----/TTCC TTCCTTCATT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TTCC 1 2 280958 CASAVA_Build 7 121943126 3D TTAATTAAAA AAT/--- AATAATAATT 1228 het 1113 hom 11 3 5 5 AAT 4 3 280959 CASAVA_Build 7 121947634 1D AATGTGTGTG T/- TTTTTTTTTA 1365 het 1365 ref 46 33 3 10 T 10 9 280960 CASAVA_Build 7 121952430 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 461 hom 34 2 19 14 A 13 12 280961 CASAVA_Build 7 121959321 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2382 hom 23 8 9 6 A 14 13 280962 CASAVA_Build 7 121965431 3I6M1D CTTATACAAA ---TTCAGTA/AGTTTCAGT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 3 N/A 0 0 280963 CASAVA_Build 7 121965964 1D TAAGGAGATA G/- GAAAGTACAC 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 G 2 1 280964 CASAVA_Build 7 121967044 18I TCTCTCTGTC ------------------/TCTCTCTCCCTGTCTGTT TCTCTCTGTC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 TCTCTCTCCCTGTCTGTT 0 1 280965 CASAVA_Build 7 121967116 4D TCTGTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 TCTT 3 2 280966 CASAVA_Build 7 121974365 1I ATCTAGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 10 11 280967 CASAVA_Build 7 121978054 2D CATGCTACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 12 14 9 AC 8 7 280968 CASAVA_Build 7 121988622 1D CTTCTATACA C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 1 0 280969 CASAVA_Build 7 122007743 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2363 het 1608 hom 26 8 10 8 A 15 16 280970 CASAVA_Build 7 122009383 3D AGCACAGCAT GAA/--- GAAGATGCCA 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 GAA 2 1 280971 CASAVA_Build 7 122025204 1D CTTTTTAACA T/- TTTTTTTTTT 1122 het 1122 ref 43 34 3 6 T 12 11 280972 CASAVA_Build 7 122028433 1I CATAAAAGAT -/G TATTTTTCAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 G 0 1 280973 CASAVA_Build 7 122029487 1D CAAATTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 11 10 280974 CASAVA_Build 7 122030751 1I ACATGAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 10 11 280975 CASAVA_Build 7 122034337 4D CAAAAGCACC TACA/---- TACATAGACA 3070 het 3070 ref 46 27 14 6 TACA 2 1 280976 CASAVA_Build 7 122058985 1I TTGTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 T 10 11 280977 CASAVA_Build 7 122063220 1D AGCTCCCACA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 111 het 43 0 38 7 T 9 8 280978 CASAVA_Build 7 122086602 1I GCTAGACATA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 832 hom 29 4 14 11 G 0 1 280979 CASAVA_Build 7 122087897 1I GTCTGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 17 5 A 13 14 280980 CASAVA_Build 7 122093338 2I CATCTAATCA --/CT CTCATTGAGC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 CT 1 2 280981 CASAVA_Build 7 122095535 1D GAAAATTCCA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 9 8 280982 CASAVA_Build 7 122096646 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 2271 hom 12 het 7 0 5 2 T 12 11 280983 CASAVA_Build 7 122099873 1I TTGAGGTCAC -/A ACACCTCCTG 3070 het 3070 hom 59 23 33 3 A 1 2 280984 CASAVA_Build 7 122106163 3I AAACCATGGC ---/AGA AGAACATAAA 3070 hom 152 het 57 0 51 6 AGA 1 2 280985 CASAVA_Build 7 122111036 1I GTTAATGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 16 11 A 10 11 280986 CASAVA_Build 7 122111727 2I TGTAGTAAGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 AT 6 7 280987 CASAVA_Build 7 122116059 2I TTGTGGTAAC --/AG GGGGAGTTAT 3070 het 3070 hom 59 22 28 9 AG 0 1 280988 CASAVA_Build 7 122123792 12D GTCTTCCATG ACCCCATGGTCA/------------ TGGAAGCAGT 3070 hom 111 het 39 0 37 5 ACCCCATGGTCA 1 0 280989 CASAVA_Build 7 122137340 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1064 het 1005 hom 16 7 4 5 A 16 15 280990 CASAVA_Build 7 122140605 1D TCCTGTACTT A/- ACACTAGCTC 3070 hom 120 het 43 0 40 4 A 2 1 280991 CASAVA_Build 7 122146303 2D CCATAAATGT AC/-- ACAATTTTGA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 AC 2 1 280992 CASAVA_Build 7 122146683 1D ACTATCCCCC T/- ATCCTTCTGT 3070 het 3070 ref 46 27 13 7 T 1 0 280993 CASAVA_Build 7 122173919 4D AAACACACAG ACAC/---- ACACACACAG 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 AC 6 4 280994 CASAVA_Build 7 122175131 2I TGTGCCTTTG --/CA CACAGTTTGC 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 CA 2 3 280995 CASAVA_Build 7 122184381 1D CTCTGAACTG T/- TGACCAAAGG 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 T 2 1 280996 CASAVA_Build 7 122184980 1I CCTAGCTGAG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 6 7 280997 CASAVA_Build 7 122186292 1I TTATTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 13 14 280998 CASAVA_Build 7 122191884 3D AAGCAAAATA AGT/--- AGTCAGGGTA 3070 het 3070 ref 32 16 12 8 AGT 2 1 280999 CASAVA_Build 7 122197929 1D GTGCCCAGTA C/- AGCTTGCTTG 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 C 1 0 281000 CASAVA_Build 7 122203265 1I AGTTCAAAAA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 1977 hom 25 5 12 8 T 7 8 281001 CASAVA_Build 7 122218653 1D CTTGCTACTC T/- TTTTTTTTTC 1188 het 1188 ref 47 39 3 6 T 10 9 281002 CASAVA_Build 7 122222043 1I AAATCATTTT -/A AAAAAAAAAA 2746 het 2746 ref 37 13 14 10 A 15 16 281003 CASAVA_Build 7 122223325 1I AATCAATGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 7 8 281004 CASAVA_Build 7 122228355 1D TATTTGGGCT A/- AAGAGAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 3 2 281005 CASAVA_Build 7 122229069 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 T 10 9 281006 CASAVA_Build 7 122232445 6D ATTTTCAATC ATTATT/------ ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 ATT 6 4 281007 CASAVA_Build 7 122254707 24I AGCACTTTGG ------------------------/GAGGTTGAGGTGGGCGGATCAACT GAGGTTGGGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 GAGGTTGAGGTGGGCGGATCAACT 0 1 281008 CASAVA_Build 7 122257312 1I ATATCATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 A 11 12 281009 CASAVA_Build 7 122267844 1D TTTTAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 654 hom 27 2 14 11 A 15 14 281010 CASAVA_Build 7 122269115 1I TAGTACTGTA -/C TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 C 0 1 281011 CASAVA_Build 7 122287436 5I CCCAACTTCC -----/TCCCA TCCCAAGTTC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 TCCCA 1 2 281012 CASAVA_Build 7 122305320 1I AGGCCGAGGC -/G GGTGGATCAT 3070 hom 81 het 30 0 25 5 G 2 3 281013 CASAVA_Build 7 122316361 4D AGTTTCCCCA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TC 10 8 281014 CASAVA_Build 7 122319662 5I AACACTTATT -----/ATATA ATATAAGTTA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 ATATA 1 2 281015 CASAVA_Build 7 122336541 1D AAGTGGAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 13 5 T 10 9 281016 CASAVA_Build 7 122340529 1D AGATTTCTAC T/- TTTTTTTTTT 2507 het 2507 ref 25 14 6 5 T 12 11 281017 CASAVA_Build 7 122342543 1D TAATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2396 het 647 hom 28 4 9 15 T 17 16 281018 CASAVA_Build 7 122350309 1I AAATCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 11 12 281019 CASAVA_Build 7 122367216 2I CTATGTTTGT --/CA CAGGGATATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CA 1 2 281020 CASAVA_Build 7 122392102 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2299 het 21 hom 18 1 14 3 A 18 16 281021 CASAVA_Build 7 122393523 1D CATTATGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 43 1 39 3 T 13 12 281022 CASAVA_Build 7 122402604 1D ATGCTCTGAC T/- TTTTCTTACT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 5 4 281023 CASAVA_Build 7 122406397 1D TTGAACTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 28 0 22 7 T 11 10 281024 CASAVA_Build 7 122409502 8I TATAGATAGA --------/TGGATAGC TGGATAGCTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TGGATAGC 1 2 281025 CASAVA_Build 7 122412829 2D GTTAATTAGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 20 0 17 7 AT 6 5 281026 CASAVA_Build 7 122419417 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1771 hom 15 het 7 0 6 1 T 17 16 281027 CASAVA_Build 7 122423229 2D TGTTTATTTC CT/-- CTTTTTCTGA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 CT 2 1 281028 CASAVA_Build 7 122427947 1D CTGGAGTGAT A/- AACAGTTTCA 3070 hom 60 het 21 0 21 1 A 3 2 281029 CASAVA_Build 7 122432827 1I GTGAGTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1277 hom 30 4 20 6 A 12 13 281030 CASAVA_Build 7 122449532 1I TATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1134 het 1134 ref 28 19 5 4 T 15 16 281031 CASAVA_Build 7 122464834 3D ATTTAGTAAT AAC/--- AACAGCATAA 3070 hom 114 het 43 0 39 6 AAC 2 1 281032 CASAVA_Build 7 122466067 2I CCATGCAATT --/AC ACACACATGA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AC 3 4 281033 CASAVA_Build 7 122475373 1I TTGGATCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 8 T 10 11 281034 CASAVA_Build 7 122492613 1I CTCTGAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 532 hom 36 2 27 7 T 10 11 281035 CASAVA_Build 7 122500896 1I TCAAGATGAC -/A AAAATCATAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 4 5 281036 CASAVA_Build 7 122502591 3I TTATACCTGG ---/AAA ATCGTTCTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 1 4 281037 CASAVA_Build 7 122513830 4I GAGAACAAGG ----/AAGA GAGACTTGCC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AAGA 0 1 281038 CASAVA_Build 7 122524788 4D CATTTTCTTA CTTT/---- CTTTTTCAGG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 CTTT 2 1 281039 CASAVA_Build 7 122531382 1D CTTCAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 33 0 27 6 T 11 10 281040 CASAVA_Build 7 122541726 1I AAATGTTTAG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 281041 CASAVA_Build 7 122547076 2D TCTACCAAAC AT/-- ATATTTTTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 3 2 281042 CASAVA_Build 7 122569043 1D GACTCCTGCT C/- CTTTTTGGTT 2524 het 2524 ref 31 20 7 4 C 2 1 281043 CASAVA_Build 7 122593061 1I AGGTTTCCTG -/A AAAAAAAAAC 1137 het 1137 ref 59 46 3 10 A 9 10 281044 CASAVA_Build 7 122593688 1D CATTTCTTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 9 8 281045 CASAVA_Build 7 122598212 1D ATTTTTAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 30 0 19 11 A 10 9 281046 CASAVA_Build 7 122598247 1I GTCTGAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2121 hom 34 5 14 15 T 10 11 281047 CASAVA_Build 7 122600866 1I ATAGGTCCTA -/T TATTTTTCTG 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 1 2 281048 CASAVA_Build 7 122607103 2D TATAACTGTT AA/-- AAACACACCT 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 A 5 3 281049 CASAVA_Build 7 122625724 3I TTGAGGGCTT ---/AGA AGAAATTTGG 3070 het 2936 hom 23 6 13 4 AGA 1 2 281050 CASAVA_Build 7 122632377 1D TCTCTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 12 12 A 13 12 281051 CASAVA_Build 7 122642047 1D CATGATCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 480 hom 30 2 19 9 T 14 13 281052 CASAVA_Build 7 122643019 1D ATTAAACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 34 3 19 13 T 17 16 281053 CASAVA_Build 7 122643190 1D AAGACAAATT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 8 7 281054 CASAVA_Build 7 122652056 1D AGTAATTCTA T/- TTTTAATTTT 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 T 5 4 281055 CASAVA_Build 7 122654163 1D AAAGGATGGT A/- AAAGTGGAAA 3070 het 3070 ref 53 22 25 6 A 4 3 281056 CASAVA_Build 7 122659443 1D CATGTGATCT A/- AGTCAGGACT 3070 het 3070 ref 59 26 22 11 A 2 1 281057 CASAVA_Build 7 122664594 3I ACAAAGTATT ---/ATA ATAATTACAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 ATA 1 2 281058 CASAVA_Build 7 122664935 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 15 22 13 T 11 12 281059 CASAVA_Build 7 122674315 18D AAATGAGTAG CAGCTTTTGTCTCTACCC/------------------ CAGATTCTTA 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 CAGCTTTTGTCTCTACCC 1 0 281060 CASAVA_Build 7 122676032 2D AGGTATGATC CT/-- CTCTTCTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 20 7 CT 3 2 281061 CASAVA_Build 7 122680923 2D GCTGTTTAAT TA/-- TGCTCAAGGA 3070 het 3070 ref 48 30 17 2 TA 1 0 281062 CASAVA_Build 7 122691327 2D TATCTCTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 21 12 T 12 10 281063 CASAVA_Build 7 122693081 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 10 9 281064 CASAVA_Build 7 122695764 4I GGAGACACTT ----/ACCC AGAGTATATC 3070 het 3070 ref 50 28 18 4 ACCC 0 1 281065 CASAVA_Build 7 122704060 2D CCTTTCCGTA TC/-- TCTGGTCTCT 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 TC 2 1 281066 CASAVA_Build 7 122705873 2D AATCGTTATC TT/-- TCTTTTACAG 3070 het 3070 ref 50 30 19 1 T 3 1 281067 CASAVA_Build 7 122715435 1D ATTCGAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 12 11 281068 CASAVA_Build 7 122723266 1I TATCAAATTG -/A AAAAAATATC 3070 hom 88 het 32 0 30 2 A 6 7 281069 CASAVA_Build 7 122723639 1I ACTATCACAA -/G CTAAAGTGCT 3070 hom 153 het 58 0 49 9 G 0 1 281070 CASAVA_Build 7 122726008 1I GTTGAAAAGC -/A AGGGAAATGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 2 281071 CASAVA_Build 7 122732362 1I CAGATTCACG -/T TAAGAGTCTT 3070 het 3070 ref 64 31 20 13 T 1 2 281072 CASAVA_Build 7 122756826 1I ATTGTTGCAC -/A TGATACTTGG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 0 1 281073 CASAVA_Build 7 122763490 1I TATCCGAAGG -/A AAAAAAAAAA 1126 het 1126 ref 51 36 3 12 A 10 11 281074 CASAVA_Build 7 122765001 1D ATCCTCTGGT C/- CTAAATATTT 3070 het 3070 hom 37 8 26 3 C 2 1 281075 CASAVA_Build 7 122765805 1I TTTTTCTTTC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 A 8 9 281076 CASAVA_Build 7 122773821 1D TCTAAAAAAC A/- AAAAACAAAA 560 het 82 hom 17 1 5 11 A 6 5 281077 CASAVA_Build 7 122783473 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 T 11 10 281078 CASAVA_Build 7 122791186 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 2574 het 2005 hom 11 5 6 0 A 8 9 281079 CASAVA_Build 7 122802594 4D AGAAATCTTA ATAT/---- ATAGAAAGAC 3070 hom 88 het 31 0 28 5 AT 3 1 281080 CASAVA_Build 7 122803111 1D TGAAAGGGAG A/- GGGGCAAAGG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 1 0 281081 CASAVA_Build 7 122806096 3I CAAAGCTCTC ---/ATT GTACTGGTTT 3070 hom 154 het 53 0 52 1 ATT 0 1 281082 CASAVA_Build 7 122812255 4D GAAGAAAAAC AATG/---- AAGTCAGATA 3070 het 3070 ref 49 27 21 4 AATG 1 0 281083 CASAVA_Build 7 122845334 1I AACCATTTTT -/C CCCTCCCAGG 3070 hom 77 het 29 0 26 3 C 3 4 281084 CASAVA_Build 7 122852023 4I AGAGACAGAT ----/GATA GATAGATGAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 GATA 1 2 281085 CASAVA_Build 7 122864499 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2321 het 2321 ref 16 7 7 2 A 10 11 281086 CASAVA_Build 7 122866779 1D ACTCACTGGA G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 50 het 28 0 20 8 G 9 8 281087 CASAVA_Build 7 122870800 4D GGGGTACAGG TATT/---- TATTTATAGG 3070 hom 85 het 34 0 29 5 TATT 2 1 281088 CASAVA_Build 7 122882171 2D GTTAATCTTG AT/-- TACCTGGCTG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 AT 1 0 281089 CASAVA_Build 7 122895841 10I TACGTGGTCA ----------/AAGTGAGAGT AAATTGTCCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAGTGAGAGT 0 1 281090 CASAVA_Build 7 122956768 2D GTCTCTAGTG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 10 8 281091 CASAVA_Build 7 122964124 1I CCACTATTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 9 10 281092 CASAVA_Build 7 122977332 2D GCAGTCTAGA CT/-- TTTATTAACT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CT 1 0 281093 CASAVA_Build 7 122977730 16I AAATGTTACA ----------------/CTGGATACCACAAATC CAAGACAACA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CTGGATACCACAAATC 0 1 281094 CASAVA_Build 7 123039259 1D ATAGTAGGAG A/- AAAAAAAAAA 809 het 809 ref 40 32 3 5 A 12 11 281095 CASAVA_Build 7 123080004 1D TACAGGCTGT A/- AAAAAAAAAA 1092 het 1092 ref 44 17 12 16 A 11 10 281096 CASAVA_Build 7 123080902 6I AAAAATTTTC ------/TTCTTT TTTTTTTTTT 1099 het 1099 ref 21 9 6 6 TTCTTT 0 1 281097 CASAVA_Build 7 123105794 1D AACAAACAAA C/- AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 52 25 20 8 C 1 0 281098 CASAVA_Build 7 123106533 2D ACCCTGGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 1859 het 276 hom 38 2 8 28 A 20 18 281099 CASAVA_Build 7 123111783 2D CACCTTAAAA AT/-- ATATATATAT 2397 hom 15 het 9 0 6 3 AT 8 7 281100 CASAVA_Build 7 123111982 3D ATGTGACTCC CAG/--- AAGAATCTAG 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 CAG 1 0 281101 CASAVA_Build 7 123115047 2I AGGCAGGGAC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 9 11 281102 CASAVA_Build 7 123117074 1I13M4D TGCATTCATG -AAAAAAAAAATTATAAT/AAAAAAAAAAATTA---- TAAAGATGAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 4 N/A 0 0 281103 CASAVA_Build 7 123117191 3I CCCAAAGACA ---/ATT ATTTTATTTA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 ATT 1 2 281104 CASAVA_Build 7 123117870 43I ATGGCCCCCA -------------------------------------------/TCCAACACTTAGAATAGAAGATATTTTTCTTTCTAAAAGATAC TTCTTACACA 2087 het 2087 ref 25 18 5 2 TCCAACACTTAGAATAGAAGATATTTTTCTTTCTAAAAGATAC 0 1 281105 CASAVA_Build 7 123121933 1D TGTATGAATG T/- TAACTGGTTT 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 T 2 1 281106 CASAVA_Build 7 123127737 1D ACTTTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1106 hom 32 9 17 6 T 12 11 281107 CASAVA_Build 7 123129236 1I CAACACTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 10 11 281108 CASAVA_Build 7 123145384 4D TATTGGACTG TTAA/---- TTAATAATAA 3070 het 3070 ref 41 18 18 9 TTAA 2 1 281109 CASAVA_Build 7 123147635 1D ATACAGCTGC A/- AAAAAAAAAA 2012 het 2012 ref 49 22 7 20 A 17 16 281110 CASAVA_Build 7 123148609 2I TTTGCTTGAC --/TT TGACATGTAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 3 281111 CASAVA_Build 7 123149173 5I TGAGATTTAA -----/TAACT TAAATGTTCT 3070 het 3070 hom 20 10 8 3 TAACT 0 1 281112 CASAVA_Build 7 123165461 4I TTAATAGAGG ----/TTAA TTAATTACAC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TTAA 1 2 281113 CASAVA_Build 7 123167745 4D AATAAATAAG ATTT/---- ATTTTGTATT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 ATTT 2 1 281114 CASAVA_Build 7 123192542 2I AGATGATAAC --/AG AGAGATGCTT 3070 het 3070 hom 45 17 27 1 AG 2 3 281115 CASAVA_Build 7 123209364 3I ATGGGCTAAT ---/ATG ATGCTTCCCC 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 ATG 1 2 281116 CASAVA_Build 7 123219444 1D AAATAGGGGG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 A 7 6 281117 CASAVA_Build 7 123237619 1D AAGAAACTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 A 10 9 281118 CASAVA_Build 7 123239654 4I AAAATCTCAG ----/TAAT CAGCATGTAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 TAAT 0 1 281119 CASAVA_Build 7 123240792 2I TATATGCCTA --/AG AGAAGATGAT 3070 het 2722 hom 23 7 13 3 AG 1 2 281120 CASAVA_Build 7 123242116 28I TTGTCCAAAT ----------------------------/GATGAAGTTCTCCGCAATGACCAACTCC TGTGGCTGTG 3070 het 3070 ref 44 23 13 10 GATGAAGTTCTCCGCAATGACCAACTCC 0 1 281121 CASAVA_Build 7 123242275 1D CCAGTTTTTA T/- TTTTTCCAGA 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 T 6 5 281122 CASAVA_Build 7 123245109 1D ATGCAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 19 8 8 4 A 10 9 281123 CASAVA_Build 7 123251020 4D ATATATATTT TATA/---- TATATATATA 1354 het 1354 ref 17 11 4 2 TA 8 6 281124 CASAVA_Build 7 123260694 1I ATTCATGTCC -/T TAGCCCACTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 1 2 281125 CASAVA_Build 7 123262518 1D TCATTGGTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 T 9 8 281126 CASAVA_Build 7 123263932 1I CCTGTATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 14 0 10 4 T 10 11 281127 CASAVA_Build 7 123266273 1D GTTTCAATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 10 9 281128 CASAVA_Build 7 123266540 1D GGTTTTCCAT C/- CCTGTGATAG 1521 het 1521 ref 23 15 4 4 C 3 2 281129 CASAVA_Build 7 123267127 1D GGATTGTTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 61 het 26 0 20 6 T 9 8 281130 CASAVA_Build 7 123271706 1I TCGTCCCAGA -/G GGGCAGCCGC 3070 hom 65 het 26 0 21 5 G 3 4 281131 CASAVA_Build 7 123289981 1D TCATAAATAA C/- TGGTTTGAAC 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 C 1 0 281132 CASAVA_Build 7 123300693 1D AATTGCCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1406 hom 32 6 20 6 A 16 15 281133 CASAVA_Build 7 123314857 2D TAATAGTTAA AC/-- ATAGAGTTGC 3070 het 3070 ref 28 14 14 2 AC 1 0 281134 CASAVA_Build 7 123337913 1D ACCTTTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 9 20 9 A 13 12 281135 CASAVA_Build 7 123361919 4D GAAAATATGG TATA/---- TAAACCTAAT 3070 het 3070 ref 43 25 18 0 TA 3 1 281136 CASAVA_Build 7 123376264 1D AATTTGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2599 hom 33 10 14 9 T 15 14 281137 CASAVA_Build 7 123377145 1I GAAAATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 945 hom 20 2 15 3 T 12 13 281138 CASAVA_Build 7 123380184 1D CTCCCCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 33 3 22 9 A 15 14 281139 CASAVA_Build 7 123387795 1D AGAATTAGTA T/- TTTTTTGCTT 3070 hom 96 het 42 0 33 10 T 7 6 281140 CASAVA_Build 7 123390639 1I GTATCTTTTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 T 8 9 281141 CASAVA_Build 7 123391031 1I CCCAATTCTT -/G GTAGCAGGAT 3070 het 3070 hom 36 19 17 0 G 1 2 281142 CASAVA_Build 7 123391338 5I3M2D ATTTTATAAG -----ACAGT/TATTTACA-- ATATTAAGTA 3070 het 3070 hom 21 10 10 3 N/A 0 0 281143 CASAVA_Build 7 123411994 1I TATGTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 T 12 13 281144 CASAVA_Build 7 123415654 1I AGGTTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 2104 het 2104 ref 27 14 8 5 T 13 14 281145 CASAVA_Build 7 123434307 1D GCAAAGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 11 10 281146 CASAVA_Build 7 123453960 1D CTTGGCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 11 13 T 15 14 281147 CASAVA_Build 7 123454368 1D AGGTAAGATG A/- AAATTAAACA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 4 3 281148 CASAVA_Build 7 123454942 1D TAAGATACTA C/- AATACAATTA 3070 het 3070 hom 33 13 18 4 C 1 0 281149 CASAVA_Build 7 123456552 2D ATATATATGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 AT 6 5 281150 CASAVA_Build 7 123461868 1D TTCTGGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 T 11 10 281151 CASAVA_Build 7 123470145 1D TTTTTTTTTT A/- ACTTAAATTT 3070 het 3070 hom 29 11 11 8 A 2 1 281152 CASAVA_Build 7 123470212 1I CCTGGATTTC -/T TAGACCCTCA 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 1 2 281153 CASAVA_Build 7 123474097 1D TCTTTATCAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 9 8 281154 CASAVA_Build 7 123480289 2D ATATATACAC AT/-- GTGCATAGAT 2445 het 2445 ref 28 10 7 12 AT 1 0 281155 CASAVA_Build 7 123481755 2D CATGGAAAAC TG/-- TATGAAAATA 3070 het 3070 hom 56 24 27 5 TG 1 0 281156 CASAVA_Build 7 123484472 1D TTTATTCCTA T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 7 6 281157 CASAVA_Build 7 123486226 6D TTTACAATCT TATATA/------ TATATCTCAT 3070 het 3070 ref 47 24 21 4 TA 5 2 281158 CASAVA_Build 7 123487356 1D CCAGTACTTT A/- AAAAAAGGTA 3006 het 3006 ref 25 16 8 1 A 7 6 281159 CASAVA_Build 7 123490095 1D ATTTCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2449 het 659 hom 12 3 6 3 T 11 10 281160 CASAVA_Build 7 123490844 1I TTTGATTGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 9 10 281161 CASAVA_Build 7 123491398 2D AGGAATCCCC CT/-- GTTTTTAGCT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 CT 1 0 281162 CASAVA_Build 7 123491756 3I TTGGAGGTGG ---/TGA TGAGAGGTGA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 TGA 1 2 281163 CASAVA_Build 7 123498590 3D AGATGAAATT ATG/--- ATGAAGATGA 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 ATG 2 1 281164 CASAVA_Build 7 123505231 2D ACTTCACTTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 CT 7 6 281165 CASAVA_Build 7 123510170 1D GGGTCCCCAG C/- CCCCAGGCCA 2559 het 2559 ref 23 12 7 6 C 5 4 281166 CASAVA_Build 7 123510288 5D CTGCCTCCTG TCAGA/----- TCAGCAGGCA 3070 het 3070 ref 41 24 15 3 TCAGA 1 0 281167 CASAVA_Build 7 123511935 1D CTTTTCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 13 12 281168 CASAVA_Build 7 123512683 2D CAGAGAACGA CT/-- CTGACACATT 3070 het 3070 ref 55 28 20 7 CT 2 1 281169 CASAVA_Build 7 123528130 1I TGAACATTCC -/T TAAATATTAA 3070 het 3070 hom 52 22 21 9 T 1 2 281170 CASAVA_Build 7 123528702 1I TTGCTTTTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 9 10 281171 CASAVA_Build 7 123532701 1I TACATGTCAC -/T TTTTTAAGGT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 5 6 281172 CASAVA_Build 7 123547834 5D CCCCCACTGT AACTA/----- AACTAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 AACTA 2 1 281173 CASAVA_Build 7 123552228 3D TTATTAAAAA TAT/--- TATTATGTTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 TAT 3 2 281174 CASAVA_Build 7 123553066 1I TGAGGTTCTG -/T TTTTTACTCA 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 5 6 281175 CASAVA_Build 7 123558944 2D AGCAAAGCTT CA/-- CCCTACCTCT 3070 het 3070 ref 50 32 11 10 CA 1 0 281176 CASAVA_Build 7 123559600 1D AAATGGAAAT A/- AAAAAATACG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 A 7 6 281177 CASAVA_Build 7 123560190 2I GACATATTTA --/AT ATCTTTGCGG 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 AT 1 2 281178 CASAVA_Build 7 123562745 4D AAAGTATAAT AATA/---- AAAAAAAATT 2672 het 486 hom 7 1 6 2 AATA 1 0 281179 CASAVA_Build 7 123563705 1I GAGGTTTTGG -/C CTGCAGTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 C 1 2 281180 CASAVA_Build 7 123565347 1I ATTCAGTGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 8 9 281181 CASAVA_Build 7 123567668 8D ATCTCACCTG AAGCCAGC/-------- AAGTCTCAGT 3070 het 3070 hom 41 19 21 4 AAGCCAGC 1 0 281182 CASAVA_Build 7 123568309 1I TTGATTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 8 9 281183 CASAVA_Build 7 123575392 2D CCTCTATAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 846 hom 35 2 15 19 T 13 11 281184 CASAVA_Build 7 123578127 1D GCCATCCAAA C/- CCCCTGGCAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 5 4 281185 CASAVA_Build 7 123578876 1D13M1D TTAATGAGCT AAAAAAAATCACACA/-AAAAAAATCACAC- AAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 33 21 10 3 N/A 0 0 281186 CASAVA_Build 7 123582210 1I ATGTGTTTTG -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 7 8 281187 CASAVA_Build 7 123598618 6I GTCTTTTCTG ------/TTTGTC TTTAAGTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TTTGTC 0 1 281188 CASAVA_Build 7 123603405 4D TTCTCGTGAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 hom 42 18 19 7 AGTG 2 1 281189 CASAVA_Build 7 123604669 1D TACATATAAT A/- AAAAAAAAAA 1183 het 1183 ref 36 29 3 5 A 11 10 281190 CASAVA_Build 7 123609237 1D ATACAATGAA T/- TTTTTCTACT 3070 het 3070 ref 39 17 19 3 T 6 5 281191 CASAVA_Build 7 123628777 1I CAATTATTTT -/G GGGGGAGGGA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 G 5 6 281192 CASAVA_Build 7 123629861 4I AAAGAAAGAA ----/TAAT TAATGATAAA 3070 hom 115 het 43 0 38 5 TAAT 1 2 281193 CASAVA_Build 7 123635932 1I CATTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 45 2 34 9 A 13 14 281194 CASAVA_Build 7 123639172 1I CCAAACACTA -/C CTGTACCCCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 1 2 281195 CASAVA_Build 7 123640093 2D GGCATCAATA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 8 7 281196 CASAVA_Build 7 123657617 1I ATATGTGATT -/A ATTTGGGTTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 1 2 281197 CASAVA_Build 7 123659713 1D TAGCACTGTA C/- TGGGGGGGGG 2901 het 2901 ref 34 19 12 3 C 1 0 281198 CASAVA_Build 7 123666082 1I ATACATACAA -/T TTATACTTCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 2 3 281199 CASAVA_Build 7 123666480 4I CTCTGAATAA ----/TGAT TGAATGTTAT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TGAT 0 1 281200 CASAVA_Build 7 123667693 4D ACTTAGAGGA CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 CTTT 4 3 281201 CASAVA_Build 7 123684050 1D ACTTTGTCGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 12 11 281202 CASAVA_Build 7 123689075 1I AATTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 11 12 281203 CASAVA_Build 7 123693411 1D ATACCCTTTT A/- AAATTAAAAC 3070 het 3070 hom 40 19 16 5 A 4 3 281204 CASAVA_Build 7 123696756 1I TATTATTTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 A 9 10 281205 CASAVA_Build 7 123698282 1D TTTTCTCTGC T/- TTTTTGGGAG 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 6 5 281206 CASAVA_Build 7 123704295 3D TTTTAAAAAA AGG/--- AGAGTTTCCC 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 AGG 1 0 281207 CASAVA_Build 7 123712958 1D ATTAGATGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 10 9 281208 CASAVA_Build 7 123716546 1I GAAGGGATGA -/T CACTGGGTAT 3070 het 3070 ref 52 25 21 6 T 0 1 281209 CASAVA_Build 7 123717382 1I CATCTTCCCG -/T TTTCCCCCCT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 T 3 4 281210 CASAVA_Build 7 123718904 4D AAAAATCATT ACTC/---- AGACCAATGA 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 ACTC 1 0 281211 CASAVA_Build 7 123719408 2D TAAATGTATA TG/-- TGTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 49 27 20 6 TG 2 1 281212 CASAVA_Build 7 123719642 1D TGCTTAGTCT C/- CGTAGTTCTA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 C 2 1 281213 CASAVA_Build 7 123726758 1D TTTTTTTTTT C/- CATATGTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 C 2 1 281214 CASAVA_Build 7 123729840 1I TTTCCTGAGG -/C CCCCCCCAGT 1578 het 1578 ref 20 10 6 4 C 7 8 281215 CASAVA_Build 7 123730919 1I6M1I CACACAGAGT -CCCACT-/CCCCACTG GGGCACTGCC 3070 hom 87 het 31 0 27 7 N/A 0 0 281216 CASAVA_Build 7 123731882 1D AGTCAATAAA C/- CCTCCTTTCT 3070 hom 94 het 38 0 32 6 C 3 2 281217 CASAVA_Build 7 123737473 2I ACAGAAAAAG --/AT ATAAAATTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AT 1 2 281218 CASAVA_Build 7 123742155 5D TCTTTTTCTT TTTTA/----- TTTTATTTTA 2340 hom 15 het 10 0 6 4 TTTTA 5 4 281219 CASAVA_Build 7 123743382 1I CAAGCAGTCA -/G TCAGAGAGTC 3070 hom 175 het 65 0 59 6 G 0 1 281220 CASAVA_Build 7 123747004 1I GATTCATCAT -/G GGGGGGTGCA 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 G 6 7 281221 CASAVA_Build 7 123752665 1I AGACAAGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 9 10 281222 CASAVA_Build 7 123757873 4D TGACTTATAA TTTG/---- TTTATTTATT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TTTG 1 0 281223 CASAVA_Build 7 123762284 1I TTTAGTATAT -/A TTTTTTTAGC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 1 281224 CASAVA_Build 7 123765069 1I37M3I GCAAGCTGAC -TATAAGGAAAATGTATGTGATTATACGGTGAATAAAC---/TTATAAGGAAAATGTATGTGATTATACGGTGAATAAACATT ATTCTTTTAA 3070 het 2085 hom 31 6 19 23 N/A 0 0 281225 CASAVA_Build 7 123765904 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 6 7 281226 CASAVA_Build 7 123766005 1I TTAGATGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 T 13 14 281227 CASAVA_Build 7 123774297 2D TTGTTGACTT TC/-- TGTCTTGATG 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 TC 1 0 281228 CASAVA_Build 7 123774912 20D GAATAGCTAT TTCTGCTCACGTTTGGTGTC/-------------------- TATTTGCAGG 3070 het 3070 ref 40 34 15 2 TTCTGCTCACGTTTGGTGTC 1 0 281229 CASAVA_Build 7 123775161 1I CTTATTTGTG -/T TTTTTTTTCA 2390 het 2390 ref 51 30 8 13 T 8 9 281230 CASAVA_Build 7 123777121 1I AGACTCACAG -/T TTTTCAGCAT 3070 hom 102 het 35 0 33 2 T 4 5 281231 CASAVA_Build 7 123777466 18D CGTTTTCTGA GTGGGCACCGTTTACTGG/------------------ TGCCCAATAA 3070 het 3070 hom 29 14 20 2 GTGGGCACCGTTTACTGG 1 0 281232 CASAVA_Build 7 123780956 1D TTTTCTGAGT G/- GCAACCCAAG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 2 1 281233 CASAVA_Build 7 123781157 4D TGAGTTTTGC TTCT/---- TTAATAGTTT 3070 het 3070 ref 44 22 20 6 TTCT 1 0 281234 CASAVA_Build 7 123781682 2D TGCCACAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 15 13 281235 CASAVA_Build 7 123782973 5D TTAAATTTGT TGCTA/----- TACTTTCAAT 3070 het 3070 ref 23 11 11 2 TGCTA 1 0 281236 CASAVA_Build 7 123783661 1I CAGTATATCA -/T TTTTTTATCA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 6 7 281237 CASAVA_Build 7 123784278 1I CTCGTCTATT -/A GGTTATTAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 0 1 281238 CASAVA_Build 7 123785718 2D CTGTAATAAC TG/-- TAATTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 15 11 10 TG 1 0 281239 CASAVA_Build 7 123786023 1I AATTCCAGCA -/C TTTTAACCAT 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 C 0 1 281240 CASAVA_Build 7 123786868 16D GGATGAAGAG AGAGAGAGAGAGAGAA/---------------- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 12 AGAGAGAGAGAGAGAA 2 1 281241 CASAVA_Build 7 123787097 3D13M1I AAAATAAGAT ATCATTTTTTCTTTTA-/---ATTTTTTCTTTTAC TCCAGGGAAA 3070 het 3070 ref 21 13 9 1 N/A 0 0 281242 CASAVA_Build 7 123787279 1I TTTTGTACAC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 2401 hom 25 9 10 6 T 7 8 281243 CASAVA_Build 7 123787386 2D TATTTTCTGC TT/-- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 29 17 9 4 T 9 7 281244 CASAVA_Build 7 123788667 1I ACAAAATTAG -/A AAAAAAGAGG 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 A 6 7 281245 CASAVA_Build 7 123788933 2I AGTTTTCTTT --/AA CAAAAAAAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 2 281246 CASAVA_Build 7 123789557 5I TCTGCACAGC -----/AAAGA AAACAATCAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AAAGA 0 1 281247 CASAVA_Build 7 123790596 10I TTCTCACTCA ----------/TTTTAGGGAG CTAAAAAATT 3070 hom 123 het 43 0 42 2 TTTTAGGGAG 0 1 281248 CASAVA_Build 7 123792167 1D TCTTTGCGGT A/- ATATGGGGCA 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 A 2 1 281249 CASAVA_Build 7 123798766 1I TCACCATTTT -/G GGATTCATCT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 G 2 3 281250 CASAVA_Build 7 123806522 1D TTTCACTGAT C/- GTCTGCCTCT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 1 0 281251 CASAVA_Build 7 123811464 1D TCAAAAATAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 56 20 24 12 A 9 8 281252 CASAVA_Build 7 123812955 3I TCCAATTAAA ---/CTT CTTTTTGTTC 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 CTT 1 2 281253 CASAVA_Build 7 123813074 3D TTTAGTGATT TAG/--- TAGATTTTCT 3070 het 3070 hom 26 10 13 5 TAG 2 1 281254 CASAVA_Build 7 123816982 1I GTCTGAAATA -/T TTGCCAGTGT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 2 3 281255 CASAVA_Build 7 123817378 1I TTAAGTATAA -/T TGTTATGGAA 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 1 2 281256 CASAVA_Build 7 123819672 1D TAACGTGCTG A/- AACACTAACC 3070 het 3070 hom 39 16 15 9 A 3 2 281257 CASAVA_Build 7 123824853 1I CTTTTTTTTT -/A AAATAACTGG 3070 het 3070 hom 51 15 31 5 A 3 4 281258 CASAVA_Build 7 123838402 10D TGTATATATA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 33 15 12 12 TG 9 4 281259 CASAVA_Build 7 123839901 2I AGTTACTCCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 12 13 T 14 16 281260 CASAVA_Build 7 123851880 1I TCCAAACGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 A 10 11 281261 CASAVA_Build 7 123855447 1D TGTCTCTATA G/- AACTCATCAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 1 0 281262 CASAVA_Build 7 123860962 1D TATGGTCCCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 8 7 281263 CASAVA_Build 7 123872390 1D TTTCTAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 11 10 281264 CASAVA_Build 7 123881412 1D CAGAATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 29 2 21 6 T 15 14 281265 CASAVA_Build 7 123898279 11D ATTATACATC AGGAATTATGG/----------- ATTTGATTTT 3070 het 3070 hom 42 20 25 1 AGGAATTATGG 1 0 281266 CASAVA_Build 7 123908948 1I TTAAAAAAAA -/T AATAATAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 0 1 281267 CASAVA_Build 7 123911712 1D TTTGAAGGCC A/- AAAATCACAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 5 4 281268 CASAVA_Build 7 123913779 1I TGATCAGGCA -/T GTTTCCACCA 3070 het 3070 hom 47 14 26 7 T 0 1 281269 CASAVA_Build 7 123921770 1I AGACAAATTG -/T TTTTTCTTTT 3070 het 1873 hom 21 6 12 3 T 5 6 281270 CASAVA_Build 7 123929674 1D GTTGTTGTCA T/- TAACAACTAA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 2 1 281271 CASAVA_Build 7 123937378 1I TTTTTAAATT -/G GGGGGTAGGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 5 6 281272 CASAVA_Build 7 123939882 1I GGGAAACAGC -/T TCAGAAAATC 3070 het 3070 hom 39 10 28 1 T 1 2 281273 CASAVA_Build 7 123940949 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1723 het 1671 hom 18 6 9 3 A 13 12 281274 CASAVA_Build 7 123943727 4I TATAACACAT ----/AAAC ATACACATAT 3070 het 2055 hom 22 6 11 5 AAAC 0 1 281275 CASAVA_Build 7 123947807 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 10 9 281276 CASAVA_Build 7 123951249 3D GTTGGAATTC CTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 862 hom 33 9 12 12 CTT 1 0 281277 CASAVA_Build 7 123951473 6I GCAGGGGTTC ------/TGTGCA TGTGCATGTT 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 TGTGCA 1 2 281278 CASAVA_Build 7 123953677 1I TTTTAAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 45 0 33 12 A 9 10 281279 CASAVA_Build 7 123953833 6D30M1I ATTTTAGTAT AAGGTAAAGGTAACACACTAAACTTTTATTCCTGAA-/------AAGGTAACACACTAAACTTTTATTCCTGAAT TTTATTAACT 3070 hom 102 het 33 0 35 10 N/A 0 0 281280 CASAVA_Build 7 123956027 1I GACTTTATGT -/G GGGGTTCCAA 3070 hom 100 het 41 0 32 9 G 4 5 281281 CASAVA_Build 7 123956929 1D TGTCCAGGGA G/- GACCTGGTGG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 G 2 1 281282 CASAVA_Build 7 123959149 23I TGCTTATTGT -----------------------/AGAGTAACCAACTTTTAAAGTCA AGATTTGTGG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AGAGTAACCAACTTTTAAAGTCA 0 1 281283 CASAVA_Build 7 123962951 1I TCTGTGATTG -/T TTTTTTAGCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 7 281284 CASAVA_Build 7 123964251 19I AAAATAAAAT -------------------/TATCTTTGGAGAAGGAATC TGAACAATCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TATCTTTGGAGAAGGAATC 0 1 281285 CASAVA_Build 7 123975492 2D TCTTTATATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 23 0 19 7 T 12 10 281286 CASAVA_Build 7 123975684 1D CTTCAAATGT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 59 het 33 0 27 6 A 9 8 281287 CASAVA_Build 7 123990534 4D AACTGTGATT CAAA/---- CAAAGTGGAG 3070 hom 126 het 44 0 42 4 CAAA 2 1 281288 CASAVA_Build 7 123992713 1D TTACTGAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 10 9 281289 CASAVA_Build 7 124055930 4D33M2D TTATTAGCCC ATATATATATATATATATACACACACACACATATATGTA/----ATATATATATATATACACACACACACATATATG-- TATGTGTATA 3070 het 251 hom 29 3 13 16 N/A 0 0 281290 CASAVA_Build 7 124087085 2I GAAAACACAC --/GA GAGGCATATA 2750 het 2750 ref 32 21 8 3 GA 1 2 281291 CASAVA_Build 7 124089639 1D AGAAAAGAGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 T 9 8 281292 CASAVA_Build 7 124092884 1I TATGATGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 10 11 281293 CASAVA_Build 7 124094726 1I TGTTAGTAGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 47 24 14 9 A 8 9 281294 CASAVA_Build 7 124096892 5I CATTTATTTT -----/ATTTG ATAAGACATT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 ATTTG 0 1 281295 CASAVA_Build 7 124099290 2I TGAACATACA --/TC TCTTCAAAGA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TC 1 2 281296 CASAVA_Build 7 124106913 2I CTGAATGTGT --/TA TATTTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 TA 1 2 281297 CASAVA_Build 7 124116966 2I TTATTTCTGG --/GT GTGTCTGTGA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 GT 2 3 281298 CASAVA_Build 7 124118931 1D GCATCACCAT C/- CCCATGACAT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 C 4 3 281299 CASAVA_Build 7 124123185 4D AAAGAAAGAG AGAA/---- AGAGAGAGGG 2856 het 2856 ref 40 20 10 13 AGAA 1 0 281300 CASAVA_Build 7 124125457 1D TTTAAAAAAA T/- AATTTCTCAC 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 T 1 0 281301 CASAVA_Build 7 124128319 1D ATTTGCTGAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 49 21 20 9 A 8 7 281302 CASAVA_Build 7 124162273 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 T 9 8 281303 CASAVA_Build 7 124171151 5D TTTCTTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 12 11 T 16 11 281304 CASAVA_Build 7 124181809 3I AAACAGTGTC ---/CTT CTAAGCAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 22 0 CTT 0 1 281305 CASAVA_Build 7 124182312 4D GCAAAAGGTC TTAA/---- TTTTGGAGTG 3070 het 3070 hom 52 23 22 8 TTAA 1 0 281306 CASAVA_Build 7 124185393 3D ACACATTCTC ATT/--- ATGATCAATG 3070 het 3070 ref 30 19 8 4 ATT 1 0 281307 CASAVA_Build 7 124190858 1I AATGCTAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 13 14 281308 CASAVA_Build 7 124223124 1I CTTTAAAGAC -/T TTGTTCCATT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 2 3 281309 CASAVA_Build 7 124228119 1I AAAACCGTGA -/G GCTCCAGCCT 3070 hom 120 het 45 0 38 7 G 1 2 281310 CASAVA_Build 7 124242771 1D CAAGATAATG A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 7 6 281311 CASAVA_Build 7 124246153 1D TGTGTGACAA G/- GGGGGCACTG 3070 het 3070 ref 59 36 15 9 G 6 5 281312 CASAVA_Build 7 124246714 2I ATTTAAAGGT --/AA GTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 A 0 2 281313 CASAVA_Build 7 124248515 4I TAAAGTGACA ----/AAAG AAAGTTGCAC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 AAAG 1 2 281314 CASAVA_Build 7 124248802 3I ATCAAAAGAG ---/TAA TTTTTAGCCT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 TAA 0 1 281315 CASAVA_Build 7 124252146 4D AATCTGAAAC TAGT/---- TAACAATAAA 3070 het 3070 ref 32 17 15 1 TAGT 1 0 281316 CASAVA_Build 7 124259298 2I ATAAAAAAAA --/AT AAAAAAAAAA 2866 het 702 hom 20 6 10 5 AT 0 1 281317 CASAVA_Build 7 124267288 1I TAAGACTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2218 hom 36 7 16 13 T 14 15 281318 CASAVA_Build 7 124281016 1I AGTTCAAACG -/T TAAGAGTTAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 1 2 281319 CASAVA_Build 7 124293540 2D54M1D TTGATAAAAC ATGTGTAGAATAGGCCTTACTATAAGATGTGGTCCTTCGTGAGGTGAGCTACTTTTG/--GTGTAGAATAGGCCTTACTATAAGATGTGGTCCTTTGTGAGGTGAGCTACTTTT- GGGGGTGAAA 3070 het 3070 ref 42 31 22 14 N/A 0 0 281320 CASAVA_Build 7 124293723 13I TATCCATTTC -------------/ATGTTCAACCACA ATGTTCAACC 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 ATGTTCAACCACA 1 2 281321 CASAVA_Build 7 124294588 2I TGTTATCCAC --/AT GTTAGTAAGA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 AT 0 1 281322 CASAVA_Build 7 124296816 1D AAGTAAGCAA T/- TTTTTGACGT 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 T 6 5 281323 CASAVA_Build 7 124304050 1I ACTTTTGTGG -/A ACATTCCACA 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 A 1 2 281324 CASAVA_Build 7 124308112 1D AATTTTACAG A/- GGAACGTGAC 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 1 0 281325 CASAVA_Build 7 124309990 1I TTTAAGAATT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 A 7 8 281326 CASAVA_Build 7 124311913 1I AAAGAAAGAA -/G GGACTCAAAA 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 G 2 3 281327 CASAVA_Build 7 124313082 4I ATAAAAATAA ----/AAAT AAATAAAATC 1909 het 863 hom 7 2 5 0 AAAT 1 2 281328 CASAVA_Build 7 124316185 2I TGTCATTCCC --/CT CTCTCCCTCT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 CT 2 3 281329 CASAVA_Build 7 124316991 1I TTCAAAATTA -/G GCAAAACCAA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 G 1 2 281330 CASAVA_Build 7 124319095 1I TTTACTTCTA -/C CCCCCCACCA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 C 6 7 281331 CASAVA_Build 7 124322851 1I GTCCTTCCTT -/A CATTCATTCA 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 A 0 1 281332 CASAVA_Build 7 124324684 1D ACAGAAACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 10 9 281333 CASAVA_Build 7 124327032 1D ATCCAAGTAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 A 9 8 281334 CASAVA_Build 7 124335911 5D TTCATAGTTA CATAT/----- CATATCTGGA 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 CATAT 2 1 281335 CASAVA_Build 7 124341027 1D CAAATGGTCA T/- TCTTAAATGG 3070 het 3070 hom 22 9 10 5 T 2 1 281336 CASAVA_Build 7 124347266 35D TAAGTAATAT ACTACCTAAATCTATTTGGGTGCCTTGCCTCCTTA/----------------------------------- ACAGCTGAAT 3070 het 3070 ref 34 25 13 7 ACTACCTAAATCTATTTGGGTGCCTTGCCTCCTTA 1 0 281337 CASAVA_Build 7 124347957 1D TACTTCAATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 14 8 T 9 8 281338 CASAVA_Build 7 124348819 4I TGTAACAAAC ----/AAAT GTCTATACGA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 AAAT 0 1 281339 CASAVA_Build 7 124351805 4I GTCCAGGACC ----/AGAT AGATGGATTC 3070 het 3070 ref 57 26 21 10 AGAT 1 2 281340 CASAVA_Build 7 124361162 4D CCCAAAAAAT ATAA/---- ATAAATGTTT 3070 het 3070 ref 27 14 12 2 ATAA 2 1 281341 CASAVA_Build 7 124362373 1I TTTCATGTCA -/T AGTCTACTGG 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 0 1 281342 CASAVA_Build 7 124363229 1D17M1I GACTAGCTGC TTTTTTTTTAATTAAAGG-/-TTTTTTTTAATTAAAGGT TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 26 17 15 2 N/A 0 0 281343 CASAVA_Build 7 124366189 1D GAATGCTTAA G/- AATGAGTGAA 3070 het 3070 hom 39 14 21 5 G 1 0 281344 CASAVA_Build 7 124367888 3D AAATTAAAAA AAT/--- AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 AAT 1 0 281345 CASAVA_Build 7 124373714 2I CAACCTAGCT --/AG AGAGACCAGC 3070 het 3070 ref 40 18 20 2 AG 2 3 281346 CASAVA_Build 7 124379835 1I AGAGAAAGGA -/T TTTTTTGGGT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 6 7 281347 CASAVA_Build 7 124386264 1I GGGGGGATTG -/T TTGGGAAGGC 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 T 2 3 281348 CASAVA_Build 7 124387022 8D CCTGGAAGAC ATTTCCAG/-------- ATGAAAGGTA 3070 het 3070 ref 32 19 11 5 ATTTCCAG 1 0 281349 CASAVA_Build 7 124393286 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 11 10 281350 CASAVA_Build 7 124395049 1D ATTTAGTTTG T/- CAAATATTGT 3070 het 3070 ref 33 17 12 6 T 1 0 281351 CASAVA_Build 7 124400604 2D GAGAAATCAC AT/-- GTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 AT 1 0 281352 CASAVA_Build 7 124402702 1I GGGGTTGTTT -/G TTTTTTTCTT 3070 het 1133 hom 18 5 10 3 G 0 1 281353 CASAVA_Build 7 124406459 1I AACTGCCCAC -/A AGAGAAATCA 3070 het 2678 hom 16 6 9 1 A 1 2 281354 CASAVA_Build 7 124414049 2I33M1I GAAAAAAACT --CAAGGGAGATACAATATAACAAGAGAACAGATA-/CACAAGGGAGATACAATATAACAAGAGAACAGATAC AGAAATTCAT 3070 het 3070 ref 31 26 21 6 N/A 0 0 281355 CASAVA_Build 7 124416079 1D ACTTCTTTGG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 T 8 7 281356 CASAVA_Build 7 124416214 1I AGGAAGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 12 18 11 A 11 12 281357 CASAVA_Build 7 124422905 1I CATTTACAAG -/A AAAAAAAAAC 2884 het 2884 ref 29 20 6 3 A 9 10 281358 CASAVA_Build 7 124425875 4I TAATCTATTT ----/ATTA ATTCATTTAG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 ATTA 0 1 281359 CASAVA_Build 7 124428834 26D AATTTAAGAT ATATCTTAAATTATTGATTTATAATC/-------------------------- ATATCAATGA 3070 het 3070 ref 25 16 12 4 ATATCTTAAATTATTGATTTATAATC 1 0 281360 CASAVA_Build 7 124433246 1I TATTATTTTA -/T TTTTTTAGTA 2608 het 1353 hom 12 5 6 1 T 6 7 281361 CASAVA_Build 7 124434695 1I GCATTTTAAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 T 8 9 281362 CASAVA_Build 7 124438068 2I CATTGCAAAC --/TT AAGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 T 0 2 281363 CASAVA_Build 7 124440917 2D CATATATTCC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2468 hom 23 6 14 3 AT 10 9 281364 CASAVA_Build 7 124444331 1I TGCATTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 12 25 9 T 9 10 281365 CASAVA_Build 7 124455300 5I CTAACAAAAC -----/AACTT AAAGCATTTG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 AACTT 0 1 281366 CASAVA_Build 7 124455384 2I AGAGGTGTAT --/TA TATATATATA 2667 het 2667 ref 20 10 7 3 TA 7 8 281367 CASAVA_Build 7 124456197 8I AAGTTACTTA --------/ACACTTTT ACATTCCAGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 ACACTTTT 0 1 281368 CASAVA_Build 7 124456648 1I GTGATGCGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 9 10 281369 CASAVA_Build 7 124458850 1D GCAAAAATAG T/- TACAATACTT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 2 1 281370 CASAVA_Build 7 124464997 4I TCTGCTTAGG ----/CTGT CTGTATATTG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 CTGT 1 2 281371 CASAVA_Build 7 124465554 5I TAACAATCAC -----/TCTTA TCTTTAATGT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TCTTA 0 1 281372 CASAVA_Build 7 124466821 5D10M4D TTTCAGATGT TTTGATTTATTTGTCTGTT/-----TTTATTTGTC---- TATTAAAACA 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 N/A 0 0 281373 CASAVA_Build 7 124469065 1I TCAATATGAT -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 6 7 281374 CASAVA_Build 7 124469198 1D TAGAATTCAC A/- AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 7 6 281375 CASAVA_Build 7 124472395 1I29M1D CTTTCAGGTT -AAAAAAATCTCACAGAAGTTTTAGTTCCAT/AAAAAAAATCTCACAGAAGTTTTAGTTCCA- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 23 12 9 N/A 0 0 281376 CASAVA_Build 7 124474491 1D CTGCAGAAGA G/- GGGGCCTGAC 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 G 5 4 281377 CASAVA_Build 7 124479639 3I TTTAATAAAT ---/AGG AGGAGTATAG 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 AGG 1 2 281378 CASAVA_Build 7 124484596 1D GGTATACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 13 12 281379 CASAVA_Build 7 124485922 3I TGTGAGCATC ---/ATT GTGTCAACTA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 ATT 0 1 281380 CASAVA_Build 7 124505575 2I AGAGAGAAAA --/AG AGAGAGAAAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AG 3 4 281381 CASAVA_Build 7 124506159 2D ATGATCAGTA AG/-- AGAGAGAAGG 3070 hom 79 het 31 0 26 6 AG 4 3 281382 CASAVA_Build 7 124509937 1D ACCTTAGCAC A/- GGACACAAAG 3070 hom 111 het 43 0 37 7 A 1 0 281383 CASAVA_Build 7 124511130 11D CTGCTTCTGC CTGGCACGTAG/----------- AAAAATGGAA 3070 hom 84 het 33 0 29 7 CTGGCACGTAG 1 0 281384 CASAVA_Build 7 124534008 4I AAAAAAAAAC ----/ACTT TCTTTGCCCA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 ACTT 0 1 281385 CASAVA_Build 7 124542043 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 1434 hom 10 het 4 0 4 0 TA 6 7 281386 CASAVA_Build 7 124552037 4D TTTAGCTCTC TGTT/---- TGTCTATTAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TGTT 1 0 281387 CASAVA_Build 7 124566438 10D40M5D2M2D TTTCTCTCTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGTCGGACTGC/----------TTTTTTTTTTTTAAGATGGAGTCTCGCTCTGTCTCCCAGG-----CT-- GGACTGCAGT 2270 hom 29 het 13 0 10 4 N/A 0 0 281388 CASAVA_Build 7 124573079 4D TATATCAGAC AAAG/---- AGAGTATTAA 3070 hom 96 het 33 0 33 1 AAAG 1 0 281389 CASAVA_Build 7 124591311 4I ATAATTTGCC ----/TTTA TTTAGCAGCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TTTA 1 2 281390 CASAVA_Build 7 124593423 1D AGGTTTTAGG A/- AAAGACTGTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 3 281391 CASAVA_Build 7 124594140 1I ATCTATGTTG -/A GAGGTACAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 0 1 281392 CASAVA_Build 7 124601675 2I CTTCTATAAG --/AA AGATTTTCAT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 1 3 281393 CASAVA_Build 7 124611847 1D TAATGTAATG T/- TTTTTTTACA 3070 hom 141 het 56 0 47 12 T 8 7 281394 CASAVA_Build 7 124621626 1D CGGACTTGCC T/- TTGTCACAGA 3070 hom 75 het 28 0 25 4 T 3 2 281395 CASAVA_Build 7 124631874 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1423 het 1423 ref 36 25 5 6 T 13 14 281396 CASAVA_Build 7 124661137 1D ATGCATCTGT G/- ACATCTCCGA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 G 1 0 281397 CASAVA_Build 7 124661803 1D TTTCTTCCCA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 8 281398 CASAVA_Build 7 124676252 1D TATTTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 1630 het 1630 ref 30 14 5 12 T 17 16 281399 CASAVA_Build 7 124735594 2D TTTTACTGAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 AT 6 5 281400 CASAVA_Build 7 124744907 4D TAAAAAAGAA AAAG/---- AAAACAGCAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AAAG 1 0 281401 CASAVA_Build 7 124747086 2I GGTAAAAATG --/GT TTCCTGAGCC 2442 het 1613 hom 20 5 9 6 GT 0 1 281402 CASAVA_Build 7 124773033 1D ATAAACAGTG T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 7 6 281403 CASAVA_Build 7 124773096 4D AACCCCACTC TGTT/---- TGGCATAGCT 3070 het 3070 ref 36 19 13 7 TGTT 1 0 281404 CASAVA_Build 7 124798049 1I AAAAAAATGC -/G GGGTGTGGTG 3070 het 276 hom 23 1 19 3 G 3 4 281405 CASAVA_Build 7 124798217 5D TTTGACAAAG AAATA/----- AAATAAACAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AAATA 2 1 281406 CASAVA_Build 7 124802991 1D TCCAGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 41 0 29 12 A 11 10 281407 CASAVA_Build 7 124805315 2D GCTTAATAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 12 10 281408 CASAVA_Build 7 124807093 1D TAAACAGCAT A/- TTTTTTTCCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 0 281409 CASAVA_Build 7 124810095 1D CCTTTAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 11 10 281410 CASAVA_Build 7 124810930 1D TCAAAAATTG A/- ATAGTTTTCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 1 281411 CASAVA_Build 7 124813001 1D GTTGTGGGGT G/- GGGGGGAGCG 2793 hom 18 het 7 0 7 0 G 7 6 281412 CASAVA_Build 7 124813159 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 8 7 281413 CASAVA_Build 7 124814402 1D TATTAATGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 10 9 281414 CASAVA_Build 7 124814509 2D AAATGAATAA AG/-- AGTGGAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 13 2 AG 2 1 281415 CASAVA_Build 7 124815305 1I CATGTGAGAG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 7 8 281416 CASAVA_Build 7 124816821 1D ATGCATTCAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 111 het 45 0 37 8 A 9 8 281417 CASAVA_Build 7 124818151 1D TGCCTTAAGT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 8 7 281418 CASAVA_Build 7 124819792 4D ATATATACAC ACAT/---- ACATACATAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 ACAT 3 2 281419 CASAVA_Build 7 124819828 2I ATATATATTC --/AT ATATATATAT 819 hom 10 het 11 0 4 7 AT 7 8 281420 CASAVA_Build 7 124820256 1D TAAGAATCCA C/- CCTTTTTTTT 3070 het 258 hom 19 1 17 1 C 3 2 281421 CASAVA_Build 7 124820603 4D AGAATTAAAC ACAT/---- ATATTTCTGT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 ACAT 1 0 281422 CASAVA_Build 7 124822012 1D CCAAGGCAAT C/- CTGCGCAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 2 1 281423 CASAVA_Build 7 124829829 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 9 10 281424 CASAVA_Build 7 124852355 1I TTGCAAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 30 0 20 10 T 10 11 281425 CASAVA_Build 7 124868228 1D GGTTGACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 50 1 37 12 T 13 12 281426 CASAVA_Build 7 124912459 1D ACACACTGCT A/- AGTGAAAGAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 2 1 281427 CASAVA_Build 7 124915923 1D GTCTCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 33 0 23 10 T 11 10 281428 CASAVA_Build 7 124922465 1D TCTCTTATTC T/- TTTTTTTTTT 1285 het 1285 ref 36 22 6 10 T 13 12 281429 CASAVA_Build 7 124925375 6D TTGAATTATT CTGAAA/------ ATGAAGCCCC 3070 hom 72 het 28 0 25 5 CTGAAA 1 0 281430 CASAVA_Build 7 124930047 1I TTAACTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 37 0 33 4 A 10 11 281431 CASAVA_Build 7 124930568 1I CTATTGTAGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 76 het 29 0 26 3 T 8 9 281432 CASAVA_Build 7 124967717 1I CATTTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 800 hom 25 4 15 6 A 13 14 281433 CASAVA_Build 7 124969469 4D ATGTAAACAC ATTT/---- AATAATATAT 3070 hom 90 het 31 0 31 2 ATTT 1 0 281434 CASAVA_Build 7 124969807 5I TGCCCCTGTG -----/TTAGT TTAGTTTGAT 3070 hom 150 het 58 0 50 11 TTAGT 1 2 281435 CASAVA_Build 7 124970167 1D CATACTTTTT G/- TTTCAGCTTG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 G 1 0 281436 CASAVA_Build 7 124977473 1D AGTAATGTTA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 78 het 32 0 27 7 T 8 7 281437 CASAVA_Build 7 124982067 1I ATAGACAAAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 T 8 9 281438 CASAVA_Build 7 124988958 2D TTCCTGAAAC AG/-- AGAAGACGAA 3070 hom 108 het 38 0 35 3 AG 2 1 281439 CASAVA_Build 7 124989038 1I AGAGAATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 10 11 281440 CASAVA_Build 7 124994452 5I CAAAATGGGG -----/ACTTT ACTTGAATAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 ACTTT 0 1 281441 CASAVA_Build 7 125005365 1I ATTTTATTAT -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 6 7 281442 CASAVA_Build 7 125007421 1D AAAGCATATG A/- AAAATGGAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 5 4 281443 CASAVA_Build 7 125010437 3I ACTCAAATGT ---/TAA TAATCTCTTT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 TAA 1 2 281444 CASAVA_Build 7 125012906 1D GGTTTACAGG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 8 7 281445 CASAVA_Build 7 125013580 2I ATGGTGTTCA --/AC ACTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 AC 1 2 281446 CASAVA_Build 7 125018655 1I AAAAAAGCAA -/T TGATGAATGA 3070 het 3070 ref 62 32 22 8 T 1 2 281447 CASAVA_Build 7 125024915 1D ATTAAATACA T/- TTTTAAAGCA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 5 4 281448 CASAVA_Build 7 125033469 1I ACCATGTTCT -/G AGTGATCAAC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 G 0 1 281449 CASAVA_Build 7 125033745 3I ATTTGGTGGG ---/GGC GGGGGGACAC 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 GGC 0 1 281450 CASAVA_Build 7 125036403 4D TGTTAATATT AATC/---- AATAACAGCA 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 AATC 1 0 281451 CASAVA_Build 7 125042323 2D TGGCAGTTAC AT/-- GTTTCCAGGA 3070 het 3070 hom 28 8 13 9 AT 1 0 281452 CASAVA_Build 7 125044606 12D TGTGTGTGTG TGTGTGTGTGTA/------------ TATACATATA 3001 het 2688 hom 13 9 7 0 TGTGTGTGTGTA 1 0 281453 CASAVA_Build 7 125045150 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3024 hom 24 10 12 2 T 10 9 281454 CASAVA_Build 7 125048189 1I AATAAAGTTG -/A AAAAAAAAAA 2940 het 2940 ref 20 10 10 0 A 11 12 281455 CASAVA_Build 7 125050172 1I GGGTTGTTTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 8 9 281456 CASAVA_Build 7 125053844 1D GCTTGAACCT G/- GGGGGGGTTC 1648 het 1648 ref 16 7 5 5 G 8 7 281457 CASAVA_Build 7 125055853 1I TCTTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 A 10 11 281458 CASAVA_Build 7 125057233 3I GAGAAAAGAT ---/GAG GAGAGGAGAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 GAG 1 2 281459 CASAVA_Build 7 125060072 2D AATAAGGTGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 AT 7 6 281460 CASAVA_Build 7 125061219 5D AAAATAAACC TAGAG/----- TAAATTTAAG 3070 het 3070 hom 26 10 13 5 TAGAG 1 0 281461 CASAVA_Build 7 125063288 1I AGGTGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 A 10 11 281462 CASAVA_Build 7 125064208 1D TCTCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2624 hom 39 8 18 13 A 13 12 281463 CASAVA_Build 7 125066873 1D GAACTTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 816 hom 45 3 20 22 T 17 16 281464 CASAVA_Build 7 125067378 2D CGTAAGAAAC TG/-- TGTCTCACGT 3070 het 3070 ref 35 16 15 6 TG 2 1 281465 CASAVA_Build 7 125071692 1D CCAAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 1375 het 1375 ref 37 24 3 11 T 11 10 281466 CASAVA_Build 7 125072034 3D GTGGACAGAA TCT/--- TCTTCTACTA 3070 het 3070 ref 37 23 13 5 TCT 3 2 281467 CASAVA_Build 7 125077555 1D CATCCTATAA T/- TTGTATAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 T 3 2 281468 CASAVA_Build 7 125091598 1D TATAAAGATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 10 9 281469 CASAVA_Build 7 125106699 1I TATACAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 861 hom 25 3 18 4 A 13 14 281470 CASAVA_Build 7 125140924 1I TCTGAAGGTT -/C CTTTTTGGAG 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 C 1 2 281471 CASAVA_Build 7 125151196 1I CTAAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 1172 het 1172 ref 14 11 3 0 A 15 16 281472 CASAVA_Build 7 125154367 1I TGTATGTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 9 10 281473 CASAVA_Build 7 125167531 1D CCTTCCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1068 het 1068 ref 42 30 3 9 T 11 10 281474 CASAVA_Build 7 125167935 1D TTCAACGTGA T/- TTTTTTTTTT 1134 het 1134 ref 34 28 3 3 T 11 10 281475 CASAVA_Build 7 125300629 4D CTTGACTGTC TACT/---- TACTTTCAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TACT 2 1 281476 CASAVA_Build 7 125304528 1D TAAACAAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 30 0 22 8 T 10 9 281477 CASAVA_Build 7 125312913 2D16M2D CCTGGGTGAC AGAGCGAGACTCCGTCTCAA/--AGCGAGACTCCGTCTC-- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 11 0 9 5 N/A 0 0 281478 CASAVA_Build 7 125314786 3D AATGCTTTTA TAT/--- TATTTTTATA 2211 hom 21 het 8 0 8 0 TAT 2 1 281479 CASAVA_Build 7 125314853 2D GTAATAAAAA AC/-- AGTTATTACA 1998 hom 12 het 5 0 5 0 AC 1 0 281480 CASAVA_Build 7 125316689 1D TATATATGTA T/- TTTTTTTTTT 1578 hom 10 het 5 0 4 1 T 12 11 281481 CASAVA_Build 7 125317270 3I TGTAATTGTG ---/ACT ACAATTCCAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 ACT 0 1 281482 CASAVA_Build 7 125318341 4D TTTTATTTTA AACT/---- AACTCACATT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 AACT 2 1 281483 CASAVA_Build 7 125326758 1D AAGACACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 765 hom 34 6 18 10 A 14 13 281484 CASAVA_Build 7 125328070 1D AGAATCTTGA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 23 2 15 6 G 2 1 281485 CASAVA_Build 7 125328816 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 8 het 37 1 33 4 A 9 10 281486 CASAVA_Build 7 125329750 1I GGAAGAAGTT -/A ATTTGAAAAT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 A 1 2 281487 CASAVA_Build 7 125332203 1D TGTCAGCCTA T/- TTTTTTTTTC 1279 het 1279 ref 54 44 3 7 T 10 9 281488 CASAVA_Build 7 125338513 4I TTTTCTCTAG ----/GCTT GCTTGCTTCC 2583 hom 18 het 8 0 7 1 GCTT 2 3 281489 CASAVA_Build 7 125344346 2I GTATTATAAT --/AG ATAGAAGTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AG 0 1 281490 CASAVA_Build 7 125389239 1D GGCAGTTTAA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 7 6 281491 CASAVA_Build 7 125395638 1D GTTTCACCAT G/- TTGGCCAGGC 2002 het 1346 hom 8 3 5 0 G 1 0 281492 CASAVA_Build 7 125413336 1I TATAACTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 T 9 10 281493 CASAVA_Build 7 125413959 1I TAAGTTTTAA -/G GGGAAAATGA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 3 4 281494 CASAVA_Build 7 125424184 4I TGTGGAGAAT ----/GACA GGTAGGGTAG 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 GACA 0 1 281495 CASAVA_Build 7 125425960 4D AAGGCAAGCA TAGT/---- TAAAGTTATA 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 TAGT 1 0 281496 CASAVA_Build 7 125427316 1I TTTCTTTAGT -/A ACATCAAACT 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 A 1 2 281497 CASAVA_Build 7 125430546 1D CTGTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 17 6 A 11 10 281498 CASAVA_Build 7 125431783 4I AGCAGGAATT ----/CTTA CTTTCTTTAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 CTTA 0 1 281499 CASAVA_Build 7 125434029 1D TTGGGACAAC A/- AAAGAGAGAT 3070 het 3070 ref 52 27 16 10 A 4 3 281500 CASAVA_Build 7 125444593 1I ATTCATATAG -/A AAAAATATGG 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 A 5 6 281501 CASAVA_Build 7 125458275 1I AAAGTAAATA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 281502 CASAVA_Build 7 125458521 1I AAAATGATAT -/A AAAAAAACTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 7 8 281503 CASAVA_Build 7 125461483 1I CCAGGAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 17 0 12 5 T 11 12 281504 CASAVA_Build 7 125463273 1I AATGGTGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 9 10 281505 CASAVA_Build 7 125464243 1I AGAGGACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 33 1 27 5 A 13 14 281506 CASAVA_Build 7 125466116 1I TAGCTCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 30 1 26 3 T 11 12 281507 CASAVA_Build 7 125466994 1I CTTTTGTTGT -/C CAGGTATAAT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 C 1 2 281508 CASAVA_Build 7 125470206 4D AAGCAAAAAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 34 het 17 0 12 7 TA 9 7 281509 CASAVA_Build 7 125472059 1D TCACCAACTC T/- TAACACTTAC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 2 1 281510 CASAVA_Build 7 125472896 3D GGTGAATATG TAA/--- TAATAATAAT 3070 hom 105 het 36 0 36 1 TAA 4 3 281511 CASAVA_Build 7 125481090 4I TGTAAATGAA ----/CTAT CTTAGATATG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CTAT 0 1 281512 CASAVA_Build 7 125488959 1D TGACAACAAC A/- AAAATCAGTG 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 5 4 281513 CASAVA_Build 7 125489927 1I TAAGCTAACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 270 hom 45 2 39 4 T 9 10 281514 CASAVA_Build 7 125490682 1D AGGAGATTAG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 7 6 281515 CASAVA_Build 7 125504692 5D ATTGTAAAAC ATAAT/----- ATAGTGCCTG 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 ATAAT 1 0 281516 CASAVA_Build 7 125505205 2I GAGTGGACTC --/TT TTTAAAGTGT 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 T 3 5 281517 CASAVA_Build 7 125506688 1D GCTTTCTTAC G/- AGCTTACCCA 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 G 1 0 281518 CASAVA_Build 7 125517399 1D3M2I TGCCTTCACA GTAT--/-TATTG CCTACCATAA 3070 het 3070 hom 52 22 29 1 N/A 0 0 281519 CASAVA_Build 7 125517878 1I AAAACAAAAA -/G AGGCAAAAAC 3070 het 682 hom 37 2 27 8 G 0 1 281520 CASAVA_Build 7 125526049 3I CTTATAAGTG ---/AGA AGAACATCAG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 AGA 1 2 281521 CASAVA_Build 7 125527564 1D ATTTTCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 31 1 26 4 T 12 11 281522 CASAVA_Build 7 125534100 1D AACTCCTTAT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 8 7 281523 CASAVA_Build 7 125537016 1D AAATCTAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 T 10 9 281524 CASAVA_Build 7 125537447 1D GAGGACACTA G/- GGTATAATTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 G 3 2 281525 CASAVA_Build 7 125540793 1I AGGAAGAAGA -/G GAAGAAGAGC 3070 hom 117 het 44 0 35 9 G 1 2 281526 CASAVA_Build 7 125541355 1I CATTATTTTG -/T TTTTTCCTGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 5 6 281527 CASAVA_Build 7 125542423 1D TCTTCCACCT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 9 8 281528 CASAVA_Build 7 125544219 1I ACAAAATGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 A 9 10 281529 CASAVA_Build 7 125544621 4I CAGCGTGAAA ----/ACTG ACTAATACAG 3070 hom 77 het 29 0 26 3 ACTG 0 1 281530 CASAVA_Build 7 125546186 1D TTGGTTGTGT C/- CCCCAACCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 5 4 281531 CASAVA_Build 7 125550156 2I TGTGTAAGAC --/AT ATATACAATG 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 AT 2 3 281532 CASAVA_Build 7 125552468 1D ACTTCTACAA G/- TTGTCTGTTT 3070 het 3070 hom 38 17 21 0 G 1 0 281533 CASAVA_Build 7 125556692 4I GTTAGAAATG ----/ACAA ACAAATTTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 ACAA 1 2 281534 CASAVA_Build 7 125557410 4I AAAATAAAAT ----/AAAA ATAGATTAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 1 5 281535 CASAVA_Build 7 125560169 1I AACTTATCAG -/A AACAACAAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 2 3 281536 CASAVA_Build 7 125587707 1D CTGAGGGGGG A/- AAAAAGCCAC 3003 het 3003 ref 24 10 10 4 A 6 5 281537 CASAVA_Build 7 125617893 2D CCTATGTGTG TA/-- TATATATATA 1574 het 1574 ref 35 24 5 6 TA 9 8 281538 CASAVA_Build 7 125646051 6D AAAAGCTTGA GAAGGT/------ GAAGACATAG 465 het 465 ref 46 41 3 4 GAAGGT 1 0 281539 CASAVA_Build 7 125657223 1I GCCCCTGAAA -/G GCATGAGAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 G 1 2 281540 CASAVA_Build 7 125660809 1I GAATTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 9 10 T 13 14 281541 CASAVA_Build 7 125665649 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 35 12 9 15 CA 10 9 281542 CASAVA_Build 7 125738549 1D TAGATTTGAT A/- AAAAACAAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 5 281543 CASAVA_Build 7 125743057 1D ATTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 12 11 281544 CASAVA_Build 7 125749210 1I TGAATATATA -/T ATTTTTGAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 0 1 281545 CASAVA_Build 7 125791249 2D CAGTAATGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 102 het 41 0 29 15 CA 9 8 281546 CASAVA_Build 7 125824245 1I AGGGAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 891 hom 33 3 25 5 A 12 13 281547 CASAVA_Build 7 125828391 2I AAATATAAGA --/CT CTGACCTCTT 3070 hom 135 het 54 0 45 9 CT 1 2 281548 CASAVA_Build 7 125851393 4D GTTTAACCTG TATC/---- TTTCTTTTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 TATC 1 0 281549 CASAVA_Build 7 125851996 1D AAGAAATCAC T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 8 7 281550 CASAVA_Build 7 125855449 5I ACTGCCCTCA -----/GATTT GATCAAATTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GATTT 0 1 281551 CASAVA_Build 7 125858995 19I TAAATTTCTG -------------------/AATAAAGTTAAATAAGGCA AATTATATAA 3070 hom 120 het 43 0 41 5 AATAAAGTTAAATAAGGCA 0 1 281552 CASAVA_Build 7 125862070 6D ATTATATAAC ATATAG/------ ATATAGATAT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 ATATAG 4 3 281553 CASAVA_Build 7 125863553 1D GGCATATCAA T/- TTATCATTGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 3 2 281554 CASAVA_Build 7 125864567 1D CTCCAAAATG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 9 8 281555 CASAVA_Build 7 125866120 1D TTCAACAGCA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 8 7 281556 CASAVA_Build 7 125869081 4D AAATTAACTC AGAT/---- AGCCCTAAGA 3070 hom 87 het 30 0 29 3 AGAT 1 0 281557 CASAVA_Build 7 125869295 2D AAAATGCGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 8 A 12 10 281558 CASAVA_Build 7 125877916 1D CTAGAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1282 het 1282 ref 37 29 3 5 T 12 11 281559 CASAVA_Build 7 125885313 1I GTTGTTAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 21 2 15 4 A 11 12 281560 CASAVA_Build 7 125886667 16I AGAGAGCCAG ----------------/GGTTCTTTTTACTAAA CCATGGAGTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GGTTCTTTTTACTAAA 0 1 281561 CASAVA_Build 7 125895555 1D TGACATAATA T/- TTGAAGGTTT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 3 2 281562 CASAVA_Build 7 125912574 1D GAGTTCAGCT A/- ACAGTTTCCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 1 281563 CASAVA_Build 7 125927209 2I ATACAATTAC --/TA TTTGTTAATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TA 0 1 281564 CASAVA_Build 7 125935542 2D CACACACTGG CA/-- CACACACACA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CA 9 8 281565 CASAVA_Build 7 125941256 1D ATTTTAATCA T/- CAGGTTCTAA 3070 hom 141 het 49 0 47 2 T 1 0 281566 CASAVA_Build 7 125975198 1I AAAAAAAAAA -/C CCTAGTTGAT 3070 het 553 hom 30 2 21 7 C 2 3 281567 CASAVA_Build 7 125975608 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 11 10 281568 CASAVA_Build 7 125977334 1D AAACAGCAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 10 9 281569 CASAVA_Build 7 125978976 1D CCATACGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 11 10 281570 CASAVA_Build 7 125984852 3D TTGTTGCTGT ACA/--- ACACTTCCTA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 ACA 2 1 281571 CASAVA_Build 7 125985264 3D AGAATAATTT TTA/--- GAATTAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TTA 1 0 281572 CASAVA_Build 7 125989172 1D CGGTGTTTGG T/- TTTTTTGTCC 3070 hom 13 het 18 1 16 1 T 7 6 281573 CASAVA_Build 7 125990588 2I GTTTTTTTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 12 281574 CASAVA_Build 7 126000881 1D TATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 26 1 20 5 T 12 11 281575 CASAVA_Build 7 126004855 1D GATTTACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 31 0 23 8 A 11 10 281576 CASAVA_Build 7 126008258 1I AAAAAAATAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 9 10 281577 CASAVA_Build 7 126009484 1D TTCTACTCCA G/- GGAACACATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 3 2 281578 CASAVA_Build 7 126011518 1I TAAAGATAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 10 281579 CASAVA_Build 7 126011597 1I CTCATTGCAA -/C CTCCATCTCC 3070 hom 72 het 31 0 24 7 C 1 2 281580 CASAVA_Build 7 126015600 1D TAGAAAGTTG A/- AAAGTGTTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 4 3 281581 CASAVA_Build 7 126017411 2D TTCATGAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 12 10 281582 CASAVA_Build 7 126019441 1D GTCTCCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 33 1 24 8 A 12 11 281583 CASAVA_Build 7 126025516 1D TTTTTTCCTA T/- TTTTTTTATA 3070 het 429 hom 30 1 25 4 T 8 7 281584 CASAVA_Build 7 126028224 1D TAGAGTGGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 9 281585 CASAVA_Build 7 126031286 1D TTTTTGCATT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 9 8 281586 CASAVA_Build 7 126031926 4D ACATGCCCAA GGCT/---- GGCTATACAG 3070 hom 90 het 32 0 31 3 GGCT 2 1 281587 CASAVA_Build 7 126034749 1D AATACAAAAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 40 0 33 9 A 9 8 281588 CASAVA_Build 7 126040576 1D AAGTGGCGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 10 9 281589 CASAVA_Build 7 126046840 1D TATTTACATT A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 6 281590 CASAVA_Build 7 126047333 15I AGTGGCTCAT ---------------/ACTTGTAATCCCAGC ACTTTGGGAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 ACTTGTAATCCCAGC 0 1 281591 CASAVA_Build 7 126050423 8I ATGTAAACTA --------/AGGACTTC AGTTAATAAT 3070 hom 84 het 30 0 27 3 AGGACTTC 0 1 281592 CASAVA_Build 7 126052022 1I ATTATTAGTT -/C CAGACAATCA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 C 1 2 281593 CASAVA_Build 7 126052817 3I CTGAGATAAC ---/AAT AGTAATTTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAT 0 1 281594 CASAVA_Build 7 126057424 2I AACACCAAAT --/AA AAGAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 2 4 281595 CASAVA_Build 7 126061969 1I CTTCCTCCCC -/T CCACCTTTCA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 0 1 281596 CASAVA_Build 7 126062529 2I TGATCAAGAG --/TA TATAAAAAAT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 TA 2 3 281597 CASAVA_Build 7 126069929 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 14 0 12 4 A 8 9 281598 CASAVA_Build 7 126070819 1D TATTAAATTT A/- AAAAATCACC 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 6 5 281599 CASAVA_Build 7 126073926 1I CAGGCTTAGG -/T TAAGTCTGAA 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 1 2 281600 CASAVA_Build 7 126076083 3I ACAAATGCTG ---/AAC AACGACACTG 3070 hom 141 het 55 0 47 8 AAC 1 2 281601 CASAVA_Build 7 126089195 8D ACAGTGGCTT CACAAGTG/-------- GATTTCTGTC 3070 hom 147 het 53 0 47 10 CACAAGTG 1 0 281602 CASAVA_Build 7 126107331 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 8 25 6 A 12 13 281603 CASAVA_Build 7 126207981 1I CAGTGAGGCT -/G TAGCAGGGGA 3070 hom 108 het 44 0 34 10 G 0 1 281604 CASAVA_Build 7 126216526 1I AAGACTAACC -/A AAAAAAAAAC 783 het 783 ref 42 36 3 3 A 9 10 281605 CASAVA_Build 7 126217304 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2053 het 2053 ref 38 24 6 8 T 12 11 281606 CASAVA_Build 7 126322951 1I AGAGTTATAG -/A AACTTCTAGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 2 3 281607 CASAVA_Build 7 126327028 1I TTATCCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2912 hom 30 6 15 9 T 11 12 281608 CASAVA_Build 7 126348156 1D ACAGAAAATT G/- GAAGAGTCTT 3070 het 2498 hom 19 6 10 4 G 2 1 281609 CASAVA_Build 7 126364562 1D GGAGTGGGCT A/- CCAAACCAAT 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 A 1 0 281610 CASAVA_Build 7 126371607 1I AGGTGGACCT -/G GGGCTGCATG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 G 3 4 281611 CASAVA_Build 7 126394458 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 57 20 24 14 TG 7 6 281612 CASAVA_Build 7 126394842 1I ATCCCTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 A 10 11 281613 CASAVA_Build 7 126401755 3D ACATATGCAC AAT/--- AAAATTTATC 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 AAT 1 0 281614 CASAVA_Build 7 126404192 1I ATTTTCATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 13 14 281615 CASAVA_Build 7 126409141 1D TCCCTATACC T/- TTCTCAGGCA 3070 het 3070 ref 35 18 14 5 T 3 2 281616 CASAVA_Build 7 126415365 1D CTCTTCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 12 11 281617 CASAVA_Build 7 126417625 1D TTTCATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2697 hom 37 11 18 8 A 13 12 281618 CASAVA_Build 7 126457589 4I5M8D TCCCCAGAAG ----GTTCACCCCTCCC/GGGAGAAGA-------- AGTCTTCTTA 3070 het 3070 ref 30 16 13 5 N/A 0 0 281619 CASAVA_Build 7 126465790 1I TTTAAGATCT -/A AAAGAACTGT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 3 4 281620 CASAVA_Build 7 126467895 2D ATTCCTTGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 24 4 12 9 A 14 12 281621 CASAVA_Build 7 126475532 5I AAGATTTCAA -----/AAAGG TGAGAGCATG 3070 het 3070 hom 45 17 21 8 AAAGG 0 1 281622 CASAVA_Build 7 126478635 1D CCTTCGTGGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 10 9 281623 CASAVA_Build 7 126481602 1I GTGGGATCCA -/T TCCAGACCTT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 T 1 2 281624 CASAVA_Build 7 126482483 19I ATACCAGAAG -------------------/AAACTTCCCCATGACAGAT AAGGGAACAT 3070 het 3070 ref 33 16 16 2 AAACTTCCCCATGACAGAT 0 1 281625 CASAVA_Build 7 126493351 1I ATTTGATGAC -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 6 7 281626 CASAVA_Build 7 126507125 1I TTCGTAGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 9 10 281627 CASAVA_Build 7 126507939 1D TTTGGCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3036 hom 30 11 10 9 A 11 10 281628 CASAVA_Build 7 126508875 1I CCTTCATGGG -/T TAAACCCCCA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 1 2 281629 CASAVA_Build 7 126518005 1I CTCCGGTTGC -/A GGCACTGGCA 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 A 0 1 281630 CASAVA_Build 7 126539315 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 21 1 18 3 A 12 11 281631 CASAVA_Build 7 126544555 5D AAAGAACCTG GCTTT/----- GCTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 GCTTT 4 3 281632 CASAVA_Build 7 126546772 4D CGAGATCCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 2403 het 2403 ref 26 10 10 7 TC 10 8 281633 CASAVA_Build 7 126549883 1D TGCCCTTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 9 8 281634 CASAVA_Build 7 126553304 1I GGGAATGCTT -/A TATACTGTTG 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 0 1 281635 CASAVA_Build 7 126562847 90D TTGACAGCTT AAGAATTAATGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------------------------------------------------------------------------ AAGAATTAAT 3070 het 1714 hom 16 7 9 7 AAGAATTAATGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 281636 CASAVA_Build 7 126575067 1I CTTTACCATG -/T TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 5 6 281637 CASAVA_Build 7 126584498 1I GAACAAATAA -/G GAAAGAGGAG 3070 het 2880 hom 28 8 13 7 G 1 2 281638 CASAVA_Build 7 126587818 2I GGCTCCATCA --/CG CGCGCGCGCA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 CG 4 5 281639 CASAVA_Build 7 126588946 1I AAAATATACC -/A TTCTTTACTT 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 A 0 1 281640 CASAVA_Build 7 126624888 1I CATGTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 11 12 281641 CASAVA_Build 7 126628330 1D CATTTTTCTT G/- CTTATGTTGA 3070 het 3070 hom 36 19 17 1 G 1 0 281642 CASAVA_Build 7 126629483 1D GTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 41 1 33 9 A 11 10 281643 CASAVA_Build 7 126629551 2I CTCACTATGA --/CC TCTGCCTCTC 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 C 0 2 281644 CASAVA_Build 7 126646447 1D ATAGAAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 46 1 36 9 T 11 10 281645 CASAVA_Build 7 126658539 1I TTGATGGGGG -/A AAAAAAAAAA 1222 het 1222 ref 40 28 3 9 A 10 11 281646 CASAVA_Build 7 126659163 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 10 11 281647 CASAVA_Build 7 126737260 1D TGGCTTTTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 10 9 281648 CASAVA_Build 7 126746529 5D GAAAACAGTA CTTTT/----- CACTCCCTAG 3070 hom 117 het 42 0 40 3 CTTTT 1 0 281649 CASAVA_Build 7 126754061 5I CCTTCCTGAA -----/AAATC AATATAGTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAATC 0 1 281650 CASAVA_Build 7 126755802 1D ACTGTTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 968 hom 35 3 14 18 T 12 11 281651 CASAVA_Build 7 126755950 1D AGGTCCATTC T/- TTTTATTGCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 5 4 281652 CASAVA_Build 7 126779679 1I AATACCTCTG -/T TAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 52 31 16 5 T 1 2 281653 CASAVA_Build 7 126780188 2D55M3I TCCCACGATT ACACACACACACACACACACAATAACCATTTTAATTAGAAATGGAAATGATGAGAAA---/--ACACATACACACACACACAATAACCATTTTAATTAGAAATGGAAATGATGAGAAAAGG AGGAACAAAA 3070 hom 66 het 25 0 21 27 N/A 0 0 281654 CASAVA_Build 7 126781137 2D TAAGCTGGCC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 36 0 31 6 A 11 9 281655 CASAVA_Build 7 126781770 1I ATTGTTAAGT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 8 9 281656 CASAVA_Build 7 126786533 1I GCTGTCACCA -/C CCCCACAGCC 3070 hom 151 het 52 0 51 1 C 4 5 281657 CASAVA_Build 7 126786764 5D AAATATTTTT AAGTA/----- AAGAAATTAA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAGTA 1 0 281658 CASAVA_Build 7 126796329 1I GACATAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 40 1 27 12 A 11 12 281659 CASAVA_Build 7 126806009 2I CCCACAACAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AC 6 7 281660 CASAVA_Build 7 126815894 6D5M5D AATGTGTTCC ATTTGTATAAATGTGC/------AGAAA----- TCCTTCTGTA 3070 hom 102 het 35 0 34 2 N/A 0 0 281661 CASAVA_Build 7 126821622 4I TGATTTTTAT ----/TTTC TTTATTCTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 TTTC 0 1 281662 CASAVA_Build 7 126823995 1I AAGCCACTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 8 9 281663 CASAVA_Build 7 126832251 1I TCTCAGAAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 8 9 281664 CASAVA_Build 7 126833189 4D GTATATGTAC ATAA/---- ATAATGTGTA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 ATAA 2 1 281665 CASAVA_Build 7 126834524 5I CTACTGTTTT -----/TAGCA TAGGTTTTCA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 TAGCA 0 1 281666 CASAVA_Build 7 126835927 1I TACTATGATC -/A GTGGTGTGGT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 0 1 281667 CASAVA_Build 7 126840010 1I GATTTAAGGG -/A CAGATTCAAA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 A 0 1 281668 CASAVA_Build 7 126843656 2I ATAAAAGCAC --/AT ATACTATACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AT 1 2 281669 CASAVA_Build 7 126844309 1I ATTTGCTACC -/A AAATAAACTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 3 4 281670 CASAVA_Build 7 126851987 1I ACTTCATCTA -/T TGAGATAATC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 1 2 281671 CASAVA_Build 7 126855681 4D GCTCTGTCCC AGGG/---- AGATGGGAGT 2681 het 1767 hom 16 7 6 3 AGGG 1 0 281672 CASAVA_Build 7 126860172 1I TCTTGAAAAG -/A AAAAATGACA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 A 5 6 281673 CASAVA_Build 7 126861456 1D AATCACTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 33 0 28 5 T 12 11 281674 CASAVA_Build 7 126861696 1I TATGATGAGT -/A AAAACATAAT 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 A 4 5 281675 CASAVA_Build 7 126862917 1I AAAAAAAAAA -/C AAACACACAT 2494 het 1623 hom 20 8 8 4 C 0 1 281676 CASAVA_Build 7 126935965 1I CTTTGCTTTG -/A AAGGAAAATG 3070 hom 138 het 56 0 46 10 A 2 3 281677 CASAVA_Build 7 126939180 2I GAACCAACAC --/AT GTGATAAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AT 0 1 281678 CASAVA_Build 7 126944647 3D ATACCGTATA ATT/--- ATTATTAACA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 ATT 3 2 281679 CASAVA_Build 7 126945826 1D AAAAATGGAT G/- GGGGGGGGTT 3070 het 864 hom 31 5 19 7 G 9 8 281680 CASAVA_Build 7 126946418 1D CCTTCTATCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 9 8 281681 CASAVA_Build 7 126947866 3D GGAATGGCCA CAC/--- TGTCTTCCAC 2350 het 1990 hom 12 4 6 2 CAC 1 0 281682 CASAVA_Build 7 126948465 1D TTTTGTATAA G/- GTGTAAGGAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 2 1 281683 CASAVA_Build 7 126950885 1I TCAACAGCTG -/T TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 47 32 4 11 T 10 11 281684 CASAVA_Build 7 126956733 1I AAAATGGCCA -/T ACTGCCCAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 281685 CASAVA_Build 7 126958164 2D AGGAAGGGAA AG/-- AGGGGGACAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AG 2 1 281686 CASAVA_Build 7 126958547 1D TTTAGAAAAC G/- GGAACCAAGA 3070 hom 141 het 53 0 48 7 G 3 2 281687 CASAVA_Build 7 126959061 9I TGCCTTCAAC ---------/CCTAAACAT CCTAAACATC 3070 hom 114 het 44 0 38 6 CCTAAACAT 1 2 281688 CASAVA_Build 7 126967611 4D TTGTTTTTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 42 het 25 0 15 10 TTTG 5 4 281689 CASAVA_Build 7 126967785 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 12 11 281690 CASAVA_Build 7 126968830 1I TACTGCCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 999 hom 30 4 18 8 A 12 13 281691 CASAVA_Build 7 126969724 1D AGGAAGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 45 1 42 2 A 11 10 281692 CASAVA_Build 7 126971542 1D CAGATATAAT G/- GGGGGGGGGC 3070 hom 46 het 32 0 23 9 G 10 9 281693 CASAVA_Build 7 126975379 6D ATAATTGCTT TAGATA/------ TAGATATATA 3070 hom 79 het 31 0 27 5 TAGATA 2 1 281694 CASAVA_Build 7 126975954 1I AAGATCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 24 1 16 7 A 13 14 281695 CASAVA_Build 7 126976719 1I AATTCATTAG -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 0 1 281696 CASAVA_Build 7 127006099 2I TGGTGGAGAT --/AA AAAGAGTGTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 3 5 281697 CASAVA_Build 7 127019535 1D TCTCTACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 7 A 11 10 281698 CASAVA_Build 7 127035279 12D GCACACATGT ACACACACACAG/------------ ACACACACAC 3070 hom 99 het 46 0 32 18 ACACACACACAG 2 1 281699 CASAVA_Build 7 127065000 1I TGAGATACTG -/C TACGCATCCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 0 1 281700 CASAVA_Build 7 127113196 2D TCTTTTTTTG TT/-- TGAGCAGAGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 3 1 281701 CASAVA_Build 7 127118506 1D CTATTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 11 10 281702 CASAVA_Build 7 127120023 1I CTTATTTAGG -/A AAGGAAGATT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 2 3 281703 CASAVA_Build 7 127133509 1I ATTAATTTGA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 9 281704 CASAVA_Build 7 127142455 1D TTTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 314 hom 30 2 21 7 T 12 11 281705 CASAVA_Build 7 127143783 1D TTTTCTTAGG T/- TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 37 28 3 6 T 13 12 281706 CASAVA_Build 7 127185791 2D ATAGTATATC AG/-- GGGATTTTTG 3070 hom 148 het 50 0 50 0 AG 1 0 281707 CASAVA_Build 7 127199991 1D AAACATGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 38 1 30 7 T 11 10 281708 CASAVA_Build 7 127208878 1D GTTCATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 289 hom 36 1 32 3 T 11 10 281709 CASAVA_Build 7 127231391 7D TCCTGTTTTC TGAGAAT/------- TGAGAATACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TGAGAAT 2 1 281710 CASAVA_Build 7 127240731 3D TTTTGGTTGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 105 het 43 0 36 8 TTG 5 4 281711 CASAVA_Build 7 127248883 1I AGGTACTTTT -/C CTTACAGGAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 C 1 2 281712 CASAVA_Build 7 127249007 1D AGGATGTGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 74 het 30 0 26 4 A 10 9 281713 CASAVA_Build 7 127259197 1D TATAATTGCA C/- CTTTGAAGAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 C 2 1 281714 CASAVA_Build 7 127280100 1D ACTTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 34 1 28 5 A 11 10 281715 CASAVA_Build 7 127282801 2I AGTTTTTTTT --/TG GTTTTTTTGA 3070 hom 98 het 43 0 33 10 TG 0 1 281716 CASAVA_Build 7 127295190 1I CCATTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 657 hom 39 2 24 14 A 13 14 281717 CASAVA_Build 7 127330013 1I TTTCTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 13 8 T 11 12 281718 CASAVA_Build 7 127351276 1D ATCTCCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 53 2 34 19 T 12 11 281719 CASAVA_Build 7 127361448 2I AAGTACATAT --/AA GAGTTTACTG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 0 2 281720 CASAVA_Build 7 127372941 3I AGTAACAGAG ---/CCT CCTTGAACAG 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 CCT 1 2 281721 CASAVA_Build 7 127374283 1I ATAGAAAATA -/C TTTTTTCTAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 0 1 281722 CASAVA_Build 7 127374865 1I GCCCTCAAGG -/C TGGCGCTTCC 3070 hom 113 het 44 0 37 7 C 0 1 281723 CASAVA_Build 7 127422168 1D GCTCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2607 het 1052 hom 10 3 7 0 T 11 10 281724 CASAVA_Build 7 127437063 1I TCTCAATAAC -/T TTTTTTTTTT 1138 het 1138 ref 40 24 3 13 T 15 16 281725 CASAVA_Build 7 127565324 1I TCTATTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 28 1 24 3 A 11 12 281726 CASAVA_Build 7 127565480 1I GGTAAAAAAA -/G AAAAGAATTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 G 0 1 281727 CASAVA_Build 7 127589617 1D ATTAGCTTTA G/- GGGTCAGCCC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 G 4 3 281728 CASAVA_Build 7 127596462 1I TTCCTTCCCC -/A AAAGGCTAGC 3070 hom 89 het 32 0 27 5 A 3 4 281729 CASAVA_Build 7 127596909 1I7M1D CAAATGCTCG -TATGTTGT/ATATGTTG- GTGGAATATC 3070 hom 87 het 30 0 29 3 N/A 0 0 281730 CASAVA_Build 7 127612690 1I AGTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 482 hom 40 2 31 7 A 12 13 281731 CASAVA_Build 7 127615230 4D ATAAAAATAC CCAA/---- AAAGTTAGCT 3070 hom 33 het 13 0 12 4 CCAA 1 0 281732 CASAVA_Build 7 127637986 1I AGTGGCTGTC -/T TTTCCACAGC 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 3 4 281733 CASAVA_Build 7 127650842 1D TAAAAACACC A/- AAAAAAAATT 3070 het 2091 hom 22 5 14 4 A 9 8 281734 CASAVA_Build 7 127650997 1D AGACCCTATC A/- AAAAAAAAAA 2421 het 2007 hom 29 9 10 10 A 15 14 281735 CASAVA_Build 7 127658393 1I ACACAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2900 het 446 hom 21 1 13 7 A 13 14 281736 CASAVA_Build 7 127686308 4I ACTATATATC ----/TATA TATATATATA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TA 6 8 281737 CASAVA_Build 7 127688650 1D CCTGGCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 14 13 281738 CASAVA_Build 7 127691951 2I CACATGCACG --/CA CACACACACA 3070 het 1008 hom 36 5 16 15 CA 7 8 281739 CASAVA_Build 7 127693120 1I TGTCTTGTCT -/G GGGGGGGAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 G 7 8 281740 CASAVA_Build 7 127697087 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 20 1 14 5 A 13 12 281741 CASAVA_Build 7 127697897 1I GACTCCGTCT -/C CAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 18 0 9 9 C 1 2 281742 CASAVA_Build 7 127704402 1D CTTTCTTTTT C/- TTTCTTTCTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 1 0 281743 CASAVA_Build 7 127714304 1I CTGCTAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 34 1 30 3 T 10 11 281744 CASAVA_Build 7 127714728 1D AGTTCTGATC A/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 1 0 281745 CASAVA_Build 7 127716916 1D ACAAAAGAAA G/- AAAATTGGGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 0 281746 CASAVA_Build 7 127725867 1I TTTTCAAATG -/C CCCCCCATTG 3070 hom 51 het 22 0 17 5 C 6 7 281747 CASAVA_Build 7 127739947 1I GTATAATGTG -/T GGACTTTGGA 3070 hom 99 het 43 0 33 10 T 0 1 281748 CASAVA_Build 7 127743353 45D TGTTCTTCCC TTTCACCTTAGAAATCTAGATAGGTACAACGATACAATGAACATT/--------------------------------------------- TATTATATGC 3070 het 3070 ref 43 37 23 3 TTTCACCTTAGAAATCTAGATAGGTACAACGATACAATGAACATT 1 0 281749 CASAVA_Build 7 127747621 1I GCTTGGGGGG -/A GGGGGGGGTG 2250 hom 25 het 15 0 8 7 A 0 1 281750 CASAVA_Build 7 127749336 1I AAATTCGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 28 1 19 8 A 15 16 281751 CASAVA_Build 7 127758480 1D AACAGCGGTG C/- CCCCCCACTA 3070 hom 54 het 22 0 17 5 C 7 6 281752 CASAVA_Build 7 127774448 1D AATATTAGCT G/- GGCTGTGGTG 3070 hom 57 het 23 0 17 6 G 3 2 281753 CASAVA_Build 7 127777775 1D GAGGTGGGTA G/- GGGGGCCTGA 3070 hom 68 het 29 0 20 9 G 6 5 281754 CASAVA_Build 7 127780748 2D CACATACACG CA/-- CACACACACA 1499 het 1499 ref 61 37 5 20 CA 8 7 281755 CASAVA_Build 7 127794969 1D TTTAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 23 0 14 9 A 15 14 281756 CASAVA_Build 7 127795346 1D TTTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 33 1 15 17 T 15 14 281757 CASAVA_Build 7 127803340 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTGGCC 1689 hom 16 het 9 0 5 4 A 4 5 281758 CASAVA_Build 7 127804001 4D CTCCCCCCCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 28 7 9 12 T 16 12 281759 CASAVA_Build 7 127805800 1I CTGGCTAATT -/A TTTTTTTAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 1 281760 CASAVA_Build 7 127806975 1I AGTGCTGGGA -/T TTATAGGCAT 3070 hom 83 het 32 0 28 4 T 2 3 281761 CASAVA_Build 7 127835867 1I GGTGCGGGTC -/G GGTTGGGGGT 1824 hom 18 het 9 0 6 3 G 2 3 281762 CASAVA_Build 7 127853835 1I GGAAAAAAGG -/A ACAGTTTTAC 3070 het 177 hom 29 1 22 6 A 1 2 281763 CASAVA_Build 7 127864208 1D ACGCCCAGCT A/- AATTTTTTGT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 3 2 281764 CASAVA_Build 7 127882207 1D GGCAGCCTAG C/- CCCCCAAATC 3070 hom 41 het 21 0 12 9 C 6 5 281765 CASAVA_Build 7 127885505 1D GTTGAAGAGG T/- TGTGTGGGTG 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 2 1 281766 CASAVA_Build 7 127889745 4I CATATGGTGC ----/TCTT TCTTGTGAGC 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 TCTT 1 2 281767 CASAVA_Build 7 127913105 4I CTGTCTCAAA ----/AATC AATCAATAAA 2868 het 2868 ref 40 31 6 3 AATC 1 2 281768 CASAVA_Build 7 127915091 4D GTGGTGCTAT CAAG/---- CAAGGCTTCA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 CAAG 2 1 281769 CASAVA_Build 7 127916726 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1989 het 1066 hom 17 6 6 5 A 12 11 281770 CASAVA_Build 7 127929637 1I TTAAACCACC -/A ATTTATTTCC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 1 2 281771 CASAVA_Build 7 127929824 1D TTCCTGACAA G/- AAAAAAATGA 1429 het 1429 ref 19 12 4 3 G 1 0 281772 CASAVA_Build 7 127936288 4I CTCAAAAAAT ----/AAAA AATAAAAAAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 2 6 281773 CASAVA_Build 7 127938837 14I ACTCAGCCCT --------------/AGCACATTTTAATG AGTACTACCC 2601 het 2601 ref 22 11 6 5 AGCACATTTTAATG 0 1 281774 CASAVA_Build 7 127941610 1D CTCTCTTGAC T/- TTTTTTTTTT 1148 het 1148 ref 17 9 4 4 T 15 14 281775 CASAVA_Build 7 127943443 2D TCTCAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 18 0 13 5 A 12 10 281776 CASAVA_Build 7 127952866 2I AACTAACAGC --/CA AGCCCCCAAC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CA 0 1 281777 CASAVA_Build 7 127962266 1I ATAGGGTTTT -/G TTTTTTTTTT 1531 het 396 hom 16 5 8 3 G 0 1 281778 CASAVA_Build 7 127962426 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTATT 2949 hom 21 het 9 0 8 1 T 7 8 281779 CASAVA_Build 7 127971065 1D TCTGGGTCTT A/- AAATTGTTAG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 4 3 281780 CASAVA_Build 7 127971224 1D TCTCGCTCTG T/- TCCCCAGGCT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 2 1 281781 CASAVA_Build 7 127972701 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 27 het 13 0 9 5 A 7 6 281782 CASAVA_Build 7 127981260 3D GATCAGGTCT TTG/--- TTGTTATTAT 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 TTG 2 1 281783 CASAVA_Build 7 127983232 1I AAAATACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 13 14 281784 CASAVA_Build 7 127983953 1D AAGTAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1411 het 1411 ref 21 13 3 5 A 13 12 281785 CASAVA_Build 7 127986871 1I TGTTTTCAAA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 T 7 8 281786 CASAVA_Build 7 127988919 5I ACCTATGGTC -----/TCTAT TCTACAAATT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TCTAT 0 1 281787 CASAVA_Build 7 127997920 1D GCCACCATGA C/- CATCCTCCTT 2835 het 2835 ref 30 17 6 7 C 2 1 281788 CASAVA_Build 7 127999709 1I GGGCGGATCA -/C TTGAAGGCAG 3070 hom 42 het 17 0 14 4 C 0 1 281789 CASAVA_Build 7 128005529 1D GGGACTCTTT G/- TTTTCCCTGT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 G 1 0 281790 CASAVA_Build 7 128008505 1D ATATATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 723 hom 22 3 9 10 T 17 16 281791 CASAVA_Build 7 128015231 2D GCTTTTAATG TT/-- TTTTTTTTGT 1318 het 1318 ref 28 10 8 10 T 10 8 281792 CASAVA_Build 7 128015566 1I TTTTACTTTT -/A TTTTTTTGAC 3070 het 2379 hom 21 7 11 3 A 0 1 281793 CASAVA_Build 7 128016832 3D TGTTTATTTT TTC/--- TTCTTGTAAT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 TTC 2 1 281794 CASAVA_Build 7 128024479 3I TGATAAAAAT ---/AGC AGGTGGCAGA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 AGC 0 1 281795 CASAVA_Build 7 128026857 2D TTGCTTATGC TT/-- TTAGTGTTGT 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 T 4 2 281796 CASAVA_Build 7 128035043 1D GTGCATCCCC T/- TGTGCATTGG 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 2 1 281797 CASAVA_Build 7 128038614 1I TTATTATTAA -/T TTTTTTTTTT 2137 het 799 hom 11 3 5 4 T 13 14 281798 CASAVA_Build 7 128045888 2I CTGTTAAGTC --/TT TTTTTTTTTT 2711 het 2711 ref 17 9 7 1 T 10 12 281799 CASAVA_Build 7 128052430 1I TCGCCTTTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 486 hom 17 1 10 6 T 9 10 281800 CASAVA_Build 7 128063782 1D CCCAGCCCCC T/- ATTATCATTA 1734 het 1561 hom 10 4 5 1 T 1 0 281801 CASAVA_Build 7 128087565 4I ACAATAAAAC ----/AATG AATAACACAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AATG 0 1 281802 CASAVA_Build 7 128088151 4D TGCACTGTGA ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 ATTT 4 3 281803 CASAVA_Build 7 128089960 1D AATGGTAGAT C/- CACTGACAGC 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 C 2 1 281804 CASAVA_Build 7 128095330 1D AAGTAAAATG T/- AAAATAAAAG 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 T 1 0 281805 CASAVA_Build 7 128100654 4D GTGCTGGGGG CATT/---- CATTCAAGGC 3070 hom 135 het 51 0 44 9 CATT 2 1 281806 CASAVA_Build 7 128102909 3I AGCATCTGTA ---/TTC TTCCACCCCT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TTC 1 2 281807 CASAVA_Build 7 128103580 3D GATTACAGGC GTG/--- AGCCACCGCG 1261 het 1261 ref 10 4 4 4 GTG 1 0 281808 CASAVA_Build 7 128103756 4D TGTGTGTGTG TGTA/---- TATATAGACA 3070 het 3070 ref 37 17 16 9 TGTA 1 0 281809 CASAVA_Build 7 128109172 1D CCACACTGCA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 1227 hom 19 6 10 3 C 9 8 281810 CASAVA_Build 7 128111330 3D CCACCAGGCA CCT/--- CCTCCAACAC 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 CCT 2 1 281811 CASAVA_Build 7 128114710 3I CGATCTTGGA ---/ATG ATGCTCTGAC 3070 het 3070 hom 54 15 35 4 ATG 1 2 281812 CASAVA_Build 7 128118461 1I TTTGGGGGAT -/G GGGGGAAAGG 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 G 5 6 281813 CASAVA_Build 7 128126551 2D ATACCTGCTG CC/-- CCCCCCCCCC 628 het 211 hom 12 4 3 5 C 13 11 281814 CASAVA_Build 7 128127575 1D TTGTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1714 hom 28 8 11 9 T 14 13 281815 CASAVA_Build 7 128131067 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 42 2 26 14 A 13 12 281816 CASAVA_Build 7 128134317 1I CTCCTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 31 1 26 4 T 11 12 281817 CASAVA_Build 7 128135470 2D ACCTGGACAA TT/-- TTTTTTTTTT 1267 het 356 hom 18 4 4 11 T 20 18 281818 CASAVA_Build 7 128155732 1D ACTCAGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 27 1 15 11 A 12 11 281819 CASAVA_Build 7 128161333 2I CCATGTACTC --/CA GAGATACATA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 CA 0 1 281820 CASAVA_Build 7 128163095 24I AGGGTTTACA ------------------------/ATTTGACATGAGATTTGGGCGGGG ACACAGATCC 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 ATTTGACATGAGATTTGGGCGGGG 0 1 281821 CASAVA_Build 7 128172731 2D CTCTACAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2496 hom 25 12 12 1 T 13 11 281822 CASAVA_Build 7 128174424 4D ATTCTCTGTT TTTA/---- TTTGTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 16 20 1 TTTA 1 0 281823 CASAVA_Build 7 128182433 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 895 hom 32 5 12 15 A 17 16 281824 CASAVA_Build 7 128185202 1I AATCTAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 9 13 T 11 12 281825 CASAVA_Build 7 128188544 1D TCATTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 11 10 281826 CASAVA_Build 7 128191564 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 10 281827 CASAVA_Build 7 128191707 6D CAGAGCAAGA CCCTGT/------ CTCAGAAGAA 3070 het 3070 ref 35 20 15 3 CCCTGT 1 0 281828 CASAVA_Build 7 128195242 1I TCCCCAGGAA -/T TTTTTTTTTT 1259 het 1259 ref 36 30 3 3 T 11 12 281829 CASAVA_Build 7 128197867 1D CCCCGCTGCC A/- AAAAAAAAAA 2300 het 1663 hom 37 7 12 18 A 15 14 281830 CASAVA_Build 7 128212328 6D GTCTCTGAAA AGAAAG/------ AGAAAGAAAA 3070 hom 106 het 39 0 33 9 AGAAAG 2 1 281831 CASAVA_Build 7 128238590 13I AGCCAGGCCC -------------/AGAGAGCCTGGGA AACATGCCCA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 AGAGAGCCTGGGA 0 1 281832 CASAVA_Build 7 128312928 1D TAACTCAGTC T/- CTCCGGGCCT 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 T 1 0 281833 CASAVA_Build 7 128320751 1I ATACTGGTGT -/C CCTGGTACTC 3070 hom 63 het 26 0 18 8 C 2 3 281834 CASAVA_Build 7 128335418 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1055 het 1055 ref 13 6 5 2 A 14 13 281835 CASAVA_Build 7 128336258 1D CTCCCACATT G/- GGTGGGGTGG 2755 het 1809 hom 19 7 7 5 G 3 2 281836 CASAVA_Build 7 128339874 2D GTGGCACATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 68 het 31 0 18 13 TG 9 8 281837 CASAVA_Build 7 128345568 2D AGCATAAGCT CA/-- GAGTCACAGT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 CA 1 0 281838 CASAVA_Build 7 128346004 1I GAGAGGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 31 1 22 8 T 10 11 281839 CASAVA_Build 7 128351390 1I ACCCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2852 hom 22 7 9 6 A 11 12 281840 CASAVA_Build 7 128353947 14D TGGTTTTAGC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 2454 het 1932 hom 21 9 9 3 T 26 12 281841 CASAVA_Build 7 128363034 14D GAAGGCTCTT CTTAGCTATTGCTC/-------------- CAGATACGAC 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 CTTAGCTATTGCTC 1 0 281842 CASAVA_Build 7 128370832 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2922 het 85 hom 21 2 12 7 T 17 16 281843 CASAVA_Build 7 128390104 1I AGATAACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 10 11 281844 CASAVA_Build 7 128391281 6D AAGTAGCCTC TGTGTA/------ TGTGTATAAT 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 TGTGTA 2 1 281845 CASAVA_Build 7 128396760 4I AACTGCTTTT ----/ATTA ACAGTAATAT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 ATTA 0 1 281846 CASAVA_Build 7 128404890 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2671 het 360 hom 28 2 11 15 T 15 14 281847 CASAVA_Build 7 128420083 5I ATTTTAATTA -----/ATGAT ATAACTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 ATGAT 0 1 281848 CASAVA_Build 7 128420425 1I CTGAGTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 13 14 281849 CASAVA_Build 7 128422991 5D GAGTCTTCAC TTTAT/----- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 TTTAT 2 1 281850 CASAVA_Build 7 128432595 1D AGTGTCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 12 11 281851 CASAVA_Build 7 128438219 1D CTATATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 12 11 281852 CASAVA_Build 7 128442671 1I ATGAAAAAAA -/T GTCCATAATG 3070 het 3070 hom 41 20 17 4 T 0 1 281853 CASAVA_Build 7 128452990 1I GGTGTGAGCC -/A CTGTGCTCAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 0 1 281854 CASAVA_Build 7 128459371 3I TAAATGTAAT ---/CCA CCACATTAAC 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 CCA 1 2 281855 CASAVA_Build 7 128472839 1I GTTTTGCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 13 14 281856 CASAVA_Build 7 128517263 1D AAGACTTCCC T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 51 22 17 12 T 7 6 281857 CASAVA_Build 7 128518176 4I TGAAGAGAAG ----/TCAC TGGGCTGCAG 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 TCAC 0 1 281858 CASAVA_Build 7 128519597 1D TCATCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 22 9 T 13 12 281859 CASAVA_Build 7 128520539 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 2618 het 2618 ref 29 15 6 8 A 11 12 281860 CASAVA_Build 7 128527904 1D TCTTTAACAG T/- TTTTCCTGGC 3070 het 3070 ref 48 23 16 10 T 5 4 281861 CASAVA_Build 7 128531709 1D TTTTTTTTTT G/- GTTTTTTGTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 2 1 281862 CASAVA_Build 7 128536047 2D GAGGGTTTGT CA/-- CAGATTCTTC 3070 hom 120 het 43 0 41 5 CA 2 1 281863 CASAVA_Build 7 128552575 2D TCAAATTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 34 1 24 11 T 16 14 281864 CASAVA_Build 7 128552740 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 26 het 28 1 23 4 T 8 7 281865 CASAVA_Build 7 128560917 1I GTAGCACCCA -/G CTAGCTGTGA 3070 hom 101 het 39 0 32 7 G 0 1 281866 CASAVA_Build 7 128568284 1I TTTTCTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 8 9 281867 CASAVA_Build 7 128571298 1I CCGAGGTTCA -/C ACTTGTATTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 0 1 281868 CASAVA_Build 7 128574222 1D CTTGGCCCTA C/- CAGTAGACTC 3070 hom 122 het 47 0 37 11 C 2 1 281869 CASAVA_Build 7 128580735 2I AGTTTAAAAA --/AG AGATCAGTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 7 AG 1 2 281870 CASAVA_Build 7 128582734 1D ACTTTATTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 79 het 31 0 27 5 T 10 9 281871 CASAVA_Build 7 128595909 22I TTGACCTGGG ----------------------/ACTCCATGGTGTTGACATGGGA CTACGCGGGA 3070 het 3070 hom 26 10 9 7 ACTCCATGGTGTTGACATGGGA 0 1 281872 CASAVA_Build 7 128599798 1D TTCAGTGTAT C/- TTCCCAACTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 C 1 0 281873 CASAVA_Build 7 128610567 7D CATGCCTGGC TATTTTT/------- TATTTTTTAT 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 TATTTTT 4 3 281874 CASAVA_Build 7 128633794 2I GCCTTCACAC --/AG AGTAGAAGGT 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 AG 1 2 281875 CASAVA_Build 7 128633916 1D TCACAGCTTG T/- TTTTTTTGTT 1186 het 1186 ref 21 10 6 5 T 8 7 281876 CASAVA_Build 7 128634969 1D GACCCTGTCT C/- CAAAGAAAAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 2 1 281877 CASAVA_Build 7 128635538 1I AAAAATTATA -/T TGGATAGCGC 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 1 2 281878 CASAVA_Build 7 128641573 3I GTACTCTTTT ---/TTG TTGTTGTTGA 1861 het 521 hom 11 2 4 5 TTG 3 4 281879 CASAVA_Build 7 128646450 1D GCCAGCCTAA T/- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 4 3 281880 CASAVA_Build 7 128647024 1D GCTTCAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 26 1 18 7 T 13 12 281881 CASAVA_Build 7 128647722 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1995 het 1898 hom 15 6 6 4 A 13 12 281882 CASAVA_Build 7 128654000 4I ATACTTTGTA ----/ACTT TCGTTAAGTC 3070 hom 103 het 37 0 35 2 ACTT 0 1 281883 CASAVA_Build 7 128662495 3D CTCCTTCTCA TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 hom 126 het 50 0 41 10 TTC 5 4 281884 CASAVA_Build 7 128664634 1D ATTTTAGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 534 hom 52 2 40 11 T 12 11 281885 CASAVA_Build 7 128670652 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTGTTTTG 738 hom 11 het 9 0 4 5 T 5 4 281886 CASAVA_Build 7 128672660 2I CTAGGTACCT --/TA TATATAAGTA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TA 3 4 281887 CASAVA_Build 7 128675588 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 26 0 22 4 T 12 11 281888 CASAVA_Build 7 128695121 1D TTGGACAAAC T/- TGCTATTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 2 1 281889 CASAVA_Build 7 128708035 1I TCTGCCTCCT -/G GGTTCAAGTG 2715 hom 15 het 7 0 6 1 G 2 3 281890 CASAVA_Build 7 128714153 1I TATTCCTGCC -/A ATCTCTTTGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 2 281891 CASAVA_Build 7 128720227 1D AGTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 31 0 28 3 T 10 9 281892 CASAVA_Build 7 128738183 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1190 het 1190 ref 22 11 4 7 A 15 16 281893 CASAVA_Build 7 128741539 2I AAAACAACAG --/TT TTTATTTCTC 3070 het 3070 ref 23 15 7 1 T 3 5 281894 CASAVA_Build 7 128767785 2I TTACCCATTT --/AA GAGTTTTTTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 0 2 281895 CASAVA_Build 7 128779121 1D TGGAGTATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 25 0 20 6 T 10 9 281896 CASAVA_Build 7 128796293 5I AATTTCAACT -----/TTTAA TTTAAAGACA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 TTTAA 1 2 281897 CASAVA_Build 7 128797478 7I TAAAAAATAA -------/TTGGTTG ATAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 TTGGTTG 0 1 281898 CASAVA_Build 7 128800494 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAACAA 3070 het 2981 hom 20 8 10 2 A 8 7 281899 CASAVA_Build 7 128802409 1D GCACCATTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 9 8 281900 CASAVA_Build 7 128805387 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 2870 het 2870 ref 24 12 8 4 A 13 14 281901 CASAVA_Build 7 128828417 1D CATCCCAGTG C/- CCCCCCCCAA 1465 het 1465 ref 18 12 5 1 C 9 8 281902 CASAVA_Build 7 128836165 1D TCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 13 12 281903 CASAVA_Build 7 128836930 1I AAGCCAGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1165 hom 31 3 26 2 T 10 11 281904 CASAVA_Build 7 128838683 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 802 hom 15 4 8 3 A 6 7 281905 CASAVA_Build 7 128864303 1I TAGCTTCAGC -/T CAGGAATTCG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 0 1 281906 CASAVA_Build 7 128878852 1D CTAGCTTTAG A/- GGGGTGGAGG 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 1 0 281907 CASAVA_Build 7 128888649 1D GTCTTTCAAG A/- AAAAAGGAGT 3070 het 3070 ref 44 23 17 5 A 6 5 281908 CASAVA_Build 7 128893305 1D GAAGGGCCAC A/- GGCACATCTC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 1 0 281909 CASAVA_Build 7 128899087 1I TTTACCCACA -/C CTACAGAGAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 C 1 2 281910 CASAVA_Build 7 128902309 1I AGCATCTGAA -/T TGGTTGTTGA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 1 2 281911 CASAVA_Build 7 128913753 4D TACAGGAGGC TTTA/---- TTTATTCAGA 3070 het 3070 ref 38 24 12 3 TTTA 2 1 281912 CASAVA_Build 7 128917653 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2306 het 60 hom 27 2 13 12 A 15 16 281913 CASAVA_Build 7 128921209 1I AGCTAAGAAT -/G TTTTTTTTAC 3070 hom 96 het 40 0 31 9 G 0 1 281914 CASAVA_Build 7 128923394 1D TACTTTATAT C/- TTTTAAAGTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 1 0 281915 CASAVA_Build 7 128926701 1I TCAGCATCCT -/G AGTAGCTGGG 1728 hom 10 het 6 0 4 2 G 0 1 281916 CASAVA_Build 7 128931634 2D TTTGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 38 0 16 22 T 13 11 281917 CASAVA_Build 7 128944636 1I CACTCAGAAC -/G TAAGTAGAGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 281918 CASAVA_Build 7 128946733 3I CTGCTGTGAT ---/TTG TGTTACTCTG 3070 hom 91 het 33 0 31 2 TTG 0 1 281919 CASAVA_Build 7 128951365 1D GATATCATAC A/- AATGCATATA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 3 2 281920 CASAVA_Build 7 128951652 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 21 0 14 7 T 10 11 281921 CASAVA_Build 7 128952975 5D ATCAGGGAGA TGTCC/----- TGCCTGATTT 3070 hom 93 het 33 0 31 3 TGTCC 1 0 281922 CASAVA_Build 7 128957931 1D ATGACCAAAA G/- GTGGAATCAA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 G 2 1 281923 CASAVA_Build 7 128958904 1D ACCTGGCCCA C/- CCCACTCCTT 3070 hom 75 het 28 0 24 5 C 4 3 281924 CASAVA_Build 7 128959671 2D55M3D GCATGTGTGC GTGTGTCTGTGTGCGTGCGTGCACACTCTGAGTGCATGTGTACACTGTGTGCGTGTGTGT/--GTGTCTGTGTGCGTGCGTGCACACTCTGAGTGCATGTGTACACTGTGTGCGTGTG--- TGTGTGTGTC 3070 hom 162 het 62 0 48 47 N/A 0 0 281925 CASAVA_Build 7 128972704 1D GAGAACTTTG T/- TCCCTTGGCA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 2 1 281926 CASAVA_Build 7 128973006 1D GTAAAAGCAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 9 8 281927 CASAVA_Build 7 128977287 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 8 9 281928 CASAVA_Build 7 128984860 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 AG 1 2 281929 CASAVA_Build 7 128991733 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2446 hom 28 8 16 4 A 10 11 281930 CASAVA_Build 7 128993150 1I GCACTTTGGG -/A GGCTGAGGCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 0 1 281931 CASAVA_Build 7 128996709 4I51M1D AAAAAAAGAA ----AAACAAACAAACAAAAAAGAAGGTTGTTTAAAGACTATGGGATTCATAAGTC/AAACAAACAAACAAACAAAAAAGAAGGTTGTTTAAAGACTATGGGATTCATAAGT- CCCCCCAGCC 3070 het 3070 ref 22 19 7 9 N/A 0 0 281932 CASAVA_Build 7 128997987 1D CTTCTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 24 3 9 12 T 13 12 281933 CASAVA_Build 7 128998915 1D ATAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 10 9 281934 CASAVA_Build 7 128999672 4D TGGAAGGGAA ATAG/---- ATAGAAGAGG 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 ATAG 2 1 281935 CASAVA_Build 7 129000389 1I TACTCTGAAA -/T TGAATAGGTT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 1 2 281936 CASAVA_Build 7 129002559 7D TCTCTTACTA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1278 hom 24 8 11 5 T 21 14 281937 CASAVA_Build 7 129013807 2I CGCTAATAAC --/AG GGGAAGCTGG 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AG 0 1 281938 CASAVA_Build 7 129020976 1D CAAAACCCCG T/- TATCTACAAA 3059 hom 18 het 8 0 7 1 T 2 1 281939 CASAVA_Build 7 129023543 1D ACCATGTTGG C/- CCAGGCTGGT 3070 hom 45 het 26 0 23 3 C 3 2 281940 CASAVA_Build 7 129027821 1D AAAACAAAAC A/- AAAAACATCA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 6 5 281941 CASAVA_Build 7 129032866 1I CACTGTGGGG -/A ACTCCAGGAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 1 2 281942 CASAVA_Build 7 129034704 2I GTGGGCCATA --/GG GCCTTAGGGC 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 G 1 3 281943 CASAVA_Build 7 129040606 1I GTGTCAAGGG -/T GTTTTTTTTT 2609 het 2609 ref 24 9 10 5 T 0 1 281944 CASAVA_Build 7 129042501 2I TGTGTGTGAC --/TA TGTGTGATGC 3070 hom 138 het 53 0 46 7 TA 0 1 281945 CASAVA_Build 7 129045281 3D GGTTATTGGG TGA/--- TGATGATGCC 3070 het 3070 ref 42 22 13 10 TGA 3 2 281946 CASAVA_Build 7 129050458 1D AAAATACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 28 1 18 10 T 13 12 281947 CASAVA_Build 7 129056355 1I GCACACACGC -/T TTTTTTTTTT 2458 het 1843 hom 25 7 8 10 T 15 16 281948 CASAVA_Build 7 129058314 1D TTTGATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 42 1 28 13 T 15 14 281949 CASAVA_Build 7 129060080 1D TTGCAAAACA G/- CTACATAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 G 1 0 281950 CASAVA_Build 7 129060866 2D CTATAAGTGA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TG 7 6 281951 CASAVA_Build 7 129063292 4I TCATCCTGTT ----/TTAA TTTGTTCAAT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 TTAA 0 1 281952 CASAVA_Build 7 129064928 1I CATTATGAGA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 7 8 281953 CASAVA_Build 7 129070257 1I ATCCAGAAAC -/A AATCCTTAGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 3 281954 CASAVA_Build 7 129071478 1I AAGGGACAAA -/T TGGCCTGAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 1 2 281955 CASAVA_Build 7 129108918 1I ATCCCAGCAC -/T TTGGAAGGCT 3070 hom 44 het 17 0 14 3 T 2 3 281956 CASAVA_Build 7 129109940 1D ACAAGGGGAT A/- AATATATCAT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 3 2 281957 CASAVA_Build 7 129124270 1I CACAGGTGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2743 hom 28 9 16 3 T 9 10 281958 CASAVA_Build 7 129129595 2D ACCATAGTCA TC/-- TCTCTGAACA 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 TC 3 2 281959 CASAVA_Build 7 129132239 4D TAAAACTTCT ATTA/---- ATTAATATAC 3070 het 3070 ref 28 13 13 5 ATTA 2 1 281960 CASAVA_Build 7 129139221 3I AAGTTCTGTT ---/ATC ATCTTCACTT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 ATC 1 2 281961 CASAVA_Build 7 129156311 1I TGAATTTATA -/G ATAAGTCCAA 3070 hom 90 het 34 0 28 6 G 0 1 281962 CASAVA_Build 7 129163687 1I GGTATTTGTA -/T TTTTTTTTTG 1237 het 1237 ref 18 4 6 8 T 9 10 281963 CASAVA_Build 7 129164671 1D GTTCCTTGTT C/- CCTGGACACA 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 C 3 2 281964 CASAVA_Build 7 129170252 1D CCCCTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1148 hom 37 3 19 15 A 15 14 281965 CASAVA_Build 7 129172080 1D AAGTTTGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 A 10 9 281966 CASAVA_Build 7 129175754 5D TAATGTTTTT GATGG/----- GATGGGATGG 3070 het 3070 hom 60 28 28 7 GATGG 3 2 281967 CASAVA_Build 7 129177582 5I ATCCCTACAG -----/TGGGA TGGTCATGCA 3070 hom 123 het 47 0 40 7 TGGGA 0 1 281968 CASAVA_Build 7 129180213 1D TTATATTTGA T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 84 het 30 0 29 3 T 8 7 281969 CASAVA_Build 7 129180803 1D AGCTGGGGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 281970 CASAVA_Build 7 129184698 4I TCCAACCTGG ----/CGCT GCAACAGAGC 1205 hom 11 het 12 0 4 8 CGCT 0 1 281971 CASAVA_Build 7 129185075 4D ATGATTAGAA TGCT/---- TGCTTGGATG 3070 hom 145 het 52 0 42 10 TGCT 2 1 281972 CASAVA_Build 7 129189920 1D GGCCGCTCTC G/- GGGGAAGCGA 3070 hom 44 het 18 0 13 7 G 5 4 281973 CASAVA_Build 7 129214125 1D CTCCGCAGTA C/- CTGCTGTGGG 3070 hom 52 het 22 0 17 5 C 2 1 281974 CASAVA_Build 7 129216567 3I AAAGTGCTCT ---/GGA GAATTATACC 3070 hom 120 het 43 0 39 4 GGA 0 1 281975 CASAVA_Build 7 129216623 26D TACACTCCAA CACACACATGCACCTGCATGGGTGTG/-------------------------- CACACACATG 3070 hom 81 het 30 0 25 13 CACACACATGCACCTGCATGGGTGTG 2 1 281976 CASAVA_Build 7 129217632 1D CCCTGAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 127 hom 29 1 17 11 T 15 14 281977 CASAVA_Build 7 129226393 6D ACCACCAGTC TCTGAG/------ TCTATTTCCT 2786 het 2786 ref 31 20 8 7 TCTGAG 1 0 281978 CASAVA_Build 7 129232864 1D AAAAAGTACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 10 9 281979 CASAVA_Build 7 129238110 1I AGCTGACTAA -/T TAGTTCTTAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 1 2 281980 CASAVA_Build 7 129240167 4D CAAACAAACA AAAC/---- AAACAAACAC 3070 het 3070 ref 32 16 16 0 AAAC 3 2 281981 CASAVA_Build 7 129247190 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 612 hom 36 2 23 11 T 12 11 281982 CASAVA_Build 7 129259579 2I CATACACACA --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 138 het 74 0 58 16 CT 6 7 281983 CASAVA_Build 7 129273649 1D CCCCCCACTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 422 hom 35 1 27 7 A 10 9 281984 CASAVA_Build 7 129276240 4D AAAAAACTTG CAAA/---- CAGAGGGCCC 3070 het 3070 ref 20 12 8 1 CAAA 1 0 281985 CASAVA_Build 7 129279543 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2375 het 399 hom 19 2 8 9 A 15 16 281986 CASAVA_Build 7 129295501 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1639 hom 10 het 4 0 4 0 A 6 7 281987 CASAVA_Build 7 129297799 1D AATGATCATT A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 A 7 6 281988 CASAVA_Build 7 129304890 1D TATTATCTAG A/- AAAAATACAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 6 5 281989 CASAVA_Build 7 129307772 1I AGGTGGTCCT -/G GGAACCAATC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 G 2 3 281990 CASAVA_Build 7 129308698 1I CACTCCAGCC -/T TGGGTGATAG 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 1 2 281991 CASAVA_Build 7 129312139 1I AACTTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2909 hom 33 10 15 8 A 13 14 281992 CASAVA_Build 7 129318887 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 25 3 15 7 A 17 16 281993 CASAVA_Build 7 129325025 2D8M3I GTATTTATTA TCTTTATCAA---/--TGTATGTATTT CATTTAGGAT 3070 het 3070 ref 47 31 14 5 N/A 0 0 281994 CASAVA_Build 7 129326320 1D TTCTAGAAGT G/- GAACTTCTAT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 G 2 1 281995 CASAVA_Build 7 129334214 1I GGTGTTCTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 9 10 281996 CASAVA_Build 7 129338451 1D CGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 941 hom 26 8 9 10 A 15 14 281997 CASAVA_Build 7 129343505 1D CTTCCCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 26 1 14 11 A 13 12 281998 CASAVA_Build 7 129348076 1D CTCTGCCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 23 0 19 5 A 11 10 281999 CASAVA_Build 7 129359889 4D GTCAGAACTG TCTA/---- TCTACATCAG 2258 het 2191 hom 15 8 6 2 TCTA 2 1 282000 CASAVA_Build 7 129365690 2I TCGATAGGCT --/GA GAGAATTGTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 GA 2 3 282001 CASAVA_Build 7 129368817 1I CCAGCTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 282002 CASAVA_Build 7 129374120 1I GCAACACTAG -/A AAAACCAACA 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 A 4 5 282003 CASAVA_Build 7 129374824 1I CTTTCCGACT -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 6 7 282004 CASAVA_Build 7 129380306 2D ATGAACCTCC CT/-- TAACACTCTG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 CT 1 0 282005 CASAVA_Build 7 129381669 1I ATAACCCCTT -/C CCCCCCCAGC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 7 8 282006 CASAVA_Build 7 129390439 1D TTTTTCTTTT G/- TTTTTCCTCC 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 G 1 0 282007 CASAVA_Build 7 129394869 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 3 A 13 11 282008 CASAVA_Build 7 129398353 1I CCTGATTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 10 282009 CASAVA_Build 7 129400159 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 597 hom 19 3 12 4 A 15 14 282010 CASAVA_Build 7 129401279 1I GTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 2522 het 266 hom 20 3 10 7 C 0 1 282011 CASAVA_Build 7 129432339 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 292 hom 14 1 12 2 A 13 12 282012 CASAVA_Build 7 129434354 2I GGGTGTGAGA --/GG GAGAGTTTCA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 G 1 3 282013 CASAVA_Build 7 129434582 2D TTGTCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 25 1 19 6 A 13 11 282014 CASAVA_Build 7 129437386 3D AGAAGGGCAG GGA/--- GGATCAACTC 3070 hom 108 het 40 0 35 8 GGA 2 1 282015 CASAVA_Build 7 129443928 4I GGCTCACTGT ----/AAGC AAGCTCCGCC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AAGC 1 2 282016 CASAVA_Build 7 129446131 1D CTGGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 572 het 572 ref 19 8 4 7 T 17 16 282017 CASAVA_Build 7 129467885 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 963 hom 20 2 13 6 A 15 14 282018 CASAVA_Build 7 129468601 1I TAACTCATTC -/T TTTTTTTTTT 1985 het 425 hom 18 3 9 6 T 17 18 282019 CASAVA_Build 7 129483699 1D TGAGGAGTAG T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 7 6 282020 CASAVA_Build 7 129493360 1D TTCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 847 het 847 ref 16 8 2 6 T 15 14 282021 CASAVA_Build 7 129500370 2D CCTATTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1769 het 60 hom 23 2 5 17 T 20 18 282022 CASAVA_Build 7 129536289 1D AGCAGGTCTC T/- TTTTTTTTTT 2495 hom 23 het 11 0 8 3 T 14 13 282023 CASAVA_Build 7 129546294 1I AAAAAAAAAA -/T AAATAAATAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 1 282024 CASAVA_Build 7 129552619 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAATAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 7 8 282025 CASAVA_Build 7 129561709 1I GTAAAACCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 639 hom 53 3 35 15 T 10 11 282026 CASAVA_Build 7 129562168 7D TTTTAATTTG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 39 0 37 4 A 21 14 282027 CASAVA_Build 7 129562870 9I CTACCCACCT ---------/CCACCACCC CCACCAGGCT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 CCACCACCC 0 1 282028 CASAVA_Build 7 129579524 2I GCACACACAT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 71 26 26 19 CA 8 9 282029 CASAVA_Build 7 129582420 2D GTAAAACAAG AC/-- AGTCCAACTG 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 AC 1 0 282030 CASAVA_Build 7 129583343 4D CCTCTTCTTC CTTT/---- GTGTTAGATT 3070 het 3070 hom 44 17 24 7 CTTT 1 0 282031 CASAVA_Build 7 129588731 1I AAAGAAGAAG -/A AAGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 2 3 282032 CASAVA_Build 7 129598541 4D GATTTTTAAA AGAT/---- AATGTTTACA 3070 het 3070 ref 33 15 15 4 AGAT 1 0 282033 CASAVA_Build 7 129617651 1I GTATTACAGT -/A AAAAAAAAAA 2149 het 1771 hom 20 6 9 5 A 12 13 282034 CASAVA_Build 7 129622708 1D AGTTATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 A 13 12 282035 CASAVA_Build 7 129623403 1D AATTTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 T 13 12 282036 CASAVA_Build 7 129629176 1I AACTAGAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 9 10 282037 CASAVA_Build 7 129632922 1I CCCCATGTAA -/T TTTTTTTTTT 2978 het 2978 ref 24 8 7 9 T 10 11 282038 CASAVA_Build 7 129633371 1D GTGAGGTGGA T/- GCAGTGCTCC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 1 0 282039 CASAVA_Build 7 129650139 1D GGCACAAGGC A/- AGCAATTTAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 2 1 282040 CASAVA_Build 7 129654784 1I TTAAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 10 11 282041 CASAVA_Build 7 129655579 1I AAGAAAATGC -/T TTTTTTCCCC 3070 het 486 hom 12 2 9 1 T 6 7 282042 CASAVA_Build 7 129661425 14D CCCAGGTGGA GGAGGGCCCCAGGT/-------------- GGAGAAGAAC 3070 het 3070 ref 39 28 10 4 GGAGGGCCCCAGGT 1 0 282043 CASAVA_Build 7 129680805 1I CTTTTTACTC -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 6 7 282044 CASAVA_Build 7 129699382 4I CCCGTGTGTA ----/ATAC ATAATATATA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 ATAC 0 1 282045 CASAVA_Build 7 129717784 1D GTGGCTAGCA T/- TTTTTTTTTT 2902 het 1765 hom 49 14 16 19 T 17 16 282046 CASAVA_Build 7 129718298 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 8 7 282047 CASAVA_Build 7 129730335 1D TAAATCGAAC T/- TTTTTCCTGA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 6 5 282048 CASAVA_Build 7 129742508 1I GGTGAGGGTG -/T TTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 6 7 282049 CASAVA_Build 7 129751130 3I ATCTGTCCTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 102 het 45 0 35 10 TTG 3 4 282050 CASAVA_Build 7 129753048 2D ACAGTTTGAC AT/-- CTTCTCAAGT 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 AT 1 0 282051 CASAVA_Build 7 129754286 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAATA 2447 hom 15 het 6 0 6 0 A 9 8 282052 CASAVA_Build 7 129754652 1I CTAGAGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 22 5 T 10 11 282053 CASAVA_Build 7 129760418 21I ATTTCTTTAC ---------------------/TGTTCCTTATAATAAAAGTAA TGTTCCTTCT 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 TGTTCCTTATAATAAAAGTAA 0 1 282054 CASAVA_Build 7 129764400 2D TCTCTATGAA TT/-- TTTTTTTTTT 2550 het 1893 hom 24 10 10 5 T 14 12 282055 CASAVA_Build 7 129770244 4D TTCTTTCTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 38 het 16 0 13 3 TCTT 5 4 282056 CASAVA_Build 7 129773324 1D GAAAAGCTAA G/- GGCCTGTCTT 3070 het 3070 ref 44 22 15 8 G 3 2 282057 CASAVA_Build 7 129776796 33D TACGTACCCA CAAAAATTAAAAATTACAAAAAAACCTGTATCC/--------------------------------- CAAATCTGTT 3070 het 3070 ref 31 28 9 3 CAAAAATTAAAAATTACAAAAAAACCTGTATCC 1 0 282058 CASAVA_Build 7 129779445 1D CGGGGATGGA G/- GGGGGTAAAT 3070 het 1777 hom 19 7 10 3 G 6 5 282059 CASAVA_Build 7 129780309 6D GTCATCTCCA TCCCTG/------ TCCGCCAGCA 3070 het 3070 ref 35 18 10 11 TCCCTG 1 0 282060 CASAVA_Build 7 129782148 3D GGGTAGGGAC AGA/--- AGAAGAGGAC 3070 hom 97 het 36 0 31 6 AGA 3 2 282061 CASAVA_Build 7 129783271 1I TGTGAGAGAT -/C CTGCTCTCCT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 C 1 2 282062 CASAVA_Build 7 129784701 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2334 het 2268 hom 21 11 7 4 A 15 14 282063 CASAVA_Build 7 129789306 1D GGATCACTTT G/- CTCGCCAATG 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 G 1 0 282064 CASAVA_Build 7 129797411 1I CACAGGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 T 11 12 282065 CASAVA_Build 7 129810894 1D TCCTGTCCTT G/- GGGGAAGCAG 3070 het 3070 hom 46 16 23 8 G 5 4 282066 CASAVA_Build 7 129811545 2I CTCTGAACCA --/CC CCCCCCACCC 1208 het 1208 ref 27 9 7 11 C 6 8 282067 CASAVA_Build 7 129822442 1I TTTCCTGGGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 A 8 9 282068 CASAVA_Build 7 129822958 1D ACTAAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 1871 het 1871 ref 25 12 6 7 A 15 14 282069 CASAVA_Build 7 129828545 5D CTGTGTGATT ATAAG/----- ATATTTCAAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 ATAAG 1 0 282070 CASAVA_Build 7 129833188 4D TAAGTGAAAT AATA/---- AATAAATACT 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 AATA 3 2 282071 CASAVA_Build 7 129852316 1I CATGACAAAA -/C CCCATCTCTA 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 C 3 4 282072 CASAVA_Build 7 129854502 1D AAATTCTGAC T/- GGTATTTCAG 3070 het 3070 ref 50 28 18 4 T 1 0 282073 CASAVA_Build 7 129858261 1D ACTGACATAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 9 8 282074 CASAVA_Build 7 129864443 1I CACTGGGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 A 10 11 282075 CASAVA_Build 7 129864673 1I CATAGGGAGA -/C CCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 C 4 5 282076 CASAVA_Build 7 129866427 1I AGTAGTTAAG -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 7 8 282077 CASAVA_Build 7 129909959 1I CCAGTTTGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 9 10 282078 CASAVA_Build 7 129929072 6D TCAAAAAAAA AAAAAG/------ AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 20 1 18 5 AAAAAG 1 0 282079 CASAVA_Build 7 129932451 1D CATAAAAGAC T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 94 het 34 0 32 2 T 8 7 282080 CASAVA_Build 7 129935799 12I TTCCATCATT ------------/TCTTAGGAAGTG CCATCTGTAC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TCTTAGGAAGTG 0 1 282081 CASAVA_Build 7 129937789 11D ATAATGTTCC TGAAACCTTAG/----------- TGGGAATTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 3 TGAAACCTTAG 1 0 282082 CASAVA_Build 7 129947657 1D CTAAATACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 45 1 40 5 A 11 10 282083 CASAVA_Build 7 129966582 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1695 het 63 hom 20 1 8 11 T 17 16 282084 CASAVA_Build 7 129967154 4I ATACTAAATT ----/AAGA CTTTTCTTTA 3070 hom 81 het 28 0 27 1 AAGA 0 1 282085 CASAVA_Build 7 129979552 7D TATCTGTTTT AAAACAA/------- AAAACAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 23 7 AAAACAA 2 1 282086 CASAVA_Build 7 129981158 2I AAATGAACAG --/AC ACACTGTCAC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AC 2 3 282087 CASAVA_Build 7 129982332 2D AGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTATA 2547 hom 31 het 17 0 10 7 TG 4 3 282088 CASAVA_Build 7 129990214 4D CCTGGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 89 het 37 0 30 7 TTTG 5 4 282089 CASAVA_Build 7 130000465 1D GGAGGCTAAA G/- TAGGAGAATT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 G 1 0 282090 CASAVA_Build 7 130006362 4D TTGGTGCTTG GTAA/---- GTGTCAGACA 3070 hom 99 het 36 0 33 4 GTAA 1 0 282091 CASAVA_Build 7 130031597 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 31 1 25 5 T 11 12 282092 CASAVA_Build 7 130041091 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 21 0 13 8 T 11 12 282093 CASAVA_Build 7 130041186 3D CCCAGGTTCA AGC/--- GATTCTTCTG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AGC 1 0 282094 CASAVA_Build 7 130047438 1I AAAACAAGTT -/A AAAAAAAAAA 1339 het 1339 ref 45 29 4 12 A 11 12 282095 CASAVA_Build 7 130057747 2D TAAGAGGGGG AA/-- AAAAAATAAA 1744 het 1744 ref 21 14 5 4 A 8 6 282096 CASAVA_Build 7 130058636 7D GGTATAGCAG GACTCCA/------- GACTCCAGAC 3070 het 3070 ref 47 23 18 8 GACTCCA 4 3 282097 CASAVA_Build 7 130059090 1I AAATGCTACA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 7 8 282098 CASAVA_Build 7 130059677 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2776 het 2776 ref 29 9 9 11 T 12 13 282099 CASAVA_Build 7 130060079 1D TCTGCTTTTT A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 7 6 282100 CASAVA_Build 7 130060220 1I CATTTCTACC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 7 8 282101 CASAVA_Build 7 130060648 4I GAAAGGTTTG ----/AGAA AGAAAGTAAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AGAA 1 2 282102 CASAVA_Build 7 130068038 1I CCAAGGTCCG -/C CCTGGTGGAT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 C 2 3 282103 CASAVA_Build 7 130077096 7I GCAGCTGTCT -------/CGTGAAC GCCTTCCTCC 3070 hom 135 het 55 0 44 11 CGTGAAC 0 1 282104 CASAVA_Build 7 130086616 2I AGGTGCACAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AT 5 6 282105 CASAVA_Build 7 130086943 1I AGTGGTTCTT -/A AAAGTAGGGG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 4 282106 CASAVA_Build 7 130093223 1I CCCCCAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 847 hom 24 2 13 9 A 14 15 282107 CASAVA_Build 7 130094717 1D GCCTCCTGAG T/- TTTAAGAGAT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 4 3 282108 CASAVA_Build 7 130095969 1I TCCTTGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 T 10 11 282109 CASAVA_Build 7 130096388 1D AGGGATGCCT A/- AAAAAATCAC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 7 6 282110 CASAVA_Build 7 130097272 1I TTTCTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 337 hom 30 2 18 10 A 11 12 282111 CASAVA_Build 7 130097454 18I TCATATCTTC ------------------/TTGTAAATGTGTTTCATT TTTGGCCATT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 TTGTAAATGTGTTTCATT 0 1 282112 CASAVA_Build 7 130102525 4D AGAGGTGAGC TTTA/---- TTTATTTAGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TTTA 3 2 282113 CASAVA_Build 7 130112399 1D CTATGTTTTA T/- AAAAGCAATG 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 1 0 282114 CASAVA_Build 7 130159867 1I GTTTTATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 786 hom 41 4 35 2 T 11 12 282115 CASAVA_Build 7 130165507 1I TTTTTCTTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 8 9 282116 CASAVA_Build 7 130181467 2D CTGAAAAATT TC/-- TCTCTCATGC 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TC 4 3 282117 CASAVA_Build 7 130219160 1D ATAGATTCTT C/- CTGACCGTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 2 1 282118 CASAVA_Build 7 130232157 2I AGGAGCCATG --/AA AAAGAGCTTT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 3 5 282119 CASAVA_Build 7 130250243 1I GCCCAGATAA -/T TTTTTTTTTT 2096 het 2096 ref 32 20 6 6 T 13 14 282120 CASAVA_Build 7 130250528 2I AAAAAAAGGA --/AT AGTCTGTGAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 0 1 282121 CASAVA_Build 7 130252562 1I CATCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 18 1 16 1 T 12 13 282122 CASAVA_Build 7 130266526 1I AAGGTAAGAC -/T TACCTTCTGT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 1 2 282123 CASAVA_Build 7 130291172 1D CAGCTACATT A/- AAAATAGCTA 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 A 5 4 282124 CASAVA_Build 7 130292845 1D TAAAAAAACT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 51 het 19 0 18 9 A 9 8 282125 CASAVA_Build 7 130296686 1D GATGACAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 44 2 30 13 T 12 11 282126 CASAVA_Build 7 130298164 10D TTTTTTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTGGAGACG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 13 3 282127 CASAVA_Build 7 130317533 1I AGATGACTTC -/A AACACATTCC 3070 het 3070 hom 58 24 28 6 A 2 3 282128 CASAVA_Build 7 130327674 1I CATGAGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 28 1 23 4 A 10 11 282129 CASAVA_Build 7 130327872 1D CATCTGACAC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 8 282130 CASAVA_Build 7 130334066 1D TCTATGCTGA T/- TTTTTTCAGA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 7 6 282131 CASAVA_Build 7 130344698 1D ATTGGGGGGT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 62 het 27 0 17 11 G 10 9 282132 CASAVA_Build 7 130347420 1D ACGTCTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 189 hom 28 3 11 14 A 18 17 282133 CASAVA_Build 7 130349047 1I GGTTGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 27 1 23 3 A 13 14 282134 CASAVA_Build 7 130350455 2I ATGCATTCTG --/TT TTTTACATTT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 4 6 282135 CASAVA_Build 7 130359612 1D CATAGCAAAC T/- TTGTAACCTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 3 2 282136 CASAVA_Build 7 130363988 1D CATTCCAGGG A/- AAAAAAAAAA 1943 het 1943 ref 26 13 5 10 A 16 15 282137 CASAVA_Build 7 130365394 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 7 8 282138 CASAVA_Build 7 130369037 1D GAAAAACATG A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 7 6 282139 CASAVA_Build 7 130382619 2I AGTGGGCAAG --/GA GAGAGAAGAA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 GA 3 4 282140 CASAVA_Build 7 130391975 4D ACTGCAGGCA TTTG/---- TTACTTGAAG 3070 het 3070 ref 27 17 9 3 TTTG 1 0 282141 CASAVA_Build 7 130392112 3D GCCTCCTTTT TTG/--- TTGTTATTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTG 2 1 282142 CASAVA_Build 7 130394791 2D ATCAGCACTC TG/-- TGTCTAGCTC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 TG 2 1 282143 CASAVA_Build 7 130396941 2D AGCCAGGTGT GG/-- GGTGGCGGGC 3070 hom 63 het 22 0 21 1 G 4 2 282144 CASAVA_Build 7 130397535 1D CTCACTGCAA G/- GCTCCGCCTC 2668 hom 20 het 13 0 7 6 G 2 1 282145 CASAVA_Build 7 130399525 1D GCAAACCATG T/- TATCTGATAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 2 1 282146 CASAVA_Build 7 130400414 5D20M1I GGTAACTCTC ATGTTATGTGTTTCTTTTTTCACAA-/-----ATGTGTTTTTTTTTTCACAAT TAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 N/A 0 0 282147 CASAVA_Build 7 130403449 8D TGTATGTCTA GAATGAAT/-------- GAGTGAATGA 3070 hom 87 het 32 0 30 5 GAAT 2 0 282148 CASAVA_Build 7 130405245 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAAAATT 3070 hom 38 het 14 0 13 4 A 8 10 282149 CASAVA_Build 7 130405850 1D TGTTCTTGTC A/- AGGGTATTGT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 2 1 282150 CASAVA_Build 7 130407067 2D GCTTAAAATA TG/-- TCTTAAGAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TG 1 0 282151 CASAVA_Build 7 130425568 4D ATAAATTCTC TTTT/---- TTTACATTCT 3070 het 3070 ref 35 17 17 4 T 7 3 282152 CASAVA_Build 7 130453853 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 18 2 15 1 A 13 12 282153 CASAVA_Build 7 130463544 1D ATGGAAAAAC A/- TGTGGCCAGG 2816 het 2816 ref 34 16 10 8 A 1 0 282154 CASAVA_Build 7 130464072 1D TCTGGATAAT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 56 hom 22 1 9 13 A 1 0 282155 CASAVA_Build 7 130484698 11I AATAGTTAAT -----------/TTGATGCCCAG TTGATGCCCA 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 TTGATGCCCAG 0 1 282156 CASAVA_Build 7 130501404 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 27 6 A 10 9 282157 CASAVA_Build 7 130507805 2D TAGTAGAGAC AG/-- GGTTTCACCA 2735 hom 18 het 7 0 6 1 AG 1 0 282158 CASAVA_Build 7 130511198 1I GACTCCACTC -/A AAAAAAAAAC 1337 het 1337 ref 11 5 4 2 A 9 10 282159 CASAVA_Build 7 130512696 1D GAACCTGGGA T/- TGCGGAGGTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 2 1 282160 CASAVA_Build 7 130522623 1I TTCATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 43 0 33 10 T 13 14 282161 CASAVA_Build 7 130524835 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 34 0 21 13 A 11 10 282162 CASAVA_Build 7 130525209 1D CTGGGGGCAA T/- AGGGCTGTCT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 1 0 282163 CASAVA_Build 7 130525759 1D TGCAGCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1819 hom 32 9 12 12 A 15 14 282164 CASAVA_Build 7 130529308 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 276 hom 26 4 14 8 G 0 1 282165 CASAVA_Build 7 130531827 1D GACACATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 46 0 37 10 T 11 10 282166 CASAVA_Build 7 130533855 2D TCCTGTGAAA AC/-- AGTCAGATAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AC 1 0 282167 CASAVA_Build 7 130534206 1I ATTTTAAAAA -/G CAACTTACTC 3070 het 3070 ref 45 29 13 3 G 0 1 282168 CASAVA_Build 7 130534556 2D AACTCACATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 29 1 10 19 A 14 12 282169 CASAVA_Build 7 130540397 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 21 0 20 1 A 12 11 282170 CASAVA_Build 7 130546902 1D AACCCTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1890 hom 38 9 14 16 T 13 12 282171 CASAVA_Build 7 130551722 1D TCTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1632 hom 19 6 9 4 A 15 14 282172 CASAVA_Build 7 130554508 1I26M1I ATTTTGGGTA -TTTTTTACCACAATTTTAAAAATGTT-/TTTTTTTACCACAATTTTAAAAATGTTA AAAAAAAAAA 3070 het 2113 hom 39 8 25 12 N/A 0 0 282173 CASAVA_Build 7 130555752 1I CAATGCCCAC -/A GCAAGTCAAT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 A 0 1 282174 CASAVA_Build 7 130562680 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 8 9 282175 CASAVA_Build 7 130564461 2D TTAGGGATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1599 hom 19 6 10 3 T 13 11 282176 CASAVA_Build 7 130564613 1I CCTCCTCTAG -/C CCCCCCACCT 2518 het 2518 ref 17 9 6 2 C 6 7 282177 CASAVA_Build 7 130581943 1D GATTTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3011 hom 37 10 17 10 T 13 12 282178 CASAVA_Build 7 130595348 2D ATCAGCAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 13 11 282179 CASAVA_Build 7 130606161 1I TTGAATCACC -/T TTTTTTTTTT 2784 het 2635 hom 16 8 7 1 T 10 11 282180 CASAVA_Build 7 130608651 1D AAAAGGTCCA T/- TTTTTTAGCA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 7 6 282181 CASAVA_Build 7 130617806 1D20M1I ATGAATGTTA CCAGATGATTAGAGATCTAGC-/-CAGATGATTAGAGATCTAGCA AAGTTCAGGG 3070 hom 96 het 32 0 31 15 N/A 0 0 282182 CASAVA_Build 7 130622405 5I AACCCTGTCT -----/CAAAA CAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 13 16 CAAAA 3 4 282183 CASAVA_Build 7 130631902 1I AAACTCAGAT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 A 7 8 282184 CASAVA_Build 7 130661002 5D ATTCTGTCTC AAAAA/----- AAAAAAACCA 3070 het 1382 hom 31 6 15 11 A 12 7 282185 CASAVA_Build 7 130661200 1D GGAGAAAAGT G/- GGGGGGGGGT 2747 hom 21 het 21 0 8 14 G 10 9 282186 CASAVA_Build 7 130683830 1D AGTCGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1054 het 1054 ref 44 31 3 10 T 12 11 282187 CASAVA_Build 7 130684501 1I TAAATCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 22 1 17 5 T 12 13 282188 CASAVA_Build 7 130689203 5D GTACCTTTGT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1867 hom 31 12 11 11 A 21 16 282189 CASAVA_Build 7 130696895 1D TCTGGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1929 het 1929 ref 47 28 6 13 T 13 12 282190 CASAVA_Build 7 130699768 1D AGGACTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1701 het 1701 ref 46 35 4 7 T 13 12 282191 CASAVA_Build 7 130708021 1D ATCCCCTAGG T/- TTTTTTTTTT 2866 het 1234 hom 44 12 10 22 T 19 18 282192 CASAVA_Build 7 130715366 1D TTGCTCTGGG C/- TGAAGACCCT 3070 hom 81 het 33 0 26 7 C 1 0 282193 CASAVA_Build 7 130735357 1I ATAGTATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 10 11 282194 CASAVA_Build 7 130760592 1I AAAAGCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 13 13 T 10 11 282195 CASAVA_Build 7 130763161 1I TTGGAAACGC -/A CTATTATTGC 3070 hom 27 het 12 0 8 4 A 0 1 282196 CASAVA_Build 7 130791344 1D GACTCTGTCT C/- CAAACCAAAA 3070 hom 12 het 26 1 21 4 C 2 1 282197 CASAVA_Build 7 130805181 1I TCAGTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 23 9 T 12 13 282198 CASAVA_Build 7 130815150 4D ATAATAAATT TAAA/---- TAAATAAATA 1613 hom 10 het 5 0 4 1 TAAA 6 5 282199 CASAVA_Build 7 130821395 2D GGAGAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 1236 het 1236 ref 30 16 4 10 AG 10 9 282200 CASAVA_Build 7 130832367 2I GAAGTGTTGC --/AA AGTTTGGGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 3 282201 CASAVA_Build 7 130842095 1D GGGCTGCCCT C/- CCAGCTAAGG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 C 3 2 282202 CASAVA_Build 7 130842991 1I AGTGTCTCAC -/A AACAATCACA 3070 het 2001 hom 28 6 13 9 A 2 3 282203 CASAVA_Build 7 130853000 2D GCTGTGTCAC TG/-- TGATCTCTGG 3070 het 3070 hom 43 15 16 12 TG 2 1 282204 CASAVA_Build 7 130853048 1D TGCGTAACTC T/- TTTTTTTTTT 2953 het 2953 ref 25 11 9 6 T 12 11 282205 CASAVA_Build 7 130861507 1D AAGAAGTGCT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 124 het 47 0 42 5 A 8 7 282206 CASAVA_Build 7 130861807 1I CATTTTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 11 12 282207 CASAVA_Build 7 130864391 2D GATGAGAAAA TG/-- TTGAGAAACA 3070 hom 111 het 41 0 37 5 TG 1 0 282208 CASAVA_Build 7 130872612 1I CTGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 11 12 282209 CASAVA_Build 7 130872888 5D CAAGACTCCG CCCCA/----- CCCCACCCCA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 CCCCA 3 2 282210 CASAVA_Build 7 130879937 20D GCAGGGCCTC CGCACGCACGCCCTGTACTA/-------------------- CGCACGCACG 3070 hom 114 het 50 0 35 18 CGCACGCACGCCCTGTACTA 2 1 282211 CASAVA_Build 7 130884124 6I TGCCCATATG ------/CCTGTT CCCCCAGGAC 3070 hom 66 het 28 0 20 8 CCTGTT 0 1 282212 CASAVA_Build 7 130911540 1I CTGGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2546 het 506 hom 35 2 18 15 T 15 16 282213 CASAVA_Build 7 130922865 3I GTGCTGTGGT ---/GTG GTGTGTGTGG 3070 hom 151 het 59 0 46 13 GTG 1 2 282214 CASAVA_Build 7 130923048 9D CGTGTGGTAT GTGTGTGTA/--------- GTGTGGGTGT 2970 het 2970 ref 54 21 13 27 GTGTGTGTA 1 0 282215 CASAVA_Build 7 130923087 9D GTGTGTGGTA TGTGTGGTG/--------- TGTGTGGTGT 3070 hom 109 het 46 0 29 24 TGTGTGGTG 2 1 282216 CASAVA_Build 7 130925858 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 10 9 282217 CASAVA_Build 7 130926183 2I CAGGGTCTTG --/CT CTGTCACCCA 3070 hom 24 het 10 0 8 2 CT 1 2 282218 CASAVA_Build 7 130954006 1D AGTACTTGGG A/- TGAGGTAGGT 3070 het 3070 hom 22 9 9 5 A 1 0 282219 CASAVA_Build 7 130956466 1D AAAATGTCTT G/- GGTAATAAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 3 2 282220 CASAVA_Build 7 130959376 4D CTAGAGTTTC TGTG/---- TGTTCACTGA 3070 hom 87 het 31 0 29 4 TG 3 1 282221 CASAVA_Build 7 130960588 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 83 hom 15 1 8 6 A 13 12 282222 CASAVA_Build 7 130960726 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 13 0 11 2 T 13 12 282223 CASAVA_Build 7 130962394 4D CTTGGAAGAC AAAT/---- AAAATGACAC 3070 hom 84 het 33 0 29 6 AAAT 1 0 282224 CASAVA_Build 7 130963930 1D TCTGTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 45 1 32 12 T 12 11 282225 CASAVA_Build 7 130969628 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 96 het 43 0 30 16 TCTT 4 3 282226 CASAVA_Build 7 130974997 2D CCTGTAATCC CA/-- CACTCTGGGA 3070 hom 60 het 25 0 19 6 CA 2 1 282227 CASAVA_Build 7 130975318 1D GATCATGCCA C/- TGCACTCCAG 1017 het 9 hom 7 0 3 4 C 1 0 282228 CASAVA_Build 7 130975358 1I CTCCATCTCG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 8 9 282229 CASAVA_Build 7 130984385 3I AAAAGAGAAA ---/AAT AATTGCCAAA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AAT 1 2 282230 CASAVA_Build 7 130989288 4D TTGTGTGTGC TGTA/---- TGTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 53 22 28 4 TGTA 1 0 282231 CASAVA_Build 7 130989491 4D61M2D CATTATGTGT TGTGTGTATGTTGCGTGTGTTGTGTGTTGTCTGGTACATTGTATTGTGGGTGTGTGTTGTAGGGATG/----TGTATGTTGCGTGTGTTGTGTGTTGTCTGGTACATTGTATTGTGGGTGTGTGTTGTAGGGA-- TGTGTGTTGT 3070 het 236 hom 58 2 77 22 N/A 0 0 282232 CASAVA_Build 7 130989782 3I TATGTGATAT ---/GTG GTGCATTGTG 3070 hom 161 het 60 0 47 13 GTG 1 2 282233 CASAVA_Build 7 130989850 10I20M1I8M1D TATGTGTGGT ----------TTGTGTTGTGGGTATGTGTG-TGTAGCTGA/ATGTGTTGGGTTGTGTTGGGGGTATGTATGTTGTGTGTG- TGTTGGGATG 713 het 713 ref 63 57 3 14 N/A 0 0 282234 CASAVA_Build 7 130996099 1I GTTGCTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 32 1 26 5 T 10 11 282235 CASAVA_Build 7 130996258 1D GCCCTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 16 11 T 11 10 282236 CASAVA_Build 7 130997838 1D TGTGATGGCA C/- CATACCCCTT 3070 hom 53 het 26 0 20 6 C 2 1 282237 CASAVA_Build 7 131000382 1D GTTTAATTGA T/- TTACAGTCCC 3070 hom 75 het 30 0 25 6 T 3 2 282238 CASAVA_Build 7 131002560 21D TCTTTTGTTT AATTGTTTAATTGTTTAATTG/--------------------- TTTAATTACC 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AATTGTTTAATTGTTTAATTG 1 0 282239 CASAVA_Build 7 131003970 1I AGAACATGCC -/T TAACTAATTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 1 2 282240 CASAVA_Build 7 131015387 3I GAGGGAGAAG ---/GAA GAAGTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 GAA 1 2 282241 CASAVA_Build 7 131019871 1I AGGAATAGAG -/A TCCTCTTTCT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 A 0 1 282242 CASAVA_Build 7 131022152 2I CCAGTCTCTT --/AA AAAAAAAAAA 2927 het 739 hom 17 3 10 4 A 10 12 282243 CASAVA_Build 7 131023086 1I AAACCAAAGG -/T TTTTTTTTTA 2192 het 2192 ref 26 12 7 7 T 9 10 282244 CASAVA_Build 7 131026374 1D TGGCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 33 1 21 11 T 13 12 282245 CASAVA_Build 7 131030985 1I GGCTTCCATA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 6 7 282246 CASAVA_Build 7 131043450 1I ACCTGCAATA -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 1 2 282247 CASAVA_Build 7 131056550 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 46 1 26 20 T 16 14 282248 CASAVA_Build 7 131091026 2D TTGATTATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 14 12 282249 CASAVA_Build 7 131092053 1D CCACTAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 8 7 T 13 12 282250 CASAVA_Build 7 131109794 2D AGTTTGACTC TT/-- TTCGTCGACA 3070 hom 86 het 32 0 27 7 T 4 2 282251 CASAVA_Build 7 131119353 7D TGTAGTACAC TTATGTG/------- ATCACGTGGT 3070 hom 141 het 52 0 48 7 TTATGTG 1 0 282252 CASAVA_Build 7 131131921 9D GGCCAATAAG CCAAGTCTC/--------- CCAGAACAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 5 CCAAGTCTC 1 0 282253 CASAVA_Build 7 131136119 3I GAAGTATAAC ---/TCT TCTTCCATGC 3070 hom 150 het 56 0 48 8 TCT 1 2 282254 CASAVA_Build 7 131141015 2D TGATGAAGAC AG/-- GGTGCATTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AG 1 0 282255 CASAVA_Build 7 131146874 1I TGAGGTTTTT -/G TTTTTCCTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 0 1 282256 CASAVA_Build 7 131154376 1I CTCCTACCCT -/C TCGCAGAGAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 0 1 282257 CASAVA_Build 7 131158414 2I AGTGGTGGCC --/TT TTTTTTTTTT 1979 het 312 hom 21 3 9 9 T 14 16 282258 CASAVA_Build 7 131183659 2I ATTACTTCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 25 0 15 10 T 11 13 282259 CASAVA_Build 7 131185853 1I CATGGGGCCT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 21 1 18 2 A 0 1 282260 CASAVA_Build 7 131188421 1D GTAATGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 607 hom 42 3 30 9 T 12 11 282261 CASAVA_Build 7 131203507 8I GAAATGAAGG --------/TCTTATGA TCTGCAATCA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 TCTTATGA 0 1 282262 CASAVA_Build 7 131217499 4I ATCCCCAGGC ----/TGTT TGTTAGTCTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TGTT 1 2 282263 CASAVA_Build 7 131219428 5D GTAAAATAAT ATGTC/----- AGAAAAAACA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 ATGTC 1 0 282264 CASAVA_Build 7 131223226 2D GTTCATGATG GA/-- GAGGGTGCTA 3070 hom 108 het 43 0 36 8 GA 2 1 282265 CASAVA_Build 7 131226666 1D ACACTACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 46 1 38 7 T 12 11 282266 CASAVA_Build 7 131234195 1I GTATCTCCCC -/A AATTGATATG 3070 hom 135 het 51 0 44 7 A 2 3 282267 CASAVA_Build 7 131242026 1I ACACCCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 34 1 23 10 T 12 13 282268 CASAVA_Build 7 131251496 1D TATCCCTAGC A/- AAAAATATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 6 5 282269 CASAVA_Build 7 131251581 1I TCATTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 35 1 30 4 T 11 12 282270 CASAVA_Build 7 131258822 1D TCCCACCAAT A/- AGTGTGCAAG 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 2 1 282271 CASAVA_Build 7 131259980 1I ACAAAGCTGC -/A GTAATAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 282272 CASAVA_Build 7 131266473 19D CACGGGAAGA GGCTTCTTGTCCTTGGAAG/------------------- GGCTTCTTGT 3070 hom 123 het 48 0 39 16 GGCTTCTTGTCCTTGGAAG 1 0 282273 CASAVA_Build 7 131279705 1I CACCTTATAG -/T TTGTTCACCA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 2 3 282274 CASAVA_Build 7 131283185 1D GTAAACACCA C/- CCCCCATGGG 3070 hom 118 het 47 0 39 8 C 6 5 282275 CASAVA_Build 7 131295753 1D ACACTGTGGG C/- CCCTGGGGGC 3070 hom 92 het 37 0 30 7 C 4 3 282276 CASAVA_Build 7 131295899 1I TCCTTCAGGC -/T TTGTTCCTCA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 2 3 282277 CASAVA_Build 7 131299129 2I CCCCAAGTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 13 15 282278 CASAVA_Build 7 131300452 1D TGCTCTTCTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 114 het 44 0 38 7 T 8 7 282279 CASAVA_Build 7 131302921 1D AAACATTAGA G/- AGGATTGATG 3070 hom 114 het 39 0 39 0 G 1 0 282280 CASAVA_Build 7 131304091 1I CCAGCCTGGG -/C CCACAGAGTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 2 3 282281 CASAVA_Build 7 131305339 3I CCTCCCACTC ---/CTT CTCTAGTCAC 3070 hom 55 het 30 0 19 11 CTT 0 1 282282 CASAVA_Build 7 131305367 3D10M1I GTTGTCTGTT CCCCCCTCTATAA-/---CCCTCTATAAT TTTTTTTTAA 3070 het 77 hom 32 1 11 26 N/A 0 0 282283 CASAVA_Build 7 131353882 1I GTAATTGCAG -/T TTTTGCCATT 3070 hom 7 het 20 1 13 6 T 4 5 282284 CASAVA_Build 7 131360665 2D CTAGTGGCCT GG/-- CCTTTTAAAT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 2 0 282285 CASAVA_Build 7 131363477 1I CTTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 915 hom 41 3 33 5 T 9 10 282286 CASAVA_Build 7 131387613 1D AGGTTTCTTT G/- GGGAGGGAGT 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 G 4 3 282287 CASAVA_Build 7 131402432 1D CCCTCGGCAA G/- GGACAGTCAT 3070 hom 87 het 34 0 25 10 G 3 2 282288 CASAVA_Build 7 131415018 1D CTATGACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 98 het 44 0 34 10 T 11 10 282289 CASAVA_Build 7 131440826 1D ATCAGGGGCA G/- GGGGGGAAGA 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 G 7 6 282290 CASAVA_Build 7 131445150 1I GACTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 2768 het 1173 hom 20 7 9 4 A 14 15 282291 CASAVA_Build 7 131450432 1D TGGCAGTCCC T/- AAATCTGCTG 3070 het 3070 hom 43 14 17 12 T 1 0 282292 CASAVA_Build 7 131456060 1I CGGGCACGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 117 het 41 0 37 4 G 1 2 282293 CASAVA_Build 7 131460302 3I TCCCTCTAAT ---/AAA AAAATAATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 4 7 282294 CASAVA_Build 7 131460336 1D AATTTGTAGT A/- AAAAAAAAAA 975 het 975 ref 26 10 3 13 A 13 12 282295 CASAVA_Build 7 131463151 1D ACAAAAACAT G/- GAATAAAATA 3070 het 1982 hom 28 7 11 11 G 2 1 282296 CASAVA_Build 7 131463195 3D AATAACAATA ATC/--- ATCATCCAGT 3070 hom 72 het 29 0 25 6 ATC 3 2 282297 CASAVA_Build 7 131463825 12D ATGGATGAGC AAGGGGAAAGAG/------------ AAGGGGAACA 3070 hom 94 het 41 0 31 13 AAGGGGAAAGAG 1 0 282298 CASAVA_Build 7 131489713 2D AAACGTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 37 2 22 15 T 16 14 282299 CASAVA_Build 7 131496235 1D GAAAAAAAAA C/- CCCTGAAATC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 4 3 282300 CASAVA_Build 7 131512475 4D CACGAGTGAG TGTA/---- TGTGAGTGTG 3070 het 3070 ref 58 30 25 5 TGTA 1 0 282301 CASAVA_Build 7 131530480 1D AGATATATGT G/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 G 1 0 282302 CASAVA_Build 7 131541350 2D TGCACACACA CG/-- CATAGACACA 3070 hom 147 het 51 0 50 4 CG 1 0 282303 CASAVA_Build 7 131569218 5I CCAGATGATC -----/CCAAA CCAAACCAAA 3070 het 3070 ref 43 25 10 8 CCAAA 3 4 282304 CASAVA_Build 7 131577121 1D TATTTCTCCT C/- CTACCCACAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 C 2 1 282305 CASAVA_Build 7 131579200 1D CTGGGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 9 21 9 T 11 10 282306 CASAVA_Build 7 131584155 1D CAGAAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 11 10 282307 CASAVA_Build 7 131618892 7D TCATGACAGA ACAGCAC/------- ACACAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 ACAGCAC 1 0 282308 CASAVA_Build 7 131631741 1I TTAATTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 13 14 282309 CASAVA_Build 7 131636792 1D GCACAAAAAA G/- GTTAAATAAC 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 G 2 1 282310 CASAVA_Build 7 131643095 5D CATGAGGTAC TTTGT/----- TTTGATTTCC 3070 het 3070 hom 41 20 19 4 TTTGT 1 0 282311 CASAVA_Build 7 131662414 1I AAAGAAATGT -/G GGAAGGAAAA 2932 het 2932 ref 29 17 9 3 G 2 3 282312 CASAVA_Build 7 131689478 2I GGCACCAACA --/GT GTGTGTGCGT 3070 het 3070 hom 43 13 20 10 GT 3 4 282313 CASAVA_Build 7 131705367 2D ACTCTGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 1894 het 284 hom 23 4 7 12 A 18 16 282314 CASAVA_Build 7 131715765 1D GAAGGACCAA G/- GCACCGAGGG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 2 1 282315 CASAVA_Build 7 131717325 1I AGGAGGGGGG -/A AAAACACAGA 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 4 5 282316 CASAVA_Build 7 131748319 1I CTTGATAGAT -/G GGGGGGTGGA 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 G 6 7 282317 CASAVA_Build 7 131764704 3I AGGGTCAGAT ---/AAG AAATAGTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 19 2 AAG 0 1 282318 CASAVA_Build 7 131766826 1D GAGGAAGGGA G/- GGGGAAGACG 3070 het 3070 hom 65 29 29 7 G 5 4 282319 CASAVA_Build 7 131774794 7I TATGCATATA -------/TATACAT TATACATACG 3070 het 3070 ref 54 28 23 3 TATACAT 1 2 282320 CASAVA_Build 7 131783125 1I ACCTGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 20 1 14 5 A 13 14 282321 CASAVA_Build 7 131784326 5I TTTGAATTGA -----/ATTGG ATTGGATTGG 3070 het 3070 ref 48 26 14 8 ATTGG 2 3 282322 CASAVA_Build 7 131817995 1I TTCGAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 30 0 22 8 T 15 16 282323 CASAVA_Build 7 131836395 2I TGCATGAGGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 54 26 16 12 GT 5 6 282324 CASAVA_Build 7 131844316 3I TAATGACATG ---/ATA ATAATAGCAG 3070 hom 74 het 31 0 23 8 ATA 2 3 282325 CASAVA_Build 7 131846332 9D CTTTGCAGAA GGAGAGTTT/--------- GGAGCTGAGG 1949 het 1949 ref 37 25 8 6 GGAGAGTTT 1 0 282326 CASAVA_Build 7 131854219 8D CCTGGCCAAG TCTGCCGT/-------- TCCCAGTAGA 3070 het 3070 ref 45 21 14 12 TCTGCCGT 1 0 282327 CASAVA_Build 7 131885071 4D TTGGGGTGAG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 66 het 34 0 22 13 TTGT 5 4 282328 CASAVA_Build 7 131886106 10D CTCATCCAAT TTGGGACTTA/---------- TTGCAGTGCA 3070 hom 123 het 42 0 40 3 TTGGGACTTA 1 0 282329 CASAVA_Build 7 131892830 5D TGAATTTTCC TTTAA/----- TTTATCTTTT 3070 het 91 hom 31 1 15 16 TTTAA 1 0 282330 CASAVA_Build 7 131906397 1I GGAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1087 het 1087 ref 33 23 3 7 A 11 12 282331 CASAVA_Build 7 131927819 1I TAATTTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 468 hom 36 2 25 9 T 13 14 282332 CASAVA_Build 7 131928611 1D CTCACTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 32 1 28 4 A 11 10 282333 CASAVA_Build 7 131936584 1D GAGTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 32 1 24 7 A 11 10 282334 CASAVA_Build 7 131938549 1I CTCTTTATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 9 10 282335 CASAVA_Build 7 131938598 1D ATTAATTCCA C/- CCCGGGAAGA 3070 hom 52 het 30 0 18 13 C 4 3 282336 CASAVA_Build 7 131939164 1D GGCCTTGAGC A/- AATCACTTAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 3 2 282337 CASAVA_Build 7 131939434 2D TCCACTACCC CT/-- CTGTGTTCTG 3070 hom 115 het 42 0 33 10 CT 2 1 282338 CASAVA_Build 7 131947387 1I GAAAAACAAG -/A GCAAAATGTC 3070 hom 165 het 60 0 55 5 A 0 1 282339 CASAVA_Build 7 131990635 6D CCTCCATCCC CTCCCA/------ CTCCATTACC 3070 het 3070 hom 39 16 22 3 CTCCCA 1 0 282340 CASAVA_Build 7 131991623 2D ACATACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 13 12 13 AC 10 9 282341 CASAVA_Build 7 131994348 2I TATATGTGAC --/TT TTGTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 2 4 282342 CASAVA_Build 7 132002585 1D GAAAAACAGA T/- TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 46 20 19 9 T 7 6 282343 CASAVA_Build 7 132003597 1D CCCACATTTT A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 38 10 21 7 A 7 6 282344 CASAVA_Build 7 132024005 2D GGAACTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 29 1 20 8 T 14 12 282345 CASAVA_Build 7 132024124 1D CAGCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 25 0 20 7 A 12 11 282346 CASAVA_Build 7 132032231 1I GTAATCTGGG -/A AAAAAAAAAA 2355 het 2355 ref 28 13 8 7 A 13 14 282347 CASAVA_Build 7 132033498 2D GAGATGCAGA CT/-- CTGTTGAAAG 2108 het 2108 ref 25 16 5 5 CT 2 1 282348 CASAVA_Build 7 132033588 10D GGAGAAAGAA AGGAGGAAAG/---------- AGAGAGAGAG 897 het 897 ref 26 17 4 9 AGGAGGAAAG 1 0 282349 CASAVA_Build 7 132047603 1D CTCAAAAAAA T/- AAAATTGTAT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 1 0 282350 CASAVA_Build 7 132047861 2D ATCAGAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 1376 hom 24 het 12 0 7 5 T 18 16 282351 CASAVA_Build 7 132052326 5D ATTTCTTGGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2465 het 205 hom 33 3 9 24 T 21 16 282352 CASAVA_Build 7 132055358 1D CGATGTGGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 58 het 34 0 20 15 T 9 8 282353 CASAVA_Build 7 132055396 1I AAGAGGTCTC -/T TTTTTTTTTT 1317 het 1317 ref 29 7 6 16 T 11 12 282354 CASAVA_Build 7 132084439 1D TCTAGCTTTA G/- GCTGCCTCCC 3070 hom 93 het 35 0 31 5 G 2 1 282355 CASAVA_Build 7 132092531 1D ATCACATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 11 10 282356 CASAVA_Build 7 132105326 1I TCAACAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 12 13 282357 CASAVA_Build 7 132112577 1I40M1D TCTGAGTCGG -TTGTCTCTCACCTCAGTGGCCATTCTCTCACATTCCTCTTG/TTTGTCTCTCACCTCAGTGGCCATTCTCTCACATTCCTCTT- GGCCAGCTCC 3070 hom 132 het 41 0 43 9 N/A 0 0 282358 CASAVA_Build 7 132116714 1D21M1D10M1D ACCCTGTTTC AAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGGCCAAAAAAG/-AAAAAAAAAAAGGAAAAAAAA-GGCCAAAAAA- GGAAAAAAAG 3070 hom 90 het 29 0 30 6 N/A 0 0 282359 CASAVA_Build 7 132142497 1I TTGGGGGAGG -/C CCCCGCTGCC 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 C 4 5 282360 CASAVA_Build 7 132144038 1D TTTATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1459 hom 28 6 17 5 T 11 10 282361 CASAVA_Build 7 132148313 1I TCTCATAGCA -/T TTGACAGCAC 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 2 3 282362 CASAVA_Build 7 132157047 10D AGCACTCAAA TCTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1518 het 1426 hom 27 12 7 8 TCTTTTTTTT 1 0 282363 CASAVA_Build 7 132166698 1I ATTAGATCCA -/T TTCACACAGC 3070 het 3070 hom 55 24 24 7 T 2 3 282364 CASAVA_Build 7 132176702 1D GAACTCATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1046 hom 36 4 18 14 A 13 12 282365 CASAVA_Build 7 132185747 4D GGTTTTTTTT TTTG/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 25 1 22 3 TTTG 1 0 282366 CASAVA_Build 7 132197113 1D TTCTTTTGAA T/- TTTTTCCCCA 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 6 5 282367 CASAVA_Build 7 132213660 2D AAGAAGAAGT CA/-- CACACAATCA 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 CA 4 3 282368 CASAVA_Build 7 132217762 20D CAATATATTC TATATATATATATATATATA/-------------------- TATATATATA 3070 het 60 hom 22 2 15 9 TA 19 9 282369 CASAVA_Build 7 132222010 1I GATATATATA -/T TTTTTGTGTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 5 6 282370 CASAVA_Build 7 132222949 5I ATATACACAA -----/ATAAT ATAAACTAGA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 ATAAT 0 1 282371 CASAVA_Build 7 132232688 2D AAATTTAGAC TT/-- AATGTTCACA 3070 het 3070 ref 46 20 20 8 T 2 0 282372 CASAVA_Build 7 132235531 48I GCTGCTAACC ------------------------------------------------/AAATCACACTCATTCTTATCTTCTATATAAAAATGAGAAAGGCCAGAA AATAATCAGG 3070 het 3070 hom 46 24 20 4 AAATCACACTCATTCTTATCTTCTATATAAAAATGAGAAAGGCCAGAA 0 1 282373 CASAVA_Build 7 132238637 1I TATATTGGGG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 7 8 282374 CASAVA_Build 7 132257861 1D CTCTCTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1700 hom 42 9 21 12 T 13 12 282375 CASAVA_Build 7 132268607 2D CAGTTCTGCC AT/-- AGTTTTATAA 3070 het 3070 hom 50 18 24 9 AT 1 0 282376 CASAVA_Build 7 132273881 18I AAGTACATCA ------------------/CCATCAAAACTCAGGAGT CCCAGGTAAA 3070 het 3070 ref 40 24 14 4 CCATCAAAACTCAGGAGT 0 1 282377 CASAVA_Build 7 132288409 1D TCCATCAAGG A/- AAATTCCTCA 3070 het 3070 hom 50 17 28 5 A 4 3 282378 CASAVA_Build 7 132304459 1D TTTTACTGTG T/- TTTTTTTTTT 1493 het 318 hom 22 5 4 13 T 12 11 282379 CASAVA_Build 7 132314874 1D GGGGAAGGAG A/- AAGTGTCTTA 3070 het 3070 hom 47 20 23 5 A 3 2 282380 CASAVA_Build 7 132321725 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2922 hom 27 11 13 3 A 15 14 282381 CASAVA_Build 7 132324701 1D GATGCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 12 11 282382 CASAVA_Build 7 132329302 4D CATTAAAGGG TTAC/---- TTAAAGAATT 3070 het 3070 hom 42 15 23 5 TTAC 1 0 282383 CASAVA_Build 7 132329997 4D TATTATTAGC TAGT/---- TAAACATAGG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 TAGT 1 0 282384 CASAVA_Build 7 132343670 1D TTAAGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 31 1 22 8 A 11 10 282385 CASAVA_Build 7 132349858 2I ATGTGATGAC --/TT TGACTATCAT 3070 het 3070 hom 47 16 28 3 T 1 3 282386 CASAVA_Build 7 132351262 3D GAGAGGGACT GTC/--- ACACACTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 GTC 1 0 282387 CASAVA_Build 7 132407564 1D AATAAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 19 1 16 4 A 11 10 282388 CASAVA_Build 7 132412355 4D TACTCCCAAA TAGT/---- TAGTTAAGAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 TAGT 2 1 282389 CASAVA_Build 7 132413203 1I AAGACCCTAC -/A AATACCATGA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 2 3 282390 CASAVA_Build 7 132423003 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 16 2 13 1 A 16 17 282391 CASAVA_Build 7 132429095 1I AAACATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 21 2 13 6 T 15 16 282392 CASAVA_Build 7 132450297 8I TAAATGTAGT --------/ATGCTACC ATGCTACCAG 3070 hom 92 het 39 0 28 11 ATGCTACC 1 2 282393 CASAVA_Build 7 132462363 2I GATAAGATAC --/TT TTTATTTTTT 3070 het 158 hom 17 1 12 4 T 3 5 282394 CASAVA_Build 7 132463754 1I GCTCCGTCTC -/G GGAAAAAAAA 3070 hom 33 het 26 0 18 8 G 2 3 282395 CASAVA_Build 7 132465323 5D ATAAATAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 21 het 9 0 8 2 AAATA 5 4 282396 CASAVA_Build 7 132469942 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 442 hom 20 1 14 5 A 10 11 282397 CASAVA_Build 7 132470082 1I TGGATCCCCC -/A ACTGTGTGGG 3070 hom 90 het 33 0 29 4 A 1 2 282398 CASAVA_Build 7 132483540 1I ATTTCTTTTT -/A ATCACTGAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 1 2 282399 CASAVA_Build 7 132486885 4D CTGGGTGACA GAGT/---- GAGTGAGACC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 GAGT 2 1 282400 CASAVA_Build 7 132487269 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2589 hom 27 het 11 0 10 1 A 16 14 282401 CASAVA_Build 7 132490860 1I TCTGAGAGCC -/A AAGTTCATCC 3070 hom 171 het 62 0 56 6 A 2 3 282402 CASAVA_Build 7 132493856 3D CTCTTTTTTA TTC/--- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 19 9 8 4 TTC 1 0 282403 CASAVA_Build 7 132502346 1D AAGAATCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 T 12 11 282404 CASAVA_Build 7 132503290 1I GATACTGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 10 11 282405 CASAVA_Build 7 132504797 1I TGCTGGGTTC -/T GAGCCACATC 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 0 1 282406 CASAVA_Build 7 132509805 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2193 het 2193 ref 14 7 5 2 T 9 10 282407 CASAVA_Build 7 132514194 1I ATATTTAGCA -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 44 13 21 10 C 7 8 282408 CASAVA_Build 7 132521947 12I GAGGAGGAGG ------------/AGAGGAAGATGA AGAGGAAGAG 3070 hom 92 het 37 0 28 9 AGAGGAAGATGA 0 1 282409 CASAVA_Build 7 132523035 1D GAATACACAC A/- AGGAAACACC 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 A 2 1 282410 CASAVA_Build 7 132560022 1I TCTTTAACCA -/T TGCTTCAAAG 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 1 2 282411 CASAVA_Build 7 132578317 1I ACTATACCTC -/T TGCTGCCATG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 1 2 282412 CASAVA_Build 7 132585540 1D TCCACATTGA T/- TTTTTTTTTT 1062 het 1062 ref 30 24 4 4 T 13 12 282413 CASAVA_Build 7 132591620 3D CTTTGATTAT CTC/--- CTCCTATCTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 CTC 2 1 282414 CASAVA_Build 7 132592533 1D ATGGAACTAA C/- CGGGGGGGAC 3070 het 2740 hom 35 9 19 7 C 2 1 282415 CASAVA_Build 7 132592939 1I TTGGGAAGAC -/A AACTTTGGTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 2 3 282416 CASAVA_Build 7 132598162 2I GTCCTCACCC --/AA AAATCTCATC 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 3 5 282417 CASAVA_Build 7 132599084 1I GGTGGGAAAC -/A AGGTTGATTG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 1 2 282418 CASAVA_Build 7 132612211 1I GCTCTTAACC -/T TTTTGGAAGC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 4 5 282419 CASAVA_Build 7 132622594 2D ATCAGTCTAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TA 7 6 282420 CASAVA_Build 7 132641077 1I GTAAGCTCCC -/T TTTGTTAGTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 3 4 282421 CASAVA_Build 7 132672932 3D CTTCCTTCCC TTT/--- TTTTTTTTTT 1594 het 147 hom 19 2 6 11 T 19 16 282422 CASAVA_Build 7 132678008 1D GCTTTGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 34 0 29 5 T 11 10 282423 CASAVA_Build 7 132684425 1D GATTTAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 665 hom 48 3 34 13 T 12 11 282424 CASAVA_Build 7 132694076 1D GAGTTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 44 1 37 8 T 11 10 282425 CASAVA_Build 7 132716559 3I CAGTACTGAG ---/TAA TATTAAGCTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAA 0 1 282426 CASAVA_Build 7 132720006 1D TGAATTGGTC T/- TTTTTTTTTT 481 het 481 ref 38 18 3 17 T 14 13 282427 CASAVA_Build 7 132721033 1D AGTCAAATAT G/- GAAGTCGGCT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 G 2 1 282428 CASAVA_Build 7 132722120 1I GAAAGGAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2853 hom 41 7 17 17 T 11 12 282429 CASAVA_Build 7 132723305 1I TACCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2931 hom 25 7 12 6 A 10 11 282430 CASAVA_Build 7 132736946 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2384 het 2384 ref 28 11 9 8 A 13 14 282431 CASAVA_Build 7 132776292 1I ACCCTCTCTT -/G GGATGTGGAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 2 3 282432 CASAVA_Build 7 132781310 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1936 hom 39 7 19 13 A 16 17 282433 CASAVA_Build 7 132783600 1I TTCATATGTC -/T TTTTTTTTTT 780 het 780 ref 45 36 3 7 T 10 11 282434 CASAVA_Build 7 132786516 1D ATTGTGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 12 11 282435 CASAVA_Build 7 132786802 2I TTGTTAATAT --/AA GAGAAAATTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 2 282436 CASAVA_Build 7 132788294 1D AGTCTGTAAG T/- TTTATCATGA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 4 3 282437 CASAVA_Build 7 132802521 1I TTATTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 12 14 T 13 14 282438 CASAVA_Build 7 132803655 2I AATATTTTAG --/AT GTTATACAAC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AT 0 1 282439 CASAVA_Build 7 132812267 3I TTGCATGTGA ---/TTC TTCTCCCTGT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 TTC 1 2 282440 CASAVA_Build 7 132816691 1I TTTTACTGTC -/T TTGATGCGTT 3070 hom 135 het 55 0 46 9 T 2 3 282441 CASAVA_Build 7 132824308 5D TGAATCTAAT ATATA/----- ATATCTAATA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 ATATA 1 0 282442 CASAVA_Build 7 132828269 2D GTTCGGAGTG GT/-- GGGTCTCTGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GT 1 0 282443 CASAVA_Build 7 132844856 1D ATGTCTTAGT G/- GGCCATCCCG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 3 2 282444 CASAVA_Build 7 132852995 1I GATTCAATTA -/C CCCCCCACTG 3070 hom 106 het 40 0 35 5 C 6 7 282445 CASAVA_Build 7 132872448 1D TATATCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1629 hom 32 6 17 9 T 11 10 282446 CASAVA_Build 7 132872657 1D TCCCCATATT G/- GGCCAACCTG 3070 hom 44 het 18 0 15 3 G 3 2 282447 CASAVA_Build 7 132879025 3D CTTGTCACTT CTC/--- CTCTATAGCC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CTC 2 1 282448 CASAVA_Build 7 132880126 1D TTTCCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 35 1 18 16 T 15 14 282449 CASAVA_Build 7 132926501 1D ATTTTTAAAA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 8 7 282450 CASAVA_Build 7 132939300 1D AATTTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 13 12 282451 CASAVA_Build 7 132957674 1I AGGTTGCAAA -/C CTTTGTTTTT 3070 hom 124 het 44 0 41 3 C 1 2 282452 CASAVA_Build 7 132960202 1I CATCTCTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 16 3 A 11 12 282453 CASAVA_Build 7 132963373 1D AAATGTTTAA T/- TTAGAAGAAG 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 T 3 2 282454 CASAVA_Build 7 132968993 2D CCTGGGCAAC AA/-- GAGCGAAACT 3070 hom 60 het 23 0 21 4 A 2 0 282455 CASAVA_Build 7 132970270 1D TCTAGAAGAC T/- TTTAAGACGA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 4 3 282456 CASAVA_Build 7 132971530 1I TCATTTCTTT -/C CAGAAATTTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 1 2 282457 CASAVA_Build 7 132976152 2D AAATCGACAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 45 het 31 0 19 13 TC 7 6 282458 CASAVA_Build 7 132976165 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 289 hom 28 2 14 12 C 1 0 282459 CASAVA_Build 7 132976725 2I CTGAGCACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 AT 5 6 282460 CASAVA_Build 7 132978609 2D GCTAGGTCAG TC/-- TCTCTTTTCA 3070 het 3070 ref 59 31 23 5 TC 3 2 282461 CASAVA_Build 7 132980981 2I GTTAGGAATT --/CA CACACAGTTC 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 CA 3 4 282462 CASAVA_Build 7 132981349 3I CTCCCCAAAC ---/CCA AGCATACATA 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 CCA 0 1 282463 CASAVA_Build 7 132984755 4I GCATTACTAC ----/TTTT TTTTTCTTTT 3070 hom 53 het 37 0 22 15 T 5 9 282464 CASAVA_Build 7 132986661 5D AATAAGAAAA AAAAC/----- ACAACACCTA 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 AAAAC 1 0 282465 CASAVA_Build 7 132987732 1I CACAGCAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 11 12 282466 CASAVA_Build 7 132990479 4I ACTTTATTTA ----/AAAT AAATAAACTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AAAT 1 2 282467 CASAVA_Build 7 132995471 1I TTTTCATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 37 1 25 11 T 13 14 282468 CASAVA_Build 7 133004886 4I CGCTAAATGC ----/CTGA CTGTGTTTAA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 CTGA 0 1 282469 CASAVA_Build 7 133016676 1I TCAAGGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 42 1 37 4 T 10 11 282470 CASAVA_Build 7 133030474 1D ATGAGATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 37 2 16 20 T 13 12 282471 CASAVA_Build 7 133033412 1I ATAATTTATG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 8 9 282472 CASAVA_Build 7 133034263 2I CTTGTAAAAC --/TG TGCACTACCT 3070 hom 144 het 55 0 49 6 TG 1 2 282473 CASAVA_Build 7 133046207 1I TAACAGCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 34 1 27 6 A 10 11 282474 CASAVA_Build 7 133058787 4I TTCTTTCTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 63 het 34 0 22 14 TTTG 4 5 282475 CASAVA_Build 7 133078949 1I TTAGTCAAAA -/C CCCCCCCATG 3070 het 3070 hom 39 11 18 10 C 7 8 282476 CASAVA_Build 7 133079429 1D TCCTGGAGGC A/- AAAAAAAAAA 2716 het 2716 ref 38 27 6 5 A 12 11 282477 CASAVA_Build 7 133085880 1I GTTTTTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1208 hom 30 4 19 7 T 12 13 282478 CASAVA_Build 7 133098994 1D TAGCCAAAAA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 26 1 18 7 G 2 1 282479 CASAVA_Build 7 133105385 1I TTGATCCCCC -/T ATAGCTATTT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 0 1 282480 CASAVA_Build 7 133107820 3D CTTAAAGTAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 22 1 16 5 A 14 11 282481 CASAVA_Build 7 133111522 2D ATTCCACCCG TC/-- GGTTCTATGA 3070 hom 120 het 45 0 40 6 TC 1 0 282482 CASAVA_Build 7 133115166 3I CCACCCCAGC ---/CAG CAGCAGCAGC 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 CAG 3 4 282483 CASAVA_Build 7 133117208 1I GTGATAACAC -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 7 282484 CASAVA_Build 7 133120590 1D TTTAAATATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 10 9 282485 CASAVA_Build 7 133120681 1I TTTTAATTGA -/T TTTTTTCTTC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 6 7 282486 CASAVA_Build 7 133127943 3I AATATGGAAT ---/ATA AAAAAACCTG 3070 hom 65 het 35 0 26 9 ATA 0 1 282487 CASAVA_Build 7 133129155 4I AAATAAATAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAAT 2 3 282488 CASAVA_Build 7 133133710 21D5M2D ATCAGTAATT TTCTTGGCATATTTACAAAGAAATAAAC/---------------------ACTAA-- AAAGGAATTA 3070 hom 84 het 25 0 28 5 N/A 0 0 282489 CASAVA_Build 7 133138076 1D GGAGGCGGAG A/- GTTGCAGTGA 2888 hom 18 het 7 0 7 0 A 1 0 282490 CASAVA_Build 7 133145385 1I GTCGAATTTT -/A AAAAGCTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 A 4 5 282491 CASAVA_Build 7 133155148 1I TGCATTAAAA -/C TCATAACTCA 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 C 0 1 282492 CASAVA_Build 7 133166855 1I ATCTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 26 11 T 13 14 282493 CASAVA_Build 7 133182690 1D TTTTTTTTTT G/- GAGACTGAGT 3070 het 543 hom 42 2 27 14 G 2 1 282494 CASAVA_Build 7 133192801 1I TTCTGTCCCC -/T TGGGCTGCCA 3070 hom 38 het 19 0 9 10 T 1 2 282495 CASAVA_Build 7 133223486 3I TCAAGCTAAT ---/CCC CCATTGTGTT 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 C 2 5 282496 CASAVA_Build 7 133231815 1D GAAAGAGAAA G/- GGGTTGTAGT 3070 het 3016 hom 23 9 7 8 G 4 3 282497 CASAVA_Build 7 133233043 1D TATAATGAGC T/- ACAATTGGAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 1 0 282498 CASAVA_Build 7 133233837 10I AGGAGATCGA ----------/GACCATCCTG GACCATCCTG 1645 hom 10 het 8 0 4 4 GACCATCCTG 1 2 282499 CASAVA_Build 7 133238160 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2615 het 2615 ref 25 12 8 5 A 11 12 282500 CASAVA_Build 7 133242669 1I GTCTTTCTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 8 9 282501 CASAVA_Build 7 133245384 1I ACTCAGCTAA -/T TTTGTATTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 3 4 282502 CASAVA_Build 7 133251800 1I GGCCTCAAGC -/A AATCCTCCTG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 2 3 282503 CASAVA_Build 7 133253443 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTATTT 2540 het 1949 hom 10 4 6 0 T 6 7 282504 CASAVA_Build 7 133254034 1D TCTGTCACTT A/- TAGAGCTGTG 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 A 1 0 282505 CASAVA_Build 7 133258281 1D ATATCCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 T 11 10 282506 CASAVA_Build 7 133259289 1I AACTTGAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 9 10 282507 CASAVA_Build 7 133262429 1D AATAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2491 hom 32 9 15 8 A 15 14 282508 CASAVA_Build 7 133264667 1I TAGAATTGTT -/A ATTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 1 2 282509 CASAVA_Build 7 133264771 1D TCTATCCCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 10 9 282510 CASAVA_Build 7 133266591 4D ATAGTGGCTC AATA/---- AATACTTGTT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 AATA 2 1 282511 CASAVA_Build 7 133268340 1D AAAGCGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 9 T 13 12 282512 CASAVA_Build 7 133269262 2D TTTGGCATAT AG/-- ATATCCAACC 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 AG 1 0 282513 CASAVA_Build 7 133279066 1I CATTTAGTGA -/T TTTTTAGAAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 5 6 282514 CASAVA_Build 7 133285069 1I ACTTCCACCA -/C ACTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 C 0 1 282515 CASAVA_Build 7 133293562 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 855 hom 35 2 26 7 T 9 10 282516 CASAVA_Build 7 133296747 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 T 8 7 282517 CASAVA_Build 7 133302579 1D GATTCACTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 56 het 28 0 19 9 T 10 9 282518 CASAVA_Build 7 133305758 1I AAACCCAGGG -/C CCTGGTGGTG 3070 hom 60 het 22 0 17 5 C 2 3 282519 CASAVA_Build 7 133306183 1I CAAATGGTTT -/C CCCCTGACCT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 4 5 282520 CASAVA_Build 7 133306568 1I TTGGTTTTTT -/A AAAAAAAATA 2313 het 1810 hom 13 5 5 3 A 8 9 282521 CASAVA_Build 7 133307311 1I44M1I TCCCATTCTC -TTGACTTTCTGATACATCCCAAGCAAAAACTCTAGCCCTGTACA-/TTTGACTTTCTGATACATCCCAAGCAAAAACTCTAGCCCTGTACAT TGGTACCTTA 3070 hom 150 het 38 0 50 6 N/A 0 0 282522 CASAVA_Build 7 133311863 1D AGTTAGCACA T/- GGAAAAGAAT 3070 hom 135 het 51 0 46 6 T 1 0 282523 CASAVA_Build 7 133316097 3D TGAACTGTTA ATT/--- ATTCTAGGGA 3070 het 3070 ref 49 27 19 4 ATT 2 1 282524 CASAVA_Build 7 133319017 1D TTATTCATCC A/- AAAATACCTT 3070 hom 102 het 40 0 33 9 A 5 4 282525 CASAVA_Build 7 133322648 1D CCAGCTACTT G/- GGAGATGAGG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 G 3 2 282526 CASAVA_Build 7 133324831 1D CCAGAGAGAG A/- AAACAACACC 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 A 4 3 282527 CASAVA_Build 7 133336766 2D TTTTAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 12 10 282528 CASAVA_Build 7 133338200 1I TGGAAAGCAA -/T TTGGTAATTT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 2 3 282529 CASAVA_Build 7 133341656 15I ACACCAAAAC ---------------/TTGGCCTACAGAGAT TTGGCCTACA 3070 het 1423 hom 18 4 10 4 TTGGCCTACAGAGAT 1 2 282530 CASAVA_Build 7 133344097 1D AATTTTTATA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 90 het 31 0 30 1 T 8 7 282531 CASAVA_Build 7 133345342 3D GCTACTATTA TTC/--- TTTATTCTGA 3070 het 3070 ref 41 17 16 9 TTC 1 0 282532 CASAVA_Build 7 133357196 1I TGATTAAACA -/T TTTGGGGTAT 3070 hom 84 het 29 0 27 2 T 3 4 282533 CASAVA_Build 7 133359744 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2359 hom 22 7 12 3 A 12 13 282534 CASAVA_Build 7 133361805 1I TTTGGTTACC -/A AAAGAAGAGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 4 282535 CASAVA_Build 7 133362124 1I TAGGCAGAGC -/A AACGTTGCTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 3 282536 CASAVA_Build 7 133369368 1I CGTCGTGTCT -/A AAAAGAGACT 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 A 4 5 282537 CASAVA_Build 7 133377771 1D GCATGCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 14 9 A 13 12 282538 CASAVA_Build 7 133378434 1I GTCTACTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 T 9 10 282539 CASAVA_Build 7 133379938 1I GAGCAGACAA -/T TGCAAGGCAT 3070 hom 144 het 55 0 49 6 T 1 2 282540 CASAVA_Build 7 133382997 3I GTTTTGTGAC ---/CTT CTTCTCTGAC 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 CTT 1 2 282541 CASAVA_Build 7 133384255 2I TCTTTCTAAA --/AC ACAGTTGTCA 3070 hom 144 het 57 0 48 9 AC 1 2 282542 CASAVA_Build 7 133385782 1D ATATTAAGAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 T 9 8 282543 CASAVA_Build 7 133387293 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 A 9 10 282544 CASAVA_Build 7 133393965 4I TTACAAAGAA ----/AGAC AGAGCTGAGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGAC 0 1 282545 CASAVA_Build 7 133402443 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2855 hom 24 het 20 0 13 7 A 25 14 282546 CASAVA_Build 7 133403814 2D TCCATTAAAC CT/-- CTTTTTCATT 3070 hom 102 het 35 0 34 2 CT 2 1 282547 CASAVA_Build 7 133404507 9I AGTTCTTCTT ---------/CTTCTTCTC CTTCTTCTCC 3070 hom 99 het 46 0 30 16 CTTCTTCTC 1 2 282548 CASAVA_Build 7 133404603 14D TCCTCCTCCT TTCTTCCTTCTCCC/-------------- CCTCCTTCTC 2420 het 248 hom 21 5 11 10 TTCTTCCTTCTCCC 1 0 282549 CASAVA_Build 7 133405358 1D AAAGCAAAGT G/- GGTGCTGAAA 3070 hom 182 het 66 0 61 5 G 3 2 282550 CASAVA_Build 7 133405608 2I TGTAATGAAC --/TG TGCGCAGCTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TG 1 2 282551 CASAVA_Build 7 133406086 1I AAAAAAATAA -/T AAGGAACTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 1 282552 CASAVA_Build 7 133408539 1D CAAAGAAAGG C/- CCCAGGCTAT 3070 hom 51 het 23 0 18 6 C 4 3 282553 CASAVA_Build 7 133411999 2I TCTATAATTG --/TA TATATATATA 1956 het 1004 hom 11 3 4 4 TA 8 9 282554 CASAVA_Build 7 133414698 1I GGTTTACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 156 het 56 0 50 6 T 9 10 282555 CASAVA_Build 7 133417475 1D TGGTTGCCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 44 het 21 0 15 6 T 10 9 282556 CASAVA_Build 7 133419917 1D CCTTGCAAGG C/- CTGGCAGGTG 3070 hom 75 het 29 0 25 5 C 2 1 282557 CASAVA_Build 7 133420216 1I ATTTATAGAC -/A AAAAAAGGGA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 6 7 282558 CASAVA_Build 7 133420626 1D CAAAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 24 2 15 7 A 13 12 282559 CASAVA_Build 7 133442247 1D GTTCTTGGCA T/- TTTTTTTTTT 2302 het 2302 ref 40 19 6 15 T 15 14 282560 CASAVA_Build 7 133449386 1I ATGGCGCTGC -/A AAACTGTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 3 4 282561 CASAVA_Build 7 133451805 2I TCATGTGTAT --/TA TATATATATA 2138 het 2138 ref 27 13 7 7 TA 7 8 282562 CASAVA_Build 7 133464334 1D AAGTAGAATA T/- TTTCTTTTCT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 4 3 282563 CASAVA_Build 7 133468994 2D TTCTGATTTG TA/-- TATGGATGGG 3070 hom 102 het 35 0 35 1 TA 2 1 282564 CASAVA_Build 7 133471420 1D ATGTGATCAC T/- TATGTTTTGT 3070 hom 160 het 59 0 54 5 T 2 1 282565 CASAVA_Build 7 133472901 1D ATCATTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 119 het 47 0 40 7 A 10 9 282566 CASAVA_Build 7 133474282 1I TGAAAATGAA -/C AAGGTGAAAG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 0 1 282567 CASAVA_Build 7 133475985 1I GGGTTTTTTT -/C CCCCTTCTAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 4 5 282568 CASAVA_Build 7 133477897 4D AATTTACAAC AAAG/---- AGAGTTTCCT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 AAAG 1 0 282569 CASAVA_Build 7 133479197 1D TAAAAACCTT C/- CTGATGATGT 3070 hom 105 het 41 0 34 7 C 2 1 282570 CASAVA_Build 7 133479694 3D AGCCTCCCAA AGT/--- GCTAGGATTA 3070 hom 57 het 22 0 17 7 AGT 1 0 282571 CASAVA_Build 7 133482243 2D CCTTAAAAAA AC/-- TTTTTTTGTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AC 1 0 282572 CASAVA_Build 7 133484402 4D TTCTTTTTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 15 11 282573 CASAVA_Build 7 133486157 2I CAATTGAGTC --/TT ATCACTAAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 0 2 282574 CASAVA_Build 7 133491574 1D TATTAGGTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 107 het 40 0 37 3 T 9 8 282575 CASAVA_Build 7 133497160 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 7 6 282576 CASAVA_Build 7 133497436 1I TAACAAGCCA -/C CCCAGTTGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 3 4 282577 CASAVA_Build 7 133508409 1I GATCCCTTTT -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 97 het 37 0 33 4 A 7 8 282578 CASAVA_Build 7 133516815 4D CGTAGTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 111 het 48 0 38 11 TTTG 5 4 282579 CASAVA_Build 7 133520076 1D ATTTTCCAAA T/- GCTTAACTTA 3070 het 3070 ref 34 23 10 2 T 1 0 282580 CASAVA_Build 7 133522473 1D AGTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 44 1 39 4 A 12 11 282581 CASAVA_Build 7 133531599 1I CCACCCCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 33 1 25 7 T 10 11 282582 CASAVA_Build 7 133532460 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 20 hom 37 1 33 3 TG 8 7 282583 CASAVA_Build 7 133549512 1D CAGGATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 11 10 282584 CASAVA_Build 7 133550897 1D TAAAGCTTTT A/- AAAAAAAAAG 1810 het 1810 ref 43 32 5 7 A 10 9 282585 CASAVA_Build 7 133642631 1D AACAAAAACT A/- AAAAAAAAAA 1519 het 1519 ref 25 16 4 6 A 15 14 282586 CASAVA_Build 7 133669390 7D GGACAGCACG AATCCAC/------- CCGCTGTCTG 3070 hom 96 het 34 0 31 3 AATCCAC 1 0 282587 CASAVA_Build 7 133669968 9D TATGCACCAA GCAAGCCCT/--------- GTGCTAAGAG 3070 hom 90 het 31 0 31 2 GCAAGCCCT 1 0 282588 CASAVA_Build 7 133673624 1D TGCAGGTCTG A/- AAAAACAGTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 6 5 282589 CASAVA_Build 7 133674756 1D31M4D CCCTACTCTT ATTTTTTTTAAGCATACTTATATCAACCTAAATAAC/-TTTTTTTTAAGCATACTTATATCAACCTAAA---- AGAGAAGTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 6 N/A 0 0 282590 CASAVA_Build 7 133680654 1D GGAGAAACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 134 het 50 0 44 6 T 10 9 282591 CASAVA_Build 7 133685418 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 9 10 282592 CASAVA_Build 7 133686913 1D GGCCCATGGA C/- CCCCCCGCCC 3070 hom 68 het 27 0 21 6 C 7 6 282593 CASAVA_Build 7 133688345 20D6M7D TATATATACG TAATGTATATATACGTAATATATATACGTAATG/--------------------TATATA------- TATATAAATG 3070 hom 66 het 23 0 23 5 N/A 0 0 282594 CASAVA_Build 7 133696606 1D CGGTCCCCAA C/- CTTTTTGGCA 3070 hom 86 het 34 0 27 7 C 2 1 282595 CASAVA_Build 7 133698551 1I CAAAAGACTC -/T TGTATTGATC 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 1 2 282596 CASAVA_Build 7 133701347 3D AAAGAATTCA CTT/--- CTTCTTGCAA 3070 hom 141 het 51 0 44 9 CTT 3 2 282597 CASAVA_Build 7 133702330 2D TATTGGAGTC TG/-- TGATCATTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TG 2 1 282598 CASAVA_Build 7 133704061 1I GTTCATTTTT -/A TTTTTAATTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 1 282599 CASAVA_Build 7 133707227 1I TTTAAGTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 9 10 282600 CASAVA_Build 7 133709585 7D TTACTCCACT TAGAAAA/------- TAGGAATTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TAGAAAA 1 0 282601 CASAVA_Build 7 133711644 1I TAACAATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 401 hom 36 1 29 6 A 8 9 282602 CASAVA_Build 7 133712305 4I TCTAGGGTTC ----/TCTA TCTGTTTCCT 3070 hom 144 het 52 0 47 5 TCTA 0 1 282603 CASAVA_Build 7 133713164 15D ACTCACGCTA GATCCAATTCCATCC/--------------- GATCTGAACT 3070 hom 78 het 29 0 27 7 GATCCAATTCCATCC 1 0 282604 CASAVA_Build 7 133713532 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 92 het 35 0 32 4 A 10 9 282605 CASAVA_Build 7 133720971 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 18 2 12 4 A 10 11 282606 CASAVA_Build 7 133723713 1I ATGCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 226 hom 46 1 38 7 A 10 11 282607 CASAVA_Build 7 133724658 9D AGAAAGAAAG AAAGAAAGA/--------- AAATAAAATA 48 het 48 ref 22 9 3 13 AAAGAAAGA 1 0 282608 CASAVA_Build 7 133736138 1D TGCTTTTGAA G/- GGTAGTCTTT 3070 hom 108 het 38 0 35 3 G 3 2 282609 CASAVA_Build 7 133745889 2I GCGAGACTCC --/AT ATATATATAT 1056 hom 10 het 6 0 4 2 AT 7 8 282610 CASAVA_Build 7 133753521 1I GCTATAGTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 383 hom 46 1 39 6 A 9 10 282611 CASAVA_Build 7 133774832 1D CATAGCTCTG C/- CCCCCTGGGG 3070 hom 84 het 34 0 27 7 C 6 5 282612 CASAVA_Build 7 133784879 1D ACCCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 28 1 19 10 A 13 12 282613 CASAVA_Build 7 133808709 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 21 3 T 12 11 282614 CASAVA_Build 7 133812666 1I ACCAGGTACA -/T TGTCAATGAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 1 2 282615 CASAVA_Build 7 133842691 1I TCACCCCTGG -/T CTTGTCCCAA 3070 hom 69 het 30 0 26 4 T 0 1 282616 CASAVA_Build 7 133843970 1I AGCATGGGGG -/A AACCACCCCC 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 2 3 282617 CASAVA_Build 7 133852869 1I AATTTTCATC -/T AAACATTTTC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 0 1 282618 CASAVA_Build 7 133859525 3D CCTCAAGTAG TCC/--- TCCTGCCTCA 3070 het 2842 hom 25 7 14 4 TCC 2 1 282619 CASAVA_Build 7 133871657 1D CCTGTGTACA G/- GAAGTTTAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 2 1 282620 CASAVA_Build 7 133875696 1D GTGGGACTCA C/- CCCCCAAACT 3070 hom 82 het 34 0 27 7 C 6 5 282621 CASAVA_Build 7 133888343 1D GCCAAGAAGG C/- CCAGCTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 C 3 2 282622 CASAVA_Build 7 133892947 27D CTGTTTATTT TCTTATTACTGTTTCTGTAACCATTTA/--------------------------- TCTTTCAACT 3014 het 3014 ref 27 21 7 6 TCTTATTACTGTTTCTGTAACCATTTA 1 0 282623 CASAVA_Build 7 133893251 2I ACTGTAACCC --/CT GTTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 CT 0 1 282624 CASAVA_Build 7 133895402 1D TCCACCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 A 12 11 282625 CASAVA_Build 7 133904158 1I CAAGTTGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 103 het 43 0 37 6 A 10 11 282626 CASAVA_Build 7 133909356 1D TTAAAACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 11 10 282627 CASAVA_Build 7 133909879 2I CAGAAGAAGG --/AA AAGCACATTG 2537 het 2537 ref 40 27 6 7 A 2 4 282628 CASAVA_Build 7 133911466 1I TGAACCAGGC -/T TTGCAAAATG 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 2 3 282629 CASAVA_Build 7 133920536 1I TCTTGATTGG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 52 22 23 7 A 7 8 282630 CASAVA_Build 7 133928221 1D CAAGAACCCC A/- GGTCAGAGAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 1 0 282631 CASAVA_Build 7 133928261 1I TTGAGAGTGG -/C CTGCCACCAT 445 het 445 ref 28 18 2 8 C 1 2 282632 CASAVA_Build 7 133929678 1D GTTGTATGGT A/- AAATAAATTT 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 A 4 3 282633 CASAVA_Build 7 133933198 2I AGGATCACGT --/TA TATATGCAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 TA 2 3 282634 CASAVA_Build 7 133936633 1I GTTGAACATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 8 9 282635 CASAVA_Build 7 133937248 1I ATAACAGGGG -/T TTATAACAGT 3070 het 3070 ref 44 26 18 0 T 2 3 282636 CASAVA_Build 7 133946356 7D TTTGGTGTCT CACAATA/------- CATCAGTTCT 3070 het 3070 ref 36 23 12 5 CACAATA 1 0 282637 CASAVA_Build 7 133948660 1I CCAGTCAGCA -/G TAGTTGAGGT 3070 hom 123 het 50 0 40 10 G 0 1 282638 CASAVA_Build 7 133950800 1I AATGTACCCC -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 T 6 7 282639 CASAVA_Build 7 133952527 2I TTGGGTGCAG --/AC ACAGAGTGGA 3070 hom 125 het 47 0 40 7 AC 1 2 282640 CASAVA_Build 7 133959650 1D TTGCTTAACT A/- AACATTTATT 3070 het 3070 hom 35 17 17 2 A 3 2 282641 CASAVA_Build 7 133963332 1D GATGTTTGTC T/- TTTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 4 3 282642 CASAVA_Build 7 133966070 1I AATGATTGTC -/A AAGGTCGTGT 3070 hom 95 het 36 0 32 4 A 2 3 282643 CASAVA_Build 7 133966659 3I GCAGTCAAGA ---/GGC TTTGACTGCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 GGC 0 1 282644 CASAVA_Build 7 133978142 1I AGAGTCCAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 9 10 282645 CASAVA_Build 7 133983980 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 T 10 11 282646 CASAVA_Build 7 133984467 1D AATTAAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 T 11 10 282647 CASAVA_Build 7 133984827 1D TGAACCGAAT G/- GTTTCTTGAA 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 G 2 1 282648 CASAVA_Build 7 133996439 19D TGTAAGCATA AATTGCCTTTGTATCTGGC/------------------- AGAAACACAG 3070 het 3070 ref 36 24 16 3 AATTGCCTTTGTATCTGGC 1 0 282649 CASAVA_Build 7 133998661 2I GCACTTGATA --/TG TGTGTGTGTG 2756 het 2756 ref 28 13 9 6 TG 8 9 282650 CASAVA_Build 7 133999841 6I CACATTATGA ------/GGTATT GGAGTTTGGG 3070 het 3070 hom 48 24 20 4 GGTATT 0 1 282651 CASAVA_Build 7 134003361 1I TCATCCATAT -/A ACCTCAACAG 3070 het 3070 hom 49 15 28 6 A 1 2 282652 CASAVA_Build 7 134004184 2I TCGGGAAATA --/AC ACAGATTGGT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 AC 1 2 282653 CASAVA_Build 7 134013037 3D GTGATTAATA AAG/--- GAGTGTTTTT 3070 het 3070 ref 50 35 14 4 AAG 1 0 282654 CASAVA_Build 7 134015183 4D TGTAACACTC AAAG/---- AAAGAATTGC 3070 hom 123 het 46 0 42 6 AAAG 2 1 282655 CASAVA_Build 7 134015337 4D ATTTGTTCAT TAAC/---- TAACTGATGG 3070 het 3070 hom 47 20 25 5 TAAC 2 1 282656 CASAVA_Build 7 134022732 1I CTGTTCTGCC -/T TTGAGTTAAG 3070 het 3070 ref 46 30 10 6 T 2 3 282657 CASAVA_Build 7 134023233 1I TTTCTTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 7 6 T 11 12 282658 CASAVA_Build 7 134030633 1I TTTTCAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 11 12 282659 CASAVA_Build 7 134043149 3D ATAGATAGAT AGA/--- TAGATAGATA 2102 het 2102 ref 32 6 7 20 AGA 1 0 282660 CASAVA_Build 7 134055293 1I AATAAAAGCT -/G GGGTTTCTTA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 3 4 282661 CASAVA_Build 7 134055477 8D AGCCCTCCTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2055 het 2049 hom 24 10 10 7 T 20 12 282662 CASAVA_Build 7 134063419 1I42M1I7M1I TGATGAGTTC -TTTGTGCTATAATACTCAATGTAGAGAATGACGTTGAGCCTA-TTTGGCC-/TTTTGTGCTATAATACTCAATGTAGAGAATGACGTTGAGCCTATTTTGGCCT TGACCAACCT 3070 hom 105 het 36 0 36 11 N/A 0 0 282663 CASAVA_Build 7 134063710 1I CAGCTCAGCG -/T TTGCCTTATC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 3 282664 CASAVA_Build 7 134066949 1I CTCCACTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 T 9 10 282665 CASAVA_Build 7 134067884 1D CCCAGCCTCC A/- AAACTGTGAG 3070 het 3070 ref 36 16 18 2 A 4 3 282666 CASAVA_Build 7 134069653 1D GGGTTTTTTG T/- TTTTACTATG 3070 het 3070 ref 51 24 22 6 T 5 4 282667 CASAVA_Build 7 134071611 1I CCTATTGAAA -/T CCCTTTGAAT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 T 0 1 282668 CASAVA_Build 7 134072592 1I ATTTTTGTAA -/T TTTTTTTTTG 2580 het 2580 ref 20 11 7 2 T 9 10 282669 CASAVA_Build 7 134081910 1D CAATACTGCT G/- GAGGGCCCAG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 G 2 1 282670 CASAVA_Build 7 134082323 2I TTTAGAAGAC --/TG TTAGTCTATT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 TG 0 1 282671 CASAVA_Build 7 134085550 2I AGGCTTGTGG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 44 14 17 13 TC 5 6 282672 CASAVA_Build 7 134086048 1I TTCTATATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 9 10 282673 CASAVA_Build 7 134090037 5I CTACTCAACT -----/ACTAA ACTAAACGCT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 ACTAA 1 2 282674 CASAVA_Build 7 134091649 1D TCATATGGCA T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 T 7 6 282675 CASAVA_Build 7 134092398 2I TTTCTTGGGC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 T 9 11 282676 CASAVA_Build 7 134096764 1I ACTGGCAGTC -/A AGGAGGTTAC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 1 2 282677 CASAVA_Build 7 134108141 1I CTAATGGTTG -/C TTTCTTAATG 3070 het 3070 ref 45 28 16 1 C 0 1 282678 CASAVA_Build 7 134108568 1D TTTTCTGAAC T/- TTTTTTTTTT 1216 het 1216 ref 21 10 5 7 T 15 14 282679 CASAVA_Build 7 134109417 1D GCTGACATGG T/- GCCACTGCAC 3070 het 1904 hom 21 4 10 7 T 1 0 282680 CASAVA_Build 7 134110320 1D ACCCTATGAT A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 A 8 7 282681 CASAVA_Build 7 134110542 1D AGGCTTTCTG C/- TTTATTCTAT 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 C 1 0 282682 CASAVA_Build 7 134111002 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 A 14 13 282683 CASAVA_Build 7 134116902 2I CACAATGAAA --/GC ACAGTAACTT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 GC 0 1 282684 CASAVA_Build 7 134172407 3I ATAAAATTTT ---/AAG AAGAACTCAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AAG 1 2 282685 CASAVA_Build 7 134205986 1I33M4D CTTTCCTTCC -TTTCTTTCTTGCTTCCATTCATTTCCTTCCTTCCTCT/TTTTCTTTCTTGCTTCCATTCATTTCCTTCCTTC---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 30 25 15 2 N/A 0 0 282686 CASAVA_Build 7 134207649 14D ACTCGGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 4 A 25 11 282687 CASAVA_Build 7 134216827 2D AAAGTATAAA GG/-- GTAATGCGCA 3070 het 3070 ref 44 26 11 8 G 3 1 282688 CASAVA_Build 7 134219401 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2702 het 2654 hom 27 10 13 4 A 11 12 282689 CASAVA_Build 7 134219926 1I TGAATACTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2333 hom 40 5 26 9 A 13 14 282690 CASAVA_Build 7 134231642 1I CACTGACCAA -/T TTTGTCTACT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 3 4 282691 CASAVA_Build 7 134232601 1D TCAGTTTTCA T/- TTTTTTTTTC 2393 het 2393 ref 17 7 5 5 T 10 9 282692 CASAVA_Build 7 134263300 1I AAAGTCCCGG -/T TTGGTAGTGT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 2 3 282693 CASAVA_Build 7 134291413 2I TTTTTTGCAT --/AA AGTTTTTTAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 3 282694 CASAVA_Build 7 134301126 2D TTGCTATGGC CA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 34 1 19 14 CA 1 0 282695 CASAVA_Build 7 134302601 1D ACCGAGAACT G/- AGTTTATGAG 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 G 1 0 282696 CASAVA_Build 7 134304151 1D GGTTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 12 11 282697 CASAVA_Build 7 134304928 4D CTTTTCTACT TTTA/---- TTTGTCATTG 3070 het 3070 ref 42 21 19 6 TTTA 1 0 282698 CASAVA_Build 7 134309780 1I TACTGTATTG -/C TCCCCCTTGA 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 C 0 1 282699 CASAVA_Build 7 134315584 2D CAACTTCAGC AA/-- AGTCTCAGGA 3070 hom 54 het 19 0 17 2 A 3 1 282700 CASAVA_Build 7 134321887 8D CCGGGTTCTC CGCGAGAT/-------- CGCGAGATCC 2035 hom 37 het 14 0 9 7 CGCGAGAT 2 1 282701 CASAVA_Build 7 134329717 1I CCCAAATTCA -/T TTTTTGCTTT 2602 het 2602 ref 25 13 7 5 T 5 6 282702 CASAVA_Build 7 134331793 1I CCCCAGAGGT -/A AAAAATAGAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 5 6 282703 CASAVA_Build 7 134334322 1I TATTTTAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2776 hom 33 9 16 8 A 10 11 282704 CASAVA_Build 7 134339923 4I ACAGTTTTGG ----/TTAT TTATTTTCCT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 TTAT 1 2 282705 CASAVA_Build 7 134343910 2D GCAACAACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 13 11 282706 CASAVA_Build 7 134344782 1D AGTGTTGGGA T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 8 7 282707 CASAVA_Build 7 134350890 6D TTCTCCAGTT ATAATG/------ ATAGGGTTTC 3070 hom 48 het 26 0 17 9 ATAATG 1 0 282708 CASAVA_Build 7 134351322 10D16M1D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGA/----------AAAAAAAAAAGAAAAG- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 12 0 13 0 N/A 0 0 282709 CASAVA_Build 7 134352999 1I TTAATGTCTT -/A AGAGTGTTTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 1 2 282710 CASAVA_Build 7 134355512 4I TACAAGAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 AAAC 1 2 282711 CASAVA_Build 7 134356955 2I TGGGATTTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 18 0 14 4 T 12 14 282712 CASAVA_Build 7 134361210 2I ATGGCGCATC --/CT GTTTCATAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CT 0 1 282713 CASAVA_Build 7 134362728 1I AAAAATTGTA -/T TTTATATTTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 3 4 282714 CASAVA_Build 7 134370409 15D CTGGATTCAC TAACCTCCCCTTAAA/--------------- TAACCTCCCC 3070 het 3070 ref 37 18 16 6 TAACCTCCCCTTAAA 2 1 282715 CASAVA_Build 7 134371656 1I GAATGTGTAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 9 282716 CASAVA_Build 7 134373558 1D ATTGGGGCCC A/- AAGACATAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 3 2 282717 CASAVA_Build 7 134375871 1D TCTTGTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 12 11 282718 CASAVA_Build 7 134376160 25D GTGATCCATG CACACACACACACACACCACACACA/------------------------- CACACACACA 3070 het 3064 hom 45 14 20 19 CACACACACACACACACCACACACA 1 0 282719 CASAVA_Build 7 134376900 12I GTAAAACTTT ------------/TAGAAGAAAACA TAGAAGAAAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TAGAAGAAAACA 0 1 282720 CASAVA_Build 7 134379100 1D AAATAGTAAA T/- TTTATTGCAG 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 T 4 3 282721 CASAVA_Build 7 134384045 1D CTCACAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 12 11 282722 CASAVA_Build 7 134385700 1D ATTTGGTCTA T/- AATGTTGTTC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 1 0 282723 CASAVA_Build 7 134385852 1D TGCTCTGATG T/- TTGGCTGCAT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 3 2 282724 CASAVA_Build 7 134386602 2I CGAGTTTGTT --/TA TATATAATAT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 TA 3 4 282725 CASAVA_Build 7 134387293 1I CTTCCATTAA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 6 7 282726 CASAVA_Build 7 134390815 1I ATTGATATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 8 9 282727 CASAVA_Build 7 134392721 5I AAAAAAAATA -----/AAAAT AAAAGATGCT 3070 hom 119 het 46 0 41 5 AAAAT 0 1 282728 CASAVA_Build 7 134394601 1D ATAATCAGGC A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 8 7 282729 CASAVA_Build 7 134397849 1D TTTTGGAGCA T/- TTTTTATCAT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 6 5 282730 CASAVA_Build 7 134408246 1D AATTTCAAAA C/- CAAAAAAGAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 2 1 282731 CASAVA_Build 7 134409343 2I GAAATTTGCT --/AA GAGAATGGGT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 A 0 2 282732 CASAVA_Build 7 134410250 4D ACTTTTAAAG AATA/---- AACAGATGAA 3070 het 3070 hom 28 11 16 5 AATA 1 0 282733 CASAVA_Build 7 134412092 2D AAATAAAAAC AG/-- TGGTACTGAA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AG 1 0 282734 CASAVA_Build 7 134412467 1I TCTTATTCTT -/C CCCCCTGCTG 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 C 5 6 282735 CASAVA_Build 7 134413014 1D TTTTTCTGCC T/- TTATGCCCCT 3070 hom 90 het 31 0 29 2 T 3 2 282736 CASAVA_Build 7 134413798 1D TGTTAGGGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 4 T 9 8 282737 CASAVA_Build 7 134417859 1D GCAGTTTAAG A/- TTATATTTCT 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 A 1 0 282738 CASAVA_Build 7 134424361 1D TTTTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2097 hom 30 7 16 7 T 11 10 282739 CASAVA_Build 7 134427481 1I TTATTCTCCT -/C TTTCCAGTTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 C 0 1 282740 CASAVA_Build 7 134428329 1D TTCCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 12 11 282741 CASAVA_Build 7 134434481 2I CCTAGATTGG --/CT CTCTAAAAAT 3070 het 2997 hom 23 7 14 2 CT 2 3 282742 CASAVA_Build 7 134437894 8D CAGTATGAGA GAACTTTG/-------- GTCCTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 14 10 11 GAACTTTG 1 0 282743 CASAVA_Build 7 134440628 1D TCCCAAAGTG C/- TGGGATTACA 2621 het 725 hom 10 2 6 2 C 1 0 282744 CASAVA_Build 7 134442436 1I ATATTATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 9 10 282745 CASAVA_Build 7 134444340 1D CAGTTAGGTT C/- TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 1 0 282746 CASAVA_Build 7 134444750 1D GATACAGGAT G/- GGGGCCCACA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 G 5 4 282747 CASAVA_Build 7 134446484 2D ATAAATATCC CT/-- CTGTTTAAGG 3070 het 3070 hom 47 20 22 6 CT 2 1 282748 CASAVA_Build 7 134449415 1I TGTTGCTTAC -/A ACTGTTGGCT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 1 2 282749 CASAVA_Build 7 134449810 1D TTCCCAGTCT C/- CCCCATGTCC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 5 4 282750 CASAVA_Build 7 134452531 1I TTCCTCCATA -/T TTGAAATCTG 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 T 2 3 282751 CASAVA_Build 7 134452661 1I ACAATGTAGG -/T TTTCAGCCCT 3070 het 3070 ref 52 28 18 6 T 3 4 282752 CASAVA_Build 7 134454685 1D CCATGCCTGG C/- CCAATTTTTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 3 2 282753 CASAVA_Build 7 134465849 2D CCAGCAACAC AT/-- GTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 AT 1 0 282754 CASAVA_Build 7 134466752 1I AACAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2534 het 2534 ref 18 11 6 1 A 10 11 282755 CASAVA_Build 7 134469697 1I CTTCCCTCTC -/T TTAGACTCAC 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 T 2 3 282756 CASAVA_Build 7 134470795 1I TTTAGTTTTT -/A ATCAGCATGG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 1 2 282757 CASAVA_Build 7 134473326 1I AATTTGGGGG -/A ATGCAACATC 3070 het 3070 ref 54 26 19 9 A 1 2 282758 CASAVA_Build 7 134475371 1D TTTAGAATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 9 282759 CASAVA_Build 7 134480053 3I ACCAAAAAAT ---/TAA TAATAATAAT 1569 het 1569 ref 11 4 6 1 TAA 5 6 282760 CASAVA_Build 7 134491325 1D AGACACACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 11 10 282761 CASAVA_Build 7 134493997 3D CAGTGTGGAA AAG/--- AAGCTGTGGG 3070 het 3070 hom 41 15 21 7 AAG 2 1 282762 CASAVA_Build 7 134502961 1D GACGGTGACC A/- AGGGTCTAGC 3070 het 3070 hom 38 10 19 9 A 2 1 282763 CASAVA_Build 7 134506619 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 51 hom 16 1 11 4 A 10 9 282764 CASAVA_Build 7 134508635 1I TACCTTTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1421 hom 20 5 8 7 A 11 12 282765 CASAVA_Build 7 134513610 1D TTGTGGCCCT G/- GGGTGGCCCC 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 G 4 3 282766 CASAVA_Build 7 134535123 1I GAGTGCTCAA -/T TCAATTGGTG 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 1 2 282767 CASAVA_Build 7 134540425 1D ATCACCAGCT G/- GGGCTTCTGC 3070 het 3070 hom 45 19 21 6 G 4 3 282768 CASAVA_Build 7 134544488 1D AGCTGAAGTT C/- TAATGATAAA 3070 het 3070 ref 38 24 12 3 C 1 0 282769 CASAVA_Build 7 134548847 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1613 hom 30 8 13 9 A 13 14 282770 CASAVA_Build 7 134562946 1I AAATTATTGC -/A AAAATAAAAA 3070 het 3070 hom 29 7 17 5 A 4 5 282771 CASAVA_Build 7 134570689 1I TATGAGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1895 hom 30 7 16 7 T 12 13 282772 CASAVA_Build 7 134575782 1I TATCTAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 A 10 11 282773 CASAVA_Build 7 134577346 1D GAAGGAAGAG A/- AGAGGAGGAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 2 1 282774 CASAVA_Build 7 134583691 1D ACCTGTGGAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 76 het 31 0 23 8 T 9 8 282775 CASAVA_Build 7 134593119 2I GGACACTTAG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 TC 5 6 282776 CASAVA_Build 7 134593538 1D ATGGGACCTT C/- CCCCCTTAGA 3070 het 2900 hom 33 9 17 7 C 6 5 282777 CASAVA_Build 7 134596735 1I TTCTGACAAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 38 9 23 6 A 8 9 282778 CASAVA_Build 7 134606932 1D TACCCTGAGG T/- TTTTTTTTTT 2460 het 762 hom 18 3 11 4 T 15 14 282779 CASAVA_Build 7 134619197 1D ATTCCATGGA T/- TCCTGGGCCA 3070 hom 184 het 66 0 62 5 T 2 1 282780 CASAVA_Build 7 134628959 1I CAAATGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 46 1 31 14 T 15 16 282781 CASAVA_Build 7 134649637 2I AAAGACTGTT --/CA CAGTCTGATG 3070 hom 93 het 36 0 29 7 CA 1 2 282782 CASAVA_Build 7 134661819 1I50M4I ATAGTGTTGG -TTTTTTTCAAAAAAAGAACAAAAGAAAGAAGAAAAGAAGAAAGAAGAAAG----/TTTTTTTTCAAAAAAAGAACAAAAGAAAGAAGAAAAGAAGAAAGAAGAAAGAGAA AGAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 31 25 11 7 N/A 0 0 282783 CASAVA_Build 7 134664923 1D CCCAGTGTGC A/- GGCTCCACAG 1518 het 1518 ref 22 10 4 9 A 1 0 282784 CASAVA_Build 7 134678680 1D CTAATCCATC A/- ACCAACACCA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 2 1 282785 CASAVA_Build 7 134679441 2I TTAAGAGTGA --/CC ACACATAAAG 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 C 0 2 282786 CASAVA_Build 7 134680002 1D ATTCAATTTG A/- AAAAAAAATT 3018 het 3018 ref 40 24 8 8 A 9 8 282787 CASAVA_Build 7 134681259 1D TTTGAATAGT C/- CTGCTGTAGC 3070 hom 57 het 28 0 20 8 C 2 1 282788 CASAVA_Build 7 134681656 1D CATGCAACCA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 T 8 7 282789 CASAVA_Build 7 134694351 2I AAATAATAAT --/TA AAAAAAAATA 3019 het 2193 hom 13 5 7 1 TA 0 1 282790 CASAVA_Build 7 134700800 4I GCAGACAAGG ----/ATAA ATAATCTGCA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 ATAA 1 2 282791 CASAVA_Build 7 134701700 1D AAACTACTCT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 69 het 28 0 23 7 A 8 7 282792 CASAVA_Build 7 134709036 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1074 hom 16 3 10 3 T 10 11 282793 CASAVA_Build 7 134709686 3D TAAAATTTGC TGA/--- TGATTCCCTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 TGA 2 1 282794 CASAVA_Build 7 134709937 1D TAAAACTCTT A/- ACATTCTTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 1 282795 CASAVA_Build 7 134715241 1D TGTAAATGCT A/- AGTGCAGTCC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 2 1 282796 CASAVA_Build 7 134718677 1I TCACTGGGGC -/T TGCTTACTTA 3070 hom 156 het 58 0 52 6 T 1 2 282797 CASAVA_Build 7 134722847 2I CCTTTCATAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 10 12 282798 CASAVA_Build 7 134741578 2I ATTAAAACAG --/AA AACATCCCCA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 2 4 282799 CASAVA_Build 7 134742980 1I10M1I GGAGTCAATG -TTTGTTTTTG-/TTTTGTTTTTGT TTTTTTGTAG 3070 hom 66 het 22 0 23 1 N/A 0 0 282800 CASAVA_Build 7 134747216 1I GATTTTCTGA -/T TTTTGCCATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 4 5 282801 CASAVA_Build 7 134755331 1I5M2I28M1I AAAAACAAAC -AACAA--CAAAAACCCTCTTATAAATCACATACCC-/AAACAAACAAAAAACCCTCTTATAAATCACATACCCA AAAGAGGTAG 3070 hom 75 het 27 0 25 9 N/A 0 0 282802 CASAVA_Build 7 134762616 1D ATTGAAAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 T 10 9 282803 CASAVA_Build 7 134767095 1I ATAATATAAC -/A AAACATGCTG 3070 hom 48 het 25 0 17 8 A 3 4 282804 CASAVA_Build 7 134767221 1I ATTTTTCCTC -/A AAATGATCTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 4 282805 CASAVA_Build 7 134767400 3D CAAAACTTAC AAT/--- AATAAAGACA 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 AAT 2 1 282806 CASAVA_Build 7 134771258 1D CCATACTTGA C/- CCAACTACAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 3 2 282807 CASAVA_Build 7 134771775 1D33M1I TGGAATGACT GGGGAACCAATTTCTAAAATATAACTAAATGTTC-/-GGGAACCAATTTCTAAAATATAACTAAATGTTCA AAATCCATAA 3070 hom 132 het 33 0 45 0 N/A 0 0 282808 CASAVA_Build 7 134776519 1I ATTATCTAAA -/T TGCTGCAAAA 3070 hom 71 het 30 0 25 5 T 1 2 282809 CASAVA_Build 7 134780272 1I TTGCCTCTGC -/T TTGTCATGCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 2 3 282810 CASAVA_Build 7 134785117 1D ATATTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 T 13 12 282811 CASAVA_Build 7 134789805 1I TTAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 35 het 15 0 10 5 A 9 10 282812 CASAVA_Build 7 134801407 2I AAGAAAAATT --/TG TGTAAATATG 2994 hom 21 het 9 0 8 1 TG 1 2 282813 CASAVA_Build 7 134816177 1D ATCTATATGC A/- AAAAAAAAAA 1387 het 1387 ref 25 15 4 6 A 17 16 282814 CASAVA_Build 7 134818923 2D ACCAGCCTGC AA/-- AACATGAGGA 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 A 4 2 282815 CASAVA_Build 7 134820970 1I GCGAGAGCAA -/T TGCGACTTCC 3070 hom 114 het 45 0 38 7 T 1 2 282816 CASAVA_Build 7 134829354 1D AACCTGTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 830 hom 27 3 12 13 A 17 16 282817 CASAVA_Build 7 134836272 1D CTACTAAACC T/- TTTTTTTTTT 412 het 412 ref 26 7 3 16 T 17 16 282818 CASAVA_Build 7 134852034 1I TTCGTGGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 10 8 T 14 15 282819 CASAVA_Build 7 134859097 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1391 het 1226 hom 18 5 4 9 A 15 16 282820 CASAVA_Build 7 134863830 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2872 hom 26 het 25 0 8 18 A 14 13 282821 CASAVA_Build 7 134863856 1D AAGAAAGAAA G/- AAAAGAAAAG 1627 het 1432 hom 19 8 6 5 G 1 0 282822 CASAVA_Build 7 134874368 4D CTTTCCTTCC TTCT/---- TTCCTTCCTT 564 het 482 hom 14 3 7 4 TTCT 1 0 282823 CASAVA_Build 7 134891160 1D TTACAGGAGT C/- CTGTCACCAC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 2 1 282824 CASAVA_Build 7 134891866 1I CTGGATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2360 hom 19 6 11 2 T 11 12 282825 CASAVA_Build 7 134923076 1I TTAAATGTCC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 39 11 14 14 T 8 9 282826 CASAVA_Build 7 134952062 1D GACATATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2423 hom 17 5 9 3 A 13 12 282827 CASAVA_Build 7 134953569 3D TGGCTACTGA AAT/--- AATATGAAAA 3070 het 3070 ref 49 20 24 6 AAT 2 1 282828 CASAVA_Build 7 134987097 25I TGCACTCCAG -------------------------/CCTGGGCAACAGAGCAAGAGTCTGT CCCCCTCCCT 3070 hom 27 het 10 0 9 1 CCTGGGCAACAGAGCAAGAGTCTGT 0 1 282829 CASAVA_Build 7 134989594 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 37 0 28 10 TA 6 5 282830 CASAVA_Build 7 135010437 1D TTTTTAAATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 9 8 282831 CASAVA_Build 7 135014539 2I ACCCTGACTC --/TT TTGAAAATTT 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 T 2 4 282832 CASAVA_Build 7 135023065 2I TTTACTTAAC --/AT GTTATCCAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 AT 0 1 282833 CASAVA_Build 7 135028720 10I37M1D TGGAAAGAAG ----------TGTTAACATGGGGTGCTAAGAATCCAGTCAATTTTGAT/TGTTAACATTTGTTAACATGGGGTGCTAAGAATCCAGTCAATTTTGA- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 40 21 33 6 N/A 0 0 282834 CASAVA_Build 7 135037364 1I AAAAGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 10 11 282835 CASAVA_Build 7 135044704 2I CCTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 1538 het 1538 ref 18 5 5 8 T 10 12 282836 CASAVA_Build 7 135050524 6D TGAGTGTATG TGTGTA/------ TGTGTATGTG 3070 het 3070 hom 80 32 36 19 TGTGTA 3 2 282837 CASAVA_Build 7 135061859 5D AGAACAGCGG AGGGA/----- AGGGAAGGGA 3070 het 3070 hom 39 17 14 13 AGGGA 3 2 282838 CASAVA_Build 7 135066252 2I CTTTTTTCTA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 9 11 282839 CASAVA_Build 7 135072721 1I CTAAAATTAC -/A AAAAAACAGC 2338 het 2338 ref 19 9 7 3 A 6 7 282840 CASAVA_Build 7 135076252 1D10M1D AAAAACAAAA CAAAACAAAACA/-AAAACAAAAC- AAAAAAAAAA 3070 het 942 hom 36 4 19 15 N/A 0 0 282841 CASAVA_Build 7 135080382 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 T 10 9 282842 CASAVA_Build 7 135082102 2D AAGAACTAAA AG/-- AGGGCCAGGC 3070 het 2948 hom 28 8 18 2 AG 2 1 282843 CASAVA_Build 7 135088733 1I GCGTGAACCC -/G GGGGGCGCAG 1501 het 1501 ref 15 8 4 3 G 5 6 282844 CASAVA_Build 7 135089601 1D TTTGACAGGG T/- TGGAGACCAG 3070 het 3070 ref 42 22 10 11 T 2 1 282845 CASAVA_Build 7 135091443 1D TGAGTAGAAA T/- TTAGATGGAA 3070 het 3070 ref 42 21 12 9 T 3 2 282846 CASAVA_Build 7 135102930 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 8 7 282847 CASAVA_Build 7 135115210 1D ATAATAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 14 13 282848 CASAVA_Build 7 135121426 13D TCTCTCTCTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTA 3070 het 1847 hom 30 9 12 13 T 22 9 282849 CASAVA_Build 7 135127994 1I AAAATATACA -/T TTTTTTTTTT 2868 hom 30 het 17 0 10 8 T 14 15 282850 CASAVA_Build 7 135145184 1D GCCATTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1670 hom 26 7 14 5 A 15 14 282851 CASAVA_Build 7 135155602 1D TTTACAGAGT C/- CCAGACCGTG 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 C 3 2 282852 CASAVA_Build 7 135159474 1D TTTCTTCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 10 9 282853 CASAVA_Build 7 135161253 1I CGATGTGTGC -/G ATGTGTGTGT 143 het 143 ref 22 6 2 14 G 0 1 282854 CASAVA_Build 7 135161272 1I TGTTGGGGGA -/G GGGGGAGAGG 3070 hom 54 het 24 0 17 7 G 5 6 282855 CASAVA_Build 7 135167374 1I AGGGAGCACA -/G GGGAAGGTAC 3070 hom 102 het 40 0 30 10 G 3 4 282856 CASAVA_Build 7 135168433 1I AGAATTCTCC -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 6 7 282857 CASAVA_Build 7 135173020 1D TGGGAATTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 10 9 282858 CASAVA_Build 7 135175465 1D TAGGACCTTA T/- TTTGTAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 4 3 282859 CASAVA_Build 7 135186696 1I TTCGATAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 29 1 17 11 T 11 12 282860 CASAVA_Build 7 135187476 2D ATATATATAC CA/-- CAGTTTCTTT 1963 het 1963 ref 21 9 6 7 CA 2 1 282861 CASAVA_Build 7 135203657 1D ATGTTCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 A 12 11 282862 CASAVA_Build 7 135204381 2D TTAAAAGTTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 11 9 282863 CASAVA_Build 7 135210410 2D ATTTTAAAGA AC/-- AGTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 AC 1 0 282864 CASAVA_Build 7 135229771 7D GTTTTTCCTG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2466 het 1415 hom 40 12 9 20 T 21 14 282865 CASAVA_Build 7 135238850 1I TACTAAAAAT -/A CCAAATTTAG 2892 het 30 hom 9 1 8 0 A 0 1 282866 CASAVA_Build 7 135242003 5D CCTGTCTCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 2194 hom 26 7 15 5 AAAAC 4 3 282867 CASAVA_Build 7 135244021 21D TCTAGAATAG GCAGATTCATGGAGACAGAAA/--------------------- GCAGATTCAT 3070 het 3070 hom 44 15 17 19 GCAGATTCATGGAGACAGAAA 2 1 282868 CASAVA_Build 7 135304016 1I AGCATTCCAG -/A AAAAAAAAAA 1731 het 1731 ref 34 17 9 8 A 15 16 282869 CASAVA_Build 7 135347397 5D ATTTTATTTT ATTTC/----- ATTTCATTTA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 ATTTC 2 1 282870 CASAVA_Build 7 135427803 4I AGAAAGAGAG ----/AGTC AGCACATGTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 AGTC 0 1 282871 CASAVA_Build 7 135435642 1I GAAGCCAATA -/C GGTGAGGAGG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 C 0 1 282872 CASAVA_Build 7 135437105 2D TTTCTGCCAA AT/-- ATATGCATAC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 AT 3 2 282873 CASAVA_Build 7 135437978 1I ACAGTCCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 937 hom 37 3 23 11 A 12 13 282874 CASAVA_Build 7 135439364 1I TATTATGTTC -/T ACACTGACTG 3070 hom 154 het 63 0 52 11 T 0 1 282875 CASAVA_Build 7 135445309 1D TCTTCTAGGG T/- TTTTATAGTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 5 4 282876 CASAVA_Build 7 135450369 1D GGGATGGGAT C/- CGGTAAGCTA 3070 hom 37 het 17 0 13 5 C 2 1 282877 CASAVA_Build 7 135461728 1D TAGGCATTTT A/- AATTTAATTA 3070 het 3070 ref 29 14 11 6 A 3 2 282878 CASAVA_Build 7 135464331 2I CTATTTTATA --/AC AGAGTGTTGG 3070 hom 75 het 29 0 26 5 AC 0 1 282879 CASAVA_Build 7 135473031 1I TGAAAAAATG -/A AAAAATTAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 5 6 282880 CASAVA_Build 7 135474980 1D CCTGCTCAGG T/- CACTAAATTA 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 T 1 0 282881 CASAVA_Build 7 135479284 3I GAATCCAAGT ---/TTG TTTTTTTTTT 3070 het 897 hom 32 3 18 11 TTG 0 1 282882 CASAVA_Build 7 135479385 1I TCTCTTCTAC -/T TTTTCCTGTT 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 T 4 5 282883 CASAVA_Build 7 135479805 1D GGATTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2479 het 660 hom 35 6 12 18 T 17 16 282884 CASAVA_Build 7 135486509 1D CTTAGCTATG A/- AAATGTAATT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 A 4 3 282885 CASAVA_Build 7 135487466 2D TTTAGTTTTG CT/-- CTCTTTCTAA 3070 het 3070 ref 46 26 13 8 CT 3 2 282886 CASAVA_Build 7 135488739 1D CCTCACAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 10 13 T 12 11 282887 CASAVA_Build 7 135489369 1I TCCTGGTCTT -/C CCTGGAGTAG 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 C 2 3 282888 CASAVA_Build 7 135490055 1D GACTTGCTTT A/- AAAAAATAGC 3070 hom 160 het 61 0 54 7 A 7 6 282889 CASAVA_Build 7 135490664 2D TTAATCTGAG GA/-- AAAGGTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 GA 1 0 282890 CASAVA_Build 7 135494884 5D TTCTTTTTTG TTTAA/----- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 TTTAA 1 0 282891 CASAVA_Build 7 135495904 1I GAATCAACCA -/T TTTATTAAGC 3070 hom 144 het 50 0 49 1 T 3 4 282892 CASAVA_Build 7 135502951 1D AACAGATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 26 1 20 5 T 13 12 282893 CASAVA_Build 7 135507319 5D TCCCTCTATT TTTTC/----- TTTTATCATC 3070 hom 54 het 22 0 19 4 TTTTC 1 0 282894 CASAVA_Build 7 135508950 1D GCTTTCAGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 T 9 8 282895 CASAVA_Build 7 135509100 1D TAAAATTATA G/- GGTAGTCAGA 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 G 3 2 282896 CASAVA_Build 7 135525460 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3007 hom 23 8 9 6 T 13 12 282897 CASAVA_Build 7 135529536 1I ATTTCAATTG -/T TTTATGCCAG 3070 hom 99 het 41 0 33 8 T 3 4 282898 CASAVA_Build 7 135533704 1I TTTTAGGTTC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 7 8 282899 CASAVA_Build 7 135533852 1I ATTTCATAAT -/A TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 A 0 1 282900 CASAVA_Build 7 135535765 1D GGTGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 12 12 T 16 15 282901 CASAVA_Build 7 135541715 7I GCCTTTTATT -------/ATCTTGC GTATCAAGCC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 ATCTTGC 0 1 282902 CASAVA_Build 7 135543068 3I TTGGCAAATG ---/TTA TTATTTTTGT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 TTA 1 2 282903 CASAVA_Build 7 135554998 1D TTGTGGGTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 35 0 35 1 T 10 9 282904 CASAVA_Build 7 135558915 2D GATGGAGAAT GA/-- GTTTGATGAA 3070 het 3001 hom 22 7 13 2 GA 1 0 282905 CASAVA_Build 7 135560709 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1568 het 585 hom 7 2 4 1 A 12 10 282906 CASAVA_Build 7 135561156 5I AATGAGATAC -----/CATCT CATGCCAGTT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 CATCT 0 1 282907 CASAVA_Build 7 135564704 2D CGTCTCAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2097 hom 16 6 9 1 AT 7 6 282908 CASAVA_Build 7 135570402 1D ATAAGCTGGG A/- AAGGAAGAGG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 3 2 282909 CASAVA_Build 7 135572230 1I GAACTCAGAT -/A AAACAAATAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 3 4 282910 CASAVA_Build 7 135577773 1D TTCGATCTGG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 T 8 7 282911 CASAVA_Build 7 135585433 4D ATAAATCAGC CACT/---- CACTGTGCTC 3070 hom 178 het 64 0 59 5 CACT 2 1 282912 CASAVA_Build 7 135587742 1I TTTATAAACT -/A AAAAAAAAAA 2617 het 2617 ref 30 11 9 10 A 13 14 282913 CASAVA_Build 7 135589697 5D TCATAAATCA TTACT/----- TTATTTTCAT 3070 het 3070 ref 41 21 17 6 TTACT 1 0 282914 CASAVA_Build 7 135607877 1D TTGGTTAAGC A/- GGGTGGTTTG 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 1 0 282915 CASAVA_Build 7 135608119 1I ATTTTAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 10 11 282916 CASAVA_Build 7 135608427 1D TCTTTTTGAG A/- AAAGGCATGC 3070 het 3070 ref 52 25 21 7 A 4 3 282917 CASAVA_Build 7 135608663 11D TGAGTTCAGA TTTTCGATCAT/----------- TTGGTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 25 19 3 TTTTCGATCAT 1 0 282918 CASAVA_Build 7 135619377 3I GGCTCAATGG ---/AGA AGGAGAGAGT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AGA 0 1 282919 CASAVA_Build 7 135622564 1I GTATCAAAAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 7 8 282920 CASAVA_Build 7 135631524 1D AAATAATTTT C/- CCAAAAGTTT 3070 hom 71 het 26 0 23 3 C 3 2 282921 CASAVA_Build 7 135631602 1I CATAAAATCC -/A AGAAATCTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 1 2 282922 CASAVA_Build 7 135632444 1D GCAGAATTTT G/- GGGGCAGCAG 3070 hom 116 het 43 0 39 5 G 5 4 282923 CASAVA_Build 7 135654495 1D TCGGCTGTCA T/- TTTTTTTTTT 1610 het 1610 ref 36 24 4 8 T 12 11 282924 CASAVA_Build 7 135668857 1I AAATTAAGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 8 9 282925 CASAVA_Build 7 135672130 2I AACCTCACCA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 54 18 25 11 TC 7 8 282926 CASAVA_Build 7 135676031 1I GGGAACACTT -/A AATCTTCTAC 3070 het 3070 ref 52 26 19 7 A 2 3 282927 CASAVA_Build 7 135679988 1I TCTAATATTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 9 10 282928 CASAVA_Build 7 135691088 1D AACATTAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 35 0 24 12 A 10 9 282929 CASAVA_Build 7 135692547 2I CATGTACGAC --/TT TTTTATGGTA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 4 6 282930 CASAVA_Build 7 135693837 1I AATTGAAGTT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 8 9 282931 CASAVA_Build 7 135694883 4D GTTCAGAAGC AGGA/---- AGGAAGAGAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 5 AGGA 2 1 282932 CASAVA_Build 7 135698005 1D AGTTTCCAAT G/- TGTTTTCCAA 3070 hom 86 het 34 0 27 7 G 1 0 282933 CASAVA_Build 7 135710883 1I TGTATCAAGG -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 6 7 282934 CASAVA_Build 7 135717275 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAACCCCAC 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 AC 0 1 282935 CASAVA_Build 7 135721249 14D ACAAAGATAT CAGGACTTACTTTA/-------------- CAGTTACAGA 3070 het 3070 ref 41 22 18 8 CAGGACTTACTTTA 1 0 282936 CASAVA_Build 7 135728193 1I ATGGCTAAAA -/T TTTGGGGCAG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 3 4 282937 CASAVA_Build 7 135730692 1I TCTACCAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2342 hom 35 8 18 9 T 10 11 282938 CASAVA_Build 7 135731033 1D GATTTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 11 10 282939 CASAVA_Build 7 135738210 4D AATCCTTGAT AAAC/---- AACTTTTACT 3070 het 3070 ref 45 21 21 7 AAAC 1 0 282940 CASAVA_Build 7 135738716 1I ATTATAGAAA -/G AAAAATATTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 G 0 1 282941 CASAVA_Build 7 135741239 1I CTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1281 hom 30 5 16 9 A 13 14 282942 CASAVA_Build 7 135742295 1D CCTACCCAGA T/- TTTTTTTTTT 2701 het 2701 ref 30 14 6 10 T 13 12 282943 CASAVA_Build 7 135744604 1I CATCCAGATC -/A ATTTCCAGTT 3070 het 190 hom 38 1 32 5 A 1 2 282944 CASAVA_Build 7 135744732 1I GAAAGGAAAC -/A AAGCCTAGTG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 3 282945 CASAVA_Build 7 135758436 3D AATATTTCCC ACT/--- ATTAAGACTG 3070 het 3070 hom 39 20 18 6 ACT 1 0 282946 CASAVA_Build 7 135760062 1I GCCTGGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1973 hom 26 6 14 6 T 10 11 282947 CASAVA_Build 7 135760331 1D TGTGTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 T 12 11 282948 CASAVA_Build 7 135766784 1D GGGTTTTGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 48 het 25 0 16 9 T 9 8 282949 CASAVA_Build 7 135766837 1D ACATGGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 11 10 282950 CASAVA_Build 7 135767591 3I AATATCTCTT ---/CTC CTACAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 CTC 0 1 282951 CASAVA_Build 7 135777453 10D TTCTGGTGAC TATGTCCGTA/---------- TAGTATAGTT 3070 het 3070 ref 38 25 9 10 TATGTCCGTA 1 0 282952 CASAVA_Build 7 135781680 2D TGTAAAAAAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 GT 11 10 282953 CASAVA_Build 7 135790129 1D TGTAAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 44 1 30 13 A 13 12 282954 CASAVA_Build 7 135805306 1I AATATTGTCA -/G GGGGGGGTGT 2626 het 2626 ref 26 9 9 8 G 7 8 282955 CASAVA_Build 7 135805354 1I GTCTAAGTCT -/C CTTTCAGTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 1 2 282956 CASAVA_Build 7 135805540 2D GCAGTCTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 20 2 11 8 T 13 11 282957 CASAVA_Build 7 135806200 4I TTAACTGTAA ----/TTGT TTGTCAGTTA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 TTGT 1 2 282958 CASAVA_Build 7 135806734 3D AATAATTTCT TAA/--- TAAATATTAA 2953 het 1892 hom 13 5 6 3 TAA 2 1 282959 CASAVA_Build 7 135809674 1D ATAAGCATGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 50 31 12 8 T 9 8 282960 CASAVA_Build 7 135815519 2D CCCAGAATAA TG/-- TTTGACCAAA 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 TG 1 0 282961 CASAVA_Build 7 135817654 1D GGGAAGCAAG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 8 7 282962 CASAVA_Build 7 135830018 7D TTTTCTCATC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 29 3 15 11 T 21 14 282963 CASAVA_Build 7 135831156 1D TGAACAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 52 hom 32 1 29 2 A 11 10 282964 CASAVA_Build 7 135831525 6I CTACAAGAGT ------/AAAATC AAAATCCATT 3070 het 3070 hom 41 12 23 6 AAAATC 1 2 282965 CASAVA_Build 7 135833105 2D TCCTCCACTC TT/-- TTTCTTCTTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 5 3 282966 CASAVA_Build 7 135834327 1I TTATTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 11 12 282967 CASAVA_Build 7 135838139 2D GTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2328 het 2328 ref 23 8 10 5 T 14 12 282968 CASAVA_Build 7 135840317 1D ACACCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 11 10 282969 CASAVA_Build 7 135844135 2D TATCCTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 42 1 24 19 T 14 12 282970 CASAVA_Build 7 135873899 3I AAAAAAAAAC ---/AGT AGATGTTGGT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 AGT 0 1 282971 CASAVA_Build 7 135881000 1D TCTCTAGCAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 A 9 8 282972 CASAVA_Build 7 135888524 1I TTGTAAAAGC -/A AAAAACTGTT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 5 6 282973 CASAVA_Build 7 135889034 1D TAATGAGACA C/- CTACTATTTC 3070 het 3070 hom 48 19 24 6 C 2 1 282974 CASAVA_Build 7 135890248 5D ATGGCCTAAG AAGAT/----- AAGATAATTG 3070 het 3070 ref 38 22 13 7 AAGAT 2 1 282975 CASAVA_Build 7 135891183 1I CTCTTGGAGG -/A AAAAAAAAAA 1184 het 233 hom 27 3 7 17 A 12 13 282976 CASAVA_Build 7 135891204 2D ACAAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 1238 het 520 hom 25 8 7 10 A 12 10 282977 CASAVA_Build 7 135900658 1D GTATACCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2238 hom 30 8 11 12 T 12 11 282978 CASAVA_Build 7 135926260 1I AGTCCTGAGG -/A AAAATGGAAA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 A 4 5 282979 CASAVA_Build 7 135941830 1I AATACATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 A 10 11 282980 CASAVA_Build 7 135944285 3I AACTAATGGG ---/TAC TACTAGGCTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TAC 1 2 282981 CASAVA_Build 7 135945819 1I GGAAATAGCA -/T TGAATCTATA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 1 2 282982 CASAVA_Build 7 135946002 1I TATTTTATTC -/T TTTTGTAGCA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 4 5 282983 CASAVA_Build 7 135949183 1D CCATTCTCCC T/- GTCTCCTTCT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 1 0 282984 CASAVA_Build 7 135949273 1I CTTTACATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 T 10 11 282985 CASAVA_Build 7 135951516 1I CTGATCTATC -/A AACACCAGGT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 2 3 282986 CASAVA_Build 7 135955057 1I TTTTTCACAA -/T TTGTATTCAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 2 3 282987 CASAVA_Build 7 135957595 1I CTCTGGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 10 11 282988 CASAVA_Build 7 135958054 1I TCCTTGTCCC -/A ATTTTTGGTT 3070 hom 138 het 51 0 45 6 A 1 2 282989 CASAVA_Build 7 135960268 1I AATATAAAAC -/A AAACTACAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 282990 CASAVA_Build 7 135963280 1I TCTCAACACC -/T TTGTCAAAAA 3070 hom 82 het 35 0 30 5 T 2 3 282991 CASAVA_Build 7 135967341 1I13M1I TTACTTTTTA -TGGTCTATTCAGG-/TTGGTCTATTCAGGT TTTGATTTCT 3070 hom 40 het 22 0 14 12 N/A 0 0 282992 CASAVA_Build 7 135967385 1I16M1I TTTTCATAGG -TGTATGTGTCTAGGAA-/TTGTATGTGTCTAGGAAT TTGTCCCTTT 3070 hom 30 het 23 0 11 15 N/A 0 0 282993 CASAVA_Build 7 135967534 1I50M1I ATTTTATTGA -TTGGATTTTTTCCCCTTTATTCTTAGTTAGCCAGGCTAAAGGTTTGTCCA-/TTTGGATTTTTTCCCCTTTATTCTTAGTTAGCCAGGCTAAAGGTTTGTCCAT TTTGTTCAAC 3070 hom 44 het 20 0 15 16 N/A 0 0 282994 CASAVA_Build 7 135968574 1D TGCATCTTGC T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 7 6 282995 CASAVA_Build 7 135974170 2I AGGCTCTTCT --/TC TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TC 0 1 282996 CASAVA_Build 7 135977903 1I76M1I ACTCCATCTC -AAAAAAAAAAAGAAAGAAAAACAATATTTTCTTTAATGCTTCAAGATACAGGTTTACATTAATTGAGTGAAAGAAC-/AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAACAATATTTTCTTTAATGCTTCAAGATACAGGTTTACATTAATTGAGTGAAAGAACA ATATATATTT 3070 hom 54 het 22 0 19 19 N/A 0 0 282997 CASAVA_Build 7 135978059 1I GAACAAAATA -/T TTTGTTATAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 3 4 282998 CASAVA_Build 7 135980778 1I GGGATCATGG -/A AAAAATTACA 3070 hom 97 het 40 0 32 8 A 5 6 282999 CASAVA_Build 7 135981428 1I CACAAATCTC -/T TTTTGTCATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 5 283000 CASAVA_Build 7 135982903 1I TACATCTGTT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 77 het 47 1 42 4 A 7 8 283001 CASAVA_Build 7 135983082 1I TATGGCAATA -/T TTGGAAGTGT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 2 3 283002 CASAVA_Build 7 135984274 1I TCCCCTCTAA -/T TTGTTGACAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 2 3 283003 CASAVA_Build 7 135987699 1D ATCACCCCCC T/- GATGGCTCCT 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 T 1 0 283004 CASAVA_Build 7 135988385 1I TATTTTTTTT -/C CCCCTGGCAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 C 4 5 283005 CASAVA_Build 7 135989689 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 10 11 283006 CASAVA_Build 7 135990327 1I GAGCAGAAGA -/G GGGGTGGGTC 3070 hom 84 het 33 0 25 8 G 4 5 283007 CASAVA_Build 7 135993719 1I CATCTTCCCC -/A AACCTGAAGC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 2 3 283008 CASAVA_Build 7 135993859 1I TAATACAAAC -/A ATGCTACTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 1 2 283009 CASAVA_Build 7 135994999 1I TTCTCATAAA -/T TTTGTCAAAA 3070 hom 114 het 39 0 38 1 T 3 4 283010 CASAVA_Build 7 135995810 1I AGTCTGATAA -/T TGTTGACTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 2 283011 CASAVA_Build 7 135995955 1I50M1I TTGGGACCTC -TTTGTACAGTACTATTTCTTATAACTACATTTTTCTTTATTATTCATATA-/TTTTGTACAGTACTATTTCTTATAACTACATTTTTCTTTATTATTCATATAT TGTTCCTCTT 3070 hom 45 het 17 0 16 14 N/A 0 0 283012 CASAVA_Build 7 135996362 1I CTCTCTTCAA -/T TGTTGTAATA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 1 2 283013 CASAVA_Build 7 136000085 1I TACTTCCTCC -/T TTTTTGCTGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 5 6 283014 CASAVA_Build 7 136000207 1I10M1I GTTGCAAACC -ACGTGCAGAC-/AACGTGCAGACA ATTTCTTAAA 3070 hom 21 het 16 0 8 9 N/A 0 0 283015 CASAVA_Build 7 136029217 2I CAAGTGACTG --/CA CACAACAAAT 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 CA 2 3 283016 CASAVA_Build 7 136078092 2D AGAACATAGG AA/-- AAAAGTCCAC 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 6 4 283017 CASAVA_Build 7 136085402 1D AGAAAGAGAG A/- AAAAAGAGAC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 6 5 283018 CASAVA_Build 7 136095626 1I AGTTCTCAAG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 T 8 9 283019 CASAVA_Build 7 136102076 1I TTAGGTGTGA -/T TTTTAAACAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 4 5 283020 CASAVA_Build 7 136107928 1D AAGACAAATT A/- AAAAAAAAAA 2582 het 899 hom 15 4 7 4 A 15 14 283021 CASAVA_Build 7 136116086 1I TGGCTTTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 10 11 283022 CASAVA_Build 7 136122010 1I GATTTATTCC -/G TATCTTAAGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 0 1 283023 CASAVA_Build 7 136133914 1I AAAGTATAAT -/A AATTAAAAAA 177 het 177 ref 22 6 4 12 A 2 3 283024 CASAVA_Build 7 136140716 6D TAATAATATA TATAAT/------ TATAAGATAA 2734 het 2734 ref 15 9 6 2 TATAAT 1 0 283025 CASAVA_Build 7 136143942 1D TATACAAACA T/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 1 0 283026 CASAVA_Build 7 136148521 1I CATTTAGCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 9 10 283027 CASAVA_Build 7 136152727 5D ACAAACAAAA TCACC/----- TCACCTCACC 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 TCACC 3 2 283028 CASAVA_Build 7 136159183 2D AACCTAGACC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 15 8 A 11 9 283029 CASAVA_Build 7 136166387 3D ATTAGATCAC TAA/--- TACATTGCCG 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 TAA 1 0 283030 CASAVA_Build 7 136172524 3I AATAAAAAAT ---/AAA AAAATCAAAA 3070 het 2024 hom 22 7 14 1 A 4 7 283031 CASAVA_Build 7 136174305 1I GTAAAACAGT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 7 8 283032 CASAVA_Build 7 136174898 2D AAAAAAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 41 0 31 10 A 15 13 283033 CASAVA_Build 7 136175747 4D TAGAAGAAAT AAAG/---- AAAAAAAATC 2796 het 2796 ref 17 7 7 5 AAAG 1 0 283034 CASAVA_Build 7 136176076 1D ATTTTTTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 9 8 283035 CASAVA_Build 7 136189230 1D ATTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 24 1 16 7 T 13 12 283036 CASAVA_Build 7 136193901 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TA 5 6 283037 CASAVA_Build 7 136195662 1I TGGTGGGTGG -/A TCACCTGAGG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 0 1 283038 CASAVA_Build 7 136200102 2I CTCTTAAACA --/TT GTCTGTGTGA 3070 het 3070 hom 53 21 28 4 T 0 2 283039 CASAVA_Build 7 136200605 1D AATGTAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 10 9 283040 CASAVA_Build 7 136201035 1D GGGAGTATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 14 18 9 T 10 9 283041 CASAVA_Build 7 136204034 16D CGCGCGCGGG CACACACACACACACA/---------------- CACACACACA 3070 het 2447 hom 30 8 14 10 CA 14 6 283042 CASAVA_Build 7 136206908 1I CATTGATAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 7 8 283043 CASAVA_Build 7 136207210 1I CTATTATCAA -/T AATGTGTTCC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 0 1 283044 CASAVA_Build 7 136209090 1I TGTTTTTGTT -/A AGATCCTCCA 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 A 1 2 283045 CASAVA_Build 7 136209838 2I TTCCCCCATG --/CC CCCTCCCTCT 3070 hom 30 het 14 0 10 4 C 3 5 283046 CASAVA_Build 7 136212130 2I CAATATTCAT --/AA GTCACCAGGT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 0 2 283047 CASAVA_Build 7 136215334 1I CTCTTGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 810 hom 37 2 26 9 T 13 14 283048 CASAVA_Build 7 136215461 1D AGACATGGGA T/- TCTAGAGTAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 2 1 283049 CASAVA_Build 7 136219773 1D ATGAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 13 11 T 13 12 283050 CASAVA_Build 7 136222624 1I CGCTTTTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 10 11 283051 CASAVA_Build 7 136232985 2I CAGTCATGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 10 12 283052 CASAVA_Build 7 136251436 20I ACTTTCCTAT --------------------/ATACCATCATTACAATTGCC ATTTTGGTTT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 ATACCATCATTACAATTGCC 0 1 283053 CASAVA_Build 7 136252122 2D TCCCTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 TC 10 9 283054 CASAVA_Build 7 136262323 4I ATAGTGTAAC ----/AGTT AGGACGTCAG 3070 het 3070 ref 58 27 22 9 AGTT 0 1 283055 CASAVA_Build 7 136265881 1D ATACGATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 138 hom 13 1 10 3 A 11 10 283056 CASAVA_Build 7 136270050 1I CAATCTCCAG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 24 8 14 3 A 6 7 283057 CASAVA_Build 7 136270147 2D GAAAATAACC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 11 9 283058 CASAVA_Build 7 136271892 2D CATGTACATG TC/-- TCTGTCTGAG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 TC 2 1 283059 CASAVA_Build 7 136272783 4I TTTTTTATTT ----/AATA AACTAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 AATA 0 1 283060 CASAVA_Build 7 136279004 23I TTTTTCAAGG -----------------------/CAGGATCATGTTTCAAATTGATA CAGTATCAAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 CAGGATCATGTTTCAAATTGATA 0 1 283061 CASAVA_Build 7 136279761 2D TATGTATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 57 23 31 3 TG 7 6 283062 CASAVA_Build 7 136285044 1D TTTTTTTTTT G/- GAGACAGAGT 885 het 192 hom 12 2 4 6 G 2 1 283063 CASAVA_Build 7 136287866 1D TTTTTAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 10 9 283064 CASAVA_Build 7 136289020 1D AAATTTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 11 10 283065 CASAVA_Build 7 136292115 1I CATATGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 10 11 283066 CASAVA_Build 7 136296976 4D GGTAAATTCT CAAA/---- CATTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 CAAA 1 0 283067 CASAVA_Build 7 136297429 1D GGTAATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 28 10 T 12 11 283068 CASAVA_Build 7 136297557 1D GTAGCTGGGA T/- TTACAGGCAT 3070 hom 90 het 33 0 29 4 T 3 2 283069 CASAVA_Build 7 136302001 1I ATAACTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 13 7 T 11 12 283070 CASAVA_Build 7 136303699 1D AAGGGAACCC T/- TGTATGCTGT 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 T 2 1 283071 CASAVA_Build 7 136305993 2I TGAAAAAAAA --/AT GTTTTTCAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 0 1 283072 CASAVA_Build 7 136307102 6D ACTAAAAGAC AAATTT/------ AAAAGCATCT 3070 het 3070 hom 37 17 19 4 AAATTT 1 0 283073 CASAVA_Build 7 136312676 1D TCCCTGAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 41 0 34 8 T 10 9 283074 CASAVA_Build 7 136313328 2I TTAATATAAG --/AT AAATAGACAC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AT 0 1 283075 CASAVA_Build 7 136322415 2D TATTTCTCTT TC/-- TTTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 TC 1 0 283076 CASAVA_Build 7 136324510 1D AGGTTAAAGA T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 5 4 283077 CASAVA_Build 7 136333618 1I TGACACAAAG -/C TGAGTCCTCT 3070 het 3070 ref 64 28 29 7 C 0 1 283078 CASAVA_Build 7 136360702 1D AAATTGGATT G/- GAGATTAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 18 0 G 2 1 283079 CASAVA_Build 7 136369218 1I CTTGATATCC -/A AAGCAGAAAT 3070 hom 34 het 24 0 12 12 A 2 3 283080 CASAVA_Build 7 136369699 1I AAATTACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 9 10 283081 CASAVA_Build 7 136374037 1D TACAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1609 hom 19 5 14 1 A 12 11 283082 CASAVA_Build 7 136389616 6D TTCTCTTACA TTAATT/------ TTAAGTATTC 3070 hom 108 het 37 0 36 2 TTAATT 1 0 283083 CASAVA_Build 7 136390800 3I ATCCTTACTG ---/TCA TCATTATCAC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 TCA 1 2 283084 CASAVA_Build 7 136408077 1I AAATTTTATT -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 76 het 32 0 24 8 C 9 10 283085 CASAVA_Build 7 136409681 1I TCTGAAATTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 80 het 30 0 27 3 A 8 9 283086 CASAVA_Build 7 136414700 1I AAATAAGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 283087 CASAVA_Build 7 136458760 1I ATTAGGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 10 11 283088 CASAVA_Build 7 136468394 1D CATTTAATAT A/- AAATTTAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 4 3 283089 CASAVA_Build 7 136469085 1D ACCCTCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 A 13 12 283090 CASAVA_Build 7 136471028 3D CATGTGGAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 28 2 17 11 A 14 11 283091 CASAVA_Build 7 136471624 4I GGAACTTAAA ----/TAAT TAAACAAGAA 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 TAAT 0 1 283092 CASAVA_Build 7 136476144 4D TATAGCTAAT AAAC/---- AAATTAAAGA 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 AAAC 1 0 283093 CASAVA_Build 7 136476386 1D TTCTTTCTGC A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 7 6 283094 CASAVA_Build 7 136481745 3D ATCCAGTGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 34 0 26 10 A 15 12 283095 CASAVA_Build 7 136482348 6I AGAAATTGTT ------/AGTAAC AGTAAAATCA 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 AGTAAC 0 1 283096 CASAVA_Build 7 136490044 1D TTATTTTATG T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 7 6 283097 CASAVA_Build 7 136495218 12D AAATATTTTG ATGGTAAATAGT/------------ ATATTTTAAA 2963 het 2963 ref 23 16 7 0 ATGGTAAATAGT 1 0 283098 CASAVA_Build 7 136501332 3I TTGGCAAAAG ---/AGA AGATTTTAGA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AGA 1 2 283099 CASAVA_Build 7 136501439 14D GAAAACAGGA TGTAGGTTAGTTTT/-------------- TGCATTTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 21 6 TGTAGGTTAGTTTT 1 0 283100 CASAVA_Build 7 136505276 1D TACTTGTTAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 8 7 283101 CASAVA_Build 7 136505506 12I TGGAGGCCTT ------------/GATGTGGCTCTG GAATGGATAC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 GATGTGGCTCTG 0 1 283102 CASAVA_Build 7 136506493 1I ATGAGCAAGG -/T TCTCTCACAC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 1 2 283103 CASAVA_Build 7 136512753 1D AATGCTGCTA G/- GCGTATGTTT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 G 2 1 283104 CASAVA_Build 7 136534597 3I CTTCTCACGT ---/TTA TTGTTATAAG 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 TTA 0 1 283105 CASAVA_Build 7 136542419 4I CTTTCCTCTC ----/TCCT TCCTTCCTTC 3070 hom 44 het 17 0 15 2 TCCT 3 4 283106 CASAVA_Build 7 136572583 1D GGAAGAGGGG C/- CTCATAGGGC 3070 het 3070 hom 29 9 13 8 C 2 1 283107 CASAVA_Build 7 136589583 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2879 hom 36 11 14 11 A 15 14 283108 CASAVA_Build 7 136589828 1I TTGCAGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 11 13 9 T 13 14 283109 CASAVA_Build 7 136597313 1I AAAGAGTTCT -/G GGTTTCTATG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 G 2 3 283110 CASAVA_Build 7 136602604 2I TGCCTCTTTT --/TC TCTCTCTTTC 3070 hom 53 het 23 0 16 7 TC 3 4 283111 CASAVA_Build 7 136622740 1I AAAATATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 10 11 283112 CASAVA_Build 7 136633185 1I TAGAAGCTTT -/C CCAAAGTGGG 3070 hom 105 het 43 0 35 8 C 2 3 283113 CASAVA_Build 7 136633701 1I TGGAAATTTA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 78 het 37 0 27 10 T 8 9 283114 CASAVA_Build 7 136636862 2I TATATTAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 46 1 39 6 A 11 13 283115 CASAVA_Build 7 136637243 4D ACTTCTAGTA ACTG/---- ACTATTTTTG 3070 het 3070 ref 28 17 8 5 ACTG 1 0 283116 CASAVA_Build 7 136648367 2I TCTCGTTCCC --/CT CCCTCTCATT 3070 hom 61 het 26 0 20 6 CT 0 1 283117 CASAVA_Build 7 136666361 1I GTTCAAGTCC -/A ATGCTGTTTC 3070 hom 138 het 51 0 46 5 A 1 2 283118 CASAVA_Build 7 136666466 4I AAACCCACAG ----/AGTC AGCCTGCTTT 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 AGTC 0 1 283119 CASAVA_Build 7 136667682 3I TGGAAAAAAA ---/AAC AATATTTCAT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 AAC 0 1 283120 CASAVA_Build 7 136670419 1I GCATGGCACA -/T TGTATACATA 1972 hom 10 het 4 0 4 0 T 1 2 283121 CASAVA_Build 7 136671215 3D GTCTTCTCGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1992 hom 45 15 15 16 T 17 14 283122 CASAVA_Build 7 136675153 2D GGTTAGAGAC AG/-- AATGCTATTT 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 AG 1 0 283123 CASAVA_Build 7 136677814 4D TGTGTGTTCC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 991 hom 31 5 11 17 TG 10 8 283124 CASAVA_Build 7 136687163 2D TTCATGTGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 40 1 25 14 A 16 14 283125 CASAVA_Build 7 136695756 2D TCTTCATATA TC/-- TCTCTCGCCT 3070 het 3070 ref 48 30 17 1 TC 4 3 283126 CASAVA_Build 7 136695851 1D CTTTTAAGTT G/- GGCAAAAACA 3070 het 3070 ref 42 25 11 7 G 3 2 283127 CASAVA_Build 7 136699768 13D AACTTCCAGG CCATTGCCATGGC/------------- CCATTGCCAT 3070 het 3070 hom 44 20 17 9 CCATTGCCATGGC 2 1 283128 CASAVA_Build 7 136700949 5D AAAAAATCTT CTTTA/----- CTTAAGTGAT 3070 het 3070 ref 37 23 14 4 CTTTA 1 0 283129 CASAVA_Build 7 136706938 1I TAAGTGTGTA -/C TTTTTAACAG 3070 hom 108 het 39 0 35 4 C 0 1 283130 CASAVA_Build 7 136709664 1I GCATATATGT -/G CTTTTTATCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 0 1 283131 CASAVA_Build 7 136710671 1I CTCTTCCCTC -/T TTTTTTTTTT 2498 het 2498 ref 41 13 8 20 T 13 14 283132 CASAVA_Build 7 136710733 1D TAAAATCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 39 0 20 20 T 16 15 283133 CASAVA_Build 7 136712427 3D AATGAGTAAT AAC/--- AACTTAATTT 3070 het 3070 ref 41 20 19 3 AAC 2 1 283134 CASAVA_Build 7 136714389 5D ATCATCAATA TTTTG/----- TTTTAAAAGT 3070 het 3070 hom 25 8 15 6 TTTTG 1 0 283135 CASAVA_Build 7 136716001 1I TATCATTTGC -/T TTCCATCTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 3 283136 CASAVA_Build 7 136718598 1I AAAAAGATAT -/G GTTTCTACTA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 G 1 2 283137 CASAVA_Build 7 136719687 3I TAGGTAAACA ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 9 12 283138 CASAVA_Build 7 136728136 1I GCTTCTCTCC -/A AAAAAATTCC 3070 het 3070 hom 40 19 21 0 A 6 7 283139 CASAVA_Build 7 136728512 1I GCTATTTCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 9 10 283140 CASAVA_Build 7 136731325 1I AGCCATTCTC -/T TCTGTGCATA 3070 het 3070 ref 56 28 28 0 T 1 2 283141 CASAVA_Build 7 136740123 1I TGACTCAGTC -/T TTGCAAGAGT 3070 hom 160 het 60 0 53 7 T 2 3 283142 CASAVA_Build 7 136740535 1I ATTGTTATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 9 10 283143 CASAVA_Build 7 136741461 1D TCAAGAAGAC A/- GCAAATAGGA 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 A 1 0 283144 CASAVA_Build 7 136743286 1D TATTAGCTGC A/- AAGAGAGACA 3070 hom 126 het 47 0 42 6 A 3 2 283145 CASAVA_Build 7 136749823 2D TGTTATGTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 42 0 35 8 A 16 14 283146 CASAVA_Build 7 136751293 1D ACCAACAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 8 7 283147 CASAVA_Build 7 136753933 1D TATTCAGTTA T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 T 7 6 283148 CASAVA_Build 7 136761935 1D TGTATTCAGG A/- AACCCATCTC 1416 het 910 hom 5 2 3 0 A 3 2 283149 CASAVA_Build 7 136786488 1D AGGTTCCCAA G/- GAAGTAAGTT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 G 2 1 283150 CASAVA_Build 7 136867321 1I AAACCAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 10 283151 CASAVA_Build 7 136872201 1I AAAACAAATT -/A AAAAAAAAAA 2883 het 2883 ref 34 13 11 10 A 10 11 283152 CASAVA_Build 7 136957348 5D3M2D ATGATTATTT GTGTAACAAC/-----TCA-- TAACTGAAAG 3070 het 3070 ref 37 21 15 3 N/A 0 0 283153 CASAVA_Build 7 136990139 1D GAATTACCTG A/- AAAAAAAAAA 1356 het 1356 ref 41 30 3 8 A 13 12 283154 CASAVA_Build 7 136997827 1D CCGCGCCCGG C/- CCCAGCACAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 4 3 283155 CASAVA_Build 7 137025318 6I AAAAACAAAA ------/ACAAAG ACAAAGAAAA 3070 het 1639 hom 26 7 11 8 ACAAAG 1 2 283156 CASAVA_Build 7 137036652 3I AAAATAAAGT ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 TAA 5 6 283157 CASAVA_Build 7 137058176 1I TGACTACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 844 hom 42 3 26 13 A 14 15 283158 CASAVA_Build 7 137074011 1D AGATGAGGTT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 36 hom 33 2 17 14 C 11 10 283159 CASAVA_Build 7 137075064 1D TTGTTTTTGG T/- CCCTGTTTTT 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 T 1 0 283160 CASAVA_Build 7 137107515 1D AATTTTAAAA C/- AAAAGGCTGA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 C 1 0 283161 CASAVA_Build 7 137178517 1D TTCTGAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1495 het 1495 ref 42 33 4 5 T 11 10 283162 CASAVA_Build 7 137189864 3I AATCCCAAAT ---/AAA GAAGATTCCA 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 A 0 3 283163 CASAVA_Build 7 137199540 1I AAACAGGTGG -/A TCACTTGAGG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 0 1 283164 CASAVA_Build 7 137203620 1I AGCCTTTTTA -/T TGTGACCATC 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 T 1 2 283165 CASAVA_Build 7 137207288 4I ATATAATAGT ----/TAAA TAAATTATAA 2607 het 2607 ref 20 10 6 4 TAAA 1 2 283166 CASAVA_Build 7 137210993 1D AATTGCTGCA T/- TTCCCATATT 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 T 3 2 283167 CASAVA_Build 7 137234042 1I ACTAAGACCA -/G GGAAGACTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 2 3 283168 CASAVA_Build 7 137234848 1I AATCCCCCCA -/G GGGAGAGGAA 3070 hom 80 het 32 0 25 7 G 3 4 283169 CASAVA_Build 7 137238080 1I ATTGTTGTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 10 283170 CASAVA_Build 7 137253483 5I TGCTTTTGCT -----/TTTTG TTTTGTTTTG 3008 het 3008 ref 39 21 8 10 TTTTG 3 4 283171 CASAVA_Build 7 137263454 3D AAGCTGTCAC TGG/--- TGGTAATGTG 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 TGG 2 1 283172 CASAVA_Build 7 137266214 1I CATTCCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1706 hom 34 8 14 12 A 15 16 283173 CASAVA_Build 7 137308462 3D AATAATAATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2846 hom 28 9 11 9 A 15 12 283174 CASAVA_Build 7 137308972 3D AAGAGGGACC CTA/--- CTAGTCAGCC 3070 het 3070 ref 47 24 21 3 CTA 2 1 283175 CASAVA_Build 7 137309341 1D TCTGCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 A 12 11 283176 CASAVA_Build 7 137317734 1I ATCTTGAATT -/G TAGCTCCCGC 3070 het 3070 ref 41 16 10 15 G 0 1 283177 CASAVA_Build 7 137327194 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 256 hom 25 2 17 7 A 14 13 283178 CASAVA_Build 7 137332845 1D CGTTTCTACC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 8 283179 CASAVA_Build 7 137334387 3D TCTGAAATAC ATG/--- ATATTAACAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 ATG 1 0 283180 CASAVA_Build 7 137341628 1D TTTTTTTTTT A/- AATAATACAA 1443 het 1006 hom 33 10 8 15 A 3 2 283181 CASAVA_Build 7 137342692 3I TACAGGTACG ---/AGC AGCAGCCAGA 3070 hom 91 het 41 0 27 14 AGC 2 3 283182 CASAVA_Build 7 137343218 1I GCAGTGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 44 0 36 8 T 10 11 283183 CASAVA_Build 7 137346278 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 11 10 283184 CASAVA_Build 7 137346399 1D TCAAGACCAG C/- CAGGGAAACA 3070 hom 83 het 32 0 28 4 C 2 1 283185 CASAVA_Build 7 137347848 2D TTCTTTCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2675 het 107 hom 28 2 13 13 T 18 16 283186 CASAVA_Build 7 137356753 1I CTGGGCCTCC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 8 9 283187 CASAVA_Build 7 137357274 1D GAAAGTTGAG T/- TTTACCCTCT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 4 3 283188 CASAVA_Build 7 137394048 1I TTGCCAGTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 8 9 283189 CASAVA_Build 7 137422601 2D CCTCCCAACA CT/-- GTTTGTCAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 CT 1 0 283190 CASAVA_Build 7 137435160 1D ATAGTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 A 11 10 283191 CASAVA_Build 7 137437601 1I ATACCTATAA -/T CCCAGCACTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 0 1 283192 CASAVA_Build 7 137448602 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2268 het 2268 ref 28 19 5 6 A 15 14 283193 CASAVA_Build 7 137456350 1I AACTCCACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2221 hom 25 5 15 5 A 11 12 283194 CASAVA_Build 7 137463279 3I21M1D GACAATCCCC ---ACAACACTGAAAGTCGACACAT/ACAACAACACTGAAAGTGGACACA- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 29 17 18 4 N/A 0 0 283195 CASAVA_Build 7 137479902 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 A 9 10 283196 CASAVA_Build 7 137480682 8I CATAATTATG --------/TCTTTTTT TCTTTTTTTC 2388 het 2388 ref 24 14 6 4 TCTTTTTT 1 2 283197 CASAVA_Build 7 137483839 5I TGTGTCAAAC -----/TAAAT TAAATTATAA 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 TAAAT 1 2 283198 CASAVA_Build 7 137528836 1I AAAAAAAAAA -/G AAATTAACGT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 G 0 1 283199 CASAVA_Build 7 137532333 1D TATTGTGGGA C/- CTTGTGATTG 3070 het 2773 hom 22 7 12 3 C 2 1 283200 CASAVA_Build 7 137534926 28D AGGGCAATAC ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 1400 het 427 hom 8 1 5 5 AT 21 7 283201 CASAVA_Build 7 137541242 1I ATGATTATTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 T 8 9 283202 CASAVA_Build 7 137543503 1I AGGTCAGCTA -/T TGTCTCAGCT 3070 hom 87 het 33 0 26 7 T 1 2 283203 CASAVA_Build 7 137546875 2D TCGGGAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 12 10 283204 CASAVA_Build 7 137548007 1I TTGAGCTATA -/T TGACAGAGAT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 1 2 283205 CASAVA_Build 7 137553942 1I ACTAGAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 10 11 283206 CASAVA_Build 7 137555094 1I CTCTTTTGTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 8 9 283207 CASAVA_Build 7 137559103 1D GGGGTGGAGC T/- GTCAGAAATT 3070 het 3070 ref 35 18 10 8 T 1 0 283208 CASAVA_Build 7 137565655 1I ACCTAACAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 9 10 283209 CASAVA_Build 7 137577305 1D AAAGTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1399 hom 19 4 9 6 T 12 11 283210 CASAVA_Build 7 137580909 2D TCCCTGTCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 86 hom 35 1 22 14 A 13 11 283211 CASAVA_Build 7 137591726 1I ATAAATGTTC -/A ATATGATGTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 283212 CASAVA_Build 7 137639502 1I AGGCCTAGTT -/A AAGAGGAGAG 3070 het 3070 ref 55 30 20 5 A 2 3 283213 CASAVA_Build 7 137640030 4D CTCCATCGCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 65 het 28 0 22 7 AAAT 5 4 283214 CASAVA_Build 7 137643975 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAATAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 7 283215 CASAVA_Build 7 137646955 4D CCTTACTTTC CTAA/---- CTGTGGTTCC 3070 hom 39 het 14 0 14 1 CTAA 1 0 283216 CASAVA_Build 7 137648131 1I GGATCAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 15 1 9 5 T 13 14 283217 CASAVA_Build 7 137656743 1I TGAAACTTTG -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 39 het 23 0 14 9 T 2 3 283218 CASAVA_Build 7 137658995 1I GCATGCTGAC -/A TATAGTTAAC 3070 het 3070 hom 54 20 30 4 A 0 1 283219 CASAVA_Build 7 137660187 2D ATAGAGTGAC AG/-- AGAGAGAACT 3070 het 3070 hom 37 16 16 9 AG 4 3 283220 CASAVA_Build 7 137666087 23D GCCCTCCCCG ACCTGTCCAATAATTTCCTCTTA/----------------------- AAGAGGTGGC 2686 het 2686 ref 30 23 8 5 ACCTGTCCAATAATTTCCTCTTA 1 0 283221 CASAVA_Build 7 137674133 1D TTTTGTGGGG T/- TTTTTTTGTT 1882 hom 39 het 19 0 11 9 T 8 7 283222 CASAVA_Build 7 137683173 1I CTGCGTAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 9 10 283223 CASAVA_Build 7 137684886 2D TCAATTATCT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 22 0 12 12 A 11 9 283224 CASAVA_Build 7 137685262 3D AGCCTAAGTC TAG/--- TAGGACTGAA 3070 het 3070 ref 52 30 18 5 TAG 2 1 283225 CASAVA_Build 7 137689270 1I ACAGTGGCAA -/G GATCATAGCT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 G 1 2 283226 CASAVA_Build 7 137697906 1D TCTCAAAAAC A/- AAAACAAACA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 5 4 283227 CASAVA_Build 7 137700063 1D GAACCACAAT G/- GGCCAGGCGT 3070 hom 46 het 18 0 16 2 G 3 2 283228 CASAVA_Build 7 137703190 2D ATCATATCCC CT/-- GTGACCTGCA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 CT 1 0 283229 CASAVA_Build 7 137705449 1D GATAAATTTT G/- GGGGAAATTG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 G 5 4 283230 CASAVA_Build 7 137717560 2D ATAATAATGA AC/-- ACACCATAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AC 3 2 283231 CASAVA_Build 7 137722418 1D ACAAAACCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 52 het 23 0 15 8 T 10 9 283232 CASAVA_Build 7 137724551 1D GAGAATTCAG T/- GTCTTATCTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 0 283233 CASAVA_Build 7 137739010 1I TCGTTTTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 9 10 283234 CASAVA_Build 7 137739946 5I GAAAGGAAGG -----/AACTT AACTGGCAAA 3070 het 3070 hom 27 10 9 8 AACTT 0 1 283235 CASAVA_Build 7 137740477 2D TATTCTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 13 11 283236 CASAVA_Build 7 137747351 1D AACTTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 902 hom 16 4 9 3 T 11 10 283237 CASAVA_Build 7 137750274 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 270 hom 25 1 17 7 TG 8 9 283238 CASAVA_Build 7 137753982 1I TGTGGTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 26 0 16 10 T 13 14 283239 CASAVA_Build 7 137761529 1I GTTGGAGACC -/A AGCCTGGGCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 1 2 283240 CASAVA_Build 7 137793934 4D GAAGGAACTA AAAC/---- AAAGGGAACA 3070 het 3070 ref 52 29 18 5 AAAC 1 0 283241 CASAVA_Build 7 137812345 2D TTTGTGTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 45 0 31 15 TG 7 6 283242 CASAVA_Build 7 137813684 2D CCCAGCACTC TG/-- GAAGGCTGAG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 TG 1 0 283243 CASAVA_Build 7 137815410 1D GGGCCATGAA T/- TAAGTTTTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 2 1 283244 CASAVA_Build 7 137819699 1I TGGCCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 2122 het 2122 ref 29 11 9 9 T 13 14 283245 CASAVA_Build 7 137827237 1I TTGGTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 11 283246 CASAVA_Build 7 137836253 1D TGTAAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 10 A 11 10 283247 CASAVA_Build 7 137838446 1I CCTTAAAAAA -/T ATCACACCAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 0 1 283248 CASAVA_Build 7 137838748 1D TGTAAAAAAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 9 8 283249 CASAVA_Build 7 137858139 3D TCAAATCATC AAG/--- AAGAAATTCC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 AAG 2 1 283250 CASAVA_Build 7 137893234 2D TTATTCTCTC AG/-- GGGGCCATTC 3070 het 3070 ref 40 20 13 8 AG 1 0 283251 CASAVA_Build 7 137900712 1D TCATCCTGTT C/- CTGCTTAGGT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 C 2 1 283252 CASAVA_Build 7 137904032 6I ACATTATCTT ------/AAAGTA AAAGTTATCA 3070 hom 69 het 24 0 22 2 AAAGTA 0 1 283253 CASAVA_Build 7 137907148 13D GAGCCACTAC ACCCAGCCAGTAT/------------- GACTATTCCA 3070 het 3070 ref 20 10 11 3 ACCCAGCCAGTAT 1 0 283254 CASAVA_Build 7 137907746 41D ACAGAAAGTA AAATTCTTTCTGCTTTTTCCTCTGCAGTCCTCATACAGGTG/----------------------------------------- AACCTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 25 12 4 AAATTCTTTCTGCTTTTTCCTCTGCAGTCCTCATACAGGTG 1 0 283255 CASAVA_Build 7 137908700 3D TTCGATAATA ATT/--- ATTAAGTTAT 3070 het 3070 ref 36 23 10 5 ATT 2 1 283256 CASAVA_Build 7 137911860 3D AAATTTTAAT AAC/--- TACTATATAT 1773 het 1773 ref 20 14 5 2 AAC 1 0 283257 CASAVA_Build 7 137914043 2D GTGCTTTTAA CT/-- ATATCTACAT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 CT 1 0 283258 CASAVA_Build 7 137914307 1I TCTCTATTTA -/T TTTTGGTATT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 T 4 5 283259 CASAVA_Build 7 137920881 1D AAATGTTTGA T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 53 22 27 4 T 5 4 283260 CASAVA_Build 7 137924410 4D GCCCTATGTA AATT/---- AATAGTTGAT 3070 het 3070 hom 41 13 25 4 AATT 1 0 283261 CASAVA_Build 7 137925563 1D GGGTGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1362 het 1225 hom 29 12 6 11 T 19 18 283262 CASAVA_Build 7 137926430 1D GTATATTTAG A/- AAAACCCCAT 1911 het 1911 ref 14 8 4 2 A 5 4 283263 CASAVA_Build 7 137942311 1I CTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 23 8 T 10 11 283264 CASAVA_Build 7 137951626 1I TCTTTAATAC -/T TTTTTTTTTT 3045 hom 47 het 22 0 12 10 T 13 14 283265 CASAVA_Build 7 137953995 2D GCACACGCGC GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 62 het 23 0 20 3 GA 7 6 283266 CASAVA_Build 7 137962137 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 30 0 26 4 A 13 12 283267 CASAVA_Build 7 137968873 2D AATAAATCTC TT/-- TTAACAGTCA 3070 hom 122 het 43 0 38 5 T 4 2 283268 CASAVA_Build 7 137973939 1D AAGTTCAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 9 8 283269 CASAVA_Build 7 137975200 1D ACTATGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 32 0 22 11 T 12 11 283270 CASAVA_Build 7 137975507 1I TTTTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 19 0 11 8 T 10 11 283271 CASAVA_Build 7 137977212 2D GTATGTGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 31 het 20 0 17 3 AC 12 11 283272 CASAVA_Build 7 137984474 1D TATGACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 3 A 11 10 283273 CASAVA_Build 7 137987902 2D GGAAAAGTTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 89 het 35 0 29 7 T 11 9 283274 CASAVA_Build 7 137990932 5D CTATTATATA TATAT/----- TATACTAATA 3070 hom 24 het 10 0 9 3 TATAT 1 0 283275 CASAVA_Build 7 138025142 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 698 het 698 ref 10 5 2 3 A 17 16 283276 CASAVA_Build 7 138038096 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 522 hom 24 3 13 8 A 16 15 283277 CASAVA_Build 7 138039888 2D GCCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 27 2 13 12 A 18 16 283278 CASAVA_Build 7 138045236 4I TGGCCTGAAG ----/CAAT CAATCCTCCT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 CAAT 1 2 283279 CASAVA_Build 7 138048566 1D CTCCAGCCTG A/- AAAAAAAAAA 1360 het 120 hom 17 2 9 6 A 19 18 283280 CASAVA_Build 7 138055969 1D CGCCCAGGCT G/- GGAGTACAGT 3070 hom 50 het 19 0 17 2 G 3 2 283281 CASAVA_Build 7 138068798 1I AGTGTGGCCC -/A ACAGGCCAAT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 1 2 283282 CASAVA_Build 7 138073312 4I CTCCCAAAGT ----/GCTG GCTGGGATTA 1622 het 666 hom 10 3 5 2 GCTG 1 2 283283 CASAVA_Build 7 138104433 2D GAACAGTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 28 3 15 11 A 16 14 283284 CASAVA_Build 7 138106250 1D CTGCCTGGTC A/- TGACAAATCC 3070 hom 120 het 48 0 39 10 A 1 0 283285 CASAVA_Build 7 138106727 1I CACTCTGTTG -/C CCTGGGCTCG 3070 hom 21 het 22 0 13 9 C 2 3 283286 CASAVA_Build 7 138107178 1I AGTGCTGGGA -/T TTACAGGCAT 3070 het 292 hom 37 2 19 16 T 2 3 283287 CASAVA_Build 7 138110431 2I AGGGGGGTGC --/TT TTTTTTTTAA 2575 het 2575 ref 36 21 8 7 T 8 10 283288 CASAVA_Build 7 138121867 1I TTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1149 hom 23 4 11 8 A 12 13 283289 CASAVA_Build 7 138124507 2D TTTTTGGGGG GT/-- TTTTTTTTGT 612 het 612 ref 29 16 7 6 GT 1 0 283290 CASAVA_Build 7 138130189 1I CCTATTTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 871 hom 29 7 13 9 A 0 1 283291 CASAVA_Build 7 138131103 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 458 hom 25 2 19 4 T 9 10 283292 CASAVA_Build 7 138136064 1I CAGCTCACTG -/A AACCTCCGCC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 2 3 283293 CASAVA_Build 7 138137451 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 9 283294 CASAVA_Build 7 138138559 4I GGCCCCTGGG ----/CCTT CTGTGCCCAG 3070 het 2855 hom 42 10 20 12 CCTT 0 1 283295 CASAVA_Build 7 138143407 6D TATAGAAGCA TATTTT/------ TAAACTTGGA 3070 hom 89 het 34 0 30 5 TATTTT 1 0 283296 CASAVA_Build 7 138145063 1I AATTGTAATT -/A AAAAAAAAAA 776 het 776 ref 32 23 5 4 A 11 12 283297 CASAVA_Build 7 138150771 1D AGGGGTATAC T/- TTTTTTTAGG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 8 7 283298 CASAVA_Build 7 138153383 1D CTGGCATAGT G/- ACTACACTAC 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 G 1 0 283299 CASAVA_Build 7 138154703 1D ATGAGTGACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 9 15 6 A 10 9 283300 CASAVA_Build 7 138183218 1I GTGTTTTATA -/T TTCTAAGTGT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 2 3 283301 CASAVA_Build 7 138186362 1D TCTTTACATT G/- TTTTGATGTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 1 0 283302 CASAVA_Build 7 138202853 1D AAAAAAAAAA T/- AATAAAAATA 1530 het 1530 ref 29 15 8 6 T 1 0 283303 CASAVA_Build 7 138237255 2I ACTGTATTAT --/AC ACTTTCACGG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AC 1 2 283304 CASAVA_Build 7 138283981 1D GTTTTGTGGC T/- TTTTTTTTTT 766 het 766 ref 19 4 4 11 T 15 14 283305 CASAVA_Build 7 138306231 1I25M1I AGGCCCAAAC -AGAGAACAAAGAAGAAAGAAGTGAC-/AAGAGAACAAAGAAGAAAGAAGTGACA AGGAGAGTTT 3070 hom 114 het 36 0 38 7 N/A 0 0 283306 CASAVA_Build 7 138311705 1I GCAAGATACC -/A AATGGTATAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 2 3 283307 CASAVA_Build 7 138337934 1D TTGATTAATG A/- AAAAAAAAAA 2887 het 2887 ref 22 13 7 2 A 11 10 283308 CASAVA_Build 7 138338324 3D TTAATTGGTT TAA/--- TAATAATAAG 3070 het 3070 hom 23 9 10 7 TAA 4 3 283309 CASAVA_Build 7 138342136 1I GAAGCCTGCC -/A AAACCCACCA 3070 hom 87 het 35 0 28 7 A 3 4 283310 CASAVA_Build 7 138343082 1D CTATAAACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2969 hom 20 9 8 4 A 10 9 283311 CASAVA_Build 7 138344380 1D CGAGACCTAT C/- CCCCCCGCGA 3070 het 3070 hom 32 11 13 10 C 7 6 283312 CASAVA_Build 7 138353986 3D CCTCCCCAAG GCA/--- GCAGCACAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 3 GCA 3 2 283313 CASAVA_Build 7 138355215 1I TCAGTTCACC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 A 8 9 283314 CASAVA_Build 7 138355895 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 2990 het 2990 ref 22 13 8 1 A 13 12 283315 CASAVA_Build 7 138356074 1D TATCAATCCC A/- AATGGCATAA 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 A 3 2 283316 CASAVA_Build 7 138356387 9D AGCCCAGGAC GCAGAGGCT/--------- GCAGAGGCTG 3070 het 3070 hom 25 10 12 5 GCAGAGGCT 2 1 283317 CASAVA_Build 7 138356588 5I TCCACAATGA -----/TATAT TATATTTTCA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 TATAT 1 2 283318 CASAVA_Build 7 138362427 2I TAAACAGCCC --/CT GACACTGGTA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 CT 0 1 283319 CASAVA_Build 7 138366038 1D CTGGGTGGCA G/- AGGTTGCAGT 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 G 1 0 283320 CASAVA_Build 7 138367839 1I GAACCCGGGA -/G GCAGAGCTTG 1852 het 810 hom 7 2 5 0 G 1 2 283321 CASAVA_Build 7 138368503 1I AAAAACTATA -/T TAAGTCTGAT 1754 het 1754 ref 35 20 5 10 T 1 2 283322 CASAVA_Build 7 138373341 1I GAGGAAGCAG -/C CCAGCAGGAA 3070 hom 81 het 30 0 25 5 C 2 3 283323 CASAVA_Build 7 138380084 3D CGTCTGCAAG AAT/--- ATATCCTCAT 3070 hom 117 het 43 0 39 5 AAT 1 0 283324 CASAVA_Build 7 138384290 8I TGCATATGGT --------/CTAATATA GGTTTATGGT 3070 hom 83 het 33 0 25 8 CTAATATA 0 1 283325 CASAVA_Build 7 138384431 3I TTTTTTTTTC ---/GTT GTTGTTGTTG 1324 het 25 hom 28 0 10 18 GTT 5 6 283326 CASAVA_Build 7 138388052 3I TATAAAAAAT ---/ACA ACAACAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 ACA 2 3 283327 CASAVA_Build 7 138392406 3D AGGCCGAAGC AGG/--- AGGATTGCTT 3070 hom 92 het 33 0 31 2 AGG 2 1 283328 CASAVA_Build 7 138392657 1I AAAAAAAAAA -/G TTTAGAGGTG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 G 0 1 283329 CASAVA_Build 7 138394295 1D CCGGAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 A 11 10 283330 CASAVA_Build 7 138398539 1I CACCTAAGAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 7 8 283331 CASAVA_Build 7 138405386 1D TTTTTCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 T 11 10 283332 CASAVA_Build 7 138410358 11D CCAGTGGGGC TGGTGGGGGGG/----------- TGGTGCTTCC 3001 het 3001 ref 24 14 9 6 TGGTGGGGGGG 1 0 283333 CASAVA_Build 7 138412299 1I CCCCCAAGTG -/T TATGAAGCCA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 1 2 283334 CASAVA_Build 7 138413096 4I GACAACTTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 AAAC 2 3 283335 CASAVA_Build 7 138431294 1D TGCTACAATG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 9 8 283336 CASAVA_Build 7 138442247 1I GGCTTCATCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 T 7 8 283337 CASAVA_Build 7 138446330 1I AGAAAAAAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 9 10 283338 CASAVA_Build 7 138493600 1I ACGCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2836 het 1087 hom 15 4 8 3 A 12 13 283339 CASAVA_Build 7 138532907 1I TGGGCGCCGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 33 het 13 0 10 3 G 1 2 283340 CASAVA_Build 7 138555238 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 2996 het 2748 hom 16 7 8 1 A 8 9 283341 CASAVA_Build 7 138640115 1I AACATACTCC -/T TTTTTTTTTT 1430 het 1430 ref 41 27 4 10 T 10 11 283342 CASAVA_Build 7 138664678 1I CATTAAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 10 11 283343 CASAVA_Build 7 138673674 1I AGTGATCCGC -/G CCCCCCTTGA 3070 het 2791 hom 19 9 9 1 G 0 1 283344 CASAVA_Build 7 138674259 1D GAGTTTCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1415 hom 21 5 13 3 A 11 10 283345 CASAVA_Build 7 138675163 1D TCAAAGGACA C/- GGCACATGTT 3070 het 2828 hom 25 7 9 10 C 1 0 283346 CASAVA_Build 7 138677482 1I TGTCCTGTCC -/T TTAAGACACT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 2 3 283347 CASAVA_Build 7 138683512 1I TAATAGAGAT -/G GGGGGTCTCA 2009 het 1077 hom 9 3 6 0 G 5 6 283348 CASAVA_Build 7 138684308 8I ACTAGCCAGA --------/CGTTGTAG CACACGCAAG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 CGTTGTAG 0 1 283349 CASAVA_Build 7 138685415 1D TAACCTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 21 2 15 4 T 11 10 283350 CASAVA_Build 7 138685970 1I CATTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 1939 het 1939 ref 24 13 7 4 C 0 1 283351 CASAVA_Build 7 138690124 5I GGAAGTAAAT -----/AAAAC AAAACAAAAA 2076 het 2076 ref 22 10 6 6 AAAAC 1 2 283352 CASAVA_Build 7 138690398 8D TCTCCTGCGT AGATCTCC/-------- CAAAGTGTGG 3001 het 3001 ref 23 13 7 5 AGATCTCC 1 0 283353 CASAVA_Build 7 138691902 1I AACCTGCGTT -/A AAAAAAAAAA 1693 het 1524 hom 16 8 5 3 A 15 16 283354 CASAVA_Build 7 138693776 4I TAACTCATTC ----/ATTT TTCTTACAGT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 ATTT 0 1 283355 CASAVA_Build 7 138697058 2D TTTCCAACAT GA/-- GAGAGGGTAT 3070 het 3070 ref 52 26 19 7 GA 3 2 283356 CASAVA_Build 7 138701777 4I CTTTAATAGT ----/CTAA TTAATAGTTA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 CTAA 0 1 283357 CASAVA_Build 7 138704994 3I TTTTAAAAAC ---/ATT ATTAATCTTT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 ATT 1 2 283358 CASAVA_Build 7 138706167 14I TTGGAAGAAA --------------/TGGAGGGAAGAAAT TGGAGGGAAA 3070 het 3070 ref 54 25 21 10 TGGAGGGAAGAAAT 0 1 283359 CASAVA_Build 7 138706324 6D ACTGTCCTGT CCCAAG/------ CCCACTGTGA 3070 het 3070 hom 48 20 25 5 CCCAAG 1 0 283360 CASAVA_Build 7 138707530 1D ATTATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 12 11 283361 CASAVA_Build 7 138708987 1I CAGGGCACAA -/T TAACTTAATA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 1 2 283362 CASAVA_Build 7 138713861 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 15 12 10 A 8 9 283363 CASAVA_Build 7 138714657 1I ATTTCCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 11 12 283364 CASAVA_Build 7 138719280 1D AAGTGACCCA C/- CCACCTTGGC 1930 het 1930 ref 15 7 6 2 C 3 2 283365 CASAVA_Build 7 138720287 1D AGGTAGGTAA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 7 6 283366 CASAVA_Build 7 138724338 1I TTTTAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 14 15 283367 CASAVA_Build 7 138725502 8D CAGTGCCCAG TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 3070 het 2913 hom 34 9 15 11 TC 12 8 283368 CASAVA_Build 7 138734356 2D TGAATCTACT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 26 9 9 8 TA 7 6 283369 CASAVA_Build 7 138735199 2I GTTTTTTTGC --/AT ATATATATAA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 AT 4 5 283370 CASAVA_Build 7 138735426 1D TTGGCCTTGC G/- GGGGTATTTT 2405 het 2405 ref 23 10 8 6 G 5 4 283371 CASAVA_Build 7 138736502 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 11 10 283372 CASAVA_Build 7 138737808 1D CTCTGTGCAG T/- TTTTTTGTTT 3070 het 2680 hom 24 8 13 3 T 7 6 283373 CASAVA_Build 7 138743113 1I AAATTTATAT -/A TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 27 3 A 0 1 283374 CASAVA_Build 7 138745838 2D CTAAAATCAC AT/-- AGCATCATGG 3070 het 3070 hom 39 17 19 5 AT 1 0 283375 CASAVA_Build 7 138747823 1I AAAATACATA -/C TTTTTTTTTT 2671 het 2671 ref 21 7 8 6 C 0 1 283376 CASAVA_Build 7 138750149 4I CACTCTTTTC ----/TCTA TCTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TCTA 0 1 283377 CASAVA_Build 7 138753516 6I GGCAGACTAA ------/TAATCT TAAGGAGGTT 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 TAATCT 0 1 283378 CASAVA_Build 7 138754417 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 2328 het 2328 ref 29 18 7 4 A 11 12 283379 CASAVA_Build 7 138755352 2I ACAAGTAGAT --/TG TCTTTGTGAC 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 TG 0 1 283380 CASAVA_Build 7 138761635 1I TAAAAAAAAA -/C CCCACATGCC 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 C 3 4 283381 CASAVA_Build 7 138763944 2D AAGGAGACTG AA/-- GAGATGATAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 2 0 283382 CASAVA_Build 7 138764149 4D ATGTCTGCAG CTTA/---- CTTTTAAATA 3070 het 3070 ref 35 17 13 9 CTTA 1 0 283383 CASAVA_Build 7 138765689 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1391 hom 25 6 17 2 A 12 11 283384 CASAVA_Build 7 138766399 4D ATGCTGAGCT AATA/---- AATCAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 AATA 1 0 283385 CASAVA_Build 7 138767339 1D TGTATGTTTT A/- AAAAAAAAAA 2666 het 2666 ref 20 9 8 3 A 12 11 283386 CASAVA_Build 7 138768608 1D TTTTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 2687 het 2687 ref 32 18 10 4 G 1 0 283387 CASAVA_Build 7 138771845 14I GTGCCGCCAT --------------/GTTCTCCAGGAGCA GATAAAGCTG 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 GTTCTCCAGGAGCA 0 1 283388 CASAVA_Build 7 138774897 1D CCAAGCTGCC A/- TCCCTCAAGA 3070 het 3070 hom 45 13 25 8 A 1 0 283389 CASAVA_Build 7 138776351 1D TCATCATGGC A/- AAAACGCTGT 2224 het 2224 ref 20 12 5 3 A 5 4 283390 CASAVA_Build 7 138776899 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 2269 hom 15 het 10 0 6 4 A 11 10 283391 CASAVA_Build 7 138779656 1D TAGTAGAGAA G/- GGGGTTTCAC 3070 het 1881 hom 21 5 12 4 G 5 4 283392 CASAVA_Build 7 138780990 1I TTTTGGTTTC -/A ACAGACCCCT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 1 2 283393 CASAVA_Build 7 138782329 1I AGACTCTGAG -/C ACTTCCTTGC 3070 het 3070 ref 46 26 12 8 C 0 1 283394 CASAVA_Build 7 138784008 1I TAAAATAAAG -/T TTTTTTAAAA 2419 het 2419 ref 19 13 5 1 T 6 7 283395 CASAVA_Build 7 138819553 1D GCAATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1804 het 1207 hom 21 8 4 9 T 17 16 283396 CASAVA_Build 7 138830613 2I TTTTGGGGGG --/GC GGGGTAATGA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 GC 0 1 283397 CASAVA_Build 7 138847509 1I CCTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 10 283398 CASAVA_Build 7 138874054 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAAC 5 4 283399 CASAVA_Build 7 138891797 5D TGTTTTGGGT AGATG/----- TAGGGTCTCA 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 AGATG 1 0 283400 CASAVA_Build 7 138895502 3I TACACTCCCG ---/GAA GAAGAACTGA 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 GAA 2 3 283401 CASAVA_Build 7 138951235 2D GGCATCAGTG TC/-- TGTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 47 21 20 8 TC 1 0 283402 CASAVA_Build 7 138981786 2D ACCTTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2275 het 541 hom 31 5 10 16 A 20 18 283403 CASAVA_Build 7 138984370 2I CAATGCAGGC --/CA CATCTATCAT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 CA 1 2 283404 CASAVA_Build 7 138984836 2I CCTGAGGGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 393 hom 39 1 27 11 TG 7 8 283405 CASAVA_Build 7 138989633 1D CTTTGTCTAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 9 8 283406 CASAVA_Build 7 138991434 1I TCCACCTCCA -/T TGGTGAACTC 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 T 1 2 283407 CASAVA_Build 7 138994729 1I CCTGAGCCGC -/G GGGGTCAGAT 3070 het 2690 hom 20 8 10 2 G 4 5 283408 CASAVA_Build 7 138995040 10D TGCATTCTCT CTCTTTTCTG/---------- CTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 18 17 6 CTCTTTTCTG 1 0 283409 CASAVA_Build 7 139005719 1I AAAATCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2572 hom 23 8 12 3 A 11 12 283410 CASAVA_Build 7 139007377 1I TACTCATTCA -/T TTGTTCAATA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 2 3 283411 CASAVA_Build 7 139008388 2I TGGTTAGAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 22 10 T 15 17 283412 CASAVA_Build 7 139029008 1D TTTTGTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 828 hom 35 4 24 7 A 14 13 283413 CASAVA_Build 7 139057287 1D CAATTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 29 1 23 5 T 12 11 283414 CASAVA_Build 7 139070357 4I AAATGCCATA ----/TCTG TCTAATATAG 3070 hom 97 het 41 0 28 13 TCTG 0 1 283415 CASAVA_Build 7 139085855 1I GACCCTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 15 5 A 13 14 283416 CASAVA_Build 7 139171405 1D CCTGAGTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 T 9 8 283417 CASAVA_Build 7 139178681 1I AAAGACAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 22 12 10 0 A 8 9 283418 CASAVA_Build 7 139187900 1D CAGAATATTA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 T 8 7 283419 CASAVA_Build 7 139224377 4D GTGTGTGTGT GAGA/---- GAGAGAGAGA 2163 het 2163 ref 20 8 10 3 GA 11 9 283420 CASAVA_Build 7 139247595 1I ATATTACTAC -/A AAAAAAAAAA 2862 het 1182 hom 23 6 9 8 A 15 16 283421 CASAVA_Build 7 139248336 1D13M1D ATCAAAACCA GGGAGAATGACCCTG/-GGAGAATGACCCT- GGTATGACCC 3070 hom 96 het 32 0 32 5 N/A 0 0 283422 CASAVA_Build 7 139252339 1D CTCTAGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 9 14 T 13 12 283423 CASAVA_Build 7 139287247 2D AGAGTCACCA AT/-- ATATATACAC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 AT 4 3 283424 CASAVA_Build 7 139287702 1D ATTAAAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 T 12 11 283425 CASAVA_Build 7 139327210 1I TCCACAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 A 11 12 283426 CASAVA_Build 7 139346955 4I TTCTGTTTAT ----/TTTC TTTATTTCCA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 TTTC 0 1 283427 CASAVA_Build 7 139349511 1D TTGAGATGGA G/- GTTTTGCTCT 3070 hom 44 het 18 0 15 3 G 2 1 283428 CASAVA_Build 7 139357551 4D58M1I GTCTCAAAAA AAACAAACAAACAAACAAACAAAAAAAACAGTCCCCTAAACAATGAAGAATAAAAAAAAAAG-/----AAACAAACAAACAAACAAAAAAAACAGTCCCCTAAACAATGAAGAATAAAAAAAAAAGA AAAAAAAAGG 3070 het 49 hom 22 1 30 15 N/A 0 0 283429 CASAVA_Build 7 139357664 4D CCTAGAGAAG AGAA/---- AGATAGAAAT 3070 het 3070 ref 38 22 10 7 AGAA 1 0 283430 CASAVA_Build 7 139358106 2I TTTTATGTTC --/TA TATATATATA 2787 het 2787 ref 30 14 6 10 TA 7 8 283431 CASAVA_Build 7 139361351 4D TAAAACAGAA AAAC/---- AAACAAACCA 3070 het 3070 ref 27 14 9 8 AAAC 3 2 283432 CASAVA_Build 7 139372769 1I AGGCCTGTAA -/G GCTCCAGCCA 3070 hom 83 het 31 0 21 10 G 1 2 283433 CASAVA_Build 7 139383092 1D ATTAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2941 hom 31 12 9 10 A 13 12 283434 CASAVA_Build 7 139399360 2I AACTATGTCT --/AA GTCTTTTACC 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 A 0 2 283435 CASAVA_Build 7 139407010 10D GGCTGTTGTT CCCTGCTCTC/---------- CCCTGGACTG 3070 het 3070 ref 34 20 11 5 CCCTGCTCTC 1 0 283436 CASAVA_Build 7 139413086 1D CATGCGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 10 9 283437 CASAVA_Build 7 139414405 3D TTTAATACAA AAG/--- AAGGCAGTAC 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 AAG 2 1 283438 CASAVA_Build 7 139428316 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 10 11 283439 CASAVA_Build 7 139429532 1D AAGTGGACTC A/- AGAGAGGTTC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 2 1 283440 CASAVA_Build 7 139434322 1D AGTAGACTAT A/- ATTGAAAAGG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 2 1 283441 CASAVA_Build 7 139438549 1D AGTTGCATCG T/- TAAGTTAAGA 3070 het 3070 hom 54 22 25 8 T 2 1 283442 CASAVA_Build 7 139443695 1D ACCCTGTGCT A/- ATGTAAGTCA 3070 het 3070 ref 40 25 12 4 A 2 1 283443 CASAVA_Build 7 139446853 2D AGCTTAATCT TC/-- TCTGATGATT 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 TC 2 1 283444 CASAVA_Build 7 139449576 1D CAGCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 2884 het 2128 hom 24 9 10 5 T 11 10 283445 CASAVA_Build 7 139449726 1D TGTTATCCCT C/- CCCCCCCCTC 2373 het 1782 hom 16 7 7 2 C 9 8 283446 CASAVA_Build 7 139456410 4I TGACACTCCC ----/ATTT ATTTAACTAC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 ATTT 1 2 283447 CASAVA_Build 7 139462091 1D ATAAATAAAT A/- AAAAAAAATA 295 het 169 hom 5 1 2 2 A 9 8 283448 CASAVA_Build 7 139463005 4I CAAAAATGTC ----/TTCT TTGAGTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 TTCT 0 1 283449 CASAVA_Build 7 139464962 1I CTAGGATTAG -/T GGCGTGAACC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 0 1 283450 CASAVA_Build 7 139470562 4D GTTCTGGAAT TAGA/---- TAGTGGTGAT 3070 het 3070 ref 43 20 15 10 TAGA 1 0 283451 CASAVA_Build 7 139472732 1D ATTTGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 11 10 283452 CASAVA_Build 7 139474296 1I CTATCATTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 A 9 10 283453 CASAVA_Build 7 139477292 6D CTGGCTAATT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 2415 hom 15 het 7 0 6 1 TTTTTG 3 2 283454 CASAVA_Build 7 139478666 1D ACCTATTTAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 9 8 283455 CASAVA_Build 7 139481606 1I CTGAGTAGCT -/G GGACTACAGG 3070 het 1867 hom 14 4 7 3 G 2 3 283456 CASAVA_Build 7 139484231 1D TTAAAATGAC A/- AAGCCTATAA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 3 2 283457 CASAVA_Build 7 139489172 1D AATGCAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2614 hom 19 6 11 3 A 10 9 283458 CASAVA_Build 7 139494490 1I ATGCTTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2234 het 2234 ref 25 12 5 8 A 14 15 283459 CASAVA_Build 7 139508867 5I CTTAAATTTG -----/TATAA TATATTTAAG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 TATAA 0 1 283460 CASAVA_Build 7 139512115 1I GTAAGGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 13 15 6 A 9 10 283461 CASAVA_Build 7 139521238 1I TAGTTCTTTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 A 8 9 283462 CASAVA_Build 7 139525932 1I TATTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 12 13 283463 CASAVA_Build 7 139541039 1D TTGATAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 24 0 19 6 A 12 11 283464 CASAVA_Build 7 139558812 1I TGCCACCAGG -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 6 7 283465 CASAVA_Build 7 139559714 6D AAAAATTAGC ATGTTG/------ TGGGCATGTT 1518 het 1518 ref 12 7 4 2 ATGTTG 1 0 283466 CASAVA_Build 7 139562362 2D TTGTTTTGCT AC/-- ACAATTCCTT 3070 het 3070 ref 39 20 19 2 AC 2 1 283467 CASAVA_Build 7 139562651 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTGGGTT 3070 het 2968 hom 32 9 17 6 T 6 5 283468 CASAVA_Build 7 139621627 1I GCTCCATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 24 1 15 8 A 12 13 283469 CASAVA_Build 7 139625870 3I ATATCTTTGC ---/CGG GGGGGGGGGC 2897 hom 47 het 19 0 14 5 CGG 0 1 283470 CASAVA_Build 7 139637221 4I ACGAACCCTG ----/AAGT AAGGATAAAT 3070 hom 72 het 29 0 24 6 AAGT 0 1 283471 CASAVA_Build 7 139639554 1D TGGAAGAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 431 hom 38 1 30 7 A 10 9 283472 CASAVA_Build 7 139644499 1I AGAATGTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 559 hom 40 2 30 8 A 13 14 283473 CASAVA_Build 7 139644801 2D CTGTATTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 560 hom 12 het 8 0 5 3 TC 8 7 283474 CASAVA_Build 7 139656321 1I GTCTCCAAAA -/C AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 0 1 283475 CASAVA_Build 7 139657500 6I CATAACTCTA ------/TGTCTT GGGTTTTTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TGTCTT 0 1 283476 CASAVA_Build 7 139660832 1I TTCTAGGGAA -/G GGCATGTAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 2 3 283477 CASAVA_Build 7 139672963 1I TCTTGCCAAG -/C ATTTCTCTGA 3070 het 2561 hom 24 7 9 8 C 0 1 283478 CASAVA_Build 7 139673755 1D CTGAGGCTTT C/- CATGGTGAGC 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 C 2 1 283479 CASAVA_Build 7 139680824 1I AGAGGATCCT -/A AAGTTCCCAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 3 283480 CASAVA_Build 7 139684163 1D CCATTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 1365 het 1365 ref 33 17 4 12 T 15 14 283481 CASAVA_Build 7 139687201 1D ATGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2988 hom 33 het 15 0 11 4 A 12 11 283482 CASAVA_Build 7 139688947 1D GAATTTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 24 9 A 12 11 283483 CASAVA_Build 7 139695808 1D AAAGGAAAAA G/- GGGGGGGGGA 1726 het 1021 hom 28 7 5 16 G 10 9 283484 CASAVA_Build 7 139701473 1D GTTTGTCTAC T/- TTTTTTTTTT 2707 het 2707 ref 22 10 7 5 T 12 11 283485 CASAVA_Build 7 139710521 1D ATTCTGTCTC G/- GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 18 4 G 7 6 283486 CASAVA_Build 7 139712751 1I AGCTCAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 A 10 11 283487 CASAVA_Build 7 139716419 3I AAATAACTAG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 14 2 T 11 14 283488 CASAVA_Build 7 139716859 1I ATTTCCTCCA -/G GTCAGTGGTT 3070 het 3070 ref 38 22 16 0 G 1 2 283489 CASAVA_Build 7 139721322 8D GGCTGAGGCA GAAGAATC/-------- GAAGAATCGC 1955 het 1955 ref 13 9 5 2 GAAGAATC 2 1 283490 CASAVA_Build 7 139737460 4I TCAACAATTC ----/ATGG CCAGATTCAT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 ATGG 0 1 283491 CASAVA_Build 7 139747969 2D AATATTTGGC AG/-- AGTCTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 AG 2 1 283492 CASAVA_Build 7 139750895 2D GTGATGAGAC AG/-- AGTGTCCTTG 3070 hom 120 het 48 0 39 9 AG 2 1 283493 CASAVA_Build 7 139756969 1D CTTAAGCGAT C/- CGCCACCTCA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 C 2 1 283494 CASAVA_Build 7 139757808 2I CTGATGAGCT --/AA AAAAAAAAAA 3008 het 28 hom 27 1 14 12 A 14 16 283495 CASAVA_Build 7 139762044 1D TGTGGTGGTG C/- ACGCCTGGAG 3070 hom 63 het 22 0 21 1 C 1 0 283496 CASAVA_Build 7 139774626 1D GCTGCTCCTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 9 8 283497 CASAVA_Build 7 139793691 1D CGGCCTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 16 1 10 5 T 11 10 283498 CASAVA_Build 7 139819024 2D ACGACTATGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 3 CT 2 1 283499 CASAVA_Build 7 139829488 4I TAAAAAAGAA ----/AAAG AAAAAACAAA 3070 het 2137 hom 16 6 9 1 AAAG 0 1 283500 CASAVA_Build 7 139838708 4I CTCCATCTGA ----/AAAG AAAGAAAGTT 3070 hom 78 het 33 0 24 9 AAAG 2 3 283501 CASAVA_Build 7 139840554 1D CTCCGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 1058 het 325 hom 8 1 4 3 A 12 11 283502 CASAVA_Build 7 139840995 1D GGAGGCAGAG T/- TGGGCAGATC 2496 hom 21 het 8 0 8 0 T 2 1 283503 CASAVA_Build 7 139842236 10D CATGGCACAG CAGTAAAGAA/---------- CAGTAAAGAA 3070 hom 90 het 39 0 30 11 CAGTAAAGAA 2 1 283504 CASAVA_Build 7 139842315 5I AGGTTAAGGA -----/TTTTC TTTTCTTTTG 3070 hom 69 het 25 0 22 3 TTTTC 1 2 283505 CASAVA_Build 7 139845564 2D CAAGACCCTG TC/-- TCTATTGATT 2899 hom 20 het 10 0 7 4 TC 2 1 283506 CASAVA_Build 7 139850515 1I CTCTGTCTCA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 1463 hom 25 5 18 2 G 0 1 283507 CASAVA_Build 7 139858566 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2804 hom 24 9 13 3 T 9 10 283508 CASAVA_Build 7 139862911 1I GAAATAAGTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 7 8 283509 CASAVA_Build 7 139879159 10I ATATAAAAAG ----------/GAGGCACAGT GAGGATAGCC 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 GAGGCACAGT 0 1 283510 CASAVA_Build 7 139894891 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 2083 het 1370 hom 12 3 5 4 T 9 10 283511 CASAVA_Build 7 139908932 4I CTCCGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 2996 hom 20 9 8 3 AAAC 3 4 283512 CASAVA_Build 7 139908947 1I AACAAACAAA -/C ACAACAACAA 640 het 640 ref 27 14 2 12 C 0 1 283513 CASAVA_Build 7 139916161 1D CTTTCAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 9 T 12 11 283514 CASAVA_Build 7 139925668 1D AAATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2261 hom 19 5 12 2 T 12 11 283515 CASAVA_Build 7 139928239 1I TGGGCAGATG -/T TTTTTTTTTT 2261 het 2261 ref 28 9 8 11 T 13 14 283516 CASAVA_Build 7 139968665 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1014 het 1014 ref 15 11 3 1 A 13 14 283517 CASAVA_Build 7 139970637 7D AACAACAACA CAACAAC/------- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 30 15 13 4 CAACAAC 1 0 283518 CASAVA_Build 7 140020393 1I AAACCTCCAG -/A AAAATCTCGC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 4 5 283519 CASAVA_Build 7 140031721 1D TCAGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2894 het 1680 hom 26 6 12 9 A 15 14 283520 CASAVA_Build 7 140037190 3I TTCTTGTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TTG 3 4 283521 CASAVA_Build 7 140038112 1I GCCATGTGGG -/C CAAGCCCCCG 3070 hom 66 het 24 0 21 3 C 1 2 283522 CASAVA_Build 7 140051032 1D AGCCATATTG T/- TTTTTTTTTT 1577 het 1577 ref 39 23 5 11 T 13 12 283523 CASAVA_Build 7 140053696 1I GGCATACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 10 11 283524 CASAVA_Build 7 140063658 1D CAAGCAGTCT C/- CCCCGACCTC 3070 het 1486 hom 19 4 9 7 C 5 4 283525 CASAVA_Build 7 140114537 1D TTGAAATTTT A/- AAAAAACTGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 7 6 283526 CASAVA_Build 7 140175469 1D TTTTTTTTGT G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 5 het 32 1 22 9 G 9 8 283527 CASAVA_Build 7 140175613 1D AAGATTTACA T/- TTTTTTTTTT 745 het 745 ref 33 23 3 7 T 15 14 283528 CASAVA_Build 7 140272749 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1263 het 1263 ref 28 19 3 6 A 13 12 283529 CASAVA_Build 7 140272986 11D GCACCTTTTC CCCTTTCATCA/----------- CCCTTTCATC 3070 hom 54 het 22 0 19 5 CCCTTTCATCA 3 2 283530 CASAVA_Build 7 140313455 1I CAGATTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 10 11 283531 CASAVA_Build 7 140317848 1I CTCAAGAAAA -/C AAAAAAACAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 0 1 283532 CASAVA_Build 7 140332123 1I TCAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1486 hom 27 4 16 7 A 11 12 283533 CASAVA_Build 7 140347461 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 375 hom 44 1 36 7 A 9 10 283534 CASAVA_Build 7 140355071 1D AAAAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 917 hom 21 4 10 7 T 17 16 283535 CASAVA_Build 7 140355706 2D TGGCCTGATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 13 11 283536 CASAVA_Build 7 140367410 1D TACATGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 566 hom 30 3 17 10 T 13 12 283537 CASAVA_Build 7 140386139 6D TGGTGACTGA GTGAGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 89 het 41 0 35 7 GTGAGT 1 0 283538 CASAVA_Build 7 140386457 1I ATGATATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 967 hom 27 3 16 8 T 15 16 283539 CASAVA_Build 7 140391763 1I CCAGTAGCAT -/A AAATCAAGTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 3 4 283540 CASAVA_Build 7 140395284 2I AATCTGTCTC --/AT ATATATATAT 3070 het 168 hom 26 1 20 5 AT 8 9 283541 CASAVA_Build 7 140395688 2I CACTTAAGAC --/AT ATCCTCTCTA 3070 hom 85 het 35 0 30 5 AT 1 2 283542 CASAVA_Build 7 140401142 1I CAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 11 12 283543 CASAVA_Build 7 140402191 1D TTTTATTTAT A/- AAAAAATACT 3070 hom 48 het 22 0 16 6 A 7 6 283544 CASAVA_Build 7 140402775 1I CAGGTGTGAG -/C CACCGCGCCT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 C 1 2 283545 CASAVA_Build 7 140405080 1I AAAAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 32 1 20 11 A 13 14 283546 CASAVA_Build 7 140417751 2D AAGGGCGGGG GA/-- GAGAGAGAGA 2130 hom 33 het 25 0 12 13 GA 10 9 283547 CASAVA_Build 7 140430153 1D TTCAGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 819 hom 28 3 15 10 T 15 14 283548 CASAVA_Build 7 140431810 4D ATCGTCATGC ATTT/---- ATATCATTTC 3070 hom 79 het 30 0 27 4 ATTT 1 0 283549 CASAVA_Build 7 140444063 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1385 het 1385 ref 33 16 4 13 T 17 16 283550 CASAVA_Build 7 140506325 2D TCAATATATA AT/-- ATATATATAT 2309 hom 15 het 7 0 6 1 AT 6 5 283551 CASAVA_Build 7 140508229 2D GAGAGAGCAT GA/-- GAGTGTGTGT 3070 hom 137 het 54 0 41 15 GA 2 1 283552 CASAVA_Build 7 140511459 1I ATACTAATGT -/C CCTTTTTGGC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 C 2 3 283553 CASAVA_Build 7 140544325 4D TCTTCTTTCC CTCT/---- CTCTCTCTGA 3070 hom 72 het 28 0 23 7 CT 6 4 283554 CASAVA_Build 7 140566477 6D TTGGGAGGCT GAGGCA/------ GAGGCAGGAG 3070 het 3070 ref 21 12 10 1 GAGGCA 2 1 283555 CASAVA_Build 7 140567695 1I GCAGATACCT -/G GCATCAATAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 G 1 2 283556 CASAVA_Build 7 140571699 1D ACAACAGGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 9 8 283557 CASAVA_Build 7 140586106 1D CATGACCTGT G/- GCAGTGAACC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 G 2 1 283558 CASAVA_Build 7 140587266 1D CTGGGATCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 665 hom 29 3 16 10 T 15 14 283559 CASAVA_Build 7 140587413 1D TAATGTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 19 8 T 11 10 283560 CASAVA_Build 7 140588481 4D GTAGTCCTAC CAAA/---- CAAAGTTGTG 3070 het 3070 ref 39 24 13 3 CAAA 2 1 283561 CASAVA_Build 7 140595929 6I AAAGGGGCTC ------/CTTGTG ATGTGCCTGG 3070 hom 93 het 33 0 30 3 CTTGTG 0 1 283562 CASAVA_Build 7 140601918 1I ATTTTTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 16 8 T 10 11 283563 CASAVA_Build 7 140634465 1D GCCTCTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 36 0 28 9 T 11 10 283564 CASAVA_Build 7 140636789 20D ATTCCTCCTT CACACACATACACATGTGCA/-------------------- CACACACATA 3070 hom 154 het 59 0 51 13 CACACACATACACATGTGCA 1 0 283565 CASAVA_Build 7 140642004 3D CAAAGCACAC GGG/--- GGCCAAGAGC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 G 5 2 283566 CASAVA_Build 7 140653449 1I TTTATATCAC -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 6 7 283567 CASAVA_Build 7 140661744 13D8M3D AATGCCCTCT CACTTTCCTCTTCTCATTTGCAAA/-------------TCAAATGC--- TCTTACCCCT 3070 het 3070 ref 46 23 26 8 N/A 0 0 283568 CASAVA_Build 7 140663337 1D AAATATTTCC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 48 14 30 4 T 8 7 283569 CASAVA_Build 7 140700721 1I CAGCAGACAG -/T TTCTGACAAA 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 T 2 3 283570 CASAVA_Build 7 140716386 2D AACCCCCCAA GT/-- GTGTGTGACT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 GT 4 3 283571 CASAVA_Build 7 140716870 1I AGGATTTCCT -/G GGAAGACAAG 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 G 2 3 283572 CASAVA_Build 7 140725743 4I GACAGAGTAA ----/ATCC ATCCCTGTCT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 ATCC 1 2 283573 CASAVA_Build 7 140738331 1I AATTCTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 13 5 T 11 12 283574 CASAVA_Build 7 140742799 2D AGTGGAAAAC AG/-- AGCCTCAGAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 7 AG 2 1 283575 CASAVA_Build 7 140756001 1I TGTCTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 13 14 283576 CASAVA_Build 7 140756692 1I TTTTCTTCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 8 9 283577 CASAVA_Build 7 140805730 1D AATTCACAGG C/- TGGCTGAGCA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 C 1 0 283578 CASAVA_Build 7 140849039 1D AACTCAGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 19 7 A 13 12 283579 CASAVA_Build 7 140863926 1D CACTTCTTCA G/- GGTGACAAGA 3070 het 3070 hom 39 11 19 9 G 3 2 283580 CASAVA_Build 7 140876236 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 25 0 10 16 A 17 16 283581 CASAVA_Build 7 140883752 1D TTTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1130 het 339 hom 16 6 3 7 A 17 16 283582 CASAVA_Build 7 140892357 1D CTTGCCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 21 9 3 T 11 10 283583 CASAVA_Build 7 140961061 2D TTCTTGAAAC AT/-- ATGAAGCAAA 3070 het 3070 hom 49 22 23 6 AT 2 1 283584 CASAVA_Build 7 140966796 2D38M12D TTGGAGAGAC AGGGGAATACAGGGGATTTTGACTTAACGAAGACACACACTGGAAACCACTT/--GGGAATACAGGGGATTTTGACTTAACGAAGACACACAC------------ TGGAAACCAC 3070 het 3070 ref 37 31 21 8 N/A 0 0 283585 CASAVA_Build 7 140990364 1D TGTGAATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 13 12 283586 CASAVA_Build 7 141009823 1I GTAGGTTTTA -/G GAAGTCCACT 3070 hom 123 het 45 0 40 5 G 1 2 283587 CASAVA_Build 7 141015752 1D CCTGATCTCA T/- GATCCACCTG 3070 het 2880 hom 23 7 11 5 T 1 0 283588 CASAVA_Build 7 141024231 1I CTCAATAATC -/T TTTTTTTTTT 691 het 691 ref 35 23 3 9 T 13 14 283589 CASAVA_Build 7 141032734 1D ACACACAGCA C/- ACGAAGACCT 3070 het 3070 hom 61 22 31 10 C 1 0 283590 CASAVA_Build 7 141041034 1D TGAAAAACAC A/- AAGTCAATGT 3070 het 3070 hom 57 29 24 4 A 3 2 283591 CASAVA_Build 7 141041692 1I ATGCACCACA -/G CTAATAGGGA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 G 0 1 283592 CASAVA_Build 7 141075694 1D CTTTTCGTTT C/- TGTAAATACT 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 C 1 0 283593 CASAVA_Build 7 141081075 1D TGTAACAGGT C/- CCCCCCACCC 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 C 7 6 283594 CASAVA_Build 7 141081614 2I47M2D TATATATACC --GTCTCAAAAATATATATGTGTATATATATTGAGATATATATACACACAT/CTGTCTCAAAAATATATATGTGTATATATATTGAGATATATATACACAC-- ATTTCATTCA 3070 het 3070 ref 30 27 11 6 N/A 0 0 283595 CASAVA_Build 7 141083336 4D ATTACAAAAC AGTT/---- AAAACGTAAA 3070 het 3070 ref 34 19 14 5 AGTT 1 0 283596 CASAVA_Build 7 141097552 7D GTAGAAACAA GTGCTGT/------- GTGCTGTGTC 3070 het 3070 ref 26 14 10 5 GTGCTGT 2 1 283597 CASAVA_Build 7 141100093 2I GGTTTTTTTG --/TT TGGGGGTTCC 1046 het 1046 ref 28 22 3 3 T 1 3 283598 CASAVA_Build 7 141102159 1D AACTCTAACT C/- CCCCCCTTTT 3070 het 2398 hom 24 11 10 3 C 7 6 283599 CASAVA_Build 7 141105797 2I ATTTATAAAC --/AA GAGAGGTTTA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 0 2 283600 CASAVA_Build 7 141108042 7D TATCCTTTAT TTATAAC/------- ATATGTATGT 2229 het 2229 ref 21 11 6 5 TTATAAC 1 0 283601 CASAVA_Build 7 141108063 7D GTATGTATGT TGGAGTC/------- TCGCTGTGTC 1409 het 1409 ref 19 10 4 6 TGGAGTC 1 0 283602 CASAVA_Build 7 141114127 2D GTGTATGTGC AT/-- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 45 22 21 4 AT 2 1 283603 CASAVA_Build 7 141115118 1D TTCCTTATTA T/- GGCGTCTAAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 T 1 0 283604 CASAVA_Build 7 141116032 4I TAATTTAAAA ----/AAAT AAATAAAAGT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 AAAT 1 2 283605 CASAVA_Build 7 141118005 4D CATGATTTGG CTCT/---- CTGTCTGTTA 1947 het 1947 ref 11 6 4 3 CT 3 1 283606 CASAVA_Build 7 141124066 8I CAAATCTATG --------/TATGTAGA TATGTAGATA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 TATGTAGA 1 2 283607 CASAVA_Build 7 141125812 2D CATTCTGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 13 8 T 12 10 283608 CASAVA_Build 7 141127846 1I TATAATACCA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 T 8 9 283609 CASAVA_Build 7 141128497 1I TTTGGTTTGA -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 hom 47 13 28 6 T 6 7 283610 CASAVA_Build 7 141129486 2D TTCTCAAAGA GC/-- GCTGGGAGGG 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 GC 2 1 283611 CASAVA_Build 7 141130348 2D GATTAATCAG TC/-- TCTCATCTTT 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 TC 3 2 283612 CASAVA_Build 7 141145571 5D AATAGGACTG ATAAA/----- ATAAATTGTG 3070 het 3070 ref 32 17 13 4 ATAAA 2 1 283613 CASAVA_Build 7 141168947 1D TTGGATAGGG T/- TTTTTTTTTT 2668 het 966 hom 15 4 6 5 T 11 10 283614 CASAVA_Build 7 141173917 5I ATCCTATGAT -----/GCACA GTGCAGCCCT 3070 het 3070 ref 57 29 23 5 GCACA 0 1 283615 CASAVA_Build 7 141184559 1D ATGAATTAAT G/- GGGGCACATA 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 G 5 4 283616 CASAVA_Build 7 141189849 5D TACGTACTCA TAAAT/----- TAAATAAGTC 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 TAAAT 2 1 283617 CASAVA_Build 7 141195378 3I TTCAAGAGTG ---/TTC TTCTTATTAA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 TTC 1 2 283618 CASAVA_Build 7 141198495 1D AAATTCACTG T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 7 6 283619 CASAVA_Build 7 141210703 1I GAAAGAAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 58 26 28 4 T 9 10 283620 CASAVA_Build 7 141213251 1D ATATTTATTT A/- AAAAATAGGT 3070 het 3070 hom 41 15 21 6 A 6 5 283621 CASAVA_Build 7 141244350 1D GAAATCAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 A 12 11 283622 CASAVA_Build 7 141248783 5D GTGAAGTAGA TTACT/----- TTACGTGTCT 3070 het 3070 hom 36 17 19 3 TTACT 1 0 283623 CASAVA_Build 7 141253270 1D ACAAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 14 22 9 A 11 10 283624 CASAVA_Build 7 141256246 1D ATGTGACAAT A/- AAAAAAAAAA 2037 het 2037 ref 24 14 7 3 A 11 10 283625 CASAVA_Build 7 141282008 1I CCCACTCCCC -/A CAAGTTTCTA 3070 hom 86 het 34 0 28 6 A 0 1 283626 CASAVA_Build 7 141286956 1D TAGCCAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 304 hom 34 3 20 11 A 12 11 283627 CASAVA_Build 7 141304797 1I TCAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 A 9 10 283628 CASAVA_Build 7 141306262 1D TTTTCGGTAC T/- GAAATTTAAT 2339 het 96 hom 18 1 11 6 T 1 0 283629 CASAVA_Build 7 141306879 1I GAGAAGGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1189 hom 48 5 31 12 A 11 12 283630 CASAVA_Build 7 141335821 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2100 het 2100 ref 32 14 8 10 T 13 14 283631 CASAVA_Build 7 141374149 1D ATACTAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 T 11 10 283632 CASAVA_Build 7 141375634 1I GTCTTGAGGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 35 16 14 7 A 8 9 283633 CASAVA_Build 7 141380464 2I CATTTCGGAT --/TG TGTGATAGTC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TG 2 3 283634 CASAVA_Build 7 141394914 1D ACAATTCCTG T/- GCTTCAAGTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 1 0 283635 CASAVA_Build 7 141409486 1I AAACAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2077 hom 26 8 14 4 A 10 11 283636 CASAVA_Build 7 141413863 1D TGTTCTTGGC A/- CTCAGCTCCT 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 1 0 283637 CASAVA_Build 7 141414423 1I TCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 392 hom 12 2 7 3 T 9 10 283638 CASAVA_Build 7 141433354 1D TGGTATACTT A/- ACTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 48 24 21 4 A 2 1 283639 CASAVA_Build 7 141441233 2D ATCTTTAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 38 1 29 8 T 14 12 283640 CASAVA_Build 7 141443199 3D TCCCAAAATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 21 2 13 7 T 17 14 283641 CASAVA_Build 7 141443616 1D AAATAGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 11 10 283642 CASAVA_Build 7 141444493 1D AGGAAGCAAT G/- AAGAGCTCCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 0 283643 CASAVA_Build 7 141453853 1D GCCAGTGGGG T/- TTTGGAGCAC 3070 hom 117 het 43 0 39 5 T 4 3 283644 CASAVA_Build 7 141456036 2I ATCAGCTGAT --/AA ACATGCCTAA 3070 het 3070 hom 59 21 32 6 A 1 3 283645 CASAVA_Build 7 141488431 1I TTCTATTTAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 44 0 32 12 T 8 9 283646 CASAVA_Build 7 141492478 1D TTGTTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 11 10 283647 CASAVA_Build 7 141498441 1D TAAGATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 222 hom 25 4 17 4 A 15 14 283648 CASAVA_Build 7 141518697 1D ATTTTACTGT G/- ACACTTTGGC 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 G 1 0 283649 CASAVA_Build 7 141522946 4D TATTTTAAAT AGAC/---- AGATTGGGAC 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AGAC 1 0 283650 CASAVA_Build 7 141526664 1D TGCGATCTTT G/- GGGTAAGTTT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 G 4 3 283651 CASAVA_Build 7 141531152 2D TTTTGAAAAC AT/-- AGAATGAATC 3070 het 3070 ref 32 16 10 8 AT 1 0 283652 CASAVA_Build 7 141537404 1D ATCTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 27 5 A 11 10 283653 CASAVA_Build 7 141544231 1I TTTAAAAATA -/C GTTTTTTCTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 0 1 283654 CASAVA_Build 7 141545750 1D AGGAAGAGAT A/- AAAATAAGTA 3070 hom 70 het 36 0 26 12 A 5 4 283655 CASAVA_Build 7 141547260 4D TAAATACCAT TATG/---- TATGATGATC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TATG 2 1 283656 CASAVA_Build 7 141548251 9D TTAGGAATAA AAAGCAATT/--------- AAAGCAATTA 3070 hom 105 het 41 0 36 8 AAAGCAATT 2 1 283657 CASAVA_Build 7 141551757 1D CTATTTTTTT A/- ATTATGATCA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 2 1 283658 CASAVA_Build 7 141555733 1I CATATTAAAT -/G ATCCCATTGG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 283659 CASAVA_Build 7 141570457 1D TCTTGACCTT C/- CCAACTCAAA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 C 3 2 283660 CASAVA_Build 7 141571411 1I TCAAGAAAAG -/C CTTTCAGGTG 3070 hom 123 het 51 0 41 10 C 1 2 283661 CASAVA_Build 7 141576948 1I TATATGTACC -/A AATTTTCTTT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 A 2 3 283662 CASAVA_Build 7 141577217 1D CATTTAATAA T/- TTCTGGCTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 3 2 283663 CASAVA_Build 7 141592248 1D CCTGCTTGTG A/- ATTAAATGCT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 2 1 283664 CASAVA_Build 7 141592877 1D CTCAGCAGTC T/- TTAGAGACTT 3070 het 3070 hom 61 23 31 8 T 3 2 283665 CASAVA_Build 7 141593734 1D CTTCTATCCT G/- GGATGTCTTT 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 G 3 2 283666 CASAVA_Build 7 141599216 1I TGGGCACAGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 2 283667 CASAVA_Build 7 141599929 1I GTTTTTATTT -/C GAAAATAATG 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 C 0 1 283668 CASAVA_Build 7 141600082 1I ATAAGATGCA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 T 8 9 283669 CASAVA_Build 7 141601184 1I GCGGGTGAAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 18 14 5 A 8 9 283670 CASAVA_Build 7 141604897 1D GGACTGCCAT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 8 7 283671 CASAVA_Build 7 141610175 1I GAAATTAAAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 7 8 283672 CASAVA_Build 7 141610424 1D AGTTAGGAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 T 10 9 283673 CASAVA_Build 7 141619423 1D CCATTTTTTC T/- TTTTATTAGC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 5 4 283674 CASAVA_Build 7 141622340 1I AACTTCCCAA -/C TGAAAGAATT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 C 0 1 283675 CASAVA_Build 7 141623219 1I ACTTCATGTT -/A AAAACGCTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 4 5 283676 CASAVA_Build 7 141628925 1D GAGATTTTGT C/- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 C 2 1 283677 CASAVA_Build 7 141629258 1I CTATAATTCT -/G TATGAGTGCT 3070 hom 90 het 39 0 30 9 G 0 1 283678 CASAVA_Build 7 141633182 1I AGGGGGGTGC -/A ACCCACTTGA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 A 1 2 283679 CASAVA_Build 7 141635580 1I ATTTTTAATG -/T TGCACTGTAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 1 2 283680 CASAVA_Build 7 141636502 1I TCTGCTCCGC -/A GCCATACAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 0 1 283681 CASAVA_Build 7 141636874 1I GGCACCACTG -/C ACTCCGGCCT 3070 hom 30 het 12 0 9 3 C 0 1 283682 CASAVA_Build 7 141638001 1I CTTGACATTC -/A TGGCCACAGG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 0 1 283683 CASAVA_Build 7 141642178 2I ATGGTACCCA --/TT TTGCAATCAG 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 T 2 4 283684 CASAVA_Build 7 141642536 1I AAAGGGCACC -/G CGTGGGGCAA 3070 hom 119 het 45 0 39 6 G 0 1 283685 CASAVA_Build 7 141644355 1I TTTGTGCATT -/C CCCTGCGGAA 3070 hom 140 het 60 0 50 10 C 3 4 283686 CASAVA_Build 7 141646134 1I24M1I GTTTTTTGAC -TTTCTTTTGACTCAAGTTAGACCC-/TTTTCTTTTGACTCAAGTTAGACCCT GGATCTCAGC 3070 hom 134 het 43 0 42 9 N/A 0 0 283687 CASAVA_Build 7 141647103 1I CTGAGCACAG -/C CCTGCATTGT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 C 2 3 283688 CASAVA_Build 7 141650615 1I CTAGAAAGGG -/T TTTTTTTTTT 2417 het 2417 ref 34 17 9 8 T 11 12 283689 CASAVA_Build 7 141670585 1I TGTACCCGAA -/G GAATTGGGTG 3070 hom 92 het 35 0 30 5 G 1 2 283690 CASAVA_Build 7 141675144 1I GGGAGGCTCT -/G GCCTCCTCCC 3070 hom 89 het 32 0 27 5 G 1 2 283691 CASAVA_Build 7 141677766 2D TTAAAAAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 21 1 12 8 T 16 14 283692 CASAVA_Build 7 141686357 1I TCATTGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 280 hom 29 1 26 2 A 10 11 283693 CASAVA_Build 7 141690125 1I CTGGCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 10 11 283694 CASAVA_Build 7 141723325 1I GCCCTGCTCC -/A ATTGAATGTA 3070 hom 98 het 38 0 33 5 A 1 2 283695 CASAVA_Build 7 141728486 1I GTGTGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 32 10 T 10 11 283696 CASAVA_Build 7 141728585 1I TTGATGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 18 14 T 15 16 283697 CASAVA_Build 7 141732381 2D AGTATTAACG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 22 1 18 3 T 13 11 283698 CASAVA_Build 7 141733052 2I ATGTCACACA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 33 17 8 8 TC 8 9 283699 CASAVA_Build 7 141734798 1D TAATTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 21 5 10 6 A 15 14 283700 CASAVA_Build 7 141740107 2I GTTGGTTACC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 815 hom 36 4 11 21 CT 8 9 283701 CASAVA_Build 7 141740119 1I CTCTCTCTCT -/A CTCTCCTGCC 3070 het 2545 hom 36 10 14 12 A 0 1 283702 CASAVA_Build 7 141740724 1D CCCTTACTCA G/- CCCCCTTGCT 3070 het 3070 hom 48 14 25 10 G 1 0 283703 CASAVA_Build 7 141745719 1I CTTTTTTCTC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 T 7 8 283704 CASAVA_Build 7 141746661 1D TACCCTGGAG A/- GGGGGGGGTG 2532 hom 16 het 12 0 7 5 A 1 0 283705 CASAVA_Build 7 141746861 1I TCCATCCGCA -/G GGCTGTGTAC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 2 3 283706 CASAVA_Build 7 141750920 1I GGTTAGGAAC -/A AAAAAACCCC 3070 het 2815 hom 23 8 13 2 A 6 7 283707 CASAVA_Build 7 141755577 1D AGAAAATCCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 16 11 8 T 9 8 283708 CASAVA_Build 7 141766224 2D GGAACAGGAC AG/-- GGGGACAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 AG 1 0 283709 CASAVA_Build 7 141772132 1D AGCTGGTGTA C/- CTGTGATGAT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 C 2 1 283710 CASAVA_Build 7 141772192 1D5M1D CGATTTGTTG TTGGCTA/-TGGCT- AGTGTTTTTA 500 hom 5 het 15 0 2 15 N/A 0 0 283711 CASAVA_Build 7 141772209 1D19M1I16M1I AGTGTTTTTA GGTGCAGTACTTCTGAGACA-TTTTGGGATACTGTAG-/-GTGCAGTACTTCTGAGACATTTTTGGTATACTGTAGA AGAGAGAAAT 2067 hom 13 het 15 0 6 16 N/A 0 0 283712 CASAVA_Build 7 141776987 2I TCACCAAAAC --/AT GTGTGTTAAA 3070 het 3070 hom 37 11 24 2 AT 0 1 283713 CASAVA_Build 7 141785777 17I TTGGTTTGGC -----------------/TCCTCACTTTCTTGACT TCCTCACTTT 3070 hom 72 het 26 0 23 5 TCCTCACTTTCTTGACT 0 1 283714 CASAVA_Build 7 141787408 1I ATTAAATAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 T 8 9 283715 CASAVA_Build 7 141792297 1D ACTGAAAAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 9 8 283716 CASAVA_Build 7 141794802 1D CTACATTCAG T/- TTACACGTTC 3070 hom 48 het 19 0 15 5 T 3 2 283717 CASAVA_Build 7 141796401 2D TTGTTTTATT TA/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 58 het 28 0 20 8 TA 1 0 283718 CASAVA_Build 7 141800566 1D GTGAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 11 10 283719 CASAVA_Build 7 141801957 13D ACAGCGCGTC AGCTAATTCAACA/------------- AGCTTCTAGG 3070 hom 95 het 35 0 31 5 AGCTAATTCAACA 1 0 283720 CASAVA_Build 7 141804195 6D CCATGCTATT CTCATG/------ ATAGTGAACA 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 CTCATG 1 0 283721 CASAVA_Build 7 141821187 3I AGTTTGCAAC ---/AAT AAAACAGGGC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 AAT 0 1 283722 CASAVA_Build 7 141824754 1D GAAGCGTGCA T/- TCACCACCGC 3070 hom 60 het 22 0 19 3 T 2 1 283723 CASAVA_Build 7 141824912 2D TATTTCTTTT TC/-- TTTTATTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 2 TC 1 0 283724 CASAVA_Build 7 141826099 1D TTCACAGACA C/- CCCAGTTTAT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 C 4 3 283725 CASAVA_Build 7 141833548 3I GTCATCCATG ---/ACT ACATGTGTAG 3070 het 3070 ref 32 21 7 4 ACT 0 1 283726 CASAVA_Build 7 141834870 9D TGGGAGTCTC ACAGACACA/--------- GCACACCTAA 3070 het 3070 ref 35 23 9 6 ACAGACACA 1 0 283727 CASAVA_Build 7 141838541 1D GGCTCTGCCC T/- TCCTCCCCCA 3070 hom 38 het 16 0 11 5 T 2 1 283728 CASAVA_Build 7 141842116 1I GATGGGGCTG -/C CCCGTTGGGC 3070 hom 48 het 20 0 16 4 C 3 4 283729 CASAVA_Build 7 141842321 1I TGCAGTGTGA -/G GCCTCTGGCT 3070 hom 33 het 19 0 13 6 G 1 2 283730 CASAVA_Build 7 141843040 1I AGAAGCTTAG -/C CACAGCGTGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 1 2 283731 CASAVA_Build 7 141844164 2D AGAAATTGTG GT/-- GTGGTACAGA 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 GT 2 1 283732 CASAVA_Build 7 141844767 2I GGATCACACA --/CT CTGATCCTAT 2160 het 2160 ref 43 35 5 3 CT 1 2 283733 CASAVA_Build 7 141857186 1I TCTAGGGTTT -/C TCCCAGCCCC 2175 het 2175 ref 19 9 8 2 C 0 1 283734 CASAVA_Build 7 141858691 2D TGCCAAACAC TG/-- GGGGCAGCCT 3070 het 3070 ref 39 13 14 12 TG 1 0 283735 CASAVA_Build 7 141860367 1D GGGATGACAA G/- GATAAACTCA 3070 hom 113 het 45 0 35 10 G 2 1 283736 CASAVA_Build 7 141863805 1D AGGGCACAGG A/- AATGGCTCTG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 3 2 283737 CASAVA_Build 7 141875715 1I TCTGGGGAAT -/G GGCGTGGCCT 3070 hom 42 het 15 0 13 2 G 2 3 283738 CASAVA_Build 7 141876916 1I ATCAGCCCCT -/C CTGCGGGAAG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 2 283739 CASAVA_Build 7 141877337 1I CAGGCGTTAG -/C CAGCACGCCT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 C 1 2 283740 CASAVA_Build 7 141878109 1I GGGGGCCATG -/C CTGCGGGTAT 3070 hom 90 het 33 0 28 5 C 1 2 283741 CASAVA_Build 7 141879735 1D ACCCTTTGTG C/- CCCTATGTTA 3070 hom 81 het 32 0 26 6 C 4 3 283742 CASAVA_Build 7 141882534 1I ATGTTGGTAC -/A ACAGAAATTA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 1 2 283743 CASAVA_Build 7 141884512 1I GCTCATAAAA -/C CTGCGGGATG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 1 2 283744 CASAVA_Build 7 141884647 1D GTCCACTGCG A/- ATGTAAAGGG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 2 1 283745 CASAVA_Build 7 141890606 1I CACTATACAG -/A AATCCCTGAG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 2 3 283746 CASAVA_Build 7 141895921 1I GGTGGGTCCT -/G GGCAGAGCCC 3070 hom 38 het 16 0 11 5 G 2 3 283747 CASAVA_Build 7 141908240 1I GCCTGGGACA -/G GAAAATATAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 2 283748 CASAVA_Build 7 141910742 1I CACTATACAG -/A AATCCCTGAG 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 2 3 283749 CASAVA_Build 7 141913147 1D GGTGTAACTT A/- AAAGCTTGTA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 4 3 283750 CASAVA_Build 7 141919795 1I ACTGCTGGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 8 9 283751 CASAVA_Build 7 141920326 4D TTTTTAAACT TGAA/---- TGAATTTCTT 1862 het 1862 ref 29 22 5 2 TGAA 2 1 283752 CASAVA_Build 7 141920531 1I TAGAGATGCA -/T ACTGAAAATC 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 0 1 283753 CASAVA_Build 7 141922496 1I TATCAAACTC -/A AGAGTAACAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 1 2 283754 CASAVA_Build 7 141922751 1I GGCCTCCGGG -/C CAAATTTGGC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 1 2 283755 CASAVA_Build 7 141923075 1D42M1D TAAGAGACAC AAAAAAAATCCCAGATAATCGAAAAACTAGAAACTGAAAGCTTC/-AAAAAAATCCCAGATAATCGAAAAACTAGAAACTGAAAGCTT- CTGGAAGAAA 3070 het 3070 hom 35 20 25 5 N/A 0 0 283756 CASAVA_Build 7 141923430 1D ATTTCTCCAG A/- CTTAGATGAT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 1 0 283757 CASAVA_Build 7 141924195 1I TGCCCCCTCT -/C GCTCAGCACA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 283758 CASAVA_Build 7 141924345 1D AAAAACCTCC A/- AAAAACGGTG 3070 hom 131 het 48 0 42 7 A 6 5 283759 CASAVA_Build 7 141924902 1D TTAGGCACAG A/- CCCTGGAGAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 0 283760 CASAVA_Build 7 141925332 1I TCTGCAGAGT -/C CCCAGGTGGC 3070 hom 65 het 23 0 20 3 C 3 4 283761 CASAVA_Build 7 141927038 2I CAGGCGTGAG --/CC ACCATGCCTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 0 2 283762 CASAVA_Build 7 141927220 1D TCAAATTGTT A/- CATGAAAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 0 283763 CASAVA_Build 7 141928275 1D TATGCTTGAA G/- GTTACTCCAC 3070 hom 96 het 37 0 32 6 G 2 1 283764 CASAVA_Build 7 141929891 1D GAAAACAGGC A/- AAAGCTGCAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 4 3 283765 CASAVA_Build 7 141933652 1I CCTTTCCCCA -/C GCTCCACTAT 3070 hom 109 het 40 0 31 9 C 0 1 283766 CASAVA_Build 7 141934098 1D CACATGCCAT A/- AAAAAATAAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 7 6 283767 CASAVA_Build 7 141935375 1D AAGGAAATCT C/- GGTATTCAGC 3070 hom 30 het 21 0 11 10 C 1 0 283768 CASAVA_Build 7 141935546 1D26M1I GTCTCAAGCC TTGCTGTTGACTGTTTTCTGTACAGAT-/-TGCTGTTGACTGTTTTCTGTACAGATA CCCTTCAATT 3070 hom 102 het 30 0 34 10 N/A 0 0 283769 CASAVA_Build 7 141939641 1D9M1I TGGAGGTATC AAATATGAAC-/-AATATGAACT TATTATTTAA 3070 hom 108 het 37 0 37 5 N/A 0 0 283770 CASAVA_Build 7 141945525 1I CTGGGCTTTG -/C CTTTACCCCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 1 2 283771 CASAVA_Build 7 141946750 1I GTGCTGTTCT -/G GCCTACTGGC 3070 hom 111 het 40 0 36 4 G 1 2 283772 CASAVA_Build 7 141950012 1I CAACTTTACA -/T TTACTTCAGG 1189 het 1189 ref 28 22 3 3 T 2 3 283773 CASAVA_Build 7 141951008 1I ACTGGCTGAG -/C CTTTGCTCAC 3070 hom 53 het 22 0 17 5 C 1 2 283774 CASAVA_Build 7 141951198 1I9M1I TTAACACATT -CCAGTTTCT-/CCCAGTTTCTG GGAATTAGAC 3070 hom 45 het 17 0 14 3 N/A 0 0 283775 CASAVA_Build 7 141951272 1I69M1I CCTGGTTACA -GGAGTGGTAAGTAATTAAATTTTTTAAAACAGAATTATGACCACAGTTTTGTATCCTGGGTCCAACAGA-/GGGAGTGGTAAGTAATTAAATTTTTTAAAACAGAATTATGACCACAGTTTTGTATCCTGGGTCCAACAGAC CCTGCAAAAG 3070 hom 37 het 18 0 16 19 N/A 0 0 283776 CASAVA_Build 7 141951575 3D GTTTGGAGAA GTG/--- GGATTAAGGG 2564 het 1377 hom 26 5 7 14 GTG 1 0 283777 CASAVA_Build 7 141951600 1I4M1I7M16D TGGCAGGGGG -CGGA-GAAAGGTCAACAGGGGAAAAAGC/CCGGAGGAAAGGT---------------- CAGGTGTTAA 3070 hom 54 het 18 0 18 5 N/A 0 0 283778 CASAVA_Build 7 141951837 1I CAGGTTTTTT -/C TACTGCAGAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 283779 CASAVA_Build 7 141952257 3D CCTCCTCTTA AAG/--- AAGTTGGGGG 3070 hom 30 het 11 0 11 6 AAG 2 1 283780 CASAVA_Build 7 141953332 1I CAACTTTACA -/T TTACTTCAGG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 2 3 283781 CASAVA_Build 7 141953484 1D GCCAAAGGCT G/- TAGCACACTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 1 0 283782 CASAVA_Build 7 141954475 1I ACGCAGATGT -/G GCATCCTACC 3070 hom 72 het 28 0 23 5 G 1 2 283783 CASAVA_Build 7 141956446 1I GCCATCCCTT -/G GGAGCCCAAA 3070 hom 51 het 27 0 18 9 G 2 3 283784 CASAVA_Build 7 141956496 1I TCTGCATGCT -/C CCCCTAGGGG 3070 hom 48 het 26 0 16 10 C 4 5 283785 CASAVA_Build 7 141956838 1I5M1I7M1I GCAATATCGA -TTCTT-AAATTGT-/TTTCTTAAAATTGTC CTAACCATAA 3070 hom 90 het 31 0 31 4 N/A 0 0 283786 CASAVA_Build 7 141958757 1I TCCCCATAAT -/G CAGCACAGCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 283787 CASAVA_Build 7 141958989 2D TGCAGAATCC CA/-- AAATGGTCTG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 CA 1 0 283788 CASAVA_Build 7 141960298 1I39M1I14M1I7M1I TGACCAAACT -AGCTTCGTAAGTGAAGAAGAAATACGATCCTTTTCAGAC-AGCAAACACTTAGG-AATTTGT-/AAGCTTCGTAAGTGAAGAAGAAATACGATCCTTTTCAGACAAGCAAACACTTAGGAAATTTGTC ACCACAGGAC 3070 hom 69 het 22 0 24 9 N/A 0 0 283789 CASAVA_Build 7 141964623 1I TCTGCCTAGG -/A AAACCAGAGA 1985 hom 15 het 6 0 6 0 A 3 4 283790 CASAVA_Build 7 141964794 1D AAAGTCGAAG A/- AAAAAAAAGA 2502 het 1934 hom 13 5 7 1 A 9 8 283791 CASAVA_Build 7 141966270 3D TATGAGTCTT AAG/--- AAAGTGTAAG 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 AAG 1 0 283792 CASAVA_Build 7 141967390 1D GGGAGGACCC A/- AAAACTTCTA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 5 4 283793 CASAVA_Build 7 141967931 1I ATCATGCTGA -/T GTGGTGGGGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 0 1 283794 CASAVA_Build 7 141968162 1D TCTTTGTTTC A/- ATGACTCTGT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 2 1 283795 CASAVA_Build 7 141968542 1D GTGTTGGAGG A/- AAAAATCTCT 3070 hom 87 het 37 0 29 9 A 6 5 283796 CASAVA_Build 7 141968851 1D ATCTTCACCC G/- ATGCCCAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 1 0 283797 CASAVA_Build 7 141970174 1I TTCCACATGT -/C CCTAGGCAAG 3070 hom 104 het 41 0 34 7 C 2 3 283798 CASAVA_Build 7 141970674 1I AATTCTTCAA -/C CCCATCAGGA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 3 4 283799 CASAVA_Build 7 141973538 1D15M1I AACCGAGTGA TCCAAAGTAAATAAAC-/-CCAAAGTAAATAAACA TGACCCATAA 3070 hom 111 het 35 0 37 7 N/A 0 0 283800 CASAVA_Build 7 141973695 1D TCAAACAAAT C/- CCAAACTGAA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 C 3 2 283801 CASAVA_Build 7 141975324 1D TGCAATGCAG A/- AAAAGAAAAG 3070 hom 74 het 28 0 25 3 A 5 4 283802 CASAVA_Build 7 141977068 1I TCTCCCCCAA -/G GGAGGGGAGA 3070 hom 82 het 32 0 27 5 G 2 3 283803 CASAVA_Build 7 141977229 1I GTGTATGTTG -/C CCTGGTTATA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 C 2 3 283804 CASAVA_Build 7 141978951 1D AAGTTCCTCG T/- TGGGTACATT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 2 1 283805 CASAVA_Build 7 141980074 1I GGTGCCGTGA -/G GATGGTGAGG 3070 hom 117 het 44 0 39 9 G 1 2 283806 CASAVA_Build 7 141980164 1I GCTTACCAAT -/G GGGTTCCATG 3070 hom 120 het 46 0 39 7 G 3 4 283807 CASAVA_Build 7 141982942 1D ATAAATTACC A/- TTATAATTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 1 0 283808 CASAVA_Build 7 141984532 1I AGAATTTGGA -/G GCAAAGCCTT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 1 2 283809 CASAVA_Build 7 141984761 1I ACACTCTAGT -/C CCACAGACTC 3070 hom 117 het 44 0 38 6 C 2 3 283810 CASAVA_Build 7 141985816 1I ATTAACAACA -/G TAGATGTTTC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 G 0 1 283811 CASAVA_Build 7 141987290 1I GAACCGGTGG -/C TCGCGCCTGT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 0 1 283812 CASAVA_Build 7 141987649 5D TCGGCCTCAT TATTC/----- TCTTTTATTA 3070 hom 72 het 26 0 22 5 TATTC 1 0 283813 CASAVA_Build 7 141988152 1D TTGGAAGGCC A/- AAAGCAAGCA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 4 3 283814 CASAVA_Build 7 141989641 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1584 het 31 hom 19 1 6 12 A 17 16 283815 CASAVA_Build 7 141990606 2D ACCCTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 31 0 23 9 A 12 10 283816 CASAVA_Build 7 141993228 2I ATTTATTGGC --/CT TCCGGAGAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 CT 0 1 283817 CASAVA_Build 7 141999141 1D CTAGCCAGGG A/- AAATTAGTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 4 3 283818 CASAVA_Build 7 141999455 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 7 A 12 11 283819 CASAVA_Build 7 142010962 1I AATATAGCAC -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 6 7 283820 CASAVA_Build 7 142014088 1D TTAAATGAAA G/- GCACAATTGA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 2 1 283821 CASAVA_Build 7 142026621 1I CAGGCGCCCG -/C CACCACGCCC 2010 hom 15 het 6 0 5 1 C 1 2 283822 CASAVA_Build 7 142030897 5D TAAAGTAGTT ATAAC/----- AGAATGGAAA 3070 het 3070 ref 28 19 7 5 ATAAC 1 0 283823 CASAVA_Build 7 142032472 1I CCCTCAATCA -/G TAGGGAACAG 2858 het 2858 ref 23 17 6 0 G 0 1 283824 CASAVA_Build 7 142040501 1D CAAACATACC A/- AAAAAAAAAT 1779 het 1331 hom 10 4 4 3 A 10 9 283825 CASAVA_Build 7 142041712 1I AGGGCAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 9 7 7 T 13 14 283826 CASAVA_Build 7 142049790 2I CACCAAAAAA --/AG GTCATAGTTG 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 AG 0 1 283827 CASAVA_Build 7 142073594 1D AACCCCTTGA G/- GGAAATTTCA 3070 hom 92 het 34 0 30 4 G 3 2 283828 CASAVA_Build 7 142074203 1I CCTCCTTTTT -/G CCTGGTAAAA 3070 het 3070 ref 31 21 7 3 G 0 1 283829 CASAVA_Build 7 142079181 1I CTAGGAGCCC -/T TTTGGCCTTA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 3 4 283830 CASAVA_Build 7 142082344 1I TATCCAGAAG -/C AATTTCTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 0 1 283831 CASAVA_Build 7 142092446 2I TTCTTTCTCT --/CC GTTTCTCTGT 2929 het 2929 ref 31 16 10 5 C 0 2 283832 CASAVA_Build 7 142092740 1I AGATTTTTTT -/C TTGTCTTGCA 3070 het 197 hom 34 1 27 6 C 0 1 283833 CASAVA_Build 7 142098343 5I CAACAAATAT -----/GTAAG GTAAGTACTT 3070 het 3070 ref 45 24 20 1 GTAAG 1 2 283834 CASAVA_Build 7 142101025 1D TTTGCTATTT G/- GGATGTCAAG 3070 het 3070 ref 41 20 17 5 G 3 2 283835 CASAVA_Build 7 142104281 1I CCAGCTGCTC -/T TTTTGTGCAG 3070 hom 93 het 40 0 31 9 T 4 5 283836 CASAVA_Build 7 142117274 1D CAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3003 het 3003 ref 19 10 8 1 A 10 9 283837 CASAVA_Build 7 142119631 8D7M5D CAGTCAGATA TTAAAGAGTCTTAAAAATTC/--------TATTACA----- TATATCATAT 3070 hom 42 het 13 0 15 0 N/A 0 0 283838 CASAVA_Build 7 142127783 8I GTTAACACTG --------/GGTGGAAA GGTGGAAAGA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 GGTGGAAA 1 2 283839 CASAVA_Build 7 142132073 5D CAGTCATGCC ATATT/----- ATATTATCAC 3070 het 2221 hom 23 5 14 5 ATATT 2 1 283840 CASAVA_Build 7 142133600 2I TATTGGATAA --/AG AGAAATTGTG 3070 het 2200 hom 21 7 9 5 AG 1 2 283841 CASAVA_Build 7 142144208 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1042 het 1042 ref 11 5 4 2 A 12 13 283842 CASAVA_Build 7 142145015 1I TGATAAAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 9 10 283843 CASAVA_Build 7 142145495 1D ACTAATCCAG A/- AACCCCCTTT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 3 2 283844 CASAVA_Build 7 142148012 1I TTCCCATCCT -/C CTTCGGCTCT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 C 1 2 283845 CASAVA_Build 7 142176021 1D AAGTTACATG C/- CTATATAGGA 3070 hom 71 het 30 0 27 3 C 2 1 283846 CASAVA_Build 7 142179182 2D GAGGAGGCTG AA/-- AAATTACTCA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 5 3 283847 CASAVA_Build 7 142183971 1D GACAGATACA T/- TTTTTTCCCT 1831 het 1831 ref 19 11 5 3 T 7 6 283848 CASAVA_Build 7 142185528 1D ATTGCTGGGT G/- GGAATCGTAG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 G 3 2 283849 CASAVA_Build 7 142185667 1I GCATCTTCTG -/T TTTTTGACAT 3070 hom 51 het 18 0 17 1 T 5 6 283850 CASAVA_Build 7 142218827 2D AACTAGCAAA TT/-- TTTAGACTAC 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 T 5 3 283851 CASAVA_Build 7 142220825 1I GGGGAGCCAA -/G GATGCAAAGC 3070 hom 84 het 34 0 25 9 G 1 2 283852 CASAVA_Build 7 142221298 1I AACCAGCTAT -/A CTCTGCACTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 0 1 283853 CASAVA_Build 7 142223408 1I TCTGGAGGTG -/C CCTACGGAAT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 C 2 3 283854 CASAVA_Build 7 142232772 1I TTCTCTTTCA -/T TTTGGATTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 3 4 283855 CASAVA_Build 7 142234677 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1277 hom 26 7 11 8 A 13 14 283856 CASAVA_Build 7 142236256 2I CATTACATAC --/AA AAAAAAAAAA 2867 het 2867 ref 36 22 9 5 A 11 13 283857 CASAVA_Build 7 142237577 1D AAAAAAACAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 9 8 283858 CASAVA_Build 7 142240736 1I GTGAATCTAG -/A AAAAACACTG 3070 het 3070 hom 53 15 24 14 A 5 6 283859 CASAVA_Build 7 142241353 3I AAGCAAAACA ---/AAC AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 AAC 0 1 283860 CASAVA_Build 7 142242207 1I TTAACTATCT -/A AGAGGATGAA 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 A 1 2 283861 CASAVA_Build 7 142249247 1I TCATGCTACT -/A AAATAACAGG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 3 4 283862 CASAVA_Build 7 142250248 2D CCCCTGGAGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 1119 hom 35 5 16 14 TC 10 9 283863 CASAVA_Build 7 142250537 1I CTGTACTGAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 A 8 9 283864 CASAVA_Build 7 142253729 1I GACACTATGC -/T TCACGTACAG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 1 2 283865 CASAVA_Build 7 142255079 1I GAAGTTCAGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 44 28 12 4 T 8 9 283866 CASAVA_Build 7 142257150 1I ATCTTGCTGG -/A AAACAGACTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 3 4 283867 CASAVA_Build 7 142260452 2D TGAACAAGTC AA/-- AAAAAAAAAA 2091 het 1175 hom 14 5 8 1 A 12 10 283868 CASAVA_Build 7 142335156 1D TGCATTGGAC T/- TTCCCCCATG 3070 het 3070 ref 57 21 19 19 T 3 2 283869 CASAVA_Build 7 142379112 1I CTACTAAAAT -/A AAAAAAGATT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 6 7 283870 CASAVA_Build 7 142390902 1D GACCTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 29 20 4 5 T 13 12 283871 CASAVA_Build 7 142471301 1I CTTCATCCTC -/T TTTTCTTCTC 869 het 869 ref 48 26 6 16 T 4 5 283872 CASAVA_Build 7 142493905 1I TCAATAGATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 A 9 10 283873 CASAVA_Build 7 142503781 1D ATTATTATAC T/- TTTAAGTTAT 1961 het 1917 hom 9 4 5 0 T 4 3 283874 CASAVA_Build 7 142525747 3D TACTAAAAAT AAA/--- AAAATTAGCC 3070 het 3070 hom 27 11 15 4 A 7 4 283875 CASAVA_Build 7 142530970 1I ATCACTGTTA -/T TCTGTTCGTT 2393 het 2393 ref 21 15 5 1 T 1 2 283876 CASAVA_Build 7 142535614 1D GGGAGGCCAA G/- GGGGGGTGGA 2458 het 1931 hom 18 6 8 4 G 7 6 283877 CASAVA_Build 7 142571985 6I TGCCTTGCTA ------/GGTTGG GGAAGTTCTC 3070 het 2313 hom 12 5 7 0 GGTTGG 0 1 283878 CASAVA_Build 7 142572656 1I GACCCTCAGC -/T TGCAGGTCTG 1450 het 1058 hom 7 3 3 1 T 1 2 283879 CASAVA_Build 7 142574052 4I AATCTTAGGC ----/CTGA CTTAGTATCA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 CTGA 0 1 283880 CASAVA_Build 7 142664510 1D TTTCTATTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 10 9 283881 CASAVA_Build 7 142665775 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 888 het 888 ref 25 20 3 2 A 11 10 283882 CASAVA_Build 7 142697761 2I TGTAGATGAC --/AT ATATTGGCAA 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 AT 2 3 283883 CASAVA_Build 7 142703949 2D AAACAGAACC AA/-- AAAAAAAAAA 1606 het 1606 ref 36 18 5 14 A 14 12 283884 CASAVA_Build 7 142735454 1I GGTGTAGTTG -/A TGGCATGAGC 3070 hom 117 het 48 0 39 9 A 0 1 283885 CASAVA_Build 7 142740516 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2217 het 1999 hom 24 8 8 8 A 17 16 283886 CASAVA_Build 7 142741429 1I ACTCCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 13 14 283887 CASAVA_Build 7 142744714 1D GGTCAGCCCT G/- GATGAGGGGA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 G 2 1 283888 CASAVA_Build 7 142745631 8I CACCATATAG --------/ATGGTTCT ATGGTTCTAT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 ATGGTTCT 1 2 283889 CASAVA_Build 7 142760339 1D TTGAGTGCTG C/- CCCGCACTTG 2361 het 2361 ref 33 22 8 3 C 4 3 283890 CASAVA_Build 7 142762194 4I CAGTGCTCCC ----/GGAA TTCCAGCAGA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 GGAA 0 1 283891 CASAVA_Build 7 142785677 3D GTCAGGAACA TCT/--- TCTTATTTGC 3070 hom 109 het 43 0 37 8 TCT 2 1 283892 CASAVA_Build 7 142793249 13D ATATGTGTGA GTGTATGTGAGTG/------------- GTGTATGTGT 3070 het 3070 ref 39 24 9 9 GTGTATGTGAGTG 1 0 283893 CASAVA_Build 7 142821325 2D TACAGGCGCC CA/-- CCACCACGCC 1356 hom 12 het 5 0 5 0 CA 1 0 283894 CASAVA_Build 7 142822568 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1897 het 1897 ref 16 8 6 2 A 16 17 283895 CASAVA_Build 7 142826245 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 981 het 981 ref 40 26 3 11 T 15 14 283896 CASAVA_Build 7 142827531 4I CTTATTATCG ----/TAAT TAATGTTACC 3070 hom 144 het 51 0 49 2 TAAT 1 2 283897 CASAVA_Build 7 142829788 2I GACCATACCC --/CT GAGATGGCTA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 CT 0 1 283898 CASAVA_Build 7 142839247 4D ATTTTGAGTA TTTC/---- TTTTAAACAG 3070 hom 93 het 33 0 32 3 TTTC 1 0 283899 CASAVA_Build 7 142852602 3I CTCCACCACA ---/CTC CTCTACATTA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 CTC 1 2 283900 CASAVA_Build 7 142857258 1D CCTTTCTTCC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 7 6 283901 CASAVA_Build 7 142860549 1D TTTCCTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1825 hom 33 7 16 10 T 15 14 283902 CASAVA_Build 7 142863232 1D TGATTTTTTT A/- AAATATGAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 4 3 283903 CASAVA_Build 7 142883802 1I AGATTGGTGG -/T TTGCCAGGGT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 2 3 283904 CASAVA_Build 7 142884828 1I AGCATGCAGG -/C AAAACTGGAC 3070 het 3070 ref 52 26 17 9 C 0 1 283905 CASAVA_Build 7 142891974 1I ATCTTACTGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 T 6 7 283906 CASAVA_Build 7 142910049 1I TCTCTCTACG -/A AAAAACAATC 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 A 5 6 283907 CASAVA_Build 7 142911158 4I ATTCTCATTG ----/GTCT ACCCTGTTAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 GTCT 0 1 283908 CASAVA_Build 7 142914035 1I GCCTTGTTGG -/C CTGGGAGAGA 3070 hom 123 het 47 0 39 8 C 1 2 283909 CASAVA_Build 7 142918860 1D CCTGCGGTGG C/- CCCGGCGTGC 1883 het 1308 hom 13 5 5 3 C 4 3 283910 CASAVA_Build 7 142921137 1D AATGCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2937 hom 38 14 12 12 A 13 12 283911 CASAVA_Build 7 142934218 6I TTTATTATTA ------/CTGCTC CTGCTCCTGC 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 CTGCTC 2 3 283912 CASAVA_Build 7 142952904 2I AAGCAACTCT --/TC TCTCTCTCTG 3070 het 1831 hom 18 4 14 0 TC 4 5 283913 CASAVA_Build 7 142972879 1I ATCACTTTGG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 7 8 283914 CASAVA_Build 7 142997764 1D AGCCCATCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 67 32 27 8 T 10 9 283915 CASAVA_Build 7 143049666 1D GTTTTTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1265 hom 23 4 14 5 A 12 11 283916 CASAVA_Build 7 143066184 1I TATGAAATAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 52 41 9 2 T 8 9 283917 CASAVA_Build 7 143080823 4D ATTCACTCAC CACT/---- CACTCACTCA 2478 het 2478 ref 32 24 6 5 CACT 4 3 283918 CASAVA_Build 7 143087829 1D AAGATGTGCC T/- TTGCTTTTCC 2142 het 2142 ref 17 9 5 3 T 3 2 283919 CASAVA_Build 7 143094378 1I CATTAAATTC -/A ACAAACAAAA 1714 het 1495 hom 9 3 4 2 A 1 2 283920 CASAVA_Build 7 143122708 2I AAGCAATCTC --/AG GGGAAAGAAA 1437 het 1437 ref 14 9 3 2 AG 0 1 283921 CASAVA_Build 7 143127297 1I AGCTTCATTT -/A AAAAAAAAGA 2126 het 2126 ref 50 41 5 4 A 8 9 283922 CASAVA_Build 7 143137001 3D ACCATTCCTT AAG/--- AAGAAGAAGT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AAG 4 3 283923 CASAVA_Build 7 143139121 1I GACCCCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 66 20 16 30 T 12 13 283924 CASAVA_Build 7 143173497 1D AGAGGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 42 1 29 13 A 11 10 283925 CASAVA_Build 7 143200076 1D TGTAATCATG A/- AAAAAAAAAA 1716 het 15 hom 6 0 4 2 A 11 10 283926 CASAVA_Build 7 143210035 1D TGTGTGAGAA G/- GGATGTTCTA 2754 het 2754 ref 21 12 7 2 G 3 2 283927 CASAVA_Build 7 143241495 2D TGTTTATGAT AA/-- GTCAGCTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 12 8 A 2 0 283928 CASAVA_Build 7 143242079 1D TTAATCTTAA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 8 283929 CASAVA_Build 7 143247068 1I TTTAGAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 10 11 283930 CASAVA_Build 7 143286364 1I CTCAGCCTCA -/T TTATGATTTT 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 T 2 3 283931 CASAVA_Build 7 143287090 1I AAAGACCGGT -/G GGCCCCAGGA 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 G 2 3 283932 CASAVA_Build 7 143293194 1D TGAGGTGAGG T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 T 7 6 283933 CASAVA_Build 7 143297261 1D TTGGGAGGCT A/- AGGCAGGAAA 1558 het 1558 ref 10 5 4 1 A 2 1 283934 CASAVA_Build 7 143315883 1D TTAATGACTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 T 9 8 283935 CASAVA_Build 7 143316874 1D TTTGCCATCT G/- AAGGAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 G 1 0 283936 CASAVA_Build 7 143345731 1I TAATTAACTG -/T TTTTTTTTTT 1050 het 1050 ref 41 31 3 7 T 11 12 283937 CASAVA_Build 7 143372551 1D ACACTCTCTC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 31 18 10 4 T 8 7 283938 CASAVA_Build 7 143378415 1D AACGCAGGTA C/- TGTCACAAGG 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 C 1 0 283939 CASAVA_Build 7 143390710 3D TTTGTTTTTA GTT/--- GTTTAAGAAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 5 GTT 2 1 283940 CASAVA_Build 7 143391375 1I ACAAAAGAGG -/A AAAAAAGTGG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 6 7 283941 CASAVA_Build 7 143397594 4I GTAAGAACTG ----/TCCT TCCTTGTTTG 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 TCCT 1 2 283942 CASAVA_Build 7 143399192 1D CCTCCCAATA C/- CCCTGCTACC 3070 het 3070 ref 37 18 10 10 C 4 3 283943 CASAVA_Build 7 143399588 1D TTTGTGAGTA T/- TTTTAATAGT 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 5 4 283944 CASAVA_Build 7 143402032 3D ATACTATAAT ATC/--- ATACTAACAT 3070 het 3070 ref 54 28 20 6 ATC 1 0 283945 CASAVA_Build 7 143404313 3I AATGGAGAAT ---/ATA ATAACTGTAA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 ATA 1 2 283946 CASAVA_Build 7 143407660 17D GCCTATAGAA TTGTTATTATTATTTAC/----------------- TCATGACCTG 3070 het 3070 ref 33 22 11 3 TTGTTATTATTATTTAC 1 0 283947 CASAVA_Build 7 143420906 4I GGTGAAGAGT ----/GAAA GAGACAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 GAAA 0 1 283948 CASAVA_Build 7 143427562 5D AAATGAAAAC AGAAT/----- AGAAGGTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 AGAAT 1 0 283949 CASAVA_Build 7 143428179 1I GATACTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 10 11 283950 CASAVA_Build 7 143434700 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 8 9 283951 CASAVA_Build 7 143441199 2D TTTTAAAAAC TG/-- TGATTTCCTT 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 TG 2 1 283952 CASAVA_Build 7 143444048 5D TATGAAAATC TATTA/----- TATTTTTGAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 6 TATTA 1 0 283953 CASAVA_Build 7 143446908 1I GATTTCATGA -/G GCCCACTGAA 1571 het 1571 ref 55 41 4 10 G 1 2 283954 CASAVA_Build 7 143452064 4I AGAATTTATT ----/ACTC ACCCCATTTT 3070 het 3070 ref 37 22 8 7 ACTC 0 1 283955 CASAVA_Build 7 143456972 1D6M1I CCATTGATAC AATGCGA-/-ATGCGAT TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 45 27 17 2 N/A 0 0 283956 CASAVA_Build 7 143457663 3D AAATCAACCA CTT/--- CTTCTGTGAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 6 CTT 2 1 283957 CASAVA_Build 7 143458132 1D AGAAGTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 11 10 283958 CASAVA_Build 7 143460585 4D GTTGCTTGTC GGTT/---- GGTTGGTTGG 3070 het 3070 ref 50 23 22 8 GGTT 5 4 283959 CASAVA_Build 7 143468851 2I AACAATGAAG --/TA CAACCCACTG 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 TA 0 1 283960 CASAVA_Build 7 143469188 1I CTAATTAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 A 9 10 283961 CASAVA_Build 7 143475251 1D GGCCTCCTGA C/- CACCTATGGG 3028 het 3028 ref 34 14 10 13 C 2 1 283962 CASAVA_Build 7 143476503 1I CCGAGAGAGT -/G GGTTGATTTA 3070 het 3070 ref 49 25 23 1 G 2 3 283963 CASAVA_Build 7 143485513 1D AGTGAAACAC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 A 8 7 283964 CASAVA_Build 7 143506143 3D AAGCTCTGAT TGA/--- TTTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 17 8 2 TGA 1 0 283965 CASAVA_Build 7 143506523 12I CTGTGACTGA ------------/GGATAATGCTGG GTAGGGTCTT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 GGATAATGCTGG 0 1 283966 CASAVA_Build 7 143552499 3D TAAGAGTTGC ATA/--- ATATTTCATT 1449 het 1449 ref 10 5 3 3 ATA 2 1 283967 CASAVA_Build 7 143563975 1D TAACGAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 11 7 A 10 9 283968 CASAVA_Build 7 143619910 2D TTCCCTAGAG CC/-- CCCCCCCCAA 3070 het 1562 hom 18 4 13 1 C 10 8 283969 CASAVA_Build 7 143625072 1D ATAAAATAAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 8 7 283970 CASAVA_Build 7 143644877 1I CCAGAGAAGC -/T TTTTTCTTCA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 5 6 283971 CASAVA_Build 7 143687710 1D CAGTGGGAGA G/- GGGGGGGATG 2640 hom 20 het 10 0 6 4 G 8 7 283972 CASAVA_Build 7 143711729 1D TGGTCTGTTC T/- TTTTTTTTTT 2703 het 1944 hom 17 6 7 5 T 13 12 283973 CASAVA_Build 7 143714457 8D TTGAACTCCT GAACTCAA/-------- GTGATCCTCC 3070 het 3070 hom 23 11 13 1 GAACTCAA 1 0 283974 CASAVA_Build 7 143735175 1D GTCTGATACT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 58 het 23 0 20 3 A 10 9 283975 CASAVA_Build 7 143736263 1D AGCATGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 43 3 27 13 T 17 16 283976 CASAVA_Build 7 143741452 1I AGTTATCTTT -/A AAAAATATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 5 6 283977 CASAVA_Build 7 143744801 1I AATTTGGGCA -/G GGGGGCATAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 5 6 283978 CASAVA_Build 7 143747571 1D CCCTCTCCTT C/- CCCATTTTGA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 4 3 283979 CASAVA_Build 7 143756412 3I ACACTCCACT ---/CTG CTGGTACCAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CTG 1 2 283980 CASAVA_Build 7 143765289 1I TATGAGTCAA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 6 7 283981 CASAVA_Build 7 143765484 1D AAGCCTTGTA T/- TTTAGGACTA 3070 hom 120 het 50 0 41 10 T 4 3 283982 CASAVA_Build 7 143768714 1D GAAGTTTAAA G/- GGGACAGACA 3070 hom 157 het 58 0 53 5 G 4 3 283983 CASAVA_Build 7 143773589 1I ACTTGAACCC -/G GGGGGGCGGA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 G 6 7 283984 CASAVA_Build 7 143782593 3D TGGAGCCCAA ACT/--- ATCAGAGTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 ACT 1 0 283985 CASAVA_Build 7 143792464 1I CTTGGGTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 34 het 24 0 17 7 A 9 10 283986 CASAVA_Build 7 143797146 1D TCTTAGGCTT G/- GGGCAGCTTC 3070 hom 134 het 51 0 41 10 G 4 3 283987 CASAVA_Build 7 143799723 1I TTTCCAGAAT -/G TATTTAATAT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 0 1 283988 CASAVA_Build 7 143800246 2I TTATAGTAAC --/AG GGGAATTTCT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 AG 0 1 283989 CASAVA_Build 7 143807298 5D TTGGTATGTG GAGCT/----- GAGCTACAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GAGCT 2 1 283990 CASAVA_Build 7 143818832 1D GTTCTATTTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 61 het 25 0 21 4 A 9 8 283991 CASAVA_Build 7 143819089 1D AGTACTATCC T/- TTTTTTTTTT 2676 het 86 hom 21 1 9 11 T 17 16 283992 CASAVA_Build 7 143827596 26I CAGCCTCCCG --------------------------/AGTAGCTGGGACTACAGGCGTCCGCC AACACGCCTG 3070 hom 42 het 14 0 14 1 AGTAGCTGGGACTACAGGCGTCCGCC 0 1 283993 CASAVA_Build 7 143840188 1D ACCTCCGTGC A/- AAAAAAGCTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 6 283994 CASAVA_Build 7 143840378 1D AAATATATGC A/- AAATTCTCTA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 4 3 283995 CASAVA_Build 7 143867212 1I GTAATGCATC -/T TTTTTTTTTT 853 het 853 ref 46 29 3 14 T 10 11 283996 CASAVA_Build 7 143882591 1D GATACCTTCC T/- TTTTTTTTTT 933 het 451 hom 22 8 6 8 T 17 16 283997 CASAVA_Build 7 143958911 2D ATTAGAAAAC TG/-- TGTTTCATTT 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 TG 2 1 283998 CASAVA_Build 7 143960118 5I CCTCAACATA -----/AACTG AACTGAAGAT 3070 het 3070 hom 52 16 31 5 AACTG 1 2 283999 CASAVA_Build 7 143988785 1I GAAAACTCTA -/T TATAAGTGTC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 1 2 284000 CASAVA_Build 7 144004018 8D ACTTAGACTG TCACTGAT/-------- TCACTGATTC 3070 het 3070 ref 32 14 10 11 TCACTGAT 2 1 284001 CASAVA_Build 7 144008501 1D CATTCAAAAT G/- TACAAATATT 3070 het 3070 ref 54 26 24 4 G 1 0 284002 CASAVA_Build 7 144011586 1I TTTCTTGAAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 8 9 284003 CASAVA_Build 7 144015904 4I ACAGGCTGAT ----/AAAC AAACAGATGA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 AAAC 1 2 284004 CASAVA_Build 7 144018767 3D AAAAAAAAAA TAT/--- ATATATATAT 1866 het 854 hom 12 3 8 3 TAT 1 0 284005 CASAVA_Build 7 144019695 1D AACTTCTCAA T/- TTTTTTTTAT 1804 het 1804 ref 14 7 5 2 T 9 8 284006 CASAVA_Build 7 144049447 1I TGGGCTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 10 11 284007 CASAVA_Build 7 144059258 5I TGATCCATCT -----/GCCTA GGCCTCCCAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GCCTA 0 1 284008 CASAVA_Build 7 144066537 2D TTCTAGATAT AA/-- GTCTTTTATC 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 A 2 0 284009 CASAVA_Build 7 144078657 2D TCTACCAGCC AA/-- AGAGAGAAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 3 1 284010 CASAVA_Build 7 144080106 2I ATCTGCAAAC --/AG AGACAATTTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AG 1 2 284011 CASAVA_Build 7 144084027 2I GAGAGCATGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 24 0 13 11 T 12 14 284012 CASAVA_Build 7 144088813 1D TAAATGGCAG T/- TCTATTTAGA 3070 hom 98 het 39 0 31 8 T 2 1 284013 CASAVA_Build 7 144089526 4I TATTACAAAC ----/TATT TAGGTAGAGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TATT 0 1 284014 CASAVA_Build 7 144091991 4I GTTGAGCGTA ----/TGGG TTAAAAGGTA 3070 hom 114 het 44 0 35 9 TGGG 0 1 284015 CASAVA_Build 7 144093400 4I AGAATAATAT ----/AAAC AAACAGTTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAAC 1 2 284016 CASAVA_Build 7 144097906 3I TATTCTAGAG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 9 A 11 14 284017 CASAVA_Build 7 144101556 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 A 9 8 284018 CASAVA_Build 7 144103395 1D TATTCCTTAT C/- TGCATAGAAA 3070 het 3070 hom 54 23 28 3 C 1 0 284019 CASAVA_Build 7 144111033 4D CAATGACTGA ACAG/---- ACAGCACATC 3070 hom 150 het 55 0 50 8 ACAG 2 1 284020 CASAVA_Build 7 144117682 5I CACTCTGTCT -----/TTAAG TTATTTAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 TTAAG 0 1 284021 CASAVA_Build 7 144120246 4I GAGCATAGCC ----/CAAA CAGAGTCCCC 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 CAAA 0 1 284022 CASAVA_Build 7 144125603 17I GCCTCTTCTC -----------------/AAAAAGTCAGTGTGGGA CCACAAATGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 AAAAAGTCAGTGTGGGA 0 1 284023 CASAVA_Build 7 144128618 1D ATTTACAGCT A/- AAAATCTGCC 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 A 5 4 284024 CASAVA_Build 7 144132453 1I GAGGTTTTAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 2819 hom 35 14 14 7 C 0 1 284025 CASAVA_Build 7 144157722 1I AGAATATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 847 hom 29 3 16 10 A 16 17 284026 CASAVA_Build 7 144197174 1D ATCCTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 32 0 25 7 T 12 11 284027 CASAVA_Build 7 144232439 2I CCTTTTCAAG --/CA CACACTCTTC 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 CA 2 3 284028 CASAVA_Build 7 144241824 1I ACAATATTAT -/A TTTTATAATG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 0 1 284029 CASAVA_Build 7 144249066 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1040 hom 28 6 14 8 A 17 16 284030 CASAVA_Build 7 144249679 1D GTTTACATCC T/- TTTTTTTTTT 1741 het 1741 ref 34 24 5 5 T 12 11 284031 CASAVA_Build 7 144249788 5D TGTAAGCTGG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 14 8 GTTTT 5 4 284032 CASAVA_Build 7 144256389 22D CTATAGCCCA GTGACATCTTAGCCATTGTAAG/---------------------- GTCATAGCAC 3070 het 3070 ref 35 28 8 3 GTGACATCTTAGCCATTGTAAG 1 0 284033 CASAVA_Build 7 144259834 1I AATCCAATGG -/C CTTGTTACAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 1 2 284034 CASAVA_Build 7 144271219 1I TTTCCCCCAT -/G TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 0 1 284035 CASAVA_Build 7 144274623 1I TTATTTGATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 9 10 284036 CASAVA_Build 7 144275395 1I AGTATTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 T 10 11 284037 CASAVA_Build 7 144276212 1D ATAAAATGAA T/- TTCCCTAAGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 3 2 284038 CASAVA_Build 7 144278280 1I TCCTTGATTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 25 het 11 0 9 2 A 8 9 284039 CASAVA_Build 7 144287634 1D ACGGCACCAC A/- ACTGCCTTTA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 2 1 284040 CASAVA_Build 7 144288631 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTTTTTTT 2994 hom 48 het 18 0 13 6 C 1 0 284041 CASAVA_Build 7 144309519 1D CTGAGCTGAA T/- TTTGTGATCA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 4 3 284042 CASAVA_Build 7 144315390 1D5M1D AATACACATT GTTACAC/-TTATA- CATGAGGTGT 3070 hom 111 het 36 0 37 4 N/A 0 0 284043 CASAVA_Build 7 144315929 1D TCTGACATAC A/- TAATACTGAG 3070 hom 154 het 58 0 52 6 A 1 0 284044 CASAVA_Build 7 144317696 1I AGAATATAAT -/A AAAATAATGG 3070 hom 77 het 31 0 27 4 A 4 5 284045 CASAVA_Build 7 144321794 3D ATAACAGCAC AAG/--- AAGATAGAAA 3070 het 3070 ref 47 27 17 4 AAG 2 1 284046 CASAVA_Build 7 144323624 7D AAACGTGGTA TTTACCT/------- TTCTGTGCCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTTACCT 1 0 284047 CASAVA_Build 7 144324811 1I CAATTTCTAC -/A AAAAAATAGT 3070 hom 102 het 36 0 33 3 A 6 7 284048 CASAVA_Build 7 144328906 1D TTATATATAT A/- TTTTTTGTTA 3070 het 258 hom 30 1 27 2 A 1 0 284049 CASAVA_Build 7 144339773 1D TTGTTGTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 T 10 9 284050 CASAVA_Build 7 144340991 1D GATTTAAATG T/- TTTTTGCTTA 3070 het 3070 hom 36 13 23 0 T 6 5 284051 CASAVA_Build 7 144343621 4D CCCAGGTGAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3031 het 2998 hom 26 8 10 9 T 18 14 284052 CASAVA_Build 7 144344525 3D AATATACTGC TCT/--- TCTTCCATTA 3070 het 3070 ref 35 22 10 4 TCT 2 1 284053 CASAVA_Build 7 144355076 1D ATTCAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 11 10 284054 CASAVA_Build 7 144358510 1D GAGTCATCAA T/- GCTGGGTGGA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 1 0 284055 CASAVA_Build 7 144390372 4D TTACATTACT TACA/---- TACATTACCT 3070 het 3070 hom 38 13 24 2 TACA 2 1 284056 CASAVA_Build 7 144397183 2I CTTGTTAACC --/TA TCTTTTATTA 3070 het 3070 hom 35 9 19 7 TA 0 1 284057 CASAVA_Build 7 144400256 1D TTGGTATCTA C/- TCTCAACCAT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 C 1 0 284058 CASAVA_Build 7 144400361 2D CTCTGCTTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 128 hom 45 2 22 22 T 11 9 284059 CASAVA_Build 7 144421652 1D GATTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 12 11 284060 CASAVA_Build 7 144427166 2D CTTTATTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 2699 het 49 hom 28 1 7 20 A 14 12 284061 CASAVA_Build 7 144461042 2D AAAATACTAT GG/-- GGGGGGGGAA 2709 het 2709 ref 32 16 10 9 G 10 8 284062 CASAVA_Build 7 144468216 4D TATATGTATA ATAG/---- ATAATGTGTG 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 ATAG 1 0 284063 CASAVA_Build 7 144469852 1D TTGAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 14 15 T 13 12 284064 CASAVA_Build 7 144471113 2D ATTGCTAAAC TA/-- TGTGTCACTA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 TA 1 0 284065 CASAVA_Build 7 144472331 1I TTCTCCAAAC -/T GCGTTTACTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 284066 CASAVA_Build 7 144474852 4D AAATTCCCAT AATA/---- AATCTCTTCA 3070 hom 63 het 32 0 22 13 AATA 1 0 284067 CASAVA_Build 7 144476619 12I TGCAAGGAAG ------------/TTTACAAATTGT TTTGCCCATG 3070 hom 68 het 29 0 20 9 TTTACAAATTGT 0 1 284068 CASAVA_Build 7 144476680 4D AATCCATTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AAAC 5 4 284069 CASAVA_Build 7 144477002 1I TGTCTCAAAA -/G AAAAAAAAAA 2430 het 1373 hom 16 8 7 1 G 0 1 284070 CASAVA_Build 7 144479220 4D TTCTACAGCA TATT/---- TATTATGTTT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 TATT 2 1 284071 CASAVA_Build 7 144480053 1D ATTAGACAAC A/- AAGCATCCCT 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 A 3 2 284072 CASAVA_Build 7 144490666 1D ATGGGAGTTT C/- CCTGGACAAG 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 C 3 2 284073 CASAVA_Build 7 144514375 1D TTTCATGCTA C/- AATGGCATAG 3070 het 1216 hom 49 3 23 23 C 1 0 284074 CASAVA_Build 7 144514398 1I GAATAGTTGC -/A AAAAAAGAGA 3070 het 1244 hom 47 3 26 18 A 6 7 284075 CASAVA_Build 7 144517933 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 18 3 12 4 T 20 18 284076 CASAVA_Build 7 144518622 1I AAAAGCAGGC -/A AAGGATATGA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 2 3 284077 CASAVA_Build 7 144524701 1D AAATTGTCAA T/- TATTGGCATA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 2 1 284078 CASAVA_Build 7 144527206 5I CCCCTATCTG -----/TTTCA TTTCGAGTTT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 TTTCA 0 1 284079 CASAVA_Build 7 144531286 1I AGAGGACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 38 1 31 6 T 10 11 284080 CASAVA_Build 7 144531475 1D TTTATCGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 10 9 284081 CASAVA_Build 7 144533961 1D GAGTATAGGC T/- ACCTGGCTGT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 1 0 284082 CASAVA_Build 7 144550155 1I GACTGCTTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 7 8 284083 CASAVA_Build 7 144557337 2D GCAGAAAAAT AG/-- AGTTTGTTAG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 AG 2 1 284084 CASAVA_Build 7 144593292 3I TTTTTATCTT ---/CAC CATTTTTAAG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 CAC 0 1 284085 CASAVA_Build 7 144606636 1I AAATATTTTG -/C CCATTTTTGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 2 3 284086 CASAVA_Build 7 144607457 2I TATCTTTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 25 1 11 13 T 10 12 284087 CASAVA_Build 7 144615297 2I CATATATAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 450 hom 22 1 18 3 AT 7 8 284088 CASAVA_Build 7 144616581 1D CCAGCACTTT G/- GGAGGCAGAG 3070 het 61 hom 21 1 17 3 G 3 2 284089 CASAVA_Build 7 144618266 3D CGAGACTCAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 AAT 7 6 284090 CASAVA_Build 7 144618424 1I AAATGTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 14 15 284091 CASAVA_Build 7 144619313 2I CTATTAAGTT --/TA TATATATATA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 TA 5 6 284092 CASAVA_Build 7 144624349 1I ATCTATGTAT -/C TTTTGTGTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 0 1 284093 CASAVA_Build 7 144641541 1D TTTGCATAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 123 het 42 0 42 1 T 9 8 284094 CASAVA_Build 7 144642264 1D AGCTATGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 23 0 16 7 A 13 12 284095 CASAVA_Build 7 144643129 2I AATGTAAACA --/GT GTATGCATGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 GT 1 2 284096 CASAVA_Build 7 144645307 1D GTACTGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 844 hom 29 3 17 10 T 15 14 284097 CASAVA_Build 7 144653625 1I AGACATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 493 hom 39 2 33 4 T 11 12 284098 CASAVA_Build 7 144664206 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAACAA 1961 hom 18 het 8 0 7 1 A 8 7 284099 CASAVA_Build 7 144666043 1D ATCAGTTGCA T/- TAATTTCAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 T 2 1 284100 CASAVA_Build 7 144668328 1D CAGAAGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 279 hom 28 1 22 6 T 14 13 284101 CASAVA_Build 7 144679212 1I TCATAGCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 17 9 T 10 11 284102 CASAVA_Build 7 144681071 2I TTTATAACAC --/AT GTCATTAGCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 0 1 284103 CASAVA_Build 7 144684779 1I AAAGTATATT -/A AAAAAAAAAA 1762 hom 15 het 7 0 6 1 A 13 14 284104 CASAVA_Build 7 144686932 4I ACCCATAATC ----/CATT ATTATTCTTA 2880 het 2880 ref 18 10 6 2 CATT 0 1 284105 CASAVA_Build 7 144687057 4D ATCAATATAA TCTC/---- TCTCTCATAT 1452 het 1452 ref 18 7 6 6 TC 5 3 284106 CASAVA_Build 7 144691095 3I GGGGGAGGGG ---/GGA GGGATAGCAT 1815 het 1815 ref 25 15 7 3 GGA 0 1 284107 CASAVA_Build 7 144700715 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 12 13 284108 CASAVA_Build 7 144703902 4D CAAAACAAAG AAAA/---- AAACTTGGAA 3070 hom 138 het 52 0 47 6 A 7 3 284109 CASAVA_Build 7 144706869 1I AGTTTAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 26 0 23 3 T 11 12 284110 CASAVA_Build 7 144708689 1D GGGGTAATAA C/- CCCCCATGAT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 C 6 5 284111 CASAVA_Build 7 144717045 2D ATCCTGATTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 95 het 41 0 32 11 A 11 9 284112 CASAVA_Build 7 144725496 1I TCTCTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 1429 het 1429 ref 27 9 10 8 T 14 15 284113 CASAVA_Build 7 144732387 2I CAGATGAGAC --/TT TGGTCTTTTG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 1 3 284114 CASAVA_Build 7 144734162 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 36 0 24 12 T 12 11 284115 CASAVA_Build 7 144740664 5D TTCAATATTT ACTTC/----- ACTTGAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 ACTTC 1 0 284116 CASAVA_Build 7 144762034 1D CTCATGGCTT G/- GGGGGATCCT 3070 hom 132 het 52 0 43 11 G 6 5 284117 CASAVA_Build 7 144794877 3D TCTCCCCTTC CAA/--- TTTGGATGCC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 CAA 1 0 284118 CASAVA_Build 7 144805350 4I TAAGTGCCAT ----/GAAA GAAAGAAATA 3070 het 3070 hom 47 15 26 6 GAAA 2 3 284119 CASAVA_Build 7 144807719 2D CAATTTTTTC TT/-- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 10 8 284120 CASAVA_Build 7 144809625 5I ATTATGAGTG -----/ATTTT ATTTTATTTT 3036 het 3036 ref 29 16 7 6 ATTTT 2 3 284121 CASAVA_Build 7 144814931 1I AAAATTATTC -/T TTTTTTTTTC 1699 het 1699 ref 20 13 5 2 T 9 10 284122 CASAVA_Build 7 144819007 1I GAAGAAGTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 54 20 27 7 A 9 10 284123 CASAVA_Build 7 144820614 1D GAAACTTTAA T/- TTTTGTATAC 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 T 5 4 284124 CASAVA_Build 7 144842047 2D CCTTGCCTTG CT/-- CTGATCAGCA 3070 het 3070 ref 37 21 14 4 CT 2 1 284125 CASAVA_Build 7 144842481 1D AAAAGATGAT G/- TAGCCATGAG 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 G 1 0 284126 CASAVA_Build 7 144847955 2D ATACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 AC 6 5 284127 CASAVA_Build 7 144852965 1D ATTAACATCA G/- GGAACTTTAT 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 G 3 2 284128 CASAVA_Build 7 144853109 1I GAAAATCACA -/C CTCTATCTTA 3070 het 3070 ref 53 22 21 10 C 1 2 284129 CASAVA_Build 7 144860335 1I ATTATTTGGC -/T TTTTATTGCA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 T 4 5 284130 CASAVA_Build 7 144861435 3I ATAATTACTC ---/CTT CTCTAAATAG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 CTT 0 1 284131 CASAVA_Build 7 144866478 1D TACACCTTTT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 21 12 8 2 A 8 7 284132 CASAVA_Build 7 144868570 1I ATTTAAGCAA -/T TTTTCTACCG 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 4 5 284133 CASAVA_Build 7 144873180 1I GTGACTTCTT -/A AAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 6 7 284134 CASAVA_Build 7 144875700 1D ATGACTTGTG A/- AAAAAGTAAT 3070 het 3070 ref 27 13 13 3 A 6 5 284135 CASAVA_Build 7 144875851 3I ATAAAGACTA ---/CAC ATTGGGTACA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 CAC 0 1 284136 CASAVA_Build 7 144875942 5D AAAAAAAAAA AAAAC/----- CCCACTTAAA 3070 het 1561 hom 26 7 13 10 AAAAC 1 0 284137 CASAVA_Build 7 144877096 1I CTAGTTCCCA -/T TTTTATTTAT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 4 5 284138 CASAVA_Build 7 144877951 1D ATATTACACA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 T 7 6 284139 CASAVA_Build 7 144879210 1D TTTCACCTTA T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 7 6 284140 CASAVA_Build 7 144879343 1I ATTAAGAAAG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 A 6 7 284141 CASAVA_Build 7 144879773 1I GTTGTATTGC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 T 7 8 284142 CASAVA_Build 7 144884785 1I GAATTATATA -/T TTTTGTTTCT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 4 5 284143 CASAVA_Build 7 144900612 1D TTTCACTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 11 10 284144 CASAVA_Build 7 144901350 1D AACATATGAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 T 8 7 284145 CASAVA_Build 7 144901559 1I CAACAATATG -/T TTTGCTAATT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 3 4 284146 CASAVA_Build 7 144908047 2D AATTTTATTC AT/-- ATATATATAG 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 AT 5 4 284147 CASAVA_Build 7 144915189 4D GGAAGGAAGG AGAA/---- AGAAAGAAAG 2416 het 2416 ref 15 8 7 1 AGAA 3 2 284148 CASAVA_Build 7 144915590 1D TTGGTGGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 10 9 284149 CASAVA_Build 7 144917709 1I AAAATAAAAA -/G GTTTGGGTCA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 G 1 2 284150 CASAVA_Build 7 144927060 1D GCAGAGTATT G/- GATCTGATCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 2 1 284151 CASAVA_Build 7 144933431 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 2610 hom 18 6 12 1 A 1 0 284152 CASAVA_Build 7 144933520 1I TTTATGCTAA -/G GCCATTTCTT 3070 het 1698 hom 19 5 13 1 G 1 2 284153 CASAVA_Build 7 144940134 1D GGTCCTGGAC T/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 T 7 6 284154 CASAVA_Build 7 144959168 2D TCAGGACATA AG/-- AGAGACACAA 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 AG 3 2 284155 CASAVA_Build 7 144970637 1I GAAAATAGGT -/C CCCCCAAAAG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 C 5 6 284156 CASAVA_Build 7 144986074 1I TATTTAGAAA -/T TCTTTATCAA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 1 2 284157 CASAVA_Build 7 144996055 2I GTAGAGGTAA --/GG GCCTGATGCT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 G 1 3 284158 CASAVA_Build 7 145005935 1I TTGTCCTCAC -/T TGCTACACTC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 1 2 284159 CASAVA_Build 7 145016606 1D AGAGCCCTCT C/- CCCATGATCA 3070 het 3070 ref 32 14 13 7 C 4 3 284160 CASAVA_Build 7 145018395 1I AGGACTCATG -/A AGAGCTGAAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 1 2 284161 CASAVA_Build 7 145021055 1D AAACAATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 10 9 284162 CASAVA_Build 7 145029344 1I TATAATTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 10 11 284163 CASAVA_Build 7 145041128 2D GCCCAAGGCC CA/-- CACTGTAACC 3070 het 3070 ref 43 22 15 9 CA 2 1 284164 CASAVA_Build 7 145045173 1I AATGTTAGGG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 T 8 9 284165 CASAVA_Build 7 145081307 1I GTGCCTGTGG -/C TGTCGCGGTG 3070 hom 57 het 31 0 22 9 C 0 1 284166 CASAVA_Build 7 145097843 2D CATAATAGTC TG/-- TAATGATTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TG 1 0 284167 CASAVA_Build 7 145100095 1I GTGGCCTTCA -/G GCCTTCAGGC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 1 2 284168 CASAVA_Build 7 145109639 3I2M2I CTAGCATCAG ---CA--/TGTCATG TCATAACTAG 1305 het 1305 ref 46 39 3 4 N/A 0 0 284169 CASAVA_Build 7 145111832 2D GTGAATATTC CA/-- CAGTTTGCTC 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 CA 2 1 284170 CASAVA_Build 7 145233704 4D TAATACTCAC AGAT/---- AGGGAGTTAG 3070 hom 84 het 29 0 29 1 AGAT 1 0 284171 CASAVA_Build 7 145349425 1D ACTAGAATAA T/- TATTTGTGCA 2450 het 2450 ref 20 11 5 4 T 2 1 284172 CASAVA_Build 7 145350755 4I CTGCTTAAAG ----/CAGA CAGTCTTTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CAGA 0 1 284173 CASAVA_Build 7 145356684 3D ATTGTCACTC ATT/--- ATTGTTCGTT 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 ATT 2 1 284174 CASAVA_Build 7 145358593 30D TTTAATGCTT TGACAAAATTATAAATGTGCATTAATAAGA/------------------------------ TGACTAAAAG 3070 het 3070 ref 30 17 14 4 TGACAAAATTATAAATGTGCATTAATAAGA 1 0 284175 CASAVA_Build 7 145361022 1D AAAATCTGTC G/- GGCATGGTAG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 3 2 284176 CASAVA_Build 7 145361414 1I CAAATACGCA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 6 7 284177 CASAVA_Build 7 145364954 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAATAT 2649 het 2510 hom 19 8 7 4 A 7 8 284178 CASAVA_Build 7 145377632 4D TCATTTCATT TGCC/---- TGCTTTGGAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TGCC 1 0 284179 CASAVA_Build 7 145378036 1I TTCCCTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 31 0 21 10 A 10 11 284180 CASAVA_Build 7 145379693 4I GTTATGGGCA ----/TTTG TTTGTTGATG 3070 hom 108 het 40 0 34 6 TTTG 1 2 284181 CASAVA_Build 7 145383599 1D ATATTCCAGC T/- TTAGTTAATC 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 T 3 2 284182 CASAVA_Build 7 145386042 1D ATTCCTATTT A/- CCATTTTCGG 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 A 1 0 284183 CASAVA_Build 7 145388203 5I CATTCAGTGG -----/TTTAT TTTATTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TTTAT 1 2 284184 CASAVA_Build 7 145392919 8I TACTTAAAAT --------/CCACTGTA ACAGCCCTGA 3070 hom 111 het 38 0 37 2 CCACTGTA 0 1 284185 CASAVA_Build 7 145422026 2D TGTGTGTATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 21 20 12 TG 8 7 284186 CASAVA_Build 7 145424727 4D TGCATGCGTG CACA/---- CACACACACA 3070 het 108 hom 37 3 18 19 CA 9 7 284187 CASAVA_Build 7 145427995 1I CTAAGCCCAT -/G GCCTCCATGG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 G 1 2 284188 CASAVA_Build 7 145431969 1D TTTTTTTTTT G/- TAAATTGACA 3070 het 769 hom 32 6 21 5 G 1 0 284189 CASAVA_Build 7 145435818 2D ACACACAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 49 0 40 10 AC 16 15 284190 CASAVA_Build 7 145441303 1D AAGATATTGG A/- AAAAAAGAGC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 7 6 284191 CASAVA_Build 7 145447112 1D AGAAAAGTAT G/- ATAGTTATAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 1 0 284192 CASAVA_Build 7 145456902 1I GGTATTACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 9 10 284193 CASAVA_Build 7 145464708 1I GTAGGTGGGG -/C CCCCTAAGAA 3070 hom 90 het 33 0 27 6 C 4 5 284194 CASAVA_Build 7 145484638 1I CTTTACAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 9 10 284195 CASAVA_Build 7 145492291 1I AACACACACT -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 A 6 7 284196 CASAVA_Build 7 145492825 2D TCCGTTTCTC TA/-- TGTTTCATAA 3070 het 3070 ref 67 34 32 1 TA 1 0 284197 CASAVA_Build 7 145497702 2I TGTGATATGA --/TT TTTTTTTTTT 2933 het 2933 ref 37 22 11 4 T 11 13 284198 CASAVA_Build 7 145498537 1D ATATCACTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 11 9 9 T 10 9 284199 CASAVA_Build 7 145507422 1D TGATATCAAA G/- AAATATAACC 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 G 1 0 284200 CASAVA_Build 7 145508427 6D TTTAAAGTTG TTAAAC/------ TTTAAGATAA 3070 het 3070 ref 20 10 9 4 TTAAAC 1 0 284201 CASAVA_Build 7 145518092 2D CTGACTTATA AT/-- ATGTCAGGTA 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 AT 2 1 284202 CASAVA_Build 7 145519141 1D TTCAGATATC G/- GGGGAACCAC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 G 5 4 284203 CASAVA_Build 7 145529379 1I GACAAAATAT -/C TTAAAATACT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 C 0 1 284204 CASAVA_Build 7 145529994 2I TCAAATCGAC --/AA AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 48 15 25 8 A 6 8 284205 CASAVA_Build 7 145531041 1I TCTGCAAAAG -/T TTTTTTGTTC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 6 7 284206 CASAVA_Build 7 145538863 1I GACTACTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 13 14 284207 CASAVA_Build 7 145548314 1D AATGCATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 A 11 10 284208 CASAVA_Build 7 145557748 1D AAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 T 10 9 284209 CASAVA_Build 7 145561201 1I AAAAAAAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 9 10 284210 CASAVA_Build 7 145563218 1I TGTAAAAATT -/C AGATAGTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 C 0 1 284211 CASAVA_Build 7 145564408 4D ACTTTAGAAG TAAA/---- TAAATAATTA 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 TAAA 2 1 284212 CASAVA_Build 7 145565844 1I GAAGTAACCC -/A TTGTTACTAG 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 0 1 284213 CASAVA_Build 7 145593483 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1560 het 1560 ref 45 24 5 16 T 14 13 284214 CASAVA_Build 7 145631418 1I AAAACAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 10 11 284215 CASAVA_Build 7 145654318 2I TTATATACAC --/AT GATTCAGAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AT 0 1 284216 CASAVA_Build 7 145662614 1D ATGCATGCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 50 19 24 8 T 10 9 284217 CASAVA_Build 7 145672496 1I TTGAACTAGC -/T TTTTTTTTTT 1092 het 1092 ref 38 24 3 11 T 13 14 284218 CASAVA_Build 7 145672594 1I AACCTCTGCC -/T CCCAAGTTCA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 0 1 284219 CASAVA_Build 7 145689820 1D TGTCGGTTAT G/- GAAGCTCAAA 3070 hom 86 het 36 0 29 9 G 2 1 284220 CASAVA_Build 7 145694284 1D CTTAAAATAA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 8 7 284221 CASAVA_Build 7 145700505 2D CTATATTACC AT/-- TCCTCCATTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AT 1 0 284222 CASAVA_Build 7 145720850 2D CATATAAAGA CT/-- CTTAGAAAAT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 CT 2 1 284223 CASAVA_Build 7 145722524 1D GGATAGAATG T/- TTTATTTCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 3 284224 CASAVA_Build 7 145723479 1I TGCTAAATAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 8 9 284225 CASAVA_Build 7 145723995 3I TAAATTGGAG ---/AAT ATTATCACTT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 AAT 0 1 284226 CASAVA_Build 7 145725908 2D TTTATTTATT TA/-- TTTATTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TA 1 0 284227 CASAVA_Build 7 145727107 2I ACAAATAAAC --/TT ATATATATTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 0 2 284228 CASAVA_Build 7 145728292 2D CTATTCTAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 26 10 A 12 10 284229 CASAVA_Build 7 145736654 1D GTCATGGGGT G/- GGGGGAGGGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 6 5 284230 CASAVA_Build 7 145743056 1D TGGCAGCGAA G/- GGCAGAATGC 3070 hom 99 het 38 0 33 6 G 3 2 284231 CASAVA_Build 7 145743667 2I ATTAAGACAC --/TT TCCACTTTTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 1 3 284232 CASAVA_Build 7 145744191 2I AAAATGAAAA --/AT AAGATGAGTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AT 0 1 284233 CASAVA_Build 7 145745975 7I TTTACCAGAT -------/GCACAAG ACACTGTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 GCACAAG 0 1 284234 CASAVA_Build 7 145749921 1I TATAGACAGA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 8 9 284235 CASAVA_Build 7 145754649 1I TAACACCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1512 hom 36 8 19 9 A 15 16 284236 CASAVA_Build 7 145754903 3D CAAAACAAAC AAT/--- AATAAGTATG 3070 hom 126 het 45 0 42 3 AAT 2 1 284237 CASAVA_Build 7 145758201 1D TTGCCTGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 29 2 20 7 T 13 12 284238 CASAVA_Build 7 145765907 1D CCCAATCTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 40 1 28 11 T 11 10 284239 CASAVA_Build 7 145766310 2D CCATAGAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 13 11 284240 CASAVA_Build 7 145767373 3I ACATGAAAAC ---/AAT ATTTCTTATT 3070 hom 150 het 59 0 50 9 AAT 0 1 284241 CASAVA_Build 7 145773146 1I GTCACCAAAA -/C TTTTTATCCA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 C 0 1 284242 CASAVA_Build 7 145776418 1I GAATATAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 10 11 284243 CASAVA_Build 7 145788410 1I ACAAAAAATT -/A AAAAATAGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 5 6 284244 CASAVA_Build 7 145789430 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 8 1 7 0 A 12 11 284245 CASAVA_Build 7 145792211 1I CCTTTGAAAC -/T TGTTTTTTTT 1462 het 202 hom 34 3 13 18 T 1 2 284246 CASAVA_Build 7 145808327 1D GAAGAAAGGC A/- ATGAGAATAA 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 A 2 1 284247 CASAVA_Build 7 145809031 1I TTAATGAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 10 11 284248 CASAVA_Build 7 145810425 4D GTGTGTGTAT TATA/---- TATATATATA 1712 het 1712 ref 19 9 5 6 TA 10 8 284249 CASAVA_Build 7 145813189 1D CTAATTGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 10 9 284250 CASAVA_Build 7 145817863 4D TCAGTGTGGC TGAG/---- TTCAGGACTT 3070 het 3070 ref 49 30 14 7 TGAG 1 0 284251 CASAVA_Build 7 145819401 1I TCTTTTTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 10 11 284252 CASAVA_Build 7 145841565 5D CTTTGATAAC AAAGA/----- AAAGATACAG 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 AAAGA 2 1 284253 CASAVA_Build 7 145863556 4I ATTTGTTTAT ----/TTAG TTAAACTTTA 3070 het 2923 hom 19 9 9 1 TTAG 0 1 284254 CASAVA_Build 7 145867563 1D TAGAAACATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 15 11 A 10 9 284255 CASAVA_Build 7 145872776 3I TTCTTTTGCC ---/AAG TGCTGAGCCG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAG 0 1 284256 CASAVA_Build 7 145875871 2I TTTATCATGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 22 9 T 12 14 284257 CASAVA_Build 7 145887877 1D AATTACATAC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 7 284258 CASAVA_Build 7 145898239 1D ACACAGCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 14 9 T 11 10 284259 CASAVA_Build 7 145909685 1D CATTTTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 26 0 17 9 A 11 10 284260 CASAVA_Build 7 145916544 2D ATTATATGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 35 0 24 12 T 13 11 284261 CASAVA_Build 7 145916986 1D TTTCAGTTAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 9 8 284262 CASAVA_Build 7 145917770 1I TGTAGAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 10 11 284263 CASAVA_Build 7 145919433 5I4M1I3M8I6M1I GGTAAATGTG -----GAAT-AAT--------AATTGA-/GAGCTGAATCAATGCAGTGGGATTTGAC GAAATGTAAA 3070 hom 96 het 30 0 32 3 N/A 0 0 284264 CASAVA_Build 7 145940265 3I ATATTAGTAA ---/TGT TGTAAAATAG 3070 hom 90 het 38 0 31 8 TGT 1 2 284265 CASAVA_Build 7 145940957 2D AACATCTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 31 1 19 11 T 16 14 284266 CASAVA_Build 7 145941850 12D TCTTTAAGTG TTCTTTCAGCTT/------------ TTCTTTCACA 3070 hom 96 het 35 0 33 5 TTCTTTCAGCTT 1 0 284267 CASAVA_Build 7 145952498 1I GCATTATTAC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 7 8 284268 CASAVA_Build 7 145958467 2D TGTGATAAAC AT/-- GTGTGTGCAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 AT 1 0 284269 CASAVA_Build 7 145959984 1I CTTTTTAAGA -/T TAAAAATTGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 1 2 284270 CASAVA_Build 7 145960968 1I ATTGGTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1256 hom 41 3 30 8 A 11 12 284271 CASAVA_Build 7 145963832 1I ACTCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1038 hom 31 3 20 8 A 11 12 284272 CASAVA_Build 7 145975400 4D GATGTACACT GAAA/---- GAAAGAAAAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 GAAA 3 2 284273 CASAVA_Build 7 145980257 1D GGCAAACTGG T/- AATGCCTTCC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 T 1 0 284274 CASAVA_Build 7 145989605 1I GCTCTTGAGA -/T CTGTAAGTTG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 0 1 284275 CASAVA_Build 7 145990385 1I CTGGCCTCCA -/T CTCCGGACCT 3070 hom 45 het 19 0 14 5 T 0 1 284276 CASAVA_Build 7 145990709 1I TTGTGTAAAA -/C GATGTCACAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 0 1 284277 CASAVA_Build 7 145991320 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAGAAAGA 3070 het 347 hom 25 1 20 4 G 0 1 284278 CASAVA_Build 7 145993484 4D AATTTTTTGT TTTG/---- TTTGTTTTTC 524 het 100 hom 27 1 5 21 TTTG 2 1 284279 CASAVA_Build 7 145995744 2D AGGTTTCCTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 32 0 23 9 T 11 9 284280 CASAVA_Build 7 145995815 3I TTGCTTGTGT ---/ACA ATAGAAATGC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 ACA 0 1 284281 CASAVA_Build 7 145997875 5I CAAATTTGGA -----/GTTCT GTTCTAATTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 GTTCT 1 2 284282 CASAVA_Build 7 145998497 1D GAACTCTAGC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 104 het 40 0 35 5 A 9 8 284283 CASAVA_Build 7 146002526 1D CTGGTGGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 487 hom 27 2 22 3 A 10 9 284284 CASAVA_Build 7 146003196 1D GATGTTTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 9 284285 CASAVA_Build 7 146004474 4I GTTTGTGTTC ----/TTTT TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 8 12 284286 CASAVA_Build 7 146009685 5D TGGGAAAAAT AACTA/----- AAAGTAATTG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 AACTA 1 0 284287 CASAVA_Build 7 146010035 2D ACGCACAGAA AC/-- ACATGTATAA 3070 hom 126 het 50 0 42 11 AC 2 1 284288 CASAVA_Build 7 146015620 1D ATTTGTGATA T/- TTTTAGGCTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 5 4 284289 CASAVA_Build 7 146029078 3I TCTGAAAAAA ---/AGG AAAAGTAGAT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 AGG 0 1 284290 CASAVA_Build 7 146070093 1I AGACTGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 34 3 22 9 A 13 14 284291 CASAVA_Build 7 146096439 1I ATGTTGTGTG -/C CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 C 7 8 284292 CASAVA_Build 7 146112999 1D ATCCCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 221 hom 39 2 23 14 T 15 14 284293 CASAVA_Build 7 146134520 1D AAATTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 21 0 15 6 A 12 11 284294 CASAVA_Build 7 146164273 1I TAAATTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 9 10 284295 CASAVA_Build 7 146166642 4I TGAGCCCAGT ----/CAAA CAGTTATTTT 3070 het 2623 hom 26 7 14 5 CAAA 0 1 284296 CASAVA_Build 7 146169913 1I TCTTGGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1284 hom 30 5 17 8 T 12 13 284297 CASAVA_Build 7 146170075 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 8 284298 CASAVA_Build 7 146174365 4D TAATCTGCAT CAAA/---- CAAACACTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CAAA 2 1 284299 CASAVA_Build 7 146182596 1D GCAAAGGGTC T/- TTAAGAGCCT 3070 hom 135 het 49 0 46 4 T 3 2 284300 CASAVA_Build 7 146184110 1I GATGGTTAAT -/A ACAAAATTAC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 1 2 284301 CASAVA_Build 7 146192860 5D AACAAAACAA AACAG/----- AACCTGCAGG 3070 hom 76 het 31 0 24 10 AACAG 1 0 284302 CASAVA_Build 7 146195807 2I TGATAGTGAC --/GT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 GT 0 1 284303 CASAVA_Build 7 146198239 1I GGTCCTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 29 0 19 10 T 11 12 284304 CASAVA_Build 7 146201299 2I TTTATGCAAG --/AC ACAGATTTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AC 1 2 284305 CASAVA_Build 7 146205352 1D CATAGTGAGA C/- CCCCCCATCT 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 C 7 6 284306 CASAVA_Build 7 146206358 1D ATGTATTATC T/- TTTTTTTTTT 2070 het 2070 ref 47 33 5 10 T 12 11 284307 CASAVA_Build 7 146250288 1D TTAATAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 38 2 27 9 A 12 11 284308 CASAVA_Build 7 146293435 1I GAACTCACAT -/A TGGGTTTTTC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 0 1 284309 CASAVA_Build 7 146317945 1D GTGCCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 9 T 12 11 284310 CASAVA_Build 7 146336988 1I GGTGTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 1015 het 1015 ref 36 20 3 13 T 13 14 284311 CASAVA_Build 7 146352351 1D TGTTTATAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 A 9 8 284312 CASAVA_Build 7 146363011 1I8M1I CAGGGTGGAG -CCCCACCA-/CCCCCACCAG GGACCCTGCC 3070 hom 73 het 28 0 21 7 N/A 0 0 284313 CASAVA_Build 7 146400874 6D TCCTTTATTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1867 het 364 hom 15 2 5 8 T 22 16 284314 CASAVA_Build 7 146456084 7D GTCTTATTTC TTAAGAT/------- TTAAAAGACC 3070 het 3070 ref 40 22 18 1 TTAAGAT 1 0 284315 CASAVA_Build 7 146481119 1D CTCCTCTGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 10 9 284316 CASAVA_Build 7 146482854 4I TTTCTCTGAT ----/ATAG ATAGTTTCTG 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 ATAG 1 2 284317 CASAVA_Build 7 146491670 4I AATTTAACTT ----/TCTC TAAGTCAGGC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TC 0 2 284318 CASAVA_Build 7 146493376 1D GGATTGTTGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 11 22 9 T 9 8 284319 CASAVA_Build 7 146498600 9I CATCTCACCC ---------/TTCTGAGTT TTCTGAGTGT 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 TTCTGAGTT 0 1 284320 CASAVA_Build 7 146499848 1I GAGTCAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 T 10 11 284321 CASAVA_Build 7 146501310 1I CAAGTCCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 11 14 10 T 11 12 284322 CASAVA_Build 7 146503288 2I CCTTCTGCTC --/TT TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 T 7 9 284323 CASAVA_Build 7 146511178 1I CAATGGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 11 12 284324 CASAVA_Build 7 146520361 3D ACCACTTCTT CTC/--- CTCTTTATGT 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 CTC 2 1 284325 CASAVA_Build 7 146530267 1I AGCCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 23 1 17 5 A 12 13 284326 CASAVA_Build 7 146533614 1D CAAAGTGGAT G/- GGAAGTGGTG 2392 het 2392 ref 25 16 5 4 G 3 2 284327 CASAVA_Build 7 146538499 3D CTTATTTAAA TCT/--- TCTCTCAGAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 3 TCT 2 1 284328 CASAVA_Build 7 146541597 1D CCCTCATCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 15 10 A 11 10 284329 CASAVA_Build 7 146544156 1I CCAGTCTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 11 284330 CASAVA_Build 7 146544574 15D CCAACACTAA ACACTAAACTTATTT/--------------- ACAGTCTTAT 3070 het 3070 ref 37 28 12 5 ACACTAAACTTATTT 1 0 284331 CASAVA_Build 7 146546594 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 33 het 24 0 12 12 T 10 9 284332 CASAVA_Build 7 146552075 3I GAGAACTGTC ---/CCA AGCCAGCGCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CCA 0 1 284333 CASAVA_Build 7 146554561 1I AAAAGAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 A 11 12 284334 CASAVA_Build 7 146560821 3I AAAGCGTTTA ---/TCT TCTTTTCTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TCT 1 2 284335 CASAVA_Build 7 146561609 1D CCAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 36 1 16 19 A 13 12 284336 CASAVA_Build 7 146561808 2D TTAATGAAAA TG/-- TATATGTCTA 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 TG 1 0 284337 CASAVA_Build 7 146568687 2D CTGCAGGAGA CT/-- CTGCAGTTAC 3070 het 3070 ref 37 19 15 4 CT 2 1 284338 CASAVA_Build 7 146586224 1I AGTGAATTTG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 7 8 284339 CASAVA_Build 7 146591403 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2235 het 2235 ref 23 12 6 5 A 11 12 284340 CASAVA_Build 7 146592563 1I TGGTCCCTGC -/G GGGCCTGTGC 3070 hom 68 het 26 0 21 5 G 3 4 284341 CASAVA_Build 7 146595584 1D GGTTAACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 55 1 42 12 T 11 10 284342 CASAVA_Build 7 146595696 8D ACTGTTAGCA TAGAATTG/-------- GGATTCACTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 TAGAATTG 1 0 284343 CASAVA_Build 7 146600384 1I TTTGCATGTA -/T TACGTATTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 1 2 284344 CASAVA_Build 7 146602540 1D TAATTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 G 1 0 284345 CASAVA_Build 7 146604250 1D TCCTCCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 16 23 11 T 12 11 284346 CASAVA_Build 7 146604856 1D TTCAATTGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 A 10 9 284347 CASAVA_Build 7 146606153 5D GAAACCATGC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2838 het 989 hom 27 10 8 10 A 17 12 284348 CASAVA_Build 7 146612264 1I TATTCTAGTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 54 31 20 3 T 8 9 284349 CASAVA_Build 7 146613290 2D TTCTGAGCCC CT/-- GAGTGACTGG 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 CT 1 0 284350 CASAVA_Build 7 146615631 1I ATCTTGCCCC -/G GTGACTTACA 3070 het 3070 ref 39 18 11 10 G 1 2 284351 CASAVA_Build 7 146620795 4D TGGTCATTTC TGTT/---- TGTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 TGTT 3 2 284352 CASAVA_Build 7 146625350 1I AACTTTAGGG -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 T 7 8 284353 CASAVA_Build 7 146628432 4I TCTCATGACA ----/AAAC AAACAAACTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AAAC 2 3 284354 CASAVA_Build 7 146635441 1I TATCTCTACT -/A AAAAAAAACC 1225 het 1225 ref 24 14 4 6 A 8 9 284355 CASAVA_Build 7 146639732 1D GAAGTTTGTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 9 8 284356 CASAVA_Build 7 146642657 3D TACATGCTTC AAA/--- AAGTCAGCAA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 A 5 2 284357 CASAVA_Build 7 146643308 2D GAATAACTTG GT/-- GTGATACTCC 3070 hom 30 het 11 0 10 2 GT 2 1 284358 CASAVA_Build 7 146651560 1I TGTGGTGCTG -/A AAAAAAAATG 1884 het 917 hom 6 2 4 0 A 8 9 284359 CASAVA_Build 7 146651918 5D ATTTCTTGCC TTTAA/----- TTTGAGAGAA 3070 het 3070 hom 27 8 14 8 TTTAA 1 0 284360 CASAVA_Build 7 146652065 1I AACTATTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 A 10 11 284361 CASAVA_Build 7 146652797 1D ACAATGAGCT G/- GGGGGGCATT 2849 het 2849 ref 20 9 9 4 G 7 6 284362 CASAVA_Build 7 146655157 1I GCTTGTTAGG -/T TTTTTCTACT 3070 het 3070 hom 47 15 26 6 T 5 6 284363 CASAVA_Build 7 146656859 1D AGCAGTGGTT G/- GGAACTGGAG 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 G 3 2 284364 CASAVA_Build 7 146657754 1I TATATCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 10 11 284365 CASAVA_Build 7 146657796 3D CCATTTATAG TTC/--- TTAATTTATG 3070 het 3070 hom 38 18 16 5 TTC 1 0 284366 CASAVA_Build 7 146663902 5D GATGTGAAAA AAAAT/----- AAAATTTAGC 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 AAAAT 2 1 284367 CASAVA_Build 7 146664275 3D AGAGGTTTGC TGT/--- TGTTGTTGCC 3070 het 3070 hom 46 15 28 7 TGT 3 2 284368 CASAVA_Build 7 146666337 1I43M1D TTGAAATTTT -AAAAACTTGAAATTTTTAGCCTAAGTATTTCTTTTCCTCATGTA/AAAAAACTTGAAATTTTTAGCCTAAGTATTTCTTTTCCTCATGT- AAAAATTCAC 3070 het 1550 hom 24 4 11 19 N/A 0 0 284369 CASAVA_Build 7 146667230 1D CCAAAAAAAA T/- GATATTAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 T 1 0 284370 CASAVA_Build 7 146667720 1I AAAGCAAGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 8 9 284371 CASAVA_Build 7 146669096 4D ATTGTGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 2071 het 301 hom 14 2 5 7 TG 10 8 284372 CASAVA_Build 7 146669462 1I TAAAGTATAA -/T AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 0 1 284373 CASAVA_Build 7 146669718 1D CATCTGATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 10 9 284374 CASAVA_Build 7 146670374 2I AGAAAAAATA --/TC TGTCTATAAA 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 TC 0 1 284375 CASAVA_Build 7 146673708 1D TCAGTGATAG T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 47 20 23 5 T 7 6 284376 CASAVA_Build 7 146676401 1D TACAAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 7 A 11 10 284377 CASAVA_Build 7 146682008 1D CTTTTTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 19 0 17 2 T 11 10 284378 CASAVA_Build 7 146703308 4D TTATTTTCTC TATT/---- TAAGAGATGA 3070 het 3070 hom 33 15 17 2 TATT 1 0 284379 CASAVA_Build 7 146705162 1I TCCTTCTTCT -/C CCCCCCCCTT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 C 8 9 284380 CASAVA_Build 7 146716603 1I TCATTCTGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 9 10 284381 CASAVA_Build 7 146720339 2I TATCAAATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 T 11 13 284382 CASAVA_Build 7 146726431 1I TGAGAGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 A 10 11 284383 CASAVA_Build 7 146735691 1I TGATGTAGCC -/A TAGAGACAGT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 0 1 284384 CASAVA_Build 7 146738763 4D GTGAATACTT CATA/---- CACACACAGG 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 CATA 1 0 284385 CASAVA_Build 7 146751307 4D TAGGTGTCTC TTAA/---- TTAAGTTAGG 3070 het 3070 hom 50 23 24 5 TTAA 2 1 284386 CASAVA_Build 7 146753240 1D TCTAAACGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 12 11 284387 CASAVA_Build 7 146753294 1D CATTGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 32 0 21 11 A 13 12 284388 CASAVA_Build 7 146782037 5D AACTGGGGCA AAAAT/----- AAAATAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 AAAAT 2 1 284389 CASAVA_Build 7 146783724 6D CAAAAGAAAG CAAAAA/------ CAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 5 CAAAAA 2 1 284390 CASAVA_Build 7 146785868 1D ATGAATCAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 9 284391 CASAVA_Build 7 146786167 3D AAAAACAAAC ATA/--- AGCATTTCAG 3070 hom 93 het 36 0 32 6 ATA 1 0 284392 CASAVA_Build 7 146793960 2D TTGTATCTAA TG/-- TGTGTGTAGC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TG 4 3 284393 CASAVA_Build 7 146795890 1I ATGTGTCTCT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 8 9 284394 CASAVA_Build 7 146802257 1D AAGGATATGA T/- GGGGTTGCAG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 1 0 284395 CASAVA_Build 7 146807759 1I ATATGCTTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 9 10 284396 CASAVA_Build 7 146812046 1I CTTTATGAAG -/C CCTTTGTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 2 3 284397 CASAVA_Build 7 146812435 1D TGAAATCCCG T/- AGTACTTTAT 3070 het 3070 ref 52 25 24 4 T 1 0 284398 CASAVA_Build 7 146814212 2D TCATTTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 222 hom 39 5 17 18 A 13 11 284399 CASAVA_Build 7 146815729 1D GCAAAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 9 A 11 10 284400 CASAVA_Build 7 146816078 1I TGGCTGGTGA -/C CTTTTTCTTT 3070 het 157 hom 38 1 35 2 C 1 2 284401 CASAVA_Build 7 146816581 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAAGCAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 6 284402 CASAVA_Build 7 146821006 1I TTTTAATGTA -/C CCCCAGAACT 2818 het 2818 ref 18 8 8 2 C 4 5 284403 CASAVA_Build 7 146822122 2I TTCCTGAAAT --/CA CACTTTTTGC 3070 het 3070 ref 58 27 26 5 CA 1 2 284404 CASAVA_Build 7 146824220 2I AAAATAAATG --/TA TATGTACTTG 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 TA 1 2 284405 CASAVA_Build 7 146824824 1D72M1D TTATTTTTTA TTTTTTTTTATAAAATCATGATAAACAGAACTCTTACTTCATCCATTTTGTTGTTGCTGTTGCCGCATTTTGCT/-TTTTTTTTATAAAATCATGATAAACAGAACTCTTACTTCATCCATTTTGTTGTTGCTGTTGCCGCATTTTGC- TTTTCTTCCT 3070 het 3070 ref 29 27 14 17 N/A 0 0 284406 CASAVA_Build 7 146826197 8D AAGCTATGAT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 19 13 7 A 20 12 284407 CASAVA_Build 7 146828179 10D ACAGTTTATG GATAAAATTA/---------- GCAATATGAT 2544 het 2544 ref 23 18 7 1 GATAAAATTA 1 0 284408 CASAVA_Build 7 146830455 1D TAGGGAACCT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 9 8 284409 CASAVA_Build 7 146830761 8D TGTGTGTGTG TGTGTGTA/-------- TATATATATA 3070 het 3070 ref 35 17 15 6 TGTGTGTA 1 0 284410 CASAVA_Build 7 146830824 4D TATATACAAT TTTA/---- TTTGTCATGT 3070 het 3070 ref 31 15 10 8 TTTA 1 0 284411 CASAVA_Build 7 146845846 3D ACAGTTTTTT AGC/--- CAGTCATTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 2 AGC 1 0 284412 CASAVA_Build 7 146865317 5I TTATTTTGAT -----/TACTC TATTAAGCAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TACTC 0 1 284413 CASAVA_Build 7 146865601 3D AAAGAACCTT AAA/--- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 30 10 16 5 A 11 8 284414 CASAVA_Build 7 146884289 3D ATAAAAGTTA TTC/--- TTTAAATAGA 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TTC 1 0 284415 CASAVA_Build 7 146886723 28D CGTTCGTTCT TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC/---------------------------- TTCCTTCCTT 3070 hom 66 het 29 0 23 13 TTCC 11 4 284416 CASAVA_Build 7 146887891 2D TGCCGATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2697 het 11 hom 23 1 8 15 A 16 14 284417 CASAVA_Build 7 146892297 1I CAGTTTAATT -/A TTTTTTTCTA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 0 1 284418 CASAVA_Build 7 146892867 1I GCAAGTAGAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 8 9 284419 CASAVA_Build 7 146893825 1D ACTTTTGACC T/- AATTAAATGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 1 0 284420 CASAVA_Build 7 146900221 4I CTCATTCCAG ----/AGAC AGCTTCTGCC 3070 hom 96 het 37 0 31 6 AGAC 0 1 284421 CASAVA_Build 7 146900611 1D TGCTCAAAAT C/- CGAGAAAGAC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 C 2 1 284422 CASAVA_Build 7 146902662 1I CGTTTTAAAA -/T TTCTTTCCTG 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 2 3 284423 CASAVA_Build 7 146904136 1I TATTTGAAAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 7 8 284424 CASAVA_Build 7 146908591 2I CTTGTATTGC --/TG TGTCTATTTC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 TG 1 2 284425 CASAVA_Build 7 146910224 9D AACTGGTTTA CACTGGCAC/--------- TTGTAGATTG 3070 het 3070 ref 46 28 16 5 CACTGGCAC 1 0 284426 CASAVA_Build 7 146913655 1D TTTTGAGGCC A/- AAAATATAAA 3070 het 1788 hom 29 5 22 3 A 5 4 284427 CASAVA_Build 7 146913801 2D TGTATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2476 hom 36 11 21 5 TG 7 6 284428 CASAVA_Build 7 146916200 4D28M5D TATGTAAAAG AGAAAGAGAGATGGACATACAGAGAGAGAGAAAAAAC/----AGAGAGATGGACATACAGAGAGAGAGAA----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 37 30 17 2 N/A 0 0 284429 CASAVA_Build 7 146930385 1D CTTCAGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1986 hom 31 9 18 4 T 16 15 284430 CASAVA_Build 7 146930517 1D ATCCTACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1097 hom 19 5 9 5 T 12 11 284431 CASAVA_Build 7 146933115 3I GCAAAGTAGC ---/AGA AGATTTAATC 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 AGA 1 2 284432 CASAVA_Build 7 146934112 8I GTTCGTACAG --------/TACATCCC TACATCCCTA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 TACATCCC 1 2 284433 CASAVA_Build 7 146934949 9D GATAAGCCTC ACAGAGAAT/--------- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 47 19 24 6 ACAGAGAAT 1 0 284434 CASAVA_Build 7 146935295 2I GTCAAGAAAC --/AG GGGACAGAAG 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 AG 0 1 284435 CASAVA_Build 7 146936236 1D TTCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 8 A 13 12 284436 CASAVA_Build 7 146936420 1I TTTCTAAGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2781 hom 26 7 15 4 T 8 9 284437 CASAVA_Build 7 146939123 1D TTAGGAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 T 10 9 284438 CASAVA_Build 7 146942804 11I TCTTTTACTC -----------/CTGATTTATTT TTTTACACAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 CTGATTTATTT 0 1 284439 CASAVA_Build 7 146943472 1D AAAAACTGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 9 8 284440 CASAVA_Build 7 146991213 1I TCGTAGGGAC -/G GGGTTTCACC 3070 hom 38 het 15 0 13 2 G 3 4 284441 CASAVA_Build 7 147005096 1D GTTTCATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 43 2 35 6 T 13 12 284442 CASAVA_Build 7 147033199 1D ATCTTTCTAC T/- TTTTTTTGAC 3070 hom 93 het 32 0 32 2 T 8 7 284443 CASAVA_Build 7 147042467 4D TGTGTGTTTG TTTT/---- TGTTTCAGTT 3070 hom 88 het 43 0 38 7 T 5 1 284444 CASAVA_Build 7 147056199 2D ACACACACAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TG 12 11 284445 CASAVA_Build 7 147057588 1I GCTTTGAGGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 417 hom 36 1 29 6 A 8 9 284446 CASAVA_Build 7 147063009 1I GATTCATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 602 hom 14 2 12 0 T 11 12 284447 CASAVA_Build 7 147065573 4D TCCAAGCTGT CAGA/---- CAGGGACATT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 CAGA 1 0 284448 CASAVA_Build 7 147068289 1I GCAGCAAGCA -/T TTTAAATTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 4 284449 CASAVA_Build 7 147071723 1I TTTTTGTGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 36 hom 41 1 35 5 T 9 10 284450 CASAVA_Build 7 147079422 3I GAATTTAGTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 31 0 19 12 A 13 16 284451 CASAVA_Build 7 147080354 1I CCCTGAACCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 9 284452 CASAVA_Build 7 147151746 2D GCAAGGGCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2953 hom 34 10 17 7 A 14 12 284453 CASAVA_Build 7 147152758 1D ACCAGCTTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 9 8 284454 CASAVA_Build 7 147160870 1I TAATATAGAT -/C CATTATATTT 3070 het 477 hom 8 1 7 0 C 1 2 284455 CASAVA_Build 7 147176740 1D AGTTAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 12 5 A 12 11 284456 CASAVA_Build 7 147187569 1D AACCAGAGAG T/- TAACATATTT 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 T 2 1 284457 CASAVA_Build 7 147189408 1I CTCATAACAC -/A AAAGGACAGA 3070 het 3070 hom 59 29 28 2 A 3 4 284458 CASAVA_Build 7 147190425 3D TAAATTTCCT ATA/--- ACATGCATCT 3070 het 3070 ref 49 26 19 5 ATA 1 0 284459 CASAVA_Build 7 147190650 2I GAGACCACTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 AT 5 6 284460 CASAVA_Build 7 147206431 8I TTGCTAATTA --------/CTTATGTT CTTATGTTGT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 CTTATGTT 1 2 284461 CASAVA_Build 7 147223215 1I GCCAGGCTGA -/T TTTTGAACCC 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 T 4 5 284462 CASAVA_Build 7 147224927 1D AGTTAGTTCC G/- CCTACACCCA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 G 1 0 284463 CASAVA_Build 7 147226994 1I TGCAAAATGT -/C CTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 C 1 2 284464 CASAVA_Build 7 147230428 1D AAGCTTTTTT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 A 8 7 284465 CASAVA_Build 7 147237937 1D TTAGTCAGCA G/- TTCCCACCTC 3070 het 3070 ref 39 17 19 4 G 1 0 284466 CASAVA_Build 7 147243305 1D CGCCGTGAAA C/- TGAGAATATT 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 C 1 0 284467 CASAVA_Build 7 147244617 1D TTTTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 11 9 A 17 16 284468 CASAVA_Build 7 147264050 1D AAAGCTCAAC T/- TAAAAGTGTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 2 1 284469 CASAVA_Build 7 147264326 1D ATTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 12 14 T 13 12 284470 CASAVA_Build 7 147267354 1D TCATGTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2938 hom 23 10 9 4 T 11 10 284471 CASAVA_Build 7 147276542 1D CCATTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 2808 het 2808 ref 17 8 8 1 A 11 10 284472 CASAVA_Build 7 147281439 1I34M1D CTAAGAAATA -CGATTCTCATTCCATACCTAGATGATGGGTTGATA/TCGATTCTCATTCCATACCTAGGTGATGGGTTGAT- AGGTGCAGCA 3070 hom 180 het 56 0 60 4 N/A 0 0 284473 CASAVA_Build 7 147286224 1I TAGAAGTTAA -/T TTCTTTGCCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 2 3 284474 CASAVA_Build 7 147288854 2I TCTCCCTCCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 65 het 26 0 18 8 TC 5 6 284475 CASAVA_Build 7 147290077 4D TTATTCAGTT ATAA/---- ATAAACTAAA 3070 hom 100 het 36 0 34 3 ATAA 2 1 284476 CASAVA_Build 7 147291077 2I CTTATAATAC --/AG AGTTATTATT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 AG 1 2 284477 CASAVA_Build 7 147310332 1I GGAAAGGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 9 10 284478 CASAVA_Build 7 147311499 1I TAAAAAAGTA -/C CCCTGTAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 3 4 284479 CASAVA_Build 7 147318086 1I CTACAAATTT -/G GGGGTTGCTA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 G 4 5 284480 CASAVA_Build 7 147319396 1I GGAGGCAGTG -/C CATGAGGCAC 3070 hom 120 het 50 0 41 9 C 1 2 284481 CASAVA_Build 7 147338687 1D TACATCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 13 12 284482 CASAVA_Build 7 147350211 1D AAGAGGGTTT A/- AAAAAAAAAA 2750 het 849 hom 15 4 8 3 A 11 10 284483 CASAVA_Build 7 147350720 1I20M1D TTTAGTTTGC -TTTTTTGTTTGTTTGGTTGGT/TTTTTTTGTTTGTTTGGTTGG- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 31 15 12 7 N/A 0 0 284484 CASAVA_Build 7 147357132 2D GGCAACACAC TT/-- TTAACCTCTC 3070 het 3070 ref 54 25 19 10 T 4 2 284485 CASAVA_Build 7 147373499 1I GCTGTCCCCT -/A GGGGAGGTGG 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 A 0 1 284486 CASAVA_Build 7 147383755 22D CAAGTTAACA CATTGCAGTTAAGAAGGAAAAG/---------------------- CATTGCAGTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 15 CATTGCAGTTAAGAAGGAAAAG 2 1 284487 CASAVA_Build 7 147389252 4I GAAGTCTGTT ----/AGTC AGAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 AGTC 0 1 284488 CASAVA_Build 7 147402541 1I CATGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 3 4 284489 CASAVA_Build 7 147406375 1I AGGCGTTGAG -/C CAAGGCATTG 3070 hom 75 het 26 0 25 1 C 1 2 284490 CASAVA_Build 7 147436390 1D CCAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1944 het 1944 ref 34 22 5 7 A 13 12 284491 CASAVA_Build 7 147447393 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 11 5 A 13 14 284492 CASAVA_Build 7 147502443 1I GTTCCTGTGA -/C CCGCCCCCCA 3070 het 345 hom 45 1 28 16 C 2 3 284493 CASAVA_Build 7 147521997 1I TAACACTGCC -/T TTTTTTTTTT 3066 het 3066 ref 38 13 12 13 T 13 14 284494 CASAVA_Build 7 147537324 2D CTTTTCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2018 het 45 hom 22 1 7 14 T 18 16 284495 CASAVA_Build 7 147540168 1D TTTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3050 het 3050 ref 29 15 8 6 T 11 10 284496 CASAVA_Build 7 147543539 1D CAGGGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 35 14 9 12 T 16 15 284497 CASAVA_Build 7 147548841 1D GTCTTCAGGA G/- TTCATCAGTT 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 G 1 0 284498 CASAVA_Build 7 147554663 1D TGGAAAGGGG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 49 29 15 6 A 8 7 284499 CASAVA_Build 7 147556742 1D AGTCCCAGCT A/- CTGGGGATGC 3070 het 924 hom 15 5 8 2 A 1 0 284500 CASAVA_Build 7 147561384 4D37M1I TAAATGAAAT AGAGAGTTAATGGAAGTCACAAAAAGTAAGTCCCCAAGATC-/----AGTTAATGGAAGTCACAAAAAGTAAGTCCCCAAGATCA GAGAAAATAG 3070 het 3070 ref 41 30 13 6 N/A 0 0 284501 CASAVA_Build 7 147567075 1D ACTGCTCTTG A/- AATTACATTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 3 2 284502 CASAVA_Build 7 147568876 1D CAGGAAGCAT C/- CCAGCATGGG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 3 2 284503 CASAVA_Build 7 147571816 1D AACTAAAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 10 9 284504 CASAVA_Build 7 147574617 4I TAAAACTAGG ----/AGAC AGACCAGCCA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 AGAC 1 2 284505 CASAVA_Build 7 147585948 6D CACACCTTAA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 132 het 48 0 45 4 AC 12 9 284506 CASAVA_Build 7 147589189 8I GCATCTGTTG --------/TTTTTCTT TTTTTCTTTT 3070 het 2886 hom 23 7 8 8 TTTTTCTT 2 3 284507 CASAVA_Build 7 147591930 1D AATGGCTGCC A/- AAAAGCCAAG 3070 hom 68 het 29 0 24 5 A 5 4 284508 CASAVA_Build 7 147608944 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 10 11 284509 CASAVA_Build 7 147617534 1I ACTTACTTGG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 55 25 23 7 T 7 8 284510 CASAVA_Build 7 147617607 4D CACTCACACT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 22 het 35 1 25 10 CA 10 8 284511 CASAVA_Build 7 147619321 20D GAATATATAT ATAATATATATATATATAAA/-------------------- ATATGGAATT 3070 het 150 hom 20 1 15 6 ATAATATATATATATATAAA 1 0 284512 CASAVA_Build 7 147621118 1D TAAAATAAAA T/- AAATGACCAA 3070 het 3070 hom 36 17 14 6 T 1 0 284513 CASAVA_Build 7 147625690 1D AATATCTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 9 8 284514 CASAVA_Build 7 147632309 1D TGGAAAAAAA T/- GTCTGCTGCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 0 284515 CASAVA_Build 7 147643937 2D CTGAGAGTAA TG/-- TCTAGGCTGG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TG 1 0 284516 CASAVA_Build 7 147644375 1I AAAATATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 18 2 14 2 A 10 11 284517 CASAVA_Build 7 147645558 1I TCCAGTCTCC -/A AAAAAAATAT 2663 het 2663 ref 20 10 6 4 A 7 8 284518 CASAVA_Build 7 147647976 1D CCACGGAAAA G/- CTGTCTTCTG 3070 het 3070 hom 45 20 23 3 G 1 0 284519 CASAVA_Build 7 147650642 1I TCAAGGAGTT -/A AATTTTTTGC 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 2 3 284520 CASAVA_Build 7 147650790 1I AAATAAGTAG -/T TTTTGTTTTG 3070 het 1891 hom 31 9 14 8 T 4 5 284521 CASAVA_Build 7 147654163 1I TGCAAACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 11 12 284522 CASAVA_Build 7 147656518 21D GTCTGTAGAT TCCATCTCTTGGTGTTCAATA/--------------------- GGCCTTGGGG 3070 het 3070 ref 36 26 11 4 TCCATCTCTTGGTGTTCAATA 1 0 284523 CASAVA_Build 7 147656809 8D CCTGACCAAC ATGGTGAA/-------- ATGGTGAAAC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 ATGGTGAA 2 1 284524 CASAVA_Build 7 147660191 2D CTGAGCGGAC AA/-- AAAAAAAAAA 2901 het 2901 ref 28 10 11 7 A 16 14 284525 CASAVA_Build 7 147661470 4D AAAAAAAAAA CACT/---- CATTTTTTAG 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 CACT 1 0 284526 CASAVA_Build 7 147663885 1I ATATTGTACG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 T 8 9 284527 CASAVA_Build 7 147664468 1I ATGGTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 36 2 26 8 A 11 12 284528 CASAVA_Build 7 147665043 2D ATTAGGCAAC AT/-- ATATAGGAAG 3070 het 3070 ref 49 25 12 13 AT 3 2 284529 CASAVA_Build 7 147669311 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 18 5 T 10 11 284530 CASAVA_Build 7 147673376 8D TCTATTTTTA TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 2933 hom 29 9 13 7 TTTG 5 3 284531 CASAVA_Build 7 147677029 4I ATTTTTAATC ----/TTCA TTAATTCATC 3070 hom 63 het 26 0 20 6 TTCA 0 1 284532 CASAVA_Build 7 147678272 1D TTCCCAATTT A/- TGGTTGAAAC 3070 het 3070 ref 51 31 15 5 A 1 0 284533 CASAVA_Build 7 147681679 2I AGTGAGTTTT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 42 13 16 13 CA 7 8 284534 CASAVA_Build 7 147684176 5I AGCTTAAAAT -----/AATTA AATTAAAAAG 3070 hom 87 het 30 0 30 1 AATTA 1 2 284535 CASAVA_Build 7 147684334 1D ACTCACTCTT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 A 8 7 284536 CASAVA_Build 7 147690239 4I AAAAAACAAA ----/AAAC AAACAAAACC 2905 hom 21 het 18 0 8 10 AAAC 1 2 284537 CASAVA_Build 7 147691014 1I CAACATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 12 24 13 T 10 11 284538 CASAVA_Build 7 147699973 1D TGCCTGTAAT C/- CCGGCACTTT 2038 het 1364 hom 12 4 6 2 C 3 2 284539 CASAVA_Build 7 147703284 4D TATATAAAAC TATA/---- TATAGTTACA 2133 hom 12 het 6 0 5 1 TA 4 2 284540 CASAVA_Build 7 147708660 1I ATTTGACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 11 284541 CASAVA_Build 7 147709896 2D TGCACATTGG CC/-- CCCCCCCAGG 3070 hom 120 het 42 0 40 2 C 9 7 284542 CASAVA_Build 7 147710519 2D CGGGAGTCAC AA/-- GTTTTCTACC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 2 0 284543 CASAVA_Build 7 147720942 4D TGAGCTAGGA ACTC/---- ACTCAGGCTT 3070 hom 130 het 47 0 42 7 ACTC 2 1 284544 CASAVA_Build 7 147723176 1I ATTATGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 30 0 13 17 T 11 12 284545 CASAVA_Build 7 147729632 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1122 hom 18 4 11 3 T 10 11 284546 CASAVA_Build 7 147730198 17D CTTTTGGTCA CTGGATCTTGGACAATC/----------------- ATGAAAGCAG 3070 het 3070 ref 30 21 7 9 CTGGATCTTGGACAATC 1 0 284547 CASAVA_Build 7 147730346 1D GGCTGGCTAC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 9 8 284548 CASAVA_Build 7 147731900 1I TGCTCACACT -/A AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 3 4 284549 CASAVA_Build 7 147732527 1I ACTTGCAACA -/G GGGTACAGCT 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 G 3 4 284550 CASAVA_Build 7 147733581 1I CCTGCTTCAG -/C CCTCCTGAGT 3070 het 1188 hom 15 4 8 3 C 2 3 284551 CASAVA_Build 7 147734272 8I ATAAAGAAAG --------/AAAGAAAT AAAGAAGGTC 3070 hom 33 het 18 0 12 6 AAAGAAAT 0 1 284552 CASAVA_Build 7 147735012 1I GCTAAAGAAC -/T TTTATTCTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 3 4 284553 CASAVA_Build 7 147735155 13D AAAAGAAAGC CAAGGTTTTTATT/------------- CAAGGTTTTT 3070 het 3070 hom 35 18 18 1 CAAGGTTTTTATT 2 1 284554 CASAVA_Build 7 147737399 4I GACACTTGAC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 TCTT 2 3 284555 CASAVA_Build 7 147739877 4D AACTGACATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3029 het 3029 ref 33 17 7 9 TG 10 8 284556 CASAVA_Build 7 147740143 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 2978 het 128 hom 11 1 7 3 T 4 5 284557 CASAVA_Build 7 147741862 4I CATTTCTACT ----/AACA AACAACCTTG 3070 het 3070 ref 40 16 18 6 AACA 1 2 284558 CASAVA_Build 7 147742446 1D CGTTGTCTCA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 T 8 7 284559 CASAVA_Build 7 147744557 5D TTTTCTTTTA TAGTT/----- TAGTTATAGC 3070 hom 126 het 44 0 43 3 TAGTT 2 1 284560 CASAVA_Build 7 147746572 2D CGATGTTTTG AA/-- AAAAGCTAGG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 6 4 284561 CASAVA_Build 7 147747626 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 877 het 400 hom 9 2 3 4 T 15 16 284562 CASAVA_Build 7 147760043 4I AACTATAGCT ----/GAAA GAAAGAAACT 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 GAAA 2 3 284563 CASAVA_Build 7 147761168 5D ACAAAAAGTC ATAAA/----- ATAATGTAAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 ATAAA 1 0 284564 CASAVA_Build 7 147778707 1D CACCTCAAAA C/- CACTCACATT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 C 2 1 284565 CASAVA_Build 7 147779146 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2996 het 8 hom 17 1 10 7 A 15 14 284566 CASAVA_Build 7 147780481 2I TTTCTCTACC --/CT GTTTCCTTCT 3070 hom 122 het 44 0 39 5 CT 0 1 284567 CASAVA_Build 7 147781791 1I GCTTACTACC -/T GGTTAATGAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 0 1 284568 CASAVA_Build 7 147798359 4D TTCTGTTTCT ACTA/---- ACTTTTTGGA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 ACTA 1 0 284569 CASAVA_Build 7 147798706 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2336 hom 26 het 13 0 6 7 A 17 16 284570 CASAVA_Build 7 147799612 1I TGTGTGTCAT -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 6 7 284571 CASAVA_Build 7 147807233 1D AAAATTAACA T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 7 284572 CASAVA_Build 7 147807939 4D GTTCTCAACA CATT/---- CCACTTAAAT 3070 hom 63 het 27 0 22 6 CATT 1 0 284573 CASAVA_Build 7 147830108 1D GCTAGACAAG A/- AACTTTTCTG 2047 het 2047 ref 19 11 6 2 A 3 2 284574 CASAVA_Build 7 147874514 1D GGTTTCCTTT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 G 9 8 284575 CASAVA_Build 7 147900710 1I TTCTCTGTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 9 10 284576 CASAVA_Build 7 147950378 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 15 4 A 15 14 284577 CASAVA_Build 7 147951593 1I TCTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2848 hom 14 het 29 1 21 7 A 15 16 284578 CASAVA_Build 7 147952144 1D TAGTGACTGA G/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 0 284579 CASAVA_Build 7 147957651 5D TTATTACAAC TTGAA/----- TTGAAAGCCT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 TTGAA 2 1 284580 CASAVA_Build 7 147973069 5I6M1I TCTCAAAAAA -----AAAAAG-/AAAAGAAAAAGA AAAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 24 10 13 3 N/A 0 0 284581 CASAVA_Build 7 147993652 1I AAATTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 24 1 17 6 A 13 14 284582 CASAVA_Build 7 147994566 1I TTCTTTTTTT -/C TTTTCCTTTT 3070 hom 14 het 33 2 30 1 C 0 1 284583 CASAVA_Build 7 148007890 1D TGACCAGTGG T/- TCAATTAAGA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 2 1 284584 CASAVA_Build 7 148008365 1I ACTCTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 674 hom 18 2 13 3 A 13 14 284585 CASAVA_Build 7 148051815 1D AGCACAGATC T/- TTTTTTTTTT 1346 het 1346 ref 27 20 3 4 T 13 12 284586 CASAVA_Build 7 148056290 1D AGAGTAGAAC T/- TTTTTTTTTT 1617 het 1617 ref 47 34 4 9 T 12 11 284587 CASAVA_Build 7 148100451 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 25 0 19 6 A 11 12 284588 CASAVA_Build 7 148104203 1I TGCAGGAAGA -/C CCCCCCTCTG 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 6 7 284589 CASAVA_Build 7 148108139 2D TAAACTCCCG TA/-- TATATATATA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TA 6 5 284590 CASAVA_Build 7 148110872 1D GGGCGTGCCG C/- GGCGCCTGGA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 C 1 0 284591 CASAVA_Build 7 148120211 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 797 hom 18 2 13 3 A 15 14 284592 CASAVA_Build 7 148132090 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 45 het 16 0 15 1 A 6 5 284593 CASAVA_Build 7 148135650 1D TTTCAGAGGA G/- GGGGGAGGAG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 6 5 284594 CASAVA_Build 7 148137688 1D AAAACATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1008 hom 33 4 21 8 A 15 14 284595 CASAVA_Build 7 148141356 1D CATCTGCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 49 1 39 10 A 14 13 284596 CASAVA_Build 7 148174627 1D ACATACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 A 11 10 284597 CASAVA_Build 7 148186317 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 10 11 284598 CASAVA_Build 7 148188358 1D GGCATAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 30 0 18 12 A 13 12 284599 CASAVA_Build 7 148189254 1D TATTTGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 27 1 20 6 T 15 14 284600 CASAVA_Build 7 148191109 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 18 2 15 1 A 16 15 284601 CASAVA_Build 7 148201892 1I GAGAGAAAAA -/G AAAAAAGATT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 0 1 284602 CASAVA_Build 7 148221373 1D CAAACTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 26 2 17 8 A 14 13 284603 CASAVA_Build 7 148221730 1D GAACTCATTA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 65 hom 35 1 17 17 C 11 10 284604 CASAVA_Build 7 148222082 1D AGCTGGGTGG C/- CTTCGGCAGC 3070 hom 103 het 38 0 34 5 C 2 1 284605 CASAVA_Build 7 148237715 1I TATTATGACT -/C CAACCAAGAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 1 2 284606 CASAVA_Build 7 148258453 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 A 9 8 284607 CASAVA_Build 7 148264925 2D AGCTCACGAC TG/-- TAATCCCAGC 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 TG 1 0 284608 CASAVA_Build 7 148266712 6I GGCACTTTTG ------/GGAGGC GGAGGCGGAG 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 GGAGGC 2 3 284609 CASAVA_Build 7 148274741 1I ATATGTGAAA -/C CCCCTCCTCT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 C 4 5 284610 CASAVA_Build 7 148286131 1D CATGATCTTG T/- TTTTTTTTTT 1129 het 1129 ref 38 28 3 7 T 11 10 284611 CASAVA_Build 7 148290961 1I GGGAGACGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 11 12 284612 CASAVA_Build 7 148291679 1I TATCCAGTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 T 8 9 284613 CASAVA_Build 7 148293903 1D CTTTCAAGTC T/- TTTTTTCTTT 1272 het 1272 ref 35 12 10 13 T 7 6 284614 CASAVA_Build 7 148309747 2D GTGTGTATGT GA/-- GAGAGAGAGA 1138 het 1138 ref 43 36 5 2 GA 8 7 284615 CASAVA_Build 7 148317624 1D CCCAGAGGGG A/- AAAAAAAAGT 2685 het 2685 ref 17 10 6 1 A 9 8 284616 CASAVA_Build 7 148338497 4D CCAGCCTGGG CAAT/---- CAGAGTGAGA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 CAAT 1 0 284617 CASAVA_Build 7 148352365 1D TACCTTTCCA T/- TTCCTCCCCA 3070 hom 63 het 22 0 22 3 T 3 2 284618 CASAVA_Build 7 148357478 3D29M4I TATGTCAGAA AAGAAGCCTGTAATGTGCATTAAGTTTGAGAC----/---AAGCCTGTAATGTGCATTAAGTTTGAGACTTTT TTTTTTTTAA 2520 het 2520 ref 22 22 7 2 N/A 0 0 284619 CASAVA_Build 7 148371772 2I CAGAGCGAGA --/CT CTCTCTCGAA 598 het 545 hom 18 7 6 5 CT 3 4 284620 CASAVA_Build 7 148379307 1I CTTGGGCCAC -/A ACATAAAATA 3070 hom 123 het 49 0 41 8 A 1 2 284621 CASAVA_Build 7 148387332 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2409 het 976 hom 12 4 7 1 A 11 10 284622 CASAVA_Build 7 148389594 4D GTGAGCCAAG CCCC/---- CTTGCGCCAT 1212 het 1212 ref 11 6 3 3 C 5 1 284623 CASAVA_Build 7 148403000 1I GACTACAGGC -/A ACGCACCACC 2838 het 2838 ref 18 9 8 1 A 1 2 284624 CASAVA_Build 7 148403771 8I TCATTGCAGC --------/CTCAACCT CTCAACCTCC 1615 het 1615 ref 17 8 5 4 CTCAACCT 1 2 284625 CASAVA_Build 7 148414870 1D GCGCAGATCC T/- TTTTTTTTTT 849 het 849 ref 24 9 7 8 T 15 14 284626 CASAVA_Build 7 148427493 1D ATGCCTACTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2384 hom 33 6 13 14 T 10 9 284627 CASAVA_Build 7 148445633 3D CACTTCTTTT AAA/--- AAAAAAGGGG 3070 het 2568 hom 23 6 15 2 A 9 6 284628 CASAVA_Build 7 148449026 1D CAACTGCTGT G/- TCATATGATG 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 G 1 0 284629 CASAVA_Build 7 148449950 1D GTTTTCTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2332 hom 34 6 19 9 T 9 8 284630 CASAVA_Build 7 148455323 4I TGTCCATGAG ----/AAAT AAAGTAGTCC 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 AAAT 0 1 284631 CASAVA_Build 7 148455415 1D TTAAAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 A 12 11 284632 CASAVA_Build 7 148463684 3D AAACTATTAG AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 40 19 16 8 AAT 4 3 284633 CASAVA_Build 7 148469914 11I GCGCCCGGCC -----------/CTAATCCACAG CTAATCCACA 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 CTAATCCACAG 1 2 284634 CASAVA_Build 7 148477700 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 2810 hom 17 8 8 1 A 8 9 284635 CASAVA_Build 7 148482620 1I GGTAGATGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 8 9 284636 CASAVA_Build 7 148489834 1D AATTAACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1271 hom 33 7 11 15 A 15 14 284637 CASAVA_Build 7 148494348 7D AAGTGACAGC AGCTCCA/------- AGAGGGCTCA 3070 het 3070 ref 53 26 25 4 AGCTCCA 1 0 284638 CASAVA_Build 7 148503369 1D CATTTAGTCC A/- AAAAAAAAAA 1354 het 1354 ref 31 20 4 8 A 13 12 284639 CASAVA_Build 7 148506317 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2435 het 778 hom 16 6 7 3 A 12 11 284640 CASAVA_Build 7 148507963 5D CTATACACTT GACTA/----- GAGACATGCT 3070 het 3070 hom 36 11 19 9 GACTA 1 0 284641 CASAVA_Build 7 148513652 4D CTGGTCTAAA ACTT/---- AAGCTACCCA 3070 het 3070 hom 47 21 24 4 ACTT 1 0 284642 CASAVA_Build 7 148516973 1I CAATAACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 10 11 284643 CASAVA_Build 7 148521277 1I AGTCTGTGAA -/G TACTCATTTC 3070 het 3070 hom 58 24 27 7 G 0 1 284644 CASAVA_Build 7 148533602 4D ACAGTGAGTT GTCA/---- GTCCGTAGGG 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 GTCA 1 0 284645 CASAVA_Build 7 148535227 15I ACTCGTTTTC ---------------/AAGGTTCTTCATAAG AGATTACCCG 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 AAGGTTCTTCATAAG 0 1 284646 CASAVA_Build 7 148545662 1D CCAGCAAGCA G/- GCAAGGTAAA 3043 het 3043 ref 30 17 8 5 G 2 1 284647 CASAVA_Build 7 148548954 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTG 1925 het 21 hom 19 1 10 8 G 0 1 284648 CASAVA_Build 7 148552800 1I GGTTGGGGGT -/C CCCCAGGGTG 2249 hom 28 het 12 0 9 3 C 4 5 284649 CASAVA_Build 7 148554280 1D CAATGGGGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 9 8 284650 CASAVA_Build 7 148554838 3I TCAAAAACAA ---/AAC AAAAACACCT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAC 0 1 284651 CASAVA_Build 7 148558145 5D GTAAAGGCAG TTATC/----- TTATGATCAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 TTATC 1 0 284652 CASAVA_Build 7 148566153 1I CCATGACACA -/T TTTTTTTTTT 1623 het 1623 ref 40 17 5 18 T 13 14 284653 CASAVA_Build 7 148566957 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2382 het 1676 hom 17 6 7 4 A 11 12 284654 CASAVA_Build 7 148583200 1I GACCCTGCAG -/C CCCTGTTGAG 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 C 3 4 284655 CASAVA_Build 7 148589260 5D CAAAAAAGAA AAAAC/----- AAAACCAAAA 2353 het 1598 hom 19 9 8 3 AAAAC 2 1 284656 CASAVA_Build 7 148589336 2D TCTAGCGGGA AG/-- AGTTTGCCAG 3070 het 3070 hom 28 9 16 4 AG 2 1 284657 CASAVA_Build 7 148594015 2D AAGAGGAAAC TG/-- AGACCCAAGA 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 TG 1 0 284658 CASAVA_Build 7 148608737 2D CCCTCTGCCT AG/-- AGTCTGTGCT 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 AG 2 1 284659 CASAVA_Build 7 148635438 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 9 10 284660 CASAVA_Build 7 148645908 1I GAGCTGATGC -/T TTTTTTTTTT 1512 het 1512 ref 31 9 6 16 T 15 16 284661 CASAVA_Build 7 148649109 3D TTCCTCTGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 13 10 284662 CASAVA_Build 7 148649870 1I CAGGTTATCA -/T TCCCAGTGGT 3070 het 3070 hom 28 15 12 1 T 1 2 284663 CASAVA_Build 7 148650423 1D TTCTGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 31 3 10 18 A 13 12 284664 CASAVA_Build 7 148650543 1D ATTTCTAGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 16 26 6 T 10 9 284665 CASAVA_Build 7 148652013 4D TAAATCTTTG ATAA/---- ATAAGCTAGT 3070 het 3070 ref 33 17 14 4 ATAA 2 1 284666 CASAVA_Build 7 148661486 2D GAACAGAAAG AA/-- AAAAGACTAA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 A 6 4 284667 CASAVA_Build 7 148663192 1I GTAATTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 11 12 284668 CASAVA_Build 7 148664994 1D AAGCGGGGCC T/- TGCAGGATGG 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 2 1 284669 CASAVA_Build 7 148666959 2D TTGTTACATA TG/-- TATACATGAG 3070 het 2374 hom 16 5 10 1 TG 1 0 284670 CASAVA_Build 7 148668285 1D GGTTGTTTGA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 6 284671 CASAVA_Build 7 148671688 1D CAAACCCTGC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 9 8 284672 CASAVA_Build 7 148679420 5D CCCATGAAAA TGAAG/----- TGATGTGTAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TGAAG 1 0 284673 CASAVA_Build 7 148684773 4D ATAATTTATA CTTT/---- CTTATAGTTC 3070 hom 135 het 47 0 46 2 CTTT 1 0 284674 CASAVA_Build 7 148685407 1I CACTTGCCAA -/G GGCAAGCCAG 3070 hom 98 het 42 0 29 13 G 2 3 284675 CASAVA_Build 7 148696150 1D TCCAGAAAGT G/- TTATTTATCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 G 1 0 284676 CASAVA_Build 7 148715023 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 520 hom 40 2 26 12 T 13 12 284677 CASAVA_Build 7 148718020 1D TTATAGAAAA C/- ACAAATTTAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 1 0 284678 CASAVA_Build 7 148731981 1D CAGTCTCTAC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 8 7 284679 CASAVA_Build 7 148737388 37I AATGTACAAG -------------------------------------/ATGGCATACAGAGAAAAATTAAGACTCCATTCCATCC TTGTCACCTG 3070 hom 87 het 29 0 30 1 ATGGCATACAGAGAAAAATTAAGACTCCATTCCATCC 0 1 284680 CASAVA_Build 7 148737906 1I AAAAAACCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 9 10 284681 CASAVA_Build 7 148741355 1I TATGCAGTCA -/T AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 0 1 284682 CASAVA_Build 7 148743698 2I TGAAGAAAAG --/GT GTAGGCCATT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 GT 1 2 284683 CASAVA_Build 7 148775890 1I TTTCATCTGT -/G GGGGGGTGTT 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 G 6 7 284684 CASAVA_Build 7 148807176 1D GAAGGCATTG T/- TAAGTCCACA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 2 1 284685 CASAVA_Build 7 148812712 1D ATAAAACAAG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 8 7 284686 CASAVA_Build 7 148817980 1I ATGTCCCCAA -/G GGGCTCTGCC 3070 hom 60 het 26 0 19 7 G 3 4 284687 CASAVA_Build 7 148818932 1I AGGACCCTGT -/C CCCAGTGGGC 3070 hom 113 het 43 0 36 7 C 3 4 284688 CASAVA_Build 7 148819466 2D CTAGGAAGCT GG/-- GGACGCGCAC 1028 het 1028 ref 30 25 3 3 G 4 2 284689 CASAVA_Build 7 148824010 1D CTTGAGTCCA C/- CCTCCACCTA 3070 het 3070 hom 54 17 29 9 C 3 2 284690 CASAVA_Build 7 148831552 2D AACAACAATC AG/-- GGGATAGATG 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 AG 1 0 284691 CASAVA_Build 7 148846067 4D GACTTCAAAT AAAC/---- AACCTAACAG 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 AAAC 1 0 284692 CASAVA_Build 7 148860984 1D TCTAACCCCT A/- AGCTTTTGGA 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 A 2 1 284693 CASAVA_Build 7 148875013 2I TAGGTGTGAG --/AA GTTTGATTTT 3070 het 3070 hom 55 23 25 7 A 0 2 284694 CASAVA_Build 7 148880267 1I TGCTACAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 10 11 284695 CASAVA_Build 7 148885123 1D GCAGCAGGCT C/- CCCCAGAAAC 2409 het 2409 ref 43 34 6 3 C 5 4 284696 CASAVA_Build 7 148885897 1I CACGGCTCCA -/C CCAGAGACAG 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 C 2 3 284697 CASAVA_Build 7 148886616 2I GAGTCACAGT --/TG AGTCACAGTC 3070 hom 126 het 46 0 41 5 TG 0 1 284698 CASAVA_Build 7 148899740 1D TTCTTTTCTT C/- CCTTTACTCC 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 C 3 2 284699 CASAVA_Build 7 148911919 1I CTATGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 T 11 12 284700 CASAVA_Build 7 148928079 4I TCAGAGAGAT ----/TCTC TCTGCCTGTT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 TC 1 3 284701 CASAVA_Build 7 148933388 6D TGACTCTCCT TATTAG/------ TATAAGATGT 3070 het 3070 ref 49 25 19 7 TATTAG 1 0 284702 CASAVA_Build 7 148933533 1D CAACCCCTCC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 8 7 284703 CASAVA_Build 7 148941402 1D AGAGGGACTC A/- AAAGAACTGG 3070 het 3070 ref 37 19 10 9 A 4 3 284704 CASAVA_Build 7 148942465 3D TTAAAAGGGA GAC/--- ACCACCTTAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 9 GAC 1 0 284705 CASAVA_Build 7 148945742 1I ACAAGCACTC -/A AGAGGGCTGC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 1 2 284706 CASAVA_Build 7 148946439 1I TGACTGAGAT -/G AGATGACGAA 3070 het 3070 ref 36 21 15 0 G 0 1 284707 CASAVA_Build 7 148947377 3I GATGACCTTT ---/ATG ATGACCCACT 3070 het 3070 ref 28 11 13 4 ATG 1 2 284708 CASAVA_Build 7 148957185 1I CTAATTCCAA -/G ACAAACCACG 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 G 0 1 284709 CASAVA_Build 7 148959155 4D GTTTGTTTGC TTGT/---- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 54 26 24 6 TTGT 1 0 284710 CASAVA_Build 7 148974460 1D GATATGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 A 11 10 284711 CASAVA_Build 7 148980362 1D CAAACTATTC A/- AAAAAAATAG 3070 hom 66 het 26 0 22 7 A 8 7 284712 CASAVA_Build 7 148981311 2D TGAAAATCCT AA/-- AGACTCCACC 3070 het 3070 ref 30 22 8 0 A 3 1 284713 CASAVA_Build 7 148982010 8I ATGCAGAAGA --------/ACAAAACT TGTCCCCTAT 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 ACAAAACT 0 1 284714 CASAVA_Build 7 148985274 3D TCTGAAATTG TCA/--- TGATGGTTGC 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 TCA 1 0 284715 CASAVA_Build 7 148994076 2I TCTTTCTCTC --/TT TGTCTTCCTG 3070 het 3070 hom 50 17 23 10 T 1 3 284716 CASAVA_Build 7 148997013 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2415 het 1760 hom 19 7 7 5 T 12 11 284717 CASAVA_Build 7 149001047 4I AGAGGGAGTC ----/AAAG AGAGAAAGTC 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 AAAG 0 1 284718 CASAVA_Build 7 149008755 1D ATCACATGCG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 44 19 19 7 T 8 7 284719 CASAVA_Build 7 149019771 1I TACATAGTTT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 7 8 284720 CASAVA_Build 7 149051754 1I TCCTTTTTCC -/T TTAGTGAAGA 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 T 2 3 284721 CASAVA_Build 7 149060130 1I CACACACGTG -/C CCCTACGGAC 3070 hom 127 het 50 0 39 11 C 3 4 284722 CASAVA_Build 7 149066572 4D TGTATAGACA TAAG/---- TGAGTATGTG 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 TAAG 1 0 284723 CASAVA_Build 7 149068545 1I TCTGGACCTT -/C CACATTAGAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 C 1 2 284724 CASAVA_Build 7 149070864 1D TGATGTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 13 7 T 12 11 284725 CASAVA_Build 7 149107600 1I GCTGTGACAG -/C CCCCTGGGGC 3070 hom 92 het 34 0 28 6 C 4 5 284726 CASAVA_Build 7 149137145 1I GAGGCAGCAG -/C CTGCGCAGCC 2173 hom 31 het 16 0 10 6 C 1 2 284727 CASAVA_Build 7 149174153 1D TCTCGCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1015 het 1015 ref 34 23 3 8 T 12 11 284728 CASAVA_Build 7 149193561 2D CTCCTCGCCC CG/-- ATCTTCCTTC 3070 het 3070 hom 32 16 11 6 CG 1 0 284729 CASAVA_Build 7 149200032 1D CTACAGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 11 10 284730 CASAVA_Build 7 149205104 18I ATTGAAATGG ------------------/GGTCTTGTCAAGACCCCT GGTCTTGAGA 2978 het 2978 ref 34 18 9 7 GGTCTTGTCAAGACCCCT 0 1 284731 CASAVA_Build 7 149206681 1D GGCTCACCAT G/- CTTTGCTGTC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 G 1 0 284732 CASAVA_Build 7 149208870 2I CCAGGACTAC --/TT TTTCCTGAGA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 3 5 284733 CASAVA_Build 7 149209087 2D GATCTGCCAG CA/-- CATCTCGCTG 1848 het 1848 ref 28 11 8 10 CA 2 1 284734 CASAVA_Build 7 149216238 1D TCTTTGTCCA C/- CCCCCTATTA 3070 het 3070 ref 44 28 12 5 C 6 5 284735 CASAVA_Build 7 149219852 3I TCTCTAAAAA ---/AAC AACAACAAAA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 AAC 2 3 284736 CASAVA_Build 7 149219924 1D CTGGAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 2333 hom 12 het 5 0 5 0 A 12 11 284737 CASAVA_Build 7 149220430 1I CCTTAAAAAA -/C ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 24 11 1 C 0 1 284738 CASAVA_Build 7 149223164 2D AGCCAGGCAC AG/-- AAAGACAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 AG 1 0 284739 CASAVA_Build 7 149226197 2D CATGGGCTAG AA/-- AAGTCTTGTG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 4 2 284740 CASAVA_Build 7 149227782 1I ATTTGGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 10 11 284741 CASAVA_Build 7 149227988 1I CACACACACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 9 10 284742 CASAVA_Build 7 149228064 2D AAAATATCCC CT/-- GAGAATAGAG 2479 hom 12 het 9 0 5 4 CT 1 0 284743 CASAVA_Build 7 149229192 2D AGATGAAAAC AG/-- AGTAGTGGTT 3070 het 3070 ref 34 18 10 8 AG 2 1 284744 CASAVA_Build 7 149229548 2I5M4I TATTTCAAAA --TAAAA----/TTTAAAATAAT TATTTTAAAT 2844 hom 18 het 8 0 6 4 N/A 0 0 284745 CASAVA_Build 7 149230450 1D GTACTTCATA T/- TTCATAGCCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 3 2 284746 CASAVA_Build 7 149230594 1I CCTGGGCAAC -/A AAGAGAGACC 3070 hom 15 het 20 1 17 2 A 2 3 284747 CASAVA_Build 7 149236808 1I GAATCCTATC -/T TTTTTTTTTT 1464 het 1464 ref 19 6 7 6 T 13 14 284748 CASAVA_Build 7 149237288 2D CATTTCCACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 17 6 A 14 12 284749 CASAVA_Build 7 149237852 1I CCTTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1003 hom 30 3 20 7 A 12 13 284750 CASAVA_Build 7 149238242 1D TTTGCGGGGT G/- GGGGGCGGCG 1635 het 1635 ref 15 6 6 3 G 6 5 284751 CASAVA_Build 7 149238600 4D AGGACTACTC TAAT/---- TAACAGTAAC 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 TAAT 1 0 284752 CASAVA_Build 7 149239350 1I TACTTCCCAC -/A AAAATGATGC 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 A 4 5 284753 CASAVA_Build 7 149243540 1I GTCCATTTTG -/T TTTTTTTTGT 1255 hom 27 het 23 0 10 13 T 8 9 284754 CASAVA_Build 7 149244693 1I AAGCCCTTGG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 7 8 284755 CASAVA_Build 7 149247189 1I TTTCATTTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 T 8 9 284756 CASAVA_Build 7 149247876 1D TATCAATTTC A/- AAAAAATGAA 2017 het 2017 ref 21 13 5 4 A 7 6 284757 CASAVA_Build 7 149251237 2I GTTTAAATAC --/AT ATATATATGT 2182 het 2182 ref 20 12 5 3 AT 4 5 284758 CASAVA_Build 7 149255088 1I CCAAATAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 10 11 284759 CASAVA_Build 7 149261143 1I CATCCTCACT -/G CACACACCTG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 0 1 284760 CASAVA_Build 7 149265119 1I GCCATCTGAT -/G TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 45 28 11 6 G 0 1 284761 CASAVA_Build 7 149265220 5D TAGCGCTTTG TGCTA/----- CAAATTCTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TGCTA 1 0 284762 CASAVA_Build 7 149266462 1D AATTTAGGAG A/- TTTTTTTTAA 3070 hom 62 het 26 0 20 6 A 1 0 284763 CASAVA_Build 7 149271134 3I CGGGGCCTGC ---/TGT TGTTTTGTAA 1647 het 1647 ref 31 21 4 6 TGT 1 2 284764 CASAVA_Build 7 149273341 20I CCATCAGTGA --------------------/CAGGCTGCAGGGTCTTGGGG CAACCTCCCA 2839 het 2839 ref 35 15 11 9 CAGGCTGCAGGGTCTTGGGG 0 1 284765 CASAVA_Build 7 149302816 3I TGTAAAATAA ---/GAT GATATTTTAG 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 GAT 1 2 284766 CASAVA_Build 7 149307313 3I AGCTCTGCAA ---/GAG AAGATAGAGT 3070 het 3070 ref 54 42 8 4 GAG 0 1 284767 CASAVA_Build 7 149315217 1I CTACCAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 36 hom 15 1 11 3 A 9 10 284768 CASAVA_Build 7 149343914 3D TTTTAGCATC ATT/--- ATTAATAGCA 2723 het 2723 ref 60 47 7 7 ATT 2 1 284769 CASAVA_Build 7 149350899 1I TTATAATAAG -/T TGCCATCTAG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 1 2 284770 CASAVA_Build 7 149356970 1D TTTCCAGGCC T/- TCCCTGAGGC 1282 het 155 hom 18 2 5 11 T 2 1 284771 CASAVA_Build 7 149357723 2I TTTCAAATGA --/CT CTCCCCATGA 1451 het 1451 ref 21 14 4 3 CT 1 2 284772 CASAVA_Build 7 149373766 1I CAAGTTAAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 49 34 12 3 T 6 7 284773 CASAVA_Build 7 149401374 1I TTAACATGAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 8 9 284774 CASAVA_Build 7 149404239 1I ACATAACAGG -/A AAAAAAAAAA 896 het 896 ref 40 30 3 7 A 11 12 284775 CASAVA_Build 7 149410789 4D TATGACTCTC TTTG/---- TATTTACGAA 3070 het 3070 hom 31 16 15 0 TTTG 1 0 284776 CASAVA_Build 7 149427404 4I AAAAGACATT ----/GAGA TTCACACCAC 3070 het 3070 ref 45 28 11 6 GA 0 2 284777 CASAVA_Build 7 149434416 2D CTAGGCAGAG AA/-- AAGTTGCTGT 3070 het 3070 ref 42 27 10 6 A 4 2 284778 CASAVA_Build 7 149439555 4I CACAGTCACG ----/CACA CATTCACCCA 3070 hom 34 het 13 0 11 2 CA 1 3 284779 CASAVA_Build 7 149440280 2I TTCCTGGCCC --/CT CTCTCCCTCA 1902 het 1902 ref 38 21 8 9 CT 2 3 284780 CASAVA_Build 7 149441475 1I TAAGCCTGTT -/C AGTTCACAAG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 C 0 1 284781 CASAVA_Build 7 149453286 3I GTATTTTTTT ---/TTG TTTTTTTAGA 1393 het 1393 ref 23 9 4 10 TTG 0 1 284782 CASAVA_Build 7 149455345 1I TAGGAAAAAG -/A AAAATGGATG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 4 5 284783 CASAVA_Build 7 149456076 3D AATTCATTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3022 het 462 hom 17 3 11 5 A 17 14 284784 CASAVA_Build 7 149473149 1D AACTGAGTGG A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 7 6 284785 CASAVA_Build 7 149475877 1I CTGGATGATT -/A AAAAAAAAGC 2412 het 2412 ref 16 8 6 2 A 8 9 284786 CASAVA_Build 7 149487204 1I ACAAAGCTGG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 119 het 45 0 38 7 A 7 8 284787 CASAVA_Build 7 149487726 2I CCCTGGACAC --/TT TATTTTTCTA 3070 het 3070 ref 46 34 8 4 T 1 3 284788 CASAVA_Build 7 149492530 2D ACTTCAAAAC AT/-- AGGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 24 16 8 0 AT 1 0 284789 CASAVA_Build 7 149498463 2D TGGAATCCAC AT/-- GTGATGATAT 3070 hom 87 het 35 0 28 8 AT 1 0 284790 CASAVA_Build 7 149524946 3I AGTGCCCCTT ---/CTC CTCTGACTGC 1857 het 1857 ref 43 36 4 3 CTC 1 2 284791 CASAVA_Build 7 149528351 1D CTTTTAACCA T/- CAAAAGTGAC 1351 het 1351 ref 42 37 3 2 T 1 0 284792 CASAVA_Build 7 149530564 1I GGATTCTTTA -/T TAGAGTCACT 1394 het 1394 ref 28 23 3 2 T 1 2 284793 CASAVA_Build 7 149591508 2I GTAAAGAAAC --/AG AGAGGATTAA 3024 hom 18 het 8 0 7 1 AG 2 3 284794 CASAVA_Build 7 149619496 1I GCTAAAAGTA -/T TAATACAGGT 1383 het 1383 ref 31 27 3 1 T 1 2 284795 CASAVA_Build 7 149621266 1D TTTTTTTTTT A/- ATTTCCATCC 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 A 2 1 284796 CASAVA_Build 7 149625020 1D AGAACTGTGA G/- AAAACAACGA 2401 het 2401 ref 64 50 6 8 G 1 0 284797 CASAVA_Build 7 149625180 1D GGCCACACTT A/- AGAGTCTTCA 2689 het 2689 ref 30 23 6 2 A 2 1 284798 CASAVA_Build 7 149625375 1D GTGTCAATTT A/- AAAAAAAAAC 1788 het 1788 ref 29 22 4 3 A 10 9 284799 CASAVA_Build 7 149643853 1D AACACTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 12 11 284800 CASAVA_Build 7 149645095 4I TCTTTCCTTC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 het 2169 hom 23 5 14 4 ATTT 3 4 284801 CASAVA_Build 7 149655171 1D CTTTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 2042 het 2042 ref 43 28 6 9 T 13 12 284802 CASAVA_Build 7 149667556 1D TAAGATTTGA T/- TTTGAGGTTG 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 4 3 284803 CASAVA_Build 7 149672726 1D CTATCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 12 11 284804 CASAVA_Build 7 149675660 1I CACGAGGGCT -/C CCTGCTTATA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 C 2 3 284805 CASAVA_Build 7 149677457 4D TGATAAGATA GATT/---- ATGAGTACCT 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 GATT 1 0 284806 CASAVA_Build 7 149690327 1D AGCTGGATTC T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 10 5 T 6 5 284807 CASAVA_Build 7 149691056 1I GCATTTAGGC -/A AGTGGAGGGC 3070 het 3070 hom 45 22 18 5 A 1 2 284808 CASAVA_Build 7 149693168 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2525 hom 34 9 16 9 A 15 16 284809 CASAVA_Build 7 149693499 3D GGTTTTTTTT TTC/--- CCCCAGTCGG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 TTC 1 0 284810 CASAVA_Build 7 149702750 3I TTTAAGCAAG ---/GGA GGTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 GGA 0 1 284811 CASAVA_Build 7 149704849 1D GAGTCAAATT G/- TGCCTGGTTC 3070 het 3070 hom 28 9 15 5 G 1 0 284812 CASAVA_Build 7 149710158 1I CCAGAGCCGT -/G GCAAACCCTC 3070 hom 69 het 30 0 23 7 G 1 2 284813 CASAVA_Build 7 149713989 1I CTTATTTAGC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 8 9 284814 CASAVA_Build 7 149715831 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 10 11 284815 CASAVA_Build 7 149723054 1I GAAAAAGTCC -/T TCACTTGAGG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 1 2 284816 CASAVA_Build 7 149727634 5D GCAGTGTGAA ATCAC/----- ACGGGGTGTT 3070 het 3070 ref 27 14 8 7 ATCAC 1 0 284817 CASAVA_Build 7 149728447 2I GCCCCTACCC --/TT GAAGAGCTCA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 0 2 284818 CASAVA_Build 7 149741386 3I ACCCAGCCAG ---/GAA GAAGAAGCCG 3070 hom 52 het 28 0 18 10 GAA 2 3 284819 CASAVA_Build 7 149744617 1D TCTTTATTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 14 het 26 0 18 8 T 7 6 284820 CASAVA_Build 7 149746380 3I TTCTTTTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3040 hom 55 het 28 0 21 7 TTC 0 1 284821 CASAVA_Build 7 149746556 1D TAATTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 18 4 T 12 11 284822 CASAVA_Build 7 149749314 1D GCCAGGGCTG T/- TTTCTCCAGT 3070 hom 61 het 27 0 21 6 T 4 3 284823 CASAVA_Build 7 149749852 8D GTCTAAAAAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 3070 hom 45 het 18 0 15 6 AAAG 5 3 284824 CASAVA_Build 7 149749953 1D CCCAAAAGCC A/- GCAGTGGAAG 3070 hom 71 het 26 0 23 4 A 1 0 284825 CASAVA_Build 7 149753544 2I GCGTATATAT --/AC ACCATATTCT 3070 hom 157 het 56 0 53 3 AC 1 2 284826 CASAVA_Build 7 149754200 1I AAAACATTTG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 7 8 284827 CASAVA_Build 7 149756088 1D AAGCAGTGGC A/- AAGTGGTGCC 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 3 2 284828 CASAVA_Build 7 149758194 1D TAACCGCATT A/- TTTTTTTGGA 3070 het 2535 hom 24 6 12 6 A 1 0 284829 CASAVA_Build 7 149759331 1D TTGAGATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 T 13 12 284830 CASAVA_Build 7 149762321 1I AGTCATAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 42 1 34 7 T 10 11 284831 CASAVA_Build 7 149763029 1I GTAATAGTCC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 8 9 284832 CASAVA_Build 7 149764383 3I GAATCAATTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 10 13 284833 CASAVA_Build 7 149765496 1D CCCCACCATG C/- CCCCACTAAT 1521 het 932 hom 7 3 4 0 C 5 4 284834 CASAVA_Build 7 149766559 1D ACACTAGCCT G/- GGCAACAGAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 G 3 2 284835 CASAVA_Build 7 149768876 4D GAATCCTCCA GTTT/---- GTTCTTTTGT 3070 het 3070 hom 25 8 14 4 GTTT 1 0 284836 CASAVA_Build 7 149771564 3D GGAACCTGAA GGT/--- GTTGGAAGGG 3070 het 3070 hom 53 18 21 14 GGT 1 0 284837 CASAVA_Build 7 149772038 1I GAGCGGAATC -/T TACTTGGGCT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 1 2 284838 CASAVA_Build 7 149775735 2I AACAAAGATG --/TC TCTGCAGTGA 3070 het 3070 ref 44 28 12 4 TC 1 2 284839 CASAVA_Build 7 149783160 2D ATTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 20 2 11 8 A 17 15 284840 CASAVA_Build 7 149783176 2D AAAAAAAAAA AC/-- CAAAAAACAA 1247 het 301 hom 20 6 5 9 AC 1 0 284841 CASAVA_Build 7 149810564 1I GAGCATCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 10 11 284842 CASAVA_Build 7 149819922 3D GAAAAAATGC TCA/--- TCATCACTGG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TCA 3 2 284843 CASAVA_Build 7 149821200 1I TGATGTATAA -/T TTTTTTAATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 6 7 284844 CASAVA_Build 7 149830322 1D CCTCTTTATA T/- TTCCAGATAG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 3 2 284845 CASAVA_Build 7 149837421 2D TGGCAGAACG TA/-- TACCCCAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 TA 2 1 284846 CASAVA_Build 7 149840576 4D TTTGCCAGCC CTAG/---- CTAGAATTCC 3070 het 3070 ref 27 16 9 5 CTAG 2 1 284847 CASAVA_Build 7 149840965 1D GAAAATACTG A/- TATCCAATGG 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 1 0 284848 CASAVA_Build 7 149841147 3I CTCAGCCATG ---/GCT GCTGCACTAA 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 GCT 1 2 284849 CASAVA_Build 7 149846658 7D GTTTTCCTAG TTTGATA/------- TTTGTGTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 TTTGATA 1 0 284850 CASAVA_Build 7 149848941 4D TTTGCAAAGA TAGT/---- TAGAGAAATA 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 TAGT 1 0 284851 CASAVA_Build 7 149849035 2I TGATTTTTAA --/AT ATATATATAT 3070 het 2488 hom 22 6 9 7 AT 8 9 284852 CASAVA_Build 7 149859408 3D GTCTTAAAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 7 A 15 12 284853 CASAVA_Build 7 149866084 1I GGAAGAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 10 8 10 T 10 11 284854 CASAVA_Build 7 149870876 1D ACATTGTTAA T/- TTTGAGTAGT 3070 het 3070 ref 48 28 16 5 T 4 3 284855 CASAVA_Build 7 149879348 12D CCAGTGCCAC TGTGCACAGGAG/------------ GACCTTGCCT 3070 het 3070 ref 50 26 22 7 TGTGCACAGGAG 1 0 284856 CASAVA_Build 7 149884588 2D AGAAGGAATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 49 20 21 9 TG 7 6 284857 CASAVA_Build 7 149884685 1D ATCAACTTCA T/- TTAAGATAGG 3070 het 3070 hom 46 18 22 7 T 3 2 284858 CASAVA_Build 7 149887718 1I GCAATTTTTA -/G GGAACAAGGG 3070 het 3070 ref 33 19 7 7 G 2 3 284859 CASAVA_Build 7 149888010 1I TAGGATGGGG -/A AAAACTCTGC 2844 het 2844 ref 22 12 6 4 A 4 5 284860 CASAVA_Build 7 149889482 1D CAGTGCTCAA G/- GGAGTGTTTC 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 G 3 2 284861 CASAVA_Build 7 149889638 1I CTTGCCCCCC -/A GCTTTTTTTA 3070 het 2112 hom 33 8 13 12 A 0 1 284862 CASAVA_Build 7 149893644 1I CCCCTTTTTT -/A AACTGGAGCT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 2 3 284863 CASAVA_Build 7 149894487 1I TGTATGTCTT -/G TCTCTTACAG 3070 het 3070 hom 52 24 23 5 G 0 1 284864 CASAVA_Build 7 149916855 2D CATTACTGGG TA/-- TATATACCCA 3070 het 984 hom 14 2 7 5 TA 4 3 284865 CASAVA_Build 7 149919700 1D37M1I TTTTTTAAAG AAAAAAAACAGCTCCTGGATTCATTGATTTTTTGAAGG-/-AAAAAAACAGCTCCTGGATTCATTGATTTTTTGAAGGT TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 20 14 8 4 N/A 0 0 284866 CASAVA_Build 7 149920579 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTCTC 2720 het 2720 ref 23 14 7 2 T 7 8 284867 CASAVA_Build 7 149922899 2D GTGATGTAGG CA/-- CCCAAGGAAA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 CA 1 0 284868 CASAVA_Build 7 149926160 1D TGGGGAAAAA G/- CAGAACAGAA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 G 1 0 284869 CASAVA_Build 7 149926277 3I ATGAGTTGAG ---/AGA AGAAGGCTTC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AGA 1 2 284870 CASAVA_Build 7 149928989 1I AACCAAAGAC -/A AAAGCCACAT 1401 het 1401 ref 21 16 3 2 A 3 4 284871 CASAVA_Build 7 149930084 1I ACACCTTATA -/C AAAAATTAAT 2625 hom 15 het 6 0 6 0 C 0 1 284872 CASAVA_Build 7 149938149 3I GAGGTCAGAT ---/AGA AGATTATTTA 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 AGA 1 2 284873 CASAVA_Build 7 149940545 1I GAGAAAAGAC -/A GTTTGAGAGA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 0 1 284874 CASAVA_Build 7 149942727 1D AAAATCAAGC A/- TATTCCACAA 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 A 1 0 284875 CASAVA_Build 7 149944822 1D TTGTTACATA G/- GTATACATGT 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 G 2 1 284876 CASAVA_Build 7 149952505 12D GGACTGGAAC TTGCAATTCTCT/------------ TTGCTACTGT 3070 het 3070 ref 31 16 14 4 TTGCAATTCTCT 1 0 284877 CASAVA_Build 7 149955472 1I AAAGGCAATG -/C CAATGAGATA 3070 hom 123 het 42 0 42 0 C 1 2 284878 CASAVA_Build 7 149962613 9I TCTCTATGCT ---------/AATGTCTTA AACACAGCAT 3070 hom 87 het 30 0 29 3 AATGTCTTA 0 1 284879 CASAVA_Build 7 149964624 1D CATTTCATCT G/- CAGAGACAAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 G 1 0 284880 CASAVA_Build 7 149971863 1D TATCACTTCA C/- GGGTACTGCA 3070 het 3070 ref 51 29 17 7 C 1 0 284881 CASAVA_Build 7 149972986 2I GGAGGGATAG --/CA TTAGGAGATA 3070 hom 105 het 40 0 35 6 CA 0 1 284882 CASAVA_Build 7 149973087 1I TGCACATGTA -/C CCTGAAACTT 3070 hom 45 het 30 0 16 14 C 2 3 284883 CASAVA_Build 7 149974808 1I ATGAACTACT -/A TAAAAATAGG 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 A 0 1 284884 CASAVA_Build 7 149975657 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 11 10 284885 CASAVA_Build 7 149976338 1I AGCAAACAAA -/T TATGACAATT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 1 2 284886 CASAVA_Build 7 149976992 2D TCCAGGAGCC CA/-- GAGACTAAGA 3070 het 3070 ref 36 16 13 9 CA 1 0 284887 CASAVA_Build 7 149978185 1D CACAGAACGA T/- TTTTTAGTCC 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 6 5 284888 CASAVA_Build 7 149978488 2D CTTAGGGAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 36 6 11 20 T 14 12 284889 CASAVA_Build 7 149978647 1I TTATCCCTCG -/C CCCCCTCCCA 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 C 5 6 284890 CASAVA_Build 7 149979369 1I TTAGATGGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 8 9 284891 CASAVA_Build 7 149983773 1I CGGGCATTGT -/C CCCTGCCTAT 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 C 3 4 284892 CASAVA_Build 7 149986246 5I TGACAAAAGA -----/AAAAG AAAAGTTTAT 2526 het 2526 ref 24 15 7 2 AAAAG 1 2 284893 CASAVA_Build 7 149987365 1I TCTGTCACAG -/C CCAGTGTCCA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 C 2 3 284894 CASAVA_Build 7 149989043 7D TAAGATATCC AAAGATG/------- AAAGATGAAA 3070 hom 93 het 41 0 35 10 AAAGATG 2 1 284895 CASAVA_Build 7 149989500 13D TATGAGGGAG AGAGAAACGGGCT/------------- AGAGAAACGG 3070 het 3070 ref 47 23 18 11 AGAGAAACGGGCT 2 1 284896 CASAVA_Build 7 149997366 1I TAGCAGATCC -/T TCTATACACT 3070 het 3070 ref 50 22 22 6 T 1 2 284897 CASAVA_Build 7 150001167 17D AGACCTCTTC AAAAAGATCCAAAAAAA/----------------- AAAAAGATCC 3070 het 3070 hom 37 15 20 9 AAAAAGATCCAAAAAAA 1 0 284898 CASAVA_Build 7 150015461 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2031 hom 15 het 6 0 5 1 T 9 10 284899 CASAVA_Build 7 150017959 4I CTTTCCCTTT ----/CTGC CTGAGAATTT 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 CTGC 0 1 284900 CASAVA_Build 7 150027024 1D TGAAAACTGT A/- AGCACAAGAA 3070 het 3070 hom 48 23 23 3 A 2 1 284901 CASAVA_Build 7 150029700 7D CTTCCCCCCC CCCCCCA/------- CCATATTACT 3070 het 617 hom 27 6 15 8 CCCCCCA 1 0 284902 CASAVA_Build 7 150046984 16D CACCCTGTAG GTGGTTATGCCTATTT/---------------- GTGGTTATGC 3070 het 3070 ref 41 20 14 18 GTGGTTATGCCTATTT 2 1 284903 CASAVA_Build 7 150047510 4D AGGAGAGAAA GAGG/---- GAGAGAAAGA 3070 het 3070 hom 29 13 12 6 GAGG 1 0 284904 CASAVA_Build 7 150059182 4I AGAAAATCTC ----/AAAG AATCAAGAAA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 AAAG 0 1 284905 CASAVA_Build 7 150075847 2D GTGCCAAAAG AC/-- AGAAGGCAAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 AC 1 0 284906 CASAVA_Build 7 150079573 1I GAAGAAAAAA -/T GTTTTTGGAA 3070 het 460 hom 17 2 13 2 T 0 1 284907 CASAVA_Build 7 150081971 3D CATCTCTACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1189 hom 28 8 13 7 A 17 14 284908 CASAVA_Build 7 150087301 1I TATTCATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 11 284909 CASAVA_Build 7 150091671 3D CTGTACCTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 23 1 13 9 T 17 14 284910 CASAVA_Build 7 150095249 1D AGGCTGGGGG T/- TTTTTAAGGG 3070 hom 103 het 39 0 34 5 T 6 5 284911 CASAVA_Build 7 150104565 1I TTTAATTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 103 het 41 0 35 6 A 9 10 284912 CASAVA_Build 7 150108965 5I TGATCTGCGG -----/TTTGA TTTAAGTTTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTTGA 0 1 284913 CASAVA_Build 7 150109932 1D CACCCACCCA C/- CCCCAATTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 3 C 5 4 284914 CASAVA_Build 7 150111204 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 17 1 11 5 A 13 14 284915 CASAVA_Build 7 150112025 17D ACACACAAAA AATCTGTTTGAACTAAT/----------------- AATCTGTTTG 3070 hom 66 het 22 0 23 1 AATCTGTTTGAACTAAT 2 1 284916 CASAVA_Build 7 150113327 1I TCCCCGTCCA -/T GCAATCTGAG 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 T 0 1 284917 CASAVA_Build 7 150122709 1D CCTGGGAGCT C/- CCCCACTGGC 3070 het 2218 hom 25 7 13 5 C 5 4 284918 CASAVA_Build 7 150143564 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1904 het 944 hom 7 2 5 0 A 11 10 284919 CASAVA_Build 7 150146975 2I TTTGCAAACC --/AT ATATATCTGG 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 AT 3 4 284920 CASAVA_Build 7 150158217 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1487 het 930 hom 18 4 6 8 T 13 14 284921 CASAVA_Build 7 150160809 1I CTGAGTAGCT -/G GGATTACAGG 1946 het 1368 hom 11 4 5 2 G 2 3 284922 CASAVA_Build 7 150161408 1D TGGGAGGCTG A/- AACGCACACA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 A 3 2 284923 CASAVA_Build 7 150161981 1D ACACAAAAAA G/- AAACCCAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 24 1 G 1 0 284924 CASAVA_Build 7 150162165 1I AGCCACCTGA -/T TTTTCAACAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 4 5 284925 CASAVA_Build 7 150165176 2I TTTCCTCTCT --/CC GTGGTTTTGA 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 C 0 2 284926 CASAVA_Build 7 150171855 1D ACAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 9 8 284927 CASAVA_Build 7 150173072 5I GTTATCAACT -----/TAAAA TAATAGATTG 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 TAAAA 0 1 284928 CASAVA_Build 7 150194653 1I CTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 8 8 A 13 14 284929 CASAVA_Build 7 150204155 1D TTCTGCGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 T 13 12 284930 CASAVA_Build 7 150244268 1I GGGGGTAAGG -/C CCAGAGGGCA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 C 2 3 284931 CASAVA_Build 7 150252365 2D AAAGAAGAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2049 hom 22 6 12 4 AT 6 5 284932 CASAVA_Build 7 150257402 1D GTTTGGGGGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 9 8 284933 CASAVA_Build 7 150263326 1I CTATGGCCTT -/G GGCAAGCCAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 2 3 284934 CASAVA_Build 7 150279373 1I CTAAGTTCCA -/G GGGCCTCACT 2940 hom 41 het 19 0 10 9 G 3 4 284935 CASAVA_Build 7 150280193 1D GACGAATTAG A/- AAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 28 10 12 7 A 7 6 284936 CASAVA_Build 7 150285556 1I CAGGCCAGCA -/G GCCCAGGGCC 3070 hom 70 het 29 0 21 8 G 1 2 284937 CASAVA_Build 7 150294316 1I AGCCTGGTAA -/G GCTTTGATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 2 284938 CASAVA_Build 7 150297488 3I CTCTGAGGGT ---/GAA GAAGCTGGGA 3070 hom 99 het 41 0 31 10 GAA 1 2 284939 CASAVA_Build 7 150314006 18D GAAGGATAAG GGAAGGCTTCACAAGGGA/------------------ GGAAGGCTTC 3070 hom 110 het 39 0 35 8 GGAAGGCTTCACAAGGGA 1 0 284940 CASAVA_Build 7 150316732 1D TGGGGCTACC A/- GGGGGCGCCC 3070 hom 61 het 24 0 14 10 A 1 0 284941 CASAVA_Build 7 150320169 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 28 4 13 11 A 14 15 284942 CASAVA_Build 7 150330828 9D ATTCCAGCAT TTTATTTTA/--------- TTTGTTTTAT 3070 hom 87 het 31 0 28 6 TTTATTTTA 1 0 284943 CASAVA_Build 7 150339391 1I AAGACCACCC -/T TTGGCCTTGG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 T 2 3 284944 CASAVA_Build 7 150339633 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 645 het 393 hom 4 1 3 0 A 17 16 284945 CASAVA_Build 7 150344836 1I GCCAGGAAGG -/C CTCAGGCTGG 3070 hom 65 het 26 0 19 7 C 1 2 284946 CASAVA_Build 7 150349854 2D ATATTTTAGT AG/-- AGACAGGGTT 2628 het 1706 hom 14 6 7 1 AG 2 1 284947 CASAVA_Build 7 150350857 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 27 8 A 13 12 284948 CASAVA_Build 7 150352541 3D AGGAACAATG ACA/--- ACAACATTAC 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 ACA 3 2 284949 CASAVA_Build 7 150355567 1D TGGGCAATGG A/- AATGTCTCGG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 3 2 284950 CASAVA_Build 7 150355703 2D AAGCACAGCA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 T 11 9 284951 CASAVA_Build 7 150367310 1D CCTGGTGCCT C/- CCCCGGCTGC 1848 het 1848 ref 26 14 6 6 C 5 4 284952 CASAVA_Build 7 150375303 3D GGAGCCGCGC CGT/--- CTTCCTAACC 1949 het 1949 ref 30 14 8 11 CGT 1 0 284953 CASAVA_Build 7 150388230 1I GGGTAAGGTC -/G GGACAAGGGG 3057 hom 33 het 12 0 9 3 G 2 3 284954 CASAVA_Build 7 150390153 10D GGGTGTGAGC GTGTGTGAGT/---------- GTGGAGACTG 1685 het 1685 ref 27 18 7 8 GTGTGTGAGT 1 0 284955 CASAVA_Build 7 150417823 1D GAAGAAGTAC A/- GCCTTCAGCT 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 A 1 0 284956 CASAVA_Build 7 150422249 4I GCATTATTCT ----/GAAA GAAAGGCGGC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 GAAA 1 2 284957 CASAVA_Build 7 150437260 1I TTGCATGCCT -/A AAAGTCCCAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 3 4 284958 CASAVA_Build 7 150473923 1I GGGGGGGGAA -/G AAAAATTCCC 3070 het 2795 hom 32 11 17 4 G 0 1 284959 CASAVA_Build 7 150481570 1D GAAGCAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 9 8 T 13 12 284960 CASAVA_Build 7 150523618 1I AGGGGTCTTT -/C TTCCTCCTTG 3070 het 975 hom 19 4 12 3 C 0 1 284961 CASAVA_Build 7 150525141 1I CCCTAATCTT -/A ACCTGAACCC 3070 het 3070 ref 50 23 16 11 A 1 2 284962 CASAVA_Build 7 150538435 5D GCACCTGGGA GGGGG/----- GGGGGGGGCA 1303 hom 11 het 6 0 3 4 G 13 8 284963 CASAVA_Build 7 150545770 1I TGAGATCGCA -/C CATTGCACTC 3070 het 2115 hom 27 8 9 10 C 1 2 284964 CASAVA_Build 7 150548231 1I CAATATGGTG -/A AACCCCATCT 2816 hom 21 het 9 0 7 2 A 2 3 284965 CASAVA_Build 7 150557912 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 T 11 10 284966 CASAVA_Build 7 150562898 2I AAATCAATTC --/CA GTGTCAGCTA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 CA 0 1 284967 CASAVA_Build 7 150568311 1I GCCCCCATAC -/G GGCCCCAGGG 2691 hom 44 het 21 0 9 12 G 2 3 284968 CASAVA_Build 7 150573267 1I GGCTGCCGAC -/G GCCGCAGCCT 1821 hom 29 het 13 0 8 5 G 1 2 284969 CASAVA_Build 7 150575730 5D ACCCCTCCCA GCCGG/----- GCCCTACTGA 3070 het 3070 ref 29 12 13 5 GCCGG 1 0 284970 CASAVA_Build 7 150577961 1I20M1I TGGGGAGGAG -CCGTGGGCTTTGGAACAAGG-/CCCGTGGGCTTTGGAACAAGGC CCCTTGGGTC 3070 hom 75 het 28 0 24 7 N/A 0 0 284971 CASAVA_Build 7 150580754 1I ACGCTCCGAA -/G GCCAGGCCAG 3070 hom 102 het 37 0 29 8 G 1 2 284972 CASAVA_Build 7 150581614 1I25M1I CGGGGCTGGG -CGCTGGGATCTGAGCATCCCGCTGG-/CCGCTGGGATCTGAGCATCCCGCTGGC CCACAGGGAA 3070 hom 44 het 15 0 14 9 N/A 0 0 284973 CASAVA_Build 7 150581853 1I TGTGGCTCTG -/C CTGGCGGGCA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 C 1 2 284974 CASAVA_Build 7 150581921 1I GGCTGTATGG -/C CCCTGGAGGG 3070 hom 114 het 42 0 37 5 C 3 4 284975 CASAVA_Build 7 150612065 1I AGCCTGGGTG -/A CAGAGCGAGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 0 1 284976 CASAVA_Build 7 150613479 3D ATCCAAAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 1702 het 764 hom 28 7 6 16 A 19 16 284977 CASAVA_Build 7 150614017 1I TGGATTTCAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 9 10 284978 CASAVA_Build 7 150614164 1I CAGAGGTTAG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 284979 CASAVA_Build 7 150619945 1D TAGCTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 462 hom 34 2 21 11 T 12 11 284980 CASAVA_Build 7 150623468 1I TCAGTTTATG -/T TTTTTTATTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 6 7 284981 CASAVA_Build 7 150624070 1D TGGAAAGTGA G/- GGGAACCTGG 3070 hom 48 het 23 0 17 6 G 4 3 284982 CASAVA_Build 7 150625128 1I ATTTTTTTTT -/G TTGGGGGGTA 3070 hom 81 het 33 0 27 7 G 0 1 284983 CASAVA_Build 7 150634701 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 316 hom 29 2 18 9 A 16 15 284984 CASAVA_Build 7 150637273 1I TCAGGGCTGG -/C CCCAGCGGGT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 C 3 4 284985 CASAVA_Build 7 150639964 1I CCAAAAAATG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 8 9 284986 CASAVA_Build 7 150640786 20D GATATGAGTG TGTGAATGTGTGTGAGAGTT/-------------------- TGTGAATGTG 3070 hom 128 het 43 0 41 19 TGTGAATGTGTGTGAGAGTT 1 0 284987 CASAVA_Build 7 150641006 1I GTGGATGTCT -/G GGGGGTGTGT 3070 hom 154 het 58 0 49 9 G 5 6 284988 CASAVA_Build 7 150675438 1I TCTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 9 10 284989 CASAVA_Build 7 150684741 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 77 het 29 0 26 3 T 7 6 284990 CASAVA_Build 7 150688330 1D ATACAGAACA C/- CCTGCCATGC 3070 het 3070 ref 48 27 13 9 C 3 2 284991 CASAVA_Build 7 150691473 1D AGAAAAGGCT A/- AAAAAAAAAA 2842 het 2842 ref 42 16 12 14 A 15 14 284992 CASAVA_Build 7 150693910 1I ATTAAAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 45 1 34 10 T 10 11 284993 CASAVA_Build 7 150716413 2I TTCACAAGGA --/CC CCCCAGGTCA 2965 het 2965 ref 29 14 9 6 C 4 6 284994 CASAVA_Build 7 150716480 1I CTGCAGCGCA -/G GGGCCACCAC 3070 hom 93 het 37 0 29 8 G 3 4 284995 CASAVA_Build 7 150723038 2D GTGAGGAAAC TG/-- AGGCCCACAG 3070 het 3070 hom 47 19 22 7 TG 1 0 284996 CASAVA_Build 7 150724713 1I AGTGGCTGGG -/C CAGGGCACTT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 C 1 2 284997 CASAVA_Build 7 150726447 2D GTGTGTGCAC AT/-- GTGTAAGTTG 3070 hom 141 het 58 0 45 14 AT 1 0 284998 CASAVA_Build 7 150726510 4I TGTATGTGTA ----/TATG TATGTGTGCG 3070 hom 205 het 85 0 69 16 TATG 1 2 284999 CASAVA_Build 7 150731206 1I CCTTGTGGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 25 9 9 7 T 8 9 285000 CASAVA_Build 7 150742769 4I GAGTCTACAG ----/AGAT AGATAGTTGG 3070 het 3070 hom 52 17 27 8 AGAT 1 2 285001 CASAVA_Build 7 150744170 1D ATTAAAAGTA T/- TTAATGTTTG 3070 het 3070 ref 41 22 17 4 T 3 2 285002 CASAVA_Build 7 150747055 1I AAAATCAGCT -/G GGCATGGTGG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 G 2 3 285003 CASAVA_Build 7 150755342 2I TGGTGTTGGG --/GT GGCCAGGCAG 3070 het 2915 hom 30 10 14 6 GT 0 1 285004 CASAVA_Build 7 150756389 1D GTGGCTTCCT G/- GGGGGAACAC 2119 het 2119 ref 20 10 6 5 G 6 5 285005 CASAVA_Build 7 150771536 1D CAACAAACTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 9 8 285006 CASAVA_Build 7 150774011 2I TGTGTGTGCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 83 het 35 0 28 7 TG 5 6 285007 CASAVA_Build 7 150776388 8I CGTGAATGAG --------/TGCATGAA TAAGGGAATA 1769 het 1428 hom 15 5 5 5 TGCATGAA 0 1 285008 CASAVA_Build 7 150778716 1I AGACTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 2802 het 2802 ref 22 10 8 4 A 10 11 285009 CASAVA_Build 7 150786818 1I CTTTTTTTTT -/G TTTGAGACAG 1872 het 1525 hom 13 4 6 3 G 0 1 285010 CASAVA_Build 7 150795556 1I AGTGTCCTCT -/G GACCTCAGGG 3070 hom 80 het 30 0 22 8 G 1 2 285011 CASAVA_Build 7 150797537 1D GCCCGGCCCT C/- CCAGGGAGGA 3070 hom 45 het 25 0 17 9 C 3 2 285012 CASAVA_Build 7 150799349 3D ACATCAGAAC AAT/--- AATTAAAATG 3070 hom 108 het 40 0 37 4 AAT 2 1 285013 CASAVA_Build 7 150802206 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 400 hom 45 1 37 8 T 10 9 285014 CASAVA_Build 7 150819756 1D ACCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 12 6 A 13 12 285015 CASAVA_Build 7 150820587 1D AGTGAGCTGA G/- ATGGCGCCAC 3070 hom 60 het 21 0 18 4 G 1 0 285016 CASAVA_Build 7 150831796 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 840 hom 35 3 27 5 T 7 8 285017 CASAVA_Build 7 150833189 1D TAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 34 6 A 11 10 285018 CASAVA_Build 7 150835427 1I CACATATATA -/T TAGTGTCACT 3070 hom 144 het 58 0 48 10 T 1 2 285019 CASAVA_Build 7 150843088 2I AATAATAGCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 21 0 17 4 A 11 13 285020 CASAVA_Build 7 150844063 5I CACTACCATT -----/TTAAC TTAAGTTGAG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TTAAC 0 1 285021 CASAVA_Build 7 150849414 1I GTGGTGAGTT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 7 8 285022 CASAVA_Build 7 150859578 4D CTGAATCATA TCAT/---- TCAGATTCTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 TCAT 1 0 285023 CASAVA_Build 7 150862542 3D TCCAACCTTG TTC/--- TTCTTTTTCA 3070 hom 90 het 33 0 30 5 TTC 2 1 285024 CASAVA_Build 7 150876917 11I AGGAGAGGGA -----------/CTCCTAAGTTG CTGCCTTGGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CTCCTAAGTTG 0 1 285025 CASAVA_Build 7 150879393 3I TAAAGCAGTA ---/CTT CTTAATTAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 CTT 1 2 285026 CASAVA_Build 7 150890840 12I CAAAAAATTA ------------/GGTGGGTGTGGT GGCGGGCGCC 3070 het 2151 hom 13 5 8 0 GGTGGGTGTGGT 0 1 285027 CASAVA_Build 7 150900261 1D ATTTGTAAAG A/- AACAATTACT 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 A 3 2 285028 CASAVA_Build 7 150905004 1D AATTAACTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 10 9 285029 CASAVA_Build 7 150905190 1I TTCAATGAGA -/C AAACAAGCAT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 C 0 1 285030 CASAVA_Build 7 150913479 4I AAAAACTCTC ----/AGTT AGCCACTAGT 3070 hom 110 het 44 0 35 9 AGTT 0 1 285031 CASAVA_Build 7 150916567 1I ATTTTAGGAG -/A GACGGTTTCG 2004 het 2004 ref 17 12 5 0 A 0 1 285032 CASAVA_Build 7 150923329 1I CATCCAAAAA -/T ATACCAAAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 1 285033 CASAVA_Build 7 150948811 1I TTAATAGATT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 34 het 14 0 12 2 A 7 8 285034 CASAVA_Build 7 150956739 16I GGAGGGAAAA ----------------/AAAAAAGAAAAACCAG ATTGCTATGG 1757 het 1757 ref 18 11 6 2 AAAAAAGAAAAACCAG 0 1 285035 CASAVA_Build 7 150960828 1D TCGCTATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2349 hom 23 7 11 5 T 11 10 285036 CASAVA_Build 7 150964044 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 8 9 285037 CASAVA_Build 7 150964725 1D ATATATATAT A/- TTTTAAATTT 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 A 1 0 285038 CASAVA_Build 7 150976929 5I CAGGATTTTT -----/TTTTC TTTTTTTCCT 3070 het 1450 hom 18 5 9 4 TTTTC 0 1 285039 CASAVA_Build 7 150978321 1I ACCCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 A 14 15 285040 CASAVA_Build 7 151002781 1I TCTGTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 11 12 285041 CASAVA_Build 7 151007922 1I TGTCTCTATT -/A AAAAAAAAAA 2529 het 2529 ref 27 13 8 6 A 13 14 285042 CASAVA_Build 7 151015347 1D CTTAGAAAGC A/- GTCCTGGGGA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 1 0 285043 CASAVA_Build 7 151027165 1D CTCTGACCTC T/- GTCCCCATCC 3070 het 3070 hom 47 19 25 4 T 1 0 285044 CASAVA_Build 7 151035143 4I AACACCTGGT ----/CAGA CAGAGGACAA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 CAGA 1 2 285045 CASAVA_Build 7 151036275 3I AATCTTATTA ---/TCT TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 TCT 0 1 285046 CASAVA_Build 7 151039280 21D AGAGTATGAA GAGTGCTAGGCTGAGAGTACT/--------------------- GAGTGCTAGG 3070 het 3070 ref 59 24 19 25 GAGTGCTAGGCTGAGAGTACT 2 1 285047 CASAVA_Build 7 151063611 1I ATCCACTCTT -/A ACTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 1 2 285048 CASAVA_Build 7 151064403 3D TCTCCAGGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 1888 het 716 hom 26 5 8 13 T 19 16 285049 CASAVA_Build 7 151068466 1D ACCAGTCCTA G/- GGGGTTCCTG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 G 5 4 285050 CASAVA_Build 7 151070247 10D AGCCTGAATC CCATAGGACT/---------- CCAGAGGACC 3070 het 3070 ref 28 15 14 5 CCATAGGACT 1 0 285051 CASAVA_Build 7 151074105 1I AGTGATTTAA -/T TTCTCTTACA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 2 3 285052 CASAVA_Build 7 151075198 1I CATAACTCAG -/T TGGCTGCTGC 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 1 2 285053 CASAVA_Build 7 151081848 1I AGCCCAGGTG -/T TTTGAGACCA 3070 hom 39 het 15 0 12 3 T 3 4 285054 CASAVA_Build 7 151088270 1D TTGTTTATTG T/- TTTTGAAACA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 5 4 285055 CASAVA_Build 7 151095855 1D14M1I AGAACTGGCC AAAAGCTCTGGTTCC-/-GAAGCTCTGGTTCCT TCTTATTCTG 3070 hom 111 het 29 0 37 3 N/A 0 0 285056 CASAVA_Build 7 151096491 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 42 0 36 8 T 9 8 285057 CASAVA_Build 7 151104435 1I GGATTTTCTA -/C CCAAGGACAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 C 2 3 285058 CASAVA_Build 7 151111521 1D GCCCAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 549 hom 25 2 15 8 T 12 11 285059 CASAVA_Build 7 151129441 1I CTTGGCCCCC -/T AGGCTGGGGC 2756 het 2756 ref 32 16 8 8 T 0 1 285060 CASAVA_Build 7 151140955 2D TGCTGGGCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 12 10 285061 CASAVA_Build 7 151143208 7D ACTCCATTCC CCCAACT/------- CCAACCAGAC 3070 het 3070 ref 44 20 22 4 CCCAACT 1 0 285062 CASAVA_Build 7 151147767 10D CTGGAGCCTT ACGGGTGAAA/---------- ACCGGTCCCC 3070 het 3070 hom 48 22 26 1 ACGGGTGAAA 1 0 285063 CASAVA_Build 7 151151264 1I TGTATCAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 9 10 285064 CASAVA_Build 7 151153077 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 54 het 20 0 19 5 A 7 6 285065 CASAVA_Build 7 151162527 1I GTTTCTGTTT -/A AAATAAAGGC 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 A 3 4 285066 CASAVA_Build 7 151173117 1D TTCCCAGCTG C/- CCCCCACATC 3070 het 2475 hom 34 9 17 8 C 6 5 285067 CASAVA_Build 7 151173495 1I TGGGGCCCAG -/C CCTCCAGGTG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 2 3 285068 CASAVA_Build 7 151177206 1I CTGCCTGGCA -/G GCCGCAGGCC 3070 hom 81 het 30 0 26 4 G 1 2 285069 CASAVA_Build 7 151190215 1I CAGGATGCTG -/T TACTAGTCAA 3070 hom 90 het 36 0 29 7 T 1 2 285070 CASAVA_Build 7 151191922 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 514 hom 28 2 21 5 A 14 13 285071 CASAVA_Build 7 151193375 2D GCCAAGCCAG CC/-- CCAACCACGA 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 C 4 2 285072 CASAVA_Build 7 151197105 1I AGGTTTTATT -/A GGGGGGGGCA 3070 het 277 hom 47 1 38 8 A 0 1 285073 CASAVA_Build 7 151203299 1D TGGAGACCCG C/- CCCTGGACTC 3070 hom 44 het 17 0 13 6 C 4 3 285074 CASAVA_Build 7 151207592 1D GCAGGACTTG T/- TTGGGTGTCC 3070 hom 108 het 42 0 36 8 T 3 2 285075 CASAVA_Build 7 151225539 1D CCAAACACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 10 9 285076 CASAVA_Build 7 151228000 11D ACGTAAAAGC CCATGTCCCCG/----------- CAATGACCCA 3070 hom 93 het 35 0 32 6 CCATGTCCCCG 1 0 285077 CASAVA_Build 7 151231578 1I GCTTAGAGAC -/A GGGGGGGTAG 3070 hom 106 het 47 0 35 12 A 0 1 285078 CASAVA_Build 7 151245200 1D TTCTTTTTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 19 6 C 1 0 285079 CASAVA_Build 7 151250550 1D AAAAGAAACA G/- GGGTTCCAAT 3070 hom 55 het 22 0 19 3 G 4 3 285080 CASAVA_Build 7 151250880 2I TGGTGAAACC --/CT GTTTCTAATA 3070 hom 26 het 13 0 11 2 CT 0 1 285081 CASAVA_Build 7 151251049 1D AGACTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 23 0 16 7 A 16 15 285082 CASAVA_Build 7 151265350 1I AGTGTCTGCA -/G GGGGTAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 G 4 5 285083 CASAVA_Build 7 151276047 2D ATGTGTGTGT GA/-- GTGTGTATGT 3070 het 3070 ref 65 38 18 12 GA 1 0 285084 CASAVA_Build 7 151276108 4D TATTGTATGC ATGT/---- ATGTGTGTAT 698 het 698 ref 76 46 7 25 ATGT 2 1 285085 CASAVA_Build 7 151276206 2D TGTGTATGTA TG/-- TGTGTGTGAA 3070 het 3070 hom 80 34 38 10 TG 5 4 285086 CASAVA_Build 7 151283578 1I TTCCCACCCA -/C CCCCCTTCCA 3070 hom 99 het 38 0 30 8 C 5 6 285087 CASAVA_Build 7 151290623 4I CATGTCTGGG ----/TTTT TTTTGTTTGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 4 8 285088 CASAVA_Build 7 151322883 3D TCACACCATT CTC/--- CTGCCTCAGC 1271 hom 10 het 4 0 4 1 CTC 1 0 285089 CASAVA_Build 7 151329231 1D GCACCAGCCA T/- TTTTTTTTTT 2261 het 2261 ref 23 16 6 1 T 12 11 285090 CASAVA_Build 7 151333242 3D TGGAAAACTT AAC/--- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 14 25 12 AAC 1 0 285091 CASAVA_Build 7 151336270 1D CCATCTCTAC T/- TTTTTTTTTT 1189 het 1189 ref 17 9 4 4 T 11 10 285092 CASAVA_Build 7 151340466 3D ATGCTATACT CTG/--- CTGCTGTGGG 3070 hom 108 het 37 0 36 1 CTG 3 2 285093 CASAVA_Build 7 151394286 1D TGGTGTGCCA T/- TTGCTAAGAC 3070 het 3070 ref 31 12 15 4 T 3 2 285094 CASAVA_Build 7 151398505 2D TGGGAGAGCA TC/-- TGTTTCCTTG 3070 het 3070 hom 52 23 22 7 TC 1 0 285095 CASAVA_Build 7 151403590 1I GAGGCCAAGG -/C CAAGGCTGGC 3070 hom 61 het 26 0 22 4 C 1 2 285096 CASAVA_Build 7 151419153 1I GCAACCTCTG -/C CTCCCGGGTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 2 285097 CASAVA_Build 7 151434024 4D AATATATCTG GTTA/---- GTCTTCAGTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 GTTA 1 0 285098 CASAVA_Build 7 151441938 1D TTAAAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 2574 het 2154 hom 20 9 9 2 T 11 10 285099 CASAVA_Build 7 151452684 1I CTGGGCCTCA -/G GCCTTCAGCC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 G 1 2 285100 CASAVA_Build 7 151459885 1I GAGTGAGGGA -/G GGGTAGTGGG 3070 hom 120 het 43 0 37 6 G 3 4 285101 CASAVA_Build 7 151513556 2D TTTAAAAGAT AG/-- AGGAGTTTCT 2261 het 2261 ref 51 44 5 2 AG 2 1 285102 CASAVA_Build 7 151515213 1D TATTGCAGTT A/- AAAAAAAAAA 2404 het 2404 ref 50 31 6 13 A 12 11 285103 CASAVA_Build 7 151520070 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAGAAGTC 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 A 5 4 285104 CASAVA_Build 7 151541360 1D TTAACAAAAC A/- GTATGGTACT 1368 het 1368 ref 40 31 3 6 A 1 0 285105 CASAVA_Build 7 151541589 1D AAAGCAACTC A/- AAATAGATTA 2988 het 2988 ref 58 47 7 4 A 4 3 285106 CASAVA_Build 7 151557738 5I8M1I TTTCAAGACA -----AGTATATT-/AAAGCAGGATATTA GTACAATATA 2324 het 2324 ref 38 34 5 5 N/A 0 0 285107 CASAVA_Build 7 151558292 1I TATTGTGCAT -/A AGAGTTTTCT 1315 het 1315 ref 50 42 3 5 A 1 2 285108 CASAVA_Build 7 151559428 2D CTGGAAAGAC AG/-- AGTTGAAACA 1596 het 1596 ref 54 47 4 3 AG 2 1 285109 CASAVA_Build 7 151560418 1D ACGTTGTTGA G/- TGAAAAAATA 3070 het 3070 ref 81 60 7 14 G 1 0 285110 CASAVA_Build 7 151563226 2D TTCAAGGGTG TA/-- TATATATATA 2159 het 2159 ref 39 23 5 11 TA 8 7 285111 CASAVA_Build 7 151563474 3I AAATATTTGC ---/TAG TAGTTAGCAA 3070 het 3070 ref 38 26 9 3 TAG 1 2 285112 CASAVA_Build 7 151563537 4D AGTAAGCAAA TATC/---- TATCAATCTT 3070 het 3070 ref 70 43 18 11 TATC 2 1 285113 CASAVA_Build 7 151563695 1D CCAGAGGCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 57 29 14 17 A 10 9 285114 CASAVA_Build 7 151565510 4D GTTTTTTGGG GGTT/---- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 22 9 5 GGTT 1 0 285115 CASAVA_Build 7 151566045 1D26M7D GGTTAAAAAA CAATAGTTCTTCCAGTCATGAAAGAAAATAAAGT/-AATAGTTCTTCCAGTCATGAAAGAAA------- ATAATCTAGA 3070 het 3070 ref 74 57 32 15 N/A 0 0 285116 CASAVA_Build 7 151566622 1D AAAGTGTTTC T/- TGGAAGCTCA 3070 het 3070 hom 72 21 46 8 T 2 1 285117 CASAVA_Build 7 151567676 3D TGAACTAATC TGA/--- TGAAGATGCT 3070 het 3070 ref 40 20 15 7 TGA 2 1 285118 CASAVA_Build 7 151567949 4I AATAAGAATG ----/TGAC TGACTACTCT 2670 het 2670 ref 64 47 7 10 TGAC 1 2 285119 CASAVA_Build 7 151567996 1D CAGTATTTTG A/- GAAAAGCCAC 2657 het 2657 ref 88 69 7 14 A 1 0 285120 CASAVA_Build 7 151570401 1I23M1I TTCTTCACTT -AAAAAAAGTTACTAAAAATTACT-/AAAAAAAAGTTACTAAAAATTACTA AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 71 40 15 24 N/A 0 0 285121 CASAVA_Build 7 151572683 3D TCTGTTACTT CTC/--- CTACCTTATC 3070 het 3070 hom 76 31 44 2 CTC 1 0 285122 CASAVA_Build 7 151574788 2I TAACTGTCAA --/AG GGAAAATACT 3070 het 3070 ref 56 39 9 8 AG 0 1 285123 CASAVA_Build 7 151574845 1D TGCACACGTC T/- TTTGCCATGC 3070 het 3070 ref 50 35 9 7 T 4 3 285124 CASAVA_Build 7 151574962 1D TTTTCACATT A/- AAAAATGATT 3070 het 3070 ref 71 37 30 4 A 6 5 285125 CASAVA_Build 7 151575152 3D TCTCCACTAT TTG/--- TTATCTTGCA 3070 het 3070 ref 46 31 11 9 TTG 1 0 285126 CASAVA_Build 7 151575372 1D AATTCTAAGA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 63 38 19 7 T 7 6 285127 CASAVA_Build 7 151575536 4D GAATAATATC AATA/---- AATAAATATA 3070 het 3070 ref 83 67 8 14 AATA 3 2 285128 CASAVA_Build 7 151577626 1D AGGTAGGGAT A/- AAAGAAAACT 1881 het 1881 ref 38 28 4 6 A 4 3 285129 CASAVA_Build 7 151579216 2D TGTAATCCTA AC/-- ACTTTGGGAG 3041 het 3041 ref 25 14 7 4 AC 2 1 285130 CASAVA_Build 7 151584326 1D AACTCCATAA G/- AAAGAAACTT 3070 het 3070 ref 57 27 22 9 G 1 0 285131 CASAVA_Build 7 151587124 2I TGGGGAAATT --/TC TGTTTGAAAA 762 het 762 ref 46 42 2 3 TC 0 1 285132 CASAVA_Build 7 151589032 5D88M1D32M4D AAGTAGAAAG GAATTATAAGAACAATTTTGCCTCAAAACAGCCAAGCATTTCAATTACAACCATCAATCCAAACAGTTACCTCTATTAAGCTTTTCAAAAGATAACATTTTTATAACACAAAAGAATCCAAAATAAAAAG/-----AAAATAAAAATTTTGCCTCAAAACAGCCAAGCATTTCAATTACAACCATCAATCCAAACAGTTACTTCTATTAAGCTTTTCAAAAGAT-ACATTTTTATAACACAAAAGAATCTAAAATAA---- ATGTGAAAAG 3070 het 3070 ref 90 102 35 95 N/A 0 0 285133 CASAVA_Build 7 151589409 3D GGTCAATTGT AAC/--- AACTTGTTGA 3070 het 3070 ref 61 34 26 1 AAC 2 1 285134 CASAVA_Build 7 151589728 5D CTTTTTCCTT AGGAA/----- AGGAAAGAAA 3070 het 3070 hom 75 33 39 4 AGGAA 2 1 285135 CASAVA_Build 7 151589860 2D TTCCAATGAT AA/-- GTCATTCAGC 3070 het 3070 ref 53 37 12 4 A 2 0 285136 CASAVA_Build 7 151589949 2D CCCACTTCCC AG/-- GTAGCCACAG 3070 het 3070 ref 56 35 12 10 AG 1 0 285137 CASAVA_Build 7 151592710 3I TTTATTCTTC ---/TCA TGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 49 28 14 7 TCA 0 1 285138 CASAVA_Build 7 151595332 2D CAGATGTTCT AA/-- AAACACTCAA 3070 het 3070 ref 63 39 18 6 A 5 3 285139 CASAVA_Build 7 151595516 1I CACATCATTC -/T TTCCTTGTAT 3070 het 3070 ref 61 46 10 5 T 2 3 285140 CASAVA_Build 7 151596351 2I CCCAAATACC --/CA TTTAGTTGTT 3070 het 3070 ref 44 26 16 3 CA 0 1 285141 CASAVA_Build 7 151596665 4I47M2I TGTTTCTTAA ----GACAGTACCAGTATTTATCTTTCAAAATATGTACATTTAAAAATTGA--/TATTGAGAGTACTAGTATTTATCTTTCAAAATATGTACATTGAAAAATTGATC TCTTTTTGCT 2665 het 2665 ref 50 48 6 13 N/A 0 0 285142 CASAVA_Build 7 151598665 1D CCCTGGAATG T/- TCTTTCCTCT 2709 het 2709 ref 91 80 7 6 T 2 1 285143 CASAVA_Build 7 151600081 5I ATTTCCTTAC -----/TTATT TTTAGTTTTA 3070 het 3070 ref 65 37 22 6 TTATT 0 1 285144 CASAVA_Build 7 151600242 5I CACCTCAGTA -----/TTTAG TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 59 30 27 2 TTTAG 0 1 285145 CASAVA_Build 7 151600793 1I TCAACAAAGA -/T AAAGGGTAAT 3070 het 3070 hom 76 32 41 27 T 0 1 285146 CASAVA_Build 7 151601101 2D ATACAATAGT AA/-- AGAGTTATAA 3070 het 3070 ref 33 21 9 5 A 3 1 285147 CASAVA_Build 7 151602168 1D AAAACCTAAA G/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 73 40 21 13 G 1 0 285148 CASAVA_Build 7 151602275 2D GGAACATATA TT/-- TTATTTATGA 3070 het 3070 ref 47 23 9 32 T 4 2 285149 CASAVA_Build 7 151603533 1I TTATATAATA -/T TTATAAGTAT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 2 3 285150 CASAVA_Build 7 151603601 1I TTAGAAACAC -/A AGAAAATAAA 3070 het 3070 ref 54 21 7 26 A 1 2 285151 CASAVA_Build 7 151603666 5I AGGTAATTTT -----/TAATA TTATAACTCC 3070 het 3070 hom 92 26 55 11 TAATA 0 1 285152 CASAVA_Build 7 151605101 2I GAACAAAATT --/TC TGAGATTAAA 3070 het 3070 hom 83 18 44 21 TC 0 1 285153 CASAVA_Build 7 151606025 5D AATATGAAAT AAATG/----- AAATACTTTG 3070 het 3070 ref 49 40 8 5 AAATG 1 0 285154 CASAVA_Build 7 151606615 20I AGGAGCAGCT --------------------/GTATATATATATATATATTC ATATATATGC 3070 het 3070 ref 60 27 15 18 GTATATATATATATATATTC 0 1 285155 CASAVA_Build 7 151608521 5D GTGAGCCGAG ACTGC/----- ACCACTGCAC 3040 het 513 hom 16 1 8 7 ACTGC 1 0 285156 CASAVA_Build 7 151609365 1I AGGAAGACAT -/A AAGTTAGCCA 3070 het 3070 hom 57 27 28 2 A 2 3 285157 CASAVA_Build 7 151610332 6D AAAAAAAGAA AGAAAG/------ AAAAGAAAGT 1437 het 1437 ref 68 36 6 42 AGAAAG 1 0 285158 CASAVA_Build 7 151610895 5D AAATTAAGTT TTTTC/----- TAGAAAATTA 3070 het 3070 ref 88 26 8 62 TTTTC 1 0 285159 CASAVA_Build 7 151611031 3D GGTTAAGAGT TTG/--- TTTTCTTCTC 3070 het 3070 hom 70 26 41 5 TTG 1 0 285160 CASAVA_Build 7 151612526 1D CAAGCAAAGA T/- TTTTTAATAA 3070 het 3070 ref 89 58 25 9 T 6 5 285161 CASAVA_Build 7 151612687 1I GCATCTCCAA -/T AACTGACTTC 3070 het 3070 hom 89 23 36 30 T 0 1 285162 CASAVA_Build 7 151613037 1I GTTAAGAATA -/T TATTTCCAAC 3070 het 3070 ref 88 43 14 31 T 1 2 285163 CASAVA_Build 7 151615476 1D ACATACACCT G/- GGAGTAGTAA 3070 het 3070 ref 42 27 9 7 G 3 2 285164 CASAVA_Build 7 151618059 1D19M3D ATTCTGTCTC AAAACAAACAAAACAAAACAAAC/-AAACAAACAAAACAAAACA--- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 89 25 66 24 N/A 0 0 285165 CASAVA_Build 7 151619957 4D CTTGGCTAAC AAAT/---- AAGCCATTGA 3070 het 3070 ref 82 42 9 35 AAAT 1 0 285166 CASAVA_Build 7 151620206 3D TCTAATTTGT TAA/--- TAATAATATA 3070 het 3070 ref 62 49 7 7 TAA 3 2 285167 CASAVA_Build 7 151625918 1I GGAGGACATT -/A CAACTGTTTT 1831 het 1831 ref 50 44 4 2 A 0 1 285168 CASAVA_Build 7 151663935 1I GGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 10 11 285169 CASAVA_Build 7 151705651 1D TACTCGGGGG A/- GCTGAGTCAG 1636 het 1636 ref 32 22 6 4 A 1 0 285170 CASAVA_Build 7 151706196 6I22M1I TTAAAGCAGT ------GTTTGAGCTGACTCCAATTTTG-/GGCAGGGTTTGAGCTGACTCCAATTTTGA AAAAAAGTTC 3070 het 3070 ref 85 50 34 15 N/A 0 0 285171 CASAVA_Build 7 151707538 1I24M2D CCTAGGCGAC -AGAGTAAGACTCTGTCTCCAAAAAAC/AAGAGTAAGTCTCTGTCTCCAAAAA-- AAACAAACAA 1851 het 1851 ref 27 22 4 9 N/A 0 0 285172 CASAVA_Build 7 151707744 3D AGTAAGACTC CAT/--- CAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 70 24 35 18 CAT 1 0 285173 CASAVA_Build 7 151707795 5I AATAAGTATA -----/AAAGT AAAGACAGAG 3070 het 3070 ref 78 31 21 26 AAAGT 0 1 285174 CASAVA_Build 7 151711159 10I AATTTGTGTG ----------/TGTGTGTGTT TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 72 31 20 21 TGTGTGTGTT 0 1 285175 CASAVA_Build 7 151712005 3D CCAAATTCTG AAA/--- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 60 42 15 4 A 10 7 285176 CASAVA_Build 7 151714228 1I GTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1116 het 1116 ref 50 12 7 31 A 15 16 285177 CASAVA_Build 7 151714771 1D TAAGACTGTA T/- TTTTTATGGA 3070 het 3070 ref 44 28 13 3 T 6 5 285178 CASAVA_Build 7 151716005 5I AAAAATACTT -----/TAAAA TAAAGCTCTA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 TAAAA 0 1 285179 CASAVA_Build 7 151716769 1D64M1D CTACTTAGAC TTTTTTTTTTTTCCTGGGATGGAGTTTTGCTCCTGTTGCTCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCT/-CTTTTTTTTTCCCTGAGATGAAGTTTTGCTCCTGTTGCTCAGGCTGGAGTGCGATGGCGTGATC- TGGGTTACTG 2872 het 2872 ref 41 32 7 20 N/A 0 0 285180 CASAVA_Build 7 151718217 1D45M2D GTGTACCCCC TGAATCTAAAATAAAATAAATTTTTTTTTAAATTGTAAAGAAAAAAAG/-GAATCTAAAATAAAATATTTTTTTTAAAAAATGGTAAAGAAAAAA-- TATTAAATGA 3070 het 3070 ref 45 58 25 10 N/A 0 0 285181 CASAVA_Build 7 151720687 3D CCTCCCCAGC ACA/--- ACAAGAACGG 3070 het 3070 ref 63 34 28 4 ACA 2 1 285182 CASAVA_Build 7 151720763 2D GGCTCAAAAA CT/-- CTTCAGTATC 3070 het 3070 ref 87 54 22 11 CT 2 1 285183 CASAVA_Build 7 151720910 3I CAGCTTTTTT ---/TGG TGAAGGAAGA 3070 het 3070 ref 54 30 20 4 TGG 0 1 285184 CASAVA_Build 7 151722174 5I CTAATATTAT -----/CTTAA CTAACATGCC 3070 het 3070 ref 40 27 10 3 CTTAA 0 1 285185 CASAVA_Build 7 151722459 1D TTCCTGCCTC T/- GGGGCTTTTG 3070 het 3070 ref 62 25 26 12 T 1 0 285186 CASAVA_Build 7 151723133 2D AAGAAAAAAT AA/-- AAGTTTGGTA 2930 het 2930 ref 37 28 8 1 A 4 2 285187 CASAVA_Build 7 151730134 11D GTCTCAAAAA AACAAACAAAC/----------- AAACAAAAGT 3070 het 3070 ref 52 22 36 7 AACAAACAAAC 1 0 285188 CASAVA_Build 7 151732453 1D AAGAGTTCAA G/- ACCAGCCTGG 3070 het 3070 hom 67 12 40 15 G 1 0 285189 CASAVA_Build 7 151732566 3I GCAGGAAAAT ---/CTC CTGAATCCGG 3070 het 3070 hom 96 20 61 20 CTC 0 1 285190 CASAVA_Build 7 151734820 4D33M1I GTGAGCCAAA AAAGGTGTGGGGCCAAAAAAGGGTTTTTTTATTTTTT-/----GTGTGGGGCCAAAAAAGGGTTTTTTTATTTTTTG GGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 84 41 55 56 N/A 0 0 285191 CASAVA_Build 7 151735715 3D GTAGCAAAGG AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 90 17 36 44 A 12 9 285192 CASAVA_Build 7 151737582 6D CTAAAAATAC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1404 het 1404 ref 16 8 4 4 A 18 12 285193 CASAVA_Build 7 151738213 1D ACAGATCACG A/- GGTCAGCAAT 3070 het 3070 hom 69 8 51 10 A 1 0 285194 CASAVA_Build 7 151738274 1D CTAAAAACAC A/- AAAAAATTAG 1223 het 1223 ref 13 8 3 2 A 7 6 285195 CASAVA_Build 7 151738659 2I ATTATATATA --/TT ATGTATAATT 3046 het 1968 hom 20 5 11 4 T 0 2 285196 CASAVA_Build 7 151739224 18I3M10I TATCCTATGA ------------------AAA----------/TATTTTTGTATCAAATATAAACTTTTTGTAT GAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 94 36 42 23 N/A 0 0 285197 CASAVA_Build 7 151740419 2D ACTCCCTCTC AA/-- AAAAAAATTT 26 het 26 ref 71 57 2 15 A 9 7 285198 CASAVA_Build 7 151742394 1I CTAAAAATAC -/A AAATTAGCCG 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 A 3 4 285199 CASAVA_Build 7 151758074 1I CATGCGCCTG -/T TAATCCCAGC 1897 het 1888 hom 14 5 5 4 T 1 2 285200 CASAVA_Build 7 151761446 3I ATTCAAAAAC ---/CTT CTCTTTGCTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 CTT 0 1 285201 CASAVA_Build 7 151771496 1D TACTCCAGCC T/- GGGTGACAAG 3070 het 3070 hom 35 16 19 0 T 1 0 285202 CASAVA_Build 7 151772317 4D AAAGGCAGAC AGAT/---- AGCAAAACAT 3070 het 3070 ref 56 40 12 4 AGAT 1 0 285203 CASAVA_Build 7 151778300 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 9 10 285204 CASAVA_Build 7 151783173 1D TCTGATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2389 hom 20 9 8 3 T 12 11 285205 CASAVA_Build 7 151794843 1I GTTGGCCAGG -/C CGGACTCAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 1 2 285206 CASAVA_Build 7 151812168 1D AAGAGGGACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 411 hom 38 1 30 8 T 10 9 285207 CASAVA_Build 7 151812420 12I AAAGTGCTGG ------------/GATTATAGGTGT GAGCCACCAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 GATTATAGGTGT 0 1 285208 CASAVA_Build 7 151833391 1I CTGGAATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 26 1 20 5 T 10 11 285209 CASAVA_Build 7 151836319 22D GTAGAGACAA GGTTTCACCATGTTGGCCAGGC/---------------------- GGTTTCACCA 3058 hom 33 het 15 0 9 10 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 2 1 285210 CASAVA_Build 7 151838476 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 27 het 11 0 9 2 A 8 9 285211 CASAVA_Build 7 151844948 2I TTAAAAATTA --/TT GAGGATGGCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 0 2 285212 CASAVA_Build 7 151856499 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 17 9 A 13 12 285213 CASAVA_Build 7 151869129 4D GCAAAAAAGA AAAC/---- AAACAAACAG 2961 het 2961 ref 23 15 7 2 AAAC 3 2 285214 CASAVA_Build 7 151870404 2D TGTATAGGCT CA/-- GTTTCACTGA 3070 het 3070 ref 38 22 16 0 CA 1 0 285215 CASAVA_Build 7 151873710 1I GTTTTAAGAC -/T TTTTTTTTTT 2916 het 2916 ref 24 12 7 5 T 11 12 285216 CASAVA_Build 7 151875643 5I GGTGAAACCC -----/CGTGT CGTGTCTACT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CGTGT 1 2 285217 CASAVA_Build 7 151876164 2D ACTCCATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 26 0 21 6 A 13 11 285218 CASAVA_Build 7 151883838 12I5M3D GATCCACCTG ------------TAAATCCA/CCTCGGCCTCCCAAAGT--- GGTTGGATTA 2776 het 2776 ref 22 10 7 6 N/A 0 0 285219 CASAVA_Build 7 151886403 1I CTGCCTGGTA -/T TTTTTAGTAT 2678 het 2678 ref 23 11 7 5 T 5 6 285220 CASAVA_Build 7 151892918 2I GAAAACAAAC --/AG TAAATGTGTA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 AG 0 1 285221 CASAVA_Build 7 151896185 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1880 het 1055 hom 14 4 5 5 A 11 12 285222 CASAVA_Build 7 151897774 1I ATGACTGGAG -/A AAACCAGAAT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 A 3 4 285223 CASAVA_Build 7 151908289 2D GGGGATAGAC TG/-- TGTGGATATC 3070 hom 104 het 42 0 35 8 TG 3 2 285224 CASAVA_Build 7 151932510 3D TAAAAAAAAG AAA/--- AAAAGAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 7 4 285225 CASAVA_Build 7 151935597 4D CCCTCTTTTC TCCT/---- TCCTTCCTTC 3070 hom 121 het 46 0 40 6 TCCT 5 4 285226 CASAVA_Build 7 151936671 11I ATGAGGGGTT -----------/GATGAAGAGCG GAGACAGCAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 GATGAAGAGCG 0 1 285227 CASAVA_Build 7 151947363 1I TATAAATTAT -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 8 285228 CASAVA_Build 7 151950050 22D6M38D TATATATATA TATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATACACACACACACACACATATA/----------------------TGTGTG-------------------------------------- TATATATAAT 1620 het 9 hom 7 0 4 3 N/A 0 0 285229 CASAVA_Build 7 151950788 1D ACATACACAT A/- AAAAATACGA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 6 5 285230 CASAVA_Build 7 151951258 2D TCACTGCAAA CT/-- CTGCCTCCTG 2991 het 2991 ref 20 11 7 3 CT 2 1 285231 CASAVA_Build 7 151959305 1D TGAGACTCCA T/- TTAAAAAAAA 2591 het 2130 hom 17 6 7 4 T 3 2 285232 CASAVA_Build 7 151960689 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 21 0 15 7 A 16 14 285233 CASAVA_Build 7 151966567 5D GATCACGGCT TTTTA/----- TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 20 8 8 5 TTTTA 2 1 285234 CASAVA_Build 7 151968852 5D ATATTGTTTA GTTTT/----- GTTTTTGAAC 3070 het 3070 hom 29 10 19 1 GTTTT 2 1 285235 CASAVA_Build 7 151969672 1D GAGTTATGTC T/- TTTTTTTTTT 2421 het 516 hom 30 6 6 18 T 19 18 285236 CASAVA_Build 7 151971026 1I ATGTATACGT -/A ACATATTTGT 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 A 1 2 285237 CASAVA_Build 7 151972049 2D GAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 AG 9 8 285238 CASAVA_Build 7 151981653 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 T 8 7 285239 CASAVA_Build 7 151984619 3D TTTCAGTAAA CTT/--- TTTTGTTAGT 3070 het 3070 ref 48 21 23 6 CTT 1 0 285240 CASAVA_Build 7 151985979 1D TTTGTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 2897 hom 22 het 19 0 8 11 T 11 10 285241 CASAVA_Build 7 151986734 2I TTTCATTTAC --/CA CAATGTCCTC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 CA 1 2 285242 CASAVA_Build 7 151991861 1D TGTCCCCCTG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 599 hom 19 4 9 6 C 12 11 285243 CASAVA_Build 7 151993812 1I GGTCTTAAGA -/T TTTTATATCC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 4 5 285244 CASAVA_Build 7 151994102 1I AAATACAGCT -/A TTTTTCATAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 0 1 285245 CASAVA_Build 7 152008399 1D AAGTTTCACC A/- TATTGTCCAG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 1 0 285246 CASAVA_Build 7 152015683 6D CATAGTGAAA CCCCAT/------ CTCTACTAAA 2830 het 2067 hom 12 5 7 0 CCCCAT 1 0 285247 CASAVA_Build 7 152017659 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAATATA 3070 hom 60 het 24 0 19 5 A 6 7 285248 CASAVA_Build 7 152020935 5I TTCTTTTCTT -----/TTTTC TTTTCTTTTC 2115 hom 20 het 17 0 7 10 TTTTC 2 3 285249 CASAVA_Build 7 152021671 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2407 het 574 hom 25 5 11 9 T 19 18 285250 CASAVA_Build 7 152024825 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 1616 het 1616 ref 21 10 5 6 A 9 10 285251 CASAVA_Build 7 152027172 1I CAGGGTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 11 12 285252 CASAVA_Build 7 152033724 1I CCCCTCACTC -/T TTTTTTTTTT 2023 het 2023 ref 26 8 7 11 T 14 15 285253 CASAVA_Build 7 152038451 1D ACCTTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 13 12 A 11 10 285254 CASAVA_Build 7 152050297 4I CTGCTGAAGA ----/GGTG GGTGAGGCTG 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 GGTG 1 2 285255 CASAVA_Build 7 152053601 2D TAGCTATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 44 1 33 10 T 14 12 285256 CASAVA_Build 7 152056623 3I TTTGGCTTTG ---/TTT TTATTTTTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 5 285257 CASAVA_Build 7 152060403 1D ATTGGAAGGT A/- CTTCCAGGAG 3070 het 3070 ref 51 27 17 7 A 1 0 285258 CASAVA_Build 7 152060716 2I ATTTTGAAAC --/AG AGTCTCGCTC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AG 1 2 285259 CASAVA_Build 7 152064100 1D AGCCCCTGGA T/- TTTTTTTTTT 2731 het 761 hom 23 5 8 10 T 17 16 285260 CASAVA_Build 7 152066389 2I GGGCGGATCA --/TT TGAGGTCAGG 3070 het 932 hom 20 4 11 5 T 1 3 285261 CASAVA_Build 7 152067244 1D GCCCGGCCAC T/- TTTTTTTTTA 2455 het 1883 hom 18 9 7 2 T 10 9 285262 CASAVA_Build 7 152069764 1D GAAGCAGAGG C/- TCCGTGTGAC 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 C 1 0 285263 CASAVA_Build 7 152072842 1D ATAAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 9 T 13 12 285264 CASAVA_Build 7 152078789 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 14 0 11 3 A 13 12 285265 CASAVA_Build 7 152097682 3I GTATTTAAAC ---/ATA ATCTTTTGCC 3070 het 3070 ref 42 28 9 5 ATA 0 1 285266 CASAVA_Build 7 152097888 1D TCTGATTTGT A/- AAAAAAAAAA 1677 het 1677 ref 15 9 4 2 A 15 14 285267 CASAVA_Build 7 152098983 1I TGGAATTTTA -/T TTTTTTTTTC 1976 het 1976 ref 26 17 5 4 T 9 10 285268 CASAVA_Build 7 152100982 4D TCTTTCAGAA TATG/---- TAGTTAAGGA 1934 het 1934 ref 35 9 4 24 TATG 1 0 285269 CASAVA_Build 7 152101007 1D TACTGTTTCA T/- TTTTTTGAAA 3070 het 1055 hom 33 5 7 21 T 7 6 285270 CASAVA_Build 7 152101171 2D AAGTTAAAAC AA/-- GAGTAAGACT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 2 0 285271 CASAVA_Build 7 152108371 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1764 hom 15 het 7 0 6 1 A 14 16 285272 CASAVA_Build 7 152121193 1I TTCTCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 268 het 214 hom 10 1 2 7 T 10 11 285273 CASAVA_Build 7 152123865 1I GTAGCTCTTG -/T TTTTTTTTTT 1244 het 1244 ref 20 6 4 10 T 14 15 285274 CASAVA_Build 7 152127580 1I AGAGACAGTT -/A AAAGATGGGG 1822 het 1822 ref 14 6 4 4 A 3 4 285275 CASAVA_Build 7 152129025 1D TTAAGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 T 11 10 285276 CASAVA_Build 7 152129918 1I AGAACAAAAA -/G GGGCTTGTTA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 G 3 4 285277 CASAVA_Build 7 152137934 1D TGAATTAAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 T 10 9 285278 CASAVA_Build 7 152141548 1D TTTTCCAGAT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 20 11 2 A 1 0 285279 CASAVA_Build 7 152146475 1D GCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1491 hom 21 5 11 5 T 10 9 285280 CASAVA_Build 7 152167283 1I GCTGCGGGGC -/G GGGGGGTGGC 2695 het 2695 ref 27 14 7 6 G 6 7 285281 CASAVA_Build 7 152170591 1I GCGTGTTCTC -/T TGTTTCCGGC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 1 2 285282 CASAVA_Build 7 152181153 1I GGTTAATCTT -/A ATTTGGGATG 3070 het 3070 ref 29 11 9 9 A 1 2 285283 CASAVA_Build 7 152186049 1D GCCTTAACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 23 11 7 A 10 9 285284 CASAVA_Build 7 152189933 1I GGTAGAAAGA -/T TGAGCTGTGA 3070 het 3070 ref 48 22 18 8 T 1 2 285285 CASAVA_Build 7 152190489 1D ATAGCAAAAT G/- TCAGCAACGT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 G 1 0 285286 CASAVA_Build 7 152198437 4I GTGTCCTGTC ----/TGTT GGGAGCACTT 3070 hom 81 het 31 0 25 6 TGTT 0 1 285287 CASAVA_Build 7 152199642 14I GGCAGCCTTC --------------/CAAGCTGGGGCTGG CCCAGGGTCC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 CAAGCTGGGGCTGG 0 1 285288 CASAVA_Build 7 152201089 1D CGGCCCCCCC G/- CCGCTCAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 G 1 0 285289 CASAVA_Build 7 152202651 2I TTCTGTCCTT --/TA GTAATAGTTT 2851 het 2826 hom 18 8 7 3 TA 0 1 285290 CASAVA_Build 7 152203020 1D AGTGTTTCTA T/- TTTCTCCACA 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 T 4 3 285291 CASAVA_Build 7 152211416 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 hom 33 het 12 0 12 2 T 6 5 285292 CASAVA_Build 7 152212231 1D TGTGACTGGA T/- TTTTTGATAG 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 T 6 5 285293 CASAVA_Build 7 152215496 2I AATCTGTGTG --/TA TATATTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TA 2 3 285294 CASAVA_Build 7 152221926 19D AGTGCCCTGG ACCTCCCAGGGCACCCTGC/------------------- ACCTCCCAGG 2156 hom 28 het 20 0 8 17 ACCTCCCAGGGCACCCTGC 2 1 285295 CASAVA_Build 7 152228251 4I ATCTGCCTGC ----/ACTG ACTGGACTTT 3070 hom 96 het 34 0 28 6 ACTG 1 2 285296 CASAVA_Build 7 152258141 1D ATTAGAACTT A/- ACTTCTTCTA 3070 het 3070 ref 43 21 19 4 A 2 1 285297 CASAVA_Build 7 152258766 47D ATACCTGAGA CTGGGTAAGTTATACACTTGATCTTAGCCAAAAGGCCGAGAAGCGAT/----------------------------------------------- CTGGGTAAGT 2661 het 2661 ref 17 15 6 5 CTGGGTAAGTTATACACTTGATCTTAGCCAAAAGGCCGAGAAGCGAT 1 0 285298 CASAVA_Build 7 152258958 1D CATCTTATGT G/- GGGGGGGGGC 2011 het 188 hom 15 3 5 8 G 10 9 285299 CASAVA_Build 7 152261962 2I GACAGACTTT --/GA CTCTTCATCG 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 GA 0 1 285300 CASAVA_Build 7 152262847 28D ATGCATGATA ACATGCACACACCCATCCCCGGGGACAC/---------------------------- ACATGCGCAC 2110 het 2110 ref 34 20 10 13 ACATGCACACACCCATCCCCGGGGACAC 1 0 285301 CASAVA_Build 7 152263502 4I GAAGATGAGT ----/TTTA TAAAGCAAAC 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 TTTA 0 1 285302 CASAVA_Build 7 152277295 1D21M1I TCTGTGTTGC TGCAAAGGACATGATTACATTC-/-GCAAAGGACATGATTACATTCT TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 33 22 10 5 N/A 0 0 285303 CASAVA_Build 7 152280693 1D ATTTTAAGTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 9 8 285304 CASAVA_Build 7 152288825 5D CTGTAGTCCC AGCTA/----- AGCTACTTAG 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AGCTA 2 1 285305 CASAVA_Build 7 152289672 4I CAAAATAAAA ----/AGAG AGATATAAAT 3070 hom 128 het 47 0 43 4 AG 1 3 285306 CASAVA_Build 7 152290852 20I GTGCTATTGA --------------------/TCGGACACCACCTGCATCCG TCGCACTGGG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TCGGACACCACCTGCATCCG 0 1 285307 CASAVA_Build 7 152297312 4D TATATGTATG TATA/---- TAAGCATATA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 TA 3 1 285308 CASAVA_Build 7 152301298 11D GGTAATTAAA TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 1774 hom 27 8 12 9 T 25 14 285309 CASAVA_Build 7 152305144 3I CCAATTAAAC ---/AAT AACATAATTC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 AAT 0 1 285310 CASAVA_Build 7 152305753 3I CTCCTAGATT ---/TTC TTCAAGTCTC 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 TTC 1 2 285311 CASAVA_Build 7 152337251 1D ATTTCAAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 13 7 T 10 9 285312 CASAVA_Build 7 152352242 2D AATAATAATA AT/-- AAAAAAAAAT 3070 het 698 hom 10 2 8 0 AT 1 0 285313 CASAVA_Build 7 152352959 1D CCTGTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 13 9 A 13 12 285314 CASAVA_Build 7 152369242 1I CTTGGCTTTT -/G CTCAGTTTTG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 G 0 1 285315 CASAVA_Build 7 152376429 1I GATTCTCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 T 9 10 285316 CASAVA_Build 7 152381292 4I TTAAGAAGCA ----/CTCT CTCTCAATGG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 CT 2 4 285317 CASAVA_Build 7 152383916 1D TTAGATAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 T 10 9 285318 CASAVA_Build 7 152387484 8D TTTTTTTTTC TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 3070 het 709 hom 33 9 16 11 TGTT 7 5 285319 CASAVA_Build 7 152388034 1D CTGGTTAAAA G/- GCTGATGTTG 3070 het 3070 ref 41 26 14 1 G 2 1 285320 CASAVA_Build 7 152396287 26D ACAGGCATAC ACACACACACACACACTCTCTCTTTT/-------------------------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 63 40 22 13 ACACACACACACACACTCTCTCTTTT 1 0 285321 CASAVA_Build 7 152403007 1I GGCAGTGATG -/T TTTGTTACTG 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 T 3 4 285322 CASAVA_Build 7 152406140 2I TGCTTCAGTG --/GA GGTAGACATC 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 GA 0 1 285323 CASAVA_Build 7 152412292 1D GTGCCGGGAT C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 50 het 23 0 11 12 C 9 8 285324 CASAVA_Build 7 152419649 1I TTCCTGAAAC -/A GCAGGTGCAG 3070 hom 114 het 44 0 37 7 A 0 1 285325 CASAVA_Build 7 152426430 1D GCAGGTGAGA C/- CCCCCCACAC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 C 7 6 285326 CASAVA_Build 7 152428178 1D CAATCATTCA G/- TTGAAGTTTA 3070 het 3070 hom 43 21 17 7 G 1 0 285327 CASAVA_Build 7 152428421 1D AATCCAGAGA T/- TAAAAACTTG 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 T 2 1 285328 CASAVA_Build 7 152434761 1I GGGGGAGGGA -/G GGGAGACCAG 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 G 3 4 285329 CASAVA_Build 7 152443317 1D GTTATCTTAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 9 8 285330 CASAVA_Build 7 152460336 1D CAGTTTCTAT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 9 8 285331 CASAVA_Build 7 152461862 1D CTTCAACTTT A/- TTTATCTTTA 3070 het 3070 hom 37 21 15 1 A 1 0 285332 CASAVA_Build 7 152465557 2D TGTTAGGTGC AT/-- ATATATATAG 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 AT 5 4 285333 CASAVA_Build 7 152465653 1D TTGCTTTAAA G/- ATTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 G 1 0 285334 CASAVA_Build 7 152469928 4I TTATTTCATC ----/TTTA TTATTCAGAA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 TTTA 0 1 285335 CASAVA_Build 7 152471794 1D CTAATTAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 22 8 13 2 T 9 8 285336 CASAVA_Build 7 152472119 1D CTGTTTAATT A/- AAAAAAATGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 7 285337 CASAVA_Build 7 152474545 1I GAGCTTTGCC -/T TGCAGGGATC 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 T 1 2 285338 CASAVA_Build 7 152475512 5I GTGCCCTCCA -----/AAATC AAATCATGTT 3070 het 3070 hom 52 16 28 8 AAATC 1 2 285339 CASAVA_Build 7 152480605 1I TCATGGGGGG -/A ATTTGCAGAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 1 2 285340 CASAVA_Build 7 152503387 2D ATCACCACAG AC/-- ATGTGAGTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 3 AC 1 0 285341 CASAVA_Build 7 152508510 1D GTTGTTTAAA C/- AACTAATTGT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 C 1 0 285342 CASAVA_Build 7 152514102 1D CCAATTCCCT C/- CTAGACCTCT 3070 hom 141 het 50 0 45 5 C 2 1 285343 CASAVA_Build 7 152518674 1D GGTCTGGTCA T/- TATGACTGCT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 2 1 285344 CASAVA_Build 7 152523606 4D CTCAATAAAT GTTA/---- GTTGTTTTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 8 GTTA 1 0 285345 CASAVA_Build 7 152524812 1D TATTACACTT C/- CCCCCCCCGC 3070 hom 94 het 41 0 32 9 C 9 8 285346 CASAVA_Build 7 152539442 4D CAATGGTATC TTTG/---- TTTGGCTTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 4 TTTG 2 1 285347 CASAVA_Build 7 152540357 1I AAATCTACAG -/A GGCTTAATTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 0 1 285348 CASAVA_Build 7 152540544 1D ATCCATTACT G/- GGGGGGGAGC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 8 7 285349 CASAVA_Build 7 152543248 6D TTTTTTGTTT TTTTTG/------ TTTTTAAACA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 TTTTTG 1 0 285350 CASAVA_Build 7 152584932 2D GCACGGGAGA CT/-- CTGTGCACTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 8 CT 2 1 285351 CASAVA_Build 7 152585006 7D AGGTCGAGTG TGCTCAT/------- TGCTCATTTT 3070 hom 152 het 55 0 48 8 TGCTCAT 2 1 285352 CASAVA_Build 7 152593964 4I TTCTGGATGT ----/TATC TATCATTCAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TATC 1 2 285353 CASAVA_Build 7 152621728 1D AGAGGTGAGT G/- GGGAAGGGGA 3070 het 3070 hom 68 29 33 6 G 4 3 285354 CASAVA_Build 7 152626018 4D GTGTATGTGA GTGT/---- GTGTATGTGT 3070 het 3070 hom 43 14 19 12 GT 4 2 285355 CASAVA_Build 7 152628052 4I AAACAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3052 hom 28 9 10 9 AAAC 2 3 285356 CASAVA_Build 7 152628352 1I ATAGCCTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 10 11 285357 CASAVA_Build 7 152653690 1I TCCCTTCCAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 1604 hom 20 5 10 6 T 8 9 285358 CASAVA_Build 7 152659493 2I GCCAGAGTGG --/GT GTGTATGTGT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 GT 2 3 285359 CASAVA_Build 7 152680065 1I GTTGTAAGTG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 9 285360 CASAVA_Build 7 152684222 5D TTTGCCAGTT TTAAC/----- TTCTGCTCCA 2538 het 842 hom 37 6 12 21 TTAAC 1 0 285361 CASAVA_Build 7 152684965 1I ATTGAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 10 11 285362 CASAVA_Build 7 152687844 1D CACTCCTGGC T/- TTTTTTTTTG 2813 hom 21 het 8 0 8 0 T 10 9 285363 CASAVA_Build 7 152692192 1I CTGCAATTGA -/C TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 C 0 1 285364 CASAVA_Build 7 152695341 5D CCATTTCACT TAGAG/----- TAAATTGCCA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 TAGAG 1 0 285365 CASAVA_Build 7 152695496 4I TAGCGCTCTC ----/TATT TGTTTCACTT 1724 het 1724 ref 35 24 4 7 TATT 0 1 285366 CASAVA_Build 7 152695735 14I CCCTGACTTA --------------/TTTTCTGTACAGTG TTTTCACTAC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 TTTTCTGTACAGTG 0 1 285367 CASAVA_Build 7 152697726 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2889 hom 29 8 13 8 T 9 8 285368 CASAVA_Build 7 152699128 1D CATAGCAAGA C/- CCCCACCCCT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 C 5 4 285369 CASAVA_Build 7 152709707 2D GGTTGATAAC AG/-- AGAGACTGGC 3070 het 3070 ref 37 17 12 9 AG 3 2 285370 CASAVA_Build 7 152735990 2D GTGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 118 het 50 0 36 14 GT 10 9 285371 CASAVA_Build 7 152758612 1D GGTAGGAGTT A/- ATTAAGAAAT 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 2 1 285372 CASAVA_Build 7 152809696 4D AAAGAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 AG 9 7 285373 CASAVA_Build 7 152812284 8I GAATGAATGA --------/ATATATAT GTATATATGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AT 0 4 285374 CASAVA_Build 7 152819491 3D CTCCATATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 41 1 32 9 A 14 11 285375 CASAVA_Build 7 152833785 2I ATATGTATAC --/AT ATATAATACA 1530 hom 10 het 6 0 4 2 AT 2 3 285376 CASAVA_Build 7 152834741 1D CCTTTAGAAG A/- TGTAATGCAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 0 285377 CASAVA_Build 7 152835057 2I GGAGGAGAAT --/TC TCTTTTTCTT 3070 hom 104 het 45 0 35 10 TC 1 2 285378 CASAVA_Build 7 152838478 1D GGGCTTTGAT A/- AAAATGCTGT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 5 4 285379 CASAVA_Build 7 152843761 1I GGGGGAGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 39 1 30 8 A 10 11 285380 CASAVA_Build 7 152843896 1D ATAAAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 38 1 29 9 A 11 10 285381 CASAVA_Build 7 152844746 1D TTACCGGTGT G/- GGCCACGACG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 3 2 285382 CASAVA_Build 7 152845423 2D CATTACGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 13 11 285383 CASAVA_Build 7 152850828 1D CTTTCCTTTC T/- TTTTTTATAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 7 6 285384 CASAVA_Build 7 152862250 2I TCTGTTTATG --/TA TATATATATA 3070 het 420 hom 34 1 28 5 TA 5 6 285385 CASAVA_Build 7 152864111 3I GTTTCTCTCT ---/CTC TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 23 4 CTC 0 1 285386 CASAVA_Build 7 152864978 4D TTCTTTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 2967 hom 36 het 20 0 11 10 T 16 12 285387 CASAVA_Build 7 152865604 3I GCGCACTCAG ---/GCA GCAGGGGCTC 3070 hom 90 het 33 0 29 4 GCA 1 2 285388 CASAVA_Build 7 152866689 1I CTCATCCTCA -/T TGGAGAGAAG 3070 hom 144 het 57 0 47 10 T 1 2 285389 CASAVA_Build 7 152869933 4I AATTACTATC ----/CTGT CTGTTAGTCT 3070 hom 114 het 45 0 36 9 CTGT 1 2 285390 CASAVA_Build 7 152878011 1D AGTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 11 10 285391 CASAVA_Build 7 152881571 2D GCCCTACCTC CA/-- CACACACACA 3070 hom 97 het 41 0 33 9 CA 7 6 285392 CASAVA_Build 7 152886375 1I CTTTTAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 44 1 34 9 T 11 12 285393 CASAVA_Build 7 152890551 10I TGAATTCTTG ----------/TACTGAAAGC CCTTCATAAG 3070 hom 120 het 47 0 40 7 TACTGAAAGC 0 1 285394 CASAVA_Build 7 152898298 2D TTTAATTGAT CA/-- CAGTTTTGTA 3070 hom 51 het 20 0 18 4 CA 2 1 285395 CASAVA_Build 7 152900004 1D CTGGCCCACT G/- GATTTCAGAC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 G 2 1 285396 CASAVA_Build 7 152924036 1D TCACAGCATG T/- TTTTCCCCAC 3070 het 3070 hom 61 22 32 8 T 5 4 285397 CASAVA_Build 7 152934981 1D AAGAAAAAAA G/- AAGAGAGAAT 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 G 1 0 285398 CASAVA_Build 7 152938773 1I AAGAGCCTGG -/C CCCTCCTTCT 3070 het 222 hom 35 1 21 13 C 3 4 285399 CASAVA_Build 7 152938790 2D TCTCTCTCTC TT/-- GCCCCCTCTC 3070 het 886 hom 32 4 9 19 T 2 0 285400 CASAVA_Build 7 152939219 1D TCACTGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 A 11 10 285401 CASAVA_Build 7 152940036 1D CCTCAAAAAA C/- TAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 C 1 0 285402 CASAVA_Build 7 152940565 2D TAAAATTACT AA/-- GAGAGTAGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 A 2 0 285403 CASAVA_Build 7 152942618 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 9 8 285404 CASAVA_Build 7 152943824 1D AGTAAGGACA T/- CAGGAAATGC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 0 285405 CASAVA_Build 7 152944270 1D GATGATTTGC A/- AAAACATTGC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 5 4 285406 CASAVA_Build 7 152945163 18I AGCGGGGGCT ------------------/GACAGCATTGCTGTGGGG GACAGCAGGC 3070 hom 114 het 44 0 37 10 GACAGCATTGCTGTGGGG 0 1 285407 CASAVA_Build 7 152956106 3I TTTCTATGGA ---/AAC AACAAACAAT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 AAC 1 2 285408 CASAVA_Build 7 152958025 1I AAGGATTTGT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 6 7 285409 CASAVA_Build 7 152958265 2D TAGTCATTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AT 8 7 285410 CASAVA_Build 7 152963152 1D GAAACCGTAA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 8 7 285411 CASAVA_Build 7 152963713 1I CTCAGCTCAC -/T TGCCAACTCT 2964 hom 33 het 12 0 10 2 T 1 2 285412 CASAVA_Build 7 152967546 5I CCACCGCTTA -----/CTGTC CTAGATTTAC 3070 hom 86 het 34 0 28 6 CTGTC 0 1 285413 CASAVA_Build 7 152973167 1I ATATTATGAA -/C ATTTACAAAA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 C 0 1 285414 CASAVA_Build 7 152974160 7D TCCTGCCTCA GCCTCCT/------- GCCTCCTGAG 3070 hom 57 het 21 0 19 3 GCCTCCT 2 1 285415 CASAVA_Build 7 152982356 4D ATTTGTACTT ACTC/---- TTTTATGCTA 3070 hom 120 het 42 0 41 5 ACTC 1 0 285416 CASAVA_Build 7 152983347 1D TTTTATTGGG A/- TGGAGAGGAT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 A 1 0 285417 CASAVA_Build 7 152987722 15D CACACAGGCT CACTCACGTGCACAA/--------------- CACTCACGTG 3070 het 3070 ref 52 22 20 19 CACTCACGTGCACAA 2 1 285418 CASAVA_Build 7 153034072 4I TAAAATAGAA ----/AGAT AGACAGAAAC 2229 het 2229 ref 22 13 5 4 AGAT 0 1 285419 CASAVA_Build 7 153045308 2D TTCATCGCAA AC/-- ACACACACAC 1133 het 1133 ref 27 12 3 12 AC 8 7 285420 CASAVA_Build 7 153095134 1D GAAGGAAGTC A/- GGGGTGAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 0 285421 CASAVA_Build 7 153095553 1I ACCCGGTTAA -/T TTTTTTTTTT 1570 het 178 hom 10 1 8 1 T 16 17 285422 CASAVA_Build 7 153095698 1D TGCCCAGCCT A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 8 7 285423 CASAVA_Build 7 153101348 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTA 968 hom 7 het 9 0 3 6 A 1 0 285424 CASAVA_Build 7 153101640 4I TGCATGTCAA ----/AAAG AAAGTTTCAA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 AAAG 1 2 285425 CASAVA_Build 7 153108995 1I TGAATTTTTT -/A AAAAAAATGG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 7 8 285426 CASAVA_Build 7 153114280 7D GTGGTTTTAA TGACATC/------- TGACATCTGA 2967 hom 15 het 9 0 6 3 TGACATC 2 1 285427 CASAVA_Build 7 153118373 1I CAGTAACTAA -/T TTTTTATAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 5 6 285428 CASAVA_Build 7 153119331 1D TATCGATAGA T/- TTTTGCAGTG 3070 hom 72 het 30 0 24 7 T 5 4 285429 CASAVA_Build 7 153120151 4I AGAATCATAC ----/TTTA TTTATTCTTT 3070 het 3070 ref 51 43 7 1 TTTA 1 2 285430 CASAVA_Build 7 153130788 1D AAGCCCCCTA T/- TTTTTATTCT 1863 het 1863 ref 26 20 4 2 T 6 5 285431 CASAVA_Build 7 153133439 1I GGAAGGTAAT -/C CTTGGGTTAA 3070 het 3070 ref 46 28 15 3 C 1 2 285432 CASAVA_Build 7 153134856 6D GGTGAGGAAA GGCAGG/------ GGCAAAAAGA 2585 het 2585 ref 18 9 8 2 GGCAGG 1 0 285433 CASAVA_Build 7 153144331 4D TCCTATGTTA ATAT/---- ATATATTTAG 3070 het 3070 ref 25 13 7 5 AT 5 3 285434 CASAVA_Build 7 153151634 1I ATCAGGAAAG -/T GGAATCATGA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 0 1 285435 CASAVA_Build 7 153155023 3I CATTAAAATT ---/AAC AACCTTTATG 3070 hom 123 het 42 0 42 0 AAC 1 2 285436 CASAVA_Build 7 153156087 10D GGGTCTGAAT CCCACATCAC/---------- CCCACAGCAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 7 CCCACATCAC 1 0 285437 CASAVA_Build 7 153168507 1I ATAAAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 10 11 285438 CASAVA_Build 7 153171043 2D54M4D CACAAGCATG CACACACACACATGCATACACACATGAGTGCATACACGAGTGCATACACACGTGCGCACA/--CACACACACATGCATACACACATGAGTGCATACACGAGTGCATACACACGTGCG---- CACACGAGTG 3070 het 3070 ref 58 47 25 25 N/A 0 0 285439 CASAVA_Build 7 153172001 1I TGGACAGGTG -/C CCCCCCATGC 2044 het 2044 ref 18 10 5 3 C 6 7 285440 CASAVA_Build 7 153177294 1D ATATGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 16 17 T 13 12 285441 CASAVA_Build 7 153188670 2D CCATGCCTTC AA/-- AAAAAAAAAA 1794 het 1794 ref 24 11 7 7 A 14 12 285442 CASAVA_Build 7 153203943 1I TATGAGGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 30 1 14 15 A 15 16 285443 CASAVA_Build 7 153205924 4I AAGGTTTGAC ----/AAAT AAATAAAGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAAT 1 2 285444 CASAVA_Build 7 153211409 1I TTTTTTGTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 9 10 285445 CASAVA_Build 7 153213129 3I GGCCCATGCT ---/TGG TGGTGGGAAA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 TGG 2 3 285446 CASAVA_Build 7 153220337 1D GCTTCTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 T 11 10 285447 CASAVA_Build 7 153223650 1D GTCCTATTGG A/- CACAAAATCT 3070 hom 154 het 59 0 52 8 A 1 0 285448 CASAVA_Build 7 153229253 3I TGAAGCTTCT ---/GAA GTGTGATCCA 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 GAA 0 1 285449 CASAVA_Build 7 153233645 4I GGCAATTTGC ----/TTAG TACTACAGTG 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 TTAG 0 1 285450 CASAVA_Build 7 153237429 9D4M2I23M1D TTGAGGACAA ACATGCTTTTACA--TTTATCTATCTTAAAAAAAACTTA/---------TAAAACTTTATCTATCTTAAAAAAAACTT- AAAACTCACA 3070 het 2342 hom 36 7 16 26 N/A 0 0 285451 CASAVA_Build 7 153247551 1D ATGTGTTTAA T/- AGAGGACTTC 3070 het 3070 hom 52 18 30 4 T 1 0 285452 CASAVA_Build 7 153248231 3I CGAGGGGGTG ---/AGC ACCTGCAGAC 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 AGC 0 1 285453 CASAVA_Build 7 153254824 1D ACAGATTTGT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 34 hom 27 1 14 12 A 8 7 285454 CASAVA_Build 7 153256135 1D GCTTAAAAAC A/- GCAGAAATTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 1 0 285455 CASAVA_Build 7 153259588 1I ATTTCATGGG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 7 8 285456 CASAVA_Build 7 153261701 6D ATTGCCACAT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 1187 het 977 hom 41 10 9 24 TC 12 9 285457 CASAVA_Build 7 153264272 1D AGTGATGCAG A/- AAAAAACACC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 7 6 285458 CASAVA_Build 7 153264829 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 652 hom 17 4 10 3 A 11 10 285459 CASAVA_Build 7 153276636 2D ACTGTTTTTT TA/-- TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 TA 1 0 285460 CASAVA_Build 7 153279145 1I GGCCAAAGTT -/G CCCATTGTCT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 G 0 1 285461 CASAVA_Build 7 153282949 1I AACAAGGCTG -/A AAAGGCAATC 3070 het 3070 hom 59 24 27 8 A 3 4 285462 CASAVA_Build 7 153285051 1D CTTCGGAAAA G/- TGTGTTTGTA 3070 het 1356 hom 35 3 28 4 G 1 0 285463 CASAVA_Build 7 153287947 1D TCATTTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 T 11 10 285464 CASAVA_Build 7 153288650 4D38M2D GCAGCCTGTC TGTGTGTGCACGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGCGGGTGTGTATG/----TGTGCACGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGCGGGTGTGTA-- TGTGTACATG 3070 het 3070 ref 33 34 11 9 N/A 0 0 285465 CASAVA_Build 7 153288737 2I GTGTGCATGC --/GT GTGTGTGTGT 2226 het 2226 ref 38 22 6 10 GT 6 7 285466 CASAVA_Build 7 153289823 8I ACCTAGATCC --------/CTCACATG CTCAGTTCAC 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 CTCACATG 0 1 285467 CASAVA_Build 7 153295085 4D ACCCTGTCTC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 hom 44 14 21 12 ACAA 4 3 285468 CASAVA_Build 7 153296871 1D GTGGAATCGT A/- CATGGTGTCA 3070 het 3070 hom 42 15 18 12 A 1 0 285469 CASAVA_Build 7 153297295 1D GATTCAGCCA T/- TTTTTTTTTC 3011 het 2758 hom 20 9 8 3 T 10 9 285470 CASAVA_Build 7 153297385 1D GACAGTTTTG T/- TCGAGCTGCT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 2 1 285471 CASAVA_Build 7 153300775 1I AAATTGCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 29 2 18 9 T 13 14 285472 CASAVA_Build 7 153316394 2I TGGATACCAC --/TG TGTCCTCTGG 3070 hom 60 het 24 0 17 7 TG 1 2 285473 CASAVA_Build 7 153317268 2I TGTGTGTCAC --/TG TGAGTGGGCG 3070 het 3070 ref 39 21 9 9 TG 1 2 285474 CASAVA_Build 7 153318196 6D GCCAGCTGGA GGTGGG/------ CCTCCTCCAG 1586 hom 10 het 4 0 4 0 GGTGGG 1 0 285475 CASAVA_Build 7 153320075 1I CCATTTTTTT -/A AATACATTAA 3070 het 3070 ref 43 27 10 6 A 2 3 285476 CASAVA_Build 7 153325049 2D ATCTTTATGC CT/-- CTCTCTCTCT 946 het 946 ref 40 27 3 10 CT 10 9 285477 CASAVA_Build 7 153344366 1I AGTTAGGAAG -/T CATTATATAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 0 1 285478 CASAVA_Build 7 153383531 5D AGATACTTGC CAAGG/----- CAAGGCTGAA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 CAAGG 2 1 285479 CASAVA_Build 7 153396799 1D AGCCTCGGCG C/- CCGGGCGGGT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 C 3 2 285480 CASAVA_Build 7 153402381 1D CCAAGACTAA C/- CAAGACAATC 3070 het 3070 ref 49 38 8 3 C 2 1 285481 CASAVA_Build 7 153407367 1I TTGTAAAAAA -/G AGACACATCA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 G 0 1 285482 CASAVA_Build 7 153409347 1I CCAAGCCTTT -/G CAACACCTTA 3070 het 3070 ref 35 23 8 4 G 0 1 285483 CASAVA_Build 7 153419659 1D TGACAGGCAA G/- GGTCCCTAAG 3070 hom 28 het 21 0 11 10 G 3 2 285484 CASAVA_Build 7 153428292 1I ACATACACTG -/A AAAAAAAAAT 2196 het 2196 ref 20 11 6 3 A 9 10 285485 CASAVA_Build 7 153443251 1I GCTGTCCCCC -/A CTTCTGCCAC 2467 het 2467 ref 31 24 6 1 A 0 1 285486 CASAVA_Build 7 153446692 5I CATACAAACC -----/AAACT AAACGTGTAC 3070 hom 31 het 19 0 10 9 AAACT 0 1 285487 CASAVA_Build 7 153478178 1I CTGTTCTAAG -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 6 7 285488 CASAVA_Build 7 153484888 1D GTAATATAAT A/- AATTTGTTCC 3070 het 3070 hom 67 25 37 8 A 3 2 285489 CASAVA_Build 7 153485361 1D CAGGTCCCTT C/- CCAGCTTCTG 2653 het 2653 ref 44 33 6 5 C 3 2 285490 CASAVA_Build 7 153486488 1I TCCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 10 11 285491 CASAVA_Build 7 153497116 1D ATTGCGCTGC T/- GGCTTCTCCA 3070 hom 92 het 32 0 30 2 T 1 0 285492 CASAVA_Build 7 153499831 6I CCACCATTCT ------/TATATA TATATGATAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TA 2 5 285493 CASAVA_Build 7 153506383 1D GCTGACCATC T/- TTTTTTTTTT 1516 het 1516 ref 33 24 5 5 T 13 12 285494 CASAVA_Build 7 153508582 2D TTTAGAGAGA AT/-- ATATATATAT 1944 het 1517 hom 10 6 4 0 AT 7 6 285495 CASAVA_Build 7 153526325 5I15M1I TCACTTCACA -----TATTTTATTATTATT-/TATTTTATTTTATTATTATTA TTTTTTTTGA 3070 hom 39 het 20 0 13 7 N/A 0 0 285496 CASAVA_Build 7 153533800 1I AAAAAAAAAA -/T AAATTAATTA 837 het 422 hom 17 3 5 9 T 0 1 285497 CASAVA_Build 7 153535158 1D CAAAGCCACA T/- TAACACACCC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 2 1 285498 CASAVA_Build 7 153537572 3D AAAAAAAAAA AAC/--- AAAAAACCTT 2973 hom 4 het 30 1 14 17 AAC 1 0 285499 CASAVA_Build 7 153538855 2I TGCAAAAAGG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 322 hom 43 1 29 13 A 9 11 285500 CASAVA_Build 7 153540004 4D CCTGCCCCTT CCTC/---- CCTCATCTCA 3070 hom 90 het 36 0 29 9 CCTC 2 1 285501 CASAVA_Build 7 153544949 2D AAACCTCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 126 het 45 0 42 3 A 12 10 285502 CASAVA_Build 7 153579823 3I CTGCCTTACT ---/GTA GCCATGCTGG 3070 hom 59 het 24 0 19 5 GTA 0 1 285503 CASAVA_Build 7 153579939 1I CACAGACACA -/C CCAGAAACAA 3070 hom 93 het 38 0 30 8 C 2 3 285504 CASAVA_Build 7 153580232 4D ACAATGTCAC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 78 het 47 0 24 23 GT 11 9 285505 CASAVA_Build 7 153584017 2D ATATGTGAAA AC/-- ACACTATGAA 3070 hom 126 het 47 0 43 5 AC 3 2 285506 CASAVA_Build 7 153592705 3D ATGATGGTGT TGA/--- TGATGATGGT 2411 het 2411 ref 80 58 6 19 TGA 3 2 285507 CASAVA_Build 7 153592810 3I ATGATGGTGT ---/TGA TGATGCTGGT 3070 het 3070 ref 92 71 9 12 TGA 1 2 285508 CASAVA_Build 7 153612106 1I GCTGAGTCAG -/T GGGGAGCTGC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 0 1 285509 CASAVA_Build 7 153614825 1I ATTTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 2137 het 2137 ref 25 10 8 7 C 0 1 285510 CASAVA_Build 7 153618666 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 28 3 19 6 A 16 17 285511 CASAVA_Build 7 153622746 2D AGCCCCAGAC AG/-- GGGACAACTC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 AG 1 0 285512 CASAVA_Build 7 153623963 2D CAGTTGCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2215 het 78 hom 22 2 10 10 T 18 16 285513 CASAVA_Build 7 153636333 1I CGTGTTTGCT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 8 9 285514 CASAVA_Build 7 153647263 1D GAAATAAAAC T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 6 285515 CASAVA_Build 7 153648503 1I GTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 G 0 1 285516 CASAVA_Build 7 153661272 1I TTCTCAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 T 10 11 285517 CASAVA_Build 7 153662207 1D CAGAAAATGG A/- AAAAAAAAAA 2911 het 1714 hom 22 6 8 8 A 15 14 285518 CASAVA_Build 7 153663077 1I TCAGTTTTTT -/A CAATGCTTAA 3070 het 3070 ref 48 22 16 10 A 0 1 285519 CASAVA_Build 7 153664618 2D GATTCAAAGT AG/-- AGTTTGTAGT 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 AG 2 1 285520 CASAVA_Build 7 153701733 1D TGTGCAGGCA T/- TTTCCACCAT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 4 3 285521 CASAVA_Build 7 153714963 4I TGAGCATGGG ----/TGTT TGGGCAGGTG 3070 hom 120 het 46 0 40 6 TGTT 0 1 285522 CASAVA_Build 7 153715324 1D ACAGTCCTTG C/- CCTCAGGGAA 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 C 3 2 285523 CASAVA_Build 7 153715961 1D AATTGCCTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 236 hom 47 1 37 10 T 10 9 285524 CASAVA_Build 7 153717470 1D TTTCCTTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 15 4 T 10 9 285525 CASAVA_Build 7 153717738 1D GCATTCTGGC A/- GTCCTCAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 25 1 A 1 0 285526 CASAVA_Build 7 153722427 2D CTGTCTATTT AA/-- AAGTTCTGCC 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 4 2 285527 CASAVA_Build 7 153723965 4D ATTTCTTGAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 34 3 14 18 T 14 10 285528 CASAVA_Build 7 153733459 1D TTGTTACTAT A/- AAAGTATTAC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 4 3 285529 CASAVA_Build 7 153734448 2D CACACGCATG CA/-- CACACACACA 3070 het 71 hom 50 2 31 19 CA 9 8 285530 CASAVA_Build 7 153736787 1D TCTTCCCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 8 11 T 12 11 285531 CASAVA_Build 7 153749181 1I CAATGCCTAA -/T TTTTCAGCAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 4 5 285532 CASAVA_Build 7 153749681 2D GAGGGGATTG GA/-- GACTGGATGA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 GA 2 1 285533 CASAVA_Build 7 153761352 2D GCATTTTTTT TG/-- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 TG 1 0 285534 CASAVA_Build 7 153770503 16D TTGCCTGGCA AAATGAAGATGAAGGG/---------------- AAATTCCAGG 3070 het 3070 ref 38 20 17 8 AAATGAAGATGAAGGG 1 0 285535 CASAVA_Build 7 153771375 1D AAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 10 9 285536 CASAVA_Build 7 153773796 1D ACATGGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 A 13 12 285537 CASAVA_Build 7 153778575 1I AAGAGGCTTC -/A AGGAGCAGTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 1 2 285538 CASAVA_Build 7 153784583 1I AAAAAATGCG -/C CCCCCCCCAC 1920 het 1920 ref 23 14 6 3 C 8 9 285539 CASAVA_Build 7 153787165 3D GATTAAAAAA AAG/--- AAGCCAATGA 3070 het 3070 ref 30 20 7 4 AAG 2 1 285540 CASAVA_Build 7 153800475 4D GTCCTCCTGG AATC/---- AATCCCTCCC 3070 het 3070 ref 45 21 21 6 AATC 2 1 285541 CASAVA_Build 7 153805546 2I4M2I CAGCATTCCA --TGCC--/TGTGCCAA AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 31 1 20 11 N/A 0 0 285542 CASAVA_Build 7 153823408 1D TTTGTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2969 hom 31 9 12 10 T 13 12 285543 CASAVA_Build 7 153829270 1D AACATGATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 A 10 9 285544 CASAVA_Build 7 153829340 1I AATGAGGAGT -/A AAAATGTTAA 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 4 5 285545 CASAVA_Build 7 153829954 6D TCCCCTGCAG AGCCAC/------ AGGAGTGGAG 1968 het 1968 ref 28 20 6 4 AGCCAC 1 0 285546 CASAVA_Build 7 153831688 4I GCCACAACAT ----/TTAA TTAAGATCAG 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 TTAA 1 2 285547 CASAVA_Build 7 153832212 2D TTGCAATAAC AG/-- GTGCTATTTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 AG 1 0 285548 CASAVA_Build 7 153840714 2I TGTAATGGGA --/AG AGGGAGTGAA 3070 het 3070 ref 49 31 17 1 AG 1 2 285549 CASAVA_Build 7 153841458 1D CCAATTAATC T/- TTTATTGGTG 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 4 3 285550 CASAVA_Build 7 153844283 1D CGAACTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2483 hom 31 7 14 11 T 13 12 285551 CASAVA_Build 7 153849987 1I TTTCTAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1822 hom 26 6 16 4 T 10 11 285552 CASAVA_Build 7 153850717 1I CAGACACGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 9 10 285553 CASAVA_Build 7 153862016 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 10 12 6 A 12 13 285554 CASAVA_Build 7 153863106 1I CATTTTTGAC -/A AAAAAAAAAT 1202 het 1202 ref 42 35 3 4 A 9 10 285555 CASAVA_Build 7 153867806 1D TTTTTAAATT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 9 19 1 A 8 7 285556 CASAVA_Build 7 153884946 1D GTGTTAGATG T/- TTTTTTGCAT 3070 hom 104 het 42 0 35 8 T 7 6 285557 CASAVA_Build 7 154007768 1I TCTACAGTCT -/C TGTAGTTTAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 285558 CASAVA_Build 7 154017657 1I GTATCATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 10 11 285559 CASAVA_Build 7 154020253 2I GAGACTCCAT --/TA AAAAAAAAAA 496 het 496 ref 24 11 3 10 TA 0 1 285560 CASAVA_Build 7 154025636 1D TTTTTTAAAG T/- TTTTTTGCTA 3070 hom 27 het 10 0 10 1 T 7 6 285561 CASAVA_Build 7 154027666 2D TTGGTATCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 12 10 285562 CASAVA_Build 7 154032486 1D TATAAGTTAT A/- ATATGCCTTT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 A 2 1 285563 CASAVA_Build 7 154035137 1D AGCGGGTTCC T/- TTTTATTGCG 3070 het 3070 ref 34 16 10 10 T 5 4 285564 CASAVA_Build 7 154035495 11D3M1D ACTTGTCTTA TTGGGCTTATTGTCT/-----------GTC- TATTTGGGCT 3070 het 3070 ref 48 22 22 6 N/A 0 0 285565 CASAVA_Build 7 154037069 1D TTGATGTAGC T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 T 7 6 285566 CASAVA_Build 7 154037407 4I TTAGATAAAC ----/AGAG GGAAGAAGGG 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 AG 0 2 285567 CASAVA_Build 7 154037859 1D TGCAAAATGA G/- GAGGCCTGGA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 G 2 1 285568 CASAVA_Build 7 154046211 10D GCAACACGCA CACACACACG/---------- CACGCACACG 3070 hom 84 het 31 0 25 6 CACACACACG 1 0 285569 CASAVA_Build 7 154070893 2D CCTGGGCAAC AA/-- GAGCAAAACT 3070 hom 58 het 21 0 19 3 A 2 0 285570 CASAVA_Build 7 154071561 4D ACTCCATCTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 A 17 13 285571 CASAVA_Build 7 154075049 4D AAGTCTGTGG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 104 het 42 0 36 6 T 15 11 285572 CASAVA_Build 7 154076189 4D ATAGATAGAT ATAG/---- ATAGATAATA 3070 het 3070 hom 45 21 19 6 ATAG 2 1 285573 CASAVA_Build 7 154076618 2D CAAATACCTG GA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 35 0 31 4 GA 1 0 285574 CASAVA_Build 7 154092487 1I CTGTGGAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 T 9 10 285575 CASAVA_Build 7 154092808 1D CAGCCTCTGC G/- GAGGGTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 G 2 1 285576 CASAVA_Build 7 154103275 2I CTGGCCAGAC --/TG TGGGCTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 TG 1 2 285577 CASAVA_Build 7 154103338 1D TATTTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 25 hom 16 1 8 8 A 9 8 285578 CASAVA_Build 7 154103741 1D AATACATTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 19 8 A 10 9 285579 CASAVA_Build 7 154105566 1D ACCACTTTGG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 193 hom 37 1 30 6 T 9 8 285580 CASAVA_Build 7 154108751 1D ACTCAGTGTA T/- TACTGTCTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 1 285581 CASAVA_Build 7 154109739 1I ACATCAACAT -/G AGTATAGATA 3070 hom 143 het 54 0 47 7 G 0 1 285582 CASAVA_Build 7 154114462 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 77 het 31 0 26 7 A 7 6 285583 CASAVA_Build 7 154114635 6I AAACCCAGCC ------/CTGACA CTCACTGGAT 3070 hom 125 het 49 0 40 9 CTGACA 0 1 285584 CASAVA_Build 7 154115759 1D ACTGACAATT A/- ACCTTCTACT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 2 1 285585 CASAVA_Build 7 154119615 3I CTGAGAGAGT ---/ACA ACGATTCTAC 3070 hom 98 het 36 0 32 4 ACA 0 1 285586 CASAVA_Build 7 154131691 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 42 het 24 0 15 9 A 6 7 285587 CASAVA_Build 7 154134304 1I AGGTTCTTTC -/T TTTTTTATCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 6 7 285588 CASAVA_Build 7 154139392 1I TGCCATTTTT -/A AAAATTTTAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 4 5 285589 CASAVA_Build 7 154139796 2I TCAATACATG --/TA TATACAATGT 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 TA 2 3 285590 CASAVA_Build 7 154140935 8D TTGTGCCTGT GCCTTTGA/-------- GTTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 GCCTTTGA 1 0 285591 CASAVA_Build 7 154146112 1D ATTTATTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 875 hom 31 8 10 14 A 13 12 285592 CASAVA_Build 7 154154850 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 30 0 21 9 T 12 11 285593 CASAVA_Build 7 154162317 3I GAACCATTAG ---/TCC TCATCATCTC 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 TCC 0 1 285594 CASAVA_Build 7 154162942 1D CTCTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 14 13 285595 CASAVA_Build 7 154176678 1D CCTTCCCCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 10 9 285596 CASAVA_Build 7 154178118 1D TTATTTAAAC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 T 7 6 285597 CASAVA_Build 7 154232799 4D TCACCTGGCC CTTA/---- CTTAACAAAC 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 CTTA 2 1 285598 CASAVA_Build 7 154239260 2D GTTAACTATC AT/-- AATTGTTTTC 3070 het 3070 hom 48 16 27 5 AT 1 0 285599 CASAVA_Build 7 154246016 3D CTAACTGTAA AAT/--- AATAATAACC 3070 hom 108 het 41 0 37 9 AAT 3 2 285600 CASAVA_Build 7 154251863 1I ATGTCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 6 7 285601 CASAVA_Build 7 154252148 4I GGAAGGAAGG ----/AAGA AAGGAAGGAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 AAGA 0 1 285602 CASAVA_Build 7 154257124 6D CATCTCAAAG AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 4 AAAAAC 4 3 285603 CASAVA_Build 7 154262499 11D TTTAAACCTA AGCCTCTGGAC/----------- AGTGGAAATA 3070 hom 111 het 36 0 37 1 AGCCTCTGGAC 1 0 285604 CASAVA_Build 7 154270870 3D CTATTTTTAG TTT/--- TTTTTTGAGG 3070 hom 102 het 40 0 34 7 T 9 6 285605 CASAVA_Build 7 154270983 1D ACTTGTTAGC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 124 het 45 0 42 4 T 8 7 285606 CASAVA_Build 7 154273897 1D TGGTTTTTTT C/- CTCTGTAAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 C 2 1 285607 CASAVA_Build 7 154275538 1I TTAAATGAAG -/A GAAACACAGG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 0 1 285608 CASAVA_Build 7 154276353 5I GAAAAGCCTG -----/TTTTC TTTTCTTGTT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 TTTTC 1 2 285609 CASAVA_Build 7 154300049 8D TGTGTGCGTG CACACACA/-------- CACACACACA 3070 het 3070 hom 34 11 12 12 CA 13 9 285610 CASAVA_Build 7 154362540 2I ATTTTCCCTC --/TA TGATAATTTT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 TA 0 1 285611 CASAVA_Build 7 154363093 3I GCTGCACAGC ---/AGG AGCTGAGAGG 3070 het 3070 hom 51 17 25 9 AGG 0 1 285612 CASAVA_Build 7 154374268 3D CAGCAAATAC TTA/--- TTAACAGTGC 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 TTA 2 1 285613 CASAVA_Build 7 154380152 1D CCTCTGTATC G/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 G 1 0 285614 CASAVA_Build 7 154397800 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2070 het 95 hom 15 2 7 6 A 17 15 285615 CASAVA_Build 7 154402287 4I AACATAATTA ----/TATT TATTATGTTA 3070 het 1748 hom 13 4 8 1 TATT 1 2 285616 CASAVA_Build 7 154403038 2I AATATATGCT --/TA TATATATGTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 TA 3 4 285617 CASAVA_Build 7 154405076 1I CTCACTGCAA -/C CTCCACCTCC 3070 het 2579 hom 17 6 8 4 C 1 2 285618 CASAVA_Build 7 154414076 1I CAGTTATTTT -/A AAAAGCAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 23 1 A 4 5 285619 CASAVA_Build 7 154421493 1D TGAATTACAG A/- AATAATTATT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 A 3 2 285620 CASAVA_Build 7 154428358 2D CGACCTGTGT GA/-- GAGAACTTAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 GA 3 2 285621 CASAVA_Build 7 154429214 2D ACACGTGAAC TG/-- TGCAAGGCGG 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 TG 2 1 285622 CASAVA_Build 7 154451747 1I ATTGAGATTT -/C CTTAATTTAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 C 1 2 285623 CASAVA_Build 7 154457181 1I AACTGCCCAG -/T TGGGTTCATC 3070 het 3024 hom 29 8 14 7 T 1 2 285624 CASAVA_Build 7 154470921 2D AAGTGTGTGT GA/-- GAGTGAGAGA 3070 het 3070 hom 39 17 17 7 GA 2 1 285625 CASAVA_Build 7 154476262 1I TCGGTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 1264 het 1264 ref 37 27 3 7 T 8 9 285626 CASAVA_Build 7 154481801 1D CAGTTAATAG A/- AAAAAAGGTG 3070 hom 85 het 32 0 26 6 A 7 6 285627 CASAVA_Build 7 154488135 1D TTGCAACAAG T/- GGTCTGTGAT 3070 het 3070 ref 52 24 22 7 T 1 0 285628 CASAVA_Build 7 154490220 2I GGACAACATG --/GT GTAAAATCCC 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 GT 1 2 285629 CASAVA_Build 7 154490336 4D CTGGATGACA GAGT/---- GAGACTCTGT 2766 het 2362 hom 12 5 7 3 GAGT 1 0 285630 CASAVA_Build 7 154491073 2D GGGTAAGGGA GG/-- GGGGAAGGAG 3070 hom 107 het 44 0 35 10 G 6 4 285631 CASAVA_Build 7 154497925 1I TTTTGGTCCT -/C CTTAATGATG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 1 2 285632 CASAVA_Build 7 154500110 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 943 hom 28 3 12 13 T 15 14 285633 CASAVA_Build 7 154500566 1D CCACATAAAC A/- AAAACATTAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 5 4 285634 CASAVA_Build 7 154505743 5D AGTAAGTCAG TTCCT/----- TTCGAGTCCA 3070 het 3070 ref 36 17 17 4 TTCCT 1 0 285635 CASAVA_Build 7 154507591 3I TTCAAATATT ---/CTC CTCTGTGGTC 3070 het 3070 hom 48 19 28 1 CTC 1 2 285636 CASAVA_Build 7 154509871 1D AATTCTTGAT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 A 9 8 285637 CASAVA_Build 7 154512202 1I GCTAGAATTT -/G GGGACAGAAT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 G 3 4 285638 CASAVA_Build 7 154539438 1D CAGAAATGAC A/- AAGAAATTTC 3070 het 3070 hom 50 19 27 4 A 3 2 285639 CASAVA_Build 7 154576454 1I CAGGCAGTCT -/G GGTTTGAGGT 3070 het 3070 hom 52 24 23 5 G 2 3 285640 CASAVA_Build 7 154590145 3I TCCCAGGGAT ---/AGG AGATTTTGTT 3070 hom 72 het 28 0 23 5 AGG 0 1 285641 CASAVA_Build 7 154590665 6D TGCATCTGGA TGTCAT/------ TGTCATTGGT 3070 hom 78 het 32 0 19 16 TGTCAT 2 1 285642 CASAVA_Build 7 154594724 20D TCCCCCGCCT GAGGTTGGAAGTTAGATCAA/-------------------- GAGGTTCCAC 3070 hom 117 het 44 0 40 9 GAGGTTGGAAGTTAGATCAA 1 0 285643 CASAVA_Build 7 154597775 4D ACATGTGCGT GCGC/---- GCACACACAC 2880 het 1381 hom 38 16 13 9 GC 3 1 285644 CASAVA_Build 7 154613218 4D GTGACAATCA CCCC/---- CCCCCCCCCC 3070 het 42 hom 15 1 11 5 C 15 11 285645 CASAVA_Build 7 154614440 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2642 het 898 hom 13 3 6 5 A 12 11 285646 CASAVA_Build 7 154615038 1I ACCCTAAGCC -/A GGGGCATGCA 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 A 0 1 285647 CASAVA_Build 7 154621691 1D GATAAGGGAG C/- CTGAGAGTCA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 C 2 1 285648 CASAVA_Build 7 154628195 1D GGTCCTATTA C/- CCCCCCATTT 3070 hom 82 het 34 0 23 11 C 7 6 285649 CASAVA_Build 7 154628909 2I23M4I GTGTGTGTCC --GTGTGTGTTAGTGTCTGTGTGTG----/GTGTGTGTGTTAGTGTCTGTGTGTGTGTT TGTGTGTGAG 3070 hom 242 het 78 0 81 10 N/A 0 0 285650 CASAVA_Build 7 154629188 12I CTTTTTCTTC ------------/TTGTAAAGCCCA TTAGTCCGTT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 TTGTAAAGCCCA 0 1 285651 CASAVA_Build 7 154630016 5D TCCATCTCTT TTATC/----- TGAGCATCTA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 TTATC 1 0 285652 CASAVA_Build 7 154630978 2D GGGTGTGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 79 het 37 0 22 15 GT 6 5 285653 CASAVA_Build 7 154631138 2I GGGGGAATGG --/GT GTGTGTGTGT 1706 het 612 hom 22 2 9 11 GT 8 9 285654 CASAVA_Build 7 154642046 1I CCTCTCCAAA -/G GGGTCTCAGA 3070 hom 117 het 44 0 38 6 G 3 4 285655 CASAVA_Build 7 154647929 12I GTGGGCACCA ------------/GACCCTGGCCTG GACCCTGGGC 3070 hom 71 het 30 0 20 10 GACCCTGGCCTG 0 1 285656 CASAVA_Build 7 154648799 2I AGACAGAGAC --/AG AGAGAGATAC 3070 hom 74 het 30 0 24 6 AG 3 4 285657 CASAVA_Build 7 154648910 1D GCCCAGAGAG C/- CCTTCTCCCA 2964 het 2964 ref 30 11 10 9 C 3 2 285658 CASAVA_Build 7 154649895 4D AGAGAAAAAT AGAG/---- AGAGACAGAG 3070 het 1402 hom 37 9 18 10 AG 4 2 285659 CASAVA_Build 7 154654218 6D GCTGGCCCGT CCATGC/------ CCATGCCCAT 3070 hom 47 het 29 0 13 19 CCATGC 4 3 285660 CASAVA_Build 7 154663687 3D GAATTATAGT AGG/--- AGAAGGCAAT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AGG 1 0 285661 CASAVA_Build 7 154665114 2D TCCTTATCCA CT/-- CTCAGTCCTG 3070 het 2951 hom 19 7 10 4 CT 2 1 285662 CASAVA_Build 7 154678379 3D AGAGGAAGAA GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 hom 46 het 21 0 17 6 GAG 7 6 285663 CASAVA_Build 7 154684885 3D CTACCACACA AGG/--- AGGAGGGCAC 3070 hom 66 het 26 0 20 7 AGG 3 2 285664 CASAVA_Build 7 154687118 2D TTCCGTCCCC CT/-- GACTGGAATG 3070 het 3070 hom 33 14 12 8 CT 1 0 285665 CASAVA_Build 7 154689588 1D CCCTCCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2642 hom 27 9 9 9 T 11 10 285666 CASAVA_Build 7 154697508 2D GTGGAACAGT GA/-- GTTTTTCCAC 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 GA 1 0 285667 CASAVA_Build 7 154711765 2D TGAGGACAGC TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TA 8 7 285668 CASAVA_Build 7 154717263 2I GGTGGAAGTC --/AG GGGATAAGGA 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 AG 0 1 285669 CASAVA_Build 7 154718100 17I GGCTGAAGAG -----------------/AATGAACCCCATTATCT AATGAACCCC 3070 het 3070 ref 46 21 18 10 AATGAACCCCATTATCT 1 2 285670 CASAVA_Build 7 154719215 1I AGTGGGTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 10 11 285671 CASAVA_Build 7 154719442 2I GAGAGCGAGA --/CT CTGCCCTGCA 2722 het 2722 ref 31 16 8 7 CT 1 2 285672 CASAVA_Build 7 154731382 1D GGCTGTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 30 2 20 8 A 12 11 285673 CASAVA_Build 7 154822909 1I GTTGGGGGGG -/T GGTGACTGAA 3070 het 1797 hom 31 8 17 6 T 0 1 285674 CASAVA_Build 7 154830004 8D CCGGGACCTT CCTGGGGC/-------- CTTCCTGGGG 2529 hom 27 het 11 0 9 4 CCTGGGGC 1 0 285675 CASAVA_Build 7 154831419 4I GAGCACCCCT ----/ATAG AGAGAGCACC 1988 het 1988 ref 19 13 5 1 ATAG 0 1 285676 CASAVA_Build 7 154832231 2I GAGCACTCAC --/AT AGAGAGAGCA 2871 het 2871 ref 29 19 7 3 AT 0 1 285677 CASAVA_Build 7 154834460 2I TTCAGGTGTC --/TG TGGCTGCGAA 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 TG 1 2 285678 CASAVA_Build 7 154838348 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 66 het 48 0 33 17 TG 6 5 285679 CASAVA_Build 7 154839739 4D CATGCAAGTT CACA/---- CACACACACA 3070 hom 36 het 52 2 45 8 CA 7 5 285680 CASAVA_Build 7 154839937 2D9M2D GCACACAGCA TGCACACACACTT/--CACACACAC-- ACATGGACAG 3070 hom 128 het 52 0 39 23 N/A 0 0 285681 CASAVA_Build 7 154840108 1I GGCATGCACA -/C ACACGGCATG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 C 0 1 285682 CASAVA_Build 7 154840167 8D10M2D CCATGGCATG CACACACTCACACACACTCA/--------CACACACACT-- CTCGCACACA 3070 hom 93 het 36 0 31 12 N/A 0 0 285683 CASAVA_Build 7 154840285 2I CACATACATG --/AC ACACAGACTT 3070 hom 220 het 81 0 74 7 AC 2 3 285684 CASAVA_Build 7 154840411 2D TTGCACACAC AT/-- GACGTGCACA 3070 hom 205 het 74 0 68 8 AT 1 0 285685 CASAVA_Build 7 154841638 6D AGCTAATAGG GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 31 het 56 2 34 23 GT 13 10 285686 CASAVA_Build 7 154845912 1D ACGGACGTCA C/- TTCCCGGGGC 3070 hom 54 het 20 0 19 3 C 1 0 285687 CASAVA_Build 7 154873639 1D GATTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 A 12 11 285688 CASAVA_Build 7 154875961 1I ATGTTTGAGT -/G GGGAAAAAAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 G 3 4 285689 CASAVA_Build 7 154881813 1D TGTCTACCAC A/- AAAAAAAAAA 1697 het 864 hom 26 6 8 13 A 15 14 285690 CASAVA_Build 7 154895160 4I GCCGCACAGA ----/CAAT CAGACTCCCA 3070 hom 96 het 36 0 29 7 CAAT 0 1 285691 CASAVA_Build 7 154895355 4D38M2D TGTCTGTGCT TGTGTGTGAGTGTACTTGTGTGTGCTTGTGTGAGTGTATCTCTG/----TGTGAGTGTACTTGTGTGTGCTTGTCTGAGTGTATCTC-- TGTGTGAGTG 3070 het 3070 ref 79 52 36 14 N/A 0 0 285692 CASAVA_Build 7 154901206 5I ATTAGCAAAA -----/GAAAC GGGAACATTT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 GAAAC 0 1 285693 CASAVA_Build 7 154917162 2D GATGACAATC AG/-- GGGTCCGGGA 3070 het 3070 ref 27 14 12 3 AG 1 0 285694 CASAVA_Build 7 154920148 1I AAAATCCAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 17 8 0 T 9 10 285695 CASAVA_Build 7 154920980 1I CCCCCAGCAA -/C CAAGTTAGAC 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 C 1 2 285696 CASAVA_Build 7 154931472 1D CACTCACAGG T/- TTTTTTTTTT 1074 het 1074 ref 27 14 3 11 T 15 14 285697 CASAVA_Build 7 154936230 1I CTGGGGGGGT -/C CCCCATCGAC 989 hom 21 het 8 0 5 3 C 4 5 285698 CASAVA_Build 7 154941473 2I CCTGGGAGCA --/GC GCTGTGGGAA 2839 het 2635 hom 30 10 10 10 GC 1 2 285699 CASAVA_Build 7 154980901 1I AAAAAATATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 9 10 285700 CASAVA_Build 7 154987749 1D AATGTGAGCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 A 10 9 285701 CASAVA_Build 7 155017922 3I CTAAAAATAC ---/AAA AAAAAATTAG 3070 het 1339 hom 12 3 9 0 A 6 9 285702 CASAVA_Build 7 155018159 1D TTGCTGAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 10 9 285703 CASAVA_Build 7 155019780 26D CACACATGCA CACACACGTGCACAGAGGCACACATG/-------------------------- CACACACGTG 3070 het 3070 ref 49 34 17 17 CACACACGTGCACAGAGGCACACATG 1 0 285704 CASAVA_Build 7 155028050 1D TGCAGAGTAG A/- AAAAAAAGCG 2391 het 2382 hom 16 6 7 3 A 8 7 285705 CASAVA_Build 7 155038628 4D CTCAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 30 het 14 0 10 5 AAAC 4 3 285706 CASAVA_Build 7 155047426 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2161 hom 17 6 10 2 A 10 11 285707 CASAVA_Build 7 155049027 1D AAATTAAAAA T/- ATAAATAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 1 0 285708 CASAVA_Build 7 155059991 4D AAAAAGAATC CAAA/---- CAGTGTGTAT 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 CAAA 1 0 285709 CASAVA_Build 7 155064690 4I CCACTGTACT ----/CCAA CCTGGGTGAT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 CCAA 0 1 285710 CASAVA_Build 7 155071679 1D TATTCACATG C/- CCCCCTGTTC 3070 hom 152 het 57 0 47 13 C 6 5 285711 CASAVA_Build 7 155072223 6I AAATTATAAA ------/TATCTT TATTCCACTC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TATCTT 0 1 285712 CASAVA_Build 7 155075442 1I CTTCCCAGGA -/C CCTAACGGTC 3070 hom 90 het 34 0 28 6 C 2 3 285713 CASAVA_Build 7 155085180 1D CTAACCCAAG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 A 7 6 285714 CASAVA_Build 7 155085397 1D TCTACATAGT A/- GGATTAATGA 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 A 1 0 285715 CASAVA_Build 7 155103517 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1695 het 1695 ref 37 26 4 7 A 13 12 285716 CASAVA_Build 7 155110810 1I AGTGCAGACT -/G GGGGGGAAGG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 G 6 7 285717 CASAVA_Build 7 155126915 1I TTTGGATCTG -/T TTTTTTTTTT 2240 het 1412 hom 42 7 7 28 T 10 11 285718 CASAVA_Build 7 155128615 1I AATTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 36 0 31 5 T 9 10 285719 CASAVA_Build 7 155134079 1D TATTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 T 11 10 285720 CASAVA_Build 7 155139038 2I CCCTCGAGGG --/GA GAGGGGCTGG 2836 het 1852 hom 22 12 7 3 GA 1 2 285721 CASAVA_Build 7 155141831 1I TAACATAACA -/G GGTATGAAAT 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 G 2 3 285722 CASAVA_Build 7 155142419 1D AGGGTGAAGG T/- TTTTTTTTTT 1162 het 1162 ref 33 22 4 7 T 13 12 285723 CASAVA_Build 7 155143329 1D TCATTAAGAA C/- TATTTTTTGG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 1 0 285724 CASAVA_Build 7 155150373 1I ACATTTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 11 12 285725 CASAVA_Build 7 155162677 2D TCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 15 13 285726 CASAVA_Build 7 155163607 5D TTTTATAGTC TCATT/----- TCAATTTAAT 3070 het 3070 hom 40 20 18 4 TCATT 1 0 285727 CASAVA_Build 7 155164963 2I GAGAGACACA --/CT CTGGTAGGTG 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 CT 1 2 285728 CASAVA_Build 7 155168463 1I GTCTTGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 A 12 13 285729 CASAVA_Build 7 155177063 1D ATGATGGTTA C/- GTAAACTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 C 1 0 285730 CASAVA_Build 7 155182866 1D TCTAATTTTT G/- CACAGTTTGC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 G 1 0 285731 CASAVA_Build 7 155183826 1D CATCTCAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 11 10 285732 CASAVA_Build 7 155186631 1I TAAGATAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 A 8 9 285733 CASAVA_Build 7 155188387 1I CAAATGGGGG -/C CTTTCCCCAA 3070 het 3070 ref 56 27 22 7 C 1 2 285734 CASAVA_Build 7 155202957 1D ACGGGGGGTT G/- GGGCTTCAAC 1975 het 1975 ref 22 7 6 9 G 4 3 285735 CASAVA_Build 7 155206594 3D AGCTGTGCTC GTA/--- GTAGTGCATA 3070 het 3070 hom 65 30 31 5 GTA 2 1 285736 CASAVA_Build 7 155207108 3D TTGCTGAGTT ATA/--- ATACCTCTAG 3070 het 3070 ref 40 23 14 4 ATA 2 1 285737 CASAVA_Build 7 155213386 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 9 10 285738 CASAVA_Build 7 155216460 3I GTCTTTGAGT ---/TTC TTCTTCTAAT 3070 het 3070 hom 50 17 26 7 TTC 2 3 285739 CASAVA_Build 7 155220356 2I CATTTAAACA --/TT TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 7 9 285740 CASAVA_Build 7 155227759 4I AAGATTAGAG ----/TTTA TTTATATATT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 TTTA 1 2 285741 CASAVA_Build 7 155230236 2I AGCTGTGTGG --/TT TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 7 9 285742 CASAVA_Build 7 155235829 1I TGTAAACTTA -/C TATAGTCATC 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 C 0 1 285743 CASAVA_Build 7 155237248 1D TGTAATTAGT A/- AAGTAATTTA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 A 3 2 285744 CASAVA_Build 7 155238018 1I TTGAGGTTCT -/A AACCTAAGTG 3070 het 3070 ref 50 27 20 3 A 2 3 285745 CASAVA_Build 7 155242609 3I AAAGGGACAA ---/GTT GTTGAATCGA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 GTT 1 2 285746 CASAVA_Build 7 155249784 1D CTGCTGCTGC G/- TGTCAGCATG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 G 1 0 285747 CASAVA_Build 7 155257624 18D AGTGTTGTTT AAACCCCCCAGGATCCTG/------------------ GAGCACTGAG 3070 het 3070 hom 39 15 22 8 AAACCCCCCAGGATCCTG 1 0 285748 CASAVA_Build 7 155288232 6I TCCTACTTTA ------/TTATTC TTATTCTTAT 3070 het 1354 hom 15 4 8 3 TTATTC 2 3 285749 CASAVA_Build 7 155298530 1D AATTAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 26 2 18 6 T 11 10 285750 CASAVA_Build 7 155298707 1D GCAGGGTGTT G/- GGGGGGGGGC 3070 hom 49 het 21 0 15 6 G 10 9 285751 CASAVA_Build 7 155329820 1I GGTGTTCCCT -/C CCGGGTCCCC 2114 hom 24 het 13 0 9 4 C 2 3 285752 CASAVA_Build 7 155332710 5D GCTGACGCAT CTTTA/----- CTTGGGAAGA 3070 het 3070 ref 32 13 14 6 CTTTA 1 0 285753 CASAVA_Build 7 155343629 1D TGTGCATGTA T/- GAGTGTATAT 3070 het 3070 hom 80 34 34 12 T 1 0 285754 CASAVA_Build 7 155347272 2D ATGACGTCGT CA/-- CAGTCATCTT 3070 hom 92 het 33 0 29 5 CA 2 1 285755 CASAVA_Build 7 155350064 4I ATGCTAGCTT ----/TTTA TTTATTAGGA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 TTTA 1 2 285756 CASAVA_Build 7 155353369 1D TCAGAAGCTC A/- AAGACATCAT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 3 2 285757 CASAVA_Build 7 155357806 1D GGTGGGGGGA G/- GGGGGAGGGA 2341 hom 10 het 10 0 5 5 G 6 5 285758 CASAVA_Build 7 155359857 1I CTAAGATTTT -/A AAATAGTGCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 3 4 285759 CASAVA_Build 7 155359980 2D AGAAAGGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 107 het 44 0 34 11 GA 9 8 285760 CASAVA_Build 7 155362967 1I CATAGTAGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 9 285761 CASAVA_Build 7 155375380 1I GCACTAGGCT -/G GGGGGACAGA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 G 5 6 285762 CASAVA_Build 7 155383107 1D ACTTGTGTTG C/- CCCAGACTGG 3070 het 3070 hom 40 18 14 8 C 4 3 285763 CASAVA_Build 7 155403323 1D AGGTTATTTC T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 7 6 285764 CASAVA_Build 7 155404017 2I TTTGTGCACC --/TG TGTGTTGTAT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 TG 2 3 285765 CASAVA_Build 7 155405025 1I GTGCTGCTGA -/G GGCTGCAGCC 2106 hom 38 het 15 0 8 7 G 2 3 285766 CASAVA_Build 7 155415966 1I ATACAACAAA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 87 het 38 0 29 9 T 8 9 285767 CASAVA_Build 7 155418033 2I TATACGTGCA --/TG TGTGTGTATG 3070 hom 130 het 48 0 41 7 TG 3 4 285768 CASAVA_Build 7 155418135 2D16M4I TGCATGTGTG TATGTGTGTGTGCATGTG----/--TGTATGTGTGCATGTGTGTA TGTGTGTGCA 2059 het 157 hom 12 2 5 5 N/A 0 0 285769 CASAVA_Build 7 155418229 12D TGTGTGTGTA TGTACGTGCATG/------------ TGTGTGTGCC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 TGTACGTGCATG 1 0 285770 CASAVA_Build 7 155418318 6D GTATGTGTGT GTGTGC/------ ATGTGTGCAT 3070 het 83 hom 20 1 19 8 GTGTGC 1 0 285771 CASAVA_Build 7 155419432 3I CATCATCATC ---/ATT ATCACCATCA 3070 hom 62 het 28 0 22 6 ATT 0 1 285772 CASAVA_Build 7 155420499 3I23M3I CTCCTCCTCC ---TCATCACTGTGTAGCCCTCCTCC---/TCATCATCACTGTGTAGCCCTCCTCCTCA TCATCATCAC 3070 hom 152 het 50 0 48 18 N/A 0 0 285773 CASAVA_Build 7 155420656 4I CCTCTTCCTC ----/ACTT ACGGAGTGCT 3070 hom 163 het 59 0 55 4 ACTT 0 1 285774 CASAVA_Build 7 155425657 1I TTACTCCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 11 12 285775 CASAVA_Build 7 155431663 2I TGCATGTCCC --/CA CTCTACCCGG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CA 0 1 285776 CASAVA_Build 7 155433217 2I GGGGTCAGGT --/GG GGGAGGTGGG 3070 hom 42 het 18 0 14 4 G 3 5 285777 CASAVA_Build 7 155462652 2D CTACTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 12 10 285778 CASAVA_Build 7 155466165 1I CACCAGGGTC -/T GAATTGTCCT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 0 1 285779 CASAVA_Build 7 155481405 1I GGCTCACTGC -/A AACTTCTCCT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 2 3 285780 CASAVA_Build 7 155484094 12D GCCTCAGAGG ACAGCTGCGAGA/------------ ACTGCTCTGG 1148 het 1148 ref 17 12 3 5 ACAGCTGCGAGA 1 0 285781 CASAVA_Build 7 155484323 1I GAGCCCGCCA -/G GCAGCGCCAG 3070 hom 62 het 23 0 18 5 G 1 2 285782 CASAVA_Build 7 155514394 1D GACGGGTTTG C/- GGGGGGGTGG 2225 hom 46 het 20 0 13 7 C 1 0 285783 CASAVA_Build 7 155521823 1D GCAGATTCAT C/- CAGGCTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 C 2 1 285784 CASAVA_Build 7 155528306 1D AAGAATTAAT C/- CCCCCCCCCC 1764 het 378 hom 19 5 4 10 C 11 10 285785 CASAVA_Build 7 155586775 3D10M9D13M8D10M3D6M7D23M2I GTGCGTGTGT CTGCTGTGTGTGTCTGGTGTACATGTGTGTGTGTGTCCAGTATGTGTGTGTGTCTGGTGTGTCTGCTGCACATGTGTGTATGTGTGTGCATG--/---CTTTGTGTGT---------ATGTGTGTGTCTG--------GTGTGCGTGT---GTGTGT-------ACATGTGTGTCTGTGTGGGTATGTT TGTGTGTGTC 2964 het 2964 ref 37 113 8 8 N/A 0 0 285786 CASAVA_Build 7 155643687 1D GAAAAATACA T/- TTTTTTTTTT 1658 het 1658 ref 33 26 4 3 T 12 11 285787 CASAVA_Build 7 155657807 1D ATAGAGTAGA G/- GTCTGGTTGA 3070 het 3070 hom 44 18 20 7 G 2 1 285788 CASAVA_Build 7 155682615 1I TGTTAAAACG -/T TATGGCATAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 1 2 285789 CASAVA_Build 7 155705906 1D CACGACATGC A/- AAATGCATCT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 4 3 285790 CASAVA_Build 7 155708465 1D TTTAACTGCA G/- GGAAGGGCAT 3070 het 3070 hom 44 17 21 8 G 3 2 285791 CASAVA_Build 7 155711781 2I ACCATGACCA --/AT ATGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 AT 1 2 285792 CASAVA_Build 7 155716388 1I TATATTTTTT -/A ATAATTTTTG 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 A 1 2 285793 CASAVA_Build 7 155717377 1D CCATCTCTAC T/- TGGAAATACA 3070 het 2267 hom 16 6 8 2 T 2 1 285794 CASAVA_Build 7 155732955 1D CACTAGGACT C/- CCCTTGGAGT 3070 het 3070 ref 50 29 16 6 C 4 3 285795 CASAVA_Build 7 155737871 6I GACAATTAAA ------/ATATAT ATATATATAT 3070 hom 29 het 17 0 9 8 AT 6 9 285796 CASAVA_Build 7 155744832 1I GCTAACATGG -/A AATGTTAGAA 3070 hom 120 het 49 0 41 8 A 2 3 285797 CASAVA_Build 7 155745920 4I GAAAACAAAC ----/AATA AATACGAAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AATA 1 2 285798 CASAVA_Build 7 155746729 1D ATAAGTATGC G/- GGGGGGGGGT 3070 het 225 hom 22 1 11 10 G 10 9 285799 CASAVA_Build 7 155749348 1D GTAAAAACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 10 9 285800 CASAVA_Build 7 155754842 1D TGGTCAGCTC A/- AAAATATATT 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 A 5 4 285801 CASAVA_Build 7 155761751 1D TGATTCTATA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 28 9 13 7 T 9 8 285802 CASAVA_Build 7 155765966 1I TCCTCTAGTT -/A AATCTTTCCC 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 A 2 3 285803 CASAVA_Build 7 155767220 1D GACTTCAGCC T/- TTTTTTAATT 3070 hom 114 het 45 0 39 8 T 7 6 285804 CASAVA_Build 7 155768957 3I GCCTATTCTT ---/TTC TTCTGCAGTA 3070 hom 108 het 37 0 36 1 TTC 1 2 285805 CASAVA_Build 7 155773149 2I TGTATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 TG 7 8 285806 CASAVA_Build 7 155785063 1D GAAAAAGGAG A/- TACAGAAAAC 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 1 0 285807 CASAVA_Build 7 155791545 2D GTTTTGCATG GT/-- GATCTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 17 21 5 GT 1 0 285808 CASAVA_Build 7 155806713 3I AAGTGCCTAG ---/CTT CTTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 32 16 9 7 CTT 5 6 285809 CASAVA_Build 7 155811756 4I AAAAAGAAAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 AG 5 7 285810 CASAVA_Build 7 155816341 1I ATCCAGGGAT -/G GGGGGGTTTA 3070 hom 87 het 33 0 28 5 G 6 7 285811 CASAVA_Build 7 155816840 18D AGGTCAGAGC TGGGAGAAATGTCAGAGT/------------------ TGGGAGAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 14 10 TGGGAGAAATGTCAGAGT 1 0 285812 CASAVA_Build 7 155821484 1D TAATTTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 21 4 12 5 T 12 11 285813 CASAVA_Build 7 155829945 6I ATCACACATT ------/CACACA CACACACACA 3070 het 3070 hom 72 31 28 13 CA 5 8 285814 CASAVA_Build 7 155830430 2I CATTCACACT --/CA CACACAAGCT 3070 hom 169 het 77 0 56 21 CA 3 4 285815 CASAVA_Build 7 155830505 2I24M6I CACAGTCTCA --CTCACAATCACACTCACTCTTACA------/GTCTTACAATCACACTCACTCTTACACACAGT CACAGTCACA 3070 het 3070 ref 62 47 19 13 N/A 0 0 285816 CASAVA_Build 7 155830637 4D10M6D38M6D33M2D CACAGTCACA CACTCACACAGTAACACAGTCACAGTCACTCACATAGTCACACTCACTCACACTCATACACACTCACACAGTCACACTCATTCTGTCACACTCTCACAA/----CACACAGTAA------CACAGTCACTCACATAGTCACACTCACTCACACTCATA------CACACAGTCACACTCATTCTGTCACACTCTCAC-- AGTCACATTC 2572 het 2572 ref 76 95 10 18 N/A 0 0 285817 CASAVA_Build 7 155830799 2D CATACACAGT CA/-- CACACACTGT 390 het 390 ref 59 45 3 12 CA 4 3 285818 CASAVA_Build 7 155903099 9I TCTAGACCTC ---------/TTAGCTGGA CTAGCTGGAT 3070 hom 66 het 35 0 25 10 TTAGCTGGA 0 1 285819 CASAVA_Build 7 155905676 2D CATATTGCGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 28 1 22 6 A 15 13 285820 CASAVA_Build 7 155908274 2D ATCTAGTAGT GC/-- GCCCAGCTTC 3070 hom 120 het 45 0 39 8 GC 2 1 285821 CASAVA_Build 7 155921561 3D AATATAATTA TAT/--- TGTTATTAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 1 TAT 1 0 285822 CASAVA_Build 7 155922859 1D ATTTTTATGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 33 0 25 9 A 9 8 285823 CASAVA_Build 7 155924178 1D AGTAACTATA T/- TTTTTTAATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 7 6 285824 CASAVA_Build 7 155924453 1I AACCCCATCT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 8 9 285825 CASAVA_Build 7 155924630 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 10 9 285826 CASAVA_Build 7 155926304 5D TTTCCACACT CCACA/----- CATTTGCCTC 3070 het 3070 ref 38 17 10 13 CCACA 1 0 285827 CASAVA_Build 7 155934910 9D GTGCTGGTGG TGATAGCAA/--------- TGATGATGGT 2118 het 2118 ref 61 11 18 39 TGATAGCAA 1 0 285828 CASAVA_Build 7 155944887 11D CACAGGGATG CCACAGGAATC/----------- CCACAGGAAT 3070 hom 102 het 44 0 34 13 CCACAGGAATC 2 1 285829 CASAVA_Build 7 155959382 18D ACATAGTGAC TTCTACTAACTCTTTCTA/------------------ TGTGCATATG 3070 hom 93 het 31 0 32 6 TTCTACTAACTCTTTCTA 1 0 285830 CASAVA_Build 7 155965481 2I GTGTGTAAGA --/GT GTGTGCGTGT 3070 het 3070 hom 55 22 26 7 GT 2 3 285831 CASAVA_Build 7 155976342 1I TGGTAGATAC -/A TAAATTCTAT 3070 het 3070 ref 34 22 8 4 A 0 1 285832 CASAVA_Build 7 155983786 2I GCACACGCAG --/AC ACACACACAT 3070 hom 177 het 74 0 57 17 AC 4 5 285833 CASAVA_Build 7 155983944 8I GCACACAGAT --------/AGACACAC AGACACACAC 3070 hom 173 het 68 0 53 15 AGACACAC 1 2 285834 CASAVA_Build 7 155993406 1D TCATGTCCCC T/- TCTCCACGCC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 2 1 285835 CASAVA_Build 7 155996606 1D GTAGCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 35 0 31 4 A 11 10 285836 CASAVA_Build 7 156000979 1I GCTTATTCTT -/C CCCCCACAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 C 5 6 285837 CASAVA_Build 7 156002640 14D TCATGAAGGT TGTGTGAGGGAGGC/-------------- TGTGTGAGGG 3070 het 3070 ref 64 30 19 22 TGTGTGAGGGAGGC 2 1 285838 CASAVA_Build 7 156004555 8D TGCCTGGACA CCTGGACG/-------- CCTGGACGCC 3070 hom 84 het 31 0 29 4 CCTGGACG 2 1 285839 CASAVA_Build 7 156005837 4I GGAGGATGTC ----/AAAG AAAGGACCAA 3070 hom 41 het 18 0 15 3 AAAG 1 2 285840 CASAVA_Build 7 156006385 1D GGCCCATAGG C/- CCCTCCTAAC 3070 hom 135 het 52 0 45 9 C 4 3 285841 CASAVA_Build 7 156012070 13D TCCATCTCAA AAAAAAAAAAAAG/------------- AAAAGAAAAG 3070 hom 51 het 16 0 16 6 AAAAAAAAAAAAG 1 0 285842 CASAVA_Build 7 156012735 5D AAGAAAACTC TTCTT/----- TTCATTTTCA 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 TTCTT 1 0 285843 CASAVA_Build 7 156013922 1I GAAGCTGTGG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 38 13 13 12 T 7 8 285844 CASAVA_Build 7 156015693 1D GTCCACAAGC A/- ACGGCCACTG 3070 hom 72 het 28 0 21 7 A 2 1 285845 CASAVA_Build 7 156017840 4D GGGACTAGTC CTGT/---- CTGTCAGACC 3070 hom 112 het 42 0 36 8 CTGT 2 1 285846 CASAVA_Build 7 156025579 8I CAGCCACTTC --------/TGCTGGGA GCTCCGGGAC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 TGCTGGGA 0 1 285847 CASAVA_Build 7 156028248 1I GACTCCGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 10 11 285848 CASAVA_Build 7 156033767 1I TGATCCCCAC -/G GGCCTTTGGC 3070 hom 77 het 31 0 22 9 G 2 3 285849 CASAVA_Build 7 156053262 1D GTACTAGAAA T/- TCTGCAGCCT 2188 het 2188 ref 17 8 6 3 T 2 1 285850 CASAVA_Build 7 156057499 1I AGATTAAAAG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 A 6 7 285851 CASAVA_Build 7 156057596 2D ATTTCAGGAT GC/-- AGAGACTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 20 5 GC 1 0 285852 CASAVA_Build 7 156070372 1D AACTTCCTAG C/- TTAAAGCTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 C 1 0 285853 CASAVA_Build 7 156072055 1D TTGTCTCTAG T/- TATCAGTAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 2 1 285854 CASAVA_Build 7 156078228 2I CTCTCTGTCC --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 CT 8 9 285855 CASAVA_Build 7 156078535 1D TAATGAGATT A/- GATGACATGT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 1 0 285856 CASAVA_Build 7 156078633 1D CTTTGAACTA T/- TTTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 T 5 4 285857 CASAVA_Build 7 156078771 3D TGTTCTTGGA AAT/--- AATGACATTT 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 AAT 2 1 285858 CASAVA_Build 7 156083134 1D GGGCAAGCTA G/- GGGGGTGCTA 3070 het 2491 hom 22 6 10 7 G 6 5 285859 CASAVA_Build 7 156087549 2D TCAAAAAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2376 hom 24 7 13 5 AC 1 0 285860 CASAVA_Build 7 156087856 1I TTCTTTTCTG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 7 8 285861 CASAVA_Build 7 156099815 2D TAATTTATCT CA/-- CAGAATAATC 3070 het 3070 ref 43 25 16 3 CA 2 1 285862 CASAVA_Build 7 156106212 1I CCTTTCATGG -/A AATTTGCAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 3 285863 CASAVA_Build 7 156107376 2D CTACAAGAGT TA/-- TGTTTATACT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TA 1 0 285864 CASAVA_Build 7 156108257 8I TTACCCAAAA --------/AAGAAAAC AAGAAAACAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAGAAAAC 1 2 285865 CASAVA_Build 7 156108913 2I GATTAAAGAC --/TT TGACATAAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 1 3 285866 CASAVA_Build 7 156116638 2I TGGAAGATTA --/AT AGTCTGAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AT 0 1 285867 CASAVA_Build 7 156135481 2I GGGCCTGAGG --/CT CTTTTTTTCC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 CT 1 2 285868 CASAVA_Build 7 156138385 1D ATGTTATTGT A/- AAAAATTTAA 2956 het 2956 ref 21 11 8 3 A 6 5 285869 CASAVA_Build 7 156138547 4D ACTCACTCAG CACT/---- CACTCACTGA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 CACT 3 2 285870 CASAVA_Build 7 156146666 3I AGGAGTGGGC ---/ATA ATAAGGGGCA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 ATA 1 2 285871 CASAVA_Build 7 156157296 1I TAGAAATAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 8 9 285872 CASAVA_Build 7 156159362 1D CCACATTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 813 hom 39 9 18 12 A 16 15 285873 CASAVA_Build 7 156164979 3I CAGTATCAAA ---/TAT TATGCTTGGT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 TAT 1 2 285874 CASAVA_Build 7 156190058 1I ATCCTAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 22 9 A 11 12 285875 CASAVA_Build 7 156191614 1D AAAAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 13 12 285876 CASAVA_Build 7 156208610 4I CATTTATACT ----/TTAA TTTTGTTTTC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TTAA 0 1 285877 CASAVA_Build 7 156221004 1I AAGAGTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 T 13 14 285878 CASAVA_Build 7 156221824 3I GCTTGCATTC ---/AGT ATTATTTAGT 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 AGT 0 1 285879 CASAVA_Build 7 156248900 1D TAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2389 het 2389 ref 24 10 8 6 A 12 11 285880 CASAVA_Build 7 156259477 1D ATTAATAAGC A/- AAAAAAAAAC 1772 het 1772 ref 32 16 4 12 A 10 9 285881 CASAVA_Build 7 156283434 1I TCCAGCCTTT -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 7 8 285882 CASAVA_Build 7 156285024 3D CATCTCTCTC CTT/--- CTCCTAGGGC 3070 het 3070 hom 49 20 24 7 CTT 1 0 285883 CASAVA_Build 7 156288244 2D CCACCTCCCC CT/-- GATTCCCAGT 2535 het 2535 ref 22 9 9 4 CT 1 0 285884 CASAVA_Build 7 156290276 1I CAGTATCTTT -/A AAAGAACAAA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 3 4 285885 CASAVA_Build 7 156291637 2I ACAATGTCTT --/AC AGTTTATAGT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 AC 0 1 285886 CASAVA_Build 7 156291920 1D TATTTTTTTT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 8 7 285887 CASAVA_Build 7 156292490 1D ACCATATGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 7 T 10 9 285888 CASAVA_Build 7 156293013 1D ACTGGCAATT G/- GTCTCTTCTT 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 G 2 1 285889 CASAVA_Build 7 156295525 1I GTAATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 10 11 285890 CASAVA_Build 7 156296698 1I TAGAATTTTG -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 7 8 285891 CASAVA_Build 7 156297773 2D TTAAACACAC AG/-- AGAGAGAGAG 1257 het 1257 ref 35 24 3 8 AG 9 8 285892 CASAVA_Build 7 156302960 22D AGAGAGAGAG AGAGAGAGAGACAGAGACAGAC/---------------------- AGAGAGACAG 3070 het 3070 ref 37 20 19 5 AGAGAGAGAGACAGAGACAGAC 1 0 285893 CASAVA_Build 7 156307242 4I CCCCAGCCAC ----/CCCT CCCTGTCATT 3070 het 3070 hom 50 15 24 11 CCCT 1 2 285894 CASAVA_Build 7 156310580 3I CTGATATATA ---/TTT TTTAAGTCAA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 3 6 285895 CASAVA_Build 7 156315015 1I GCTTGTACAT -/C CTGCAGAACT 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 C 1 2 285896 CASAVA_Build 7 156319035 9I CAATAGGAGA ---------/GAACCAGTG TTGGATTATC 3070 het 3070 ref 45 24 19 3 GAACCAGTG 0 1 285897 CASAVA_Build 7 156322626 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2282 het 2282 ref 16 8 8 0 A 12 13 285898 CASAVA_Build 7 156330071 1D CACCTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1234 hom 32 6 12 14 A 17 16 285899 CASAVA_Build 7 156331110 1D TGGGTTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 T 11 10 285900 CASAVA_Build 7 156333519 1D ATTCAACACT A/- AAAAAAAAAA 1587 het 1587 ref 37 29 4 4 A 13 12 285901 CASAVA_Build 7 156345026 1D AATTTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 A 11 10 285902 CASAVA_Build 7 156352061 1D TTTCTGGGGA T/- TTTTTTTTTT 1212 het 1212 ref 38 21 4 13 T 15 14 285903 CASAVA_Build 7 156352143 2I TCACTGCAAC --/CT CTGCCTCCCA 2655 het 2655 ref 21 8 7 6 CT 1 2 285904 CASAVA_Build 7 156368490 1D ACTCTGACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 A 10 9 285905 CASAVA_Build 7 156368760 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATTGCTT 3070 het 1921 hom 28 4 20 4 AGG 1 0 285906 CASAVA_Build 7 156370136 1I CCCCATGGAA -/C CTCACTGAAA 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 C 1 2 285907 CASAVA_Build 7 156374819 2D AATTGCATGT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 TA 6 5 285908 CASAVA_Build 7 156375800 3D CTATATTAAA ATT/--- AATAATTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 ATT 1 0 285909 CASAVA_Build 7 156417167 3D5M3D TTCAGTATCA AATATATAATT/---ATATA--- TACTCAAATA 3070 het 3070 ref 36 19 17 2 N/A 0 0 285910 CASAVA_Build 7 156422186 1D ATAGGCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2151 hom 31 7 18 7 T 12 11 285911 CASAVA_Build 7 156428503 1I AGTGGCAAAG -/C CCTGCGGGAT 3070 hom 59 het 23 0 17 6 C 2 3 285912 CASAVA_Build 7 156428940 9I ACTACTCTGT ---------/GTTCACGTG GTGCATCTGG 3070 hom 117 het 45 0 32 14 GTTCACGTG 0 1 285913 CASAVA_Build 7 156433024 10D CTGGAGCGGG GGGAAGCGGC/---------- GGGAAGCGGC 2938 hom 62 het 29 0 16 16 GGGAAGCGGC 2 1 285914 CASAVA_Build 7 156433383 2D TGAGACACAG CA/-- CACACACCTA 3070 het 3070 ref 57 28 21 10 CA 4 3 285915 CASAVA_Build 7 156434350 4I CGCTCTGCCC ----/CCGG TCGGGGCCCA 3070 hom 57 het 20 0 15 5 CCGG 0 1 285916 CASAVA_Build 7 156440938 2I TTTAAATGAT --/AC AGTCTCTTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AC 0 1 285917 CASAVA_Build 7 156441648 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 31 1 20 10 A 14 15 285918 CASAVA_Build 7 156444562 1D GTAGTGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 15 14 285919 CASAVA_Build 7 156444860 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 12 0 9 3 T 9 10 285920 CASAVA_Build 7 156451252 1I CACCTGTAAT -/C CCAGCTACTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 2 3 285921 CASAVA_Build 7 156451372 6D GTCTCAAAAA AAAAAG/------ TAAGAAAATG 3070 hom 63 het 23 0 22 5 AAAAAG 1 0 285922 CASAVA_Build 7 156452359 5D TTGTTAGTGA TATAT/----- TATAGTAATT 3070 hom 114 het 40 0 39 2 TATAT 1 0 285923 CASAVA_Build 7 156453365 1D CTGAATAGCC A/- AAAAAAAAAA 2345 het 1340 hom 28 6 8 14 A 11 10 285924 CASAVA_Build 7 156455727 1D ACAGTGAGAC T/- TTTGACAGTG 1316 hom 33 het 15 0 6 9 T 4 3 285925 CASAVA_Build 7 156456364 1I TAAACAACTC -/T TGAGGTCACC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 1 2 285926 CASAVA_Build 7 156457031 1I GGCCTCAAGT -/G GATCCTCTTA 3070 hom 75 het 30 0 23 7 G 1 2 285927 CASAVA_Build 7 156457918 1D TGCTAGAGAG T/- TATATGTATG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 2 1 285928 CASAVA_Build 7 156458559 2I TTTCAGGGTA --/TC TCATTTTTAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TC 1 2 285929 CASAVA_Build 7 156460430 1I TTTTTGGGGG -/T TTTGATTTGG 3070 hom 68 het 29 0 23 6 T 3 4 285930 CASAVA_Build 7 156460477 9D GTTTTTTTTT GTTTTTTGG/--------- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 28 1 22 13 GTTTTTTGG 1 0 285931 CASAVA_Build 7 156461160 2I CAAATATCAC --/TG TGTTATAAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TG 1 2 285932 CASAVA_Build 7 156463537 2D CACTCTGTCT AA/-- AAAAAAAAAG 1180 hom 15 het 9 0 6 3 A 11 9 285933 CASAVA_Build 7 156467556 2D11M1D26M2I16M2I ATAAACTGTG TATGTATCATATATTAATACATCTGCACATATAAACTATC--ATCTGTACATATAAAC--/--TGTATCATACA-TAATACATCTGCACATATAAACTATCATATCTGTACATATAAACTG TGTATATCAT 1383 het 1383 ref 43 27 3 33 N/A 0 0 285934 CASAVA_Build 7 156469335 2D ACATAGAAAC TG/-- TGTATCATAT 193 hom 7 het 14 0 3 12 TG 2 1 285935 CASAVA_Build 7 156469397 2D34M4D ACATATAAAC TGTGTGTATCATATATAATACATCTGCACATATAAATGTG/--TGTGTATCATATATAATACATCTGCACATATAAA---- TGTATCATAT 3070 hom 54 het 34 0 19 25 N/A 0 0 285936 CASAVA_Build 7 156471529 1D TCTGGAATGA T/- TTTTTTTTTC 1869 hom 17 het 22 1 16 6 T 10 9 285937 CASAVA_Build 7 156472339 6D TCAAAAAAAA AAAAAG/------ AAAAGAAAAG 3070 hom 63 het 23 0 20 4 AAAAAG 1 0 285938 CASAVA_Build 7 156483704 3D CATAACAGAT ATA/--- ATAATAATGA 3070 het 3070 hom 58 26 26 8 ATA 3 2 285939 CASAVA_Build 7 156500933 1D GCCCCTACCA G/- GGGGGCTTGG 2146 het 2014 hom 16 7 6 3 G 6 5 285940 CASAVA_Build 7 156504545 2D TGCACATAAC TG/-- TGTCCGGAAA 3070 het 1945 hom 29 9 17 4 TG 2 1 285941 CASAVA_Build 7 156508109 1I GAGTCCATCT -/G GGGGGGGTAA 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 G 7 8 285942 CASAVA_Build 7 156518254 1I GGCACAGGTG -/C CCTGGGCGGG 3070 hom 53 het 20 0 18 2 C 2 3 285943 CASAVA_Build 7 156521797 1D ATACAGTCTA C/- CCCACCCCTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 C 4 3 285944 CASAVA_Build 7 156532501 1D AATAAATTCC T/- TTTTTTTTTT 2814 het 2453 hom 32 10 10 12 T 15 14 285945 CASAVA_Build 7 156547593 1I AGGCCACTGG -/C CAACTTCCTG 3070 hom 116 het 42 0 37 5 C 1 2 285946 CASAVA_Build 7 156547719 1I TCCTCACTGA -/G ACCTGCCCAC 3070 het 3070 ref 48 26 19 3 G 0 1 285947 CASAVA_Build 7 156553295 1D AAAAAAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 19 0 13 6 T 13 12 285948 CASAVA_Build 7 156566411 1D ACTTCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2113 hom 15 6 8 1 A 11 10 285949 CASAVA_Build 7 156569900 2I AGAAATTTGC --/AT ATAAGTAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 AT 1 2 285950 CASAVA_Build 7 156571251 1I CAGACATGGT -/G GCAAGCGCCT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 G 1 2 285951 CASAVA_Build 7 156615103 3I TGCCGTTATG ---/GAA GAAGACTTGT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 GAA 1 2 285952 CASAVA_Build 7 156627821 3D AGATCTGTGT ACG/--- ACAAGTCTGA 3070 het 3070 hom 24 11 13 3 ACG 1 0 285953 CASAVA_Build 7 156630146 1I TGCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3007 hom 23 8 9 6 A 9 10 285954 CASAVA_Build 7 156631866 1D TAGTACAGAC G/- GGGGTTTCAC 3017 het 3010 hom 20 8 7 5 G 5 4 285955 CASAVA_Build 7 156639533 4D CCAGCACCTT GGGA/---- GGGAGGCCGA 2201 het 2201 ref 20 11 7 2 GGGA 2 1 285956 CASAVA_Build 7 156648425 1I CTTCTACAAA -/C CCAAGTCATT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 2 3 285957 CASAVA_Build 7 156656577 1I TTAGGGTCTC -/T TTTTGTGGGG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 4 5 285958 CASAVA_Build 7 156657483 1I GCTATTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 14 12 T 12 13 285959 CASAVA_Build 7 156676004 1D TTAGAACACA C/- CCACCCTCAC 3070 het 3070 hom 58 24 18 16 C 3 2 285960 CASAVA_Build 7 156678743 3I AGAAAAATTT ---/CAG CAGAAGAACA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 CAG 1 2 285961 CASAVA_Build 7 156682210 1I GATCACCTGA -/G GGTCGGGAGT 2879 het 315 hom 13 2 8 3 G 2 3 285962 CASAVA_Build 7 156682965 1D AAATAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 8 9 T 15 14 285963 CASAVA_Build 7 156691586 2D GACCATGGAC TT/-- TATAGAAAGA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 3 1 285964 CASAVA_Build 7 156692249 2I GATGGGTGAA --/AG AGGCTGCTGA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 AG 1 2 285965 CASAVA_Build 7 156693848 5D CTTTTTAATT AAGAA/----- AAGTAATTTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 6 AAGAA 1 0 285966 CASAVA_Build 7 156709031 1D GAAAGCCAGT A/- AACACTATAG 3070 hom 123 het 44 0 40 4 A 3 2 285967 CASAVA_Build 7 156717372 1D CACACTCTTT G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 8 7 285968 CASAVA_Build 7 156719582 4I CAAGTATTTT ----/CTTC CTTCTCTGGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTTC 1 2 285969 CASAVA_Build 7 156733765 4D CATATGGCTC TTTG/---- TTTGTAGAAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 TTTG 2 1 285970 CASAVA_Build 7 156737312 1D TAGAGGGGCT G/- GGCGCAGTGG 3070 het 930 hom 16 2 11 3 G 3 2 285971 CASAVA_Build 7 156737591 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1315 het 1315 ref 33 19 4 10 A 13 12 285972 CASAVA_Build 7 156746903 1D GGTCTTACTG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 18 het 33 1 21 13 T 8 7 285973 CASAVA_Build 7 156746931 2D ATGTTCTAAC AT/-- ATGTGAAATT 2921 het 2921 ref 35 8 8 20 AT 2 1 285974 CASAVA_Build 7 156758655 4I CCTCCCCTGC ----/CACA CACACCCTAT 3070 hom 85 het 34 0 27 7 CA 2 4 285975 CASAVA_Build 7 156764329 3I GCTTCCTCGG ---/TGA TGATGCCACG 1448 het 1448 ref 21 10 5 6 TGA 1 2 285976 CASAVA_Build 7 156768103 17I CTCACCCAGC -----------------/AGCAGACATTGTCGAGA AGCAATAAAT 2131 hom 30 het 15 0 7 8 AGCAGACATTGTCGAGA 0 1 285977 CASAVA_Build 7 156773980 1D TGAAATCCCA C/- ACAACTGCTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 1 0 285978 CASAVA_Build 7 156775448 1D GTTTGGGGGT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 54 het 22 0 12 10 G 9 8 285979 CASAVA_Build 7 156775668 1I TGGGCCGGGA -/G GGCAGGGCCT 3070 hom 38 het 15 0 11 4 G 2 3 285980 CASAVA_Build 7 156777548 3I CGTGTGGGTC ---/AAG AAGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 AAG 2 3 285981 CASAVA_Build 7 156777885 2D ATCTGTGCGA AT/-- ATGTGTGTTG 3070 het 3070 ref 64 25 23 17 AT 2 1 285982 CASAVA_Build 7 156784616 7D TGTGTGTGGT GTGTGTG/------- GTGTGTAGTG 3070 het 3070 ref 79 34 22 25 GTGTGTG 1 0 285983 CASAVA_Build 7 156796132 18I ACCACAAACT ------------------/TGGTTTGAAGATCTTAAC TGGCTTTATT 3070 het 3070 ref 44 21 19 5 TGGTTTGAAGATCTTAAC 0 1 285984 CASAVA_Build 7 156798288 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2144 het 1179 hom 22 7 6 9 A 17 16 285985 CASAVA_Build 7 156810683 9D CTCCTGACCG CAGGTGATC/--------- CACCCACCTT 2721 het 402 hom 12 1 8 3 CAGGTGATC 1 0 285986 CASAVA_Build 7 156823383 1I CTGTGCTAAC -/T TTCTCACGTA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 2 3 285987 CASAVA_Build 7 156828406 1D CTGCTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 T 11 10 285988 CASAVA_Build 7 156831495 1D GAGGGCCCAC A/- TTTTTCTGGG 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 A 1 0 285989 CASAVA_Build 7 156836154 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 T 9 10 285990 CASAVA_Build 7 156839930 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAATTA 2691 het 2691 ref 24 15 7 2 A 7 8 285991 CASAVA_Build 7 156846617 1D CTGCTACACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 850 hom 27 3 13 11 T 15 14 285992 CASAVA_Build 7 156865261 10D CAGAAATGCC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2106 het 2106 ref 31 16 9 7 T 24 14 285993 CASAVA_Build 7 156866455 1D AGTCACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 T 12 11 285994 CASAVA_Build 7 156867991 3I GGTCTGCGCT ---/TAA TAACCTACAT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 TAA 1 2 285995 CASAVA_Build 7 156870704 8D GCAGCATTGT TAAAATGG/-------- TAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 TAAAATGG 2 1 285996 CASAVA_Build 7 156872073 1D GCGGTAGCTC A/- ACGCCTGTAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 2 1 285997 CASAVA_Build 7 156879316 1I CTCAGAAAAC -/T TTTATTTCCT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 T 3 4 285998 CASAVA_Build 7 156879985 1I CCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 A 10 11 285999 CASAVA_Build 7 156897215 1I CCGAGGCCAC -/A ACCTGTATGT 3070 hom 59 het 25 0 15 10 A 1 2 286000 CASAVA_Build 7 156900054 2I CTTGGCGGTT --/CA CTGAACGCGC 3070 hom 104 het 42 0 28 14 CA 0 1 286001 CASAVA_Build 7 156905182 2D TTTTTGAGGC AG/-- AGTCTCACTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AG 2 1 286002 CASAVA_Build 7 156906503 2D TGGACGGAGG GA/-- GAGAGTATTT 3070 hom 30 het 11 0 11 1 GA 3 2 286003 CASAVA_Build 7 156949955 1I GACCTTGTGA -/C CCTTTGGGGA 3070 hom 109 het 42 0 36 6 C 2 3 286004 CASAVA_Build 7 156951864 1I GAGATAGAAA -/T TAAAGCCACG 3070 hom 69 het 30 0 22 8 T 1 2 286005 CASAVA_Build 7 156952595 1D CCCGTGGATT C/- CAGTTGCTTT 3070 het 3070 ref 44 21 17 8 C 2 1 286006 CASAVA_Build 7 156952803 1I CCATTGCCTC -/T CCCTTCTCCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 286007 CASAVA_Build 7 156954715 1I CAGGACCCTC -/G GGCCTGGCCA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 2 3 286008 CASAVA_Build 7 156966840 3I GGTGTGTGTC ---/ATG GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 61 25 23 13 ATG 0 1 286009 CASAVA_Build 7 156966892 3I41M3I GTAGTGTGTG ---TGTTTGTGGTATGTGAGTGGTGTGTGTGGTATGTGGTGTGC---/TGTTGTTTGTGGTATGTGAGTGGTGTGTGTGGTATGTGGTGTGCTTG TTGTGTGCCT 3070 het 3070 ref 64 47 26 22 N/A 0 0 286010 CASAVA_Build 7 156967196 2D5M11D GGTGTGCCTG TTGTGTCGTGTGTTGTGT/--GTGTC----------- GTGTGTTGTG 3070 het 3070 ref 67 48 18 14 N/A 0 0 286011 CASAVA_Build 7 156994290 1D TGCGGCAGGA G/- GGACATATTG 2893 het 2893 ref 30 16 8 6 G 3 2 286012 CASAVA_Build 7 156995559 1D AGATAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 1665 hom 10 het 5 0 4 1 A 12 11 286013 CASAVA_Build 7 157004148 4I GCACAGATGA ----/ACAT ACACACAGAC 3070 het 3070 hom 98 37 42 19 ACAT 0 1 286014 CASAVA_Build 7 157006143 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2861 hom 25 7 12 6 T 11 12 286015 CASAVA_Build 7 157015973 1D TGTGAACAGC A/- ATGAGGAAAT 3070 hom 120 het 45 0 40 6 A 2 1 286016 CASAVA_Build 7 157033695 3D ACAACAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 2535 hom 25 9 11 8 AAC 5 4 286017 CASAVA_Build 7 157034318 1D TTAAACCAGG C/- CCTCCCCGTG 3070 hom 65 het 24 0 19 6 C 3 2 286018 CASAVA_Build 7 157042278 2I CATACATATG --/CA CACACACAAA 3070 hom 186 het 73 0 62 11 CA 4 5 286019 CASAVA_Build 7 157046982 1I TCCTCCCTCT -/G GGGCCCTGAG 3070 hom 50 het 20 0 16 4 G 3 4 286020 CASAVA_Build 7 157051069 1I CACCCAGCAT -/G GCTCAGCCCA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 G 1 2 286021 CASAVA_Build 7 157057357 2I AAAATTTCTT --/AC AGTCCAGACA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 AC 0 1 286022 CASAVA_Build 7 157064498 1I AAACAGACAC -/A AAAATCCAAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 4 5 286023 CASAVA_Build 7 157068328 4D ACTCCACCTC AAAA/---- AAAAAAAACA 226 het 226 ref 34 17 3 15 A 12 8 286024 CASAVA_Build 7 157074898 15D TTAAAATACA CTTTCTAGAGAAAGG/--------------- CTTTCTAGAG 3070 het 3070 ref 40 17 15 13 CTTTCTAGAGAAAGG 2 1 286025 CASAVA_Build 7 157076125 10D ATGGGGCCTC GCGGTGCCAT/---------- GCTGGGGGAG 2085 het 2085 ref 34 15 8 13 GCGGTGCCAT 1 0 286026 CASAVA_Build 7 157082924 2I CCTTCTGAAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1719 hom 28 7 10 11 TG 7 8 286027 CASAVA_Build 7 157082938 3I TGTGTGTGTG ---/TGT TTTTTTTTTT 1276 het 1276 ref 32 16 5 11 TGT 0 1 286028 CASAVA_Build 7 157086902 1I CCAAATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 10 11 286029 CASAVA_Build 7 157102306 1D TTTGGGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 11 10 A 13 12 286030 CASAVA_Build 7 157115047 3D TGGAGGCGCC CAT/--- CATCACTCCG 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 CAT 2 1 286031 CASAVA_Build 7 157129570 1D GTTACCCCGC A/- ACATAACCTC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 2 1 286032 CASAVA_Build 7 157142272 2D AAACACACAT AC/-- ACACACACAT 1176 het 1176 ref 42 14 12 17 AC 5 4 286033 CASAVA_Build 7 157151093 1I TATGTGAACT -/A AAGAAAAGGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 2 3 286034 CASAVA_Build 7 157151969 1D AAAAAAAAAA C/- CCCACAGTAG 3070 hom 80 het 34 0 28 6 C 4 3 286035 CASAVA_Build 7 157154879 2I TTTGCACGCG --/CA CACACACACA 3070 hom 44 het 34 0 20 14 CA 7 8 286036 CASAVA_Build 7 157160993 1D TGCAGACACC A/- ATGTCCTCAG 3070 hom 57 het 28 0 18 10 A 2 1 286037 CASAVA_Build 7 157165828 1D GCAATATTTT A/- AAAAACTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 5 286038 CASAVA_Build 7 157166496 1D CTGGGAAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 10 9 286039 CASAVA_Build 7 157180223 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 10 11 286040 CASAVA_Build 7 157189075 1D GGTCTTCCAC A/- AAAGAACTTC 3070 het 3070 ref 27 10 11 6 A 4 3 286041 CASAVA_Build 7 157192651 4I AGCATACACG ----/CACA CACACACACA 3070 hom 135 het 53 0 44 9 CA 5 7 286042 CASAVA_Build 7 157193042 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2123 het 2123 ref 20 8 8 4 T 9 10 286043 CASAVA_Build 7 157196900 25D ACGCGCCGGA GGTCCGGTTTGTGCACCTGCACACG/------------------------- GGTCCTGTCT 1220 hom 10 het 4 0 4 0 GGTCCGGTTTGTGCACCTGCACACG 1 0 286044 CASAVA_Build 7 157198682 3I CCTCCTCCTC ---/CTG CTAGCACTGC 3070 hom 120 het 47 0 37 10 CTG 0 1 286045 CASAVA_Build 7 157204464 1I CTCCCTCCTG -/C CAGGCGTCTC 3070 hom 50 het 23 0 13 10 C 1 2 286046 CASAVA_Build 7 157206492 4D GTCCACAGAG CTGA/---- CTATCACAGC 2483 het 2483 ref 27 18 8 1 CTGA 1 0 286047 CASAVA_Build 7 157219703 26D CCCAGCACAC TCTTCCGTCCCATGTGCCCAGTGCAG/-------------------------- TCTTCCGTCC 3070 het 2921 hom 32 13 17 12 TCTTCCGTCCCATGTGCCCAGTGCAG 1 0 286048 CASAVA_Build 7 157357218 2I ATGCACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 198 hom 34 1 18 15 AC 7 8 286049 CASAVA_Build 7 157360461 8D AACGTGCATG CACACAGA/-------- CACACAGACA 3070 hom 146 het 50 0 44 13 CACACAGA 2 1 286050 CASAVA_Build 7 157366798 2I CCTTGTAGGA --/AG AGGAGATGCA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AG 1 2 286051 CASAVA_Build 7 157392089 1D TAAAACTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 A 11 10 286052 CASAVA_Build 7 157397295 4I ATACACGTTC ----/TGTG TGTGATGTGC 3070 het 3070 hom 50 17 27 6 TG 2 4 286053 CASAVA_Build 7 157403102 1I CAGTTTTCAA -/T TTGTTCAAAT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 2 3 286054 CASAVA_Build 7 157408042 1D TAGTTGGACA C/- AAACTAGCAA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 C 1 0 286055 CASAVA_Build 7 157408275 4D TCTAAGTCAC AAAT/---- AACACAGCTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAAT 1 0 286056 CASAVA_Build 7 157415154 15I TCCCTGTCCC ---------------/TCTGACCAGCAGTAT TCGGGTGGGG 2613 het 2613 ref 22 14 7 2 TCTGACCAGCAGTAT 0 1 286057 CASAVA_Build 7 157417119 1I TCTGGCTCTT -/A ACATGACGAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 1 2 286058 CASAVA_Build 7 157417840 5D TAGAAAATCC TTCAG/----- TTCAGTCTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 TTCAG 2 1 286059 CASAVA_Build 7 157439617 27D CTGTGTACTG TGTGTGCTGTGTGGTGTGTGTGGTACA/--------------------------- TGTGTGCTGT 3070 het 545 hom 34 3 10 27 TGTGTGCTGTGTGGTGTGTGTGGTACA 1 0 286060 CASAVA_Build 7 157479997 1D GCTCCTTGTT C/- CTAAAATCAG 826 het 140 hom 17 1 7 10 C 2 1 286061 CASAVA_Build 7 157485824 4I GCCCCAGGGC ----/CATG CATGCTTGGT 3070 het 3070 ref 24 12 12 0 CATG 1 2 286062 CASAVA_Build 7 157486799 2D GACCACACTC CA/-- CACTCACAGC 2735 het 2735 ref 20 10 6 4 CA 2 1 286063 CASAVA_Build 7 157489626 3D TATCACCAAA AAG/--- AAGACTTCAC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AAG 2 1 286064 CASAVA_Build 7 157500341 6I ATCCATCCCC ------/CACCTA TACCTATCTC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 CACCTA 0 1 286065 CASAVA_Build 7 157524221 5I GAAATATAAG -----/ATTTT ATTATACATA 2991 het 2488 hom 12 5 7 0 ATTTT 0 1 286066 CASAVA_Build 7 157535356 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 11 10 286067 CASAVA_Build 7 157541319 2I AGGGCCCAGC --/TG TCTTTTATCT 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 TG 0 1 286068 CASAVA_Build 7 157557612 1I TTCAGTTGAA -/C CCTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 C 2 3 286069 CASAVA_Build 7 157560487 5D CTACCACAGC GTTGT/----- GTTGTCTGCG 3070 het 3070 hom 34 16 12 8 GTTGT 2 1 286070 CASAVA_Build 7 157562984 44D CCCCACCATT CAGGGTCAGCACAGGAGCCCCCTATGAGCCACACCCCCACCACA/-------------------------------------------- CAGGGCTGAG 1684 het 1684 ref 19 15 6 7 CAGGGTCAGCACAGGAGCCCCCTATGAGCCACACCCCCACCACA 1 0 286071 CASAVA_Build 7 157569394 26I ATATGTGCAG --------------------------/GCTCTTCCCTAAAACCCATAGTGGCT GCTCTGACGT 3070 hom 84 het 35 0 27 8 GCTCTTCCCTAAAACCCATAGTGGCT 0 1 286072 CASAVA_Build 7 157575632 1D TTCACACAAA C/- CCTTCCTCCC 3070 het 1352 hom 29 5 14 11 C 3 2 286073 CASAVA_Build 7 157595452 34D AAGTCACCCT GTGTGAAGGGACCAGTGAGTGAATGATGTCACCC/---------------------------------- GTGTGAAGGG 3070 hom 106 het 47 0 35 15 GTGTGAAGGGACCAGTGAGTGAATGATGTCACCC 1 0 286074 CASAVA_Build 7 157599232 1D GTCGACGCTA C/- AAGCTGTTGT 3070 hom 111 het 40 0 35 5 C 1 0 286075 CASAVA_Build 7 157614400 2D AGGCAACCAA AC/-- ACACACACAC 1171 het 1171 ref 53 35 3 17 AC 9 8 286076 CASAVA_Build 7 157614948 7I AGCACACACA -------/CACACAC CACACCATGC 3070 het 3070 ref 86 42 27 18 CACACAC 0 1 286077 CASAVA_Build 7 157615912 2I CATCTACCCA --/AC ACACACTCAT 3070 hom 187 het 72 0 63 9 AC 3 4 286078 CASAVA_Build 7 157631525 1D TTCCCCCTTT C/- CCATCCATTC 3070 hom 86 het 33 0 28 5 C 3 2 286079 CASAVA_Build 7 157639349 4D CCCTGGGTGT GCTC/---- GCTCGGAAGG 3070 hom 69 het 28 0 21 7 GCTC 2 1 286080 CASAVA_Build 7 157640213 6D AAAAAAAATC ATAAGT/------ ATATAAGAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 ATAAGT 1 0 286081 CASAVA_Build 7 157643201 1I CACAGAGTGA -/C CCCCCCCAGC 1557 het 642 hom 14 3 7 4 C 7 8 286082 CASAVA_Build 7 157643937 5D GAGAGAACTG GGAGC/----- GGAGCCCATG 3070 hom 93 het 34 0 32 4 GGAGC 2 1 286083 CASAVA_Build 7 157645111 5I CACCCCACAC -----/AAATG ATTATTTGTC 3070 hom 139 het 49 0 43 6 AAATG 0 1 286084 CASAVA_Build 7 157645388 1D CCAAATAGTG A/- AATCCCCAAA 3070 hom 157 het 60 0 53 7 A 3 2 286085 CASAVA_Build 7 157647259 1I22M7I GCCACAGACT -GGAGAAAATGTTTACAAAAGAC-------/GGGAGAAAATGATTACAAAAGACATATCTG ATATCTGATA 3070 hom 72 het 25 0 25 5 N/A 0 0 286086 CASAVA_Build 7 157650518 1I GCAGTGAAGA -/C CCCCTGATAG 3070 hom 131 het 65 0 51 14 C 4 5 286087 CASAVA_Build 7 157651758 1D ATCTCCTCCT C/- CCCCCCGGCC 3070 hom 68 het 33 0 23 10 C 7 6 286088 CASAVA_Build 7 157667391 4I ATCTTTGTTA ----/TTTC TTTTCTTCTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTTC 0 1 286089 CASAVA_Build 7 157669525 9D ATGTGGCTTG TCTTTTCAA/--------- TCTTTTGTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TCTTTTCAA 1 0 286090 CASAVA_Build 7 157671469 1D CTCCCAGCCC T/- CTCCCTCCTC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 1 0 286091 CASAVA_Build 7 157725709 2D ATACCAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 34 13 13 9 AG 8 7 286092 CASAVA_Build 7 157746793 3I GGAGGTAACA ---/ACG GCCCCTGGGA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 ACG 0 1 286093 CASAVA_Build 7 157748878 2I CAAACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 477 hom 62 2 45 15 CA 6 7 286094 CASAVA_Build 7 157752769 1D TCCCGCGGGG A/- ACCCCGGGGG 3070 hom 64 het 29 0 17 12 A 2 1 286095 CASAVA_Build 7 157763801 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2063 het 352 hom 25 1 9 16 A 15 14 286096 CASAVA_Build 7 157775649 1I AAGGGGCTGG -/C CTGGCACCAG 3070 hom 88 het 33 0 25 8 C 1 2 286097 CASAVA_Build 7 157779210 1I CTTTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 521 hom 32 2 22 8 A 13 14 286098 CASAVA_Build 7 157791982 3I ATCTGTCTGG ---/TCA TCATCTGACC 3070 hom 109 het 43 0 35 8 TCA 1 2 286099 CASAVA_Build 7 157794141 4D TTTGAATTAA TAAT/---- TAAATTAATA 3070 hom 72 het 25 0 25 1 TAAT 1 0 286100 CASAVA_Build 7 157797520 4D57M2I TCACATGTAG ACACACACACGTGCACTCATTCACATGCTCACATGTAGACGCCCACACAAGGCAAACACAC--/----ACACACGTGCACTCATTCACATGCTCACATGTAGACGCCCACACAAGGCAAACACACAT GTGCTCACGT 3070 hom 130 het 64 1 79 20 N/A 0 0 286101 CASAVA_Build 7 157797763 2I GTGCTCACAC --/AT AGACACCCAC 3070 hom 65 het 27 0 21 7 AT 0 1 286102 CASAVA_Build 7 157797873 4D ATGTAGACAT ACAC/---- ACACATGCAC 3070 hom 189 het 68 0 63 8 AC 4 2 286103 CASAVA_Build 7 157797991 2D CTGCACACAC AT/-- GTGCTCCAGT 3070 hom 109 het 45 0 34 11 AT 1 0 286104 CASAVA_Build 7 157800134 4I ACACGCGTTT ----/CTCC CTCTCAACCC 3070 hom 52 het 20 0 15 5 CTCC 0 1 286105 CASAVA_Build 7 157804757 3I TTAATAGACT ---/TTA TTATTTTTAG 3070 hom 143 het 51 0 47 4 TTA 1 2 286106 CASAVA_Build 7 157807234 2D CAAAACACTC AT/-- GTGTGCAAAT 3070 het 3070 ref 58 31 20 7 AT 1 0 286107 CASAVA_Build 7 157809422 2D71M4I CAACACATGT ACACACACACAAGTGTGCACACACTCATTTGCATGCACTTGATTATGCAGACACACACACAGGAGCACGTACA----/--ACACACACAAGTGTGCACACACTCATTTGCATGCACTTGATTATGCAGACACACACACAGGAGCACGTACACACT CACACATTTG 3070 het 3070 ref 57 31 24 44 N/A 0 0 286108 CASAVA_Build 7 157809956 1D ACCAAAAAGG C/- TGGTGGTGGG 3070 hom 49 het 26 0 16 10 C 1 0 286109 CASAVA_Build 7 157810169 1D GCCCAGGGTG C/- CCCCAGAGGG 3070 hom 61 het 24 0 18 7 C 5 4 286110 CASAVA_Build 7 157810811 2D TACTTTTACT TA/-- TATGTCTTTT 2443 het 915 hom 32 6 9 17 TA 2 1 286111 CASAVA_Build 7 157829983 1D ATACAAGACA C/- CCTGGAGTCT 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 C 3 2 286112 CASAVA_Build 7 157833168 4D TTTTAACAAT ATTA/---- ATTCTTTCAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 ATTA 1 0 286113 CASAVA_Build 7 157837779 15D CTGCCAGCTA CCCTCCTGACCGCTC/--------------- CCCTCCTGTC 2601 hom 13 het 19 1 9 11 CCCTCCTGACCGCTC 1 0 286114 CASAVA_Build 7 157839946 1I AGTTAACAAC -/A AGATTGAAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 286115 CASAVA_Build 7 157840480 3D TCTTGAAAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 1958 het 384 hom 38 5 6 29 A 14 11 286116 CASAVA_Build 7 157847847 4I ATTTACTCAC ----/AGAG AGAGAAGAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 AG 2 4 286117 CASAVA_Build 7 157848162 1D TCACAACCAC G/- CTCATCCTGG 3070 hom 75 het 27 0 26 2 G 1 0 286118 CASAVA_Build 7 157850435 2D CACACACATT CA/-- CACACACACA 3070 hom 172 het 67 0 58 9 CA 6 5 286119 CASAVA_Build 7 157870759 1D ACACCACTGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 69 het 41 1 36 4 A 9 8 286120 CASAVA_Build 7 157883328 2D2M3D GGGTGCCACG GCCTGAC/--CT--- AGTAACAATC 3070 hom 120 het 41 0 39 2 N/A 0 0 286121 CASAVA_Build 7 157899928 2D AGATTTCACT AC/-- AGTAATTGCA 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 AC 1 0 286122 CASAVA_Build 7 157902496 2D CCCCTGTGCT AA/-- GTCACAGTGC 3070 het 3070 ref 72 41 23 8 A 2 0 286123 CASAVA_Build 7 157908993 1I TGGTTCCTCA -/T TTTTTTTTTT 2439 het 2439 ref 28 8 10 10 T 12 13 286124 CASAVA_Build 7 157909198 1I TCCTGACCTC -/A AAGTGTTCCG 3070 het 3046 hom 25 8 12 5 A 2 3 286125 CASAVA_Build 7 157928358 3I TGCCTTACGG ---/ACA ACAAGAGGAG 3070 het 2841 hom 28 7 14 7 ACA 1 2 286126 CASAVA_Build 7 157937660 1I CACACAACTT -/C TCTTTTTCAT 3070 hom 146 het 53 0 48 5 C 0 1 286127 CASAVA_Build 7 157939062 9I TGTTGCCCCT ---------/GGGTGTGGG GGGTGAGCTC 3070 hom 69 het 30 0 17 13 GGGTGTGGG 0 1 286128 CASAVA_Build 7 157947523 13I CCCTGTGCTT -------------/CCTCCCGCGTGAC CCGCCCACGC 3070 hom 89 het 34 0 27 7 CCTCCCGCGTGAC 0 1 286129 CASAVA_Build 7 157948458 33I ATTTGAACTC ---------------------------------/AGAACCACAAGCTATTGGAGCTTGAGTCTTAAA AGATCATTAG 3070 hom 120 het 37 0 40 4 AGAACCACAAGCTATTGGAGCTTGAGTCTTAAA 0 1 286130 CASAVA_Build 7 157952744 1I GGGTTTTTTT -/G TGTGTGTTGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 0 1 286131 CASAVA_Build 7 157957205 4D AAGCTAAATG AATA/---- AAGAAAAGGA 3070 hom 50 het 18 0 16 4 AATA 1 0 286132 CASAVA_Build 7 157958450 6I3M9D GAAATTAGTT ------ATGGGTTTTACC/GCAGAAATG--------- CACGCACCGA 3070 hom 108 het 36 0 37 3 N/A 0 0 286133 CASAVA_Build 7 157959227 1D26M1I GATTGGGGGG AAAAAAACATTTTAAACATTAATTTTT-/-AAAAAACATTTTAAACATTAATTTTTA AAAAAAAGGT 3070 hom 117 het 31 0 40 4 N/A 0 0 286134 CASAVA_Build 7 157985487 1D CACTTGAGCT A/- AAAAAAAAAA 1324 het 400 hom 26 5 8 13 A 18 17 286135 CASAVA_Build 7 157999079 2I TATTATAGAC --/AG AGAGAGAGAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AG 4 5 286136 CASAVA_Build 7 158026863 2I AAGCAAGCAT --/TA TATTCCACCC 3070 het 3070 ref 46 24 12 10 TA 1 2 286137 CASAVA_Build 7 158063991 2I CTGTCTCTGT --/AA AAAAAAAAAA 2952 het 2952 ref 36 9 15 12 A 14 16 286138 CASAVA_Build 7 158083129 3D TTTGCTATAA AAT/--- AATATTCTAG 3070 het 3070 ref 26 15 9 4 AAT 2 1 286139 CASAVA_Build 7 158086126 2I ATTTGGGATG --/GC ACTTCATTAT 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 GC 0 1 286140 CASAVA_Build 7 158087072 3D GACAATATGG TCC/--- TCAACTTGGT 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 TCC 1 0 286141 CASAVA_Build 7 158089528 12I AGGGGCACCG ------------/CCTCAGCACCCA CCTCAGCACC 2914 het 2860 hom 26 10 9 7 CCTCAGCACCCA 0 1 286142 CASAVA_Build 7 158091188 1D AGCAAGACCG T/- TATCTCTACA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 2 1 286143 CASAVA_Build 7 158091389 1I TTTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 A 11 12 286144 CASAVA_Build 7 158096999 1I CTCTTTCTAT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 6 7 286145 CASAVA_Build 7 158102074 1D AGCCCAAGAG A/- AAAAGACTTA 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 A 5 4 286146 CASAVA_Build 7 158108982 1I CACTGAGGCT -/G CACCACAGGT 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 G 0 1 286147 CASAVA_Build 7 158115685 3D TGTGGAAAAA GAG/--- GAGAATAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 GAG 2 1 286148 CASAVA_Build 7 158119650 2I3M2I TAAAATCCAC --AGA--/TAAGATG TGTTCAAGTC 3070 het 3070 hom 39 18 19 5 N/A 0 0 286149 CASAVA_Build 7 158121176 4D AGCACCCAAA AGAC/---- AGACCAGTCA 3070 het 3070 hom 30 10 16 6 AGAC 2 1 286150 CASAVA_Build 7 158128042 1I AGATAAATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 9 10 286151 CASAVA_Build 7 158138029 1I AAATGGTAAC -/A AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 A 6 7 286152 CASAVA_Build 7 158140454 4D AAATGTCCCT GTAA/---- GTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 37 11 25 1 GTAA 1 0 286153 CASAVA_Build 7 158151466 2I AGACAGAGCA --/TT ACCCCAGTAC 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 T 0 2 286154 CASAVA_Build 7 158169099 1D ATGGCAATGT A/- AGATTCCACC 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 A 2 1 286155 CASAVA_Build 7 158177761 1D TTCTGTCTCT A/- AAAAAAAATG 2006 het 2006 ref 32 18 9 5 A 9 8 286156 CASAVA_Build 7 158181814 1I CGTCAAAGCA -/G GCACAAGCCC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 G 1 2 286157 CASAVA_Build 7 158186211 3I CTCTAATTCT ---/TTG TTGTCACTAA 3070 het 3070 hom 47 14 27 6 TTG 1 2 286158 CASAVA_Build 7 158193198 1D TGGAGGGTGA G/- CAAGGCAGAG 3070 het 3070 ref 63 31 28 6 G 1 0 286159 CASAVA_Build 7 158193952 1I ATATAATATC -/T TTTTTTTTTT 3040 hom 20 het 11 0 7 4 T 14 15 286160 CASAVA_Build 7 158198429 12I GGGGGCAATG ------------/GGAGGACACATT GGCCCACGTA 3070 hom 49 het 20 0 13 7 GGAGGACACATT 0 1 286161 CASAVA_Build 7 158199233 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 A 9 10 286162 CASAVA_Build 7 158201459 1I CAAAAAATAA -/T TTTTTTTTTA 1994 het 1994 ref 17 10 6 1 T 9 10 286163 CASAVA_Build 7 158201620 2D ACCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1741 hom 33 6 14 14 A 18 16 286164 CASAVA_Build 7 158202549 3D GAGAACAGTT TCC/--- TCCTCCTCCT 1599 het 1599 ref 45 14 10 21 TCC 7 6 286165 CASAVA_Build 7 158204070 5D TGAGGTAGAT AAGTA/----- AACTGTGGCA 3070 het 3070 ref 42 24 16 4 AAGTA 1 0 286166 CASAVA_Build 7 158204758 13D GGAGCCCAGG AGTCTGAGGCTGC/------------- AGCGAGCTGG 3070 het 3070 ref 31 17 14 4 AGTCTGAGGCTGC 1 0 286167 CASAVA_Build 7 158205117 1D CTAGAGTTCA G/- CCACGCTTCC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 G 1 0 286168 CASAVA_Build 7 158205213 3I GATGTTCTCT ---/GGC GGCCTTTTAG 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 GGC 1 2 286169 CASAVA_Build 7 158213240 1I GCCCAGCTAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 2469 hom 24 7 8 9 T 7 8 286170 CASAVA_Build 7 158216900 5D ACTACAGGCG TGCGC/----- TCCACCACCA 1882 het 1140 hom 8 3 5 0 TGCGC 1 0 286171 CASAVA_Build 7 158220237 4D ACCCTGTCTC TAAA/---- TAAATAAACA 3070 het 3070 hom 29 8 17 4 TAAA 3 2 286172 CASAVA_Build 7 158221616 9I67M1I ACCGTGCTGG ---------GGGGCAAGTGGAGTCTCCAGACGCTTAAATGCCTCGGATGGGTAGGAGCACCCTGCACAACCTCATC-/AAACCCAGATGGGCAAGTGGAGTCTGCAGACGCTTAAATGCCTCGGATGGGTAGGAGCACCCTGCACAACCTCATCG GGGCTGATGC 3070 het 3070 ref 29 24 15 14 N/A 0 0 286173 CASAVA_Build 7 158222059 3I CATTCTTTTC ---/ATT ATTATGTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 ATT 1 2 286174 CASAVA_Build 7 158225251 1I TATACCCCCC -/A CCTTCGCAGT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 0 1 286175 CASAVA_Build 7 158225378 1I CCATGCCAGG -/C CAAGGGTAAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 C 1 2 286176 CASAVA_Build 7 158225983 12D CTTCCCATCT GATGAGACTGCA/------------ GCGCCCTTCC 3070 het 3070 ref 41 23 19 3 GATGAGACTGCA 1 0 286177 CASAVA_Build 7 158226925 1I AGCGTGGGGT -/G GGGGGGCGCT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 G 6 7 286178 CASAVA_Build 7 158227452 2D TCTTTAAAAC TT/-- AGCTCAAAAA 1976 het 1976 ref 26 16 6 5 T 2 0 286179 CASAVA_Build 7 158230889 3I TACCTGATAT ---/AAG AAGTAGTCTG 3070 het 3070 hom 53 18 24 11 AAG 1 2 286180 CASAVA_Build 7 158231145 1I TAGAAAGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 9 10 286181 CASAVA_Build 7 158231489 4I AAAAAATTGG ----/TTCT TTAAGAAAAT 2877 het 2877 ref 33 22 8 3 TTCT 0 1 286182 CASAVA_Build 7 158237063 5D ATATAACAAT TATAA/----- TATATATTAT 3070 het 3070 hom 31 11 19 4 TATAA 1 0 286183 CASAVA_Build 7 158243213 1I TGGGTTTTTT -/G TTTTTTTGTT 3070 het 185 hom 32 3 19 10 G 0 1 286184 CASAVA_Build 7 158243544 5I CTAAGGTAAA -----/TACTT TAAGAGAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TACTT 0 1 286185 CASAVA_Build 7 158244834 3D AAAACACAAC AAG/--- AAGAGAACAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 AAG 2 1 286186 CASAVA_Build 7 158254537 2D ACAAATAAAT TC/-- TGAGACCGTG 3070 het 3070 ref 46 30 12 6 TC 1 0 286187 CASAVA_Build 7 158255775 6D AACATTTATG TAAACA/------ TAATTTATTA 3070 het 3070 ref 19 10 7 3 TAAACA 1 0 286188 CASAVA_Build 7 158259942 1D ACCCATTGAA C/- CCACCTGGCT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 C 3 2 286189 CASAVA_Build 7 158260840 4D CATGCCACAC TGTT/---- TGATAGCATT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 TGTT 1 0 286190 CASAVA_Build 7 158267082 3D CGAGTGTGAG AAC/--- AAAGTGAGGT 3070 het 3070 ref 67 33 28 6 AAC 1 0 286191 CASAVA_Build 7 158267439 2I TGTGAGATGT --/GA GTGTAATTAC 3070 hom 240 het 93 0 80 13 GA 0 1 286192 CASAVA_Build 7 158267591 2I ACGAGAACAA --/GT GTGAGTGAAC 3070 hom 214 het 78 0 70 8 GT 1 2 286193 CASAVA_Build 7 158267676 2D TGAGAACAGA TG/-- TGAGTGTAAC 3070 het 2368 hom 60 12 22 26 TG 2 1 286194 CASAVA_Build 7 158267691 4D GTGTAACAAC GAGT/---- GAGAATGAGT 3070 hom 63 het 70 1 31 39 GAGT 1 0 286195 CASAVA_Build 7 158268047 1I TGAGTGTGAA -/G GGAACAAGAG 3070 het 2735 hom 38 7 12 19 G 2 3 286196 CASAVA_Build 7 158268102 2I GAGAACAAAG --/AA AAGTATTAAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 2 4 286197 CASAVA_Build 7 158268221 2D AGTGTGAAAA TG/-- TGTGTCCATG 3070 het 3070 hom 50 18 21 12 TG 3 2 286198 CASAVA_Build 7 158277402 4D TATTTGTATC TTCT/---- TTGATTTCTT 2052 het 2052 ref 23 15 6 4 TTCT 1 0 286199 CASAVA_Build 7 158278530 3I CACTGAGTAT ---/AAC GTTAACTGTG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 AAC 0 1 286200 CASAVA_Build 7 158278885 3I GTGTCTTTAA ---/CTT CTTCTTATTT 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 CTT 2 3 286201 CASAVA_Build 7 158280156 1I CTGAGCCCGG -/C GGGGGTAAGG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 C 0 1 286202 CASAVA_Build 7 158281782 3D TGAAAGGTGG TAT/--- TAGGAAGTAT 3070 het 3070 hom 58 22 30 6 TAT 1 0 286203 CASAVA_Build 7 158283309 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2413 het 175 hom 13 1 9 3 A 13 14 286204 CASAVA_Build 7 158285507 1I GGCCTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 2753 het 1526 hom 24 7 12 5 T 15 16 286205 CASAVA_Build 7 158287099 5I CTTTCAACTT -----/AAAAA AAAGACTCAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 3 8 286206 CASAVA_Build 7 158287285 3I ATTCTAATAC ---/GCT GCTGCTATTA 3070 hom 74 het 28 0 25 3 GCT 2 3 286207 CASAVA_Build 7 158304811 5D AAAGAGCAGA AAATT/----- AAATATCTCA 3070 het 3070 ref 38 20 16 7 AAATT 1 0 286208 CASAVA_Build 7 158313573 1I TTATACTTGC -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 7 8 286209 CASAVA_Build 7 158318060 3D GAAGGGGAGG TTC/--- TTCTTTACAG 3070 hom 148 het 54 0 50 6 TTC 2 1 286210 CASAVA_Build 7 158318639 1I CCATCTTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 29 0 28 2 A 9 10 286211 CASAVA_Build 7 158318876 3D GAAGAGACAT AAC/--- AACTCCATGC 3070 hom 96 het 37 0 31 9 AAC 2 1 286212 CASAVA_Build 7 158334375 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2119 het 1521 hom 19 7 6 7 A 13 12 286213 CASAVA_Build 7 158339477 1I TTTAGTGGGT -/G GGGGGGGCGT 1707 het 1707 ref 28 15 8 5 G 7 8 286214 CASAVA_Build 7 158351555 3I CAGTAATGTT ---/AAC AACCATTAAG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 AAC 1 2 286215 CASAVA_Build 7 158355273 7I AATAAATTAT -------/TTTAAAC TTTAAACATT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 TTTAAAC 1 2 286216 CASAVA_Build 7 158355451 2D ACTGTATAAC TT/-- TGGTTATGTG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 3 1 286217 CASAVA_Build 7 158355815 2D AATTTTACTC TT/-- TTTTTTAGAG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 8 6 286218 CASAVA_Build 7 158356836 3D AAGAAAAGCT GAA/--- GGAGAAACAT 3070 het 3070 ref 36 17 11 9 GAA 1 0 286219 CASAVA_Build 7 158357427 2D CTGTTGCGGG GT/-- GTGTGTGTGT 1285 het 1285 ref 35 26 3 6 GT 7 6 286220 CASAVA_Build 7 158363142 1D CTTTTGCTTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 39 11 26 2 T 8 7 286221 CASAVA_Build 7 158369051 4I AATTTGAGAT ----/AGAA AGAGTATGAG 3047 het 3047 ref 27 15 7 5 AGAA 0 1 286222 CASAVA_Build 7 158388794 2I AAAGGAAAAC --/TG TGACATTCTG 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 TG 1 2 286223 CASAVA_Build 7 158406086 3D TGGGGAACTC GTG/--- AAGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 53 27 21 5 GTG 1 0 286224 CASAVA_Build 7 158412849 2D AATGAGACCT TG/-- TCTCTCTGTT 856 het 856 ref 17 7 5 5 TG 1 0 286225 CASAVA_Build 7 158419560 1I ATCTGTTCAT -/C TTTGTTACTT 3070 het 3070 hom 55 25 27 3 C 0 1 286226 CASAVA_Build 7 158419777 1I TACTCTTTTC -/T TTTATAAAGT 3070 het 3070 ref 57 28 22 7 T 3 4 286227 CASAVA_Build 7 158429147 11D ATAGTGGAGA GCATGTTTGTT/----------- GTCATTAGCA 3070 het 3070 hom 27 13 14 3 GCATGTTTGTT 1 0 286228 CASAVA_Build 7 158434038 1I GCTCAGTGAA -/C GGTGGCGCGG 3070 hom 90 het 37 0 29 8 C 0 1 286229 CASAVA_Build 7 158438019 1I CTAGATACTT -/A AAAAAAATAT 3028 het 3028 ref 26 14 7 5 A 7 8 286230 CASAVA_Build 7 158442463 1I TGTTGATCTC -/T TGTCCTCTCC 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 T 1 2 286231 CASAVA_Build 7 158446705 4I CGTTTCATGA ----/AATG AATGGTATGG 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 AATG 1 2 286232 CASAVA_Build 7 158447368 3I GATCATGGGA ---/CTT CTTCATCATT 3070 hom 86 het 46 0 37 9 CTT 1 2 286233 CASAVA_Build 7 158448005 2I ATGTGCACAC --/AT GTGTTGTGTG 3070 hom 211 het 84 0 70 14 AT 0 1 286234 CASAVA_Build 7 158448120 2I GTATGCACAC --/AT GTGCATGTAT 3070 het 3070 hom 73 18 47 8 AT 0 1 286235 CASAVA_Build 7 158453777 4D TCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 35 0 26 10 AAAC 5 4 286236 CASAVA_Build 7 158455077 1I CATTCAATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 9 10 286237 CASAVA_Build 7 158457796 4D GTTAGTTGGT AATA/---- AATAAAAACT 3070 het 3070 ref 30 16 13 3 AATA 2 1 286238 CASAVA_Build 7 158464227 1D TTTTAAATTG A/- AAAAAAGATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 6 286239 CASAVA_Build 7 158470397 2D TTAATGGACT CA/-- CAATTCCACG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 CA 2 1 286240 CASAVA_Build 7 158471459 1I TGATATTGGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 539 hom 50 2 43 5 A 9 10 286241 CASAVA_Build 7 158476827 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 7 8 286242 CASAVA_Build 7 158478143 1D TCCTCCGTCG T/- GGGGGACAGC 916 het 11 hom 12 0 4 8 T 1 0 286243 CASAVA_Build 7 158478891 4D14M1D CAACTGAACA CCTTCCTTAAGGCTTTGCT/----CCTTAAGGCTTTGC- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 21 9 N/A 0 0 286244 CASAVA_Build 7 158492238 5D CTTTGAGTGT CATCA/----- CACCCACACT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 CATCA 1 0 286245 CASAVA_Build 7 158503348 3D CAGTCTCACT CTC/--- CTCCACATTC 3070 het 3070 ref 37 19 11 8 CTC 2 1 286246 CASAVA_Build 7 158525051 19I GGGTGTTAGT -------------------/GGGTGGGGCCTTGCCACAG GGGTGGCGCT 3070 hom 88 het 37 0 25 12 GGGTGGGGCCTTGCCACAG 0 1 286247 CASAVA_Build 7 158527008 1I GGGTCCGTCA -/T GGGTCCTGAG 2878 het 2878 ref 62 40 11 11 T 0 1 286248 CASAVA_Build 7 158530043 1D TAAAGAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 31 1 22 8 A 13 12 286249 CASAVA_Build 7 158532023 1I GGCTTCCTTT -/A TGGGACAATA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 0 1 286250 CASAVA_Build 7 158532989 1D CAGCTACTGC A/- AGGTCAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 286251 CASAVA_Build 7 158533613 8D AACACTTTTT CTAATCAA/-------- TGGATTTAGA 3070 het 3070 ref 37 28 10 5 CTAATCAA 1 0 286252 CASAVA_Build 7 158536245 3D TACAAACCCC AAG/--- AAGGAGAAAT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AAG 2 1 286253 CASAVA_Build 7 158545694 1I CACCTAACCA -/C CCCCCACTCA 3070 het 3070 ref 67 29 26 12 C 5 6 286254 CASAVA_Build 7 158547105 1I GACCTGTCGC -/A AAAAAAAAAA 2519 het 2519 ref 28 13 6 9 A 10 11 286255 CASAVA_Build 7 158555067 3I TCTCCAACCC ---/TGT TGTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 TGT 1 2 286256 CASAVA_Build 7 158555255 1D CACACTTTCA C/- CCCCAGTTCC 3070 het 3070 hom 50 24 24 2 C 5 4 286257 CASAVA_Build 7 158568251 4D TGCAGACAGG CAGA/---- CAGACAAACA 3070 het 3070 ref 62 30 25 11 CAGA 2 1 286258 CASAVA_Build 7 158571169 1D TTTGTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 T 11 10 286259 CASAVA_Build 7 158581269 1D TCCTTCTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1475 hom 26 6 11 9 T 10 9 286260 CASAVA_Build 7 158596043 2I AACCCAGGAC --/TT TTTCCTACTT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 3 5 286261 CASAVA_Build 7 158598758 4D TCTGTTTCAC TCTG/---- ACCACCCGTG 1849 het 1849 ref 33 25 6 5 TCTG 1 0 286262 CASAVA_Build 7 158600254 4I AAGAAAGAAT ----/AGAA AGAAAGAGAG 3070 het 1332 hom 25 5 11 9 AGAA 1 2 286263 CASAVA_Build 7 158601402 2I CAGGCAGCAG --/GT GTGTGAGGCA 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 GT 2 3 286264 CASAVA_Build 7 158605882 1I ACAGAGGGGG -/C CACCACCAAG 3070 hom 87 het 34 0 28 6 C 1 2 286265 CASAVA_Build 7 158615917 1I CTTTTCAGGG -/T TTCTGCATGT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 2 3 286266 CASAVA_Build 7 158617402 1I GCCAACAAAC -/T TTTAATAATC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 3 4 286267 CASAVA_Build 7 158625299 1D AAAGCCCCCT C/- CAGGGACCTG 3070 hom 96 het 36 0 28 8 C 2 1 286268 CASAVA_Build 7 158625691 1I AAAGTGGCTG -/T TAACAGACCC 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 T 1 2 286269 CASAVA_Build 7 158626390 1I CCTCAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 T 10 11 286270 CASAVA_Build 7 158634613 1I CGTGCCGCAG -/C CCTGCCCGGG 3070 hom 51 het 21 0 14 7 C 2 3 286271 CASAVA_Build 7 158635910 1I TATCAAGAAC -/T TTTGTCCTCG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 3 4 286272 CASAVA_Build 7 158640436 5I GACAGAAAAT -----/AAATG AAATAAGTAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAATG 0 1 286273 CASAVA_Build 7 158640828 1I AGGTGCTTTG -/T TTTGTTGCCC 3070 hom 105 het 41 0 33 8 T 3 4 286274 CASAVA_Build 7 158642051 1I GTGGAGCAAA -/C CCCCTGGTTT 3070 hom 81 het 29 0 26 3 C 4 5 286275 CASAVA_Build 7 158642731 1I CCCATGTAAC -/G GGGGGTTTCA 3070 hom 78 het 28 0 24 4 G 5 6 286276 CASAVA_Build 7 158644251 1I GGCTGAAGGA -/C CCACCTCCCA 3070 hom 122 het 44 0 38 6 C 2 3 286277 CASAVA_Build 7 158644410 1I GCTGGGGCTG -/C CCACGTGTGT 3070 hom 57 het 28 0 18 10 C 2 3 286278 CASAVA_Build 7 158646151 1I CACTGTCCAT -/C CGTGGTCTGC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 2 286279 CASAVA_Build 7 158647054 3D CTTAGTTGCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 26 0 17 9 A 13 10 286280 CASAVA_Build 7 158649160 1I28M1D7M1D CTGCTGTTGT -ATAGCTCAGGGTTGTGTGCAAGAGGCCACAAATCTGA/AATAGCTCAGGGTTGTGTGCAAGAGGCCA-AAATCTG- AGTTAGTTGT 2251 hom 18 het 7 0 6 1 N/A 0 0 286281 CASAVA_Build 7 158649681 1I CCCGTCCGTG -/A ATGATTTCAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 1 2 286282 CASAVA_Build 7 158649819 1I AGTTCCAGAT -/G GGGTGTCCCA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 3 4 286283 CASAVA_Build 7 158651813 1D GTGTGTGTAT A/- TTGGTGTGTG 3070 hom 211 het 79 0 67 15 A 1 0 286284 CASAVA_Build 7 158652716 1I ACAACAGCTG -/C CAAGACACCA 3070 hom 75 het 38 0 24 14 C 1 2 286285 CASAVA_Build 7 158654093 1I36M2I TGGAAGCAGA -GGCGGGATGGTTGTTACCAGGGGCTGGGGAAGGAGG--/GGGCGGGATGGTTGTTACCAGGGGCTGGGGAAGGAGGGA AAGGAGGAGA 3070 hom 114 het 39 0 39 9 N/A 0 0 286286 CASAVA_Build 7 158657815 1D8M1D CTGCATTTGT ACCGTGGGCA/-CCCTGGGC- CTTGGTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 4 N/A 0 0 286287 CASAVA_Build 7 158658236 1I CCGTCTGTGT -/G AGTCCCGTCA 3070 hom 81 het 29 0 25 4 G 0 1 286288 CASAVA_Build 7 158672281 1I CCAGGAGCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 9 10 286289 CASAVA_Build 7 158678171 1I TCCTTAATGT -/G GGCCTTTCGC 3070 hom 125 het 44 0 38 6 G 2 3 286290 CASAVA_Build 7 158681041 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 559 het 559 ref 13 5 2 6 A 15 14 286291 CASAVA_Build 7 158682595 1I TACTTTGGGG -/T TTCTTTGCTC 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 2 3 286292 CASAVA_Build 7 158687148 1D TGCCTCAGAC A/- CAAGGTCCTA 3070 hom 98 het 36 0 29 7 A 1 0 286293 CASAVA_Build 7 158687868 1I4M1I TAAGGCTGGA -GCGA-/GGCGAG GTAACCCAAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 N/A 0 0 286294 CASAVA_Build 7 158688021 1I GGCCCTAAGA -/G GCAGTGCTCA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 G 1 2 286295 CASAVA_Build 7 158692674 1I8M1I TCCCTTCAGA -GGCGACCA-/GGGCGACCAG GGCCCCTAAA 3070 hom 78 het 26 0 26 2 N/A 0 0 286296 CASAVA_Build 7 158698347 4D GAAGGGGAGG GAGT/---- AAGTCCCTCA 3070 hom 90 het 35 0 30 6 GAGT 1 0 286297 CASAVA_Build 7 158699748 1D GGATAAAGAT G/- CCGAGTTTGC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 G 1 0 286298 CASAVA_Build 7 158699826 2I TTGAGGATAG --/TT TCAATTTGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 3 286299 CASAVA_Build 7 158702610 2I GGTGGGAGGT --/TC TCTGTTAAGC 3070 hom 104 het 41 0 34 7 TC 1 2 286300 CASAVA_Build 7 158703198 8I GGAAATGCCT --------/GGGAAAAA GGAAAACAAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 GGGAAAAA 0 1 286301 CASAVA_Build 7 158703960 1I GCATTTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 30 0 25 5 A 12 13 286302 CASAVA_Build 7 158710408 3I CTCTTCCAAC ---/CCT CGGTCCAGGT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CCT 0 1 286303 CASAVA_Build 7 158711410 1D CTGTACGGAG T/- AACTCCCAAG 3070 hom 108 het 40 0 34 7 T 1 0 286304 CASAVA_Build 7 158712296 1D ATCTGATGCT G/- GGCCAGCACT 3070 hom 82 het 35 0 23 12 G 3 2 286305 CASAVA_Build 7 158715450 1I AGATTTAAAA -/T TTTGGGAAAC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 3 4 286306 CASAVA_Build 7 158717218 12I TTCCCAGTGG ------------/AGGGAGCAACCT GACCCCTGCT 3070 hom 129 het 48 0 41 8 AGGGAGCAACCT 0 1 286307 CASAVA_Build 7 158721595 1D6M1D13M1I TGCAGAGGAC AAGTATCAAGATGACTGGAGA-/-AGTATC-AGATGACTGGAGAG GGGCCCCTGA 3070 hom 68 het 24 0 22 8 N/A 0 0 286308 CASAVA_Build 7 158723258 5D CCCCCCAAAA AAGTC/----- AGTCAAGTCA 3070 het 3070 hom 25 11 13 3 AAGTC 1 0 286309 CASAVA_Build 7 158723575 1D AGATGACAGA T/- TTTTAACCCA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 5 4 286310 CASAVA_Build 7 158725743 11I TAAACACTGG -----------/GTAAAAGACCA GAACAAATTC 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 GTAAAAGACCA 0 1 286311 CASAVA_Build 7 158727413 1I GAAATAAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 T 9 10 286312 CASAVA_Build 7 158727477 3D TAATTTTTAC TTA/--- TTTATTTTTT 3070 het 432 hom 15 1 13 1 TTA 1 0 286313 CASAVA_Build 7 158729339 1D TTTGTCCCTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 T 8 7 286314 CASAVA_Build 7 158729417 1D TATTACTATC A/- AAAGTAGGCT 2168 het 2168 ref 20 14 6 0 A 4 3 286315 CASAVA_Build 7 158732586 1I TTTACACAAT -/G GCAAATAACA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 G 1 2 286316 CASAVA_Build 7 158734155 1D TAAGTCAAAT A/- AGCCAGTCAC 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 A 2 1 286317 CASAVA_Build 7 158735968 3I GTAAACATTA ---/ATT ATTTTCAATG 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 ATT 1 2 286318 CASAVA_Build 7 158745923 1I AGTTACCAGA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 7 8 286319 CASAVA_Build 7 158746047 2D ATAACCACCT GA/-- GGATTCTGAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 GA 1 0 286320 CASAVA_Build 7 158746522 1I CATTAGTAGG -/A ATAATGGAGA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 1 2 286321 CASAVA_Build 7 158751138 2D TCAATACTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1623 hom 37 9 12 16 T 16 14 286322 CASAVA_Build 7 158759529 1I ATACAGGCAT -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 A 6 7 286323 CASAVA_Build 7 158764983 1D CGGATGGATC A/- ACCTGAGGTC 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 A 2 1 286324 CASAVA_Build 7 158766299 1D17M1D TACTCTTAAA TTTCCTGTCACCTTAGCAT/-TTCCTGTCACCTTAGCA- TTCTTGAATT 3070 hom 151 het 48 0 50 6 N/A 0 0 286325 CASAVA_Build 7 158774120 1I11M1I TCCTCTCTCA -CACTCCTATTC-/CCACTCCTATTCA ACATAGTATT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 N/A 0 0 286326 CASAVA_Build 7 158774197 2I69M1I ATTCAAATAG --AGAGAGAAAGTCAAATTGTCTCTGTTTGCAGAGACATGATTCTCTAGAAAACTGCATCATCTCAGCCCC-/GAGGAGAGAAAGTCAAATTGTCTCTCTTTGCAGAGACATGATTCTCTAGAAAACTGCATCATCTCAGCCCCA AAACTCCTTA 3070 hom 33 het 6 0 12 15 N/A 0 0 286327 CASAVA_Build 7 158774828 1I ACCATATGAT -/C TTCAACAAAC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 0 1 286328 CASAVA_Build 7 158777342 2D CACTGATTTT AG/-- AGTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 AG 2 1 286329 CASAVA_Build 7 158777458 1I CTAAAGTGAC -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 49 20 19 10 A 7 8 286330 CASAVA_Build 7 158778025 1I ACTATCTTGT -/C CTTCTTGCAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 C 1 2 286331 CASAVA_Build 7 158779244 1D TGACTTGTAG T/- TTTTCAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 16 9 T 5 4 286332 CASAVA_Build 7 158779655 1D TGGCCAGGAG C/- CCCCCCAGGA 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 C 7 6 286333 CASAVA_Build 7 158781186 2D AGCAAGAACT CA/-- CTACCATGAG 3070 het 3070 ref 93 38 33 22 CA 1 0 286334 CASAVA_Build 7 158781812 1I AAACAGCCCT -/G CCAGAGTTCT 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 G 0 1 286335 CASAVA_Build 7 158781981 6D TTTTTTTTTT TTTTTC/------ ATTTGCTGGG 3070 het 3070 ref 60 27 27 10 TTTTTC 1 0 286336 CASAVA_Build 7 158782649 1D GTACAGATTA T/- TTTCATCACC 3070 het 3070 ref 78 43 27 10 T 4 3 286337 CASAVA_Build 7 158783409 3I TTGTTTTTTT ---/TTC CTTGTAAATT 3070 het 3070 ref 44 29 12 4 TTC 0 1 286338 CASAVA_Build 7 158783611 4I TCAAAAAAAA ----/AAAG AAAAAAAAAA 574 het 574 ref 23 5 4 14 AAAG 0 1 286339 CASAVA_Build 7 158783654 2I TTGATTTATT --/TC AAAATATAGA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 TC 0 1 286340 CASAVA_Build 7 158789962 2I AAAGGATAAT --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 8 10 286341 CASAVA_Build 7 158790333 1D52M1I AATAAACTTT ATGTGGTACATTTTCTATAACCTTATACTCCCAGTCCTAGGTTTCAATGAGAG-/-TGTGGTACATTTTCTATAACCTTATACTGCCAGTCCTAGGTTTTAATGAGAGA AAATCATGCA 3070 het 3070 ref 88 65 38 16 N/A 0 0 286342 CASAVA_Build 7 158790467 1I ATCTGGAAGT -/A ACCCAAAGAT 3070 het 3070 hom 72 33 35 4 A 1 2 286343 CASAVA_Build 7 158790734 1I GTAACGAAAA -/G CAATGGAACT 3070 het 3070 hom 87 39 40 9 G 0 1 286344 CASAVA_Build 7 158790827 1D TTCGGATGCC G/- GGGCTGGGGG 3070 het 3070 ref 55 29 22 4 G 4 3 286345 CASAVA_Build 7 158791089 1D36M2I CACTACCAAA CATCCCCCATTAAATTTTTCCTGTGGATTTAAAACTC--/-TTCCCCCATTAAATTTTTCCTGTGGTTTTAAAACTCTT TATCTGTAGG 3070 het 3070 ref 74 42 34 28 N/A 0 0 286346 CASAVA_Build 7 158791756 1D CACCAAATCT C/- ATGTTGAAAT 3070 het 3070 ref 78 47 21 11 C 1 0 286347 CASAVA_Build 7 158791958 1I CTGCAGAACT -/G TAAATTAAAT 3070 het 3070 ref 64 41 15 9 G 0 1 286348 CASAVA_Build 7 158793300 4I TACAAGCAAC ----/TTCA TTCACATCAG 3070 het 3070 hom 89 34 47 8 TTCA 1 2 286349 CASAVA_Build 7 158793438 2I4M5D TTTATCAACC --ATAATCAAC/GAATAA----- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 78 36 37 12 N/A 0 0 286350 CASAVA_Build 7 158793813 1I CATCTCTTTA -/T TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 78 36 33 9 T 4 5 286351 CASAVA_Build 7 158793959 1D AAGATGCTTT C/- CCTAAGAAAC 3070 het 3070 ref 88 45 34 10 C 3 2 286352 CASAVA_Build 7 158794007 3D TGAAATGATC TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 ref 80 43 21 17 TAA 6 5 286353 CASAVA_Build 7 158794130 3D CAATCTAAAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 95 43 37 28 T 16 13 286354 CASAVA_Build 7 158794257 1I GGACATTTAA -/T TGAGTGGTCA 3070 het 3070 ref 95 48 39 8 T 1 2 286355 CASAVA_Build 7 158797262 1D CCATCTTTTT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 8 7 286356 CASAVA_Build 7 158797858 1D TTGAAGGAGT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 60 29 25 7 A 8 7 286357 CASAVA_Build 7 158797963 4D GATGACAGAC TTGA/---- TTGATTTATT 3070 het 3070 ref 54 26 25 4 TTGA 2 1 286358 CASAVA_Build 7 158798138 5I AGACAGAGAT -----/AAGAG AAAAGAGAAG 3070 het 3070 ref 64 32 28 4 AAGAG 0 1 286359 CASAVA_Build 7 158798439 1D GGAGATAAAC A/- GGATTATTTG 3070 het 3070 ref 69 35 23 12 A 1 0 286360 CASAVA_Build 7 158802112 1D GAAAAATGAG A/- GGAAAATCCA 3070 het 3070 ref 75 33 35 7 A 1 0 286361 CASAVA_Build 7 158802322 1I ATACACTAGG -/C CCCAACAGAC 3070 hom 181 het 71 0 61 10 C 3 4 286362 CASAVA_Build 7 158803968 1I AGCTTCTCAT -/C AATCCATCCA 3070 hom 144 het 57 0 49 8 C 0 1 286363 CASAVA_Build 7 158806408 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1233 hom 15 5 8 2 A 13 14 286364 CASAVA_Build 7 158807287 1I ATTATGTGGG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 8 9 286365 CASAVA_Build 7 158810964 1D ATAAACACAA C/- AGGTAAGAAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 1 0 286366 CASAVA_Build 7 158813372 1I AGCAAATTTG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 31 15 12 4 A 7 8 286367 CASAVA_Build 7 158815115 3D GAACTTTAGG TTT/--- CCAGATAGTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 T 3 0 286368 CASAVA_Build 7 158815502 1D19M1D TTTTTGTTTT CCCAGTAAAGAAATGTTATTA/-CCAGTAAAGAAATGTTATT- ACATAAAATT 3070 hom 96 het 33 0 33 5 N/A 0 0 286369 CASAVA_Build 7 158817064 1I73M1I TAAGTGAAGA -GTCAACCATGTGCCACTTGGTGGAGGAAGATACACTCTGCACAGTCCATGCTTATGCAAAGCCACTGACCCCA-/GGTCAACCATGTGCCACTTGGTGGAGGAAGATACACTCTGCACAGTCCATGCTTATGCAAAGCCACTGACCCCAC CTCTGGAACT 3070 het 8 hom 43 1 66 7 N/A 0 0 286370 CASAVA_Build 7 158819135 1I GCATGCATGC -/T GCAATTGAGT 3070 het 3070 ref 68 44 13 11 T 0 1 286371 CASAVA_Build 7 158819632 1I TGGGGTTAAT -/G GCAGCTGTAT 3070 het 3070 ref 83 56 8 19 G 1 2 286372 CASAVA_Build 7 158819786 1D TCATCTATTG T/- TAAGACTTTC 3070 het 3070 ref 52 26 19 7 T 2 1 286373 CASAVA_Build 7 158820688 1D9M1D GCCATAGATC TTTTTCTGCGC/-TTCTCTGCG- CCCGCGCCGG 3070 het 812 hom 22 2 19 3 N/A 0 0 286374 CASAVA_Build 2 9536 4D TCTAAAAGAC TTTT/---- TTAAGAGCAT 1114 het 1114 ref 36 31 3 5 T 6 2 286375 CASAVA_Build 2 28999 4I TGAAAAAGGG ----/GAAT GAATGTTCAA 3070 het 3070 hom 51 12 31 8 GAAT 1 2 286376 CASAVA_Build 2 42532 1I TAAAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 A 10 11 286377 CASAVA_Build 2 52985 1D AAATACTGTT A/- AAAAAAAAAG 1346 het 1346 ref 33 25 4 5 A 10 9 286378 CASAVA_Build 2 100983 1D TATGTATTTA T/- TTTTTTACAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 7 6 286379 CASAVA_Build 2 115178 1I ATTTGATATA -/T ACTATTTATT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 0 1 286380 CASAVA_Build 2 121524 1D TATTCATGTT A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 67 33 30 5 A 7 6 286381 CASAVA_Build 2 122040 1D GATTGAGGCA T/- TGTTAGACTA 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 T 2 1 286382 CASAVA_Build 2 137793 29D TGAAATCCAA TATTTCCTTATTAAATTTTGTCTGTGTAT/----------------------------- TATTCTGTTC 3070 het 3070 ref 31 28 11 2 TATTTCCTTATTAAATTTTGTCTGTGTAT 1 0 286383 CASAVA_Build 2 139024 1D GAGAAGCCTT A/- AAGTCTTTTC 3070 het 3070 ref 39 16 15 9 A 3 2 286384 CASAVA_Build 2 145199 1I CTCTCTTTTT -/C CTTCTCCTAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 1 2 286385 CASAVA_Build 2 183826 1I CGCTTTTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1809 hom 33 5 20 8 A 13 14 286386 CASAVA_Build 2 187427 13D CCCCGTAACA GAACACAGAAACG/------------- CGCAGGGCCT 3070 het 661 hom 15 2 13 7 GAACACAGAAACG 1 0 286387 CASAVA_Build 2 197721 4D GGAAGGGAGG GAGA/---- GAGGGAGGGA 735 hom 10 het 4 0 4 0 GA 3 1 286388 CASAVA_Build 2 199644 10D TCTTACCTCT CTGCCCCTCC/---------- CTGCCCCTCC 3070 hom 81 het 32 0 20 13 CTGCCCCTCC 2 1 286389 CASAVA_Build 2 222446 1I TTTAAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 23 1 19 3 T 10 11 286390 CASAVA_Build 2 227138 1D GCTTCCCACA T/- TTCCCACTCG 3070 hom 138 het 52 0 45 8 T 3 2 286391 CASAVA_Build 2 261999 1D AGGAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 746 hom 38 3 22 13 A 16 15 286392 CASAVA_Build 2 273232 1I ATAAATCGCA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 7 8 286393 CASAVA_Build 2 284786 1I GATAAGCTAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 8 9 286394 CASAVA_Build 2 301907 1D GGCATTAATT A/- ATCTCACTAA 3070 hom 162 het 56 0 54 4 A 2 1 286395 CASAVA_Build 2 303886 15D TTTTTCTCGC TGATTTGCTATGAAA/--------------- TGATAGTTGG 3070 hom 54 het 18 0 16 7 TGATTTGCTATGAAA 1 0 286396 CASAVA_Build 2 309054 14D ACGTGAGTGT GGGCATGTGTGTGC/-------------- GGGCATGTGA 890 het 10 hom 21 0 6 20 GGGCATGTGTGTGC 1 0 286397 CASAVA_Build 2 309097 4D TGAGTGTGTC TGTG/---- TGTGCGCACA 1204 hom 22 het 22 0 8 16 TG 4 2 286398 CASAVA_Build 2 309177 2I TGTGGGCGTA --/TG TGTGTGTGGG 3070 hom 10 het 37 1 15 21 TG 4 5 286399 CASAVA_Build 2 317091 1D TCAATACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 12 11 286400 CASAVA_Build 2 321228 1I TTTATCAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 9 10 286401 CASAVA_Build 2 336072 1I TAATTTCAGC -/A ATGTTTGGTA 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 1 2 286402 CASAVA_Build 2 339496 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 7 A 12 11 286403 CASAVA_Build 2 340838 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAATATCA 3051 het 3051 ref 29 17 9 3 A 5 6 286404 CASAVA_Build 2 341249 1D AGTATAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 19 19 9 T 13 12 286405 CASAVA_Build 2 362100 1I GGTGATTGTT -/A ATGATTTCAG 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 A 1 2 286406 CASAVA_Build 2 367205 2I CATGTTACCC --/CT GTCACTCTTC 3070 het 3070 hom 49 18 20 11 CT 0 1 286407 CASAVA_Build 2 397559 4D TCCCAGCAGA ATGC/---- ATGCCAGAGA 3070 het 3070 ref 61 31 21 9 ATGC 2 1 286408 CASAVA_Build 2 397802 1I CTCCTCAGAA -/C CCCCCCCCAA 2059 het 2059 ref 48 24 11 13 C 8 9 286409 CASAVA_Build 2 399389 4D19M1D GACTCTGTCT CAAACAAACAAACAAACAACAACA/----CAAACAAACAAACAACAAC- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 25 10 15 4 N/A 0 0 286410 CASAVA_Build 2 401263 8D TGCCCCAGTT CCTGATAA/-------- CCACTCTTCT 3070 het 3070 hom 47 21 27 2 CCTGATAA 1 0 286411 CASAVA_Build 2 404971 1D TTGAGGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 11 10 286412 CASAVA_Build 2 422383 5D GAGGAAATGT GGTAG/----- GTTTCATTAT 3070 het 3070 hom 36 12 18 8 GGTAG 1 0 286413 CASAVA_Build 2 429952 1D CATGCAGGGC A/- GGGGCTCCTC 866 het 866 ref 26 16 5 5 A 1 0 286414 CASAVA_Build 2 434157 1I GTTGAGGGCT -/G GTGGAGAAAC 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 G 1 2 286415 CASAVA_Build 2 448622 1D CCCAGGGGCT G/- GGGGGAGGGA 3070 hom 84 het 33 0 26 8 G 6 5 286416 CASAVA_Build 2 454222 1D AACCATGTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 10 9 286417 CASAVA_Build 2 459437 4I AGCCTTGCAC ----/CTTT CTATTATCTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CTTT 0 1 286418 CASAVA_Build 2 517247 2D GATGTATGTG GT/-- GTGTGTGGTG 3070 hom 9 het 71 1 50 21 GT 4 3 286419 CASAVA_Build 2 552606 1D CTGCCGCGTA G/- GGGGGGGACA 3070 hom 71 het 33 0 18 17 G 8 7 286420 CASAVA_Build 2 555281 1I CCCTCAGCTG -/C TTTTCTCTTT 3070 hom 126 het 46 0 41 5 C 0 1 286421 CASAVA_Build 2 574556 1I TGGGCTCTGA -/T TTTTTAACGT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 5 6 286422 CASAVA_Build 2 575056 4D AGGGTGTTCA ACTT/---- ACTTAATTAA 3070 hom 102 het 41 0 34 11 ACTT 2 1 286423 CASAVA_Build 2 582110 3I TTGTAAAGTC ---/AAT AACTGAATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAT 0 1 286424 CASAVA_Build 2 586756 1I GCAAGGACAA -/G GGGGTCCTAG 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 G 4 5 286425 CASAVA_Build 2 588047 1D TAGGCAAGGT G/- GGGGGAAGGA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 G 6 5 286426 CASAVA_Build 2 594830 1D CCACACACAA G/- ACCACACGCA 1424 hom 30 het 20 0 6 14 G 1 0 286427 CASAVA_Build 2 601144 5D CTCAGACAAG GTGCT/----- GTGTCTGTTG 3070 het 3070 ref 35 19 16 5 GTGCT 1 0 286428 CASAVA_Build 2 601934 2D GGGAGGGGAA AG/-- AGAGAAAGAT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 AG 3 2 286429 CASAVA_Build 2 603047 2I AAATCCAAAC --/AT GTGTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 AT 0 1 286430 CASAVA_Build 2 603732 1I ACATTTGCAC -/A GGTGGTGAAA 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 A 0 1 286431 CASAVA_Build 2 603995 20I GTATTATTAA --------------------/CATATTATGTCTCAAATCTC AAGTACAATT 3070 het 3070 hom 49 14 31 4 CATATTATGTCTCAAATCTC 0 1 286432 CASAVA_Build 2 604886 4D ATACAAAGTA TCTT/---- TCAAGCCTCA 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 TCTT 1 0 286433 CASAVA_Build 2 605259 5D ATTTTGGATT TTGGA/----- TTTTTTTTCA 596 het 596 ref 28 14 2 12 TTGGA 1 0 286434 CASAVA_Build 2 606505 5I ACCATCTCTA -----/TTACT TTAGTGATAT 3070 het 3070 ref 54 26 24 4 TTACT 0 1 286435 CASAVA_Build 2 608105 4I CTTTGATAAG ----/ATCA AAGAAGGCAG 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 ATCA 0 1 286436 CASAVA_Build 2 610418 1D ATCTGGGGGG A/- AAAAAGAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 6 5 286437 CASAVA_Build 2 611603 1I ACTTCCAGGG -/T GGCGTCTCCT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 0 1 286438 CASAVA_Build 2 613864 3D GCCAAGGAAG TTC/--- TTCTTCCTGC 3070 het 3070 ref 38 19 14 7 TTC 3 2 286439 CASAVA_Build 2 619772 4D16M10D TCTATATATT TATCTATCAATTATACCAATTGATAGATAA/----TATCAATTATACCAAT---------- TCAATCATCT 3070 het 3070 ref 35 25 12 0 N/A 0 0 286440 CASAVA_Build 2 619862 4I ACTGTCTGTC ----/ATCT ATCATCTATC 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 ATCT 0 1 286441 CASAVA_Build 2 620554 1D ATAATTCTTG A/- AAAAAGGTTA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 6 5 286442 CASAVA_Build 2 620865 4D ATTTAATTAT TTAA/---- TTATTTACAT 809 het 809 ref 6 3 3 0 TTAA 1 0 286443 CASAVA_Build 2 621072 1D CTTTTTTGTA T/- TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 T 7 6 286444 CASAVA_Build 2 621166 1D GACATCTAGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 A 9 8 286445 CASAVA_Build 2 621397 1I ACAAAGTGAT -/A ATTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 1 2 286446 CASAVA_Build 2 622088 1D TTAGATATAT A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 A 7 6 286447 CASAVA_Build 2 622188 4I ATTATAAAAT ----/AGAG AGAGATGAAT 3070 het 3070 hom 29 8 21 0 AG 2 4 286448 CASAVA_Build 2 622579 1D ACTATGTGTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 7 6 286449 CASAVA_Build 2 622790 3I TTTCCCTTTC ---/TTG TTGTTAACTT 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 TTG 1 2 286450 CASAVA_Build 2 622941 2I GAAATATATT --/CA GTCTATTTTA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 CA 0 1 286451 CASAVA_Build 2 623054 1I26M1D TGCTGAAGTA -AATTTTTTTGCAAGTCCTTGTAGAGAT/CATTTTTTTTACAAGTCCTTGTAGAGA- TTGCCAATTT 3070 het 3070 ref 27 16 15 3 N/A 0 0 286452 CASAVA_Build 2 625608 1D21M5D AAGCTGATTT AAAAAAATCACAGCTTTAAATATATAT/-AAAAAATCACAGCTTTAAATA----- TATATTATTT 3070 het 3070 hom 30 15 16 4 N/A 0 0 286453 CASAVA_Build 2 630960 4D23M4D ATATAAACAC ACATACATACTACCTACACATGCACACACAT/----ACATACTACCTACACATGCACAC---- ACACACTTTT 3070 het 3070 ref 90 64 37 14 N/A 0 0 286454 CASAVA_Build 2 631134 2I CATGTGCACA --/CT CACCCATACA 3070 het 3070 hom 79 36 36 7 CT 0 1 286455 CASAVA_Build 2 635812 1I TGCAACAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 10 11 286456 CASAVA_Build 2 636691 1I GGGGATGAGA -/C CCCCCCATAT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 C 6 7 286457 CASAVA_Build 2 636942 1I AGGCTGAGGT -/G GGAGGATTGC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 G 2 3 286458 CASAVA_Build 2 647293 3I CACCTGGTAA ---/AAG AAGGAGGACA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAG 1 2 286459 CASAVA_Build 2 653847 2D TATTATTTGA TT/-- TGTCACATCA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 T 3 1 286460 CASAVA_Build 2 675486 3D ATACATTAGA GAC/--- AAGAGAACAT 3070 hom 84 het 29 0 29 1 GAC 1 0 286461 CASAVA_Build 2 689393 1D TCACATAGTA T/- TTTATCTTGT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 4 3 286462 CASAVA_Build 2 695046 2D GAAATTGTGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 111 het 44 0 38 7 TA 7 6 286463 CASAVA_Build 2 696232 4I GAGAATAAAC ----/ACTT ACAGAAAAGA 3070 hom 144 het 58 0 49 9 ACTT 0 1 286464 CASAVA_Build 2 696679 1D CTCTAGTACC T/- TTTCCCTTCT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 4 3 286465 CASAVA_Build 2 696973 4I ATTTTTTTGT ----/TTAA TTCTCTCTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 TTAA 0 1 286466 CASAVA_Build 2 706103 1I AAAAAGACTT -/A ACAAGGATTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 286467 CASAVA_Build 2 706952 4I TCCCAAGAAG ----/ACAC ACACCAGGAC 3070 hom 54 het 23 0 17 6 AC 2 4 286468 CASAVA_Build 2 738123 3D CCTCACCATC ACT/--- ACCACCAATG 944 het 944 ref 53 32 8 15 ACT 1 0 286469 CASAVA_Build 2 752989 7D GTGAAGCATA CTGAAAT/------- CTGAGAATAT 3070 het 3070 ref 37 19 18 5 CTGAAAT 1 0 286470 CASAVA_Build 2 760594 1I GGTAGACCAT -/C ATAAAGGTCT 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 C 0 1 286471 CASAVA_Build 2 766900 1I TGGATCGAAA -/C CCTGTGGTTA 3070 het 3070 ref 41 21 11 9 C 2 3 286472 CASAVA_Build 2 776229 6D GTAATTTCTT ACATCA/------ ACAATAGAAA 3070 het 3070 hom 34 13 19 4 ACATCA 1 0 286473 CASAVA_Build 2 785669 2I AACTTAATTT --/TA CAAGGAATGG 3070 hom 55 het 22 0 13 9 TA 0 1 286474 CASAVA_Build 2 787787 1D GCCTTATCAC A/- AGGGCAGAGA 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 A 2 1 286475 CASAVA_Build 2 804801 1I TAATTAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 106 hom 39 1 34 4 A 8 9 286476 CASAVA_Build 2 808342 4I TTGTTGGCTT ----/ATTA ATTAATTAGT 3070 hom 120 het 50 0 41 9 ATTA 2 3 286477 CASAVA_Build 2 810865 1D AAAATTAAAG C/- CGCAACGGAT 3070 hom 138 het 49 0 47 3 C 2 1 286478 CASAVA_Build 2 820685 1D GTAATATTCC A/- AAAAAGAGTT 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 A 6 5 286479 CASAVA_Build 2 826211 2I ACATGCACAC --/AT ATGTTTATTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AT 1 2 286480 CASAVA_Build 2 828323 1D GCTCCTGCAA G/- GGCGCAGTGG 3070 hom 105 het 37 0 34 3 G 3 2 286481 CASAVA_Build 2 836713 2I CTTAAATTCC --/CT GTCTCCAAGA 3070 hom 124 het 45 0 40 5 CT 0 1 286482 CASAVA_Build 2 836848 22I GAGAAATGGA ----------------------/CACAGCCCTGGGAGCTCATGTC CACACAGGGA 3070 hom 81 het 30 0 25 5 CACAGCCCTGGGAGCTCATGTC 0 1 286483 CASAVA_Build 2 839913 2D AAAAAAAAAA GG/-- GGGATAGGGT 3070 het 148 hom 33 2 22 9 G 5 3 286484 CASAVA_Build 2 839943 2I TCTCTCTCAC --/CT CTCTCTCTCT 1680 het 1230 hom 34 7 13 14 CT 7 8 286485 CASAVA_Build 2 841031 2D ACCTGCCTTC TT/-- TTGTCTGCCT 3070 hom 144 het 52 0 48 4 T 4 2 286486 CASAVA_Build 2 845969 1D TGTTACAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 10 9 286487 CASAVA_Build 2 852669 1D CTCTTCCCAA G/- ACCACCTTAG 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 G 1 0 286488 CASAVA_Build 2 862232 2I GTTCCTTCAG --/CC CCCAGACCCA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 C 3 5 286489 CASAVA_Build 2 865513 6D6M7D CTCCTACGCA GCTGCCTTCCGTCCTCCCC/------TTCCGT------- CGTGGGCCAT 1010 het 1010 ref 39 30 4 10 N/A 0 0 286490 CASAVA_Build 2 868530 4D AGCCTCAGAT ACAA/---- ACAAACAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 22 8 ACAA 3 2 286491 CASAVA_Build 2 872848 3I GTGATTAAAT ---/ACA CAGTGGGGGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ACA 0 1 286492 CASAVA_Build 2 877441 4D ATAGATACTA AATC/---- TATCTATCTC 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 AATC 1 0 286493 CASAVA_Build 2 880169 1D AGAGTGTTAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 9 8 286494 CASAVA_Build 2 885269 1D AATACCAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 10 9 286495 CASAVA_Build 2 885979 6I AATTTGCTAG ------/TGTACA TACACCCCAG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TGTACA 0 1 286496 CASAVA_Build 2 889215 2D CCACATTTTC CT/-- CTCTTGCTTC 3070 het 3070 ref 45 21 16 10 CT 3 2 286497 CASAVA_Build 2 890684 1D GAGGTAGCAC A/- GGGGGGAGCA 3070 het 3070 ref 37 18 11 9 A 1 0 286498 CASAVA_Build 2 891795 1D TCTGAGAGCT G/- GGGGTCCTTT 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 G 5 4 286499 CASAVA_Build 2 892467 4D GTAATTAGTA TAAT/---- TAATTATTAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 6 TAAT 2 1 286500 CASAVA_Build 2 905442 4D GATGATAGAA AGAT/---- AGATAGATGA 3070 het 3070 ref 49 26 18 7 AGAT 3 2 286501 CASAVA_Build 2 909226 1I TGCCCATCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 T 8 9 286502 CASAVA_Build 2 919380 2D AACAAAAAAC AG/-- GGTATACTCT 3070 het 3070 hom 27 9 16 5 AG 1 0 286503 CASAVA_Build 2 927062 2D AGTCTCACTC TG/-- TCACCAGGCT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 TG 1 0 286504 CASAVA_Build 2 938349 1D TGAAAGAAAC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 9 8 286505 CASAVA_Build 2 947991 5I CTCCTGGTCT -----/TGAAC TAAGCGACCC 3070 hom 72 het 26 0 23 3 TGAAC 0 1 286506 CASAVA_Build 2 949314 1I GCCAGTTTTT -/A AACTTCACTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 3 286507 CASAVA_Build 2 950682 2D CTTGGCCACC TT/-- TGCTTTTCCT 3070 hom 65 het 31 0 21 12 T 3 1 286508 CASAVA_Build 2 952142 1D ATGGTGAGAA T/- TCTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 2 1 286509 CASAVA_Build 2 952650 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAACAA 834 het 7 hom 9 0 3 8 AAC 1 0 286510 CASAVA_Build 2 953829 1I ATTTCAAGCG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 9 10 286511 CASAVA_Build 2 954008 2I TGTGGTGATG --/CC CCCCTTTTCC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 C 4 6 286512 CASAVA_Build 2 954981 3D AGTTGGGTAA TGT/--- TGTGCCTCCA 3070 het 3070 hom 41 21 18 2 TGT 2 1 286513 CASAVA_Build 2 955067 2I TTTATAATAG --/TT TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 8 10 286514 CASAVA_Build 2 957401 1I AGTTTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 26 1 19 6 T 11 12 286515 CASAVA_Build 2 959227 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 9 10 286516 CASAVA_Build 2 961334 1I AATGTTTGAC -/A AAAAAATACC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 6 7 286517 CASAVA_Build 2 965574 5D AGATTATAAT TTAAG/----- TTATGTTAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 3 TTAAG 1 0 286518 CASAVA_Build 2 970659 1I AGAAAAGACA -/T GTTCTAGGCT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 0 1 286519 CASAVA_Build 2 972426 1D CTTTTAGTAG A/- AAAGATAAAA 3070 het 3070 ref 48 26 19 4 A 4 3 286520 CASAVA_Build 2 974416 1D TTTTATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 T 11 10 286521 CASAVA_Build 2 975040 4I TCACACTCAG ----/TAAA TAGATTGTCA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 TAAA 0 1 286522 CASAVA_Build 2 978159 5D TTTCAAAAAT AAATG/----- AAATATTTAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAATG 1 0 286523 CASAVA_Build 2 978757 3D TTGTGGGTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 18 1 13 4 T 17 14 286524 CASAVA_Build 2 992098 2I CAAAAAAAAA --/AG AGAAAATTCT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AG 1 2 286525 CASAVA_Build 2 994742 2I AATATTTTCT --/AC AGAGAAACTC 3070 hom 66 het 28 0 21 7 AC 0 1 286526 CASAVA_Build 2 995402 2I6M4D9M1D CAGCCACACC --TGTGCCACATCAGGAAGACA/CATGTCCC----CAGGAAGAC- TGCTGCTTCT 3070 het 3070 hom 46 20 26 14 N/A 0 0 286527 CASAVA_Build 2 997367 1D AATTGCAGGC T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 23 8 10 5 T 7 6 286528 CASAVA_Build 2 997449 3D CATTGGACTT TAA/--- TCAATTACTG 3070 het 3070 ref 27 13 13 3 TAA 1 0 286529 CASAVA_Build 2 1003235 2D ACAGGCAGGG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 164 het 71 0 54 18 AC 6 5 286530 CASAVA_Build 2 1006266 7D TTTTTTAAAA AAATTCC/------- AACAGAAAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AAATTCC 1 0 286531 CASAVA_Build 2 1008829 1I TTCACATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 26 2 17 7 T 12 13 286532 CASAVA_Build 2 1009234 3D GGGTAATAGG TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 TTA 4 3 286533 CASAVA_Build 2 1019211 2D GGATGGAAAC AG/-- GGTATGTTAA 3070 hom 129 het 47 0 42 7 AG 1 0 286534 CASAVA_Build 2 1019740 2I TTCATGTCAC --/AG GGGTTTGTTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AG 0 1 286535 CASAVA_Build 2 1022412 3D TCCAGCTGAT CCC/--- CCAATTGTGT 3070 hom 90 het 35 0 31 6 C 5 2 286536 CASAVA_Build 2 1039964 3I GTTCCCACCC ---/GAG AAGAGAGGCG 3070 hom 63 het 26 0 18 8 GAG 0 1 286537 CASAVA_Build 2 1042642 4D CCCCGCTGTG GGGA/---- GGGAGGGAGG 1406 hom 12 het 5 0 4 2 GGGA 4 3 286538 CASAVA_Build 2 1045048 1D GCAAAAGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1188 hom 32 3 23 6 A 13 12 286539 CASAVA_Build 2 1052822 1I AGTCACTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 17 12 18 A 14 15 286540 CASAVA_Build 2 1057335 2D AAGTATAATA AT/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AT 1 0 286541 CASAVA_Build 2 1058002 6D29M1I AAGCCAGTGA TTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTTCT-/------TTTTCTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTTTTC TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 38 1 32 8 N/A 0 0 286542 CASAVA_Build 2 1065150 1I CTGACTTTAG -/T TTTTTTAACA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 6 7 286543 CASAVA_Build 2 1068871 1D ACTAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 1 0 286544 CASAVA_Build 2 1068946 2D TAAAAAAAAA AC/-- AAACGCCTGG 2249 hom 27 het 11 0 7 4 AC 1 0 286545 CASAVA_Build 2 1075321 5D ACTCCGTCTC AAAAT/----- AATAATAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AAAAT 1 0 286546 CASAVA_Build 2 1077934 2D CCCTTCAATT AG/-- AGAGAGAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 AG 4 3 286547 CASAVA_Build 2 1079581 1I GGTTACTGGC -/A AAGGGCTGCC 3070 hom 90 het 32 0 28 4 A 2 3 286548 CASAVA_Build 2 1086645 1I AGCCCGTGTG -/C CCCTCCCGAG 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 C 3 4 286549 CASAVA_Build 2 1087304 1I GTGCAGGAGG -/C GCTGTGGGAC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 C 0 1 286550 CASAVA_Build 2 1090964 1D GCCATGCAGA G/- GGTCTTGGCT 3070 het 3070 ref 46 22 14 10 G 3 2 286551 CASAVA_Build 2 1098671 1I CTAAGTGAGG -/T TTAAACCTTG 3070 het 3070 ref 57 31 20 6 T 2 3 286552 CASAVA_Build 2 1101886 4D GGTTTTAGGG CTTT/---- CTTTCTGAGA 3070 het 3070 hom 47 20 21 7 CTTT 2 1 286553 CASAVA_Build 2 1104350 1I TAAGCAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 21 0 A 10 11 286554 CASAVA_Build 2 1107146 1I CTAAGAATTG -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 5 6 286555 CASAVA_Build 2 1107258 2D GTGTTTGACT CA/-- CAGTTCCGCA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 CA 2 1 286556 CASAVA_Build 2 1109527 3I TCAGGTTAAT ---/AGA AGAACAAGTA 3070 hom 108 het 37 0 36 1 AGA 1 2 286557 CASAVA_Build 2 1111429 2D TTTTTCTCTC TT/-- GGGGCAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 T 2 0 286558 CASAVA_Build 2 1112702 4I TTTTTGAGGT ----/CTTA TTTATACAAT 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 CTTA 0 1 286559 CASAVA_Build 2 1112815 1D TTTGAGTTGA T/- TTTTTTATAC 3070 hom 97 het 38 0 33 5 T 7 6 286560 CASAVA_Build 2 1113857 1D TATTAAATGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 9 8 286561 CASAVA_Build 2 1119390 4D CACTTTTTAA TTTT/---- TTTTAAGGCT 3070 het 3070 ref 37 17 17 5 T 8 4 286562 CASAVA_Build 2 1119603 1I CGGACCCTCG -/C CGGTGAGTGT 2177 het 2177 ref 23 14 5 4 C 1 2 286563 CASAVA_Build 2 1123189 4I TGGACACATG ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 hom 67 21 22 24 CA 7 9 286564 CASAVA_Build 2 1126503 1D AAGTGCTATG A/- AAACCATTGA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 A 4 3 286565 CASAVA_Build 2 1127474 2I CTCTGTACTC --/AG AGGGGAGTTA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 AG 1 2 286566 CASAVA_Build 2 1127647 2D GTCCAGCAGC AT/-- TTTTTGTCCA 3070 hom 70 het 29 0 20 11 AT 1 0 286567 CASAVA_Build 2 1130975 1D TCAAGATAGG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 9 8 286568 CASAVA_Build 2 1134523 1D AGGGAAGGGA G/- GAGGCGCCTT 3070 hom 86 het 32 0 25 7 G 2 1 286569 CASAVA_Build 2 1136400 1I ATGTCGTGTT -/A AGAGTATAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 1 2 286570 CASAVA_Build 2 1136606 1I GGCTGCTGAA -/C CCGAGCTCCA 3070 hom 66 het 32 0 21 11 C 2 3 286571 CASAVA_Build 2 1137679 3I CTAGAGAACA ---/ATT ATTCAAATAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATT 1 2 286572 CASAVA_Build 2 1138262 2D GCACATGTGC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 188 het 66 0 61 8 AT 1 0 286573 CASAVA_Build 2 1140643 4I AAACTCACAC ----/CACA CACACACAAA 3070 hom 156 het 65 0 51 14 CA 4 6 286574 CASAVA_Build 2 1140699 2D CAAACAACAC AT/-- AGTCATACAC 3070 hom 129 het 52 0 44 11 AT 1 0 286575 CASAVA_Build 2 1140850 15D CACACACACA CGTAGACCCCCCCCC/--------------- CACACACATA 2171 het 2171 ref 69 21 13 40 CGTAGACCCCCCCCC 1 0 286576 CASAVA_Build 2 1144800 2D ACCTGTGTGT TC/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 61 het 50 0 17 37 TC 1 0 286577 CASAVA_Build 2 1144832 1D GTGCATATGT G/- GGGGGGGTGT 3070 hom 99 het 51 0 33 18 G 8 7 286578 CASAVA_Build 2 1144921 2D GTGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 151 het 62 0 49 14 GT 7 6 286579 CASAVA_Build 2 1155665 1I AGGCGAAACG -/T TCCTCTGCTG 3070 het 3070 hom 40 19 18 3 T 1 2 286580 CASAVA_Build 2 1155846 4D AAGAGAAAAT AAAC/---- AACCGTTTGA 3070 het 3070 hom 42 16 23 4 AAAC 1 0 286581 CASAVA_Build 2 1156310 1D GTTTCAGAGT C/- CGCCCCCAAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 C 2 1 286582 CASAVA_Build 2 1159976 8D AGTTTTATCC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 9 14 13 AT 10 6 286583 CASAVA_Build 2 1162086 43D AAGCCCCCAT AACACAAGTTTACCTATATAACAAACCTGCACATGTACCCCTG/------------------------------------------- AACCTAAAAT 3070 het 3070 hom 19 10 12 1 AACACAAGTTTACCTATATAACAAACCTGCACATGTACCCCTG 1 0 286584 CASAVA_Build 2 1162337 2D AATTTACAAG AA/-- AAAAAAAAAC 2648 het 2648 ref 22 11 7 4 A 11 9 286585 CASAVA_Build 2 1166907 2I GTATAATAAT --/AA AATAAAATAA 3070 het 1984 hom 12 4 8 0 A 2 4 286586 CASAVA_Build 2 1167396 1I TTACTAACTA -/C CTGCTTTCCT 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 C 1 2 286587 CASAVA_Build 2 1168928 5D CAATGTTGCT ATCTA/----- ATCTAATGAT 3070 het 3070 hom 48 16 27 8 ATCTA 2 1 286588 CASAVA_Build 2 1169034 1I GTAGTATCCA -/T TTTCTTCTGG 3070 het 3070 hom 47 15 26 6 T 3 4 286589 CASAVA_Build 2 1170039 6I TGAGTGAGCA ------/AAAAAT AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 AAAAAT 1 2 286590 CASAVA_Build 2 1171852 1D CTCTTTGCTA T/- AAGTGTAACA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 1 0 286591 CASAVA_Build 2 1175074 1D GTTCTCAACA T/- ATTTGTAAGA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 1 0 286592 CASAVA_Build 2 1175456 1I AATGGTCTCA -/T ATCTCTTGAC 2326 het 684 hom 7 2 5 0 T 0 1 286593 CASAVA_Build 2 1179290 1I AATAAAGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 9 23 5 A 9 10 286594 CASAVA_Build 2 1180201 1D CGTTGGTTGA T/- TCTTCCTGGC 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 2 1 286595 CASAVA_Build 2 1183636 1I AGATTATCTA -/G AAAGAAAATC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 G 0 1 286596 CASAVA_Build 2 1187997 15I GCACAGTCAG ---------------/TTAAATTGTTCCATT TTGAGGTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 14 2 TTAAATTGTTCCATT 0 1 286597 CASAVA_Build 2 1193105 1D GCTATGTGAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 T 9 8 286598 CASAVA_Build 2 1194669 1D CCTCACTTGC T/- TTTTTATCAG 3070 hom 132 het 53 0 45 8 T 6 5 286599 CASAVA_Build 2 1243335 1D CCACTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 384 hom 34 1 26 7 T 13 12 286600 CASAVA_Build 2 1263993 3D12M5D11M1D14M3D GTGTGGTGTG TGTGTGTTTGTGTTTATGTGGTGTGGTGTGTGGTGTGTGTGTGGTGGTA/---GTGTGTGTGTTT-----GTGTGGTGTGT-GTGTGTATGTGGCG--- TGTGTGTGCT 908 het 908 ref 33 49 3 31 N/A 0 0 286601 CASAVA_Build 2 1270739 14I GACCCGGGGT --------------/GGAGCACCTGAGGC GGAGCACCTG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 GGAGCACCTGAGGC 0 1 286602 CASAVA_Build 2 1273591 3I GGGTGTACAA ---/ATC ATCATCTTGT 3070 het 3070 ref 51 27 17 7 ATC 2 3 286603 CASAVA_Build 2 1274989 1D TTGTGCAGGA T/- TTGCTTAATT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 3 2 286604 CASAVA_Build 2 1317961 1D CCCCCGTGCG T/- TCCTCTGCAT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 T 2 1 286605 CASAVA_Build 2 1325142 1D TGGCACTTTT C/- CCCCTGTTCT 1900 het 599 hom 11 3 6 2 C 5 4 286606 CASAVA_Build 2 1329001 1D TGGCACTTTT C/- CCCCTGTTCT 3070 het 487 hom 23 5 11 7 C 5 4 286607 CASAVA_Build 2 1329870 1D GGGAAAGAGG A/- AAAAAAAAGG 2891 het 2891 ref 34 17 9 9 A 9 8 286608 CASAVA_Build 2 1341160 1I CCAATCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 10 11 286609 CASAVA_Build 2 1342837 1D TTCCCATAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 A 10 9 286610 CASAVA_Build 2 1343042 15D TCTTGGCTTT CCCAGCATCTGGAGG/--------------- CTTTGCCCTT 3070 het 3070 ref 45 28 17 4 CCCAGCATCTGGAGG 1 0 286611 CASAVA_Build 2 1343431 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 9 10 286612 CASAVA_Build 2 1344125 2I TGACCCATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 A 11 13 286613 CASAVA_Build 2 1345909 1I ACAAAATGGA -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 41 22 11 8 C 8 9 286614 CASAVA_Build 2 1346763 2I TTTTCTTTTT --/TG TTTTGAGACA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 TG 0 1 286615 CASAVA_Build 2 1348831 2D ACAGGCCTTA GC/-- GTTGCTCTTC 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 GC 1 0 286616 CASAVA_Build 2 1356441 1D TCTAAAAGTG C/- CTGTGTCCGT 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 C 2 1 286617 CASAVA_Build 2 1377811 1I TTCTAGGATG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 8 9 286618 CASAVA_Build 2 1407093 1D AAGGTTTTAT G/- AGCTTCACAG 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 1 0 286619 CASAVA_Build 2 1420227 1D AAGGAAGATG C/- CCCCCCCGAG 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 C 8 7 286620 CASAVA_Build 2 1420617 1I TGAAGCCTGG -/C GGGGGGGTCT 3070 het 2449 hom 33 15 13 5 C 0 1 286621 CASAVA_Build 2 1423161 1I GTTTCTAAGG -/C CTTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 C 1 2 286622 CASAVA_Build 2 1434986 4D ATTAGAACAC AATT/---- GATTTAATAA 3070 het 3070 hom 34 16 17 3 AATT 1 0 286623 CASAVA_Build 2 1436953 3D AGCAATCCAC TTG/--- TTGATGTAAA 3070 het 3070 ref 54 27 22 7 TTG 2 1 286624 CASAVA_Build 2 1440240 2I GTGGGTACAC --/AT ATATATAGCA 3070 het 719 hom 16 2 13 1 AT 3 4 286625 CASAVA_Build 2 1441936 1D GGACATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2501 het 1112 hom 19 5 8 6 T 13 12 286626 CASAVA_Build 2 1469988 2I14M6D CAAACGCTTC --TTTTTTTTGTAATCTTTCTG/TTTTTTTTTTGTAATC------ TTGCTGAGAA 3070 het 3070 ref 25 13 11 7 N/A 0 0 286627 CASAVA_Build 2 1474944 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 7 8 286628 CASAVA_Build 2 1508083 1D13M3I CTCCTCAAAT CCCCCCCACTGTGT---/-CCCCCCACTGTGTGCA GCCTCCTCAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 8 N/A 0 0 286629 CASAVA_Build 2 1517442 3D GTCCCCAAAT ACC/--- CCCCCCACTC 3070 het 3070 hom 42 12 28 6 ACC 1 0 286630 CASAVA_Build 2 1517972 1I50M1D TCCCGCCACT -TGTGCAACCTCATCAATTTCCCCCCATTCTGTGCAACCTCCCCAAATCCAC/CTGTGCAACCTCACCAAATTCCCCCCATTCTGTGCAACCTCCCCAAATCCA- CCCACTCTGT 2291 het 2291 ref 15 15 5 5 N/A 0 0 286631 CASAVA_Build 2 1518305 1I CTCCCCAAAT -/C CCCCGTGTGC 2153 hom 21 het 12 0 8 4 C 4 5 286632 CASAVA_Build 2 1518417 1D AAATCCTCCC T/- CGCTGTGTGC 700 het 146 hom 9 2 5 2 T 1 0 286633 CASAVA_Build 2 1521277 5D TTAAAAAGAC ATAAG/----- AGCTCTCTAG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 ATAAG 1 0 286634 CASAVA_Build 2 1523204 3I TTTTTTCCAA ---/AAT AATATATCAG 3070 het 3070 ref 35 14 11 10 AAT 1 2 286635 CASAVA_Build 2 1562283 26D CATATCTAAA ATATAAGGGTATATATTCTTATATAT/-------------------------- ATATAAGGGT 3070 hom 24 het 18 0 9 10 ATATAAGGGTATATATTCTTATATAT 2 1 286636 CASAVA_Build 2 1576218 1I TGGTGTGGAG -/C CCCATGGGTG 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 C 3 4 286637 CASAVA_Build 2 1580779 4D42M4D AGATCATATG CGTACAGTGAGATCATACACACACAGATCACACACACATACACATGCACA/----CAGTGAGATCATACACACACAGATCACACACACATACACATG---- CACAATCATA 3070 het 3070 ref 75 60 37 10 N/A 0 0 286638 CASAVA_Build 2 1581178 3I GCCAGGCAGC ---/TGG TGATGGGCAC 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 TGG 0 1 286639 CASAVA_Build 2 1587040 4D ATACACACAG ACAC/---- ACACAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 21 22 12 AC 4 2 286640 CASAVA_Build 2 1587503 12D ACTCACAGAC ACACACACATAG/------------ ACACACACAA 3070 het 3070 hom 82 34 39 20 ACACACACATAG 1 0 286641 CASAVA_Build 2 1589503 1I AGCCTGGGGA -/G GGGGCAGAGT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 4 5 286642 CASAVA_Build 2 1595809 2I ACAAAAAGAT --/TC TGTTTTCATC 3070 het 3070 hom 37 9 15 13 TC 0 1 286643 CASAVA_Build 2 1600567 1I TCCCCAGGCA -/C CCGTCTCCCC 2643 het 2643 ref 23 10 8 5 C 2 3 286644 CASAVA_Build 2 1601738 3I AGGGGGCAAC ---/ATT AGTTCGTGGT 3070 het 1326 hom 14 4 10 0 ATT 0 1 286645 CASAVA_Build 2 1603157 1I CAACCCCTCA -/C CCCCCCAGTG 3070 het 3070 hom 43 22 16 5 C 6 7 286646 CASAVA_Build 2 1618985 1D AAACCATCCT G/- GATTTGGAGT 3070 hom 129 het 48 0 44 6 G 2 1 286647 CASAVA_Build 2 1620568 1D CTGACAGCTG C/- CTGGGGGATG 1043 het 1043 ref 60 46 4 10 C 2 1 286648 CASAVA_Build 2 1635272 9D TCTGATGCTT CTCCCCAAG/--------- AATGTGCCTG 3070 het 3070 ref 26 15 11 3 CTCCCCAAG 1 0 286649 CASAVA_Build 2 1644316 13D GGCAGTGCAG GGATGCAGGTGGA/------------- GGATGGGACC 3070 het 3070 hom 40 18 17 8 GGATGCAGGTGGA 1 0 286650 CASAVA_Build 2 1657834 1I TGCTCTCCTC -/T GCCTGGCACC 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 0 1 286651 CASAVA_Build 2 1658970 1D CTCCCATCTC T/- TCCCCCTAGA 3070 hom 53 het 22 0 16 6 T 2 1 286652 CASAVA_Build 2 1662408 2D TGTGTCTGCA CG/-- TGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 94 65 10 24 CG 1 0 286653 CASAVA_Build 2 1669205 2D CGTTTCTCCC CT/-- GACTTGCCCT 3070 het 3070 ref 42 21 14 8 CT 1 0 286654 CASAVA_Build 2 1675518 2D AGGTGCAGGA AC/-- ACACAGAGGT 3070 het 3070 ref 60 32 18 12 AC 3 2 286655 CASAVA_Build 2 1680392 1D TAATCCTAAC G/- GGGGGGGAAA 3070 hom 64 het 32 0 21 11 G 8 7 286656 CASAVA_Build 2 1687897 10D GAGCCGTGAG AGCAGAGGGC/---------- ACGTCTGCAC 2991 het 2991 ref 25 15 8 4 AGCAGAGGGC 1 0 286657 CASAVA_Build 2 1688781 1I GGCTTGGACA -/C CCGTCAAGGC 3070 het 2723 hom 29 11 14 4 C 2 3 286658 CASAVA_Build 2 1694442 2D CCAGCACCCA CT/-- CTCCACCAGC 1317 het 261 hom 21 4 4 13 CT 2 1 286659 CASAVA_Build 2 1694858 1I CAACGAGGGT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 A 8 9 286660 CASAVA_Build 2 1700393 1I GTCTTCTAAT -/A AATGCAGACA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 3 286661 CASAVA_Build 2 1719460 1D AAAGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 2528 het 2528 ref 24 11 7 6 A 11 10 286662 CASAVA_Build 2 1720326 1D TATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 247 hom 25 1 19 5 T 11 10 286663 CASAVA_Build 2 1721332 1I ATCTTCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 33 0 21 12 T 14 15 286664 CASAVA_Build 2 1723340 1D TGAACACAGG C/- CGGGAGGTGG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 C 2 1 286665 CASAVA_Build 2 1727749 1D ATTTAACGTT C/- CAAAAAAGCC 3070 hom 62 het 24 0 21 4 C 2 1 286666 CASAVA_Build 2 1756262 1I TTAAAGTGAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 9 286667 CASAVA_Build 2 1758877 2D TCAATATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1183 het 1183 ref 19 8 4 7 T 14 12 286668 CASAVA_Build 2 1767449 12I4M8I TGTAAACCGT ------------CTGG--------/CAGAGAGACAGGCTGGGAGTGTCT GGGGAGACAC 3070 het 3070 ref 32 16 11 8 N/A 0 0 286669 CASAVA_Build 2 1769089 1D TTACCCAGCT G/- TGTTGTGTAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 1 0 286670 CASAVA_Build 2 1769805 1D ATAAAAAAAA T/- AAAATCTGAT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 T 1 0 286671 CASAVA_Build 2 1772996 1D GCTAAAAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 9 286672 CASAVA_Build 2 1792202 1I TTGGCGGGGG -/A GTCTTGGGAG 3070 hom 74 het 30 0 22 8 A 0 1 286673 CASAVA_Build 2 1796083 3D CAGGTCTGTG CTT/--- CTTTCTCCCT 3070 hom 81 het 30 0 24 6 CTT 2 1 286674 CASAVA_Build 2 1813597 1D CTCTGTCCTC G/- CCTGCTGGCT 3070 het 3070 ref 34 16 10 9 G 1 0 286675 CASAVA_Build 2 1816638 1D CCCTCCTGCC T/- AACCCTCAAC 2500 het 1197 hom 18 5 8 5 T 1 0 286676 CASAVA_Build 2 1819880 1D TCCCCCATGG A/- AAAAGGGGCA 3070 het 3070 hom 38 15 15 9 A 5 4 286677 CASAVA_Build 2 1831934 1D AACTCCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1801 hom 40 7 21 12 A 15 14 286678 CASAVA_Build 2 1832130 1I GTTTTACAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 9 10 286679 CASAVA_Build 2 1836244 5I GTCTAAAAAA -----/TAAAT TAAATGACTG 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 TAAAT 1 2 286680 CASAVA_Build 2 1838603 2I TCATCTCTGG --/TC TCATGGGTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 TC 1 2 286681 CASAVA_Build 2 1839724 1D GCTGCCACAT G/- CTTTTGTTAG 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 G 1 0 286682 CASAVA_Build 2 1846521 1I AAACAAAAAA -/G GGGGGGGGCA 1490 het 1490 ref 22 7 5 10 G 8 9 286683 CASAVA_Build 2 1846782 1I GAGAAGTGCA -/G GGAGCATCAC 1613 het 1613 ref 22 7 6 9 G 2 3 286684 CASAVA_Build 2 1851236 4D GGAAGGAAGG AAGA/---- AACCCTTGAT 3070 het 3070 hom 24 11 10 4 AAGA 1 0 286685 CASAVA_Build 2 1852846 3I TCAGAGGGCA ---/TTC TTCTTCTCCT 3070 het 3070 hom 59 21 31 7 TTC 2 3 286686 CASAVA_Build 2 1857865 2D AATGGGCAAC AT/-- GTGCTGAGGG 3070 het 2494 hom 21 7 9 6 AT 1 0 286687 CASAVA_Build 2 1858512 3D GGAAAGAAAT CTC/--- CTCTAGAAGA 3070 het 3070 hom 44 18 18 10 CTC 2 1 286688 CASAVA_Build 2 1873424 1D ACAGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 961 het 961 ref 40 31 3 6 A 12 11 286689 CASAVA_Build 2 1875286 1D TCCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1414 het 1414 ref 33 15 6 13 T 17 16 286690 CASAVA_Build 2 1877398 1I CACATAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 8 9 286691 CASAVA_Build 2 1910706 5D TAAGGAAAAA AAACC/----- AAACCACATA 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 AAACC 2 1 286692 CASAVA_Build 2 2005483 1D TCCTGCTCTG A/- AAAAAAAAAA 2509 het 2509 ref 40 26 7 7 A 13 12 286693 CASAVA_Build 2 2006403 1D GCTTTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 1590 het 1590 ref 34 18 4 12 T 13 12 286694 CASAVA_Build 2 2059589 2D GGAAAGTATG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 AC 7 6 286695 CASAVA_Build 2 2075086 1I CAGTTTAGAA -/G GGGGGAGATA 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 G 5 6 286696 CASAVA_Build 2 2171671 7I TCCTGCCACA -------/TACGGCC GTCTGATTTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TACGGCC 0 1 286697 CASAVA_Build 2 2173236 1D TGTATGCCTA T/- TTTTTTTTTC 2265 het 2265 ref 23 8 7 8 T 10 9 286698 CASAVA_Build 2 2175197 1D GTTAGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 35 2 20 13 T 15 14 286699 CASAVA_Build 2 2207603 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 986 het 986 ref 19 10 3 6 A 13 14 286700 CASAVA_Build 2 2224825 1D AAAAGGAAGA G/- AAAAGGAGAA 3070 het 3070 hom 39 12 19 9 G 1 0 286701 CASAVA_Build 2 2259754 1I CGATTGATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 9 10 286702 CASAVA_Build 2 2268769 1I TTCTTCTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 11 12 12 T 9 10 286703 CASAVA_Build 2 2312751 1D TGCAATGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 19 8 9 3 T 11 10 286704 CASAVA_Build 2 2328398 1I GTTATAAAAT -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 7 8 286705 CASAVA_Build 2 2329836 1I TCTTCTGTTT -/A AAAAAATCTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 6 7 286706 CASAVA_Build 2 2334944 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1037 het 1037 ref 31 13 5 13 A 19 18 286707 CASAVA_Build 2 2340592 1I ATTATTGAAT -/A AAAAATGTGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 5 6 286708 CASAVA_Build 2 2350641 1D TTCATATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 11 10 286709 CASAVA_Build 2 2364886 12D TATAAATTTA AGAACTTCAGTG/------------ AAATATTTAA 3070 het 3070 ref 41 26 16 4 AGAACTTCAGTG 1 0 286710 CASAVA_Build 2 2370073 1D CCTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1935 hom 33 6 23 4 T 13 12 286711 CASAVA_Build 2 2377311 1I AAACAGAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 362 hom 34 1 30 3 T 8 9 286712 CASAVA_Build 2 2380457 1D GGTGAATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 489 hom 31 2 20 9 T 15 14 286713 CASAVA_Build 2 2381208 1I TATTAAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 345 hom 35 2 26 7 A 9 10 286714 CASAVA_Build 2 2389053 2D AGATCTAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 32 0 23 9 A 15 13 286715 CASAVA_Build 2 2399043 2D AGAAATTCCT AA/-- GAGAGAATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 0 286716 CASAVA_Build 2 2402272 1D CTTTAGGTGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 8 7 286717 CASAVA_Build 2 2456908 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 8 9 286718 CASAVA_Build 2 2459646 3D CCTTTCTCTT TTC/--- TTCTTCTTCT 2866 het 2566 hom 34 14 15 5 TTC 7 6 286719 CASAVA_Build 2 2462715 1D AATGAAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 T 11 10 286720 CASAVA_Build 2 2464019 12D CTTCTTCTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 2828 hom 36 12 15 11 T 22 10 286721 CASAVA_Build 2 2485245 1D TAATAACAGG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 40 0 33 8 T 8 7 286722 CASAVA_Build 2 2487976 1D ATTACTGAAG A/- AAAATTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 A 5 4 286723 CASAVA_Build 2 2494741 2I GGGCTTGGGG --/AA AAAGGGCCAC 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 3 5 286724 CASAVA_Build 2 2499007 1D CCACATAGCT G/- GGGGTGACTG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 G 5 4 286725 CASAVA_Build 2 2500965 1I GTGTCTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 10 18 14 T 13 14 286726 CASAVA_Build 2 2505001 1D TCATTTATCC A/- TCCATCCATC 3070 hom 135 het 49 0 44 5 A 1 0 286727 CASAVA_Build 2 2506366 2D AGATGCACTG CA/-- CACACACACA 1152 het 1152 ref 44 29 3 12 CA 8 7 286728 CASAVA_Build 2 2521041 1D CTGTTGGAAC G/- GGGGTAGTTT 3070 het 3070 ref 53 31 19 3 G 5 4 286729 CASAVA_Build 2 2522014 1I TTACTAGACA -/G AACCTCTAGC 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 G 0 1 286730 CASAVA_Build 2 2522784 1I TCCCTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 2771 het 2771 ref 33 16 8 9 A 12 13 286731 CASAVA_Build 2 2528453 1I ACTTAACTTG -/A AAAAAATGCT 3070 het 2519 hom 35 7 20 8 A 6 7 286732 CASAVA_Build 2 2530161 1D GACTTATGTT G/- GGTTTTTTTT 3070 het 740 hom 37 6 18 13 G 3 2 286733 CASAVA_Build 2 2532370 1I TACATATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 9 10 286734 CASAVA_Build 2 2541711 5D ATGGAGGTAA TTAAG/----- TTAAGTGAAG 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 TTAAG 2 1 286735 CASAVA_Build 2 2543986 4I2M1I TGCTGGAACC ----GA-/TGTGGAT ATTTGCTAAT 3070 het 3070 hom 51 20 26 9 N/A 0 0 286736 CASAVA_Build 2 2545233 1D GGGTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1718 het 1718 ref 38 22 5 11 T 12 11 286737 CASAVA_Build 2 2561812 3I TTTTTCTTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 7 T 11 14 286738 CASAVA_Build 2 2566399 2D GGACTCAGCT GG/-- GGGCACAGCA 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 G 5 3 286739 CASAVA_Build 2 2605218 4I5M2D GTTTTAACTA ----CATCAAT/GAACCATCA-- TTACAAATGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 N/A 0 0 286740 CASAVA_Build 2 2605551 3I TCATTAAAAC ---/TAA TAATAAGCTA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 TAA 2 3 286741 CASAVA_Build 2 2612972 5D TTTTCTTTCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1935 het 399 hom 14 3 7 4 T 21 16 286742 CASAVA_Build 2 2619077 1I ATGACACTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1382 hom 30 6 14 10 T 9 10 286743 CASAVA_Build 2 2626867 3D CCACCGCAAC ACA/--- ACATCACAAC 3070 het 3070 ref 63 24 15 27 ACA 2 1 286744 CASAVA_Build 2 2626955 3D ACACAACCAC ACA/--- ACAACAACAC 3070 het 3070 hom 62 18 21 24 ACA 4 3 286745 CASAVA_Build 2 2630491 7D TGATTATTTT CTGTATA/------- CCCACATTAT 3070 hom 114 het 41 0 39 5 CTGTATA 1 0 286746 CASAVA_Build 2 2635146 2D CTGTGTGTGC AT/-- ATGTGTATGC 3070 hom 202 het 75 0 67 12 AT 2 1 286747 CASAVA_Build 2 2635909 1D TCAAGTCTCT G/- TCTCCTGAAA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 G 1 0 286748 CASAVA_Build 2 2638232 1D GGTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 26 8 A 12 11 286749 CASAVA_Build 2 2639872 1D AGGTGTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 38 2 23 13 T 13 12 286750 CASAVA_Build 2 2652150 10I TTCCCATGCG ----------/CACCGAGTGC CACAGTGTCC 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 CACCGAGTGC 0 1 286751 CASAVA_Build 2 2655255 2D CTGCACAGCC AG/-- AGAGTTAAGC 3070 het 3070 ref 42 26 11 5 AG 3 2 286752 CASAVA_Build 2 2679964 1I ATGTGGGCTG -/C TGGAGTGCCT 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 C 0 1 286753 CASAVA_Build 2 2696576 1D GGTGCTCTTA C/- CCCAGGGACT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 C 4 3 286754 CASAVA_Build 2 2698655 1D CCTGGTCACC T/- TCCCCCACTC 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 2 1 286755 CASAVA_Build 2 2698947 1D TAACTTTGTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 9 8 286756 CASAVA_Build 2 2722610 1I TCCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 9 10 286757 CASAVA_Build 2 2722994 3D CTACTGGAAT GAG/--- GAGGAGGCTG 3070 het 3070 ref 40 21 11 10 GAG 3 2 286758 CASAVA_Build 2 2731897 1D ATGTAACATC A/- GGACAGCGCC 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 1 0 286759 CASAVA_Build 2 2733261 2D TATATGTGTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 39 14 16 10 GT 6 5 286760 CASAVA_Build 2 2733529 1D25M1I TATATATGTT GGGGGGGTGGGGTGTGTATATGTGTG-/-GGGGGGTGGGGTGTGTATATGTGTGT GGGGGGGTGG 2626 het 480 hom 9 2 6 1 N/A 0 0 286761 CASAVA_Build 2 2735012 1I TCCCTGGTGT -/C CGGGGCTGCC 2939 hom 43 het 18 0 10 8 C 1 2 286762 CASAVA_Build 2 2744925 1D GCAGAGGGCA G/- GGGAGCCCGG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 G 4 3 286763 CASAVA_Build 2 2761356 3I GAGCATGTGC ---/AGG AGAACTGCTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AGG 0 1 286764 CASAVA_Build 2 2768762 1I GGCCGTGTCT -/G GGGTGGTGCA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 G 3 4 286765 CASAVA_Build 2 2770005 3I AAAAAATGCA ---/TTT TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 8 11 286766 CASAVA_Build 2 2770299 3D CGGCCCCATG CAC/--- CACCGGGATT 3070 het 3070 hom 27 11 10 7 CAC 2 1 286767 CASAVA_Build 2 2774566 1I GAGGAACACA -/G GGGGGGGGGA 3070 het 706 hom 20 2 12 6 G 9 10 286768 CASAVA_Build 2 2782630 1I TTAAGTGAAG -/A AAAAAGGTAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 5 6 286769 CASAVA_Build 2 2826641 1I TTCCAAGGGG -/A AAAAAATCAC 3070 hom 98 het 39 0 33 6 A 6 7 286770 CASAVA_Build 2 2835364 2D ATACACATGG AC/-- ACACACACAC 1428 het 1428 ref 78 59 5 14 AC 8 7 286771 CASAVA_Build 2 2835807 2I GTAGATACAC --/AG AGACACAAAA 3070 hom 206 het 77 0 67 10 AG 1 2 286772 CASAVA_Build 2 2836053 4D AACCACACTA CATG/---- CATGCATGCA 3070 hom 208 het 85 0 70 19 CATG 4 3 286773 CASAVA_Build 2 2843780 1D AGGGTGGTTT C/- ATCAGGGCCC 3070 hom 91 het 36 0 28 10 C 1 0 286774 CASAVA_Build 2 2849177 1D CCAGAAGAGG A/- AAGCAGAAGC 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 A 3 2 286775 CASAVA_Build 2 2859408 1D CTTTCTGTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 51 het 24 0 19 7 T 9 8 286776 CASAVA_Build 2 2871499 1I AAGAGAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 11 0 A 10 11 286777 CASAVA_Build 2 2871674 5D CTGTGGGCGG TGTGA/----- TGTGTCTCCT 3070 het 3070 ref 41 22 18 4 TGTGA 1 0 286778 CASAVA_Build 2 2881431 2D GAAAATTACC AA/-- AAAAAAAAAA 2062 het 3 hom 21 1 10 10 A 14 12 286779 CASAVA_Build 2 2889974 1I CCACAGCCGC -/T CAACCCTACA 1982 het 1982 ref 25 13 5 7 T 0 1 286780 CASAVA_Build 2 2919376 3I CGCTCAAGGT ---/GAC GACGGGTTCA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 GAC 1 2 286781 CASAVA_Build 2 2927327 4D CCTAGAAGGC TGAG/---- TGAGACACCC 3070 het 3070 ref 38 19 16 8 TGAG 2 1 286782 CASAVA_Build 2 2955192 2D AACAAATATA TG/-- TATATATAAT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 TG 1 0 286783 CASAVA_Build 2 2958701 1D GAAATAAGAA C/- CCCCCCCTTT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 8 7 286784 CASAVA_Build 2 2960667 1D CCATATGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 29 0 15 15 A 12 11 286785 CASAVA_Build 2 2962761 1D TCCCAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 26 2 16 9 A 13 12 286786 CASAVA_Build 2 2968588 2D CTCTTACCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 AC 10 9 286787 CASAVA_Build 2 2971578 4I TTTTAATGGT ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TTTG 1 2 286788 CASAVA_Build 2 2974653 1I CCTGAGGTCA -/G GATTTCGAGA 3070 hom 83 het 32 0 26 6 G 1 2 286789 CASAVA_Build 2 2974877 1I CCAAAAAAAA -/C AAAAAAATCT 3070 hom 82 het 35 0 27 8 C 0 1 286790 CASAVA_Build 2 2980547 1D GAACCATGAA C/- CAGTTAAACC 3070 het 3070 hom 28 8 12 8 C 2 1 286791 CASAVA_Build 2 2982354 5I TTTTAATTAA -----/TATTT TAGTTTAGCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TATTT 0 1 286792 CASAVA_Build 2 2984413 4D ATTAATAACA TAAT/---- TAATAACTCA 3070 het 3070 ref 45 27 14 5 TAAT 2 1 286793 CASAVA_Build 2 2995354 1I AGACACTGAT -/G AACTCACAGA 3070 hom 111 het 42 0 35 7 G 0 1 286794 CASAVA_Build 2 3000265 1I ACTCAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 127 hom 32 2 22 8 A 12 13 286795 CASAVA_Build 2 3005252 1D ATCTGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 127 het 47 0 41 9 A 11 10 286796 CASAVA_Build 2 3009695 1I TTAAGTTCTA -/G GGTACATGTG 3070 hom 61 het 27 0 21 6 G 2 3 286797 CASAVA_Build 2 3028805 3D8M1I4M1D9M3D TGTGTGTGTG TGTTATGTATG-TGTGCTGTGTGTGCATG/---TATGTATGCTGTG-TATGTGTGC--- TGTGTATGTG 1810 het 1810 ref 37 37 9 17 N/A 0 0 286798 CASAVA_Build 2 3039484 1I AAGCAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 41 0 29 12 A 10 11 286799 CASAVA_Build 2 3091571 1I AGGGCCATGG -/C CGCCCGGCTC 3070 hom 95 het 37 0 30 7 C 1 2 286800 CASAVA_Build 2 3095817 5D ATAAACTCTA AAAAT/----- AAAATAATAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 AAAAT 2 1 286801 CASAVA_Build 2 3096213 2D TACACGTCTG CT/-- CTGTGTCCCA 3070 hom 74 het 28 0 24 5 CT 2 1 286802 CASAVA_Build 2 3103311 1I AAAAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 11 12 286803 CASAVA_Build 2 3110809 2I CCCAAGGAGA --/AC ATTAAGAAGA 3070 hom 99 het 37 0 31 6 AC 0 1 286804 CASAVA_Build 2 3121130 3D CAGTCACACA CAG/--- ATCTACACAC 3070 het 3070 ref 63 28 23 14 CAG 1 0 286805 CASAVA_Build 2 3121198 8D CACACACATT TACATATG/-------- CACACACATG 1806 het 1806 ref 65 20 11 42 TACATATG 1 0 286806 CASAVA_Build 2 3122560 1I CTCCCCGTGA -/G GCGACGCCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 1 2 286807 CASAVA_Build 2 3123112 1I GTGTTTTCTC -/T TTTTTCCATT 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 T 5 6 286808 CASAVA_Build 2 3126560 6D CACACACACA CGAACG/------ CACACACCAG 483 het 483 ref 64 38 6 29 CGAACG 1 0 286809 CASAVA_Build 2 3127393 1D TCTTTAAAGG A/- AAAAAAGTCT 3070 hom 113 het 45 0 36 10 A 7 6 286810 CASAVA_Build 2 3134700 15D ATCACAGCAT CTCGCCTCACAGGAA/--------------- GCCACATCCA 3070 hom 45 het 15 0 15 1 CTCGCCTCACAGGAA 1 0 286811 CASAVA_Build 2 3140828 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 7 6 286812 CASAVA_Build 2 3141564 3D TAACATCATG ACC/--- ACCACACTAC 3070 het 3070 ref 88 44 34 10 ACC 2 1 286813 CASAVA_Build 2 3147593 1I AACAAAATGA -/G GCCTCCCTGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 1 2 286814 CASAVA_Build 2 3147673 22I AACTGTAAAG ----------------------/ATCTTCAGTGAAAAACAGGGGA AAACTATTTA 3070 hom 66 het 26 0 22 5 ATCTTCAGTGAAAAACAGGGGA 0 1 286815 CASAVA_Build 2 3151704 3D TTCGTGGATT CTC/--- TTTTCTGCCC 3070 het 3070 hom 36 17 17 4 CTC 1 0 286816 CASAVA_Build 2 3166493 1I AGCTGGCCCT -/G CTGGAGTTCC 3070 hom 69 het 26 0 22 4 G 0 1 286817 CASAVA_Build 2 3173741 1I ACATGGTGCC -/A ATGGGCCTGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 2 286818 CASAVA_Build 2 3175649 1D CTAAAATTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 24 2 16 6 A 15 14 286819 CASAVA_Build 2 3177474 1I AGAGAGAGAA -/G AGGGGGGGGC 2857 hom 25 het 11 0 8 3 G 0 1 286820 CASAVA_Build 2 3194064 4I GAAACAAGCC ----/TCTT TCTTTCCTCT 3070 hom 77 het 29 0 25 4 TCTT 1 2 286821 CASAVA_Build 2 3197733 2I GGCAGGCTTC --/CT CTGTCTCTCT 3070 hom 107 het 43 0 34 9 CT 1 2 286822 CASAVA_Build 2 3199293 3D CACATCACAG GAT/--- GAGAACTAGC 3070 hom 114 het 46 0 37 10 GAT 1 0 286823 CASAVA_Build 2 3205313 1I TAGAAAATAA -/C CTGGCTTCGA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 1 2 286824 CASAVA_Build 2 3209936 3I TGGAGAGCTC ---/AGA AGAAGACAGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AGA 2 3 286825 CASAVA_Build 2 3215702 3D TAAAGAAGTT CTC/--- CTCTGAGTAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTC 2 1 286826 CASAVA_Build 2 3226179 10D AGGTCAAGGC AGGTGGATCA/---------- CCTGAGGTCA 3070 hom 38 het 14 0 12 2 AGGTGGATCA 1 0 286827 CASAVA_Build 2 3238611 2I GCACACATAC --/AT GTGTGCACAG 3070 hom 126 het 46 0 41 5 AT 0 1 286828 CASAVA_Build 2 3251183 4D CTGTGGACCA GCTC/---- CAGCCTGGCC 3070 het 3070 hom 40 20 13 9 GCTC 1 0 286829 CASAVA_Build 2 3266317 1D CACGTTCACA C/- CCCGGCACAC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 C 4 3 286830 CASAVA_Build 2 3277763 10D CATCCTCTCT ACACACACAC/---------- ACACACACCC 2465 het 2465 ref 33 17 7 13 AC 9 4 286831 CASAVA_Build 2 3279817 8I TGGTGGCAGT --------/TAACATGC TTCTCTCTGT 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 TAACATGC 0 1 286832 CASAVA_Build 2 3296211 1I CAGGAGACGA -/G GGTCAAAAGG 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 G 2 3 286833 CASAVA_Build 2 3297425 2D CGTCCCTCTC TT/-- GTGTCCCCTC 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 2 0 286834 CASAVA_Build 2 3305890 1D TTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 12 11 286835 CASAVA_Build 2 3326284 1D TAAACTTTTC A/- AGCCACATTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 2 1 286836 CASAVA_Build 2 3328241 3I CGTCTCTACT ---/AAA AAAAATATAA 2535 het 363 hom 9 2 6 1 A 5 8 286837 CASAVA_Build 2 3337466 14D TTAATAGAGA TTATGAAGTTAGAT/-------------- TTAAAAAGGC 3070 hom 126 het 42 0 43 4 TTATGAAGTTAGAT 1 0 286838 CASAVA_Build 2 3338449 6D AAAAATCATC TGGGAA/------ TGGTGGCTCG 3070 het 3070 ref 21 9 8 6 TGGGAA 1 0 286839 CASAVA_Build 2 3344491 2D CTTGGACTCC CT/-- CACACGGGCA 1847 het 1847 ref 22 13 5 5 CT 1 0 286840 CASAVA_Build 2 3345534 1D ACAGAGGGCA T/- TGGCTGCTGA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 2 1 286841 CASAVA_Build 2 3345950 1D TCCTGCTGGA C/- CAGGAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 C 2 1 286842 CASAVA_Build 2 3358167 1D ATAATAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1072 hom 17 5 10 4 A 10 9 286843 CASAVA_Build 2 3372573 2I GAGGGCGGAC --/AA GAGTTTTATT 3070 hom 57 het 24 0 15 9 A 0 2 286844 CASAVA_Build 2 3375075 3I GGCATCCTCT ---/CTC CTCCTGACAC 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 CTC 1 2 286845 CASAVA_Build 2 3377609 1I TAGTAAATTA -/T TGTTATAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 1 2 286846 CASAVA_Build 2 3389091 1I GTCTGAATCC -/T TCTGGTAGCC 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 T 1 2 286847 CASAVA_Build 2 3390199 1I ATTTTACATG -/T TCATGTACAG 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 T 1 2 286848 CASAVA_Build 2 3395031 1I CATGAGCAGG -/A AAAGGCACCA 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 A 3 4 286849 CASAVA_Build 2 3403148 6D AGGCACGCAC ACGCTG/------ ACTCTGGATT 3070 het 3070 ref 44 23 17 6 ACGCTG 1 0 286850 CASAVA_Build 2 3410673 1D TCTGTCCCAC A/- AAAAAAAAAA 2700 het 2291 hom 25 7 11 9 A 13 12 286851 CASAVA_Build 2 3427973 2I CCTGGTCCTG --/AA TTATGTCCTA 3070 hom 126 het 43 0 42 1 A 0 2 286852 CASAVA_Build 2 3429881 1D CTCAGGAAGC T/- TTTTTTTTTT 2764 het 2764 ref 29 14 8 7 T 13 12 286853 CASAVA_Build 2 3438241 1D ATTTGTTCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 10 9 286854 CASAVA_Build 2 3446903 4D TGAGGGAGCT CACA/---- CACACACGTC 3070 het 2216 hom 32 8 14 12 CA 5 3 286855 CASAVA_Build 2 3499689 4I TGTGTGTGGC ----/TTTT TTGTTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 6 286856 CASAVA_Build 2 3563494 2I AAGAGCGAAA --/CT CTGTCTTAAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 CT 1 2 286857 CASAVA_Build 2 3565775 1D TTCTTTTAAT A/- AAAAAAAAAT 2610 het 2610 ref 22 12 8 3 A 10 9 286858 CASAVA_Build 2 3579845 2D GAGGAAAAAA AC/-- ACACTTGTCA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 AC 3 2 286859 CASAVA_Build 2 3587145 1I TTAAAATTAG -/A AAAAAAAAAA 2199 het 2199 ref 25 15 7 3 A 10 11 286860 CASAVA_Build 2 3589210 3I CAGAGCACGG ---/CTT CTTCTCCATG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 CTT 1 2 286861 CASAVA_Build 2 3589879 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2553 hom 18 7 8 3 A 11 12 286862 CASAVA_Build 2 3608397 3I ATCTATTTGT ---/TAA TAATCCCTTC 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 TAA 1 2 286863 CASAVA_Build 2 3624524 1I AAAGAGGAAA -/G CAGCCAACAG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 G 0 1 286864 CASAVA_Build 2 3634772 2D CTTTTCAGGG TC/-- TCTTTCCGTG 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TC 2 1 286865 CASAVA_Build 2 3636662 4D CGTAACTTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AAAC 3 2 286866 CASAVA_Build 2 3639446 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 26 1 16 12 T 14 15 286867 CASAVA_Build 2 3639609 1I ATTTTTTTTT -/G GGGGGGTATT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 6 7 286868 CASAVA_Build 2 3640574 1I23M3D ATTTTCTTTC -TTTTTTTTTTAAAGGGATTTTATTTA/TTTTTTTTTTTAAAGGGATTTTAT--- TTTATTTATT 3070 hom 36 het 15 0 12 4 N/A 0 0 286869 CASAVA_Build 2 3653705 1D ATCCTCCCTT C/- CCCAGGTGAA 3070 hom 80 het 30 0 25 5 C 4 3 286870 CASAVA_Build 2 3655537 2I ATATTGCATA --/TC TCTGTTAATA 3070 hom 175 het 66 0 58 8 TC 1 2 286871 CASAVA_Build 2 3658372 2I CAAACACCAC --/AG GGGCTGAGGA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AG 0 1 286872 CASAVA_Build 2 3671231 1D TACCTCATGG T/- TTTTTTTTTT 2456 het 2456 ref 37 16 7 15 T 13 12 286873 CASAVA_Build 2 3672414 1I TTGTCACTGA -/T GCAGGTCATC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 286874 CASAVA_Build 2 3672775 2D TGCACACACT CA/-- CACACACACA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 CA 7 6 286875 CASAVA_Build 2 3676023 2I GGCCCGGTGA --/AC ACATGTGGGC 3070 hom 92 het 35 0 27 8 AC 1 2 286876 CASAVA_Build 2 3686125 1I ACGCACGTGG -/C CCCCTGCTGC 2133 het 2133 ref 19 10 6 3 C 4 5 286877 CASAVA_Build 2 3686758 2D TGGTACACAC AT/-- GTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 45 26 14 7 AT 1 0 286878 CASAVA_Build 2 3696387 1I GCAAAGTCTC -/T TTTTTAGTTC 2982 het 2982 ref 22 12 8 2 T 5 6 286879 CASAVA_Build 2 3699513 4D GGTTGCTTTA TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 47 15 26 7 TCTT 5 4 286880 CASAVA_Build 2 3702246 2I GTCCTTGGTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 1412 hom 33 9 16 8 TC 8 9 286881 CASAVA_Build 2 3716420 1D CACATTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 800 hom 45 2 33 11 T 12 11 286882 CASAVA_Build 2 3725216 3D TAATGATTAG TGA/--- TGTCAGCCAT 2646 het 2646 ref 24 16 7 4 TGA 1 0 286883 CASAVA_Build 2 3727027 3D GACAACTCAG GAA/--- GAAGAAGCCG 3070 hom 96 het 39 0 31 8 GAA 3 2 286884 CASAVA_Build 2 3739955 1I CAATTCAATG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 57 24 22 11 T 6 7 286885 CASAVA_Build 2 3761280 1I GGTTTGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 13 14 286886 CASAVA_Build 2 3764857 1D AAGACCACCC T/- TGGCCTGCCA 1429 het 1429 ref 27 14 5 9 T 2 1 286887 CASAVA_Build 2 3768662 9I CCCATCAAGA ---------/ATATACAAC ATATACAACA 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 ATATACAAC 1 2 286888 CASAVA_Build 2 3780938 2I GTATGGAGAC --/AT ATGTGTGCAT 3070 hom 255 het 91 0 84 7 AT 1 2 286889 CASAVA_Build 2 3787628 1D TGCTTGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1699 hom 38 8 17 13 T 15 14 286890 CASAVA_Build 2 3798151 5I AATGTTCTCA -----/CTTTT CTTGTTCAGC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 CTTTT 0 1 286891 CASAVA_Build 2 3798711 2D TAACGACCCC CT/-- GTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 CT 1 0 286892 CASAVA_Build 2 3800236 1D GAATTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 T 13 12 286893 CASAVA_Build 2 3804937 1D GATTATGCAA C/- TTATCGTCCA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 C 1 0 286894 CASAVA_Build 2 3808082 1D TAGCTGGGAC T/- ACAGGCACCT 3070 het 562 hom 17 2 14 1 T 1 0 286895 CASAVA_Build 2 3817456 1D TATTAGTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 18 18 8 T 10 9 286896 CASAVA_Build 2 3829640 1D GAGCCCTGGT C/- ATAGAGTAGG 3070 het 3070 ref 54 24 24 6 C 1 0 286897 CASAVA_Build 2 3832175 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1386 hom 19 4 13 2 T 11 10 286898 CASAVA_Build 2 3837507 1I TGAAGTTTTC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 7 8 286899 CASAVA_Build 2 3837677 1D GGTCCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 1867 het 1867 ref 30 15 6 9 T 12 11 286900 CASAVA_Build 2 3841488 4I TATGGAGAGA ----/TAAC TAACGGGTGA 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 TAAC 1 2 286901 CASAVA_Build 2 3841776 1I GAGTGCCCAA -/G GGGGTTTAGC 3070 hom 51 het 26 0 15 11 G 4 5 286902 CASAVA_Build 2 3848014 1D ATTTTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 T 11 10 286903 CASAVA_Build 2 3849726 3D TGATATCATA TGT/--- AGCAGGGATT 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 TGT 1 0 286904 CASAVA_Build 2 3859659 3D TGACCCCTCA CAT/--- CATCATCACC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 CAT 3 2 286905 CASAVA_Build 2 3863087 40D4M78D GAAACTGAGG AAGAAATCAGCCTTTGGCTCCCCCTTTCTGTCACACCTACATACCTAGTCTAGCAACAATTTTGCTAGACCAGGGTTTCTCAAGCGCAACACCATTGAAATTTTGGGCTGGATGATTCTTTG/----------------------------------------ATAC------------------------------------------------------------------------------ AGTATCAAGA 3070 hom 30 het 8 0 11 2 N/A 0 0 286906 CASAVA_Build 2 3866927 2I ATCCTAAATC --/TA TTTTTAATTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TA 0 1 286907 CASAVA_Build 2 3875022 1D CTCTTTCATC A/- AACCTTTTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 A 3 2 286908 CASAVA_Build 2 3884770 1I GTGCTGCTGG -/C GCCCCCATGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 0 1 286909 CASAVA_Build 2 3885191 1I AAATTGACAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 8 9 286910 CASAVA_Build 2 3887154 2D ATACACATAT AC/-- ACACACATAC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AC 4 3 286911 CASAVA_Build 2 3895056 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 9 8 286912 CASAVA_Build 2 3895210 1I AACAAGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2125 hom 24 6 15 3 A 11 12 286913 CASAVA_Build 2 3899945 1D CTTCTACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2807 hom 30 9 18 3 T 11 10 286914 CASAVA_Build 2 3903510 1D CATTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3030 het 2873 hom 21 8 7 6 T 13 12 286915 CASAVA_Build 2 3909457 1I GTCTCTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 23 2 17 4 T 13 14 286916 CASAVA_Build 2 3910340 1D TGGCGGGGGT G/- GGGGGGGGGC 2014 het 88 hom 16 1 7 8 G 10 9 286917 CASAVA_Build 2 3910614 1I AATCTGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 T 11 12 286918 CASAVA_Build 2 3919192 1D TTTTAAGGAG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 9 8 286919 CASAVA_Build 2 3919313 4D AAAGACTATA TCTT/---- TCCTTCATTT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 TCTT 1 0 286920 CASAVA_Build 2 3920498 4D CGTGAAGATC TTTG/---- TTTGTAGTTT 3070 het 3070 hom 45 20 20 7 TTTG 2 1 286921 CASAVA_Build 2 3922488 3I TTTCTGTCTC ---/AAT GATGTTTCTA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AAT 0 1 286922 CASAVA_Build 2 3922681 2D TTTCTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 29 6 14 9 T 12 10 286923 CASAVA_Build 2 3937763 1D CTTTGCCTTT C/- CCCTCTCATT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 C 4 3 286924 CASAVA_Build 2 3938480 1I AACTAGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 10 11 286925 CASAVA_Build 2 3944883 1I AACGTTAGGT -/C GGGAGCATGG 3070 het 3070 ref 46 28 16 2 C 0 1 286926 CASAVA_Build 2 3947024 3D ACAGAATGTT GTC/--- TATGACCATA 3070 het 3070 hom 31 9 18 6 GTC 1 0 286927 CASAVA_Build 2 3947235 2D CAAACTTGAC AG/-- AGTTAAAATG 3070 het 3070 ref 36 23 8 5 AG 2 1 286928 CASAVA_Build 2 3947451 1D17M1D AAACAGGAAG TTTTTGAGCAGATGTTGTA/-TTTTGAGCAGATGTTGT- AAAAAGGGCA 3070 het 3070 ref 27 16 14 3 N/A 0 0 286929 CASAVA_Build 2 3951896 1D19M1I TTCCCATTTC TTTTTTTTTTTTCCTTTTTA-/-TTTTTTTTTTTCCTTTTTAT TTTTTTTTGA 1813 het 1813 ref 33 18 15 2 N/A 0 0 286930 CASAVA_Build 2 3953237 1D9M17D TGAGGCATTG AAACCAGAGTTCTGCCCCGAGCTGGCA/-AATAGGAGT----------------- TCTTAACCAG 3070 het 3070 ref 43 26 19 7 N/A 0 0 286931 CASAVA_Build 2 3959501 2I GCTGGGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 1721 het 589 hom 13 2 4 7 T 10 12 286932 CASAVA_Build 2 3966715 1I GTTTATTATG -/T TTTTTTTTTT 2078 het 2078 ref 24 14 7 3 T 11 12 286933 CASAVA_Build 2 3981679 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1977 hom 27 8 11 8 T 12 11 286934 CASAVA_Build 2 3981770 1I TTCTCACATT -/A AAAAAAAAAA 1089 het 1089 ref 32 23 3 6 A 13 14 286935 CASAVA_Build 2 3989412 1D TTCCTCCCCC T/- TAAAACACCA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 2 1 286936 CASAVA_Build 2 3993727 1D TGGAATTTGG C/- CCCCCATGTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 C 6 5 286937 CASAVA_Build 2 3996815 5D TGTATGTGTG TGTTA/----- TGTTATGTGG 3070 het 3070 ref 81 36 34 17 TGTTA 2 1 286938 CASAVA_Build 2 3997669 2D TGTGTGGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 67 24 28 15 GT 7 6 286939 CASAVA_Build 2 4040490 1D TTTAAAGTTA T/- TTTTTGAAAA 3070 hom 69 het 43 1 40 2 T 6 5 286940 CASAVA_Build 2 4042831 15I AGCTGTCAGT ---------------/GGATCTGACATTCTG GGATCTGTAT 2358 hom 21 het 12 0 7 5 GGATCTGACATTCTG 0 1 286941 CASAVA_Build 2 4044250 1D GGCCTGTGGT G/- GGAGGGGCTG 1466 het 1466 ref 27 16 8 3 G 3 2 286942 CASAVA_Build 2 4049166 1D TACAGGGCTT C/- CTTAGGGTGG 3070 het 3070 ref 37 19 11 9 C 2 1 286943 CASAVA_Build 2 4055155 4I GGCCGGGTGT ----/GGTG GGTGGCTCAC 2847 het 1345 hom 16 4 9 3 GGTG 1 2 286944 CASAVA_Build 2 4057056 8I CAGTCAGCTT --------/TCCCTAGG TCGCTCAGCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCCCTAGG 0 1 286945 CASAVA_Build 2 4066424 1D TTCATTCATT C/- CATTCATGTA 3070 hom 123 het 45 0 41 5 C 2 1 286946 CASAVA_Build 2 4071889 2D CTTATACAGG GT/-- GTGTGTGTGT 1395 het 1395 ref 45 27 4 14 GT 9 8 286947 CASAVA_Build 2 4073644 8I ATGGAAGTGA --------/TAATTGAC TAATTGACGC 3070 het 3070 hom 53 18 24 11 TAATTGAC 1 2 286948 CASAVA_Build 2 4077086 1D CCCTGACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 11 10 286949 CASAVA_Build 2 4077154 1D GGCTTATGAT A/- AAAAAAAAAA 3066 het 1794 hom 31 8 12 12 A 15 14 286950 CASAVA_Build 2 4085871 1I TCTAGGATTT -/A GGAGCAAGTC 3070 hom 56 het 24 0 19 5 A 0 1 286951 CASAVA_Build 2 4090684 8D TTTCAAAAAG TGTGCAAA/-------- TCACTCTCTC 3070 het 3070 ref 32 19 10 6 TGTGCAAA 1 0 286952 CASAVA_Build 2 4093377 1I CCCAAGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 10 11 286953 CASAVA_Build 2 4098480 2D ATATATATAT AG/-- AGAGAGAGAG 1799 het 1799 ref 19 10 5 5 AG 7 6 286954 CASAVA_Build 2 4100078 1I CTACTGTGAA -/C CCCGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 C 3 4 286955 CASAVA_Build 2 4104559 1I AGCTATCCCT -/C CCCCCTCCCC 1375 hom 11 het 5 0 4 1 C 5 6 286956 CASAVA_Build 2 4112675 2D AAATTTAATC AG/-- AAAAGAAATT 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 AG 1 0 286957 CASAVA_Build 2 4117769 1D GGTATAAGCA T/- TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 52 28 19 5 T 7 6 286958 CASAVA_Build 2 4118280 1D AGGTAGACTC T/- AGTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 T 1 0 286959 CASAVA_Build 2 4124401 2D TAAATAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 13 11 286960 CASAVA_Build 2 4126966 1I GTCCATTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 T 10 11 286961 CASAVA_Build 2 4132378 3D CTGTCTGCTA AAC/--- AACTTCACTT 1971 het 1971 ref 25 15 6 5 AAC 2 1 286962 CASAVA_Build 2 4136570 13D TCCCTCCCTT CCTCCCTCCCTCC/------------- GTTTCCTTTC 1062 hom 7 het 3 0 3 0 CCTCCCTCCCTCC 1 0 286963 CASAVA_Build 2 4156823 1I GTTTCCATTT -/G GTTTCCTCAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 1 2 286964 CASAVA_Build 2 4164826 3I CTGTTTCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 AAC 3 4 286965 CASAVA_Build 2 4167038 1D CAAAAAAGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 A 10 9 286966 CASAVA_Build 2 4172897 1D ATATGGTTTT A/- TTTCTTATAT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 1 0 286967 CASAVA_Build 2 4175773 9D TGAAGATCTT GACATTTTA/--------- GACATTTTAG 3070 het 3070 hom 44 18 23 6 GACATTTTA 2 1 286968 CASAVA_Build 2 4183270 1D TATGAATGCT G/- GGGGGGGGAG 1651 het 1651 ref 25 13 4 9 G 9 8 286969 CASAVA_Build 2 4190792 1D ACTTTTTTAT G/- GGCAGCCCCA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 G 3 2 286970 CASAVA_Build 2 4191522 1D AGTAGACAGC T/- TTTTTTGGAT 3070 hom 48 het 18 0 17 2 T 7 6 286971 CASAVA_Build 2 4193072 1I ATCTTGTGCA -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 7 8 286972 CASAVA_Build 2 4198243 1I GAAAACGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 26 het 13 0 9 4 T 9 10 286973 CASAVA_Build 2 4210422 3D TCCCCGGCTC AAG/--- AAATCCTTCC 3070 het 3070 ref 23 13 8 3 AAG 1 0 286974 CASAVA_Build 2 4210797 10I CACAGACAGA ----------/AGGAGAGGAG AGGAGAGGAG 3070 hom 72 het 26 0 22 4 AGGAG 2 4 286975 CASAVA_Build 2 4213686 1I ATGACTTGCT -/C CTCCTTGCCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 1 2 286976 CASAVA_Build 2 4215912 1D TGTGATTTGA T/- TTTTTTAAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 7 6 286977 CASAVA_Build 2 4218111 1I ACAACCTCTG -/A AATCTAGGCA 3070 hom 81 het 32 0 26 6 A 2 3 286978 CASAVA_Build 2 4219292 1I GAGAATTTAA -/C TTTTTTTTTT 3070 het 296 hom 38 1 33 4 C 0 1 286979 CASAVA_Build 2 4221471 5I GAGAAAAAGG -----/AAATA AAATGTGAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAATA 0 1 286980 CASAVA_Build 2 4222523 4D CTGTCTTTTC CTTT/---- CTTTCTCTTT 3070 hom 117 het 42 0 37 7 CTTT 2 1 286981 CASAVA_Build 2 4233017 1D GTGTAGAATT C/- CCAATTTTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 3 2 286982 CASAVA_Build 2 4249241 1I TGGTTCAGTG -/C CCCCCTAGGG 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 C 5 6 286983 CASAVA_Build 2 4259427 1D AATGGAAAAC A/- AAAAAAAGGC 3070 het 2766 hom 24 9 12 3 A 8 7 286984 CASAVA_Build 2 4285263 18D ACCTTGAAAA AACATGAAGAATCACTTC/------------------ ATCTCCTCTT 3070 het 3070 ref 25 16 12 4 AACATGAAGAATCACTTC 1 0 286985 CASAVA_Build 2 4289273 1I TAGCTACACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 9 10 286986 CASAVA_Build 2 4290848 1D TTCTCCCCCC A/- CCCAGTTCTC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 1 0 286987 CASAVA_Build 2 4291047 7D GCATGGTACT TGATCTA/------- TGATCTATGA 3070 het 3070 hom 43 15 20 10 TGATCTA 2 1 286988 CASAVA_Build 2 4299397 1I TAAATAATGC -/A ATTCATTTCA 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 A 1 2 286989 CASAVA_Build 2 4300632 3D TGATTTTTAC TTA/--- TTATAGGATA 3070 het 3070 ref 31 21 10 0 TTA 2 1 286990 CASAVA_Build 2 4302036 1I AGTTACTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 14 12 T 13 14 286991 CASAVA_Build 2 4307929 1I CAGACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2389 hom 32 9 14 9 T 11 12 286992 CASAVA_Build 2 4317362 1D TGACTTTTTT C/- TTTTTTTTGA 1659 het 430 hom 11 1 7 3 C 1 0 286993 CASAVA_Build 2 4319964 1D AGAAAAAGAT A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 A 8 7 286994 CASAVA_Build 2 4324106 7I CAGTGTTTGC -------/TTTTTCT TTTTTCTTTT 3070 het 2371 hom 33 11 15 7 TTTTTCT 1 2 286995 CASAVA_Build 2 4324621 2D TAGCATTCTG CT/-- CTGTGATGTC 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 CT 2 1 286996 CASAVA_Build 2 4359447 1I CATTTGCCCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 8 9 286997 CASAVA_Build 2 4365327 4I TCTTTACTAC ----/TTTA TTTATTCTTT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 TTTA 1 2 286998 CASAVA_Build 2 4366592 2I TATTGTAAAC --/TG TCATTCATCA 1932 het 1932 ref 19 11 4 4 TG 0 1 286999 CASAVA_Build 2 4372507 2D TTTTTATCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 T 13 11 287000 CASAVA_Build 2 4373243 17D GGGATGAGCG TGCCTATAAATTTGAGA/----------------- TGCCTATAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 9 TGCCTATAAATTTGAGA 2 1 287001 CASAVA_Build 2 4377055 1D GATCCAGTTA G/- GATCCCGAAG 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 G 2 1 287002 CASAVA_Build 2 4381097 1D AAAAGGCTAC A/- AAAAACATTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 6 5 287003 CASAVA_Build 2 4381404 1D AACTGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 A 11 10 287004 CASAVA_Build 2 4382087 1D AAAGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1467 hom 30 5 14 11 A 13 12 287005 CASAVA_Build 2 4382224 8I GATGTTTATC --------/TGAGAGAA TGTGTTTATT 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 TGAGAGAA 0 1 287006 CASAVA_Build 2 4382513 1I CTTCTTTATC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 8 9 287007 CASAVA_Build 2 4388922 7D TTACAGTTTC ATGTCTT/------- ATATTTAAAT 3070 het 3070 ref 44 26 18 3 ATGTCTT 1 0 287008 CASAVA_Build 2 4392062 3D CAGTTTTCTC GTT/--- GTTTTGTAGA 3062 het 3062 ref 23 14 7 3 GTT 2 1 287009 CASAVA_Build 2 4393835 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1925 hom 37 9 22 8 T 15 14 287010 CASAVA_Build 2 4403807 1D CTCTGTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3032 het 2815 hom 40 10 13 17 A 15 14 287011 CASAVA_Build 2 4412129 1D AATCAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 T 12 11 287012 CASAVA_Build 2 4414151 1D GTATTCTTTC T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 37 19 17 3 T 7 6 287013 CASAVA_Build 2 4419077 1I CACTGAGCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 8 9 287014 CASAVA_Build 2 4430823 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 13 1 11 1 A 12 11 287015 CASAVA_Build 2 4431327 30D GTTTTGTGTC TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/------------------------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 17 het 32 1 19 17 TG 23 8 287016 CASAVA_Build 2 4436540 2D CTGACATGGC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 27 12 7 8 AG 9 8 287017 CASAVA_Build 2 4439342 1D TCAATTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 44 2 31 12 A 15 14 287018 CASAVA_Build 2 4453227 4I CTTTTCTTGC ----/TCTG TCTTATTTTG 3070 het 3070 hom 53 26 22 5 TCTG 0 1 287019 CASAVA_Build 2 4456472 5D ATCAGAATGT TATGA/----- TATGTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 7 TATGA 1 0 287020 CASAVA_Build 2 4457384 3D TTTTATTCTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 28 1 18 10 T 17 14 287021 CASAVA_Build 2 4464645 1I22M1I AAAAATTAGA -TTTTTTTTTTATTTTTTATTTA-/TTTTTTTTTTTATTTTTTATTTAT TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 28 17 10 4 N/A 0 0 287022 CASAVA_Build 2 4465931 1D TCTTTCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 15 10 T 12 11 287023 CASAVA_Build 2 4467621 1D TTACATCATG T/- TTTTGTTGGC 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 T 5 4 287024 CASAVA_Build 2 4474313 1D TGAAAGTCTA T/- TTGTTAAGTT 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 T 3 2 287025 CASAVA_Build 2 4476304 1I AAGGGCTGGG -/C CCTCATGGGC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 2 3 287026 CASAVA_Build 2 4477616 3I TTCTTCTTCT ---/TCC TCCTCCTCCT 2199 het 2199 ref 42 16 12 14 TCC 3 4 287027 CASAVA_Build 2 4479874 1D CCCTTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2419 hom 31 9 13 9 A 14 13 287028 CASAVA_Build 2 4498870 4D ATTAAGTTGA CACT/---- CAATATTAAC 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 CACT 1 0 287029 CASAVA_Build 2 4513661 1D TAAGCCACTA C/- TTTAAGTGGC 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 C 1 0 287030 CASAVA_Build 2 4515701 2D GGCACAGAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3063 hom 23 8 8 7 TA 8 7 287031 CASAVA_Build 2 4516168 1D GGGAGGGGCT A/- GGGGCAGAAT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 1 0 287032 CASAVA_Build 2 4516499 4D TCTCCAGGTG TTTC/---- TTTATTAGCA 3070 het 3070 hom 45 18 22 6 TTTC 1 0 287033 CASAVA_Build 2 4522206 1D GTTTTTGTTC T/- GAGTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 1 0 287034 CASAVA_Build 2 4527988 2D ATGAATACAC TG/-- TAGAGTGTTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 TG 1 0 287035 CASAVA_Build 2 4540079 3D GAAACTTGCT ACC/--- ACCCCCTGGG 3070 het 3070 ref 36 20 10 9 ACC 2 1 287036 CASAVA_Build 2 4544994 1I TCATATGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 12 287037 CASAVA_Build 2 4546787 1D TTCAACACTC A/- AAAACCTTGG 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 A 5 4 287038 CASAVA_Build 2 4547731 4D AAAAAATCAT AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 AATA 4 3 287039 CASAVA_Build 2 4548352 1D GAGGAAAGGT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 137 het 54 0 45 10 A 8 7 287040 CASAVA_Build 2 4549073 1D GCTGAGAGAA T/- TCGGGAGGCA 3070 het 3070 hom 47 20 20 8 T 2 1 287041 CASAVA_Build 2 4549514 1I AAAAATACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 10 11 287042 CASAVA_Build 2 4551866 11D CATAAGCTAC AGTTTTATAAT/----------- AGTTTTATAA 3070 hom 54 het 20 0 19 3 AGTTTTATAAT 2 1 287043 CASAVA_Build 2 4552140 1I TTTTCTTTTC -/T CTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 28 9 T 0 1 287044 CASAVA_Build 2 4575137 1I TGTCTTTAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 T 9 10 287045 CASAVA_Build 2 4578101 1I CATATGTATC -/A CCTACAAAGC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 0 1 287046 CASAVA_Build 2 4579508 5D GTGTGTGTGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 639 het 238 hom 12 2 3 7 T 26 21 287047 CASAVA_Build 2 4582412 4D GGAATTTTCA TCTG/---- TCTAAGTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TCTG 1 0 287048 CASAVA_Build 2 4583668 1D TCTGTTTTAA C/- CTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 C 2 1 287049 CASAVA_Build 2 4583786 1D TTAGCATATT C/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 C 1 0 287050 CASAVA_Build 2 4585688 2D TGCCTAGAAG TA/-- TATGTTTATG 3070 het 3070 ref 53 30 19 5 TA 2 1 287051 CASAVA_Build 2 4589389 1D TAAATTGTGA T/- TTATATATAT 2693 hom 15 het 8 0 6 2 T 3 2 287052 CASAVA_Build 2 4622321 2I TTGAGGATGA --/AT ACAGTCAAGG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AT 0 1 287053 CASAVA_Build 2 4631323 4I TAGCATGCTT ----/TTTC TTTCTTTCTG 3070 hom 108 het 44 0 37 7 TTTC 2 3 287054 CASAVA_Build 2 4631423 1D TGGCTGTCTT A/- ATGGGACTTT 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 A 2 1 287055 CASAVA_Build 2 4633980 1I TGTGATACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 10 11 11 A 9 10 287056 CASAVA_Build 2 4637598 1D TTTGTTTACC A/- AACTGGGAGT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 3 2 287057 CASAVA_Build 2 4664474 1I ACTGGCTATG -/C CACTGAGGTG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 1 2 287058 CASAVA_Build 2 4668506 1D CGCAGAAGAC G/- GGTGATTTCT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 3 2 287059 CASAVA_Build 2 4686780 7D TTCTTCCACA CATATTG/------- CATTTTACTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 CATATTG 1 0 287060 CASAVA_Build 2 4693369 1I GGATTAAGTG -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 hom 50 17 24 9 T 6 7 287061 CASAVA_Build 2 4694327 3I TGCAATTCCT ---/GCA GTTTCACCCT 3070 het 3070 ref 53 27 20 6 GCA 0 1 287062 CASAVA_Build 2 4707957 1D TATTATTCCA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 8 7 287063 CASAVA_Build 2 4710628 1D GGAGATTGTA G/- GCAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 G 2 1 287064 CASAVA_Build 2 4716232 1I ACCAGTCTCT -/C CTCTGAGGCC 3070 hom 63 het 27 0 21 6 C 1 2 287065 CASAVA_Build 2 4733948 1D GCTGGAGTGG C/- TTTTATGTTA 3070 het 3070 hom 36 12 13 11 C 1 0 287066 CASAVA_Build 2 4738760 1I TTTGAAGCTA -/T TTTTTAAAAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 5 6 287067 CASAVA_Build 2 4739718 1I ATTCATAGAC -/T TTTTTTTACA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 7 8 287068 CASAVA_Build 2 4748673 2I CTCAGTTCTC --/AA AGTCTTTGGC 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 1 3 287069 CASAVA_Build 2 4756148 1I AGAGGTTAAG -/A AAAACTTCTC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 4 5 287070 CASAVA_Build 2 4757258 13I GGAAGACTAT -------------/GCCCTTTGTGGAA GCCCTTAACT 3070 hom 86 het 31 0 27 5 GCCCTTTGTGGAA 0 1 287071 CASAVA_Build 2 4758479 22D CACATATGTC AAAGAAAAAGTCTCTAGAATTG/---------------------- AAAGAAAAAG 3070 hom 69 het 25 0 24 8 AAAGAAAAAGTCTCTAGAATTG 2 1 287072 CASAVA_Build 2 4773202 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 A 12 11 287073 CASAVA_Build 2 4799010 1D CAGAGTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 11 10 287074 CASAVA_Build 2 4800602 2D AAATTCTAAC AG/-- AACATCTAGA 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 AG 1 0 287075 CASAVA_Build 2 4805190 2I TTTTTGACAC --/TT AACTTTCTGG 3070 hom 102 het 40 0 33 7 T 0 2 287076 CASAVA_Build 2 4807474 2D TTCTTGGTAT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 het 306 hom 28 4 16 9 G 12 10 287077 CASAVA_Build 2 4808166 1D ACTATTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 T 13 12 287078 CASAVA_Build 2 4809887 1D CAAGTATCTT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 A 8 7 287079 CASAVA_Build 2 4810003 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 9 8 287080 CASAVA_Build 2 4815538 9D TTTCCTGGAG GTAACCATT/--------- GTGCCCCCAT 3070 het 3070 ref 52 24 25 5 GTAACCATT 1 0 287081 CASAVA_Build 2 4816828 1D GGTAGCCTTA C/- CCAGAAAACT 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 C 3 2 287082 CASAVA_Build 2 4829887 9D GTACATTACA CATATTCCT/--------- CATATTCATC 2890 het 2890 ref 27 13 10 4 CATATTCCT 1 0 287083 CASAVA_Build 2 4831556 1I GTGGAGGGGG -/A AAAATGGACA 3070 het 3070 ref 48 19 19 10 A 4 5 287084 CASAVA_Build 2 4831979 2I ATATATATGT --/TC TCTGTCTCTA 2224 het 1982 hom 23 8 9 7 TC 1 2 287085 CASAVA_Build 2 4832069 1I GCTGAAGGAC -/T TTTTTTTTTT 2733 het 2733 ref 16 9 6 2 T 12 13 287086 CASAVA_Build 2 4837517 3I AAATAATAAT ---/CTC CTGAAACTTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 CTC 0 1 287087 CASAVA_Build 2 4839747 1I TTAAGTCCCT -/A GGCTGCACAG 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 A 0 1 287088 CASAVA_Build 2 4842637 1I GGCTCATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 11 12 287089 CASAVA_Build 2 4851612 1D GAATAAATGT A/- AAAAACATAC 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 A 6 5 287090 CASAVA_Build 2 4852050 2D TGCTTTCCAC AT/-- AGAGTGTTGT 3070 het 3070 hom 50 21 21 9 AT 1 0 287091 CASAVA_Build 2 4856687 1I AGGAAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 8 15 10 A 10 11 287092 CASAVA_Build 2 4861207 1I AGTTGAGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2106 hom 19 7 8 4 A 10 11 287093 CASAVA_Build 2 4866182 1D ATGTCTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 13 12 287094 CASAVA_Build 2 4877804 1D TTAAGAAAAT A/- AAAAAAAAGC 2681 het 2681 ref 24 12 8 4 A 9 8 287095 CASAVA_Build 2 4880372 4D GTGTGTACAT ACAC/---- AATTATGAAT 3070 het 3070 ref 42 20 20 4 AC 2 0 287096 CASAVA_Build 2 4881893 8I TCTTTTTTAA --------/AATGTTTT AATGTTTTAA 3070 het 1552 hom 16 5 9 2 AATGTTTT 1 2 287097 CASAVA_Build 2 4882053 1D AAAGTGAGAT C/- CTGTCTCTGT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 C 2 1 287098 CASAVA_Build 2 4883296 1I AAACAGGGTC -/T GATAAGTAAC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 0 1 287099 CASAVA_Build 2 4896213 1D CTGATAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 36 0 18 18 T 13 12 287100 CASAVA_Build 2 4902218 2D GAAGATTTAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 20 hom 20 1 12 8 AT 9 8 287101 CASAVA_Build 2 4913145 4D AGGGGTTCCT ACTG/---- ACTAAGTTTG 3070 hom 87 het 30 0 30 1 ACTG 1 0 287102 CASAVA_Build 2 4913236 1I GAAATCAAGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 7 8 287103 CASAVA_Build 2 4916225 1D TTCATTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 T 15 14 287104 CASAVA_Build 2 4917564 1I TCTATATTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 18 25 6 T 9 10 287105 CASAVA_Build 2 4918827 1I CCTCTTATTC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3064 hom 34 8 18 8 A 8 9 287106 CASAVA_Build 2 4921859 1D GTGTTTTTTC T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 7 287107 CASAVA_Build 2 4922963 4D CTTGGAAAAG AGGA/---- AGTCAAATTA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 AGGA 1 0 287108 CASAVA_Build 2 4928099 2I AATCCACATC --/AT ATGCAACAGA 3070 het 3070 hom 48 19 21 8 AT 1 2 287109 CASAVA_Build 2 4929234 1D AGGGAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1683 hom 26 9 14 4 A 13 12 287110 CASAVA_Build 2 4931728 5I TGGCCAGGCC -----/GGTCT GGTCTGGAAC 3070 het 3070 ref 40 25 9 6 GGTCT 1 2 287111 CASAVA_Build 2 4933597 1D TTCTACAATT A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 7 6 287112 CASAVA_Build 2 4938045 1I TTTTCCTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 25 4 A 9 10 287113 CASAVA_Build 2 4940481 1D CACCACTAGT G/- GCTGGGGCCA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 G 2 1 287114 CASAVA_Build 2 4942111 13D CATATATAGC ATTGTACAGACTG/------------- ATGTAGACAT 3070 hom 84 het 26 0 29 4 ATTGTACAGACTG 1 0 287115 CASAVA_Build 2 4942976 1I CAATATATTA -/T TTTTTTGAAT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 6 7 287116 CASAVA_Build 2 4943031 1D CTGCAAATCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 45 het 21 0 16 6 T 9 8 287117 CASAVA_Build 2 4958786 5D GAAAACAGAC TAATA/----- CACCATCTTT 3070 het 3070 ref 44 23 20 6 TAATA 1 0 287118 CASAVA_Build 2 4959339 6I TCCAGAGGGT ------/TTTTTG TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 TTTTTG 1 2 287119 CASAVA_Build 2 4962222 1D TCTTCTCTGC A/- AAATGAGGAG 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 4 3 287120 CASAVA_Build 2 4972785 1I TTATAAGAAG -/T ATTTTCAATG 3070 het 3070 hom 43 21 19 3 T 0 1 287121 CASAVA_Build 2 4973116 5D TAGTACTGAA TACTT/----- TATAAGGAAC 3070 het 3070 hom 52 20 26 10 TACTT 1 0 287122 CASAVA_Build 2 5090536 1D AGTTATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 28 0 20 8 A 13 12 287123 CASAVA_Build 2 5160161 1I TCTCCTTTTC -/T TTTTGTTTTT 3070 hom 85 het 32 0 28 4 T 4 5 287124 CASAVA_Build 2 5171785 1D AACAGCTCCA G/- CACAAGTCAT 3070 hom 165 het 60 0 54 6 G 1 0 287125 CASAVA_Build 2 5174505 1D TGCAAAGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 183 hom 32 2 23 7 A 13 12 287126 CASAVA_Build 2 5178150 1D AGAAATGTCC A/- CAGTCTTCTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 5 A 1 0 287127 CASAVA_Build 2 5193188 1I CCTCAAGACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 8 9 287128 CASAVA_Build 2 5196288 2D GATGAGAGGT AA/-- AACAATCTTA 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 A 4 2 287129 CASAVA_Build 2 5200742 2D GAATTGCACA AG/-- AGTGTTTTTC 3070 het 2632 hom 19 8 10 1 AG 2 1 287130 CASAVA_Build 2 5207792 2I CTATATATAT --/AA AATCTTCATA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 2 4 287131 CASAVA_Build 2 5231221 1I ACTCTTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 31 2 24 5 T 11 12 287132 CASAVA_Build 2 5249088 1D GCAAAAAAAA T/- CATATTTACT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 T 1 0 287133 CASAVA_Build 2 5252323 1D TTTCAACTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 10 9 287134 CASAVA_Build 2 5265122 3I ATTGTAATAA ---/GAT GATGATTAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GAT 2 3 287135 CASAVA_Build 2 5278911 1I TCGTTTGTGG -/T TTTTCTCTCA 3070 hom 118 het 53 0 48 5 T 4 5 287136 CASAVA_Build 2 5281330 1I AAATAGCACT -/G GTCACAGAGT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 G 1 2 287137 CASAVA_Build 2 5289941 1I AAGGTGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 39 3 19 17 T 15 16 287138 CASAVA_Build 2 5290705 1D AGAGGCTTTG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 A 9 8 287139 CASAVA_Build 2 5299085 1I TCTGTTTAAT -/A GCTGTTTCTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 0 1 287140 CASAVA_Build 2 5301881 1D CTAAAATGCT G/- GGGTTTTCAT 3070 het 3070 ref 52 28 16 8 G 4 3 287141 CASAVA_Build 2 5305911 1I CATGCTCATG -/C CCCCCCCACC 1643 het 1643 ref 28 17 4 7 C 7 8 287142 CASAVA_Build 2 5306925 1I GTCTTATCAG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 A 7 8 287143 CASAVA_Build 2 5313126 6D TGTATATAGA CTCATT/------ TATGAGTAGC 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 CTCATT 1 0 287144 CASAVA_Build 2 5321655 1D GTATTCTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2439 hom 39 7 27 5 A 10 9 287145 CASAVA_Build 2 5322022 2D TAAAAGCCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 A 13 11 287146 CASAVA_Build 2 5330532 1D TTTCTTTTTT A/- CCACCATAAT 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 A 1 0 287147 CASAVA_Build 2 5334807 1D TTTGGGTCAT A/- GGGGCAAATT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 1 0 287148 CASAVA_Build 2 5335847 2I CACATTTGTT --/AA AGAGTATTTA 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 1 3 287149 CASAVA_Build 2 5336816 1I TCCCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1896 het 611 hom 28 4 12 12 T 17 18 287150 CASAVA_Build 2 5341571 1D GACTAGGTTG A/- AAATGTGAGA 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 A 4 3 287151 CASAVA_Build 2 5342967 3D TCAGTGAGAC AAA/--- AAAAAAAAAA 1690 het 1522 hom 37 15 5 19 A 19 16 287152 CASAVA_Build 2 5344024 7I AAGCTAAAAG -------/AAAAAGA AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 AAAAAGA 1 2 287153 CASAVA_Build 2 5346064 1I GATGCTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 11 12 287154 CASAVA_Build 2 5353093 1D TACCTAATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 30 1 27 2 A 11 10 287155 CASAVA_Build 2 5353950 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 8 7 287156 CASAVA_Build 2 5371943 1D ATTAGAAATA T/- TTTTTTACAG 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 T 7 6 287157 CASAVA_Build 2 5372852 2D TTTCAGCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 A 12 10 287158 CASAVA_Build 2 5378172 1I ATAGATATAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 58 33 22 3 T 8 9 287159 CASAVA_Build 2 5394288 3I GCTAACACGG ---/TGA AACCCCGTCT 2213 hom 15 het 6 0 6 0 TGA 0 1 287160 CASAVA_Build 2 5410582 4I AGAAATTCTG ----/ATGT GTCTTTGATC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 ATGT 0 1 287161 CASAVA_Build 2 5414392 1I GAATTTGGGT -/G GGGGGGACAC 3070 het 3070 ref 38 18 10 10 G 6 7 287162 CASAVA_Build 2 5422376 5D TTCTAGAAAT AAATC/----- CAAGTCTACT 3070 het 3070 ref 36 24 9 5 AAATC 1 0 287163 CASAVA_Build 2 5433623 1D TTGGCTTGTT A/- AAAAAAAAAA 2819 het 344 hom 20 2 7 13 A 13 12 287164 CASAVA_Build 2 5447138 4D TCTTTTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1402 hom 29 10 13 6 T 20 16 287165 CASAVA_Build 2 5465157 1I CAAGCATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 33 0 23 10 A 10 11 287166 CASAVA_Build 2 5478524 3D CTGATGTGTT AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 A 12 9 287167 CASAVA_Build 2 5485216 2I AAATTGGCAG --/CT CTTATATGTT 3070 hom 132 het 50 0 43 7 CT 1 2 287168 CASAVA_Build 2 5495766 2D TCTCTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 41 17 16 11 TC 6 5 287169 CASAVA_Build 2 5501733 1I GTCGTGCGGG -/C CCTGAGGGGG 3070 hom 45 het 23 0 15 8 C 2 3 287170 CASAVA_Build 2 5507941 1I CATGGTCCAT -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 A 6 7 287171 CASAVA_Build 2 5510661 6I ACCCTCAAAA ------/GTCACT AGTCATTGAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 GTCACT 0 1 287172 CASAVA_Build 2 5511578 1D CCCACAAATG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 102 het 41 0 32 9 T 9 8 287173 CASAVA_Build 2 5513674 1D TTATTTTGAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 9 8 287174 CASAVA_Build 2 5529944 3D CAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 237 het 237 ref 27 14 2 12 AAG 1 0 287175 CASAVA_Build 2 5539588 1D CTCAGCCAGT G/- GAAAACACAG 3070 het 3070 hom 38 13 22 4 G 2 1 287176 CASAVA_Build 2 5542784 1D GCTTGGGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 37 4 15 20 A 11 10 287177 CASAVA_Build 2 5548200 1D CAGAATTTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 T 8 7 287178 CASAVA_Build 2 5563183 4D AATGTAAACT TAAA/---- TAAGTTTAGA 3070 het 3070 hom 54 21 31 3 TAAA 1 0 287179 CASAVA_Build 2 5563325 1D TTTAAGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 9 8 T 12 11 287180 CASAVA_Build 2 5564081 1I ATTCTGATGA -/T TAAAAGCTTC 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 T 1 2 287181 CASAVA_Build 2 5569855 3I TGTCCCTGGC ---/GCA GCAGCCTTTG 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 GCA 1 2 287182 CASAVA_Build 2 5573276 1D TTTTTTTTTT G/- ATGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 9 G 1 0 287183 CASAVA_Build 2 5573871 1D TATGCCCCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 10 9 287184 CASAVA_Build 2 5607999 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1832 het 197 hom 22 3 7 12 T 19 18 287185 CASAVA_Build 2 5618025 1D AGGTGAAATC A/- AAATGCCTTA 3070 het 3070 hom 39 19 18 3 A 4 3 287186 CASAVA_Build 2 5620789 3D TATGTGTGTT GTG/--- GGGGATGTTT 3070 het 3070 ref 61 27 26 9 GTG 1 0 287187 CASAVA_Build 2 5621418 1D CTTTTTATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 9 287188 CASAVA_Build 2 5621755 27D ATCCAGATAT TCCACCACCTGTGTGACACCCGGGTAC/--------------------------- TCCACCACCT 2829 het 2829 ref 27 17 8 9 TCCACCACCTGTGTGACACCCGGGTAC 1 0 287189 CASAVA_Build 2 5630533 1D CATGTGCTAA G/- TAATGCAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 G 1 0 287190 CASAVA_Build 2 5631426 1D CACTGATCTT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 18 10 A 1 0 287191 CASAVA_Build 2 5632008 1D CCAGCAATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 9 287192 CASAVA_Build 2 5634842 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1681 hom 20 8 11 4 A 16 14 287193 CASAVA_Build 2 5635821 1D AGGAATAGAT A/- AAATTCCTAG 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 4 3 287194 CASAVA_Build 2 5636987 1I TCCCAATGAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 T 8 9 287195 CASAVA_Build 2 5637554 1D TTAATAGAGT A/- AAAAAAACCT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 7 287196 CASAVA_Build 2 5664415 1I TTCAAATAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 A 9 10 287197 CASAVA_Build 2 5680675 2D TTGACAGGTG AT/-- ATAGGGAAGA 3070 het 3070 hom 37 19 17 1 AT 2 1 287198 CASAVA_Build 2 5687004 6I TTTGAACTCA ------/AATATC ACATTTATAT 2886 het 2886 ref 24 15 6 3 AATATC 0 1 287199 CASAVA_Build 2 5689804 4I ATGCAGTAGT ----/TTCA TTCAATATGA 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 TTCA 1 2 287200 CASAVA_Build 2 5690519 4I CATTTGGAAA ----/TTAT TTATTTCTAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TTAT 1 2 287201 CASAVA_Build 2 5691312 4D CTGTCTTTGC ACTA/---- ACTACCGTTA 3070 het 3070 hom 75 23 49 7 ACTA 2 1 287202 CASAVA_Build 2 5693040 1D ACCATGTTGC T/- GAAGAAATCT 3070 het 3070 ref 89 70 9 10 T 1 0 287203 CASAVA_Build 2 5693356 1D GCATTAGAGG A/- GGTGAGTGCA 2003 het 2003 ref 58 45 7 6 A 1 0 287204 CASAVA_Build 2 5693710 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1850 het 1208 hom 23 6 8 9 A 15 16 287205 CASAVA_Build 2 5694625 1I TTTTGGGGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 80 25 44 11 A 9 10 287206 CASAVA_Build 2 5695059 1D ATTCAAAATT G/- GCTTTAAAAA 1845 het 1845 ref 46 35 4 7 G 2 1 287207 CASAVA_Build 2 5696514 3D TTATAAATGC TTT/--- TTTTCTGTAG 3070 het 3070 hom 66 31 34 2 T 7 4 287208 CASAVA_Build 2 5696591 1D GGTACTTGTC T/- AAGTGCATTG 3070 het 3070 ref 54 41 13 1 T 1 0 287209 CASAVA_Build 2 5697952 2I GGGAAAGTTC --/AA AAAAAAAAAA 2410 het 2410 ref 44 14 13 17 A 11 13 287210 CASAVA_Build 2 5700425 1D TACTTACAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 10 9 287211 CASAVA_Build 2 5701376 1I TCCTGTGGTT -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 64 30 24 10 A 7 8 287212 CASAVA_Build 2 5703445 1I CACAAATAAA -/G ATACTACTGG 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 G 0 1 287213 CASAVA_Build 2 5711990 1I CAGAACCGAG -/A AAAAAAAAGC 2633 het 2633 ref 45 26 8 11 A 8 9 287214 CASAVA_Build 2 5719370 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 A 10 9 287215 CASAVA_Build 2 5719912 1D TTGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 12 26 7 A 10 9 287216 CASAVA_Build 2 5723675 1D AGATATCGTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 23 8 12 4 A 9 8 287217 CASAVA_Build 2 5727914 4I CTCAGTACTA ----/AAGT ACGACTGCAT 3070 het 3070 hom 56 22 25 9 AAGT 0 1 287218 CASAVA_Build 2 5729321 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1203 het 1203 ref 23 11 4 8 T 17 18 287219 CASAVA_Build 2 5731841 6D CTTCCTTCCT TCTTTC/------ TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 37 19 14 7 TCTTTC 2 1 287220 CASAVA_Build 2 5752370 1I AAACGCTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 11 12 287221 CASAVA_Build 2 5753016 1D AGCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 10 9 287222 CASAVA_Build 2 5755613 1D ATAGTCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 36 1 31 4 T 12 11 287223 CASAVA_Build 2 5756135 3D CCTTTTATTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 27 3 12 12 A 14 11 287224 CASAVA_Build 2 5757293 5D TACTGCTGGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 32 0 18 14 T 18 13 287225 CASAVA_Build 2 5762304 1D AAAATAAAAG A/- AAAAAAAATT 2808 het 2808 ref 25 14 8 3 A 9 8 287226 CASAVA_Build 2 5764701 1D GTCAAGGAGA G/- GGTGTGGACT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 G 3 2 287227 CASAVA_Build 2 5774629 1D TGTTAAGCAT A/- AGAATATCTG 3070 het 3070 hom 28 12 12 5 A 2 1 287228 CASAVA_Build 2 5778582 1D ACCACGACAG C/- CCCCCCTTAA 3070 hom 106 het 40 0 36 4 C 7 6 287229 CASAVA_Build 2 5788323 4D GCTGCGTGGG GCCA/---- GATCACACCC 3070 het 3070 ref 44 24 19 4 GCCA 1 0 287230 CASAVA_Build 2 5789118 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 23 0 13 10 T 17 16 287231 CASAVA_Build 2 5793395 1I CCGTTTGTTT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 2579 hom 27 8 13 6 G 1 2 287232 CASAVA_Build 2 5794008 1D AATATTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2365 hom 36 11 19 6 T 12 11 287233 CASAVA_Build 2 5794501 1D GGGCATGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 T 11 10 287234 CASAVA_Build 2 5798106 6I CTTCTCCCTC ------/CGCAAT CGCAATCCCA 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 CGCAAT 1 2 287235 CASAVA_Build 2 5809150 1D TTGTGCTGGG T/- CTCAGCTCCT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 1 0 287236 CASAVA_Build 2 5815627 1I AAATGATTTT -/A TTTTTTTTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 1 287237 CASAVA_Build 2 5822685 2I ATAGGCAGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 53 21 25 7 AG 7 8 287238 CASAVA_Build 2 5822772 4D GTAGTTAGAT GATA/---- GATAGGCAAA 3070 het 3070 hom 48 19 24 7 GATA 2 1 287239 CASAVA_Build 2 5836643 4D ATATTCAACC AACT/---- AACATACTCA 3070 het 3070 ref 37 16 17 5 AACT 1 0 287240 CASAVA_Build 2 5844701 1D CAAACTACCC T/- GAAACTTAGC 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 T 1 0 287241 CASAVA_Build 2 5846140 6I AAATTTTACT ------/AATTTA AACAGTTACT 2987 het 2987 ref 23 15 7 1 AATTTA 0 1 287242 CASAVA_Build 2 5846534 4I TAAGAGAAAT ----/ATTA ATTAATTAAG 3070 hom 81 het 38 0 28 10 ATTA 2 3 287243 CASAVA_Build 2 5847528 2D ATAGGCATAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 TA 6 5 287244 CASAVA_Build 2 5849840 9D TTTCCAGTTC ATAGTGGCT/--------- ATAGTGGCTC 3070 het 3070 ref 45 22 17 8 ATAGTGGCT 2 1 287245 CASAVA_Build 2 5870384 10D CACACACACA CACACACACT/---------- CACACACACA 3070 hom 104 het 40 0 32 10 CACACACACT 1 0 287246 CASAVA_Build 2 5873120 1D TGGCATCCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 40 0 33 7 T 10 9 287247 CASAVA_Build 2 5875640 1D AGAATGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 22 2 20 0 T 12 11 287248 CASAVA_Build 2 5880211 3I TTACATTTTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 16 8 A 13 16 287249 CASAVA_Build 2 5881097 2D TATTTACTGA TT/-- TTTTTTTCCT 3070 hom 96 het 34 0 32 5 T 9 7 287250 CASAVA_Build 2 5889051 1I CACGCGTCTG -/A GGGGCACAGC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 0 1 287251 CASAVA_Build 2 5913905 1D TTAATTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2349 hom 22 6 12 5 T 12 11 287252 CASAVA_Build 2 5921178 1I GGTGGAAGGT -/G GGGGGGGGGT 2886 het 429 hom 15 1 8 6 G 9 10 287253 CASAVA_Build 2 5927885 1D GTTTATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 25 20 13 T 15 14 287254 CASAVA_Build 2 5941966 1I TGTTCTCCGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1991 hom 23 7 11 5 T 9 10 287255 CASAVA_Build 2 5971991 1D AACCTGCAAC A/- GGGGGGACTT 3070 het 3070 hom 43 17 25 1 A 1 0 287256 CASAVA_Build 2 5989899 1D AGTTGCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 T 12 11 287257 CASAVA_Build 2 5996561 3D AACTCAAAGA GAT/--- GATATGAAGG 3070 het 3070 hom 46 20 22 7 GAT 2 1 287258 CASAVA_Build 2 6001234 1I AGAGGGCTAA -/G GACAGGCTCA 3070 hom 120 het 50 0 40 10 G 1 2 287259 CASAVA_Build 2 6009088 1D TGCTATTGTT C/- CTTTATTTTG 3070 het 3070 hom 46 19 24 3 C 2 1 287260 CASAVA_Build 2 6022073 1D CTGTAAAATC A/- AAAGTAAGTT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 A 4 3 287261 CASAVA_Build 2 6023488 1I GGTGATTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 A 11 12 287262 CASAVA_Build 2 6027773 1D AAATATTTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 T 9 8 287263 CASAVA_Build 2 6046004 1D GTCTTCTGCC T/- TTCCTCTTTC 3070 het 3070 ref 47 24 20 4 T 3 2 287264 CASAVA_Build 2 6058840 1I TGGGACTGTT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 7 8 287265 CASAVA_Build 2 6060380 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2870 hom 24 8 9 7 A 13 12 287266 CASAVA_Build 2 6066741 1D TTTTTTTAGT A/- AAAAAGTAAT 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 A 6 5 287267 CASAVA_Build 2 6066827 3D CAATCGCCAG TTT/--- TTTTTTTTTT 2662 het 393 hom 23 4 9 10 T 15 12 287268 CASAVA_Build 2 6071671 1D TATATATATA T/- TGTTCTGGAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 1 287269 CASAVA_Build 2 6084602 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 126 het 54 0 43 11 T 8 9 287270 CASAVA_Build 2 6092581 4D CCTTTGGAAT TCTG/---- TCTGTGTTCT 3070 hom 135 het 48 0 46 4 TCTG 2 1 287271 CASAVA_Build 2 6095824 3I TGAGAAGAGA ---/GTT GTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 GTT 2 3 287272 CASAVA_Build 2 6098554 1D ACACTTTAAT A/- TTTTGTCTCT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 1 0 287273 CASAVA_Build 2 6100653 1I AATAACCCAC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 100 het 40 0 32 8 A 7 8 287274 CASAVA_Build 2 6122333 1I GAAACAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 51 1 42 8 A 10 11 287275 CASAVA_Build 2 6129405 1D CTTATAGTTC T/- TTTTTTTTTT 2214 het 2214 ref 43 30 6 8 T 12 11 287276 CASAVA_Build 2 6129750 1D TATTTGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 T 11 10 287277 CASAVA_Build 2 6129834 1D AGGCACACAC A/- AAAAAATATT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 7 6 287278 CASAVA_Build 2 6141927 1D TTCTTTTATG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 8 7 287279 CASAVA_Build 2 6144443 1D AGAATACGTA G/- GAAGAGATAA 3070 hom 117 het 45 0 40 7 G 2 1 287280 CASAVA_Build 2 6144615 1D ACCTGAATCC A/- AAAGGGCATC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 3 287281 CASAVA_Build 2 6146560 2I TTAAAAACAC --/AT AGAATATATC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AT 0 1 287282 CASAVA_Build 2 6172897 2D47M1D CCAGTAACTA TTTACTAAGTCTTAAGAACTTACCTTATGTGATCAATGTTGCCAATTTCT/--TACTAAGTCTTAAGAACTTACCTTATGTGATCAATGTTGCCAATTTC- TTTTTTTTTT 3070 hom 125 het 33 0 42 6 N/A 0 0 287283 CASAVA_Build 2 6173328 1D AGGTCAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 43 1 25 18 T 12 11 287284 CASAVA_Build 2 6225407 1D ACCGAGCTCT G/- GGCATGTTCA 3070 hom 72 het 27 0 20 7 G 3 2 287285 CASAVA_Build 2 6236456 2I TAAAATGAGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 T 10 12 287286 CASAVA_Build 2 6242135 4D GATGGAGGGC AGGA/---- GGGAGGGAGG 3070 het 1334 hom 28 6 13 9 AGGA 1 0 287287 CASAVA_Build 2 6245276 1D CATACATTTA T/- TTTTTTTTTA 2458 het 1232 hom 10 3 5 2 T 10 9 287288 CASAVA_Build 2 6250913 1I TTGGGATTGC -/T TTGCAAAGAA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 T 2 3 287289 CASAVA_Build 2 6251139 3I TTAGGTTGAT ---/TTC TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 12 TTC 0 1 287290 CASAVA_Build 2 6254877 1I TTTATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2919 het 2918 ref 33 8 11 14 T 15 16 287291 CASAVA_Build 2 6255106 1I ACATTTGACC -/T GAAGTGATCT 3070 het 1764 hom 27 5 19 4 T 0 1 287292 CASAVA_Build 2 6255246 3D TTTTCTTAAT ATC/--- ATTGAATATA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 ATC 1 0 287293 CASAVA_Build 2 6263348 1D CCCCCTAACT A/- AAAAAAAAAA 1501 het 1501 ref 29 14 5 10 A 13 12 287294 CASAVA_Build 2 6264447 1I TAATTTACAC -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 7 8 287295 CASAVA_Build 2 6268423 1I CATCAAACAC -/A TACCTGTGCC 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 0 1 287296 CASAVA_Build 2 6281415 2D TCTATGTTCA TC/-- TGTTATTTTT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 TC 1 0 287297 CASAVA_Build 2 6285527 4D TGTATATATG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3048 hom 28 7 16 6 TA 8 6 287298 CASAVA_Build 2 6289104 1D TCAATTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 19 9 A 11 10 287299 CASAVA_Build 2 6291175 1D AGATAAATCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 T 9 8 287300 CASAVA_Build 2 6304453 1D CAACTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 11 10 287301 CASAVA_Build 2 6310801 5D ATATATATAC ACACA/----- CTATATATAT 265 hom 5 het 5 0 2 3 ACACA 1 0 287302 CASAVA_Build 2 6311482 10D CTGTCCTCCA TTGCACCCAG/---------- ATGCCGTGGG 3070 hom 65 het 20 0 19 5 TTGCACCCAG 1 0 287303 CASAVA_Build 2 6311808 1I TCATAGATTC -/T CATTTCCATA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 0 1 287304 CASAVA_Build 2 6318406 4I AGATATAAAA ----/AGAT AGATCAAGAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AGAT 1 2 287305 CASAVA_Build 2 6319866 2I TACCAGTTCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 44 1 32 11 A 12 14 287306 CASAVA_Build 2 6320749 15D TTTTTCTTTC TTTCTTTCTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2356 het 527 hom 14 4 7 3 TTTCTTTCTTTTTTT 1 0 287307 CASAVA_Build 2 6321263 3I GGGGAGGGTA ---/GTT GTTGTTGTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 GTT 3 4 287308 CASAVA_Build 2 6321742 1D TGGGTGGAAG A/- GGCTGCCTTT 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 A 1 0 287309 CASAVA_Build 2 6323210 1D ATTTCTAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 19 0 14 5 T 10 9 287310 CASAVA_Build 2 6325030 2I TTTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 2074 het 2074 ref 35 15 7 13 TG 8 9 287311 CASAVA_Build 2 6327012 1D41M1D ATCCATGACA TTTTTTTCTGTGTACCTAAAAACTGCAATAAAATTTTAAAAGT/-TTTTTTCTGTGTACCTAAAAACTGCAATAAAATTTTAAAAG- TTATTTAAAA 3070 het 3070 ref 38 30 23 6 N/A 0 0 287312 CASAVA_Build 2 6327596 3D ACTAAATAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 A 14 11 287313 CASAVA_Build 2 6329627 1I TCTAAGCAAT -/G GGTATTCATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 2 3 287314 CASAVA_Build 2 6330450 1I GACAAATAGG -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 7 8 287315 CASAVA_Build 2 6335536 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 A 8 7 287316 CASAVA_Build 2 6341059 2D19M2I GTGTGTGCGC GTGTGTGTGTGCGTGTGTGCA--/--GTGCGTGTGCGTGTGTGCATG TGTGTGCGTG 3070 hom 62 het 21 0 20 5 N/A 0 0 287317 CASAVA_Build 2 6341711 1D ATTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 17 9 T 12 11 287318 CASAVA_Build 2 6355996 1D ATAATAGGGG A/- AAACTGTGAA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 4 3 287319 CASAVA_Build 2 6357119 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3027 hom 27 het 11 0 10 1 AC 6 7 287320 CASAVA_Build 2 6379940 1I GCAAAAAGAA -/T AAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 0 1 287321 CASAVA_Build 2 6384082 1I CTTTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 28 1 21 6 T 14 15 287322 CASAVA_Build 2 6397900 1I TCTTTTGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 30 1 23 6 T 14 15 287323 CASAVA_Build 2 6443749 1D CCACAATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 190 hom 25 1 19 8 A 11 10 287324 CASAVA_Build 2 6446798 1D CAATTGTCAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 135 het 49 0 46 4 T 9 8 287325 CASAVA_Build 2 6457842 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 617 hom 25 2 16 7 A 12 13 287326 CASAVA_Build 2 6460536 3D CCGTTATTGT TGA/--- TATTTTCATG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TGA 1 0 287327 CASAVA_Build 2 6462902 1D TTGAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 229 hom 21 1 16 4 T 12 11 287328 CASAVA_Build 2 6463530 1I CTTGCAGAAG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 79 het 33 0 26 7 T 7 8 287329 CASAVA_Build 2 6466526 1D TATTCCACTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 110 het 52 0 36 17 A 8 7 287330 CASAVA_Build 2 6477170 1D TATTGAAGGC A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 8 7 287331 CASAVA_Build 2 6481911 1I AGATTGCTTT -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 7 8 287332 CASAVA_Build 2 6482499 4D AAAAAGTAAC ACTT/---- ACGCAATTTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 6 ACTT 1 0 287333 CASAVA_Build 2 6487657 4D GCTTGTTTTG CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 33 10 16 8 CTTT 3 2 287334 CASAVA_Build 2 6489587 1I TTCGGAAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 T 10 11 287335 CASAVA_Build 2 6506303 1I CTGATAACCA -/G GAGATGAACA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 G 1 2 287336 CASAVA_Build 2 6511069 1I CGGGCGCAGT -/G GCTCATGCCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 1 2 287337 CASAVA_Build 2 6511232 1I CCAGATACTT -/G GGAGGCTCAG 3070 hom 103 het 37 0 35 3 G 2 3 287338 CASAVA_Build 2 6517260 2I TCCCCGAGGA --/CT CTCTTTCAAC 3070 het 3070 ref 35 12 12 11 CT 2 3 287339 CASAVA_Build 2 6518954 2D CAAATGACTC TT/-- AAATCCACAC 3070 het 3070 ref 36 23 8 5 T 2 0 287340 CASAVA_Build 2 6519563 1I TATTTTATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 A 9 10 287341 CASAVA_Build 2 6524477 3D TGCTTCTGGT TTA/--- TTATTATTAC 3070 het 3070 hom 44 16 24 7 TTA 4 3 287342 CASAVA_Build 2 6531097 1I AAAAATGACA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 9 10 287343 CASAVA_Build 2 6532564 1I TTAGCTGTAT -/C ATATACTAAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 0 1 287344 CASAVA_Build 2 6547148 11I AAATAAATGT -----------/TTATTTTCCAA TTATTTCTAA 3070 hom 166 het 59 0 56 4 TTATTTTCCAA 0 1 287345 CASAVA_Build 2 6547960 2D CATTGTCCCA TT/-- TTTTTTTTTT 1549 het 120 hom 16 2 5 9 T 20 18 287346 CASAVA_Build 2 6551562 1D GTTTGGCTCT G/- TGTCCCCACC 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 G 1 0 287347 CASAVA_Build 2 6554517 1I TTGACAAAAG -/A AAAAAAATTC 2085 het 2085 ref 21 14 5 2 A 7 8 287348 CASAVA_Build 2 6556233 1I CCAATTCCTG -/A AAATCTCTTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 3 4 287349 CASAVA_Build 2 6557020 1I TAGAAGTGAG -/A ACATTTTCTC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 1 2 287350 CASAVA_Build 2 6557980 2D ACATGCACAT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 46 22 17 9 AC 5 4 287351 CASAVA_Build 2 6558469 2D ATACACACAC TT/-- ATACATACAC 3070 het 3070 ref 56 29 23 5 T 2 0 287352 CASAVA_Build 2 6559379 3D GTCAACATGT CCA/--- GAATCTACCC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 CCA 1 0 287353 CASAVA_Build 2 6562507 44D AAACAAATTC CTTCTTACAGTGCTGTATTAGTCAGGATCATTTAGTGCTTCTTA/-------------------------------------------- CTTCTTACAG 3070 hom 24 het 14 0 9 11 CTTCTTACAGTGCTGTATTAGTCAGGATCATTTAGTGCTTCTTA 1 0 287354 CASAVA_Build 2 6572959 1D TTGTAATCAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2407 hom 20 7 8 5 T 9 8 287355 CASAVA_Build 2 6573165 2D GAGGACAGAA AT/-- AAATATTCAG 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 AT 1 0 287356 CASAVA_Build 2 6573630 6I GTATTATGTA ------/TATGTG TATGTGTATG 3070 het 3070 ref 45 21 13 11 TATGTG 2 3 287357 CASAVA_Build 2 6577896 3D TTGGAAAAAA AGG/--- AGGAGGAGGT 3070 hom 103 het 38 0 33 8 AGG 4 3 287358 CASAVA_Build 2 6579202 1D AAAATTCAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 9 8 287359 CASAVA_Build 2 6585871 1D GGCAATTTTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 9 8 287360 CASAVA_Build 2 6586013 1I TGCAGCCATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 8 9 287361 CASAVA_Build 2 6588505 1D TTTAATTTAC T/- TTGCCTATAG 3070 het 3070 hom 47 17 24 7 T 3 2 287362 CASAVA_Build 2 6610072 1I AGACAGAAGA -/G GAGACAGAGC 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 G 1 2 287363 CASAVA_Build 2 6611138 1D CGTGTGTTGT G/- GGGGTGGGAG 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 G 5 4 287364 CASAVA_Build 2 6621551 4D TTTTAAATCT TAAA/---- TAAATTCAAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 4 TAAA 2 1 287365 CASAVA_Build 2 6627971 1I ACTTTATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 11 12 287366 CASAVA_Build 2 6639225 3I TTCACAAAAT ---/TAA TTATTATACG 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 TAA 0 1 287367 CASAVA_Build 2 6639836 1D TAGCTGAAGA G/- GTACATGAGC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 G 2 1 287368 CASAVA_Build 2 6641570 2I TTCAAAGAAT --/GA GAGTTCGAGA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 GA 1 2 287369 CASAVA_Build 2 6646327 1D AATAAGATAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 8 7 287370 CASAVA_Build 2 6657010 10D ATGTCATATT GCAATAAGAG/---------- GCAATAAGAG 3070 hom 108 het 38 0 37 3 GCAATAAGAG 2 1 287371 CASAVA_Build 2 6660714 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 25 0 20 5 A 12 11 287372 CASAVA_Build 2 6662748 8I AAGTGTGTAG --------/TTAGAACA TTAGAACATG 3070 het 3070 hom 39 13 21 7 TTAGAACA 1 2 287373 CASAVA_Build 2 6664668 2D TGGTATAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 13 11 287374 CASAVA_Build 2 6665738 1D GTCTCTTCAC T/- TTTTTTGATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 287375 CASAVA_Build 2 6666255 1D TTTATGGGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 10 9 287376 CASAVA_Build 2 6669249 1I AAATGTCTTC -/T TTTGAGAAGT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 3 4 287377 CASAVA_Build 2 6669874 1D TGCTTTATTC T/- TTTTTTATTA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 7 6 287378 CASAVA_Build 2 6696500 1I AAGGACATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 62 het 37 0 26 11 A 9 10 287379 CASAVA_Build 2 6697494 2D CTCTTCACAG CT/-- CTCTCTCTAC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 CT 5 4 287380 CASAVA_Build 2 6703589 1D TAACAGGCTT C/- CCCCTTTACT 3070 het 2943 hom 41 10 24 8 C 5 4 287381 CASAVA_Build 2 6703639 1D ATGTCCACCA T/- GTCCACCATG 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 1 0 287382 CASAVA_Build 2 6707304 24D GCAATGCCTA GTCTTAGAGAACAGAAGAGGCAGG/------------------------ GTCCGCATCT 3070 hom 126 het 46 0 42 7 GTCTTAGAGAACAGAAGAGGCAGG 1 0 287383 CASAVA_Build 2 6712052 1I TTCTCTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 10 11 287384 CASAVA_Build 2 6714774 2D5M22I4M19I2M10I CACGGTGTAT GCATGTG----------------------ACAT-------------------AC----------/--ATGTGGATATGCTCATCAACTGAGGGAACATTGGACACTTTTCATTCTCCACCCTAGAGCTG ACATAAAGTC 3070 hom 81 het 28 0 28 3 N/A 0 0 287385 CASAVA_Build 2 6717651 18I CAGCTGACAA ------------------/CAGCTGACCAGCCAGCCT CAGCTGGCTG 3070 hom 95 het 39 0 27 12 CAGCTGACCAGCCAGCCT 0 1 287386 CASAVA_Build 2 6717710 1D CCAATGGTTG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 96 het 44 0 33 12 A 8 7 287387 CASAVA_Build 2 6719262 1D CTTCTTTCCA G/- GTGGTCTATT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 G 2 1 287388 CASAVA_Build 2 6723938 4D ACTTCCAAAC ACTT/---- ATAAAAGCAT 3070 het 3070 hom 49 24 23 4 ACTT 1 0 287389 CASAVA_Build 2 6729207 1I AGAGGTTTTG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 8 9 287390 CASAVA_Build 2 6730810 6I CTTGCAAAGG ------/GTAGAA GTGGAATTCA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 GTAGAA 0 1 287391 CASAVA_Build 2 6741337 1I GGCAAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2877 hom 27 10 10 7 A 13 14 287392 CASAVA_Build 2 6746883 4D ATATTCCATG GTGT/---- GTGTGTGTGT 1552 het 1111 hom 12 4 5 3 GT 11 9 287393 CASAVA_Build 2 6747925 1I AAAGGGGAGT -/G AAATAACTTG 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 G 0 1 287394 CASAVA_Build 2 6761345 1D AGAGGTAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 T 11 10 287395 CASAVA_Build 2 6786794 1I ACAGATCGTA -/G GTCAGATTTT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 G 1 2 287396 CASAVA_Build 2 6789851 1I GAACTGGAAG -/A AAATAAATTC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 3 4 287397 CASAVA_Build 2 6798265 1D AAGCACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 9 11 A 11 10 287398 CASAVA_Build 2 6799735 4I TAGGTATATC ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 ATCT 2 3 287399 CASAVA_Build 2 6804964 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 2959 het 1297 hom 18 4 9 5 A 8 9 287400 CASAVA_Build 2 6809698 1I TGTCTCTGCC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 A 8 9 287401 CASAVA_Build 2 6860618 9D TCAGGGGAGA CTGGCACTG/--------- GGTCATTCTT 3070 het 3070 hom 44 22 21 4 CTGGCACTG 1 0 287402 CASAVA_Build 2 6864716 1D TCAGTCCAAT G/- GGGCCGTCTT 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 G 4 3 287403 CASAVA_Build 2 6866089 1I AGTGATGTCA -/T TCACATATGA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 1 2 287404 CASAVA_Build 2 6866731 1I GGCTCTGGAA -/G GGCGTCCAGG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 G 2 3 287405 CASAVA_Build 2 6869508 2D AAGTACTGGG AA/-- CACAAGTGCC 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 A 2 0 287406 CASAVA_Build 2 6871863 1D AAAAAAAGTG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 91 het 35 0 31 4 A 8 7 287407 CASAVA_Build 2 6904010 1D GTCTTGAATT C/- CCTGTTTCCA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 3 2 287408 CASAVA_Build 2 6912893 6D CTGCTCTCTC GCCTCT/------ GCCTCTGCCC 2510 hom 33 het 15 0 11 5 GCCTCT 2 1 287409 CASAVA_Build 2 6921789 1I GAACTGGGGT -/G GGGGGGGTGC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 G 7 8 287410 CASAVA_Build 2 6924404 1I CTGAAAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 33 1 27 5 T 10 11 287411 CASAVA_Build 2 6926970 1D TCATGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 10 9 287412 CASAVA_Build 2 6932274 1I ACACTTAAAT -/A TTTTTTTCAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 0 1 287413 CASAVA_Build 2 6940028 1D TTAAAGTCTT A/- ACCAAAATGA 3070 hom 123 het 46 0 42 6 A 2 1 287414 CASAVA_Build 2 6950829 6D GGTAAATCGA CCCTTT/------ AGCTCCAAAA 3070 hom 114 het 39 0 37 4 CCCTTT 1 0 287415 CASAVA_Build 2 6951878 1D TTCCTCTGTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 77 het 30 0 26 5 T 9 8 287416 CASAVA_Build 2 6960523 1D ATTTGGTATG T/- TTTTGCAGTG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 5 4 287417 CASAVA_Build 2 6960704 1I TTGAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 T 10 11 287418 CASAVA_Build 2 6963631 1I AGCTCATTTG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 8 9 287419 CASAVA_Build 2 6965120 1I CACCTGCCGT -/G GGGACAGCCT 3070 het 3070 hom 49 23 22 4 G 3 4 287420 CASAVA_Build 2 6977198 1D GTGGTGTGCC T/- TACTGTGGCT 3070 hom 123 het 49 0 40 9 T 2 1 287421 CASAVA_Build 2 6979830 14I CTGGGGCCAG --------------/CGACTGGGAACCTC CGAACTAGAC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CGACTGGGAACCTC 0 1 287422 CASAVA_Build 2 7008860 1D TGTATTCATG T/- TTTTTTTTTT 2973 het 2973 ref 28 15 10 3 T 13 12 287423 CASAVA_Build 2 7009975 1D AGAGGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 T 12 11 287424 CASAVA_Build 2 7017022 2D TGCTGTTGGA TG/-- TCTTAGTTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 TG 1 0 287425 CASAVA_Build 2 7017372 1I AAGATCACCA -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 C 8 9 287426 CASAVA_Build 2 7026276 1I TGTCAATGTG -/T TTTTTTTTTT 2623 het 2623 ref 30 15 8 7 T 11 12 287427 CASAVA_Build 2 7053559 1D GGATTATCAG C/- CCCCTCATGT 3070 het 3070 hom 56 19 27 10 C 5 4 287428 CASAVA_Build 2 7054335 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 21 9 7 A 8 9 287429 CASAVA_Build 2 7064337 4D TCTCTGAAAT AGAC/---- ACTCAGTCTA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 AGAC 1 0 287430 CASAVA_Build 2 7067111 1I AGTCTGGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 978 hom 30 3 20 7 T 11 12 287431 CASAVA_Build 2 7072278 1I CCTGTTTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 9 10 287432 CASAVA_Build 2 7074197 2D ATGTTCAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 23 0 17 8 T 13 11 287433 CASAVA_Build 2 7081777 1D TTCTGGTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2733 hom 31 9 18 4 T 10 9 287434 CASAVA_Build 2 7140255 1I CTGATGAGCT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 7 8 287435 CASAVA_Build 2 7143728 1I TTTTTGACAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 9 10 287436 CASAVA_Build 2 7154159 1I ATTAGGCAAG -/A GGAGAGACTG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 0 1 287437 CASAVA_Build 2 7155952 3I CCTTGGGCAA ---/CTT CTTCTACCTC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 CTT 1 2 287438 CASAVA_Build 2 7157786 1I ATTTAAAAAT -/G GGGACTACTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 3 4 287439 CASAVA_Build 2 7171170 1I TTGCTCTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 9 10 287440 CASAVA_Build 2 7174778 14I AGTGCTGTGG --------------/TAACTAACGTACAA TATGTTGGAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 TAACTAACGTACAA 0 1 287441 CASAVA_Build 2 7210985 2D AGAATACAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2328 hom 31 10 15 7 A 14 12 287442 CASAVA_Build 2 7242529 8I AAAGGAGTCT --------/TAGAAATC AGGGTTTTAG 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 TAGAAATC 0 1 287443 CASAVA_Build 2 7242924 1D TGAGAAATGT A/- AAGATTATTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 3 2 287444 CASAVA_Build 2 7243246 1I TACTGGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 10 11 287445 CASAVA_Build 2 7243660 1D ACTTTTTTTT C/- TCAGTAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 15 10 C 1 0 287446 CASAVA_Build 2 7246399 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 5 het 5 ref 14 6 1 7 A 17 14 287447 CASAVA_Build 2 7247063 4I31M3I GTGCACATGA ----GTGTGTGTGTGCATGAGTGAATGTGTATGTG---/GTGTGTGTGTGTGTGCATGAGTGAATGTGTATGTGTTC TTAAGTGTGT 2653 het 2653 ref 44 35 6 15 N/A 0 0 287448 CASAVA_Build 2 7249082 2I AGAAATAAGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 10 12 287449 CASAVA_Build 2 7250588 1I TAGAACTGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 57 19 30 8 A 9 10 287450 CASAVA_Build 2 7251453 1I ACGCGCTGGT -/G GGGGCCTCTG 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 G 4 5 287451 CASAVA_Build 2 7269853 2I AAATACTATG --/TA TATATATATA 3070 het 2054 hom 20 5 10 5 TA 6 7 287452 CASAVA_Build 2 7274910 1D CTTGTAGATA C/- GCCCGTGCTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 C 1 0 287453 CASAVA_Build 2 7275222 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2357 hom 22 7 11 4 A 12 10 287454 CASAVA_Build 2 7281733 1D AACATAAATA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 8 7 287455 CASAVA_Build 2 7288487 3D TACTGACAAA TAT/--- TATGTGAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 TAT 2 1 287456 CASAVA_Build 2 7296552 5D GAAAAAAGAA AAAAT/----- AAAACAAATG 3070 het 3070 hom 38 15 18 7 AAAAT 1 0 287457 CASAVA_Build 2 7301488 2I CACACATGGG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 34 12 14 8 CA 5 6 287458 CASAVA_Build 2 7319886 1I CCCTCCTCTA -/T TTTTAAGCCC 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 T 4 5 287459 CASAVA_Build 2 7321943 1D CAGAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1379 hom 24 5 17 2 A 12 11 287460 CASAVA_Build 2 7336686 16D TCTGTCTGTT TATCTATCTATCTATC/---------------- TATCTATCTA 3070 het 3070 hom 39 12 18 16 TATC 8 4 287461 CASAVA_Build 2 7337970 5I TGAAAACAAA -----/TATCT TACCTTTGAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 TATCT 0 1 287462 CASAVA_Build 2 7354688 1I CAGCAGGTCA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 7 8 287463 CASAVA_Build 2 7417690 1D TAACAATTCT G/- GGTCCCATTC 3070 het 3070 ref 56 28 21 8 G 3 2 287464 CASAVA_Build 2 7420283 1I AATGGTCTCC -/A AACCAACACA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 2 3 287465 CASAVA_Build 2 7446915 1I CTAGGCAGTG -/C CCCAGTAGGG 3070 hom 71 het 26 0 23 3 C 3 4 287466 CASAVA_Build 2 7455692 1I ACCTCAGCCT -/C CCAGAGGGCT 3070 hom 49 het 23 0 15 8 C 2 3 287467 CASAVA_Build 2 7561277 1D ATTTCTACCA T/- TTTTTTTTTT 634 het 634 ref 31 24 3 4 T 11 10 287468 CASAVA_Build 2 7605746 2D CTTTGCAGAC AG/-- AGATATTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 AG 2 1 287469 CASAVA_Build 2 7609979 1D CTTTTGCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 779 hom 32 2 24 6 T 11 10 287470 CASAVA_Build 2 7710336 2D ATTCTATTGT AA/-- ATGGTACTGC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 3 1 287471 CASAVA_Build 2 7712252 4I CATATGACCA ----/TTTG AATTCACCAG 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 TTTG 0 1 287472 CASAVA_Build 2 7718268 2D TGACGAGGCT GA/-- GTCAGTCTGG 3070 hom 84 het 32 0 28 6 GA 1 0 287473 CASAVA_Build 2 7725651 1I TTTATGATAT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 7 8 287474 CASAVA_Build 2 7749349 1D AAAAACCAAC A/- AAAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 26 14 12 0 A 7 6 287475 CASAVA_Build 2 7749481 2I CGAGATTCTC --/TT GTTTCATTAT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 0 2 287476 CASAVA_Build 2 7757064 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 12 11 287477 CASAVA_Build 2 7757076 1D TTTTTTTTTT A/- GCTTTTACTT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 1 0 287478 CASAVA_Build 2 7759333 1I TAAAAACCTT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 92 het 32 0 30 2 A 8 9 287479 CASAVA_Build 2 7761071 1I AGACCACCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 9 10 287480 CASAVA_Build 2 7762430 1D TAGAATGGCC A/- CATAAATTAC 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 A 1 0 287481 CASAVA_Build 2 7763257 3I CTAAAAGTTC ---/AAG ATCAGCCTGG 3070 hom 33 het 18 0 12 8 AAG 0 1 287482 CASAVA_Build 2 7768117 1I TTAGGGTTAC -/A AAAATAATGG 3070 hom 80 het 31 0 26 5 A 4 5 287483 CASAVA_Build 2 7782614 1D CATTTTTCCT A/- CCTTGACTGT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 1 0 287484 CASAVA_Build 2 7784588 4I AGAGGAAAAA ----/TCTG TCTCTTAGAG 3070 het 3070 hom 45 22 22 1 TCTG 0 1 287485 CASAVA_Build 2 7790970 2D AACATTCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2791 het 1028 hom 24 5 7 12 A 16 14 287486 CASAVA_Build 2 7804794 1I CTTTCCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 10 11 287487 CASAVA_Build 2 7835997 1I GCTCCGTTCC -/A AAAAAAAAAA 1912 het 1002 hom 22 7 10 5 A 14 15 287488 CASAVA_Build 2 7857382 13I CCATAAATAT -------------/TTTTCTGCTTAGG TTTCCTTTCT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 TTTTCTGCTTAGG 0 1 287489 CASAVA_Build 2 7897597 1D GACAAATATT A/- AAAACATGTT 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 A 5 4 287490 CASAVA_Build 2 7900394 1D GCATTTTCCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 9 8 287491 CASAVA_Build 2 7916763 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1424 het 937 hom 19 6 4 9 T 14 12 287492 CASAVA_Build 2 7922686 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1864 hom 33 8 19 7 A 15 14 287493 CASAVA_Build 2 7924218 7D TGTAAGGTGC CAGAAGT/------- ACTGATGTAA 3070 het 3070 ref 30 19 10 4 CAGAAGT 1 0 287494 CASAVA_Build 2 7929829 2D CCTCCAGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 1400 het 1400 ref 39 13 4 23 T 18 16 287495 CASAVA_Build 2 7942082 1D GAGGGAACTC G/- GGGGGGAATC 3070 het 1688 hom 17 5 12 0 G 7 6 287496 CASAVA_Build 2 7948445 1D ACATTTAGGC T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 8 7 287497 CASAVA_Build 2 7951494 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 AC 8 7 287498 CASAVA_Build 2 7952326 4I AAGCATAAAA ----/ACAG ACAAATTTCC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 ACAG 0 1 287499 CASAVA_Build 2 7953090 3D TGGCTGTGGG TGA/--- TGATTCTCTC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 TGA 2 1 287500 CASAVA_Build 2 7955655 4I AAAAGAGAGA ----/GAAG GAAAGAATGA 3070 hom 59 het 25 0 17 8 GAAG 0 1 287501 CASAVA_Build 2 7955984 2D CACACAGAGA CC/-- CCCCCACTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 7 5 287502 CASAVA_Build 2 7956849 4D CTCACACTCT TTCC/---- TTCCTCCTGC 3070 het 3070 ref 49 23 20 8 TTCC 2 1 287503 CASAVA_Build 2 7958986 1I ACCTCAAAAA -/G GAATATCTAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 1 2 287504 CASAVA_Build 2 7959535 2D TAAAAATCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 12 10 287505 CASAVA_Build 2 7992087 5D AAGTCTGGGC TAAAG/----- TAAAGTAGAA 3070 het 3070 ref 37 19 17 5 TAAAG 2 1 287506 CASAVA_Build 2 7998075 1D TCTGGACAAG A/- CACCTGCTAA 3070 het 3070 hom 44 16 26 3 A 1 0 287507 CASAVA_Build 2 8002292 1D CTCTGCACGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 12 11 287508 CASAVA_Build 2 8007710 1I TTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 10 11 287509 CASAVA_Build 2 8013305 1I GCACGCATAC -/A ATTATCTGAT 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 A 1 2 287510 CASAVA_Build 2 8017816 6D TTTCCCTCGA CCATCC/------ CCATCCCTTG 3070 het 3070 ref 55 28 24 5 CCATCC 2 1 287511 CASAVA_Build 2 8018205 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2989 het 1301 hom 15 5 8 2 A 9 8 287512 CASAVA_Build 2 8023600 1D ATTCAGCAAA G/- TATGGGAACC 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 G 1 0 287513 CASAVA_Build 2 8024077 1D CACGGCTGGA C/- CACCCGTTGA 3070 het 3070 ref 46 25 15 7 C 2 1 287514 CASAVA_Build 2 8025096 1I GATCTACTCA -/C CTTTTATGTG 3070 het 3070 ref 59 27 23 9 C 1 2 287515 CASAVA_Build 2 8026066 1D GAGTACTCAG T/- TTGCAAAACA 3070 het 3070 ref 47 21 18 9 T 3 2 287516 CASAVA_Build 2 8028997 1D CATAATGTCC A/- AGTTCTATTC 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 2 1 287517 CASAVA_Build 2 8057138 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 13 het 13 0 11 2 A 9 10 287518 CASAVA_Build 2 8060471 1I TCAACTCCCA -/G GGGGCTCAGC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 G 4 5 287519 CASAVA_Build 2 8095875 1I GAAGCAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 12 13 A 10 11 287520 CASAVA_Build 2 8101988 1I GCTCCAGGGG -/C CCTGCAGGCA 3070 hom 80 het 35 0 24 11 C 2 3 287521 CASAVA_Build 2 8150421 1D ATAGTCACAA T/- TTTTTTTTTT 1815 het 1815 ref 19 6 5 8 T 17 16 287522 CASAVA_Build 2 8236166 2D CCTGGGCAAC AG/-- AGAGTGAGAC 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 AG 3 2 287523 CASAVA_Build 2 8237049 1I CAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 11 12 287524 CASAVA_Build 2 8237607 1I AATGTAGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 A 9 10 287525 CASAVA_Build 2 8244176 23D AGGAAATGAT AATATTCTGACCTCTGACACCTC/----------------------- AATATTCTGA 3070 het 3070 ref 18 7 9 6 AATATTCTGACCTCTGACACCTC 2 1 287526 CASAVA_Build 2 8289302 1D ATAAACAAAT G/- GAAAAAAATA 3070 hom 84 het 36 0 29 8 G 2 1 287527 CASAVA_Build 2 8291623 10D TCTGTGCAGA ACTCACAGAT/---------- GCCAAAAGTC 3070 hom 96 het 35 0 32 4 ACTCACAGAT 1 0 287528 CASAVA_Build 2 8293951 2D TGAGACCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 31 0 21 11 A 15 13 287529 CASAVA_Build 2 8306601 1I GAAAGTTGGA -/T TTTTTATTTC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 5 6 287530 CASAVA_Build 2 8333057 1D CCCATTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 48 0 34 14 T 11 10 287531 CASAVA_Build 2 8357897 4D AGGGGCAGCC ACCA/---- TGGTGAATTA 3070 het 3070 hom 56 20 28 9 ACCA 1 0 287532 CASAVA_Build 2 8358820 1D ACTCTCACCA G/- TGCATTCCTT 3070 het 3070 hom 60 22 28 10 G 1 0 287533 CASAVA_Build 2 8359254 1I TGTTATTCTT -/C TGGTTTTGCC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 0 1 287534 CASAVA_Build 2 8360531 12D GGGTGGTTGT TTGTTGTTGTTG/------------ TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 55 23 21 14 TTG 10 6 287535 CASAVA_Build 2 8394870 1D TGAGCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 7 18 5 A 12 11 287536 CASAVA_Build 2 8397095 1D TTTTTATTCC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 49 15 27 8 T 9 8 287537 CASAVA_Build 2 8401609 4I TCTCGTGAGA ----/ACTC ACTCACTATC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 ACTC 1 2 287538 CASAVA_Build 2 8411160 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 13 12 287539 CASAVA_Build 2 8419482 4I GTGGGGATGG ----/GAGA GAGAAATTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 GA 2 4 287540 CASAVA_Build 2 8419577 1I TGAAATGTGA -/C CCCCCAGTGT 3070 het 357 hom 42 1 36 5 C 5 6 287541 CASAVA_Build 2 8421624 1I AACCTGTGAT -/G GGGGGGGGAG 3070 het 220 hom 32 2 20 10 G 8 9 287542 CASAVA_Build 2 8428407 1D TGCAAGGACA G/- GGTGGGGCAC 3070 hom 134 het 51 0 43 8 G 3 2 287543 CASAVA_Build 2 8438243 2D TGGAACCAGA AG/-- AGAGGCTCAG 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 AG 3 2 287544 CASAVA_Build 2 8439349 1D CCATTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 26 8 T 11 10 287545 CASAVA_Build 2 8455967 2D CACGTACATG CA/-- CACACATGCA 3070 hom 176 het 98 2 78 20 CA 4 3 287546 CASAVA_Build 2 8460070 5D CTGGAGGTAA ATGGC/----- ATGGCATGGC 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 ATGGC 3 2 287547 CASAVA_Build 2 8463899 4I TTTAACTGAC ----/AAAT AAAAGTTGTC 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 AAAT 0 1 287548 CASAVA_Build 2 8483816 1D GCAAGTCCCC G/- GGGGGGGAGG 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 G 8 7 287549 CASAVA_Build 2 8499503 3D TCTTCGTATT GGG/--- GTGCTTTGCT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 4 1 287550 CASAVA_Build 2 8500206 2D TGCAAAAGAC AG/-- AGAGAAAGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AG 3 2 287551 CASAVA_Build 2 8500625 3D CCCTTTCTGG GAA/--- AAAAAAAAAA 1773 het 55 hom 37 1 8 28 GAA 1 0 287552 CASAVA_Build 2 8505080 1D TAAGAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 11 10 287553 CASAVA_Build 2 8516007 1I ATTTAAGTCA -/T TTTTTTTTCC 2775 het 2775 ref 28 11 8 9 T 8 9 287554 CASAVA_Build 2 8516179 2D CCACCTTCCT CA/-- CACCGCTACT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 CA 2 1 287555 CASAVA_Build 2 8525130 1I TTATATATTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2137 hom 20 8 8 4 T 8 9 287556 CASAVA_Build 2 8568806 8D CACTGCCCAG GAACTGCA/-------- GGCACTGAAC 3070 hom 45 het 19 0 13 6 GAACTGCA 1 0 287557 CASAVA_Build 2 8590123 1D GAAAGGGCAT G/- GGGGGGGGCC 3070 hom 60 het 26 0 20 7 G 9 8 287558 CASAVA_Build 2 8603914 1D TTGTCAGAGG T/- GGAGGGTTTG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 T 1 0 287559 CASAVA_Build 2 8615135 1I CTGTCTGAGG -/A ATGAATTGTA 3070 het 3070 hom 44 22 20 2 A 1 2 287560 CASAVA_Build 2 8619748 1I GGCAATTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 538 hom 35 4 18 13 A 14 15 287561 CASAVA_Build 2 8620577 1I GCCAGGGACC -/G GGGGGACAGG 3070 hom 83 het 32 0 26 6 G 5 6 287562 CASAVA_Build 2 8629849 2I TCTTTGAGTC --/TG TGGCTCCTAC 1591 het 1591 ref 35 23 6 6 TG 1 2 287563 CASAVA_Build 2 8633765 3D GCACACACCA GCT/--- ACACCCTGCA 3070 het 3070 hom 80 39 34 9 GCT 1 0 287564 CASAVA_Build 2 8634820 1I GAGCTGCCTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 52 26 24 2 T 8 9 287565 CASAVA_Build 2 8646480 3D CCTGCATCCC AAG/--- AAGAAGTTTA 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 AAG 3 2 287566 CASAVA_Build 2 8648444 1D ATCTTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 19 2 9 8 A 15 14 287567 CASAVA_Build 2 8652160 1D TGATTTATCT A/- TTATGAAACA 3070 hom 117 het 46 0 40 7 A 1 0 287568 CASAVA_Build 2 8653634 2I ACATCCACCC --/CT GTCGCAAAGG 3070 hom 86 het 35 0 27 8 CT 0 1 287569 CASAVA_Build 2 8654509 6D GTATGTGTGT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 115 het 42 0 38 9 TG 9 6 287570 CASAVA_Build 2 8655026 2I TGTATGTGTG --/GT GTGTGTTTGC 3070 hom 216 het 83 0 69 14 GT 3 4 287571 CASAVA_Build 2 8656669 3D GTCTTCAATT ATG/--- ATGGATGCAA 3070 het 3070 hom 64 29 32 3 ATG 2 1 287572 CASAVA_Build 2 8662172 6D ACATAATACT TGATAA/------ TGATAATAAA 3070 het 3070 ref 33 22 10 3 TGATAA 2 1 287573 CASAVA_Build 2 8664115 2I CATGTGGAGG --/GT ACTGAGGCTT 3070 het 3070 hom 68 23 34 11 GT 0 1 287574 CASAVA_Build 2 8665918 1D AAGTAATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 25 1 15 10 A 12 11 287575 CASAVA_Build 2 8665930 1D AAAAAAAAAA C/- CCCAAAGCCA 3070 het 470 hom 25 3 16 6 C 4 3 287576 CASAVA_Build 2 8666852 5D CTCTACTACC CTACT/----- CTACTCTACT 3070 het 3070 hom 48 15 19 15 CTACT 5 4 287577 CASAVA_Build 2 8668806 3I GGAGGGAGAA ---/GGC GGCTAAAGCA 3070 hom 92 het 36 0 28 8 GGC 1 2 287578 CASAVA_Build 2 8684324 2D CGGGGTGTGC GA/-- GAGTGTGTCT 3070 het 3070 ref 41 16 12 14 GA 2 1 287579 CASAVA_Build 2 8684584 4I9M2D GTCAGTACAT ----GTGTGAGTGAT/GTGAGTGTGAGTG-- GTGTGTGTGT 3070 hom 85 het 34 0 28 10 N/A 0 0 287580 CASAVA_Build 2 8684631 2D GAGAGTGTGT GA/-- GTGTGTGTGT 29 het 29 ref 38 3 2 37 GA 1 0 287581 CASAVA_Build 2 8686210 4I GGTCTCAGCC ----/CAGG AAACCCTGTG 3070 hom 42 het 17 0 14 3 CAGG 0 1 287582 CASAVA_Build 2 8699328 4I TGCCAGTGGG ----/CTCA CTAATTTTCA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 CTCA 0 1 287583 CASAVA_Build 2 8705316 2I GGTAGAGGAC --/AG AGAGGATGGA 3070 het 3070 hom 39 11 21 7 AG 2 3 287584 CASAVA_Build 2 8706872 4D ACATAATATA TATT/---- TATTTTATAC 2765 het 2538 hom 15 6 8 3 TATT 2 1 287585 CASAVA_Build 2 8707048 2I41M2I ATATATGTAT --GTGTATAACATGTATATATATATGTGTGTAGGTATAACGTG--/GAGTGTATAACATGTATATATATATGTGTGTAGGTATAATGTGTA TATATATATA 3070 het 3070 ref 41 24 25 8 N/A 0 0 287586 CASAVA_Build 2 8707471 16D10M2D GTATATATTA TATGTGTGTACGTATGTGTATGTGTGTA/----------------TGTATGTGTG-- TATGTGTGTA 3070 het 3070 ref 40 30 15 7 N/A 0 0 287587 CASAVA_Build 2 8707552 2I ATATGTGTAT --/GA GTGTATAGCA 3070 het 3070 ref 48 29 16 3 GA 0 1 287588 CASAVA_Build 2 8708514 1I TGGTGAGGAA -/G ATGGCTGCAG 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 G 0 1 287589 CASAVA_Build 2 8713665 1D ATTTTCATTA G/- GTGATAAATC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 G 2 1 287590 CASAVA_Build 2 8714196 2I TTCTAGAGGT --/AA AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 8 10 287591 CASAVA_Build 2 8718154 2D AGAACTCACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 25 0 20 6 T 12 10 287592 CASAVA_Build 2 8719100 1I GCCTAAGCCA -/C CCTGCCTTCA 3070 hom 124 het 48 0 40 8 C 2 3 287593 CASAVA_Build 2 8726027 4I AGGGATGAAT ----/GGAA GGAAGGAAGG 3070 hom 148 het 71 0 42 29 GGAA 2 3 287594 CASAVA_Build 2 8738400 1D ACGAGTTCTT A/- AAAGATTTTC 3070 hom 80 het 37 0 25 13 A 4 3 287595 CASAVA_Build 2 8746596 1D ATTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 9 287596 CASAVA_Build 2 8752707 1I AGGATTTTAG -/T AACTGTCATC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 0 1 287597 CASAVA_Build 2 8758687 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2373 het 2373 ref 26 12 8 6 A 13 14 287598 CASAVA_Build 2 8766325 1I TGCCTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 17 2 10 5 A 13 14 287599 CASAVA_Build 2 8771177 1I TTTTTTTGGG -/C GGGGGGGGAC 3070 het 59 hom 29 1 20 8 C 0 1 287600 CASAVA_Build 2 8775415 8I GACTGTCATC --------/ATCTGCTG ATCTGCTGCC 3070 het 3070 hom 56 23 23 10 ATCTGCTG 1 2 287601 CASAVA_Build 2 8777041 1D AACTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 37 1 31 5 A 13 12 287602 CASAVA_Build 2 8800415 1I CTGATCACAC -/A AAGCATCGGT 3070 het 3070 hom 53 20 27 6 A 2 3 287603 CASAVA_Build 2 8804059 1I TTTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1411 het 1411 ref 21 8 6 7 T 12 13 287604 CASAVA_Build 2 8819195 1D CCTGAAGCCA T/- TTTTTTTTTT 1125 het 1125 ref 42 33 3 6 T 11 10 287605 CASAVA_Build 2 8823786 1D TCACTTGCTT C/- ACTGCACCCC 3070 het 3070 ref 56 29 21 6 C 1 0 287606 CASAVA_Build 2 8830413 3I TTCCTAATAG ---/CAA CAACTATTTG 3070 hom 114 het 42 0 37 5 CAA 1 2 287607 CASAVA_Build 2 8837869 1I AGAGGAACTT -/A ATATTATTAG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 1 2 287608 CASAVA_Build 2 8846762 1D TTATATTATA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 8 7 287609 CASAVA_Build 2 8856855 1D TCCTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 13 12 287610 CASAVA_Build 2 8868877 1I ACAAAATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 15 17 12 A 15 16 287611 CASAVA_Build 2 8905031 1D TGGACAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1494 het 1494 ref 39 33 4 2 A 11 10 287612 CASAVA_Build 2 8907758 3I TAGCCAGGGA ---/AAT AATAATAATT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 AAT 3 4 287613 CASAVA_Build 2 8909091 1I TTCTCATGCG -/A AAAAAAAAAA 1096 het 1096 ref 39 27 3 9 A 10 11 287614 CASAVA_Build 2 8942067 1I CCTTTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 1998 het 1998 ref 34 10 9 15 A 15 16 287615 CASAVA_Build 2 8954022 2I CACTGCTGCC --/AA AGAGTCTATT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 1 3 287616 CASAVA_Build 2 8984466 1I CAAGAGCTAA -/G GGTCACCACC 3070 hom 105 het 44 0 35 9 G 2 3 287617 CASAVA_Build 2 8987559 8I TTCCCTGTGT --------/CCTCTCTC CCTCTCTCCC 1346 het 1346 ref 43 37 3 4 CCTCTCTC 1 2 287618 CASAVA_Build 2 9042765 4D ATTAGCTGAG AGTT/---- AGGTCAGACA 3070 het 3070 hom 39 17 17 8 AGTT 1 0 287619 CASAVA_Build 2 9116975 1I AAAAAAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3068 het 16 hom 22 1 15 6 T 11 12 287620 CASAVA_Build 2 9119382 1D TGGCAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 A 13 12 287621 CASAVA_Build 2 9139441 5I CTGATTAAAT -----/TTAAG TTAGACTTTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TTAAG 0 1 287622 CASAVA_Build 2 9140772 4I GAACACCAAT ----/GATG TATCTATCCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GATG 0 1 287623 CASAVA_Build 2 9146739 1I CTAAATTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 21 2 14 5 T 13 14 287624 CASAVA_Build 2 9147819 1D GGTGTCATAG A/- AATCTTGAGG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 3 2 287625 CASAVA_Build 2 9151170 2D AGAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 33 het 18 0 12 7 AG 7 6 287626 CASAVA_Build 2 9155132 2I GCACACGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 51 17 19 15 GT 6 7 287627 CASAVA_Build 2 9163755 1I TCAGGCCTGA -/C CCCCCCAGGT 2332 het 2332 ref 23 12 7 4 C 6 7 287628 CASAVA_Build 2 9171866 1I TAGGTATGTG -/T GCTGCATATC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 0 1 287629 CASAVA_Build 2 9186549 1I CAGAAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 11 12 287630 CASAVA_Build 2 9191802 2D TCAAACACAC AT/-- GTTTTACAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AT 1 0 287631 CASAVA_Build 2 9209311 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1702 het 1702 ref 22 13 4 5 A 15 14 287632 CASAVA_Build 2 9210817 2D CGCCCCGTCC CT/-- GTCTTTGGGA 3070 hom 42 het 16 0 12 5 CT 1 0 287633 CASAVA_Build 2 9215992 12D TTTTGCCTCT TTAAAGAGGTTA/------------ TTAATAACCA 3070 hom 75 het 27 0 25 4 TTAAAGAGGTTA 1 0 287634 CASAVA_Build 2 9216386 1D GACTCTGTCT C/- CAAAAAAAAA 967 het 3 hom 11 0 4 7 C 2 1 287635 CASAVA_Build 2 9259911 1I GCGCGGTGGC -/G GGCGCCTGTA 1438 het 492 hom 7 1 4 2 G 2 3 287636 CASAVA_Build 2 9266581 1I AATTGGCATA -/C CCTTTCTCTG 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 C 2 3 287637 CASAVA_Build 2 9268003 4D CCAGATTATA TAGT/---- TAGTGAGTCC 3070 hom 120 het 49 0 40 11 TAGT 2 1 287638 CASAVA_Build 2 9303081 1I AAGTGATGAC -/A GTTACCTTCT 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 A 0 1 287639 CASAVA_Build 2 9308172 2D ATGCAGTGTG GT/-- GTGCTCTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 14 5 GT 2 1 287640 CASAVA_Build 2 9313998 1D ATGCTGTGCC A/- ATGATGATGC 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 A 2 1 287641 CASAVA_Build 2 9314874 3I TCTGAAAGCA ---/GGG GGGACTGTTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 G 3 6 287642 CASAVA_Build 2 9315825 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2114 het 2114 ref 38 17 8 13 A 15 16 287643 CASAVA_Build 2 9317134 13D CACAGTTTTC AGCCCAAAACCTT/------------- AAGGAACAAA 3070 het 3070 ref 42 24 15 6 AGCCCAAAACCTT 1 0 287644 CASAVA_Build 2 9317625 2I GCCTCTCCCC --/CA GAGTCAGGCA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 CA 0 1 287645 CASAVA_Build 2 9317999 1I TGGATTGTAG -/A AAAAATGAAA 1517 het 1517 ref 17 10 5 2 A 5 6 287646 CASAVA_Build 2 9328682 1I CCTGTTTTCA -/T TTTTTTTTTA 1697 het 1697 ref 12 6 4 2 T 9 10 287647 CASAVA_Build 2 9345361 1D CCTTCTCCCC G/- CTGCTGGCTA 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 G 1 0 287648 CASAVA_Build 2 9347570 3I GGAAGAAGCC ---/GGT GGTGAGAGGC 3070 het 2835 hom 32 10 14 8 GGT 1 2 287649 CASAVA_Build 2 9368622 1I AAGTGAACTC -/G GGGGGGAAAA 2523 het 2523 ref 28 16 7 5 G 6 7 287650 CASAVA_Build 2 9374617 4D CAATCATTCC CAAT/---- CACTCACATC 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 CAAT 1 0 287651 CASAVA_Build 2 9374917 4I ATATCTTCAC ----/TCAA TCACACACAC 3070 hom 139 het 62 0 42 20 TCAA 0 1 287652 CASAVA_Build 2 9374965 2D AACTCACATC CA/-- CACACACACC 3070 het 3070 ref 50 12 12 26 CA 5 4 287653 CASAVA_Build 2 9375023 2I TACTCACATT --/CA CTCACACACA 699 het 201 hom 53 4 8 41 CA 0 1 287654 CASAVA_Build 2 9375143 2D CACAATCACA CT/-- CTCACACACC 3070 het 3070 ref 60 30 16 15 CT 2 1 287655 CASAVA_Build 2 9375393 4I CACACTCACA ----/CAAT CAATCACACC 3070 het 3070 hom 81 30 42 9 CAAT 1 2 287656 CASAVA_Build 2 9375576 2I TCCGTCCCCA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 AC 5 6 287657 CASAVA_Build 2 9384057 1D AAGGCGTGAG A/- AGATCCTCTG 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 A 2 1 287658 CASAVA_Build 2 9384709 1D GGTACCCCTA C/- CCCACCCCCG 2019 het 2019 ref 18 8 5 6 C 4 3 287659 CASAVA_Build 2 9400986 2I CACTGGTGGC --/CT CTCCTACTCT 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 CT 1 2 287660 CASAVA_Build 2 9402013 4D TGTTGTTGTT AAAA/---- AAAAAACACA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 10 6 287661 CASAVA_Build 2 9402571 1D CCTGTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 21 9 T 13 12 287662 CASAVA_Build 2 9404652 3D TTCCAGAGGT CTC/--- CTCCTGCCTT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 CTC 2 1 287663 CASAVA_Build 2 9459513 2D ACAGGGAGGT CA/-- CACACACACA 3070 het 1992 hom 33 11 15 8 CA 6 5 287664 CASAVA_Build 2 9465478 1I GTTTGGGGGT -/G GGGGGGGGCA 1541 het 1005 hom 11 3 5 3 G 8 9 287665 CASAVA_Build 2 9482988 16D CAGTGTAGCA GATGAATAAAAGCATG/---------------- GATGAATAAA 3070 het 3070 ref 49 25 22 10 GATGAATAAAAGCATG 2 1 287666 CASAVA_Build 2 9483327 23D TGAGATACAG TTTACATACCATACAACTCACAA/----------------------- TTTACATACC 3070 het 3070 hom 51 22 24 15 TTTACATACCATACAACTCACAA 1 0 287667 CASAVA_Build 2 9489925 1I ACAATAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 13 12 14 A 10 11 287668 CASAVA_Build 2 9494975 2I CAGAGGGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 2452 hom 30 10 14 6 CT 1 2 287669 CASAVA_Build 2 9497992 1I TCATTTCTTG -/T TTCTGTGTGT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 2 3 287670 CASAVA_Build 2 9501274 1I TTGTATTAAA -/G GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 G 3 4 287671 CASAVA_Build 2 9502240 4D GTGTTTTTTG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 44 11 19 15 GTTT 6 5 287672 CASAVA_Build 2 9533753 3D ATCAGTATAT AGG/--- AGAAGGAACA 3070 het 3070 ref 38 17 16 6 AGG 1 0 287673 CASAVA_Build 2 9546750 3I GTTGTTGTTG ---/TTC TTGTTAAGAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 TTC 0 1 287674 CASAVA_Build 2 9547395 1I TACAGTGTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 9 10 287675 CASAVA_Build 2 9547696 1D CTGTGATTGA T/- TTGTAGGTCA 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 T 3 2 287676 CASAVA_Build 2 9549174 3I TGGCCTCACT ---/CTC CTCTTAGCTG 3070 het 3070 ref 48 19 19 10 CTC 1 2 287677 CASAVA_Build 2 9557669 4D ACAAAAACTC ATAG/---- ATAAATGTTC 3070 het 3070 ref 42 20 19 8 ATAG 1 0 287678 CASAVA_Build 2 9558650 3I AGACGTATGC ---/AAA CCAAATGGAT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 0 3 287679 CASAVA_Build 2 9565311 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 31 19 11 2 T 7 6 287680 CASAVA_Build 2 9566572 1I ATAAAAAGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 9 10 287681 CASAVA_Build 2 9567802 4I AAATAGAGCC ----/ATAA TTATAATCAG 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 ATAA 0 1 287682 CASAVA_Build 2 9569598 10D TACATATAAA CTTAAAATTC/---------- CTGAGTTCTT 1827 het 1440 hom 9 4 5 3 CTTAAAATTC 1 0 287683 CASAVA_Build 2 9569839 1D AATGACTCTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 9 8 287684 CASAVA_Build 2 9597599 2D CTGCTTTCTT AC/-- ACAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 AC 2 1 287685 CASAVA_Build 2 9611661 1I AAAATGGTCT -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 6 7 287686 CASAVA_Build 2 9620413 1D TACTACACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 A 13 12 287687 CASAVA_Build 2 9625280 1I TATATATTGA -/T TTATTTACAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 2 3 287688 CASAVA_Build 2 9626474 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 11 10 287689 CASAVA_Build 2 9632033 1D CTTAATTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 13 12 287690 CASAVA_Build 2 9634352 16D TCACGCCACT CTCCTGCCTCAGTCTC/---------------- CTGAGTAGCT 2931 het 2256 hom 14 7 7 1 CTCCTGCCTCAGTCTC 1 0 287691 CASAVA_Build 2 9639067 3I GATTCTATTC ---/TCA TGTTAGAATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TCA 0 1 287692 CASAVA_Build 2 9639657 2I CAGAGTCTTC --/CT CTGTCACCCA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 CT 1 2 287693 CASAVA_Build 2 9649968 3D ATGATAGAAA TCT/--- TCTTAGATTC 2742 het 2742 ref 16 10 6 0 TCT 2 1 287694 CASAVA_Build 2 9654283 1I AAGCTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 41 1 32 8 T 10 11 287695 CASAVA_Build 2 9660851 1D CTCCCTTGAA T/- TTTTTTTTTT 2716 het 2206 hom 29 8 9 12 T 17 16 287696 CASAVA_Build 2 9662367 1D TGGTTATAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 A 9 8 287697 CASAVA_Build 2 9663308 1D GACCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1874 hom 27 10 11 6 T 15 14 287698 CASAVA_Build 2 9663383 4I CTCAAGTGAT ----/CTGC CTGCCCGCTG 2165 het 2165 ref 20 8 7 5 CTGC 1 2 287699 CASAVA_Build 2 9664104 2I AACATCTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 TG 7 8 287700 CASAVA_Build 2 9667166 1I CAAGCAAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 A 9 10 287701 CASAVA_Build 2 9674158 1I TAATATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 A 12 13 287702 CASAVA_Build 2 9679177 1I ATATCACTAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 T 8 9 287703 CASAVA_Build 2 9683590 2I ATTTTTTATT --/AA GAGATTAAAT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 0 2 287704 CASAVA_Build 2 9689858 27I AATGGATCAT ---------------------------/AGAAGGCCCAAGAATGCCACAGGCAAG AAAGAATTTC 3070 het 3070 ref 40 21 17 4 AGAAGGCCCAAGAATGCCACAGGCAAG 0 1 287705 CASAVA_Build 2 9703114 10I GCTAATCCTG ----------/AGGAGGCTGC AGGAGGCTGA 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 AGGAGGCTGC 0 1 287706 CASAVA_Build 2 9712902 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 221 hom 24 1 19 4 A 9 10 287707 CASAVA_Build 2 9713916 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAC 2400 het 2400 ref 23 15 7 1 A 9 10 287708 CASAVA_Build 2 9715870 1D CGCACCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 16 21 11 T 11 10 287709 CASAVA_Build 2 9717956 1I TGGGCCCGGC -/G GGAGCCCGCT 3070 hom 53 het 21 0 15 6 G 2 3 287710 CASAVA_Build 2 9719274 3D GGCTGGGACT GTG/--- GTGGGCCTCT 3070 het 1915 hom 33 8 17 8 GTG 2 1 287711 CASAVA_Build 2 9725065 2D TGTGGAGGAG TC/-- TCTCCCACAG 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 TC 3 2 287712 CASAVA_Build 2 9731488 1D ACAGAACTCT A/- AAAAAAAAAA 2071 het 862 hom 45 13 8 24 A 17 16 287713 CASAVA_Build 2 9737113 1I GCAACCTCGT -/G GGGGTCCTTC 3070 hom 81 het 30 0 25 5 G 4 5 287714 CASAVA_Build 2 9742753 1I CATGAAGCAG -/T TAAGACCAAC 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 1 2 287715 CASAVA_Build 2 9759633 1I TTGAATTTAT -/A TTTTGGATAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 0 1 287716 CASAVA_Build 2 9771262 1D ATTCCAACAG A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 A 7 6 287717 CASAVA_Build 2 9771588 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2770 hom 26 9 10 7 A 12 11 287718 CASAVA_Build 2 9771857 1D GAATCTCTAC A/- AAAATTAAAA 2401 het 2401 ref 23 10 8 5 A 5 4 287719 CASAVA_Build 2 9777107 1I AGGCGCGGTA -/G CTCACGCCTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 0 1 287720 CASAVA_Build 2 9785184 4D CCTTCAGGAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1270 het 1270 ref 22 8 4 10 T 20 16 287721 CASAVA_Build 2 9787544 1I CAGGGGTGGG -/C CCCTGCTCCC 3070 hom 44 het 17 0 13 4 C 3 4 287722 CASAVA_Build 2 9800094 1D GGCTGAGGCA G/- GGGAATCACT 3070 het 474 hom 11 1 10 2 G 4 3 287723 CASAVA_Build 2 9803190 1D AATTTAAAAA T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 7 6 287724 CASAVA_Build 2 9804538 1D CTGCCCCCCC T/- GATCTCAGGG 2846 het 2846 ref 28 15 9 4 T 1 0 287725 CASAVA_Build 2 9808119 1D TCAGAGGTGA T/- TTTTTTTTTC 2682 het 2682 ref 22 9 9 4 T 10 9 287726 CASAVA_Build 2 9813593 1I TTTGGAACTA -/G GGTCATTGCC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 G 2 3 287727 CASAVA_Build 2 9816593 1D AGGAGAAGCC A/- GATTTGAGCC 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 A 1 0 287728 CASAVA_Build 2 9823760 1I CGACCTGAGG -/C CTGCAGGCCC 2571 hom 49 het 19 0 12 7 C 1 2 287729 CASAVA_Build 2 9826989 1D AACACCCATG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 2873 hom 29 9 11 9 C 9 8 287730 CASAVA_Build 2 9831313 15I CGTCTCCGCC ---------------/TCCAATTCCCGCCCT TCCCCTCTCT 2739 het 2739 ref 23 11 10 3 TCCAATTCCCGCCCT 0 1 287731 CASAVA_Build 2 9831433 1D GCTCTGGAAC A/- AATCCCTTGA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 3 2 287732 CASAVA_Build 2 9837242 1D CAGCTTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 12 11 287733 CASAVA_Build 2 9840550 5I GTGTTCAAGT -----/GAAAG GAAAAGTCAG 3070 hom 120 het 46 0 40 6 GAAAG 0 1 287734 CASAVA_Build 2 9841639 1I GAATCTACTC -/T TGTCTGTGCT 3070 het 3070 ref 63 31 24 8 T 1 2 287735 CASAVA_Build 2 9843390 1D ATCTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 29 2 11 16 T 12 11 287736 CASAVA_Build 2 9844173 1D GCTGGAATTA C/- AGGCATGCGC 3070 het 515 hom 12 2 9 1 C 1 0 287737 CASAVA_Build 2 9844955 1I GTTCTTATGG -/T AGGGCAGGCA 3070 hom 75 het 31 0 24 7 T 0 1 287738 CASAVA_Build 2 9846260 1D GCTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1189 hom 10 het 12 0 4 8 T 15 14 287739 CASAVA_Build 2 9849151 1D AGATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 48 1 40 7 A 11 10 287740 CASAVA_Build 2 9849625 5I GGGGAAGAGC -----/AGCAG CCTCAGTACT 3070 hom 66 het 23 0 21 2 AGCAG 0 1 287741 CASAVA_Build 2 9850202 2I AAAATAAAAT --/AA AAAAGGTGGT 3070 het 382 hom 26 5 10 11 A 4 6 287742 CASAVA_Build 2 9853666 3D TGCTTGTGGT CCC/--- CCCAGCTACT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 C 6 3 287743 CASAVA_Build 2 9862866 1I GTTTGCAATT -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 7 8 287744 CASAVA_Build 2 9885072 1I ATAAACCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 9 10 287745 CASAVA_Build 2 9885672 1I ATATTTTATC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 16 20 0 A 8 9 287746 CASAVA_Build 2 9886228 1D AAAAAGTAAG A/- AAAAAAAAGA 723 het 546 hom 18 6 4 8 A 9 8 287747 CASAVA_Build 2 9890146 1I TTGTATTTCC -/A AATAGACATG 3070 het 3070 hom 63 25 31 7 A 2 3 287748 CASAVA_Build 2 9890434 9I CAGCCTGAGT ---------/AAGCCTTCA AGGCGTAAAT 3070 hom 129 het 52 0 44 8 AAGCCTTCA 0 1 287749 CASAVA_Build 2 9894598 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2843 hom 29 10 11 8 T 9 10 287750 CASAVA_Build 2 9901043 1I CCGGCCGGAA -/G GCTTCTCCAG 3070 hom 66 het 27 0 20 7 G 1 2 287751 CASAVA_Build 2 9902793 1D GTCCTCTTCT C/- CCATAGGAAG 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 C 3 2 287752 CASAVA_Build 2 9903554 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 CT 2 1 287753 CASAVA_Build 2 9916777 3I TGCTTAGAAT ---/TTC TTCTGCCAGA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 TTC 1 2 287754 CASAVA_Build 2 9945131 1I CCACTCCAAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 8 9 287755 CASAVA_Build 2 9945892 2I TGCATTGGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 10 12 287756 CASAVA_Build 2 9951378 4I TTCAGTAAAC ----/TAGT TAGTTACCTC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TAGT 1 2 287757 CASAVA_Build 2 9951826 2I GTTTAAACAC --/TT TATTTTCAGA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 1 3 287758 CASAVA_Build 2 9953086 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 A 11 10 287759 CASAVA_Build 2 9957246 1D ATTTTTGAAT G/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 G 1 0 287760 CASAVA_Build 2 9973489 3I GCAGTACAGA ---/CTT CTTCTTATGC 3070 hom 165 het 63 0 55 8 CTT 2 3 287761 CASAVA_Build 2 9984603 1I CCTCCCCCTG -/C CCCCCACCCC 1327 hom 12 het 6 0 5 1 C 5 6 287762 CASAVA_Build 2 10001498 1I GCTCCAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2452 hom 24 6 10 8 T 13 14 287763 CASAVA_Build 2 10002722 4D GGGTAGAACC CTGT/---- CTACTTCCAA 3070 het 3070 ref 73 36 33 6 CTGT 1 0 287764 CASAVA_Build 2 10004175 1D CTCATAACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 29 0 22 8 A 10 9 287765 CASAVA_Build 2 10006143 6I CTGCAACGGT ------/GGGGTG GGGGGGGGTC 2620 het 2620 ref 41 20 8 13 GGGGTG 0 1 287766 CASAVA_Build 2 10029616 1I GCAGGCCGGA -/G GGTAAGGGCC 3070 hom 99 het 37 0 31 6 G 2 3 287767 CASAVA_Build 2 10035850 1I AGCTGTACAT -/A AGAGTGCAGT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 1 2 287768 CASAVA_Build 2 10037229 1D TTCTCAGTGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 9 8 287769 CASAVA_Build 2 10037744 1I TGGTGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 2443 het 2443 ref 25 12 6 7 T 10 11 287770 CASAVA_Build 2 10064788 2D AACTCCCCCC TT/-- TTTTTTTTCC 2404 het 1962 hom 27 9 8 10 T 10 8 287771 CASAVA_Build 2 10066574 2D AGAGGGAGTA TC/-- TAATGGGGCT 3070 het 3070 hom 42 17 18 8 TC 1 0 287772 CASAVA_Build 2 10067187 1I GCCTGGCGGA -/G CGTCCCGCAC 3070 hom 30 het 14 0 10 4 G 0 1 287773 CASAVA_Build 2 10067666 1I GCCCGGCTGG -/C CACCGGCCAC 2584 hom 39 het 17 0 11 6 C 1 2 287774 CASAVA_Build 2 10071145 1I GGGCAGGCAT -/G CCTACAGGCG 3070 hom 80 het 33 0 21 12 G 0 1 287775 CASAVA_Build 2 10080519 2D ACGTGTAAAC AT/-- GTGCACACAC 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 AT 1 0 287776 CASAVA_Build 2 10082079 2D CGAAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 36 0 27 9 A 13 11 287777 CASAVA_Build 2 10083205 2I CCGCCCCCCC --/CA CCCCCCCAGA 1550 het 115 hom 17 2 4 11 CA 0 1 287778 CASAVA_Build 2 10100270 1I AATATAGGGA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 10 9 G 1 2 287779 CASAVA_Build 2 10102228 1I TTTCCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 19 1 12 6 T 14 15 287780 CASAVA_Build 2 10110303 2I TTTGTTTTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 12 287781 CASAVA_Build 2 10124408 1D TATTTGGGGG A/- AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 7 6 287782 CASAVA_Build 2 10130788 4D CTGGGAACCG CCCC/---- CCCCCCCCCC 1962 het 214 hom 16 3 8 5 C 16 12 287783 CASAVA_Build 2 10138702 1D TGGTCTCGGA T/- TTTTTTTTTT 938 het 938 ref 30 21 3 6 T 14 13 287784 CASAVA_Build 2 10143758 1I AATAGACCAG -/C CGAGCTCTGA 3070 hom 117 het 42 0 37 5 C 1 2 287785 CASAVA_Build 2 10150326 4I TGAAGCCACT ----/AGAA AGAAGAAACT 3070 hom 115 het 47 0 37 10 AGAA 1 2 287786 CASAVA_Build 2 10154565 1I AAATCCATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 31 1 21 10 T 11 12 287787 CASAVA_Build 2 10157962 1D ACCCCCTCAA C/- CCCCCCCCAC 2694 het 2686 hom 17 9 7 1 C 9 8 287788 CASAVA_Build 2 10160235 1D AAATACAAAA T/- TAACTGGGCG 2690 het 1632 hom 12 4 7 2 T 2 1 287789 CASAVA_Build 2 10190509 1I GAGGGCCTGC -/A AGAGAGTTGA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 1 2 287790 CASAVA_Build 2 10190720 3D GGTGTGAATT ATA/--- ATCACCTGGG 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 ATA 1 0 287791 CASAVA_Build 2 10199355 1I GTGGCCATGG -/C CCTGGGGCTG 3070 hom 54 het 25 0 15 10 C 2 3 287792 CASAVA_Build 2 10200225 1I TATCCCTGCA -/G GGCTCAGGCC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 G 2 3 287793 CASAVA_Build 2 10205867 1I CACTCACATT -/G GCCCTACAGG 3070 het 3070 ref 41 24 10 7 G 1 2 287794 CASAVA_Build 2 10205980 1I GGACTAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 9 10 287795 CASAVA_Build 2 10218005 1I CTCGGGCTTG -/C CCATCGGGCC 3070 hom 46 het 18 0 14 4 C 2 3 287796 CASAVA_Build 2 10219258 4D CACACACATT CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 CA 9 7 287797 CASAVA_Build 2 10220250 1D GCCACCTGCA C/- CCCCCCGCCG 740 het 641 hom 7 3 3 1 C 7 6 287798 CASAVA_Build 2 10234215 1I ATCTGGTTTC -/T TTTTGCTTAA 3070 het 3070 ref 43 21 11 11 T 4 5 287799 CASAVA_Build 2 10234859 1D AAAATAGAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 15 0 12 4 A 9 8 287800 CASAVA_Build 2 10236639 1I TGGAACAGAC -/T TAAGACACTG 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 1 2 287801 CASAVA_Build 2 10242856 2D GCGTGAGAGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 2655 hom 37 11 14 12 GA 8 7 287802 CASAVA_Build 2 10248307 3D TGATGATCTT GGC/--- GGTGATGGTG 3070 het 283 hom 86 4 47 37 GGC 1 0 287803 CASAVA_Build 2 10249702 1I AGCTCCCGGA -/G GCCGCAGCCA 2862 hom 39 het 19 0 11 8 G 1 2 287804 CASAVA_Build 2 10250328 1D TGCCACTCCA C/- CCCCCCCTGC 2698 het 898 hom 31 9 13 9 C 8 7 287805 CASAVA_Build 2 10256856 2I CTCCAGCTAG --/AA AAAAAAAAAA 2625 hom 44 het 27 0 13 14 A 10 12 287806 CASAVA_Build 2 10269308 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 22 1 16 5 A 15 14 287807 CASAVA_Build 2 10280909 4D ACTCAAGCCT GAGA/---- AAGTTCCAGG 3070 hom 63 het 25 0 21 5 GA 2 0 287808 CASAVA_Build 2 10285431 1D TCCGCCTCCC G/- GGGTTCACAC 1710 het 1404 hom 11 4 6 1 G 4 3 287809 CASAVA_Build 2 10287231 1I CAGCTAGGTG -/C TTCTGCTGTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 C 0 1 287810 CASAVA_Build 2 10287648 2I ACCCCCTCCA --/TT TTTTTTTTTT 2484 het 2484 ref 25 8 11 6 T 11 13 287811 CASAVA_Build 2 10290692 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 13 12 287812 CASAVA_Build 2 10290968 2I GTGTGTGCGA --/GT GTGTGTGTAC 3070 het 3070 ref 92 41 35 16 GT 4 5 287813 CASAVA_Build 2 10298447 1D AGAGCACCCA C/- CCTCCTATGG 2293 het 2293 ref 21 11 6 4 C 3 2 287814 CASAVA_Build 2 10308678 1I TTAATTCTTA -/T TTTTTTTTTT 2189 het 2189 ref 28 17 6 5 T 10 11 287815 CASAVA_Build 2 10310788 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 1458 hom 16 4 10 2 T 6 7 287816 CASAVA_Build 2 10321100 1D GGCTAACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 11 10 287817 CASAVA_Build 2 10324487 2I AGAGAAAAAC --/AT GTGTGCATGT 3070 hom 61 het 25 0 19 6 AT 0 1 287818 CASAVA_Build 2 10328214 4I ACACTGGAAG ----/GACT GACTCCTCCT 3070 hom 89 het 35 0 28 7 GACT 1 2 287819 CASAVA_Build 2 10331837 1D GCATTATATT A/- TTTTTTTTTT 2658 het 2658 ref 35 23 8 4 A 1 0 287820 CASAVA_Build 2 10333626 1I CCTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 8 9 287821 CASAVA_Build 2 10353266 2D CATAGGCAGA GC/-- GCAGGGGCAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 5 GC 2 1 287822 CASAVA_Build 2 10361200 1I GGGACCCGAC -/G GGGCAAGGGC 544 hom 18 het 8 0 4 4 G 3 4 287823 CASAVA_Build 2 10362021 1D ATGTTTGCCA G/- GGACGCCGAG 2827 hom 27 het 11 0 8 3 G 3 2 287824 CASAVA_Build 2 10388056 1I ACAGGAATTC -/T TTTTTTTTTT 2726 het 2726 ref 31 16 10 5 T 10 11 287825 CASAVA_Build 2 10403042 1I CTAGAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1126 hom 38 3 23 12 T 14 15 287826 CASAVA_Build 2 10407077 4I GAGGTCAGGA ----/GATC GAGACCATCC 3070 het 726 hom 13 2 10 4 GATC 0 1 287827 CASAVA_Build 2 10419294 1D ACTTCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 961 het 961 ref 33 15 6 12 T 17 16 287828 CASAVA_Build 2 10429882 1D CCCATGGGGG C/- CCCACTGGAG 1321 het 1321 ref 33 17 7 9 C 4 3 287829 CASAVA_Build 2 10430005 1D AAGGCATAAT C/- CCCCCCCAGG 1349 het 1349 ref 19 10 6 3 C 8 7 287830 CASAVA_Build 2 10434023 1D AAAATCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 12 11 287831 CASAVA_Build 2 10439206 1I CCTGATGGCA -/C ATTTTGAGAC 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 C 0 1 287832 CASAVA_Build 2 10441605 4I CACACACACA ----/CACC CCCACACACA 3070 het 352 hom 35 2 32 1 CACC 0 1 287833 CASAVA_Build 2 10442675 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2591 hom 24 het 13 0 8 6 A 15 14 287834 CASAVA_Build 2 10442940 7I GTCGGGAATG -------/CAGTGTC CAGGGCTGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CAGTGTC 0 1 287835 CASAVA_Build 2 10451709 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 A 10 9 287836 CASAVA_Build 2 10460918 1D AACACATATT G/- GACCCTGATG 3070 het 2506 hom 19 7 12 1 G 2 1 287837 CASAVA_Build 2 10465840 6D CCCTGCTGGG TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 43 23 16 6 TC 8 5 287838 CASAVA_Build 2 10468360 1I AAGGTGGCTG -/T TTCTGCTGGG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 2 3 287839 CASAVA_Build 2 10476810 4D ACAAATAAAC AAAT/---- AAAGAAGGTG 3070 het 3070 ref 38 22 14 6 AAAT 1 0 287840 CASAVA_Build 2 10485457 3D CTTCCCTCTC CTT/--- CTCCTTCCAC 3070 het 3070 ref 41 20 13 11 CTT 1 0 287841 CASAVA_Build 2 10490594 2D CCCAGCGGGC TG/-- TGTGACTGTA 2735 hom 30 het 12 0 10 2 TG 3 2 287842 CASAVA_Build 2 10493454 13D CCTTCACCAA TCCTCCCTTGTAG/------------- CTGCCCTGCC 3070 het 465 hom 19 3 12 8 TCCTCCCTTGTAG 1 0 287843 CASAVA_Build 2 10494337 1I GGTCACTGCT -/G GGGGTGTGAC 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 G 4 5 287844 CASAVA_Build 2 10500295 1D ATGCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1449 het 1449 ref 33 22 4 7 T 12 11 287845 CASAVA_Build 2 10517843 2I ATGTAGCAGA --/CT CTTTCTTGAT 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 CT 1 2 287846 CASAVA_Build 2 10535422 3I AGAAGCCGCT ---/CTC CTCTGAACTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 CTC 1 2 287847 CASAVA_Build 2 10537951 8I19M2D TCTTTCTTTC --------TCTTTCTCCTTCCTTCCTTTC/TTTTTCTTTCTCTCTCCTTCCTTCCTT-- TCTCTCTTTC 3070 hom 24 het 9 0 9 6 N/A 0 0 287848 CASAVA_Build 2 10538130 2D CTTCCATCTC TT/-- TCTTTCTTTC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 3 1 287849 CASAVA_Build 2 10538251 4D TATCTCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 27 het 11 0 9 2 TCTT 3 2 287850 CASAVA_Build 2 10538890 12D CACAGGGGAA TCTTGACCACCC/------------ TGGGCACGGA 3070 hom 105 het 32 0 34 5 TCTTGACCACCC 1 0 287851 CASAVA_Build 2 10539646 4I AGGCATTATG ----/GGGA GGGAAGCTCT 3070 hom 78 het 31 0 24 7 GGGA 1 2 287852 CASAVA_Build 2 10576889 1D GTGGGTGCCT G/- ACGGGGCGTG 2059 het 2059 ref 29 17 6 8 G 1 0 287853 CASAVA_Build 2 10585883 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 16 7 8 1 T 6 7 287854 CASAVA_Build 2 10587006 2I TATGCTGTTT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 16 19 7 A 9 11 287855 CASAVA_Build 2 10588133 2D GTGAGCAATG TC/-- TCTATTTCTG 3070 het 3070 ref 31 20 11 1 TC 2 1 287856 CASAVA_Build 2 10597833 4D AGAAGCCTCC CTCT/---- AAGTCTACGC 3070 het 3070 hom 54 24 25 7 CT 2 0 287857 CASAVA_Build 2 10600181 1I GTATTTTTTT -/A AGCAGAGATG 3070 het 2781 hom 22 7 13 3 A 1 2 287858 CASAVA_Build 2 10602959 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 1753 hom 10 het 5 0 4 1 A 8 7 287859 CASAVA_Build 2 10613951 5D TTCCTTGGGC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1588 hom 23 9 9 6 T 15 10 287860 CASAVA_Build 2 10615159 8D GCTGTGAGAT CCACACAA/-------- CAGAGGTGTC 3070 het 1895 hom 17 6 11 1 CCACACAA 1 0 287861 CASAVA_Build 2 10617998 6D TTACTCCCTG CCAGCC/------ CCAGGGGCCA 3070 hom 69 het 24 0 23 4 CCAGCC 1 0 287862 CASAVA_Build 2 10619654 1D ACACGTTAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 9 8 287863 CASAVA_Build 2 10634638 2I CCTCCTACAA --/TG TGTGACAGGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 2 3 287864 CASAVA_Build 2 10636217 3D TACCCATTAT AAA/--- ATGAAACTTC 3070 hom 87 het 31 0 30 3 A 4 1 287865 CASAVA_Build 2 10638281 4I ACCAGGGAGG ----/CTGA CTAATTTACT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CTGA 0 1 287866 CASAVA_Build 2 10638851 1D TGGCAGTCTC T/- TATCGCATAC 3070 hom 123 het 47 0 41 6 T 2 1 287867 CASAVA_Build 2 10638989 1I CATCGTCAGA -/G GAACAACATA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 G 1 2 287868 CASAVA_Build 2 10642091 1I TATAGAAACA -/G TTTTAAAGCT 3070 hom 129 het 44 0 44 0 G 0 1 287869 CASAVA_Build 2 10645090 1D TCATGATCTG C/- CCCCCCCTTG 3070 hom 36 het 16 0 12 4 C 8 7 287870 CASAVA_Build 2 10647650 1I ATTTTAATGC -/A AAAAAAACAC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 7 8 287871 CASAVA_Build 2 10648136 25D TTCCAGCTGA GTTACTGGGAAACAGAAGGGACGTT/------------------------- TCCATCCCCT 3070 hom 111 het 35 0 38 0 GTTACTGGGAAACAGAAGGGACGTT 1 0 287872 CASAVA_Build 2 10650707 2D AACAAATTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 13 11 287873 CASAVA_Build 2 10651720 10D GATGGGCTTG CAGCACAGTA/---------- CAGTCGCTTC 3070 hom 117 het 41 0 39 6 CAGCACAGTA 1 0 287874 CASAVA_Build 2 10653485 1D GTTTGTGTTA G/- GCACTGTGCC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 2 1 287875 CASAVA_Build 2 10656383 5I GAAATAAAAG -----/AAAAC AAAGAAAATA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 AAAAC 0 1 287876 CASAVA_Build 2 10656662 1I ACAAAGAAAT -/G GGGGGGAAGG 3070 hom 106 het 42 0 36 6 G 6 7 287877 CASAVA_Build 2 10658181 4D ATTTTGAAAC AAAT/---- AAGACAGGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 5 AAAT 1 0 287878 CASAVA_Build 2 10663804 4D TACATTTATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 14 10 287879 CASAVA_Build 2 10666099 5I AGCTAGAGGT -----/ATTCC AATGAGAGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATTCC 0 1 287880 CASAVA_Build 2 10666827 1I AAGATGGCTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 34 0 27 7 A 8 9 287881 CASAVA_Build 2 10671556 1I TTTTTTTTTT -/A AGAAGGAGTC 3070 het 354 hom 28 1 24 3 A 1 2 287882 CASAVA_Build 2 10674127 1D TCATTCTTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 9 8 287883 CASAVA_Build 2 10674583 1I GATACTCAGT -/A GACAAAACAC 3070 hom 60 het 24 0 19 5 A 0 1 287884 CASAVA_Build 2 10675612 3D ACACTTCATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 15 12 287885 CASAVA_Build 2 10675822 2I GCTGTTTTTT --/AA TAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 0 2 287886 CASAVA_Build 2 10676815 2I CCTTGATCAC --/CT GGGCTTAAGC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CT 0 1 287887 CASAVA_Build 2 10676884 12D CATGCCTAGC TAATTTATTTTT/------------ TAATTTATTT 3070 hom 39 het 16 0 14 3 TAATTTATTTTT 1 0 287888 CASAVA_Build 2 10677222 1I TAAATAGCAT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 7 8 287889 CASAVA_Build 2 10679754 1D GTAAACAGTT A/- ACACAGGAAA 3070 hom 126 het 49 0 43 7 A 2 1 287890 CASAVA_Build 2 10680791 1I AAAGCAAAAG -/C TAAAATTTTA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 0 1 287891 CASAVA_Build 2 10685451 1I CTATACATGT -/A ACCCCCTGAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 1 2 287892 CASAVA_Build 2 10694191 1D TCAATCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 681 hom 39 2 31 6 A 13 12 287893 CASAVA_Build 2 10695512 2D ATTTTAAACA GT/-- CAAAATATTT 3070 hom 51 het 19 0 18 5 GT 1 0 287894 CASAVA_Build 2 10697605 1I TCAGATAGGC -/A AAAAATTAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 5 6 287895 CASAVA_Build 2 10698936 1D ATTAAAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 12 11 287896 CASAVA_Build 2 10704766 14I ATAGTGTATA --------------/GTATGCAGTGCACT GTACGCTGTA 3070 hom 104 het 41 0 34 7 GTATGCAGTGCACT 0 1 287897 CASAVA_Build 2 10707884 3D ACTACAGGCG CAC/--- AGTGCCACTG 3070 hom 69 het 24 0 23 1 CAC 1 0 287898 CASAVA_Build 2 10709828 11D AAAAAAAAAA AGAAAAAAAAG/----------- AAAAAAGAAA 3070 hom 32 het 11 0 11 2 AGAAAAAAAAG 1 0 287899 CASAVA_Build 2 10719829 4D ATAGAAAGCA CTAT/---- CTGTCAGCTA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CTAT 1 0 287900 CASAVA_Build 2 10724281 1D TGTTATGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 12 11 287901 CASAVA_Build 2 10726228 2I TTACTAAAAC --/AA TACTCACGCA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 0 2 287902 CASAVA_Build 2 10751577 1I CTCTCCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 13 14 287903 CASAVA_Build 2 10754432 1I AAAAATAAAA -/T AAAAAAATAA 2268 hom 15 het 7 0 6 1 T 0 1 287904 CASAVA_Build 2 10754734 1I CAGTGAGACT -/G TCTCGAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 0 1 287905 CASAVA_Build 2 10762806 5D AACAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAGAA 3070 hom 114 het 42 0 39 5 AAAAG 1 0 287906 CASAVA_Build 2 10766478 13I GGGGATGGAG -------------/GTGGGGTCAGAGA GTGGGGTACT 3070 hom 54 het 22 0 18 5 GTGGGGTCAGAGA 0 1 287907 CASAVA_Build 2 10768543 1I GCTGACTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 697 hom 30 2 21 7 T 11 12 287908 CASAVA_Build 2 10769064 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 35 1 27 9 A 11 10 287909 CASAVA_Build 2 10775715 1I AATCATACTC -/T TTTTAATATA 3070 het 3070 ref 47 23 14 10 T 4 5 287910 CASAVA_Build 2 10776235 2I TTTAAAAAAC --/AG AGAAATTTCA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 AG 1 2 287911 CASAVA_Build 2 10782252 1D TCCTAATTAC T/- TTTTTTTTTT 2517 het 241 hom 17 1 7 9 T 17 16 287912 CASAVA_Build 2 10788231 1D GGTGTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 25 1 13 11 T 16 15 287913 CASAVA_Build 2 10797551 11I4M3I TGGTGGTGGG -----------CAAG---/CACCTGTAATCCAAGCTA CTTGGGAGGC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 N/A 0 0 287914 CASAVA_Build 2 10799012 2D GAGGCAGGGA AC/-- ACAGGGTCCC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AC 2 1 287915 CASAVA_Build 2 10799288 2D TCTGGGCCTC TG/-- TGCACTCCAT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 TG 2 1 287916 CASAVA_Build 2 10805279 1D TCTTTGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 A 11 10 287917 CASAVA_Build 2 10808106 1D AACGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 12 11 A 12 11 287918 CASAVA_Build 2 10814990 3D TAACTCCACC TTA/--- TTATATTGCA 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 TTA 2 1 287919 CASAVA_Build 2 10893630 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 493 hom 22 2 10 10 A 13 14 287920 CASAVA_Build 2 10901328 13D TTTCTACTTT ACTAGTACACGTC/------------- ACTAGTACAC 3070 hom 112 het 46 0 36 11 ACTAGTACACGTC 2 1 287921 CASAVA_Build 2 10909232 1I ACTATCACCA -/C CCTTCCTCTC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 2 3 287922 CASAVA_Build 2 10909490 2D TTTTTAAGAC TG/-- TGTGATATTG 3070 het 3070 hom 46 22 22 3 TG 3 2 287923 CASAVA_Build 2 10919278 1D GGAGGAAATG C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 C 9 8 287924 CASAVA_Build 2 10921553 1D ACCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2874 hom 44 11 21 12 A 12 11 287925 CASAVA_Build 2 10922623 3D TTTCACTTTT GAA/--- GAAGTGTGCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 GAA 2 1 287926 CASAVA_Build 2 10935115 1I TGAATGCATG -/T TTTTTGTAGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 5 6 287927 CASAVA_Build 2 10938904 1D AGCTTTTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 32 1 27 6 A 14 13 287928 CASAVA_Build 2 10958555 1D TCACATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 42 0 30 12 T 13 12 287929 CASAVA_Build 2 10965412 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 27 1 14 12 A 16 15 287930 CASAVA_Build 2 10986957 37D TCTACATCCG CAGATGTAAATGTCAATTCCATCCATTTCATTCTCTA/------------------------------------- CATCTGATGC 3070 het 3070 ref 28 29 13 8 CAGATGTAAATGTCAATTCCATCCATTTCATTCTCTA 1 0 287931 CASAVA_Build 2 10992830 4D GGGCAGGCCA GCTG/---- GCCCTTGGTG 3070 het 3070 ref 46 24 16 8 GCTG 1 0 287932 CASAVA_Build 2 10997092 2D AACCAGAACT TG/-- TGTGAAAACT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 TG 3 2 287933 CASAVA_Build 2 10999530 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 2081 het 2081 ref 17 8 5 5 T 8 7 287934 CASAVA_Build 2 11004623 4D CTCAGCACTC AAAT/---- GAGCCAGGAA 3070 het 3070 ref 27 15 8 5 AAAT 1 0 287935 CASAVA_Build 2 11007923 4I TTCTCATGAT ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 AGTG 1 2 287936 CASAVA_Build 2 11028636 2I GGCTATGACC --/AT GTTTTCTGCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AT 0 1 287937 CASAVA_Build 2 11032488 1I GATTTGGGCA -/G GGACACAGGT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 G 2 3 287938 CASAVA_Build 2 11033546 1I GTCTCAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 A 9 10 287939 CASAVA_Build 2 11041384 1I TCAGGGACAG -/C CGCCAGGCAT 3070 het 2039 hom 30 6 14 10 C 1 2 287940 CASAVA_Build 2 11042826 2D CTCAGTACAC AT/-- GTCTGAGGCC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 AT 1 0 287941 CASAVA_Build 2 11051885 1D ACATGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 39 het 14 0 14 1 T 7 6 287942 CASAVA_Build 2 11069407 13D CTAAGACCAA CAAGAACTTACGG/------------- CAGGCCAGAC 2412 het 2412 ref 19 13 7 2 CAAGAACTTACGG 1 0 287943 CASAVA_Build 2 11079012 2D GAAATAAACC TT/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 8 het 37 2 29 6 T 3 1 287944 CASAVA_Build 2 11089744 1I TATCCTTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 9 10 287945 CASAVA_Build 2 11093175 1D AGCATTTTAG T/- TTTAATTAGG 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 T 4 3 287946 CASAVA_Build 2 11106361 2D TGCACGCACA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 56 21 22 13 TG 6 5 287947 CASAVA_Build 2 11119442 1I ATTAGTACAT -/A AGTATTTCAT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 1 2 287948 CASAVA_Build 2 11126537 1D GGACACATAT C/- CCCCCCAGGC 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 C 7 6 287949 CASAVA_Build 2 11131154 2D TTGTTTGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 6 A 13 11 287950 CASAVA_Build 2 11154634 4D ATGTCCTGAA TGTT/---- TGTTTGTTAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 TGTT 3 2 287951 CASAVA_Build 2 11157377 1I CCACTTCTGC -/A AGAAAGTCCT 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 1 2 287952 CASAVA_Build 2 11157856 1D CATGGTGGCA G/- GGGGGGGTGT 3070 hom 93 het 34 0 29 6 G 8 7 287953 CASAVA_Build 2 11164931 1D TTTATTGTAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 8 287954 CASAVA_Build 2 11170286 4I GTGTCTGTTC ----/CTGT CTAAGAAAAG 3070 hom 102 het 42 0 31 11 CTGT 0 1 287955 CASAVA_Build 2 11182046 12I TTAGAATGTC ------------/ACCCCTGCCAGG GCACCTGCCT 3070 hom 54 het 21 0 15 6 ACCCCTGCCAGG 0 1 287956 CASAVA_Build 2 11186736 1I CTGATACATT -/A AAAAAAAAAA 2647 hom 31 het 14 0 9 5 A 11 12 287957 CASAVA_Build 2 11189479 1D CCCCCATGTG C/- CCTGCCACCC 2755 het 2755 ref 29 13 7 10 C 3 2 287958 CASAVA_Build 2 11191778 3D ATGAAATAGG AGA/--- AGGAGCCAAG 3070 hom 103 het 38 0 34 4 AGA 1 0 287959 CASAVA_Build 2 11202399 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 35 0 29 6 T 10 11 287960 CASAVA_Build 2 11207918 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 10 9 287961 CASAVA_Build 2 11208218 1I GGTTTAGGAA -/T TTTTTTTTTT 2996 het 175 hom 14 2 10 2 T 11 12 287962 CASAVA_Build 2 11216396 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 28 0 25 4 A 9 8 287963 CASAVA_Build 2 11218840 1I CAGGAGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 879 hom 26 4 14 8 T 13 14 287964 CASAVA_Build 2 11228107 4D TGCTGCTGGA GTTT/---- GTTTGTCAGT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 GTTT 2 1 287965 CASAVA_Build 2 11229834 1I AGTTGCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 40 3 29 8 A 10 11 287966 CASAVA_Build 2 11234468 3I ACACAAAGAT ---/ATC ATCTTAAATC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 ATC 1 2 287967 CASAVA_Build 2 11235676 11D TCCAAGAAGC CCATTTTGAGG/----------- CCATTTTGAG 3070 hom 93 het 32 0 30 6 CCATTTTGAGG 1 0 287968 CASAVA_Build 2 11239589 6I TAATATAAAA ------/AAAAAC AAAAACAAAA 3070 hom 57 het 29 0 19 10 AAAAAC 2 3 287969 CASAVA_Build 2 11240530 2D ATTAGAGTAC TA/-- TATATATATA 3070 het 390 hom 43 2 30 11 TA 9 8 287970 CASAVA_Build 2 11241326 1D CTTAGAAGAT A/- AAAGTTTGAT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 4 3 287971 CASAVA_Build 2 11241545 4I TTGCAACTTG ----/CTTA CTTACTTAGA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 CTTA 2 3 287972 CASAVA_Build 2 11243349 1I AATAAATAAT -/A AAAAAAAAGC 2521 hom 15 het 7 0 6 1 A 8 9 287973 CASAVA_Build 2 11246198 3D TATTTTATTT TTA/--- TTTTTTTATT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TTA 1 0 287974 CASAVA_Build 2 11247943 3D AGAAGTTTTT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 44 0 35 9 TAA 1 0 287975 CASAVA_Build 2 11252360 1I GTATGAGGAC -/A AAAAATTTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 5 6 287976 CASAVA_Build 2 11256885 1D TGTGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 35 1 24 10 T 12 11 287977 CASAVA_Build 2 11265816 5I TGAATAAACC -----/TAACT TATTAATTCA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TAACT 0 1 287978 CASAVA_Build 2 11266061 4D ATAAATTTAC AAAT/---- AAAAGAAGCA 3070 hom 84 het 33 0 29 8 AAAT 1 0 287979 CASAVA_Build 2 11266179 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1132 hom 25 3 16 6 T 14 15 287980 CASAVA_Build 2 11267839 1D ACAAAAAAAA C/- AATCACCATA 3070 hom 71 het 29 0 23 6 C 1 0 287981 CASAVA_Build 2 11289708 1I TGGACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 26 1 19 6 T 11 12 287982 CASAVA_Build 2 11314859 1I AGTCCCTGCT -/G GGCCCTGTGG 3070 hom 46 het 27 0 23 4 G 2 3 287983 CASAVA_Build 2 11316887 1I CAGACTGAAG -/T TATCTTTGCA 3070 hom 92 het 34 0 31 3 T 1 2 287984 CASAVA_Build 2 11317246 1D ATTAGTAATT A/- TCCTTAGTGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 0 287985 CASAVA_Build 2 11321558 1D AAAAAAGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 616 hom 30 2 21 8 A 13 12 287986 CASAVA_Build 2 11321977 2D GACAGAAAAA AG/-- AGTAATCAGT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 AG 2 1 287987 CASAVA_Build 2 11323509 1D TTGTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 21 0 15 6 A 15 14 287988 CASAVA_Build 2 11326056 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTCCTT 2188 hom 21 het 20 0 8 12 T 7 6 287989 CASAVA_Build 2 11327683 24D CTAGATTGGT AATTTTGCTTTCTTTTTTATTCGC/------------------------ AATTTTGCTT 3070 hom 59 het 26 0 20 10 AATTTTGCTTTCTTTTTTATTCGC 1 0 287990 CASAVA_Build 2 11335014 1I ATCCCCCAAG -/C AGTATACACT 3070 hom 99 het 37 0 32 6 C 0 1 287991 CASAVA_Build 2 11340185 1I ATCTACATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 29 1 20 8 A 14 15 287992 CASAVA_Build 2 11346254 1D GAGGGTAAAC A/- GGGAAGCTAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 1 0 287993 CASAVA_Build 2 11349128 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 10 11 287994 CASAVA_Build 2 11349572 1I ATGACAGACT -/A ATGATAGTTA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 1 2 287995 CASAVA_Build 2 11352713 3D TTTTATCTTT TCC/--- TCTATTAAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 5 TCC 1 0 287996 CASAVA_Build 2 11362624 1D TGGAACTAGA T/- TGTATCAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 1 287997 CASAVA_Build 2 11368303 4D AGCTCAATTG AAGA/---- AAGAATCATA 3070 het 3070 hom 57 24 27 7 AAGA 2 1 287998 CASAVA_Build 2 11371895 4D ATACGTCCTT TGTC/---- TGTATGTTCT 3070 hom 81 het 28 0 28 3 TGTC 1 0 287999 CASAVA_Build 2 11372019 6I GAACTTCATT ------/TACCAG TACATTTATT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 TACCAG 0 1 288000 CASAVA_Build 2 11374508 1D GATCCTAAGT G/- TGGTCGTTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 1 0 288001 CASAVA_Build 2 11383820 1I AAAAAAAAAG -/T TAAGGAACAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 288002 CASAVA_Build 2 11386678 1I AAAAAGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 23 het 17 0 14 3 A 9 10 288003 CASAVA_Build 2 11389159 1I AGAATGGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 32 1 22 10 A 10 11 288004 CASAVA_Build 2 11397120 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 378 hom 30 1 23 7 A 10 9 288005 CASAVA_Build 2 11398659 1D ACTCGCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 43 3 29 11 A 11 10 288006 CASAVA_Build 2 11416528 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 12 9 T 15 13 288007 CASAVA_Build 2 11421921 1I AAGCTGAATC -/T TTTTTTTTTT 2292 het 429 hom 15 1 6 8 T 10 11 288008 CASAVA_Build 2 11426056 1I CCGTCAAACT -/G GGCACGCTGT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 2 3 288009 CASAVA_Build 2 11433224 1I AAGATTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 30 0 21 9 A 10 11 288010 CASAVA_Build 2 11439399 4D TTGCATTAAC CGTA/---- CGTAGTTCCT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 CGTA 2 1 288011 CASAVA_Build 2 11448437 1D TACCATTCGA G/- GGGGGGGTGT 3070 hom 80 het 30 0 25 6 G 8 7 288012 CASAVA_Build 2 11459426 1D CAATAACAAC A/- AAAAAAACCA 3070 het 224 hom 19 5 11 3 A 8 7 288013 CASAVA_Build 2 11460204 9D CCTCGGGTGA CACCACCAC/--------- CACCACCGCC 2040 hom 51 het 26 0 14 14 CAC 5 2 288014 CASAVA_Build 2 11462534 1I GCATGCATGG -/C CCGGTGAGCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 2 3 288015 CASAVA_Build 2 11463054 1I GACTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2973 het 360 hom 11 1 8 2 A 13 14 288016 CASAVA_Build 2 11469151 1I TATGACCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 10 11 288017 CASAVA_Build 2 11471145 4D AGGAAGACAA CAAC/---- CAACCCATGT 3070 hom 69 het 25 0 23 3 CAAC 2 1 288018 CASAVA_Build 2 11471932 2D36M9I ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAAG---------/--AAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAGAA AAAAAAGAAA 3070 hom 19 het 10 0 8 5 N/A 0 0 288019 CASAVA_Build 2 11476341 1D AGGGGGTTAT A/- ATGGGAATTT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 2 1 288020 CASAVA_Build 2 11478947 7I47M30D GGTCATCATG -------AGTTAATGTTTGCCTGTTTGCCCCAACTGCTGAAGAGCTGTCTGACAATTAAGACCATCTCTAGTAACTACAGCACG/ATTTGATAGTTAATGTTTGCCTGTTTGCCCCAACTGCTGAAGAGCTGTATGACA------------------------------ AGCTGAAAGA 3070 het 3070 ref 34 39 18 5 N/A 0 0 288021 CASAVA_Build 2 11479822 2I TTTTTTTGAG --/AC ACGGTCTCTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 AC 1 2 288022 CASAVA_Build 2 11482025 1D TTTTAGCTGC T/- TTTTTTTTTT 697 het 697 ref 40 25 4 12 T 15 14 288023 CASAVA_Build 2 11484933 3D GTTTTCAATT AAG/--- AAGTCCCAGG 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 AAG 2 1 288024 CASAVA_Build 2 11498423 1I TTTGGCAATC -/G TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 G 0 1 288025 CASAVA_Build 2 11517903 1D TATTTTTCAA T/- TATGCAGACC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 1 288026 CASAVA_Build 2 11525689 1D AACCAGAGTT G/- GGGTTGGGCA 3070 het 3070 hom 46 18 25 4 G 4 3 288027 CASAVA_Build 2 11525856 1D CTTTTGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 15 25 9 T 11 10 288028 CASAVA_Build 2 11533835 1D TTTCTTACTC T/- TTTTTTTTTT 2954 het 2954 ref 33 18 9 6 T 13 12 288029 CASAVA_Build 2 11539203 2D AGAGAGAGAG AA/-- AGAAAAAAAA 3070 hom 38 het 16 0 12 7 A 3 1 288030 CASAVA_Build 2 11540849 4D ACGTGTGTGC GTGT/---- GTGAGTGCGC 2981 het 2918 hom 24 9 8 7 GT 3 1 288031 CASAVA_Build 2 11541399 1I GTCAACTCTC -/T TTTGATGCCT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 3 4 288032 CASAVA_Build 2 11542853 2D TATATATGTA TT/-- TTTTTTTTTT 1456 het 9 hom 8 0 5 3 T 15 13 288033 CASAVA_Build 2 11546369 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2745 het 36 hom 16 1 11 5 A 17 16 288034 CASAVA_Build 2 11546525 2I TATTTGTCTG --/AT ATATTGTCTC 3070 hom 93 het 35 0 32 5 AT 2 3 288035 CASAVA_Build 2 11548347 1D GCTGGTCTTG A/- ACTCCTGACC 3070 hom 59 het 22 0 18 4 A 2 1 288036 CASAVA_Build 2 11560713 1D GGCTTGGCTG T/- TGTACATGGC 3070 hom 127 het 50 0 41 9 T 2 1 288037 CASAVA_Build 2 11561435 1D TCCAGTAATT C/- CCCCTTGTCC 3070 hom 115 het 42 0 39 3 C 5 4 288038 CASAVA_Build 2 11564981 1I GCAAGACTCC -/A AAAAAAAAAA 1931 het 440 hom 19 3 9 7 A 15 16 288039 CASAVA_Build 2 11566709 1I GCCTTGGCCT -/C CCAAAGTGCT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 2 3 288040 CASAVA_Build 2 11567064 2I AAAAAAAAAA --/AT GTTACCACAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 AT 0 1 288041 CASAVA_Build 2 11571916 1I CAGTTATGTT -/C CCAAGTTTGC 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 C 2 3 288042 CASAVA_Build 2 11586076 1I GGTTATAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 10 11 288043 CASAVA_Build 2 11588245 1D GATGTGAGTT A/- ATGGGGGGCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 1 288044 CASAVA_Build 2 11593115 6I GAAAGGACTT ------/TTCCTC TACTCTTCGA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 TTCCTC 0 1 288045 CASAVA_Build 2 11594368 1D AGAAAGCATA G/- TGGGTTCAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 0 288046 CASAVA_Build 2 11594510 6I ACCTTGAATT ------/CTTTCA CTTAGAGGCA 3070 hom 55 het 25 0 18 7 CTTTCA 0 1 288047 CASAVA_Build 2 11598348 2D GAGGACCGTC AA/-- AGAGTTTATA 3070 hom 175 het 64 0 58 7 A 3 1 288048 CASAVA_Build 2 11603767 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 442 hom 23 1 18 6 A 9 10 288049 CASAVA_Build 2 11611508 21D GTCCACCTTA AAGCTTCTTCCTGTGTGCCTT/--------------------- AAGCTCTATA 3070 hom 117 het 38 0 40 2 AAGCTTCTTCCTGTGTGCCTT 1 0 288050 CASAVA_Build 2 11637017 4D CAATTGTAAG AATT/---- AAATAAGGCG 3070 hom 169 het 57 0 57 3 AATT 1 0 288051 CASAVA_Build 2 11639640 1I20M1D CTTCTCTGCC -GGTGCTGCATTTGGGGGCAAC/ACGTGCTGCATTTGGGGGCAA- CCTGTGGCTG 3070 hom 97 het 34 0 23 15 N/A 0 0 288052 CASAVA_Build 2 11641079 2D GAAGTGATAA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 102 het 41 0 35 10 T 10 8 288053 CASAVA_Build 2 11641428 2D AAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCGAA 3070 hom 56 het 22 0 18 6 CT 2 1 288054 CASAVA_Build 2 11643513 1I AGTCGTGGGG -/A ATGGGAGAAC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 2 288055 CASAVA_Build 2 11644845 1D CCATGAAGTT G/- TCTTAGATTC 3070 hom 102 het 40 0 32 9 G 1 0 288056 CASAVA_Build 2 11649765 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 385 het 253 hom 34 2 4 29 T 16 14 288057 CASAVA_Build 2 11651940 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 10 11 288058 CASAVA_Build 2 11698713 1D ACTAAAAGGG T/- TTTTTGGGGG 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 6 5 288059 CASAVA_Build 2 11702582 1D AGAAAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 11 10 288060 CASAVA_Build 2 11702745 1D GCATTTCCTG T/- TTCTATATGT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 3 2 288061 CASAVA_Build 2 11708331 1I CCATGCTTTC -/T TTGCAAGCTA 3070 het 3070 ref 57 31 21 5 T 2 3 288062 CASAVA_Build 2 11720358 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1780 hom 16 4 9 3 A 10 11 288063 CASAVA_Build 2 11741918 1I AACCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 9 10 288064 CASAVA_Build 2 11742524 10D TAAAACAAAC ATCCTGCCCT/---------- CCTGGAGCTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 6 ATCCTGCCCT 1 0 288065 CASAVA_Build 2 11743860 1D CATGTGATCA C/- CCACAGCCCC 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 C 3 2 288066 CASAVA_Build 2 11760498 4I AATATCTCGC ----/AACT ACCTTATCTT 3070 het 3070 hom 61 23 27 11 AACT 0 1 288067 CASAVA_Build 2 11764673 4D ACGTGAGGCA TTAT/---- CACAGGTGCT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 TTAT 1 0 288068 CASAVA_Build 2 11779620 1D GAAGGCAGAG A/- AAAAGAAGGA 3070 hom 125 het 52 0 40 12 A 5 4 288069 CASAVA_Build 2 11862198 1D GCTTCACCGT G/- GGGGTCTCTG 3070 het 3070 ref 45 25 12 8 G 5 4 288070 CASAVA_Build 2 11867963 1D AGTAGGAGCG A/- GAGGGGAGGC 2275 het 2275 ref 27 15 7 5 A 1 0 288071 CASAVA_Build 2 11871764 2D CACCCGGACA CT/-- CTGGAGTCCT 3006 het 3006 ref 43 24 10 9 CT 2 1 288072 CASAVA_Build 2 11893465 1I CAGTCTACTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 8 9 288073 CASAVA_Build 2 11903856 1D ATACAGTGTT G/- GAAGTTCTGG 2887 het 2106 hom 11 5 6 0 G 2 1 288074 CASAVA_Build 2 11911638 1D CATTCGCCCC A/- AATGATACAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 3 2 288075 CASAVA_Build 2 11914271 1D CCAGGAGAAA G/- GGAGAGCTTG 3070 hom 90 het 37 0 30 8 G 3 2 288076 CASAVA_Build 2 11923312 3D GGGAGGGAAA TGT/--- TGTATCGCTG 3070 hom 93 het 33 0 28 8 TGT 2 1 288077 CASAVA_Build 2 11924671 5D GGAGATACCT GAATC/----- GAATCGTTGG 3070 hom 78 het 32 0 27 6 GAATC 2 1 288078 CASAVA_Build 2 11954963 1D TGGCTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 36 1 21 14 T 15 14 288079 CASAVA_Build 2 11956037 1I TGTATCCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1166 hom 26 4 16 6 A 15 16 288080 CASAVA_Build 2 11983634 4I TTTTGGTATT ----/AAAA AAAAAACCTT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 6 10 288081 CASAVA_Build 2 11989084 3D TCTGCCTGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 1378 het 1378 ref 31 11 5 15 T 19 16 288082 CASAVA_Build 2 11991572 4D ACGTGACCTC AAAG/---- AAAGCTGTGT 3070 het 3070 hom 67 27 30 11 AAAG 2 1 288083 CASAVA_Build 2 11991935 1D GTATAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 19 17 11 T 15 14 288084 CASAVA_Build 2 12000891 3D ATAAATAAAT AAA/--- AAAGCTTCCG 3070 hom 48 het 18 0 16 3 A 6 3 288085 CASAVA_Build 2 12002433 1I TCTGGAGGAG -/C CAACTGAACA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 C 1 2 288086 CASAVA_Build 2 12002926 1D TTATAACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 242 hom 24 2 17 5 T 15 14 288087 CASAVA_Build 2 12004254 2D TCAGCTTTGA CT/-- CTAACTGTGA 3070 het 3070 ref 48 23 21 5 CT 2 1 288088 CASAVA_Build 2 12009238 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 247 hom 28 3 17 10 T 17 16 288089 CASAVA_Build 2 12010315 4D ATGCAATATA AATT/---- AATATAATTC 2288 het 2288 ref 22 14 6 2 AATT 1 0 288090 CASAVA_Build 2 12021898 1D CAGTATATTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 10 9 288091 CASAVA_Build 2 12024222 1I TAGCCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 1193 het 1193 ref 21 8 8 5 T 17 18 288092 CASAVA_Build 2 12024836 1D GATTATACTA T/- TTTTTTTTTT 1068 het 1068 ref 28 17 3 8 T 12 11 288093 CASAVA_Build 2 12028746 2I TTTAGTATGG --/TT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 8 10 288094 CASAVA_Build 2 12030397 1D TCAAAAAACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 27 0 24 5 T 9 8 288095 CASAVA_Build 2 12032687 1I ACCTCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 17 8 T 13 14 288096 CASAVA_Build 2 12036541 1I TTTTATTCTG -/T TTTTTTTCGA 3070 het 2950 hom 18 7 10 1 T 7 8 288097 CASAVA_Build 2 12036741 1I TTTGTGGACA -/C CATTAATTTT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 C 1 2 288098 CASAVA_Build 2 12044213 1I TTCTAGCTTA -/T TTTTTATCAC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 5 6 288099 CASAVA_Build 2 12049714 8D CCCTGGCCAT TGCTGATA/-------- TGCTGATATG 3070 het 3070 ref 45 28 14 4 TGCTGATA 2 1 288100 CASAVA_Build 2 12052976 2I TCTTGGAAAT --/AA AAGTCTGTTT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 2 4 288101 CASAVA_Build 2 12063905 1I CAGGCTTGCA -/G GGGTATTAGA 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 G 3 4 288102 CASAVA_Build 2 12083076 4I ATTTTTCTCC ----/CTTA CTTTTCTTGG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 CTTA 0 1 288103 CASAVA_Build 2 12092837 1D TGCCTCCCAG T/- CATTTTTCAC 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 T 1 0 288104 CASAVA_Build 2 12097021 2I TGTTACTCTT --/TG TGTGCAGACT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 TG 2 3 288105 CASAVA_Build 2 12107644 1D TCTGCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1087 het 1087 ref 14 5 5 4 A 17 16 288106 CASAVA_Build 2 12107709 1I TCATCTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 86 hom 23 1 13 9 T 11 12 288107 CASAVA_Build 2 12112437 4D TGCCACAGAC ACTT/---- ACCCATTACT 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 ACTT 1 0 288108 CASAVA_Build 2 12113740 1D CCCACCCTAA T/- TGACTTTATC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 1 288109 CASAVA_Build 2 12126398 1I CCCCGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 43 1 32 10 A 10 11 288110 CASAVA_Build 2 12128562 2I CTGTGGGTTA --/TT TGGGGAAGGC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 3 288111 CASAVA_Build 2 12135539 1D ATTTGCAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 584 hom 34 5 14 15 T 17 16 288112 CASAVA_Build 2 12136695 1D TCCTTGAGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 70 het 30 0 23 7 T 10 9 288113 CASAVA_Build 2 12136947 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 6 7 288114 CASAVA_Build 2 12140021 1D ATAAATAAGT A/- AATAAATAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 A 3 2 288115 CASAVA_Build 2 12148686 5D TCTTTCTAAT TCTCC/----- TCTTTTATTT 3070 hom 78 het 28 0 27 4 TCTCC 1 0 288116 CASAVA_Build 2 12161998 1D TTGCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 1335 het 1335 ref 25 12 4 9 T 16 15 288117 CASAVA_Build 2 12167469 2D TCTGTAAAGA CT/-- CTGTTTCCAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 CT 2 1 288118 CASAVA_Build 2 12169309 1D TGAAGAACAT C/- CTCCAAATTA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 C 2 1 288119 CASAVA_Build 2 12185390 1I TCTCTTTCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 A 9 10 288120 CASAVA_Build 2 12188303 1D ATGTGCAATC T/- CCACTGGTGA 3070 het 3070 ref 53 24 20 10 T 1 0 288121 CASAVA_Build 2 12189711 2I TCTGTCATAA --/AG AGGGGAGAGG 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 AG 1 2 288122 CASAVA_Build 2 12195100 5D ACCCGTTAAT TAATG/----- CAGTTTCTTC 3070 het 3070 ref 23 15 8 1 TAATG 1 0 288123 CASAVA_Build 2 12199816 1D GTCTGTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 29 1 27 1 T 11 10 288124 CASAVA_Build 2 12202581 1D TGCAATACCA C/- CCTAATAGAT 3070 hom 129 het 48 0 42 6 C 3 2 288125 CASAVA_Build 2 12202690 4I CATTTTGCTC ----/TAAG TGAGTCAGTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAAG 0 1 288126 CASAVA_Build 2 12210754 4D CTTTCTTCCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 1828 het 1828 ref 30 15 7 9 TTCC 3 2 288127 CASAVA_Build 2 12223537 1D CTATCTTTCC A/- AAAAAAAAAA 805 het 805 ref 31 23 3 5 A 13 12 288128 CASAVA_Build 2 12258638 1D AAAAAAACAC A/- AGAGAATTTC 589 het 589 ref 35 5 4 26 A 2 1 288129 CASAVA_Build 2 12268042 1I GTCAAAGGTC -/T AAACCCTGCA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 0 1 288130 CASAVA_Build 2 12273636 26D GTTTTATGTT TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 2597 hom 18 het 5 0 7 0 TA 19 6 288131 CASAVA_Build 2 12285451 1D ATAAAATTAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 8 7 288132 CASAVA_Build 2 12302651 3I TTTTTAAATT ---/CTC CTTTTGATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CTC 0 1 288133 CASAVA_Build 2 12302863 3D AATTGTCTGA CTT/--- CTTCTTCTTT 3070 het 409 hom 36 5 15 17 CTT 4 3 288134 CASAVA_Build 2 12303270 1D TATAGTTAAT A/- AAATCTCTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 4 3 288135 CASAVA_Build 2 12305074 2D AATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 TA 8 7 288136 CASAVA_Build 2 12308957 5D ACCATATAAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 44 24 12 12 AAAAC 4 3 288137 CASAVA_Build 2 12313710 1D ACTTTTTTTT C/- CCCTACAATC 3070 hom 99 het 37 0 33 7 C 4 3 288138 CASAVA_Build 2 12330928 2I ATTTTGACTC --/AT GTATTATTTA 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 AT 0 1 288139 CASAVA_Build 2 12331669 1I TTCTGTGTCC -/T TTTCTATTTG 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 T 3 4 288140 CASAVA_Build 2 12340957 1D ACTACTCCCT A/- AAAAAGATCT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 A 6 5 288141 CASAVA_Build 2 12343545 1D TGCTTCGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 6 T 15 14 288142 CASAVA_Build 2 12344961 1D TACAGAAGGG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 9 8 288143 CASAVA_Build 2 12347210 1I TCTATTTGTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 127 hom 20 1 14 5 T 8 9 288144 CASAVA_Build 2 12350653 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 8 9 288145 CASAVA_Build 2 12363296 1D GTGAAGATGT C/- CCCCCCATGT 3070 hom 107 het 41 0 36 5 C 7 6 288146 CASAVA_Build 2 12368114 2I TTTGCTTCTC --/TA TGCAGTTTTA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 TA 0 1 288147 CASAVA_Build 2 12380881 1I CCCCTGCTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 35 0 25 10 T 9 10 288148 CASAVA_Build 2 12384181 2D GACACACACG CA/-- CACACACACA 930 het 930 ref 59 47 3 11 CA 6 5 288149 CASAVA_Build 2 12413511 1I GTTTCCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 26 2 18 6 T 13 14 288150 CASAVA_Build 2 12415797 2I10M2I2M1D7M7I12M10I CCATTTTTGT --CTCTATATAT--CTGTGTGTGT-------GTATATATATAC----------/AACTCAAAAAATGACT-TTTTTGTCATAGCAATATATATATACACACACACAA ATATATATTG 1832 het 1832 ref 20 17 6 7 N/A 0 0 288151 CASAVA_Build 2 12427576 1I CAAGAAGTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 8 9 288152 CASAVA_Build 2 12431397 8I TGAAAGCATG --------/GTTCAGTT GTGCCCATGA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 GTTCAGTT 0 1 288153 CASAVA_Build 2 12437639 1D TAGAGACAGC T/- TAGAGACCAG 3070 hom 93 het 36 0 30 6 T 2 1 288154 CASAVA_Build 2 12446641 8D GCGCTCTCTT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 35 11 16 10 TC 10 6 288155 CASAVA_Build 2 12452703 2D AGAGAGAAAA AG/-- AGAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 41 20 18 4 AG 3 2 288156 CASAVA_Build 2 12462975 4D TATGCGTGTT TATG/---- TATGTATGTA 3070 hom 72 het 34 0 25 11 TATG 5 4 288157 CASAVA_Build 2 12470288 1I TTTTCAGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 9 10 288158 CASAVA_Build 2 12483488 1D CCTACCCTCC T/- TATCCTGGCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 2 1 288159 CASAVA_Build 2 12495543 2D ATATATATAC AT/-- ATATATACAC 217 hom 5 het 5 0 2 3 AT 4 3 288160 CASAVA_Build 2 12496304 1D AGTGCTCAGT A/- AGTGATAGCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 1 288161 CASAVA_Build 2 12498024 1I AATTACTATT -/A AAAAGCAAGA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 4 5 288162 CASAVA_Build 2 12499041 1D CCAAGTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 37 1 34 2 A 11 10 288163 CASAVA_Build 2 12515515 2I GGGAAGAAAC --/AG AGACAATCCC 3070 het 3070 ref 58 29 22 7 AG 1 2 288164 CASAVA_Build 2 12516118 4D TTCCCCATTA TTAT/---- TTTATGTATT 3070 het 3070 hom 24 11 12 2 TTAT 1 0 288165 CASAVA_Build 2 12516744 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 25 5 14 7 A 12 11 288166 CASAVA_Build 2 12517486 1I ATCCCCTTGC -/T TTTATTTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 3 4 288167 CASAVA_Build 2 12524803 2D CAAGCTAACG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 2 T 12 10 288168 CASAVA_Build 2 12528314 2I AAAAAAAAAG --/AA AAAAAAATAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 7 9 288169 CASAVA_Build 2 12529943 1D TGGCTAGGGA G/- GCCTCACAAT 2728 het 2728 ref 23 14 6 3 G 2 1 288170 CASAVA_Build 2 12532029 1D TCTTCTATTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 10 9 288171 CASAVA_Build 2 12533288 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 20 1 17 2 A 11 10 288172 CASAVA_Build 2 12537092 2D GAATTATGAC AT/-- AGAAAATAAG 3070 het 3070 hom 20 7 10 4 AT 1 0 288173 CASAVA_Build 2 12540808 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 11 10 288174 CASAVA_Build 2 12542273 1D CAGCCTTTCC T/- TGGTGAACAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 2 1 288175 CASAVA_Build 2 12542511 2I CTCAAAGGAA --/TT TTTCCACCAG 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 T 3 5 288176 CASAVA_Build 2 12543244 1I ATCAATTCAC -/A AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 6 7 288177 CASAVA_Build 2 12544615 4D TTTCTTTCTC TCTT/---- TCTTTCCTTT 3070 hom 83 het 30 0 27 5 TCTT 2 1 288178 CASAVA_Build 2 12568837 1I CTTTTACTTA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 6 7 288179 CASAVA_Build 2 12572975 5D TAGACCAACC TCAAG/----- TCAAGTCTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TCAAG 2 1 288180 CASAVA_Build 2 12573614 1I TAGGATATGA -/T TTTTACCTCT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 4 5 288181 CASAVA_Build 2 12618956 1I TTGCCAGGGG -/T TAAGGGGATG 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 1 2 288182 CASAVA_Build 2 12620509 20D AAATCAGCAA CATTATTTTAAAAATTAATT/-------------------- CTCCAAGAAC 3070 het 3070 ref 26 18 10 0 CATTATTTTAAAAATTAATT 1 0 288183 CASAVA_Build 2 12624279 1D AATATATATT A/- AATACACATG 3070 het 2914 hom 16 7 8 2 A 3 2 288184 CASAVA_Build 2 12627424 2D CACCTTAACT GA/-- GTGATTAACC 3070 het 889 hom 14 4 9 1 GA 1 0 288185 CASAVA_Build 2 12659581 1I TCAGGTATTT -/A ACTCCAGACA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 1 2 288186 CASAVA_Build 2 12659735 5I ACCTTATCTT -----/AACTA ATTACATCTG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 AACTA 0 1 288187 CASAVA_Build 2 12663776 2D GGCAAGGCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 13 12 A 13 11 288188 CASAVA_Build 2 12669448 5D TCCATATGCA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 14 9 AAAAT 3 2 288189 CASAVA_Build 2 12695195 1I AGTATCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 10 11 288190 CASAVA_Build 2 12701088 1D TTAAAAAAAA T/- AAATGTTCAG 3070 het 3070 hom 45 17 22 7 T 1 0 288191 CASAVA_Build 2 12744586 2I TGCCAATGAC --/AA AGAGTATGAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 3 288192 CASAVA_Build 2 12780240 2D GGATTCTATC AT/-- ATTCCTACCT 3070 het 3070 hom 46 17 23 7 AT 2 1 288193 CASAVA_Build 2 12794042 1I TGCCTGATAT -/C CCCCACCCCC 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 C 4 5 288194 CASAVA_Build 2 12794953 1I TGAGAATGGG -/A TAGAGGAAGC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 0 1 288195 CASAVA_Build 2 12796302 1I GGCTGGTCTA -/G GGAGCTTGGG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 G 2 3 288196 CASAVA_Build 2 12800274 2D TTTGTCCTAA TC/-- TCTTCAATCA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 TC 2 1 288197 CASAVA_Build 2 12815115 1D AATTTCTGTT C/- CGTAGGTACA 2586 het 2586 ref 32 15 6 11 C 2 1 288198 CASAVA_Build 2 12821169 1I CAAGAGAAAC -/A GAGAAGGAAT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 0 1 288199 CASAVA_Build 2 12827864 1D CCTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1559 hom 23 4 16 3 A 10 9 288200 CASAVA_Build 2 12832077 1I CTCCCTATAA -/C CCCCCTGGGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 5 6 288201 CASAVA_Build 2 12833538 3I GACAGGTGCT ---/AAG AAGGAGAACA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 AAG 1 2 288202 CASAVA_Build 2 12839137 4D ATGCATGCAC ATAA/---- ATATATTCAT 3070 het 3070 hom 48 19 25 6 ATAA 1 0 288203 CASAVA_Build 2 12851443 1D TAAATGTGTA T/- TTTTTTTTTT 1314 het 1314 ref 26 8 5 13 T 15 14 288204 CASAVA_Build 2 12862113 1I AGGTAGTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 A 9 10 288205 CASAVA_Build 2 12876098 1I ATGCAAATGC -/A CTGATTGCCT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 0 1 288206 CASAVA_Build 2 12883190 2I TTTTGTGGGG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 1719 hom 20 6 11 3 T 9 11 288207 CASAVA_Build 2 12883522 1D GAAAGAAGAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 A 8 7 288208 CASAVA_Build 2 12884655 1D GAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 10 9 288209 CASAVA_Build 2 12889302 1D TGCTCCTGGT A/- AAAAAACAGG 3070 het 3070 hom 59 26 25 9 A 7 6 288210 CASAVA_Build 2 12895124 1I AGCAAGTTGT -/G GGACTTGAAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 2 3 288211 CASAVA_Build 2 12916967 1I AAGATAACTA -/C CATTACAGTG 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 C 1 2 288212 CASAVA_Build 2 12924410 1D AATAGCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 9 T 11 10 288213 CASAVA_Build 2 12930851 1I AAGAGGAAAC -/A ACGACCTGCA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 1 2 288214 CASAVA_Build 2 12942120 1D TAGGAGCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 10 9 288215 CASAVA_Build 2 12951584 3I31M3D TAATTTATAG ---ATTATAAGATTGATATAGATTATAATAGTCTATA/ATTATTATAAGATTGATATAGATTATAATAGTCT--- ATATTATCAA 2431 het 2431 ref 14 10 5 7 N/A 0 0 288216 CASAVA_Build 2 12955211 1D AAAGTGTCCC T/- CTCTGGAGGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 1 0 288217 CASAVA_Build 2 12956390 1D ACAACTAAGG A/- ACTGAAGTTT 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 A 2 1 288218 CASAVA_Build 2 12957991 1D TTACTAGAAC A/- AAAGACTGAC 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 A 4 3 288219 CASAVA_Build 2 12963157 1D TAGTTTTTTT A/- AAGGAACTGC 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 A 3 2 288220 CASAVA_Build 2 12973677 1I AATTGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 9 10 288221 CASAVA_Build 2 12985527 1D ACTGTTCCTG C/- TTTTGTGCTT 3070 het 3070 ref 21 10 7 5 C 1 0 288222 CASAVA_Build 2 12989415 8I GTTTAAAAAC --------/CTCCTAAG CTCCTAAGCA 3070 het 3070 ref 58 26 22 10 CTCCTAAG 1 2 288223 CASAVA_Build 2 12990490 2I TACATAAAAA --/CT CTGCATTCAT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 CT 1 2 288224 CASAVA_Build 2 12990810 1I CCTGCCACCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 9 10 288225 CASAVA_Build 2 12999699 1D CACCACTGCA C/- CTCCAGCCTG 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 C 2 1 288226 CASAVA_Build 2 13005143 4D TCTTTTTTTT TTTG/---- TTTTTTGTTT 1456 het 1456 ref 30 15 7 8 TTTG 1 0 288227 CASAVA_Build 2 13007309 1I GAGATATATG -/C TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 C 0 1 288228 CASAVA_Build 2 13014123 1D GTGTTTCAAT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 G 1 0 288229 CASAVA_Build 2 13033610 1D GAGTTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 21 3 10 8 A 13 12 288230 CASAVA_Build 2 13042929 1I CTTGCTAAAT -/G GTACCACCAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 1 2 288231 CASAVA_Build 2 13048211 3D CAAATGTCTT CTC/--- CTCATCATTG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 CTC 2 1 288232 CASAVA_Build 2 13058209 1D AGTGACAGAG T/- TTTTCTGCTC 3070 het 3070 hom 34 17 14 5 T 5 4 288233 CASAVA_Build 2 13063245 4D TAACAACAAC CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 CA 9 7 288234 CASAVA_Build 2 13065798 3D GATTTTAAAA AAT/--- AACTCATGTG 3070 het 3070 ref 27 15 10 4 AAT 1 0 288235 CASAVA_Build 2 13081492 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 812 het 812 ref 16 8 4 4 T 13 12 288236 CASAVA_Build 2 13084734 1D TTTATAATTG A/- AAAAAAAAAA 2702 het 2702 ref 27 19 7 1 A 12 11 288237 CASAVA_Build 2 13087272 4I AACAAACATA ----/TATT TATTTATTTA 3070 het 2714 hom 25 10 9 6 TATT 2 3 288238 CASAVA_Build 2 13095460 1I AGGAAATTTT -/A CTTATTTGTG 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 A 0 1 288239 CASAVA_Build 2 13111221 3D TTTCCTGAGA TGT/--- TGTACGTTAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 TGT 2 1 288240 CASAVA_Build 2 13120702 2D GTGAATAGTG CT/-- GTTATAGACA 3070 het 3070 hom 52 23 25 4 CT 1 0 288241 CASAVA_Build 2 13123295 2I TGATATTTAC --/TA TTTCTTCACT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TA 0 1 288242 CASAVA_Build 2 13124158 1D AATTCAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 13 12 288243 CASAVA_Build 2 13131430 1D GGCATTGAGT A/- ATCTGTAACT 2619 het 2619 ref 37 19 8 10 A 2 1 288244 CASAVA_Build 2 13133254 2I TAATCTCTGA --/GG GGGGGGGAAT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 G 7 9 288245 CASAVA_Build 2 13133832 1I GACATTACGT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 A 7 8 288246 CASAVA_Build 2 13134592 2D GGAGAAAACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 22 4 A 12 10 288247 CASAVA_Build 2 13135314 5I ATCTAAAAGA -----/TCTAT TCTATAGTCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 TCTAT 1 2 288248 CASAVA_Build 2 13136814 1I GTTAGATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 T 10 11 288249 CASAVA_Build 2 13147069 1I ACTAAACCAT -/A AAAAAACGTT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 6 7 288250 CASAVA_Build 2 13149407 1I GTAGTTATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 9 10 288251 CASAVA_Build 2 13150648 1I CTATAGATAG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 7 8 288252 CASAVA_Build 2 13151150 1D ATTCTATCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 21 24 3 A 10 9 288253 CASAVA_Build 2 13157937 1D ATTAGGATTA T/- TTTTTCCAGT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 6 5 288254 CASAVA_Build 2 13162962 4I ACACACACAC ----/ACAT ATATATATAT 3070 het 730 hom 18 6 11 1 ACAT 0 1 288255 CASAVA_Build 2 13164997 4D TAGAGAAAAA TACT/---- TACTTTCCAA 3070 het 3070 hom 29 13 16 0 TACT 2 1 288256 CASAVA_Build 2 13168414 1D TCAGTGCACG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 65 29 30 7 T 9 8 288257 CASAVA_Build 2 13170640 1D AAAGGACTGG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 8 7 288258 CASAVA_Build 2 13171885 1I TGACCTGGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 15 20 10 A 9 10 288259 CASAVA_Build 2 13173662 2I TCATTATTTT --/AC ATATATTGCT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 AC 0 1 288260 CASAVA_Build 2 13176204 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 686 het 686 ref 7 3 3 1 A 7 6 288261 CASAVA_Build 2 13181788 1I TTTTTTTTTC -/T TAAGTATTCC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 1 2 288262 CASAVA_Build 2 13193111 15I GAGGTCACAA ---------------/ATGAAAATGAGAAAC AAGGTATTGG 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 ATGAAAATGAGAAAC 0 1 288263 CASAVA_Build 2 13218934 1I AAAATCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2130 hom 39 11 13 15 A 17 18 288264 CASAVA_Build 2 13227367 1I CTTCCATACC -/T TCATAGGTCA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 1 2 288265 CASAVA_Build 2 13228078 1D ATGGAATGTT C/- TCCTGTGCTC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 1 0 288266 CASAVA_Build 2 13229413 1D AAATGCATTG T/- TTAGAAAATG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 3 2 288267 CASAVA_Build 2 13229789 1D CCTTAAATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 10 11 A 10 9 288268 CASAVA_Build 2 13230021 1I GAAACATTTG -/T TTTTACCTAT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 4 5 288269 CASAVA_Build 2 13231480 1I TATATTTCTC -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 7 8 288270 CASAVA_Build 2 13233282 8D TTCTCTCCTT CTCTGCCA/-------- CTCTGCCACT 3070 het 2579 hom 40 10 11 22 CTCTGCCA 3 2 288271 CASAVA_Build 2 13240463 1D GATATGCGGA C/- TGACGACATC 3070 het 3070 hom 35 12 15 10 C 1 0 288272 CASAVA_Build 2 13242805 1D ACAATTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 15 14 288273 CASAVA_Build 2 13247030 1I ACCTGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 10 11 288274 CASAVA_Build 2 13249601 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 2716 het 2670 hom 26 12 7 7 A 15 14 288275 CASAVA_Build 2 13256328 4I AATTAATGAG ----/TAAA TAAATGTAAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 TAAA 1 2 288276 CASAVA_Build 2 13257249 1I ATCAACAAAT -/A AAATTGGTTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 3 4 288277 CASAVA_Build 2 13258713 1I ACAGAATACC -/A AAAAAAAGAA 1962 het 1962 ref 20 15 5 0 A 7 8 288278 CASAVA_Build 2 13258980 1D AAAAATAGGT A/- AAAAATATAT 1929 het 1929 ref 22 17 5 0 A 6 5 288279 CASAVA_Build 2 13261432 2D CCATTTATTG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 11 9 288280 CASAVA_Build 2 13264446 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 A 9 8 288281 CASAVA_Build 2 13264934 1D AACAGCCTGC A/- GAACCATGAG 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 A 1 0 288282 CASAVA_Build 2 13265735 1I TATTTTTTTT -/A AAAAAGGGAA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 5 6 288283 CASAVA_Build 2 13271129 1I AAACAGAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2283 hom 25 5 17 3 A 9 10 288284 CASAVA_Build 2 13274340 1D ATCTTCAAAC A/- AAAAAATTCC 2301 het 2301 ref 15 9 5 1 A 7 6 288285 CASAVA_Build 2 13276042 2D TTCTGAGTGA AT/-- ATGTGTGAAC 3070 het 3070 hom 37 18 17 3 AT 2 1 288286 CASAVA_Build 2 13291654 1I ACCATTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 10 11 288287 CASAVA_Build 2 13295626 2D TCTTTTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 8 7 T 14 12 288288 CASAVA_Build 2 13297007 2I AGTAAAAGAC --/GG GGGGGGCTCT 2750 het 2750 ref 29 11 11 7 G 6 8 288289 CASAVA_Build 2 13307064 1I GTGTTAAACA -/T TTTTTTCATC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 6 7 288290 CASAVA_Build 2 13397451 1D CAGATAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 31 0 18 13 T 15 14 288291 CASAVA_Build 2 13449534 2D TTCTCAAGGT TC/-- TCTCTCTCCA 1851 het 1851 ref 46 39 6 1 TC 5 4 288292 CASAVA_Build 2 13452280 1D AAACTATGTT C/- AAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 54 33 18 3 C 1 0 288293 CASAVA_Build 2 13468725 2D CTAATATTAC AG/-- AGAGTCTATC 1275 het 1275 ref 38 34 3 3 AG 3 2 288294 CASAVA_Build 2 13503637 2I GGAATATATA --/TG TATGTATATA 1886 het 1886 ref 19 12 5 2 TG 0 1 288295 CASAVA_Build 2 13503800 4I AAGGAAAAAG ----/TGAT TAGTGCATAG 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 TGAT 0 1 288296 CASAVA_Build 2 13541409 1D CTAGAAAACT A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 8 7 288297 CASAVA_Build 2 13542528 1D TGGAATAAAT A/- AGTCATTGGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 1 288298 CASAVA_Build 2 13543631 6D ATGATATCTA AAATAT/------ CCTGCTCCAC 3070 hom 60 het 22 0 20 4 AAATAT 1 0 288299 CASAVA_Build 2 13547459 1D AGGCTGGGAA C/- CCTTGAAGCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 3 2 288300 CASAVA_Build 2 13552767 8I TGACAAAAAA --------/AACAAAAC AAAAAAAAAA 1679 hom 18 het 36 0 12 24 AACAAAAC 0 1 288301 CASAVA_Build 2 13552866 3I ACACACACAC ---/CTT CTCCTTATAG 3070 hom 99 het 35 0 33 2 CTT 0 1 288302 CASAVA_Build 2 13554586 7D CTTTGTGAAA GATTGCT/------- GTTGCCAAAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 GATTGCT 1 0 288303 CASAVA_Build 2 13555906 1I CCCTGAAGAT -/A ACCAAATTCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 288304 CASAVA_Build 2 13559831 1I GTTTTACAGT -/G CATTCTATCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 0 1 288305 CASAVA_Build 2 13565229 1I TTTTTTGAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 8 9 288306 CASAVA_Build 2 13568750 1D TAACCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 12 11 288307 CASAVA_Build 2 13579625 2D AAGAGAAGAG CT/-- CTCTGTTGCA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 CT 3 2 288308 CASAVA_Build 2 13587511 1D AGTCTTCAAC T/- TCTATGATCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 1 288309 CASAVA_Build 2 13588840 3I CATAAACTGT ---/TTG TGTTTTTTTT 2409 het 409 hom 9 2 5 2 TTG 0 1 288310 CASAVA_Build 2 13589114 4D TTTCTCTCTC TCTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 11 1 9 1 TCTT 1 0 288311 CASAVA_Build 2 13593930 4I CAGAAAATAA ----/TTTG TTTATTATGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TTTG 0 1 288312 CASAVA_Build 2 13599831 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 5 6 288313 CASAVA_Build 2 13600565 2D CAGGCAAGGT TA/-- TAGCACAGTG 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 TA 2 1 288314 CASAVA_Build 2 13601138 2D TAGAGGGAGT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 TC 1 0 288315 CASAVA_Build 2 13601883 1D TAAATAAAAG A/- GGCTTAATTG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 1 0 288316 CASAVA_Build 2 13604085 1D37M3D TTCAACATTC AAAAAACAATTAAGATTATACACTGTTTTAACAGGCTAAAG/-AAAAACAATTAAGATTATACACTGTTTTAACAGGCTA--- AAGAAGAATC 3070 het 3070 ref 47 40 21 4 N/A 0 0 288317 CASAVA_Build 2 13605118 1I TAACAAAGGC -/A AAAAAAAAAT 2300 het 2300 ref 29 20 6 3 A 9 10 288318 CASAVA_Build 2 13609693 1D TGAAAAAAAA T/- CTCAACATCA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 1 0 288319 CASAVA_Build 2 13613199 2D AGCGGTCAGA AC/-- ACACACCATT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AC 4 3 288320 CASAVA_Build 2 13620282 6I GAAAGAAGAG ------/AAAGAT AAAGGTAGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAAGAT 0 1 288321 CASAVA_Build 2 13631747 1I TTCTAAATTT -/G TACATTTCTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 0 1 288322 CASAVA_Build 2 13635083 3D CTTTCTGAAA CAT/--- CATACAAAGT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CAT 2 1 288323 CASAVA_Build 2 13635925 2D TTTTGAAAAC AT/-- ATGATAAGGT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 AT 2 1 288324 CASAVA_Build 2 13639929 6I ATTTTACAGG ------/TAATAT TAATATTAAA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 TAATAT 1 2 288325 CASAVA_Build 2 13641153 1I GGAAAAAAAA -/T ATGTAATCTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 288326 CASAVA_Build 2 13642008 5D GAAACCAACC AAAAA/----- AAAAAAAACC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 13 8 288327 CASAVA_Build 2 13643160 5D AATATTAGAA AGTTT/----- AGTTTAGATA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 AGTTT 2 1 288328 CASAVA_Build 2 13644877 1D TTCAAGACTT A/- TCTAGCCAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 A 1 0 288329 CASAVA_Build 2 13647299 1I GTCTGAAAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 9 10 288330 CASAVA_Build 2 13647721 1I TCTTTTTTTT -/C CTCTATTAGT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 2 288331 CASAVA_Build 2 13650378 1D CTCCATTGGC G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 32 het 24 0 13 11 G 8 7 288332 CASAVA_Build 2 13654722 2I CTTTTGAGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 12 14 288333 CASAVA_Build 2 13656451 1I AAAATTATCT -/A AAAAGAAATA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 4 5 288334 CASAVA_Build 2 13656724 1I TGTGAAATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 10 288335 CASAVA_Build 2 13658302 3D29M1D AGTGTTATTG AATAATAAGATACTTAAAAAAATTAAAAAGTTA/---AATAAGATACTTAAAAAAATTAAAAAGTT- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 32 2 39 4 N/A 0 0 288336 CASAVA_Build 2 13672032 1D TTGTTGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 11 10 288337 CASAVA_Build 2 13676659 1I AAGTTTCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 25 2 20 3 A 10 11 288338 CASAVA_Build 2 13679339 6D AAGGAAATCG ATAATA/------ ATAATAATAA 3070 hom 69 het 30 0 22 11 ATA 6 4 288339 CASAVA_Build 2 13681391 5D GAATAATAGA TAAAT/----- TAAAATGAAT 3070 hom 90 het 32 0 30 3 TAAAT 1 0 288340 CASAVA_Build 2 13683798 1D ACTCAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 A 13 12 288341 CASAVA_Build 2 13686191 2D CACTGTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 40 0 29 11 T 14 12 288342 CASAVA_Build 2 13703266 3D CAATTGTGTC CTG/--- CTGCAAAAGA 3070 hom 60 het 35 1 31 3 CTG 2 1 288343 CASAVA_Build 2 13705651 1I CAAGAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 595 hom 25 3 17 5 A 11 12 288344 CASAVA_Build 2 13707334 1D AGTTTGGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 34 0 22 12 A 12 11 288345 CASAVA_Build 2 13713903 1D ACTTTACCAG A/- ATAAAGATAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 2 1 288346 CASAVA_Build 2 13719965 1D TTTTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 33 2 25 7 T 13 12 288347 CASAVA_Build 2 13726270 5I57M4I AAAGTGAAAA -----TAGTAAAAAAATTTCAAAATTTAATAGTTAAATTTTTTTTGAGAATAAAGAAAACTT----/GAAACTAGTAAAAAAATTTCAAAATTTAATAGTTAAATTTTTTTTGAGAATAAAGAAAACTTAGAC AACCAAACAT 3070 hom 72 het 15 0 25 1 N/A 0 0 288348 CASAVA_Build 2 13726572 4D AAAGTGAAAT AAAG/---- ATTTTCTCAA 3070 hom 63 het 22 0 22 1 AAAG 1 0 288349 CASAVA_Build 2 13726791 1D ACCCATTCCT C/- CCACTTCTTG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 C 3 2 288350 CASAVA_Build 2 13734800 1D GGTTATTGGT A/- GAATAAAAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 0 288351 CASAVA_Build 2 13737830 1D CTATCATCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 9 288352 CASAVA_Build 2 13740225 1D CATTTTTCTT C/- CACCTGCCTA 3070 hom 103 het 40 0 31 11 C 2 1 288353 CASAVA_Build 2 13742667 1I GGAAAAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 24 0 19 5 T 12 13 288354 CASAVA_Build 2 13743438 2I TCTCTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TC 8 9 288355 CASAVA_Build 2 13746963 1I GATACACGAC -/T TTGAAATCTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 3 288356 CASAVA_Build 2 13751695 1I ATAAATATGT -/A ATAATAAACA 1554 hom 10 het 4 0 4 0 A 1 2 288357 CASAVA_Build 2 13754871 1I AAGCCCCATT -/A TATAGCCAAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 0 1 288358 CASAVA_Build 2 13756290 13D TATGAGTTTT GCATTAAATAACA/------------- GATTGTCTTT 3070 hom 144 het 53 0 49 7 GCATTAAATAACA 1 0 288359 CASAVA_Build 2 13757385 2I GTGGTCAGGA --/CT CTCTGCCATA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CT 2 3 288360 CASAVA_Build 2 13766265 1D AGCCATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 39 1 26 12 A 13 12 288361 CASAVA_Build 2 13769122 2D AAATGTAGAC TT/-- TTTTTCTTCT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 7 5 288362 CASAVA_Build 2 13771825 1D CAACTTCACC A/- AGAGGTTTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 2 1 288363 CASAVA_Build 2 13773686 2I TGGATTGGCC --/CA CAGACCACAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 CA 1 2 288364 CASAVA_Build 2 13776030 1I TTAGGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1284 hom 24 3 17 4 T 10 11 288365 CASAVA_Build 2 13786831 1I GCCAAAAAAA -/G AAATGCAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 0 1 288366 CASAVA_Build 2 13804726 1D CAAGAGCTCC T/- TAAGGAAGCA 3070 hom 27 het 10 0 10 1 T 2 1 288367 CASAVA_Build 2 13808325 4I ATAATAATTA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 AAAT 3 4 288368 CASAVA_Build 2 13810024 1D TGGAGAGAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 9 288369 CASAVA_Build 2 13810172 1D AATGTTCCCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 27 0 25 3 T 9 8 288370 CASAVA_Build 2 13810400 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 24 1 23 0 T 11 10 288371 CASAVA_Build 2 13812145 4I TTACTAAATA ----/TAAG TAAGTTACTA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TAAG 1 2 288372 CASAVA_Build 2 13815400 4I70M4I TCCAAATATT ----ATCAATCACATTAGGGGATAGATTTTAACACATGATTTTGGGGGGAACACATTCAGTCCATAACATTTCT----/ATCAATCAATCACATTAGGGGATAGATTTTAACACATGATTTTGGGGGGAACACATTCAGTCCATAACATTTCTTGAG TGAGTCTTCT 3070 hom 152 het 38 0 50 8 N/A 0 0 288373 CASAVA_Build 2 13818000 4I CCAGGACCAG ----/AGAC AGACAGACAG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 AGAC 2 3 288374 CASAVA_Build 2 13818705 1I CAAATGAACA -/T TTTTGAAGTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 4 5 288375 CASAVA_Build 2 13820074 1D AATAAAATAT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 7 6 288376 CASAVA_Build 2 13822301 5I GCTGTGTCTA -----/TTCTT GTTAAGCAAG 3070 hom 108 het 38 0 35 3 TTCTT 0 1 288377 CASAVA_Build 2 13823191 3D CACTTAAAAT TGG/--- TGGTGGATTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TGG 3 2 288378 CASAVA_Build 2 13824614 4I AGGCCTCAAC ----/TTAA TTAGTTCCAC 3070 hom 129 het 51 0 44 8 TTAA 0 1 288379 CASAVA_Build 2 13844958 1D TCTTTTTTTT G/- GGGGGGGGAA 2381 het 2319 hom 17 7 7 3 G 9 8 288380 CASAVA_Build 2 13845673 1I ATGGCATCTG -/A GAATTGAGTT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 A 0 1 288381 CASAVA_Build 2 13853277 1I TTCATTTATC -/T TTTTTTTTTT 2848 hom 15 het 8 0 6 2 T 11 12 288382 CASAVA_Build 2 13855596 3D GCTCCAGAAT TTC/--- TTCTTGATTC 2851 het 2851 ref 28 19 8 2 TTC 2 1 288383 CASAVA_Build 2 13857497 1D TCTGAAAAAA T/- AACACTAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 0 288384 CASAVA_Build 2 13858080 1I TCTCCATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 10 11 288385 CASAVA_Build 2 13880216 1D AGAGGCTTTT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 A 8 7 288386 CASAVA_Build 2 13881257 10I ATCATATTTA ----------/ATATTAGAAT ATACATTTCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 ATATTAGAAT 0 1 288387 CASAVA_Build 2 13890563 1D GGGCAGGGGT G/- GGGGGAGGGA 2448 het 471 hom 14 5 7 3 G 6 5 288388 CASAVA_Build 2 13895814 1I GAGCTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 21 18 6 T 11 12 288389 CASAVA_Build 2 13903028 1I AACTCATAAC -/T TTTGTAATGT 3070 het 3070 ref 53 25 24 4 T 3 4 288390 CASAVA_Build 2 13920279 10I CATTTTATTT ----------/TTTAATTGAG TTTGTATATA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 TTTAATTGAG 0 1 288391 CASAVA_Build 2 13924734 1I TTTTAATCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2825 hom 30 8 16 6 T 9 10 288392 CASAVA_Build 2 13926053 4D AAAAATAAAA AAAT/---- AAATAAAGAA 799 het 651 hom 5 2 3 0 AAAT 2 1 288393 CASAVA_Build 2 13936048 2D CAATTCCCCC CT/-- GTCTTTGAGC 3070 het 3070 ref 45 25 20 1 CT 1 0 288394 CASAVA_Build 2 13937499 1D ATATTATGAC A/- AAAAACAGAG 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 A 6 5 288395 CASAVA_Build 2 13949333 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTTGGT 2990 het 2990 ref 18 7 8 3 T 7 8 288396 CASAVA_Build 2 13950728 3D CCAAAGTTTC TGT/--- TGTTATTTAT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 TGT 2 1 288397 CASAVA_Build 2 13953710 1D CCACAATAAC A/- AATACCTCCT 3070 het 3070 ref 48 22 19 8 A 3 2 288398 CASAVA_Build 2 13955087 1D ACAATTCCAG A/- AGCCTAGGAG 3070 het 3070 hom 28 15 10 3 A 2 1 288399 CASAVA_Build 2 13957688 3D GCAAAAAAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 25 11 10 7 AAC 4 3 288400 CASAVA_Build 2 13958827 1I AGAGCCAATT -/A AAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 A 6 7 288401 CASAVA_Build 2 13976185 1D AGGAAACATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 A 10 9 288402 CASAVA_Build 2 13976299 1D ACAGAAACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 10 9 288403 CASAVA_Build 2 14015276 1I CGGGCGCGGA -/G GCTTATGCCC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 1 2 288404 CASAVA_Build 2 14029652 1D TTAGAGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 33 1 24 8 A 13 12 288405 CASAVA_Build 2 14034603 1I GTAAACAAGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 8 9 288406 CASAVA_Build 2 14041392 1D GGTAACAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2313 hom 38 8 16 14 T 17 16 288407 CASAVA_Build 2 14066335 1D CTCTTCACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 T 11 10 288408 CASAVA_Build 2 14116144 1D AAACAACTAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 9 288409 CASAVA_Build 2 14118590 2D GTTGTGTTGT TA/-- TATATATATA 1081 het 1081 ref 24 16 3 5 TA 9 8 288410 CASAVA_Build 2 14126124 2I TGAAGCTTTT --/AA AAAATGAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 4 6 288411 CASAVA_Build 2 14135080 1D GACTCTCAGA C/- CCCAGAGACT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 C 4 3 288412 CASAVA_Build 2 14137325 3D ATAAGTAAAC ATA/--- ATATCACCCA 3070 het 3070 ref 44 25 17 4 ATA 2 1 288413 CASAVA_Build 2 14150391 4I GGAGGGAGGG ----/AGGA AGGAAGGGAG 2066 het 2066 ref 38 12 9 17 AGGA 1 2 288414 CASAVA_Build 2 14202058 1D CCTGTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 1470 het 1470 ref 41 18 6 17 T 17 16 288415 CASAVA_Build 2 14207332 1D AAATTCTTCC A/- AAAAAAAAAA 1895 het 1895 ref 37 22 6 9 A 15 14 288416 CASAVA_Build 2 14213348 1I TTTAGCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 792 hom 35 2 24 9 A 10 11 288417 CASAVA_Build 2 14221414 17D GGTGCTGAGC TTAAATTCCAATAGTGT/----------------- TTCAACCCTT 3070 het 3070 ref 36 31 11 3 TTAAATTCCAATAGTGT 1 0 288418 CASAVA_Build 2 14224033 1D ATTTTTTGTC T/- TTTTTAACTT 3070 het 3070 hom 35 18 16 2 T 6 5 288419 CASAVA_Build 2 14224110 6I AACGTTAGAG ------/CAATAA CAATAAGTTC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 CAATAA 1 2 288420 CASAVA_Build 2 14225850 5I ATTTTGGCTT -----/TTGTA TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 TTGTA 0 1 288421 CASAVA_Build 2 14228694 3I AAAAAACCTA ---/TCT TCTTATTTTA 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 TCT 1 2 288422 CASAVA_Build 2 14229088 2D AAAAACCTAT AA/-- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 4 A 9 7 288423 CASAVA_Build 2 14229273 9I ACAGATTTAT ---------/ACATAATTA ACCAAAAATG 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 ACATAATTA 0 1 288424 CASAVA_Build 2 14229468 1I21M4D TCTCCAAAAA -AATCATATAATTTAATCTTTCTTTT/CAATCATATAATTTAATCTTTC---- TATCTTCTTT 3070 het 3070 hom 23 9 17 8 N/A 0 0 288425 CASAVA_Build 2 14229638 1D TCTCACTGAA C/- AGAATCTTCC 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 C 1 0 288426 CASAVA_Build 2 14231758 3D TGCTTTAAAA ATT/--- ATTTTAGAAT 2644 het 2644 ref 16 10 6 0 ATT 2 1 288427 CASAVA_Build 2 14238779 5D39M1I AATATATTAC ATATTATATCATTGAATTCTATTATGTAATAGAAAAAATATTAG-/-----ATATCACTGAATTCTATTATGTAATAGAAAAAATATTAGA AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 26 20 17 1 N/A 0 0 288428 CASAVA_Build 2 14243842 2I TCAAAAGTGA --/AG AGAGTTATTC 3070 het 3070 hom 54 24 26 4 AG 2 3 288429 CASAVA_Build 2 14250477 1I TGCCGGGAGG -/T TGTTTGGCAA 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 1 2 288430 CASAVA_Build 2 14251331 1I GACCCGTGTA -/G GGCCATATTG 3070 hom 86 het 33 0 28 5 G 2 3 288431 CASAVA_Build 2 14278912 1D AATAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1445 het 1445 ref 36 23 6 7 T 13 12 288432 CASAVA_Build 2 14301096 4D TTAGTCACAC CATT/---- CAAACACCCC 3070 het 3070 ref 35 15 16 6 CATT 1 0 288433 CASAVA_Build 2 14309059 2I ATTTTGTCAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 11 13 288434 CASAVA_Build 2 14316041 1D ATCTAACCCA G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 G 1 0 288435 CASAVA_Build 2 14319748 1D GGGTACAGAG A/- GACTTTGTGT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 A 1 0 288436 CASAVA_Build 2 14320007 8I AAAGCAACAT --------/GTTCTCAG GTTCTCAGAG 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 GTTCTCAG 1 2 288437 CASAVA_Build 2 14322243 1D TGGAGGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 10 11 A 13 12 288438 CASAVA_Build 2 14323187 5I ATATGTTACA -----/TATAT TATATTATAT 2281 het 690 hom 10 2 6 2 TATAT 2 3 288439 CASAVA_Build 2 14324895 2D TTATCTGCTT TA/-- TATATATTCA 3070 het 3070 ref 29 14 11 6 TA 4 3 288440 CASAVA_Build 2 14325779 1I AAGAAGAATA -/C TTTTTATAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 C 0 1 288441 CASAVA_Build 2 14326031 1D AAAGGGAAAG A/- GAGACTTCAT 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 A 1 0 288442 CASAVA_Build 2 14326364 6I CAGAGCATAT ------/TTTTTC TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 TTTTTC 0 1 288443 CASAVA_Build 2 14327769 1D TCCGGTCAGA G/- GGGAGGTTAT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 G 4 3 288444 CASAVA_Build 2 14328637 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2931 het 2931 ref 20 10 7 4 A 9 8 288445 CASAVA_Build 2 14328800 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 10 11 288446 CASAVA_Build 2 14333519 2I AGTACACATG --/TA TATGGCATTT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 TA 1 2 288447 CASAVA_Build 2 14338439 3D ACACATATGT ATG/--- ATAAGTAAAT 3070 het 3070 ref 57 28 12 19 ATG 1 0 288448 CASAVA_Build 2 14341830 1D TTTATGGAAA T/- AATAAATTCT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 1 0 288449 CASAVA_Build 2 14345879 1I ACCTGTCTAG -/C CACTCCAGAA 3070 het 3070 ref 43 15 15 13 C 1 2 288450 CASAVA_Build 2 14383178 3D AAAGAAAGGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 529 hom 37 5 14 20 A 14 11 288451 CASAVA_Build 2 14394966 1I TTTATTTGAG -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 6 7 288452 CASAVA_Build 2 14401133 3I GCATTGTTCA ---/TAG TAGTTAAGAT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TAG 1 2 288453 CASAVA_Build 2 14404210 1D AGTCTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 13 12 288454 CASAVA_Build 2 14406653 3I AGTAGGTATT ---/TTA TTATCAATAA 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 TTA 1 2 288455 CASAVA_Build 2 14412815 19I TGGACAGATT -------------------/CTAGGTTAAAATAACAAAA CTGTATATCA 3070 het 3070 hom 56 19 31 9 CTAGGTTAAAATAACAAAA 0 1 288456 CASAVA_Build 2 14414179 12D AGACACCTGA CAAAGGCTACCT/------------ CAACCAAGTG 3070 het 3070 ref 45 30 14 5 CAAAGGCTACCT 1 0 288457 CASAVA_Build 2 14423985 1I ACCCACGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 T 10 11 288458 CASAVA_Build 2 14425204 1D AATAAGATAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 A 10 9 288459 CASAVA_Build 2 14426340 1I TCAGTGCACA -/T AATAAAATAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 0 1 288460 CASAVA_Build 2 14445554 21I CTTTCTCTCA ---------------------/TCTCTTTCTTTCCTCTCTCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 46 30 17 0 TCTCTTTCTTTCCTCTCTCTC 0 1 288461 CASAVA_Build 2 14445884 1D AAATATCTTG A/- AAGCAGAAGG 3070 het 3070 hom 42 21 19 2 A 3 2 288462 CASAVA_Build 2 14446236 5D GTAAAAAAAA AATAG/----- ATAAATAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 3 AATAG 1 0 288463 CASAVA_Build 2 14446929 1D ATTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 23 5 10 8 A 12 11 288464 CASAVA_Build 2 14447925 5D11M2D CAGAAGAAAT AAAACAAAATGAGAACAA/-----AAAATGAGAAC-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 N/A 0 0 288465 CASAVA_Build 2 14453613 1I ATAAAAAAAA -/T ACATATAAAA 2593 het 1559 hom 12 6 6 0 T 0 1 288466 CASAVA_Build 2 14453679 1D TTCTCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 1928 het 1928 ref 20 12 4 5 A 12 11 288467 CASAVA_Build 2 14453925 2I GTTATATACA --/TT TTATATATAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 2 4 288468 CASAVA_Build 2 14461961 4I CATAATGGTT ----/AATA TATATTTTTT 3070 hom 75 het 35 0 26 9 AATA 0 1 288469 CASAVA_Build 2 14468543 3I ATTCGAACTG ---/AAC AACAACAATG 2401 het 2401 ref 30 21 5 4 AAC 2 3 288470 CASAVA_Build 2 14477034 3D TCTCTATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1717 hom 29 6 17 7 A 15 12 288471 CASAVA_Build 2 14484966 1D TCTGCACCGG A/- AAAAAAAAAA 1776 het 1776 ref 45 31 4 10 A 11 10 288472 CASAVA_Build 2 14489253 1I GCTGAGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 11 12 288473 CASAVA_Build 2 14495826 29I CAAAGAAAAT -----------------------------/GAAATTGGGCTATTTTATTACTAACCCCA GAATGAGAAT 3070 hom 93 het 31 0 31 3 GAAATTGGGCTATTTTATTACTAACCCCA 0 1 288474 CASAVA_Build 2 14505672 1I TTGACTTCTA -/T GAATGACATA 3070 hom 135 het 53 0 44 9 T 0 1 288475 CASAVA_Build 2 14516286 1I ACAATGTTTT -/C CCCCCAGTAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 5 6 288476 CASAVA_Build 2 14523027 1D TTTAATTGCT A/- TTTTTAATTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 0 288477 CASAVA_Build 2 14523796 3I TTGCCAGTGA ---/AAT AATTAGAGCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAT 1 2 288478 CASAVA_Build 2 14529103 2D AAATTAACTC TT/-- GGTGTCATTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 0 288479 CASAVA_Build 2 14530012 2I CTCCAATTCA --/AC AGTGTTGAGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AC 0 1 288480 CASAVA_Build 2 14531554 1D ACAGAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 25 0 21 4 A 11 10 288481 CASAVA_Build 2 14539674 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 21 0 16 5 A 12 11 288482 CASAVA_Build 2 14540658 1D CAGGAGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 T 12 11 288483 CASAVA_Build 2 14541326 10D AAGACAAAAA ACACATGATT/---------- ATCTCAATAG 3070 hom 102 het 36 0 35 4 ACACATGATT 1 0 288484 CASAVA_Build 2 14545863 2D GAAGAGCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 38 1 29 11 A 12 10 288485 CASAVA_Build 2 14566223 2D CTGATTAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 843 hom 47 7 18 23 A 14 12 288486 CASAVA_Build 2 14587687 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1762 hom 11 het 7 0 4 3 T 13 14 288487 CASAVA_Build 2 14589994 1D CAGCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 953 het 953 ref 24 16 4 4 A 12 11 288488 CASAVA_Build 2 14620965 5I AAGGATTCCC -----/AGGAA AGGTTCTATC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AGGAA 0 1 288489 CASAVA_Build 2 14621572 1I GTTTCATCTA -/C CCCCTCTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 C 4 5 288490 CASAVA_Build 2 14687032 1D AACCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 A 13 12 288491 CASAVA_Build 2 14728846 1D CTTAGTAGTC T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 T 7 6 288492 CASAVA_Build 2 14735340 1D CTGTAGCTAC A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 A 8 7 288493 CASAVA_Build 2 14752582 8D AGATAAAAGT AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGTA 3070 het 3070 hom 32 16 16 1 AAAG 4 2 288494 CASAVA_Build 2 14772871 1I AGACATTTCT -/C CGAATGAGAA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 1 2 288495 CASAVA_Build 2 14776029 1D CACTCTTTTT C/- CCGTAACTTG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 3 2 288496 CASAVA_Build 2 14783727 1D ATTATAAAAC T/- TTGATTGAAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 3 2 288497 CASAVA_Build 2 14787307 1I AAAAAATATT -/A AAATTTAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 288498 CASAVA_Build 2 14814615 1D TACACAAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 T 10 9 288499 CASAVA_Build 2 14820158 3I GAAAAACAAA ---/TCT TCTTGAAAAC 3070 hom 150 het 53 0 49 4 TCT 1 2 288500 CASAVA_Build 2 14822202 1D AATTATTGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 10 9 288501 CASAVA_Build 2 14830776 1I TTTTTTGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 10 288502 CASAVA_Build 2 14832933 1I TTTTTTCTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 9 10 288503 CASAVA_Build 2 14855240 1D GCCCGGCCTC T/- TTGCTCACAC 3070 hom 78 het 33 0 25 10 T 3 2 288504 CASAVA_Build 2 14879633 6D AATGTAACAT CCAAAA/------ TGACACCCAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 CCAAAA 1 0 288505 CASAVA_Build 2 14891276 7D AGAAAAAGCC TTGGACT/------- GGGAGGTAGG 3070 het 3070 ref 37 18 16 7 TTGGACT 1 0 288506 CASAVA_Build 2 14896776 1I AATAGAAATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 A 8 9 288507 CASAVA_Build 2 14898972 4I CTAAAGAGAC ----/AAAG AAGAGCCAAC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 AAAG 0 1 288508 CASAVA_Build 2 14899076 5D AACTGGAAAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 495 hom 26 5 14 10 A 15 10 288509 CASAVA_Build 2 14904094 1I27M4I GTAAGTACAC -AAAAAACTATATAATATGATAAAACTG----/AAAAAAACTATATAATATGATAAAACTGTAGC TAGCTGTGGT 3070 het 3070 ref 32 19 11 8 N/A 0 0 288510 CASAVA_Build 2 14914441 1I TCCAAATTGG -/A AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 A 6 7 288511 CASAVA_Build 2 14916210 1I CATGGAGATA -/G ACAGTAGAAG 3070 het 3070 ref 54 28 25 1 G 0 1 288512 CASAVA_Build 2 14919355 2D ATATCAGCGT CA/-- CTCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 CA 1 0 288513 CASAVA_Build 2 14931263 1I GATGTTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 974 hom 23 4 17 2 A 14 15 288514 CASAVA_Build 2 14931419 1D TTGCATTACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 4 hom 31 1 26 5 T 10 9 288515 CASAVA_Build 2 14935266 1D CAGAGTCTCA C/- TTTTTACTAA 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 C 1 0 288516 CASAVA_Build 2 14948428 2D ACAAACAACA AC/-- AAAAAAAAAC 660 het 660 ref 27 12 5 10 AC 1 0 288517 CASAVA_Build 2 14950246 1D CAATATGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 11 10 288518 CASAVA_Build 2 14952744 1I CAGGTGTATA -/G AAGAGAGGGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 0 1 288519 CASAVA_Build 2 14953581 2I TATAAAGGGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 62 het 25 0 20 5 A 9 11 288520 CASAVA_Build 2 14954652 1D TTTTTTTTTT C/- CATCATTTTA 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 C 2 1 288521 CASAVA_Build 2 14956933 4D ACCTTTTCAC TAAA/---- TAAATGTCAA 3070 het 3070 ref 50 27 18 7 TAAA 2 1 288522 CASAVA_Build 2 14959016 1D AGGTAATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 24 2 20 2 A 11 10 288523 CASAVA_Build 2 14960910 6I TGCAAAAAAA ------/AAAAAG AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 AAAAAG 0 1 288524 CASAVA_Build 2 14962477 2D ACAAAAAATT AG/-- CCAGGCGCAG 2096 hom 12 het 5 0 5 0 AG 1 0 288525 CASAVA_Build 2 14970278 17D CATTCATTTT TAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAG 3070 het 1070 hom 24 7 13 8 TAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 288526 CASAVA_Build 2 14974157 2D GCTTTCAGTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 43 13 24 8 AT 6 5 288527 CASAVA_Build 2 14980771 1I57M3D AGTGGTTCTC -CGTTCATTCATTCTTTCATTCAGTTATTCATTACTATAAGTCAATGTTGTGCCAAGCTCT/TCTTTCATTCATTCTTTCATTCAGTTATTCATTACTATAAGTCAATGTTGTGCCAAGC--- TCTTTGGCTG 3070 het 3070 ref 37 27 12 12 N/A 0 0 288528 CASAVA_Build 2 14984060 1D CATTTCAGCT G/- GTACTTGTGT 3070 het 3070 hom 44 19 22 4 G 2 1 288529 CASAVA_Build 2 14986950 5D CAGTATATTA TGTTT/----- TGTTTTGTTT 2776 het 2776 ref 27 10 8 9 TGTTT 4 3 288530 CASAVA_Build 2 15004560 5D AAATGAAAAT ATAAC/----- ATACCAAATC 2974 het 2974 ref 22 12 9 6 ATAAC 1 0 288531 CASAVA_Build 2 15006307 1I ACAGAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 9 10 288532 CASAVA_Build 2 15023347 1I GCAAAATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 10 11 288533 CASAVA_Build 2 15027119 1I ACGCGGCTAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 2335 hom 18 6 10 2 T 7 8 288534 CASAVA_Build 2 15048852 1D ATTATAATTT A/- AAAAAAAAAC 2507 het 2507 ref 20 9 8 3 A 10 9 288535 CASAVA_Build 2 15055029 1D CCTGTGCTTG T/- TTTTTTTTTT 2795 het 2795 ref 43 21 10 12 T 15 14 288536 CASAVA_Build 2 15074191 1I AAAATAGGAG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 7 8 288537 CASAVA_Build 2 15075094 2I GGTGTTGCTC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 9 11 288538 CASAVA_Build 2 15079239 1I TTCTTGGAAG -/A AGCAGATTTG 3070 hom 117 het 45 0 37 8 A 1 2 288539 CASAVA_Build 2 15081364 12D GTCAACTTGT AAGAGATCTTTG/------------ AATATTAAAA 3070 hom 69 het 23 0 24 3 AAGAGATCTTTG 1 0 288540 CASAVA_Build 2 15081800 1I CATGCAGTAT -/A TGGTTTTCTG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 0 1 288541 CASAVA_Build 2 15081864 2D ATGTTCCTGC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 23 0 17 9 A 11 9 288542 CASAVA_Build 2 15085025 5D ATATCAAATT AGAGA/----- AAAGTCATTA 3070 hom 108 het 37 0 37 4 AGAGA 1 0 288543 CASAVA_Build 2 15090989 7D AAGACTTCAA ACTTTAG/------- ACTTTAGAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 ACTTTAG 2 1 288544 CASAVA_Build 2 15092771 2I TAATTTACAC --/AT ATAAATGTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AT 1 2 288545 CASAVA_Build 2 15093580 5D CCCCAGAACT TAAAA/----- TAAAGTATGC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TAAAA 1 0 288546 CASAVA_Build 2 15095006 1I CCCGCAAGGC -/G GGGGTACTAC 3070 hom 79 het 29 0 19 10 G 4 5 288547 CASAVA_Build 2 15096290 4I CAGCAGTAGC ----/CTAA CTATTTCCAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CTAA 0 1 288548 CASAVA_Build 2 15105610 1D7M1D GGCTAGTGGA GAACTCCTG/-ATCTTCT- CTGGGCCGAG 3070 hom 91 het 32 0 30 2 N/A 0 0 288549 CASAVA_Build 2 15106702 1D TTTTTCCAAA C/- CTGGGGTGAT 3070 hom 81 het 32 0 21 11 C 2 1 288550 CASAVA_Build 2 15111517 1D CCTCCTTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 37 8 14 17 A 12 11 288551 CASAVA_Build 2 15114409 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2544 het 85 hom 24 3 12 9 T 15 14 288552 CASAVA_Build 2 15114969 1D CTTTGATACC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 10 9 288553 CASAVA_Build 2 15129200 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2191 het 627 hom 18 5 9 4 A 17 16 288554 CASAVA_Build 2 15134346 1I TGTGCAGGCA -/G CTGTCTGTCT 3070 het 3070 ref 60 30 21 9 G 0 1 288555 CASAVA_Build 2 15148869 20I ACTTCATACA --------------------/GTTGACCCTCGAACAACACG GTTTGAACTG 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 GTTGACCCTCGAACAACACG 0 1 288556 CASAVA_Build 2 15151304 1D GGTAAAATAA T/- ATGAAGTCAT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 1 0 288557 CASAVA_Build 2 15170337 24I ATATAAACCG ------------------------/AAGATTTTATATTCAGTAAAATTA AATTTCAAGT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 AAGATTTTATATTCAGTAAAATTA 0 1 288558 CASAVA_Build 2 15174069 1I CGGATTAGGG -/A ATCCCCCTTA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 A 1 2 288559 CASAVA_Build 2 15179306 1D ACAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 286 hom 41 2 38 1 T 14 13 288560 CASAVA_Build 2 15190440 1I CAAACACACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 30 1 20 9 A 11 12 288561 CASAVA_Build 2 15208557 1I GTAAGAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 8 9 288562 CASAVA_Build 2 15217034 2I GGACCAGCAC --/AT GTTACAACAT 3070 hom 126 het 57 0 42 15 AT 0 1 288563 CASAVA_Build 2 15236522 1D TTGAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 42 2 34 6 A 13 12 288564 CASAVA_Build 2 15247139 5D CTCATGAGAC CCAGT/----- CCATGAGCTC 3070 hom 162 het 61 0 54 12 CCAGT 1 0 288565 CASAVA_Build 2 15254413 4D TTGTTCGTTT AAAG/---- AAAGAAACAT 3070 hom 99 het 35 0 33 3 AAAG 2 1 288566 CASAVA_Build 2 15263054 1I TGAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 233 hom 40 1 24 15 A 10 11 288567 CASAVA_Build 2 15265603 2D GAGCACCCAG AT/-- ATATATAAAG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 AT 4 3 288568 CASAVA_Build 2 15270444 4I ATTGTGAGTC ----/AATT AAACCTCTTT 3070 hom 61 het 24 0 20 4 AATT 0 1 288569 CASAVA_Build 2 15287357 1D AACTCCACGT A/- AAAAAAAAAA 1379 het 1379 ref 33 27 3 4 A 12 11 288570 CASAVA_Build 2 15290434 1I CCAGTTGAAG -/T TTTTTTTTTT 1085 het 1085 ref 32 19 5 8 T 15 16 288571 CASAVA_Build 2 15296274 4I TAAAAAAAAG ----/AATT AATAGTGAGA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AATT 0 1 288572 CASAVA_Build 2 15301153 1D TCAGGCAATG A/- AAAAAAAAAA 1783 het 1783 ref 35 21 6 8 A 13 12 288573 CASAVA_Build 2 15317528 4I AGTATCTGGC ----/TTTA TTTCTCTTTG 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 TTTA 0 1 288574 CASAVA_Build 2 15318392 2D ATTATTATAC AT/-- ATATATACAC 3070 het 3070 hom 44 20 20 6 AT 4 3 288575 CASAVA_Build 2 15321273 1D CTCATCAGTT A/- AAGACTCAGC 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 3 2 288576 CASAVA_Build 2 15334732 2D ATTAAAGTGA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 10 8 288577 CASAVA_Build 2 15351227 1I CAAATTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 17 24 10 A 10 11 288578 CASAVA_Build 2 15351488 1D ACTATATTTA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 56 28 24 6 T 7 6 288579 CASAVA_Build 2 15391772 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 19 6 T 11 10 288580 CASAVA_Build 2 15393668 1D TCCTCATTTC A/- AAAAAAAAAA 1927 het 1927 ref 35 20 7 9 A 15 14 288581 CASAVA_Build 2 15397500 1D GGCAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 42 28 3 11 A 12 11 288582 CASAVA_Build 2 15419945 3D TAGCTGGGCA TGG/--- TGGTACATGC 3070 hom 44 het 18 0 13 5 TGG 2 1 288583 CASAVA_Build 2 15430970 1I CAACAGCGTG -/A ATCATGGCTT 3070 hom 93 het 37 0 30 7 A 1 2 288584 CASAVA_Build 2 15436772 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 23 1 18 4 T 11 12 288585 CASAVA_Build 2 15438157 2D41M4D AAAACAAGAG ACACTGAAGGTATTCATACAAATATCATTGTACTCTACTAGACAACT/--ACTGAAGGTATTCATACAAATATCATTGTACTCTACTAGAC---- AACAACATCA 3070 hom 57 het 23 0 20 19 N/A 0 0 288586 CASAVA_Build 2 15438507 1I TAGACAAGTC -/T TTGGTAAGAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 2 3 288587 CASAVA_Build 2 15438849 7I GCCACTGAAC -------/TTTCAAA TTATTTTCCA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTTCAAA 0 1 288588 CASAVA_Build 2 15439679 2D ACAAACGGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AT 6 5 288589 CASAVA_Build 2 15440759 1D TTGTTAAATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 41 0 36 6 A 9 8 288590 CASAVA_Build 2 15442100 1D TATGAAAAGA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 10 9 288591 CASAVA_Build 2 15442566 2D ACAGCAAAAA AT/-- ATAGTCTTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AT 2 1 288592 CASAVA_Build 2 15443080 2D CTTTTTAAGA AT/-- ATATTCAGTA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 AT 3 2 288593 CASAVA_Build 2 15446141 4D TTTGAAAAAC TGTT/---- TGGCAGAATC 3070 hom 129 het 45 0 44 6 TGTT 1 0 288594 CASAVA_Build 2 15448181 4I CTCCTGCCAC ----/ACAA ACAAACAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 ACAA 2 3 288595 CASAVA_Build 2 15448952 1I CTCTTAGAGA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 3 288596 CASAVA_Build 2 15449597 1I CTAGCACTAC -/A CAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 0 1 288597 CASAVA_Build 2 15454314 1I GCTTAAAGGT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 7 8 288598 CASAVA_Build 2 15456192 4D ATTAAATGAG TGAT/---- TGCTCATTTC 3070 hom 66 het 27 0 23 5 TGAT 1 0 288599 CASAVA_Build 2 15457380 1D AATCTTCTTT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 8 7 288600 CASAVA_Build 2 15461484 1D GTCTATACAC T/- TTTTTTTTTT 2848 het 176 hom 23 4 7 12 T 13 12 288601 CASAVA_Build 2 15482738 1I GTTTAAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 32 1 22 9 A 10 11 288602 CASAVA_Build 2 15486613 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1728 hom 33 4 19 10 A 14 15 288603 CASAVA_Build 2 15503486 1I CTCGGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 24 1 21 2 A 10 11 288604 CASAVA_Build 2 15504462 1I CACTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 24 1 18 5 A 11 12 288605 CASAVA_Build 2 15507167 1I CCCTGAACCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 T 8 9 288606 CASAVA_Build 2 15512504 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCACTC 3070 hom 66 het 23 0 22 1 AG 1 2 288607 CASAVA_Build 2 15513385 1D CAGACAACTG T/- TCAAAATACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 1 288608 CASAVA_Build 2 15514473 1I TAGGAGTAAG -/T GCTATGAAGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 0 1 288609 CASAVA_Build 2 15516455 1I GAAAACAAGC -/G TAACTTAAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 0 1 288610 CASAVA_Build 2 15517582 4I14M2D AGACCAGAAA ----TAAGTGCCAAATACAT/TAAGTAAGTGCCAAATAC-- AGTAATTACT 3070 hom 120 het 34 0 41 2 N/A 0 0 288611 CASAVA_Build 2 15518739 1I TATCAATATA -/T AAAAAGAAGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 1 288612 CASAVA_Build 2 15525723 4I TTCAAATGGT ----/AATA AGTGTCAGTC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 AATA 0 1 288613 CASAVA_Build 2 15535616 30I CAGGAGAGCC ------------------------------/ATGCTGCATACATACCCTAGGCTCTGACCT AGCTTTTAGG 3070 hom 105 het 36 0 34 6 ATGCTGCATACATACCCTAGGCTCTGACCT 0 1 288614 CASAVA_Build 2 15547679 1D TATTGGGGTC A/- AATACTAGCT 3070 hom 111 het 45 0 38 8 A 3 2 288615 CASAVA_Build 2 15557501 2I TAGCAAAGAG --/TA TATCACTAGT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 TA 1 2 288616 CASAVA_Build 2 15564896 1D ATTACTTCTA T/- TTTTTTCAGG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 7 6 288617 CASAVA_Build 2 15565565 4D CAGCAACCTT AAAC/---- AAACAGTAAG 3070 hom 111 het 42 0 38 6 AAAC 2 1 288618 CASAVA_Build 2 15566217 4I TTTATCTCTA ----/TGTG TGTGTGTGTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TG 4 6 288619 CASAVA_Build 2 15567432 1D GTGCTCACTT C/- CTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 2 1 288620 CASAVA_Build 2 15572816 1I TCTAAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1484 hom 39 4 30 5 A 10 11 288621 CASAVA_Build 2 15574298 13D ACTCCATTTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 21 8 288622 CASAVA_Build 2 15575705 1D AGTCTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 588 hom 24 4 13 8 A 17 16 288623 CASAVA_Build 2 15577062 1I CCCAAGCTGG -/T AGTGCAATGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 0 1 288624 CASAVA_Build 2 15581039 3D GTAATCTAGA GAT/--- GATGTGAAAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 GAT 2 1 288625 CASAVA_Build 2 15584675 1I GGGACAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 240 hom 33 1 23 9 A 12 13 288626 CASAVA_Build 2 15588311 1D GAATTAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 36 0 32 7 A 9 8 288627 CASAVA_Build 2 15595953 1D ATTATTTCTG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 9 8 288628 CASAVA_Build 2 15598305 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 11 10 288629 CASAVA_Build 2 15600225 1I TAAATAAGAT -/A AAAAAAAATA 1991 het 1991 ref 18 9 6 3 A 8 9 288630 CASAVA_Build 2 15602588 1I TCTGGCTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 615 hom 28 2 14 12 A 11 12 288631 CASAVA_Build 2 15611616 1I AGAAAAACAT -/A TGAATTTCAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 0 1 288632 CASAVA_Build 2 15619950 2I CTAGCCTGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 28 9 T 11 13 288633 CASAVA_Build 2 15622534 1I TTCCCTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1194 hom 34 6 21 7 T 15 16 288634 CASAVA_Build 2 15623651 1I TGAATAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 803 hom 29 2 20 7 T 10 11 288635 CASAVA_Build 2 15623800 2I CAGCCTCTTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 112 het 43 0 38 6 TC 5 6 288636 CASAVA_Build 2 15627080 4I GTTTTTAAAT ----/ATTA ATTATTATAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 ATTA 1 2 288637 CASAVA_Build 2 15630997 8D ACTAGCCTCC TTATAGAT/-------- AACAGCTCTG 3070 hom 129 het 47 0 43 7 TTATAGAT 1 0 288638 CASAVA_Build 2 15631629 1I ATCTTTCTAT -/G GGGGGGGGGA 3070 hom 68 het 32 0 19 13 G 9 10 288639 CASAVA_Build 2 15647497 1I TGCCCAACTA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 6 7 288640 CASAVA_Build 2 15648328 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1823 het 595 hom 21 5 7 9 T 15 14 288641 CASAVA_Build 2 15650475 1D CATGTAAGAT A/- TTTTTTTTCT 1156 het 1156 ref 19 7 7 5 A 1 0 288642 CASAVA_Build 2 15656845 1D AAAATACTTG T/- TTTTTTTTTT 1905 het 1866 hom 14 5 5 4 T 11 10 288643 CASAVA_Build 2 15665093 1D AAAATTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 10 9 288644 CASAVA_Build 2 15666103 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1911 het 963 hom 9 4 5 2 A 16 11 288645 CASAVA_Build 2 15668438 1D CCCAGACTTG T/- TTTTTTTTTT 2550 het 1044 hom 12 5 6 1 T 11 10 288646 CASAVA_Build 2 15673128 1I TTGAACTTGC -/T TGTAATTATC 3070 het 3070 ref 40 29 11 0 T 1 2 288647 CASAVA_Build 2 15674678 1D CTGTAACTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 12 11 288648 CASAVA_Build 2 15681512 1I GGGAATGAGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 A 8 9 288649 CASAVA_Build 2 15682803 4D TGTATCAATC TATT/---- TATATGACAT 3070 het 3070 hom 39 17 19 6 TATT 1 0 288650 CASAVA_Build 2 15691456 3D TATTTTTTTG GTT/--- GTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 GTT 3 2 288651 CASAVA_Build 2 15705309 1D TCCAGCTTGT C/- CCAGATGGGC 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 C 3 2 288652 CASAVA_Build 2 15708030 1I GGATGGAGCA -/G GGGGCCTCAC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 G 4 5 288653 CASAVA_Build 2 15709406 3D CTTTTTTCCA TTT/--- TTTTTTTTTT 2054 het 231 hom 13 1 5 7 T 19 16 288654 CASAVA_Build 2 15710664 3D ACTCAGCCCT CAG/--- GCTGGAGATC 3070 het 3070 ref 32 17 11 6 CAG 1 0 288655 CASAVA_Build 2 15717893 6I CCATAATAAT ------/TATCTC TGAATGATAG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 TATCTC 0 1 288656 CASAVA_Build 2 15742291 1D CCAGGCCTTC G/- TGGTTCCTTT 3070 het 3070 ref 39 17 13 11 G 1 0 288657 CASAVA_Build 2 15743862 3I CATAGGTAGT ---/AAG AAGAAGTCAG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AAG 2 3 288658 CASAVA_Build 2 15752022 1I GCAGCCCCCA -/G GGGCTCCTCC 3070 hom 94 het 37 0 28 9 G 3 4 288659 CASAVA_Build 2 15764314 1I GAATGTACAC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 8 9 288660 CASAVA_Build 2 15764473 1I CTTACCAACT -/A TCTGGGCATC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 0 1 288661 CASAVA_Build 2 15767531 2D CCCAGGTAGT GA/-- GAGAGTCACT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 GA 3 2 288662 CASAVA_Build 2 15783376 1I ATTGTGAAGA -/G GGGGGTCTGT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 G 5 6 288663 CASAVA_Build 2 15789742 6I CCCTCCATTA ------/GACAAT GATCTCTGGA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 GACAAT 0 1 288664 CASAVA_Build 2 15793970 1I CCCCAGTGCC -/T TGGGATTACA 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 1 2 288665 CASAVA_Build 2 15798753 1D CCCAAATTTC T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 111 het 46 0 37 9 T 9 8 288666 CASAVA_Build 2 15811049 1D GACTTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 27 1 13 13 A 15 14 288667 CASAVA_Build 2 15814852 3I GGAAGATAGA ---/GGT GGTGATTGCA 3070 hom 156 het 58 0 51 7 GGT 1 2 288668 CASAVA_Build 2 15817810 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 11 10 288669 CASAVA_Build 2 15826881 2I CAGGGTCAAG --/GA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 GA 0 1 288670 CASAVA_Build 2 15831080 1I AAAGTAGGTC -/A GGGGGTTGCT 3070 hom 120 het 42 0 40 2 A 0 1 288671 CASAVA_Build 2 15840447 2D AGTTTGTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 144 het 52 0 48 5 A 12 10 288672 CASAVA_Build 2 15844185 1D AAATAATAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 38 0 36 3 T 10 9 288673 CASAVA_Build 2 15846669 1D ACAGGCATCG A/- ATTCTCATTT 3070 hom 127 het 47 0 41 6 A 2 1 288674 CASAVA_Build 2 15847476 1I CTTCCTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 10 11 288675 CASAVA_Build 2 15865580 5D GAGAATGCTA CCCGC/----- CCCCCCCCCA 3070 hom 37 het 34 1 18 16 CCCGC 1 0 288676 CASAVA_Build 2 15865794 15I CCACGAGGCC ---------------/GACTTAGCATCTCCT GCCTTCCCAT 3070 hom 64 het 31 0 15 16 GACTTAGCATCTCCT 0 1 288677 CASAVA_Build 2 15868117 2D TCTGCTCCAC AA/-- ACACCAGTCC 3070 hom 99 het 41 0 31 10 A 3 1 288678 CASAVA_Build 2 15869197 3I TGGAGAGGTA ---/GTT GTTGTTTCTT 3070 hom 60 het 30 0 23 7 GTT 2 3 288679 CASAVA_Build 2 15869396 2D AGCCTCCCTT GG/-- GGCATGGAGG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 G 4 2 288680 CASAVA_Build 2 15874502 6I CAGGTTTGTT ------/CCAACC CCAAACCCCA 3070 hom 149 het 53 0 48 5 CCAACC 0 1 288681 CASAVA_Build 2 15879298 1I TTAGTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 24 2 18 4 T 13 14 288682 CASAVA_Build 2 15883407 3D TGGGCTTTCG GCT/--- GCTGCGAGGA 3070 hom 138 het 47 0 47 1 GCT 2 1 288683 CASAVA_Build 2 15887076 4D AGAGAGAGAG AGAA/---- AGAGAAAGAG 3070 hom 72 het 30 0 26 4 AGAA 1 0 288684 CASAVA_Build 2 15889729 4D ATGTGGTAAT AGTC/---- AGACCACAGA 3070 hom 117 het 42 0 39 4 AGTC 1 0 288685 CASAVA_Build 2 15896734 10I CAATACACAG ----------/GAAGAGCCCT GAAGAGCCCT 3070 hom 45 het 24 0 15 9 GAAGAGCCCT 1 2 288686 CASAVA_Build 2 15903172 1I TCCCCTCTCA -/T TTGTGCCCTC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 2 3 288687 CASAVA_Build 2 15910186 1D TTAAATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 34 1 26 7 T 11 10 288688 CASAVA_Build 2 15912445 1I TCCTCTTCAA -/T TTTTTTGGAA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 T 6 7 288689 CASAVA_Build 2 15923857 1D AATTTACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 9 8 9 A 10 9 288690 CASAVA_Build 2 15927187 1D ATTAAACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 9 22 5 A 11 10 288691 CASAVA_Build 2 15937382 1I ATATGGAAAA -/T ATCTGATATA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 288692 CASAVA_Build 2 15937923 8D ATCTCAAAAA AAAAAAAT/-------- AAATAAAAAT 540 het 540 ref 45 6 5 42 AAAAAAAT 1 0 288693 CASAVA_Build 2 15939137 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 12 11 288694 CASAVA_Build 2 15940027 2D TAATAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 2775 hom 18 het 7 0 7 1 A 12 10 288695 CASAVA_Build 2 15945076 12D AACCGAGATC CCCAGCCAACAG/------------ CCAGCATCAA 3070 het 3070 ref 60 32 24 9 CCCAGCCAACAG 1 0 288696 CASAVA_Build 2 15947459 1I TTGGGTGCTG -/C CCCTCGCATA 3070 hom 108 het 41 0 31 10 C 3 4 288697 CASAVA_Build 2 15957755 1I ACAAACATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 13 14 288698 CASAVA_Build 2 15968352 1I AGAGAGACAC -/A AGGAAGCTTT 1551 het 1551 ref 28 15 5 8 A 1 2 288699 CASAVA_Build 2 15973442 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1569 het 266 hom 18 5 7 6 A 17 16 288700 CASAVA_Build 2 15975890 1I GCCAAGAAAC -/A AGTGCACATG 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 1 2 288701 CASAVA_Build 2 15977623 1I CTGGCAGGTG -/C CCCCACTGAG 3070 hom 86 het 32 0 28 4 C 4 5 288702 CASAVA_Build 2 16002546 4D24M6I CATATATGTA TATGTATGTATGTATGTATGGGGGGTTG------/----TATGTACGTATGTATGGGGGGTTGTTTTGT TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 19 4 N/A 0 0 288703 CASAVA_Build 2 16005170 1D CGAGTGACAG T/- TACGTAGTCC 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 T 2 1 288704 CASAVA_Build 2 16008652 23D ATCAAGCACT GTTCTAAGTGCTTGGGAGACATC/----------------------- AATGAACAAA 3070 het 3070 ref 23 17 8 4 GTTCTAAGTGCTTGGGAGACATC 1 0 288705 CASAVA_Build 2 16027964 1D TAGGGTTAGA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 9 8 288706 CASAVA_Build 2 16031938 2D CTTATGCACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 35 2 15 18 T 13 11 288707 CASAVA_Build 2 16037242 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1708 hom 22 6 14 2 T 10 11 288708 CASAVA_Build 2 16038626 1I GGCTCACAGT -/A AACCTCTGCC 2640 het 2640 ref 21 11 7 3 A 2 3 288709 CASAVA_Build 2 16043556 2D TCTGTGTGTG TC/-- TCTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 70 18 40 15 TC 2 1 288710 CASAVA_Build 2 16053332 17I ATGCAAAGGC -----------------/AACATCTTCTTTGGCAG ATATGGAGAC 3070 hom 108 het 39 0 36 6 AACATCTTCTTTGGCAG 0 1 288711 CASAVA_Build 2 16060312 1D TAGGAACACC T/- TGTTAAATTT 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 T 2 1 288712 CASAVA_Build 2 16060697 1I TACAAATACA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 T 7 8 288713 CASAVA_Build 2 16063071 1I CACCTGGTTA -/T TTTTTTTTTT 2067 het 2067 ref 21 12 5 4 T 10 11 288714 CASAVA_Build 2 16067415 1D TATCTGTTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 85 het 33 0 29 4 T 9 8 288715 CASAVA_Build 2 16068845 17D CCTCCAGAAG TGTAAGAAATAAATGTT/----------------- TGTTGTTGAA 3070 het 3070 ref 41 23 18 7 TGTAAGAAATAAATGTT 1 0 288716 CASAVA_Build 2 16074082 1I CACAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 9 10 288717 CASAVA_Build 2 16078682 11D ATAGCAAAAG CAGGCCAGGCA/----------- CAGTGGCTCA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CAGGCCAGGCA 1 0 288718 CASAVA_Build 2 16080878 5I CCTTGGAGAT -----/TAAAG TAATGTGGAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TAAAG 0 1 288719 CASAVA_Build 2 16081793 1D GCCTCATGAA T/- TTGCTATGAA 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 3 2 288720 CASAVA_Build 2 16083713 1D GAGGTTTGGG T/- TGGGGCCACA 3070 hom 70 het 32 0 22 12 T 2 1 288721 CASAVA_Build 2 16086887 1D TATTTGTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 758 hom 38 2 31 5 A 11 10 288722 CASAVA_Build 2 16121128 1I TATGTTGGCT -/C CTTTTAGCCA 3070 hom 27 het 29 1 22 6 C 1 2 288723 CASAVA_Build 2 16132716 1D TCTAGTAGTG C/- CCAGTGTTGA 3070 het 3070 hom 28 7 14 7 C 3 2 288724 CASAVA_Build 2 16133548 1I GTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 9 10 288725 CASAVA_Build 2 16146023 1D GTAAAAAAAT A/- AAAAAATACT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 7 6 288726 CASAVA_Build 2 16148556 1D GAGGGAGAAA G/- AGAGAGAGAG 2913 het 2073 hom 37 9 8 20 G 1 0 288727 CASAVA_Build 2 16150644 1D AAGTCTGCAG A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 A 7 6 288728 CASAVA_Build 2 16154016 4D TCAGGATTCC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 34 9 18 8 TTTA 5 4 288729 CASAVA_Build 2 16155409 1D TCTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 1737 het 725 hom 22 3 8 11 T 17 16 288730 CASAVA_Build 2 16155978 1I ATCATCTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 30 0 25 5 T 13 14 288731 CASAVA_Build 2 16160458 1I CAGAGGGGCA -/T TTGTCTCAGT 2417 het 2417 ref 29 14 7 8 T 2 3 288732 CASAVA_Build 2 16166138 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2664 hom 13 het 8 0 6 2 T 11 10 288733 CASAVA_Build 2 16169902 1D AGAAGACATT G/- GTCCAGAACA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 G 2 1 288734 CASAVA_Build 2 16170918 12D GTATGTGTGC ATCTGTGTGTAT/------------ ATCTGTGTGT 3070 hom 157 het 60 0 52 16 ATCTGTGTGTAT 3 2 288735 CASAVA_Build 2 16229178 7D TTCATTTTCC TTTTCTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 TTTTCTT 1 0 288736 CASAVA_Build 2 16231544 4D CCCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 28 12 10 9 AAAC 5 4 288737 CASAVA_Build 2 16234672 10D CTTACACAGG CATGCACACA/---------- CATGCACACA 3070 het 3070 ref 53 29 21 6 CATGCACACA 2 1 288738 CASAVA_Build 2 16238624 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 10 11 288739 CASAVA_Build 2 16239991 1D TCCCAACTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 11 10 288740 CASAVA_Build 2 16244059 5D TACCAAAAAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 1781 hom 20 6 13 2 AAAAT 3 2 288741 CASAVA_Build 2 16250590 13D CAAGGCTTTT CTGGTGAGCAAAA/------------- CTGACTGTCC 3070 hom 108 het 41 0 35 7 CTGGTGAGCAAAA 1 0 288742 CASAVA_Build 2 16251510 1D GTGGCATATG C/- CAGGAATGAA 3070 hom 100 het 38 0 32 7 C 2 1 288743 CASAVA_Build 2 16251639 1D TTCCTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 30 3 17 11 T 17 16 288744 CASAVA_Build 2 16252113 1D TGTGGCCACG A/- AAGACCTTCC 3070 hom 127 het 51 0 39 14 A 3 2 288745 CASAVA_Build 2 16289667 1I AGGCAGCTGT -/G GGGACCCCAA 3070 hom 101 het 38 0 32 6 G 3 4 288746 CASAVA_Build 2 16312308 1I AGATTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 A 10 11 288747 CASAVA_Build 2 16333864 1D ATATTACAGC T/- TTTTTTTTTT 1666 het 1666 ref 37 26 4 7 T 12 11 288748 CASAVA_Build 2 16356144 1I AATTTATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 534 hom 28 3 23 2 A 12 13 288749 CASAVA_Build 2 16373610 1D CTGATGATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 12 11 288750 CASAVA_Build 2 16387470 2D ACATCAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 8 7 288751 CASAVA_Build 2 16395191 1D GGCAGATTTT C/- CCCTTGCTGT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 C 4 3 288752 CASAVA_Build 2 16401344 2I TCTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 13 15 288753 CASAVA_Build 2 16406633 1I AGAAGTGTTA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 126 het 53 0 42 11 T 7 8 288754 CASAVA_Build 2 16416833 1I TATTCCATAA -/T CTATTTGTAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 0 1 288755 CASAVA_Build 2 16421653 5D6M2I TGCTAACATA CATACCTATGT--/-----CTATGTTA CCTATGTATA 902 het 902 ref 33 17 3 15 N/A 0 0 288756 CASAVA_Build 2 16431238 14I CCAGGACAAA --------------/TTCCTCCGTGGGGG TTCCTTCAGC 3070 hom 120 het 43 0 39 4 TTCCTCCGTGGGGG 0 1 288757 CASAVA_Build 2 16434637 34D GAACAGCCTA GTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGCATATGT/---------------------------------- GTGTGTGCGT 3070 hom 115 het 36 0 39 5 GTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGCATATGT 1 0 288758 CASAVA_Build 2 16441620 1D TTTCCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2192 het 2192 ref 24 9 7 8 T 12 11 288759 CASAVA_Build 2 16445513 1D TTGCAGTGAC A/- GGGGGTGGCG 2765 het 2765 ref 21 11 8 3 A 1 0 288760 CASAVA_Build 2 16451765 1D GAAAAAAGAA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 10 9 288761 CASAVA_Build 2 16459141 9I CACAATATTG ---------/CACAATTAT CACGTGGCAG 3070 hom 159 het 57 0 53 5 CACAATTAT 0 1 288762 CASAVA_Build 2 16460536 1I ATATACCACA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 8 9 288763 CASAVA_Build 2 16462380 1D GATGGTAGCC A/- AAAATGGTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 A 5 4 288764 CASAVA_Build 2 16466585 1D ATTCTTTAGA T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 7 288765 CASAVA_Build 2 16466943 4I AGGCACTATG ----/GGGT GGGTGTGTAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 GGGT 1 2 288766 CASAVA_Build 2 16468656 2D CAGCTGCACC CT/-- CTGAGTTTTG 3070 hom 108 het 39 0 37 6 CT 2 1 288767 CASAVA_Build 2 16478073 3I GCTCTCTGGT ---/GAA GAAGGCCCAG 3070 hom 81 het 29 0 25 4 GAA 1 2 288768 CASAVA_Build 2 16480567 1I CTTATATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 288769 CASAVA_Build 2 16485096 4D TACAACAGAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 20 0 12 8 TA 11 9 288770 CASAVA_Build 2 16488199 4I TATTTTTAGT ----/TAAA TAATTAATTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAA 0 1 288771 CASAVA_Build 2 16491795 2I ATACTGTTCC --/CA CAGTCTTTCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CA 1 2 288772 CASAVA_Build 2 16492798 1I AAAAAAAACA -/C AAAAACAAAA 3070 het 279 hom 31 1 29 1 C 0 1 288773 CASAVA_Build 2 16500863 1D TCTTCCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 11 10 288774 CASAVA_Build 2 16502346 1D GAAAATATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 28 1 21 6 T 13 12 288775 CASAVA_Build 2 16509098 2I GAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAGAT 3070 hom 120 het 46 0 39 7 AG 4 5 288776 CASAVA_Build 2 16518402 4I AGAATCTAAG ----/ATTA ATTACCAAGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATTA 1 2 288777 CASAVA_Build 2 16527069 2D TGATCTGATG CA/-- CACTAAGTAG 3070 hom 135 het 51 0 46 6 CA 2 1 288778 CASAVA_Build 2 16533703 1I ACTATAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 887 hom 36 2 25 9 T 10 11 288779 CASAVA_Build 2 16540545 1D TTATCTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 23 4 T 11 10 288780 CASAVA_Build 2 16557456 1I TCAGAAACAC -/T TTTTTTTTTT 1767 het 1767 ref 50 37 4 9 T 11 12 288781 CASAVA_Build 2 16560527 8I TCTTCCTTTC --------/CATTTCAT CATTTCATCA 3070 hom 147 het 55 0 46 10 CATTTCAT 1 2 288782 CASAVA_Build 2 16602154 1D ACACACAGTG C/- CTGCCTCTCT 3070 het 3070 hom 54 19 24 11 C 2 1 288783 CASAVA_Build 2 16602293 1D TATATGTCGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 50 15 31 5 A 10 9 288784 CASAVA_Build 2 16617080 1D AAAAAATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 35 4 11 21 T 13 12 288785 CASAVA_Build 2 16624044 1I TTAAAATAAG -/T TTTTTTAGAC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 6 7 288786 CASAVA_Build 2 16634239 1I AGTAGTCTAT -/C CTTTGTTAGA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 C 1 2 288787 CASAVA_Build 2 16646461 1I TTCCAGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2020 hom 33 10 9 14 A 15 16 288788 CASAVA_Build 2 16649876 1D CGGGAATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 103 het 43 0 30 14 A 12 11 288789 CASAVA_Build 2 16672913 3I CTAGAATAAT ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 48 14 20 14 AAC 4 5 288790 CASAVA_Build 2 16674607 3D ACTATATGTT ATA/--- ATGTTATTCT 3070 het 3070 hom 49 21 26 3 ATA 1 0 288791 CASAVA_Build 2 16678156 4D TCTCATGACT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 36 13 16 9 TTTA 5 4 288792 CASAVA_Build 2 16679419 1D GCATGTGTCT G/- GGGGGTGGCA 3070 het 3070 ref 42 21 14 8 G 6 5 288793 CASAVA_Build 2 16681557 1I AAAAAAAAAT -/A AAGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 2 3 288794 CASAVA_Build 2 16681885 1I TGAGTGAGAT -/A AAAGAAATCT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 3 4 288795 CASAVA_Build 2 16684241 3D CTCCAGCTAA AAG/--- AAGGCAAGAC 3070 het 3070 ref 47 29 11 7 AAG 2 1 288796 CASAVA_Build 2 16721909 17D GTTCTGATTA ATCTATTTTTATAATAC/----------------- ATCTTCATCT 3070 het 3070 ref 21 13 9 2 ATCTATTTTTATAATAC 1 0 288797 CASAVA_Build 2 16730881 1I CCAGGGCGGA -/G CGTGCGGCAA 3070 hom 126 het 48 0 39 9 G 0 1 288798 CASAVA_Build 2 16742196 1I ATTCTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 944 het 944 ref 49 35 3 11 T 11 12 288799 CASAVA_Build 2 16806497 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 CA 7 6 288800 CASAVA_Build 2 16851824 6D AAATAAGAAC TTCATA/------ TTCTTATTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TTCATA 1 0 288801 CASAVA_Build 2 16992138 3I TTGTTATTGA ---/TAG TAGTATTTCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TAG 1 2 288802 CASAVA_Build 2 16994704 5D TGTCTTTGTG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 49 19 19 13 GTTTT 4 3 288803 CASAVA_Build 2 17002886 4D TCTTTCAAGG TGTC/---- TGTCTCCACA 3070 hom 114 het 43 0 39 6 TGTC 2 1 288804 CASAVA_Build 2 17005400 1D AAAGTCCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1553 hom 35 8 15 12 T 15 14 288805 CASAVA_Build 2 17007765 2D ACATACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 57 20 25 14 AC 7 6 288806 CASAVA_Build 2 17013196 1D CTTTCTATAG T/- TCCCAAGTAA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 2 1 288807 CASAVA_Build 2 17020276 1I GGAGTTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 A 11 12 288808 CASAVA_Build 2 17021666 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 10 11 288809 CASAVA_Build 2 17022370 2D ATACAGTGGT AG/-- AGTTTGTAAG 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 AG 2 1 288810 CASAVA_Build 2 17028260 1D TCTATTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 467 hom 37 2 28 7 T 12 11 288811 CASAVA_Build 2 17029467 2D ATTGGAGATT TG/-- TGTGTGTGTG 1276 het 1276 ref 36 27 3 6 TG 10 9 288812 CASAVA_Build 2 17030374 2D CTTTATATTA TG/-- TGTTTGGCAG 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 TG 2 1 288813 CASAVA_Build 2 17037847 1I ATGAACGACC -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 6 7 288814 CASAVA_Build 2 17048602 1I ACAGCTATAC -/T GATTAAGTCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 288815 CASAVA_Build 2 17052507 1I GATGATAGAG -/A AAAGTGATTA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 3 4 288816 CASAVA_Build 2 17057949 1D TCAATGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 11 10 288817 CASAVA_Build 2 17087119 1I GGAGGAATCT -/G GGGGGGGGGG 1061 het 352 hom 22 2 6 14 G 10 11 288818 CASAVA_Build 2 17137097 1D TGAATAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 124 het 46 0 38 8 A 14 13 288819 CASAVA_Build 2 17145919 1I AAATTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 10 11 288820 CASAVA_Build 2 17153041 1D GGAACATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 36 0 29 8 T 13 12 288821 CASAVA_Build 2 17160659 22D CGTGCGCACG CACACACACACACACACACACA/---------------------- CACACACACA 3070 hom 154 het 52 0 49 10 CA 22 11 288822 CASAVA_Build 2 17182761 27I TTTTTCTTCA ---------------------------/TGACATCAATTCATAAAATCCATGCCG TGACACAATT 3070 hom 87 het 31 0 30 4 TGACATCAATTCATAAAATCCATGCCG 0 1 288823 CASAVA_Build 2 17199010 4D ATTCTCAGTT ATTA/---- ATTGAGTTGT 3070 hom 107 het 38 0 34 5 ATTA 1 0 288824 CASAVA_Build 2 17224673 19I CGCCTCCTGG -------------------/GTTCATGCCATTCTCCTGC CGGAGCCTCC 3070 het 2187 hom 16 7 10 1 GTTCATGCCATTCTCCTGC 0 1 288825 CASAVA_Build 2 17252132 1I CCCATAGCAT -/C CTGGGCTTAT 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 C 1 2 288826 CASAVA_Build 2 17255260 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 16 2 12 2 A 18 17 288827 CASAVA_Build 2 17255964 2D TCTTAATTTC TT/-- TTTTTCAGGT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 7 5 288828 CASAVA_Build 2 17256286 1I ACTTTTCACC -/A ATTGAGTATG 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 A 1 2 288829 CASAVA_Build 2 17256410 2D TCAAATAGTC TT/-- TCTGCATCTA 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 T 3 1 288830 CASAVA_Build 2 17262241 1I GTCAATTTGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 9 10 288831 CASAVA_Build 2 17280315 2D AAGGAGATTT AG/-- AGTCATTATA 3070 het 3070 ref 34 21 12 2 AG 2 1 288832 CASAVA_Build 2 17296852 19D TTAAAGTTGG CTTGAGGAGTCTCCAATGC/------------------- CTTGAGGAGT 3070 het 3070 hom 40 14 14 22 CTTGAGGAGTCTCCAATGC 2 1 288833 CASAVA_Build 2 17330455 2I GAAATAATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3001 hom 30 7 17 6 A 11 13 288834 CASAVA_Build 2 17334843 2D CAAAAGAGAG AA/-- ATTTTAAAGC 2495 het 2392 hom 14 6 7 1 A 3 1 288835 CASAVA_Build 2 17338993 1D ACCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 11 10 288836 CASAVA_Build 2 17339353 1D TCAATACCCC T/- ATATCTATTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 1 0 288837 CASAVA_Build 2 17344403 1I CTCCTCCTCT -/G GACCTCAGTT 3070 hom 199 het 72 0 67 5 G 1 2 288838 CASAVA_Build 2 17357398 1D TCCCATTCAT A/- AAATGCGCAC 3070 het 3070 hom 55 20 28 8 A 4 3 288839 CASAVA_Build 2 17361148 39D CTTCTTAGTG CAGGACAATTCTGTAATGGATGTTAAATTCAAGCACCCA/--------------------------------------- CAGGACAATT 3070 het 3070 ref 32 18 11 11 CAGGACAATTCTGTAATGGATGTTAAATTCAAGCACCCA 2 1 288840 CASAVA_Build 2 17372627 1D CTAGGCTGGT G/- GATCACCTGA 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 G 2 1 288841 CASAVA_Build 2 17377347 1I TTGGCAGCAA -/G GAACAGAATG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 1 2 288842 CASAVA_Build 2 17381369 2D TGCCAACATT TC/-- TCTCTGTTCT 3070 het 3070 ref 52 25 18 9 TC 3 2 288843 CASAVA_Build 2 17398247 2D TATCTGTGTG CA/-- CAGAGTCACA 3070 het 3070 hom 35 13 21 2 CA 2 1 288844 CASAVA_Build 2 17402883 1I ATCCTGTGTC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 8 9 288845 CASAVA_Build 2 17414588 1D TTTAAATTTC T/- TTTTTTTTCA 2364 het 2364 ref 16 7 6 3 T 9 8 288846 CASAVA_Build 2 17423389 4I TTTCTTTATC ----/TATT CATCTGTTGA 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 TATT 0 1 288847 CASAVA_Build 2 17426994 1D GTAAGAGAAA C/- CCTAGAAGCC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 C 3 2 288848 CASAVA_Build 2 17433957 1D ACTGGGTACC A/- AAAAAAAAAA 1683 het 1683 ref 30 20 4 7 A 15 14 288849 CASAVA_Build 2 17434707 8D ATGTATACAC ACATGTAT/-------- ACATGTATAC 1205 het 1205 ref 25 16 6 9 ACATGTAT 2 1 288850 CASAVA_Build 2 17444069 1D TCTGTTTAAC T/- TTTGAGTTTT 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 T 4 3 288851 CASAVA_Build 2 17444846 1I TAGCAAAACA -/T TATAGCATCC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 1 2 288852 CASAVA_Build 2 17451764 1D GCCTTCCACC A/- TGATTATGAG 3070 het 1962 hom 25 6 14 6 A 1 0 288853 CASAVA_Build 2 17457390 1D GAAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 31 1 23 8 A 14 13 288854 CASAVA_Build 2 17479519 1D ATGATAGAAA T/- TTTACTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 T 4 3 288855 CASAVA_Build 2 17483569 4I TGCTCCTTTG ----/TACT GGTTATAATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TACT 0 1 288856 CASAVA_Build 2 17484930 2D TTGAAACTGC CT/-- GGAATTGGAG 3070 hom 117 het 44 0 40 5 CT 1 0 288857 CASAVA_Build 2 17487661 16D TGCTCATTCT CAGTGTTCTTACTCAA/---------------- CAGTGTTCTT 3070 hom 66 het 35 0 23 15 CAGTGTTCTTACTCAA 2 1 288858 CASAVA_Build 2 17488698 1D CTCACCACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 31 1 19 11 A 14 13 288859 CASAVA_Build 2 17491632 1D TGTGAAGCAT G/- CACAAGTATC 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 G 1 0 288860 CASAVA_Build 2 17494012 1D GCACAATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 35 2 19 14 A 12 11 288861 CASAVA_Build 2 17516973 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 666 hom 37 3 20 14 A 8 9 288862 CASAVA_Build 2 17516986 6D AAAAATAATT AAAAAG/------ AAAATGAAAT 3070 het 1317 hom 35 7 16 13 AAAAAG 1 0 288863 CASAVA_Build 2 17528848 1I CCTGCTATAC -/A AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 6 7 288864 CASAVA_Build 2 17547124 1I TTTATTCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 A 9 10 288865 CASAVA_Build 2 17553726 12D AGAAACATTT TTATAAAACTCA/------------ TAAGAATAGC 3070 het 3070 hom 49 19 26 6 TTATAAAACTCA 1 0 288866 CASAVA_Build 2 17555432 1D TTATACACTC A/- AAAAAAAAAA 1883 het 1883 ref 22 11 6 5 A 11 10 288867 CASAVA_Build 2 17559756 1D TTCTTGCTGG A/- AAAAAAAAAA 2339 het 2339 ref 40 29 5 7 A 13 12 288868 CASAVA_Build 2 17565504 1I TTTCAGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 42 1 32 9 T 13 14 288869 CASAVA_Build 2 17574032 1D TTACTTAAAA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 T 8 7 288870 CASAVA_Build 2 17584552 1D ATGGGGAGCC G/- GGGGGAGGGC 3070 hom 55 het 22 0 16 6 G 6 5 288871 CASAVA_Build 2 17586954 2D TACGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 2848 het 2848 ref 31 12 11 8 TG 6 5 288872 CASAVA_Build 2 17597808 1I AAGAGGGGGA -/G GGGGGAAAGA 3070 het 2549 hom 31 8 16 7 G 5 6 288873 CASAVA_Build 2 17599768 17I CATTTTAACT -----------------/TTTAAAATGGTATTTCC TTTAAAATAC 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 TTTAAAATGGTATTTCC 0 1 288874 CASAVA_Build 2 17628999 1D CCCACAAAAA G/- GGATACAAGG 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 G 3 2 288875 CASAVA_Build 2 17631415 1D AAGATTCTTA C/- AAACATCTGC 3070 hom 129 het 52 0 44 8 C 1 0 288876 CASAVA_Build 2 17640470 1D AGTGTGACGT G/- TCTTTAGGAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 0 288877 CASAVA_Build 2 17651057 1I GTGAAGAGTC -/A GGGGGCTGGA 3070 hom 121 het 47 0 41 6 A 0 1 288878 CASAVA_Build 2 17673258 1I TTATTAGGCC -/A ACTGGATTGT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 1 2 288879 CASAVA_Build 2 17681471 2D TTAAAAACTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 12 10 288880 CASAVA_Build 2 17703314 7D GGTTCTAGAC GAATTAT/------- GTGGCATAAA 3070 hom 132 het 49 0 45 8 GAATTAT 1 0 288881 CASAVA_Build 2 17703715 1D AGTTCTGAAA T/- TCCAGCCAGG 3070 hom 117 het 47 0 40 8 T 2 1 288882 CASAVA_Build 2 17716132 1D TTTAAAGGAA C/- CCTAGAAGTT 3070 hom 85 het 31 0 28 3 C 3 2 288883 CASAVA_Build 2 17717170 2I CTAATACTTT --/CC TTTTTCTCCA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 0 2 288884 CASAVA_Build 2 17751261 1D TTTATAATTC T/- TTTTTTTTTT 1116 het 1116 ref 35 23 3 9 T 12 11 288885 CASAVA_Build 2 17790407 1D TCTCTATTAA T/- TTTTCTAATA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 5 4 288886 CASAVA_Build 2 17830335 1I TTCTTTTAGA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 7 8 288887 CASAVA_Build 2 17838830 1I GAGCAAATCA -/T TTTTGCACTC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 4 5 288888 CASAVA_Build 2 17839269 2D ACAGGGAGCT CA/-- AGGCATCCTT 3070 hom 48 het 18 0 12 6 CA 1 0 288889 CASAVA_Build 2 17842149 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 8 288890 CASAVA_Build 2 17850221 2I CTTCACACAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 AC 5 6 288891 CASAVA_Build 2 17853486 1I TTTCACCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 852 hom 37 2 26 9 A 11 12 288892 CASAVA_Build 2 17869117 1D CGATCAAGGC T/- CACTGCAGCC 3064 het 2389 hom 20 6 7 7 T 1 0 288893 CASAVA_Build 2 17869231 1D AAAAGATATA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 19 9 7 3 T 9 8 288894 CASAVA_Build 2 17870190 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGTCCCAC 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 G 4 5 288895 CASAVA_Build 2 17871244 1D TCCTTTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 19 1 T 11 10 288896 CASAVA_Build 2 17872663 1I CGCCCATTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3032 hom 40 9 16 15 T 8 9 288897 CASAVA_Build 2 17874141 1I AATGTTCTCA -/G GGGATTGGAA 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 G 3 4 288898 CASAVA_Build 2 17876011 1D TTTCTGGTAA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 53 21 22 11 T 7 6 288899 CASAVA_Build 2 17888028 1D AGAAAGGGAT G/- GGAAACTCTG 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 G 3 2 288900 CASAVA_Build 2 17892978 1D CATGGCATTG T/- CCCCAACTTA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 1 0 288901 CASAVA_Build 2 17904298 1D GTGTTTGCAC A/- GACCTGCTCA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 1 0 288902 CASAVA_Build 2 17911294 1I GCTTCTGGCC -/T TTTTTTCTTA 3070 het 2097 hom 24 6 14 4 T 6 7 288903 CASAVA_Build 2 17919586 11D TTTAAGGAAT TTTTCTTTTTC/----------- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 28 8 11 10 TTTTCTTTTTC 2 1 288904 CASAVA_Build 2 17921820 3I GCTTATGCTA ---/AAG AAGATGAACT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAG 1 2 288905 CASAVA_Build 2 17935148 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 22 1 10 11 T 13 12 288906 CASAVA_Build 2 17942993 1D TGCCTCTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 28 1 14 13 T 17 16 288907 CASAVA_Build 2 17957887 1I TTTTATTTAA -/G TTAAACACTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 288908 CASAVA_Build 2 17961752 1D GGAAACTGGA T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 T 8 7 288909 CASAVA_Build 2 17973418 1D TATTATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 27 10 T 11 10 288910 CASAVA_Build 2 17978658 1D CCTGCTCATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 9 8 288911 CASAVA_Build 2 17983845 12D CCCATATTAT AATGCATATGGA/------------ TATAATGCAT 2336 het 2336 ref 58 22 7 33 AATGCATATGGA 1 0 288912 CASAVA_Build 2 17999027 1I CCAGATGTGA -/C CCCTTGACCT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 3 4 288913 CASAVA_Build 2 18003045 2D TCATACCGCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 5 T 13 11 288914 CASAVA_Build 2 18003779 2D CATTTTTTTT AC/-- ACTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 AC 2 1 288915 CASAVA_Build 2 18037594 15I TTTATAAGTG ---------------/TTTGACAGTTCTTCC TTCACATGCT 3070 het 3070 ref 55 29 18 9 TTTGACAGTTCTTCC 0 1 288916 CASAVA_Build 2 18073113 1D TTTTGAATTT C/- CATATGAATT 3070 het 3070 ref 33 14 15 5 C 2 1 288917 CASAVA_Build 2 18076798 1D TGATATAGAA T/- TAATAGTTGA 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 T 2 1 288918 CASAVA_Build 2 18094728 1D GTTTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 2339 het 2339 ref 29 12 7 12 A 13 12 288919 CASAVA_Build 2 18096415 3I GCTAGTATGC ---/AGG AGAAGTGAGA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 AGG 0 1 288920 CASAVA_Build 2 18098945 9D GCAGAGTGAT GAGTATATG/--------- AACGAGCTCA 3070 het 3070 hom 36 12 23 5 GAGTATATG 1 0 288921 CASAVA_Build 2 18101670 4D TCCTCTCCTC TCTT/---- TCTTCTGCTC 3070 het 3070 ref 42 27 13 3 TCTT 2 1 288922 CASAVA_Build 2 18110572 1D TGGAACAAAT G/- CCTTCTCTTC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 G 1 0 288923 CASAVA_Build 2 18113253 1D TTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2756 hom 34 8 18 8 T 12 11 288924 CASAVA_Build 2 18121487 4I GTTATTTTTC ----/TTTT TTTTTAAAAA 663 het 663 ref 26 17 4 5 T 5 9 288925 CASAVA_Build 2 18123033 1D GGATAGTCTG T/- TTTTTCATGT 3070 het 3070 hom 49 19 25 6 T 6 5 288926 CASAVA_Build 2 18126536 1D TTATACTCTT A/- AAAAATAACT 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 A 6 5 288927 CASAVA_Build 2 18133128 1I CTCTTTAGTT -/C CCTCTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 C 2 3 288928 CASAVA_Build 2 18138398 5I ATAGTTTGAC -----/ATTAT ATTATATATT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 ATTAT 1 2 288929 CASAVA_Build 2 18142016 1I CCATGCGTCA -/C CTTGTTTAAT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 C 1 2 288930 CASAVA_Build 2 18146636 2D AGTCTGTATC AG/-- AATCATGTGC 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 AG 1 0 288931 CASAVA_Build 2 18147287 1D GGAATATGCA T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 43 26 11 7 T 6 5 288932 CASAVA_Build 2 18152745 3D TGTTTTTCTT ATG/--- ATGACACTGG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 ATG 2 1 288933 CASAVA_Build 2 18152918 1D CAAGTTATTC T/- TTTTTCTCCC 3070 het 3070 hom 33 12 20 2 T 6 5 288934 CASAVA_Build 2 18153042 3I TTATTTGGAG ---/TTC TTCTTCTACA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 TTC 2 3 288935 CASAVA_Build 2 18155228 1I CCTCTCAAAG -/T TATGATTGGT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 T 1 2 288936 CASAVA_Build 2 18155308 2D GCTGACATTG TC/-- TCTTGACATT 3070 het 3070 ref 53 35 14 4 TC 2 1 288937 CASAVA_Build 2 18160120 2D CAGCTTGCAC TG/-- TGCACCTGGA 3070 het 2594 hom 22 7 9 8 TG 2 1 288938 CASAVA_Build 2 18170074 1D GTACAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2915 hom 30 8 15 8 A 13 12 288939 CASAVA_Build 2 18176266 4I GGAGGCTCTT ----/TCTC TGAGATCAGG 3070 het 3070 ref 51 23 23 5 TC 0 2 288940 CASAVA_Build 2 18177876 1D GTAGTGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 13 12 288941 CASAVA_Build 2 18181986 1D TACACAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 718 hom 38 3 28 7 T 13 12 288942 CASAVA_Build 2 18190095 1D GTTTAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 14 14 T 12 11 288943 CASAVA_Build 2 18218003 1D TGGTTTTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 29 0 24 6 T 10 9 288944 CASAVA_Build 2 18233185 3I ATATGAATAT ---/TAA TAATGGATTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TAA 1 2 288945 CASAVA_Build 2 18243442 8I CAAAGCCCAA --------/GTATTTAT GTATTTATGG 3070 hom 106 het 45 0 35 10 GTATTTAT 1 2 288946 CASAVA_Build 2 18246060 1I TCCAAATTAG -/C TCTCTTTGTA 3070 hom 153 het 54 0 51 3 C 0 1 288947 CASAVA_Build 2 18252021 1I GTCATCTAGA -/T TTTTATACTG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 4 5 288948 CASAVA_Build 2 18256792 2I AACTTCAAAC --/CT CTGAATTTAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CT 1 2 288949 CASAVA_Build 2 18257694 2I TCAGCTGCGA --/CT CTACATAACT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 CT 1 2 288950 CASAVA_Build 2 18258399 4D CATCCAGTGA TCTT/---- TCTTTCTTTT 3070 hom 81 het 37 0 26 11 TCTT 3 2 288951 CASAVA_Build 2 18261167 2D13M16I ACTGGCACCT AAGTTTCTATTTGTG----------------/--GTTTCTATTTGTGGTAATAAATAAACCAA CCTCATGGTT 2060 hom 15 het 12 0 6 9 N/A 0 0 288952 CASAVA_Build 2 18261935 2D AGGTAAATGC AT/-- ATATATTCAA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 AT 4 3 288953 CASAVA_Build 2 18264403 1D TGTAATTGCA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 86 het 47 1 40 7 T 9 8 288954 CASAVA_Build 2 18271010 11D GTGAAGAGAC TGGCGGCATTG/----------- TGCCCCTGCC 3070 hom 60 het 23 0 20 5 TGGCGGCATTG 1 0 288955 CASAVA_Build 2 18275290 15D GATAAATTCC TGGAAACATACAACT/--------------- TTCCAAGATT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TGGAAACATACAACT 1 0 288956 CASAVA_Build 2 18277430 1D56M1D TTATAGGAAG AAAGTTAGGACTTACCTTTTTAATCCAAAGAGTTTTTCTCAAATAAGACTCACTAAAT/-AAGTTAGGACTTATCTTTTTAATCCAAAGAGTTTTTCTCAAATAAGACTCACTAAA- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 21 N/A 0 0 288957 CASAVA_Build 2 18284624 2D AAATTGACTC AG/-- AGATACTAAC 3070 hom 184 het 66 0 62 6 AG 2 1 288958 CASAVA_Build 2 18285840 2D CACCTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 20 0 15 6 T 16 14 288959 CASAVA_Build 2 18290129 1I TCTAAAAGTA -/T TCTGAATTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 2 288960 CASAVA_Build 2 18291995 1D AAGTAGAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 10 9 288961 CASAVA_Build 2 18294109 1I AAATGCTCCC -/A TATTGATGGA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 0 1 288962 CASAVA_Build 2 18328774 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 29 2 15 12 A 17 16 288963 CASAVA_Build 2 18339135 3D GTATATAATA ATG/--- TATAATATAT 1448 hom 10 het 5 0 4 2 ATG 1 0 288964 CASAVA_Build 2 18365396 1I GATTGTTGAT -/A AAAAAAACGC 3070 hom 112 het 41 0 36 5 A 7 8 288965 CASAVA_Build 2 18366155 1I CATATTATCC -/T TTTTTTTTTT 1752 het 1752 ref 42 19 7 16 T 17 18 288966 CASAVA_Build 2 18367754 37D GCTGATTTGC CTGTGAACAATGAGTGAGATAACTGTACTCTGTACTA/------------------------------------- CTGTGAACAA 3070 hom 54 het 41 0 19 26 CTGTGAACAATGAGTGAGATAACTGTACTCTGTACTA 2 1 288967 CASAVA_Build 2 18369108 5I ATATAGCATT -----/AAGAA AAGAGATCTC 3070 hom 117 het 47 0 39 8 AAGAA 0 1 288968 CASAVA_Build 2 18381570 3D GTTCTTAAAA GGT/--- GGTGGTTTGT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 GGT 3 2 288969 CASAVA_Build 2 18384753 2I CTAATTAACT --/AA AACGTTGGAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 2 4 288970 CASAVA_Build 2 18388592 2D TAATAAAAAT AG/-- AGAAAATATA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 AG 2 1 288971 CASAVA_Build 2 18388765 3D TATATCTAAA AAG/--- GAGAATATAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAG 1 0 288972 CASAVA_Build 2 18389121 1I CGGTGTTTGG -/T TTTTTGTCCT 3070 hom 66 het 29 0 21 8 T 5 6 288973 CASAVA_Build 2 18391477 1I TTTAAGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 601 hom 43 2 33 8 A 10 11 288974 CASAVA_Build 2 18401513 1D CAGAATGAAG A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 81 het 33 0 27 7 A 8 7 288975 CASAVA_Build 2 18404785 1D AGGATGAGGG C/- CAGTAGACTG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 C 2 1 288976 CASAVA_Build 2 18409891 1D ATGTTGCAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 10 9 288977 CASAVA_Build 2 18413815 1D AGAAGTGTAC A/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 42 17 21 5 A 1 0 288978 CASAVA_Build 2 18417627 1I AACAGAGGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 9 10 288979 CASAVA_Build 2 18418807 1D AAGCTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1545 hom 30 10 12 8 A 15 14 288980 CASAVA_Build 2 18422218 1D CAGGAGTACG A/- GGTTTGGAAA 3070 het 2352 hom 24 7 13 5 A 1 0 288981 CASAVA_Build 2 18425132 1I AAAAAACAAA -/C AAAAAAAAAC 3070 het 270 hom 33 1 26 6 C 0 1 288982 CASAVA_Build 2 18425547 1I GGTGGGAGGT -/G GGGGGTGGAT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 5 6 288983 CASAVA_Build 2 18433954 4D TTTGGAGTTG TAAA/---- TAAATAAATA 3070 het 3070 hom 33 14 17 7 TAAA 4 3 288984 CASAVA_Build 2 18439583 1I GGAGAAGAAA -/C AAAAATAACT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 C 0 1 288985 CASAVA_Build 2 18439700 1I CCTCCCTGAA -/C CTAAAAGTTA 3070 het 1750 hom 27 5 16 6 C 1 2 288986 CASAVA_Build 2 18439822 1D ATTTGGTGAC A/- GGGGGAAGAC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 1 0 288987 CASAVA_Build 2 18440005 2D CTTGAGACTC TT/-- TAGAAATACA 3070 het 3070 ref 20 11 9 1 T 3 1 288988 CASAVA_Build 2 18452022 1D GGATGTATTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 8 7 288989 CASAVA_Build 2 18452590 1I CATATTTTAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 7 8 288990 CASAVA_Build 2 18455575 1D AGCAATAGTC T/- TTTCTAGTTC 3070 het 3070 ref 53 31 16 8 T 4 3 288991 CASAVA_Build 2 18458830 6D14M1D AATTTTGAGG TCTTTCTTTTTCTTTCTTTCT/------TTTTTCTTTCTTTC- TTCTTTCTTT 620 het 620 ref 28 23 3 10 N/A 0 0 288992 CASAVA_Build 2 18459598 2I AAAATATGAC --/TT GTTATAAATG 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 T 0 2 288993 CASAVA_Build 2 18461099 2D TATCCTTCAG AA/-- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 9 7 288994 CASAVA_Build 2 18462357 1D19M2I GGAGAACATC TTGAAACCAGTGAGAAAGAT--/-TGAAACCAGTGAGAAAGATAA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 17 15 3 N/A 0 0 288995 CASAVA_Build 2 18467534 4D ACATCTTCAT TTCA/---- TTCATTCAAC 3070 het 3070 ref 57 27 25 7 TTCA 3 2 288996 CASAVA_Build 2 18468341 4D CGGCCATTCC TCTG/---- TCTATGTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 16 10 TCTG 1 0 288997 CASAVA_Build 2 18470452 2I TCCCCTGAAG --/TA TATAGTCCTA 3070 het 3070 hom 38 18 20 0 TA 2 3 288998 CASAVA_Build 2 18483383 1D CTAAGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 12 11 288999 CASAVA_Build 2 18488336 12D TTAGAAATAT ATACATATATAC/------------ ATACATATAT 3070 het 3070 hom 25 10 12 5 ATACATATATAC 2 1 289000 CASAVA_Build 2 18496355 1I ACTCAGCTCC -/A ATCACTGACC 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 1 2 289001 CASAVA_Build 2 18501898 1I TAATTTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 910 hom 38 3 31 4 T 11 12 289002 CASAVA_Build 2 18543657 1D TTTGCTAACC T/- TTTTTTTTTA 1209 het 1209 ref 39 27 3 9 T 10 9 289003 CASAVA_Build 2 18564865 1D AGGCTGCTAC T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 7 6 289004 CASAVA_Build 2 18565914 1I TGTATTAGCG -/C CCCCCCCCCT 3070 hom 72 het 31 0 20 11 C 9 10 289005 CASAVA_Build 2 18567746 15I GCCAGTTTTT ---------------/CTGCCATGACAAGAA CTGCTTGCTA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 CTGCCATGACAAGAA 0 1 289006 CASAVA_Build 2 18569552 6D GTTGGTATCT GGATAA/------ GGATAACATG 3070 het 3070 hom 42 16 25 9 GGATAA 2 1 289007 CASAVA_Build 2 18574211 1D TTAACTCAAG C/- CCCCCCAGCA 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 C 7 6 289008 CASAVA_Build 2 18577787 1D CCTTCCCTGA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 7 6 289009 CASAVA_Build 2 18580103 1D AAATCAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 12 11 289010 CASAVA_Build 2 18583767 1I TTGAAAAACT -/G GTACCCCACA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 G 1 2 289011 CASAVA_Build 2 18592726 2D AGGTACTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 33 0 25 11 T 16 14 289012 CASAVA_Build 2 18592794 1I ATTGGTGACA -/T TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 6 7 289013 CASAVA_Build 2 18594556 20D CTATAAGGGG AACAACAAGGTCTGGATGAC/-------------------- AGCACATCTG 3070 het 3070 ref 31 19 16 4 AACAACAAGGTCTGGATGAC 1 0 289014 CASAVA_Build 2 18598389 6D TGAAACAAAT AATTAA/------ AATTAAGTAG 3070 het 3070 hom 47 18 27 3 AATTAA 2 1 289015 CASAVA_Build 2 18601973 3I AAAGAAATGC ---/ACA ACATGTTCCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ACA 1 2 289016 CASAVA_Build 2 18665018 1D ATTGGATTCC T/- TTTTTTTTTT 1864 het 682 hom 22 5 8 9 T 17 16 289017 CASAVA_Build 2 18679700 1D ATGCTAGTGA T/- TTTTTGCACA 2644 het 2644 ref 23 10 6 7 T 6 5 289018 CASAVA_Build 2 18685740 1D CACAGTTTTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 T 7 6 289019 CASAVA_Build 2 18688116 1D CAATTTATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 16 8 7 T 10 9 289020 CASAVA_Build 2 18691481 1D ACTAATCTTC T/- TAAGTACAAG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 2 1 289021 CASAVA_Build 2 18706735 2D CTTATGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 29 1 18 11 T 12 10 289022 CASAVA_Build 2 18709961 11I CCAAGTTACC -----------/TTTTTCTTTTT TTTTTCTTTG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 TTTTTCTTTTT 0 1 289023 CASAVA_Build 2 18723176 1D ATGCATTTTA T/- TTTTTTAATA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 7 6 289024 CASAVA_Build 2 18751424 12I AGAGCAAGTC ------------/AGAGGCTCTGGA AGAAAAGTTT 3070 hom 117 het 40 0 40 0 AGAGGCTCTGGA 0 1 289025 CASAVA_Build 2 18752693 3D CTCGATCAGA TTG/--- TTATTATACA 3070 het 3070 ref 34 19 15 2 TTG 1 0 289026 CASAVA_Build 2 18752850 1D TGTATCTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 18 17 7 T 10 9 289027 CASAVA_Build 2 18792295 1I GGCATTTTGC -/G GGGGGGGGGG 479 het 249 hom 16 2 3 11 G 13 14 289028 CASAVA_Build 2 18812923 1I AATTATACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 11 289029 CASAVA_Build 2 18818088 3I AGGTTTCCAT ---/GTA AACTTGAATC 3070 hom 138 het 48 0 45 3 GTA 0 1 289030 CASAVA_Build 2 18821275 2D TATAATGTTA TC/-- TCTTTATTCA 3070 het 3070 hom 53 17 30 8 TC 2 1 289031 CASAVA_Build 2 18821679 1D TGATAAGCCA G/- TAAATATTTC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 G 1 0 289032 CASAVA_Build 2 18822795 17D CATTCTCTGC AAAAAGAAACACAATTT/----------------- AAAAAGAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 11 9 AAAAAGAAACACAATTT 2 1 289033 CASAVA_Build 2 18824832 5D GTCAAATGAT ATATA/----- ATATTATAAA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 ATATA 1 0 289034 CASAVA_Build 2 18834833 9D ACACTAACTA CATAGTATC/--------- CATAGTATCT 3070 het 3070 hom 38 16 18 8 CATAGTATC 2 1 289035 CASAVA_Build 2 18839989 1I ATACAACTTT -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 7 8 289036 CASAVA_Build 2 18843731 4D AGTGACATGA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 56 hom 20 1 10 9 AT 11 9 289037 CASAVA_Build 2 18850804 3I AAGAGAGAAT ---/AAA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 A 9 12 289038 CASAVA_Build 2 18851861 1D CTCCGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 1619 het 1215 hom 15 6 4 5 A 15 14 289039 CASAVA_Build 2 18853638 4D TATAACATTC TAAA/---- TAAATAGCAA 3070 het 3070 ref 31 21 8 2 TAAA 2 1 289040 CASAVA_Build 2 18856480 1D GGTCCCATTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 53 22 25 6 T 9 8 289041 CASAVA_Build 2 18861885 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1957 het 1957 ref 24 7 9 8 T 13 12 289042 CASAVA_Build 2 18881777 2D TTTCAAAAGC TG/-- TGTGTGTGTG 843 het 843 ref 32 19 4 11 TG 10 9 289043 CASAVA_Build 2 18939191 1D CCCTGACATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 10 9 289044 CASAVA_Build 2 18942090 4I TTACAGTCTC ----/AAAG AAATTATTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 AAAG 0 1 289045 CASAVA_Build 2 18956690 2D GGTGCTGAGT GA/-- GGGGAAAGTT 3070 hom 39 het 20 0 10 12 GA 1 0 289046 CASAVA_Build 2 18957737 6I TATATATACA ------/TATATT TATATTATGT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TATATT 1 2 289047 CASAVA_Build 2 18961378 1D AATTACAACA T/- TTTTTCTGTT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 T 6 5 289048 CASAVA_Build 2 18965984 2I TTTAAAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 2196 hom 21 het 11 0 8 3 A 10 12 289049 CASAVA_Build 2 18966264 8D37M8D26M2D57M2I ATATATACAC ATACGTATATGTGTGTGCATATATGTGTATATATACACACGCGTGTGCGTATATGTGTGTATACACACATGTGTGTGAGTATATATATATACACGTATGTGTGGTATATATACACATATGTATGTATATACATATATA--/--------ACGCGTGTGCGTATATGTGTGTATACACACATATGTG--------TGTGTGTATACACACATGTGTGTGAG--TATATATATACACATATGTGTGGTATATATACACATATGTATGTATATACATATATATG TGTGTATATA 3070 het 3070 hom 35 27 21 16 N/A 0 0 289050 CASAVA_Build 2 18984049 8D TTATATTAAA ACAAACAG/-------- ACAAACAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 6 ACAAACAG 1 0 289051 CASAVA_Build 2 18992667 1D TAAAATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 26 1 21 4 A 12 11 289052 CASAVA_Build 2 18994085 1D AGATACAGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 10 9 289053 CASAVA_Build 2 18997289 1D GTACATAATT C/- TTTTATCACT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 1 0 289054 CASAVA_Build 2 19019726 1D AAGAGAAGAT G/- GCTGACGGTT 3070 hom 132 het 46 0 44 2 G 2 1 289055 CASAVA_Build 2 19024267 1D CTCACTTGCC T/- CACCCCTAGT 3070 hom 168 het 62 0 55 7 T 1 0 289056 CASAVA_Build 2 19032907 1D AGACATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 29 1 23 6 T 12 11 289057 CASAVA_Build 2 19034781 4I TTCTCCAACT ----/GTAA GTATTTGATT 3070 hom 69 het 24 0 23 1 GTAA 0 1 289058 CASAVA_Build 2 19037047 1I AAGGAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 9 10 289059 CASAVA_Build 2 19040128 1I AACTGCTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1150 hom 38 3 22 13 A 15 16 289060 CASAVA_Build 2 19092705 1I GGTACTCAGA -/G CCCAGGAGAA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 G 0 1 289061 CASAVA_Build 2 19103901 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 609 het 24 hom 12 1 3 8 A 19 18 289062 CASAVA_Build 2 19107525 1D TGTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 9 289063 CASAVA_Build 2 19109224 1D ATCCTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 1734 het 1734 ref 33 14 5 14 A 15 14 289064 CASAVA_Build 2 19117360 2D TTTGATGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2981 het 135 hom 20 4 8 9 T 16 14 289065 CASAVA_Build 2 19124282 5I CATTCTGATA -----/AAAAG AAAAGAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AAAAG 1 2 289066 CASAVA_Build 2 19131139 1I CTTCCAGCAG -/A ATGGCCAGAC 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 A 1 2 289067 CASAVA_Build 2 19131407 2D TATTAAAAAT TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 TA 5 4 289068 CASAVA_Build 2 19138266 1D CCTTCTTCAG C/- CTCCCAAGTA 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 C 2 1 289069 CASAVA_Build 2 19148434 1D GAAATATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 12 11 289070 CASAVA_Build 2 19150130 1D AAGATACAGC A/- AAAAAAGGAG 3070 het 3070 hom 39 15 17 8 A 7 6 289071 CASAVA_Build 2 19159068 2I AAAAACAAAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AC 5 6 289072 CASAVA_Build 2 19160985 4I CCTAAATCTT ----/AACA AACAATGACA 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 AACA 1 2 289073 CASAVA_Build 2 19161154 1D ACAGCTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 841 hom 39 5 16 18 T 11 10 289074 CASAVA_Build 2 19161264 4I TGGAAGGTGT ----/AAAC AAACATGACT 3070 het 3070 ref 47 18 20 9 AAAC 1 2 289075 CASAVA_Build 2 19162123 6D TTGTTAGTAT TAGTGG/------ TGGTGGTGGT 3070 het 3070 ref 41 20 20 5 TAGTGG 1 0 289076 CASAVA_Build 2 19162444 1I CCAAATGCTT -/G GGGCAAACCT 3070 het 3070 ref 51 26 15 10 G 3 4 289077 CASAVA_Build 2 19173492 1D TCCTTAGAGA G/- GTCTATGGAT 3070 hom 116 het 47 0 42 5 G 2 1 289078 CASAVA_Build 2 19182287 1D CCTCCAAGTG T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 6 289079 CASAVA_Build 2 19193560 1I TGCCAGCTTA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 289080 CASAVA_Build 2 19200836 10I TCCATCACTA ----------/CACCCCTACT CACCCAGGCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CACCCCTACT 0 1 289081 CASAVA_Build 2 19207978 1D ACTAAAAAAA T/- AAATAGCTGG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 1 0 289082 CASAVA_Build 2 19240151 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 38 0 34 6 TG 6 5 289083 CASAVA_Build 2 19254668 2I TTTATACATT --/TA TATATATATA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TA 6 7 289084 CASAVA_Build 2 19255905 1D TATAAATTAT G/- ATAAAAATCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 1 0 289085 CASAVA_Build 2 19256780 1D TTGTGTCTTA G/- GTAGCGCTAA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 G 2 1 289086 CASAVA_Build 2 19264281 1I GTAAAATATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 10 289087 CASAVA_Build 2 19274362 4I GTTGATGGGG ----/TTGT TTGTTTTTTT 2170 hom 12 het 5 0 5 0 TTGT 1 2 289088 CASAVA_Build 2 19289455 1I AGGAGTCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 A 14 15 289089 CASAVA_Build 2 19304733 1D CCTCCATAGC A/- AAAAATGGCC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 6 5 289090 CASAVA_Build 2 19306424 4I ACTCAATAGG ----/TATT TATGTTTTAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TATT 0 1 289091 CASAVA_Build 2 19309906 1I AAAGGGGAGA -/G GGCCAGTCAG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 2 3 289092 CASAVA_Build 2 19321243 1D ACTCAGCCAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 7 289093 CASAVA_Build 2 19323642 1I ATACCTAATG -/C TAAATGACGA 1381 het 1381 ref 8 4 3 1 C 0 1 289094 CASAVA_Build 2 19361887 1I CATTTTTTCC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 8 9 289095 CASAVA_Build 2 19368040 2I TTGAGTAAAA --/AT ATAGAGTTGA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 AT 1 2 289096 CASAVA_Build 2 19378877 2I CTTTTTTACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 424 hom 32 1 21 10 A 13 15 289097 CASAVA_Build 2 19404075 1I AATATTAACC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 8 9 289098 CASAVA_Build 2 19469387 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 24 2 12 10 T 13 12 289099 CASAVA_Build 2 19491490 2D TGTCCTTGGG CT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 47 9 18 21 CT 1 0 289100 CASAVA_Build 2 19496438 1D CTTTAAGAGC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 9 8 289101 CASAVA_Build 2 19499299 3D CTGTTGCTGG CCT/--- CCTCCCTATT 3070 het 3070 hom 43 19 21 5 CCT 2 1 289102 CASAVA_Build 2 19520950 3D TTCTCTGATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 5 T 13 10 289103 CASAVA_Build 2 19525086 1I TTTTTTCCTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 6 7 289104 CASAVA_Build 2 19526521 39D AACCAGTAGC CAGAGGTCAAGGAAGGGGGTGTCCAGAGGGGTAGAGGGG/--------------------------------------- CAGACAAGCT 3070 het 3070 ref 30 24 12 6 CAGAGGTCAAGGAAGGGGGTGTCCAGAGGGGTAGAGGGG 1 0 289105 CASAVA_Build 2 19528437 1D TCTACTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 12 11 289106 CASAVA_Build 2 19529514 2I CTGTGTGAGC --/AG AGAGAGCAGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AG 3 4 289107 CASAVA_Build 2 19530950 1I GGCCAATAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 T 9 10 289108 CASAVA_Build 2 19535537 1I ATCTAACTCA -/C CCAAAGGGAT 3070 hom 104 het 39 0 33 6 C 2 3 289109 CASAVA_Build 2 19537918 1D TTATGAATTG A/- AAAAAAAAAG 1151 het 1151 ref 34 28 3 3 A 10 9 289110 CASAVA_Build 2 19544552 1D CAGTAAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 49 1 36 12 A 12 11 289111 CASAVA_Build 2 19546190 2D TGTATACATG TA/-- TATGTATACG 1905 het 1905 ref 19 11 5 4 TA 2 1 289112 CASAVA_Build 2 19556837 1D GTTCTGGCCC T/- TTGGGGAGCT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 3 2 289113 CASAVA_Build 2 19557010 1D AAGCGAGAGG A/- AGTTTGGGAA 3070 het 3070 ref 65 31 26 8 A 2 1 289114 CASAVA_Build 2 19564388 2I ACTGAGAAAT --/AC AGTTTTTTAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AC 0 1 289115 CASAVA_Build 2 19567563 1D GATCCAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 36 3 15 19 A 17 16 289116 CASAVA_Build 2 19571449 1D TTCAGAATAT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 7 289117 CASAVA_Build 2 19572909 1D CAAAGGGGGG A/- AAAAACCCCT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 6 5 289118 CASAVA_Build 2 19580087 1D AACTGCATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 T 9 8 289119 CASAVA_Build 2 19583615 1I AGATCATTTG -/A AAAAAATTAC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 6 7 289120 CASAVA_Build 2 19586177 3I AAGATCCAGA ---/CCC CCCCTGATAG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 4 7 289121 CASAVA_Build 2 19593296 2I ACATTTATCT --/CG TGGGGTGTGT 3070 het 337 hom 36 1 28 7 CG 0 1 289122 CASAVA_Build 2 19605041 1D TCTTCTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1383 hom 36 4 26 6 A 13 12 289123 CASAVA_Build 2 19605446 2I CTCTCTAATA --/CT CTCTGAAACA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 CT 2 3 289124 CASAVA_Build 2 19614800 1I TCGCCAAATG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 52 25 17 10 T 7 8 289125 CASAVA_Build 2 19619263 1I AGTCACCCCA -/G GGAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 G 2 3 289126 CASAVA_Build 2 19619538 3D TCACAGAGGA GAG/--- GAGATCTTCC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 GAG 2 1 289127 CASAVA_Build 2 19621670 1D GTGTTGTCTG T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 T 8 7 289128 CASAVA_Build 2 19635674 4D GTATCCAGGG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 3 het 50 2 34 16 CT 12 10 289129 CASAVA_Build 2 19643027 1D TGGTGAGGTT A/- AAAAAAAAAC 838 het 838 ref 27 21 3 3 A 10 9 289130 CASAVA_Build 2 19650693 4I GGCTTCAGAG ----/GGCA GGCACTATGC 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 GGCA 1 2 289131 CASAVA_Build 2 19651283 2D CTCTTTTCTT TA/-- TATATATATA 1314 het 1314 ref 38 26 3 10 TA 7 6 289132 CASAVA_Build 2 19655773 2D TCTCCACTAT AA/-- AAGTCATTCT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 A 4 2 289133 CASAVA_Build 2 19659162 1D CTCTAGAGAA C/- CCTGACTAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 3 2 289134 CASAVA_Build 2 19664991 2D ACACACACGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 105 het 48 0 35 13 AC 9 8 289135 CASAVA_Build 2 19675768 1I TCAGCAATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 40 0 33 8 T 9 10 289136 CASAVA_Build 2 19683418 25D ACAAGAAACT ACAGAAACAAGAATAAAACAAACAA/------------------------- ACAAAAACAA 3070 hom 60 het 21 0 21 1 ACAGAAACAAGAATAAAACAAACAA 1 0 289137 CASAVA_Build 2 19689952 1I GACTTTTACA -/C CCAGACATGC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 2 3 289138 CASAVA_Build 2 19695413 1D TTAAATTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1275 hom 38 5 24 10 A 16 15 289139 CASAVA_Build 2 19700532 1D AGAAATTATG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 9 8 289140 CASAVA_Build 2 19701766 2D AGCTGTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 142 hom 28 3 16 9 T 16 14 289141 CASAVA_Build 2 19702168 1I AAGACACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 41 2 28 11 A 15 16 289142 CASAVA_Build 2 19702425 1D GTCATAAGTA T/- TTTTTTACCA 3070 hom 96 het 41 0 33 10 T 7 6 289143 CASAVA_Build 2 19703988 1I AAATAGTACC -/A AAAAAAACTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 8 289144 CASAVA_Build 2 19711159 1D ATTTTTAGCC T/- TTTTTTTTTT 1970 het 1970 ref 41 26 6 9 T 13 12 289145 CASAVA_Build 2 19719564 1D TTTCTACAGC A/- AAAAGGGCCA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 5 4 289146 CASAVA_Build 2 19747239 10I GGCTAATTTC ----------/TTTTCTTTCA TTCTCTGGCC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 TTTTCTTTCA 0 1 289147 CASAVA_Build 2 19753814 14D AGGGAGAGAC AGGGAGGGAGAGAG/-------------- AGGGAGGGAG 3070 hom 46 het 24 0 17 13 AGGGAGGGAGAGAG 1 0 289148 CASAVA_Build 2 19754056 4I AGTGCCATCC ----/CTTA CTTAGAGAAC 3070 het 3070 ref 30 19 7 4 CTTA 1 2 289149 CASAVA_Build 2 19774234 4D CCAGATGAAT AAAG/---- AAAGTATCTA 3070 het 3070 hom 28 11 16 3 AAAG 2 1 289150 CASAVA_Build 2 19775769 2D AAAACTATCT CA/-- GTTTTAGCAC 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 CA 1 0 289151 CASAVA_Build 2 19776041 1D GTAATAATTC A/- CTTATTGAGA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 1 0 289152 CASAVA_Build 2 19778003 1D AATTGAGGTC A/- GGGGGAGACT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 1 0 289153 CASAVA_Build 2 19779169 1I TAATGGATCC -/A AATTGCTCTT 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 A 2 3 289154 CASAVA_Build 2 19789765 3D AATGAAAAAT CTC/--- CTCCTTCGGC 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 CTC 2 1 289155 CASAVA_Build 2 19796417 1D GTTTTCAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 T 10 9 289156 CASAVA_Build 2 19799204 2D TCAGCCCATG CT/-- CTCTTTTCCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CT 3 2 289157 CASAVA_Build 2 19806351 1I ATAGGCCTTG -/C CCTTGGCCAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 3 289158 CASAVA_Build 2 19809286 3I GCAGCTGGGA ---/GAG GAGGAGGACA 3070 hom 62 het 25 0 18 7 GAG 2 3 289159 CASAVA_Build 2 19815085 1D CCCAGGGACC A/- AGGGTTAGGA 3070 hom 71 het 27 0 24 3 A 2 1 289160 CASAVA_Build 2 19847584 2D ATATACACAC CA/-- CAGTCACATA 3070 hom 58 het 27 0 16 13 CA 2 1 289161 CASAVA_Build 2 19890000 1D TTTGTTTAAA C/- AAAAAAAAAA 2392 het 2392 ref 47 20 13 16 C 1 0 289162 CASAVA_Build 2 19901284 1I TCATGATCCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 49 21 18 10 T 8 9 289163 CASAVA_Build 2 19910749 14D GTCGCTTTGG TGGCCCTCCCTAAA/-------------- TAGAGGAAGA 3070 het 3070 ref 53 25 23 11 TGGCCCTCCCTAAA 1 0 289164 CASAVA_Build 2 19940939 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 A 12 11 289165 CASAVA_Build 2 19942840 1D TCCTCCCTCT C/- CCCCCAACTT 3070 hom 103 het 41 0 33 8 C 6 5 289166 CASAVA_Build 2 19949119 1I GGTGTGGGTT -/A AAAAAAAAAA 1053 het 1053 ref 35 23 4 8 A 13 14 289167 CASAVA_Build 2 19958642 1D TTGCTTTTTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 A 9 8 289168 CASAVA_Build 2 19970564 4I CTGTATTTCT ----/ATTA ATTGATTTTG 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 ATTA 0 1 289169 CASAVA_Build 2 19978340 25D AAAAGCAGAC TTAATATTAGATTTAATATTAAGAT/------------------------- TTAATATTAG 3070 het 3070 ref 25 16 10 1 TTAATATTAGATTTAATATTAAGAT 1 0 289170 CASAVA_Build 2 19999114 3I AAATGAAAAG ---/AAT AAAAGCCAAT 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 AAT 0 1 289171 CASAVA_Build 2 20005791 1I TCATTAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 T 10 11 289172 CASAVA_Build 2 20019150 1D AACTGAGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 T 10 9 289173 CASAVA_Build 2 20047255 30D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATAC/------------------------------ ATATATACAC 3070 hom 5 het 26 0 20 9 ATATATATATATATATATATATATATATAC 1 0 289174 CASAVA_Build 2 20068905 4I CCACCAAAAA ----/AAAG AGAATAATAC 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 AAAG 0 1 289175 CASAVA_Build 2 20070758 1I GCAATAAGAG -/C CAAGACATCA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 C 1 2 289176 CASAVA_Build 2 20078893 1D AATCTTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 13 18 11 T 10 9 289177 CASAVA_Build 2 20083126 3I AAACTGCTAG ---/GAC CTCTCAGCTC 3070 het 3070 ref 56 24 21 11 GAC 0 1 289178 CASAVA_Build 2 20088038 1D ACTCCTGACC T/- CATGATCTGC 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 T 1 0 289179 CASAVA_Build 2 20099435 1I CAGGCCAACA -/G GCCCTGCCCC 2674 hom 35 het 18 0 10 8 G 1 2 289180 CASAVA_Build 2 20099475 1I TCCCCACCCT -/C CCCTCTGTGT 853 het 853 ref 20 5 3 12 C 3 4 289181 CASAVA_Build 2 20122308 4D61M1D TTATTCTATC TATTCTATCAAGCAAAACATTAAGCAGATTTGCAAAATATTAAATAATGCCACTCTTCTTGCAAGC/----CTATCAAGCAAAACATTAAGCAGATTTGCAAAATATTAAATAATGCCACTCTTCTTGCAAG- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 29 19 14 7 N/A 0 0 289182 CASAVA_Build 2 20127537 1D CCGCCTCTTA G/- GGCCTCAGTC 3070 het 3070 hom 57 24 25 10 G 3 2 289183 CASAVA_Build 2 20132996 1I ATTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 12 0 8 4 A 10 11 289184 CASAVA_Build 2 20138664 1I TTATTTTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2462 hom 27 8 12 7 A 13 14 289185 CASAVA_Build 2 20138730 1D TTTGGTGGAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 2481 hom 18 6 8 4 A 9 8 289186 CASAVA_Build 2 20157015 1I AGCCTGGGAG -/A AAAAAAAAAA 1288 het 1288 ref 38 22 7 9 A 11 12 289187 CASAVA_Build 2 20161563 3I TGCATCCAGC ---/ACT ACAAGAAACC 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 ACT 0 1 289188 CASAVA_Build 2 20162279 1D AAATAACTAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 16 16 0 T 9 8 289189 CASAVA_Build 2 20184470 1D ATATCTACCA G/- GTATTTCAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 G 2 1 289190 CASAVA_Build 2 20192001 2D TATGTATGTC AT/-- ATTGTATATA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AT 2 1 289191 CASAVA_Build 2 20197021 1D CACTCCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 27 1 14 12 A 14 13 289192 CASAVA_Build 2 20197321 5D ATAAAATCTT AAAAG/----- AAAAAAGAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAAAG 1 0 289193 CASAVA_Build 2 20200602 1D CCCCGGAGGC A/- GCGAGTGTGC 3070 het 1780 hom 24 7 13 5 A 1 0 289194 CASAVA_Build 2 20200661 1I CTCCCCCGCA -/G GGCTTCGCCA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 2 3 289195 CASAVA_Build 2 20215829 12D AATTGAGGTG TTTGTTTTTGTT/------------ TTTGTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 TTTGTT 4 2 289196 CASAVA_Build 2 20218542 4D CTCTCTTTCT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 1807 hom 25 7 14 5 TC 11 9 289197 CASAVA_Build 2 20223993 1I TTATAAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 20 11 T 12 13 289198 CASAVA_Build 2 20229522 2D CACTCACAAA AC/-- ACACACACAC 1458 het 1458 ref 49 31 4 15 AC 8 7 289199 CASAVA_Build 2 20233651 1D TTTTAAATCA C/- CACTTAAGAC 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 C 2 1 289200 CASAVA_Build 2 20238972 1D GACCTCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2371 hom 22 7 11 4 A 12 11 289201 CASAVA_Build 2 20257378 1I GTGTCTCACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 22 2 20 0 A 11 12 289202 CASAVA_Build 2 20257863 1I TTTTGCTTTA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 101 het 40 0 32 8 T 8 9 289203 CASAVA_Build 2 20258577 5D CCTTATTTGC AATTA/----- AATTAAATAA 3070 het 3070 ref 55 26 24 7 AATTA 2 1 289204 CASAVA_Build 2 20262705 2D CATGCAATGT AC/-- ACACACACTC 3070 het 3070 ref 38 23 13 4 AC 5 4 289205 CASAVA_Build 2 20263455 7D CAGGCCATTC CTGGGGT/------- CTGGGGTCTG 3070 hom 72 het 30 0 20 11 CTGGGGT 3 2 289206 CASAVA_Build 2 20265340 1D CTCCTAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 943 hom 35 6 15 14 A 17 16 289207 CASAVA_Build 2 20275344 1I GCTGGCCCCG -/C CGGCTTTAGC 3070 hom 66 het 25 0 19 6 C 1 2 289208 CASAVA_Build 2 20279133 1D CTCGGTCCCA C/- CTCAGCTGTG 3070 hom 143 het 51 0 44 7 C 2 1 289209 CASAVA_Build 2 20285331 4D ACCACAGTAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 96 het 43 0 32 11 AC 11 9 289210 CASAVA_Build 2 20292838 4I AGAGAACGAG ----/GGAA GGAAGGAAGG 3070 hom 29 het 16 0 10 6 GGAA 3 4 289211 CASAVA_Build 2 20309991 4D GATTCATGAG TATT/---- TATTTGTGAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 6 TATT 2 1 289212 CASAVA_Build 2 20317410 1D TATTTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 31 1 25 5 T 11 10 289213 CASAVA_Build 2 20325144 1I AGCTCAGCCT -/G GGCAACACAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 2 3 289214 CASAVA_Build 2 20329109 2I TACCTCAAAC --/AT ACCCTTAATG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AT 0 1 289215 CASAVA_Build 2 20330439 1D TAAGTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 9 8 289216 CASAVA_Build 2 20333790 2D TAAAAAACAA AT/-- AAACACACAC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AT 1 0 289217 CASAVA_Build 2 20353678 27D TCTGATACAT ATTTACCATTCCTGTCGTTGAGTCTCA/--------------------------- ATTTACCATT 3070 hom 66 het 28 0 23 13 ATTTACCATTCCTGTCGTTGAGTCTCA 2 1 289218 CASAVA_Build 2 20367230 3I CTGGCTGATC ---/CTT CTTCTTTGTA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 CTT 2 3 289219 CASAVA_Build 2 20373912 7I TTTGCTTTTG -------/ATAATTA AAGGCAATAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 ATAATTA 0 1 289220 CASAVA_Build 2 20394525 6I GCTCAGTTAC ------/TAAAGG TAAACGTTAC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 TAAAGG 0 1 289221 CASAVA_Build 2 20405698 1D AAAACTGTTT A/- ACCTTAACCC 3070 hom 118 het 46 0 39 7 A 2 1 289222 CASAVA_Build 2 20445376 1D CTCTATAAAG A/- AAAAAAAAAA 1227 het 1227 ref 29 16 4 9 A 15 14 289223 CASAVA_Build 2 20467864 1I ACACTGCTAA -/T AAGGACATAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 0 1 289224 CASAVA_Build 2 20469405 1I AACATTTTAC -/T TTTTTGTAGT 3070 hom 75 het 31 0 24 7 T 5 6 289225 CASAVA_Build 2 20472482 1I TGGTTGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 10 11 289226 CASAVA_Build 2 20474878 1D AGTATCAACT A/- CCTTCTCTGG 3070 hom 112 het 44 0 36 8 A 1 0 289227 CASAVA_Build 2 20487696 1D CTGGGTACCA C/- CACCTGCCTC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 C 2 1 289228 CASAVA_Build 2 20497369 1I AAGGGCCTGG -/C CCTGTGGGGG 3070 hom 89 het 33 0 28 5 C 2 3 289229 CASAVA_Build 2 20507739 1I TTCTAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 11 12 289230 CASAVA_Build 2 20512415 1I TTGGGGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 16 9 T 12 13 289231 CASAVA_Build 2 20513009 1I48M3D CACTTGTGTC -TTTAAGTCTATTATGGGGCTTTGCTTATTCTTTGAGTCTTGGAAAGTTATC/TTTTAAGTCTATTATGGGGCTTTGCTTATTCTTTGAGTCTTGGAAAGTT--- ATTTGTGCAT 3070 het 3070 ref 43 29 24 5 N/A 0 0 289232 CASAVA_Build 2 20516492 3D CTTTACTGAT GAG/--- GAAACTGAGC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 GAG 1 0 289233 CASAVA_Build 2 20521531 1D CAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 11 10 289234 CASAVA_Build 2 20527978 1D CAAACCTGCA G/- ATCCTGCACA 3070 het 2167 hom 13 5 7 2 G 1 0 289235 CASAVA_Build 2 20536354 1I CAGCTTCCCA -/C TGAAGGGTAC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 0 1 289236 CASAVA_Build 2 20543058 9I CTCTCCAGGC ---------/CCTGAGCAT CCAGGTGTCC 3070 het 3070 hom 53 15 26 12 CCTGAGCAT 0 1 289237 CASAVA_Build 2 20543752 1D GCCTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2718 het 2141 hom 18 7 7 4 A 13 12 289238 CASAVA_Build 2 20544052 3D15M1I GAAAAAAAAC AAAAAAAAACAAAAAAAC-/---AAAAACCAAAAAAACA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 21 11 13 3 N/A 0 0 289239 CASAVA_Build 2 20545452 1D CAGAAAGCTC T/- TTTTTGTGGT 3070 het 3070 ref 29 13 12 5 T 6 5 289240 CASAVA_Build 2 20549397 2I GGTGATATTT --/GA GAAAGATCTG 3070 het 3009 hom 27 9 12 6 GA 1 2 289241 CASAVA_Build 2 20552247 1I AGTCCCTCTT -/C CCTTTCGGGA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 2 3 289242 CASAVA_Build 2 20552619 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 199 hom 17 2 9 6 T 16 15 289243 CASAVA_Build 2 20554078 1D AGATGACTTC T/- CTTGTGCTTG 3070 het 3070 hom 56 19 24 14 T 1 0 289244 CASAVA_Build 2 20564129 1D AGGCTCACTC A/- AAAAAAAAAA 647 het 647 ref 22 7 4 11 A 19 18 289245 CASAVA_Build 2 20568518 1I GGTTGTGACA -/T TTTTTCATTA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 5 6 289246 CASAVA_Build 2 20569533 1I GGATGGGAGA -/T AGGGCCAAGC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 0 1 289247 CASAVA_Build 2 20572228 1D TGGTCTGACC A/- AGGCGTAAAC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 2 1 289248 CASAVA_Build 2 20575068 1D TGGGGCGCAC A/- ATTCTAAATC 2255 het 2255 ref 27 9 9 10 A 2 1 289249 CASAVA_Build 2 20579187 3I GGGGTTCAGA ---/GGT GGTGGCGGGC 3070 het 3070 hom 30 16 10 4 GGT 1 2 289250 CASAVA_Build 2 20591614 2D CCAGGGGTTC AA/-- CTAAGTCAAC 3070 het 3070 ref 37 20 12 6 A 2 0 289251 CASAVA_Build 2 20593751 3D TGGCTCTTGC AGT/--- AGTACATCAG 3070 het 3070 ref 48 26 15 8 AGT 2 1 289252 CASAVA_Build 2 20598745 1I AAGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2882 hom 31 8 15 8 A 10 11 289253 CASAVA_Build 2 20601276 9D TGACACCTGT GTCTTTTCC/--------- GTCTTTTCCG 3004 het 3004 ref 35 20 9 10 GTCTTTTCC 2 1 289254 CASAVA_Build 2 20604867 1I GAGCCACTTG -/C TCAATCAGGC 3070 hom 111 het 41 0 35 6 C 0 1 289255 CASAVA_Build 2 20606119 1I AGTGGAGAGA -/C CCACACCCTG 3070 hom 99 het 38 0 32 6 C 2 3 289256 CASAVA_Build 2 20619714 1D AAATATATTA T/- CAAATTCTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 8 T 1 0 289257 CASAVA_Build 2 20630782 1D GCCAAACAAA G/- GGGGTCTGCG 3070 hom 56 het 24 0 17 7 G 5 4 289258 CASAVA_Build 2 20633424 1D GAAAAGAGAG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 114 het 42 0 36 7 T 8 7 289259 CASAVA_Build 2 20639002 4D CTTGGTTCCA CCCC/---- CCCCCCCCCC 3070 hom 44 het 18 0 13 7 C 14 10 289260 CASAVA_Build 2 20643216 1D AATGTAAGTG A/- AAATGTTTTG 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 A 4 3 289261 CASAVA_Build 2 20655390 1D GTGCCCTGCT G/- CTGCAACCCC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 G 1 0 289262 CASAVA_Build 2 20661488 1D CTTGTTTGCC T/- GCAACTAGAT 3070 hom 69 het 29 0 24 7 T 1 0 289263 CASAVA_Build 2 20670221 1I TATCTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 9 10 289264 CASAVA_Build 2 20670403 1I AACTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 1559 het 1261 hom 17 4 6 7 T 12 13 289265 CASAVA_Build 2 20672697 1I TTGTAGCTCA -/G GCTCTTGGAG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 1 2 289266 CASAVA_Build 2 20680872 6I CCCTCAGGGC ------/TGGCTT TGGCTTTGGT 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 TGGCTT 1 2 289267 CASAVA_Build 2 20705604 1I GGAGGCAGCT -/G GGGGGGATTT 3070 hom 55 het 24 0 15 9 G 6 7 289268 CASAVA_Build 2 20732159 12I GACTGAAGGG ------------/TGCCCTGTAGGC TCCCAGGCTG 2444 het 2444 ref 33 15 9 9 TGCCCTGTAGGC 0 1 289269 CASAVA_Build 2 20732666 1D18M1D AATTTTAAAC TTTTTTTTTTTCTGAGCCCA/-TTTTTTTTTTCTGAGCCC- AAAAGGAAAA 2272 het 2272 ref 28 19 5 6 N/A 0 0 289270 CASAVA_Build 2 20735236 6D AGCATCTTTC TTTTTT/------ TAACTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 6 T 7 1 289271 CASAVA_Build 2 20736444 1I CTCCCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 A 9 10 289272 CASAVA_Build 2 20739327 1D CCTGGTTGGT C/- ACCCAAACGG 2971 het 2971 ref 37 17 9 12 C 1 0 289273 CASAVA_Build 2 20745436 1D CTGCCTGATG C/- ATATTTTTGC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 1 0 289274 CASAVA_Build 2 20747100 1D33M5D TATCTCCATT AAAAAAAAAATGAGGAGCTGGGGGACTCAGGGAGGTGAA/-AAAAAAAAATGAGGAGCTGGGGGACTCAGGGAG----- GTGAAGTCTT 3070 het 349 hom 31 1 28 17 N/A 0 0 289275 CASAVA_Build 2 20754590 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 92 het 43 0 33 10 T 9 10 289276 CASAVA_Build 2 20757401 1I CCAGCTAGGG -/C CCCCTACCCT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 4 5 289277 CASAVA_Build 2 20772729 1D TGGCTATAAT A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 49 22 24 4 A 7 6 289278 CASAVA_Build 2 20780104 31I TTTTTTTTTC -------------------------------/ATACTGTATAGTATTCCATGGTGTAGATGTG CCAGAGCCTC 3070 het 3070 ref 26 14 12 1 ATACTGTATAGTATTCCATGGTGTAGATGTG 0 1 289279 CASAVA_Build 2 20782708 3I AATAATGAGT ---/AAG AAGATCTAAA 3070 het 3070 ref 41 22 19 0 AAG 1 2 289280 CASAVA_Build 2 20791777 2I TTGAGTGTTG --/CT CTCTCTCAGT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 CT 3 4 289281 CASAVA_Build 2 20792058 1I GGTTATGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 11 12 289282 CASAVA_Build 2 20792454 1I GGAAGAGTCC -/T TTTCTTTCAA 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 T 3 4 289283 CASAVA_Build 2 20793725 1I TGGTTGCTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 8 9 289284 CASAVA_Build 2 20796136 10D TAGAGACAGG GTCTCACTAT/---------- GTCGCCTAGG 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 GTCTCACTAT 1 0 289285 CASAVA_Build 2 20806035 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2817 het 683 hom 28 4 10 14 T 18 17 289286 CASAVA_Build 2 20806553 2D CCAAGTCCAC TT/-- TTTTTTTTTT 1602 het 1345 hom 13 6 5 2 T 16 14 289287 CASAVA_Build 2 20815448 1D AGTAGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 11 10 289288 CASAVA_Build 2 20824629 1D TTGTGGCTAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 95 het 37 0 30 7 A 9 8 289289 CASAVA_Build 2 20827207 1D CCAAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1653 hom 29 4 13 12 T 13 12 289290 CASAVA_Build 2 20835000 42D GAGGTGACCT TTTGGACAATTTATTGCACACATTATTTTCTAGCTTACACCC/------------------------------------------ TTTGGACAAT 2416 hom 21 het 21 0 8 18 TTTGGACAATTTATTGCACACATTATTTTCTAGCTTACACCC 2 1 289291 CASAVA_Build 2 20850584 2D ACCTAGGCTG GA/-- GTGCAGTGGC 3070 het 3070 hom 33 8 20 5 GA 1 0 289292 CASAVA_Build 2 20857299 2D CAAAGAAGAG GT/-- TTCATGGACT 3070 het 3070 hom 36 13 17 7 GT 1 0 289293 CASAVA_Build 2 20864331 2I TGACACAAAC --/AT ACACACACAC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 AT 0 1 289294 CASAVA_Build 2 20868506 4D CTAACACCTC AAAT/---- AAAATAAGCT 3070 het 3070 ref 33 18 12 5 AAAT 1 0 289295 CASAVA_Build 2 20869140 4I TCTATGTAAA ----/TACT TATAATATTT 3070 het 3070 hom 24 13 11 0 TACT 0 1 289296 CASAVA_Build 2 20877471 1D GTCTGACAAT G/- GGGGGGGGGG 2542 het 10 hom 21 0 11 11 G 12 11 289297 CASAVA_Build 2 20881812 1D AAACTACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 11 10 289298 CASAVA_Build 2 20882458 1D ACACACACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 7 20 6 T 9 8 289299 CASAVA_Build 2 20885371 1D CTATCAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 722 hom 26 2 15 9 T 13 12 289300 CASAVA_Build 2 20889890 1D TTGGATATGG T/- TTGTTTTGGC 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 3 2 289301 CASAVA_Build 2 20900181 1D GATCATTCAG T/- TTTTTTTTTT 1826 het 1826 ref 26 11 7 8 T 15 14 289302 CASAVA_Build 2 20917749 1I AGTATTTCTG -/T TTTATTTTCC 3070 het 3070 hom 43 21 19 3 T 3 4 289303 CASAVA_Build 2 20932313 4D TGCATATATA GATT/---- ATGTGTATAT 3070 het 3070 ref 25 12 12 3 GATT 1 0 289304 CASAVA_Build 2 20950956 1I TTCTTTTTTT -/A ATGGCTGTGT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 A 1 2 289305 CASAVA_Build 2 20966191 3I TTCCCAAACC ---/TCT TCAAGTCCTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 TCT 0 1 289306 CASAVA_Build 2 20975526 1D GACCCTGTAG A/- AAAAAAAAAA 854 het 854 ref 46 34 3 10 A 13 12 289307 CASAVA_Build 2 20999586 1D AAAAACAAGC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 A 9 8 289308 CASAVA_Build 2 21004846 2I TATCCGTCTC --/CT ATACCTTAGA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 CT 0 1 289309 CASAVA_Build 2 21038420 2D GCCCCATGGC GG/-- GGGGGGGTTG 3070 het 238 hom 28 2 11 15 G 9 7 289310 CASAVA_Build 2 21039647 2D CCCACATGTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 18 18 9 A 11 9 289311 CASAVA_Build 2 21040040 1I TAAGTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2455 hom 39 8 13 18 A 15 16 289312 CASAVA_Build 2 21043772 4D TGCTTCAGTG CGCC/---- CGCCCGTCAG 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 CGCC 2 1 289313 CASAVA_Build 2 21107127 1D ACAACTCAAC A/- AAAAAATCCC 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 7 6 289314 CASAVA_Build 2 21109079 5I CAAATCTAAC -----/CATCT TTCAAAACCC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 CATCT 0 1 289315 CASAVA_Build 2 21114034 1I ATTTACTGTG -/T TACACCATAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 2 289316 CASAVA_Build 2 21126269 1D AATCTATAAA G/- GAAAGAGGTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 2 1 289317 CASAVA_Build 2 21146841 2I TTACTTTGCT --/AG ACTCAAAGTA 3070 hom 108 het 38 0 35 3 AG 0 1 289318 CASAVA_Build 2 21150188 1I TATAATCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 26 1 20 5 T 12 13 289319 CASAVA_Build 2 21153441 8D TTGACCTCCT ATCCTGCA/-------- ATCCTGCAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 8 ATCCTGCA 3 2 289320 CASAVA_Build 2 21154592 4D ATATCCTGGA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AT 9 7 289321 CASAVA_Build 2 21159997 2I TTTTACCCTG --/TT TTATTGCCCA 3070 hom 132 het 53 0 45 8 T 2 4 289322 CASAVA_Build 2 21162198 1D TATAAGAGCA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 9 8 289323 CASAVA_Build 2 21163733 3D TCACATATTA ATG/--- ATATTTTGGC 3070 hom 45 het 16 0 16 1 ATG 1 0 289324 CASAVA_Build 2 21167284 1D TTCTATATTT C/- ACAAGTTTTG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 C 1 0 289325 CASAVA_Build 2 21173492 6D TGGGGCTTTG TGATGT/------ TGATGTTGGA 3070 het 3070 ref 35 15 13 9 TGATGT 2 1 289326 CASAVA_Build 2 21175523 1I CTTTAGATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 9 10 289327 CASAVA_Build 2 21177334 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1400 het 1395 hom 20 6 7 7 T 11 10 289328 CASAVA_Build 2 21180548 10D AAAATGTTTG CTAGTGCCTA/---------- CTCCATGCGA 3070 het 3070 ref 38 19 19 6 CTAGTGCCTA 1 0 289329 CASAVA_Build 2 21191746 1I AGTTAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1851 hom 26 6 12 8 T 11 12 289330 CASAVA_Build 2 21195433 1I AGGAAAAGGG -/A AAAAGTTGCG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 4 5 289331 CASAVA_Build 2 21197523 1I ACGAAATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 11 12 289332 CASAVA_Build 2 21224701 3D AGACATAATC TCT/--- TCTTTCCTTG 3070 hom 84 het 31 0 29 4 TCT 2 1 289333 CASAVA_Build 2 21225776 2D TTATGATGCC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 25 0 20 6 T 11 9 289334 CASAVA_Build 2 21231434 3D82M1I ATACATGTGA ATTATTATTATTATTATTATACTATGACTCAACATATTTTCCATATATTAGTCTCTCTGCATTGCATTCTGGGTAATCTCCTTAC-/---ATTATTGTTATTATTATACTATGACTCAACATATTTTCCATATATTAGTCTCTCTGCATTGCATTCTGGGTAATCTCCTTACA CCTGTCTCCC 3070 hom 205 het 48 0 69 11 N/A 0 0 289335 CASAVA_Build 2 21231937 1D GCCAAGTGCC T/- TGAGGGCACT 3070 hom 81 het 30 0 27 4 T 2 1 289336 CASAVA_Build 2 21232065 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 18 hom 45 1 32 13 T 10 9 289337 CASAVA_Build 2 21232650 5D GCAAAAACAC AACTA/----- AATAGCACTT 3070 hom 114 het 40 0 39 5 AACTA 1 0 289338 CASAVA_Build 2 21235611 1I CGGGAGGAGG -/A AAAACTAACA 3070 hom 97 het 40 0 33 7 A 4 5 289339 CASAVA_Build 2 21235825 1I GTTTCTGGGC -/T TTGTGGGATA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 3 289340 CASAVA_Build 2 21241907 1I AGCAGTTAAG -/A AAAATGTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 4 5 289341 CASAVA_Build 2 21242850 1I ATTTATTTCA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 6 7 289342 CASAVA_Build 2 21243815 1D ATCATTTAAT A/- ATTTTTGAAA 3070 hom 93 het 36 0 31 6 A 2 1 289343 CASAVA_Build 2 21245081 1D TAAGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 28 1 22 6 T 13 12 289344 CASAVA_Build 2 21245786 1D CCTCCCACCC T/- TTCCCCCCAG 3070 het 105 hom 13 1 11 2 T 3 2 289345 CASAVA_Build 2 21247213 1I GGTACAGAAA -/T GGGGAAAGGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 289346 CASAVA_Build 2 21247874 3I TTATAAAGAA ---/AAG AAGTTTATTT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 AAG 1 2 289347 CASAVA_Build 2 21249598 2I CCTTGTAAAG --/AA TGAAAAATCA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 0 2 289348 CASAVA_Build 2 21252363 1D TATCTTTTAG A/- ATTTAAAAGT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 2 1 289349 CASAVA_Build 2 21252476 1D CTGAAATGCA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 289350 CASAVA_Build 2 21253470 1D CCCAGCTGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 9 8 289351 CASAVA_Build 2 21255389 2I19M6I GGTATCAAGA --CTCTGATAGATTGGATGTG------/CTCTCTGATAGATTGGATGTGAAAGAT AAAGATAAAG 3070 hom 66 het 23 0 23 4 N/A 0 0 289352 CASAVA_Build 2 21256433 4I GTAACCCTAG ----/ATGC ATGCAATTGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 ATGC 1 2 289353 CASAVA_Build 2 21257751 2D TTTTGGAGAC TA/-- TGAGAAGTGC 3070 hom 123 het 45 0 42 4 TA 1 0 289354 CASAVA_Build 2 21268056 1D CACTTCCATT G/- CCTCCTCTTG 2280 het 2280 ref 21 13 5 3 G 1 0 289355 CASAVA_Build 2 21269851 2I GTGGAACAGG --/AA TGTCTCTCCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 0 2 289356 CASAVA_Build 2 21273156 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 38 15 16 9 A 9 8 289357 CASAVA_Build 2 21276724 1I AATAGATTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 T 8 9 289358 CASAVA_Build 2 21280745 4D GCTTTAAATA TTTT/---- TTTTCTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 T 8 4 289359 CASAVA_Build 2 21282443 1D TGTTTTGATA C/- ATATATGCAT 3070 het 3070 hom 41 16 18 8 C 1 0 289360 CASAVA_Build 2 21292188 4D TTCTTAAAGA TTGT/---- TTGCTGCAAA 3070 het 3070 ref 39 23 13 6 TTGT 1 0 289361 CASAVA_Build 2 21296174 2I GTTTAAAGCC --/AT GTTTCCACCT 3070 het 3070 ref 45 30 12 3 AT 0 1 289362 CASAVA_Build 2 21296450 19D CCATGATTGT TGCTCCCCTCTGCTTAGCA/------------------- TGCTCCCCTC 3070 het 3070 hom 31 15 16 7 TGCTCCCCTCTGCTTAGCA 1 0 289363 CASAVA_Build 2 21297601 2D TGGTCTGCAG GT/-- GTCTAGATTT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 GT 2 1 289364 CASAVA_Build 2 21302784 1D TTAAAATGAT A/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 31 13 15 3 A 1 0 289365 CASAVA_Build 2 21310390 1I CACAAACATA -/C CACAATTTAT 3070 het 3070 ref 34 22 7 5 C 1 2 289366 CASAVA_Build 2 21318648 2D AAAATGAAAG AA/-- TGATTGAATC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 2 0 289367 CASAVA_Build 2 21326820 2D CATTGAAATC AT/-- ATAAAATGTT 3070 het 3070 hom 54 20 29 5 AT 2 1 289368 CASAVA_Build 2 21329829 3I CTCCAGATAT ---/GAA GAAGTACAAT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 GAA 1 2 289369 CASAVA_Build 2 21330837 5D TTTTTTTCTC TTTTG/----- TTTTGTTTTC 3070 hom 60 het 26 0 20 8 TTTTG 2 1 289370 CASAVA_Build 2 21336395 8D TCGTCAGTCT GCACTGAG/-------- GGTGTCCCAT 3070 hom 98 het 38 0 30 8 GCACTGAG 1 0 289371 CASAVA_Build 2 21357659 4D TGTGCGTGTG TGTT/---- TGTGAGTGTG 3070 het 3070 hom 49 20 21 10 TGTT 1 0 289372 CASAVA_Build 2 21362273 1D GTGAAATGAT A/- AAAAAAGGTA 3070 hom 126 het 49 0 42 7 A 7 6 289373 CASAVA_Build 2 21363371 3D TCAAAAAAAA AAT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 948 hom 17 6 9 2 AAT 1 0 289374 CASAVA_Build 2 21364542 2D TAGAAACAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 19 17 17 A 14 12 289375 CASAVA_Build 2 21365476 1D ATCAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1287 het 1287 ref 39 26 4 10 A 12 11 289376 CASAVA_Build 2 21383914 1I CAGAGGGCAT -/C TTGGTTTCAT 3070 het 3070 ref 52 32 16 4 C 0 1 289377 CASAVA_Build 2 21387049 2I ACAAACCACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 645 hom 27 4 13 10 T 14 16 289378 CASAVA_Build 2 21387565 1I TATGTGTAAC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 A 7 8 289379 CASAVA_Build 2 21430700 2I AGAACAATGA --/AC AGTTATTGTA 3070 het 3070 ref 31 13 16 2 AC 0 1 289380 CASAVA_Build 2 21444421 2I TTTTTGTAAC --/TT TGCATTCATT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 1 3 289381 CASAVA_Build 2 21457791 4D ACTAGCACTA AAAC/---- AAAATAAGAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 AAAC 1 0 289382 CASAVA_Build 2 21465270 1D GAATATGAAG A/- AAAAGAAGGT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 A 5 4 289383 CASAVA_Build 2 21467552 1I ACAATAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 T 11 12 289384 CASAVA_Build 2 21467709 1I ATCAAAAAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 T 7 8 289385 CASAVA_Build 2 21473621 1D GAGATACATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 A 10 9 289386 CASAVA_Build 2 21476367 1D TTTTTTTTTT C/- CTCTAATATA 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 C 2 1 289387 CASAVA_Build 2 21477026 1D CACCTTCAGG C/- TATCCCATAA 3070 het 3070 hom 56 25 26 6 C 1 0 289388 CASAVA_Build 2 21478998 1I CTTCGCATTC -/T GCAGAGGGCC 3070 het 2604 hom 30 6 14 10 T 0 1 289389 CASAVA_Build 2 21490663 1I GTCAATTGTG -/T TATCAGTAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 2 289390 CASAVA_Build 2 21494399 1D GTGACATAGA G/- TTGATTTGAA 3070 het 3070 hom 46 18 24 5 G 1 0 289391 CASAVA_Build 2 21515092 2D GAATATTAAC TG/-- TATGAATTTA 3070 het 2182 hom 14 5 9 0 TG 1 0 289392 CASAVA_Build 2 21515927 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 2155 het 2152 ref 19 8 8 3 T 13 14 289393 CASAVA_Build 2 21541598 2I CCTGAGTGAT --/TG AGCCATGCTG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TG 0 1 289394 CASAVA_Build 2 21557456 1D AGACTAAATG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 43 21 19 5 A 9 8 289395 CASAVA_Build 2 21578723 1I CCTCTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 938 hom 35 2 29 4 T 12 13 289396 CASAVA_Build 2 21596611 1D GAAATTAAAG C/- AAAAACAGTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 1 0 289397 CASAVA_Build 2 21603157 1I CACAGGATAT -/A AATCTCCTGG 3070 hom 45 het 18 0 14 4 A 2 3 289398 CASAVA_Build 2 21603451 1I TGGAGCTGTT -/C CTATTTGGCC 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 1 2 289399 CASAVA_Build 2 21607108 6D TATCCCTTCG CCTTCT/------ CCTTCTCCTT 3070 hom 82 het 37 0 24 17 CCTTCT 4 3 289400 CASAVA_Build 2 21607996 1D TGCTAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 685 hom 31 3 24 4 T 12 11 289401 CASAVA_Build 2 21612865 1D AACTAACTTG T/- TTTTTGATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 5 289402 CASAVA_Build 2 21622741 2D ATATGGACAG TA/-- TTTTTTTCAA 3070 hom 100 het 39 0 33 6 TA 1 0 289403 CASAVA_Build 2 21638182 3D GGTTTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 32 14 10 10 TTG 5 4 289404 CASAVA_Build 2 21639011 2I TCCTGGCCTC --/AT ATAAAATATT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AT 1 2 289405 CASAVA_Build 2 21639126 1I ATCTGTGTGG -/A AGTAGGAAGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 1 2 289406 CASAVA_Build 2 21643084 1I ACCTTCCACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 486 hom 28 2 19 7 A 9 10 289407 CASAVA_Build 2 21644336 1I GATAATCACA -/T TTTAATTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 3 4 289408 CASAVA_Build 2 21645391 1I AAATGCTTTA -/T TTTACCTTAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 3 4 289409 CASAVA_Build 2 21646051 1D65M1D TTTTTTATTC TTTTTTTTTTCTGTCTTTGTATTTCAGTTTGAGAAGTTTCTATTACCATATCTTCAAGCTCAACAAT/-TTTTTTTTTCTCTCTTTGTATTTCAGTTTGAGAAGTTTCTATTACCATATCTTCAAGCTCAACAA- TTTTTTTCTT 3070 hom 105 het 37 0 36 32 N/A 0 0 289410 CASAVA_Build 2 21646425 5I TCTTTTACCA -----/TGCCT TGTTATTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TGCCT 0 1 289411 CASAVA_Build 2 21654475 2D AGACTGCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 32 1 23 8 A 13 11 289412 CASAVA_Build 2 21655703 1D AAGTTCTTGG A/- AAAAAAGGCA 3070 hom 123 het 43 0 42 2 A 7 6 289413 CASAVA_Build 2 21658035 1D AACAGCTCAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 10 9 289414 CASAVA_Build 2 21659359 1I TTTGATGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 11 12 289415 CASAVA_Build 2 21667203 6I TCTGCAGAAC ------/TGAAAT TAAATATTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TGAAAT 0 1 289416 CASAVA_Build 2 21668080 1D CACCTGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 10 9 289417 CASAVA_Build 2 21675895 1D TGAATTAAGC T/- TTTTTTTTTT 2786 het 1697 hom 30 10 12 8 T 17 16 289418 CASAVA_Build 2 21691503 2I TTTCCCCTAG --/TA TATAGGTGAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TA 2 3 289419 CASAVA_Build 2 21697938 1D TTAAGAATAG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 83 het 30 0 28 2 T 7 6 289420 CASAVA_Build 2 21813582 24D ACTGAGGGTG GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/------------------------ GTGTGTGTGT 3070 hom 54 het 21 0 18 7 GT 21 9 289421 CASAVA_Build 2 21866702 2D CTATATATAT AC/-- ACACACACAT 3070 hom 103 het 39 0 35 5 AC 5 4 289422 CASAVA_Build 2 21868072 4D TGCTTGCTTG CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 hom 106 het 43 0 35 8 CTTC 4 3 289423 CASAVA_Build 2 21891227 1I ACTACATTTG -/T TTCAATGGTG 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 2 3 289424 CASAVA_Build 2 21891334 1D TCCAAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 10 9 289425 CASAVA_Build 2 21899496 1I ATAAGTATAT -/C CCATGCAATA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 2 3 289426 CASAVA_Build 2 21902078 1I TGGCCTGCAG -/A AATGGAGATG 3070 hom 137 het 51 0 45 6 A 2 3 289427 CASAVA_Build 2 21903085 5D TTTCTACCTC TTAAT/----- TTATTTGTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 TTAAT 1 0 289428 CASAVA_Build 2 21903828 2I GCATAATTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 T 10 12 289429 CASAVA_Build 2 21904906 6D TTTTTCTTTT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 8 TTTTTC 2 1 289430 CASAVA_Build 2 21907260 1I GTGTACTTTG -/T TTTTTTTGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 289431 CASAVA_Build 2 21907542 1I GAAGATAGGT -/C CCCAATCCCT 3070 het 91 hom 24 2 19 3 C 3 4 289432 CASAVA_Build 2 21912117 1I TCTGTGACTT -/C CCACTTCGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 2 3 289433 CASAVA_Build 2 21916454 1D TAACTCATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 10 9 289434 CASAVA_Build 2 21918049 11D GGGGCCAATG TACAGCTCAGC/----------- CTGTTACTTC 3070 hom 69 het 25 0 22 4 TACAGCTCAGC 1 0 289435 CASAVA_Build 2 21920185 1I ATTTTGTGTG -/T TTTTTTTTTT 984 het 984 ref 49 33 3 13 T 10 11 289436 CASAVA_Build 2 21922906 1I CTCCTAGAGA -/G ATTGCCATGG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 0 1 289437 CASAVA_Build 2 21941338 4D TGGTCAATAA TTTT/---- TTTTTTTCGC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 T 11 7 289438 CASAVA_Build 2 21957204 1D ATAAGTTTTG A/- AAAAAAAAAA 1844 het 1844 ref 36 20 6 11 A 13 12 289439 CASAVA_Build 2 21959393 1D ATGAAGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 16 1 11 5 A 13 12 289440 CASAVA_Build 2 21996045 1I TCTTTCCATG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 7 8 289441 CASAVA_Build 2 22004661 2I GAACTGCCAG --/AC CAGATGACCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AC 0 1 289442 CASAVA_Build 2 22011991 1D CTACACGTCA T/- TCCCAACTCT 3070 het 3070 hom 55 20 28 8 T 2 1 289443 CASAVA_Build 2 22019885 1D TTAAATATAG A/- AAAAAATAGG 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 7 6 289444 CASAVA_Build 2 22023722 3D GCAACCGACT GAC/--- GACAGGGTTG 3070 hom 120 het 42 0 41 3 GAC 2 1 289445 CASAVA_Build 2 22028027 4I TGATGAAGAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 AGAA 2 3 289446 CASAVA_Build 2 22093188 1I TGTTTTAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 17 1 9 8 T 12 13 289447 CASAVA_Build 2 22109083 4D GTAGACATGC ACTG/---- ACTAAGTATT 3070 hom 129 het 49 0 44 7 ACTG 1 0 289448 CASAVA_Build 2 22135267 1I ACCTTTAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 11 12 289449 CASAVA_Build 2 22187033 6D CATCACACTC CACACA/------ CACACACACA 3070 het 3070 hom 34 12 14 11 CA 9 6 289450 CASAVA_Build 2 22228070 1D CACAGCCAAG C/- ATTAAATACT 3070 het 3070 hom 62 25 32 5 C 1 0 289451 CASAVA_Build 2 22290129 1I CTCCCATCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 9 10 289452 CASAVA_Build 2 22290207 4I GCATGTACCT ----/GATA AATATGTACA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 GATA 0 1 289453 CASAVA_Build 2 22291828 2D TCCATCTCAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 AC 10 9 289454 CASAVA_Build 2 22295274 1I TATATAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 10 11 289455 CASAVA_Build 2 22305765 1D TTTTGCTGAT G/- GGGTTCTATT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 G 4 3 289456 CASAVA_Build 2 22327250 2I AGGGGACGCA --/AG ACACCTCCAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 AG 0 1 289457 CASAVA_Build 2 22334177 1D TCAAATCTAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 9 8 289458 CASAVA_Build 2 22334671 1I CTGTTCTTGA -/T TTTTTCACGG 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 5 6 289459 CASAVA_Build 2 22335152 1I TTTAAGACCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2102 hom 36 8 22 6 T 9 10 289460 CASAVA_Build 2 22340357 1D GTTTTGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 12 11 289461 CASAVA_Build 2 22347143 1D TTTCATGAAG T/- TTCATGAAGC 3070 het 3070 ref 53 28 20 5 T 3 2 289462 CASAVA_Build 2 22351889 5I TTCCCTATAC -----/TTCTA TTGTGCACAG 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 TTCTA 0 1 289463 CASAVA_Build 2 22352713 1I CTGCATAGAG -/A AAAGTCTCAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 3 4 289464 CASAVA_Build 2 22364223 1I AAGACATAGG -/T ATTGTGTTTG 3070 hom 87 het 31 0 28 3 T 0 1 289465 CASAVA_Build 2 22368443 4D ATTTGGCAAA TTAG/---- TTAAGAGTTT 3070 het 3070 ref 41 24 16 4 TTAG 1 0 289466 CASAVA_Build 2 22388577 1D CGTAACATGA T/- TTTTGCATAT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 5 4 289467 CASAVA_Build 2 22391701 2I AGTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 1912 het 1912 ref 21 11 6 4 TG 8 9 289468 CASAVA_Build 2 22394548 1D TCTTGCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 32 1 27 4 T 13 12 289469 CASAVA_Build 2 22395244 1D GTAGTCCCAG A/- TACTCTGGAG 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 A 1 0 289470 CASAVA_Build 2 22404488 1D CAACACTTAA C/- CATGTGTTGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 C 2 1 289471 CASAVA_Build 2 22407057 1D ACCAGTGGGG A/- CATTACAACA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 1 0 289472 CASAVA_Build 2 22407630 2I AAGAATGCTC --/AG AGTCTGTCAT 3070 hom 93 het 39 0 30 9 AG 1 2 289473 CASAVA_Build 2 22408327 3D ATGCAATCAC TAT/--- TTGTAGTACC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 TAT 1 0 289474 CASAVA_Build 2 22410406 4D TGCTATAGTT AGAA/---- AGAAAATCTG 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 AGAA 2 1 289475 CASAVA_Build 2 22410689 1D ATCTACAACA T/- TTTTTTTTTT 1962 het 148 hom 22 2 6 14 T 13 12 289476 CASAVA_Build 2 22415244 1D TTTATTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 13 12 289477 CASAVA_Build 2 22422374 8I GTGTTGCAGG --------/CATTTGTA CATTTGTACA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 CATTTGTA 1 2 289478 CASAVA_Build 2 22449785 1D GCTTTTTTTT C/- CCCCCTCATT 3070 het 2934 hom 25 8 15 2 C 6 5 289479 CASAVA_Build 2 22462375 1D TCTCTCTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 A 12 11 289480 CASAVA_Build 2 22466933 1D ATTATGAGGG A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 A 8 7 289481 CASAVA_Build 2 22481845 10I TGGGCTATAT ----------/CCAGGCTGCA GAATATTAAC 3070 het 3070 hom 30 15 15 1 CCAGGCTGCA 0 1 289482 CASAVA_Build 2 22487280 1I TAAAAAATTG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 7 8 289483 CASAVA_Build 2 22494932 1I TCCGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2818 het 2818 ref 16 9 6 1 A 10 11 289484 CASAVA_Build 2 22504745 4I ACTTTAGGAT ----/TAAG TGTTTATGGT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 TAAG 0 1 289485 CASAVA_Build 2 22513218 1I CATTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 A 11 12 289486 CASAVA_Build 2 22516840 3D TATCATGAGA TCT/--- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 TCT 2 1 289487 CASAVA_Build 2 22525485 1I TTTATCTTTA -/C CCCCTATAAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 C 4 5 289488 CASAVA_Build 2 22526772 2I CTATATACAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 AT 6 7 289489 CASAVA_Build 2 22544390 2D TATTGCTGTC AA/-- AAAGGCTGGG 3070 het 3070 hom 62 24 29 9 A 5 3 289490 CASAVA_Build 2 22549225 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 14 13 A 11 12 289491 CASAVA_Build 2 22565098 2D TGTAGGCATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 12 19 13 A 13 11 289492 CASAVA_Build 2 22566350 3D GAAGTGTACA AAC/--- AACAACATCT 3070 het 3070 hom 35 8 21 6 AAC 3 2 289493 CASAVA_Build 2 22581166 1D AGGAAAAGAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 8 7 289494 CASAVA_Build 2 22582897 21D GTCAGACGGG GTCATCCCAGGAAAAAGTTGT/--------------------- GTTCTATTTG 3070 het 3070 ref 35 22 15 7 GTCATCCCAGGAAAAAGTTGT 1 0 289495 CASAVA_Build 2 22586122 1D GTCTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 2938 het 2101 hom 20 6 8 6 A 12 11 289496 CASAVA_Build 2 22591056 1I TATAACTTTG -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 6 7 289497 CASAVA_Build 2 22622099 4D TGTGTGTGTA TGTT/---- TGTTTGTGTG 3070 hom 108 het 39 0 36 4 TGTT 2 1 289498 CASAVA_Build 2 22636741 2D CCCGGATGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 23 0 15 9 A 18 16 289499 CASAVA_Build 2 22646735 1D CTCCTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 34 3 16 15 T 15 14 289500 CASAVA_Build 2 22647044 1I TATTTTCAGG -/A AAAAAAACAC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 7 8 289501 CASAVA_Build 2 22657336 1I CTTTAATCTA -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 T 6 7 289502 CASAVA_Build 2 22665515 29D TCTCCTGCCA TAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGC/----------------------------- TAGCCTCCTG 3070 hom 57 het 24 0 19 7 TAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGC 2 1 289503 CASAVA_Build 2 22670134 4D GATAGAGGAC ACAA/---- ACAAATGAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 5 ACAA 2 1 289504 CASAVA_Build 2 22679171 1D GATAATTTAT A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 7 6 289505 CASAVA_Build 2 22695041 4D CAAATTGATG CTAA/---- CTATCACCTG 3070 hom 60 het 25 0 19 6 CTAA 1 0 289506 CASAVA_Build 2 22702278 1I TCAGCGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 33 1 23 9 T 15 16 289507 CASAVA_Build 2 22714912 1D AATGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 A 11 10 289508 CASAVA_Build 2 22737642 4I AATATTTTAA ----/AAAT AAATATTAAA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 AAAT 1 2 289509 CASAVA_Build 2 22740413 2I AACAAACACC --/AA AAAGTCCAAC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 3 5 289510 CASAVA_Build 2 22745145 1I ATCTAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 A 10 11 289511 CASAVA_Build 2 22745886 1I TAAAAAAAAA -/T AAATAGTGTC 3070 het 147 hom 38 1 33 4 T 0 1 289512 CASAVA_Build 2 22790443 1D ATATCCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 13 12 289513 CASAVA_Build 2 22816271 20D TCACTATCAT GAGAACTCATTCACTATCAC/-------------------- GAGAACAGGA 3070 het 3070 ref 26 16 9 10 GAGAACTCATTCACTATCAC 1 0 289514 CASAVA_Build 2 22824837 1I TGCAGATTTG -/C TTTTTCAAGT 3070 het 3070 hom 56 27 25 4 C 0 1 289515 CASAVA_Build 2 22849782 1D TTAGAATGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 35 0 26 9 A 10 9 289516 CASAVA_Build 2 22861400 1I TTTTACAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 11 12 289517 CASAVA_Build 2 22880035 1D AAACAAAAAC A/- AAACAAACAA 211 het 211 ref 33 17 2 14 A 4 3 289518 CASAVA_Build 2 22922680 1I GCAGTTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 A 12 13 289519 CASAVA_Build 2 22929224 5D TCCCTTTTGG GCCAA/----- GCCAAGTTAG 3070 hom 151 het 55 0 49 9 GCCAA 2 1 289520 CASAVA_Build 2 22940933 2D AACAACAGTT AC/-- AGTTTTTACA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 AC 1 0 289521 CASAVA_Build 2 22941181 1D CCTTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 T 11 10 289522 CASAVA_Build 2 22944195 1D ACAGCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 12 23 13 T 11 10 289523 CASAVA_Build 2 22951971 1D TAACAACTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 32 0 23 9 A 12 11 289524 CASAVA_Build 2 22958798 1D TAATAAAAAT A/- AAATATATTT 2611 hom 18 het 8 0 7 1 A 4 3 289525 CASAVA_Build 2 23015275 4I GAAATATAAA ----/AGAG AGAGAGAGAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AG 4 6 289526 CASAVA_Build 2 23023588 1I GTCAGGCTCC -/T TGTCCTGTCA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 1 2 289527 CASAVA_Build 2 23025403 1D ACTGGGGGAT G/- GGGGAGCTCC 3070 hom 90 het 35 0 28 7 G 5 4 289528 CASAVA_Build 2 23028399 9I GAGACCAGTG ---------/TGGCCAACA TGGCAAAACC 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 TGGCCAACA 0 1 289529 CASAVA_Build 2 23036409 4D TATGGGTGAG AAAT/---- AAGATACCCA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 AAAT 1 0 289530 CASAVA_Build 2 23037308 18D TCATGAGAAT ACACACACACACACACAC/------------------ ACACACACAG 3070 het 1406 hom 34 9 12 20 AC 13 4 289531 CASAVA_Build 2 23042417 1I TTAATCTGCA -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 6 7 289532 CASAVA_Build 2 23046663 2I GAGTCCAAAA --/AG AGAGTCAGCA 2099 het 2099 ref 17 11 5 1 AG 2 3 289533 CASAVA_Build 2 23055340 1D GGGAATTGGA C/- CCCCAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 20 21 7 C 5 4 289534 CASAVA_Build 2 23066578 1D CTTGCTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 15 14 289535 CASAVA_Build 2 23068883 1D CTTTCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 496 hom 32 3 14 16 A 17 16 289536 CASAVA_Build 2 23076920 8D ATCTATATAT ATATATAG/-------- ATATATATAT 2605 het 91 hom 15 2 8 5 ATATATAG 1 0 289537 CASAVA_Build 2 23086146 1D GTTAAGTTTG A/- AATTAAAGAT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 A 3 2 289538 CASAVA_Build 2 23087283 4I ACAACTCTGC ----/TTGT TTATTTTGGC 3070 hom 148 het 58 0 50 8 TTGT 0 1 289539 CASAVA_Build 2 23099392 1D TAATAAAACT A/- AAAAAAAAAA 1022 het 1022 ref 44 36 3 5 A 11 10 289540 CASAVA_Build 2 23105988 4I TATATTTTAA ----/TTGT TTGTTTCATT 3070 hom 120 het 46 0 38 8 TTGT 1 2 289541 CASAVA_Build 2 23108834 2I ACAGACTGAG --/AA AGTTAATTGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 3 289542 CASAVA_Build 2 23111230 1I GCCTGTTTAA -/T TATAACTAAT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 T 1 2 289543 CASAVA_Build 2 23112979 2D ATGAAAAATA CT/-- GTTTCCTCCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 CT 1 0 289544 CASAVA_Build 2 23118570 1I CTTTTCCCAC -/G GCCACAAAGG 3070 hom 51 het 50 1 44 5 G 1 2 289545 CASAVA_Build 2 23133272 1D CATATTGAGC T/- GCAAGGAAGC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 0 289546 CASAVA_Build 2 23155793 1D TACTACATGC A/- AAAAAAAAAT 814 het 814 ref 43 34 3 6 A 10 9 289547 CASAVA_Build 2 23194698 1D CAAACCAGAG C/- CTGATCTGAA 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 C 2 1 289548 CASAVA_Build 2 23198515 1I TTTCCTGAAA -/G GCCTCAACTG 3070 hom 107 het 42 0 30 12 G 1 2 289549 CASAVA_Build 2 23209432 1D AATATGTAGG A/- AAAAAAAAAA 2247 het 2247 ref 45 29 6 10 A 12 11 289550 CASAVA_Build 2 23224179 1I CCAAGAGCCC -/T TTTGTGGGTG 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 T 3 4 289551 CASAVA_Build 2 23243102 1D AGGAAGGAAA G/- CTTCTTACTT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 G 1 0 289552 CASAVA_Build 2 23255520 1I AAGAGAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 A 11 12 289553 CASAVA_Build 2 23276576 1I CATTCAAAGT -/C CTTCTCAATC 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 C 1 2 289554 CASAVA_Build 2 23291407 2D CCTGGTGTGG CT/-- CTCCGGGAAG 3070 hom 77 het 29 0 25 4 CT 2 1 289555 CASAVA_Build 2 23299137 1I AAACATACAA -/C CCCCGCTGAG 3070 het 3070 hom 40 15 14 11 C 4 5 289556 CASAVA_Build 2 23330298 1I TTATGAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 9 10 289557 CASAVA_Build 2 23340921 2D TTAAAAAGAC TT/-- TGTTTTCTCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 3 1 289558 CASAVA_Build 2 23341530 1D TTGCTAAATT C/- ACTTCTTCGC 3070 hom 78 het 32 0 27 6 C 1 0 289559 CASAVA_Build 2 23367577 5D GCAAAATGTG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 33 0 22 11 A 17 12 289560 CASAVA_Build 2 23372372 1D TGTTTAATCA C/- CAGTGTCCCA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 2 1 289561 CASAVA_Build 2 23374703 1D CAGGGTCGGA T/- TTTTGTCATC 3070 hom 122 het 45 0 38 8 T 5 4 289562 CASAVA_Build 2 23378582 1D AAACTTCCCA C/- CTTTTCCACT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 C 2 1 289563 CASAVA_Build 2 23452717 1D TGCCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 1579 het 1579 ref 43 26 4 14 A 13 12 289564 CASAVA_Build 2 23456177 1D CTACGTCCTA C/- CAAAAACCCA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 2 1 289565 CASAVA_Build 2 23465899 1D AAATCCAGCC T/- TTAGTTGTGC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 3 2 289566 CASAVA_Build 2 23474367 2D GAAACTGCAA CC/-- CTTATGCACT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 C 3 1 289567 CASAVA_Build 2 23480647 1I GATGACTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 26 1 22 3 A 10 11 289568 CASAVA_Build 2 23488499 2D TGTGCGTGAA GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 74 het 31 0 20 12 G 13 11 289569 CASAVA_Build 2 23510796 1I GGTTCCCATT -/C CCCTGGTGGG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 C 3 4 289570 CASAVA_Build 2 23514339 1D TCTTCCATTT G/- TTTGTATCCT 2434 hom 12 het 5 0 5 0 G 1 0 289571 CASAVA_Build 2 23531378 1I ACAGTGGGTT -/G GGGGGGGGGG 2156 hom 6 het 15 0 7 8 G 10 11 289572 CASAVA_Build 2 23532666 1I CGGCCCTGGG -/C CCTTGGTGCA 3070 hom 74 het 26 0 22 4 C 2 3 289573 CASAVA_Build 2 23556875 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 9 8 289574 CASAVA_Build 2 23558279 1D GTGACAGGTT A/- AAAAAAAAAA 2378 het 2378 ref 28 14 8 6 A 12 11 289575 CASAVA_Build 2 23565756 1D AGAGTCCCTA T/- TCCGGTGGCT 3070 hom 117 het 42 0 38 4 T 2 1 289576 CASAVA_Build 2 23567935 5D TGGGCCAGCA GCTCT/----- GCTCTGCTCC 3070 het 3070 hom 40 16 16 10 GCTCT 2 1 289577 CASAVA_Build 2 23571141 1I ATTCTGGTGA -/C CCGTCACCTA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 C 2 3 289578 CASAVA_Build 2 23588821 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2803 het 2803 ref 31 14 8 9 A 13 12 289579 CASAVA_Build 2 23594001 4I TTTTTAACAT ----/GCAG GTGCAGAGTG 3070 hom 80 het 30 0 27 3 GCAG 0 1 289580 CASAVA_Build 2 23604614 1I AAAAAGTGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 A 9 10 289581 CASAVA_Build 2 23610909 2D CCAGAATGAC TT/-- ATTTCTTTGC 3070 het 3070 ref 44 21 16 9 T 2 0 289582 CASAVA_Build 2 23615589 2D GCCCTAGGTG TC/-- TCTGTTACGT 3070 hom 68 het 26 0 23 4 TC 2 1 289583 CASAVA_Build 2 23624453 1I GTCAAGCCGA -/G GGCAGGGCCC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 2 3 289584 CASAVA_Build 2 23631496 1D AGGATGACCT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 5 hom 23 1 14 11 C 11 10 289585 CASAVA_Build 2 23649436 1I18M1I TAGCATGAAG -CCTCACGGGTTCGTAGTT-/CCCTCACGGGTTCGTAGTTG GGGCCTGAGC 3070 hom 90 het 29 0 31 4 N/A 0 0 289586 CASAVA_Build 2 23666659 1I CATTCTGAAG -/T TTTTTTTGCC 3070 hom 110 het 41 0 36 5 T 7 8 289587 CASAVA_Build 2 23668628 1I CCATCAGGCT -/G GGTGACCCCG 3070 hom 59 het 24 0 18 6 G 2 3 289588 CASAVA_Build 2 23668684 1D CCATCCTGAG C/- CCCTGGTTGC 2572 het 2314 hom 22 6 6 10 C 4 3 289589 CASAVA_Build 2 23680512 9D TTCTTTTTTG TTTTTTTAT/--------- TTTTTTTATT 3070 hom 42 het 22 0 14 9 TTTTTTTAT 3 2 289590 CASAVA_Build 2 23680643 8I CACGCCTGGC --------/TGATTTTT TGTATTTTTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TGATTTTT 0 1 289591 CASAVA_Build 2 23684821 1I GGGCCCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 30 0 23 7 T 10 11 289592 CASAVA_Build 2 23688260 2I AGATGCAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 641 hom 32 2 25 5 A 12 14 289593 CASAVA_Build 2 23689363 5D GGTGGAGAAC AAATG/----- AAATGAAATT 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 AAATG 2 1 289594 CASAVA_Build 2 23696012 1I CCCTTTGGTG -/A AAAAATCAAT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 A 5 6 289595 CASAVA_Build 2 23704106 7D CAGGATTGTT GTGTGGC/------- GTCAAGAGTC 3070 hom 99 het 34 0 32 4 GTGTGGC 1 0 289596 CASAVA_Build 2 23709357 4D CAAAAGTCTG GCAT/---- GGCCAATCAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 GCAT 1 0 289597 CASAVA_Build 2 23711335 4I CATGGAGCTT ----/TGCC TGCAAAGACA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 TGCC 0 1 289598 CASAVA_Build 2 23717942 1I ATTCACCACA -/T TGCCAGACAC 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 1 2 289599 CASAVA_Build 2 23720648 1D GTCTCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 2109 het 2109 ref 22 9 6 7 A 13 12 289600 CASAVA_Build 2 23722423 1D AGCTGTAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 9 14 11 T 10 9 289601 CASAVA_Build 2 23726729 2I ATCATAGAGT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 CA 7 8 289602 CASAVA_Build 2 23747437 5D ACTCCTCCCT GGATG/----- GGATTCGCAG 3070 hom 18 het 22 0 11 11 GGATG 1 0 289603 CASAVA_Build 2 23750239 3D ACCCTTGTAC CCA/--- CCACATGCTC 3070 hom 184 het 67 0 60 8 CCA 2 1 289604 CASAVA_Build 2 23755427 1D TACCACAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 170 hom 35 3 21 12 A 15 14 289605 CASAVA_Build 2 23759272 1I TTCGGCCTTG -/C CCATGGCTCC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 2 3 289606 CASAVA_Build 2 23761617 1I CATGAGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 880 hom 32 3 18 11 T 11 12 289607 CASAVA_Build 2 23762544 1I AGATGGCCCT -/C CCAGAGGGGG 3070 hom 59 het 22 0 18 4 C 2 3 289608 CASAVA_Build 2 23769538 1D CAGTCAGGGT C/- CCCCGGGATG 3070 hom 64 het 28 0 20 8 C 5 4 289609 CASAVA_Build 2 23774647 4I CAGCCCACCA ----/GAGT GAGTCTGCCA 3070 hom 93 het 33 0 30 3 GAGT 1 2 289610 CASAVA_Build 2 23777570 21I GGCAACTATC ---------------------/TCCTTTAGCGCCAGCATCTCA TCAATGAGCA 3070 hom 152 het 57 0 47 10 TCCTTTAGCGCCAGCATCTCA 0 1 289611 CASAVA_Build 2 23778047 4D ATAATCATGC CACT/---- CACTGCATTC 3070 hom 57 het 21 0 18 4 CACT 2 1 289612 CASAVA_Build 2 23778355 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 11 1 10 0 T 15 13 289613 CASAVA_Build 2 23779596 1I GAGGCGGTGG -/C CCCTCTGCCC 3070 hom 62 het 29 0 18 11 C 3 4 289614 CASAVA_Build 2 23782826 4I AGTGAAATGC ----/CTAA CTAACTCTGT 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 CTAA 1 2 289615 CASAVA_Build 2 23786014 1I TCTCCTTGCC -/A AAAAAAAAAA 2731 het 2117 hom 36 8 12 16 A 13 14 289616 CASAVA_Build 2 23786525 4D ATAAGAAGAG AACA/---- GTCAGGAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 25 3 AACA 1 0 289617 CASAVA_Build 2 23789777 1I TTTATGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2839 hom 28 8 13 7 T 11 12 289618 CASAVA_Build 2 23804342 5I TTCTGAATGA -----/TACTG TACTGCAATA 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 TACTG 1 2 289619 CASAVA_Build 2 23807438 2D TTTGAAAAGA CT/-- CTGACAGGAC 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 CT 2 1 289620 CASAVA_Build 2 23807580 4D TAAGGAAATA ATTC/---- ATTAAATTCA 3070 het 3070 ref 36 17 15 7 ATTC 1 0 289621 CASAVA_Build 2 23819516 1D ATGTTCGCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2278 hom 38 10 14 14 A 15 14 289622 CASAVA_Build 2 23820657 1I CCTGGGAGAA -/T TTTTTTTTTT 1445 het 1445 ref 29 8 8 13 T 15 16 289623 CASAVA_Build 2 23828782 4D CAACACTTAA TGAG/---- TAAGTTATTA 3070 het 2444 hom 21 5 14 3 TGAG 1 0 289624 CASAVA_Build 2 23833613 2D TGCATGCCTC TG/-- TGTGTGTGTG 1077 het 1077 ref 49 39 3 8 TG 6 5 289625 CASAVA_Build 2 23841169 17I ACCAGTTTAA -----------------/CACACATCAAGCTATTT CACACCTCTG 3070 het 3070 ref 54 28 25 1 CACACATCAAGCTATTT 0 1 289626 CASAVA_Build 2 23843295 1I GTAAGGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1664 hom 37 10 19 8 A 13 14 289627 CASAVA_Build 2 23846700 4I AAAAATAAAT ----/AAAC AAACAAATAA 3070 hom 24 het 16 0 9 7 AAAC 1 2 289628 CASAVA_Build 2 23848506 1D ATTTTGTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3015 hom 32 9 18 5 T 10 9 289629 CASAVA_Build 2 23852314 5D ACATGGTGAA ACCCC/----- ATCTCTATTA 1785 het 1766 hom 11 4 4 4 ACCCC 1 0 289630 CASAVA_Build 2 23877134 1D TGATCCAATT A/- AAAAAAAAAT 2531 het 2048 hom 16 5 6 5 A 10 9 289631 CASAVA_Build 2 23878597 1I TATAAAAATT -/A AAAAGGCACT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 4 5 289632 CASAVA_Build 2 23883678 3I ACACACTAGA ---/AAG AAGTACATTC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AAG 1 2 289633 CASAVA_Build 2 23888561 1D TCCAAGAAAT C/- AACCAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 C 1 0 289634 CASAVA_Build 2 23888683 1D TATTCACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1702 hom 36 7 11 18 A 15 14 289635 CASAVA_Build 2 23889223 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1826 hom 30 8 13 9 A 17 18 289636 CASAVA_Build 2 23889955 1I ACAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2317 het 1742 hom 18 4 6 8 A 15 16 289637 CASAVA_Build 2 23896857 1I CTACTGAGAA -/T TGCAACACTT 3070 het 3070 ref 54 30 17 7 T 1 2 289638 CASAVA_Build 2 23899446 4D ACATTCATTC ATTT/---- GTCTTAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 ATTT 1 0 289639 CASAVA_Build 2 23900177 1I TTTTAATTAA -/C AAAAAACATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 0 1 289640 CASAVA_Build 2 23902169 1I AGAAACTATT -/A AGGCAAAACA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 1 2 289641 CASAVA_Build 2 23905532 1I CTTGTCTGTG -/T TTCACAACCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 3 289642 CASAVA_Build 2 23909765 1I TTGAATTGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 433 hom 45 2 35 8 A 9 10 289643 CASAVA_Build 2 23910962 1D CTTGGCAACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 27 0 19 9 A 10 9 289644 CASAVA_Build 2 23920862 16D CCAGAAATAC AATATTAGAATTGCCA/---------------- AAGGCATTAA 3070 het 3070 ref 40 26 20 1 AATATTAGAATTGCCA 1 0 289645 CASAVA_Build 2 23921330 1D GTCAAGAAGG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 9 8 289646 CASAVA_Build 2 23925388 1D TTGAGACTCT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 9 8 289647 CASAVA_Build 2 23937524 1I GTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1809 het 1809 ref 25 11 7 7 T 15 16 289648 CASAVA_Build 2 23940422 1D GAGACGGAAT C/- CTCACTGTCA 3070 hom 75 het 26 0 24 2 C 2 1 289649 CASAVA_Build 2 23947033 1I AGAATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 30 1 22 7 A 10 11 289650 CASAVA_Build 2 23951892 1I AAAAAAAAGT -/A AAAACCTTCC 3070 hom 80 het 31 0 26 5 A 4 5 289651 CASAVA_Build 2 23958419 5I TGGCAATAGC -----/TATAA TATAACATCT 2657 hom 27 het 15 0 9 6 TATAA 1 2 289652 CASAVA_Build 2 23991059 1I TAAAAATACC -/A AAAAAAAATT 2163 het 489 hom 7 1 5 1 A 8 9 289653 CASAVA_Build 2 23994422 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 22 10 9 3 A 8 9 289654 CASAVA_Build 2 23998859 1I ATAAGAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 A 9 10 289655 CASAVA_Build 2 24000483 1I CGTGAACCCC -/G GGGGGGCGGA 1591 hom 12 het 5 0 4 1 G 6 7 289656 CASAVA_Build 2 24003954 1I CAGCTGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 A 10 11 289657 CASAVA_Build 2 24006087 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 2764 het 1723 hom 11 4 7 0 A 9 10 289658 CASAVA_Build 2 24011772 1I CAACAACAAC -/A AACAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 2 3 289659 CASAVA_Build 2 24012920 1I ATCCTACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 11 12 289660 CASAVA_Build 2 24029029 1D ATGTTGGCCA G/- GCTAGTCTTG 2832 het 2832 ref 20 12 8 0 G 2 1 289661 CASAVA_Build 2 24029341 1D CTCTTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 25 1 16 8 T 14 13 289662 CASAVA_Build 2 24037467 6I CTTTGAATTT ------/TTTTTG TTTTTGTTTT 1669 het 1669 ref 23 12 5 6 TTTTTG 2 3 289663 CASAVA_Build 2 24040589 1D ATTATCCAAT C/- CTTTTTTTTT 3070 het 2861 hom 23 10 10 3 C 2 1 289664 CASAVA_Build 2 24050014 1I GTGTCCAGCC -/T TTTTTTTTTT 1127 het 1127 ref 18 7 8 3 T 13 14 289665 CASAVA_Build 2 24058579 1I TAAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 573 het 99 hom 8 1 3 4 A 13 14 289666 CASAVA_Build 2 24061443 1I CCCAGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 2269 het 1375 hom 16 4 6 6 T 11 12 289667 CASAVA_Build 2 24063293 1I TCTTAAAAGC -/T TTTTTTTTGG 1084 het 1084 ref 16 9 4 3 T 8 9 289668 CASAVA_Build 2 24063473 1I TCTCAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3046 het 3046 ref 34 16 12 6 A 11 12 289669 CASAVA_Build 2 24063581 4D TGTGGTACAG ATAA/---- ATAACAAATA 2120 het 2120 ref 25 17 5 6 ATAA 2 1 289670 CASAVA_Build 2 24080612 2I GAAAACAAAC --/TG AATTTGCTAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TG 0 1 289671 CASAVA_Build 2 24081134 2D TTTATATACT TC/-- TCTCGGTATA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 TC 3 2 289672 CASAVA_Build 2 24083163 1D CACAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2769 hom 30 9 11 10 A 14 13 289673 CASAVA_Build 2 24083361 4I TGACTTGCTC ----/TTTA TAAACTGGGT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 TTTA 0 1 289674 CASAVA_Build 2 24092694 6I GGCACCTGGT ------/CCTGGC CCTGGCCCTG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 CCTGGC 1 2 289675 CASAVA_Build 2 24105178 4D AAAAACCCCC CAAA/---- CAAATAAAAT 2744 het 2744 ref 27 19 7 1 CAAA 2 1 289676 CASAVA_Build 2 24107166 2D CAGGGGAAAC AG/-- GGGGAAACCA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 AG 1 0 289677 CASAVA_Build 2 24108200 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1180 het 1180 ref 15 8 4 4 A 13 12 289678 CASAVA_Build 2 24111689 29D ATATCACCTT CCCTTTTGTGTAACAAAAGGGGAAATAAA/----------------------------- AATACATAAC 3070 het 3070 ref 36 23 16 2 CCCTTTTGTGTAACAAAAGGGGAAATAAA 1 0 289679 CASAVA_Build 2 24112838 1D ACAGCCTTAT A/- CATAGCTGGC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 1 0 289680 CASAVA_Build 2 24120263 1I TCTTTCACTT -/A AAAAAAAAAA 1971 het 1971 ref 34 14 8 12 A 11 12 289681 CASAVA_Build 2 24134777 1I TTAATGCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 52 22 21 9 A 9 10 289682 CASAVA_Build 2 24151708 4D TTGCTTGTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2687 hom 32 het 26 0 13 13 TTTC 6 5 289683 CASAVA_Build 2 24155255 1D GCATATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 T 11 10 289684 CASAVA_Build 2 24181363 3I CCTGCCAGAG ---/CTT CTGGCCCAGT 3070 het 2562 hom 38 12 15 11 CTT 0 1 289685 CASAVA_Build 2 24183109 1I GCTGAGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 T 11 12 289686 CASAVA_Build 2 24183269 3I ATAACCAGCT ---/AAC AACATGATGA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AAC 1 2 289687 CASAVA_Build 2 24196643 5D AACTCGTCTC AAAAA/----- AAAAAACAAC 468 het 468 ref 16 8 4 7 A 11 6 289688 CASAVA_Build 2 24206330 1I TAATGCTCAC -/T CTCCCCTCAC 2565 het 2565 ref 21 12 7 2 T 0 1 289689 CASAVA_Build 2 24215320 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1713 hom 22 6 9 7 A 15 16 289690 CASAVA_Build 2 24226501 1I GATAAGAGTA -/G TTTGCACACC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 G 0 1 289691 CASAVA_Build 2 24230502 1I TGCTCTCCTC -/A ATGCCTCTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 289692 CASAVA_Build 2 24234133 1D AAATTAATAT C/- CCAAGCCATA 1816 hom 42 het 18 0 13 5 C 3 2 289693 CASAVA_Build 2 24240430 1I ATTTTCACAC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 A 7 8 289694 CASAVA_Build 2 24240683 1I TGAGCCTCAG -/C CAGGAACGGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 1 2 289695 CASAVA_Build 2 24242870 4I TCCTCCCATG ----/TGCT TGCTTGCTTG 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 TGCT 4 5 289696 CASAVA_Build 2 24249946 3D TTCTGTGTAT GTC/--- GTCTACTCAA 3070 hom 111 het 44 0 37 8 GTC 2 1 289697 CASAVA_Build 2 24251023 11D TTCACCCTTC AGTGGGAGTAA/----------- GGAGCCGGAC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 AGTGGGAGTAA 1 0 289698 CASAVA_Build 2 24252727 1I CATTTTAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 25 het 24 1 20 3 A 8 9 289699 CASAVA_Build 2 24253916 1I CTATCAGGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 8 9 289700 CASAVA_Build 2 24255632 2I AAAATGAAAC --/AA GAGAATGTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 2 289701 CASAVA_Build 2 24257447 1I TAAAATTACC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 52 15 30 7 A 7 8 289702 CASAVA_Build 2 24264411 5D TCTGCCATAT TCTCC/----- TCTCCTCTCT 3070 het 3070 hom 34 13 16 8 TCTCC 2 1 289703 CASAVA_Build 2 24276583 1I TCCCTGGGCT -/A GGACCCAGTT 3070 hom 96 het 37 0 30 7 A 0 1 289704 CASAVA_Build 2 24276787 2I CAGACAGAGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 GA 6 7 289705 CASAVA_Build 2 24293622 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1680 hom 21 9 9 5 A 13 12 289706 CASAVA_Build 2 24300441 3I TTGTGGAGCA ---/AGG AGGAGAGGCT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AGG 1 2 289707 CASAVA_Build 2 24305417 38D ATCTTATTTG CAACTAACAGGAAAGCCTCAAAGTGTAAAATAAAAAAA/-------------------------------------- CAACTAACAG 3070 hom 33 het 24 0 12 15 CAACTAACAGGAAAGCCTCAAAGTGTAAAATAAAAAAA 1 0 289708 CASAVA_Build 2 24307384 3I GCAGGTGCAA ---/CCC AATCTGCCCA 3070 hom 57 het 21 0 18 3 C 0 3 289709 CASAVA_Build 2 24312494 4I ATAATGAATG ----/GATA AACAAAACGT 3070 hom 198 het 70 0 66 4 GATA 0 1 289710 CASAVA_Build 2 24313740 4I CTCATATAAC ----/CTCT CTGTTTCCCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CT 1 3 289711 CASAVA_Build 2 24317921 1I TTAAAAAGCT -/C CCCCCAAAAT 3070 het 3070 ref 45 23 13 9 C 5 6 289712 CASAVA_Build 2 24319848 5D CTTTTTCTTC TTATT/----- TTAATCTTTC 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 TTATT 1 0 289713 CASAVA_Build 2 24329712 2I GTGATTACAA --/TC GGTTTAGGTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TC 0 1 289714 CASAVA_Build 2 24338345 4D AGACAAATAG CATT/---- CATTATATAT 3070 hom 110 het 40 0 37 4 CATT 2 1 289715 CASAVA_Build 2 24339839 1D AAATTTGATG T/- TTTGACATAT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 T 4 3 289716 CASAVA_Build 2 24340804 4I ATTTATTAGA ----/TTCT TTGTCATAGC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTCT 0 1 289717 CASAVA_Build 2 24350049 1I GGATGTCAGG -/C CCCCTCTACT 3070 het 3070 ref 31 23 7 1 C 4 5 289718 CASAVA_Build 2 24351817 1D TCAGAAAGAT A/- AAAATAACTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 5 4 289719 CASAVA_Build 2 24363589 1I GTAAGATATC -/T TTATCAATCA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 2 3 289720 CASAVA_Build 2 24367286 1D TCCTCCCCCC T/- ACCAAAGTTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 1 0 289721 CASAVA_Build 2 24368794 1D GGGGTGAGGT G/- GGGGCTAATA 3070 hom 74 het 29 0 24 5 G 5 4 289722 CASAVA_Build 2 24373412 2I AGTCAAGATG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 13 11 11 AT 6 7 289723 CASAVA_Build 2 24396587 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAACTTA 2499 hom 15 het 6 0 6 0 A 7 6 289724 CASAVA_Build 2 24399573 3I AACAATAGAC ---/TCT TGAGTATTAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TCT 0 1 289725 CASAVA_Build 2 24405630 6D TCTGTTTTTT TTTTTG/------ TTTGTTTTGT 420 het 100 hom 24 1 4 22 TTTTTG 1 0 289726 CASAVA_Build 2 24412068 1D GCTGGAGTGC A/- GTGCGCCATC 2841 hom 24 het 11 0 7 4 A 1 0 289727 CASAVA_Build 2 24413436 1I TTGGCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2876 het 2876 ref 29 11 8 10 T 13 14 289728 CASAVA_Build 2 24415679 9D CTCCATCTCT ACAAAAAAC/--------- ACAAAAATTA 3070 het 3070 hom 25 9 12 7 ACAAAAAAC 1 0 289729 CASAVA_Build 2 24423757 1I TAATGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 185 hom 34 1 30 3 A 10 11 289730 CASAVA_Build 2 24432865 1I TATCTACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 146 hom 13 1 8 4 A 10 11 289731 CASAVA_Build 2 24439273 1I AAAATAAACC -/A AAAAAACTAA 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 6 7 289732 CASAVA_Build 2 24440459 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 10 het 33 1 29 3 T 8 9 289733 CASAVA_Build 2 24440976 1I CATTTTTCAA -/C CCCCCAACCC 3070 hom 107 het 42 0 35 7 C 5 6 289734 CASAVA_Build 2 24443388 3I TAGTAGAGAT ---/GGA GTTTCACCAT 2781 hom 15 het 6 0 6 0 GGA 0 1 289735 CASAVA_Build 2 24445470 1I TGTGGTGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 9 10 289736 CASAVA_Build 2 24446010 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 17 7 T 10 11 289737 CASAVA_Build 2 24446135 9I CACTCTTTTT ---------/TTTTTGAGA TTTTTGAGAT 3070 hom 47 het 18 0 14 4 TTTTTGAGA 1 2 289738 CASAVA_Build 2 24446847 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 14 13 289739 CASAVA_Build 2 24447374 1D CCATCGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 15 14 289740 CASAVA_Build 2 24447503 1D ACACCACTGC A/- ACTCCAGCCT 3070 hom 71 het 26 0 24 2 A 2 1 289741 CASAVA_Build 2 24448478 1I CCTCAACACA -/T TTTTTTATAA 3070 hom 26 het 16 0 9 9 T 6 7 289742 CASAVA_Build 2 24449728 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 18 0 18 1 A 10 9 289743 CASAVA_Build 2 24451465 1D GCCTCTGCCT C/- CCGGGTTCAA 3070 hom 26 het 15 0 9 6 C 3 2 289744 CASAVA_Build 2 24454683 1D CTGTGGATTC T/- TTTTTTTTTT 2325 het 371 hom 18 1 7 10 T 15 14 289745 CASAVA_Build 2 24466544 1I TTTCTTCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 11 12 289746 CASAVA_Build 2 24466993 4D ATATGTACTC TGTT/---- TGGCACAATT 3070 hom 99 het 34 0 33 2 TGTT 1 0 289747 CASAVA_Build 2 24482414 5I GTAAGAGTTC -----/TTTAG TTTAAAGTTC 3070 het 1880 hom 12 4 8 0 TTTAG 0 1 289748 CASAVA_Build 2 24491177 1D CTAATATTAG T/- TTTTTCATTA 3070 het 3070 ref 25 16 9 1 T 6 5 289749 CASAVA_Build 2 24494696 6I TCCCAATAAT ------/TAATAA TAAGCAATAA 3070 het 3070 hom 53 21 27 5 TAA 1 3 289750 CASAVA_Build 2 24496850 1I TGGTTACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 60 26 28 6 A 10 11 289751 CASAVA_Build 2 24501818 2I TTTTCTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 1973 hom 24 9 9 6 TC 0 1 289752 CASAVA_Build 2 24503059 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1439 hom 30 10 13 9 A 13 12 289753 CASAVA_Build 2 24503498 1D TGGGAATTGC T/- TCACCCCTTC 3070 het 3070 ref 46 27 17 3 T 2 1 289754 CASAVA_Build 2 24510684 1I CCCGTATTTG -/T TTTTTTTTTC 2369 het 2369 ref 33 14 9 10 T 9 10 289755 CASAVA_Build 2 24517101 1I TCTCCGCCAA -/T TTTTTTTTTT 1867 het 6 hom 18 1 11 6 T 15 16 289756 CASAVA_Build 2 24531881 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGGGGGGG 1996 hom 18 het 10 0 7 3 G 11 10 289757 CASAVA_Build 2 24537707 1D ATTGAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 T 11 10 289758 CASAVA_Build 2 24540386 1D GGTGTGCTTG T/- TTTTTTTTTT 1320 het 1320 ref 48 41 4 3 T 11 10 289759 CASAVA_Build 2 24587077 10D AAAGCCTTAG GGCTTGACCT/---------- GGACACATTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 4 GGCTTGACCT 1 0 289760 CASAVA_Build 2 24597291 18I CTTGCTCATT ------------------/CTTTAGCCAAACTAGCAA CTTTGCTGTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 CTTTAGCCAAACTAGCAA 0 1 289761 CASAVA_Build 2 24602889 1I GACCTTTTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 8 9 289762 CASAVA_Build 2 24615525 1D TTTAAGAGAT G/- GGGGTCTCAC 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 G 5 4 289763 CASAVA_Build 2 24618641 5I AGAACTAACC -----/AAATA TGATTAGTGA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 AAATA 0 1 289764 CASAVA_Build 2 24621825 4D AATAAATGGT TAAA/---- TAAATAACTG 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 TAAA 2 1 289765 CASAVA_Build 2 24624063 1I TGAGATTGTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 8 9 289766 CASAVA_Build 2 24633547 1I ACGGTGGGTT -/G GGGGCGGGAA 3070 hom 96 het 34 0 30 4 G 4 5 289767 CASAVA_Build 2 24636151 1I CTCCACCACC -/G TGGCAGAGGT 3070 hom 129 het 48 0 42 6 G 0 1 289768 CASAVA_Build 2 24639896 1D AATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1864 het 1864 ref 41 23 4 14 T 13 12 289769 CASAVA_Build 2 24646936 1D CAGATAGAAT A/- AAAACATCAC 3070 hom 135 het 52 0 46 7 A 5 4 289770 CASAVA_Build 2 24651457 1D GTTTTTTATC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 9 8 289771 CASAVA_Build 2 24653596 4D TTCTCTACTC AAAT/---- GAATGAGTGA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 AAAT 1 0 289772 CASAVA_Build 2 24677588 1I ACATCTTCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 8 9 289773 CASAVA_Build 2 24679560 1D TCTAAAAAAA T/- ATATATACCT 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 T 1 0 289774 CASAVA_Build 2 24686099 1D TATTTGTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 10 9 289775 CASAVA_Build 2 24697785 1D ATTTTTTGTG T/- TATGTGTGTA 3070 hom 28 het 25 0 12 13 T 2 1 289776 CASAVA_Build 2 24702125 1D TTCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 650 hom 30 2 24 4 T 12 11 289777 CASAVA_Build 2 24703957 4D AGAGATTTAA TATT/---- TACTTTTTCT 3070 het 3070 ref 48 22 21 6 TATT 1 0 289778 CASAVA_Build 2 24708433 4I TAGATTGAGC ----/ACTT ACTTAGTATT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 ACTT 1 2 289779 CASAVA_Build 2 24724653 1I CATATTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 12 13 289780 CASAVA_Build 2 24726159 1I TTGTATTTAG -/A AAAAATTAAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 5 6 289781 CASAVA_Build 2 24733595 5I TACTTAAGCA -----/AAAGC GGGATGCTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 AAAGC 0 1 289782 CASAVA_Build 2 24739338 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2958 het 1642 hom 32 9 14 9 T 13 14 289783 CASAVA_Build 2 24745176 1I TTCCATAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 20 20 11 A 10 11 289784 CASAVA_Build 2 24746513 1I GTGTCTTAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 8 9 289785 CASAVA_Build 2 24748511 3I TATATATAAC ---/AAT AATATATTGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AAT 1 2 289786 CASAVA_Build 2 24750414 1I CTGCATTCTC -/T AATATAGATG 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 T 0 1 289787 CASAVA_Build 2 24751127 1D AGTATGGGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 9 8 289788 CASAVA_Build 2 24759189 1I TCTCTCCTGC -/A GTATCACAAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 0 1 289789 CASAVA_Build 2 24770104 1D TATCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2410 hom 26 8 13 5 T 11 10 289790 CASAVA_Build 2 24774590 1I ACCAAAGAAG -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 A 7 8 289791 CASAVA_Build 2 24776138 23D AACACTTTCA TGAGAATCACCTGTTAAAGATAG/----------------------- TGACCTGCTG 3070 het 3070 hom 24 15 12 7 TGAGAATCACCTGTTAAAGATAG 1 0 289792 CASAVA_Build 2 24787097 1D ATGAATACTA T/- TATCAGAAGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 2 1 289793 CASAVA_Build 2 24795826 1D ATGTAAATTA T/- ACATCAATGA 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 T 1 0 289794 CASAVA_Build 2 24806217 1D27M1I CAGTTGATAC TTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTCTCAC-/-TTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTCTCACT CTGTCACCAG 3070 het 1317 hom 39 11 12 17 N/A 0 0 289795 CASAVA_Build 2 24810641 1D AAGAACATCC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 22 16 5 A 9 8 289796 CASAVA_Build 2 24811178 1D CCTTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 6 A 11 10 289797 CASAVA_Build 2 24816169 1D GAAAAAACTC T/- TATTTCTGTA 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 T 2 1 289798 CASAVA_Build 2 24824184 1D GTCATAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 A 10 9 289799 CASAVA_Build 2 24825022 1D AACCTATAAT A/- AAAAAAACGA 3070 het 8 hom 20 1 13 6 A 8 7 289800 CASAVA_Build 2 24829252 1D CACTAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 1470 het 1470 ref 32 19 4 9 T 13 12 289801 CASAVA_Build 2 24829743 1D TGGCTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 A 11 10 289802 CASAVA_Build 2 24835459 1D CCTTTTAATT C/- AATAAGCATT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 C 1 0 289803 CASAVA_Build 2 24841550 1D ACTTCGACTC A/- AAAAAAAAAA 1940 het 1383 hom 14 4 7 3 A 12 11 289804 CASAVA_Build 2 24874649 6D TATGTGTGTG TATATA/------ TATATATATA 3070 het 497 hom 29 3 17 11 TA 9 6 289805 CASAVA_Build 2 24875414 21D TGGAGTGCAA TGGCACTCCAATGGAGTGCAG/--------------------- TGATCTTGGC 1605 het 1605 ref 18 11 5 3 TGGCACTCCAATGGAGTGCAG 1 0 289806 CASAVA_Build 2 24875947 1D AAGTTCTGGT A/- AAAAAAAAAA 2930 het 2930 ref 28 12 8 8 A 13 12 289807 CASAVA_Build 2 24883646 12D GCCTCTTCCT AGTCTTCTCTTA/------------ AGTCTTCTCT 3070 het 3070 hom 38 16 14 13 AGTCTTCTCTTA 2 1 289808 CASAVA_Build 2 24894533 1I GGGCATTAAC -/T TCTGGGAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 2 289809 CASAVA_Build 2 24894854 4D AGTTCTTCAG TGTT/---- TGTTTGGTTA 3070 het 3070 ref 31 17 11 5 TGTT 2 1 289810 CASAVA_Build 2 24895017 4D GAAAAAGCAC AGTT/---- AGTTAGTTAG 3070 hom 75 het 29 0 25 5 AGTT 3 2 289811 CASAVA_Build 2 24903121 2D AAGATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1814 hom 32 9 16 7 TA 7 6 289812 CASAVA_Build 2 24906453 4I TCTTGCTGTC ----/TGTT GCCTAGGCTG 3070 hom 36 het 14 0 12 2 TGTT 0 1 289813 CASAVA_Build 2 24931564 1D AGCCCCAGGT C/- CCCCCCACCC 1941 het 1682 hom 13 5 5 3 C 7 6 289814 CASAVA_Build 2 24940665 5D CTGTCTCAAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 31 9 15 8 AAAAC 3 2 289815 CASAVA_Build 2 24951538 4I TGCCAGTGAG ----/CTCA CTGATTCTAG 2458 het 2458 ref 29 13 7 9 CTCA 0 1 289816 CASAVA_Build 2 24957388 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 2709 het 1570 hom 24 6 9 9 A 15 14 289817 CASAVA_Build 2 24957627 5I CCAAAGCCAT -----/CCGAG CCCAGCCCAG 3070 het 2458 hom 36 11 16 9 CCGAG 0 1 289818 CASAVA_Build 2 24958184 2D CCATTCCACA GT/-- GTGTCTGGAG 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 GT 3 2 289819 CASAVA_Build 2 24959730 1D CAAAAAAAAT A/- AAAAAAAGAA 3017 het 3017 ref 20 10 9 1 A 8 7 289820 CASAVA_Build 2 24961217 1D TTTTACCATC T/- TTTTTCCCTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 6 5 289821 CASAVA_Build 2 24968627 1I GTATTGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 22 2 13 7 T 13 14 289822 CASAVA_Build 2 24969976 1D AATACCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 T 12 11 289823 CASAVA_Build 2 24971673 1I CATGTTTGTC -/A GATGGTCTCG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 0 1 289824 CASAVA_Build 2 24979523 1D CTCTATCTCC A/- AAAAAAAAAA 1981 het 1436 hom 31 6 9 16 A 19 18 289825 CASAVA_Build 2 24980511 4D GGAAGGAGAC AGAG/---- AGAGAGAGAA 2717 het 2460 hom 26 12 10 7 AG 6 4 289826 CASAVA_Build 2 24982671 2I GAGAGTGAGA --/CT CTGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 CT 1 2 289827 CASAVA_Build 2 24984697 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1573 hom 14 4 10 0 A 9 10 289828 CASAVA_Build 2 24984989 1D GCCTCTATAT A/- ATTACCCACC 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 2 1 289829 CASAVA_Build 2 24987035 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 14 13 T 16 14 289830 CASAVA_Build 2 24989695 1D CTTCTCCCTT C/- TTTGCATCCA 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 C 1 0 289831 CASAVA_Build 2 25006290 8D TGTCAAGAGA AAACTGGG/-------- CCGGGCACAG 3070 het 3070 hom 37 18 16 6 AAACTGGG 1 0 289832 CASAVA_Build 2 25017041 1I CTATTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 990 het 820 hom 21 6 4 11 T 17 18 289833 CASAVA_Build 2 25038594 1D TTTTTCTTTT G/- TTTTTTTTTG 3070 het 535 hom 32 2 24 6 G 1 0 289834 CASAVA_Build 2 25050749 4I CGAAAAAAAA ----/AGTT AGCCGTTGTG 3070 hom 60 het 30 0 16 14 AGTT 0 1 289835 CASAVA_Build 2 25063918 1I ACCTGGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 115 hom 27 1 18 8 A 13 14 289836 CASAVA_Build 2 25072597 1D GCTTCTTTAC A/- ACTATAAGTA 3070 hom 45 het 17 0 14 3 A 2 1 289837 CASAVA_Build 2 25074837 3D TTCTTTTTCT TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 hom 31 het 32 1 22 10 TTC 4 3 289838 CASAVA_Build 2 25080308 4D ATTAGTTCCA TCTC/---- TCTCCCTCGG 3070 hom 57 het 21 0 20 3 TC 4 2 289839 CASAVA_Build 2 25086021 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 20 0 11 9 A 15 16 289840 CASAVA_Build 2 25088269 1D AAAAAAAAAA C/- AAGAGAATTT 3070 het 150 hom 31 4 18 10 C 1 0 289841 CASAVA_Build 2 25095027 1I CACCACCATG -/C CCGGCTAATT 2042 hom 20 het 8 0 6 2 C 2 3 289842 CASAVA_Build 2 25106550 1I TTCCAAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 6 7 289843 CASAVA_Build 2 25132153 1D CAGCGTGTGC A/- AGGAGGGATG 3070 hom 108 het 41 0 37 6 A 2 1 289844 CASAVA_Build 2 25137310 3I CAAACAAACA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 45 het 20 0 14 6 AAC 5 6 289845 CASAVA_Build 2 25148647 1I CCAGCCCTTA -/T TTTCTTTTCT 3070 hom 65 het 29 0 21 9 T 3 4 289846 CASAVA_Build 2 25156195 3I ACACACCAAA ---/AAG AAGAACAATA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAG 1 2 289847 CASAVA_Build 2 25163735 2D TTCATATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 34 het 16 0 11 6 TA 9 8 289848 CASAVA_Build 2 25178213 3D CGAAACTGTA AAG/--- ATTTTAACCA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 AAG 1 0 289849 CASAVA_Build 2 25185546 1D ACTTAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 A 11 10 289850 CASAVA_Build 2 25189357 1D ATCTTTGGAG C/- TTTTACTCTC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 1 0 289851 CASAVA_Build 2 25192910 1D GGCATGAGAA T/- TGCTTGAACC 3070 het 3070 ref 24 9 10 6 T 2 1 289852 CASAVA_Build 2 25197019 3D CCGTCTCAAA AAC/--- AACAACAACA 2812 het 1137 hom 12 4 7 6 AAC 6 5 289853 CASAVA_Build 2 25205829 3D GGGCTGGGAG TCC/--- TCCGGCTCCT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TCC 2 1 289854 CASAVA_Build 2 25210551 1D TCAGTTTATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 523 hom 23 5 14 4 T 19 18 289855 CASAVA_Build 2 25241363 3I GAGGGAATGG ---/ACC TGGGTAAACT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 ACC 0 1 289856 CASAVA_Build 2 25252442 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2965 het 1113 hom 17 5 9 3 A 15 14 289857 CASAVA_Build 2 25253058 2I GAGAAGAGAC --/TG GGATCATCAC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 TG 0 1 289858 CASAVA_Build 2 25257025 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3043 het 3043 ref 22 11 9 2 A 11 10 289859 CASAVA_Build 2 25259595 14I ATAATTTTAG --------------/CACAGTTTCATTAC CCCTAAGGGG 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 CACAGTTTCATTAC 0 1 289860 CASAVA_Build 2 25261267 1I TTTGGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 10 11 289861 CASAVA_Build 2 25262509 1I GAAAATTAGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 A 7 8 289862 CASAVA_Build 2 25265092 1I CTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1675 het 557 hom 19 5 6 8 T 13 14 289863 CASAVA_Build 2 25265874 3D TAATAATAAC AAT/--- AATAATAGTA 1406 het 1406 ref 15 10 4 1 AAT 3 2 289864 CASAVA_Build 2 25300615 2I CAGGGGTCCC --/CT GTCCCCCTTG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 CT 0 1 289865 CASAVA_Build 2 25319285 6D AGCACTACTT ATAATA/------ ATAATAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 ATA 4 2 289866 CASAVA_Build 2 25337980 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 15 0 10 5 A 15 14 289867 CASAVA_Build 2 25339167 1D TGTGACCATC T/- TGCTTTCTAG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 2 1 289868 CASAVA_Build 2 25383380 1D CTACTTTGTA G/- CCGTGTGGCC 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 G 1 0 289869 CASAVA_Build 2 25393254 1D ATAATGTTTG T/- TAACAGCCAC 3070 hom 155 het 56 0 51 5 T 2 1 289870 CASAVA_Build 2 25393695 1I TCAGCCTCCC -/T AAAGTGTTGG 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 0 1 289871 CASAVA_Build 2 25409594 1D CTGTGGCCCC T/- GACTCCCAGC 2404 het 2404 ref 31 17 10 5 T 1 0 289872 CASAVA_Build 2 25416320 1D CCCAGGAGGC G/- GGTTCAGCCG 2350 hom 41 het 18 0 8 10 G 3 2 289873 CASAVA_Build 2 25425716 1I AAGGGAAAGA -/G TATGCAGGGG 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 G 0 1 289874 CASAVA_Build 2 25442866 4D GAGCCTGGGT GACA/---- GAGCAAGATG 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 GACA 1 0 289875 CASAVA_Build 2 25459564 3I TTCATTTGAT ---/CTC CTATTTATTT 3070 hom 71 het 36 0 26 10 CTC 0 1 289876 CASAVA_Build 2 25489644 1D ATCAGACACC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 10 9 289877 CASAVA_Build 2 25499582 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 35 16 12 8 A 7 6 289878 CASAVA_Build 2 25504173 1I TTTTGCCTAC -/T TTCCTGGACT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 2 3 289879 CASAVA_Build 2 25507579 1I TCTTCTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1692 hom 28 7 17 4 T 13 14 289880 CASAVA_Build 2 25510394 1I CGGGAGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 T 11 12 289881 CASAVA_Build 2 25518184 1D GAACCAGAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 10 9 289882 CASAVA_Build 2 25521632 2D CTAGAGCAGT TG/-- TGACTGACTG 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 TG 2 1 289883 CASAVA_Build 2 25575555 1D GTGTCATTGC A/- AAAAAAAAAA 2877 het 2877 ref 23 11 7 5 A 11 10 289884 CASAVA_Build 2 25577581 1I GATCTAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 11 12 289885 CASAVA_Build 2 25581305 1I CAAATTTAGA -/G GACACAAACT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 1 2 289886 CASAVA_Build 2 25590375 1D TTTGGTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2318 hom 24 7 11 6 A 15 14 289887 CASAVA_Build 2 25594576 1I TTTATATTAT -/G TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 G 0 1 289888 CASAVA_Build 2 25597986 12D TGAACTCCTG TGATCCACTCCC/------------ AACTCAAGTG 3070 het 3070 ref 39 18 17 6 TGATCCACTCCC 1 0 289889 CASAVA_Build 2 25609685 15D GGGCGACAGA GTGAGACCCCATCTC/--------------- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 21 8 3 GTGAGACCCCATCTC 1 0 289890 CASAVA_Build 2 25613570 1I CATATAAATC -/T TTTTTTTTTT 1155 het 1155 ref 27 20 3 4 T 11 12 289891 CASAVA_Build 2 25640048 2D TGTGAATATC CA/-- GTTGTTGTCT 3070 het 3070 ref 30 15 12 5 CA 1 0 289892 CASAVA_Build 2 25641986 1D GTTTATTGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 10 9 289893 CASAVA_Build 2 25659620 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1499 hom 10 het 9 0 4 5 A 17 16 289894 CASAVA_Build 2 25676314 1I TACAAAAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 A 8 9 289895 CASAVA_Build 2 25680773 2I CTCCCTTCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 2558 hom 40 11 17 12 TC 8 9 289896 CASAVA_Build 2 25682565 1I CTTTCAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 A 11 12 289897 CASAVA_Build 2 25687089 1I ACTTCTATCC -/T TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 33 16 7 10 T 12 13 289898 CASAVA_Build 2 25689141 4I CAGAAATAAT ----/AAAG AAAGATTATT 3070 het 3070 ref 46 23 22 1 AAAG 1 2 289899 CASAVA_Build 2 25693305 7D ACCCCGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2713 het 719 hom 14 4 10 2 A 21 14 289900 CASAVA_Build 2 25721590 1I ACCCCGTCAC -/T TACTAGAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 1 2 289901 CASAVA_Build 2 25724806 3D GGCTTAAGGA TAT/--- TATATAAAGT 3070 het 3070 hom 33 15 18 2 TAT 2 1 289902 CASAVA_Build 2 25733662 1D CCCATGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 11 10 289903 CASAVA_Build 2 25742850 6D ATGCCCATTA TTATAC/------ TTATTCTTGT 3070 het 3070 ref 50 22 24 8 TTATAC 1 0 289904 CASAVA_Build 2 25787117 4D GAGCCTGTCT CAAA/---- CAAACAAAGA 3070 het 2509 hom 23 6 12 6 CAAA 3 2 289905 CASAVA_Build 2 25788787 5D CATCATATCA ATAAG/----- ATAAAAGACA 3070 het 3070 ref 47 28 18 2 ATAAG 1 0 289906 CASAVA_Build 2 25791806 1I AACCCAGTTT -/G GGGGGGGCTG 3070 het 3067 hom 26 9 9 8 G 7 8 289907 CASAVA_Build 2 25803920 1D ATGAAGAAAT A/- AAGCCTCTTA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 3 2 289908 CASAVA_Build 2 25808497 2I TTGTAGAGAT --/GG GGGGTCTGTG 3070 het 3070 ref 67 34 27 6 G 4 6 289909 CASAVA_Build 2 25824097 1D GTGAATGACA T/- TGAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 2 1 289910 CASAVA_Build 2 25829615 1I TGGGGTTATA -/G GTGTGAGCCA 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 G 1 2 289911 CASAVA_Build 2 25857764 2I GAGAGCAAAA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 CT 1 2 289912 CASAVA_Build 2 25859880 1D ATTTCCACCA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 42 het 31 0 14 17 T 8 7 289913 CASAVA_Build 2 25867089 2D GCAGAAAAAC AA/-- AAGACGCTAG 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 4 2 289914 CASAVA_Build 2 25877978 6D CAAGTATCTG AAATAT/------ AAATATAATT 3070 het 3070 ref 40 19 17 6 AAATAT 2 1 289915 CASAVA_Build 2 25880358 1I AACACTTTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 12 12 10 T 9 10 289916 CASAVA_Build 2 25885670 1I ACTTCTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 12 13 289917 CASAVA_Build 2 25898535 16D AAACTTGTAG ATAATAAAAGGTAAAA/---------------- GTAACTCTTT 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 ATAATAAAAGGTAAAA 1 0 289918 CASAVA_Build 2 25900102 1D GATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 11 22 16 T 13 12 289919 CASAVA_Build 2 25902622 7D ATCTTTGAAA GTGGGCT/------- GGAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 35 18 17 1 GTGGGCT 1 0 289920 CASAVA_Build 2 25911472 1D GCTGGGATTA C/- CAGGTGTGAG 3070 het 3070 ref 23 11 10 3 C 2 1 289921 CASAVA_Build 2 25912862 1D GAGATATGGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 8 7 289922 CASAVA_Build 2 25917482 5I ACCGGCCTGG -----/GCAAC ATGGCGAAAC 3035 het 3035 ref 26 16 7 3 GCAAC 0 1 289923 CASAVA_Build 2 25927532 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAGAA 3070 het 2611 hom 26 11 12 5 AAAAG 1 0 289924 CASAVA_Build 2 25928423 1I ACATTATCTT -/A CCACAAGCGG 3070 hom 93 het 40 0 30 10 A 0 1 289925 CASAVA_Build 2 25934241 5I TTTATTTTAC -----/TTTAT TTTATTTTAT 2397 het 2354 hom 16 7 6 3 TTTAT 3 4 289926 CASAVA_Build 2 25935551 1D TAGGCTCAAG T/- TGATTCTCCT 2598 het 2598 ref 23 12 7 4 T 2 1 289927 CASAVA_Build 2 25937118 1I TGGGTGTGGT -/G GCTCATGCCT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 1 2 289928 CASAVA_Build 2 25947892 1D TCAACAAACT A/- GGAGGCTTGT 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 A 1 0 289929 CASAVA_Build 2 25950832 1D ACTGCATTCC A/- GCCTGGGCAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 5 A 1 0 289930 CASAVA_Build 2 25953927 1I CGGAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 11 12 289931 CASAVA_Build 2 25956001 1D TCTGTTGTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 A 10 9 289932 CASAVA_Build 2 25964996 2I AGGCACTAAC --/AG GGGAAGAGGA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 AG 0 1 289933 CASAVA_Build 2 25965679 1I TCTTTCTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 9 10 289934 CASAVA_Build 2 25966022 1I AGGTTTTTTT -/A TAAAAAAAAC 744 het 744 ref 14 10 3 1 A 0 1 289935 CASAVA_Build 2 25976311 1I CTTGGGACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 9 10 289936 CASAVA_Build 2 25981475 2D ATTTATATAG AT/-- ATATATATAT 1507 het 1507 ref 17 7 5 5 AT 7 6 289937 CASAVA_Build 2 25988544 1I GCAACCTCTA -/C CTTCCGGGTT 1160 hom 6 het 5 0 3 2 C 1 2 289938 CASAVA_Build 2 25988598 1I TGGGATTACA -/G GGCCCCCCCA 3070 hom 27 het 12 0 9 3 G 2 3 289939 CASAVA_Build 2 25996328 1I ACCTCCGCCT -/C CCAGGTTCAA 3070 het 2546 hom 16 8 8 0 C 2 3 289940 CASAVA_Build 2 25997425 1I CCTCTCCCCC -/T ACCCTGTTGT 3070 het 2085 hom 35 10 16 9 T 0 1 289941 CASAVA_Build 2 26003301 2I GGAAAAGGAG --/AA AGAAAGAGAG 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 1 3 289942 CASAVA_Build 2 26014731 1I TCTGAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2616 het 1409 hom 25 5 9 11 A 15 16 289943 CASAVA_Build 2 26018222 3I CACTGCACTC ---/TAG ACTGGGCAAC 3070 het 3070 hom 23 10 9 4 TAG 0 1 289944 CASAVA_Build 2 26026844 2I ATCCACCTGC --/CT CTCAGCCTCC 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 CT 1 2 289945 CASAVA_Build 2 26027268 2D TATAGTTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 22 20 6 A 14 12 289946 CASAVA_Build 2 26031115 1D ACACAACCAG C/- CAATAGAAGA 3070 het 3070 hom 34 10 22 2 C 2 1 289947 CASAVA_Build 2 26060218 1D AGTCTTAATC T/- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 38 25 4 10 T 12 11 289948 CASAVA_Build 2 26081619 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 A 9 10 289949 CASAVA_Build 2 26084278 1I CAGCCCTCTA -/T TTTTTTTTTT 1315 het 1315 ref 26 9 6 11 T 15 16 289950 CASAVA_Build 2 26086267 4I ATACCTAGTC ----/ATGT ATGATCTAGC 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 ATGT 0 1 289951 CASAVA_Build 2 26089817 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1470 het 1470 ref 17 7 5 5 A 19 18 289952 CASAVA_Build 2 26095620 10D TTTTCTTTTC TTTTCTTTTT/---------- TTTTTTTTTG 1477 het 1477 ref 17 8 6 3 TTTTCTTTTT 1 0 289953 CASAVA_Build 2 26108617 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1052 het 1052 ref 57 44 3 10 A 12 11 289954 CASAVA_Build 2 26120921 1I GGCTAATTAG -/T TTTTTTTTTT 395 het 395 ref 45 27 4 14 T 15 16 289955 CASAVA_Build 2 26121198 1I GGATTACAGG -/T TGTAAGCCAT 3070 het 1053 hom 16 3 9 4 T 1 2 289956 CASAVA_Build 2 26130093 1D TGTATATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 10 9 289957 CASAVA_Build 2 26131354 1D ACCCCACCTT A/- AAAAAAAAAA 2856 het 890 hom 24 2 9 13 A 12 11 289958 CASAVA_Build 2 26131400 1D GAGCATAGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1970 hom 24 5 13 6 T 10 9 289959 CASAVA_Build 2 26139489 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1730 hom 28 7 13 8 A 14 15 289960 CASAVA_Build 2 26139804 1I CTTTATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 10 11 289961 CASAVA_Build 2 26141872 1D AACCTGAAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 T 10 9 289962 CASAVA_Build 2 26148062 2D ACTTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1969 hom 26 7 13 6 A 14 12 289963 CASAVA_Build 2 26148446 2I GTTATAAAAT --/TG TGCGCAGATA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 TG 1 2 289964 CASAVA_Build 2 26150559 12D CCTGAGATGA TGGTATGGTAGT/------------ GGAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 17 24 6 TGGTATGGTAGT 1 0 289965 CASAVA_Build 2 26151873 2D TTTGTCTCTC TG/-- ATTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 TG 1 0 289966 CASAVA_Build 2 26152590 2D TGGGGAAAAC AG/-- AGACCTGGAG 3070 het 3070 hom 49 21 24 6 AG 2 1 289967 CASAVA_Build 2 26161085 14I TTTACCCCTT --------------/CTTTCATAGTTCTG CAGTTTCAGT 3070 het 3070 ref 49 22 22 6 CTTTCATAGTTCTG 0 1 289968 CASAVA_Build 2 26166876 1I TTTTCTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 10 11 289969 CASAVA_Build 2 26175585 9I TTTCCAGCAA ---------/ATGTGTTTT ATGTGTATTA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 ATGTGTTTT 0 1 289970 CASAVA_Build 2 26177216 1I CATTCAAGGA -/T TTTTTTTTTT 958 het 958 ref 50 28 3 19 T 15 16 289971 CASAVA_Build 2 26177348 1D TGAATAGGGT A/- AAGTGTTGGA 3070 het 3070 ref 50 23 15 12 A 3 2 289972 CASAVA_Build 2 26178099 1I TGAATGGTGG -/C CCTGCAGATG 3070 hom 89 het 34 0 26 8 C 2 3 289973 CASAVA_Build 2 26184999 1I AAAAAAAAAA -/C AACCCTGAAA 2828 het 2828 ref 31 16 10 5 C 0 1 289974 CASAVA_Build 2 26187246 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTGTATTT 3070 het 1287 hom 21 4 10 7 T 5 4 289975 CASAVA_Build 2 26189947 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3012 hom 24 8 12 4 A 8 9 289976 CASAVA_Build 2 26191690 2D CACAATAGCC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 52 16 31 6 A 11 9 289977 CASAVA_Build 2 26204987 5I TAGGAAATTT -----/TAAGA TAAGAAATGA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 TAAGA 1 2 289978 CASAVA_Build 2 26205217 2D TGTAAGTAAC AT/-- GTAGTCAAAT 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 AT 1 0 289979 CASAVA_Build 2 26219379 1D CCCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 11 10 289980 CASAVA_Build 2 26224534 1D GCCCACAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2389 hom 35 11 17 8 T 13 12 289981 CASAVA_Build 2 26236358 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 849 hom 38 5 25 8 A 13 14 289982 CASAVA_Build 2 26251902 1D AGATGGGGTT G/- GGGGTTTCTG 1702 het 1702 ref 19 8 5 6 G 5 4 289983 CASAVA_Build 2 26254784 1D AAACAAACAA C/- CCCCCCCCCC 2191 het 190 hom 15 2 8 5 C 11 10 289984 CASAVA_Build 2 26266068 3D TTCTTTTGAA AAC/--- AAGGCCATGG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 AAC 1 0 289985 CASAVA_Build 2 26275035 1I CTTAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 10 11 289986 CASAVA_Build 2 26294673 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2449 hom 35 9 20 6 A 11 13 289987 CASAVA_Build 2 26296408 1I CTTCCCCAAA -/G GGACCTATGG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 G 2 3 289988 CASAVA_Build 2 26303884 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 A 13 12 289989 CASAVA_Build 2 26319776 1D GGGTGATTCG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 65 30 27 8 T 9 8 289990 CASAVA_Build 2 26321636 4D GGGTGTGGGG GTGT/---- GTGTGTGTGT 2971 het 2370 hom 31 11 10 11 GT 8 6 289991 CASAVA_Build 2 26329669 1I TCAAACTTTG -/A AAAAAGTTGC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 5 6 289992 CASAVA_Build 2 26330630 3I TTCCAGAATG ---/ACT ACTATCTTGA 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 ACT 1 2 289993 CASAVA_Build 2 26340998 2I AAGATACACA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 TG 5 6 289994 CASAVA_Build 2 26356632 1D TGGAGTCATT A/- AAAAAAAAAT 738 het 738 ref 46 39 3 4 A 10 9 289995 CASAVA_Build 2 26357524 3I TTATCAACAT ---/GTA GTAGCTTCAT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 GTA 1 2 289996 CASAVA_Build 2 26369681 1I AGTCAAATGC -/T TTTTTTTGTT 2687 het 2687 ref 18 10 8 0 T 7 8 289997 CASAVA_Build 2 26375100 1D CAGAGTGGCT G/- GGGGGCGGCA 1490 het 1490 ref 27 12 6 11 G 6 5 289998 CASAVA_Build 2 26376291 1I CTCCCAGAAG -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 A 6 7 289999 CASAVA_Build 2 26378943 2I AAAAAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 2529 het 2529 ref 28 12 10 6 A 11 13 290000 CASAVA_Build 2 26382980 1D CTTTCTTTTT C/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 C 1 0 290001 CASAVA_Build 2 26383138 1I CTAATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2495 het 1489 hom 27 7 14 6 T 13 14 290002 CASAVA_Build 2 26388649 1I CCAACCACCT -/G GGGGCATCTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 G 4 5 290003 CASAVA_Build 2 26401441 2D AGAGGTCATG AC/-- AGCTGTTATG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 AC 1 0 290004 CASAVA_Build 2 26404626 1D GCTTTCAAGA T/- TTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 6 5 290005 CASAVA_Build 2 26412015 1D GCCAACGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 443 hom 40 6 19 15 T 10 9 290006 CASAVA_Build 2 26419810 1D TCAAATGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1908 hom 22 6 16 0 T 12 11 290007 CASAVA_Build 2 26426567 3I ACTTGGCTCT ---/CAA CAACAACAGC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 CAA 2 3 290008 CASAVA_Build 2 26455107 1D GTTTTAAATA T/- TTTTGTCTGG 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 T 5 4 290009 CASAVA_Build 2 26458945 3I AAGACAAAGC ---/AGA AGAAGATAGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AGA 2 3 290010 CASAVA_Build 2 26463909 1I CAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 11 8 A 10 11 290011 CASAVA_Build 2 26464068 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 24 0 13 11 A 18 16 290012 CASAVA_Build 2 26467448 2D ACTTCTGACA TT/-- TTAAGGTCAC 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 4 2 290013 CASAVA_Build 2 26468088 1I TTATGGTATT -/A AAAAAAGTCG 3070 het 12 hom 42 1 33 8 A 6 7 290014 CASAVA_Build 2 26476499 1D AATGGCTAGA G/- AGAGCCAGGA 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 G 1 0 290015 CASAVA_Build 2 26492006 1I CTCTTCATTT -/A AAAAGTCAGT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 4 5 290016 CASAVA_Build 2 26505170 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 A 12 13 290017 CASAVA_Build 2 26508978 4I AAAGAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGGA 3070 het 3070 hom 34 17 12 5 AAAG 2 3 290018 CASAVA_Build 2 26528466 1D ATGTTGGCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 13 12 A 13 12 290019 CASAVA_Build 2 26532313 2D AGTTGCACAC GT/-- GTGAGGTGAC 3070 hom 83 het 36 0 23 15 GT 2 1 290020 CASAVA_Build 2 26545238 17D AACACTTGGA CACAGGGAGGGGAACAT/----------------- CACACACCGG 3070 het 3070 ref 27 13 11 7 CACAGGGAGGGGAACAT 1 0 290021 CASAVA_Build 2 26554324 2D TGGTGTTCAT GG/-- GGGTTCTTCA 3070 hom 94 het 34 0 29 6 G 5 3 290022 CASAVA_Build 2 26555562 1D GCTTTGTGTG T/- TCCAGGGAAG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 2 1 290023 CASAVA_Build 2 26571036 1I GGTGGGGGGG -/T GGTTCTTTCA 3070 hom 47 het 21 0 14 7 T 0 1 290024 CASAVA_Build 2 26571810 1I TGTATTTTTA -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 7 8 290025 CASAVA_Build 2 26581092 1I GCCTGTGGTT -/C CCTGGCACCA 3070 hom 126 het 47 0 39 8 C 2 3 290026 CASAVA_Build 2 26593634 1D GCTCTAGTTT C/- CCCCCCAGTG 3070 hom 95 het 35 0 31 4 C 7 6 290027 CASAVA_Build 2 26619960 5I CTCTTTGCCC -----/TTGGG TTGTTTCCTC 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 TTGGG 0 1 290028 CASAVA_Build 2 26621413 6D ATGCCATCCC AAAAAA/------ AAAAAAAAAG 427 het 427 ref 26 9 4 16 A 15 9 290029 CASAVA_Build 2 26623121 1I ACATGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2647 het 2647 ref 39 26 9 4 T 15 16 290030 CASAVA_Build 2 26638123 16I AGTCACAGGG ----------------/AGGGAGGGAGGCAGGC AGGATTACAC 3070 hom 89 het 35 0 24 11 AGGGAGGGAGGCAGGC 0 1 290031 CASAVA_Build 2 26647514 2D ACCCAGAGGT AG/-- AGAGGCTGTC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 AG 3 2 290032 CASAVA_Build 2 26681681 1D TTGTTCAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 11 10 290033 CASAVA_Build 2 26687334 1I AAATACACAT -/G GGGTGTCATA 3070 het 3070 hom 61 24 30 7 G 3 4 290034 CASAVA_Build 2 26688504 1D AGGAGCTTTT G/- CTTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 27 18 9 0 G 1 0 290035 CASAVA_Build 2 26691955 3D AGCCCTGAGC TCT/--- TCTTCCCCAA 3070 het 3070 ref 33 12 16 6 TCT 2 1 290036 CASAVA_Build 2 26697625 5D AGTTTCCAGG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2061 het 822 hom 18 6 6 7 A 19 14 290037 CASAVA_Build 2 26702703 5D GTTCAAAAGA CGGTT/----- CTGGCTGTTA 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 CGGTT 1 0 290038 CASAVA_Build 2 26762937 2D CTGCCCTGAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 10 13 15 AC 10 9 290039 CASAVA_Build 2 26791174 1D AGGAGAATCA C/- TTGAACCCAG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 1 0 290040 CASAVA_Build 2 26794989 1I GTGAATACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2070 hom 24 5 15 4 T 10 11 290041 CASAVA_Build 2 26811473 2I GTTCCAGCTC --/CT CTGTTTCAGA 3070 hom 35 het 21 0 12 9 CT 1 2 290042 CASAVA_Build 2 26814770 1D TCTGGCCCTT G/- GGGCCACATT 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 G 4 3 290043 CASAVA_Build 2 26816533 2I AGCCTAGATG --/AT AGAGTGAGAC 2767 hom 27 het 13 0 8 5 AT 0 1 290044 CASAVA_Build 2 26841746 1I TAAGGACCCA -/G GGCAGTCATG 3070 hom 118 het 49 0 36 13 G 2 3 290045 CASAVA_Build 2 26842970 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2733 het 2733 ref 19 9 8 2 A 11 10 290046 CASAVA_Build 2 26871047 1I ACAGCCACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2528 hom 38 12 19 7 T 9 10 290047 CASAVA_Build 2 26872879 1I GCATTCACTT -/A AAAAAAAAAA 2747 het 2747 ref 23 8 7 8 A 12 13 290048 CASAVA_Build 2 26873348 12I TACTCATCAT ------------/TACTTTAGTATG TACTTATTGC 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 TACTTTAGTATG 0 1 290049 CASAVA_Build 2 26873826 3D AGATAGGAGT AGG/--- AGAATGGTCA 3070 het 3070 ref 37 16 16 7 AGG 1 0 290050 CASAVA_Build 2 26874662 1D TTATTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1807 het 145 hom 9 1 6 2 T 14 13 290051 CASAVA_Build 2 26881144 3I AGTCTCACTC ---/TGT TGCCCAGGCT 3070 het 3070 ref 17 10 7 0 TGT 0 1 290052 CASAVA_Build 2 26881406 4I AAGCCCAGCC ----/TGTT TGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 TGTT 2 3 290053 CASAVA_Build 2 26884536 1D GGGGAAAGTA C/- CCCCCTTCCC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 C 6 5 290054 CASAVA_Build 2 26886141 3D ACTTGAACCC AGG/--- AGGAGGAGGT 2829 het 2829 ref 19 10 7 3 AGG 4 3 290055 CASAVA_Build 2 26887804 1I AAGTCACGGG -/A AAAATTGCCA 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 A 4 5 290056 CASAVA_Build 2 26891875 1I CCAGATACGC -/T GTCTTTTAAG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 0 1 290057 CASAVA_Build 2 26893149 9D GAAATCACTC TAATGTACG/--------- TAGAGGGGCC 3070 het 3070 ref 26 13 9 6 TAATGTACG 1 0 290058 CASAVA_Build 2 26893810 7D TCCTTTTTTT CCCCCCC/------- CCCCCCCCCC 354 het 208 hom 17 2 4 11 C 17 10 290059 CASAVA_Build 2 26896035 4D TATCCCTTGA CTCT/---- CTATACCTAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 CT 3 1 290060 CASAVA_Build 2 26899571 2D TAGGTATAAA AG/-- ATATCTTTAG 2593 het 2593 ref 15 8 6 1 AG 1 0 290061 CASAVA_Build 2 26901354 1I AATAATTACC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 53 het 21 0 18 3 T 9 10 290062 CASAVA_Build 2 26903311 5I TGATGAACTC -----/ATCTT AGAGTGCATG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 ATCTT 0 1 290063 CASAVA_Build 2 26903560 4D ATGCTTTTTC ATTA/---- ATTATCTTCT 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 ATTA 2 1 290064 CASAVA_Build 2 26907103 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1730 het 279 hom 14 3 5 6 A 17 16 290065 CASAVA_Build 2 26909629 3D GAATAGCTAG TCT/--- GCCTGGATGC 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 TCT 1 0 290066 CASAVA_Build 2 26909760 1I CAAAAAATAC -/A AACATTAGCT 3070 het 103 hom 17 1 13 3 A 2 3 290067 CASAVA_Build 2 26909933 4I AAAGTGAATA ----/AAAT AAATGATAAT 1780 het 1780 ref 15 8 5 2 AAAT 1 2 290068 CASAVA_Build 2 26911328 4D TCAATACTGT TTTG/---- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 18 3 TTTG 1 0 290069 CASAVA_Build 2 26913036 1D GGGCAGGGCA G/- GGGATGCAAG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 G 4 3 290070 CASAVA_Build 2 26914063 1D TCTGCTAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 10 9 290071 CASAVA_Build 2 26914166 5I TGAAGACCTT -----/AACAA AACAAGAGCA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AACAA 1 2 290072 CASAVA_Build 2 26914565 1I TCACTAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 11 12 290073 CASAVA_Build 2 26915460 4D TCTTAATTCA TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 het 2566 hom 34 10 17 9 TTCT 4 3 290074 CASAVA_Build 2 26915769 3D CCGGCCTAAA CTT/--- CTTAATTCTT 3070 het 2269 hom 17 6 9 2 CTT 2 1 290075 CASAVA_Build 2 26916246 1D AGCTAATTTT A/- AAATTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 3 A 4 3 290076 CASAVA_Build 2 26916403 2D ACATTTGCTG AC/-- ACATCTCAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 AC 2 1 290077 CASAVA_Build 2 26920126 8D GTTGCCCCCC CGGCCCCG/-------- TGCTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 CGGCCCCG 1 0 290078 CASAVA_Build 2 26921381 1I TATAAGGAGC -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 7 8 290079 CASAVA_Build 2 26926951 1D TTCCCAGACT G/- GGCGATACTT 3070 het 3070 hom 50 22 23 6 G 3 2 290080 CASAVA_Build 2 26927356 4I ATACACACAT ----/ACAC ATATATATAC 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 AC 0 2 290081 CASAVA_Build 2 26933088 1I TGGAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 2973 het 2973 ref 25 13 8 4 A 10 11 290082 CASAVA_Build 2 26943832 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1207 het 327 hom 20 5 6 9 T 14 13 290083 CASAVA_Build 2 26947081 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1155 het 1155 ref 26 12 5 9 A 19 18 290084 CASAVA_Build 2 26969038 1D ATAGAGAACT A/- AAAAAAAAAA 973 het 973 ref 36 24 3 9 A 12 11 290085 CASAVA_Build 2 26980062 24D TCTTGTTTTG ACCTTGCTGGTCTTTCTTATTTGC/------------------------ ACCTTGCTGG 3070 het 3070 ref 36 15 11 15 ACCTTGCTGGTCTTTCTTATTTGC 2 1 290086 CASAVA_Build 2 26986146 1D GTCTAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 A 10 9 290087 CASAVA_Build 2 26987753 2D AATCAAAAAC AT/-- AGAGAAACGA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 AT 1 0 290088 CASAVA_Build 2 26994854 3D TTTTTTTTTT TTC/--- CTCTGGTACT 3070 het 3070 ref 42 21 14 9 TTC 1 0 290089 CASAVA_Build 2 26996552 1D ATTTCATTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 8 290090 CASAVA_Build 2 27002159 1I GTTTTTCTGC -/T TTTTTTGCCC 3070 hom 109 het 43 0 35 8 T 6 7 290091 CASAVA_Build 2 27006600 5D AGAACAGGAG AGAGC/----- AAGGGGTGGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AGAGC 1 0 290092 CASAVA_Build 2 27015512 1I GGAGGATGGC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 80 het 32 0 24 8 T 8 9 290093 CASAVA_Build 2 27026878 1D AGAGACTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 28 0 22 6 T 15 14 290094 CASAVA_Build 2 27027110 1D ATGGCCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 30 0 19 13 A 12 11 290095 CASAVA_Build 2 27027849 1D GGTTTGGATG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 6 290096 CASAVA_Build 2 27078792 1I GCTTTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 633 hom 34 3 18 13 T 13 14 290097 CASAVA_Build 2 27088590 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 66 het 25 0 21 4 AAG 5 6 290098 CASAVA_Build 2 27104586 1I TCCCCCCCCC -/A CATACATAGA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 0 1 290099 CASAVA_Build 2 27116268 3D TGGGTGTCAG GGA/--- GGAGGCGACA 3070 hom 60 het 27 0 21 7 GGA 2 1 290100 CASAVA_Build 2 27140630 3D CAACCTGTGC CAA/--- CAACTCTCAC 3070 hom 66 het 23 0 22 2 CAA 2 1 290101 CASAVA_Build 2 27148916 1D GCCTCTGCCC A/- AGCCAGAGCT 2768 hom 48 het 18 0 15 3 A 2 1 290102 CASAVA_Build 2 27149233 1D CTTGTCACCC A/- AGGGCTTCAG 3070 hom 99 het 36 0 31 5 A 2 1 290103 CASAVA_Build 2 27165670 2I GTGCAGGGAC --/AG TGGGGAAGGG 3070 hom 82 het 33 0 25 8 AG 0 1 290104 CASAVA_Build 2 27179753 2I CCATAAGGTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 68 het 30 0 23 7 T 9 11 290105 CASAVA_Build 2 27181923 5I TTTTTCTTTT -----/TTTTC TTTTCTTTTT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 TTTTC 1 2 290106 CASAVA_Build 2 27185070 3I TTCTTGACAT ---/CAA CAATGATGCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CAA 1 2 290107 CASAVA_Build 2 27186779 2D CCAAAAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 31 het 23 0 19 5 AC 9 8 290108 CASAVA_Build 2 27192410 1D CAAAATGAGA C/- CCCCCCCATC 3070 hom 42 het 16 0 15 2 C 8 7 290109 CASAVA_Build 2 27197758 1D GAAGACAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 255 hom 25 2 13 10 T 13 12 290110 CASAVA_Build 2 27221402 1I CGCCTGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 10 11 290111 CASAVA_Build 2 27237164 1D AATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 17 1 10 6 T 15 14 290112 CASAVA_Build 2 27237599 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2937 hom 18 het 23 0 9 15 T 13 12 290113 CASAVA_Build 2 27237685 1D CCTGCCTTCC A/- AAAACAGAGT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 A 5 4 290114 CASAVA_Build 2 27238499 1D ACAAATGACA T/- TTTTTTTTTG 1825 het 83 hom 20 2 5 13 T 10 9 290115 CASAVA_Build 2 27243456 1D CACCTCTTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 10 9 290116 CASAVA_Build 2 27245183 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1252 hom 26 6 16 4 A 12 11 290117 CASAVA_Build 2 27249332 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 29 0 27 3 A 10 9 290118 CASAVA_Build 2 27261707 1D GGAAAGTTCC T/- TATGCTTCCT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 2 1 290119 CASAVA_Build 2 27268356 1D AATAACAGCC A/- AAAAAAAAAA 2536 het 2536 ref 21 8 7 6 A 12 11 290120 CASAVA_Build 2 27290788 4I ATTTATGTGA ----/CTTG CTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 36 0 26 10 CTTG 0 1 290121 CASAVA_Build 2 27291325 1D AGACACTGAA T/- TTTTAGGTTA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 T 5 4 290122 CASAVA_Build 2 27293518 1D TAATAAACAC T/- TTTTTCTTTT 3070 het 2935 hom 25 8 13 4 T 6 5 290123 CASAVA_Build 2 27295052 2D AAACTGAGTT TC/-- TTCCTACAGT 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 TC 1 0 290124 CASAVA_Build 2 27295721 1I ATGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2993 hom 30 12 14 4 T 10 11 290125 CASAVA_Build 2 27297029 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1631 het 1053 hom 18 5 7 6 A 14 12 290126 CASAVA_Build 2 27305805 1I ACCTTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 11 12 290127 CASAVA_Build 2 27320903 2D TTCTCACCCT CA/-- GTTTTCAGCC 3070 het 3070 ref 56 26 23 8 CA 1 0 290128 CASAVA_Build 2 27322939 2I AATCCTTTGA --/CT CTATCCCCCA 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 CT 1 2 290129 CASAVA_Build 2 27355720 4D TCACCCAGGC TGGA/---- TGGAGTGCAG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 TGGA 2 1 290130 CASAVA_Build 2 27388816 1I TTCTTCCCCT -/G GGCTGTCAGC 3070 hom 106 het 45 0 29 16 G 2 3 290131 CASAVA_Build 2 27394607 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTGTATTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 4 5 290132 CASAVA_Build 2 27410572 1D AGGCCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1119 het 1119 ref 47 31 5 11 T 13 12 290133 CASAVA_Build 2 27414832 4D CGCACGCGCG CACA/---- CACACACACA 3070 het 1911 hom 31 9 12 12 CA 11 9 290134 CASAVA_Build 2 27442529 3I CTCACCTCAG ---/CCT CCTAAGTAGC 1206 hom 13 het 8 0 5 3 CCT 1 2 290135 CASAVA_Build 2 27443049 2I AACAAAACTG --/TT TAACTTTGGG 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 T 1 3 290136 CASAVA_Build 2 27465354 1D TTTCGACATT C/- ATTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 46 30 12 4 C 1 0 290137 CASAVA_Build 2 27481412 1I TTACCTTATA -/T ATTTTTCAGG 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 0 1 290138 CASAVA_Build 2 27510327 1I GTGATTTGTG -/A ACTCTGTTAT 3070 het 3070 hom 67 24 33 10 A 1 2 290139 CASAVA_Build 2 27513337 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2123 hom 29 9 12 8 T 12 11 290140 CASAVA_Build 2 27521025 4I ATGTGGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 TTTG 2 3 290141 CASAVA_Build 2 27528436 3D TATTTGGTCA AAC/--- ATTATTCTGG 2455 het 2455 ref 17 11 6 1 AAC 1 0 290142 CASAVA_Build 2 27592883 1I CCAGGCTGGT -/C CTCAAACTCC 2333 het 2333 ref 15 7 6 2 C 1 2 290143 CASAVA_Build 2 27602497 1D TCATTTTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 10 9 290144 CASAVA_Build 2 27608130 2D AAATAAAAAC AT/-- GTATTATGGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AT 1 0 290145 CASAVA_Build 2 27611010 1D AATAATCTTC A/- AAAAAATGGA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 7 6 290146 CASAVA_Build 2 27611542 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 24 7 A 11 10 290147 CASAVA_Build 2 27617969 2D GATGATGGTG TT/-- TTTTAAACGA 3070 hom 126 het 44 0 43 4 T 6 4 290148 CASAVA_Build 2 27619861 1I TGGCAAGGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 9 10 290149 CASAVA_Build 2 27619919 1D CTAGGTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 34 0 19 15 A 14 13 290150 CASAVA_Build 2 27621397 1D AAAAGTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 27 1 17 9 T 15 14 290151 CASAVA_Build 2 27626596 1I GTGGGGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 27 0 20 7 T 10 11 290152 CASAVA_Build 2 27627269 1I CTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2548 hom 24 7 12 5 T 10 11 290153 CASAVA_Build 2 27636707 2I AATTTGACTG --/AC TATTTTTTCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AC 0 1 290154 CASAVA_Build 2 27663640 4D AATTCATGGG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 56 hom 34 2 22 10 T 18 14 290155 CASAVA_Build 2 27675788 2I AGTTAATGAG --/AC AAGTTACACC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AC 0 1 290156 CASAVA_Build 2 27682471 4D ATGTGCTTAC ACCA/---- TGGTGATTTG 3070 hom 120 het 42 0 41 2 ACCA 1 0 290157 CASAVA_Build 2 27682658 5I TTTGATATAG -----/TTTGA TTTATGTATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTTGA 0 1 290158 CASAVA_Build 2 27691178 1D TATCCCTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 10 9 290159 CASAVA_Build 2 27705622 6I AAGGGAGGGA ------/GGTCTT AGAGGATTTG 3070 hom 52 het 23 0 16 7 GGTCTT 0 1 290160 CASAVA_Build 2 27710156 1I CCTGGAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 492 hom 30 2 21 7 T 13 14 290161 CASAVA_Build 2 27743243 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTTTTT 2117 hom 15 het 6 0 6 1 T 13 11 290162 CASAVA_Build 2 27773471 1I GAGGTGATCC -/T TTTTTTTTTT 1329 het 1329 ref 39 27 3 9 T 10 11 290163 CASAVA_Build 2 27783121 1D GGACAGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 168 hom 27 1 19 7 T 13 12 290164 CASAVA_Build 2 27817179 2I AAATCAAATA --/TG TTAAGCAAAA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TG 0 1 290165 CASAVA_Build 2 27841478 1I AGACCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 375 hom 19 1 16 2 A 11 12 290166 CASAVA_Build 2 27865772 1I ATTTTGAAGC -/T TTTTTTTTTT 485 het 485 ref 28 11 3 14 T 17 18 290167 CASAVA_Build 2 27870996 7D TTTTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTGA 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 15 8 290168 CASAVA_Build 2 27872597 1D ACTGGTATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 10 9 290169 CASAVA_Build 2 27878802 6D AACATATGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 36 0 22 16 TG 12 9 290170 CASAVA_Build 2 27891320 1I ACGTACACAT -/A AAGCACATGA 3070 het 3070 hom 62 23 32 7 A 2 3 290171 CASAVA_Build 2 27899118 4D TGTGAAGGAT AGAA/---- AGAAAGGAGA 3070 het 3070 ref 32 16 10 7 AGAA 2 1 290172 CASAVA_Build 2 27903371 1I AGATTAAATG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 8 9 290173 CASAVA_Build 2 27908266 2D AACCTGGGTG AA/-- ACAGTGAGTT 3070 hom 124 het 48 0 41 8 A 3 1 290174 CASAVA_Build 2 27908495 4D TGTACCAGTT GATA/---- GATAGTCTGT 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 GATA 2 1 290175 CASAVA_Build 2 27923599 1D CTGGAATGAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 11 22 1 A 9 8 290176 CASAVA_Build 2 27941045 1D TCATTCTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 43 1 36 6 A 11 10 290177 CASAVA_Build 2 27960097 1I TCATATGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 23 7 T 14 15 290178 CASAVA_Build 2 27961850 3D CTCCTGACTC TTT/--- TTTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 49 25 20 6 T 7 4 290179 CASAVA_Build 2 27971527 1I AAAAAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 912 hom 43 3 33 7 T 10 11 290180 CASAVA_Build 2 27991892 1I CATCTCAAGC -/A GCAATCTAAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 290181 CASAVA_Build 2 27992050 1D ATAAAAAACG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 8 7 290182 CASAVA_Build 2 28004835 5I TCTGGTTCTT -----/TTCTC TTTCACATTC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TTCTC 0 1 290183 CASAVA_Build 2 28010352 1D TCCCTGATAT A/- AAAGGGCATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 4 3 290184 CASAVA_Build 2 28016995 17I TAAATCAAAC -----------------/AGTTTGCTAACATTGGT AGTTTGCTAA 3070 hom 105 het 42 0 34 8 AGTTTGCTAACATTGGT 1 2 290185 CASAVA_Build 2 28018906 1D AATTTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 29 1 16 12 T 15 14 290186 CASAVA_Build 2 28032353 1I TGGCAACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 895 hom 45 2 35 8 T 10 11 290187 CASAVA_Build 2 28035921 1D TAATGTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 38 1 30 7 T 11 10 290188 CASAVA_Build 2 28037465 1I TGGTTGGTTA -/T TTTTTTTTTT 1199 het 1199 ref 48 37 4 7 T 10 11 290189 CASAVA_Build 2 28052124 1D ACTGTTAAGA G/- GAAGAGGAGG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 2 1 290190 CASAVA_Build 2 28057107 1D TCTTTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 12 11 290191 CASAVA_Build 2 28073637 11I TTCTCTTGAG -----------/TTGAATGCAGC TTGTAATCAA 3070 hom 87 het 31 0 29 4 TTGAATGCAGC 0 1 290192 CASAVA_Build 2 28081061 1D TTAAAGATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 31 2 21 8 T 15 14 290193 CASAVA_Build 2 28088201 1I CTGAGACAGG -/A AAAATGTTAC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 4 5 290194 CASAVA_Build 2 28091040 1D ATGAAGCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 21 1 16 5 T 14 13 290195 CASAVA_Build 2 28123138 1I GGTTAGGGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 62 het 29 0 20 9 T 8 9 290196 CASAVA_Build 2 28133867 1D CAGGTGACCA T/- TTTTTTTTTT 1048 het 1048 ref 42 30 3 9 T 12 11 290197 CASAVA_Build 2 28144414 1I CTTTTTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 10 11 290198 CASAVA_Build 2 28154715 1D TTAATTATGG C/- CCCAAAGTGC 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 C 4 3 290199 CASAVA_Build 2 28159364 5D AGTACCTGGG TCTTA/----- TCTTCTCTCC 3070 het 3070 ref 53 26 21 7 TCTTA 1 0 290200 CASAVA_Build 2 28166263 1I CTCTGTGGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 8 9 290201 CASAVA_Build 2 28186581 1D TTCTTTTTTT G/- TAAGGCTGGA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 G 1 0 290202 CASAVA_Build 2 28199222 1D AAATGAACCA T/- TATGATCTAA 3070 het 3070 ref 46 26 19 1 T 2 1 290203 CASAVA_Build 2 28199841 1I AAATGTATAC -/T TTGTACGTTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 2 3 290204 CASAVA_Build 2 28217681 8D ACCCTAAACC CCCATGAT/-------- GCCATGAGGC 3070 het 3070 ref 36 25 10 5 CCCATGAT 1 0 290205 CASAVA_Build 2 28218432 3I CTCTGTACAC ---/TGT TGTTGTTGGA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 TGT 2 3 290206 CASAVA_Build 2 28223849 1D TAGGAAAATC T/- TTTTTTTTTT 1086 het 1086 ref 18 10 5 3 T 13 12 290207 CASAVA_Build 2 28228049 4I TAATTACTAA ----/TACT TACAAGCATG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 TACT 0 1 290208 CASAVA_Build 2 28228382 1I TAGTTCTGCA -/G GGGGGCTGTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 G 5 6 290209 CASAVA_Build 2 28244478 3D AGAGGAACTC AAG/--- GAGCCCAGTG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AAG 1 0 290210 CASAVA_Build 2 28248231 1I TTTGTTCTTC -/A GATTTTAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 0 1 290211 CASAVA_Build 2 28250397 1I GAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 17 14 12 A 9 10 290212 CASAVA_Build 2 28253636 1D GTACTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2882 het 2882 ref 24 12 7 5 A 12 11 290213 CASAVA_Build 2 28254078 1D CTGAATGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2480 hom 25 8 10 7 A 13 12 290214 CASAVA_Build 2 28255071 1I AAAACAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 21 1 18 2 T 10 11 290215 CASAVA_Build 2 28272707 10D AAAAAAAAAA TGAATTTTTT/---------- ACAAAAAAGC 11 het 11 ref 16 15 1 7 TGAATTTTTT 1 0 290216 CASAVA_Build 2 28278311 1I ATACAGAACC -/G GGTGTTCTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 2 3 290217 CASAVA_Build 2 28283715 1D TCTCTAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 22 1 15 7 A 16 15 290218 CASAVA_Build 2 28285831 1D GTGTGGCCTG A/- GGAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 1 0 290219 CASAVA_Build 2 28289230 3I CTTACTGAGG ---/ATT GTAATTCTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATT 0 1 290220 CASAVA_Build 2 28292036 1D TTGTCATTTA T/- TTTTCTCTTT 3070 hom 130 het 49 0 43 6 T 5 4 290221 CASAVA_Build 2 28293531 1D TAGCATATAC T/- TTTCTATGAG 3070 hom 129 het 49 0 44 6 T 4 3 290222 CASAVA_Build 2 28297553 1I CCCTTTTCCC -/T TCTAAACTTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 1 2 290223 CASAVA_Build 2 28305961 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 855 hom 37 6 19 12 T 13 12 290224 CASAVA_Build 2 28310351 1I CCCTCATCAT -/G TTGGGATGCT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 G 0 1 290225 CASAVA_Build 2 28315212 1I CATTTTCCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 9 10 290226 CASAVA_Build 2 28317242 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 15 14 290227 CASAVA_Build 2 28320831 4D ATGATTTATC TTAT/---- TTGTTTTTCA 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 TTAT 1 0 290228 CASAVA_Build 2 28328600 1I AACAGGAATG -/A AAAATTAATT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 4 5 290229 CASAVA_Build 2 28347799 2D CCTGGGCCCT CA/-- CAGGGACAGC 3070 het 3070 ref 41 27 9 6 CA 2 1 290230 CASAVA_Build 2 28359391 9I AAAAAAAAAG ---------/TATTTATTA GAATGAAAAC 2917 het 59 hom 14 1 6 7 TATTTATTA 0 1 290231 CASAVA_Build 2 28378788 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 19 0 14 5 A 16 15 290232 CASAVA_Build 2 28391502 3D GGGAAGGGAG AGA/--- AGGAGAGGGG 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 AGA 1 0 290233 CASAVA_Build 2 28394640 3D GGGTTGGGCA AAC/--- AACAGCCTGA 3070 het 3070 ref 37 17 12 9 AAC 2 1 290234 CASAVA_Build 2 28396386 2D TGGAGAAGAC TG/-- TGATGAACTC 3070 het 3070 hom 50 20 19 13 TG 2 1 290235 CASAVA_Build 2 28403299 4D TTTTCCTTCT ATTA/---- ATTACAACAT 3070 hom 118 het 46 0 39 9 ATTA 2 1 290236 CASAVA_Build 2 28418525 1D ATGAGAGAGG A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 290237 CASAVA_Build 2 28424999 1I TTTTCCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3062 het 1795 hom 21 7 9 5 T 10 11 290238 CASAVA_Build 2 28426409 12D GCTTCCTCCA CTTCCTCCTCCT/------------ CTTCCTCCTC 3070 hom 89 het 37 0 27 15 CTTCCTCCTCCT 2 1 290239 CASAVA_Build 2 28428471 1I GCTGTACAGA -/G TGAGGAAACT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 G 0 1 290240 CASAVA_Build 2 28444374 4D CCAGTGAAGC GACT/---- GACTGAAGGG 2721 hom 24 het 12 0 8 5 GACT 2 1 290241 CASAVA_Build 2 28450326 2D GTTACTTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 29 1 26 2 T 12 10 290242 CASAVA_Build 2 28472845 1I TTTGCTGTTG -/T TTTTTTCTCT 3070 het 1946 hom 26 6 10 10 T 6 7 290243 CASAVA_Build 2 28476791 15D TACCCCAGTG TCTGAATAACACGTT/--------------- TCTGAATAAC 3070 het 3070 ref 56 23 19 19 TCTGAATAACACGTT 2 1 290244 CASAVA_Build 2 28482100 1D AGAGCCACTT G/- GGGAGGTGTG 3070 hom 110 het 45 0 36 9 G 4 3 290245 CASAVA_Build 2 28492836 1D TCTCGCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 27 2 16 9 T 17 16 290246 CASAVA_Build 2 28505277 1D TCAGTGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 47 1 36 10 A 13 12 290247 CASAVA_Build 2 28524114 1I18M3I AAAGAGAAAG -CCTGACATGGGAAAATGA---/ACCTGACATGGGAAAATGACTT CTTGAGATCA 3070 het 3070 hom 35 19 23 5 N/A 0 0 290248 CASAVA_Build 2 28526854 1I AGGTCCTTTG -/C TGGGGAGGCA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 C 0 1 290249 CASAVA_Build 2 28527802 1D AAGTCCATCT C/- CGTTCTTAGC 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 C 2 1 290250 CASAVA_Build 2 28532119 2I CGGCACATCC --/TG TGAGGGGGAT 3070 hom 101 het 38 0 31 7 TG 1 2 290251 CASAVA_Build 2 28535661 1I GGTTATTTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 27 het 12 0 10 2 T 7 8 290252 CASAVA_Build 2 28539319 1I TAACTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 1998 het 691 hom 16 3 10 3 T 15 16 290253 CASAVA_Build 2 28541836 1I GTATTTTCCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 8 9 290254 CASAVA_Build 2 28548924 1D GGCAGCCCTC A/- GCTCATTCTT 3070 hom 58 het 24 0 15 9 A 1 0 290255 CASAVA_Build 2 28559758 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAAACTG 2083 hom 28 het 22 0 12 10 A 8 7 290256 CASAVA_Build 2 28565577 1D ATACTAGCCT G/- TCTCCATGGG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 1 0 290257 CASAVA_Build 2 28575478 1I TTTTATTTTG -/A AAATGTTTGT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 3 4 290258 CASAVA_Build 2 28576371 1I TGCTAAGAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 6 7 290259 CASAVA_Build 2 28611251 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAACAG 3070 het 563 hom 22 2 17 3 A 7 8 290260 CASAVA_Build 2 28622448 1I CCATCAGCAT -/G GGGAGGTGAC 3070 hom 125 het 47 0 39 8 G 3 4 290261 CASAVA_Build 2 28624227 1D AACAACTTTT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 8 7 290262 CASAVA_Build 2 28630690 2D ATGTCTATAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 70 het 35 0 23 14 AG 7 6 290263 CASAVA_Build 2 28630861 13D CACACCTGCC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 2486 hom 56 het 19 0 18 4 T 29 16 290264 CASAVA_Build 2 28637691 1D GCTCAAACTC A/- AAAGATAAAA 3070 hom 106 het 43 0 34 9 A 4 3 290265 CASAVA_Build 2 28638303 2I ATGCTATAAC --/AT AAATGAACCT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AT 0 1 290266 CASAVA_Build 2 28641239 2I CATTTTAAAC --/TG TGCATAGGTG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 TG 1 2 290267 CASAVA_Build 2 28641933 1D CCTTGAGCCA G/- GAATCCAGGA 3070 hom 108 het 41 0 35 7 G 2 1 290268 CASAVA_Build 2 28645607 3I TGGAGCTGAG ---/ATA ATACTAGCCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATA 1 2 290269 CASAVA_Build 2 28646842 1I AACAAAAATG -/T TAACACCACT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 1 2 290270 CASAVA_Build 2 28646894 1D CAGTGGCTCA C/- GCCTGTACTA 3070 hom 54 het 29 0 19 11 C 1 0 290271 CASAVA_Build 2 28647945 2I TAATCAAGAC --/AT GTGGTACTAG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 AT 0 1 290272 CASAVA_Build 2 28650710 4I ATCCCTCACC ----/CCCG CCCCCCACCC 2192 hom 24 het 10 0 7 3 CCCG 0 1 290273 CASAVA_Build 2 28650756 2I TATATCATTC --/TT TTTTTTTTTT 834 het 70 hom 8 1 2 5 T 16 18 290274 CASAVA_Build 2 28652492 1D TTTCCAGAGG C/- CTTGGGGCTC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 2 1 290275 CASAVA_Build 2 28657775 1I GCTCGGACAT -/C CCCCATGTTA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 C 4 5 290276 CASAVA_Build 2 28658340 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1891 hom 26 7 14 5 A 12 11 290277 CASAVA_Build 2 28659838 1D TACAGGCGTG A/- AGCCACCATG 3070 het 3070 hom 37 11 18 9 A 2 1 290278 CASAVA_Build 2 28664478 1I TACGGCTCTC -/A TCACTCTCCC 3070 het 3070 hom 55 26 26 3 A 0 1 290279 CASAVA_Build 2 28670964 2D TGATCAAGAC TG/-- TGAAGGTTCT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 TG 2 1 290280 CASAVA_Build 2 28686105 1D CTGTTCCTTA G/- GAGTTCTCTA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 G 2 1 290281 CASAVA_Build 2 28687257 1D ATTCAGTCGG C/- CCCCCTTTCT 3070 hom 121 het 46 0 37 9 C 6 5 290282 CASAVA_Build 2 28698249 3D CATCATCATT TTG/--- TTGTTCTTGT 3070 hom 120 het 47 0 41 9 TTG 2 1 290283 CASAVA_Build 2 28699418 1I CAGTGCTTCG -/T CATGGAGTAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 0 1 290284 CASAVA_Build 2 28700781 2I TTATGGCTGA --/GT GTAGTGTTCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 GT 1 2 290285 CASAVA_Build 2 28701171 1I AAGGGAAAGT -/C CCTGAGGGGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 2 3 290286 CASAVA_Build 2 28702966 15D CTGGCCCTGC CCCGAGCTCCTTGCT/--------------- CATGGGAACC 3070 hom 78 het 29 0 25 6 CCCGAGCTCCTTGCT 1 0 290287 CASAVA_Build 2 28703680 18D TAACTCATGG GGATTTAAGTATTGCTGT/------------------ GTTCTGGACT 3070 het 3070 hom 29 12 13 9 GGATTTAAGTATTGCTGT 1 0 290288 CASAVA_Build 2 28707524 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 769 hom 32 3 20 10 A 14 13 290289 CASAVA_Build 2 28709423 1I GAGCAGCCAA -/G GGCCTGGTGG 3070 hom 138 het 49 0 42 7 G 2 3 290290 CASAVA_Build 2 28715703 1D AGTTGAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 22 2 9 11 A 15 14 290291 CASAVA_Build 2 28718714 4I ATTCACTGAG ----/AGAA AGGAGAGTGG 3070 hom 96 het 39 0 30 9 AGAA 0 1 290292 CASAVA_Build 2 28723467 2D CAATAATTAG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 CT 8 7 290293 CASAVA_Build 2 28729358 1D GTAAGAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 12 11 290294 CASAVA_Build 2 28735724 4I ACACTTGTTA ----/TAGT TAGTCTTTTT 3070 hom 138 het 52 0 45 7 TAGT 1 2 290295 CASAVA_Build 2 28744333 1I CATGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 4 5 290296 CASAVA_Build 2 28746565 1I TGAGAGAAGA -/G GAGATGGATG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 290297 CASAVA_Build 2 28750144 1D TGAAATCATC A/- AGATGCAAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 5 A 2 1 290298 CASAVA_Build 2 28779770 2I9M12D CAAAGTGAGA --CTGACTCAGAAAAAAAAAAAA/CTCTGACTCAG------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 N/A 0 0 290299 CASAVA_Build 2 28780532 1D ACACTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 12 11 290300 CASAVA_Build 2 28796265 1I AGATTTCATT -/A AAAAAAAAAA 2743 het 416 hom 14 1 9 4 A 14 15 290301 CASAVA_Build 2 28796851 1D CATGATGAGA T/- TACCACTTCC 3070 hom 111 het 42 0 38 6 T 2 1 290302 CASAVA_Build 2 28805688 1D AACAGTAGTT G/- GGAGTGTGCT 3070 hom 144 het 60 0 47 14 G 3 2 290303 CASAVA_Build 2 28806665 1I TAGATTATTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 2627 hom 22 8 12 2 A 8 9 290304 CASAVA_Build 2 28810192 1D TAGCATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 36 1 12 23 T 17 16 290305 CASAVA_Build 2 28833179 1D TTTGAAGGTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 92 het 37 0 30 7 A 8 7 290306 CASAVA_Build 2 28840299 3I TGGTCTTGAA ---/CAC CTGACCTCCT 3070 hom 51 het 20 0 16 4 CAC 0 1 290307 CASAVA_Build 2 28851410 1D TGTGGAGGCC T/- TTTTTTTTTT 1907 het 1907 ref 25 15 4 6 T 11 10 290308 CASAVA_Build 2 28881187 2D TTGTAATCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 33 4 18 11 T 18 16 290309 CASAVA_Build 2 28914113 13D GAGTCAGTGC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 5 T 22 9 290310 CASAVA_Build 2 28915754 2D CTGACAAAAC TG/-- AGGAACAGCG 3070 hom 102 het 35 0 35 1 TG 1 0 290311 CASAVA_Build 2 28919374 1I AGAAAGACAC -/A AAAAGTTTAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 4 5 290312 CASAVA_Build 2 28924124 5D TCAAAAAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 189 het 189 ref 15 6 2 12 AAAAG 1 0 290313 CASAVA_Build 2 28929167 1D GACTCTATTG A/- AAAAAAAAAA 1205 het 1205 ref 28 19 3 7 A 13 12 290314 CASAVA_Build 2 28930206 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 788 hom 24 2 20 2 A 11 12 290315 CASAVA_Build 2 28948227 1I AGTTGAACTT -/A AAAGTCCAAG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 3 4 290316 CASAVA_Build 2 28997374 1D TTCTCTTTTT C/- TGACTGAATT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 1 0 290317 CASAVA_Build 2 29002787 1I TTTGACACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 11 11 T 10 11 290318 CASAVA_Build 2 29020662 2I TTTCATTAAA --/AC TTGATTTGTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AC 0 1 290319 CASAVA_Build 2 29026586 2I GCTGACTGAC --/AA GAGAGTTTGA 3070 hom 143 het 54 0 47 7 A 0 2 290320 CASAVA_Build 2 29033441 1I GCCACTACAC -/T TCCAGCCTGG 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 1 2 290321 CASAVA_Build 2 29052327 12D AAATGACAAT ATATGTACAGGA/------------ ATATGTACAT 3070 het 3070 ref 30 20 11 5 ATATGTACAGGA 1 0 290322 CASAVA_Build 2 29054696 3I CAGAGCAAGG ---/GGA GGAGAAGACC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 GGA 1 2 290323 CASAVA_Build 2 29065774 1I CATTATCTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 247 hom 22 3 16 3 T 9 10 290324 CASAVA_Build 2 29073593 5D TAATAACCAG AATAT/----- ATAAGGAACT 3070 het 3070 hom 40 14 22 6 AATAT 1 0 290325 CASAVA_Build 2 29081018 2D ATGTGTATGA GT/-- GTGTATGTGT 3070 hom 114 het 72 1 48 27 GT 3 2 290326 CASAVA_Build 2 29081120 2I ATGTGTGTGT --/AC GTGTCTGAGT 3070 hom 268 het 99 0 90 9 AC 0 1 290327 CASAVA_Build 2 29081579 1I GCATGTGTGT -/G GGGTATGTGT 3070 hom 99 het 36 0 34 12 G 3 4 290328 CASAVA_Build 2 29081712 6D AGACCGTGTG TGTGCA/------ TGTGTGGAGC 421 hom 3 het 22 0 3 20 TGTGCA 1 0 290329 CASAVA_Build 2 29081747 4I36M4I AGAACGTGCA ----TGTATGTGGGTGCATGTATGTGGAGTGTGTGTGTGC----/TGTCTGTGTGTGGGTGCATGTATGTGGAGTGTGTGTGTGCGTGT GTGTGTGAGA 3070 hom 69 het 34 0 24 18 N/A 0 0 290330 CASAVA_Build 2 29082562 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGAG 3070 hom 155 het 61 0 51 10 TG 4 5 290331 CASAVA_Build 2 29091565 2I ACTGGGTGAC --/TG TGTTAAATCA 3070 het 3070 hom 58 22 31 5 TG 1 2 290332 CASAVA_Build 2 29094847 1D TGTTGCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 T 12 11 290333 CASAVA_Build 2 29101764 1I ATGAATTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 T 10 11 290334 CASAVA_Build 2 29103968 1D GTCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 14 13 290335 CASAVA_Build 2 29119931 1I TACACGTGCT -/G GGGCTGCTGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 3 4 290336 CASAVA_Build 2 29125049 2D ATTTCCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 2365 het 2365 ref 32 14 8 12 T 18 16 290337 CASAVA_Build 2 29132756 1I GGCAGCTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 9 10 290338 CASAVA_Build 2 29143449 1I GCTTCTGCCT -/C GCACGGAGTG 3070 hom 96 het 37 0 31 6 C 0 1 290339 CASAVA_Build 2 29155448 1I TAAATTAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 T 10 11 290340 CASAVA_Build 2 29159688 1D CATGATTAGC T/- TTTTTTTTTT 2740 het 2111 hom 30 10 9 11 T 15 14 290341 CASAVA_Build 2 29161195 4I TGGGAGTGAC ----/TGTT TGATGGATAC 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 TGTT 0 1 290342 CASAVA_Build 2 29198611 1D TCCAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 37 1 25 12 T 15 14 290343 CASAVA_Build 2 29200705 2D CCCATTTGCA TT/-- GTTTCTGCTG 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 T 2 0 290344 CASAVA_Build 2 29200965 4D5M8D TGCTTGAAGT TGTCCCATAACTCACTG/----CTATA-------- ATTTATTTTA 3070 hom 75 het 25 0 26 1 N/A 0 0 290345 CASAVA_Build 2 29210974 2D TAATAATTCA AG/-- AGAGTTTGTC 3070 het 3070 hom 39 14 21 5 AG 3 2 290346 CASAVA_Build 2 29219670 2D TTTGGATCTC TG/-- TGGAGATGCA 3070 het 3070 ref 33 15 13 8 TG 2 1 290347 CASAVA_Build 2 29226099 1D TTTGGCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1166 hom 32 3 19 10 A 15 14 290348 CASAVA_Build 2 29227901 1I AAATAAGTTT -/A AAAAAAGATA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 7 290349 CASAVA_Build 2 29228759 1D CGTAAAGGTT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 A 8 7 290350 CASAVA_Build 2 29229280 1I ATTGCTTCAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 414 hom 38 1 30 7 T 8 9 290351 CASAVA_Build 2 29231776 2D CCAAGTGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 75 het 37 0 26 12 AC 10 9 290352 CASAVA_Build 2 29233246 4I TTTGTATAAA ----/TAAG AGGGGACTCT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 TAAG 0 1 290353 CASAVA_Build 2 29234741 1D ATGGAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 12 11 290354 CASAVA_Build 2 29247892 1D TAGGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2099 het 143 hom 23 2 8 13 T 15 14 290355 CASAVA_Build 2 29248380 1D CCACCCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 30 1 19 10 T 15 14 290356 CASAVA_Build 2 29257211 2D TATATATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 36 0 28 9 TG 10 9 290357 CASAVA_Build 2 29278152 1D ATGACAGTCT A/- AAAAAAAAAA 1462 het 1462 ref 24 14 5 5 A 17 16 290358 CASAVA_Build 2 29288145 15I GCCCCAGAAG ---------------/AAAAGATTTGATTGA GACAGTTTCT 3070 hom 96 het 38 0 32 7 AAAAGATTTGATTGA 0 1 290359 CASAVA_Build 2 29289121 3I TTGTTGCCCA ---/CGC GGCTGGAGTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 CGC 0 1 290360 CASAVA_Build 2 29293053 4I GTGTTGTGTA ----/TGTG TATGTGGGGT 3070 hom 138 het 53 0 45 8 TG 0 2 290361 CASAVA_Build 2 29306659 1D ACACAATCAT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 583 hom 44 7 20 17 C 1 0 290362 CASAVA_Build 2 29307326 1D AGGTTTCTGA C/- CCCCATACCC 3070 het 3070 ref 52 26 19 7 C 5 4 290363 CASAVA_Build 2 29307971 1I TACTCTTCTA -/T TTCTAGCCGT 2942 het 2942 ref 28 19 8 1 T 2 3 290364 CASAVA_Build 2 29308406 15I CTAACAATTG ---------------/CAAGTTGGTAAAACC CAGGGAGGGC 3070 hom 81 het 28 0 26 3 CAAGTTGGTAAAACC 0 1 290365 CASAVA_Build 2 29330674 4D TCTCTCTCTC TCTA/---- TATATATATA 3070 het 3070 ref 45 19 19 8 TCTA 1 0 290366 CASAVA_Build 2 29333613 1D TTTATGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 34 0 28 6 A 11 10 290367 CASAVA_Build 2 29336598 3I TGTTTTTCTT ---/AGG ACAATGACTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AGG 0 1 290368 CASAVA_Build 2 29355354 1I GTGCCTGGGG -/A GGGGGGACAG 3070 hom 65 het 26 0 21 5 A 0 1 290369 CASAVA_Build 2 29361638 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 6 7 290370 CASAVA_Build 2 29361940 1D TCAGTGGCTC T/- TTTTTTTTTT 2372 het 213 hom 16 2 7 7 T 11 10 290371 CASAVA_Build 2 29363299 3D CACCATCTCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 T 15 12 290372 CASAVA_Build 2 29365727 1D ACTTGAAGTG T/- TTTGAACCCC 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 T 4 3 290373 CASAVA_Build 2 29370215 22I GGTCAGATTT ----------------------/ATATTTCATGTAACAGCCAGGG CCAATACCGT 3070 hom 120 het 41 0 41 3 ATATTTCATGTAACAGCCAGGG 0 1 290374 CASAVA_Build 2 29376586 2D TGAGATGCCC AA/-- GAGTGGAGGA 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 A 2 0 290375 CASAVA_Build 2 29384734 1D CTTTCCTGCA T/- TTTTCCTAAT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 5 4 290376 CASAVA_Build 2 29385270 1I TTCTGTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 11 12 290377 CASAVA_Build 2 29389372 1I7M3I GAGATAACAT -TACCCTG---/CTAGCTAGAGA GAATCCCTCT 3070 het 3070 hom 45 16 27 4 N/A 0 0 290378 CASAVA_Build 2 29394191 2I TCCCTCCACC --/CA CACACCAATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CA 2 3 290379 CASAVA_Build 2 29425436 1D ACTGTCCATC A/- AGTTCTTAGT 3070 het 3070 hom 65 28 31 7 A 2 1 290380 CASAVA_Build 2 29428185 3D ACCCTAGTTG GAA/--- GAAGAAGCAC 3070 het 3070 hom 39 16 16 9 GAA 3 2 290381 CASAVA_Build 2 29430094 1D GTGAGGATCT A/- AAAAAAAAAA 2941 het 2941 ref 53 36 8 9 A 13 12 290382 CASAVA_Build 2 29432844 1D AAAAAAAAAA G/- TCCCAGGGAA 3070 het 3070 hom 30 16 12 3 G 1 0 290383 CASAVA_Build 2 29435474 1I TATGGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 A 11 12 290384 CASAVA_Build 2 29447242 12D ATTGCACCTG TCTTGAAGGAAA/------------ TGTTCTTGAA 3070 hom 111 het 40 0 37 4 TCTTGAAGGAAA 1 0 290385 CASAVA_Build 2 29450803 1D GCTTGCCATG A/- AAAAAAAAAA 1702 het 1702 ref 35 21 4 10 A 12 11 290386 CASAVA_Build 2 29461022 2I ATGTCTGCGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 46 22 13 11 GT 8 9 290387 CASAVA_Build 2 29470689 1D TCCAGACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 11 9 A 12 11 290388 CASAVA_Build 2 29477346 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 A 13 14 290389 CASAVA_Build 2 29480678 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2417 het 1003 hom 16 5 8 4 A 19 14 290390 CASAVA_Build 2 29487799 1D CCTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 628 hom 27 3 18 7 A 12 11 290391 CASAVA_Build 2 29503528 1D ACAAAGGATT G/- GGGGGGGCAG 3070 hom 48 het 23 0 17 6 G 8 7 290392 CASAVA_Build 2 29516055 8D TGTTCTTGTT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 20 12 290393 CASAVA_Build 2 29518495 3I ACCCTCTGGT ---/CTC CTCCGGCAGC 3070 hom 102 het 37 0 29 8 CTC 1 2 290394 CASAVA_Build 2 29518678 1D CTGATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 33 0 19 15 A 13 12 290395 CASAVA_Build 2 29522516 4I TGTCTCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AAAC 2 3 290396 CASAVA_Build 2 29545098 1D GCAGCATGTG C/- CTGTGGTCCC 3070 hom 37 het 14 0 12 2 C 2 1 290397 CASAVA_Build 2 29546697 9I AGGCAATATG ---------/TGAAGAAAT TGAAGAAATA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 TGAAGAAAT 1 2 290398 CASAVA_Build 2 29548111 2D CTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 999 het 999 ref 53 11 3 40 T 14 12 290399 CASAVA_Build 2 29549239 1I AGAAGATCTG -/A ATAAATGAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 1 2 290400 CASAVA_Build 2 29550078 1D ATCTCTACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 10 9 290401 CASAVA_Build 2 29551610 1D ACCAGAGCCA C/- CATCGCTGGA 3070 hom 78 het 30 0 25 8 C 2 1 290402 CASAVA_Build 2 29555333 1D GCCCTGCAAA G/- AATAGGACCC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 1 0 290403 CASAVA_Build 2 29562471 2I AAACACGGTG --/TC TCTATTGTTC 3070 hom 126 het 53 0 40 13 TC 1 2 290404 CASAVA_Build 2 29574741 1D TGAACTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 10 9 290405 CASAVA_Build 2 29583127 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 11 10 290406 CASAVA_Build 2 29588410 1D CTTTTGAATA T/- TTAAAAGTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 3 2 290407 CASAVA_Build 2 29592081 1D GGTGGGACTT A/- ACATTACTCT 3070 hom 99 het 35 0 33 3 A 2 1 290408 CASAVA_Build 2 29615420 1I CTCTTCCACA -/C CCCCCCTCCC 3070 hom 108 het 37 0 36 1 C 6 7 290409 CASAVA_Build 2 29616963 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1513 hom 27 6 15 6 A 12 11 290410 CASAVA_Build 2 29623173 1I TAAAAAGCAA -/T TTTTTTGCCC 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 T 6 7 290411 CASAVA_Build 2 29624918 3I CTGTCTCCGC ---/TCT TCTTCTTGTG 3070 hom 120 het 42 0 39 3 TCT 2 3 290412 CASAVA_Build 2 29640817 1D CACCACCCCC A/- CCGCCACCCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 1 0 290413 CASAVA_Build 2 29645942 2D TTCCCCCCCC CT/-- AGTGAGGTCC 3070 hom 126 het 47 0 40 7 CT 1 0 290414 CASAVA_Build 2 29650436 1I TGAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 26 1 18 7 A 11 12 290415 CASAVA_Build 2 29661731 1D AGTCTTGCTC T/- TGTCACCCAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 2 1 290416 CASAVA_Build 2 29663644 2I AGCTTCACTT --/GA CTTCCTTTGA 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 GA 0 1 290417 CASAVA_Build 2 29682342 1D GGTCCCAAAG A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 7 6 290418 CASAVA_Build 2 29684411 5I TTTCTATTGC -----/TTTCT TTTGTCTGGA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 TTTCT 0 1 290419 CASAVA_Build 2 29686015 1D CATATTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 15 14 290420 CASAVA_Build 2 29696856 1D TACTTTTCTC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 9 8 290421 CASAVA_Build 2 29699852 18I AATAAAATGA ------------------/TAGCTAACACATATATGG TAGCTCACTT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 TAGCTAACACATATATGG 0 1 290422 CASAVA_Build 2 29701148 1I CAAAAACAAA -/C CACATAAAAG 3070 het 3070 hom 51 20 29 2 C 1 2 290423 CASAVA_Build 2 29709544 3I CCATGATGAT ---/CCA CCTCATAGGC 3070 het 3070 hom 52 25 24 3 CCA 0 1 290424 CASAVA_Build 2 29710488 1I CTGGTGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 11 12 290425 CASAVA_Build 2 29712148 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 17 2 12 3 T 12 11 290426 CASAVA_Build 2 29714389 2I TGAAATAAGC --/AG AGAGCTCTAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 AG 2 3 290427 CASAVA_Build 2 29720947 1D GTTTTTTTTT C/- CCCCCACTCT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 C 6 5 290428 CASAVA_Build 2 29721093 1D GGAAGACCTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3052 hom 29 8 16 6 A 9 8 290429 CASAVA_Build 2 29736894 1D CAATTCCCTC T/- TTTTTAAAGG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 6 5 290430 CASAVA_Build 2 29737056 2I AGAAAGGGGG --/GA AAAAAGGGGT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 GA 0 1 290431 CASAVA_Build 2 29739097 1D CCTCTCATTG T/- TTTTTTTGCG 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 8 7 290432 CASAVA_Build 2 29746243 1D AAACAAAGGC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 8 290433 CASAVA_Build 2 29748425 1I GGACATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 23 1 17 5 T 13 14 290434 CASAVA_Build 2 29751244 1I GTCTATTCAG -/A GATTCAACTT 2348 het 289 hom 6 1 5 0 A 0 1 290435 CASAVA_Build 2 29756103 1I GAAGAATAAG -/A AAAAAGGTTG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 5 6 290436 CASAVA_Build 2 29809271 2D AGTCTATAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 14 12 290437 CASAVA_Build 2 29831450 2I AGCTTCTCTA --/AG AGGGTACCAA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 AG 1 2 290438 CASAVA_Build 2 29852729 75D CAGCAATGGT AAACCCCCTCCTCATTCCTTCCAATCCTAACCTTGATTCAGCGTTGAGCAAGAAACAGTGGCAGACGATAGTTTG/--------------------------------------------------------------------------- AAAACAGCCT 3070 hom 51 het 18 0 17 11 AAACCCCCTCCTCATTCCTTCCAATCCTAACCTTGATTCAGCGTTGAGCAAGAAACAGTGGCAGACGATAGTTTG 1 0 290439 CASAVA_Build 2 29861356 1I TGACACAGAA -/G GGGAGGATCA 3070 hom 159 het 59 0 53 6 G 3 4 290440 CASAVA_Build 2 29864404 1I GTATAAAGGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 A 8 9 290441 CASAVA_Build 2 29869166 1I CATAATCTCT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 7 8 290442 CASAVA_Build 2 29869399 1D TTTGATAGCA T/- TTTGCCCACA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 4 3 290443 CASAVA_Build 2 29887605 2D CATTCTGACT CC/-- CCCCCTTTGA 3070 hom 111 het 41 0 37 5 C 7 5 290444 CASAVA_Build 2 29889798 3D GGGAGTGGAT GGA/--- GGAGGAGGAG 3070 het 3070 hom 50 17 27 7 GGA 5 4 290445 CASAVA_Build 2 29902085 1I TTTTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 135 het 50 0 45 5 G 0 1 290446 CASAVA_Build 2 29902632 4I AGAAAAAGAA ----/AGAC AGAGTGTGCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AGAC 0 1 290447 CASAVA_Build 2 29921811 1D TTTAACGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 37 0 31 6 T 11 10 290448 CASAVA_Build 2 29924107 4I TTTATAGAAT ----/GGTG GGTGTTCCAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 GGTG 1 2 290449 CASAVA_Build 2 29930284 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 20 0 13 7 T 11 12 290450 CASAVA_Build 2 29930578 5I CCCTGTATTC -----/TCTTT TATTTGTATA 3070 hom 84 het 39 0 28 11 TCTTT 0 1 290451 CASAVA_Build 2 29934430 2D TGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 48 het 72 1 60 11 TG 7 6 290452 CASAVA_Build 2 29938475 4I CCTCAGCAAA ----/TTAG TTATAGAAGG 3070 hom 96 het 43 0 31 12 TTAG 0 1 290453 CASAVA_Build 2 29939195 1I CAATCTTGAG -/A AAAAAAAAAA 2836 het 2836 ref 32 12 9 11 A 11 12 290454 CASAVA_Build 2 29945223 1I TAGCTACTGA -/G GGTAACATAT 3070 hom 134 het 53 0 46 7 G 2 3 290455 CASAVA_Build 2 29946976 4D TTAGAAAATA TTAT/---- TTATTTATTA 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 TTAT 3 2 290456 CASAVA_Build 2 29966686 2D TTCCAGAGTC AA/-- ACAGGCCTGG 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 A 3 1 290457 CASAVA_Build 2 29972953 1I GAGAAACCCA -/C CCTGTGGCAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 3 290458 CASAVA_Build 2 30005733 1I CTACGGCCAA -/G GGGGGGCATT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 G 6 7 290459 CASAVA_Build 2 30005953 7D GTTTCCATCA GATCTGT/------- GATCTTATAA 3070 het 3070 ref 41 22 15 7 GATCTGT 1 0 290460 CASAVA_Build 2 30009874 1D CAATGTTGAG C/- CTTTCTGTCC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 C 2 1 290461 CASAVA_Build 2 30010210 5D ATTGGAGTTA TATAT/----- TATATAATAT 3070 het 3070 hom 22 9 12 2 TATAT 2 1 290462 CASAVA_Build 2 30011484 1D CATGTCACAG T/- TTCCCAACAT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 3 2 290463 CASAVA_Build 2 30013606 1D ACATAATTGA T/- TTTGTCCTTC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 4 3 290464 CASAVA_Build 2 30016016 2D GTTTTCTCCC CT/-- TTTTCCTGCC 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 CT 1 0 290465 CASAVA_Build 2 30025382 1D TGGGCAATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 T 10 9 290466 CASAVA_Build 2 30027526 1I TAGAATAAAC -/A AAAGGACAGA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 A 3 4 290467 CASAVA_Build 2 30044522 1I GAGAGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 10 11 290468 CASAVA_Build 2 30094238 1D CAATCAGGAT C/- CCAGCTGGAA 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 C 3 2 290469 CASAVA_Build 2 30109041 1I AAATGAAAGA -/G GGTTTAATGG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 2 3 290470 CASAVA_Build 2 30118224 1I TGAGTGGTGA -/C CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 C 7 8 290471 CASAVA_Build 2 30122266 1D TATTGACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 11 10 290472 CASAVA_Build 2 30125830 1I AATGCCCTTA -/C CCTTGCTTCC 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 C 2 3 290473 CASAVA_Build 2 30137363 1I CAGCTCCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 15 16 12 A 9 10 290474 CASAVA_Build 2 30140694 1I TAAAAAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 10 11 290475 CASAVA_Build 2 30150032 2D GATCAAAGAC AG/-- GGGGAAAGAA 3070 het 3070 hom 49 16 25 9 AG 1 0 290476 CASAVA_Build 2 30156505 3I AGCGAGAACC ---/CTT CTGTTGGAAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 CTT 0 1 290477 CASAVA_Build 2 30175147 1D AGCAGGATGT G/- GACCATAATA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 G 2 1 290478 CASAVA_Build 2 30190641 1D GTTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 1574 het 1536 hom 24 9 5 10 T 13 12 290479 CASAVA_Build 2 30196600 1D TTTTAAAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 10 21 8 T 10 9 290480 CASAVA_Build 2 30239395 1D TGGGACTGGC T/- TTATGATGAC 3070 het 3070 hom 58 21 30 7 T 3 2 290481 CASAVA_Build 2 30241465 1D GTTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2575 hom 28 11 11 6 A 15 14 290482 CASAVA_Build 2 30246950 1D TTCGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 28 1 17 10 T 13 12 290483 CASAVA_Build 2 30269361 1D GCTTTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2680 hom 28 8 15 5 A 15 14 290484 CASAVA_Build 2 30272169 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2827 hom 31 10 15 7 T 13 12 290485 CASAVA_Build 2 30272519 1I GGGTGTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 28 3 16 9 T 13 14 290486 CASAVA_Build 2 30289197 1I TTTTTTTTTT -/C CAGTAGAGAT 3070 het 1140 hom 22 3 17 2 C 1 2 290487 CASAVA_Build 2 30300969 12D10M2I TTTGTTTTTG TTTTTGTTTTTTTTTTTGAGAC--/------------TTTTTGAGACAG AGTTTTGCTC 3070 hom 101 het 37 0 34 4 N/A 0 0 290488 CASAVA_Build 2 30391460 1I CAGAGAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 39 1 29 9 A 10 11 290489 CASAVA_Build 2 30393588 1I CCGAGTCTCT -/C CAGCCCATAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 1 2 290490 CASAVA_Build 2 30403427 1I ACAGATAAAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 8 290491 CASAVA_Build 2 30447359 1D GCTAGTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 13 12 290492 CASAVA_Build 2 30453481 1D CTGGAAACAT C/- CCCATTCATA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 C 4 3 290493 CASAVA_Build 2 30464087 4D GCTATGCTTC CTGT/---- CTGTCACTCC 3070 het 3070 hom 49 19 24 9 CTGT 2 1 290494 CASAVA_Build 2 30475051 1I ATCATATTCT -/C CCCTGTAGGG 3070 hom 77 het 32 0 25 7 C 3 4 290495 CASAVA_Build 2 30482599 1I AAGATCTGGC -/G GAGCCAATGC 3070 hom 138 het 52 0 44 8 G 1 2 290496 CASAVA_Build 2 30495475 1D TAGATTTTAA G/- TGTTTTCACC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 G 1 0 290497 CASAVA_Build 2 30495616 1I AATTAAAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 10 290498 CASAVA_Build 2 30512178 1D ATTCCGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1886 hom 23 4 13 6 A 13 12 290499 CASAVA_Build 2 30524730 1D GTAAAACATA T/- TTTTTGAGAG 3070 het 3070 ref 59 33 23 3 T 6 5 290500 CASAVA_Build 2 30525229 4D TTATCTCTAA AGTG/---- AGTATTTCTT 3070 het 3070 hom 42 16 23 6 AGTG 1 0 290501 CASAVA_Build 2 30530128 1I TGACGGCTAT -/G GAAACTATTA 3070 het 3070 ref 57 26 23 8 G 1 2 290502 CASAVA_Build 2 30532802 4I CACCTGGCAG ----/GGAA GGAAGTCTAG 3070 het 3070 ref 46 19 16 11 GGAA 1 2 290503 CASAVA_Build 2 30544893 1D TATATATCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 T 10 9 290504 CASAVA_Build 2 30559148 1I TGTCCCTATT -/A AAAAAAAAAA 1425 het 1425 ref 29 19 5 5 A 13 14 290505 CASAVA_Build 2 30565728 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2497 het 368 hom 19 3 7 9 T 13 12 290506 CASAVA_Build 2 30570936 2I ATACGTGCAT --/AC ACACACATGC 3070 het 3070 hom 58 25 25 8 AC 3 4 290507 CASAVA_Build 2 30579084 1D CATCTCTCTC T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 57 27 25 5 T 8 7 290508 CASAVA_Build 2 30580663 12I TGCTTTCTGA ------------/CAGTCTATATGC CTTCATCACT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 CAGTCTATATGC 0 1 290509 CASAVA_Build 2 30583594 1D TATTTGTTTT A/- ACTGACTCCC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 2 1 290510 CASAVA_Build 2 30600443 1D TATAAGGCTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 T 9 8 290511 CASAVA_Build 2 30601121 3I TTATTTTACT ---/TAA TAATACTTTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 TAA 1 2 290512 CASAVA_Build 2 30601411 1I GTTTTATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 10 11 290513 CASAVA_Build 2 30607986 2I GTAACTTAAT --/GA GGACCTATGG 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 GA 0 1 290514 CASAVA_Build 2 30617823 1I TCTTGTTTAT -/C CCCCCCAAAT 3070 het 2825 hom 27 6 15 6 C 6 7 290515 CASAVA_Build 2 30618211 1I ACCAGTAGTG -/T TAAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 49 23 24 2 T 1 2 290516 CASAVA_Build 2 30622027 4D AAAATGTTTC ATAG/---- AGTTCAACTG 3070 het 3070 ref 32 20 10 3 ATAG 1 0 290517 CASAVA_Build 2 30624099 1I ATAGTAGAGT -/G GGGAGATCCT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 3 4 290518 CASAVA_Build 2 30632895 1I TCAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 9 10 290519 CASAVA_Build 2 30637399 1D GCAACCTCTG C/- CCCCCGGGTT 2706 het 1160 hom 12 3 8 1 C 6 5 290520 CASAVA_Build 2 30645983 3I AGGTATGAAG ---/TTC TTCTTTCCCT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 TTC 1 2 290521 CASAVA_Build 2 30653511 4I ATATTTTGTC ----/ATAT ACATAGGCTC 2399 het 2399 ref 16 9 5 2 AT 0 2 290522 CASAVA_Build 2 30674785 1D CTAGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1972 het 1972 ref 27 15 5 7 T 15 14 290523 CASAVA_Build 2 30676052 1D TTAAATTGAA C/- CCTTTATCAT 3070 het 3070 hom 33 9 19 6 C 3 2 290524 CASAVA_Build 2 30676995 3I ACCCCAAGTC ---/TCT TCTTCTGGCT 2737 het 2737 ref 33 20 8 5 TCT 2 3 290525 CASAVA_Build 2 30678043 3D TTAATAGATG CAC/--- TTTAAAACAA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 CAC 1 0 290526 CASAVA_Build 2 30679106 13I TGTTTCTAAT -------------/GGTGTAAAGTTTA GGTGTAAAGT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 GGTGTAAAGTTTA 1 2 290527 CASAVA_Build 2 30704222 3D CTACTTTAAT ATG/--- ATTTTTACCA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 ATG 1 0 290528 CASAVA_Build 2 30711616 2I ATATACACAA --/AT ATATATATAT 3003 het 851 hom 13 3 8 2 AT 7 8 290529 CASAVA_Build 2 30715754 15I TCTGGCCTGT ---------------/GACTGCTGAAAACAC TTAAGTGAAA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 GACTGCTGAAAACAC 0 1 290530 CASAVA_Build 2 30718258 1D AGCTGCACAC T/- TTTTTTTCTT 1148 het 1148 ref 39 17 8 14 T 8 7 290531 CASAVA_Build 2 30719492 10I CACCTCACCT ----------/CACCGCACCG CACTGCACCG 3070 het 1538 hom 20 8 8 4 CACCG 0 2 290532 CASAVA_Build 2 30720874 1I AGCCTTGCTA -/T TTGAGAACAA 3070 het 3070 ref 54 27 19 8 T 2 3 290533 CASAVA_Build 2 30724842 4I AAATATTAAC ----/TATT TACTGGATGT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 TATT 0 1 290534 CASAVA_Build 2 30731982 2I TGTTTTAAAT --/AA ACAGATCACT 3070 het 3070 ref 52 25 18 9 A 1 3 290535 CASAVA_Build 2 30743550 1D17M21I TGTTTTATTA TTTTTTTTTTTTACTGAT---------------------/-TTGTTTTTTTTACTGATATATCTGTCAAGGATTATTAA TTTTCCTCTG 3070 het 3070 hom 20 10 11 2 N/A 0 0 290536 CASAVA_Build 2 30783522 1D TTGAAGTGAC A/- GCCTGAGGAG 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 A 1 0 290537 CASAVA_Build 2 30787594 2D GCCTCAGCCT CC/-- CGAGTAGCTG 2326 het 111 hom 9 1 7 1 C 3 1 290538 CASAVA_Build 2 30788245 1I CTAGTGTGCC -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 6 7 290539 CASAVA_Build 2 30789794 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 92 het 36 0 30 6 A 10 9 290540 CASAVA_Build 2 30794005 14D CCTTGAGTGG TTTTTTTTGTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2812 hom 36 12 16 10 TTTTTTTTGTTTTT 1 0 290541 CASAVA_Build 2 30794315 1D CTGTCACTTC T/- TTTTTTTTTT 2753 het 772 hom 23 7 8 8 T 15 14 290542 CASAVA_Build 2 30809705 14I GCCAGGTCCT --------------/CTCCTGCTTGCCAC GTTCTCAGTC 3070 hom 87 het 31 0 29 3 CTCCTGCTTGCCAC 0 1 290543 CASAVA_Build 2 30814905 1D CCGTGTAAAA G/- CACTCAGATT 3070 het 3070 hom 65 26 29 10 G 1 0 290544 CASAVA_Build 2 30815247 1D TGTGTGTGTG T/- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 T 2 1 290545 CASAVA_Build 2 30826129 7I GGATCCCAGC -------/ATGTGAT GTGTGCATGA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 ATGTGAT 0 1 290546 CASAVA_Build 2 30835521 5I CTTCCCCTTC -----/CTTAT CTTTTTTCCT 1019 het 1019 ref 15 6 4 5 CTTAT 0 1 290547 CASAVA_Build 2 30835640 2D TTCCTGCCCC CT/-- GTCTGGGGTA 3070 het 2490 hom 19 8 8 4 CT 1 0 290548 CASAVA_Build 2 30849720 1I TATTCTGAGG -/A AATTATTCAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 2 3 290549 CASAVA_Build 2 30897289 1D CAGTTTCAAA C/- TTCCATGCAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 0 290550 CASAVA_Build 2 30897734 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTATAC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 7 6 290551 CASAVA_Build 2 30971716 1D GAGAGTCCCC T/- GGGAACACAG 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 1 0 290552 CASAVA_Build 2 30977879 2I AAATATATTC --/AT ATATATATAT 2430 het 2430 ref 15 8 5 2 AT 5 6 290553 CASAVA_Build 2 30989541 1I TTAAGTCAGT -/G GGGGCAGAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 G 4 5 290554 CASAVA_Build 2 30995575 7I ACTTGTTAAC -------/CTGGAGA CTTCTCGGGC 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 CTGGAGA 0 1 290555 CASAVA_Build 2 31042182 1I TGGGTGCTGA -/C CCCAGCCTGA 3070 hom 84 het 31 0 24 7 C 3 4 290556 CASAVA_Build 2 31061420 14D AGCTCCTAGG GCCCACTAGGCCAT/-------------- GAGTGGAGAC 3070 het 3070 hom 41 17 20 12 GCCCACTAGGCCAT 1 0 290557 CASAVA_Build 2 31071501 30D GAACCAATGT TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/------------------------------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 13 15 14 TG 23 8 290558 CASAVA_Build 2 31116055 1D AGAAGATCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 9 8 290559 CASAVA_Build 2 31120030 1D GATCAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 T 11 10 290560 CASAVA_Build 2 31120321 8D TACAGCGTGC TCCCTGCA/-------- TCCCAGGGAC 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 TCCCTGCA 1 0 290561 CASAVA_Build 2 31127140 5D GCAAAAAGTT TTTTG/----- TTTTTTTTTT 2981 het 1483 hom 23 6 10 7 TTTTG 1 0 290562 CASAVA_Build 2 31149856 1D GGAATAAAGA G/- GGGGGGGGAA 3070 het 114 hom 35 3 26 6 G 9 8 290563 CASAVA_Build 2 31150778 1D CTTTGGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 35 1 28 7 T 11 10 290564 CASAVA_Build 2 31167245 4D GCACTGTGAG AAGT/---- AAGTAATGCA 3070 hom 108 het 40 0 36 7 AAGT 2 1 290565 CASAVA_Build 2 31177073 2D TTAGCCTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 43 1 34 10 A 13 11 290566 CASAVA_Build 2 31178545 3I TCATTAATCT ---/CTA CTTTTATTTA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 CTA 0 1 290567 CASAVA_Build 2 31179553 1I CTTGGCATTA -/T TTTTCGTCTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 4 5 290568 CASAVA_Build 2 31187969 1I CACAAATTGC -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 A 7 8 290569 CASAVA_Build 2 31201840 2D AGCTTTCTCA CC/-- CCCCATTCTT 3070 het 3070 ref 45 20 17 10 C 6 4 290570 CASAVA_Build 2 31205347 2I GAAAAAAAAA --/AC AAAAACACAC 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 AC 0 1 290571 CASAVA_Build 2 31219132 1D ATTTCCCCCA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 55 het 22 0 16 6 C 10 9 290572 CASAVA_Build 2 31253705 1D CTACTCTTCA C/- CCCTGTCTGT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 C 4 3 290573 CASAVA_Build 2 31257893 5D TTTTTTATTT TTTTA/----- TTTTATTATT 49 het 49 ref 16 8 1 7 TTTTA 2 1 290574 CASAVA_Build 2 31260680 1I AGTGGCTCAC -/T GGTCCTAGTT 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 T 0 1 290575 CASAVA_Build 2 31272959 1I CTGTAAAGGA -/T TTAAGTATTA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 2 3 290576 CASAVA_Build 2 31274370 1I TTTATGGTAA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 6 7 290577 CASAVA_Build 2 31274728 2I ACCAAGCTGT --/TC TCTGACCACC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 TC 1 2 290578 CASAVA_Build 2 31277486 8I CATGTGCGTG --------/CGTGTGCA TGTGTGCATG 3070 het 3070 hom 58 22 20 16 CGTGTGCA 0 1 290579 CASAVA_Build 2 31291347 3D AGCCCTGGGG CAT/--- CATCTCTTCT 3070 het 3070 hom 42 16 18 11 CAT 2 1 290580 CASAVA_Build 2 31292219 2D CTTAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 14 12 A 16 14 290581 CASAVA_Build 2 31295343 1I TATTATTATT -/G ATCTATCTCC 3070 het 3070 hom 51 23 22 6 G 0 1 290582 CASAVA_Build 2 31303765 1D AGACTCAGAC A/- GACCCTCTTT 3070 hom 129 het 52 0 43 9 A 1 0 290583 CASAVA_Build 2 31310659 13D GGGCCGATCG GGGACCCCGGCTT/------------- GGGACCCCGG 3070 hom 53 het 19 0 15 4 GGGACCCCGGCTT 1 0 290584 CASAVA_Build 2 31316217 2I CTCGAGCTGA --/CT CTCTAACAGG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CT 2 3 290585 CASAVA_Build 2 31323724 2D TATATTTTAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 30 hom 19 1 8 10 A 11 9 290586 CASAVA_Build 2 31339267 4D CCTGGGCAAC AGAG/---- AAAGACTCCA 3070 hom 72 het 25 0 23 3 AG 2 0 290587 CASAVA_Build 2 31346989 2D AAAACACTCA AT/-- ATAAAGTCTA 3070 hom 102 het 37 0 34 4 AT 2 1 290588 CASAVA_Build 2 31353037 3D GACCCAGGAA ATC/--- ATCATGTCCC 3070 hom 117 het 42 0 38 4 ATC 2 1 290589 CASAVA_Build 2 31353774 3D AAAAAAAAAA ATT/--- TTTTTTTTAA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 ATT 1 0 290590 CASAVA_Build 2 31367982 1I TAATAGGTGC -/A AAAAAATTAA 3070 hom 70 het 31 0 24 7 A 6 7 290591 CASAVA_Build 2 31383659 1I TATATTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 10 11 290592 CASAVA_Build 2 31384560 1I TTGTTGGTAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 T 7 8 290593 CASAVA_Build 2 31387252 1D TGGTACTACA G/- GTTGTCTGCA 3070 het 3070 ref 43 20 15 10 G 2 1 290594 CASAVA_Build 2 31391461 1D GTACCTTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 9 8 290595 CASAVA_Build 2 31392632 11I AAGTGATCTT -----------/AAAACAAAACA AAAACAAAAA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 AAAACAAAACA 0 1 290596 CASAVA_Build 2 31394013 16D TGCAAATGCT CTCAGAATAGCATTTG/---------------- CTCAGAATAG 3070 hom 86 het 34 0 28 6 CTCAGAATAGCATTTG 1 0 290597 CASAVA_Build 2 31395014 1I TCATTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 11 12 10 T 11 12 290598 CASAVA_Build 2 31400624 4D AAATAAAGCC TTTT/---- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 T 12 8 290599 CASAVA_Build 2 31419081 1I26M2D CTGTTCACAC -AGTTCTCCTGCTTACCTTCTCAAGGTGA/AAGTTCTCCTGCTTACCTTCTCAAGGT-- GAAAGTTAAT 3070 hom 120 het 32 0 41 2 N/A 0 0 290600 CASAVA_Build 2 31420190 4I TATGCCTAAC ----/ATAT ATATATATGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AT 4 6 290601 CASAVA_Build 2 31425987 1I CTTCCTATAT -/G GGGGTCAGCA 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 G 4 5 290602 CASAVA_Build 2 31427314 3D TCCAGAAGCA ACT/--- ACTTACAATT 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 ACT 2 1 290603 CASAVA_Build 2 31434020 3D TATGGTGACT ATA/--- ATATTTTTAA 2726 het 2726 ref 19 10 6 3 ATA 2 1 290604 CASAVA_Build 2 31438426 2D CTCATTACAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 11 8 8 AT 8 7 290605 CASAVA_Build 2 31463236 1I TGGCTGAAAG -/C CCAGATTCCT 3070 hom 32 het 14 0 12 2 C 2 3 290606 CASAVA_Build 2 31531406 1D TAATTAGAGC T/- TCTTTTTTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 1 290607 CASAVA_Build 2 31615529 1I AAATATAAAG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 7 8 290608 CASAVA_Build 2 31620135 1I15M1D CCCCACTGCA -GAAGACCTATTTAACA/GGAAGACCAATTTAAC- AACTATCTAC 3070 hom 60 het 23 0 21 6 N/A 0 0 290609 CASAVA_Build 2 31625096 1D TTATTCAAAG C/- CAAATTAATA 3070 hom 98 het 39 0 34 6 C 2 1 290610 CASAVA_Build 2 31633730 1D ACACAACTAG A/- AAAAAAAAAA 1880 het 1880 ref 36 21 5 10 A 13 12 290611 CASAVA_Build 2 31650620 1D CATTGCAGCA C/- GTATTCACAA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 C 1 0 290612 CASAVA_Build 2 31656940 1I ATCTGGAGTC -/T TACTGCCTGG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 290613 CASAVA_Build 2 31659385 1I CGTAGCCGGA -/G GGCTTCGCGA 3070 hom 56 het 25 0 17 8 G 2 3 290614 CASAVA_Build 2 31659635 1I CCTGGCGCGG -/C TTCGCAGCAA 2955 hom 30 het 13 0 9 4 C 0 1 290615 CASAVA_Build 2 31665146 1I TGTTTGGGAG -/A AAGTAAGGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 3 290616 CASAVA_Build 2 31666892 1D CAAGGCATTT A/- AATAATTAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 2 290617 CASAVA_Build 2 31747050 1I AATAAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 10 11 290618 CASAVA_Build 2 31783061 1I CTTGTGAGGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 377 hom 39 1 33 5 A 8 9 290619 CASAVA_Build 2 31797496 1I AGGAATGAGC -/T TTCACTAAGC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 2 3 290620 CASAVA_Build 2 31825088 4D GTTGTTTTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1890 hom 21 7 8 6 TTTG 4 3 290621 CASAVA_Build 2 31829303 5D AAATTCCTCG ACACA/----- TACAACCTCC 3070 het 459 hom 9 1 8 1 ACACA 1 0 290622 CASAVA_Build 2 31836660 1D GGGAGAGGCC A/- GGGGTGGAAT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 1 0 290623 CASAVA_Build 2 31850729 1I TTTCTTCCCC -/A AAAAAAGTTG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 6 7 290624 CASAVA_Build 2 31857705 1D AGGATAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 10 9 290625 CASAVA_Build 2 31858626 9D ATTCCATCTC AAAAAAAAG/--------- AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 20 0 18 4 AAAAAAAAG 2 1 290626 CASAVA_Build 2 31881330 1I GAGCAAACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 9 10 290627 CASAVA_Build 2 31909066 4I TTTTGGTGGG ----/TTTT TTGTTTGTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 4 T 2 6 290628 CASAVA_Build 2 31922310 1I GCATAATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 9 10 290629 CASAVA_Build 2 31922948 1D TATATCCACC A/- AAAAAATGAA 3070 hom 58 het 24 0 20 5 A 7 6 290630 CASAVA_Build 2 31940358 1D AATAAAAAAA C/- AACTGCATTA 2896 het 2896 ref 26 14 7 6 C 1 0 290631 CASAVA_Build 2 31950072 2D TTCCATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 152 hom 32 1 27 6 AC 10 9 290632 CASAVA_Build 2 31950092 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 279 hom 41 7 30 5 AT 6 5 290633 CASAVA_Build 2 31953492 2I GCAAGTGTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2915 hom 29 8 18 3 AT 5 6 290634 CASAVA_Build 2 31957386 2I TTTTAATGAC --/AG GGGAAAATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AG 0 1 290635 CASAVA_Build 2 32004950 1D CTCAAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 275 hom 36 3 13 20 A 17 16 290636 CASAVA_Build 2 32034914 1D AATTTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 1066 het 1066 ref 40 29 3 8 A 13 12 290637 CASAVA_Build 2 32038359 1D AGCAATTGTA T/- TTTTTATACC 3070 hom 151 het 55 0 51 6 T 6 5 290638 CASAVA_Build 2 32047837 2I GCTACAAAGC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 TA 8 9 290639 CASAVA_Build 2 32047998 2D GTATATATAC AT/-- ATATGTGTGT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 AT 3 2 290640 CASAVA_Build 2 32070260 2I TAATTCAAAC --/AT ATTTCCAATT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 AT 1 2 290641 CASAVA_Build 2 32083976 2I AAAATTTTTC --/TA TGTTCTTAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 TA 0 1 290642 CASAVA_Build 2 32101084 1I TATTTATGTA -/T TTTTTTTTTT 2241 het 2241 ref 18 8 7 3 T 11 12 290643 CASAVA_Build 2 32138946 1D GTTATTTAAG A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 A 8 7 290644 CASAVA_Build 2 32148641 2D AAAAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTTT 1360 het 1129 hom 20 8 5 7 AT 1 0 290645 CASAVA_Build 2 32151655 3I TTTAGCTGGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 TTG 3 4 290646 CASAVA_Build 2 32156547 1I GTTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 729 hom 12 3 8 1 G 0 1 290647 CASAVA_Build 2 32158199 2I AGTAGCACAA --/TC TCAACTCACT 3070 het 1509 hom 22 4 12 7 TC 1 2 290648 CASAVA_Build 2 32159174 1I GTTGGGAGCT -/A AATGTTAAAG 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 A 2 3 290649 CASAVA_Build 2 32167291 1D GAGTAAAAAA C/- AATTTAATTA 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 C 1 0 290650 CASAVA_Build 2 32172392 2D TATCTTAAAA AT/-- ATATATATAT 1432 het 1432 ref 23 16 4 3 AT 8 7 290651 CASAVA_Build 2 32178530 8I TGTTGTGAAT --------/AGTGCTGC AGTGCTGCAG 2200 het 2200 ref 24 12 5 7 AGTGCTGC 1 2 290652 CASAVA_Build 2 32201352 1D ATCTATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 A 12 11 290653 CASAVA_Build 2 32202577 1I ATGATCCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 10 11 290654 CASAVA_Build 2 32208917 4D TTGGCAAACA TACT/---- TAAACTGAAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 TACT 1 0 290655 CASAVA_Build 2 32211103 2D AAACTCAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 T 13 11 290656 CASAVA_Build 2 32211620 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2338 hom 22 7 12 3 A 11 12 290657 CASAVA_Build 2 32214987 1I AGGGACGGTT -/C AGTAGTACTC 3070 het 3070 hom 46 22 23 1 C 0 1 290658 CASAVA_Build 2 32215584 4I AGCATTTTAG ----/TATA TATATTTTCC 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 TA 2 4 290659 CASAVA_Build 2 32224229 1I TTTTTAATTA -/T TATCTTTTGA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 1 2 290660 CASAVA_Build 2 32235232 3I TTCATTTAAA ---/AGG AGATTAACGT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AGG 0 1 290661 CASAVA_Build 2 32239400 3D AGATTGTGAT AAG/--- AATGCATTTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 AAG 1 0 290662 CASAVA_Build 2 32245921 2I GTGCTGGGAT --/TG TACAGGCGTG 2580 het 1325 hom 17 5 8 4 TG 0 1 290663 CASAVA_Build 2 32250270 1D CTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2293 hom 24 8 11 5 T 13 12 290664 CASAVA_Build 2 32251281 14D ACAGACCATT AGTGCTGCCTATTA/-------------- AGTGCTGCCT 3070 het 3070 ref 50 29 18 6 AGTGCTGCCTATTA 2 1 290665 CASAVA_Build 2 32285014 1D GCGAGATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1733 hom 23 6 14 4 A 12 11 290666 CASAVA_Build 2 32287252 3D CACCGGCTAA TTG/--- TTGTACTTTT 2896 het 2896 ref 17 7 8 2 TTG 2 1 290667 CASAVA_Build 2 32294441 3I GGCTAATTTA ---/TTT TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 6 9 290668 CASAVA_Build 2 32296418 1I GATTGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 989 hom 26 3 14 9 T 13 14 290669 CASAVA_Build 2 32303376 1D GGAAGAAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 3 T 8 7 290670 CASAVA_Build 2 32303983 10D ATACAAAGGA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 66 22 28 20 TG 18 13 290671 CASAVA_Build 2 32314998 1I ATTCTGAGTT -/C TTATCTTCTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 1 290672 CASAVA_Build 2 32315442 4I GATGAGAAAA ----/AAAG AAAACAAATA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 AAAG 0 1 290673 CASAVA_Build 2 32317238 1I CTTAAACAGC -/G GGGGGGGCTG 3070 het 3070 ref 27 10 12 5 G 7 8 290674 CASAVA_Build 2 32320359 3D TGAAAAATAT AAA/--- AATAAAAACA 3070 het 2594 hom 16 7 9 1 A 5 2 290675 CASAVA_Build 2 32332926 1I CATTGTATCT -/C CCACAGACTT 3070 het 3070 ref 54 28 16 10 C 2 3 290676 CASAVA_Build 2 32335298 1D ATCACCAGTA T/- TTGGTAGCAG 3070 het 3070 hom 64 29 32 4 T 3 2 290677 CASAVA_Build 2 32336186 2D CCTCAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 1220 het 1220 ref 22 8 6 9 A 18 16 290678 CASAVA_Build 2 32338457 4D GCTTGCAGTA TAAG/---- TAGTTTGTAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 TAAG 1 0 290679 CASAVA_Build 2 32358155 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 518 hom 5 het 5 0 3 2 T 9 8 290680 CASAVA_Build 2 32362295 1I ATCTCATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 880 hom 19 3 14 2 T 13 14 290681 CASAVA_Build 2 32384712 2D ATGCACAAAC TT/-- TTTAATTTGG 3070 het 3070 ref 24 15 7 2 T 5 3 290682 CASAVA_Build 2 32388255 15D ATTGTGACCC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 1620 het 1620 ref 22 7 5 11 T 25 10 290683 CASAVA_Build 2 32421642 1I CACTAATGTG -/A AACAAAACCG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 2 3 290684 CASAVA_Build 2 32436563 1I AGGTCCCGCA -/G GTGCGGGGGA 1914 hom 15 het 7 0 6 1 G 1 2 290685 CASAVA_Build 2 32445757 1D TCTGTGGCCT G/- GGCATGGTGG 3070 hom 93 het 32 0 31 4 G 3 2 290686 CASAVA_Build 2 32448891 2I TAGCAAAGTA --/AG AGTGGTCTGA 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 AG 1 2 290687 CASAVA_Build 2 32454316 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 15 11 T 15 14 290688 CASAVA_Build 2 32464455 1I GGTTGGTGTT -/A ACAAGTTGGA 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 A 1 2 290689 CASAVA_Build 2 32465017 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2491 het 2491 ref 48 20 8 20 T 15 14 290690 CASAVA_Build 2 32482787 1I CAGGCGTGAG -/C CACCACGCCC 2933 hom 24 het 9 0 8 1 C 1 2 290691 CASAVA_Build 2 32499510 2D GTTTTATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2949 het 2326 hom 25 9 8 8 T 16 14 290692 CASAVA_Build 2 32502802 2I ATTTATCATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 TG 5 6 290693 CASAVA_Build 2 32503671 1D CACTTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1222 hom 35 7 13 15 T 13 12 290694 CASAVA_Build 2 32508161 1D TGAAAAGGTG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 33 0 28 6 A 9 8 290695 CASAVA_Build 2 32515421 1I CAGGCGTCAG -/C CACCGCACCT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 1 2 290696 CASAVA_Build 2 32533052 1I TTTTCTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 10 11 290697 CASAVA_Build 2 32538721 2D TGTATTATAT TA/-- TATATATGAT 2334 het 2334 ref 14 6 6 2 TA 4 3 290698 CASAVA_Build 2 32544487 2I AGTATTTTCT --/GC GCCCAACTAA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 GC 1 2 290699 CASAVA_Build 2 32561680 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 2 3 290700 CASAVA_Build 2 32562539 1I TCTCATTGGG -/T TTTTTGGGGG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 5 6 290701 CASAVA_Build 2 32562856 1I CAGGTGCGGT -/A GGTCACGCCT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 0 1 290702 CASAVA_Build 2 32566617 1I7M1I ACAGCTGTGA -TTAGAGA-/TTTAGAGAC TTGAATCACA 3070 hom 63 het 25 0 22 8 N/A 0 0 290703 CASAVA_Build 2 32587626 1I GGTGAGAGTG -/A AACTCTGTCT 3070 het 45 hom 22 1 20 1 A 2 3 290704 CASAVA_Build 2 32592576 1D5M2I5M1I TGCAGAAGTT CGCCAT--GCTGC-/-GCAGTGAGCTGCG CTCACGCCAC 3070 hom 56 het 20 0 16 7 N/A 0 0 290705 CASAVA_Build 2 32596344 1I GGTAGAGACA -/G GGTTTCACCA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 2 3 290706 CASAVA_Build 2 32609195 1I TTGTTTCCAA -/T TTTTTACTCC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 5 6 290707 CASAVA_Build 2 32626887 1D GTATCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 T 14 13 290708 CASAVA_Build 2 32627178 1I CATGGTGAAA -/C CCTGCCTCTA 1446 hom 10 het 4 0 4 0 C 2 3 290709 CASAVA_Build 2 32631867 1I TTTTTGTGAC -/T TAACAGTAGT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 1 2 290710 CASAVA_Build 2 32635519 4I CAAAAAACAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 AAAG 3 4 290711 CASAVA_Build 2 32636892 1I ATTTATATAC -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 ref 33 19 7 7 A 6 7 290712 CASAVA_Build 2 32656151 2I AAAATGGAGT --/TA TATAGAGTAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 TA 2 3 290713 CASAVA_Build 2 32665391 1D GTAACTTGTT C/- ATATTATCTA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 C 1 0 290714 CASAVA_Build 2 32695132 7D CCTTGTTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1428 het 1428 ref 22 8 6 11 A 25 18 290715 CASAVA_Build 2 32699169 1I GTAAAGTGAA -/T TTGGTCTATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 2 3 290716 CASAVA_Build 2 32708173 1D GACCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1863 het 1108 hom 10 3 6 1 T 11 10 290717 CASAVA_Build 2 32738193 1D GTGCCATGGT G/- GTTTGCTGCA 3070 hom 84 het 30 0 28 3 G 2 1 290718 CASAVA_Build 2 32749504 36D TTGCCCATTT TTAATTTGAGTTGTTTGTCTTCTTATTGAGTTCTAA/------------------------------------ GAGTTCTCCA 3070 hom 36 het 10 0 13 1 TTAATTTGAGTTGTTTGTCTTCTTATTGAGTTCTAA 1 0 290719 CASAVA_Build 2 32749865 2I TGAAGGGTCA --/TT TTTTTTTTTC 1563 hom 21 het 42 0 7 35 T 9 11 290720 CASAVA_Build 2 32751797 1I ACCTTATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 25 1 15 9 T 13 14 290721 CASAVA_Build 2 32765071 4D GCTGGGACTA CAGG/---- CGTGAACCAC 3070 hom 64 het 25 0 20 7 CAGG 1 0 290722 CASAVA_Build 2 32770315 1I TTTATTTCAC -/T ATTCACAACA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 0 1 290723 CASAVA_Build 2 32819025 1I TTTTGGGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1188 hom 37 3 26 8 T 11 12 290724 CASAVA_Build 2 32820218 1D20M3I GCGAGAATCC AATAAAAAAAACAAAAAACAA---/-ATTAAAAAAGCAAAAAACAAAAC AACAACAACA 3070 hom 60 het 19 0 21 3 N/A 0 0 290725 CASAVA_Build 2 32873704 1D ACATTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 37 0 25 12 A 14 13 290726 CASAVA_Build 2 32922266 8D TTTGGGCTCT AGGTTTTG/-------- AGATAGAATG 3070 het 3070 ref 44 28 15 6 AGGTTTTG 1 0 290727 CASAVA_Build 2 32968665 1D TTCTCTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3005 het 3005 ref 41 20 7 14 T 15 14 290728 CASAVA_Build 2 32980749 1I GGTTCGTAGC -/T GCTACACTAA 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 T 0 1 290729 CASAVA_Build 2 32993986 1I TTGTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 30 0 19 11 T 11 12 290730 CASAVA_Build 2 33007749 1I GGTCATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2250 hom 29 5 20 4 A 10 11 290731 CASAVA_Build 2 33012165 2D CCACCCCTTT TC/-- CCCCGGCAAG 3070 hom 81 het 32 0 26 9 TC 1 0 290732 CASAVA_Build 2 33014151 1I CAAGATTGAG -/C CCATTGCATT 3070 het 17 hom 28 1 24 3 C 2 3 290733 CASAVA_Build 2 33019445 1D CTGTAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 33 0 26 8 T 11 10 290734 CASAVA_Build 2 33020472 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 10 9 290735 CASAVA_Build 2 33034202 1I TTTCCACAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 8 9 290736 CASAVA_Build 2 33040125 1D TTTTGTTCAT C/- CCCCCCACCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 C 7 6 290737 CASAVA_Build 2 33040612 1I GTTTGTACAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 T 7 8 290738 CASAVA_Build 2 33047916 3I ATTGTGTGTT ---/GTG GTGGTTTGAT 3070 het 3070 ref 40 26 11 3 GTG 1 2 290739 CASAVA_Build 2 33050689 1I GAGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 34 1 22 11 T 11 12 290740 CASAVA_Build 2 33050700 2I TTTTTTTTTT --/TC CTGTGGATTC 3070 het 101 hom 37 2 19 16 TC 0 1 290741 CASAVA_Build 2 33050845 1D ATCTTTTGTG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 T 8 7 290742 CASAVA_Build 2 33063843 7D GTACTGTCTA CTGAGCT/------- CTTGATGTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 CTGAGCT 1 0 290743 CASAVA_Build 2 33067506 1D CTTAGACCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 T 9 8 290744 CASAVA_Build 2 33072719 2D GTGCTAAAAC AT/-- AAAGGGTGAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 AT 1 0 290745 CASAVA_Build 2 33082411 1D AAACCTCTGC A/- AAAACCACAA 3070 het 3070 ref 57 27 27 3 A 5 4 290746 CASAVA_Build 2 33082671 1I ATAAATATCA -/T TTTTTTTTTT 2684 het 2684 ref 33 16 9 8 T 13 14 290747 CASAVA_Build 2 33111790 1D GTGTAAGTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 T 10 9 290748 CASAVA_Build 2 33113062 1I TTTGGATTTT -/A AAAATCTATA 3070 het 3070 ref 38 26 11 1 A 4 5 290749 CASAVA_Build 2 33122610 1D TTTCTGTTCG T/- TTTTTTTTTT 1769 het 1769 ref 31 21 5 6 T 12 11 290750 CASAVA_Build 2 33131451 1D TAAAACAGGC T/- TTTTTTTTTT 2746 het 1669 hom 20 5 9 6 T 12 11 290751 CASAVA_Build 2 33138760 2I AGTTAGCTTA --/CT CTCTGTTGCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CT 2 3 290752 CASAVA_Build 2 33140798 2D TCTGTCTCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 40 0 31 10 AC 8 7 290753 CASAVA_Build 2 33142425 1I TTGTATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1530 hom 30 5 18 7 T 12 13 290754 CASAVA_Build 2 33150215 3I ATGATGTCGT ---/AAC AACAAGTCAT 3070 hom 122 het 52 0 40 12 AAC 1 2 290755 CASAVA_Build 2 33150608 1I CACGAGACTG -/C CCCCCGTTTC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 C 5 6 290756 CASAVA_Build 2 33151857 1D TGTTTTTTTT G/- TTTTTGTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 1 0 290757 CASAVA_Build 2 33154462 1D AATGTGCTTC T/- TTATTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 T 3 2 290758 CASAVA_Build 2 33158519 1I ACTAAAAAAC -/T TTTAACTATG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 3 4 290759 CASAVA_Build 2 33159701 1I GGAACTTAGC -/A AAAGCCCCTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 3 4 290760 CASAVA_Build 2 33168747 4D TTTCATTTGC TCTG/---- TCTTTCAGAC 3070 het 3070 hom 54 23 28 5 TCTG 1 0 290761 CASAVA_Build 2 33171217 1D ATAGGTGGAA T/- TTTTAGTCTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 T 5 4 290762 CASAVA_Build 2 33191110 1D GGCTGTTGTT C/- AGAAAGAAGC 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 C 1 0 290763 CASAVA_Build 2 33197738 4I GTCAGACTGA ----/TTTT TTTTTTTTTT 2271 het 2271 ref 31 17 7 7 T 10 14 290764 CASAVA_Build 2 33232446 1I TGTCCCCAGA -/G GCGGCATCAT 2753 het 1544 hom 21 8 10 3 G 1 2 290765 CASAVA_Build 2 33237190 2D AAGGACCTAT GA/-- GATTCATTGA 3070 het 3070 ref 45 24 18 4 GA 2 1 290766 CASAVA_Build 2 33245933 1I TTGTACATTC -/A AAAAAAAAAA 928 het 928 ref 48 27 3 18 A 15 16 290767 CASAVA_Build 2 33257629 3D TGCTTTTATT TGC/--- TGTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 9 TGC 1 0 290768 CASAVA_Build 2 33259561 2D AATCAAAATC AT/-- GTGTGTGTCT 3070 het 3070 ref 46 25 17 5 AT 1 0 290769 CASAVA_Build 2 33261535 1D TTGATAATTT A/- AAATGTTAGA 3070 het 3070 ref 24 14 7 4 A 4 3 290770 CASAVA_Build 2 33268443 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 41 het 18 0 14 4 A 6 5 290771 CASAVA_Build 2 33281642 8I GTGTTACTGA --------/GTCTGGTT GTCTCTTGTG 3070 het 3070 hom 55 21 28 6 GTCTGGTT 0 1 290772 CASAVA_Build 2 33283142 1D GATAAGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 11 10 290773 CASAVA_Build 2 33286076 6D GAGTGGACTT AAAAAA/------ AAGAAAGAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 6 A 8 2 290774 CASAVA_Build 2 33298908 1D TCCACACCTC T/- TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 T 8 7 290775 CASAVA_Build 2 33309463 11D CATTTTTGGC ACGTACTGTGG/----------- GCAATACCAC 3070 het 3070 ref 49 30 17 9 ACGTACTGTGG 1 0 290776 CASAVA_Build 2 33321144 1I CCAGCTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 9 10 290777 CASAVA_Build 2 33336225 1D TGATTGGGGG C/- TGCCCTGTGT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 1 0 290778 CASAVA_Build 2 33340141 1D TGAACAACTG T/- TAAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 T 2 1 290779 CASAVA_Build 2 33349871 1I CACCTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 11 12 290780 CASAVA_Build 2 33352910 1I TTAATTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 17 4 T 11 12 290781 CASAVA_Build 2 33358083 1D TCTCCTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 13 12 290782 CASAVA_Build 2 33365323 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAATGAT 3070 het 1458 hom 14 3 11 0 A 7 6 290783 CASAVA_Build 2 33367426 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2564 het 621 hom 16 7 8 1 A 16 15 290784 CASAVA_Build 2 33394754 27I GTTCTTGATG ---------------------------/ACCTATTATAGCTTGCTAAATGGAGGA ATAATTTACC 3070 hom 81 het 25 0 28 2 ACCTATTATAGCTTGCTAAATGGAGGA 0 1 290785 CASAVA_Build 2 33396462 1D ATGAATTGTC T/- TTAAGTGTAG 3070 hom 132 het 47 0 45 4 T 3 2 290786 CASAVA_Build 2 33400706 1D TTCCTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 40 2 23 15 T 13 12 290787 CASAVA_Build 2 33404651 1I TGCTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 11 12 290788 CASAVA_Build 2 33409334 1D AGACAATATC T/- TTTTTTTTTT 1691 het 1691 ref 33 21 4 8 T 11 10 290789 CASAVA_Build 2 33409386 1D TCATGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2308 het 2308 ref 32 17 7 10 A 17 16 290790 CASAVA_Build 2 33411803 1D ATTTGTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 T 11 10 290791 CASAVA_Build 2 33419658 1I TTGTTTCTCC -/A AAATCTTACA 3070 hom 80 het 31 0 26 5 A 3 4 290792 CASAVA_Build 2 33478901 4I TACCTGTAAC ----/ACTT ACAAGAAGAG 3070 hom 54 het 20 0 15 5 ACTT 0 1 290793 CASAVA_Build 2 33479082 14D AAGCCGCCCA GTTTTTGGTACTTT/-------------- GTTATGGCAG 3070 het 3070 hom 23 9 16 1 GTTTTTGGTACTTT 1 0 290794 CASAVA_Build 2 33479572 1I GAGGCTGAGG -/C CAGGAGAATC 1876 het 789 hom 7 2 5 0 C 1 2 290795 CASAVA_Build 2 33479789 3I GAAGGTTATA ---/GAT GATAAGCTGC 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 GAT 1 2 290796 CASAVA_Build 2 33480654 1I ATTACTTATA -/T TTAAGCAGGA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 2 3 290797 CASAVA_Build 2 33482849 1I GGAACAAGGA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 6 7 290798 CASAVA_Build 2 33483158 1I GTTCTCAGGG -/A AAAAAAGCTC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 6 7 290799 CASAVA_Build 2 33484679 9I GAGTGCAGTG ---------/GCAGGATCT GCGGGATCTG 1687 hom 18 het 11 0 5 6 GCAGGATCT 0 1 290800 CASAVA_Build 2 33485162 1D62M2I ATCTTGTCAC TTTTTTTTTTTCAGTCAGTAATGTGAACTCTGAAATCCTTACTGTGTCAAAAACGTCAAATGC--/-TTTTTTTTTTCAGTCAGTAATGTGAACTCTGAAATCCTTACTGTGTCAAAAACGTCAAATGCTT TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 36 0 32 26 N/A 0 0 290801 CASAVA_Build 2 33514269 24D GTAAAGAGCA GCTAAAACAAACACTTACTGGGTG/------------------------ GCTAAAACAA 3070 het 3070 ref 36 20 14 5 GCTAAAACAAACACTTACTGGGTG 1 0 290802 CASAVA_Build 2 33525063 1D ATTTTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1024 hom 25 4 17 4 T 13 12 290803 CASAVA_Build 2 33534926 4D CGATTTATCA TTCT/---- TTCTTTCCTG 3070 hom 117 het 44 0 39 6 TTCT 2 1 290804 CASAVA_Build 2 33540956 1I TTTGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1911 het 540 hom 20 2 14 4 T 13 14 290805 CASAVA_Build 2 33543043 1I ATCAGTGATC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 49 het 19 0 18 1 T 7 8 290806 CASAVA_Build 2 33545640 2I ACATACTAAC --/TA TATATATATA 2430 het 2430 ref 22 11 5 6 TA 5 6 290807 CASAVA_Build 2 33547608 1I TCGTTTTTTC -/A ATCTTTGTCA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 1 2 290808 CASAVA_Build 2 33550469 2D CAATCAATGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 11 9 290809 CASAVA_Build 2 33555502 1I TTTCGGCAAC -/G GTGTCTTGTA 3070 hom 90 het 34 0 28 6 G 1 2 290810 CASAVA_Build 2 33555622 1I CAAAGTCAAG -/A TTCAGGTTAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 0 1 290811 CASAVA_Build 2 33564736 1D CTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 10 20 11 T 14 13 290812 CASAVA_Build 2 33567526 1D GTTTGACCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 14 13 T 12 11 290813 CASAVA_Build 2 33569744 1I AAAATTAGCT -/G GGTGTGGTGG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 2 3 290814 CASAVA_Build 2 33587971 1I AGACCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 9 22 7 A 12 13 290815 CASAVA_Build 2 33609424 1D GTATTGTTCC T/- TCCTTTCAGG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 2 1 290816 CASAVA_Build 2 33610569 4I GTTTTCTCTC ----/TTTA TTTATTTATG 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 TTTA 2 3 290817 CASAVA_Build 2 33617646 1I AAATATGTGG -/T TTTTTTTTTT 2559 het 2559 ref 30 13 7 10 T 10 11 290818 CASAVA_Build 2 33619433 1I TACTGGAATT -/A AAAAAAAAAA 2190 het 2190 ref 33 18 9 6 A 11 12 290819 CASAVA_Build 2 33627938 2D TATGCTCCTG CA/-- CACACACACA 771 het 771 ref 48 32 2 14 CA 8 7 290820 CASAVA_Build 2 33641481 4D AGAATTGACC CTAA/---- CTAACTAACT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 CTAA 3 2 290821 CASAVA_Build 2 33641565 2D TAGTCAGTAC TT/-- TTTTCTCATG 3070 het 3070 hom 44 19 23 3 T 6 4 290822 CASAVA_Build 2 33641775 5D TTTGTTTTTC TTGTT/----- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 46 21 19 8 TTGTT 5 4 290823 CASAVA_Build 2 33642252 1I TAATTTTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 10 11 290824 CASAVA_Build 2 33642907 4I ATGTGAAGTT ----/ATCA ATCAGTTGGA 3070 het 3070 ref 52 32 14 6 ATCA 1 2 290825 CASAVA_Build 2 33645132 1D GTTGCCTCTT A/- AAAAGAATTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 5 4 290826 CASAVA_Build 2 33646172 4I GCAGCAAATA ----/TCTT TCTTACACAC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TCTT 1 2 290827 CASAVA_Build 2 33646425 1D TCTTTATGAT G/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 19 8 5 G 1 0 290828 CASAVA_Build 2 33646911 1D TCTACCCGAT A/- AAAAATCTGT 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 A 6 5 290829 CASAVA_Build 2 33679995 1I AGAAAGAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 A 8 9 290830 CASAVA_Build 2 33680184 1D TAAGAAAGAA T/- TTTTCTAACA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 T 5 4 290831 CASAVA_Build 2 33680528 1D TGTCTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 13 12 290832 CASAVA_Build 2 33682189 1D GGAGGGGGGT C/- CATACCACAC 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 C 2 1 290833 CASAVA_Build 2 33693281 4I TCTGTCTGTC ----/TGTT TGTCTGTGTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TGTT 0 1 290834 CASAVA_Build 2 33693769 1I TATTTTTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 A 10 11 290835 CASAVA_Build 2 33698985 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 A 11 10 290836 CASAVA_Build 2 33703453 1I AGAGTAAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 9 10 290837 CASAVA_Build 2 33711841 1I ATTTAAAACA -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 5 6 290838 CASAVA_Build 2 33713415 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1146 het 1144 ref 22 5 7 10 T 14 13 290839 CASAVA_Build 2 33721305 15D TGTACTAAGT GAATATTTTCTAGTG/--------------- GAAAAACTTA 3070 het 3070 hom 34 14 17 6 GAATATTTTCTAGTG 1 0 290840 CASAVA_Build 2 33725409 1D CCCTGTGTCT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 A 9 8 290841 CASAVA_Build 2 33728225 1D ACTGATGCCA G/- GGTCCTACCC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 G 3 2 290842 CASAVA_Build 2 33734820 2D TTCTGGCTTT TC/-- TCTCTCTCTG 2948 het 2948 ref 30 20 7 5 TC 5 4 290843 CASAVA_Build 2 33735420 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 2962 het 2962 ref 21 13 7 1 A 10 9 290844 CASAVA_Build 2 33743056 4I TCTTTTTTGC ----/TAAA TAAATGACTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TAAA 1 2 290845 CASAVA_Build 2 33749616 1I CAATCAAACC -/A TTACCAGAGC 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 A 0 1 290846 CASAVA_Build 2 33753146 3I TTATGCAATT ---/AGG AGAAGATTTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 AGG 0 1 290847 CASAVA_Build 2 33761151 1D TTTGCGTTGC T/- TTTTTTTTTT 1929 het 1929 ref 33 20 5 8 T 15 14 290848 CASAVA_Build 2 33763057 1I AAATCTAATT -/G CTTTCTTAAT 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 G 0 1 290849 CASAVA_Build 2 33772380 3I CATTTTCCTG ---/TCT TCTTCTGAGC 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 TCT 2 3 290850 CASAVA_Build 2 33778144 1I TTCGAGCCAA -/G ATGGCGGACT 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 G 0 1 290851 CASAVA_Build 2 33791302 1D GGGTGGTGGC G/- GGGGGGTGGG 1387 hom 7 het 4 0 3 2 G 7 6 290852 CASAVA_Build 2 33797046 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATAG 3070 het 2598 hom 17 10 7 0 A 7 8 290853 CASAVA_Build 2 33805359 4D AAGAAACAAA AGAG/---- AGAGTGGAAA 3070 het 2149 hom 24 7 14 3 AG 4 2 290854 CASAVA_Build 2 33843961 1D GTAAGGAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 T 10 9 290855 CASAVA_Build 2 33845792 2D TCTTGAACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 13 9 A 12 10 290856 CASAVA_Build 2 33846043 49D AAGATGACTT GCTTGGTTATAATTTTTCATCTTTCCCTTGCGGTACTATATCTATTGCG/------------------------------------------------- CCATGTGAGG 3070 het 3070 ref 36 38 10 7 GCTTGGTTATAATTTTTCATCTTTCCCTTGCGGTACTATATCTATTGCG 1 0 290857 CASAVA_Build 2 33846264 5D TCAGTCTGCT CAGAA/----- CAGAAGGGTT 3070 het 3070 ref 47 26 16 9 CAGAA 2 1 290858 CASAVA_Build 2 33847995 1D ACCTGGATTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 14 21 2 A 9 8 290859 CASAVA_Build 2 33859736 1D AATGTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 T 10 9 290860 CASAVA_Build 2 33870773 4D ATGTGTCCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 1749 hom 17 5 8 5 AAAC 5 4 290861 CASAVA_Build 2 33873203 2D ACTCTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 2 A 13 11 290862 CASAVA_Build 2 33873377 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2667 het 75 hom 18 1 11 6 T 11 10 290863 CASAVA_Build 2 33876894 6I AGCTACTCAG ------/GAGGCT GAGGCTGAGG 3070 hom 30 het 12 0 9 3 GAGGCT 1 2 290864 CASAVA_Build 2 33876998 1D AAACTCCATC T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 2 1 290865 CASAVA_Build 2 33878043 2D CCATTATTAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 43 0 35 9 T 11 9 290866 CASAVA_Build 2 33878351 2I TTTATCCACA --/TG TGAGTGTATT 3070 hom 151 het 57 0 51 6 TG 1 2 290867 CASAVA_Build 2 33879020 1D GGTTAAAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 10 9 290868 CASAVA_Build 2 33880406 1D TTTATTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 7 290869 CASAVA_Build 2 33891379 2D GTACAGAAAA CC/-- CTATCAGATG 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 C 3 1 290870 CASAVA_Build 2 33894250 4D CCCATATTAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 TTTA 5 4 290871 CASAVA_Build 2 33895547 1I AAAAAAAAAA -/C AAACTTGGTA 3070 hom 88 het 34 0 29 5 C 0 1 290872 CASAVA_Build 2 33896790 4D TCTTTTGAAA TAAT/---- TCCAAATGCA 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 TAAT 1 0 290873 CASAVA_Build 2 33897214 4I CATTCACCTT ----/TGAC TGACAGGAGT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 TGAC 1 2 290874 CASAVA_Build 2 33898011 2D ATGTGTACGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 131 hom 36 4 14 18 AC 9 8 290875 CASAVA_Build 2 33902715 1D AAGGTTATAG A/- TGGTTTTAGT 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 A 1 0 290876 CASAVA_Build 2 33904137 11I TGGTTTATAT -----------/TTCTTTGGGTA TATATTATAT 3070 het 3070 ref 30 19 10 3 TTCTTTGGGTA 0 1 290877 CASAVA_Build 2 33906480 1I CAGTCTTCTT -/C CATAGGGCTA 3070 het 3070 ref 36 26 9 1 C 1 2 290878 CASAVA_Build 2 33907318 1D TGCTTTATCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 9 8 290879 CASAVA_Build 2 33908527 1I AATTTTTCTT -/C CCTTAGAATT 3070 het 3070 ref 46 22 23 1 C 2 3 290880 CASAVA_Build 2 33909308 1I GGGGATGGGC -/T TACTTGATAC 3070 het 3070 hom 32 14 15 5 T 1 2 290881 CASAVA_Build 2 33913134 1D AATGAAGATT A/- ATGTGGAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 2 1 290882 CASAVA_Build 2 33928066 1D TTGAAGGATA T/- TGGAGATGCA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 T 2 1 290883 CASAVA_Build 2 33932469 1I ATCTTTAAGT -/C TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 41 0 34 7 C 0 1 290884 CASAVA_Build 2 33939520 4D TGGCCTATAG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 TTTA 5 4 290885 CASAVA_Build 2 33942874 4I TTTCTGGTCT ----/TTAA TTAGTCTCTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTAA 0 1 290886 CASAVA_Build 2 33944165 1I AGGCCAAGGC -/G GGTGGAATCA 1232 het 1232 ref 17 11 3 4 G 2 3 290887 CASAVA_Build 2 33950213 1D GCCCACCATG C/- CCCCCCTATC 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 C 7 6 290888 CASAVA_Build 2 33952902 1D CTGGGCTCTC T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 T 7 6 290889 CASAVA_Build 2 33959610 2D GAAAGCAGAC AT/-- GTGCAGGTTC 3070 het 3070 ref 42 23 19 1 AT 1 0 290890 CASAVA_Build 2 33960806 1I ACAATATATA -/T TTTTTGAATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 5 6 290891 CASAVA_Build 2 33961898 1I CTTTGGACTT -/A ACAGTGGTTT 3070 hom 90 het 34 0 29 8 A 1 2 290892 CASAVA_Build 2 33966593 2D TAGACTCCAG CC/-- CCCAGGCTCA 3070 hom 129 het 47 0 42 5 C 5 3 290893 CASAVA_Build 2 33967530 1D ACAAACAAAA C/- AAAAACCAAA 3070 het 2565 hom 19 7 11 2 C 1 0 290894 CASAVA_Build 2 33971626 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2285 hom 23 8 9 6 A 13 14 290895 CASAVA_Build 2 33973053 1I ATTTTGTCTT -/A AGAGTTCTTT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 A 1 2 290896 CASAVA_Build 2 33974832 2D CTGATACAGG CA/-- CAACTTTTCC 3070 hom 126 het 44 0 43 1 CA 2 1 290897 CASAVA_Build 2 33979976 1I AAAATAACTA -/T TTTTTTTTTG 1970 het 1970 ref 17 9 6 2 T 9 10 290898 CASAVA_Build 2 33985886 3D TTAAATTAAA TGT/--- TGTTTCTATA 3070 het 3070 ref 40 23 15 6 TGT 2 1 290899 CASAVA_Build 2 34014615 1D GATCCTTTGA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 7 6 290900 CASAVA_Build 2 34015503 2D TTCTACCCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 13 11 290901 CASAVA_Build 2 34018088 13D3M13D TCTAGAAACT GGATGTGAGAGCAGAGTTCCTCATTTTGC/-------------GAG------------- TGACTTGGAG 3070 het 3070 ref 33 28 9 2 N/A 0 0 290902 CASAVA_Build 2 34019868 6D CAACAACAAC AACAAA/------ AACTCATTAG 2818 het 2818 ref 27 18 9 4 AACAAA 1 0 290903 CASAVA_Build 2 34022721 1I ACTAGGACAT -/C CCCCCATAAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 C 5 6 290904 CASAVA_Build 2 34022984 1I GTATAACCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 T 10 11 290905 CASAVA_Build 2 34024182 1D ACTAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2347 het 1582 hom 13 4 7 3 A 11 10 290906 CASAVA_Build 2 34027600 1D TAATGTTGGG T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 T 8 7 290907 CASAVA_Build 2 34028612 1I TCATGCTAAT -/C AAGTGACCTT 3070 het 3070 ref 59 27 23 9 C 0 1 290908 CASAVA_Build 2 34028815 1I ATTTTGCTTT -/A TTTTTTTTTT 2802 het 1740 hom 24 7 10 7 A 0 1 290909 CASAVA_Build 2 34042257 1D CATATATTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 A 10 9 290910 CASAVA_Build 2 34051753 2D CTGCAGTCCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 A 12 10 290911 CASAVA_Build 2 34061142 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 679 hom 19 4 13 2 A 17 12 290912 CASAVA_Build 2 34065689 1I TATGAGCCTG -/T TAAAATCAGA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 T 1 2 290913 CASAVA_Build 2 34066278 7D AAGCCACCAA GGCTTAT/------- GGCTTGTGCC 3070 het 3070 ref 51 24 18 12 GGCTTAT 1 0 290914 CASAVA_Build 2 34075110 1D TGTAATCTTA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 T 7 6 290915 CASAVA_Build 2 34075587 15D ATTTCTATTA TTAAAATTAATTTCT/--------------- ATTTAATTTT 417 het 417 ref 15 11 2 4 TTAAAATTAATTTCT 1 0 290916 CASAVA_Build 2 34078321 1I GATTTTTTTC -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 T 7 8 290917 CASAVA_Build 2 34078964 1I TTTTTTCCCA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 1658 hom 20 7 8 5 T 7 8 290918 CASAVA_Build 2 34080167 7I AGCTGTCAAA -------/CTGCCCT CTGCCCTTGC 3070 het 3070 ref 56 28 26 2 CTGCCCT 1 2 290919 CASAVA_Build 2 34088397 1I TCATTTTTTT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 7 8 290920 CASAVA_Build 2 34095868 1I TTGGGATGCA -/G GGGGAAACAC 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 G 4 5 290921 CASAVA_Build 2 34096436 8D TGGTACTGTT CCCACATG/-------- CCCACATGCC 3070 hom 63 het 27 0 18 10 CCCACATG 3 2 290922 CASAVA_Build 2 34097176 1D TAAATATGGG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 290923 CASAVA_Build 2 34108013 3D GCTTTTAAAT CAA/--- CAAGCAAATA 3070 het 3070 ref 47 30 15 3 CAA 2 1 290924 CASAVA_Build 2 34108410 1I TGCCTTATAT -/A AAAAATTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 5 6 290925 CASAVA_Build 2 34109721 1I TGATTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1369 hom 42 5 18 19 T 10 11 290926 CASAVA_Build 2 34109731 2I TTTTTTTTTT --/TC CCCAAATACA 3070 het 1413 hom 42 5 18 19 TC 0 1 290927 CASAVA_Build 2 34116081 1D TCCCTGTTTA T/- TTTTCTCTAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 5 4 290928 CASAVA_Build 2 34124653 1D TGGATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2693 hom 35 10 16 9 T 12 11 290929 CASAVA_Build 2 34130631 3I GTAAGAATTT ---/ATA AATATTCTTT 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 ATA 0 1 290930 CASAVA_Build 2 34142343 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 9 10 290931 CASAVA_Build 2 34147302 2D ACTCTTAGAA TT/-- TTACCTTTAG 3070 het 3070 ref 48 20 21 9 T 4 2 290932 CASAVA_Build 2 34149334 1D AATTACTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 11 19 16 T 15 14 290933 CASAVA_Build 2 34153468 2D CCGGTCATTA CT/-- CTCTTCAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 CT 3 2 290934 CASAVA_Build 2 34164666 1I AACTTTCAGT -/A TACCTAAATG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 0 1 290935 CASAVA_Build 2 34169240 4D TCTCAGAAAA AAAT/---- AAATAATAAT 3070 het 2346 hom 24 6 18 4 AAAT 2 1 290936 CASAVA_Build 2 34192529 9D ACTCGTCATT TACATTATA/--------- TACATTAGGT 803 het 803 ref 8 5 3 1 TACATTATA 1 0 290937 CASAVA_Build 2 34193957 3D CAATGACAAG AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 52 25 22 6 AAC 4 3 290938 CASAVA_Build 2 34196789 1D CTGGCTGGAT A/- ATCAAGCTCT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 A 2 1 290939 CASAVA_Build 2 34201268 1I TTAAAAGCGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 25 10 8 T 8 9 290940 CASAVA_Build 2 34205565 4D TTTTGGCATT AGAC/---- AGTCTTTTCG 3070 het 3070 hom 46 21 23 4 AGAC 1 0 290941 CASAVA_Build 2 34206078 4D AACATGTAGA ATAT/---- GATCCTTTGG 3070 het 3070 ref 54 29 23 3 AT 2 0 290942 CASAVA_Build 2 34207581 3D AGGGAGGCAG AGA/--- AACAACTTGT 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 AGA 1 0 290943 CASAVA_Build 2 34215878 2D GAAAACATTC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 11 9 290944 CASAVA_Build 2 34217738 1D TTAACTTAGG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 A 7 6 290945 CASAVA_Build 2 34217989 13I CCCAACCCCT -------------/ATAGCTGGAAAGC AAATTTCTAT 3070 het 3070 hom 37 19 17 2 ATAGCTGGAAAGC 0 1 290946 CASAVA_Build 2 34218267 1D ATAAAAGCTA T/- TCTTAATTCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 5 T 2 1 290947 CASAVA_Build 2 34233578 1D AATTTTTATC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 T 9 8 290948 CASAVA_Build 2 34235873 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2300 hom 37 9 16 12 T 15 14 290949 CASAVA_Build 2 34239750 5I CTGAGTTTTC -----/AAGGT AAGGTAAAAT 3070 het 3070 ref 53 21 20 12 AAGGT 1 2 290950 CASAVA_Build 2 34239934 1D CTTATTTTTC A/- AAAAAAAAAA 2649 het 2649 ref 31 17 8 6 A 13 12 290951 CASAVA_Build 2 34252612 1D ATCAGGAATG T/- AAAGTTAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 1 0 290952 CASAVA_Build 2 34267525 1D CAGATTGATC T/- TTTCTCCTCC 3070 het 3070 hom 46 16 24 7 T 4 3 290953 CASAVA_Build 2 34268209 1I4M3D17M1D TCTTTGTGTA -TTATGTAACATATACATATATATAG/CGTAT---ACACATATATGTATATA- TGTGTGTGTG 1111 het 1111 ref 27 17 4 13 N/A 0 0 290954 CASAVA_Build 2 34275992 15D TTCAATTCTG TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2224 hom 30 14 11 13 T 27 12 290955 CASAVA_Build 2 34280943 1I AAACCAGCAA -/T GTAAAGATAA 3070 het 3070 hom 46 15 24 7 T 0 1 290956 CASAVA_Build 2 34286229 1D AAATGCAAAG A/- AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 40 18 18 5 A 7 6 290957 CASAVA_Build 2 34292937 1I TATTCCCTAC -/A AAAAAAAAAA 2574 het 2574 ref 29 13 8 8 A 11 12 290958 CASAVA_Build 2 34295108 1D TGTGGTCCAA T/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 1 0 290959 CASAVA_Build 2 34295179 1I TTTTATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1521 hom 24 5 15 4 T 13 14 290960 CASAVA_Build 2 34299643 1I ACTCTACCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 287 hom 26 1 23 2 T 9 10 290961 CASAVA_Build 2 34309265 2D GACTGAAAAC TG/-- AGAGAGAGAC 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 TG 1 0 290962 CASAVA_Build 2 34309625 4D ATGTGTGTCA GTGT/---- GTTTGTCAGT 3070 het 3070 ref 32 17 12 5 GT 3 1 290963 CASAVA_Build 2 34310616 3I TGCAGCTTGA ---/TAG TAGTCTATGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TAG 1 2 290964 CASAVA_Build 2 34331234 5D CAGGCAGTGG TTGTT/----- TTGTTTTGTT 3070 hom 63 het 26 0 22 6 TTGTT 5 4 290965 CASAVA_Build 2 34336130 1I CCTTGTTCTT -/A AGACTTCCCA 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 A 1 2 290966 CASAVA_Build 2 34337286 14I ATCCAGTAAC --------------/CTTGAAGACATTTT CTGATTTCAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CTTGAAGACATTTT 0 1 290967 CASAVA_Build 2 34383277 1D TAACTTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 A 10 9 290968 CASAVA_Build 2 34384505 17I GGCTAGTTTT -----------------/TGCAGTGAGACTTTTGC AATTTGTTGC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 TGCAGTGAGACTTTTGC 0 1 290969 CASAVA_Build 2 34384926 1D GGATCTAGAG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 A 8 7 290970 CASAVA_Build 2 34385891 1D GGAAGCTATG T/- TATAGAAGCC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 2 1 290971 CASAVA_Build 2 34390830 14D GTGCATTGTG TGTGTGTGTATATA/-------------- TGTGTGTGTA 3070 hom 118 het 55 0 39 23 TGTGTGTGTATATA 2 1 290972 CASAVA_Build 2 34396701 2I GAATTGACTT --/CC CCTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 51 27 22 2 C 2 4 290973 CASAVA_Build 2 34397047 5D ACAGATAAAT TACTC/----- TATCTTGTGA 3070 het 3070 hom 32 11 18 5 TACTC 1 0 290974 CASAVA_Build 2 34398980 1D TATGTGAGGG T/- TAAAAAGGCT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 2 1 290975 CASAVA_Build 2 34403964 4I TATCTGTTTC ----/TCTG TATTTCTGCT 3070 hom 132 het 50 0 43 7 TCTG 0 1 290976 CASAVA_Build 2 34408213 1D TGTTCTTTAA T/- TTAAGGACTC 3070 het 3070 ref 47 29 16 3 T 3 2 290977 CASAVA_Build 2 34411479 1D GGAAGCATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 33 1 26 6 T 12 11 290978 CASAVA_Build 2 34412980 1D CAATTGCCAA T/- GGTTATCACA 3070 het 3070 ref 48 25 15 8 T 1 0 290979 CASAVA_Build 2 34415289 1D TATTTCTCAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 9 8 290980 CASAVA_Build 2 34417930 1I ATGATAAAAT -/A AAACTGTTCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 3 4 290981 CASAVA_Build 2 34422246 1D ATTACTGATA T/- TTTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 42 25 12 5 T 5 4 290982 CASAVA_Build 2 34423942 1D GTTTCTCATG T/- GGTTCTCCTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 1 0 290983 CASAVA_Build 2 34426371 3I AATTTCGCTC ---/TTG TTGTCCAGGT 3070 het 1497 hom 22 5 12 9 TTG 1 2 290984 CASAVA_Build 2 34427000 1I ACTGTACTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 T 8 9 290985 CASAVA_Build 2 34428659 1D ATTTTTCCTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 8 290986 CASAVA_Build 2 34429012 1D ACTCCAGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 108 hom 20 2 13 6 A 17 16 290987 CASAVA_Build 2 34430819 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTTTTTT 2892 het 393 hom 22 7 9 6 A 2 3 290988 CASAVA_Build 2 34430992 3D GTATTTTTAG TAA/--- AGACGGGTTT 1253 het 1253 ref 9 4 4 1 TAA 1 0 290989 CASAVA_Build 2 34434986 1I TGAAGAGATC -/T ATTTTTGGGA 3070 hom 94 het 38 0 31 7 T 0 1 290990 CASAVA_Build 2 34437814 16D TCCTGAGGAA ATTTCCACTTTTACGT/---------------- ATCTTACTAT 3070 het 3070 ref 33 18 16 4 ATTTCCACTTTTACGT 1 0 290991 CASAVA_Build 2 34441870 1I TCTTGTCTTT -/G GGGATAATGG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 G 3 4 290992 CASAVA_Build 2 34445224 1I AACTCTATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 9 10 290993 CASAVA_Build 2 34450139 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 24 1 18 5 A 13 14 290994 CASAVA_Build 2 34452071 3I ATTATTCTTT ---/ATC ATCATCATCA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 ATC 4 5 290995 CASAVA_Build 2 34460516 1I TAATCATTTC -/T TTTTCTTTAC 3070 het 3070 ref 51 25 20 6 T 4 5 290996 CASAVA_Build 2 34460981 2I TCATGAAGAA --/AT ATCCTTCAAA 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 AT 1 2 290997 CASAVA_Build 2 34461840 1D TAAACTCAAC T/- TTTTCTTATC 3070 het 3070 ref 46 25 17 5 T 5 4 290998 CASAVA_Build 2 34468961 1I ATCCGGGCAT -/G GTGGTGCATG 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 G 1 2 290999 CASAVA_Build 2 34475896 1I AGAAGGAAAC -/A AAAAAAAAAA 2884 het 2884 ref 24 11 9 4 A 10 11 291000 CASAVA_Build 2 34489181 1D CACAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2073 hom 27 7 12 9 A 14 13 291001 CASAVA_Build 2 34491902 1I CCCTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2155 hom 23 7 13 3 A 12 13 291002 CASAVA_Build 2 34499220 1I TATTTTTAAA -/T TTTCTTAAAT 1852 het 1852 ref 18 11 5 2 T 3 4 291003 CASAVA_Build 2 34499691 1D CTGTCCTGCC T/- GTCTCTTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 19 5 T 1 0 291004 CASAVA_Build 2 34501510 4I AGAAAAATAA ----/TACT TACAGTACCC 3070 hom 99 het 35 0 33 2 TACT 0 1 291005 CASAVA_Build 2 34512086 1D TTTGTGGAAA G/- GTTGGGGAAT 3070 het 3070 ref 61 29 24 8 G 2 1 291006 CASAVA_Build 2 34514056 3I ACATTTAGAC ---/ATT ATGTGTTTGT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 ATT 0 1 291007 CASAVA_Build 2 34528793 1I TTTGTCAAAT -/G GGTGGTTTGC 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 G 2 3 291008 CASAVA_Build 2 34591178 1I ACCTTTTTTC -/T ATTAGAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 0 1 291009 CASAVA_Build 2 34609803 1D GAGTGAAATC A/- AAAGTTGTCC 3070 het 3070 ref 51 29 15 7 A 4 3 291010 CASAVA_Build 2 34616709 1I TTTGGGTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 11 12 291011 CASAVA_Build 2 34630347 1I TGCTGTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 33 1 25 7 A 13 14 291012 CASAVA_Build 2 34632554 1I ATCCTTTTTT -/A ATGGCTGCAT 1432 hom 7 het 3 0 3 0 A 1 2 291013 CASAVA_Build 2 34646872 1D CCTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 55 3 39 13 T 11 10 291014 CASAVA_Build 2 34661644 2D15M4D CAATGAACTC AAAAAAAAATCAGCAAGAAAT/--AAAAAAATCAGCAAG---- AAATAAATAA 3070 hom 90 het 26 0 31 3 N/A 0 0 291015 CASAVA_Build 2 34669375 3D ATTATCATCT TAA/--- TAAGTCCATG 3070 het 3070 ref 36 26 10 0 TAA 2 1 291016 CASAVA_Build 2 34670003 1D CTTCCCAATT G/- GGATGCTTCT 3070 hom 69 het 31 0 23 8 G 3 2 291017 CASAVA_Build 2 34670633 3D ATCATGCAAT AGA/--- AGAATTCATA 3070 hom 129 het 47 0 43 5 AGA 2 1 291018 CASAVA_Build 2 34673775 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 6 A 12 11 291019 CASAVA_Build 2 34675053 1I TGATTTTATT -/C TAAGCCTGAC 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 C 0 1 291020 CASAVA_Build 2 34679918 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 18 1 12 6 A 15 14 291021 CASAVA_Build 2 34680208 9I TGATAATAGA ---------/ACTCATGTT ACTCATGTTC 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 ACTCATGTT 1 2 291022 CASAVA_Build 2 34683970 2I TAAAAAGAAT --/AG AGTCTTTATC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AG 1 2 291023 CASAVA_Build 2 34684420 1D GACAGAAGGG T/- TGAGGGTATA 3070 hom 126 het 47 0 43 5 T 2 1 291024 CASAVA_Build 2 34687444 3D GTCTGGTCCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 5 T 15 12 291025 CASAVA_Build 2 34689069 1I GCAGCTGGAA -/C CTACAGCACC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 1 2 291026 CASAVA_Build 2 34690523 1D CAACAACAGC A/- AAAAAAGCCC 3070 hom 75 het 30 0 26 6 A 7 6 291027 CASAVA_Build 2 34691548 4D TATTCAGTAA TAAC/---- TAACTTGTGG 3070 hom 87 het 33 0 30 6 TAAC 2 1 291028 CASAVA_Build 2 34692369 4I TCCAAAAAAA ----/AAAC AATCAATCTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AAAC 0 1 291029 CASAVA_Build 2 34696244 4I TGTTGGACAG ----/AATT AATTAGACGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AATT 1 2 291030 CASAVA_Build 2 34720593 1D CCTATGTGTC A/- AGGAGCATGG 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 2 1 291031 CASAVA_Build 2 34721698 1I GTAAATGAAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 A 8 9 291032 CASAVA_Build 2 34722088 1I TTTCTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 A 10 11 291033 CASAVA_Build 2 34739051 2D GATTAAAAAT TC/-- TGAGTCCAAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 3 TC 1 0 291034 CASAVA_Build 2 34744454 4D TAAAATGTAT ATTA/---- ATTATATACA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ATTA 2 1 291035 CASAVA_Build 2 34748966 2D TGCCGCTCCT AG/-- AGAGACTCCT 3070 hom 66 het 26 0 20 7 AG 3 2 291036 CASAVA_Build 2 34750047 1D AGAACAGCAT G/- GGAAATACCT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 3 2 291037 CASAVA_Build 2 34755269 4I GTACAAAAAC ----/ATAG ATAGAATGAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 ATAG 1 2 291038 CASAVA_Build 2 34764301 4D GCTCTCTCTC TCTT/---- TCTGTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 18 16 2 TCTT 1 0 291039 CASAVA_Build 2 34766943 5I TTATTCAATT -----/GAGTC ATTTTTGTTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 GAGTC 0 1 291040 CASAVA_Build 2 34767385 1D ATTGCTGGGG A/- AACAATACGT 3070 hom 108 het 42 0 37 7 A 3 2 291041 CASAVA_Build 2 34768007 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 156 het 61 0 52 10 AC 8 7 291042 CASAVA_Build 2 34770733 1D AGAATGGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 T 10 9 291043 CASAVA_Build 2 34777260 3I AATAATCCCT ---/GAG GAGGAGTAGT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 GAG 2 3 291044 CASAVA_Build 2 34781707 1D ATAATCTATA T/- TTTAAATGTA 3070 hom 78 het 28 0 26 4 T 4 3 291045 CASAVA_Build 2 34784137 22D CTTCCTCCTT TTTCTCCTCCTTCTCTTCCTCC/---------------------- TTTCTCCTCC 3070 hom 69 het 30 0 21 13 TTTCTCCTCCTTCTCTTCCTCC 1 0 291046 CASAVA_Build 2 34787308 3I TGTTCTACAC ---/TAG TAAATTCTTG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 TAG 0 1 291047 CASAVA_Build 2 34793341 1I TATATATATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 438 hom 26 1 22 3 T 9 10 291048 CASAVA_Build 2 34798845 1I AGGAGGGTCT -/C CCTTTCCCAC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 2 3 291049 CASAVA_Build 2 34801417 4D AGAAAAAGAG AGAA/---- AGAGAGAGAA 827 het 827 ref 22 8 3 15 AGAA 1 0 291050 CASAVA_Build 2 34806203 1I AGTTGATGTT -/A ATATGAAGTA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 A 1 2 291051 CASAVA_Build 2 34808360 1D ATATTTGTAT C/- CCCCCCCTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 C 8 7 291052 CASAVA_Build 2 34810774 2I CTTGTAATTC --/AA ACAGTCATTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 1 3 291053 CASAVA_Build 2 34811928 1D TTTTTCTTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 1863 hom 16 5 9 2 T 9 8 291054 CASAVA_Build 2 34813023 2D AAGAAGAGTC AT/-- ATAGCTTAGT 3070 het 472 hom 37 3 16 18 AT 2 1 291055 CASAVA_Build 2 34814189 1D AAAGATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 11 10 291056 CASAVA_Build 2 34819232 4I AGGGTGATAC ----/CAAA CAGTCAGTGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CAAA 0 1 291057 CASAVA_Build 2 34822745 1D AACACCAGGT A/- TTATAACTTA 3070 het 3070 ref 50 24 24 4 A 1 0 291058 CASAVA_Build 2 34825702 1D AGCCAAAACC A/- AACAAAGCTC 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 A 3 2 291059 CASAVA_Build 2 34826900 4I ATATGAACAC ----/AAAG AAGGGAACAA 3070 het 3070 ref 58 29 20 9 AAAG 0 1 291060 CASAVA_Build 2 34829170 4I TAAATAAATA ----/AATT CCTATTTTAT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 AATT 0 1 291061 CASAVA_Build 2 34835378 1I CAGAATTGTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 7 8 291062 CASAVA_Build 2 34838128 2I TCAATAATAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1646 hom 22 6 11 5 T 12 14 291063 CASAVA_Build 2 34844876 3I GAAAATTTTT ---/ATA ATGAGAATTT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 ATA 0 1 291064 CASAVA_Build 2 34846247 2D CATCTTTTAA AT/-- ATATATATAT 2449 het 1377 hom 18 3 9 6 AT 10 9 291065 CASAVA_Build 2 34847311 2I ACATACACAC --/AT ATGTGCATGC 3070 het 3070 ref 22 12 7 3 AT 1 2 291066 CASAVA_Build 2 34848576 1I GTGGGGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 12 13 A 13 14 291067 CASAVA_Build 2 34850514 1D ATGGCATGAA C/- CCCCCGGGGG 1636 het 1636 ref 16 7 4 6 C 6 5 291068 CASAVA_Build 2 34854116 1I CTTTTTCACC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 T 8 9 291069 CASAVA_Build 2 34857375 2D ATTATAATTG TT/-- ATTTAATAAC 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 T 2 0 291070 CASAVA_Build 2 34859155 1D ATGAAAGGCA C/- CTTCTTACAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 C 2 1 291071 CASAVA_Build 2 34874863 4I ATACACACAT ----/TTTA TATATATATA 3070 het 3070 ref 33 14 16 3 TTTA 0 1 291072 CASAVA_Build 2 34875488 4I AGGACATGAT ----/TGAA TGATTAGCCA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 TGAA 0 1 291073 CASAVA_Build 2 34878842 1I GAAGGCATAA -/G GATGTGAATG 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 G 1 2 291074 CASAVA_Build 2 34878957 1D TTTATTTTTT A/- ATATCCTCCA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 2 1 291075 CASAVA_Build 2 34885811 1D CTTATTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 11 10 291076 CASAVA_Build 2 34890662 13D CACATGCACA CACATACAGATTC/------------- CACATAGACA 3070 het 3070 ref 38 22 15 6 CACATACAGATTC 1 0 291077 CASAVA_Build 2 34897387 1I GTCTATTACA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 T 8 9 291078 CASAVA_Build 2 34912328 3I GGAGAAGAAG ---/AAC AACAACAAGA 3070 het 2918 hom 27 10 11 6 AAC 2 3 291079 CASAVA_Build 2 34922993 1I ACCTGGGTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 T 9 10 291080 CASAVA_Build 2 34937457 4D ATACCAAAAC CAGA/---- CAAAGACCCA 3070 het 3070 ref 33 19 11 5 CAGA 1 0 291081 CASAVA_Build 2 34938474 4D TATCCTAAGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2713 het 1839 hom 23 12 7 7 A 15 11 291082 CASAVA_Build 2 34942351 1D TAATGCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 14 12 T 15 14 291083 CASAVA_Build 2 34945977 2D GATAATAAAC AG/-- TGTGCTCTGG 3070 het 3070 ref 40 17 15 9 AG 1 0 291084 CASAVA_Build 2 34956561 1I AAAACCAGAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 8 9 291085 CASAVA_Build 2 34961520 10D TCAGTGCCAG ACATATTAAA/---------- ATATATTAGC 3070 hom 120 het 42 0 41 2 ACATATTAAA 1 0 291086 CASAVA_Build 2 34967484 6I TATCCAGTGC ------/TCTTAA ATCCTTTGTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TCTTAA 0 1 291087 CASAVA_Build 2 34982174 1D ATTTTTCATG A/- AATGCAATTA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 A 3 2 291088 CASAVA_Build 2 34982795 3I AAAATATGTA ---/TTG TTTTACTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTG 0 1 291089 CASAVA_Build 2 34983496 1D ACAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAC 3042 het 517 hom 11 2 7 2 A 10 9 291090 CASAVA_Build 2 34990148 1I TATATATTGA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 8 291091 CASAVA_Build 2 34992351 5D GACACAAACC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 16 11 291092 CASAVA_Build 2 35001205 4D TAAAAAACTT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 TA 7 5 291093 CASAVA_Build 2 35047161 5I GTTTTATTTA -----/TAGAG TAGAGGTAGA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 TAGAG 1 2 291094 CASAVA_Build 2 35050875 1I TATTCTTATG -/A AAAAAATAAC 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 6 7 291095 CASAVA_Build 2 35052305 4D AGTTATAGTT AAAC/---- AGGAAGAAAA 3070 hom 123 het 43 0 41 3 AAAC 1 0 291096 CASAVA_Build 2 35073039 1I TCTGGTTAAC -/T TTACTTTAAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 3 291097 CASAVA_Build 2 35073635 1D TTGGTTCCTT A/- AGACAGTCTG 3070 hom 123 het 46 0 42 5 A 2 1 291098 CASAVA_Build 2 35075403 5I ATTTTTGTAA -----/ATTTT ATTTTATTTT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 ATTTT 2 3 291099 CASAVA_Build 2 35079272 8I GACAACCATC --------/AGAGAGAG AGTACAATCT 3070 hom 151 het 51 0 51 1 AG 1 5 291100 CASAVA_Build 2 35116277 1I AAAGAAGTTT -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 A 6 7 291101 CASAVA_Build 2 35124892 1I TGGCCAGCAT -/G GCGGTGCCCA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 G 1 2 291102 CASAVA_Build 2 35131687 1I CTTCTTCCAA -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 T 6 7 291103 CASAVA_Build 2 35136945 1I TCTTTTCCTA -/C TTTTATCTGC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 C 0 1 291104 CASAVA_Build 2 35137945 1D CTCAAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 768 hom 32 3 20 9 A 16 15 291105 CASAVA_Build 2 35147411 1D CTTCTCAAAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 A 9 8 291106 CASAVA_Build 2 35156314 4I AGACAATGGA ----/TTTG TTTGTTTTGA 3070 het 3070 hom 60 17 37 6 TTTG 1 2 291107 CASAVA_Build 2 35169996 2I TGGCTCCAAC --/TT TGTTTTTTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 1 3 291108 CASAVA_Build 2 35182362 1I GACAGAGAAC -/A ACTGTGAGCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 291109 CASAVA_Build 2 35196824 2D TGAATAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 34 0 18 18 A 16 14 291110 CASAVA_Build 2 35197545 1I AATATCACCC -/A AATAAATAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 2 3 291111 CASAVA_Build 2 35199081 1I AAACCTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 10 11 291112 CASAVA_Build 2 35208064 1D AAAAAAACAA C/- CCCATCAAAA 3070 het 3070 ref 18 9 7 3 C 4 3 291113 CASAVA_Build 2 35209111 1D TTTATTTTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 A 10 9 291114 CASAVA_Build 2 35215162 1I AGTATCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 11 15 9 T 10 11 291115 CASAVA_Build 2 35216058 1D CAGGTTATTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 29 17 5 G 1 0 291116 CASAVA_Build 2 35221382 3D TGCCAGGTAC TGT/--- ATTTGTGATG 3070 het 3070 ref 37 22 13 3 TGT 1 0 291117 CASAVA_Build 2 35231787 1D TAGAACTGAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 8 7 291118 CASAVA_Build 2 35236041 1I CTCTTCCAAC -/T TTCTGTACCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 2 3 291119 CASAVA_Build 2 35238214 9I TTTCAATTAA ---------/TTGCTTTTT CTTTGAGAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTGCTTTTT 0 1 291120 CASAVA_Build 2 35253471 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2248 hom 37 11 18 8 A 10 11 291121 CASAVA_Build 2 35254441 1D AATAATAAAC T/- TTTTTTTATC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 8 7 291122 CASAVA_Build 2 35257385 1I CAGAAATGAG -/T TTCCCCATTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 2 3 291123 CASAVA_Build 2 35260500 1I CCATATTTTC -/T TTTTTTTTTA 2992 het 1777 hom 20 6 8 6 T 9 10 291124 CASAVA_Build 2 35267759 5I TTTTTTTGAC -----/TTTTA TTTTAAGTTC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TTTTA 1 2 291125 CASAVA_Build 2 35275332 2D TATATGATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 306 hom 27 1 23 4 AT 7 6 291126 CASAVA_Build 2 35278586 1I GTGTTGACAA -/T TTTTTTTTTT 2366 het 2366 ref 34 11 8 15 T 14 15 291127 CASAVA_Build 2 35278649 1D AAAAGGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 12 11 291128 CASAVA_Build 2 35283097 1D TGACATTCCG T/- TTTTTTTTTT 1519 het 1519 ref 38 29 6 3 T 13 12 291129 CASAVA_Build 2 35286640 1I AAGGAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 40 1 34 5 T 10 11 291130 CASAVA_Build 2 35286930 1D TCTATAAAAT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 8 7 291131 CASAVA_Build 2 35295758 1I AAGTCTAAAA -/T TTTTCAATTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 4 5 291132 CASAVA_Build 2 35296147 1I TTTTTCTTAT -/A TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 0 1 291133 CASAVA_Build 2 35297845 1D CCTGTGAAGA T/- TATTAGTTTT 3070 het 3070 hom 59 29 27 4 T 2 1 291134 CASAVA_Build 2 35308287 3D CAATTTCATT ATC/--- ATCTATTAAA 2982 het 2982 ref 26 14 9 3 ATC 2 1 291135 CASAVA_Build 2 35308558 2D CTGCAGATAC AT/-- ATCTCTTTAC 3070 het 3070 ref 46 26 15 7 AT 2 1 291136 CASAVA_Build 2 35310146 4I ATGAATGAAA ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 44 hom 38 1 26 13 AC 5 7 291137 CASAVA_Build 2 35311465 11I AGGGATCAAG -----------/ATGACTGGCTT ACTCCTAATA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 ATGACTGGCTT 0 1 291138 CASAVA_Build 2 35315220 3I CTCCTGAATG ---/ACT ACTGGGTACA 3040 het 372 hom 9 2 7 0 ACT 1 2 291139 CASAVA_Build 2 35317600 1D GGAACTTTGC A/- AAAAAATTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 7 6 291140 CASAVA_Build 2 35317690 1D ACACAATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 107 het 41 0 36 6 A 12 11 291141 CASAVA_Build 2 35318447 14D GAGGTAAAAT AACTCCACAAGGAG/-------------- AACTACAAAA 3070 hom 101 het 37 0 34 7 AACTCCACAAGGAG 1 0 291142 CASAVA_Build 2 35320093 1D TCCATGACAC A/- AGTTTACCTA 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 A 2 1 291143 CASAVA_Build 2 35320726 6I ACTGATAGGT ------/TAAAAG TAAAAGGATG 3070 hom 96 het 35 0 31 4 TAAAAG 1 2 291144 CASAVA_Build 2 35321736 2I ACAGGACAAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 11 291145 CASAVA_Build 2 35325956 1D TTCAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 2230 het 176 hom 18 1 7 10 T 15 14 291146 CASAVA_Build 2 35329285 1I GAGTCTCAAG -/A AATTGTTTTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 2 3 291147 CASAVA_Build 2 35329629 6D TATGCATAGA TAAAGT/------ TAGGAAATTA 3070 hom 93 het 36 0 32 7 TAAAGT 1 0 291148 CASAVA_Build 2 35333017 2I ATGGGGAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 31 0 27 4 A 11 13 291149 CASAVA_Build 2 35337287 3I ACTTTGTCTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 TTG 3 4 291150 CASAVA_Build 2 35342043 1D AAAGACATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 10 9 291151 CASAVA_Build 2 35346761 1D CACATACCTC T/- TTGCATTTCT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 3 2 291152 CASAVA_Build 2 35354099 1D TTTTACTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 207 hom 32 1 26 5 T 11 10 291153 CASAVA_Build 2 35357501 1I ATGGTATTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 T 13 14 291154 CASAVA_Build 2 35372292 1D GCCATCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 9 10 A 12 11 291155 CASAVA_Build 2 35375244 1D AGTATAATAA T/- AAAAAAAAGA 3070 het 1358 hom 12 3 8 1 T 1 0 291156 CASAVA_Build 2 35377764 1I GTCTACAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 A 9 10 291157 CASAVA_Build 2 35382421 1I22M4I AACATTGCAG -AAAAAAGACAAGACATAAATAG----/AAAAAAAGACAAGACATAAATAGCAAA CAAACAAAAT 3070 het 3070 hom 28 15 20 3 N/A 0 0 291158 CASAVA_Build 2 35383297 1D GAGAGTTTTA C/- CTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 26 8 16 3 C 2 1 291159 CASAVA_Build 2 35405372 1I GCCAATGGTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 47 18 19 10 T 8 9 291160 CASAVA_Build 2 35407135 1D ATATAAAACA T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 7 6 291161 CASAVA_Build 2 35408784 3I TAAAAAAAAA ---/AAG AAGTCTTAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 AAG 1 2 291162 CASAVA_Build 2 35419370 1D ATGTAATTAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 8 7 291163 CASAVA_Build 2 35421244 4I CACCTCTCTC ----/TCTT TCCTGCAGGT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 TCTT 0 1 291164 CASAVA_Build 2 35421493 1I GTATGCCTCC -/A TCATGACAGC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 A 0 1 291165 CASAVA_Build 2 35426276 1I ATTTAGCCAT -/A ATAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 A 1 2 291166 CASAVA_Build 2 35429839 10D CTGATCAGTT CAATTTAGAC/---------- ACTTTACCTT 3070 het 3070 ref 35 21 16 2 CAATTTAGAC 1 0 291167 CASAVA_Build 2 35434358 1I AATGAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 10 18 11 T 10 11 291168 CASAVA_Build 2 35436957 4I AAGGTTAAAC ----/AATT AAATAAAAAG 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 AATT 0 1 291169 CASAVA_Build 2 35490401 1D TTCTTTGATA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 8 7 291170 CASAVA_Build 2 35491605 4D AACATGGTGA AGCC/---- CCGTCTCTAC 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 AGCC 1 0 291171 CASAVA_Build 2 35496420 2D AGGGAAGGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 108 hom 40 5 27 9 AG 10 9 291172 CASAVA_Build 2 35496936 1I CTACAGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 10 11 291173 CASAVA_Build 2 35501000 1I AAAGTGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 36 1 28 7 A 10 11 291174 CASAVA_Build 2 35503322 1I ATAAAAAAAA -/C AAAAGGAGAT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 C 0 1 291175 CASAVA_Build 2 35505351 1D GAAGAGAAAA G/- TTTCTGTGGA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 G 1 0 291176 CASAVA_Build 2 35507681 1D AATCTCAGCA C/- TTTGGGAGGC 3070 het 1248 hom 15 4 9 3 C 1 0 291177 CASAVA_Build 2 35509836 4I ACTCTGTTCT ----/CTAA CTTTTTAGTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CTAA 0 1 291178 CASAVA_Build 2 35514293 2D TTAATGAAAA AT/-- ATATTTTTGG 3070 het 3070 hom 33 14 17 3 AT 3 2 291179 CASAVA_Build 2 35516521 3D GGGGCCTAAT AAA/--- AAGAGCATCT 3070 het 1292 hom 10 3 7 1 A 5 2 291180 CASAVA_Build 2 35521341 3I GGAAAATAAT ---/GAG GAATCTGTAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 GAG 0 1 291181 CASAVA_Build 2 35522069 1I TTTTCCAGAA -/G ATTCATGCAC 3070 hom 181 het 65 0 61 4 G 0 1 291182 CASAVA_Build 2 35529506 5D AGACCTTGAG ATTTT/----- ATTTTATTTT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 ATTTT 3 2 291183 CASAVA_Build 2 35530459 1D TATAGGTGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 9 8 291184 CASAVA_Build 2 35530660 1I AACATATTTC -/T ATATAAGTGG 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 T 0 1 291185 CASAVA_Build 2 35538537 1D AATTGTTAAT A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 2 1 291186 CASAVA_Build 2 35540240 1I AACTACATAC -/T TTTCCCCAGA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 T 3 4 291187 CASAVA_Build 2 35541255 1D AAGCTCTCTG A/- AAAAGGGCAC 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 5 4 291188 CASAVA_Build 2 35542975 2I TCACTAACAG --/AA AACTGTGTTT 3070 het 3070 hom 55 19 26 10 A 2 4 291189 CASAVA_Build 2 35549240 1D CCTCACATAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 10 21 8 T 10 9 291190 CASAVA_Build 2 35555028 5I CTATAAAATT -----/ATCTC ATCCGTAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 ATCTC 0 1 291191 CASAVA_Build 2 35555651 4I TCTGTACAAG ----/TCAT TCAAACATTT 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 TCAT 0 1 291192 CASAVA_Build 2 35556127 4D AAACATCATC ATTG/---- ATATTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 ATTG 1 0 291193 CASAVA_Build 2 35556942 1I CCCTCTGGGA -/T TGAAGGTTCC 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 T 1 2 291194 CASAVA_Build 2 35557948 1D TAACTACAAA G/- GGAAGCCCAT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 G 3 2 291195 CASAVA_Build 2 35559394 1D AAGACCCTCC A/- AAAAAACCAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 7 6 291196 CASAVA_Build 2 35565257 1I GTTGAATCTA -/G TGTTTCTTAC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 G 0 1 291197 CASAVA_Build 2 35567936 2D TAAATATTTA AC/-- AGAGAATTAA 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 AC 1 0 291198 CASAVA_Build 2 35572203 1D CTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 2107 het 1258 hom 11 4 6 1 A 11 10 291199 CASAVA_Build 2 35572771 4D TAAAAATAAA ACTC/---- AAGGTAATTG 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 ACTC 1 0 291200 CASAVA_Build 2 35579943 2I75M1I CGTCAAGCAA --CTGCTCAATTCCTACCTGCTTTGGCATTTACAGTCCTGATTTTGCACATATTTAACTGTTTTATACTTCTCATTC-/CTCTGCTCAATTCCTACCTGCTTTGGCATTTACAGTCCTGATTTTGCACATATTTAACTGTTTTATACTTCTCATTCT TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 44 33 36 7 N/A 0 0 291201 CASAVA_Build 2 35580173 2D TATTCTCTAT TG/-- TGTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 TG 2 1 291202 CASAVA_Build 2 35581751 1D CCTTCCAAGG A/- GCGAAACTAG 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 A 1 0 291203 CASAVA_Build 2 35582641 1D ATTACAAAAT G/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 40 17 16 8 G 1 0 291204 CASAVA_Build 2 35583496 2D CATTTATAAA AT/-- ATAGTTTCAT 3070 het 3070 hom 36 12 23 2 AT 2 1 291205 CASAVA_Build 2 35583718 4I TGTTGTCTGG ----/GAAA TATTGTGGGA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 GAAA 0 1 291206 CASAVA_Build 2 35584131 1D TATAATAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 18 3 10 5 A 12 11 291207 CASAVA_Build 2 35585965 3D TGGAAAGCTG TCT/--- TCTTCACTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TCT 2 1 291208 CASAVA_Build 2 35592692 1I GTGTAAAATA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2693 hom 26 7 17 2 T 8 9 291209 CASAVA_Build 2 35595272 4I TTTTAAAGCA ----/TAAT TAAATTATTA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TAAT 0 1 291210 CASAVA_Build 2 35596203 1D GCAGAAGGGG C/- CATTGTCTGA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 C 2 1 291211 CASAVA_Build 2 35596598 1I AAAAAAGGTG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 40 11 22 7 T 7 8 291212 CASAVA_Build 2 35603446 1D TTTATATATA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 7 6 291213 CASAVA_Build 2 35610658 3D CCAGTCTATC GTT/--- GTCAGACATT 1557 het 1557 ref 15 10 4 1 GTT 1 0 291214 CASAVA_Build 2 35612306 2D ATATGAACAC AT/-- GTCTATACAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 AT 1 0 291215 CASAVA_Build 2 35612446 1I CTATTCAACA -/T TTTTTTTTTT 2775 het 2534 hom 28 8 11 9 T 14 15 291216 CASAVA_Build 2 35618403 1I TTTTCTTGCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 8 9 291217 CASAVA_Build 2 35627394 2D AATTTTCTGA AG/-- AGTGACATTT 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 AG 2 1 291218 CASAVA_Build 2 35632703 1I TTTCTTTTAA -/T GGTCTCAAAT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 T 0 1 291219 CASAVA_Build 2 35639855 1D ACAATGAACA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 52 25 19 8 T 8 7 291220 CASAVA_Build 2 35649757 12I TCATTTTTTG ------------/TTTCCTCTCCAA TTTCTTTTAT 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 TTTCCTCTCCAA 0 1 291221 CASAVA_Build 2 35652543 1D CATTTTTATC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 T 10 9 291222 CASAVA_Build 2 35660744 6I ATTGTAATAA ------/TATACT TATAAAATTA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TATACT 0 1 291223 CASAVA_Build 2 35663274 1I CTATTTTGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2988 hom 25 10 12 3 T 9 10 291224 CASAVA_Build 2 35664918 1I CCTTCCTCGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 378 hom 37 1 29 7 A 9 10 291225 CASAVA_Build 2 35666442 1I TACTTTTTTT -/C CCCACAGCAC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 C 3 4 291226 CASAVA_Build 2 35667757 1I CTATAGCCTC -/T TAGTTATGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 291227 CASAVA_Build 2 35671597 2D ATTGAGAGAC TA/-- TATAAAGTGC 3070 het 3070 hom 39 13 19 9 TA 3 2 291228 CASAVA_Build 2 35672242 1I AAGTTCATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 9 10 291229 CASAVA_Build 2 35673392 3D TATCTTATTA ATG/--- ATCATTTGAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 ATG 1 0 291230 CASAVA_Build 2 35676545 1I CCCATGAGAC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 291231 CASAVA_Build 2 35681778 1D AAAAGACAAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 A 9 8 291232 CASAVA_Build 2 35684406 1I TGTACAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 10 11 291233 CASAVA_Build 2 35688604 6I AGTAGATTAT ------/AATATA AATATAAATG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AATATA 1 2 291234 CASAVA_Build 2 35691064 1D ACAAAACCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2089 hom 23 8 13 4 A 12 11 291235 CASAVA_Build 2 35691379 1I GTTTTTGGAC -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 6 7 291236 CASAVA_Build 2 35694898 1I AAATGCTATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 T 9 10 291237 CASAVA_Build 2 35695378 1I TTAAATGATC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 8 9 291238 CASAVA_Build 2 35697496 3D TTTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 27 2 15 10 T 13 10 291239 CASAVA_Build 2 35700063 1I TTTTAATATA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 T 6 7 291240 CASAVA_Build 2 35704728 1I GCTACAGCTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 A 8 9 291241 CASAVA_Build 2 35759449 1I CAAGAGGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 420 hom 32 1 28 3 A 9 10 291242 CASAVA_Build 2 35765993 4I ATGGCTCATC ----/TCAT TCATGAATAT 3070 het 3070 ref 51 28 16 7 TCAT 1 2 291243 CASAVA_Build 2 35770536 1D GCCTGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2324 hom 33 14 8 12 T 17 16 291244 CASAVA_Build 2 35774093 1I TTGTTTGTTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 8 9 291245 CASAVA_Build 2 35779769 3D TATTGTTTAA AAT/--- AATAATTTTT 3070 het 2901 hom 21 7 13 2 AAT 3 2 291246 CASAVA_Build 2 35785814 1I AACAATAAAT -/A AGTTTAGTAT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 1 2 291247 CASAVA_Build 2 35786539 1I AGGAATACTC -/T TAATTTTTAA 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 T 1 2 291248 CASAVA_Build 2 35788039 2I GTTATGTCTA --/AC AGAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 18 10 7 1 AC 0 1 291249 CASAVA_Build 2 35788259 12D TAATGCAATC TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 2569 het 2569 ref 31 15 8 9 TG 12 6 291250 CASAVA_Build 2 35788423 4I TGCTTCTGAT ----/AAAG AACTCAGTAA 2617 het 2617 ref 25 13 6 6 AAAG 0 1 291251 CASAVA_Build 2 35788830 4I GTTACAGAAC ----/TAAG TAAGTGGTTT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 TAAG 1 2 291252 CASAVA_Build 2 35789425 1I TCAGCCTCCC -/A AAAGTGCTAG 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 3 4 291253 CASAVA_Build 2 35789640 3D ATCTTGAATT TTC/--- TTTAGAAAGG 3070 het 3070 hom 43 18 22 5 TTC 1 0 291254 CASAVA_Build 2 35789740 1I TTTGTCTCTC -/A AGGAAGTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 1 2 291255 CASAVA_Build 2 35790272 5D19M4D33M2I AGATTTTAGA TATATTATATTTTAATAATTTGGAAATTAATTGTATTGAGGGCTATTAATAATAATAAAAC--/-----TATATTTTAATAATTTGGA----AATTGTATTGAGGGCTATTAATAATAATAAAACAT ACTCTATAAT 3070 het 3070 ref 30 22 25 7 N/A 0 0 291256 CASAVA_Build 2 35790435 3D GAATAGGTAA TGT/--- TCTGTGGCTG 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 TGT 1 0 291257 CASAVA_Build 2 35791604 4I CTGTATATCT ----/ATCA ATCATTCTCC 3070 het 3070 hom 32 10 20 4 ATCA 1 2 291258 CASAVA_Build 2 35792871 6I AAAAAAATAA ------/ATAAAT ATGTTCATTC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 ATAAAT 0 1 291259 CASAVA_Build 2 35793086 1D ATATTTTTTT A/- AAAAATAGGC 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 6 5 291260 CASAVA_Build 2 35793757 4I GATGACAAAC ----/TGAA TGTCCACAGA 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 TGAA 0 1 291261 CASAVA_Build 2 35795740 1I ATAATTTGTA -/G GGAAAATACT 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 G 2 3 291262 CASAVA_Build 2 35796717 1I GCTCTCCCCA -/C CTTCGCTCTT 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 C 1 2 291263 CASAVA_Build 2 35800344 2I TTTTTGACTC --/AT AGAAATTTAA 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 AT 0 1 291264 CASAVA_Build 2 35804347 5I AGGTTACGTT -----/GTAAA GTAAAGTACG 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 GTAAA 1 2 291265 CASAVA_Build 2 35809395 1I AAGTAGGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1680 hom 31 9 14 8 A 13 14 291266 CASAVA_Build 2 35810440 1D AATCAGCAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 9 8 291267 CASAVA_Build 2 35862482 42D AATTTTTCTT CCTCCTTGCCCTCATTTAGCTCCATCTCTCTATCAATGACTA/------------------------------------------ CCTCCTTGCC 3070 het 3070 ref 38 12 12 21 CCTCCTTGCCCTCATTTAGCTCCATCTCTCTATCAATGACTA 1 0 291268 CASAVA_Build 2 35986094 1D TATTTCATTG C/- CTTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 44 13 26 5 C 2 1 291269 CASAVA_Build 2 35996296 2D ATACATACAC AT/-- ATATATATAT 1301 hom 10 het 8 0 4 4 AT 9 8 291270 CASAVA_Build 2 36002196 4D CATAGAAACC CTGT/---- CTGACTTATT 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 CTGT 1 0 291271 CASAVA_Build 2 36010081 5D AAAACTTTAG TAAAA/----- TAAAGTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TAAAA 1 0 291272 CASAVA_Build 2 36015827 2D ATAACACTTT TC/-- TTTTTCTTGG 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 TC 1 0 291273 CASAVA_Build 2 36015957 3D GAATTTAATC CTT/--- CTTTATTAAT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 CTT 2 1 291274 CASAVA_Build 2 36021118 1D GTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 T 12 11 291275 CASAVA_Build 2 36021755 1I CCACCTAAAA -/G TTTAGTATCC 3070 hom 111 het 38 0 37 1 G 0 1 291276 CASAVA_Build 2 36026841 1D TTTAATCAAC A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 44 23 15 8 A 7 6 291277 CASAVA_Build 2 36030999 2D AAATTGTGAC AG/-- AGACTATTCA 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 AG 2 1 291278 CASAVA_Build 2 36031678 1I GATCTCATTC -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 6 7 291279 CASAVA_Build 2 36038534 1D TTCTTTTTTA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 9 8 291280 CASAVA_Build 2 36039503 1I TTAGAGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 532 hom 52 2 40 10 T 11 12 291281 CASAVA_Build 2 36042215 3I AGAAAAAGAA ---/GAG AGATGCCAGA 3070 hom 105 het 46 0 36 10 GAG 0 1 291282 CASAVA_Build 2 36043000 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATCAG 2788 het 2345 hom 18 7 8 3 A 6 7 291283 CASAVA_Build 2 36043576 2I AAACTCCCTA --/AG ATCCCAAAGT 3070 het 3070 hom 40 9 22 9 AG 0 1 291284 CASAVA_Build 2 36044518 2D GAATTTGCAG TC/-- TCTGCTTAAC 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 TC 2 1 291285 CASAVA_Build 2 36046597 1I ACTCGCTAAA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 45 het 22 0 20 2 T 7 8 291286 CASAVA_Build 2 36047537 1I CTGTTTAAGA -/T TTTTAACACT 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 T 4 5 291287 CASAVA_Build 2 36049167 1I ATACATTTGT -/G TTTCTTCTTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 0 1 291288 CASAVA_Build 2 36057294 1I TTTTGCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 9 10 291289 CASAVA_Build 2 36063724 1I CAGCTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 12 13 291290 CASAVA_Build 2 36067985 1D TCCCCTCCTT G/- TGTCATTTCA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 G 1 0 291291 CASAVA_Build 2 36068398 1D CTCCTGCAGC A/- ATTAAGGAGA 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 A 2 1 291292 CASAVA_Build 2 36081138 1D TATAAAAAAA C/- ATCTTACTAC 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 C 1 0 291293 CASAVA_Build 2 36086885 2D TGGCTCACGC CT/-- CTGTAATCCC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 CT 2 1 291294 CASAVA_Build 2 36098611 7I AGAAGAAAGG -------/TATAAGC TATAAGCTAA 3070 hom 60 het 30 0 21 9 TATAAGC 1 2 291295 CASAVA_Build 2 36100647 1I ACACAGCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 13 14 291296 CASAVA_Build 2 36102620 1D TCTAAAAACT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 14 het 19 1 18 0 A 8 7 291297 CASAVA_Build 2 36110876 1D GTATTGTTGG A/- AAAAAAAAAG 1737 het 1737 ref 42 29 4 9 A 10 9 291298 CASAVA_Build 2 36111017 1D TCTTATTACC A/- AAAAAAAAAA 1222 het 1222 ref 31 22 3 6 A 13 12 291299 CASAVA_Build 2 36122300 16I6M2I AGTTGTGTCC ----------------TCTTAC--/TATATGCCTCCGACTATCTAACAG CTTCACAATA 3070 hom 54 het 22 0 18 6 N/A 0 0 291300 CASAVA_Build 2 36123706 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1374 hom 26 5 17 4 A 9 10 291301 CASAVA_Build 2 36127509 2D TCTAGTTGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2438 hom 36 10 18 9 A 15 13 291302 CASAVA_Build 2 36132214 1D ACCTTTAACA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 7 6 291303 CASAVA_Build 2 36133316 1I GAGTGAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 9 10 291304 CASAVA_Build 2 36140333 1D TATTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2226 hom 35 10 12 13 T 15 14 291305 CASAVA_Build 2 36161521 2I CTAAACGGAC --/CT CTCTCCCAGG 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 CT 2 3 291306 CASAVA_Build 2 36165571 6I TTTTCTTAGA ------/GAGCAC CCTGTGCCCC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GAGCAC 0 1 291307 CASAVA_Build 2 36166908 2D CCTATTATTC CA/-- CACACACACA 1156 het 1156 ref 60 50 3 7 CA 9 8 291308 CASAVA_Build 2 36201470 4D ATTTGATTCT TCTC/---- TCTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 TC 3 1 291309 CASAVA_Build 2 36217178 1I ATTACCTGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 10 11 291310 CASAVA_Build 2 36220244 10D TAGTATCTTC TGCTAGAATA/---------- TGCATGACTC 3070 hom 117 het 40 0 40 6 TGCTAGAATA 1 0 291311 CASAVA_Build 2 36220640 1D AATAGTCCTC A/- ACAGCCATAG 3070 het 3070 hom 44 21 18 7 A 2 1 291312 CASAVA_Build 2 36221923 1I GTAGTCACTC -/T TAAGTGGTGG 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 1 2 291313 CASAVA_Build 2 36223987 1I GTTCCTCTAA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 7 8 291314 CASAVA_Build 2 36243805 1D CTGGACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 537 hom 27 5 12 10 T 17 16 291315 CASAVA_Build 2 36248015 2D TGTTCCTGCT CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 82 hom 15 3 9 3 C 15 13 291316 CASAVA_Build 2 36259822 21D AGGTAGTGAG AAACTTGAAAAACGTTTTCAA/--------------------- AAACTTGAAA 2183 het 2183 ref 27 15 8 8 AAACTTGAAAAACGTTTTCAA 2 1 291317 CASAVA_Build 2 36265530 2I30M2D ACATATACAC --ATGTGTGTGTATACATATAGATTTAAATGCCT/ATATGTGTGTGTATACATATAGATTTAAATGC-- CTCTCTATAT 3070 hom 33 het 9 0 12 2 N/A 0 0 291318 CASAVA_Build 2 36265588 4I ATATAGAGCT ----/ATAG ATAGATAGAT 1461 het 428 hom 8 1 3 4 ATAG 3 4 291319 CASAVA_Build 2 36267069 1I ACCCTCAGAA -/C TTTTTTAAAA 3070 het 2653 hom 31 7 19 5 C 0 1 291320 CASAVA_Build 2 36270840 2I GATACCAATT --/CA CAGTCACTAG 3070 hom 132 het 49 0 44 5 CA 1 2 291321 CASAVA_Build 2 36279491 1D TCCCCCGTCA C/- CCCCACCCCA 3070 het 648 hom 16 4 11 1 C 5 4 291322 CASAVA_Build 2 36279809 1D CAGGAAAAAA G/- CAAGTCAGAA 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 G 1 0 291323 CASAVA_Build 2 36283515 3D TTTTAAACTC TCA/--- TTTTTGCTTG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 TCA 1 0 291324 CASAVA_Build 2 36285317 1I ATCCTTACAA -/G TCAAAGAGAT 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 G 0 1 291325 CASAVA_Build 2 36289669 5D CCATTGTGGG CTCTT/----- GACACTCCTG 3070 het 3070 ref 26 16 9 3 CTCTT 1 0 291326 CASAVA_Build 2 36290364 2I GCTGTTGGAT --/AG AGTGTTCTGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 1 2 291327 CASAVA_Build 2 36290983 5D TATACATTGA TTTCT/----- TTTCTTATTT 3070 het 3070 hom 50 16 30 4 TTTCT 2 1 291328 CASAVA_Build 2 36294427 1D ATAAAAGAGG T/- TTTGTTACCA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 4 3 291329 CASAVA_Build 2 36299788 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 13 12 291330 CASAVA_Build 2 36338281 1I GTATTGCAAA -/T TTTTATGTAT 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 4 5 291331 CASAVA_Build 2 36340351 1I CATTTTGGTG -/T TCTTTCACTG 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 T 1 2 291332 CASAVA_Build 2 36349337 4D AATGGTGTAC ATCT/---- ATCTCTCTGA 3070 het 3070 ref 24 12 11 3 ATCT 2 1 291333 CASAVA_Build 2 36396258 1I CAGGCTGCTG -/C CTCACGGGTC 3070 hom 63 het 23 0 18 5 C 1 2 291334 CASAVA_Build 2 36419298 4D CTTCCCTTCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 101 het 42 0 32 12 TTCC 6 5 291335 CASAVA_Build 2 36421341 1I TGTATTGGAG -/A ATATCTTTAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 291336 CASAVA_Build 2 36447186 1D TGGAAAGATT A/- AAAAAAAAAG 1357 het 1357 ref 29 21 3 6 A 10 9 291337 CASAVA_Build 2 36453654 1I GGCTTCATAT -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 8 291338 CASAVA_Build 2 36546697 1I CACACGCGGC -/A TAATTTTTTT 1869 het 1222 hom 9 4 4 1 A 0 1 291339 CASAVA_Build 2 36595376 1D TGTAGCCGGG A/- GCCTGAGGCC 3070 het 3070 ref 36 18 13 7 A 1 0 291340 CASAVA_Build 2 36599749 5D ATTTGTGTTA GGATC/----- TGAGTGATGA 3070 het 3070 ref 52 26 23 7 GGATC 1 0 291341 CASAVA_Build 2 36600574 4I GGTAGAAAAT ----/AAAA AGAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 1 5 291342 CASAVA_Build 2 36617006 4I TCCTTCTAGA ----/TATC TGCCTTTGTA 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 TATC 0 1 291343 CASAVA_Build 2 36656923 2D AGGCTTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2657 hom 33 9 19 5 T 12 10 291344 CASAVA_Build 2 36659854 1D AAACACAAAA G/- TCGAGGGAAA 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 G 1 0 291345 CASAVA_Build 2 36662875 1I ACCTAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 20 20 1 A 11 12 291346 CASAVA_Build 2 36668306 1I TTCTTTTGTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 8 9 291347 CASAVA_Build 2 36670673 2I AACACTGTGA --/TT TTTTCCATTT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 T 4 6 291348 CASAVA_Build 2 36671009 1I TTTCAGTGCA -/T CCAAATTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 0 1 291349 CASAVA_Build 2 36672924 1D TAAGAATGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 T 10 9 291350 CASAVA_Build 2 36678195 12D GGCGACACAC GTGCCCCAGGAG/------------ GTGCCCCAGG 3070 hom 58 het 25 0 19 8 GTGCCCCAGGAG 2 1 291351 CASAVA_Build 2 36697802 2I TAATGAGGAA --/TG TGTCTGTCTC 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TG 1 2 291352 CASAVA_Build 2 36697897 1I TCAGATGGTT -/G GGGGGGGCTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 G 7 8 291353 CASAVA_Build 2 36706538 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 11 1 9 1 A 15 14 291354 CASAVA_Build 2 36716173 1I TTGCTCTGCC -/A TAGCTGTGGG 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 A 0 1 291355 CASAVA_Build 2 36717375 1D GGGGATGCAG T/- TCATAGGGGT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 T 2 1 291356 CASAVA_Build 2 36728110 1D GAAAAAGTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 10 9 291357 CASAVA_Build 2 36730593 1D ACTTTCTGCT C/- CCCCATTCAC 3070 hom 122 het 46 0 40 8 C 5 4 291358 CASAVA_Build 2 36732618 3I GTGTCTCTAT ---/GTC AATTGAAATG 3070 hom 117 het 42 0 40 3 GTC 0 1 291359 CASAVA_Build 2 36733374 1D TTAAAATGGG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 6 291360 CASAVA_Build 2 36745942 1D GAATCTTGAG T/- TTCAAAAAGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 3 2 291361 CASAVA_Build 2 36754126 1I ATAATAATAC -/T TTTTTTTACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 7 8 291362 CASAVA_Build 2 36754755 1I AATCTTGTAG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 7 8 291363 CASAVA_Build 2 36758435 1I GTGTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 32 1 27 4 A 10 11 291364 CASAVA_Build 2 36760608 4I AATCTTATGG ----/TGGT TGGTTTTCTT 3070 hom 108 het 44 0 36 8 TGGT 1 2 291365 CASAVA_Build 2 36765624 1D CCTTTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 25 1 17 7 A 15 14 291366 CASAVA_Build 2 36770645 1I TATTTATTTA -/T TTATTTGTGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 2 3 291367 CASAVA_Build 2 36774401 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 13 1 10 2 A 14 15 291368 CASAVA_Build 2 36776264 1I ACCATGTTTT -/A ATAGCATTAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 1 2 291369 CASAVA_Build 2 36778801 1D AAGACTTGCA T/- TTTTTTATTG 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 7 6 291370 CASAVA_Build 2 36779648 1I CCCACATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 29 0 22 7 A 11 12 291371 CASAVA_Build 2 36780522 2I AGGCGGAAAG --/CT CTGTTACTTT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 CT 1 2 291372 CASAVA_Build 2 36780658 4D AGTGCCAAAT GTTA/---- GTTAATTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 GTTA 2 1 291373 CASAVA_Build 2 36781388 3D ATCTCAATTA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 AAT 7 6 291374 CASAVA_Build 2 36781753 1I AAATTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1295 hom 43 4 31 8 A 11 12 291375 CASAVA_Build 2 36782270 1I ATTCAAAAAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 85 het 33 0 29 4 A 7 8 291376 CASAVA_Build 2 36791267 1I TACAGTTTCT -/A GATGCAGTGT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 0 1 291377 CASAVA_Build 2 36792797 1I GAGGGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 10 11 291378 CASAVA_Build 2 36833859 1D TGTCAGAGTT G/- GGGGGTGGGG 2296 het 2296 ref 31 15 11 6 G 6 5 291379 CASAVA_Build 2 36838111 1I ATAGAAACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 9 10 291380 CASAVA_Build 2 36840661 1I TTCTTTTTTT -/G GAGACGGAGT 3070 het 363 hom 25 2 19 4 G 1 2 291381 CASAVA_Build 2 36847013 1D CTTTCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 A 10 9 291382 CASAVA_Build 2 36851866 1I AATGGCCAAT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 A 7 8 291383 CASAVA_Build 2 36857090 1I TAGAAAACAG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 8 9 291384 CASAVA_Build 2 36861683 1D CAGTTTGTGG T/- TGAAGGCCAT 3070 hom 117 het 45 0 39 7 T 2 1 291385 CASAVA_Build 2 36871566 1I AGAACAGCCA -/G GGCAAGCCAT 3070 hom 105 het 43 0 36 9 G 2 3 291386 CASAVA_Build 2 36874369 5I TTTGAGAAAA -----/TAGTT TAGAAAAGTT 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 TAGTT 0 1 291387 CASAVA_Build 2 36874978 1D TATTCCCTAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 9 8 291388 CASAVA_Build 2 36877747 1D TTTCAACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2405 hom 34 9 13 12 T 15 14 291389 CASAVA_Build 2 36886630 2D AGCGAACATA CT/-- CTCTCTCTCT 1016 het 1016 ref 45 26 4 15 CT 8 7 291390 CASAVA_Build 2 36891280 1I TGTGCCTAAA -/T TTTTTTTTTT 1979 het 1979 ref 36 9 8 19 T 17 18 291391 CASAVA_Build 2 36906514 1D GTTTTCTGTG C/- CTGGCACCAT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 C 2 1 291392 CASAVA_Build 2 36909287 5D CTTTGTCCTG TTTAC/----- TTTATTTTAT 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 TTTAC 1 0 291393 CASAVA_Build 2 36910802 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2471 het 2118 hom 16 8 6 2 A 11 10 291394 CASAVA_Build 2 36911543 1D AAAATTTTCT C/- TTATTCACTG 3070 het 3070 hom 36 12 20 7 C 1 0 291395 CASAVA_Build 2 36913363 1D ATATACCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 T 10 9 291396 CASAVA_Build 2 36916732 1D TTCAAAAAAA G/- AATCAGTCAA 1408 het 1408 ref 30 20 4 6 G 1 0 291397 CASAVA_Build 2 36923362 2D CGAGTCATTT TA/-- TGTTTGGTGG 3070 het 3070 hom 48 17 23 9 TA 1 0 291398 CASAVA_Build 2 36926677 1D TAAGGCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 15 0 7 8 T 11 10 291399 CASAVA_Build 2 36933804 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 2069 het 2069 ref 13 7 5 1 A 9 10 291400 CASAVA_Build 2 36937735 2I AAATATAGTC --/TT TTTTTTTTTT 3068 het 3059 hom 29 10 10 9 T 12 14 291401 CASAVA_Build 2 36948902 1I AACAAAACAG -/A AAAAATGGGA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 5 6 291402 CASAVA_Build 2 36950900 2D CACTGGTAAA AC/-- ACACATGTTC 3070 hom 61 het 27 0 21 6 AC 3 2 291403 CASAVA_Build 2 36953710 10D ACGACAGTGG GGCTCAGTAA/---------- GTCACTTTGC 3070 het 3070 hom 27 12 14 3 GGCTCAGTAA 1 0 291404 CASAVA_Build 2 36954589 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 17 1 10 6 A 15 14 291405 CASAVA_Build 2 36956307 1I ATAGAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 927 hom 18 5 10 3 T 15 16 291406 CASAVA_Build 2 36956918 1D ACCCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 206 hom 18 1 11 6 A 15 14 291407 CASAVA_Build 2 36970116 1I TGGGTCCCCA -/G AATGTCTTCA 1836 het 1836 ref 19 11 6 2 G 0 1 291408 CASAVA_Build 2 36972170 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 10 11 291409 CASAVA_Build 2 36974091 1I TTTTAGAACA -/T TTTTGAGAAG 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 T 4 5 291410 CASAVA_Build 2 36983123 4I TATTAAGTTA ----/TAAT TAAATTATTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TAAT 0 1 291411 CASAVA_Build 2 36989646 1I AACACCCCAG -/A AAAAAAAAAT 1871 het 1871 ref 19 11 5 3 A 9 10 291412 CASAVA_Build 2 36997717 1I34M3I AAAAATAAAT -AAAAAAAAAAGACTGGGACATTAATATAAACAAC---/AAAAAAAAAAAGACTGGGACATTAATATAAACAACAAT AATTTGAAAA 1574 het 1574 ref 26 22 4 9 N/A 0 0 291413 CASAVA_Build 2 36998478 1D ATTAAGAAGG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 A 7 6 291414 CASAVA_Build 2 37000733 4D AGCTGAAATG AATT/---- ACAAGGTATC 3070 het 3070 ref 28 18 8 3 AATT 1 0 291415 CASAVA_Build 2 37002360 2I TGTTGATGTG --/TC TCTATTTCAG 3024 het 3024 ref 18 9 7 2 TC 1 2 291416 CASAVA_Build 2 37002858 4I TCCTCTATTA ----/GTTT GAGGTCATTT 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 GTTT 0 1 291417 CASAVA_Build 2 37005111 3I CAGGAAAAGG ---/AGT AAACACTATA 3070 het 3070 ref 30 20 7 3 AGT 0 1 291418 CASAVA_Build 2 37006047 1D TAAAAAGGGC T/- GGGGGGACAT 3070 het 3070 hom 79 27 47 6 T 1 0 291419 CASAVA_Build 2 37006855 1I AACAGAGGGG -/C TAGGAAAGAG 3070 het 3070 ref 76 42 31 3 C 0 1 291420 CASAVA_Build 2 37007583 18D CCAACTTGTC ATTTCCAAATGTTTGTCT/------------------ ATGCCAAACG 3070 het 3070 ref 55 41 21 7 ATTTCCAAATGTTTGTCT 1 0 291421 CASAVA_Build 2 37007902 1D CCCTGTAATT A/- ACAGCACTTT 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 A 2 1 291422 CASAVA_Build 2 37019630 4D TTTTTTTTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 1080 hom 16 4 8 4 TTTG 4 3 291423 CASAVA_Build 2 37034050 1D GATAAGGTCC T/- TTTTTTTTTT 1449 het 1449 ref 26 11 5 10 T 17 16 291424 CASAVA_Build 2 37040283 1D TAATATTCTA C/- TGCCTAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 C 1 0 291425 CASAVA_Build 2 37041933 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTCT 1971 het 1971 ref 21 9 6 6 T 9 8 291426 CASAVA_Build 2 37045755 3D AGATTTCTCC TCT/--- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 13 8 TCT 2 1 291427 CASAVA_Build 2 37056052 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1221 het 139 hom 15 2 6 7 A 19 18 291428 CASAVA_Build 2 37072274 1D AATTAGAAAT A/- ACTAGAAATA 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 A 2 1 291429 CASAVA_Build 2 37074476 1D ACCTGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 11 10 291430 CASAVA_Build 2 37076712 1I AATGCAATTC -/T TTTTTTTTTT 1788 het 440 hom 12 2 5 5 T 15 16 291431 CASAVA_Build 2 37082453 1D TGGGATTACA G/- GGCATACGCC 3070 het 2434 hom 23 6 14 4 G 3 2 291432 CASAVA_Build 2 37086432 1D TAAAAACATG T/- TTTTTCACTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 6 5 291433 CASAVA_Build 2 37091183 1D TTTTTGAGAT G/- GGAGTCTCGA 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 G 3 2 291434 CASAVA_Build 2 37097098 1I TGGACCAAGA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 40 26 14 0 T 7 8 291435 CASAVA_Build 2 37098843 1D AACTTCTTAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 46 16 22 9 A 9 8 291436 CASAVA_Build 2 37101707 3D AGGACTTACA ATG/--- ATATGTTATG 3070 het 3070 hom 43 19 22 7 ATG 1 0 291437 CASAVA_Build 2 37106319 1I ATGTATAAAG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 A 6 7 291438 CASAVA_Build 2 37117164 2D ATATCAATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 8 7 T 12 10 291439 CASAVA_Build 2 37123537 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAG 1723 het 1188 hom 15 7 4 6 A 20 9 291440 CASAVA_Build 2 37124254 1D TGTTGTTTCC T/- AATCCTTAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 1 0 291441 CASAVA_Build 2 37126001 1D TATTGCTGAG T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 7 6 291442 CASAVA_Build 2 37136774 1D TTATAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 11 10 291443 CASAVA_Build 2 37156061 1D ATTTTAAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 9 8 291444 CASAVA_Build 2 37156791 3D GATAGTATAC TCA/--- TCACAGTGTA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 TCA 2 1 291445 CASAVA_Build 2 37157302 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 509 hom 36 8 10 19 A 12 11 291446 CASAVA_Build 2 37157400 1D CCCTTCCCCC T/- GATATACATT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 T 1 0 291447 CASAVA_Build 2 37160417 1D AGACAACAGG A/- AAAAAAAATA 887 het 887 ref 39 30 3 6 A 9 8 291448 CASAVA_Build 2 37161424 1D TGTACAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 15 10 17 A 13 12 291449 CASAVA_Build 2 37162557 5D TACAGAAACC TAAAA/----- TACTAAGGTC 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 TAAAA 1 0 291450 CASAVA_Build 2 37163560 1I ATGCAGGAAG -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 A 6 7 291451 CASAVA_Build 2 37177601 1I GAAAAGTATT -/C CCCCTCAATA 3070 hom 81 het 35 0 27 8 C 4 5 291452 CASAVA_Build 2 37192391 1I CTGTAGTCCT -/G GCTACTGAGG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 G 1 2 291453 CASAVA_Build 2 37212973 1I GGTGCGGTAG -/C TCACGCCTGT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 C 0 1 291454 CASAVA_Build 2 37215439 1I ACATATCTTT -/A GTCTCCCCAC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 0 1 291455 CASAVA_Build 2 37220686 1D TAAGTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 576 hom 43 2 15 26 T 12 11 291456 CASAVA_Build 2 37221248 1D TCAGATACTG C/- CCCCCCCCGC 3070 het 1996 hom 26 9 14 3 C 9 8 291457 CASAVA_Build 2 37221527 6D TTTTTTTTCT TCTTTC/------ TCTTTAACTG 3070 het 3070 ref 35 27 8 2 TCTTTC 1 0 291458 CASAVA_Build 2 37224949 2I GATAAGTAAC --/TG TTACTGGTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TG 0 1 291459 CASAVA_Build 2 37225012 2I CCTTCTACTT --/AA AAAAAAAAAA 934 het 934 ref 26 14 5 7 A 12 14 291460 CASAVA_Build 2 37227487 1I TAGGAAAAAA -/T GGCAATCACT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 0 1 291461 CASAVA_Build 2 37227954 1D ATCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2765 hom 22 8 14 0 T 10 9 291462 CASAVA_Build 2 37230214 1I CGGTTCCCAT -/G GGCACAAATT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 G 2 3 291463 CASAVA_Build 2 37233772 1D ACCATTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 14 13 T 11 10 291464 CASAVA_Build 2 37243020 1I TTTGTATTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 T 9 10 291465 CASAVA_Build 2 37244485 1I TATTTATCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1323 hom 19 5 10 4 T 9 10 291466 CASAVA_Build 2 37245985 1D TTATCTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 T 11 10 291467 CASAVA_Build 2 37246834 2D GCCTGGTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2311 het 128 hom 21 3 8 11 T 20 18 291468 CASAVA_Build 2 37255441 5I TTTTAAAAAA -----/TAACT TGACTGGATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TAACT 0 1 291469 CASAVA_Build 2 37257799 3D GACAAGTTTC TCA/--- TCATCATTTG 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 TCA 3 2 291470 CASAVA_Build 2 37259262 1D AAATCTTAAA T/- TAAAATAATG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 2 1 291471 CASAVA_Build 2 37262269 1D CTCAAGCGAT C/- CCTCCTGCTT 3038 het 3038 ref 19 10 7 7 C 3 2 291472 CASAVA_Build 2 37268513 1D ATCAGTTAAG A/- AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 A 7 6 291473 CASAVA_Build 2 37276474 1D TAGTTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 2752 het 2270 hom 22 8 10 4 T 13 12 291474 CASAVA_Build 2 37285145 1D GGATGGTCTT G/- ATCTCTTGAC 2316 het 1070 hom 12 3 5 6 G 1 0 291475 CASAVA_Build 2 37291182 5D AAAACCAAAC ATTCT/----- ATGTTCTCAG 3070 het 3070 hom 43 18 21 8 ATTCT 1 0 291476 CASAVA_Build 2 37300051 1D TCATACTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 13 26 14 T 12 11 291477 CASAVA_Build 2 37305196 21D TCAATTTTCT CTCTTTACATTTAAATTTTCC/--------------------- CTCTTTACAT 3070 het 3070 hom 27 11 10 10 CTCTTTACATTTAAATTTTCC 2 1 291478 CASAVA_Build 2 37320389 2I AGCAGTTTGC --/AA AAGAGTTCGT 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 A 2 4 291479 CASAVA_Build 2 37326334 1D CTAGGCAGAC A/- AAAAAAATCC 3070 hom 67 het 43 1 36 6 A 8 7 291480 CASAVA_Build 2 37329562 1I AATCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 10 11 291481 CASAVA_Build 2 37335960 3D CTTTTGGAAA AAC/--- AAAAAAGATC 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 AAC 1 0 291482 CASAVA_Build 2 37339700 1D GAACACTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 12 11 291483 CASAVA_Build 2 37369728 2I AAAAAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 1747 hom 22 8 10 4 A 12 14 291484 CASAVA_Build 2 37379059 1I AACAAAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 30 1 24 5 T 11 12 291485 CASAVA_Build 2 37379672 1D AAAGGCTTTC A/- GTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 A 1 0 291486 CASAVA_Build 2 37381668 3D TTTGCATTTC TTT/--- TTTTATTACA 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 T 7 4 291487 CASAVA_Build 2 37400404 1D ATACTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 56 25 24 8 A 13 12 291488 CASAVA_Build 2 37402994 15D AAATACCTAT TACTTTAGATTAACA/--------------- TACTTTTCCT 3070 het 3070 ref 20 14 11 0 TACTTTAGATTAACA 1 0 291489 CASAVA_Build 2 37403623 1D AGAGTCTTTT A/- AAAAAATGAG 3070 het 3070 hom 31 12 18 2 A 7 6 291490 CASAVA_Build 2 37422155 1D CGTCCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 11 10 291491 CASAVA_Build 2 37430478 1I ACAGTGGCAG -/A AAAAATGCCC 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 A 5 6 291492 CASAVA_Build 2 37494684 1D AATTTTTTTT G/- GGGGGGGGCA 3070 het 2732 hom 26 10 12 4 G 9 8 291493 CASAVA_Build 2 37544002 1D CTTTTAAAAA G/- CTTCCTGGGA 3070 het 3070 hom 28 8 19 3 G 1 0 291494 CASAVA_Build 2 37547685 1I TCATAGTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 T 9 10 291495 CASAVA_Build 2 37550144 2I AGAAACTGTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 AT 7 8 291496 CASAVA_Build 2 37551065 1I TCTTTTGAGC -/T TCTAGGTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 1 2 291497 CASAVA_Build 2 37555361 4D TGAATTAAAA TTGG/---- TTGGGGAGTT 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 TTGG 2 1 291498 CASAVA_Build 2 37570246 1D CTGATACAGG A/- AAAAATTCAA 3070 het 3070 hom 47 23 21 4 A 6 5 291499 CASAVA_Build 2 37591445 1I TCAACTGCAT -/G GGGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 7 8 291500 CASAVA_Build 2 37596960 2D ACTTATAAAC AG/-- AAATAATTAA 3070 het 3070 ref 45 26 16 6 AG 1 0 291501 CASAVA_Build 2 37604156 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 8 291502 CASAVA_Build 2 37611167 4I CCTGAATAGA ----/CTGT CTATGTGTTT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 CTGT 0 1 291503 CASAVA_Build 2 37618088 1I CACCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 189 hom 38 1 31 6 A 12 13 291504 CASAVA_Build 2 37634087 3D ATAAGAAAAA AAG/--- AAGTTTTATT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 AAG 2 1 291505 CASAVA_Build 2 37651318 14D CTTGGTTTAA GAAAATGGATCTGG/-------------- GATAATCTAG 3070 het 3070 ref 56 28 29 5 GAAAATGGATCTGG 1 0 291506 CASAVA_Build 2 37655034 1I AGACAGGGGA -/G GCAAGGCCCA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 1 2 291507 CASAVA_Build 2 37657494 1D CCAGGAGTTT A/- AGGCTGCAGT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 2 1 291508 CASAVA_Build 2 37698854 1D GGGGTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 1371 het 1371 ref 44 27 4 13 T 15 14 291509 CASAVA_Build 2 37700444 2I GGAATGTAAC --/AT ATGATCACGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AT 1 2 291510 CASAVA_Build 2 37705380 1D ATCTAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 24 11 A 13 12 291511 CASAVA_Build 2 37707317 1I ACAGCGTAAT -/G GGCTTTTTGG 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 2 3 291512 CASAVA_Build 2 37708259 1I ACAGTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 30 2 22 6 T 10 11 291513 CASAVA_Build 2 37709028 1D TTTAGATTTG A/- AAAAAATTGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 6 291514 CASAVA_Build 2 37713904 5I ACATAACATG -----/TTTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 10 15 291515 CASAVA_Build 2 37729724 1D CCAATTATTT A/- AAAAAAAAAA 1141 het 1141 ref 20 11 4 6 A 17 16 291516 CASAVA_Build 2 37746513 1I TGGCTCACTG -/A TTCTGGAGCC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 0 1 291517 CASAVA_Build 2 37751439 1D ATTCATAACG A/- AAAAATGGCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 6 5 291518 CASAVA_Build 2 37762926 6D AGCAGAGGAA ACAGAG/------ ACTAAAGAAA 3070 het 3070 hom 32 13 18 3 ACAGAG 1 0 291519 CASAVA_Build 2 37773750 2I GAGTTTTTGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 38 1 30 7 A 10 12 291520 CASAVA_Build 2 37775408 1D AGGCTAGGAG A/- GTGGGGGAGC 2082 het 2082 ref 21 12 7 2 A 1 0 291521 CASAVA_Build 2 37782239 2D GTGTATATAT AC/-- ACCACAGTTT 3070 hom 70 het 30 0 24 6 AC 2 1 291522 CASAVA_Build 2 37801978 1I GAGCCAATGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 53 27 18 8 T 8 9 291523 CASAVA_Build 2 37802883 2D GGTTTGAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1950 hom 31 14 12 6 T 18 16 291524 CASAVA_Build 2 37812515 4D TTTACTGTAT CTAA/---- CTAATTGTAG 3070 het 3070 ref 85 42 37 11 CTAA 2 1 291525 CASAVA_Build 2 37812736 1D20M1D TCCCTTCCTG AAAGCCACTCTGATGGCTTTCA/-AAGCCACTCTGATGACTTTC- AAGGCATCTA 3070 het 3070 ref 81 50 34 13 N/A 0 0 291526 CASAVA_Build 2 37813425 1D GAATACTATG C/- ATTAATGCAT 3070 het 3070 ref 73 33 29 13 C 1 0 291527 CASAVA_Build 2 37813789 1I AGGGAAGAAG -/T TTTAATCTCA 3070 het 3070 ref 77 44 26 7 T 3 4 291528 CASAVA_Build 2 37814194 1D ATGTTCCCAG A/- AAAAAAGACA 3070 het 3070 ref 68 33 22 13 A 7 6 291529 CASAVA_Build 2 37814726 1D GGAAATGGGG A/- CTGCACTGTA 3070 het 3070 ref 78 43 29 6 A 1 0 291530 CASAVA_Build 2 37814904 23D GGTGTTTCTA AAGCTGGTTAATTAACTAGGGGG/----------------------- AAGTGAAGCA 3070 het 3070 ref 76 61 30 5 AAGCTGGTTAATTAACTAGGGGG 1 0 291531 CASAVA_Build 2 37815280 1D AGTGGGAGAC A/- AAAACTCTAA 3070 het 3070 ref 75 37 32 7 A 5 4 291532 CASAVA_Build 2 37815380 1D TTTAAAAAAA G/- TCTGAAAAAC 3070 het 3070 ref 71 43 23 5 G 1 0 291533 CASAVA_Build 2 37815895 1D AGAGCTAAAT A/- AAAAGAAGAT 3070 het 3070 ref 49 30 14 5 A 5 4 291534 CASAVA_Build 2 37815963 3D TTGCTTTAAA AAG/--- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 56 29 23 7 AAG 1 0 291535 CASAVA_Build 2 37816126 1I CATCTTCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 64 32 26 6 A 11 12 291536 CASAVA_Build 2 37816567 8I TTTGCTTTAC --------/TCATTTGT TTAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 66 34 27 5 TCATTTGT 0 1 291537 CASAVA_Build 2 37816812 2D19M1D TTTTAAAAAA GTTAGAAAGTCTGAAAAAAAAC/--TAGAAAGTCTGAAAAAAAA- AAGAATTGGT 3070 het 3070 ref 52 34 15 15 N/A 0 0 291538 CASAVA_Build 2 37817649 2D ACCCACTCAC AA/-- TCACGAGAAC 3070 het 3070 ref 59 34 18 8 A 2 0 291539 CASAVA_Build 2 37817903 1I10M1D GGTCTTGAAG -GGGAGCTGCAC/AGAGAGCTGCA- AGGGGGAGAA 3070 het 3070 ref 54 40 18 5 N/A 0 0 291540 CASAVA_Build 2 37818012 1D CCAGCTGGGG A/- AAAAACTATC 3070 het 3070 ref 87 50 30 10 A 6 5 291541 CASAVA_Build 2 37819716 3I AGCGTCTCAG ---/AGC AGCTCTGCTT 3070 het 3070 hom 80 35 40 5 AGC 1 2 291542 CASAVA_Build 2 37820261 1D60M2D AACAACCTAA GAAAAATCTGATAAATTAGATGAAACTATTTTTCAAGACAGGGAACATCGGATAATGAAGGAC/-AAAAATCTGATAAATTAGATGAAACTATTTTTCAAGACAGGGAACATCGGATAATGAAGG-- AGAGATCCCT 3070 het 3070 ref 72 61 26 36 N/A 0 0 291543 CASAVA_Build 2 37820486 5D CAGTTCTGCA TGGCT/----- TGGAAGGCCT 3070 het 3070 ref 64 47 17 1 TGGCT 1 0 291544 CASAVA_Build 2 37820596 7D GTGCCAGGAG GAAAAAA/------- GAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 59 44 15 14 GAAAAAA 2 1 291545 CASAVA_Build 2 37820986 1D TGTAATTCTG T/- TTTCTGTTTA 3070 het 3070 ref 89 58 13 21 T 4 3 291546 CASAVA_Build 2 37821015 17I TCAAATAGAG -----------------/GATAAAGACATAGCATA GATAAAGACA 3070 het 3070 ref 99 52 17 30 GATAAAGACATAGCATA 1 2 291547 CASAVA_Build 2 37821425 1D16M1D ATTTGAGGTC TGCTTATCTTGAACTAGA/-GCTTATCCTGAACTAG- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 74 48 33 8 N/A 0 0 291548 CASAVA_Build 2 37823195 1D GGCAAAAAAA G/- TGGCTCTAAT 3070 het 3070 ref 63 29 26 8 G 1 0 291549 CASAVA_Build 2 37823863 1D GTAGTGGCAG T/- GATGGTGGTG 3070 het 3070 hom 82 36 38 8 T 1 0 291550 CASAVA_Build 2 37823976 2I TAGTGGACAT --/TG TCTCTTACTC 3070 het 3070 ref 91 49 34 13 TG 0 1 291551 CASAVA_Build 2 37824943 1D ACAGTAGAGC A/- AATGGATATG 3070 het 3070 ref 66 40 20 7 A 3 2 291552 CASAVA_Build 2 37825413 1I GCCTGGCTAA -/T TCTTTTGTAT 3070 het 458 hom 12 1 11 0 T 1 2 291553 CASAVA_Build 2 37826040 1I CAATTAAATT -/G TAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 74 31 38 5 G 0 1 291554 CASAVA_Build 2 37826141 1I TTTTGGAGCA -/C CCCTAAGGCC 3070 het 3070 ref 58 27 28 3 C 3 4 291555 CASAVA_Build 2 37826259 7D ACTCAAATAC TTTATTA/------- TTTATTGGAA 3070 het 3070 ref 56 32 21 8 TTTATTA 1 0 291556 CASAVA_Build 2 37826710 2D TATGGCTTTC TT/-- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 58 25 26 8 T 9 7 291557 CASAVA_Build 2 37827131 7I TGGAAATGGG -------/CTCAGAC CTGAGACCTC 3070 het 3070 ref 84 43 32 9 CTCAGAC 0 1 291558 CASAVA_Build 2 37828148 18D GCCAACCTTC AAAAATAATTATTGAATA/------------------ AAAGAACAGA 3070 het 3070 ref 62 35 29 5 AAAAATAATTATTGAATA 1 0 291559 CASAVA_Build 2 37828740 1I TATTAAATCA -/T TTTTTCAGTC 3070 het 3070 hom 83 42 35 8 T 5 6 291560 CASAVA_Build 2 37829452 1D ACTCATTTGC T/- GAATTTCTTC 3070 het 3070 ref 49 28 17 4 T 1 0 291561 CASAVA_Build 2 37829515 1D CCCCCCGCCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 58 27 26 6 T 9 8 291562 CASAVA_Build 2 37829650 1D TTGATTTATA T/- TCAGTTAGAA 3070 het 3070 hom 77 31 36 10 T 2 1 291563 CASAVA_Build 2 37832545 1D GGTCCGCATC T/- TTTTTGTTAT 3070 het 3070 ref 52 28 17 9 T 6 5 291564 CASAVA_Build 2 37832902 1D TGAAATATCC T/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 64 23 33 8 T 7 6 291565 CASAVA_Build 2 37834055 12D17M2D TGCCTGGCTA ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGGTAGAGAC/------------TTTCTTTTTCTGTAGAG-- AAGTTTTGTC 1553 het 1553 ref 24 11 4 16 N/A 0 0 291566 CASAVA_Build 2 37834340 1D CAGCATATTA C/- TTTTAGGGGA 3070 het 3070 ref 60 36 21 4 C 1 0 291567 CASAVA_Build 2 37836520 5D ATGATTCACT TTGAG/----- TTAAGTTTTG 3070 het 3070 ref 70 42 21 12 TTGAG 1 0 291568 CASAVA_Build 2 37836808 1D TCGGTGAAGG C/- CTTCAGAGCA 3070 het 3070 ref 90 53 28 11 C 2 1 291569 CASAVA_Build 2 37837301 2D TGAACCACTC TT/-- GAGTTCCTGG 3070 het 3070 ref 77 37 35 5 T 2 0 291570 CASAVA_Build 2 37837467 1D10M1D TTGTAAATTG AAGATGTTTTTG/-AGAGGTCTTT- TAATTTTAAG 3070 het 3070 ref 60 36 28 2 N/A 0 0 291571 CASAVA_Build 2 37837646 1D TATTACATTC T/- TTTCCCCATT 3070 het 3070 ref 74 35 27 14 T 4 3 291572 CASAVA_Build 2 37839360 3I ACTCTTTTTT ---/AAA TAAATAGCAG 3070 het 3070 hom 62 28 30 4 A 0 3 291573 CASAVA_Build 2 37839826 4I TCTCAGAGGG ----/AATA AATAATCAGC 3070 het 3070 ref 67 34 20 14 AATA 1 2 291574 CASAVA_Build 2 37839932 1D AGGTTACTGG C/- CCCAGACATC 3070 het 3070 ref 63 31 28 4 C 4 3 291575 CASAVA_Build 2 37840017 1D TTTAGCCTTT C/- CTTGAATCTA 3070 het 3070 ref 77 38 28 11 C 2 1 291576 CASAVA_Build 2 37840124 1D AGTGTGGACA G/- GGACCTGGCT 3070 het 3070 ref 78 41 27 10 G 3 2 291577 CASAVA_Build 2 37840260 1I CATGCTTTGG -/T TTTTTCATTA 3070 het 3070 hom 76 34 36 8 T 5 6 291578 CASAVA_Build 2 37840354 1D GCTGTTTTCA C/- CATGGTCTTG 3070 het 3070 ref 86 58 25 5 C 2 1 291579 CASAVA_Build 2 37841357 1I CTCAAATTAG -/A GGAAATATTG 3070 het 3070 ref 55 28 17 10 A 0 1 291580 CASAVA_Build 2 37842043 1D TTTTATTTCT C/- TCACCTTTTC 3070 het 3070 ref 58 30 21 7 C 1 0 291581 CASAVA_Build 2 37842208 2I CAGTTTTAGT --/AA AAAAGGTATT 3070 het 3070 ref 63 40 18 5 A 4 6 291582 CASAVA_Build 2 37842742 1D AAGAGAATGG A/- GAAGAAAAGT 3070 het 3070 ref 75 47 25 7 A 1 0 291583 CASAVA_Build 2 37842967 5I10M1I AAAAATCTCA -----AACTAAAAAC-/AAAAGAACTAAAAACA AGAAAAATAT 3070 het 3070 ref 90 51 36 15 N/A 0 0 291584 CASAVA_Build 2 37843740 1D AATATTACAG A/- AAAAAAAAGC 312 het 312 ref 45 27 2 18 A 9 8 291585 CASAVA_Build 2 37844462 1D ATATTATCAT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 81 38 40 4 A 8 7 291586 CASAVA_Build 2 37844618 2I AAATCTGCAG --/AT TGAGAGAATA 3070 het 3070 ref 85 37 40 9 AT 0 1 291587 CASAVA_Build 2 37844802 1D TACTTTCACT C/- CCTTTCTCAC 3070 het 3070 ref 76 40 29 8 C 3 2 291588 CASAVA_Build 2 37845428 26I TCTTTCATTG --------------------------/TTCTTTTCATTCACAATAGCTGCTCT GCAGCAAGAG 3070 het 3070 ref 55 27 17 11 TTCTTTTCATTCACAATAGCTGCTCT 0 1 291589 CASAVA_Build 2 37845789 2D52M3D TGAGAGGGAA CTCTCTATACTATTTTGGCAACTGAGTCTAAAATTATTTCAAAATATAGTTGAAAAG/--CTCTATACTATTTTGGCAACTGAATCTAAAATTATTTCAAAATATAGTTGAA--- AAGGGATAAG 3070 het 3070 ref 65 67 31 12 N/A 0 0 291590 CASAVA_Build 2 37846155 7D AGCAATTCTG TATTCTA/------- TACAAGCAGC 3070 het 3070 ref 74 38 34 5 TATTCTA 1 0 291591 CASAVA_Build 2 37846644 1D AAAATCTTAG A/- AAACTCGTAA 1491 het 1491 ref 48 26 6 17 A 4 3 291592 CASAVA_Build 2 37846691 6D AGTTTGGAAA CAGCAC/------ CAGCACCAGT 3070 het 3070 ref 53 30 9 19 CAGCAC 2 1 291593 CASAVA_Build 2 37847039 1D TGCCTAAAAC T/- TGAGTTTCAG 3070 het 3070 ref 54 37 13 6 T 2 1 291594 CASAVA_Build 2 37847807 2I ATAAGCAAAA --/CT CTCTAATATG 3070 het 3070 hom 75 33 34 20 CT 2 3 291595 CASAVA_Build 2 37848033 2D TCAGAGAAAA CT/-- CTCTGATACA 3070 het 3070 ref 82 43 22 25 CT 3 2 291596 CASAVA_Build 2 37849736 1I CCTGGTGTCA -/G CTTTTTGGAG 3070 het 3070 ref 75 35 25 15 G 0 1 291597 CASAVA_Build 2 37849836 2D TCTCGGCGGG GT/-- GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 43 23 12 9 GT 1 0 291598 CASAVA_Build 2 37850671 1D CTTTTTGCTC T/- ATTTGGACCT 3070 het 3070 hom 81 35 38 11 T 1 0 291599 CASAVA_Build 2 37851325 28D CAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAGGTATGTGACATAATG/---------------------------- TGTTACATTA 2531 het 2531 ref 23 24 6 13 AAAAAAAAAAAAGGTATGTGACATAATG 1 0 291600 CASAVA_Build 2 37851938 4I12M4I AGAAAGGACT ----CATCATGCTACA----/CATACATCATGCTACATACT TGGTGACAGC 3070 het 3070 ref 56 33 27 7 N/A 0 0 291601 CASAVA_Build 2 37852120 1D GGCTGGGGCC A/- AAGGGAGACA 3070 het 3070 ref 76 35 21 20 A 3 2 291602 CASAVA_Build 2 37852599 22D GAACTGCTCT CCAGTGTGTGTGCATGTGAGGA/---------------------- CCCATGAAAC 3070 het 3070 ref 75 59 28 11 CCAGTGTGTGTGCATGTGAGGA 1 0 291603 CASAVA_Build 2 37853383 1D26M1D GCCAGGGTAG AAAACCCCTGCCTTAGGCAAATGCCTTA/-AAACCCCTGCCTTAGGCAAATGCCTT- TAGATTTTTT 3070 het 3070 ref 51 41 21 8 N/A 0 0 291604 CASAVA_Build 2 37853923 1I TTTTCAAGGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 51 30 18 3 T 7 8 291605 CASAVA_Build 2 37854213 2D CCCCTCCCTG CC/-- CAGAGTTCAG 3070 het 3070 ref 88 48 33 11 C 3 1 291606 CASAVA_Build 2 37854671 2D37M5D ATTTTGCAGC AAAAAAAGCCATTCTAACTTGAAGCTTTTAATAGCAAATAAATA/--AAAAATCCATTCTAACTTGAAGCTTTTAATAGCAAAT----- AAGTGATCCA 3070 het 3070 ref 41 41 11 10 N/A 0 0 291607 CASAVA_Build 2 37855084 1D AACTTGAAAA G/- CACAAGAGGT 3070 het 3070 ref 82 37 34 11 G 1 0 291608 CASAVA_Build 2 37855419 1I AAAGAGCAGA -/T TGGGCAAGGA 3070 het 3070 hom 80 27 46 7 T 1 2 291609 CASAVA_Build 2 37856212 3D AGCTGTGGCA CCC/--- CCCCCCCCAC 1314 het 613 hom 24 9 9 6 C 11 8 291610 CASAVA_Build 2 37856471 3D65M1D TCACTCTGAT TTTTTTTTTTAAGACACCTCTCTGCCCTTCATGTAATATGGGGAGTTTAGCGGTTTCTCGGGATTGGCC/---ATTTTTTTAAGACACATATCTGCCCTTCATATAATATGGGGAGTTTAGTGTTTTCTCAGAATCGG- CTGCAAGATA 3070 het 3070 ref 59 71 10 12 N/A 0 0 291611 CASAVA_Build 2 37856893 1I GGTCTTAGCC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 8 9 291612 CASAVA_Build 2 37857386 3I TGTGGTCAGT ---/AGA AGGAGTGTAG 3070 hom 116 het 49 0 38 11 AGA 0 1 291613 CASAVA_Build 2 37861571 1D TTATCCATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 T 10 9 291614 CASAVA_Build 2 37864023 2I TTTTATTTTT --/TA TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TA 0 1 291615 CASAVA_Build 2 37884640 1I AAAGGAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 10 11 291616 CASAVA_Build 2 37894416 56D TCTTTTGAAG AAGGTTCAATTTGACTTCTGGACTCATGGCTATTTTCAGAAAGTGTGTTTTCTGGA/-------------------------------------------------------- ACTTCATTCT 3070 het 3070 ref 26 21 11 2 AAGGTTCAATTTGACTTCTGGACTCATGGCTATTTTCAGAAAGTGTGTTTTCTGGA 1 0 291617 CASAVA_Build 2 37897993 1D CTTCTGGTAT A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 102 het 44 0 35 9 A 8 7 291618 CASAVA_Build 2 37904606 1I GACTGTGTTC -/T TTCTTATTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 3 291619 CASAVA_Build 2 37914290 1D ATGTATGCGG T/- GATTTCCAAC 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 T 1 0 291620 CASAVA_Build 2 37914879 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2511 het 635 hom 19 4 8 7 A 17 18 291621 CASAVA_Build 2 37915565 2D AGGCCAGGGT GG/-- GGGGCACTCT 3070 het 3070 hom 26 12 11 4 G 6 4 291622 CASAVA_Build 2 37916444 1I GAAGTCCCAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 8 9 291623 CASAVA_Build 2 37920323 1I TGCCTTGAGC -/A AAGGCTGCTC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 2 3 291624 CASAVA_Build 2 37930421 4I GAGAAAAGGT ----/CATG CATGGGCTTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 CATG 1 2 291625 CASAVA_Build 2 37940476 1I TCTCCACCAG -/A TGTGGCAGGT 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 A 0 1 291626 CASAVA_Build 2 37943405 1D CACAGCCAAG A/- AGGAAACACA 2461 het 1822 hom 29 6 9 14 A 2 1 291627 CASAVA_Build 2 37947134 1I TACATAAGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 59 23 29 7 A 9 10 291628 CASAVA_Build 2 37951145 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 971 hom 30 6 15 9 T 12 13 291629 CASAVA_Build 2 37953039 14D TAGGACATCC CAGCTGTCCCTGCT/-------------- CCCCAGTCCT 3070 hom 81 het 28 0 24 9 CAGCTGTCCCTGCT 1 0 291630 CASAVA_Build 2 37956708 1D AGTATTAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1139 hom 33 5 19 9 A 14 13 291631 CASAVA_Build 2 37960143 1D55M1I GTGATGAGCT AATGAGCTTGAGCTATGATGAAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA-/-ATGAGCTTGAGCTATGATCAAGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC CCCCCCCATC 3070 het 3070 ref 30 27 9 8 N/A 0 0 291632 CASAVA_Build 2 37961486 8I AGCCGCCAGC --------/CACCACAT TCTCCGGCTA 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 CACCACAT 0 1 291633 CASAVA_Build 2 37965065 1I GGTTCCCGAG -/T TAGCTGGGAT 3070 het 2392 hom 16 6 8 2 T 1 2 291634 CASAVA_Build 2 37965140 1I GGTTTCACTA -/T TGTTGGTCAG 3070 het 960 hom 11 2 8 1 T 1 2 291635 CASAVA_Build 2 37967331 6D AACTCAAGAC ATCCTA/------ ATTCCTTTGA 3070 het 3070 hom 31 13 18 1 ATCCTA 1 0 291636 CASAVA_Build 2 37973415 1I AAAAAAAAAA -/G AAAACCACTT 3070 het 409 hom 34 2 24 8 G 0 1 291637 CASAVA_Build 2 37976101 1D GGGCTGGAAG C/- CAGAAACAAA 3070 hom 105 het 41 0 35 8 C 2 1 291638 CASAVA_Build 2 37981963 1D GTTTCCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 12 11 291639 CASAVA_Build 2 37983433 1D CCTAAATTGT G/- GGTAGCAATA 3070 het 3070 hom 41 16 22 5 G 3 2 291640 CASAVA_Build 2 37999337 1I TTTCAATGCT -/G GGGCATTGCC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 3 4 291641 CASAVA_Build 2 37999463 1I TATGTTAGTT -/G GCAGAGGCCA 3070 hom 144 het 55 0 48 7 G 1 2 291642 CASAVA_Build 2 38006444 1I TGGGCTCTCG -/C CTCGGCTTTC 3070 hom 44 het 17 0 11 6 C 1 2 291643 CASAVA_Build 2 38006742 4D TCTCTTAGGA AACT/---- TAAACCTCGG 3070 het 3070 hom 30 12 12 7 AACT 1 0 291644 CASAVA_Build 2 38007248 1I AATTACTATA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 T 7 8 291645 CASAVA_Build 2 38007578 1I GCGAGACTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 11 12 291646 CASAVA_Build 2 38021927 1I TCATCCCAGA -/G GGGCACCCGC 3070 hom 68 het 26 0 20 6 G 3 4 291647 CASAVA_Build 2 38022590 1D CTGGGGTACC A/- AAAAAAAAAA 2881 het 1877 hom 26 7 9 11 A 17 16 291648 CASAVA_Build 2 38036616 1I TCATTCAGAA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 7 8 291649 CASAVA_Build 2 38040985 2I GTATTGGGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 20 10 8 2 TA 6 7 291650 CASAVA_Build 2 38047116 1I TCCTAGATTT -/G GGCTTTGGCC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 2 3 291651 CASAVA_Build 2 38048980 1I ATCCCAGCTT -/G GGGGGGCTGA 3070 het 2171 hom 24 8 15 1 G 6 7 291652 CASAVA_Build 2 38053744 1I AATTTGTGTG -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 6 7 291653 CASAVA_Build 2 38068535 1I GTGAAATCCC -/A ATCTCTACTA 1441 het 39 hom 6 1 3 3 A 1 2 291654 CASAVA_Build 2 38071251 2D TAGTTAACAA TC/-- TCTGCATATT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 TC 2 1 291655 CASAVA_Build 2 38071975 1D TATAAACTTT A/- TTTGAATATA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 1 0 291656 CASAVA_Build 2 38077236 18D AGACATTGCC AAAAAAAAAAAAGAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 2845 het 2845 ref 23 11 12 5 AAAAAAAAAAAAGAAAAA 1 0 291657 CASAVA_Build 2 38098605 1D GTAACAAGGT G/- CTCATTGCAG 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 G 1 0 291658 CASAVA_Build 2 38104488 2D ATTTTATAAA TT/-- TTGACGTGTA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 4 2 291659 CASAVA_Build 2 38115479 1I AAAATTTAAT -/A AAGTAGAAAT 2390 het 2390 ref 18 10 5 3 A 2 3 291660 CASAVA_Build 2 38126294 1I CATAAAAAAA -/T TTAAGAAGCA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 2 3 291661 CASAVA_Build 2 38127756 5D AAATGAAGAC AAAAT/----- AAAAGACATT 3070 het 3070 ref 30 16 12 5 AAAAT 1 0 291662 CASAVA_Build 2 38131912 2D GGAGTGTTTA AG/-- AGAGGTAGTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AG 3 2 291663 CASAVA_Build 2 38139055 14D TTTAATTCCC AGCCTTGGAAGGGA/-------------- AGGCTTGGAG 3070 het 3070 ref 25 18 10 2 AGCCTTGGAAGGGA 1 0 291664 CASAVA_Build 2 38141476 1D GGTACACAGC A/- CAACACCAGG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 1 0 291665 CASAVA_Build 2 38150490 1D ATTTGGTGAC T/- TTTTTTTTTA 1074 het 1074 ref 32 25 3 4 T 10 9 291666 CASAVA_Build 2 38151159 1I TCTTTGACTC -/A AAAAAAATCT 3070 hom 89 het 42 0 30 12 A 7 8 291667 CASAVA_Build 2 38153546 1D ACTAAAAAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 9 8 291668 CASAVA_Build 2 38156522 1I GGAACCCGCA -/G GCCCGGCCTG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 G 1 2 291669 CASAVA_Build 2 38173882 3I GAGGAGCATT ---/CTC CTCTCTGATG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 CTC 1 2 291670 CASAVA_Build 2 38211000 3I TTCTGAATTC ---/TCT TATTAGGGTC 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 TCT 0 1 291671 CASAVA_Build 2 38219285 4D GCCTGACAGA AAGT/---- AAGTTCCAGG 3070 het 2752 hom 34 10 14 11 AAGT 2 1 291672 CASAVA_Build 2 38222909 38D TGTGTTGCTG AGTTTTATATTTCTGATTCAGTTTTATATTTCTGATTC/-------------------------------------- AGTTTTATAT 2873 het 2873 ref 28 15 7 15 AGTTTTATATTTCTGATTC 3 1 291673 CASAVA_Build 2 38225362 3D TTGGTCCTAT ATA/--- CTGTTCTGGA 3070 het 3070 hom 66 28 30 8 ATA 1 0 291674 CASAVA_Build 2 38226124 3I CTTCACCTGA ---/TTT TTAATGCTTC 3070 het 3070 hom 53 21 29 3 T 2 5 291675 CASAVA_Build 2 38226859 1I AGGAAGAAAA -/G GAAAGCATGA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 G 1 2 291676 CASAVA_Build 2 38227310 1D TGCCTCACCT C/- CCCCCACTGA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 C 6 5 291677 CASAVA_Build 2 38234093 1I CAAGGTGGCC -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 6 7 291678 CASAVA_Build 2 38245223 4I TATAAAAATG ----/ATTT GTTATATATA 1670 het 1232 hom 18 5 8 5 ATTT 0 1 291679 CASAVA_Build 2 38247623 1D CTAGGACCCA G/- GCTTCAGTGT 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 G 2 1 291680 CASAVA_Build 2 38248450 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 1376 het 1376 ref 16 12 4 0 A 8 7 291681 CASAVA_Build 2 38254374 1D CAAGTTATTT A/- AAAAAAAAAA 2882 het 2882 ref 30 17 8 5 A 12 11 291682 CASAVA_Build 2 38254531 4I TCCTCCCACA ----/CTGT CTGGTCTGGG 1944 het 1944 ref 25 12 6 7 CTGT 0 1 291683 CASAVA_Build 2 38255165 1I AAAGCTGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 39 1 32 6 T 10 11 291684 CASAVA_Build 2 38260066 1I TTGTAAGTGA -/G CTCATTCAGT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 0 1 291685 CASAVA_Build 2 38264233 1I TTGTAGGGAT -/G GGGGGTCTCA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 G 5 6 291686 CASAVA_Build 2 38267973 1D CAAGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 T 15 14 291687 CASAVA_Build 2 38278131 6I GCAGTGCAGA ------/CAGATT CAGATTCTTC 3070 het 3070 ref 53 26 23 5 CAGATT 1 2 291688 CASAVA_Build 2 38296513 1I GATTTGCTTA -/T TTCTAGATAT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 2 3 291689 CASAVA_Build 2 38298657 4I TTTGCCCTGT ----/CTTC CTTATGATTC 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 CTTC 0 1 291690 CASAVA_Build 2 38299374 12D GCCCCAGCCC TGCCAGCAGGCA/------------ GGACTATTCA 3070 het 3070 ref 32 20 13 3 TGCCAGCAGGCA 1 0 291691 CASAVA_Build 2 38367241 1D GTGCTCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 740 hom 39 9 13 18 A 17 16 291692 CASAVA_Build 2 38368775 4D AAAGGGGGCT TTTG/---- TTTGTTTGAG 3070 het 3070 ref 31 19 8 5 TTTG 3 2 291693 CASAVA_Build 2 38369446 1I CACTTAGTAC -/A AAAAAAAAAA 1728 het 1728 ref 29 9 7 13 A 11 12 291694 CASAVA_Build 2 38370825 1D TGAGACCCCA C/- CCCCATCCCT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 C 5 4 291695 CASAVA_Build 2 38375287 1D ATATACCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 A 13 12 291696 CASAVA_Build 2 38395086 3I CCTGTTCGCC ---/TAT TACTGATAAG 3070 het 3070 ref 45 27 17 1 TAT 0 1 291697 CASAVA_Build 2 38398449 1I CTTTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 21 22 9 A 10 11 291698 CASAVA_Build 2 38400251 1I CCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1985 het 1985 ref 24 12 5 7 A 12 13 291699 CASAVA_Build 2 38406534 8D AGTTTAAGGT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 1178 het 1178 ref 20 7 5 9 TTTG 4 2 291700 CASAVA_Build 2 38418985 4I AGGGTTGAAA ----/AACT AACTATTGGT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 AACT 1 2 291701 CASAVA_Build 2 38424262 1D ATTGCCCCCT C/- CCCCCATTAT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 C 6 5 291702 CASAVA_Build 2 38432683 1D GCTTGAACCC A/- GGGGTGGAGG 1942 het 1942 ref 18 9 5 4 A 1 0 291703 CASAVA_Build 2 38435730 2D ATAAAAACGC AG/-- AGACTGCCAG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 AG 2 1 291704 CASAVA_Build 2 38459925 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1414 het 1414 ref 43 34 4 5 T 10 9 291705 CASAVA_Build 2 38461980 7I GCCAGGCATG -------/GTGGCAC GTGCCTGTAA 1452 het 1452 ref 15 8 3 4 GTGGCAC 0 1 291706 CASAVA_Build 2 38472628 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 732 hom 21 4 13 4 T 8 9 291707 CASAVA_Build 2 38478546 10D17M1I TTGTAAATGC ACCAAAACGGACCAATCAGCTCTCTGT-/----------ACCAATCAGCACCCTGTC AAAATGGACC 2126 het 2126 ref 16 9 6 8 N/A 0 0 291708 CASAVA_Build 2 38479092 1D CGCGCCTGGG T/- TTTTTTTTTT 2611 het 886 hom 27 8 10 9 T 19 18 291709 CASAVA_Build 2 38518223 1D TGGCTATTTC T/- TTTTTTTTCT 2058 hom 29 het 14 0 10 4 T 9 8 291710 CASAVA_Build 2 38518732 19D ATGACAGTCC CAAAGGAAGGGAACTGCTG/------------------- CAAAGGGCCA 3070 hom 80 het 24 0 26 4 CAAAGGAAGGGAACTGCTG 1 0 291711 CASAVA_Build 2 38526797 1I AGGGGCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 185 hom 43 1 38 4 T 10 11 291712 CASAVA_Build 2 38533560 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 20 1 16 3 A 12 11 291713 CASAVA_Build 2 38568233 4I AAAAATAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 60 het 30 0 21 9 AAAC 2 3 291714 CASAVA_Build 2 38573116 2I GGAATCAGTT --/GG GGGTAATTAT 3070 het 3070 hom 42 8 13 21 G 3 5 291715 CASAVA_Build 2 38576285 1I TTCCATTCTA -/T TTTTGCAAGG 3070 het 3070 ref 48 25 15 8 T 4 5 291716 CASAVA_Build 2 38584097 3I CAAAAGAGAG ---/AGA AGAAGGAGAA 3070 het 3070 ref 41 22 10 9 AGA 1 2 291717 CASAVA_Build 2 38585843 1D CAAATGGTTG T/- TTTTTTACCA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 7 6 291718 CASAVA_Build 2 38590973 1D TCATGGGAAG A/- AAAAAAGGGC 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 A 7 6 291719 CASAVA_Build 2 38592586 1I ATTCTAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 14 10 T 11 12 291720 CASAVA_Build 2 38594585 1D CAAGAGTTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 10 9 291721 CASAVA_Build 2 38606370 1D CAAATAATCC A/- AAAAAAAAAG 2902 het 2902 ref 26 16 7 3 A 10 9 291722 CASAVA_Build 2 38608522 3I TGGTTATGGG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 14 11 T 11 14 291723 CASAVA_Build 2 38614052 2I GGTCTGAGCT --/CA GTCTGTCCCG 3070 het 3070 hom 53 25 21 7 CA 0 1 291724 CASAVA_Build 2 38622319 1I AAAGAAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 12 8 A 9 10 291725 CASAVA_Build 2 38622795 4I CAGTTTTCTT ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 het 2376 hom 21 9 10 2 TTTG 1 2 291726 CASAVA_Build 2 38627541 4I TCTTTTTTTG ----/TTTT TTGTTTTTTT 3070 het 1167 hom 27 5 16 6 T 2 6 291727 CASAVA_Build 2 38630831 3I GGAGATCTGA ---/TGT TGTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 37 13 12 12 TGT 1 2 291728 CASAVA_Build 2 38660388 1I AAAGTTTTTA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 T 8 9 291729 CASAVA_Build 2 38676989 2I CACTGCAAAC --/CT CTGTCTCCTG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 CT 1 2 291730 CASAVA_Build 2 38685994 1D CCAGTTGAGT A/- AAAAAAAAAA 1838 het 1838 ref 42 32 4 7 A 11 10 291731 CASAVA_Build 2 38689822 2I GAAAATTAAT --/AA GTCACTGTAT 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 A 0 2 291732 CASAVA_Build 2 38711561 2D TTACTTAGAG AC/-- ACACACACAC 1871 het 1871 ref 48 31 4 13 AC 7 6 291733 CASAVA_Build 2 38713940 1I TTGCTGTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 35 2 23 10 A 14 15 291734 CASAVA_Build 2 38749695 1I GAAAATGGGA -/T TTTTTTTCTT 2901 het 2901 ref 17 9 8 0 T 7 8 291735 CASAVA_Build 2 38751735 1I GGAAAGGGGG -/C AAGCGTTTCC 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 C 0 1 291736 CASAVA_Build 2 38754614 2D TTTATATGGA AT/-- ATGTGTGTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 AT 2 1 291737 CASAVA_Build 2 38760832 1D ACCTCGCTAA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 T 7 6 291738 CASAVA_Build 2 38781148 1I TCTTTTTTTT -/A AATCGTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 A 2 3 291739 CASAVA_Build 2 38794087 1D GACAGTGGTG C/- CCCCCTCATG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 C 6 5 291740 CASAVA_Build 2 38794551 1D ACCCTGCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 28 3 13 12 A 17 16 291741 CASAVA_Build 2 38804449 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 83 het 37 0 29 8 A 10 9 291742 CASAVA_Build 2 38807543 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 9 10 291743 CASAVA_Build 2 38809507 1I TGGCTGTTAC -/T TACTCCTGGG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 1 2 291744 CASAVA_Build 2 38819937 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 2586 hom 32 11 17 4 A 9 8 291745 CASAVA_Build 2 38819953 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAAAAG 60 het 60 ref 24 11 1 14 AAAC 1 0 291746 CASAVA_Build 2 38823114 4I TCAAAAAAAA ----/TATT TATGCTGAGG 3070 hom 54 het 21 0 17 4 TATT 0 1 291747 CASAVA_Build 2 38825146 2I ATCCAGAAAT --/CA GTTTCTATTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CA 0 1 291748 CASAVA_Build 2 38833714 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 2428 het 2085 hom 11 5 5 1 A 9 10 291749 CASAVA_Build 2 38839910 1I CTGCAATGGT -/A TTTGGTTCTC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 0 1 291750 CASAVA_Build 2 38844162 4I CAAATATGTC ----/ACTT ACTCTAAATA 3070 het 3070 hom 53 19 32 2 ACTT 0 1 291751 CASAVA_Build 2 38852975 1I TCAAAGTTTC -/A AAATTCCAAA 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 3 4 291752 CASAVA_Build 2 38868268 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 8 7 A 15 11 291753 CASAVA_Build 2 38870522 3D ACTCCGACTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2373 het 151 hom 18 4 9 5 A 17 14 291754 CASAVA_Build 2 38873716 1D GCTAGAGTGC T/- GTGGCACAAT 3070 het 3070 hom 31 9 17 7 T 1 0 291755 CASAVA_Build 2 38878548 1D ACAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2637 het 131 hom 28 3 11 15 A 12 11 291756 CASAVA_Build 2 38882057 4I TCTATCTATC ----/TATT TATTTATTTA 3070 het 1955 hom 20 5 11 4 TATT 4 5 291757 CASAVA_Build 2 38884136 1D AGCTAACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 22 1 13 8 T 15 14 291758 CASAVA_Build 2 38886379 1D TTGGGGATCA T/- TGAGTTTGAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 2 1 291759 CASAVA_Build 2 38892912 1I GCACAAACAA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 T 6 7 291760 CASAVA_Build 2 38895375 1I GAAAACCCTG -/T TTTTTTTTTT 1985 het 1334 hom 23 5 7 11 T 11 12 291761 CASAVA_Build 2 38903566 1D ATGCCCTTGA T/- TTCCCCCATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 3 2 291762 CASAVA_Build 2 38909930 1I ACACTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 1808 het 1808 ref 23 8 8 7 T 15 16 291763 CASAVA_Build 2 38912504 7D AAAAAAAAAA AAATTAC/------- AAAAATTAGC 6 het 6 ref 20 13 1 7 AAATTAC 1 0 291764 CASAVA_Build 2 38920204 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2203 het 702 hom 15 3 8 4 A 14 13 291765 CASAVA_Build 2 38930194 2D CCCATCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 23 4 9 10 A 12 10 291766 CASAVA_Build 2 38931268 2I TAATGAAAAC --/AT ATTCTTATAC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AT 1 2 291767 CASAVA_Build 2 38931339 7I TTTCTTTTTC -------/AGGGAAA AGGGAAATAG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AGGGAAA 1 2 291768 CASAVA_Build 2 38936084 12D ATTTGCACTC CAATCAAAAGGA/------------ CAATCAAATA 3070 het 3070 ref 35 17 16 5 CAATCAAAAGGA 1 0 291769 CASAVA_Build 2 38939078 2D CACATGACTC TG/-- AGACTATTTG 3070 het 3070 hom 41 16 23 3 TG 1 0 291770 CASAVA_Build 2 38944892 1D TCTGATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 969 hom 29 7 11 11 A 17 16 291771 CASAVA_Build 2 38946730 1D ACTGTCCAAA G/- GAAGGAGCAC 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 G 2 1 291772 CASAVA_Build 2 38956537 1I CTTGGAGCAG -/C CCTGCGGTGG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 C 2 3 291773 CASAVA_Build 2 38973067 2I GGTAAACAGA --/TC TAACTGGGGA 3070 hom 93 het 38 0 30 8 TC 0 1 291774 CASAVA_Build 2 38973803 2D CTGGTAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 1154 het 437 hom 27 7 4 16 T 16 14 291775 CASAVA_Build 2 38975069 1I ATGCTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 707 hom 41 2 27 12 A 11 12 291776 CASAVA_Build 2 38980672 1D TCACTTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 10 9 291777 CASAVA_Build 2 38984063 1I AAGGGATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 451 hom 26 2 15 9 T 13 14 291778 CASAVA_Build 2 39013088 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTA 2889 het 2520 hom 21 9 7 5 T 10 9 291779 CASAVA_Build 2 39016290 1D CTGTAATTTC T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 8 7 291780 CASAVA_Build 2 39022651 3D TGTCTTGGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 22 7 T 14 11 291781 CASAVA_Build 2 39024188 1D CATCTGGTAT G/- GGGGGTGAGG 3070 hom 92 het 36 0 31 5 G 6 5 291782 CASAVA_Build 2 39024437 1D TTGCAGATGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 10 9 291783 CASAVA_Build 2 39027075 3D CTAGACTAAC CTT/--- CTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 17 20 3 CTT 2 1 291784 CASAVA_Build 2 39035279 2D AGCTAAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 1983 het 200 hom 23 4 7 12 T 18 16 291785 CASAVA_Build 2 39039360 1D ATTGTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 291786 CASAVA_Build 2 39043669 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1596 het 118 hom 15 1 5 9 A 17 16 291787 CASAVA_Build 2 39062017 1I TTGACACAGA -/G GGAAATGTGG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 2 3 291788 CASAVA_Build 2 39064224 2I GTTATCACCT --/TA TATTGAAGGC 3070 hom 123 het 42 0 42 0 TA 1 2 291789 CASAVA_Build 2 39064863 1D TGAACCAGAT A/- AACTCTCTAA 3070 hom 157 het 56 0 53 3 A 3 2 291790 CASAVA_Build 2 39066070 2I TGTTTAAGTT --/TG TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TG 0 1 291791 CASAVA_Build 2 39070202 1D AAACATTCAT A/- AAAAAATCGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 7 6 291792 CASAVA_Build 2 39072900 4I TGATAGGTTT ----/TAAG TAAGGGATTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TAAG 1 2 291793 CASAVA_Build 2 39078120 1I AAAATGCAAG -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 7 8 291794 CASAVA_Build 2 39082888 1I GGAGAACTGC -/T TGAACCCGGG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 1 2 291795 CASAVA_Build 2 39083719 12I ATCAAAAAAA ------------/AAACAAACAAAC AAAAAGAACG 3070 hom 5 het 22 1 14 7 AAAC 0 3 291796 CASAVA_Build 2 39096448 12D ATTGTAAATC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2894 het 2894 ref 31 13 9 12 T 24 12 291797 CASAVA_Build 2 39101549 1I GAAAAATATC -/A AAAAAACTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 6 7 291798 CASAVA_Build 2 39104880 3I ATTCAACTGT ---/CAC CACAATAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 CAC 1 2 291799 CASAVA_Build 2 39105589 2D GGCAAATATC TG/-- TGTCAGACAG 3070 hom 102 het 37 0 35 4 TG 2 1 291800 CASAVA_Build 2 39118262 1D ATATATTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 35 1 27 8 T 12 11 291801 CASAVA_Build 2 39127141 14D AGACAGTGTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 1347 hom 17 het 12 0 5 7 T 27 13 291802 CASAVA_Build 2 39128475 1D ACTATGCCCA C/- CCTAATTTTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 3 2 291803 CASAVA_Build 2 39138549 1D ACTATCACTT A/- AGAGTCTTGT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 A 2 1 291804 CASAVA_Build 2 39139056 4D CATCTGAGAT AAAC/---- AAAATCCACA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AAAC 1 0 291805 CASAVA_Build 2 39142644 1I TACTTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 11 291806 CASAVA_Build 2 39143068 1I GTCTCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 11 12 291807 CASAVA_Build 2 39143991 1D GCATATGGGA G/- GGGTGTTCAT 3070 hom 102 het 43 0 34 12 G 4 3 291808 CASAVA_Build 2 39156234 17I GGATTACCTG -----------------/AGTCTAGGAGTCCGAGA AGTCTAGGAG 3070 hom 45 het 17 0 15 3 AGTCTAGGAGTCCGAGA 1 2 291809 CASAVA_Build 2 39159159 4I ATTAGGAACC ----/CTCA AGGCCACAGA 3070 hom 87 het 30 0 28 2 CTCA 0 1 291810 CASAVA_Build 2 39196833 4I AATAACCCAA ----/AAAG ACTTTTAAGT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AAAG 0 1 291811 CASAVA_Build 2 39207464 1D GGCTACTTGC T/- TTTTTTTTTG 1018 het 1018 ref 28 21 3 4 T 10 9 291812 CASAVA_Build 2 39241759 21D TCCTTAGGAA TTTTGCAATTTGAAATTGAAG/--------------------- TTTCAATTTC 3070 het 3070 hom 27 14 16 3 TTTTGCAATTTGAAATTGAAG 1 0 291813 CASAVA_Build 2 39252966 1I CCCCGCTCCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2652 hom 27 7 12 8 A 12 13 291814 CASAVA_Build 2 39256483 1I GCATGTAAAA -/G CATGGGGAAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 0 1 291815 CASAVA_Build 2 39263913 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 24 11 A 13 12 291816 CASAVA_Build 2 39283301 1D AGAGTTTTGT A/- AGCTTTATTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 1 291817 CASAVA_Build 2 39286707 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 10 9 291818 CASAVA_Build 2 39289963 1I TCTCAGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 31 2 20 9 A 15 16 291819 CASAVA_Build 2 39322127 7D TGAGATATCA TCCTTTC/------- TCAGAAATGT 3070 hom 123 het 45 0 41 6 TCCTTTC 1 0 291820 CASAVA_Build 2 39323826 10D GATTTTGAAG ATCAGGCCAT/---------- ATCAGTTAGG 3070 hom 28 het 16 0 10 8 ATCAGGCCAT 1 0 291821 CASAVA_Build 2 39329349 2D GAAATGGTGC CT/-- CTCTTGATCC 3070 hom 157 het 59 0 53 6 CT 3 2 291822 CASAVA_Build 2 39341974 2I AATTTTATAT --/AA GTTTAAAATT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 0 2 291823 CASAVA_Build 2 39347141 1D ACCTTTATGA T/- TTTTTTTTTG 1340 het 1340 ref 47 36 3 10 T 10 9 291824 CASAVA_Build 2 39347553 1I AAAATGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 34 1 26 7 A 12 13 291825 CASAVA_Build 2 39349758 2D TGTACAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 31 0 26 6 T 13 11 291826 CASAVA_Build 2 39354182 1D GAGAGGACCC A/- GGGGTGAATG 3070 hom 82 het 30 0 28 2 A 1 0 291827 CASAVA_Build 2 39370746 8D AAAAAAAAAA AAAAAAAG/-------- AACACTAAAT 2305 het 166 hom 15 4 9 6 AAAAAAAG 1 0 291828 CASAVA_Build 2 39394101 4D CTTTCTTTCC TTCT/---- TTCTTTCCTT 3070 hom 92 het 34 0 27 7 TTCT 2 1 291829 CASAVA_Build 2 39396163 1D ACTTTGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 35 1 27 7 T 12 11 291830 CASAVA_Build 2 39402701 2I TCTCTGTGTC --/TT TTTCTTTTCC 3070 hom 41 het 19 0 13 6 T 3 5 291831 CASAVA_Build 2 39415092 1D GGTTGGGGAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 9 8 291832 CASAVA_Build 2 39432174 4I TAGATATCTT ----/CGTA TCTGTGGAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CGTA 0 1 291833 CASAVA_Build 2 39464067 1I TCAATTACCT -/C CCACCAGGTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 2 3 291834 CASAVA_Build 2 39471418 1D CATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 283 hom 37 1 31 5 A 13 12 291835 CASAVA_Build 2 39493183 1D AGAATATGAC T/- TGAGATAAGC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 2 1 291836 CASAVA_Build 2 39506346 2I TGGTCTGTGG --/TA TATGTTGTTA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TA 1 2 291837 CASAVA_Build 2 39515870 1D CCCAACTGCT C/- CATTCCACTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 2 1 291838 CASAVA_Build 2 39522635 1I AGAAAATACA -/T GGGAAAGGAG 3070 hom 60 het 24 0 22 2 T 0 1 291839 CASAVA_Build 2 39523343 13I TTGGTAGAGA -------------/GTTTTTGTACTGG GTCAAAGTAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 GTTTTTGTACTGG 0 1 291840 CASAVA_Build 2 39533821 2I AACACATGAA --/AC AATACTAGAT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AC 0 1 291841 CASAVA_Build 2 39538842 1I TGTCAGACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1564 hom 32 6 20 6 A 12 13 291842 CASAVA_Build 2 39539300 1D AACCTATCTC T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 2 1 291843 CASAVA_Build 2 39542206 1D AACTGCTGTG T/- TGGAGTGGCA 3070 het 3070 ref 44 30 9 5 T 2 1 291844 CASAVA_Build 2 39542552 2I GGAGGCCAAG --/GA GAGTGGGTCA 3070 hom 74 het 30 0 22 8 GA 1 2 291845 CASAVA_Build 2 39556269 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 A 9 10 291846 CASAVA_Build 2 39560666 1D ACTTTGAAAA T/- TGAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 2 1 291847 CASAVA_Build 2 39574199 4D TTTCTTTTGT TCTC/---- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 42 21 19 3 TC 5 3 291848 CASAVA_Build 2 39576409 4D TCTTGAACAT ACTC/---- ACTTGTAGAA 3070 het 3070 ref 37 22 12 6 ACTC 1 0 291849 CASAVA_Build 2 39584070 1D ATATCTAGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 10 9 291850 CASAVA_Build 2 39592872 2D CCACAGCTTT TA/-- TGTCTTTCCA 3070 hom 129 het 47 0 41 6 TA 1 0 291851 CASAVA_Build 2 39608478 1I CACTGAATAT -/A GACTCCATTA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 0 1 291852 CASAVA_Build 2 39616774 3D ACAAAATAAA AAT/--- AATGAACTCT 3070 het 3070 ref 28 16 10 4 AAT 2 1 291853 CASAVA_Build 2 39634080 1D CTATTTATTG A/- AAAGACTGTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 3 291854 CASAVA_Build 2 39643962 1I GGTTGACAGG -/T TTTTTCCCCC 980 het 980 ref 8 4 3 1 T 5 6 291855 CASAVA_Build 2 39649137 1I TATTGTCATT -/A AAAAGGGAAC 3070 hom 62 het 33 0 29 4 A 4 5 291856 CASAVA_Build 2 39649696 1D ATCTTTTGGC T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 110 het 48 0 38 10 T 7 6 291857 CASAVA_Build 2 39670026 1D AACAGAAAAC A/- AAAACACACA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 5 4 291858 CASAVA_Build 2 39672073 1I CCCAGTTTTT -/A GTAGCCATTA 3070 hom 101 het 37 0 30 7 A 0 1 291859 CASAVA_Build 2 39691318 2D TCTTACAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 1976 het 106 hom 23 1 7 15 T 18 16 291860 CASAVA_Build 2 39697011 4D ATCCTGGGGG CAGT/---- CAGACTGGTT 3070 het 3070 ref 46 29 15 3 CAGT 1 0 291861 CASAVA_Build 2 39702469 4D ATGAGAGTGG ACTA/---- ACTGCTTCAT 3070 het 3070 ref 46 24 19 4 ACTA 1 0 291862 CASAVA_Build 2 39715833 3D GATAGGTGGG TAA/--- TAATAATGAT 3070 het 3070 hom 62 27 29 8 TAA 3 2 291863 CASAVA_Build 2 39741561 1D TTCTTTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 T 13 12 291864 CASAVA_Build 2 39747980 2D GATAGTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2986 het 2986 ref 26 11 8 8 T 16 14 291865 CASAVA_Build 2 39748095 1I CTTTGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2781 hom 23 7 14 2 A 11 12 291866 CASAVA_Build 2 39756060 2I TATAAAAGGG --/CA CAGTTTTGTA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 CA 1 2 291867 CASAVA_Build 2 39760041 1I ACTTGGTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 47 20 21 6 A 9 10 291868 CASAVA_Build 2 39798833 3D ATTTACAATT TTC/--- TTCTTCTCCT 625 het 625 ref 38 15 7 18 TTC 3 2 291869 CASAVA_Build 2 39817924 5I ATTTTTACTC -----/TACTT AAAAGGCAAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 TACTT 0 1 291870 CASAVA_Build 2 39824687 1D AGAAGGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3011 hom 37 15 14 8 T 15 14 291871 CASAVA_Build 2 39829814 6D CCAAAGTAAT GCATAA/------ GCACACAGAT 3070 het 3070 hom 52 17 32 5 GCATAA 1 0 291872 CASAVA_Build 2 39831359 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 A 9 8 291873 CASAVA_Build 2 39835064 1I GTTATCCTAG -/T TATTTTCTTC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 1 2 291874 CASAVA_Build 2 39835679 1I GATGCAACAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 T 9 10 291875 CASAVA_Build 2 39836403 5I ATCTATTTTG -----/AGTAT AGTAAATAAT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 AGTAT 0 1 291876 CASAVA_Build 2 39851655 18D GGAATCTCTT ATGCCCCCTTTACCTCTA/------------------ ATGCTTGGTA 3070 het 3070 hom 31 14 19 3 ATGCCCCCTTTACCTCTA 1 0 291877 CASAVA_Build 2 39862202 3D CTCCATCATC TCT/--- TCTTCTTTAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 6 TCT 3 2 291878 CASAVA_Build 2 39868645 5D TACACTAAGC TAAGA/----- TTACTTTATT 2434 het 2434 ref 17 10 6 2 TAAGA 1 0 291879 CASAVA_Build 2 39874614 1D AATTAATTGC T/- TGAGATATTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 2 1 291880 CASAVA_Build 2 39878239 1D TTTTTTTTTT A/- ATTATACTTC 3070 het 2640 hom 25 7 11 8 A 2 1 291881 CASAVA_Build 2 39893983 1I GCCCCTGACT -/G GGGCTGCTGC 3070 hom 78 het 29 0 21 8 G 3 4 291882 CASAVA_Build 2 39911007 1I TTGTCCCAGA -/G GGGCACCCGC 3070 het 196 hom 16 1 9 6 G 3 4 291883 CASAVA_Build 2 39915668 1D TCATGATGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 21 17 11 T 10 9 291884 CASAVA_Build 2 39916252 1I TTTTAAATTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 9 10 291885 CASAVA_Build 2 39922615 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATGTG 2025 het 1080 hom 17 3 9 5 TA 4 3 291886 CASAVA_Build 2 39924243 4D CTCTATTACC CTTA/---- CTATTTCTCA 3070 het 3070 ref 43 23 17 5 CTTA 1 0 291887 CASAVA_Build 2 39926597 2D TGTGAGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 11 25 8 TG 10 9 291888 CASAVA_Build 2 39927458 1D ATATTTGTTG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 T 7 6 291889 CASAVA_Build 2 39931334 4I GTAAGAATGT ----/ATAA ATAAATGTTC 3070 het 1981 hom 16 4 9 3 ATAA 1 2 291890 CASAVA_Build 2 39980572 1D AGCAGCCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 49 het 27 0 20 9 A 10 9 291891 CASAVA_Build 2 40006212 1D15M1I CTCAACCTGG TGGGGTTTCCCCCTGG-/-GGGGTTTCCCCCTGGA AGGGGGTAGG 3070 hom 111 het 37 0 37 6 N/A 0 0 291892 CASAVA_Build 2 40006671 1I GAGAGGGGCC -/T TGGAGCTAGG 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 1 2 291893 CASAVA_Build 2 40008673 1I GTGGCTGCTG -/C CCCCTCTCTC 3070 hom 113 het 41 0 37 4 C 4 5 291894 CASAVA_Build 2 40015941 5D TCTTGCAAAC ATGTT/----- AAGTAAAAGC 3070 het 3070 hom 48 20 26 7 ATGTT 1 0 291895 CASAVA_Build 2 40016789 1D TGGTACTGGT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 33 9 17 8 A 8 7 291896 CASAVA_Build 2 40035747 1D TTAGGACTTT C/- ATGTCAGTTA 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 C 1 0 291897 CASAVA_Build 2 40035913 1D CCTATATAGA G/- GGCTCTCTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 5 G 3 2 291898 CASAVA_Build 2 40048378 4D AGATTTATCA TAAC/---- TAACTACTCC 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 TAAC 2 1 291899 CASAVA_Build 2 40051895 2I GGTTTATAAA --/TC TCTCTCGCTC 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 TC 3 4 291900 CASAVA_Build 2 40063005 2I AAATAGGATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 310 hom 43 1 33 9 T 10 12 291901 CASAVA_Build 2 40065867 7D TCAAGTGGGT CCCTGAC/------- CCCTGACCCC 2257 hom 18 het 9 0 6 3 CCCTGAC 2 1 291902 CASAVA_Build 2 40071890 2D AATTATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 28 0 23 8 AT 6 5 291903 CASAVA_Build 2 40073058 1D ATTAATGTGA T/- TTTTTTCATA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 7 6 291904 CASAVA_Build 2 40076253 1D GGAACATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 T 11 10 291905 CASAVA_Build 2 40101651 2D AGCCTGAAGA TG/-- TGTGATTAAA 3070 hom 27 het 19 0 17 4 TG 3 2 291906 CASAVA_Build 2 40112535 2I TAAGTTAAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 AC 8 9 291907 CASAVA_Build 2 40117132 7I TGAATTTAAC -------/TTTGTGG TCCTATTGGC 3070 hom 105 het 42 0 34 8 TTTGTGG 0 1 291908 CASAVA_Build 2 40134490 1D GCATGTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 34 0 26 8 T 13 12 291909 CASAVA_Build 2 40146227 1I TTTTCAGAGG -/C CAAGACCTCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 1 2 291910 CASAVA_Build 2 40164006 1D GGTCCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 2833 het 991 hom 30 7 10 13 T 19 18 291911 CASAVA_Build 2 40182174 2I TGATTAGAAA --/TC TCTCTGACTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TC 2 3 291912 CASAVA_Build 2 40183007 1I GCTGACTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 645 hom 37 3 23 11 T 13 14 291913 CASAVA_Build 2 40186392 1D CAGCTGAAAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 8 7 291914 CASAVA_Build 2 40188930 3D GTGTGCCAAA AAC/--- ATGCTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 19 13 3 AAC 1 0 291915 CASAVA_Build 2 40192983 2D GCATTTCCCG CC/-- CCCCCCCCAA 3070 het 19 hom 34 1 14 19 C 10 8 291916 CASAVA_Build 2 40194176 1D TAGAGGAGAC A/- ACACTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 2 1 291917 CASAVA_Build 2 40209879 1D AGATGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1796 het 1796 ref 45 27 6 12 T 15 14 291918 CASAVA_Build 2 40210050 1D AATTTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 30 0 23 7 T 11 10 291919 CASAVA_Build 2 40221479 2D CAATTACCTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 52 20 28 6 AT 6 5 291920 CASAVA_Build 2 40226610 5D AGAGTTGATC TCTCT/----- TTTTTTTGTA 3070 het 271 hom 43 4 19 21 TCTCT 1 0 291921 CASAVA_Build 2 40233583 3I GTGCCACTGC ---/AGT AGTCCAGCCT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 AGT 1 2 291922 CASAVA_Build 2 40237145 4D ACATTAGGTA AAAG/---- AAAGAGGGAG 3070 hom 78 het 29 0 27 4 AAAG 2 1 291923 CASAVA_Build 2 40237321 2D AATATTAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 22 7 A 12 10 291924 CASAVA_Build 2 40237990 3I CGAACTGAGA ---/TCT TCTTGAGGTG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 TCT 1 2 291925 CASAVA_Build 2 40256151 2I CATACGTATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 56 hom 45 2 26 17 TG 8 9 291926 CASAVA_Build 2 40257694 1D TTATTTTTTC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 8 7 291927 CASAVA_Build 2 40259683 4D AAAATATCAC AAAG/---- AAAATATAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 AAAG 1 0 291928 CASAVA_Build 2 40260876 4I AATTTGCATC ----/TTTA TTTAGTATAA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TTTA 1 2 291929 CASAVA_Build 2 40261524 5D ATTCACAAAT AAATA/----- AATCACCAAA 3070 hom 102 het 39 0 33 7 AAATA 1 0 291930 CASAVA_Build 2 40273009 1I TCCTTTTAGA -/G GTTTTTTTTA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 1 2 291931 CASAVA_Build 2 40279582 1I TAATTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 933 hom 30 4 22 4 A 13 14 291932 CASAVA_Build 2 40279736 6I ATAGAAAATT ------/GTTCAA GTTCAAGACT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 GTTCAA 1 2 291933 CASAVA_Build 2 40280480 4D GGGGAACCAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 59 29 21 11 GAAA 3 2 291934 CASAVA_Build 2 40285896 11I TTTCATCAAT -----------/TTAAAAATAAC TTAAAAATAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 TTAAAAATAAC 0 1 291935 CASAVA_Build 2 40298581 1I GTATTCTGAG -/A ATAAAATAGC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 1 2 291936 CASAVA_Build 2 40298750 1D CAGTTAGTTT G/- TAAATCTAAC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 1 0 291937 CASAVA_Build 2 40299372 1I CTTCTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 790 hom 33 2 21 10 A 12 13 291938 CASAVA_Build 2 40299679 25I AATCCTATTT -------------------------/CTACCTGCAACCCTTGATTGGCCTC CTTGGTCTGA 3070 hom 144 het 54 0 49 8 CTACCTGCAACCCTTGATTGGCCTC 0 1 291939 CASAVA_Build 2 40300451 127D AGAGATGTGC TTTGTTTGCTATGCATGAGATTGCTTGAAAAATGTGATTTAGCTCCAACAGAGCCTCCCTACTATAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGAAAATCAATACATCTTTCTGTCAAAATT/------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TGGTTAGGGC 3070 hom 24 het 7 0 9 3 TTTGTTTGCTATGCATGAGATTGCTTGAAAAATGTGATTTAGCTCCAACAGAGCCTCCCTACTATAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGAAAATCAATACATCTTTCTGTCAAAATT 1 0 291940 CASAVA_Build 2 40300793 1D CAAAATAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 37 3 22 12 T 14 13 291941 CASAVA_Build 2 40307903 4D AACAGGGGAC CTAT/---- CTATCTGTAA 3070 hom 87 het 34 0 29 7 CTAT 2 1 291942 CASAVA_Build 2 40313039 1I18M1I GTGCAAGTTA -TTTTTTTTTTGTCTTCAG-/TTTTTTTTTTTGTCTTCAGT TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 33 0 32 6 N/A 0 0 291943 CASAVA_Build 2 40319696 1D ATTGCAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 A 12 11 291944 CASAVA_Build 2 40322524 1I TAGATATCAG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 291945 CASAVA_Build 2 40324695 1I TTTTGTTATT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 48 het 49 1 41 7 A 8 9 291946 CASAVA_Build 2 40325304 2D TGATCGAGGC CT/-- TTTCCTACTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CT 1 0 291947 CASAVA_Build 2 40327590 1I TGCTAAAAAA -/T AAAAAGAATA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 1 291948 CASAVA_Build 2 40333542 4D CCAAATTTTA TATG/---- TATGTATATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TATG 2 1 291949 CASAVA_Build 2 40337661 8D ATCAAGTAAG TAAATAAA/-------- TAAATAAATA 3070 hom 72 het 30 0 25 7 TAAA 8 6 291950 CASAVA_Build 2 40338028 1I GAAACTCCTG -/A AAAAAATCAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 6 7 291951 CASAVA_Build 2 40339196 1D AAACTCAGTC T/- TTACTGGCCG 3070 hom 113 het 39 0 34 5 T 3 2 291952 CASAVA_Build 2 40339575 1D GAAAGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 7 A 13 12 291953 CASAVA_Build 2 40339662 5I ATTGTGAGAC -----/ATATT ATAAAGAGAC 3070 hom 57 het 26 0 18 8 ATATT 0 1 291954 CASAVA_Build 2 40339899 1I GGAGATAATA -/G GAAGCCTTCC 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 G 1 2 291955 CASAVA_Build 2 40342389 4I GCGTAAGTGC ----/CACT CACAGTCGTT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 CACT 0 1 291956 CASAVA_Build 2 40345491 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2809 hom 30 8 18 4 A 10 9 291957 CASAVA_Build 2 40350430 1D ACTGTTGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2569 hom 28 9 14 5 T 10 9 291958 CASAVA_Build 2 40364997 4D ATAAATATAT ATAG/---- ATATATACAT 1873 hom 15 het 6 0 6 0 ATAG 1 0 291959 CASAVA_Build 2 40365306 6I ATAAATATAA ------/ATATAT ATATATATAT 1548 hom 12 het 5 0 5 0 AT 5 8 291960 CASAVA_Build 2 40369509 1D ATATATATGA T/- TTTTTTTTTT 2361 het 491 hom 14 1 8 5 T 15 14 291961 CASAVA_Build 2 40379732 1I ACAGTTACTT -/G GGGGTATTTC 3070 hom 152 het 61 0 51 10 G 4 5 291962 CASAVA_Build 2 40380181 3I AAGGAGATTT ---/AAG AAAGTGACAA 3070 hom 148 het 51 0 50 1 AAG 0 1 291963 CASAVA_Build 2 40383168 2D CATATATAAC AT/-- ATATATTTAC 3070 het 2885 hom 21 8 13 0 AT 4 3 291964 CASAVA_Build 2 40387097 1I GAATGGTTGT -/G GGGGGGGGGC 1831 het 1831 ref 22 10 6 6 G 9 10 291965 CASAVA_Build 2 40389290 1I TCTCTGTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 10 291966 CASAVA_Build 2 40392088 3I ATGCATTCAT ---/ATA ATGAGAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATA 0 1 291967 CASAVA_Build 2 40399142 1I TACAGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 110 het 46 0 36 10 A 9 10 291968 CASAVA_Build 2 40407092 1I GGGAAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 11 12 291969 CASAVA_Build 2 40408227 1I ATGCAACCAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 764 hom 55 3 47 5 A 9 10 291970 CASAVA_Build 2 40408602 1I AATAAAACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 24 7 A 9 10 291971 CASAVA_Build 2 40410930 1I ACATTAAAAT -/G GATGAGGATA 3070 hom 151 het 59 0 51 8 G 1 2 291972 CASAVA_Build 2 40413083 1I GGACGGGGGC -/G GGGGGGCGGT 1242 hom 15 het 7 0 6 1 G 6 7 291973 CASAVA_Build 2 40437979 1I CTACAAAACA -/T TTTTTTTTTT 2489 het 2489 ref 22 8 7 7 T 11 12 291974 CASAVA_Build 2 40442109 3D TGAAGGAGCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2383 hom 27 12 10 5 T 13 10 291975 CASAVA_Build 2 40445095 1I CAAGTAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 A 10 11 291976 CASAVA_Build 2 40446640 1I ACCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 11 12 291977 CASAVA_Build 2 40449593 4D ATAATTCCTT ACTC/---- AATCAATTGT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 ACTC 1 0 291978 CASAVA_Build 2 40450530 1I CCAAAAAAAT -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 7 8 291979 CASAVA_Build 2 40453700 1I CAAACTATGT -/C CCTAGCCATA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 C 2 3 291980 CASAVA_Build 2 40453817 3I CCAGGTTTTG ---/TGT TGTTGTAATA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 TGT 2 3 291981 CASAVA_Build 2 40460289 1D TGATTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1851 het 1851 ref 44 34 4 7 T 11 10 291982 CASAVA_Build 2 40463035 4D TTTGCCAAGG GTTA/---- GTATTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 18 21 8 GTTA 1 0 291983 CASAVA_Build 2 40463312 6I CCATCTAAAC ------/TAAAAT TGAAAATCGT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 TAAAAT 0 1 291984 CASAVA_Build 2 40466101 2D TTTTGGAAAC TG/-- TATCAATTGC 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 TG 1 0 291985 CASAVA_Build 2 40466155 6I GAGATTTATA ------/ATAGAG ATAAACACGG 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 ATAGAG 0 1 291986 CASAVA_Build 2 40467266 1D TTTAAAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 22 6 A 11 10 291987 CASAVA_Build 2 40482290 5D ACATTAAGTG AAAAA/----- AAAAAAAAAG 1879 het 1879 ref 17 7 4 9 A 14 9 291988 CASAVA_Build 2 40487595 1I TTCTCCACAG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 49 23 16 10 T 8 9 291989 CASAVA_Build 2 40516057 1D AGATTTCAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 A 10 9 291990 CASAVA_Build 2 40516671 3I CCTGCCTCAG ---/CCT CCCTAAGTGC 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 CCT 0 1 291991 CASAVA_Build 2 40516819 1D TTTTCATTTC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 8 7 291992 CASAVA_Build 2 40518651 1D ACACTGAGCA C/- TGAAGTGGAC 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 C 1 0 291993 CASAVA_Build 2 40522213 1D AAAACAGACA T/- TATAGACCAA 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 T 2 1 291994 CASAVA_Build 2 40530318 5D ATAATAATAT TAAAG/----- TAAAGACATA 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 TAAAG 2 1 291995 CASAVA_Build 2 40536209 2I ACATAATAGC --/AT CCCTAGCCTG 3070 het 3070 hom 47 20 25 2 AT 0 1 291996 CASAVA_Build 2 40540013 1I GGACAGTATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 9 10 291997 CASAVA_Build 2 40541511 4I GCCACCGCAC ----/CTGA CTGACTATAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 CTGA 1 2 291998 CASAVA_Build 2 40543657 1D ATTATCAGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 10 9 291999 CASAVA_Build 2 40545958 2D AACCTATTAC AT/-- ATATATATAG 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 AT 5 4 292000 CASAVA_Build 2 40547617 1D TGAGTTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 31 3 18 10 A 15 14 292001 CASAVA_Build 2 40550244 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 T 8 7 292002 CASAVA_Build 2 40558885 4I CACACACAAT ----/CAGA CAGAGTCCAT 3070 het 3070 ref 48 29 14 5 CAGA 1 2 292003 CASAVA_Build 2 40563863 1I TATTTATGTA -/T TTTTATATTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 4 5 292004 CASAVA_Build 2 40577719 1D AAAGTACAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1762 hom 11 4 7 0 A 10 9 292005 CASAVA_Build 2 40579834 1D AAGAAGATAC T/- TTTTTCAGTT 3070 het 3070 hom 47 22 21 5 T 6 5 292006 CASAVA_Build 2 40586749 1D TCATAGATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 14 17 T 17 16 292007 CASAVA_Build 2 40591389 5I TAGTATTTTT -----/AAGTA AAGTAAAATA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AAGTA 1 2 292008 CASAVA_Build 2 40592862 1I CTCCAACCTA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 7 8 292009 CASAVA_Build 2 40594130 1I TTTCCATTGA -/T TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 T 8 9 292010 CASAVA_Build 2 40600995 1I TTTAAATATG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 8 9 292011 CASAVA_Build 2 40605391 1I ATCTTAAGTA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 7 8 292012 CASAVA_Build 2 40605652 1D ATTGCCTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 16 16 9 T 9 8 292013 CASAVA_Build 2 40608065 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 10 9 292014 CASAVA_Build 2 40618419 1D GCCTGGTTAA T/- TTAAAAAAAA 2183 het 2183 ref 30 13 13 4 T 3 2 292015 CASAVA_Build 2 40623390 7D GTGGAGACAT ATTTTCA/------- ATTTTCACCA 2963 het 2963 ref 22 13 7 3 ATTTTCA 2 1 292016 CASAVA_Build 2 40629183 4D ATATGTGTGT TGTG/---- TGTGTTTGTG 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 TG 4 2 292017 CASAVA_Build 2 40632599 1I CAGAAATTTC -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 6 7 292018 CASAVA_Build 2 40635052 5I TTGAATCTCT -----/GAGAA GAGAAGTGGC 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 GAGAA 1 2 292019 CASAVA_Build 2 40635916 1I ATGAGGGGGG -/T TAGAATGAAC 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 1 2 292020 CASAVA_Build 2 40636864 1D TCTGTATTTA C/- AGAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 C 1 0 292021 CASAVA_Build 2 40652835 3I TTTAGTGGAT ---/AGA AGATCAAACC 3070 hom 84 het 34 0 26 8 AGA 1 2 292022 CASAVA_Build 2 40659026 3I TGTTTCTGAT ---/ACA ATGTTTCAAC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 ACA 0 1 292023 CASAVA_Build 2 40661664 1I GGCAGCAGGC -/A AAAAAAAAAA 2980 het 1795 hom 28 6 11 11 A 15 16 292024 CASAVA_Build 2 40667359 1I AGTATGATAG -/T TTTTTGTATA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 5 6 292025 CASAVA_Build 2 40667865 13I TTTCTTTCCT -------------/TTTTTTTTTTTTC TTTTTTTTGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTTTTTTTTTTTC 0 1 292026 CASAVA_Build 2 40669682 1D AAAATAATTT A/- AATTATTCAT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 3 2 292027 CASAVA_Build 2 40669937 1D CCCATGACAT G/- GGTATACTTA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 G 3 2 292028 CASAVA_Build 2 40678440 2I ATTTAGAAAC --/TA TATATATATA 753 hom 12 het 6 0 5 1 TA 6 7 292029 CASAVA_Build 2 40692930 1D TGATACTAGC T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 8 7 292030 CASAVA_Build 2 40694820 1I TGAAAGCTCC -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 7 8 292031 CASAVA_Build 2 40697206 1D AGTACTTTTT C/- CCCCCCCTCA 3070 het 3070 hom 44 19 19 7 C 8 7 292032 CASAVA_Build 2 40700362 1D TTGATGTGTT A/- TTCCATGAGA 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 A 1 0 292033 CASAVA_Build 2 40702637 1D AGCCAAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 11 10 292034 CASAVA_Build 2 40712689 1I ATTAAAATTC -/T TTCAATAGCA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 2 3 292035 CASAVA_Build 2 40714688 1I TACCTTTCCA -/T TTTTTCCAAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 5 6 292036 CASAVA_Build 2 40716503 1I TACTAGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 42 1 32 9 T 10 11 292037 CASAVA_Build 2 40718401 1D GTTCCATAGC T/- TTTTTTTTTT 2714 het 2324 hom 21 7 9 5 T 17 16 292038 CASAVA_Build 2 40720403 1D TTAGAGGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 800 hom 31 2 26 5 A 12 11 292039 CASAVA_Build 2 40726978 1D CCTACATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 11 10 292040 CASAVA_Build 2 40727490 1D ATCTGCTATT G/- GGCTGAAGTT 3070 het 3046 hom 23 7 12 4 G 3 2 292041 CASAVA_Build 2 40736000 63D TTTAAAATTG TTTTAATTATTCTATATTTTACATATATTACAAGTATTTTTATTACAGAAAATGAATCATCTT/--------------------------------------------------------------- TTTAGAATTA 3070 het 3070 ref 40 30 18 3 TTTTAATTATTCTATATTTTACATATATTACAAGTATTTTTATTACAGAAAATGAATCATCTT 1 0 292042 CASAVA_Build 2 40742515 14D TTTTCTAAAT AATAGGATTTTAAA/-------------- AATAGGATAC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AATAGGATTTTAAA 1 0 292043 CASAVA_Build 2 40758684 1I GCAGGATGTA -/G GCGGGGCCAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 1 2 292044 CASAVA_Build 2 40766644 1D CATCAAATGA C/- CAACTGCCTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 2 1 292045 CASAVA_Build 2 40784335 1I CTTTCATCTA -/T TTTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 T 5 6 292046 CASAVA_Build 2 40788983 4D TTTGATGGGG TTGT/---- TTGTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 21 8 4 TTGT 2 1 292047 CASAVA_Build 2 40790649 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 11 10 292048 CASAVA_Build 2 40796854 1I ATGGCAGAAG -/C CAGAGGCCAT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 C 1 2 292049 CASAVA_Build 2 40797097 2D AAAGAAGACT GA/-- GAGAGGAGCA 3070 het 3070 ref 39 16 17 7 GA 3 2 292050 CASAVA_Build 2 40804218 1D CCAGGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 21 0 11 11 T 17 16 292051 CASAVA_Build 2 40828533 1D TGAAATAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 27 0 19 8 T 10 9 292052 CASAVA_Build 2 40834971 1I GGGAAATGTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 796 hom 48 4 41 3 T 8 9 292053 CASAVA_Build 2 40835275 1I TTAAAAATCG -/T TAAGTTTACT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 1 2 292054 CASAVA_Build 2 40837022 4I TTATTTCCTT ----/CCTC CCTCCCTCCC 3070 het 3018 hom 29 11 10 8 CCTC 3 4 292055 CASAVA_Build 2 40852924 1I CTGGACATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1361 hom 42 4 31 7 A 11 12 292056 CASAVA_Build 2 40865600 1D TCCCAAACTG C/- CCCCCCCCCC 1885 het 691 hom 22 2 7 15 C 11 10 292057 CASAVA_Build 2 40872209 1I TTGCAGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 A 13 14 292058 CASAVA_Build 2 40872797 1D GTACTTAATG T/- TTTTCCAAGA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 5 4 292059 CASAVA_Build 2 40876266 2D TAGGTTTCAA AT/-- ATATATATAT 2738 hom 30 het 15 0 11 4 AT 8 7 292060 CASAVA_Build 2 40877482 7D CAACTGTGGC TTTTCTT/------- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 28 15 13 2 TTTTCTT 2 1 292061 CASAVA_Build 2 40881742 3D ACAAATTTTC TAA/--- TGATTTTTAT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 TAA 1 0 292062 CASAVA_Build 2 40888342 3D AATACTATAG TTA/--- TTTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 45 24 15 8 TTA 1 0 292063 CASAVA_Build 2 40898370 10D AGGGCACATA AGGGACCACT/---------- TGGGGGCATG 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 AGGGACCACT 1 0 292064 CASAVA_Build 2 40899905 1D GAATTTAGTA C/- TATAAACGTG 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 C 1 0 292065 CASAVA_Build 2 40908617 1D ATTCTGTTCA T/- TTTTGATTGT 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 T 5 4 292066 CASAVA_Build 2 40910307 3I TAGTAAAGTG ---/AGA AGAATTAAGC 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 AGA 1 2 292067 CASAVA_Build 2 40912752 4D ACTTGCACTT AGAC/---- AGAGACTATA 3070 het 3070 hom 40 18 21 2 AGAC 1 0 292068 CASAVA_Build 2 40917340 5I GGCTGAGGTG -----/TAATC GGCAGATCAC 3070 het 2466 hom 15 6 8 1 TAATC 0 1 292069 CASAVA_Build 2 40928214 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 64 het 25 0 22 3 AT 5 4 292070 CASAVA_Build 2 40947609 1I ATTTTGCTAG -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 6 7 292071 CASAVA_Build 2 40959209 1D AATATTATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 14 9 7 T 10 9 292072 CASAVA_Build 2 40961141 1D TTATTATTAC T/- TTTTTTTTTT 1494 het 1203 hom 19 6 5 8 T 15 14 292073 CASAVA_Build 2 40967313 4I GGATTCGGTG ----/GAGT GAGTGTCTTG 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 GAGT 1 2 292074 CASAVA_Build 2 40978211 1D AAACAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 11 10 292075 CASAVA_Build 2 40978351 2D GGACTCACGC AT/-- ATATACTACT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 AT 3 2 292076 CASAVA_Build 2 40979570 1I ACAGTTTTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 9 10 292077 CASAVA_Build 2 40996146 1I TCACCTTTGA -/G CCCCTAGCAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 0 1 292078 CASAVA_Build 2 41010699 5I TGTTCTTTCC -----/TAAGT TATCGAATTG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 TAAGT 0 1 292079 CASAVA_Build 2 41011872 1D GTCGATTTTT A/- AAAAATAGAC 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 A 6 5 292080 CASAVA_Build 2 41014268 4D TAACACTACC TTTG/---- TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 7 TTTG 1 0 292081 CASAVA_Build 2 41015959 4D TAGCACACTG GAAA/---- GAGAGATGTG 3070 het 3070 ref 48 24 20 7 GAAA 1 0 292082 CASAVA_Build 2 41016847 1I ATTTGGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 11 12 292083 CASAVA_Build 2 41021742 1I CATCACTTTT -/A AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 6 7 292084 CASAVA_Build 2 41029085 1D GTGCAACATA T/- TTTTACCTAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 5 4 292085 CASAVA_Build 2 41029240 6D CTGTCCAATT TTAAGA/------ TTTTCTCTTT 3070 het 3070 hom 35 13 21 5 TTAAGA 1 0 292086 CASAVA_Build 2 41036958 1D ATAGCTACAT A/- AAAAAATCTA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 7 6 292087 CASAVA_Build 2 41041591 1D AAACACTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 14 9 T 11 10 292088 CASAVA_Build 2 41045724 4D TCTGATTCAT AAAC/---- AAATTATATT 3070 het 3070 hom 42 13 26 3 AAAC 1 0 292089 CASAVA_Build 2 41045980 1I ACAAAAATCC -/T AACACATGGC 3070 hom 138 het 52 0 45 7 T 0 1 292090 CASAVA_Build 2 41047251 1I AAAAATTACT -/G GGGGGCTCTT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 G 5 6 292091 CASAVA_Build 2 41048033 1I TAGCATCAGG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 7 8 292092 CASAVA_Build 2 41048917 4D AATTAAAAAA AAAT/---- ATATATATAT 1451 hom 10 het 6 0 4 3 AAAT 1 0 292093 CASAVA_Build 2 41060997 3D ATGCTTTTGG TAT/--- TATATATGGT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 TAT 2 1 292094 CASAVA_Build 2 41061515 4D GGAAAATGAG ATTA/---- ATTAATTTCA 3070 het 3070 ref 50 28 19 5 ATTA 2 1 292095 CASAVA_Build 2 41062328 3I GAAAATTCTA ---/CTT CTGCATTGAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 CTT 0 1 292096 CASAVA_Build 2 41064169 1I GACCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 10 11 292097 CASAVA_Build 2 41073270 1I CCATGATGCA -/T TATAACTAGA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 T 1 2 292098 CASAVA_Build 2 41083249 6D ACTAAACTTT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 110 het 43 0 38 10 AC 11 8 292099 CASAVA_Build 2 41083744 1D TATTTTACTG A/- AAAAAAAAAA 1982 het 1982 ref 35 16 7 12 A 17 16 292100 CASAVA_Build 2 41086736 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 27 1 17 9 A 13 12 292101 CASAVA_Build 2 41086812 1D AAGGGGAATG A/- AAAAAAGCAC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 7 6 292102 CASAVA_Build 2 41087067 4D TGCTGCTTTA AAAT/---- AAATAAAATA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AAAT 2 1 292103 CASAVA_Build 2 41093391 2D TGTGTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 10 11 9 TA 9 8 292104 CASAVA_Build 2 41093611 4D ATACTGCTTC CAAT/---- CAAATAGAAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 CAAT 1 0 292105 CASAVA_Build 2 41115433 2I ATTGTCTATC --/TT TTTATTGTTC 3070 het 3070 hom 45 13 25 7 T 3 5 292106 CASAVA_Build 2 41117105 1D GTGAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 533 hom 26 3 11 12 T 12 11 292107 CASAVA_Build 2 41119631 1I CTTGAGGTCG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 9 10 292108 CASAVA_Build 2 41125208 4I GAGGAGAAAT ----/CAAA CACCACATGT 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 CAAA 0 1 292109 CASAVA_Build 2 41125872 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 1749 het 613 hom 7 2 5 0 T 7 8 292110 CASAVA_Build 2 41141171 1D CTGCCCTTCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 10 11 10 A 10 9 292111 CASAVA_Build 2 41151599 2I ATATATATGC --/AT ATATATGTGT 2562 het 2562 ref 25 14 7 4 AT 3 4 292112 CASAVA_Build 2 41160135 1I TTAACTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2581 hom 25 8 14 3 T 9 10 292113 CASAVA_Build 2 41181820 2I GATAGCCCAT --/AG AGTTACCTTG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 AG 1 2 292114 CASAVA_Build 2 41183451 1I AATAAAAAAT -/A TTATTGACTA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 A 0 1 292115 CASAVA_Build 2 41188031 4I TTGAGCAAAA ----/TAAT TAATAAAGTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 TAAT 1 2 292116 CASAVA_Build 2 41188564 5D GCAAATGATC TAATA/----- TGAGTATACA 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 TAATA 1 0 292117 CASAVA_Build 2 41191408 5D TTAGCATAAA TAAAG/----- TAAAATAGCT 3070 het 3070 hom 36 13 22 3 TAAAG 1 0 292118 CASAVA_Build 2 41193849 1I GAAGAGACGG -/A AAAAATGTAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 5 6 292119 CASAVA_Build 2 41193953 1I TTGTATATGA -/G GAAAATATGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 2 292120 CASAVA_Build 2 41194661 2D GAATTCAGCG AT/-- ATTTCTCCCA 3070 het 223 hom 18 1 15 2 AT 2 1 292121 CASAVA_Build 2 41194828 1I CATGCTCTAC -/A AAAAAATGTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 6 7 292122 CASAVA_Build 2 41195295 1D TCAAATAGTC A/- AAAATGCATG 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 5 4 292123 CASAVA_Build 2 41195933 1D ATAAAACATG T/- AAAGAAGTAA 3070 hom 129 het 48 0 44 5 T 1 0 292124 CASAVA_Build 2 41198299 1I TCAAATAGCT -/A AAAGGGCAAA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 3 4 292125 CASAVA_Build 2 41202903 1I ATCTCTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 27 2 18 7 A 12 13 292126 CASAVA_Build 2 41209613 1I TTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 769 hom 39 2 25 12 A 12 13 292127 CASAVA_Build 2 41210625 1I TTGTTTTTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 9 10 292128 CASAVA_Build 2 41217441 2I ATCTCTACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 26 0 22 4 A 13 15 292129 CASAVA_Build 2 41221025 1I AATATTTCCA -/T CTGGCTTGCC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 0 1 292130 CASAVA_Build 2 41221317 1I AAAAGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 11 12 292131 CASAVA_Build 2 41230002 3I CTATACTGTC ---/TTA TTAATACAGA 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 TTA 1 2 292132 CASAVA_Build 2 41230799 1D AATAAGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 32 0 15 17 T 11 10 292133 CASAVA_Build 2 41231381 1D AAAGAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 12 11 292134 CASAVA_Build 2 41241068 1I GTGCCTGAAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 56 23 25 8 A 7 8 292135 CASAVA_Build 2 41241794 4I CTGTACATGC ----/TTTA TTTATGCTGA 3070 het 3070 hom 36 10 23 3 TTTA 1 2 292136 CASAVA_Build 2 41244796 1D GGTTTTTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 9 8 292137 CASAVA_Build 2 41247418 1I GTCAAAACTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 8 9 292138 CASAVA_Build 2 41262749 1I GATTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 12 13 292139 CASAVA_Build 2 41267764 9I AGCATAGAGT ---------/AACTTTTCC ATCCAGAAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AACTTTTCC 0 1 292140 CASAVA_Build 2 41269764 2D TAACATATGA AT/-- ATAGCTTCTG 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 AT 2 1 292141 CASAVA_Build 2 41278152 2I TGTATATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2846 hom 40 11 13 16 TG 6 7 292142 CASAVA_Build 2 41279811 1I TGTCTCTCGG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 7 8 292143 CASAVA_Build 2 41282475 1D CAAACAAGGA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 111 het 43 0 38 6 T 8 7 292144 CASAVA_Build 2 41285564 6D TGATTTGAAA GATATT/------ GAAAGCGGAT 3070 het 3070 hom 55 27 28 1 GATATT 1 0 292145 CASAVA_Build 2 41287757 1I CAACTTGATG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 7 8 292146 CASAVA_Build 2 41290338 1D TATTTTCACA T/- TTTTAACAAT 3070 hom 80 het 32 0 30 2 T 5 4 292147 CASAVA_Build 2 41301169 1D TATTTCAATT A/- AAAAAACCAT 3070 hom 94 het 35 0 30 6 A 7 6 292148 CASAVA_Build 2 41302763 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3012 het 111 hom 13 1 9 3 A 13 12 292149 CASAVA_Build 2 41307476 1D AATAATTATC T/- GCTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 1 0 292150 CASAVA_Build 2 41309241 1I CACATGAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 10 292151 CASAVA_Build 2 41309389 1I AATAGAAAAA -/T TAGCCAGGCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 2 292152 CASAVA_Build 2 41309869 1I TCAGAGACAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 8 9 292153 CASAVA_Build 2 41310192 1I ACATGAATTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 A 0 1 292154 CASAVA_Build 2 41326284 1D TTCTATGTTT A/- CTCATATATC 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 A 1 0 292155 CASAVA_Build 2 41328013 1D ATACCAAGGA G/- TTATTTCATT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 G 1 0 292156 CASAVA_Build 2 41329478 1D AATCACCTTT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 A 8 7 292157 CASAVA_Build 2 41335614 5D CACACACACA CACAC/----- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 CACAC 1 0 292158 CASAVA_Build 2 41335793 5I GGGACCTAAT -----/TAAAC TAAAGAGCTT 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 TAAAC 0 1 292159 CASAVA_Build 2 41339383 1D GGATTCAGAC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 107 het 41 0 36 5 A 8 7 292160 CASAVA_Build 2 41339956 1I AATTTAATGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 8 9 292161 CASAVA_Build 2 41347124 1I TATGACTGCA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 47 15 25 7 T 6 7 292162 CASAVA_Build 2 41352758 1I TTTATCTTGA -/T TTTATAGCAA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 3 4 292163 CASAVA_Build 2 41363194 1D TAATTTGGAT A/- AAAAAAGACT 2351 het 483 hom 7 1 5 1 A 7 6 292164 CASAVA_Build 2 41363687 1D TTTGCTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 11 10 292165 CASAVA_Build 2 41369150 1I ATTCCACCCC -/T GGCCCCTGCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 1 292166 CASAVA_Build 2 41395861 1D AACATTTGTA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 45 21 21 4 T 8 7 292167 CASAVA_Build 2 41397706 1D AATCATAAGG A/- AAAAAAAAAA 1903 het 1903 ref 48 35 5 8 A 12 11 292168 CASAVA_Build 2 41408354 4D CATACATTCT CAGA/---- CAAATTTATC 3070 het 3070 ref 46 24 20 5 CAGA 1 0 292169 CASAVA_Build 2 41415565 1I AGTCATAAAT -/G TTTTTTAGAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 G 0 1 292170 CASAVA_Build 2 41422524 2D TGTCATTAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 11 17 11 A 14 12 292171 CASAVA_Build 2 41422608 1I GTATAAGGTG -/T TAAGTTAGGG 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 1 2 292172 CASAVA_Build 2 41423306 6I CCCAAACTTT ------/AAAGTA AAATTTAAAA 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 AAAGTA 0 1 292173 CASAVA_Build 2 41434514 1D AAAGAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 24 1 A 11 10 292174 CASAVA_Build 2 41466182 1I CTGACAATAG -/A TAACCATCTT 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 A 0 1 292175 CASAVA_Build 2 41466302 4I GTGACATTAA ----/CAGC CTTGTTGCTC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 CAGC 0 1 292176 CASAVA_Build 2 41468528 3I AAAAAAATCT ---/TTA TTGACTTATG 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 TTA 0 1 292177 CASAVA_Build 2 41482479 1I CAAACCTGAG -/A ACATTGTGCT 3070 het 3070 ref 50 24 21 6 A 1 2 292178 CASAVA_Build 2 41484279 1I TTCCTTTCTT -/A AATGGGTGAG 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 2 3 292179 CASAVA_Build 2 41489298 2I ATCAGCCAAC --/TT TAAGAGAAGA 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 T 1 3 292180 CASAVA_Build 2 41491578 1D AGACAGAGGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 53 18 31 4 A 10 9 292181 CASAVA_Build 2 41500395 6I CATCTCACAT ------/TGTGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 24 19 9 TG 6 9 292182 CASAVA_Build 2 41505074 1I GCTGCTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 G 0 1 292183 CASAVA_Build 2 41506233 1D CATTCATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 A 12 11 292184 CASAVA_Build 2 41508953 1I AAGCCTTCCT -/A AACTTCAGGG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 2 3 292185 CASAVA_Build 2 41510804 4D TTGATAGATG GATA/---- GATAGATAGA 3070 het 3070 ref 39 17 18 6 GATA 4 3 292186 CASAVA_Build 2 41522048 3I TGCTAATAGA ---/TGT TGTTATTCAG 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 TGT 1 2 292187 CASAVA_Build 2 41535457 1D44M3D AAGAAAAAAA GTACCCTTAATGAAATTAATCACACATCCTTAATGCTCAGGACTGATT/-TACCCTTAATGAAATTAATCACACATCCTTAATGCTCAGGACTG--- ATTTCTTACA 3070 het 3070 ref 41 29 25 6 N/A 0 0 292188 CASAVA_Build 2 41551227 4I ACTAAGTCTC ----/TTTG TTTGTTTATA 3065 het 3065 ref 30 14 8 8 TTTG 1 2 292189 CASAVA_Build 2 41557289 1D TTAGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3068 het 3068 ref 24 12 8 5 A 11 10 292190 CASAVA_Build 2 41569774 1D TTGGTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2823 hom 27 9 13 5 T 12 11 292191 CASAVA_Build 2 41576673 1I TATAGCATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 13 18 14 A 16 17 292192 CASAVA_Build 2 41579724 1D AAGGAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 14 13 T 15 14 292193 CASAVA_Build 2 41580868 14D CTCTCTCCTT CCATAAGCCCAGGC/-------------- TAGGAAAGGC 3070 het 3070 ref 29 17 10 5 CCATAAGCCCAGGC 1 0 292194 CASAVA_Build 2 41581039 1I CTATCAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 11 12 292195 CASAVA_Build 2 41617750 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1296 het 1296 ref 29 10 6 13 T 15 16 292196 CASAVA_Build 2 41641978 2I GAGAAAGAAC --/TA TATCAGATTA 3070 het 3070 ref 59 31 22 6 TA 1 2 292197 CASAVA_Build 2 41647650 1I TCCTTTGCTG -/T TATTTAACAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 1 2 292198 CASAVA_Build 2 41653760 6D TTGAAAAGTT ACATTA/------ ACCGTCTACA 3070 het 3070 ref 64 33 27 5 ACATTA 1 0 292199 CASAVA_Build 2 41657092 1D AAATTTACTG A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 50 31 11 8 A 8 7 292200 CASAVA_Build 2 41659111 11D GAGAAGCAGT TTCTGGACATA/----------- TTTTAATTAC 3070 het 3070 ref 32 21 12 0 TTCTGGACATA 1 0 292201 CASAVA_Build 2 41674628 1D TGTTTCTTTT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 29 9 19 1 A 8 7 292202 CASAVA_Build 2 41674906 5I ATCATTTTTA -----/TTTTG TTTTAATTAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 TTTTG 0 1 292203 CASAVA_Build 2 41688174 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 14 13 T 13 12 292204 CASAVA_Build 2 41694615 8D GAAGACAGAC AATGAATG/-------- AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 44 21 15 9 AATG 5 3 292205 CASAVA_Build 2 41695310 1I GAATTTTCCA -/T TAATCAACAT 3070 het 3008 hom 20 9 7 4 T 1 2 292206 CASAVA_Build 2 41696797 1D TCTATTATAT A/- AAAATAGAAA 3070 het 3070 ref 32 20 10 3 A 5 4 292207 CASAVA_Build 2 41697732 2D32M3I AAAAAAATGC ATATGTCATTTCTTAACCTTCAAAGACCTGTCTA---/--ATGTCATTTCTTAACCTTCAAAGACCTGTCTAGTT GTTCTTCCAC 3070 het 3070 ref 28 25 7 7 N/A 0 0 292208 CASAVA_Build 2 41704448 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 10 9 292209 CASAVA_Build 2 41706627 2I CTTCCCCCCC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 AG 8 9 292210 CASAVA_Build 2 41715208 1I CATCCCTTCC -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 7 8 292211 CASAVA_Build 2 41730012 3D TCCTCCTTCC TAT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 TAT 1 0 292212 CASAVA_Build 2 41736487 1D CTGCCAGTTC A/- AAAATTCTAT 3070 het 3070 hom 38 11 18 10 A 5 4 292213 CASAVA_Build 2 41756582 5I TATGGTTAAC -----/AATAT AATATTGTGT 3070 het 3070 ref 56 36 18 2 AATAT 1 2 292214 CASAVA_Build 2 41759106 4D TTTGTATGTG TATC/---- TATCTCCCTA 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 TATC 2 1 292215 CASAVA_Build 2 41761799 1I GAGTTATTCT -/C CTACGTTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 C 1 2 292216 CASAVA_Build 2 41769789 1D TTGTATAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 12 11 292217 CASAVA_Build 2 41770807 6I34M2D TATCATAGTA ------TTATTTACACATGCATTTTTAAAATCTGAAAGACTG/TGTAACTTATTTACACATGCATTTTTAAAATCTGAAAGAC-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 22 20 3 N/A 0 0 292218 CASAVA_Build 2 41771747 1I TTCTGGGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 8 9 292219 CASAVA_Build 2 41777089 3I TGTAAATTCC ---/ATG ATGACAGGGC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 ATG 1 2 292220 CASAVA_Build 2 41786876 4I TGATTAAGAG ----/AGAT AGATCTGTTT 3070 het 2667 hom 30 8 21 1 AGAT 1 2 292221 CASAVA_Build 2 41795148 12D CGCCTCAAAA AAATAAATAAAT/------------ AAATAAATAA 2068 het 803 hom 9 2 6 1 AAAT 6 3 292222 CASAVA_Build 2 41795308 1I GCAACCTTTT -/C TTTCCTATCA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 C 0 1 292223 CASAVA_Build 2 41797880 1I AAAAAGTAGT -/A AAAAAATAGG 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 A 6 7 292224 CASAVA_Build 2 41800829 1I TATCTGCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2716 hom 44 10 14 20 A 15 16 292225 CASAVA_Build 2 41811969 1I CTGGAGTAGT -/G GCCCTCATAG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 G 1 2 292226 CASAVA_Build 2 41814578 1D CACACTCACT A/- AAAAAAAAAA 1574 het 1574 ref 29 21 4 5 A 15 14 292227 CASAVA_Build 2 41816471 1D TTTCTCAACA T/- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 7 6 292228 CASAVA_Build 2 41818362 2D TCTGAATCAT AA/-- ATCAGCATTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 A 3 1 292229 CASAVA_Build 2 41818416 1D TTGGACAGAG A/- AAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 46 25 10 13 A 7 6 292230 CASAVA_Build 2 41818748 1D GATCACTTGA G/- GCCAAGCATC 3070 het 3070 ref 53 35 14 4 G 2 1 292231 CASAVA_Build 2 41820115 9D TCCTGAGACT TTGCTGAAG/--------- TTGCTTATCA 1844 het 890 hom 6 3 4 0 TTGCTGAAG 1 0 292232 CASAVA_Build 2 41823110 1I ACTCTGGCAG -/C CCCTCTGAAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 C 3 4 292233 CASAVA_Build 2 41823945 2I ATTGCATATC --/TG TGCAATATTG 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 TG 1 2 292234 CASAVA_Build 2 41824053 1D GCTGATATGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 9 8 292235 CASAVA_Build 2 41824771 1I TTTTCCCCAT -/G TTGTTCTGGT 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 G 0 1 292236 CASAVA_Build 2 41826363 1D AGTGTGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 11 10 292237 CASAVA_Build 2 41831923 1I AAGGAATGGC -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 6 7 292238 CASAVA_Build 2 41832326 1D GATTAGTCTT A/- ACTGCTTTTG 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 A 2 1 292239 CASAVA_Build 2 41842431 1I TACCTGCTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 8 9 292240 CASAVA_Build 2 41843185 9D CAAATATCGC ATGCACGGT/--------- ATGCACGGTT 3070 het 3070 ref 48 27 21 5 ATGCACGGT 2 1 292241 CASAVA_Build 2 41843726 1I GTATACTCTC -/T GGAAATCCAA 3070 het 3070 hom 51 22 20 9 T 0 1 292242 CASAVA_Build 2 41847469 1I GGGCAGATCA -/C CTGAGGTCAG 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 C 1 2 292243 CASAVA_Build 2 41848072 5D TACTTAGATG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 53 25 16 12 GTTTT 5 4 292244 CASAVA_Build 2 41897010 1I AGATATAGAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 8 9 292245 CASAVA_Build 2 41924643 1D TATGCATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 8 11 7 T 10 9 292246 CASAVA_Build 2 41942063 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 23 0 20 4 A 15 14 292247 CASAVA_Build 2 41942530 6D AATTTGTCAA TATAAG/------ TATATTTCAT 3070 het 3070 ref 34 22 9 4 TATAAG 1 0 292248 CASAVA_Build 2 41954365 4I GATAATCTTT ----/CTTC CTTATTTATT 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 CTTC 0 1 292249 CASAVA_Build 2 41957604 1I TCTCTCACCA -/C CCCCAGGCTC 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 C 4 5 292250 CASAVA_Build 2 41958440 1I GAAGGCCGGG -/C CAGCCGATCC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 1 2 292251 CASAVA_Build 2 41958902 1D TATCCCTGGC A/- AGAAGGGGAT 3070 hom 68 het 27 0 21 6 A 2 1 292252 CASAVA_Build 2 41959680 1I AGGAAGCTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 8 9 292253 CASAVA_Build 2 41963198 4I ATTTACAAAT ----/AAAG AAACCAAAGC 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 AAAG 0 1 292254 CASAVA_Build 2 41966832 1D CATCACTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2416 hom 40 10 16 14 T 15 14 292255 CASAVA_Build 2 41972151 1I ACAGTAGGAG -/A AAAAAAACAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 8 292256 CASAVA_Build 2 41987687 8D TCAACACAAC ACAACACA/-------- ACAACACAAC 3070 het 3070 ref 35 14 11 11 ACAACACA 2 1 292257 CASAVA_Build 2 41988851 1I ACTCTCTTTA -/C CCTTCTGCCT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 C 2 3 292258 CASAVA_Build 2 41991703 13D TAAACAACAT AGAACTAGGTAGA/------------- AGAAAGTTCC 3070 het 3070 ref 36 19 17 8 AGAACTAGGTAGA 1 0 292259 CASAVA_Build 2 41992761 4I GCAATGCCAC ----/ATTT ATCATATACT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 ATTT 0 1 292260 CASAVA_Build 2 41994412 9I ATAAAAGGTA ---------/GTTAATTGG TGCCCCATGA 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 GTTAATTGG 0 1 292261 CASAVA_Build 2 41996611 1D GGTGTGGGTA G/- GGGGGAAAAG 3070 het 3070 hom 31 12 14 7 G 6 5 292262 CASAVA_Build 2 41998816 7I GTTCGAAAAA -------/TATGAAG TATGGCTATT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 TATGAAG 0 1 292263 CASAVA_Build 2 42000546 2I CATTTCACAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 10 12 292264 CASAVA_Build 2 42002202 1D TGAAAATGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 10 9 292265 CASAVA_Build 2 42015977 1D GTACACACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 11 10 292266 CASAVA_Build 2 42056933 1I GTGGGAGTGT -/A AATCAGTTTA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 A 2 3 292267 CASAVA_Build 2 42067966 3D TAAAATAGGT ATA/--- ATAATTGTAC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 ATA 2 1 292268 CASAVA_Build 2 42132128 1D CACGCTTCCT G/- GGGGGGGTTA 1441 het 1441 ref 20 12 4 4 G 8 7 292269 CASAVA_Build 2 42133461 1D TCACATCTTA G/- GCTCCTACAT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 G 2 1 292270 CASAVA_Build 2 42153726 2D27M2I TCCTCCCTCC TTCTCCCTGCCTCTCTTTCTCTCACACAC--/--CTCTCTTTCTCTCTTTCTCTCACACACAA ACACATCTAG 1656 het 1656 ref 43 29 7 12 N/A 0 0 292271 CASAVA_Build 2 42174396 1I CTCCATCTCG -/A AAAAAAAAAA 2439 het 886 hom 18 2 7 9 A 13 14 292272 CASAVA_Build 2 42190609 25I TCATGGACAA -------------------------/AAGTCTAACAAAAGTTAGACTTAAG AAGTCTAACA 3041 het 3041 ref 22 11 7 4 AAGTCTAACAAAAGTTAGACTTAAG 0 1 292273 CASAVA_Build 2 42191225 1D TCTTCTCCTA T/- TTCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 41 25 12 5 T 3 2 292274 CASAVA_Build 2 42191925 1I ATAAGCCTTG -/A AAGTGGGGTA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 2 3 292275 CASAVA_Build 2 42192076 1D AGTCCTGCAG A/- AAAAAATGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 7 6 292276 CASAVA_Build 2 42192523 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1426 hom 12 het 8 0 5 3 TA 9 8 292277 CASAVA_Build 2 42193505 3D8M1D TGAAAAATAC AAGAAGGTGTTA/---AAGGTGTT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 N/A 0 0 292278 CASAVA_Build 2 42200291 1I ATATTCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 15 0 10 5 T 11 12 292279 CASAVA_Build 2 42202417 1I ACAGAATGAG -/A AAAAAAAAAA 2391 het 2391 ref 18 7 7 4 A 11 12 292280 CASAVA_Build 2 42215790 10D GGATGATCTG TGTTTTGTTT/---------- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 27 13 13 5 TGTTT 4 2 292281 CASAVA_Build 2 42219569 1I TGTCATTTTA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 7 8 292282 CASAVA_Build 2 42224405 2D ATACTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2619 het 85 hom 31 3 11 17 T 20 18 292283 CASAVA_Build 2 42227730 1I CTCAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 1076 het 1076 ref 36 15 6 15 A 17 18 292284 CASAVA_Build 2 42246648 1I TTAACTCTGA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 7 8 292285 CASAVA_Build 2 42257901 1I TTCATACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 26 1 20 5 T 11 12 292286 CASAVA_Build 2 42262803 1I AAAATTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2294 het 779 hom 21 4 9 8 T 12 13 292287 CASAVA_Build 2 42279390 1D AATGGGAGTT G/- GAGTTCACTT 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 G 2 1 292288 CASAVA_Build 2 42324045 31D AGAGACTGAA TTGTTCTTATCATTCCTTAAGCATCTCAGAG/------------------------------- TTGGACACAT 3070 het 3070 ref 24 18 8 5 TTGTTCTTATCATTCCTTAAGCATCTCAGAG 1 0 292289 CASAVA_Build 2 42329938 5I TTATGTGTGA -----/TTTTT TTTTTTAGCC 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 6 11 292290 CASAVA_Build 2 42335262 1D CCCTCTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 23 1 14 9 T 15 14 292291 CASAVA_Build 2 42345743 1I TACATTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 10 11 292292 CASAVA_Build 2 42364089 3D AATGTGAGAA CTC/--- CTTTTAAATG 3070 het 3070 ref 43 27 12 5 CTC 1 0 292293 CASAVA_Build 2 42382202 1I AACTTTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 10 11 292294 CASAVA_Build 2 42436260 8D GTTACCTATA ATCTCATT/-------- ATCTCATCCC 3070 het 3070 ref 21 13 8 2 ATCTCATT 1 0 292295 CASAVA_Build 2 42441363 4I GGCAGATGAC ----/AAAG AAACGACAAG 3070 hom 80 het 30 0 25 5 AAAG 0 1 292296 CASAVA_Build 2 42513579 1D CTTTTATGAT A/- AAAAAAAAAA 2756 het 898 hom 36 7 14 15 A 14 13 292297 CASAVA_Build 2 42519896 2D TATATTATTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 TA 7 6 292298 CASAVA_Build 2 42525543 1D CCGTCTCCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 343 hom 25 1 17 8 A 10 9 292299 CASAVA_Build 2 42526378 1D ATAGGATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 33 1 25 7 T 11 10 292300 CASAVA_Build 2 42534738 1D CTACTATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 27 0 14 13 A 17 16 292301 CASAVA_Build 2 42539447 1I CTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 764 hom 36 2 27 7 A 10 11 292302 CASAVA_Build 2 42540626 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 19 1 14 4 A 12 13 292303 CASAVA_Build 2 42543971 16D3M4D TTGCCTGCTG TAGTGAGTGTTATTGTTTCCTGA/----------------TTC---- TGAAGTGAGT 3070 hom 114 het 36 0 38 8 N/A 0 0 292304 CASAVA_Build 2 42558538 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTGAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 1 0 292305 CASAVA_Build 2 42570341 10D CATTGCACAG TAAGGGACAT/---------- TTGAGTGGCT 3070 het 3070 ref 50 31 15 8 TAAGGGACAT 1 0 292306 CASAVA_Build 2 42573352 1I13M1I GGCCGCGCCT -GGGCCTCGCTGGG-/GGGGCCTCGCTGGGC CGCGCACCCC 3070 hom 38 het 14 0 11 4 N/A 0 0 292307 CASAVA_Build 2 42580417 1D AGGCAACAGA G/- GGAAAAAAAA 3070 het 964 hom 21 3 16 3 G 3 2 292308 CASAVA_Build 2 42586415 2I AAATTGATAA --/TT TTTTTTTTTT 2030 het 350 hom 23 2 12 9 T 16 18 292309 CASAVA_Build 2 42605531 1I GGCCTGAAGG -/C CATCCTGGCG 3070 hom 63 het 26 0 17 9 C 1 2 292310 CASAVA_Build 2 42642348 1I AACATGTTGA -/G CTGTTTCAAG 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 G 0 1 292311 CASAVA_Build 2 42661748 2D ATTGTGTTTT TC/-- TGTTTCTGTA 3070 het 3070 hom 51 24 20 9 TC 1 0 292312 CASAVA_Build 2 42669452 2D TGTATTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 10 18 6 AT 6 5 292313 CASAVA_Build 2 42671761 1D ACCTAGATGG T/- ATAGCCTATT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 T 1 0 292314 CASAVA_Build 2 42673823 3D ATAGAATTAA AAC/--- AACAATAAAA 1736 het 1736 ref 20 14 4 3 AAC 2 1 292315 CASAVA_Build 2 42673989 2D AGCGAGACTC TG/-- TGTCAAAACA 2647 het 1910 hom 16 6 9 1 TG 2 1 292316 CASAVA_Build 2 42674596 7D TAGGATTAAG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 2030 hom 38 12 19 7 T 21 14 292317 CASAVA_Build 2 42680685 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 1823 het 1614 hom 8 4 4 0 A 8 9 292318 CASAVA_Build 2 42697589 1I GTGCTTTTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 8 9 292319 CASAVA_Build 2 42698429 1I TCTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 11 12 292320 CASAVA_Build 2 42716417 1I AATTTTTCTG -/T TTTTTTTTTC 1667 het 1667 ref 24 10 6 8 T 9 10 292321 CASAVA_Build 2 42719350 1D GTGATGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1447 hom 24 4 14 6 T 15 14 292322 CASAVA_Build 2 42743637 1D CCTCCCAGAG T/- TGCTGGGATT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 2 1 292323 CASAVA_Build 2 42746040 4D CTCTCAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 29 14 12 7 AAAG 3 2 292324 CASAVA_Build 2 42761560 1I ACCATGCCTG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 39 11 21 7 T 7 8 292325 CASAVA_Build 2 42767166 1D TCTGCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1572 hom 25 4 12 9 A 12 11 292326 CASAVA_Build 2 42770483 2D TGAACTTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 A 14 12 292327 CASAVA_Build 2 42773010 4D CTGAATTCCT TCTG/---- TCTGTCATCT 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 TCTG 2 1 292328 CASAVA_Build 2 42773726 6D GAAACAGTGT CTCTCC/------ CTCTCCCTCT 2249 het 2249 ref 38 16 9 17 CTCTCC 3 2 292329 CASAVA_Build 2 42776393 1D GATAGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 2416 het 2416 ref 23 12 7 4 T 13 12 292330 CASAVA_Build 2 42789924 1I GCCAACCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 10 11 292331 CASAVA_Build 2 42794004 2I AAGTTAATGA --/TT GTATAAGCTT 3070 het 3070 ref 39 23 10 6 T 0 2 292332 CASAVA_Build 2 42794268 1D TTAAGTATCC A/- AAAAATATTC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 6 5 292333 CASAVA_Build 2 42820090 1I CTTTATTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 988 hom 24 4 16 4 A 15 16 292334 CASAVA_Build 2 42856506 1D TGTGTTATCC T/- TTTTTTTTTT 2728 het 166 hom 25 3 12 10 T 19 18 292335 CASAVA_Build 2 42859975 1I GTTCATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 T 11 12 292336 CASAVA_Build 2 42875588 4I GAAGTCTAGG ----/TTCT TTCTGGTCCT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 TTCT 1 2 292337 CASAVA_Build 2 42911687 1I GCCACTCAGC -/A AAAAAAAAAA 2957 het 2957 ref 37 18 13 6 A 10 11 292338 CASAVA_Build 2 42913421 1I CTAGATACAC -/T TTGAATTTAC 3070 het 3070 hom 61 27 28 6 T 2 3 292339 CASAVA_Build 2 42914394 5D TTTGGGAGGC TGAGG/----- TGGGCGGATC 3070 het 1685 hom 18 5 8 5 TGAGG 1 0 292340 CASAVA_Build 2 42918189 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2575 hom 23 8 13 2 T 11 12 292341 CASAVA_Build 2 42923018 28D GATTCATAAA ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATCT 3070 het 354 hom 12 1 10 2 AT 18 4 292342 CASAVA_Build 2 42940230 4D TTCATTTCGC CTGT/---- CTCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 13 13 6 CTGT 1 0 292343 CASAVA_Build 2 42941298 1I CTTAAAAGGT -/G GGACATTCAG 3070 hom 174 het 61 0 58 3 G 2 3 292344 CASAVA_Build 2 42949876 1I ATAAATCTCA -/T CACCAACTGA 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 T 0 1 292345 CASAVA_Build 2 42953654 1I CATTACAATG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 38 0 28 10 A 8 9 292346 CASAVA_Build 2 42992112 1D CAAAGGGGTG C/- ACTGCAGAGC 3070 het 3070 hom 47 23 21 3 C 1 0 292347 CASAVA_Build 2 42995952 1D CAAAGAGTTA T/- TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 T 5 4 292348 CASAVA_Build 2 42997615 4D ACACACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 19 18 8 AC 9 7 292349 CASAVA_Build 2 42999458 1I TGACGCAGTA -/T TTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 T 5 6 292350 CASAVA_Build 2 43003255 1I TCATCTCCAT -/C CCCCCCGGCC 2447 het 2447 ref 29 11 9 9 C 6 7 292351 CASAVA_Build 2 43006386 1D CCTAGGGATT A/- AAAAGGTCAC 2755 het 2755 ref 25 13 8 4 A 5 4 292352 CASAVA_Build 2 43016639 2D5M6I AGCGTGTGTG ACTGCAG------/--TGTGGGTGTGT GAGACTGCAG 103 het 103 ref 55 38 3 20 N/A 0 0 292353 CASAVA_Build 2 43034729 1D TTTTGTGGAG A/- GGGGGTTTCA 2375 het 1382 hom 17 5 7 6 A 1 0 292354 CASAVA_Build 2 43058737 2I AAGGACACTA --/AG AGCTTTGCAT 3070 hom 93 het 36 0 28 8 AG 1 2 292355 CASAVA_Build 2 43061222 6D AAGCGAAAGG AATGCT/------ AATGCTGATG 3070 het 3070 ref 43 21 20 5 AATGCT 2 1 292356 CASAVA_Build 2 43061708 1I GTGATTCCAC -/A AAAACCGGAG 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 A 4 5 292357 CASAVA_Build 2 43067975 1I ATTGCACAAT -/A TGTGTATGTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 0 1 292358 CASAVA_Build 2 43076153 4I AAAATAAAAA ----/AAAG AAATATTTGC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AAAG 0 1 292359 CASAVA_Build 2 43079331 1D GTCTGAAATA C/- CCACCGAGGT 3070 het 3070 ref 48 29 16 3 C 3 2 292360 CASAVA_Build 2 43081131 1I TAGCCAGTGG -/C CCCCACGTAC 3070 hom 123 het 49 0 42 7 C 4 5 292361 CASAVA_Build 2 43083392 3D TTCACTCAGC CAT/--- CACCACATGA 3070 het 3070 hom 43 17 24 4 CAT 1 0 292362 CASAVA_Build 2 43085742 1I GCCTTCCCTC -/T TGTCTCACTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 1 2 292363 CASAVA_Build 2 43088312 1D GTTTTCCTGG T/- GTCCTATACC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 1 0 292364 CASAVA_Build 2 43090481 1D ATTATGGTGA G/- GGGGCTCCCT 3070 het 2343 hom 40 12 15 14 G 5 4 292365 CASAVA_Build 2 43103107 4D CTGGGAGGTT GGGG/---- GGGGGGGGGG 3070 het 302 hom 24 2 14 8 G 14 10 292366 CASAVA_Build 2 43105338 1D CAGGGAGCAG A/- GGGCTTGGGG 2048 het 2048 ref 29 16 7 8 A 1 0 292367 CASAVA_Build 2 43113333 1I AGAGGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 19 1 14 4 A 13 14 292368 CASAVA_Build 2 43117537 1D AGGTAGGACT A/- GGACACCCCT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 1 0 292369 CASAVA_Build 2 43120262 1I CCAGGCCGGG -/C CTGCGGGGGT 3070 hom 49 het 21 0 15 6 C 1 2 292370 CASAVA_Build 2 43130972 1I TGAGGCAGAG -/C CCAGGATGGG 3070 hom 48 het 18 0 15 3 C 2 3 292371 CASAVA_Build 2 43134985 1D GAGGCTTTCA C/- CAAGCCCAAA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 C 2 1 292372 CASAVA_Build 2 43137023 4D11M1D TGGGGAGTGC GTAAGTAAGTGGAGGT/----GTAAGTGGAGG- TTTTGGGGGA 3070 hom 105 het 35 0 36 2 N/A 0 0 292373 CASAVA_Build 2 43141859 1D TCCTTAGTTG T/- TTTTTTTTTT 1736 het 1736 ref 35 25 4 6 T 11 10 292374 CASAVA_Build 2 43145930 1I AGGCCCACAT -/A AGGCCAGTGA 3070 hom 117 het 45 0 37 8 A 1 2 292375 CASAVA_Build 2 43146927 2I TTGTTTGTGG --/TT TTTTTTTTTT 2067 het 2067 ref 22 10 8 4 T 10 12 292376 CASAVA_Build 2 43169208 5I CTTATTAAAG -----/GCACA TTTAGGACTG 3070 het 3070 ref 32 15 16 1 GCACA 0 1 292377 CASAVA_Build 2 43178413 1I CGCTTTATTC -/A GGTTCTACTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 0 1 292378 CASAVA_Build 2 43185489 1D ACCCCCCACC T/- TCCGCCACCC 3070 hom 79 het 32 0 25 7 T 2 1 292379 CASAVA_Build 2 43188295 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2414 hom 39 12 17 11 A 11 10 292380 CASAVA_Build 2 43197651 2D TTGAGCTCAG GA/-- GTCCAAGACC 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 GA 1 0 292381 CASAVA_Build 2 43197944 30D CCCCACCACC CTAGGTGGTAGATCCCATTCTGCAGCTCTG/------------------------------ CTAGTCACCT 2790 het 2790 ref 22 17 8 8 CTAGGTGGTAGATCCCATTCTGCAGCTCTG 1 0 292382 CASAVA_Build 2 43202587 1I TTGAATACAC -/A CCCCCCCCAC 3070 hom 19 het 27 0 23 4 A 0 1 292383 CASAVA_Build 2 43204894 2I ACACACCCAG --/AC ACGGTGCAGA 2881 het 2881 ref 33 14 10 9 AC 1 2 292384 CASAVA_Build 2 43205527 2D CACATGCGCG CA/-- CACACACACA 3070 hom 100 het 42 0 31 11 CA 8 7 292385 CASAVA_Build 2 43206302 2D TGTGCACATC AG/-- AGACTCAGTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 AG 2 1 292386 CASAVA_Build 2 43215392 1I GCTTTGAGGA -/C CCCCCCTTCT 2115 het 1643 hom 18 9 6 3 C 6 7 292387 CASAVA_Build 2 43228737 1I AGATGTTAGC -/T TTTTTTTTTT 2461 het 2461 ref 41 22 6 13 T 13 14 292388 CASAVA_Build 2 43238426 1D CTTGGAGTGG C/- CCTGGGGGAG 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 C 3 2 292389 CASAVA_Build 2 43238996 1I GCCGGCCCTT -/C CAGCTCCTCC 2404 het 1278 hom 16 7 6 3 C 1 2 292390 CASAVA_Build 2 43250297 1I CTGTGGCCGT -/G GTGGTGTCCC 1507 het 1507 ref 28 11 8 9 G 1 2 292391 CASAVA_Build 2 43254833 1D ATGATATAGA C/- CCCCCCAGTG 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 C 7 6 292392 CASAVA_Build 2 43262535 1D TATATCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1922 hom 27 7 11 9 T 12 11 292393 CASAVA_Build 2 43270230 1D CTACTCAGGA G/- GCTGGGGCAG 2844 hom 24 het 12 0 8 4 G 2 1 292394 CASAVA_Build 2 43273743 4D CTCACATCCA CACT/---- CACTGGGTCC 3070 het 3070 hom 45 21 15 10 CACT 2 1 292395 CASAVA_Build 2 43279996 3D CTGCCTTCTT CTC/--- CTCCCATCAA 3070 het 3070 ref 40 23 9 8 CTC 2 1 292396 CASAVA_Build 2 43284055 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 9 10 292397 CASAVA_Build 2 43289134 7D AAAAAAAAAA AAAAAAT/------- AGAAATTGGC 2103 het 1689 hom 21 9 6 11 AAAAAAT 1 0 292398 CASAVA_Build 2 43380516 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 33 het 12 0 10 3 A 6 5 292399 CASAVA_Build 2 43433988 2D CGCTTATCTC TT/-- GTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 48 23 23 2 T 2 0 292400 CASAVA_Build 2 43465015 1I GGCTAGGGTA -/C CACTGGTATT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 1 2 292401 CASAVA_Build 2 43482594 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAATT 2877 het 2865 hom 27 9 12 6 A 8 9 292402 CASAVA_Build 2 43488390 12I GCTAGATGCC ------------/AGGCAATGTGCT AGGTACTTTA 3070 hom 48 het 17 0 17 1 AGGCAATGTGCT 0 1 292403 CASAVA_Build 2 43496537 1D TCTCTCTAGT C/- AAGCTTTTCT 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 C 1 0 292404 CASAVA_Build 2 43497815 1I GCTATTATTG -/T TTTTTTTTTT 1180 het 1180 ref 33 26 3 4 T 10 11 292405 CASAVA_Build 2 43500466 1D TAAATTTAAA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 8 7 292406 CASAVA_Build 2 43503811 7D GTGTTTGTCA GTCCTAT/------- GCTTGAAGGT 3070 het 3070 ref 59 35 27 5 GTCCTAT 1 0 292407 CASAVA_Build 2 43504079 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1092 hom 27 7 13 7 T 15 14 292408 CASAVA_Build 2 43509752 1I GTGTGTGTGT -/G TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 G 0 1 292409 CASAVA_Build 2 43520241 1I AGCACAAGAG -/T TGTGATGCTG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 1 2 292410 CASAVA_Build 2 43592294 17I ACTAACATAC -----------------/AACACACACACGACACA AACACACACA 3070 het 3070 hom 56 23 25 9 AACACACACACGACACA 0 1 292411 CASAVA_Build 2 43606989 2I TTCCAAGACA --/CT CTATAATTTG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 CT 1 2 292412 CASAVA_Build 2 43632362 1D ATACTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 11 10 292413 CASAVA_Build 2 43641660 6D ACTTGGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2517 het 2517 ref 34 17 11 7 A 22 16 292414 CASAVA_Build 2 43642381 1D ACTGCTTTTT A/- TTTTTTTCTT 1238 het 1238 ref 43 34 4 6 A 1 0 292415 CASAVA_Build 2 43646780 1D AAAATGAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 10 9 292416 CASAVA_Build 2 43650370 2I AATAGGTAAG --/CT CTGTCTTCTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 CT 1 2 292417 CASAVA_Build 2 43651486 3I GATAATGATC ---/ATT TTTTGAGGTG 3070 hom 45 het 22 0 16 6 ATT 0 1 292418 CASAVA_Build 2 43654690 5D TCAGTGATAC AATAA/----- AATAAATTCA 3070 het 3070 hom 34 13 20 2 AATAA 2 1 292419 CASAVA_Build 2 43660837 1I CCAGCTAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 16 0 12 4 T 9 10 292420 CASAVA_Build 2 43661051 2D TTTTAGACTA AC/-- ACAGTCCTCT 3070 het 3070 ref 26 15 7 6 AC 2 1 292421 CASAVA_Build 2 43661527 1D CATCTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 832 het 832 ref 22 16 2 5 A 11 10 292422 CASAVA_Build 2 43671455 1D CTTCCCTTCC T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 7 6 292423 CASAVA_Build 2 43672462 1I AAACAGAAAA -/G AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 G 0 1 292424 CASAVA_Build 2 43679142 8I GACTCTTTCA --------/CTCTTAAG TGAAATGAGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CTCTTAAG 0 1 292425 CASAVA_Build 2 43705489 4D GCAGTTCAGA AGAG/---- AGACTCAGTG 3070 hom 87 het 30 0 30 2 AG 3 1 292426 CASAVA_Build 2 43710351 1D CACCATCGGT C/- AATGAATAAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 C 1 0 292427 CASAVA_Build 2 43711229 1D TGGCATCAGA T/- TTTTTTTTTT 2852 het 357 hom 25 1 9 16 T 17 16 292428 CASAVA_Build 2 43711403 1I AAGTTTTGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 44 het 18 0 13 5 T 8 9 292429 CASAVA_Build 2 43713222 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 30 0 17 14 T 16 15 292430 CASAVA_Build 2 43713913 2D TCAAAGAAAC TG/-- TTTTCCTGGT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 TG 1 0 292431 CASAVA_Build 2 43714784 3I GAAAACAGAC ---/AAT AAAATAATCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAT 0 1 292432 CASAVA_Build 2 43716489 2D AGGAGAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 34 0 27 7 A 16 14 292433 CASAVA_Build 2 43719459 1I TGTACTTGTT -/A AACTAACTGA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 2 3 292434 CASAVA_Build 2 43722145 1I TGTTTTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 945 hom 34 4 24 6 T 11 12 292435 CASAVA_Build 2 43725092 4D ACAGTTGGGC TCCA/---- TCCAGCCTTA 3070 hom 94 het 36 0 32 5 TCCA 2 1 292436 CASAVA_Build 2 43735348 4D TAGTAAGACA CCCC/---- CCCCCCCCGC 2019 hom 26 het 12 0 7 5 C 12 8 292437 CASAVA_Build 2 43736608 2I ATCTTAGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 19 11 T 12 14 292438 CASAVA_Build 2 43737095 8D AGAGCTAAGA GAAGATAT/-------- GAAGATATTC 3070 hom 105 het 39 0 36 6 GAAGATAT 2 1 292439 CASAVA_Build 2 43737679 10D CAAACAAAAC AAAACAAAAT/---------- AAAACAAAAA 3070 hom 54 het 15 0 19 3 AAAACAAAAT 1 0 292440 CASAVA_Build 2 43750783 1I GTATTTAGGC -/A AAAAACAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 5 6 292441 CASAVA_Build 2 43751267 2D AATATTCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 41 0 32 9 T 12 10 292442 CASAVA_Build 2 43760051 1D CCTAAGAGTT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 8 292443 CASAVA_Build 2 43760666 1I TCTGGGTCTT -/G CCAGCATTAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 G 0 1 292444 CASAVA_Build 2 43761012 1D ATACACACAT G/- GAAATATCCC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 G 2 1 292445 CASAVA_Build 2 43767624 2D TCTATATATA TT/-- TATATTTTAA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 3 1 292446 CASAVA_Build 2 43773746 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 27 13 T 11 10 292447 CASAVA_Build 2 43778895 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 825 hom 24 3 15 6 T 14 15 292448 CASAVA_Build 2 43779851 1D AGACTCTCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 359 hom 29 1 22 6 T 10 9 292449 CASAVA_Build 2 43800924 1D CAGGTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 31 0 18 13 T 15 14 292450 CASAVA_Build 2 43802899 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 918 hom 18 3 11 5 A 17 16 292451 CASAVA_Build 2 43804756 38D AGACTGGGCA GAGCAGGTTGTCAAGGAGGACTTACCAAGGTAAGTCTG/-------------------------------------- AAATGCTGTT 3070 hom 117 het 40 0 40 8 GAGCAGGTTGTCAAGGAGGACTTACCAAGGTAAGTCTG 1 0 292452 CASAVA_Build 2 43806768 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 29 1 19 10 A 16 14 292453 CASAVA_Build 2 43838422 1D TTCTTTAATT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 43 het 27 0 23 5 A 9 8 292454 CASAVA_Build 2 43845613 1I AATCTGAAGC -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 T 7 8 292455 CASAVA_Build 2 43849918 1D TTCTTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 35 2 28 5 T 11 10 292456 CASAVA_Build 2 43903123 1I TCCCCCAGGC -/G CCCCCCCCAT 3070 hom 42 het 16 0 13 3 G 0 1 292457 CASAVA_Build 2 43909554 1D GTTGCAGTGA G/- GCAAGATGGC 2516 het 2516 ref 20 11 6 3 G 2 1 292458 CASAVA_Build 2 43922657 1D ATGGATAAGA T/- TTTTTTTTTT 2059 het 2059 ref 26 10 7 9 T 13 12 292459 CASAVA_Build 2 43923423 1I ATCTTTCCCA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 T 7 8 292460 CASAVA_Build 2 43929927 7D TTTAATTGAC TCAGAGT/------- TCCTCATGGC 3070 het 3070 hom 31 11 15 8 TCAGAGT 1 0 292461 CASAVA_Build 2 43943231 3D ATAGAACTCT TAC/--- TACCTGGAAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 4 TAC 2 1 292462 CASAVA_Build 2 43947991 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 2020 het 2020 ref 19 7 7 5 A 12 13 292463 CASAVA_Build 2 43954719 1D GTTTGATTTC A/- TTGTGATTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 1 0 292464 CASAVA_Build 2 44000309 1D ATGGTTGGAA G/- AGGAAACATC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 G 1 0 292465 CASAVA_Build 2 44019924 6D TCCGTCTCAA AAAAAT/------ AAAAATAAAA 1364 het 921 hom 6 3 3 3 AAAAAT 4 3 292466 CASAVA_Build 2 44047058 1I GGCCACAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 919 hom 36 2 23 11 T 13 14 292467 CASAVA_Build 2 44048046 4I ATTGATAGAA ----/AGAT AGACAGATAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AGAT 0 1 292468 CASAVA_Build 2 44061228 4D AAAGAAAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 68 het 32 0 23 12 AG 8 6 292469 CASAVA_Build 2 44063978 1I AGAGACTAGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 15 het 44 1 38 5 A 8 9 292470 CASAVA_Build 2 44074382 1D TCTACTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 A 13 12 292471 CASAVA_Build 2 44075241 9I CTGGAGTAGG ---------/CTGCAGTCT CTGCAGTCTG 3070 hom 129 het 46 0 42 4 CTGCAGTCT 1 2 292472 CASAVA_Build 2 44077854 1D AGGCAAACGC G/- GCGGGTATTT 3070 hom 116 het 46 0 36 10 G 2 1 292473 CASAVA_Build 2 44084480 1I AGGGAGAGAG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 7 8 292474 CASAVA_Build 2 44098899 2D TTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 26 2 17 7 T 15 13 292475 CASAVA_Build 2 44108672 2D ATATAATATC AT/-- ATATATATAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AT 5 4 292476 CASAVA_Build 2 44117435 1I GAAGCAGAGG -/T TAACACCCTC 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 1 2 292477 CASAVA_Build 2 44117741 3D ACCCCAGCCT AGA/--- AGGAGGACCA 3070 het 3070 hom 46 21 18 7 AGA 1 0 292478 CASAVA_Build 2 44127718 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 9 8 292479 CASAVA_Build 2 44161416 1D CTACGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 22 8 A 13 12 292480 CASAVA_Build 2 44170136 2I AGATAGGACC --/AT ATGTCAACCA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AT 1 2 292481 CASAVA_Build 2 44198236 1D CTCACTGTTT G/- GGGGGGGCTT 3070 het 3070 ref 37 24 10 3 G 8 7 292482 CASAVA_Build 2 44220452 3I TGAGAACTGT ---/GAA GAAGAGGGAA 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 GAA 1 2 292483 CASAVA_Build 2 44221129 6I GACTTAGTGT ------/ATGCAA AGACACTGTT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 ATGCAA 0 1 292484 CASAVA_Build 2 44231963 1I GGAATGTGTA -/T TTTATGTGTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 4 292485 CASAVA_Build 2 44249007 2D GAAATTGGCT CA/-- GTGACTGACC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 CA 1 0 292486 CASAVA_Build 2 44256668 1D ACCTCATGAT C/- CACCTGCCTC 3070 het 2065 hom 20 6 11 3 C 2 1 292487 CASAVA_Build 2 44260694 1D AAGTCAACTC T/- TAAAATATTC 3070 hom 72 het 38 0 21 18 T 2 1 292488 CASAVA_Build 2 44268782 4D ATTTTTGGGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 10 TTTG 4 3 292489 CASAVA_Build 2 44284117 1I CCCCAATTAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 190 hom 28 1 20 7 A 8 9 292490 CASAVA_Build 2 44292233 2D TATTTAATAA AT/-- ATGTTATACT 3070 hom 66 het 29 0 23 7 AT 2 1 292491 CASAVA_Build 2 44297546 1I CCAGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 484 hom 31 3 17 11 A 13 14 292492 CASAVA_Build 2 44305099 2D CTCCGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 1256 het 18 hom 8 0 5 3 A 20 18 292493 CASAVA_Build 2 44305344 2D GTAAAAGCTT AA/-- AAACTAGGGT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 5 3 292494 CASAVA_Build 2 44329242 1D16M1I TCTTTTTTTC TTTTTTTTTAATTACAC-/-TTTTTTTTAATTACACT TTAAGTTCTA 3070 hom 54 het 20 0 18 4 N/A 0 0 292495 CASAVA_Build 2 44329389 1I CCTCCCTCAG -/C CCCCCCCACC 2007 hom 12 het 7 0 5 2 C 7 8 292496 CASAVA_Build 2 44332742 1I CTAACAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 33 0 29 4 T 11 12 292497 CASAVA_Build 2 44334353 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 20 0 18 3 A 12 11 292498 CASAVA_Build 2 44334940 1I CCAATCTCTT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 8 292499 CASAVA_Build 2 44335808 4D TGGCAGTGAA AGAT/---- AGGACATCAA 3070 hom 93 het 36 0 31 10 AGAT 1 0 292500 CASAVA_Build 2 44374161 1D CACCGTTTTA G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 76 het 30 0 26 5 G 6 5 292501 CASAVA_Build 2 44374603 1I AGGATGCTAT -/G TTTTTTTACT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 0 1 292502 CASAVA_Build 2 44378831 1D TCAGATCTTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 8 7 292503 CASAVA_Build 2 44384203 1D CATTTTTTTT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 422 hom 16 1 14 1 G 8 7 292504 CASAVA_Build 2 44395236 2I CACCCTCTGC --/CA CACACACACA 3070 het 447 hom 31 2 24 5 CA 8 9 292505 CASAVA_Build 2 44395422 2D AAGACACAAA AT/-- ATATATGGGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AT 4 3 292506 CASAVA_Build 2 44398739 1D CTCAACACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 817 hom 36 2 17 17 T 15 14 292507 CASAVA_Build 2 44399244 13D14M13I TAAACATATG AAATGATACATTCTGTGCCTATGCAAA-------------/-------------TTTGCATAGGCACAGAATGTATCATTT CATATGATAC 3070 hom 99 het 29 0 34 3 N/A 0 0 292508 CASAVA_Build 2 44410732 3D TGTTATGACA TTG/--- TTAACTTTCA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 TTG 1 0 292509 CASAVA_Build 2 44412590 2D ATAAATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2678 het 49 hom 20 2 11 7 T 18 16 292510 CASAVA_Build 2 44414270 1I TCTTATTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 32 1 26 5 A 12 13 292511 CASAVA_Build 2 44422387 1I AAAGAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 10 11 292512 CASAVA_Build 2 44424720 3D TTCTTTCAAC AAT/--- GATGGCAGCT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 AAT 1 0 292513 CASAVA_Build 2 44431609 1I ACTCCCTGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 447 hom 34 2 27 5 T 9 10 292514 CASAVA_Build 2 44432172 1D AAAAAAAAAA C/- AAAACCCTGT 3070 het 616 hom 42 7 28 7 C 1 0 292515 CASAVA_Build 2 44437454 1D AAACTCCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 39 1 28 10 T 13 12 292516 CASAVA_Build 2 44454604 1D CCACCTTTAC A/- AAAAATACAA 3070 hom 36 het 16 0 12 5 A 6 5 292517 CASAVA_Build 2 44475064 4D TGAATTCTAA GACT/---- GACCAGGATT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 GACT 1 0 292518 CASAVA_Build 2 44476938 1I TTCAAAAAGC -/A GCATCAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 292519 CASAVA_Build 2 44487135 2I CCAGTGTCTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 337 hom 23 1 20 2 TG 7 8 292520 CASAVA_Build 2 44513484 1D AAAAAAAAAA C/- ATATGCTTTC 3070 het 524 hom 37 5 27 6 C 1 0 292521 CASAVA_Build 2 44516707 1I GGAATCAAAC -/T CAATTCTTTT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 0 1 292522 CASAVA_Build 2 44521270 2I ATTTCACATT --/TC TCAATGCACA 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 TC 1 2 292523 CASAVA_Build 2 44544707 2D ATGTGTTACA AG/-- AGAATACAGA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AG 2 1 292524 CASAVA_Build 2 44548185 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 9 10 292525 CASAVA_Build 2 44549912 3D TTAGTTAAAT ATA/--- ATAATAATTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ATA 3 2 292526 CASAVA_Build 2 44549994 2I TTAAACCTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 10 12 292527 CASAVA_Build 2 44551144 2I TGGAGGTGTC --/AG TGGTTTCTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AG 0 1 292528 CASAVA_Build 2 44557299 1D TTACTTTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 15 9 A 10 9 292529 CASAVA_Build 2 44559346 1D CTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2892 hom 12 het 20 1 15 4 T 17 16 292530 CASAVA_Build 2 44561424 2D CATTTGTAAA CT/-- CTATATTTTT 3070 het 3070 ref 28 18 8 3 CT 2 1 292531 CASAVA_Build 2 44565335 1D TAAATAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 838 hom 32 3 26 4 A 13 12 292532 CASAVA_Build 2 44580582 2D TAAAAAGCTT TG/-- TGTACTATGT 3070 het 3070 hom 39 14 24 1 TG 2 1 292533 CASAVA_Build 2 44582946 1D ATCTCTCCCC T/- AAACCCTGCC 3070 hom 57 het 21 0 20 2 T 1 0 292534 CASAVA_Build 2 44587717 1I TTGTGCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 36 1 28 7 T 11 12 292535 CASAVA_Build 2 44589221 4D TACTGTGGCT AAAC/---- GTTTACCTTA 3070 hom 129 het 45 0 43 2 AAAC 1 0 292536 CASAVA_Build 2 44593496 4D AAAGCAAATA AAAT/---- AAATGTCAGT 3070 het 3070 ref 25 11 8 9 AAAT 2 1 292537 CASAVA_Build 2 44594926 1D54M4D CTTAATGTTT ATGCCAGATGATGTAGGAAAAATAACTTCTGCCAGACCTTGGTGACTGACTAGATAGAG/-TGCCAGATGATGTAGGAAAAATAACTTCTGCCAGACCTTGGTGACTGACTAGAT---- AGGCTGATAA 3070 het 3070 ref 41 39 18 12 N/A 0 0 292538 CASAVA_Build 2 44602498 6D ATTCTGTCTC TAAAAA/------ TAAAAATAAA 2593 het 2593 ref 25 11 6 10 TAAAAA 3 2 292539 CASAVA_Build 2 44605619 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACTTA 3070 het 1854 hom 28 8 17 3 C 0 1 292540 CASAVA_Build 2 44608429 1D ATGTGTACAG C/- CCCCCCCCCC 1276 het 48 hom 14 1 5 8 C 11 10 292541 CASAVA_Build 2 44615477 2D AAGCAAGAAC AA/-- ACCGAACCTA 3070 het 3070 hom 32 14 12 7 A 3 1 292542 CASAVA_Build 2 44628357 1D CATTTGAAAT A/- ATACCCATTT 3070 het 3070 ref 44 25 13 7 A 2 1 292543 CASAVA_Build 2 44630012 3D CCTAAAAAAA AAG/--- ACCTGAAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 AAG 1 0 292544 CASAVA_Build 2 44631773 9D TGTAGTCACA AGATTATGT/--------- AGTCCTGTTT 3070 het 3070 ref 48 21 22 5 AGATTATGT 1 0 292545 CASAVA_Build 2 44640194 1I ACATAACCAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 9 10 292546 CASAVA_Build 2 44655277 1D CAAGCTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 12 11 292547 CASAVA_Build 2 44656007 1D CAGGCATGAG C/- CACCACGCCC 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 C 2 1 292548 CASAVA_Build 2 44659875 1I TAATGTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 10 11 292549 CASAVA_Build 2 44660543 1D GTGACTGCCA T/- TTCTTTTGGA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 3 2 292550 CASAVA_Build 2 44667026 1D CAATCAAAAT A/- ATGAACATAT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 2 1 292551 CASAVA_Build 2 44672941 1D15M1D TTGAATAATC TTTGATAGTTGGTGTCT/-TTGATAGTTGGTGTC- TTCAAAGAAC 2855 het 2855 ref 17 15 6 1 N/A 0 0 292552 CASAVA_Build 2 44673464 1D TTTAAGTGTA T/- TGTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 T 2 1 292553 CASAVA_Build 2 44691359 2D GTTCTTAAAC TT/-- TTTGTGTTGA 3070 het 3070 hom 42 15 21 7 T 5 3 292554 CASAVA_Build 2 44692836 1I ATTAGAATGA -/T TCAAAACCTG 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 1 2 292555 CASAVA_Build 2 44695721 1I CAGGTGCACC -/A CCACACCCGG 3070 het 2408 hom 30 5 19 6 A 0 1 292556 CASAVA_Build 2 44697180 1I TTTAACAATA -/T TATTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 1 2 292557 CASAVA_Build 2 44726949 1I AGAAATCTTG -/T TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 3 4 292558 CASAVA_Build 2 44737404 1I CCAAATTAAG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 A 7 8 292559 CASAVA_Build 2 44758351 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 13 12 292560 CASAVA_Build 2 44769151 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 2549 het 2549 ref 29 14 7 8 AT 6 7 292561 CASAVA_Build 2 44780245 1I TTTTCTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 T 10 11 292562 CASAVA_Build 2 44782612 1D TTTTACGTGA T/- TTTTTTTTTT 1312 het 1312 ref 32 24 3 5 T 11 10 292563 CASAVA_Build 2 44802820 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1221 hom 41 7 17 17 T 17 16 292564 CASAVA_Build 2 44806483 1D GTTCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1863 het 1863 ref 45 31 4 11 T 12 11 292565 CASAVA_Build 2 44807747 1D ATTTGGACTC T/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 T 7 6 292566 CASAVA_Build 2 44816384 1D ATCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 882 het 882 ref 28 21 3 4 A 11 10 292567 CASAVA_Build 2 44822725 2D TTCAAGTCTT AG/-- ACTCTAAAAC 3070 het 3070 hom 51 19 32 0 AG 1 0 292568 CASAVA_Build 2 44831656 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 10 11 292569 CASAVA_Build 2 44834049 1I TCTCAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3030 het 3030 ref 30 13 9 8 A 13 14 292570 CASAVA_Build 2 44835494 1I CTCATGCATT -/A AAAAAAAAAA 1987 het 1987 ref 25 13 6 6 A 13 14 292571 CASAVA_Build 2 44858324 8D TACATGCAGA GCAGCCTG/-------- GCCCCGCCCA 2458 het 2458 ref 38 23 11 4 GCAGCCTG 1 0 292572 CASAVA_Build 2 44862097 1I GATAATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 13 14 292573 CASAVA_Build 2 44886172 1D TAGTCAACGG C/- CCCCCCCCCC 1806 het 248 hom 20 3 6 12 C 11 10 292574 CASAVA_Build 2 44889001 4D TTCAACAAAC ATTT/---- ATTGAGCAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 ATTT 1 0 292575 CASAVA_Build 2 44889858 1D GATCAGTTAG T/- TGAAGGGTCT 3070 het 3070 hom 59 23 27 10 T 2 1 292576 CASAVA_Build 2 44904639 1D CTCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 1275 het 1275 ref 29 17 5 8 A 12 11 292577 CASAVA_Build 2 44916777 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1892 hom 23 9 12 3 A 14 12 292578 CASAVA_Build 2 44940195 1D GGGGAGGAGA G/- TACACAACTC 2310 het 2310 ref 31 16 7 9 G 1 0 292579 CASAVA_Build 2 44945624 1I TGACAACACC -/A AAATGCAGGT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 3 4 292580 CASAVA_Build 2 44956751 1I TAGGAAAAAA -/G AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 G 0 1 292581 CASAVA_Build 2 44996218 4I GTAGTTTGAC ----/CAAG CAAGCCCATG 3070 het 3070 ref 51 27 16 8 CAAG 1 2 292582 CASAVA_Build 2 44999234 1D ATAATAGTCA C/- CCCTTGCCCA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 C 4 3 292583 CASAVA_Build 2 45002894 3I TTCTTTTTCT ---/TTC TTTTTTTTTT 2871 het 1439 hom 30 7 12 11 TTC 0 1 292584 CASAVA_Build 2 45007294 3D TGCCCAGTTG GGT/--- GGGGGGGGGG 2639 het 132 hom 11 2 6 3 GGT 1 0 292585 CASAVA_Build 2 45027708 6D CCATCCCCAG CAGCAC/------ CAGCACCAGG 3070 het 3070 ref 39 23 9 8 CAGCAC 2 1 292586 CASAVA_Build 2 45053095 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 503 hom 26 3 13 11 A 17 16 292587 CASAVA_Build 2 45057087 1D CATGTCAGGG T/- TTGGGCACAT 3070 hom 155 het 58 0 52 6 T 3 2 292588 CASAVA_Build 2 45061099 3D TTATCACTGC TGT/--- TATCACTACT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TGT 1 0 292589 CASAVA_Build 2 45061376 1I TTCTTGTCCC -/G CACCCCAGCA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 G 0 1 292590 CASAVA_Build 2 45061712 1I GGTATAAAAT -/A ACAGCTGCAG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 1 2 292591 CASAVA_Build 2 45066529 5I TCTCAAAAAT -----/AATAA AATAAAATAA 3070 hom 21 het 11 0 8 3 AATAA 3 4 292592 CASAVA_Build 2 45074029 6I AAGACAACTT ------/TTAGTC AGGCTGGCAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TTAGTC 0 1 292593 CASAVA_Build 2 45075047 1I CTCTTTTAGA -/G TTCTCTGCTG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 0 1 292594 CASAVA_Build 2 45084894 1D GTCGTTTAAA G/- GGGGGGGCTG 1936 hom 17 het 9 0 5 5 G 8 7 292595 CASAVA_Build 2 45095329 1D TCTCTCCCAG C/- CCCCCCTCTT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 C 7 6 292596 CASAVA_Build 2 45095725 2I GCTTGGCACT --/TC TCTCTCATGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TC 3 4 292597 CASAVA_Build 2 45097358 1D TTCCCTGTGT G/- GAGACAAACT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 G 2 1 292598 CASAVA_Build 2 45098273 2D27M1I TCCAATGGTT GAGAGAGTTCCTTCTAGGTATCAGGAAGA-/--GAGAGTTCCTTCTAGGTATCAGGAAGAT TAGGTCTAGG 3070 hom 96 het 28 0 31 6 N/A 0 0 292599 CASAVA_Build 2 45101772 6I TAAAAATACA ------/TTATAC TTATAATTAG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TTATAC 0 1 292600 CASAVA_Build 2 45103660 1I TCAGTTCCAG -/T CCCTAACTGG 3070 hom 161 het 62 0 54 8 T 0 1 292601 CASAVA_Build 2 45105744 1D TGAAAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 29 1 20 8 T 13 12 292602 CASAVA_Build 2 45112365 7I GATGCCAGGA -------/GTTTGAG GCCAGCCTGG 3070 hom 87 het 31 0 27 5 GTTTGAG 0 1 292603 CASAVA_Build 2 45113604 1I ACAACACACA -/T TATCTGACAC 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 1 2 292604 CASAVA_Build 2 45122004 1I AAATAAAACT -/C CCAAGTAGAT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 C 2 3 292605 CASAVA_Build 2 45123724 2D TACAACAAAC AT/-- GTGGTGGAGT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AT 1 0 292606 CASAVA_Build 2 45126667 6D TTGACCGCCC CACCCT/------ CATGACTTAA 3070 het 3070 ref 54 26 24 7 CACCCT 1 0 292607 CASAVA_Build 2 45133262 1I AGGGACATGA -/T TTTTTTTTTT 1428 het 1110 hom 27 5 6 16 T 13 14 292608 CASAVA_Build 2 45174939 4D TTGGGCAAGT TAAC/---- TAAGCTCTTG 3070 het 3070 hom 51 20 26 7 TAAC 1 0 292609 CASAVA_Build 2 45182460 7I ATTATAATGG -------/TATAGAC CTTTAAAATT 3070 het 3070 hom 23 10 12 2 TATAGAC 0 1 292610 CASAVA_Build 2 45183512 1D AGAATTTGAC T/- TTTTTTTTTT 1809 het 1809 ref 29 18 4 7 T 13 12 292611 CASAVA_Build 2 45192485 53I GCCCAGGGCG -----------------------------------------------------/TAGAGAAGGCATTCCAGGTGAGGAGAGTTAAGTGAACAAGAGGCTGAGAGATC ACACTAGGTC 3070 het 3070 ref 25 17 13 1 TAGAGAAGGCATTCCAGGTGAGGAGAGTTAAGTGAACAAGAGGCTGAGAGATC 0 1 292612 CASAVA_Build 2 45193062 1D CTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 26 3 14 10 T 13 12 292613 CASAVA_Build 2 45194316 1I GAGAAAATAT -/A CCATATTTAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 1 292614 CASAVA_Build 2 45196491 1I TTTCAAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 A 10 11 292615 CASAVA_Build 2 45205397 2I ACTTTTTCTA --/AC AAGGCTCAGA 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 AC 0 1 292616 CASAVA_Build 2 45206594 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAACTGG 2063 het 703 hom 21 9 9 3 G 0 1 292617 CASAVA_Build 2 45212602 1I CTGATTGGTC -/T ATTTTATAAT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 0 1 292618 CASAVA_Build 2 45222113 1D GGTACTAACA G/- GGGGGATTAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 G 6 5 292619 CASAVA_Build 2 45237119 4I AGCCTTTTAG ----/CAAA CAGTCACTGT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 CAAA 0 1 292620 CASAVA_Build 2 45247283 1D ATTGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 631 hom 30 3 22 5 A 13 12 292621 CASAVA_Build 2 45248140 5D TCTTCAGATG TTAAT/----- TTAAGTCTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 6 TTAAT 1 0 292622 CASAVA_Build 2 45251377 1D CGTCTGGGAA C/- CGGCCATTGC 3011 het 3011 ref 31 12 10 9 C 2 1 292623 CASAVA_Build 2 45252327 1I TGGAATCTTA -/G ATTTTTATTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 0 1 292624 CASAVA_Build 2 45252591 1D TAAATTGTGC T/- TTTTAATGAC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 5 4 292625 CASAVA_Build 2 45253267 3I ATCCATAATC ---/GTA GTAATAGGTG 3070 het 3070 ref 55 27 19 9 GTA 1 2 292626 CASAVA_Build 2 45255239 1I AACTATTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 170 hom 27 1 15 11 A 13 14 292627 CASAVA_Build 2 45255383 2I TAGAGATGAC --/TT AAAGTACACT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 0 2 292628 CASAVA_Build 2 45259001 20D AGCAAAGTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 22 12 10 6 T 29 9 292629 CASAVA_Build 2 45262783 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 11 13 8 A 9 10 292630 CASAVA_Build 2 45267760 5D15M12D TATACACATA TATATTATATATTTATTTTAATTTTAATTTTT/-----TATATATTTATTTTA------------ ATTTTATTTT 934 hom 7 het 2 0 3 1 N/A 0 0 292631 CASAVA_Build 2 45272938 1I TCTGGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 14 16 11 A 12 13 292632 CASAVA_Build 2 45273973 4I GTAACCCTTT ----/ACCA ACCAATAGAT 3070 het 2957 hom 34 8 23 3 ACCA 1 2 292633 CASAVA_Build 2 45284450 1D ATACCTACAT A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 7 6 292634 CASAVA_Build 2 45284739 1D TGCAGAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 A 11 10 292635 CASAVA_Build 2 45287038 1I AGGCCTAGGG -/C CCCTTAGGGT 3070 hom 95 het 33 0 30 3 C 3 4 292636 CASAVA_Build 2 45292029 1D TTTATATGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 10 9 292637 CASAVA_Build 2 45293922 1I ATTAAACTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 7 8 292638 CASAVA_Build 2 45326038 3I CCATATTGTT ---/ATA ATGTCATATT 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 ATA 0 1 292639 CASAVA_Build 2 45327831 2I TGATAGTGAG --/TT TTTTTTTTTT 2899 hom 45 het 21 0 16 5 T 14 16 292640 CASAVA_Build 2 45337100 1D AGGCAGATGG A/- AAAAAAAAAA 109 het 109 ref 17 10 2 5 A 17 16 292641 CASAVA_Build 2 45346486 1I TGTAACTTTC -/T TTTTTTTTTT 2931 het 819 hom 27 4 10 13 T 13 14 292642 CASAVA_Build 2 45354939 1I AGCAGGCTGC -/A AAAAAACTGG 3070 het 3070 ref 47 22 12 13 A 6 7 292643 CASAVA_Build 2 45364677 7I GCCCCAGGTG -------/ATCTTAC ACCCAAGGCC 3070 hom 106 het 40 0 29 11 ATCTTAC 0 1 292644 CASAVA_Build 2 45367945 1D CCTGAAAGTG T/- TTCTCTAGAT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 3 2 292645 CASAVA_Build 2 45368231 3I GTGCAGTGGC ---/ATG ATGATAGCTT 3070 hom 78 het 33 0 25 8 ATG 1 2 292646 CASAVA_Build 2 45369148 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2739 hom 22 10 10 2 T 9 8 292647 CASAVA_Build 2 45372924 2I AACTCCCCTT --/TA TATATATATA 2251 het 2251 ref 23 15 7 1 TA 7 8 292648 CASAVA_Build 2 45373848 1I AAGTAAATGA -/G GGTTTCCCTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 G 2 3 292649 CASAVA_Build 2 45376821 1D TCACCAAGGG T/- TTTCTGGCCC 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 4 3 292650 CASAVA_Build 2 45395842 1I CGGGCTTGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 57 29 16 12 T 8 9 292651 CASAVA_Build 2 45406810 7I AAATACTTTT -------/GTTTCTG GTTATTCCAT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 GTTTCTG 0 1 292652 CASAVA_Build 2 45431917 1D GCTTAAATGG C/- TTGACTATTT 3070 het 3070 ref 37 18 17 3 C 1 0 292653 CASAVA_Build 2 45455574 2D TTTGTAACAT TA/-- TATATATATA 2697 het 2697 ref 33 16 7 10 TA 8 7 292654 CASAVA_Build 2 45483975 1I TAGATTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 10 11 292655 CASAVA_Build 2 45486398 16I AGAATGGGTA ----------------/AAAGAGTTAAGAATGG AAAGAGACGA 3070 hom 100 het 36 0 33 5 AAAGAGTTAAGAATGG 0 1 292656 CASAVA_Build 2 45496921 1D TTAAAAAAAA C/- AGGCATATAC 3070 het 3070 hom 40 15 23 3 C 1 0 292657 CASAVA_Build 2 45499320 1D AAGGGAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 37 2 25 10 A 11 10 292658 CASAVA_Build 2 45519286 2I GTGAACACGA --/AG AGAGAGATAT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 AG 3 4 292659 CASAVA_Build 2 45528096 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 10 9 292660 CASAVA_Build 2 45543661 4D AGAATAACCC GGGG/---- GGGGGGGGGG 3070 hom 16 het 33 0 16 17 G 14 10 292661 CASAVA_Build 2 45553600 1I ATCAAGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 37 1 27 9 T 10 11 292662 CASAVA_Build 2 45554350 4D GCAGATAAAC TGTT/---- TGCTCTCTGA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 TGTT 1 0 292663 CASAVA_Build 2 45558610 2I TTTATTGTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 39 1 28 10 T 11 13 292664 CASAVA_Build 2 45562350 1D CAAAAATGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 126 het 49 0 43 7 A 10 9 292665 CASAVA_Build 2 45564091 1I GACCACATGC -/A AGTAGCCTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 2 292666 CASAVA_Build 2 45572611 1D ATTATAGGTG C/- CCACCATCAT 3070 het 3070 ref 32 13 9 11 C 3 2 292667 CASAVA_Build 2 45574720 1I AACAAAGTGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 7 8 292668 CASAVA_Build 2 45578376 1I TTTCATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 525 hom 23 2 17 4 T 11 12 292669 CASAVA_Build 2 45583860 5I CCTTTCCATG -----/AAGAA AAGAAAACTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AAGAA 1 2 292670 CASAVA_Build 2 45586451 10D GACCAAAATA ATCTAAAACC/---------- ATGACTTAGG 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 ATCTAAAACC 1 0 292671 CASAVA_Build 2 45598483 1I ACCAAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 10 11 292672 CASAVA_Build 2 45608221 3D TTTTGAAGTT ATA/--- ATAAAAATAA 3070 het 3070 ref 35 17 17 3 ATA 2 1 292673 CASAVA_Build 2 45612345 1I AGAAGTTCTA -/C CCCCATATAT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 C 4 5 292674 CASAVA_Build 2 45624293 1I GCACTTTGAA -/T TTGGCAAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 2 3 292675 CASAVA_Build 2 45629939 2D CAATCCACAC AG/-- AGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 15 3 AG 2 1 292676 CASAVA_Build 2 45680031 1D GTACAACCCC T/- ATGCTAGTCA 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 T 1 0 292677 CASAVA_Build 2 45680956 1I ACCATTCGGG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 53 29 20 4 A 6 7 292678 CASAVA_Build 2 45689280 3I TGCCTTTAAC ---/TAA ATTCAGATTT 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 TAA 0 1 292679 CASAVA_Build 2 45689466 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 1097 het 1097 ref 29 16 4 9 T 15 16 292680 CASAVA_Build 2 45707057 1D CCTTTACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 25 8 12 A 15 14 292681 CASAVA_Build 2 45718631 1I TGCCAGCCCT -/G GGCACTTCAG 3070 hom 99 het 36 0 30 6 G 2 3 292682 CASAVA_Build 2 45743336 2I CAGCTCCTGC --/TT TTTTTTTTTT 2623 het 2623 ref 25 8 9 8 T 10 12 292683 CASAVA_Build 2 45770908 17D TGACTGTAAC ATCTAAGTTAAAAAGAT/----------------- GTCTGAGATG 3070 het 3070 ref 34 18 14 9 ATCTAAGTTAAAAAGAT 1 0 292684 CASAVA_Build 2 45783769 2D GTTTTATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 27 1 12 14 T 12 10 292685 CASAVA_Build 2 45788834 5I AGCAAGTTGC -----/TGGTT TAAGCTGGGG 3070 hom 90 het 39 0 30 9 TGGTT 0 1 292686 CASAVA_Build 2 45797686 5D GGGTACTACA AGATG/----- AGATGAGATT 3070 hom 161 het 57 0 49 8 AGATG 2 1 292687 CASAVA_Build 2 45822111 3I CAGTAGCACC ---/AGA AGAATGGGGC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 AGA 1 2 292688 CASAVA_Build 2 45823081 1D CTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 12 11 A 13 12 292689 CASAVA_Build 2 45829534 1I GGGAACAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2146 hom 36 7 18 12 T 15 16 292690 CASAVA_Build 2 45832150 1I TTGTTTATTT -/G GGTTTCTCAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 G 2 3 292691 CASAVA_Build 2 45851511 1D AAACAAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 119 hom 32 4 13 15 T 15 14 292692 CASAVA_Build 2 45852776 1I CGAGTGCAGC -/A CAGAATTAGC 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 A 0 1 292693 CASAVA_Build 2 45860710 7I CGATCTCAAA -------/AGAAAAG GACACTTTTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 AGAAAAG 0 1 292694 CASAVA_Build 2 45879411 1D CAGAAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 17 7 T 12 11 292695 CASAVA_Build 2 45882037 1D TGTTCTGGAA T/- TTCAGGCCAA 3070 hom 74 het 28 0 24 4 T 3 2 292696 CASAVA_Build 2 45882147 6D CAGTGAGTGC TGAGGG/------ TGAGGGTGAG 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TGAGGG 3 2 292697 CASAVA_Build 2 45898181 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAATCAG 1290 het 238 hom 6 1 3 2 A 7 6 292698 CASAVA_Build 2 45909670 1D ATTCAACAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 49 het 27 0 24 3 T 10 9 292699 CASAVA_Build 2 45911328 1I TTAGAATACT -/G AGGATAAAGA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 G 0 1 292700 CASAVA_Build 2 45912543 17D CAAAAATATA TAACCCAAATGAAACTT/----------------- TGACTAATTT 3070 het 3070 ref 26 16 9 4 TAACCCAAATGAAACTT 1 0 292701 CASAVA_Build 2 45913782 1D GCAACATGGC A/- AAAAAAAAAA 962 het 962 ref 18 9 4 5 A 15 14 292702 CASAVA_Build 2 45919769 1D GTGCTTAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 17 10 A 10 9 292703 CASAVA_Build 2 45922712 2I AGAGTTACTA --/CT CTCTCTTATA 3070 het 3070 ref 54 22 23 9 CT 3 4 292704 CASAVA_Build 2 45926019 1D GGACTAAGTA T/- TTTTTTTTTT 2482 het 499 hom 22 5 10 7 T 17 16 292705 CASAVA_Build 2 45929366 1D AAGTGTAAAA C/- CCCTTTGCCT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 C 4 3 292706 CASAVA_Build 2 45945135 1D TAATAGAAAT A/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 1 0 292707 CASAVA_Build 2 45952734 1D CAGATACTTG A/- AAAGTCCTAG 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 A 4 3 292708 CASAVA_Build 2 45958394 1D TTGCTCATGG T/- TCCCTTTGAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 2 1 292709 CASAVA_Build 2 45973015 1I CTGGATGAAC -/G GGGGCTCACT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 4 5 292710 CASAVA_Build 2 45984537 22D TTTTTTTGTT TGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG/---------------------- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 26 16 18 5 TGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG 1 0 292711 CASAVA_Build 2 45990054 1I CATCATAATC -/T TCCCCCATCC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 1 2 292712 CASAVA_Build 2 45996825 6D TAAAATGTAG TATCTT/------ TATGACAGGA 3070 het 3070 ref 39 24 12 6 TATCTT 1 0 292713 CASAVA_Build 2 46005968 1I TTGAGACAGT -/C TTGCTCTTGT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 C 0 1 292714 CASAVA_Build 2 46015533 1I ATGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 23 3 13 7 A 16 17 292715 CASAVA_Build 2 46021548 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3024 het 1419 hom 15 5 7 3 A 12 11 292716 CASAVA_Build 2 46031200 1I AGAAAATAAC -/T TTCAAGGTCA 3070 het 3070 ref 52 22 22 8 T 2 3 292717 CASAVA_Build 2 46037678 1I CATATTCTAC -/A ATGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 A 1 2 292718 CASAVA_Build 2 46061401 4D TTGTCTAATG AGCT/---- AGCTGATGGG 3070 het 3070 ref 31 15 12 7 AGCT 2 1 292719 CASAVA_Build 2 46073521 3I CCAGACAACA ---/CTG CTGCTGCTGC 3070 het 3070 ref 45 19 15 11 CTG 4 5 292720 CASAVA_Build 2 46077267 1D GTCTATTGAT A/- ACAATTGATT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 2 1 292721 CASAVA_Build 2 46081101 3D AATCTCTGAT AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 2930 hom 26 9 15 2 A 12 9 292722 CASAVA_Build 2 46104537 2D CAGGAATTTC TA/-- TATAGTGTTC 3070 hom 99 het 36 0 33 4 TA 3 2 292723 CASAVA_Build 2 46104950 1I TATGAGGACA -/T TTTTTTTTTT 2505 het 1602 hom 35 8 10 17 T 16 17 292724 CASAVA_Build 2 46123748 1I AGAAAAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 43 1 32 10 T 11 12 292725 CASAVA_Build 2 46126522 1D TGTCTCAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 8 13 11 A 10 9 292726 CASAVA_Build 2 46134395 12D CATTTATCCT GTGGGTGGACAC/------------ GTGGGTGGAC 3070 hom 144 het 50 0 47 8 GTGGGTGGACAC 2 1 292727 CASAVA_Build 2 46140967 1I GACAGCCCTT -/C CCTCCTGGGC 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 C 2 3 292728 CASAVA_Build 2 46142080 1D TCTTTTTTTT C/- CCCCCTATAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 C 6 5 292729 CASAVA_Build 2 46151286 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 10 11 292730 CASAVA_Build 2 46157811 2D CTTTCTCGTG CA/-- CACACACACA 2708 het 2708 ref 28 10 11 7 CA 10 9 292731 CASAVA_Build 2 46159184 2D CCCTGTCTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 26 0 12 16 A 14 12 292732 CASAVA_Build 2 46167802 2D TATTCTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 9 T 13 11 292733 CASAVA_Build 2 46174047 1D AAAAAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 41 0 26 15 T 13 12 292734 CASAVA_Build 2 46174174 2D TGTACTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 30 0 17 15 T 16 14 292735 CASAVA_Build 2 46178163 10D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAGC 3070 het 573 hom 21 3 16 5 A 18 8 292736 CASAVA_Build 2 46186093 1D TTATCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 46 4 30 12 T 15 14 292737 CASAVA_Build 2 46189604 1D AAGACTGTTC T/- TTTTTTATTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 7 6 292738 CASAVA_Build 2 46191836 5D AATGTCAATT TATAA/----- ATGTTAAGTT 3070 hom 108 het 38 0 37 4 TATAA 1 0 292739 CASAVA_Build 2 46193143 8D TGGTTTTTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 hom 55 het 25 0 19 6 TTTG 5 3 292740 CASAVA_Build 2 46195350 26D GCATGAGCCA CCGTGCCCAGCCCCAGAGTCCAAGGC/-------------------------- TTTTAAGAGA 3070 hom 54 het 17 0 18 3 CCGTGCCCAGCCCCAGAGTCCAAGGC 1 0 292741 CASAVA_Build 2 46197392 1D CTGTTCGGAG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 93 het 37 0 30 8 A 9 8 292742 CASAVA_Build 2 46200658 1I TATGCTTTGT -/C CTGTTAAGCC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 C 1 2 292743 CASAVA_Build 2 46218240 1D CTAAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 170 het 170 ref 11 8 2 2 A 17 16 292744 CASAVA_Build 2 46230357 14D TATATGTATT TTTATATATATGTA/-------------- TTTATATATA 2695 het 184 hom 14 2 8 6 TTTATATATATGTA 2 1 292745 CASAVA_Build 2 46232563 1D TTGAAATCCG T/- GAAAGCTGAG 3070 het 3070 ref 44 20 16 9 T 1 0 292746 CASAVA_Build 2 46237021 2D GGGAGTTCAT CA/-- CAGTCTCAGC 3070 het 3070 ref 51 25 20 8 CA 2 1 292747 CASAVA_Build 2 46241225 1D GGGAGGTGAA G/- GGGGGTGTGC 3070 hom 46 het 25 0 17 10 G 6 5 292748 CASAVA_Build 2 46253132 10D GCCTGGGCGG GCCTGGGCGT/---------- GCCTGGGCGG 2820 het 2820 ref 37 18 14 6 GCCTGGGCGT 1 0 292749 CASAVA_Build 2 46273348 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 42 2 30 10 A 13 12 292750 CASAVA_Build 2 46274026 2I TTTTCTGTTT --/TC TCTCGTCTTT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 TC 2 3 292751 CASAVA_Build 2 46285297 1I CAGTCTCATT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 755 hom 23 2 17 4 G 0 1 292752 CASAVA_Build 2 46291695 1D TTCTTGTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 10 9 292753 CASAVA_Build 2 46317709 3I GCCTGCACTT ---/CTC CTCCTCACCC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 CTC 2 3 292754 CASAVA_Build 2 46336988 1D ATCCTAATAG A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 7 292755 CASAVA_Build 2 46345143 1D ATTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2921 het 2921 ref 35 18 9 8 A 11 10 292756 CASAVA_Build 2 46345388 4D AAGAATCATT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 52 17 21 15 TG 11 9 292757 CASAVA_Build 2 46347627 2D AAAAAAAAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 60 het 25 0 20 6 TA 7 6 292758 CASAVA_Build 2 46352333 2D CTTTCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 27 2 12 13 T 14 12 292759 CASAVA_Build 2 46355686 1I AAAAGCAGGC -/A AAAAATTCCT 3070 het 3070 ref 38 22 16 0 A 5 6 292760 CASAVA_Build 2 46360335 1I TAACAAAAAT -/A TTTCCATGTC 3070 het 2138 hom 15 5 9 1 A 0 1 292761 CASAVA_Build 2 46386361 1I CTTGAACTAT -/C CCCCCCATCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 6 7 292762 CASAVA_Build 2 46413416 6D GCCCTGGCAT CCTCTG/------ CCAGAAATCT 3070 het 3070 ref 37 16 15 8 CCTCTG 1 0 292763 CASAVA_Build 2 46436786 1I ACCCCCCCCC -/T CTTTCCAGTT 3070 het 1377 hom 42 7 14 21 T 0 1 292764 CASAVA_Build 2 46455913 2I AGTGCTTGAC --/AG GGGATGGCGC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 AG 0 1 292765 CASAVA_Build 2 46456815 1D TGCTTTTGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 A 10 9 292766 CASAVA_Build 2 46460278 5D4M4D TTGTATTCCC CTGCTTGTATCAT/-----TGTA---- GCGTCCGTCA 3070 het 3070 ref 54 33 23 2 N/A 0 0 292767 CASAVA_Build 2 46465831 2D AATTTCAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 38 1 29 9 T 13 11 292768 CASAVA_Build 2 46468065 4D TGGTCTCACA TGTT/---- TGTTAGCTTG 3070 het 3070 hom 69 24 37 9 TGTT 2 1 292769 CASAVA_Build 2 46476398 1I CATCTCCATT -/A AAAAAAAAAA 2854 het 2854 ref 28 13 11 4 A 11 12 292770 CASAVA_Build 2 46481909 2D TGAAGTATCC AT/-- ATTACTTAGG 3070 het 3070 ref 47 24 18 7 AT 2 1 292771 CASAVA_Build 2 46499027 1D AGGATTTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 36 1 32 3 A 11 10 292772 CASAVA_Build 2 46512217 6D2M3I TTAACAGTAC CAGGCATG---/------TGTAA GAGCTCCTGT 3070 hom 141 het 51 0 47 6 N/A 0 0 292773 CASAVA_Build 2 46512976 1D GGGACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 42 1 35 7 A 12 11 292774 CASAVA_Build 2 46533922 1I AGAAACTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 51 1 39 11 A 10 11 292775 CASAVA_Build 2 46536597 2D GTAGATATAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AT 7 6 292776 CASAVA_Build 2 46546479 1I AGTGAAACTC -/T TGACTCTACT 3070 hom 72 het 27 0 20 7 T 1 2 292777 CASAVA_Build 2 46549148 4D TATATATAAA ATAT/---- ATATGCATAT 3070 hom 57 het 20 0 20 1 AT 4 2 292778 CASAVA_Build 2 46554202 1I TTTAGAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 10 11 292779 CASAVA_Build 2 46567060 2D CATTTATAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 118 het 51 0 40 11 AC 10 9 292780 CASAVA_Build 2 46581552 12D TCTTTCTTTC TTTCTTTCTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTTCTTTCTTTT 1 0 292781 CASAVA_Build 2 46589382 1D ACCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1210 het 1210 ref 27 17 3 7 A 14 13 292782 CASAVA_Build 2 46591115 9D ACTCCATCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAGA 3070 hom 52 het 20 0 15 7 A 17 8 292783 CASAVA_Build 2 46592191 1I CCTTCTGAGC -/A TTGGCCCCTG 3070 hom 112 het 47 0 31 16 A 0 1 292784 CASAVA_Build 2 46593837 16D AACTCATGGT CAGCCAGGATTTAATC/---------------- CAGCCAGGAT 3070 hom 100 het 40 0 34 8 CAGCCAGGATTTAATC 1 0 292785 CASAVA_Build 2 46597384 1I ACTCTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 29 1 24 4 A 11 12 292786 CASAVA_Build 2 46602771 1I TCTCTACAAA -/T TTTTTTTTTT 1391 het 1391 ref 14 4 4 6 T 11 12 292787 CASAVA_Build 2 46611672 1I GGTGAATACG -/T TTTTTTGAAA 3070 het 426 hom 32 1 26 5 T 6 7 292788 CASAVA_Build 2 46615412 4I CTCCTAATGC ----/CTTA CTTACCCTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 CTTA 1 2 292789 CASAVA_Build 2 46619138 1I CTCACTGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 26 0 21 5 A 10 11 292790 CASAVA_Build 2 46621257 13D TTTCTGTAAC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 29 1 22 10 T 27 14 292791 CASAVA_Build 2 46630883 1D GTGTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 1311 het 1311 ref 32 21 4 7 A 15 14 292792 CASAVA_Build 2 46634398 1I AATTTTGGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 4 5 292793 CASAVA_Build 2 46634765 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 12 11 292794 CASAVA_Build 2 46637131 1D ATTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 13 12 292795 CASAVA_Build 2 46659539 2D CATTTCACTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 GT 7 6 292796 CASAVA_Build 2 46661748 2D AGTGGCCAAG GA/-- AACTGTCCAT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 GA 1 0 292797 CASAVA_Build 2 46668083 1D GGTAAAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 38 1 32 6 A 11 10 292798 CASAVA_Build 2 46671177 5I TACAAAATGA -----/TATGT TTATTATATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TATGT 0 1 292799 CASAVA_Build 2 46675180 2D AGAGTTAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 35 2 20 13 T 16 14 292800 CASAVA_Build 2 46685125 1I CTAATGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 11 12 292801 CASAVA_Build 2 46692606 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 19 0 15 4 T 11 10 292802 CASAVA_Build 2 46697587 1I TGAGGCGAGA -/G CGCCGAGGGC 3070 hom 59 het 22 0 18 4 G 0 1 292803 CASAVA_Build 2 46712749 1I GATGGTGAGA -/C CCCCATCTCT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 4 5 292804 CASAVA_Build 2 46712931 1I TTCTCTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 19 1 15 3 A 10 11 292805 CASAVA_Build 2 46718545 1D GGTTGAGTGC T/- TTTTTTTTTT 2002 het 520 hom 42 5 9 28 T 19 18 292806 CASAVA_Build 2 46732912 1I AGAATGGTGC -/A CTGGTCCATA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 0 1 292807 CASAVA_Build 2 46743648 1I TTGCTTGTGG -/A AAAAAGTAAA 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 A 5 6 292808 CASAVA_Build 2 46753670 11D CTTATTCCCC AGCTAATGCAT/----------- AGCTAATGCA 3070 het 3070 hom 25 11 10 8 AGCTAATGCAT 2 1 292809 CASAVA_Build 2 46756418 1D GAGCCATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 T 12 11 292810 CASAVA_Build 2 46759236 1I TGCTAATGTC -/A ATGAAGAGAG 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 1 2 292811 CASAVA_Build 2 46760567 1I ATTTTCAACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 T 8 9 292812 CASAVA_Build 2 46796015 1D ACACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 27 10 A 14 13 292813 CASAVA_Build 2 46802977 1D GTCAAGGGGG A/- AAAAAATCTG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 7 6 292814 CASAVA_Build 2 46824640 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 28 1 22 5 T 11 10 292815 CASAVA_Build 2 46847641 1I ATAGGAACAT -/G AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 0 1 292816 CASAVA_Build 2 46850176 2D ACTCTCTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 23 0 18 7 A 14 12 292817 CASAVA_Build 2 46854215 4D GTGAGTTACA CAAT/---- CAAATCAGAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CAAT 1 0 292818 CASAVA_Build 2 46861884 11I ATGACCGTGG -----------/GGCCTGGCCGT GCATGGGCAG 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 GGCCTGGCCGT 0 1 292819 CASAVA_Build 2 46864685 1I TTAATCTGGC -/T CTTTGGTTAA 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 0 1 292820 CASAVA_Build 2 46869956 1D GTTATGATTG C/- CTATTTTATT 3070 het 3070 hom 45 20 17 8 C 2 1 292821 CASAVA_Build 2 46870897 2D TACACTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 7 A 12 10 292822 CASAVA_Build 2 46871620 2D ATATTTGAAC CT/-- AATGAAAATG 3070 het 3070 ref 37 18 15 7 CT 1 0 292823 CASAVA_Build 2 46876501 1D TTTATTGTGG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 92 het 36 0 30 6 T 9 8 292824 CASAVA_Build 2 46877852 1I CACCATGAAC -/A CAAGGGCTGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 0 1 292825 CASAVA_Build 2 46881799 1I GGCCCTCCTT -/C CCCCCGGTCC 3070 hom 75 het 33 0 23 10 C 5 6 292826 CASAVA_Build 2 46904532 1I CTGCGGTTCT -/G GGGCTGCTAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 G 3 4 292827 CASAVA_Build 2 46910780 1D TTCAAAGCCC A/- GCTCATGCCC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 1 0 292828 CASAVA_Build 2 46913901 1D ATCACATAAC A/- ATGTCATCTT 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 A 2 1 292829 CASAVA_Build 2 46922513 1D AGCAAGTTCC T/- TTTAAAGAAG 3070 hom 123 het 46 0 41 6 T 4 3 292830 CASAVA_Build 2 46953565 1D CAAAGCCTGA G/- GGGGATCCTG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 G 5 4 292831 CASAVA_Build 2 46976425 3D TATTTATTTA TTT/--- TTTTTTTAAC 509 het 44 hom 21 1 3 17 T 10 7 292832 CASAVA_Build 2 47003198 1D CCCCAGTCAA G/- GGGGCAAGGC 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 G 5 4 292833 CASAVA_Build 2 47007618 4I AAATATAACG ----/GATA GATAGATTGA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 GATA 1 2 292834 CASAVA_Build 2 47047235 1D ATGCTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 27 0 23 5 T 12 11 292835 CASAVA_Build 2 47049771 1I ACAGTATGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2823 hom 18 6 10 2 T 8 9 292836 CASAVA_Build 2 47052252 3I GAGGCCAGTT ---/AGG AGGCCGATGT 3070 hom 115 het 46 0 37 9 AGG 1 2 292837 CASAVA_Build 2 47053722 1I AACTGTATGC -/T TTTTCAATTA 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 4 5 292838 CASAVA_Build 2 47056731 1D CCCTTGGTTC A/- ATGCTAAGGG 2865 het 2865 ref 31 20 8 4 A 2 1 292839 CASAVA_Build 2 47057690 2I TGTGGTTGGG --/GA AGGAAACTTT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 GA 0 1 292840 CASAVA_Build 2 47073953 1I GTTACAACTC -/T TAACTTTTCA 3070 hom 92 het 34 0 28 6 T 1 2 292841 CASAVA_Build 2 47077609 6D TTTTGTGGTG GTTGTT/------ GTTGTTGTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 4 GTT 9 7 292842 CASAVA_Build 2 47083832 6I GTCACACCCT ------/GCGAAG GCAGGTTGAG 3070 het 3070 ref 46 21 14 11 GCGAAG 0 1 292843 CASAVA_Build 2 47086833 7I TGACCTCGGC -------/AGACTTG AAGTTGTACA 3070 het 3070 hom 59 22 29 8 AGACTTG 0 1 292844 CASAVA_Build 2 47098579 2D CAAAATATGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 AT 6 5 292845 CASAVA_Build 2 47100378 5D GAAGCTGGCA TTTGC/----- TGAGCAGAAG 3070 hom 135 het 49 0 45 6 TTTGC 1 0 292846 CASAVA_Build 2 47107317 4D TTCTGTCCTA TTCC/---- TTAGTTTTCT 3070 hom 110 het 44 0 36 9 TTCC 1 0 292847 CASAVA_Build 2 47108511 1I CCAGGACTGG -/C CAGCCTCTTT 3070 hom 84 het 34 0 26 8 C 1 2 292848 CASAVA_Build 2 47110682 2I AGGGGGAGTC --/TT TTGATTTCTG 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 2 4 292849 CASAVA_Build 2 47118902 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 17 3 12 2 A 16 15 292850 CASAVA_Build 2 47123147 1D TTGTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 4 A 11 10 292851 CASAVA_Build 2 47134000 1I AGGGGCCGCA -/T TGGAGCCCCA 2607 het 2084 hom 22 7 9 6 T 1 2 292852 CASAVA_Build 2 47134899 7D TTCTCATGTA ACAGTTT/------- ACAGTTTACA 3070 hom 131 het 50 0 42 12 ACAGTTT 2 1 292853 CASAVA_Build 2 47137554 1D TCTGACCCCT C/- CCCCCCATCC 3070 hom 40 het 32 0 13 19 C 7 6 292854 CASAVA_Build 2 47173443 2D CACGGTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 17 1 12 4 T 13 11 292855 CASAVA_Build 2 47179871 4D CATCCTCTGT TTTC/---- TTAGGAGGCC 3070 hom 102 het 36 0 32 5 TTTC 1 0 292856 CASAVA_Build 2 47192663 1D TATCAAGAGG C/- CTTCGGGCAC 3070 het 3070 ref 54 27 24 3 C 2 1 292857 CASAVA_Build 2 47198571 3D ATATATATAT ATA/--- TTTTTTTTTT 397 het 52 hom 14 1 3 12 ATA 1 0 292858 CASAVA_Build 2 47201210 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 414 hom 33 1 30 2 A 12 11 292859 CASAVA_Build 2 47203330 1D GTTTTCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 25 1 20 5 T 11 10 292860 CASAVA_Build 2 47206368 1I TTAGATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 17 1 13 3 T 13 14 292861 CASAVA_Build 2 47220051 2I TCCTGCTTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 22 1 14 7 T 12 14 292862 CASAVA_Build 2 47222918 1D CTTTTTGACC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 70 het 27 0 21 6 A 9 8 292863 CASAVA_Build 2 47228600 1I TACATATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 28 2 21 5 T 13 14 292864 CASAVA_Build 2 47232844 2D GCTTAGCCAA TG/-- TAGGATGTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TG 1 0 292865 CASAVA_Build 2 47249427 1D AGACACAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 14 1 10 3 T 12 11 292866 CASAVA_Build 2 47252775 2D TGAAGTCAGT CA/-- CAGATTGTTT 3070 hom 66 het 23 0 22 2 CA 2 1 292867 CASAVA_Build 2 47275148 5I TCCATTCTTC -----/TAATG TATTTACCAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TAATG 0 1 292868 CASAVA_Build 2 47333039 1I TTTTTTATTC -/T TTTTTTTTCT 1463 het 1463 ref 29 19 7 3 T 8 9 292869 CASAVA_Build 2 47343537 1I CTGCCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 2262 het 2262 ref 38 17 10 11 A 13 14 292870 CASAVA_Build 2 47351075 1I AATTGGTACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 9 10 292871 CASAVA_Build 2 47351731 1I ACTCATTCTC -/A AAAAAAAAAA 2647 het 1812 hom 14 5 8 1 A 10 11 292872 CASAVA_Build 2 47352508 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2456 het 2456 ref 27 13 7 7 T 13 14 292873 CASAVA_Build 2 47354324 2I GTCACTTCCC --/CA GACACCCCCA 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 CA 0 1 292874 CASAVA_Build 2 47361947 2D TATTTTTGGT AG/-- AGACAGGGTT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 AG 2 1 292875 CASAVA_Build 2 47380745 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 7 8 292876 CASAVA_Build 2 47384088 1D AATGAAAGAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 9 8 292877 CASAVA_Build 2 47386941 1D AGACCCTATG T/- TAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 12 10 8 T 2 1 292878 CASAVA_Build 2 47394421 2I CTGTCCTCAG --/TC TCTCTCTCTG 2493 het 2493 ref 26 12 6 8 TC 4 5 292879 CASAVA_Build 2 47396599 3D TGAAAAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 42 14 16 12 AAC 4 3 292880 CASAVA_Build 2 47402135 2I AGCTGACATT --/TC TCTGTGTCTA 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 TC 1 2 292881 CASAVA_Build 2 47431849 1I CAGGCATAGT -/G GCATGCACCT 1371 het 1371 ref 26 17 3 6 G 1 2 292882 CASAVA_Build 2 47457623 1I GGTACAAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 9 10 292883 CASAVA_Build 2 47466369 2I TTCACATATC --/TG TCAATTTTTG 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 TG 0 1 292884 CASAVA_Build 2 47496016 1D CTCGAATTGC T/- TTTTTTTTTT 1972 het 1972 ref 34 19 5 10 T 15 14 292885 CASAVA_Build 2 47496438 25D TGGCTGGGTG ACGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAA/------------------------- CGCTTTGGGA 2954 het 2954 ref 24 12 7 7 ACGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAA 1 0 292886 CASAVA_Build 2 47503294 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3005 het 1527 hom 14 5 8 1 A 12 11 292887 CASAVA_Build 2 47505536 1D ACTTTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 16 8 A 13 12 292888 CASAVA_Build 2 47505643 3D ATCTATCCTC CTT/--- GTTTGTTCTT 3070 het 3070 hom 41 21 19 3 CTT 1 0 292889 CASAVA_Build 2 47518063 16D TATTCCTGAC AAATAAATAAATAAAT/---------------- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 20 9 12 4 AAAT 8 4 292890 CASAVA_Build 2 47518938 1D TGTTCAGCTT C/- CCCCACACTC 3070 het 3070 hom 49 17 24 9 C 5 4 292891 CASAVA_Build 2 47523118 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 2100 het 2100 ref 22 11 6 5 AT 6 7 292892 CASAVA_Build 2 47527116 3I CTTCTAAAAT ---/TTC TTGTTAATTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TTC 0 1 292893 CASAVA_Build 2 47528429 1D TTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1239 het 435 hom 20 6 6 8 T 19 18 292894 CASAVA_Build 2 47532330 3I AAGAGTAGTT ---/CTC CTCTTCCTGC 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 CTC 1 2 292895 CASAVA_Build 2 47533590 2D ATGATTTCAG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 16 19 7 CA 8 7 292896 CASAVA_Build 2 47555557 3I AGTGTAAATT ---/AGG AGGAAATGGG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 AGG 1 2 292897 CASAVA_Build 2 47566491 1D TTAGCTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 22 20 7 T 11 10 292898 CASAVA_Build 2 47572599 1D TCCTATTTGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 38 24 13 1 T 8 7 292899 CASAVA_Build 2 47577881 1I TAAAACTGGA -/G GGGGGGCATG 2893 het 2893 ref 30 14 9 7 G 6 7 292900 CASAVA_Build 2 47585121 4I GAAAGAAAGA ----/CAGC CAGGCCCACT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 CAGC 0 1 292901 CASAVA_Build 2 47588087 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2828 hom 18 7 8 3 A 10 11 292902 CASAVA_Build 2 47591338 5D ATTTTTAGAA CTTAT/----- CTTAGGGCAA 3070 het 3070 hom 48 22 22 6 CTTAT 1 0 292903 CASAVA_Build 2 47615076 1I CGTCTCCAGG -/C CCCCCCCCAC 2307 het 955 hom 14 5 6 3 C 8 9 292904 CASAVA_Build 2 47677605 4D ATCCTGTGAT GCTC/---- ACCCCCAACC 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 GCTC 1 0 292905 CASAVA_Build 2 47703595 1I CATGCAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 T 10 11 292906 CASAVA_Build 2 47712280 2D CGCGTGCGCG CA/-- CACACACACA 1199 het 1199 ref 50 32 5 14 CA 10 9 292907 CASAVA_Build 2 47723440 1I TGGAAATAGC -/G TCCTAATCCA 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 G 0 1 292908 CASAVA_Build 2 47729127 2I CTCAAAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 A 13 15 292909 CASAVA_Build 2 47754616 1I CCCTTGCATC -/G GGGGGGGAAG 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 G 7 8 292910 CASAVA_Build 2 47754870 1D GCTCTAGCAG C/- CCCCGGACTG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 C 5 4 292911 CASAVA_Build 2 47755357 1D CCCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1274 hom 26 8 11 7 A 15 14 292912 CASAVA_Build 2 47757737 1I AAAAAAATCC -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 6 7 292913 CASAVA_Build 2 47801455 4I AGACAAACAT ----/AAAC AAACATCAGC 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 AAAC 1 2 292914 CASAVA_Build 2 47802541 1I AGGACCCTGC -/G GGCCTTCCGC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 2 3 292915 CASAVA_Build 2 47806481 1D ATCTCTATAA T/- TTTTTTTTTT 2086 het 1852 hom 18 6 9 3 T 15 14 292916 CASAVA_Build 2 47806647 1D CTCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 14 12 2 A 10 9 292917 CASAVA_Build 2 47835921 1D TGGGGGGGGT G/- GGGGGGCGGT 3070 hom 30 het 17 0 10 7 G 7 6 292918 CASAVA_Build 2 47853663 1D TCTCAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 1540 het 1540 ref 23 13 4 6 A 13 12 292919 CASAVA_Build 2 47860037 1I GGGTCTGAGT -/G GTCCCCACAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 G 1 2 292920 CASAVA_Build 2 47867167 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 3070 hom 74 het 29 0 24 5 G 3 4 292921 CASAVA_Build 2 47885193 2D AAAAAAAAAA AG/-- GTGCAGAGAT 3070 het 1496 hom 23 8 10 6 AG 1 0 292922 CASAVA_Build 2 47894409 1I ATTAACACAG -/A AAAAAAGATG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 6 7 292923 CASAVA_Build 2 47912976 4D TTTCTATTAA AAAT/---- AAGTGTTCTT 3070 het 3070 ref 42 21 19 3 AAAT 1 0 292924 CASAVA_Build 2 47929800 1I TCTAACTGCT -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 7 8 292925 CASAVA_Build 2 47956142 1D TTTTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 29 9 T 12 11 292926 CASAVA_Build 2 47962398 1I CATTTTAGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2497 hom 22 7 10 5 T 9 10 292927 CASAVA_Build 2 47967145 1I CGAGACTCTC -/A AAAAAAAAAA 829 het 829 ref 11 5 4 2 A 17 18 292928 CASAVA_Build 2 47970277 1D AGTGAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 34 1 25 8 T 13 12 292929 CASAVA_Build 2 48027246 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 15 11 T 14 13 292930 CASAVA_Build 2 48029314 4I AAACGTGCTT ----/AATC AATTAATCTC 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 AATC 0 1 292931 CASAVA_Build 2 48029732 1D AAGACTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1138 het 1138 ref 23 12 6 5 A 17 16 292932 CASAVA_Build 2 48041983 1I TATCCTAAGC -/A AAAATAATAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 4 5 292933 CASAVA_Build 2 48047192 2D CAGCCCAAAC TT/-- ACTGAATAAG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 2 0 292934 CASAVA_Build 2 48047955 1D TGAGCTGCAC T/- TTTTTTTTTT 1763 het 1763 ref 44 31 5 8 T 11 10 292935 CASAVA_Build 2 48050406 1D TAATTTGCAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 T 8 7 292936 CASAVA_Build 2 48060628 2D CATATGTGTG TA/-- TATATATATA 1789 het 1789 ref 15 9 6 0 TA 6 5 292937 CASAVA_Build 2 48064231 1I AATTCCAGGA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 6 7 292938 CASAVA_Build 2 48087919 2D TTCCCCCTCA TT/-- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 35 14 20 2 T 10 8 292939 CASAVA_Build 2 48089425 1I ACTTTTGAAA -/T TTTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 T 5 6 292940 CASAVA_Build 2 48091357 1I TTCTTCTTTA -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 T 7 8 292941 CASAVA_Build 2 48102824 1I GATCTCAGCT -/C CCTGTAACCT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 C 2 3 292942 CASAVA_Build 2 48107325 1I CAGGACATTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3045 hom 25 9 11 5 T 9 10 292943 CASAVA_Build 2 48120087 4I TCTTTCTTTC ----/TTTT TCTTTCTTTC 2905 het 2905 ref 27 15 8 4 T 1 5 292944 CASAVA_Build 2 48130784 1D GGAAAGGTGC G/- GGGGGGATGG 3070 het 3070 ref 34 12 14 8 G 7 6 292945 CASAVA_Build 2 48158039 1I TAAATCTTTA -/G GGGAAAGGGT 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 G 3 4 292946 CASAVA_Build 2 48167812 1D ATAAGTAGTT A/- TTTGGGGTTG 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 A 1 0 292947 CASAVA_Build 2 48179489 1D GGGCACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 947 hom 21 5 10 6 A 13 12 292948 CASAVA_Build 2 48181654 2D TACAAATGGC AA/-- AGAGTAAAGA 3070 het 3070 hom 37 18 18 3 A 3 1 292949 CASAVA_Build 2 48201097 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 747 hom 24 5 9 10 T 13 12 292950 CASAVA_Build 2 48220722 5D TTTTGTTTAA ATTTT/----- ATTTTATTTC 3070 het 2689 hom 22 7 15 2 ATTTT 2 1 292951 CASAVA_Build 2 48234866 1D GAACTGCAGC T/- TTTTTTTTTT 2621 het 1716 hom 27 8 9 10 T 17 16 292952 CASAVA_Build 2 48250742 2I TTTTCGAGAC --/AG AGTTTTGCTC 3070 het 3070 hom 22 10 12 0 AG 1 2 292953 CASAVA_Build 2 48256012 12I AAACAAAAAC ------------/CATGTGGTTTTT GTGACTGTTT 3070 het 3070 hom 51 21 26 5 CATGTGGTTTTT 0 1 292954 CASAVA_Build 2 48280615 1I TCGTTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2838 hom 29 7 14 8 A 11 12 292955 CASAVA_Build 2 48297085 1D TGGTCTGTAT A/- AATAGTCAAC 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 A 3 2 292956 CASAVA_Build 2 48302318 1D ATTGCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 13 12 292957 CASAVA_Build 2 48309021 1D TATGAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 15 10 T 15 14 292958 CASAVA_Build 2 48341536 8D CCTCTGCCCC TTCTCCCA/-------- TTCTCCCATT 3070 hom 129 het 54 0 43 14 TTCTCCCA 3 2 292959 CASAVA_Build 2 48354493 2D TTTTGCAAGA AT/-- ATCTTGAATG 3070 het 3070 hom 46 21 22 5 AT 2 1 292960 CASAVA_Build 2 48367957 1D TCTCAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 1331 het 1331 ref 45 32 3 10 T 12 11 292961 CASAVA_Build 2 48397595 3I GAAAAGTTAA ---/TAG ATAAAGATAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TAG 0 1 292962 CASAVA_Build 2 48442110 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1341 het 966 hom 16 8 4 4 A 16 15 292963 CASAVA_Build 2 48444029 1D AAATTAAAAA G/- TTTATAAAGT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 G 1 0 292964 CASAVA_Build 2 48459332 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1493 het 1493 ref 26 15 6 5 T 15 14 292965 CASAVA_Build 2 48475163 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 12 11 A 12 13 292966 CASAVA_Build 2 48481913 1D GGGGTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1429 het 1429 ref 35 21 7 7 T 17 16 292967 CASAVA_Build 2 48491498 1D TTGCTGGAAA C/- CCTGGGTTGA 2723 het 2723 ref 33 17 7 10 C 3 2 292968 CASAVA_Build 2 48526744 10D ATGTATAAAT GTCAAAAAAA/---------- GTCCACTGCA 3070 het 3070 hom 55 27 28 7 GTCAAAAAAA 1 0 292969 CASAVA_Build 2 48529226 29D CAGGGGTATG AAATAAAATCTAACGTCTTTAGATTTATA/----------------------------- AAATAAAATC 3070 het 3070 ref 33 18 18 7 AAATAAAATCTAACGTCTTTAGATTTATA 1 0 292970 CASAVA_Build 2 48565673 1I GGATGAGCAA -/G TTCAGTATAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 292971 CASAVA_Build 2 48572201 3D AGAAAAAAAA AAG/--- AGAGAAGATA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AAG 1 0 292972 CASAVA_Build 2 48574241 4D AAAAAAATAC ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 4 ATAA 3 2 292973 CASAVA_Build 2 48584596 1I ACTATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 21 0 14 7 A 16 17 292974 CASAVA_Build 2 48593853 1D TTCCTCTGAC T/- TTTTTTTTTT 1138 het 1138 ref 27 19 3 5 T 11 10 292975 CASAVA_Build 2 48603154 2D AACCAAAAAC AA/-- GAGACTGGGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 2 0 292976 CASAVA_Build 2 48613081 1D AAGTAAGTCC A/- AAAAAAAAAA 2520 het 1743 hom 18 6 8 4 A 15 14 292977 CASAVA_Build 2 48667367 1I GGTTGTTTTC -/A GGCATGACTG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 0 1 292978 CASAVA_Build 2 48687789 1D CTAAGAAACT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 9 8 292979 CASAVA_Build 2 48688787 1D TCTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2267 hom 22 7 13 3 T 10 9 292980 CASAVA_Build 2 48703587 2I AAATAACAAA --/AT AGTCTTGCAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 AT 0 1 292981 CASAVA_Build 2 48714541 3I GCCTTCTTTG ---/TCT TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 TCT 0 1 292982 CASAVA_Build 2 48723504 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 483 hom 26 2 16 9 A 13 12 292983 CASAVA_Build 2 48740739 1I CAGTATGATT -/G TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 G 0 1 292984 CASAVA_Build 2 48746855 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 911 het 911 ref 15 10 2 3 T 12 13 292985 CASAVA_Build 2 48747759 1I TCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2926 het 1109 hom 19 3 10 6 T 15 16 292986 CASAVA_Build 2 48759699 1I AAGGCAGGGA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 408 hom 37 1 32 4 T 8 9 292987 CASAVA_Build 2 48766433 4I GGGTTGAGTC ----/AAAG AAGCCTTATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAAG 0 1 292988 CASAVA_Build 2 48777476 1I TTCACATGCC -/A AGTGATTTCA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 1 2 292989 CASAVA_Build 2 48793871 2D TGATTTTAAA AG/-- CCTTTTTTGT 3070 hom 123 het 44 0 42 5 AG 1 0 292990 CASAVA_Build 2 48808731 1D ACATTATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2632 hom 32 9 15 8 T 15 14 292991 CASAVA_Build 2 48869688 4I30M1D GTTAATTAGC ----TCATTCATTTCTTTATTCCATATTAATGGGT/TCAATCATTCATTTCTTTATTCCATATTAATGGG- TTTTTTGTGG 3070 hom 123 het 46 0 41 15 N/A 0 0 292992 CASAVA_Build 2 48880650 4D ACAAACAAAC AAAA/---- AAAAAACCCA 3070 hom 122 het 49 0 42 7 A 10 6 292993 CASAVA_Build 2 48881792 1D TTTTCGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 24 1 21 4 T 12 11 292994 CASAVA_Build 2 48891120 1D TCACTAAAGC T/- GTAAAACTCG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 0 292995 CASAVA_Build 2 48950721 1I AATTAGCAGC -/T TTTTTTTTTT 1426 het 1426 ref 52 34 6 12 T 13 14 292996 CASAVA_Build 2 48973126 1D AATGTAAAGA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 28 14 10 6 T 8 7 292997 CASAVA_Build 2 48975824 8I GCTGGAGTGA --------/AATTACTG AATTACTGAC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 AATTACTG 1 2 292998 CASAVA_Build 2 48977270 1I CTGCCCCCCC -/T CGAAGCCCAA 3070 het 3070 hom 52 19 26 7 T 0 1 292999 CASAVA_Build 2 49008591 1I TCAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2863 hom 33 9 15 9 A 10 11 293000 CASAVA_Build 2 49011567 1I GCAATACGCA -/C CCCCCTGCCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 5 6 293001 CASAVA_Build 2 49026348 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 26 4 17 5 A 16 14 293002 CASAVA_Build 2 49045637 4D TTTTGGATGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 9 15 A 16 12 293003 CASAVA_Build 2 49055402 1D TTTATATTAG C/- CAGGGACAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 2 1 293004 CASAVA_Build 2 49065238 2I TATTTTTTTT --/TG TTTTGTAATA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TG 0 1 293005 CASAVA_Build 2 49066069 1I ACGCATATCA -/C CTCATTTTAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 293006 CASAVA_Build 2 49071536 2I AGTATACATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 10 12 293007 CASAVA_Build 2 49075274 1I TAAATTCATG -/T CTGATGGAGG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 293008 CASAVA_Build 2 49079926 1I CCACTACCTT -/A GGAGACAGGT 3070 hom 129 het 45 0 42 3 A 0 1 293009 CASAVA_Build 2 49088822 1I CCTCCCCCCT -/C CCCCCACCCC 870 hom 5 het 3 0 2 1 C 5 6 293010 CASAVA_Build 2 49097445 3I TTCTCTTGAT ---/GAG GAAACAATAT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 GAG 0 1 293011 CASAVA_Build 2 49099477 2D CACGCGCATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 87 het 38 0 30 9 CA 7 6 293012 CASAVA_Build 2 49101151 2D TCAGTAAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2623 hom 42 10 20 12 T 16 14 293013 CASAVA_Build 2 49102212 1I GAAGGCCCCT -/G GGGGGAGGGG 2712 het 2712 ref 33 11 10 12 G 5 6 293014 CASAVA_Build 2 49102928 4I AAATTATTAG ----/AACA AACAAAGTAA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 AACA 1 2 293015 CASAVA_Build 2 49117141 12D TTTGCATCTG TATATCTATATC/------------ TATATCTATA 3070 het 3070 ref 20 11 9 2 TATATC 4 2 293016 CASAVA_Build 2 49119776 1D TTTACAGGTT A/- TTTTGTTGTA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 1 0 293017 CASAVA_Build 2 49120568 2D ACATTGGTGG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 226 hom 24 3 10 13 T 11 9 293018 CASAVA_Build 2 49120952 1I GTACCTCAGA -/C CTGGGGAGTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 C 1 2 293019 CASAVA_Build 2 49121490 1D ATGTGCTGAG A/- AGCAGTGCAG 3070 hom 123 het 42 0 42 0 A 2 1 293020 CASAVA_Build 2 49123241 1D TTACTAAATC T/- TTTTGAATTC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 5 4 293021 CASAVA_Build 2 49127649 11I ATCAGCCTGC -----------/TTGAGACAAAT ACTTGTCTCA 3070 het 3070 hom 46 19 27 1 TTGAGACAAAT 0 1 293022 CASAVA_Build 2 49128906 1D TGAGGATGAT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 A 9 8 293023 CASAVA_Build 2 49129832 1D AGCAAGGAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 10 9 293024 CASAVA_Build 2 49130468 12D CCCTACTCTA ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 3070 hom 27 het 19 0 10 11 AT 13 7 293025 CASAVA_Build 2 49144076 2D AAGAAAATGC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 TA 8 7 293026 CASAVA_Build 2 49144898 1I TGGTTTAAAT -/G ATTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 50 23 24 3 G 0 1 293027 CASAVA_Build 2 49156083 4D AAATAACAAT AAAC/---- AAGATCAACA 3070 het 3070 ref 25 13 9 5 AAAC 1 0 293028 CASAVA_Build 2 49170370 15D TGTCTTGATT TTTGACAGTTCCTAA/--------------- TTTGACAGTA 3070 het 3070 ref 30 18 10 9 TTTGACAGTTCCTAA 1 0 293029 CASAVA_Build 2 49171777 3D CAACTTACCA TTT/--- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 10 7 293030 CASAVA_Build 2 49174561 1D AAACATTATA T/- TTAAAATGGA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 3 2 293031 CASAVA_Build 2 49183490 6I GATTTCTGCC ------/ACCTAA ACGGTTTGTT 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 ACCTAA 0 1 293032 CASAVA_Build 2 49202440 1I ATAGCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 11 12 293033 CASAVA_Build 2 49206969 1I AAAGGAAGAG -/A GGGGGGAGAG 3070 hom 105 het 37 0 34 3 A 0 1 293034 CASAVA_Build 2 49209322 1D TTGAATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 12 11 293035 CASAVA_Build 2 49215872 1I TAAAAAAAAA -/T CTTCAATATT 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 0 1 293036 CASAVA_Build 2 49219263 1I ATATTGTATG -/A ATCCCACTCA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 1 2 293037 CASAVA_Build 2 49222428 1I GAGTTTAGAC -/T TTTACTTTAG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 3 4 293038 CASAVA_Build 2 49225268 12D TGTTGCATTT TCTAATGTCCTC/------------ TCCAATGTAT 188 het 188 ref 32 17 4 18 TCTAATGTCCTC 1 0 293039 CASAVA_Build 2 49242216 1I TCCGGGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 32 1 27 4 T 10 11 293040 CASAVA_Build 2 49248401 1D TATGTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 540 hom 29 3 16 10 T 17 16 293041 CASAVA_Build 2 49267719 1I CACTCATAGT -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 6 7 293042 CASAVA_Build 2 49286886 10I AAACACAGAC ----------/CGTACATGGT CAAGAGAAAT 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 CGTACATGGT 0 1 293043 CASAVA_Build 2 49290966 4D GCAGGGGGAG GGGT/---- GGGTGTCTGC 3070 het 3049 hom 29 9 11 9 GGGT 2 1 293044 CASAVA_Build 2 49292689 1D GGGCTAAATG C/- CCCCAATTAA 1962 het 1962 ref 21 14 5 2 C 5 4 293045 CASAVA_Build 2 49296743 15D CAAGGTATTG GCTGGGGCTGTAGTT/--------------- GCTGGCAGGA 3070 het 3070 ref 37 24 9 10 GCTGGGGCTGTAGTT 1 0 293046 CASAVA_Build 2 49303554 1D ATTCCACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 6 A 12 11 293047 CASAVA_Build 2 49306690 1D ATGTAAAAGG T/- TAGATATTTC 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 T 2 1 293048 CASAVA_Build 2 49307949 1D ACAAACAAAC A/- AACAAACAAA 3070 hom 40 het 35 1 26 8 A 3 2 293049 CASAVA_Build 2 49312138 3I TGTTATTTTA ---/AAG AAGTCTGTTT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 AAG 1 2 293050 CASAVA_Build 2 49313622 1D GACGCTGTTT G/- CCTGGGTATC 2106 het 1360 hom 15 4 6 5 G 1 0 293051 CASAVA_Build 2 49317654 1I TAGATGCTTG -/C CCAATCAGAT 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 C 2 3 293052 CASAVA_Build 2 49330434 1I AGTTTCTTTT -/A ATATTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 A 1 2 293053 CASAVA_Build 2 49332765 1I TTCCAGAGCC -/T TTTTCTCTAG 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 T 4 5 293054 CASAVA_Build 2 49333492 1I ATATCATTAG -/T TACCCCCATT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 1 2 293055 CASAVA_Build 2 49337203 1I TCTGCTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 11 12 293056 CASAVA_Build 2 49338097 1D CGGTTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 2363 het 2363 ref 42 22 8 12 T 13 12 293057 CASAVA_Build 2 49343569 4I ATTCTCTCTC ----/TCTT GTTTTGAAGT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 TCTT 0 1 293058 CASAVA_Build 2 49347231 1D TACCAGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 12 11 293059 CASAVA_Build 2 49349978 1D ATGTCATTGC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 8 7 293060 CASAVA_Build 2 49350766 1I AACTTAATCA -/C CCCCTAGAGC 3070 hom 84 het 32 0 27 5 C 4 5 293061 CASAVA_Build 2 49365682 1D AGGAAAAAAG A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 26 13 11 3 A 7 6 293062 CASAVA_Build 2 49366574 1D ATGTCATTTG C/- CAGATGCTGC 3070 het 3070 hom 52 20 27 7 C 2 1 293063 CASAVA_Build 2 49367458 2I TGAAGAAGAC --/TT TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 8 10 293064 CASAVA_Build 2 49367829 5D CTGTGAAGAG AAGAA/----- AAGTATAAAC 3070 hom 126 het 45 0 43 3 AAGAA 1 0 293065 CASAVA_Build 2 49368138 4D49M4D ACATACACAA ACACACACACACACACACACACAGCACAAACTTATTATGAATCTTACTGACATAAAG/----ACACACACACACACACACAGCACAAACTTATTATGAATCTTACTGACAT---- GATGTGTGGC 3070 hom 57 het 36 1 39 13 N/A 0 0 293066 CASAVA_Build 2 49371911 3I TGTTTAGCTA ---/TTG TTGTTTTGTT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 TTG 1 2 293067 CASAVA_Build 2 49372540 4D ACTAACTAGA TTCG/---- TTCGTCAGTG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TTCG 2 1 293068 CASAVA_Build 2 49378520 1D TATTTCTATT G/- GTAAGTCTTC 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 G 2 1 293069 CASAVA_Build 2 49390886 1I CTGTTGAGGT -/G GGGGGGGGGG 1450 het 100 hom 17 1 5 11 G 10 11 293070 CASAVA_Build 2 49403593 1D GTGTTTGCTT C/- CCCTGACACC 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 C 4 3 293071 CASAVA_Build 2 49404685 1D ATCAACAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 33 hom 35 1 31 3 A 10 9 293072 CASAVA_Build 2 49408852 1I ACAAAAGCAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 8 9 293073 CASAVA_Build 2 49422698 2D AGAATGAATC AA/-- AGACAGCTTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 A 3 1 293074 CASAVA_Build 2 49426475 1I TTTCTTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 31 1 27 3 T 10 11 293075 CASAVA_Build 2 49462606 2D CCACTGCTCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 69 het 32 0 24 10 GT 10 9 293076 CASAVA_Build 2 49474071 1I AGTCAGAATT -/C TTTGTATTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 0 1 293077 CASAVA_Build 2 49481679 1I CTCCTCACAT -/G GGTTATCTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 2 3 293078 CASAVA_Build 2 49482977 1D TGTTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 18 0 11 7 A 11 10 293079 CASAVA_Build 2 49484718 1I CCTTGGATTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 1001 hom 45 3 38 4 A 0 1 293080 CASAVA_Build 2 49485292 6I ATGTGACCAG ------/TACTGA TCACAACTTT 3070 hom 181 het 63 0 61 2 TACTGA 0 1 293081 CASAVA_Build 2 49487915 2D CATGTGTGGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 67 het 27 0 23 4 T 11 9 293082 CASAVA_Build 2 49488072 1D GGTGTCCCTC A/- ACTGGATCTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 2 1 293083 CASAVA_Build 2 49495722 1D ATGCGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 10 9 293084 CASAVA_Build 2 49496078 4I GGAAAAAAAG ----/AGTT AGTTATTTCT 3070 hom 109 het 39 0 35 5 AGTT 1 2 293085 CASAVA_Build 2 49513549 3D ACACATGTAC TTT/--- TTTTCCTTTA 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 T 7 4 293086 CASAVA_Build 2 49528829 1I ATATATATAT -/A TTTTAATGGA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 0 1 293087 CASAVA_Build 2 49557469 1D ATGCTTAACT A/- AAATTGCCAT 3070 hom 69 het 26 0 24 5 A 4 3 293088 CASAVA_Build 2 49570772 1I GAGCAGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 13 14 293089 CASAVA_Build 2 49571459 1I AGGTCCCCAG -/C CCTCTAGCCC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 C 2 3 293090 CASAVA_Build 2 49573571 1I AAGAAACTTA -/C AGCAAAACTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 0 1 293091 CASAVA_Build 2 49574427 1I TCCACGTTTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 8 9 293092 CASAVA_Build 2 49575349 2I AGGAAAAAAC --/AG AGAATACCCA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AG 1 2 293093 CASAVA_Build 2 49579692 1I AGAGATAATT -/G GGGGCCAGTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 4 5 293094 CASAVA_Build 2 49581178 1D CTATTTCCTA T/- GAAAAAATGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 0 293095 CASAVA_Build 2 49583532 1D CGGGCAATCC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 9 8 293096 CASAVA_Build 2 49583955 4I AGAAACATAT ----/TAAA TAAACTGCAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TAAA 1 2 293097 CASAVA_Build 2 49588248 6I ATCTATATCT ------/ATATAC ATATACATAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 ATATAC 2 3 293098 CASAVA_Build 2 49639073 1D ATCATTGTTG T/- TTTAAAAACA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 T 4 3 293099 CASAVA_Build 2 49703866 1D AGGGATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2217 hom 38 10 22 6 T 15 14 293100 CASAVA_Build 2 49710173 6D ACAACTATAA TCAAAG/------ TCTTTCTTCC 3070 het 3070 ref 51 29 20 3 TCAAAG 1 0 293101 CASAVA_Build 2 49715463 1D ACAAAATCTA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 9 8 293102 CASAVA_Build 2 49717647 1D TCTTTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 1278 het 1278 ref 30 21 3 6 T 11 10 293103 CASAVA_Build 2 49732797 1I CAGAAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 2765 het 2765 ref 33 17 8 8 A 11 12 293104 CASAVA_Build 2 49751842 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 30 0 24 6 T 10 9 293105 CASAVA_Build 2 49761680 4D AATAATACAC ATCT/---- ATTAAATAAA 3070 het 3070 ref 39 23 15 2 ATCT 1 0 293106 CASAVA_Build 2 49770918 5D GATTTGATAA TTAAG/----- TTGAGGTTTT 633 het 633 ref 38 10 5 23 TTAAG 1 0 293107 CASAVA_Build 2 49793634 1D TTTGTTTTAG T/- TATGTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 20 20 2 T 2 1 293108 CASAVA_Build 2 49818945 2D AAAAGTACAG AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 AT 1 0 293109 CASAVA_Build 2 49835815 1I TCTCCAATCA -/T TTTTATCTTG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 4 5 293110 CASAVA_Build 2 49840566 1D AGAAGTATTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 14 0 A 10 9 293111 CASAVA_Build 2 49855484 1I TAGAACCCCT -/A AGGAAAACTC 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 A 1 2 293112 CASAVA_Build 2 49859845 1D GTGCACATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 18 18 11 T 11 10 293113 CASAVA_Build 2 49861681 1I TTTCTAAGAG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 6 7 293114 CASAVA_Build 2 49863926 2I GGCATAGTAA --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 8 10 293115 CASAVA_Build 2 49868410 8D TATAGCTTAG AGGTCATT/-------- AGGAGGGGAC 3070 het 3070 ref 44 23 19 5 AGGTCATT 1 0 293116 CASAVA_Build 2 49868859 4D ATTATTTTAT TTTA/---- TTTATTTATT 2272 het 409 hom 10 1 6 3 TTTA 5 4 293117 CASAVA_Build 2 49869200 7I1M6D CTGAAGTAGC -------TCTTTTA/AAACAAGT------ ATTTCCTTCA 3070 het 3070 ref 46 24 20 4 N/A 0 0 293118 CASAVA_Build 2 49870041 1D TTCAAATTCG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 9 8 293119 CASAVA_Build 2 49881588 4I ACAGAAGGCT ----/AGAG AATCAGGCTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 AG 0 2 293120 CASAVA_Build 2 49883555 1D TATGGGAAAC G/- GAAGGGATGA 2986 het 2489 hom 17 6 7 6 G 2 1 293121 CASAVA_Build 2 49885161 1D TATATCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 18 9 A 12 11 293122 CASAVA_Build 2 49902844 1D GGCTCCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 13 13 T 12 11 293123 CASAVA_Build 2 49907046 1I CACACTAGTT -/G ATGCAGTTTC 3070 het 3070 hom 22 8 14 0 G 0 1 293124 CASAVA_Build 2 49910544 1I CTCATAATGG -/C ATTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 C 0 1 293125 CASAVA_Build 2 49935391 1I GCAAATATTT -/A TTGAATAAGC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 0 1 293126 CASAVA_Build 2 49979211 2D TTTTTTAAAC AG/-- AATGATAAAC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 AG 1 0 293127 CASAVA_Build 2 49998453 2D ATAATTATTT TA/-- TGTTAAATAT 1671 het 1272 hom 7 3 4 0 TA 1 0 293128 CASAVA_Build 2 49999085 1I GATTTGTTTG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 7 8 293129 CASAVA_Build 2 50001616 4I TAAAAAATAA ----/AAGT AAGTAATTGT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 AAGT 1 2 293130 CASAVA_Build 2 50014272 1D33M1D TTATCAGAAA CCATGATAATGACACATAAATTATTTATATCCCAG/-CATGATAATGACACATAAATTATTTATATCCCA- GGGTTACTGT 3070 hom 184 het 54 0 61 5 N/A 0 0 293131 CASAVA_Build 2 50017364 2D TTATATTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 14 12 293132 CASAVA_Build 2 50018484 1I AACAAAATTA -/T TTTTCTAATC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 4 5 293133 CASAVA_Build 2 50036254 1D TCATTTTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 T 10 9 293134 CASAVA_Build 2 50047160 1I AAAGCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 T 12 13 293135 CASAVA_Build 2 50048781 1D CCATCCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 10 A 13 12 293136 CASAVA_Build 2 50055398 2I ATTCTTAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 T 12 14 293137 CASAVA_Build 2 50063126 1I CTTAAAAAAA -/C ACACACAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 C 0 1 293138 CASAVA_Build 2 50064658 1I TAAAAAAAAA -/G ATTAGCTGGG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 G 0 1 293139 CASAVA_Build 2 50065156 1D AGGACTCATA T/- TGAAGTGAGT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 2 1 293140 CASAVA_Build 2 50068402 1D TGAAACAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 13 12 293141 CASAVA_Build 2 50073029 1I AAATACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2001 hom 28 8 13 7 A 10 11 293142 CASAVA_Build 2 50079685 3D AATCTGGGGA TCT/--- TCTTAAAATT 3070 het 3070 ref 34 19 11 7 TCT 2 1 293143 CASAVA_Build 2 50085611 1D ATTGTTTAAC T/- TGTGGCATCA 3070 het 3070 hom 54 27 26 1 T 2 1 293144 CASAVA_Build 2 50087844 4D AATAATTAGC CAGA/---- CATAGTAGTG 3070 het 3070 ref 41 23 17 3 CAGA 1 0 293145 CASAVA_Build 2 50090792 1I AACTCAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 13 7 A 11 12 293146 CASAVA_Build 2 50108709 1I AGAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1774 het 1774 ref 30 17 4 9 A 13 14 293147 CASAVA_Build 2 50117966 1I TATAAAAAAA -/T ATTTTTGAAG 3070 het 3070 hom 30 7 21 2 T 0 1 293148 CASAVA_Build 2 50123338 3I ATACACACAT ---/TAA TAAGACAAAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TAA 1 2 293149 CASAVA_Build 2 50128353 1I CCTTCCTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 41 0 32 9 T 9 10 293150 CASAVA_Build 2 50131430 1D TTCCCTAATG T/- TTTTTCCCCA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 6 5 293151 CASAVA_Build 2 50133449 1D GCTGGCTATC A/- ATTCAAAACT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 2 1 293152 CASAVA_Build 2 50134889 1D AAACAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 322 hom 32 1 27 5 A 11 10 293153 CASAVA_Build 2 50145076 1I TGGGATCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 303 hom 24 1 17 6 T 11 12 293154 CASAVA_Build 2 50149044 1D AACTTTCCCC T/- AATACAAGTT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 1 0 293155 CASAVA_Build 2 50156440 1I GTGACAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 36 0 30 6 A 10 11 293156 CASAVA_Build 2 50166338 1I AATTATAAAT -/A TCTATGGTTA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 0 1 293157 CASAVA_Build 2 50173758 1D GGTCTGAGCT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 9 8 293158 CASAVA_Build 2 50176407 1D AACATCCGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 T 13 12 293159 CASAVA_Build 2 50179473 33D TTGGTTTTAG TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/--------------------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 26 4 23 8 T 52 19 293160 CASAVA_Build 2 50180008 1I ATCAATTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 8 9 293161 CASAVA_Build 2 50200209 1D ATTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 28 0 18 10 A 13 12 293162 CASAVA_Build 2 50209846 1I TACTAAAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 10 7 T 9 10 293163 CASAVA_Build 2 50212548 1I ACTAGACGGT -/C CCAACAGCTC 3070 hom 159 het 58 0 53 5 C 2 3 293164 CASAVA_Build 2 50225942 2D CCACACAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 72 het 34 0 25 11 AC 7 6 293165 CASAVA_Build 2 50240831 1D GGATATATGA T/- TTTTTCTTCT 3070 hom 114 het 44 0 38 7 T 6 5 293166 CASAVA_Build 2 50250354 1D CTTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1984 het 448 hom 19 2 6 11 A 17 16 293167 CASAVA_Build 2 50261957 1D CCTCTGAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 10 9 293168 CASAVA_Build 2 50286871 2D ACACACAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 99 het 40 0 33 8 AC 17 16 293169 CASAVA_Build 2 50287944 1I GTGGAAATAC -/T TTTTCATATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 5 293170 CASAVA_Build 2 50292489 2D AGAAGAAGAC AG/-- GGTAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AG 1 0 293171 CASAVA_Build 2 50299133 1D TAGCACCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1019 hom 26 5 10 11 T 17 16 293172 CASAVA_Build 2 50300002 1D TGTTTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 22 1 16 6 A 13 12 293173 CASAVA_Build 2 50301827 1D TGTTGGAAAT A/- AACAACAAAG 3070 hom 108 het 40 0 35 5 A 3 2 293174 CASAVA_Build 2 50311873 1D TTCTATTCAA G/- GAAAACCCTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 2 1 293175 CASAVA_Build 2 50317220 1D TTCACACTCC A/- AAAAAAAAAA 3014 het 1080 hom 22 4 10 8 A 17 16 293176 CASAVA_Build 2 50320145 1I TTTCACAATT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 8 9 293177 CASAVA_Build 2 50327370 1D GGCTTCTCTG C/- TGCACCTTGA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 1 0 293178 CASAVA_Build 2 50329799 1D ACCCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 30 1 21 8 A 13 12 293179 CASAVA_Build 2 50330285 1D CTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 308 hom 23 1 12 10 T 13 12 293180 CASAVA_Build 2 50331078 2D CTTTTTAATA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 23 8 T 12 10 293181 CASAVA_Build 2 50332010 1I ATCTCAGTCC -/T TTTTTATGGC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 5 6 293182 CASAVA_Build 2 50332825 2D CATTTAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1733 hom 10 het 7 0 4 3 T 12 10 293183 CASAVA_Build 2 50334516 1D TGAAGTTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 59 het 25 0 20 6 T 9 8 293184 CASAVA_Build 2 50334946 2I TTATTTTCTC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 9 11 293185 CASAVA_Build 2 50338536 1D ATCTGCACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 444 hom 25 1 20 4 T 10 9 293186 CASAVA_Build 2 50341272 4D TTTTTTTCCG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 31 0 20 13 T 20 16 293187 CASAVA_Build 2 50347197 20D ACACACACAC ACACACACACACACACACAT/-------------------- ATTTTCTTTC 3070 hom 36 het 11 0 13 2 ACACACACACACACACACAT 1 0 293188 CASAVA_Build 2 50351316 1D ATAGATATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 604 hom 31 3 19 9 T 15 14 293189 CASAVA_Build 2 50356630 1I CCTACCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 15 16 293190 CASAVA_Build 2 50360358 1D ACTTTGAAAG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 46 15 24 8 A 8 7 293191 CASAVA_Build 2 50366511 2I TTTGAAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 10 12 293192 CASAVA_Build 2 50377723 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 3 4 293193 CASAVA_Build 2 50379170 1D AATTTACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 33 1 28 4 T 12 11 293194 CASAVA_Build 2 50382749 1I GATATGTAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 A 8 9 293195 CASAVA_Build 2 50383555 8D GTCTACCAGG CCATCCAT/-------- CCATCCATCC 3070 hom 81 het 38 0 27 12 CCAT 6 4 293196 CASAVA_Build 2 50384569 1I CTTCTGTGGC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 7 8 293197 CASAVA_Build 2 50385323 2D TCTAAATTTA TC/-- TTTTACTATC 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 TC 1 0 293198 CASAVA_Build 2 50395266 1D AATGTCATTA T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 T 7 6 293199 CASAVA_Build 2 50400767 1D GACTGAGAAG C/- AAAAAGTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 C 1 0 293200 CASAVA_Build 2 50408161 1D AAACTTGCAC A/- ATTGTATTGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 2 1 293201 CASAVA_Build 2 50432256 1D AGGCTTTTCA C/- CCTTTATTAT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 C 3 2 293202 CASAVA_Build 2 50435934 2I TTATATATAC --/AT ATATATATAT 2402 het 1507 hom 18 5 7 6 AT 6 7 293203 CASAVA_Build 2 50446795 1D GGCTGGACAC T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 28 13 4 11 T 17 16 293204 CASAVA_Build 2 50452408 6I TTACTGTTGC ------/AAGTGT AATTTATAAG 3019 het 3019 ref 18 7 8 3 AAGTGT 0 1 293205 CASAVA_Build 2 50454733 8I TTCATCTCAG --------/GAATTCAA GACTAGCCTG 3070 het 2968 hom 31 8 12 11 GAATTCAA 0 1 293206 CASAVA_Build 2 50461872 1I ACTTATGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 A 9 10 293207 CASAVA_Build 2 50467230 3I CCCAAATTGA ---/GAC GACCTTCAAG 3070 het 3070 ref 56 28 24 4 GAC 1 2 293208 CASAVA_Build 2 50471856 1I TTGCAGAAAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 8 9 293209 CASAVA_Build 2 50495004 1I ATATACTGAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 24 8 9 7 A 7 8 293210 CASAVA_Build 2 50509899 1I AAAAAAATAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 8 9 293211 CASAVA_Build 2 50510218 1D TCAAAATTTT A/- ATTTTGAAGA 3070 het 2956 hom 23 6 15 2 A 2 1 293212 CASAVA_Build 2 50510977 1I GGGCAGGTAG -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 7 8 293213 CASAVA_Build 2 50514206 1I GAGGTAATAA -/T TTTTTTTTTT 2542 het 2542 ref 35 11 8 16 T 15 16 293214 CASAVA_Build 2 50517100 1I CGTCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2842 hom 27 9 8 10 A 14 15 293215 CASAVA_Build 2 50522404 1D TTTTGGTCTT A/- AAAATATCGA 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 A 5 4 293216 CASAVA_Build 2 50544731 2D TTATTAAGAC TT/-- TATGTAAAGT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 3 1 293217 CASAVA_Build 2 50546731 1D ATTCACATGC T/- TTTAACAATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 4 3 293218 CASAVA_Build 2 50547009 2D AACCCAAATA AC/-- AGTTACTGCA 3070 het 3070 ref 49 26 22 4 AC 1 0 293219 CASAVA_Build 2 50556053 4I AAGAGGAAAC ----/AGTA AGTAAGGCAA 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 AGTA 1 2 293220 CASAVA_Build 2 50557201 2I CTGGTATGGC --/TG TGTCAGTATA 3070 hom 171 het 68 0 56 12 TG 1 2 293221 CASAVA_Build 2 50560269 4D GTTCACATTC AATA/---- AATAATCATT 3070 het 3070 ref 40 22 12 8 AATA 2 1 293222 CASAVA_Build 2 50565523 1I TTTATGGAAT -/A AGAAAGTGTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 1 2 293223 CASAVA_Build 2 50573573 3I GAAAGATGCC ---/TGT TGTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 54 24 23 7 TGT 1 2 293224 CASAVA_Build 2 50583086 2I GGGAATAAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 AC 6 7 293225 CASAVA_Build 2 50584213 1D AAGAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 10 9 293226 CASAVA_Build 2 50589110 2D TGTTTAATAA CT/-- CTGCAGCATC 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 CT 2 1 293227 CASAVA_Build 2 50597401 1I GCTTGCCTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 8 9 293228 CASAVA_Build 2 50598056 1D TTTGTGGGAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 T 8 7 293229 CASAVA_Build 2 50599292 1I CACAAATGCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 T 7 8 293230 CASAVA_Build 2 50599555 1I CATATTAGAG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 7 8 293231 CASAVA_Build 2 50603793 2I AATTTTTTTT --/TA GATTTTTGCT 3070 het 3070 ref 44 24 19 1 TA 0 1 293232 CASAVA_Build 2 50611814 1I GTTTGCAGGC -/A AAATTGAACA 3070 het 3070 hom 45 17 26 2 A 3 4 293233 CASAVA_Build 2 50612955 1D ACTGTCATCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 27 8 12 8 T 9 8 293234 CASAVA_Build 2 50624872 4D ATGCACAACA TAAG/---- TAATAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 TAAG 1 0 293235 CASAVA_Build 2 50629083 1D AGTAATGTAA T/- TTAAATAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 3 2 293236 CASAVA_Build 2 50632025 1D ATCTTCTTGA T/- CTATAAACAG 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 1 0 293237 CASAVA_Build 2 50637163 12I TTTTTTTTTT ------------/AAAGAGTGATTC AAAGAGTGAT 2446 het 2446 ref 38 16 9 13 AAAGAGTGATTC 1 2 293238 CASAVA_Build 2 50642447 4D GATAGCATTT AGAA/---- AGACACTGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 6 AGAA 1 0 293239 CASAVA_Build 2 50648223 8I GATATAGAAT --------/CAGTATTA CTGATTTTTC 3070 het 3070 ref 31 17 10 5 CAGTATTA 0 1 293240 CASAVA_Build 2 50654006 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 12 11 293241 CASAVA_Build 2 50670188 3I TAGTGGAGAC ---/GGT GTTTCACCAT 2527 het 2527 ref 26 18 6 2 GGT 0 1 293242 CASAVA_Build 2 50671910 1D TCGACAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 11 10 293243 CASAVA_Build 2 50675747 4D CAAACATGGG GTGT/---- GTATTGTTAT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 GT 3 1 293244 CASAVA_Build 2 50701561 1I ACTGGCTGAG -/C CTGCGGTCAC 3070 hom 92 het 37 0 28 9 C 1 2 293245 CASAVA_Build 2 50741729 2D ATTCTTGCCC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AT 5 4 293246 CASAVA_Build 2 50743219 1I ACACTATGAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 T 8 9 293247 CASAVA_Build 2 50747832 5I TTACAGACTT -----/AACTC AGTCAAGTAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 AACTC 0 1 293248 CASAVA_Build 2 50751049 3I TTGTAACGTA ---/AAC AACAATATTA 3070 het 3070 hom 35 18 16 1 AAC 1 2 293249 CASAVA_Build 2 50762519 3I TAGTAATTAA ---/AAT AATTGTGTTC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 AAT 1 2 293250 CASAVA_Build 2 50769329 1I ACAATGGGCA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 52 18 28 6 T 6 7 293251 CASAVA_Build 2 50781359 1D TATTTATTGA T/- TTGCTCATTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 2 293252 CASAVA_Build 2 50782999 1D TGTTGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 51 1 39 12 A 11 10 293253 CASAVA_Build 2 50792821 1I ATTGATTACA -/T TTTTACAGAT 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 T 4 5 293254 CASAVA_Build 2 50807752 1I AAAAGGTCTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 8 9 293255 CASAVA_Build 2 50808100 2I ACACACACAC --/AT ACCTACACAT 3070 het 351 hom 42 1 36 5 AT 0 1 293256 CASAVA_Build 2 50821907 4D TGGATCTATT AATA/---- AATATCTATT 3070 het 3070 ref 35 22 11 3 AATA 2 1 293257 CASAVA_Build 2 50859898 4I CTCCCACTTA ----/TGAG TGAGAACATG 3070 het 3070 ref 44 28 14 2 TGAG 1 2 293258 CASAVA_Build 2 50868355 2D AACATGTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 18 7 A 15 13 293259 CASAVA_Build 2 50876482 1D GTTACATGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 10 9 293260 CASAVA_Build 2 50893835 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 A 11 10 293261 CASAVA_Build 2 50894581 6D GAAGCTTAGT TGTTTC/------ TACCAAGATT 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 TGTTTC 1 0 293262 CASAVA_Build 2 50895079 1D ATAAACCAAG A/- GTCATTGCTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 1 0 293263 CASAVA_Build 2 50925502 1D CAGCTAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 12 11 293264 CASAVA_Build 2 50925791 1D GGCTCTCAAC T/- AATCTCTGAA 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 T 1 0 293265 CASAVA_Build 2 50929804 1D TGAACTACGT A/- ACTCGGAATT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 2 1 293266 CASAVA_Build 2 50931385 2D TAAACTAAGG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 40 0 31 9 T 11 9 293267 CASAVA_Build 2 50938461 1I AAAATAGATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 8 9 293268 CASAVA_Build 2 50939218 1D AAGGCTACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 10 9 293269 CASAVA_Build 2 50940783 4D ATCATAACTC TCAA/---- TCAATCAACA 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 TCAA 3 2 293270 CASAVA_Build 2 50958656 1D AAGGGACTGC A/- AGTTCTGTTT 3070 het 3070 ref 51 27 22 2 A 2 1 293271 CASAVA_Build 2 50964064 2D CATTTACATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 17 7 T 13 11 293272 CASAVA_Build 2 50965466 1D ACTGTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 10 9 293273 CASAVA_Build 2 50966029 2D ATAAACTACC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 11 9 293274 CASAVA_Build 2 50970670 1I TCCTACTTTC -/T TATGTGCTCA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 T 1 2 293275 CASAVA_Build 2 50977489 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3062 het 1381 hom 15 7 8 0 A 15 14 293276 CASAVA_Build 2 50985306 4D ATGATCAGAC CTTT/---- CTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 4 CTTT 2 1 293277 CASAVA_Build 2 50989283 1D TATGGAAGAG A/- AAAAATCTGA 3070 het 3070 hom 35 12 20 4 A 6 5 293278 CASAVA_Build 2 50990656 1I GCCTCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 9 10 T 10 11 293279 CASAVA_Build 2 50997109 3I24M1I CTAAAAGTGT ---TGATGGTTGTTAAAAATCTAGATT-/TGATGATGGTTGTTAAAAATCTAGATTA AAAAAAGTAC 3070 het 3070 ref 55 29 29 10 N/A 0 0 293280 CASAVA_Build 2 50998509 1I AAAATGTATT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 7 8 293281 CASAVA_Build 2 50999426 1D TAGAAAGGAG A/- ATAAAATTAG 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 A 2 1 293282 CASAVA_Build 2 50999655 1I TCTTTGTTTA -/G GGAATGTAAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 G 2 3 293283 CASAVA_Build 2 51000140 1I TTTTATAGTC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 7 8 293284 CASAVA_Build 2 51003937 1I AATTTACTAC -/A AAAAAAGGGT 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 A 6 7 293285 CASAVA_Build 2 51004780 1I ATTTTATAAG -/T TTTTATGGAC 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 T 4 5 293286 CASAVA_Build 2 51005016 4D TATATTCTAA AAAT/---- AAATCTTACC 3070 het 3070 hom 36 13 21 5 AAAT 2 1 293287 CASAVA_Build 2 51026161 2D TCTCTCTTAC TA/-- TATATATATA 3070 het 2322 hom 21 7 11 3 TA 9 8 293288 CASAVA_Build 2 51042607 1I CCTGCTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 A 10 11 293289 CASAVA_Build 2 51042738 4D GAGACTGCTG CTGA/---- CTATTTTCCA 3070 het 3070 ref 40 23 15 4 CTGA 1 0 293290 CASAVA_Build 2 51052737 2I CACAAAAAAA --/AT AAAAATTATT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 AT 0 1 293291 CASAVA_Build 2 51054642 1D CATCTGATGT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 77 het 34 0 29 5 A 9 8 293292 CASAVA_Build 2 51067372 1D TATAATTGCC A/- AATATTCATA 3070 hom 45 het 28 0 16 12 A 3 2 293293 CASAVA_Build 2 51073160 1I TAGTGCTTAT -/A AAAAAGCACA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 5 6 293294 CASAVA_Build 2 51081186 1D TACTATTACC A/- AAAAAAACAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 8 7 293295 CASAVA_Build 2 51085307 4D ATAAACAAAT AAAC/---- AAACATTTGC 3070 het 3070 ref 43 24 18 4 AAAC 2 1 293296 CASAVA_Build 2 51100701 1D ATTTGAAAGG T/- TTTTTTTTTT 1650 het 1650 ref 45 29 4 13 T 11 10 293297 CASAVA_Build 2 51102194 2D ACATGTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 392 hom 37 4 14 21 AT 7 6 293298 CASAVA_Build 2 51110753 1D TAATCACTGA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 7 6 293299 CASAVA_Build 2 51118312 1D TTAAACCTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 T 9 8 293300 CASAVA_Build 2 51125182 1I GCTGGCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 9 13 6 T 11 12 293301 CASAVA_Build 2 51127049 1D AAATCTCTAG A/- AAAATATCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 5 4 293302 CASAVA_Build 2 51131260 3D CTAGGCAACA TGG/--- TAAAACCCTG 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 TGG 1 0 293303 CASAVA_Build 2 51135043 1D TAGTTACTGC T/- TAGGCATGAG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 2 1 293304 CASAVA_Build 2 51136318 3I AATATTTTTT ---/AAA ATATCTTGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 4 293305 CASAVA_Build 2 51137186 1I GACTAGGGAC -/A GGGGCTAATG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 293306 CASAVA_Build 2 51168725 2I TGCCCTTAAA --/TT TGTTTATTGC 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 T 1 3 293307 CASAVA_Build 2 51187939 1I CAACCAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 456 hom 41 2 30 9 A 9 10 293308 CASAVA_Build 2 51196148 2I ATGTCTTTGG --/TC TCTCATTCAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 TC 2 3 293309 CASAVA_Build 2 51199489 2I TATTATATGT --/GA GAGAGAGTGT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 GA 3 4 293310 CASAVA_Build 2 51210694 1D ATGTAATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1422 hom 23 3 14 6 T 11 10 293311 CASAVA_Build 2 51215082 14D CAATAAAGTA TAGGCTGAGGTGGT/-------------- CTCAGATGGT 3070 het 3070 ref 31 19 11 2 TAGGCTGAGGTGGT 1 0 293312 CASAVA_Build 2 51215405 1I AGCAATGGGG -/A AAAATATCTC 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 4 5 293313 CASAVA_Build 2 51215474 1D AGCCTAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 34 0 22 12 A 12 11 293314 CASAVA_Build 2 51220881 1D CTTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1332 het 1030 hom 14 5 5 4 A 11 10 293315 CASAVA_Build 2 51221209 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAA 3070 het 419 hom 37 2 32 3 G 0 1 293316 CASAVA_Build 2 51225236 1D TTATAAAATA T/- TTTTTTCAAT 2136 het 2136 ref 12 6 5 1 T 7 6 293317 CASAVA_Build 2 51228530 1D TCATTTTAAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 9 8 293318 CASAVA_Build 2 51229522 1I TTGTGTGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 10 11 293319 CASAVA_Build 2 51237690 2D TTGTCAAGAC TA/-- TGTATAGTAA 3070 het 3070 hom 31 15 14 3 TA 1 0 293320 CASAVA_Build 2 51238542 1I TGTCAAGTCA -/G GGGTTCCTGG 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 G 3 4 293321 CASAVA_Build 2 51251611 6D TGTGTTTCAG ATATAA/------ ATATAATAAA 3070 het 3070 ref 45 22 22 3 ATATAA 2 1 293322 CASAVA_Build 2 51252026 1D ATTAAAAAAA T/- ATTAAATATC 3070 het 3070 hom 54 23 28 4 T 1 0 293323 CASAVA_Build 2 51253125 1I GAAAAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 32 17 7 8 T 10 11 293324 CASAVA_Build 2 51253446 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 TA 5 4 293325 CASAVA_Build 2 51253870 2D GTATATATAT AC/-- ACATGTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 18 5 AC 2 1 293326 CASAVA_Build 2 51254243 16D AATGTATATG TGTGTGTATATACATA/---------------- TATGTGTATA 3070 het 3070 hom 25 10 16 4 TGTGTGTATATACATA 1 0 293327 CASAVA_Build 2 51261806 1I GGAAAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 2012 het 2012 ref 29 16 5 8 A 11 12 293328 CASAVA_Build 2 51268563 1D TTAATCTGTC T/- TTTTTTGCAG 3070 het 3070 hom 39 21 18 0 T 7 6 293329 CASAVA_Build 2 51273593 1D TTTTTGTTCA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 8 7 293330 CASAVA_Build 2 51275836 1D ACCTTTTGTA T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 T 7 6 293331 CASAVA_Build 2 51291748 1D CTTGTCTATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 T 10 9 293332 CASAVA_Build 2 51305003 7I TGGTGTCTTT -------/ATTTTTA TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 21 1 19 2 ATTTTTA 0 1 293333 CASAVA_Build 2 51311366 1D TCATTAAGAC A/- AGGATAAATT 3070 het 3070 ref 54 29 19 6 A 2 1 293334 CASAVA_Build 2 51323225 1D CTAAACCATA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 10 9 293335 CASAVA_Build 2 51323659 1I TTGAGCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 500 hom 36 2 28 6 T 10 11 293336 CASAVA_Build 2 51331052 1D AATTGCAAAA C/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 9 C 1 0 293337 CASAVA_Build 2 51333204 2D AAAAAACATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 14 12 293338 CASAVA_Build 2 51335841 1I TCAAACTTTC -/A AAAAAAATTG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 7 8 293339 CASAVA_Build 2 51338748 1D AAGTTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 14 13 293340 CASAVA_Build 2 51341382 1D ACATTCTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 17 18 9 T 10 9 293341 CASAVA_Build 2 51344578 1D ATTAAATCAG A/- ATGTCTTTGT 3070 het 3070 ref 49 22 22 6 A 2 1 293342 CASAVA_Build 2 51346835 1I60M9D GAGGGGGCAT -AACACGATGTGTTTGACCTTCCTTCCCGTCATGGCCACCAAGAATGCAATTTTTCAGGATTCTCTGGGG/AAACACGATGTGTTTGACCTTCCTTCCCGTCATGGCCACCAAGAATGCAATTTTTCAGGAT--------- TCTCTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 31 19 13 N/A 0 0 293343 CASAVA_Build 2 51381248 1D CAGGTTCTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 T 9 8 293344 CASAVA_Build 2 51393756 3I ATCCACTCTG ---/TCA TTGTTGGACA 1278 het 1278 ref 25 16 3 6 TCA 0 1 293345 CASAVA_Build 2 51439301 1D TTTTATGAGT A/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 11 19 8 A 1 0 293346 CASAVA_Build 2 51439650 1D ATGATATTTT G/- ATGACAACGA 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 G 1 0 293347 CASAVA_Build 2 51452013 1D CAAAATGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 A 12 11 293348 CASAVA_Build 2 51452215 5I ACATTAACTA -----/AAATT AAATTGTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AAATT 1 2 293349 CASAVA_Build 2 51457922 3I AGTGTGGAAG ---/GAA GAAAATGTGG 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 GAA 1 2 293350 CASAVA_Build 2 51464726 2I GTTTGTTTCT --/TC TCTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 TC 2 3 293351 CASAVA_Build 2 51465461 2D TAAAAAACAG TT/-- TTTTTTTTTT 2196 het 1065 hom 23 5 7 11 T 12 10 293352 CASAVA_Build 2 51477164 1I TAAAAACCCT -/A GAAGAAAACC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 0 1 293353 CASAVA_Build 2 51478859 1I AGCCAAAGAA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 1 2 293354 CASAVA_Build 2 51488627 1I TCAGGCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 686 hom 40 3 30 7 T 10 11 293355 CASAVA_Build 2 51493528 1D ACCTTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 37 1 23 14 T 12 11 293356 CASAVA_Build 2 51515545 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 431 hom 27 1 20 6 A 9 10 293357 CASAVA_Build 2 51516355 1I ATAAATGCAG -/A AAAATTAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 5 293358 CASAVA_Build 2 51519204 2D GAACTAAATT CA/-- CACATACAAG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CA 3 2 293359 CASAVA_Build 2 51519387 6D TATATAATGT TATATA/------ TAACATTATA 986 hom 7 het 10 0 3 7 TA 4 1 293360 CASAVA_Build 2 51519622 4D CATATACATA TATC/---- TCTTTTTTAC 2008 het 1402 hom 12 3 6 3 TATC 1 0 293361 CASAVA_Build 2 51520031 4D TTGAGGTGAC TATT/---- TGTACATTTC 3070 hom 157 het 55 0 53 3 TATT 1 0 293362 CASAVA_Build 2 51543594 1D TAAATTTTTG A/- AAAAAACTTG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 7 6 293363 CASAVA_Build 2 51561526 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 12 11 293364 CASAVA_Build 2 51575081 4D ATGTGTATAC AGAT/---- ACTTATATAC 3070 hom 135 het 48 0 46 6 AGAT 1 0 293365 CASAVA_Build 2 51590990 1D AGAAAAGAAG A/- AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 8 7 293366 CASAVA_Build 2 51600814 1D CAAGTCAGAT G/- GCCAAGCCCA 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 G 2 1 293367 CASAVA_Build 2 51601321 1I GATCTTTATT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 7 8 293368 CASAVA_Build 2 51602275 2D TTGAACAAGG TA/-- TATAGATCAT 3070 het 3070 hom 55 19 30 7 TA 3 2 293369 CASAVA_Build 2 51617420 2D AATATTATAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 TG 6 5 293370 CASAVA_Build 2 51621854 1D GCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 13 7 5 1 A 11 10 293371 CASAVA_Build 2 51629275 2D GTTATATAAC AT/-- ATATATGCTA 3070 het 3070 ref 23 10 10 4 AT 4 3 293372 CASAVA_Build 2 51630640 1I TAATATATAT -/A TATATATAAC 2442 het 1308 hom 10 3 5 2 A 0 1 293373 CASAVA_Build 2 51632112 1D ACCCATGCTA G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 G 1 0 293374 CASAVA_Build 2 51643522 1D TTTCTATGTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 26 17 9 2 T 9 8 293375 CASAVA_Build 2 51646147 6I TAAAATGTAT ------/CTTTTA CTTATTGTAA 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 CTTTTA 0 1 293376 CASAVA_Build 2 51647931 1D TTGATCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 T 11 10 293377 CASAVA_Build 2 51648680 1I GGATTTTCTA -/T CTATAAGATC 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 0 1 293378 CASAVA_Build 2 51649051 1D TATTTTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 T 12 11 293379 CASAVA_Build 2 51649265 5D CTGTTTATCC TATCT/----- TGTGTGTTCT 3070 het 3070 hom 31 14 16 2 TATCT 1 0 293380 CASAVA_Build 2 51651615 3D GATGTCTAAT GGA/--- AAGGTAAACA 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 GGA 1 0 293381 CASAVA_Build 2 51653237 1D TTGAATTGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 10 9 293382 CASAVA_Build 2 51658988 4D TATCTAGTAC ATTT/---- ATTTGATTTA 3070 het 3070 ref 45 27 16 4 ATTT 2 1 293383 CASAVA_Build 2 51671310 1I TCTCACCAAC -/G GGGTGACCAG 3070 het 3070 hom 51 17 28 6 G 3 4 293384 CASAVA_Build 2 51677998 1I AAAAGCTTTC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 A 7 8 293385 CASAVA_Build 2 51678382 1D TAATGAAAAT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 39 17 22 0 A 8 7 293386 CASAVA_Build 2 51685100 3I GTTCTCCCGA ---/ATG ATATCCTGAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 ATG 0 1 293387 CASAVA_Build 2 51698590 2I CAGAGTCTCA --/CT CTGTCGCCCA 3070 het 1282 hom 15 4 10 1 CT 1 2 293388 CASAVA_Build 2 51708331 5I TGTTGAAAAT -----/AAATG AAATTATATA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 AAATG 0 1 293389 CASAVA_Build 2 51718247 1I AGAGACCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 34 0 23 11 A 11 12 293390 CASAVA_Build 2 51718977 1I ATTTAAAAAA -/C GATGATTTAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 293391 CASAVA_Build 2 51719756 1D CGCATTAGCC A/- CAGACTAAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 293392 CASAVA_Build 2 51733398 1I CAAATTTTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 69 hom 39 1 34 4 T 8 9 293393 CASAVA_Build 2 51765531 2D TATTGAGTAA GG/-- GTGTAGAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 3 1 293394 CASAVA_Build 2 51768498 2I AACAAATGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 12 293395 CASAVA_Build 2 51768844 3D GTGATAGACT ATA/--- ATGTTAATCA 3070 hom 138 het 50 0 46 5 ATA 1 0 293396 CASAVA_Build 2 51770487 4D GTGAATACAA AGAC/---- AGAAAAATGT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AGAC 1 0 293397 CASAVA_Build 2 51778152 1D TGCACCCACC A/- AAAAAAAAAA 1993 het 1993 ref 32 10 11 11 A 19 18 293398 CASAVA_Build 2 51778955 1I ATCAGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 A 11 12 293399 CASAVA_Build 2 51795422 3D TTATTCCTAG GTT/--- GTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 GTT 2 1 293400 CASAVA_Build 2 51800029 1D AGGCCAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 11 10 293401 CASAVA_Build 2 51820938 1D GAACAGAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 11 22 11 A 11 10 293402 CASAVA_Build 2 51825729 1D TTCTTTAGGG A/- AAAAAAACAG 3070 het 2784 hom 22 7 14 2 A 8 7 293403 CASAVA_Build 2 51841934 2D ATTATGTAAC AT/-- ATTATATATC 1957 het 1054 hom 7 3 4 0 AT 2 1 293404 CASAVA_Build 2 51846691 1D GAAATCAAAA G/- CTACCCAGCA 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 G 1 0 293405 CASAVA_Build 2 51860798 4D CTGATTGGTG TATT/---- TATTTACAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 1 TATT 2 1 293406 CASAVA_Build 2 51877377 5I AGATAACCTT -----/AACTC AAGAAGAAGG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 AACTC 0 1 293407 CASAVA_Build 2 51879865 1D GAAAACACTT C/- CCATGTTCAT 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 C 3 2 293408 CASAVA_Build 2 51881514 1D AAAGAAGAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 9 8 293409 CASAVA_Build 2 51882979 1I ATATTACATG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 7 8 293410 CASAVA_Build 2 51896776 1I TTGATTTATC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 T 8 9 293411 CASAVA_Build 2 51900769 1D TTGAAATTTT G/- GGGGGGATTC 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 G 7 6 293412 CASAVA_Build 2 51901460 2D ATATGTTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 14 12 293413 CASAVA_Build 2 51903596 1I GAGAGTCTAC -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 T 6 7 293414 CASAVA_Build 2 51914083 2I CCATTATCAC --/AT GTCACCAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 AT 0 1 293415 CASAVA_Build 2 51922343 18D TATGGAACCT TCTTGGATAGCACCCAGA/------------------ AAAATCTGGA 3070 het 3070 ref 41 21 18 6 TCTTGGATAGCACCCAGA 1 0 293416 CASAVA_Build 2 51926122 1I TCACGTATAG -/T TCACAATTCT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 1 2 293417 CASAVA_Build 2 51937570 1D AAAAAAAAAA T/- AGCAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 T 1 0 293418 CASAVA_Build 2 51962215 1D AAAAAAGCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 22 19 8 T 10 9 293419 CASAVA_Build 2 51969936 2I AAACGTATAC --/AT GTGTCAAAAC 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 AT 0 1 293420 CASAVA_Build 2 51970405 1D AAAAAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2597 hom 29 9 14 6 A 15 14 293421 CASAVA_Build 2 52002911 2D GTTACTCATC AA/-- AAATGATCAG 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 A 5 3 293422 CASAVA_Build 2 52009309 2D AACATCAAAC TA/-- TAATAATTAG 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 TA 2 1 293423 CASAVA_Build 2 52042628 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2471 hom 36 11 16 9 A 14 15 293424 CASAVA_Build 2 52074221 1I ACCTGACTAA -/T TTTTTTTTTT 1220 het 1220 ref 12 5 5 2 T 15 16 293425 CASAVA_Build 2 52109449 5D ACTAATTCTC TAATT/----- TAATTTTCTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 TAATT 2 1 293426 CASAVA_Build 2 52130807 1D TCCACTCAAC A/- AAAGAATTTA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 A 4 3 293427 CASAVA_Build 2 52137169 2D AAACTTGGTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 TA 1 0 293428 CASAVA_Build 2 52138119 20I TGGTGCCGTC --------------------/CTCATGATACTGAGTGAGGT CTCATGAGAT 3070 het 3070 hom 47 16 25 8 CTCATGATACTGAGTGAGGT 0 1 293429 CASAVA_Build 2 52140369 1I GGCCTAATAC -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 A 6 7 293430 CASAVA_Build 2 52142726 4I AAAAACACAT ----/AAAA AAGGGCACAT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 2 6 293431 CASAVA_Build 2 52145720 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 13 14 293432 CASAVA_Build 2 52150759 1I ACGTGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 11 12 293433 CASAVA_Build 2 52152577 1I AACTTCTGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 16 15 13 A 9 10 293434 CASAVA_Build 2 52156142 1I TCAACTGGAG -/A AGGAAGGCTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 1 2 293435 CASAVA_Build 2 52156964 1D4M2D ACACATTCCA TGCCATG/-GTCA-- ACTTACTTGC 3070 het 3070 ref 53 30 18 5 N/A 0 0 293436 CASAVA_Build 2 52170317 12I ATGAGTTGGG ------------/AGTAAAAAGTTT AGCTGAACAT 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 AGTAAAAAGTTT 0 1 293437 CASAVA_Build 2 52170630 1D ACATGGCTAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 A 9 8 293438 CASAVA_Build 2 52182440 5D TTGTGTTGGC TATTA/----- TATTAGTCCA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 TATTA 2 1 293439 CASAVA_Build 2 52189585 1D AATGTTAATC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 T 7 6 293440 CASAVA_Build 2 52192496 1D TGGTGGCTCA T/- TGCCTGTAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 2 1 293441 CASAVA_Build 2 52205595 6D TTACCCACAC ACATTT/------ ACATTTACAT 3070 het 3070 ref 24 15 7 9 ACATTT 3 2 293442 CASAVA_Build 2 52207935 1D TGTTCCAGTC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 T 8 7 293443 CASAVA_Build 2 52214444 4I ATTGGTTCCT ----/TCCC TCTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 TCCC 0 1 293444 CASAVA_Build 2 52241678 1D ACTTTGTTGA T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 T 8 7 293445 CASAVA_Build 2 52263662 2D CTTCTGCAGG CT/-- CTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 43 28 11 6 CT 2 1 293446 CASAVA_Build 2 52263848 14D TTAGCTGAAA CCATTTACTTAATT/-------------- CCTCCAATTC 3070 het 3070 ref 41 25 16 5 CCATTTACTTAATT 1 0 293447 CASAVA_Build 2 52266531 2D AAAAAAATAC TT/-- TTACAGATAA 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 T 4 2 293448 CASAVA_Build 2 52269423 4I TTAATATCCA ----/AAGT ATGTAAAGCA 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 AAGT 0 1 293449 CASAVA_Build 2 52270611 1D TCTTCAAAAG T/- TGTTAGGGAT 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 T 2 1 293450 CASAVA_Build 2 52283078 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAGC 2315 het 2315 ref 22 7 8 7 A 9 8 293451 CASAVA_Build 2 52289707 1I CTATAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 30 21 3 A 11 12 293452 CASAVA_Build 2 52297649 1D TGGTATTTGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 9 8 293453 CASAVA_Build 2 52298719 2D ATTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 16 12 6 A 17 15 293454 CASAVA_Build 2 52301860 3I AGAGTAGTAA ---/AAT AATAACAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 AAT 1 2 293455 CASAVA_Build 2 52306076 8D GAGGGGGGAG GAGAGAGA/-------- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 45 15 24 9 GA 10 6 293456 CASAVA_Build 2 52316506 1D AAAAATTAGA T/- TATCACCCCA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 T 2 1 293457 CASAVA_Build 2 52320180 3I AAAAAAAAAA ---/AAC ACTATTTTCT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 AAC 0 1 293458 CASAVA_Build 2 52347153 1I TTTTTGGTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 9 10 293459 CASAVA_Build 2 52380786 2D ACAGGGCAAG AT/-- ATATATATAT 1380 het 1380 ref 35 28 3 4 AT 7 6 293460 CASAVA_Build 2 52388198 5D TTTGCTCCTT TGTCA/----- AAGATCAATT 3070 het 3070 ref 51 28 21 3 TGTCA 1 0 293461 CASAVA_Build 2 52393006 1D ATAATGTGTA T/- TTTTTTTTTT 2453 het 2453 ref 50 36 6 8 T 12 11 293462 CASAVA_Build 2 52393828 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 539 hom 18 3 8 7 A 13 12 293463 CASAVA_Build 2 52396333 1D ATTTATTGCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2769 hom 32 8 19 5 T 10 9 293464 CASAVA_Build 2 52399260 2I CTGGATAACT --/TA TATATATATT 2063 het 1579 hom 16 5 7 4 TA 4 5 293465 CASAVA_Build 2 52409542 1D CCATAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 11 10 293466 CASAVA_Build 2 52413957 1D CAATCTAATC T/- TTTTTTTTTT 2924 het 232 hom 25 4 8 13 T 17 16 293467 CASAVA_Build 2 52421271 2D ACATACGTAC AT/-- ATATATATAT 2127 het 1730 hom 16 7 5 4 AT 8 7 293468 CASAVA_Build 2 52427865 1I CCCAGTTTAT -/C AAAAGGAGAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 0 1 293469 CASAVA_Build 2 52429651 1D GTTTTAATGC T/- GGGATTCTTC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 1 0 293470 CASAVA_Build 2 52439674 1D TTATAGTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 11 10 293471 CASAVA_Build 2 52443920 5D CATGTTTATT TTTCC/----- TTTCTTCTGT 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 TTTCC 1 0 293472 CASAVA_Build 2 52447195 1I GGTATTTGTA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 30 hom 32 2 16 14 T 7 8 293473 CASAVA_Build 2 52448301 2D TGAATATGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 6 A 13 11 293474 CASAVA_Build 2 52452207 1D AAACTAAACC A/- AGTCTTATAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 2 1 293475 CASAVA_Build 2 52453249 1I AAACAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 57 28 21 8 A 10 11 293476 CASAVA_Build 2 52457110 1D CCTATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2617 hom 32 9 9 14 T 15 14 293477 CASAVA_Build 2 52457953 4D4M4D ATATTAAACG AAGAATGCAAGA/----ATTC---- ATGCATCCCT 3070 het 3070 ref 33 24 14 0 N/A 0 0 293478 CASAVA_Build 2 52464896 3D GAAGAAATGA TGG/--- TGGGCAAATA 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 TGG 2 1 293479 CASAVA_Build 2 52466310 1D TCTTATATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 10 9 293480 CASAVA_Build 2 52467916 1D CAACATCTCA C/- CCCTATTCTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 C 4 3 293481 CASAVA_Build 2 52472837 1D TGATGTGGTT A/- ATGTATGTAT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 2 1 293482 CASAVA_Build 2 52475396 1I TCACTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 14 11 T 11 12 293483 CASAVA_Build 2 52483328 1I CTATGAGACA -/T TTAGTACATG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 2 3 293484 CASAVA_Build 2 52483547 5I TTCATTTTGA -----/ATCTC ATCTCACTTT 3070 het 3070 ref 58 28 24 6 ATCTC 1 2 293485 CASAVA_Build 2 52485838 1D TTAAAGGCCG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 10 9 293486 CASAVA_Build 2 52510312 1D34M10I5M9I ATTACTCTTA TTTTTACTCTCCAATTTCCAAGTGAAGTGTAAGCT----------AATTT---------/-TTTTACTCTCCAATTTCCAAGTGAAGTGTAAGCTTTAGGTTTACACTTTAGGTTTGAC TTTAGGTTTA 3070 het 3070 hom 32 20 25 5 N/A 0 0 293487 CASAVA_Build 2 52515377 1D TGGGGGTCCC A/- AACAGCAACA 3070 hom 66 het 25 0 22 4 A 3 2 293488 CASAVA_Build 2 52520723 1D AGAGATTAGG A/- AAAAAAAAAT 2645 het 2645 ref 22 11 8 3 A 10 9 293489 CASAVA_Build 2 52526775 6D TAGACCTGGT ATATTA/------ ATATTAATGA 3070 het 3070 ref 40 20 16 9 ATATTA 2 1 293490 CASAVA_Build 2 52531326 2I CAATTGATCA --/AT GTGTCTGAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 0 1 293491 CASAVA_Build 2 52537887 18I ATAACCTCAG ------------------/GATTAAAGGGTTCCAAAT GATTAAAGGG 3070 hom 84 het 34 0 27 7 GATTAAAGGGTTCCAAAT 0 1 293492 CASAVA_Build 2 52540773 1D ATTCTTAGTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 8 7 293493 CASAVA_Build 2 52549212 1D ATTGTAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 38 1 34 3 A 11 10 293494 CASAVA_Build 2 52550606 1D CATACAAAAC T/- GTGAGTCAAT 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 T 1 0 293495 CASAVA_Build 2 52551307 1D CCTAAGAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 10 9 293496 CASAVA_Build 2 52552672 2I TCTTTCTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 TG 5 6 293497 CASAVA_Build 2 52557261 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTTTTCA 3070 het 380 hom 40 1 31 8 C 0 1 293498 CASAVA_Build 2 52558026 16D TGACAAAATG CTTGGGAAGGTGAAAC/---------------- CACTCCTGAG 3070 hom 93 het 32 0 32 5 CTTGGGAAGGTGAAAC 1 0 293499 CASAVA_Build 2 52559538 1D AATAAAGTAA C/- TATTCATGTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 1 0 293500 CASAVA_Build 2 52562409 1D TTTTGCTTAT C/- AAGTATGTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 1 0 293501 CASAVA_Build 2 52563170 1D GGCTGAATAG A/- AATATCGTGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 2 293502 CASAVA_Build 2 52570675 1I ATTTTATTAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 2641 hom 20 9 10 1 A 0 1 293503 CASAVA_Build 2 52584989 1I TGGAGTTGCA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 6 7 293504 CASAVA_Build 2 52585297 3I AGGATAGAAT ---/AAC ATCCTCTTGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAC 0 1 293505 CASAVA_Build 2 52587841 1D GAGAACTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 29 2 25 2 A 12 11 293506 CASAVA_Build 2 52641706 1I AATTTTAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 538 hom 27 2 23 2 T 9 10 293507 CASAVA_Build 2 52655061 2I TCTATTGTAC --/AT ATAGTGCTGC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AT 1 2 293508 CASAVA_Build 2 52657621 1D ATTTCAATGA T/- TTTTTTTTTT 1242 het 1242 ref 38 28 4 7 T 13 12 293509 CASAVA_Build 2 52657995 13D TTTATTCCAT TGTGGTAAGATAA/------------- TGTACTTGAT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TGTGGTAAGATAA 1 0 293510 CASAVA_Build 2 52658949 1D TTGGGCAGCA T/- TTTTTTTTTT 1722 het 1722 ref 25 16 4 5 T 11 10 293511 CASAVA_Build 2 52669089 1D TTTTGATGGG T/- TTTTTTTTTT 2312 hom 23 het 12 0 6 6 T 11 10 293512 CASAVA_Build 2 52690973 7D ACAACAAAAT TAATTCA/------- TTTTTTAAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAATTCA 1 0 293513 CASAVA_Build 2 52693424 3D ATAAAATGGA TGG/--- TGGTGGCTAA 3070 hom 83 het 33 0 25 9 TGG 3 2 293514 CASAVA_Build 2 52699674 1I TTGAGGAAGA -/G TATAAGAACT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 0 1 293515 CASAVA_Build 2 52707737 3I AATTAATGAC ---/AAA GAATAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 0 3 293516 CASAVA_Build 2 52711023 1I CCCAGGAGGG -/A AATTCATTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 2 3 293517 CASAVA_Build 2 52717435 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2185 het 1849 hom 14 5 6 3 A 16 17 293518 CASAVA_Build 2 52725341 1D CTGAGTCATG T/- TTGTAACCAG 3070 het 3070 ref 46 24 13 9 T 3 2 293519 CASAVA_Build 2 52731427 1I GTGGATCAGT -/A AGGGGTGATG 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 1 2 293520 CASAVA_Build 2 52732595 1I GTCCTCTCTT -/C CTCTGTCAAC 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 C 1 2 293521 CASAVA_Build 2 52742862 1D TCATCTTGAT A/- GACACAGGAG 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 1 0 293522 CASAVA_Build 2 52746800 3I CTGCAGCAGA ---/CTT CTGTCTGGAG 3070 het 3070 ref 43 26 11 6 CTT 0 1 293523 CASAVA_Build 2 52748970 1I GAAGGAATAA -/T CCTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 62 32 24 6 T 0 1 293524 CASAVA_Build 2 52757385 1I TTTGTTTCAA -/T TTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 6 7 293525 CASAVA_Build 2 52773775 1I CTGAAAAATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 1497 hom 29 4 22 3 A 8 9 293526 CASAVA_Build 2 52776167 1I CATTCTAGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 8 9 293527 CASAVA_Build 2 52779632 9I AGGCATATGT ---------/TCTACAATA TCTTCAGTTT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 TCTACAATA 0 1 293528 CASAVA_Build 2 52783450 1D GAGGAATATG C/- CCCCCATGAC 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 C 6 5 293529 CASAVA_Build 2 52784345 1D GGATTGATTT A/- TTTCCCCTGT 3070 het 3070 ref 42 24 13 6 A 1 0 293530 CASAVA_Build 2 52786198 2I TTAAAAAAAA --/AT AAAAAAAAAA 3070 het 2393 hom 30 10 15 5 AT 0 1 293531 CASAVA_Build 2 52790653 1I CCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 T 10 11 293532 CASAVA_Build 2 52798979 1D ATATTTGATG A/- AAACCTACAC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 A 4 3 293533 CASAVA_Build 2 52799247 1D GTTAATTACC T/- TAAAAGTTTG 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 T 2 1 293534 CASAVA_Build 2 52806237 1D CTAAGGGCTC T/- TGTTCACTAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 2 1 293535 CASAVA_Build 2 52826518 1I AGTTCCCACT -/G GGGCACTGCC 3070 hom 135 het 47 0 44 3 G 3 4 293536 CASAVA_Build 2 52875978 1I5M4I4M3D5M7I7M5I4M2D ATAGTAAAAT -TATAG----TAAAATTATAGT-------AACATAT-----AAAATT/GGAAAGGAGATAAA---AGAGTGTCAGCCAACAAATGTAGGAAAA-- AAAGTAAAAT 3070 hom 84 het 24 0 29 4 N/A 0 0 293537 CASAVA_Build 2 52876521 4I CTATTATGAA ----/TATT TCTTTAAAAT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TATT 0 1 293538 CASAVA_Build 2 52889071 1I AAAATAATAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 9 293539 CASAVA_Build 2 52892621 1D GTTGAAAAAA T/- CTGGGATTCC 3070 hom 80 het 31 0 26 5 T 1 0 293540 CASAVA_Build 2 52906543 1D GGACCAGACA T/- TATTTTAAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 2 1 293541 CASAVA_Build 2 52908830 1D GTTCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 27 0 20 7 T 11 10 293542 CASAVA_Build 2 52909045 5D AGTAGAGAGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 6 T 16 11 293543 CASAVA_Build 2 52909679 2I TGCCAAAAAC --/AG AGCATCATCA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 AG 1 2 293544 CASAVA_Build 2 52910196 2D AAGCAAACAG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 48 0 41 8 A 11 9 293545 CASAVA_Build 2 52911626 1I GTAGCATGTT -/A AAAAAACCCT 3070 hom 78 het 45 0 27 18 A 6 7 293546 CASAVA_Build 2 52911661 1I GCTTTTTCTA -/T TTTTTTGGAA 3070 hom 30 het 36 0 11 25 T 6 7 293547 CASAVA_Build 2 52912582 1I CCATTTTATG -/T TGTTTTTTTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 1 2 293548 CASAVA_Build 2 52917543 2I CAAAAAACTC --/AA GAGTCCATTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 0 2 293549 CASAVA_Build 2 52922414 10I AAGAAGAATG ----------/GGAGGGAGAA GGAGGGAGAA 3070 hom 44 het 17 0 15 2 GGAGGGAGAA 1 2 293550 CASAVA_Build 2 52925054 4D TCATGGTCTC AATT/---- AATTTCTTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 8 AATT 2 1 293551 CASAVA_Build 2 52925218 1D AATACATTTA T/- TTTTGTTTGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 5 4 293552 CASAVA_Build 2 52926081 4D TTTACAGATT TTTA/---- TTTATTTGTG 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TTTA 2 1 293553 CASAVA_Build 2 52927788 1D TTCCTGTGTT A/- AGTTTGCTGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 1 293554 CASAVA_Build 2 52927943 4D9M1I TGGTTCCATG TCTTTCTTTGCTA-/----TCTTTGCTAT TGTAAATAGT 3070 hom 49 het 16 0 17 1 N/A 0 0 293555 CASAVA_Build 2 52934461 1D TCTCCAATTT G/- GGGGGCAGCA 3070 hom 143 het 51 0 48 4 G 6 5 293556 CASAVA_Build 2 52970761 2D AGTATTTTAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 67 het 35 0 22 14 TG 7 6 293557 CASAVA_Build 2 52983780 1D GAGAGATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 17 0 12 6 A 11 10 293558 CASAVA_Build 2 52988223 1D AAAACATATG A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 8 7 293559 CASAVA_Build 2 53029873 1D AACAGCAGCA T/- GGGGGTAACT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 1 0 293560 CASAVA_Build 2 53029915 1I CCCACCGGGT -/C CCCCCCCACA 1239 hom 10 het 14 0 4 10 C 7 8 293561 CASAVA_Build 2 53071423 1D CTCCCCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 11 10 293562 CASAVA_Build 2 53080425 2I TCAAGACATG --/TA TATATATATA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TA 5 6 293563 CASAVA_Build 2 53081190 7D CTGCAAAAGG AACAAAA/------- AACAAAAAAC 3070 hom 69 het 24 0 24 1 AACAAAA 3 2 293564 CASAVA_Build 2 53084986 1I TTTTCTACCC -/T TAACCATCAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 293565 CASAVA_Build 2 53113156 2D ATGTGCAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 9 T 14 12 293566 CASAVA_Build 2 53121477 2D TAGTATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 90 het 41 0 30 12 AC 11 10 293567 CASAVA_Build 2 53124273 1D CTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 171 hom 17 1 8 8 T 13 12 293568 CASAVA_Build 2 53139129 1D GTATCTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 5 A 12 11 293569 CASAVA_Build 2 53153359 1I TTTTTTAAAA -/T TTTTTGACAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 5 6 293570 CASAVA_Build 2 53204070 1I CACCTATTGT -/A AAAAGGGGTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 4 5 293571 CASAVA_Build 2 53217806 8I CCTGCTATAA --------/ACTGCTAT ACCTTAAACT 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 ACTGCTAT 0 1 293572 CASAVA_Build 2 53218374 23D GATAAATTAC ATACCAAAATAATGTACTGCCAG/----------------------- GTACATTTCT 3070 het 3070 ref 32 21 19 3 ATACCAAAATAATGTACTGCCAG 1 0 293573 CASAVA_Build 2 53224176 1D TGAAAAGTAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 9 8 293574 CASAVA_Build 2 53224627 2D GAGTTATAGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 1492 hom 20 4 10 6 AT 10 9 293575 CASAVA_Build 2 53226636 1I TAATCAGGGG -/A AAAAATACTT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 5 6 293576 CASAVA_Build 2 53231101 3I GTAGTAGTAA ---/TTG TTGTTGTAGT 3070 hom 56 het 25 0 17 8 TTG 2 3 293577 CASAVA_Build 2 53232914 5D21M3I TCTGGCTTAT TTCACTTAACAAACATAATGTCCTCT---/-----TTAACAAACATAATGTCCTCTAAC AACAACAACA 3070 hom 93 het 31 0 32 9 N/A 0 0 293578 CASAVA_Build 2 53236065 1I CCATATATTA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 7 8 293579 CASAVA_Build 2 53259798 1D TTCAGTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 514 hom 32 2 17 13 A 14 13 293580 CASAVA_Build 2 53261769 1D AATTACAAAC A/- AAAATCTCAT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 5 4 293581 CASAVA_Build 2 53261982 1D GGAACTTGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 389 hom 40 1 34 5 A 10 9 293582 CASAVA_Build 2 53266428 1I GAGGCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 10 11 293583 CASAVA_Build 2 53267188 1D TACAGACTAA C/- TGGGGAGGCA 3070 hom 151 het 56 0 51 6 C 1 0 293584 CASAVA_Build 2 53269486 1D AGTAAAAAAG T/- AAAAAAAAAA 3070 het 231 hom 41 1 37 4 T 1 0 293585 CASAVA_Build 2 53277758 1D AGATGGATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 10 9 293586 CASAVA_Build 2 53282916 1D GTGTGTCAGT C/- CTGAGGTGTG 3070 hom 144 het 52 0 49 6 C 2 1 293587 CASAVA_Build 2 53298721 2D GACCCCATTA GG/-- GTCTATGAGT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 3 1 293588 CASAVA_Build 2 53305298 1I TAAGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 41 1 30 10 T 11 12 293589 CASAVA_Build 2 53347515 1I TTTTTCTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 409 hom 42 1 31 10 A 9 10 293590 CASAVA_Build 2 53347918 1I TTGAAAGGGG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 T 7 8 293591 CASAVA_Build 2 53428637 1I CATTTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 1395 het 1395 ref 26 19 3 4 T 11 12 293592 CASAVA_Build 2 53443023 1D ACACTGATAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 9 8 293593 CASAVA_Build 2 53447073 1D TTCTCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 12 11 293594 CASAVA_Build 2 53490922 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 6 7 293595 CASAVA_Build 2 53496271 2D GGAAATACAG AT/-- ATCTCTTCAA 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 AT 2 1 293596 CASAVA_Build 2 53499054 1I TCATATGTTT -/G TTGGCCACAT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 G 0 1 293597 CASAVA_Build 2 53503044 1I TTTTTCCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 450 hom 30 1 17 12 T 10 11 293598 CASAVA_Build 2 53512893 1I CCCATGATTC -/A ATTATCTCCA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 A 1 2 293599 CASAVA_Build 2 53547221 2D GAAAGAATTC CT/-- TCTCTCTACC 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 CT 1 0 293600 CASAVA_Build 2 53548322 1D TTCACTGTGA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 51 27 15 10 T 8 7 293601 CASAVA_Build 2 53563821 1I TGGAAAACTG -/A AATCAGCAGC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 2 3 293602 CASAVA_Build 2 53568290 11D GATAAAAGAG ACGGTGGGGAC/----------- ACAGTAGAAA 2652 het 2361 hom 20 7 7 6 ACGGTGGGGAC 1 0 293603 CASAVA_Build 2 53575720 1D CCATCAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 A 12 11 293604 CASAVA_Build 2 53580357 1D AAATGGTTTC A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 A 8 7 293605 CASAVA_Build 2 53581478 1I AGACAAAAAC -/A AAAAATTACT 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 A 5 6 293606 CASAVA_Build 2 53583535 1D TGCTCTCTGC T/- TCTTCACCCT 3070 het 3070 ref 32 19 13 1 T 2 1 293607 CASAVA_Build 2 53583802 1I TTCTTGGGGT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 48 19 18 11 A 8 9 293608 CASAVA_Build 2 53584795 3I TTCCCCAGGG ---/ACT ACTAATGTCT 3070 het 3070 hom 43 14 25 4 ACT 1 2 293609 CASAVA_Build 2 53589529 2I TTAACTGACT --/CA CAGTTCCACA 3070 hom 78 het 31 0 25 6 CA 1 2 293610 CASAVA_Build 2 53591456 4D CACAAATGAA GGAT/---- GGATGCCCAG 3070 het 3070 hom 45 21 21 6 GGAT 2 1 293611 CASAVA_Build 2 53596205 1I ATTACCGGAA -/G GAGGCAGAAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 1 2 293612 CASAVA_Build 2 53597631 6I TAGTAAACTT ------/AACTCC AACTCCAAAT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 AACTCC 1 2 293613 CASAVA_Build 2 53616544 1I CAAGAGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 A 10 11 293614 CASAVA_Build 2 53631778 2I ATTTAATAAC --/TA TCTTATGGAG 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 TA 0 1 293615 CASAVA_Build 2 53634588 1I AAGGGCAGGG -/C CAAGCCCAGG 3070 hom 87 het 34 0 27 7 C 1 2 293616 CASAVA_Build 2 53655544 1D GAGCAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 15 12 3 A 11 10 293617 CASAVA_Build 2 53661565 1I TTAAATGTAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 8 9 293618 CASAVA_Build 2 53663564 1I TTTGCTATCC -/A AAAAAAAAAA 1285 het 1285 ref 45 31 4 10 A 10 11 293619 CASAVA_Build 2 53667144 1I GCAAGTACAC -/A ATATTTTGTT 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 A 1 2 293620 CASAVA_Build 2 53669040 2I AAAGACCAAA --/TC TACGTCTGAT 1369 het 1369 ref 11 6 3 2 TC 0 1 293621 CASAVA_Build 2 53673699 2D GGAAAAAAAA AG/-- GAAGAAAAAA 3070 het 1333 hom 18 4 13 1 AG 1 0 293622 CASAVA_Build 2 53676785 1D GAGACTTCTC T/- TTTTTTTTTT 918 het 918 ref 38 26 4 8 T 13 12 293623 CASAVA_Build 2 53689317 1I GTCTCTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 720 hom 22 2 14 6 A 12 13 293624 CASAVA_Build 2 53722934 2D CGAGTGCCTT TA/-- ATTCAGAGTG 3070 het 3070 ref 58 29 23 6 TA 1 0 293625 CASAVA_Build 2 53723223 6D TCTGAATTAT CTAAGA/------ CTAAAGCATA 3070 het 3070 ref 39 23 14 5 CTAAGA 1 0 293626 CASAVA_Build 2 53731289 1I TGCTGAGGTT -/C CCCCCCCTCA 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 C 7 8 293627 CASAVA_Build 2 53758129 1D TATCTGCAGG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 14 17 6 T 8 7 293628 CASAVA_Build 2 53758782 2D TACCTTGCTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 99 het 48 0 33 16 GT 9 8 293629 CASAVA_Build 2 53767304 1D TAGAACATGT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 A 9 8 293630 CASAVA_Build 2 53778100 1D TATGGACTTG C/- CCCGAATTCT 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 C 4 3 293631 CASAVA_Build 2 53791612 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 A 12 11 293632 CASAVA_Build 2 53817342 2D TCCATCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2670 het 1166 hom 16 6 9 1 A 16 14 293633 CASAVA_Build 2 53823376 1D ATAGAGGCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 48 19 21 10 A 10 9 293634 CASAVA_Build 2 53833684 1D ATGTACGCAA T/- TTAAAAAAAA 1405 het 1405 ref 31 25 4 2 T 3 2 293635 CASAVA_Build 2 53846542 29D CACAACGCAT TCTTTGGTGCTCCATTGATAAGAGCACCC/----------------------------- TCTTTGGTGC 3070 het 3070 ref 38 18 11 17 TCTTTGGTGCTCCATTGATAAGAGCACCC 1 0 293636 CASAVA_Build 2 53870902 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 2438 het 1324 hom 11 3 7 1 T 9 8 293637 CASAVA_Build 2 53875675 1D AAAACAAGAT A/- ACAATTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 A 2 1 293638 CASAVA_Build 2 53876752 1D TTGTGTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 11 10 293639 CASAVA_Build 2 53888053 1I CCTTACTGCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 8 9 293640 CASAVA_Build 2 53891563 4D GATGAGTTTC TTAA/---- TTAAAGAAAT 3070 het 3070 hom 42 20 19 4 TTAA 2 1 293641 CASAVA_Build 2 53897780 1D TATTTACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2678 hom 27 9 8 10 T 13 12 293642 CASAVA_Build 2 53901929 1I AACCAGATTC -/T TTTTTTTTTT 2902 het 2462 hom 28 9 12 7 T 11 12 293643 CASAVA_Build 2 53927035 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTGAG 1166 het 1166 ref 17 12 3 2 T 8 7 293644 CASAVA_Build 2 53942930 1I TTTTTTTCTA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 2994 hom 25 7 10 8 T 6 7 293645 CASAVA_Build 2 53945075 1D AAGTGAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 15 4 A 12 11 293646 CASAVA_Build 2 53945990 1D CAGATGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 A 11 10 293647 CASAVA_Build 2 53953538 1D ATAAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 12 11 293648 CASAVA_Build 2 53953880 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 1590 het 1590 ref 13 6 5 2 A 9 10 293649 CASAVA_Build 2 53972194 1D AAATTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 T 11 10 293650 CASAVA_Build 2 53972500 1D AAGACTGTCC A/- AAAAAAAAAA 2651 het 2522 hom 40 15 8 19 A 15 14 293651 CASAVA_Build 2 53973880 1D GTTTTGGGTA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 45 17 23 6 T 8 7 293652 CASAVA_Build 2 53984519 1I TTAAAAAAAA -/T GAACAGATAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 0 1 293653 CASAVA_Build 2 53987670 2I8M4I TTATATAAAA --ATGTTGTC----/ATATGTTGTCTTAA TTAATTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 18 2 N/A 0 0 293654 CASAVA_Build 2 53997699 4D ATTATATTAT TAAG/---- TATCAGGAAG 2957 het 2957 ref 16 8 7 2 TAAG 1 0 293655 CASAVA_Build 2 54007624 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 G 1 0 293656 CASAVA_Build 2 54009162 2I CCAAATATTT --/CA GTGTCCTGAG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 CA 0 1 293657 CASAVA_Build 2 54009807 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2826 hom 21 7 13 1 A 9 10 293658 CASAVA_Build 2 54014600 1I AGAAGTAAAC -/T TTTTAAACAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 4 5 293659 CASAVA_Build 2 54017229 5I AGAATACAAC -----/AAATA AAATAATATA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 AAATA 1 2 293660 CASAVA_Build 2 54019396 10D TGTTAATTAA AATCATACTG/---------- CAATCTTCTA 3070 het 3070 hom 29 12 15 4 AATCATACTG 1 0 293661 CASAVA_Build 2 54030927 1I CTTGTCTTCC -/A AAAAAAAAAA 2075 het 1917 hom 28 9 9 10 A 13 14 293662 CASAVA_Build 2 54034243 1I GCTGTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2955 hom 32 8 15 9 T 13 14 293663 CASAVA_Build 2 54038998 8D CTCCATCTCA AAAAAAAC/-------- AAAAAAACAA 2892 het 2892 ref 20 12 7 5 AAAAAAAC 3 2 293664 CASAVA_Build 2 54045888 1D GGCCAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2051 hom 28 11 9 8 T 17 16 293665 CASAVA_Build 2 54057277 1I ATTTGGGAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 7 8 293666 CASAVA_Build 2 54060273 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2773 hom 18 9 8 2 A 11 10 293667 CASAVA_Build 2 54078193 3D GTGATCCACT CTC/--- CTCGGCCTCC 2945 het 1432 hom 11 3 7 2 CTC 2 1 293668 CASAVA_Build 2 54082992 1I CATTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2703 het 730 hom 26 4 10 12 T 13 14 293669 CASAVA_Build 2 54085551 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAACAAA 2068 het 123 hom 11 2 7 2 AC 0 1 293670 CASAVA_Build 2 54092379 1D TTTTGGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 11 10 293671 CASAVA_Build 2 54095965 3I CCAGCCTGAT ---/CAA CATGGAGAAA 2368 het 2368 ref 17 7 6 4 CAA 0 1 293672 CASAVA_Build 2 54107200 2D CATTACTGGG TA/-- TCTACCCAGA 3070 het 3070 hom 27 13 14 1 TA 1 0 293673 CASAVA_Build 2 54110039 1I CTTTTTTTTT -/A CCGTCCAGAG 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 0 1 293674 CASAVA_Build 2 54113840 1D CTGTGGGCAA T/- TTTTTTTTTT 1482 het 1482 ref 30 12 8 10 T 17 16 293675 CASAVA_Build 2 54121751 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2811 hom 32 7 20 5 T 9 8 293676 CASAVA_Build 2 54122437 1I TTAGAATGCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 T 7 8 293677 CASAVA_Build 2 54125088 1D ATACCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1585 het 1585 ref 15 6 7 2 A 13 12 293678 CASAVA_Build 2 54145106 1I GGGGCCATAT -/C CTTTTATAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 C 1 2 293679 CASAVA_Build 2 54157646 2D TTTACTAAAA AC/-- ACATACACAT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 AC 2 1 293680 CASAVA_Build 2 54158992 1I ATATCTTCCT -/A AAAAAAAAAA 2870 het 2870 ref 24 10 8 6 A 11 12 293681 CASAVA_Build 2 54159246 1D CTCAATAAGC T/- TTTTTTTTTT 2181 het 2181 ref 15 6 6 3 T 13 12 293682 CASAVA_Build 2 54163715 1D30M1I ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATAGTCACTA-/-AAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATAGTCACTAT TTTCTCAGGA 3070 het 2879 hom 21 8 13 7 N/A 0 0 293683 CASAVA_Build 2 54164241 1D ATTAAAAGAA C/- CAAACACATG 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 C 2 1 293684 CASAVA_Build 2 54168553 1D TTAAGGATAT A/- AAAAGTGGCA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 5 4 293685 CASAVA_Build 2 54178512 2D TCTTTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 35 11 14 14 TC 8 7 293686 CASAVA_Build 2 54178607 1D CCTTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 749 het 749 ref 25 12 3 10 T 15 14 293687 CASAVA_Build 2 54183280 24D GGCTTAAGCC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------ AAAAAAAAAA 2261 het 2261 ref 24 14 6 10 A 36 12 293688 CASAVA_Build 2 54190898 1I TACCTGCCAA -/C CCCTGAGGAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 3 4 293689 CASAVA_Build 2 54209017 1I TCAAATTCCA -/T TTTTTTTTTT 1528 het 1528 ref 53 36 4 13 T 10 11 293690 CASAVA_Build 2 54218737 4I GAGAAGTGTC ----/TGTT CATGTCCTTG 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 TGTT 0 1 293691 CASAVA_Build 2 54221170 2D TTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 het 1570 hom 57 18 22 17 CA 10 9 293692 CASAVA_Build 2 54233905 1D GAACCTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 4 A 11 10 293693 CASAVA_Build 2 54234102 1D CTACTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 1138 het 1138 ref 28 8 4 16 T 15 14 293694 CASAVA_Build 2 54243959 1I GACAATTTAT -/A AGAATGTAAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 1 2 293695 CASAVA_Build 2 54265487 1D ATTTAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2946 hom 37 13 10 14 T 17 16 293696 CASAVA_Build 2 54270230 1D TATATCTGTG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 8 7 293697 CASAVA_Build 2 54279266 1I ATTAAAGCTT -/A AAAATATTAG 3070 het 3070 hom 41 9 25 7 A 4 5 293698 CASAVA_Build 2 54281517 2I CCCACTGGCA --/GT GTGTATGAGT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 GT 2 3 293699 CASAVA_Build 2 54283848 4D TATTCCTAAA TATT/---- TATTCTTCTT 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 TATT 2 1 293700 CASAVA_Build 2 54285710 1D CCATTAATTT G/- GCTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 G 2 1 293701 CASAVA_Build 2 54289347 2I AAAGGGAGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 10 12 293702 CASAVA_Build 2 54289628 2D TTGCTTTTAC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 11 14 11 T 11 9 293703 CASAVA_Build 2 54291373 1I TCATTAAGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 T 9 10 293704 CASAVA_Build 2 54293469 1D CAAAAAGTTT A/- ATGTAAAGAA 3070 het 3070 hom 36 13 20 4 A 2 1 293705 CASAVA_Build 2 54297177 2I TCCTAATCAC --/AT GTTTACATTT 809 het 809 ref 31 19 4 8 AT 0 1 293706 CASAVA_Build 2 54299335 10I GGGTGGTATA ----------/GTGGTAATAG GTGGTACTAG 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 GTGGTAATAG 0 1 293707 CASAVA_Build 2 54300433 6D CTAATTTTTA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 1205 het 958 hom 19 5 4 10 TG 9 6 293708 CASAVA_Build 2 54305361 2I GTACCAGCCC --/CT GTCTGCCTAG 3070 het 3070 ref 63 31 25 7 CT 0 1 293709 CASAVA_Build 2 54314713 1D AAATCAGGTC T/- GTAGGTGGTT 3070 het 3070 ref 44 28 14 2 T 1 0 293710 CASAVA_Build 2 54318000 2I GTTTATCCAC --/AT GTTTGCCCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 0 1 293711 CASAVA_Build 2 54331119 1I TGGGTGGGGT -/G GGGGGGGGCG 1605 het 1605 ref 16 5 5 6 G 8 9 293712 CASAVA_Build 2 54332230 1D TTACCACCCT A/- AAAGTTTATT 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 A 4 3 293713 CASAVA_Build 2 54334581 3D GAACTACTAC TTT/--- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 4 1 293714 CASAVA_Build 2 54340353 3D ATTGAATATT GAC/--- AATTCTTTTG 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 GAC 1 0 293715 CASAVA_Build 2 54343316 5D28M2I ATTCCTATTA TTTTCTTGAGTTGTCATTTTAGGATAATCTCTC--/-----TTGAGTTGTCATTTTAGGATAATCTCTCTT TGTGATTACT 3070 het 3070 ref 28 18 11 3 N/A 0 0 293716 CASAVA_Build 2 54344265 1D CACCCTGTCG A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 A 8 7 293717 CASAVA_Build 2 54344545 4D TCATCAAATC CAAA/---- CAAACAGTGA 3070 het 3070 hom 55 24 25 8 CAAA 2 1 293718 CASAVA_Build 2 54353108 1D TAGTAAGTCT A/- ATGTGAAAGT 3070 hom 172 het 60 0 57 3 A 2 1 293719 CASAVA_Build 2 54356837 3D TTACAGAAAA AGT/--- AAAAGTCCTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AGT 1 0 293720 CASAVA_Build 2 54360227 15D GGCAGGATCC AGAGCTGCAGTCTCA/--------------- AGAGCTGCAG 3070 hom 89 het 34 0 30 5 AGAGCTGCAGTCTCA 1 0 293721 CASAVA_Build 2 54375559 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 11 12 293722 CASAVA_Build 2 54377744 1I TGGGTGGGTG -/A AACACTTTTC 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 A 2 3 293723 CASAVA_Build 2 54378405 2I AGAAAAATAT --/AA GAGTATAAAT 3070 het 2754 hom 24 8 10 6 A 0 2 293724 CASAVA_Build 2 54378986 6I ATGAAAGATT ------/TAAATA TAAAGGATAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 TAAATA 0 1 293725 CASAVA_Build 2 54384046 3D TTTAGCTTTC ATT/--- ATTATTTGTG 2336 het 2336 ref 18 11 5 2 ATT 3 2 293726 CASAVA_Build 2 54393683 1D CACAGAGCTC A/- AGGCTCCAGA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 2 1 293727 CASAVA_Build 2 54403714 3I CAAATTTTTA ---/TTG TTATCATTTA 3070 hom 45 het 20 0 16 5 TTG 0 1 293728 CASAVA_Build 2 54404272 1D CTATTTCCAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 9 8 293729 CASAVA_Build 2 54404372 1I TGGAAGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 T 10 11 293730 CASAVA_Build 2 54425358 4I AGCTGATCCC ----/CCGT CCGTCCCCTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CCGT 1 2 293731 CASAVA_Build 2 54426732 3D AAGTCCTGGC ACA/--- ACATTTGACC 3070 het 3070 hom 46 17 25 4 ACA 2 1 293732 CASAVA_Build 2 54430840 1D TTATGGAAGG T/- TTTAGATTAC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 4 3 293733 CASAVA_Build 2 54439435 4D TCTTTTCATG AAGA/---- AAGAATGGTG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 AAGA 2 1 293734 CASAVA_Build 2 54453982 1D GGCCTTCACA C/- CCCCCATGGC 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 C 6 5 293735 CASAVA_Build 2 54469904 1D ACAACACGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2465 hom 20 5 12 4 A 12 11 293736 CASAVA_Build 2 54475502 3I GTCTGGTAAT ---/ACC ACATTAGCGA 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 ACC 0 1 293737 CASAVA_Build 2 54479247 1I TTTATTTATA -/G GGTCAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 G 2 3 293738 CASAVA_Build 2 54489499 1I CCATTATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 11 10 T 10 11 293739 CASAVA_Build 2 54490229 2D TATGGAGCTT TA/-- TATATATATA 2623 het 1680 hom 17 4 6 7 TA 8 7 293740 CASAVA_Build 2 54504945 14D GGTTTTTTTT AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 14 12 4 A 23 9 293741 CASAVA_Build 2 54521412 1I AAATTTCTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 11 15 16 A 9 10 293742 CASAVA_Build 2 54552117 1I GGTGGTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2242 hom 50 8 24 18 T 15 16 293743 CASAVA_Build 2 54554145 1I13M2D TCCAGTTTTG -TTTTTTTTTTAAGCA/TTTTTTTTTTTAAG-- CACACGCACA 3070 het 3070 ref 33 17 18 4 N/A 0 0 293744 CASAVA_Build 2 54559556 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 2331 het 2331 ref 30 14 9 7 TA 6 7 293745 CASAVA_Build 2 54560505 1D CAAATTTTGC T/- TTTTTTTTTT 2640 het 2640 ref 25 12 8 5 T 11 10 293746 CASAVA_Build 2 54565412 3I TGGGGTGGTT ---/GTG GTGTCGGAGA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 GTG 1 2 293747 CASAVA_Build 2 54568044 3D ATGCATGACA TAC/--- TACTACTGTA 3070 het 3070 hom 39 16 16 8 TAC 3 2 293748 CASAVA_Build 2 54570175 1I AACCCCGTCT -/C TACTAAAAAT 2191 het 1420 hom 10 3 5 2 C 0 1 293749 CASAVA_Build 2 54575559 1D GTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 A 13 12 293750 CASAVA_Build 2 54575802 3D TGAGAATCAT AGG/--- AGGTTGCAGG 3070 het 3070 hom 47 18 24 6 AGG 2 1 293751 CASAVA_Build 2 54579618 1I AGAAACCCAG -/A GAGACTTTGC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 0 1 293752 CASAVA_Build 2 54579792 4I GGATCGATCT ----/GTTA GTTCTCAGAT 3070 hom 105 het 41 0 34 7 GTTA 0 1 293753 CASAVA_Build 2 54587265 1I CATTTGTGTA -/T TTGTTGTCTG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 2 3 293754 CASAVA_Build 2 54590598 1D GCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 29 2 14 13 T 17 16 293755 CASAVA_Build 2 54597771 4D TGCTGGAGGG GGAT/---- GGATAGTGAG 3070 hom 70 het 29 0 23 7 GGAT 2 1 293756 CASAVA_Build 2 54598588 1D CCTGGTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 587 hom 23 4 16 3 T 15 14 293757 CASAVA_Build 2 54605591 1D TCTGCTGTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 110 het 45 0 38 7 T 9 8 293758 CASAVA_Build 2 54607796 3D CAGTGAGGGT GAG/--- GAGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 77 35 33 11 GAG 2 1 293759 CASAVA_Build 2 54612250 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1720 het 1720 ref 43 27 5 12 T 12 11 293760 CASAVA_Build 2 54620504 3I TATTGAAAAC ---/ATT ATTATGAGCT 3070 hom 150 het 51 0 50 1 ATT 1 2 293761 CASAVA_Build 2 54627600 2D TAATGGTGGT AA/-- AAAAAAAAAA 1524 het 1524 ref 41 13 4 25 A 16 14 293762 CASAVA_Build 2 54633107 1D TGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 11 10 293763 CASAVA_Build 2 54633205 3D TCAAGCGATT CTC/--- CTGCCTCAGC 3070 hom 54 het 19 0 19 1 CTC 1 0 293764 CASAVA_Build 2 54637298 2I TCAACTTCTC --/TT TTGTAGTCTT 3070 hom 84 het 36 0 28 8 T 2 4 293765 CASAVA_Build 2 54642084 2I CTGTACTGGG --/TT TTTAATGCCT 3070 hom 96 het 42 0 31 11 T 3 5 293766 CASAVA_Build 2 54652726 1D CCCTAGGACT C/- TGCTGGGTGC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 C 1 0 293767 CASAVA_Build 2 54657097 4D GTTGGCTCTG TTAC/---- TTCAATTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 TTAC 1 0 293768 CASAVA_Build 2 54660279 1I CTGGGAAGAT -/A ATATTGCTGC 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 1 2 293769 CASAVA_Build 2 54673012 1D TATTTCATAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 155 hom 27 2 10 15 T 10 9 293770 CASAVA_Build 2 54673030 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 505 hom 25 4 13 8 T 9 10 293771 CASAVA_Build 2 54679110 1D TGCCATTTTC T/- TTTGTTGTTC 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 4 3 293772 CASAVA_Build 2 54683912 1I GAGAGCATTT -/G GGAGGTAGCA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 G 2 3 293773 CASAVA_Build 2 54691716 2D CATTACAATC TG/-- TGTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 TG 2 1 293774 CASAVA_Build 2 54693952 1D TAAAGATCTG T/- TTTGATTTTT 3070 hom 102 het 44 0 34 10 T 4 3 293775 CASAVA_Build 2 54695778 1D AAATAGAGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 44 0 37 8 T 9 8 293776 CASAVA_Build 2 54700300 2I CTTCTCACTT --/AA CTTTGAGTTT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 0 2 293777 CASAVA_Build 2 54701118 2I GGAATGGTGA --/AT GGTCAAGTTT 3070 hom 144 het 52 0 49 5 AT 0 1 293778 CASAVA_Build 2 54732021 1I GGCTATGATG -/T TTATAGCAGT 3070 hom 147 het 54 0 49 5 T 2 3 293779 CASAVA_Build 2 54735596 19D ACCTGAAAGA CCATCAGTTTCTTTCAAGG/------------------- CCATCAGTTT 2619 het 2619 ref 38 22 7 15 CCATCAGTTTCTTTCAAGG 1 0 293780 CASAVA_Build 2 54740246 1I TGGTGATGCG -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 T 6 7 293781 CASAVA_Build 2 54752526 1D CTGAGAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 15 14 293782 CASAVA_Build 2 54752669 4D AGAATATTGA CATT/---- CAGTCAAGAT 3070 het 3070 ref 37 19 11 9 CATT 1 0 293783 CASAVA_Build 2 54754817 1D CGCCTGTAAT C/- CCAACACTTT 2301 het 988 hom 16 4 9 3 C 3 2 293784 CASAVA_Build 2 54760771 1D TCTCATCATT A/- AAAAAAAAAA 2315 het 2315 ref 35 16 9 10 A 17 16 293785 CASAVA_Build 2 54761070 1I TTCTTCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 10 11 293786 CASAVA_Build 2 54766503 1I CGGCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 1342 het 1342 ref 11 5 4 2 T 9 10 293787 CASAVA_Build 2 54767565 2I GCCTGGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 2620 het 2620 ref 27 10 8 9 T 11 13 293788 CASAVA_Build 2 54796066 1D ACTTTAGAAA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 7 293789 CASAVA_Build 2 54801826 3I GCTATTCATT ---/AAA ACAACAACAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 4 293790 CASAVA_Build 2 54807087 1D TTCCAGAGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 10 9 293791 CASAVA_Build 2 54838153 1D GGCAAGTGTT C/- CAGGAGTAAA 3070 het 3070 ref 58 28 19 11 C 2 1 293792 CASAVA_Build 2 54839555 11I ATAAAATATG -----------/GGTGGTTCATA GGTGGTTCAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 GGTGGTTCATA 1 2 293793 CASAVA_Build 2 54850210 1I AAATTTTATA -/G TACTTTATTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 0 1 293794 CASAVA_Build 2 54855488 1D ACTTGCATTA G/- AAAAGATAGT 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 G 1 0 293795 CASAVA_Build 2 54867937 1D GGTGAGGGTT G/- GGGGGGGGTC 3070 het 2766 hom 31 11 12 8 G 9 8 293796 CASAVA_Build 2 54890586 1D TTCTGGGAAG C/- CTGATGGGAA 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 C 2 1 293797 CASAVA_Build 2 54893168 1D ATTAGGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 8 19 11 T 12 11 293798 CASAVA_Build 2 54898664 2I ACTTCACGGC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 45 16 14 15 AT 4 5 293799 CASAVA_Build 2 54904100 1D TATTCCATAG T/- TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 40 14 14 12 T 8 7 293800 CASAVA_Build 2 54920497 2D AGTTGGAAGG TT/-- TTGGTCTTTG 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 T 4 2 293801 CASAVA_Build 2 54920939 1D TCTTTAAAAC A/- ATCAATGGCA 3070 het 3070 hom 56 22 27 9 A 2 1 293802 CASAVA_Build 2 54921741 1D AGGACAAGGA G/- GGGGGGCTGT 3070 het 3070 hom 50 17 26 7 G 7 6 293803 CASAVA_Build 2 54928382 1D14M1I TTCAAATAGG AATACTATAGATCTA-/-GGATCGTAGATCTAT CGATCCCCTA 3070 het 3070 ref 41 24 17 3 N/A 0 0 293804 CASAVA_Build 2 54928701 1I GATTGTGGGC -/T TTTGTAGTAA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 3 4 293805 CASAVA_Build 2 54931220 1I AAGAGCAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 19 13 16 A 9 10 293806 CASAVA_Build 2 54934093 1D TTTTCTTTTT A/- ATGTCTGAGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 1 293807 CASAVA_Build 2 54936100 1D TTCTACCATG C/- CCCCCCCCCG 3070 hom 8 het 32 1 22 9 C 10 9 293808 CASAVA_Build 2 54958101 1D TAAAAGTCTT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 8 7 293809 CASAVA_Build 2 54964868 12I TGCCAGGTTA ------------/TTACAGAGGATG TTACAAAGGT 3070 het 3070 hom 55 22 26 7 TTACAGAGGATG 0 1 293810 CASAVA_Build 2 54972697 4D CATGAAGACT TTGC/---- TTGCTCCTTC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 TTGC 2 1 293811 CASAVA_Build 2 54978336 1D ATTCTCTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 130 het 51 0 41 10 T 12 11 293812 CASAVA_Build 2 54991321 3D CAGTGCAGCA TAT/--- CAATAAAACA 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 TAT 1 0 293813 CASAVA_Build 2 54992074 1I AACAACAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2183 hom 25 8 10 7 T 15 16 293814 CASAVA_Build 2 54995199 7D TCTTGCTCTG AAGAGTT/------- AAGAGTTAAT 3070 hom 111 het 42 0 37 6 AAGAGTT 2 1 293815 CASAVA_Build 2 54997146 3I CCTTATTATT ---/ATC ATCAAATTTC 3070 het 3070 hom 49 16 26 7 ATC 1 2 293816 CASAVA_Build 2 55005024 1D TTTACTATTT G/- GGGAAGTATC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 G 4 3 293817 CASAVA_Build 2 55009668 1D CCATGCCCAG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 47 17 18 13 A 7 6 293818 CASAVA_Build 2 55028180 1D GGCAGGCTGA C/- CTACCAAGAA 3070 het 3063 hom 28 10 13 5 C 2 1 293819 CASAVA_Build 2 55032193 1I TTTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 988 hom 30 3 22 5 A 11 12 293820 CASAVA_Build 2 55032344 1D ATGCCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2326 hom 38 6 25 9 A 13 12 293821 CASAVA_Build 2 55036879 45D CAACTCATTG TTTGTTTGCACTTCTCCCATGACTGGTGAGCTGGAATCTCTTTCC/--------------------------------------------- TTTGTTTGCA 3070 hom 39 het 30 0 14 21 TTTGTTTGCACTTCTCCCATGACTGGTGAGCTGGAATCTCTTTCC 2 1 293822 CASAVA_Build 2 55037044 4I AGTGGGAGGG ----/TTGT TTGTCTTTTA 3070 hom 99 het 40 0 29 11 TTGT 1 2 293823 CASAVA_Build 2 55037275 1I CTCTGTGGGT -/C CCCCCTAGCC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 C 5 6 293824 CASAVA_Build 2 55037626 6I GTGATGATAA ------/TACTAT TACTATTACT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TACTAT 1 2 293825 CASAVA_Build 2 55040802 1I GAGGGCCGGA -/G GGGGTAGTGG 3070 hom 50 het 18 0 14 4 G 4 5 293826 CASAVA_Build 2 55053062 3I ATGAAATTGA ---/TGT TGTTGGAGTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 TGT 1 2 293827 CASAVA_Build 2 55053543 4D CCAGTGCCTC AGAT/---- AGATAGGAAA 3070 het 104 hom 33 2 18 15 AGAT 2 1 293828 CASAVA_Build 2 55058047 2I GCTCAGGCCG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 38 0 24 14 T 13 15 293829 CASAVA_Build 2 55059868 1D GATTTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 622 hom 25 2 19 4 T 13 12 293830 CASAVA_Build 2 55062458 26I TTCATGTACA --------------------------/TATGAATCACATACAAGCTAAGAAAC TAAGTGCTAG 3070 het 3070 ref 27 13 8 6 TATGAATCACATACAAGCTAAGAAAC 0 1 293831 CASAVA_Build 2 55093056 1D ACAAGGAAAA C/- TAGCTTGTGG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 C 1 0 293832 CASAVA_Build 2 55109428 1D TCCAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 20 8 A 14 13 293833 CASAVA_Build 2 55119139 2I CAAAGAAAAC --/AT ACACACAAAG 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 AT 0 1 293834 CASAVA_Build 2 55121641 1D AGACTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 12 11 A 12 11 293835 CASAVA_Build 2 55128216 1D GTGAATTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 11 10 293836 CASAVA_Build 2 55131458 1I GCCCGCAGCT -/G GGCGTCCGTA 3070 hom 53 het 20 0 18 2 G 2 3 293837 CASAVA_Build 2 55136627 2D TATATGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 70 het 33 0 25 8 TG 9 8 293838 CASAVA_Build 2 55139507 1I TTTTTGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 17 1 16 0 T 10 11 293839 CASAVA_Build 2 55139951 1D GACTTAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 12 11 293840 CASAVA_Build 2 55144845 1I ACCATGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2417 het 2417 ref 32 15 9 8 A 13 14 293841 CASAVA_Build 2 55146156 1I CTTATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 10 11 293842 CASAVA_Build 2 55146395 1D GCTAGATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 54 14 33 7 A 10 9 293843 CASAVA_Build 2 55148076 2D TTTTTAAGAT AG/-- AGTCTTGTTC 3070 het 828 hom 33 6 16 11 AG 2 1 293844 CASAVA_Build 2 55152790 1I TTTTTAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 40 3 18 19 T 10 11 293845 CASAVA_Build 2 55152877 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 28 1 22 5 T 11 10 293846 CASAVA_Build 2 55167138 2D TAATCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 13 11 293847 CASAVA_Build 2 55172830 1D ACCATGACTT A/- AAAAAAAAAA 2989 hom 24 het 13 0 9 4 A 12 11 293848 CASAVA_Build 2 55212067 1I CAGGCTGGTC -/T CTAACTCCTG 2465 het 2465 ref 20 10 6 4 T 0 1 293849 CASAVA_Build 2 55213536 1D TTTTGTTGTT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 18 10 7 1 G 1 0 293850 CASAVA_Build 2 55215371 1D TGACCTGCAG C/- CCCCTGAGTG 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 C 5 4 293851 CASAVA_Build 2 55221080 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1805 het 1805 ref 20 11 5 4 A 15 14 293852 CASAVA_Build 2 55226966 2D GCTGGACGTT CA/-- CAGTCACTGT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 CA 2 1 293853 CASAVA_Build 2 55231559 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 243 het 23 hom 14 1 2 11 A 19 18 293854 CASAVA_Build 2 55253148 1I ATTATCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 11 12 293855 CASAVA_Build 2 55253342 1D GTACAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 18 0 12 6 A 15 14 293856 CASAVA_Build 2 55254653 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 590 hom 37 4 21 12 A 17 16 293857 CASAVA_Build 2 55258593 1I AGCCCCCGTC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 69 het 34 0 23 11 A 8 9 293858 CASAVA_Build 2 55259716 1I CTACAGACCC -/T ATCCCTAAAA 3070 hom 84 het 30 0 27 3 T 0 1 293859 CASAVA_Build 2 55282829 1D AAGAAATAAA G/- GGCATCCAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 3 2 293860 CASAVA_Build 2 55294246 1D TGAGATAAAA C/- TAAGTTTATC 3070 hom 99 het 38 0 35 3 C 1 0 293861 CASAVA_Build 2 55318832 1I CACCATGCCC -/A ACTAATTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 1 2 293862 CASAVA_Build 2 55326392 1I ACCATAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 11 293863 CASAVA_Build 2 55326891 2D TAACAATAAC AT/-- GTAACAAAAA 3070 hom 127 het 46 0 43 4 AT 1 0 293864 CASAVA_Build 2 55331058 1D GATAATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2217 het 2217 ref 39 22 5 12 A 16 15 293865 CASAVA_Build 2 55334435 33D AGCCTGGGTG ACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAGAAAAAAA/--------------------------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 11 0 13 2 ACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAGAAAAAAA 1 0 293866 CASAVA_Build 2 55334991 3I TCCTATACAT ---/ATA ATGACAGACT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 ATA 0 1 293867 CASAVA_Build 2 55337514 1D ATCCTACTAA T/- TTTTTGTAGA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 6 5 293868 CASAVA_Build 2 55340145 1I GGTAATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 933 hom 27 3 16 8 A 13 14 293869 CASAVA_Build 2 55344250 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1849 het 1849 ref 27 12 7 8 A 15 14 293870 CASAVA_Build 2 55355709 1D TAATCCCAGA T/- ACTTTGGGAG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 T 1 0 293871 CASAVA_Build 2 55358976 4I TAAAACCAAC ----/TATT TGAAGGATAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TATT 0 1 293872 CASAVA_Build 2 55363335 2D TTGAGAACCA GC/-- ACAACATACG 3070 hom 120 het 44 0 40 6 GC 1 0 293873 CASAVA_Build 2 55366636 4D GAAAAAAAAA AGAG/---- AGAAAAGTTA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 AG 3 1 293874 CASAVA_Build 2 55366956 3I CAAAACACAT ---/AAA AATAGCTGTG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 A 2 5 293875 CASAVA_Build 2 55372657 2D ATTTCCCCCC CT/-- CTTAGTGCCA 3070 hom 81 het 35 0 28 9 CT 2 1 293876 CASAVA_Build 2 55378929 1D54M4D TTCAAATCAG AAAAAAAAAAATCCTATTTTCAGACTACATTTTTCTACTGGATGTAAAAACATTTTTAA/-AAAAAAAAAATCCTATTTTCAGACTACATTTTTCTACTGGATGTAAAAACATTT---- TTAAATAATT 3070 hom 39 het 18 0 14 17 N/A 0 0 293877 CASAVA_Build 2 55382053 13D TCATAGACTC AACTAGAAACTGG/------------- AACTAGGAAT 3070 hom 93 het 32 0 31 2 AACTAGAAACTGG 1 0 293878 CASAVA_Build 2 55393452 5D TGGGTCTAAT ATATA/----- ATATATTATC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 ATATA 2 1 293879 CASAVA_Build 2 55402564 1D GTGTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 13 12 293880 CASAVA_Build 2 55403028 1I GAACAAATAG -/A AAAAAGGACT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 5 6 293881 CASAVA_Build 2 55411146 2I TTAGATTAAT --/AA AGGAATTAGG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 3 293882 CASAVA_Build 2 55452428 2D GCCTAGCCCA CT/-- CTATAATTAT 3070 hom 86 het 33 0 27 7 CT 2 1 293883 CASAVA_Build 2 55459240 5D TTTTCAAGTA TTAAG/----- TTATGTCTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTAAG 1 0 293884 CASAVA_Build 2 55461094 5D TACAATCATT AAGAA/----- AAGACAGAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 7 AAGAA 1 0 293885 CASAVA_Build 2 55463714 2D CATAAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 A 14 12 293886 CASAVA_Build 2 55469090 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 A 8 7 293887 CASAVA_Build 2 55472003 1D CACTCCAAAA T/- ATAATCATTA 3070 hom 146 het 57 0 48 9 T 1 0 293888 CASAVA_Build 2 55480491 1D AAACAGTATT A/- AAAATTTCTT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 5 4 293889 CASAVA_Build 2 55482204 5D2M2D TTCTCCCCCC CATAAATTC/-----AT-- AAATTCAATT 1927 hom 10 het 7 0 4 3 N/A 0 0 293890 CASAVA_Build 2 55482644 2D CCTTTATTTC TT/-- TTAGAATAAG 3070 hom 60 het 27 0 21 7 T 4 2 293891 CASAVA_Build 2 55487403 1D TGTCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 46 1 29 16 A 12 11 293892 CASAVA_Build 2 55490379 10D TATACCTCCC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2505 hom 26 het 13 0 8 5 T 22 12 293893 CASAVA_Build 2 55491533 1D GCCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 14 6 A 15 14 293894 CASAVA_Build 2 55494609 2D AAACAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 16 7 A 12 10 293895 CASAVA_Build 2 55495356 1D AACAGAGTCA T/- TAAATTAATC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 2 1 293896 CASAVA_Build 2 55495706 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 258 hom 22 1 13 8 A 15 16 293897 CASAVA_Build 2 55501108 1D TCTCCTTTTT G/- TTTTCTTCCA 1422 het 1422 ref 28 19 3 6 G 1 0 293898 CASAVA_Build 2 55505518 1I GGGAGGCTAA -/G GGGGGGCGGA 3070 hom 44 het 19 0 12 7 G 6 7 293899 CASAVA_Build 2 55511320 1D CATGACCGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 11 10 293900 CASAVA_Build 2 55530442 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCCCTC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AG 1 2 293901 CASAVA_Build 2 55550926 1D TGTCTCTACT A/- AAAATACAAA 3070 hom 24 het 11 0 8 3 A 5 4 293902 CASAVA_Build 2 55580510 1I TAGGTCAGTG -/T TTTTCATTTG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 4 5 293903 CASAVA_Build 2 55582689 1D GTAAGCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 11 10 293904 CASAVA_Build 2 55599312 1D ATGTAAAAAA T/- ATATATATAT 1769 hom 32 het 27 0 7 20 T 1 0 293905 CASAVA_Build 2 55603889 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 868 het 99 hom 10 1 5 4 A 17 16 293906 CASAVA_Build 2 55617568 2I TACTTTTAGT --/AG AGACAGGGTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AG 1 2 293907 CASAVA_Build 2 55618936 2D TTCTTTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 1674 het 340 hom 25 5 6 14 T 16 14 293908 CASAVA_Build 2 55622488 4I GAGTTTTTCG ----/TAGA TACTCTTTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TAGA 0 1 293909 CASAVA_Build 2 55622627 4I GTTACCTTGC ----/TTCT TTCTTTGTAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TTCT 1 2 293910 CASAVA_Build 2 55623709 1I AAGGTATTTT -/G TTTTTTTTAA 3070 hom 118 het 46 0 40 6 G 0 1 293911 CASAVA_Build 2 55632967 1D ATGTTCATAT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 86 het 33 0 29 4 A 8 7 293912 CASAVA_Build 2 55655305 2I GCGATCTTGG --/CT CTCACAGTAA 3070 hom 64 het 26 0 20 6 CT 1 2 293913 CASAVA_Build 2 55660048 1I CCACATTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 8 9 293914 CASAVA_Build 2 55676987 1D GTCTATTTCG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 408 hom 40 1 32 8 A 10 9 293915 CASAVA_Build 2 55693995 1I TTATGTTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 661 hom 26 2 18 6 A 11 12 293916 CASAVA_Build 2 55699713 1D GGATTCATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 11 10 293917 CASAVA_Build 2 55711735 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 28 1 21 6 A 13 14 293918 CASAVA_Build 2 55716309 7I TGTTTATGAT -------/TTGGTAA TTGGTAACTA 3070 hom 85 het 34 0 29 5 TTGGTAA 1 2 293919 CASAVA_Build 2 55716571 4D40M2D TATGACATAT TCTATCTAAGTTTTTCATATATTTCAGAATTGTAAAAACAAAACTA/----TCTAAGTTTTTCATATATTTCAGAATTGTAAAAACAAAAC-- TGTAATTTTT 3070 hom 72 het 20 0 25 6 N/A 0 0 293920 CASAVA_Build 2 55718943 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 22 0 17 5 A 15 14 293921 CASAVA_Build 2 55727413 4D CTTACACTGT GTAA/---- GTATTACTGC 3070 hom 42 het 16 0 15 4 GTAA 1 0 293922 CASAVA_Build 2 55751610 2D23M1I AACTAAAGTT AAAAAAAAAAAAAGTCTATTATTTC-/--AAAAAAAAAAAGTCTATTATTTCT TTTTAATGCT 3070 hom 99 het 31 0 34 4 N/A 0 0 293923 CASAVA_Build 2 55753736 1I AAGGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 728 hom 37 2 30 5 A 10 11 293924 CASAVA_Build 2 55766167 1D AAGACCCTGT C/- TCTTAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 16 2 C 1 0 293925 CASAVA_Build 2 55766776 1D GCACTTCCAA T/- CTTCTTGTCA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 1 0 293926 CASAVA_Build 2 55770988 6D CTGAAGATAC AGAGAA/------ AGAGAAAGAT 3070 hom 108 het 46 0 36 11 AGAGAA 2 1 293927 CASAVA_Build 2 55780258 1D ATCAGCCAAT G/- GGAAGTACCA 3070 hom 35 het 34 0 20 14 G 3 2 293928 CASAVA_Build 2 55787101 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 8 7 293929 CASAVA_Build 2 55792035 5D CACATTTTCT TTATC/----- TAGTCGATTA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TTATC 1 0 293930 CASAVA_Build 2 55797498 1D ACAGAAATAG A/- ACTCAGAGGA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 2 1 293931 CASAVA_Build 2 55805288 1I AACATGGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 38 1 30 7 A 10 11 293932 CASAVA_Build 2 55810511 5D TTCTGAAGAT AATTA/----- AATAGGAAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 AATTA 1 0 293933 CASAVA_Build 2 55823227 1I TTATGTTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 9 293934 CASAVA_Build 2 55823850 1I AGAAAATGGC -/T GCTCTTGCCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 1 293935 CASAVA_Build 2 55828702 2D TGGTACAAGA AC/-- AGACACGTAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AC 1 0 293936 CASAVA_Build 2 55830661 1D AGTTGAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 36 0 29 8 A 15 14 293937 CASAVA_Build 2 55834567 1D GTAAGGCAGG A/- AAAAAAGGGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 7 6 293938 CASAVA_Build 2 55839137 4I TTTCATAAGA ----/GCAG GCAGGAACTT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 GCAG 1 2 293939 CASAVA_Build 2 55841700 4D TTTTCTCTTC CTTT/---- GTCATTTAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 4 CTTT 1 0 293940 CASAVA_Build 2 55843242 8D TCCCTTTCAC CCTTTCTT/-------- CCTTTCTTCC 3070 het 3070 ref 36 20 13 6 CCTTTCTT 3 2 293941 CASAVA_Build 2 55844266 1I AGATTTTGAG -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 132 het 50 0 43 7 T 5 6 293942 CASAVA_Build 2 55848499 1D GACACTAAGC T/- TTTAGGTGAT 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 T 4 3 293943 CASAVA_Build 2 55850526 2D TGGGGGCAGA AC/-- ACAGCCTGGC 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 AC 2 1 293944 CASAVA_Build 2 55860291 6D TTGGAAATGT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 1095 hom 49 6 16 33 AC 10 7 293945 CASAVA_Build 2 55861256 4I GTTAACAAAT ----/AGAA GGAAGGCATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AGAA 0 1 293946 CASAVA_Build 2 55864395 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 10 11 293947 CASAVA_Build 2 55867962 2I AAATTGCCTC --/TT GTCCTTCTGA 3070 hom 57 het 25 0 18 7 T 0 2 293948 CASAVA_Build 2 55880518 6D ACTCCGTCTC AAAACA/------ AAAACAAAAA 2813 hom 21 het 11 0 8 3 AAAACA 4 3 293949 CASAVA_Build 2 55880682 2I AAAAGGGATT --/AA AAAAAGGCGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 5 7 293950 CASAVA_Build 2 55880882 3D GAGACTATAT ATA/--- ATATTTTTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 7 ATA 2 1 293951 CASAVA_Build 2 55881276 1I TTTTTCCAGG -/T TTAAACAAAT 3070 het 227 hom 34 1 28 5 T 2 3 293952 CASAVA_Build 2 55885907 1D TGATCTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 T 14 13 293953 CASAVA_Build 2 55895691 2D AAAGATGGGG AA/-- AAAACAGAGC 1904 het 986 hom 8 3 4 1 A 6 4 293954 CASAVA_Build 2 55900787 1I TAATATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 43 hom 20 1 16 3 A 9 10 293955 CASAVA_Build 2 55904665 1D ACAAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 1269 het 1269 ref 25 16 4 5 A 12 11 293956 CASAVA_Build 2 55905755 1I GGACCCCCAG -/T TACAGCACAG 3070 hom 78 het 31 0 23 8 T 1 2 293957 CASAVA_Build 2 55907933 1D AAAAAAGAGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 97 het 36 0 32 4 A 9 8 293958 CASAVA_Build 2 55921333 1I TCTATGAGTG -/T TATATATATA 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 T 1 2 293959 CASAVA_Build 2 55924616 1D TAAGGAACTA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 9 8 293960 CASAVA_Build 2 55929181 1D CAATGATGCA T/- AACCTGTAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 T 1 0 293961 CASAVA_Build 2 55935538 5D ACATTCAAAA TCTTC/----- TCTTCTAGCT 3070 het 3070 ref 20 10 10 2 TCTTC 2 1 293962 CASAVA_Build 2 55941704 1D TCTATATTTT A/- AAAGGAGCGT 3070 het 3070 ref 45 25 18 3 A 4 3 293963 CASAVA_Build 2 55946492 1I TTTATTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2984 hom 29 10 13 6 A 10 11 293964 CASAVA_Build 2 55955566 1D CTAACATATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 A 10 9 293965 CASAVA_Build 2 55962964 4D TATGTATAAA TCTT/---- TCATTGCAAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 4 TCTT 1 0 293966 CASAVA_Build 2 55975073 1D CTGGTCATTT G/- TTCTTAATAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 1 0 293967 CASAVA_Build 2 55978034 2I GATAGAAAAT --/AA AAAAAGTAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 5 7 293968 CASAVA_Build 2 55981309 2I TCTCTATTTT --/TC TCTCTCTGGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TC 3 4 293969 CASAVA_Build 2 56020042 2D AAACAAAACC AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 10 8 293970 CASAVA_Build 2 56035596 1D TAGCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 11 10 293971 CASAVA_Build 2 56038874 1D AAAGAAAGTG A/- AAGTGCAAGA 3070 het 3070 ref 65 29 26 10 A 3 2 293972 CASAVA_Build 2 56042269 1I AGATGGGCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 44 0 33 11 A 9 10 293973 CASAVA_Build 2 56044524 1D CTAAAGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 27 1 22 5 A 12 11 293974 CASAVA_Build 2 56047590 10I AAGGCTTTGT ----------/GCAGTGACTG GCACATGTTC 3070 hom 126 het 44 0 43 4 GCAGTGACTG 0 1 293975 CASAVA_Build 2 56058984 1I TCTTTCTCTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 8 9 293976 CASAVA_Build 2 56063304 1D ATAAACCGAC A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 7 6 293977 CASAVA_Build 2 56063969 1D TTTAAAAATA G/- CTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 G 1 0 293978 CASAVA_Build 2 56064015 2D CCACCTTAGC TT/-- TTTTTTTTTT 1698 het 1129 hom 16 5 5 6 T 14 12 293979 CASAVA_Build 2 56065112 1D AGGTTAATCA T/- ATTTTCATTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 T 1 0 293980 CASAVA_Build 2 56070169 4I AGATGGTGGT ----/GTTC ATGTCCTCCC 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 GTTC 0 1 293981 CASAVA_Build 2 56091108 1D CTCAGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 10 12 A 12 11 293982 CASAVA_Build 2 56096038 5I TTAAATTAAT -----/TACTC TATTCATACG 3070 hom 99 het 43 0 33 10 TACTC 0 1 293983 CASAVA_Build 2 56100763 1D TTTAGTGGGT A/- GACATCTTTG 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 1 0 293984 CASAVA_Build 2 56101611 1D CACAAAAAAA C/- AAAAGTAAAA 1895 het 1478 hom 14 5 8 1 C 1 0 293985 CASAVA_Build 2 56102415 2D TAATTGCTGG GT/-- GTGTGTAAAT 3070 hom 96 het 35 0 32 6 GT 4 3 293986 CASAVA_Build 2 56103085 1D CATGAATTGA T/- GAATTGCTTT 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 T 1 0 293987 CASAVA_Build 2 56119850 1I CCCAAAGGTG -/C CCCGTGTTTG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 3 4 293988 CASAVA_Build 2 56121848 2D TGAAAGGGAC TT/-- TTTAGTACCA 3070 het 3070 hom 40 16 20 7 T 5 3 293989 CASAVA_Build 2 56125846 2D CTATCATGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 42 5 23 15 T 12 10 293990 CASAVA_Build 2 56125858 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTAAGAG 3070 het 125 hom 37 3 17 17 A 3 2 293991 CASAVA_Build 2 56127690 6D GTACCTGTGG TTGGAA/------ GGCCCATCTC 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 TTGGAA 1 0 293992 CASAVA_Build 2 56128777 1I ATTAGATGAT -/A AATATGTGTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 2 3 293993 CASAVA_Build 2 56132488 9I GAGTTCCTAA ---------/AGGACTTTG AGGACTTTGA 3070 het 3070 ref 38 15 13 10 AGGACTTTG 1 2 293994 CASAVA_Build 2 56137034 1D GAAAGGAATC T/- TTTTTTTTTT 1226 het 1226 ref 37 27 4 6 T 13 12 293995 CASAVA_Build 2 56145577 1I TCATCCCAAA -/G GGGCACCTAC 3070 hom 54 het 24 0 17 7 G 3 4 293996 CASAVA_Build 2 56170684 1I CTCTTTTTTT -/C CCCCTGCTCT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 C 4 5 293997 CASAVA_Build 2 56172272 1I TCATCTGTAA -/G GGGCTCTAGT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 G 3 4 293998 CASAVA_Build 2 56183918 1D TAAAGGTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 482 hom 51 2 37 12 T 12 11 293999 CASAVA_Build 2 56187442 39D CATCTGTCTA TTTGGCTAAGAGCAGGATAGGTGAACATGCATCCATCTG/--------------------------------------- TTTGGCTAAG 3070 het 3070 ref 39 23 16 15 TTTGGCTAAGAGCAGGATAGGTGAACATGCATCCATCTG 1 0 294000 CASAVA_Build 2 56191522 1D CTTCCATATC T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 35 15 16 5 T 7 6 294001 CASAVA_Build 2 56193394 3D TATATATTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 896 hom 34 4 12 19 T 15 12 294002 CASAVA_Build 2 56195609 1I ACTGAACACG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 8 17 9 T 8 9 294003 CASAVA_Build 2 56199740 2D ATTCAGAGAC AG/-- GGGAGGAATT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 AG 1 0 294004 CASAVA_Build 2 56205498 2D AGTATTGTCA CT/-- CTGTAAGTGT 3070 het 1789 hom 26 6 13 8 CT 2 1 294005 CASAVA_Build 2 56208006 1I TGTCTTACCT -/C CCCCAACTCT 3070 het 3070 hom 55 20 27 8 C 4 5 294006 CASAVA_Build 2 56208881 2D AGGAAATGAA AG/-- AGGCATCAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 2 1 294007 CASAVA_Build 2 56241653 2I TATTACAGTG --/GA ATTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 GA 0 1 294008 CASAVA_Build 2 56251040 2I ATCTCTGGAT --/AC AAACACAGGC 3070 het 3070 ref 57 27 26 4 AC 0 1 294009 CASAVA_Build 2 56255692 4D AAAAGAGGAT ACAA/---- ACAAATGGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 ACAA 2 1 294010 CASAVA_Build 2 56261629 4I AATCTCCATT ----/TAAC TAATATACCC 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 TAAC 0 1 294011 CASAVA_Build 2 56262490 1D TTGTGGAGAC T/- TTTTTTTTTT 2695 het 2695 ref 32 11 10 11 T 15 14 294012 CASAVA_Build 2 56278674 1I CCCACTTTGT -/G GGTTTCACCC 3070 hom 98 het 41 0 31 10 G 2 3 294013 CASAVA_Build 2 56296217 1I TTGCTGATAG -/T TTTTTTTTTT 1034 het 1034 ref 41 23 5 13 T 17 18 294014 CASAVA_Build 2 56297377 1D TATTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 1467 het 1467 ref 33 17 4 12 T 13 12 294015 CASAVA_Build 2 56353584 1D ATTGGAAAAA G/- AAAAAGAGAG 3070 hom 102 het 39 0 35 6 G 1 0 294016 CASAVA_Build 2 56405095 1I AATACAAGCA -/G GAGACACTCC 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 G 1 2 294017 CASAVA_Build 2 56423386 1I CTGGGAGATA -/T TTTTTTTTTC 2896 het 2071 hom 26 6 11 9 T 9 10 294018 CASAVA_Build 2 56425569 1D CCATCTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 7 8 A 11 10 294019 CASAVA_Build 2 56437369 1I TCCATCTCAA -/G GGAAAAAAAA 2154 hom 27 het 18 0 11 7 G 2 3 294020 CASAVA_Build 2 56439431 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 10 11 294021 CASAVA_Build 2 56439591 1D17M3I GCCCGGCTAA TTTTTTTGTATTTTTTTT---/-TTTTTTGTATTTTTTTTGTA TTTTTTTTTT 2756 hom 31 het 18 0 11 9 N/A 0 0 294022 CASAVA_Build 2 56444974 1I TTTCGTTTTA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 6 7 294023 CASAVA_Build 2 56454019 1D CTACTTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2022 hom 30 8 16 6 A 13 12 294024 CASAVA_Build 2 56456806 1I TTGTTTTGAG -/T AATGTGATTC 3070 het 3070 ref 54 25 25 4 T 0 1 294025 CASAVA_Build 2 56458948 1I CATGGTTTGT -/G GGGAAATGTA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 G 3 4 294026 CASAVA_Build 2 56465048 3I GATAGAAGAC ---/AAG AAGAAGAAAA 3070 het 3070 hom 58 24 23 11 AAG 2 3 294027 CASAVA_Build 2 56471770 2D ATGTATGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 GT 6 5 294028 CASAVA_Build 2 56478861 8D7M5D5M3I8M4I TTGTCTTTGT AACTAAAGTGTATTTCTTGTAGTCT---TGTTTTTT----/--------GTGTATT-----TAGACCATTAGCATTTAAAG GATTATTCTG 1029 het 1029 ref 35 36 3 5 N/A 0 0 294029 CASAVA_Build 2 56483544 2D TATAGTCTAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 17 16 9 T 11 9 294030 CASAVA_Build 2 56486235 3D ATAATATAAG ATA/--- ATGTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 ATA 1 0 294031 CASAVA_Build 2 56486411 3D AAAAAAAACT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2041 hom 22 7 11 4 A 13 10 294032 CASAVA_Build 2 56489093 1D AAATCTTGTA T/- TGTGTGCGAG 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 T 2 1 294033 CASAVA_Build 2 56491416 1D CAGGGAGCTG T/- TTGTCTCCTA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 3 2 294034 CASAVA_Build 2 56496418 1I AGTTTCTGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 9 10 294035 CASAVA_Build 2 56497530 1D TGGAAAGTGC T/- TTTTTTTTTT 2794 het 2794 ref 32 14 9 9 T 14 13 294036 CASAVA_Build 2 56509556 1D AAAGAGAGGA T/- GTTTGAATTG 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 T 1 0 294037 CASAVA_Build 2 56512678 1D GAATGCTGAT C/- TTTTTCATTA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 C 1 0 294038 CASAVA_Build 2 56539373 2D7M1I CAGAATGAGA CTCTGTCTC-/--CTGTCTCA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 N/A 0 0 294039 CASAVA_Build 2 56540575 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 T 10 11 294040 CASAVA_Build 2 56544925 1D ATCCCCTAGC G/- TAGCCAGTGC 3070 het 3070 ref 44 17 9 18 G 1 0 294041 CASAVA_Build 2 56566060 1D ACAGATGAAA T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 8 7 294042 CASAVA_Build 2 56566143 4I TTTCACTGTG ----/CATT CATTCTACAT 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 CATT 1 2 294043 CASAVA_Build 2 56573295 1D GGAATGATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 10 9 294044 CASAVA_Build 2 56573721 2D AGTATGTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 T 12 10 294045 CASAVA_Build 2 56582771 1I TAAAAATAAA -/T TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 4 5 294046 CASAVA_Build 2 56588281 3I TACCTCCTCC ---/CCA TCACCTCTGC 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 CCA 0 1 294047 CASAVA_Build 2 56590463 1D GGATGGAGCA C/- CACGGCATGC 3070 het 3070 hom 43 19 21 4 C 2 1 294048 CASAVA_Build 2 56605644 1D ATGTTTTGAT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 A 8 7 294049 CASAVA_Build 2 56615083 1D GTCCCTGAAG T/- TTTTTTTTTT 956 het 956 ref 38 19 4 15 T 17 16 294050 CASAVA_Build 2 56641170 1D CTTATATGGG A/- AAAATATTAA 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 A 5 4 294051 CASAVA_Build 2 56645540 1D ATTTAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 15 14 294052 CASAVA_Build 2 56653165 3I TTAGCTAAAA ---/TTG TTAAGGAATT 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 TTG 0 1 294053 CASAVA_Build 2 56660716 1I CTAGTAGGAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 8 9 294054 CASAVA_Build 2 56664278 2D TTAAAGTGTG AT/-- ATAGGCATCT 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 AT 2 1 294055 CASAVA_Build 2 56679022 1D AAAATGAGAA T/- TTTTTTTTTA 2860 het 1796 hom 13 5 8 0 T 10 9 294056 CASAVA_Build 2 56690679 1I TAGTCTTGCA -/T TTTCATTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 3 4 294057 CASAVA_Build 2 56695966 1D TTTTTTTTTG T/- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 4 3 294058 CASAVA_Build 2 56709903 1I TCCAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 10 11 294059 CASAVA_Build 2 56720145 2D GAAATATGTT AA/-- GAGAGTAGAT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 2 0 294060 CASAVA_Build 2 56724964 1I TCTTTGTTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 T 8 9 294061 CASAVA_Build 2 56729260 1D TCAAAAGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 10 9 294062 CASAVA_Build 2 56751967 4D GTTGGGATTA CAGG/---- CACCCACCAC 1620 het 1620 ref 12 5 4 3 CAGG 1 0 294063 CASAVA_Build 2 56774087 9I GCTCTTATTT ---------/TTCTTCTTC CAATGCTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 TTC 0 3 294064 CASAVA_Build 2 56779973 1I TCACCTGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 10 11 294065 CASAVA_Build 2 56782857 2D GTATTTTGTG TA/-- TATATATATA 2817 het 528 hom 14 3 8 4 TA 10 9 294066 CASAVA_Build 2 56809071 6I CACACACATA ------/TATATC TATATCTATA 3070 hom 81 het 39 0 28 11 TATATC 2 3 294067 CASAVA_Build 2 56830961 1D ACCATGCTTG T/- ACATTGTGGC 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 1 0 294068 CASAVA_Build 2 56842333 1D AGTTTATAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 9 8 294069 CASAVA_Build 2 56852270 1I TGCAATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2500 hom 27 7 12 8 A 11 12 294070 CASAVA_Build 2 56853506 1D GTCAGAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 10 9 294071 CASAVA_Build 2 56855789 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 9 21 6 T 8 9 294072 CASAVA_Build 2 56861678 2D AGTGATGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 A 13 11 294073 CASAVA_Build 2 56867983 1D GAGAAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2252 hom 22 6 9 8 T 13 12 294074 CASAVA_Build 2 56875496 2I CACCACACAT --/AC ACACACACAC 2270 het 2270 ref 51 29 13 9 AC 6 7 294075 CASAVA_Build 2 56881689 1D GTGCTGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 12 11 294076 CASAVA_Build 2 56890503 1I GCCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2886 hom 32 13 10 9 A 15 16 294077 CASAVA_Build 2 56902069 3I TTCCTTACAC ---/CTT CTAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 CTT 0 1 294078 CASAVA_Build 2 56912397 3D TATTTGGAGA AAG/--- AAGAATAGTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 AAG 2 1 294079 CASAVA_Build 2 56935266 1I CTGTACTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 11 17 A 12 13 294080 CASAVA_Build 2 56936551 1I CCTTTGCCCA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 6 7 294081 CASAVA_Build 2 56936707 1D TGCTGTGTGG A/- AAGCTCTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 A 3 2 294082 CASAVA_Build 2 56939502 1I AAAATGTACA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 T 7 8 294083 CASAVA_Build 2 56951461 5I ATAAAAAAAG -----/TAATT TAGTGAGTAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 TAATT 0 1 294084 CASAVA_Build 2 56971674 1D TTCAGTTTCA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 8 7 294085 CASAVA_Build 2 57038208 4D GTATATACAT ACAC/---- ACACACAGAC 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 AC 5 3 294086 CASAVA_Build 2 57050487 1D ACAGTGGGGC A/- AAAAAAAAAA 2977 het 1800 hom 36 9 11 16 A 17 16 294087 CASAVA_Build 2 57053464 1I GAGCAATATA -/C CTACATTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 C 1 2 294088 CASAVA_Build 2 57059399 1I GCTATAGCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 9 10 294089 CASAVA_Build 2 57065207 16I ATGTTAGAGA ----------------/TGTTACTGGGACCCAT TGCCCTCGTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 TGTTACTGGGACCCAT 0 1 294090 CASAVA_Build 2 57070840 1I TGTATCAGAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 A 8 9 294091 CASAVA_Build 2 57078119 1I TGTAAATAAA -/G CACTTAGGGT 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 G 0 1 294092 CASAVA_Build 2 57078543 1I GGCTGGAGAC -/T CCCACTTGGG 3070 het 3070 ref 37 13 17 7 T 0 1 294093 CASAVA_Build 2 57079914 1I ACACAGACCA -/G GGGGGGCACT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 G 6 7 294094 CASAVA_Build 2 57080410 4D TAAAAAAAAT AGAG/---- AGAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 AG 3 1 294095 CASAVA_Build 2 57087909 3I CCTAAATGAC ---/TAT TGAGTCAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TAT 0 1 294096 CASAVA_Build 2 57090938 2D GAAATAAAAG AT/-- ATATATATAT 1114 het 1047 hom 12 4 6 2 AT 7 6 294097 CASAVA_Build 2 57092544 2I TAAGCGTAAA --/AC ACAAGTTGTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 AC 1 2 294098 CASAVA_Build 2 57096680 1D TTATTTTCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 8 7 294099 CASAVA_Build 2 57101328 2I ACATCTGTTG --/TT TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 T 8 10 294100 CASAVA_Build 2 57101840 1I TATTTGGATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 T 9 10 294101 CASAVA_Build 2 57112648 1I TAAGAAACTC -/T TAAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 1 2 294102 CASAVA_Build 2 57129744 2D GTTTTTCTCT TC/-- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 TC 1 0 294103 CASAVA_Build 2 57145439 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 7 6 294104 CASAVA_Build 2 57156187 1I AAAAAAAAAA -/T AATGGAGTGA 2956 het 2956 ref 36 16 10 10 T 0 1 294105 CASAVA_Build 2 57166780 2I CACTCCTGGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 2577 hom 34 9 15 10 GT 5 6 294106 CASAVA_Build 2 57169293 1D ATTTGGTAGT A/- ATATGGTGAT 3070 het 3070 ref 44 24 17 5 A 2 1 294107 CASAVA_Build 2 57170249 1D AATGCTAAAT A/- TTATTAGTTC 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 A 1 0 294108 CASAVA_Build 2 57175357 3D AAGAATTAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 20 17 3 A 14 11 294109 CASAVA_Build 2 57190147 1D GAAAAGAATC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 46 25 14 8 T 9 8 294110 CASAVA_Build 2 57191589 4D ATTGTACCCC ATAA/---- ATATATATAA 3070 het 2767 hom 27 10 15 2 ATAA 1 0 294111 CASAVA_Build 2 57196150 4D CCAGGCAATG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 34 10 16 9 TC 9 7 294112 CASAVA_Build 2 57200922 2I ATACAGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 37 15 12 10 TA 5 6 294113 CASAVA_Build 2 57206832 3I GGGAAAAGAT ---/ATC ATCATCATTA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 ATC 2 3 294114 CASAVA_Build 2 57213813 5I CCTAATTGCT -----/CTTGC CTGACTAGAT 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 CTTGC 0 1 294115 CASAVA_Build 2 57216226 1I GATGGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 10 11 294116 CASAVA_Build 2 57217008 1D AGACATGGGG A/- AAAAAGATAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 6 5 294117 CASAVA_Build 2 57222287 4D CAGTGATTAT TTAA/---- TTGAGTTAAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 8 TTAA 1 0 294118 CASAVA_Build 2 57234008 10D CCTTCATGAT TAATTCCACA/---------- TAATTCCACA 3070 het 2404 hom 26 6 14 8 TAATTCCACA 2 1 294119 CASAVA_Build 2 57241137 3D ATATTTGGAA AAC/--- AACGAGAATT 3070 het 3070 hom 41 20 19 5 AAC 2 1 294120 CASAVA_Build 2 57241217 3D CCTTCTACTC TGA/--- TAGAGTGTCC 3070 het 3070 ref 43 23 18 4 TGA 1 0 294121 CASAVA_Build 2 57242114 1D TTTCGCTGTA T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 8 7 294122 CASAVA_Build 2 57242581 1D ATTCAGATAG A/- AAAAAAAAAA 2527 het 2349 hom 33 10 13 11 A 13 12 294123 CASAVA_Build 2 57247149 3D TAATTGACTG ATA/--- ATAATTGTAC 3070 het 3070 hom 31 13 18 0 ATA 2 1 294124 CASAVA_Build 2 57249574 2D ACATATTATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 7 AT 6 5 294125 CASAVA_Build 2 57249701 11D TTTGCAATAA ATAACCTGTAT/----------- ATAAATAACC 1428 het 1428 ref 27 15 6 6 ATAACCTGTAT 1 0 294126 CASAVA_Build 2 57251483 4D TAACAAAACC TATT/---- TAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 TATT 1 0 294127 CASAVA_Build 2 57253532 6D AAAATAGAAC TAGCAT/------ GTGATCCAGC 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 TAGCAT 1 0 294128 CASAVA_Build 2 57255439 1I AATTACATCA -/T TGAAACTATT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 1 2 294129 CASAVA_Build 2 57256808 3I45M1D CATTAAATCA ---AATAGTCTGATTTTGATGCAAAAGCTAATGTCTTACCATGCATCCT/AATAATAGTCTGATTTTGATGCAAAAGCTAATGTCTTACCATGCATCC- TCTGGCTTAC 3070 het 3070 ref 39 29 14 9 N/A 0 0 294130 CASAVA_Build 2 57267810 1I AAAAAAAGTT -/C TATATCAATA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 C 0 1 294131 CASAVA_Build 2 57268552 1D ATAAAAGTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 47 18 14 15 A 10 9 294132 CASAVA_Build 2 57293734 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 1808 het 1323 hom 35 15 14 6 C 0 1 294133 CASAVA_Build 2 57323530 4I TGTTGTACAT ----/GATA AATATAAACA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 GATA 0 1 294134 CASAVA_Build 2 57492311 2I21M3I TTAGAGCTAA --AGAGAGGTAGCTCACAATAGA---/GGAGAGAGATAGACCCCAATAAAAAG ATAATAGCTG 1274 het 1274 ref 44 47 3 4 N/A 0 0 294135 CASAVA_Build 2 57540388 1D ATTGGTTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 10 9 294136 CASAVA_Build 2 57560196 2I CACATAACCC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 9 11 294137 CASAVA_Build 2 57560642 2D TGTTTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 51 28 14 11 TG 8 7 294138 CASAVA_Build 2 57572591 4D CTCTCTTACT AGAG/---- AGAGGTAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 20 4 AG 4 2 294139 CASAVA_Build 2 57592460 1D GTTTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2829 hom 33 9 14 11 T 13 12 294140 CASAVA_Build 2 57593270 1D GTTTGGAGAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 A 9 8 294141 CASAVA_Build 2 57596830 1I ACAAGAAAGT -/A ATACTTGTTC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 1 2 294142 CASAVA_Build 2 57603172 3D GTGAGTTCTC AGA/--- AGATCTGGTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 AGA 2 1 294143 CASAVA_Build 2 57607520 1I TCTAAGATAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 7 8 294144 CASAVA_Build 2 57608110 2I TCCTTTCTTG --/TT TTTTTTTTTT 2825 het 2825 ref 24 11 8 5 T 10 12 294145 CASAVA_Build 2 57617818 1D TCTTTTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 10 9 294146 CASAVA_Build 2 57713952 1D ACAATTAATC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 T 8 7 294147 CASAVA_Build 2 57797794 4D AGTTTGTAAG TTGA/---- TTATCTTTCA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TTGA 1 0 294148 CASAVA_Build 2 57798092 1D TGTTACATTT A/- TAAATGCCTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 1 0 294149 CASAVA_Build 2 57801326 1I GATTACACAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 8 294150 CASAVA_Build 2 57812245 1D AAAAGTGAGA T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 7 6 294151 CASAVA_Build 2 57832753 1I GCTATGGAAT -/C TCAGAGGAAG 3070 het 275 hom 44 1 41 2 C 0 1 294152 CASAVA_Build 2 57848925 16D ATCTCAGGTC ACTGCAACCTCTGCCT/---------------- CCCGGGTTCA 3070 het 2307 hom 24 7 13 4 ACTGCAACCTCTGCCT 1 0 294153 CASAVA_Build 2 57858082 1I AAAAACATAA -/T ATACGCATTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 0 1 294154 CASAVA_Build 2 57860424 1D TTTTTTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 28 2 17 9 A 12 11 294155 CASAVA_Build 2 57879244 1D TAAACTTGGT A/- AAAAAAACAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 7 294156 CASAVA_Build 2 57920048 1I CGTATTAGGC -/A AAAAAAGAAC 3070 hom 63 het 37 0 22 15 A 6 7 294157 CASAVA_Build 2 57930959 1D CCTGGAGGAG C/- CTCCCTGGGC 3070 hom 125 het 55 0 42 13 C 2 1 294158 CASAVA_Build 2 57932894 1D TGGATTTCAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 114 het 41 0 39 3 T 9 8 294159 CASAVA_Build 2 57939202 1D ATATTTGAAT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 8 7 294160 CASAVA_Build 2 57959311 1I GGGAGTTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 9 10 294161 CASAVA_Build 2 57979979 1D AGTACTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 13 24 10 T 13 12 294162 CASAVA_Build 2 57985609 1D ATATTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 30 1 23 6 A 13 12 294163 CASAVA_Build 2 57998988 1I TTTCATTTCA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 53 30 17 6 T 8 9 294164 CASAVA_Build 2 58003395 6D AACAATCCAA TTATAC/------ TTATAGTTAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 TTATAC 1 0 294165 CASAVA_Build 2 58014303 1I TTTTGGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2890 hom 34 10 12 12 T 10 11 294166 CASAVA_Build 2 58016307 1I TCTCATTCTC -/T TCCCAATCTT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 T 1 2 294167 CASAVA_Build 2 58019134 4I ATCCATTGTA ----/GAAG ATTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 GAAG 0 1 294168 CASAVA_Build 2 58019472 2D TTGTCTTCCT TC/-- TCTTGCTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 22 5 TC 2 1 294169 CASAVA_Build 2 58021203 1D GTCTATTTAG A/- AAGAGCACTG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 3 2 294170 CASAVA_Build 2 58021526 1D CCTGCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1180 het 1180 ref 24 18 3 3 A 11 10 294171 CASAVA_Build 2 58025464 1I CCTTGTTCCC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 2018 hom 24 6 13 5 T 7 8 294172 CASAVA_Build 2 58137251 2I AGTGTGGCTA --/CT CTCACCCCAC 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 CT 1 2 294173 CASAVA_Build 2 58138143 4D ATCAGTTTTC TCTT/---- TCTAATAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 15 6 TCTT 1 0 294174 CASAVA_Build 2 58156503 28I2M7I GCTTATAGTA ----------------------------AA-------/CTTATAGAGTACTTATAGGCTTATAGAGAACATTGGG ACTCTGCCCC 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 N/A 0 0 294175 CASAVA_Build 2 58158159 1D GTCTCCTCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 10 9 294176 CASAVA_Build 2 58187791 1D TTTTGCCTTA T/- GGTATCTTGT 3070 het 3070 ref 42 23 15 5 T 1 0 294177 CASAVA_Build 2 58227407 2D AGGGACTCAA TG/-- TATTCTATAC 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 TG 1 0 294178 CASAVA_Build 2 58231202 1D TTTTTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 2761 het 2761 ref 33 16 10 7 T 14 13 294179 CASAVA_Build 2 58246803 3I TAGTAATGAG ---/TAC TACAAGATGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAC 1 2 294180 CASAVA_Build 2 58275566 2I ATTATATCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 31 5 14 12 A 10 12 294181 CASAVA_Build 2 58278668 2I AGGCTGGATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 34 12 10 12 GT 8 9 294182 CASAVA_Build 2 58280466 1I TGACAAATTA -/T TTAAAAGAAG 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 2 3 294183 CASAVA_Build 2 58281506 3I CAATATGTAT ---/ATA ATAATAAATT 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 ATA 2 3 294184 CASAVA_Build 2 58283027 1D TTTTTTTCCT A/- AAAAAAAAAA 843 het 843 ref 23 19 3 1 A 11 10 294185 CASAVA_Build 2 58284982 4I CCATTATAAA ----/AATT AATCAGAGCA 3070 het 3070 hom 53 25 23 5 AATT 0 1 294186 CASAVA_Build 2 58285805 1I AGGAAATATA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 T 6 7 294187 CASAVA_Build 2 58286000 6I CTTAGAAAAC ------/AAAAGT AAAACTATTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AAAAGT 0 1 294188 CASAVA_Build 2 58296344 1I ATTAAGTGGC -/A AAAAAAAAAA 2407 het 2407 ref 39 12 11 16 A 14 15 294189 CASAVA_Build 2 58302956 1I TATCGGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2517 hom 31 8 19 4 A 10 11 294190 CASAVA_Build 2 58303647 1I TATATATCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 8 9 294191 CASAVA_Build 2 58308525 1I TCATCATTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2668 hom 26 7 13 6 T 7 8 294192 CASAVA_Build 2 58310775 2D CATCCGAAGC AA/-- AGTTTTCCAC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 3 1 294193 CASAVA_Build 2 58313893 1I AACTATTCTA -/C TATAGAAATC 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 C 0 1 294194 CASAVA_Build 2 58338209 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1093 het 124 hom 7 3 3 2 A 13 12 294195 CASAVA_Build 2 58378477 1D AGGAAAGATT A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 7 6 294196 CASAVA_Build 2 58416929 1I AATCATGTAT -/A TTTTTTACTC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 0 1 294197 CASAVA_Build 2 58423062 1I CCAGAGTCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 8 9 294198 CASAVA_Build 2 58427021 1D ACTTGCAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 A 10 9 294199 CASAVA_Build 2 58428086 1I AGAGAAATAG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 7 8 294200 CASAVA_Build 2 58432139 4I TAAACTAACC ----/TTTA TTTGTTTTTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TTTA 0 1 294201 CASAVA_Build 2 58449931 1I TGCCTCGTCA -/C CCTGGGCTTC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 2 3 294202 CASAVA_Build 2 58471932 5D22M1D TTATTTGGCA CTCTTCTCTTATTTGTCTCTATGCTAGT/-----CTCTTATTTGTCTCTATGCTAG- AATCTCATAC 3070 het 3070 hom 47 22 26 5 N/A 0 0 294203 CASAVA_Build 2 58482459 16D CTTTCTCTCT TTGCATCACTGTGACA/---------------- TTGCTTCCAT 3070 het 3070 ref 53 30 18 10 TTGCATCACTGTGACA 1 0 294204 CASAVA_Build 2 58484665 1D TCTCATGCCA C/- TCTCCAGTAA 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 C 1 0 294205 CASAVA_Build 2 58497351 1D GCCCCGCGTA T/- TTTGTATCTA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 4 3 294206 CASAVA_Build 2 58498985 1D GCAGTAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1781 hom 21 6 9 6 T 13 12 294207 CASAVA_Build 2 58512990 8I TTTCTGAAAC --------/ACCTGACT ACACAGCCCA 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 ACCTGACT 0 1 294208 CASAVA_Build 2 58522772 1I AATAAATAAC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 7 8 294209 CASAVA_Build 2 58528969 3D TGAGTGGGCC TAG/--- TAGTACCTTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 TAG 2 1 294210 CASAVA_Build 2 58548904 1D CTGTAGGGGA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 8 7 294211 CASAVA_Build 2 58555079 2I TTTTTTTTTT --/TG TTTTTTTGGA 2531 het 1631 hom 24 10 8 6 TG 0 1 294212 CASAVA_Build 2 58572964 4D AAAAAATAAC TCCT/---- TATTTTGCTG 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 TCCT 1 0 294213 CASAVA_Build 2 58589357 8D TTTAACCAGG TTTATTTA/-------- TTTATTTATT 3070 het 2338 hom 23 7 8 8 TTTA 6 4 294214 CASAVA_Build 2 58589738 1D TTTGTTTTTT C/- CCCAGGAGTG 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 C 4 3 294215 CASAVA_Build 2 58604479 1I TTCCTTTAGC -/A AAAACTCTTT 3070 het 2999 hom 33 11 16 6 A 4 5 294216 CASAVA_Build 2 58608567 1I GGGACTCAAT -/C CCATTGAAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 2 3 294217 CASAVA_Build 2 58616306 1D AAAACTGACC T/- TTTATTTCCA 3070 het 3070 ref 37 19 13 6 T 4 3 294218 CASAVA_Build 2 58657956 1D TTTTTCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 34 20 3 11 T 11 10 294219 CASAVA_Build 2 58658641 1D GAAAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 37 2 28 8 A 12 11 294220 CASAVA_Build 2 58686308 4D TGTAACTAAG TAAT/---- TAACTAGGAC 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 TAAT 1 0 294221 CASAVA_Build 2 58692894 1D CTACAGATAA T/- TTTTTTTTTT 2562 het 485 hom 14 2 8 5 T 15 14 294222 CASAVA_Build 2 58697097 1D GAAAAATGGG A/- AAAATATATT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 5 4 294223 CASAVA_Build 2 58702667 1I TCTGTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 10 11 294224 CASAVA_Build 2 58710807 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 15 16 294225 CASAVA_Build 2 58715985 1D ATAATATTTT G/- AGTTTGAAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 7 G 1 0 294226 CASAVA_Build 2 58718732 4I TGTAATTTTA ----/GGTG CGTATGGGAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 GGTG 0 1 294227 CASAVA_Build 2 58720168 1D TACTTGTTCT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 8 7 294228 CASAVA_Build 2 58724255 1I ATCAGGGGAG -/C TTTTAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 C 0 1 294229 CASAVA_Build 2 58726058 1I AACAGATAGG -/T TTTTTTTTTT 2995 het 2995 ref 35 18 8 9 T 11 12 294230 CASAVA_Build 2 58739414 2I GGAGAGAGAG --/AA AACGCGCACA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 2 4 294231 CASAVA_Build 2 58741833 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 2823 het 2823 ref 24 13 7 4 T 7 8 294232 CASAVA_Build 2 58759167 4I ATTTCATAAG ----/TCTT TATTTATTTA 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 TCTT 0 1 294233 CASAVA_Build 2 58759764 4I TGTGTATATA ----/TATG TGTGTGTATA 2327 het 2327 ref 21 12 7 2 TATG 0 1 294234 CASAVA_Build 2 58759808 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 2834 het 2810 hom 23 9 9 5 TA 6 5 294235 CASAVA_Build 2 58764323 1I AAAGCAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2987 hom 18 8 10 0 A 10 11 294236 CASAVA_Build 2 58788001 1I CTGATTTTCT -/A AAAAAAAAAA 2236 het 2236 ref 34 12 8 14 A 15 16 294237 CASAVA_Build 2 58794549 2I ACTACAATGA --/AC AGTTTTTCCT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 AC 0 1 294238 CASAVA_Build 2 58800664 1D CACCTCACTC T/- TTTTTTTTTT 1664 het 1664 ref 38 26 4 8 T 13 12 294239 CASAVA_Build 2 58828417 1D TATATATATA T/- TTTTTTTAAT 1694 het 864 hom 7 3 4 0 T 8 7 294240 CASAVA_Build 2 58829748 1I ATGAAGTCAT -/C TTTTTTTTTC 3070 het 358 hom 39 1 34 4 C 0 1 294241 CASAVA_Build 2 58846211 1I TCACCTGGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 8 9 294242 CASAVA_Build 2 58863863 1D TTATAAACTG A/- TATAGATGTT 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 A 1 0 294243 CASAVA_Build 2 58866619 1I TTTTCATCTG -/A AAAAAAGTCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 6 7 294244 CASAVA_Build 2 58879249 1I ATCACTGTGC -/A AAATAAAAGT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 3 4 294245 CASAVA_Build 2 58882343 1D TAGGGATACA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 76 het 42 1 38 3 T 9 8 294246 CASAVA_Build 2 58883298 2D GGGAACATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 A 12 10 294247 CASAVA_Build 2 58908910 1D TTGTTATTTG T/- TTCTAATTTT 3070 het 3070 ref 27 15 8 6 T 3 2 294248 CASAVA_Build 2 58916554 1D TTTCACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 19 11 A 14 13 294249 CASAVA_Build 2 58928341 4I CTCCCAAAGA ----/AGAG AGAGTGAAGC 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 AG 2 4 294250 CASAVA_Build 2 58935687 1I TAAATGTATC -/A GGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 A 0 1 294251 CASAVA_Build 2 58953120 1D ACTATACATC T/- GGATTCTAGA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 1 0 294252 CASAVA_Build 2 58953967 1D GACACTATAA T/- TTAAGAGAAT 3070 hom 129 het 48 0 43 6 T 3 2 294253 CASAVA_Build 2 58977865 1I TTAACATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 9 10 294254 CASAVA_Build 2 58985077 1D ATCCAACTAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 64 het 23 0 22 1 T 9 8 294255 CASAVA_Build 2 59002049 1I TTATAAAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 T 9 10 294256 CASAVA_Build 2 59005007 1D CACCAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 16 7 A 11 10 294257 CASAVA_Build 2 59025211 2D TAATAGTTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 14 21 11 T 13 11 294258 CASAVA_Build 2 59026016 1D AGTGACTAAT A/- ATGCTGTTAA 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 A 2 1 294259 CASAVA_Build 2 59038814 1D TAAAAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 1302 het 1302 ref 40 33 4 3 A 11 10 294260 CASAVA_Build 2 59039085 2D ACTTTGTCAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 58 18 23 17 AC 10 9 294261 CASAVA_Build 2 59055511 1D TACCTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 30 0 25 5 T 12 11 294262 CASAVA_Build 2 59061489 2I AAAATAAATG --/CT TTATGATTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 CT 0 1 294263 CASAVA_Build 2 59079018 1I TTCCCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1889 hom 25 6 14 5 T 10 11 294264 CASAVA_Build 2 59090072 3I GTGTGTGTAT ---/ATG TGTGTGTATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ATG 0 1 294265 CASAVA_Build 2 59095193 3I GAGTAAATCA ---/GAT GATGCATAAA 3070 het 3070 hom 54 25 27 2 GAT 1 2 294266 CASAVA_Build 2 59099057 2I CAAAATGCTC --/TT TCTCAGATTC 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 T 1 3 294267 CASAVA_Build 2 59102468 1I TTTTGTTAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 A 8 9 294268 CASAVA_Build 2 59112986 1I TCCTTTGGTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 A 8 9 294269 CASAVA_Build 2 59121760 1D TTCAAACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2288 hom 29 8 14 7 A 14 13 294270 CASAVA_Build 2 59131000 2D ACACACACAC AT/-- ATATATACAC 1662 het 66 hom 16 2 11 3 AT 4 3 294271 CASAVA_Build 2 59131189 2I TATATGGCTG --/TA TATATATATA 1198 het 594 hom 10 3 4 3 TA 7 8 294272 CASAVA_Build 2 59135904 1I CATAGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 29 0 10 19 A 11 12 294273 CASAVA_Build 2 59142681 1D CTTTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 34 1 29 4 A 12 11 294274 CASAVA_Build 2 59146135 1I TATGAATTGA -/T CAACTGTGTC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 0 1 294275 CASAVA_Build 2 59149257 1I ATGGGGAAAA -/G AAAGACAAGG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 G 0 1 294276 CASAVA_Build 2 59156180 1I TAAAATAATT -/A ACACCTCAAG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 1 2 294277 CASAVA_Build 2 59162418 1I ATTTTTTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 24 7 14 3 A 0 1 294278 CASAVA_Build 2 59167390 1I ACAGCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 24 0 18 6 T 12 13 294279 CASAVA_Build 2 59191683 1I TGGGTACAAA -/G GGGGGTCACA 3070 hom 144 het 53 0 48 5 G 5 6 294280 CASAVA_Build 2 59201933 1D TAATACATAT A/- ATATACGTTA 1471 hom 7 het 3 0 3 0 A 2 1 294281 CASAVA_Build 2 59206514 5I TTAGTTACGT -----/CTTGC CTTCTGCTAG 3070 hom 21 het 10 0 8 2 CTTGC 0 1 294282 CASAVA_Build 2 59208674 2I TTAAAACAAC --/TA TGCAAAACGT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TA 0 1 294283 CASAVA_Build 2 59212796 1D TAGAAAACAT G/- GATGATGAGT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 G 2 1 294284 CASAVA_Build 2 59213879 1I ATGCCCCCCC -/T TTAGCCATTG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 2 3 294285 CASAVA_Build 2 59215334 1D AAGTGCATAT A/- GTCTGATTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 1 0 294286 CASAVA_Build 2 59220588 1I TGCCTAACCA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 72 het 41 0 29 12 T 7 8 294287 CASAVA_Build 2 59234914 1D TACTAACTCA T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 T 7 6 294288 CASAVA_Build 2 59238617 4I AAAGAAAGAA ----/AGAC TGAAAGAGAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AGAC 0 1 294289 CASAVA_Build 2 59251266 3D AAATGGTCTC CTT/--- CTCCTCCTCC 3070 het 3070 ref 38 20 14 6 CTT 1 0 294290 CASAVA_Build 2 59255072 1I CCCCAGATCC -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 A 7 8 294291 CASAVA_Build 2 59255724 6D GCAGCTGATC CCGCTG/------ CCGCTGCTCC 3070 hom 31 het 21 0 15 7 CCGCTG 2 1 294292 CASAVA_Build 2 59263423 1I TCAAGGGGCC -/A GTAACATCTA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 0 1 294293 CASAVA_Build 2 59264484 1D GTGCAATATA T/- TTTTTTTCCT 1361 het 1361 ref 39 34 3 2 T 8 7 294294 CASAVA_Build 2 59282267 1I CACTTCTGTG -/A AGGGACAGTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 294295 CASAVA_Build 2 59317334 4I TTACACTTGT ----/TCTG TCTATCTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 TCTG 0 1 294296 CASAVA_Build 2 59325305 1D TGGGTGCTTT A/- GTTAATATAA 3070 hom 94 het 38 0 32 6 A 1 0 294297 CASAVA_Build 2 59335722 5I CTGACAGATT -----/GACTC GACTCAGCCT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 GACTC 1 2 294298 CASAVA_Build 2 59338181 4I GGTGAGTTAT ----/AATC AATCATGGAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 AATC 1 2 294299 CASAVA_Build 2 59349264 5D CTTAATTGAA TTAAT/----- TTAACAGTTA 3070 het 2554 hom 18 6 11 2 TTAAT 1 0 294300 CASAVA_Build 2 59356679 1D ATACTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2077 hom 26 7 14 5 A 13 12 294301 CASAVA_Build 2 59358368 2I CATGCACGAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 45 19 14 12 TG 7 8 294302 CASAVA_Build 2 59359997 4D CTCACTGTTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 TG 8 6 294303 CASAVA_Build 2 59360900 2I ACATGCATAT --/AA AAAGCATAAT 3070 het 3070 ref 50 27 15 8 A 3 5 294304 CASAVA_Build 2 59384653 1I GATCTTTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 T 10 11 294305 CASAVA_Build 2 59391952 1I CCCATTTTTT -/G GGGGGGGTTA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 G 7 8 294306 CASAVA_Build 2 59401546 4D CAATTCAAAA ACTG/---- ACTGCAAATA 3070 het 3070 ref 26 15 11 2 ACTG 2 1 294307 CASAVA_Build 2 59404308 2I CACCATAATC --/AT GTAATATTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AT 0 1 294308 CASAVA_Build 2 59420730 1I CTTCTGCAAA -/G GGATGTAACT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 2 3 294309 CASAVA_Build 2 59425022 1I CAGTCTTCCT -/C CTGCCAGGGC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 C 1 2 294310 CASAVA_Build 2 59432405 1I TGATAATCCC -/G TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 294311 CASAVA_Build 2 59434660 4D CAGCTTAAAT AGTC/---- AGAGAAGTTT 3070 het 3070 hom 55 24 27 7 AGTC 1 0 294312 CASAVA_Build 2 59464828 2I TGTGCATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 TG 6 7 294313 CASAVA_Build 2 59474288 2D TCATGAAATC CA/-- CAGATTGACT 3070 het 3070 hom 47 22 20 6 CA 2 1 294314 CASAVA_Build 2 59481679 1I AGAGAGAGAA -/G AGAAGAAAAG 3070 hom 39 het 19 0 14 5 G 0 1 294315 CASAVA_Build 2 59481975 1D GAATTCAACA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 135 het 49 0 46 4 T 9 8 294316 CASAVA_Build 2 59486931 1I TTCACAGAAA -/C TAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 C 0 1 294317 CASAVA_Build 2 59487644 1D AACAAACATG A/- AAAAAATGCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 6 294318 CASAVA_Build 2 59496681 4I AGTGGGCAAC ----/AGAG AAAGTAAATC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 AG 0 2 294319 CASAVA_Build 2 59506189 1I TGTGGAGGGG -/C GGGGGCGGCG 3070 het 1289 hom 18 5 12 1 C 0 1 294320 CASAVA_Build 2 59539896 2I CCTATAGAAT --/AG AGAGTCTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AG 2 3 294321 CASAVA_Build 2 59556554 1I TGGAATTATT -/A AAAAATAGAA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 5 6 294322 CASAVA_Build 2 59563100 1D AAAACCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 10 11 7 T 11 10 294323 CASAVA_Build 2 59569685 1I TGCTAGCCCT -/G GGGGCTGAGC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 4 5 294324 CASAVA_Build 2 59571956 23D3M5D CATCCTGTGA CTTAGAATGCTTAACTGTCTAGGAATGCAGC/-----------------------AAT----- CCAGTAGGTT 3070 het 3070 ref 37 29 13 9 N/A 0 0 294325 CASAVA_Build 2 59595280 1D AAAGAAAAGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 A 10 9 294326 CASAVA_Build 2 59599987 2I TGGCCTAAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 10 12 294327 CASAVA_Build 2 59603983 1D CCAAGAACGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 12 12 7 T 10 9 294328 CASAVA_Build 2 59616770 16D AACTAAGTAG TATTCTATTGTGCAGA/---------------- TATACCACAA 3070 het 3070 ref 30 19 14 4 TATTCTATTGTGCAGA 1 0 294329 CASAVA_Build 2 59626293 3D TTCATTAAAA AAT/--- TTTCATTAAA 3070 het 3070 hom 40 12 25 5 AAT 1 0 294330 CASAVA_Build 2 59641526 3D AGAGACCAAG AGA/--- AGAAGGGAAG 3070 het 3070 ref 47 27 16 7 AGA 2 1 294331 CASAVA_Build 2 59651653 1D GAAAGAGAGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 8 7 294332 CASAVA_Build 2 59720397 4I AAAATTAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAT 2 3 294333 CASAVA_Build 2 59723272 2I TTTAGTTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 20 1 13 6 T 12 14 294334 CASAVA_Build 2 59723785 1D TTCGGTACTC T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 82 het 37 0 33 4 T 7 6 294335 CASAVA_Build 2 59725232 5I TTTGTTCTCC -----/TTACT TTGAGTTTAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TTACT 0 1 294336 CASAVA_Build 2 59728739 3I GAAAAAAACA ---/AAC AACCCCATCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AAC 1 2 294337 CASAVA_Build 2 59736832 1D TGCTGAGATC G/- GCGCCACTGC 3070 hom 48 het 22 0 16 7 G 2 1 294338 CASAVA_Build 2 59744169 1I ACATTCTCAA -/G GAGAATCCAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 1 2 294339 CASAVA_Build 2 59769998 9D CACCATGGCA CATGTATAC/--------- CTATGTAACA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CATGTATAC 1 0 294340 CASAVA_Build 2 59770136 4D ATGGTTTGAA TGTT/---- TGTCTTCTCC 3070 hom 69 het 24 0 24 1 TGTT 1 0 294341 CASAVA_Build 2 59784069 1D AGTCTTAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 30 0 23 8 A 10 9 294342 CASAVA_Build 2 59791169 2I TTGTTTCATT --/TA TATATATATA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TA 6 7 294343 CASAVA_Build 2 59797547 1I TAAGTATGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 10 294344 CASAVA_Build 2 59806737 1D ATGGCTCACA G/- GGGTACGGTT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 G 4 3 294345 CASAVA_Build 2 59816452 1I TAGCCAAGAA -/C AGCTAACTAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 C 0 1 294346 CASAVA_Build 2 59833045 1I AGCACTTGAT -/A ATGAATTAAC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 1 2 294347 CASAVA_Build 2 59833868 1I AATTTTTTTT -/C CTTCCTCTCC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 1 2 294348 CASAVA_Build 2 59836251 1D GAAATGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 37 1 26 10 T 13 12 294349 CASAVA_Build 2 59845773 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 10 9 294350 CASAVA_Build 2 59852073 1D GTGAAGAGAT C/- TGCTAAAAGC 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 C 1 0 294351 CASAVA_Build 2 59864843 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 1408 het 1408 ref 24 15 4 6 A 10 9 294352 CASAVA_Build 2 59866451 1D CATGCATATG A/- TCTTAAGCCA 3070 het 3070 hom 48 15 27 6 A 1 0 294353 CASAVA_Build 2 59879286 1I GGATCTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 9 10 294354 CASAVA_Build 2 59884335 1I GTGAGAAGTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 8 9 294355 CASAVA_Build 2 59912222 1D TTCTTTTTTT A/- ATTATACTTT 2087 het 468 hom 7 1 5 1 A 2 1 294356 CASAVA_Build 2 59914823 1D ATGACAGAAG A/- AAAAAAAAAA 2276 het 1366 hom 30 9 11 11 A 11 10 294357 CASAVA_Build 2 59921804 1I TTCTAGGTGG -/A AACTCCAGTC 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 A 2 3 294358 CASAVA_Build 2 59935044 1D CTAGATGAAT A/- AACGTGTCAC 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 A 3 2 294359 CASAVA_Build 2 59941064 1D GTGTGTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 11 10 294360 CASAVA_Build 2 59964320 25D GTGATCAAAA CTAGAGAGCTAGCATTTCATATATG/------------------------- CTGTTAAACA 3070 het 3070 ref 47 36 17 3 CTAGAGAGCTAGCATTTCATATATG 1 0 294361 CASAVA_Build 2 60067819 7I ATGGTTGAAC -------/TAAAAAA TAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 38 14 17 9 TAAAAAA 1 2 294362 CASAVA_Build 2 60095095 1I AAATGATGCT -/G GGAAAACTGG 3070 hom 102 het 40 0 34 6 G 2 3 294363 CASAVA_Build 2 60107562 7I CAATTATATG -------/TTATTAT CGGGTTGTGC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 TTATTAT 0 1 294364 CASAVA_Build 2 60113471 1D ACTGGAACTA T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 T 7 6 294365 CASAVA_Build 2 60115816 1D AACGGTCTTA G/- CAAACGGCAC 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 G 1 0 294366 CASAVA_Build 2 60124094 5I AAAAAATTAA -----/AAGTT AAGTTTAATT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AAGTT 1 2 294367 CASAVA_Build 2 60125194 8I8M9D TGAGCTAAAG --------CTTGAAAAGATGTACTT/CCCATGGACTTGAAAA--------- GATGTACTTG 3070 het 3070 ref 65 40 28 9 N/A 0 0 294368 CASAVA_Build 2 60157011 1I AAGTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 15 1 10 4 A 14 15 294369 CASAVA_Build 2 60228446 1D TCCAAATCCC T/- TTTCCCAACA 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 T 4 3 294370 CASAVA_Build 2 60232419 1I GTAGGTGACC -/A AAAAAAAAAA 1901 het 1821 hom 27 8 9 10 A 13 14 294371 CASAVA_Build 2 60238356 4I AATTAGGAGT ----/ATAA ATAGGCCTGG 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 ATAA 0 1 294372 CASAVA_Build 2 60241715 1I TCTCTGAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 13 14 294373 CASAVA_Build 2 60247681 1I AGTGTGGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 A 9 10 294374 CASAVA_Build 2 60260337 1D CTCTGGGGCC A/- AAAGATTTAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 4 3 294375 CASAVA_Build 2 60263288 1I ATGGCATTGA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 45 14 23 8 T 6 7 294376 CASAVA_Build 2 60275775 1I CTGAAAAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 8 9 294377 CASAVA_Build 2 60318836 4D TTTTGTCATA TTTG/---- TTTGCAGTAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TTTG 2 1 294378 CASAVA_Build 2 60331292 2I AGCAGGAGCA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 62 27 22 13 AG 5 6 294379 CASAVA_Build 2 60342703 1D ACCACTTTGT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 9 8 294380 CASAVA_Build 2 60353366 1I GAGAAAAAAA -/G GTGAATCATG 3070 het 3070 hom 59 27 24 8 G 1 2 294381 CASAVA_Build 2 60367627 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 4 5 294382 CASAVA_Build 2 60368960 1D TGTCTTTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 9 8 294383 CASAVA_Build 2 60374695 1I ATTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 12 13 294384 CASAVA_Build 2 60379005 1D TTTCCGAGGG C/- CTCCTCTAAC 3070 het 2989 hom 36 11 17 8 C 2 1 294385 CASAVA_Build 2 60383911 3D TGGAATTTTA CTT/--- CTTCTGGTCT 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 CTT 2 1 294386 CASAVA_Build 2 60384412 1I TGACACACAG -/C CCGGTATGCA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 C 2 3 294387 CASAVA_Build 2 60386716 1D CACCACCACC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 22 10 5 T 9 8 294388 CASAVA_Build 2 60390992 14D AGCATCCCTC CTCCATGGGGCTGG/-------------- AGAGGGATCA 3070 het 3070 hom 40 17 19 7 CTCCATGGGGCTGG 1 0 294389 CASAVA_Build 2 60395058 1D CGATATAACC T/- TTTTTTTTTT 2198 het 2198 ref 41 18 8 15 T 17 16 294390 CASAVA_Build 2 60404870 1I TCAGGAAGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 9 10 294391 CASAVA_Build 2 60405259 1D CCAGCCAAAG C/- TTTTGCTCCC 3070 het 3070 hom 34 17 14 3 C 1 0 294392 CASAVA_Build 2 60408317 1I TCTGCAGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 9 10 294393 CASAVA_Build 2 60410793 1D GAAATCTAGC A/- AATAAAACGA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 3 2 294394 CASAVA_Build 2 60423855 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 8 9 294395 CASAVA_Build 2 60425688 1I TAGAGGAAAA -/T TTAGGGCTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 2 3 294396 CASAVA_Build 2 60427007 2I AAATGTAGAG --/AT ATGTCATGCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AT 1 2 294397 CASAVA_Build 2 60429225 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTGTATTT 3070 het 2354 hom 19 7 7 6 T 5 4 294398 CASAVA_Build 2 60439043 3D TTCAGTTTTG CCA/--- CCACCTGCAC 3070 het 3070 hom 35 11 18 7 CCA 2 1 294399 CASAVA_Build 2 60452539 1D ATTTTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 1135 het 1135 ref 39 29 3 7 T 11 10 294400 CASAVA_Build 2 60460174 1D GTAGGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2038 hom 33 13 17 3 T 16 15 294401 CASAVA_Build 2 60464733 2D AGAAATCAGC AG/-- AGTTAGGAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 AG 2 1 294402 CASAVA_Build 2 60483788 1I TCTCTGCTCA -/G ATGTAAGAAA 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 G 0 1 294403 CASAVA_Build 2 60486920 1D AAGTGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 2692 het 2692 ref 28 11 9 8 T 12 11 294404 CASAVA_Build 2 60490112 1I TGTCCGATCT -/C CCCCAACTTG 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 C 4 5 294405 CASAVA_Build 2 60490460 4D CTAAATTGCT CTAA/---- CTCTTTGAAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 6 CTAA 1 0 294406 CASAVA_Build 2 60491454 7D GTGGACTAGG TCAAATT/------- TCATTCATTT 2701 het 2701 ref 21 12 8 1 TCAAATT 1 0 294407 CASAVA_Build 2 60496643 5I CTCTGGACTT -----/TATTC TGTTCTATTG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 TATTC 0 1 294408 CASAVA_Build 2 60499100 3D TCAACCCCTT CTC/--- CTTCACGCTC 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 CTC 1 0 294409 CASAVA_Build 2 60505169 2D CTGCACCCTT GA/-- GAGAGACCCT 3070 het 3070 ref 49 21 22 8 GA 4 3 294410 CASAVA_Build 2 60516385 9D CCATGTTGGC CAGGCTGGT/--------- CTTGAACTCC 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 CAGGCTGGT 1 0 294411 CASAVA_Build 2 60517571 1D GTTTGCCTGC T/- TTTTTTGATG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 7 6 294412 CASAVA_Build 2 60522573 2I AGGAACTATA --/TG TGTGACTGTG 3070 hom 190 het 69 0 64 5 TG 2 3 294413 CASAVA_Build 2 60524598 2D ACTCAGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1238 het 529 hom 12 5 4 3 A 20 18 294414 CASAVA_Build 2 60532508 4D TAAGTCAGAC AGTT/---- AGGAAAACCA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 AGTT 1 0 294415 CASAVA_Build 2 60546826 8D TCAAGCTCAG ACTTTCCT/-------- ACCAGTCAAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 ACTTTCCT 1 0 294416 CASAVA_Build 2 60553639 52D TGTGTTTGCA AGCATTTATGTGTACATATGTGTGTTAGCGTGTGCATGCATATGTGTTTGTG/---------------------------------------------------- AGCATGTGCA 3070 het 3070 ref 61 57 21 10 AGCATTTATGTGTACATATGTGTGTTAGCGTGTGCATGCATATGTGTTTGTG 1 0 294417 CASAVA_Build 2 60553768 2D TGCATGCACA TG/-- TGTGTTAGCG 3070 het 3070 ref 69 38 26 5 TG 3 2 294418 CASAVA_Build 2 60553880 1D AATTTCCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 22 13 17 T 15 14 294419 CASAVA_Build 2 60564532 1D TCTTGGTTGC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 8 7 294420 CASAVA_Build 2 60566654 1I CCACACGTAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 A 8 9 294421 CASAVA_Build 2 60573823 1D TACTGTTGAG T/- TGTATTCCAC 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 T 2 1 294422 CASAVA_Build 2 60576601 1I TATTCTTAGC -/A TATTTTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 294423 CASAVA_Build 2 60578268 3D TATGATGATG ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 96 het 41 0 32 10 ATA 5 4 294424 CASAVA_Build 2 60617816 5D TTTTTCTCCT TAACA/----- TAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 14 16 4 TAACA 2 1 294425 CASAVA_Build 2 60621869 1D CATTATTTAT A/- AAAGATGACT 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 A 4 3 294426 CASAVA_Build 2 60633527 1D CAAAACTGGC G/- GGGCGGGGGG 1356 het 910 hom 17 5 6 6 G 4 3 294427 CASAVA_Build 2 60638233 1D AACCTTTTAG A/- AAAAAAAAAA 2251 het 2251 ref 22 10 7 6 A 11 10 294428 CASAVA_Build 2 60646888 1I TGATGGCCAT -/A AGCTCTATAG 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 A 1 2 294429 CASAVA_Build 2 60663582 1I GCAGGTGAGG -/C TTTTGCAGTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 294430 CASAVA_Build 2 60664616 1D TAAATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 11 10 294431 CASAVA_Build 2 60665557 11D CTCAGCCTTG CCTTGGGCTCC/----------- CCTTGGGCTC 3070 hom 74 het 24 0 19 10 CCTTGGGCTCC 3 2 294432 CASAVA_Build 2 60671128 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 83 hom 35 1 26 8 A 12 11 294433 CASAVA_Build 2 60673213 1D TGGTACTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1959 hom 35 10 18 7 A 14 13 294434 CASAVA_Build 2 60680724 1D GGGGAGCCAC T/- TGAGGGGCTT 3070 hom 102 het 36 0 31 5 T 2 1 294435 CASAVA_Build 2 60701217 2D AATGGAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 943 het 192 hom 34 4 2 28 A 13 11 294436 CASAVA_Build 2 60726299 2D AGCGAAATGA TG/-- TGTTTGACTT 3070 hom 123 het 43 0 40 3 TG 2 1 294437 CASAVA_Build 2 60738346 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1102 hom 33 6 16 11 A 17 16 294438 CASAVA_Build 2 60749009 1D CAGAAACAGA T/- ACGAGAATCT 3070 het 3070 ref 31 22 9 0 T 1 0 294439 CASAVA_Build 2 60755351 1I CCGTGCTCAC -/A GCAGGTCCCC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 0 1 294440 CASAVA_Build 2 60762861 1D TACAAACACA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 32 10 17 6 T 8 7 294441 CASAVA_Build 2 60764296 1D CCTCGAACCC G/- GGAGGCAGAG 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 G 3 2 294442 CASAVA_Build 2 60764805 1I TATATCTGTT -/A AAAAATTAGC 872 hom 5 het 3 0 2 2 A 5 6 294443 CASAVA_Build 2 60798948 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2424 hom 30 12 15 3 T 13 12 294444 CASAVA_Build 2 60800033 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1486 het 498 hom 16 2 6 8 A 11 12 294445 CASAVA_Build 2 60803144 1D AAGGCAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 9 8 294446 CASAVA_Build 2 60810267 5D CTTCCTATTT TAATA/----- TGAGTCTTTA 3070 het 2856 hom 16 7 8 3 TAATA 1 0 294447 CASAVA_Build 2 60814854 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 12 11 294448 CASAVA_Build 2 60816905 4D CATCAGTCTT TTTC/---- TTTCTTTTTT 1285 het 1285 ref 15 8 4 3 TTTC 2 1 294449 CASAVA_Build 2 60819062 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1784 het 1784 ref 34 16 6 13 A 15 14 294450 CASAVA_Build 2 60819845 1D TTGTGTTAGG T/- CACACATGTC 3070 het 3070 ref 69 29 29 12 T 1 0 294451 CASAVA_Build 2 60819960 4I AAGGTTTTTC ----/TTTG TTTGTTTCTT 3070 het 3070 hom 57 24 30 3 TTTG 1 2 294452 CASAVA_Build 2 60820647 1I CGTACCCGGC -/T TTTTTTTTTT 1731 het 1731 ref 22 7 5 10 T 13 14 294453 CASAVA_Build 2 60829220 1I GTTAAGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 13 10 19 T 15 16 294454 CASAVA_Build 2 60829875 18D CTTGAGGCCA GGAATTCAAAACTAGCCT/------------------ GGGCAGCATG 232 het 232 ref 27 19 2 12 GGAATTCAAAACTAGCCT 1 0 294455 CASAVA_Build 2 60854341 2I ATAAAATGTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 22 14 15 A 12 14 294456 CASAVA_Build 2 60856402 1D TACTGTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 794 hom 17 6 9 2 T 12 11 294457 CASAVA_Build 2 60860917 1D TTACCTAGCC T/- TTTTTTTTTT 1552 het 1552 ref 35 13 6 16 T 17 16 294458 CASAVA_Build 2 60861996 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 A 11 12 294459 CASAVA_Build 2 60863204 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1302 hom 21 6 14 1 A 11 10 294460 CASAVA_Build 2 60876246 2I AAACCTTCTC --/TT TGAGAGTTTA 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 T 1 3 294461 CASAVA_Build 2 60877361 1D ATGAACTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 T 10 9 294462 CASAVA_Build 2 60912272 4D TTCTTTTCTC TCTT/---- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 TCTT 2 1 294463 CASAVA_Build 2 60922327 1I TTACTGAAGC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 7 8 294464 CASAVA_Build 2 60930608 1D AGGCTGGGTT C/- AACTTCAGAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 C 1 0 294465 CASAVA_Build 2 60936138 1I CCTCATCTCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 8 9 294466 CASAVA_Build 2 60956574 1D GATAATCCAA T/- TTTTTTTTTT 1877 het 1877 ref 25 9 6 10 T 15 14 294467 CASAVA_Build 2 60959560 1D ATACTACTGT G/- GTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 15 17 12 G 2 1 294468 CASAVA_Build 2 60964599 1I GGCCTGGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2951 hom 24 8 13 3 A 13 14 294469 CASAVA_Build 2 60977943 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2117 het 1496 hom 17 5 9 3 T 11 12 294470 CASAVA_Build 2 60983173 1I TACAAATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 815 hom 19 2 12 5 T 11 12 294471 CASAVA_Build 2 61001788 3D AGGGCTAATT AGA/--- AGAAGTCTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AGA 2 1 294472 CASAVA_Build 2 61011308 4D CCCTATTAAT AAAC/---- AAAATACAGA 3070 het 3070 hom 38 17 19 4 AAAC 1 0 294473 CASAVA_Build 2 61024111 1D AGAGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2126 hom 39 12 12 15 A 15 14 294474 CASAVA_Build 2 61024767 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1610 het 1610 ref 19 4 6 9 A 13 14 294475 CASAVA_Build 2 61027483 2I TGTGTGTGTA --/AT ATATATATAT 3070 het 112 hom 37 5 31 1 AT 6 7 294476 CASAVA_Build 2 61049317 1D TAGTTGATCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 8 294477 CASAVA_Build 2 61072000 2D AGATTTAAAC AT/-- GTGTCAAATT 3070 het 3070 ref 38 20 17 4 AT 1 0 294478 CASAVA_Build 2 61072652 1D ACAGAAGCAC T/- TTTTTTTTTT 1005 het 1005 ref 40 19 4 17 T 17 16 294479 CASAVA_Build 2 61077236 1I GGTATGGTTT -/A AAAAAAAAAA 928 het 928 ref 54 37 4 13 A 13 14 294480 CASAVA_Build 2 61114613 1D GACTTAGGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 9 8 294481 CASAVA_Build 2 61139717 1D AAAGATTAAG A/- ATGACTGGTA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 2 1 294482 CASAVA_Build 2 61154611 10D GCAAGTTTTG ATAGTTTTGT/---------- ATAGTTTTGT 3070 hom 66 het 23 0 22 3 ATAGTTTTGT 2 1 294483 CASAVA_Build 2 61172233 1D AACTCCGTCC A/- AAAAAAAAAA 407 het 99 hom 12 3 4 5 A 17 16 294484 CASAVA_Build 2 61172272 1D GATGACACAT A/- ACCTGTAATC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 2 1 294485 CASAVA_Build 2 61178697 2D AGGCACAAAT TA/-- TATATATATA 2254 hom 18 het 13 0 6 7 TA 10 9 294486 CASAVA_Build 2 61185122 1D AAAAAAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 25 3 A 12 11 294487 CASAVA_Build 2 61191487 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 35 0 30 5 A 13 12 294488 CASAVA_Build 2 61195986 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 10 11 294489 CASAVA_Build 2 61200946 1I TCAAGACCAT -/C CTGGCCAACA 3070 het 465 hom 15 4 9 2 C 1 2 294490 CASAVA_Build 2 61210084 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 29 1 22 6 A 11 12 294491 CASAVA_Build 2 61212767 1D ATTCTTAGAT A/- AGACAATAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 2 1 294492 CASAVA_Build 2 61214830 1D CAGAAAAAGT G/- GTTTGAGCAG 3070 het 3070 hom 46 22 18 6 G 2 1 294493 CASAVA_Build 2 61220920 2D CAAGACCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 31 4 15 12 A 19 17 294494 CASAVA_Build 2 61224615 2I GAGAGAGCGT --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 GA 7 8 294495 CASAVA_Build 2 61224941 1I TATTAACCCC -/T GACACTTTTG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 0 1 294496 CASAVA_Build 2 61227848 5D ATGGGAGATT TTTCC/----- TTTCCTTTCC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 TTTCC 3 2 294497 CASAVA_Build 2 61236474 1D AATCAAGGTG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 8 7 294498 CASAVA_Build 2 61242078 2D TAGCATGAAA GT/-- GTGTTAAATT 3070 het 3070 ref 59 25 28 8 GT 3 2 294499 CASAVA_Build 2 61247734 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 21 0 13 8 T 13 14 294500 CASAVA_Build 2 61250524 1I CTGGGAAACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 780 hom 29 3 16 10 T 13 14 294501 CASAVA_Build 2 61252802 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 35 het 26 1 25 0 A 9 10 294502 CASAVA_Build 2 61265911 4D TTCAGTCATA TATG/---- ACCTGGGAAC 3070 het 3070 ref 66 29 27 12 TATG 1 0 294503 CASAVA_Build 2 61266542 4D TTTAAACCAT ATTA/---- ATTGTTATAT 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 ATTA 1 0 294504 CASAVA_Build 2 61268144 4D CACAGAATAG CAAT/---- CAATCAATCA 3070 hom 129 het 52 0 44 8 CAAT 3 2 294505 CASAVA_Build 2 61270123 3D ATGTTGGCCA TTG/--- AGATGGTCTC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 TTG 1 0 294506 CASAVA_Build 2 61284571 1I TGGCCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 13 14 294507 CASAVA_Build 2 61301614 1D ACACACCCAT A/- ACCCACTCAT 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 A 2 1 294508 CASAVA_Build 2 61309899 1D TTACAGATTA T/- TTTTTAAACA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 6 5 294509 CASAVA_Build 2 61320885 4I TTCTGAAATG ----/AAGA AAGCCTCATA 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 AAGA 0 1 294510 CASAVA_Build 2 61340194 1D GCCTGGCTTA T/- TTTTTTTTTT 2801 het 2452 hom 25 7 8 10 T 11 10 294511 CASAVA_Build 2 61346334 1D TTTTTTAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 A 9 8 294512 CASAVA_Build 2 61429686 3D ATGATTTCTA AAG/--- AAGATGTAAG 3070 het 3070 hom 43 18 21 6 AAG 2 1 294513 CASAVA_Build 2 61446186 1D TAACATCCAC A/- AATTTCTCTT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 3 2 294514 CASAVA_Build 2 61452084 1D TTAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1115 het 1115 ref 24 15 4 6 A 13 12 294515 CASAVA_Build 2 61475879 1D TATCCTAATT A/- AAAAAAAAAA 1369 het 1369 ref 33 24 5 4 A 12 11 294516 CASAVA_Build 2 61479219 1I GGGGAAAGTC -/G GGGGGAGGGA 3070 hom 36 het 13 0 10 3 G 5 6 294517 CASAVA_Build 2 61487951 1D GAGGCTGAGA C/- AGCAGTGAAC 3070 het 3070 hom 38 13 18 9 C 1 0 294518 CASAVA_Build 2 61519263 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 10 9 294519 CASAVA_Build 2 61522442 1D ACTGCATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 29 0 16 13 A 13 12 294520 CASAVA_Build 2 61523704 2I GTTCTTACTC --/AT ATGTGGAAGC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 AT 1 2 294521 CASAVA_Build 2 61524133 1I CAGATGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 10 11 11 A 13 14 294522 CASAVA_Build 2 61529792 9D AGGAGGGAAT GGAGGGACG/--------- GGAGGGACAG 3070 hom 68 het 24 0 19 10 GGAGGGACG 1 0 294523 CASAVA_Build 2 61529894 2D ACTCCCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 23 1 12 11 A 16 14 294524 CASAVA_Build 2 61530149 1D CATAATTTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 319 hom 31 1 25 5 A 10 9 294525 CASAVA_Build 2 61530740 1I AGTCTTAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 625 hom 27 2 23 2 A 9 10 294526 CASAVA_Build 2 61531526 1I GAGGAGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 528 hom 24 3 15 6 A 15 16 294527 CASAVA_Build 2 61533545 10D CCCCACAACC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 32 0 21 13 A 22 12 294528 CASAVA_Build 2 61539350 2D AAGGTAGGCC AT/-- ATTTCACTCC 3070 hom 79 het 29 0 27 2 AT 2 1 294529 CASAVA_Build 2 61541287 1D CTGTATACCC T/- TTTTCTCCTC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 5 4 294530 CASAVA_Build 2 61553087 1D TTTATTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 119 het 51 0 39 12 T 12 11 294531 CASAVA_Build 2 61566714 7D CTGAAAACAG GAAAATC/------- TTGTGTTTGT 3070 hom 99 het 36 0 34 6 GAAAATC 1 0 294532 CASAVA_Build 2 61568664 3D TAACGTAAGG ACT/--- ACAATAAATA 3070 het 3070 hom 38 13 16 11 ACT 1 0 294533 CASAVA_Build 2 61576024 1I TACATTTTAG -/A AAAAAGGCAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 5 6 294534 CASAVA_Build 2 61582405 2I AGAATCCAAC --/AT AGAGTCCAGT 3070 hom 30 het 19 0 10 9 AT 0 1 294535 CASAVA_Build 2 61583386 1D AGCAAGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 12 11 294536 CASAVA_Build 2 61615525 1I GGGATTGAAA -/T TAAAGCTACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 294537 CASAVA_Build 2 61626018 7I TTGGAAGGTG -------/GAAGGTA TGACACAATT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 GAAGGTA 0 1 294538 CASAVA_Build 2 61634660 1D CTGCCCTGCC A/- AAAAAAAAAA 2381 het 823 hom 24 3 11 10 A 14 13 294539 CASAVA_Build 2 61647506 1D GCATTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2549 hom 26 8 11 7 T 15 14 294540 CASAVA_Build 2 61657170 1I AGATACATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1099 hom 22 3 11 8 T 13 14 294541 CASAVA_Build 2 61658302 1I ACCTGGTGAT -/C CATCCGCCTC 3070 hom 30 het 12 0 10 2 C 1 2 294542 CASAVA_Build 2 61664078 14D CCAGATCAGC CTGGAGTATCCAGG/-------------- CTGGAGTATC 3070 hom 57 het 23 0 18 9 CTGGAGTATCCAGG 1 0 294543 CASAVA_Build 2 61667123 3D TCAAAAAAAC AAA/--- AAAACAAAAA 3070 hom 80 het 28 0 27 3 A 7 4 294544 CASAVA_Build 2 61699437 1D TTGATCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 13 12 294545 CASAVA_Build 2 61699816 1I GGGTGGAGGT -/G GGGGGGGCGG 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 G 7 8 294546 CASAVA_Build 2 61701396 1D TGAGGGCTTC T/- TTACAACATG 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 T 3 2 294547 CASAVA_Build 2 61709265 1D TTAATTTTTC T/- TTTTTCTTTT 2499 het 162 hom 10 1 8 1 T 6 5 294548 CASAVA_Build 2 61714732 1D GAGGGTAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 10 9 294549 CASAVA_Build 2 61728139 1D ATTAAAAATG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 9 8 294550 CASAVA_Build 2 61733916 5D TATTTATTTA TTTAT/----- TTGTTTTCGA 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 TTTAT 1 0 294551 CASAVA_Build 2 61736931 1I TGCAAAGGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 98 het 37 0 32 5 T 9 10 294552 CASAVA_Build 2 61749979 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 965 het 965 ref 13 7 3 3 T 9 10 294553 CASAVA_Build 2 61772452 1D AAATTTTAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2975 hom 23 10 11 2 T 9 8 294554 CASAVA_Build 2 61777152 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAGAAAAG 2559 het 1456 hom 23 8 9 7 AG 1 0 294555 CASAVA_Build 2 61780083 3I GACTTCTATA ---/TTG TTGTTAATAG 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 TTG 1 2 294556 CASAVA_Build 2 61786096 1I CTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2769 het 2335 hom 25 7 9 9 T 11 12 294557 CASAVA_Build 2 61795306 2D GTATTTCTTT TC/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 TC 1 0 294558 CASAVA_Build 2 61797006 1D TGTGTGTCAG A/- ACTTATTTGG 3070 het 3070 ref 24 13 11 1 A 2 1 294559 CASAVA_Build 2 61802636 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 20 0 15 5 A 13 14 294560 CASAVA_Build 2 61803339 1I AGTTAAACTC -/A TATTTTTTGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 0 1 294561 CASAVA_Build 2 61805724 1I AATTTAAAAA -/T TTTTTTTTTT 2405 het 2405 ref 26 8 10 8 T 14 15 294562 CASAVA_Build 2 61815156 1D TTTTAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 12 11 294563 CASAVA_Build 2 61816152 1I GTAATCCGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 11 10 A 10 11 294564 CASAVA_Build 2 61826676 3I TGTTGAAGAT ---/GAA GAAGAAGAAG 1796 het 580 hom 19 3 6 10 GAA 5 6 294565 CASAVA_Build 2 61827241 1I GAATCTGTCA -/C AAAAAAAAAA 1787 het 962 hom 9 2 5 2 C 0 1 294566 CASAVA_Build 2 61837089 3I CATTTCATAA ---/GAG TAGTAACTCC 3070 het 3070 hom 66 31 32 3 GAG 0 1 294567 CASAVA_Build 2 61839401 8D AGTTGATTAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 9 AAAC 6 4 294568 CASAVA_Build 2 61844562 1I ATCAGGCCTC -/G GGAATTCTGG 3070 het 3070 ref 35 15 9 11 G 2 3 294569 CASAVA_Build 2 61889521 1I TAATGTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2895 hom 30 9 17 4 T 10 11 294570 CASAVA_Build 2 61903972 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1476 hom 13 het 6 0 5 1 A 14 13 294571 CASAVA_Build 2 61907051 3D ACACCCTGAC GCT/--- GCAAACAACA 3070 het 3070 hom 40 20 18 3 GCT 1 0 294572 CASAVA_Build 2 61907383 1I CAAAAAAAAG -/A AAGAAAACGC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 294573 CASAVA_Build 2 61908924 1D AAGATATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 26 1 20 5 A 13 12 294574 CASAVA_Build 2 61908976 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 983 het 983 ref 22 6 4 12 T 10 11 294575 CASAVA_Build 2 61914376 4D TATAACAAAA AGAC/---- AGACAAAAGC 3070 het 3070 hom 44 18 23 4 AGAC 2 1 294576 CASAVA_Build 2 61916108 1D AGACTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 11 10 294577 CASAVA_Build 2 61916846 1D CAAAGTCAAT G/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 1 0 294578 CASAVA_Build 2 61919922 5D CAAAATATCA TATAT/----- TATATAGTAA 3070 het 2859 hom 21 7 11 4 TATAT 2 1 294579 CASAVA_Build 2 61923778 4D TTTCAGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 46 11 19 19 TTTG 4 3 294580 CASAVA_Build 2 61927645 2I TCTACTAAAA --/AC ACAAAACTTA 3070 hom 55 het 33 1 30 2 AC 1 2 294581 CASAVA_Build 2 61930505 8I TAAACAAATT --------/AACACAGG AACAGAAAAC 3070 hom 71 het 30 0 22 8 AACACAGG 0 1 294582 CASAVA_Build 2 61942934 1I TGATGGTGGT -/G GGGGGGGGTC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 8 9 294583 CASAVA_Build 2 61946382 1I TATATATGTA -/T TTTTTTTTTT 3038 het 3038 ref 31 12 9 10 T 14 15 294584 CASAVA_Build 2 61946827 2I TATGCCCGGC --/TT TTTTTTTTTT 2603 hom 33 het 13 0 12 1 T 12 14 294585 CASAVA_Build 2 61948557 1I GCTTTTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3069 het 3069 ref 22 9 9 4 A 13 14 294586 CASAVA_Build 2 61955781 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 25 1 22 2 A 10 11 294587 CASAVA_Build 2 61960387 1D CACTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 2836 het 2836 ref 31 14 8 9 T 13 12 294588 CASAVA_Build 2 61960881 1I AAAGTTTGTT -/C TTTTAAACTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 0 1 294589 CASAVA_Build 2 61961854 5D CAATGCTTTC TTATT/----- TTATGTTCCA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TTATT 1 0 294590 CASAVA_Build 2 61964737 2D ACATTAAGAT AC/-- AAAGTTACAT 3070 het 3070 ref 41 25 14 3 AC 1 0 294591 CASAVA_Build 2 61965726 1I AGATGGGGGG -/A GAAAAAAAAG 3070 het 2432 hom 31 9 19 3 A 0 1 294592 CASAVA_Build 2 61987274 4I TATAGGAATG ----/AATC TAGTGTCAAT 3070 het 3070 hom 44 14 26 4 AATC 0 1 294593 CASAVA_Build 2 61995646 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 128 hom 28 2 19 7 T 15 14 294594 CASAVA_Build 2 62002578 1I TTTATTTAAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 T 8 9 294595 CASAVA_Build 2 62030296 5D CAGATTCAGT TAAAA/----- TAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 14 28 5 TAAAA 2 1 294596 CASAVA_Build 2 62059017 1D AAATGTGAAA T/- TTTAGGGGAC 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 T 4 3 294597 CASAVA_Build 2 62059710 1D TCTTTCTATA T/- TTTTGTACCC 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 5 4 294598 CASAVA_Build 2 62066794 1D TGGTATAAAG T/- TTTTTTTTTT 1357 het 1357 ref 29 26 3 0 T 13 12 294599 CASAVA_Build 2 62075738 1I CAGCTTAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 76 het 30 0 25 5 T 9 10 294600 CASAVA_Build 2 62089001 14D ACACAGACAG ACACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 het 1560 hom 28 5 14 11 AC 14 7 294601 CASAVA_Build 2 62102636 1D TAAACTCCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 9 8 294602 CASAVA_Build 2 62104127 1D TTACTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2541 hom 31 8 16 8 T 13 12 294603 CASAVA_Build 2 62140583 1I AATGAATTTT -/G GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 8 9 294604 CASAVA_Build 2 62142624 1D CAGTTACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 11 9 A 16 15 294605 CASAVA_Build 2 62160839 3I TGCCTGTAAT ---/CCC CCCAGTACTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 C 3 6 294606 CASAVA_Build 2 62161425 1D ATAGTTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 30 1 18 11 T 17 16 294607 CASAVA_Build 2 62162095 1I TCTCCATGTT -/G GTCAGGTTGG 3070 het 2389 hom 22 8 11 3 G 1 2 294608 CASAVA_Build 2 62179082 16D TGACAGCTAG GTCAGCTAGGGTTGAT/---------------- GTCAGCTAGG 3070 het 3070 ref 45 22 19 10 GTCAGCTAGGGTTGAT 1 0 294609 CASAVA_Build 2 62198632 1I GGACCTGACT -/A CCTACTCTGC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 0 1 294610 CASAVA_Build 2 62199747 1D AGAGGGGCTC A/- AATCCAGAAT 3070 het 3070 hom 45 19 20 8 A 3 2 294611 CASAVA_Build 2 62203079 1D AGTTTCTTTC T/- TTTCTTTTTT 3070 het 2514 hom 31 11 14 6 T 4 3 294612 CASAVA_Build 2 62204140 1I CAAGACATGT -/C GAAAAAAAAA 2265 het 1992 hom 17 6 10 1 C 0 1 294613 CASAVA_Build 2 62233084 1I TCTCCTGTGC -/T TTTTTTTTTT 2826 het 2826 ref 35 14 11 10 T 13 14 294614 CASAVA_Build 2 62234624 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2177 hom 28 7 15 6 A 12 13 294615 CASAVA_Build 2 62239517 1D TGAAAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1333 hom 24 4 15 5 A 15 14 294616 CASAVA_Build 2 62243912 1I CACAATTTAG -/T CCATAGCACT 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 T 0 1 294617 CASAVA_Build 2 62247035 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 40 het 40 ref 23 15 3 5 AAAAG 1 0 294618 CASAVA_Build 2 62248273 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3000 hom 23 8 11 4 A 10 11 294619 CASAVA_Build 2 62251089 1I TTGCCTTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2427 hom 20 6 12 2 A 9 10 294620 CASAVA_Build 2 62255089 7D TCAAAAAAAA AAAAAAG/------- AAAAAGAAAA 3070 het 1490 hom 17 4 10 4 AAAAAAG 1 0 294621 CASAVA_Build 2 62260504 12D GAAATGGTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2514 het 1818 hom 23 7 6 10 T 26 14 294622 CASAVA_Build 2 62284942 1D CTGGTAGAAA T/- TTTTCTAATT 3070 hom 56 het 22 0 19 5 T 5 4 294623 CASAVA_Build 2 62318297 1I AAGGCAGGTT -/A GGGGTTGCCT 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 A 0 1 294624 CASAVA_Build 2 62363538 7I CAATGATCAT -------/CATTGCA CACTGTCTCA 3070 het 3070 hom 49 17 27 5 CATTGCA 0 1 294625 CASAVA_Build 2 62376070 1I AAAAAATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 19 1 16 2 A 10 11 294626 CASAVA_Build 2 62381520 1D TTGCCTATGA G/- CTTGTCTTTC 3070 het 3070 hom 49 21 26 2 G 1 0 294627 CASAVA_Build 2 62394067 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 552 hom 25 2 17 6 A 13 14 294628 CASAVA_Build 2 62398800 1I CAAGGTGAAA -/C CCCGTGTCTA 1839 hom 12 het 5 0 5 0 C 3 4 294629 CASAVA_Build 2 62411969 1I AACCTAATCA -/C CCCCCAAAGG 3070 hom 42 het 19 0 13 6 C 5 6 294630 CASAVA_Build 2 62479836 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2027 het 1859 hom 21 8 8 5 A 17 16 294631 CASAVA_Build 2 62480116 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1989 het 1989 ref 27 10 7 10 T 11 10 294632 CASAVA_Build 2 62485907 3I AAACCCAGCC ---/CAA CAAGCCCTGT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 CAA 1 2 294633 CASAVA_Build 2 62486678 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 1391 hom 15 4 8 3 T 9 8 294634 CASAVA_Build 2 62489568 1D AAAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 771 hom 36 3 22 11 A 15 14 294635 CASAVA_Build 2 62519524 6I CATCAAGACT ------/AGTTCA TCACTAGGTG 3070 het 3070 hom 31 16 15 0 AGTTCA 0 1 294636 CASAVA_Build 2 62558037 4I CTCCGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAAC 2 3 294637 CASAVA_Build 2 62561338 1D GCCCCTTCGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 A 9 8 294638 CASAVA_Build 2 62561568 1I AATTGTAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 54 16 27 11 T 9 10 294639 CASAVA_Build 2 62576306 1D TCTGTTTGCC G/- CTTTGTTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 18 2 G 1 0 294640 CASAVA_Build 2 62576725 1D AGCTTTTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 10 9 294641 CASAVA_Build 2 62578186 1D TTTAAATCTC A/- AGTGTCACTT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 A 2 1 294642 CASAVA_Build 2 62583252 1I TTTAAGATAG -/A AAAAAATTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 6 7 294643 CASAVA_Build 2 62589196 10D AAAGGACCAC GTCTTTTAAT/---------- TATTAAAGAA 3070 hom 148 het 51 0 50 2 GTCTTTTAAT 1 0 294644 CASAVA_Build 2 62613164 1D TACTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 1288 het 1288 ref 31 19 5 7 T 15 14 294645 CASAVA_Build 2 62642504 3D TCAAAAAAAA AAT/--- AAATAAATAA 48 het 48 ref 32 13 2 20 AAT 1 0 294646 CASAVA_Build 2 62652288 1I TCCCCCCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 10 11 294647 CASAVA_Build 2 62654441 1D GAATCACCTG A/- AAGCAGATGA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 3 2 294648 CASAVA_Build 2 62666722 1D GGACCCTCAG C/- TGCAGGTCTG 2887 hom 21 het 10 0 8 2 C 1 0 294649 CASAVA_Build 2 62679155 2I TTTAAAGTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 10 12 294650 CASAVA_Build 2 62693638 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 38 2 20 17 A 17 16 294651 CASAVA_Build 2 62694685 1I ATTTTGTAAC -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 81 het 42 0 31 11 T 7 8 294652 CASAVA_Build 2 62696541 4D AAACTCCCTC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 30 het 15 0 11 6 AAAT 5 4 294653 CASAVA_Build 2 62699600 15D TCCAATGTTT GGAATAGTTTCAGAA/--------------- GGAATGGTAC 3070 hom 36 het 13 0 12 1 GGAATAGTTTCAGAA 1 0 294654 CASAVA_Build 2 62705192 1D TCTAATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 11 10 294655 CASAVA_Build 2 62719678 1D GGCAATCATT A/- AAAAGTCAGG 1035 hom 12 het 5 0 5 0 A 5 4 294656 CASAVA_Build 2 62756559 1I GGCCCACAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 46 het 23 0 14 9 T 9 10 294657 CASAVA_Build 2 62761298 1D TCAGAAATAT G/- GGTTCTTCTA 3070 hom 141 het 50 0 48 3 G 3 2 294658 CASAVA_Build 2 62763782 2D AACGGTCCCA CC/-- CCCTCCTATC 3070 hom 112 het 42 0 36 11 C 5 3 294659 CASAVA_Build 2 62801666 1D GCAAGCTACA G/- GACTTTATTA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 G 2 1 294660 CASAVA_Build 2 62859508 1I CCTTTAGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 350 hom 33 1 26 6 T 9 10 294661 CASAVA_Build 2 62861551 3D GTATTTGGAG ATT/--- ATTCGTCTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 ATT 2 1 294662 CASAVA_Build 2 62883874 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2359 het 2359 ref 39 14 5 22 A 16 15 294663 CASAVA_Build 2 62883910 1I CGTGCATGAT -/A AGATTCCCAG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 1 2 294664 CASAVA_Build 2 62884566 1D TCGTTTTGTG C/- CCAGTTTTCT 3070 hom 129 het 52 0 44 11 C 3 2 294665 CASAVA_Build 2 62982301 1D CACTTAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 12 11 294666 CASAVA_Build 2 63127634 1I TAGGCTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 33 1 18 14 A 13 14 294667 CASAVA_Build 2 63141160 1I TTTTTTTGAG -/A AAAAAAATCT 2018 het 2018 ref 34 13 10 11 A 7 8 294668 CASAVA_Build 2 63148294 2I GATGGAGAAA --/TG TGTGTGTGTT 3070 het 45 hom 33 2 12 19 TG 4 5 294669 CASAVA_Build 2 63156162 1D GGTGAGCATC T/- TTTTCATGTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 4 294670 CASAVA_Build 2 63187865 1I TTACTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 417 hom 36 1 29 6 T 9 10 294671 CASAVA_Build 2 63192146 1D CAAGACCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 21 0 14 7 T 13 12 294672 CASAVA_Build 2 63196807 2D TGTCTGTTTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TA 10 9 294673 CASAVA_Build 2 63236196 1D GCAAACCACA G/- TCCCTAGGCC 3070 hom 57 het 25 0 20 6 G 1 0 294674 CASAVA_Build 2 63256058 1D ATTAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 39 0 33 6 A 11 10 294675 CASAVA_Build 2 63341829 1D TTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 520 hom 38 2 25 12 T 13 12 294676 CASAVA_Build 2 63343179 1D CATATAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 113 hom 40 2 15 23 A 17 16 294677 CASAVA_Build 2 63349380 2D GTAGCCTCCC AG/-- AAAGTGATGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AG 1 0 294678 CASAVA_Build 2 63356596 2D CCATAGACTC TT/-- TGAAGGAACT 3070 hom 84 het 38 0 28 13 T 3 1 294679 CASAVA_Build 2 63357859 2D AAGAACTGCT AA/-- AAAAAAAAGC 3070 hom 42 het 47 2 40 5 A 10 8 294680 CASAVA_Build 2 63359088 1I AAACAACGCA -/C AAAAAAATAC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 C 0 1 294681 CASAVA_Build 2 63371129 1I TAATATTAGT -/C CACATGCTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 1 2 294682 CASAVA_Build 2 63371848 1I TTTAAAAAAA -/C ATACAGTTTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 0 1 294683 CASAVA_Build 2 63373010 1I AGTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 627 hom 36 2 28 6 A 10 11 294684 CASAVA_Build 2 63374960 1I CTGGCCAACA -/G GGGGAAACCC 3070 hom 60 het 23 0 19 5 G 4 5 294685 CASAVA_Build 2 63376190 5D AAAAAAAAGA ATATT/----- ATATAAGTAC 3070 hom 63 het 24 0 22 4 ATATT 1 0 294686 CASAVA_Build 2 63376418 3I AAAATCTTCG ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAC 5 6 294687 CASAVA_Build 2 63376850 1I CAGTAGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1039 hom 39 4 28 7 A 13 14 294688 CASAVA_Build 2 63388689 4D ATGTACAAGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 AAAC 3 2 294689 CASAVA_Build 2 63391332 15I GTAAAAAGTC ---------------/ATATTTTTTTGCAAA TAAAATATTT 3070 hom 111 het 38 0 38 2 ATATTTTTTTGCAAA 0 1 294690 CASAVA_Build 2 63394824 1D CCCCATCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 13 hom 13 1 11 1 T 10 9 294691 CASAVA_Build 2 63396067 4I GGATTAAAGC ----/CTTT CTAATAGAGG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CTTT 0 1 294692 CASAVA_Build 2 63401415 10D GTGAAGAAAC AAAAATTAGT/---------- AAAAATTAGT 3070 hom 102 het 40 0 34 8 AAAAATTAGT 2 1 294693 CASAVA_Build 2 63407202 4D TGAGGGAGTC AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 hom 48 het 21 0 17 9 AGAA 3 2 294694 CASAVA_Build 2 63415470 1I TAGGACAGAT -/A ACAAAGATTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 294695 CASAVA_Build 2 63417962 1I CATGATTTCA -/T TTTTTGATGG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 5 6 294696 CASAVA_Build 2 63423665 10D TTTCTTTGAG ACAGAGTCTT/---------- ACTCTGTTAC 3070 hom 69 het 23 0 23 2 ACAGAGTCTT 1 0 294697 CASAVA_Build 2 63431116 1D AACGAAACCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 621 hom 31 3 22 6 A 15 14 294698 CASAVA_Build 2 63444380 1I GAAGAATATA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 7 8 294699 CASAVA_Build 2 63447162 8D GTGCCCTTAT TATCTATC/-------- TATCTTCCAG 3070 hom 144 het 52 0 47 8 TATC 3 1 294700 CASAVA_Build 2 63455481 2D TCTCTCTGTT TA/-- TCCATCAATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TA 1 0 294701 CASAVA_Build 2 63468372 2I AACCCAATAG --/TC TCTGCCCAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TC 1 2 294702 CASAVA_Build 2 63470930 4D TGCTCCTGAA TGAC/---- TGACTACTGG 3070 hom 24 het 12 0 9 5 TGAC 2 1 294703 CASAVA_Build 2 63475016 1D TTAATAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 30 1 23 6 A 11 10 294704 CASAVA_Build 2 63477296 1I AAAGTATTTC -/T TCTTTTTTTT 3070 hom 19 het 32 1 22 9 T 1 2 294705 CASAVA_Build 2 63479406 1D CAAGCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 547 hom 34 2 26 8 A 13 12 294706 CASAVA_Build 2 63480218 2I AGGAGAGATT --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 32 het 31 0 12 19 GA 8 9 294707 CASAVA_Build 2 63480715 4I ATGTATTTAC ----/CTTT CTATGTTTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CTTT 0 1 294708 CASAVA_Build 2 63484067 1I TACATAAAAG -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 2 3 294709 CASAVA_Build 2 63494623 1I AATCAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 27 0 20 7 A 10 11 294710 CASAVA_Build 2 63496839 1I CTTTTTTTTC -/T CTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 25 1 19 5 T 0 1 294711 CASAVA_Build 2 63499961 1D TTGTATTTTT A/- GTAAAGACGG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 1 0 294712 CASAVA_Build 2 63505387 1I GTGTGGGCCT -/G GGGCATGCCT 3070 hom 45 het 18 0 14 4 G 3 4 294713 CASAVA_Build 2 63511798 1I TTAAAAAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 9 294714 CASAVA_Build 2 63530139 4D AAGGAAAAGA AAGC/---- AAGTGGCCAC 3070 hom 108 het 44 0 36 9 AAGC 1 0 294715 CASAVA_Build 2 63538867 1D GTCAGGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 473 hom 31 2 21 9 A 16 15 294716 CASAVA_Build 2 63559663 1D ACAGAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2235 het 2235 ref 26 20 5 1 A 12 11 294717 CASAVA_Build 2 63564101 2I TCTGAAAAAT --/AA AAGTTTATGC 3070 hom 114 het 44 0 37 7 A 2 4 294718 CASAVA_Build 2 63566001 1D ACTCAGACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 29 1 20 9 A 15 14 294719 CASAVA_Build 2 63572717 2D GCAGATAAAC TT/-- GATGAAAATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 0 294720 CASAVA_Build 2 63597280 4D TGAGCCACCT TGGA/---- TGGAAATCCA 3070 hom 128 het 47 0 40 9 TGGA 2 1 294721 CASAVA_Build 2 63599696 1D CATCCTGCCA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 432 hom 31 2 17 12 C 10 9 294722 CASAVA_Build 2 63604423 1D GTGGCACATG C/- CTGTAATCCC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 2 1 294723 CASAVA_Build 2 63604941 1I CCAAAGCAAT -/C CTAAGCAAAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 1 2 294724 CASAVA_Build 2 63611524 1I AAAGCAAGGC -/G GGGCATTGCC 3070 hom 51 het 20 0 16 7 G 3 4 294725 CASAVA_Build 2 63614526 1D ATAGAGACAC A/- AAAAAACCCT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 A 7 6 294726 CASAVA_Build 2 63628195 4I TGGTATGTAT ----/ATAC ACACACACAC 3070 hom 39 het 48 1 38 10 ATAC 0 1 294727 CASAVA_Build 2 63630530 4D TCCAAATAGT AAGA/---- AAGGGAGATG 3070 het 3070 ref 54 24 19 12 AAGA 1 0 294728 CASAVA_Build 2 63630711 3D TCTCTCTCTC CTT/--- GTCTTCTATA 3070 hom 87 het 34 0 29 6 CTT 1 0 294729 CASAVA_Build 2 63631870 1D AAATAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 10 9 294730 CASAVA_Build 2 63632598 1D TTTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 795 hom 33 4 19 10 T 15 14 294731 CASAVA_Build 2 63635291 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 917 hom 29 3 22 4 A 12 11 294732 CASAVA_Build 2 63636047 1I CTTAGTTTTT -/C CCCCTGCTGT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 C 4 5 294733 CASAVA_Build 2 63639166 10D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAGA 1570 hom 10 het 4 0 4 0 A 18 8 294734 CASAVA_Build 2 63648994 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 45 het 21 0 16 6 A 9 8 294735 CASAVA_Build 2 63651719 1D ATTTTTGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 11 10 294736 CASAVA_Build 2 63660409 4D ATACACAGAT AGAC/---- AGACAGACAG 3070 hom 96 het 39 0 31 8 AGAC 5 4 294737 CASAVA_Build 2 63664318 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 4 A 14 13 294738 CASAVA_Build 2 63674051 1D TTTTTTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 11 10 294739 CASAVA_Build 2 63691207 1D TTTGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 1969 het 1969 ref 40 27 5 8 A 12 11 294740 CASAVA_Build 2 63733409 7I TTGGAAAACT -------/CAGGTAC TAAGTCCAAC 3070 hom 102 het 45 0 34 11 CAGGTAC 0 1 294741 CASAVA_Build 2 63733663 1I AGAAAGGAAT -/A AAATAAGATG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 3 4 294742 CASAVA_Build 2 63735475 1I TATATTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 9 10 294743 CASAVA_Build 2 63747658 1D ACCATCTCCT G/- GAAACACCCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 2 1 294744 CASAVA_Build 2 63748405 1I TAGCTAATAC -/T TTGCTGCACC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 3 294745 CASAVA_Build 2 63755356 1D TTGACGCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 31 1 24 6 A 12 11 294746 CASAVA_Build 2 63757431 4D AACTACACAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 87 het 32 0 29 6 AC 10 8 294747 CASAVA_Build 2 63758180 1D AAAATCAAAG A/- AAAAAAGTCT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 7 6 294748 CASAVA_Build 2 63762630 1D TTTGGGGGTG C/- CCCCAATGCA 3070 hom 128 het 48 0 41 7 C 5 4 294749 CASAVA_Build 2 63776950 1I ACCCCAGCAA -/G GTTTCTTCTT 3070 hom 126 het 50 0 42 8 G 1 2 294750 CASAVA_Build 2 63777787 1D GTAGTAGTAG T/- TATAGTAGTT 1300 hom 17 het 27 0 8 19 T 2 1 294751 CASAVA_Build 2 63894990 1D TCCTGGTTTG A/- AAAAAAAAAA 805 het 805 ref 40 29 3 8 A 11 10 294752 CASAVA_Build 2 63905023 1D CTATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2616 het 158 hom 22 1 10 11 A 14 13 294753 CASAVA_Build 2 63971499 1I CTGGCCATGC -/T TGTGGCACCG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 1 2 294754 CASAVA_Build 2 63973368 1I TGCCAGGATC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 41 0 35 6 T 9 10 294755 CASAVA_Build 2 63979422 1D AGCTGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 7 A 11 10 294756 CASAVA_Build 2 63981391 1I TCAAATCTGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 113 het 41 0 38 3 T 8 9 294757 CASAVA_Build 2 63991728 1D ACAGTCTTCT A/- ACCTTGTTAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 2 1 294758 CASAVA_Build 2 63999124 2I AGTGGTCAGA --/GT GTTTTATTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 GT 1 2 294759 CASAVA_Build 2 64003957 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 9 8 294760 CASAVA_Build 2 64013821 3D ATTTCAAAAT AAG/--- AAGTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 19 17 1 AAG 2 1 294761 CASAVA_Build 2 64028899 3D TTTTTTACTA GTT/--- GTTGTCAGTG 3070 hom 81 het 29 0 28 3 GTT 2 1 294762 CASAVA_Build 2 64030301 3D TGAGTAGGCT GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 GAG 4 3 294763 CASAVA_Build 2 64033693 3D TATAGAGCAG TTT/--- TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 T 9 6 294764 CASAVA_Build 2 64042149 1I GCTTGCAATT -/A AGTCTATAAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 1 2 294765 CASAVA_Build 2 64049502 1I CCAAAGGGTC -/A AAAAAAAAAA 2100 het 2100 ref 35 12 10 13 A 14 15 294766 CASAVA_Build 2 64050557 1I CAAAGGTTGC -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 6 7 294767 CASAVA_Build 2 64062833 1D ATTACTCTAT C/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 1 0 294768 CASAVA_Build 2 64068114 1I TCCAATTTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 8 9 294769 CASAVA_Build 2 64080170 1I TTATCCTTGT -/C CTTTGGGAAT 3070 hom 83 het 34 0 27 7 C 1 2 294770 CASAVA_Build 2 64087291 2I GACAGTCTCA --/CT CTGTCAGCAG 3070 hom 60 het 21 0 20 1 CT 1 2 294771 CASAVA_Build 2 64089052 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 34 1 23 10 A 14 13 294772 CASAVA_Build 2 64096401 1D ATTTGGATTT A/- AAAAAATAAG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 7 6 294773 CASAVA_Build 2 64170119 1I CTCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 10 17 T 11 12 294774 CASAVA_Build 2 64171289 4D TTTACTTTTT CTTG/---- CTTATTTCTA 3070 het 3070 ref 18 9 9 4 CTTG 1 0 294775 CASAVA_Build 2 64198137 1I ATATCTAAAT -/A AGAGCATATA 3070 het 3070 ref 44 23 20 1 A 1 2 294776 CASAVA_Build 2 64214471 1D ATGGTTTTAT G/- GGCATTATAG 3070 het 3070 hom 46 14 30 2 G 3 2 294777 CASAVA_Build 2 64227132 9I ATTTTAATTG ---------/CTTTTTCTT CTTTATTGTT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 CTTTTTCTT 0 1 294778 CASAVA_Build 2 64228179 1I ATACCAAGTG -/C TCTAATATTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 0 1 294779 CASAVA_Build 2 64229151 5I ACAAACAAAC -----/AAACA AAACACCCTG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 AAACA 1 2 294780 CASAVA_Build 2 64233310 17I TATATATGTA -----------------/ATATTTTCTCCTACCTG GACTAGCTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 ATATTTTCTCCTACCTG 0 1 294781 CASAVA_Build 2 64235058 1I ACCCCAAATA -/T TTTCTCAATA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 3 4 294782 CASAVA_Build 2 64265367 1I AGTGGAATTC -/T TTGTTCCTAC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 2 3 294783 CASAVA_Build 2 64268233 1I TGTTTCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 13 11 13 A 11 12 294784 CASAVA_Build 2 64269294 1I TCATAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 A 9 10 294785 CASAVA_Build 2 64270424 1I CCTTTAGACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 9 10 294786 CASAVA_Build 2 64294496 1I AAATTATTGC -/T AAAAGAATGG 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 T 0 1 294787 CASAVA_Build 2 64297185 2I ATTTGCCACC --/AT ATGTTGGGAG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 AT 1 2 294788 CASAVA_Build 2 64299357 1I CTACCATTTC -/A AAAAAAAAAA 1181 het 1181 ref 18 6 8 4 A 14 15 294789 CASAVA_Build 2 64300100 1D CTTCCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1366 hom 25 8 10 7 T 15 14 294790 CASAVA_Build 2 64300385 2I GCAGAGTAAC --/TG AGACATTTTC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TG 0 1 294791 CASAVA_Build 2 64307433 1I GTAAGATGTT -/G GCTCCCCCTT 3070 hom 105 het 38 0 32 6 G 1 2 294792 CASAVA_Build 2 64308483 1D AAAAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 11 9 T 13 12 294793 CASAVA_Build 2 64336970 3D TTCAGGCTCT TAG/--- TATTCAGTGA 3070 het 1653 hom 15 4 10 1 TAG 1 0 294794 CASAVA_Build 2 64342710 3D CTCAGTAGAC CTT/--- CTTTTCTAGT 3070 het 3070 ref 46 25 17 5 CTT 2 1 294795 CASAVA_Build 2 64355204 1D GAGCCTTATC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 8 7 294796 CASAVA_Build 2 64358462 1I12M2D TCTTTCTTTC -TCCTTTCTTTCTTC/TTCCTTTCTTTCT-- CTTTCTTTCT 1631 hom 14 het 9 0 4 6 N/A 0 0 294797 CASAVA_Build 2 64369884 1I AGGTGCTCTG -/A AAAAATCCCT 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 5 6 294798 CASAVA_Build 2 64371249 1I TGAAAACCCC -/A GTCTCTGCTA 3070 het 2191 hom 21 7 11 3 A 0 1 294799 CASAVA_Build 2 64374336 2D ATTTACTTTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 11 9 294800 CASAVA_Build 2 64382711 4I TTAAAAATGT ----/AAAC TATCTTGTAA 3070 hom 23 het 41 1 36 4 AAAC 0 1 294801 CASAVA_Build 2 64385573 1D TTTGAGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 12 11 294802 CASAVA_Build 2 64392657 1I GAAAATAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2174 hom 28 8 11 9 T 10 11 294803 CASAVA_Build 2 64403350 18D CAGGGTGTTT GCTCCAAACCCTCTTACA/------------------ GCTACAAACG 3070 het 3070 ref 33 23 13 4 GCTCCAAACCCTCTTACA 1 0 294804 CASAVA_Build 2 64430996 1D AAATGCGTAT G/- GGAGTGCATA 3070 het 3070 hom 55 23 24 8 G 3 2 294805 CASAVA_Build 2 64434273 5I AAACCTTACT -----/GAGGA GAGAGTGGCA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 GAGGA 0 1 294806 CASAVA_Build 2 64450904 1D AGGGCGTTCC A/- AAGCAGAGGG 3070 het 3070 hom 45 18 16 11 A 3 2 294807 CASAVA_Build 2 64451311 4I GAGGCCTAAA ----/AGAT AGGTGATTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AGAT 0 1 294808 CASAVA_Build 2 64452351 1I CACATTAATG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 51 21 19 11 A 7 8 294809 CASAVA_Build 2 64453834 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 7 8 294810 CASAVA_Build 2 64466575 1D TGCCTGTGCC T/- GTCATTTGGC 3070 het 3070 ref 37 21 10 8 T 1 0 294811 CASAVA_Build 2 64473227 1D GAAGCTATAC G/- GGGCACACTA 3070 het 3070 hom 43 19 19 6 G 4 3 294812 CASAVA_Build 2 64488612 1D ACCAACAGGC A/- AAGGTCTAGG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 3 2 294813 CASAVA_Build 2 64500858 1I ATGCAGTGTT -/C CTACTCACTG 3070 hom 141 het 54 0 48 6 C 1 2 294814 CASAVA_Build 2 64502365 3I ATGGTGCTCC ---/TTA TTAATTTCTT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 TTA 1 2 294815 CASAVA_Build 2 64506103 6D CACCCTCAGG TATGAT/------ TATGATTATG 3070 hom 70 het 28 0 23 5 TATGAT 5 4 294816 CASAVA_Build 2 64509752 1I TGTTCTGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 12 13 294817 CASAVA_Build 2 64515811 1D ATAAAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 32 1 27 4 T 12 11 294818 CASAVA_Build 2 64518110 1D TTGGATTGCT G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 65 het 27 0 19 8 G 9 8 294819 CASAVA_Build 2 64521045 1I AAGGGGTCAG -/T TGGGGAATGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 1 2 294820 CASAVA_Build 2 64543140 3I TCCTTAAGGC ---/CTT CTTCATTCAT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 CTT 1 2 294821 CASAVA_Build 2 64550647 15D AATATCTATT AAATGTTACATGTGA/--------------- AAATAATTTT 3070 het 3070 ref 47 25 22 4 AAATGTTACATGTGA 1 0 294822 CASAVA_Build 2 64571002 10D TGCTCACACA CTCTCTCTCT/---------- CTCTCTCTCT 3070 hom 123 het 52 0 42 11 CT 12 7 294823 CASAVA_Build 2 64580761 4I AGGAGGGAAC ----/AAGA GAGATGCCTG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AAGA 0 1 294824 CASAVA_Build 2 64648680 1I CTCTATCTCC -/A AAAAAAAAAA 1458 het 1458 ref 30 18 4 8 A 13 14 294825 CASAVA_Build 2 64654071 1I TGCTGGGTTT -/A AAAAAAAAAA 742 het 742 ref 34 26 3 5 A 15 16 294826 CASAVA_Build 2 64670583 5D ATACATATAT GGGGG/----- GGGGGGGGGG 2397 het 19 hom 18 0 7 13 G 16 11 294827 CASAVA_Build 2 64704987 5I TAGGTAAGTG -----/GTAGT GTAGTGCATC 3070 het 3070 ref 50 23 15 12 GTAGT 1 2 294828 CASAVA_Build 2 64707623 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1086 het 1086 ref 27 14 3 10 A 13 12 294829 CASAVA_Build 2 64713534 6D AAAAACTCAC TTCAAA/------ TTCAAAGCTC 3070 hom 87 het 32 0 29 6 TTCAAA 2 1 294830 CASAVA_Build 2 64715016 1D ATAAGGTGAT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 88 het 38 0 28 10 G 9 8 294831 CASAVA_Build 2 64719341 6D AAAAAATGGC TGTCAA/------ TGTCAATCAC 3070 hom 135 het 55 0 49 9 TGTCAA 2 1 294832 CASAVA_Build 2 64721113 2D CCTCAGAAGC CT/-- CTCTTTCCTC 3070 hom 46 het 24 0 13 11 CT 3 2 294833 CASAVA_Build 2 64723147 1D TTTAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 11 10 294834 CASAVA_Build 2 64723578 4I TTTTCTACTC ----/TGTT TGGAGAAAGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TGTT 0 1 294835 CASAVA_Build 2 64726031 1I GAAGAAGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 325 hom 24 1 21 2 A 9 10 294836 CASAVA_Build 2 64726583 1D CACTTGATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 79 het 34 0 27 7 A 9 8 294837 CASAVA_Build 2 64726790 1I AACAAACAAA -/C AAAAAACCCA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 0 1 294838 CASAVA_Build 2 64728314 1D TTTTGTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 35 1 26 9 A 15 14 294839 CASAVA_Build 2 64733485 5I CTGCTAAAGG -----/TAAGA TAACTTATAG 3070 hom 132 het 48 0 40 8 TAAGA 0 1 294840 CASAVA_Build 2 64755777 1I TGTAAAAAAA -/T AAACAAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 1 294841 CASAVA_Build 2 64756374 1I AGCCTAAGTT -/A ACTATAAACA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 1 2 294842 CASAVA_Build 2 64760257 1I GGTTTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 236 hom 38 3 28 7 T 11 12 294843 CASAVA_Build 2 64761182 3I TTCTCCTACC ---/CTT CTTCTGATGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CTT 1 2 294844 CASAVA_Build 2 64763301 2I GCCCTGCTAT --/AG AGTGATTCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AG 1 2 294845 CASAVA_Build 2 64769430 1I ATAGACATCT -/A AGTCAGTATA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 2 294846 CASAVA_Build 2 64783233 2I TCTCTCTCTC --/TA TATATATATA 3070 hom 27 het 29 1 18 10 TA 6 7 294847 CASAVA_Build 2 64801184 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 686 hom 33 2 18 13 A 13 14 294848 CASAVA_Build 2 64801957 5I GAAATATTAC -----/TTTTA TTAAATCTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTTTA 0 1 294849 CASAVA_Build 2 64806093 3D AACTCCGTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 25 0 15 11 A 18 15 294850 CASAVA_Build 2 64808919 4D GAGTAGCTTA CGTG/---- CGGCACGGCT 3070 hom 70 het 27 0 18 9 CGTG 1 0 294851 CASAVA_Build 2 64810132 1D CATTTGCTTT A/- ATGTATAGGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 1 294852 CASAVA_Build 2 64811486 2D TAACTGCTTG GT/-- GTGTGCACAA 3070 hom 140 het 51 0 46 5 GT 3 2 294853 CASAVA_Build 2 64812157 9D GAACACTGAA GAAGAGATG/--------- GAAGAGATGT 3070 hom 81 het 32 0 28 7 GAAGAGATG 2 1 294854 CASAVA_Build 2 64828840 2D ACAATAAATT TA/-- TCTTTACAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 TA 1 0 294855 CASAVA_Build 2 64833944 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 8 9 294856 CASAVA_Build 2 64838530 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAAAC 3070 hom 61 het 37 0 26 11 C 1 0 294857 CASAVA_Build 2 64844507 3D CTGAAAGGTT ATG/--- TCTGAGCTGA 3070 hom 120 het 42 0 39 5 ATG 1 0 294858 CASAVA_Build 2 64858565 8D GAGCTCTCTA TCTCTGTC/-------- TCTCTGTCTC 3070 hom 129 het 52 0 43 10 TCTCTGTC 3 2 294859 CASAVA_Build 2 64868342 8D GGACTTCTGG CCTCCAGA/-------- CCTCCAGAAC 3070 hom 106 het 41 0 35 8 CCTCCAGA 2 1 294860 CASAVA_Build 2 64886980 1I GGGCTTCCTG -/C CCTTGAGGGG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 C 2 3 294861 CASAVA_Build 2 64887905 7I TTCAAGCGAT -------/TCTCGTG TCTCAGGCTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TCTCGTG 0 1 294862 CASAVA_Build 2 64889329 4I TCTGGGTGTG ----/TGTC TGTCTGTGAG 3070 hom 141 het 54 0 47 7 TGTC 1 2 294863 CASAVA_Build 2 64898005 4I CTTCTTTTGT ----/CAAA CAGAGATAGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CAAA 0 1 294864 CASAVA_Build 2 64928830 1I GGCTGGGTCA -/G GGGAGGGACC 3070 hom 54 het 22 0 16 6 G 3 4 294865 CASAVA_Build 2 64935185 9I CAATGCTTTT ---------/TTTTTTTTC TTTTTTTTCT 2694 hom 18 het 7 0 7 0 TTTTTTTTC 1 2 294866 CASAVA_Build 2 64936634 17D ACTCCATCTC CAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 2452 hom 35 het 12 0 10 4 CAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 294867 CASAVA_Build 2 64945564 2I GACAGGGGAA --/TT TTTTTTTTTT 838 het 838 ref 14 4 5 5 T 14 16 294868 CASAVA_Build 2 64946950 1I CGCCCGCAGT -/G GGCCAGACCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 2 3 294869 CASAVA_Build 2 64955891 1D TGGCCTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 23 1 14 8 A 14 13 294870 CASAVA_Build 2 64960217 1I GGTTGTACTT -/G GGGGGCTACT 3070 het 2981 hom 30 10 12 8 G 5 6 294871 CASAVA_Build 2 64966690 3I TGCCTGGAAA ---/CAC CACATTTGGT 3070 het 3070 hom 54 23 25 7 CAC 1 2 294872 CASAVA_Build 2 64969576 3D TGGATCCATC CCT/--- CTTCTATCAC 3070 het 3070 hom 53 19 26 11 CCT 1 0 294873 CASAVA_Build 2 64970461 1D AACACGGGGG C/- CAATCTTTAA 3070 het 3070 ref 34 19 8 7 C 2 1 294874 CASAVA_Build 2 64982780 2D TTTCTTTTCC TT/-- TCTTTTTTCT 3070 hom 40 het 16 0 14 2 T 3 1 294875 CASAVA_Build 2 64982856 4I TCCCTCTCTC ----/TCTT TCTCTCTTCT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TCTT 0 1 294876 CASAVA_Build 2 64990500 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2742 het 2742 ref 20 9 7 4 A 9 10 294877 CASAVA_Build 2 65007592 1D TTTGCCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1935 hom 23 7 9 7 A 14 13 294878 CASAVA_Build 2 65008620 1D TGTTTTTTTA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 7 6 294879 CASAVA_Build 2 65011893 1I TTTATTTTAA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 7 8 294880 CASAVA_Build 2 65016380 3D GCTTAGAGTT ATC/--- ATATGATATA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 ATC 1 0 294881 CASAVA_Build 2 65027839 1I ATTCTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 10 11 294882 CASAVA_Build 2 65036954 1D GTAATTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1186 hom 17 4 10 3 T 13 12 294883 CASAVA_Build 2 65055339 2I CCCCCACCCC --/CT GTCTACTTCC 2163 het 2163 ref 28 10 6 12 CT 0 1 294884 CASAVA_Build 2 65061991 1I TTACCAGGTA -/T TTAACATCTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 2 3 294885 CASAVA_Build 2 65064221 4D CTTATTCCTC CTAT/---- CTAATTGAAA 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 CTAT 1 0 294886 CASAVA_Build 2 65069518 1I CGGGCCGCGC -/G GGGGCGAAAG 936 hom 12 het 6 0 5 1 G 4 5 294887 CASAVA_Build 2 65084568 1D TAACAGTGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 T 9 8 294888 CASAVA_Build 2 65087909 6D AGAGTGTGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 141 het 55 0 46 11 TG 9 6 294889 CASAVA_Build 2 65103207 13I3M5I GGACAGCTTT -------------CTC-----/GGAGAAAGGACTGCTCTGTGG CACAGAGTCC 3070 het 3070 ref 34 15 16 6 N/A 0 0 294890 CASAVA_Build 2 65117226 1I TTGAAAACCA -/T TTTTTTTTTT 2742 het 2742 ref 27 11 9 7 T 13 14 294891 CASAVA_Build 2 65157279 3D ATTTTGTCTT AAC/--- ACGGGGTTGC 3070 hom 87 het 30 0 30 2 AAC 1 0 294892 CASAVA_Build 2 65162078 3I TCTGCAGATA ---/AGC AGCTTCCTCT 3070 hom 110 het 41 0 35 6 AGC 1 2 294893 CASAVA_Build 2 65166720 2I ACGTCAACAC --/AG GGCTATTTTG 3070 hom 138 het 55 0 47 8 AG 0 1 294894 CASAVA_Build 2 65175223 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 14 1 10 3 A 15 14 294895 CASAVA_Build 2 65179171 1D CTAATTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 33 1 27 5 T 11 10 294896 CASAVA_Build 2 65181784 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 27 7 A 11 12 294897 CASAVA_Build 2 65190017 1I TGACTTAAGT -/G GAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 G 1 2 294898 CASAVA_Build 2 65195503 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 A 10 9 294899 CASAVA_Build 2 65200199 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 381 hom 30 1 22 7 A 9 8 294900 CASAVA_Build 2 65203732 2I AGAAGAGAAA --/AC ACACACACAT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 AC 4 5 294901 CASAVA_Build 2 65204539 1I AGACAACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 11 12 294902 CASAVA_Build 2 65207835 4D GTATTTACTT ATTA/---- ATTACTGTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ATTA 2 1 294903 CASAVA_Build 2 65219174 2D TAAAAAAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 54 het 20 0 18 6 AG 7 6 294904 CASAVA_Build 2 65222172 1D CTCAAAAAAA G/- AAAAAAAGAA 3070 hom 88 het 42 0 32 10 G 1 0 294905 CASAVA_Build 2 65224753 3D AGTCTCACTC TGT/--- TGTTGCCCAG 3070 hom 59 het 21 0 20 1 TGT 2 1 294906 CASAVA_Build 2 65226589 1I TTGCTGCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 29 1 21 7 A 11 12 294907 CASAVA_Build 2 65227255 1I AACTCAGCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 42 het 34 1 25 8 A 9 10 294908 CASAVA_Build 2 65233677 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 7 6 294909 CASAVA_Build 2 65252468 27D TTTAGGCTGG GCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA/--------------------------- GCACTTTGGG 3070 hom 44 het 18 0 14 7 GCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 1 0 294910 CASAVA_Build 2 65253015 2D GCAGACTTGA TC/-- TCTCCTGGGC 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TC 3 2 294911 CASAVA_Build 2 65254356 1D TGAGTTGCTG A/- AGTAAATTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 2 1 294912 CASAVA_Build 2 65256160 10D CTCCACCTCC TGGGTTCAAG/---------- TGATTCTCCT 1895 hom 20 het 10 0 6 7 TGGGTTCAAG 1 0 294913 CASAVA_Build 2 65287959 4D ATTTTTTTCT CTTA/---- CTTTTCTGAG 2308 het 2308 ref 23 15 5 3 CTTA 1 0 294914 CASAVA_Build 2 65288227 1D GGTAAGAATC T/- TTTTTTTTTA 756 het 756 ref 36 27 3 6 T 10 9 294915 CASAVA_Build 2 65288363 1D TCTAAATATC T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 41 21 17 5 T 8 7 294916 CASAVA_Build 2 65289491 4D CATGTCCAGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1865 hom 28 9 12 7 T 14 10 294917 CASAVA_Build 2 65303643 4I TTGCTCTCCC ----/TCTT TCTTTCTTTT 1760 hom 24 het 20 0 8 12 TCTT 2 3 294918 CASAVA_Build 2 65307822 3I GGGACTACTG ---/GAA GAAGGAGGCG 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 GAA 1 2 294919 CASAVA_Build 2 65310405 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAGAAAA 2458 het 308 hom 23 4 10 9 G 0 1 294920 CASAVA_Build 2 65315808 4D TGTGTGAGAG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 369 hom 47 7 23 18 GT 10 8 294921 CASAVA_Build 2 65326638 4I GTGCTATTTA ----/TAAG TTAGTTGGTG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 TAAG 0 1 294922 CASAVA_Build 2 65343964 4D TTCACAGATA CTCT/---- CTCTGTTTGC 2719 het 2719 ref 25 14 6 6 CT 4 2 294923 CASAVA_Build 2 65349078 1I CCAAATATTA -/C CGTTCTACTT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 C 1 2 294924 CASAVA_Build 2 65352128 1D TCCCAAAAGA T/- TTAAGGTGGC 3070 het 3070 ref 45 20 18 8 T 3 2 294925 CASAVA_Build 2 65354874 1I AATTTGGGCC -/T TAAATGAGGC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 T 1 2 294926 CASAVA_Build 2 65361040 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 633 hom 20 5 10 5 A 15 14 294927 CASAVA_Build 2 65361650 5D AGTCCGTCTC AAAAT/----- AAAATAAAAT 1817 het 1817 ref 17 11 5 1 AAAAT 4 3 294928 CASAVA_Build 2 65362392 2I GAGTTCTAAC --/AT GTGTAAGAAC 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 AT 0 1 294929 CASAVA_Build 2 65374434 1I TTTCAGGTCT -/G GGGGGGGGCC 2653 het 2594 hom 22 8 9 5 G 8 9 294930 CASAVA_Build 2 65383497 1I CCTGTTAACC -/A AAGAGAGGAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 2 3 294931 CASAVA_Build 2 65385179 1D AATTTCATGG A/- AAAAAAAAAA 592 het 592 ref 23 18 2 4 A 12 11 294932 CASAVA_Build 2 65411635 1I AATGAAACAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 8 9 294933 CASAVA_Build 2 65416371 2I16M4D AAATAACCCC --GTCTAGCACAGTTGATAGAG/CTGTCTAGCACAGTTGAT---- ATACTAGAAT 3070 het 3070 ref 38 24 17 3 N/A 0 0 294934 CASAVA_Build 2 65418374 1D TATGGATGTA T/- TAGATTTATT 3070 het 3070 hom 41 13 25 4 T 2 1 294935 CASAVA_Build 2 65420359 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAAT 286 het 286 ref 19 15 2 2 A 9 10 294936 CASAVA_Build 2 65435284 1D TATTTGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 11 10 294937 CASAVA_Build 2 65440062 1I ATTCAGAAAG -/A AACTCCAGGA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 2 3 294938 CASAVA_Build 2 65450294 14D5M30D CCTGACCACA GAGCAGCTTCAGGTCTAATTCTGGCTTAGAGGTAGGGAAACAGCAGAAG/--------------CTAGT------------------------------ CTGCTCTGTG 3070 hom 87 het 25 0 27 7 N/A 0 0 294939 CASAVA_Build 2 65450967 3I TGTGAACAAC ---/AAT GACAATGATT 3070 het 3070 hom 43 8 32 3 AAT 0 1 294940 CASAVA_Build 2 65461496 2I TTCAAGCCAC --/AT GATTATATCT 3070 hom 108 het 45 0 36 9 AT 0 1 294941 CASAVA_Build 2 65464735 3I TGCAGGATCT ---/GCA GCTCAGCTAG 3070 het 3070 ref 43 15 13 15 GCA 0 1 294942 CASAVA_Build 2 65467619 1I GGCTAAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1785 hom 27 4 14 9 T 15 16 294943 CASAVA_Build 2 65469882 1D ATGCTCAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 15 11 23 T 18 17 294944 CASAVA_Build 2 65470317 2I AAAACAATTA --/AC TAGAATTTCT 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 AC 0 1 294945 CASAVA_Build 2 65480652 1D CAACAAAGTA C/- CTGAGCTAGT 3070 het 3070 ref 31 14 10 9 C 2 1 294946 CASAVA_Build 2 65487914 3D GTCCCATGAC AGA/--- AGGATTCTGA 3070 het 3070 hom 25 8 9 8 AGA 1 0 294947 CASAVA_Build 2 65489894 1D ACAAGTGGCA C/- TGAGCACATG 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 C 1 0 294948 CASAVA_Build 2 65491397 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1746 het 594 hom 18 3 6 10 A 17 16 294949 CASAVA_Build 2 65496091 1D AAGTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 44 0 34 10 A 13 12 294950 CASAVA_Build 2 65504411 1D TCATTTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 46 0 28 18 T 14 13 294951 CASAVA_Build 2 65505406 1D CTGGGCAACG T/- TAAGAAGACC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 1 294952 CASAVA_Build 2 65521722 1I GTTTTTGTGC -/T TTTTTTTTTT 1390 het 1390 ref 26 14 5 7 T 10 11 294953 CASAVA_Build 2 65541521 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 T 12 11 294954 CASAVA_Build 2 65546336 1D TTTTTTTTTT A/- ATCTCTTAAA 2891 het 2891 ref 25 13 8 4 A 2 1 294955 CASAVA_Build 2 65550057 1D CCCCCCCCCC T/- CCCCGCTCTC 3070 hom 36 het 18 0 10 8 T 1 0 294956 CASAVA_Build 2 65570443 1D TAGTAGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 529 hom 30 5 17 8 A 16 15 294957 CASAVA_Build 2 65587221 1I AAAAGCCAAA -/T TAGCAGCTCT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 1 2 294958 CASAVA_Build 2 65618351 1I TTTCCCACTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 9 294959 CASAVA_Build 2 65623037 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 732 het 245 hom 8 2 4 2 A 14 15 294960 CASAVA_Build 2 65633853 3D AAAACAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 AAC 7 6 294961 CASAVA_Build 2 65635817 1I TGGTCAGTGG -/C ACCAGATGCC 3070 hom 129 het 50 0 41 10 C 0 1 294962 CASAVA_Build 2 65636555 1D TGTACGTGGT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 A 7 6 294963 CASAVA_Build 2 65644312 2D CAGAGTGAGG AA/-- AAAAAAAAAA 1226 het 30 hom 20 1 7 12 A 18 16 294964 CASAVA_Build 2 65645215 2I CCCTCCAGCT --/GG GGGGGGCACT 3070 het 2382 hom 23 8 9 6 G 6 8 294965 CASAVA_Build 2 65645563 1D ATGATCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 17 7 T 13 12 294966 CASAVA_Build 2 65648271 1D GTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1258 het 3 hom 5 0 4 1 A 12 11 294967 CASAVA_Build 2 65648722 1D TGGAGATAAG A/- AAGGTTTTCC 3070 het 3070 hom 41 18 18 6 A 3 2 294968 CASAVA_Build 2 65653834 2I ACATATATAT --/AC ATATTTGTAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AC 0 1 294969 CASAVA_Build 2 65654188 1I TAAAAAAAAA -/C CAAACAAAAA 3070 het 2250 hom 21 7 13 1 C 1 2 294970 CASAVA_Build 2 65660785 1D TCCTCCTTCT C/- CCCCTCCATC 2880 het 2880 ref 30 19 9 2 C 5 4 294971 CASAVA_Build 2 65782029 1I TTGATTTTTC -/T TTTATGCAGC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 3 4 294972 CASAVA_Build 2 65788271 1D TAAAGAACTA T/- TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 20 10 10 0 T 7 6 294973 CASAVA_Build 2 65801727 1I TGTGCACACA -/T TTTTTTTTAA 2842 het 2842 ref 18 9 7 2 T 8 9 294974 CASAVA_Build 2 65804702 1I GATAATGGAG -/C CCCATGATAA 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 C 3 4 294975 CASAVA_Build 2 65809217 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 A 10 11 294976 CASAVA_Build 2 65814471 5I GAATGCTGAT -----/TTGAG TTGTCTGCAG 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 TTGAG 0 1 294977 CASAVA_Build 2 65821732 1D17M1I TCTGGGGCAT GCAAATTGCTTAAGATTT-/-CAAATTGCTTAAGATTTG GGGGGGGGTC 1138 het 1138 ref 19 14 4 8 N/A 0 0 294978 CASAVA_Build 2 65824545 1D CCCTTCCCTC T/- GTTATTATTT 3070 het 3070 ref 40 14 14 13 T 1 0 294979 CASAVA_Build 2 65825294 3I GGTGGAAAGC ---/AGG AGAAGGGAGG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AGG 0 1 294980 CASAVA_Build 2 65828166 1D GACAGTCAGA G/- CCCAAGCAGT 3070 het 3070 hom 46 17 21 9 G 1 0 294981 CASAVA_Build 2 65875219 2I TTGACAGGAG --/AA GAGAGGATGT 3070 het 3070 hom 63 18 33 12 A 0 2 294982 CASAVA_Build 2 65919552 2D TTTCTCTGTA AC/-- ACAACAATTA 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 AC 2 1 294983 CASAVA_Build 2 65933921 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 8 9 294984 CASAVA_Build 2 65935297 2D ATGTCTTGTT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 11 21 4 A 10 8 294985 CASAVA_Build 2 65935978 2D AAATGCCAGC TT/-- TTTTTTTTTT 2030 het 1688 hom 19 6 7 8 T 12 10 294986 CASAVA_Build 2 65936161 1D CACTATGGCA T/- TTTTTTTTCC 2411 het 2411 ref 20 13 5 3 T 9 8 294987 CASAVA_Build 2 65937868 1I CAAATTATAC -/A AAAAAAAAAA 2737 het 1771 hom 27 8 9 10 A 12 13 294988 CASAVA_Build 2 65939261 1I TGATTTTCAG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 7 8 294989 CASAVA_Build 2 65941637 2D TATTTCCAAC TG/-- TGACTGTTGA 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 TG 2 1 294990 CASAVA_Build 2 65945713 1D CACCATAATG T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 8 7 294991 CASAVA_Build 2 65948523 1D TATGCACACA C/- TCACACACAT 3070 het 3070 hom 63 17 40 6 C 1 0 294992 CASAVA_Build 2 65955050 1D TTAGCTGGGG T/- TAGTTTACAG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 2 1 294993 CASAVA_Build 2 65955580 1I TGATAAAGCA -/T GCTATCTGAT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 0 1 294994 CASAVA_Build 2 65956882 1D GTTATTTCCT G/- GGCATGAATA 3070 het 3070 hom 48 23 22 4 G 3 2 294995 CASAVA_Build 2 65967887 1I ATGACAATCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 T 7 8 294996 CASAVA_Build 2 65970289 1I GCCTTTGTCA -/G GGCCATGTAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 G 2 3 294997 CASAVA_Build 2 65980359 1I CACTAGTAAC -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 6 7 294998 CASAVA_Build 2 65987306 1D GGTCAATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 T 11 10 294999 CASAVA_Build 2 65988921 1D TTATTAAATA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 7 6 295000 CASAVA_Build 2 66021472 1I TAATAACAGG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 T 8 9 295001 CASAVA_Build 2 66021816 1I TGTTAGAATG -/A CATTGACTTT 3070 het 3070 ref 63 25 27 11 A 0 1 295002 CASAVA_Build 2 66039102 15D GAGTACTCTC AGGATCAATACCTCT/--------------- AGGGGAGAAG 3070 het 3070 ref 38 21 15 11 AGGATCAATACCTCT 1 0 295003 CASAVA_Build 2 66041555 5I GAAAAGAAAT -----/AGAAG AGAAAATATT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 AGAAG 0 1 295004 CASAVA_Build 2 66056864 1D CATGAACTTA C/- AATCTGGTCT 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 C 1 0 295005 CASAVA_Build 2 66066673 1D37M1I ATGGTTTGGA TTTTTTACTCCTCCTGGAAGAATGTTTACTTTGGAAAG-/-TTTTTACTCCTCCTGGAAGAATGTTTACTTTGGAAAGA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 23 17 5 N/A 0 0 295006 CASAVA_Build 2 66067654 14D AAACAAAATG AACAAACAAAAACA/-------------- AACAAACAAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 8 AACAAACAAAAACA 1 0 295007 CASAVA_Build 2 66069151 13D TGAGGAAGGT ACTGTCACCTTTG/------------- ACTGAGAGGT 3070 het 3070 ref 51 31 19 8 ACTGTCACCTTTG 1 0 295008 CASAVA_Build 2 66078567 2I CGCCTTACCC --/TT TCCTCCGTCT 3070 het 3070 hom 54 21 25 8 T 1 3 295009 CASAVA_Build 2 66081726 1I CATTCTCAGG -/C CCCACCCAGA 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 C 3 4 295010 CASAVA_Build 2 66086713 1I GTCAAAGGGG -/A AACAGGTACT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 2 3 295011 CASAVA_Build 2 66092469 1D CCTCATTTGC A/- AAAAAGGGGA 3070 het 3070 ref 53 28 24 1 A 6 5 295012 CASAVA_Build 2 66092659 4D TATTATTCTT AATC/---- AGACATTGTT 3070 het 3070 ref 34 23 8 5 AATC 1 0 295013 CASAVA_Build 2 66093401 1D AATGATATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 10 9 295014 CASAVA_Build 2 66093734 1I TTGCCACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 A 10 11 295015 CASAVA_Build 2 66095634 1I TTTTGTGTGT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 G 8 9 295016 CASAVA_Build 2 66111651 2D ATTCAGTAGT AA/-- AATCAAGGCA 3070 het 3070 hom 61 27 26 9 A 4 2 295017 CASAVA_Build 2 66115884 1D TCTCAAAAAA G/- CAAATTAAAA 2114 het 2114 ref 17 10 5 2 G 1 0 295018 CASAVA_Build 2 66140874 2I TTTGCTCTTC --/AT ATACATTCAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 AT 1 2 295019 CASAVA_Build 2 66151582 3D TTAGGAAGAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1518 hom 24 7 9 10 T 17 14 295020 CASAVA_Build 2 66154787 4I CTTTCTTTCC ----/TTCT TTCTTTCTTT 1729 hom 32 het 14 0 10 4 TTCT 2 3 295021 CASAVA_Build 2 66157075 1I GTATCACAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 9 10 295022 CASAVA_Build 2 66160457 6I GACTGTTTTC ------/TATTCT TATTCTTATT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TATTCT 1 2 295023 CASAVA_Build 2 66160625 2D AAATGCACAC AG/-- AGACTGTGGT 3070 hom 90 het 35 0 30 7 AG 2 1 295024 CASAVA_Build 2 66178516 1D GGGAAGTCTG T/- TAGCAACTCA 3070 het 3070 ref 56 24 25 7 T 2 1 295025 CASAVA_Build 2 66185651 1I GCCTGAGTGC -/T TTTAAGTAGA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 3 4 295026 CASAVA_Build 2 66187022 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 11 12 295027 CASAVA_Build 2 66191894 1I CACCCCGGCA -/G GGCAGAGCCA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 G 2 3 295028 CASAVA_Build 2 66203533 1I AAATGGCTTG -/C CTAATAGGCT 3070 hom 138 het 54 0 47 7 C 1 2 295029 CASAVA_Build 2 66205116 1D GCATGGTGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 9 8 295030 CASAVA_Build 2 66214668 1I CATAGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 33 1 26 6 A 11 12 295031 CASAVA_Build 2 66218743 1I TGCCATGTGG -/C CCTGTTGGGG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 2 3 295032 CASAVA_Build 2 66234452 1I TTATTTAGTA -/G TAACATTTGG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 G 0 1 295033 CASAVA_Build 2 66237115 2D TAAAGGAAAC AT/-- GTGTAAAATA 3070 het 3070 hom 47 19 20 10 AT 1 0 295034 CASAVA_Build 2 66239680 2D ATGAGAGAGC GA/-- GAGAGAGAGA 1691 het 1691 ref 58 42 6 10 GA 7 6 295035 CASAVA_Build 2 66240471 1D TGAGGGTTGA G/- GAAATGGGTT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 G 2 1 295036 CASAVA_Build 2 66251190 1D CCAGCACTTT G/- GGAGGCCAAG 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 G 3 2 295037 CASAVA_Build 2 66251441 1I AAAAAAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 25 2 18 5 C 0 1 295038 CASAVA_Build 2 66263826 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 13 12 295039 CASAVA_Build 2 66268286 2I TGGCTGTGTA --/GT ATACCATGGT 3070 het 3070 ref 43 30 11 3 GT 0 1 295040 CASAVA_Build 2 66271479 1D CAAATTTCGG C/- TGGGCACGGT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 C 1 0 295041 CASAVA_Build 2 66273892 1D TGCAGGTCAC A/- AAACATTTCA 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 A 4 3 295042 CASAVA_Build 2 66279591 1D ATCTTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 16 20 15 T 12 11 295043 CASAVA_Build 2 66281135 18D74M1I AGAGTAGATG CTATTATTGCATAAGATACATGTCTTAGGATGTGTTTATAGATGACCCGTGTGCATCCTGATGCTTTGGACAGGGGTAGCCTGAGAATGCAC-/------------------CATGTCTTAGGATGTGTTTATAGATGACCCATGTGCATCCTGATGCTTTGGACAGGGGTAGCCTGAGAATGCACA AAGGAAATCA 3070 het 3070 ref 34 39 10 13 N/A 0 0 295044 CASAVA_Build 2 66282485 13D TTCAAGCATC CTGCCTCAGCATT/------------- CTGCCTCAGC 2081 het 2081 ref 20 13 6 2 CTGCCTCAGCATT 1 0 295045 CASAVA_Build 2 66282788 4I ATATCTTGTT ----/AATC AATCCTATAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 AATC 1 2 295046 CASAVA_Build 2 66300469 1I CAGTTTGACC -/A AAAAAAAAAA 1755 het 1755 ref 21 8 6 7 A 12 13 295047 CASAVA_Build 2 66304402 1D TTTCAATAAT A/- ACTGTACATT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 2 1 295048 CASAVA_Build 2 66309350 1D TACCCTTTTA T/- TTCTGCTTAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 3 2 295049 CASAVA_Build 2 66339683 1I CGCTGACTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 T 7 8 295050 CASAVA_Build 2 66366610 1I TTAAATACCT -/A ACCACATGCC 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 A 1 2 295051 CASAVA_Build 2 66377775 1I TTGGCTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 17 16 19 T 12 13 295052 CASAVA_Build 2 66386516 1D ACGTGTGATG A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 49 22 20 8 A 8 7 295053 CASAVA_Build 2 66392715 1D GAAAGCTTGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 101 het 36 0 34 2 A 10 9 295054 CASAVA_Build 2 66445688 1D AGACCCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 125 het 46 0 40 6 T 13 12 295055 CASAVA_Build 2 66507803 1D AATCGCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2399 hom 27 8 12 7 A 11 10 295056 CASAVA_Build 2 66509332 1I TCCTAAAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 8 9 295057 CASAVA_Build 2 66512250 2D GAAAGACTGT GG/-- GGGGGGGGAG 3070 het 2666 hom 31 11 8 12 G 10 8 295058 CASAVA_Build 2 66557538 1I GCATGTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 A 10 11 295059 CASAVA_Build 2 66558496 1I TAGAGTCTTC -/A AGATTACCTG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 1 2 295060 CASAVA_Build 2 66560561 1D TGGCTCAATG C/- CACTGACTTC 3070 het 3070 ref 47 23 20 5 C 2 1 295061 CASAVA_Build 2 66562642 7D AGGTGCACAC CACCACA/------- CACCACACCC 3070 het 1955 hom 19 6 10 9 CACCACA 2 1 295062 CASAVA_Build 2 66578666 2I AAAAAAATGG --/TA TATGCCATGT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 TA 1 2 295063 CASAVA_Build 2 66584308 3I CATCAATAGG ---/CTT TTGTTAAATG 3070 hom 48 het 22 0 18 4 CTT 0 1 295064 CASAVA_Build 2 66592466 17D CGGTAGGAGT TACACTTAACCTGTCTC/----------------- AGCTATACAT 3070 het 3070 ref 43 26 22 3 TACACTTAACCTGTCTC 1 0 295065 CASAVA_Build 2 66611352 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1722 hom 23 8 9 7 A 12 11 295066 CASAVA_Build 2 66613033 1D TGAACATGTA T/- CCTTTCAGAG 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 1 0 295067 CASAVA_Build 2 66615196 1D TTTTAAAATG T/- TTTCCTTTAG 2592 het 2592 ref 31 16 7 8 T 4 3 295068 CASAVA_Build 2 66615978 4I AATGTAAAGC ----/TATA TATATACAAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 TA 3 5 295069 CASAVA_Build 2 66616420 1D AGTTTTTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 295070 CASAVA_Build 2 66623111 1D ATAAGGCTTA T/- ATTGGACAGT 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 T 1 0 295071 CASAVA_Build 2 66647240 1I CGTATATTAA -/C TACTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 C 0 1 295072 CASAVA_Build 2 66648428 1I ATTAATGTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 8 9 295073 CASAVA_Build 2 66660297 8D GGCTGCGGGG GGGGGGGC/-------- GGGGGGCGGC 3070 hom 55 het 28 0 18 11 GGGGGGGC 1 0 295074 CASAVA_Build 2 66661245 5D AGCCCACTGT TAAAA/----- TAATGAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 4 TAAAA 1 0 295075 CASAVA_Build 2 66675860 20D CGCCCAGCTA TTATTTTATTTTATTTTATT/-------------------- TTATTTTATT 2329 het 88 hom 13 2 5 7 TTATT 8 4 295076 CASAVA_Build 2 66679967 2D ACTCATGTCA GG/-- GGGGGTTTGC 3070 hom 112 het 46 0 37 9 G 7 5 295077 CASAVA_Build 2 66706662 1I ATGGGGTATG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 8 9 295078 CASAVA_Build 2 66729404 1D CTTAATGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 18 7 T 13 12 295079 CASAVA_Build 2 66743966 2D TTCTTTCTTC TG/-- TGTGTCAACA 3070 het 3070 hom 56 24 25 9 TG 3 2 295080 CASAVA_Build 2 66745747 1I GTGCAGGTAG -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 ref 48 24 23 1 A 6 7 295081 CASAVA_Build 2 66758489 1D CACACAGTCA G/- GAAAAAGAAG 3070 het 3070 ref 41 19 16 8 G 2 1 295082 CASAVA_Build 2 66760931 4D TATACATAGT TAGA/---- TAGTCTGGCA 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 TAGA 1 0 295083 CASAVA_Build 2 66761074 1I AGGGAAGCCA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 T 5 6 295084 CASAVA_Build 2 66764848 1D AATAAAATCA T/- TAAATTGGAT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 2 1 295085 CASAVA_Build 2 66781388 1D CACACCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 35 0 26 9 A 13 12 295086 CASAVA_Build 2 66785048 1D TGCGCCTTGA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 T 8 7 295087 CASAVA_Build 2 66785519 1I CAAAAGACAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 110 het 46 0 39 7 T 9 10 295088 CASAVA_Build 2 66788337 1I TTAGCCATGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 414 hom 33 1 30 2 A 9 10 295089 CASAVA_Build 2 66795277 2D ATATACACAC AT/-- ATATATATGG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 AT 5 4 295090 CASAVA_Build 2 66806378 2I TGTGTGTGTG --/TT TGTGTGTGTG 2160 het 94 hom 26 3 11 12 T 1 3 295091 CASAVA_Build 2 66807785 1D TTTTGGAAGA G/- GTAGGGGTCT 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 G 2 1 295092 CASAVA_Build 2 66811306 1I TCAAGCAAAA -/C CCAACTTGGC 3070 hom 150 het 54 0 49 5 C 2 3 295093 CASAVA_Build 2 66812657 1I CCTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 1211 het 1211 ref 31 19 3 9 T 10 11 295094 CASAVA_Build 2 66819537 1D GGTGATATTA T/- AACATCTATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 0 295095 CASAVA_Build 2 66868402 1I CCAGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 11 12 295096 CASAVA_Build 2 66874675 2D TGTGTGTATC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 18 14 10 TG 8 7 295097 CASAVA_Build 2 66901834 3I GTCACCTGGG ---/CAA CAACCTCTGG 3070 hom 117 het 48 0 39 9 CAA 1 2 295098 CASAVA_Build 2 66903337 1D ATGCGATGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 10 9 295099 CASAVA_Build 2 66943180 1I ATTTGCTGAG -/A GCCTCACATC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 0 1 295100 CASAVA_Build 2 66956234 15I TACAACCAAT ---------------/CTTCTCATTGGATAG TTTAGGACAT 3070 hom 105 het 36 0 36 2 CTTCTCATTGGATAG 0 1 295101 CASAVA_Build 2 66969857 3D TCCTCTGCAA CCC/--- CCCCCCCCCA 3070 hom 36 het 20 0 16 4 C 12 9 295102 CASAVA_Build 2 66978792 1D ACATTAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 35 2 21 12 T 14 13 295103 CASAVA_Build 2 66994068 6D CTTAACATTT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 52 18 20 16 TC 10 7 295104 CASAVA_Build 2 67008225 1D TGTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 10 9 295105 CASAVA_Build 2 67025457 1I AGGCCCCTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 13 het 35 1 31 3 A 9 10 295106 CASAVA_Build 2 67055357 2I TCCATTGGTC --/TA TGTGTCTGTT 3070 hom 64 het 23 0 19 4 TA 0 1 295107 CASAVA_Build 2 67059866 1D CTGTCGGGGC G/- GGGGGGGGGT 1485 het 27 hom 14 0 6 8 G 10 9 295108 CASAVA_Build 2 67082157 9I TTTAATTTAT ---------/AAAATTAAG AAAATTAAGT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 AAAATTAAG 1 2 295109 CASAVA_Build 2 67087873 1D CATTATGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 29 2 16 11 A 17 16 295110 CASAVA_Build 2 67087948 3D CTACTTGGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2423 het 125 hom 42 2 9 32 A 17 14 295111 CASAVA_Build 2 67094049 8I CACACATATA --------/TATGTGTG TATGTGTGTA 3070 hom 88 het 36 0 30 6 TATGTGTG 1 2 295112 CASAVA_Build 2 67096391 1I TACATTCCTG -/T CTGAAGAACT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 0 1 295113 CASAVA_Build 2 67101230 1I CAGCAAATTG -/A AAAAAAAAAA 1142 het 1142 ref 55 43 3 9 A 10 11 295114 CASAVA_Build 2 67115632 1D GGTTTGGGGG T/- TAGGAGGGCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 2 1 295115 CASAVA_Build 2 67117563 2I TTTGAAATAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 33 0 23 10 T 12 14 295116 CASAVA_Build 2 67132267 4I GAAAACTTGA ----/ATTT ATTACAGTTA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 ATTT 0 1 295117 CASAVA_Build 2 67132379 1I CTCCCTTCCT -/C CCCTTTCTTC 2406 hom 18 het 10 0 7 3 C 3 4 295118 CASAVA_Build 2 67139456 1I ATTTATTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 13 14 295119 CASAVA_Build 2 67152283 1D GAGACAGCAC T/- TTGGCAAACC 3070 hom 147 het 55 0 48 8 T 3 2 295120 CASAVA_Build 2 67159058 4D GATACTCAAC TATT/---- TATTTAATTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TATT 2 1 295121 CASAVA_Build 2 67190781 1I CTGAAGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 T 10 11 295122 CASAVA_Build 2 67194954 1I AGCAGAGAAG -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 112 het 51 0 38 13 A 6 7 295123 CASAVA_Build 2 67196653 1D TCAAACAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 9 8 295124 CASAVA_Build 2 67199723 1I AGAATTTGGG -/A GAAAAAAAAG 3070 het 493 hom 55 2 46 7 A 0 1 295125 CASAVA_Build 2 67200482 2D ACCTAAAATA AC/-- AGTTTTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 AC 1 0 295126 CASAVA_Build 2 67200595 1I CTGTTTTTTT -/C CTGTAATGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 2 295127 CASAVA_Build 2 67201329 2I TTTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 4 T 10 12 295128 CASAVA_Build 2 67203091 4I AGCTTGGAAA ----/CTCT CTCAAGGCAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CT 1 3 295129 CASAVA_Build 2 67203947 4I AAACTTTAAA ----/TAAC AAAATTAGAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TAAC 0 1 295130 CASAVA_Build 2 67204114 6I AAATGTTACT ------/TTAGAG TTAAACAGAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTAGAG 0 1 295131 CASAVA_Build 2 67204235 1D CTGAGTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 52 1 35 16 T 12 11 295132 CASAVA_Build 2 67208193 2D GTAAAAAGAC AG/-- ATACTGCAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 AG 1 0 295133 CASAVA_Build 2 67213547 1I TACTTTACCC -/A ACTTTTTGAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 1 2 295134 CASAVA_Build 2 67224438 1I TTTCTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 32 1 23 8 A 14 15 295135 CASAVA_Build 2 67229554 1D CAGAGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 11 10 295136 CASAVA_Build 2 67234116 1I ACTATATGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 A 9 10 295137 CASAVA_Build 2 67238683 1D AGTTCAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 420 hom 41 1 31 9 A 10 9 295138 CASAVA_Build 2 67251353 6D CATATTTTAT AATAAA/------ AATAACATTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AATAAA 1 0 295139 CASAVA_Build 2 67254323 4D ATGAATACCC TAAA/---- TAAATAGCAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TAAA 2 1 295140 CASAVA_Build 2 67257032 5D TTTTTTTTAA TTAAT/----- TTATTTTTTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TTAAT 1 0 295141 CASAVA_Build 2 67260622 2I AAAGAAGAGA --/CT CTGTTCATTA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 CT 1 2 295142 CASAVA_Build 2 67262803 5I45M1I CCTTTAATAT -----TTATCACTAATGTATTAGAATAAAACACAGTTGTTACTGAAGAGG-/TTATGTTATCACTAATGTATTAGAATAAAACACAGTTGTTACTGAAGAGGT TTTTTTTTCA 3070 hom 138 het 35 0 46 4 N/A 0 0 295143 CASAVA_Build 2 67264293 18D TTCCTCTTCC AACTACATGTCTATGTGA/------------------ AGCTGGATTT 3070 hom 75 het 26 0 26 4 AACTACATGTCTATGTGA 1 0 295144 CASAVA_Build 2 67264624 4I TCAATAATTT ----/TAAG TAAGTGTAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TAAG 1 2 295145 CASAVA_Build 2 67268575 1D AAGGTGTAGC A/- AAAAAAAAAA 890 het 890 ref 23 18 3 4 A 13 12 295146 CASAVA_Build 2 67270197 2D7M3D41M7I AACAACAACA ACAACAAACAAAAAAAAAACCTATTCTTCATCTATTCAGGTCTCTTGCCCATT-------/--AACAAAC---AAAAAAACCTATTCTTCATCTATTCAGCTCTCTTGCCCATTTCCTGGA TCCTGGATTC 3070 hom 69 het 20 0 22 13 N/A 0 0 295147 CASAVA_Build 2 67275151 3D TTTCTTTTTA TTC/--- TTTTTTCTCC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTC 1 0 295148 CASAVA_Build 2 67281802 21I AGAGAATCCC ---------------------/TCAAAATCCTCTCCCCAAACA TCAAAATCCC 3070 hom 123 het 49 0 42 9 TCAAAATCCTCTCCCCAAACA 0 1 295149 CASAVA_Build 2 67281872 31D CAATTGGTTG GTATCAATATACCAACCAATACAATTGGTCT/------------------------------- GTATCAATAT 3070 hom 74 het 34 0 25 17 GTATCAATATACCAACCAATACAATTGGTCT 2 1 295150 CASAVA_Build 2 67284002 2D AGTTCCACTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 AT 8 7 295151 CASAVA_Build 2 67284329 4I GCTTTATCGG ----/CAAT CAATCACCAA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 CAAT 1 2 295152 CASAVA_Build 2 67284713 4D GAAACTGTTA AAAT/---- AAATAAATCG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 AAAT 3 2 295153 CASAVA_Build 2 67289659 1D GAAGGATCTA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 8 7 295154 CASAVA_Build 2 67300857 1D GCAATGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 21 26 7 T 11 10 295155 CASAVA_Build 2 67305135 3D TAATGGTAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 203 hom 34 4 17 13 A 19 16 295156 CASAVA_Build 2 67322632 1D CAGTTTTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 9 295157 CASAVA_Build 2 67322992 1D TCCTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 22 4 A 11 10 295158 CASAVA_Build 2 67331573 2D ATCAGGTGGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AT 9 8 295159 CASAVA_Build 2 67335322 7D CCCAATAGCT AGAATAC/------- ACAGGGCCAT 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 AGAATAC 1 0 295160 CASAVA_Build 2 67338247 1I TTTCAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 10 11 295161 CASAVA_Build 2 67338986 2D AGAAATAGAT CA/-- CGTCTATTGT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 CA 1 0 295162 CASAVA_Build 2 67339162 1I CTCTTTACAG -/A AAAAGTTTGT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 4 5 295163 CASAVA_Build 2 67349207 1D TCTTAGCCAG C/- CCCCATACAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 5 4 295164 CASAVA_Build 2 67362750 3D TGGGGGGGGG GGT/--- GGGTTCTTTT 3070 het 478 hom 23 3 15 6 GGT 1 0 295165 CASAVA_Build 2 67372160 3D TACCTATTAC ATA/--- ATTACATATA 3070 het 454 hom 10 1 8 2 ATA 1 0 295166 CASAVA_Build 2 67377868 6D TCCCAACTCC AATTCT/------ ATTTCTCTAG 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 AATTCT 1 0 295167 CASAVA_Build 2 67408228 5D GCTGGGATTT TTTTC/----- TTTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 18 7 TTTTC 2 1 295168 CASAVA_Build 2 67421322 5I TTCCCAAGGG -----/GTGAT GTGATGTTTC 3070 het 3070 ref 49 25 15 9 GTGAT 1 2 295169 CASAVA_Build 2 67424599 5I TCCACCAATT -----/AAAGA AAACATACTT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 AAAGA 0 1 295170 CASAVA_Build 2 67445211 1D TTCTTTTTCC A/- TTTGCATCCA 3070 het 3070 ref 42 19 17 7 A 1 0 295171 CASAVA_Build 2 67456318 1D ATCTAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 11 12 A 12 11 295172 CASAVA_Build 2 67458720 1I ACCCCATTCC -/A AAAAAAAAAA 2286 het 2286 ref 26 15 7 4 A 10 11 295173 CASAVA_Build 2 67459366 4D ATAACCCTTT ACTA/---- ACTAATTTCT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 ACTA 2 1 295174 CASAVA_Build 2 67464075 1D ATAGGAACAC T/- TTTACACTGT 3070 het 1303 hom 22 3 17 2 T 4 3 295175 CASAVA_Build 2 67470286 1D GTTTTATGTT A/- AAATTATGGT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 A 4 3 295176 CASAVA_Build 2 67472093 2D TACTACCCTT AG/-- AGAGTGTGGC 3070 het 3070 ref 47 21 22 5 AG 3 2 295177 CASAVA_Build 2 67476315 2I TCAAATGCGT --/TC TCTGTCATGA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 TC 1 2 295178 CASAVA_Build 2 67476621 8I TAATTACCAT --------/AACTTTAC ATAAGTCTTG 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 AACTTTAC 0 1 295179 CASAVA_Build 2 67478856 1I TTTAGGTGTT -/A ACTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 1 2 295180 CASAVA_Build 2 67480550 3D TTAACAACAT ACG/--- ACATCATTTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 7 ACG 1 0 295181 CASAVA_Build 2 67489528 1D CTTTGAGACT A/- AAAGTATTAG 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 A 4 3 295182 CASAVA_Build 2 67510767 1D AAAAATACGT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 20 5 13 2 G 1 0 295183 CASAVA_Build 2 67512069 4D TTGATTATCT TATC/---- TATCTTTCAT 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 TATC 2 1 295184 CASAVA_Build 2 67515721 1D TTTACTCCAT C/- CTTTTCAGGA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 C 2 1 295185 CASAVA_Build 2 67533486 1D TGCTCGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2757 hom 30 7 19 5 T 11 10 295186 CASAVA_Build 2 67537281 1D TTAGTTGCCA G/- GGTATTTGGC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 3 2 295187 CASAVA_Build 2 67537465 1D CCTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 A 10 9 295188 CASAVA_Build 2 67540055 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 2520 hom 22 7 10 5 T 8 7 295189 CASAVA_Build 2 67544483 1D AGATTGGTGA T/- TTTTTTTTTT 2086 het 2086 ref 42 30 5 7 T 13 12 295190 CASAVA_Build 2 67549286 2D TTTGCAACAC TG/-- TGTATTTTGT 3070 het 3070 ref 49 23 21 7 TG 2 1 295191 CASAVA_Build 2 67552760 1D TACATGGTAC A/- AAAAGGTAGG 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 A 5 4 295192 CASAVA_Build 2 67557890 1D TGAATAATCA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 1294 hom 25 5 12 9 C 10 9 295193 CASAVA_Build 2 67558317 4D ATTTTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 TTTC 1 0 295194 CASAVA_Build 2 67561403 1D ACAAGAGAAA T/- CCTGATTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 1 0 295195 CASAVA_Build 2 67563583 1D AAAAAAAAAA G/- CCATGTCCAT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 G 1 0 295196 CASAVA_Build 2 67572303 4D TATATAACTT ATAA/---- ATAAATAAAT 2632 het 2632 ref 20 6 7 10 ATAA 5 4 295197 CASAVA_Build 2 67574644 1I TTCTATTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 9 10 295198 CASAVA_Build 2 67595157 1D ACTTTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2662 het 368 hom 31 3 12 17 A 17 16 295199 CASAVA_Build 2 67599082 1D GAGGCCTAAA G/- GTCCTTTCCT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 G 2 1 295200 CASAVA_Build 2 67599604 1I GAGAAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1981 hom 41 6 22 13 A 11 12 295201 CASAVA_Build 2 67602246 2D CCAAACAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 12 10 295202 CASAVA_Build 2 67602755 5D GTTCCAACTT AAGAA/----- AAGAAGGGGG 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 AAGAA 2 1 295203 CASAVA_Build 2 67602953 1I ATGCAAAGGA -/G GGAGGAATCT 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 G 2 3 295204 CASAVA_Build 2 67604259 2D GAGATAAGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 14 10 19 A 16 14 295205 CASAVA_Build 2 67605742 1I GATCCAATAG -/C TAGTATGGTA 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 C 0 1 295206 CASAVA_Build 2 67607557 1I AGAACCAAAT -/A AATAGAAAGA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 A 2 3 295207 CASAVA_Build 2 67608331 7D AGCAAATGGG CCAAATA/------- CCTTAACAGA 3070 het 3070 ref 32 17 15 4 CCAAATA 1 0 295208 CASAVA_Build 2 67622282 1D ATTTCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 12 7 T 11 10 295209 CASAVA_Build 2 67644648 1I CAACTATCCA -/G GGGCAAAGTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 3 4 295210 CASAVA_Build 2 67659004 2D ATAGAACTAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 AC 10 9 295211 CASAVA_Build 2 67666601 4D AGGAATCAAA CTAT/---- CTATCTCTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 6 CTAT 2 1 295212 CASAVA_Build 2 67672749 1I CAGGAGCTGG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 465 hom 14 1 11 2 T 7 8 295213 CASAVA_Build 2 67677337 5D TTTATTGCTA ATATT/----- ATGTTTGTGC 3070 het 3070 ref 39 19 17 9 ATATT 1 0 295214 CASAVA_Build 2 67679184 6D ACTTATATTT TTGTTC/------ TTATCATTTC 3070 het 3070 hom 35 9 20 6 TTGTTC 1 0 295215 CASAVA_Build 2 67681517 1I18M2I TGACATATGT -AAAAAAAATCCAGAATTT--/AAAAAAAAATCCAGAATTTAA AAAAAAAAAA 3070 het 1003 hom 34 5 23 9 N/A 0 0 295216 CASAVA_Build 2 67689227 1D AAAAGAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1249 hom 32 4 10 19 T 14 13 295217 CASAVA_Build 2 67699047 2D TACCAAACTC TT/-- TAGAAAACCA 3070 het 3070 hom 49 23 22 5 T 3 1 295218 CASAVA_Build 2 67700214 4D30M1D CTAATAAGAT TAACTATATTGATACAAATTTAATAATCCAGATCA/----TATATTGATACAAGTTTAATAATCCAGATC- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 49 35 23 6 N/A 0 0 295219 CASAVA_Build 2 67701467 1I AGAATATTCC -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 6 7 295220 CASAVA_Build 2 67703455 4D CCTAGGAAAT AGTC/---- AGAAATGCAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 AGTC 1 0 295221 CASAVA_Build 2 67710070 15I TCTGGCTGCG ---------------/ATGATGATGATGATA ATGATGATGA 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 ATGATGATGATGATA 1 2 295222 CASAVA_Build 2 67720885 1D AGGAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 27 0 21 8 A 11 10 295223 CASAVA_Build 2 67724078 1D GGCTGGATTT G/- GGAGAGGGAT 3070 het 3070 ref 44 22 21 1 G 3 2 295224 CASAVA_Build 2 67730105 10I GAGAAATACT ----------/CTGGGTGAAA AGTTTTTCAC 3070 hom 151 het 55 0 51 4 CTGGGTGAAA 0 1 295225 CASAVA_Build 2 67732688 1I TTCCCCTGGG -/A AAAAAAATCC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 7 8 295226 CASAVA_Build 2 67736531 1I AGAAGAGAGT -/G GGGGGCCAAT 2252 hom 18 het 7 0 7 0 G 5 6 295227 CASAVA_Build 2 67737368 5I AAAAAAAAAA -----/ACAAC AAAAAAAAAA 3070 het 1047 hom 29 8 12 9 ACAAC 0 1 295228 CASAVA_Build 2 67737677 2D TTTGGTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 1633 het 1518 hom 40 10 4 27 A 13 11 295229 CASAVA_Build 2 67748611 2I CATCCAAGAC --/TA TGTTAATCCA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 TA 0 1 295230 CASAVA_Build 2 67751185 1D CCAGAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1691 hom 29 8 13 8 A 15 14 295231 CASAVA_Build 2 67752779 1D ACACACAGCA C/- ATACACACAC 3070 hom 207 het 86 1 77 8 C 1 0 295232 CASAVA_Build 2 67762641 1D ACAATGGTCC T/- TTCCCCCCGT 3070 hom 159 het 57 0 52 5 T 3 2 295233 CASAVA_Build 2 67762780 1I AAATAGTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 9 10 295234 CASAVA_Build 2 67765287 1D AGGGAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 12 11 295235 CASAVA_Build 2 67767965 1D TACACACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 28 4 A 11 10 295236 CASAVA_Build 2 67769307 4D CTGATCGGCC ACTT/---- ACTTAATCAT 3070 hom 132 het 48 0 44 5 ACTT 2 1 295237 CASAVA_Build 2 67772162 3D CCCCTGTCTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 TTA 6 5 295238 CASAVA_Build 2 67772825 2I TAATGGGTAT --/AG AGTCTCAGTT 3070 hom 148 het 52 0 50 2 AG 1 2 295239 CASAVA_Build 2 67774628 6D TTTCAAGTTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 2298 het 2298 ref 30 13 6 14 TG 11 8 295240 CASAVA_Build 2 67774883 1D TCCACCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 732 hom 39 7 14 18 A 13 12 295241 CASAVA_Build 2 67782558 1I AAGAAGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 22 20 12 T 10 11 295242 CASAVA_Build 2 67785550 4D GCAAATTCAT AGTC/---- AGATTGAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 AGTC 1 0 295243 CASAVA_Build 2 67793005 20D TGTATGTGTC CGTGCACATGCATGCACACG/-------------------- CGTGCACATG 2954 het 2954 ref 37 22 8 12 CGTGCACATGCATGCACACG 2 1 295244 CASAVA_Build 2 67799091 1D CAGATAACTT C/- CCCCAAAGAG 3070 het 3070 hom 55 17 31 7 C 5 4 295245 CASAVA_Build 2 67799751 3I CATTCCTCTT ---/AAG AAGATGCAAA 3070 hom 114 het 45 0 36 9 AAG 1 2 295246 CASAVA_Build 2 67807448 1I AAAGCAATAA -/T AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 0 1 295247 CASAVA_Build 2 67808244 1D GAAGGGGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 7 het 17 1 13 3 T 9 8 295248 CASAVA_Build 2 67812189 4I TGCTGAGCAT ----/ATTA ATTACTTATT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 ATTA 1 2 295249 CASAVA_Build 2 67813043 5D TCATTTAGTC TCTAG/----- TCTAGTGTTT 3070 het 3070 hom 41 14 23 6 TCTAG 2 1 295250 CASAVA_Build 2 67815867 1D GAGCATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1252 hom 47 7 13 27 A 19 18 295251 CASAVA_Build 2 67817357 2D GGCTGAAAAC TA/-- TGTTCAAACA 3070 het 3070 hom 53 21 22 10 TA 1 0 295252 CASAVA_Build 2 67830061 3D ACTTTGTGTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 36 1 22 15 T 13 10 295253 CASAVA_Build 2 67830872 1I AATAGGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 11 13 T 11 12 295254 CASAVA_Build 2 67835783 3I TTATCTGAAA ---/CAT CATGGTTTCA 3070 hom 137 het 49 0 45 4 CAT 1 2 295255 CASAVA_Build 2 67842486 1D GACATCTTTC A/- CTTCCCTGTA 3070 het 3070 hom 43 14 21 9 A 1 0 295256 CASAVA_Build 2 67858682 1D GATTTTGTTA C/- TTACTTTGTG 3070 het 3070 ref 52 25 22 6 C 1 0 295257 CASAVA_Build 2 67858991 4I TATACCTGAC ----/AATT AATGAGGGGA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 AATT 0 1 295258 CASAVA_Build 2 67861313 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2041 hom 23 5 13 5 A 10 11 295259 CASAVA_Build 2 67864622 2I TTTTTTAAAC --/AT GTTTCCAGGT 3070 hom 98 het 37 0 32 5 AT 0 1 295260 CASAVA_Build 2 67866240 1D CATGAGGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 37 2 27 11 A 12 11 295261 CASAVA_Build 2 67867080 4D CCTAGAATGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 15 11 295262 CASAVA_Build 2 67871719 1D TCTAAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 27 1 21 6 A 13 12 295263 CASAVA_Build 2 67883639 1D AGCATCTTTG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 T 8 7 295264 CASAVA_Build 2 67884644 1D ACAACCTCAA G/- AGTGTCAGCT 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 G 1 0 295265 CASAVA_Build 2 67888511 3D CCTCCTCCCC CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 het 2659 hom 39 9 14 16 CTT 5 4 295266 CASAVA_Build 2 67888645 1D CGTTTGCTTC T/- TCTTCTTTGT 3070 het 3070 ref 30 10 11 9 T 2 1 295267 CASAVA_Build 2 67888898 1D AAATTCACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 10 9 295268 CASAVA_Build 2 67897642 1D ATTATTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 12 11 295269 CASAVA_Build 2 67898627 1D ATGTGATGAG A/- AAAAAAGTGG 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 A 7 6 295270 CASAVA_Build 2 67900397 2D ACTAACCTTT CA/-- CACAATACAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 CA 3 2 295271 CASAVA_Build 2 67902763 1D ATGTACACCC T/- TAAGAATACC 3070 het 3070 hom 64 29 32 3 T 2 1 295272 CASAVA_Build 2 67906715 6I CCAACATCTT ------/AAACTA AAATAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AAACTA 0 1 295273 CASAVA_Build 2 67911101 1D GCATTCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3040 hom 33 11 11 12 T 11 10 295274 CASAVA_Build 2 67918367 27D TGGGCTCTAC CCTCAGGACCTAATTATCTCCCAATGG/--------------------------- CCTCAGGACC 3070 het 3070 ref 33 12 12 13 CCTCAGGACCTAATTATCTCCCAATGG 1 0 295275 CASAVA_Build 2 67926660 1I AAAACTCCTT -/C CCCCACTCCC 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 C 4 5 295276 CASAVA_Build 2 67930181 2I AACATTTACA --/AC AGTCATCATC 3070 hom 172 het 61 0 58 3 AC 0 1 295277 CASAVA_Build 2 67933171 1I CCTTTTCTAT -/C CCCCCCTCAC 3070 hom 81 het 35 0 27 8 C 6 7 295278 CASAVA_Build 2 67939626 19D GAAGCAAGCA TGCATTCTCCAGGCTCTCT/------------------- TGCATTCTCC 3070 het 3070 ref 50 33 16 11 TGCATTCTCCAGGCTCTCT 2 1 295279 CASAVA_Build 2 67940340 1D GATATTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 7 A 13 12 295280 CASAVA_Build 2 67940890 1I AATGACCTCT -/A AAAGCAATGA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 A 3 4 295281 CASAVA_Build 2 67943309 1I AGAATTCCTG -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 6 7 295282 CASAVA_Build 2 67943537 1D TATTTATGCT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 132 het 54 0 45 9 A 8 7 295283 CASAVA_Build 2 67945534 3D TGTCAGCTGC TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 158 het 63 0 53 10 TAT 6 5 295284 CASAVA_Build 2 67956039 1I CAAAAGAAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 17 12 11 A 8 9 295285 CASAVA_Build 2 67963693 4D TTTTTATTTA TTGT/---- TTATCTGAAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 TTGT 1 0 295286 CASAVA_Build 2 67965794 2D GATATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 84 het 37 0 29 9 TA 7 6 295287 CASAVA_Build 2 67968361 1D TTACAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 T 11 10 295288 CASAVA_Build 2 67975837 1D TTTGGGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 11 T 12 11 295289 CASAVA_Build 2 67983019 1D TTTCACCCAG C/- CTCCCCCACG 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 C 2 1 295290 CASAVA_Build 2 67989815 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 26 1 20 6 A 14 13 295291 CASAVA_Build 2 67992413 1D TGTAGGGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 10 9 295292 CASAVA_Build 2 68017312 1I AACTTACAGT -/A TAATTTAAAA 2358 hom 12 het 5 0 5 0 A 0 1 295293 CASAVA_Build 2 68025153 1I ATAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 11 12 295294 CASAVA_Build 2 68025431 1D ATTTTTGTGA T/- TAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 34 18 16 0 T 2 1 295295 CASAVA_Build 2 68026547 13D TATATATATA AATATATATATAT/------------- ATTTTTTTTC 2194 het 69 hom 10 1 6 3 AATATATATATAT 1 0 295296 CASAVA_Build 2 68026900 1I TGGACTTATC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 112 het 41 0 37 4 T 7 8 295297 CASAVA_Build 2 68029864 1I ATACCACCCC -/T ACCTTTCTTC 3070 hom 92 het 33 0 29 4 T 0 1 295298 CASAVA_Build 2 68030743 2D ACAGCATCCC CT/-- GTCTTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 CT 1 0 295299 CASAVA_Build 2 68034053 1D TATGTGAAAA C/- AAGGTATTTG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 C 1 0 295300 CASAVA_Build 2 68044061 2D AAGCCTCGTG TT/-- TTTTTTTTTA 1198 het 1198 ref 42 24 3 15 T 11 9 295301 CASAVA_Build 2 68044495 1I TCCAGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2396 het 2396 ref 36 19 8 9 A 11 12 295302 CASAVA_Build 2 68050584 1D CAAATACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 11 10 295303 CASAVA_Build 2 68050901 1I CAGCAAAATA -/C CAAAAAAAAA 3070 het 348 hom 38 1 33 4 C 1 2 295304 CASAVA_Build 2 68052678 1I CACTGAGATT -/C CGACTGTCTC 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 C 1 2 295305 CASAVA_Build 2 68056544 3D CAAGCTTCAA TTC/--- TTCTTCTTTA 3070 het 3070 hom 40 11 25 4 TTC 3 2 295306 CASAVA_Build 2 68056659 1I ACCGCGTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 22 21 11 A 13 14 295307 CASAVA_Build 2 68077781 7D CCTGTTCTAC CTGAAGT/------- CTGAACACTT 21 het 21 ref 42 22 1 21 CTGAAGT 1 0 295308 CASAVA_Build 2 68083450 1D AAAGGAAAGC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 9 8 295309 CASAVA_Build 2 68094066 1I TGAGGAGATG -/T TTTTTCCTGG 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 5 6 295310 CASAVA_Build 2 68105015 1I GCACTTCTGG -/C CCAGGGCTCT 3070 hom 71 het 26 0 22 4 C 2 3 295311 CASAVA_Build 2 68106651 7D CTTTCTCTTC TTTTTAT/------- GGAGCTATAA 3070 het 3070 ref 38 20 18 2 TTTTTAT 1 0 295312 CASAVA_Build 2 68116713 1D TTATGACAAC A/- AAAAATATTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 6 5 295313 CASAVA_Build 2 68127585 1D TGAGTGCTCC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 9 8 295314 CASAVA_Build 2 68135616 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 2892 het 2712 hom 37 15 12 10 A 14 15 295315 CASAVA_Build 2 68136113 1I AGCATGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 25 23 13 A 12 13 295316 CASAVA_Build 2 68151290 1D TCTAAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 A 12 11 295317 CASAVA_Build 2 68153097 1I CCATGCCCAG -/C GTTTTTTGTT 3052 het 3052 ref 22 10 9 3 C 0 1 295318 CASAVA_Build 2 68359419 1D CATTGGGTAG T/- TTTTTTTTTT 837 het 837 ref 37 27 3 7 T 11 10 295319 CASAVA_Build 2 68365011 1D AATAATTTGG A/- AAAAAAAAAA 1178 het 1178 ref 37 25 4 8 A 12 11 295320 CASAVA_Build 2 68396237 2D ATGACATTCC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 AT 6 5 295321 CASAVA_Build 2 68402355 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 2016 het 1605 hom 29 8 10 11 A 16 15 295322 CASAVA_Build 2 68444620 5D GTATGACCTC ATCTT/----- AACTAATTAT 3070 het 3070 ref 43 22 17 9 ATCTT 1 0 295323 CASAVA_Build 2 68452814 1I GAGAAGTTCA -/T TTTTTTTTTT 1405 het 1405 ref 28 18 3 7 T 11 12 295324 CASAVA_Build 2 68510605 1I GAGGACTTCA -/G GGTTGGTGGA 3070 het 3070 hom 59 23 25 11 G 2 3 295325 CASAVA_Build 2 68562731 1I TATAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 11 12 295326 CASAVA_Build 2 68625786 1D GAATATCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 20 18 8 T 10 9 295327 CASAVA_Build 2 68634083 5D TTTGTGAGAG TATAT/----- TATTTTTGAG 3070 het 3070 hom 24 9 12 6 TATAT 1 0 295328 CASAVA_Build 2 68662704 1D TCTGACTAAA T/- TCTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 2 1 295329 CASAVA_Build 2 68669253 1I AACACTATGG -/T TGTCAATTAA 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 T 1 2 295330 CASAVA_Build 2 68711071 2D AATCTCCCTG AT/-- ATATATATAT 1517 het 1517 ref 40 30 5 5 AT 8 7 295331 CASAVA_Build 2 68743089 1I TTTTCCATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 9 10 295332 CASAVA_Build 2 68751757 1D CTTGCAGTTA C/- CCCCTCCAGG 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 C 5 4 295333 CASAVA_Build 2 68751932 1D CATGTAGGTG T/- TTGGGAATTC 3070 het 3070 hom 49 17 30 2 T 3 2 295334 CASAVA_Build 2 68761241 4D GGGAATAAAC AAAT/---- GAATATATAC 3070 het 3070 ref 41 23 13 7 AAAT 1 0 295335 CASAVA_Build 2 68781458 1D TGTCTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 16 0 13 3 A 15 14 295336 CASAVA_Build 2 68784160 2D ATATAACTAA CT/-- CTGTCAATGG 3070 het 3070 hom 38 16 22 2 CT 2 1 295337 CASAVA_Build 2 68786225 1D CTTTTCACTC T/- GCTTTCCTCA 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 T 1 0 295338 CASAVA_Build 2 68787590 3I TTTTATACTC ---/CTT CTTCTCTTCT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 CTT 1 2 295339 CASAVA_Build 2 68788182 3I ACCATATCAC ---/CTT CTTCTCTCTT 3070 hom 40 het 48 1 37 10 CTT 1 2 295340 CASAVA_Build 2 68790787 1D TTTACAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 9 8 295341 CASAVA_Build 2 68803214 1I ACCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 23 0 11 12 A 15 16 295342 CASAVA_Build 2 68807545 1I TGCACAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 10 11 295343 CASAVA_Build 2 68823963 2I GTGATCACTT --/AC ACATGTGGGT 2328 het 740 hom 44 10 9 25 AC 1 2 295344 CASAVA_Build 2 68833384 1I GCAAAATGTG -/C CTTGATTTCT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 C 1 2 295345 CASAVA_Build 2 68833715 1I TGGGGTGGAT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 G 8 9 295346 CASAVA_Build 2 68834943 6D TCTGTTCCTA TGCTTT/------ TGCTTTTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 4 TGCTTT 2 1 295347 CASAVA_Build 2 68836288 1D TTTTGCATGC T/- TTTTTCTTGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 6 5 295348 CASAVA_Build 2 68842169 1D TAAACTCTAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 8 295349 CASAVA_Build 2 68845997 1I GTTGACATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 30 0 19 11 A 13 14 295350 CASAVA_Build 2 68861223 3D TCTTTTTCTT CTC/--- CTCCTTCCCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 CTC 2 1 295351 CASAVA_Build 2 68879154 1I GAGGAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1059 hom 38 3 29 6 A 11 12 295352 CASAVA_Build 2 68881746 1I TAGCCAAGCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 9 10 295353 CASAVA_Build 2 68882865 17D TAACACGGAG AAACCCCGTCTCTACTA/----------------- AAAATACAAA 3070 het 3070 hom 21 10 11 5 AAACCCCGTCTCTACTA 1 0 295354 CASAVA_Build 2 68883535 18D ATATGTACAC ACACATATATCCATATAT/------------------ ACACATATAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 11 ACACATATATCCATATAT 2 1 295355 CASAVA_Build 2 68883603 12D ATACACACAC ATATATACACAT/------------ ATATATACAC 2752 het 2237 hom 22 8 7 11 ATATATACACAT 1 0 295356 CASAVA_Build 2 68892296 1I GCCTTTTCAG -/A AGACAGCTAC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 1 2 295357 CASAVA_Build 2 68892890 3D CACGACACAC TCT/--- TCTTCTTGTG 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TCT 3 2 295358 CASAVA_Build 2 68896443 1I TGCACCGTCC -/T TCCAGCGTGG 3070 het 3070 hom 50 24 22 4 T 1 2 295359 CASAVA_Build 2 68896769 1D GTTATTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 11 10 295360 CASAVA_Build 2 68897748 1I ATTGTGTCCT -/G TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 G 0 1 295361 CASAVA_Build 2 68903935 3I ACTTACAGAA ---/CTT CTTCTAGTGG 3070 het 3070 ref 23 13 10 0 CTT 1 2 295362 CASAVA_Build 2 68904902 6D CCACAGATGT GTCAGA/------ GTCCTCTGAA 3070 het 3070 hom 36 17 18 5 GTCAGA 1 0 295363 CASAVA_Build 2 68905378 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAACA 2967 het 1871 hom 16 4 9 3 A 8 9 295364 CASAVA_Build 2 68909171 1D AGAAACAGGG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 9 8 295365 CASAVA_Build 2 68911833 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2907 het 2907 ref 37 14 10 13 A 15 14 295366 CASAVA_Build 2 68913369 1I GGGACTAGGT -/A ACTGTTGTCT 3070 het 3070 ref 52 22 23 7 A 1 2 295367 CASAVA_Build 2 68914310 4I TCAAAGGAAA ----/CACT CAACCTGTGT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 CACT 0 1 295368 CASAVA_Build 2 68926392 1D CAAGTCTTAG T/- TTCTTCAACA 3070 het 3070 ref 51 27 21 4 T 3 2 295369 CASAVA_Build 2 68929866 27D GAGCTAGGGA ATCAGTGATATGAAAATTATCTTTCAT/--------------------------- ATCAGTGATA 3070 het 3070 ref 44 18 8 25 ATCAGTGATATGAAAATTATCTTTCAT 2 1 295370 CASAVA_Build 2 68942435 1D AACAGTTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 A 10 9 295371 CASAVA_Build 2 68949871 19I TGATAAAGGA -------------------/GCAGTGCTAGGAATTGAGG GCACGCTTTT 3070 het 3070 hom 40 20 19 2 GCAGTGCTAGGAATTGAGG 0 1 295372 CASAVA_Build 2 68954973 6D TTATTTTGTA TCCTTC/------ TCATTTGGAA 3070 het 3070 hom 50 21 28 3 TCCTTC 1 0 295373 CASAVA_Build 2 68958667 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 8 9 295374 CASAVA_Build 2 68970923 1I GCTTCTGTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 T 8 9 295375 CASAVA_Build 2 68982687 1D CCACCTGCCC A/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 1 0 295376 CASAVA_Build 2 68987768 1D TTTTTTATAA T/- TTTTTTTTAA 2075 het 873 hom 9 3 5 1 T 9 8 295377 CASAVA_Build 2 68988787 2I ACCTGAGTCC --/CT GTTTTGGATC 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 CT 0 1 295378 CASAVA_Build 2 68996917 1D TTGAAAGGCC A/- AAAAAAAAAA 1850 het 1850 ref 34 20 6 9 A 13 12 295379 CASAVA_Build 2 69009736 2D CCTTCTGTTT AA/-- AAGAGGATCA 3070 hom 141 het 54 0 47 7 A 4 2 295380 CASAVA_Build 2 69011991 31D GTAATTTATA AAGAAAAGAGATTTAATTGACTCACAGTTCT/------------------------------- AAGAAAAGAG 3070 hom 33 het 13 0 11 5 AAGAAAAGAGATTTAATTGACTCACAGTTCT 2 1 295381 CASAVA_Build 2 69034213 3D TCTTAGATTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 14 11 295382 CASAVA_Build 2 69034696 1D CAAAACAAAA C/- AAAAAACCCC 3070 hom 42 het 16 0 15 2 C 1 0 295383 CASAVA_Build 2 69039007 1D TTCTATTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 31 0 23 8 T 10 9 295384 CASAVA_Build 2 69046828 1D GAACAGCACG T/- TTTTAATAAT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 5 4 295385 CASAVA_Build 2 69060870 4I GTGTTAACTC ----/AGTT GGTTCTTCAC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AGTT 0 1 295386 CASAVA_Build 2 69065041 3I GATACACATC ---/ATT GAGAAGGTGA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 ATT 0 1 295387 CASAVA_Build 2 69072319 1I TAAAAACTTC -/T AATATTTAGA 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 T 0 1 295388 CASAVA_Build 2 69074292 3D TAGCTTATGG AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 17 15 1 A 12 9 295389 CASAVA_Build 2 69075148 3D CAAAAGTCAA GGT/--- GGTGCAGGTA 3070 het 3070 ref 48 30 16 3 GGT 2 1 295390 CASAVA_Build 2 69076998 1D AAAATTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 A 13 12 295391 CASAVA_Build 2 69077895 2D AAAACAAAGA AC/-- ACACAGAGTA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 AC 3 2 295392 CASAVA_Build 2 69082848 2D TTCTGTTGTG TT/-- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 T 9 7 295393 CASAVA_Build 2 69090919 1D AAAATCATTC T/- GGAAAATGCT 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 T 1 0 295394 CASAVA_Build 2 69092605 1I AATTACTCAC -/A AGGTCAGTCT 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 A 1 2 295395 CASAVA_Build 2 69092964 3I GGGCTCAGAG ---/GCT GCTGATTCTC 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 GCT 1 2 295396 CASAVA_Build 2 69093261 4D TTTTATGGTC CAGA/---- CAGACTAAGA 3070 het 3070 hom 40 18 20 4 CAGA 2 1 295397 CASAVA_Build 2 69095051 1I CCCAGATGTA -/G GTGAATTCAA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 G 1 2 295398 CASAVA_Build 2 69096603 1I CAAAGAAATG -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 6 7 295399 CASAVA_Build 2 69097123 2I TGTGTCTAAC --/AG AGCAGTGGAT 3070 het 3070 ref 50 24 23 3 AG 1 2 295400 CASAVA_Build 2 69100252 1I AAAAGATGTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 A 8 9 295401 CASAVA_Build 2 69100449 1D GCTCCCACTT A/- ACAAGTGAGA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 2 1 295402 CASAVA_Build 2 69104166 3I GATGATGATG ---/ATA ATGATGATGA 3070 het 3070 ref 57 29 17 11 ATA 0 1 295403 CASAVA_Build 2 69109678 1D CATGTTGAGA C/- CCCCCCCCCT 2243 het 977 hom 16 5 7 5 C 10 9 295404 CASAVA_Build 2 69117316 2I ACACAGCATT --/GC GCATTTCAGA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 GC 1 2 295405 CASAVA_Build 2 69128012 4I GCAAGCACTT ----/TATA TATCCTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 TA 1 3 295406 CASAVA_Build 2 69129793 1D CATAAAATGA T/- TTACAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 T 3 2 295407 CASAVA_Build 2 69134817 1D AAGATGGGGA T/- TATCGAGGTG 3070 het 3070 hom 46 23 20 3 T 2 1 295408 CASAVA_Build 2 69139170 2D CTACTTCTTG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 20 18 7 A 11 9 295409 CASAVA_Build 2 69140118 1D AAGTGTGTAC T/- TTTTTTTTTT 2432 het 1476 hom 23 8 7 8 T 14 13 295410 CASAVA_Build 2 69155695 1I TGTAGGAATG -/A AAAGGGCTTT 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 A 3 4 295411 CASAVA_Build 2 69159593 1D TCAAATCTGC T/- TTTTTTTTTA 961 het 961 ref 41 31 3 7 T 10 9 295412 CASAVA_Build 2 69163015 3D ATAAAATTAC AAG/--- AAGAAGTCTG 3070 het 3070 ref 46 20 14 13 AAG 3 2 295413 CASAVA_Build 2 69166344 1I ACCAAACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 A 10 11 295414 CASAVA_Build 2 69188489 4D AGGATAAGAC TTCT/---- TTAACATAAA 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 TTCT 1 0 295415 CASAVA_Build 2 69243950 1I CTTTTCATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 10 11 295416 CASAVA_Build 2 69264283 2I GCACTCCTGA --/GC TAAAGCAGTC 2323 het 1647 hom 13 4 7 2 GC 0 1 295417 CASAVA_Build 2 69305637 1D GTGTTCCCAG C/- CTATGTGAAT 3070 het 3070 hom 52 23 22 8 C 2 1 295418 CASAVA_Build 2 69390196 2D GCCCAGGAGA CT/-- CTGGACCCAG 3070 het 3070 hom 43 17 19 8 CT 2 1 295419 CASAVA_Build 2 69392058 2D GGTATTACAC AT/-- GTTACCTATA 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 AT 1 0 295420 CASAVA_Build 2 69394838 1I AAAAGCACAA -/T ATCAGGGAAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 0 1 295421 CASAVA_Build 2 69395563 1I TTTTTTAAAC -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 7 8 295422 CASAVA_Build 2 69397967 1I ACATGGTCTT -/G GTTCTGTCGT 3070 het 3070 hom 34 8 24 2 G 1 2 295423 CASAVA_Build 2 69399315 1I TTATCAGATC -/A AAAAAAAAAA 2724 het 2671 hom 24 10 8 6 A 11 12 295424 CASAVA_Build 2 69406880 1D CTGCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1339 hom 37 3 29 5 A 13 12 295425 CASAVA_Build 2 69412383 4D TTTTTCACTT AGTA/---- AGAACCTTTC 3070 het 3070 hom 19 7 11 1 AGTA 1 0 295426 CASAVA_Build 2 69413514 3I CATGATGTGG ---/ATA ATGAGACTCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATA 0 1 295427 CASAVA_Build 2 69416990 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAAAG 3070 het 149 hom 16 3 11 2 G 0 1 295428 CASAVA_Build 2 69419347 1D TAAAATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 A 12 11 295429 CASAVA_Build 2 69420001 4D TTTAACAGGG CTCA/---- CTATTTTCAA 3070 het 3070 hom 48 21 27 1 CTCA 1 0 295430 CASAVA_Build 2 69422285 2D CACTGACAAT AC/-- ACATTTTTGA 3070 het 3070 hom 46 16 21 10 AC 2 1 295431 CASAVA_Build 2 69427847 1D GCACCTGGAC T/- TTTTTTTTTT 1387 het 819 hom 22 4 4 14 T 13 12 295432 CASAVA_Build 2 69436028 1I17M3I ACAGGTTTTT -GGTTTTTTTTTAATTAT---/GGGTTTTTTTTTAATTATTTC TTTTCTTAAT 3070 hom 56 het 33 0 19 16 N/A 0 0 295433 CASAVA_Build 2 69437900 1D CTCTGCCCTA G/- TAATTGTACA 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 G 1 0 295434 CASAVA_Build 2 69455889 1D TGCTTATTTT A/- AAACTTCCTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 4 3 295435 CASAVA_Build 2 69458227 1D ACCTGGGAGG C/- AGAGGTTGCA 3070 het 974 hom 19 3 12 5 C 1 0 295436 CASAVA_Build 2 69465330 3D GCCCCGTCAC AAA/--- AAAAAAAAAA 1313 het 179 hom 18 4 5 9 A 19 16 295437 CASAVA_Build 2 69465428 2D AAAGAAAGAA AG/-- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 AG 1 0 295438 CASAVA_Build 2 69466180 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 23 0 19 5 A 1 0 295439 CASAVA_Build 2 69466490 1I TAATCTACTC -/T TAAATTTAAA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 1 2 295440 CASAVA_Build 2 69478254 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 295441 CASAVA_Build 2 69479183 1D AGCATAAATC T/- TGCCCTTAAG 3070 het 3070 hom 55 20 30 6 T 2 1 295442 CASAVA_Build 2 69480513 1D AGTTACTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2127 hom 27 7 10 10 T 15 14 295443 CASAVA_Build 2 69481342 1D TAGAATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 21 3 8 10 T 12 11 295444 CASAVA_Build 2 69482535 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1298 het 1298 ref 27 10 5 12 T 12 11 295445 CASAVA_Build 2 69483603 5D TTCTTTCCTT TTCTC/----- TTCTCTTTTC 3070 hom 58 het 25 0 16 9 TTCTC 2 1 295446 CASAVA_Build 2 69487068 1I AAAGAAACTG -/A ATTTTGATGG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 1 2 295447 CASAVA_Build 2 69496628 1I TAAAGGGAAA -/G GGAAGAAAGA 2925 het 2243 hom 18 6 7 5 G 2 3 295448 CASAVA_Build 2 69498750 1I ACTGAAGAAT -/G GGGGGGCTGG 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 G 6 7 295449 CASAVA_Build 2 69499851 1D TCAGGGTGGC G/- GGGGGGGGCG 2154 hom 13 het 8 0 6 2 G 9 8 295450 CASAVA_Build 2 69500640 1D AAACAGACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 13 12 295451 CASAVA_Build 2 69503251 1D TTGATGAATA T/- TTTTTCTTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 5 295452 CASAVA_Build 2 69504059 1I ACAGGCCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 10 11 295453 CASAVA_Build 2 69509063 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1317 het 1317 ref 28 21 3 4 A 13 12 295454 CASAVA_Build 2 69510854 1D TATTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 24 3 16 5 T 13 12 295455 CASAVA_Build 2 69513417 3I CCTGTCCCTT ---/ACC ACGTTTCCCT 3070 hom 80 het 34 0 27 7 ACC 0 1 295456 CASAVA_Build 2 69514577 1D GCCCAGCTAG T/- TTTTTTTTTT 2778 het 482 hom 31 5 9 17 T 17 16 295457 CASAVA_Build 2 69557841 1I TGACTTTTAT -/A AATGATTAGG 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 A 2 3 295458 CASAVA_Build 2 69565422 4I GAGGCAAGAG ----/AATT AATTGCTTGT 3036 het 2154 hom 12 5 7 0 AATT 1 2 295459 CASAVA_Build 2 69566372 1D TTCGGCTCAC T/- TGCAACCTCC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 2 1 295460 CASAVA_Build 2 69571290 1D GCCAGGGGCT G/- GGGGGAGGGG 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 G 6 5 295461 CASAVA_Build 2 69576999 1I ACCTCCGCCT -/C CCCGGTTCAA 3070 het 2350 hom 22 9 10 3 C 3 4 295462 CASAVA_Build 2 69577871 4D ACCTCAGCCT AGTA/---- GCCTAGTAGC 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 AGTA 1 0 295463 CASAVA_Build 2 69599056 1I AGTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 2165 het 815 hom 15 4 7 4 G 0 1 295464 CASAVA_Build 2 69604229 3D GTATAAATAT CTC/--- CTGCGCTACC 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 CTC 1 0 295465 CASAVA_Build 2 69605254 2I TATTTTTAGT --/AG AGATGGGATT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 AG 1 2 295466 CASAVA_Build 2 69619518 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 9 10 295467 CASAVA_Build 2 69620053 1D GGTGCAGAAC G/- GGGGCTACAG 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 G 5 4 295468 CASAVA_Build 2 69628965 1I AAGCATAAGG -/A AAAAAAGATC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 6 7 295469 CASAVA_Build 2 69637300 3I TCTCAAAATG ---/CTC CTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 CTC 0 1 295470 CASAVA_Build 2 69638976 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2344 hom 27 8 12 7 A 16 17 295471 CASAVA_Build 2 69639673 1I TAAAAAGAAA -/T TTTAATGGGC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 3 4 295472 CASAVA_Build 2 69651590 1I AGCTCTAAGT -/C TTGGTGTAGA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 C 0 1 295473 CASAVA_Build 2 69658054 5I AGGGGGCAGG -----/GTGCC GTGCCATCCT 3070 het 3070 hom 58 19 30 9 GTGCC 1 2 295474 CASAVA_Build 2 69668114 2I TATATATATA --/TT TTTTTTTGAT 2890 het 1761 hom 17 5 8 4 T 7 9 295475 CASAVA_Build 2 69669550 21D ACTGCTACCA AAAAGGCAGCCTCTGATTTTC/--------------------- AAAAGAACTT 3070 het 3070 ref 23 15 11 1 AAAAGGCAGCCTCTGATTTTC 1 0 295476 CASAVA_Build 2 69669962 2D GCAACGAGGC AG/-- AGAGTCAAGA 3070 het 3070 hom 29 13 13 7 AG 3 2 295477 CASAVA_Build 2 69677833 1D TGAGATTCTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 T 9 8 295478 CASAVA_Build 2 69678344 2D CATCTCTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2036 hom 30 10 13 8 A 13 11 295479 CASAVA_Build 2 69678802 1I CCCCAATGCC -/A AAGTACATCA 3070 het 3070 ref 55 26 25 4 A 2 3 295480 CASAVA_Build 2 69695721 1D AACCACGAGG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 51 22 25 5 A 7 6 295481 CASAVA_Build 2 69700257 4D AAGCAGGGAA GAGG/---- GAGGGAGTGC 3070 het 3070 hom 45 19 20 7 GAGG 2 1 295482 CASAVA_Build 2 69708921 1I GTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 11 12 295483 CASAVA_Build 2 69717342 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1946 het 1946 ref 27 7 7 13 T 12 13 295484 CASAVA_Build 2 69718129 1I TTCATAATGC -/A AGTGTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 A 1 2 295485 CASAVA_Build 2 69721118 1I CATGCTACTG -/T TATGTGTGAA 3070 het 3070 hom 62 27 29 6 T 1 2 295486 CASAVA_Build 2 69740573 1D ATGAAGCACC T/- TAGTCCTGGG 3070 het 3070 hom 43 16 24 5 T 2 1 295487 CASAVA_Build 2 69742119 1I AGATCTACCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 A 10 11 295488 CASAVA_Build 2 69743795 1D CGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTGT 1925 het 308 hom 7 1 5 1 T 9 8 295489 CASAVA_Build 2 69754690 2I CGGTGAACAC --/TG TGTCTGGTGC 3070 het 3070 hom 57 21 20 16 TG 1 2 295490 CASAVA_Build 2 69755570 1I TTTTTTTTCG -/T TTTTTTTGAG 1334 het 1154 hom 14 3 7 4 T 7 8 295491 CASAVA_Build 2 69759906 1I CCAAGTAGAT -/G GGACCACAGG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 G 2 3 295492 CASAVA_Build 2 69761124 1D TCTGGATGCC T/- TTTATTTCTT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 4 3 295493 CASAVA_Build 2 69763553 1D GATCTTCTTT G/- TGCTTTTCTA 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 G 1 0 295494 CASAVA_Build 2 69765631 3D TGAGAAAACA TTG/--- TTGTGGGATC 3070 het 3070 ref 36 26 8 4 TTG 2 1 295495 CASAVA_Build 2 69765989 1D TTTAATAAAG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 2635 hom 34 7 21 6 T 9 8 295496 CASAVA_Build 2 69776547 1I CTTTTTTGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 9 10 295497 CASAVA_Build 2 69778972 1D TAGCAGATGG A/- AGATGAAGCC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 2 1 295498 CASAVA_Build 2 69782452 1D TATTGGCGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2993 hom 31 9 15 7 T 10 9 295499 CASAVA_Build 2 69783869 1D TCTGGCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 T 11 10 295500 CASAVA_Build 2 69783880 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTTAATAA 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 C 1 0 295501 CASAVA_Build 2 69789583 1D TCTTCTGAAT A/- ATAATTTGAA 3070 het 3070 ref 23 10 7 6 A 2 1 295502 CASAVA_Build 2 69789855 1I8M1D CAGAAATTAC -TTAGAGTTA/TTTAGAGTT- AGAAATTAAA 3070 hom 117 het 40 0 40 2 N/A 0 0 295503 CASAVA_Build 2 69805515 2I GATGGAATTT --/GA GAGAGGAAGC 3070 hom 110 het 41 0 34 7 GA 2 3 295504 CASAVA_Build 2 69809473 1I TGCTCTTTTT -/G GTCGTTTGCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 1 2 295505 CASAVA_Build 2 69817695 1I8M3D CACCTTGGCC -TCTCAGAGTGC/AACTCAGAG--- TGGGATTACA 3070 hom 126 het 45 0 43 3 N/A 0 0 295506 CASAVA_Build 2 69827464 1D CAAACAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 12 11 295507 CASAVA_Build 2 69830849 1I AATTATCAGA -/T TTTCCAACCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 4 295508 CASAVA_Build 2 69831826 2D GTCAGTATGA CT/-- CTATATCCTA 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 CT 2 1 295509 CASAVA_Build 2 69842156 5I TTTCCAAGTT -----/AAGTA AATTCACGAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AAGTA 0 1 295510 CASAVA_Build 2 69843498 2D CACACACTCA CT/-- CACACACTCA 134 het 134 ref 42 12 3 29 CT 1 0 295511 CASAVA_Build 2 69867993 2D TTCCCTTCCA TC/-- TCTCTCTCTT 3070 hom 129 het 52 0 44 8 TC 5 4 295512 CASAVA_Build 2 69873246 1I ATTTTTACAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 51 20 20 11 T 9 10 295513 CASAVA_Build 2 69874507 1I AGAAAAAAAA -/C GTTTCCAGAT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 0 1 295514 CASAVA_Build 2 69900711 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 296 hom 31 3 23 6 A 13 12 295515 CASAVA_Build 2 69900873 1D GAGGAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 42 3 28 12 T 13 12 295516 CASAVA_Build 2 69912002 1D TGTATTTATT A/- TACAAAAATG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 1 0 295517 CASAVA_Build 2 69920076 2I AATCGTTGAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 10 12 295518 CASAVA_Build 2 69920473 1D AGTATGACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 23 0 19 4 T 11 10 295519 CASAVA_Build 2 69921763 1D AAAGCTTAGC T/- TTTTTGGAGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 6 5 295520 CASAVA_Build 2 69933181 4I TCTGTCTGTC ----/TGTT TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 TGTT 0 1 295521 CASAVA_Build 2 69942649 4D CAAAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 35 12 20 6 AAAC 4 3 295522 CASAVA_Build 2 69946886 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 28 2 13 13 A 15 14 295523 CASAVA_Build 2 69963367 4D GAAATATGTT CAAC/---- CAATATGGAC 3070 hom 63 het 27 0 22 7 CAAC 1 0 295524 CASAVA_Build 2 69965430 3D GACTTGTGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 32 3 15 15 T 18 15 295525 CASAVA_Build 2 69973985 5I ACCCTGGAAC -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 hom 63 het 37 0 22 15 AAAAT 3 4 295526 CASAVA_Build 2 69977774 1I GAAACCCAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 9 10 295527 CASAVA_Build 2 69986662 1D TTTTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 28 3 15 10 T 15 14 295528 CASAVA_Build 2 70001203 1D TTGGTGCCCC T/- GATGTAAATG 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 1 0 295529 CASAVA_Build 2 70003677 2D AGTAAACACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 33 0 19 16 A 15 13 295530 CASAVA_Build 2 70005382 2D ATTGCCATGG CT/-- CTCAAAAAAA 3070 hom 62 het 29 0 22 7 CT 2 1 295531 CASAVA_Build 2 70006563 1D CCTTTATGAG T/- TTGATAAGTA 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 3 2 295532 CASAVA_Build 2 70012085 1D26M8I CTGTGCCTGG CTTATTTCACTTAACCTAATGACCTCC--------/-TTATTTCATTTAACATAATGACCTCCATTTCCAT AGTTCCATCC 1341 het 1341 ref 36 41 3 3 N/A 0 0 295533 CASAVA_Build 2 70014140 1D GAAAGACTTA C/- AAAATAGTAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 C 1 0 295534 CASAVA_Build 2 70018085 4I ACCCCAGAGC ----/AGGG AGGGGTTCAG 3070 hom 66 het 25 0 21 4 AGGG 1 2 295535 CASAVA_Build 2 70025331 3I GGAGGGGACC ---/TTA TTATATTCCA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 TTA 1 2 295536 CASAVA_Build 2 70025857 4D CCTGGGCGAC AGAG/---- AGAGACCCTG 3070 het 3070 hom 27 10 15 5 AG 4 2 295537 CASAVA_Build 2 70054974 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 13 14 295538 CASAVA_Build 2 70057809 1I GAGACTCTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 10 295539 CASAVA_Build 2 70137365 1D AACTGCTTTT G/- TTTTGTTTTG 198 hom 5 het 11 0 1 10 G 1 0 295540 CASAVA_Build 2 70183891 1D ATCATCTTGC T/- TTTTTTTTTA 1125 het 1125 ref 30 18 3 9 T 10 9 295541 CASAVA_Build 2 70187865 1D GAGAGAGAAA G/- AAGGAGAGAA 2069 het 1016 hom 15 3 10 2 G 1 0 295542 CASAVA_Build 2 70188640 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 377 het 377 ref 24 10 4 11 AG 1 0 295543 CASAVA_Build 2 70212787 2I CATCTTTTCA --/TT TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 10 295544 CASAVA_Build 2 70221390 2I TGCCTTTCTC --/TT GTCTTTTGTG 3070 hom 108 het 41 0 35 6 T 0 2 295545 CASAVA_Build 2 70227363 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 15 14 295546 CASAVA_Build 2 70228699 4I TTTTACTAAC ----/TGTT TGAGAATATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TGTT 0 1 295547 CASAVA_Build 2 70233669 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1240 hom 25 4 11 10 A 15 14 295548 CASAVA_Build 2 70244643 1D CTATCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1297 het 1297 ref 21 12 3 7 T 15 14 295549 CASAVA_Build 2 70264850 3I TAATCAGTGG ---/ACT ATAGAAGATG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 ACT 0 1 295550 CASAVA_Build 2 70266045 1D ATTCCGTGTC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 9 8 295551 CASAVA_Build 2 70267043 3I GATTTAACAT ---/ATC ATCAAAGTGG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 ATC 1 2 295552 CASAVA_Build 2 70294294 1D CACAAAATCC T/- TTTTTTTTTT 972 het 972 ref 29 13 3 13 T 12 11 295553 CASAVA_Build 2 70298041 3D CTTCTTCTTC TTT/--- TTTTTTTCTT 3070 hom 27 het 13 0 10 5 T 10 7 295554 CASAVA_Build 2 70302435 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 23 1 16 6 T 11 12 295555 CASAVA_Build 2 70302785 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 40 3 34 3 A 10 11 295556 CASAVA_Build 2 70332444 1I ACCTGGCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 18 1 11 6 T 11 12 295557 CASAVA_Build 2 70334257 4D ACTAGTTATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 21 11 6 TTTG 4 3 295558 CASAVA_Build 2 70352415 1D CAAAATACCT A/- AAAATAGGTA 1091 het 1091 ref 33 26 3 4 A 5 4 295559 CASAVA_Build 2 70352493 4D TCAAATATAT TTTC/---- TTTAACAGAA 3070 het 3070 ref 33 24 7 3 TTTC 1 0 295560 CASAVA_Build 2 70397084 2I CTATTATATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 45 1 29 15 T 15 17 295561 CASAVA_Build 2 70397698 1D CCCTCTTATT A/- CTGTGGTTGT 3070 het 3070 hom 27 10 17 0 A 1 0 295562 CASAVA_Build 2 70398090 4D AAATTGTGAA GAGT/---- AAGAAGAGAG 3070 hom 129 het 44 0 44 0 GAGT 1 0 295563 CASAVA_Build 2 70399056 3D CTGAACTTTT AGC/--- AGACATGCGG 3070 hom 95 het 36 0 29 11 AGC 1 0 295564 CASAVA_Build 2 70401490 1D TCTTAGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1115 hom 32 4 18 10 T 17 16 295565 CASAVA_Build 2 70403135 3I ATAGTACTTA ---/AAC ATGTTTTAGA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AAC 0 1 295566 CASAVA_Build 2 70405349 1D ATCACAGGTC A/- AAGGCAGCAA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 3 2 295567 CASAVA_Build 2 70407633 2D AGTCTCAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 25 2 12 11 A 16 14 295568 CASAVA_Build 2 70409935 5D CTCACTCCCG CTGCC/----- CTGCCCTGCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTGCC 3 2 295569 CASAVA_Build 2 70410971 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 233 hom 26 1 20 6 A 12 11 295570 CASAVA_Build 2 70411195 1I AAGCTTGATG -/T TTAGTGGATG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 3 295571 CASAVA_Build 2 70417292 1D GACCCTTTCT A/- AAAAAAAAAA 570 het 570 ref 23 9 2 12 A 19 18 295572 CASAVA_Build 2 70435341 2D GAGCAAACTC AG/-- AGCCTGAGTC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 AG 2 1 295573 CASAVA_Build 2 70448166 1D AACATGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 693 hom 35 2 27 8 T 12 11 295574 CASAVA_Build 2 70450941 26D TTAAATGATT AACTAATGAGGAAAGGAGTAAGATAC/-------------------------- AACTGGTTCA 3070 het 3070 ref 43 33 16 5 AACTAATGAGGAAAGGAGTAAGATAC 1 0 295575 CASAVA_Build 2 70453383 1D CTCTTCTAAC T/- TTCCCCCCCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 3 2 295576 CASAVA_Build 2 70453732 1D TAAATGTTAA T/- CACATCCGAA 3070 het 2727 hom 27 7 17 4 T 1 0 295577 CASAVA_Build 2 70457473 1I AACTCCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 30 1 22 7 T 13 14 295578 CASAVA_Build 2 70461488 1D TTTGAAATCA G/- GAAGTGTAGT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 G 2 1 295579 CASAVA_Build 2 70471342 7I GGAATATACA -------/TAGAGAT TAAACAATTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TAGAGAT 0 1 295580 CASAVA_Build 2 70483285 2D TTAAAAAGCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 26 0 12 14 T 13 11 295581 CASAVA_Build 2 70486097 4I CACCTGCTTC ----/TTTG TTTGATCACC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 TTTG 1 2 295582 CASAVA_Build 2 70488663 2D AACAGTCAGC AG/-- AGTGAACAGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AG 2 1 295583 CASAVA_Build 2 70489242 2D GAAACTGTGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TA 7 6 295584 CASAVA_Build 2 70491160 1I TTAACACAGT -/A AATCTGTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 2 3 295585 CASAVA_Build 2 70491214 4D ATATATATAA TGTG/---- TGTGTGTATT 947 het 410 hom 23 4 4 17 TG 5 3 295586 CASAVA_Build 2 70491654 1I TTTGTATTTT -/C CCCCCCACTC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 C 6 7 295587 CASAVA_Build 2 70493729 3D GGAGGTGGGG AGA/--- AGGACACCTG 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 AGA 1 0 295588 CASAVA_Build 2 70494152 1D TGCCTGTGCT G/- GGGGAGCCTG 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 G 5 4 295589 CASAVA_Build 2 70502910 1I ATTAAGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 10 11 295590 CASAVA_Build 2 70503182 1D TGCCACAGAA G/- AGAACCCAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 G 1 0 295591 CASAVA_Build 2 70510047 1I GTTTTCAAAC -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 7 8 295592 CASAVA_Build 2 70510099 2D ATAGTGTTTT CA/-- CAGTGTTTTA 1341 het 1341 ref 27 16 4 14 CA 2 1 295593 CASAVA_Build 2 70512042 1I17M3I GTATAATAAT -AAAAAAAAAAACTAGAC---/AAAAAAAAAAAACTAGACAGA AGAATTCTCA 3070 het 812 hom 21 7 18 5 N/A 0 0 295594 CASAVA_Build 2 70512207 1I AAAGGAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 8 9 295595 CASAVA_Build 2 70518640 1D ATGGTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 26 0 12 14 T 15 14 295596 CASAVA_Build 2 70518719 2D TCACTGCAAC CT/-- CTGCCTCCCA 2449 het 2449 ref 14 6 6 4 CT 2 1 295597 CASAVA_Build 2 70529837 4D AAAAAAAAAT AAAG/---- AGAAAATTCA 3070 het 3070 hom 32 12 19 2 AAAG 1 0 295598 CASAVA_Build 2 70533116 4D TTTTAAGGTC ATTA/---- GAGACCTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 ATTA 1 0 295599 CASAVA_Build 2 70534067 11D CTCCAGCTCT AAACCAGCTCC/----------- AAACCAGCTC 2313 het 2313 ref 18 8 8 7 AAACCAGCTCC 2 1 295600 CASAVA_Build 2 70537502 1I ACCAAATGTG -/T GTTTTCAGAC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 0 1 295601 CASAVA_Build 2 70548294 1I GCCCACTTAG -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 7 8 295602 CASAVA_Build 2 70554321 1I GCTGTCTTAG -/A AGGGGGGTGT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 1 2 295603 CASAVA_Build 2 70558725 6D AAACCCTGGT CCCCAG/------ CTTAAGGTCT 3070 het 3070 ref 38 19 17 4 CCCCAG 1 0 295604 CASAVA_Build 2 70559141 1D ATACCACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 11 10 295605 CASAVA_Build 2 70560705 4D ATTTTGGGGC TAGA/---- TAAAGACAGA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 TAGA 1 0 295606 CASAVA_Build 2 70577070 1D AGCCACAGGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 56 22 26 9 A 9 8 295607 CASAVA_Build 2 70601060 1I GAGGCAGAGG -/C AGGAGAATTG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 C 0 1 295608 CASAVA_Build 2 70613506 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 25 1 16 8 T 15 14 295609 CASAVA_Build 2 70620037 1I CCAATGGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 A 9 10 295610 CASAVA_Build 2 70624166 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1939 het 1026 hom 15 5 8 3 A 14 12 295611 CASAVA_Build 2 70626889 19I AGAGCAAGAC -------------------/ACTGTACTATACATATAGT ACTGGAACCT 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 ACTGTACTATACATATAGT 0 1 295612 CASAVA_Build 2 70628485 2I ATATATAGAG --/AT ATATATATAT 2642 het 151 hom 9 2 6 1 AT 5 6 295613 CASAVA_Build 2 70631712 3I AGTAACAACA ---/ATG ACAATGATGA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 ATG 0 1 295614 CASAVA_Build 2 70632835 10I GACCCTGTGT ----------/CCACAGGAAA GCTTTACTTT 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 CCACAGGAAA 0 1 295615 CASAVA_Build 2 70644888 1I CCCCCCCCCC -/A GGACTTATAT 1999 het 1999 ref 28 12 8 8 A 0 1 295616 CASAVA_Build 2 70652357 1D TATTTTTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 11 19 10 T 10 9 295617 CASAVA_Build 2 70676786 1D9M4D TAAATATGGG AAAAAAAAGAAAAG/-AAAAAAAGA---- AAAGAAAACC 3070 het 3070 ref 23 13 12 4 N/A 0 0 295618 CASAVA_Build 2 70683828 4I CTCTTTGTTA ----/GTTT GAGTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 GTTT 0 1 295619 CASAVA_Build 2 70712523 1D AGTGGCCAGT G/- GGGGGAGAGA 3070 het 3070 hom 33 15 14 6 G 6 5 295620 CASAVA_Build 2 70719647 1D GTGTGCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 17 8 A 11 10 295621 CASAVA_Build 2 70721520 1D ACGTGATAAG T/- TGAGAGACAG 2555 het 2555 ref 24 15 6 3 T 2 1 295622 CASAVA_Build 2 70724107 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1285 hom 32 5 9 18 T 12 11 295623 CASAVA_Build 2 70724412 1D CTGGCTAACT A/- AAAAAAAAAA 1899 het 1605 hom 22 7 11 5 A 13 12 295624 CASAVA_Build 2 70727509 7D4M2I CTGGGGGTAT GGGTGAAGCCT--/-------GCCTGG GGGCATGCAC 3070 het 3070 ref 33 18 14 4 N/A 0 0 295625 CASAVA_Build 2 70737039 1D GGGTGACTTC T/- TAGCCCTCTC 3070 het 3070 hom 35 12 13 12 T 2 1 295626 CASAVA_Build 2 70749933 1D ATGCATCTTC T/- TTAGTGTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 3 2 295627 CASAVA_Build 2 70750498 12D ATAGAGGGAG AGAGAGACAGAC/------------ AGAGAGACAG 3070 het 3070 ref 42 20 17 9 AGAGAGACAGAC 2 1 295628 CASAVA_Build 2 70755297 2D GGAAGCAAGG GT/-- GTGCCTCAGG 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 GT 2 1 295629 CASAVA_Build 2 70788201 1I GTGGGAATTT -/G GCGAAGCCCG 3070 hom 86 het 32 0 27 5 G 1 2 295630 CASAVA_Build 2 70800673 5D ATCCTAAGCC ATAAG/----- ATAAGAGGTG 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 ATAAG 2 1 295631 CASAVA_Build 2 70801038 1I ATCTCAAAAG -/C CTGAGCAGTG 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 C 1 2 295632 CASAVA_Build 2 70804033 1I AACAATTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 12 14 13 T 14 15 295633 CASAVA_Build 2 70806454 1D ATTTTGCTAA C/- CTGCAGATTC 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 C 2 1 295634 CASAVA_Build 2 70821271 1I TTTGTGGGGA -/T TTTTTTTGTT 1663 het 1663 ref 19 11 6 2 T 7 8 295635 CASAVA_Build 2 70832378 1D TACTTGACTA T/- TTAGGTTGTT 3070 het 3070 ref 51 25 24 3 T 3 2 295636 CASAVA_Build 2 70836712 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2870 het 1010 hom 19 4 8 7 A 16 15 295637 CASAVA_Build 2 70842041 2D CTGAGATCAG GA/-- GTTTGAGACC 2413 het 2054 hom 11 5 6 0 GA 1 0 295638 CASAVA_Build 2 70851216 1D TCCCCCCGGC A/- AAAAAAAAAA 2762 het 2037 hom 13 5 6 2 A 11 10 295639 CASAVA_Build 2 70855691 1I CATGATGAGA -/C CCCTATCTGT 3070 het 881 hom 27 3 17 7 C 3 4 295640 CASAVA_Build 2 70855704 1I TATCTGTACT -/A AAAAACACAA 3070 het 1554 hom 29 5 20 4 A 5 6 295641 CASAVA_Build 2 70857922 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 744 hom 19 2 11 6 A 16 17 295642 CASAVA_Build 2 70859143 1I TAAATTTTAA -/T TTTTTTTCAT 1632 het 1632 ref 19 12 5 2 T 7 8 295643 CASAVA_Build 2 70868976 11D ATCAAATGTA CAAATACTTGT/----------- CAACTCAAGC 3070 het 3070 hom 35 18 18 5 CAAATACTTGT 1 0 295644 CASAVA_Build 2 70869784 4I13M2D TGTACTGAAT ----ATTTTGTAAAAATTA/GACAATTTTGTAAAAAT-- TATATATATA 3070 het 1840 hom 22 5 14 5 N/A 0 0 295645 CASAVA_Build 2 70873374 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 26 0 19 7 A 9 10 295646 CASAVA_Build 2 70889698 1D GCCAGTTGTC A/- GACTGATTCT 3070 het 3070 hom 49 15 30 4 A 1 0 295647 CASAVA_Build 2 70890267 2D CCACACACGT CA/-- CACACACATA 3070 het 3070 hom 74 31 31 13 CA 5 4 295648 CASAVA_Build 2 70893665 1D CATCCTGGGA C/- CTGGTCATCA 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 C 2 1 295649 CASAVA_Build 2 70902227 1I GGACCCCACT -/G GGCCTTGCCC 3070 hom 108 het 42 0 35 7 G 2 3 295650 CASAVA_Build 2 70903087 1I TACTGCTTCA -/G GGGGTTCCTG 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 G 4 5 295651 CASAVA_Build 2 70904925 8I GAATGCAAAC --------/CACCATCT CACCTGGCTT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 CACCATCT 0 1 295652 CASAVA_Build 2 70906637 2D TTAAAAAAAA AT/-- TAGCTGGGCA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AT 1 0 295653 CASAVA_Build 2 70907182 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 8 7 295654 CASAVA_Build 2 70908436 4D AAGTGATTCA ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 28 17 9 3 ATAG 3 2 295655 CASAVA_Build 2 70916342 1I ATGTGGCTTG -/C CTCGGGGCCA 3070 hom 114 het 45 0 35 10 C 1 2 295656 CASAVA_Build 2 70916918 1I GAGTAATGGG -/A AAAAAAAAAA 1029 het 1029 ref 55 46 3 6 A 11 12 295657 CASAVA_Build 2 70918900 1I AAGCCTTAGC -/G GGCTGGGCCC 3070 hom 60 het 23 0 18 5 G 2 3 295658 CASAVA_Build 2 70947902 2D TTCTTCGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2463 hom 34 10 17 7 T 12 10 295659 CASAVA_Build 2 70948521 1I GCCACAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 T 10 11 295660 CASAVA_Build 2 70954334 1I ATAGGCTCGG -/C CCAAAGGGGA 3070 hom 71 het 32 0 17 15 C 2 3 295661 CASAVA_Build 2 70955807 1I TTGTTGTGGC -/T TTTTTTTTTT 2899 het 2899 ref 31 15 11 5 T 11 12 295662 CASAVA_Build 2 70964884 1D GTCTGAATTG A/- ATTGTGAGGA 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 A 2 1 295663 CASAVA_Build 2 70969404 1D CCCTTGCCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 A 10 9 295664 CASAVA_Build 2 70970607 1I CAAAAAAATA -/T AAAAATAAAA 2444 het 2444 ref 27 11 10 6 T 0 1 295665 CASAVA_Build 2 70971042 1D TCTAGCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 A 11 10 295666 CASAVA_Build 2 70971663 2D CACCTGAGCC CG/-- AGAGCAGAGC 3070 het 3070 ref 38 18 11 12 CG 1 0 295667 CASAVA_Build 2 70974991 1I TGGATGGAGA -/G GGCTTTTCAG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 G 2 3 295668 CASAVA_Build 2 70998393 1D GCAATCCCCC T/- TTTAGGTCTT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 4 3 295669 CASAVA_Build 2 70999998 1I TGGGGATCAT -/A ATAGTTCCAA 3070 het 3070 hom 40 16 23 1 A 1 2 295670 CASAVA_Build 2 71003657 2I GAGACAGATA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 GT 8 9 295671 CASAVA_Build 2 71004434 1D GCACTTCCAC G/- TGTTCGCCAA 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 G 1 0 295672 CASAVA_Build 2 71010117 8D ACGAGGTCAG GAGTTCGA/-------- GACCAGCCTG 1740 het 1740 ref 14 5 5 6 GAGTTCGA 1 0 295673 CASAVA_Build 2 71010448 1I AATCATTTGA -/G GAAACACGGC 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 G 1 2 295674 CASAVA_Build 2 71010886 1I TCAAAACACC -/A AACTCACATC 3070 het 3070 ref 55 25 26 4 A 2 3 295675 CASAVA_Build 2 71020410 1I AGCAGTGGGG -/A AGAGGACCCA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 A 1 2 295676 CASAVA_Build 2 71042645 24I CAAGAAGATC ------------------------/ATTTCCCTAAACATTTATTTAGAA AAACTGCTAT 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 ATTTCCCTAAACATTTATTTAGAA 0 1 295677 CASAVA_Build 2 71071068 2D TACGTTCTGG AC/-- ACACACACAC 1104 het 1104 ref 49 34 3 12 AC 8 7 295678 CASAVA_Build 2 71077579 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 650 het 333 hom 5 2 3 0 A 11 12 295679 CASAVA_Build 2 71088659 1I GATATTCAAC -/A GGCTGCTTCC 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 A 0 1 295680 CASAVA_Build 2 71092012 2D AGGGGTGGGC GA/-- GAGAGAGAGG 2477 het 2477 ref 19 8 7 4 GA 5 4 295681 CASAVA_Build 2 71101870 1I AGCAATCACA -/G GGGGGTCCCC 3070 hom 39 het 16 0 13 3 G 5 6 295682 CASAVA_Build 2 71117587 2I CATGTTGGCC --/GG GGGATGGTCT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 3 5 295683 CASAVA_Build 2 71147991 2I AATCTACTAA --/CT CTGTAATTCT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 CT 1 2 295684 CASAVA_Build 2 71158047 1I TTTTCCTCCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 T 9 10 295685 CASAVA_Build 2 71166384 1I GAGGCTGCAG -/A AGGTGCTCTG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 1 2 295686 CASAVA_Build 2 71174731 1I TCTTTTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2428 hom 25 7 10 8 T 11 12 295687 CASAVA_Build 2 71183714 2I TCATGAATGG --/CA CGTAGCACCA 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 CA 0 1 295688 CASAVA_Build 2 71186300 4D ATGGTGAGAG AGAA/---- AGAGAGAGCA 3070 het 3070 ref 37 18 15 7 AGAA 1 0 295689 CASAVA_Build 2 71194989 1D AAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 12 11 295690 CASAVA_Build 2 71205342 1I GGAAAAACTT -/A ACATCAGAAT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 1 2 295691 CASAVA_Build 2 71208268 4D CACGTAATAA GTTT/---- GTTTGTTTTT 2322 het 2322 ref 28 17 6 6 GTTT 3 2 295692 CASAVA_Build 2 71208737 1I CTATGATCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 8 9 295693 CASAVA_Build 2 71210135 1I GGAGGAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 11 12 295694 CASAVA_Build 2 71212335 3D AGCAGAGGAG GAC/--- GGGGTCACAA 2293 het 2293 ref 47 39 5 3 GAC 1 0 295695 CASAVA_Build 2 71214244 3I GAGAGCACTT ---/TCC TCCTCCTCAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TCC 2 3 295696 CASAVA_Build 2 71217208 1D CAAGAATATC A/- AAAGAATTGT 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 A 4 3 295697 CASAVA_Build 2 71222674 4D CATCTCAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 4 AAAG 4 3 295698 CASAVA_Build 2 71226148 2I GTTTGTTTGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 39 0 29 10 T 10 12 295699 CASAVA_Build 2 71231555 1D GAGCTAGGCT G/- GGGGCTACAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 5 4 295700 CASAVA_Build 2 71243348 1D TTAAAAGAGT A/- TTGTCTCAGC 1678 hom 10 het 4 0 4 0 A 1 0 295701 CASAVA_Build 2 71252201 3I AGTATTTTAA ---/AAT AATATTTTCA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 AAT 1 2 295702 CASAVA_Build 2 71260400 3I TGTCTACTCC ---/CCT CCTCCCCTGC 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 CCT 1 2 295703 CASAVA_Build 2 71263544 4I10M3I CAAGTAATGA ----TTAGGGGAAA---/TTATTTAGGAGAAAAAC AAAAGCAAAA 3070 hom 30 het 12 0 10 4 N/A 0 0 295704 CASAVA_Build 2 71284812 9D ATTATGAGTT CCATAAATA/--------- CCTGAGGCTT 3070 het 3070 hom 39 19 23 3 CCATAAATA 1 0 295705 CASAVA_Build 2 71298480 1I CCAAGGGGGG -/A AGATTACTTG 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 1 2 295706 CASAVA_Build 2 71300372 1I TACATAGTTC -/A AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 5 6 295707 CASAVA_Build 2 71307944 1I TCTTCCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 22 10 T 10 11 295708 CASAVA_Build 2 71323139 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 30 0 26 6 A 12 11 295709 CASAVA_Build 2 71340901 1D ACTAAAAATA C/- AAAATTAGCC 3070 hom 66 het 23 0 22 2 C 1 0 295710 CASAVA_Build 2 71353760 1I AAAACCTTCT -/A AAAAAAAAAA 2740 het 2740 ref 27 15 6 6 A 10 11 295711 CASAVA_Build 2 71363438 1D AAACATTTTG T/- ATGGGTAAAC 3070 hom 138 het 51 0 44 7 T 1 0 295712 CASAVA_Build 2 71366782 5D GTAGAGTGTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1092 hom 32 12 11 9 T 16 11 295713 CASAVA_Build 2 71367561 3D TTCTTGTTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTA 6 5 295714 CASAVA_Build 2 71370270 2I TATGTACAAC --/AT ATGCTAGTCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AT 1 2 295715 CASAVA_Build 2 71371451 1I TTGCCCCCCC -/G TCAGCCTCCC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 G 0 1 295716 CASAVA_Build 2 71390895 4D AGTTCTATCA TTTC/---- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 TTTC 2 1 295717 CASAVA_Build 2 71391970 1D ATTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1220 het 1220 ref 29 18 3 8 A 13 12 295718 CASAVA_Build 2 71393130 5D TGCCTTACTG ATAAC/----- ATAAACAGTT 3070 het 3070 ref 42 25 15 5 ATAAC 1 0 295719 CASAVA_Build 2 71399782 12D ATTCCTGAGG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2150 het 1739 hom 19 9 5 6 T 24 12 295720 CASAVA_Build 2 71402949 1I TATTCTTAGG -/T TTTGGTCATT 3070 het 2506 hom 23 6 12 5 T 3 4 295721 CASAVA_Build 2 71405357 1D TGGCAATTTT C/- TTTCTTTTTC 2424 het 2424 ref 31 16 9 6 C 1 0 295722 CASAVA_Build 2 71409500 2D GTCATAAATG AA/-- AAGATTGATA 3070 het 3070 hom 46 15 25 8 A 4 2 295723 CASAVA_Build 2 71409814 4I TTAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 86 het 33 0 26 7 AAAG 2 3 295724 CASAVA_Build 2 71414386 1D TTAGTCTTTC T/- TGAGCTTTTG 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 2 1 295725 CASAVA_Build 2 71423322 2D TTGTGCGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 GT 7 6 295726 CASAVA_Build 2 71435374 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 30 0 22 9 A 10 9 295727 CASAVA_Build 2 71438541 4I AACCCTGTGT ----/CAAG CAAGTCTACT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 CAAG 1 2 295728 CASAVA_Build 2 71442454 1D AATATTTAGC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 9 8 295729 CASAVA_Build 2 71444086 2D TCTCTTGTAA AT/-- GCCTTGAATG 3070 het 3070 ref 38 20 14 7 AT 1 0 295730 CASAVA_Build 2 71445947 1I AAAATCTAGA -/T TTTTTGTATT 3070 het 3070 hom 48 18 28 2 T 5 6 295731 CASAVA_Build 2 71447002 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1878 hom 23 6 9 9 A 13 12 295732 CASAVA_Build 2 71449680 4D CAACATAAAA TAGT/---- TAGTTAAGGC 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 TAGT 2 1 295733 CASAVA_Build 2 71449803 3I TGAAACCCCG ---/TGT TGTCTACTAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 TGT 1 2 295734 CASAVA_Build 2 71453935 3D TTTTCCTATT TTA/--- TTATTGTTGT 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 TTA 2 1 295735 CASAVA_Build 2 71457356 1D CAGAAAAGGT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 8 7 295736 CASAVA_Build 2 71461584 4D ATTTTGGAGG TTAA/---- TTGAGAGCCA 3070 het 3070 ref 41 24 16 2 TTAA 1 0 295737 CASAVA_Build 2 71465564 1I ATAAAAGCCC -/T TTTGCTCACC 2813 het 2813 ref 30 21 7 2 T 3 4 295738 CASAVA_Build 2 71466127 4D GATTAGTGAT AGTC/---- AGGGTTGGTG 3043 het 3043 ref 25 13 9 4 AGTC 1 0 295739 CASAVA_Build 2 71468294 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTCTCAAAAA 485 hom 12 het 26 0 5 22 CT 3 2 295740 CASAVA_Build 2 71475488 1I AGCAGGGTAC -/A AAATCAAAAG 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 A 3 4 295741 CASAVA_Build 2 71480188 1D CTGACTGTAC T/- TTTACAAGCA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 T 4 3 295742 CASAVA_Build 2 71481986 1D GGCAGAAAAC A/- AAAGTGCTTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 4 3 295743 CASAVA_Build 2 71486485 23D AGGTACTGGA GTGCATATTAAGTGGTCTAATAG/----------------------- GTCAATATCT 3070 het 3070 ref 30 16 15 2 GTGCATATTAAGTGGTCTAATAG 1 0 295744 CASAVA_Build 2 71499363 3D TGGCTCACAT GTA/--- GTGAAAAGTT 3070 het 3070 hom 37 16 20 3 GTA 1 0 295745 CASAVA_Build 2 71502000 1D GGTGTGATTA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 4 3 295746 CASAVA_Build 2 71512398 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2850 het 96 hom 9 2 7 0 A 15 14 295747 CASAVA_Build 2 71513330 1I ATAAAGACTT -/A ACGTTTTCTG 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 A 1 2 295748 CASAVA_Build 2 71515364 1I TTTATATTGC -/A AAATTGCTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 3 4 295749 CASAVA_Build 2 71519672 12D TGTGTGTGTT TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 1002 hom 31 7 12 19 TG 15 9 295750 CASAVA_Build 2 71521977 4I GCTAAAGAAG ----/AAAA AAAAACATGA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 5 9 295751 CASAVA_Build 2 71522055 3D AGTAGATCAT AAA/--- GAAGGAACTT 3070 het 3070 ref 30 18 12 3 A 3 0 295752 CASAVA_Build 2 71573337 1D CTCCCTTCCT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 95 hom 31 1 16 14 C 11 10 295753 CASAVA_Build 2 71587137 1I GAGTTGGAGA -/C CTGAGGACCT 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 C 1 2 295754 CASAVA_Build 2 71608230 1I ACGTTGTTTG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 7 8 295755 CASAVA_Build 2 71634670 2D GCACACACTG AC/-- ACACGGCTGT 3070 het 3070 ref 63 30 25 8 AC 3 2 295756 CASAVA_Build 2 71638670 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1456 het 1456 ref 28 20 4 5 A 13 12 295757 CASAVA_Build 2 71656477 1I CATTAGGCCT -/G GGCAGGAAAC 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 G 2 3 295758 CASAVA_Build 2 71658161 1D TCTCATGCAG C/- CCCCCCACTC 3070 het 1240 hom 53 7 23 23 C 7 6 295759 CASAVA_Build 2 71658309 2D CACACGCACC CA/-- CACACACTCT 3070 het 3070 hom 62 24 30 14 CA 4 3 295760 CASAVA_Build 2 71689635 1I GGGTTGGGCA -/C TAGCCATAAG 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 C 0 1 295761 CASAVA_Build 2 71699316 3I GTGTGGTAGA ---/GGT GGGATGTGAG 3070 het 2858 hom 42 10 18 14 GGT 0 1 295762 CASAVA_Build 2 71702256 2D CATATTTGTA TG/-- TGTGTATATA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TG 3 2 295763 CASAVA_Build 2 71702682 3D GCCATTTAAT TTG/--- TTTATTTCTC 3070 hom 80 het 29 0 27 2 TTG 1 0 295764 CASAVA_Build 2 71703814 1D TAGGGACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 21 7 T 11 10 295765 CASAVA_Build 2 71717150 1D TTGAGCATCT G/- GAAGGAGAGA 3070 hom 153 het 56 0 48 8 G 2 1 295766 CASAVA_Build 2 71726286 1I CTAGGCCTGT -/G GGCACAGGCC 3070 hom 80 het 34 0 26 8 G 2 3 295767 CASAVA_Build 2 71727644 2D AATGAAAAGA CT/-- CTCAAATATT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 CT 2 1 295768 CASAVA_Build 2 71729180 1D CCAAAATAGT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 114 het 46 0 39 8 A 8 7 295769 CASAVA_Build 2 71743133 2D TATTTGTGTG TA/-- TGTGTGTGTA 1538 het 1538 ref 63 29 16 19 TA 1 0 295770 CASAVA_Build 2 71743280 4I GTGTGTATTT ----/TGTG TGTGTGTATG 3070 hom 177 het 69 0 56 13 TG 3 5 295771 CASAVA_Build 2 71756963 1D ACTGTACATT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3062 hom 22 7 12 3 A 9 8 295772 CASAVA_Build 2 71764566 1I CCATGCAGTT -/C CTAACAGCTG 3070 hom 138 het 49 0 43 6 C 1 2 295773 CASAVA_Build 2 71774462 2D ATATAAAGGG TT/-- TTTTTTTTTT 1998 het 522 hom 46 7 9 30 T 18 16 295774 CASAVA_Build 2 71782121 2D CACATTTGTA TT/-- TTGTACTTGG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 4 2 295775 CASAVA_Build 2 71783493 1D GGGCCGACTC T/- TCCTTCATCC 3070 hom 64 het 25 0 22 3 T 2 1 295776 CASAVA_Build 2 71784732 1D CCTTCCATAT G/- GGGGAGATGG 3070 hom 30 het 19 0 12 7 G 5 4 295777 CASAVA_Build 2 71790975 1D AATCAGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 5 A 11 10 295778 CASAVA_Build 2 71795261 2D AATCAAGCAG TT/-- TCTTTGTCTG 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 3 1 295779 CASAVA_Build 2 71802419 1D TGACTATGAC T/- TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 35 9 6 20 T 17 16 295780 CASAVA_Build 2 71805176 1I GTTGGAAGAT -/A AAGTAAAGAC 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 A 2 3 295781 CASAVA_Build 2 71806198 2D TATTCGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 46 22 18 8 TG 8 7 295782 CASAVA_Build 2 71837141 1D ACTAACTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 508 hom 38 6 15 17 A 17 16 295783 CASAVA_Build 2 71845266 1D TTGAAGGAAT G/- GTGGATTCCA 3070 hom 93 het 33 0 31 3 G 2 1 295784 CASAVA_Build 2 71849345 2I ATGTGTGTGC --/AT ATATATATAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AT 4 5 295785 CASAVA_Build 2 71850880 4I ATATACACAT ----/ACAC ATACATACAC 3070 hom 49 het 41 0 16 25 AC 0 2 295786 CASAVA_Build 2 71850918 2I ATATACACAC --/AT ATATGTATAC 3070 hom 51 het 46 0 18 28 AT 2 3 295787 CASAVA_Build 2 71880515 1I GGCAATGTCA -/C CCTCACAGCT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 C 2 3 295788 CASAVA_Build 2 71900824 1D TAGCAATAGT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 295789 CASAVA_Build 2 71929785 4I GAGGGGCTGT ----/GCCC GCCCTGACGC 3070 hom 73 het 29 0 22 7 GCCC 1 2 295790 CASAVA_Build 2 71936883 4D TTCTCTTCCT AGTC/---- AGTCAGCAGC 3070 hom 87 het 35 0 29 7 AGTC 2 1 295791 CASAVA_Build 2 71949209 1I CTATTCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 8 18 9 T 13 14 295792 CASAVA_Build 2 71971565 2D CAAAAAACTA TG/-- TGGTGAACAC 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 TG 2 1 295793 CASAVA_Build 2 71990428 1D CCATAACCAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 A 8 7 295794 CASAVA_Build 2 72010908 1D CTTACAAGAC A/- AGCATTTGGA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 2 1 295795 CASAVA_Build 2 72031020 1D GACCTGATTT G/- GGGGAGTGCA 3070 het 3070 hom 47 20 18 9 G 5 4 295796 CASAVA_Build 2 72036652 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 12 11 295797 CASAVA_Build 2 72050704 1I CGTAAATGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 9 10 295798 CASAVA_Build 2 72053991 1D AGGATGCAAA T/- TTTACATTAC 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 T 4 3 295799 CASAVA_Build 2 72061382 13D AGGACATACC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 2704 het 1275 hom 24 6 10 10 A 23 10 295800 CASAVA_Build 2 72069439 1D AGAGAAGACG T/- GGAGGCAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 T 1 0 295801 CASAVA_Build 2 72076511 13I ACACCTTCAG -------------/TGCGGGGCAACCC TGTGATCTTT 3070 het 3070 ref 55 27 24 4 TGCGGGGCAACCC 0 1 295802 CASAVA_Build 2 72088246 1I ACCTGAGGGC -/A ACGGAGGACA 3070 het 3070 ref 37 15 14 8 A 1 2 295803 CASAVA_Build 2 72088329 1D ATTGTCTAAC A/- AAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 35 12 15 9 A 7 6 295804 CASAVA_Build 2 72089658 1D CCCAGGCTGG A/- GTGCAGTGGC 3070 het 1068 hom 17 3 10 5 A 1 0 295805 CASAVA_Build 2 72112531 3I CCTCCACGGA ---/GCT GCTGCTGGGC 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 GCT 2 3 295806 CASAVA_Build 2 72117310 1I CCTCCTTGGG -/C CCCCCCCCCG 736 het 664 hom 16 4 4 8 C 9 10 295807 CASAVA_Build 2 72126345 1I TTTTATACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 39 1 30 8 T 13 14 295808 CASAVA_Build 2 72152858 2I TAGAAGCATT --/AC ATAGTTTTAG 3070 het 3070 ref 56 27 24 5 AC 0 1 295809 CASAVA_Build 2 72160400 1I AGCCCGCCCA -/G GGCCAAGAGC 3070 hom 85 het 31 0 27 4 G 2 3 295810 CASAVA_Build 2 72195106 1I GACAGGGCAG -/C CCATGGCCCA 3070 hom 54 het 24 0 17 7 C 2 3 295811 CASAVA_Build 2 72216716 1D GGCTGCGCAG C/- CCCCCTTGCC 1655 het 1655 ref 32 15 8 9 C 6 5 295812 CASAVA_Build 2 72218175 1I GCCATAGTGG -/C CCAGGAGGGG 2656 hom 39 het 17 0 8 9 C 2 3 295813 CASAVA_Build 2 72292663 1D GCCGAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 1127 het 1127 ref 46 35 3 8 A 11 10 295814 CASAVA_Build 2 72393802 15D ACACATGGAT ACACAGAGAGGAACA/--------------- ACACAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 22 11 8 ACACAGAGAGGAACA 2 1 295815 CASAVA_Build 2 72417164 4I CAGATGTATT ----/AAAC AACAATATAC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 AAAC 0 1 295816 CASAVA_Build 2 72425090 1D GTTGATTTAC T/- TTTTTTTTTT 1162 het 1162 ref 38 33 3 2 T 11 10 295817 CASAVA_Build 2 72433369 1D ACTGTAATCA T/- TTTTTTTTTT 2130 het 2130 ref 32 19 5 8 T 13 12 295818 CASAVA_Build 2 72446918 1D ATATAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1374 het 1374 ref 39 29 3 7 A 11 10 295819 CASAVA_Build 2 72447974 1I TGATTAATCT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 63 het 30 0 22 8 A 8 9 295820 CASAVA_Build 2 72477612 1D AACTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 1375 het 1375 ref 41 29 3 9 A 13 12 295821 CASAVA_Build 2 72537650 1D CATGGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 1050 het 1050 ref 34 27 4 4 A 12 11 295822 CASAVA_Build 2 72545781 2I GGACAAAGTA --/AG AGCAACTGCC 3070 hom 138 het 48 0 46 2 AG 1 2 295823 CASAVA_Build 2 72573302 1I ATTCTGGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 9 10 295824 CASAVA_Build 2 72573957 2D CTGTTTTTCT CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 23 hom 40 2 25 14 C 15 13 295825 CASAVA_Build 2 72581240 2D AATAAAAAAC AT/-- GAGAAATACA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 AT 1 0 295826 CASAVA_Build 2 72605978 4I ACCAATAAAG ----/CCTT CTTTAATTGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CCTT 0 1 295827 CASAVA_Build 2 72611735 1I ATCTGTCAGG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 7 8 295828 CASAVA_Build 2 72616508 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 17 1 11 6 A 17 16 295829 CASAVA_Build 2 72620371 2D TGGGCTATGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 GT 8 7 295830 CASAVA_Build 2 72631557 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 1637 het 1221 hom 21 9 5 7 T 17 16 295831 CASAVA_Build 2 72632622 2D AATTCAGTAA GT/-- GTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 GT 2 1 295832 CASAVA_Build 2 72637388 1I GAGGTATTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 10 295833 CASAVA_Build 2 72638675 2D TTATAAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 1204 het 223 hom 25 6 3 16 A 12 10 295834 CASAVA_Build 2 72649973 1D CACAACATTA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 T 9 8 295835 CASAVA_Build 2 72663177 1I AAGTACAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 542 hom 26 2 20 4 T 12 13 295836 CASAVA_Build 2 72669779 1D CTTAAAAAAT A/- AAAAAATTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 6 295837 CASAVA_Build 2 72670168 1I ACATTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 10 11 295838 CASAVA_Build 2 72711829 2D GCAAGTGTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 16 hom 48 1 34 13 AT 7 6 295839 CASAVA_Build 2 72718176 1I CTGTAATCCC -/A AGCACTTTGG 3070 hom 55 het 23 0 16 7 A 1 2 295840 CASAVA_Build 2 72729455 1D AAAATGTTGC A/- ATGTTCTCAT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 2 1 295841 CASAVA_Build 2 72747145 3D ATTCAATATA GTG/--- GTGGAAGTCT 3070 het 3070 ref 34 17 10 9 GTG 2 1 295842 CASAVA_Build 2 72749084 1I TTGTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 A 12 13 295843 CASAVA_Build 2 72772483 1D CCCACCTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 38 het 17 0 12 5 T 10 9 295844 CASAVA_Build 2 72802642 2D GCTCTAATTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 31 1 17 14 A 16 14 295845 CASAVA_Build 2 72811531 3I ACAAAAGGTT ---/AAG AAGATGTTAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AAG 1 2 295846 CASAVA_Build 2 72845727 1I CCATCACTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 10 295847 CASAVA_Build 2 72848926 2D GAATGCAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 1202 het 533 hom 20 5 5 10 T 19 17 295848 CASAVA_Build 2 72887381 1I GTGAGATGGT -/A TGTCATTGTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 0 1 295849 CASAVA_Build 2 72893329 1I CCCCATCTCT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 27 het 16 0 9 7 A 6 7 295850 CASAVA_Build 2 72896914 2I ATCCAGAAAC --/AG AGAACTAGTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AG 1 2 295851 CASAVA_Build 2 72898265 1I CAAAAATAAA -/T ATGTCAGGCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 295852 CASAVA_Build 2 72903318 4I GTATTTTAGG ----/GATA GATATACTAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 GATA 1 2 295853 CASAVA_Build 2 72925445 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 11 10 295854 CASAVA_Build 2 72932846 1D ATTGGAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 17 13 T 15 14 295855 CASAVA_Build 2 72934162 1D ATGCAGCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 11 10 295856 CASAVA_Build 2 72939619 1I CATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 36 1 31 4 T 10 11 295857 CASAVA_Build 2 72941548 1I GAACACACAC -/A AAAAAAATGT 3070 het 438 hom 35 2 30 3 A 7 8 295858 CASAVA_Build 2 72942593 1D AAATATAATT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 7 295859 CASAVA_Build 2 72942712 1D CCTTTTCCCA G/- GGGGGTTGGA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 6 5 295860 CASAVA_Build 2 72957303 4D AAGCTGTTTA TTTG/---- TTTATTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTTG 1 0 295861 CASAVA_Build 2 72997940 1I GACGGCGGCA -/G CGGCCACCAG 2510 hom 29 het 18 0 11 7 G 0 1 295862 CASAVA_Build 2 73017564 1I CCTGCTGGTG -/C CCTCGGCGTG 3070 hom 71 het 27 0 18 9 C 2 3 295863 CASAVA_Build 2 73039342 1I GAAATACCCG -/C CCTTCCCTCT 3070 hom 95 het 35 0 28 7 C 2 3 295864 CASAVA_Build 2 73049346 4D GGTCTCCTTT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 81 het 39 0 27 12 TTCC 5 4 295865 CASAVA_Build 2 73087266 1I AGATTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 12 8 A 14 15 295866 CASAVA_Build 2 73090496 1D GTAAGGAGAG A/- GTGGAAACGT 3070 het 3070 ref 55 24 21 10 A 1 0 295867 CASAVA_Build 2 73097815 1D AAAAAGGGGG A/- AAGCAGATAT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 A 3 2 295868 CASAVA_Build 2 73111315 1I TGGAAACCGC -/T GTCTGCTTTC 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 T 0 1 295869 CASAVA_Build 2 73126695 18I AAGAACTTTA ------------------/AAAACAACCATGGCTTCC AGCCTGGCTA 2731 het 2731 ref 34 20 7 7 AAAACAACCATGGCTTCC 0 1 295870 CASAVA_Build 2 73133220 3I TAGTATTGAA ---/TTG TTGTTATTAA 3070 het 3070 hom 37 10 25 2 TTG 1 2 295871 CASAVA_Build 2 73145734 1I AGAAGTTGTT -/A AAAAAACTTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 6 7 295872 CASAVA_Build 2 73147481 10D TCTACAAAAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 5 AAAAG 3 1 295873 CASAVA_Build 2 73147687 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 9 8 295874 CASAVA_Build 2 73152872 1I GGAGCATGCT -/G GGGCCTGCCC 3070 hom 66 het 26 0 20 6 G 3 4 295875 CASAVA_Build 2 73153904 4D TGCCCCCTTA TAAG/---- GGGCAGGGAC 3070 het 3070 hom 55 22 24 14 TAAG 1 0 295876 CASAVA_Build 2 73178598 3D CAGTTAGCAC CTA/--- CTGTGTGCTG 3070 het 3070 ref 53 29 20 5 CTA 1 0 295877 CASAVA_Build 2 73191656 5I AAGGAGGAAA -----/AAAAC AAAACAAGGT 2938 het 2938 ref 26 10 9 7 AAAAC 1 2 295878 CASAVA_Build 2 73232625 1I ACTCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 1436 het 1436 ref 39 29 4 6 A 11 12 295879 CASAVA_Build 2 73285524 1I TATTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2034 hom 16 het 14 0 5 9 T 12 13 295880 CASAVA_Build 2 73328988 1D GGAAGGGGTC T/- TTTTTTTTTT 834 het 834 ref 31 18 4 9 T 12 11 295881 CASAVA_Build 2 73353992 1D GTCGATCTTT G/- ACATCTAAGA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 G 1 0 295882 CASAVA_Build 2 73358222 1D ACTCTCTTTC A/- AGTCCTCATC 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 A 2 1 295883 CASAVA_Build 2 73360745 1I TGGATAGCGA -/C CCCCCCCTGC 1530 het 697 hom 13 3 6 4 C 7 8 295884 CASAVA_Build 2 73384486 1D ATGATAAAAA T/- TTTTTCTGAA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 6 5 295885 CASAVA_Build 2 73390858 1D TTTTTTTTTT C/- CTTAGGGTTA 3070 het 376 hom 32 1 26 5 C 2 1 295886 CASAVA_Build 2 73393869 12I CTGTCTGCCC ------------/GCCCCCTCGCCA GTACTGATTA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 GCCCCCTCGCCA 0 1 295887 CASAVA_Build 2 73395699 1D ACAGGCGTGA G/- CCACTGCGCC 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 G 1 0 295888 CASAVA_Build 2 73416761 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1460 het 1460 ref 26 16 4 6 A 12 11 295889 CASAVA_Build 2 73440551 1D CAGGAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 46 32 3 11 T 12 11 295890 CASAVA_Build 2 73458112 1D TTTCCCATTC A/- AAAAAAAAAA 1517 het 1517 ref 46 24 5 17 A 15 14 295891 CASAVA_Build 2 73480573 1D ATATTAATTG T/- TTTTTTTTTT 1722 het 1105 hom 35 11 6 18 T 19 18 295892 CASAVA_Build 2 73495010 1D TTTTAGTAGC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 6 5 295893 CASAVA_Build 2 73497435 4I AAATTGAATG ----/AATT AATTATTTAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AATT 1 2 295894 CASAVA_Build 2 73516177 1I CTATTCCCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 315 hom 27 1 25 1 T 9 10 295895 CASAVA_Build 2 73525677 1I TGAATTTGAG -/T TTTACTTCTC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 3 4 295896 CASAVA_Build 2 73526283 1I TTCGTCACCT -/A AGGAAGCCTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 295897 CASAVA_Build 2 73526421 1I TAGTATAGTC -/T TTTTCTGGCA 3070 het 381 hom 43 1 41 1 T 4 5 295898 CASAVA_Build 2 73527695 4I GATTATTGTC ----/TGTT TGTTTATTGC 3070 hom 132 het 50 0 42 8 TGTT 1 2 295899 CASAVA_Build 2 73528409 1D TTGTTGAAGA T/- TTAAAATGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 2 295900 CASAVA_Build 2 73528528 1D CAAAGCTGGC T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 7 6 295901 CASAVA_Build 2 73528736 3I GCTGTAAGTT ---/CTC CTCTAGAAAC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 CTC 1 2 295902 CASAVA_Build 2 73547753 2I AAAAATACAC --/TA TTCATAAAAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TA 0 1 295903 CASAVA_Build 2 73553889 1I ACTGGGAGTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 112 het 43 0 38 5 T 8 9 295904 CASAVA_Build 2 73559261 1I AGCTAATGAC -/A GAATATTTTT 3070 hom 30 het 17 0 11 6 A 0 1 295905 CASAVA_Build 2 73641840 1D TGTAGTTCAG G/- CCTACTCAGG 3070 het 3070 ref 79 32 9 41 G 2 1 295906 CASAVA_Build 2 73644734 1I GGTTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 2897 het 2897 ref 35 18 11 6 A 10 11 295907 CASAVA_Build 2 73654390 1D TTTATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 17 25 8 T 12 11 295908 CASAVA_Build 2 73654487 1D TAATACAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 8 T 11 10 295909 CASAVA_Build 2 73673748 3I GAGATCATTA ---/GAG GAGATGCGTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GAG 1 2 295910 CASAVA_Build 2 73707968 1I AATAACTGCC -/G GGGGGGGGAG 3070 hom 67 het 29 0 22 7 G 8 9 295911 CASAVA_Build 2 73709392 1D TTCTATTCAT A/- AGGTTTTTTC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 2 1 295912 CASAVA_Build 2 73734030 4I TTATTAATTA ----/AATT AATTATATTC 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AATT 1 2 295913 CASAVA_Build 2 73734830 1D TCCCTTTTTG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 9 8 295914 CASAVA_Build 2 73740521 1I TATGTTTTTT -/C GTATGAGATT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 0 1 295915 CASAVA_Build 2 73768775 1I24M4D CAGCGGTTGG -AAGAGTCTGGAGGGCCCAGAAGACAGAA/AAAGAGTCTGGAGGGCCCAGAAGAC---- AGATGAGAAA 3070 het 3070 ref 34 35 9 7 N/A 0 0 295916 CASAVA_Build 2 73769450 1D AAGGTTTTTT C/- CGACCACATA 3070 hom 114 het 39 0 39 1 C 2 1 295917 CASAVA_Build 2 73772418 1D CCTACTGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 28 0 21 8 A 10 9 295918 CASAVA_Build 2 73779098 1D13M1D CTTCCATATG TTTTTTTTTTTGTCT/-TTTTTTTTTTGTC- TTTTTTTTTG 3070 hom 12 het 27 1 17 13 N/A 0 0 295919 CASAVA_Build 2 73793180 1I AAGAATATAC -/A AAAAACTCAC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 5 6 295920 CASAVA_Build 2 73793536 1I CTGGCTAATT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 59 het 24 0 20 4 A 8 9 295921 CASAVA_Build 2 73793620 14I GTCTTCCCAC --------------/CTCAGCCTCCCAAA ACACTGAGAT 3070 hom 54 het 19 0 18 1 CTCAGCCTCCCAAA 0 1 295922 CASAVA_Build 2 73801966 1I AGGGCAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 910 hom 24 3 13 8 A 14 15 295923 CASAVA_Build 2 73808166 2D ATAATAAAAA AC/-- AAAACAAAAC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 AC 1 0 295924 CASAVA_Build 2 73815968 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 12 11 295925 CASAVA_Build 2 73821722 3I ATTTATTTAT ---/TTA TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 24 6 TTA 0 1 295926 CASAVA_Build 2 73905267 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TTTC 1 0 295927 CASAVA_Build 2 73912288 3D CTCCATTGAC AAT/--- GATACATAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 AAT 1 0 295928 CASAVA_Build 2 73927717 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2083 het 1757 hom 23 8 7 9 A 17 16 295929 CASAVA_Build 2 73985295 1D CCTATATATA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2047 hom 13 5 8 0 T 9 8 295930 CASAVA_Build 2 73991307 5I CTTATTTTTG -----/TCTTT TCTTTATTTA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 TCTTT 1 2 295931 CASAVA_Build 2 73991602 2I ACTAAAATAT --/AC ACACATTAGC 3070 het 2888 hom 22 9 11 2 AC 2 3 295932 CASAVA_Build 2 73995673 1D AAAATTAGGG A/- AAAATCTCAT 3070 hom 44 het 21 0 14 8 A 5 4 295933 CASAVA_Build 2 73997010 2D TCCATCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 34 3 19 13 A 16 14 295934 CASAVA_Build 2 74007150 1D ACAAGCACCT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 60 het 28 0 22 6 G 10 9 295935 CASAVA_Build 2 74014244 1D ATTTTTTGCC T/- TTTTTTTTTC 2720 het 2720 ref 52 33 7 12 T 10 9 295936 CASAVA_Build 2 74015723 4I ATAAATAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAAC 2 3 295937 CASAVA_Build 2 74022545 1D TGTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 29 0 22 8 T 17 16 295938 CASAVA_Build 2 74023234 3D TTAATTTCTC ATT/--- ATTTTTTTAT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 ATT 2 1 295939 CASAVA_Build 2 74030814 4D GATTCACTTG TTTA/---- TTTGTTTTGG 3070 hom 101 het 40 0 33 8 TTTA 1 0 295940 CASAVA_Build 2 74039917 1I AGCATGGGGG -/A ACCTGTCCCG 3070 hom 89 het 35 0 28 7 A 1 2 295941 CASAVA_Build 2 74050306 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 841 hom 32 2 24 6 T 8 9 295942 CASAVA_Build 2 74052114 1I CTGGGATTAC -/A AGGCATGCGC 3070 hom 78 het 28 0 26 3 A 1 2 295943 CASAVA_Build 2 74054490 1D GTCCAGCTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2507 hom 21 9 9 3 T 9 8 295944 CASAVA_Build 2 74071802 3I TGGTCTTGAA ---/CTC CTGGTGAATT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 CTC 0 1 295945 CASAVA_Build 2 74073250 3D TGCCCGGCCC TTG/--- TTGTTTTTTT 3070 het 2019 hom 21 5 15 1 TTG 2 1 295946 CASAVA_Build 2 74097375 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 7 8 295947 CASAVA_Build 2 74111596 1I CTTAACGTGA -/T TTTTTTTTTG 2774 het 2562 hom 20 7 10 3 T 9 10 295948 CASAVA_Build 2 74126892 1I TTTCCTTTTT -/C CCCCCTTCTC 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 C 5 6 295949 CASAVA_Build 2 74143825 1D GGCCTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 9 10 T 13 12 295950 CASAVA_Build 2 74147234 2I TAAAAGAAAC --/AA TGCTTTTAAG 3070 het 3070 ref 45 17 19 9 A 0 2 295951 CASAVA_Build 2 74148980 2I GTACACGAAC --/TG TAGCATCTTA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 TG 0 1 295952 CASAVA_Build 2 74149781 1D TATAGTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2605 het 2605 ref 29 14 8 8 T 11 10 295953 CASAVA_Build 2 74155390 2I ATGTGTGGAA --/AC ACACTTAGTG 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 AC 2 3 295954 CASAVA_Build 2 74155518 1I GTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 9 10 295955 CASAVA_Build 2 74166267 12I CACATGCGCA ------------/GTTCACAATAGG GTTCATGCTC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 GTTCACAATAGG 0 1 295956 CASAVA_Build 2 74172546 1D TTCTGTGATG T/- GTGGAAACAT 3070 het 3070 hom 38 13 16 10 T 1 0 295957 CASAVA_Build 2 74186334 4D TAAAGCGCTA AAGC/---- AAGGAAAGAA 3070 hom 86 het 33 0 26 9 AAGC 1 0 295958 CASAVA_Build 2 74186729 1I GTCTCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 46 0 35 11 T 10 11 295959 CASAVA_Build 2 74210730 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2109 het 1253 hom 20 5 8 7 A 18 17 295960 CASAVA_Build 2 74223958 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 40 hom 15 1 12 2 T 10 9 295961 CASAVA_Build 2 74230679 2D TTTTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2153 het 308 hom 20 4 8 8 A 18 16 295962 CASAVA_Build 2 74235172 2D TTAGTGGTGA AG/-- AGAGGGAACA 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 AG 3 2 295963 CASAVA_Build 2 74258657 6I TATGAATTTG ------/TTTTAA TTTTAACTTT 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 TTTTAA 1 2 295964 CASAVA_Build 2 74262242 1I AGGGTTAGGG -/A AAAAATCCTC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 5 6 295965 CASAVA_Build 2 74274922 1D AAGACTGGAA T/- TTTTTTTTTT 2090 het 2090 ref 21 7 8 6 T 17 16 295966 CASAVA_Build 2 74276154 1D GTTTTATGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 11 10 12 T 10 9 295967 CASAVA_Build 2 74278935 5I16M16D AATGAATGAA -----CTTTTCTCTTGTGTTGTCCGGCCTTCGGTGAC/CTTTTCTTTTCTCTTGTGTTG---------------- ACTAGCGGCG 3070 het 3070 ref 41 31 13 8 N/A 0 0 295968 CASAVA_Build 2 74293545 1I TTCAGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 2818 het 2818 ref 25 13 7 5 T 11 12 295969 CASAVA_Build 2 74298925 3D AATTTTAAAT TGA/--- TATTTGTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 TGA 1 0 295970 CASAVA_Build 2 74320431 17I GAGGCAGGAT -----------------/GCCTTTTCCCTCAGCAG GCCTGGCTCC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 GCCTTTTCCCTCAGCAG 0 1 295971 CASAVA_Build 2 74321405 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 13 14 295972 CASAVA_Build 2 74325116 1D7M1D TTTCTTTCTT CTCCTTTCT/-TCTTCTC- CTCTCCCTTC 3070 het 3070 ref 25 11 12 5 N/A 0 0 295973 CASAVA_Build 2 74388453 1I CCATCCCCAT -/G GCCAGGCCCC 3070 hom 37 het 17 0 11 6 G 1 2 295974 CASAVA_Build 2 74397988 1D GAACAGATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 T 10 9 295975 CASAVA_Build 2 74412967 2D CAAAATAAAC AT/-- ACATTGACAG 3070 het 3070 hom 48 19 23 7 AT 1 0 295976 CASAVA_Build 2 74436966 2D GCCCTGGGCC TA/-- TACTTGACAG 3070 het 3070 hom 52 20 22 11 TA 2 1 295977 CASAVA_Build 2 74440246 1I TCGTGGATGT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 A 7 8 295978 CASAVA_Build 2 74449677 1I TGAAGCCCAG -/A ACCCCATACC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 1 2 295979 CASAVA_Build 2 74452508 3D ACAGTGAGAA AAG/--- AAGAATGAAG 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 AAG 2 1 295980 CASAVA_Build 2 74465160 1I AGAGGAGGGG -/A AAAAATCTCT 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 A 5 6 295981 CASAVA_Build 2 74468412 4I TCCCCCTTCA ----/GTCT ATTTCCACAT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 GTCT 0 1 295982 CASAVA_Build 2 74481207 1I CTAACACTTT -/G GGGGGGCCAA 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 G 6 7 295983 CASAVA_Build 2 74483832 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAATA 1218 het 1218 ref 10 5 3 2 A 9 8 295984 CASAVA_Build 2 74486202 1D GATCGCACCA C/- TGCACTCCAC 2314 het 1982 hom 14 5 5 4 C 1 0 295985 CASAVA_Build 2 74488851 15D AGTCATTCCT AAGAAGGTGAGACAC/--------------- AAGGAGAGTG 1834 het 1834 ref 50 28 6 21 AAGAAGGTGAGACAC 1 0 295986 CASAVA_Build 2 74490104 1D CTTAATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 A 13 12 295987 CASAVA_Build 2 74500923 1D GTAATCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 13 12 295988 CASAVA_Build 2 74511701 1I CCAGTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 T 14 15 295989 CASAVA_Build 2 74513887 1I CAAAAAAAAA -/C AAAAACATAT 2305 het 255 hom 6 1 5 0 C 0 1 295990 CASAVA_Build 2 74540767 7I CCCTTTTCCA -------/CACATTT CACATTTCAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 CACATTT 1 2 295991 CASAVA_Build 2 74645858 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2316 hom 23 8 10 5 A 13 14 295992 CASAVA_Build 2 74668600 1D TTATAAAATT A/- AAGTGTGTTT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 A 3 2 295993 CASAVA_Build 2 74694181 1I AAGTTGAGTA -/T TTCCTTTCTG 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 T 2 3 295994 CASAVA_Build 2 74732020 1D AGAACAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 T 10 9 295995 CASAVA_Build 2 74732556 1D GGACAATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2799 hom 30 9 11 10 T 11 10 295996 CASAVA_Build 2 74736805 1D CACCTTGCCT G/- GCTAATTTTT 3070 het 561 hom 16 2 11 3 G 2 1 295997 CASAVA_Build 2 74748819 2I AGCAGAAGAC --/TT TGCTCTTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 1 3 295998 CASAVA_Build 2 74764724 1D CCAAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 803 hom 37 8 13 16 T 17 16 295999 CASAVA_Build 2 74771142 2I GCACTAAGAC --/AT GTTTGATAAT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 AT 0 1 296000 CASAVA_Build 2 74781728 1I ATGTGTAGCA -/C CCCAGCTGCC 3070 het 3070 ref 48 27 12 9 C 3 4 296001 CASAVA_Build 2 74783016 1D AAAATTGCTC A/- TCAGCATCTA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 1 0 296002 CASAVA_Build 2 74786412 14D TATTGTCCAG GCTGGTCTTGAACT/-------------- GCTGGTCTCA 3070 het 3070 ref 29 16 10 5 GCTGGTCTTGAACT 1 0 296003 CASAVA_Build 2 74786599 2I TTTTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 9 11 296004 CASAVA_Build 2 74787079 2D TGAGACAAAC AT/-- AGGGTCATGG 3070 het 3070 ref 48 23 19 8 AT 1 0 296005 CASAVA_Build 2 74787471 1I AGCACTTCTC -/A AGTGAGTGAG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 1 2 296006 CASAVA_Build 2 74787720 4I TGTATCTGAC ----/AAAT AAATGCATTT 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 AAAT 1 2 296007 CASAVA_Build 2 74793822 3D GCTAGTTGTT ATC/--- ATTATTAATA 3070 het 3070 ref 49 22 22 10 ATC 1 0 296008 CASAVA_Build 2 74797396 4D AAAGAGTCAT TAAC/---- TAAGTAGATG 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 TAAC 1 0 296009 CASAVA_Build 2 74800122 1D AGATGATTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 9 8 296010 CASAVA_Build 2 74802898 8I AGCGGGTCCT --------/GTGGTATA GTGGTATAGT 3070 het 3070 hom 56 20 24 12 GTGGTATA 1 2 296011 CASAVA_Build 2 74811517 4I GCCTCCTCAG ----/TTTC TTTCCTTAGG 3070 het 3070 ref 50 24 16 10 TTTC 1 2 296012 CASAVA_Build 2 74816848 4D AGAGATATAA CTTT/---- CTTTCTGTTC 2288 het 2288 ref 16 9 6 1 CTTT 2 1 296013 CASAVA_Build 2 74824142 1I TCTGGCACAC -/A GGGGCAATGA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 0 1 296014 CASAVA_Build 2 74824683 2I GCTTGGGATG --/AC ACATACATGG 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 AC 1 2 296015 CASAVA_Build 2 74832505 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1305 hom 18 3 13 2 A 11 12 296016 CASAVA_Build 2 74836206 1D CCACCAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 39 0 26 13 T 12 11 296017 CASAVA_Build 2 74837023 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 25 2 15 8 A 15 14 296018 CASAVA_Build 2 74838882 1I CCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 28 2 22 4 T 11 12 296019 CASAVA_Build 2 74851169 1D AACCAAAGGT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 9 8 296020 CASAVA_Build 2 74852027 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1288 het 972 hom 9 3 5 1 A 11 10 296021 CASAVA_Build 2 74852105 2D AAAGAAAAAG AA/-- AGAAAGAAGG 1565 het 1565 ref 25 8 7 11 A 3 1 296022 CASAVA_Build 2 74852154 4D TTGAGAAGTT AAAC/---- AATAGTTAAG 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 AAAC 1 0 296023 CASAVA_Build 2 74859708 2I CTGCCCTCTC --/CT CTCCCTGCAC 3070 hom 85 het 34 0 28 6 CT 1 2 296024 CASAVA_Build 2 74860579 2I AATCAGACTC --/TG TGCTGGACAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TG 1 2 296025 CASAVA_Build 2 74871127 2I CTTCTTCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 28 0 17 11 T 14 16 296026 CASAVA_Build 2 74885717 1D TCTGTGGGGT C/- CTTTTTGCAA 1805 het 1805 ref 31 21 6 4 C 2 1 296027 CASAVA_Build 2 74893396 1I AAGTTGGAGG -/C CAGCCTGGGC 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 C 1 2 296028 CASAVA_Build 2 74906973 1D TCGGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 2016 het 1519 hom 15 5 6 4 A 13 12 296029 CASAVA_Build 2 74909920 2I TTAATAACAA --/TT TTTTTTTTTT 2178 het 2178 ref 29 12 10 7 T 12 14 296030 CASAVA_Build 2 74911839 1I TGCCCTTGAA -/T TTTTTTTTTT 1389 het 1389 ref 23 8 5 10 T 15 16 296031 CASAVA_Build 2 74926954 1I GCAACCTGCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 8 9 296032 CASAVA_Build 2 74929105 5D12M2D ATTTCCAGAA TTAATTTCTTGTAAAATTA/-----TTCTTGTAAAAT-- TGTTTCTGTA 3070 het 3070 hom 44 20 26 1 N/A 0 0 296033 CASAVA_Build 2 74948612 2I ACCCAACATG --/TA TACTCAGTAT 3070 het 3070 ref 59 27 24 8 TA 1 2 296034 CASAVA_Build 2 74949756 1D AGTCCGGATT A/- AAAAAAAAAA 1874 het 1874 ref 37 30 4 4 A 11 10 296035 CASAVA_Build 2 74961707 3I ACATAAGGTT ---/TTA TTATTACACA 3070 hom 132 het 49 0 42 7 TTA 2 3 296036 CASAVA_Build 2 74977928 1I GAAACTTTCC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 T 7 8 296037 CASAVA_Build 2 74979616 1D TAAACAACAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 9 8 296038 CASAVA_Build 2 75002202 2D TCCCAGACTC TT/-- TCCTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 T 3 1 296039 CASAVA_Build 2 75003894 14D TTTTCTTTCC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 2936 het 1861 hom 21 9 10 3 T 25 11 296040 CASAVA_Build 2 75011126 4I TTTGGGTGAT ----/CCTC AATCAGGCGC 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 CCTC 0 1 296041 CASAVA_Build 2 75015193 5I AGAGAAAGAT -----/AAAAC AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 AAAAC 0 1 296042 CASAVA_Build 2 75018168 2I GTTGGGAAAA --/AG GTGGAAATTC 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 AG 0 1 296043 CASAVA_Build 2 75020213 4D CACTCACTGA CTGT/---- CTGGGTGGTG 3070 het 3070 ref 30 17 11 5 CTGT 1 0 296044 CASAVA_Build 2 75035366 1D AATAGGAGCT G/- GGCAAAATGA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 G 3 2 296045 CASAVA_Build 2 75048035 1I ATCTGTTGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 9 10 296046 CASAVA_Build 2 75066630 2I GATTTTAAAC --/AG AAAAATAATT 3070 het 3070 hom 36 10 25 1 AG 0 1 296047 CASAVA_Build 2 75074837 1D CGTATAGGTT C/- CCCCCCCCCC 1373 het 41 hom 9 1 4 4 C 14 13 296048 CASAVA_Build 2 75092944 7I TTTAAATGCA -------/AAGTACT TTAACTCCTC 3070 het 3070 ref 38 22 8 8 AAGTACT 0 1 296049 CASAVA_Build 2 75094766 3D TAAAATATTT GAG/--- GAGGATTATG 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 GAG 2 1 296050 CASAVA_Build 2 75105835 3I TGCCTCCCTC ---/CTT CTTCCTATGC 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 CTT 1 2 296051 CASAVA_Build 2 75116695 1I GCAGTTTGTA -/T TTAGTTGTTT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 2 3 296052 CASAVA_Build 2 75122541 1D GAAAATCTAG A/- AAGTGAAAGT 3070 het 3070 hom 38 14 21 5 A 3 2 296053 CASAVA_Build 2 75178014 1I TCTTCATTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 819 hom 40 2 33 5 T 12 13 296054 CASAVA_Build 2 75186588 1I CGTCCCGGAT -/G GGATCCTGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 2 3 296055 CASAVA_Build 2 75188599 2D TATAATTGTA TG/-- TTATTAAATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TG 1 0 296056 CASAVA_Build 2 75203792 32I ATTATTTCCC --------------------------------/AAACGCAAATTGTTTTCCCCCTACAAAGCTGG AAATGCAGCG 3070 hom 123 het 40 0 41 4 AAACGCAAATTGTTTTCCCCCTACAAAGCTGG 0 1 296057 CASAVA_Build 2 75222164 1I GGAGGCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 13 14 296058 CASAVA_Build 2 75234036 1I ACACCTAAGT -/G GGGTGACTGA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 G 3 4 296059 CASAVA_Build 2 75239685 1D TATTGGTACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 16 15 8 T 10 9 296060 CASAVA_Build 2 75240882 2I GAGTAAATAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 A 9 11 296061 CASAVA_Build 2 75259171 1I TTCCCCATTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 9 10 296062 CASAVA_Build 2 75268040 1D CCCTTGGTGG T/- ATACCTGGGA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 1 0 296063 CASAVA_Build 2 75276043 1I CTTTCCCCCC -/G ATCCCTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 G 0 1 296064 CASAVA_Build 2 75309310 1D ACTCAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 2908 het 2908 ref 36 12 10 14 T 13 12 296065 CASAVA_Build 2 75309598 1I TCAACTTTAT -/A ACATGGATTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 296066 CASAVA_Build 2 75311793 3I AAAGAAAAAA ---/AGT AAGCAATTAC 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 AGT 0 1 296067 CASAVA_Build 2 75317739 5D CTCTTCTTGA TTTCT/----- TTAAGTTCTT 1486 het 1486 ref 15 11 4 0 TTTCT 1 0 296068 CASAVA_Build 2 75323988 1I GGCGACAGAG -/C GAGAATCTGT 1070 het 1070 ref 21 12 3 6 C 0 1 296069 CASAVA_Build 2 75324513 1I GGGTTAATTG -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 A 6 7 296070 CASAVA_Build 2 75324950 4I TTCTGCATTT ----/CTTC CTTTAAATCT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 CTTC 0 1 296071 CASAVA_Build 2 75325939 4D GTAGAGTCTC TGAG/---- TGCTGTTCCT 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 TGAG 1 0 296072 CASAVA_Build 2 75326260 1D AGAACAAGCC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 45 22 20 3 T 8 7 296073 CASAVA_Build 2 75326836 1D TCTTGGGGAG A/- AAGACACACA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 3 2 296074 CASAVA_Build 2 75336898 1I TTTCAATAAC -/T TTTTTTTTTT 2845 het 395 hom 27 5 11 11 T 15 16 296075 CASAVA_Build 2 75338843 1I ATGTCTTTTT -/A ATCTCAGGTC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 A 1 2 296076 CASAVA_Build 2 75342784 2I CACATGGAAC --/CT CTCTGCCCAT 3070 het 3070 hom 56 19 32 5 CT 2 3 296077 CASAVA_Build 2 75354577 1I TTTGTGGGGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 9 10 296078 CASAVA_Build 2 75357808 1I CAATAAACTG -/A AAAAAAAAAA 1343 het 1343 ref 30 20 4 6 A 13 14 296079 CASAVA_Build 2 75406646 1I AGTTTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 10 11 296080 CASAVA_Build 2 75407867 2D GAAATGAGTA TG/-- TGTGTTTATT 3070 het 3070 hom 49 19 25 9 TG 3 2 296081 CASAVA_Build 2 75408445 1I TTAACCTGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 9 10 296082 CASAVA_Build 2 75413362 4I ATTTCTATAA ----/TATC TATCTATCTA 3070 het 1253 hom 16 5 8 3 TATC 3 4 296083 CASAVA_Build 2 75422093 1D ATTGGCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 11 10 296084 CASAVA_Build 2 75425385 1I AATCTTAAGC -/A AAAGCTATAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 3 4 296085 CASAVA_Build 2 75442593 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 1 0 296086 CASAVA_Build 2 75447967 3D TGTTTGGAAT TTC/--- TTTTCTTTAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 TTC 1 0 296087 CASAVA_Build 2 75457679 2I CTTAAAATAC --/AA GGAGATACTA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 0 2 296088 CASAVA_Build 2 75461623 1I ATGTGGAGGT -/G GGGGACCATC 3070 hom 15 het 41 1 35 5 G 4 5 296089 CASAVA_Build 2 75464340 5D TGTAATTCTC ATATG/----- ATATAATTCT 3070 het 3070 hom 34 16 16 5 ATATG 1 0 296090 CASAVA_Build 2 75472231 1I GAATGATTTT -/G GGATTAACAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 G 2 3 296091 CASAVA_Build 2 75478843 1D CAGAATTATG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 8 7 296092 CASAVA_Build 2 75511571 1D TTGACTGTAA T/- TTTCCCACTA 3070 hom 29 het 11 0 10 1 T 4 3 296093 CASAVA_Build 2 75516611 1D AAAATATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 22 1 20 1 A 11 10 296094 CASAVA_Build 2 75529050 1D TCCGCCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 31 1 28 2 A 12 11 296095 CASAVA_Build 2 75530468 1I TGTTATATCT -/A AAACTTAAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 3 4 296096 CASAVA_Build 2 75534851 1I GGGGTTGGAA -/C CCCAAGACAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 3 4 296097 CASAVA_Build 2 75547205 1D AATCACTCAA C/- TCTGTCATTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 0 296098 CASAVA_Build 2 75552453 5I CATCCTAAAA -----/TGTCC TGTGCAGGCA 3070 hom 144 het 51 0 48 3 TGTCC 0 1 296099 CASAVA_Build 2 75556871 1I CCTGTTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 10 296100 CASAVA_Build 2 75561356 1I CCTCCCAAAG -/T TTCTGGGATT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 2 3 296101 CASAVA_Build 2 75635362 1I CCCTAACACA -/G GTGCCTGGCA 3070 hom 81 het 33 0 26 7 G 1 2 296102 CASAVA_Build 2 75647482 1I TGCTTCTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 9 10 296103 CASAVA_Build 2 75657657 5I AAGATACAAA -----/AAAGC AAAGCAGAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AAAGC 1 2 296104 CASAVA_Build 2 75677154 1D AATCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 42 1 30 11 A 11 10 296105 CASAVA_Build 2 75682618 1D TCCAAAGCCC T/- TCATGTCACA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 2 1 296106 CASAVA_Build 2 75693982 10D AAGGGCCTGC GGGGGGGGGG/---------- GGGGGGGGGG 3070 hom 86 het 30 0 26 7 G 20 10 296107 CASAVA_Build 2 75706976 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 28 0 19 11 A 11 10 296108 CASAVA_Build 2 75714466 4D GCGTTAATAC TCAT/---- TCATACCTCA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 TCAT 2 1 296109 CASAVA_Build 2 75719845 3I ATGATGGCAT ---/ATC AAAACTTTCT 3070 hom 166 het 60 0 56 4 ATC 0 1 296110 CASAVA_Build 2 75724579 1D TTAAGAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 23 1 18 4 T 12 11 296111 CASAVA_Build 2 75736516 1I GAAAAACCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 750 hom 38 2 29 7 A 10 11 296112 CASAVA_Build 2 75738497 1D AATCTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 30 1 27 2 T 11 10 296113 CASAVA_Build 2 75739575 5I TATCACTATC -----/TTGTT TTGTTTTGTT 3070 hom 135 het 58 0 46 12 TTGTT 3 4 296114 CASAVA_Build 2 75752399 4D AGCCATGTTC ATTT/---- GTTTATGTAC 3070 hom 108 het 38 0 35 4 ATTT 1 0 296115 CASAVA_Build 2 75757101 1D AATATCATAC T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 48 40 3 5 T 13 12 296116 CASAVA_Build 2 75759720 4D ATTAAATAAG TGTT/---- TGTTATCTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TGTT 2 1 296117 CASAVA_Build 2 75766388 12D GGACCTCCCC CTTTAAGACTCA/------------ TGTATTCAAC 3070 hom 123 het 43 0 42 9 CTTTAAGACTCA 1 0 296118 CASAVA_Build 2 75772781 4D CGATAATGAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AT 12 10 296119 CASAVA_Build 2 75773009 1D ATGGGGGCCA G/- GATGTGGTAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 2 1 296120 CASAVA_Build 2 75774741 4I TAAGAGAATG ----/CTTA CTATCATCTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 CTTA 0 1 296121 CASAVA_Build 2 75788197 1I TTAAAACACT -/A AAAAAAAATA 3070 het 123 hom 33 1 27 5 A 8 9 296122 CASAVA_Build 2 75801301 1D TACATCTGTT A/- AAAAAAAAAA 1175 het 1175 ref 40 27 4 10 A 13 12 296123 CASAVA_Build 2 75812042 5D TGCAGCAGAA AAAAG/----- AAAAGACCCC 3070 het 3070 hom 41 14 24 4 AAAAG 2 1 296124 CASAVA_Build 2 75933783 1D GCGGAAGTGG T/- TTTTTTTTTT 1846 het 1846 ref 45 26 5 14 T 15 14 296125 CASAVA_Build 2 75941555 1I TTTGCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 43 1 33 9 T 10 11 296126 CASAVA_Build 2 75941940 1I TTTCCCCGGG -/T TCAGCTGTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 296127 CASAVA_Build 2 76002370 1I TATATAAGGC -/T TTTTTGAGAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 5 6 296128 CASAVA_Build 2 76007252 1I TGCATCCTAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 51 0 41 10 T 8 9 296129 CASAVA_Build 2 76014107 1I TACCAGACAA -/G GGTACAGAGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 2 3 296130 CASAVA_Build 2 76015402 1D ATCATTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 43 1 37 6 T 11 10 296131 CASAVA_Build 2 76058467 2D AAAGTATAAC AA/-- GAGTGTATTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 2 0 296132 CASAVA_Build 2 76082461 1D CCTCACACAC T/- TTTTTTTTTT 1562 het 1562 ref 47 35 5 7 T 13 12 296133 CASAVA_Build 2 76112449 2I TTTTAAAAAC --/AT ATTACTAACC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 AT 1 2 296134 CASAVA_Build 2 76120803 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 43 hom 34 1 26 8 A 10 9 296135 CASAVA_Build 2 76139012 1I CTGATTGTTG -/C CCCCCCAGGG 3070 hom 93 het 38 0 28 10 C 6 7 296136 CASAVA_Build 2 76144583 1I TTTTCCACAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 9 296137 CASAVA_Build 2 76149423 1D CAGATTGGAT A/- GGTATTAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 1 0 296138 CASAVA_Build 2 76169558 1I TCAGATGCTG -/T TAAGTCTTGT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 T 1 2 296139 CASAVA_Build 2 76185895 5I TAGTTATTCC -----/TCTTT TCTTTCTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TCTTT 1 2 296140 CASAVA_Build 2 76188452 1I CTTTCAAAAC -/G TTAAATATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 296141 CASAVA_Build 2 76192191 1I ATGATGCAAT -/A AAATTGAGAA 3070 hom 81 het 39 0 28 11 A 3 4 296142 CASAVA_Build 2 76193415 1I ACACAAAAAA -/G GTCTGGTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 2 296143 CASAVA_Build 2 76214510 6I GGATATATAG ------/TAGTAT TTTAATTTGC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TAGTAT 0 1 296144 CASAVA_Build 2 76236004 1I CTTTGTGGAA -/G GGTCCCGGTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 2 3 296145 CASAVA_Build 2 76243276 1D CTATCTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 26 2 14 10 A 16 15 296146 CASAVA_Build 2 76253648 2I TGGCTATGGG --/GA GGGGGGGGTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 GA 0 1 296147 CASAVA_Build 2 76254149 1I CTATTTGAAT -/A ACCTTTGTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 1 2 296148 CASAVA_Build 2 76263365 2I TGTGTGTGGT --/TG TGTGTCTGTA 3070 hom 107 het 40 0 36 4 TG 2 3 296149 CASAVA_Build 2 76282812 2I ACACACACAC --/AT ACACATATAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AT 0 1 296150 CASAVA_Build 2 76288361 5I TACTTTTTAT -----/TTTTA TTTTAAGTTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TTTTA 1 2 296151 CASAVA_Build 2 76294235 4D CAAGAAAAAA CAAT/---- CAATCCCATC 3070 hom 48 het 19 0 17 3 CAAT 2 1 296152 CASAVA_Build 2 76302783 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 1630 het 457 hom 14 1 8 5 A 15 16 296153 CASAVA_Build 2 76308923 4D TCCCCGACCC AACA/---- AACAAACAAA 3070 hom 82 het 35 0 27 13 AACA 4 3 296154 CASAVA_Build 2 76309600 3I GCAGTGAAAA ---/AGC AGACATTACA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AGC 0 1 296155 CASAVA_Build 2 76341792 1I TTTTTTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 11 12 12 A 10 11 296156 CASAVA_Build 2 76348295 4D AGGCTGAGGT AGAA/---- AGAAGGGTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AGAA 2 1 296157 CASAVA_Build 2 76348517 1I CCAGGGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 35 0 31 4 T 12 13 296158 CASAVA_Build 2 76357787 1D CAGTGTTTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 32 0 26 7 A 10 9 296159 CASAVA_Build 2 76358133 1I TTTAAAAAAA -/T ATATAATTGC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 0 1 296160 CASAVA_Build 2 76359460 1I TTGCTTCCCC -/T GGCTCTTCTT 3070 hom 114 het 48 0 38 10 T 0 1 296161 CASAVA_Build 2 76360133 1I ACTTAGAGGT -/G GGGGGAAGTC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 5 6 296162 CASAVA_Build 2 76374125 2D GTCATAATTT TA/-- TATGTCATCA 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 TA 2 1 296163 CASAVA_Build 2 76375430 1I TTGTGAGAGA -/G GGGGAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 G 4 5 296164 CASAVA_Build 2 76376212 1D CCAGGTGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 T 10 9 296165 CASAVA_Build 2 76377791 2D ACAAATACAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 40 0 33 8 T 12 10 296166 CASAVA_Build 2 76379887 1D ATTTTATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 T 13 12 296167 CASAVA_Build 2 76383066 1D TACTTACTAC T/- TTTTTTTTTT 2088 het 2088 ref 44 30 5 9 T 11 10 296168 CASAVA_Build 2 76385162 1D TTAGGTGCTC T/- TTTATGCTTT 3070 hom 144 het 64 0 49 16 T 4 3 296169 CASAVA_Build 2 76389315 1I ATTTTCTGCA -/T TTTTAATATG 3070 hom 138 het 53 0 46 7 T 4 5 296170 CASAVA_Build 2 76390028 5I TGTGAATCCT -----/AAGAG AAAATTCTAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AAGAG 0 1 296171 CASAVA_Build 2 76395282 2D TTAGACCATA AG/-- AAATTACTTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AG 1 0 296172 CASAVA_Build 2 76398835 1D GCTGGACATA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 54 30 22 2 T 7 6 296173 CASAVA_Build 2 76400053 1D TATTTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 20 0 18 4 T 11 10 296174 CASAVA_Build 2 76401975 2D TTTGATGAGC AG/-- AGTATTTTAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AG 2 1 296175 CASAVA_Build 2 76404908 1D TGCATCACAC A/- AATAGGAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 A 3 2 296176 CASAVA_Build 2 76405649 1I TGAACCTAAA -/G GCACAAATGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 1 2 296177 CASAVA_Build 2 76406672 1I TCAGCTTGTG -/T TATCAGTCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 296178 CASAVA_Build 2 76407412 9I CCTGACTAAT ---------/TCTGTATTA ACAGAAGAGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TCTGTATTA 0 1 296179 CASAVA_Build 2 76409202 4I AAAAAACAAC ----/CAAA CAACCAAACA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 CAAA 0 1 296180 CASAVA_Build 2 76409510 1D TAAATTTTTT A/- AAAAACATTT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 6 5 296181 CASAVA_Build 2 76411256 1I TTAAACTAAT -/G TAATTCTCTC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 G 0 1 296182 CASAVA_Build 2 76412810 1D TTTATCAGAT A/- AAGGAATTGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 2 296183 CASAVA_Build 2 76412924 4D24M1D ATTCCTTGTT AAACAAAACAAAATAAAAGCCTTACTGGA/----AAAACAAAATAAAAGCCTTACTGG- ATGAGTGAGA 3070 het 1366 hom 28 4 16 12 N/A 0 0 296184 CASAVA_Build 2 76413207 6D GAGGTTACAG TGAGCC/------ TGAGCCAAGA 3070 hom 53 het 20 0 14 7 TGAGCC 2 1 296185 CASAVA_Build 2 76415273 2D TTTATCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 T 13 11 296186 CASAVA_Build 2 76417469 1D TGGTTCAGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 55 het 24 0 19 5 T 9 8 296187 CASAVA_Build 2 76418832 1I AATACATTTT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 7 8 296188 CASAVA_Build 2 76419741 1D TGATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 19 27 5 T 13 12 296189 CASAVA_Build 2 76420473 1D TTTGACTTCT C/- AGTTTATAAC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 C 1 0 296190 CASAVA_Build 2 76423192 1D GATTTTAGGG T/- TTTTTCCCCT 3070 hom 106 het 43 0 36 7 T 6 5 296191 CASAVA_Build 2 76424993 1I GGCTGTGAGG -/C CTCAGTATAC 3070 hom 111 het 45 0 37 8 C 1 2 296192 CASAVA_Build 2 76436518 1I CACTGCCTTA -/G GATCTTAAAG 3070 hom 150 het 59 0 51 8 G 1 2 296193 CASAVA_Build 2 76437631 1I TGGAGGCCTA -/G GGGGGAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 24 10 G 5 6 296194 CASAVA_Build 2 76441725 1I AGAAAAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 10 11 296195 CASAVA_Build 2 76443758 2D AAATAGTAAA TC/-- TAGAAGTATC 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 TC 1 0 296196 CASAVA_Build 2 76446007 2D TGCAGTTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 37 1 30 7 T 14 12 296197 CASAVA_Build 2 76446084 2I TTGGTTTGCT --/AC AGTTTCTGGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AC 0 1 296198 CASAVA_Build 2 76447432 1I ACTTTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 11 12 296199 CASAVA_Build 2 76453714 1D TTTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 545 hom 17 2 12 3 T 15 14 296200 CASAVA_Build 2 76455619 1D AATTTATATG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 8 7 296201 CASAVA_Build 2 76457114 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 859 het 859 ref 19 7 3 9 T 15 14 296202 CASAVA_Build 2 76473470 1D ATCATACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 38 0 29 10 T 12 11 296203 CASAVA_Build 2 76484762 13D AAAATCTATT TAAGTGTGAAACC/------------- AGGTTTAGCA 3070 het 3070 ref 34 23 12 1 TAAGTGTGAAACC 1 0 296204 CASAVA_Build 2 76493088 4D TGGTTAAATT AATA/---- AATATCAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 AATA 2 1 296205 CASAVA_Build 2 76493441 24I AGACACCAAG ------------------------/ACAGACCATATTCTGGGTCATAAT ACAGACTCAT 3070 hom 120 het 42 0 40 4 ACAGACCATATTCTGGGTCATAAT 0 1 296206 CASAVA_Build 2 76496303 1I GAAACTTGCC -/T CTCTTTTTCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 0 1 296207 CASAVA_Build 2 76516512 1D TAAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 55 het 22 0 20 2 A 10 9 296208 CASAVA_Build 2 76518885 1D TTTTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 106 hom 35 1 17 17 T 15 14 296209 CASAVA_Build 2 76521345 6D TTTATTATAC TTTAAG/------ TTTTAGGGTA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 TTTAAG 1 0 296210 CASAVA_Build 2 76532007 1D TCAATAGAAT A/- AGGCCAATAC 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 A 2 1 296211 CASAVA_Build 2 76535569 1I TAGGAGAATC -/T TTTTTTTTTT 2888 het 2888 ref 29 13 9 7 T 15 16 296212 CASAVA_Build 2 76552239 6D CTTGAGCTCA AGAGTT/------ AGAGGCCAGA 3070 het 3070 hom 36 17 16 6 AGAGTT 1 0 296213 CASAVA_Build 2 76569636 7I GGATGGTCTT -------/GATCTAC GATCTACTGA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 GATCTAC 1 2 296214 CASAVA_Build 2 76588435 4I AAAAAATAAT ----/AGAA AGACTTTACC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AGAA 0 1 296215 CASAVA_Build 2 76598003 6D AGGTTGGTGC AAAAGT/------ AATTGTGGTT 3070 het 3070 hom 26 11 12 5 AAAAGT 1 0 296216 CASAVA_Build 2 76599165 1I ATGTTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 T 11 12 296217 CASAVA_Build 2 76606278 1I GGGTTCAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 10 15 5 T 9 10 296218 CASAVA_Build 2 76607018 1I TATTTGAGCA -/T TTTTTTTTTC 2169 het 2169 ref 32 17 7 8 T 9 10 296219 CASAVA_Build 2 76607067 1D AAATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1561 het 1561 ref 27 11 6 10 T 12 11 296220 CASAVA_Build 2 76607237 1D ATTTATTTCA T/- TAGTTATTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 2 1 296221 CASAVA_Build 2 76608119 2D TTCATATCAC AT/-- GTTATGTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 6 AT 1 0 296222 CASAVA_Build 2 76609593 1D TTTTTAAATC T/- TTTTTGTATG 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 T 6 5 296223 CASAVA_Build 2 76610697 1I TTGTCCCAAA -/C AAATTCAGAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 C 0 1 296224 CASAVA_Build 2 76614370 1I TTTTTGCCCC -/T GGGCTTCTCC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 0 1 296225 CASAVA_Build 2 76614880 2D CGATTTGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 31 1 23 8 T 16 14 296226 CASAVA_Build 2 76618926 1D TGAAACACAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 10 9 296227 CASAVA_Build 2 76621102 9D AGAGACAGAG ATTAACATT/--------- ATTTAATGAT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 ATTAACATT 1 0 296228 CASAVA_Build 2 76630293 1I AAACAGGGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 A 11 12 296229 CASAVA_Build 2 76633950 4I AATTTCAAAT ----/AAAC AAAGTTATCC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAAC 0 1 296230 CASAVA_Build 2 76635908 1I TCATCACTGC -/A ATACTGTACC 3070 hom 148 het 59 0 50 9 A 1 2 296231 CASAVA_Build 2 76636079 1D AAGGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 28 1 19 8 A 11 10 296232 CASAVA_Build 2 76636200 1I TATTTTCTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 8 9 296233 CASAVA_Build 2 76642461 1D AAAAGTGTTT G/- GAGAAGTATT 3070 hom 166 het 62 0 56 6 G 2 1 296234 CASAVA_Build 2 76653959 8D TTTCAAAATT TCAAAATG/-------- TCAAGCTGAT 3070 het 3070 hom 37 19 17 5 TCAAAATG 1 0 296235 CASAVA_Build 2 76658989 2D CCTAGAGAAA AG/-- AGAGAGTAGA 3070 hom 45 het 18 0 15 4 AG 4 3 296236 CASAVA_Build 2 76663345 1D TTATTGACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 11 10 296237 CASAVA_Build 2 76664551 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 9 10 296238 CASAVA_Build 2 76665954 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 1359 het 1359 ref 9 6 3 0 T 7 8 296239 CASAVA_Build 2 76666290 2D ATGTGATCCA CT/-- GTTAGTTTTT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 CT 1 0 296240 CASAVA_Build 2 76675040 1D AGTAGTCAAG A/- AAAGGTATGA 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 A 4 3 296241 CASAVA_Build 2 76677956 1I ATAAGGCCCA -/C CAGAAGCAAT 3070 het 3070 ref 49 26 21 2 C 1 2 296242 CASAVA_Build 2 76682816 1D CAGCTTTCAT G/- GGCTGGCGTT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 G 3 2 296243 CASAVA_Build 2 76696036 1D ATCTATGGCC A/- GCTTGGCTGT 3070 het 3070 hom 43 19 21 5 A 1 0 296244 CASAVA_Build 2 76708872 1I TATGTGAGGC -/T TTGTTCTTGT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 T 2 3 296245 CASAVA_Build 2 76719243 3D ATACTCTGCC CTT/--- CTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 CTT 2 1 296246 CASAVA_Build 2 76726272 1D AAAGAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 A 12 11 296247 CASAVA_Build 2 76726479 1D CACAATGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 12 11 296248 CASAVA_Build 2 76726751 17I TTGCAGGAAT -----------------/ATGAATGGAGCTGGAAG ATGAATGGAG 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 ATGAATGGAGCTGGAAG 1 2 296249 CASAVA_Build 2 76727090 1D CAGGTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 11 10 296250 CASAVA_Build 2 76736339 1I TAATCTTTGA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 6 7 296251 CASAVA_Build 2 76737655 5I TTTACATATT -----/TTCTC TTTTCTAATA 3070 het 1219 hom 16 5 11 0 TTCTC 0 1 296252 CASAVA_Build 2 76774321 1D TCACAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 33 2 17 14 A 11 10 296253 CASAVA_Build 2 76774451 2I CATTCTAGTT --/TC TGTCTTAATT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 TC 0 1 296254 CASAVA_Build 2 76775292 1D GTTTTGAGTC A/- AGAGTGTTGA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 2 1 296255 CASAVA_Build 2 76776625 1I TCATTCCAAT -/A AAGTGTGTAG 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 A 2 3 296256 CASAVA_Build 2 76777256 6D31M1D AAAACGGTAT TCTTTCTCTATTTTCTTTTTCTCCTTTTTGAAAATAGT/------TCTATTTTCTTTTTCTCCTTTTTGAAAATAG- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 22 16 4 N/A 0 0 296257 CASAVA_Build 2 76780123 4D TTAGAAACTC AGAG/---- AGAAGTGTAA 3070 het 3070 hom 32 13 19 1 AG 3 1 296258 CASAVA_Build 2 76780500 1I TGTCACTGAG -/A ATAGAGAGTA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 1 2 296259 CASAVA_Build 2 76780700 1I TACAATGACC -/A TGTTGATTTA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 0 1 296260 CASAVA_Build 2 76781847 5I ACAAGAATAG -----/GAAAA GAAAAGGTGT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 GAAAA 1 2 296261 CASAVA_Build 2 76790988 1I TTATCCTGAG -/T TTTTTGTATA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 5 6 296262 CASAVA_Build 2 76792802 2D TTCCCATCTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 11 9 296263 CASAVA_Build 2 76797965 4I TTTATAAAGG ----/ATTT ATTTGTTATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ATTT 1 2 296264 CASAVA_Build 2 76845275 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAACAA 2904 het 2904 ref 17 9 7 3 A 8 7 296265 CASAVA_Build 2 76848329 2D ATTTTCTCTT TC/-- TTTTACTTCT 3070 het 3070 hom 64 21 36 7 TC 1 0 296266 CASAVA_Build 2 76851760 1I TTTAATCCTG -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 A 7 8 296267 CASAVA_Build 2 76854813 1D AAAAGGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3001 hom 20 8 11 1 T 13 12 296268 CASAVA_Build 2 76854993 1I TCCCAGATAA -/T TTTTTGTATT 3070 het 2539 hom 15 6 7 2 T 5 6 296269 CASAVA_Build 2 76865426 4D TGTATGGTTT TTTA/---- TTTATTTGTT 3070 het 3070 hom 33 15 17 5 TTTA 2 1 296270 CASAVA_Build 2 76867165 8I ATGAAGCTCT --------/TTGAATCC TTGAAGGAGT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 TTGAATCC 0 1 296271 CASAVA_Build 2 76867502 3D TTCTTTGTGC TAA/--- TAATAGCATC 3070 het 3070 ref 44 21 20 6 TAA 2 1 296272 CASAVA_Build 2 76874239 5D GTGCTCTCGG TAAGT/----- TAAGTTTTGA 3070 het 3070 hom 53 23 27 5 TAAGT 2 1 296273 CASAVA_Build 2 76875976 11I CATGTCTGTG -----------/AGTTCTATATC AGTTCTATAT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 AGTTCTATATC 1 2 296274 CASAVA_Build 2 76876229 12I ACACACATAC ------------/ATACATATATAT ACACACACTA 3070 het 3070 ref 63 29 27 7 ATACATATATAT 0 1 296275 CASAVA_Build 2 76888388 4D TCCACACCTG ACTA/---- ACTTTTATAT 1326 het 936 hom 6 2 3 3 ACTA 1 0 296276 CASAVA_Build 2 76889458 1I TCTGCTGAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 T 9 10 296277 CASAVA_Build 2 76894540 3I CAATTTGGCA ---/ATT ATTATTAAGT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 ATT 2 3 296278 CASAVA_Build 2 76895032 4I AGCTATTGGC ----/TGTT TGTTTGTATT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 TGTT 1 2 296279 CASAVA_Build 2 76899887 2D GTTTTTAAAA AT/-- ATATGAGACA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AT 3 2 296280 CASAVA_Build 2 76901538 16D ACCCGTTCTC TGGAGGCTGTGAAAAT/---------------- TAGGGCAAAC 3070 het 3070 ref 41 24 17 4 TGGAGGCTGTGAAAAT 1 0 296281 CASAVA_Build 2 76907168 1I TGCTACATAG -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 A 6 7 296282 CASAVA_Build 2 76910171 1I ATGTAATTGC -/T CTTGGATTGG 3070 het 3070 hom 60 28 30 2 T 0 1 296283 CASAVA_Build 2 76914217 5I TATATTCATA -----/ATATG ATATATTACC 3070 het 3070 ref 32 21 11 0 ATATG 0 1 296284 CASAVA_Build 2 76915934 4D GAAAACTAAT GTGA/---- GTGTCTGGCT 3070 het 3070 hom 29 12 16 3 GTGA 1 0 296285 CASAVA_Build 2 76944820 1I AAACTAACTC -/T TATTTGTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 T 1 2 296286 CASAVA_Build 2 76945481 2I CCATCTCAGC --/CT CTCTCGAGTA 2659 het 1338 hom 19 5 7 7 CT 2 3 296287 CASAVA_Build 2 76945526 1D ACTTCAGCTG T/- TTTTTTTTTT 2335 het 1177 hom 24 8 8 8 T 16 15 296288 CASAVA_Build 2 76958012 1D ATTTCTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 7 16 7 T 10 9 296289 CASAVA_Build 2 76958551 1D AAGAAGAAGG A/- AAAAAGGTCA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 6 5 296290 CASAVA_Build 2 76959142 1D TTGCAAATGG A/- AAAAAAAAAA 1709 het 1709 ref 29 19 4 6 A 13 12 296291 CASAVA_Build 2 76962103 1D TGCTAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 2842 het 2842 ref 31 15 9 7 T 15 14 296292 CASAVA_Build 2 76963178 1I GTTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2955 het 2955 ref 33 17 10 6 A 11 12 296293 CASAVA_Build 2 76969735 5D AATATACTAC TTCAT/----- TTCATTTATT 3070 het 3070 ref 45 24 19 4 TTCAT 2 1 296294 CASAVA_Build 2 76973692 1D GAAAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 16 21 11 A 13 12 296295 CASAVA_Build 2 76978833 4I AGAGACTATG ----/TACT TACTTGCTTT 3070 het 3070 hom 38 11 25 2 TACT 1 2 296296 CASAVA_Build 2 76979009 1I AAATGATTTC -/T TTTGCTTCAA 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 3 4 296297 CASAVA_Build 2 76980977 4D AAAAATATGA ATTT/---- ATTTAAATAG 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 ATTT 2 1 296298 CASAVA_Build 2 76981047 2I TTATCTCTAT --/TA TCTTGTTTAT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 TA 0 1 296299 CASAVA_Build 2 76981595 4D AACATTTCTT TCTC/---- TCTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 17 19 5 TC 3 1 296300 CASAVA_Build 2 76984169 5D GATTCTGTCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 17 9 CAAAA 4 3 296301 CASAVA_Build 2 76992570 2D TGTGCTTTTT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 het 118 hom 23 1 13 9 G 15 13 296302 CASAVA_Build 2 77001280 1I GGTTTGTTGG -/T TTTAGAGGTG 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 T 3 4 296303 CASAVA_Build 2 77003329 1D CTGGAGGCCT A/- AATGTACAGC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 3 2 296304 CASAVA_Build 2 77031743 4D AAAGTCAAAT GATA/---- GATTGGCTGC 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 GATA 1 0 296305 CASAVA_Build 2 77033803 1D AAAATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1980 hom 26 6 14 6 A 11 10 296306 CASAVA_Build 2 77035143 1D AAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 A 10 9 296307 CASAVA_Build 2 77036603 6I TTATTACTAT ------/TACTTA CAGTAATTAC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 TACTTA 0 1 296308 CASAVA_Build 2 77040134 1I CCTTTAAAAA -/G TGGGGTTTGT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 G 0 1 296309 CASAVA_Build 2 77041199 4D TCTTCAACTC AAAT/---- ACTCAATTTA 3070 het 3070 ref 41 20 19 6 AAAT 1 0 296310 CASAVA_Build 2 77045634 3I AGAAAAATAG ---/ATC ATCTGATTAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 ATC 1 2 296311 CASAVA_Build 2 77063692 2D ACTATAAATA TT/-- GTGTCCTTTA 3070 het 3070 hom 31 13 15 5 T 2 0 296312 CASAVA_Build 2 77065806 4D CTTTTAAAAT TTTA/---- TTTGAGATTA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 TTTA 1 0 296313 CASAVA_Build 2 77066761 1D TTCATTGGAC T/- TTTGCATTTT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 4 3 296314 CASAVA_Build 2 77070321 6I GTGTGTTATT ------/GTGAGG GTTACATTTA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 GTGAGG 0 1 296315 CASAVA_Build 2 77076139 13D TAATTCCATG AAGTTTCTAGATC/------------- AAATTCTGGG 3070 het 3070 ref 43 27 17 2 AAGTTTCTAGATC 1 0 296316 CASAVA_Build 2 77076678 3D GAAATAAAAT AAG/--- AAGATCGTAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 AAG 2 1 296317 CASAVA_Build 2 77077988 2D TATTTCTCAC TG/-- TAAGTTTGAT 3070 het 3070 hom 45 22 21 2 TG 1 0 296318 CASAVA_Build 2 77080801 1I CCGTAGATGG -/A AAAGCATGAC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 3 4 296319 CASAVA_Build 2 77081436 2I GGAAGATTCC --/TT TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 T 7 9 296320 CASAVA_Build 2 77083804 3D GCTTTTTATG TTC/--- TTATTTGTTA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 TTC 1 0 296321 CASAVA_Build 2 77090981 1D ATGAGTTTGA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 8 7 296322 CASAVA_Build 2 77094141 1D AAACACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 27 20 14 A 14 13 296323 CASAVA_Build 2 77096298 1D ACTGGATGTA T/- TTTTGAAGTA 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 T 5 4 296324 CASAVA_Build 2 77100822 1I AATAAAAAAA -/T ATAGAAGGCA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 0 1 296325 CASAVA_Build 2 77101245 3I TGTTTTTAAG ---/GGA GTAGTAACAT 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 GGA 0 1 296326 CASAVA_Build 2 77102466 3D GGTGCACAAC ATG/--- ATGATTTCAT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 ATG 2 1 296327 CASAVA_Build 2 77108616 1I TTTACAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 10 11 296328 CASAVA_Build 2 77114059 4I AATAAATGCA ----/TAAT TAGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TAAT 0 1 296329 CASAVA_Build 2 77119961 1D ATTGTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 T 13 12 296330 CASAVA_Build 2 77122398 4D TGCTAGTGAA TTGT/---- TTGAGTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 TTGT 1 0 296331 CASAVA_Build 2 77122566 2I73M4D GAATAAAGAG --AATCATCTGAATACACTTTCTTTATGCTCATATTGAGACTAAGGAGATGTTCCAAATTTAAAAAACAAGAAAGAACA/ACAATCATCTGAATACACTTTCTTTATGCTCATATTGAGACTAAGGAGATGTTCCAAATTTAAAAAACAAGAAAG---- AATAAACATA 3070 het 3070 ref 26 31 10 6 N/A 0 0 296332 CASAVA_Build 2 77129350 1D ATGTAATTAT C/- AATTCAGGGT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 C 1 0 296333 CASAVA_Build 2 77130272 4I TTAAATTAAA ----/TTAT TTAATTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 TTAT 0 1 296334 CASAVA_Build 2 77131650 1D ACTTAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 T 13 12 296335 CASAVA_Build 2 77132639 4D ACTTTTAAAA ATTT/---- ATTTTATTTA 3070 het 3070 ref 33 19 14 0 ATTT 2 1 296336 CASAVA_Build 2 77136820 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 1978 hom 15 4 10 1 ATA 3 4 296337 CASAVA_Build 2 77139135 4D ATCTCTTTCC TTCT/---- TTCTTTCTTC 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 TTCT 3 2 296338 CASAVA_Build 2 77140000 4I AAAGTCACTT ----/TTTC TTTCTTTATT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 TTTC 1 2 296339 CASAVA_Build 2 77143566 3D GTTCCTCTTG TTC/--- TTTTTTAAAA 1949 het 1884 hom 15 6 6 3 TTC 1 0 296340 CASAVA_Build 2 77150361 1D TTCTAAAGTC T/- TTCTTGAGCA 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 T 3 2 296341 CASAVA_Build 2 77155555 1D CACTTTTTTT C/- CAAGATAACA 3070 het 3070 ref 48 22 21 6 C 2 1 296342 CASAVA_Build 2 77157058 2I GTTTCAGCCC --/CT GTTACTCCCC 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 CT 0 1 296343 CASAVA_Build 2 77161284 4D TTGACCTCTC TCTT/---- TCTCATTTTA 3070 het 3070 ref 53 25 25 3 TCTT 1 0 296344 CASAVA_Build 2 77167555 3D TAAATAACCT CCA/--- GAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 CCA 1 0 296345 CASAVA_Build 2 77174652 2I CCTTCGCTGA --/CT CTCTTTTCGG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 CT 2 3 296346 CASAVA_Build 2 77179345 4I TATACAAATC ----/ACTG ACTAAGAGAT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 ACTG 0 1 296347 CASAVA_Build 2 77180261 3I GATAGATGAA ---/TGT TGTTATTTAT 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 TGT 1 2 296348 CASAVA_Build 2 77187943 1D TATATATTGC A/- AAAAATATGC 3070 het 3070 ref 30 19 9 3 A 6 5 296349 CASAVA_Build 2 77206541 2D TATGCGTTGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 AT 9 8 296350 CASAVA_Build 2 77208777 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2399 het 521 hom 14 3 7 4 A 11 12 296351 CASAVA_Build 2 77209463 1D TAGCAGAGAT G/- GAGTTTCACC 3070 het 2897 hom 21 7 13 2 G 2 1 296352 CASAVA_Build 2 77214248 1D TCACAGGCTT A/- AAAAAATCAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 7 6 296353 CASAVA_Build 2 77215630 1D CCTTCTGAGG C/- ATCAGTAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 C 1 0 296354 CASAVA_Build 2 77239823 1D TGCTAACTCC A/- ATGTATTCAA 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 A 2 1 296355 CASAVA_Build 2 77240158 1D AGTATAATGG A/- AAAAAAAAAA 1671 het 1671 ref 30 23 4 3 A 13 12 296356 CASAVA_Build 2 77251421 4I TTCTTTCTTA ----/GTTT GTTTTTTCTA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 GTTT 1 2 296357 CASAVA_Build 2 77255709 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 837 hom 29 2 17 10 T 15 14 296358 CASAVA_Build 2 77270926 3D CATTTTCATC TTT/--- TTTTTTTTTT 2023 het 145 hom 30 2 7 21 T 21 18 296359 CASAVA_Build 2 77273239 11I TTTGGTAAAT -----------/AATTTGGTAAA CATTCCAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AATTTGGTAAA 0 1 296360 CASAVA_Build 2 77286814 1D CAAAATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 679 hom 25 3 14 9 T 17 16 296361 CASAVA_Build 2 77292990 2D TTAACTCATG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 16 0 10 7 AT 8 7 296362 CASAVA_Build 2 77314407 3D TGTTTGTTGC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 hom 72 het 33 0 25 9 TGT 6 5 296363 CASAVA_Build 2 77317802 1D TGTTGGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 37 2 24 11 T 14 13 296364 CASAVA_Build 2 77323323 1D AAAGAAAAGC A/- AAAAACTAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 6 5 296365 CASAVA_Build 2 77324408 2I TTCTTTTTCC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 9 11 296366 CASAVA_Build 2 77325847 1I GAAATAATAC -/T TTTAAATGTA 3070 hom 138 het 50 0 47 4 T 3 4 296367 CASAVA_Build 2 77326258 1I CTTTAAACAC -/T TTTTTTTTTG 1225 het 21 hom 25 0 5 20 T 9 10 296368 CASAVA_Build 2 77330124 1D TGAAAATATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 315 hom 31 1 27 3 A 10 9 296369 CASAVA_Build 2 77333179 1D AAAGAAAATT A/- AAGTGAATTT 3070 hom 69 het 30 0 23 8 A 3 2 296370 CASAVA_Build 2 77337944 1D AATCATCTAC A/- AAAAAAAAAC 1301 het 1301 ref 40 32 4 4 A 10 9 296371 CASAVA_Build 2 77348335 1I TTCCAGAATA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 85 het 42 0 28 14 T 9 10 296372 CASAVA_Build 2 77423484 13D CCAGGCAGGT TCAAACTGAGGAC/------------- TCTATGCCAT 582 het 582 ref 35 9 4 27 TCAAACTGAGGAC 1 0 296373 CASAVA_Build 2 77435589 6I TTACATATAC ------/ATAGAG ATAAAGATAG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 ATAGAG 0 1 296374 CASAVA_Build 2 77444777 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAGTTCTTGT 3070 hom 42 het 31 0 21 11 AC 1 0 296375 CASAVA_Build 2 77446798 1D GCTCTACCTA C/- CCCTCAAACA 3070 hom 99 het 40 0 34 7 C 4 3 296376 CASAVA_Build 2 77447920 1I CATTATTTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 7 8 296377 CASAVA_Build 2 77453584 1I ACTTCTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 765 hom 19 3 15 1 A 10 11 296378 CASAVA_Build 2 77466785 1D AATCATCCAC A/- AAAATAATCG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 5 4 296379 CASAVA_Build 2 77489858 1I AGTCTTTTTT -/G TTTGTCTTTG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 G 0 1 296380 CASAVA_Build 2 77503984 1D TAAATAACTG A/- ATATAAGGTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 2 1 296381 CASAVA_Build 2 77504742 1D GTGGCAGATG T/- TACTGTACTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 1 296382 CASAVA_Build 2 77505068 3I TTATACAGTG ---/AAC AACTGATGAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AAC 1 2 296383 CASAVA_Build 2 77505813 1I AGAGTAAACC -/T AACATCTGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 1 296384 CASAVA_Build 2 77514854 1D25M1I GTGTGTAGAC TTTTTTTTATCAGATCCCAGATTGGG-/-TTTTTTTATCAGATCCCAGATTGGGA AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 31 2 23 8 N/A 0 0 296385 CASAVA_Build 2 77519028 13D ATCATGATAA TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 1444 het 1444 ref 13 5 4 5 T 31 18 296386 CASAVA_Build 2 77520084 1D GCTTGATTGA T/- TTTTTTCTAG 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 T 7 6 296387 CASAVA_Build 2 77525612 1D CACGATCCGG A/- AAAAAAAAAA 1722 hom 14 het 17 0 5 12 A 13 12 296388 CASAVA_Build 2 77545180 1I ATCCAGTGCA -/T TTTTTTTACA 3007 het 3007 ref 24 12 9 3 T 7 8 296389 CASAVA_Build 2 77550020 1D GGGGGGCAGG A/- AAAAAATCCT 3070 het 2376 hom 30 7 15 8 A 7 6 296390 CASAVA_Build 2 77550077 1I TAATGTACTC -/A AAAAATAAGC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 5 6 296391 CASAVA_Build 2 77550354 18D GCATATATAT ATGTATAGCATATATATA/------------------ TATAAACATA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATGTATAGCATATATATA 1 0 296392 CASAVA_Build 2 77553153 1I GTGTGTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 21 18 11 T 11 12 296393 CASAVA_Build 2 77553475 21D ATGGCTGGTG AATGAAATAAAGGAAGGAATA/--------------------- AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 46 24 18 7 AATGAAATAAAGGAAGGAATA 1 0 296394 CASAVA_Build 2 77556386 1D CTAATCTGGC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 7 296395 CASAVA_Build 2 77560861 1D TTTCTACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 11 10 296396 CASAVA_Build 2 77562503 1D GAGTGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 281 hom 38 4 15 19 T 11 10 296397 CASAVA_Build 2 77563088 6I ACACACACAC ------/ACACAT ACACACAGAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 ACACAT 0 1 296398 CASAVA_Build 2 77569640 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 7 296399 CASAVA_Build 2 77569767 2I GGCCAAATGG --/TC TCTCTATATA 3070 hom 120 het 41 0 41 0 TC 2 3 296400 CASAVA_Build 2 77571995 1I GAGGTAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 A 9 10 296401 CASAVA_Build 2 77575223 1I GCTTTTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 16 6 T 10 11 296402 CASAVA_Build 2 77579283 3I GACCCTGTGA ---/GAT GATAGTGTAT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 GAT 1 2 296403 CASAVA_Build 2 77585423 6I AGAAGATGTT ------/TAAGGA TAAGTATTAC 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 TAAGGA 0 1 296404 CASAVA_Build 2 77593795 1D GTGCTCACAC A/- TGTGTATGCG 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 1 0 296405 CASAVA_Build 2 77594227 1I ATTTTGAGAT -/G GAGTCTTGTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 1 2 296406 CASAVA_Build 2 77598764 1I TCAACCATTT -/A AAAAAAAAAA 2092 het 2092 ref 27 13 7 7 A 15 16 296407 CASAVA_Build 2 77602113 1D TTTATAGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 47 18 18 12 A 10 9 296408 CASAVA_Build 2 77608158 1D GAATGAAAAT A/- AAATGAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 A 4 3 296409 CASAVA_Build 2 77614612 1D CATGTATCTA C/- AGCTCAAGTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 C 1 0 296410 CASAVA_Build 2 77616180 5I AAAAATCTAC -----/ATTCT ATGAAAAAGG 3070 hom 60 het 24 0 19 5 ATTCT 0 1 296411 CASAVA_Build 2 77616898 15I CACCTGTAAT ---------------/CCCAGCTACTTGGGA GGCTGAGGCA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 CCCAGCTACTTGGGA 0 1 296412 CASAVA_Build 2 77619091 4I TCCTTGAAAG ----/GTTT GTTTTAGGCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 GTTT 1 2 296413 CASAVA_Build 2 77627266 1D GAATACTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 13 12 296414 CASAVA_Build 2 77632054 1I CACTTTATGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 8 9 296415 CASAVA_Build 2 77632799 6D3M9D AATCTTAAGC AGAAAAAAGTCCTCTCCC/------AAG--------- AAATTGAAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 4 N/A 0 0 296416 CASAVA_Build 2 77633893 1D ATTTTTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 826 hom 31 7 16 8 A 11 10 296417 CASAVA_Build 2 77720053 1I TTCAATCTTG -/T TACTGGTTTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 2 296418 CASAVA_Build 2 77834355 1D TATCACAAAA G/- TCAAACTCAC 2379 het 2379 ref 14 7 5 2 G 1 0 296419 CASAVA_Build 2 77898743 1D AAGTTCCCTG T/- TTCCTCCTCT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 3 2 296420 CASAVA_Build 2 77904847 2D TTAGACGTTT TA/-- TATATATATA 1862 het 1862 ref 14 6 7 1 TA 7 6 296421 CASAVA_Build 2 77918772 1I TGTTTATGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 9 10 296422 CASAVA_Build 2 77920363 1D GTTTCTATAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 8 7 296423 CASAVA_Build 2 77920572 5D AAAGACCAAC TAAAT/----- TAATCAAATT 2986 het 2986 ref 29 17 7 7 TAAAT 1 0 296424 CASAVA_Build 2 77932217 1I CCTGGATGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 A 9 10 296425 CASAVA_Build 2 77950625 2I GTTACATATG --/TA TATATATATC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 TA 4 5 296426 CASAVA_Build 2 77955297 2I CTATTTTATC --/TA TATATATATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TA 6 7 296427 CASAVA_Build 2 77960630 3D CCAACAAATT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 111 het 50 0 38 12 TTG 7 6 296428 CASAVA_Build 2 77966239 1I AATTCTATTC -/T GAGTCTCAGT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 0 1 296429 CASAVA_Build 2 77967323 1I GAATGTGTGT -/A AACTTCTGCT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 2 3 296430 CASAVA_Build 2 77974799 1I TTTTAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 12 13 296431 CASAVA_Build 2 77976503 1D CATTAAGTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 9 8 296432 CASAVA_Build 2 77982439 1D ATTTGTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 12 11 296433 CASAVA_Build 2 77983377 1I GCTATAAAAT -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 0 1 296434 CASAVA_Build 2 77984736 1D CCACATGGTT C/- CCCCCCATAA 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 C 7 6 296435 CASAVA_Build 2 77985082 4D TCATGTTTAT CAGA/---- CAATGAAGTA 3070 het 3070 hom 56 22 28 9 CAGA 1 0 296436 CASAVA_Build 2 77994517 1D CAGCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2747 hom 27 7 11 9 A 11 10 296437 CASAVA_Build 2 78006220 6D TTTCTCAAAA TTAGAG/------ TTAATCTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 17 5 TTAGAG 1 0 296438 CASAVA_Build 2 78012329 1I CAGAACAAAA -/G AAAACAGAAA 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 G 0 1 296439 CASAVA_Build 2 78022335 3I AAAAACGAAA ---/ACT AAGCCACTTT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 ACT 0 1 296440 CASAVA_Build 2 78024649 2I ATTTTGCCCC --/CT GTCTGTTTCT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 CT 0 1 296441 CASAVA_Build 2 78026112 1D CCATATTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 10 9 296442 CASAVA_Build 2 78026811 3I TGTTAAGGTG ---/ATA ATAATTGGCT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 ATA 1 2 296443 CASAVA_Build 2 78044933 3I TATAATAATG ---/ATA ATAAATCTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 ATA 1 2 296444 CASAVA_Build 2 78059582 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2901 het 2001 hom 12 7 6 1 A 23 12 296445 CASAVA_Build 2 78060151 1D TTCTTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 A 12 11 296446 CASAVA_Build 2 78061813 1D TAACAACCAG A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 A 8 7 296447 CASAVA_Build 2 78066123 5I CATTAAAAAT -----/AAGAC AATGCAATGG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AAGAC 0 1 296448 CASAVA_Build 2 78067336 1I TTTTTTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 894 hom 27 2 21 4 A 12 13 296449 CASAVA_Build 2 78081930 1D TTTGTCTTGA T/- TAGTCAGCAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 5 T 2 1 296450 CASAVA_Build 2 78098055 2I CTAGTCATTA --/TG TGTCTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 TG 1 2 296451 CASAVA_Build 2 78098652 1D TCATTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2306 hom 32 10 14 10 T 15 14 296452 CASAVA_Build 2 78108687 2I GAAATGTATG --/AA GTCAGAAAGT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 0 2 296453 CASAVA_Build 2 78112196 1D GAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 404 hom 25 1 19 6 A 10 9 296454 CASAVA_Build 2 78114221 3D CCCCGCCTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 1900 het 1140 hom 13 5 6 2 A 14 11 296455 CASAVA_Build 2 78117573 1D ATGTTTGGCC T/- TTTTTTTTTT 1598 het 1598 ref 38 29 4 5 T 13 12 296456 CASAVA_Build 2 78119262 1D GCATTTATTT A/- ACACATATTA 3070 het 3070 hom 54 17 25 13 A 2 1 296457 CASAVA_Build 2 78120378 2D GCAAAGTTAG AA/-- AAAGCAGGTA 3070 het 3070 ref 35 20 15 0 A 5 3 296458 CASAVA_Build 2 78121012 7D TTCTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTG 3070 het 365 hom 25 3 11 12 T 16 9 296459 CASAVA_Build 2 78123315 1D ATCCTCCCTT C/- CACAACACCT 3070 het 3070 hom 40 19 18 4 C 2 1 296460 CASAVA_Build 2 78131857 1I AAGTCTGCTG -/T TTAGTCTGAT 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 T 2 3 296461 CASAVA_Build 2 78161930 1D CTGCACTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2905 hom 38 8 22 8 A 12 11 296462 CASAVA_Build 2 78169145 2D TAATCATTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 AC 7 6 296463 CASAVA_Build 2 78176680 4D ACCCTATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 1591 hom 25 9 14 3 A 26 22 296464 CASAVA_Build 2 78176962 6D CTATATATAC ATATAT/------ ATATATATAT 2116 het 1366 hom 26 6 11 11 AT 9 6 296465 CASAVA_Build 2 78190359 2D GCAACACTGT AA/-- AAGTCCATTG 3070 het 3070 ref 52 28 21 4 A 4 2 296466 CASAVA_Build 2 78200198 2D ATGTAGCTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 T 11 9 296467 CASAVA_Build 2 78208640 1D TGTATTGAGA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 7 6 296468 CASAVA_Build 2 78214123 2I GGTATACCTC --/TT TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 9 296469 CASAVA_Build 2 78216611 1I TGATTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 T 11 12 296470 CASAVA_Build 2 78229626 1D TTGTTAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3032 hom 23 8 8 7 T 12 11 296471 CASAVA_Build 2 78229699 1I TTACTCTCTC -/T TAGTTGCATC 3070 hom 96 het 33 0 32 2 T 1 2 296472 CASAVA_Build 2 78241957 12I TTGAGGGGTA ------------/TCTTTGTGGTAT TCTTTGTATT 2437 het 2437 ref 17 9 5 3 TCTTTGTGGTAT 0 1 296473 CASAVA_Build 2 78242836 1I TTCGTCCCAC -/A GGGGCACCCA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 0 1 296474 CASAVA_Build 2 78257717 31D TCAGGAGATT GGATGGATGTTTACTCAGGAGATTGGATGGA/------------------------------- TAGGAGTTTG 3070 het 3070 hom 33 17 19 7 GGATGGATGTTTACTCAGGAGATTGGATGGA 1 0 296475 CASAVA_Build 2 78264349 1I TTTTTATACA -/T TTGTTTTTTA 3070 het 2333 hom 24 6 15 3 T 2 3 296476 CASAVA_Build 2 78265236 2I GTGGTCAAAC --/TT TTAAATTCTG 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 T 2 4 296477 CASAVA_Build 2 78266119 2I TCGAATTAAT --/TC TGAGTGCCCT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 TC 0 1 296478 CASAVA_Build 2 78266628 1D ATTTATTCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 14 18 10 T 10 9 296479 CASAVA_Build 2 78276590 2D ATAAACACTC TT/-- AACAATTAGA 3070 het 3070 ref 44 25 17 4 T 2 0 296480 CASAVA_Build 2 78277882 3D ACTCAATAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 1832 het 1832 ref 15 9 4 2 A 20 17 296481 CASAVA_Build 2 78282977 1I GAGATTAAAA -/G TCCAGAGCTT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 G 0 1 296482 CASAVA_Build 2 78287972 1I TAAAGTCTCT -/G GATTCTGAAT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 G 1 2 296483 CASAVA_Build 2 78295343 2I CCCAGTAAAG --/AA AAAAGCCCAG 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 A 4 6 296484 CASAVA_Build 2 78296285 2I ATACAAATAG --/AT AAAAGAAATT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 AT 0 1 296485 CASAVA_Build 2 78296770 3D AAACTTGACC ACT/--- ATCTCTTGCC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 ACT 1 0 296486 CASAVA_Build 2 78298162 3D AATAGTCTCA TAT/--- TATATTAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 TAT 2 1 296487 CASAVA_Build 2 78298368 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACAAGA 2448 het 2178 hom 37 16 10 11 C 0 1 296488 CASAVA_Build 2 78315977 1D AACATTGGTA G/- AATTTTTGTA 3070 het 3070 hom 36 19 16 1 G 1 0 296489 CASAVA_Build 2 78329796 1D AATTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 11 10 296490 CASAVA_Build 2 78337451 2I ATGTCTGATA --/TT TTGTTACATG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 2 4 296491 CASAVA_Build 2 78343116 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 10 11 296492 CASAVA_Build 2 78358217 8D CAGGCGTGGT GGTTCACG/-------- TCTGTAATCC 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 GGTTCACG 1 0 296493 CASAVA_Build 2 78367107 1I TTGAAGTTAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 8 9 296494 CASAVA_Build 2 78381608 8D TATTTTCTTC CAAGCACT/-------- TCTTTGCTTC 3070 het 3070 ref 35 18 17 0 CAAGCACT 1 0 296495 CASAVA_Build 2 78382062 1I TCTCTGTATT -/G TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 42 12 25 5 G 0 1 296496 CASAVA_Build 2 78388421 1D AGAAAAAAAA T/- ATTTTATCAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 1 0 296497 CASAVA_Build 2 78390709 1I TTCAAAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 8 9 296498 CASAVA_Build 2 78390784 1I TATACTTATA -/T TTAATATTAA 3070 het 3070 ref 26 18 7 1 T 2 3 296499 CASAVA_Build 2 78390916 1D ATAGCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 15 6 T 12 11 296500 CASAVA_Build 2 78392831 1D TTACAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 19 10 T 11 10 296501 CASAVA_Build 2 78395073 8D TCCAGACACA CTAGTGTT/-------- CTAGTGTTCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 7 CTAGTGTT 2 1 296502 CASAVA_Build 2 78397197 2D ATATATACAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 23 10 8 6 AG 8 7 296503 CASAVA_Build 2 78409617 10D AGTGCTGTAT TCCTTATACA/---------- TCCTCTGTTC 3070 het 3070 hom 48 21 27 2 TCCTTATACA 1 0 296504 CASAVA_Build 2 78415140 1I ACCTCTGCCT -/C CCCGGTTCAA 3070 hom 52 het 22 0 17 5 C 3 4 296505 CASAVA_Build 2 78415884 2D AAAGAATCAC TG/-- TGCTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 TG 2 1 296506 CASAVA_Build 2 78417992 1D CCTTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 39 1 28 11 T 12 11 296507 CASAVA_Build 2 78420584 4D TTGGAGCTAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 194 hom 32 3 14 16 A 20 16 296508 CASAVA_Build 2 78422418 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAATAGAAGC 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 A 5 3 296509 CASAVA_Build 2 78425600 1D TTTTAACAAG T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 6 296510 CASAVA_Build 2 78427979 1I TCCTAAGTAG -/C TGAGGCTACA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 C 0 1 296511 CASAVA_Build 2 78433926 1D CAGTAGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 17 13 A 15 14 296512 CASAVA_Build 2 78435546 1D TCATTGAGAC T/- TGAGTAAGTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 T 2 1 296513 CASAVA_Build 2 78437962 5D AGTGCTAGAC TAGTG/----- TAGTGAAACA 3070 hom 126 het 45 0 43 4 TAGTG 2 1 296514 CASAVA_Build 2 78438069 5I TAATATTATT -----/TGGGG TGGGGGCTAA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 TGGGG 1 2 296515 CASAVA_Build 2 78445028 1D GGATTTGCAG T/- TTTATGAGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 6 T 4 3 296516 CASAVA_Build 2 78447267 1I ACCTTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 T 10 11 296517 CASAVA_Build 2 78453506 1D AATAAGAAAT A/- AAAAAAAAAT 1585 hom 12 het 8 0 4 4 A 10 9 296518 CASAVA_Build 2 78456028 2D TTCAAAACAC AT/-- GTGAAATCCT 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 AT 1 0 296519 CASAVA_Build 2 78456510 1I AGTATTCTAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 8 9 296520 CASAVA_Build 2 78461990 1D AACAAACATG A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 7 296521 CASAVA_Build 2 78463703 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 892 hom 25 2 9 15 A 16 15 296522 CASAVA_Build 2 78466265 2D CACATGTCTC TT/-- TCAGCTGGCT 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 T 3 1 296523 CASAVA_Build 2 78466884 1I AACTATGAAA -/T AGCATTTTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 0 1 296524 CASAVA_Build 2 78467840 11D TTGTCAATGC AGTGAAAGTAT/----------- ATTTTACTTT 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 AGTGAAAGTAT 1 0 296525 CASAVA_Build 2 78470789 2D TGCTACTAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 32 0 27 6 TG 10 9 296526 CASAVA_Build 2 78476416 1I CTTTGTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 11 12 296527 CASAVA_Build 2 78478142 1I GCACAATAAA -/C AAAAATGCAA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 C 0 1 296528 CASAVA_Build 2 78482309 1D GCCTGACTTC A/- AACTATACTA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 A 3 2 296529 CASAVA_Build 2 78486503 1I GCTTTTAAGG -/T TTTTCTCTTT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 4 5 296530 CASAVA_Build 2 78494299 2D ATTACACAAT AG/-- AGTTATATCT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 AG 2 1 296531 CASAVA_Build 2 78495804 1I TTAAATTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 A 9 10 296532 CASAVA_Build 2 78497671 2I AATGCAAAAC --/CA CAGTTACTTT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 CA 1 2 296533 CASAVA_Build 2 78500536 1I TGTAAGTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 33 0 21 12 T 10 11 296534 CASAVA_Build 2 78503962 2D AACTGTACGT AA/-- AAAAAAAAAA 2105 het 41 hom 13 1 7 6 A 18 16 296535 CASAVA_Build 2 78504242 1D TGTCTTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3035 hom 31 8 16 7 A 11 10 296536 CASAVA_Build 2 78508553 1I GTTCATATCC -/A AAAATATATA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 4 5 296537 CASAVA_Build 2 78508634 1D TACCTGAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 10 9 296538 CASAVA_Build 2 78517944 2D CTGGAGAAAC AG/-- GGCATAGAGT 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 AG 1 0 296539 CASAVA_Build 2 78528650 4I ATTTAAACAT ----/CAAA CAAAGTTAGC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CAAA 1 2 296540 CASAVA_Build 2 78539494 3I CTTATACAGC ---/TCT TATTATTTTG 3070 hom 83 het 32 0 28 4 TCT 0 1 296541 CASAVA_Build 2 78551635 2D TATATGGTAA GT/-- GAAGTTATTA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 GT 1 0 296542 CASAVA_Build 2 78553384 1D TTGGCTCGTG T/- TCCATTTTTC 3070 het 3070 hom 48 16 27 6 T 2 1 296543 CASAVA_Build 2 78560991 5D AGTATAATAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 2905 hom 15 7 8 1 AAAAT 4 3 296544 CASAVA_Build 2 78563000 1D AATAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 A 11 10 296545 CASAVA_Build 2 78563108 1D CTGTACTTTT C/- TATATAAACC 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 C 1 0 296546 CASAVA_Build 2 78589815 1D CACATAGGGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 9 8 296547 CASAVA_Build 2 78592223 3D TGTTATTCCC AAT/--- AATAACAACA 3070 het 3070 ref 40 24 13 7 AAT 2 1 296548 CASAVA_Build 2 78592587 9I AAGATAGTGA ---------/CTTCAAACC CTGGTATGAT 3070 hom 109 het 43 0 37 6 CTTCAAACC 0 1 296549 CASAVA_Build 2 78594375 1I AAAAAAAAAA -/T TTGGAATCTT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 T 2 3 296550 CASAVA_Build 2 78595393 4D TGTCTCTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 69 het 31 0 24 9 TC 10 8 296551 CASAVA_Build 2 78600122 1D TAGGGACAAT A/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 30 13 12 7 A 1 0 296552 CASAVA_Build 2 78602008 17D GCTTTGAGTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 1571 het 96 hom 10 1 4 5 T 29 12 296553 CASAVA_Build 2 78607835 2I TCCAAAATTT --/AC AGAGGTGTAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AC 0 1 296554 CASAVA_Build 2 78609490 1I TGCTACAATT -/A ACTGAATACT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 296555 CASAVA_Build 2 78609894 1I ACAGAAGGCA -/G AGTCAGCACT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 G 0 1 296556 CASAVA_Build 2 78614776 2I GGTAGGTGAC --/TG TGGCATTGTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TG 1 2 296557 CASAVA_Build 2 78614981 1I AATATGGTAT -/A AAAAATACAG 3070 hom 108 het 48 0 36 12 A 5 6 296558 CASAVA_Build 2 78616884 2D TTCTCTTTTT TC/-- TTAGTGTAGG 3070 het 3070 hom 46 18 24 6 TC 1 0 296559 CASAVA_Build 2 78621461 3D AAACTGATTT GAG/--- GAGAATAGAC 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 GAG 2 1 296560 CASAVA_Build 2 78623909 2I ACATTCATGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 27 1 16 10 T 14 16 296561 CASAVA_Build 2 78643078 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 375 hom 33 1 32 0 T 10 9 296562 CASAVA_Build 2 78644074 1D CTATTTTCTA T/- TGTTTAGTAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 T 2 1 296563 CASAVA_Build 2 78649364 1I AAGGTTTTTC -/A AAAAACATTT 3070 het 3070 hom 53 27 21 5 A 5 6 296564 CASAVA_Build 2 78657066 1D GCACTTTACC T/- TTCCTGAAGT 3070 het 3070 hom 60 26 28 7 T 3 2 296565 CASAVA_Build 2 78659177 2I ATTAGAGTTG --/TA TATAATTCTG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TA 2 3 296566 CASAVA_Build 2 78668975 1D AAATACATAA C/- CCATCAGGAG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 C 3 2 296567 CASAVA_Build 2 78681941 1D GCACAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 19 11 A 17 16 296568 CASAVA_Build 2 78688300 4D GAAGCTAAAA TTAT/---- TTGTTTCTCT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 TTAT 1 0 296569 CASAVA_Build 2 78694325 3D GAACCCAAAG CCA/--- CCACCTCTCC 3070 het 3070 ref 49 24 20 8 CCA 2 1 296570 CASAVA_Build 2 78698410 5I GGTAGAAGAA -----/TTTTT TTTAAGTTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 3 8 296571 CASAVA_Build 2 78699095 4D GTTTCTATTC TCTT/---- TCTTTAAATT 3070 het 3070 hom 45 21 23 3 TCTT 2 1 296572 CASAVA_Build 2 78706428 2I AAATAATCAC --/AT GTTATTTAGA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 AT 0 1 296573 CASAVA_Build 2 78731169 1D AAAGTAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 9 6 T 11 10 296574 CASAVA_Build 2 78738355 1I TGAAAGACTC -/G GGGGGTAAAT 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 G 5 6 296575 CASAVA_Build 2 78747122 3D GAGAGCATTG AAC/--- AATAATAAAG 3070 het 3070 hom 47 16 28 5 AAC 1 0 296576 CASAVA_Build 2 78753764 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 15 0 13 2 A 11 10 296577 CASAVA_Build 2 78758486 1D GGGGAAAAGT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 75 het 28 0 23 5 G 9 8 296578 CASAVA_Build 2 78772477 4I CCTCTCTCTC ----/TCTG TCTGTCTTCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TCTG 1 2 296579 CASAVA_Build 2 78772934 2D GAGAGAGAGG AA/-- AAAAAAAATA 2247 hom 15 het 15 0 6 9 A 10 8 296580 CASAVA_Build 2 78785390 2D TCTTCCACTC AA/-- GAGATGGAAT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 2 0 296581 CASAVA_Build 2 78787901 1D TCATAGTTCT G/- GGAAGCTGGG 3070 hom 144 het 51 0 49 3 G 3 2 296582 CASAVA_Build 2 78788939 1D GTTCCTTGTC A/- AATGTAACAA 3070 het 3070 hom 42 14 25 5 A 3 2 296583 CASAVA_Build 2 78807251 1D AGAGATTGCA C/- CCACTGCATT 3070 hom 72 het 26 0 23 3 C 3 2 296584 CASAVA_Build 2 78816533 2D ACAACACCAC TT/-- TTTTTATTCT 3070 hom 117 het 43 0 40 5 T 7 5 296585 CASAVA_Build 2 78817174 1I TCCTAGACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 T 12 13 296586 CASAVA_Build 2 78830309 1D AATAAGATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 10 9 296587 CASAVA_Build 2 78840834 1I GGCCACTGGG -/C CAAGGAATGC 3070 hom 84 het 29 0 27 2 C 1 2 296588 CASAVA_Build 2 78845211 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1938 hom 16 5 9 2 A 11 12 296589 CASAVA_Build 2 78848498 1I GTTCCAGGCG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 8 9 296590 CASAVA_Build 2 78851386 1I AAAAATGGCA -/G GAGGCTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 G 1 2 296591 CASAVA_Build 2 78855887 1I GGGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 13 14 296592 CASAVA_Build 2 78856490 1I AACCGGAGAC -/A GGGAAATTGA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 0 1 296593 CASAVA_Build 2 78861539 3D AATAACAGTA TCT/--- TCTTCTAATT 3070 het 3070 ref 46 22 18 8 TCT 3 2 296594 CASAVA_Build 2 78863654 4I GTTGGGGTGT ----/AGCA AGCAAGCATG 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 AGCA 2 3 296595 CASAVA_Build 2 78878974 7D TCAGTTATAG ACTTAGT/------- ACTTTGGCAT 3070 het 3070 ref 33 21 9 7 ACTTAGT 1 0 296596 CASAVA_Build 2 78890004 2D43M1I AAGAAAATTA ATAGTTTTTTAAAAATATGAATTATACATATAATAAAATTAAAAA-/--AGTTTTTTAAAAATATGAATTATACATATAATAAAATTAAAAAT ATAACTATTT 3070 het 3070 ref 19 12 8 1 N/A 0 0 296597 CASAVA_Build 2 78890135 1D ATCCTTTATA T/- TTTTTTTTTT 2301 het 2301 ref 12 5 6 1 T 11 10 296598 CASAVA_Build 2 78893151 2I GATCATGCTG --/CT CTCTCTGCTT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 CT 3 4 296599 CASAVA_Build 2 78896596 1D GCACCTCAGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 T 9 8 296600 CASAVA_Build 2 78913131 11I TTTCAAAGAG -----------/ATAGTAAAGAA ATAAGTCTGG 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 ATAGTAAAGAA 0 1 296601 CASAVA_Build 2 78923465 5I TGTTGAGAAG -----/AGAGA AGAGATCTGA 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 AGAGA 1 2 296602 CASAVA_Build 2 78942261 1I CGTTTGATAC -/T TACTTATCTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 1 2 296603 CASAVA_Build 2 78943011 1D ATTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 13 13 A 17 16 296604 CASAVA_Build 2 78961874 4D TGACAGGACT CTGA/---- CTTTTACAAT 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 CTGA 1 0 296605 CASAVA_Build 2 78976302 4D GTCTCACCTG ATAA/---- ATCCTCCCAC 3070 het 3070 ref 30 18 12 1 ATAA 1 0 296606 CASAVA_Build 2 78980048 3I CAGTGGCAAG ---/AGA AGGTTATTAC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 AGA 0 1 296607 CASAVA_Build 2 78980610 2I GTATATATAT --/AC ACACATACAC 2734 het 2734 ref 26 14 9 3 AC 2 3 296608 CASAVA_Build 2 78988322 1I CAGTAGGGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 15 16 296609 CASAVA_Build 2 78989371 1I TGACCTGAGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 118 het 44 0 40 4 A 8 9 296610 CASAVA_Build 2 79003768 17D CCAAAAGAAC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 28 1 15 12 T 32 15 296611 CASAVA_Build 2 79007312 1I AAGGCCTGTT -/A TATTAGACTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 0 1 296612 CASAVA_Build 2 79014774 1D GATCAGAGAG A/- AAAATGACCT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 5 4 296613 CASAVA_Build 2 79045113 1I CAGAACTTCC -/A AAAAACAGTT 3070 het 3070 hom 57 22 23 12 A 5 6 296614 CASAVA_Build 2 79052193 1I ATTCACCAAC -/A AAAAAATTTC 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 6 7 296615 CASAVA_Build 2 79056085 1I AACTTACCTA -/T TTTTTTTTAT 2742 het 2742 ref 33 24 8 1 T 8 9 296616 CASAVA_Build 2 79071969 5D CTTCATTTTC TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 12 20 12 TTTCT 4 3 296617 CASAVA_Build 2 79079716 1D AAGGGCTGGG T/- TATGGTGGCT 1839 het 1839 ref 32 22 6 4 T 2 1 296618 CASAVA_Build 2 79080460 3I ATATCCCTCT ---/GAA GAAGGAGGTC 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 GAA 1 2 296619 CASAVA_Build 2 79080639 11I CAGGTTGAGC -----------/ACAAATACCCA AGGTTTCCAT 3070 het 3070 hom 55 26 27 2 ACAAATACCCA 0 1 296620 CASAVA_Build 2 79081281 2I41M1I TCCCATAGTC --TGAGCATTTTTCAGTCATAGACCACTCCTTCATTTTATTTG-/TGTGAGCATTTTTCAGTCATAGACCACTCCTTCATTTTATTTGT TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 41 21 20 17 N/A 0 0 296621 CASAVA_Build 2 79083675 4I CTGCAGACAC ----/TATG TGTGCATGAC 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 TATG 0 1 296622 CASAVA_Build 2 79084317 1D GATGAAGACA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 8 7 296623 CASAVA_Build 2 79085025 1I AATTTCACAG -/A AAAAAAGGCT 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 A 6 7 296624 CASAVA_Build 2 79089847 3D GATAGAGAGG AGA/--- AGATTGATGC 3070 het 3070 hom 50 21 26 6 AGA 2 1 296625 CASAVA_Build 2 79093196 2D TAAAATATCT CA/-- TTCATAATTT 3070 het 3070 ref 23 12 7 4 CA 1 0 296626 CASAVA_Build 2 79093755 1D GTAACAAACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 15 10 A 10 9 296627 CASAVA_Build 2 79094152 1I GGAGGTATTT -/A GGTTTAGGCA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 0 1 296628 CASAVA_Build 2 79095172 1D GATTGTAACA G/- GGCTTTATAT 3070 het 3070 ref 42 25 12 6 G 3 2 296629 CASAVA_Build 2 79096717 1D AAGATTACTT G/- AATTTTACCC 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 G 1 0 296630 CASAVA_Build 2 79098174 1I ACGTCAAGAG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 7 8 296631 CASAVA_Build 2 79105485 3D GAACTTCTAT CCA/--- CCATTTATTT 3070 het 3070 hom 44 19 23 5 CCA 2 1 296632 CASAVA_Build 2 79107496 16D26M1I TTGGAGGTGA TAGGGGAAAGTCCATGCAGGTCTCAGGGGGAGGAGGGTCTCC-/----------------CCGGTCTCAGGGGGAGGAGGGTCTCCA TTCAGGAGAG 3070 het 3070 ref 36 35 12 6 N/A 0 0 296633 CASAVA_Build 2 79111143 1I ATGAGCAGAA -/T CGAATATCTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 0 1 296634 CASAVA_Build 2 79111330 1D AATAAATATC A/- AAAAACCAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 5 296635 CASAVA_Build 2 79111707 1I AAAGAGTGTT -/A TAAAAAAGTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 0 1 296636 CASAVA_Build 2 79112015 2D TACAATTAAG GT/-- ATAAGAGAGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 GT 1 0 296637 CASAVA_Build 2 79117647 1I AGCTCAGCAA -/T TAAGGGTGAA 3070 het 3070 ref 58 35 19 4 T 1 2 296638 CASAVA_Build 2 79136210 1D CGAGGATTTG C/- CCCCACCCAG 1303 hom 7 het 3 0 3 0 C 5 4 296639 CASAVA_Build 2 79165257 1D CTCCAAAAAT G/- TACCACTAAT 3070 het 3070 hom 50 22 26 3 G 1 0 296640 CASAVA_Build 2 79170807 5I CTAAAAATAA -----/TTATG TTTTCTTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 TTATG 0 1 296641 CASAVA_Build 2 79174272 1I AAAAGGGAGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 8 9 296642 CASAVA_Build 2 79183127 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 10 9 296643 CASAVA_Build 2 79201638 1D GGTCTACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 775 hom 47 3 25 19 A 15 14 296644 CASAVA_Build 2 79204331 1D GTTACACAGG T/- TTTTTTTTTT 2414 het 2414 ref 45 31 7 7 T 13 12 296645 CASAVA_Build 2 79257847 1I GATTATTAAT -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 7 8 296646 CASAVA_Build 2 79266049 1I CCAAGAACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 9 10 296647 CASAVA_Build 2 79282078 4D CTCAAATTCA CCTT/---- CCTTCCCTGT 2954 het 2954 ref 40 27 9 6 CCTT 2 1 296648 CASAVA_Build 2 79282972 1I TTTTTTTATT -/A TTTTTTATTT 1953 het 1953 ref 22 12 6 4 A 0 1 296649 CASAVA_Build 2 79290398 39I CTTGAAGATT ---------------------------------------/TTCACTAGCTCACCAATCCAAAGCTACTCATATCACGAG TTGCCCAACT 3070 het 3070 hom 38 15 23 2 TTCACTAGCTCACCAATCCAAAGCTACTCATATCACGAG 0 1 296650 CASAVA_Build 2 79301784 1D AATTTGTTTT G/- TTTTTGTTGT 3070 het 3070 hom 31 12 16 5 G 1 0 296651 CASAVA_Build 2 79302239 1D GCTTGGCAAA T/- TTTTTTTTTT 1368 het 1368 ref 41 32 3 6 T 12 11 296652 CASAVA_Build 2 79330896 3I AACAAGACTT ---/AAG AGGTCTACAG 3070 het 3070 hom 59 22 27 10 AAG 0 1 296653 CASAVA_Build 2 79333452 1D TTATCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 11 10 296654 CASAVA_Build 2 79335412 4I AATAGGACTT ----/AATC AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 AATC 0 1 296655 CASAVA_Build 2 79345051 1I ACATGGCTAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 56 18 27 11 T 7 8 296656 CASAVA_Build 2 79345368 1D CTGCAACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 24 18 13 T 12 11 296657 CASAVA_Build 2 79359156 1I CAAGCCCACG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 A 9 10 296658 CASAVA_Build 2 79390256 8I CATATTTGTG --------/TAAGAACC TAAGATGAGA 3070 het 3070 hom 57 23 28 6 TAAGAACC 0 1 296659 CASAVA_Build 2 79391002 2D AAATTTTTCA TT/-- AAGACCTTTC 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 T 2 0 296660 CASAVA_Build 2 79392195 1D GATAGTGCGT C/- CCCCGGTGAC 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 C 5 4 296661 CASAVA_Build 2 79392706 1I ATGGCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 2849 het 2725 hom 37 12 11 14 A 13 14 296662 CASAVA_Build 2 79408610 1I ATGGGGTTGC -/G GGGGGTGAGG 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 G 5 6 296663 CASAVA_Build 2 79419771 1I AGAGTGAACA -/G GGGGATGTTC 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 G 4 5 296664 CASAVA_Build 2 79425743 1D GTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 7 15 7 A 10 9 296665 CASAVA_Build 2 79451779 1I CTGGGGAAGA -/G GGGGAGGGGT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 G 4 5 296666 CASAVA_Build 2 79454304 1D CCTGGAAGCA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 T 7 6 296667 CASAVA_Build 2 79455155 2I TATATATATA --/TT TTTTTCTATT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 5 7 296668 CASAVA_Build 2 79455401 1D CTCCATGAGA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 T 8 7 296669 CASAVA_Build 2 79457086 1I TGTTGGTTGG -/T TTTTGTTTTT 2166 het 2166 ref 15 7 7 1 T 4 5 296670 CASAVA_Build 2 79461012 18D TGCCTCTTCC ATTTTATGAAAATGGAAG/------------------ ATTTTATGAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 4 ATTTTATGAAAATGGAAG 1 0 296671 CASAVA_Build 2 79475422 1I CTTAAAAAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 49 20 26 3 T 8 9 296672 CASAVA_Build 2 79479484 1D GTGTTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 16 11 A 13 12 296673 CASAVA_Build 2 79494569 26D AGCTGAATTC ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 2646 hom 15 het 6 0 6 1 AT 19 6 296674 CASAVA_Build 2 79496626 3D AGCAAGAATT ATA/--- ATAACTGTCT 3070 het 3070 ref 51 27 23 2 ATA 2 1 296675 CASAVA_Build 2 79499518 4D ATGTTGAACA AGTG/---- AGATTATTAA 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 AGTG 1 0 296676 CASAVA_Build 2 79499707 1I TACTTATGCA -/G AAAAAGCATC 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 G 0 1 296677 CASAVA_Build 2 79508267 1D AAAAAAAAAA T/- AATAACTGTA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 1 0 296678 CASAVA_Build 2 79511442 4D CCCAAGGTTC AAAG/---- AAAGACTGGT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 AAAG 2 1 296679 CASAVA_Build 2 79511514 1D ATTATATTGT G/- TACACTATTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 6 G 1 0 296680 CASAVA_Build 2 79517130 1I TAAAAACACT -/G GATCCCACAC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 G 1 2 296681 CASAVA_Build 2 79535338 22D GCCATTATTT CTCATAAGAGAAATAATGCAGA/---------------------- CTCATAAGAG 3070 het 3070 ref 26 14 9 6 CTCATAAGAGAAATAATGCAGA 1 0 296682 CASAVA_Build 2 79544620 1D TTAAAGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1676 hom 29 8 11 10 T 13 12 296683 CASAVA_Build 2 79555874 1I CTAAGCTGTG -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 7 8 296684 CASAVA_Build 2 79556314 1I CTTTGAATAC -/A TTTTTTTTTT 552 het 552 ref 20 11 4 5 A 0 1 296685 CASAVA_Build 2 79567894 1I CGTTGCAAAA -/T AACTATCTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 0 1 296686 CASAVA_Build 2 79599515 1I ACAAAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 10 11 296687 CASAVA_Build 2 79605545 1I TCCATGGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 11 12 296688 CASAVA_Build 2 79607089 1D CCTAGCTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 10 9 296689 CASAVA_Build 2 79608832 5D CACGTTCTCT TTTTC/----- TTTTCTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTTTC 3 2 296690 CASAVA_Build 2 79610347 2D TGGAAAAGAA AT/-- ATGTTACTCC 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 AT 2 1 296691 CASAVA_Build 2 79611131 1I CACTGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 11 296692 CASAVA_Build 2 79611502 3I GTTTGAGCAC ---/AGG AGAACACTCA 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 AGG 0 1 296693 CASAVA_Build 2 79613450 3I GAAGTTCTAA ---/TCT TCTTGCTGAA 3070 hom 135 het 47 0 45 2 TCT 1 2 296694 CASAVA_Build 2 79614431 4I ATTAAACAGG ----/CAAA CAAACAAATA 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 CAAA 2 3 296695 CASAVA_Build 2 79617423 1D GCAACCTCTA C/- CCCCCGGGTT 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 C 6 5 296696 CASAVA_Build 2 79618431 1D TTACTATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 545 hom 30 3 23 4 T 13 12 296697 CASAVA_Build 2 79618878 1I TGATTATTCG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 491 hom 39 2 33 4 A 9 10 296698 CASAVA_Build 2 79621843 2D AGTTTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 30 13 16 2 TA 7 6 296699 CASAVA_Build 2 79622377 2D TCTCCTGCCT CA/-- GTTTCCTGAG 3070 het 792 hom 12 2 8 2 CA 1 0 296700 CASAVA_Build 2 79627623 3I AATTTGTGAA ---/AAG AAGAACGCTT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 AAG 1 2 296701 CASAVA_Build 2 79640725 1I GTCAGCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1382 hom 45 4 33 8 T 13 14 296702 CASAVA_Build 2 79645885 1D GGTGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 22 0 15 7 A 11 10 296703 CASAVA_Build 2 79666993 1D GATGTGTGAT A/- ATCTGGCATC 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 2 1 296704 CASAVA_Build 2 79670354 1I TTTTTTTTCC -/G CCCCCCCGAG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 0 1 296705 CASAVA_Build 2 79672108 1I CCTGAGGGGG -/A AAAAACAGCA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 5 6 296706 CASAVA_Build 2 79678100 2D AGCGGGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1789 hom 4 het 8 0 7 1 A 16 14 296707 CASAVA_Build 2 79693800 1I CGTTCAGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 12 13 296708 CASAVA_Build 2 79704969 1I TTCATTAGGC -/T TTTTTTTTTT 1095 het 1095 ref 39 27 3 9 T 10 11 296709 CASAVA_Build 2 79733942 1D TGAGTGTCCA T/- TCAGCCTTCG 3070 het 3070 hom 33 11 19 4 T 2 1 296710 CASAVA_Build 2 79739316 1D AATTTTGTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 T 9 8 296711 CASAVA_Build 2 79739850 1D CCAGTGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 33 4 15 15 T 17 16 296712 CASAVA_Build 2 79749060 1D ACTCTGTTAG T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 7 296713 CASAVA_Build 2 79764359 2D TTCACACAAT TG/-- TGAGAGAGTT 3070 hom 135 het 52 0 44 10 TG 2 1 296714 CASAVA_Build 2 79773938 1I TTCATTAAGA -/T TTTTTTATAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 6 7 296715 CASAVA_Build 2 79784588 2I TTAAATTTAT --/AA GTGATAAGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 0 2 296716 CASAVA_Build 2 79796661 1D ATAAGGATTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 234 hom 40 1 32 7 A 10 9 296717 CASAVA_Build 2 79797648 1D GATTGAATAA T/- TAAGGGATAT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 2 1 296718 CASAVA_Build 2 79801704 1D TTTTTTTTTT A/- AATCACATCA 3070 het 547 hom 39 3 30 7 A 3 2 296719 CASAVA_Build 2 79803810 3I ACCTGCGTAG ---/TTC TTCATCTCAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TTC 1 2 296720 CASAVA_Build 2 79812473 3D TTTATTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 62 het 39 1 33 6 T 12 9 296721 CASAVA_Build 2 79821717 1I CGGCAACTCA -/G GGGGAAGGAG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 4 5 296722 CASAVA_Build 2 79822603 1I CATTTGTCTC -/T TTTTCCCTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 4 5 296723 CASAVA_Build 2 79824171 1I ATTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 2805 het 2145 hom 22 9 8 5 T 14 15 296724 CASAVA_Build 2 79827874 3I CAGTGCCAAA ---/TCT TCTAAGTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 TCT 1 2 296725 CASAVA_Build 2 79834044 2D TAATGGTGTA AC/-- ACAGCATTGG 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 AC 2 1 296726 CASAVA_Build 2 79836684 19D3M6D AAAGTTTGCA TTAGCTGAGGGCCCAGGAGTACTTCAGG/-------------------TAC------ TCAGCACAGA 3070 het 3070 ref 33 26 9 3 N/A 0 0 296727 CASAVA_Build 2 79837898 1D GCATAATAAT A/- AAAAAACCAT 3070 het 3070 hom 42 12 26 4 A 7 6 296728 CASAVA_Build 2 79840029 6D CCATCTCAAA GATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 2859 hom 20 6 14 0 GATAAT 1 0 296729 CASAVA_Build 2 79841579 1I CAGGTTTGCC -/A AAAAGCCAAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 4 5 296730 CASAVA_Build 2 79879816 1I TCAGATCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 13 14 296731 CASAVA_Build 2 79886862 1I AGTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 10 11 296732 CASAVA_Build 2 79896089 3I GTATAAGGTG ---/AGA AGAAATGAGG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 AGA 1 2 296733 CASAVA_Build 2 79900721 3I ATATATGTAA ---/TAT TATGTGATTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TAT 1 2 296734 CASAVA_Build 2 79912497 1D CTCTAAATCG T/- TACAAATAAT 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 T 2 1 296735 CASAVA_Build 2 79915273 1D TTATGTACTA T/- TTTTTGCAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 6 5 296736 CASAVA_Build 2 79915403 1D ATTTAAGAAA T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 7 6 296737 CASAVA_Build 2 79926622 1I TGAAGAATGG -/A AAAATCAGTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 4 5 296738 CASAVA_Build 2 79934305 1D ATTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2718 het 1647 hom 22 5 7 10 T 15 14 296739 CASAVA_Build 2 79936352 11D ACTGGGATCA ACCATGTAGCT/----------- ACCTGGGTTC 3070 het 3070 ref 55 34 20 3 ACCATGTAGCT 1 0 296740 CASAVA_Build 2 79940246 1D TGCTTGGAAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 8 7 296741 CASAVA_Build 2 79943864 1D ATTTAGATGG A/- TAACAGAATA 3070 het 3070 ref 52 27 19 7 A 1 0 296742 CASAVA_Build 2 79946193 2I CTAGTAATGG --/TA TATAGCCAGC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 TA 2 3 296743 CASAVA_Build 2 79953500 1D TCCCAGAGAT A/- ACACAGCTGG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 2 1 296744 CASAVA_Build 2 79954373 1I CTTCCACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 54 15 23 16 T 12 13 296745 CASAVA_Build 2 79963568 1I TTCCTTGGCT -/G GGGGGTGGGG 3070 hom 74 het 29 0 24 5 G 5 6 296746 CASAVA_Build 2 79969116 1I TACCTTTCAA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 8 296747 CASAVA_Build 2 79973051 1I TACCTGTATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 A 9 10 296748 CASAVA_Build 2 79977969 1I CTTTACCGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 23 9 A 10 11 296749 CASAVA_Build 2 79987958 2I TTATATGGAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 TA 5 6 296750 CASAVA_Build 2 79989803 4D GAGGATTAAC GTGT/---- GTGTATACAA 3070 hom 108 het 38 0 37 3 GT 4 2 296751 CASAVA_Build 2 79990300 3D GAGGCTGGAG AGC/--- AGCATCATCA 3070 hom 59 het 24 0 15 9 AGC 2 1 296752 CASAVA_Build 2 79995834 4I ACAAAAAGAC ----/AAAG AAAGAAGAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAAG 1 2 296753 CASAVA_Build 2 79995944 6D ACACACACAA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 54 het 41 0 18 26 AC 12 9 296754 CASAVA_Build 2 79996002 2D AAATGGACTC AT/-- ATTGTAAATG 3070 hom 72 het 37 0 25 14 AT 2 1 296755 CASAVA_Build 2 80001575 1D AGGATGTGTC T/- GAGGGCTTGG 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 T 1 0 296756 CASAVA_Build 2 80006515 2D CATCTAAGAC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 24 0 20 6 T 11 9 296757 CASAVA_Build 2 80015990 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 30 2 23 5 T 13 14 296758 CASAVA_Build 2 80016886 1D CATGCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 12 11 296759 CASAVA_Build 2 80017183 1D CCAAGCGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 39 2 23 14 T 12 11 296760 CASAVA_Build 2 80030832 2D AGTGACATTA AG/-- AGAGAAAGCA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AG 3 2 296761 CASAVA_Build 2 80044723 2D TTCTGCAGAC AG/-- AGCATGTCCT 3070 het 3070 hom 45 15 27 4 AG 2 1 296762 CASAVA_Build 2 80048851 1D TTACTTCAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 22 18 9 A 10 9 296763 CASAVA_Build 2 80049468 1I ATGACCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 20 19 12 T 11 12 296764 CASAVA_Build 2 80051446 1D GTAAACGTCT A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 44 28 10 6 A 7 6 296765 CASAVA_Build 2 80063218 4I TAGGTTTCTG ----/ATAA ATGTTTCTGT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 ATAA 0 1 296766 CASAVA_Build 2 80067670 1D TTTTCTTGAC T/- GGCAGCCCCG 3070 het 3070 hom 28 11 13 6 T 1 0 296767 CASAVA_Build 2 80086307 1I TACTTATAGA -/T TTTTTTAATT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 6 7 296768 CASAVA_Build 2 80086411 2I TGTTTATTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 40 0 29 11 T 12 14 296769 CASAVA_Build 2 80091354 1D TGCCATTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 23 1 14 8 T 11 10 296770 CASAVA_Build 2 80092238 4D AGGGAGTTAG ATGA/---- ATGATCTCCA 3070 hom 144 het 53 0 49 5 ATGA 2 1 296771 CASAVA_Build 2 80095034 1D ATCTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 22 0 17 6 T 13 12 296772 CASAVA_Build 2 80114995 1I TTTTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 671 het 242 hom 21 6 5 10 C 0 1 296773 CASAVA_Build 2 80118705 1D TTGAAAATTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 125 het 45 0 40 5 A 10 9 296774 CASAVA_Build 2 80125020 1I CCACATTTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 9 10 296775 CASAVA_Build 2 80147822 1D GACTATAGTT A/- ATGTATTCTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 2 1 296776 CASAVA_Build 2 80151355 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 929 hom 19 3 11 5 A 14 15 296777 CASAVA_Build 2 80158224 1D TGTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1756 hom 17 8 9 0 A 15 14 296778 CASAVA_Build 2 80162423 4I TGTCTGTGTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TC 6 8 296779 CASAVA_Build 2 80189543 1I GATTTTCACT -/A AAACAAAACA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 3 4 296780 CASAVA_Build 2 80189941 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAACATT 3070 het 2185 hom 24 6 15 3 A 6 7 296781 CASAVA_Build 2 80196692 1D TTTAATAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 15 21 10 T 10 9 296782 CASAVA_Build 2 80202796 2D GAGCTTGGAA TC/-- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 21 7 TC 4 3 296783 CASAVA_Build 2 80251010 3D TGACAGTTTA TCT/--- TCTTCTTCAC 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 TCT 3 2 296784 CASAVA_Build 2 80266755 1I CCACCCCCAT -/C CCTATGGGAA 3070 hom 91 het 36 0 28 8 C 2 3 296785 CASAVA_Build 2 80270385 1I TCAACCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 A 10 11 296786 CASAVA_Build 2 80273589 4I GTGTATAGTG ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 GT 6 8 296787 CASAVA_Build 2 80314690 1D TCACTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 11 10 296788 CASAVA_Build 2 80315449 1D AGTTGGCAGA T/- TTTTTTTTTT 2099 het 2099 ref 36 22 5 9 T 13 12 296789 CASAVA_Build 2 80328615 1I ATTCTAAAAG -/C CCTTTAAAAT 3053 het 3053 ref 23 8 8 7 C 2 3 296790 CASAVA_Build 2 80343538 27D CTATTCCATC AACAACAATATTGACAAAAATAATAAA/--------------------------- AACAACAATA 2902 het 2902 ref 29 18 8 13 AACAACAATATTGACAAAAATAATAAA 2 1 296791 CASAVA_Build 2 80449144 5I TTTTTTTAAC -----/TGAAG CATTTTTGCT 3070 het 3070 hom 26 7 14 5 TGAAG 0 1 296792 CASAVA_Build 2 80482433 1I TAAGAGACAG -/A AAAAAAAAAA 1969 het 1969 ref 39 21 7 11 A 12 13 296793 CASAVA_Build 2 80503076 1D TTATAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 32 0 21 11 T 13 12 296794 CASAVA_Build 2 80542318 1D TCCGAAACTT A/- AAAAAAAAAA 1062 het 1062 ref 39 32 3 4 A 11 10 296795 CASAVA_Build 2 80555022 1I GAGGTGGGTG -/T TCCATATCCA 3070 hom 139 het 49 0 42 7 T 1 2 296796 CASAVA_Build 2 80587941 2D ACCTAGGCAA CT/-- CTTTTATTTA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 CT 2 1 296797 CASAVA_Build 2 80591603 1I CAAAGAGACA -/C CTGTATTGCC 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 C 1 2 296798 CASAVA_Build 2 80623515 1I CTGATTTTTT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 C 9 10 296799 CASAVA_Build 2 80631443 2D CAAAGTCGAC TA/-- TGAGGGTTGG 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 TA 1 0 296800 CASAVA_Build 2 80635796 4I CTGCGTGATA ----/TTTG TTTATTTTTC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TTTG 0 1 296801 CASAVA_Build 2 80637357 1D TATATGAGAT A/- AGATATATAG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 2 1 296802 CASAVA_Build 2 80639119 6D TGTGTGTGTG TGTGTA/------ TATATATATG 3070 hom 65 het 38 0 22 19 TGTGTA 1 0 296803 CASAVA_Build 2 80640706 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAAAAAA 3048 het 303 hom 30 4 11 15 AG 0 1 296804 CASAVA_Build 2 80641645 2D GACCAATTTC TG/-- TGTATCAATG 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 TG 2 1 296805 CASAVA_Build 2 80642722 2I TGTAAACATA --/TC TCTGGAGAAG 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 TC 1 2 296806 CASAVA_Build 2 80643647 20D AGCAGAACAA ACAGCACTTCTCTAGTGCCT/-------------------- GTTTGTCAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 8 ACAGCACTTCTCTAGTGCCT 1 0 296807 CASAVA_Build 2 80646237 4I TGCCTGGTAG ----/AAAC AAACAGTGTG 3070 hom 147 het 52 0 46 6 AAAC 1 2 296808 CASAVA_Build 2 80652213 4D TGTATATGTT TAAA/---- TAATGCACAG 3070 het 3070 hom 37 18 19 2 TAAA 1 0 296809 CASAVA_Build 2 80661653 4I CCCTGTCTCA ----/AAAC AAACAACAAA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 AAAC 1 2 296810 CASAVA_Build 2 80671068 2D TTTTACTGTA GT/-- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 GT 2 1 296811 CASAVA_Build 2 80673358 3I GCTATATCTC ---/ATT ATTGGAGAGT 3070 het 3070 hom 53 20 21 12 ATT 1 2 296812 CASAVA_Build 2 80693703 5I AAATTGTGAC -----/AAATG AAATGAAATG 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 AAATG 2 3 296813 CASAVA_Build 2 80696180 1I TCTATGTTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 8 9 296814 CASAVA_Build 2 80697327 5I AAGTATACAG -----/CTAAT CTAATCTACA 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 CTAAT 1 2 296815 CASAVA_Build 2 80697939 1I AGATTGTTAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 6 7 296816 CASAVA_Build 2 80702398 1I TATGGGGGAT -/A AAAAAAGTGT 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 A 6 7 296817 CASAVA_Build 2 80704625 4D GTTATTAAAT ATAA/---- ATAATCAGTG 3070 het 3070 ref 37 20 12 7 ATAA 2 1 296818 CASAVA_Build 2 80704879 1I ACTTCCTTGG -/A AAAAAAAACG 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 8 9 296819 CASAVA_Build 2 80707813 2D ATAAACATAC GT/-- GTGTGTGTGT 2400 het 2400 ref 20 12 6 2 GT 7 6 296820 CASAVA_Build 2 80712003 2I ACTAATTTTT --/TC TTTTTTTTTT 2830 het 2830 ref 33 14 9 10 TC 0 1 296821 CASAVA_Build 2 80718961 1D TCCCAATTAT G/- GGGGGGGTGC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 8 7 296822 CASAVA_Build 2 80719688 1I AACAGACCTC -/T TTGTCCTCTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 2 3 296823 CASAVA_Build 2 80726215 4I GTTTTGATTC ----/AGTA AGTAAGTTTT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 AGTA 1 2 296824 CASAVA_Build 2 80729238 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 5 6 296825 CASAVA_Build 2 80730188 4I AGATCACAGA ----/TAAC TAACTAGCCT 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 TAAC 1 2 296826 CASAVA_Build 2 80730385 3I CCAATGACCT ---/GAA GAACAAAGAA 3070 hom 135 het 47 0 45 2 GAA 1 2 296827 CASAVA_Build 2 80732606 1I TGTGCCCCCA -/C CCCCTCCCTG 3070 hom 114 het 48 0 37 11 C 4 5 296828 CASAVA_Build 2 80734005 10D3M2D AAGAATCTCT TCAACTTATATATTG/----------GAT-- TGTTCCCAAC 3070 hom 90 het 28 0 31 4 N/A 0 0 296829 CASAVA_Build 2 80754537 1D AATCTTTCCC T/- TTATTTACAG 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 3 2 296830 CASAVA_Build 2 80754980 1D TCTCTTTTCC A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 36 11 22 4 A 8 7 296831 CASAVA_Build 2 80756468 1I CCTTCAAATG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 8 9 296832 CASAVA_Build 2 80768351 1I TTCCTTTCAC -/T TTTCAATACC 3070 het 3070 ref 54 25 22 7 T 3 4 296833 CASAVA_Build 2 80768912 1D CATTTCTGAC A/- ATGTAGCTAG 3070 het 3070 hom 54 22 25 8 A 2 1 296834 CASAVA_Build 2 80771038 1I TTGCAACATA -/T TTTTTTAATT 3070 het 2057 hom 19 5 9 5 T 6 7 296835 CASAVA_Build 2 80773404 1D GGTGGATAAG C/- TTTTTGATGT 3070 het 480 hom 9 1 8 0 C 1 0 296836 CASAVA_Build 2 80773681 1D AGCAGAAACT G/- GGTGTGGAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 5 G 3 2 296837 CASAVA_Build 2 80776525 1I CTATGGTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 T 10 11 296838 CASAVA_Build 2 80783296 1I TGGATCAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 8 9 296839 CASAVA_Build 2 80793792 1D TTGACAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2415 hom 31 11 10 10 T 15 14 296840 CASAVA_Build 2 80815937 1I GAGTTTTTTT -/C TTTGACATTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 C 0 1 296841 CASAVA_Build 2 80838414 2D GGCTGGAGTC CT/-- GTTTCTGTCA 3070 het 3070 hom 53 19 29 6 CT 1 0 296842 CASAVA_Build 2 80846858 1D TATCTGTACC A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 7 6 296843 CASAVA_Build 2 80851981 3D TCTCTGCCTC CTT/--- CTCTCCTCTC 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 CTT 1 0 296844 CASAVA_Build 2 80871279 1I TAAACCCTAC -/T TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 6 7 296845 CASAVA_Build 2 80892970 11I ATGGATGAAG -----------/TTGGAAACCAT CATTCTGAGC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TTGGAAACCAT 0 1 296846 CASAVA_Build 2 80895845 1D GCAGGTGGTG T/- TTTTTTTTTT 2771 het 2206 hom 29 13 10 6 T 13 12 296847 CASAVA_Build 2 80901824 1D CCTCCACTTG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 952 hom 25 6 11 8 C 9 8 296848 CASAVA_Build 2 80905233 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1470 het 593 hom 10 4 5 1 A 16 14 296849 CASAVA_Build 2 80939871 1D ATATAAGGGT G/- GGGGGGGGCA 3070 het 3070 hom 27 10 8 10 G 9 8 296850 CASAVA_Build 2 80941241 1I AAATTTCAAA -/G AAGGGAAATA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 G 0 1 296851 CASAVA_Build 2 80941845 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1233 het 1233 ref 18 11 3 4 A 15 14 296852 CASAVA_Build 2 80966564 1I TTGTACTTTT -/C TTTTGCTTTT 3070 het 3070 hom 56 27 24 5 C 0 1 296853 CASAVA_Build 2 80989288 5I ATTTAAGATC -----/TTTAT TTTATCTTTT 2634 het 2634 ref 32 24 6 2 TTTAT 1 2 296854 CASAVA_Build 2 81001551 1I TGGTGACTTA -/T TTAGTTCATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 3 296855 CASAVA_Build 2 81016566 1I TAGATTTTAT -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 7 8 296856 CASAVA_Build 2 81021883 26I AAGCTCATCA --------------------------/ATACCTAAGTTTATACTTTTAAATAT ATCTTCTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 ATACCTAAGTTTATACTTTTAAATAT 0 1 296857 CASAVA_Build 2 81025818 1D TTTTATGCAA G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 7 6 G 1 0 296858 CASAVA_Build 2 81030197 5D AGTATTTGAA CACCT/----- CTTTATATTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 CACCT 1 0 296859 CASAVA_Build 2 81037701 1I GATCATGACC -/T TCCTACATGA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 1 2 296860 CASAVA_Build 2 81055535 1D CTCAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 1275 het 1275 ref 22 10 6 6 A 17 16 296861 CASAVA_Build 2 81088454 1D TTTCTGGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2055 hom 29 11 15 3 A 15 14 296862 CASAVA_Build 2 81103069 1D GTTTTCTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 T 10 9 296863 CASAVA_Build 2 81105093 6D AATTCATTTA TCTTTG/------ TCTTTGTCTA 3029 het 3029 ref 17 10 9 0 TCTTTG 2 1 296864 CASAVA_Build 2 81105307 4I ATTTTTAAAA ----/TTTC TTTAAGTTGA 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 TTTC 0 1 296865 CASAVA_Build 2 81134398 1D CTATCTTCAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 8 7 296866 CASAVA_Build 2 81157030 1D TAAAGTTCGG A/- AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 A 7 6 296867 CASAVA_Build 2 81180519 3D AGTTCAAACC GTT/--- GTTGTTCAAG 3070 het 3070 hom 34 13 16 7 GTT 3 2 296868 CASAVA_Build 2 81184456 3D AAAAATTAGT GAA/--- GAAGAAACAA 3070 het 3070 ref 40 23 14 4 GAA 3 2 296869 CASAVA_Build 2 81188004 1D AGTTTAAGAG T/- TTTTAGTATT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 T 5 4 296870 CASAVA_Build 2 81192355 4D GCCTGCAACC ATCT/---- ATCTGATCTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 ATCT 2 1 296871 CASAVA_Build 2 81192870 1D TGTATAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 A 11 10 296872 CASAVA_Build 2 81195418 5D TTTGTTAGAA TTTTT/----- TTTTCTCCTT 3070 het 3070 ref 36 22 11 5 T 9 4 296873 CASAVA_Build 2 81199347 5D TTATTTCCTC AAATT/----- AAACATTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 AAATT 1 0 296874 CASAVA_Build 2 81199433 4D TATTAGTATA TTAC/---- TTATATAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 4 TTAC 1 0 296875 CASAVA_Build 2 81201706 1I CACTCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 10 11 296876 CASAVA_Build 2 81213512 4I GGTTGATAAA ----/TGAT TGATCCTGAA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 TGAT 1 2 296877 CASAVA_Build 2 81247215 1I AATAATAGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 9 10 296878 CASAVA_Build 2 81251611 2D TATTTAAAAA AG/-- AGTTAAAATG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 AG 2 1 296879 CASAVA_Build 2 81282856 13I ATACTGACTA -------------/AAGTTGTTAAATG AAGAAGATGT 3070 het 3070 ref 53 28 18 8 AAGTTGTTAAATG 0 1 296880 CASAVA_Build 2 81290367 5D CCCTCCCAAG ACTAA/----- ACCAGGAAGA 2929 het 2179 hom 11 5 6 1 ACTAA 1 0 296881 CASAVA_Build 2 81293845 3I GCCACTGGCC ---/TCG TTGTTTGAAG 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 TCG 0 1 296882 CASAVA_Build 2 81295323 1I GCAGAATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 9 10 296883 CASAVA_Build 2 81313874 2I TATATATATA --/TT TCTCATATAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 1 3 296884 CASAVA_Build 2 81321983 1D CTTTTATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 11 10 296885 CASAVA_Build 2 81328102 1I TTCAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 35 1 26 8 A 10 11 296886 CASAVA_Build 2 81334554 1D26M1D GTTTCCTATG TTTTTTTTTAGGCCTTTTACAGTTTTAG/-TTTTTTTTAGGCCTTTTACAGTTTTA- GTTTTACATT 3070 hom 111 het 35 0 38 5 N/A 0 0 296887 CASAVA_Build 2 81339804 1D TTTTAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 449 hom 27 3 14 10 T 13 12 296888 CASAVA_Build 2 81340942 2I TAATTTTACA --/AT ATGTCATCAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AT 1 2 296889 CASAVA_Build 2 81343968 4D CTACAGTCTT TATA/---- TAACGCAAGA 3070 hom 81 het 28 0 28 2 TA 3 1 296890 CASAVA_Build 2 81348873 1I AGTTTAAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 8 9 296891 CASAVA_Build 2 81380167 1I CCATCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 1463 het 1463 ref 34 25 4 5 A 13 14 296892 CASAVA_Build 2 81454084 1I ATATTCTTCC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 6 7 296893 CASAVA_Build 2 81458403 36D AATCATTGAA TGGATTAACTTCCTGGATGCTTTAATCAATCACAAG/------------------------------------ TGTGTTTTCA 3070 het 3070 ref 27 26 11 3 TGGATTAACTTCCTGGATGCTTTAATCAATCACAAG 1 0 296894 CASAVA_Build 2 81460323 1D CCCCACATTT A/- AAAAAAAAAA 2012 het 2012 ref 25 14 6 5 A 17 16 296895 CASAVA_Build 2 81461676 1I TATATACATA -/G ATAGGAGTTG 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 G 0 1 296896 CASAVA_Build 2 81465915 2I TAGCTAAGTC --/AT GTGTGATTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AT 0 1 296897 CASAVA_Build 2 81470984 4I GTTCACACAC ----/ACAT ACATACACAC 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 ACAT 1 2 296898 CASAVA_Build 2 81486627 1D ACTTGGTGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 144 het 56 0 49 7 T 9 8 296899 CASAVA_Build 2 81503306 1I AAGCAAGGGA -/G GCAAGCCCTT 3070 hom 159 het 57 0 53 4 G 1 2 296900 CASAVA_Build 2 81510446 1I TAGTTTATAA -/T TTTTTTTACC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 7 8 296901 CASAVA_Build 2 81521061 3D CAGGTGAGGG ATA/--- AAAAACCACA 2854 het 2854 ref 27 15 8 7 ATA 1 0 296902 CASAVA_Build 2 81553244 2D TGACAACTTT AG/-- ATAATTTAAG 3070 het 3070 ref 48 28 16 5 AG 1 0 296903 CASAVA_Build 2 81595092 1I ACAAATCACT -/A AAACTTGAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 3 4 296904 CASAVA_Build 2 81658084 4D CAGAGATTGC TGTT/---- TGTTTACCAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 6 TGTT 2 1 296905 CASAVA_Build 2 81680061 1D CATTTTATAC T/- TTTTTTTTTT 1264 het 1264 ref 39 23 6 10 T 17 16 296906 CASAVA_Build 2 81739521 1I GTAAGTAGAC -/A AAAAAAAAAA 1212 het 1212 ref 42 34 4 4 A 10 11 296907 CASAVA_Build 2 81784461 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3023 hom 29 13 12 4 T 11 10 296908 CASAVA_Build 2 81828663 1D TTTGCTGGCA T/- TTTTTTTTTT 1103 het 1103 ref 32 23 3 6 T 13 12 296909 CASAVA_Build 2 81847938 1D ATAACAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 112 het 45 0 38 7 A 10 9 296910 CASAVA_Build 2 81867663 1D AGAAACTTCA C/- ACCCTCAATT 3070 het 3070 ref 41 17 19 5 C 1 0 296911 CASAVA_Build 2 81867946 4I TGACATTGAT ----/GTTC GTTCATACAA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 GTTC 1 2 296912 CASAVA_Build 2 81870232 1I GATAGGATGT -/A AAAAAAAGGA 2893 het 2893 ref 20 8 7 5 A 7 8 296913 CASAVA_Build 2 81872206 1I TATTTGGATT -/G TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 G 0 1 296914 CASAVA_Build 2 81872282 4I ATTTACTGAG ----/ACTT ACTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 ACTT 1 2 296915 CASAVA_Build 2 81874205 1I55M1I AAGCAATTAT -AAAAAAAAACAATCACACATATGCTTATGGTTCAGGGTTCAGCAGATTGGGAGGA-/AAAAAAAAAACAATCACACATATGCTTATGGTTCAGGGTTCAGCAGATTGGGAGGAT TTTTGGATTT 3070 het 3070 ref 42 32 22 8 N/A 0 0 296916 CASAVA_Build 2 81875396 4D AAAACAGTCT AATA/---- AATACAGTAG 3070 het 3070 ref 38 17 18 4 AATA 2 1 296917 CASAVA_Build 2 81877689 1I AGATAGGCTG -/A AAAATAATTT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 A 4 5 296918 CASAVA_Build 2 81878130 1D GTAATTATCC T/- TTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 T 8 7 296919 CASAVA_Build 2 81878745 2I ATAATCAATC --/TT TTTTGAAAGA 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 T 4 6 296920 CASAVA_Build 2 81879350 2D ATTATTCGTT TC/-- TTTGGGGGCA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 TC 1 0 296921 CASAVA_Build 2 81888302 1I CTTATTTCTG -/A GCTCTATATT 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 A 0 1 296922 CASAVA_Build 2 81889484 27D TTGTCGGTCT GAGAAATAAAGAGAAAGAGTAGAAAGA/--------------------------- GAGAAATTTT 2748 het 2748 ref 18 16 7 3 GAGAAATAAAGAGAAAGAGTAGAAAGA 1 0 296923 CASAVA_Build 2 81891694 1I47M3D TTTCACTAGC -AAAAAAAATGGAGAATTTTGACAGCAGGGTTTATTATTGTACTTAAGTTT/AAAAAAAAATGGAGAATTTTGACAGCAGGGTTTATTATTGTACTTAAG--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 20 12 9 N/A 0 0 296924 CASAVA_Build 2 81893495 1D TCTATCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 12 11 296925 CASAVA_Build 2 81894699 1D ATCAGTTTCC T/- TTTTTACTTA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 T 6 5 296926 CASAVA_Build 2 81895381 2I GGAACTTTAA --/CT CTGAGTATCT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 CT 1 2 296927 CASAVA_Build 2 81896174 4D AAAAAAGTAT TTTC/---- TTTCTATTTG 1982 het 1982 ref 20 10 6 5 TTTC 2 1 296928 CASAVA_Build 2 81897546 1D GGAGCATTTT A/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 43 26 17 0 A 1 0 296929 CASAVA_Build 2 81897684 1D ATTCCAGAGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 9 8 296930 CASAVA_Build 2 81903002 17D CCCAGCCTCC AGAACTATGTGAGACAT/----------------- AGAACTATGT 3070 het 3070 ref 43 27 17 6 AGAACTATGTGAGACAT 2 1 296931 CASAVA_Build 2 81909674 5I GCATACTCCT -----/AAGTC AAGTCAGGTT 3070 het 3070 hom 42 21 21 0 AAGTC 1 2 296932 CASAVA_Build 2 81910310 4I GAGAGTGGAA ----/AGAT AGATACATTC 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 AGAT 1 2 296933 CASAVA_Build 2 81913773 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAATAG 2852 het 2852 ref 26 15 6 5 A 7 8 296934 CASAVA_Build 2 81914248 1I CAAAATAGCT -/A AAAAGGAAAT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 4 5 296935 CASAVA_Build 2 81915625 3I AAAGATGAAA ---/AAC AACAAGTATT 3070 hom 141 het 49 0 48 1 AAC 1 2 296936 CASAVA_Build 2 81916606 2D AAGGTTAAAG TT/-- TTTACTGTAT 3070 het 3070 hom 48 19 25 5 T 5 3 296937 CASAVA_Build 2 81917201 1I ACATACACTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 8 20 6 T 8 9 296938 CASAVA_Build 2 81923107 1I TAATGGGAGA -/G CTTTAACACC 3070 het 2020 hom 13 5 8 0 G 0 1 296939 CASAVA_Build 2 81929932 1I ATCTTAATCA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 130 het 52 0 43 9 T 7 8 296940 CASAVA_Build 2 81930373 4D AAGAGAATCA TACT/---- TACCCTATTT 3070 het 3070 ref 46 24 18 10 TACT 1 0 296941 CASAVA_Build 2 81930949 1D CTAACATCTA C/- CCCCTCACAC 3070 het 3070 hom 60 24 31 6 C 5 4 296942 CASAVA_Build 2 81931169 1D AAATGTGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 10 9 296943 CASAVA_Build 2 81931469 1I CTCATCCCCA -/T ATCCTAGCCA 3070 het 2593 hom 36 12 19 5 T 0 1 296944 CASAVA_Build 2 81931713 3D TTCATCAACA GAT/--- GATGACTGGA 3070 hom 160 het 57 0 54 7 GAT 2 1 296945 CASAVA_Build 2 81931890 1I ACCAAGAGTA -/G TCAGCTTTAT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 G 0 1 296946 CASAVA_Build 2 81949676 1I CTAAAACAAA -/T TTTTTATACA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 5 6 296947 CASAVA_Build 2 81950251 11D AAACAATGTG AATCTTACAAA/----------- AATCAATGAA 3070 het 3070 ref 30 14 15 4 AATCTTACAAA 1 0 296948 CASAVA_Build 2 81954585 4I CACTGTGTTG ----/AAGT AAGGTTTTGC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 AAGT 0 1 296949 CASAVA_Build 2 81963042 1D AGTAGGATAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 9 8 296950 CASAVA_Build 2 81967390 1D GTAAAAGAAT A/- TGTTGTTACA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 1 0 296951 CASAVA_Build 2 81968389 1I TTTAACTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 13 12 T 10 11 296952 CASAVA_Build 2 81968706 1I CACAAATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 32 1 15 16 A 11 12 296953 CASAVA_Build 2 81970086 1D CTCAGCTCAC T/- TGCAAGCTCC 3070 hom 45 het 17 0 14 3 T 2 1 296954 CASAVA_Build 2 81970552 2D GCATCCACAG AA/-- AATATACTAA 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 A 4 2 296955 CASAVA_Build 2 81972433 1D TTGAAGTATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 A 9 8 296956 CASAVA_Build 2 81980161 2D GGACAAAAAC TT/-- TCTTTTGATA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 3 1 296957 CASAVA_Build 2 81981611 1D TCAACATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 38 3 16 19 A 12 11 296958 CASAVA_Build 2 81984872 3D TTGGCTAGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 12 14 20 A 15 12 296959 CASAVA_Build 2 81988914 2D AAATGCAGAT TA/-- TATGTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 8 23 1 TA 2 1 296960 CASAVA_Build 2 82015987 1D ATCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 105 hom 23 1 16 7 A 15 14 296961 CASAVA_Build 2 82018540 4I GAAAGAGAAA ----/GAGG GAGAGAAAGA 3070 het 3070 hom 42 22 19 1 GAGG 0 1 296962 CASAVA_Build 2 82020138 5D TAGTGGTTAG AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 40 21 12 13 AAAAC 4 3 296963 CASAVA_Build 2 82023073 1I TATTCTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 11 11 A 11 12 296964 CASAVA_Build 2 82023290 1I AGAGAAAAGA -/G GGCAAGCCTC 3070 hom 109 het 41 0 33 8 G 2 3 296965 CASAVA_Build 2 82025165 12D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 16 9 8 2 A 20 8 296966 CASAVA_Build 2 82032502 1D CAGGCCTTTT A/- TTTTTCACCA 3070 het 3070 ref 32 16 12 6 A 1 0 296967 CASAVA_Build 2 82035525 1D TTTTTAGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 6 A 10 9 296968 CASAVA_Build 2 82040987 1D ATAAACACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 11 10 296969 CASAVA_Build 2 82041797 2I AAAGTAGAGG --/AT ATTGGCCAAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AT 1 2 296970 CASAVA_Build 2 82041896 1D ACAAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 13 12 296971 CASAVA_Build 2 82044919 5I TTTTTGAAAT -----/AAAAG AAATTTGTGT 3070 het 3070 hom 39 14 24 1 AAAAG 0 1 296972 CASAVA_Build 2 82048867 1I TAGAAAAAAA -/C AATTCTAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 C 0 1 296973 CASAVA_Build 2 82051389 1I CCAAAGTGCT -/G GGTTTACAGG 3070 het 2441 hom 20 7 11 2 G 2 3 296974 CASAVA_Build 2 82052649 1I GTACAAAAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 8 9 296975 CASAVA_Build 2 82059516 5D GTTCAGTATA TATTT/----- AAGATCTCTA 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 TATTT 1 0 296976 CASAVA_Build 2 82071222 7D CATTTTCTGA TAGCTTT/------- CTGTTTTTCT 885 het 885 ref 32 9 6 18 TAGCTTT 1 0 296977 CASAVA_Build 2 82086887 1D CTATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 36 1 25 12 T 12 11 296978 CASAVA_Build 2 82092998 1I GTCATGCATG -/A AAAAAACACG 3070 hom 65 het 26 0 22 4 A 6 7 296979 CASAVA_Build 2 82097629 1I ATTTAGAGAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 8 9 296980 CASAVA_Build 2 82101726 3D TAGCAAATAT ACA/--- GAGTCAAACT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 ACA 1 0 296981 CASAVA_Build 2 82115042 1I AGCTTTGTTT -/A ATGGCCAGTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 1 2 296982 CASAVA_Build 2 82117595 2I20M2D ATTCTAAAAA --GAATATTATAGAACTGAAAAAC/GTGAATATTATAGAACTGAAAA-- ACAACAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 19 1 N/A 0 0 296983 CASAVA_Build 2 82118241 2D AAGAAAAGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 12 10 296984 CASAVA_Build 2 82126733 1D GAACATATAT G/- GGGGGAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 G 6 5 296985 CASAVA_Build 2 82126945 1I ACAAAATTAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 A 8 9 296986 CASAVA_Build 2 82127609 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 9 10 296987 CASAVA_Build 2 82129025 1I AACTCAATTT -/A AAAAATGGGC 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 5 6 296988 CASAVA_Build 2 82130025 1I ACCAGAGGCT -/A GGGTGGTTAG 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 A 0 1 296989 CASAVA_Build 2 82131043 1D TATAATAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 T 1 0 296990 CASAVA_Build 2 82131895 2I ATATATATAT --/AA AAAACTTATT 1247 het 1247 ref 10 6 3 1 A 4 6 296991 CASAVA_Build 2 82132714 2D ATTTGGGAAT CA/-- CACTATAATT 3070 het 3070 ref 48 22 20 7 CA 2 1 296992 CASAVA_Build 2 82135441 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 8 9 296993 CASAVA_Build 2 82138265 1I GTTGACTTAT -/A AAAGTGTCAT 3070 het 3070 hom 51 22 25 4 A 3 4 296994 CASAVA_Build 2 82138904 1D AATAATTTTT A/- AAAAGTGATA 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 A 5 4 296995 CASAVA_Build 2 82139247 2D GAAAATTGGT AA/-- AAGAGTCAAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 A 4 2 296996 CASAVA_Build 2 82139693 1D TCTCTTTTCT G/- GCTATTCCTC 3070 het 2135 hom 26 5 18 5 G 2 1 296997 CASAVA_Build 2 82141598 1I TGTCTTGTAA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 6 7 296998 CASAVA_Build 2 82144305 1D GCAGATCATA T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 6 5 296999 CASAVA_Build 2 82145434 4I ACTGAGTCTA ----/TTAC TTATTTATAT 2901 het 2901 ref 22 7 9 6 TTAC 0 1 297000 CASAVA_Build 2 82150812 1I CCAGAGCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 18 1 A 10 11 297001 CASAVA_Build 2 82151211 1D ATTCTTTATA T/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 7 6 297002 CASAVA_Build 2 82151285 2I TTAAATTGAC --/AT ATTATAATCA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AT 1 2 297003 CASAVA_Build 2 82153670 1D ATGCTACCCA C/- CCATTAGTCA 3070 het 3070 ref 49 27 14 8 C 3 2 297004 CASAVA_Build 2 82154365 1I TTAAAAAAAA -/T TTAAGTTTAT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 T 2 3 297005 CASAVA_Build 2 82155015 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 10 11 297006 CASAVA_Build 2 82155666 6D GAGATTAATT TAAAAA/------ AAAACAAAAT 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 TAAAAA 1 0 297007 CASAVA_Build 2 82163923 1D ATGTGTAAAC A/- TGATTGAGAT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 1 0 297008 CASAVA_Build 2 82173585 3I TAGGCTGCAT ---/AAC AACATTTCAG 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 AAC 1 2 297009 CASAVA_Build 2 82174116 1D TGGGGAAATG T/- TTTTACTAAC 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 5 4 297010 CASAVA_Build 2 82178221 1I TTATATTACA -/T TTTTTAAGAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 5 6 297011 CASAVA_Build 2 82180336 4I GCCCAGACTT ----/CAAA CAAAGATGAA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CAAA 1 2 297012 CASAVA_Build 2 82181610 3D CTTTGTTTGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 797 hom 23 6 11 6 T 14 11 297013 CASAVA_Build 2 82181842 1D AGCTAGCTTA G/- GATTTGAGTG 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 G 2 1 297014 CASAVA_Build 2 82182587 1D ATTCTGCTAT C/- TTTTAGATAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 C 1 0 297015 CASAVA_Build 2 82184637 1I AAAGAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 10 11 297016 CASAVA_Build 2 82202266 1I GGATATGAAG -/A AAAAAAAATC 2828 het 2828 ref 22 12 6 4 A 8 9 297017 CASAVA_Build 2 82204812 1D AATAATGAAA C/- AGGTATTTGT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 C 1 0 297018 CASAVA_Build 2 82205629 1D TCTACCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 29 1 16 12 A 13 12 297019 CASAVA_Build 2 82210437 1I GAATAATCCA -/C CCCTTGTTAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 3 4 297020 CASAVA_Build 2 82219220 6I TCATCCGGAA ------/TCACTT TTGTGCAAGA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 TCACTT 0 1 297021 CASAVA_Build 2 82248447 1D GTGCGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 11 10 297022 CASAVA_Build 2 82265982 3D GTAGATCATC ATT/--- ATTATTTATC 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 ATT 3 2 297023 CASAVA_Build 2 82274495 1I TAACTCAAAT -/A GCAAAAATAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 0 1 297024 CASAVA_Build 2 82277166 1I TTGCTTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 33 2 24 7 A 12 13 297025 CASAVA_Build 2 82278799 1D TGAAATTAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2609 hom 34 7 16 13 A 10 9 297026 CASAVA_Build 2 82284463 5D TACATGGGGG AAGAC/----- AAGACATATA 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 AAGAC 2 1 297027 CASAVA_Build 2 82286040 1I ATTGTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1843 hom 31 10 10 11 A 13 14 297028 CASAVA_Build 2 82287237 5I GGCTGAATAA -----/TATTT TATTTCATGA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 TATTT 1 2 297029 CASAVA_Build 2 82287369 1D TAGATTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 11 10 297030 CASAVA_Build 2 82287619 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2613 het 2276 hom 20 6 7 7 T 15 14 297031 CASAVA_Build 2 82292138 2D TTTAGTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 T 11 9 297032 CASAVA_Build 2 82298008 1D GAGATTGAGA T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 36 20 10 7 T 7 6 297033 CASAVA_Build 2 82300361 1D CATCCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 12 11 297034 CASAVA_Build 2 82302690 1D CATCTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 1253 het 1253 ref 27 19 3 5 A 12 11 297035 CASAVA_Build 2 82302837 4D GATGCAGTCT AAGA/---- GTTATGTGCT 3070 het 3070 ref 33 20 12 3 AAGA 1 0 297036 CASAVA_Build 2 82304489 5I TGCTCTTGTA -----/TTTGT TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 TTTGT 0 1 297037 CASAVA_Build 2 82565375 2I ATATATGTTG --/AT ATATATATAT 1579 het 314 hom 6 1 5 0 AT 8 9 297038 CASAVA_Build 2 82591890 1I AACTTGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 26 17 14 T 11 12 297039 CASAVA_Build 2 82609606 1I CAATATGGCA -/G GGGGTGTACA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 G 4 5 297040 CASAVA_Build 2 82611377 3I CTGGAGGGAA ---/GAG GATGATATTA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 GAG 0 1 297041 CASAVA_Build 2 82659680 1D ATCTTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 2241 het 2241 ref 37 19 6 12 T 15 14 297042 CASAVA_Build 2 82713389 4D TCTGTCTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 27 11 10 7 TTTC 5 4 297043 CASAVA_Build 2 82850128 1I ATTTTTTTTT -/A TAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 26 12 13 1 A 0 1 297044 CASAVA_Build 2 82865895 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTAT 3070 het 1697 hom 30 7 15 8 G 0 1 297045 CASAVA_Build 2 82878086 4D GGATTTGGCT TAAA/---- TAGAGAAATT 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 TAAA 1 0 297046 CASAVA_Build 2 82888566 12I TTAGTTTAAC ------------/CATTGTGGAAAA CATTGTGGTG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 CATTGTGGAAAA 0 1 297047 CASAVA_Build 2 82892018 2D CCTATGTACA AT/-- ATAACTCATC 3070 het 3070 ref 38 21 11 7 AT 2 1 297048 CASAVA_Build 2 82894872 1D GAGTAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 2446 het 2446 ref 35 22 6 7 T 13 12 297049 CASAVA_Build 2 82896322 4D TTGGTCTTAG GAAC/---- GAACCAAAAG 3070 het 3070 hom 41 14 24 4 GAAC 2 1 297050 CASAVA_Build 2 82896443 1D CAACCTCTGC A/- AAAAAAGGTT 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 A 7 6 297051 CASAVA_Build 2 82901443 4D CCCTCTCTCC CTCT/---- CTCTCTCTCT 1531 het 1531 ref 18 8 6 5 CT 7 5 297052 CASAVA_Build 2 82904424 2D TTATACCCTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 CT 9 8 297053 CASAVA_Build 2 82916330 7D TTTTCCATTC TTTGCTA/------- TGCAATTATG 3070 het 3070 ref 53 31 19 4 TTTGCTA 1 0 297054 CASAVA_Build 2 82917037 6I ACATGCACTG ------/TTTAAC TTTATGTTCC 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 TTTAAC 0 1 297055 CASAVA_Build 2 82927100 1I TTGTTAAAGC -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 A 7 8 297056 CASAVA_Build 2 82930793 4D CATGACAGTC TCTT/---- TGATATTTAC 3070 het 3070 ref 37 25 12 2 TCTT 1 0 297057 CASAVA_Build 2 82941137 2I ATTTAAAAAC --/AT GTAATATCAT 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 AT 0 1 297058 CASAVA_Build 2 82941687 1D TATCTTTCTC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 8 7 297059 CASAVA_Build 2 82970059 15D ATACCTAGCA TAAAATATTGGTAAG/--------------- TAAAATTCTA 3070 het 2700 hom 23 7 14 5 TAAAATATTGGTAAG 1 0 297060 CASAVA_Build 2 82971497 1D TGTAAATTGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 A 9 8 297061 CASAVA_Build 2 82978900 4D TGGTTCTCCA AACT/---- AACTCAGTCA 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 AACT 2 1 297062 CASAVA_Build 2 82979046 1I GTGGTTCTGC -/T TTTGCCAGTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 3 4 297063 CASAVA_Build 2 82979721 2D TCTTTTGCTA CT/-- TTAAAAATTA 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 CT 1 0 297064 CASAVA_Build 2 83017398 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 634 het 634 ref 15 4 3 8 A 11 12 297065 CASAVA_Build 2 83017786 4I CTGCTTTATC ----/AAGT AAGTTTATAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 AAGT 1 2 297066 CASAVA_Build 2 83021411 1I TCCTCTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 16 15 15 T 12 13 297067 CASAVA_Build 2 83023938 1D AATCTTTTCC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 7 6 297068 CASAVA_Build 2 83024841 2D CCCATTGTGG TA/-- TATATATATA 1400 het 1400 ref 13 4 5 4 TA 7 6 297069 CASAVA_Build 2 83024891 8D TACATATATT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 2026 het 1510 hom 12 4 5 5 TC 13 9 297070 CASAVA_Build 2 83025744 1D GATGAGGTTG T/- TTTTTTCCTG 3070 het 2483 hom 20 8 9 4 T 7 6 297071 CASAVA_Build 2 83032593 1D AGTATACAAC T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 7 6 297072 CASAVA_Build 2 83032696 2D ATCAACACTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 AT 7 6 297073 CASAVA_Build 2 83038253 1D AAATGCTTAA T/- AAATAACGAA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 1 0 297074 CASAVA_Build 2 83042228 2D GTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2207 het 940 hom 15 5 7 3 T 14 12 297075 CASAVA_Build 2 83046111 1D TAAAACAATT A/- AAAAAAAATA 1970 het 1970 ref 24 14 6 4 A 9 8 297076 CASAVA_Build 2 83048237 1I ACTTGACCCA -/G GAAGTCCAGC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 1 2 297077 CASAVA_Build 2 83053030 1I CTCAATAAAC -/A GAATCGAATA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 A 0 1 297078 CASAVA_Build 2 83053708 1D GACAGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 8 9 A 13 12 297079 CASAVA_Build 2 83054051 1D TCTATTTTCC T/- TTTTTTTGGG 2598 het 2598 ref 34 13 10 11 T 8 7 297080 CASAVA_Build 2 83067276 1D GGAAAATGTA T/- TCAAATCTGA 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 T 2 1 297081 CASAVA_Build 2 83073036 1I16M1D GAGATATGTT -AAAGTAAATTGGAAGGA/AAAAGTAAATTGGAAGG- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 40 24 16 4 N/A 0 0 297082 CASAVA_Build 2 83074711 1I CTAAATAAGG -/A AAGACATAAT 3070 het 3070 hom 41 12 17 12 A 2 3 297083 CASAVA_Build 2 83075534 4D GGGAAACTTA CTCT/---- CTCTGAGTAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 CT 4 2 297084 CASAVA_Build 2 83079322 1D TATCTCAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 T 11 10 297085 CASAVA_Build 2 83080311 4I AATTAGATTC ----/ACAG ACAAATTAAC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 ACAG 0 1 297086 CASAVA_Build 2 83083884 2I TGTGGGTGCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 TG 8 9 297087 CASAVA_Build 2 83085285 4D ATTTTTGTAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 AT 8 6 297088 CASAVA_Build 2 83085994 1D TATTTCAGAG A/- TTTATGTATC 3070 het 3070 hom 41 15 21 6 A 1 0 297089 CASAVA_Build 2 83086598 1I TAATGTTAGC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 T 7 8 297090 CASAVA_Build 2 83087303 1D TTGACCCCTC T/- TTCCATTTTT 325 het 325 ref 21 7 3 11 T 3 2 297091 CASAVA_Build 2 83088623 1D AGTTGGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3019 het 537 hom 20 3 7 10 T 17 16 297092 CASAVA_Build 2 83091250 1I AGAAAAATTC -/A AAAAAGAATA 2238 het 2238 ref 25 13 9 3 A 5 6 297093 CASAVA_Build 2 83093410 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 146 het 146 ref 33 6 3 25 A 16 14 297094 CASAVA_Build 2 83102505 1I ACCTTACAGG -/A AAAAAAAAAA 2345 het 2345 ref 28 9 6 13 A 17 18 297095 CASAVA_Build 2 83105328 1D CTCTCCATTA C/- CCCAAATTGA 3070 het 3070 hom 28 8 15 5 C 4 3 297096 CASAVA_Build 2 83107400 1I CACGACTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 9 10 297097 CASAVA_Build 2 83109540 1D GAATTATCCA T/- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 T 7 6 297098 CASAVA_Build 2 83111255 1D GCAGTCTGCT A/- AAACCTGTAG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 4 3 297099 CASAVA_Build 2 83111537 3D AACTGTACTT TTA/--- TTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 41 25 14 5 TTA 1 0 297100 CASAVA_Build 2 83114060 4D CTTGTTGATT GATG/---- GGGATTTGGG 3070 het 2846 hom 21 9 12 1 GATG 1 0 297101 CASAVA_Build 2 83123354 2D AGAAACTAAA AT/-- ATGTTTTCTT 3070 het 2680 hom 21 6 13 3 AT 2 1 297102 CASAVA_Build 2 83124121 1D AATACAGAAG C/- CTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 C 2 1 297103 CASAVA_Build 2 83124813 1D CAGTATCTCC A/- AGCCACTTTC 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 2 1 297104 CASAVA_Build 2 83126249 1I TGAATCTTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 T 8 9 297105 CASAVA_Build 2 83127404 1D TAGAGTTCTA T/- TTTCTCTGGA 3070 het 3070 ref 34 12 13 9 T 4 3 297106 CASAVA_Build 2 83128104 1D TGAGTATTTA T/- TTTCATGAAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 4 3 297107 CASAVA_Build 2 83128670 1D AGCTGAAGTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 9 8 297108 CASAVA_Build 2 83130404 5I TTTGAAATGA -----/AAGCC AAGCCAATTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 AAGCC 1 2 297109 CASAVA_Build 2 83138433 1I GGTGCAGTGG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 7 8 297110 CASAVA_Build 2 83139239 2I GTGTTTTTCC --/AA AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 A 8 10 297111 CASAVA_Build 2 83143894 1I AATGTAGGGG -/A AAAAGGATGA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 4 5 297112 CASAVA_Build 2 83147516 5I TTGGATATCA -----/TAACT TAACATACAT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 TAACT 0 1 297113 CASAVA_Build 2 83155875 1I TTGACTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 59 22 19 18 T 13 14 297114 CASAVA_Build 2 83158407 4D CCAAAAACAG TAGT/---- TAGTTAATTT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 TAGT 2 1 297115 CASAVA_Build 2 83160438 2I TATCAAATAT --/TA TTATTATTAT 3070 het 77 hom 30 1 18 11 TA 0 1 297116 CASAVA_Build 2 83162812 4I CTTAGAACTA ----/ACTT AAATAAGTAA 3070 het 3070 hom 59 25 32 2 ACTT 0 1 297117 CASAVA_Build 2 83169192 1D AAAAATAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 20 9 10 2 A 9 8 297118 CASAVA_Build 2 83179272 2D AAAATCAAAC AG/-- AATTAATAAA 3070 het 3070 hom 23 10 10 4 AG 1 0 297119 CASAVA_Build 2 83179994 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 A 6 7 297120 CASAVA_Build 2 83181956 2D GGTTGGGTAA GG/-- GAGACCTATT 3070 het 3070 hom 37 16 18 7 G 3 1 297121 CASAVA_Build 2 83184136 2I GTGCCTGGCC --/TT TTTTTTTTTT 2899 het 2899 ref 28 14 11 3 T 11 13 297122 CASAVA_Build 2 83184459 2I ATTATGCATT --/AA GTTTTGCCAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 0 2 297123 CASAVA_Build 2 83186944 1D TAAGAAACTT A/- AAATAACTGA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 A 4 3 297124 CASAVA_Build 2 83188587 8I GGTGGAGGAT --------/GGAGGATG GGGGGGAGGG 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 GGAGGATG 0 1 297125 CASAVA_Build 2 83207212 1D CAACAACCAA C/- CAAGAAACTA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 C 2 1 297126 CASAVA_Build 2 83208386 1D TTTTTTTTTT G/- GCCTATTCTA 3070 het 1070 hom 29 6 19 4 G 2 1 297127 CASAVA_Build 2 83216598 1I TCTTAGCACC -/A GTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 0 1 297128 CASAVA_Build 2 83222723 1D ATTGGTAAAC A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 A 2 1 297129 CASAVA_Build 2 83232310 1I TTTTAATTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 8 9 297130 CASAVA_Build 2 83232932 1D AAATAGAGCA G/- GGAAGGTGAA 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 G 3 2 297131 CASAVA_Build 2 83239728 1D TATATATGAG T/- TTCTGGATGC 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 T 3 2 297132 CASAVA_Build 2 83240378 1I TATATGTGTG -/T GGGGGGGGGG 3070 het 2576 hom 37 11 20 6 T 0 1 297133 CASAVA_Build 2 83248991 7I GTCATTCAGT -------/TGTTGTA AGCTCAGACG 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 TGTTGTA 0 1 297134 CASAVA_Build 2 83263251 4D AAGAATCTGT TCTC/---- TCTCTCTTCT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 TC 5 3 297135 CASAVA_Build 2 83265948 4I ATATATTTAT ----/ATAG ATAGATAGAT 1510 het 1510 ref 13 6 5 2 ATAG 2 3 297136 CASAVA_Build 2 83271388 1I CTTCAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 11 12 297137 CASAVA_Build 2 83287420 3D GCCTTATTTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 TTG 5 4 297138 CASAVA_Build 2 83298208 1D TTTCAAAACC T/- TTTTTTTTTT 1497 het 800 hom 26 9 7 10 T 19 18 297139 CASAVA_Build 2 83302430 1D AAATACTGGC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 9 8 297140 CASAVA_Build 2 83307469 1D GAATTCCCTC T/- TCTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 T 2 1 297141 CASAVA_Build 2 83309854 1D GTTTCACAAG A/- AATGTTCCTG 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 A 3 2 297142 CASAVA_Build 2 83312342 1D ATAAAAAAAA C/- AACAACAATA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 C 1 0 297143 CASAVA_Build 2 83313420 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAATAA 1262 het 1262 ref 12 6 4 2 A 8 7 297144 CASAVA_Build 2 83346256 1D TAATGTTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 12 16 13 A 10 9 297145 CASAVA_Build 2 83351181 2D ATGTTTTGAG AT/-- ATATATATAT 1646 het 1646 ref 30 23 4 3 AT 8 7 297146 CASAVA_Build 2 83353053 2D CATGTATAAA TG/-- TGTGTGTGTG 2268 het 911 hom 11 3 6 3 TG 6 5 297147 CASAVA_Build 2 83364773 6I CTCTCAGTTT ------/AAATAA ACTTTAGACA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 AAATAA 0 1 297148 CASAVA_Build 2 83373703 2I TTTGGATAAC --/AA ACACAGTAAA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 1 3 297149 CASAVA_Build 2 83375284 1D TTAGAGTTCC A/- CAAAATTACT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 1 0 297150 CASAVA_Build 2 83381074 7D GTGAGTGTGT GTGTGTG/------- GTGTGTGCGT 3070 het 3070 ref 49 27 19 4 GTGTGTG 2 1 297151 CASAVA_Build 2 83385689 1D ACATCACCCC T/- AGTCTGCCTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 1 0 297152 CASAVA_Build 2 83386263 1D AAGTAAGTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 21 8 9 4 A 10 9 297153 CASAVA_Build 2 83389038 1D ATTTTAATGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 A 9 8 297154 CASAVA_Build 2 83398080 2I CACAAATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 TG 7 8 297155 CASAVA_Build 2 83412287 1I AGAAAAAAAA -/T ATATATCTTC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 0 1 297156 CASAVA_Build 2 83434131 1D TAAATTAATT A/- AAAAAAATAA 3070 het 1798 hom 15 5 10 0 A 8 7 297157 CASAVA_Build 2 83445365 1D TAATATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2709 hom 22 9 10 3 A 12 11 297158 CASAVA_Build 2 83482748 1D TAAAGACTAC T/- CCATAAAGCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 1 0 297159 CASAVA_Build 2 83504198 2I ATACTGAAAC --/AT GTGTACAAAC 3070 hom 144 het 52 0 49 3 AT 0 1 297160 CASAVA_Build 2 83505482 2D TTTGGCAAAC TT/-- TCTGTGAAGA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 3 1 297161 CASAVA_Build 2 83530250 1I33M3I CTTGTTTTCA -GCATATTGGTAGTTAAAAACCTACCTCAACAAC---/GGCATATTGGTAGTTAAAAACCTACCTCAACAACAAT GAGATATTAT 3070 hom 171 het 47 0 56 8 N/A 0 0 297162 CASAVA_Build 2 83547458 1D AGGCCAGACA T/- TTTTTTTTTT 1932 het 1932 ref 42 27 5 11 T 13 12 297163 CASAVA_Build 2 83557556 1D GTAAAAATAC A/- AAAAAAACAC 3070 hom 108 het 46 0 37 10 A 8 7 297164 CASAVA_Build 2 83559467 1D TAGGACTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 36 1 32 3 A 12 11 297165 CASAVA_Build 2 83560262 4I TAGATAAATG ----/GATA GATAGATAAA 3070 hom 121 het 45 0 41 4 GATA 2 3 297166 CASAVA_Build 2 83572415 16I TTGGGAGGCT ----------------/GAGGTGGGTGGATCAC GAGGTCAGGA 3070 hom 30 het 14 0 10 4 GAGGTGGGTGGATCAC 0 1 297167 CASAVA_Build 2 83582060 4D TATGTATGTA TGTG/---- TGTGTATATA 3070 hom 51 het 25 0 22 4 TG 4 2 297168 CASAVA_Build 2 83583486 1D ACAACACTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2900 hom 31 9 14 8 A 10 9 297169 CASAVA_Build 2 83609162 2D ATTTTTTAAA TC/-- TCTGTTTATA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 TC 2 1 297170 CASAVA_Build 2 83612279 2I TCAAAGAAAC --/AT GTGACAAACA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AT 0 1 297171 CASAVA_Build 2 83617598 1I ATAAATACTG -/T TTTTTTTTTC 1126 het 1126 ref 38 31 3 4 T 9 10 297172 CASAVA_Build 2 83619534 1I CAGAGGGAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 7 8 297173 CASAVA_Build 2 83620905 2I AATGTCAATC --/CT CTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 31 1 21 9 CT 1 2 297174 CASAVA_Build 2 83621461 1D ATTGGAAATA C/- CACCTGCTTC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 C 2 1 297175 CASAVA_Build 2 83621928 6D TAGGATTTAC TTATTA/------ TTATTCTGAA 3070 het 3070 ref 22 11 10 4 TTA 3 1 297176 CASAVA_Build 2 83622036 2D GGTTTGAATC CT/-- CTCATCAATA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 CT 2 1 297177 CASAVA_Build 2 83629578 4D CATATACAGA CTCT/---- CTATAAATAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 5 CT 3 1 297178 CASAVA_Build 2 83639460 4I TTAGTAAGAC ----/ATGG ATGGATACTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 ATGG 1 2 297179 CASAVA_Build 2 83640661 5I TGATGCTCTC -----/AAATT AAAATGCTTT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AAATT 0 1 297180 CASAVA_Build 2 83647280 2I TGTTAATGCT --/AG AGAGAGGTAT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 AG 3 4 297181 CASAVA_Build 2 83652707 28D TTGTTGGTGT GTGTATGTGTGTGTGTGCTCACACATGC/---------------------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 29 19 14 4 GTGTATGTGTGTGTGTGCTCACACATGC 1 0 297182 CASAVA_Build 2 83656745 2I ATTTTGGGGG --/AC ACAAACGTTC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 AC 1 2 297183 CASAVA_Build 2 83659718 1I CTAGGTCTAT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 7 8 297184 CASAVA_Build 2 83664629 2I5M5I CCATAGCCAC --AGGTA-----/TGAGTTAACTTT CAGTTAACAA 3070 het 3070 ref 42 22 18 6 N/A 0 0 297185 CASAVA_Build 2 83668355 4D AATAATTATT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 TA 10 8 297186 CASAVA_Build 2 83669611 2D GTGTGGGAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 103 hom 46 5 32 9 AC 10 9 297187 CASAVA_Build 2 83670952 4D AAGAAGAAAT AAAG/---- AACATTGACA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 AAAG 1 0 297188 CASAVA_Build 2 83671712 3I GAAAGAAAGA ---/AAG AAGAAGGAAG 3070 hom 49 het 26 0 20 6 AAG 2 3 297189 CASAVA_Build 2 83671784 3I GAAGAAAGAA ---/AAG AAGTTACAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AAG 1 2 297190 CASAVA_Build 2 83675342 29D ATGAAAGGCC ACACACTCTATCATTCCATGCGGAATGGA/----------------------------- ATTAACTGCT 3070 het 3070 ref 53 41 18 7 ACACACTCTATCATTCCATGCGGAATGGA 1 0 297191 CASAVA_Build 2 83678856 4I ACATATATAC ----/GTAT GTATGTATAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 GTAT 2 3 297192 CASAVA_Build 2 83679885 2D TCATCTAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 35 2 12 22 A 14 12 297193 CASAVA_Build 2 83680834 4I AGACTACCTC ----/AAAT AAATCACCTA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 AAAT 1 2 297194 CASAVA_Build 2 83681924 4D ATAAGTGAAA TTAT/---- TTGTTTGTGA 3070 het 3070 ref 28 17 11 0 TTAT 1 0 297195 CASAVA_Build 2 83686445 4D AACAAAAAAA AGAG/---- AGAAGATTCA 3070 het 3070 ref 39 26 12 1 AG 3 1 297196 CASAVA_Build 2 83692554 2D TGCCTGTCCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1075 hom 44 4 24 17 A 13 11 297197 CASAVA_Build 2 83697528 1D TCTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 2605 het 2605 ref 27 12 7 8 T 12 11 297198 CASAVA_Build 2 83708365 4D TATATATAAA ATAT/---- ATATAATATA 1007 het 492 hom 6 1 4 1 AT 4 2 297199 CASAVA_Build 2 83708421 5D TATAAAATAT ATATA/----- ATATATCAAA 2586 het 486 hom 7 1 6 0 ATATA 2 1 297200 CASAVA_Build 2 83711200 1D CAATGAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 T 13 12 297201 CASAVA_Build 2 83716174 1I TAAAACGCTA -/T TTAGGAGGGG 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 T 2 3 297202 CASAVA_Build 2 83719536 1D GATCCAATCA C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 C 8 7 297203 CASAVA_Build 2 83725050 2D ACTTTGAAGT AA/-- AGTCACATTC 3070 het 3070 ref 43 23 14 8 A 3 1 297204 CASAVA_Build 2 83725335 1D TTGGAATGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 10 9 297205 CASAVA_Build 2 83732421 4D ACAGTAGGCT TGTG/---- TGTGGTACCC 3070 het 3070 ref 49 28 16 7 TG 4 2 297206 CASAVA_Build 2 83741114 1I CAACTTCTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 9 10 297207 CASAVA_Build 2 83743637 1I CTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2975 het 2975 ref 26 10 11 5 T 11 12 297208 CASAVA_Build 2 83753037 1D TTCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 20 0 14 6 T 12 11 297209 CASAVA_Build 2 83761136 1I TTGAATATTT -/A AATATATGGG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 2 3 297210 CASAVA_Build 2 83766969 1D GTAATTACTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 8 297211 CASAVA_Build 2 83770105 6D TCCAAACTTT GAGAAA/------ TTGTAGACAA 3070 hom 111 het 39 0 36 4 GAGAAA 1 0 297212 CASAVA_Build 2 83793959 1D TTATTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 T 11 10 297213 CASAVA_Build 2 83795101 2I ATTGATCATT --/AA TTATTGGTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 2 297214 CASAVA_Build 2 83798923 4D ATCCAATGTA CTTT/---- CTATTTTCCA 3070 hom 120 het 45 0 40 7 CTTT 1 0 297215 CASAVA_Build 2 83799491 1I TTCTTCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 33 2 26 5 T 12 13 297216 CASAVA_Build 2 83882703 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 12 6 T 12 11 297217 CASAVA_Build 2 83912927 3D CATTTAAAAT CTA/--- CTCTCTTACT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 CTA 1 0 297218 CASAVA_Build 2 83914017 2D ATATATATAT AC/-- ACATACACAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AC 2 1 297219 CASAVA_Build 2 83919814 1D CCCAGTTTTC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 47 het 20 0 16 5 T 8 7 297220 CASAVA_Build 2 83932196 1D TGCAAAAAAA G/- TTAAAGGCAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 0 297221 CASAVA_Build 2 83938227 1I CTTTGAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 A 10 11 297222 CASAVA_Build 2 83942542 1I TTGATGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 40 1 32 7 A 11 12 297223 CASAVA_Build 2 83954430 20D CACCAGCCCC AGGGACTATAAATCCGTAGA/-------------------- AGCCTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 15 9 13 AGGGACTATAAATCCGTAGA 1 0 297224 CASAVA_Build 2 83957447 12D ACCCACGGTT GGCGTGTCTCGA/------------ GAGCCAATTT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 GGCGTGTCTCGA 1 0 297225 CASAVA_Build 2 83964710 6D CAATTCTTAT ATCTGC/------ ATCTGCATTC 3070 hom 108 het 39 0 37 4 ATCTGC 2 1 297226 CASAVA_Build 2 83966715 1D AGCTTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 126 het 48 0 43 6 A 12 11 297227 CASAVA_Build 2 84048012 1D ATTTGGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 12 11 297228 CASAVA_Build 2 84053423 1I GAACCCAGTG -/A AAAAATGAAA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 A 5 6 297229 CASAVA_Build 2 84055644 1I AAGTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1016 het 1016 ref 35 22 3 10 A 13 14 297230 CASAVA_Build 2 84063161 6D AAACTTAAAG AATAAT/------ AATAATACAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 AAT 4 2 297231 CASAVA_Build 2 84065325 1D GACTATTGAG A/- AGTTTTTATG 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 A 2 1 297232 CASAVA_Build 2 84082751 1I ATAAAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 10 11 297233 CASAVA_Build 2 84085366 3I GGGAATTGTA ---/ATT ATTACTTGAC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 ATT 1 2 297234 CASAVA_Build 2 84087559 1D CCTGCCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2972 hom 28 9 15 4 A 11 10 297235 CASAVA_Build 2 84087980 1I GAAAAGCATT -/A ATAAAGGCAT 1918 het 1894 hom 12 6 5 1 A 1 2 297236 CASAVA_Build 2 84094099 1D CCTGGAAAAG A/- AAAAAACTAT 2141 het 2141 ref 16 8 5 3 A 7 6 297237 CASAVA_Build 2 84107402 1D TTCCCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1464 het 1464 ref 33 14 5 16 T 17 16 297238 CASAVA_Build 2 84134320 1D CGTGTGAACA T/- TTTTTTTTTC 925 het 925 ref 48 38 3 7 T 10 9 297239 CASAVA_Build 2 84177901 2I CACCTCACAC --/AT GTTAGAATAG 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 AT 0 1 297240 CASAVA_Build 2 84181883 2I CTTCTGTTAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 10 12 297241 CASAVA_Build 2 84203964 1D CATTTTCACA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 8 7 297242 CASAVA_Build 2 84205818 1D ATAAAAACTT A/- AAAAATATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 6 5 297243 CASAVA_Build 2 84214720 6I TGAGGATAAC ------/AATTGT AATACTAATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AATTGT 0 1 297244 CASAVA_Build 2 84216533 1D AAAATAGAAA G/- GGGTGATAGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 4 3 297245 CASAVA_Build 2 84219308 2D AAAAAAAAAA AC/-- AGGGATGCTA 1990 het 1432 hom 33 9 7 18 AC 1 0 297246 CASAVA_Build 2 84220729 1D ATCCAATAGC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 9 8 297247 CASAVA_Build 2 84223133 2D AACTTTGGCT TC/-- TGTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 51 23 21 9 TC 1 0 297248 CASAVA_Build 2 84227281 1I CAGCCAAGAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 7 8 297249 CASAVA_Build 2 84246950 1D CTTTTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 13 12 297250 CASAVA_Build 2 84251596 1I TATATACTGT -/A TTTTTATAAA 3070 het 1474 hom 14 3 11 0 A 0 1 297251 CASAVA_Build 2 84279763 1D AGATAGGTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 10 9 297252 CASAVA_Build 2 84279823 22D CAGTGTCTGT TGTTCCCTTCTTAGTGTCCAAG/---------------------- TGTTCCCCTC 2669 het 2669 ref 22 13 6 7 TGTTCCCTTCTTAGTGTCCAAG 1 0 297253 CASAVA_Build 2 84286131 1D TAAATATTGC A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 A 7 6 297254 CASAVA_Build 2 84291789 1D GGAAATGATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 11 6 A 10 9 297255 CASAVA_Build 2 84293281 1I TTTACACATA -/T TTTCTAAAAT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 3 4 297256 CASAVA_Build 2 84326496 5I AAAGTATAAT -----/AATAA AATAAAATAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AATAA 3 4 297257 CASAVA_Build 2 84329389 1D TACACTTATA G/- GGGCAAGAAG 3070 hom 107 het 41 0 36 7 G 4 3 297258 CASAVA_Build 2 84330838 4D TGAGTGCAAG ATGT/---- ATGTATAATT 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 ATGT 2 1 297259 CASAVA_Build 2 84332538 10D AAAGGAAAAG GAAAAGGAAA/---------- GAAAAGGAAA 3070 hom 34 het 20 0 18 3 GAAAAGGAAA 2 1 297260 CASAVA_Build 2 84334072 3I TTTGTTTTTG ---/TTT TTTTTTTACC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 7 10 297261 CASAVA_Build 2 84334843 1D ATAGCATTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 10 9 297262 CASAVA_Build 2 84339557 5I GGAAACATTA -----/CATTT ATTTTCTCTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 CATTT 0 1 297263 CASAVA_Build 2 84352470 1I CCTTCCATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 36 1 31 4 A 11 12 297264 CASAVA_Build 2 84361835 1I CTTTGGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 47 1 44 2 A 10 11 297265 CASAVA_Build 2 84370496 1I ATAAAATTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 80 hom 37 1 32 4 T 9 10 297266 CASAVA_Build 2 84372396 1I TTTAAGCATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 62 het 42 0 28 14 A 9 10 297267 CASAVA_Build 2 84375744 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 11 12 297268 CASAVA_Build 2 84414461 5I AGAACTAATA -----/AAGTT AAGTACAAAC 3070 hom 111 het 38 0 38 0 AAGTT 0 1 297269 CASAVA_Build 2 84417282 1D AAACTTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 4 A 12 11 297270 CASAVA_Build 2 84417681 1D CTATTCAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 33 1 26 6 A 15 14 297271 CASAVA_Build 2 84417925 1D CAAAAAAAAA T/- ATTTAGAATG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 0 297272 CASAVA_Build 2 84420126 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 8 9 297273 CASAVA_Build 2 84420518 1I GGTTTTTTAA -/C TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 36 0 28 8 C 0 1 297274 CASAVA_Build 2 84446015 5I AAGGAGACTG -----/AGACA AGCAAAACCA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AGACA 0 1 297275 CASAVA_Build 2 84460252 5D GAGTTATGAA TATTT/----- TATTTAATAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TATTT 2 1 297276 CASAVA_Build 2 84503124 1I CCTAATATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 20 7 T 12 13 297277 CASAVA_Build 2 84507301 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 24 1 22 1 A 11 12 297278 CASAVA_Build 2 84527939 3I TTACTTTAAA ---/AAC AACAACAAAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AAC 2 3 297279 CASAVA_Build 2 84541341 1D ATTTTTTGGA T/- CCACAGGCAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 0 297280 CASAVA_Build 2 84570352 1D AATTGGTTAG A/- CCCACAGTTC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 1 0 297281 CASAVA_Build 2 84570867 1I AAGTCTTAAC -/T GCTTGGTTTT 3070 hom 76 het 32 0 26 6 T 0 1 297282 CASAVA_Build 2 84579138 1D CTGCTCAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 35 1 27 7 A 13 12 297283 CASAVA_Build 2 84579669 12I CCTCAAGCAT ------------/TTATCCTTTAAG TTGCAAACAA 3070 hom 60 het 26 0 21 6 TTATCCTTTAAG 0 1 297284 CASAVA_Build 2 84580523 1D AGGTTATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 125 hom 30 2 24 4 T 13 12 297285 CASAVA_Build 2 84600663 3D CTAAATCATT CTC/--- CTCTTTTGAG 3070 hom 99 het 36 0 34 3 CTC 2 1 297286 CASAVA_Build 2 84609508 1I CAAAGACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 40 0 29 11 T 11 12 297287 CASAVA_Build 2 84612386 4D TGGGGTAAAA AAAG/---- AGGATTTTTC 3070 hom 78 het 28 0 27 5 AAAG 1 0 297288 CASAVA_Build 2 84617204 4D ACACTGCATC AAAG/---- AAAGACAAGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAAG 2 1 297289 CASAVA_Build 2 84628565 1D CAATAGGTTT G/- TTAAAATTAA 3070 hom 100 het 37 0 33 4 G 1 0 297290 CASAVA_Build 2 84632034 1I TTCAAAGGGG -/A AAAAAAGATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 7 297291 CASAVA_Build 2 84633964 4I36M1D AAGAGATCAC ----TTGTGAATACCTTTTCCTTTCTTTTCTTTTCTTTTCT/TCTGTTGTGAATACCTTTTCCTTTCTTTTCTTTTCTTTTC- TTTCTTTCTT 3070 het 417 hom 20 2 15 6 N/A 0 0 297292 CASAVA_Build 2 84645964 1D GGTCCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 285 hom 30 1 27 2 T 11 10 297293 CASAVA_Build 2 84661393 4D CACTTCAAAC AAAT/---- AACCCAAACC 3070 hom 126 het 44 0 42 5 AAAT 1 0 297294 CASAVA_Build 2 84674919 36I TATGCTACAG ------------------------------------/AGCAGGAAGTATTCTTGTAAGCCAGGCTTCTCAGGT GCTCCATATT 3070 hom 108 het 31 0 37 1 AGCAGGAAGTATTCTTGTAAGCCAGGCTTCTCAGGT 0 1 297295 CASAVA_Build 2 84679878 1D TTTCAGATAT G/- TAACTTGAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 1 0 297296 CASAVA_Build 2 84679999 1D TTCTTTTATG A/- ATCAAGCTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 2 1 297297 CASAVA_Build 2 84681875 1D AATTTTAGGC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 30 0 23 8 A 9 8 297298 CASAVA_Build 2 84682287 1D CTATTTTTTT A/- ATCCAGTCTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 1 297299 CASAVA_Build 2 84682736 4D GTTTTTGCTC CAGA/---- CAGTTATCTT 3070 hom 90 het 31 0 31 2 CAGA 1 0 297300 CASAVA_Build 2 84688916 38I TTCCAAACTC --------------------------------------/CTCTTAGTGTTGATATTTTGACTTCCTCCCATGAATGA CAAATATTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 CTCTTAGTGTTGATATTTTGACTTCCTCCCATGAATGA 0 1 297301 CASAVA_Build 2 84689352 1I GGCCTTGAGA -/T TTTTTTGAAT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 6 7 297302 CASAVA_Build 2 84695334 1D AACATCTATT A/- TTTTTTTTAT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 1 0 297303 CASAVA_Build 2 84753911 1D GGGCCCATGA G/- GAGGAATCTG 3070 hom 92 het 37 0 28 9 G 2 1 297304 CASAVA_Build 2 84762378 1D TCTTTCACTG A/- AAAAAAAAAA 1534 het 1534 ref 31 18 5 8 A 15 14 297305 CASAVA_Build 2 84762636 1D CTCCCATCTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 8 297306 CASAVA_Build 2 84763708 1D ATAGCCACAT A/- AGCTCACTTT 3070 hom 157 het 53 0 53 0 A 2 1 297307 CASAVA_Build 2 84804532 20D GCAGGCAATG CCAATTTTGCTAAAGACTTC/-------------------- CAGGGAAGAC 3070 het 3070 ref 46 32 16 6 CCAATTTTGCTAAAGACTTC 1 0 297308 CASAVA_Build 2 84845654 3I AATAAACTAG ---/AAT AATAATGTCT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AAT 2 3 297309 CASAVA_Build 2 84851455 1I CTGCCTCTAC -/A AAAAAATAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 6 7 297310 CASAVA_Build 2 84892495 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1386 het 1152 hom 16 4 7 5 A 17 16 297311 CASAVA_Build 2 84897822 1D GTCAGAGACC A/- AAAAAAAAAA 1668 het 1668 ref 40 32 4 5 A 12 11 297312 CASAVA_Build 2 84950424 1I AGACCAGCCT -/G GGCAACATGG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 G 2 3 297313 CASAVA_Build 2 84971448 1D GTATTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 1849 het 1529 hom 26 8 8 10 T 19 18 297314 CASAVA_Build 2 84991703 1D GAGGGATGCC T/- TTTTTTTTTT 2526 het 2526 ref 44 31 7 7 T 11 10 297315 CASAVA_Build 2 85000166 8D CCGAATAATG TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTG 3070 het 3070 ref 30 14 11 7 TC 8 4 297316 CASAVA_Build 2 85006924 1I GAGCTATGAA -/G GCTCCCCAGG 3070 hom 101 het 37 0 31 6 G 1 2 297317 CASAVA_Build 2 85016921 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1408 het 1408 ref 22 6 6 10 A 15 16 297318 CASAVA_Build 2 85025315 1I GGGCGGCCTG -/C CCAGAGGAGA 3070 hom 123 het 45 0 37 8 C 2 3 297319 CASAVA_Build 2 85041185 2I TTCTTTTTTG --/AC ACAGAGTCTC 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 AC 1 2 297320 CASAVA_Build 2 85145391 1D AGTTTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 779 hom 31 2 15 14 A 15 14 297321 CASAVA_Build 2 85160503 3D TCTGAGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 TTG 4 3 297322 CASAVA_Build 2 85171812 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 A 11 10 297323 CASAVA_Build 2 85172896 1I CCAGTAACCA -/T TGAGGCACAG 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 1 2 297324 CASAVA_Build 2 85177073 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3045 het 1361 hom 32 7 10 17 T 15 14 297325 CASAVA_Build 2 85179982 1D ACTAACCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 A 12 11 297326 CASAVA_Build 2 85181201 3I CCAAATGTTT ---/GAA GAAGAACTAA 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 GAA 2 3 297327 CASAVA_Build 2 85186348 1D ACAACTCACA G/- GGGAAAAAAA 2923 het 2923 ref 32 18 12 4 G 4 3 297328 CASAVA_Build 2 85186650 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 609 hom 15 3 11 1 A 13 12 297329 CASAVA_Build 2 85201497 5D TCACCCAGGC TGCAG/----- TGCAATGGTG 2216 het 2216 ref 18 13 5 0 TGCAG 1 0 297330 CASAVA_Build 2 85206967 1D TATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 801 hom 31 7 14 10 T 17 16 297331 CASAVA_Build 2 85216425 4I GAGGGAGGGA ----/GGTC GGTCTTGCAG 2156 het 2156 ref 22 10 8 4 GGTC 1 2 297332 CASAVA_Build 2 85221115 1I CCTTTCTTTT -/C CCTCCATGGT 3070 hom 55 het 26 0 16 10 C 2 3 297333 CASAVA_Build 2 85221254 1D CAAACACAGT G/- GAAACCCTGT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 G 2 1 297334 CASAVA_Build 2 85221548 4I AGAGAGAGAC ----/AGAG AGAAGAGAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AG 1 3 297335 CASAVA_Build 2 85221855 2I GGTGACAGAC --/AG AGTGAGACCC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AG 1 2 297336 CASAVA_Build 2 85225340 6D CATCCCCCTT TCTCTC/------ TCTCTCTCTG 930 het 930 ref 20 7 10 4 TC 7 4 297337 CASAVA_Build 2 85227132 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1443 het 47 hom 15 2 6 7 T 21 18 297338 CASAVA_Build 2 85245997 6D AAGCTTTTGA ACAAGC/------ CCAGCCTTAA 3070 het 3070 ref 33 14 15 5 ACAAGC 1 0 297339 CASAVA_Build 2 85267078 1I ATGGGCCCAC -/T ACTGCTTGCA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 0 1 297340 CASAVA_Build 2 85285520 1I CTTAGTTTTG -/T TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 3 4 297341 CASAVA_Build 2 85286171 1D AGCCCACATT G/- TTTTTTTTTT 2107 het 1766 hom 28 12 11 5 G 1 0 297342 CASAVA_Build 2 85287601 2D ATTCAGAACA AC/-- AGTGTTAAGG 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 AC 1 0 297343 CASAVA_Build 2 85289797 1D CTGGCCTTCG T/- TAAGTTAGGC 3070 het 3070 ref 61 33 20 10 T 2 1 297344 CASAVA_Build 2 85291859 1D CCTCCTTATT A/- ATAAATTTAG 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 A 2 1 297345 CASAVA_Build 2 85299274 2I TTATTCCAAT --/GG GGGGGGGGGA 1647 het 1647 ref 31 12 9 10 G 9 11 297346 CASAVA_Build 2 85307225 3I CTCCCAACTT ---/CTC TATTCTCTTA 3070 het 3070 hom 54 20 27 7 CTC 0 1 297347 CASAVA_Build 2 85322658 1I GCGGTGGTGC -/G GGGGGGGCAA 1035 hom 12 het 7 0 4 3 G 7 8 297348 CASAVA_Build 2 85360012 4I GGGCAACGTA ----/CGTT GCAAGACCCC 2152 het 2152 ref 28 14 5 9 CGTT 0 1 297349 CASAVA_Build 2 85362624 1I CAAAGGCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 9 10 297350 CASAVA_Build 2 85379334 2D CAGCTTCCTG GC/-- CATGCACACC 3070 het 3070 hom 40 20 16 5 GC 1 0 297351 CASAVA_Build 2 85387808 5I AGCCACTCCT -----/AACCC AACCCAGGGC 3070 het 3070 ref 47 18 15 14 AACCC 1 2 297352 CASAVA_Build 2 85389091 2D CTTTCCCTCC CT/-- CTCTTTCCCT 2458 hom 7 het 10 0 7 3 CT 3 2 297353 CASAVA_Build 2 85392802 1I ACTCTTTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 8 9 297354 CASAVA_Build 2 85393148 1D ATTCTGTCTT G/- GGGAAAAAAA 3070 hom 34 het 21 0 17 4 G 4 3 297355 CASAVA_Build 2 85394158 2D AAGATCAAAA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 33 het 15 0 11 4 CT 2 1 297356 CASAVA_Build 2 85396672 4I ACCAACCAGT ----/TCTA TCTGGCTGCT 3070 hom 40 het 17 0 11 6 TCTA 0 1 297357 CASAVA_Build 2 85398101 5I CTACTGAAAG -----/CAACA CAGGCAGCCA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 CAACA 0 1 297358 CASAVA_Build 2 85399461 2D TCAACTTCCC CT/-- GAGTCCAGAA 3070 het 3070 hom 58 21 30 8 CT 1 0 297359 CASAVA_Build 2 85401580 1D GTGAGTTAGT A/- AAAGTCATGA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 4 3 297360 CASAVA_Build 2 85420495 5I CTGGAGTGCA -----/GTGGT GTGATCACAG 3070 hom 87 het 32 0 28 4 GTGGT 0 1 297361 CASAVA_Build 2 85421131 1I TTTTTGTAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 302 hom 33 1 29 3 T 9 10 297362 CASAVA_Build 2 85429963 2D AGACCCCAGG TC/-- TCGCCCACAC 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 TC 2 1 297363 CASAVA_Build 2 85432566 3D AGGGAAACCA AAG/--- AAGACTTCTC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 AAG 2 1 297364 CASAVA_Build 2 85445217 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1294 het 433 hom 14 4 4 6 A 14 13 297365 CASAVA_Build 2 85445280 4D CTTATCCTCC TGAG/---- TATCTGGGAA 2069 het 2069 ref 14 7 5 3 TGAG 1 0 297366 CASAVA_Build 2 85463156 1I TCACAAGGAC -/T TTTTTTTTTT 1639 het 1639 ref 20 7 6 7 T 11 12 297367 CASAVA_Build 2 85495065 1D AGAACTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 42 2 19 21 T 17 16 297368 CASAVA_Build 2 85521135 2I AATTTTTGTA --/TT TTTTTTTTAG 3070 hom 60 het 21 0 20 5 T 8 10 297369 CASAVA_Build 2 85521930 1D CCTTTGACAC A/- AGTTTACCTA 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 A 2 1 297370 CASAVA_Build 2 85522518 3D GTAATAATTA TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 14 6 TTG 3 2 297371 CASAVA_Build 2 85523875 1I CACCCACCTA -/C CCTCGTACTT 1752 het 1752 ref 32 15 5 12 C 2 3 297372 CASAVA_Build 2 85531531 1D ACCCCATCTC A/- ACAAAAAAAA 2444 het 2444 ref 23 12 7 4 A 2 1 297373 CASAVA_Build 2 85533965 1D TGTTGAGATT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 G 8 7 297374 CASAVA_Build 2 85578707 1D AAATGGAGTC A/- ACTCATGCTA 3070 het 3070 ref 52 26 22 5 A 2 1 297375 CASAVA_Build 2 85579588 7I TTTGTTTTTG -------/TTTTGTT TTTTGTTTTG 642 het 227 hom 17 3 4 10 TTTTGTT 1 2 297376 CASAVA_Build 2 85602081 1I GGTCTCCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2535 hom 25 8 15 2 A 11 12 297377 CASAVA_Build 2 85606977 2D TTGGTTTGTT TG/-- TTTTTTTTTT 2460 hom 24 het 15 0 9 6 TG 1 0 297378 CASAVA_Build 2 85610578 1D ATTCATTCAT G/- TTGTGGCATG 1253 het 957 hom 16 3 3 10 G 1 0 297379 CASAVA_Build 2 85612482 12D ACCATGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 15 11 10 A 22 10 297380 CASAVA_Build 2 85627121 1D44M2I GAGGCTAATG CGGGTGGATCACCTGAGGTCACGGTTTGATACCAGCCTGGCAAAC--/-GGGTGGATCACCTGAGGTCACGGTTTGATACCAGCCTGGCAAACTG TGAAACCCCG 3070 het 2587 hom 26 7 15 11 N/A 0 0 297381 CASAVA_Build 2 85628340 2D CAAAGTAATC AG/-- GGGACCCTGT 3070 het 3070 hom 47 19 24 6 AG 1 0 297382 CASAVA_Build 2 85630002 4I CAAGAGCCAC ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 TTTA 3 4 297383 CASAVA_Build 2 85636662 1D AAGGGATTGG A/- AAAAATGAGA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 6 5 297384 CASAVA_Build 2 85647351 2I TCACTGCAAC --/CT CTGACTCCCT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 CT 1 2 297385 CASAVA_Build 2 85656583 1D GGAGGGAGGA T/- TACTTGAGAA 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 T 2 1 297386 CASAVA_Build 2 85661294 16D AGATACAGCA TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTG 3070 het 2312 hom 35 10 15 10 T 25 9 297387 CASAVA_Build 2 85664233 9D AAAAAAAAAA CAAACAAAC/--------- AAAAAAAAAA 1485 het 1485 ref 33 20 12 5 CAAACAAAC 1 0 297388 CASAVA_Build 2 85676988 1D TAGCAGTTGT A/- AACTATTTCC 3070 het 3070 hom 51 18 23 10 A 3 2 297389 CASAVA_Build 2 85702510 10I TTTGAGACAG ----------/AGTCCCGCTA TGTTGCCCAG 3070 het 2093 hom 19 6 10 3 AGTCCCGCTA 0 1 297390 CASAVA_Build 2 85707745 1D ACTGTAGAAA T/- TTTTTTTTTT 1586 het 1586 ref 30 21 4 5 T 11 10 297391 CASAVA_Build 2 85712595 1I2M6I GTTGGCCAGG -TG------/CTGGTCTCA AACTCCTGAC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 N/A 0 0 297392 CASAVA_Build 2 85716628 4D CAGTGCATGG TTTA/---- AGTTAACTCT 3070 het 3070 hom 38 19 18 1 TTTA 1 0 297393 CASAVA_Build 2 85721239 2D CTTTCTTTAC AT/-- ATATATATAT 1489 het 1489 ref 14 7 5 2 AT 8 7 297394 CASAVA_Build 2 85722652 4D GAGTTTTAGG CTGT/---- CTTAGTGGTG 3070 het 3070 ref 30 18 11 5 CTGT 1 0 297395 CASAVA_Build 2 85729736 1D AACTTATGTC T/- TGAGTATCTG 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 2 1 297396 CASAVA_Build 2 85734305 4D ATTTTTTTGA GACG/---- GACGGAGTTT 3070 het 2748 hom 30 10 17 4 GACG 2 1 297397 CASAVA_Build 2 85741895 1D GGCAGTGCTC G/- GGGTCCGGAA 2266 het 1259 hom 9 3 6 2 G 4 3 297398 CASAVA_Build 2 85764730 2I ATGGAGCAAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AT 4 5 297399 CASAVA_Build 2 85766543 1I TTCACTTTTA -/C ATGGCAACAT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 C 0 1 297400 CASAVA_Build 2 85775246 1I GGAGGCCTGG -/C CCTCCCCTCA 3070 hom 53 het 24 0 13 11 C 2 3 297401 CASAVA_Build 2 85785514 1D TCTGTTCCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 9 17 5 T 10 9 297402 CASAVA_Build 2 85787681 2I GGGGAGATCT --/CA GAGTGTGAAG 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 CA 0 1 297403 CASAVA_Build 2 85804922 1I TTTTCTTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 9 10 297404 CASAVA_Build 2 85806943 1I GTCTCTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2920 hom 21 8 11 2 A 11 12 297405 CASAVA_Build 2 85807413 1D TTACAGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 18 8 8 2 T 9 8 297406 CASAVA_Build 2 85812879 1I GGATGGTCTC -/G ATCTCCTGAC 1736 het 474 hom 6 1 4 1 G 0 1 297407 CASAVA_Build 2 85827762 2D ATCTTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1437 het 975 hom 37 14 6 17 T 20 18 297408 CASAVA_Build 2 85842683 2I GGCTCCAGAC --/CT CTCTGGCTTC 3070 hom 84 het 31 0 25 6 CT 2 3 297409 CASAVA_Build 2 85847779 1I CTTCGTTTTG -/T TGCCTCCCAG 3070 hom 16 het 31 1 24 6 T 1 2 297410 CASAVA_Build 2 85862516 11D TGTCTAAAAA AAATAAAAAAT/----------- AAATAAAAAT 3070 het 3070 hom 17 9 10 2 AAATAAAAAAT 1 0 297411 CASAVA_Build 2 85879309 1I GGAATCTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 10 11 297412 CASAVA_Build 2 85882188 1I AGACCAGAGA -/T TTTTTCCCTT 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 T 5 6 297413 CASAVA_Build 2 85890554 1D ACCATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 32 1 22 9 A 15 14 297414 CASAVA_Build 2 85901668 2I CTGTAGACCA --/AG AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 30 2 14 14 AG 0 1 297415 CASAVA_Build 2 85912852 1I CCATTTCTAC -/A AAAAAACTAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 6 7 297416 CASAVA_Build 2 85915068 1D AATGAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 12 11 297417 CASAVA_Build 2 85917126 1D GAGGTATATG A/- AAAAAATGCT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 7 6 297418 CASAVA_Build 2 85921662 1I CAGAATCATT -/A AAAAAAAAAA 2242 het 246 hom 16 1 9 6 A 11 12 297419 CASAVA_Build 2 85922682 3D TGTAAAGTGG AAC/--- AACAGTGGAC 3070 hom 138 het 51 0 43 8 AAC 2 1 297420 CASAVA_Build 2 85926346 1I TTCAACTGGG -/T GGGCAGGGTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 0 1 297421 CASAVA_Build 2 85930826 1D AAAAAGGAAC T/- GATATTCTTG 3070 hom 108 het 40 0 36 5 T 1 0 297422 CASAVA_Build 2 85937701 15D TGCCTCTACC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 30 0 17 13 A 31 16 297423 CASAVA_Build 2 85943134 1I ATTTTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 10 11 297424 CASAVA_Build 2 85945229 1I AAAAAAAAAA -/G AGAAAAAGAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 0 1 297425 CASAVA_Build 2 85950021 1I TTTGCATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 744 hom 30 2 24 4 T 13 14 297426 CASAVA_Build 2 85951486 1I AATTTTTGTA -/T TTTTCAGTAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 4 5 297427 CASAVA_Build 2 85989876 1D GCCCCACCCT C/- CCTTGCCTGG 3070 hom 110 het 40 0 35 5 C 3 2 297428 CASAVA_Build 2 85993667 4I GAAAAACAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAAC 3 4 297429 CASAVA_Build 2 86015778 15D CTAAGTACTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 15 10 T 26 11 297430 CASAVA_Build 2 86026768 1I TTCTCTTGCA -/C CATCCTACTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 1 2 297431 CASAVA_Build 2 86034867 2I CTCGGGGGGG --/GA AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 20 0 16 4 GA 0 1 297432 CASAVA_Build 2 86036475 1D GGCTGGTCTC A/- AAATTCCTGA 3070 hom 66 het 24 0 22 3 A 4 3 297433 CASAVA_Build 2 86050588 1D AAAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 1037 het 53 hom 9 1 7 1 A 14 13 297434 CASAVA_Build 2 86055784 6I CCACCTCTGG ------/ATCCCA CCCTGTGACC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 ATCCCA 0 1 297435 CASAVA_Build 2 86061604 1I GACAAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 72 hom 33 2 19 12 T 14 15 297436 CASAVA_Build 2 86064269 1D TTTATTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 36 0 26 10 T 11 10 297437 CASAVA_Build 2 86075087 1D AGAATGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 30 0 18 12 T 17 16 297438 CASAVA_Build 2 86080549 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 21 1 12 8 T 12 11 297439 CASAVA_Build 2 86142462 1D ACCTTTGACG A/- GGGGTAGAAA 3070 hom 104 het 39 0 34 5 A 1 0 297440 CASAVA_Build 2 86151338 2D ATCCCCCCCC CG/-- CCGTGATCAC 3070 hom 39 het 23 0 15 8 CG 1 0 297441 CASAVA_Build 2 86153848 1D AAAATAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 26 5 A 14 13 297442 CASAVA_Build 2 86168391 1D TGGCCAGGCC G/- GTCTTGAACT 3070 hom 54 het 19 0 18 2 G 2 1 297443 CASAVA_Build 2 86176745 1I GTTGCAGGAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 2903 hom 21 10 9 2 A 8 9 297444 CASAVA_Build 2 86181170 1I TTATTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 1215 het 1215 ref 39 12 8 19 T 17 18 297445 CASAVA_Build 2 86190041 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2311 hom 27 het 11 0 8 3 A 13 14 297446 CASAVA_Build 2 86203213 1D GTCTGGCTAG T/- TTTTTTTGGG 3070 hom 38 het 17 0 11 6 T 8 7 297447 CASAVA_Build 2 86203896 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 535 hom 27 3 15 9 A 17 16 297448 CASAVA_Build 2 86210571 4D TGCCCTGTCC ATTA/---- ATTCTAGTTT 3070 hom 96 het 39 0 32 9 ATTA 1 0 297449 CASAVA_Build 2 86218218 1D GAGCAGCAAT G/- GGTCTCACCA 3070 hom 156 het 56 0 48 10 G 3 2 297450 CASAVA_Build 2 86222692 1D AAGCAATCAA G/- GGGGGTGGGT 3070 hom 67 het 27 0 20 7 G 6 5 297451 CASAVA_Build 2 86225700 7I TCTTCATATC -------/AGGCAGT AAAGTCAGAA 3070 hom 114 het 40 0 37 3 AGGCAGT 0 1 297452 CASAVA_Build 2 86225900 1I AGGCCGAGGT -/G GGGTGGATCA 3070 hom 54 het 21 0 16 6 G 3 4 297453 CASAVA_Build 2 86229511 4D AGTGCATAAG TATT/---- TATGAAGTGC 3070 hom 132 het 47 0 45 4 TATT 1 0 297454 CASAVA_Build 2 86230514 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 24 1 19 5 A 19 16 297455 CASAVA_Build 2 86231555 2D ACTGTCAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 32 1 19 13 T 16 14 297456 CASAVA_Build 2 86233394 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 10 11 297457 CASAVA_Build 2 86236019 3I AGAGAATAGT ---/GAG GCTAGTGGGG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GAG 0 1 297458 CASAVA_Build 2 86238423 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 387 het 387 ref 6 3 2 1 A 15 14 297459 CASAVA_Build 2 86239194 1D GTTAAAACAT C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 1 0 297460 CASAVA_Build 2 86241263 9I TTTGAGTGAC ---------/AAATAACTA AAATAACTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 4 AAATAACTA 1 2 297461 CASAVA_Build 2 86246387 5I GTGTTTCGCA -----/TAAAT TAAATAATCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TAAAT 1 2 297462 CASAVA_Build 2 86255373 1I TAACTTGCTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 154 het 54 0 52 2 T 7 8 297463 CASAVA_Build 2 86260562 1I ACACCCTGCC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 7 8 297464 CASAVA_Build 2 86262734 4D ATTTCTTAAT AATA/---- AATATGTGGA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 AATA 2 1 297465 CASAVA_Build 2 86263395 6D ATGAGAATCA CTTGAG/------ CTTGAGCCCC 3070 hom 48 het 17 0 17 1 CTTGAG 2 1 297466 CASAVA_Build 2 86264270 1D ATACTTCTTT C/- CCCAGCCACC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 4 3 297467 CASAVA_Build 2 86276308 3I TTATCCGGAA ---/GCT GGGGTTACTA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 GCT 0 1 297468 CASAVA_Build 2 86283243 4I GCGATTTAAC ----/TTAT TTATTTGATT 3070 hom 105 het 47 0 35 12 TTAT 1 2 297469 CASAVA_Build 2 86285086 2D TATTAGTGCA TT/-- TTTTTTTTTA 1359 hom 14 het 23 0 5 18 T 11 9 297470 CASAVA_Build 2 86286050 2D GTTGGTTTTG CT/-- CTCTCTGCGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 CT 4 3 297471 CASAVA_Build 2 86298301 4D GGATTTCAGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1738 het 58 hom 32 2 7 23 T 18 14 297472 CASAVA_Build 2 86301342 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 29 1 20 8 T 11 10 297473 CASAVA_Build 2 86308503 1D GGGCCTTGGC A/- ATAGAGTAGG 3070 hom 123 het 51 0 42 11 A 2 1 297474 CASAVA_Build 2 86310233 11D CCTGTCTTCC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1118 het 109 hom 24 2 5 18 T 27 16 297475 CASAVA_Build 2 86317852 1D GAACTGTTTG A/- GAAAGGAATA 3070 hom 120 het 42 0 40 4 A 1 0 297476 CASAVA_Build 2 86330427 1D TCTTCTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 10 9 297477 CASAVA_Build 2 86345087 1I CTGATCTTCC -/T TTTTATCTCT 3070 hom 115 het 41 0 39 2 T 4 5 297478 CASAVA_Build 2 86364983 2I CCCACAAGAC --/TG TGTGTTCCAC 3070 hom 100 het 38 0 28 10 TG 2 3 297479 CASAVA_Build 2 86369436 6D TGCCACTGTG ATGGGT/------ ATGGGTGTAA 3070 hom 121 het 45 0 40 8 ATGGGT 2 1 297480 CASAVA_Build 2 86384165 1I CTGGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 11 12 297481 CASAVA_Build 2 86387523 1D GAGCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1155 het 1155 ref 26 21 3 2 A 13 12 297482 CASAVA_Build 2 86389022 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 120 het 42 0 39 5 A 9 8 297483 CASAVA_Build 2 86439837 1I TCCTGTCCTC -/T TTTTTTTTTT 1033 het 1033 ref 55 31 4 20 T 13 14 297484 CASAVA_Build 2 86443339 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 2242 het 2242 ref 27 14 6 8 A 16 15 297485 CASAVA_Build 2 86457482 4D CCAGGCTGGT CTCA/---- CTCAAACTCC 1245 het 1245 ref 12 6 4 2 CTCA 2 1 297486 CASAVA_Build 2 86510733 1I GATCGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 11 12 297487 CASAVA_Build 2 86570724 4D CAAGTGGTCC TACT/---- TGTTACTAGC 3070 het 3070 ref 42 21 17 6 TACT 1 0 297488 CASAVA_Build 2 86583455 1D ATGCACATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 26 7 7 A 13 12 297489 CASAVA_Build 2 86614415 1I TTGGGATTAA -/G GCCACCACAC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 1 2 297490 CASAVA_Build 2 86755621 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2278 het 2250 hom 19 9 6 4 A 16 15 297491 CASAVA_Build 2 86779555 3I ACTGTGTAAC ---/ATA ATGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 ATA 0 1 297492 CASAVA_Build 2 86800306 1D TGGTTTTTCA T/- TCCCGGGAGA 1057 het 1007 hom 11 2 4 5 T 2 1 297493 CASAVA_Build 2 86802244 1I ACCTAGATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 T 11 12 297494 CASAVA_Build 2 86804721 2D CAGGAATATC TT/-- TTTTTTTTTT 1991 het 1991 ref 37 19 5 13 T 13 11 297495 CASAVA_Build 2 86808799 2D TTTAAAAGAA AC/-- ATTATTCATG 3070 het 3070 hom 47 9 33 5 AC 1 0 297496 CASAVA_Build 2 86809507 1I CCTGCCTCAG -/C CCCCCGAGTA 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 C 5 6 297497 CASAVA_Build 2 86810302 1I CAGAAAGAGC -/T AGATGGAGTG 1867 het 1867 ref 22 16 5 1 T 0 1 297498 CASAVA_Build 2 86821366 1I TCTTATTTCC -/A AAAAATAAAA 1422 het 1422 ref 18 14 3 1 A 5 6 297499 CASAVA_Build 2 86824133 1D ACTCTCACTC T/- TTTTGCCCAA 3070 het 3070 ref 38 16 17 6 T 5 4 297500 CASAVA_Build 2 86825364 1I TGCCTAGGCT -/G GGAGTGCAGT 3070 het 2208 hom 27 6 18 3 G 2 3 297501 CASAVA_Build 2 86825628 4D11M1D ATAAATAATA TTTGTTCTGTGACAAT/----TTCTGTGACAA- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 20 11 11 1 N/A 0 0 297502 CASAVA_Build 2 86831137 2D TGTAAGTAAC AT/-- GTCACTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 19 8 AT 1 0 297503 CASAVA_Build 2 86838796 3D ATCAAAAGGC ACA/--- ACAAGATAAA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 ACA 2 1 297504 CASAVA_Build 2 86840247 1I AGTTTGCTTG -/C CCCCCCCGCC 3070 hom 30 het 18 0 14 4 C 7 8 297505 CASAVA_Build 2 86841397 1D GAAAGATTTG A/- AAAAGGACAA 3070 hom 118 het 43 0 40 3 A 5 4 297506 CASAVA_Build 2 86843827 4D TTAAAATTTG TAGT/---- TACTCTATTA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TAGT 1 0 297507 CASAVA_Build 2 86845849 2I GTCAGATGTT --/AA ATTAATGTTT 3070 hom 132 het 50 0 44 6 A 1 3 297508 CASAVA_Build 2 86848060 10D TTTGGCAGTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 21 11 297509 CASAVA_Build 2 86859677 2I ACCAGCAGCA --/TC TCAGCATCAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TC 1 2 297510 CASAVA_Build 2 86860460 1D GAAAGTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 43 0 34 10 A 12 11 297511 CASAVA_Build 2 86869145 2I TGAGCAGGCT --/GA GAGTTCAAAA 3070 hom 84 het 35 0 26 9 GA 1 2 297512 CASAVA_Build 2 86910507 4D ACAGATAATT TCTC/---- TCCTCTTCTG 3070 hom 81 het 29 0 26 4 TC 3 1 297513 CASAVA_Build 2 86915102 4D TTCTTCTCTT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 481 hom 21 3 11 10 AC 10 8 297514 CASAVA_Build 2 86923225 1I TCTAAGAGAA -/T TCACAAATTT 3070 het 3070 ref 54 39 9 6 T 1 2 297515 CASAVA_Build 2 86935441 1D AGGGGGACAG A/- AAAAAAAAAA 2595 het 2167 hom 15 5 7 3 A 12 11 297516 CASAVA_Build 2 86936498 1D CTGGGTCTAG T/- GGGAGACTCA 2466 het 2466 ref 45 30 6 9 T 1 0 297517 CASAVA_Build 2 86944205 1D TCATGTGCTT G/- TTGGCCATTT 3070 het 3070 ref 46 34 8 5 G 1 0 297518 CASAVA_Build 2 86947204 1I AAAATAAAAA -/T AAAAAATGTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 0 1 297519 CASAVA_Build 2 86947656 1I TAAAAAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 946 hom 13 3 10 0 T 10 11 297520 CASAVA_Build 2 86951200 1I GTTATCCACA -/T TTTTTTTAGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 7 8 297521 CASAVA_Build 2 86958989 5D TTTATTACTC TAATT/----- TATTTTTTCT 2632 het 2632 ref 15 9 6 0 TAATT 1 0 297522 CASAVA_Build 2 86967687 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 13 3 A 13 14 297523 CASAVA_Build 2 86975962 1I TATAGGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1246 hom 22 5 11 6 T 15 16 297524 CASAVA_Build 2 86996819 1D AGTGAGCTAT A/- ATTGCACCAC 1241 het 1241 ref 58 45 3 10 A 2 1 297525 CASAVA_Build 2 87004717 1D GCTATTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 12 11 297526 CASAVA_Build 2 87017868 2I ATTAGAAGAC --/TG TGAGACAAGA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TG 1 2 297527 CASAVA_Build 2 87019090 2D GTAGGGAGTT AA/-- ACTTTAAGGA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 A 3 1 297528 CASAVA_Build 2 87019234 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2845 het 2602 hom 30 9 9 12 A 15 14 297529 CASAVA_Build 2 87025653 1D CTCAGCCTGA T/- TTTTTTTTTT 2441 het 221 hom 13 1 9 3 T 13 12 297530 CASAVA_Build 2 87028251 1I TTTCTTACCC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 7 8 297531 CASAVA_Build 2 87032349 5I CAATGAATAA -----/GAAAT AAAACTGTAA 2429 het 2429 ref 14 8 5 1 GAAAT 0 1 297532 CASAVA_Build 2 87037406 4I AAAGTGTGTG ----/TATT TATATGTGTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TATT 0 1 297533 CASAVA_Build 2 87106650 2D TCTTTTCCAC AT/-- GTTAGCCTTT 2271 hom 21 het 9 0 7 2 AT 1 0 297534 CASAVA_Build 2 87131617 1I TAAAAAATTG -/T TTTAAGTAGA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 3 4 297535 CASAVA_Build 2 87184620 1I GTTTTTTTTT -/A AATTTTGATC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 2 3 297536 CASAVA_Build 2 87202544 1D TGTACTATGT A/- TTAAAACCCT 3070 het 669 hom 27 2 19 6 A 1 0 297537 CASAVA_Build 2 87211705 14D CTTCTTCTTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 2375 het 2375 ref 23 10 10 5 T 25 11 297538 CASAVA_Build 2 87217752 1I GTATACTATA -/T TGTGAGTGTG 3070 het 3070 ref 42 25 9 10 T 1 2 297539 CASAVA_Build 2 87222949 1I TAGAATATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 12 1 11 0 T 11 12 297540 CASAVA_Build 2 87223770 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 13 0 9 4 A 10 11 297541 CASAVA_Build 2 87244718 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2064 hom 9 het 12 0 7 5 T 13 14 297542 CASAVA_Build 2 87256435 9D AACATTAGTA TCTTAATAT/--------- TTATCTTTGA 2147 hom 12 het 6 0 5 1 TCTTAATAT 1 0 297543 CASAVA_Build 2 87267601 1D TGGGACTTAA T/- TTTTTTTTTT 2743 het 2743 ref 24 14 7 3 T 13 12 297544 CASAVA_Build 2 87271021 1D AAAACTAGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 9 8 297545 CASAVA_Build 2 87276189 1D AAGACATTTT A/- AAAGTATAGA 3035 hom 18 het 9 0 7 2 A 4 3 297546 CASAVA_Build 2 87290293 1D TGTCAAATGC T/- TTTTTTTTCC 1975 hom 10 het 4 0 4 0 T 9 8 297547 CASAVA_Build 2 87299460 1D TGCAGTCTGG T/- TTAGTGCCTG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 3 2 297548 CASAVA_Build 2 87335930 1I TAAAGAGAGA -/T TTTTTTTTCC 2759 het 2759 ref 33 18 6 9 T 8 9 297549 CASAVA_Build 2 87335972 1I TTTTAGGTTG -/T TTTTTTTTTT 1293 het 1293 ref 40 15 6 19 T 13 14 297550 CASAVA_Build 2 87355481 3I TGGGTGGTTT ---/TGA TGATACTAGC 1804 het 1804 ref 31 21 4 6 TGA 1 2 297551 CASAVA_Build 2 87362581 1I TGCTCATGCC -/G ACGGCTTTTG 3070 het 3070 ref 44 26 12 6 G 0 1 297552 CASAVA_Build 2 87382589 1I TTGGCACAAG -/C TTTGGGTCAA 2883 het 2883 ref 53 41 7 5 C 0 1 297553 CASAVA_Build 2 87397293 1D TAATTTTCAC T/- TTTTTTCTTT 1332 het 1332 ref 36 30 3 3 T 7 6 297554 CASAVA_Build 2 87397499 4D TTAAATGTAC AGTT/---- AAATTATTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 5 AGTT 1 0 297555 CASAVA_Build 2 87407396 1I CAACAAACAC -/A TTTTCCTGGG 1582 het 1582 ref 37 20 5 12 A 0 1 297556 CASAVA_Build 2 87428309 2I TGGGGTGAAA --/AG AGGAAGTGAC 3070 het 3070 hom 50 21 20 9 AG 1 2 297557 CASAVA_Build 2 87429901 2D TTCTCCTCTG CA/-- CACACTTCGG 1282 het 1282 ref 13 9 4 0 CA 3 2 297558 CASAVA_Build 2 87432026 1I GACGACCAGA -/G TGGTAGGACA 3070 het 3070 ref 63 42 13 8 G 0 1 297559 CASAVA_Build 2 87435580 6I ACCCTGGCAG ------/CCCTGA CCCTGGCCCT 1136 het 1136 ref 24 10 4 10 CCCTGA 0 1 297560 CASAVA_Build 2 87438294 1D CCTTGCCCTT C/- CCCTGGTCTT 3070 het 3070 hom 73 16 36 21 C 4 3 297561 CASAVA_Build 2 87438718 1I CCTGGCCATG -/T TTTTTTCCAT 2207 het 610 hom 13 3 6 4 T 6 7 297562 CASAVA_Build 2 87440155 2D ATAAGATGAC TT/-- GAGATGAGAT 2279 het 2279 ref 44 38 5 3 T 2 0 297563 CASAVA_Build 2 87440187 6D3M2D37M3I GATGAAATGA CAAAATGATGAGATGAGATGAGATGATGAGATGAAATGGAGAGTGGAA---/------GAT--GATGAGATGAAATTTTGAGATGAAATGGAGAGTGGAAATG ATGAGATGAA 1737 het 1737 ref 69 76 4 46 N/A 0 0 297564 CASAVA_Build 2 87440347 2I ATGAAACGAG --/CC ATGAAATGAT 797 het 797 ref 46 40 2 4 C 0 2 297565 CASAVA_Build 2 87440407 5D TGAAATTGAA ATGAG/----- ATGAGATGAG 2466 het 2466 ref 63 51 6 7 ATGAG 3 2 297566 CASAVA_Build 2 87440440 3I ATGAGATAAA ---/ATG ATGAGATGAA 2230 het 2230 ref 57 44 6 7 ATG 1 2 297567 CASAVA_Build 2 87441003 5I GAAATGACAT -----/AATGA AATGAAATGA 3070 het 3070 hom 60 13 34 13 AATGA 2 3 297568 CASAVA_Build 2 87441523 5I AAGATACGAG -----/ATGAA ATGAAGTGAT 3070 het 1893 hom 17 6 10 1 ATGAA 1 2 297569 CASAVA_Build 2 87441912 5D ATGAAATGAG ATGAA/----- ATGAATGAGA 3070 het 3070 hom 63 20 33 16 ATGAA 2 1 297570 CASAVA_Build 2 87442007 3I ATGAGGTGAA ---/ATG ATGAAATGCT 3070 het 3070 hom 62 25 26 11 ATG 1 2 297571 CASAVA_Build 2 87442856 4I AATGAAATTG ----/AAAT AAATAAAATT 2350 het 2350 ref 74 37 5 32 AAAT 1 2 297572 CASAVA_Build 2 87443981 3D ATGAGATGAA ATG/--- ATGAGATGAT 1691 het 1691 ref 30 24 4 4 ATG 2 1 297573 CASAVA_Build 2 87444071 5D GAAATGAAAT AATGA/----- AATGAAATTG 2756 het 2756 ref 37 26 7 6 AATGA 2 1 297574 CASAVA_Build 2 87444351 13D AATAATGAAA TGAAATAATGAAC/------------- TGGAAATGAT 2126 hom 12 het 5 0 5 0 TGAAATAATGAAC 1 0 297575 CASAVA_Build 2 87445159 5I GAAATGACAT -----/AATGA AATGAAATGA 1312 het 1312 ref 42 36 3 3 AATGA 2 3 297576 CASAVA_Build 2 87445880 5I AAATGGAAAT -----/GATGA GATGAGATGA 1521 het 1521 ref 44 35 4 5 GATGA 2 3 297577 CASAVA_Build 2 87446888 12D ATGAAATGAG ATGAAAAATGAT/------------ ATGAAAAATG 3070 het 3070 ref 82 39 15 53 ATGAAAAATGAT 2 1 297578 CASAVA_Build 2 87447037 5D TGAAATGGAA ATGCG/----- ATGAGATGAG 2635 het 2635 ref 60 41 9 11 ATGCG 1 0 297579 CASAVA_Build 2 87447595 1D TATATCAAAT A/- AAAAATGTTA 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 A 6 5 297580 CASAVA_Build 2 87453469 1I TGTTCAGGAC -/T TTTTATGTCT 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 T 4 5 297581 CASAVA_Build 2 87456076 4D CTTGGAGACA AAAC/---- AAACATGACA 3070 het 3070 ref 94 61 25 9 AAAC 2 1 297582 CASAVA_Build 2 87456296 1D ATGGGTGGTT A/- AAAAAAAACC 1300 het 1300 ref 42 20 3 20 A 9 8 297583 CASAVA_Build 2 87457520 1I ACTCCACAGA -/G GGGGAAACTC 3070 het 3070 ref 55 25 15 15 G 4 5 297584 CASAVA_Build 2 87460894 1I AACAGGCCAG -/A TCTTGACCCC 3070 het 3070 hom 52 19 20 13 A 0 1 297585 CASAVA_Build 2 87462409 3D CTGTCCTCTC CTT/--- CCCTCCCTGG 1668 het 1668 ref 68 50 4 14 CTT 1 0 297586 CASAVA_Build 2 87462893 4I GGCTGTTTGC ----/TTAT TTGTTTGGTG 3070 het 3070 ref 27 11 7 9 TTAT 0 1 297587 CASAVA_Build 2 87466322 2D GTAAAGTTCC TT/-- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 57 36 17 4 T 8 6 297588 CASAVA_Build 2 87469166 5I GGCTGGCCTT -----/CTAGC CCAGCCTGGA 3070 het 3070 ref 66 34 18 14 CTAGC 0 1 297589 CASAVA_Build 2 87470461 4D GTTTTGTGAT TCTG/---- TCTGTCTTTG 3070 het 3070 ref 54 38 9 9 TCTG 2 1 297590 CASAVA_Build 2 87471264 4I128M1I AGTGTGTGAA ----TGTGTGTGCATGTGTGCCTGTGTTTGTGTGAGTGTAAGAGTGTTGTACATTTATACACTCACATTTTGTTTTCTGGTTAATAACAAGATCTATCTTTGATTTAGGATATGAAGAATTCTTATAAGCAA-/TGTGTGTGTGTGCATGTGTGCCTGTGTTTGTGTGAGTGTAAGAGTGTTGTACATTTATACACACACATTTTGTTTTCTGGTTAATAACAAGATCTATCTTTGATTTAGGATATGAAGAATTCTTATAAGCAAC CCCCCCACAC 3070 het 3070 ref 62 97 37 52 N/A 0 0 297591 CASAVA_Build 2 87472503 3I ATAAAATTGA ---/TAT TATTATATTT 2819 het 2819 ref 22 13 6 4 TAT 2 3 297592 CASAVA_Build 2 87474133 4D TATACATGTG TGTA/---- TGTATGTGTA 3070 het 3070 ref 42 29 8 6 TGTA 2 1 297593 CASAVA_Build 2 87474314 2D AATATATAGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 AT 7 6 297594 CASAVA_Build 2 87475981 1I GAAATATATG -/T CTTTGTTTAA 3070 het 3070 hom 52 13 36 3 T 0 1 297595 CASAVA_Build 2 87485635 2I CTCAAAAAAA --/AG AAAAAAAAAA 2525 het 903 hom 59 13 17 29 AG 0 1 297596 CASAVA_Build 2 87515592 3D CAAGCAGCAG AAC/--- AACAAGAAAA 3070 het 3070 hom 51 29 15 9 AAC 2 1 297597 CASAVA_Build 2 87518935 5D TTAAGTGAAA TAAAG/----- TAGAGTCCTA 1737 het 1737 ref 20 9 6 6 TAAAG 1 0 297598 CASAVA_Build 2 87524489 3D AGTGAAAATT AAG/--- AAGCTATGAA 2851 het 2851 ref 34 25 6 3 AAG 2 1 297599 CASAVA_Build 2 87531685 1D TTTCAAACTC T/- TTTTTTTTTT 2480 het 507 hom 25 7 9 9 T 17 16 297600 CASAVA_Build 2 87534124 1I GCAATTATGT -/G GGGGCTGGTG 3070 hom 53 het 21 0 17 4 G 4 5 297601 CASAVA_Build 2 87534302 1I ATGCGACACT -/G GGGGGGGACA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 7 8 297602 CASAVA_Build 2 87546659 1D TTTTAAAATC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 47 het 25 0 16 9 T 8 7 297603 CASAVA_Build 2 87546799 1I TAAAAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 35 1 29 5 T 10 11 297604 CASAVA_Build 2 87595948 1I AAACAAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 10 11 297605 CASAVA_Build 2 87634142 3D GATGATGATA ATG/--- ATGATGATGA 3070 het 3070 hom 51 19 14 18 ATG 7 6 297606 CASAVA_Build 2 87638447 1I TTACCTCAAT -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 A 6 7 297607 CASAVA_Build 2 87638669 1D TCTGTCTCAC T/- TTTTTAAAAA 1413 het 1413 ref 22 16 3 3 T 6 5 297608 CASAVA_Build 2 87655706 2D TCATCCAGCT CA/-- CACTTGTACA 3070 het 3070 ref 58 31 25 3 CA 2 1 297609 CASAVA_Build 2 87669436 1I TTAAAAAATC -/A AATGTTCAAA 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 A 2 3 297610 CASAVA_Build 2 87751551 1I CAGGGAGAGT -/G GGGGGTCACT 3070 het 3070 ref 35 21 8 6 G 5 6 297611 CASAVA_Build 2 87785210 1I TTGTTCACTC -/G TTGAACTTCT 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 G 0 1 297612 CASAVA_Build 2 87793543 1D GTATACTATA T/- TGTGAGTGTG 1315 het 1315 ref 38 29 3 6 T 2 1 297613 CASAVA_Build 2 87805616 1D TCTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2776 het 2776 ref 27 15 8 4 T 11 10 297614 CASAVA_Build 2 87824553 2D AAAGGCTAAC AT/-- GTGGAAAAGA 1908 het 1908 ref 23 15 4 5 AT 1 0 297615 CASAVA_Build 2 87830712 1D TGAATAAGAG A/- AAAAAAAAAT 1791 het 1791 ref 57 45 4 8 A 10 9 297616 CASAVA_Build 2 87835379 1I TACCAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 68 32 23 13 A 11 12 297617 CASAVA_Build 2 87838931 1D GGTTTTTTTT A/- TTAGGACTAA 3070 het 2585 hom 21 6 11 4 A 1 0 297618 CASAVA_Build 2 87871749 2D TCGGGAACCT TC/-- TCTGTGTCAG 1839 het 1769 hom 9 4 5 0 TC 2 1 297619 CASAVA_Build 2 87925026 5I TTTTCTTATC -----/TGATA TATTTACACA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 TGATA 0 1 297620 CASAVA_Build 2 87925363 2D AGATATTATC TA/-- TGTTATTTGT 3070 het 2545 hom 17 8 7 2 TA 1 0 297621 CASAVA_Build 2 87935493 3D TTTCCCAGCT TTA/--- TTGAGATATT 3070 het 3070 ref 34 17 7 10 TTA 1 0 297622 CASAVA_Build 2 87935648 2I GTGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 2861 het 2861 ref 48 16 9 23 GT 6 7 297623 CASAVA_Build 2 87950456 5D GTTAACGTAA TACAG/----- TAAAGACTAT 3070 het 3070 ref 34 24 10 5 TACAG 1 0 297624 CASAVA_Build 2 87953021 1I TGATAAACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 22 8 4 A 9 10 297625 CASAVA_Build 2 87953886 1D CTGATGGTCA T/- TTTGGGTTTA 3070 het 3070 ref 45 28 11 7 T 4 3 297626 CASAVA_Build 2 87960046 2I TTTTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 37 11 6 T 12 14 297627 CASAVA_Build 2 87962826 1D TGTCACACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 59 33 17 10 T 11 10 297628 CASAVA_Build 2 87968934 3I TGCTATTAAA ---/AAT AATAAAGTAA 3070 het 3070 ref 57 29 19 9 AAT 1 2 297629 CASAVA_Build 2 88038005 1I AAAGAGAACC -/T TTTCCAGAAA 3070 hom 80 het 33 0 27 6 T 3 4 297630 CASAVA_Build 2 88038900 4I CACCACAGAG ----/TAGA TAGATATTCA 3070 het 3070 ref 65 33 28 4 TAGA 1 2 297631 CASAVA_Build 2 88059947 1D TTCATGACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 600 hom 16 2 8 6 A 12 11 297632 CASAVA_Build 2 88065766 5D ATTTTGTAAA TAATC/----- TAATAAGGGC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TAATC 1 0 297633 CASAVA_Build 2 88075186 1I GATGCTGAGG -/A TTTTTTTTCA 2875 het 2875 ref 32 24 6 2 A 0 1 297634 CASAVA_Build 2 88075736 1D TTCCTGGTCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 8 297635 CASAVA_Build 2 88082564 1D ACACCGCCCG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 49 het 18 0 14 4 C 10 9 297636 CASAVA_Build 2 88084819 5D GACAAGCAAC TAAAT/----- TAATCTAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 4 TAAAT 1 0 297637 CASAVA_Build 2 88085034 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 10 9 297638 CASAVA_Build 2 88096986 41D TCACTAATGG TTAGCAGGTGCACCGTTTCTGGAAGTACTGCAATACCAAAT/----------------------------------------- CGATGCGTAG 3070 het 3070 ref 40 25 20 4 TTAGCAGGTGCACCGTTTCTGGAAGTACTGCAATACCAAAT 1 0 297639 CASAVA_Build 2 88097304 1D TTGAAAACAT A/- GGCCCTTTGA 3070 het 1914 hom 33 8 19 6 A 1 0 297640 CASAVA_Build 2 88097347 1D TCTTAGTGAC T/- TCGAGCTTTG 3070 het 1152 hom 31 3 15 15 T 2 1 297641 CASAVA_Build 2 88107538 1D TTCGGACCCC T/- TTTCCTATAA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 T 4 3 297642 CASAVA_Build 2 88107828 3D AGACTGACAC ACA/--- ACAACATGTA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 ACA 3 2 297643 CASAVA_Build 2 88111709 2D TAAATTATTT TA/-- GAGTATATTC 1862 het 1862 ref 17 9 4 4 TA 1 0 297644 CASAVA_Build 2 88117106 1I AAGGAAGTAC -/A AATCATTAGA 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 A 2 3 297645 CASAVA_Build 2 88119783 1I AATTGGGTCA -/G AAAATGAGTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 0 1 297646 CASAVA_Build 2 88125036 8D AAAAGAAAAC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAGAA 2777 het 675 hom 21 5 6 14 A 15 7 297647 CASAVA_Build 2 88132031 3D AACTGGAAAC ATG/--- ACAATTCTTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 6 ATG 1 0 297648 CASAVA_Build 2 88134020 1I TTGCAAAATC -/A AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 56 24 23 9 A 5 6 297649 CASAVA_Build 2 88137804 2D ATCTCATCCC CT/-- GTTTCCCAAA 3070 het 3070 ref 55 29 21 5 CT 1 0 297650 CASAVA_Build 2 88141821 31D GTTGGGGAGG GGTTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTT/------------------------------- GGGGAGTTCA 3070 hom 114 het 35 0 39 2 GGTTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTT 1 0 297651 CASAVA_Build 2 88150756 1D AAAGAGATAG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 9 8 297652 CASAVA_Build 2 88152652 1D AAAAAAAAAA C/- CCCAGCTATT 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 C 4 3 297653 CASAVA_Build 2 88174737 6I GATGGGTCTT ------/TTCCTC AGGGTGGGGT 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 TTCCTC 0 1 297654 CASAVA_Build 2 88197488 1I GCTTCCTGCA -/G TTGCCGGCTA 3070 hom 72 het 33 0 22 11 G 0 1 297655 CASAVA_Build 2 88201042 1I TTTGGGGAAT -/A ATTTTTATAT 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 A 1 2 297656 CASAVA_Build 2 88202145 2D10M6D AGAGTAATAG TTTATGATGTACAAGTTA/--TATCATAAAC------ TATGAAATTC 3070 het 3070 hom 52 23 31 6 N/A 0 0 297657 CASAVA_Build 2 88212237 1D TCCCTTTGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 313 hom 46 1 32 15 T 10 9 297658 CASAVA_Build 2 88214995 1D ATTTCTATTC T/- ATTCTAATAC 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 1 0 297659 CASAVA_Build 2 88221182 1I CCTTTGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 32 1 23 8 A 10 11 297660 CASAVA_Build 2 88221528 3I AGAACCTTAC ---/AGT AGTTTTCTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AGT 1 2 297661 CASAVA_Build 2 88221583 6D TCTTTCTTTC TTTCTT/------ TTTCTTTCTC 3070 het 67 hom 20 2 11 8 TTTCTT 2 1 297662 CASAVA_Build 2 88225198 1D TGTTTTATGG T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 8 7 297663 CASAVA_Build 2 88233006 1D ACACCTAATC A/- AAAAAGAAAG 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 A 6 5 297664 CASAVA_Build 2 88239472 2D TTCCTAAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 24 5 T 12 10 297665 CASAVA_Build 2 88241166 2D CACATTATAC AT/-- ATATATATAT 1169 het 1169 ref 7 3 3 2 AT 8 7 297666 CASAVA_Build 2 88244437 5I GGCTCTGTGC -----/TGAGT TATTAGTGAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 TGAGT 0 1 297667 CASAVA_Build 2 88251486 1D GTCGGCTCCT G/- GGGTCCGAGT 2234 het 2234 ref 21 12 7 2 G 4 3 297668 CASAVA_Build 2 88255013 1I GAAGAAGTAT -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 6 7 297669 CASAVA_Build 2 88256527 1I AGCCCAGGAG -/T TTTGAGACCA 3070 het 2472 hom 26 8 14 4 T 3 4 297670 CASAVA_Build 2 88264420 1I TTCTGTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 489 hom 18 1 12 5 A 13 14 297671 CASAVA_Build 2 88265416 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 80 het 29 0 27 2 A 8 9 297672 CASAVA_Build 2 88267084 1I GGGTTTAGGA -/C CCCCAGACCT 3070 hom 94 het 40 0 23 17 C 4 5 297673 CASAVA_Build 2 88272520 1I CCTTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 16 0 12 4 A 10 11 297674 CASAVA_Build 2 88276032 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2578 hom 18 7 8 4 A 10 9 297675 CASAVA_Build 2 88279023 1D CGCCACATCT A/- AACTATCCAT 3070 hom 123 het 46 0 41 6 A 3 2 297676 CASAVA_Build 2 88281242 1D TGATCATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1069 hom 31 4 21 6 A 13 12 297677 CASAVA_Build 2 88285761 2D AGGGTTTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 28 hom 35 3 30 3 TG 7 6 297678 CASAVA_Build 2 88287875 3D AGTGTGAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 1777 het 421 hom 25 6 4 15 T 19 16 297679 CASAVA_Build 2 88291473 3I AAACTTACAC ---/AGG GCTATCAAGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AGG 0 1 297680 CASAVA_Build 2 88357058 1D TGCTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2089 het 2089 ref 25 12 8 5 T 13 12 297681 CASAVA_Build 2 88372938 1D ATGAAACACT A/- AAAAAAAAAA 1097 het 1097 ref 40 29 3 10 A 11 10 297682 CASAVA_Build 2 88378186 1D CTTTCCTTTT A/- AAAAAAAAAA 760 het 760 ref 33 22 4 7 A 15 14 297683 CASAVA_Build 2 88420347 1D TTTGTATTCC T/- TTTTTTTTTT 1734 het 1734 ref 36 23 5 8 T 13 12 297684 CASAVA_Build 2 88466568 1I AAGGCAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 32 1 24 7 A 15 16 297685 CASAVA_Build 2 88490791 2I GCTGGGTGTG --/GT GTGGCATGTG 2401 het 1313 hom 13 5 6 2 GT 1 2 297686 CASAVA_Build 2 88503897 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1386 het 1386 ref 24 10 6 8 T 17 16 297687 CASAVA_Build 2 88529860 1I TCGTGTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1430 het 1430 ref 33 16 6 11 A 15 16 297688 CASAVA_Build 2 88647847 1I CTTTCTAACC -/T TTTTTTTTTT 2630 het 2630 ref 29 15 8 6 T 11 12 297689 CASAVA_Build 2 88719626 1D ATGTGGAAAA T/- TTAAACCCTC 3070 het 3070 ref 57 25 25 7 T 3 2 297690 CASAVA_Build 2 88734703 1I TTTTTGCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 T 10 11 297691 CASAVA_Build 2 88746280 1D TATTGGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 13 12 297692 CASAVA_Build 2 88753852 1D ATCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1063 het 1063 ref 31 23 3 7 A 11 10 297693 CASAVA_Build 2 88755468 1D TGAGAACCCT C/- CTTTCGCGGC 3010 het 3010 ref 32 19 7 6 C 2 1 297694 CASAVA_Build 2 88824206 1I GAGGATTCCC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 T 7 8 297695 CASAVA_Build 2 88848236 6I ATGCCTACTT ------/ATATTG ATACATGTTT 1377 het 1377 ref 37 29 3 5 ATATTG 0 1 297696 CASAVA_Build 2 88851769 1D CTGGCTAGGT A/- ATTTGGAGGT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 2 1 297697 CASAVA_Build 2 88852499 1I GATTATTATG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 68 29 37 2 A 7 8 297698 CASAVA_Build 2 88852590 1I TAATGCATAC -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 51 36 8 7 T 6 7 297699 CASAVA_Build 2 88853669 1I TCACTAACTT -/C CAGCGAAGGT 3070 het 3070 ref 49 31 11 7 C 1 2 297700 CASAVA_Build 2 88853739 1I AAATGCTCAT -/A GTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 64 28 30 6 A 0 1 297701 CASAVA_Build 2 88854902 1D CAAATCACAG T/- TTTAGAACCC 3070 het 3070 ref 82 44 26 12 T 4 3 297702 CASAVA_Build 2 88855093 1D TGTTTCTGTC T/- CATGGCACTC 3070 het 3070 ref 78 36 35 11 T 1 0 297703 CASAVA_Build 2 88855344 3I41M1D TAACACATAA ---TTGTGTAATGTGTATTTAACCATAAATTAGCTTCATAAAAAG/TGGTGGTGTAATGTGTATTTAACCATAAATTAGCTTCACAAAAA- TTTGTGTACA 3070 het 3070 ref 80 59 26 9 N/A 0 0 297704 CASAVA_Build 2 88855578 2D ACTATGAAAC AG/-- TGTGTCTATG 3070 het 3070 ref 60 30 23 10 AG 1 0 297705 CASAVA_Build 2 88855975 1D12M2D100M4D CTGGAAGCAG AAGGTGGAAGAATGAGAGTCAACCACAGGGACTCAATTCTTCTCTCTGTAGGGGTCACACATCGACAATAGGACAGGTGCTTCATGTTAGCAAAATGCGATGCACTGCATGTCAAACTG/-AGGTGGAAGAAT--GAGTAAACCACAGGGACTCAATTCTTCTCTCTGTAGGGGTAACACATCGACACTAGGATAGGTGCTTCATGTTAGCAAAATGCGATGCAGTGCATGTCAA---- ACTGTGGAAG 3070 het 3070 hom 82 45 45 52 N/A 0 0 297706 CASAVA_Build 2 88856156 16D54M2I TTTATTTTTA AATTTTATTATTATTGTACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAACGTGCAGGTTTGTTAAAATGTAAC--/----------------TACTTTAAGTTTTAGGGTATATGTGCACAACGTGCAGGTTTGTTAAAATGTAACTG TCAATAATCA 918 het 918 ref 19 15 2 35 N/A 0 0 297707 CASAVA_Build 2 88856273 4I GATTAACATG ----/AAAA AAGCCTCTGA 3070 het 3070 hom 49 14 18 17 A 2 6 297708 CASAVA_Build 2 88856688 10D ATCCTTCTGG GGTCCTATTT/---------- GGTCCTTTCG 3042 het 3042 ref 52 42 11 5 GGTCCTATTT 1 0 297709 CASAVA_Build 2 88857445 1D TGATAAAGAT C/- CCAATGTGGA 3070 het 3070 hom 103 36 60 7 C 3 2 297710 CASAVA_Build 2 88859183 3D GACCTCTTCA AGG/--- AGAACGACAA 2260 het 2260 ref 36 23 5 10 AGG 1 0 297711 CASAVA_Build 2 88859353 1I ACAGAATTAG -/A AAAGAACTAC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 3 4 297712 CASAVA_Build 2 88859919 1I GGGAGTGTGC -/A ATGAGGTACC 1907 het 1907 ref 41 34 6 1 A 1 2 297713 CASAVA_Build 2 88859985 2D TCTTTGGTAG AC/-- ACAGCCTTTT 3070 het 3070 ref 56 36 17 4 AC 2 1 297714 CASAVA_Build 2 88860171 1I TATTTTGTGT -/A TAAAAAGCTT 1908 het 1908 ref 50 37 6 7 A 0 1 297715 CASAVA_Build 2 88860766 4D TTGTGTGTGA ATGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 61 29 32 2 ATGT 1 0 297716 CASAVA_Build 2 88861424 1I GTCAAGTGTC -/T TGACACATTT 3070 het 3070 ref 47 31 13 3 T 1 2 297717 CASAVA_Build 2 88862036 1D ATATATGTGT G/- TATGTCATAT 1323 het 1323 ref 13 4 3 9 G 1 0 297718 CASAVA_Build 2 88862092 4D ATTTAGAAAC TTTG/---- TTTAGTTTAT 3070 het 3070 ref 36 21 9 9 TTTG 1 0 297719 CASAVA_Build 2 88863409 4I TTAAAGTCTC ----/ATTT ATATGTTGAA 3070 het 3070 ref 79 44 22 13 ATTT 0 1 297720 CASAVA_Build 2 88865168 1D ACACTGCATG A/- ATGTTTGAAT 3070 het 3070 ref 47 31 11 5 A 2 1 297721 CASAVA_Build 2 88880299 1D TAATATTTAA T/- TTTTCTCAGT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 5 4 297722 CASAVA_Build 2 88882039 1I22M9D ATATAAAAAA -GATACATATGATAAATATATCTGCTATATCA/GGATACATATGATAAATATATCT--------- GCTTAGAAAC 3070 het 3070 hom 66 35 46 16 N/A 0 0 297723 CASAVA_Build 2 88882205 2D TAATGTAGTC TT/-- ATACTGCTGA 3070 het 3070 hom 69 22 44 5 T 2 0 297724 CASAVA_Build 2 88882351 1D TAATTTCAGA T/- TTCCTAGATG 3070 het 3070 ref 95 78 10 7 T 3 2 297725 CASAVA_Build 2 88882997 1I GTAATAAAAA -/G AAAGAGGGAA 3070 het 3070 ref 46 28 15 3 G 0 1 297726 CASAVA_Build 2 88883712 4D27M2D ACCTTAATCT CTGGCTTTCATTCTGCCGTTTTTTATACATATG/----CTTTTATTCTGCCATTTTTTATACATA-- TTTTTTTCTT 1683 het 1683 ref 25 17 7 15 N/A 0 0 297727 CASAVA_Build 2 88884174 3I TGGGGGTTAT ---/AGA AGGTCAGCAA 3070 hom 181 het 67 0 61 6 AGA 0 1 297728 CASAVA_Build 2 88884922 1D GTCTAAAATA T/- TTTATATATA 3070 het 3070 ref 78 63 12 5 T 4 3 297729 CASAVA_Build 2 88885260 3D21M2D TGCATATTAT CGACAAAACACAGTTAGAAAAATGAC/---CAAAACACAGGTAGAAAAATG-- ACAGTAGCCC 3070 het 3070 ref 57 61 10 3 N/A 0 0 297730 CASAVA_Build 2 88885368 2I ATTTACATGA --/TT TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 56 23 27 7 T 1 3 297731 CASAVA_Build 2 88885619 1I TAGATTTTTT -/C TCAGATTTTG 3070 het 3070 ref 99 40 39 20 C 0 1 297732 CASAVA_Build 2 88886012 1I TTTCAGATGC -/T CACAGGTGTT 3070 het 3070 ref 56 37 10 9 T 0 1 297733 CASAVA_Build 2 88920360 3I TTTCACATTG ---/CAT TATGACTTGG 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 CAT 0 1 297734 CASAVA_Build 2 88948951 5D TTCATTTGCT TCCTA/----- TTTATGATGA 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 TCCTA 1 0 297735 CASAVA_Build 2 88951362 8D CTTCTCTCTC TCTTTCTT/-------- TCTTTCTTCC 1056 het 776 hom 13 3 4 7 TCTT 4 2 297736 CASAVA_Build 2 88967503 2D GTAGAAAGAT TA/-- TATATACACA 2661 het 2661 ref 35 14 14 7 TA 4 3 297737 CASAVA_Build 2 88971785 1I TGGCAGAAGG -/A GGATTATTTT 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 A 0 1 297738 CASAVA_Build 2 88995734 1D CTCTGCAGAC A/- GTAATAATTT 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 A 1 0 297739 CASAVA_Build 2 88996077 1I CCCATGTAGG -/C CCATGCATTG 3070 het 3070 ref 60 26 26 8 C 2 3 297740 CASAVA_Build 2 89004108 6I GAACATATTT ------/TTCTTA TTCTTAACTG 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 TTCTTA 1 2 297741 CASAVA_Build 2 89021118 1D ATTTTCTGTT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 G 2 1 297742 CASAVA_Build 2 89030928 1D GTCCTGATAA G/- ACATGGCCTT 2204 het 2204 ref 55 41 6 9 G 1 0 297743 CASAVA_Build 2 89031292 1I TCATCTTCTG -/T CTCCTGCCTC 2558 het 2558 ref 45 37 6 2 T 0 1 297744 CASAVA_Build 2 89061811 3D ATCCCAGACA GTT/--- GTTGTAGGAA 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 GTT 2 1 297745 CASAVA_Build 2 89068168 1I CTACTTATTA -/T TTAATTTGTG 3070 het 3070 hom 23 12 10 1 T 2 3 297746 CASAVA_Build 2 89078260 1I ATGGCTCATT -/C CCAGCTTCCC 3070 hom 87 het 37 0 29 8 C 2 3 297747 CASAVA_Build 2 89078543 1D GGATGAATTT G/- CATCATGAAT 1595 het 1595 ref 51 41 5 5 G 1 0 297748 CASAVA_Build 2 89078725 1I CACTTAGTAG -/C CCCCTGGGCA 3070 het 3070 ref 50 30 12 8 C 4 5 297749 CASAVA_Build 2 89079260 3D11M2D16M23D14M3D TGAGTGTGGG GAACACAACACCCCCACACAGCAAGTTACATGAAATGGGTTTATTATTTACAGATAAGCAGCAAGGGAACAC/---TACAACACCCC--CACAGCAAGTTACATG-----------------------AAGCAGCAAGGGAA--- CACAAAAGTC 3070 het 3070 ref 49 60 10 21 N/A 0 0 297750 CASAVA_Build 2 89086568 1D ATCAAGACCA T/- TCCTGGCCCA 2798 het 2798 ref 23 12 7 5 T 2 1 297751 CASAVA_Build 2 89095274 1D TATTTTCTTG T/- CAATTTTGGT 2440 het 2440 ref 16 8 5 3 T 1 0 297752 CASAVA_Build 2 89095544 1D AAGTTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 17 10 A 11 10 297753 CASAVA_Build 2 89110092 2D AGGAAGTCTC TT/-- TGCTTTTTCC 2313 het 2313 ref 32 22 7 3 T 3 1 297754 CASAVA_Build 2 89111474 1D CTTATGGCCC T/- TTTTTTTTTG 2188 het 2188 ref 23 9 7 7 T 10 9 297755 CASAVA_Build 2 89112110 2D TGCAAAGCAA AC/-- ACATATATCA 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 AC 2 1 297756 CASAVA_Build 2 89112405 1I GGGCTCCTAC -/G GGGGAACTGG 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 G 4 5 297757 CASAVA_Build 2 89123621 1I TAAGATAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2627 hom 33 8 17 8 A 11 12 297758 CASAVA_Build 2 89127571 1D GTTCCTTTCT A/- AAAAAAATCA 1926 het 1926 ref 20 13 4 3 A 8 7 297759 CASAVA_Build 2 89133429 2D GCTTTAACTC AT/-- GTGCTCTCTC 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 AT 1 0 297760 CASAVA_Build 2 89140022 4D TTTTTACCTC GGTT/---- GGTTAAGTCA 3070 het 3070 ref 31 19 9 5 GGTT 2 1 297761 CASAVA_Build 2 89141781 1I TAGTTATACA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 7 8 297762 CASAVA_Build 2 89168377 1I AAAGCTACAA -/T TTTTTTTTTT 2014 het 2014 ref 21 9 5 7 T 11 12 297763 CASAVA_Build 2 89170523 5D CAATATTGAT GCAAG/----- GCAAGTCCTC 1161 het 1161 ref 28 22 4 2 GCAAG 2 1 297764 CASAVA_Build 2 89180974 2I ATTCCTGCAC --/AA AGTCTGACCA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 3 297765 CASAVA_Build 2 89192463 2D10M2D CAGAGTGAGA CTCTATCTGAAGAA/--CTATCTGAGG-- AAAAAAAAAA 1744 het 1744 ref 33 29 4 5 N/A 0 0 297766 CASAVA_Build 2 89214624 1I AATGAAAGAG -/T TTTTAACATC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 4 5 297767 CASAVA_Build 2 89232155 2D GTGCCCATAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 2777 hom 34 10 15 9 AC 8 7 297768 CASAVA_Build 2 89232337 1D GGGGTTTCAT G/- TGCATTATTT 3070 het 3011 hom 23 10 9 5 G 1 0 297769 CASAVA_Build 2 89235479 1D CGGGCATAAT G/- GGCAGGGGCT 2389 het 2389 ref 26 17 6 4 G 3 2 297770 CASAVA_Build 2 89238460 3D ACTTAACAAA CAT/--- CATGCTTCAG 3070 het 3070 ref 18 10 8 5 CAT 2 1 297771 CASAVA_Build 2 89238545 1I AATCCATGGG -/A ATCTTCTGTC 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 A 1 2 297772 CASAVA_Build 2 89243407 1I ACTCTTGGCT -/G GGCACGGTGG 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 G 2 3 297773 CASAVA_Build 2 89247322 1I TAATAGCCTG -/A AAAAAAAACC 3070 het 2340 hom 23 5 14 4 A 8 9 297774 CASAVA_Build 2 89250411 1I GTTTTGTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 9 10 297775 CASAVA_Build 2 89268433 1D GAAAAGTTAA G/- TAAAAAAAAA 2377 het 2377 ref 22 17 5 0 G 1 0 297776 CASAVA_Build 2 89272594 1I ATAATTTTAA -/T TTTTAGCAGT 1912 het 1912 ref 16 11 4 1 T 4 5 297777 CASAVA_Build 2 89278098 1I TGAAGTAAAC -/A TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 A 0 1 297778 CASAVA_Build 2 89278344 1D TAAGGAGTCT G/- GGGAGTCATG 2203 het 2203 ref 16 7 5 4 G 4 3 297779 CASAVA_Build 2 89293679 1I CCCCTGTATC -/A AAAAAAAATT 2892 het 2892 ref 24 10 6 8 A 8 9 297780 CASAVA_Build 2 89295835 7I AAGACTAATG -------/AAGGTGT AAGGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 AAGGTGT 1 2 297781 CASAVA_Build 2 89301639 5I TCCATCTGAA -----/AACAC AACACAACAA 3070 het 1918 hom 23 7 11 5 AACAC 1 2 297782 CASAVA_Build 2 89313706 1I TTGGTTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 A 10 11 297783 CASAVA_Build 2 89354540 1D GAAGTGCAAT A/- AGGCTAGTCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 2 1 297784 CASAVA_Build 2 89365900 1I TTTGCCTTAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 33 19 7 7 T 8 9 297785 CASAVA_Build 2 89378858 1I AACAAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 38 9 9 T 10 11 297786 CASAVA_Build 2 89380454 1D CAAATTAATA G/- GAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 76 18 41 20 G 2 1 297787 CASAVA_Build 2 89388199 2D CACCATTTAG CA/-- CCCTGGCAGC 3070 het 3070 ref 74 38 20 18 CA 1 0 297788 CASAVA_Build 2 89389256 1I TAGACCTTAT -/C CCCTGTCTCA 3070 het 3070 hom 86 28 53 5 C 3 4 297789 CASAVA_Build 2 89389762 1I GAAACCTTAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 77 51 18 8 T 8 9 297790 CASAVA_Build 2 89392584 1I GAAACTAATG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 68 32 31 5 A 8 9 297791 CASAVA_Build 2 89392759 4I AAGGTAGAAG ----/AAGA AATAATCAAA 3070 hom 211 het 74 0 71 3 AAGA 0 1 297792 CASAVA_Build 2 89393598 1I AAACACCCTC -/A AAAATCTAGA 3070 het 3070 ref 94 53 30 12 A 4 5 297793 CASAVA_Build 2 89397512 1D ATAGGTATGC A/- AGCCTCATTA 3070 het 3070 ref 96 73 16 7 A 2 1 297794 CASAVA_Build 2 89399649 1D CCAGAGTTGC T/- CGTAAGACGT 3070 het 3070 ref 88 64 17 9 T 1 0 297795 CASAVA_Build 2 89401637 1D CTTCCATTAT C/- CAGAGCTATA 3070 het 3070 ref 102 61 34 8 C 2 1 297796 CASAVA_Build 2 89402551 4D ACACAATTTC GTGT/---- GTGTGTGTGT 2537 het 2537 ref 79 38 12 29 GT 10 8 297797 CASAVA_Build 2 89402569 1D GTGTGTGTGT G/- TGGGGGGGGT 3070 het 3070 ref 82 41 18 23 G 1 0 297798 CASAVA_Build 2 89407500 1I ACTCCTACTT -/C CCCAGTGTTC 3070 het 3070 ref 89 47 32 10 C 3 4 297799 CASAVA_Build 2 89408138 8I TGTTCTCAGG --------/GTGTTCGT GTGTTCGTGC 3070 het 3070 ref 89 55 16 18 GTGTTCGT 1 2 297800 CASAVA_Build 2 89562738 1D TAAGATCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 17 6 A 11 10 297801 CASAVA_Build 2 89585016 1I TGCCATTATG -/C CCTACAGGGT 3070 hom 39 het 14 0 13 1 C 2 3 297802 CASAVA_Build 2 89594567 2D58M1D TTTGCTTATA TGTGTTTGTATATATATATGTGTGTGTGTGTGTATACACACAGATGTAACATTCTTATTCT/--TGTTTGTATATATATATGTGTGTGTGTGTGTATACACACAGATGTAACATTCTTATTC- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 22 30 16 3 N/A 0 0 297803 CASAVA_Build 2 89597243 1D GTTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 2521 hom 4 het 11 0 8 3 T 13 12 297804 CASAVA_Build 2 89598352 4I TTTGCTGAAG ----/TTAC TTATCAGCTT 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 TTAC 0 1 297805 CASAVA_Build 2 89612430 1D TGATTGGGAT G/- GGGGGAACAG 1850 het 1850 ref 37 26 4 8 G 6 5 297806 CASAVA_Build 2 89619212 3D AATATAAAAT GAG/--- GAGTAATAAA 3070 het 3070 ref 33 23 7 3 GAG 2 1 297807 CASAVA_Build 2 89645608 1I TTTGGTAGAA -/G GGGGTCAGGG 1362 het 1362 ref 17 10 4 3 G 4 5 297808 CASAVA_Build 2 89662663 1I CAGTCTCCAC -/A GCTCCTGATC 2979 het 2979 ref 44 32 7 5 A 0 1 297809 CASAVA_Build 2 89677738 1D TGTCTTTATT A/- AAAAAAAAAA 766 het 766 ref 34 16 3 15 A 17 16 297810 CASAVA_Build 2 89691475 2I TAAGAAACAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 7 6 A 9 11 297811 CASAVA_Build 2 89701714 1D AATAAGACAA T/- TTTTGATCCC 2736 het 2736 ref 46 37 6 3 T 5 4 297812 CASAVA_Build 2 89764893 1D CAAGATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 11 10 297813 CASAVA_Build 2 89773289 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAATC 2901 het 2901 ref 25 15 6 4 A 8 9 297814 CASAVA_Build 2 89786528 2D ATCCAGAAGT CA/-- CAGCGCCTTG 3070 het 3070 ref 40 23 11 7 CA 2 1 297815 CASAVA_Build 2 89786866 1I GAGCCAGCCA -/C CTCACCACTA 1197 het 1197 ref 56 43 4 9 C 1 2 297816 CASAVA_Build 2 89788959 2D AGATACTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 29 3 10 16 A 16 14 297817 CASAVA_Build 2 89793135 1I TCTTACAATT -/A AAAAAAAAAA 2806 het 2806 ref 29 16 7 6 A 10 11 297818 CASAVA_Build 2 89808608 1I GCTGTATGCA -/C CCAAGGGCTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 2 3 297819 CASAVA_Build 2 89862214 1I GTGAAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 10 11 297820 CASAVA_Build 2 89884548 2I TATATAAAAC --/TA CAAAGGCATT 1863 het 1863 ref 42 34 4 4 TA 0 1 297821 CASAVA_Build 2 89888216 4D CCCTGTGTCT AGAC/---- GTCTTAGGTA 3070 het 3070 ref 44 36 7 5 AGAC 1 0 297822 CASAVA_Build 2 89918749 1D AGGAGACTCA C/- CCAAACAAGA 3005 het 3005 ref 40 32 7 1 C 3 2 297823 CASAVA_Build 2 89919011 1D AAATCAAAAT A/- AAAAAAATGG 3070 het 114 hom 22 1 16 6 A 8 7 297824 CASAVA_Build 2 89920082 2D GAGCTGTGGG TA/-- TATGCGACTA 3070 het 2324 hom 38 7 20 14 TA 2 1 297825 CASAVA_Build 2 89920192 2I TGGGGTGAAA --/AG AGGAAGTGAC 3070 het 3070 ref 53 23 17 13 AG 1 2 297826 CASAVA_Build 2 89924463 1I AGGAGTGCAG -/C CCCAGTGGGC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 3 4 297827 CASAVA_Build 2 89930369 2I CCCCACCCTA --/CC CTGGCCTTGC 3070 hom 35 het 15 0 11 4 C 1 3 297828 CASAVA_Build 2 89931918 2D ATAAGATGAC TT/-- GAGATGAGAT 1853 het 1853 ref 35 22 4 9 T 2 0 297829 CASAVA_Build 2 89932176 5D TGAAATTGAA ATGAG/----- ATGAGATGAG 2089 het 2089 ref 39 31 5 5 ATGAG 3 2 297830 CASAVA_Build 2 89932530 2D33M2I TGGATGAAAT GAGATGAAATGTAATGAGATGAAATGAAATGAAAT--/--GATGAGATGAAATGAGATGAAATGTAATGAGATGA AATGAAATGA 3070 het 3070 ref 59 30 9 23 N/A 0 0 297831 CASAVA_Build 2 89932586 2I ATAATGAAAT --/GA GATGAAATAA 316 het 316 ref 43 15 3 26 GA 1 2 297832 CASAVA_Build 2 89932691 3I ATGAAATGAA ---/ATG ATGAGATGAG 3070 het 3070 hom 78 32 42 4 ATG 1 2 297833 CASAVA_Build 2 89933598 5D ACGAAATGAG ATGAA/----- ATGAATGAGA 2257 het 2257 ref 43 31 5 23 ATGAA 2 1 297834 CASAVA_Build 2 89933726 3I GAGATGAAAT ---/GAG GAGATGAAAC 3070 het 3070 hom 70 27 37 8 GAG 1 2 297835 CASAVA_Build 2 89934081 5D11M3I GAGATGAAAT GAAAAGAAATGATGAA---/-----GAAATGATGAAATG ATGATATTGA 2027 het 2027 ref 92 88 6 8 N/A 0 0 297836 CASAVA_Build 2 89934457 9D ATGAAATGAG ATGAAAAAT/--------- ATGAAAAATG 3070 het 3070 ref 62 42 8 18 ATGAAAAAT 2 1 297837 CASAVA_Build 2 89934596 6I17M13D TAATGGAAAT ------GAGATGAGATGAGATTTGGTGAAATGATGA/GAAATGGAAATGAGATGAGATTT------------- GATGAAATGA 3070 het 3070 ref 63 49 19 9 N/A 0 0 297838 CASAVA_Build 2 89938560 7I TTGTTTATGG -------/TAGACAT TAGACTACAG 3070 het 1978 hom 15 5 8 2 TAGACAT 0 1 297839 CASAVA_Build 2 89940463 1D TTTGCTGAAT A/- AAAAAAGGTT 1439 het 1439 ref 12 8 3 1 A 7 6 297840 CASAVA_Build 2 89941948 3I ATGGTATCTC ---/ATT GTGGTTTTGA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 ATT 0 1 297841 CASAVA_Build 2 89943632 4D CTTGGAGACA AAAC/---- AAACATGACA 3070 het 3070 ref 43 26 8 11 AAAC 2 1 297842 CASAVA_Build 2 89943679 7I AGAATCACAA -------/GTTCCCC AGTGGGAGAC 3070 het 3070 ref 91 59 9 23 GTTCCCC 0 1 297843 CASAVA_Build 2 89943961 6D TGTCTTTGTG TTGTTT/------ TTGTTTTTGT 3070 hom 36 het 23 0 13 10 TTGTTT 4 3 297844 CASAVA_Build 2 89944671 1D TCCCCAGTGA C/- CCCCCCCTCT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 C 8 7 297845 CASAVA_Build 2 89946650 2D GAAAATTCAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 31 0 20 14 AT 9 8 297846 CASAVA_Build 2 89947208 1D CTCCTTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2304 hom 38 13 21 5 T 11 10 297847 CASAVA_Build 2 89947479 2I CAGGGAGGCT --/AA GAGTCCTGCC 3070 het 3070 ref 45 30 11 4 A 0 2 297848 CASAVA_Build 2 89950320 4I GGCTGTTTGC ----/TTAT TTGTTTGGTG 3070 het 3070 ref 59 32 12 15 TTAT 0 1 297849 CASAVA_Build 2 89953769 3I10M4I GTAAAGTTCC ---TTTTTTTTGT----/TTGTTTTTTTTGTTTTG TTGTTTTTTG 3070 het 3070 ref 90 53 25 12 N/A 0 0 297850 CASAVA_Build 2 89956437 1I TGGATGTCTC -/A CCCCCCCCCG 3070 het 2654 hom 59 24 12 23 A 0 1 297851 CASAVA_Build 2 90981064 1I TTACCTCTGA -/T TCTTCCTTAT 3070 het 3070 hom 97 34 53 10 T 1 2 297852 CASAVA_Build 2 90985553 2D CTGAGAAAAC CT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 90 25 27 40 CT 1 0 297853 CASAVA_Build 2 90988013 5I ACTTAATGGT -----/GAAAG AAAGGATGCT 703 het 703 ref 95 83 3 9 GAAAG 0 1 297854 CASAVA_Build 2 90993630 1I TTTTTCCCTC -/T TTTCTGATTT 3070 het 3070 ref 93 44 25 24 T 3 4 297855 CASAVA_Build 2 90996594 6I TATTTTATAG ------/ATAGAT ATAGATATAC 3070 het 3070 ref 57 24 16 17 ATAGAT 1 2 297856 CASAVA_Build 2 90996912 1D AACCCTCTCT G/- AAAAATAAAA 940 het 940 ref 92 79 3 10 G 1 0 297857 CASAVA_Build 2 91009807 4D AAATAAACAT AGAG/---- AGAAATTTAA 3070 het 3070 ref 100 62 27 16 AG 3 1 297858 CASAVA_Build 2 91012497 2I CTAAAAACAT --/AA AGAGAAAAAT 3070 het 224 hom 40 4 36 0 A 1 3 297859 CASAVA_Build 2 91012713 1D AATGTGAAGA T/- GGAATTTGCT 3070 het 3070 ref 96 70 16 12 T 1 0 297860 CASAVA_Build 2 91013162 1D AGGAAAAAAA G/- GTTTACAGAT 1883 het 1883 ref 32 15 4 13 G 2 1 297861 CASAVA_Build 2 91017342 2I ATATTTACTC --/AG TGATATAAAT 1120 het 1120 ref 95 83 4 8 AG 0 1 297862 CASAVA_Build 2 91020857 1I CCATGCCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1471 hom 78 9 49 20 T 10 11 297863 CASAVA_Build 2 91023086 4D AGAGAAAGAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 87 40 18 31 AGAA 5 4 297864 CASAVA_Build 2 91024870 1I CCCCACTTTG -/T CTTTAGGAAT 2200 het 2200 ref 74 55 8 11 T 0 1 297865 CASAVA_Build 2 91025019 1I TCGTTGCTAT -/A AAAGTAAAGT 3070 het 3070 ref 81 56 17 8 A 3 4 297866 CASAVA_Build 2 91026196 1D CTTACCATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 79 42 24 15 A 12 11 297867 CASAVA_Build 2 91027000 3D TGGTAAACTT ACA/--- ACAACAATAA 3070 het 3070 ref 91 50 25 21 ACA 3 2 297868 CASAVA_Build 2 91027016 1D ACAATAAAAA G/- TCTCAAAAAT 3070 het 3070 ref 96 59 13 24 G 1 0 297869 CASAVA_Build 2 91028893 4D AAATTTCACT AAAA/---- AAAAAAAAAA 1420 het 1420 ref 84 54 4 33 A 14 10 297870 CASAVA_Build 2 91030594 3I GAGAAAAAAG ---/GTA GTGACTTAGG 3070 hom 69 het 28 0 24 5 GTA 0 1 297871 CASAVA_Build 2 91030842 1I CAAATTTATG -/A AAAAATATTG 3070 het 3070 hom 57 12 38 7 A 5 6 297872 CASAVA_Build 2 91035265 2I CTTTTTGCGC --/GT CTCGGCTTTT 3070 hom 89 het 37 0 17 20 GT 0 1 297873 CASAVA_Build 2 91038397 1D TAACACAAAT G/- GGGCTCCGGG 1638 het 1638 ref 101 81 4 17 G 4 3 297874 CASAVA_Build 2 91044811 3D TCTCAAAGAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 81 37 41 5 AAT 6 5 297875 CASAVA_Build 2 91048240 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 1474 hom 60 6 47 16 A 7 6 297876 CASAVA_Build 2 91048396 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 88 27 18 44 A 11 12 297877 CASAVA_Build 2 91048443 1D GCTAGAACAA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 86 34 19 34 T 8 7 297878 CASAVA_Build 2 91052785 9D29M2I CAGCCTGGCC AAGATGGTGAAACCCCATCTCAACTAAAAATACAAAAA--/---------AAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAG AAAATTAGCC 3070 het 2238 hom 19 7 13 2 N/A 0 0 297879 CASAVA_Build 2 91053267 1D AAGAAAATTT A/- TTTTTTTATT 2866 het 2866 ref 48 37 7 4 A 1 0 297880 CASAVA_Build 2 91053458 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 809 het 476 hom 6 2 3 1 T 6 7 297881 CASAVA_Build 2 91053944 1I GTTTTACCAC -/G TTGGTCAGAC 3070 het 3070 ref 68 41 17 10 G 0 1 297882 CASAVA_Build 2 91056846 1I21M1I CTAAAAATAC -AAAAAATTAGGTGGACATGGT-/AAAAAAATTAGGTGGACATGGTG GGTGGGTGCC 3070 het 3070 ref 74 63 19 10 N/A 0 0 297883 CASAVA_Build 2 91056926 2I GTGTGAACCC --/GG GGGAGGTGGA 3070 het 3070 ref 58 30 25 3 G 3 5 297884 CASAVA_Build 2 91059609 4I CCTTCCTTCC ----/TTCT TTCTTCCTTT 1498 het 1498 ref 48 31 9 8 TTCT 1 2 297885 CASAVA_Build 2 91059636 8D41M4D TCCTTCCTTC CTTACATTCTTCTTTCTTTCTCTTCTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTTTCTTTCC/--------TTTCTTTCTCTCTCTCCTTCTTTCTTTCTTTCTCTCTTTCT---- TTCCTTCCTT 1861 het 1861 ref 40 39 11 14 N/A 0 0 297886 CASAVA_Build 2 91062580 1D CAGGCTGGTG T/- TTTTTTTCAT 1235 het 1235 ref 49 15 4 32 T 8 7 297887 CASAVA_Build 2 91062808 1I CAAGGTGCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 T 9 10 297888 CASAVA_Build 2 91071868 1D TATTAAATAT A/- AACATGTATT 2151 het 2151 ref 18 10 5 3 A 3 2 297889 CASAVA_Build 2 91076321 1D TATTTTTTAA T/- TAAAAAAAAT 1791 het 1791 ref 34 19 6 9 T 2 1 297890 CASAVA_Build 2 91076600 1I AATTTTGTGT -/G GGGGGGTTGC 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 G 6 7 297891 CASAVA_Build 2 91076887 3I ATTAACAAAT ---/ATA ATAAGATCAA 3070 het 3070 hom 68 28 35 5 ATA 1 2 297892 CASAVA_Build 2 91077097 4I TAATAAAATA ----/TATT TATTTATATC 2884 het 2423 hom 14 6 6 2 TATT 1 2 297893 CASAVA_Build 2 91078168 1I AGTGAGCCAA -/G ATCACACCAC 3070 het 1363 hom 36 5 18 13 G 0 1 297894 CASAVA_Build 2 91078377 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1915 hom 71 18 34 23 A 19 14 297895 CASAVA_Build 2 91078834 5I GGAGACGTCC -----/AGGCT AGGCTGGAAG 2443 het 2443 ref 19 11 6 2 AGGCT 1 2 297896 CASAVA_Build 2 91081836 2D AAAAACAAAC AA/-- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 A 8 6 297897 CASAVA_Build 2 91082728 6I AAAAAAAAAC ------/AAAAAA AACCGTGATT 3070 het 58 hom 18 2 11 5 A 2 8 297898 CASAVA_Build 2 91085291 4D AATCAACCAA CAAG/---- CAAGCAAGCA 912 het 912 ref 31 22 3 9 CAAG 4 3 297899 CASAVA_Build 2 91088101 2I GGCAGGACTC --/TT AGCCTCCCTG 3070 het 3070 ref 46 34 8 4 T 0 2 297900 CASAVA_Build 2 91089246 7D TGCATCTGCA ATGACTC/------- TCAGGGGGCT 955 het 955 ref 92 84 3 7 ATGACTC 1 0 297901 CASAVA_Build 2 91090930 2D GGCCGCATGA GG/-- GGGGGGGGTC 3070 het 2041 hom 49 10 17 25 G 10 8 297902 CASAVA_Build 2 91095091 1D GTTTGGTGCA T/- TTTTTTCCAG 1333 het 1333 ref 13 5 4 6 T 7 6 297903 CASAVA_Build 2 91102322 3D CAATTCAATT TCC/--- TTTCATTATT 3070 het 3070 ref 84 48 18 19 TCC 1 0 297904 CASAVA_Build 2 91102343 5D TTTCATCTCA TTCAT/----- TTCATCTCAT 3070 het 3070 ref 84 46 15 27 TTCAT 2 1 297905 CASAVA_Build 2 91102895 4D TCATTTCAAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2239 hom 47 13 11 23 TTTA 3 2 297906 CASAVA_Build 2 91102937 8D TTCATTTCAT CTCATCAG/-------- TTCATCTCAT 2416 het 2285 hom 34 15 7 17 CTCATCAG 1 0 297907 CASAVA_Build 2 91103002 3D25M3D ATCATTCATC TCATCATTTCATATCATTTTATCTCATCTCA/---TCATTTCATATCATTTTATCTCATC--- TCATTTCATC 2352 het 2352 ref 39 37 5 6 N/A 0 0 297908 CASAVA_Build 2 91103290 18D TTTTATCTCA TCTCATCTCATCATTTCT/------------------ TCTCATCTCA 966 het 966 ref 92 76 6 22 TCTCATCTCATCATTTCT 1 0 297909 CASAVA_Build 2 91103361 5D TCATTTCATT ATTTC/----- ATTTCATCTC 3070 het 3070 ref 88 56 21 11 ATTTC 2 1 297910 CASAVA_Build 2 91103777 5D TCTCATTATT TCATC/----- TCATCTCATC 3070 het 3070 ref 80 52 16 15 TCATC 3 2 297911 CASAVA_Build 2 91104016 6D TCATCTCATC ATTTTG/------ TCATTTCATC 278 het 278 ref 49 29 2 21 ATTTTG 1 0 297912 CASAVA_Build 2 91112611 4I ACCTTCAAAT ----/AAAC AATACATCTT 1416 het 1416 ref 17 12 3 2 AAAC 0 1 297913 CASAVA_Build 2 91113108 1I AACTATTTTG -/A AAAACAGGAG 2350 het 2350 ref 21 11 5 5 A 4 5 297914 CASAVA_Build 2 91114303 2D CTCCGAAGTC TG/-- TGCAGAGGAG 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 TG 2 1 297915 CASAVA_Build 2 91121817 1D TGGTGATGCC T/- CTGAAGTGCT 1980 het 1980 ref 54 40 8 8 T 1 0 297916 CASAVA_Build 2 91122034 1I GGAAAATGAC -/T TGAGTCCACC 1000 het 1000 ref 89 70 3 16 T 1 2 297917 CASAVA_Build 2 91141572 9D TGCTGCTGCA GATGCTGTG/--------- GATGCTGTGG 3070 het 3070 hom 75 17 32 32 GATGCTGTG 2 1 297918 CASAVA_Build 2 91147219 4D AATAAAACAC AAAT/---- AAAGTAAGTA 3070 het 3070 ref 103 58 39 13 AAAT 1 0 297919 CASAVA_Build 2 91151712 1D GAGGCACAAG A/- ATCACTTGAA 3070 het 3070 ref 83 45 31 9 A 2 1 297920 CASAVA_Build 2 91151958 2I ATTTTGAGAC --/AG AGTTTCACTC 3070 hom 138 het 53 0 47 6 AG 1 2 297921 CASAVA_Build 2 91174395 1I TTTGAGTGTA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 99 60 19 20 T 7 8 297922 CASAVA_Build 2 91183620 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 84 39 40 5 A 9 8 297923 CASAVA_Build 2 91185913 1I GATGCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 81 33 10 38 T 12 13 297924 CASAVA_Build 2 91186279 1I GGAAGCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 55 17 25 13 A 10 11 297925 CASAVA_Build 2 91191157 1I TCTTTTTTTT -/C TTTTAGATAG 3070 het 3070 hom 53 22 21 10 C 0 1 297926 CASAVA_Build 2 91199557 5D ACCTGGCTAA CTTTT/----- CTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 66 17 35 14 CTTTT 5 4 297927 CASAVA_Build 2 91201385 2D ATTGTCTTCT TA/-- TATGTTTTCT 3070 het 3070 ref 88 68 12 9 TA 2 1 297928 CASAVA_Build 2 91201742 1D ACTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2832 hom 51 10 27 14 T 11 10 297929 CASAVA_Build 2 91202952 1I CTTTTTAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 93 63 18 12 T 9 10 297930 CASAVA_Build 2 91206783 1I TCACAAGGGC -/A AGACCCCTGG 928 het 928 ref 98 79 4 15 A 1 2 297931 CASAVA_Build 2 91208093 1I ACCAAGCCAT -/A GGGGGGGCGT 3070 het 3070 hom 75 20 36 19 A 0 1 297932 CASAVA_Build 2 91221658 1D TTCAAAAAAA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 75 23 46 8 T 2 1 297933 CASAVA_Build 2 91227115 1I AAATTAAAAA -/G AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 55 19 32 4 G 0 1 297934 CASAVA_Build 2 91227879 8I TCCATCAGAA --------/CAAGAAAG CAAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 79 35 18 26 CAAGAAAG 1 2 297935 CASAVA_Build 2 91228770 1I TTAATAAGAG -/C CCATTTAATA 3070 het 3070 hom 89 34 48 7 C 2 3 297936 CASAVA_Build 2 91229065 1I ATTCACACAT -/C CCCCCACCTC 3070 het 3070 hom 79 31 38 10 C 5 6 297937 CASAVA_Build 2 91230212 2I AGTAGCTTCT --/CA CACAGTCTGT 3070 het 3070 hom 69 31 35 3 CA 2 3 297938 CASAVA_Build 2 91238878 1I ACCCAGACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2781 hom 20 7 8 5 A 9 10 297939 CASAVA_Build 2 91241282 1I AAAGCAACTC -/A AAATAGATTA 3070 het 3070 ref 85 63 14 8 A 3 4 297940 CASAVA_Build 2 91241461 1I GCATAGCAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 84 47 12 25 A 9 10 297941 CASAVA_Build 2 91241591 2I AAAAAAAAAA --/AT CCCCAAATAA 3070 het 3070 ref 97 52 28 17 AT 0 1 297942 CASAVA_Build 2 91241876 1I GAGTTTCCTT -/A AAAAAAAAAT 2076 het 2076 ref 52 16 7 29 A 9 10 297943 CASAVA_Build 2 91242227 1I ATGCAAAATG -/A AAAAAAAAAT 2977 het 2977 ref 91 64 7 20 A 9 10 297944 CASAVA_Build 2 91242251 1I TTTGTCATAC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 93 60 15 18 T 7 8 297945 CASAVA_Build 2 91246645 4D TTCCAATTCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 89 37 29 23 T 18 14 297946 CASAVA_Build 2 91248281 1D GGCCACGCTA T/- TTCTGATTTA 3070 het 3070 ref 101 50 39 14 T 3 2 297947 CASAVA_Build 2 91249758 2D CACTGAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 95 46 24 29 A 12 10 297948 CASAVA_Build 2 91252701 1D AAAAAATACC A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 99 46 46 8 A 7 6 297949 CASAVA_Build 2 91256505 4D ACATACCATG AGCA/---- AGCAACTAAT 2152 het 2152 ref 42 30 5 7 AGCA 2 1 297950 CASAVA_Build 2 91259685 1I TAGCTGGGAC -/T TACAGGCGCC 371 het 371 ref 9 4 2 3 T 1 2 297951 CASAVA_Build 2 91263749 2I AGAAACCTGG --/CT TATTATTTTT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 CT 0 1 297952 CASAVA_Build 2 91267192 1I AATTTGCAAA -/T TAAAATGCCT 3070 het 3070 ref 54 30 17 7 T 1 2 297953 CASAVA_Build 2 91267466 5D ACCAAAACTT AAGAC/----- AAGGTACATA 3070 het 3070 ref 79 65 8 9 AAGAC 1 0 297954 CASAVA_Build 2 91267732 1D CAAACACTTT A/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 91 34 35 23 A 1 0 297955 CASAVA_Build 2 91270010 2I TTTAAATATA --/TG TATATATAAA 3070 het 428 hom 33 2 31 0 TG 0 1 297956 CASAVA_Build 2 91270344 1I AAAGTTGGTC -/A AAACTAATGA 2840 het 2840 ref 96 73 7 16 A 3 4 297957 CASAVA_Build 2 91270613 2I CTCTCCTTAT --/AC ATGTCTCTTT 3070 het 3070 ref 92 69 7 16 AC 0 1 297958 CASAVA_Build 2 91272246 2I TTTTATATTA --/TG TATGAGAGCA 3070 het 3070 hom 81 18 46 17 TG 0 1 297959 CASAVA_Build 2 91275994 4I ATGAAATGGT ----/TTGC TTGAGGCCAC 2686 het 2686 ref 46 36 6 4 TTGC 0 1 297960 CASAVA_Build 2 91277849 1D GTTTCTAATA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 83 54 15 17 T 7 6 297961 CASAVA_Build 2 91280152 1D29M1D TCTATGTAAG TTTTTTTTCTACTTTTTGAGTCAATTTTGAT/-TTTTTTTCTACTTTTTGAGTGAATTTTGA- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 86 94 16 23 N/A 0 0 297962 CASAVA_Build 2 91280326 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 63 44 12 7 A 8 9 297963 CASAVA_Build 2 91280489 2D ACCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2778 het 1537 hom 62 24 7 32 A 20 18 297964 CASAVA_Build 2 91282471 1D AGGTGTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 82 20 35 28 T 15 14 297965 CASAVA_Build 2 91282903 1I TGTGCCTAGA -/G GAGGTAGGTT 3070 het 3070 hom 104 39 54 11 G 1 2 297966 CASAVA_Build 2 91283071 1I CTTTGAACAA -/C CAAATATCTT 3070 het 3070 hom 102 39 54 9 C 1 2 297967 CASAVA_Build 2 91283337 2D ATATTGGTGT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 71 37 16 18 A 11 9 297968 CASAVA_Build 2 91286233 4I AAATGTCACC ----/ATAT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 98 77 12 9 AT 0 2 297969 CASAVA_Build 2 91287360 5I TAATAAGTGA -----/CAAAG CTAGCATCGG 3070 het 3070 hom 94 35 44 15 CAAAG 0 1 297970 CASAVA_Build 2 91288439 10I TTTGCATTTT ----------/GGTCTGAGAA GTAAGTGAGC 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 GGTCTGAGAA 0 1 297971 CASAVA_Build 2 91291754 5I GTAGGTGGTA -----/GTATT CCTATTTTGC 2971 het 2971 ref 47 36 7 4 GTATT 0 1 297972 CASAVA_Build 2 91293273 3D CTTGAGGAGT CAG/--- CAGGAGAAGA 2380 het 2380 ref 45 30 6 10 CAG 2 1 297973 CASAVA_Build 2 91294270 3D GCCAGCAAGA AGC/--- AGAGCAGGAG 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 AGC 1 0 297974 CASAVA_Build 2 91295760 2D GCTGTCTGGC TT/-- TTTCAGCAGA 1140 het 1140 ref 44 30 4 10 T 5 3 297975 CASAVA_Build 2 91297362 4D AAGAAGTGGG TAGA/---- TAGATGCCTG 1286 het 1286 ref 63 58 3 7 TAGA 2 1 297976 CASAVA_Build 2 91298061 1D ATCTTTTTTT C/- CCCTGGCAAT 2013 het 2013 ref 41 32 6 3 C 4 3 297977 CASAVA_Build 2 91300209 2D AGAAATCCGT AA/-- GTTTGTGATT 3070 het 3070 ref 49 35 11 4 A 2 0 297978 CASAVA_Build 2 91303296 2D TCCTCACGCA CT/-- CTGCAAAACT 2304 het 2304 ref 37 26 5 7 CT 2 1 297979 CASAVA_Build 2 91305032 1D TTGCTTCTCA T/- TGGGGTAAAG 3070 het 3070 ref 63 45 15 3 T 2 1 297980 CASAVA_Build 2 91310758 1D TGAGTGGGGG A/- AAGTTGGGAT 3070 het 3070 ref 40 30 9 1 A 3 2 297981 CASAVA_Build 2 91312494 1D TCAGGGGAGT G/- CGGGGTTCTC 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 G 1 0 297982 CASAVA_Build 2 91313589 1I AAAGAAAGTT -/G TTTTTTTTTA 2282 het 2282 ref 36 26 8 2 G 0 1 297983 CASAVA_Build 2 91316532 1D ACAATCCAGT T/- TTTTTTGGCC 2628 het 2628 ref 36 27 6 3 T 8 7 297984 CASAVA_Build 2 91328040 1D GAGCCAAACA G/- GGCCCCTTTT 3070 het 3070 ref 55 41 10 4 G 3 2 297985 CASAVA_Build 2 91330041 1D AATATTTTTC A/- TTTCTGGGTG 3070 het 3070 ref 66 49 13 4 A 1 0 297986 CASAVA_Build 2 91338225 35D GTCCCTAAGC CAAATGTACATAGGATGAAATTCTAAGGAGCTCAG/----------------------------------- CAAAGGACTC 3070 het 3070 ref 56 72 10 8 CAAATGTACATAGGATGAAATTCTAAGGAGCTCAG 1 0 297987 CASAVA_Build 2 91338909 1I AAATTTATAG -/A AACAAAATAG 2221 het 2221 ref 57 43 5 9 A 2 3 297988 CASAVA_Build 2 91339404 4I TAGTGCAGTC ----/AAAG AAAGAGCAAT 3070 het 3070 hom 57 19 29 9 AAAG 1 2 297989 CASAVA_Build 2 91339974 1I GATGGAAGAG -/A AAAAAAAGAA 2753 het 2753 ref 75 58 8 9 A 7 8 297990 CASAVA_Build 2 91341129 1I GAAATGCAAA -/C CTCCCCAACA 3070 het 3070 ref 46 23 13 10 C 1 2 297991 CASAVA_Build 2 91350938 8D27M1D AGAATAAGAG GAAAGAAAGAAAGAAGGAAAGAAGGAAGGAAGGAGA/--------GGAAGAAGGAAAGAAGGAAGGAAGGAG- AAAAAAGAAA 1500 het 1500 ref 39 24 5 25 N/A 0 0 297992 CASAVA_Build 2 91358646 1I CTAAACGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 18 8 10 0 T 9 10 297993 CASAVA_Build 2 91375972 2D43M1I GCTGGGTAAC TGAGTGAGACCCTGTGATTTTTCGCCTACATTTTACAGAATTTTT-/--AGAGAGACCCTGTGATTTTTCCCCTACATTTTACAGAATTTTTG TTTTGCCTCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 N/A 0 0 297994 CASAVA_Build 2 91393931 2D TTGAATACTT AC/-- AGTTATATCT 3070 het 3070 ref 45 22 15 9 AC 1 0 297995 CASAVA_Build 2 91395163 1I CACCAGCCCT -/C CCTGTGGTAG 3070 het 3070 ref 53 24 17 12 C 2 3 297996 CASAVA_Build 2 91397896 4I CGCCTCAAAA ----/ACAG ACAGATAGAT 3070 het 3070 ref 39 23 8 8 ACAG 1 2 297997 CASAVA_Build 2 91398296 4D GATAGATCAA TGAT/---- TGATTATAGA 3070 het 3070 ref 52 24 25 10 TGAT 2 1 297998 CASAVA_Build 2 91402891 1D AGGCCAACCA G/- CACAAATATA 3070 het 3070 ref 34 25 7 3 G 1 0 297999 CASAVA_Build 2 91405549 2D AAAACAGAAA AC/-- AAAAACAATG 3070 het 3070 ref 73 33 14 28 AC 1 0 298000 CASAVA_Build 2 91408856 1D GGGAACCCTG A/- CCCCTAACCC 3070 het 3070 hom 38 17 17 6 A 1 0 298001 CASAVA_Build 2 91410776 1D TTATAGCAAG A/- AAAAATTATA 3070 het 3070 hom 65 21 40 4 A 6 5 298002 CASAVA_Build 2 91411712 5D TTGTGTTTTC ACAGA/----- GATAGACTCT 3070 het 3070 ref 54 34 19 4 ACAGA 1 0 298003 CASAVA_Build 2 91411869 2I TGTGTCTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 47 27 18 2 TG 5 6 298004 CASAVA_Build 2 91413541 1I TGGTAGTAAG -/C CTGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 C 1 2 298005 CASAVA_Build 2 91413713 1D GTGGTAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 85 45 31 10 A 10 9 298006 CASAVA_Build 2 91414509 2I83M2D49M1D ACCGGGCACC --TGGCACACGCGTAGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGGCACAAGAATCTCTTGAGTTGAGGAGGCCAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGAGTGAAACCCTATCTTA/AGTGGCGCACCCGTAGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGGCACAAGAAACTCTTGAGTTGAGGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCA--ATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGAGTGAAACCCTATCTT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 32 11 19 N/A 0 0 298007 CASAVA_Build 2 91417715 1D99M3D CAAAAAAACC AAAACTATAGACCAATCTGACTTATACATATGAATGAATATTCTAAATAAAAACCCAGCAATTTTATCAATAATTGCAACAACAAAAAAGAGTAATACAGGCC/-AATCTATAGACCAATCTGACTTATACATATGAATGAATGTTCTAAATAAAAACCCAGCAATTTTATCAATAATTGCAACAACAAAAAAAAGTAATACAG--- TATGCAAAGA 3070 het 3070 ref 33 45 13 24 N/A 0 0 298008 CASAVA_Build 2 91418207 1D AAAACTTTTT G/- TGGATATGAT 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 G 1 0 298009 CASAVA_Build 2 91419349 1D ACAAAAAAAG A/- AAAGAAAACT 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 A 4 3 298010 CASAVA_Build 2 91419408 2D TAAATTAAAC AT/-- GTGTACACAT 3070 het 3070 ref 47 27 15 6 AT 1 0 298011 CASAVA_Build 2 91420351 4I TTAGTAATTG ----/AATA AATAAACATA 3070 het 3070 hom 72 27 38 7 AATA 1 2 298012 CASAVA_Build 2 91421661 1I CAGAAAGCAA -/G GGGGGGATGT 3070 het 3070 ref 76 31 33 12 G 6 7 298013 CASAVA_Build 2 91423056 15I AATGGAATAG ---------------/AATAGAGAGCCTCAA AATACATCCA 2768 het 2768 ref 43 34 6 3 AATAGAGAGCCTCAA 0 1 298014 CASAVA_Build 2 91423708 2I AAAAGATAAC --/AT GTGTTGGCGA 3070 het 3070 hom 74 32 37 5 AT 0 1 298015 CASAVA_Build 2 91425745 1D CTAGATCAGT A/- ACCATTATAT 3070 het 3070 ref 60 33 16 11 A 2 1 298016 CASAVA_Build 2 91426175 14D GTTTCCCCAG CAAAAGAAACCAAC/-------------- CAAAATCCTG 3070 het 3070 ref 58 47 17 4 CAAAAGAAACCAAC 1 0 298017 CASAVA_Build 2 91427028 5I TTAAGCTAAG -----/AAAAT ACATGGAGAA 3070 het 3070 ref 60 39 13 8 AAAAT 0 1 298018 CASAVA_Build 2 91429384 4D AAAAAAACTT AAAA/---- AAAAAAAAAG 3070 het 2095 hom 32 8 10 15 A 13 9 298019 CASAVA_Build 2 91430155 1D AGGAAAAAGG A/- AAAATAACTC 2422 het 2422 ref 35 24 8 3 A 5 4 298020 CASAVA_Build 2 91430575 2D TAGCAAAGTC TT/-- TGTTGGATTA 2682 het 2682 ref 57 47 6 5 T 3 1 298021 CASAVA_Build 2 91432037 1I AATACTATGG -/A AAAAAATTTG 2027 het 2027 ref 35 21 6 8 A 6 7 298022 CASAVA_Build 2 91433622 1I TAAAACAGTA -/G CTATTTTATC 3070 het 3070 ref 46 27 10 10 G 0 1 298023 CASAVA_Build 2 91434320 3D TCTATTACTT AAC/--- ATATTATTTA 1874 het 1874 ref 40 30 4 6 AAC 1 0 298024 CASAVA_Build 2 91434611 1I TTTCCTAGGG -/T ATTTACAGAT 1198 het 1198 ref 29 22 3 4 T 0 1 298025 CASAVA_Build 2 91435139 5D28M1I ATGGCTCTGT TAAAATAAACAAAATCTAGTACTAGACTATTAG-/-----TAAACAAAATCTGGTACTAGACTATTAGA AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 59 44 17 9 N/A 0 0 298026 CASAVA_Build 2 91436004 7I GTAACAACAT -------/AATGGTA TAAACATTAC 3070 het 3070 hom 62 24 34 4 AATGGTA 0 1 298027 CASAVA_Build 2 91437307 3I CTTTTCTAAC ---/ATG ATAATAGAGG 3070 het 3070 ref 40 30 8 2 ATG 0 1 298028 CASAVA_Build 2 91438922 4I TTTGTTTTTG ----/TTTA TTTACTTATT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 TTTA 1 2 298029 CASAVA_Build 2 91439431 1D ATTTCTAAAA C/- TTTTAAAAGC 2998 het 2998 ref 40 31 8 1 C 1 0 298030 CASAVA_Build 2 91439497 1I CAATGATAAT -/A AAAAATGAAT 3070 het 3070 ref 48 32 8 8 A 5 6 298031 CASAVA_Build 2 91439607 1I ACTAATAGAC -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 T 7 8 298032 CASAVA_Build 2 91439775 19D TGGGATTACA GGTGCGCACTACCACACCT/------------------- GGCTAATTTT 3070 het 3070 ref 24 17 10 2 GGTGCGCACTACCACACCT 1 0 298033 CASAVA_Build 2 91440241 3D TCTTACCAAC AAT/--- ATTTGATTCA 1392 het 1392 ref 31 24 3 4 AAT 1 0 298034 CASAVA_Build 2 91440421 1D CTCCCTCACC T/- TTTTTTTTTC 1191 het 1191 ref 52 39 7 7 T 10 9 298035 CASAVA_Build 2 91441382 2D CTGGGTTTAA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 67 48 8 13 T 11 9 298036 CASAVA_Build 2 91441610 1D TTTACCATTT A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 56 25 24 7 A 7 6 298037 CASAVA_Build 2 91441786 1I AGGAACAGCC -/A AAAAATACTT 3070 het 3070 hom 51 22 25 4 A 5 6 298038 CASAVA_Build 2 91441877 7D TAGAAATAGA GAAGTAG/------- GATTAAATAG 1181 het 1181 ref 70 65 3 6 GAAGTAG 1 0 298039 CASAVA_Build 2 91442170 2D40M1I GTGTGTGTGT ACATATATATATATAGTTTGTAAGATACACATATGTATATAT-/--ATATATATATATAGTTTGTAAGATACACATATGTATATATG TATTACCTTA 3070 het 3070 ref 51 32 14 17 N/A 0 0 298040 CASAVA_Build 2 91442516 1D TATACATAAC A/- AAGGATCAGT 1351 het 1351 ref 41 32 3 6 A 3 2 298041 CASAVA_Build 2 91443893 1D TGATATAAGT A/- ATATAATAAT 2969 het 2969 ref 41 31 8 2 A 2 1 298042 CASAVA_Build 2 91445259 1D GGCACACAAT A/- AAAAAAAAAC 1133 het 1133 ref 41 24 3 14 A 10 9 298043 CASAVA_Build 2 91446887 1D TGGAACGGAA T/- AGTTTTATGA 3070 het 3070 ref 103 50 36 21 T 1 0 298044 CASAVA_Build 2 91449269 2D CAGAGATAAG GC/-- CTTGCTGGTC 1582 het 1582 ref 51 37 4 10 GC 1 0 298045 CASAVA_Build 2 91449493 3D AGGAGGTGTA AAT/--- AAGTAGAGTT 1339 het 1339 ref 35 27 3 5 AAT 1 0 298046 CASAVA_Build 2 91450212 3I ATAACCAGAC ---/AGA AGATCAACTG 1858 het 1858 ref 50 41 5 4 AGA 1 2 298047 CASAVA_Build 2 91450333 1I CATACCAAGA -/C TTTTCCAGGA 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 C 0 1 298048 CASAVA_Build 2 91450381 1I TTTTAAAAAA -/T TTAAGAAAAC 3070 het 3070 ref 52 24 11 17 T 2 3 298049 CASAVA_Build 2 91451854 1D AATATTTAAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 50 25 17 9 A 8 7 298050 CASAVA_Build 2 91456423 1I CCAGGGAAAT -/A AAAACTACCA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 4 5 298051 CASAVA_Build 2 91462040 3D TTCCCAACAA GTT/--- GTTCATCTCC 3070 het 3070 ref 88 58 20 13 GTT 2 1 298052 CASAVA_Build 2 91462315 2I GAACTAATAG --/GA AATATATATA 1305 het 1305 ref 45 16 5 25 GA 0 1 298053 CASAVA_Build 2 91462368 1D ACACCATCAC A/- AAGTGAAGTC 2687 het 2687 ref 58 29 6 24 A 3 2 298054 CASAVA_Build 2 91464228 1D ATGCCCGGCT A/- AGTTTTGTAT 961 het 961 ref 17 12 3 2 A 2 1 298055 CASAVA_Build 2 91465170 2D ACTATAAAAC TA/-- TATATATTAC 3070 het 3070 ref 41 28 8 5 TA 4 3 298056 CASAVA_Build 2 91465663 1D TGGAATGAGC T/- TTCTATGGAG 3070 het 3070 ref 94 59 25 11 T 3 2 298057 CASAVA_Build 2 91465982 1I AAACTGAAAG -/A AAGAATGAAA 3070 het 3070 ref 70 35 26 9 A 2 3 298058 CASAVA_Build 2 91466282 3D CAAAAGGTGA ATC/--- ATCAATGGAC 3070 het 3070 ref 68 53 11 5 ATC 2 1 298059 CASAVA_Build 2 91466374 1D CAAAATGTGT G/- TAAATAAAAT 1361 het 1361 ref 43 28 3 12 G 1 0 298060 CASAVA_Build 2 91467781 2I ATTAATCAGA --/CT TACACCAATC 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 CT 0 1 298061 CASAVA_Build 2 91467947 1D AGTGACATAT A/- AAAAGACAAA 3070 het 3070 ref 63 35 17 12 A 5 4 298062 CASAVA_Build 2 91468422 1I TCTGAACAAC -/A AAAAAAAAGA 2455 het 2455 ref 56 40 7 9 A 8 9 298063 CASAVA_Build 2 91468617 2I TCCCCCTTTT --/AC TCTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 100 73 19 8 AC 0 1 298064 CASAVA_Build 2 91468703 2D TCTTAGAGTG AA/-- AAAAAAATCA 2524 het 2524 ref 52 32 7 15 A 9 7 298065 CASAVA_Build 2 91470748 4D TTCAGCATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2649 het 2649 ref 46 23 7 16 T 15 11 298066 CASAVA_Build 2 91472047 3I ATAACCACAG ---/AAT AATAGTGGGA 3070 het 3070 hom 87 38 43 6 AAT 1 2 298067 CASAVA_Build 2 91472181 3D ACACTCCACC CAA/--- CAACAACAGA 3070 het 3070 ref 53 29 21 3 CAA 3 2 298068 CASAVA_Build 2 91480181 1D TCAAAAAATT A/- AAAAAAAATA 2107 het 2107 ref 36 29 5 3 A 9 8 298069 CASAVA_Build 2 91481028 1D GAAAAAAAAT A/- AAAAAGACAT 3070 het 3070 ref 82 47 15 20 A 6 5 298070 CASAVA_Build 2 91481716 2D TGTTTCTCAA AT/-- ATATATATAT 2383 het 2383 ref 35 21 7 8 AT 8 7 298071 CASAVA_Build 2 91482423 2D AATATTATTG TA/-- TATTTTAATT 3070 het 3070 hom 54 24 26 4 TA 2 1 298072 CASAVA_Build 2 91482626 1D TGCATAATTC A/- TTTTAAAAGG 3070 het 3070 ref 61 46 12 4 A 1 0 298073 CASAVA_Build 2 91482715 2I ATTTGTGCTC --/TT GAGCTATTTC 3070 het 3070 ref 46 30 13 3 T 0 2 298074 CASAVA_Build 2 91482931 1I TAATCACCCT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 60 29 27 4 A 6 7 298075 CASAVA_Build 2 91483561 3D TATGTCTCTC ATT/--- ATTTTGGTAA 1343 het 1343 ref 33 28 3 2 ATT 2 1 298076 CASAVA_Build 2 91484670 1D AGTGATGGTT A/- AAAATCAAAG 2811 het 2811 ref 31 20 6 5 A 5 4 298077 CASAVA_Build 2 91484950 1D AACTTAATCC A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 61 41 14 7 A 7 6 298078 CASAVA_Build 2 91485207 4I GTGAATCATT ----/CTTC CATAAAGACA 3070 het 3070 ref 72 34 28 10 CTTC 0 1 298079 CASAVA_Build 2 91489488 4D CTAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 52 25 14 14 AG 9 7 298080 CASAVA_Build 2 91490845 4D CTTTTAAGAT AAAA/---- GGATATGACA 3070 het 3070 ref 39 26 8 6 A 4 0 298081 CASAVA_Build 2 91492018 4D CACTTATTTG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 72 40 27 9 TTTA 4 3 298082 CASAVA_Build 2 91494226 2I TGTTATAAAC --/TT AAAATACAAA 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 T 0 2 298083 CASAVA_Build 2 91494304 1I GTATAGCTTT -/A AAAACAGAAA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 4 5 298084 CASAVA_Build 2 91495525 1I AGAACTAAGA -/G GGGGGCTTAG 3070 het 3070 ref 66 37 21 8 G 5 6 298085 CASAVA_Build 2 91504528 1I GAGACACAAC -/A CAAAAAAGAG 1945 het 1945 ref 11 6 4 1 A 0 1 298086 CASAVA_Build 2 91505714 1I AAAAGTCATT -/A TGTAAAGACA 3070 het 3070 ref 52 39 10 3 A 0 1 298087 CASAVA_Build 2 91510298 1I ACTCACAGCT -/C CACATGGCTG 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 C 1 2 298088 CASAVA_Build 2 91510562 1I ACATAAAGCC -/A AACTGTATCA 3070 het 3070 ref 68 45 20 3 A 2 3 298089 CASAVA_Build 2 91519878 1D GGCTCAGGCA G/- GGGCATGTGG 2919 het 2919 ref 55 39 8 8 G 4 3 298090 CASAVA_Build 2 91523879 1I GGGAGCAGAG -/T CCCTTTCATT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 0 1 298091 CASAVA_Build 2 91530034 1I ACATATGGTC -/T TTTGTGATTG 3070 het 3070 ref 54 34 14 6 T 3 4 298092 CASAVA_Build 2 91539547 8D TTTTCTTTAT TAAATAAA/-------- TAAATAAATA 1298 het 1298 ref 13 10 3 1 TAAA 5 3 298093 CASAVA_Build 2 91540742 7I ATGATGAAAT -------/AAATGGA AATGAAATGG 3070 het 3070 ref 65 49 7 9 AAATGGA 0 1 298094 CASAVA_Build 2 91541926 9D GATGTAATGA AATGAAATG/--------- AATGAGATGA 216 het 216 ref 82 39 2 43 AATGAAATG 1 0 298095 CASAVA_Build 2 91541990 3D ATGAGATGAA ATG/--- ATGAGATAAA 3070 het 3070 ref 79 45 8 27 ATG 2 1 298096 CASAVA_Build 2 91542201 5D82M3D ATGAGATGAG ATGAAATGAAATGAAATAAAGTGAAATGAAATGAAATAATGAAACTGAAATGAGGTGAGATGAAATGAGATAAAATGATGAGATGAAATG/-----ATGAAATGAAATAAAGTGAAATGAAATGAAATAATGAAACTGAAATGAGGTGAGATGGAATGAGATAAAATGATGAGATGAA--- ATGAGAAGAA 3070 het 3070 ref 73 70 34 27 N/A 0 0 298097 CASAVA_Build 2 91542371 2D TGATGAGATG AA/-- AAATGATGAG 1032 het 1032 ref 56 38 3 15 A 5 3 298098 CASAVA_Build 2 91542488 1I GAGATGAGAT -/G AAATGATGAG 2297 het 2297 ref 56 42 6 8 G 0 1 298099 CASAVA_Build 2 91542756 5D15M3D24M2I AAATGATGAG ATGAAATGAATTGAGATGAAGTGATGAGATGAAAAATGATATGAAAA--/-----ATGAATTGAGATGAA---ATGAGATGAAAAATGATATCAAAAAT ATGAGATGAA 2555 het 2555 ref 61 72 7 12 N/A 0 0 298100 CASAVA_Build 2 91545669 1D GATATTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 T 11 10 298101 CASAVA_Build 2 91549393 6D TCTATTTCTT TTTTTA/------ TTTTTTTATA 1689 het 1689 ref 44 10 5 29 TTTTTA 1 0 298102 CASAVA_Build 2 91551569 6I GAAAAAAGGT ------/CAGAAG CAGAGTGTTG 3070 het 3070 hom 64 20 34 10 CAGAAG 0 1 298103 CASAVA_Build 2 91553963 2I CAATACAATG --/AT AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 102 38 53 13 AT 0 1 298104 CASAVA_Build 2 91558564 1I GAGCAGGCTC -/T TTGCCCACAT 3070 het 3070 ref 55 33 13 9 T 2 3 298105 CASAVA_Build 2 91559018 1D TGCACATAAC A/- AAAATGAAAA 3070 het 3070 ref 59 41 12 6 A 5 4 298106 CASAVA_Build 2 91559558 1I42M1D GTTTACAGAG -TTTTTGAGTTGTTAGTGTTCCCTAAATTGTATGGTCTTCAGAG/TTTTTTGAGGTGTTAGTGTTCCCTAAATTGTATGGTCTTCAGA- GTTTACCCTC 1735 het 1735 ref 50 69 4 5 N/A 0 0 298107 CASAVA_Build 2 91559946 1D11M3D AAGCCACCAC TGTTTTCTAATGTTA/-GTTTTCTAATG--- TTTTCTTGTT 3070 het 3070 ref 64 48 9 13 N/A 0 0 298108 CASAVA_Build 2 91561472 1D CCTGGGCCCT G/- GGGGCAAAGG 1230 het 1230 ref 51 44 3 4 G 5 4 298109 CASAVA_Build 2 91561818 1D AAATAAGAGA G/- AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 78 34 12 33 G 1 0 298110 CASAVA_Build 2 91562135 1D ATAGTAGCAA C/- AAAATAAAGA 1819 het 1819 ref 60 48 4 10 C 1 0 298111 CASAVA_Build 2 91562481 2D TTAAAAAAAA AT/-- TATTCTTACT 2993 het 2993 ref 37 25 8 4 AT 1 0 298112 CASAVA_Build 2 91562663 5D ATCAATCATT AAAAA/----- ATAAAATAAA 3070 het 3070 ref 43 31 9 3 A 6 1 298113 CASAVA_Build 2 91563053 4D ACAGTATCAA ACAC/---- AAACAAACAA 1366 het 1366 ref 30 24 3 5 AC 2 0 298114 CASAVA_Build 2 91563584 1D ACACTTAAAA T/- TTTATTTACC 3070 het 3070 ref 63 46 9 9 T 4 3 298115 CASAVA_Build 2 91563606 12D TTTAAAAAGG AAATTAAAAATA/------------ AAATTAAAAA 1907 het 1907 ref 55 37 6 13 AAATTAAAAATA 1 0 298116 CASAVA_Build 2 91563985 12D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAG/------------ AAAGAAAAAC 1376 het 1376 ref 18 15 3 4 AAAAAAAAAAAG 1 0 298117 CASAVA_Build 2 91602485 5D GTTTTTTTTT TTTTA/----- ATGTGGTAGG 1561 het 1009 hom 13 4 4 5 TTTTA 1 0 298118 CASAVA_Build 2 91605332 8D CCTTCTTTCC TTCTTTCT/-------- TTCTTTCCTC 1937 hom 21 het 28 0 7 21 TTCT 3 1 298119 CASAVA_Build 2 91612075 3D AGGTGGATAT TTG/--- TTGTTTTTTT 880 het 880 ref 56 26 3 31 TTG 2 1 298120 CASAVA_Build 2 91615909 4D33M1I TAATATAAAG AATTAATTAAGGTAGCACCTACTTTTCAAATAGCGCA-/----AACTAAGGTAGCAGCTAATTTTCAAATAGCGCAT TTTTTTCACA 2202 het 2202 ref 69 62 5 20 N/A 0 0 298121 CASAVA_Build 2 91617382 1I AAAGCTTCTA -/T TTTTTTTCTA 1885 het 1885 ref 38 31 5 2 T 7 8 298122 CASAVA_Build 2 91619287 1I ATACATTTTT -/A AAAAAATAGA 1607 het 1607 ref 38 32 4 2 A 6 7 298123 CASAVA_Build 2 91619723 1D GTCCACTCAG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 53 32 14 8 T 9 8 298124 CASAVA_Build 2 91621184 2I AAGATTGGGA --/AC ACAGAGTCTC 3070 het 3070 ref 56 36 11 9 AC 1 2 298125 CASAVA_Build 2 91621398 1I GAAAATGTAG -/T TAGGGATTGG 3070 het 3070 ref 83 61 10 12 T 1 2 298126 CASAVA_Build 2 91621802 1I CCCTCAACCA -/C CGCTGCCCAG 3070 het 3070 ref 43 27 11 5 C 1 2 298127 CASAVA_Build 2 91622128 1D GCTGGTTAGC A/- AAGTGGTCTG 3070 het 3070 ref 83 40 22 22 A 3 2 298128 CASAVA_Build 2 91622957 1D CTCTCAAAAA T/- AAAAAAAGTA 777 het 777 ref 57 36 2 23 T 1 0 298129 CASAVA_Build 2 91623186 1I ATATCAATGC -/T TTTTTAAAAG 2775 het 2775 ref 81 64 6 11 T 5 6 298130 CASAVA_Build 2 91623832 1D TAGTAACAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 51 29 10 14 T 9 8 298131 CASAVA_Build 2 91623845 5D TTTTTTAACA TAGAG/----- TAATTTGGTC 3070 het 3070 ref 53 28 8 21 TAGAG 1 0 298132 CASAVA_Build 2 91626980 1I TCTTTCTTAA -/T TTTTTTTTAA 2671 het 2671 ref 46 28 6 12 T 8 9 298133 CASAVA_Build 2 91629652 2D10M1D TAACCACAAA AGAAAAATCAGCT/--AAAAATCAGC- TTCTTGAGTT 3070 het 3070 ref 100 32 11 61 N/A 0 0 298134 CASAVA_Build 2 91630703 3I TTATCTTTCC ---/TAA TAATGAATTG 3070 het 3070 ref 53 30 21 2 TAA 1 2 298135 CASAVA_Build 2 91631220 1I TTTTTCTAAT -/A TTTGGTTCAA 3070 het 3070 ref 84 57 14 13 A 0 1 298136 CASAVA_Build 2 91636937 1I TCAGAAACTT -/C GTTGTGATGT 3070 het 3070 ref 82 41 13 28 C 0 1 298137 CASAVA_Build 2 91644275 1I TAAACAGACG -/C ATTCTCAGAA 3070 het 3070 hom 65 17 41 7 C 0 1 298138 CASAVA_Build 2 91644951 2I TGAAATCGAG --/AC ACAAGCATTC 1965 het 1965 ref 46 28 10 8 AC 1 2 298139 CASAVA_Build 2 91646800 1I14M1I CGGTGAAGAA -GGTATATTTTCGCA-/GGGTATATCCTCGCAT TAAAAACTAG 3070 het 3070 ref 44 30 8 14 N/A 0 0 298140 CASAVA_Build 2 91649357 1I CGTTGGAAAC -/G GGAATATGTC 3070 het 3070 ref 75 36 27 12 G 2 3 298141 CASAVA_Build 2 91650429 1D AAACGTCTTT G/- GGGATGTTAG 3070 het 129 hom 50 4 34 14 G 4 3 298142 CASAVA_Build 2 91650937 1I TCTCCAAAAC -/T TGCTTGGAAT 3070 het 3070 ref 63 30 25 9 T 1 2 298143 CASAVA_Build 2 91658051 1I CGGTGAAAAA -/G GGTATATCTT 3070 het 3070 ref 103 65 21 17 G 2 3 298144 CASAVA_Build 2 91658826 1D TCTTTCTTTT G/- ATAGAGCAGT 3070 het 3070 ref 62 48 8 7 G 1 0 298145 CASAVA_Build 2 91661287 7D1M3I GAAACGGGAT TGTCTTCA---/-------AAGG TATAAACTCT 1646 het 1646 ref 52 53 4 3 N/A 0 0 298146 CASAVA_Build 2 91664130 1I TGAAACACTC -/T TTTTGTGGAA 1788 het 1788 ref 72 56 4 12 T 4 5 298147 CASAVA_Build 2 91672152 8D TAAAATCTGC AAAAATAT/-------- ATTTGGATAG 3070 het 3070 ref 71 54 11 28 AAAAATAT 1 0 298148 CASAVA_Build 2 91681282 2I TTCTTTTGAT --/AG AGAGCAGTTT 2751 het 2751 ref 96 68 6 23 AG 2 3 298149 CASAVA_Build 2 91682043 4D GAAACGGGAT TGTC/---- TTCATATAAA 233 het 233 ref 88 85 3 0 TGTC 1 0 298150 CASAVA_Build 2 94718669 1D CATCAGACAT A/- AAAGATTTTG 1349 het 1349 ref 46 38 3 5 A 4 3 298151 CASAVA_Build 2 94723551 4I AATAATAATG ----/TCTT TCAAGCAGAA 2904 het 2904 ref 28 21 6 1 TCTT 0 1 298152 CASAVA_Build 2 94735961 1D GATTTCAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 10 9 298153 CASAVA_Build 2 94744941 1I TATATACTGT -/A AACATTTTGA 2159 het 2159 ref 38 27 5 6 A 2 3 298154 CASAVA_Build 2 94756991 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2250 het 2044 hom 18 5 7 6 T 11 12 298155 CASAVA_Build 2 94762277 4D CTTCTTTAAA TTTT/---- TTTTTTTTTG 1824 het 1824 ref 29 19 4 6 T 13 9 298156 CASAVA_Build 2 94774808 7I GCAGCCTTCC -------/GTAGTGT GCAGTGTATT 1377 het 1377 ref 22 17 3 2 GTAGTGT 0 1 298157 CASAVA_Build 2 94775781 1I AAAATTATTA -/T TTTTTTTGTT 2605 het 2605 ref 18 10 6 2 T 7 8 298158 CASAVA_Build 2 94779894 1I ACTCCGAGGG -/A AAGATTGGGG 828 het 828 ref 35 30 2 4 A 2 3 298159 CASAVA_Build 2 94801910 1D AGCTGCAAAA G/- TCATCAAGAG 1623 het 1623 ref 25 19 5 2 G 1 0 298160 CASAVA_Build 2 94832056 2I GTCCCATCTC --/TA TGTTATGCCA 3070 het 3070 ref 42 29 11 2 TA 0 1 298161 CASAVA_Build 2 94835798 3D AGATAAAATA ATT/--- TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 69 48 8 15 ATT 1 0 298162 CASAVA_Build 2 94836943 1D CTCAGTAAAT A/- AAATAGGAAA 3070 het 3070 ref 61 25 21 15 A 4 3 298163 CASAVA_Build 2 94837155 3I GTAAATTTCC ---/ATG ATATGTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 ATG 0 1 298164 CASAVA_Build 2 94837762 1I GCTGACTCCC -/A GCCCCATGAC 3070 het 3070 hom 59 13 42 4 A 0 1 298165 CASAVA_Build 2 94837870 2I67M4I ATTTGTATCT --GTTTTAGTCAAGTAAAATTAGCGTTAAATCAATTAATAAATGGTTAACATGTTCTACAATATGAAAA----/AGGTTTTAGTCAAGTAAAATTAGAGTTAAATCAATTAATAAGTGGTTAACATGTTCTACAATATGAAAACCAT CCATACCCAG 3070 het 3070 ref 48 53 26 13 N/A 0 0 298166 CASAVA_Build 2 94838710 1I TCAGAAATAT -/A TTTTTCATCA 3070 het 3070 ref 61 31 19 11 A 0 1 298167 CASAVA_Build 2 94841474 2I CCATAAAAAA --/AT AAAAGCCATG 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 AT 0 1 298168 CASAVA_Build 2 94842586 1I AAAAATACTG -/T TTTAACAGGA 2860 het 2860 ref 44 36 7 1 T 3 4 298169 CASAVA_Build 2 94842813 1I CATGTTATAT -/A AATTCAACTA 2243 het 2243 ref 40 32 5 4 A 2 3 298170 CASAVA_Build 2 94843928 4I TTGAAAATAC ----/TCAT TTCAGGTGTA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TCAT 0 1 298171 CASAVA_Build 2 94844106 4I TCTCTCACCT ----/CTAC CTTTTATTTC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 CTAC 0 1 298172 CASAVA_Build 2 94844457 2I TTTTTATCTA --/TT GATTTTTATA 3070 het 2994 hom 23 8 14 1 T 0 2 298173 CASAVA_Build 2 94846905 3I TCTGCAGATG ---/CTC TTTATTATCC 3070 het 3070 ref 47 30 13 4 CTC 0 1 298174 CASAVA_Build 2 94853143 1I AGGCCAGGAG -/T TTTAAGACCA 3070 het 3070 ref 52 36 10 6 T 3 4 298175 CASAVA_Build 2 94857171 1I AAGTTATATT -/C CTGGTTTCTG 3070 het 3070 ref 49 37 8 4 C 1 2 298176 CASAVA_Build 2 94859364 5I CATAAAACAC -----/ATAAA ATAAACCATG 3070 het 3070 ref 45 28 10 7 ATAAA 1 2 298177 CASAVA_Build 2 94859459 1I TACATATTTA -/T ATTTCAAAAT 3070 het 3070 ref 43 26 13 5 T 0 1 298178 CASAVA_Build 2 94859520 5D GAATGAATTT TATAA/----- TATGATTGCT 3070 het 3070 ref 57 32 18 7 TATAA 1 0 298179 CASAVA_Build 2 94864964 1D CAATTTTTAA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 43 30 8 5 T 8 7 298180 CASAVA_Build 2 94867308 1D TTTAACATGA G/- TTCAAATCTC 2837 het 2837 ref 44 31 6 7 G 1 0 298181 CASAVA_Build 2 94867341 1I TCCTATGTCT -/A AAAAAAAAGC 2794 het 2794 ref 59 38 7 14 A 8 9 298182 CASAVA_Build 2 94867404 2D TTTGACCAGA AT/-- GTTCAACACA 2812 het 2812 ref 52 38 6 10 AT 1 0 298183 CASAVA_Build 2 94872499 1D ACCTTGACAC A/- AATTCATTGT 3070 het 3070 ref 91 68 11 15 A 3 2 298184 CASAVA_Build 2 94874133 1I TTTGTCAGGA -/T CTACTTATGC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 0 1 298185 CASAVA_Build 2 94875257 8I TCTCTTAGGC --------/TCCGTGGT TTCTTCTAAA 3070 het 3070 hom 97 37 56 4 TCCGTGGT 0 1 298186 CASAVA_Build 2 94875561 2D TTACTAAATT TA/-- TATATATATA 3032 het 3032 ref 58 34 12 12 TA 7 6 298187 CASAVA_Build 2 94876082 1D ATTGATCCAA T/- TTTAAAATAT 3070 het 3070 ref 91 67 14 13 T 4 3 298188 CASAVA_Build 2 94881063 1D TACCCATAAG C/- AAATTTCTGA 3070 het 3070 ref 42 29 9 5 C 1 0 298189 CASAVA_Build 2 94882117 1D AAACAAACTT A/- AAAAAAAAAA 2451 het 998 hom 24 6 9 10 A 17 16 298190 CASAVA_Build 2 94883239 4I TCAAAACAAA ----/TACT TAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 75 40 25 10 TACT 0 1 298191 CASAVA_Build 2 94884365 3I AGGTTATCTT ---/CTA CTATTTTCTA 1754 het 1754 ref 28 20 4 4 CTA 1 2 298192 CASAVA_Build 2 94887935 8I TGCAGTTTTG --------/CAGTTTTC TGCAGCAGCT 3057 het 3057 ref 27 14 9 5 CAGTTTTC 0 1 298193 CASAVA_Build 2 94888245 4I AACATATTCA ----/GATG GATGGCGGCG 1773 het 1773 ref 51 32 5 14 GATG 1 2 298194 CASAVA_Build 2 94888680 2I11M7I CTTGTGACAC --ATCATTTTGCT-------/TTATCATGTTGCTCCTATTG ATTATTCATT 3070 het 3070 ref 54 27 7 22 N/A 0 0 298195 CASAVA_Build 2 94888869 8D TTCTTGAGTT TAAGTACA/-------- TAAGAGTGGA 1895 het 1895 ref 100 81 5 18 TAAGTACA 1 0 298196 CASAVA_Build 2 94889086 1D TGTCTGCCTT C/- CCCCACAACA 3070 het 3070 hom 82 35 40 10 C 5 4 298197 CASAVA_Build 2 94889170 2D TAGAAGGGTG AT/-- ATGTGGGTAG 3070 het 3070 hom 92 30 56 6 AT 2 1 298198 CASAVA_Build 2 94889744 3D TCACAATAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 78 24 34 20 T 14 11 298199 CASAVA_Build 2 94891347 3D TCCCGTCTGC GGA/--- GGAGGAGAGC 3070 het 3070 ref 96 43 27 31 GGA 3 2 298200 CASAVA_Build 2 94899569 1D TGCTGTCCTC A/- AAAGCCCCAT 3070 het 3070 hom 101 22 66 16 A 4 3 298201 CASAVA_Build 2 94900907 2D CTCTTGGTTT AC/-- ACAGTGTCAC 3070 het 3070 hom 80 17 51 12 AC 2 1 298202 CASAVA_Build 2 94900969 1D GTTGGAGCTG C/- CCCGCTGACC 3070 het 3070 hom 83 29 44 14 C 4 3 298203 CASAVA_Build 2 94901812 25D TGACCCTGGG CTCCCTGGGCTAAGCCACAAGGCAC/------------------------- CTCCCCAGAG 3070 het 3070 ref 75 42 49 13 CTCCCTGGGCTAAGCCACAAGGCAC 1 0 298204 CASAVA_Build 2 94902002 2D CACAGGTCCC CT/-- CTCCTCCATG 3070 het 3070 hom 88 31 46 13 CT 2 1 298205 CASAVA_Build 2 94902488 2I CCCAATCACA --/GG GAGAAAAGGC 3070 het 3070 ref 53 22 28 3 G 1 3 298206 CASAVA_Build 2 94903183 1I AGGTCACAGT -/G GGAGCGCAGG 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 G 2 3 298207 CASAVA_Build 2 94905294 1D AACACTCCAA C/- ACCCCGCACA 3070 het 3070 hom 93 26 41 27 C 1 0 298208 CASAVA_Build 2 94906694 1D ATACTCCTGT G/- GACAGGGCGC 3070 het 3070 hom 84 22 51 13 G 2 1 298209 CASAVA_Build 2 94909136 1D GAAGGTGGAT G/- GCCCACACTG 3070 het 3070 ref 79 21 33 34 G 2 1 298210 CASAVA_Build 2 94909169 22D GCCCCTCTCC CCACACTGGGCCCACAGCCCAG/---------------------- CCACCCTGGG 3070 het 3070 ref 79 35 24 45 CCACACTGGGCCCACAGCCCAG 1 0 298211 CASAVA_Build 2 94909838 1D AATCCTGACC T/- CCCCAGGGCC 3070 het 3070 hom 69 22 42 5 T 1 0 298212 CASAVA_Build 2 94913227 4D AATAAAAAAT AAAA/---- AAAAAAGTCT 3070 het 2729 hom 49 14 31 9 A 10 6 298213 CASAVA_Build 2 94914850 4I21M3D13M2D TCTGCACTTT ----TCTATTTTTTCTAAAACTGCTAGGAAAAAAGAGTCTACT/TCTCTCTATTTTTTCTAAAACTGCT---AAAAAAAAGTCTA-- ATGTTTTTAA 3070 het 3070 ref 46 28 10 27 N/A 0 0 298214 CASAVA_Build 2 94915714 1I CTGCACTAAG -/C TATGATTACA 3070 het 3070 hom 99 21 52 27 C 0 1 298215 CASAVA_Build 2 94915827 2I ATTTGATTTG --/TA GTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 19 14 10 TA 0 1 298216 CASAVA_Build 2 94916960 1I GGTTTTGGAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 97 38 35 25 T 8 9 298217 CASAVA_Build 2 94920039 1D17M2I GTAAACTTTA TTTTTTATCAAAAAGGGG--/-TTTTTATCAAAAAGGGGGT TGGGGGTATT 3070 het 3070 hom 78 20 64 13 N/A 0 0 298218 CASAVA_Build 2 94920212 6D ATAACATTTG ACTAAT/------ ACTAATTTAG 3070 het 3070 ref 73 34 31 22 ACTAAT 2 1 298219 CASAVA_Build 2 94921314 1D ACCTGGCTGA T/- TTTTTTATTT 2662 het 2662 ref 31 22 6 3 T 7 6 298220 CASAVA_Build 2 94925540 1I ACACAAAAAA -/G TAAGAAAACA 3070 het 3070 hom 69 30 31 8 G 0 1 298221 CASAVA_Build 2 94925987 2D CAGACGAGGT AG/-- AGAGAGCCCT 1081 het 1081 ref 43 37 3 6 AG 4 3 298222 CASAVA_Build 2 94926275 3I AGAAAAAATA ---/TAC AAAATCTATT 3070 het 3070 ref 58 31 19 8 TAC 0 1 298223 CASAVA_Build 2 94928518 1I9M1D TGTGCGTGCT -CATGGCCTTA/GCATGGCCTT- ATTCAATTAA 1843 het 1843 ref 41 33 8 6 N/A 0 0 298224 CASAVA_Build 2 94930408 1D TCATCAATTT A/- GTAAGGACTT 1836 het 1836 ref 51 42 4 7 A 1 0 298225 CASAVA_Build 2 94930937 6D TCAATATTCC TCACTG/------ TCTGCCTTCT 1277 het 1277 ref 62 45 3 16 TCACTG 1 0 298226 CASAVA_Build 2 94931653 1I TATATTTACA -/G GGGGGGTGTC 567 het 567 ref 41 28 4 9 G 6 7 298227 CASAVA_Build 2 94932077 3D38M3I ACTGGATATT ACAAACAATATCATACGGGGATGTACAACCCCTGCGATATT---/---AACAATATCACATGGGGATGTACAACCCCTGTGATATTCGG AGAAATATCT 2664 het 2664 ref 47 53 7 6 N/A 0 0 298228 CASAVA_Build 2 94933227 4I TATTACTCCC ----/CACA CCCCATTATA 1409 het 1409 ref 42 35 4 3 CA 0 2 298229 CASAVA_Build 2 94934837 3I GGAGGGAAAG ---/GAT GATATTATTC 2559 het 2559 ref 39 27 6 6 GAT 1 2 298230 CASAVA_Build 2 94935222 3D AATATTGAGT GTA/--- ATATTATCCT 3070 het 3070 ref 53 28 20 6 GTA 1 0 298231 CASAVA_Build 2 94941532 4I CCCGTTTTGT ----/GAGC ATTTCCTTAC 3070 het 3070 ref 69 33 29 7 GAGC 0 1 298232 CASAVA_Build 2 94941670 3I ACTGGGATGA ---/TGT TGTTTCTAGG 3070 het 3070 ref 62 46 10 6 TGT 1 2 298233 CASAVA_Build 2 94948991 2D CATGAACAAC AA/-- AAAAATAACC 3070 het 3070 ref 63 46 11 6 A 7 5 298234 CASAVA_Build 2 94949446 3I AAATATTAGC ---/TAA TAATAGATTT 334 het 334 ref 39 31 1 7 TAA 1 2 298235 CASAVA_Build 2 94954199 1D11M1D24M2I TTCTTTAATC TAGCATCCCATACTTCATATAATTGGGAAAATCGGTA--/-AGCATCCCATA-TTCATATAATTGGGAAAAGCCGTAGT GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 35 12 23 N/A 0 0 298236 CASAVA_Build 2 94977400 1I ATACAGTGAG -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 6 7 298237 CASAVA_Build 2 95005267 1I ATTTCTCAAA -/G AACTTAAAAC 2803 het 2803 ref 46 30 7 10 G 0 1 298238 CASAVA_Build 2 95027743 1D CAGGGAGGGC G/- GCCCTCGGTG 2774 het 613 hom 19 4 9 6 G 2 1 298239 CASAVA_Build 2 95098530 1I TAATTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 10 11 298240 CASAVA_Build 2 95108032 1D CAGCACATAG A/- AAAAAAAAAA 846 het 846 ref 33 22 2 9 A 15 14 298241 CASAVA_Build 2 95110028 2I AAGTTTTGAG --/AT ATATATATAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AT 6 7 298242 CASAVA_Build 2 95152425 46D CAAATCCATA TCCAAAGTGTCTATTCTAGTGAGAACAATTGCTGCCCCTTCCATGG/---------------------------------------------- TCCAACCTAC 3070 hom 81 het 22 0 23 9 TCCAAAGTGTCTATTCTAGTGAGAACAATTGCTGCCCCTTCCATGG 1 0 298243 CASAVA_Build 2 95167153 1D TTATATTAAT G/- GGGTTGAAGC 3070 hom 84 het 34 0 27 7 G 4 3 298244 CASAVA_Build 2 95169074 1I AAATAACTTG -/T ATTTTTTTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 298245 CASAVA_Build 2 95194465 1I GTGTACCCAC -/A AAAAACTTAA 3070 hom 110 het 41 0 36 5 A 5 6 298246 CASAVA_Build 2 95206392 1D AAGGATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 39 2 31 7 A 11 10 298247 CASAVA_Build 2 95206808 1D GGCCACTTTT C/- CCAAATGCTT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 C 3 2 298248 CASAVA_Build 2 95210768 3D ACAAAGGCTT GCG/--- GCGGCGACGG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 GCG 3 2 298249 CASAVA_Build 2 95216133 1I CCAGTTTATA -/C ACTTTTCTTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 0 1 298250 CASAVA_Build 2 95217543 5D TAGTTGTGTT TTATA/----- TTATCTAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 TTATA 1 0 298251 CASAVA_Build 2 95232148 1I TTTCTTCTTC -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 24 6 A 0 1 298252 CASAVA_Build 2 95298867 1I CCTGCCTGCA -/G GGCCCCTGCC 3070 hom 74 het 29 0 24 5 G 2 3 298253 CASAVA_Build 2 95327704 6I AGGATAGTTC ------/AGGACT AGGTCTGGCT 3070 hom 101 het 42 0 32 10 AGGACT 0 1 298254 CASAVA_Build 2 95330053 13D CCTGAGAGTC GGGGGAGGGCACA/------------- GCATGGGGCG 1946 het 1508 hom 24 8 8 10 GGGGGAGGGCACA 1 0 298255 CASAVA_Build 2 95330598 1I GGACAGTGCT -/C CCAGAGAACC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 C 2 3 298256 CASAVA_Build 2 95355736 2D CACACATACA CT/-- CACACATACA 3070 hom 193 het 73 0 64 11 CT 1 0 298257 CASAVA_Build 2 95356974 1I TACATGCACC -/T GGAAGCAGTG 3070 hom 122 het 49 0 35 14 T 0 1 298258 CASAVA_Build 2 95358697 1I CTCCCAGCGC -/G GGGCCAAGCC 3070 hom 144 het 50 0 45 5 G 3 4 298259 CASAVA_Build 2 95362510 1I GACAGCCTCT -/G GCTGGGCCTC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 1 2 298260 CASAVA_Build 2 95373473 1I GGGCTCAGGG -/C CCCAGCCTTC 3070 hom 88 het 33 0 30 3 C 3 4 298261 CASAVA_Build 2 95408943 1I GGGCCTGGTG -/C CCTCTGGGGC 3070 hom 63 het 24 0 20 4 C 2 3 298262 CASAVA_Build 2 95510980 2D AAAATCTGGC AT/-- ATGAGAATTT 1381 het 1381 ref 36 27 3 6 AT 2 1 298263 CASAVA_Build 2 95530925 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 7 6 298264 CASAVA_Build 2 95557243 1I CGTCTCAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 68 het 29 0 24 5 A 9 10 298265 CASAVA_Build 2 95598733 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 10 10 7 A 1 0 298266 CASAVA_Build 2 95607515 1I ACAAGAAAAG -/A AAGAGAAAAT 3070 het 17 hom 34 1 33 0 A 2 3 298267 CASAVA_Build 2 95629135 1I CTGTTCAGGC -/T TTTTTTGTAC 1437 het 997 hom 5 2 3 0 T 6 7 298268 CASAVA_Build 2 95709810 1D TTGGAGACTT G/- ATTTTTTACT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 G 1 0 298269 CASAVA_Build 2 95759402 4D CAGTGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2967 het 1637 hom 17 6 8 3 TTTG 5 4 298270 CASAVA_Build 2 95773472 2D AGACACACAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 16 23 1 AG 7 6 298271 CASAVA_Build 2 95779401 1D ACACAAACGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 A 10 9 298272 CASAVA_Build 2 95780973 1D CGCGTTCTGA G/- CACTTCAGAG 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 G 1 0 298273 CASAVA_Build 2 95797039 1I AAATTCACTT -/C TTTTTCACTC 3070 het 3070 ref 45 33 9 3 C 0 1 298274 CASAVA_Build 2 95842473 2D AACTGGACAC TT/-- ATTTCTTTCA 2853 het 2853 ref 40 32 6 4 T 2 0 298275 CASAVA_Build 2 95867258 1I CCACAGATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 9 10 298276 CASAVA_Build 2 95869628 1D CTGTGAATGC A/- AAAAAAAAAA 1330 het 1330 ref 49 42 3 4 A 11 10 298277 CASAVA_Build 2 95869858 1I CAAGTTTAAA -/G CTAGCAGAGG 3070 het 3070 ref 43 33 8 2 G 0 1 298278 CASAVA_Build 2 95870405 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TA 7 8 298279 CASAVA_Build 2 95870961 1I TTGAAATGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 18 6 A 12 13 298280 CASAVA_Build 2 95873647 5D AACATTAGAT TTGAA/----- TTATACTTTG 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 TTGAA 1 0 298281 CASAVA_Build 2 95875735 1D CAAGTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 10 4 A 11 10 298282 CASAVA_Build 2 95876420 2I GTTACAAGTA --/CC AGCCAAGAGG 3070 het 3070 ref 41 28 13 0 C 0 2 298283 CASAVA_Build 2 95880423 1I CTTCTTGCGA -/T TTTTTTAAAG 3027 het 3027 ref 70 26 9 35 T 6 7 298284 CASAVA_Build 2 95880467 1D AGCATAAGTA T/- TACCCTTCAC 3070 het 3070 ref 66 31 16 19 T 2 1 298285 CASAVA_Build 2 95880564 1D GCAATTGAGA G/- GGAATACCGT 3070 het 3070 ref 46 28 17 1 G 3 2 298286 CASAVA_Build 2 95880664 1I TCAAACACCT -/G GCAGCATCTG 3070 het 3070 ref 55 45 8 2 G 1 2 298287 CASAVA_Build 2 95881047 1D TATGCAAATA T/- TCCAAAATCT 3070 het 3070 ref 38 25 7 7 T 2 1 298288 CASAVA_Build 2 95881392 2D21M3D ATTGGGCTAC TGTGTCATTTTTCTACCTGTGTTTTG/--TGTCATTTTTCTACCTGTGTT--- TTGATAATAT 3070 het 3070 ref 101 87 21 40 N/A 0 0 298289 CASAVA_Build 2 95882946 1D18M4D AATATATGTA TAAAAAATGGCAGAATGAAAGCC/-AAAAAATGGCAGAATAAA---- AGAGATTAAG 1972 het 1972 ref 21 19 5 0 N/A 0 0 298290 CASAVA_Build 2 95883339 5D ACAGCTACCT GATAA/----- GATGTTATTT 3070 het 3070 ref 81 41 34 7 GATAA 1 0 298291 CASAVA_Build 2 95884063 1D TATTTAAAAA C/- TGAAAGTAAA 3070 het 3070 hom 77 29 39 10 C 1 0 298292 CASAVA_Build 2 95884145 5D CCCATATTAT AATAG/----- AAGTAAAATT 3070 het 3070 hom 87 35 44 14 AATAG 1 0 298293 CASAVA_Build 2 95884480 2D TCAGCAGTAT AA/-- GACTACATTA 3070 het 3070 hom 69 29 32 9 A 2 0 298294 CASAVA_Build 2 95888049 2D TGAATCATTT AG/-- AGTTAATTAA 3070 het 3070 hom 95 36 38 26 AG 2 1 298295 CASAVA_Build 2 95888427 2D TCTACATAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 61 36 21 5 AG 6 5 298296 CASAVA_Build 2 95889165 1I TAGAGAAGTA -/T TCACAATTAA 3070 het 3070 hom 71 26 42 6 T 1 2 298297 CASAVA_Build 2 95889445 1I TTATTTTTCA -/T GTTTTCGAAT 3070 het 3070 hom 87 24 44 31 T 0 1 298298 CASAVA_Build 2 95890075 2I TACATTAAAC --/AA TGATTTTCAA 3070 het 3070 ref 82 45 22 39 A 0 2 298299 CASAVA_Build 2 95890973 1D GTATCATTGT C/- ATTTTTTATA 3070 het 3070 ref 45 30 13 2 C 1 0 298300 CASAVA_Build 2 95898858 2I TATAAAGGCA --/CT GTCACTTTAA 3070 het 3070 hom 43 21 18 4 CT 0 1 298301 CASAVA_Build 2 95910289 1D TACAAGCTTC A/- AAAACATACA 3070 het 3070 ref 56 47 9 0 A 5 4 298302 CASAVA_Build 2 95956953 8I CATTCATGAA --------/TGGATAGC GTGTTAGCAT 1707 het 1707 ref 57 33 7 17 TGGATAGC 0 1 298303 CASAVA_Build 2 95957563 3I CAATAAAAAT ---/ATC ATCAATTACC 3070 het 3070 ref 60 39 15 6 ATC 1 2 298304 CASAVA_Build 2 95958634 1I9M4D ATGGGATTTG -AAACAAAATAATC/AAAACAAAAT---- AATATGTAAA 3070 het 3070 ref 85 45 41 21 N/A 0 0 298305 CASAVA_Build 2 95960063 4D AAAATAAACT AAAC/---- AAAGTTTCTA 3070 het 3070 ref 69 46 21 5 AAAC 1 0 298306 CASAVA_Build 2 95960407 6D ATCCTTCTAA CTTCTG/------ CTTCTGCTTT 3070 het 3070 ref 55 33 21 3 CTTCTG 2 1 298307 CASAVA_Build 2 95960684 1I TAAATATGTC -/A AGACACTTGA 3070 het 3070 ref 70 45 15 10 A 1 2 298308 CASAVA_Build 2 95960756 2D CCCATAGACA CT/-- CTTTCACAGC 3070 het 3070 ref 55 35 13 8 CT 2 1 298309 CASAVA_Build 2 95960892 2D2M6I TCTCCAGCAG ACAG------/--AGGAAATT TACTGAGCAA 806 het 806 ref 46 39 2 6 N/A 0 0 298310 CASAVA_Build 2 95961092 1D TTGATGCACC A/- AAATCTTCAG 3070 het 3070 ref 52 22 22 9 A 4 3 298311 CASAVA_Build 2 95961157 1D AAAATGAAGC A/- CTGACATAAT 3070 het 3070 hom 63 22 32 10 A 1 0 298312 CASAVA_Build 2 95961325 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 1083 het 1083 ref 30 20 3 9 AC 9 8 298313 CASAVA_Build 2 95962752 1I23M1I GCCCTTTTTT -GTTCCATATGAAATTTCCAGTAG-/GGTTCCATATGAAATTTCCAGTAGT TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 72 31 43 2 N/A 0 0 298314 CASAVA_Build 2 95963034 3D GCGTTCACTC ATG/--- ATGATTTTGC 3070 het 3070 ref 43 27 14 3 ATG 2 1 298315 CASAVA_Build 2 95964467 2I GCAGAAATTC --/AA AAGCTGGTAA 3070 het 3070 hom 85 38 39 11 A 2 4 298316 CASAVA_Build 2 95964796 3I CATAGACACT ---/AAC AACAGCATCA 2962 het 2962 ref 45 35 7 3 AAC 1 2 298317 CASAVA_Build 2 95965024 8I TACAACATAA --------/TGATTAAT TGATTAATAT 3070 het 3070 hom 99 28 58 13 TGATTAAT 1 2 298318 CASAVA_Build 2 95965278 10D59M1D GTCAAAAGAA AGGACCAAATAGGACCCCAGAAGGATAAATGTCAAAGCCCATGGTAGAACGCTATGGTGTACCCTGAAGA/----------AGGACCCCAGGAGGATAAATGTCAAAGCCCATGGTAGAACGCTATGGTGTACCCTGAAG- AAATCACCCA 3070 het 3070 ref 40 44 13 69 N/A 0 0 298319 CASAVA_Build 2 95965994 2D CTGTGGTTTA CT/-- CTCATTCTTC 3070 het 3070 ref 54 31 19 4 CT 2 1 298320 CASAVA_Build 2 95966598 1D TGTACACAAA C/- TTTTTGTGAA 3070 het 3070 hom 49 20 26 3 C 1 0 298321 CASAVA_Build 2 95967024 4I ATCTGGAGAC ----/TATT TATCATTTGA 3070 het 3070 hom 101 37 45 19 TATT 0 1 298322 CASAVA_Build 2 95967313 1I TTAATTTCTT -/A TATAGTACAA 3070 het 3070 hom 102 28 60 15 A 0 1 298323 CASAVA_Build 2 95967881 5I AGATGTGATT -----/AAGTA AAGATTCTCA 3070 het 3070 ref 59 30 26 6 AAGTA 0 1 298324 CASAVA_Build 2 95967974 5I GATGAAGAAG -----/AGAGA AGAGTATTGC 3070 het 3070 ref 80 44 32 4 AGAGA 0 1 298325 CASAVA_Build 2 95969245 5D CTCTCAATCA TTAGT/----- TTAGATATCT 3070 het 3070 ref 77 52 18 9 TTAGT 1 0 298326 CASAVA_Build 2 95969380 1I TCACTTATGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 56 32 7 17 A 9 10 298327 CASAVA_Build 2 95969639 4D GACTACAGGC ACAT/---- ACATGCCATC 3070 het 3070 hom 49 19 23 8 ACAT 2 1 298328 CASAVA_Build 2 95969887 1D TTGTTTTTTT C/- TAAAGTCAGT 3070 het 3070 ref 52 34 13 8 C 1 0 298329 CASAVA_Build 2 95969968 1D AACAGCACTG T/- TTTTAAAGAA 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 T 5 4 298330 CASAVA_Build 2 95970486 9I25M3I TTTTAAATTA ---------TAGTTATATTTATTTTCAAAAATTA---/TATTTAAATTAGTTATATTTATTTTCAAAAATTATAT TATTAAAGCA 1425 het 1425 ref 14 13 3 0 N/A 0 0 298331 CASAVA_Build 2 95970845 2I AAAAAAGAAA --/TT CATAAAAACA 3070 het 3070 hom 52 19 29 7 T 0 2 298332 CASAVA_Build 2 95972071 1D GATTCTCCTG T/- AAATGATATA 3070 het 3070 hom 55 22 26 7 T 1 0 298333 CASAVA_Build 2 95972427 2D ATTCTGTGTA CT/-- CTGTTGGCAA 3070 het 3070 hom 87 31 47 13 CT 2 1 298334 CASAVA_Build 2 95974123 1I TTTGGTCTTC -/A AAACAAGGTT 3070 het 3070 hom 70 31 35 4 A 3 4 298335 CASAVA_Build 2 95974295 2I GGCAGATCAT --/AC ATGAGGTCAG 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 AC 0 1 298336 CASAVA_Build 2 95974515 1I19M5D CTCTGTCTAC -AAAAAATAAGAAAGAAAAAGAAAG/AAAAAAATAAGAAAGAAAAA----- AAAAAAAAGA 1776 het 1776 ref 44 43 13 13 N/A 0 0 298337 CASAVA_Build 2 95975064 1I TTTCTGCGGG -/A AAAAAATGTG 1612 het 1612 ref 46 33 4 9 A 6 7 298338 CASAVA_Build 2 95976851 1D TAACATTCCA T/- TTAAAAAAAG 2289 het 2289 ref 33 21 6 7 T 3 2 298339 CASAVA_Build 2 95977544 3D TACAAGAAAT GAA/--- AAGAAACTAT 3070 het 3070 ref 89 54 35 1 GAA 1 0 298340 CASAVA_Build 2 95977833 2I TTTGCAAAGT --/GA AAAAAAAAAT 2161 het 2161 ref 53 22 5 26 GA 0 1 298341 CASAVA_Build 2 95978162 1I GTCCCCTCCA -/C AAACAAATGG 3070 het 3070 ref 44 23 16 9 C 0 1 298342 CASAVA_Build 2 95979110 3D CAATGACAGA ATG/--- ATGTAAAAGA 1200 het 1200 ref 76 70 3 4 ATG 2 1 298343 CASAVA_Build 2 95979263 1I GATTCAAGTA -/C TAGAAGATAT 3070 het 3070 hom 58 21 32 6 C 0 1 298344 CASAVA_Build 2 95981183 1D AAAAATGTAC T/- CATATGTAAT 3070 het 3070 ref 77 37 23 19 T 1 0 298345 CASAVA_Build 2 95981266 3D34M1D ATAGGTATGC ATGATGATGTATGTTTGTGCGAATTACTTTCTGTGGGA/---ATGATGTATATTTGTGCGAATTGCATTTTGTGGG- AAAAATGTGA 3070 het 3070 ref 64 68 7 34 N/A 0 0 298346 CASAVA_Build 2 95982578 1I AAACAGGTTA -/T TTTAAACAAA 3070 het 3070 hom 62 24 32 6 T 3 4 298347 CASAVA_Build 2 95987235 1I TTTCTAAAAT -/A AGTCTGGTTT 3070 het 3070 ref 74 39 22 23 A 1 2 298348 CASAVA_Build 2 95989247 3D ACTAACTGAT AAC/--- AACAAAACAT 3070 het 3070 ref 65 37 27 1 AAC 2 1 298349 CASAVA_Build 2 95990983 1D TTCAACATTA T/- TTTTCTTTCT 3070 het 3070 hom 65 29 28 10 T 5 4 298350 CASAVA_Build 2 95993526 1I86M6D ATATTGGTAG -TTTTTTTTAGTACTCAAGATATACATTCTTTTATTACTTTGTTTCTAAAGCTAGTTTGATATAATATACCATAGGGGTCTCTCAGGTCCTTT/TTTTTTTTTAGTACTCAAGATATACATTCTTTTACTACTTTGTTTCTAAAGCTAGTTTGAAATAATATACCATAGGGGTCTCTCAGG------ TATGAAATAA 1265 het 1265 ref 12 21 4 19 N/A 0 0 298351 CASAVA_Build 2 95993820 1I GTGACTCCCC -/A AAAGTCTCCT 3070 het 3070 hom 95 40 48 7 A 3 4 298352 CASAVA_Build 2 95993984 1I CACTACTGTA -/T TGTGACATTT 3070 het 3070 ref 60 37 15 8 T 1 2 298353 CASAVA_Build 2 95995256 2D GATAGATCTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 43 20 12 12 AT 7 6 298354 CASAVA_Build 2 95995432 2I TTTCTTTTTT --/AA AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 53 23 15 15 A 8 10 298355 CASAVA_Build 2 96014929 6I GTTGTTGTTG ------/TTGTGT TGTTGTTGCT 3070 het 3070 hom 54 26 22 6 TTGTGT 0 1 298356 CASAVA_Build 2 96016544 2D TCTCATGCTC AA/-- AAAGAGTCAG 3070 het 3070 hom 18 8 9 2 A 5 3 298357 CASAVA_Build 2 96036780 1D AGCTGCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1346 hom 39 3 28 9 A 12 11 298358 CASAVA_Build 2 96043662 3D GGAGGTGATT AAC/--- AATTTGAAGG 3070 het 3070 ref 25 16 7 2 AAC 1 0 298359 CASAVA_Build 2 96048122 3D CCAACTCTGG TTA/--- TTATTAGAAA 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 TTA 3 2 298360 CASAVA_Build 2 96051154 2D GCACAGGCCC TG/-- CACATAGGAT 3070 hom 66 het 23 0 19 4 TG 1 0 298361 CASAVA_Build 2 96077595 1D CCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 10 12 A 11 10 298362 CASAVA_Build 2 96081350 1D GGGCAAGCAT G/- GGAATGGGAA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 G 3 2 298363 CASAVA_Build 2 96083979 6I TTGTGTTTGT ------/GTCTGG GCATTTCAAA 2660 het 2660 ref 33 25 6 2 GTCTGG 0 1 298364 CASAVA_Build 2 96090018 1D TGGGAGAAGA G/- GGGGTCCTAC 1250 het 1250 ref 39 25 3 12 G 5 4 298365 CASAVA_Build 2 96106819 1I CAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 T 13 14 298366 CASAVA_Build 2 96141268 1I CTTAAGCACT -/G GGGGACAATG 3070 het 3070 ref 45 28 9 8 G 4 5 298367 CASAVA_Build 2 96144714 9I CTCCTCCTCC ---------/TCCTCCTCT TCCTCCTCTT 2566 het 2566 ref 25 10 8 7 TCCTCCTCT 1 2 298368 CASAVA_Build 2 96150441 12D CTGCAAGGTT CAGGGCCGTCCC/------------ CACAATAAAG 3070 het 3070 ref 41 23 17 5 CAGGGCCGTCCC 1 0 298369 CASAVA_Build 2 96157567 1I GCATGGTGGT -/G GCGTGACTGT 1425 het 1425 ref 13 8 4 1 G 1 2 298370 CASAVA_Build 2 96160743 2I TTGGCTTTTC --/TA TAGTCTTTCA 3070 het 3070 ref 45 23 21 1 TA 1 2 298371 CASAVA_Build 2 96179978 1D GTGCACTGTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 1526 hom 29 8 12 9 G 10 9 298372 CASAVA_Build 2 96183804 1D TCTGCTGGCC T/- GGGTGCTGAG 2779 het 2779 ref 28 12 10 6 T 1 0 298373 CASAVA_Build 2 96187716 1I CAGGGGGCAG -/C CCCCACCTAT 3070 hom 63 het 27 0 18 9 C 4 5 298374 CASAVA_Build 2 96360614 1D ACTCTGTCGC A/- AAAAAAAAAA 2032 het 1168 hom 16 6 5 5 A 13 12 298375 CASAVA_Build 2 96407008 1I GTAATTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 25 14 14 T 11 12 298376 CASAVA_Build 2 96420368 1D TTTGTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 22 1 15 7 T 16 15 298377 CASAVA_Build 2 96421556 2D CACCAGTTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1117 het 1117 ref 68 50 5 13 GT 8 7 298378 CASAVA_Build 2 96433485 3D CTCTTCTCTC CTT/--- CTCTTCTCTC 3070 het 3070 hom 40 20 18 3 CTT 1 0 298379 CASAVA_Build 2 96439511 1I AGGTGCCCTT -/G GGGCTCCCCG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 G 3 4 298380 CASAVA_Build 2 96446074 1D TACAGATTCC T/- TTTTTTTTTT 2879 het 2879 ref 29 10 10 9 T 12 11 298381 CASAVA_Build 2 96453020 1I TCAAGTGGGG -/A ATCCCCTCCC 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 A 1 2 298382 CASAVA_Build 2 96502297 1I CAGCTGGCTG -/C CACCCCAGGG 3070 hom 72 het 26 0 19 7 C 1 2 298383 CASAVA_Build 2 96521586 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3001 het 3001 ref 27 11 7 9 A 10 11 298384 CASAVA_Build 2 96533745 1I ATCCCGCCTC -/G GGGGAAGCCC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 4 5 298385 CASAVA_Build 2 96594407 2D TGGTGGTGGG GT/-- GTGTGTGTGT 1247 het 1247 ref 44 31 3 10 GT 10 9 298386 CASAVA_Build 2 96595754 1D CCACTTTTAT A/- AAGAGCTAAG 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 A 3 2 298387 CASAVA_Build 2 96600380 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1633 hom 26 het 16 0 8 8 T 15 14 298388 CASAVA_Build 2 96608583 1I CAGTAAATAT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 7 8 298389 CASAVA_Build 2 96702883 2I TTTGCCAAAC --/TG TATAGCTAGC 3070 hom 141 het 55 0 48 7 TG 0 1 298390 CASAVA_Build 2 96769695 1I GAATGCCCAG -/C CCCCCCCCCT 1161 het 1161 ref 21 3 5 13 C 9 10 298391 CASAVA_Build 2 96919441 1I CATCTTTATT -/A AAAAAAAAAA 1293 het 150 hom 10 2 6 2 A 15 16 298392 CASAVA_Build 2 96974844 1I CCCTCAACTC -/T TTTCCTTACT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 3 4 298393 CASAVA_Build 2 96986488 1D CCATGGCTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 10 9 298394 CASAVA_Build 2 96991893 6D ACTTCGTCTC AAGAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAGAAA 1 0 298395 CASAVA_Build 2 96993614 2D AGCCTGGGCG AC/-- AGAGTGAGAC 3070 hom 60 het 28 0 20 9 AC 1 0 298396 CASAVA_Build 2 96993681 2D GAAAAACTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 29 0 21 9 A 12 10 298397 CASAVA_Build 2 96994098 4I CGTGCTGTTA ----/CTCT CTCTATCAAA 3070 hom 98 het 36 0 31 5 CT 2 4 298398 CASAVA_Build 2 96995982 1I AGGCAGAGAT -/C TGTCTGGTTT 3070 hom 123 het 46 0 37 9 C 0 1 298399 CASAVA_Build 2 96996699 2I TTATTTTCCC --/AA GAGATCTGTT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 0 2 298400 CASAVA_Build 2 96998158 1I TGGCTGTGAG -/C CCCGTCCCAG 3070 hom 63 het 24 0 18 6 C 3 4 298401 CASAVA_Build 2 97008093 1D TGATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1613 het 191 hom 13 1 7 5 T 15 14 298402 CASAVA_Build 2 97020215 1D TAAATTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 35 2 21 13 T 12 11 298403 CASAVA_Build 2 97035564 1I GGAACCAAAG -/A TGTGTGCCAC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 0 1 298404 CASAVA_Build 2 97042748 1I TCACATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 895 hom 28 2 18 8 T 13 14 298405 CASAVA_Build 2 97045726 2D CTCTCTATCC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AT 7 6 298406 CASAVA_Build 2 97051987 4D TATTAAAAAC ACTT/---- AAATAGCCAT 1342 het 1342 ref 44 40 3 2 ACTT 1 0 298407 CASAVA_Build 2 97054577 4I TAGTTTATTT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTTA 2 3 298408 CASAVA_Build 2 97081070 1D TAATGTTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 10 9 298409 CASAVA_Build 2 97087992 1D CTCCCCGCAC A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 31 10 14 8 A 8 7 298410 CASAVA_Build 2 97091947 2I GAAACTCCAC --/AT ATATATATAT 1751 het 1751 ref 17 9 4 4 AT 6 7 298411 CASAVA_Build 2 97093070 1D TCAAAGTAGC A/- GGCTTTTTCA 3070 het 3070 ref 48 31 17 0 A 1 0 298412 CASAVA_Build 2 97096550 4I TGGCACTGTC ----/TAAA TAACTTTTTC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TAAA 0 1 298413 CASAVA_Build 2 97097526 2D8M3D ATTGAGTGAC GGATAAATGGGAT/--AGACGTGG--- ATCTCAGTGG 3070 het 3070 ref 74 47 22 15 N/A 0 0 298414 CASAVA_Build 2 97097702 8D TGCCACTCCA CTCTGCTG/-------- CTCTGCTGCT 3070 het 3070 ref 95 40 36 29 CTCTGCTG 2 1 298415 CASAVA_Build 2 97098232 1I AGAAACTTGA -/T TGTGATCACA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 T 1 2 298416 CASAVA_Build 2 97098966 1D ACACACGGCC T/- GCCACACTCA 3070 het 1315 hom 19 8 8 3 T 1 0 298417 CASAVA_Build 2 97102798 2I CCCTGTAGAA --/AG AGTTTACAAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AG 1 2 298418 CASAVA_Build 2 97106341 1D GCCAGAGGGT C/- CTTTTATCAC 3070 het 251 hom 23 1 20 2 C 2 1 298419 CASAVA_Build 2 97112974 1I CTCTCTTCTT -/C CCCAGTCCCA 3070 hom 68 het 25 0 20 5 C 3 4 298420 CASAVA_Build 2 97118133 1D CCCTGTTCTA G/- GTTAAAACTA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 G 2 1 298421 CASAVA_Build 2 97126871 1D TTGTAATAGT C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 42 het 19 0 14 5 C 9 8 298422 CASAVA_Build 2 97131503 1D AAGAAAAGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 18 0 16 4 T 10 9 298423 CASAVA_Build 2 97145091 1I28M1I TATTTAAGTT -AAAAAAGGAATGAAATACTATTTTCTAT-/AAAAAAAAGAATGAAATACTGTTTTCTATC CACAAGTTTG 2413 het 2413 ref 44 13 5 29 N/A 0 0 298424 CASAVA_Build 2 97149935 1I TCCCTAAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 7 8 298425 CASAVA_Build 2 97153003 3D ACATTACTTA TTG/--- CCAAGTATGT 3070 het 273 hom 12 1 11 0 TTG 1 0 298426 CASAVA_Build 2 97160110 1D TGTCTTTTAT A/- ATAATGTCAT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 2 1 298427 CASAVA_Build 2 97167057 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 956 hom 39 11 19 14 AC 8 6 298428 CASAVA_Build 2 97167566 1D CAGGGTAATC A/- GGCAAGAGAA 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 A 1 0 298429 CASAVA_Build 2 97168777 5D TAAAAAAAGA AAAAG/----- AAATCACCCA 1768 het 1768 ref 42 36 5 4 AAAAG 1 0 298430 CASAVA_Build 2 97170138 1I GTCAAGTGTC -/T TGATACATTT 3070 het 3070 ref 78 65 10 3 T 1 2 298431 CASAVA_Build 2 97170322 1I AAATTAGGCA -/G AACAAAGAAA 3070 het 3070 ref 65 31 18 16 G 0 1 298432 CASAVA_Build 2 97170705 11I45M2D ATATATATAT -----------ATTTACATATATATATATTTGGTTGGTTATTAATAAGAAAAGAAGTC/AGATATAGTACATATGTATATGTATATATTTGGTTGGTTATTAATAAGAAAAGAAG-- TCTTGTGATT 3070 het 3070 hom 58 24 23 22 N/A 0 0 298433 CASAVA_Build 2 97170845 2D AAGTGGAAAA AG/-- AGATGGCAAA 3070 het 3070 hom 39 10 28 1 AG 2 1 298434 CASAVA_Build 2 97172302 1I TGGGACAGGT -/A ATTTTGGAAT 3070 het 3070 ref 41 32 8 1 A 1 2 298435 CASAVA_Build 2 97172761 2I AAGAGGGATT --/GA GAGGCAAGAA 3070 het 3070 ref 67 35 24 8 GA 1 2 298436 CASAVA_Build 2 97173137 1D TTTTAGAAAC A/- AAAATAATGT 3070 het 3070 ref 75 41 29 5 A 5 4 298437 CASAVA_Build 2 97174022 1I TATTATACTC -/T TCATTCATAT 1849 het 1849 ref 31 23 5 3 T 1 2 298438 CASAVA_Build 2 97174867 3D GATATATGTT TTG/--- TTGTTATCAG 2638 het 2638 ref 40 30 7 6 TTG 2 1 298439 CASAVA_Build 2 97175912 3D TAGGTTCCTA TTG/--- TTGATTTAAA 3070 het 3070 hom 62 28 29 5 TTG 2 1 298440 CASAVA_Build 2 97177088 3D TCTTCTTTTA CAT/--- CATTCTGTCA 3070 het 3070 ref 79 57 21 1 CAT 2 1 298441 CASAVA_Build 2 97178988 2I GTTAATTTTA --/TT ATTTTTTTTA 2221 het 2221 ref 48 30 6 15 T 0 2 298442 CASAVA_Build 2 97179009 4D TTTGGCAAAT AAGA/---- AATAGTTGAT 1099 het 1099 ref 50 29 5 21 AAGA 1 0 298443 CASAVA_Build 2 97179047 1I GTGTGATCTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 67 39 17 11 A 8 9 298444 CASAVA_Build 2 97179656 1I CATTTTGTTT -/A AAATAACCTG 627 het 627 ref 47 30 5 12 A 3 4 298445 CASAVA_Build 2 97180167 7I TGGATACAGC -------/CTGTTTT CTAATATCTT 3070 het 3070 hom 69 17 49 3 CTGTTTT 0 1 298446 CASAVA_Build 2 97180329 12D9M6D GTTGCTGGAA TTTTATTGTTTTTTTTTTTTTCTTTCC/------------TTTTTTTTT------ CCCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 28 15 18 4 N/A 0 0 298447 CASAVA_Build 2 97180922 1D CATTCTCACA T/- TTTTTCCCAC 2046 het 2046 ref 52 44 5 13 T 6 5 298448 CASAVA_Build 2 97180998 1D ATTAATTTAC T/- TTTTTTATTA 2432 het 2432 ref 58 34 14 11 T 7 6 298449 CASAVA_Build 2 97181457 4I TCATTTGTTT ----/TTTG TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 73 19 37 17 TTTG 0 1 298450 CASAVA_Build 2 97182485 1I AACCATCAAA -/G TTTTAAAGGC 3070 het 3070 ref 51 21 12 18 G 0 1 298451 CASAVA_Build 2 97182948 1I ATATCTTCTA -/G TACTTGAATC 3070 het 3070 hom 82 16 64 2 G 0 1 298452 CASAVA_Build 2 97183622 2D ATGGGCCCTC TT/-- TAAGTAGCTT 3070 het 3070 ref 35 24 7 7 T 3 1 298453 CASAVA_Build 2 97184049 1I CCATTTTTTT -/G TGGAGGGGAC 3070 het 3070 ref 56 17 13 26 G 0 1 298454 CASAVA_Build 2 97184385 1I ATTTTTTTTT -/C ACTTTGCAAA 2851 het 2851 ref 22 9 6 7 C 0 1 298455 CASAVA_Build 2 97186596 8I TTTTTTTTCC --------/TCTCTCTG TCTCTCTCTC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TCTCTCTG 0 1 298456 CASAVA_Build 2 97187345 1D TGTATAATAA C/- TCAACTGGGG 1944 het 1944 ref 25 17 5 4 C 1 0 298457 CASAVA_Build 2 97187563 4I ACCTATTGTG ----/TCTT TCTTCTAGAA 3070 het 3070 hom 95 25 61 9 TCTT 1 2 298458 CASAVA_Build 2 97187925 2I ACCTGACCTC --/TT ATATGATCTG 2483 het 2483 ref 26 16 7 3 T 0 2 298459 CASAVA_Build 2 97188456 1D CAACCTGAAA G/- AACAGCTCCA 1251 het 1251 ref 35 27 5 3 G 1 0 298460 CASAVA_Build 2 97190960 4I TCCCCATGTT ----/TATC TATCTGTATA 3070 het 3070 ref 52 33 13 6 TATC 1 2 298461 CASAVA_Build 2 97191189 7I ATGCTGTTTC -------/ATGCTTT ATTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 54 33 16 5 ATGCTTT 0 1 298462 CASAVA_Build 2 97191381 4I TCTTTCTGCT ----/TTTG TTTGTTTTTA 2597 het 2597 ref 26 16 7 8 TTTG 1 2 298463 CASAVA_Build 2 97191546 1I TGAAGATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 T 12 13 298464 CASAVA_Build 2 97191669 4D TTTTGTGTAC AAAG/---- AAACAAAGGT 1577 het 1577 ref 22 17 4 4 AAAG 1 0 298465 CASAVA_Build 2 97192854 3D TAATGCATAC TTT/--- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 51 16 30 7 T 10 7 298466 CASAVA_Build 2 97194402 2I TCTGCATGTG --/TA TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 52 39 8 5 TA 0 1 298467 CASAVA_Build 2 97194570 1I TGAATTAACG -/T TTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 87 43 42 2 T 5 6 298468 CASAVA_Build 2 97195156 4I GTGTCAAATG ----/ATAA ATAGTCTCCA 3070 het 3070 ref 54 32 12 10 ATAA 0 1 298469 CASAVA_Build 2 97195514 1D AATTTTAGAG T/- TCTGTTTATC 3070 hom 87 het 48 0 30 18 T 2 1 298470 CASAVA_Build 2 97195585 1D TTCACAAAAA G/- TTTGTGTACA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 G 1 0 298471 CASAVA_Build 2 97196535 1I TAATGTATAC -/A TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 A 0 1 298472 CASAVA_Build 2 97196810 1D TCTTGGGTGA T/- TTTCTTCAGG 3070 het 3070 ref 76 37 31 8 T 4 3 298473 CASAVA_Build 2 97197471 1D TGATAAAGAT C/- CCAATGTGGA 3070 het 3070 hom 96 30 51 17 C 3 2 298474 CASAVA_Build 2 97197695 2I GATTACCAGC --/TT TTGAATTTCT 3070 het 3070 ref 73 43 17 14 T 2 4 298475 CASAVA_Build 2 97199209 3D GACCTCTTCA GGG/--- AGAACTACAA 2413 het 2413 ref 18 10 5 3 G 3 0 298476 CASAVA_Build 2 97201430 1I GGGAGTGTGC -/A ATGAGGTACC 3070 het 3070 ref 72 40 29 3 A 1 2 298477 CASAVA_Build 2 97202489 1D AATTATGTCA G/- TGCTTCATTT 3070 het 3070 ref 46 25 12 10 G 1 0 298478 CASAVA_Build 2 97202552 1D TTTCTGAAGA T/- TTTGGTGCAT 3070 het 3070 ref 54 28 22 6 T 4 3 298479 CASAVA_Build 2 97202963 1I GTCAAGTGTC -/T TGACACATTT 3070 het 3070 ref 83 37 40 7 T 1 2 298480 CASAVA_Build 2 97203037 1I AGATGTCACA -/T TACAGTGGTG 3070 het 3070 hom 98 25 56 17 T 1 2 298481 CASAVA_Build 2 97209891 3I GAAAAAGAAG ---/AAA GTATTTATGT 3070 het 3070 hom 80 18 52 10 A 0 3 298482 CASAVA_Build 2 97210378 3I CATTGGTAAT ---/TGA TGATATTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 10 6 TGA 1 2 298483 CASAVA_Build 2 97211733 3I GAGGGAAAAT ---/AAG AAGTTATTTA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 AAG 1 2 298484 CASAVA_Build 2 97212074 1D ACTATTTTAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 A 9 8 298485 CASAVA_Build 2 97212488 1D CAGGCAAGTT A/- AAAGAGCGTG 3070 het 3070 ref 59 47 8 4 A 4 3 298486 CASAVA_Build 2 97225788 1I TCGGCCTAAG -/C ACATTGATAT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 C 0 1 298487 CASAVA_Build 2 97238128 2D TACTCCTCTT GG/-- TTACTAGGAG 2883 het 2883 ref 48 38 7 3 G 2 0 298488 CASAVA_Build 2 97243765 2D TATCAGACTT AA/-- ACACGTTTTG 920 hom 9 het 4 0 3 1 A 3 1 298489 CASAVA_Build 2 97248320 1D TAACTGTATG T/- TTTTGAAGCT 3070 hom 154 het 63 0 52 12 T 5 4 298490 CASAVA_Build 2 97269578 1D TGTTTTTTTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 339 hom 47 6 20 21 A 9 8 298491 CASAVA_Build 2 97270181 2I TTGAAAATCA --/TT GTTTAATGTA 3070 het 3070 hom 84 16 59 9 T 0 2 298492 CASAVA_Build 2 97270819 1I GTAAAAATTC -/A GAAAACTGAA 3070 het 3070 ref 26 19 7 0 A 0 1 298493 CASAVA_Build 2 97271219 1D TTCAGGTTTT A/- AAAAGTTTTT 1780 het 1780 ref 22 16 6 0 A 5 4 298494 CASAVA_Build 2 97272908 1D GAGAGAGCAG A/- TTGTAAAATG 1835 het 1835 ref 14 7 6 1 A 1 0 298495 CASAVA_Build 2 97273522 2D ATTTCTACTC TT/-- ATTAATATTA 3070 het 3070 hom 72 27 40 5 T 2 0 298496 CASAVA_Build 2 97341832 1D TTAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 23 2 14 8 A 13 12 298497 CASAVA_Build 2 97381422 12I TCCACAGATG ------------/GATCCCACAGAT GATCCCACAG 3070 hom 82 het 34 0 19 15 GATCCCACAGAT 0 1 298498 CASAVA_Build 2 97382656 1I GAGTGTGGGG -/C TATTTGTTAG 3070 hom 48 het 24 0 17 7 C 0 1 298499 CASAVA_Build 2 97385395 14I AAGGGAGGGG --------------/GGTACTTTGTGTGA GTGTAAAATT 3070 hom 102 het 35 0 35 1 GGTACTTTGTGTGA 0 1 298500 CASAVA_Build 2 97388588 1I TTATTAGTTC -/A ATTGATTTTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 1 2 298501 CASAVA_Build 2 97425607 1I GCACACATGG -/C CCGCCACACG 3070 het 100 hom 23 1 21 1 C 2 3 298502 CASAVA_Build 2 97429213 1D GAAATAAACC A/- AACAAAAAAT 3070 het 561 hom 37 2 32 3 A 3 2 298503 CASAVA_Build 2 97429328 2D ATCTGAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 14 2 10 5 T 14 12 298504 CASAVA_Build 2 97473460 1I CCTCCCAACC -/A GGGCCTCCAG 3070 hom 37 het 18 0 12 6 A 0 1 298505 CASAVA_Build 2 97477135 28D ACTAGGTAAT AAGGTATAAGGAACAGGTATAAGACTAG/---------------------------- GTATAAGGAA 3070 hom 36 het 9 0 12 2 AAGGTATAAGGAACAGGTATAAGACTAG 1 0 298506 CASAVA_Build 2 97477321 1D TAGAGAGGTA G/- GAAGAGAGGG 3070 hom 141 het 50 0 40 10 G 2 1 298507 CASAVA_Build 2 97478960 1D CTGTGAATGC A/- AAAAAAAAAA 2096 het 2096 ref 72 55 7 11 A 12 11 298508 CASAVA_Build 2 97479128 3D GAGCTAAGCC TTA/--- GTAACATTCT 3070 hom 138 het 51 0 46 7 TTA 1 0 298509 CASAVA_Build 2 97483734 1D TGAAGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1036 hom 55 3 42 11 T 13 12 298510 CASAVA_Build 2 97490682 2D5M1I16M3D ATTGGGCTAC TGTGTCA-TTTTCTACCTGTGTTTTGG/--TGTCATTTTTCTACCTGTGTTT--- TGATAATATG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 N/A 0 0 298511 CASAVA_Build 2 97494468 1I ACTTACTCTC -/A AGCTTTAGAA 2188 het 2188 ref 30 22 5 3 A 1 2 298512 CASAVA_Build 2 97497303 2I35M2D ATCTTTTCTT --CACAGTAATTACTCCTCAATTAGGATGAATCATTTAG/CACACAGTAATTACTCCTCAGTTAGGATGAATCATTT-- AGTTAATTAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 N/A 0 0 298513 CASAVA_Build 2 97497483 2D TTTATGAAAC AT/-- ATATCAGCAG 3070 hom 57 het 21 0 20 3 AT 3 2 298514 CASAVA_Build 2 97497718 4I TACATAGCAG ----/AGAC AGAGATGTTG 3070 het 853 hom 54 2 46 6 AGAC 0 1 298515 CASAVA_Build 2 97515061 4I GTTTTATAAC ----/TAGT TAAATGTTTT 2904 hom 15 het 6 0 6 0 TAGT 0 1 298516 CASAVA_Build 2 97519414 4I AGAAATATAT ----/AATC AATCATATGT 2417 hom 12 het 5 0 5 0 AATC 1 2 298517 CASAVA_Build 2 97520599 2I CAATCCCTCT --/TC CTTGATGAAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TC 0 1 298518 CASAVA_Build 2 97537553 1D CGTTCTACAA T/- TTTTACTGGT 1485 het 1485 ref 38 25 6 8 T 5 4 298519 CASAVA_Build 2 97543647 1I9M4D ATGGGATTTG -AAACAAAATAATC/AAAACAAAAT---- AATATGTAAA 3070 het 3070 ref 32 26 8 0 N/A 0 0 298520 CASAVA_Build 2 97544394 3D CCTTCCAAAA GTT/--- CCTTCATCCA 3070 het 3070 ref 63 39 23 2 GTT 1 0 298521 CASAVA_Build 2 97544894 9I ATCTGAAGTG ---------/ATGCATTTA AGTTCACTTA 3070 het 3070 hom 70 32 29 9 ATGCATTTA 0 1 298522 CASAVA_Build 2 97545229 1D CCTTTTTTTT A/- AAATCTAGTT 3070 het 3070 ref 61 32 19 20 A 4 3 298523 CASAVA_Build 2 97545309 12D13M1D CACAGCTTTC CAAAAACAAAAACAAAAAACAAAAAT/------------CAAAAAAGAAAAA- CTGATGTGAA 3070 het 3070 ref 37 41 8 2 N/A 0 0 298524 CASAVA_Build 2 97545532 1I TTGACATACA -/C TTTTTTTCGT 3070 het 3070 ref 73 34 34 8 C 0 1 298525 CASAVA_Build 2 97545696 1I TAAATGTGTC -/A AGACACTTGA 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 A 1 2 298526 CASAVA_Build 2 97546104 1D TTGATGCACC A/- AAATCTTCAG 3070 het 3070 ref 32 24 7 2 A 4 3 298527 CASAVA_Build 2 97546169 1D AAAATGAAGC A/- CTGACATAAT 1877 het 1877 ref 22 17 4 2 A 1 0 298528 CASAVA_Build 2 97546218 1D AGATCCTTAC T/- AGATCCAAGA 1809 het 1809 ref 24 18 4 2 T 1 0 298529 CASAVA_Build 2 97546327 4D AGAAAAAAAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 50 25 16 9 AC 11 9 298530 CASAVA_Build 2 97546888 2I GATAGATCTG --/AT AAATATATAT 3070 het 2062 hom 28 7 17 4 AT 0 1 298531 CASAVA_Build 2 97547044 5D ATTTGGGTGA TTTCT/----- TTTGCTTTTT 2441 het 2441 ref 32 18 6 12 TTTCT 1 0 298532 CASAVA_Build 2 97547924 2I TCCATTTGTT --/TG TGTCTCTTAT 3070 hom 42 het 32 0 14 18 TG 1 2 298533 CASAVA_Build 2 97548261 1D TTCTCTTGCC T/- GATTACCCTG 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 T 1 0 298534 CASAVA_Build 2 97548491 1D CAAACATCTG A/- AAAAAAGCTC 3070 het 1137 hom 37 6 13 18 A 7 6 298535 CASAVA_Build 2 97549055 2D ACAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2139 hom 18 het 7 0 6 1 A 12 10 298536 CASAVA_Build 2 97555177 1D ACTCAATCTC A/- AAAAAAAAAA 2307 hom 16 het 12 0 5 8 A 15 14 298537 CASAVA_Build 2 97558545 2I CAGGAAAAGA --/AG TCCCTATCAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AG 0 1 298538 CASAVA_Build 2 97558982 1D CATGTGACTA T/- TAAAAAAATA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 2 1 298539 CASAVA_Build 2 97559176 2I TACAATTTAA --/AC AGTGATTTTT 3070 het 156 hom 20 1 17 2 AC 0 1 298540 CASAVA_Build 2 97562198 1I GGGCAAGAAA -/C TATGCTCAGG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 0 1 298541 CASAVA_Build 2 97564008 2D GTTACAAAAC TG/-- TGCATTATGT 1419 het 1419 ref 21 15 3 3 TG 2 1 298542 CASAVA_Build 2 97570723 1I TATTTCATTC -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 44 het 28 1 24 3 T 7 8 298543 CASAVA_Build 2 97574088 4I AGGAATGCTT ----/CTTA CTTACTTCCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CTTA 1 2 298544 CASAVA_Build 2 97576172 1D GGGGCCTTTT G/- GGAGGTGATT 3070 hom 63 het 23 0 21 3 G 3 2 298545 CASAVA_Build 2 97587279 2I AAATTGACAC --/AG ATTCGTCAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AG 0 1 298546 CASAVA_Build 2 97593488 6I TTGTGTTTGT ------/GTCTGG GCATTTCAAA 2636 hom 18 het 10 0 7 3 GTCTGG 0 1 298547 CASAVA_Build 2 97594994 1D GCTTCCCCCC T/- AAACCACTGT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 0 298548 CASAVA_Build 2 97606276 1D GTATGCTGCA G/- GTGCTGGTCA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 G 2 1 298549 CASAVA_Build 2 97642447 21D GGAAGCTGAC CCTCACCTGCCCTGACCAGAA/--------------------- CCTCACCTGC 3070 hom 47 het 29 0 13 18 CCTCACCTGCCCTGACCAGAA 2 1 298550 CASAVA_Build 2 97654230 1I TTGTAGAGTC -/G GGGGGTCTCC 3070 hom 37 het 17 0 12 5 G 5 6 298551 CASAVA_Build 2 97662070 1I TTGACATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 586 hom 47 3 34 10 A 11 12 298552 CASAVA_Build 2 97664061 3I GTAAAGGAAT ---/AGA AGACTTGAAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AGA 1 2 298553 CASAVA_Build 2 97667832 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTATTTT 3070 het 724 hom 18 2 13 3 T 5 6 298554 CASAVA_Build 2 97686470 2D CTCCTGACCT CA/-- GGTGATCCCC 3070 hom 60 het 22 0 19 3 CA 1 0 298555 CASAVA_Build 2 97693882 1I GAATTTCTTC -/A GAGGCTCTTG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 0 1 298556 CASAVA_Build 2 97712618 1D CTACCTAGCA T/- TTTTTTTTTT 1186 het 1186 ref 38 28 4 7 T 15 14 298557 CASAVA_Build 2 97734984 2I CTTTTTGTCA --/CT CTCTGGCAGG 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 CT 2 3 298558 CASAVA_Build 2 97743422 1D ATTTATGGAT A/- AAAAGGTGCT 3070 hom 65 het 24 0 19 5 A 5 4 298559 CASAVA_Build 2 97746094 2D CTTCCCTGGT CA/-- CACCCTGTAG 3070 het 3070 ref 37 16 13 10 CA 2 1 298560 CASAVA_Build 2 97750961 5D TCAAAGGACA TTTTC/----- TTTTGTTTCG 3070 het 3070 ref 30 19 11 1 TTTTC 1 0 298561 CASAVA_Build 2 97751357 3D ATTGGTTTTT AAG/--- AAGAAAGGTG 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 AAG 2 1 298562 CASAVA_Build 2 97785245 1D TATGAGCTGC A/- AATAAGGCTT 3070 het 3070 ref 28 14 14 0 A 3 2 298563 CASAVA_Build 2 97790729 5I ATAAATAACG -----/AAGTC AAGAGTTTAG 3070 hom 116 het 43 0 40 3 AAGTC 0 1 298564 CASAVA_Build 2 97824506 22D ATTCAAAATC CAGACTGCTGTATTCCAAAATT/---------------------- CAGACTGCTG 3070 hom 69 het 34 0 24 14 CAGACTGCTGTATTCCAAAATT 2 1 298565 CASAVA_Build 2 97825413 1I AAAAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 46 3 39 4 A 10 11 298566 CASAVA_Build 2 97825989 5D CACAGGAACT GTAAA/----- GTAATGTGTC 3070 het 3070 hom 37 12 15 11 GTAAA 1 0 298567 CASAVA_Build 2 97826874 2D TGATTTGAAT AG/-- AGATATTGAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 AG 2 1 298568 CASAVA_Build 2 97835325 1D AGTGCTGGGA C/- TACAGGCGTG 3070 het 2108 hom 21 6 9 6 C 1 0 298569 CASAVA_Build 2 97848921 6I GGGACTACAG ------/GTGCCC GTGCCCACTA 3070 het 2738 hom 20 8 9 3 GTGCCC 1 2 298570 CASAVA_Build 2 97868188 6I CGCTTCCCGG ------/GTTCAC TCCATTCTCC 1261 hom 7 het 4 0 3 1 GTTCAC 0 1 298571 CASAVA_Build 2 97868336 6I TGATCCGCCC ------/GCCTCG GCCTCCCAAA 1762 hom 15 het 7 0 6 2 GCCTCG 0 1 298572 CASAVA_Build 2 97870627 1D CATAAGAAGA T/- TTTTAAATAG 3070 het 3070 hom 37 18 16 5 T 5 4 298573 CASAVA_Build 2 97874405 1D ATAAATTTTC A/- CTAAAATCTT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 1 0 298574 CASAVA_Build 2 97879904 3I TTAATTACTC ---/TAT TATATTACAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TAT 1 2 298575 CASAVA_Build 2 97893118 4D TTTAAAAAGA AAAT/---- AAGGATCTTT 3070 het 3070 ref 26 13 12 3 AAAT 1 0 298576 CASAVA_Build 2 97901746 3I AGCGGCTTAA ---/AAC AACAATTTAT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 AAC 1 2 298577 CASAVA_Build 2 97913502 1D AATTAACGTA T/- TTTGCTTTAA 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 T 4 3 298578 CASAVA_Build 2 97913846 1I ACATTATGAT -/C CCATTTTAAG 3070 het 222 hom 31 1 28 2 C 2 3 298579 CASAVA_Build 2 97916934 1D CAAGGCAAGG A/- AAAAAAAAAG 1108 het 1108 ref 56 46 3 7 A 10 9 298580 CASAVA_Build 2 97917889 1I CACAATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 8 15 10 A 10 11 298581 CASAVA_Build 2 97925373 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 21 0 11 11 A 12 11 298582 CASAVA_Build 2 97939588 1I AAACTAGATT -/A TTTTTTTTAC 2838 het 2838 ref 27 17 6 4 A 0 1 298583 CASAVA_Build 2 97943050 4I TTGTAATAGA ----/TAAG TAATTCATAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TAAG 0 1 298584 CASAVA_Build 2 97951820 1D TCTACTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 31 0 26 5 A 11 10 298585 CASAVA_Build 2 97951982 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1519 hom 38 5 22 11 A 13 14 298586 CASAVA_Build 2 97962545 1D AGAGAAGAGA G/- GGGCCTTGCT 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 G 4 3 298587 CASAVA_Build 2 97968252 2I TACTTAATAC --/AT ATATATATAT 2972 het 2972 ref 31 10 9 12 AT 6 7 298588 CASAVA_Build 2 97971003 4D ATAAAGACAG ACAC/---- ACAGAGCAGT 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 AC 3 1 298589 CASAVA_Build 2 97972416 3D AGCTTTACAT GAA/--- GAAGTTCTGA 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 GAA 2 1 298590 CASAVA_Build 2 97982952 2D TCATCTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 798 hom 38 6 11 22 T 16 14 298591 CASAVA_Build 2 97987491 1D AAGAAAAGCA G/- TAACAGGGAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 G 1 0 298592 CASAVA_Build 2 97990977 1I CGGCGAGGGA -/G GGGGGGGGTC 2570 het 2570 ref 16 7 7 2 G 8 9 298593 CASAVA_Build 2 97994357 7D6M1D CTTTTCTTTC TCTTCTTTCTTTCT/-------TCTTTC- TTTTCTTTCT 1983 het 130 hom 35 2 15 21 N/A 0 0 298594 CASAVA_Build 2 98005436 1D CAGAGAGAGG A/- AACACAAGTG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 3 2 298595 CASAVA_Build 2 98053416 2I CAACCACAGG --/TT TTTTCTTCAC 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 4 6 298596 CASAVA_Build 2 98053889 1D GGAAAATGGC A/- TTGATGTTGC 3070 hom 117 het 45 0 40 7 A 1 0 298597 CASAVA_Build 2 98060683 1D AACTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 538 hom 18 2 14 2 A 13 12 298598 CASAVA_Build 2 98062019 3D AAATGCCCCA CTC/--- CTCAATACTG 3070 hom 80 het 31 0 27 8 CTC 2 1 298599 CASAVA_Build 2 98088660 1I AAATGGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3001 het 3001 ref 22 12 8 2 T 10 11 298600 CASAVA_Build 2 98111992 1D CTGGGAAGTA C/- TAGGTGAAGG 3070 hom 85 het 32 0 26 6 C 1 0 298601 CASAVA_Build 2 98127462 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 119 hom 25 1 17 7 T 14 13 298602 CASAVA_Build 2 98127722 1I TCGGCCTCCC -/A AAGTGCTGGG 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 2 3 298603 CASAVA_Build 2 98134015 1I CTAGTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 739 het 739 ref 43 20 2 21 T 15 16 298604 CASAVA_Build 2 98140729 1I ACTCAAGGGT -/C CCCGAGGGTG 3070 hom 68 het 26 0 19 7 C 3 4 298605 CASAVA_Build 2 98141606 1D ACCGTTTCCT G/- GGGGTGGTGG 3070 hom 62 het 26 0 21 5 G 5 4 298606 CASAVA_Build 2 98155242 15D TTCTGCTGGT CAGGGGCCTGCTGGC/--------------- CAGGGGCCTG 3070 hom 101 het 47 0 31 17 CAGGGGCCTGCTGGC 2 1 298607 CASAVA_Build 2 98156867 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1482 het 1482 ref 14 8 4 2 A 10 11 298608 CASAVA_Build 2 98162306 1I TTGGCATTGT -/G GGTTATTCTT 3070 hom 153 het 59 0 51 8 G 2 3 298609 CASAVA_Build 2 98181444 1D TGCATGCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 7 A 11 10 298610 CASAVA_Build 2 98184521 1I AGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 1227 het 1227 ref 46 38 3 5 T 8 9 298611 CASAVA_Build 2 98195726 1I CTATCAACTT -/C ACTGTGTTTT 3070 het 76 hom 34 1 27 7 C 0 1 298612 CASAVA_Build 2 98198783 1I ACGTGGTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 9 10 298613 CASAVA_Build 2 98199879 2I TTGTAAGCAC --/CA CCGCCCCGCA 3070 hom 51 het 35 0 19 16 CA 0 1 298614 CASAVA_Build 2 98206204 1I AAAATAGACC -/A AAAAAAAAAA 1679 het 1679 ref 31 13 8 10 A 15 16 298615 CASAVA_Build 2 98207649 1I AGTGTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1459 hom 41 5 22 14 A 13 14 298616 CASAVA_Build 2 98207859 1I ATATTTGTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 9 10 298617 CASAVA_Build 2 98238307 6I3M5I AAAGCCTGCT ------TTT-----/GCAGGCTTTCTGTC GGGTAATGAT 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 N/A 0 0 298618 CASAVA_Build 2 98239095 1I CCCTCCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1054 hom 36 3 25 8 T 11 12 298619 CASAVA_Build 2 98240449 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 26 6 T 11 10 298620 CASAVA_Build 2 98251575 1D TCTCCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 11 9 13 T 13 12 298621 CASAVA_Build 2 98262001 1D AGAGAAAATG A/- AGCCCTTCAT 3070 het 3070 ref 46 20 18 9 A 2 1 298622 CASAVA_Build 2 98278545 1I TCTTCAGCTT -/G GCCACCCTTC 3070 hom 74 het 29 0 23 6 G 1 2 298623 CASAVA_Build 2 98279306 1I TTTATGGTAG -/A AAATGTGTGA 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 A 3 4 298624 CASAVA_Build 2 98307805 1I TCTTAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 A 12 13 298625 CASAVA_Build 2 98336204 1D AATATTAACA T/- TTTATAGTTC 3070 het 3070 hom 39 14 17 9 T 4 3 298626 CASAVA_Build 2 98341663 4D AGATCTTCTG AGTT/---- ATCTTAAACT 3070 het 3070 hom 53 24 27 4 AGTT 1 0 298627 CASAVA_Build 2 98419979 1D CTTTGCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 35 1 23 12 T 14 13 298628 CASAVA_Build 2 98423146 1D TATGTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 14 13 T 12 11 298629 CASAVA_Build 2 98425318 9D GCACAAACTA CAGTAGGAT/--------- CAGTAGGATC 3070 het 3070 ref 46 24 15 10 CAGTAGGAT 2 1 298630 CASAVA_Build 2 98430261 1I TCGAAACGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 9 10 298631 CASAVA_Build 2 98450989 4D TTTCCAACTC AGTG/---- AGACCATGAA 3070 het 3070 hom 48 15 28 6 AGTG 1 0 298632 CASAVA_Build 2 98469550 3I AGGTTACATC ---/AGA AGGAGTCCAG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 AGA 0 1 298633 CASAVA_Build 2 98474792 1D CACAAGTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 10 11 T 11 10 298634 CASAVA_Build 2 98477520 1D AGGGTGTTCT A/- AAAAAAAAAA 1473 het 1473 ref 36 26 4 7 A 13 12 298635 CASAVA_Build 2 98480580 4I AATATTTTCT ----/TCTA TCTGATTTTG 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 TCTA 0 1 298636 CASAVA_Build 2 98488319 1D GCTCGTTCAC T/- TTCCCTGCAG 3070 het 3070 hom 47 18 20 10 T 3 2 298637 CASAVA_Build 2 98507158 1D TTTATTTAGT G/- TTTATTCAGC 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 G 1 0 298638 CASAVA_Build 2 98515281 1I GAGTTAATAC -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 6 7 298639 CASAVA_Build 2 98515619 4D AAAGGTAATG TGTT/---- TGTTCTGGGA 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 TGTT 2 1 298640 CASAVA_Build 2 98526941 2D CACGCGTGCG CA/-- CACACACACA 3041 het 3041 ref 40 18 11 11 CA 9 8 298641 CASAVA_Build 2 98531024 1D AGGCTGAGCA G/- GGAACGGAAG 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 G 3 2 298642 CASAVA_Build 2 98536257 5I TTATACAGAC -----/ATAAG ATAAGAAGAA 3070 hom 128 het 48 0 43 5 ATAAG 1 2 298643 CASAVA_Build 2 98547748 1D ATACCAGTAA T/- GCGTGCTTAT 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 1 0 298644 CASAVA_Build 2 98566222 1D AAAAAATGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 10 9 298645 CASAVA_Build 2 98582056 2D CATGTTATAT AA/-- AAAGTGTCTT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 A 5 3 298646 CASAVA_Build 2 98592199 4D GCAGTGCGCT GATG/---- GATCTGTGTG 3070 het 3070 ref 36 19 16 3 GATG 1 0 298647 CASAVA_Build 2 98594787 1D AAAAGAAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 19 7 9 3 T 10 9 298648 CASAVA_Build 2 98630200 2I TGTAATGTGC --/TT TCTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 1 3 298649 CASAVA_Build 2 98631808 1I GTGCATGCCT -/G TAGTCCCAGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 298650 CASAVA_Build 2 98636017 1D AAACGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 11 10 298651 CASAVA_Build 2 98644824 10D AAATATAATC ATGAGAAAAT/---------- ATCAGATAAA 3070 hom 99 het 35 0 33 3 ATGAGAAAAT 1 0 298652 CASAVA_Build 2 98650015 1I TGCCATCCAC -/G ATAAGATGTG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 0 1 298653 CASAVA_Build 2 98693889 1I AAGTTGGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 9 10 298654 CASAVA_Build 2 98697829 1D TTTAAACAAC A/- AAATAAGTTA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 4 3 298655 CASAVA_Build 2 98701103 2I ATGGCATGTC --/AT AGTTTAATCA 3070 het 3070 ref 51 24 24 3 AT 0 1 298656 CASAVA_Build 2 98704306 1I TTCTGTTAAC -/T GATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 40 24 15 1 T 0 1 298657 CASAVA_Build 2 98712063 1D CTAATATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 12 11 298658 CASAVA_Build 2 98725568 1I GTTTGTCTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 8 9 298659 CASAVA_Build 2 98738033 2I ACAAGCCCAT --/GG AAATGCCATT 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 G 0 2 298660 CASAVA_Build 2 98748247 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 A 11 10 298661 CASAVA_Build 2 98905334 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 843 het 843 ref 14 8 3 3 A 17 16 298662 CASAVA_Build 2 99023653 1D ATAGAACCAG A/- AAAAAAAAAA 1803 het 1803 ref 48 39 4 5 A 11 10 298663 CASAVA_Build 2 99065130 6I CATATCTAAC ------/TCTAAT AAAGGATTTA 1042 het 1042 ref 33 26 4 3 TCTAAT 0 1 298664 CASAVA_Build 2 99076442 2D ATGAATTCAG AA/-- AAGTTTCAGG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 4 2 298665 CASAVA_Build 2 99081510 4I AACAAACAAT ----/AGAG AGGATCAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AG 1 3 298666 CASAVA_Build 2 99089449 1D GCGACACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 11 10 298667 CASAVA_Build 2 99091912 1I GAATTTGAAA -/T TCTTCTTTGA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 2 298668 CASAVA_Build 2 99095440 1D CAGGAAGTCC T/- CATTGAAAGG 3070 hom 126 het 49 0 43 7 T 1 0 298669 CASAVA_Build 2 99099258 1D CTCAATCAAG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 8 7 298670 CASAVA_Build 2 99101843 2D TCTAAGATAC TG/-- TGTTAGTACC 3070 het 3070 hom 40 16 24 1 TG 2 1 298671 CASAVA_Build 2 99104522 1I ATGCACCACC -/A TGCCTAGATA 3070 hom 42 het 17 0 12 5 A 0 1 298672 CASAVA_Build 2 99110605 3I CACAAATTAA ---/AAC AACACTGAGA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AAC 1 2 298673 CASAVA_Build 2 99120463 1I TTCTTTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 10 298674 CASAVA_Build 2 99126914 1I GCTGTGTTCC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 22 het 31 1 25 5 T 8 9 298675 CASAVA_Build 2 99129389 1I ATCAAACTCA -/C CTGTTTTCCT 3070 hom 78 het 27 0 26 1 C 1 2 298676 CASAVA_Build 2 99130693 4D TGTATCTATG TATC/---- TATCTATCTA 3070 hom 81 het 39 0 28 15 TATC 3 2 298677 CASAVA_Build 2 99134707 1D TTAATATGAG A/- AAAAACAACC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 6 5 298678 CASAVA_Build 2 99147441 1I CCATCCTTTT -/A TTTATTTTTA 3070 hom 85 het 30 0 26 4 A 0 1 298679 CASAVA_Build 2 99147772 3I TCAGGCAAAG ---/GGT GGTGTTAAGG 3070 hom 93 het 39 0 31 8 GGT 1 2 298680 CASAVA_Build 2 99160571 1I TAACTGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 T 11 12 298681 CASAVA_Build 2 99166066 1I GATCAAACAA -/G GGGGGGCAGC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 G 6 7 298682 CASAVA_Build 2 99166979 4I GAATTTAGGG ----/TTGT TTATTTATTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TTGT 0 1 298683 CASAVA_Build 2 99180731 1I GTAGAGCCAA -/G GTGTTGCTAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 1 2 298684 CASAVA_Build 2 99190501 1D CTGATCTTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 32 het 21 0 12 9 T 9 8 298685 CASAVA_Build 2 99200186 1I CTCACTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 458 hom 48 2 37 9 T 11 12 298686 CASAVA_Build 2 99200649 2D AAAATTGCTA AG/-- AGAGCAGATT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 AG 3 2 298687 CASAVA_Build 2 99212640 1D ACCAATAGTT A/- AAAAAAAAAA 2656 het 2656 ref 27 19 7 1 A 11 10 298688 CASAVA_Build 2 99237305 21D CCCTGTTTCA AGATAGTATTCTCACAGGCTC/--------------------- AGTACATAGT 3070 het 3070 ref 38 25 15 5 AGATAGTATTCTCACAGGCTC 1 0 298689 CASAVA_Build 2 99242109 1D AAGAGCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 13 12 298690 CASAVA_Build 2 99264168 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAGGAATAAT 3070 het 54 hom 19 1 14 4 AAG 1 2 298691 CASAVA_Build 2 99277409 4D TGACAGGTTC TTTT/---- TTATTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 T 6 2 298692 CASAVA_Build 2 99278740 1D AATCATAGTG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 44 13 22 12 A 8 7 298693 CASAVA_Build 2 99280616 1I GGAATTTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 8 9 298694 CASAVA_Build 2 99282977 1D CACTAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 11 10 298695 CASAVA_Build 2 99285912 2I CCTCCATCTG --/AA AAAAAAAAAA 1430 het 1417 hom 29 5 10 14 A 14 16 298696 CASAVA_Build 2 99289134 1D CCAGAGAATT G/- AATCCAGCCA 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 G 1 0 298697 CASAVA_Build 2 99289383 1D GGGGAAAATC A/- AGCTGCTTAG 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 2 1 298698 CASAVA_Build 2 99294855 3I AAAAAGGAAA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 AAT 3 4 298699 CASAVA_Build 2 99299013 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 39 3 18 18 T 16 14 298700 CASAVA_Build 2 99307477 1D AAGGAACGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2928 hom 27 9 14 4 T 10 9 298701 CASAVA_Build 2 99321069 1D TTCCGGCCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 120 het 51 0 37 14 T 9 8 298702 CASAVA_Build 2 99325523 1D TTTTGTCTCC T/- TTTCTCCTTC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 4 3 298703 CASAVA_Build 2 99330849 2I AGAAGTTGCT --/AG AGAGAATTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 AG 2 3 298704 CASAVA_Build 2 99333292 1D ATTTACATTT C/- CCCCCACAGT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 C 6 5 298705 CASAVA_Build 2 99343595 10D AGGGAAAAAT AGGAATGTAA/---------- AGGTATTTTG 3070 het 3070 hom 54 23 29 4 AGGAATGTAA 1 0 298706 CASAVA_Build 2 99347775 1D TTCATGACCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 9 8 298707 CASAVA_Build 2 99348984 2D CTAAGCATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 306 hom 54 5 29 20 AC 6 5 298708 CASAVA_Build 2 99350327 1I GTTGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 339 hom 23 1 20 2 T 13 14 298709 CASAVA_Build 2 99354886 1D ATGATGTTAC A/- AAATAGGGTT 3070 het 3070 ref 58 35 18 5 A 4 3 298710 CASAVA_Build 2 99361891 1D TAATTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2894 hom 29 9 13 7 T 15 14 298711 CASAVA_Build 2 99371332 1I GTTTTTTTGG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 T 7 8 298712 CASAVA_Build 2 99372494 4I AAAGTGTATG ----/AGTA AGTAAGTCAC 3070 het 3070 hom 35 18 15 2 AGTA 1 2 298713 CASAVA_Build 2 99373323 1I CAGTTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1800 hom 34 9 8 17 T 14 15 298714 CASAVA_Build 2 99386045 1D ATGATAGTAT G/- GATAGTCTGG 3070 het 3070 ref 49 23 20 8 G 2 1 298715 CASAVA_Build 2 99388110 1I CTGTTCCTTT -/G GCCAGGGCCT 3070 hom 111 het 48 0 37 11 G 1 2 298716 CASAVA_Build 2 99397351 1D TTAACAATTT A/- AAAAAAAAAA 2756 het 2756 ref 47 26 8 13 A 15 14 298717 CASAVA_Build 2 99416859 4D TCTACTGTTT GTTA/---- TTCTACTTCC 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 GTTA 1 0 298718 CASAVA_Build 2 99417749 1I TCAATTTTAC -/A GCAACAGAAA 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 A 0 1 298719 CASAVA_Build 2 99419027 4I TCTCTAATTA ----/GTTT GTCAAAAAGT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 GTTT 0 1 298720 CASAVA_Build 2 99421091 4I TCTATGTCAA ----/AATT AATTAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 AATT 1 2 298721 CASAVA_Build 2 99432573 1D GCTATGTTGC T/- TTTAGTACAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 4 3 298722 CASAVA_Build 2 99434668 1I AGACTCTACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 13 9 A 10 11 298723 CASAVA_Build 2 99435485 4D TTACCATGTC TGTT/---- TGTTTACTTG 3070 het 3070 ref 42 26 14 5 TGTT 2 1 298724 CASAVA_Build 2 99440503 1D CGCTTGAGCC A/- GGGAGGCAGA 3070 het 3070 ref 24 11 11 4 A 1 0 298725 CASAVA_Build 2 99440832 1D ATCCACAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 12 11 298726 CASAVA_Build 2 99442102 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2123 hom 20 7 11 4 A 13 12 298727 CASAVA_Build 2 99443916 4I GAAGCAATGC ----/CTAT CTGTTTTCAT 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 CTAT 0 1 298728 CASAVA_Build 2 99447994 5I CAACTGATGA -----/AAGTC AAGTATACAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 AAGTC 0 1 298729 CASAVA_Build 2 99454033 2D CAAGGTTGAA AC/-- ACAATTTGCC 3070 het 3070 ref 42 20 11 11 AC 2 1 298730 CASAVA_Build 2 99457803 1D TTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 12 11 298731 CASAVA_Build 2 99459976 1I GGTCTTGGGA -/C CCCCAACTCC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 C 4 5 298732 CASAVA_Build 2 99464587 2I GGAGATCCCT --/AC ACACACACAC 3070 het 1200 hom 32 6 11 15 AC 8 9 298733 CASAVA_Build 2 99466930 1D TATGTAAAAA C/- ATCCCACCTA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 C 1 0 298734 CASAVA_Build 2 99467492 3I ACTTTTAAAT ---/ATA ATGAGAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 ATA 0 1 298735 CASAVA_Build 2 99468769 13D CACCATTTTG GGAGGATGAGGCA/------------- GGAGGATGAG 3070 het 3070 ref 24 13 9 5 GGAGGATGAGGCA 2 1 298736 CASAVA_Build 2 99469812 1D AATAAGTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 10 9 298737 CASAVA_Build 2 99475095 1I CATTCCAGAA -/T TATTATGTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 1 2 298738 CASAVA_Build 2 99486277 1I CAGCTGGAGT -/C CCACAGGGAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 2 3 298739 CASAVA_Build 2 99486465 1I GGGCTACTAG -/C CAGATGGCTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 1 2 298740 CASAVA_Build 2 99517803 1D ATGCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 11 10 298741 CASAVA_Build 2 99545925 3I GTTCCCTGGT ---/GGA GAAGGGAATT 3070 hom 74 het 32 0 23 9 GGA 0 1 298742 CASAVA_Build 2 99562641 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 TA 7 6 298743 CASAVA_Build 2 99578555 2I GGCCTGTATT --/AA AAGAGCAGAA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 2 4 298744 CASAVA_Build 2 99583789 1I ATCATTTTTT -/G TAGGGTGATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 0 1 298745 CASAVA_Build 2 99588752 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 11 12 298746 CASAVA_Build 2 99589065 3D CCAGCTACTC AGG/--- AGGATTACTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 AGG 2 1 298747 CASAVA_Build 2 99594781 2I ATATCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 29 1 19 9 A 13 15 298748 CASAVA_Build 2 99609211 4D TGCCTCCCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 3070 hom 82 het 46 0 22 25 CCTT 4 3 298749 CASAVA_Build 2 99610836 1D TGTACCAGTA C/- CCATGTTGTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 3 2 298750 CASAVA_Build 2 99623509 1I GGCCAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 33 0 24 9 T 11 12 298751 CASAVA_Build 2 99631194 19I AATGACCAAG -------------------/TTTTGTAAACTTTGAGGGT TTTCCCTTGC 3070 hom 111 het 38 0 38 3 TTTTGTAAACTTTGAGGGT 0 1 298752 CASAVA_Build 2 99638033 1I GACTTGGCTT -/A AGGTGGCAGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 298753 CASAVA_Build 2 99639147 1D GTTCTAAGAG A/- AAAAGATTTA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 5 4 298754 CASAVA_Build 2 99653430 2D TGTATGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 2560 het 2560 ref 55 33 7 15 TG 10 9 298755 CASAVA_Build 2 99654454 1D TGTTCTCTCT G/- TAAGTTATTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 0 298756 CASAVA_Build 2 99673672 1I AAGGTAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 42 1 32 9 T 12 13 298757 CASAVA_Build 2 99675639 1D CCTGGCAGAT C/- TTCCTTCACC 3070 hom 177 het 61 0 58 3 C 1 0 298758 CASAVA_Build 2 99679610 11I GAGTGCAGTG -----------/GCGCAATCATA GCTCACTGCA 3070 hom 91 het 35 0 25 10 GCGCAATCATA 0 1 298759 CASAVA_Build 2 99686540 1I CATTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 197 hom 26 1 19 6 T 11 12 298760 CASAVA_Build 2 99699787 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 421 hom 19 1 12 7 T 1 0 298761 CASAVA_Build 2 99701441 1I AGTAGTCCTT -/A AGATTCTTAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 2 298762 CASAVA_Build 2 99711887 6D CCTAAAATAG AGAGTT/------ ATAACACCTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AGAGTT 1 0 298763 CASAVA_Build 2 99715804 3D TAATTTTGTT GTG/--- GTGTCTGCAT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 GTG 2 1 298764 CASAVA_Build 2 99717261 1I TAACAGGTAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 8 9 298765 CASAVA_Build 2 99720338 1I ACTCATTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 35 1 27 7 T 10 11 298766 CASAVA_Build 2 99720875 1I ATTCCTAGAA -/G TTCTGTTTAA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 G 0 1 298767 CASAVA_Build 2 99721359 2D ACCAATCTGT TC/-- TCTTTTTATT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TC 2 1 298768 CASAVA_Build 2 99726035 1I TGGTGCCTGT -/A ACCCACAGCA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 1 2 298769 CASAVA_Build 2 99729215 1I CACGAGTATA -/G GCTGTTATGG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 G 1 2 298770 CASAVA_Build 2 99736194 1D GGGTTTCACC A/- TGTTGGCCAG 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 1 0 298771 CASAVA_Build 2 99742339 3I GAGGGATATT ---/ATC TACTTATCTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 ATC 0 1 298772 CASAVA_Build 2 99798040 1I AGTAGCCCAC -/A AAAAAAGGTC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 6 7 298773 CASAVA_Build 2 99805210 1D CTAAGACACT G/- GGGGATGGGG 3070 hom 53 het 21 0 18 5 G 5 4 298774 CASAVA_Build 2 99814502 2I ACTGCAATCG --/AA AAAACCTCAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 4 6 298775 CASAVA_Build 2 99818457 3D CCAAATACCA ACT/--- ACTACTACTA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 ACT 4 3 298776 CASAVA_Build 2 99820505 1I TAGTCCCCCC -/T CAACAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 0 1 298777 CASAVA_Build 2 99850471 1D TTTCTATATT A/- AAAAAAAAAA 2327 het 647 hom 16 5 7 5 A 17 16 298778 CASAVA_Build 2 99883833 3D CATTTTCCTC CTT/--- CTCCTAAAGA 3070 het 3070 ref 44 22 14 10 CTT 1 0 298779 CASAVA_Build 2 99884743 1D GATAGCTGTG C/- CCCCCAGAGC 3070 hom 175 het 62 0 58 4 C 6 5 298780 CASAVA_Build 2 99887304 1I TAGAGTTCGG -/A AAAAAAAAAA 1248 het 1248 ref 32 24 5 3 A 13 14 298781 CASAVA_Build 2 99909602 1I TGCCCTGCCT -/G GGGGGTTACA 3070 hom 79 het 36 0 26 10 G 5 6 298782 CASAVA_Build 2 99959693 1I TTTGTTCCTG -/T TTTTTTTTTT 1907 het 1907 ref 37 20 7 10 T 15 16 298783 CASAVA_Build 2 99999180 3D GTAGTGGGGG TGA/--- TGATGGTGGT 3070 het 3070 ref 48 20 14 19 TGA 2 1 298784 CASAVA_Build 2 99999334 1I TGGTGGTGAT -/G GTGGTGGTGG 3070 het 3070 ref 70 27 21 22 G 1 2 298785 CASAVA_Build 2 100095430 1I TACAAAAAAT -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 A 6 7 298786 CASAVA_Build 2 100141818 5D CATTCATGGT AACCC/----- AGCTGAGAGG 3070 het 3070 ref 35 22 11 4 AACCC 1 0 298787 CASAVA_Build 2 100159774 1D AATACTGGTC T/- TGTGCACTTG 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 T 2 1 298788 CASAVA_Build 2 100161272 1D TACTGCCCCC T/- CCCTAAATAA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 1 0 298789 CASAVA_Build 2 100162395 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATGGCGT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 AGG 0 1 298790 CASAVA_Build 2 100187808 1D AGTGTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 2814 het 2814 ref 36 21 7 8 T 15 14 298791 CASAVA_Build 2 100208235 1D CCATGAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 13 12 298792 CASAVA_Build 2 100220648 1I AGACTTAGGC -/A AAAAAAACAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 7 8 298793 CASAVA_Build 2 100265687 14I CCATGATGAG --------------/ACTGAGTTTTATCT ACTGAAAACT 2988 het 2988 ref 21 11 7 3 ACTGAGTTTTATCT 0 1 298794 CASAVA_Build 2 100274072 1I CATTCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 T 10 11 298795 CASAVA_Build 2 100280203 1D TGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 1289 het 442 hom 25 2 4 19 T 10 9 298796 CASAVA_Build 2 100280882 1D TTGTAAAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 35 12 18 7 A 9 8 298797 CASAVA_Build 2 100283048 4D TCATATGCAA TCTG/---- TCTGTCTGTC 3070 het 3070 ref 35 14 14 8 TCTG 3 2 298798 CASAVA_Build 2 100283147 1I CTTTGCTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 9 10 298799 CASAVA_Build 2 100337305 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 13 3 A 12 11 298800 CASAVA_Build 2 100416021 1D TGAACCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 A 10 9 298801 CASAVA_Build 2 100418242 1D GCATTTTCTA T/- TTGGTAAAAA 3070 hom 126 het 50 0 43 8 T 3 2 298802 CASAVA_Build 2 100479389 4I AGAGCAAGAC ----/TCTG TCTCCAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 26 2 TCTG 0 1 298803 CASAVA_Build 2 100503004 1D GCATTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 13 12 298804 CASAVA_Build 2 100516391 1D CTCCACAGGT G/- GGGAGTGCCT 3070 hom 87 het 32 0 27 6 G 4 3 298805 CASAVA_Build 2 100540116 4I ATATTTCTAG ----/TACT TACTTGTTAA 3070 het 3070 hom 53 22 25 6 TACT 1 2 298806 CASAVA_Build 2 100549106 3D ACTCTCAGTC ATT/--- ATTAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 16 13 8 ATT 2 1 298807 CASAVA_Build 2 100551207 40D AGAAAAGTAG TCAAAGGTTTGAGCCTGGGGAATTTTAATCAGCAAAGGGT/---------------------------------------- TCAACAGTAG 3070 het 3070 ref 22 14 11 5 TCAAAGGTTTGAGCCTGGGGAATTTTAATCAGCAAAGGGT 1 0 298808 CASAVA_Build 2 100554806 14I TCACTTCTGC --------------/CTGTGTATGAGTGA CTGTGTATGA 3070 het 3070 hom 41 17 18 8 CTGTGTATGAGTGA 0 1 298809 CASAVA_Build 2 100556566 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1728 het 1005 hom 17 5 6 6 A 17 16 298810 CASAVA_Build 2 100559566 1D TTTGGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 10 298811 CASAVA_Build 2 100559710 2D AAAAAGAAAT AC/-- AGTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 20 4 AC 1 0 298812 CASAVA_Build 2 100559979 1D TGTTAACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 266 hom 34 1 22 11 T 15 14 298813 CASAVA_Build 2 100572807 1D TTTGGTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 10 6 T 12 11 298814 CASAVA_Build 2 100572915 1D TAACAGTATA C/- AACAACTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 C 1 0 298815 CASAVA_Build 2 100603226 1I AAAATCAATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 9 10 298816 CASAVA_Build 2 100613326 2D TCAGGGTCAC AG/-- AGAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 50 21 24 6 AG 2 1 298817 CASAVA_Build 2 100616210 1I TGAGATTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 27 1 21 5 T 10 11 298818 CASAVA_Build 2 100623109 1D AGCAGATGCA G/- GGTCAGAGCA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 G 3 2 298819 CASAVA_Build 2 100631777 1D TCTGCTGGTG C/- CCAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 C 3 2 298820 CASAVA_Build 2 100642397 1D TGCCTTTAAT C/- ATTGATGGGT 3070 het 3070 ref 49 25 22 2 C 1 0 298821 CASAVA_Build 2 100664728 8I GCTGAAGGCC --------/CACATACT CACATACTCA 3070 het 3070 ref 47 21 14 12 CACATACT 1 2 298822 CASAVA_Build 2 100673240 3I AATGATAATG ---/ACA ACAACAAACT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 ACA 2 3 298823 CASAVA_Build 2 100679832 1D GAGCCTCAGG A/- AAAAGTAGGA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 5 4 298824 CASAVA_Build 2 100691167 5D TATATATGTG ATTGC/----- ATTGCATATG 3070 het 3070 ref 36 22 14 4 ATTGC 2 1 298825 CASAVA_Build 2 100692806 4D GGTTAAACTT TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 TA 8 6 298826 CASAVA_Build 2 100699041 1I CTCATGGAAT -/A TCACTGTACC 3070 het 3070 ref 54 34 15 5 A 0 1 298827 CASAVA_Build 2 100705786 1I ACTTACAGTA -/C CCCTAGTAAC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 3 4 298828 CASAVA_Build 2 100709073 1I CAAAGTAACA -/T TAGGAACAGA 3070 het 3070 ref 55 29 19 7 T 1 2 298829 CASAVA_Build 2 100710304 1I TGCACCTATC -/A ACCCATCACC 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 A 1 2 298830 CASAVA_Build 2 100716103 3D GTTATCTACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3019 hom 27 9 12 7 A 15 12 298831 CASAVA_Build 2 100725281 1D ACACCGTACA C/- TATTATCTCC 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 C 1 0 298832 CASAVA_Build 2 100726575 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 1208 hom 22 5 12 5 T 8 9 298833 CASAVA_Build 2 100731057 1D AGAGGGTGCT G/- GGGAATCGGG 3070 het 3070 hom 44 13 20 13 G 4 3 298834 CASAVA_Build 2 100737230 1D CAAAACCTAG T/- TTTGTTAACA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 4 3 298835 CASAVA_Build 2 100740937 1I TATTTCAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 13 14 298836 CASAVA_Build 2 100744354 1D GACTGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 11 10 298837 CASAVA_Build 2 100747630 9D AACCATTGGC TCTCCTGGG/--------- TCTCCAGCTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 6 TCTCCTGGG 1 0 298838 CASAVA_Build 2 100750246 2D TTTGTCAGAC AT/-- GTGTGCTGGG 3070 het 3070 ref 53 31 18 4 AT 1 0 298839 CASAVA_Build 2 100753132 1I AGTAGAGGGG -/T TTTCTTGTTT 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 T 3 4 298840 CASAVA_Build 2 100758313 2I GTTTCCTCTC --/TT AAGGCCTCCA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 0 2 298841 CASAVA_Build 2 100763149 1D ACCTTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 126 hom 31 1 20 10 A 15 14 298842 CASAVA_Build 2 100766430 1D CATCTCTACT A/- AAAATACAAA 3070 het 1876 hom 13 4 8 1 A 5 4 298843 CASAVA_Build 2 100779372 2D TTCAGACCAT CG/-- CGCACCCACT 3070 het 3070 hom 47 22 23 5 CG 2 1 298844 CASAVA_Build 2 100790042 1D GTGGCCTCAT C/- CCCCTTTGCC 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 C 5 4 298845 CASAVA_Build 2 100796815 5D GTGCAAACAC ATTAA/----- ATTACCTCTT 3070 het 3070 hom 52 22 27 7 ATTAA 1 0 298846 CASAVA_Build 2 100798654 1D GTACATGGGA G/- GGGGGGTGTA 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 G 7 6 298847 CASAVA_Build 2 100809612 3I GATTATTAGG ---/ATT CCTGGGTAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 ATT 0 1 298848 CASAVA_Build 2 100814719 4D CTGGATTTGG ATCC/---- AGTTCAAGGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 ATCC 1 0 298849 CASAVA_Build 2 100815620 1I AATGGGGGTG -/C CTAGTGCAGG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 C 1 2 298850 CASAVA_Build 2 100823498 1D ACAGCCCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2995 hom 29 8 14 7 T 11 10 298851 CASAVA_Build 2 100840697 2D CAAATGACTC TT/-- TGTCCCACTG 3070 het 3070 hom 46 20 20 7 T 3 1 298852 CASAVA_Build 2 100887405 1I CCCAATGAAA -/T GAGTGCCTGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 0 1 298853 CASAVA_Build 2 100887606 1D TTCTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1866 hom 29 5 14 10 T 17 16 298854 CASAVA_Build 2 100900963 4I TATATATATT ----/TATA TATATATATT 1646 het 1646 ref 19 8 6 5 TA 4 6 298855 CASAVA_Build 2 100919691 1D CCTGGCCAAT A/- ATGGTGAAAC 2680 het 803 hom 12 3 7 2 A 2 1 298856 CASAVA_Build 2 100931518 2D AAGATTTCTC TT/-- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 9 7 298857 CASAVA_Build 2 100936281 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAAAAA 3070 het 3021 hom 32 15 11 6 C 0 1 298858 CASAVA_Build 2 100937695 3D GATGTAATAT TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 TAA 4 3 298859 CASAVA_Build 2 100945214 1D ATATATATTT A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 5 A 7 6 298860 CASAVA_Build 2 100948367 1D TCTATATGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 A 10 9 298861 CASAVA_Build 2 100948678 14D CCACTGCCCA GCCCAGGCATGGGG/-------------- GCCTTGCGTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 GCCCAGGCATGGGG 1 0 298862 CASAVA_Build 2 100949968 4I TCAGGCCTAC ----/TCAA TCAGAGTGTC 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TCAA 0 1 298863 CASAVA_Build 2 100963885 3I GGCTCGTCGT ---/GAA GAAGCACAAC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 GAA 1 2 298864 CASAVA_Build 2 100992301 8D CTCTGTCTCC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAG 3070 het 588 hom 13 3 11 1 A 17 9 298865 CASAVA_Build 2 100995520 2D CTGAATATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 12 13 A 13 11 298866 CASAVA_Build 2 101001226 4D ATCAATTAAG TTCA/---- TTCAGGTTTT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 TTCA 2 1 298867 CASAVA_Build 2 101031562 4I GGCCATGAAT ----/GAAG GGACACTCTC 3070 hom 78 het 29 0 25 4 GAAG 0 1 298868 CASAVA_Build 2 101031630 1I ATAATAAGTC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 1303 hom 29 5 15 9 T 5 6 298869 CASAVA_Build 2 101041806 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 2752 het 307 hom 17 1 11 5 T 12 11 298870 CASAVA_Build 2 101056043 2D TGTTAGCCCC TA/-- TATCAAGAGG 3070 hom 89 het 34 0 29 5 TA 2 1 298871 CASAVA_Build 2 101061648 11D CTTTCTTAGC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 1876 hom 29 9 9 12 A 21 10 298872 CASAVA_Build 2 101065748 7D TGGATGGTGG TGATGGT/------- TGTACCATTC 3070 het 3070 hom 33 15 16 4 TGATGGT 1 0 298873 CASAVA_Build 2 101071853 1I AAACAAACTG -/A AAAAAAAAAT 2336 het 2336 ref 34 25 6 3 A 9 10 298874 CASAVA_Build 2 101080452 1I TCTGTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 12 13 298875 CASAVA_Build 2 101102266 1I GGTACCCACC -/T CCCTTCTGAC 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 T 0 1 298876 CASAVA_Build 2 101105826 6D GTTGGAGAAA AACATC/------ AGGCCCCGCA 3070 het 3070 ref 26 14 10 5 AACATC 1 0 298877 CASAVA_Build 2 101118312 1I CTCAACTAAT -/A AAAAAAAAAA 1782 het 1782 ref 44 23 5 16 A 13 14 298878 CASAVA_Build 2 101122221 1D AAAAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2168 hom 47 12 23 13 A 11 10 298879 CASAVA_Build 2 101124744 1I AAAAAAAACT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 8 9 298880 CASAVA_Build 2 101128953 2I ATACTGTTTA --/TT TTAATTCTAA 3070 het 3070 hom 37 17 20 0 T 2 4 298881 CASAVA_Build 2 101130110 2D TATTTATCTC TT/-- GTTGGACACT 3070 het 3070 ref 50 27 18 6 T 2 0 298882 CASAVA_Build 2 101145163 4D GCATCTCAAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 48 19 17 13 AC 10 8 298883 CASAVA_Build 2 101149816 1D TTGACTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 10 9 298884 CASAVA_Build 2 101153640 1D GGGGTTGGAG C/- CCCCCCCCAC 2147 het 2147 ref 17 9 6 3 C 9 8 298885 CASAVA_Build 2 101157670 1I GAGACCCTAA -/C CCAGCAGCGC 2767 het 2767 ref 22 12 7 3 C 2 3 298886 CASAVA_Build 2 101177493 1I CTGCTTTCAG -/C CCCTCATGGA 3070 hom 83 het 34 0 20 14 C 3 4 298887 CASAVA_Build 2 101187637 1I AGTCTAAGAA -/C CCCCCCCCTT 3070 hom 60 het 26 0 19 7 C 8 9 298888 CASAVA_Build 2 101190679 1D ACAAAGTTAA T/- TTTTTTTTTT 2816 het 2816 ref 24 12 9 3 T 13 12 298889 CASAVA_Build 2 101193991 1I GATAATTTGA -/T TTTTTCCTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 5 6 298890 CASAVA_Build 2 101205881 1D ATATTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 26 1 16 9 T 12 11 298891 CASAVA_Build 2 101213236 1I CAGCTAATTA -/G GGAACCTTGC 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 G 2 3 298892 CASAVA_Build 2 101220360 6D AAATATATAA ATATAG/------ ATATAGATAT 2761 het 2761 ref 20 8 9 4 ATATAG 4 3 298893 CASAVA_Build 2 101231290 1D AGTTGGGGGG A/- AAAAAAGAAT 2554 het 2554 ref 20 7 8 6 A 7 6 298894 CASAVA_Build 2 101231703 1I AGATAGGAAA -/G GGGCAGCTTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 3 4 298895 CASAVA_Build 2 101243720 1D CCAATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 T 13 12 298896 CASAVA_Build 2 101250382 1I ATAGATACTA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 6 7 298897 CASAVA_Build 2 101251099 2D CATCTCCCCC CT/-- CTTTGTTCCA 3070 het 3070 hom 42 20 17 7 CT 2 1 298898 CASAVA_Build 2 101253427 8D TAAATTGTCT ATAATAAA/-------- TTGTTTTTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 ATAATAAA 1 0 298899 CASAVA_Build 2 101260946 1I TGAAGTATAC -/A AAAATCACTT 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 A 4 5 298900 CASAVA_Build 2 101265879 1D CAAACTCCTG C/- CCAGCCTAGC 3070 het 3070 hom 51 17 22 14 C 3 2 298901 CASAVA_Build 2 101280442 1I TTTTAGAGAT -/G GGGGTCTCAC 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 G 4 5 298902 CASAVA_Build 2 101284133 1I GCAATTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 10 11 298903 CASAVA_Build 2 101285876 2D ACTTGTCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2009 het 483 hom 26 4 8 14 A 16 14 298904 CASAVA_Build 2 101322094 1I AGCAACGGAA -/C CAGTTGCGGG 3070 hom 36 het 16 0 13 3 C 1 2 298905 CASAVA_Build 2 101324191 28D ATTTTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/---------------------------- AAAAAAAAAA 2225 hom 15 het 7 0 6 1 A 40 12 298906 CASAVA_Build 2 101333491 1D TTTTTTTTTT C/- CTTAAACAAT 3070 hom 66 het 41 0 33 9 C 2 1 298907 CASAVA_Build 2 101334943 2D TTAAAAAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 17 6 T 14 12 298908 CASAVA_Build 2 101359178 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 19 1 13 5 T 12 11 298909 CASAVA_Build 2 101363674 1I CATCCCTACT -/A AAAAAAAATA 2631 het 2631 ref 18 8 7 3 A 8 9 298910 CASAVA_Build 2 101365322 1D CTCTATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 15 14 298911 CASAVA_Build 2 101394398 1I GGGCGGGGGA -/G GGGGGTGTCT 3070 hom 43 het 19 0 14 5 G 5 6 298912 CASAVA_Build 2 101400284 1I ACTTTTTTGT -/A GAGACAGGAT 3070 hom 63 het 24 0 21 5 A 0 1 298913 CASAVA_Build 2 101407934 1I TTTGAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 17 1 14 2 A 10 11 298914 CASAVA_Build 2 101408533 1I CTGAAGTCAA -/T TCCCTGAGGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 298915 CASAVA_Build 2 101410956 1I GGGAGGCCAA -/G GGGGGGCAGA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 G 6 7 298916 CASAVA_Build 2 101414359 1D TGGTGATCAG T/- TTACCCTGAT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 3 2 298917 CASAVA_Build 2 101417436 10D AGCAAATAGC AATGCAACAG/---------- ACGTTGCATT 3070 hom 81 het 29 0 26 5 AATGCAACAG 1 0 298918 CASAVA_Build 2 101417628 1D GACAGCAACC A/- AGGTAATACA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 2 1 298919 CASAVA_Build 2 101418727 1I ATTTTCATTT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 298920 CASAVA_Build 2 101419517 1I CACCCAGGCA -/T TAAAACATTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 1 2 298921 CASAVA_Build 2 101420657 1I11M20D CACTCTGCTG -ATCTTAAATTTCCCAAGTTTTACTTAAATTC/TATCTTAAATTT-------------------- CCCAAGTTTT 3070 hom 66 het 23 0 23 2 N/A 0 0 298922 CASAVA_Build 2 101420764 10D TTCATGTATC CACCACCACA/---------- AACAACCACA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CACCACCACA 1 0 298923 CASAVA_Build 2 101420932 3D AGTTTGTTCC TCT/--- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 31 0 22 10 TCT 1 0 298924 CASAVA_Build 2 101421102 1D TATACTTTTA T/- TTTTTTAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 6 298925 CASAVA_Build 2 101422148 11D ACTGTTGACT TTTGAGCCTTC/----------- TTTCTATATT 3070 hom 60 het 18 0 21 2 TTTGAGCCTTC 1 0 298926 CASAVA_Build 2 101422611 1D TTTAAGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 9 10 5 T 13 12 298927 CASAVA_Build 2 101423002 2I GCTGAGATTT --/AA TAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 2 298928 CASAVA_Build 2 101428953 1I ATACACTTTT -/A GTATGTTCTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 298929 CASAVA_Build 2 101429320 1D54M19D6M3D CACTCGCCTT GGTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGCTCCCAGCCAAGTTGATCAATTATTAAGTATATGCTGAGCATAG/-GTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGCTCCCAGCCAAGTTGA-------------------TGAACA--- AGTACATGAA 3070 het 1132 hom 12 5 16 7 N/A 0 0 298930 CASAVA_Build 2 101430167 3I TTCCCAACTA ---/TTC TTCTTAAACC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTC 1 2 298931 CASAVA_Build 2 101432080 2D GAAATAGGCA AC/-- ACACGGTTGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AC 3 2 298932 CASAVA_Build 2 101433983 1D GAAACCCAGG A/- GGGAAGCCAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 1 0 298933 CASAVA_Build 2 101443095 1I TGAGCTTCCT -/G GGTGAGGCGA 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 G 2 3 298934 CASAVA_Build 2 101443211 1D ATCACCTGTC T/- TTCTGCGTCG 3070 het 3070 ref 37 22 9 7 T 3 2 298935 CASAVA_Build 2 101445555 15D ATGAAATAGG TACTATTATTAATAT/--------------- TACTATTATT 3070 het 3070 hom 45 23 24 2 TACTATTATTAATAT 2 1 298936 CASAVA_Build 2 101452216 1D CCAGATACTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3022 hom 25 7 10 8 A 9 8 298937 CASAVA_Build 2 101459342 2D AAAACATATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 CA 8 7 298938 CASAVA_Build 2 101474575 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 21 0 16 5 A 13 12 298939 CASAVA_Build 2 101487769 8D TTTCTCCTCC CACCTCCT/-------- CACCTCCTCA 3070 hom 42 het 17 0 12 5 CACCTCCT 3 2 298940 CASAVA_Build 2 101490255 1D GACAGTCCAG C/- CAGGGTGGGG 3070 hom 65 het 23 0 20 3 C 2 1 298941 CASAVA_Build 2 101490369 10D TTTATTAGTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2601 het 60 hom 20 2 9 9 T 21 11 298942 CASAVA_Build 2 101494507 1D TCAGCCATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 10 9 298943 CASAVA_Build 2 101498615 1D GCCAGAGAGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 74 het 31 0 23 10 T 9 8 298944 CASAVA_Build 2 101505255 1I GTTCTAGAGG -/C CGGAAGTCCA 3070 hom 73 het 27 0 25 2 C 1 2 298945 CASAVA_Build 2 101512871 20D ATATATACAA ACACATATATGCATACATAT/-------------------- ACATACATAT 3070 hom 66 het 26 0 23 6 ACACATATATGCATACATAT 1 0 298946 CASAVA_Build 2 101522049 1D AATTAGATAA C/- TTTGCTCAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 C 1 0 298947 CASAVA_Build 2 101524484 1I GTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 13 12 12 T 13 14 298948 CASAVA_Build 2 101546388 2D GACAAGTTGG TT/-- TTTTTTTTTT 1319 het 1207 hom 23 8 5 10 T 18 16 298949 CASAVA_Build 2 101548638 6D AAACAGAAAG AAAAGA/------ AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 AAAAGA 1 0 298950 CASAVA_Build 2 101548727 2D TTTGGAACAG GT/-- ATATATCGTC 3070 het 3070 ref 26 12 13 3 GT 1 0 298951 CASAVA_Build 2 101549283 3I GTGCTGATGG ---/GAT GATGGCAGGG 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 GAT 1 2 298952 CASAVA_Build 2 101554257 1D GCCTGGGCAA C/- AGAGCGAGAC 2708 het 1206 hom 12 3 6 3 C 1 0 298953 CASAVA_Build 2 101569952 1D AATGTATATA T/- TTGTTTATTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 3 2 298954 CASAVA_Build 2 101584430 1I TGAGAAAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 T 14 15 298955 CASAVA_Build 2 101585998 5I CTTTTCCCAC -----/AAAAA AAAAAGTCAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 5 10 298956 CASAVA_Build 2 101588070 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 A 9 8 298957 CASAVA_Build 2 101590550 1I TGACAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 10 11 298958 CASAVA_Build 2 101595094 1D TGAGGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 17 19 11 A 11 10 298959 CASAVA_Build 2 101603193 2I CCAAAGCCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 A 10 12 298960 CASAVA_Build 2 101605050 2I TCTCCAAGTG --/GC GCCTCTTTCA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 GC 1 2 298961 CASAVA_Build 2 101608137 1I TGGCTAATTA -/T TTTTGTATTT 3070 het 2915 hom 20 9 7 4 T 4 5 298962 CASAVA_Build 2 101611031 1D CTACCAGGAA G/- GTTATATCAG 3070 het 3070 ref 41 19 15 9 G 2 1 298963 CASAVA_Build 2 101613083 1I ATTTTAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 13 14 298964 CASAVA_Build 2 101620562 3I TCTTGGTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 612 het 612 ref 34 16 2 16 TTG 5 6 298965 CASAVA_Build 2 101620751 1D AGGTGTGCCA G/- GATGCCCAGC 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 G 2 1 298966 CASAVA_Build 2 101624359 1D CACTCCAACC T/- TGGGCAACAG 3070 het 3070 ref 28 15 8 7 T 2 1 298967 CASAVA_Build 2 101637120 3D ATAAAGAAAT AGC/--- AGCATAAGCA 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 AGC 2 1 298968 CASAVA_Build 2 101654501 5D ACTCTGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 75 het 8 hom 12 0 1 11 A 16 11 298969 CASAVA_Build 2 101656362 1D ACTAATTTTT G/- GTATTTTTAC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 2 1 298970 CASAVA_Build 2 101658449 6D CTCTATACAC CTGTGG/------ CCGGGAGGAT 3070 hom 132 het 49 0 45 6 CTGTGG 1 0 298971 CASAVA_Build 2 101660426 1I TAATGCTACT -/G TTAATTCAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 0 1 298972 CASAVA_Build 2 101660925 2I ACACACACAC --/AT ACGTGTATTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AT 0 1 298973 CASAVA_Build 2 101664936 1D GAGACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1419 het 1419 ref 25 12 4 10 A 12 11 298974 CASAVA_Build 2 101675664 3I TTGACCCAAG ---/TCC TCAATGAGTT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TCC 0 1 298975 CASAVA_Build 2 101677834 4I ACAACTGACC ----/AATA AATAACTAGG 3070 het 3070 hom 57 22 23 12 AATA 1 2 298976 CASAVA_Build 2 101678793 4D TTCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 42 20 21 1 AAAC 4 3 298977 CASAVA_Build 2 101684763 3D TTGGATTTTA TTG/--- TTATTTTGTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TTG 1 0 298978 CASAVA_Build 2 101688310 4D GTTCAGACAC AATG/---- AATGCACTGA 3070 het 3070 ref 50 26 18 8 AATG 2 1 298979 CASAVA_Build 2 101696614 1I CATGGCGAAA -/C CCCCGTCTCT 3070 het 2422 hom 20 8 11 1 C 4 5 298980 CASAVA_Build 2 101696950 2D CAATAGAGAC AA/-- ACCTCAAATC 3070 het 3070 ref 50 22 22 6 A 3 1 298981 CASAVA_Build 2 101701359 1D TTTTGCCAGA T/- TTGTTTCCCA 2797 het 2797 ref 23 14 6 4 T 3 2 298982 CASAVA_Build 2 101703080 1D GTCAGTGGTG T/- TTTTTTTTTT 1631 het 721 hom 22 6 6 10 T 15 14 298983 CASAVA_Build 2 101712149 5I GCTTACAGTC -----/TCTTT TCTTTTATTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TCTTT 1 2 298984 CASAVA_Build 2 101717486 1D CCGCGCACAC A/- ATCAGAGCCA 3070 hom 129 het 50 0 42 11 A 2 1 298985 CASAVA_Build 2 101722297 3D TCCCTAAAAT ATC/--- ATTTAATTCT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 ATC 1 0 298986 CASAVA_Build 2 101725425 2D AATGTGTGCC AG/-- AGAGTGAAGC 3070 hom 84 het 32 0 29 5 AG 3 2 298987 CASAVA_Build 2 101727019 2D ACAAAATGTC AG/-- GGAAGTCTTC 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 AG 1 0 298988 CASAVA_Build 2 101728343 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAAAAAAA 3070 het 888 hom 24 8 10 6 AG 0 1 298989 CASAVA_Build 2 101729185 1D CTGGCCCTGA T/- TTTTTTTTTT 2714 het 2714 ref 36 14 8 14 T 17 16 298990 CASAVA_Build 2 101766176 1I GTTTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1374 hom 37 3 26 8 A 10 11 298991 CASAVA_Build 2 101783925 1D TAAATTGCTG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 88 het 33 0 30 4 T 8 7 298992 CASAVA_Build 2 101792246 1D TTATTCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 11 10 298993 CASAVA_Build 2 101799897 1D TAAACTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2544 hom 23 9 11 3 T 13 12 298994 CASAVA_Build 2 101802157 1I TGCAACCACC -/A AAACATATGT 3070 het 3070 ref 52 30 16 6 A 3 4 298995 CASAVA_Build 2 101814167 1D CAGTACTGTG T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 53 24 22 7 T 8 7 298996 CASAVA_Build 2 101815095 1I CAATATAAAG -/T TAATAGCTTC 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 T 1 2 298997 CASAVA_Build 2 101869281 10I2M1I TAGAGACCTT ----------AT-/TATAGTTCAAATA GCTACTAGTA 3070 het 3070 ref 45 22 21 6 N/A 0 0 298998 CASAVA_Build 2 101881809 4I TCATTGGCTC ----/AGTT AGCGCACTCT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 AGTT 0 1 298999 CASAVA_Build 2 101888093 1D AAGTTGAGCA T/- TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 7 6 299000 CASAVA_Build 2 101903001 9D GTGATATAAA TTAAGACTT/--------- TTTAACTTAT 3070 het 3070 ref 43 25 19 5 TTAAGACTT 1 0 299001 CASAVA_Build 2 101906370 1I TACTCACAGT -/G TGTACAGGAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 299002 CASAVA_Build 2 101911558 19D CTGCTGCTGT GGGATAAATCCAGCACATA/------------------- GGGTGGTCCC 3070 het 3070 ref 39 21 16 14 GGGATAAATCCAGCACATA 1 0 299003 CASAVA_Build 2 101914957 1D AATGAATGTG T/- TTAAATTTTC 3070 het 3070 hom 50 24 21 5 T 3 2 299004 CASAVA_Build 2 101928358 2I TCAGACGGAG --/TC TCTCTCTGTA 3070 hom 60 het 30 0 20 10 TC 3 4 299005 CASAVA_Build 2 101935994 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 11 12 299006 CASAVA_Build 2 101955100 1I AGCAAGGCCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 8 9 299007 CASAVA_Build 2 101964036 1D ACCCCGAGAT G/- GGGGGGGGGT 2207 het 1747 hom 20 9 8 4 G 10 9 299008 CASAVA_Build 2 101972283 1I ATTAAAAAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2146 hom 33 9 18 6 T 8 9 299009 CASAVA_Build 2 101979804 1D CCACTAGGGC A/- GGGGAATTAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 1 0 299010 CASAVA_Build 2 101987244 1I CAGGGCTGTG -/C CATCAGCTCT 3070 hom 138 het 52 0 45 7 C 1 2 299011 CASAVA_Build 2 102008991 1I TAAGTGAATG -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 59 28 22 9 T 7 8 299012 CASAVA_Build 2 102017184 3I ACCGAGTGTC ---/CTT CTCTCCTACA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 CTT 0 1 299013 CASAVA_Build 2 102021086 1D TTTCTCTGCA C/- CCCCATCCCT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 C 5 4 299014 CASAVA_Build 2 102025248 1D AGAAGGAAGG A/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 35 18 11 8 A 7 6 299015 CASAVA_Build 2 102028816 1I AATAGCCGCA -/G GGTATACTTG 3070 hom 87 het 31 0 24 7 G 2 3 299016 CASAVA_Build 2 102031912 8I GATCCCACAA --------/CCGTGGGC TCCTAGTTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CCGTGGGC 0 1 299017 CASAVA_Build 2 102032328 1D CTCATAGTCA G/- GGTTCTTAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 G 3 2 299018 CASAVA_Build 2 102037752 2D5M14I TGCAGATAAG ACGTCAG--------------/--GTCAGGTCTTCATGAGGTT CCAGGGCTAC 3070 het 3070 ref 50 28 22 5 N/A 0 0 299019 CASAVA_Build 2 102042273 2D TGGGAAGATC AA/-- AGATTTGGGA 3070 het 3070 ref 61 29 26 7 A 3 1 299020 CASAVA_Build 2 102046264 1I GGTGCCCATA -/G GGTGCATGCC 3070 hom 80 het 34 0 22 12 G 2 3 299021 CASAVA_Build 2 102059073 1D CTTCGTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 184 hom 34 1 25 8 T 15 14 299022 CASAVA_Build 2 102065177 3D TTAATTTAAA TAT/--- TATTTCTGGA 3070 hom 72 het 25 0 25 3 TAT 2 1 299023 CASAVA_Build 2 102085588 1I CTACCATAAG -/A ACATGATGTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 2 299024 CASAVA_Build 2 102088226 1I TAACCCAATG -/T TTGACTGAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 2 3 299025 CASAVA_Build 2 102091132 3D GTGTGTGTGT GTG/--- GGGGGGGGTG 3070 hom 99 het 34 0 31 6 GTG 1 0 299026 CASAVA_Build 2 102114540 1I TAGAAACTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 18 het 27 1 23 3 A 9 10 299027 CASAVA_Build 2 102114796 1D CATAATTAAA T/- TTCTTAAAAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 3 2 299028 CASAVA_Build 2 102116794 2D TAGCTGGTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 29 4 A 13 11 299029 CASAVA_Build 2 102117149 5D GCACTGTTCT TGTCG/----- GTGCACTCAA 1081 het 995 hom 43 6 5 33 TGTCG 1 0 299030 CASAVA_Build 2 102118037 1D CTAAAATCTG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 7 299031 CASAVA_Build 2 102118167 1I TACCTACAAT -/A AAAAAATGCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 6 7 299032 CASAVA_Build 2 102128872 1D AGTGCTCAGG A/- AAAAAAGCAT 3070 hom 113 het 48 0 37 11 A 7 6 299033 CASAVA_Build 2 102135880 1D TGATTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 32 0 27 5 A 11 10 299034 CASAVA_Build 2 102170971 3I GAAACAGAGA ---/ACC ACCAGCTCCA 3070 hom 69 het 28 0 21 7 ACC 1 2 299035 CASAVA_Build 2 102177452 1D TTTATGCCCC T/- ATACCTGACA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 1 0 299036 CASAVA_Build 2 102177603 2I CTTGGATGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 95 het 42 0 33 9 TG 7 8 299037 CASAVA_Build 2 102177800 1D GGAGGTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 31 1 24 6 T 11 10 299038 CASAVA_Build 2 102183095 1D TTTATACATC T/- AACTCTGATT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 T 1 0 299039 CASAVA_Build 2 102186235 3D GTTTTCTCTC TCT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 38 1 32 5 TCT 1 0 299040 CASAVA_Build 2 102186416 1D AGTCCTAGAC T/- TTTCTTTAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 3 299041 CASAVA_Build 2 102187579 1I ACTCCTGCTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 8 9 299042 CASAVA_Build 2 102187805 2I CTGCTTGTTT --/TG TGGTCTTCTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TG 1 2 299043 CASAVA_Build 2 102192937 1I AGATGAAAGC -/A GTGAAGGAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 299044 CASAVA_Build 2 102197612 4D TGCTGGAAAC AGTT/---- AGCCAAGAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 AGTT 1 0 299045 CASAVA_Build 2 102232853 1D TCTGGGTTGA G/- GGGGGGGCAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 8 7 299046 CASAVA_Build 2 102234661 1I GCGCACCAGC -/G GCCTTGCCTC 3070 hom 55 het 25 0 17 8 G 1 2 299047 CASAVA_Build 2 102234791 1I ATACTTTTTT -/A TAAATCTTTA 3070 hom 39 het 17 0 12 5 A 0 1 299048 CASAVA_Build 2 102235453 1I CCTTGCGTTG -/T TTTTTTTGAC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 7 8 299049 CASAVA_Build 2 102239693 3D TTTTAAACAA TGT/--- TGTTGCCTTT 3070 hom 93 het 33 0 31 4 TGT 2 1 299050 CASAVA_Build 2 102275432 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1127 het 1127 ref 23 9 5 9 A 11 12 299051 CASAVA_Build 2 102279305 1D TCTCTCAATT G/- TTGACTTTTA 3070 het 3070 ref 54 30 19 5 G 1 0 299052 CASAVA_Build 2 102284427 1I TTCATATAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 T 9 10 299053 CASAVA_Build 2 102285358 3D TTTATTTAAA TAT/--- TATTAGTCTA 3070 het 3070 ref 19 9 8 3 TAT 2 1 299054 CASAVA_Build 2 102292427 1I AAAAAAAAAA -/C CCAAAAAATC 3070 het 2722 hom 30 9 14 7 C 2 3 299055 CASAVA_Build 2 102306166 8D TATATATATA GTGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 832 het 493 hom 13 1 3 9 GT 11 7 299056 CASAVA_Build 2 102315738 1I AATCAGAAGC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 7 8 299057 CASAVA_Build 2 102317486 1I AAATGAGGGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 8 9 299058 CASAVA_Build 2 102318282 1I CATTGGGGGG -/A AGAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 1 2 299059 CASAVA_Build 2 102336698 1D TAGCTAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 T 12 11 299060 CASAVA_Build 2 102340898 1D AAATTATATT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 9 8 299061 CASAVA_Build 2 102352079 1D ACAAACACCG C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 C 8 7 299062 CASAVA_Build 2 102353936 1I CCAGATCACC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 8 299063 CASAVA_Build 2 102356504 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 A 10 9 299064 CASAVA_Build 2 102357670 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2495 hom 23 11 8 4 A 13 12 299065 CASAVA_Build 2 102374125 1I ACTTCAGTAG -/C CCCCCCTTCC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 C 6 7 299066 CASAVA_Build 2 102393089 1I ATGGAACCCC -/A GAAATTAAAA 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 0 1 299067 CASAVA_Build 2 102404176 1I GAAGGGAGAG -/A GGCGCTTCTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 A 0 1 299068 CASAVA_Build 2 102406680 1I GTTTCCATGT -/G GCTTTGTTTA 3070 het 3070 hom 54 20 25 9 G 1 2 299069 CASAVA_Build 2 102409324 1I ATTGTTTAAA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 T 7 8 299070 CASAVA_Build 2 102409743 1D CTGAAAACTT A/- ACTCCTCCCA 3070 het 3070 hom 57 20 31 6 A 2 1 299071 CASAVA_Build 2 102411272 1D CTTTTGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 11 10 T 13 12 299072 CASAVA_Build 2 102417295 3I TTTCTGTTAA ---/ATG ATAATTTGTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 ATG 0 1 299073 CASAVA_Build 2 102419574 1D TCAGAGAGAG A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 8 7 299074 CASAVA_Build 2 102425638 1I ATCGAAATAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 7 8 299075 CASAVA_Build 2 102431955 1I GAAGTCTGGA -/G TTTGAGATCA 1806 het 1806 ref 21 15 4 2 G 0 1 299076 CASAVA_Build 2 102439564 4I GTGCCTATAT ----/ATAA ATATATTATT 1545 het 1041 hom 12 4 6 2 ATAA 0 1 299077 CASAVA_Build 2 102448551 1D TTTGTTTTTA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 8 7 299078 CASAVA_Build 2 102455721 1I ATAGAGATCT -/G GAACTTCATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 2 299079 CASAVA_Build 2 102464788 1D AAGCAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 16 12 T 11 10 299080 CASAVA_Build 2 102475519 1D CAGGAAACCA T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 7 6 299081 CASAVA_Build 2 102475691 1D CCAGAAAATG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 T 8 7 299082 CASAVA_Build 2 102481522 1D AACTCCAACA G/- TGCAATACTC 3070 het 3070 hom 48 17 22 10 G 1 0 299083 CASAVA_Build 2 102484180 1I GGCTGGCTAA -/T ATTTTGTATT 1939 het 1939 ref 20 10 6 4 T 0 1 299084 CASAVA_Build 2 102567085 1D AATTGTGTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 299085 CASAVA_Build 2 102567797 1D AGTTAAATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 9 299086 CASAVA_Build 2 102576799 1D ATGTCCTATT G/- ATACAAATGT 3070 hom 108 het 46 0 36 11 G 1 0 299087 CASAVA_Build 2 102586819 1D ATAGTAAATC A/- TGAGTTGTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 1 0 299088 CASAVA_Build 2 102587670 2D AGGTGAAAAA CT/-- CTGTGCTGAG 3070 hom 129 het 45 0 43 2 CT 2 1 299089 CASAVA_Build 2 102596996 4D AAAGAAATGA ATGG/---- ATGGATGGAT 3070 hom 81 het 39 0 27 13 ATGG 5 4 299090 CASAVA_Build 2 102600284 1I ATAAAACGAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 73 het 30 0 26 4 T 8 9 299091 CASAVA_Build 2 102601258 2D ACTTTGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 29 2 14 14 A 16 14 299092 CASAVA_Build 2 102621084 1I TGCTTCAGAC -/T TTTTCATGTT 3070 het 3070 hom 41 19 16 6 T 4 5 299093 CASAVA_Build 2 102634826 3D ATAAGGGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 13 14 12 TTG 7 6 299094 CASAVA_Build 2 102649029 1I ATAACAGCTT -/A AGTCATTCAA 2629 het 2629 ref 21 12 6 3 A 1 2 299095 CASAVA_Build 2 102653070 1I TACCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 1884 hom 15 het 8 0 6 2 T 11 12 299096 CASAVA_Build 2 102662262 2D ACACCAAAGC TA/-- TATATATATA 1931 het 1821 hom 17 5 8 4 TA 7 6 299097 CASAVA_Build 2 102663050 1I CTTGGCAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 9 10 299098 CASAVA_Build 2 102666644 3D GTTTCTCTTT CTC/--- CTCCTCTTCC 3070 het 3070 ref 43 23 16 5 CTC 3 2 299099 CASAVA_Build 2 102672398 1D TTTATAGACC T/- TGTGAAGACC 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 T 2 1 299100 CASAVA_Build 2 102693341 2D TAACTATTAT AA/-- AGAGTTTAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 3 1 299101 CASAVA_Build 2 102695296 5D GAATTCTTCA AAGGT/----- AAGAGCTTCA 3070 hom 111 het 40 0 37 5 AAGGT 1 0 299102 CASAVA_Build 2 102695934 10I ACATACAGCC ----------/CCACAAGGGT CCACAAGGGT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 CCACAAGGGT 1 2 299103 CASAVA_Build 2 102700088 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 40 het 22 0 18 4 T 10 9 299104 CASAVA_Build 2 102703472 1I CTCAGGCTCT -/G GGGGTAAGCT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 G 4 5 299105 CASAVA_Build 2 102706447 1D GAAAACACTA G/- GGGGGGTTCC 3070 het 79 hom 38 1 32 5 G 7 6 299106 CASAVA_Build 2 102708601 1D TAAGAATGTT G/- GGGGGGCTGA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 G 7 6 299107 CASAVA_Build 2 102720927 2D CAGGTGAAAC TG/-- TCAATCGTGA 3070 het 3070 hom 42 19 21 4 TG 1 0 299108 CASAVA_Build 2 102766865 1I CACTCATCTT -/A ACCCTGGCTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 299109 CASAVA_Build 2 102830244 4I CATATACTGG ----/CTTT CTATCTTTCC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 CTTT 0 1 299110 CASAVA_Build 2 102878586 1I AGTGGAGCTG -/C AGAACTACAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 299111 CASAVA_Build 2 102897936 1D AGTGAATCTA C/- CTTCCCCAGC 3070 hom 117 het 41 0 38 3 C 2 1 299112 CASAVA_Build 2 102903436 1D AATTTGAAGG T/- TGTTAGTGAA 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 2 1 299113 CASAVA_Build 2 102919365 1I TCAGAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 32 0 25 7 T 10 11 299114 CASAVA_Build 2 102969798 1D CTTATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 11 10 299115 CASAVA_Build 2 102987864 1D TTATCAGTCA G/- GGAGGGGAAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 7 G 3 2 299116 CASAVA_Build 2 103058031 1I TAAAAATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 13 20 14 A 14 15 299117 CASAVA_Build 2 103069503 4D TTTGTGGATG CAAA/---- CAAACTGATT 3070 het 3070 ref 37 21 11 10 CAAA 2 1 299118 CASAVA_Build 2 103106946 1D CAGTGGAACA C/- AATGTTCAGA 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 C 1 0 299119 CASAVA_Build 2 103128476 1I TTCTTGAAAG -/T TTTTTTTTGA 2703 het 2703 ref 20 8 6 6 T 8 9 299120 CASAVA_Build 2 103140922 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 31 0 23 8 A 11 12 299121 CASAVA_Build 2 103148052 1D TGGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 686 hom 43 2 31 10 A 13 12 299122 CASAVA_Build 2 103150170 1I GGATCCCCCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 429 hom 34 1 25 8 A 9 10 299123 CASAVA_Build 2 103163557 2D GATAGCCATT TC/-- TCTCTCTCTC 987 het 987 ref 50 35 3 12 TC 10 9 299124 CASAVA_Build 2 103168461 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 13 14 299125 CASAVA_Build 2 103195256 1D AATCAGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 13 12 299126 CASAVA_Build 2 103202133 4I GTTATCTGAC ----/ACTT ACACGTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ACTT 0 1 299127 CASAVA_Build 2 103204085 1D TCTCAGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 11 10 299128 CASAVA_Build 2 103246883 8I TATGTTGATG --------/TTTTCACT TTTTCACAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TTTTCACT 0 1 299129 CASAVA_Build 2 103254124 1I CTCAGTGTAT -/C CTTTTTCTGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 2 299130 CASAVA_Build 2 103255873 1I CCTTCTGCCT -/A AAAAAACTAC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 6 7 299131 CASAVA_Build 2 103258930 8D GAAGATTCTA CTCTGTAT/-------- CTCCAGCACC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CTCTGTAT 1 0 299132 CASAVA_Build 2 103260576 1D AAAACATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 771 hom 40 2 32 6 A 13 12 299133 CASAVA_Build 2 103274914 1D AATGTCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 841 hom 32 2 20 10 T 13 12 299134 CASAVA_Build 2 103278241 1I CTTTAACTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1002 hom 47 3 39 5 A 9 10 299135 CASAVA_Build 2 103308562 5D TGTTCAGAAA TAGAG/----- TAGATACTTG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TAGAG 1 0 299136 CASAVA_Build 2 103310710 1I TGGATGCGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 43 1 34 8 A 10 11 299137 CASAVA_Build 2 103327248 2D CTCAAACCAT AA/-- GTTGTATTTT 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 A 2 0 299138 CASAVA_Build 2 103426682 1I ATTTAAAACC -/A AAAAAAAAAA 1507 het 1507 ref 28 15 6 7 A 13 14 299139 CASAVA_Build 2 103432923 1D GAAACACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 16 6 A 12 11 299140 CASAVA_Build 2 103458968 1I TCGTCCCAGA -/G GGGCACTCAC 3070 hom 118 het 44 0 38 6 G 3 4 299141 CASAVA_Build 2 103482942 1D TATCACTCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 28 0 19 9 T 10 9 299142 CASAVA_Build 2 103484253 1D TTTGGGTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1420 hom 27 4 14 9 T 15 14 299143 CASAVA_Build 2 103494687 5I AGTTTGAAGT -----/TTAGA TTATTCATTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTAGA 0 1 299144 CASAVA_Build 2 103496572 1D CAAAGTTCAA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 126 het 47 0 43 6 T 9 8 299145 CASAVA_Build 2 103502463 1D TAAAAAAAAA T/- AAGTTTATTA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 T 1 0 299146 CASAVA_Build 2 103509307 3I ATCTTGGACT ---/AGG AGGAAGCTAA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 AGG 1 2 299147 CASAVA_Build 2 103511608 1D GAGGGCTCAC A/- CTAAAGCAAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 1 0 299148 CASAVA_Build 2 103512874 1D CTTTGCTCCA G/- CTTTGGCCTA 3070 het 3070 ref 41 24 17 0 G 1 0 299149 CASAVA_Build 2 103513927 1D CTTCTAGATG C/- CCCCACTAAT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 C 5 4 299150 CASAVA_Build 2 103516462 1D CTATAGGTCT A/- ACTTTTATAC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 2 1 299151 CASAVA_Build 2 103517415 1D TCTATTTTTT C/- AGTCTTTTGG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 1 0 299152 CASAVA_Build 2 103520189 1I AATTTTAGGG -/T TTTTTTTGCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 7 8 299153 CASAVA_Build 2 103525417 2I TAAAATATGA --/TG TGTCATAACA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TG 1 2 299154 CASAVA_Build 2 103537274 1D GCTTTTAAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 9 8 299155 CASAVA_Build 2 103537441 1I TGAGTCTTGT -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 6 7 299156 CASAVA_Build 2 103541282 1I AAGTCTGTAT -/C CTGGAGGTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 2 299157 CASAVA_Build 2 103541966 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 7 6 299158 CASAVA_Build 2 103542262 1D ATAAAAAAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 10 9 299159 CASAVA_Build 2 103546448 1I ATACAGAAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 6 7 299160 CASAVA_Build 2 103551414 1I AACCCAATTG -/A AAAAAAAAAA 2825 het 2825 ref 38 21 8 9 A 12 13 299161 CASAVA_Build 2 103558910 1I AAACAAAACG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 8 299162 CASAVA_Build 2 103560704 1D TCATCTTAAA G/- GTGTTTTGTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 2 1 299163 CASAVA_Build 2 103560871 1I GTGTAAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 935 hom 35 3 23 9 T 12 13 299164 CASAVA_Build 2 103577011 1I AGAAAACAGG -/A AAATGTGGGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 3 4 299165 CASAVA_Build 2 103591113 4I AGAGGCATCC ----/GTAA GTGTTACATC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 GTAA 0 1 299166 CASAVA_Build 2 103599355 1I AAAAGACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1275 hom 45 4 28 13 T 13 14 299167 CASAVA_Build 2 103604709 1I AACCAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 33 0 23 10 A 13 14 299168 CASAVA_Build 2 103607937 1I GAACTAGCAG -/A AAAAAATTAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 6 7 299169 CASAVA_Build 2 103619943 2I GCCTAGCACC --/AG AGGCAGTATA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 AG 1 2 299170 CASAVA_Build 2 103672993 2D AGGGAGTGAC AT/-- GTGTAAATGC 3070 het 3070 hom 31 11 16 5 AT 1 0 299171 CASAVA_Build 2 103696528 1D TTGTGTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 10 9 299172 CASAVA_Build 2 103701802 1D AATCCACCAG C/- AAAGAGAAAT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 C 1 0 299173 CASAVA_Build 2 103715144 1D CTGGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1400 het 1400 ref 36 20 6 11 T 15 14 299174 CASAVA_Build 2 103718025 1D CACTAGGACA G/- TGTGTGCTGG 3070 het 3070 hom 44 18 21 8 G 1 0 299175 CASAVA_Build 2 103721819 1D ACTATTTCAC T/- TTTTTTTTTT 2010 het 2010 ref 35 21 5 9 T 12 11 299176 CASAVA_Build 2 103725633 1I AAAATCAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 468 hom 15 1 12 2 A 9 10 299177 CASAVA_Build 2 103737344 1D CGTCTCAGAG A/- AAAAAAAAAA 1061 het 1061 ref 15 5 4 7 A 16 15 299178 CASAVA_Build 2 103751854 1D TGTTAGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 27 1 22 4 T 12 11 299179 CASAVA_Build 2 103765534 1D TGGACCAGAA T/- GGGGATAGGC 3070 het 3070 ref 51 21 21 9 T 1 0 299180 CASAVA_Build 2 103785310 9I ATTCTTGATT ---------/TATACTATA TAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 TATACTATA 0 1 299181 CASAVA_Build 2 103804282 8D69M1D ATTCATGCTG CAGAAACCCAGAACTTGGGTATCAGGAATCTTAGAAACTTTTCTGAGGATTGGCTGAAAATCCGATTATAAAGTAGCT/--------CAGAACTTGGGTATCAGGAATCTTAGAAACTTTTCTGAGGATTGGCTGAAAATCCGATTATAAAGTAGC- TAGATATGAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 30 N/A 0 0 299182 CASAVA_Build 2 103806570 1D AATTCCAACA T/- TTTTTTTTTT 927 het 927 ref 45 29 5 12 T 13 12 299183 CASAVA_Build 2 103811327 2D ATTTCACAGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 11 9 299184 CASAVA_Build 2 103816672 1I TGTGAGTAAC -/T GAAAGCTTAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 0 1 299185 CASAVA_Build 2 103817424 4D CCAAGTGGCA TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 180 het 66 0 57 11 TTGT 6 5 299186 CASAVA_Build 2 103818195 21D TTCTTGCTCA GTTAATGTCCCTGTGATTAAC/--------------------- TTTCAGTCAA 3070 het 3070 ref 32 23 10 4 GTTAATGTCCCTGTGATTAAC 1 0 299187 CASAVA_Build 2 103822429 1I CATTAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 10 11 299188 CASAVA_Build 2 103841981 4I CTGTGCGTGC ----/ACAT ACAAACACAC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 ACAT 0 1 299189 CASAVA_Build 2 103842954 2I CTATTGACTT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 AC 8 9 299190 CASAVA_Build 2 103854670 2D CTGAAAAGAA AG/-- AGAACTTTGT 3070 het 3070 hom 55 18 30 8 AG 2 1 299191 CASAVA_Build 2 103855425 1I TATGTCGATA -/T TTTTTGTATC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 5 6 299192 CASAVA_Build 2 103858475 1D GGAACGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 A 13 12 299193 CASAVA_Build 2 103859702 1D TAGGGCTGTA G/- GCAGCTTCAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 G 2 1 299194 CASAVA_Build 2 103894212 1D GTTGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 11 10 299195 CASAVA_Build 2 103921722 1I ATTTTAGGAG -/T TTTTTTTTTT 943 het 943 ref 47 37 4 6 T 11 12 299196 CASAVA_Build 2 103933164 1D TAAAATAAAG A/- AAAAAAAAAA 2189 het 1895 hom 13 5 5 4 A 12 11 299197 CASAVA_Build 2 103936619 1D TTAATAAATC A/- AAAAAAAAAA 1968 het 1968 ref 39 21 6 12 A 15 14 299198 CASAVA_Build 2 103936684 1I AATTTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 20 16 15 T 10 11 299199 CASAVA_Build 2 103972028 2I TCTCTTTCTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1696 hom 28 9 11 8 TG 8 9 299200 CASAVA_Build 2 103977243 10I AAATTTTATT ----------/TCGATCATTA TCCAAGCAGC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 TCGATCATTA 0 1 299201 CASAVA_Build 2 103992338 4D TTCTTCTCTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1208 hom 44 11 10 23 T 16 12 299202 CASAVA_Build 2 104004598 1D CGCCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 2020 hom 11 het 11 0 6 5 A 10 9 299203 CASAVA_Build 2 104004611 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 1637 hom 12 het 12 0 5 7 A 7 8 299204 CASAVA_Build 2 104006093 1D AATCAAACAC G/- GAGCACACAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 G 2 1 299205 CASAVA_Build 2 104007549 2I TATTTCCTTT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 9 11 299206 CASAVA_Build 2 104010660 1D TCAGGCTTGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 9 8 299207 CASAVA_Build 2 104012029 1D TTCACAGATT C/- TTCCTCCTTT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 C 1 0 299208 CASAVA_Build 2 104015270 1I TCAAAAAAAA -/T GGTAGTTTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 1 299209 CASAVA_Build 2 104070350 9I4M22I GTACAAGAGT ---------TGTA----------------------/TTATGTGGATGTACATTTTCATTTCTCTTTCATTT CTGAATAGAA 3070 hom 72 het 22 0 25 2 N/A 0 0 299210 CASAVA_Build 2 104070969 1I TTTTGAAGAA -/T TTTTACATAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 4 5 299211 CASAVA_Build 2 104078061 1I ACTTCCTACA -/G GTCTCTGTTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 2 299212 CASAVA_Build 2 104080957 2D AAAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 29 1 21 7 A 14 12 299213 CASAVA_Build 2 104086076 1D ATTCAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 18 11 A 13 12 299214 CASAVA_Build 2 104088304 1I ATTTTTATTT -/A AAAAAAATAA 2688 het 2688 ref 21 14 6 1 A 7 8 299215 CASAVA_Build 2 104089334 2D AGGCATATCC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 60 23 29 9 A 11 9 299216 CASAVA_Build 2 104091460 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 10 9 299217 CASAVA_Build 2 104099630 2D AACTGTCATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3050 hom 20 8 11 1 T 12 10 299218 CASAVA_Build 2 104099699 1D AGAATTTCCA T/- TTGGGATTGG 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 3 2 299219 CASAVA_Build 2 104104237 1D AAAAAAAAAA C/- CAATTATCAT 1740 het 1740 ref 39 20 9 10 C 2 1 299220 CASAVA_Build 2 104116246 8I AACAAAGTGC --------/TGCACGTT TGCACGTTGT 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 TGCACGTT 1 2 299221 CASAVA_Build 2 104123463 4D CTTAGTGGTG GCCA/---- ACAACATCAC 3070 het 3070 ref 55 29 23 3 GCCA 1 0 299222 CASAVA_Build 2 104135436 2D ATTGTAAGTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 AT 7 6 299223 CASAVA_Build 2 104146698 1D TTCATTAGTT A/- AAGAGTTGCT 3070 hom 108 het 45 0 35 11 A 3 2 299224 CASAVA_Build 2 104191465 1D TTCCTTAAGT A/- ACATCAAACT 3070 het 3070 ref 39 21 12 7 A 2 1 299225 CASAVA_Build 2 104192660 1D GAAGAAGATC A/- AATTCTCCAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 3 2 299226 CASAVA_Build 2 104199648 3I GAAATTTGAC ---/ACA ACAATTGTAA 3070 hom 108 het 44 0 37 8 ACA 1 2 299227 CASAVA_Build 2 104276294 7D AGTCCTCAGG CACTTTT/------- CACTTTTCAC 3070 het 3070 hom 38 13 17 10 CACTTTT 3 2 299228 CASAVA_Build 2 104278833 1D TATGCTATCC T/- ATTTTCACTT 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 T 1 0 299229 CASAVA_Build 2 104288096 1D ATTCCACTTT A/- ATTTGTTCTA 3070 het 3070 hom 24 9 11 7 A 2 1 299230 CASAVA_Build 2 104296948 1I CTATGAATAA -/T TTTTTTTTTT 2058 het 2058 ref 23 15 6 2 T 10 11 299231 CASAVA_Build 2 104308598 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2767 hom 21 7 12 2 T 11 12 299232 CASAVA_Build 2 104314036 2I GTTATATAAC --/AT ATACTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 AT 1 2 299233 CASAVA_Build 2 104334328 1D2M1D GACCCTATTT CTCA/-TC- CTTTCATAAC 2214 het 178 hom 39 2 10 27 N/A 0 0 299234 CASAVA_Build 2 104345260 1D ATAAGTGGAT A/- TTCATTCCTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 A 1 0 299235 CASAVA_Build 2 104347786 1I ATGAGGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 12 13 299236 CASAVA_Build 2 104348241 1D AAAAAAAAAA G/- TAGTTTAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 1 0 299237 CASAVA_Build 2 104349918 1D TTCAAAGCAA C/- CTGAGTGTTA 3070 het 3070 hom 36 13 17 8 C 2 1 299238 CASAVA_Build 2 104350224 1D TAGAGCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 13 12 299239 CASAVA_Build 2 104351917 1D AAATCCACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 13 12 299240 CASAVA_Build 2 104352076 8D AAACGTTTGA AATGGTGG/-------- AATGGTGGAA 3070 het 3070 ref 33 15 10 10 AATGGTGG 3 2 299241 CASAVA_Build 2 104400921 1I TTTTTTGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 9 10 299242 CASAVA_Build 2 104409742 4I AATCGTAATG ----/TCTT AGAGTCGACC 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 TCTT 0 1 299243 CASAVA_Build 2 104421942 1D CAACCAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 7 12 4 A 11 10 299244 CASAVA_Build 2 104436298 1D TGAGGCATAT C/- TTTGTGCTCA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 C 1 0 299245 CASAVA_Build 2 104443904 1I GATTTTTCTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 7 8 299246 CASAVA_Build 2 104451129 1I ACATTTAGTC -/T TCTGCTTGTT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 1 2 299247 CASAVA_Build 2 104457081 1D AATAACAGAT G/- TAATAAATGT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 G 1 0 299248 CASAVA_Build 2 104472164 1D TTTTCCCCTT C/- CCTCTGTAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 C 3 2 299249 CASAVA_Build 2 104474093 1D AGATAGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 8 17 1 A 10 9 299250 CASAVA_Build 2 104474394 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 A 13 14 299251 CASAVA_Build 2 104481463 1D TATCTGTACC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 51 19 29 3 A 9 8 299252 CASAVA_Build 2 104512004 1I ACGGAACTAG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 50 16 25 9 A 7 8 299253 CASAVA_Build 2 104517082 1D CAAAAAAGCT G/- GGCACTTATA 3070 het 3070 hom 28 12 16 2 G 3 2 299254 CASAVA_Build 2 104527919 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2261 het 2261 ref 26 11 9 6 A 11 12 299255 CASAVA_Build 2 104532196 1I ACCCCATGTC -/A AAAAAAAAGA 2971 het 2971 ref 28 17 9 2 A 8 9 299256 CASAVA_Build 2 104537304 3D TGCATGCATA TAC/--- TACATATGTA 3070 het 3070 hom 61 28 29 8 TAC 2 1 299257 CASAVA_Build 2 104540872 1D TAAGTAAAGC T/- TATTTTTCAT 3070 het 3070 hom 59 25 28 8 T 2 1 299258 CASAVA_Build 2 104550272 1I CAGAAAAGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 9 10 299259 CASAVA_Build 2 104553873 1D GCATAGTGCC A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 35 16 18 2 A 7 6 299260 CASAVA_Build 2 104554577 1D ACTACCTGGG T/- TTTTTTTTTT 2491 het 1785 hom 32 9 8 15 T 13 12 299261 CASAVA_Build 2 104568040 1I TGAGAAATCA -/G GATCCCCAGG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 1 2 299262 CASAVA_Build 2 104589461 1I AGCCTGGCCA -/T CAGGACAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 0 1 299263 CASAVA_Build 2 104601884 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2606 het 2606 ref 20 9 7 4 A 11 12 299264 CASAVA_Build 2 104616138 1D ATTTTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 17 9 T 15 14 299265 CASAVA_Build 2 104616498 1I AAAAAAAAAA -/C ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 C 0 1 299266 CASAVA_Build 2 104648152 2D ACACGCACAT AC/-- ACACACACAC 1713 het 1713 ref 55 34 4 17 AC 10 9 299267 CASAVA_Build 2 104672140 1I ACTGCAACCT -/C CCGTCTCCTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 2 3 299268 CASAVA_Build 2 104673006 14I2M1D AAACAGAACT --------------TCA/CTGAAGTTTGAAAGTC- GATGGCTTTC 2951 het 2951 ref 22 14 7 3 N/A 0 0 299269 CASAVA_Build 2 104695139 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 T 10 9 299270 CASAVA_Build 2 104723710 1D TAAGCTGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 10 10 A 15 14 299271 CASAVA_Build 2 104730284 1I TGTTTATGGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 372 hom 50 1 44 5 T 8 9 299272 CASAVA_Build 2 104760006 1I GGATTCTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 71 het 37 0 23 14 T 9 10 299273 CASAVA_Build 2 104760837 1I AAAGTTCCCC -/A AAAAATATTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 6 299274 CASAVA_Build 2 104775225 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2036 hom 23 8 9 6 T 13 12 299275 CASAVA_Build 2 104784750 5I GAAATACTGA -----/GTGGT GTGGTAAAAA 3070 het 3070 ref 47 18 22 7 GTGGT 1 2 299276 CASAVA_Build 2 104786107 1D TTTTGCCTGG A/- AAAAAAAAAA 1200 het 1200 ref 27 22 3 2 A 11 10 299277 CASAVA_Build 2 104795043 1D TCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2692 het 40 hom 26 1 7 18 A 15 14 299278 CASAVA_Build 2 104816941 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1790 het 1790 ref 30 15 6 9 T 15 14 299279 CASAVA_Build 2 104819815 1D TTTTGTCTTG T/- TTTTTTTTTT 2724 het 2291 hom 36 13 12 11 T 15 14 299280 CASAVA_Build 2 104822777 1D TTGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 T 13 12 299281 CASAVA_Build 2 104829581 1D TTCAAATGTC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 50 het 20 0 17 3 A 9 8 299282 CASAVA_Build 2 104835438 1I GCGGGCGCAA -/G GCGGGCGCAC 1017 hom 18 het 8 0 5 3 G 1 2 299283 CASAVA_Build 2 104835962 1D CTGCTGCCAC A/- GGGAATTCCT 3070 hom 59 het 25 0 14 11 A 1 0 299284 CASAVA_Build 2 104840653 1I AGTCTCCAAG -/A AAAAAAATAA 2847 het 2847 ref 21 10 9 2 A 7 8 299285 CASAVA_Build 2 104842027 1I GCTTTTTGGG -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 6 7 299286 CASAVA_Build 2 104860169 8D AGTATAAGCA TCTCTCTT/-------- TCTCTCTTCT 3070 het 3070 ref 38 17 14 12 TCTCTCTT 2 1 299287 CASAVA_Build 2 104877534 1I CCAGGCTGTG -/C CTTTCAGGAC 3070 hom 87 het 35 0 28 7 C 1 2 299288 CASAVA_Build 2 104879531 1I TGGCTGAGAG -/C CTGGCTTGCA 3070 hom 138 het 52 0 45 7 C 1 2 299289 CASAVA_Build 2 104895343 1I TATGTGGTGT -/G GGGGGGCCCC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 G 6 7 299290 CASAVA_Build 2 104901613 1I AGGCTTCCAG -/C CTCCAGAACT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 C 1 2 299291 CASAVA_Build 2 104910544 1I AAGCTGGGGC -/A GGGGGATTGT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 0 1 299292 CASAVA_Build 2 104949160 1D CATATTCTGC T/- CTTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 36 8 22 6 T 1 0 299293 CASAVA_Build 2 104958306 6D CTGTCTCAAA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 het 1943 hom 27 9 15 4 AAC 8 6 299294 CASAVA_Build 2 104960102 1I CACCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 10 11 299295 CASAVA_Build 2 104972363 1D TCTGGCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 14 9 T 11 10 299296 CASAVA_Build 2 104975023 1D AGACATTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 58 19 29 11 T 11 10 299297 CASAVA_Build 2 105031880 1D GCTTTGAGTA G/- GGGACACATT 3070 het 3070 ref 53 32 18 4 G 4 3 299298 CASAVA_Build 2 105032354 1D19M2D CAGAATAAGG AAAAATGCTGCTATACATTGTT/-AAAATGCTGCTATACATTG-- TAAGTTGGAG 3070 het 3070 ref 40 22 21 7 N/A 0 0 299299 CASAVA_Build 2 105032852 3D TTAATCGAAG AAC/--- AACATCTTTG 3070 het 3070 hom 40 14 22 5 AAC 2 1 299300 CASAVA_Build 2 105034680 3I TTAATGTCTT ---/AAA AACTTCTATT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 A 2 5 299301 CASAVA_Build 2 105034987 1I CATTTTTCCT -/A ATTTGGATAC 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 A 1 2 299302 CASAVA_Build 2 105036429 12I AAAATATCTT ------------/TTAAAAATGTTG TTAAAGTATT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TTAAAAATGTTG 0 1 299303 CASAVA_Build 2 105041617 4D CCAGGCAACA GATC/---- GTGCAGTGGC 2635 het 1598 hom 19 5 8 7 GATC 1 0 299304 CASAVA_Build 2 105044231 3D ATTGGGCCTT GTG/--- GGGTGGGAAG 3070 het 3070 ref 47 23 19 7 GTG 1 0 299305 CASAVA_Build 2 105047234 1D AGGACCAGAA T/- TATGGCTAGG 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 T 2 1 299306 CASAVA_Build 2 105047316 4D GGACAGGAAT GTGA/---- GTGAGAATTG 3070 het 3070 ref 45 21 18 10 GTGA 2 1 299307 CASAVA_Build 2 105048838 10D TTGTAAAAGA AAAGAAAAAG/---------- AAAGAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 12 17 8 AAAGAAAAAG 2 1 299308 CASAVA_Build 2 105055219 1I CAGTGAACTT -/A ACACTTCCTA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 1 2 299309 CASAVA_Build 2 105060376 2D AAAAGCAAGT AA/-- AAAAATGGTG 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 A 7 5 299310 CASAVA_Build 2 105063797 2I TTTATTTCTT --/GG GGGGGAAAAA 302 het 302 ref 27 16 4 7 G 5 7 299311 CASAVA_Build 2 105072330 1D AGACAGCGAT A/- AGATCAGATC 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 A 2 1 299312 CASAVA_Build 2 105073381 5I CGGAATCCCT -----/TGAAA TGAAATGCTG 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 TGAAA 1 2 299313 CASAVA_Build 2 105087945 2I TGAAAAACCA --/CC CCTGAAGAAG 3070 het 3070 ref 54 28 23 3 C 2 4 299314 CASAVA_Build 2 105089560 1D GTGGCCAATT C/- CAAAACCCAC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 C 2 1 299315 CASAVA_Build 2 105097598 20D AATAAGCAAC TAGGCGCACAGAGACCAGGA/-------------------- GGAAGAGGAT 3070 het 3070 ref 47 26 24 5 TAGGCGCACAGAGACCAGGA 1 0 299316 CASAVA_Build 2 105124866 2I TAGGCATCCG --/CA CACCCACTCT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 CA 1 2 299317 CASAVA_Build 2 105135374 1I CTGGCCTTAT -/G ACCCCTATTG 3070 hom 157 het 58 0 53 5 G 0 1 299318 CASAVA_Build 2 105140039 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 29 0 21 8 A 11 10 299319 CASAVA_Build 2 105140320 1I GCAGCAGGGT -/G GGGGGGCTAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 6 7 299320 CASAVA_Build 2 105142077 4D TATAAAAACA CAAT/---- CAATCAGAAA 3070 hom 80 het 31 0 28 4 CAAT 2 1 299321 CASAVA_Build 2 105148177 4D CCGCATTAAA CACT/---- CACTCTCCAT 3070 het 3070 ref 34 16 11 9 CACT 2 1 299322 CASAVA_Build 2 105157321 1I TTGGCAGGTG -/A AGATGCAGTT 3070 hom 120 het 43 0 35 8 A 1 2 299323 CASAVA_Build 2 105160042 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 77 het 31 0 26 6 TTTC 6 5 299324 CASAVA_Build 2 105165455 1I ACTCGATCTC -/A TTCTTTTTTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 0 1 299325 CASAVA_Build 2 105169618 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAATC 2558 het 2558 ref 18 10 7 1 A 9 8 299326 CASAVA_Build 2 105169829 1I CAGTGTTAAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 8 299327 CASAVA_Build 2 105174534 2I AATGATACAG --/AC AAAAAAAAGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AC 0 1 299328 CASAVA_Build 2 105180121 2D AGGCTCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 37 1 31 6 A 14 12 299329 CASAVA_Build 2 105186422 23D TGTTGTATAT TTGTGCTGTTGTATATTTGTATA/----------------------- TTGTGCTTTG 3070 hom 67 het 30 0 22 16 TTGTGCTGTTGTATATTTGTATA 1 0 299330 CASAVA_Build 2 105206370 1I TCTTGTTGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 8 9 299331 CASAVA_Build 2 105214137 1D TACATCCAAG T/- TTTTTTTTTT 1804 het 1804 ref 27 10 4 13 T 17 16 299332 CASAVA_Build 2 105250057 28D TTTAGGGGTT TTCCATGTACATTCATAGAGCCTGGTCA/---------------------------- TTCCATGTAC 3070 hom 48 het 25 0 17 10 TTCCATGTACATTCATAGAGCCTGGTCA 2 1 299333 CASAVA_Build 2 105257344 1D GGATTTGTGT C/- CCAGCTCTAC 3070 het 3070 ref 40 20 16 7 C 3 2 299334 CASAVA_Build 2 105290078 2D TGCTGGCTCA CT/-- CTCTCAGCAT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CT 3 2 299335 CASAVA_Build 2 105294052 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAACAAA 2606 het 50 hom 37 2 19 16 A 6 7 299336 CASAVA_Build 2 105320371 1I GCATGCGGCG -/C ACTCAGAGTG 3070 hom 39 het 20 0 10 10 C 0 1 299337 CASAVA_Build 2 105330897 17D CTTGTTTTTT CTTTTCCCTCTTTGTTC/----------------- CTTCTTTTCC 1670 het 1670 ref 42 8 10 29 CTTTTCCCTCTTTGTTC 1 0 299338 CASAVA_Build 2 105334565 3D TCCTTTCTGG TAT/--- TATAGGATGC 3070 hom 111 het 41 0 37 6 TAT 2 1 299339 CASAVA_Build 2 105337556 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 12 11 299340 CASAVA_Build 2 105342089 1D GAATTCCCCC T/- AACCATTAAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 1 0 299341 CASAVA_Build 2 105355123 1D CATAACTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1133 hom 15 3 8 5 T 10 9 299342 CASAVA_Build 2 105377468 1D ATGAGACCCT G/- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 G 3 2 299343 CASAVA_Build 2 105380780 1I GTTTTTTGTT -/G TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 G 0 1 299344 CASAVA_Build 2 105381190 1I ACTTAGAATC -/T TTTTCATTTA 2921 het 2921 ref 23 14 7 2 T 4 5 299345 CASAVA_Build 2 105401321 1I CAACATCAAC -/A AAAAAAAAAA 1001 het 1001 ref 42 31 4 7 A 10 11 299346 CASAVA_Build 2 105408121 1D AAAATCAAGG T/- TTTAAGGGAC 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 T 4 3 299347 CASAVA_Build 2 105431225 1I TATTTAGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 10 10 T 11 12 299348 CASAVA_Build 2 105448201 1I ATTCAGTCCA -/T TAACAGGTGG 2415 het 2415 ref 18 12 6 0 T 1 2 299349 CASAVA_Build 2 105452650 3D TGGTCCTGTT CAG/--- CAGCAGCCCT 3070 het 3070 ref 52 25 23 6 CAG 3 2 299350 CASAVA_Build 2 105455630 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTC 3024 hom 21 het 9 0 8 1 T 9 10 299351 CASAVA_Build 2 105461394 4D TTCCTTAAAT TAAA/---- TAGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 13 3 TAAA 1 0 299352 CASAVA_Build 2 105475455 2D CACATATAAC TG/-- TCATTTGGCT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 TG 1 0 299353 CASAVA_Build 2 105480496 2D TTTCTAAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 2326 het 668 hom 26 4 8 14 T 14 12 299354 CASAVA_Build 2 105484457 2D CAAACTAACT CA/-- CCCAGTATGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 CA 1 0 299355 CASAVA_Build 2 105500385 7I TTTCTTTTTT -------/CTTTTTC TTTTTTTTTT 1737 het 257 hom 16 4 8 4 CTTTTTC 0 1 299356 CASAVA_Build 2 105500552 1D AGCCAGCTAA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 7 6 299357 CASAVA_Build 2 105504242 5D ACAAACAAAC AAAAA/----- AAAAAAAAAC 3070 het 1675 hom 30 7 14 10 A 14 9 299358 CASAVA_Build 2 105505038 1D TGTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 1749 het 83 hom 17 2 4 11 A 12 11 299359 CASAVA_Build 2 105505575 13D AATACCACTC ATTATGAGCATTA/------------- ATTAGCTTAC 3070 het 3070 ref 47 31 17 4 ATTATGAGCATTA 1 0 299360 CASAVA_Build 2 105507115 2I ACAAAACAAC --/AT AATGTGAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 AT 0 1 299361 CASAVA_Build 2 105509897 1D TTTTCTTGTC A/- GAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 29 10 17 3 A 1 0 299362 CASAVA_Build 2 105510895 1D CTTTCAAGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 22 het 25 1 22 2 A 10 9 299363 CASAVA_Build 2 105511214 1D GAGCAACAAC A/- AGGCTGGGAG 3070 het 3070 ref 26 17 8 2 A 2 1 299364 CASAVA_Build 2 105511430 2I ATATATATAT --/AA AACACTGAAA 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 A 2 4 299365 CASAVA_Build 2 105511886 1I TTTAGTGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 274 hom 25 1 24 2 A 9 10 299366 CASAVA_Build 2 105514331 1D CTACAAATTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 8 7 299367 CASAVA_Build 2 105516282 20D TAGCCATCCC ACAATGTGTACGTAGATCAA/-------------------- AACATCATGT 3070 hom 48 het 15 0 17 1 ACAATGTGTACGTAGATCAA 1 0 299368 CASAVA_Build 2 105516996 1I CAATGCACTC -/T CCAAATTGGA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 0 1 299369 CASAVA_Build 2 105518053 1D TCAAAACTTC T/- TTTTTTTTTT 1013 het 423 hom 10 2 5 3 T 17 16 299370 CASAVA_Build 2 105518982 2I ATGTCCTAAT --/CC CCCCCAGTAA 3070 hom 129 het 46 0 43 3 C 5 7 299371 CASAVA_Build 2 105532409 4D TGTGTGTATA TATG/---- TATGTATGTA 3070 het 2304 hom 29 9 13 7 TATG 6 5 299372 CASAVA_Build 2 105532654 1D AAAACAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 716 hom 25 2 21 3 A 12 11 299373 CASAVA_Build 2 105534756 1D GTGAAAGAAC A/- AAACTCCTTC 1449 het 1449 ref 9 5 3 1 A 4 3 299374 CASAVA_Build 2 105536469 1I TAAGGGCTAA -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 T 5 6 299375 CASAVA_Build 2 105547905 11D CTTCACGTGG TGTCTCCTGAC/----------- TGTCTCCTGA 3070 het 3070 ref 52 26 18 10 TGTCTCCTGAC 2 1 299376 CASAVA_Build 2 105551409 1D TGAAGGTTTG A/- AAAAAAAAAT 1374 het 1374 ref 34 30 3 1 A 10 9 299377 CASAVA_Build 2 105551928 1D TTGGGTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 18 0 14 5 T 10 9 299378 CASAVA_Build 2 105554452 10D CAAAAGGATA CAGGGCGATC/---------- CAGTGCGATC 3070 hom 111 het 39 0 36 11 CAGGGCGATC 1 0 299379 CASAVA_Build 2 105560267 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 13 12 299380 CASAVA_Build 2 105560706 2D CCTCAGTGTC TA/-- TTGCTGCCAT 3070 het 3070 ref 42 18 14 12 TA 1 0 299381 CASAVA_Build 2 105561569 2I GAAAATAAAC --/AG AGTTTTAAGA 3070 hom 123 het 51 0 42 9 AG 1 2 299382 CASAVA_Build 2 105562114 1D GCATTATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 180 hom 27 3 19 5 A 13 12 299383 CASAVA_Build 2 105562281 1D CTGAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 12 11 299384 CASAVA_Build 2 105563114 1I AAACTTGAGG -/T TGTGGCCCCC 3070 hom 98 het 37 0 30 7 T 1 2 299385 CASAVA_Build 2 105605458 1I ACATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 545 hom 35 2 25 8 A 11 12 299386 CASAVA_Build 2 105612810 3D CCTTTTCCAC CAA/--- CAAGTATGTT 3070 het 1477 hom 26 6 13 9 CAA 2 1 299387 CASAVA_Build 2 105612844 1D AAAAAAAAAA C/- AAATGCCAAG 1928 het 1928 ref 33 13 11 10 C 1 0 299388 CASAVA_Build 2 105683976 1D ATGCCTGCAA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 7 299389 CASAVA_Build 2 105698274 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 18 2 11 5 A 15 14 299390 CASAVA_Build 2 105699381 1D TTTTCCACTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 A 9 8 299391 CASAVA_Build 2 105699944 4D TTCCTATGAA CTGT/---- CTGTTTCTTT 3070 het 3070 hom 38 12 24 3 CTGT 2 1 299392 CASAVA_Build 2 105710639 1I AACACTAATA -/T TTTAAAGTAA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 T 3 4 299393 CASAVA_Build 2 105713423 2D GGAGACACAG TC/-- TCTATTCTCC 3070 het 3070 hom 54 24 26 4 TC 2 1 299394 CASAVA_Build 2 105716732 1I GATTTTTTAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 8 9 299395 CASAVA_Build 2 105735284 4D TTAAAACTAA TATC/---- TATCATCAAA 3070 het 3070 ref 50 30 17 4 TATC 2 1 299396 CASAVA_Build 2 105738295 5D TTTGTTGCTT CTTAA/----- CTTGATTGTG 3070 het 3070 hom 39 17 16 11 CTTAA 1 0 299397 CASAVA_Build 2 105739234 1D ATCAATCTTT C/- CCTTTCTTCA 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 C 3 2 299398 CASAVA_Build 2 105740841 4I ACAGCTGGGG ----/TGAA TGAAGCACCT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TGAA 1 2 299399 CASAVA_Build 2 105742362 10I TTTATATAAT ----------/ATTACACATA AAAACATATG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ATTACACATA 0 1 299400 CASAVA_Build 2 105747911 1D AGTGGAACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 39 1 23 15 T 13 12 299401 CASAVA_Build 2 105748880 1I GGTGACGCTT -/A ACACTGCACA 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 A 1 2 299402 CASAVA_Build 2 105752686 1D GTAAAAGGAG T/- TGTAGAAGGT 3070 hom 64 het 25 0 19 6 T 2 1 299403 CASAVA_Build 2 105753809 6D GTTTGTTTGT TTTTGC/------ TTTTGTTTTT 3070 hom 28 het 15 0 9 6 TTTTGC 1 0 299404 CASAVA_Build 2 105765574 1I TTCTGAGAGT -/A GGGGGATCCG 3070 hom 80 het 31 0 24 7 A 0 1 299405 CASAVA_Build 2 105778192 1D ATATTTTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 T 10 9 299406 CASAVA_Build 2 105782160 1I TCCTAGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 11 12 299407 CASAVA_Build 2 105789600 1I TTAATGAGGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 7 8 299408 CASAVA_Build 2 105789726 1D TTACAAAATT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 A 9 8 299409 CASAVA_Build 2 105795679 3I TCATTACTGA ---/CCC AGCCAGGTGA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 0 3 299410 CASAVA_Build 2 105798958 1I GGTGGGAAGA -/G GGGAGTACAT 2668 het 2668 ref 26 10 9 7 G 3 4 299411 CASAVA_Build 2 105802807 1D TGTAGCAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 16 18 5 A 10 9 299412 CASAVA_Build 2 105802958 1I TGACCCTTTA -/G GGGACAGTAT 3070 hom 105 het 41 0 34 7 G 3 4 299413 CASAVA_Build 2 105805068 1I TTTGGAGAGT -/C TCTTTGGAAA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 C 0 1 299414 CASAVA_Build 2 105815735 1D TTCTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 12 11 299415 CASAVA_Build 2 105817540 1D CATTAAAGGG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 T 9 8 299416 CASAVA_Build 2 105820991 1I AGAACAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 9 14 T 11 12 299417 CASAVA_Build 2 105821199 1D TATTAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 T 13 12 299418 CASAVA_Build 2 105824605 1I AGGGGCTGCC -/A AGCCACCAGT 3070 het 3070 hom 38 10 19 9 A 1 2 299419 CASAVA_Build 2 105828286 2D ATATTTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 15 11 T 16 14 299420 CASAVA_Build 2 105829366 2D ATACTCACTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 34 1 26 8 A 12 10 299421 CASAVA_Build 2 105838258 1I TTGCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 562 hom 35 2 24 9 A 12 13 299422 CASAVA_Build 2 105839221 3I CATTTAAAAC ---/ATT GTTGTTACCT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 ATT 0 1 299423 CASAVA_Build 2 105850327 4D ATAAATGTGG GTTT/---- GTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 30 15 13 6 GTTT 2 1 299424 CASAVA_Build 2 105853642 4D CTGTCTCAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 2795 hom 23 7 14 3 AAAG 4 3 299425 CASAVA_Build 2 105865948 1I GGGATGTGCT -/C CTCTTTGAGG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 1 2 299426 CASAVA_Build 2 105875386 2I GAATCGTGGA --/CT CTACCTCCAG 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 CT 1 2 299427 CASAVA_Build 2 105876624 4I TGCTTGCAAT ----/AAAG AAAGAATTTC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AAAG 1 2 299428 CASAVA_Build 2 105879902 1I GTGTAGCCCA -/C TTGGACCTCC 3070 hom 78 het 31 0 23 8 C 0 1 299429 CASAVA_Build 2 105879998 1I TTTTTTTTTT -/A TATAACTTGT 3057 het 832 hom 26 5 10 11 A 0 1 299430 CASAVA_Build 2 105887465 1I TTTATACATC -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 6 7 299431 CASAVA_Build 2 105902258 3I TCCCTGGGCT ---/ACG ACGTCCTTGG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 ACG 1 2 299432 CASAVA_Build 2 105914628 1D TTATTGAGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 10 9 299433 CASAVA_Build 2 105919949 2D TCTCACGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 156 het 57 0 52 7 AC 7 6 299434 CASAVA_Build 2 105922978 1I CTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 13 6 T 11 12 299435 CASAVA_Build 2 105927082 1D CCCAGCCAAA C/- CCAGCCCAGA 3070 hom 54 het 23 0 16 7 C 3 2 299436 CASAVA_Build 2 105928387 2I ACAAAATGTG --/GT GTGTGTGTGT 2968 hom 47 het 25 0 15 10 GT 6 7 299437 CASAVA_Build 2 105963509 1I TGATTGAGGC -/T TTTAAGACCC 3070 hom 24 het 11 0 8 3 T 3 4 299438 CASAVA_Build 2 105966588 1I GTGATCTTCA -/G GCTGGTGCTG 2921 hom 47 het 22 0 12 10 G 1 2 299439 CASAVA_Build 2 105978864 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 611 hom 22 2 16 4 A 14 13 299440 CASAVA_Build 2 106007812 2D TCTCTGTCTG TC/-- TCTCTCTGTC 3070 hom 107 het 42 0 35 7 TC 4 3 299441 CASAVA_Build 2 106008368 1I CTCATATTTT -/G GGGGGCAATT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 G 5 6 299442 CASAVA_Build 2 106012393 1I AGAAGCTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 71 het 40 0 30 10 T 9 10 299443 CASAVA_Build 2 106021272 2I TCTCTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 49 22 14 13 TC 7 8 299444 CASAVA_Build 2 106025343 8I ATGGTGGTGC --------/ACCGCTAT AATCCCAGCT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 ACCGCTAT 0 1 299445 CASAVA_Build 2 106025464 1I TCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 13 14 299446 CASAVA_Build 2 106031094 1D TCCTTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 31 14 3 14 T 17 16 299447 CASAVA_Build 2 106040797 1D GTTGGGGGCT A/- GGGGAGGGAT 2801 het 2573 hom 22 9 8 5 A 1 0 299448 CASAVA_Build 2 106045436 4I GAGGACAGGT ----/GATC GATCTAATTA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 GATC 1 2 299449 CASAVA_Build 2 106050526 6I CCCAGCTAAG ------/GTTTTT GTTTTTGTTT 3070 het 1681 hom 21 7 8 6 GTTTTT 2 3 299450 CASAVA_Build 2 106052154 4D CTCTTTCCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 925 het 925 ref 13 7 4 2 TTTC 3 2 299451 CASAVA_Build 2 106063660 5I ATAGTTTTTG -----/TGTTT TGTTTTGTTG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TGTTT 1 2 299452 CASAVA_Build 2 106064617 6D AGTGATTTGG TTTTAT/------ TTTTAACATC 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TTTTAT 1 0 299453 CASAVA_Build 2 106065431 6D ATGTAAATTT TAATTA/------ TATTTTTCCT 3070 het 3070 hom 42 16 21 8 TAATTA 1 0 299454 CASAVA_Build 2 106066632 1I AAAAGGTTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 8 9 299455 CASAVA_Build 2 106070095 1D TTCACTGATA T/- TCTCTATTGC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 2 1 299456 CASAVA_Build 2 106070713 5D GGTTACCTAT TTCTC/----- TTCTAAGGTC 3070 het 3070 hom 50 21 25 6 TTCTC 1 0 299457 CASAVA_Build 2 106088288 1I GGTGGCAGGA -/G GGAGGGTCAC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 2 3 299458 CASAVA_Build 2 106101111 1D GGCTGCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 687 hom 37 2 20 15 T 15 14 299459 CASAVA_Build 2 106101325 1I CACAGACCTC -/A AGAGTCAGAC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 1 2 299460 CASAVA_Build 2 106106185 1D TTTACTTACA G/- GGGAAAAAAA 3070 het 227 hom 27 1 25 1 G 4 3 299461 CASAVA_Build 2 106109284 1D AGGCGACATA C/- CCCACCCCCA 3070 hom 87 het 35 0 26 9 C 4 3 299462 CASAVA_Build 2 106135446 9D AAGGGAGAAA GAAAGGAAG/--------- GAAAGGAAGG 1961 het 1961 ref 19 13 5 2 GAAAGGAAG 2 1 299463 CASAVA_Build 2 106135762 1D AGGGGCAAGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 8 7 299464 CASAVA_Build 2 106140165 1I CTGTTACTTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 8 9 299465 CASAVA_Build 2 106144022 1D CCAGCTGCCT G/- GGTGCTCCCA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 G 3 2 299466 CASAVA_Build 2 106146218 3I TTGCATATGG ---/TAC TACATTTCAG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 TAC 1 2 299467 CASAVA_Build 2 106146488 2I GCAAACAAAC --/TG AGAATTAATT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 TG 0 1 299468 CASAVA_Build 2 106147258 19I ATCTGTGCAC -------------------/GTGGATGCTCTTTACATTT GTGGCCTAGC 3070 hom 141 het 54 0 47 9 GTGGATGCTCTTTACATTT 0 1 299469 CASAVA_Build 2 106148705 1I AAGGAGGGAA -/G GCGGGGGTGG 3070 hom 62 het 24 0 21 3 G 1 2 299470 CASAVA_Build 2 106154195 2I ACTTTCATAA --/TC TCTCTGAGTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TC 2 3 299471 CASAVA_Build 2 106161409 4D TATACAAGTC TATG/---- TATATGTATG 3070 hom 75 het 28 0 26 4 TATG 1 0 299472 CASAVA_Build 2 106168848 2D TAAATATCTC TT/-- GTTTCAAAGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 2 0 299473 CASAVA_Build 2 106178703 13I GGCTTTCTGG -------------/GTTTGCCTTAGAT CTATGGTTTT 3070 hom 102 het 42 0 32 10 GTTTGCCTTAGAT 0 1 299474 CASAVA_Build 2 106179564 1I TTAACATTTA -/T TAAACCTCTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 1 2 299475 CASAVA_Build 2 106179768 1D GCCAATGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 T 11 10 299476 CASAVA_Build 2 106180894 1I AAATGTGGTG -/A AGTGGTCACT 3070 hom 184 het 72 0 60 12 A 1 2 299477 CASAVA_Build 2 106181087 1D CCAGGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1135 hom 44 4 31 9 T 15 14 299478 CASAVA_Build 2 106181822 1I CTAGCTTGTG -/C TCACTGCATC 3070 hom 117 het 42 0 38 4 C 0 1 299479 CASAVA_Build 2 106185054 26D GCATATATTT TATATATATATATATATATATATATA/-------------------------- TATATATATA 3070 hom 52 het 30 0 24 10 TA 19 6 299480 CASAVA_Build 2 106188620 4D TGCCTGAACA TTGT/---- TTGTTTACTT 3070 hom 55 het 20 0 19 3 TTGT 2 1 299481 CASAVA_Build 2 106189716 1I AGCAATTTAA -/T TTTTTTCAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 6 7 299482 CASAVA_Build 2 106190123 2D TGTGCAAGCA AG/-- AGAGTCTGTG 3070 het 3070 hom 36 17 18 3 AG 3 2 299483 CASAVA_Build 2 106192101 14D9M3I AAGAAATTCG GGGCAACCCCCTTTGGGTCCATT---/--------------GGGTCCATTTTA TTATGGGAGC 3070 hom 99 het 35 0 34 4 N/A 0 0 299484 CASAVA_Build 2 106209698 1I TAAAAGTTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 A 9 10 299485 CASAVA_Build 2 106220040 4D GTCTCCAAGA AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 7 AATT 5 4 299486 CASAVA_Build 2 106229722 4D GCAAAGGAAA CAAT/---- CAACAGAGTA 3070 het 3070 ref 32 22 8 3 CAAT 1 0 299487 CASAVA_Build 2 106231301 1I TCGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 27 2 19 6 A 11 12 299488 CASAVA_Build 2 106232564 1D CACATGGCTA C/- AAAAAAAAAA 2165 het 2165 ref 20 9 8 3 C 1 0 299489 CASAVA_Build 2 106233807 1D TGTATACAAA G/- AATTATGTCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 1 0 299490 CASAVA_Build 2 106235487 1I AAAACTTCAA -/T TTTTTTGGAT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 6 7 299491 CASAVA_Build 2 106247076 9I GCTCCTTGCA ---------/AATCTCGCC AGGAATTGTT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 AATCTCGCC 0 1 299492 CASAVA_Build 2 106250775 1D GTATTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1059 het 1059 ref 20 15 3 2 T 11 10 299493 CASAVA_Build 2 106256146 1D TTGTCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 26 1 23 4 A 17 16 299494 CASAVA_Build 2 106261902 1I GTTCTCCATC -/T TTTTTTTTTT 2519 hom 33 het 18 0 12 6 T 13 14 299495 CASAVA_Build 2 106264182 4D ATATGTACAC ACAT/---- ACATACATAC 3070 hom 78 het 33 0 27 8 ACAT 4 3 299496 CASAVA_Build 2 106269777 1D CCAAAATGAA G/- GGGAAAAAAC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 G 4 3 299497 CASAVA_Build 2 106277904 2D GAATGAAAAC AT/-- GTGATATTTG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 AT 1 0 299498 CASAVA_Build 2 106279208 5D ACAAAAACAA AAACC/----- AAACCAAACC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AAACC 3 2 299499 CASAVA_Build 2 106280915 1D TTTATAACAA C/- AAAAAAAGGA 3070 hom 84 het 32 0 28 5 C 1 0 299500 CASAVA_Build 2 106283371 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 12 11 299501 CASAVA_Build 2 106287388 3I GCTGTGTAAC ---/TTG TTGTTCTACT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTG 1 2 299502 CASAVA_Build 2 106298376 2D TGTTAAACAC TG/-- TGTTTTATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TG 2 1 299503 CASAVA_Build 2 106311465 1I CAGAAAATAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 299504 CASAVA_Build 2 106312698 3D GGTGGTGGTA GTG/--- GTGTTGTATG 3070 hom 157 het 58 0 53 6 GTG 2 1 299505 CASAVA_Build 2 106315703 1I ATACTCATCA -/T TCTCAGTGAT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 1 2 299506 CASAVA_Build 2 106333336 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 25 1 14 10 T 15 14 299507 CASAVA_Build 2 106339884 18D GTGGTATAAA CTATCAACATACAGGAGC/------------------ CTGAGTTACT 3070 het 3070 ref 34 24 14 1 CTATCAACATACAGGAGC 1 0 299508 CASAVA_Build 2 106339986 1D TTTATATTCT G/- GGGGAATTAA 3070 hom 54 het 20 0 19 3 G 5 4 299509 CASAVA_Build 2 106351932 1I TGTATGTATG -/A AAAAACCCAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 5 6 299510 CASAVA_Build 2 106357415 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 32 het 18 0 11 7 T 10 9 299511 CASAVA_Build 2 106359396 1I GTGGGCAAAA -/G TTCCTGTGCT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 G 0 1 299512 CASAVA_Build 2 106363064 2I40M1I GAGATCTCTC --TATATATCTCTTTTCTCAGTTCATGCCATTCTTTCAGGTA-/TATATATATCTCTTTTCTCAGTTCATGCCGTTCTTTCAGGTAG GAAAGCACCT 1488 het 1488 ref 47 45 5 13 N/A 0 0 299513 CASAVA_Build 2 106363666 1D GTAGAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 34 1 27 7 T 12 11 299514 CASAVA_Build 2 106364345 5D TTGATGTCTT ATAAC/----- ATAAGTTATA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 ATAAC 1 0 299515 CASAVA_Build 2 106371665 1D TACCAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 13 12 299516 CASAVA_Build 2 106374427 1D ATGCCTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3004 hom 21 het 18 0 8 10 A 11 10 299517 CASAVA_Build 2 106375269 1I CCTCAAATGG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 8 9 299518 CASAVA_Build 2 106375997 3D ATTAACCTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 15 12 299519 CASAVA_Build 2 106378040 1D GCTTTTGAAG T/- ATCTATTGAC 3070 het 107 hom 20 1 19 0 T 1 0 299520 CASAVA_Build 2 106379712 1I TATCCATCTC -/A AAAACAACAA 3049 het 3049 ref 17 9 7 1 A 4 5 299521 CASAVA_Build 2 106388691 1D AACATGAAGC A/- ATCTAGAACT 1440 het 1440 ref 13 8 3 2 A 2 1 299522 CASAVA_Build 2 106391569 2D TATTTCTTAA TT/-- TTTTTTTAAA 2813 het 2813 ref 41 32 6 4 T 9 7 299523 CASAVA_Build 2 106397416 2D AGGCTGAGGC AG/-- GGGAATCGCT 3070 het 261 hom 15 1 14 0 AG 1 0 299524 CASAVA_Build 2 106413176 4I TGCTCCCATT ----/TTCA TTCGTTAATA 2178 het 2178 ref 21 15 5 1 TTCA 0 1 299525 CASAVA_Build 2 106413276 4I CTACATTAAC ----/CTTT CTGACGTTCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CTTT 0 1 299526 CASAVA_Build 2 106419507 1D GTTAAGTTAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 14 12 4 A 9 8 299527 CASAVA_Build 2 106423998 1D CAAATATTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 3 T 8 7 299528 CASAVA_Build 2 106441030 2D CTAACAGTAC TA/-- TATATCCAGC 2228 het 2228 ref 36 29 5 2 TA 3 2 299529 CASAVA_Build 2 106448449 1I CTAAGCTTGC -/T TTTTTTTTTT 2413 het 242 hom 20 1 11 8 T 12 13 299530 CASAVA_Build 2 106452347 1I GGTTTGAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 2727 hom 20 7 9 4 A 8 9 299531 CASAVA_Build 2 106458250 2I TTCTGTACTC --/TT AATGTTTTAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 0 2 299532 CASAVA_Build 2 106462882 4I TTGGTAATTA ----/ATTG ATTATTTGTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ATTG 0 1 299533 CASAVA_Build 2 106468286 1D AAATGGCCAA C/- AAGCACATGA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 C 1 0 299534 CASAVA_Build 2 106476440 1I ACAGAACTAC -/T TCTAGGGCCG 3070 hom 93 het 34 0 29 5 T 1 2 299535 CASAVA_Build 2 106486600 1I GGAGGGAGGA -/G TCACTTGAGC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 G 0 1 299536 CASAVA_Build 2 106487473 1I GACCCCATCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 9 10 299537 CASAVA_Build 2 106489544 1I TAAATTTGTG -/A ATTCTCTTAG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 1 2 299538 CASAVA_Build 2 106491818 3D2M6I TGGCCTTAGA TGCCC------/---CCAATTAA TGCCCCCAGA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 N/A 0 0 299539 CASAVA_Build 2 106503802 6D AATAGGCAAA AGAAAG/------ AGAAAGGAGT 3070 hom 39 het 14 0 14 5 AGAAAG 2 1 299540 CASAVA_Build 2 106516357 1D AGTTGAACTG T/- GAAATCCTAT 3070 het 3070 ref 54 26 25 3 T 1 0 299541 CASAVA_Build 2 106526780 3I TTCTGTGGAT ---/TTG TTGTGCTTAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TTG 1 2 299542 CASAVA_Build 2 106531895 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 7 6 299543 CASAVA_Build 2 106539027 3D TTGCTTTTGC TAT/--- TATTAGCCAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TAT 2 1 299544 CASAVA_Build 2 106542610 1D CCCTTCCCTT C/- TCTTCCTTCC 2669 het 1360 hom 33 6 8 19 C 1 0 299545 CASAVA_Build 2 106557123 1I TTTGCACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 26 8 T 11 12 299546 CASAVA_Build 2 106557666 1D GCCCCAGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 73 het 30 0 25 6 A 10 9 299547 CASAVA_Build 2 106558287 1D GGCACTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 33 0 23 10 T 13 12 299548 CASAVA_Build 2 106564558 2D TTTGTTTGGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 90 het 45 0 28 17 GT 10 9 299549 CASAVA_Build 2 106564754 4I AGAGGCAGAT ----/AGAG AGACAGACAG 3070 hom 83 het 31 0 26 5 AG 1 3 299550 CASAVA_Build 2 106570993 2I GGGCAACAGA --/GT GTGAGATTCC 1143 het 1143 ref 21 12 4 5 GT 1 2 299551 CASAVA_Build 2 106580011 1D GGATGCTTAC T/- TTGAAGTAAG 3070 het 3070 hom 51 19 26 8 T 3 2 299552 CASAVA_Build 2 106581666 1I ATTCAGTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 9 10 299553 CASAVA_Build 2 106584318 1I CATCTGGAGA -/T TTTTTTTTTT 2655 het 538 hom 40 2 11 27 T 13 14 299554 CASAVA_Build 2 106587365 4D CCTTGATGAT AAAA/---- AAAAGGCATT 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 8 4 299555 CASAVA_Build 2 106594607 2D TGCCCCAGTC TG/-- TAGTAGAATT 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 TG 1 0 299556 CASAVA_Build 2 106594878 1D TCTCTGAAAA C/- CTAACTTTGA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 C 2 1 299557 CASAVA_Build 2 106596305 1I TCTGAATTGC -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 T 6 7 299558 CASAVA_Build 2 106597920 1I CTATGTGGAA -/T TAGGGTACCT 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 T 1 2 299559 CASAVA_Build 2 106621512 2D GTTTTCAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 12 10 299560 CASAVA_Build 2 106622393 1I CTGCCCTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 A 9 10 299561 CASAVA_Build 2 106626018 1D AAGAAAACAG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 8 7 299562 CASAVA_Build 2 106638549 7D ATAACAGATG AAATTGA/------- AAATTGACAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 AAATTGA 2 1 299563 CASAVA_Build 2 106638737 1I ATGAAACTTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 A 8 9 299564 CASAVA_Build 2 106638962 2D TTAAAAAATT TG/-- TACTACAGTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 TG 1 0 299565 CASAVA_Build 2 106643263 1D AATTAAAAAG C/- TTTTGGGACT 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 C 1 0 299566 CASAVA_Build 2 106645638 2I GTCAGAACAC --/AT GTGTATCTAA 3070 het 3070 hom 51 15 28 8 AT 0 1 299567 CASAVA_Build 2 106652641 1D TTTTTGCATC T/- TGCATTTTTC 3070 het 3070 ref 55 37 17 1 T 2 1 299568 CASAVA_Build 2 106655830 2I TTTCAATAAC --/AG AAGTTTTAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 0 1 299569 CASAVA_Build 2 106682745 4I ACATACTCAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 AC 7 9 299570 CASAVA_Build 2 106682862 1D CATATATACA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 T 8 7 299571 CASAVA_Build 2 106688424 4I TTTGGGAAAC ----/AAAA AGAAGTCAGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 1 5 299572 CASAVA_Build 2 106703173 1D TTTAAATTGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 9 8 299573 CASAVA_Build 2 106712345 7I AGGGCTTCAG -------/CTATGGA CCCCTGGACA 3070 hom 108 het 41 0 32 9 CTATGGA 0 1 299574 CASAVA_Build 2 106754397 2D GTACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 14 16 8 AT 6 5 299575 CASAVA_Build 2 106755880 5I TTATGTAAGA -----/AGTAC AGTACATTGG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AGTAC 1 2 299576 CASAVA_Build 2 106761736 1I TTATTCCCCC -/T ATCTGCACTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 1 299577 CASAVA_Build 2 106763264 1D CAGAATCTTC T/- CCCTATGTGT 3070 hom 102 het 41 0 35 8 T 1 0 299578 CASAVA_Build 2 106767430 1I AATTTTAATA -/T TTTTTTCTCC 3070 hom 82 het 39 0 36 3 T 6 7 299579 CASAVA_Build 2 106771862 1I TCTTTTTCCT -/A AAAATGTGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 5 299580 CASAVA_Build 2 106775373 2I TACCCCCTCT --/AA CAACCACTGT 3070 het 3070 hom 56 17 29 10 A 0 2 299581 CASAVA_Build 2 106812803 1D CTGAAATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 32 1 24 8 A 11 10 299582 CASAVA_Build 2 106828930 9D GTTCCAGCCG TCCCAGCCA/--------- TCCCAGCCAT 3070 hom 82 het 32 0 25 14 TCCCAGCCA 2 1 299583 CASAVA_Build 2 106855578 8I GCTCACTGCA --------/ACCTCCGC CTCCCGGGTT 3070 hom 39 het 14 0 12 2 ACCTCCGC 0 1 299584 CASAVA_Build 2 106859043 1D TTAAAGTGTG T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 8 7 299585 CASAVA_Build 2 106866645 4D AAAAGAAAAA ACTC/---- AATCAATCAG 3070 het 3070 hom 31 16 13 3 ACTC 1 0 299586 CASAVA_Build 2 106903994 1D CTTTTCTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2469 hom 20 6 10 4 A 10 9 299587 CASAVA_Build 2 106906542 1D TGTATGGGAT G/- GGTTTTCCAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 3 2 299588 CASAVA_Build 2 106907414 1I CTACTATAGA -/T TTTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 T 6 7 299589 CASAVA_Build 2 106908977 2D TTCTATTTCC AT/-- ATATATATTA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 AT 5 4 299590 CASAVA_Build 2 106941554 1I TTGTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 32 0 22 10 T 11 12 299591 CASAVA_Build 2 106949098 1D TTATAGGAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 9 8 299592 CASAVA_Build 2 106952973 2D TCTCTCTTTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 114 het 49 0 38 11 CT 7 6 299593 CASAVA_Build 2 106953473 2I TGGTGGCATA --/AC ACACACCTGA 3070 hom 158 het 61 0 51 10 AC 3 4 299594 CASAVA_Build 2 106977993 4D AAATATTAAT TGAA/---- TGAATAAAAA 3070 het 3070 ref 57 35 19 4 TGAA 2 1 299595 CASAVA_Build 2 106980004 1D CTGAGACTCT C/- TTAAAGTCCA 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 C 1 0 299596 CASAVA_Build 2 106984156 1I GGATTTTGTC -/A GTCTGAGCCA 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 A 0 1 299597 CASAVA_Build 2 106986128 1D TTTTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2244 hom 27 6 13 8 T 15 14 299598 CASAVA_Build 2 106991097 4D CTTTGGGGGA AAAC/---- AAACAAACAA 2854 het 2854 ref 28 17 8 3 AAAC 5 4 299599 CASAVA_Build 2 106991324 2I TTTTTTAAAG --/TT TTTTTTTTTT 1457 het 408 hom 12 2 6 4 T 12 14 299600 CASAVA_Build 2 106996153 1I AGCAGGGGGC -/A AACAAGATGC 3070 het 3070 hom 52 24 23 5 A 2 3 299601 CASAVA_Build 2 107027731 1I GACTCCATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2039 hom 19 6 9 4 A 11 12 299602 CASAVA_Build 2 107031701 1D TTGAGACTTG T/- TTTTTTTTTT 554 het 554 ref 42 33 3 6 T 12 11 299603 CASAVA_Build 2 107032863 1D TTAGTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 10 9 299604 CASAVA_Build 2 107044248 1D TTATTGCAAG A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 7 6 299605 CASAVA_Build 2 107080239 1I CTTTCAGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 100 het 38 0 33 5 T 9 10 299606 CASAVA_Build 2 107082962 2D GGAAAACATC TT/-- TTTTTTTTTT 770 het 129 hom 20 4 2 14 T 18 16 299607 CASAVA_Build 2 107097407 1I TTGTTATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 10 11 299608 CASAVA_Build 2 107105409 1I GAAGTGTAGC -/A CACCTCAATC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 0 1 299609 CASAVA_Build 2 107108181 4I ACTCCTCTTG ----/CTCT CTCTCCATCT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CT 2 4 299610 CASAVA_Build 2 107116633 1I TCTGTCTGGT -/G GGGGGGGAGT 3070 hom 144 het 56 0 44 12 G 7 8 299611 CASAVA_Build 2 107148024 3I GTGGCAAGAT ---/ATC ATTTATCATT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 ATC 0 1 299612 CASAVA_Build 2 107152838 3I GAGGTTCAGC ---/AGG AGAATATGAA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 AGG 0 1 299613 CASAVA_Build 2 107176359 1D TAGTGCATCA T/- TTTTCTCCAC 3070 hom 130 het 52 0 44 8 T 5 4 299614 CASAVA_Build 2 107179662 5I ATATTTTGTC -----/TTATT TTATTTCCAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTATT 1 2 299615 CASAVA_Build 2 107179982 2D CATGAATAAC AT/-- ATATTAGCTT 3070 hom 59 het 32 0 29 3 AT 3 2 299616 CASAVA_Build 2 107190166 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 10 A 11 10 299617 CASAVA_Build 2 107191642 2D CAATACATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 13 11 299618 CASAVA_Build 2 107194024 1D TACTTGTATA T/- TTATAAGTCA 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 T 3 2 299619 CASAVA_Build 2 107194889 1I CAAAATGTCA -/G TTTATGGCTT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 G 0 1 299620 CASAVA_Build 2 107217326 1I TGATCATGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 25 13 9 A 9 10 299621 CASAVA_Build 2 107222645 1D CAATTTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 11 10 299622 CASAVA_Build 2 107240498 6D AAACCAAAGC CAACAG/------ CAACAGCATG 3070 hom 102 het 40 0 33 8 CAACAG 2 1 299623 CASAVA_Build 2 107246255 1D GAAGGATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 17 14 A 13 12 299624 CASAVA_Build 2 107247866 1I TTAATTTATC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 8 9 299625 CASAVA_Build 2 107248360 5I ACTGCAAAGT -----/ACTTA ACTTTTCACT 1883 het 1883 ref 25 9 4 12 ACTTA 0 1 299626 CASAVA_Build 2 107263662 1D TCTAGTGGAG A/- AAAATCACAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 5 4 299627 CASAVA_Build 2 107266771 1D AAGTGTGGCT A/- AAAAACTGAA 3070 het 3070 hom 39 18 16 7 A 6 5 299628 CASAVA_Build 2 107274832 1D CGAACAAAAA T/- AACTGAGCCT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 T 1 0 299629 CASAVA_Build 2 107279443 1I AGTCTTGGGA -/G GGTGTATGTG 1198 het 1198 ref 13 10 3 0 G 2 3 299630 CASAVA_Build 2 107287399 4I CTCTTTTCTC ----/TCTT TCTTTCTGTC 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 TCTT 1 2 299631 CASAVA_Build 2 107290339 2I TACGATACAC --/TG TTGTGAACTA 3070 het 3070 ref 38 23 15 0 TG 0 1 299632 CASAVA_Build 2 107293695 2I GTTAGTCATA --/GT GTGTTTAGCT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 GT 2 3 299633 CASAVA_Build 2 107297921 1I ATATCACATG -/A TATTCAGTTG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 0 1 299634 CASAVA_Build 2 107299344 2D TGTTTGGGGC AG/-- AGTCTTATTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 AG 2 1 299635 CASAVA_Build 2 107302467 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 12 11 299636 CASAVA_Build 2 107326484 1I GATTTACTCT -/A AAAAAAAAGA 2331 het 2331 ref 19 9 6 4 A 8 9 299637 CASAVA_Build 2 107327318 4D TTGAAATTTT AAGA/---- AAGAAAATTG 3070 hom 75 het 32 0 26 8 AAGA 2 1 299638 CASAVA_Build 2 107327964 4D ATAAATATAT AGAA/---- AGAGTGTGTA 3070 het 3070 ref 27 13 13 3 AGAA 1 0 299639 CASAVA_Build 2 107328550 1I GGAAACAGTG -/C TTCCTTCCTT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 C 0 1 299640 CASAVA_Build 2 107330327 1D TCTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 751 hom 35 2 23 11 T 17 16 299641 CASAVA_Build 2 107336181 1I CTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1266 het 1266 ref 31 18 3 10 A 13 14 299642 CASAVA_Build 2 107365769 4I ATCAATATCT ----/TCTA TCTATTATCT 3070 hom 116 het 42 0 39 3 TCTA 1 2 299643 CASAVA_Build 2 107370949 23I GCCCTGTCAT -----------------------/GATGCGGCATAAACTCCTCACCA GATGCCAGTG 3070 hom 99 het 36 0 32 8 GATGCGGCATAAACTCCTCACCA 0 1 299644 CASAVA_Build 2 107372671 1D AGTCTTTAAA C/- CTTTCACTTC 3070 het 2995 hom 31 9 13 9 C 2 1 299645 CASAVA_Build 2 107373104 1I GACTCTGTAT -/A AAAAAAATAG 3039 het 3039 ref 20 10 7 3 A 7 8 299646 CASAVA_Build 2 107415894 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 10 11 299647 CASAVA_Build 2 107418380 1I GTGTAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 197 hom 36 1 32 3 A 10 11 299648 CASAVA_Build 2 107426605 1D AAAATTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 9 8 299649 CASAVA_Build 2 107428658 3I ATTAAAAAAA ---/TAT AAATATATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TAT 0 1 299650 CASAVA_Build 2 107430247 3D ATTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 20 1 12 8 A 19 16 299651 CASAVA_Build 2 107432068 3I TAAAAACGAA ---/ATG ATACTAGATT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 ATG 0 1 299652 CASAVA_Build 2 107434086 1D ATTTTTGTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 10 9 299653 CASAVA_Build 2 107435389 2I AGTGGTATTA --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 102 het 43 0 34 9 TC 6 7 299654 CASAVA_Build 2 107440854 1D GAAGGTAGGA C/- CATGCTTGAA 3070 hom 100 het 40 0 34 6 C 2 1 299655 CASAVA_Build 2 107444368 1I GACTGGTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 850 hom 38 3 20 15 A 11 12 299656 CASAVA_Build 2 107450323 1I AACAAAATCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 755 hom 43 2 32 9 A 9 10 299657 CASAVA_Build 2 107451014 2D ATTTTTTTTT TA/-- ATAAAAGCTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TA 1 0 299658 CASAVA_Build 2 107453098 2I GATACACACA --/CG CGCACACACA 3070 hom 159 het 57 0 53 4 CG 1 2 299659 CASAVA_Build 2 107461469 3D TTCATGAGCT ATA/--- ATATTTAATA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 ATA 2 1 299660 CASAVA_Build 2 107461737 1D TGTATCAACG A/- AAGAGAATTG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 3 2 299661 CASAVA_Build 2 107462693 1I ACGATTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 29 9 T 11 12 299662 CASAVA_Build 2 107463043 3D TAATTTTTGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 25 0 15 10 A 19 16 299663 CASAVA_Build 2 107464493 1D AATAAAGAGG T/- TTTTTTTAGC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 299664 CASAVA_Build 2 107466391 3I ATGTGTACAT ---/ATC ATATATGACA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATC 0 1 299665 CASAVA_Build 2 107467398 1D CTGTTTGGAT C/- CCCCCTCCCT 3070 hom 103 het 40 0 34 6 C 6 5 299666 CASAVA_Build 2 107468726 7I CCAAATAAGT -------/CCTTTTA CTTTATAAAT 3070 hom 83 het 32 0 27 5 CCTTTTA 0 1 299667 CASAVA_Build 2 107475032 1I TGTTTTTTTT -/A TGAACGACGA 3070 hom 135 het 47 0 45 2 A 0 1 299668 CASAVA_Build 2 107478169 2I ATGCCCTTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 39 1 29 9 T 11 13 299669 CASAVA_Build 2 107482984 4D CTTCCTGATT TTTG/---- TTTATTTAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TTTG 1 0 299670 CASAVA_Build 2 107489960 1I TCTTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 780 hom 34 3 25 6 T 12 13 299671 CASAVA_Build 2 107502929 2D ATTCTGTGTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 39 0 35 6 T 11 9 299672 CASAVA_Build 2 107509081 1D GTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 10 9 299673 CASAVA_Build 2 107511099 1D ACTAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 35 0 31 5 A 12 11 299674 CASAVA_Build 2 107514219 3I TCTTCCCCCA ---/CTT CTTCTTTTTT 3070 hom 66 het 36 0 23 13 CTT 2 3 299675 CASAVA_Build 2 107515566 2D ATATACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AC 9 8 299676 CASAVA_Build 2 107515777 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 103 het 42 0 34 8 A 8 9 299677 CASAVA_Build 2 107521161 1I TTAAAAAAAG -/A TAACTGGGCT 3070 het 9 hom 30 1 29 0 A 0 1 299678 CASAVA_Build 2 107521630 2D AGGGCTCTGT GA/-- GAGGGGAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 GA 2 1 299679 CASAVA_Build 2 107522635 1I GTGAGACAAG -/A AAAAAAACTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 8 299680 CASAVA_Build 2 107524170 3I GCGTGCTTGT ---/CCC CTGTGGTTCC 3070 hom 171 het 62 0 56 6 C 1 4 299681 CASAVA_Build 2 107529385 4I TTAGTGAGAC ----/AAAT AAAAACATAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AAAT 0 1 299682 CASAVA_Build 2 107533177 2D TGAAAAACAC TG/-- TATTTTAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 TG 1 0 299683 CASAVA_Build 2 107533670 4D TTTACATAAA TGTT/---- TGTAGAGCTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TGTT 1 0 299684 CASAVA_Build 2 107537666 1I TGACATTCTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 7 8 299685 CASAVA_Build 2 107537886 3D CAAGTCTTCC TAT/--- TATTAACATT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TAT 2 1 299686 CASAVA_Build 2 107540794 1D AAAAAGGTAA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 36 het 32 1 22 9 T 8 7 299687 CASAVA_Build 2 107561468 1D AAACTGCAGG A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 127 het 48 0 43 5 A 8 7 299688 CASAVA_Build 2 107575884 1I ATGCTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 8 9 299689 CASAVA_Build 2 107632420 1D AGGATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 399 hom 29 1 23 5 A 10 9 299690 CASAVA_Build 2 107669222 23D CAAAGTCCTC AAGTCTAATGAACCATTACAATG/----------------------- AAGAGAAACA 3070 hom 108 het 39 0 36 8 AAGTCTAATGAACCATTACAATG 1 0 299691 CASAVA_Build 2 107771793 2I TGTTCTTATA --/TC TCCTTTTGGA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TC 1 2 299692 CASAVA_Build 2 107779323 5D ATATGCAGAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 AAAAT 5 4 299693 CASAVA_Build 2 107781436 1I ACAAATAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 923 hom 49 3 43 3 A 9 10 299694 CASAVA_Build 2 107804884 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTGGT 2245 het 2245 ref 29 16 10 4 T 8 7 299695 CASAVA_Build 2 107848565 4D TTGTATTAAC GAAT/---- GAAAATGGGA 942 het 942 ref 29 23 3 5 GAAT 1 0 299696 CASAVA_Build 2 107857389 2D CAATCTCTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 T 11 9 299697 CASAVA_Build 2 107878827 2I TTTCTTTTTT --/GA GAGAGAGAGA 2962 hom 18 het 10 0 7 3 GA 5 6 299698 CASAVA_Build 2 107879820 2I GTTTGAACTT --/CA GTCTTTAGTT 3070 het 3070 ref 43 31 8 4 CA 0 1 299699 CASAVA_Build 2 107879908 2D TTATTCAGTG AT/-- ATGTGTTTTT 3070 het 3070 ref 38 23 12 4 AT 2 1 299700 CASAVA_Build 2 107881996 3I GTTTTTGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 2017 het 2017 ref 35 15 5 15 TTG 5 6 299701 CASAVA_Build 2 107886802 2I CTTTTAATAC --/AA CCATACAGGT 1853 het 1853 ref 41 34 4 3 A 0 2 299702 CASAVA_Build 2 107887390 1I TATAGTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 11 12 299703 CASAVA_Build 2 107892829 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 10 11 299704 CASAVA_Build 2 107897840 1D GGGCAAAAAA C/- AAAGCAGGTT 2237 het 2237 ref 16 9 6 1 C 1 0 299705 CASAVA_Build 2 107925813 10I TGGTTTTTGC ----------/AAGATGATAA AAGCAAAGGT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 AAGATGATAA 0 1 299706 CASAVA_Build 2 107931051 1I CTTGCTGAGA -/C CAGCTCAGTT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 C 1 2 299707 CASAVA_Build 2 107968098 1D AAAAATGGGG T/- TATATTAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 T 2 1 299708 CASAVA_Build 2 107971610 1I CGTGTCCGGT -/A AATACATGCA 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 A 2 3 299709 CASAVA_Build 2 107981750 4D TCTCCTCATC TTTA/---- TTTATTTATC 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 TTTA 3 2 299710 CASAVA_Build 2 107996280 4D AGTACAAAAA AGTT/---- TAAGATTGCA 3070 het 3070 ref 37 22 13 3 AGTT 1 0 299711 CASAVA_Build 2 108003416 2D GCTTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 1478 het 918 hom 28 4 5 19 T 16 14 299712 CASAVA_Build 2 108010898 1I GTGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 A 10 11 299713 CASAVA_Build 2 108011874 1I CTTGAATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 11 12 299714 CASAVA_Build 2 108016435 4I TGGGGACAGT ----/TCTA TCTATCATCC 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 TCTA 1 2 299715 CASAVA_Build 2 108018829 1I GACCTACGCC -/A CCATATTCTT 2811 het 1296 hom 26 5 9 12 A 0 1 299716 CASAVA_Build 2 108018846 1I CTTCAAATCC -/T TTTTTTTTTT 1823 het 62 hom 21 1 5 15 T 15 16 299717 CASAVA_Build 2 108027523 1D ATGTTCATAG A/- AAAAATAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 6 5 299718 CASAVA_Build 2 108027984 1D GATATGCAGC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 A 9 8 299719 CASAVA_Build 2 108047497 1I TATCTCATAG -/A GAGAGTAGGC 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 A 0 1 299720 CASAVA_Build 2 108055486 1D AAGCTGACCC T/- CCACCAACAT 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 T 1 0 299721 CASAVA_Build 2 108060796 1I TTTTCTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 10 11 299722 CASAVA_Build 2 108063806 1D GATCTTGTTC T/- TTTTTGTGAC 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 6 5 299723 CASAVA_Build 2 108069545 1I TGTCTCTACA -/C CTTCTTGTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 1 2 299724 CASAVA_Build 2 108070145 3D TGATTTCAAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 19 13 T 14 11 299725 CASAVA_Build 2 108081813 2D GTAAGTTCAT AG/-- AGACAGAAAG 3070 het 3070 hom 32 14 18 1 AG 2 1 299726 CASAVA_Build 2 108081894 1D GTTTGGGGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 T 10 9 299727 CASAVA_Build 2 108082651 1I GTGTACACAT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 7 8 299728 CASAVA_Build 2 108104031 1I TGCTCCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 A 10 11 299729 CASAVA_Build 2 108117683 1D ATATTGTGCC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 58 36 16 7 T 9 8 299730 CASAVA_Build 2 108118322 1D ATTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 61 22 26 14 T 11 10 299731 CASAVA_Build 2 108119407 8I AAGATGCATT --------/TAAGATTC GTTAAGTTGT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 TAAGATTC 0 1 299732 CASAVA_Build 2 108124983 1D ATATGCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2525 hom 31 10 14 7 A 15 14 299733 CASAVA_Build 2 108125959 1D AGTTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 A 12 11 299734 CASAVA_Build 2 108136258 1D AGAGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2435 hom 25 9 11 5 A 13 12 299735 CASAVA_Build 2 108137813 4D AAGAACCAGG AGAC/---- AGACAGCTCA 3070 het 3070 hom 31 14 16 2 AGAC 2 1 299736 CASAVA_Build 2 108151567 1I ACAAGAGGAA -/T TCATCCCTGT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 1 2 299737 CASAVA_Build 2 108164731 1D TAAAATAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 T 15 14 299738 CASAVA_Build 2 108179682 3I TTAGTATCAA ---/AAT AATAACAGCT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 AAT 1 2 299739 CASAVA_Build 2 108185727 1I CAAGACAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 9 10 299740 CASAVA_Build 2 108209025 1I TATTGCTCAG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 0 1 299741 CASAVA_Build 2 108210207 1I GACTATTGCA -/C CTCAGCCATC 3070 het 3070 ref 54 27 26 1 C 1 2 299742 CASAVA_Build 2 108211842 1I GAGGTAGTAA -/T TATGGGCAGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 1 2 299743 CASAVA_Build 2 108221027 2D AAAAAAAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 9 9 T 13 11 299744 CASAVA_Build 2 108226519 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3003 het 1988 hom 25 6 9 10 A 15 16 299745 CASAVA_Build 2 108227020 3I TTAAGATCAA ---/CCT CAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 CCT 0 1 299746 CASAVA_Build 2 108233489 1I ACTTGTACAC -/A AACACTATAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 2 3 299747 CASAVA_Build 2 108263607 3D GAGTTATTGG AGA/--- AGAAGGCTGC 2575 het 1679 hom 39 7 11 25 AGA 2 1 299748 CASAVA_Build 2 108263639 1I GGAGCTGCAG -/C TCTGCCAGGA 3070 hom 65 het 37 0 19 18 C 0 1 299749 CASAVA_Build 2 108265874 1D TCTCTACCCC T/- AATACAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 1 0 299750 CASAVA_Build 2 108271829 1I CTGCTGAGCG -/C CCCCCGTAAC 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 C 5 6 299751 CASAVA_Build 2 108279293 2D TCTGCCCAGC CA/-- CAGACAGCTG 3070 hom 84 het 35 0 27 10 CA 2 1 299752 CASAVA_Build 2 108292641 1I TGAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 1357 het 1357 ref 30 22 3 5 A 10 11 299753 CASAVA_Build 2 108298860 3D CAGAGGAAGG TCT/--- TCTTCGAAAC 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 TCT 2 1 299754 CASAVA_Build 2 108312697 1I TGTAGCTCAG -/A GGTGTTAAAT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 A 0 1 299755 CASAVA_Build 2 108315640 1I AACTTGCCTA -/T CATTACCCTG 3070 het 3070 hom 62 24 31 7 T 0 1 299756 CASAVA_Build 2 108405292 2I TCCTGGTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 13 22 11 T 11 13 299757 CASAVA_Build 2 108414578 1D AATGGAAAGC A/- AAAAAAAAGC 2939 het 2939 ref 16 9 6 1 A 9 8 299758 CASAVA_Build 2 108415738 1D ATTGAGGCAG T/- TAATTAGTAG 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 2 1 299759 CASAVA_Build 2 108423444 1D AGTAAAACCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 A 11 10 299760 CASAVA_Build 2 108423569 1I TAAACCCCCC -/A CACACACACA 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 A 0 1 299761 CASAVA_Build 2 108429071 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2540 het 801 hom 20 4 9 7 A 13 14 299762 CASAVA_Build 2 108430917 4D ACTTGGGGAT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 16 22 6 TG 8 6 299763 CASAVA_Build 2 108434495 1D TCTTAGCACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2450 hom 19 7 11 1 T 10 9 299764 CASAVA_Build 2 108437866 2D CTGCAACCTC TA/-- TAGAGTGTTA 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TA 2 1 299765 CASAVA_Build 2 108438480 2D TCATTAAATC AG/-- AGTATTTACT 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 AG 2 1 299766 CASAVA_Build 2 108439655 2D CCTGAGAAAC AT/-- AGCAAGATCC 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 AT 1 0 299767 CASAVA_Build 2 108445786 1D TTTACCCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 12 10 1 T 11 10 299768 CASAVA_Build 2 108450956 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 12 11 299769 CASAVA_Build 2 108452087 4D TAATATAAAC AAAG/---- AAACCGAGAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 AAAG 1 0 299770 CASAVA_Build 2 108463647 1D AGAAGGTGGA G/- GGGTAGGAGG 3070 het 1580 hom 24 5 14 5 G 4 3 299771 CASAVA_Build 2 108463759 3D TTGCCTACAT AAC/--- AAACCTGCAC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 AAC 1 0 299772 CASAVA_Build 2 108472567 1I AATATCTTTT -/G TATTATGTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 G 0 1 299773 CASAVA_Build 2 108473474 2I CAAGGGTGTT --/AA GATAATTTTA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 A 0 2 299774 CASAVA_Build 2 108481971 2I TCCTCTCCTC --/TT GTCAGTGATA 3013 het 3013 ref 34 19 10 5 T 0 2 299775 CASAVA_Build 2 108483046 2D CAATGCAGTC AT/-- ATATAGCCCA 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 AT 3 2 299776 CASAVA_Build 2 108486064 1I TTAAAAAAAA -/G AAGAAGAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 G 0 1 299777 CASAVA_Build 2 108490117 1D GCATCTCCAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 2441 hom 18 9 8 1 A 8 7 299778 CASAVA_Build 2 108490989 2I TGAGCTGTGA --/TT CTCCCACTGC 1606 het 1606 ref 17 12 4 1 T 0 2 299779 CASAVA_Build 2 108491352 1I GGTGGGCCCA -/C CACTTGAGTT 3070 hom 42 het 15 0 11 4 C 1 2 299780 CASAVA_Build 2 108495250 4I GCCATCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 AAAC 3 4 299781 CASAVA_Build 2 108499898 7D CTTGGTACTT TGTCAGA/------- TGTCCCGCTG 2333 het 2333 ref 24 14 7 3 TGTCAGA 1 0 299782 CASAVA_Build 2 108507394 1I TAGGCACTTG -/C CCCGGTGGGA 2140 hom 17 het 9 0 6 3 C 3 4 299783 CASAVA_Build 2 108515404 5D TGTATTTTAT TTTTG/----- TTTTATGATA 3070 het 3070 hom 28 12 14 4 TTTTG 1 0 299784 CASAVA_Build 2 108531178 1D TTGGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 25 3 T 12 11 299785 CASAVA_Build 2 108541111 1D CATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1850 het 1850 ref 28 10 7 11 T 13 12 299786 CASAVA_Build 2 108547845 21D CAGCGCTCTG CCCTAGCTCTTTAAGAGAAAC/--------------------- CCCTAGCTCT 3070 het 2566 hom 31 9 12 15 CCCTAGCTCTTTAAGAGAAAC 2 1 299787 CASAVA_Build 2 108556928 1I AATCCCCCCT -/C CCCCCCCACC 1522 het 1522 ref 23 9 4 10 C 7 8 299788 CASAVA_Build 2 108558175 1I AAACATAGTT -/A ATATGCTCGT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 1 2 299789 CASAVA_Build 2 108571159 1D TAAATACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 11 10 299790 CASAVA_Build 2 108584850 5D TTTTTTGGTG TTCTA/----- TTCAATTTTC 3070 het 3070 ref 31 19 11 3 TTCTA 1 0 299791 CASAVA_Build 2 108597988 3D TATGTATAGT TGG/--- TGGTCAGGCA 3070 het 3070 hom 46 15 26 6 TGG 2 1 299792 CASAVA_Build 2 108606106 1D TTATGCCTGG A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 1 0 299793 CASAVA_Build 2 108612312 3D ACTTTCACTC ATA/--- ATAGAAATAG 3070 het 3070 hom 49 15 31 4 ATA 2 1 299794 CASAVA_Build 2 108614439 1D CCGTGTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2741 hom 54 14 16 24 T 14 13 299795 CASAVA_Build 2 108618533 1D GGTTTCGGTG A/- ACTGAGACCG 2544 het 1861 hom 16 6 6 4 A 2 1 299796 CASAVA_Build 2 108620686 1I TACAGAGACA -/T TTTTCTAGTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 4 5 299797 CASAVA_Build 2 108626443 1D33M1I GCACAAAACT GGGCGGCCTTTAGGGCAGACACCGAGCTAGCCAG-/-GGCGGCCTTTAGGGCAGACACCGAGCTAGCCAGT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 17 8 6 N/A 0 0 299798 CASAVA_Build 2 108626577 1D CCTGGAAAGG A/- GGGCTGAAGC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 1 0 299799 CASAVA_Build 2 108633750 4D TTATTTATTT ATTC/---- ATTCATTCAT 3070 het 3070 ref 43 22 14 10 ATTC 5 4 299800 CASAVA_Build 2 108636923 1D TGACTTTGAG T/- TTGTGTCTGT 3070 het 3070 ref 34 21 13 1 T 3 2 299801 CASAVA_Build 2 108644225 1I CTTCTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 T 13 14 299802 CASAVA_Build 2 108648922 2I GTGTGGGAAC --/TT TTCACCACAC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 2 4 299803 CASAVA_Build 2 108651296 2D CTCTATTTTA CT/-- CTCTATTTCT 1786 het 1786 ref 46 38 4 5 CT 3 2 299804 CASAVA_Build 2 108652611 1D TTTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 12 11 299805 CASAVA_Build 2 108658332 1D TAATCACCCC T/- TAGAGGTCCT 3070 het 3070 ref 43 25 12 8 T 2 1 299806 CASAVA_Build 2 108661325 1I TCTAGGACTT -/A ACCACCCTTG 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 1 2 299807 CASAVA_Build 2 108662643 6I CCATCTCTAC ------/AAAATA AAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 AAAATA 1 2 299808 CASAVA_Build 2 108663299 1D GTGGCATGCA C/- CTGTAGTCCC 1948 hom 12 het 5 0 5 0 C 2 1 299809 CASAVA_Build 2 108667548 1I ATAGCTAGCT -/A GTAGGATGTC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 0 1 299810 CASAVA_Build 2 108668322 1I AATATTTGGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 T 8 9 299811 CASAVA_Build 2 108682604 6I CGTGAACCTG ------/GGAGAC GGAGCTTGCA 3070 het 1861 hom 18 6 9 3 GGAGAC 0 1 299812 CASAVA_Build 2 108692377 1D AGAATAGATT A/- AAAAAAAAAA 2801 het 2801 ref 20 9 6 5 A 12 11 299813 CASAVA_Build 2 108695071 1D AAATGCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 11 6 A 10 9 299814 CASAVA_Build 2 108700891 1D TTCCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1562 het 1562 ref 20 7 5 8 T 17 16 299815 CASAVA_Build 2 108705532 3I TGCTTTTGCC ---/CTT CTTAAAAATA 3070 het 2190 hom 22 7 10 5 CTT 1 2 299816 CASAVA_Build 2 108717374 1I ACCAGTTTGG -/A GGGTTCTTCT 3070 het 3070 ref 29 19 8 2 A 0 1 299817 CASAVA_Build 2 108717970 1D ACTGTCTTCA T/- TTAAGGTCAG 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 3 2 299818 CASAVA_Build 2 108723685 5I GAATTAAAGT -----/TAAAA TGAAATAGTC 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 TAAAA 0 1 299819 CASAVA_Build 2 108727294 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2736 het 2736 ref 24 14 7 4 A 13 12 299820 CASAVA_Build 2 108728486 1D TTCATCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 T 11 10 299821 CASAVA_Build 2 108737663 3I CTTTCACGTG ---/TAT TATTATTTAA 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 TAT 2 3 299822 CASAVA_Build 2 108752843 1D CAATCTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 11 10 299823 CASAVA_Build 2 108759955 1D TCTAGGTCCT G/- GGGTAAAGCT 3070 hom 110 het 40 0 37 4 G 4 3 299824 CASAVA_Build 2 108760193 15D11M15D3M3D GTTTTTTGTT GCAGTATATAACTAAGTTAGAAGTTTCTTCCCTTACCCCCCAGTTTG/---------------TTTAGTTGTTT---------------AGT--- TTTTAGTGTT 1258 het 1258 ref 26 20 4 10 N/A 0 0 299825 CASAVA_Build 2 108761611 6D TGCTGAACAA TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 TTTTGT 3 2 299826 CASAVA_Build 2 108767724 5I TCGGGTTCAT -----/TCTAG TCTAAAGTAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 TCTAG 0 1 299827 CASAVA_Build 2 108769018 1I TTTTCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 1797 het 1797 ref 21 13 6 2 A 11 12 299828 CASAVA_Build 2 108776082 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2241 het 2057 hom 14 7 6 1 A 11 10 299829 CASAVA_Build 2 108777681 5D ACGAAATTTG AATAT/----- AATATATTTC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 AATAT 2 1 299830 CASAVA_Build 2 108777946 1I TAAGTACTTA -/T TATATAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 T 1 2 299831 CASAVA_Build 2 108786282 1D TTTTCTCTCA T/- TTCTTTAGTG 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 3 2 299832 CASAVA_Build 2 108788905 2D CTCTCCTAGA GT/-- TCCTTTGCCA 3070 het 3070 ref 32 13 11 9 GT 1 0 299833 CASAVA_Build 2 108799441 1I TCACATGGCT -/A GGGGGCTGAG 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 A 0 1 299834 CASAVA_Build 2 108802757 1D CAGATCTCTG A/- ACTTTGTGAT 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 A 2 1 299835 CASAVA_Build 2 108803907 1I CAAAAGTATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 A 8 9 299836 CASAVA_Build 2 108807059 1D GAAAAAAAAA T/- TTTTTCTTCA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 6 5 299837 CASAVA_Build 2 108827308 1D TGTCTTCTTT G/- GTAAGACTTT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 G 2 1 299838 CASAVA_Build 2 108839195 2I TGAAATTATC --/TT TTGTTTCAGC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 2 4 299839 CASAVA_Build 2 108845837 1D CAATTTGGGT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 A 7 6 299840 CASAVA_Build 2 108856186 3D AATTTTTCAA ATG/--- ATGATATTTT 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 ATG 2 1 299841 CASAVA_Build 2 108860193 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAC 2051 het 2051 ref 17 8 5 4 A 9 10 299842 CASAVA_Build 2 108860491 1I GTATATAGAG -/A ATAGTACTCA 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 A 1 2 299843 CASAVA_Build 2 108861925 1D GTCATGTTCT A/- AATAAATTTG 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 A 3 2 299844 CASAVA_Build 2 108863080 2D AGGGTAACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 13 12 A 12 10 299845 CASAVA_Build 2 108866843 1I TCTCTCACAG -/T GTTCCTAGGC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 0 1 299846 CASAVA_Build 2 108869624 1I TTTAATGGGA -/T TTTAAAAAAA 1403 het 738 hom 12 4 4 4 T 3 4 299847 CASAVA_Build 2 108870091 1I AATATGTGTC -/T TTATTTCTGG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 2 3 299848 CASAVA_Build 2 108873018 1D TTGGCTGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 13 18 16 T 14 13 299849 CASAVA_Build 2 108876105 4I TTTAAACTTC ----/CTGT CTGTTACTTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 CTGT 1 2 299850 CASAVA_Build 2 108890538 1D TCTCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 1969 het 1573 hom 17 6 8 4 A 12 11 299851 CASAVA_Build 2 108900328 1D AAGTGATAAA C/- GTTTGAGGTC 3070 het 3070 hom 50 20 27 3 C 1 0 299852 CASAVA_Build 2 108962875 2I TCTGCTTCTT --/CA CACTTGAAAA 3070 hom 44 het 20 0 15 5 CA 1 2 299853 CASAVA_Build 2 108963870 1I ACTAGACCGT -/G GGGAATGACT 3070 hom 89 het 34 0 27 7 G 3 4 299854 CASAVA_Build 2 108975859 1I TCTCAGAGCA -/C CCCGCTACTC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 3 4 299855 CASAVA_Build 2 108990771 3I AAGAAACCAC ---/AAG AAGAAATCTA 3070 hom 111 het 48 0 36 12 AAG 1 2 299856 CASAVA_Build 2 109031543 1I AAAATCAATC -/T TTTTTTTGGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 299857 CASAVA_Build 2 109033028 1I ATTAAGTATG -/A AAAAAACTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 7 299858 CASAVA_Build 2 109033330 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGGGTCTC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 6 7 299859 CASAVA_Build 2 109045043 2D TTCACTTTGG AT/-- AAAAGTTATC 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 AT 1 0 299860 CASAVA_Build 2 109054562 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 27 1 20 6 A 11 12 299861 CASAVA_Build 2 109059343 6I TATCCAACTT ------/AAAAAG AAACAAGGAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AAAAAG 0 1 299862 CASAVA_Build 2 109060435 1D GAGAAAATAC A/- ACCCATATAT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 2 1 299863 CASAVA_Build 2 109063169 3D GAGTGGCTGG GCA/--- GCAGAGGCTG 2662 het 1807 hom 29 7 12 12 GCA 2 1 299864 CASAVA_Build 2 109076512 1I TTTAAAAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 T 9 10 299865 CASAVA_Build 2 109078068 1D CGCTAGTTAT G/- CTGGAAAGAG 3070 het 3070 hom 37 19 16 3 G 1 0 299866 CASAVA_Build 2 109080521 1D CATTATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 34 2 21 11 T 12 11 299867 CASAVA_Build 2 109085320 1D ATTCCGCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 13 12 299868 CASAVA_Build 2 109087333 1I TCCGTTCAGC -/T GGTTGAGGGG 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 0 1 299869 CASAVA_Build 2 109091824 2D AGTTCAGTCC CT/-- CTGTGTCGGG 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 CT 2 1 299870 CASAVA_Build 2 109094365 4I CAATCTGAAC ----/TCTA TCTATACTCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TCTA 1 2 299871 CASAVA_Build 2 109104403 4D CTCTGTCACC TTCT/---- TTGTCATAGG 3070 het 3070 ref 51 29 17 6 TTCT 1 0 299872 CASAVA_Build 2 109116611 1D CAAGGGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 42 1 19 24 T 19 18 299873 CASAVA_Build 2 109119767 4I CGGGCTCTCT ----/GAGA GAGAGCAAGA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 GA 2 4 299874 CASAVA_Build 2 109129679 1D TTCTTTAGTG C/- CCCCCCCATT 3070 hom 34 het 14 0 11 3 C 8 7 299875 CASAVA_Build 2 109131731 1D CATGGCAGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 34 0 31 3 T 9 8 299876 CASAVA_Build 2 109142032 1I AGGTGCCCTT -/A ACACAGTGTT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 1 2 299877 CASAVA_Build 2 109145768 1I GATGATTACC -/A AAAAAAACCA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 7 8 299878 CASAVA_Build 2 109148096 2D GAGGGAAGAC TG/-- TGCTAATCCT 3070 hom 132 het 49 0 45 6 TG 2 1 299879 CASAVA_Build 2 109151563 1I AACCTTTCAG -/T TCAGGAGTTC 3070 hom 114 het 49 0 36 13 T 1 2 299880 CASAVA_Build 2 109152239 1I TGAGCCCACC -/A AAGTTTCAGG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 2 3 299881 CASAVA_Build 2 109162856 1D TGGACCCAAA G/- GTGTTCTTAA 3070 hom 87 het 35 0 28 8 G 2 1 299882 CASAVA_Build 2 109166198 1D CTTTCGTGTT C/- TTAATAAAGT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 C 1 0 299883 CASAVA_Build 2 109166491 1D TTTTTGAGAT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 8 7 299884 CASAVA_Build 2 109178097 6D AGGAGAGTGA TAGGAC/------ TAGGACTAGG 3070 hom 84 het 48 0 28 22 TAGGAC 4 3 299885 CASAVA_Build 2 109181262 2I CAACTTAAAC --/AT AAAACTCAGT 3070 hom 111 het 44 0 36 8 AT 0 1 299886 CASAVA_Build 2 109198322 1I TACTCAAGCT -/A AGCTGACCCC 3070 hom 133 het 49 0 37 12 A 1 2 299887 CASAVA_Build 2 109204868 1I GATGAATGGA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 4 hom 33 1 17 15 T 2 3 299888 CASAVA_Build 2 109234984 3I AAAATACAAA ---/AAT TAGCTGAGTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAT 0 1 299889 CASAVA_Build 2 109240892 2D GTGCACACAC AT/-- ACCCACATAC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AT 1 0 299890 CASAVA_Build 2 109251631 1I ACTTTATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 498 hom 27 3 18 6 A 11 12 299891 CASAVA_Build 2 109261065 1I ACCCAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 484 hom 21 2 16 3 A 13 14 299892 CASAVA_Build 2 109262647 1I ACGCGAAACT -/A TCGCAGACGC 3070 hom 60 het 22 0 19 3 A 0 1 299893 CASAVA_Build 2 109270918 2D TTGGCTGACT GC/-- CACCAGCAGG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 GC 1 0 299894 CASAVA_Build 2 109281199 1I GCGGGAAGGG -/A AAGCGCATCT 3070 hom 132 het 50 0 40 10 A 2 3 299895 CASAVA_Build 2 109285163 1I TCCTGGGGCA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 T 7 8 299896 CASAVA_Build 2 109295490 2D CACTCTGGAG AT/-- TTGATATAAG 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 AT 1 0 299897 CASAVA_Build 2 109300793 1D GTGGCCAGCA G/- CAGCTCGCTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 G 1 0 299898 CASAVA_Build 2 109307938 2D GTGTGGTTTT TG/-- TGTCTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 17 10 9 TG 2 1 299899 CASAVA_Build 2 109317230 1D TGGGTGACAG T/- TTTTTTTTTT 1447 hom 24 het 21 0 12 9 T 12 11 299900 CASAVA_Build 2 109317673 2D CCTGCCTCTG TT/-- TTTCTCTCTC 3070 hom 129 het 47 0 41 7 T 5 3 299901 CASAVA_Build 2 109329513 1I CCAGATGGAC -/T TTGATGAGAC 3070 het 3070 ref 37 22 10 5 T 2 3 299902 CASAVA_Build 2 109332057 1I CAGAGCTCGA -/C GGTGGCACTC 3070 het 3070 ref 54 27 18 9 C 0 1 299903 CASAVA_Build 2 109368789 3D GAAACTCTGC TCT/--- TCTTCATATT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 TCT 2 1 299904 CASAVA_Build 2 109371725 3I AGAGAGACTA ---/GAG GAGAGAAGGG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 GAG 1 2 299905 CASAVA_Build 2 109382337 1D TTTCCACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 12 11 299906 CASAVA_Build 2 109383579 4I GGTGGATACA ----/CACT CACCTGCACG 3070 het 3070 hom 57 20 32 5 CACT 0 1 299907 CASAVA_Build 2 109384394 1I GCCAGGCCAG -/T TGCCTATCCT 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 T 1 2 299908 CASAVA_Build 2 109390076 1I ATTGGCCCTT -/G GCCAGCTTCT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 G 1 2 299909 CASAVA_Build 2 109390635 1D TGGGATGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 A 10 9 299910 CASAVA_Build 2 109392667 1I AGAAGAATCA -/G GCCATAAATG 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 1 2 299911 CASAVA_Build 2 109393745 1D AGAGATTTCC A/- TTGGATGATC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 1 0 299912 CASAVA_Build 2 109398038 1D AGGCAGGGAA T/- TGGAGTCTCC 1674 het 1674 ref 38 18 8 12 T 2 1 299913 CASAVA_Build 2 109405505 1D GTGTTGGGCT G/- GGGCTTGTCC 3070 hom 120 het 49 0 38 13 G 4 3 299914 CASAVA_Build 2 109407367 1I AGATACTGCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 T 8 9 299915 CASAVA_Build 2 109408587 2I TACTGCTCAG --/AA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 22 9 4 A 8 10 299916 CASAVA_Build 2 109414759 1D ATGCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 819 het 819 ref 32 24 3 5 A 11 10 299917 CASAVA_Build 2 109424842 1D AATATCTTTC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 45 19 18 10 A 9 8 299918 CASAVA_Build 2 109429660 2D ACTCCCTCTC TT/-- CTTTGGTGCC 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 2 0 299919 CASAVA_Build 2 109438417 1I TGTGTGTTAC -/A TATGGCATAT 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 A 0 1 299920 CASAVA_Build 2 109628765 1I AGCTACCCCA -/G GGGGACCACC 3070 hom 68 het 27 0 18 9 G 4 5 299921 CASAVA_Build 2 109637472 1I GTGCCCAGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 32 hom 19 1 15 3 T 9 10 299922 CASAVA_Build 2 109652428 1I TGAGTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 2460 het 2460 ref 28 12 10 6 T 10 11 299923 CASAVA_Build 2 109663006 1I AGGTCCAAGG -/A AGAATGTAGG 3070 hom 85 het 37 0 30 7 A 1 2 299924 CASAVA_Build 2 109678977 2D GAACTGAAAC AG/-- GGGGCCTCTG 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AG 1 0 299925 CASAVA_Build 2 109683537 3I AACTGAATTG ---/CCT CCTCAATTCA 3070 hom 66 het 28 0 22 6 CCT 1 2 299926 CASAVA_Build 2 109693409 1D AGGAGGGTGG A/- ATCACCTGAG 2877 hom 47 het 18 0 14 6 A 2 1 299927 CASAVA_Build 2 109699168 1I CAAGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 3 4 299928 CASAVA_Build 2 109701598 5I AGCCTGTAAG -----/TTAAA TTAAAGAGTC 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 TTAAA 1 2 299929 CASAVA_Build 2 109705291 1D AGGTAAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 11 10 299930 CASAVA_Build 2 109721187 6I AGGCTGAGGC ------/AGGAGA AGGAGAATCG 3070 het 1751 hom 23 7 10 6 AGGAGA 1 2 299931 CASAVA_Build 2 109724205 3D GGATACAAAG AAT/--- AATACAGGTT 3070 het 3070 ref 31 19 9 6 AAT 2 1 299932 CASAVA_Build 2 109746111 1D ATAAGTCACC T/- TGTGGCAGAG 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 2 1 299933 CASAVA_Build 2 109749674 2I ATTTACTAAA --/AC ACTAATTATT 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 AC 1 2 299934 CASAVA_Build 2 109749975 1D CTCCAGTGTT A/- AAAAAAAAAA 2465 het 2465 ref 18 8 6 4 A 12 11 299935 CASAVA_Build 2 109756623 1D CATCACCATC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 32 het 26 1 21 4 T 9 8 299936 CASAVA_Build 2 109758060 1D TTTTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 A 13 12 299937 CASAVA_Build 2 109759007 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAACT 1366 hom 12 het 7 0 5 2 A 9 8 299938 CASAVA_Build 2 109767265 3D ATTTTTTGTA TTT/--- TTTTTAGTAG 2571 het 788 hom 9 2 7 0 T 8 5 299939 CASAVA_Build 2 109773188 4D TGGCAGGCAC CTGT/---- AATCCCAGCT 3070 hom 29 het 15 0 12 3 CTGT 1 0 299940 CASAVA_Build 2 109782757 3I CTCAAGCAGA ---/AGG AGGAGAAGCT 3070 hom 140 het 50 0 44 6 AGG 1 2 299941 CASAVA_Build 2 109783217 4I GGGTGAATGT ----/CTGA TAGTGGATTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CTGA 0 1 299942 CASAVA_Build 2 109798818 1I CAAAACCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 10 11 299943 CASAVA_Build 2 109806648 1I TCATGATCAG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 54 het 22 0 17 5 T 7 8 299944 CASAVA_Build 2 109806756 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGCCTCAGC 3070 het 37 hom 16 1 13 2 CTC 1 0 299945 CASAVA_Build 2 109812352 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1372 hom 33 6 17 10 A 16 17 299946 CASAVA_Build 2 110061133 1I TGCCCAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 T 11 12 299947 CASAVA_Build 2 110142924 1I AGACTCCCCA -/C CCTCAACCCC 3070 hom 11 het 14 0 11 3 C 2 3 299948 CASAVA_Build 2 110181856 1D AATCATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 61 24 20 18 T 13 12 299949 CASAVA_Build 2 110182832 1D AATGTGATGA T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 72 36 24 12 T 7 6 299950 CASAVA_Build 2 110193361 9D TCTTGGCTTA CTGCAACCT/--------- CTGCCTCCCT 2597 het 2597 ref 30 17 8 5 CTGCAACCT 1 0 299951 CASAVA_Build 2 110205459 1D ATAAGGAAAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 199 het 76 0 67 10 A 8 7 299952 CASAVA_Build 2 110211770 2D CTGTTCAACT CA/-- GTAATTTCAC 3070 hom 108 het 40 0 37 4 CA 1 0 299953 CASAVA_Build 2 110213859 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 938 hom 40 3 29 8 A 11 12 299954 CASAVA_Build 2 110215341 1D TCTGTCCCCC A/- CCCTAAAAAA 3070 hom 37 het 18 0 12 7 A 1 0 299955 CASAVA_Build 2 110217233 2D CCACTGTCAT TG/-- TCTCTCTTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TG 1 0 299956 CASAVA_Build 2 110243976 8I AAAAGGCCTA --------/GACCAGAT GACAGAACTC 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 GACCAGAT 0 1 299957 CASAVA_Build 2 110248646 1I ACTTAAACAA -/C CAATGGCTCA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 C 1 2 299958 CASAVA_Build 2 110257304 11D ACCTCTTGGG CTCAAGCAATC/----------- CTCAAGCAAT 3070 het 3070 ref 34 20 13 4 CTCAAGCAATC 2 1 299959 CASAVA_Build 2 110273794 1I TTGCATTTTG -/C CAATTTGAGG 3070 het 3070 hom 49 17 27 5 C 1 2 299960 CASAVA_Build 2 110275328 1I ATTTGAAATA -/T TTGCATTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 T 2 3 299961 CASAVA_Build 2 110290907 1D AGAATTTTCA T/- TTTGGTCTTT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 4 3 299962 CASAVA_Build 2 110302776 1D AACTTAAGAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 A 9 8 299963 CASAVA_Build 2 110313665 2D GGAAGGACCC CT/-- CTCTATCTAA 3070 het 3070 hom 21 12 9 0 CT 3 2 299964 CASAVA_Build 2 110322486 7D TAGCCAAGTG TGTTGGC/------- ACATGCCTGT 3070 het 1828 hom 15 5 10 2 TGTTGGC 1 0 299965 CASAVA_Build 2 110340074 2I AAAAATAAAG --/AA AAATTAAAAA 1402 het 1402 ref 15 6 3 6 A 3 5 299966 CASAVA_Build 2 110558021 5D CTCTAGGCAC ACAAA/----- CTAGAAAACC 3070 het 3070 hom 34 10 20 7 ACAAA 1 0 299967 CASAVA_Build 2 110574993 1I CTGATGGGTA -/G GTAGTTTCTT 3070 het 3070 hom 28 12 9 7 G 1 2 299968 CASAVA_Build 2 110742642 2I ACCACATACT --/AC ATGATTCCAT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 AC 0 1 299969 CASAVA_Build 2 110748807 1D TGGTTTAATG T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 7 299970 CASAVA_Build 2 110811870 5I CATCTTAACC -----/ATTAT ATTAGTATTA 2913 het 2913 ref 18 10 6 2 ATTAT 0 1 299971 CASAVA_Build 2 111171197 6D CAAGAAAAAA AGAAAT/------ AGAAATAGAA 3070 het 3070 hom 77 33 33 16 AGAAAT 4 3 299972 CASAVA_Build 2 111177559 5D TCCACCAAAT TTTTA/----- TTTTATTATC 3070 het 3070 ref 32 17 15 2 TTTTA 2 1 299973 CASAVA_Build 2 111185201 6I CGTACAGGTG ------/AAGGCT AAGGCTAAAA 3070 het 3070 ref 54 25 21 8 AAGGCT 1 2 299974 CASAVA_Build 2 111208943 1I CCTTATTGAC -/T TTACATTTGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 2 3 299975 CASAVA_Build 2 111300801 1D CTCTCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1192 het 1192 ref 43 27 4 12 T 15 14 299976 CASAVA_Build 2 111326403 8I CGCGTGGGGG --------/CCCTGGCT CCCTGGCTCC 2541 het 2541 ref 31 15 6 10 CCCTGGCT 2 3 299977 CASAVA_Build 2 111372233 1I TAGCAACAGT -/C CTATACAACT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 1 2 299978 CASAVA_Build 2 111417948 1I TTATTAGTGC -/T TTACGTGGAG 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 2 3 299979 CASAVA_Build 2 111423440 4I ACTCCCTTTC ----/TTTT TATTTTATTG 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 T 1 5 299980 CASAVA_Build 2 111428870 1I CATTTAGTGT -/G GGTCTGTAGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 2 3 299981 CASAVA_Build 2 111434715 1D TTCTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 35 4 14 17 T 12 11 299982 CASAVA_Build 2 111437368 1I AGAACGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 10 11 299983 CASAVA_Build 2 111442827 1I TATGGACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 A 15 16 299984 CASAVA_Build 2 111446698 2D CACACACGTG CA/-- CACACACACA 2398 het 2398 ref 30 12 10 8 CA 14 13 299985 CASAVA_Build 2 111449464 2D GTTTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 GT 10 9 299986 CASAVA_Build 2 111449857 1D TAAAGATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 A 13 12 299987 CASAVA_Build 2 111459219 1D TGGATTGCTA T/- TATCATTTTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 2 1 299988 CASAVA_Build 2 111468496 1I GCCACTTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 36 0 28 8 T 9 10 299989 CASAVA_Build 2 111471395 1I ATGCTAACGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 270 hom 45 1 40 4 A 8 9 299990 CASAVA_Build 2 111478364 1D ATGCTTGGCC A/- AACCCTTCTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 3 2 299991 CASAVA_Build 2 111480998 1I TTTCTCCATC -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 6 7 299992 CASAVA_Build 2 111486059 1I AATAGAGATT -/A AAAAATACAT 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 A 5 6 299993 CASAVA_Build 2 111490979 1I CCAGTCATGG -/A AGTTGGGCAA 3070 hom 132 het 47 0 41 6 A 1 2 299994 CASAVA_Build 2 111492759 1D GAGAGGCTGG A/- GGGGGTGTTG 3070 het 2311 hom 26 9 11 6 A 1 0 299995 CASAVA_Build 2 111502131 3I GGCTACCCAG ---/TCT AAGGCTGAGG 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 TCT 0 1 299996 CASAVA_Build 2 111502602 1I TGATAACAGA -/C ATCCTCATCT 3070 het 3070 hom 51 19 29 3 C 0 1 299997 CASAVA_Build 2 111504780 1I CCTTGAGCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 11 12 299998 CASAVA_Build 2 111505321 5D TTGAGGATTA GATTC/----- AAGTAGTTTG 3070 het 3070 ref 50 24 21 13 GATTC 1 0 299999 CASAVA_Build 2 111507842 2D CTTCACTCTC AG/-- GGGTGGTGTG 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 AG 1 0 300000 CASAVA_Build 2 111513458 1I AACCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 9 10 4 A 11 12 300001 CASAVA_Build 2 111519654 11D AATTACCCAC TCTCAGGTATG/----------- TCTTTATGAA 3070 het 3070 ref 16 8 8 2 TCTCAGGTATG 1 0 300002 CASAVA_Build 2 111524068 4I CTTTCCCACC ----/ACTG ACTAAGACTC 3070 het 3070 ref 54 26 24 4 ACTG 0 1 300003 CASAVA_Build 2 111532026 2I AGTCTAGCAC --/AG GGCTTGCGGG 3070 hom 120 het 42 0 40 2 AG 0 1 300004 CASAVA_Build 2 111537697 1D GAGTATCTAC A/- AAATTCCTAT 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 A 4 3 300005 CASAVA_Build 2 111548182 1I TAGAGGATTT -/A AGGGCATGTC 3070 het 3070 ref 48 26 13 9 A 1 2 300006 CASAVA_Build 2 111549276 1I TAGAGATTTC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 8 9 300007 CASAVA_Build 2 111549514 4I GTAATTTGTG ----/TCTT TCTATTTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 TCTT 0 1 300008 CASAVA_Build 2 111553872 1D AAGAGTCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2906 hom 45 15 14 16 T 12 11 300009 CASAVA_Build 2 111553921 1I GTGAAAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 38 2 16 20 A 15 16 300010 CASAVA_Build 2 111554246 1I TTTTGAAGGA -/T TTTTTTGTGT 1461 het 470 hom 5 1 3 1 T 6 7 300011 CASAVA_Build 2 111657763 2D AAGAATGCTC CT/-- CTGTTTTATT 3070 het 3070 ref 45 21 15 10 CT 2 1 300012 CASAVA_Build 2 111662556 1I CTCTCCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 11 12 A 13 14 300013 CASAVA_Build 2 111663749 1D CCAGGCAGCC T/- TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 49 22 18 10 T 3 2 300014 CASAVA_Build 2 111669171 1I TCTTGTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 11 13 12 T 10 11 300015 CASAVA_Build 2 111670283 2I AAAAAAATCC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 9 11 300016 CASAVA_Build 2 111691839 1I GCTAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 10 11 300017 CASAVA_Build 2 111701212 1D TAACATGCAG A/- AAAAACTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 6 5 300018 CASAVA_Build 2 111704958 2D AACACATTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 39 1 19 22 A 12 10 300019 CASAVA_Build 2 111706215 1D ACTGAAGGGG A/- AAAAAAGCCA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 A 7 6 300020 CASAVA_Build 2 111708614 2D AGTGCCTCTC TT/-- TCCCTCCCAG 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 T 3 1 300021 CASAVA_Build 2 111715699 2D ATCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1190 het 489 hom 16 3 5 8 T 20 18 300022 CASAVA_Build 2 111716627 2D AGCTTTCTAT AA/-- GAGATGCATT 2866 het 2866 ref 25 16 6 3 A 2 0 300023 CASAVA_Build 2 111718408 1I TAATGTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 8 7 A 10 11 300024 CASAVA_Build 2 111721286 1D AGCTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 10 A 13 12 300025 CASAVA_Build 2 111724474 1I AGCTTTTGCT -/A CCTCTGAACT 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 A 0 1 300026 CASAVA_Build 2 111727175 2I TATTTGATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 13 15 300027 CASAVA_Build 2 111742019 2D GGTTTGTTAG AA/-- AGATATTTTA 3070 het 3070 ref 24 11 8 8 A 3 1 300028 CASAVA_Build 2 111781231 1D CCTTTGGGAT G/- GGCTGTCATC 3070 het 3070 hom 36 10 12 16 G 3 2 300029 CASAVA_Build 2 111792795 1D AAATCGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 11 10 300030 CASAVA_Build 2 111801053 4D CCTATATTGC TTTT/---- AGATAAATGT 3070 het 715 hom 30 2 27 1 T 4 0 300031 CASAVA_Build 2 111818917 1I TTTATAACAG -/A AAAAAAAAAT 2050 het 2050 ref 30 21 6 3 A 9 10 300032 CASAVA_Build 2 111834924 4I GCCGACTTAC ----/TTAT ATTTGTTCTC 3070 het 3070 ref 46 30 10 6 TTAT 0 1 300033 CASAVA_Build 2 111860787 1D AACTTCTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 10 9 300034 CASAVA_Build 2 111866847 1I CTTAATTTTT -/A AAAAAGTGAG 1437 het 1437 ref 13 9 3 1 A 5 6 300035 CASAVA_Build 2 111869538 1D GTCACCCCCA C/- CCCCCCCAGC 951 het 951 ref 21 10 2 9 C 8 7 300036 CASAVA_Build 2 111871200 15I ACCCACGTTT ---------------/CTGGAGATAGGGTCA CTGCTTTACC 1920 het 1920 ref 20 6 6 8 CTGGAGATAGGGTCA 0 1 300037 CASAVA_Build 2 111876010 4I ACACACACAC ----/ACAT ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 ACAT 0 1 300038 CASAVA_Build 2 111900019 1I TCCCTCCAAC -/A AAAAAAAGAA 1324 het 1324 ref 29 20 3 6 A 7 8 300039 CASAVA_Build 2 111905221 1I TGTTTCCCCC -/T CACCCCCAGT 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 T 0 1 300040 CASAVA_Build 2 111921869 1I TGTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 A 10 11 300041 CASAVA_Build 2 111924294 1D ACTCCTCATT C/- CCCCCCCTTG 1801 het 1801 ref 16 7 4 5 C 8 7 300042 CASAVA_Build 2 111943425 1D TGATCCTCTC A/- CCTCAGACTC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 1 0 300043 CASAVA_Build 2 111958088 1I AAAAAAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 27 0 24 3 T 9 10 300044 CASAVA_Build 2 111971113 1I GGAACTTTCT -/G GGAGTAGATT 2550 het 2550 ref 36 25 6 5 G 2 3 300045 CASAVA_Build 2 111973507 1I AGAGCCATAT -/C AAAAAAAAAA 2745 het 283 hom 18 4 8 6 C 0 1 300046 CASAVA_Build 2 111984549 1D CGGGGGCCCC T/- GTGTGCCTCC 3070 hom 45 het 17 0 12 5 T 1 0 300047 CASAVA_Build 2 112000580 4D TCCCTCAAAG GGTT/---- TTTGACCTAT 3070 het 1313 hom 18 3 12 6 GGTT 1 0 300048 CASAVA_Build 2 112007967 1D CATATCAGCT A/- CCTAGGGCGT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 1 0 300049 CASAVA_Build 2 112019002 1D TTTGTTAAAG A/- AAAAAAGTGA 1575 het 1575 ref 17 13 4 0 A 7 6 300050 CASAVA_Build 2 112034309 4D CACACACGCG CACA/---- CACACACACA 2108 hom 21 het 12 0 6 6 CA 10 8 300051 CASAVA_Build 2 112042858 3D TTGAAACAAT AAC/--- AACAACAACT 3070 hom 45 het 19 0 14 5 AAC 4 3 300052 CASAVA_Build 2 112052828 1I ATTATTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 53 hom 18 1 13 4 A 11 12 300053 CASAVA_Build 2 112059523 1I ATCCTGTGCA -/G GGGCTGCTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 3 4 300054 CASAVA_Build 2 112082984 1I GGCCAACAAA -/G AAGGAGGAGG 3070 hom 90 het 33 0 28 5 G 0 1 300055 CASAVA_Build 2 112085601 1I AGATTCACTG -/T TTCAGAAAAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 2 3 300056 CASAVA_Build 2 112097457 1D CTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1786 het 1786 ref 46 36 4 6 A 11 10 300057 CASAVA_Build 2 112099050 13I ATGCTAATCT -------------/CACTTAAGCCCAG CACATCAGTG 3070 hom 123 het 43 0 42 2 CACTTAAGCCCAG 0 1 300058 CASAVA_Build 2 112106041 1D CTACATCCCC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 118 het 45 0 39 6 A 8 7 300059 CASAVA_Build 2 112109947 1D AGTTGTTTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 10 9 300060 CASAVA_Build 2 112119119 1D AGTGAATATC A/- AGTGATAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 3 A 2 1 300061 CASAVA_Build 2 112123461 1D ATATCCACAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 10 9 300062 CASAVA_Build 2 112131303 2D ATTGGGGATT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 28 het 37 1 22 14 TC 10 9 300063 CASAVA_Build 2 112133050 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAAAA 2048 het 14 hom 21 1 9 11 AC 1 0 300064 CASAVA_Build 2 112140673 3D GTGATGGTGA TGG/--- TGGTGTTACT 3070 hom 205 het 78 0 64 16 TGG 2 1 300065 CASAVA_Build 2 112145472 3D TTATTTCAAT AAG/--- AATACAGAGC 3070 hom 84 het 35 0 29 10 AAG 1 0 300066 CASAVA_Build 2 112172102 1I AGACCTCCTG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 A 7 8 300067 CASAVA_Build 2 112229634 2D GAAAACAAAG AC/-- ACAAATTATC 3070 het 3070 ref 43 23 12 9 AC 2 1 300068 CASAVA_Build 2 112235904 1D ACAGTATACT G/- GGGTAGATGA 3070 het 3070 ref 55 33 13 9 G 4 3 300069 CASAVA_Build 2 112243661 2I ATGCTTCTGA --/AG AGAGAGGTGT 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 AG 3 4 300070 CASAVA_Build 2 112252985 1D TAAACATTAA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 2 1 300071 CASAVA_Build 2 112259891 1D TCTTCTCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 23 7 7 T 10 9 300072 CASAVA_Build 2 112263707 9D TTCAAAGATA AATATTAAG/--------- ATACTAATGT 2453 het 2453 ref 27 23 6 1 AATATTAAG 1 0 300073 CASAVA_Build 2 112298046 4I CATATTTAAA ----/TTTT TTTATCCTCA 2529 het 2529 ref 29 19 6 4 T 3 7 300074 CASAVA_Build 2 112337970 1D GAGAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 1493 het 1493 ref 25 17 4 4 A 13 12 300075 CASAVA_Build 2 112339738 4I TACTGTGTTA ----/AAGT TTTGTATCCT 2306 het 2306 ref 33 25 5 3 AAGT 0 1 300076 CASAVA_Build 2 112377183 3D GGTAAGCTCC TGG/--- TGGCAGGGCT 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 TGG 2 1 300077 CASAVA_Build 2 112378428 2D CAGAAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1873 het 1335 hom 19 9 5 5 T 14 12 300078 CASAVA_Build 2 112380128 1I ACTCTGTGCC -/T TCCATGTATT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 1 2 300079 CASAVA_Build 2 112381717 1D TCCCCCCTGA G/- GGGGAACAGC 3070 het 3070 ref 37 19 18 0 G 5 4 300080 CASAVA_Build 2 112389638 2I TTCTTGACAC --/TT TTCTTTGACC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 4 300081 CASAVA_Build 2 112393404 1I TAAGAGGAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2954 hom 23 10 12 1 T 9 10 300082 CASAVA_Build 2 112410466 1D AAAATTTTTT A/- ATTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 2 1 300083 CASAVA_Build 2 112411338 1I ACAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3051 het 1172 hom 19 5 8 6 A 13 14 300084 CASAVA_Build 2 112412313 1I TTGTTGTTTG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 7 8 300085 CASAVA_Build 2 112414158 1D GCTTCTACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 T 10 9 300086 CASAVA_Build 2 112426528 1I CTGATCCAAC -/A AAATGAGCCA 3070 het 3070 ref 60 37 17 6 A 3 4 300087 CASAVA_Build 2 112429127 1I GTTCCCAGGG -/A GACGCCATTC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 0 1 300088 CASAVA_Build 2 112438417 12D TCATTGTCTC GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGTGT 2308 het 1850 hom 35 6 9 23 GT 15 9 300089 CASAVA_Build 2 112452167 1D TAATTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 15 3 T 11 10 300090 CASAVA_Build 2 112457068 1D GAAGAGCACG A/- TTAGTCATCT 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 A 1 0 300091 CASAVA_Build 2 112464458 1I GATAAACACT -/G GGCCAGCATC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 2 3 300092 CASAVA_Build 2 112466435 1I GGCGGGCATG -/A AAAGCTCTGC 3070 hom 114 het 43 0 37 6 A 3 4 300093 CASAVA_Build 2 112467186 3D GTTGACTATT GTG/--- GTGTGGGAGC 3070 hom 75 het 28 0 26 5 GTG 2 1 300094 CASAVA_Build 2 112470253 1D TACCACAGTT A/- AATAACACCC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 3 2 300095 CASAVA_Build 2 112480941 3D CTTCAGTAGA AAG/--- AAGATTAATA 3070 het 3070 ref 34 18 11 6 AAG 2 1 300096 CASAVA_Build 2 112481067 4I AGACTTTTTA ----/TTTG TTTGTTTTTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TTTG 1 2 300097 CASAVA_Build 2 112481903 1D GGTGTTGGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 10 9 300098 CASAVA_Build 2 112488591 1D ATTTTGTAGC A/- AAAAAGATTA 3070 hom 27 het 13 0 10 4 A 6 5 300099 CASAVA_Build 2 112490000 7D TTGAGTTGCT CTTGTAC/------- CTTTGTCTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 CTTGTAC 1 0 300100 CASAVA_Build 2 112491681 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 37 1 18 20 A 13 12 300101 CASAVA_Build 2 112493127 2D TTCCCTCCTC TG/-- TGCAATGCGT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 TG 2 1 300102 CASAVA_Build 2 112495758 2I CTTGCTCAGA --/TC TCTCTTTTAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TC 2 3 300103 CASAVA_Build 2 112497926 1I TGGACAGCAC -/T CCTCCCTACA 3070 het 3070 ref 46 23 13 10 T 0 1 300104 CASAVA_Build 2 112501015 1D CGTATGAATT A/- TCAGTTTCTC 3070 het 3070 ref 33 16 11 9 A 1 0 300105 CASAVA_Build 2 112502995 1I GTTTTTGGTA -/T TTTGTCTTCC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 3 4 300106 CASAVA_Build 2 112509368 1D GCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1328 hom 17 4 10 3 T 14 13 300107 CASAVA_Build 2 112524354 2I TTATATGATA --/CT CTCTCAAAAT 3070 het 3070 ref 50 20 23 7 CT 2 3 300108 CASAVA_Build 2 112526615 4D GCTTTCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 15 10 TCTT 3 2 300109 CASAVA_Build 2 112527400 1I AGTGTTCTTA -/C ACTAAAGGTG 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 C 0 1 300110 CASAVA_Build 2 112531876 1D TGCCTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 2519 het 1186 hom 28 6 10 12 T 17 16 300111 CASAVA_Build 2 112532597 2I TATGTCAACT --/AA AAAGTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 3 5 300112 CASAVA_Build 2 112545985 1I GGTGGCTCTT -/A ATTATTTTGA 3070 het 3070 ref 46 28 13 5 A 1 2 300113 CASAVA_Build 2 112561465 2D TTCTCTCAGA CT/-- CTACCCTGAC 3070 het 3070 hom 42 15 16 12 CT 2 1 300114 CASAVA_Build 2 112592086 1I TGATGCTACC -/T CTGTAGCTCA 3070 het 3070 hom 54 13 35 6 T 0 1 300115 CASAVA_Build 2 112595947 1D AGTTCTAATC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 T 7 6 300116 CASAVA_Build 2 112596033 1I GATGAAGAAA -/G AAAACTTAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 0 1 300117 CASAVA_Build 2 112600822 4D GGAAATCAGA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 AAAG 4 3 300118 CASAVA_Build 2 112603124 3D GCCCCATATT TTA/--- TTATTCTGTT 3070 het 3070 hom 45 22 16 9 TTA 2 1 300119 CASAVA_Build 2 112603680 2D AAAAAAAAAC AA/-- AAACAATAAC 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 5 3 300120 CASAVA_Build 2 112606126 4D AGAAAGAAAG AGAA/---- AGAAAGAAAA 1568 het 1568 ref 26 14 5 7 AGAA 3 2 300121 CASAVA_Build 2 112608410 2D CATTTAGAAC CA/-- CAGAGAAATG 3070 het 3070 hom 40 19 16 5 CA 2 1 300122 CASAVA_Build 2 112611984 1I ATCAGAAGGA -/C CGTAGATCCC 3070 het 3070 ref 50 23 16 11 C 1 2 300123 CASAVA_Build 2 112623227 1D CTGTCAAGGG C/- AGCCCTGATT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 1 0 300124 CASAVA_Build 2 112634689 12D TGCGTGCACA CACACGCGCACG/------------ CACACGCGCA 2670 hom 31 het 20 0 10 10 CACACGCGCACG 2 1 300125 CASAVA_Build 2 112634897 2D CGCACACGCG CA/-- CACACACACA 1990 het 1988 ref 30 9 7 14 CA 9 8 300126 CASAVA_Build 2 112649064 1I CCACTCAGAG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 7 8 300127 CASAVA_Build 2 112652316 8D AAAAAAAAAA ACCAAAAG/-------- AAAACAAACA 133 het 133 ref 18 16 2 7 ACCAAAAG 1 0 300128 CASAVA_Build 2 112652953 13I TACGGAATGG -------------/GCAAAAGCTGAAA GCATTCTCCT 3070 het 3070 hom 36 18 18 2 GCAAAAGCTGAAA 0 1 300129 CASAVA_Build 2 112658856 2D CCATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AT 6 5 300130 CASAVA_Build 2 112685802 4D AAAACATGTC TTTT/---- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 T 9 5 300131 CASAVA_Build 2 112711628 1D AAAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1898 hom 24 7 9 8 T 15 14 300132 CASAVA_Build 2 112746511 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 A 9 8 300133 CASAVA_Build 2 112750508 1D GAACACCTCT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 20 9 11 1 A 7 6 300134 CASAVA_Build 2 112751071 1D TGTAGTAATG T/- GATCGGCTTG 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 T 1 0 300135 CASAVA_Build 2 112751829 1D AAGGAGATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 T 11 10 300136 CASAVA_Build 2 112754169 1I TCAATTTTCC -/A TTCCCACTTA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 0 1 300137 CASAVA_Build 2 112755032 1D ACAAGTTAGG A/- AGCTTTTCAG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 A 2 1 300138 CASAVA_Build 2 112762256 1I CTTCCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 62 26 23 13 T 12 13 300139 CASAVA_Build 2 112762874 23D TTTTTGTTTT GGTTTGCATCCTCTCTAACTTTA/----------------------- GGTAGAAATT 3070 het 3070 ref 50 42 8 7 GGTTTGCATCCTCTCTAACTTTA 1 0 300140 CASAVA_Build 2 112763762 1D GCTTCATATG A/- TTTAAATATT 3070 het 3070 hom 43 15 17 12 A 1 0 300141 CASAVA_Build 2 112765002 6I AGGTAATATC ------/GTCATT ATCAGGACCC 3070 het 3070 hom 82 16 57 9 GTCATT 0 1 300142 CASAVA_Build 2 112772209 3I TTTTAAAAAA ---/TTT TTTATTTTTT 2609 het 2609 ref 16 8 7 1 T 3 6 300143 CASAVA_Build 2 112780223 5D TCTGTATTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2809 het 1110 hom 23 6 9 8 T 16 11 300144 CASAVA_Build 2 112788248 1I TTCTTGTATT -/G TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 G 0 1 300145 CASAVA_Build 2 112790320 1I AGAAATAGGC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 8 9 300146 CASAVA_Build 2 112795417 1D GTGATAAATG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 8 7 300147 CASAVA_Build 2 112798722 1D GTAAGTTTAC T/- TTTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 T 6 5 300148 CASAVA_Build 2 112829906 1I GTCTCTAAGC -/T TTTTAAAAAT 3070 hom 24 het 16 0 9 7 T 4 5 300149 CASAVA_Build 2 112837339 2D TATGTTGCAC TT/-- TTTTTTTTTT 1952 het 1952 ref 43 26 8 9 T 13 11 300150 CASAVA_Build 2 112841375 5D TGAATTTGGC TTTCT/----- TTTATTTTTT 2822 het 2822 ref 52 39 6 9 TTTCT 1 0 300151 CASAVA_Build 2 112851337 6I AGTTTTTTTT ------/TGTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 1470 hom 33 15 12 6 TGTTTG 0 1 300152 CASAVA_Build 2 112853091 1I AACAAAAGTT -/C AGACACAGTG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 C 0 1 300153 CASAVA_Build 2 112974287 1D TAATAGGTAC A/- AGAGTTTTTT 2567 het 2567 ref 25 13 7 6 A 2 1 300154 CASAVA_Build 2 112976686 1D23M1D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAATCATCTGAT/-AAAAAAAAAAAAAAATCATCTGA- TTTTTTATCT 3070 het 2732 hom 14 8 8 7 N/A 0 0 300155 CASAVA_Build 2 112994664 2I CCGTGTATAG --/TA GCCAGATAGG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TA 0 1 300156 CASAVA_Build 2 113006814 21I TTTCTCCAAC ---------------------/TCTTAAAAAATAAAAAACTAT TCTTAGCTCA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 TCTTAAAAAATAAAAAACTAT 0 1 300157 CASAVA_Build 2 113009793 1D GGCAAATTGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 8 7 300158 CASAVA_Build 2 113013626 1I TAATGGTGAT -/G GTGAAAGCTC 3070 het 3070 hom 45 17 27 1 G 1 2 300159 CASAVA_Build 2 113014496 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AGAAAGAAAT 3070 het 1459 hom 37 12 19 6 AAG 1 0 300160 CASAVA_Build 2 113017431 1D GGGTGAAGAT A/- ATGAAAGCAG 3070 het 3070 hom 48 18 24 8 A 2 1 300161 CASAVA_Build 2 113026669 1D TGTTTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 T 12 11 300162 CASAVA_Build 2 113028651 2I ATTAATTTAA --/TC TGTTATTAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 TC 0 1 300163 CASAVA_Build 2 113032207 1D CTGAGAGTTC T/- TTTTAAAAGC 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 5 4 300164 CASAVA_Build 2 113035112 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2727 het 2726 ref 25 9 8 8 A 12 11 300165 CASAVA_Build 2 113035513 1D AAGAGTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 12 11 300166 CASAVA_Build 2 113044831 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2732 het 143 hom 17 2 8 7 T 14 13 300167 CASAVA_Build 2 113058142 1D CCTGGGTGCC A/- GGGGGATTAT 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 A 1 0 300168 CASAVA_Build 2 113066639 14D GTAGTGATAA CCCCCTTTTCATTT/-------------- CTGACATTGG 3070 het 3070 ref 29 18 13 6 CCCCCTTTTCATTT 1 0 300169 CASAVA_Build 2 113067819 3D TCTAAACATA AGG/--- AGGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 AGG 2 1 300170 CASAVA_Build 2 113090952 1D AAGGAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 332 hom 31 2 16 13 T 15 14 300171 CASAVA_Build 2 113095812 1I GCACAGAATT -/G GTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 2 300172 CASAVA_Build 2 113097793 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 12 11 300173 CASAVA_Build 2 113112695 1D GTGATAGGGT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 8 7 300174 CASAVA_Build 2 113130797 1I TGTGGCAGTT -/A ACGATCATGA 3070 hom 141 het 55 0 47 8 A 1 2 300175 CASAVA_Build 2 113134748 2I CTTATTGTCA --/GT TTGTTCTTTT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 GT 0 1 300176 CASAVA_Build 2 113134900 5I TTTTATTTGT -----/CTTTA CTTGGGAGCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 CTTTA 0 1 300177 CASAVA_Build 2 113136517 1I TAATCCCAGC -/T ACTTGGGAGG 3070 hom 69 het 24 0 24 1 T 0 1 300178 CASAVA_Build 2 113140736 2I ACCCCAGAAA --/AG AGCTTCAGAA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 AG 1 2 300179 CASAVA_Build 2 113162213 5D TCCCCCCCCC CCCCA/----- CAGGCCCTCA 3070 het 451 hom 16 3 9 4 CCCCA 1 0 300180 CASAVA_Build 2 113169334 5D GTGAGATTTT AAAAA/----- TACAATACAG 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 A 5 0 300181 CASAVA_Build 2 113176803 1D TATGTCACCA T/- GCCTGGTTAA 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 T 1 0 300182 CASAVA_Build 2 113177269 1D17M12D ATATGCTTAC TTTACCATCTGTGTATCCTGTTTGGTGAGG/-TTACCATCTGTGTATCC------------ TGTCTGTTAA 3070 het 3070 ref 34 29 16 5 N/A 0 0 300183 CASAVA_Build 2 113180389 7I TCCTTCCCCT -------/CTCTCCA CTCTCCACCC 3070 het 3070 hom 45 14 21 10 CTCTCCA 1 2 300184 CASAVA_Build 2 113194283 1D TTTTTTTTTT C/- TTCGTATTTT 2785 hom 33 het 13 0 11 2 C 1 0 300185 CASAVA_Build 2 113196217 1D TGCCCCCCGA C/- CCCCCGTCTG 2472 hom 33 het 16 0 10 6 C 6 5 300186 CASAVA_Build 2 113206259 1D GAGCCTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 11 10 300187 CASAVA_Build 2 113207300 1D ATTTGGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 473 hom 20 3 13 5 T 15 14 300188 CASAVA_Build 2 113221146 1D TTAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 11 10 300189 CASAVA_Build 2 113221414 5D AAACAAATCC TAGAG/----- TAAACATTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 TAGAG 1 0 300190 CASAVA_Build 2 113222508 1I GCATGAAGGC -/A AAATAACAAG 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 3 4 300191 CASAVA_Build 2 113223271 9D GGATGGAAAA AGAGCTACC/--------- AGAGCTACCA 3070 hom 99 het 35 0 34 4 AGAGCTACC 2 1 300192 CASAVA_Build 2 113231355 1D CTAAAAAAAA T/- AATCATTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 0 300193 CASAVA_Build 2 113233293 1I TTTTACTCTC -/A AAAGTGTCCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 300194 CASAVA_Build 2 113245682 5D TTTTGTAAAT TATTA/----- TATTGTCATA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 TATTA 1 0 300195 CASAVA_Build 2 113247557 1I TAATTTTTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1832 hom 20 6 11 3 T 9 10 300196 CASAVA_Build 2 113248187 4I CAGGTGGAAT ----/TGAA TGAAACAAGA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 TGAA 1 2 300197 CASAVA_Build 2 113251154 1D ACCCTATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 26 0 11 15 T 15 14 300198 CASAVA_Build 2 113254072 1I GAGAAAAAAA -/T GAATGCATTA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 0 1 300199 CASAVA_Build 2 113285137 1D ATAGCTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 T 11 10 300200 CASAVA_Build 2 113287608 2I CAGAGCCTTA --/TT TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 8 10 300201 CASAVA_Build 2 113292988 2I GGAGTAGGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 18 8 T 14 16 300202 CASAVA_Build 2 113294987 1D CTAAAACTCC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 9 8 300203 CASAVA_Build 2 113305227 2D CAAAATTGTC AA/-- ATAGACCTGT 3070 het 2538 hom 21 7 13 1 A 3 1 300204 CASAVA_Build 2 113309364 1D ATGAAATGGG A/- AACATTATCA 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 A 3 2 300205 CASAVA_Build 2 113311625 4D TCTTGGTAAT ACCA/---- ACCAAGAGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 ACCA 2 1 300206 CASAVA_Build 2 113317849 2D AGTTTGAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 678 hom 25 het 24 0 11 13 GT 10 9 300207 CASAVA_Build 2 113317899 5I AGGGGAAGGG -----/AAACA AAACAAAAGT 3070 hom 52 het 25 0 16 9 AAACA 1 2 300208 CASAVA_Build 2 113324753 1D CCAGCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 11 11 A 12 11 300209 CASAVA_Build 2 113346450 3D GCAGACTACT CAA/--- CAACAACAAT 3070 het 3070 ref 51 25 20 7 CAA 4 3 300210 CASAVA_Build 2 113350613 1D CTCAGACTAA T/- TTTTTTTTTT 1196 het 1196 ref 43 35 3 6 T 13 12 300211 CASAVA_Build 2 113359980 1I TCCTTCTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 T 11 12 300212 CASAVA_Build 2 113372009 1D CTCCCTCTCA T/- TTTTTTTTTT 1579 het 1579 ref 24 14 5 5 T 15 14 300213 CASAVA_Build 2 113392248 1I GGATGGAGCA -/T CCTTTCACTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 0 1 300214 CASAVA_Build 2 113401402 3I AAGAATCATA ---/TTT TTTTCAACAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 4 7 300215 CASAVA_Build 2 113402818 1I ACTACATCTC -/A AAAAAAAAAA 2235 het 2235 ref 28 11 12 5 A 13 14 300216 CASAVA_Build 2 113403238 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 843 het 84 hom 21 1 6 14 A 11 10 300217 CASAVA_Build 2 113411040 2D CTCTTCTTTA AC/-- ACACGAAGGA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 AC 3 2 300218 CASAVA_Build 2 113424578 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 12 11 A 14 13 300219 CASAVA_Build 2 113425347 1I CTGCACTTGT -/G TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 G 0 1 300220 CASAVA_Build 2 113432579 2D CAAAGTACAC TT/-- ACCAAAGTGG 3070 het 3070 ref 43 20 15 11 T 2 0 300221 CASAVA_Build 2 113433720 14I GTGAGCTGAG --------------/TGCTTGCAACTGGA TGCTTGGGTG 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 TGCTTGCAACTGGA 0 1 300222 CASAVA_Build 2 113443920 1I CCTAAACTCC -/A AAAAAGTTAA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 5 6 300223 CASAVA_Build 2 113448635 1D ATTTATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 9 8 5 T 11 10 300224 CASAVA_Build 2 113470618 4D TTAAAAAAAA TTTT/---- ATTTTATTTT 146 het 146 ref 15 1 1 13 T 4 0 300225 CASAVA_Build 2 113474507 3I ACTTAACCTG ---/CCA CCACCACAAG 3070 hom 91 het 38 0 31 7 CCA 2 3 300226 CASAVA_Build 2 113513918 5I AGATAGCGAA -----/GGGGT GGGAAACTGC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 GGGGT 0 1 300227 CASAVA_Build 2 113515627 1I ACCATGAAAG -/A AAATAAAGAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 3 4 300228 CASAVA_Build 2 113516408 6I TAAACGGCGC ------/ATATTT AAAATATACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATATTT 0 1 300229 CASAVA_Build 2 113520250 14D TTTCTTCAGG TTTTTTCTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 14 8 TTTTTTCTTTTTTT 1 0 300230 CASAVA_Build 2 113520856 4I GATGTTAATC ----/TTGA TTACCTGGCT 3070 hom 111 het 38 0 37 1 TTGA 0 1 300231 CASAVA_Build 2 113524394 5D AACTAATAAC AAAAA/----- AAAAAAAATA 3070 het 55 hom 25 1 16 8 A 13 8 300232 CASAVA_Build 2 113531198 1I CTAAGTTACG -/T TTTTAAAGAC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 4 5 300233 CASAVA_Build 2 113532009 1I AATAAAACTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 30 het 19 0 11 8 A 9 10 300234 CASAVA_Build 2 113534190 2D ATATGAGTGA CT/-- CTGAGGTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 CT 2 1 300235 CASAVA_Build 2 113535624 2I ATGTGTGAGC --/AT ATGTGTGCAT 3070 het 3070 hom 71 28 33 10 AT 1 2 300236 CASAVA_Build 2 113542389 1D TTTTGTTTTC G/- TTTTTTTTTT 3070 het 2198 hom 33 12 12 12 G 1 0 300237 CASAVA_Build 2 113543352 1D GGATGTGGTG A/- AAAAAATCTT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 7 6 300238 CASAVA_Build 2 113545489 2D AGTAAGGGAA AC/-- ACATGCAATC 3070 het 3070 ref 43 29 11 3 AC 2 1 300239 CASAVA_Build 2 113547949 4I GTATACACTC ----/AATT AATCTCTGTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AATT 0 1 300240 CASAVA_Build 2 113550904 1D AATATTAGAT G/- GGGGGGTCAG 2681 het 665 hom 21 5 11 6 G 7 6 300241 CASAVA_Build 2 113551758 1D CCCAGCTAGG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 8 7 300242 CASAVA_Build 2 113552998 1I AAAATTTTCA -/G CATGTAAAAT 1654 het 1654 ref 28 22 4 2 G 0 1 300243 CASAVA_Build 2 113553312 1D CTCATTCCTT A/- AATTCCTTCT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 A 3 2 300244 CASAVA_Build 2 113558595 2D GCCTTGTACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 33 0 22 11 A 13 11 300245 CASAVA_Build 2 113560964 2I AAGAAATAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 12 14 300246 CASAVA_Build 2 113565354 3D CTTGCCTCCA TTT/--- TTTTTTTGTT 568 het 568 ref 29 17 3 9 T 10 7 300247 CASAVA_Build 2 113580950 3I AGAAAGAATT ---/AAA TTGAGCTTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 0 3 300248 CASAVA_Build 2 113582507 5D CCTTCCCTTC TCTTA/----- TCTTATCACT 3009 het 1699 hom 14 5 9 1 TCTTA 2 1 300249 CASAVA_Build 2 113583654 2D GGATGGAAGA AC/-- ACAGTCAAAC 3070 het 3070 ref 48 23 21 6 AC 2 1 300250 CASAVA_Build 2 113587630 3I TGTTCTTACC ---/AAT AATAATAATA 3070 het 2915 hom 37 10 15 12 AAT 5 6 300251 CASAVA_Build 2 113587681 1D CTTCAAAAGG T/- GATGGATATG 3070 het 2703 hom 45 8 25 12 T 1 0 300252 CASAVA_Build 2 113588461 1D CTGCCCACCG T/- TAAGTCCAGT 3070 hom 79 het 32 0 26 6 T 2 1 300253 CASAVA_Build 2 113592539 1I GCTTGGCACA -/G GTCAGTTCCA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 G 1 2 300254 CASAVA_Build 2 113598488 1D TGATTGACAG C/- CCCCCCCCTT 3070 het 1684 hom 34 10 15 9 C 9 8 300255 CASAVA_Build 2 113614469 6D TATATCTATC AATATA/------ TATATATATA 2293 hom 18 het 8 0 7 2 AATATA 1 0 300256 CASAVA_Build 2 113618997 1I GATTATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 10 11 300257 CASAVA_Build 2 113632378 1I TCAGGGGACC -/T AGTATCAAAG 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 T 0 1 300258 CASAVA_Build 2 113634202 1I GAAAGATGAG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 6 7 300259 CASAVA_Build 2 113669214 2D GGTCATCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1422 hom 28 6 12 10 T 14 12 300260 CASAVA_Build 2 113670440 2D ACAGGTGTGC AG/-- AGAGACAGCC 1545 het 1545 ref 28 18 5 5 AG 3 2 300261 CASAVA_Build 2 113673652 1I TGTTCCTTCT -/A AATACCTACC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 A 2 3 300262 CASAVA_Build 2 113674182 1I CAGTAATGAC -/T TTTGTTGACT 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 T 3 4 300263 CASAVA_Build 2 113688227 1I AAAGGGGGCC -/A AATATTCAGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 2 3 300264 CASAVA_Build 2 113705594 1I CTATGAAGTA -/G GTGAAGGAGT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 G 1 2 300265 CASAVA_Build 2 113709272 2D AGCATGTCTT CC/-- CCGTCACAGA 3070 het 2647 hom 23 7 12 4 C 4 2 300266 CASAVA_Build 2 113710768 1I CGGGTAGAGG -/C CCTGGGGAGC 3070 hom 53 het 25 0 17 8 C 2 3 300267 CASAVA_Build 2 113723028 4I AAGAAAAAAA ----/AGGG AGGGAGGTGG 3070 het 1669 hom 39 11 19 9 AGGG 1 2 300268 CASAVA_Build 2 113725045 1D CAGGGGGAAA G/- AAATCCATGC 3070 het 3070 ref 42 24 16 3 G 1 0 300269 CASAVA_Build 2 113726632 6D TGGCATGCTG GAAAGC/------ AGCATCCTGC 3070 het 3070 ref 60 29 23 8 GAAAGC 1 0 300270 CASAVA_Build 2 113730042 1I CTCAATCAGT -/A AAAAAAAAAA 950 hom 26 het 19 0 10 9 A 17 18 300271 CASAVA_Build 2 113733753 4I TATCGAAAGC ----/ATTA ATTAATTGAT 3070 hom 100 het 40 0 34 6 ATTA 1 2 300272 CASAVA_Build 2 113734536 2D AAAATCACTC AG/-- AGATGGGTAA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 AG 2 1 300273 CASAVA_Build 2 113744903 1D GAAGATGACG A/- AAAAAAGTTA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 A 7 6 300274 CASAVA_Build 2 113747512 2I CTTTACTCTT --/TC TGATCTAGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TC 0 1 300275 CASAVA_Build 2 113750709 1D AGTAGCCGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 23 1 14 9 A 13 12 300276 CASAVA_Build 2 113754668 1D TGTGGAGTGT G/- GCAGCCACAG 3070 hom 82 het 35 0 24 12 G 2 1 300277 CASAVA_Build 2 113763602 1D CAAATTGACT A/- AAGCAACCTT 2408 het 1520 hom 19 5 6 8 A 3 2 300278 CASAVA_Build 2 113765118 1I GAACGGCGAG -/C CCCTCCAGGG 1710 hom 27 het 13 0 4 9 C 3 4 300279 CASAVA_Build 2 113769449 1D AGTCTTCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 10 9 300280 CASAVA_Build 2 113775464 1D TAATTCTGCA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 8 7 300281 CASAVA_Build 2 113779414 1D AGACAAGCCT A/- AACCATGGTG 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 3 2 300282 CASAVA_Build 2 113781375 1D TTAGGGATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 10 9 300283 CASAVA_Build 2 113794219 1D TATGTCTCAG A/- AAAAGGAAGA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 5 4 300284 CASAVA_Build 2 113797743 1D GCCCCTAAAA G/- CACCACTTCA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 1 0 300285 CASAVA_Build 2 113803381 3D GGGGGTTCTC AGG/--- AAGCCCCACA 2974 het 2974 ref 23 13 7 5 AGG 1 0 300286 CASAVA_Build 2 113825317 1D CAAAAAAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1957 hom 20 6 9 6 A 10 9 300287 CASAVA_Build 2 113843456 1D ATTGTTGGGC T/- GTATGATTAG 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 T 1 0 300288 CASAVA_Build 2 113867626 2I GATAGAACAG --/AC AGTGATTTTC 2246 het 2246 ref 46 34 6 6 AC 0 1 300289 CASAVA_Build 2 113887705 3D AAGAGAGGAA AGG/--- AGGTATGGTC 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 AGG 2 1 300290 CASAVA_Build 2 113887931 1I TGGAAGACTG -/T TTCCCAGAAG 3070 het 3070 ref 52 37 7 8 T 2 3 300291 CASAVA_Build 2 113889839 3I AATATTTTAT ---/TAA TAATAATTCA 2234 het 2234 ref 39 23 6 10 TAA 2 3 300292 CASAVA_Build 2 113891019 1D GACATAGGGT A/- AATAGTATAG 2345 het 2345 ref 41 31 5 6 A 3 2 300293 CASAVA_Build 2 113893572 1I TTAGTTACAC -/A AAAAAAAGGA 1643 het 1643 ref 77 58 4 15 A 7 8 300294 CASAVA_Build 2 113895692 1I TGCACTCTCA -/C CCCCTCATTC 3070 het 3070 ref 38 23 8 7 C 4 5 300295 CASAVA_Build 2 113895946 1D GCAAGGTCTC A/- AAAGAGTTCA 3070 het 3070 ref 43 33 8 2 A 4 3 300296 CASAVA_Build 2 113899912 2I ATCAGCATAC --/AT ATATATATAT 1055 het 1055 ref 21 9 4 8 AT 6 7 300297 CASAVA_Build 2 113906714 1D AATACATTGG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 8 7 300298 CASAVA_Build 2 113907669 1D TCAGGAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 7 A 11 10 300299 CASAVA_Build 2 113908171 1D CTTAACACAG T/- TGCCTATCAG 1402 het 1402 ref 17 8 3 6 T 2 1 300300 CASAVA_Build 2 113916609 3D CTGTTTTTTT ATC/--- ATCTTATTAA 3070 het 2723 hom 20 7 10 3 ATC 2 1 300301 CASAVA_Build 2 113927288 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 T 11 10 300302 CASAVA_Build 2 113927802 1I GGTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1740 het 1740 ref 19 11 6 2 A 10 11 300303 CASAVA_Build 2 113929900 2I CCTGAGTATC --/TG GGATTACAGG 1838 het 1838 ref 17 9 4 4 TG 0 1 300304 CASAVA_Build 2 113930502 2D AGACATTTTG TT/-- TTTTTTTTTA 2450 het 2450 ref 29 19 6 4 T 11 9 300305 CASAVA_Build 2 113931808 1I TTTTTTTGAG -/A GGGGGTGGTA 1824 het 1824 ref 15 9 4 2 A 0 1 300306 CASAVA_Build 2 113933560 1I TAAAATTATG -/T TCATTTTACT 3070 het 3070 ref 44 34 7 3 T 1 2 300307 CASAVA_Build 2 113935634 1D ATAATTGAGG A/- AAATTGAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 4 3 300308 CASAVA_Build 2 113939552 1I ATTTGAAGTG -/T TTTAAATGGC 1605 het 1605 ref 15 9 5 1 T 3 4 300309 CASAVA_Build 2 113940597 3D ACTAAAATCT TCC/--- GTGAATTCTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 TCC 1 0 300310 CASAVA_Build 2 113952692 1I TTTCAACTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 7 6 T 11 12 300311 CASAVA_Build 2 113961049 1D CATTTAAAAA G/- TGCATATTAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 G 1 0 300312 CASAVA_Build 2 113964460 4I CGGAAAGAGC ----/ACAG ACAATCTACG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 ACAG 0 1 300313 CASAVA_Build 2 113972545 1D ATTTGAGTCA G/- GGGAGAGCAT 2196 het 2196 ref 15 10 5 0 G 4 3 300314 CASAVA_Build 2 113972910 1D GCTTGCCTAC T/- TGTCTGGCTG 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 2 1 300315 CASAVA_Build 2 113975208 1I CACTACATCG -/T TTATTTTCTA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 2 3 300316 CASAVA_Build 2 113975621 1I CTTATTTCTT -/A AAAAAAAAAA 2017 het 22 hom 7 1 5 1 A 13 14 300317 CASAVA_Build 2 113976225 1D GTTTGGAAAC A/- AACTGAGAAT 1900 het 1900 ref 28 22 5 1 A 3 2 300318 CASAVA_Build 2 113980429 1I TAGGCTTCTT -/C TTTCTTTAAC 3070 het 3070 ref 47 29 13 5 C 0 1 300319 CASAVA_Build 2 113984489 3D TGGAAGAAAT ATC/--- ATCCTCTCCA 1587 het 1587 ref 29 21 4 5 ATC 2 1 300320 CASAVA_Build 2 113984865 4I TTACTATTAA ----/TAAT TAATAGCAAC 2149 het 2149 ref 22 12 6 4 TAAT 1 2 300321 CASAVA_Build 2 113984953 6I TAAAACAATA ------/ATTAAT ATTAAGATTA 3070 het 3070 ref 41 20 14 9 ATTAAT 0 1 300322 CASAVA_Build 2 114001831 1D CAGATGCAAT A/- AAAAAAACAA 1912 het 1912 ref 19 10 4 7 A 8 7 300323 CASAVA_Build 2 114018724 1I TCTCACTTTG -/T TGCCCAGGCT 1609 hom 10 het 6 0 4 2 T 1 2 300324 CASAVA_Build 2 114041553 2D CTGTTGTATC CT/-- CTCTAATTGG 3070 het 3070 ref 61 36 17 9 CT 3 2 300325 CASAVA_Build 2 114044322 5I TACGAAACTC -----/TAGAA TAGGCAAAAC 3070 het 3070 ref 57 29 24 4 TAGAA 0 1 300326 CASAVA_Build 2 114050250 1D GGTACCTGAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 71 15 40 16 A 9 8 300327 CASAVA_Build 2 114050784 1I CGTACCACAG -/A GTCAATCTGC 3070 het 3070 ref 54 37 11 6 A 0 1 300328 CASAVA_Build 2 114052874 1D AGTGAGAAAT A/- AACTTCCATT 2432 het 2432 ref 17 11 5 1 A 3 2 300329 CASAVA_Build 2 114053980 1I TAAAAAAAAA -/G AAGAAAAAAA 2819 het 2819 ref 36 15 7 14 G 0 1 300330 CASAVA_Build 2 114055777 1I TACAAAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 T 10 11 300331 CASAVA_Build 2 114059173 1D TCAGATGAGC A/- ACTACAGGCT 3070 het 3070 ref 52 31 15 7 A 2 1 300332 CASAVA_Build 2 114059624 3I TAAAATTGGG ---/GAT GATGATAAAT 3070 hom 146 het 59 0 47 12 GAT 2 3 300333 CASAVA_Build 2 114059688 2I GGTTCTAACG --/TA TGTAAGTATT 2798 het 2798 ref 48 23 8 17 TA 0 1 300334 CASAVA_Build 2 114059821 1D TGATAACGTT A/- TGATGATTAA 1824 het 1824 ref 45 35 4 6 A 1 0 300335 CASAVA_Build 2 114060053 2D GCATGTAATC AA/-- TATAAAATAA 3070 het 3070 ref 57 45 9 3 A 2 0 300336 CASAVA_Build 2 114061452 1D40M3D GGCTCCAGCT GGGTGAAGATGTTGGTGTGGTATGTTATGTAAAATATACAAATT/-GGTGAAGATGTTGGTGTGGTACGTTATGTAAAATATACAA--- ATTATTGGGA 3070 het 3070 ref 72 57 12 27 N/A 0 0 300337 CASAVA_Build 2 114063139 2D TACCTCTCCA CC/-- TGGAGCGCAC 3070 het 3070 ref 60 25 28 9 C 2 0 300338 CASAVA_Build 2 114064438 2I CAATAGTAAC --/AG AAAGTGCTGG 3070 het 3070 ref 87 54 19 14 AG 0 1 300339 CASAVA_Build 2 114066313 1I CCTCCACTTG -/C CCCCTCCTGT 3070 het 3070 ref 91 39 26 26 C 4 5 300340 CASAVA_Build 2 114068387 2D AGTGGGGTGA TG/-- TGTGCCTTAA 3070 het 3070 ref 43 27 10 6 TG 3 2 300341 CASAVA_Build 2 114073024 5D GCCACTGTGT TCTTC/----- TCTTAAGAGG 2767 het 2767 ref 29 16 7 8 TCTTC 1 0 300342 CASAVA_Build 2 114074366 1I GGGCAGGCAA -/C CCCCCTTTCC 3070 het 3070 hom 68 19 36 13 C 5 6 300343 CASAVA_Build 2 114074610 1D GAGGCTTTAT A/- AGGCCACCGC 3070 het 2607 hom 33 10 18 5 A 2 1 300344 CASAVA_Build 2 114074903 4D TGGGGCCGGT GGGC/---- CCACACATCA 2253 het 2253 ref 32 21 8 4 GGGC 1 0 300345 CASAVA_Build 2 114075697 1I GAAATCCGGC -/A AATTTGCGCA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 2 3 300346 CASAVA_Build 2 114078883 2I ACCTCCTCAC --/TG TTGATTGAGG 3070 het 3070 hom 50 17 26 7 TG 0 1 300347 CASAVA_Build 2 114080395 1I AATTATTTTG -/A AAAAAAAATG 2258 het 2258 ref 38 20 6 12 A 8 9 300348 CASAVA_Build 2 114082408 2I GAGTTTGTAT --/AA AAGCCTAAAT 3070 het 3070 ref 47 28 13 6 A 2 4 300349 CASAVA_Build 2 114087766 4I GCATTGCTGG ----/TTCT TTAATATTCT 1734 het 1734 ref 35 25 4 6 TTCT 0 1 300350 CASAVA_Build 2 114087873 1D AGCGTTTATC T/- TTTTTTCTTG 1908 het 1908 ref 26 19 4 3 T 7 6 300351 CASAVA_Build 2 114087985 1D ACCTTATAAC A/- GGACATAATT 3070 het 3070 ref 57 39 14 4 A 1 0 300352 CASAVA_Build 2 114098290 2I AAAATACTAG --/CT CTGTTGATAA 2762 het 2762 ref 32 21 6 5 CT 1 2 300353 CASAVA_Build 2 114108466 1D CACGCAGGGG C/- CAAGTCCCAG 3070 hom 38 het 15 0 11 4 C 2 1 300354 CASAVA_Build 2 114109336 3D CTCCCCAGAG CTT/--- CTTAGTGAGA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CTT 2 1 300355 CASAVA_Build 2 114110432 2D GGCATCTCCC CA/-- CACACACACT 3070 hom 62 het 27 0 20 7 CA 5 4 300356 CASAVA_Build 2 114129714 4I AATAATTCTG ----/ATAA ATAAATAAAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 ATAA 3 4 300357 CASAVA_Build 2 114138850 2I AGATCAATTT --/AG AGAGACATAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 AG 2 3 300358 CASAVA_Build 2 114142168 2D GGACAATTTC CA/-- CAGTCACATG 3070 hom 37 het 17 0 12 6 CA 2 1 300359 CASAVA_Build 2 114146872 2D TTTCAATTCT CA/-- CAGTTTTTCT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 CA 2 1 300360 CASAVA_Build 2 114159408 1D TCTCACACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 37 1 33 4 A 12 11 300361 CASAVA_Build 2 114161603 3D AGTATCAAAA CAT/--- CAGAAACATA 3070 hom 54 het 22 0 19 5 CAT 1 0 300362 CASAVA_Build 2 114163948 4I GATTATGTCA ----/ATAG ATATAGGAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATAG 0 1 300363 CASAVA_Build 2 114167905 3D TCTTTTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2584 het 5 hom 25 1 11 14 T 19 16 300364 CASAVA_Build 2 114169943 1I CAGAAATTCA -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 6 7 300365 CASAVA_Build 2 114170038 1I TACTATTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 278 hom 29 2 24 3 A 9 10 300366 CASAVA_Build 2 114170542 1I ATTTCCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 11 12 300367 CASAVA_Build 2 114176632 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 13 14 300368 CASAVA_Build 2 114181227 3D TCCATAACTC ATT/--- ATAAATATTT 3070 hom 51 het 21 0 18 5 ATT 1 0 300369 CASAVA_Build 2 114182902 1D AAACTATACC T/- TTTGAACATG 3070 hom 108 het 45 0 36 9 T 4 3 300370 CASAVA_Build 2 114185561 1D CTGTTACTAT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 8 7 300371 CASAVA_Build 2 114185845 4I GGTAGAAACG ----/AAGC AAGATCATAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAGC 0 1 300372 CASAVA_Build 2 114189811 1I ATGTTGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 19 10 A 11 12 300373 CASAVA_Build 2 114195872 4D TTATGTAAGA TAAT/---- TAATTCTCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TAAT 2 1 300374 CASAVA_Build 2 114196436 2D ACACATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 50 het 26 0 18 8 AC 9 8 300375 CASAVA_Build 2 114197409 2I GATGATTCTC --/AA AGTTTTTCTT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 A 1 3 300376 CASAVA_Build 2 114203351 1D CATACGGAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 126 het 46 0 42 5 A 9 8 300377 CASAVA_Build 2 114206196 5D TGGTAAAATC TAAAT/----- TAACAGTAAA 3070 hom 124 het 47 0 42 7 TAAAT 1 0 300378 CASAVA_Build 2 114206474 1I ATTGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1243 hom 38 3 30 5 A 11 12 300379 CASAVA_Build 2 114211140 2D GTTTTTGGTG TC/-- TCTGTTACTT 3070 het 3070 ref 48 29 18 3 TC 2 1 300380 CASAVA_Build 2 114216747 1D ACCACAAAGC A/- AAAAAAAAAG 1109 het 1109 ref 41 33 3 5 A 10 9 300381 CASAVA_Build 2 114222886 2I CGGAGTTTCA --/CT CTGTCACCAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CT 1 2 300382 CASAVA_Build 2 114225861 7I CTCTGTCCCC -------/AAAAAAG AAAAAAGAAA 3070 hom 39 het 20 0 13 7 AAAAAAG 1 2 300383 CASAVA_Build 2 114226265 1I GTCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 25 2 17 6 A 16 17 300384 CASAVA_Build 2 114228353 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 16 0 14 2 A 15 14 300385 CASAVA_Build 2 114228985 1I ATAGTCTCTC -/T TAAGTAACCC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 1 2 300386 CASAVA_Build 2 114231912 1D CCAATGAACA T/- TTTTTAATTG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 6 5 300387 CASAVA_Build 2 114233376 4D ACCAATCACT AATA/---- AATGTTATTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AATA 1 0 300388 CASAVA_Build 2 114257878 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 8 9 300389 CASAVA_Build 2 114258514 1I ATCAGTGCCT -/A AAGCATAGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 3 300390 CASAVA_Build 2 114273010 1D TATCCAAGAC T/- TAGTAGATGA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 T 2 1 300391 CASAVA_Build 2 114273145 5D CAAGTGATAA TATGT/----- TATATTTGTA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 TATGT 1 0 300392 CASAVA_Build 2 114293822 1D TGGATCACCT G/- GGGTCAGGAG 3070 hom 16 het 9 0 8 4 G 4 3 300393 CASAVA_Build 2 114303983 1I AGTATGAGAA -/G GGCAGCCTCA 2930 hom 30 het 27 0 9 18 G 2 3 300394 CASAVA_Build 2 114309882 1D GATCTGCCCT C/- CCTCAGCCTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 C 3 2 300395 CASAVA_Build 2 114313658 1D TAATGAGGAC T/- ACAGGGGAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 7 T 1 0 300396 CASAVA_Build 2 114320972 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 11 10 300397 CASAVA_Build 2 114322574 2D TTTCTGGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 24 3 8 13 T 12 10 300398 CASAVA_Build 2 114325723 1D GAACAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 34 2 22 10 A 15 14 300399 CASAVA_Build 2 114336452 2D AAATCTACTT TC/-- TGTCTCTGTT 3070 hom 161 het 59 0 51 8 TC 1 0 300400 CASAVA_Build 2 114340191 2D TATGCTACTT CA/-- AGCTTTCCTC 3070 hom 96 het 40 0 33 8 CA 1 0 300401 CASAVA_Build 2 114340663 1I TGAGGGAATA -/T TTGTGCAAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 3 300402 CASAVA_Build 2 114363143 1I TTGGAGGGAT -/G GGGGGGGGGT 3039 het 483 hom 22 2 10 10 G 9 10 300403 CASAVA_Build 2 114379897 3I GAGGCTGAAT ---/TAA AATATTCCAT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 TAA 0 1 300404 CASAVA_Build 2 114388160 1I TTGTTATTCA -/T TTATGAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 2 3 300405 CASAVA_Build 2 114391358 1D TTCTGCAAAC T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 82 het 32 0 26 7 T 7 6 300406 CASAVA_Build 2 114396688 1D ATTCTTAGTC T/- TTAGCACCCT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 T 3 2 300407 CASAVA_Build 2 114402751 1D TTCCAATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 41 1 32 8 T 12 11 300408 CASAVA_Build 2 114424874 4D GCAATTTATA AAAG/---- AAAGAGGTTT 3070 hom 75 het 26 0 25 2 AAAG 2 1 300409 CASAVA_Build 2 114440774 1D AAAATAATGG T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 7 6 300410 CASAVA_Build 2 114447271 1I GCTCTTGTTA -/T TTTTTTTTTT 1754 het 1754 ref 46 34 4 8 T 13 14 300411 CASAVA_Build 2 114450359 4D AGACAGCAGA CAGC/---- TAGCTCTATG 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 CAGC 1 0 300412 CASAVA_Build 2 114454579 2D TTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 331 hom 37 6 13 19 T 13 11 300413 CASAVA_Build 2 114463840 3D TGTGCTTAAA GTT/--- GTTGTCCACG 3070 het 3070 ref 42 21 17 7 GTT 2 1 300414 CASAVA_Build 2 114506245 2D CATTAGTAGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 102 het 40 0 34 8 AT 6 5 300415 CASAVA_Build 2 114518623 2I TGACAAAATG --/AA AAGAGTGGCT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 A 2 4 300416 CASAVA_Build 2 114519476 1D ACCTAAATAA T/- TTTAGAGAGG 3070 hom 111 het 39 0 36 4 T 4 3 300417 CASAVA_Build 2 114557340 1D ACATGGACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 272 hom 42 2 27 14 T 15 14 300418 CASAVA_Build 2 114559558 10I GCTTCAGATA ----------/AGGATCAAAG AACAGAGAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 AGGATCAAAG 0 1 300419 CASAVA_Build 2 114561753 1I CATCTGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 855 hom 30 2 22 6 T 10 11 300420 CASAVA_Build 2 114569352 3I TTCCTATTGC ---/TGT TGTTACAGAG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 TGT 1 2 300421 CASAVA_Build 2 114570417 1I TATGTATACA -/T GTGCCATGCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 0 1 300422 CASAVA_Build 2 114579886 1I TCATGTATTT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 7 8 300423 CASAVA_Build 2 114584289 1D AGTTTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 26 0 19 7 A 12 11 300424 CASAVA_Build 2 114613345 1D ATTACCATTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 9 8 300425 CASAVA_Build 2 114619176 1I TAAAAATTAA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 6 7 300426 CASAVA_Build 2 114619536 1D TCAAGACCAG C/- CTAAATGACT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 C 2 1 300427 CASAVA_Build 2 114622260 1D GCTGAATATA T/- TTTTATCATC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 5 4 300428 CASAVA_Build 2 114635499 1D GTGTGTATTG A/- AAAAATGATT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 A 6 5 300429 CASAVA_Build 2 114651571 1D CCTTCTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 30 1 17 12 T 12 11 300430 CASAVA_Build 2 114653424 1I TTTGTTTTTT -/A TCTATTGTGT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 0 1 300431 CASAVA_Build 2 114658269 1D TAGTTGTAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 9 8 300432 CASAVA_Build 2 114663966 1I CCAAATAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 9 10 300433 CASAVA_Build 2 114667497 4I CACTCACACT ----/CACA CACACACACA 3070 hom 63 het 31 0 20 11 CA 7 9 300434 CASAVA_Build 2 114669148 11D8M1I CTTTTTTAAA AAAAAATTTTCAGAACTCC-/-----------AGCACTCCT TTTATATTCT 3070 het 3070 hom 28 9 21 1 N/A 0 0 300435 CASAVA_Build 2 114670937 2D44M62D CCATTTCTAC ATATATATATATATGTATGTATGTGTGTGCGTGTATATATATGTACATATATATATATATATGTATATATATGTACATATATATATATATATATATATATATATATAT/--ATATATATATATGTATGTATGTGTGTGCGTGTATATATATGTAC-------------------------------------------------------------- ATATATATAT 3070 het 1801 hom 21 5 18 4 N/A 0 0 300436 CASAVA_Build 2 114671816 1I GTTTTGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 10 11 300437 CASAVA_Build 2 114672273 1I AATTTATAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 9 300438 CASAVA_Build 2 114678645 2D ATTCATGTTC AT/-- ATATATATAT 2654 hom 9 het 15 0 9 6 AT 11 10 300439 CASAVA_Build 2 114679488 1I ATTTTCATTT -/G GGGTCTTAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 G 3 4 300440 CASAVA_Build 2 114680974 5I ATGACTAAAC -----/ATTTT ATTTTATTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATTTT 1 2 300441 CASAVA_Build 2 114687420 1D CTGATAAGGA T/- TTTACATCAA 3070 het 3070 ref 53 26 24 5 T 4 3 300442 CASAVA_Build 2 114702635 1I TCTCATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 10 11 300443 CASAVA_Build 2 114704052 1I CGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 52 het 24 0 18 6 T 9 10 300444 CASAVA_Build 2 114706944 3I GTCTTTTCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 13 1 11 1 TTC 0 1 300445 CASAVA_Build 2 114710736 1D TTAAGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 12 11 300446 CASAVA_Build 2 114715299 1I AAAAATGAAG -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 81 het 38 0 28 10 T 7 8 300447 CASAVA_Build 2 114718085 1I TAAAGGAAGG -/A AATGAGCTTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 2 3 300448 CASAVA_Build 2 114736264 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGGATCATTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AGG 1 2 300449 CASAVA_Build 2 114736643 4D TTCAAAAGTT GTTA/---- GTTAAGTGAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 GTTA 2 1 300450 CASAVA_Build 2 114745438 1D GAAGAGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 39 0 33 6 T 11 10 300451 CASAVA_Build 2 114763960 1D TTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 T 10 9 300452 CASAVA_Build 2 114764190 4I TATCATTTCC ----/TTTG TTTGTGATAT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 TTTG 1 2 300453 CASAVA_Build 2 114766474 2I TGCCAATGAC --/TA TGTTTGTCTG 3070 hom 123 het 50 0 42 8 TA 0 1 300454 CASAVA_Build 2 114775321 1D GATTCATTGA T/- TTTTTGAAGG 2067 het 2067 ref 13 8 5 0 T 6 5 300455 CASAVA_Build 2 114780482 1D CCAATCGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 38 1 33 4 T 11 10 300456 CASAVA_Build 2 114796517 8D AATTCCTTAT TTTTTTAA/-------- ATACTTCTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TTTTTTAA 1 0 300457 CASAVA_Build 2 114819428 1D GAGAGGGAAA G/- GGGGGGGAGA 3070 hom 67 het 29 0 23 6 G 8 7 300458 CASAVA_Build 2 114827914 2I TTTTAGAAAG --/AA AATTTCAAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 2 4 300459 CASAVA_Build 2 114829799 1I TATTCCCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1952 hom 26 4 18 4 T 11 12 300460 CASAVA_Build 2 114856506 1I ATGGGCATAC -/A AATTAGGCCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 300461 CASAVA_Build 2 114882662 1D GAACTCATCC T/- TTTTTTATGG 3070 het 2743 hom 19 8 9 2 T 7 6 300462 CASAVA_Build 2 114918606 4D TTGGCTGCCC ACAA/---- ACAAACTGTG 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 ACAA 2 1 300463 CASAVA_Build 2 114923517 1D GATGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1600 hom 32 9 12 11 T 15 14 300464 CASAVA_Build 2 114925142 1I CTTTATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 9 10 T 11 12 300465 CASAVA_Build 2 114949994 1I ACAGTGAACA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 T 7 8 300466 CASAVA_Build 2 114953459 2I TGAAAAAATG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 9 11 300467 CASAVA_Build 2 114959510 1I GGAAAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 815 hom 34 5 15 14 T 14 15 300468 CASAVA_Build 2 114971471 2D CATATGCATC TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 TA 5 4 300469 CASAVA_Build 2 114989565 4D CGTAGGTCTC AAAT/---- AAAGGTGCCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 7 AAAT 1 0 300470 CASAVA_Build 2 115005683 4D ATATCTCCTA TTGG/---- TTCTGTTTCT 3070 het 3070 ref 29 15 10 7 TTGG 1 0 300471 CASAVA_Build 2 115008754 1I TGCTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 11 12 300472 CASAVA_Build 2 115009140 2I TTGTTTCTAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 9 11 300473 CASAVA_Build 2 115017921 3I CTTGTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGG 3070 het 4 hom 43 3 35 5 TTG 3 4 300474 CASAVA_Build 2 115026392 1D CCATTACAAG T/- TTGCTCCTGT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 3 2 300475 CASAVA_Build 2 115043498 1I GCAAATGTGC -/T TTTTAACTTA 3070 het 3070 ref 47 29 14 4 T 4 5 300476 CASAVA_Build 2 115050921 1I GGGAAGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 T 10 11 300477 CASAVA_Build 2 115053872 2I TAAAAATGCC --/TT TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 8 10 300478 CASAVA_Build 2 115056875 1I CTAACCAATT -/A AAAAATTTGA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 5 6 300479 CASAVA_Build 2 115061349 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2259 het 131 hom 15 2 8 5 A 20 18 300480 CASAVA_Build 2 115063078 1I AAGGCAAAGG -/T TTTTTTTGGG 1045 het 1045 ref 21 9 6 6 T 7 8 300481 CASAVA_Build 2 115070203 1I AATATGCAAC -/T TTTTTTAGCT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 6 7 300482 CASAVA_Build 2 115082313 1I ATCAGTGCCA -/T TTCAATCTCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 2 3 300483 CASAVA_Build 2 115135199 1I AACAACAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 9 10 300484 CASAVA_Build 2 115149855 1D TCTTTAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 13 12 300485 CASAVA_Build 2 115163317 1D GTGTGTTATT C/- CCCCCCAACA 3070 hom 94 het 37 0 30 8 C 7 6 300486 CASAVA_Build 2 115217469 1D ATGGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 A 12 11 300487 CASAVA_Build 2 115224822 1I ACATTATTCC -/A AAACAGAAGG 3070 hom 74 het 29 0 24 5 A 3 4 300488 CASAVA_Build 2 115229999 1I GGAAGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1550 hom 31 5 14 12 A 17 18 300489 CASAVA_Build 2 115233513 1D GCTGTAAATC T/- TTTTTTTTTT 1645 het 1645 ref 38 25 4 9 T 12 11 300490 CASAVA_Build 2 115263213 12I AGCGCCATCA ------------/CATACAGATACT CTGGGATAGT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 CATACAGATACT 0 1 300491 CASAVA_Build 2 115282591 1D GGAATCTAAC T/- TTTTTTTTTT 1433 het 1433 ref 34 20 4 11 T 17 16 300492 CASAVA_Build 2 115304225 2I CTAAGTTCCC --/CT GTTATTGCCC 3070 hom 117 het 47 0 34 13 CT 0 1 300493 CASAVA_Build 2 115307330 1I TTAATTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 11 12 300494 CASAVA_Build 2 115309971 1I TGAGACAAAA -/C TTTTAGATTG 3070 hom 135 het 52 0 46 6 C 0 1 300495 CASAVA_Build 2 115329996 1I CCCTCAGGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 9 10 A 11 12 300496 CASAVA_Build 2 115333414 1D AAACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 24 1 20 3 A 16 15 300497 CASAVA_Build 2 115336322 1D GTCCAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 32 1 28 3 A 11 10 300498 CASAVA_Build 2 115342386 1D AAAGTAGAAC T/- TTTTGGGACC 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 T 5 4 300499 CASAVA_Build 2 115344493 1I TGTGTAGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 A 10 11 300500 CASAVA_Build 2 115345035 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2245 hom 32 9 15 8 T 10 11 300501 CASAVA_Build 2 115347763 2D CAGGATGTGA TT/-- TTAAAATTAA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 T 4 2 300502 CASAVA_Build 2 115358085 1D TTAATTTCAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 9 8 300503 CASAVA_Build 2 115372557 1D ATAACAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 11 10 300504 CASAVA_Build 2 115389178 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 328 hom 15 1 13 1 A 11 10 300505 CASAVA_Build 2 115409338 1I GCCCCATTCA -/C CCTTATCCAT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 2 3 300506 CASAVA_Build 2 115409911 1I AAACTGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1744 hom 31 7 13 11 T 13 14 300507 CASAVA_Build 2 115421180 1D TTCAAGTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 10 9 300508 CASAVA_Build 2 115424517 1I AATTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 1151 het 1128 hom 9 3 3 3 T 10 11 300509 CASAVA_Build 2 115426641 3D TATGCCAAAT AGA/--- AAAATCTGGC 3070 het 3070 hom 23 9 12 5 AGA 1 0 300510 CASAVA_Build 2 115430408 1I GAATAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 12 4 A 10 11 300511 CASAVA_Build 2 115440786 3D ATGATAAAGT TAG/--- TTTAAGAATA 3070 het 3070 hom 46 17 20 10 TAG 1 0 300512 CASAVA_Build 2 115467412 1D TGAATAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 45 1 36 8 T 12 11 300513 CASAVA_Build 2 115469474 1I CCTTTCTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 42 0 35 8 A 9 10 300514 CASAVA_Build 2 115474064 1I AACCAATTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 300515 CASAVA_Build 2 115474953 1I ATTATACAAG -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 6 7 300516 CASAVA_Build 2 115476572 1I AAATGGCATC -/T TAATTGAACT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 T 1 2 300517 CASAVA_Build 2 115491722 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 7 6 300518 CASAVA_Build 2 115495223 1D GATTGGAGCA G/- AGCTACGAAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 4 G 1 0 300519 CASAVA_Build 2 115499252 3D CTCTCTTCAT GAG/--- GAGATCTATC 3070 hom 123 het 46 0 41 9 GAG 2 1 300520 CASAVA_Build 2 115505209 1D AATTTTTTTT C/- CTCAGGAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 16 1 C 2 1 300521 CASAVA_Build 2 115520058 4D TGTGTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 31 0 26 6 TG 13 11 300522 CASAVA_Build 2 115521152 1D GATTTTAACA G/- AAGTGACGTT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 G 1 0 300523 CASAVA_Build 2 115525423 1D TTAAGGTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 20 8 A 11 10 300524 CASAVA_Build 2 115525885 1D GTTCTCATAA C/- CAAAAAAATG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 C 2 1 300525 CASAVA_Build 2 115540427 1D AAGATTATGC A/- AAAAAATGAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 6 300526 CASAVA_Build 2 115549753 1I AATGGTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 14 16 15 T 15 16 300527 CASAVA_Build 2 115552862 5I GTATCACAGA -----/TAACT TAAATTACTC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TAACT 0 1 300528 CASAVA_Build 2 115553420 11I CTCAAAAAAC -----------/AAAAAAAAAGA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 AAAAAAAAAGA 1 2 300529 CASAVA_Build 2 115555502 1I TTCCAGAAGA -/T TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 6 7 300530 CASAVA_Build 2 115560894 3I CTTGGGCACA ---/TGT TGTCAGGACC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TGT 1 2 300531 CASAVA_Build 2 115564737 1I TTCTGGACGA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 16 het 26 1 15 10 T 7 8 300532 CASAVA_Build 2 115583088 2I TGTTAACATA --/GT AACTGATCAT 3070 het 3070 ref 57 33 18 6 GT 0 1 300533 CASAVA_Build 2 115587232 1I TAACACATAC -/A AATATATGCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 2 3 300534 CASAVA_Build 2 115587462 9D TTCATGAAGT ATATCTTAG/--------- ACACGTTTTT 3070 het 3070 ref 30 18 11 3 ATATCTTAG 1 0 300535 CASAVA_Build 2 115607863 11D CTGTCTGTGA AGTTATCTTCC/----------- AGCTATTTTG 3070 het 3070 ref 50 26 22 9 AGTTATCTTCC 1 0 300536 CASAVA_Build 2 115610212 1D GTTTATGCTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 135 het 51 0 43 8 A 10 9 300537 CASAVA_Build 2 115617968 1D AAGAATAGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 T 10 9 300538 CASAVA_Build 2 115641307 1I GACAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 974 het 974 ref 31 16 3 12 A 15 16 300539 CASAVA_Build 2 115641440 4D TTTGTCTCTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 AAAC 5 4 300540 CASAVA_Build 2 115654966 1I CTCCCTTCCT -/C CCTGCCTCCC 3070 hom 90 het 33 0 29 7 C 2 3 300541 CASAVA_Build 2 115655051 32I AAATATACGT --------------------------------/TAGGAATTTTACTTAGTATATTTAGGAAAATA CACTTAGTGA 3070 het 3070 ref 28 16 11 2 TAGGAATTTTACTTAGTATATTTAGGAAAATA 0 1 300542 CASAVA_Build 2 115657058 2D TATTTACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 43 21 11 11 CA 9 8 300543 CASAVA_Build 2 115659292 1D TTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 594 hom 43 4 27 13 T 13 12 300544 CASAVA_Build 2 115664390 1I TCTTCTACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 T 9 10 300545 CASAVA_Build 2 115675900 1D ACTTGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 44 1 37 6 A 11 10 300546 CASAVA_Build 2 115678179 1I ATTAGTGAAA -/T TGTCTTCTAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 300547 CASAVA_Build 2 115685285 1I GTCTTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1211 hom 34 3 20 11 T 13 14 300548 CASAVA_Build 2 115695003 4I AAATATTATA ----/TAGT TAATCAGTGG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TAGT 0 1 300549 CASAVA_Build 2 115699540 4D ACCGCATGAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 167 hom 41 5 15 22 TG 9 7 300550 CASAVA_Build 2 115706371 1D ATTTTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 11 10 300551 CASAVA_Build 2 115710851 2I TAGTTAACTC --/TT TGATATCCTC 3070 het 3070 hom 55 21 32 2 T 1 3 300552 CASAVA_Build 2 115711181 1D AGACAATGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 10 9 300553 CASAVA_Build 2 115711291 3D AAATTAATTC ATT/--- ATTATTGTAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 ATT 3 2 300554 CASAVA_Build 2 115716380 2D GCCATTAATT CA/-- CATTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CA 2 1 300555 CASAVA_Build 2 115717071 2D GTGTTTTATA AC/-- ACACACATAC 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 AC 4 3 300556 CASAVA_Build 2 115717820 2I TTTTAAACTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 14 16 10 T 10 12 300557 CASAVA_Build 2 115718893 4D ATATATATAC ATAT/---- ATATATAATT 3070 het 3070 ref 31 19 11 4 AT 5 3 300558 CASAVA_Build 2 115732526 1I CCAAGTTGGC -/A AAAAAAAAAA 2025 het 1691 hom 25 5 8 12 A 15 16 300559 CASAVA_Build 2 115736943 1D CTACAGAAGG A/- AAAAAACATA 3070 hom 27 het 28 1 23 6 A 7 6 300560 CASAVA_Build 2 115737655 1D GGCTTTTCCA G/- GGATACATTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 3 2 300561 CASAVA_Build 2 115744932 1D GTTCTTTATA T/- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 T 2 1 300562 CASAVA_Build 2 115782413 1D AGAAAGGATG A/- AAAGCAGTTG 3070 het 3070 hom 48 15 21 14 A 4 3 300563 CASAVA_Build 2 115789241 1I ACAACAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 33 1 27 5 A 10 11 300564 CASAVA_Build 2 115808962 1D AGGATATATC T/- TTTTTTTTTT 1878 het 1878 ref 34 23 4 8 T 13 12 300565 CASAVA_Build 2 115811190 1D TGAAGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 16 15 300566 CASAVA_Build 2 115838031 41D TAGCTAGTTA GTAGCAAAGGTGGAGGTAGATGCTTCAGGTCATTAAATAAG/----------------------------------------- GTAGCAAAGG 3070 hom 27 het 22 0 9 15 GTAGCAAAGGTGGAGGTAGATGCTTCAGGTCATTAAATAAG 2 1 300567 CASAVA_Build 2 115841916 1I ATGCAAAAGG -/A AAAAAAATAC 3070 het 396 hom 41 1 36 4 A 7 8 300568 CASAVA_Build 2 115846452 1I CTTTAGAGGT -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 7 8 300569 CASAVA_Build 2 115847557 4D AAATCTGAGC ATAT/---- ATTATACCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 6 AT 3 1 300570 CASAVA_Build 2 115862977 1I ATTCTTTTAA -/C CTTTGAAGGT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 C 1 2 300571 CASAVA_Build 2 115863419 5D GCAAGCAACA TAACT/----- TGTTGGCTTT 3070 het 3070 ref 34 20 14 4 TAACT 1 0 300572 CASAVA_Build 2 115863879 1I AATATATCAA -/T TTTATAGAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 3 4 300573 CASAVA_Build 2 115866233 1I ATTTTTATGC -/T TTTTTTTTTG 2971 het 2971 ref 29 15 9 5 T 9 10 300574 CASAVA_Build 2 115866512 4D TATATTTCAC AAAT/---- AAAGATGTAT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 AAAT 1 0 300575 CASAVA_Build 2 115872221 1D TGTATATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 33 9 T 12 11 300576 CASAVA_Build 2 115873916 5D GTAAGGAAAT ATATG/----- AGATGGGGTC 3070 het 2800 hom 31 7 22 5 ATATG 1 0 300577 CASAVA_Build 2 115877428 29D TCTTTCCTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------------------- TTTTTTTGAT 3070 het 2235 hom 20 8 14 4 T 36 7 300578 CASAVA_Build 2 115885457 3D AAAATTGTAG AAC/--- AACTGGTTTA 3070 het 3070 ref 36 15 13 9 AAC 2 1 300579 CASAVA_Build 2 115887960 1D CTCTCAATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 T 10 9 300580 CASAVA_Build 2 115892818 2D GATCCTGTCT CA/-- CACACACAGA 2411 het 2411 ref 20 11 5 6 CA 5 4 300581 CASAVA_Build 2 115903278 1I AAAATATATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 8 9 300582 CASAVA_Build 2 115903782 3I ACATAAACTT ---/CTC CTCAGAAGAG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 CTC 1 2 300583 CASAVA_Build 2 115908663 1D GTATATAAGA T/- TTAATGCTCC 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 T 3 2 300584 CASAVA_Build 2 115910447 1I TGCAAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 10 11 300585 CASAVA_Build 2 115920618 1D TAAGGATTCA G/- GGTGGGAAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 G 3 2 300586 CASAVA_Build 2 115925935 14D TGTGTTTGTG TGTGTGTGTGTGTC/-------------- TGTGTCTGTG 3070 hom 72 het 24 0 24 5 TGTGTGTGTGTGTC 1 0 300587 CASAVA_Build 2 115931720 7I TCAAAACGGC -------/AATACCA AACATTGGCA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AATACCA 0 1 300588 CASAVA_Build 2 115935252 1D GATTTGATGC T/- TTTTTTTTTA 1232 het 1232 ref 44 31 3 10 T 10 9 300589 CASAVA_Build 2 115938452 1I TTCTGCAGCC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 10 300590 CASAVA_Build 2 115939878 1I AAAAAATAAT -/A AAAAATAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 5 6 300591 CASAVA_Build 2 115945640 1D CTCTCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 48 1 40 7 T 11 10 300592 CASAVA_Build 2 115948225 1I TCATAATCAC -/A AAAGGGAAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 3 4 300593 CASAVA_Build 2 115950984 1D ATTGATACAG A/- AAAAATCATT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 6 5 300594 CASAVA_Build 2 115956365 4D CATAGTAAAA TAGT/---- TAGTATAGGG 3070 het 3070 ref 28 14 12 4 TAGT 2 1 300595 CASAVA_Build 2 115958186 1D CACCAGTACA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 10 9 300596 CASAVA_Build 2 115958299 1I GGAGAGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 12 13 300597 CASAVA_Build 2 115959285 2D ACACTGTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 22 0 13 10 A 18 16 300598 CASAVA_Build 2 115959632 4D TTAATTAAGT CTTA/---- CTTTATGGTT 3070 het 3070 ref 34 19 11 6 CTTA 1 0 300599 CASAVA_Build 2 115960286 3D TCATAAGGGT GAG/--- AAAACTTGCT 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 GAG 1 0 300600 CASAVA_Build 2 115962927 7D AGAGTATAAT AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 2 A 20 13 300601 CASAVA_Build 2 115964465 4I TCCTACCGGG ----/TCCC TCCCCTGACA 1521 het 1521 ref 28 15 5 8 TCCC 1 2 300602 CASAVA_Build 2 115971712 1I AGAATATTTT -/A AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 32 19 13 1 A 6 7 300603 CASAVA_Build 2 115971996 1D AGTTAATGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 13 13 3 A 10 9 300604 CASAVA_Build 2 115972088 1D AACTATCAGT C/- CATACGGCCA 3070 het 3070 hom 36 15 17 6 C 2 1 300605 CASAVA_Build 2 115972734 2D TTACCTAATC AT/-- ATATATATAT 1566 het 1566 ref 18 4 6 9 AT 7 6 300606 CASAVA_Build 2 115976920 1D TTTAAAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 24 2 11 11 T 13 12 300607 CASAVA_Build 2 115980042 9I ATTAATACAA ---------/ATAAATTTT ATAAAATAAT 2767 het 2767 ref 21 15 6 0 ATAAATTTT 0 1 300608 CASAVA_Build 2 115989263 2D CATATTTCAA AT/-- ATATATGTAG 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 AT 4 3 300609 CASAVA_Build 2 115990519 3D CAAATCAATC TAT/--- TATTAGGAGT 3070 het 3070 ref 46 21 19 7 TAT 2 1 300610 CASAVA_Build 2 115994559 1D TGGAGCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 11 10 300611 CASAVA_Build 2 115997248 1D AGGCAGTAGA G/- GGATAATTAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 G 3 2 300612 CASAVA_Build 2 116002792 1I ATGCCAAGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 A 9 10 300613 CASAVA_Build 2 116004726 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 A 11 10 300614 CASAVA_Build 2 116005193 2I TTCAAGATTG --/AA AGTTTTTTTT 3070 hom 65 het 37 0 21 16 A 1 3 300615 CASAVA_Build 2 116032775 1I ATTTATTCAG -/A AAAATCATAT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 4 5 300616 CASAVA_Build 2 116043989 5I TAAAATTAGA -----/TAAAT TAAAAATAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TAAAT 0 1 300617 CASAVA_Build 2 116045763 1D CTGATTTTAG A/- AAAAAATATG 3070 hom 32 het 31 1 21 9 A 7 6 300618 CASAVA_Build 2 116046262 1D CCCACAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 12 11 300619 CASAVA_Build 2 116047809 1I GCCGTGTTGG -/C CAGGCTGTTC 3070 het 37 hom 29 1 25 3 C 1 2 300620 CASAVA_Build 2 116054545 6D ATAATAATCC TCTCTG/------ TCTCTGTGAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TCTCTG 2 1 300621 CASAVA_Build 2 116056329 2I ATGATCACTT --/GA GGCATTTTTC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 GA 0 1 300622 CASAVA_Build 2 116066617 1D18M1D CGTCTCTGCT AAAAAAAAACAAAAAAAACA/-AAAAAAAACAAAAAAAAC- AAAAAAAAAA 2816 het 498 hom 18 3 12 5 N/A 0 0 300623 CASAVA_Build 2 116067625 1I AATGGGAAAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 7 8 300624 CASAVA_Build 2 116072860 1I CCTGAAGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1190 hom 30 4 19 7 T 12 13 300625 CASAVA_Build 2 116073902 1D CACATCTCAC T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 7 300626 CASAVA_Build 2 116078126 8D CTTCTAGCTG TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 27 4 16 12 T 27 19 300627 CASAVA_Build 2 116078751 4D TAATTATTCT CTGA/---- CTGTCTTTCA 3070 hom 96 het 38 0 33 8 CTGA 1 0 300628 CASAVA_Build 2 116082475 1D AAAAACAGAC A/- AAAAAAATAC 3070 hom 107 het 42 0 35 8 A 8 7 300629 CASAVA_Build 2 116091104 4D GTCTTGATTC ATTG/---- ATTAATTATT 1492 het 1492 ref 20 12 4 4 ATTG 1 0 300630 CASAVA_Build 2 116105084 15D GATCCTGGGC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTG 3070 het 2245 hom 29 13 16 6 T 24 9 300631 CASAVA_Build 2 116113674 1D GCATTACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 19 14 T 11 10 300632 CASAVA_Build 2 116114393 1I TTTCTGCCCC -/T CTCCTCCTCC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 0 1 300633 CASAVA_Build 2 116114497 1D TCTGAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 9 hom 30 1 20 9 A 9 8 300634 CASAVA_Build 2 116124457 1D CATGGGGAAA G/- GGGGGGGGGG 3070 het 24 hom 27 1 11 15 G 11 10 300635 CASAVA_Build 2 116135034 1D ATTTCTCTGT C/- CACCCAGGCT 3070 hom 96 het 35 0 32 5 C 2 1 300636 CASAVA_Build 2 116136481 1D TTGTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 27 3 11 14 T 12 11 300637 CASAVA_Build 2 116137044 2D TTTTTTATTT TA/-- TCTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 11 10 4 TA 1 0 300638 CASAVA_Build 2 116142311 2D CATTTTAACA GT/-- GTGGAGAAGT 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 GT 2 1 300639 CASAVA_Build 2 116144490 2I AATATTAAAC --/TG TGTGTTCACC 3070 het 3070 ref 45 27 14 4 TG 2 3 300640 CASAVA_Build 2 116149490 2D AACAGCAAAC CA/-- CACACATTGA 3070 het 3070 hom 65 33 26 7 CA 4 3 300641 CASAVA_Build 2 116151444 13D ACAATGTAAA AAATGATAGGAGT/------------- AAGTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 23 11 5 AAATGATAGGAGT 1 0 300642 CASAVA_Build 2 116166259 1D AGTTTTACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 10 9 300643 CASAVA_Build 2 116168311 5D GTCATTACAA TACTT/----- TAATTAGTTT 3070 het 3070 ref 23 14 9 1 TACTT 1 0 300644 CASAVA_Build 2 116170884 1D GTATTTCACA T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 8 7 300645 CASAVA_Build 2 116171432 2D AAGAATGGAA AG/-- AGATATTTCA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 AG 2 1 300646 CASAVA_Build 2 116183672 1D TATTTAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 10 9 300647 CASAVA_Build 2 116192234 1D TCCAGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 40 1 31 10 A 13 12 300648 CASAVA_Build 2 116195645 1I CAGCTATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 A 10 11 300649 CASAVA_Build 2 116197669 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3052 het 2672 hom 48 14 21 13 T 15 16 300650 CASAVA_Build 2 116198573 1D TGTTCTTCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 9 8 300651 CASAVA_Build 2 116200994 4D CTTGCCCTGG ACAA/---- TGTTGTGCTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 ACAA 1 0 300652 CASAVA_Build 2 116202335 3D CTTTATTTCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 8 A 18 15 300653 CASAVA_Build 2 116206107 1D CTAGGGAATG C/- ATGTAATTTC 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 C 1 0 300654 CASAVA_Build 2 116206546 1I TGCTCAAAAA -/G GGAAGATTAT 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 G 2 3 300655 CASAVA_Build 2 116208795 1I TATATGTATA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 7 8 300656 CASAVA_Build 2 116215407 1I ACAAAAAAAA -/T AATACTAAGA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 0 1 300657 CASAVA_Build 2 116222276 1D TGTTTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2593 hom 22 6 12 4 T 12 11 300658 CASAVA_Build 2 116224252 1D AAGGGTGCTT C/- CCTACTCCCT 3070 het 3070 ref 60 34 18 9 C 3 2 300659 CASAVA_Build 2 116226012 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 T 6 7 300660 CASAVA_Build 2 116231828 5I ATCAATATAA -----/TTTAT TATATTAAGA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 TTTAT 0 1 300661 CASAVA_Build 2 116232375 1D TGATATTAAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 A 8 7 300662 CASAVA_Build 2 116233767 2I ATATAAAAAC --/AT ACATTATAGG 3070 hom 45 het 16 0 15 2 AT 0 1 300663 CASAVA_Build 2 116242204 1I CATACATTCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 T 7 8 300664 CASAVA_Build 2 116243992 1D TATATTCTAG A/- AGCTCTGTGA 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 A 2 1 300665 CASAVA_Build 2 116250909 1D TTCTAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 12 11 300666 CASAVA_Build 2 116256317 1D ATTTGGGGGG A/- AAAAACTATT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 6 5 300667 CASAVA_Build 2 116281747 1I TAGAAGAGAG -/A AAAAAAGGGA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 6 7 300668 CASAVA_Build 2 116291726 1I TAGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 11 12 300669 CASAVA_Build 2 116292959 1I TCTTAAATGG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 51 21 28 2 A 6 7 300670 CASAVA_Build 2 116293685 1D TTTATATACA T/- TTTTTCATCA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 T 6 5 300671 CASAVA_Build 2 116308551 1I CAGTAGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 T 11 12 300672 CASAVA_Build 2 116329320 1I AACTTTATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 9 10 300673 CASAVA_Build 2 116333100 2I AAAAAAAGAC --/TT TTTTATTTAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 4 6 300674 CASAVA_Build 2 116333590 2I CCCTAGTTAG --/CA CACACATTGA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 CA 3 4 300675 CASAVA_Build 2 116334160 1I TCCATTGATC -/A ATATGTCTAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 1 2 300676 CASAVA_Build 2 116340873 1I CAAGAGTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 T 10 11 300677 CASAVA_Build 2 116364254 1D GTTTTCATGG T/- TTTTAGGTCT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 5 4 300678 CASAVA_Build 2 116364443 1I TTGTGCTGCA -/T CTTTTTTTCT 1845 het 1845 ref 23 15 5 3 T 0 1 300679 CASAVA_Build 2 116369313 1I GTTTGTGGAG -/A CCATGGGAAA 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 A 0 1 300680 CASAVA_Build 2 116377098 1I AGCAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 11 12 300681 CASAVA_Build 2 116378220 1D ATCACAACAG T/- GGTATACATC 3070 het 3070 hom 51 16 27 8 T 1 0 300682 CASAVA_Build 2 116381718 1I GTCAGGTATG -/A AAAAATATCT 2417 het 2417 ref 22 15 5 2 A 5 6 300683 CASAVA_Build 2 116387159 1I AGTTTAGTGG -/T TTTTTTACAG 3070 hom 76 het 35 0 26 9 T 6 7 300684 CASAVA_Build 2 116387802 2D GTGGGGAAGG TT/-- TTGTGTGTGT 3070 hom 97 het 38 0 33 5 T 4 2 300685 CASAVA_Build 2 116408385 1I AGAAACAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 35 4 14 17 T 13 14 300686 CASAVA_Build 2 116437416 2I TTGATTTCAC --/TG TGGTCTGAGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TG 1 2 300687 CASAVA_Build 2 116486958 1D AGAACTCTTC A/- ACCAGTGGAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 2 1 300688 CASAVA_Build 2 116495074 1D TATTTAAATT G/- TTAATTTTAT 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 G 1 0 300689 CASAVA_Build 2 116506467 1I TAGAAACATA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 8 9 300690 CASAVA_Build 2 116506720 1D GCTACTGTAA T/- TTTTTTATAT 3070 het 2449 hom 23 6 13 4 T 7 6 300691 CASAVA_Build 2 116516324 1I CACACTAAGA -/C CCCCCCCCAT 1739 het 1739 ref 39 24 7 8 C 8 9 300692 CASAVA_Build 2 116519083 3I GCACAGCAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 AAC 3 4 300693 CASAVA_Build 2 116522544 1I ATCTTTTCCC -/T TTCCTATGTC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 2 3 300694 CASAVA_Build 2 116532113 1D TAACTTTTTG A/- ATGGCTGAAT 3070 het 3070 hom 22 10 10 3 A 2 1 300695 CASAVA_Build 2 116536747 1I CTTATTAATA -/T TGCCCTAGTC 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 1 2 300696 CASAVA_Build 2 116538050 15D CTCAATCTCT GGGGAACAGAAGGTG/--------------- GGGTTAAGAG 3070 het 3070 ref 40 26 18 3 GGGGAACAGAAGGTG 1 0 300697 CASAVA_Build 2 116539752 1D CAAAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 T 12 11 300698 CASAVA_Build 2 116547128 1D GTCGTTTTTT G/- GGGGGTGAAC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 G 6 5 300699 CASAVA_Build 2 116550570 1I GTGGTGTTTC -/T TGGCCTTAGA 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 T 1 2 300700 CASAVA_Build 2 116551781 1D TGGAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 10 9 300701 CASAVA_Build 2 116557592 1I ATTGTTTGAG -/T TTGAAGCCCA 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 T 2 3 300702 CASAVA_Build 2 116558685 1I AAGAAGCTAC -/T GTCTATGAAC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 0 1 300703 CASAVA_Build 2 116560758 1D16M1I TTTTCTCTCC AAAAAAAGAGTTTTTCT-/-AAAAAAGAGTTTTACTA AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 31 17 15 5 N/A 0 0 300704 CASAVA_Build 2 116561204 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 2424 het 2424 ref 31 16 11 4 A 9 10 300705 CASAVA_Build 2 116569824 1I AAATGCATTA -/C TTAGGGATCT 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 C 0 1 300706 CASAVA_Build 2 116601419 1D TTTAAACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 T 13 12 300707 CASAVA_Build 2 116616209 1I AAAGGCCAGG -/A AAAGGCATGT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 A 3 4 300708 CASAVA_Build 2 116619786 1I AAATCACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 18 23 10 T 12 13 300709 CASAVA_Build 2 116620532 1D TTTTAATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 13 19 19 T 11 10 300710 CASAVA_Build 2 116626669 1I GTTCTAACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 9 10 300711 CASAVA_Build 2 116632142 3D CAAAGGGTAT CTA/--- CTAAGTATGA 2370 het 2370 ref 39 22 6 14 CTA 2 1 300712 CASAVA_Build 2 116640090 1I CCCCCCCACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 9 10 300713 CASAVA_Build 2 116648892 1D TAGTGTCATT A/- TTTTTGGCTA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 1 0 300714 CASAVA_Build 2 116649335 1D GCTCAGAGAG A/- ATTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 2 1 300715 CASAVA_Build 2 116651911 12I TTTCAAAATT ------------/AAAAACAAATGC AAAAACAATG 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 AAAAACAAATGC 0 1 300716 CASAVA_Build 2 116667569 4D AAAGCATGGG GGAA/---- ATTGCCCCCA 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 GGAA 1 0 300717 CASAVA_Build 2 116668262 1D GGGACTCTGT G/- GGGGGGGCTC 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 G 8 7 300718 CASAVA_Build 2 116668365 5D CCATCTGTTT CCATA/----- CCATACATCC 3070 het 3070 ref 49 26 22 3 CCATA 2 1 300719 CASAVA_Build 2 116672763 4D ATCAGTTGAC TTTA/---- TTTATGTAGA 3070 het 3070 ref 42 20 16 8 TTTA 2 1 300720 CASAVA_Build 2 116673383 2I AGTCTTCTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 11 13 300721 CASAVA_Build 2 116674688 1I TAGAACTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 9 10 300722 CASAVA_Build 2 116686161 1I TACACACAGT -/A AAAAAAAAAA 3000 het 2499 hom 26 8 11 7 A 10 11 300723 CASAVA_Build 2 116689328 14I TTTGAAGGAC --------------/ACCAGTCCTATCCA ATTAGGGCTC 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 ACCAGTCCTATCCA 0 1 300724 CASAVA_Build 2 116689420 2I TATTCAGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 10 12 300725 CASAVA_Build 2 116690116 4D AAATGTTGAC TCTT/---- TCTTTGAGTA 3070 het 3070 hom 46 19 25 2 TCTT 2 1 300726 CASAVA_Build 2 116694506 4I AAAGAAAAAA ----/AATC AAACACATAA 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 AATC 0 1 300727 CASAVA_Build 2 116695795 1D CATTCATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 A 11 10 300728 CASAVA_Build 2 116697509 1D AGAATGGTAA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 6 5 300729 CASAVA_Build 2 116699308 3D GAATGAAGGC AGA/--- AGAATAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AGA 2 1 300730 CASAVA_Build 2 116710904 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1882 hom 15 4 9 2 A 12 11 300731 CASAVA_Build 2 116711896 1I TTACTCAGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 9 10 300732 CASAVA_Build 2 116713609 1D TTCCTGGATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 12 5 T 10 9 300733 CASAVA_Build 2 116733767 2I AAAAACAAAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 10 12 300734 CASAVA_Build 2 116744871 1D AGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 15 14 300735 CASAVA_Build 2 116745473 1D CTGTTCAACA T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 41 28 12 2 T 7 6 300736 CASAVA_Build 2 116754785 1I ACTCTGATCA -/T TCAATCACAT 3070 het 3070 ref 39 25 9 5 T 1 2 300737 CASAVA_Build 2 116773551 1I GAAATAAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 8 9 300738 CASAVA_Build 2 116780224 1D CCACTTTTTT G/- TTTTTTTTTA 2474 het 2474 ref 22 14 7 1 G 1 0 300739 CASAVA_Build 2 116784735 4D30M1D CAAAAATTCT TCACTCACTCCAATTCGTGAAGAATTTCCTCTGAT/----TCACTCCAATTCGTGAAGAATTTCCTCTGA- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 37 22 17 5 N/A 0 0 300740 CASAVA_Build 2 116786020 1D TACTGACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1083 hom 38 6 21 11 A 11 10 300741 CASAVA_Build 2 116791030 3I TGTGAACTTT ---/AAG AAGAGGAGAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AAG 1 2 300742 CASAVA_Build 2 116813601 2D AAGCTCATTT AC/-- ACACACACAC 1128 het 1128 ref 32 12 9 12 AC 8 7 300743 CASAVA_Build 2 116813615 4D ACACACACAC ACAT/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 ACAT 1 0 300744 CASAVA_Build 2 116838490 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 C 0 1 300745 CASAVA_Build 2 116844783 1D TTCCATAGGG A/- AAAAGATAAT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 5 4 300746 CASAVA_Build 2 116860917 3I CAGTAGAGAT ---/AGG AGAAGTTTAC 3070 hom 101 het 36 0 34 2 AGG 0 1 300747 CASAVA_Build 2 116864449 3D TTTTTTCTTT ACA/--- ACAACACTCC 3070 hom 114 het 43 0 38 8 ACA 3 2 300748 CASAVA_Build 2 116867689 1I ACAGAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 11 300749 CASAVA_Build 2 116887051 2D GTTTGGCACA CT/-- CTGAGCAGAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CT 2 1 300750 CASAVA_Build 2 116905852 3D CACGTAAAAC ATT/--- ATAGTGGTTT 3070 hom 108 het 42 0 37 7 ATT 1 0 300751 CASAVA_Build 2 116913634 4D CACTAGAATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 39 0 27 13 A 18 14 300752 CASAVA_Build 2 116922740 1D TGGAGGAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 10 9 300753 CASAVA_Build 2 116925240 2D ATTTGCAGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 12 10 300754 CASAVA_Build 2 116927077 1D ATTTTCAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 114 het 41 0 38 4 A 9 8 300755 CASAVA_Build 2 116932629 3D AATTAATCAC CTA/--- CTTATGGCGA 3070 het 3070 ref 37 20 16 4 CTA 1 0 300756 CASAVA_Build 2 116935187 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAC 1801 het 1801 ref 19 9 5 6 A 10 9 300757 CASAVA_Build 2 116935568 1I CACACAAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 A 8 9 300758 CASAVA_Build 2 116937741 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 2970 hom 33 10 18 5 TC 0 1 300759 CASAVA_Build 2 116938166 1D TTCTTCCTTC T/- TTTTCACTGA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 5 4 300760 CASAVA_Build 2 116940670 1I TTTTGTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 9 10 300761 CASAVA_Build 2 116948394 1D GTGGTCCCCG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 A 8 7 300762 CASAVA_Build 2 116949208 3D TACAGGTCAT ACC/--- ACCACCACAC 1470 het 1470 ref 15 6 4 5 ACC 3 2 300763 CASAVA_Build 2 116949744 1I59M1I ATATAATTAT -AAACTGCTGATGTATTGTTTCTTTGTCAAGGAGGAGAAAAAAGTTCAGAGTTACAAAAT-/AAAACTGCTGATGTATTGTTTCTTTGTCAAGGAGGAGAAAAAAGTTCAGAGTTACAAAATA GTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 33 26 22 9 N/A 0 0 300764 CASAVA_Build 2 116952726 1D AGAGTTACAA C/- CAGTTACATT 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 2 1 300765 CASAVA_Build 2 116953186 1I CCTTTAAAAT -/C CCAATGAAGA 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 C 2 3 300766 CASAVA_Build 2 116953371 1D ATGTAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 13 12 300767 CASAVA_Build 2 116955245 4D AAATCAATTT ATAA/---- ATAAATTAAT 3070 het 3070 hom 36 13 22 2 ATAA 2 1 300768 CASAVA_Build 2 116956228 2D17M70D TTCTGGTAAT TCTATTCTGATGCCAGTATGCATAAGAATACCTTAGGCTATACATGTAGGGATACAAATCATTAAGACTGAAGAAGTATTCAGTACATG/--TATTCTGATGCCAGTAT---------------------------------------------------------------------- GTCAACTTCA 3070 het 3070 ref 26 25 12 0 N/A 0 0 300769 CASAVA_Build 2 116956595 1I TTCAAATAAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 8 9 300770 CASAVA_Build 2 116957389 2I ATTGTAAGTG --/AT ATGAATTTTA 3070 het 3070 ref 46 25 20 1 AT 1 2 300771 CASAVA_Build 2 116959920 1I AAGGAAAAAA -/G AATAAAAATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 0 1 300772 CASAVA_Build 2 116962257 2I ACCTGGCTAC --/AG CCACCACTGT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 AG 0 1 300773 CASAVA_Build 2 116964485 27I AACTTTAGGG ---------------------------/GAATGTGGGTGGATATAAATGCATTTT GAATGTGGGA 3070 het 3070 ref 47 25 13 10 GAATGTGGGTGGATATAAATGCATTTT 0 1 300774 CASAVA_Build 2 116965305 1I CGGGTGCAGT -/G GGCAGGCACC 1839 het 206 hom 8 1 5 2 G 2 3 300775 CASAVA_Build 2 116969003 4I AACTTACAGT ----/ATTA ATTGTTTTTT 3070 het 2914 hom 31 6 18 7 ATTA 0 1 300776 CASAVA_Build 2 116972029 1I TAGAAAAGGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 6 7 300777 CASAVA_Build 2 116974775 29D AACTCAGCCC ATAACAGTGCCCTTTGGCAGTAATAAATT/----------------------------- ATAGCCGTGA 3070 hom 81 het 26 0 25 6 ATAACAGTGCCCTTTGGCAGTAATAAATT 1 0 300778 CASAVA_Build 2 116978948 1I GGGTTTTGAC -/T TTTTTAATAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 5 6 300779 CASAVA_Build 2 116982856 16D TTCTTTTCCC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1036 hom 23 6 10 9 T 26 10 300780 CASAVA_Build 2 116983531 2D ATTTTTCAGG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 11 9 300781 CASAVA_Build 2 116983789 1D CTATACTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 11 10 300782 CASAVA_Build 2 116987414 1I CCTGTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1367 hom 15 het 9 0 6 3 T 10 11 300783 CASAVA_Build 2 116988634 1I TTTTGAACAC -/T TTTTGGAAAC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 4 5 300784 CASAVA_Build 2 116993183 1I ATAAAAGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 10 12 A 12 13 300785 CASAVA_Build 2 116994064 5I AAACAGTAAA -----/AAATT AAAAGTAAAG 3070 hom 72 het 32 0 25 8 AAATT 0 1 300786 CASAVA_Build 2 117012056 1I CAAATTCAGC -/G CCAAACTAGG 3070 hom 169 het 62 0 57 5 G 0 1 300787 CASAVA_Build 2 117018380 1I33M1D TCCCTATTTT -ATATGTTCACTCACATAAGATCTTCCTTTACTAT/AATATGTTCACTCACATAAGATCTTCCTTTACTA- TTTTTTTCTA 3070 het 1477 hom 23 3 10 19 N/A 0 0 300788 CASAVA_Build 2 117019631 1I TCTTCATAGG -/A AAAATCACAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 4 5 300789 CASAVA_Build 2 117036932 9D AAGTCAAACA TACTTTAAG/--------- AACTAACGTA 3070 het 3070 ref 45 24 24 3 TACTTTAAG 1 0 300790 CASAVA_Build 2 117038416 2D TCATGGTGAC AT/-- GTGTTAGATT 3070 het 3070 hom 57 25 28 4 AT 1 0 300791 CASAVA_Build 2 117041573 1D TGTATCTCCT A/- TTTTGAGAAA 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 A 1 0 300792 CASAVA_Build 2 117044261 1I ATGGTGAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 26 14 9 A 9 10 300793 CASAVA_Build 2 117045633 3I GCTCACTCCA ---/ACC ACCTTCTCCT 2555 het 2555 ref 17 9 6 2 ACC 1 2 300794 CASAVA_Build 2 117052802 1D TTTTGAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 9 8 300795 CASAVA_Build 2 117060624 2I CATTACCAAA --/GT GTGTGATTGT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 GT 2 3 300796 CASAVA_Build 2 117063986 3I CTGCAAAAGA ---/AAG AAGAAGTAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 AAG 2 3 300797 CASAVA_Build 2 117065006 4I AGCCAAGGCT ----/GGCA GATTGCTTGC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 GGCA 0 1 300798 CASAVA_Build 2 117066093 1D GACTTGAGTA G/- AAAAGACAAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 1 0 300799 CASAVA_Build 2 117067757 1D TAATCCCACA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 T 8 7 300800 CASAVA_Build 2 117071256 1I AGGTAGTTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 9 10 300801 CASAVA_Build 2 117071772 1I GAGTTCAGGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 9 10 300802 CASAVA_Build 2 117073933 17D TGACTGCAAC ATATATATATATGCAAT/----------------- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 12 18 3 ATATATATATATGCAAT 1 0 300803 CASAVA_Build 2 117082567 1I TTTTCTTTTC -/A AAATGTAATG 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 A 3 4 300804 CASAVA_Build 2 117084554 1D ACCTCGTGAT C/- TGCCCACCTC 3070 het 954 hom 10 2 7 1 C 1 0 300805 CASAVA_Build 2 117086116 1D AAATGGTCTC T/- TTTTTAAACA 3070 het 3070 ref 38 24 8 7 T 6 5 300806 CASAVA_Build 2 117086812 2D TTTTTTTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2024 hom 22 6 11 5 AT 7 6 300807 CASAVA_Build 2 117088982 1D GTCCTAAAAG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 24 11 11 4 A 8 7 300808 CASAVA_Build 2 117089209 2D CCAGTAAAGG TA/-- TATTTACATA 3070 het 3070 hom 31 13 18 1 TA 2 1 300809 CASAVA_Build 2 117090684 1D TAGAAAGAAT A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 A 7 6 300810 CASAVA_Build 2 117095220 4I ATTCAAACTT ----/AAAA AAAGGAAATC 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 3 7 300811 CASAVA_Build 2 117103309 1D CTTTTTAATA T/- TTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 7 6 300812 CASAVA_Build 2 117104033 1D TTGTTGATAA T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 T 7 6 300813 CASAVA_Build 2 117110259 1D AGAAAATTTT A/- AATTGTACAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 3 2 300814 CASAVA_Build 2 117113672 1I CAACATGGAT -/A GAATTTGGAG 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 0 1 300815 CASAVA_Build 2 117121301 4D TTTCTCTGTC TATA/---- TATAGATATG 3070 hom 60 het 23 0 21 3 TA 4 2 300816 CASAVA_Build 2 117137080 1I AGTTACGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 429 hom 44 2 37 5 T 9 10 300817 CASAVA_Build 2 117139721 10I TTTGAGGAAT ----------/TTCCAAATTG TTCTCTACAG 3070 hom 120 het 42 0 41 2 TTCCAAATTG 0 1 300818 CASAVA_Build 2 117167147 1D TAGTCCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 32 0 24 9 T 13 12 300819 CASAVA_Build 2 117183677 3D GTATTCTGTC TGT/--- TGTTGTTTCT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 TGT 3 2 300820 CASAVA_Build 2 117190403 1D ATGAAGACTC A/- GAATAATTTC 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 A 1 0 300821 CASAVA_Build 2 117192664 2D GCCCTAAATC TA/-- TGACTCATAC 3070 het 3070 ref 57 35 15 9 TA 1 0 300822 CASAVA_Build 2 117195589 2I TTAAAGATAC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 48 15 20 13 TG 5 6 300823 CASAVA_Build 2 117246853 1I ATAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 12 het 33 1 25 7 A 8 9 300824 CASAVA_Build 2 117255347 7D TTGTATATTG TTTCTAA/------- TAATAAAATC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 TTTCTAA 1 0 300825 CASAVA_Build 2 117258527 1D AAGGATCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 33 1 23 9 T 11 10 300826 CASAVA_Build 2 117261578 2I AAATTGGCAC --/AT AATCTTTATT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AT 0 1 300827 CASAVA_Build 2 117270212 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1043 het 246 hom 7 3 4 0 A 19 18 300828 CASAVA_Build 2 117293143 1D GCACAGAACT A/- AAAAACTGGA 3070 hom 138 het 50 0 47 4 A 6 5 300829 CASAVA_Build 2 117296586 1D TTGATTAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 10 9 300830 CASAVA_Build 2 117306228 5I ATTCCTAGGC -----/AATCA AATCGTTAAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AATCA 0 1 300831 CASAVA_Build 2 117308644 1I TGCTCCCAAA -/T TTATTCGTGC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 2 3 300832 CASAVA_Build 2 117310211 7I AGAATGTTAT -------/GAGAAAA AAGAAAAAGT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 GAGAAAA 0 1 300833 CASAVA_Build 2 117314492 1D CTCTCTCCAC T/- TTGGAGAATG 3070 hom 118 het 43 0 40 5 T 3 2 300834 CASAVA_Build 2 117315426 1D TTGACATCTA G/- TCAGGTAAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 G 1 0 300835 CASAVA_Build 2 117318284 6D TTTTTCCCTC TTTCTT/------ TTTCTTTTTC 3070 hom 81 het 38 0 28 12 TTTCTT 3 2 300836 CASAVA_Build 2 117318467 2D AAAACATTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 14 12 300837 CASAVA_Build 2 117321089 4D GTACAAAGAA AGAG/---- AAAGGAGTAA 3070 hom 138 het 52 0 47 6 AG 2 0 300838 CASAVA_Build 2 117321405 1I AGAAGATAAT -/A ATTAATGATA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 2 300839 CASAVA_Build 2 117326879 1I GTTTTCTAAT -/C CTTTATTTTG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 C 1 2 300840 CASAVA_Build 2 117332998 1D CTTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 12 11 300841 CASAVA_Build 2 117334061 1D ACTCAGCATT A/- AAATGAATGA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 4 3 300842 CASAVA_Build 2 117335785 3I TTCATTTATG ---/AGA AGACTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AGA 1 2 300843 CASAVA_Build 2 117351583 1D AAAAACACAG A/- AAAAAAGTGC 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 7 6 300844 CASAVA_Build 2 117366319 1D ATCTTCCCCC T/- GGGACCACTC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 1 0 300845 CASAVA_Build 2 117370743 2D ATGGTGACAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 GA 6 5 300846 CASAVA_Build 2 117372053 1I TAAAATCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 445 hom 35 1 25 9 T 12 13 300847 CASAVA_Build 2 117373192 1D ATATGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1454 het 1454 ref 35 20 4 11 T 13 12 300848 CASAVA_Build 2 117374117 12D ATATATATAT ATACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 51 het 16 0 17 3 ATACACACACAC 1 0 300849 CASAVA_Build 2 117377020 1I GTCCTGTAAA -/G GGTCTATAGT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 G 2 3 300850 CASAVA_Build 2 117406365 1I TCACAAGAAC -/A AAAAAACCAA 1170 hom 7 het 3 0 3 0 A 6 7 300851 CASAVA_Build 2 117409616 1D CTGAAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 1617 het 1617 ref 44 27 4 13 A 15 14 300852 CASAVA_Build 2 117412192 1D TGTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 38 0 23 15 A 11 10 300853 CASAVA_Build 2 117418436 1D CTTACAGATC A/- ATATGAAAAG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 2 1 300854 CASAVA_Build 2 117420201 1I CTGAGCTACT -/A AATCATACTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 3 300855 CASAVA_Build 2 117423550 11D CTATGAGTGC TGCCTAGAGTT/----------- TGCCACCACC 3070 het 3070 hom 42 16 24 5 TGCCTAGAGTT 1 0 300856 CASAVA_Build 2 117437951 1D TGATGAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 34 0 28 7 A 12 11 300857 CASAVA_Build 2 117442220 2I TGTACTCCCA --/TG TGTGTATTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TG 2 3 300858 CASAVA_Build 2 117444143 14I TACATTGAGT --------------/CAGTTCCTCAGAGG CAGTTTTCAG 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 CAGTTCCTCAGAGG 0 1 300859 CASAVA_Build 2 117444762 1I CTCCCTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 A 10 11 300860 CASAVA_Build 2 117460529 2I ATAAAATGTT --/TA TATATATATA 3070 het 500 hom 27 2 19 6 TA 6 7 300861 CASAVA_Build 2 117464337 2D GTTTTTGTAA GT/-- GTGAGTGTAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 GT 2 1 300862 CASAVA_Build 2 117495125 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TCTTTCTCTC 3070 hom 65 het 36 0 25 12 T 5 1 300863 CASAVA_Build 2 117495147 13D TCTCTCTCTT TTTCTTTCCTTTC/------------- TTTCTTTCCC 1333 het 1333 ref 35 17 4 15 TTTCTTTCCTTTC 1 0 300864 CASAVA_Build 2 117501098 1D TTTTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1354 het 23 hom 14 1 5 8 T 12 11 300865 CASAVA_Build 2 117512503 3D TTTTCTTTGG TTC/--- CACTGCATCA 3070 hom 107 het 41 0 32 10 TTC 1 0 300866 CASAVA_Build 2 117521634 1D CCCCACAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 10 9 300867 CASAVA_Build 2 117525815 3D GTTTCATGGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 47 2 35 11 A 17 14 300868 CASAVA_Build 2 117527413 1I TCTAAAAGTT -/A CTGTCAATAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 0 1 300869 CASAVA_Build 2 117528696 17I GTCATGAATT -----------------/TTAAAGAATTACGGAAC TTACTACAGT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 TTAAAGAATTACGGAAC 0 1 300870 CASAVA_Build 2 117534755 5I TGACATTTCA -----/GATCT GACATTTATG 3070 hom 123 het 47 0 41 6 GATCT 0 1 300871 CASAVA_Build 2 117541790 2D AAACTTGTTT TC/-- TGTTTTAATA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TC 1 0 300872 CASAVA_Build 2 117548731 14D CATTGAATGA ATCAATGATAATGG/-------------- ATCTAGGCAG 3070 hom 93 het 35 0 29 12 ATCAATGATAATGG 1 0 300873 CASAVA_Build 2 117560417 7D TAAAACAGGC TTCTGTT/------- TTCTGTGAAA 3070 hom 80 het 32 0 23 11 TTCTGTT 1 0 300874 CASAVA_Build 2 117563802 5D TGTTTCTGAA ATAAT/----- ATATTTTATT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 ATAAT 1 0 300875 CASAVA_Build 2 117566590 11D GCTTAGAGAG AAAATCTCTCA/----------- AAAATGTAGA 3070 hom 117 het 43 0 37 9 AAAATCTCTCA 1 0 300876 CASAVA_Build 2 117576272 10I TTTAATATGA ----------/TCACAGTTTT TCACTGTAGC 3070 hom 129 het 44 0 43 1 TCACAGTTTT 0 1 300877 CASAVA_Build 2 117589673 1D ATGTTTCCAA G/- GGGCTCTCAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 G 4 3 300878 CASAVA_Build 2 117593944 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 9 300879 CASAVA_Build 2 117595691 4I TGAAACTTTA ----/CTCT CTCTCCCTCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CT 2 4 300880 CASAVA_Build 2 117597920 1D TAAATTATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 10 9 300881 CASAVA_Build 2 117608308 1I ATGATGACAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 9 10 300882 CASAVA_Build 2 117612102 1I ATTAAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 25 2 18 5 T 14 15 300883 CASAVA_Build 2 117618167 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2696 het 486 hom 17 3 9 5 A 19 18 300884 CASAVA_Build 2 117655804 1I CAGTTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 13 14 300885 CASAVA_Build 2 117665261 2I ATGCTAGTGT --/AC ACCAAGGTAT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AC 1 2 300886 CASAVA_Build 2 117667889 2D TTATCATGCT AA/-- GATTGATTCT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 2 0 300887 CASAVA_Build 2 117682964 1D AAAATCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 19 0 12 7 A 14 13 300888 CASAVA_Build 2 117690119 1D TATAGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 5 A 11 10 300889 CASAVA_Build 2 117692194 2I TGCTATAATT --/AA GTCAAGAATT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 0 2 300890 CASAVA_Build 2 117702208 2D AATAAAAGTG TT/-- TTGAAAGTGA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 4 2 300891 CASAVA_Build 2 117713997 1D GGGAAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 19 0 15 4 T 15 14 300892 CASAVA_Build 2 117734656 1D ATCAAAAACA T/- TTAAGAGTAA 3070 hom 117 het 44 0 40 6 T 3 2 300893 CASAVA_Build 2 117760421 2I TGTAGGACAC --/TA TACAAATACA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TA 1 2 300894 CASAVA_Build 2 117777726 2D TAAGAAAAAT AA/-- AAGAGACCCA 3070 hom 96 het 34 0 32 3 A 4 2 300895 CASAVA_Build 2 117784777 1I GTGGCTCTTA -/G GAAGATGGAT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 1 2 300896 CASAVA_Build 2 117786238 1D CACTATTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 25 1 19 5 A 14 13 300897 CASAVA_Build 2 117803354 3D AAAGGGTCTA AAT/--- AAGTATGTGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AAT 1 0 300898 CASAVA_Build 2 117805075 1D ACAAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 13 12 300899 CASAVA_Build 2 117811726 1D ATTTGTTTTG T/- TTTTCATAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 5 4 300900 CASAVA_Build 2 117825274 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3063 het 4 hom 17 1 12 4 A 14 13 300901 CASAVA_Build 2 117825367 1D ACAACATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 25 1 21 4 A 12 11 300902 CASAVA_Build 2 117840833 1D GAGAATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 526 hom 20 2 12 6 T 11 10 300903 CASAVA_Build 2 117842682 1D ACTAGGGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 10 9 300904 CASAVA_Build 2 117847331 2I CTTTTTCCCC --/CT GTTTCTTGCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 CT 0 1 300905 CASAVA_Build 2 117849440 7I ATTATATATT -------/TATATTA TATATTATAT 2737 hom 18 het 10 0 7 3 TATATTA 2 3 300906 CASAVA_Build 2 117875909 6D GTTTTTTTGA TTGTTT/------ TTAAGTTCCA 3070 het 3070 hom 41 19 22 0 TTGTTT 1 0 300907 CASAVA_Build 2 117876257 1I CTCCACTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 39 1 31 7 A 10 11 300908 CASAVA_Build 2 117877503 4D CCAAAAAGTT ATTA/---- ATTAATTTAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 6 ATTA 2 1 300909 CASAVA_Build 2 117878675 1D TCTAAACAAC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 8 7 300910 CASAVA_Build 2 117881931 4I TTTCTTCCTT ----/CCTC CCTCCCTCCC 3070 hom 22 het 23 0 14 9 CCTC 3 4 300911 CASAVA_Build 2 117886275 1I TACACACCTG -/T TAATTATATA 3070 hom 123 het 42 0 40 2 T 1 2 300912 CASAVA_Build 2 117903189 1D TTAAGTGACA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 8 7 300913 CASAVA_Build 2 117910472 3I GTCAACCTTT ---/ATA ATATCCAAGC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 ATA 1 2 300914 CASAVA_Build 2 117913376 1D TCTGTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 28 1 16 12 A 13 12 300915 CASAVA_Build 2 117922453 1D ATTACAAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 408 hom 41 1 34 7 T 10 9 300916 CASAVA_Build 2 117932072 1I CATGTTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 T 13 14 300917 CASAVA_Build 2 117952012 6I ATGAACAGAT ------/ATGAAC GCTTCTCAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ATGAAC 0 1 300918 CASAVA_Build 2 117954011 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 11 10 300919 CASAVA_Build 2 117992976 4D AACATTATGA AATT/---- AATAAAATTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AATT 1 0 300920 CASAVA_Build 2 117994982 1D TAGAGGGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 10 9 300921 CASAVA_Build 2 118031995 3I CCACTGCAAG ---/GAA GAAGAGGGAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 GAA 1 2 300922 CASAVA_Build 2 118038470 2I GAAAAAATAG --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 112 het 45 0 38 7 A 8 10 300923 CASAVA_Build 2 118040660 1D ACAGAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 11 10 300924 CASAVA_Build 2 118048563 5I GTCTCATCTG -----/AGACA AGACAAGTCC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AGACA 1 2 300925 CASAVA_Build 2 118059470 1I ATATCCTCAA -/C AAAATACTAA 3070 hom 111 het 41 0 36 5 C 0 1 300926 CASAVA_Build 2 118059670 1D TTTCATGATT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 9 8 300927 CASAVA_Build 2 118060987 1I AAACTACTAG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 9 300928 CASAVA_Build 2 118073528 3D AATCAGGAGG AGA/--- AATTTGAGCA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AGA 1 0 300929 CASAVA_Build 2 118076901 2I GTTGTTCCAA --/AG ATTCTAACAA 3070 hom 102 het 37 0 31 6 AG 0 1 300930 CASAVA_Build 2 118091060 1D GACCCAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 880 hom 41 2 32 7 A 11 10 300931 CASAVA_Build 2 118103333 2I GAAAAAAAAA --/AG AGTTCATAGC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AG 1 2 300932 CASAVA_Build 2 118112834 4D TTTCAGTAGA GGCC/---- GGCCACACAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 GGCC 2 1 300933 CASAVA_Build 2 118113030 1D ATAGTCCAAG A/- AAGGAATATG 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 A 3 2 300934 CASAVA_Build 2 118115648 8D TGTAGCAAAG TCTTTATT/-------- TAGAGTACTC 3070 het 3070 ref 40 24 13 7 TCTTTATT 1 0 300935 CASAVA_Build 2 118118458 1I ACTGTGCTGC -/A GTTTGAATTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 0 1 300936 CASAVA_Build 2 118118895 15I CTTGACTTTG ---------------/CCTGAGCCAGAGGCC CTCATTTAAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 CCTGAGCCAGAGGCC 0 1 300937 CASAVA_Build 2 118120028 4I AGGAATAAGT ----/ACAA ACAAAGTGAA 3070 hom 97 het 41 0 28 13 ACAA 1 2 300938 CASAVA_Build 2 118121995 1I ACTCTACTCA -/T TTTATATGAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 3 4 300939 CASAVA_Build 2 118130829 1D TATGTGCCTG C/- CTTATACAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 1 300940 CASAVA_Build 2 118134625 2D AAAGCTGGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 833 hom 38 7 15 18 A 14 12 300941 CASAVA_Build 2 118143072 1I TGCTTGGGGC -/T GAAAACGCCC 3070 hom 99 het 34 0 33 1 T 0 1 300942 CASAVA_Build 2 118162438 4I ACCAAATGGA ----/AAGT AAGTTTAGAA 3070 hom 162 het 60 0 54 6 AAGT 1 2 300943 CASAVA_Build 2 118164200 2I CAACACACAC --/TG GGGCCTGTTA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TG 0 1 300944 CASAVA_Build 2 118176486 2D AGAGAGAAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 AG 10 9 300945 CASAVA_Build 2 118179897 2D CTTATTAGGG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 42 0 32 11 GT 1 0 300946 CASAVA_Build 2 118181838 1I CTGCCCCCAA -/G GGGCTGACAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 3 4 300947 CASAVA_Build 2 118185410 2D CTTTTCTGAG TC/-- TCTATTTCAT 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 TC 2 1 300948 CASAVA_Build 2 118201678 1I CTTGGGTGTA -/C TAGAAGCACA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 0 1 300949 CASAVA_Build 2 118202283 2D CTTCAACAGT AG/-- AGATTGTCAA 3070 het 3070 ref 55 27 19 10 AG 2 1 300950 CASAVA_Build 2 118205965 1D TACAGCAGCA G/- TGACCAAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 G 1 0 300951 CASAVA_Build 2 118206763 1D TAAAAGCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 29 3 22 4 A 14 13 300952 CASAVA_Build 2 118212652 2D ACGAAATGGT AC/-- AGTTGAAACA 3070 het 3070 ref 59 29 21 9 AC 1 0 300953 CASAVA_Build 2 118221326 1D TGCATGTGTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 47 12 29 7 T 9 8 300954 CASAVA_Build 2 118231491 6D CCTACCCCAA GCCAGT/------ GTCTGTTAGA 3070 hom 171 het 62 0 57 6 GCCAGT 1 0 300955 CASAVA_Build 2 118234144 3D AGGGGAACAT CTC/--- CTTCTGTGTG 3070 hom 141 het 50 0 48 4 CTC 1 0 300956 CASAVA_Build 2 118236296 1I ATCCCCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 901 hom 37 3 30 4 T 12 13 300957 CASAVA_Build 2 118242916 1D CCCTTTATCA T/- TTTTTTATTA 2887 hom 23 het 11 0 7 4 T 7 6 300958 CASAVA_Build 2 118243692 1D GTGTGGGAGT C/- CTAAGTCTCT 2586 hom 18 het 9 0 7 2 C 2 1 300959 CASAVA_Build 2 118246392 1I AATTTAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 9 10 300960 CASAVA_Build 2 118249120 1I AATGAAAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 9 10 300961 CASAVA_Build 2 118272165 4I GAGAGTGAGA ----/CACT CAATAGGCCA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 CACT 0 1 300962 CASAVA_Build 2 118278016 1I AGCAGGGCGA -/G GCATTGCCTC 1790 hom 12 het 6 0 5 1 G 1 2 300963 CASAVA_Build 2 118295162 1D ATACTTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 94 het 36 0 32 4 A 9 8 300964 CASAVA_Build 2 118299407 5I GAGCTCGAAA -----/TAAAG TAGGGTAACA 3070 hom 128 het 46 0 39 7 TAAAG 0 1 300965 CASAVA_Build 2 118308696 6I CAGCTAATTT ------/TTGTTG TTGTTGTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TTG 2 4 300966 CASAVA_Build 2 118342924 4D TGTGTCACAT TGAC/---- TGATTTGCAC 3070 hom 108 het 38 0 37 4 TGAC 1 0 300967 CASAVA_Build 2 118343708 1D TTTTTGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 23 1 20 2 T 12 11 300968 CASAVA_Build 2 118344878 1I TTGGCATGTG -/C CACCTCACCC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 1 2 300969 CASAVA_Build 2 118359926 2I TTGTCTATTT --/TC TCTCTTATTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TC 2 3 300970 CASAVA_Build 2 118360613 1D ACCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 36 0 30 6 A 12 11 300971 CASAVA_Build 2 118369808 1D CTTTTTGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 24 1 18 5 A 12 11 300972 CASAVA_Build 2 118371233 1I CTGATAAACG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 12 300973 CASAVA_Build 2 118376712 1I AATAAAACAT -/A AAATGGTACA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 4 300974 CASAVA_Build 2 118387599 1D GTCAACACAG C/- CCTCCAGAGG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 C 3 2 300975 CASAVA_Build 2 118395073 3I AAAAATATAA ---/ATT ATTAGCCAGG 3070 hom 54 het 19 0 19 1 ATT 1 2 300976 CASAVA_Build 2 118397885 1I TTCCTCATGT -/G GGTCCCTGAC 3070 hom 69 het 27 0 22 5 G 2 3 300977 CASAVA_Build 2 118425130 2I ATAAGTCACT --/GA TAGTTTATAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 GA 0 1 300978 CASAVA_Build 2 118429459 2I CAGGTAGAAG --/TA TAAATTGATA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 TA 1 2 300979 CASAVA_Build 2 118430938 2D CTGGTACCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 16 14 300980 CASAVA_Build 2 118436520 1I TGAAACCCTA -/T CTCTACTAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 1 300981 CASAVA_Build 2 118456802 2D ATAGTGTAGT GG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 9 het 20 1 12 7 G 11 9 300982 CASAVA_Build 2 118459587 2D TTTTTTAAAC TA/-- GAGATGTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TA 1 0 300983 CASAVA_Build 2 118464680 2D CCAAGTGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 47 3 30 15 A 14 12 300984 CASAVA_Build 2 118466848 1D AACAATGTTT G/- GGGCACTATG 3070 hom 120 het 42 0 41 2 G 4 3 300985 CASAVA_Build 2 118469619 2I CACTCAGATA --/TC TGTCTTATAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TC 0 1 300986 CASAVA_Build 2 118479799 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2588 het 635 hom 20 2 11 7 A 15 16 300987 CASAVA_Build 2 118480713 1I CACAGTAGAC -/A ACTCAAAAGT 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 A 1 2 300988 CASAVA_Build 2 118485255 3I TGACAATGGA ---/AAG AAGTTTATTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AAG 1 2 300989 CASAVA_Build 2 118497807 2I AAAAAAAAAA --/AC AACCTTAAAG 3070 het 85 hom 24 1 16 7 AC 0 1 300990 CASAVA_Build 2 118508487 1D ACGCTCTTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 A 11 10 300991 CASAVA_Build 2 118510350 5D TCTTGATTTC TTAAT/----- TTAATTTAAT 2770 het 2770 ref 28 16 8 5 TTAAT 3 2 300992 CASAVA_Build 2 118510423 2D ATAGGTAAAC AT/-- GTGCCATGGT 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 AT 1 0 300993 CASAVA_Build 2 118516879 1D TTTGATGAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 9 8 300994 CASAVA_Build 2 118520458 1I CATGCCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 16 2 11 3 T 13 14 300995 CASAVA_Build 2 118525427 1I GGTTTGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 35 1 29 5 A 11 12 300996 CASAVA_Build 2 118551008 1I ATCAAAGCAA -/T TTAAAGGACT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 2 3 300997 CASAVA_Build 2 118565676 5D TTCTTAAAGC TTTTA/----- TTTTTTGTCA 3070 het 3070 hom 39 18 17 6 TTTTA 1 0 300998 CASAVA_Build 2 118571219 1I TTCTGTCTCA -/T TTCTATCTGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 2 3 300999 CASAVA_Build 2 118582504 1I GTATATATGG -/A ATAAATATAT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 A 1 2 301000 CASAVA_Build 2 118584484 3D GTAGTAGGCT GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 hom 72 het 33 0 23 10 GAG 6 5 301001 CASAVA_Build 2 118586403 4D AAAAAAAAAG AGTA/---- AGAGGAAAAC 1475 het 658 hom 10 2 7 1 AGTA 1 0 301002 CASAVA_Build 2 118599012 1I GCCATGAGTA -/G GACCTTGTCC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 1 2 301003 CASAVA_Build 2 118636537 1I GGTGGAGGTT -/G GGGGGGAGGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 6 7 301004 CASAVA_Build 2 118642863 1I TATCCCAAGC -/A TTTGGCAGAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 0 1 301005 CASAVA_Build 2 118644047 1D ATTTTTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 34 1 21 12 T 11 10 301006 CASAVA_Build 2 118664259 1D TGTAAAATGG C/- CCTGACTGTG 3070 hom 95 het 50 1 42 7 C 3 2 301007 CASAVA_Build 2 118667005 3I ATCATTATTA ---/TTG TTGTTGCTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTG 2 3 301008 CASAVA_Build 2 118673857 1D TTCTCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1590 hom 36 7 19 10 T 15 14 301009 CASAVA_Build 2 118675460 8I CCAGCCTCTG --------/CTCCTGAA CTCCTTTCTC 3070 hom 120 het 46 0 38 8 CTCCTGAA 0 1 301010 CASAVA_Build 2 118676327 3I GAGGCTGTCT ---/GGA TGAGGAGACA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 GGA 0 1 301011 CASAVA_Build 2 118677354 2D GCACACACAC AT/-- GTCTTTTTCT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 AT 1 0 301012 CASAVA_Build 2 118680079 1I ACTCCATACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 10 301013 CASAVA_Build 2 118682753 1D ATAGCAACCT C/- CCGGGTTATG 3070 hom 110 het 42 0 37 5 C 3 2 301014 CASAVA_Build 2 118685926 1D AAGCAGCCAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 8 7 301015 CASAVA_Build 2 118692647 2D AATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TG 7 6 301016 CASAVA_Build 2 118701354 1I CATCTTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 144 hom 12 1 11 0 A 10 11 301017 CASAVA_Build 2 118724054 2D CCAAGTAGCA CT/-- CTCTGCCTTC 3070 hom 158 het 57 0 49 11 CT 3 2 301018 CASAVA_Build 2 118731373 1I TGAGTGGTAT -/G GGATAGGGAT 3070 hom 156 het 58 0 50 8 G 2 3 301019 CASAVA_Build 2 118733452 1D TATTATTTTT A/- AATTTTTATT 3070 het 3070 ref 41 20 20 1 A 3 2 301020 CASAVA_Build 2 118733948 1D ATTAGAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 33 1 23 9 T 14 13 301021 CASAVA_Build 2 118748342 1D TAGTAAAAGG A/- AAAAAACCAG 3070 het 17 hom 28 1 26 1 A 7 6 301022 CASAVA_Build 2 118750424 1I TGAATAGTCA -/C CGCAGAGTGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 2 301023 CASAVA_Build 2 118760642 1I CTAGAGAGAG -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 6 7 301024 CASAVA_Build 2 118766335 1D ACTCGTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2815 hom 39 14 16 9 T 13 12 301025 CASAVA_Build 2 118766942 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TA 10 9 301026 CASAVA_Build 2 118823365 2D TTTGGGAGTC TT/-- TATTATGTTA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 3 1 301027 CASAVA_Build 2 118833525 1D TCCTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 11 10 301028 CASAVA_Build 2 118834836 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 20 1 14 6 A 15 14 301029 CASAVA_Build 2 118848492 1I TATGTGTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 88 het 36 0 30 6 T 9 10 301030 CASAVA_Build 2 118916414 1D CCAGCCAGGA T/- TTTTTTTTTC 1108 het 1108 ref 51 42 3 6 T 10 9 301031 CASAVA_Build 2 118925373 1D TGGATGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 T 12 11 301032 CASAVA_Build 2 118931378 1I CTGGATTATG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 9 301033 CASAVA_Build 2 118944186 2D CATCGGAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 20 14 11 AC 8 7 301034 CASAVA_Build 2 118961997 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1327 hom 7 het 13 0 7 6 A 12 13 301035 CASAVA_Build 2 118965723 1I CAAAATGCAG -/C CCTGAGAATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 C 2 3 301036 CASAVA_Build 2 118979338 3I TGCCATCAGT ---/GTG GTGGTGACTT 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 GTG 2 3 301037 CASAVA_Build 2 118979751 3I GTTCTATCAT ---/CTG TACCATGTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CTG 0 1 301038 CASAVA_Build 2 118981301 1I TCTTATTAAG -/C CACCTTAATA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 C 1 2 301039 CASAVA_Build 2 118985304 1I TAACTTAATA -/T TCAAATTGTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 1 2 301040 CASAVA_Build 2 118985756 4D TGAACTAGAT ACTC/---- ACCAACTAAT 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 ACTC 1 0 301041 CASAVA_Build 2 118989140 1D CAAAAACAAA C/- AAAAAAAAAG 3070 hom 55 het 23 0 19 4 C 1 0 301042 CASAVA_Build 2 118995485 4D TCCAGCCCAG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 10 TTGT 4 3 301043 CASAVA_Build 2 119003957 2D TTTTTAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 40 2 17 22 A 12 10 301044 CASAVA_Build 2 119006053 8D AGCACTCCTA ATCCTCAG/-------- ATCCTTGGCA 3070 het 3070 ref 43 22 15 9 ATCCTCAG 1 0 301045 CASAVA_Build 2 119009805 1I CTCCATGGGC -/T GCCAGGTGGA 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 T 0 1 301046 CASAVA_Build 2 119014042 6D CCAAAATCAA GGTGTT/------ GGCAGGGCTG 3070 het 3070 ref 38 27 9 4 GGTGTT 1 0 301047 CASAVA_Build 2 119020806 4D ACACAAGGGA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 48 16 22 11 TG 9 7 301048 CASAVA_Build 2 119044225 1D GGTGTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 2644 het 2644 ref 31 21 6 5 A 13 12 301049 CASAVA_Build 2 119058426 1D TGCTTTGAGG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 9 8 301050 CASAVA_Build 2 119127121 1I CCAAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 40 1 34 5 T 10 11 301051 CASAVA_Build 2 119134388 1I TGGCCACTGG -/C CCCCAGGGGC 3070 hom 122 het 45 0 41 4 C 4 5 301052 CASAVA_Build 2 119135261 1D CAACTTTTAA C/- TCAATTTAAG 3070 het 3070 hom 27 9 13 6 C 1 0 301053 CASAVA_Build 2 119141249 3D TCTTGATTCC AAT/--- AATATCTGAG 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 AAT 2 1 301054 CASAVA_Build 2 119148138 1I TTAAAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1105 hom 29 6 15 8 A 14 15 301055 CASAVA_Build 2 119173551 1I AGATGCTCCT -/C CCCTGGGGGC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 C 3 4 301056 CASAVA_Build 2 119180918 1D AGGCCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 T 15 14 301057 CASAVA_Build 2 119183542 1D ATTGCTAAGT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 39 16 18 6 A 9 8 301058 CASAVA_Build 2 119192738 1D AAGTTTTCTT G/- GTTGAGACAT 3070 het 3070 ref 36 15 12 10 G 2 1 301059 CASAVA_Build 2 119210259 1D GCCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1005 hom 31 4 15 12 A 12 11 301060 CASAVA_Build 2 119227661 1D GCCTGCCACC G/- GGGGCTTTGA 3070 het 1200 hom 20 5 11 6 G 5 4 301061 CASAVA_Build 2 119238154 1D CTTCCACCCC T/- GACCATGCCC 3070 hom 103 het 42 0 31 11 T 1 0 301062 CASAVA_Build 2 119238984 1I CCCAAAGGGG -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 301063 CASAVA_Build 2 119240594 1I TATCTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 10 11 301064 CASAVA_Build 2 119242030 1I TAAGCAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 11 12 301065 CASAVA_Build 2 119262567 2D AGTGTCACTC TG/-- TGTCTTTTTC 2852 het 1845 hom 24 8 9 9 TG 2 1 301066 CASAVA_Build 2 119262604 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1654 het 1616 hom 20 7 6 7 T 15 14 301067 CASAVA_Build 2 119275425 1D TCATGCCTGT C/- CAGAAGAAGG 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 C 2 1 301068 CASAVA_Build 2 119277051 12D ATCGTGAAGG AAAAACTCTAAA/------------ ATCTTCAGAC 3070 het 3070 ref 53 27 22 7 AAAAACTCTAAA 1 0 301069 CASAVA_Build 2 119281486 1I CGACTCTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 10 11 301070 CASAVA_Build 2 119285219 1D GCCTCATCCT G/- GCCACTGCCA 3070 hom 96 het 39 0 30 9 G 2 1 301071 CASAVA_Build 2 119294494 1D CCAAAGGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 A 15 14 301072 CASAVA_Build 2 119296351 1D CGGCTGCCCC A/- AATCCACGCA 3070 het 3070 hom 45 15 15 15 A 3 2 301073 CASAVA_Build 2 119298209 1I CCAAAAGGGG -/T TTTTTTCCTA 3070 hom 90 het 40 0 30 10 T 6 7 301074 CASAVA_Build 2 119309051 1D CTGGTGCAGG A/- AAAGTTCAGT 3070 hom 36 het 14 0 10 4 A 4 3 301075 CASAVA_Build 2 119309909 1I ATGGCTGGAG -/C CTGCGGCCCA 2860 hom 33 het 15 0 10 5 C 1 2 301076 CASAVA_Build 2 119335676 2D AGGAAATCGC TA/-- TGTTTCCCTT 3070 hom 125 het 49 0 39 11 TA 1 0 301077 CASAVA_Build 2 119344713 1D ATTAGTCTGA T/- TTCCATCATG 3070 hom 96 het 39 0 33 7 T 3 2 301078 CASAVA_Build 2 119350428 1D GTGGGGAGTT C/- CCACTCCATA 3070 hom 131 het 49 0 41 8 C 3 2 301079 CASAVA_Build 2 119353633 1I CGTCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 2945 het 2945 ref 44 19 9 16 A 11 12 301080 CASAVA_Build 2 119356119 1I GGGGAATATG -/A GATAGGGATT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 0 1 301081 CASAVA_Build 2 119423694 3I GAAAGGAAAA ---/GAT AGATAGACTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 GAT 0 1 301082 CASAVA_Build 2 119464606 1D ATTATCTCCT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 2979 hom 31 10 14 7 C 10 9 301083 CASAVA_Build 2 119465300 1I TGTTTTATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2189 hom 31 10 13 8 T 13 14 301084 CASAVA_Build 2 119489425 6D TTTAATTAAT TTTTAA/------ TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 21 9 11 4 TTTTAA 1 0 301085 CASAVA_Build 2 119500537 1I ACCGTGTAAA -/G TTTTTGACAT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 G 0 1 301086 CASAVA_Build 2 119514565 3I ATAGCCTATT ---/ATC ATAATAGCCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATC 0 1 301087 CASAVA_Build 2 119515787 1I TGTTTGGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2271 hom 27 6 16 5 T 9 10 301088 CASAVA_Build 2 119516801 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 TG 9 8 301089 CASAVA_Build 2 119528530 1I AGATCTCTAT -/G GGGGGGAAGC 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 G 6 7 301090 CASAVA_Build 2 119536483 1I TGGACGTAAC -/A AGACACCCTG 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 1 2 301091 CASAVA_Build 2 119547584 12D AGGAAGGAAG GAAGGAAGGAAA/------------ GAAGGAAGGA 3070 hom 131 het 46 0 35 18 GAAGGAAGGAAA 2 1 301092 CASAVA_Build 2 119555070 2D AATTCAATGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 35 0 23 13 T 15 13 301093 CASAVA_Build 2 119557142 46D GTTAGCTGGG ACAAGGGATAGGCATTGGGAAGAGAATTAACCCAGGGACTGAACAA/---------------------------------------------- GGCCCCTCCC 3070 hom 69 het 22 0 23 4 ACAAGGGATAGGCATTGGGAAGAGAATTAACCCAGGGACTGAACAA 1 0 301094 CASAVA_Build 2 119563435 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 22 0 17 5 T 12 11 301095 CASAVA_Build 2 119569958 13I GCCCACAGAG -------------/CACGGTGGGGCAT CACCTCACGC 3070 hom 71 het 26 0 22 4 CACGGTGGGGCAT 0 1 301096 CASAVA_Build 2 119570969 1D GATGTTCGAA C/- CCCATCACAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 4 3 301097 CASAVA_Build 2 119603039 2D CACGTGAGTG CA/-- CACACACACA 2388 het 2388 ref 26 10 6 11 CA 9 8 301098 CASAVA_Build 2 119604448 1D AACAAAGGTA T/- TAGAGGTGAT 3070 hom 107 het 42 0 36 6 T 2 1 301099 CASAVA_Build 2 119607097 1I CTCTATCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 A 10 11 301100 CASAVA_Build 2 119610268 1D GCAGACTGCA G/- GCAGGTGCTT 3070 het 3070 hom 41 18 15 8 G 2 1 301101 CASAVA_Build 2 119613535 1I TGAGGCCATT -/G GCACTGGCCA 3070 hom 105 het 40 0 32 8 G 1 2 301102 CASAVA_Build 2 119622746 41D CCCTTTCTCA CTCCAAGAAGTCTCAGTTTGATGATTCCTGAAATGTATCGG/----------------------------------------- CTCAGGAGAA 3070 het 3070 ref 42 29 22 8 CTCCAAGAAGTCTCAGTTTGATGATTCCTGAAATGTATCGG 1 0 301103 CASAVA_Build 2 119631603 1D GAGGGTTTAC G/- GGGGCCGGTG 3070 hom 39 het 16 0 13 4 G 5 4 301104 CASAVA_Build 2 119654679 7D ACTCCAAGTC AAAAAGA/------- AAAAAGAAAA 3070 het 284 hom 23 4 12 8 AAAAAGA 3 2 301105 CASAVA_Build 2 119667383 1D GCTTTTTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 10 9 301106 CASAVA_Build 2 119669025 1I TTCATTCATC -/A AAAAATGTAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 5 6 301107 CASAVA_Build 2 119671587 1D GCCAGGGCCT C/- CCCCCCGAGC 3070 het 2540 hom 35 10 19 7 C 7 6 301108 CASAVA_Build 2 119678817 1I CCGGTGGCGG -/C CCTGCACGGG 3070 hom 82 het 35 0 25 10 C 2 3 301109 CASAVA_Build 2 119694299 1D TGTATGTGGA G/- GGGGGGGTGT 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 G 8 7 301110 CASAVA_Build 2 119697367 1D GACAGAGATT G/- GGGGGGGACC 3070 hom 83 het 32 0 25 7 G 8 7 301111 CASAVA_Build 2 119708223 1I TGCCCTTTCC -/T TAACCCCACG 2490 het 2490 ref 31 14 9 8 T 1 2 301112 CASAVA_Build 2 119722311 1D TCCAGCACCT C/- CCCCCCCCAC 1967 het 1010 hom 19 7 7 6 C 9 8 301113 CASAVA_Build 2 119723109 1D GACTCTGGGG T/- TTGGGTCTGA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 3 2 301114 CASAVA_Build 2 119729793 1I CTTGCCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1304 hom 18 4 8 6 A 13 14 301115 CASAVA_Build 2 119732975 1I GCCTTCCTTT -/G GGTATTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 G 2 3 301116 CASAVA_Build 2 119733045 3D AGTTTTAACT GGC/--- TGTTAGATAT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 GGC 1 0 301117 CASAVA_Build 2 119734367 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 1549 het 1549 ref 23 8 7 8 T 9 10 301118 CASAVA_Build 2 119742612 4I CAAAAATCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 90 het 41 0 31 10 AAAC 3 4 301119 CASAVA_Build 2 119743278 1I AAAAGCAGTC -/A GAGAAAAATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 1 301120 CASAVA_Build 2 119745188 1I AGCAAAAAAA -/T AAAAAAGAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 301121 CASAVA_Build 2 119749693 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 751 hom 23 6 10 7 A 16 15 301122 CASAVA_Build 2 119780839 1I AAGCAAAAAC -/T TCCACTGACG 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 1 2 301123 CASAVA_Build 2 119785752 1D TCATTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1281 het 1281 ref 40 24 5 11 A 12 11 301124 CASAVA_Build 2 119814960 1D GCAAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 13 12 301125 CASAVA_Build 2 119844480 1D TATGAATGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 12 5 T 10 9 301126 CASAVA_Build 2 119871864 44D CACATCTGGC TAAGCCAGTGATGGAAAACAAAGACGGGGCACATCTGGCTAAGA/-------------------------------------------- TAGACCACTC 3070 het 6 hom 18 1 13 16 TAAGCCAGTGATGGAAAACAAAGACGGGGCACATCTGGCTAAGA 1 0 301127 CASAVA_Build 2 119884589 1D AGTTTCATAG T/- TTGGGACCTT 3070 hom 59 het 23 0 20 3 T 3 2 301128 CASAVA_Build 2 119909304 14D AGATACTCTT GCTGGGCTCTTTGA/-------------- CCACAGGAGT 3070 het 3070 hom 38 19 18 5 GCTGGGCTCTTTGA 1 0 301129 CASAVA_Build 2 119911122 6I ACCAACCAGA ------/GTGTGC CGATCTGCTT 3070 hom 65 het 25 0 19 6 GTGTGC 0 1 301130 CASAVA_Build 2 119911967 5D TCAGTGCCTA GGACT/----- TTCTTCCACC 3070 het 3070 ref 43 19 20 7 GGACT 1 0 301131 CASAVA_Build 2 119912170 1I AGCTGGCTGT -/C GCCTCTGGGA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 C 0 1 301132 CASAVA_Build 2 119918161 2I ACATTTTCTC --/AT ATGTGTGTGT 2329 hom 27 het 12 0 10 2 AT 1 2 301133 CASAVA_Build 2 119921176 1D ACCTCCATCA G/- TAAAAAGAAA 2959 het 2959 ref 22 11 7 5 G 1 0 301134 CASAVA_Build 2 119929084 1D GCTCAGATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 70 het 29 0 25 4 T 10 9 301135 CASAVA_Build 2 119931737 1D CCAGCTTGGG C/- CAAGAGAGTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 C 2 1 301136 CASAVA_Build 2 119933451 1D ACTAGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 2076 het 2076 ref 27 16 6 5 T 11 10 301137 CASAVA_Build 2 119938501 1D CTGCAGTGAG A/- AAAAAAAAAA 1699 het 1357 hom 40 11 8 21 A 15 14 301138 CASAVA_Build 2 119958667 12I GTGGGTGCGG ------------/TGGAATACTTTC TGGAATACTT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 TGGAATACTTTC 1 2 301139 CASAVA_Build 2 119958717 4D TCCTGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2544 hom 32 6 9 18 TTTG 4 3 301140 CASAVA_Build 2 119969159 2D ATATAGATTT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 36 0 28 8 AC 8 7 301141 CASAVA_Build 2 119977034 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2251 hom 13 het 12 0 8 5 A 13 12 301142 CASAVA_Build 2 119993857 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2356 het 1017 hom 20 6 7 7 A 17 16 301143 CASAVA_Build 2 120002951 1D TGTATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 7 17 T 15 14 301144 CASAVA_Build 2 120017114 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2177 het 2177 ref 33 20 6 7 A 14 15 301145 CASAVA_Build 2 120041313 3I TCCCATGCTT ---/CTC CTATTCATTC 3070 hom 111 het 39 0 37 2 CTC 0 1 301146 CASAVA_Build 2 120081487 3D CACTTTAAAA ATC/--- ATAACTATTA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 ATC 1 0 301147 CASAVA_Build 2 120107395 1I TCCATAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 9 10 301148 CASAVA_Build 2 120107777 1D ATGAAAAAAA T/- ACCACCAATC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 0 301149 CASAVA_Build 2 120114261 1I ATCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 29 1 20 8 A 12 13 301150 CASAVA_Build 2 120119041 3I TTCCAGGTCC ---/CCG CCCCCCCCAC 2380 hom 21 het 11 0 8 3 CCG 0 1 301151 CASAVA_Build 2 120121100 1D TAGAACGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 31 1 18 13 T 14 13 301152 CASAVA_Build 2 120134717 1D AGTCACTTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 9 8 301153 CASAVA_Build 2 120138168 6D CTTTACACAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 12 hom 46 1 31 16 AC 12 9 301154 CASAVA_Build 2 120143485 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 2897 hom 15 het 6 0 6 0 A 10 9 301155 CASAVA_Build 2 120144882 2D TCTGTGTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 23 1 12 11 T 17 15 301156 CASAVA_Build 2 120158582 1D CTCCATAATA T/- TTATTTTTTG 3070 hom 88 het 32 0 27 5 T 3 2 301157 CASAVA_Build 2 120159259 2D CCTCAGCCCG CC/-- CCCCCCCCCC 2040 hom 26 het 23 0 8 15 C 12 10 301158 CASAVA_Build 2 120160316 1D AGTAGGCTTT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 A 8 7 301159 CASAVA_Build 2 120167853 6I3M1D19M2D18M2I8M7D10M2D9M2D CACACATACA ------CATCACACATATCACACACAAACATACCACATACACATCACAC--CACACACATCACATGCCACAAACACAACACACAAACAT/ACATGGCAT-ACACACATAAAACACAAAC--ACCACACATGCAACATACTGTACACACA-------ACACAAACAC--CACAGAAAC-- ACCACATACA 1827 het 1827 ref 71 103 5 12 N/A 0 0 301160 CASAVA_Build 2 120168112 4D CATGCAACAT ACAC/---- ACACAACATA 3070 hom 229 het 87 0 68 21 AC 4 2 301161 CASAVA_Build 2 120182903 2I GTATTGACTC --/TT TTATTGTTTT 3070 hom 86 het 37 0 27 10 T 2 4 301162 CASAVA_Build 2 120187120 1D AATGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1436 het 1436 ref 19 12 4 3 T 13 12 301163 CASAVA_Build 2 120207603 1I TTTAAAAGCC -/A AAAAAGAAAA 2387 het 1511 hom 21 6 13 2 A 5 6 301164 CASAVA_Build 2 120207771 2I AAGATAGAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 10 12 301165 CASAVA_Build 2 120208804 1I TCCTCTGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 274 hom 41 1 28 12 A 13 14 301166 CASAVA_Build 2 120215651 1D TTAAGTAGCT G/- GGACTACAGG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 G 3 2 301167 CASAVA_Build 2 120216577 1I TGCCTGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 496 hom 29 2 19 8 T 15 16 301168 CASAVA_Build 2 120257046 1I CTGAAATCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 629 hom 31 3 19 9 T 13 14 301169 CASAVA_Build 2 120259006 3D TTATGATACT GAG/--- GAGGAAAAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 6 GAG 2 1 301170 CASAVA_Build 2 120274573 1D TTTTGCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 44 2 40 3 T 12 11 301171 CASAVA_Build 2 120316905 4D TGCTGTCATT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 17 9 9 TG 8 6 301172 CASAVA_Build 2 120378510 1D GCAAAGGCAT A/- AAAAAAAAAC 1012 het 1012 ref 42 35 3 5 A 10 9 301173 CASAVA_Build 2 120381483 1I TCGTCTCTAT -/A AAAAAATATT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 6 7 301174 CASAVA_Build 2 120381658 1D CTCTATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 40 1 33 6 A 11 10 301175 CASAVA_Build 2 120404876 1D TTGGTAATTG T/- TTTTTTTTTT 1166 het 1166 ref 39 26 3 11 T 13 12 301176 CASAVA_Build 2 120419652 6D AATAATAATA AAAATT/------ AAAAATAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 2 AAAATT 1 0 301177 CASAVA_Build 2 120420635 1I GTTATCTAAA -/T TGTTTCAAAT 3070 hom 110 het 42 0 37 5 T 1 2 301178 CASAVA_Build 2 120433288 1I TGATAAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1037 hom 33 4 24 5 T 11 12 301179 CASAVA_Build 2 120435268 10I GTATATACAG ----------/AACTCTTTAC AACTCTACAG 3070 hom 138 het 51 0 47 5 AACTCTTTAC 0 1 301180 CASAVA_Build 2 120446222 2I CTGAAAAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 A 10 12 301181 CASAVA_Build 2 120452478 1D AATTTTCTTG T/- TTTTTTGTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 7 6 301182 CASAVA_Build 2 120456522 2I GAAGAAAAAC --/TA ATTTTCATTA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 TA 0 1 301183 CASAVA_Build 2 120493443 1D ATCAGGCACT G/- TAACATTCAG 3070 hom 141 het 49 0 48 2 G 1 0 301184 CASAVA_Build 2 120493958 1D TTTGGATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 34 2 24 8 T 12 11 301185 CASAVA_Build 2 120493970 1D TTTTTTTTTT C/- AGAAATATAT 3070 het 128 hom 29 3 19 8 C 1 0 301186 CASAVA_Build 2 120494642 1D ACATTCCAAC A/- TGAGATATTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 0 301187 CASAVA_Build 2 120506582 1D CAGAGTGACA T/- TTCTGTGTGG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 3 2 301188 CASAVA_Build 2 120520112 1I ATTGATGGGG -/A TTTGGGTTGG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 A 0 1 301189 CASAVA_Build 2 120522165 2I GGTCTAAAAT --/TC TCTTTTTTTG 3070 hom 26 het 12 0 10 2 TC 1 2 301190 CASAVA_Build 2 120525881 1D CATTGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 65 het 28 0 22 6 T 10 9 301191 CASAVA_Build 2 120528577 10D GTCTCACTCT TCTCACTCCA/---------- GTCACCAGGC 3070 hom 69 het 26 0 21 5 TCTCACTCCA 1 0 301192 CASAVA_Build 2 120530720 1I TTCTTGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 278 hom 43 3 30 10 T 13 14 301193 CASAVA_Build 2 120531792 1I AGGGAAACAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 104 het 37 0 35 2 T 9 10 301194 CASAVA_Build 2 120536894 6I ATTTTGATTC ------/TTAAGA TTAAGATATG 3070 hom 63 het 29 0 22 7 TTAAGA 1 2 301195 CASAVA_Build 2 120542873 1D TTGGAACGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 49 het 21 0 15 7 A 10 9 301196 CASAVA_Build 2 120546976 1I TAAAGTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1999 hom 21 5 10 6 A 13 14 301197 CASAVA_Build 2 120551759 2D GCTTAAAGAC TT/-- TGATAAACTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 T 3 1 301198 CASAVA_Build 2 120562771 1D GTTATTGGTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 7 301199 CASAVA_Build 2 120569799 7D ACTGCAACCT CCGCCTC/------- CCAGGTTCAA 3070 het 2770 hom 17 7 10 3 CCGCCTC 1 0 301200 CASAVA_Build 2 120573388 1D TGTAGTTTCT G/- GGTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 G 3 2 301201 CASAVA_Build 2 120597452 1I TGATCACTTG -/T TTTTAGAAAG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 4 5 301202 CASAVA_Build 2 120602870 3D ATTTTTTAAG GTA/--- GTAGTCTGTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 GTA 2 1 301203 CASAVA_Build 2 120619992 1D ACTCAATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 86 het 34 0 29 6 A 10 9 301204 CASAVA_Build 2 120623006 1I AAAATGGCCG -/T TAACATTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 1 2 301205 CASAVA_Build 2 120640504 1I CAGATTTTGT -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 G 3 4 301206 CASAVA_Build 2 120646076 4I AAAGGAAAAC ----/AAGG AAGCATTTTT 3070 hom 66 het 25 0 20 5 AAGG 0 1 301207 CASAVA_Build 2 120648515 1I CGTCTCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 901 hom 46 5 27 14 A 11 12 301208 CASAVA_Build 2 120663130 1D TGCATTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 763 hom 30 3 19 8 A 15 14 301209 CASAVA_Build 2 120675193 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 27 2 17 9 A 17 14 301210 CASAVA_Build 2 120685084 1I AAGCATAAGA -/C CCCCCTGAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 5 6 301211 CASAVA_Build 2 120690915 4D CGCCTGAGCC CTTT/---- CTATTACTCT 3070 het 3070 hom 27 12 14 2 CTTT 1 0 301212 CASAVA_Build 2 120692731 4D CTCACCACTG CTAA/---- CTGAGGGGCT 3070 het 3070 hom 39 9 19 15 CTAA 1 0 301213 CASAVA_Build 2 120699101 1D GCCAGGAGCG C/- CCCCACCCTC 3070 het 3070 hom 39 12 15 12 C 5 4 301214 CASAVA_Build 2 120700774 1I9M20D CTGTGATTAC -TTTGGGTTACTCAGCTAACCCAGGATCAC/TTTTGGGTTA-------------------- CTCTCTATTT 3070 het 3070 ref 32 21 9 11 N/A 0 0 301215 CASAVA_Build 2 120709716 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 1448 het 963 hom 23 5 11 7 A 12 13 301216 CASAVA_Build 2 120714497 1I CATCTGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3050 het 3050 ref 29 14 8 7 T 9 10 301217 CASAVA_Build 2 120715773 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACA 2394 het 2394 ref 17 9 6 2 A 8 9 301218 CASAVA_Build 2 120722608 7I ACCCTGTCTA -------/GCCCTCT GGACCCCACT 3070 hom 89 het 35 0 28 7 GCCCTCT 0 1 301219 CASAVA_Build 2 120728728 4D TAATCCTTTT TTTG/---- TTTGTTTTTG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 TTTG 2 1 301220 CASAVA_Build 2 120729977 17I TGTTCCAAGC -----------------/TATGTGATTTTACTGAG TATACGGCAT 3070 hom 84 het 29 0 28 2 TATGTGATTTTACTGAG 0 1 301221 CASAVA_Build 2 120730143 2I TTTCTGAAGT --/TC TGAAATCTGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TC 0 1 301222 CASAVA_Build 2 120730385 3D AATGAATATG ATA/--- ATGATCAAGA 3070 het 3070 hom 48 18 26 5 ATA 1 0 301223 CASAVA_Build 2 120731154 1I AGGAACATCT -/G GAATTTTTTT 3070 hom 93 het 41 0 31 10 G 1 2 301224 CASAVA_Build 2 120731558 1D ATGATCCTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 10 9 301225 CASAVA_Build 2 120738602 1D CCTGTCCCAC A/- ACTGTAGTTG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 2 1 301226 CASAVA_Build 2 120738993 4I TTCCTTTGTA ----/ATAC AGGCTGAATA 3070 het 3070 ref 53 24 21 8 ATAC 0 1 301227 CASAVA_Build 2 120739819 6D AGAGATGCTA TAGAAG/------ TAGAAGTAGA 3070 hom 79 het 33 0 27 7 TAGAAG 3 2 301228 CASAVA_Build 2 120741450 1D ACATGGAAAG T/- TGAGTCATAA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 2 1 301229 CASAVA_Build 2 120742366 1I TTCCTGTAGC -/A ATAGTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 1 2 301230 CASAVA_Build 2 120742984 1I AAACAAACAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 301231 CASAVA_Build 2 120744662 1I GGTTAAAATC -/G GGTTAGTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 2 3 301232 CASAVA_Build 2 120747220 1I CAGTCTCCCT -/A AAAGGCTCAG 3070 hom 69 het 31 0 22 9 A 3 4 301233 CASAVA_Build 2 120750178 1D TGCTAAAAAT G/- GGGGAGGTGG 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 G 5 4 301234 CASAVA_Build 2 120751373 2D22M4I15M2D CATGTGAGAT TGTGTGTGGTGTGAGCATGTGAAC----ATGTGTGTGAGAGCATG/--TCTGTGGTGTGAGCATGTGAACATGTATGTGTGTGAGAGCA-- TGTGTGGTGG 3070 het 3070 hom 62 36 33 8 N/A 0 0 301235 CASAVA_Build 2 120751558 2I26M3D GCATGTGAAC --GTTAGAGCGTATGTGAGTGTGTAGTTGTG/ATGTTAGAGCGTATGTGAGTGTGTAGTT--- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 10 19 36 N/A 0 0 301236 CASAVA_Build 2 120751701 3D26M2I3M4D AATTTGAAAG TGTTGTGAGAGCGTTGTGAACGTGTTATG--AGTGAAA/---TGTGAGAGCGTTGTGAACGTGTTATGAAAGT---- GTGTGTATGT 3070 het 3070 hom 68 22 33 33 N/A 0 0 301237 CASAVA_Build 2 120751878 2D44M2I TGTGTGAATA TGTGTGTTTGAATGTGAGAACATGAGCATGTGTGAATGTGAGAACA--/--TGTGTTTGAATGTGAGAACATGAGCATGTGTGAATGTGAGAACATG TGAGTGTGAA 3070 het 3070 ref 77 47 30 17 N/A 0 0 301238 CASAVA_Build 2 120752083 2I ATGTGAGAGC --/GT GTGAGTGTGT 3070 hom 222 het 81 0 73 8 GT 1 2 301239 CASAVA_Build 2 120752395 1D TTTTGGTGAC T/- GGGTGTCCTC 3070 hom 76 het 29 0 24 5 T 1 0 301240 CASAVA_Build 2 120755029 1I TTTGTATTAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 8 9 301241 CASAVA_Build 2 120758450 1D AAGTGTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 12 11 301242 CASAVA_Build 2 120758805 1D AAAAAACCAA C/- CTACGTATTA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 2 1 301243 CASAVA_Build 2 120761027 1I TGCCCTTCCC -/A TTTCTCCTAC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 0 1 301244 CASAVA_Build 2 120763291 1D68M4I CTTCTTTTTG TTTTTTTTTTTGTGTGTGCATAAGTTGGGGACCCTGTTGTGACGTAAAATCCTGGGCTCCTATCCAGAC----/-TTTTTTTTTTGTGTGTGCATAAGTTGGGGACCCTGTTGTGACGTAAAATCCTGGGCTCCTATCCAGACACTT ACTTCTGTAA 3070 het 241 hom 30 3 22 22 N/A 0 0 301245 CASAVA_Build 2 120764046 1D TGCTTAATGT G/- TTCTTTTGGG 3070 het 3070 ref 40 22 18 1 G 1 0 301246 CASAVA_Build 2 120779153 1I TGAGTTATTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 A 7 8 301247 CASAVA_Build 2 120781112 22D TCCACTAGCT ACACACACACACACACACACAC/---------------------- ACACACACAC 3070 het 1818 hom 23 9 9 9 AC 19 8 301248 CASAVA_Build 2 120782411 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1835 hom 19 6 10 3 A 9 10 301249 CASAVA_Build 2 120786459 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2606 hom 17 8 8 1 T 11 12 301250 CASAVA_Build 2 120787329 1D TTTTAATATC G/- TAAGTCCCCA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 G 1 0 301251 CASAVA_Build 2 120795076 3I CATAAGGGCC ---/TCT TCTTCTTCTT 3070 het 1742 hom 22 7 9 6 TCT 5 6 301252 CASAVA_Build 2 120800425 1D TTTGAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 2517 het 1109 hom 27 4 9 14 T 15 14 301253 CASAVA_Build 2 120809673 1I CAGTAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 2513 het 2513 ref 43 18 10 15 T 13 14 301254 CASAVA_Build 2 120812016 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1213 het 1213 ref 23 13 4 6 A 12 11 301255 CASAVA_Build 2 120831183 1I GGGTCAGGCA -/G GGGAGGGAGA 2635 het 1922 hom 17 6 8 3 G 3 4 301256 CASAVA_Build 2 120841926 1I TCCTGGGGGT -/G GGGGGGCCCT 1547 het 1547 ref 29 8 11 10 G 6 7 301257 CASAVA_Build 2 120843836 1I AGAATGCTGC -/T GTGAGTATTC 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 0 1 301258 CASAVA_Build 2 120844407 8D TTTATCTGTT TTCTTTTG/-------- TTCTTTTGTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 4 TTCTTTTG 2 1 301259 CASAVA_Build 2 120846206 1I CTCCCCGTGT -/G GGGGGAAGCC 2104 het 2104 ref 37 15 8 14 G 5 6 301260 CASAVA_Build 2 120925977 3D GGAAGATGGG GAA/--- GAAGGGAAGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 GAA 2 1 301261 CASAVA_Build 2 120932171 1D CCTCAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 A 11 10 301262 CASAVA_Build 2 120936940 2D19M1I AGACAGGAAC TGAACCCCCAGAAGCTCAATG-/--AACCCCCAGAAGCTCAATGC CCCCCAGCTG 3070 hom 60 het 20 0 20 5 N/A 0 0 301263 CASAVA_Build 2 120941491 1I CTCTGTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1630 hom 26 7 15 4 A 12 13 301264 CASAVA_Build 2 120953443 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1346 het 803 hom 11 2 6 3 A 12 13 301265 CASAVA_Build 2 120954792 2I GTGTGTGTAT --/GA GTGTGTGTGT 3070 hom 61 het 70 1 49 20 GA 0 1 301266 CASAVA_Build 2 120955042 2D GAGAGTGAGA GT/-- GTGTGTGAGT 3070 het 3070 ref 65 36 24 6 GT 4 3 301267 CASAVA_Build 2 120955110 2I GAGTGTCTGA --/GT GTGTGTGTGA 3070 het 3070 hom 72 26 35 11 GT 4 5 301268 CASAVA_Build 2 120961954 5D GTAAACAAAT GCCTG/----- GCCTGCCTGA 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 GCCTG 2 1 301269 CASAVA_Build 2 120969248 1D TGACAACCCT C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 C 9 8 301270 CASAVA_Build 2 120985585 2I CACTGAAAGA --/GG GGGCAAGGGA 3070 hom 63 het 24 0 20 4 G 3 5 301271 CASAVA_Build 2 120987241 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 24 1 19 4 A 14 15 301272 CASAVA_Build 2 120994986 1I ATGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 13 14 301273 CASAVA_Build 2 121022527 5D TCAAAAAAAA AAACC/----- AAAAAACAAA 418 het 418 ref 15 5 2 9 AAACC 1 0 301274 CASAVA_Build 2 121026495 3I CTGGATGATT ---/GAA GGAGGAGATC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 GAA 0 1 301275 CASAVA_Build 2 121069982 1I TGGAAGAGGT -/G GGGGAAGGGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 G 4 5 301276 CASAVA_Build 2 121073112 3D CTAGTCTCTC CTT/--- CTTGCTTTAT 3070 hom 96 het 39 0 30 9 CTT 2 1 301277 CASAVA_Build 2 121080587 1I ACCTGCCTAT -/G GCCACACGGC 3070 hom 65 het 26 0 20 6 G 1 2 301278 CASAVA_Build 2 121110402 1I ATCCCTATCA -/G GCCCCAGACA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 G 1 2 301279 CASAVA_Build 2 121132302 2I AAGCCAGGCT --/CC ATGTGAGAAG 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 C 0 2 301280 CASAVA_Build 2 121141080 4D TCTTTTCTTA GTTT/---- ATCTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 GTTT 1 0 301281 CASAVA_Build 2 121141679 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2006 het 240 hom 9 2 6 1 T 15 14 301282 CASAVA_Build 2 121148905 28I TAATTCATGG ----------------------------/GCAGCACGAGGGGTGCACTTTGAGCCCA AATTCTGGAA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 GCAGCACGAGGGGTGCACTTTGAGCCCA 0 1 301283 CASAVA_Build 2 121152365 4D AAAAGTGAAA AAAG/---- AAAGAGAAGG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AAAG 2 1 301284 CASAVA_Build 2 121152737 2D AAATAAGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1911 hom 21 7 8 7 A 13 11 301285 CASAVA_Build 2 121157412 1I GCCCTGCCTT -/G GGGCTCTTGG 3070 het 3018 hom 27 11 9 7 G 3 4 301286 CASAVA_Build 2 121159665 3D CACCCAGAGT AGG/--- GCCTGGCCCA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 AGG 1 0 301287 CASAVA_Build 2 121165276 3D TAAGGGTGAT AAG/--- AAAAGTCATG 3070 het 3070 ref 47 22 21 5 AAG 1 0 301288 CASAVA_Build 2 121174571 1D CTGGCCAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 71 het 29 0 23 6 A 9 8 301289 CASAVA_Build 2 121184477 3I AAAAGGGCAG ---/GAA GAAGATGGTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 GAA 1 2 301290 CASAVA_Build 2 121184801 1I CATGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 2681 hom 15 het 7 0 6 1 C 3 4 301291 CASAVA_Build 2 121193573 1D TAAGACTGCT G/- GCTGACCCGA 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 G 2 1 301292 CASAVA_Build 2 121199526 1I ATTTTCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 10 11 8 T 10 11 301293 CASAVA_Build 2 121204935 1I GTGGGCACGG -/T GGGGGGGGGT 1761 het 45 hom 13 1 9 3 T 0 1 301294 CASAVA_Build 2 121226316 7D CTATCTTTAA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1586 het 1116 hom 20 6 5 9 T 19 12 301295 CASAVA_Build 2 121243892 1D GTGCATGGGC T/- TTAAGTGTGT 3070 het 3070 ref 61 29 24 8 T 3 2 301296 CASAVA_Build 2 121245589 1D GACAGAAGAT G/- TTTCTGTTGA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 G 1 0 301297 CASAVA_Build 2 121252696 1D TCTGTGCCCA G/- GGGGTATACA 3070 het 3070 ref 36 19 12 6 G 5 4 301298 CASAVA_Build 2 121277416 2I GGGCACAGAG --/GT GGCCTTGTGT 3070 het 3070 hom 58 24 29 5 GT 0 1 301299 CASAVA_Build 2 121281200 1I CTTGGGCAAG -/C CCCCTGGGGA 3070 hom 95 het 36 0 28 8 C 4 5 301300 CASAVA_Build 2 121290695 1I CTCCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 14 0 9 5 A 10 11 301301 CASAVA_Build 2 121293018 2D GCTGGGAAAC AT/-- ATCATTTTGT 3070 hom 55 het 23 0 19 4 AT 2 1 301302 CASAVA_Build 2 121297126 1D ACCCCCTGCA C/- CCCCCGCCAC 3070 hom 50 het 18 0 12 6 C 6 5 301303 CASAVA_Build 2 121303146 4I CACGCACCTG ----/CACC CACCCATGCA 3070 hom 116 het 46 0 35 11 CACC 1 2 301304 CASAVA_Build 2 121355884 1I TAGAGGGCAA -/G GACAGGTGGG 209 hom 3 het 6 0 1 5 G 1 2 301305 CASAVA_Build 2 121355914 1D GTGGGAAGGA G/- GGGCAGGTGG 3070 hom 18 het 13 0 7 6 G 4 3 301306 CASAVA_Build 2 121364489 6D ACACATTCAC ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 126 het 51 0 43 12 AT 9 6 301307 CASAVA_Build 2 121368748 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 26 0 22 4 T 14 12 301308 CASAVA_Build 2 121393891 3I GACCCTGGAG ---/TGT CGGCCAATTG 3070 hom 102 het 38 0 28 10 TGT 0 1 301309 CASAVA_Build 2 121394762 1I CAAATGTGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 20 0 16 4 T 9 10 301310 CASAVA_Build 2 121397115 2D ACACATATGG CA/-- CACACACACA 1178 het 1178 ref 69 57 4 9 CA 7 6 301311 CASAVA_Build 2 121397299 2I26M37D CACACAACAG --CACACACATACACAGCAACATACATGTACAACACACACATACACAGCAATGCATATGTACACA/CACACACACATACACAGCAACATACATG------------------------------------- TACAACACAC 3070 het 65 hom 62 1 70 17 N/A 0 0 301312 CASAVA_Build 2 121412998 1I TTTAAAAAAA -/C AAATTGGTCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 0 1 301313 CASAVA_Build 2 121457080 2D ACCAGGACTC TT/-- TGAGACCTAG 3070 hom 90 het 35 0 30 7 T 3 1 301314 CASAVA_Build 2 121470425 4I TGTCTCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 102 het 41 0 32 9 AAAC 3 4 301315 CASAVA_Build 2 121471172 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 6 7 301316 CASAVA_Build 2 121478128 1D TCTTTATAGA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 7 301317 CASAVA_Build 2 121497342 1I TACAAAAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 9 10 301318 CASAVA_Build 2 121509035 4I TCAGGGTCTG ----/TGTC TGGGTAGGGT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 TGTC 0 1 301319 CASAVA_Build 2 121509275 3D GTTGTTGTTT TTG/--- TTGTTGGTTT 3070 hom 138 het 52 0 47 6 TTG 3 2 301320 CASAVA_Build 2 121511536 1D CTATTGATTT C/- TTGTTAGGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 0 301321 CASAVA_Build 2 121517751 1D GTCTGTGGTA T/- TTGTTACAGC 3070 hom 122 het 43 0 38 5 T 3 2 301322 CASAVA_Build 2 121520500 1I GCACGATTTT -/C CAACAAGCCA 3070 hom 169 het 58 0 57 1 C 1 2 301323 CASAVA_Build 2 121540005 1D CAATGTATGA G/- GCTTCGAGGA 3070 hom 83 het 34 0 27 7 G 2 1 301324 CASAVA_Build 2 121567099 1D GGGAACCCCT A/- AAACTTGTAA 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 A 4 3 301325 CASAVA_Build 2 121573008 2I GACTCTATTC --/AA AGAGGCTTTC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 1 3 301326 CASAVA_Build 2 121593954 2D GTGGAAAGAC AG/-- AGAGTGGAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 AG 3 2 301327 CASAVA_Build 2 121612796 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TA 8 6 301328 CASAVA_Build 2 121618587 3I CACACATGTT ---/AAG GAGGGCAACC 3070 het 3070 ref 60 27 23 10 AAG 0 1 301329 CASAVA_Build 2 121638900 1D ATTAAAAAAG T/- TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 25 13 10 3 T 7 6 301330 CASAVA_Build 2 121639782 1I AAAATGGTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 420 hom 35 1 28 6 T 9 10 301331 CASAVA_Build 2 121643255 2D CATGGTGAAA CT/-- CTGTCTCTAC 3070 het 2100 hom 17 5 11 1 CT 2 1 301332 CASAVA_Build 2 121650720 1I ACTCAGAAAA -/T TATAGCTATT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 T 1 2 301333 CASAVA_Build 2 121651145 4I TCAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 43 het 44 1 36 7 AAAG 2 3 301334 CASAVA_Build 2 121652292 1D CTGAATTATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 10 9 301335 CASAVA_Build 2 121660864 20D TATGAAGGGC ATTTATTTATTTATTTATTT/-------------------- ATTTATTTAT 3070 hom 54 het 30 0 19 11 ATTT 10 5 301336 CASAVA_Build 2 121662810 2I GTTTTTGAAG --/AC AGTCTCGTGT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 AC 0 1 301337 CASAVA_Build 2 121668600 1D AGTAAGGCAT A/- AGTGGCCTGG 3070 hom 85 het 30 0 27 3 A 2 1 301338 CASAVA_Build 2 121676457 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1885 het 221 hom 13 1 7 5 A 17 16 301339 CASAVA_Build 2 121680217 2I CAATTGGTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 19 1 13 5 A 11 13 301340 CASAVA_Build 2 121695691 3I CTAAAAGTAT ---/ACA AGTTCTTAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ACA 0 1 301341 CASAVA_Build 2 121696005 1D CAGAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 32 1 23 8 A 11 10 301342 CASAVA_Build 2 121696876 1D CCCCGCTTCT C/- CTCTAAAGAA 3070 hom 123 het 43 0 42 3 C 2 1 301343 CASAVA_Build 2 121697328 4D AATTTCCCGA TAGT/---- TAGGCCATTA 3070 hom 117 het 42 0 39 4 TAGT 1 0 301344 CASAVA_Build 2 121702503 1D AATAGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 1383 het 1383 ref 34 22 5 7 A 15 14 301345 CASAVA_Build 2 121711202 2I TTCTGTCTGA --/GG GGGCCCATCA 3070 hom 101 het 36 0 30 6 G 3 5 301346 CASAVA_Build 2 121749300 15D CATGGCGGCG GGCGCCTGTAGTCGC/--------------- GGCGCCTGTA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 GGCGCCTGTAGTCGC 1 0 301347 CASAVA_Build 2 121766956 1D TGTGTATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 37 0 28 9 T 11 10 301348 CASAVA_Build 2 121778556 1I TCTTTTTTTT -/C TTTTTTTTTC 3070 het 1978 hom 37 12 20 5 C 0 1 301349 CASAVA_Build 2 121790167 1D GAGCAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 1338 het 1338 ref 25 11 3 12 A 12 11 301350 CASAVA_Build 2 121795279 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1918 het 1410 hom 35 13 8 16 T 16 14 301351 CASAVA_Build 2 121806670 1I CAGAGGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 10 11 301352 CASAVA_Build 2 121811990 1D CATGAAAAAG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 19 het 19 0 12 7 C 11 10 301353 CASAVA_Build 2 121836437 1D GAGTTTTTGC T/- GAGTGTGCAC 3070 het 3070 ref 39 18 12 10 T 1 0 301354 CASAVA_Build 2 121933198 1I AGTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 11 12 301355 CASAVA_Build 2 121970633 1I AAAGCTGGTT -/C CGGTGAAACA 3070 het 3070 hom 60 27 30 3 C 1 2 301356 CASAVA_Build 2 122012299 1I GTCTCTAATC -/A AAATACAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 3 4 301357 CASAVA_Build 2 122027573 1I CATGGTGAAA -/C CCTGTCTCCA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 C 2 3 301358 CASAVA_Build 2 122087676 1D CTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 41 0 32 11 A 12 11 301359 CASAVA_Build 2 122116164 1D TACATATAAT A/- AAAAAAAAAA 955 het 955 ref 19 14 3 2 A 11 10 301360 CASAVA_Build 2 122142876 1D ACTATTTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 32 0 24 8 A 10 9 301361 CASAVA_Build 2 122184045 1I GGCCTTGTTG -/C CACTGGCAGG 3070 hom 71 het 29 0 25 4 C 1 2 301362 CASAVA_Build 2 122199263 1I ATCCCAGCAC -/T TTTAGGAGGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 3 4 301363 CASAVA_Build 2 122268838 1D AGGTGATGAT G/- GGGGGGGGGG 2880 hom 21 het 22 0 9 13 G 11 10 301364 CASAVA_Build 2 122282765 1D TTTGGGTCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 9 8 301365 CASAVA_Build 2 122289463 1D TCGCAAGTCT G/- GGCTGCTTCT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 G 3 2 301366 CASAVA_Build 2 122301997 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2289 het 1816 hom 17 8 8 1 A 13 14 301367 CASAVA_Build 2 122304798 1I GACTTAATCA -/T TTTTTTACCA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 6 7 301368 CASAVA_Build 2 122307749 1I CAAATGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 268 hom 35 1 27 8 T 12 13 301369 CASAVA_Build 2 122325257 1D CAACGAAACC T/- TTTTTTTTTT 2348 het 2348 ref 33 16 8 9 T 15 14 301370 CASAVA_Build 2 122330418 1D TGGCTTTATG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 7 6 301371 CASAVA_Build 2 122338816 2D AAGCCTTTCA CT/-- CTCTATCAAA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 CT 3 2 301372 CASAVA_Build 2 122340226 54D TTCAGTGTGA GCATAAGCATTGTGTTTTCTCGACCAGAGAAATCTATGTTAAAGGCTTGCTTCT/------------------------------------------------------ AATTGTGGAA 3070 het 3070 ref 52 37 22 7 GCATAAGCATTGTGTTTTCTCGACCAGAGAAATCTATGTTAAAGGCTTGCTTCT 1 0 301373 CASAVA_Build 2 122343335 1I AACAAGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 14 12 A 10 11 301374 CASAVA_Build 2 122348315 1D GAATAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 18 15 4 T 11 10 301375 CASAVA_Build 2 122350174 1I GAAAGATATG -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 7 8 301376 CASAVA_Build 2 122352534 1D TGTAGATTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 41 14 21 7 T 9 8 301377 CASAVA_Build 2 122354253 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2228 het 1403 hom 15 4 9 2 A 12 13 301378 CASAVA_Build 2 122361983 1D AGTTATTGGT G/- GGGGGGGTCG 1284 het 1101 hom 19 7 4 8 G 8 7 301379 CASAVA_Build 2 122371972 1D AAAGAATTTT G/- GGGGGGGGAC 3070 het 2433 hom 50 10 24 16 G 9 8 301380 CASAVA_Build 2 122397049 1I ATCCTTAAAT -/G ACTCAATCAC 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 G 0 1 301381 CASAVA_Build 2 122415293 11D GACCTTCTAG CCTACTGTCTT/----------- CTTAAAGAGG 3070 het 3070 ref 51 26 25 6 CCTACTGTCTT 1 0 301382 CASAVA_Build 2 122421627 1I TCTGTTTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 T 9 10 301383 CASAVA_Build 2 122430343 1I CTCCCGTGAG -/T TGGGGGGCAG 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 1 2 301384 CASAVA_Build 2 122440441 1D CACACAGGGT G/- GTTGACTTGG 3070 het 3070 hom 35 11 15 11 G 2 1 301385 CASAVA_Build 2 122530246 1D ACCTCTCAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 71 het 31 0 24 7 A 10 9 301386 CASAVA_Build 2 122537406 8D CATTTCATCG ACTCTAGT/-------- ACTCTAGTGC 3070 het 3070 ref 47 24 17 7 ACTCTAGT 2 1 301387 CASAVA_Build 2 122541028 2I AATGAATTCC --/AA AAAAAAAAAA 3032 het 3032 ref 39 17 10 12 A 14 16 301388 CASAVA_Build 2 122566389 1D CCTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 12 11 301389 CASAVA_Build 2 122585270 1I CCATTGGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1677 hom 36 7 15 14 T 15 16 301390 CASAVA_Build 2 122595635 4I AGGTGTGAAG ----/CTGA CTTGATCGTG 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 CTGA 0 1 301391 CASAVA_Build 2 122599230 4D GGTATGGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 60 16 28 16 AAAC 5 4 301392 CASAVA_Build 2 122601875 1I CTCATGTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 10 11 301393 CASAVA_Build 2 122614944 2D CTCTTCTTCT TC/-- TTTTTTTTTT 2576 het 2576 ref 28 10 10 8 TC 1 0 301394 CASAVA_Build 2 122623979 2D TTTTTCACTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 8 T 12 10 301395 CASAVA_Build 2 122626862 2I GATTGGAGAC --/AT GTGCTCAGGT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 AT 0 1 301396 CASAVA_Build 2 122630933 1D AAGATAGAGC A/- AAAATCGGTA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 5 4 301397 CASAVA_Build 2 122631876 3D AAGAAAAGAA AAG/--- AAAATGTGTG 3070 het 3070 ref 30 16 14 1 AAG 1 0 301398 CASAVA_Build 2 122654705 2D CAGGAGAAGA TG/-- TGAATGACCC 3070 hom 126 het 47 0 41 7 TG 2 1 301399 CASAVA_Build 2 122659352 3I TGCTTGGGGT ---/AGG AGGAGAACGC 3070 hom 125 het 43 0 40 3 AGG 1 2 301400 CASAVA_Build 2 122714561 1D ACACCTTGCT G/- GGCGCCTCAG 3070 hom 87 het 35 0 28 7 G 3 2 301401 CASAVA_Build 2 122718404 1I CACATGCACC -/A GGGGGATGGG 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 0 1 301402 CASAVA_Build 2 122733838 1D TTAACAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 11 13 A 12 11 301403 CASAVA_Build 2 122756875 1D TGTTTCCCCG T/- CAGAGATTCT 2846 het 2846 ref 15 8 6 1 T 1 0 301404 CASAVA_Build 2 122794822 1D ACTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 94 hom 16 1 12 3 T 10 9 301405 CASAVA_Build 2 122806506 1I TGGTTGGAAA -/C CACTCCATCA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 C 1 2 301406 CASAVA_Build 2 122809666 1D CCCTGGTCCA C/- CATTGCTTAT 3070 hom 120 het 47 0 38 9 C 2 1 301407 CASAVA_Build 2 122830916 1I AATCCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 10 301408 CASAVA_Build 2 122855684 3D GTTTGTTGGT TAA/--- TCTTGTGCAT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 TAA 1 0 301409 CASAVA_Build 2 122858866 1I CTTTTCAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 T 9 10 301410 CASAVA_Build 2 122860625 1D GAAGGTTAAA G/- GCAGGATAGA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 2 1 301411 CASAVA_Build 2 122866822 1D ATAAAATAAT A/- AAAAAAAATC 2616 hom 15 het 9 0 6 3 A 9 8 301412 CASAVA_Build 2 122867109 1D GCAAACTCGG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 66 hom 44 1 38 5 T 8 7 301413 CASAVA_Build 2 122875442 1D TGAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1487 het 1487 ref 30 19 4 7 T 13 12 301414 CASAVA_Build 2 122878536 4I AATATGTTTA ----/AATT AATCTGACTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AATT 0 1 301415 CASAVA_Build 2 122887681 10D CTTCTCACCT GAAGAATGGG/---------- GAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 44 23 15 12 GAAGAATGGG 1 0 301416 CASAVA_Build 2 122891611 6D CCACTTGGGT TCTGAC/------ TCCAGAAAAC 3070 het 3070 hom 45 19 23 5 TCTGAC 1 0 301417 CASAVA_Build 2 122893503 10I CCTGCATTCT ----------/TTGACTCAAG GATGTACTCA 3070 het 3070 ref 55 29 23 3 TTGACTCAAG 0 1 301418 CASAVA_Build 2 122895032 4I CTATGTATAT ----/ATAC ATACATACAT 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 ATAC 2 3 301419 CASAVA_Build 2 122896428 4D29M4I TTAATCATCT TTTATTTGATTTCCACCATGTTAGATATGTCCC----/----TTTGATTTCCACCATGTTAGATATGTCCCACTT ACTTTTTTGA 3070 het 1882 hom 31 7 17 17 N/A 0 0 301420 CASAVA_Build 2 122908091 4I AGATTTTGTG ----/TAAA TATTTTCACT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 TAAA 0 1 301421 CASAVA_Build 2 122920589 1I TCTCCTTCAG -/T TTTTCATTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 4 5 301422 CASAVA_Build 2 122921087 1D CAAAACTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 35 2 25 8 T 15 14 301423 CASAVA_Build 2 122921828 1D TAGAAAAAAA T/- AACAAAATGG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 1 0 301424 CASAVA_Build 2 122924261 2D CTGAAACATG AT/-- CAGACCACAC 3070 het 3070 hom 53 18 27 8 AT 1 0 301425 CASAVA_Build 2 122925298 9I TTCTTAAGTG ---------/CCACCTACT CCACCTACTG 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 CCACCTACT 1 2 301426 CASAVA_Build 2 122925542 1I TAGCAAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 26 17 11 A 11 12 301427 CASAVA_Build 2 122926234 1I GGTCAATGCC -/A AAAAAAAAAA 2144 het 2144 ref 30 22 5 3 A 11 12 301428 CASAVA_Build 2 122932228 1D CACTTATAAA T/- TGGGAGCTAA 3070 hom 132 het 49 0 43 6 T 2 1 301429 CASAVA_Build 2 122932333 15D AAAAACTATC GTTCAAACCTCAGAA/--------------- GTTCAAACCT 3070 het 3070 ref 34 24 13 6 GTTCAAACCTCAGAA 1 0 301430 CASAVA_Build 2 122934475 3I TAAAAAAAAA ---/AAC AAACAAAATC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AAC 0 1 301431 CASAVA_Build 2 122963849 9D CCACGTTTTT CTCTATGAA/--------- CTGCTGGGGG 3070 hom 160 het 59 0 54 8 CTCTATGAA 1 0 301432 CASAVA_Build 2 122965115 3I CCTCTGTCAG ---/TTC TTCTTCTCCA 3070 hom 132 het 53 0 44 9 TTC 2 3 301433 CASAVA_Build 2 122969741 4D GGAAATGAAA TTAC/---- TTTCTTAATT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 TTAC 1 0 301434 CASAVA_Build 2 122971238 1I TGATTTGAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 8 9 301435 CASAVA_Build 2 122971594 1D GTGATTGGTT A/- AAAAAATTAC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 A 7 6 301436 CASAVA_Build 2 122972310 1D CCAAAAAAGT A/- TTGTTTAAAT 3070 hom 68 het 24 0 23 1 A 1 0 301437 CASAVA_Build 2 122976047 1D TAGTTTGATC T/- TTTTTTTTTC 1358 het 1358 ref 36 30 3 3 T 10 9 301438 CASAVA_Build 2 122986298 1I AAGAGAGGCA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 120 het 51 0 41 10 T 7 8 301439 CASAVA_Build 2 123012092 1D GTTCATTGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 10 9 301440 CASAVA_Build 2 123025361 1D5M5I GACTTAAATG AACCCT-----/-TCCCTGTCTG ACAGCTTGGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 N/A 0 0 301441 CASAVA_Build 2 123030201 1I AAAAGTCAGG -/A AACAACAGGT 2479 hom 12 het 5 0 5 0 A 2 3 301442 CASAVA_Build 2 123033918 1I TGGATGAGTA -/T TAAGCCTTAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 1 2 301443 CASAVA_Build 2 123034877 10I GTCCGTGATC ----------/TCTGGCTCCT ATGGCTATGC 3070 hom 138 het 49 0 46 4 TCTGGCTCCT 0 1 301444 CASAVA_Build 2 123037136 1I AAAAAGTCGG -/A AAGGATGAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 3 301445 CASAVA_Build 2 123038253 14I GCTTCTCAAC --------------/CTTCCATGTCCAAA TTTACTCTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CTTCCATGTCCAAA 0 1 301446 CASAVA_Build 2 123054152 2I ATTAATAGAC --/TT ATTCTCAGAA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 0 2 301447 CASAVA_Build 2 123056538 1I AGCAACATAG -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 73 het 34 0 25 9 A 7 8 301448 CASAVA_Build 2 123057464 4D AGGAAGGAAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 hom 52 het 24 0 15 9 GAAA 4 3 301449 CASAVA_Build 2 123057549 4I GAAAGAAAAA ----/AAGG AAGGAAGGAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AAGG 3 4 301450 CASAVA_Build 2 123063021 12D TGCTAGGTTT CAGACTTGCTTG/------------ CAACCTGTTA 3070 hom 99 het 34 0 33 6 CAGACTTGCTTG 1 0 301451 CASAVA_Build 2 123073611 2D TGGGGAGGGT CA/-- CAGAGACCTT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 CA 2 1 301452 CASAVA_Build 2 123073940 1I CCTAAACCAT -/A AAGTTTTGTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 3 301453 CASAVA_Build 2 123077655 1I CCACATTTGC -/A AATGAGTTGC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 2 3 301454 CASAVA_Build 2 123078087 3D ACTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 244 hom 31 2 14 17 T 17 14 301455 CASAVA_Build 2 123087926 2D11M2I AAAGAAGAAC AGAATGTTATAAC--/--AATGTTATAACAG TGTTAACTAT 3070 hom 99 het 34 0 34 4 N/A 0 0 301456 CASAVA_Build 2 123090094 1I TTTTCTGTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 8 9 301457 CASAVA_Build 2 123091684 1I TGATTATAAT -/G TTTTTTAATG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 0 1 301458 CASAVA_Build 2 123112312 1I GGCCAGTTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 8 9 301459 CASAVA_Build 2 123128724 1I TTGTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 10 11 301460 CASAVA_Build 2 123139177 1I GAGGCAGACA -/T TCCCAACTCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 1 2 301461 CASAVA_Build 2 123139970 1I AGAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 864 hom 40 2 34 4 A 10 11 301462 CASAVA_Build 2 123148231 3D CCCAATGGGC GCT/--- CGAGCCCTGG 3070 hom 111 het 42 0 37 5 GCT 1 0 301463 CASAVA_Build 2 123181629 1I GAATGCCTCC -/A TTTTATTAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 0 1 301464 CASAVA_Build 2 123193561 3D TAGTGAATAA GAG/--- GAGTGTAGGA 3070 hom 45 het 17 0 16 2 GAG 2 1 301465 CASAVA_Build 2 123195110 1D CAACCACCCT G/- GTAGAGGAGG 3070 hom 81 het 33 0 24 10 G 2 1 301466 CASAVA_Build 2 123199352 2I TATATAAAAC --/AT AAAATTCTAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AT 0 1 301467 CASAVA_Build 2 123203843 1D GACAAACACC T/- TGTAATTCAT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 T 2 1 301468 CASAVA_Build 2 123211392 1I AACAAATGTA -/T TTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 6 7 301469 CASAVA_Build 2 123222425 1I TGTGTGATCA -/C CAGATAAAAT 3070 het 3070 ref 54 23 21 10 C 1 2 301470 CASAVA_Build 2 123233857 1D TACTTTTTAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 8 7 301471 CASAVA_Build 2 123243024 45D GTAAGCTGTT ACCAAGGAAACAAAGGTTTGGGGGATAAAGTTCCTTAAACTTTGC/--------------------------------------------- AATTTTCCAG 3070 het 3070 ref 41 31 22 4 ACCAAGGAAACAAAGGTTTGGGGGATAAAGTTCCTTAAACTTTGC 1 0 301472 CASAVA_Build 2 123244026 1D ACAAGATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 T 11 10 301473 CASAVA_Build 2 123247095 1I CAACATCAAC -/A AAAAGAACCC 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 4 5 301474 CASAVA_Build 2 123250674 16I AATATTGTGA ----------------/AAATGGCCTACTGCCC AAAGTATAAG 3070 het 3070 ref 37 26 9 2 AAATGGCCTACTGCCC 0 1 301475 CASAVA_Build 2 123252611 1I CCAATTTGAA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 7 8 301476 CASAVA_Build 2 123253329 1I TTAATAAATG -/A ACGGTTCTTC 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 1 2 301477 CASAVA_Build 2 123255659 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 14 0 10 4 T 10 11 301478 CASAVA_Build 2 123279914 1I AAAAATAGCC -/G GGGGGGGGCG 2867 hom 34 het 15 0 11 4 G 8 9 301479 CASAVA_Build 2 123282657 1I AACCAAGCCC -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 89 het 34 0 28 6 T 7 8 301480 CASAVA_Build 2 123284343 1D GCTAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 13 12 301481 CASAVA_Build 2 123285049 1D ATATCAAGCA C/- CCTTTCAGAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 3 2 301482 CASAVA_Build 2 123287486 1D GCCGTAGTCA C/- CAAAACAGCA 3070 hom 63 het 25 0 22 4 C 2 1 301483 CASAVA_Build 2 123289714 3D GCCTAAACTT ATC/--- AGAAACTGCT 3070 hom 129 het 50 0 44 7 ATC 1 0 301484 CASAVA_Build 2 123290634 3D AATGGACTAT TAA/--- TAAATTATAA 3070 hom 33 het 16 0 12 5 TAA 2 1 301485 CASAVA_Build 2 123292686 1D TCAGTTTCCA C/- CATATGTGCC 3070 hom 153 het 52 0 51 1 C 2 1 301486 CASAVA_Build 2 123297259 2D TCAGAGAGAC AG/-- ACGTTTCAGA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AG 1 0 301487 CASAVA_Build 2 123298066 1I AAGGTGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 40 0 33 7 T 12 13 301488 CASAVA_Build 2 123306219 1I TTGATCTTAG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 9 301489 CASAVA_Build 2 123310328 1I TTATTTCACC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 9 301490 CASAVA_Build 2 123312785 3I CCGGGCTTTA ---/TCT TGCAAAATTG 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TCT 0 1 301491 CASAVA_Build 2 123315202 1I TCCATGTAAC -/A AGAAAACTTC 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 1 2 301492 CASAVA_Build 2 123323128 2I GATTTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 841 hom 45 2 31 12 TG 6 7 301493 CASAVA_Build 2 123343400 12D GAAAGGAAAA GTGTGTGTGGGG/------------ GTGTGTGTGT 3070 hom 66 het 26 0 23 7 GTGTGTGTGGGG 1 0 301494 CASAVA_Build 2 123364134 1D CAAATGCTTG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 8 7 301495 CASAVA_Build 2 123373713 2D CTCATTATAA AT/-- GAGTGTCATG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AT 1 0 301496 CASAVA_Build 2 123383458 8I AACCTTTATA --------/CACTGGAT CACTGGATTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 CACTGGAT 1 2 301497 CASAVA_Build 2 123388523 1D CATTTAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 25 1 18 6 T 15 14 301498 CASAVA_Build 2 123394329 5I TTTTGATATA -----/CTTAT CTTGATATAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTTAT 0 1 301499 CASAVA_Build 2 123402359 8D TTTTTTTTTC TTTTTCTT/-------- TTTTTCTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 6 TTTTTCTT 2 1 301500 CASAVA_Build 2 123419833 5D AGTTTTTCAA TTTTC/----- TTTGCTCAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 TTTTC 1 0 301501 CASAVA_Build 2 123426088 1D TTTATTTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 23 6 T 10 9 301502 CASAVA_Build 2 123426480 1D ATTTCGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 11 10 301503 CASAVA_Build 2 123427309 1I CATTTGTTTG -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 48 het 27 0 17 11 T 7 8 301504 CASAVA_Build 2 123436995 2D TACTCCCATC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 75 hom 48 1 43 5 AT 1 0 301505 CASAVA_Build 2 123441951 3D TTAACAAATA ATT/--- ATTATTAATT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 ATT 3 2 301506 CASAVA_Build 2 123461111 1D TACTGGAGAC A/- GGGGATTGAT 3070 het 733 hom 28 10 16 2 A 1 0 301507 CASAVA_Build 2 123465108 1D ATTTCATGGA G/- GGGGAAAGCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 5 4 301508 CASAVA_Build 2 123467056 1I ATAACACAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 8 9 301509 CASAVA_Build 2 123485180 2D TAGAGCATTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 A 12 10 301510 CASAVA_Build 2 123485414 3I TTAAAAAAAA ---/ATT AAAAATTAAC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 ATT 0 1 301511 CASAVA_Build 2 123485764 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 7 het 25 1 21 3 A 8 9 301512 CASAVA_Build 2 123492439 2I ACATTTTTAT --/AA GAGTTCATAA 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 A 0 2 301513 CASAVA_Build 2 123516970 1I CTAGAAGCTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 8 9 301514 CASAVA_Build 2 123520183 1D GTGTATTATA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 T 8 7 301515 CASAVA_Build 2 123523677 1D GAAAAAAAAA C/- CCCAGGATCT 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 C 4 3 301516 CASAVA_Build 2 123524797 1I TGAGAAAAAC -/A AACTTTCACT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 A 2 3 301517 CASAVA_Build 2 123542648 1D CACTGCAAAA T/- AATTGGTATT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 1 0 301518 CASAVA_Build 2 123543971 1D ATATAGTACC A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 7 6 301519 CASAVA_Build 2 123544859 1I TAGTAGTGAT -/C TTATTATTAA 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 C 0 1 301520 CASAVA_Build 2 123547895 3D GGGTACTCTA AAG/--- AAAGTTTCTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 4 AAG 1 0 301521 CASAVA_Build 2 123548146 1D ACTCCTTAGA G/- GGCCCCACTT 3070 het 2955 hom 21 8 13 2 G 3 2 301522 CASAVA_Build 2 123552194 1D TACATATAGG A/- CCCCTGGGGT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 1 0 301523 CASAVA_Build 2 123553159 3D AATAAATATT TTA/--- TTATTTTGAA 2315 het 2315 ref 19 10 6 3 TTA 2 1 301524 CASAVA_Build 2 123554148 1I AGATTATATG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 7 8 301525 CASAVA_Build 2 123554785 1I TTTAGGGCTG -/T TTTTTTGGTT 3070 hom 65 het 40 0 21 19 T 6 7 301526 CASAVA_Build 2 123556073 1I AATAATATTA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 5 6 301527 CASAVA_Build 2 123557193 1D GTGAAAATAG T/- TTAAATTTGT 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 T 3 2 301528 CASAVA_Build 2 123558740 1D AATAGAAATC A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 A 7 6 301529 CASAVA_Build 2 123560584 1I GCCTTAATAC -/A ACAAATTTCC 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 A 1 2 301530 CASAVA_Build 2 123561558 1I CAACCCCTTT -/A ACTTACAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 301531 CASAVA_Build 2 123562107 1D ACTTTGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 A 12 11 301532 CASAVA_Build 2 123562431 1I CTGAGAAGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 301533 CASAVA_Build 2 123565298 1D TATGCATTAG A/- AAACTAATGT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 4 3 301534 CASAVA_Build 2 123568986 2D AGCAGCTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 188 hom 36 4 14 19 T 13 11 301535 CASAVA_Build 2 123577404 1D CAAGATGCTC T/- TGAGTCGATG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 1 301536 CASAVA_Build 2 123579491 1D GTCTCAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 31 2 23 6 A 12 11 301537 CASAVA_Build 2 123600045 2I TCATATGTCT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 TA 0 1 301538 CASAVA_Build 2 123606556 1I TGTCCCCACT -/G GGCCACTGCC 3070 hom 74 het 29 0 24 5 G 2 3 301539 CASAVA_Build 2 123649820 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1859 het 1859 ref 26 12 7 8 TA 8 7 301540 CASAVA_Build 2 123656957 1D GGAATCTGGA T/- ATTTCTATAC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 1 0 301541 CASAVA_Build 2 123657890 5D AGGAAACTGA AGGAC/----- ATTATGTTAA 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 AGGAC 1 0 301542 CASAVA_Build 2 123657963 7D TCTGTGGATG TTAAAAA/------- TTAAACCACT 3070 het 3070 ref 41 22 18 4 TTAAAAA 1 0 301543 CASAVA_Build 2 123658043 1I GCAGGGGTTG -/C GGGGAGGAAG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 C 0 1 301544 CASAVA_Build 2 123659976 3D AGGATCTCAT CAA/--- CATTTATGAA 3070 het 3070 ref 46 29 13 5 CAA 1 0 301545 CASAVA_Build 2 123664094 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 2766 het 2508 hom 16 7 8 1 A 10 9 301546 CASAVA_Build 2 123672512 1I TTTACAACAG -/T TTTAGAATTA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 3 4 301547 CASAVA_Build 2 123682883 2D ATTGCTTAAA CT/-- CTCTGAGCAT 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 CT 3 2 301548 CASAVA_Build 2 123689276 2I TATTTAACAA --/AG AGAGATATAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AG 2 3 301549 CASAVA_Build 2 123689798 6I AAGGCTTAAA ------/AGTTAG AGTGCCACTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AGTTAG 0 1 301550 CASAVA_Build 2 123695239 1I TATATCTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 9 10 301551 CASAVA_Build 2 123705618 2I GTTAGAATTA --/TT TTTTTTTTTT 1640 het 603 hom 13 6 5 2 T 12 14 301552 CASAVA_Build 2 123724667 1D ATTTAGAAAG C/- CCCATCATCT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 C 4 3 301553 CASAVA_Build 2 123733572 1D TGATTCACGT C/- CCTATTTAGT 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 C 3 2 301554 CASAVA_Build 2 123733684 1I AGAGTCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 T 12 13 301555 CASAVA_Build 2 123740228 1D TATTTCTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 11 10 301556 CASAVA_Build 2 123748592 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAATGATG 2104 het 1748 hom 16 5 8 3 A 6 5 301557 CASAVA_Build 2 123773288 1D CTGGGTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 10 9 301558 CASAVA_Build 2 123775980 1I GAAAATTCTC -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 6 7 301559 CASAVA_Build 2 123779354 1I AAGACGAAGA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 2793 hom 26 8 12 6 T 7 8 301560 CASAVA_Build 2 123779677 1D TAATTTCATT A/- AAAAAGTTAT 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 A 6 5 301561 CASAVA_Build 2 123786958 4I GCTAGACCTC ----/TCTT TCTCACCATA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TCTT 0 1 301562 CASAVA_Build 2 123794460 1D ATAAATTGTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 8 7 301563 CASAVA_Build 2 123795699 1I TATTATATAT -/G TTTTTTTTTT 2751 het 2751 ref 41 25 8 8 G 0 1 301564 CASAVA_Build 2 123800645 1I AAGATTCAAA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 T 5 6 301565 CASAVA_Build 2 123803908 1D TGAAAAAGAA G/- ACTTTTTACT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 G 1 0 301566 CASAVA_Build 2 123805120 1D AACGGGAGAA C/- TGTGTGTGAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 C 1 0 301567 CASAVA_Build 2 123807008 1D CTTCGGTCTG A/- CACACAGAGC 3070 het 3070 hom 42 16 13 13 A 1 0 301568 CASAVA_Build 2 123810398 1D ATTAAATGTG A/- AAAGGAAAGA 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 A 4 3 301569 CASAVA_Build 2 123815114 4D AGAAAGAGAA AAGG/---- AAGGAAGGGA 1379 het 1379 ref 22 7 5 11 AAGG 3 2 301570 CASAVA_Build 2 123819206 4I ACATAAAGTT ----/TGTC TGTGATAAAT 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 TGTC 0 1 301571 CASAVA_Build 2 123820828 3I GAATTACCAT ---/ATA ATAAGTTCTG 3070 het 3070 ref 54 28 20 6 ATA 1 2 301572 CASAVA_Build 2 123823734 1I GCACAAACAC -/A AAATCACAAA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 3 4 301573 CASAVA_Build 2 123826967 1D GGCATTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 11 10 301574 CASAVA_Build 2 123829042 1D CATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 10 9 301575 CASAVA_Build 2 123836182 2I ATTCACTGAG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 T 8 10 301576 CASAVA_Build 2 123840342 1I GAAGAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 9 10 301577 CASAVA_Build 2 123852577 1D TAATAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 15 14 301578 CASAVA_Build 2 123870652 4I ATATATACAC ----/ACAT ACACACACAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ACAT 0 1 301579 CASAVA_Build 2 123873980 1D GGGATTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 10 9 301580 CASAVA_Build 2 123878619 1I ATTCTTTTTA -/T TTTTTTCAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 7 301581 CASAVA_Build 2 123880620 4I TTCCAATGAT ----/CAAA CAGAGAACTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CAAA 0 1 301582 CASAVA_Build 2 123882400 2D CAAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AT 8 7 301583 CASAVA_Build 2 123885030 2D ATATCCCCGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 45 1 21 23 T 16 14 301584 CASAVA_Build 2 123889394 1D ACACACACAC A/- AAAACATTCA 3070 het 488 hom 30 3 9 18 A 5 4 301585 CASAVA_Build 2 123890113 1D TATATGACAG T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 6 301586 CASAVA_Build 2 123891053 4I CCCATGATAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAAC 3 4 301587 CASAVA_Build 2 123897814 1I AAAACCCTTT -/A AAAAATCAAT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 5 6 301588 CASAVA_Build 2 123901217 1I TATGCAATGT -/A AAAGGCTAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 4 301589 CASAVA_Build 2 123904561 1D ATCATACATA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 7 6 301590 CASAVA_Build 2 123910952 1D GAAGACAATT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 8 301591 CASAVA_Build 2 123914122 1I TAAATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 811 hom 16 2 10 4 T 10 11 301592 CASAVA_Build 2 123916595 1I TGGTCACTTG -/T TTTTGCCTCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 4 5 301593 CASAVA_Build 2 123920252 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAACTTG 394 het 394 ref 26 15 4 8 A 7 6 301594 CASAVA_Build 2 123923796 1I TTGTCAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1162 hom 31 3 19 9 T 12 13 301595 CASAVA_Build 2 123924633 1D ACAGTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 31 1 26 4 T 13 12 301596 CASAVA_Build 2 123930852 3D ACAGAAGTAA AGT/--- AGATGTATCA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 AGT 1 0 301597 CASAVA_Build 2 123930954 1D TACTTTTTTA G/- TTTTTTTCTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 1 0 301598 CASAVA_Build 2 123932396 1D CTGTATCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 23 1 18 4 A 12 11 301599 CASAVA_Build 2 123941393 1D TACTGTGAGA G/- GATTTGACCT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 2 1 301600 CASAVA_Build 2 123941480 2D GTTTTAGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 28 3 18 8 T 16 14 301601 CASAVA_Build 2 123951904 4D CTTTTCATAT TGAG/---- TAATTAATTT 3070 hom 83 het 32 0 28 6 TGAG 1 0 301602 CASAVA_Build 2 123955937 1D TTTTTACTTG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 9 8 301603 CASAVA_Build 2 123956853 3D TATGACATAT AAC/--- ATTTATATAC 3070 hom 90 het 33 0 31 4 AAC 1 0 301604 CASAVA_Build 2 123957477 3D TATGAAGGAG TTC/--- TTCTTTTTTT 2884 hom 38 het 19 0 16 3 TTC 2 1 301605 CASAVA_Build 2 123962832 2I CACTGGAGAC --/TT GACATTAACT 3070 hom 91 het 35 0 31 4 T 0 2 301606 CASAVA_Build 2 123962991 3I TATTTATCTA ---/TTT TTTTTTAAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 6 9 301607 CASAVA_Build 2 123964262 13D GCTATAAAGC CTGTATAAAGAGG/------------- CTGTATAAAG 3070 hom 88 het 29 0 29 4 CTGTATAAAGAGG 2 1 301608 CASAVA_Build 2 123964982 1D AAGGCTAAAC A/- TCTTATTTTA 3070 hom 104 het 39 0 34 5 A 1 0 301609 CASAVA_Build 2 123968325 1D CATACAATTC A/- AGATGAGATT 3070 hom 87 het 36 0 28 8 A 2 1 301610 CASAVA_Build 2 123982918 1I CTCCCCCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 30 2 22 6 A 10 11 301611 CASAVA_Build 2 123990576 5I TTTGACAGAC -----/AAGAT AAGGAAATGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAGAT 0 1 301612 CASAVA_Build 2 124015344 2I TGACTTTCTA --/TT TTTCAATGTT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 3 5 301613 CASAVA_Build 2 124030568 14D CTGCAGAAAT TCTACTGCTCTCTC/-------------- TATAGTCATC 3070 het 3070 hom 26 11 14 3 TCTACTGCTCTCTC 1 0 301614 CASAVA_Build 2 124051266 1I CATTTGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 11 12 301615 CASAVA_Build 2 124084370 1D AGTCTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 2112 het 2112 ref 25 15 5 5 A 15 14 301616 CASAVA_Build 2 124093592 1I ACAACATTTT -/A AAAAGTTGAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 4 5 301617 CASAVA_Build 2 124146649 2I AGAGTTTTAA --/AC AGTTTCTATG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 AC 0 1 301618 CASAVA_Build 2 124149890 1I AGAATTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 31 0 27 4 A 10 11 301619 CASAVA_Build 2 124151602 1D GCAACCTCCA C/- CCTCTCGGGT 3070 hom 45 het 17 0 14 3 C 3 2 301620 CASAVA_Build 2 124155449 1D ACTTTCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 29 0 20 9 T 12 11 301621 CASAVA_Build 2 124167298 1D ATGTACTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 115 het 42 0 37 7 A 10 9 301622 CASAVA_Build 2 124170624 1D AACCAAAGTG A/- AAAAGCACTC 3070 hom 108 het 40 0 36 7 A 5 4 301623 CASAVA_Build 2 124182905 1D TTTTTTTTTT G/- GTCAATATAG 3070 het 319 hom 23 3 11 9 G 2 1 301624 CASAVA_Build 2 124187640 1I GCTGAAGTGG -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 7 8 301625 CASAVA_Build 2 124188776 1I TTATATTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 9 10 301626 CASAVA_Build 2 124195630 4D AGAGAGGAAG AGAT/---- AGATAGAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 5 AGAT 2 1 301627 CASAVA_Build 2 124203997 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 12 11 301628 CASAVA_Build 2 124205652 1D GCAAAACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 29 4 12 14 T 15 14 301629 CASAVA_Build 2 124205760 1D TCTTCCAGAG A/- AAAGAAAACC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 4 3 301630 CASAVA_Build 2 124208483 6I ATGCTTATCA ------/TTCTTT TTCTTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 TTCTTT 1 2 301631 CASAVA_Build 2 124210824 1D TTTGTTTACC T/- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 6 5 301632 CASAVA_Build 2 124215016 1I ATAACAATAT -/G GTATCCAATT 3070 het 3070 hom 36 16 20 0 G 1 2 301633 CASAVA_Build 2 124215084 1D TTGTAACAAC T/- TTTTTTTTTC 1254 het 1254 ref 23 16 3 4 T 10 9 301634 CASAVA_Build 2 124217310 1I CAGAGTATGG -/T TTTTAAGCAC 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 4 5 301635 CASAVA_Build 2 124231107 4I GCATGTGAGA ----/GAGT GAGAAAGGGC 3070 hom 128 het 46 0 42 4 GAGT 0 1 301636 CASAVA_Build 2 124237431 1I TTTGAAAAAT -/A AAAGTCAGTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 301637 CASAVA_Build 2 124237603 1I TTGTCTTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 9 10 301638 CASAVA_Build 2 124244328 1D AGTATCCTAA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 9 8 301639 CASAVA_Build 2 124248552 1D ACTCATTCTT A/- AAAAAAAAAA 1936 het 1936 ref 47 33 6 8 A 15 14 301640 CASAVA_Build 2 124248969 1D AGCTTTGACT G/- GGGCATAGGC 3070 het 3070 hom 46 22 20 5 G 4 3 301641 CASAVA_Build 2 124282603 1I GCACCTGGGT -/C CCCCCCCCAG 2499 het 2499 ref 28 15 9 4 C 8 9 301642 CASAVA_Build 2 124282798 1D CATTAAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 10 9 301643 CASAVA_Build 2 124284855 1I CTGTGTTAAG -/A GGAACATTTA 2644 het 2644 ref 37 31 6 0 A 0 1 301644 CASAVA_Build 2 124297005 1I GATGTTACTG -/A TGAAATAGTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 0 1 301645 CASAVA_Build 2 124305916 1I TACTGTATAG -/A TAATTATTTG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 0 1 301646 CASAVA_Build 2 124307601 2D GATAGCATAT AG/-- ATAGGTTGAA 3070 het 3070 ref 51 24 23 5 AG 1 0 301647 CASAVA_Build 2 124335698 1I AATACTTCAG -/A AAAAAAAAAA 950 het 950 ref 26 13 4 9 A 11 12 301648 CASAVA_Build 2 124338217 1D TGTAGACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 12 12 11 A 11 10 301649 CASAVA_Build 2 124395110 50D TCTCATCTGT TCTTAGTCTCCTCTCCACTGATTCATTCTGCCCCACTGAACTTAGTGAAC/-------------------------------------------------- TCTTAGTCTC 1668 het 1668 ref 34 22 7 18 TCTTAGTCTCCTCTCCACTGATTCATTCTGCCCCACTGAACTTAGTGAAC 1 0 301650 CASAVA_Build 2 124398875 1I AAATAAACTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 301651 CASAVA_Build 2 124399755 1I TGATATCCCC -/T TTAATACCAC 3070 het 3070 hom 52 18 29 5 T 2 3 301652 CASAVA_Build 2 124403232 6D TTATTTTTAT TTACTA/------ TTACTATTTT 1691 het 1691 ref 15 9 4 3 TTACTA 2 1 301653 CASAVA_Build 2 124406915 1D TTTGGGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 27 0 12 15 T 11 10 301654 CASAVA_Build 2 124407627 1D TGTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 11 10 301655 CASAVA_Build 2 124408449 1D TCTTTTTCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 8 301656 CASAVA_Build 2 124411062 13D CAGCCTCCCA AGTAGCTGGGACT/------------- ACAGGCACCC 3070 het 3070 hom 22 11 14 4 AGTAGCTGGGACT 1 0 301657 CASAVA_Build 2 124420226 1D TATACCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 A 11 10 301658 CASAVA_Build 2 124423203 1D TCAAAATAAT A/- AAAGCCATGT 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 A 4 3 301659 CASAVA_Build 2 124435660 1I GAAGAGAAGT -/A AAAAAACACT 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 6 7 301660 CASAVA_Build 2 124443284 1I ACACTGAGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 8 9 301661 CASAVA_Build 2 124449206 1I AAATACCATA -/T TTTTTTAGAA 3070 hom 52 het 19 0 17 2 T 6 7 301662 CASAVA_Build 2 124449860 30I GCTATAAGGT ------------------------------/TGATAATAACCATAATGCCAACTTAAGGTC TGGAAGGGCA 3070 hom 93 het 29 0 31 5 TGATAATAACCATAATGCCAACTTAAGGTC 0 1 301663 CASAVA_Build 2 124457051 1I GAAAAAAAAA -/G AAAAGCAAAA 3008 het 2635 hom 27 13 10 4 G 0 1 301664 CASAVA_Build 2 124464237 5I GCAAAAAAAA -----/AAAAC AAACAAACAA 3070 het 834 hom 37 4 11 22 AAAAC 0 1 301665 CASAVA_Build 2 124471324 1I GTTTAAGCCA -/C CCAGTATCTC 3070 hom 144 het 56 0 49 7 C 2 3 301666 CASAVA_Build 2 124490070 1D ATATTTAGTG C/- CACCTAATTA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 C 2 1 301667 CASAVA_Build 2 124491326 1D TCCATCTAGG A/- AAAAAAAAAA 2419 het 692 hom 19 4 8 9 A 17 16 301668 CASAVA_Build 2 124492174 2D GTTAAAAAAA AC/-- ACACAATTTA 3070 het 3070 ref 48 28 16 4 AC 3 2 301669 CASAVA_Build 2 124494540 1I CTATTTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 A 15 16 301670 CASAVA_Build 2 124494956 1I AAGCTGCAAA -/G CCAAGGCTAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 0 1 301671 CASAVA_Build 2 124505152 1I ACCCTTTTTC -/G TTTGTTATCT 3070 hom 76 het 36 0 26 10 G 0 1 301672 CASAVA_Build 2 124507738 1I GGGCCTGGTG -/C CCACAGGGAA 3070 hom 132 het 49 0 43 6 C 2 3 301673 CASAVA_Build 2 124509449 4I TACTCCTTTC ----/CTTT CTTTCTATCT 3070 hom 103 het 41 0 31 10 CTTT 1 2 301674 CASAVA_Build 2 124515906 2D GTCAAATTAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 30 0 22 9 AT 8 7 301675 CASAVA_Build 2 124525248 1D CTCTTTCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 A 10 9 301676 CASAVA_Build 2 124529687 1I AATCCCAAGT -/C CTTTGTCCCC 3070 hom 174 het 69 0 56 13 C 1 2 301677 CASAVA_Build 2 124530516 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 9 8 301678 CASAVA_Build 2 124531330 1D AACAAGTCCA T/- TTTTTTTTTT 1754 het 293 hom 19 5 5 9 T 17 16 301679 CASAVA_Build 2 124531793 1I AGAAGGATGG -/T TAACAGAGGC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 1 2 301680 CASAVA_Build 2 124536119 1I TTCAGGGCTA -/C CCTATCAACT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 2 3 301681 CASAVA_Build 2 124540704 1I AATTTTTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 10 11 301682 CASAVA_Build 2 124547731 2I ATGTCAGGCA --/AG ATAACCAATG 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 AG 0 1 301683 CASAVA_Build 2 124553557 1D GAACCCCTGA T/- TTTTCCCTTC 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 T 5 4 301684 CASAVA_Build 2 124558101 2I ATGTTTGGCT --/TG TTTTATCAGT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TG 0 1 301685 CASAVA_Build 2 124562626 1I TTTAACTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 20 22 14 T 11 12 301686 CASAVA_Build 2 124572075 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAATAA 3070 het 2075 hom 22 6 13 3 A 8 7 301687 CASAVA_Build 2 124574747 8D GCCTCGTCTC TACAAAAA/-------- TACAAAAATT 3070 het 669 hom 22 2 15 6 TACAAAAA 2 1 301688 CASAVA_Build 2 124593410 1D AGCAGGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 38 1 20 17 T 14 13 301689 CASAVA_Build 2 124596950 2I AAAATATATG --/TA TATATATATA 2942 het 2252 hom 23 9 9 5 TA 7 8 301690 CASAVA_Build 2 124600477 1D CTTACCAACC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 8 7 301691 CASAVA_Build 2 124600659 1D ACAAAAAAAG A/- GAATTTTAGT 3070 het 1654 hom 13 4 8 1 A 1 0 301692 CASAVA_Build 2 124624306 1I TAACTGAGAA -/T TTGAAATGCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 2 3 301693 CASAVA_Build 2 124631222 7D GGATTTGCAG GTTGCAC/------- CGTGAGTCTG 3070 het 3070 ref 44 25 16 7 GTTGCAC 1 0 301694 CASAVA_Build 2 124634572 1D TGTCTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 25 1 19 5 T 12 11 301695 CASAVA_Build 2 124637911 1I TGCCTCTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 36 0 25 11 A 10 11 301696 CASAVA_Build 2 124644311 1D TTTTGTTTTT G/- TTTTTCCTGA 3070 het 869 hom 32 3 25 5 G 1 0 301697 CASAVA_Build 2 124646827 6D TCTCTCTCTC TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 618 het 618 ref 37 16 9 12 TG 11 8 301698 CASAVA_Build 2 124669094 1I AGAATTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1696 hom 31 4 21 6 A 10 11 301699 CASAVA_Build 2 124670117 1D AAAAATAGCA G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 G 1 0 301700 CASAVA_Build 2 124676526 1D AGTGGTAAAC A/- ACCAGTCAGG 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 A 2 1 301701 CASAVA_Build 2 124689185 1D AAAATGTATG T/- TTTATATCTT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 4 3 301702 CASAVA_Build 2 124703943 1I CTATTGCATG -/T TTTTTTTTTT 2610 het 2610 ref 33 18 8 7 T 10 11 301703 CASAVA_Build 2 124707089 1D TATCTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2221 hom 24 7 9 8 T 13 12 301704 CASAVA_Build 2 124707833 2D CCTGTGAGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 2468 hom 16 6 7 4 TA 9 8 301705 CASAVA_Build 2 124713236 1D TCATTCTCTA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 7 6 301706 CASAVA_Build 2 124713742 1D TTCAACAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 32 4 11 18 T 12 11 301707 CASAVA_Build 2 124714060 1D TTTTTTTTCC T/- GTTGAAGAAT 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 T 1 0 301708 CASAVA_Build 2 124721638 1D ATAAATATAC A/- AAAAAATGGG 3070 het 3070 hom 39 17 16 8 A 7 6 301709 CASAVA_Build 2 124739885 1I TGAGAATGGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 20 21 8 A 9 10 301710 CASAVA_Build 2 124748542 1I GACAATCAGG -/T TTTTTTTTTC 2079 het 2079 ref 33 19 6 8 T 9 10 301711 CASAVA_Build 2 124773680 2I GTTGTGAATA --/GT GTGCTGCAAT 3070 hom 123 het 44 0 42 5 GT 1 2 301712 CASAVA_Build 2 124789035 1D CAAACAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 12 11 301713 CASAVA_Build 2 124795491 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2475 het 684 hom 13 5 6 2 A 13 12 301714 CASAVA_Build 2 124810097 1I TGAGGGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 10 11 301715 CASAVA_Build 2 124816887 1I AGAAAGTTGT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 A 6 7 301716 CASAVA_Build 2 124820823 1D CAGTATTATT A/- AAATCCAGTA 3070 het 2714 hom 26 6 17 3 A 4 3 301717 CASAVA_Build 2 124823233 1D GTACTTTCAC A/- AAACCTGGAT 3070 hom 135 het 50 0 44 6 A 4 3 301718 CASAVA_Build 2 124825044 1D TTTTCCAAAG A/- ACTTCGATTT 3070 hom 134 het 54 0 44 10 A 2 1 301719 CASAVA_Build 2 124844352 1D GGAAGAAGAG A/- AAGGGTTGCA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 3 2 301720 CASAVA_Build 2 124860032 3D GAGCACGTAG ACA/--- ACATCGATGT 3070 het 3070 hom 52 20 26 6 ACA 2 1 301721 CASAVA_Build 2 124860780 1D TCAAATGTCT C/- CCCAGTTTTG 3070 hom 122 het 43 0 40 3 C 4 3 301722 CASAVA_Build 2 124860865 1D GATGTTTGTG T/- CCCCCCAGAA 3070 hom 93 het 32 0 31 2 T 1 0 301723 CASAVA_Build 2 124860952 2D ATTAAGTCAT AA/-- GAGTGGAGCC 3070 hom 123 het 45 0 42 4 A 2 0 301724 CASAVA_Build 2 124865985 2D CCTGGGTGAC AG/-- AGCGAGACTC 3070 het 2009 hom 23 7 14 4 AG 2 1 301725 CASAVA_Build 2 124871924 1D TGAAATGAAG A/- ATGAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 A 2 1 301726 CASAVA_Build 2 124872528 12D AAATTTTTAC TTTATTTATTTA/------------ TTTATTTATT 3070 het 2990 hom 22 7 9 6 TTTA 7 4 301727 CASAVA_Build 2 124874164 1I GCTTATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 A 12 13 301728 CASAVA_Build 2 124887951 1I TAAATAAATT -/A AAAAAAAAAG 2483 hom 18 het 7 0 7 0 A 9 10 301729 CASAVA_Build 2 124890407 1I GGATTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 567 hom 31 2 27 2 T 12 13 301730 CASAVA_Build 2 124899683 7D7M4D CTCCTTAGAG TTCTATTCCATTTCATTA/-------CAAGCTC---- TTTATAGCTC 3070 hom 140 het 44 0 44 8 N/A 0 0 301731 CASAVA_Build 2 124902721 1D GCAATCAGCA T/- TTTTTTTTTT 1881 het 1881 ref 36 27 4 5 T 13 12 301732 CASAVA_Build 2 124929743 2D ATCCAACAAC AT/-- ATCAAAACAA 3070 hom 99 het 39 0 34 7 AT 2 1 301733 CASAVA_Build 2 124935921 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 10 301734 CASAVA_Build 2 124947334 1I TTTAAAAAAT -/A ATCCATTCTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 2 301735 CASAVA_Build 2 124959160 1D TAGAAAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 70 het 30 0 22 9 A 10 9 301736 CASAVA_Build 2 124982136 1I CACAAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 10 11 301737 CASAVA_Build 2 124989587 7D6M1D CAATCAATCA ATCATTCATCACGT/-------ATCACG- TTTATATGCC 3070 hom 154 het 54 0 52 9 N/A 0 0 301738 CASAVA_Build 2 124996742 6I TAAAGTCCTC ------/CTGAGA CTGGTATGTG 3070 het 3070 hom 39 19 16 4 CTGAGA 0 1 301739 CASAVA_Build 2 125017358 1D CTTGTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 23 6 A 11 10 301740 CASAVA_Build 2 125017999 1I TGCTAGCTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 T 9 10 301741 CASAVA_Build 2 125018660 1D CTATGCTGTC T/- TAACATCTTG 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 T 2 1 301742 CASAVA_Build 2 125026099 1I CTTAGACAAA -/G GGACCATTTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 G 2 3 301743 CASAVA_Build 2 125027083 12D GGGACATTAT ATTCTATTTCTG/------------ GGAAAGAAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 5 ATTCTATTTCTG 1 0 301744 CASAVA_Build 2 125027612 1I ATGCAGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 A 8 9 301745 CASAVA_Build 2 125031325 1D ATTGCTCCTT G/- CCTGTGGCTG 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 G 1 0 301746 CASAVA_Build 2 125032480 24I ATTGGAAAGT ------------------------/TCGGTTTGGGTACACAAAGTTTGG AATATCTATT 3070 hom 95 het 33 0 32 5 TCGGTTTGGGTACACAAAGTTTGG 0 1 301747 CASAVA_Build 2 125034679 1D GTAAGAGAAT C/- CCAGCTCGGA 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 C 3 2 301748 CASAVA_Build 2 125035196 1I GGCAAAAGGA -/T GGTGTGGAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 0 1 301749 CASAVA_Build 2 125036914 6D TGTAAAATGA TTATCT/------ TTATACATTT 3070 het 3070 hom 31 14 16 3 TTATCT 1 0 301750 CASAVA_Build 2 125040000 1I TGAGGGATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1933 hom 24 5 12 7 T 13 14 301751 CASAVA_Build 2 125074237 1I TAGTAAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 T 10 11 301752 CASAVA_Build 2 125075740 1I TATTCAAAGG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 7 8 301753 CASAVA_Build 2 125085002 2D ACACCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 23 0 11 13 A 17 15 301754 CASAVA_Build 2 125085074 4D ACGCACATTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 434 hom 26 2 15 12 TTTG 4 3 301755 CASAVA_Build 2 125085119 1D GAGATGCCAG C/- TGCATCATGT 3070 het 3070 hom 42 11 18 13 C 1 0 301756 CASAVA_Build 2 125089031 5D GCATTATATC AAAAA/----- AAAAAAAAAC 3070 het 30 hom 31 1 19 12 A 14 9 301757 CASAVA_Build 2 125101531 4I GAAGAAAGGC ----/CTGA CTGTTAGAAG 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 CTGA 0 1 301758 CASAVA_Build 2 125101570 4D CAACAACATC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2191 het 2191 ref 39 18 5 16 A 16 12 301759 CASAVA_Build 2 125106754 1D CTGTAACTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 10 9 301760 CASAVA_Build 2 125112248 13D GATATATATA ATACATATATATG/------------- ATACATATAT 2985 het 2205 hom 16 7 9 3 ATACATATATATG 3 2 301761 CASAVA_Build 2 125113677 6D ACAAGTACTA TTATAC/------ TTATACTATT 3070 het 3070 hom 47 17 23 9 TTATAC 2 1 301762 CASAVA_Build 2 125119614 1D GCCCCTGTAT C/- TAAACAATAA 3070 hom 68 het 28 0 21 7 C 1 0 301763 CASAVA_Build 2 125121203 9I AAGGTCCTCA ---------/TCTCTATGC TCTTTCATTG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TCTCTATGC 0 1 301764 CASAVA_Build 2 125121449 2D ACTTATTAAC TG/-- TGGGATATTG 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TG 2 1 301765 CASAVA_Build 2 125129585 4D ATCAAATGAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 TA 11 9 301766 CASAVA_Build 2 125134692 1I ATTGGGTGCG -/T TTTTTTGCAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 T 6 7 301767 CASAVA_Build 2 125135614 1D GCTGTTTCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 10 9 301768 CASAVA_Build 2 125140983 1I GATGGTGCAT -/G AACTACAGCA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 G 0 1 301769 CASAVA_Build 2 125141071 1D GAAGAACGAT G/- GGGGAAACAT 3070 hom 147 het 54 0 48 7 G 5 4 301770 CASAVA_Build 2 125147290 1D ACATTCTCTT A/- AAAAAAACAC 3070 hom 127 het 49 0 43 7 A 8 7 301771 CASAVA_Build 2 125164072 1I TTACGGGAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 266 hom 16 1 15 0 T 9 10 301772 CASAVA_Build 2 125171659 1I CCTTAGTTTG -/A AAAAAAAAAA 2009 het 2009 ref 44 14 12 18 A 17 18 301773 CASAVA_Build 2 125173240 11D TCACCCCTAA GAAGATTACGT/----------- GCACAGGGGC 3070 hom 117 het 43 0 38 7 GAAGATTACGT 1 0 301774 CASAVA_Build 2 125174484 1D ATCACCAAAC T/- TTTTTCCATA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 6 5 301775 CASAVA_Build 2 125197999 1D GAGGCCATCC T/- GGCAAAACAT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 T 1 0 301776 CASAVA_Build 2 125201942 1D TAATCTTAGA G/- GAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 G 2 1 301777 CASAVA_Build 2 125211967 1I CTAGAACATT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 A 8 9 301778 CASAVA_Build 2 125229119 1I TTAAAGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 10 11 301779 CASAVA_Build 2 125239521 4D AAAAATAAAC AATT/---- AGATTTGAGT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 AATT 1 0 301780 CASAVA_Build 2 125245766 3D TCACCTTCAT CAC/--- CACCATCACC 3070 het 3070 ref 63 21 22 22 CAC 2 1 301781 CASAVA_Build 2 125274422 2D ACACACATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 62 26 21 19 AC 8 7 301782 CASAVA_Build 2 125283634 1D CATGATCTTT A/- AAAAAAAACC 2994 het 2994 ref 18 9 8 2 A 9 8 301783 CASAVA_Build 2 125285078 1I AGGATCCTAG -/A AAAAGTCTGC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 4 5 301784 CASAVA_Build 2 125285179 4D GGTGATAGAC CTAT/---- ACAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 38 17 17 7 CTAT 1 0 301785 CASAVA_Build 2 125288291 1D TCGAATCCTC T/- TTTTTTTTTT 874 het 874 ref 35 21 2 12 T 13 12 301786 CASAVA_Build 2 125294584 1I ACAAAGGAAA -/G GGGGGGGGAG 2066 het 2066 ref 39 17 8 14 G 8 9 301787 CASAVA_Build 2 125308436 2I CCAGCTGTAC --/TT TCTCTGAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 1 3 301788 CASAVA_Build 2 125309310 1D AGGTTAATTT A/- AAATTTTGCT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 4 3 301789 CASAVA_Build 2 125329215 17D GGGCTTTTGC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1959 hom 28 9 10 9 T 29 12 301790 CASAVA_Build 2 125334222 1I CATGGTGAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 3 4 301791 CASAVA_Build 2 125344539 1I TGTCCATCCA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 7 8 301792 CASAVA_Build 2 125357118 5D ATCCATTCTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2924 hom 44 17 14 15 T 18 13 301793 CASAVA_Build 2 125380152 1I AATACTGATT -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 6 7 301794 CASAVA_Build 2 125423531 2D TTCTTTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 1262 het 522 hom 18 4 6 8 T 20 18 301795 CASAVA_Build 2 125431755 1D ACCATTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 15 11 A 12 11 301796 CASAVA_Build 2 125432911 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1348 hom 19 4 13 2 A 13 12 301797 CASAVA_Build 2 125437135 1I CGATTATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 A 10 11 301798 CASAVA_Build 2 125443790 4D GTGCAAAGGC TTAA/---- TTAAGATCAT 3070 het 3070 ref 49 25 23 3 TTAA 2 1 301799 CASAVA_Build 2 125449471 1I GGACCAGCAG -/A AGGAAACATT 3070 het 3070 hom 47 13 27 7 A 1 2 301800 CASAVA_Build 2 125456759 2D ATATATGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3022 hom 23 9 9 5 AC 10 9 301801 CASAVA_Build 2 125457016 1I ATTTAAATTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 T 8 9 301802 CASAVA_Build 2 125460124 1D CTGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 38 0 28 12 A 12 11 301803 CASAVA_Build 2 125468688 1I TAATTTGGGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 7 8 301804 CASAVA_Build 2 125468816 1I GTTATGTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 7 het 22 1 18 3 A 9 10 301805 CASAVA_Build 2 125469684 1I GTGGCGGTGC -/G GGGGGGTTGG 3070 hom 76 het 30 0 25 5 G 6 7 301806 CASAVA_Build 2 125474715 4D ACTGCATACT TTGA/---- TTGGAGGTCA 3070 hom 105 het 41 0 36 7 TTGA 1 0 301807 CASAVA_Build 2 125479552 1I TCAATCAGTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 389 hom 42 1 38 3 A 8 9 301808 CASAVA_Build 2 125486001 2I GAATCTGGTG --/AT AATATACTCT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 AT 0 1 301809 CASAVA_Build 2 125492915 1D CTAGTAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 T 11 10 301810 CASAVA_Build 2 125496488 3D TTGATATTCC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TGT 4 3 301811 CASAVA_Build 2 125511019 1I TTGGACTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 10 11 301812 CASAVA_Build 2 125524600 1D CTTCTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 12 11 301813 CASAVA_Build 2 125536096 1I AAGTGTATGT -/G GGGGGGGGGT 3070 hom 38 het 17 0 12 5 G 9 10 301814 CASAVA_Build 2 125546616 1I TATATATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 28 0 16 12 T 12 13 301815 CASAVA_Build 2 125562474 1D TTTGATTTAA T/- TTTTTTTTTT 1077 het 1077 ref 25 8 3 14 T 15 14 301816 CASAVA_Build 2 125563299 1D CCTGAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 794 hom 37 2 27 8 A 15 14 301817 CASAVA_Build 2 125566100 1I TTTATAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 10 11 301818 CASAVA_Build 2 125567648 1I TCCATAACAA -/C CACCACTTTC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 1 2 301819 CASAVA_Build 2 125567758 1I TCCAACTTTG -/A AAAAAATTAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 7 301820 CASAVA_Build 2 125578446 1D TACTTAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 17 0 14 3 T 13 12 301821 CASAVA_Build 2 125580813 1D TTTTCATCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 64 het 27 0 23 4 T 10 9 301822 CASAVA_Build 2 125601644 1I AGTGATCCAT -/G GGGTAGGATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 3 4 301823 CASAVA_Build 2 125605351 1I TGAAATATCA -/T TTTTTTATAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 6 7 301824 CASAVA_Build 2 125622898 1D TATTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 24 0 16 8 T 15 14 301825 CASAVA_Build 2 125633997 1D AAACTATTCT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 8 301826 CASAVA_Build 2 125634947 1I AGAATTTGGA -/C AAAATGATTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 0 1 301827 CASAVA_Build 2 125638104 1D CAATTACAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 10 9 301828 CASAVA_Build 2 125656326 1D GCTCTTCACC T/- TTCCTATATG 3070 hom 90 het 32 0 30 3 T 3 2 301829 CASAVA_Build 2 125659832 1I GTGAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 1928 het 1928 ref 28 13 9 6 A 10 11 301830 CASAVA_Build 2 125673196 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 0 1 301831 CASAVA_Build 2 125776146 1D CTAATGAATC A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 17 10 7 0 A 7 6 301832 CASAVA_Build 2 125789864 2I TTCATTTGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 10 12 301833 CASAVA_Build 2 125799590 1I TAAGGGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 10 11 301834 CASAVA_Build 2 125800532 1I GATTATTTTT -/G TTCCTGTTCC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 G 0 1 301835 CASAVA_Build 2 125813380 14D TTTCCCTGCT ATGTAACCCCCTAA/-------------- ATGTAGTTGG 3070 het 3070 ref 54 37 17 10 ATGTAACCCCCTAA 1 0 301836 CASAVA_Build 2 125830349 1D TCTTAACAAT A/- AAAAATATAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 6 5 301837 CASAVA_Build 2 125842100 1I TATTTGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 9 10 301838 CASAVA_Build 2 125854762 1D GCTGTTCAGC A/- GTGGAGAACC 3070 het 3070 ref 44 22 21 1 A 1 0 301839 CASAVA_Build 2 125868333 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1788 hom 19 5 14 0 A 11 12 301840 CASAVA_Build 2 125870014 1I CATGCATGTC -/A ATAGCCCATT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 1 2 301841 CASAVA_Build 2 125883351 1D GTTGGCTGCG C/- CCCCTTATTT 3070 het 3070 hom 40 14 14 14 C 5 4 301842 CASAVA_Build 2 125884069 2I GTATATGCAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 AC 7 8 301843 CASAVA_Build 2 125890482 1I CTTCCCGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 19 13 T 12 13 301844 CASAVA_Build 2 125890814 4D TGACAAATAG CAAA/---- CAGTTTCAAA 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 CAAA 1 0 301845 CASAVA_Build 2 125905172 1D CAAGACAGAG A/- TGCAAAGTAT 3070 het 3070 hom 38 10 26 2 A 1 0 301846 CASAVA_Build 2 125907826 3I TACTTTACTT ---/ATC ATCTGCACAA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 ATC 1 2 301847 CASAVA_Build 2 125912199 2D CAGAAAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 15 8 3 A 12 10 301848 CASAVA_Build 2 125913087 4I ACGTCCAAAT ----/ACTC AGGAAGAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 ACTC 0 1 301849 CASAVA_Build 2 125915983 1I AATAATAATG -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 6 7 301850 CASAVA_Build 2 125916997 1D AACATATGTA T/- TTTCTGAAAA 3070 het 3070 ref 54 27 21 9 T 4 3 301851 CASAVA_Build 2 125919447 9D CCTTTTCAAT AGGTTGTTA/--------- AGGAGATTGC 3070 het 3070 ref 41 20 20 4 AGGTTGTTA 1 0 301852 CASAVA_Build 2 125934791 5I TCTATTTTCT -----/TTATA TAAGTTTCTA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TTATA 0 1 301853 CASAVA_Build 2 125935298 1D ACATGAAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 11 6 T 10 9 301854 CASAVA_Build 2 125947076 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAATGAAAGT 3041 het 608 hom 15 3 9 4 AG 1 0 301855 CASAVA_Build 2 125963945 2I ATCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 A 14 16 301856 CASAVA_Build 2 125964128 1D AGATAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 13 13 A 11 10 301857 CASAVA_Build 2 125964986 13I GTCCCCAGAG -------------/TCCATTGTATCAT TCCTATGCCC 2322 het 2322 ref 31 16 7 8 TCCATTGTATCAT 0 1 301858 CASAVA_Build 2 125965630 1D TTTGATGGGA T/- TTTTTTTTCT 2152 het 2152 ref 36 20 6 10 T 9 8 301859 CASAVA_Build 2 125976640 1D TTATTCATCC T/- TTTTTTTTTC 1317 het 1317 ref 36 28 3 5 T 10 9 301860 CASAVA_Build 2 125978347 1I ATGCCCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 17 1 T 10 11 301861 CASAVA_Build 2 125986612 3D AATATTATAA TAT/--- TATTATCATA 1296 het 1296 ref 9 4 5 1 TAT 3 2 301862 CASAVA_Build 2 125987853 1I AAAGAATGTT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 A 7 8 301863 CASAVA_Build 2 125987961 1I CTAGAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 10 11 301864 CASAVA_Build 2 125995055 1I TGTACTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 10 11 301865 CASAVA_Build 2 126000951 1I GAGATTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 T 10 11 301866 CASAVA_Build 2 126004640 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2103 het 449 hom 21 3 7 11 T 15 14 301867 CASAVA_Build 2 126004830 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1196 het 1144 hom 10 4 5 1 T 11 12 301868 CASAVA_Build 2 126005828 1D CATGTCTTCC A/- ACCCCATATT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 2 1 301869 CASAVA_Build 2 126007030 2I TTTTAGTAAG --/TA TAAAGATAAT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 TA 1 2 301870 CASAVA_Build 2 126014674 9D AAACAATATA ACTCAACAG/--------- ACTCAACAGA 3070 het 3070 hom 35 12 19 7 ACTCAACAG 2 1 301871 CASAVA_Build 2 126019524 1I AATAAGATGA -/T TAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 1 2 301872 CASAVA_Build 2 126035504 1I TGTAAAAGGC -/T TTTAAACATA 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 T 3 4 301873 CASAVA_Build 2 126042205 1D CGGGTTTATC A/- AATCATTTGA 3070 hom 84 het 34 0 29 7 A 3 2 301874 CASAVA_Build 2 126043301 9I GTCTTCCTTA ---------/CAGCAAATC CAGCAAATCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CAGCAAATC 1 2 301875 CASAVA_Build 2 126060608 1I TTGAAAAATT -/G TAAGTCAAAC 3070 hom 101 het 39 0 34 5 G 0 1 301876 CASAVA_Build 2 126063569 1D AAAAAGCTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 T 9 8 301877 CASAVA_Build 2 126093531 1I TAGATTTTGC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 8 9 301878 CASAVA_Build 2 126127476 2I ACATGTGCAA --/AC ACACACACAC 3070 het 83 hom 52 1 44 7 AC 5 6 301879 CASAVA_Build 2 126129705 2I GGGGACTCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TC 5 6 301880 CASAVA_Build 2 126130146 1I TGGGCCTGGT -/G GTGTGCGACT 3070 hom 4 het 13 1 11 1 G 1 2 301881 CASAVA_Build 2 126133127 1D TATGAGTTTG C/- CTATCCTGCA 3070 hom 122 het 45 0 41 4 C 2 1 301882 CASAVA_Build 2 126156455 1I AAGCATTGAG -/A AACCAAACAA 3070 het 120 hom 39 1 38 0 A 2 3 301883 CASAVA_Build 2 126182090 1I TATCTAAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 9 10 301884 CASAVA_Build 2 126183375 1D AATGAGAGGG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 9 8 301885 CASAVA_Build 2 126183652 1D ATTCTTCAAG A/- AAAGGACCAA 3070 hom 169 het 62 0 57 5 A 4 3 301886 CASAVA_Build 2 126186692 1D CAGTGTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 647 hom 43 2 28 14 A 13 12 301887 CASAVA_Build 2 126190697 2D AATATATATG TA/-- TATATATGTG 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TA 4 3 301888 CASAVA_Build 2 126190816 1I AAATGACAAA -/T TAATTTTTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 1 2 301889 CASAVA_Build 2 126200448 1I AAGCAAATTC -/T TTTTTTTTTT 2282 het 880 hom 34 4 13 17 T 16 17 301890 CASAVA_Build 2 126213751 1D TCCCCCCCCC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 16 het 18 1 17 1 A 9 8 301891 CASAVA_Build 2 126217516 1D ACATTGTTTG T/- TTTATTTCAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 4 3 301892 CASAVA_Build 2 126249085 5I ATTCTGCCCA -----/GTGTC GTGTCTGGAT 3070 hom 117 het 41 0 35 6 GTGTC 1 2 301893 CASAVA_Build 2 126250771 1D ACCCAGCTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 37 hom 33 1 25 7 T 10 9 301894 CASAVA_Build 2 126254695 3I TCAGGGCAAC ---/TAT TATTATTATT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TAT 5 6 301895 CASAVA_Build 2 126258216 1I ATTTTTCAAG -/A TTTTTTTTCT 3070 het 265 hom 29 1 23 5 A 0 1 301896 CASAVA_Build 2 126259595 1D TGTATCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 97 hom 34 2 19 14 T 15 14 301897 CASAVA_Build 2 126262422 6D ATAGACTCTA ATGCAC/------ ATTAGAACAA 3070 hom 114 het 42 0 39 4 ATGCAC 1 0 301898 CASAVA_Build 2 126268290 1I GCATGGCTCA -/T AAAAGCGAGG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 T 0 1 301899 CASAVA_Build 2 126273183 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2577 hom 30 het 16 0 9 7 A 15 16 301900 CASAVA_Build 2 126273239 1D TACTGGCATT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 8 7 301901 CASAVA_Build 2 126284294 1D CGTTTTGGTA G/- GTTGAAAAGA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 G 2 1 301902 CASAVA_Build 2 126287478 4D ACTTGCTAAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 47 0 35 14 TG 11 9 301903 CASAVA_Build 2 126295380 28D ATGCTCTCTG CAAGCTTAAGCATAAAACAAAATGGCTC/---------------------------- CATGGCTCCC 3070 hom 66 het 21 0 21 4 CAAGCTTAAGCATAAAACAAAATGGCTC 1 0 301904 CASAVA_Build 2 126299044 1I AGGAACAACC -/T CTTAAAATGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 0 1 301905 CASAVA_Build 2 126314366 1I AATGGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 37 1 34 2 A 11 12 301906 CASAVA_Build 2 126317740 3I35M1I TAATTCTACA ---TATTATTTTAGATAGTAGAATTGTCGAGGTTTTTT-/TATTATTATTTTAGATAGTAGAATTGTCGAGGTTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 31 0 31 7 N/A 0 0 301907 CASAVA_Build 2 126320236 1D TTTAGTTCTG C/- TCTGATCTTG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 1 0 301908 CASAVA_Build 2 126324200 1I TGATTTCGGC -/T TTTTTTTTTG 1343 het 1343 ref 40 30 4 6 T 9 10 301909 CASAVA_Build 2 126324790 1I GCCTTGCTTG -/C CTTGTCAGAA 3070 hom 98 het 38 0 31 7 C 1 2 301910 CASAVA_Build 2 126329977 1I AATGTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 41 0 29 12 T 10 11 301911 CASAVA_Build 2 126337219 1D TTCTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 2398 hom 21 het 14 0 8 6 A 14 13 301912 CASAVA_Build 2 126337262 4I ATAAAAATAA ----/AAAT AAATAAAGAT 2700 hom 24 het 20 0 9 11 AAAT 1 2 301913 CASAVA_Build 2 126337609 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1935 hom 21 het 11 0 7 4 TA 7 6 301914 CASAVA_Build 2 126340750 1I TTGTTCTATT -/A TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 301915 CASAVA_Build 2 126355792 8I TTTTATTCCC --------/AATGTGTA ATGTTGAATT 3070 hom 122 het 46 0 39 8 AATGTGTA 0 1 301916 CASAVA_Build 2 126384801 1D AGGGCTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 41 0 31 10 A 12 11 301917 CASAVA_Build 2 126397391 4D CTGTTTTGTA CATG/---- CATGCATGCA 3070 hom 114 het 49 0 37 15 CATG 6 5 301918 CASAVA_Build 2 126398871 1I ATACTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 793 hom 24 3 19 2 A 10 11 301919 CASAVA_Build 2 126400014 1I GTACTTTACA -/C CCGTCTAGTC 3070 hom 102 het 42 0 33 9 C 2 3 301920 CASAVA_Build 2 126407086 2D TGTGTCAGAC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 11 9 301921 CASAVA_Build 2 126407487 1D ACGTTTTATG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 8 301922 CASAVA_Build 2 126408725 1D TTGATCTAAC T/- TTTTGAGTCT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 5 4 301923 CASAVA_Build 2 126410383 7D GATACTATAG ATCTTTT/------- TTCTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATCTTTT 1 0 301924 CASAVA_Build 2 126415185 1D TGCTTGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 12 11 301925 CASAVA_Build 2 126420666 12D AAGAAGAAGA AGAAGAAGAAGC/------------ AAAAGCAAAG 3070 hom 69 het 22 0 24 2 AGAAGAAGAAGC 1 0 301926 CASAVA_Build 2 126422288 3D GAAGGAAAAA AAC/--- AATTTATTGA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 AAC 1 0 301927 CASAVA_Build 2 126424777 1D CATATCAAAC T/- AAAAAGCTCC 3070 hom 117 het 44 0 40 5 T 1 0 301928 CASAVA_Build 2 126429654 1D TTACTTAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 290 hom 36 1 32 4 T 10 9 301929 CASAVA_Build 2 126430464 4I AATAAATAAT ----/GTAA ATATTTATGT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 GTAA 0 1 301930 CASAVA_Build 2 126431231 1D ATTGCCTATC T/- TTTTGTTATG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 5 4 301931 CASAVA_Build 2 126431489 1D TGCTTTTTTT C/- ATTTATCAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 C 1 0 301932 CASAVA_Build 2 126447423 1I TTCTTGAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 417 hom 35 1 29 5 A 9 10 301933 CASAVA_Build 2 126462083 1D AGTGTTTTTA G/- TAGTGATTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 1 0 301934 CASAVA_Build 2 126478810 1D GTGCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 876 het 876 ref 38 30 3 6 A 13 12 301935 CASAVA_Build 2 126485151 4D AAGCAAATAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 8 het 18 0 12 7 AT 11 9 301936 CASAVA_Build 2 126500816 4I ACTTTTGGTA ----/TTAG TTATTTTCTT 3070 hom 58 het 24 0 20 6 TTAG 0 1 301937 CASAVA_Build 2 126503494 1D AGATGGAAGG A/- ATTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 A 2 1 301938 CASAVA_Build 2 126506440 1I TCAGGCTCCC -/A AGGTTGGATA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 1 2 301939 CASAVA_Build 2 126512477 1I ACCCAGAGCT -/G GGCATGGTCT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 G 2 3 301940 CASAVA_Build 2 126517840 1D TGTGCTGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 11 10 301941 CASAVA_Build 2 126533886 1I GGGCTTCCTT -/G GGAACTGGGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 2 3 301942 CASAVA_Build 2 126539586 2I TTTAGGAAAC --/AA GAGAGGAGAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 0 2 301943 CASAVA_Build 2 126540319 1I TGAGAATGAC -/A AAAAAATCTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 6 7 301944 CASAVA_Build 2 126546170 1D CTGATGAGCC T/- TTTTTTGCCA 3070 hom 103 het 41 0 33 9 T 7 6 301945 CASAVA_Build 2 126549762 1D GATGAGATTT G/- GTTGGGGATA 3070 hom 63 het 23 0 21 3 G 2 1 301946 CASAVA_Build 2 126580194 2D TGTGTGTGTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 160 het 65 0 52 14 GT 7 6 301947 CASAVA_Build 2 126583803 6I TATATATAGA ------/CATTAT CACAATTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CATTAT 0 1 301948 CASAVA_Build 2 126594612 2I AAATAAACAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 10 12 301949 CASAVA_Build 2 126598145 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 383 hom 19 1 12 6 T 13 12 301950 CASAVA_Build 2 126599870 1D TGCCACACAA T/- TAGAAAGTGG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 1 301951 CASAVA_Build 2 126603917 1D TGGGTGCTGC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 117 het 41 0 39 2 A 8 7 301952 CASAVA_Build 2 126611404 1I AGGTTAATTA -/T TTGTTACTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 3 301953 CASAVA_Build 2 126612164 3I TAAAAGAAGA ---/AGC ATTTTCACAT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 AGC 0 1 301954 CASAVA_Build 2 126612461 2D TTCTAAAAAC AT/-- GTGTGTTTCG 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AT 1 0 301955 CASAVA_Build 2 126612771 1I TTCTTCTTCC -/A TGTAGTTTTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 0 1 301956 CASAVA_Build 2 126644106 1D TCAGAGCAGC A/- ACAGGGTAGT 3070 hom 104 het 41 0 34 7 A 2 1 301957 CASAVA_Build 2 126644695 1I GGAGTTTGAG -/A CCAGCCTGGC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 0 1 301958 CASAVA_Build 2 126645195 1D ATGCAATGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 A 10 9 301959 CASAVA_Build 2 126650326 4I GCACTTTGAT ----/AATC AAAAAGAAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 AATC 0 1 301960 CASAVA_Build 2 126686794 1D AAGATCACAT A/- AGGACATAGC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 2 1 301961 CASAVA_Build 2 126687564 5D GGTCATTAAT TTAAG/----- TTGATTCTTG 3070 hom 75 het 28 0 25 9 TTAAG 1 0 301962 CASAVA_Build 2 126695741 2D CAGGAAACAG CC/-- CCCAGGAATC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 5 3 301963 CASAVA_Build 2 126702995 2I AAACTATAAC --/AG AGAAAAAGGC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AG 1 2 301964 CASAVA_Build 2 126706106 2D CCCTACCTCG CT/-- CTCTCTCCCT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 CT 4 3 301965 CASAVA_Build 2 126708018 1D TGCTGAGATT A/- ACAGGCTTGA 2641 hom 27 het 10 0 9 1 A 2 1 301966 CASAVA_Build 2 126718094 2D ACTGTCACTA CT/-- CTCTGGTTGT 3070 hom 138 het 51 0 47 5 CT 3 2 301967 CASAVA_Build 2 126722606 1D TCTTAAATGT A/- AAAAAAAAAA 530 het 530 ref 28 18 2 8 A 13 12 301968 CASAVA_Build 2 126724169 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 6 7 301969 CASAVA_Build 2 126763823 10D AAAAGGAATG ATTTTGAAAT/---------- ACACCAGAGC 3070 het 3070 ref 25 12 14 3 ATTTTGAAAT 1 0 301970 CASAVA_Build 2 126765402 1I AAGGCACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 A 13 14 301971 CASAVA_Build 2 126788006 4I ATAAAGGCTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 TTTG 2 3 301972 CASAVA_Build 2 126797191 4I TGAAAGAATT ----/AGAG AGAAAGTTGC 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 AG 1 3 301973 CASAVA_Build 2 126798185 1D TACCAGATTA T/- TTTTTATTTG 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 6 5 301974 CASAVA_Build 2 126798358 4D TGTAATACAA ACTG/---- ACTATTAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 17 1 ACTG 1 0 301975 CASAVA_Build 2 126799758 3D CTTGTAATTC TGT/--- TATTACCTTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 TGT 1 0 301976 CASAVA_Build 2 126799887 2D GTAATTTTTT TC/-- TTTTTTCGAG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 TC 1 0 301977 CASAVA_Build 2 126801407 1D50M2D AATCTGCATG AAAAAAATTTTGGAAATTTATTGGTGTCATAATATCTACCAAATCAGGGCCAA/-AAAAAATTTTGGATATTTATTGGTGTCATAATATCTACCAAATCAGGGCC-- ATCTAGAGAT 3070 het 3070 ref 41 32 29 3 N/A 0 0 301978 CASAVA_Build 2 126803202 1D CTTGTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 6 A 11 10 301979 CASAVA_Build 2 126803357 1I TTTCATGCTG -/T CCCCTGACAC 3070 het 2807 hom 27 9 13 5 T 0 1 301980 CASAVA_Build 2 126814471 2D ACTTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 14 12 301981 CASAVA_Build 2 126830051 1D TAGAAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 11 10 301982 CASAVA_Build 2 126837702 4D CAATTGTGTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 35 0 25 10 A 16 12 301983 CASAVA_Build 2 126839874 1I TTCATGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 572 hom 34 3 22 9 A 11 12 301984 CASAVA_Build 2 126845468 2I AGTCCAGCGG --/CC CGCCCCCACA 2685 het 2685 ref 29 14 10 5 C 1 3 301985 CASAVA_Build 2 126846770 2I GCAACCATCC --/CA CAGTGACTTG 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 CA 1 2 301986 CASAVA_Build 2 126847785 1D TGCGCATGGA T/- CCCCACTTAG 3070 het 3070 ref 56 30 22 5 T 1 0 301987 CASAVA_Build 2 126848922 1D TCTGCCTCCC G/- GGGTTCAAGC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 G 4 3 301988 CASAVA_Build 2 126853061 1I GAAACTGGCC -/T TTTTTTTTTT 2246 het 2246 ref 25 10 8 7 T 13 14 301989 CASAVA_Build 2 126859919 14I TTCAACCATC --------------/AAATATGATTTAAT AAACATAATA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 AAATATGATTTAAT 0 1 301990 CASAVA_Build 2 126864213 5D ACAGGATAGA AGCAG/----- AGCAGAGAGG 3070 het 3070 ref 56 33 20 5 AGCAG 2 1 301991 CASAVA_Build 2 126866511 2I TAGAAAAATT --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 27 hom 45 1 36 8 AG 5 6 301992 CASAVA_Build 2 126885293 3D TTTAATTGAC ATT/--- ATTAAGGCAT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 ATT 2 1 301993 CASAVA_Build 2 126885712 1I TCTAAAAAAA -/T GTACATATCT 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 T 0 1 301994 CASAVA_Build 2 126886089 1I GGCATCTTAT -/C CAGGAATAGA 3070 het 3070 ref 57 32 15 10 C 1 2 301995 CASAVA_Build 2 126892801 1D TTTAAAAAAA T/- GACTTAATTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 1 0 301996 CASAVA_Build 2 126892929 1D TGGCATCCAT A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 1 0 301997 CASAVA_Build 2 126894039 3D GATATGTTCT TTC/--- TTATGTTCAC 3070 het 3070 hom 45 20 22 4 TTC 1 0 301998 CASAVA_Build 2 126894616 4D GAATATGACA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 46 23 15 9 TC 11 9 301999 CASAVA_Build 2 126895595 1D ATAAGAGTTT A/- AAGGATCTCT 3070 het 3070 ref 36 26 10 0 A 3 2 302000 CASAVA_Build 2 126895677 1I GATAATTATA -/T TTTTTAGTTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 5 6 302001 CASAVA_Build 2 126897893 3I CTTTCTTTCT ---/TCC TCCATTTCTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 TCC 1 2 302002 CASAVA_Build 2 126898801 1D ATTGAAAATT A/- AAAAAAAATT 2663 het 2663 ref 27 13 8 6 A 9 8 302003 CASAVA_Build 2 126903081 6I AAAATAACCT ------/TTGAGA TTAAGTATCC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TTGAGA 0 1 302004 CASAVA_Build 2 126903137 6I CCATTAGCAA ------/CTAGTC CTAGTCACTC 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 CTAGTC 1 2 302005 CASAVA_Build 2 126903794 1I CAGACTTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 8 9 302006 CASAVA_Build 2 126905460 4I ACCCAGTGAC ----/AGTT AGAACACAAA 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 AGTT 0 1 302007 CASAVA_Build 2 126905739 4D TAGTTATAAA AATC/---- AATAAGTAAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 7 AATC 1 0 302008 CASAVA_Build 2 126909724 1D TTACTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 1655 het 1655 ref 24 13 5 6 T 16 15 302009 CASAVA_Build 2 126911707 3D14M28D GTCTCAAAAA AACAAAAACAAAAACAAATATATATATATATATATATATATATAT/---AAAAACAAAAACAA---------------------------- ATATATATAT 2013 het 105 hom 6 1 6 5 N/A 0 0 302010 CASAVA_Build 2 126913467 1D GAAGCAGTTT G/- CAAGCAAGTT 3070 het 3070 hom 53 19 29 6 G 1 0 302011 CASAVA_Build 2 126914474 1I TTTACAGGGG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 6 7 302012 CASAVA_Build 2 126917152 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 11 10 302013 CASAVA_Build 2 126917348 5D TCACCATGTT GGCCA/----- GGATGGTCTC 1682 het 6 hom 7 0 4 4 GGCCA 1 0 302014 CASAVA_Build 2 126920744 1I GAGTGGAAGC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 7 8 302015 CASAVA_Build 2 126920991 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 112 hom 24 3 14 7 T 17 16 302016 CASAVA_Build 2 126922419 1D TAGCATTCCC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 20 7 T 7 6 302017 CASAVA_Build 2 126924760 1D TTAATGTGCG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 9 8 302018 CASAVA_Build 2 126934847 5D CAGCACCACA CTTTG/----- CTAAAATGCA 3070 het 3070 ref 43 20 13 12 CTTTG 1 0 302019 CASAVA_Build 2 126935888 1D GGAAGAAGAC T/- CACCAACCAC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 1 0 302020 CASAVA_Build 2 126937295 1D TATCAATAAG A/- AAAAAAAAAA 2007 het 198 hom 14 2 6 6 A 13 12 302021 CASAVA_Build 2 126938748 1I AAATACTCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 8 9 302022 CASAVA_Build 2 126943513 18I TGTAGAATAA ------------------/TTTTGAGATGCTTTTTGC TTTTTGCTCA 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 TTTTGAGATGCTTTTTGC 0 1 302023 CASAVA_Build 2 126946360 2I CTGGGAAGCT --/GG GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 G 6 8 302024 CASAVA_Build 2 126959129 2D CTATATGTTC TA/-- TAATCCCTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TA 2 1 302025 CASAVA_Build 2 126964424 1D CTCAAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 1643 het 1643 ref 29 20 5 4 A 15 14 302026 CASAVA_Build 2 126975037 5I ATATATATAC -----/TTATA ACTATAGAGA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 TTATA 0 1 302027 CASAVA_Build 2 126975639 11D AGGAAAAATG CAATAATAACC/----------- ACCTTTGCCC 3070 het 3070 ref 51 28 25 5 CAATAATAACC 1 0 302028 CASAVA_Build 2 126982995 1I ACAACTTTAG -/A TTTAACGTGG 3070 het 3070 ref 65 33 25 7 A 0 1 302029 CASAVA_Build 2 126988519 1I TGAAAACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 31 1 14 17 T 13 14 302030 CASAVA_Build 2 126990147 3D TCTGTTTAAA TAT/--- GGTGCTAGAA 3070 het 3070 ref 35 22 13 1 TAT 1 0 302031 CASAVA_Build 2 126990523 12D TGTCTATGCA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 het 1158 hom 39 7 23 12 TG 15 9 302032 CASAVA_Build 2 126997330 1D GTCCTGTTTG A/- GGGGGTGGGG 3070 het 3070 ref 36 20 10 7 A 1 0 302033 CASAVA_Build 2 127006917 1D ACCCTTGACC T/- TGTGATCTGC 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 T 2 1 302034 CASAVA_Build 2 127010038 2D CCACTCGAGA TG/-- TGTTCCCTGA 3070 hom 90 het 35 0 30 7 TG 2 1 302035 CASAVA_Build 2 127022990 2D AAGTCAACCT AG/-- AATACAATAC 2431 het 2431 ref 21 12 5 4 AG 1 0 302036 CASAVA_Build 2 127040913 2D AAAAAAAAAA GC/-- CACCACCACC 1179 het 1179 ref 38 25 5 9 GC 1 0 302037 CASAVA_Build 2 127067271 1D CAAGAATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 7 4 A 12 11 302038 CASAVA_Build 2 127073557 1D CCCCCAAATG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 A 8 7 302039 CASAVA_Build 2 127079345 1D CTGTGCATAC A/- AACTAGAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 A 3 2 302040 CASAVA_Build 2 127079579 3D CAGATGTACA AAG/--- AAGAGCTGGT 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 AAG 2 1 302041 CASAVA_Build 2 127080859 4I GAAATAAGGC ----/CACA CACCTACAAC 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 CA 1 3 302042 CASAVA_Build 2 127095103 2I CTACTGTATC --/AG AGGGCAGCAG 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 AG 1 2 302043 CASAVA_Build 2 127096882 4I ACTCACTTCT ----/CAGG CAGGGCGCTG 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 CAGG 1 2 302044 CASAVA_Build 2 127097236 1I ATACATGTTA -/T TTTTTTAGCT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 6 7 302045 CASAVA_Build 2 127104022 1I4M7I4M2I TATTATAAAC -ACTT-------CTAA--/AACTTTATGTTCATAAAT GTGATAACTT 3070 het 3070 ref 29 16 13 3 N/A 0 0 302046 CASAVA_Build 2 127104777 1I TAAATATCTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 6 7 302047 CASAVA_Build 2 127106238 1D GAATTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 11 6 A 11 10 302048 CASAVA_Build 2 127106524 2D48M5D AACAAACTTA ATATATGTCCATACAATGAAATATTATTTAGTAATTTTTAAAAATGAGCTTTTCC/--ATATGTCCATACAATGAAATATTATTTAGTAATTTTTAAAAATGAGCT----- TCTAAGCCAC 3070 het 3070 ref 21 8 8 19 N/A 0 0 302049 CASAVA_Build 2 127108038 1I ACTAGCTAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 9 10 302050 CASAVA_Build 2 127115016 1I ATAGATAGAT -/G TAGTCTTTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 302051 CASAVA_Build 2 127127393 4D TGTATCAGCC ACAG/---- ACAGTCAATG 3070 hom 108 het 40 0 35 6 ACAG 2 1 302052 CASAVA_Build 2 127133173 1I TCACACTGCA -/T TTTTTTATCT 3070 hom 127 het 49 0 43 6 T 6 7 302053 CASAVA_Build 2 127148510 1D GTGGGGGGGG A/- ATACAGGCTC 3070 hom 56 het 28 0 20 8 A 2 1 302054 CASAVA_Build 2 127151487 2D50M2I GAGAGTAGGA GTGTGTGTGTATAAGAGTGTGACAGTGTGTGTGTGAGCACGTGTGAGTCTGA--/--GTGTGTGTATAAGAGTGTGACAGTGTGTGTGTGAGCACGTGTGAGTCTGAGT GTGTGTGTAT 3070 het 740 hom 64 7 56 24 N/A 0 0 302055 CASAVA_Build 2 127153921 1I AAATCCATCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 216 hom 31 1 25 5 A 9 10 302056 CASAVA_Build 2 127155825 1D AACTTCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 39 0 19 20 A 16 15 302057 CASAVA_Build 2 127157366 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 30 0 24 8 A 10 11 302058 CASAVA_Build 2 127160705 1I GGGTGTTGCA -/G GGGGGCCGGG 3070 het 2202 hom 33 10 15 8 G 5 6 302059 CASAVA_Build 2 127166865 1D CAGGAGCCCT G/- GGAAGGGCTT 3070 het 3070 hom 31 14 13 6 G 3 2 302060 CASAVA_Build 2 127168854 2I AAGAAAAGAC --/AG AGGCTTGCTC 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 AG 1 2 302061 CASAVA_Build 2 127193519 3I CTGTGCATGT ---/CAC CCTGAGTGCT 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 CAC 0 1 302062 CASAVA_Build 2 127203034 1I AGTTTTAAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 9 10 302063 CASAVA_Build 2 127211461 4D36M4D ATAGATAGAT AGACAGATGATAGATAGATAGAAGATGAAAGATGATAGAAAGAT/----AGATGATAGATAGATAGAAGATGAAAGATGATAGAA---- AGAAGATTGA 3014 het 2168 hom 33 9 7 33 N/A 0 0 302064 CASAVA_Build 2 127240786 5D TGCCCAATCC ACCCG/----- ACCCGAAGTG 3070 hom 96 het 33 0 31 4 ACCCG 2 1 302065 CASAVA_Build 2 127250018 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2066 hom 29 8 10 11 A 12 13 302066 CASAVA_Build 2 127257954 2I ACACACACAC --/AT ACACACACAG 3070 het 3070 hom 51 17 22 12 AT 0 1 302067 CASAVA_Build 2 127262869 2I GAATCATATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 48 14 18 16 CA 7 8 302068 CASAVA_Build 2 127271158 4D ATATGCATGC ACAG/---- ACAAATACAC 3070 het 3070 ref 65 32 29 6 ACAG 1 0 302069 CASAVA_Build 2 127273124 6D2M3I TGCCCCCTTC TGCCCACT---/------CTGTA GAACGTTGGG 3070 het 3070 ref 41 22 13 8 N/A 0 0 302070 CASAVA_Build 2 127273614 3D CTGTTCTCTT TTA/--- TTTTCAGCCA 3070 het 3070 ref 36 17 13 10 TTA 1 0 302071 CASAVA_Build 2 127274897 1D ATATTGACTA C/- CTGTATGACA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 C 2 1 302072 CASAVA_Build 2 127276592 6I GGCCCTGGCC ------/CTGGCT CTGGCTCTGG 2715 het 1586 hom 32 9 10 13 CTGGCT 2 3 302073 CASAVA_Build 2 127282135 3D CAAGACAGTG GCT/--- GCTGCCCTTG 3070 het 3070 hom 37 16 14 10 GCT 2 1 302074 CASAVA_Build 2 127282848 1D CATGGTTTTA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 48 24 22 3 T 7 6 302075 CASAVA_Build 2 127288442 6I TTTTATTCTC ------/TCTCTT TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 TCTCTT 0 1 302076 CASAVA_Build 2 127288694 1D GGTTACGGAC T/- TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 T 7 6 302077 CASAVA_Build 2 127289992 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 10 9 302078 CASAVA_Build 2 127290703 8I CTTGAACTCC --------/TCAGGTGT CGACCTCAGG 2108 het 2108 ref 17 8 5 4 TCAGGTGT 0 1 302079 CASAVA_Build 2 127290866 1D GCCTAGTGGT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 9 8 302080 CASAVA_Build 2 127291810 1D TTTGTTCATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 10 9 302081 CASAVA_Build 2 127292222 1D TTAAATTGCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 T 8 7 302082 CASAVA_Build 2 127294519 1D AGCAGTGTCC T/- CAGCAGAATG 3070 het 3070 ref 54 28 22 4 T 1 0 302083 CASAVA_Build 2 127295306 1I GAAAATGCAC -/T GTGGATTACA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 0 1 302084 CASAVA_Build 2 127304420 1D CCGTCTAACC A/- AAAAAAAAAA 1794 het 1794 ref 20 11 4 5 A 15 14 302085 CASAVA_Build 2 127308520 3I CGTCATAACT ---/ATC ATCGTCACAA 3070 het 3070 ref 103 48 44 11 ATC 1 2 302086 CASAVA_Build 2 127324972 2D TGAGGGGTGC AG/-- AGAGAGAGAG 1889 het 1889 ref 39 24 4 11 AG 8 7 302087 CASAVA_Build 2 127333526 1I TATTCTCTCT -/A AATGTAATTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 2 3 302088 CASAVA_Build 2 127336625 1D AATAAAGGTA G/- GTGGAAATGG 3070 hom 105 het 43 0 36 8 G 2 1 302089 CASAVA_Build 2 127342115 1I AATCAAAGCT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 67 het 33 0 25 8 A 9 10 302090 CASAVA_Build 2 127342359 5I TACTAAAAAT -----/ATATA ATAAATATAT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 ATATA 0 1 302091 CASAVA_Build 2 127349564 1D TTTCAGCACT G/- GAGGAAGAAG 3070 hom 108 het 39 0 35 5 G 2 1 302092 CASAVA_Build 2 127351524 2D ATCCAGTAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 23 0 13 11 A 13 11 302093 CASAVA_Build 2 127356794 1D GCAAAGCACG C/- TGGGTCACCA 3070 hom 81 het 34 0 26 8 C 1 0 302094 CASAVA_Build 2 127366389 2I GACTCCTTTG --/GT AAGCTTAGTC 3070 hom 129 het 48 0 42 6 GT 0 1 302095 CASAVA_Build 2 127368688 1D GGCCTGTCTG C/- AAGACTCTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 302096 CASAVA_Build 2 127371762 1D TTGTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 6 T 13 12 302097 CASAVA_Build 2 127388594 1D TCCCCGGTGA G/- GAACTCTATA 3070 hom 102 het 40 0 34 7 G 2 1 302098 CASAVA_Build 2 127394690 1D AAAACGTCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 9 8 302099 CASAVA_Build 2 127419063 1D GGATTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 12 11 302100 CASAVA_Build 2 127429832 1D GGCTTCTACT G/- GGGGGGAGGG 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 G 7 6 302101 CASAVA_Build 2 127432168 2D TTCCTTTGGG TA/-- TATAGCCAGT 3070 het 3070 ref 18 11 7 1 TA 3 2 302102 CASAVA_Build 2 127434608 1D TAATTTTTTC A/- AAAAACCAGT 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 A 6 5 302103 CASAVA_Build 2 127438999 6D TACAAGTATG CACCAC/------ CACGCCTGGC 3070 het 3070 ref 27 12 12 5 CAC 3 1 302104 CASAVA_Build 2 127440056 2I GTCTAATATT --/AA GTCACCTCAA 2589 het 2589 ref 27 17 7 3 A 0 2 302105 CASAVA_Build 2 127442584 4D GTCATGGTGG TGGA/---- TGGAAGTGTG 3070 het 3070 ref 39 20 16 8 TGGA 2 1 302106 CASAVA_Build 2 127443396 1D GTGACAAAAA C/- CCCGCACTGA 3070 het 3070 hom 49 15 20 17 C 4 3 302107 CASAVA_Build 2 127448667 1D TGCAGGAACT G/- TCCAGACCCC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 G 1 0 302108 CASAVA_Build 2 127475846 1I TTTTTTTCTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 A 7 8 302109 CASAVA_Build 2 127476190 3I CTCAGCAGGT ---/TGC TGCTGCTCAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 TGC 2 3 302110 CASAVA_Build 2 127477829 11D CCACCCAGCA GACTACTATAG/----------- GACATCTCAT 3070 het 3070 ref 30 15 9 12 GACTACTATAG 1 0 302111 CASAVA_Build 2 127479240 15I GAGCGACCTG ---------------/ATAAGCAAGAAGGTA ATAGCTTAAA 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 ATAAGCAAGAAGGTA 0 1 302112 CASAVA_Build 2 127481156 1I CTGTAAAACC -/A AAACTACAGT 3070 het 3070 ref 47 25 22 0 A 3 4 302113 CASAVA_Build 2 127483523 1D TTCAAGATAG T/- TTTGGCTATT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 4 3 302114 CASAVA_Build 2 127491165 1I CTATTATATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 8 9 302115 CASAVA_Build 2 127496442 1I CAAGATATGA -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 T 6 7 302116 CASAVA_Build 2 127500988 1I AAAAGATAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 9 10 302117 CASAVA_Build 2 127502610 2D GTCCCATATT AA/-- AAGTCTTTTA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 A 4 2 302118 CASAVA_Build 2 127505578 2D GCTCAGCTAG TT/-- TTTTTTTTTG 2169 het 1492 hom 15 6 6 3 T 11 9 302119 CASAVA_Build 2 127518498 2D CATACACATT CA/-- CACTCACATT 3070 het 3070 hom 85 35 41 9 CA 2 1 302120 CASAVA_Build 2 127518714 4D CATTCACACA CACT/---- CATTCACACA 3070 het 3070 ref 79 48 26 9 CACT 1 0 302121 CASAVA_Build 2 127520620 1I TATATTGTCA -/T AAAACCTAAT 3070 hom 81 het 32 0 26 6 T 0 1 302122 CASAVA_Build 2 127520683 5I TTTTTTGTTT -----/TTTTG TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 TTTTG 3 4 302123 CASAVA_Build 2 127528183 2I ACCACGCATG --/CA CAGAGCAAGC 2977 het 2977 ref 31 20 9 2 CA 1 2 302124 CASAVA_Build 2 127531943 1D CGAAGAAGAG A/- AGAGGCCCCA 3070 hom 36 het 13 0 11 2 A 2 1 302125 CASAVA_Build 2 127541115 2D AAACCCGTTC AA/-- AAAAAAAAAA 2354 het 123 hom 19 2 7 10 A 16 14 302126 CASAVA_Build 2 127546668 2D AGCATGTGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 127 hom 29 2 9 18 A 13 11 302127 CASAVA_Build 2 127557125 1D TGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1157 het 1157 ref 43 31 4 8 T 13 12 302128 CASAVA_Build 2 127565772 1D CCATTTCTAC A/- AAAAAAAAAT 2717 het 2717 ref 24 12 7 5 A 10 9 302129 CASAVA_Build 2 127568594 1I TGGGAGCTCC -/A GGTCCCTCTG 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 A 0 1 302130 CASAVA_Build 2 127585268 6D TTTCTCCTAC TTCTTT/------ TTCTTTTTAT 3070 het 2985 hom 29 9 18 4 TTCTTT 2 1 302131 CASAVA_Build 2 127599343 1I TCACCTCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 8 9 302132 CASAVA_Build 2 127607137 8D2M9D TCCATCTGGT TGACCCAGCACGGGGGATG/--------CA--------- CTTCAATCTA 3070 het 3070 ref 33 18 14 10 N/A 0 0 302133 CASAVA_Build 2 127617803 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 9 10 302134 CASAVA_Build 2 127623446 1D GTTTAACAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 71 het 29 0 26 4 T 10 9 302135 CASAVA_Build 2 127625956 1I TGCCACTTCC -/T TTTTTTTTTT 2360 het 2360 ref 29 14 7 8 T 10 11 302136 CASAVA_Build 2 127626922 2D ACAGATTTTT AC/-- AGTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 AC 1 0 302137 CASAVA_Build 2 127651789 1D GGCCACATTT C/- CCCCCCACAC 3070 hom 102 het 37 0 32 5 C 7 6 302138 CASAVA_Build 2 127657355 1I TCTGACTTGT -/C CTGTCTTTCC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 2 302139 CASAVA_Build 2 127661252 1I TGATCAGCGA -/C ACACAAATAC 3070 hom 54 het 25 0 16 9 C 0 1 302140 CASAVA_Build 2 127663215 1D AAAAACACTG C/- CCCCCCCCTC 3070 hom 38 het 28 0 14 14 C 9 8 302141 CASAVA_Build 2 127666666 3D TGCCTTTCCC GGG/--- GGGGGGGGCT 2653 hom 45 het 20 0 11 9 G 11 8 302142 CASAVA_Build 2 127670309 2I AGGATTTCAC --/TG TGTTAGCCAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TG 1 2 302143 CASAVA_Build 2 127670580 1D CTCTTTCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 27 1 19 7 A 12 11 302144 CASAVA_Build 2 127676790 1D AAACAAAATG T/- TTTTTTTTTT 1694 het 1694 ref 36 22 5 9 T 12 11 302145 CASAVA_Build 2 127677216 1D TTCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 925 het 925 ref 35 19 3 14 A 15 14 302146 CASAVA_Build 2 127679894 1D GAGGGGGCCT C/- CCCCTGAGCT 3070 hom 48 het 22 0 12 10 C 5 4 302147 CASAVA_Build 2 127687354 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 370 hom 21 2 17 2 A 11 12 302148 CASAVA_Build 2 127697973 1D AGCCTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 22 1 17 4 T 13 12 302149 CASAVA_Build 2 127698735 8I TATTGCCTTT --------/ATAATAAA ATAATAAAAT 3070 hom 18 het 11 0 7 4 ATAATAAA 2 3 302150 CASAVA_Build 2 127706135 1I CCGAGTAGCT -/G GGGACTACAG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 3 4 302151 CASAVA_Build 2 127706379 1D GGAGATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 37 1 31 5 A 11 10 302152 CASAVA_Build 2 127720383 8D GAGATGAGGG TCTCGCTA/-------- TGTTGCCCAG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TCTCGCTA 1 0 302153 CASAVA_Build 2 127750818 1I ACGATGAAAG -/A AAAAACATTA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 5 6 302154 CASAVA_Build 2 127752285 1D CCCTAACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 292 hom 27 1 13 13 A 13 12 302155 CASAVA_Build 2 127760029 1I AGAGCAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 30 1 24 5 A 10 11 302156 CASAVA_Build 2 127772991 1D TTATATTAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 8 302157 CASAVA_Build 2 127774031 2I CCTGATACAC --/AG AGTTAAAAGC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AG 1 2 302158 CASAVA_Build 2 127792095 1I AGAAAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 22 2 12 8 T 14 15 302159 CASAVA_Build 2 127816086 2I ACTAACTTTG --/TA TATGTTTTTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TA 1 2 302160 CASAVA_Build 2 127816740 3I GGAAAACAAA ---/ATG ATATGTAAAC 3070 hom 132 het 46 0 45 1 ATG 0 1 302161 CASAVA_Build 2 127820791 1I CCCAGCACTT -/A TGGGAGGCTG 3070 hom 84 het 29 0 28 1 A 0 1 302162 CASAVA_Build 2 127824356 1I CACTGAATAG -/A AAAAAATGAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 6 7 302163 CASAVA_Build 2 127843160 1D CGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 35 het 16 0 12 4 T 10 9 302164 CASAVA_Build 2 127851435 1I ATTTCAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 30 1 24 5 T 13 14 302165 CASAVA_Build 2 127855950 27D GGAACAAGCT AAACAATGCTATGACGGGGGGAGGGGG/--------------------------- GTGGAATCTG 3070 hom 81 het 26 0 28 3 AAACAATGCTATGACGGGGGGAGGGGG 1 0 302166 CASAVA_Build 2 127879287 14D ATACCTGAAC AAAACTGGGGTGCT/-------------- AAAACTGGGG 3070 hom 87 het 29 0 28 4 AAAACTGGGGTGCT 2 1 302167 CASAVA_Build 2 127897705 1D CCTCCGGGCG C/- CCCCTGCGCA 3070 hom 43 het 17 0 9 8 C 5 4 302168 CASAVA_Build 2 127907020 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 3 A 12 11 302169 CASAVA_Build 2 127918485 1I CATATAGAAC -/T TTTTACTTAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 4 5 302170 CASAVA_Build 2 127920163 3D GAAGAAGTGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 57 het 24 0 20 5 TTG 5 4 302171 CASAVA_Build 2 127932324 1I ATTCCAAACC -/A AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 22 8 6 8 A 13 14 302172 CASAVA_Build 2 127953383 5D CACTAGATGC CTCTG/----- CTTTTTCCTT 3070 hom 15 het 33 1 17 17 CTCTG 1 0 302173 CASAVA_Build 2 127959845 2D ATTAAGAAAG CA/-- CACACACACA 717 het 717 ref 56 42 3 13 CA 7 6 302174 CASAVA_Build 2 127965494 1D TTACTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 33 2 23 8 T 13 12 302175 CASAVA_Build 2 127966593 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 24 0 12 13 A 14 12 302176 CASAVA_Build 2 127971157 3D AATATATCCC TGT/--- TGTTAAGCGA 3070 hom 76 het 32 0 26 6 TGT 2 1 302177 CASAVA_Build 2 127982399 1D ACTGAGCTGC A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 148 het 59 0 50 9 A 8 7 302178 CASAVA_Build 2 127993406 1D AAAAAATAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 32 0 24 9 T 10 9 302179 CASAVA_Build 2 127993624 1D TGAGGGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 11 10 302180 CASAVA_Build 2 127998920 6D GGAAAGTGTT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 2944 hom 26 het 23 0 10 13 TTTTTG 4 3 302181 CASAVA_Build 2 128016021 1I TGGGTTGGCT -/G GGCCCTGTGC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 2 3 302182 CASAVA_Build 2 128024604 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 825 hom 28 4 15 9 A 13 12 302183 CASAVA_Build 2 128024915 1I GAAGATGTGA -/G GGGAGGATAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 3 4 302184 CASAVA_Build 2 128040596 1I TGATAACCCC -/T GAGGGCAGAG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 0 1 302185 CASAVA_Build 2 128053371 1D ATAAACTGTT C/- TAGAGCAATG 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 C 1 0 302186 CASAVA_Build 2 128058002 2D AGGAGAGAGA GT/-- GTGCAGGAAT 3070 hom 168 het 62 0 55 10 GT 2 1 302187 CASAVA_Build 2 128080001 1I GGCGGCTGGG -/C CCGCGGGACC 3070 hom 71 het 26 0 16 10 C 2 3 302188 CASAVA_Build 2 128124592 1I GCCTCTGACG -/C TCACGCACAC 3070 hom 113 het 42 0 34 8 C 0 1 302189 CASAVA_Build 2 128165606 2D TTTTCAGGTA TT/-- TTTATAGCAA 1358 het 1358 ref 32 28 3 1 T 5 3 302190 CASAVA_Build 2 128231122 1D ACCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1164 het 1164 ref 35 11 5 19 A 17 16 302191 CASAVA_Build 2 128243488 3D AAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAAAA 652 het 652 ref 41 24 6 11 AAC 1 0 302192 CASAVA_Build 2 128258034 1D ATTAGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 10 6 A 11 10 302193 CASAVA_Build 2 128268237 4D GAAAGAAAGT AAGC/---- AAGCAAGCAA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 AAGC 3 2 302194 CASAVA_Build 2 128309074 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1994 het 1994 ref 38 25 5 8 A 12 11 302195 CASAVA_Build 2 128310464 2I ACATTTTCTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 TA 6 7 302196 CASAVA_Build 2 128321678 1D ATCTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 1273 het 1273 ref 37 20 7 10 A 17 16 302197 CASAVA_Build 2 128344287 1I TGAACCCAGG -/A GGTGGAGGTT 3070 hom 27 het 11 0 9 2 A 0 1 302198 CASAVA_Build 2 128355142 1I TGTCAGTTCT -/G GAACTGGCTT 3070 het 3070 ref 52 23 23 6 G 1 2 302199 CASAVA_Build 2 128406083 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 18 0 14 4 A 13 12 302200 CASAVA_Build 2 128414344 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAGCCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 0 1 302201 CASAVA_Build 2 128418478 1I GTCTCTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 16 7 T 10 11 302202 CASAVA_Build 2 128422025 1D GTAGGGACGA G/- GTTTCACCAT 3070 hom 57 het 23 0 18 5 G 2 1 302203 CASAVA_Build 2 128426495 2D ACTCCATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 30 0 15 16 A 20 18 302204 CASAVA_Build 2 128448520 1I ACATAAGGAT -/G TTTCAATGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 302205 CASAVA_Build 2 128453544 89D GAAAAAAAAA AGATAGAGGAAACCTCGATAATAAAATGGCTTTTAAAGTCATATTAACTAATCACAATGTATGCATCTTATCAGAATACTCATTCAAAT/----------------------------------------------------------------------------------------- AGATAATATA 3070 hom 58 het 20 0 20 2 AGATAGAGGAAACCTCGATAATAAAATGGCTTTTAAAGTCATATTAACTAATCACAATGTATGCATCTTATCAGAATACTCATTCAAAT 1 0 302206 CASAVA_Build 2 128469091 1D ACTTTGTGTA T/- ACTGTATAGG 3070 hom 105 het 42 0 34 8 T 1 0 302207 CASAVA_Build 2 128528629 1I ACATCTATTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 7 8 302208 CASAVA_Build 2 128529905 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 27 1 19 7 A 14 13 302209 CASAVA_Build 2 128538511 1I TAGAGTCAAC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 815 hom 45 4 35 6 A 0 1 302210 CASAVA_Build 2 128564693 1D31M1D GCTACCTATT CCAAAACAATTTTAAACTGGTTTATATTAGTTA/-CTAAACAATTTTAAACTGGTTTATATTAGTT- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 9 N/A 0 0 302211 CASAVA_Build 2 128566282 1D TTCACTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 13 12 302212 CASAVA_Build 2 128567307 1I AGGATTTTCA -/T TTTTACCTAT 3070 hom 146 het 54 0 48 6 T 4 5 302213 CASAVA_Build 2 128579937 2I TTGAACTCCT --/GA GCTCAAGCAG 3070 hom 41 het 17 0 12 5 GA 0 1 302214 CASAVA_Build 2 128581250 1D CTACTGGTTT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 66 het 30 0 23 10 A 9 8 302215 CASAVA_Build 2 128582306 4I7M4D TTAAAAAAAT ----AAAAGAATATC/AAGAAAAAGAA---- TATATAGAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 N/A 0 0 302216 CASAVA_Build 2 128582620 4D TAAGAAGAGA CAGT/---- CAAAGATGTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CAGT 1 0 302217 CASAVA_Build 2 128582726 1D TCACAAAAAA T/- ATATAGTAAT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 1 0 302218 CASAVA_Build 2 128586632 1D ATTTTATTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 16 0 10 6 T 13 12 302219 CASAVA_Build 2 128592038 6D GTGTGTGTGT GAGAGA/------ GAGAGAGAGA 1008 het 91 hom 14 2 7 6 GA 11 8 302220 CASAVA_Build 2 128594994 11D TGTGCTACAT GCGTTAGTGTA/----------- GCGTTAGTGT 3070 hom 78 het 26 0 27 2 GCGTTAGTGTA 1 0 302221 CASAVA_Build 2 128596578 1D AACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 2549 het 1968 hom 28 9 7 12 A 15 14 302222 CASAVA_Build 2 128598732 1D TCTCTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 12 11 302223 CASAVA_Build 2 128600803 4I CTCGGCTCAC ----/TGCA TGCAGCCTCT 3070 hom 47 het 18 0 17 1 TGCA 1 2 302224 CASAVA_Build 2 128602360 1I CCTTTCTATC -/T TTTTTTTTTT 2360 hom 30 het 13 0 10 3 T 13 14 302225 CASAVA_Build 2 128607349 1I TTTCTCCCTT -/G GCCTAGTCCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 2 302226 CASAVA_Build 2 128608086 1I CTCTTTTCTT -/C CCCCCCACTC 3070 hom 92 het 36 0 29 7 C 6 7 302227 CASAVA_Build 2 128610488 4I TTTTCCAGAA ----/CGTT CTAGGTTGCA 3070 hom 123 het 49 0 41 8 CGTT 0 1 302228 CASAVA_Build 2 128620612 5D ATATAAATAT TAATA/----- TATATAGTTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TAATA 1 0 302229 CASAVA_Build 2 128626221 1D CCTTTTCCTA T/- TTTTTTTTTT 2205 het 2205 ref 33 21 6 6 T 12 11 302230 CASAVA_Build 2 128627160 3D GAAGAAAACA TCT/--- TCTGGGCAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 4 TCT 2 1 302231 CASAVA_Build 2 128732145 1D TAAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 1295 het 1295 ref 17 9 5 4 A 16 15 302232 CASAVA_Build 2 128748607 4D GAAAAAACAG AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 51 19 18 15 AACA 5 4 302233 CASAVA_Build 2 128753180 1D GTGAGCCCTG T/- TCCTCAGGCC 3070 het 1974 hom 27 6 14 7 T 2 1 302234 CASAVA_Build 2 128759652 1I GGGCTGTCTG -/C CCAGCACCTG 3070 hom 77 het 27 0 19 8 C 2 3 302235 CASAVA_Build 2 128762065 1I CAGGAGAAGG -/T TGACAGTGCC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 1 2 302236 CASAVA_Build 2 128762744 12I AACAAACAAA ------------/ACGATAATGTAC ACAATCTAAT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 ACGATAATGTAC 0 1 302237 CASAVA_Build 2 128784640 2I GCCCCATCTT --/CA CACCACGGCT 3070 het 3070 hom 50 16 23 11 CA 1 2 302238 CASAVA_Build 2 128785054 1I TCCACACCCC -/T GCTCATCCTG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 0 1 302239 CASAVA_Build 2 128800533 1I TAAAGCCGAG -/T TTTTCATTCT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 4 5 302240 CASAVA_Build 2 128801244 1I CCCTGTGAGG -/C CCTACAGGGT 3070 hom 72 het 27 0 23 4 C 2 3 302241 CASAVA_Build 2 128802011 2D AACAGGTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 12 10 302242 CASAVA_Build 2 128813753 1I TAATAACAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 10 302243 CASAVA_Build 2 128822541 1D GTTTCTCCTG C/- CCTGAACCTC 3070 hom 94 het 39 0 30 9 C 3 2 302244 CASAVA_Build 2 128829561 2D TACACTCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 26 0 16 10 T 13 11 302245 CASAVA_Build 2 128870526 6D AACAAACAGT CGTGGC/------ AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 30 16 13 4 CGTGGC 1 0 302246 CASAVA_Build 2 128872387 1I CAGTTGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2181 hom 27 8 14 5 T 10 11 302247 CASAVA_Build 2 128873808 3I CTCTCTCTCT ---/CTC TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 CTC 0 1 302248 CASAVA_Build 2 128879374 1I TGAGGTGGTC -/A CAGCAAGCAT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 0 1 302249 CASAVA_Build 2 128880731 3I TGCCTTTCCC ---/AGG AGGAGCAAGT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 AGG 1 2 302250 CASAVA_Build 2 128899803 4D GGGGTCTCCA CCAG/---- CCAGTCCTCC 3070 het 3070 hom 43 20 18 7 CCAG 2 1 302251 CASAVA_Build 2 128906952 1I CATTTGGTTC -/T TTTTTTTTTT 1830 het 735 hom 24 2 7 15 T 15 16 302252 CASAVA_Build 2 128916645 1I CCGTGCCCCG -/C CCCCCCACTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 C 6 7 302253 CASAVA_Build 2 128925676 1D TGTGTTCTTA T/- TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 6 5 302254 CASAVA_Build 2 128935673 3I AGCTAGAAGT ---/CAA CAACAGAAAA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 CAA 1 2 302255 CASAVA_Build 2 128954904 1D AATATCAGGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 38 15 15 9 A 9 8 302256 CASAVA_Build 2 128963776 3I TCTCGGCCCC ---/CTT CTTCTCCTCT 2323 het 2323 ref 27 11 9 7 CTT 1 2 302257 CASAVA_Build 2 129015298 1I TGCATTTTGA -/T TTTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 T 6 7 302258 CASAVA_Build 2 129140690 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1726 hom 25 7 13 5 A 15 14 302259 CASAVA_Build 2 129149881 2D GAAATACGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 30 0 24 7 A 14 12 302260 CASAVA_Build 2 129153574 1D AGTTATAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 11 10 302261 CASAVA_Build 2 129155460 1I AAAAATGGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 T 9 10 302262 CASAVA_Build 2 129162509 4D46M2D TGGGAAGTAC TCTGTCTGCTTCTATTATCTGGAAGAGATTGTGATGAATGACAATCAATATT/----TCTGCTTCTATTATCTGGAAGAGATTGTGATGAATGACAATCAATA-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 14 N/A 0 0 302263 CASAVA_Build 2 129172852 1D TTATAAATAC A/- TGGAAATTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 1 0 302264 CASAVA_Build 2 129175610 2D TTTTTTTTTT TA/-- AATTAAAGCC 3070 hom 87 het 32 0 29 6 TA 1 0 302265 CASAVA_Build 2 129186063 1I TCATACAGTA -/T TTTTATTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 4 5 302266 CASAVA_Build 2 129192128 31D TTCATCATTC TGGTTGTTAATGATCTCTTTCTGTGTTTATT/------------------------------- TGGTTGTTAA 3070 het 3070 ref 57 30 16 20 TGGTTGTTAATGATCTCTTTCTGTGTTTATT 1 0 302267 CASAVA_Build 2 129212667 1D CCCCAGCTTG T/- CCCCCACAGA 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 T 1 0 302268 CASAVA_Build 2 129219912 1I TCAAAGCAGT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 7 8 302269 CASAVA_Build 2 129223153 1D ATGCAGTGGA G/- GTTGAAGAAT 3070 het 3070 ref 62 32 28 3 G 2 1 302270 CASAVA_Build 2 129223603 1D ACATGCCCCG T/- GTCTGGAATT 3070 het 3070 ref 55 23 25 9 T 1 0 302271 CASAVA_Build 2 129226109 1I TCCACTGTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 9 10 302272 CASAVA_Build 2 129229827 1I TGGCTGTTTA -/G GGTTTCATAT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 G 2 3 302273 CASAVA_Build 2 129235082 1D TAATGAAGTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 T 9 8 302274 CASAVA_Build 2 129237642 1I ATGATTTCAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 28 0 21 7 T 9 10 302275 CASAVA_Build 2 129240632 1D CCTTATACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 35 1 27 8 T 11 10 302276 CASAVA_Build 2 129251932 1I GCCAAGCTGA -/G GGGAAGAATC 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 G 3 4 302277 CASAVA_Build 2 129252063 1D ATAAATACCT C/- TGGGGGGACA 3070 het 3070 ref 41 22 17 4 C 1 0 302278 CASAVA_Build 2 129255968 1D TGTGATTAAA G/- GAGGTTGGAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 2 1 302279 CASAVA_Build 2 129256425 6I CAGTACTGCT ------/AAGGAA AAGGAAAAGT 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 AAGGAA 1 2 302280 CASAVA_Build 2 129263080 2D TGTGTCTGCA TG/-- TGTGTGTGCA 2345 het 2345 ref 85 65 8 13 TG 5 4 302281 CASAVA_Build 2 129263181 2D ATATGTGTGC AT/-- GTGTGTGTGC 3070 hom 31 het 65 1 56 8 AT 1 0 302282 CASAVA_Build 2 129266510 1I23M2I CACACACAAC -CCTCACACATCCACACAGTGTCT--/ACCTCACACATCCACACAGTGTCTCA CACACACACA 3070 het 629 hom 42 6 27 35 N/A 0 0 302283 CASAVA_Build 2 129267041 2I CACACAGTAC --/CA CACACACATG 3070 hom 138 het 58 0 46 12 CA 4 5 302284 CASAVA_Build 2 129267234 2D AGGGTTAAAG AA/-- AAAGCTTTTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 5 3 302285 CASAVA_Build 2 129268055 1I ATCTACACCA -/C CCCCCGCCAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 5 6 302286 CASAVA_Build 2 129274560 1I CATATAGTCG -/T TTCTTACATT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 T 2 3 302287 CASAVA_Build 2 129274960 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 48 het 17 0 16 1 T 5 6 302288 CASAVA_Build 2 129276415 4D TTCCTTCCTT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 71 het 29 0 24 6 TTCC 5 4 302289 CASAVA_Build 2 129309074 1I AGTCATGATG -/C CCCCCTGATG 3070 hom 85 het 34 0 28 6 C 5 6 302290 CASAVA_Build 2 129312311 1D CCAACAGTCC A/- CAGTTGACAG 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 A 1 0 302291 CASAVA_Build 2 129333032 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 10 11 302292 CASAVA_Build 2 129354892 11D21M4D11M3D9M20I AGGGAGAGGC AGTGTTTCCAATCTCAAAGGAAAGAATGAGGGAGAAACAGAGGGACCCAGAGGACAGAT--------------------/-----------TTGCAGATGACCTATTGTGGG----ACCTTGTGATC---ATGTGAGTTAATACTACTTAATAAACTCC CCAGGATATC 1036 het 1036 ref 16 19 4 3 N/A 0 0 302293 CASAVA_Build 2 129358324 1I TTATCAAGCA -/C TTTTCCTGAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 C 0 1 302294 CASAVA_Build 2 129365857 11D TGCCTCAGGC TGGTATTATTT/----------- TTGGTTAACT 3070 hom 94 het 34 0 31 5 TGGTATTATTT 1 0 302295 CASAVA_Build 2 129368452 1D AGTTTATTGC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 74 het 32 0 23 10 A 10 9 302296 CASAVA_Build 2 129384917 1D TCCGCCTCCT G/- GGTTCAAGCA 3070 het 2619 hom 17 6 10 1 G 3 2 302297 CASAVA_Build 2 129388249 1D ATGTAAAGGG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 8 302298 CASAVA_Build 2 129404466 1D ATTGTTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 23 16 3 T 10 9 302299 CASAVA_Build 2 129404844 1D GTGCTAATAT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 G 1 0 302300 CASAVA_Build 2 129415065 12D ACACACACAC ACACACACACAG/------------ ACAGAGAGAG 1603 het 128 hom 26 2 11 16 ACACACACACAG 1 0 302301 CASAVA_Build 2 129415898 26D GTTTCAAGGG CACCGATCAGCAAACACAGCTCCAAT/-------------------------- CACCGATCAG 3070 hom 93 het 40 0 31 18 CACCGATCAGCAAACACAGCTCCAAT 2 1 302302 CASAVA_Build 2 129419052 1D TTGTAGTTCT C/- CTTGAAGAGG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 2 1 302303 CASAVA_Build 2 129429461 1D TGTTCTTGTT C/- CTTTTTGTGG 3070 hom 72 het 25 0 25 1 C 2 1 302304 CASAVA_Build 2 129450103 1D TCTACTCTAT A/- AAAGATTCCG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 4 3 302305 CASAVA_Build 2 129454997 7I CTAGTAGCTG -------/GGATTAC AGGCACATGC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 GGATTAC 0 1 302306 CASAVA_Build 2 129482098 1I GAGGGCAAAG -/C CAAAGGCAGA 3070 hom 153 het 57 0 50 7 C 1 2 302307 CASAVA_Build 2 129483731 1I GATACCGCAA -/G GGCCCCATGG 3070 hom 52 het 24 0 17 7 G 2 3 302308 CASAVA_Build 2 129496541 1D CTATAGAAAA T/- TGTCTTCAGA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 2 1 302309 CASAVA_Build 2 129497144 1I ATGTTGCACA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 423 hom 35 1 27 7 T 7 8 302310 CASAVA_Build 2 129505076 1I TAGAAATTCC -/A CTCCCAGCTA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 0 1 302311 CASAVA_Build 2 129509986 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 2345 hom 26 10 13 3 A 9 8 302312 CASAVA_Build 2 129510138 1D GCTTTGTCAG A/- AAAAGATTAG 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 A 5 4 302313 CASAVA_Build 2 129521259 1I CTGGCTCCAT -/G AAAAGAGTTA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 0 1 302314 CASAVA_Build 2 129525887 2D AACAAGATAT CA/-- CACACACACA 3070 hom 125 het 51 0 39 15 CA 6 5 302315 CASAVA_Build 2 129527132 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 7 302316 CASAVA_Build 2 129529969 1D CTGAGCCTGT C/- CCATTATCCG 3070 het 3070 hom 58 22 21 16 C 3 2 302317 CASAVA_Build 2 129531458 2D CCTTATCCTC TA/-- TACATTCCTG 3070 hom 81 het 33 0 27 9 TA 2 1 302318 CASAVA_Build 2 129540782 2I CTAGAGACAC --/AG TGAAATCTTT 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 AG 0 1 302319 CASAVA_Build 2 129542518 1D ATGAGTGATA G/- GTTCATTTGC 3070 het 3070 ref 33 19 14 1 G 2 1 302320 CASAVA_Build 2 129546745 3D AAATAAAAGA CAT/--- CTTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 37 22 13 3 CAT 1 0 302321 CASAVA_Build 2 129556711 1I TACGCATACC -/T TTGGATATCT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 2 3 302322 CASAVA_Build 2 129558531 2D TTGTATTCTC TG/-- TATGCAGAAT 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 TG 1 0 302323 CASAVA_Build 2 129587216 1I TTAGATCTAT -/G GTCCATTTTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 1 2 302324 CASAVA_Build 2 129590062 1I AGGGGTTTGT -/A ACTGAAGTCT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 A 1 2 302325 CASAVA_Build 2 129597296 2I ATCCTGTATC --/TT TTTTTTTTTT 1295 het 1295 ref 25 11 4 10 T 12 14 302326 CASAVA_Build 2 129607382 1I CCAATTTGCC -/T TTGTCAACTG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 2 3 302327 CASAVA_Build 2 129608711 1D GGCAATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 19 17 16 A 12 11 302328 CASAVA_Build 2 129612114 4D CATTTGGGTT TTTG/---- TTTGTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 21 10 4 TTTG 2 1 302329 CASAVA_Build 2 129615196 2D TATTTGTTAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 43 2 37 4 AT 7 6 302330 CASAVA_Build 2 129618291 1D TTATTCCCTT A/- TTCGGCCCCG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 1 0 302331 CASAVA_Build 2 129619244 6I TGATGTTTTG ------/ATATAC ATGTACATTG 3070 hom 138 het 54 0 47 7 ATATAC 0 1 302332 CASAVA_Build 2 129624413 3I ATAGCTACTC ---/CTT CTCTCTTTTG 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 CTT 0 1 302333 CASAVA_Build 2 129625037 3D GCTTTTTAAC TTG/--- TTGTTGTTTC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 TTG 3 2 302334 CASAVA_Build 2 129628196 1D TCTTATTAAC T/- TGTCTCTGAT 3070 het 3070 ref 42 19 16 8 T 2 1 302335 CASAVA_Build 2 129631665 5D AATGTTTTTG TTGAC/----- TTGAATTGTA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 TTGAC 1 0 302336 CASAVA_Build 2 129633113 1I61M6I TATTTGGAGG -AAAAAAAGGCTGGAAACTTTTCATATTTGACAAAAGACACAAATTTTTCAATTCAGAAAGC------/AAAAAAAAGGCTGGAAACTTTTCATATTTGACAAAAGACACAAATTTTTCAATTCAGAAAGCCAAACA TGTTCCAAGT 3070 hom 160 het 33 0 54 3 N/A 0 0 302337 CASAVA_Build 2 129637172 2D TTGAAGTCAC AG/-- GGGAAAATTT 3070 hom 90 het 33 0 30 4 AG 1 0 302338 CASAVA_Build 2 129652139 1D TCTCTGACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 122 het 48 0 44 4 T 10 9 302339 CASAVA_Build 2 129658406 1I TTATGCAAGG -/C TTTTGTCTCC 3070 het 3070 hom 36 15 21 0 C 0 1 302340 CASAVA_Build 2 129659162 4D AAAAGATTAT TAAG/---- TGTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 31 16 15 2 TAAG 1 0 302341 CASAVA_Build 2 129666374 1I29M10D GAGGCGCCAT -GCCCCTGCTCTCAAGAAGCTCTCATGGTGCGCCCACCCA/GGCCCCTGCTCTCAAGAAGCTCTCATGGTG---------- TGCGGATGGG 2877 het 2877 ref 26 22 8 3 N/A 0 0 302342 CASAVA_Build 2 129673274 2D TTTTAGACAT AA/-- GAGATATAAA 2008 het 2008 ref 23 12 5 7 A 2 0 302343 CASAVA_Build 2 129673322 1I GGATATTGTT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 7 8 302344 CASAVA_Build 2 129675772 4I CACAAGTGAA ----/TATG TATGCAAATT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 TATG 1 2 302345 CASAVA_Build 2 129677768 5D TAAAAGTGAC AAAAT/----- TGCCATTATG 3070 het 3070 hom 32 12 20 0 AAAAT 1 0 302346 CASAVA_Build 2 129687035 2D AGCTCTCTTG TC/-- TCTGAGATTT 3070 het 3070 hom 39 16 19 7 TC 2 1 302347 CASAVA_Build 2 129694035 1D ATATAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2844 hom 23 7 10 6 A 11 10 302348 CASAVA_Build 2 129694285 1I ATTATGCATT -/A GAAGAATGCA 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 A 0 1 302349 CASAVA_Build 2 129694790 15D AAATCTATAG GGAACGAAGGTTAGT/--------------- GGTTGCCTAG 3070 het 3070 ref 38 18 19 7 GGAACGAAGGTTAGT 1 0 302350 CASAVA_Build 2 129699320 6D ATTTCTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 20 6 11 3 T 22 16 302351 CASAVA_Build 2 129700167 1D AACCCTGGAT A/- GAGGCCCTTC 3070 hom 78 het 34 0 29 6 A 1 0 302352 CASAVA_Build 2 129702932 1I TCATGCCCTT -/G GCAGTCTGGC 3070 hom 121 het 46 0 34 12 G 1 2 302353 CASAVA_Build 2 129711152 1I TAAAGATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1429 hom 34 6 22 6 A 13 14 302354 CASAVA_Build 2 129714964 1D GTGCATTATA T/- GATAGGTGGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 1 0 302355 CASAVA_Build 2 129719595 1D TCTTCTTTTA T/- TGGAAAATAT 3070 hom 101 het 39 0 34 6 T 2 1 302356 CASAVA_Build 2 129723166 1I TAAGATTACA -/G GCATGAGCCA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 G 1 2 302357 CASAVA_Build 2 129735467 4I AGCCTTTGCC ----/TGTT TGTTTTGGTC 3070 hom 96 het 42 0 33 9 TGTT 1 2 302358 CASAVA_Build 2 129773283 2D AAAAGATATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 67 het 28 0 21 7 CA 10 9 302359 CASAVA_Build 2 129783470 12I TGCAACAGCA ------------/ACTTGGTAGCAG GTGTTGTACT 3070 hom 173 het 62 0 51 12 ACTTGGTAGCAG 0 1 302360 CASAVA_Build 2 129786094 4I TTTAAATAAT ----/AAAC AAACTATTAG 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AAAC 1 2 302361 CASAVA_Build 2 129811401 4D GTGTTGAATA TTTG/---- TTCTTACTCC 3070 hom 120 het 44 0 41 4 TTTG 1 0 302362 CASAVA_Build 2 129817855 2D CTTGGGTGAC AA/-- GAGCAAAACT 3070 hom 72 het 26 0 25 5 A 2 0 302363 CASAVA_Build 2 129820599 2I TAGTCATTTC --/TG TAAAAAATAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TG 0 1 302364 CASAVA_Build 2 129823437 5D GCTTTTTAAA TTGTG/----- TTGTTTTGTT 3070 hom 87 het 36 0 30 9 TTGTG 1 0 302365 CASAVA_Build 2 129823946 1D TGTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 901 het 213 hom 30 2 3 25 T 11 10 302366 CASAVA_Build 2 129829321 1D TTTCAGGAAG T/- TTCAGTTCAG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 3 2 302367 CASAVA_Build 2 129831857 2D GCATCTGGAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 126 het 48 0 41 9 AC 6 5 302368 CASAVA_Build 2 129835200 2D TTTGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1806 het 3 hom 15 0 7 8 T 14 12 302369 CASAVA_Build 2 129862435 1I TTGGCATAAG -/C CCTATCGGTG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 C 2 3 302370 CASAVA_Build 2 129875861 1D CCTCTCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 26 6 T 12 11 302371 CASAVA_Build 2 129877862 4D TACATAACAG TATT/---- TAATTTATAA 3070 hom 72 het 31 0 25 10 TATT 1 0 302372 CASAVA_Build 2 129882360 4D CCTTTGTGCT TTAA/---- TTGTCATACA 3070 het 3070 hom 41 18 19 7 TTAA 1 0 302373 CASAVA_Build 2 129884024 2D ACACATGTAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 30 0 23 8 AT 7 6 302374 CASAVA_Build 2 129897872 1I CCCCTATCTG -/T GCTAAGATCT 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 0 1 302375 CASAVA_Build 2 129898779 2I CGCAATAAAC --/AT ATGTGTGCAT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AT 1 2 302376 CASAVA_Build 2 129902823 1I GCCCTGCCTT -/G GCCCAGCCCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 2 302377 CASAVA_Build 2 129931852 1D AGCAAGGCCC A/- GGGGAGGGAT 3070 hom 109 het 45 0 35 10 A 1 0 302378 CASAVA_Build 2 129940300 3I CGTAGTGTGC ---/TCT TCTTCTATTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TCT 2 3 302379 CASAVA_Build 2 129949514 4D AGCAAGACTT ACTC/---- AGGAAGAAGG 3070 het 3070 ref 39 19 19 2 ACTC 1 0 302380 CASAVA_Build 2 129955613 1I TTTGGCAAGG -/C CAAGACTTCC 3070 hom 87 het 39 0 28 11 C 1 2 302381 CASAVA_Build 2 129959517 1I GCAGCCTCCT -/C CCCCATGGGC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 4 5 302382 CASAVA_Build 2 129972040 4I ATTTTAAAGT ----/AAGA AAGAGGCAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AAGA 1 2 302383 CASAVA_Build 2 129981911 1D CCTTAGAACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 10 9 302384 CASAVA_Build 2 129986935 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTCTTT 2141 het 587 hom 26 3 14 9 T 7 6 302385 CASAVA_Build 2 129994977 1D CTGAATACTT G/- TTTTTTTCAT 3070 hom 106 het 42 0 36 6 G 1 0 302386 CASAVA_Build 2 129999652 1I GAAGAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 25 1 18 6 A 10 11 302387 CASAVA_Build 2 130003427 1I AAAATAACTT -/A AAAATTATAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 4 5 302388 CASAVA_Build 2 130009241 1I GAAAATCTAG -/A AAAAAACGGA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 6 7 302389 CASAVA_Build 2 130012514 1I TGCCAAATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 8 9 302390 CASAVA_Build 2 130019402 1D CGGTCCACTG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 51 het 28 0 13 15 C 10 9 302391 CASAVA_Build 2 130034706 4D TCCTCCTCCT TCTC/---- TCTCTGTCCC 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 TC 4 2 302392 CASAVA_Build 2 130035223 3D AACAGTCTGG AGA/--- AGGACAGAAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 5 AGA 1 0 302393 CASAVA_Build 2 130045665 4I TGAAAATCAT ----/AACA AACAGTCTCT 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 AACA 1 2 302394 CASAVA_Build 2 130059679 3I TGATAAAAGA ---/CTG CTATCTAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 CTG 0 1 302395 CASAVA_Build 2 130071827 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2411 het 1426 hom 15 4 6 5 A 13 12 302396 CASAVA_Build 2 130083385 1D GAAACCAAGA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 8 7 302397 CASAVA_Build 2 130091981 1D TTTACCGTAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 C 1 0 302398 CASAVA_Build 2 130124341 1I GAAAGGGCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 9 10 302399 CASAVA_Build 2 130129458 2D AAGCATTGTC AG/-- AGACTAACTT 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 AG 2 1 302400 CASAVA_Build 2 130137881 1I GCAACTCTTC -/T GTAAGCCTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 0 1 302401 CASAVA_Build 2 130139657 1I GTTTAGATAT -/A TATCCAGTCA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 0 1 302402 CASAVA_Build 2 130140035 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 9 8 302403 CASAVA_Build 2 130146126 1D GTAGAACTGA T/- TAGAGACAAA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 T 2 1 302404 CASAVA_Build 2 130156325 1D AACAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 1584 het 102 hom 12 2 5 5 T 15 14 302405 CASAVA_Build 2 130168161 3D GGCATGCCAA AAT/--- AAAAAAAAAA 1432 het 879 hom 32 8 7 19 AAT 1 0 302406 CASAVA_Build 2 130170414 1I TTTTAAAATG -/T GAAGACATGA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 0 1 302407 CASAVA_Build 2 130177839 1D TTATTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 11 19 8 T 10 9 302408 CASAVA_Build 2 130178120 4D GTGGGCTTTG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 20 6 TGTT 4 3 302409 CASAVA_Build 2 130181880 1I TGCCCCTAGA -/G GGCCTGAACG 3070 hom 72 het 27 0 21 6 G 2 3 302410 CASAVA_Build 2 130184924 22D GCGTCCGCAG GAGCCTCCTCTCCATCAGTGCT/---------------------- GAGCCTCCTC 3046 hom 41 het 17 0 11 11 GAGCCTCCTCTCCATCAGTGCT 2 1 302411 CASAVA_Build 2 130202098 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAGAAT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 6 7 302412 CASAVA_Build 2 130202402 10D GGTTTTGGGT GGTTTTGGCC/---------- GGTTTTGGCC 3070 hom 102 het 33 0 35 5 GGTTTTGGCC 2 1 302413 CASAVA_Build 2 130210030 18D GTAGGGATGG TGATGGTGGTGATAGTGA/------------------ TGATGGTGGT 3070 hom 160 het 61 0 51 18 TGATGGTGGTGATAGTGA 1 0 302414 CASAVA_Build 2 130225320 1I GTGGCAATGC -/A AATTAGGCAG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 2 3 302415 CASAVA_Build 2 130233882 4I CACACAGCAC ----/ACAT AGAGTATTCA 3070 het 3070 ref 86 38 35 13 ACAT 0 1 302416 CASAVA_Build 2 130244166 1D CTTCAATAGG A/- AAAAAAAAAA 2655 het 2655 ref 35 13 7 15 A 16 15 302417 CASAVA_Build 2 130279314 5I ATTCCCCTAG -----/ATTCT AGGAGTACCC 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 ATTCT 0 1 302418 CASAVA_Build 2 130284256 1D AAAATTCGAA G/- AAAACCGTAT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 G 1 0 302419 CASAVA_Build 2 130312179 2I TATTCAGCCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 17 15 19 A 12 14 302420 CASAVA_Build 2 130364877 2D AAGATGAAAG TT/-- TTTAACTATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 5 3 302421 CASAVA_Build 2 130373813 1D TCCTGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 2241 het 970 hom 23 6 6 11 A 18 17 302422 CASAVA_Build 2 130392656 10I GAAAGAAAAG ----------/AAAGAAAGAA AAAGAAAGAA 3070 hom 65 het 26 0 23 3 AAAGAAAGAA 1 2 302423 CASAVA_Build 2 130392667 1D5M3D AAGAAAGAAA GAAGAAAAG/-AAGAA--- AAAAAAAAGA 2992 het 239 hom 31 2 14 17 N/A 0 0 302424 CASAVA_Build 2 130403168 2I AAGGGACTCC --/TT TTTTTTTTTT 2625 hom 44 het 20 0 14 6 T 14 16 302425 CASAVA_Build 2 130409447 3I GAGCTGGCTC ---/AGA AGAAGAATTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AGA 2 3 302426 CASAVA_Build 2 130410180 1D AGACTTCGTA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 18 1 16 1 T 2 1 302427 CASAVA_Build 2 130410572 1I TTGGGCTGCA -/G GGGGGCGCCA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 5 6 302428 CASAVA_Build 2 130419961 1I CCATGGTCAT -/A AAAAAAAAAC 1035 het 1035 ref 41 30 3 8 A 9 10 302429 CASAVA_Build 2 130424476 1D ATGCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 25 1 21 3 A 13 12 302430 CASAVA_Build 2 130427405 1I TAGTACAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 T 11 12 302431 CASAVA_Build 2 130427991 5D TCAGTTTGCT TACAA/----- TAGTTTTAAC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TACAA 1 0 302432 CASAVA_Build 2 130442999 1D AACGAAGTGC A/- AAAAAAAAAA 1717 het 1717 ref 34 24 4 6 A 12 11 302433 CASAVA_Build 2 130444175 3I ATCTAACAAC ---/AAT GTGTAAAACC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AAT 0 1 302434 CASAVA_Build 2 130445977 4I AAACATAGAC ----/AAAT AGGCATATGT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AAAT 0 1 302435 CASAVA_Build 2 130453319 7I ATTCAGTCTA -------/ATATCTT ATACAAGTCT 3070 hom 78 het 36 0 26 10 ATATCTT 0 1 302436 CASAVA_Build 2 130455915 7D AGGTCAAATT GAAGACG/------- GAAGACGGAA 3070 hom 48 het 23 0 17 7 GAAGACG 3 2 302437 CASAVA_Build 2 130456117 4D CTGTATAGTT TAAC/---- TAGTGATTTA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 TAAC 1 0 302438 CASAVA_Build 2 130461570 1I ACCTCAGCTG -/A AAAATTCTAA 1377 het 1377 ref 36 29 3 4 A 4 5 302439 CASAVA_Build 2 130464247 3I GGAGGAAGAA ---/GAG GAGGAGGAGA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 GAG 3 4 302440 CASAVA_Build 2 130467725 1I CTATGTGGGA -/C CCCCCTGGTG 1985 het 1985 ref 26 12 7 7 C 5 6 302441 CASAVA_Build 2 130470501 1I CAGGAGATTA -/G TGTAAACACG 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 0 1 302442 CASAVA_Build 2 130471721 1D TCAGCAACTT A/- GATGCCATTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 1 0 302443 CASAVA_Build 2 130477288 5D AAAATTAAAT AAATA/----- AAATAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 3 AAATA 2 1 302444 CASAVA_Build 2 130477641 2I CCTGCTTTAC --/AT ATATATATGT 1122 hom 10 het 6 0 4 2 AT 4 5 302445 CASAVA_Build 2 130483909 4D TCAGAATCAG AAAT/---- AAATATCAGG 3070 hom 54 het 21 0 19 4 AAAT 2 1 302446 CASAVA_Build 2 130485564 1I TCATTCAGGG -/T AGTCCCTCTC 3070 hom 60 het 25 0 22 3 T 0 1 302447 CASAVA_Build 2 130486659 1I TTGAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 21 1 16 4 A 11 12 302448 CASAVA_Build 2 130491077 1D ACAAAACTGA T/- TCCATCCCCA 3070 hom 45 het 16 0 15 1 T 2 1 302449 CASAVA_Build 2 130492769 1D CTATGAGGTT A/- ATCCCATGTC 3070 hom 75 het 28 0 24 5 A 2 1 302450 CASAVA_Build 2 130493003 5D CATAAAAACA TTTTT/----- TTTTTTCCAG 3070 hom 39 het 18 0 14 6 T 11 6 302451 CASAVA_Build 2 130494479 1D62M13D CTAGTCCTTG TTTTTACTTGTCTAGGGCCAAATAAATTACCCAGAGTTTCCCAAACACACCACACCGTTCATGGATTTGCAAGCGT/-TTTTACTTGTCTAGGGCCAAATAAATTACCCAGAGTTTCCCAAACACACCACACCATTCACG------------- GATTCTTTCT 3070 hom 84 het 28 0 29 3 N/A 0 0 302452 CASAVA_Build 2 130495460 2D ATACATATAA AT/-- ATATACACAT 3070 hom 60 het 26 0 21 6 AT 3 2 302453 CASAVA_Build 2 130496183 1D TTCTCATTCA G/- GGGGGGTTGA 3070 hom 38 het 15 0 13 2 G 7 6 302454 CASAVA_Build 2 130498090 4I AGATCTTTGA ----/AAGT AATAAAATTA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 AAGT 0 1 302455 CASAVA_Build 2 130499117 3I27M1D AAAAATGAAA ---AAGGGGGAGCTTACAAATAACAAAAATG/AAGAAGAGGGAGCTTACAAATAACAAAAAT- TATATCCCAA 3070 het 3070 hom 36 10 10 20 N/A 0 0 302456 CASAVA_Build 2 130499223 3D CTGTAGATGT GAA/--- GAAGATGTCT 2119 het 2119 ref 28 22 5 2 GAA 2 1 302457 CASAVA_Build 2 130500303 1I TACCAACCTC -/G TCACATTAAG 3070 hom 72 het 25 0 23 2 G 0 1 302458 CASAVA_Build 2 130504404 1I AAGTGGCTGA -/C AGGTAATCAG 1328 het 1328 ref 37 30 3 4 C 0 1 302459 CASAVA_Build 2 130504573 1D ATGCTGAGGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 860 hom 28 4 20 4 A 9 8 302460 CASAVA_Build 2 130513806 1D CCTTTTAGTA G/- GGATCTACCT 3070 het 3070 ref 52 34 14 6 G 3 2 302461 CASAVA_Build 2 130519273 4D ACTCAAATCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 CAAA 4 3 302462 CASAVA_Build 2 130523489 1I AACAGATATG -/A AAACTCTGGA 3070 hom 67 het 30 0 23 7 A 3 4 302463 CASAVA_Build 2 130524594 2I CCCCTAACCC --/CT GAGCTAGGGA 3070 hom 27 het 10 0 9 1 CT 0 1 302464 CASAVA_Build 2 130528067 4D TCACATGAGA ACTC/---- ACTATCAGAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 ACTC 1 0 302465 CASAVA_Build 2 130533069 4D TCTCATGAGA ACTC/---- ACTATCACGA 3070 het 3070 ref 41 32 7 3 ACTC 1 0 302466 CASAVA_Build 2 130541562 1I GCTCAAAGAG -/C AACCAGCCAC 3070 hom 42 het 15 0 14 1 C 0 1 302467 CASAVA_Build 2 130542565 5I TTTATGCTTC -----/TTAAG TTAATTTTTG 3070 hom 42 het 21 0 14 7 TTAAG 0 1 302468 CASAVA_Build 2 130552399 1D TACAGTGGCT G/- CAAAAAGGTG 2433 hom 15 het 6 0 6 0 G 1 0 302469 CASAVA_Build 2 130554371 3I GAAAATTGTT ---/AAC AACTTTTTAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AAC 1 2 302470 CASAVA_Build 2 130563075 2I ATTCCTCCAC --/AT GTCTGTCCCC 2429 het 2355 hom 12 6 5 1 AT 0 1 302471 CASAVA_Build 2 130582999 1D TCTACTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 61 42 12 7 T 10 9 302472 CASAVA_Build 2 130587570 9D TGTTGTTGTC GTTGTTGTT/--------- GTTGTTGTTG 3070 het 126 hom 26 1 18 7 GTT 7 4 302473 CASAVA_Build 2 130591978 11D TATTTCATTC CTTTTTTTTTT/----------- CTTTTTTTTT 2063 het 54 hom 14 1 7 6 CTTTTTTTTTT 2 1 302474 CASAVA_Build 2 130602800 1I CCAGCATTGT -/A AGCTCCAAAT 1464 het 411 hom 9 1 4 4 A 1 2 302475 CASAVA_Build 2 130603218 8I GCCTCCAGCA --------/TGCGTCGG TGCCGCTCCC 3070 hom 53 het 20 0 16 4 TGCGTCGG 0 1 302476 CASAVA_Build 2 130604842 1I AGACGGTGGG -/A AAAAACAGTG 2354 hom 36 het 21 0 6 15 A 5 6 302477 CASAVA_Build 2 130610576 8I GCTCTGTCTT --------/CATATACA CTGGGCCCAG 3070 het 2798 hom 21 9 10 2 CATATACA 0 1 302478 CASAVA_Build 2 130611801 2I CAAGGCCTGC --/CT CTCGGCTGCT 1956 het 1956 ref 30 12 8 10 CT 1 2 302479 CASAVA_Build 2 130612840 1I CCAACGAAGT -/G GGGCCGTGGG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 G 3 4 302480 CASAVA_Build 2 130615994 1I GTCCTGCCCA -/C CCCCCCCTTA 1438 het 1438 ref 13 6 6 1 C 7 8 302481 CASAVA_Build 2 130623154 3D CCTTGGGAGT TCC/--- TAAACACATG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 TCC 1 0 302482 CASAVA_Build 2 130634725 1I GTCCTTCCCA -/C CCCCCTGCCT 2909 het 2909 ref 26 16 7 3 C 5 6 302483 CASAVA_Build 2 130642572 1I TCGTTATCAA -/T TTTTTTTTTG 2578 het 2578 ref 25 14 8 3 T 9 10 302484 CASAVA_Build 2 130648016 1I AAATAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1155 hom 16 3 7 6 A 9 10 302485 CASAVA_Build 2 130652203 14I AATCTTGTAA --------------/TGCACAGCTGAGCT TGCCTGGACT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 TGCACAGCTGAGCT 0 1 302486 CASAVA_Build 2 130652843 1I CAAAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 11 12 302487 CASAVA_Build 2 130662343 2D GAAGATCTGA CT/-- CTGTCTGGCC 1077 het 1077 ref 36 25 4 8 CT 2 1 302488 CASAVA_Build 2 130662381 3D TGTGGCCTCA GAG/--- GAGGATGCTG 2770 het 2131 hom 28 7 10 11 GAG 2 1 302489 CASAVA_Build 2 130686954 1I GATCCTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 11 12 302490 CASAVA_Build 2 130694350 1D AAGCAACAAG C/- TTGAGAACTC 3070 hom 56 het 21 0 19 2 C 1 0 302491 CASAVA_Build 2 130695617 4I CACAGCAAAT ----/AAAC AAAAATAGAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAAC 0 1 302492 CASAVA_Build 2 130695836 2D TGTACTCCCC CT/-- GTTTGAGCTG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 CT 1 0 302493 CASAVA_Build 2 130698681 4D ATATAAAATA TTTT/---- GTTATTTAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 T 4 0 302494 CASAVA_Build 2 130723493 1D GAACATTAGC A/- GAAACTTTCC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 1 0 302495 CASAVA_Build 2 130726230 3I GGATGGCGCA ---/CCG CCAGAACTTC 3070 hom 45 het 22 0 16 6 CCG 0 1 302496 CASAVA_Build 2 130735314 1I TTTAGCACAT -/A AAAGCTCAAC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 3 4 302497 CASAVA_Build 2 130752656 1I ACCCTAGCAA -/C CGTAGTACCC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 1 2 302498 CASAVA_Build 2 130753483 1I CAGGACTCCT -/A AAAACTAGGC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 4 5 302499 CASAVA_Build 2 130753707 3D2M2I AAGCTTTACC AGTTT--/---TTGC AATTATCCTC 3070 hom 21 het 10 0 8 2 N/A 0 0 302500 CASAVA_Build 2 130754146 16I ATTATACAGT ----------------/CTATACCCTACAAATA CAGTTTAATC 3070 hom 33 het 15 0 12 4 CTATACCCTACAAATA 0 1 302501 CASAVA_Build 2 130755400 3I TCTGAAAAAC ---/AGA AGGACTATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AGA 0 1 302502 CASAVA_Build 2 130757003 3I TTCATCTGCC ---/TCT TCTTCCTACA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 TCT 1 2 302503 CASAVA_Build 2 130757267 12D TCACCTTCCA TTTCATCTTACC/------------ TTTCATCATT 2264 hom 18 het 8 0 7 1 TTTCATCTTACC 1 0 302504 CASAVA_Build 2 130757351 1D ACCCCTCAGG A/- AATCTCATCA 3070 hom 24 het 10 0 8 2 A 3 2 302505 CASAVA_Build 2 130763913 10I TACAAAAGTG ----------/GAGTTTACAT GAGTTTACAT 3070 hom 119 het 44 0 40 5 GAGTTTACAT 1 2 302506 CASAVA_Build 2 130764285 14D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 2995 hom 17 het 17 0 12 7 A 28 14 302507 CASAVA_Build 2 130768521 1D AACAAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 31 2 24 5 A 11 10 302508 CASAVA_Build 2 130832361 3I CGATTCACTA ---/AAT ATTATTATTA 3070 het 3070 ref 51 25 24 2 AAT 0 1 302509 CASAVA_Build 2 130880903 1I ATGTGAATAC -/T TAAATGTCTT 2982 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 2 302510 CASAVA_Build 2 130898860 1D TAACTATCAA C/- TTTTGCTTTA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 C 1 0 302511 CASAVA_Build 2 130900351 4I ATTAATAAAC ----/TTAG TTAATTACCA 3070 het 3070 ref 49 39 7 3 TTAG 0 1 302512 CASAVA_Build 2 130909084 2D ATAACGTTTG CT/-- CTCTCTTTCT 1916 het 1916 ref 14 7 4 3 CT 4 3 302513 CASAVA_Build 2 130942746 2I GCCAAACTAT --/TG TGGGGGGGGG 1920 het 1080 hom 29 4 6 19 TG 1 2 302514 CASAVA_Build 2 130942922 1I CAGAAAATTG -/T TAACAACTTT 2616 het 2616 ref 25 13 6 6 T 1 2 302515 CASAVA_Build 2 130946513 1D CAGACCAAGG T/- TTTTAAAGGC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 5 4 302516 CASAVA_Build 2 130948157 1I TGCACACGTA -/C CCCGAAGCTA 1958 het 1958 ref 28 17 6 5 C 3 4 302517 CASAVA_Build 2 130953316 1D TTCTTACAGG A/- AAAAAAAATT 2577 het 2577 ref 23 16 6 1 A 9 8 302518 CASAVA_Build 2 130956990 2D CCTACTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 12 1 T 13 11 302519 CASAVA_Build 2 130971756 2I GCTAGTCAGC --/AA AAATAGTCAA 3070 het 3070 hom 16 8 8 0 A 3 5 302520 CASAVA_Build 2 130974553 2I TCCATCTAGA --/AC ACACAGATTA 1397 het 1397 ref 23 17 3 3 AC 2 3 302521 CASAVA_Build 2 131088719 2I CTTATCTGTG --/AC ATTTCTGCAA 3070 het 3070 ref 63 41 13 9 AC 0 1 302522 CASAVA_Build 2 131088832 1D TCACATTCTA T/- TATTTATTTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 2 1 302523 CASAVA_Build 2 131095922 1D CACCTATGCA T/- GGGATAAAAA 1401 het 1401 ref 25 20 3 2 T 1 0 302524 CASAVA_Build 2 131114947 1I GTGTGCTGCA -/G GGGGCTCATT 1257 het 1257 ref 29 24 3 2 G 4 5 302525 CASAVA_Build 2 131179708 3D TAAGCTCCCC CTT/--- CTTTTTCATT 2745 het 2745 ref 30 20 6 4 CTT 2 1 302526 CASAVA_Build 2 131283950 2I CTAATTTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TG 6 7 302527 CASAVA_Build 2 131284906 1D TTTTTCATGC T/- GGCCAAATGA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 1 0 302528 CASAVA_Build 2 131293349 1D CCGTCTGTGA G/- GGTTCCAGTG 2041 hom 15 het 15 0 6 9 G 3 2 302529 CASAVA_Build 2 131295168 2I CACAGGCACC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 29 het 39 1 29 9 T 9 11 302530 CASAVA_Build 2 131376959 7I GCCCCACAGG -------/TCCTTAA GGCTCTGTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TCCTTAA 0 1 302531 CASAVA_Build 2 131377291 1I TTATCTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 23 2 19 2 T 10 11 302532 CASAVA_Build 2 131378826 2I TTTTCACTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 29 0 21 8 A 10 12 302533 CASAVA_Build 2 131379153 1D GTATTATTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 8 302534 CASAVA_Build 2 131396806 1I ATTCCTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 T 11 12 302535 CASAVA_Build 2 131400400 4D CTTTAAAATC TTTG/---- TTTGATAATT 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 TTTG 2 1 302536 CASAVA_Build 2 131403943 1I TACTTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 2011 het 2011 ref 22 10 7 5 T 11 12 302537 CASAVA_Build 2 131404081 1I GGACTACAGG -/C GCCCACCACC 2021 het 2021 ref 18 8 6 4 C 0 1 302538 CASAVA_Build 2 131409200 12D ATTTTTTATC TATTTATTCATT/------------ TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 26 12 12 6 TATTTATTCATT 1 0 302539 CASAVA_Build 2 131410109 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 11 12 302540 CASAVA_Build 2 131411198 1I AGGTGATCTT -/C CCCCCCTCGG 1969 het 1969 ref 23 13 6 4 C 6 7 302541 CASAVA_Build 2 131416196 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2888 het 148 hom 21 4 8 9 T 15 14 302542 CASAVA_Build 2 131423008 2D TGTTCCTGAC TT/-- TGTAGAATTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 T 3 1 302543 CASAVA_Build 2 131429007 1I GCTTTGTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 9 10 302544 CASAVA_Build 2 131431292 1I CAACTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1860 hom 21 7 9 5 T 12 13 302545 CASAVA_Build 2 131431884 1D CTTGGCCAGG C/- TGGCACCCTG 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 C 1 0 302546 CASAVA_Build 2 131456656 12D CCTCCTCCTC CTTTCTTCTTTT/------------ CTTTCTTACC 3070 hom 43 het 20 0 15 7 CTTTCTTCTTTT 1 0 302547 CASAVA_Build 2 131458601 1I GGTGTAGTGG -/C CTGCGCCTGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 C 1 2 302548 CASAVA_Build 2 131486606 2I CCAGGACTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 43 hom 40 1 27 12 TG 7 8 302549 CASAVA_Build 2 131496701 3D CACATTATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 35 0 28 9 A 14 11 302550 CASAVA_Build 2 131498457 1I TAGCTAGGAC -/T TACAGGTGTG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 1 2 302551 CASAVA_Build 2 131504286 1I CGAAGAGGTG -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 113 het 47 0 36 11 T 7 8 302552 CASAVA_Build 2 131575968 9I GCTGCACATT ---------/CAGGACAGG CAGATAGGGG 3070 hom 71 het 27 0 23 4 CAGGACAGG 0 1 302553 CASAVA_Build 2 131587131 1D CGCTGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 239 hom 31 1 22 9 T 15 14 302554 CASAVA_Build 2 131629992 1I GGAGGCAGCG -/C CCTGCTGGGT 3070 hom 80 het 34 0 26 8 C 2 3 302555 CASAVA_Build 2 131682642 1D TCTACCCAAA C/- ACTTTTTACC 1953 het 5 hom 10 0 6 4 C 1 0 302556 CASAVA_Build 2 131690767 6D ACTTGGCAAT GAAAAA/------ GAAAAACATA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 GAAAAA 2 1 302557 CASAVA_Build 2 131699218 4D ATGTTTAAAT AATC/---- AACAAGTCTA 2774 het 2774 ref 42 33 6 6 AATC 1 0 302558 CASAVA_Build 2 131699883 2I CTGACTTTTA --/TC TCTGTGACTG 3070 het 3070 ref 60 37 19 4 TC 1 2 302559 CASAVA_Build 2 131703784 2I CATTTGACTA --/TT TTTGCTGACT 2797 het 2797 ref 36 24 6 6 T 3 5 302560 CASAVA_Build 2 131707650 1I GTTGGCCTTT -/G TTTTTTTGGT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 G 0 1 302561 CASAVA_Build 2 131708182 1I AGCATCCACA -/G ACATAGAATG 3070 het 3070 ref 63 42 14 7 G 0 1 302562 CASAVA_Build 2 131714530 1D TAAATTTTTA T/- TGTCAGTGCC 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 2 1 302563 CASAVA_Build 2 131719105 3I CTTTGTAGAA ---/GAC GACATTGAGC 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 GAC 1 2 302564 CASAVA_Build 2 131742831 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 15 1 12 2 A 10 11 302565 CASAVA_Build 2 131743486 1D GATGAACTAA T/- TTATACTACC 2940 het 2940 ref 27 19 7 2 T 3 2 302566 CASAVA_Build 2 131748488 1D GCTGATGGAG C/- CAGAGGCATT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 2 1 302567 CASAVA_Build 2 131752488 4I ACCTCGTGAT ----/AGTG AGTTCTCATG 2998 het 2998 ref 47 24 7 16 AGTG 0 1 302568 CASAVA_Build 2 131752534 2I CACCTCTTTC --/CT CTCTCTGTCT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 CT 3 4 302569 CASAVA_Build 2 131753271 3I GAGCAGCCTG ---/TGT TGTTATGTAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 TGT 1 2 302570 CASAVA_Build 2 131765846 4D TCTCCTGCTC TCTT/---- TGTCTCCTGT 3070 het 3070 ref 37 26 10 6 TCTT 1 0 302571 CASAVA_Build 2 131767300 2I GTTGAATGAG --/AT AAAATTGGAG 1352 het 1352 ref 29 22 3 4 AT 0 1 302572 CASAVA_Build 2 131767628 1I GTTTATATAG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 7 8 302573 CASAVA_Build 2 131771681 1D26M1I AAAGGTAGAT CCCTACTAAAAGGCTCAACGAATATTA-/-CCTACTAAAAGGCTCAACGAATATTAG TCCCTTCATC 3070 hom 62 het 20 0 21 2 N/A 0 0 302574 CASAVA_Build 2 131772046 1I CTCCTGCTAC -/A AACAACAATC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 2 3 302575 CASAVA_Build 2 131772495 1D TCTTTTAGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 9 8 302576 CASAVA_Build 2 131778579 1I TTGATGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 25 1 20 4 T 14 15 302577 CASAVA_Build 2 131782941 1D CCCCAGGATT C/- CAGGTCTTGG 3070 het 271 hom 24 1 22 3 C 2 1 302578 CASAVA_Build 2 131784121 3D ACATAGGACA TCT/--- TCTTCCTCTG 3070 hom 57 het 22 0 20 4 TCT 2 1 302579 CASAVA_Build 2 131786227 3D CTTGTAGACA TCT/--- TCTTCACATC 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 TCT 2 1 302580 CASAVA_Build 2 131786313 1D TTGGGATATA C/- ATTTTTGTTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 1 0 302581 CASAVA_Build 2 131787362 5I TCTTTTCTGT -----/CTTTA CTTCTATTAT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 CTTTA 0 1 302582 CASAVA_Build 2 131787672 3I TTCCTCACAA ---/AAT AATATCTAAT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 AAT 1 2 302583 CASAVA_Build 2 131792524 4D GTACACACCT ATAC/---- ACAAACAGAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 ATAC 1 0 302584 CASAVA_Build 2 131793102 1I TCTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1098 het 1098 ref 30 14 3 13 T 17 18 302585 CASAVA_Build 2 131802045 1I CTTTTAAACC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 9 10 302586 CASAVA_Build 2 131808018 5D CTTTATAGAT ATAGA/----- ATACTTTAGA 3070 hom 63 het 26 0 22 6 ATAGA 1 0 302587 CASAVA_Build 2 131809697 1I CTGTGGAGCC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 56 het 25 0 18 7 A 8 9 302588 CASAVA_Build 2 131811996 12I GACTGGAACA ------------/AGAATAGATGAC AGAATTCCAT 3070 hom 66 het 27 0 22 6 AGAATAGATGAC 0 1 302589 CASAVA_Build 2 131824004 1I TTTTAAAAAC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 388 hom 19 1 16 2 T 7 8 302590 CASAVA_Build 2 131824935 1I TTTCTAGGAA -/T TTTTTCTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 5 6 302591 CASAVA_Build 2 131825904 4I CGTGCCACAT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TTTC 2 3 302592 CASAVA_Build 2 131828438 4D TTTTTTTTGA GATG/---- GATGGAGTCT 879 hom 9 het 11 0 5 6 GATG 2 1 302593 CASAVA_Build 2 131831516 4I ACATATATAT ----/ATAC ACACACACAC 1495 het 494 hom 18 8 5 5 ATAC 0 1 302594 CASAVA_Build 2 131832401 5I TTTTGTAGTT -----/TATAA TATAATAAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TATAA 1 2 302595 CASAVA_Build 2 131835102 1I AAGGCAATCA -/C CCCCCATGTC 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 C 5 6 302596 CASAVA_Build 2 131835739 1I GAAAGTTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 9 10 302597 CASAVA_Build 2 131836972 1I AGACGCTGAC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 7 8 302598 CASAVA_Build 2 131841524 1I TGCAAATGGG -/A ACGGAGGGAG 3070 hom 33 het 29 1 23 5 A 1 2 302599 CASAVA_Build 2 131842695 1D GCAGTGTAAG A/- GCAGCTAGGT 3070 het 3070 ref 29 21 7 1 A 1 0 302600 CASAVA_Build 2 131843192 12D GGGCTATAAT GATGAAAGGTAA/------------ GATGAAATGG 3070 het 3070 ref 53 28 22 7 GATGAAAGGTAA 1 0 302601 CASAVA_Build 2 131846140 1I GTGATTATTA -/C TTTTATTTGG 2831 het 2831 ref 44 31 6 7 C 0 1 302602 CASAVA_Build 2 131846634 4I TTGCTATAAG ----/CCAT CAAAAGGGTA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 CCAT 0 1 302603 CASAVA_Build 2 131846996 1I AGCCGCCTAG -/T TTTTAGGAGT 2055 het 2055 ref 34 24 5 5 T 4 5 302604 CASAVA_Build 2 131867642 1I GCTACCCTGG -/A AAAAAAACCA 3070 hom 50 het 28 0 15 13 A 7 8 302605 CASAVA_Build 2 131874565 2I GCAGAGTTGT --/GC CACCATCCTG 3070 hom 68 het 27 0 22 5 GC 0 1 302606 CASAVA_Build 2 131893591 1D ACGTGGTCTT A/- ACACAGGCTG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 2 1 302607 CASAVA_Build 2 131894272 1I TTAATCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 10 11 302608 CASAVA_Build 2 131926892 5D CTGGACATCC CTTAG/----- CTTAGCCAAG 3070 het 3070 ref 54 44 8 4 CTTAG 2 1 302609 CASAVA_Build 2 131937668 1I ATACATTTCC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 A 6 7 302610 CASAVA_Build 2 131990459 1D TGAGTGTTGG C/- CCCGTCACAC 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 C 4 3 302611 CASAVA_Build 2 132017327 2D ATACTGAGGT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 TA 6 5 302612 CASAVA_Build 2 132017899 2D GCCCGCATGT GG/-- GGGCAGGGGT 1940 het 443 hom 19 1 8 10 G 5 3 302613 CASAVA_Build 2 132023842 1D CATTGATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 11 10 302614 CASAVA_Build 2 132032659 1I TTTCACTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 18 13 T 11 12 302615 CASAVA_Build 2 132045456 1I AGGTTATTAT -/A AAAAAGATGT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 5 6 302616 CASAVA_Build 2 132047193 1I45M2D ATGGGCATTT -GGCTGGTTAAATATTTTTGCAGTTGTGAATTGTGCTGCTGTAAACAT/GGGCTGGTTAAATACTTCTGCAGTTGTGAATTGTGCTGCTGAAAAC-- GTGTGTACAA 1901 het 1901 ref 20 18 5 8 N/A 0 0 302617 CASAVA_Build 2 132051696 106D30M1D ATTGTGAATA GCGCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGTCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGTGCGCTTCTTAAAGCATGGGAAGGCAGATAGT/----------------------------------------------------------------------------------------------------------GCGCTTCTTAAAGCATGGGAAGGCAGATAG- TTTTTTACGG 1702 hom 15 het 9 0 6 14 N/A 0 0 302618 CASAVA_Build 2 132052567 1D AGAGCACGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 9 8 302619 CASAVA_Build 2 132053031 2D CTTGTACGTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 11 9 302620 CASAVA_Build 2 132055562 2I CTCCACCGAC --/TT TGTGTGTGTA 3070 hom 64 het 34 0 27 7 T 1 3 302621 CASAVA_Build 2 132059707 3D AGTGGGCTCA GCC/--- GCCCCTGTGC 3070 hom 96 het 38 0 32 7 GCC 2 1 302622 CASAVA_Build 2 132061953 1I AAACTACTAG -/A AAAAACATAG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 5 6 302623 CASAVA_Build 2 132064942 1D TTCAAGAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 10 9 302624 CASAVA_Build 2 132067387 2D ATATACAGAA AG/-- AGAAACATAC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AG 2 1 302625 CASAVA_Build 2 132071581 1D GTAAGATGGC A/- AAATTTGCCC 2404 het 2404 ref 17 8 5 4 A 4 3 302626 CASAVA_Build 2 132079220 5I GAGCTGTCTC -----/TATTT CATTTATGTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TATTT 0 1 302627 CASAVA_Build 2 132080096 1D CTTTTAAACA G/- GGAGAAAACT 3070 hom 32 het 17 0 12 5 G 3 2 302628 CASAVA_Build 2 132082975 1I CCTGACTCAT -/A AAAAAAAAAA 2253 het 2253 ref 22 13 5 4 A 11 12 302629 CASAVA_Build 2 132085046 4I CAGTTTAATT ----/TTAA TTATTTTCTA 1689 hom 10 het 5 0 4 1 TTAA 0 1 302630 CASAVA_Build 2 132097307 32D GTTTATAAAA TACATAGGAATCAAGAATATAAGTGGAAAGTG/-------------------------------- TTTCCAAAAA 3070 het 3070 ref 23 20 10 3 TACATAGGAATCAAGAATATAAGTGGAAAGTG 1 0 302631 CASAVA_Build 2 132098567 2D TTTTTAAGTC AT/-- ATATATGTGT 3070 het 2674 hom 24 7 16 2 AT 4 3 302632 CASAVA_Build 2 132104350 1D CGAGAGCTCC T/- TGAAGGAAGC 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 T 2 1 302633 CASAVA_Build 2 132104795 3D GATAAATCTC ATT/--- ATTGCTTGAT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 ATT 2 1 302634 CASAVA_Build 2 132111864 1I TTATTTTGTG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 7 8 302635 CASAVA_Build 2 132117514 4D CGTTATTTTT CTTC/---- CTTCCTTCCT 3070 het 857 hom 34 8 8 18 CTTC 4 3 302636 CASAVA_Build 2 132118928 4I ATTGTCTCCT ----/ATTA ATTTTTCTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 ATTA 0 1 302637 CASAVA_Build 2 132119703 4D ACTGCCACAC ACAG/---- ACACACCGCC 3070 het 3070 ref 83 43 29 12 ACAG 1 0 302638 CASAVA_Build 2 132123177 3I AATTATGAAA ---/AAT AATAATGTTG 2054 het 2054 ref 48 38 7 3 AAT 2 3 302639 CASAVA_Build 2 132126847 1D TTAACTTACA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 8 7 302640 CASAVA_Build 2 132127173 2I AACCCAGGAC --/TT TAATAGTAGA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 1 3 302641 CASAVA_Build 2 132127316 2D GCCTTTTTTT TC/-- CCCTACATTT 3070 het 419 hom 21 1 13 7 TC 1 0 302642 CASAVA_Build 2 132128885 6I TTTACTCACT ------/TCTTTC ACTTAACATA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TCTTTC 0 1 302643 CASAVA_Build 2 132134214 3D CTTTCACGCT GAG/--- ATTGGCCATT 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 GAG 1 0 302644 CASAVA_Build 2 132137932 1D TAAAATAATC T/- CTTTGAATGT 3070 het 3070 ref 24 13 7 5 T 1 0 302645 CASAVA_Build 2 132139493 17D AGCCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 1420 het 1420 ref 20 14 3 5 A 34 17 302646 CASAVA_Build 2 132140512 1I CTTGCTGAAC -/T CAATTTCCAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 0 1 302647 CASAVA_Build 2 132141081 1D TTCTTTCCAT C/- CCAGCAACAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 C 3 2 302648 CASAVA_Build 2 132141479 1I TGGACCTAAT -/A ACCTCTACTT 3070 hom 51 het 21 0 19 2 A 1 2 302649 CASAVA_Build 2 132145349 1I CAGTCCACAC -/T GGCACGTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 0 1 302650 CASAVA_Build 2 132158453 1D CTCATCCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2055 hom 23 10 10 3 T 14 13 302651 CASAVA_Build 2 132158710 4I ATGCAGTGTT ----/TGTC TTTCTAGGCC 2191 het 2191 ref 57 47 5 5 TGTC 0 1 302652 CASAVA_Build 2 132170691 1I CAGGCTTTCA -/T TTTTATGGCT 2850 het 2850 ref 42 28 8 6 T 4 5 302653 CASAVA_Build 2 132191191 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTATTTC 3070 het 3070 ref 27 13 8 8 T 6 5 302654 CASAVA_Build 2 132194873 1D ATTTGTGCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 380 hom 22 1 18 3 A 10 9 302655 CASAVA_Build 2 132197962 1D ATTGTGCTGA G/- GGCTACTGTG 3070 het 3070 ref 36 16 10 11 G 3 2 302656 CASAVA_Build 2 132199689 2D AGCCACCAAA AC/-- ACTACTAACT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 AC 2 1 302657 CASAVA_Build 2 132200184 5D ATGGGGACAC AATTG/----- AAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 32 19 13 1 AATTG 1 0 302658 CASAVA_Build 2 132200819 4D GTTTCTGAGT AATA/---- AATGTCATGC 3070 het 3070 ref 38 23 14 2 AATA 1 0 302659 CASAVA_Build 2 132201694 1I TATGAACAAG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 8 9 302660 CASAVA_Build 2 132203234 4I TCATATCTTT ----/TTTG TTTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 35 8 3 TTTG 1 2 302661 CASAVA_Build 2 132205660 5D ACATTGGGAA CTTTT/----- CTTCGTAGTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 CTTTT 1 0 302662 CASAVA_Build 2 132210202 3I CTATGTGTTC ---/ATG ACTACATTTT 586 het 586 ref 38 29 2 8 ATG 0 1 302663 CASAVA_Build 2 132211245 4D14M2D35M2D GCAAAACTAA TTATTTAATGTAATTTATAATATTCTTTCTGTTTTTTAAACTTTAAGAACAAAGACT/----TTAATGTAATTTAT--CATTCTTTCTGTTTTTTAAACTTTAAGAACAAAGA-- CTAGGTAAGA 2189 het 2189 ref 29 47 5 3 N/A 0 0 302664 CASAVA_Build 2 132213011 1I TTCACCACAG -/C CATAGTTAAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 1 2 302665 CASAVA_Build 2 132214847 1I ACATAAGCTT -/G CAAATCAGAT 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 G 0 1 302666 CASAVA_Build 2 132230868 1D ACAAAACTGC G/- CCGCCGAGAA 3070 het 161 hom 21 2 13 7 G 1 0 302667 CASAVA_Build 2 132231933 1D TGGGGCTTGA T/- TTTTTTACTT 3070 het 3070 hom 80 28 40 12 T 7 6 302668 CASAVA_Build 2 132235472 1D AGAGCCTGAT G/- TTTCAGATGG 3070 het 3070 ref 84 37 35 12 G 1 0 302669 CASAVA_Build 2 132236421 11I TCTACCTGGG -----------/ATCTGGTGTTT GCCTGAGGCC 3070 hom 181 het 63 0 61 2 ATCTGGTGTTT 0 1 302670 CASAVA_Build 2 132237056 1D CTAGTGTGCA C/- CTGAAGCCTG 3070 het 2537 hom 34 9 23 2 C 2 1 302671 CASAVA_Build 2 132241320 1D CCAAAGGAAG C/- TTTTAAACTC 1045 het 867 hom 6 2 3 1 C 1 0 302672 CASAVA_Build 2 132241422 1I CATAACACTG -/A AATAAAGTTT 1572 hom 12 het 6 0 5 1 A 2 3 302673 CASAVA_Build 2 132241674 1D ATCATGTAGG T/- TTCATTTCTC 3070 hom 30 het 12 0 10 2 T 3 2 302674 CASAVA_Build 2 132242093 1I TTGAATTTGA -/G GGGGACAATA 3070 het 1862 hom 38 4 33 1 G 4 5 302675 CASAVA_Build 2 132243305 1D GAGTACCAAC A/- CTGATTTACT 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 A 1 0 302676 CASAVA_Build 2 132244108 2I TAGATGTCTC --/TT TGCTTCTGAC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 1 3 302677 CASAVA_Build 2 132244345 1I GCAAAAAATA -/T TTTTTAACTG 3070 hom 93 het 73 0 32 41 T 5 6 302678 CASAVA_Build 2 132245603 2D TGCTGAAAAC AA/-- GAGCTATTAA 3070 het 191 hom 21 1 19 3 A 2 0 302679 CASAVA_Build 2 132245893 12I TGGGTGTTTT ------------/TTTGTTTTTGTA TTTGTTTTTG 3070 het 141 hom 36 5 21 11 TTTGTTTTTGTA 0 1 302680 CASAVA_Build 2 132246483 2D ATACCTAGCT AA/-- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 63 31 18 14 A 9 7 302681 CASAVA_Build 2 132246796 1D TTTGTAAAAC T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 hom 63 16 37 14 T 7 6 302682 CASAVA_Build 2 132247224 4I TCTTTCTGTA ----/TCTG TCTGATTCTC 3070 hom 151 het 68 0 49 19 TCTG 1 2 302683 CASAVA_Build 2 132247514 3I CTATTATACA ---/TTT TTCTTATTTC 1230 het 1230 ref 32 19 7 6 T 2 5 302684 CASAVA_Build 2 132247903 5D TTTTGTTATC GATTA/----- GATTAGATTA 3070 hom 38 het 34 1 24 9 GATTA 5 4 302685 CASAVA_Build 2 132248135 1I GTCCTCATTA -/T TTTTTAATCC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 5 6 302686 CASAVA_Build 2 132248589 10I GAAAGGTTAA ----------/GGAATTTCTT CACCATATAA 2672 het 2672 ref 96 70 6 21 GGAATTTCTT 0 1 302687 CASAVA_Build 2 132248612 1D CAGAGCCTGT A/- TTTTTAGATT 3070 het 3070 ref 98 77 10 11 A 1 0 302688 CASAVA_Build 2 132249206 1I GATCCAATTT -/C CCCTTTGCCT 3070 het 3070 hom 82 27 42 13 C 3 4 302689 CASAVA_Build 2 132249928 1I GCTACCCCCA -/G GACCTCACAC 3070 het 3070 hom 72 17 38 17 G 1 2 302690 CASAVA_Build 2 132251030 1D CAGTGTTCTG C/- CCCAGGGCAG 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 C 4 3 302691 CASAVA_Build 2 132251174 1I CCTGTCCCAC -/A AGTGCCCAGC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 1 2 302692 CASAVA_Build 2 132252963 1D CTTTTATATT A/- AAAAAAAAAA 2134 het 2134 ref 29 16 5 8 A 12 11 302693 CASAVA_Build 2 132253522 5D AGTGGTCTTT TTTTC/----- TTTTTACCTG 3070 het 3070 hom 88 23 55 11 TTTTC 1 0 302694 CASAVA_Build 2 132254635 1I AGAATAGAGA -/C CCCAACCCCA 1172 het 1172 ref 48 38 3 7 C 3 4 302695 CASAVA_Build 2 132254698 1I ACGCAATACT -/G CCTTCCTTGT 3070 het 3070 ref 64 42 18 4 G 0 1 302696 CASAVA_Build 2 132255074 11I ATGCGACATG -----------/AACACATAATT AACTGTTTCC 3070 het 3070 ref 34 12 12 10 AACACATAATT 0 1 302697 CASAVA_Build 2 132255603 3D ATTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 57 15 9 38 A 12 9 302698 CASAVA_Build 2 132255909 1I29M3I TGTTGTTGGA -TTCAACTTTCTGTTGGATTTTGGTGAATT---/TTTCAACTTTCTGTTGGATTTTGGTGATTTTTC TTTTTGCCAC 3070 het 3070 hom 65 31 33 10 N/A 0 0 302699 CASAVA_Build 2 132256142 2D TTGGAAGGAG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 28 13 15 GT 1 0 302700 CASAVA_Build 2 132257549 1D TCATTCTAGG A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 hom 93 25 54 15 A 7 6 302701 CASAVA_Build 2 132257648 4D TCTTTGATAC ATTA/---- ATTAATTTTA 3070 het 3070 ref 96 75 13 13 ATTA 2 1 302702 CASAVA_Build 2 132257878 3D CTAACTTGTA GTC/--- GTTGTACAAC 3070 het 3070 hom 91 32 45 14 GTC 1 0 302703 CASAVA_Build 2 132258668 17I GGCATTCTTG -----------------/CTATAATTGTACTATGA CATTACTATA 3070 het 3070 ref 51 35 13 3 CTATAATTGTACTATGA 0 1 302704 CASAVA_Build 2 132262989 3I TTTATAATGT ---/TCA TAATGGCTTT 2743 het 2743 ref 74 58 7 9 TCA 0 1 302705 CASAVA_Build 2 132266397 1D CTAATGTGGC T/- GCTGAAGATG 2231 het 2231 ref 102 73 6 24 T 1 0 302706 CASAVA_Build 2 132266827 3I TGGGCTTCTC ---/TTG TTGTATAACT 3070 het 3070 hom 50 11 23 16 TTG 1 2 302707 CASAVA_Build 2 132267194 1I GATTTCTTAG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 84 63 12 9 A 7 8 302708 CASAVA_Build 2 132267349 3D TTTAGAAAAA CTT/--- CTACGCATTT 3070 het 3070 ref 66 37 23 12 CTT 1 0 302709 CASAVA_Build 2 132267463 1D AATTCCCCTT C/- AGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 C 1 0 302710 CASAVA_Build 2 132268326 9D GCATAAGGCT CTGGGTAAC/--------- CTGATGCTAT 2713 het 2713 ref 30 15 8 8 CTGGGTAAC 1 0 302711 CASAVA_Build 2 132268782 1D CTGAGAAATG A/- AACCTACATG 3070 het 3070 ref 65 41 17 8 A 3 2 302712 CASAVA_Build 2 132270010 1D TGGGATCACT G/- GTGAGGCCTG 3070 het 3070 ref 67 48 15 5 G 2 1 302713 CASAVA_Build 2 132270905 19D TTGGGTAGCC ACCTGGGGACCAGGTATCA/------------------- ACCTGGGGAC 1941 het 1941 ref 47 30 10 12 ACCTGGGGACCAGGTATCA 1 0 302714 CASAVA_Build 2 132272781 1I ATAAAGCTAC -/A AGTGGCCACC 3070 het 3070 ref 91 50 25 16 A 1 2 302715 CASAVA_Build 2 132272849 18I TGAACACCAG ------------------/GCCCCTGGTGAACACAAA GCCCCAGGTG 3070 het 3070 ref 78 45 16 17 GCCCCTGGTGAACACAAA 0 1 302716 CASAVA_Build 2 132272950 1D GGCCCCAGGT G/- GGGTGGGTTA 3070 het 3070 hom 73 19 39 16 G 4 3 302717 CASAVA_Build 2 132273377 1D CCAGGCTTCA G/- GTGCACACTA 2017 het 2017 ref 54 44 6 4 G 2 1 302718 CASAVA_Build 2 132280412 1I AAGATTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 T 10 11 302719 CASAVA_Build 2 132283978 1D CAGATATATA C/- AGAACATTTC 1412 het 1412 ref 21 16 3 2 C 1 0 302720 CASAVA_Build 2 132293718 21D TGTGTGTTAA GGCACTTCCCACAGCATCTGC/--------------------- GACACAGAAC 2245 het 2245 ref 74 68 6 7 GGCACTTCCCACAGCATCTGC 1 0 302721 CASAVA_Build 2 132301362 2D CGGCTTGCTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 71 het 29 0 22 9 CT 6 5 302722 CASAVA_Build 2 132324745 1D AAAAGGGGAT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 19 het 9 0 7 2 A 8 7 302723 CASAVA_Build 2 132333769 2I ACACATATGC --/AT ATATGTTTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AT 2 3 302724 CASAVA_Build 2 132334408 3I GTTTATATTT ---/TAA TAATAATGCT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TAA 2 3 302725 CASAVA_Build 2 132339322 1I GTTGATATCT -/A AAAAAAGTAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 6 7 302726 CASAVA_Build 2 132346739 1D ATTGAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 11 10 302727 CASAVA_Build 2 132350072 1I TTTATGCATT -/A AAAATATTAT 3070 het 190 hom 13 1 10 2 A 4 5 302728 CASAVA_Build 2 132351496 1D GCATTTGCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 10 9 302729 CASAVA_Build 2 132351837 1D CAGTAAAGGG A/- AATAATTCTA 1568 het 1568 ref 51 43 4 4 A 3 2 302730 CASAVA_Build 2 132353065 1D TTTATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 688 hom 16 3 10 3 T 12 11 302731 CASAVA_Build 2 132354914 1D TTGTAGCAGT G/- GTGAATGGTT 3070 het 3070 hom 37 9 23 6 G 2 1 302732 CASAVA_Build 2 132364307 1I CCAGTATAGC -/A AAATATACAG 1405 het 1405 ref 24 18 3 3 A 3 4 302733 CASAVA_Build 2 132365043 5I ATGTATTATA -----/TAATT TAATATCTTC 2228 het 2228 ref 44 32 5 7 TAATT 0 1 302734 CASAVA_Build 2 132374029 1D AAGGAACAGA C/- CTTAAAATAG 2157 het 2157 ref 44 38 5 1 C 2 1 302735 CASAVA_Build 2 132383628 1I ATTGTCCCTG -/T TTTTTCTCTA 2333 het 2333 ref 25 18 6 1 T 5 6 302736 CASAVA_Build 2 132383724 3D ATCCCAAATT TTG/--- TTGTTGTTGT 2311 het 2311 ref 28 21 5 3 TTG 4 3 302737 CASAVA_Build 2 132408803 4D CAAAAAACCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAAC 4 3 302738 CASAVA_Build 2 132410175 4D TATAGCTGTT TAAA/---- TAGGAGAAAT 2337 het 2337 ref 23 13 7 3 TAAA 1 0 302739 CASAVA_Build 2 132411891 2D CTGTCACCCT CA/-- CAGTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 CA 2 1 302740 CASAVA_Build 2 132423805 1I CTTTTATTTC -/A CTGGTTTTCT 1401 het 1401 ref 27 21 3 3 A 0 1 302741 CASAVA_Build 2 132423929 1D GAAGATAGTC A/- TATTATTGAT 2348 het 2348 ref 31 23 5 3 A 1 0 302742 CASAVA_Build 2 132424358 4D CTACAACTGA GAGT/---- GAGGTACTGA 2174 het 2174 ref 47 39 5 3 GAGT 1 0 302743 CASAVA_Build 2 132427910 4I AGGTCTTCTC ----/TCTT TCTTATTCTG 2867 het 2867 ref 33 21 6 6 TCTT 1 2 302744 CASAVA_Build 2 132429931 1D TTTGCAAATA T/- TTTTATCCAC 3070 het 3070 ref 49 28 17 4 T 5 4 302745 CASAVA_Build 2 132433017 2I ATTGTGCTTA --/TT TTTTTTTAAC 2367 het 2367 ref 31 21 5 6 T 7 9 302746 CASAVA_Build 2 132433156 1D ATTGACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 20 0 11 10 T 11 10 302747 CASAVA_Build 2 132433383 1D TATTTAATCA T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 39 het 18 0 14 5 T 8 7 302748 CASAVA_Build 2 132452411 3I CAGATCCTGT ---/GGA GGAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 GGA 1 2 302749 CASAVA_Build 2 132454599 17D CCAGGTGCAT GGTGCATGTTGTCAGTG/----------------- GATCTACCAT 3070 het 3070 ref 29 19 10 4 GGTGCATGTTGTCAGTG 1 0 302750 CASAVA_Build 2 132465330 1I ATATTTTCCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 8 9 302751 CASAVA_Build 2 132469426 1D CATGTGAAGC T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 45 33 8 5 T 8 7 302752 CASAVA_Build 2 132469517 1I ACATACAGTG -/A AAACAAAATT 1376 het 1376 ref 28 18 3 7 A 3 4 302753 CASAVA_Build 2 132469556 5D CTCTCAAATT TAAAC/----- TAAGCATAAA 2145 het 2145 ref 31 17 5 11 TAAAC 1 0 302754 CASAVA_Build 2 132469602 2D ATTCTAAAAA AT/-- AAAAATGAAT 2365 het 2365 ref 27 18 5 5 AT 1 0 302755 CASAVA_Build 2 132480434 4I TTATTGCACA ----/CATG TATATATATA 3070 het 3070 ref 102 66 15 21 CATG 0 1 302756 CASAVA_Build 2 132481134 1I TGATTTTTTT -/G TGTGGTTATA 2939 het 2939 ref 57 46 7 4 G 0 1 302757 CASAVA_Build 2 132481431 2I CCTATGCCCT --/AA GAGAGGTCAT 3070 het 3070 hom 53 23 25 6 A 0 2 302758 CASAVA_Build 2 132483183 1I CTTTCAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 A 10 11 302759 CASAVA_Build 2 132483343 1D CCCTTTTTTT C/- CTTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 C 2 1 302760 CASAVA_Build 2 132483468 3I CATTCTCTCT ---/TCC TCCTTTCCTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 TCC 1 2 302761 CASAVA_Build 2 132483622 1D CATATTATTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 8 7 302762 CASAVA_Build 2 132484493 4I GCAGCGCAAG ----/ACAA ACAAAGATGT 2172 het 2172 ref 89 64 6 19 ACAA 1 2 302763 CASAVA_Build 2 132484554 1I CTTGATGTTA -/G ACTATCAGCT 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 G 0 1 302764 CASAVA_Build 2 132484717 1I AATTAAAAAA -/T GTGTATGTAG 3070 het 3070 ref 83 47 29 7 T 0 1 302765 CASAVA_Build 2 132484905 3D GGAAAGGGGC AGG/--- AGAAGTATCA 2305 het 2305 ref 51 36 6 11 AGG 1 0 302766 CASAVA_Build 2 132485022 2D TGCATGTATG AT/-- ATATGTCAAT 3070 het 3070 ref 62 34 10 18 AT 3 2 302767 CASAVA_Build 2 132485038 5D GTCAATAAAA TGTCT/----- TAAATTATAT 3070 het 3070 ref 70 37 11 24 TGTCT 1 0 302768 CASAVA_Build 2 132485329 3I TGTCTTAAAA ---/CTC CTCTTATGTT 3070 het 3070 ref 88 30 16 46 CTC 1 2 302769 CASAVA_Build 2 132485353 1D AATTAAGAAA T/- TATTGTAATA 3070 het 3070 ref 98 31 9 59 T 2 1 302770 CASAVA_Build 2 132486098 5D ATATAAAAAT ATATA/----- TTATTAATAT 1171 het 1171 ref 52 12 5 36 ATATA 1 0 302771 CASAVA_Build 2 132487510 2I GTAGAGACTC --/TG TGTTCCCAAT 3070 het 3070 hom 60 16 40 5 TG 1 2 302772 CASAVA_Build 2 132489189 5I GTATTGTATG -----/TTATA TTTTAGTAGA 3070 het 3070 hom 87 31 49 7 TTATA 0 1 302773 CASAVA_Build 2 132491506 1D TTCATAAAGA T/- TAATTGGTAG 2722 het 2722 ref 100 72 6 23 T 2 1 302774 CASAVA_Build 2 132492898 2I AAATCTGTTT --/TC TGTCTCTATA 3070 het 3070 hom 42 14 26 3 TC 0 1 302775 CASAVA_Build 2 132493281 1D AAGTGGCCAG T/- TCTAGCCATA 2986 het 2986 ref 67 56 8 3 T 2 1 302776 CASAVA_Build 2 132493473 4D TTCAAGATAC ATAT/---- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 55 35 20 0 AT 6 4 302777 CASAVA_Build 2 132493817 1I CAGCTTGTTC -/A AAGACTGTCT 3070 het 3070 ref 57 25 28 4 A 2 3 302778 CASAVA_Build 2 132495100 3I TACTAACAAA ---/TAT TATTGTTATA 3070 het 467 hom 24 2 12 11 TAT 1 2 302779 CASAVA_Build 2 132495335 2D ACAATGGAAA CT/-- TAACATTCAA 2880 het 2880 ref 61 20 8 34 CT 1 0 302780 CASAVA_Build 2 132495350 1D CATTCAAAAT C/- CTCCTAGATT 3070 het 3070 ref 66 21 22 24 C 2 1 302781 CASAVA_Build 2 132496397 1D AAACATACTT A/- AAACATAGAA 3070 het 3070 ref 50 35 10 13 A 4 3 302782 CASAVA_Build 2 132497281 10D AATTAAATAC CATTCATATT/---------- CTGAATCACA 3070 het 3070 ref 97 64 12 22 CATTCATATT 1 0 302783 CASAVA_Build 2 132497930 1I TATATATTTA -/C ATGTTCCCAA 1800 het 1800 ref 34 23 6 6 C 0 1 302784 CASAVA_Build 2 132498461 1D TTTAATGAGT A/- AAAAATATGT 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 A 6 5 302785 CASAVA_Build 2 132498798 7D GGGTTAATTT GAAAGAA/------- TGTTTCCAAA 767 het 767 ref 63 60 2 3 GAAAGAA 1 0 302786 CASAVA_Build 2 132499103 5D CTTGAAACTG ATGAA/----- ATGAATAAAA 1164 het 1164 ref 103 97 3 9 ATGAA 2 1 302787 CASAVA_Build 2 132499943 1I CATTAGATGC -/T TGATGATTTT 3070 het 3070 ref 51 26 12 13 T 1 2 302788 CASAVA_Build 2 132501585 1I ATAAAAATGA -/C TTGAGATTGG 3070 het 3070 hom 64 23 37 4 C 0 1 302789 CASAVA_Build 2 132501744 1D GTAGACTCAC A/- AAAAAATTCA 2156 het 2156 ref 59 47 5 7 A 7 6 302790 CASAVA_Build 2 132502045 1D TAGCTTGTAT A/- AAAATATAGT 2916 het 2916 ref 17 10 7 0 A 5 4 302791 CASAVA_Build 2 132503319 4D ATATACAACA AATT/---- AATAAAACAA 3070 het 166 hom 22 1 17 6 AATT 1 0 302792 CASAVA_Build 2 132503605 1D AAAATAAGTT A/- GTCTAACCAG 1698 het 1698 ref 55 38 5 13 A 1 0 302793 CASAVA_Build 2 132503706 10I ACACACCACA ----------/CACTCTCTCT CACACACACA 3070 het 663 hom 45 5 28 12 CACTCTCTCT 0 1 302794 CASAVA_Build 2 132503767 4D29M1I AAATATCAGA AAGTAAGTAGAAATGGATAAGCCCCCAAATCAT-/----AAGTAGAAATGGATAAGCCCCCAAATATTA TAGACATTTC 2687 het 2687 ref 42 21 6 17 N/A 0 0 302795 CASAVA_Build 2 132504922 5I GAAAAAAAGA -----/AAAAG AAAACTGTTA 2677 het 2118 hom 29 6 6 17 AAAAG 0 1 302796 CASAVA_Build 2 132504951 1D GTAGAAAATG T/- TAAGCACTAT 3070 het 1904 hom 41 7 16 18 T 2 1 302797 CASAVA_Build 2 132505205 2I TGTATTCAAC --/AT TACTATCAAT 3070 het 3070 ref 36 24 9 3 AT 0 1 302798 CASAVA_Build 2 132506115 3I ATAGTTGAGA ---/TAT GATTATATCA 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 TAT 0 1 302799 CASAVA_Build 2 132507719 5I ATCATTTGAC -----/TTCAT TTCATCATTT 3070 hom 116 het 42 0 39 3 TTCAT 1 2 302800 CASAVA_Build 2 132507831 3D TTTCATCCTT TCA/--- TCATTTTATC 3070 hom 99 het 35 0 34 4 TCA 2 1 302801 CASAVA_Build 2 132508660 5D ACTTCATCTC TTCAT/----- TTCATCTCAT 3070 het 3070 ref 73 28 16 30 TTCAT 2 1 302802 CASAVA_Build 2 132508721 5D CATTTAATCA TTTCG/----- TTTCATTTCA 3070 het 3070 ref 76 29 15 35 TTTCG 1 0 302803 CASAVA_Build 2 132509227 1D34M3I CCTAAAACAT AAAACACAACACTTGGTTGTAAGTGAGCCAACAGT---/-AAACACAACACTTGGTTGTAAGTGAGACAACAGTTTC TTGTCTCTTT 3070 het 3070 ref 48 43 11 1 N/A 0 0 302804 CASAVA_Build 2 132510498 5D TGCACAAACC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1751 het 1751 ref 33 21 6 7 T 16 11 302805 CASAVA_Build 2 132510985 3D ATAACAGGTG TGA/--- GGAGCCACCA 3070 het 3070 ref 53 24 25 5 TGA 1 0 302806 CASAVA_Build 2 132516428 3D GAAGGAGAGA AAG/--- AAGAAGAGAA 3070 het 3070 ref 65 21 22 22 AAG 3 2 302807 CASAVA_Build 2 132516608 12I TCATTTTTTA ------------/TTTGTTATTCTT TCTGTTTCTC 2291 het 2291 ref 46 40 5 1 TTTGTTATTCTT 0 1 302808 CASAVA_Build 2 132516752 2D CTGTTATCTC TT/-- TGTTGATATT 3070 het 3070 ref 71 40 11 22 T 3 1 302809 CASAVA_Build 2 132517211 2I ATGTTTTGAC --/AG TGATTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 AG 0 1 302810 CASAVA_Build 2 132518382 3D CCTCTACTCA ATT/--- TTCTTCTTTT 1121 het 1121 ref 47 30 4 17 ATT 1 0 302811 CASAVA_Build 2 132520481 1D TATTATGTGA T/- TTTTTACCTT 2452 het 2452 ref 22 11 6 5 T 6 5 302812 CASAVA_Build 2 132521997 4I AATAGAACAA ----/AAAT AAATAAGAAT 3070 het 3070 ref 45 32 10 3 AAAT 1 2 302813 CASAVA_Build 2 132525507 1I ATCTGACAAT -/G GGTCCATATG 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 G 2 3 302814 CASAVA_Build 2 132529187 1I TATGCATATG -/C AAATTAATCT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 C 0 1 302815 CASAVA_Build 2 132529368 4D GAGAATCCCC TATT/---- TATTTTTTAT 3070 het 3070 ref 49 28 20 2 TATT 2 1 302816 CASAVA_Build 2 132529518 4D GGATATTATT TTTA/---- TTTTATTTGG 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 TTTA 1 0 302817 CASAVA_Build 2 132530288 1I ATATTTATAA -/C CTTTTCTTCC 1285 het 1285 ref 40 27 5 8 C 1 2 302818 CASAVA_Build 2 132530354 1I CTTCATCCTC -/A GAAAGACCTA 2763 het 2763 ref 42 28 10 4 A 0 1 302819 CASAVA_Build 2 132533198 1D AATAATTTAA G/- CTAAATACAT 1651 het 1651 ref 28 15 4 9 G 1 0 302820 CASAVA_Build 2 132534411 1I TATCAGTGAT -/C TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 C 0 1 302821 CASAVA_Build 2 132535086 1I AGTTTTTTTT -/G GGGGGGGTAT 3070 het 2001 hom 37 12 15 10 G 7 8 302822 CASAVA_Build 2 132535282 1I ACTAGGGCAT -/G AACCTCCAGT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 G 0 1 302823 CASAVA_Build 2 132536550 1I GCTTTCATTG -/T TTCATTTGAG 2879 het 2879 ref 45 35 7 3 T 2 3 302824 CASAVA_Build 2 132545217 4I TGCTGGGTTC ----/TGAG TGTTTGTCCC 2147 het 2147 ref 28 21 5 2 TGAG 0 1 302825 CASAVA_Build 2 132547681 5I CTTAGGAATC -----/CAGAA CACTGATTCT 1645 het 1645 ref 34 20 4 10 CAGAA 0 1 302826 CASAVA_Build 2 132550597 4D GGGTTCTGAC TGTT/---- TGTCCCTCAC 1752 het 1752 ref 49 38 4 9 TGTT 1 0 302827 CASAVA_Build 2 132555360 4I TTGAGCAGAT ----/TGTC TGTGATTCTT 1329 het 1329 ref 39 31 3 5 TGTC 0 1 302828 CASAVA_Build 2 132556280 1I TCTTTTGCCT -/C TGTAAATCCA 2777 het 2777 ref 46 38 6 2 C 0 1 302829 CASAVA_Build 2 132556461 2I TGATGGGAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 27 1 22 4 T 14 16 302830 CASAVA_Build 2 132568990 3D GGCACCACAC TTA/--- TTGTACATTT 1367 het 1367 ref 31 23 3 7 TTA 1 0 302831 CASAVA_Build 2 132569396 1D GTGGATACTG T/- TTGCATGGAA 3070 het 1263 hom 42 3 24 15 T 3 2 302832 CASAVA_Build 2 132571385 1I GTGTTTTTAG -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 T 5 6 302833 CASAVA_Build 2 132573913 4D AAATAAGAGA GTTG/---- TTGACTTACG 3070 het 3070 ref 60 39 18 3 GTTG 1 0 302834 CASAVA_Build 2 132575429 1D CTATTTTTTT C/- TGATTTTATT 2325 het 2325 ref 45 39 5 1 C 1 0 302835 CASAVA_Build 2 132576071 1I GCAAATGTAA -/C AAACTTTTCT 3070 het 3070 ref 49 32 11 6 C 0 1 302836 CASAVA_Build 2 132580320 5D TACATAATGC ATTTA/----- TTTTTTTGTG 2666 het 2666 ref 41 28 7 8 ATTTA 1 0 302837 CASAVA_Build 2 132582959 2D34M1I GCACAGAAAC TATGTATCTTTCATACTATTCAGACAGGTTTATGAC-/--TGTATCTTTCATACTATTTAGACAGGTTTATGACA AAAAACACAG 3070 het 3070 ref 47 35 17 4 N/A 0 0 302838 CASAVA_Build 2 132583076 4I ATGAAATATG ----/TATT TATTTTGTGA 3070 het 3070 ref 41 28 12 1 TATT 1 2 302839 CASAVA_Build 2 132583670 1D TGTGAAAGCT C/- CCCTCTTTCT 2749 het 2749 ref 36 26 6 5 C 4 3 302840 CASAVA_Build 2 132586541 1D AACAACATTC A/- AAAATGAGGA 3070 het 3070 ref 46 35 8 3 A 5 4 302841 CASAVA_Build 2 132588599 1I TTTTTTGTGA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 7 8 302842 CASAVA_Build 2 132596155 4I CCAGCAGGGT ----/AGTC AGTCATTGAA 3061 het 3061 ref 21 12 8 1 AGTC 1 2 302843 CASAVA_Build 2 132618884 1I CACCATTATT -/C TTCCTCAAAA 3070 hom 96 het 38 0 31 7 C 0 1 302844 CASAVA_Build 2 132622116 1I ATCTTCCCCC -/A TCTTGAATTT 3070 het 3070 ref 56 39 13 4 A 0 1 302845 CASAVA_Build 2 132624286 4D AACAAATAAA TAAT/---- TTATTTGTTA 3070 het 3070 ref 36 20 16 1 TAAT 1 0 302846 CASAVA_Build 2 132624830 4I ATAAAAAAAC ----/ACTT ACATATAGGT 2859 het 2859 ref 40 29 6 5 ACTT 0 1 302847 CASAVA_Build 2 132625466 2I AGCAAAAAAA --/TT ATTTGTTCTT 3070 het 3070 ref 42 27 9 6 T 0 2 302848 CASAVA_Build 2 132628688 1D GTTTTTTAAT A/- AAAAAAACTA 2908 het 29 hom 26 1 7 18 A 8 7 302849 CASAVA_Build 2 132635163 3I TGTATCTAAC ---/ATT ATCTTTTAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 ATT 0 1 302850 CASAVA_Build 2 132639260 1D CAAATCATTT A/- TTTTTTTAGG 3070 het 2284 hom 30 6 12 12 A 1 0 302851 CASAVA_Build 2 132642944 2D GAAAAATAAG AA/-- AAAAAAACAT 3070 hom 33 het 21 0 12 9 A 9 7 302852 CASAVA_Build 2 132643480 2D TCAGGAGGTC AA/-- GAGATCGAGA 1732 het 1732 ref 17 9 4 4 A 2 0 302853 CASAVA_Build 2 132643850 3D CAGAATTTTA TTC/--- TTCTCCATTT 1443 het 1443 ref 19 10 6 5 TTC 2 1 302854 CASAVA_Build 2 132644012 1I AAGGATTTAT -/C TTTTTGCCTC 2346 het 2346 ref 40 32 5 3 C 0 1 302855 CASAVA_Build 2 132645953 4D GTAATGATTA TTCT/---- TTCTGTCTCT 3070 het 3070 ref 51 35 14 2 TTCT 2 1 302856 CASAVA_Build 2 132647100 3I ACTAATTTTT ---/TTG TTATTTTTTC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTG 0 1 302857 CASAVA_Build 2 132649243 4I CTCAGTTTTT ----/ATTG ATTATTATTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 ATTG 0 1 302858 CASAVA_Build 2 132649925 14D TCTCAAGGTG GGGGCAAAGAGGTT/-------------- GGGGCAAAGT 3070 hom 24 het 10 0 9 2 GGGGCAAAGAGGTT 1 0 302859 CASAVA_Build 2 132652672 1D TATTTTTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 35 0 32 4 T 10 9 302860 CASAVA_Build 2 132653684 2D AAAAGAAAAC TG/-- AACAGTAGAG 1655 het 1655 ref 76 62 4 10 TG 1 0 302861 CASAVA_Build 2 132653811 2I GAATATGAAG --/GT GTGGAAGACA 1258 het 1258 ref 65 51 3 11 GT 1 2 302862 CASAVA_Build 2 132654264 1D AAGTGTACCC T/- TTTTTTTTTT 1963 het 140 hom 34 1 10 23 T 17 16 302863 CASAVA_Build 2 132656838 1I AAATTGCCCA -/T TTTTTGTGAA 1861 het 1861 ref 43 32 5 6 T 5 6 302864 CASAVA_Build 2 132658123 2I GGAATCAAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 32 12 12 T 12 14 302865 CASAVA_Build 2 132658459 2D AATATTTGCT AA/-- AAACTGAATT 3070 het 3070 ref 38 28 9 2 A 5 3 302866 CASAVA_Build 2 132663230 3D TCTGCACTTA GAT/--- GAAATTTTAT 1756 het 1756 ref 50 41 4 5 GAT 1 0 302867 CASAVA_Build 2 132666090 1I TTTTTCTACA -/T GTCCAGTAAA 572 het 572 ref 33 28 2 3 T 0 1 302868 CASAVA_Build 2 132669386 2D TTACAAAACA TG/-- TGGAGAATTA 3070 het 3070 ref 32 21 7 4 TG 2 1 302869 CASAVA_Build 2 132676460 2I19M3I ACTCATAAAG --ACACTTCATTTTTATCCTC---/ACACACTTCGTTTTTATCCTCTTT TTTTTTTTTA 2570 het 2570 ref 29 20 6 7 N/A 0 0 302870 CASAVA_Build 2 132676979 5I TTTGATTATG -----/CTTCT GTGTTTATTA 1332 het 1332 ref 49 44 3 2 CTTCT 0 1 302871 CASAVA_Build 2 132677386 1D TTAGGAAGTT A/- AAAAAAAGTG 2880 het 2880 ref 35 22 6 7 A 8 7 302872 CASAVA_Build 2 132677853 3D TACCAATGAT GTA/--- GTAGATTAAT 3070 het 3070 ref 41 31 7 5 GTA 2 1 302873 CASAVA_Build 2 132677975 1I ACATTGAAGA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 55 33 16 6 T 7 8 302874 CASAVA_Build 2 132678980 1D ATATTGGAGT A/- AAAAAAAATA 904 het 904 ref 46 33 4 10 A 9 8 302875 CASAVA_Build 2 132687295 13I TTTGAAACAC -------------/TCTTTTTGTAGAA TCTGCAAGTG 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 TCTTTTTGTAGAA 0 1 302876 CASAVA_Build 2 132687474 1I AACCCGCAAG -/T GGACATTTGG 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 T 0 1 302877 CASAVA_Build 2 132688478 1D GGAAACACTC T/- TTTTGTAGAT 3070 het 3070 ref 48 37 8 3 T 5 4 302878 CASAVA_Build 2 132689401 1D ATATCTTCAC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 64 34 27 5 A 8 7 302879 CASAVA_Build 2 132691172 9D CTCAGAAACT TCTTTGTGA/--------- TGTCAGCATT 3070 het 3070 ref 59 43 7 14 TCTTTGTGA 1 0 302880 CASAVA_Build 2 132697785 1D TGCAGAATCT G/- CAAGTGGACA 2989 het 2989 ref 79 54 8 18 G 1 0 302881 CASAVA_Build 2 132698193 1D TAAACACTAG A/- TAGAAGCATT 1353 het 1353 ref 42 31 3 8 A 1 0 302882 CASAVA_Build 2 132699298 1D TTTGAAACAC T/- TTTTTTGTAG 1815 het 1815 ref 73 52 4 17 T 7 6 302883 CASAVA_Build 2 132702169 3I TTCTTAGAAA ---/CTT CTTTGTGATG 3070 het 3070 ref 50 30 14 6 CTT 1 2 302884 CASAVA_Build 2 132714261 1D AATCACAGAG T/- TACACCTTTC 3070 het 3070 ref 74 31 13 30 T 2 1 302885 CASAVA_Build 2 132718186 2D AACTCACGGA TT/-- TAAACCTTTC 3070 het 3070 ref 76 59 10 8 T 3 1 302886 CASAVA_Build 2 132718959 1D GCCTATGGTG A/- AAAAGGAAAT 2835 het 2835 ref 54 36 7 12 A 5 4 302887 CASAVA_Build 2 132724088 1D CACATTCTAC A/- AAAACACCAT 2321 het 2321 ref 86 71 8 9 A 5 4 302888 CASAVA_Build 2 132724581 1I GTGAATATTT -/G GGGGACCTCG 3070 het 3070 ref 99 34 48 17 G 4 5 302889 CASAVA_Build 2 132725347 1D22M1D AGATTGCAAC TGTTTTGCATGCATTCATTTTTGT/-CATTTGTATGCATTCATTTTTG- ACGTGTGTAT 1460 het 1460 ref 102 107 4 17 N/A 0 0 302890 CASAVA_Build 2 132728165 1I GCTCACCAGG -/C CTGCGAGCCA 1052 het 1052 ref 57 22 9 26 C 1 2 302891 CASAVA_Build 2 132734261 1D GAACTCATCA T/- TTTTTATGGC 1994 het 1994 ref 12 6 5 1 T 6 5 302892 CASAVA_Build 2 132739052 4D TCCAGCCAGG GCGA/---- GGGACAGAGC 3070 het 3070 ref 75 34 9 41 GCGA 1 0 302893 CASAVA_Build 2 132749750 11I CGTGATGGGG -----------/GGGTGGGGGTC GCTTCCGCCT 3070 het 3070 ref 91 43 35 31 GGGTGGGGGTC 0 1 302894 CASAVA_Build 2 132750558 6D AAGAAAAAAA AGAAAG/------ AAAGAAAGAA 970 het 970 ref 47 29 7 12 AGAAAG 1 0 302895 CASAVA_Build 2 132751697 2D25M4D27M4D11M2D20M3I ATACATACAC ATGTATATGTAAATGAAATGGGTTTTCATTTAATACATATTCATACATTAAAATTAACATTTATAATATAAACAAGTATTAATTATGGAAATATC---/--GTGTATGTAAATGAAATGGGGCTTC----GATACATATTCATCCATTAAAAGTAAC----ATAATATAAAC--GTATTAATTATGGAAATATCATT TATATAGTTT 3070 het 3070 ref 74 74 11 38 N/A 0 0 302896 CASAVA_Build 2 132753268 3I AGGATCAAAA ---/AGC AACATCCCTA 3070 het 3070 ref 73 44 20 9 AGC 0 1 302897 CASAVA_Build 2 132753420 3D TTTTGCCCTT CTG/--- CTCCACAAGA 3070 het 3070 ref 104 60 20 27 CTG 1 0 302898 CASAVA_Build 2 132753593 1I CTAGGGGCTC -/G ACCCCCTGCC 1557 het 1557 ref 74 56 10 8 G 0 1 302899 CASAVA_Build 2 132753687 1D CACGGGGATA G/- GGGGGCACTG 3070 het 3070 ref 71 32 19 22 G 6 5 302900 CASAVA_Build 2 132754871 1D CTTCACAAAG A/- AAAAGAGAAC 3070 het 3070 ref 95 34 29 35 A 5 4 302901 CASAVA_Build 2 132758726 1I ATCACCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 15 16 20 T 14 15 302902 CASAVA_Build 2 132759497 1D12M9D7M2I AACACCCGGT GGATACTAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAT--/-GTTACTGAAACC---------ACAAAATGC GGTTTCCCAC 3070 het 3070 ref 85 59 24 29 N/A 0 0 302903 CASAVA_Build 2 132759982 1D CTGTGAATGG A/- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 99 64 20 15 A 2 1 302904 CASAVA_Build 2 132762854 2I TGTGTGTTTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 61 31 16 14 TG 6 7 302905 CASAVA_Build 2 132762924 4I AAACCAATGT ----/GACA GACAGACAGA 3070 het 3070 ref 72 35 21 16 GACA 2 3 302906 CASAVA_Build 2 132763629 2D TATGCTAATC TG/-- TTTTAAAATT 3070 het 3070 ref 40 27 9 5 TG 1 0 302907 CASAVA_Build 2 132763920 4D AATGGTAAAT GTAA/---- GTGTTTCCCT 3070 het 3070 ref 55 31 13 13 GTAA 1 0 302908 CASAVA_Build 2 132765618 1D CTTATGTTTT A/- ATTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 61 34 25 5 A 2 1 302909 CASAVA_Build 2 132766440 2I TCTTTGTGTG --/TA TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 75 38 26 11 TA 0 1 302910 CASAVA_Build 2 132766722 32D GCTGTTTTTT TTTTGTTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGTTTTTG/-------------------------------- TTGTTGCTCT 3070 het 3070 ref 36 20 13 24 TTTTGTTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGTTTTTG 1 0 302911 CASAVA_Build 2 132766905 2D TATTTCTCTC TT/-- AGAGCATTCA 3070 het 3070 ref 65 47 14 6 T 2 0 302912 CASAVA_Build 2 132767677 5D CTTGAAATGG AAGTT/----- AAGTTAATTT 3070 het 3070 hom 92 21 46 32 AAGTT 2 1 302913 CASAVA_Build 2 132767702 1D ATTTTCACTC T/- TGTGTTTCAT 3070 het 3070 hom 90 14 39 37 T 2 1 302914 CASAVA_Build 2 132768978 1I TAACATGGCA -/G TTTTCCCTCT 3070 het 3070 ref 84 42 28 15 G 0 1 302915 CASAVA_Build 2 132769164 1I TTTTTGGGAT -/G GGGGGGGCAC 3070 het 3070 hom 66 27 27 12 G 7 8 302916 CASAVA_Build 2 132769381 1I CTAGTCCTTA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 84 55 26 3 T 3 4 302917 CASAVA_Build 2 132769814 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCA 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 A 4 5 302918 CASAVA_Build 2 132771236 1I TAGATGCTAA -/G TCTTCCTCTT 3070 hom 220 het 81 0 73 8 G 0 1 302919 CASAVA_Build 2 132771481 1I AATGGATGCA -/T ATTGCTGAAG 3070 het 3070 hom 87 40 41 6 T 0 1 302920 CASAVA_Build 2 132771688 1D AAGAAAAAAA T/- AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 69 43 18 9 T 1 0 302921 CASAVA_Build 2 132772556 1D22M10D CAGCCTGGGC AAAAAAGTAAGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAA/-ATGGAGCAAGAGACTCTGTCTC---------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 22 8 9 N/A 0 0 302922 CASAVA_Build 2 132773675 1I GTTTTTCTGA -/T ATTATCATCT 2807 het 2807 ref 39 28 6 5 T 0 1 302923 CASAVA_Build 2 132774542 2D GTTTGTGTCA TC/-- TATGATTTCT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 TC 1 0 302924 CASAVA_Build 2 132774622 1D TTCTTAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 321 hom 40 1 24 15 T 15 14 302925 CASAVA_Build 2 132775451 3I TAATAAGATA ---/AAG AAAAATGCTA 2367 het 2367 ref 39 32 5 2 AAG 0 1 302926 CASAVA_Build 2 132775571 1I GTACTTAAAA -/T TGTTAATGAC 1185 het 1185 ref 53 47 3 3 T 1 2 302927 CASAVA_Build 2 132778693 1I GACGAATGCA -/T CGAAGTCAAA 3070 het 3070 hom 57 24 24 9 T 0 1 302928 CASAVA_Build 2 132779970 10D AAAAAAAAAA AAAAAGAAAG/---------- AAAGAAAGAA 995 het 733 hom 9 4 3 5 AAAAAGAAAG 1 0 302929 CASAVA_Build 2 132781167 1I8M1I TTGTTTTTTT -TTTTTTTG-/GTTTGTTTGT TTTTGTTTTT 1045 het 1045 ref 37 23 8 9 N/A 0 0 302930 CASAVA_Build 2 132783062 1D AAAAGGAAAA G/- AATGTGCAGG 3070 het 3070 ref 58 34 21 4 G 1 0 302931 CASAVA_Build 2 132783195 3D AATGAGAAGA GAT/--- GATATCTAGG 3070 het 3070 ref 53 31 15 8 GAT 2 1 302932 CASAVA_Build 2 132783438 3I TTTTCTGAAA ---/GGT GGTCAGCATT 3070 het 3070 ref 71 42 23 6 GGT 1 2 302933 CASAVA_Build 2 132783783 1D TGGGTATGTA T/- TTGGTCAGAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 3 2 302934 CASAVA_Build 2 132783907 1D ACAGGGCAGT C/- CCTCAGGAAG 3070 het 3070 ref 45 29 13 3 C 3 2 302935 CASAVA_Build 2 132784469 1D GAGCTCACAC T/- TTTATCCTTC 3070 het 3070 ref 66 35 26 6 T 4 3 302936 CASAVA_Build 2 132785170 3I TGCTATTGAC ---/TTG TTGTAGAAAC 3070 het 3070 ref 56 29 18 10 TTG 1 2 302937 CASAVA_Build 2 132786403 1I TCAGGCTTTT -/A GTTACCCTGT 3070 het 3070 ref 67 37 25 5 A 0 1 302938 CASAVA_Build 2 132787621 5I GTGCTACCTA -----/AGTTT GGTTTATGAG 3070 het 3070 ref 76 39 26 11 AGTTT 0 1 302939 CASAVA_Build 2 132788589 1I GAAAGACCCG -/C CCCCATAATT 1048 het 1048 ref 31 24 5 2 C 4 5 302940 CASAVA_Build 2 132790109 2I CCCCATTCTC --/AA ATTCATGGCT 3070 het 3070 ref 58 27 23 8 A 1 3 302941 CASAVA_Build 2 132790450 3I29M1I GAGATAGGAC ---TTGCTTGTTTCTGAAACCTCTTGTGACCC-/TTGTTGCTTGTTTCTGAAACCTCTTGTGACCCT TTGTGTCCCT 2894 het 2894 ref 79 70 7 22 N/A 0 0 302942 CASAVA_Build 2 132791039 4D TACTGTGGCT TTAA/---- CTGTTTCCCA 3070 het 3070 ref 67 33 27 11 TTAA 1 0 302943 CASAVA_Build 2 132792375 1I GAAACAATAC -/A AATGCAATGT 3070 het 3070 ref 89 46 30 13 A 2 3 302944 CASAVA_Build 2 132792588 1D TCAGATCTTC A/- ATGTTCATCT 3070 het 3070 ref 73 46 17 14 A 2 1 302945 CASAVA_Build 2 132792811 2D TTAGGAAAAC AG/-- AAGCCACACT 2732 het 2732 ref 73 53 10 11 AG 1 0 302946 CASAVA_Build 2 132793136 1I AGTCCTTAGA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 62 29 24 9 T 7 8 302947 CASAVA_Build 2 132796780 11D CTCCGTCTCT ACTAAAAATAC/----------- AAAAAATTAG 2022 het 2022 ref 16 7 6 4 ACTAAAAATAC 1 0 302948 CASAVA_Build 2 132797199 1D ATAATAGTCA T/- TTTAATAACT 3070 het 3070 ref 73 48 23 3 T 4 3 302949 CASAVA_Build 2 132797518 1I46M1D TTCCCTTGTG -CCCTTTCCCTTCATTTCTTTCCAAAAAAGGATATAATCACTGTTTTG/CCCCTTTCCCTTCATTTCTTTCCAAAAAAGGATATAATCACTGTTTT- GTTTCTATCA 3070 het 3070 ref 53 28 28 20 N/A 0 0 302950 CASAVA_Build 2 132797955 1D ACTTCCCTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 61 31 21 9 T 8 7 302951 CASAVA_Build 2 132799135 1I GACTGGCTTA -/T TTAACTTTCC 3070 het 3070 ref 44 28 10 6 T 2 3 302952 CASAVA_Build 2 132800813 19I AAAGTTTTGC -------------------/TTGTTTTTTGTTGGTTTGT TTCCTTACTG 3070 het 3070 ref 51 26 17 8 TTGTTTTTTGTTGGTTTGT 0 1 302953 CASAVA_Build 2 132801002 4I CTCTTTTTTG ----/CCTA CCTATGAAAT 3070 het 3070 ref 62 32 23 7 CCTA 1 2 302954 CASAVA_Build 2 132801688 21D TCGCCCAGGC TGGAGTGCAGTGGCATGATCT/--------------------- TGGCTCACTG 2428 het 2428 ref 28 18 7 8 TGGAGTGCAGTGGCATGATCT 1 0 302955 CASAVA_Build 2 132801890 3D TTCTGCCCTC CTT/--- GGCCTGACAA 2277 het 2277 ref 32 23 6 3 CTT 1 0 302956 CASAVA_Build 2 132802230 1D GTATCACTCT A/- CTATGATATT 3070 het 3070 ref 46 25 15 7 A 1 0 302957 CASAVA_Build 2 132802816 4D AGTGAACACA AAAC/---- AAACAAAACT 46 het 46 ref 50 28 2 21 AAAC 2 1 302958 CASAVA_Build 2 132803944 23D TTTATCTTGA TTGTGGTAGTAGCTATATCCGTC/----------------------- TACAAGTGAT 3070 het 3070 ref 57 45 26 2 TTGTGGTAGTAGCTATATCCGTC 1 0 302959 CASAVA_Build 2 132808532 1D ATTCAAGGGT C/- CCCATTCAAG 3070 het 3070 ref 84 46 34 5 C 4 3 302960 CASAVA_Build 2 132808899 1I TATTTTGAGG -/C TCTGATTAGG 3070 het 3070 ref 95 56 30 9 C 0 1 302961 CASAVA_Build 2 132809443 3I GTGAACCTTG ---/TTC TTCTTCTAAT 3070 het 3070 ref 55 29 21 5 TTC 2 3 302962 CASAVA_Build 2 132810051 1D TTACAATAAC A/- AAAAGGGCAG 3070 het 3070 ref 72 34 33 5 A 5 4 302963 CASAVA_Build 2 132810565 1D3M2D TTCTTGTGGG TTCTTG/-TCT-- TATCATGGAA 3070 het 3070 ref 64 36 25 6 N/A 0 0 302964 CASAVA_Build 2 132812080 2I AGAATGACTC --/TT TGGCTCCTAG 3070 het 3070 ref 38 19 10 9 T 1 3 302965 CASAVA_Build 2 132812123 3D ACTTAGCATC CTT/--- CTTCTTGCTG 3070 het 3070 ref 42 25 9 9 CTT 3 2 302966 CASAVA_Build 2 132813105 12D ACACACACAC ACACACATATAT/------------ ATATATATAT 3070 het 2863 hom 44 13 18 14 ACACACATATAT 1 0 302967 CASAVA_Build 2 132815467 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1408 het 1408 ref 38 25 6 7 A 10 11 302968 CASAVA_Build 2 132816416 4I TAGCCCTTCC ----/CTCT AAGTTCTGAA 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 CT 0 2 302969 CASAVA_Build 2 132818042 1I TTAATCAAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 62 32 15 15 T 9 10 302970 CASAVA_Build 2 132818180 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1291 het 59 hom 20 1 5 14 T 13 12 302971 CASAVA_Build 2 132818708 4D TAAAAGTGGT TTGA/---- TTAATTTCTA 3070 het 3070 ref 56 36 14 9 TTGA 1 0 302972 CASAVA_Build 2 132819121 6D AGACTCTGTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 2704 hom 41 15 22 7 A 25 19 302973 CASAVA_Build 2 132820148 6D TTAAATTTTC CTTTCA/------ TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 57 32 24 2 CTTTCA 1 0 302974 CASAVA_Build 2 132820642 1I GTTGCATCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 61 33 17 11 T 9 10 302975 CASAVA_Build 2 132821212 1I ACACGCGCCA -/G AAAAGGCGCC 3070 het 3070 hom 59 22 26 11 G 0 1 302976 CASAVA_Build 2 132822343 1I TTTTTTCCCA -/G GGGAGACAAT 3070 het 3070 ref 65 37 19 9 G 3 4 302977 CASAVA_Build 2 132822876 4I AGAGTAAAAG ----/AAAA AAACTAATTA 3070 hom 144 het 55 0 49 6 A 3 7 302978 CASAVA_Build 2 132823315 1I ATGGTCCTTA -/C TTGAGGACGC 3070 het 3070 ref 86 53 28 5 C 0 1 302979 CASAVA_Build 2 132823442 1D CTTTATCTAA G/- TCCATACACT 3070 het 3070 ref 82 44 29 9 G 1 0 302980 CASAVA_Build 2 132823592 1I AGAATTGGAA -/T TAGGTATCAA 3070 het 3070 ref 58 31 20 7 T 1 2 302981 CASAVA_Build 2 132823730 1I TCGATAATCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 58 37 13 8 A 9 10 302982 CASAVA_Build 2 132823955 11I ATCACCCCAA -----------/AAACTCCGCTC ATGTCTTCCC 3070 het 3070 ref 71 50 15 6 AAACTCCGCTC 0 1 302983 CASAVA_Build 2 132824158 1D CTTCATTTCT G/- TTTACTTCTG 3070 het 3070 ref 87 47 29 12 G 1 0 302984 CASAVA_Build 2 132825150 1I AAATTTATTC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 70 45 17 8 T 7 8 302985 CASAVA_Build 2 132828109 3I TTAGAAATTC ---/TGT TGTTGAGTTG 3070 het 3070 hom 80 30 43 7 TGT 1 2 302986 CASAVA_Build 2 132828800 1D AATCTGTAGA T/- TACTTTAGAT 3070 het 3070 ref 70 40 22 10 T 2 1 302987 CASAVA_Build 2 132828910 2I AAGTTTTGTG --/TA TTCCACCATG 3070 het 3070 ref 67 36 27 6 TA 0 1 302988 CASAVA_Build 2 132829608 1D TGCTTATATA T/- TCATAAGGGA 3070 het 3070 ref 54 33 17 5 T 2 1 302989 CASAVA_Build 2 132829753 3D ATGGTATTAA TTC/--- TTCTTTAAAT 1687 het 1687 ref 83 70 5 10 TTC 2 1 302990 CASAVA_Build 2 132830377 1D CCACGCATCA G/- TAAGTTGTCT 3070 het 3070 ref 65 38 22 5 G 1 0 302991 CASAVA_Build 2 132830648 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2113 het 185 hom 53 5 6 42 T 18 16 302992 CASAVA_Build 2 132833764 1I ATCAACAAGC -/A AGCAGCAAGT 3070 het 3070 ref 57 28 23 6 A 1 2 302993 CASAVA_Build 2 132834146 1I ATATCCTACC -/A AAAAAGACAC 3070 het 3070 ref 103 68 21 14 A 5 6 302994 CASAVA_Build 2 132834453 4D TATAATCCCA ACAC/---- TTTGAGAGGC 1252 het 1252 ref 21 14 3 4 AC 2 0 302995 CASAVA_Build 2 132835663 14I3M1I ATATGCCATA --------------CCA-/TATTTTTATGGCATCCAC CCCTGTGTCC 3070 hom 74 het 49 0 31 20 N/A 0 0 302996 CASAVA_Build 2 132835863 2D GCTCGTGCCC CT/-- CAGAGCCCCG 3070 het 3070 ref 63 35 16 12 CT 1 0 302997 CASAVA_Build 2 132836292 1D CTCCTTTTTA C/- TTTTTGAGAC 3054 het 3054 ref 82 58 7 18 C 1 0 302998 CASAVA_Build 2 132836985 1D122M1D ATGCTATTTT CAATGGAATTTTAAAAACTTGGATTGTACCGTGTAATGAAGAGAAATACACTTAATTTTGTATTCTGCAATTTTGCTAAATGCAACTATTAGTTCTAACAGGTATTGTTTTCAGCGTATAGGAT/-AATGGAATTTTAAAAACTTGGATTGTACCTTGTAATGAAGATAAACACACTTAATTTTGTATTCTGCAATTTTGCTAAATGCAACTATTAGTTCTAACAGATATTGTGTTCAGCATATAGGA- TTTTTTGTAT 3008 het 3008 ref 94 152 8 72 N/A 0 0 302999 CASAVA_Build 2 132837181 1I GATCTTTTCT -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 60 44 12 4 T 7 8 303000 CASAVA_Build 2 132839152 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAAAG 2950 het 1650 hom 17 5 8 4 A 10 9 303001 CASAVA_Build 2 132843957 1D TCACTGTGGG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 8 7 303002 CASAVA_Build 2 132852955 1I CTTATTTATC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 A 7 8 303003 CASAVA_Build 2 132853583 1D CCTGCATACA T/- GGAGCTCCAT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 T 1 0 303004 CASAVA_Build 2 132856106 1D AAACAGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 11 10 303005 CASAVA_Build 2 132865943 1I ACTTTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 86 het 39 0 27 12 A 9 10 303006 CASAVA_Build 2 132866439 2D GACTTCCTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 26 1 17 8 A 16 14 303007 CASAVA_Build 2 132867425 1D CTGAGAACCT C/- CCCCACTGTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 5 4 303008 CASAVA_Build 2 132888654 2I GCTCCAGTGC --/AG ACTGTGCAGA 3070 hom 92 het 37 0 30 7 AG 0 1 303009 CASAVA_Build 2 132888963 1D TCCGTCCCCT C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 60 het 27 0 20 7 C 9 8 303010 CASAVA_Build 2 132895491 1I TGAAAAAAGA -/T TTTTACAGAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 4 5 303011 CASAVA_Build 2 132895871 7I GAAGAAGAAG -------/AGAGAGA AGAGAGAAGA 3070 hom 104 het 42 0 35 7 AGAGAGA 1 2 303012 CASAVA_Build 2 132901376 1I CTGGCTAATA -/T TATTTTTTTT 3070 hom 18 het 10 0 8 2 T 1 2 303013 CASAVA_Build 2 132909796 1D CATATTTTCT C/- GTGTAAAGCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 0 303014 CASAVA_Build 2 132910200 3D GAAGAGCAAG AGC/--- AGCAGCTCCA 3070 hom 72 het 26 0 24 3 AGC 3 2 303015 CASAVA_Build 2 132917386 2D ATGGAGTGAC TT/-- ATGATATTTT 3070 het 3070 ref 38 21 15 4 T 2 0 303016 CASAVA_Build 2 132919209 2I TACTCGTACA --/TT TGTAAACTAC 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 T 1 3 303017 CASAVA_Build 2 132919713 7I ATGACAAATT -------/GTTTGCC GTTTGCCATA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 GTTTGCC 1 2 303018 CASAVA_Build 2 132923769 1I GCACTGATCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 8 9 303019 CASAVA_Build 2 132926914 1D CTTAATCCAG T/- TCTATTCATT 3070 hom 32 het 16 0 11 5 T 2 1 303020 CASAVA_Build 2 132952447 2D ACACAGATCA TT/-- GTTAGACCCA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 2 0 303021 CASAVA_Build 2 132978827 2I TAATTTAAAA --/AT ATATATATAG 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 AT 4 5 303022 CASAVA_Build 2 132980205 1I ATGCTGAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1260 hom 41 3 36 2 T 9 10 303023 CASAVA_Build 2 132980914 1D GTTTCTCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 19 16 13 T 11 10 303024 CASAVA_Build 2 132982632 1I TTGAAATGAC -/T TAACAAGCCA 3070 het 3070 hom 52 20 21 11 T 1 2 303025 CASAVA_Build 2 132983496 8I CACACACAGA --------/CACTCACT CACTCACTCG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CACT 2 4 303026 CASAVA_Build 2 132985907 3D8M9D GTCCAAGCAA AGTGATGACTCAAGTCCAGG/---TCTGACTC--------- CAGACTCTAT 3070 het 2811 hom 38 10 11 32 N/A 0 0 303027 CASAVA_Build 2 132987344 1I CGTCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 hom 38 het 16 0 13 3 A 4 5 303028 CASAVA_Build 2 132993328 3I AGAAGGTTGT ---/TTA TTATTATTAT 3070 hom 69 het 35 0 24 11 TTA 5 6 303029 CASAVA_Build 2 132995742 1D GTTCTTTTTC T/- TTTCCCCCCC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 4 3 303030 CASAVA_Build 2 133010053 1D TAATTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2264 hom 25 9 11 5 A 12 11 303031 CASAVA_Build 2 133063052 2I ACTTAGACTC --/TG TGCAAATGCC 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 TG 1 2 303032 CASAVA_Build 2 133063255 1I TCTGGCCATG -/T TCCCCCCCTC 3070 het 2720 hom 33 10 17 6 T 1 2 303033 CASAVA_Build 2 133064764 1D CTGTCTTTCA G/- GGATGGACTC 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 G 3 2 303034 CASAVA_Build 2 133073797 3D CTAGTGGGTT GAG/--- GAGTGCAAGA 3070 het 3070 ref 63 32 23 11 GAG 2 1 303035 CASAVA_Build 2 133076076 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 8 A 11 10 303036 CASAVA_Build 2 133086129 5I TGCCCTGAAC -----/TGCAA TGAGTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 TGCAA 0 1 303037 CASAVA_Build 2 133088230 13D CTTTTTTTTT TGTTTTTGTTTTG/------------- TTTTGTTTTT 310 het 310 ref 32 19 3 10 TGTTTTTGTTTTG 1 0 303038 CASAVA_Build 2 133111021 1I CAGGCTGAGA -/G GATAGCTACA 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 G 1 2 303039 CASAVA_Build 2 133114008 4D TCGAGGGTAG AATC/---- AATCCAGTGT 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 AATC 2 1 303040 CASAVA_Build 2 133116922 1I CAGGAAAGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 48 16 22 10 A 8 9 303041 CASAVA_Build 2 133118727 4I CCTTTAAAAT ----/ACAA ACAAACACTG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 ACAA 1 2 303042 CASAVA_Build 2 133122321 1D TAAAAAAATA T/- TTACTGAATG 3070 het 3070 hom 28 14 11 3 T 3 2 303043 CASAVA_Build 2 133122527 7I GCACACAGTT -------/GTTAACA GTATCACATC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 GTTAACA 0 1 303044 CASAVA_Build 2 133128043 1D AATGAAATGC A/- ACGTGGGATC 3070 het 3070 hom 66 29 29 11 A 2 1 303045 CASAVA_Build 2 133142257 6D CCTTGGTAAT TAACTC/------ TAATGAGATT 3070 het 3070 hom 36 12 21 4 TAACTC 1 0 303046 CASAVA_Build 2 133157310 1I AATAGAACCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 A 9 10 303047 CASAVA_Build 2 133168517 8I GGCCCAAAAC --------/TTTTAAAG TTTTAGTCCC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 TTTTAAAG 0 1 303048 CASAVA_Build 2 133171081 1I CAGGCATGTG -/C CACCATACCC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 C 1 2 303049 CASAVA_Build 2 133171216 1I7M1I CAGGCATGGG -CACTGCG-/CCACTGCGC CCGGCCGACA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 N/A 0 0 303050 CASAVA_Build 2 133171650 1D AGGTCCCATC T/- TTTTTTTTTT 3014 het 2534 hom 25 8 9 8 T 13 12 303051 CASAVA_Build 2 133174974 1D TCCCCTGGGC G/- GGGGGGGGGG 2606 het 371 hom 16 5 8 3 G 11 10 303052 CASAVA_Build 2 133179311 1I TCTCATCCTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 A 8 9 303053 CASAVA_Build 2 133184927 1I CAATTTTTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 A 8 9 303054 CASAVA_Build 2 133187160 1I ATGTGCATTT -/C TTTGCTTTGT 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 C 0 1 303055 CASAVA_Build 2 133187428 3D GGCAGTATCT GGA/--- GGAAGATATC 3070 het 3070 hom 63 26 31 8 GGA 2 1 303056 CASAVA_Build 2 133187756 1D AAGGGCCAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 C 1 0 303057 CASAVA_Build 2 133209218 1I CTTCTCGCCA -/G GGATTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 G 2 3 303058 CASAVA_Build 2 133218679 1D TAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 957 het 957 ref 40 29 3 8 A 11 10 303059 CASAVA_Build 2 133219439 1D CATGACAGAC A/- AAAAAAAAAC 1264 het 1264 ref 37 28 3 6 A 10 9 303060 CASAVA_Build 2 133221215 1D TCAGCCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 A 12 11 303061 CASAVA_Build 2 133248523 2I TATCTAGATA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 9 11 303062 CASAVA_Build 2 133252369 4D AAATTTAATT CAGA/---- CAAACATTAA 3070 het 3070 hom 27 13 13 2 CAGA 1 0 303063 CASAVA_Build 2 133291489 1D TACAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 28 4 A 11 10 303064 CASAVA_Build 2 133294279 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2094 het 2094 ref 21 11 6 4 T 10 11 303065 CASAVA_Build 2 133298175 4I TCAGCTGCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 AAAC 3 4 303066 CASAVA_Build 2 133315681 1I ACATTTGCTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 7 8 303067 CASAVA_Build 2 133317612 1I CATTTTTCCC -/T TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 T 6 7 303068 CASAVA_Build 2 133331215 1I TTCCATTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 16 14 T 11 12 303069 CASAVA_Build 2 133338396 1D TAATATCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 35 1 29 6 A 11 10 303070 CASAVA_Build 2 133352404 1D AATCTACTGA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 55 19 26 11 T 7 6 303071 CASAVA_Build 2 133359244 1D GGCAACAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 A 10 9 303072 CASAVA_Build 2 133360220 1D ATTAAAAAAA T/- AATTGGATGT 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 1 0 303073 CASAVA_Build 2 133364448 1D CACCATAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 8 7 303074 CASAVA_Build 2 133415529 4D TGGAATGACA TTCT/---- TTCCACTGGG 3070 hom 111 het 38 0 35 3 TTCT 1 0 303075 CASAVA_Build 2 133437062 1I GAACTCATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 10 11 303076 CASAVA_Build 2 133471848 1I AGCTTATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 40 1 30 9 A 11 12 303077 CASAVA_Build 2 133473159 14D GAAACAAACT AAATACATATATGC/-------------- AAACAGTATG 3070 het 3070 hom 31 15 19 1 AAATACATATATGC 1 0 303078 CASAVA_Build 2 133484114 3D ATTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAT 437 hom 7 het 10 0 3 7 A 12 9 303079 CASAVA_Build 2 133489403 1D AACCGAACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 42 0 33 9 T 10 9 303080 CASAVA_Build 2 133490087 1D GGACATGAAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 110 het 41 0 37 4 A 8 7 303081 CASAVA_Build 2 133491655 1I GTAGATTCTG -/A AAAAAAAAAA 1340 het 1340 ref 41 34 3 4 A 11 12 303082 CASAVA_Build 2 133500239 1I TGGTTTGTGG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 7 8 303083 CASAVA_Build 2 133500422 1D TGTTCTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 16 14 T 15 14 303084 CASAVA_Build 2 133521004 4D AATCCAAGTA AATT/---- GGCAGGTTGG 3070 het 3070 hom 50 20 27 3 AATT 1 0 303085 CASAVA_Build 2 133535122 3D AAAAAAACAA AAC/--- AACAACAACA 2790 het 2790 ref 19 9 7 4 AAC 4 3 303086 CASAVA_Build 2 133541070 1D TGCCATTTTA T/- TTTTTATTTT 310 het 86 hom 27 1 7 19 T 6 5 303087 CASAVA_Build 2 133548413 1I ATTTAATTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 8 9 303088 CASAVA_Build 2 133564833 1D GGAGACTTGG C/- GGGGGAAATT 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 C 1 0 303089 CASAVA_Build 2 133576181 1I TTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2256 hom 26 7 17 2 T 8 9 303090 CASAVA_Build 2 133578024 1I CTGAGGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 10 11 303091 CASAVA_Build 2 133579431 1I TCTCCTCTGG -/T TTTTAGTTTG 3070 het 3070 hom 52 17 24 11 T 4 5 303092 CASAVA_Build 2 133583806 1D AGTTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 23 7 A 12 11 303093 CASAVA_Build 2 133592664 1D TGCCAGCAAG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 A 7 6 303094 CASAVA_Build 2 133599100 3I AATAATAATA ---/ATC ATCATCATCA 3070 het 3070 hom 39 17 12 10 ATC 5 6 303095 CASAVA_Build 2 133602020 1I ATAATGCTGA -/C CACACAGGAG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 1 2 303096 CASAVA_Build 2 133604888 3D TGTTTTTGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 70 25 30 18 TTG 7 6 303097 CASAVA_Build 2 133606010 1I GAAACAGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 10 11 303098 CASAVA_Build 2 133627808 1D ACACACCCCT A/- ATCGCCTTAG 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 A 2 1 303099 CASAVA_Build 2 133631769 1I GATAGTGTAT -/A AAAAAGAAAC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 5 6 303100 CASAVA_Build 2 133633501 1D GAGATGCCAT G/- TATCTGTTGT 3070 hom 135 het 52 0 45 8 G 1 0 303101 CASAVA_Build 2 133636269 1I TTTTAGATAA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 6 7 303102 CASAVA_Build 2 133648019 1I ATACATACGC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 T 7 8 303103 CASAVA_Build 2 133648745 1I AAGTAACATC -/T TTTTTTTTTT 2323 het 2323 ref 36 13 8 15 T 13 14 303104 CASAVA_Build 2 133649164 1D ACTACTGAAC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 T 8 7 303105 CASAVA_Build 2 133666709 1D GCCACTAACC A/- TTAGAGTAAT 3070 het 3070 ref 48 22 21 6 A 1 0 303106 CASAVA_Build 2 133683120 1I AAATTACATT -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 6 7 303107 CASAVA_Build 2 133706037 1D AAGGACACAC T/- TTTTAAGTGT 3070 het 3070 ref 46 20 21 5 T 5 4 303108 CASAVA_Build 2 133709947 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2475 het 2406 hom 20 9 9 2 A 15 14 303109 CASAVA_Build 2 133711090 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 A 10 11 303110 CASAVA_Build 2 133723964 1D AGCAATGTGC T/- TCTGAAGCAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 2 1 303111 CASAVA_Build 2 133725596 1D TGCCAAAGTA T/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 1 0 303112 CASAVA_Build 2 133729563 2D CTTTAGGGAA TG/-- TGTGTACAAA 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 TG 3 2 303113 CASAVA_Build 2 133741292 1D TCCTAGTAAG A/- AAAAAAAAAT 2879 het 1806 hom 20 6 9 5 A 10 9 303114 CASAVA_Build 2 133741340 2D CACGCCCCCA CC/-- CCCAGCCTCA 335 het 335 ref 15 4 2 9 C 5 3 303115 CASAVA_Build 2 133745506 1D ATATTTTTGC A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 A 7 6 303116 CASAVA_Build 2 133747848 1I CCAAAAAAAA -/T ATTTGGGGGA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 T 0 1 303117 CASAVA_Build 2 133747937 1D TTCAGGGTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 29 9 19 2 A 9 8 303118 CASAVA_Build 2 133749431 8D GGAAAAGGCT CACACATA/-------- CACACATACA 2908 het 2908 ref 43 25 10 11 CACACATA 2 1 303119 CASAVA_Build 2 133760848 1I AAAGACTGCG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 50 19 20 11 A 8 9 303120 CASAVA_Build 2 133763459 3D TAAGCTCCTA TAT/--- TATTAGTCTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TAT 2 1 303121 CASAVA_Build 2 133800685 1I GGACATTATG -/T GTTATTAATA 3070 hom 105 het 45 0 32 13 T 0 1 303122 CASAVA_Build 2 133815327 1D AGTGAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 33 1 18 15 T 15 14 303123 CASAVA_Build 2 133825270 1D AGGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 10 9 303124 CASAVA_Build 2 133875272 1I CAGGTTGGTG -/C CTCCGGAGAG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 C 1 2 303125 CASAVA_Build 2 133883664 1I GCTTTTGGAG -/C CCAAGGTTAG 3070 hom 120 het 47 0 39 8 C 2 3 303126 CASAVA_Build 2 133903335 1I TTGGAGCTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 61 29 27 5 T 8 9 303127 CASAVA_Build 2 133911985 3I TGAACTTACA ---/AAT AATATTTCAT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAT 1 2 303128 CASAVA_Build 2 133918583 1D CAAGAGGTTA G/- TGAACCCTGC 3070 hom 102 het 36 0 35 2 G 1 0 303129 CASAVA_Build 2 133935953 4I TCTGACTCTG ----/CTGT CTATTTCTTC 3070 hom 150 het 53 0 50 3 CTGT 0 1 303130 CASAVA_Build 2 133952815 8D TCTTAAACCC AAATATGT/-------- AAGGATCAGG 3070 het 3070 ref 46 27 16 4 AAATATGT 1 0 303131 CASAVA_Build 2 133954464 1D TTCTCCCAGC T/- TTTGGTAACA 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 4 3 303132 CASAVA_Build 2 133957669 1I CAAAAAAAAA -/G GGGGGGGGGG 1719 het 1044 hom 16 3 5 8 G 10 11 303133 CASAVA_Build 2 133958849 1I TTCTAAAATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 9 10 303134 CASAVA_Build 2 133973591 7D CTAAGTGTTC TTTTTTG/------- TTTTTTGTTT 3070 hom 45 het 24 0 15 9 TTTTTTG 3 2 303135 CASAVA_Build 2 133984420 4D ATATATATGG GTAT/---- GTGTGTACAC 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 GTAT 1 0 303136 CASAVA_Build 2 133996739 1D AATACTAGAC A/- CATTTACAAG 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 A 1 0 303137 CASAVA_Build 2 133997147 1D TTAATAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 12 11 303138 CASAVA_Build 2 134002366 1D TTACTGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 T 11 10 303139 CASAVA_Build 2 134004300 1D ACCCTCAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 A 11 10 303140 CASAVA_Build 2 134015817 1D ATAAAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 11 10 303141 CASAVA_Build 2 134040268 2D AAGAGAAGGT TC/-- CACTGGAGAG 3070 het 3070 ref 41 20 14 9 TC 1 0 303142 CASAVA_Build 2 134043216 4I AATCCCACTC ----/ACTT ACAACTATCA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 ACTT 0 1 303143 CASAVA_Build 2 134044101 1I ACAAGAAAAC -/A AAAAATGGAG 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 A 5 6 303144 CASAVA_Build 2 134048183 1D AGGAAGAGGA T/- GGGGACAGCC 3070 het 3070 ref 44 22 17 7 T 1 0 303145 CASAVA_Build 2 134050262 1D CTTCCCATTC T/- TTTTTCTTCA 3070 het 3070 hom 39 12 20 9 T 6 5 303146 CASAVA_Build 2 134057510 1D CCAGCACCGT G/- GATTCCTGTA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 2 1 303147 CASAVA_Build 2 134064360 36D TGAAACCCCA TCAAGAGATCAAGACGGCCAACACGGTGAAACCCCG/------------------------------------ TCTCTACTAA 2807 het 1447 hom 14 5 10 2 TCAAGAGATCAAGACGGCCAACACGGTGAAACCCCG 1 0 303148 CASAVA_Build 2 134064937 4D27M4D GTATGCTGTC TGTGTGTGTGTTTGTGTGTGCATGTGTGTGTGAGA/----TGTGTGTTTGTGTGTGCATGTGTGTGT---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 53 41 33 8 N/A 0 0 303149 CASAVA_Build 2 134068926 4D CTCACTTACA CATT/---- CATTCATTCA 3070 hom 105 het 45 0 35 12 CATT 5 4 303150 CASAVA_Build 2 134069422 3D CCCTTCTTCT TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 TCC 4 3 303151 CASAVA_Build 2 134074385 3D AAGGGAGAGA GAG/--- AAGAGGAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 GAG 1 0 303152 CASAVA_Build 2 134077270 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2284 het 270 hom 17 3 7 7 T 15 14 303153 CASAVA_Build 2 134080181 1I ATAGAACTTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 53 23 22 8 A 8 9 303154 CASAVA_Build 2 134085167 1D TTAATGCCCG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 85 het 33 0 28 6 A 9 8 303155 CASAVA_Build 2 134094221 1I TAACACAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 27 0 16 11 A 9 10 303156 CASAVA_Build 2 134148286 1D GGGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 34 1 29 4 A 11 10 303157 CASAVA_Build 2 134155802 3D ATTTGTTTTT TTG/--- TTTTGTTTTG 3070 hom 132 het 54 0 44 12 TTG 1 0 303158 CASAVA_Build 2 134161006 1D GTTAAACCAG C/- AGCTAACTGC 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 C 1 0 303159 CASAVA_Build 2 134162333 1D AATTCTGATC T/- TTTTCAACCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 5 4 303160 CASAVA_Build 2 134165253 1D ATTTTGTTTC A/- AAACACAGAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 A 4 3 303161 CASAVA_Build 2 134171573 1I CATAAAAAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 405 hom 39 1 32 6 T 9 10 303162 CASAVA_Build 2 134202543 1D TTGAAGTATT G/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 G 1 0 303163 CASAVA_Build 2 134205550 1I31M1I CCATCAAATC -ATGTTTTAGGCAGCAGAAAAGAGGAAAAGGC-/AATGTTTTAGGCAGCAGAAAAGAGGAAAAGGCA AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 30 0 34 9 N/A 0 0 303164 CASAVA_Build 2 134214907 4D TTAAACAACC ACCA/---- ACCAACCAAC 3070 hom 136 het 56 0 45 14 ACCA 4 3 303165 CASAVA_Build 2 134220715 1D CTATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 30 0 19 11 T 15 14 303166 CASAVA_Build 2 134224317 1D ACAGAGGCAT C/- CCGCTCTCTA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 C 3 2 303167 CASAVA_Build 2 134224560 1I GCAGGATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 634 hom 46 3 31 12 T 12 13 303168 CASAVA_Build 2 134225635 8I ACTTAAATTT --------/AAAATGAA AAAATAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AAAATGAA 0 1 303169 CASAVA_Build 2 134225779 1I AGATTTCAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 414 hom 37 1 30 6 T 9 10 303170 CASAVA_Build 2 134226240 1I TATTTTTTTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 A 8 9 303171 CASAVA_Build 2 134229157 1D AGCCTGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 A 11 10 303172 CASAVA_Build 2 134231588 4D ATGTGAAAAG AACA/---- AAATAATGAG 3070 hom 60 het 23 0 20 5 AACA 1 0 303173 CASAVA_Build 2 134239327 1I AAGGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 10 11 303174 CASAVA_Build 2 134240152 2I CAAAGAGGGG --/AA AAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 A 8 10 303175 CASAVA_Build 2 134246176 1I TTATACTTTT -/G TTCTCCAGAT 3070 hom 178 het 62 0 60 2 G 0 1 303176 CASAVA_Build 2 134260273 1D CCCAGAACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2880 hom 27 8 12 7 A 10 9 303177 CASAVA_Build 2 134267037 2I TAAACAGATA --/AC ACAGAGTTCC 3070 het 3070 hom 55 18 30 7 AC 1 2 303178 CASAVA_Build 2 134270885 1D TTGGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1412 het 873 hom 34 6 8 20 T 19 18 303179 CASAVA_Build 2 134273208 2I CTTATCTCCC --/CA CAGTTTGTAC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 CA 1 2 303180 CASAVA_Build 2 134284559 1I ATATGAAAGC -/A AAAAAAAAGA 2854 het 2854 ref 26 10 7 9 A 8 9 303181 CASAVA_Build 2 134285907 1I AGGGAAGTAA -/G AATGGGAAGG 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 G 0 1 303182 CASAVA_Build 2 134287213 1I GTTACAATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 65 22 29 14 A 9 10 303183 CASAVA_Build 2 134291031 4D AAACAACAGC AAAA/---- AAAAAAAATA 818 het 13 hom 32 1 8 24 A 12 8 303184 CASAVA_Build 2 134294154 4I AGCTGCTCTT ----/TCTC TATCTCTTCT 3070 hom 125 het 49 0 41 8 TC 0 2 303185 CASAVA_Build 2 134300907 1I CTAGTGCCTT -/A ACAATCAAGC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 1 2 303186 CASAVA_Build 2 134303769 1I ATGATTCTTT -/C CCCCTTGGGA 2862 het 2862 ref 29 16 8 5 C 4 5 303187 CASAVA_Build 2 134304552 3I TTGTGTGGGA ---/GGT GGGGATGGTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 GGT 0 1 303188 CASAVA_Build 2 134313793 4I TTATACTCCA ----/GCCT GGGTGACAGG 3070 hom 93 het 33 0 31 2 GCCT 0 1 303189 CASAVA_Build 2 134317605 1I ACACATGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 10 11 303190 CASAVA_Build 2 134318841 2D CTCCTAAATG TA/-- GCCAACCCCA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TA 1 0 303191 CASAVA_Build 2 134321375 2D ACAATTTCTA CT/-- CTGTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 CT 2 1 303192 CASAVA_Build 2 134341110 2I CACCAAATTT --/CC ATTATAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 0 2 303193 CASAVA_Build 2 134344140 1D AACCTATTGG A/- AAAAAAAAAA 2464 het 2464 ref 25 12 8 5 A 13 12 303194 CASAVA_Build 2 134344209 6D GATAAAAAGT TAAAAA/------ TAAACTAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 7 TAAAAA 1 0 303195 CASAVA_Build 2 134348925 1I ATAAATCTAT -/C CCAGTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 C 2 3 303196 CASAVA_Build 2 134350868 1D GTAAGCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 12 11 303197 CASAVA_Build 2 134352804 4I TAATTGCAAT ----/AGAG AAAGTGTAAT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 AG 0 2 303198 CASAVA_Build 2 134353618 5D AGTTTTGGTA GTTTT/----- GTTCTTTCAA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 GTTTT 1 0 303199 CASAVA_Build 2 134356715 1I GTATAACAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 9 10 303200 CASAVA_Build 2 134369137 1D GAAAGCTTAA G/- GCTTTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 G 2 1 303201 CASAVA_Build 2 134377308 1I TTGGCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 A 11 12 303202 CASAVA_Build 2 134395723 2D GGAGACTCTC TG/-- TTGCTGCTCT 3070 hom 125 het 46 0 36 11 TG 1 0 303203 CASAVA_Build 2 134401630 1D ATGGACCACA T/- TAGTGTGGCC 3070 hom 126 het 47 0 39 8 T 2 1 303204 CASAVA_Build 2 134405285 1D AAAGAGAAAA G/- AAAAGAAAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 1 0 303205 CASAVA_Build 2 134406801 1D AACAGCACCA T/- TTGTTAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 3 2 303206 CASAVA_Build 2 134407181 1I CCACAAAAAT -/G GGGGGGGGTG 3070 hom 66 het 27 0 20 7 G 8 9 303207 CASAVA_Build 2 134409106 4D TTTCTTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 hom 68 het 41 1 37 4 T 13 9 303208 CASAVA_Build 2 134409771 1I CTAAATTTTG -/T GTTAATGTAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 303209 CASAVA_Build 2 134411078 1I AAGAAGAAGG -/A AAGCACTGTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 2 3 303210 CASAVA_Build 2 134419878 1I CCATGCCACA -/C CTGAAAAACG 3070 hom 78 het 28 0 25 3 C 1 2 303211 CASAVA_Build 2 134420779 3D TGGGAGCTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 42 0 34 10 T 13 10 303212 CASAVA_Build 2 134422788 1D GCCATTGTAG A/- AACAAAAGCA 3070 hom 122 het 46 0 41 5 A 3 2 303213 CASAVA_Build 2 134429565 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 36 1 28 7 A 10 11 303214 CASAVA_Build 2 134435633 1I CACTACACTA -/C CCTGGGTTTT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 C 2 3 303215 CASAVA_Build 2 134472757 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 1825 hom 24 5 10 9 T 8 9 303216 CASAVA_Build 2 134478475 1I CCGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 2957 het 2957 ref 26 12 9 5 A 13 14 303217 CASAVA_Build 2 134484688 1I GTGTTTGTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 8 9 303218 CASAVA_Build 2 134486456 1I AAACCACAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 T 9 10 303219 CASAVA_Build 2 134491202 3D AAAAAGAAAC AAT/--- AAGATAATAA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 AAT 1 0 303220 CASAVA_Build 2 134491733 1D TTTTTAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 13 12 303221 CASAVA_Build 2 134508421 4D ATTTTAAGAT AATC/---- AATATTAATA 2825 het 2825 ref 24 18 6 0 AATC 1 0 303222 CASAVA_Build 2 134512459 4I TGGATTGCTT ----/GAGC GAGCCTAGGA 3070 het 2973 hom 32 10 20 2 GAGC 1 2 303223 CASAVA_Build 2 134512748 1I TATTTTCTAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 8 9 303224 CASAVA_Build 2 134556806 1D TTATGTCAGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 9 8 303225 CASAVA_Build 2 134565932 1I TTTTTTCCTT -/C CTTTTTTTTT 3070 het 904 hom 34 11 20 3 C 1 2 303226 CASAVA_Build 2 134569738 1I ACAAGCTGTG -/T TGTTGTCCAA 2767 het 2767 ref 24 13 8 3 T 1 2 303227 CASAVA_Build 2 134570052 1D TTAAAGCCTT G/- GGGCTGTTCA 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 G 4 3 303228 CASAVA_Build 2 134586858 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1751 hom 22 6 10 6 A 13 12 303229 CASAVA_Build 2 134596151 1I CTCTCCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2682 hom 24 9 10 5 T 11 12 303230 CASAVA_Build 2 134612257 1I ATCATTGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 28 9 T 10 11 303231 CASAVA_Build 2 134613472 1I TGGTATAATC -/A TTACTCTGAG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 0 1 303232 CASAVA_Build 2 134653555 4D5M4I4M4D5M4I TCAGTGTTTG CAGAGACTT----TATAGAACAAGAC----/----GTCTTGTTCTATA----AAGTCTCTG CATTCTGGGC 3070 het 3070 ref 49 26 23 11 N/A 0 0 303233 CASAVA_Build 2 134662815 1I TGGTTCCCAA -/C AAGGCTGTTC 3070 hom 105 het 43 0 35 8 C 0 1 303234 CASAVA_Build 2 134663649 2I TTTTGTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 506 het 23 hom 14 1 6 7 TG 0 1 303235 CASAVA_Build 2 134670444 1I CTTAAGGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 A 14 15 303236 CASAVA_Build 2 134671661 1D AGTAGTTCTT A/- GTCATGTTCC 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 A 1 0 303237 CASAVA_Build 2 134676125 4D CAGTAACTCA TATC/---- TATCTATGAC 3070 het 3070 hom 36 13 19 6 TATC 2 1 303238 CASAVA_Build 2 134701010 2D GATAGTCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2188 hom 33 11 14 8 T 16 14 303239 CASAVA_Build 2 134709031 1I ACCACCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 9 13 12 T 10 11 303240 CASAVA_Build 2 134713372 1D CTTGGGGTTT C/- CCCCTCAGTA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 5 4 303241 CASAVA_Build 2 134722728 8D CGCTGTCCTA TGTGAATG/-------- TGTGAATGTG 3070 het 3070 ref 52 26 21 7 TGTGAATG 2 1 303242 CASAVA_Build 2 134732207 4I TCAGGACCTT ----/TGTC TGATTGTGTA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 TGTC 0 1 303243 CASAVA_Build 2 134746411 1I TTGTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 T 10 11 303244 CASAVA_Build 2 134747068 6D GTGTGCGCGC GCGCGT/------ GCGCGTGCAT 3070 het 3070 hom 43 14 21 9 GCGCGT 2 1 303245 CASAVA_Build 2 134757033 1D ACCAAAACCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 11 10 A 13 12 303246 CASAVA_Build 2 134757346 1D TGGCACATGG T/- TAAGTGCTCA 3070 het 3070 ref 56 31 21 4 T 2 1 303247 CASAVA_Build 2 134758628 1D AAAATAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 11 10 303248 CASAVA_Build 2 134764457 3D AATTGGGGAC TGA/--- TGATCTAGTC 3070 het 3070 ref 52 24 24 7 TGA 2 1 303249 CASAVA_Build 2 134764851 1I GTTGTGGTTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 144 het 55 0 49 6 A 8 9 303250 CASAVA_Build 2 134769262 7I TGCCAGAAAA -------/GAACAAT GAACAATGAG 3070 het 3070 hom 53 19 23 11 GAACAAT 1 2 303251 CASAVA_Build 2 134779128 10D AGCTTCTTTT ATACATTCTC/---------- TCTGTCCTAC 3070 het 3070 hom 35 17 19 3 ATACATTCTC 1 0 303252 CASAVA_Build 2 134780325 1D ACATGCAGAG T/- TTTGCATTAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 T 4 3 303253 CASAVA_Build 2 134781436 1D TTTTATCCAC A/- AAATGTGACT 3070 het 3070 hom 36 12 18 7 A 4 3 303254 CASAVA_Build 2 134794414 1D AGCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 10 11 T 11 10 303255 CASAVA_Build 2 134799049 1I AGTAAAAGAA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 48 hom 32 2 29 1 T 3 4 303256 CASAVA_Build 2 134800080 4I GATTTCTCTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 2494 hom 24 het 22 0 11 11 TC 7 9 303257 CASAVA_Build 2 134804596 20D AAATTGTGTA GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/-------------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 30 14 10 12 GT 15 5 303258 CASAVA_Build 2 134808065 1D GTGCTAAGAT G/- TTCATAATTG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 G 1 0 303259 CASAVA_Build 2 134809255 2I AGCTCCACAC --/AT GTCTCTGCTA 3070 hom 108 het 45 0 37 8 AT 0 1 303260 CASAVA_Build 2 134811902 3D GTCAAACAGC CTG/--- CTAAGAATTG 3070 het 3070 hom 50 24 25 3 CTG 1 0 303261 CASAVA_Build 2 134812701 2D CCTGTAAGAC TT/-- TTCCTTTGAA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 4 2 303262 CASAVA_Build 2 134817949 4D AAGATAATCA CTGT/---- CTGGCCCTTA 3070 het 3070 ref 47 25 19 5 CTGT 1 0 303263 CASAVA_Build 2 134818924 1D CCTTTTAAGT A/- AATGATTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 3 2 303264 CASAVA_Build 2 134827289 4D AATTGAAAAC AGAT/---- AGAGACAAAC 3070 het 3070 ref 29 18 11 0 AGAT 1 0 303265 CASAVA_Build 2 134829383 1D ATATATCATC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 T 9 8 303266 CASAVA_Build 2 134831919 1I CACCATTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 40 1 28 11 A 13 14 303267 CASAVA_Build 2 134832645 3D GCGCTGGGGT TTC/--- TTCTCTTGGT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 TTC 2 1 303268 CASAVA_Build 2 134834616 1D TGATCCTGAA G/- TATAGTGTCA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 G 1 0 303269 CASAVA_Build 2 134834935 2I ACAACCCTGT --/TG TATCTCCTCA 1548 het 1548 ref 33 20 6 7 TG 0 1 303270 CASAVA_Build 2 134838542 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 10 11 303271 CASAVA_Build 2 134858022 1D GCCTGGCCGC T/- TAAGCATGGT 3070 hom 47 het 21 0 16 5 T 2 1 303272 CASAVA_Build 2 134858256 1I CCGGCCCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 752 hom 31 3 19 9 A 15 16 303273 CASAVA_Build 2 134866941 1I CAGAAAGCCC -/T TTGGTGAGGG 3070 hom 90 het 36 0 27 9 T 2 3 303274 CASAVA_Build 2 134872786 1I TCGGCCATTT -/A AAAAAAATGG 2773 het 2773 ref 36 20 12 4 A 7 8 303275 CASAVA_Build 2 134893691 1I TCTCAATAAA -/T TAGCAAGAAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 1 2 303276 CASAVA_Build 2 134915553 1D CCTGGAGCCC T/- TTGTGGAAGG 3070 het 3070 hom 46 20 16 10 T 3 2 303277 CASAVA_Build 2 134929422 3I CTTTAGTTCA ---/TGT TGTTGTTACA 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 TGT 2 3 303278 CASAVA_Build 2 134930505 1I TCCAGAGACT -/A AAAAAACGCC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 6 7 303279 CASAVA_Build 2 134934120 1I GATGTTACCC -/G CCCCCCAAAT 3070 hom 36 het 19 0 11 8 G 0 1 303280 CASAVA_Build 2 134948487 1I ACCAACGGTG -/A AAAAAATGAA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 A 6 7 303281 CASAVA_Build 2 134954445 1I CCTCACCCCC -/T GATCTTTCTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 0 1 303282 CASAVA_Build 2 134954869 1D GGATTAAGAG T/- TTTTTAATTA 3070 hom 68 het 27 0 23 4 T 6 5 303283 CASAVA_Build 2 134955419 1D ATTGAATCAT G/- GGGGGGGGGG 2020 het 2020 ref 24 12 7 6 G 12 11 303284 CASAVA_Build 2 134962045 1I ACAATCTCCA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 21 hom 27 1 19 7 T 3 4 303285 CASAVA_Build 2 134963617 1D ACTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 240 hom 29 2 16 13 A 15 14 303286 CASAVA_Build 2 134965186 1I AGTGTCCCAA -/G GTCAAGTAGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 1 2 303287 CASAVA_Build 2 134969015 14D TTTACTGCTG CCTCCCAGGTTCTC/-------------- CCTCCCAGGT 3070 hom 91 het 38 0 27 18 CCTCCCAGGTTCTC 2 1 303288 CASAVA_Build 2 134970861 2I TTCCTTGTCC --/CT CTCCTCCTTT 3070 hom 132 het 51 0 44 7 CT 1 2 303289 CASAVA_Build 2 134973223 3I TTAAAAAAAT ---/ATA ATAATAACTA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 ATA 2 3 303290 CASAVA_Build 2 134974684 1D ATTCTGCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 45 2 34 9 A 11 10 303291 CASAVA_Build 2 134982008 1I TAAAGCCTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 743 hom 49 2 35 12 T 9 10 303292 CASAVA_Build 2 134982853 6I TCTCCTCTAT ------/CTTCAA CTTCATCTAC 3070 hom 101 het 36 0 32 4 CTTCAA 0 1 303293 CASAVA_Build 2 134991992 1D TGTCAGATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 39 1 28 10 A 11 10 303294 CASAVA_Build 2 135002791 2D TAATATGTCT CA/-- CACTTCTGAT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 CA 2 1 303295 CASAVA_Build 2 135003428 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAATCTC 3070 hom 89 het 36 0 29 7 A 7 6 303296 CASAVA_Build 2 135010273 1D TAAAACACCA T/- TTTTTTTGCC 3070 hom 99 het 35 0 32 5 T 8 7 303297 CASAVA_Build 2 135012673 2D CACAATAGAA AT/-- GGAGTACTGC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AT 1 0 303298 CASAVA_Build 2 135044834 1I AGGACCCTTT -/G GGGTCAATTC 3070 hom 87 het 38 0 30 8 G 3 4 303299 CASAVA_Build 2 135061109 1I TAAAGTCCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 9 10 303300 CASAVA_Build 2 135064162 1D CAACTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 8 14 T 13 12 303301 CASAVA_Build 2 135067457 4D GCCAAAGAGA CAGT/---- CAGTCCCCTC 3070 het 3070 ref 59 32 23 4 CAGT 2 1 303302 CASAVA_Build 2 135072961 3D ACTCTATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 366 het 366 ref 18 10 3 6 A 15 12 303303 CASAVA_Build 2 135078477 1D CTTTTACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2388 hom 41 13 14 14 A 15 14 303304 CASAVA_Build 2 135080384 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2149 het 2149 ref 22 10 5 7 A 13 12 303305 CASAVA_Build 2 135104401 1I TTCCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 888 hom 46 2 32 12 A 11 12 303306 CASAVA_Build 2 135105054 1I CACTTGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 62 20 28 14 A 10 11 303307 CASAVA_Build 2 135111243 4D ACCAGGGCCA CTGT/---- CTGTGTGGAG 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 CTGT 2 1 303308 CASAVA_Build 2 135124549 8D ATTTCTTTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 363 het 363 ref 12 3 3 10 TTTG 6 4 303309 CASAVA_Build 2 135134928 3I CTGAGGAAAG ---/GTA GTTTCACTTT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 GTA 0 1 303310 CASAVA_Build 2 135151510 1I TATAGTTGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 T 8 9 303311 CASAVA_Build 2 135183719 1D CCTCTCCTCT C/- AGCCAAGGGC 3070 het 3070 hom 48 16 26 6 C 1 0 303312 CASAVA_Build 2 135264992 3I TGAAAGGATC ---/AAG AAGAACTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 AAG 1 2 303313 CASAVA_Build 2 135314779 3D TAAACCAGGT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TTC 3 2 303314 CASAVA_Build 2 135321896 1D CTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 17 1 13 3 T 13 12 303315 CASAVA_Build 2 135323313 4I ATCTACTGAC ----/TTAT TTATTTCCAG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 TTAT 1 2 303316 CASAVA_Build 2 135324323 2D TTTTTTTTTT TC/-- TGAGATGGAG 1649 het 7 hom 23 0 6 17 TC 1 0 303317 CASAVA_Build 2 135328852 1D7M4I ATGATCCACA TTTTACAG----/-TTTACAGCCTC ACAGAAAAAG 3070 het 3070 hom 50 24 24 6 N/A 0 0 303318 CASAVA_Build 2 135329080 1I GTTTCTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 10 11 303319 CASAVA_Build 2 135330946 1I AAATGTATGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 41 0 29 12 T 9 10 303320 CASAVA_Build 2 135335828 1I ATCTTTACTT -/A ACTTCCCTAG 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 A 1 2 303321 CASAVA_Build 2 135337098 1I CTGGGAGGTA -/G GGGGGGCATT 3070 het 2971 hom 26 8 13 5 G 6 7 303322 CASAVA_Build 2 135338665 1I AATTAAGATA -/T TTTTTAAGTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 5 6 303323 CASAVA_Build 2 135357306 1I GATCACAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 A 10 11 303324 CASAVA_Build 2 135359529 2I AGGTCTAGTT --/AC AGTCAGACTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AC 0 1 303325 CASAVA_Build 2 135366266 1D CTTACATGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 10 9 303326 CASAVA_Build 2 135367250 2D TCACACTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1377 hom 34 6 16 12 T 18 16 303327 CASAVA_Build 2 135393942 4I GTAAGTACTA ----/GTTT GTTGTCTGTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 GTTT 0 1 303328 CASAVA_Build 2 135395394 1I TATTTATTAA -/T TTTTTTTTTT 2798 het 2798 ref 22 9 9 4 T 10 11 303329 CASAVA_Build 2 135400071 1I ACACAGTTAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 T 7 8 303330 CASAVA_Build 2 135403166 2D TGTAAATGCC AA/-- AAAGTTATTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 A 5 3 303331 CASAVA_Build 2 135406227 2D GGTTTCACCA TG/-- TGTTAATCTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 4 TG 2 1 303332 CASAVA_Build 2 135410192 1D GCTTTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 T 15 14 303333 CASAVA_Build 2 135414395 11I TAGAAATATT -----------/GAAAAAATTAA GAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 GAAAAAATTAA 0 1 303334 CASAVA_Build 2 135419809 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 10 9 303335 CASAVA_Build 2 135420121 1D ATTGTCTTCG T/- TTTTTTTTTT 1252 het 1252 ref 49 39 4 6 T 13 12 303336 CASAVA_Build 2 135420723 1D CAATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2979 hom 33 12 12 9 T 15 14 303337 CASAVA_Build 2 135422391 4D AAAAAATAAA TAAG/---- TAAGGTTTAG 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 TAAG 2 1 303338 CASAVA_Build 2 135426412 1I TTTTTTTATT -/G GGGGGGGTGA 3070 het 1027 hom 25 4 17 4 G 7 8 303339 CASAVA_Build 2 135429856 4D AACAATAAAT AAAA/---- AAGAAAAGAT 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 A 6 2 303340 CASAVA_Build 2 135431645 1D GTGGTTTGTT C/- ACTGAAACAT 3070 hom 107 het 42 0 35 8 C 1 0 303341 CASAVA_Build 2 135431936 4D ATTGTATTAA TAAT/---- TAATAGAATA 3070 hom 93 het 32 0 32 2 TAAT 2 1 303342 CASAVA_Build 2 135434198 17I ATAGTTGCAG -----------------/TTATCTGGAAGGGGAAT TACCCATTTA 3070 hom 48 het 23 0 15 8 TTATCTGGAAGGGGAAT 0 1 303343 CASAVA_Build 2 135444038 1I TACCATGCTG -/T TTTGGTTACT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 3 4 303344 CASAVA_Build 2 135454468 7I GAAATCTCCA -------/ATTAGAC ATTTGTTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 ATTAGAC 0 1 303345 CASAVA_Build 2 135459705 4D ACCTTGTGAT CAAA/---- CAGTGAGACC 3070 het 3070 hom 40 18 19 4 CAAA 1 0 303346 CASAVA_Build 2 135464501 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 12 11 303347 CASAVA_Build 2 135466716 2I GAGCTGCAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1416 hom 27 5 14 8 T 12 14 303348 CASAVA_Build 2 135511040 1D TAAAACATTC T/- TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 35 21 3 11 T 15 14 303349 CASAVA_Build 2 135512898 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1736 het 1736 ref 34 22 5 8 A 12 11 303350 CASAVA_Build 2 135513460 1D CCATGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 815 het 815 ref 28 20 3 6 A 13 12 303351 CASAVA_Build 2 135622034 2I GCTGTGCTCC --/CT CTCTCATTTC 2319 het 2319 ref 19 13 5 1 CT 2 3 303352 CASAVA_Build 2 135648318 1I CATGGCCCAG -/C CCCTCAGGGT 1650 hom 33 het 33 0 10 23 C 3 4 303353 CASAVA_Build 2 135692556 1D CTCAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 1781 het 1781 ref 50 36 5 9 A 13 12 303354 CASAVA_Build 2 135696442 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 670 het 670 ref 17 12 3 2 A 15 14 303355 CASAVA_Build 2 135713458 1I ATAAAAAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 33 1 28 4 A 10 11 303356 CASAVA_Build 2 135716219 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1869 het 1869 ref 38 26 5 7 A 11 12 303357 CASAVA_Build 2 135785363 1D TAGTGCTCAC A/- AAGATATCAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 A 3 2 303358 CASAVA_Build 2 135792833 1D AAAGAATCTT A/- AAAAAAAAAT 1346 het 1346 ref 42 34 4 4 A 10 9 303359 CASAVA_Build 2 135847100 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 1033 het 1033 ref 28 19 3 7 A 15 14 303360 CASAVA_Build 2 135999889 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2762 het 2339 hom 23 14 7 3 A 19 18 303361 CASAVA_Build 2 136176258 11D TCTCAGGGGG AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 17 1 15 2 A 23 12 303362 CASAVA_Build 2 136178518 1D GCATGCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1403 hom 28 3 18 7 T 15 14 303363 CASAVA_Build 2 136221232 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 57 het 22 0 17 5 A 7 6 303364 CASAVA_Build 2 136226098 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 107 het 40 0 35 5 T 8 9 303365 CASAVA_Build 2 136235471 1D TCCCTCACTT G/- GCAGTAACCT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 G 2 1 303366 CASAVA_Build 2 136238169 5D GTCTCAAAAT AAATA/----- AAATAAAATA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AAATA 4 3 303367 CASAVA_Build 2 136243914 4I ACTGAGGTTG ----/TGAT TGATTGATTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TGAT 2 3 303368 CASAVA_Build 2 136253363 1D TTTTGTGTAC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 8 7 303369 CASAVA_Build 2 136257532 1D ATGTCTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 42 1 33 8 T 11 10 303370 CASAVA_Build 2 136258898 1I TTGTATTTTT -/A AAAAGTACAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 4 5 303371 CASAVA_Build 2 136268191 6I AAAAATAAAT ------/AAAATA AAAATAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 2 AAAATA 1 2 303372 CASAVA_Build 2 136269254 1D TCTTGTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 23 0 18 5 T 12 11 303373 CASAVA_Build 2 136281847 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 18 1 13 4 A 13 12 303374 CASAVA_Build 2 136290912 1D TGATTAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 27 1 20 6 T 15 14 303375 CASAVA_Build 2 136311770 1I ATTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 9 303376 CASAVA_Build 2 136312846 2I AGATCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 11 13 303377 CASAVA_Build 2 136315376 1I TTTTTAATTA -/C TGACCACTGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 0 1 303378 CASAVA_Build 2 136324447 5I CACCCACTCT -----/CTCTC ATTTTTTACA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CTCTC 0 1 303379 CASAVA_Build 2 136327774 1D AGAATACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 39 1 26 12 A 12 11 303380 CASAVA_Build 2 136332928 1I GAATGCTGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 9 303381 CASAVA_Build 2 136347705 9D AGCCCTATAA CAGAGGTAC/--------- CTGAGGCTGA 3070 hom 111 het 39 0 37 3 CAGAGGTAC 1 0 303382 CASAVA_Build 2 136378192 1I GTTACTCAAC -/T TTTTTTTTTT 1921 het 1921 ref 36 23 7 6 T 15 16 303383 CASAVA_Build 2 136386998 1I ACTCCTGGCC -/T TCAAATGATC 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 T 1 2 303384 CASAVA_Build 2 136533488 1D GGGTGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 577 hom 43 2 29 13 T 13 12 303385 CASAVA_Build 2 136533723 1I ATGATATTTC -/T TTTTTCCCTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 5 6 303386 CASAVA_Build 2 136538349 1D CAGCCAGAAG C/- CAGAGGTCAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 2 1 303387 CASAVA_Build 2 136540337 1D GCCATCCTGA G/- GGGCAGCATT 3070 hom 126 het 45 0 42 5 G 4 3 303388 CASAVA_Build 2 136545217 1D TTCAGAAGAC A/- AAAAAGTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 A 6 5 303389 CASAVA_Build 2 136545584 1I CTAAGGAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 9 10 303390 CASAVA_Build 2 136553898 1I GCTTGGCTTG -/C CAACGGCCAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 303391 CASAVA_Build 2 136559478 1D GCCTGTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 13 12 303392 CASAVA_Build 2 136580010 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 1330 hom 17 4 11 4 AAAC 3 2 303393 CASAVA_Build 2 136581642 2D2M7I AAGACCCAGT AAAG-------/--TGCTTCTTT AAGCAAGATT 3070 het 3070 ref 37 19 17 3 N/A 0 0 303394 CASAVA_Build 2 136581996 1I TTAGTGATTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 2909 hom 32 9 16 7 A 8 9 303395 CASAVA_Build 2 136596151 1D CTAAGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 23 1 12 10 A 12 11 303396 CASAVA_Build 2 136603046 2D CATAAAAAAC TG/-- TGATAAAAGC 3070 het 3070 hom 54 21 27 9 TG 2 1 303397 CASAVA_Build 2 136603633 7I AAGGGAGAGA -------/TGAAGGG TGAAGGGAGA 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 TGAAGGG 1 2 303398 CASAVA_Build 2 136611803 1I GGGGGCAGGA -/C CCCTCCGGAA 3070 hom 115 het 44 0 34 10 C 3 4 303399 CASAVA_Build 2 136629276 1I GTCCTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 T 10 11 303400 CASAVA_Build 2 136642553 1D TTCACAGGGG T/- TTTTTCCTGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 6 5 303401 CASAVA_Build 2 136652136 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 13 14 303402 CASAVA_Build 2 136698081 11I AATTTAGAAT -----------/CCATACCTTCA ACTCTTCAAG 3070 hom 87 het 36 0 28 8 CCATACCTTCA 0 1 303403 CASAVA_Build 2 136702329 1D TGGACCCAGG T/- TAGGGTAGTG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 2 1 303404 CASAVA_Build 2 136710693 1I GACCCTCAAT -/C TCCAGCCCAC 3070 hom 104 het 40 0 35 5 C 0 1 303405 CASAVA_Build 2 136714517 4I TTGTGTAAGA ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 338 hom 43 1 32 10 GT 7 9 303406 CASAVA_Build 2 136715043 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 1587 hom 6 het 5 0 4 1 A 14 12 303407 CASAVA_Build 2 136735394 1D AGATTGCGAA T/- TTTTTTTTCC 2861 hom 21 het 8 0 8 0 T 9 8 303408 CASAVA_Build 2 136746547 10D ACTGTCTCAA AAAATAAAAT/---------- AAAATAAAAT 2680 hom 15 het 6 0 6 2 AAAAT 5 3 303409 CASAVA_Build 2 136773886 1I GTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 38 0 36 2 A 11 12 303410 CASAVA_Build 2 136778491 7I AAAAGGCAAA -------/TATCCCT ACAATGCCCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TATCCCT 0 1 303411 CASAVA_Build 2 136793125 1D CTCTCCTTTT A/- TTTTTCTCTA 3070 het 391 hom 22 2 17 4 A 1 0 303412 CASAVA_Build 2 136793581 1D GGCCTCCCTA T/- TTTTTTTTTT 2587 het 2048 hom 32 12 8 12 T 15 14 303413 CASAVA_Build 2 136794791 4D AAAACCCCGT TTTC/---- TTTCTTTCTT 1316 hom 39 het 22 0 12 10 TTTC 5 4 303414 CASAVA_Build 2 136795712 2D CTAAGCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 29 0 17 14 T 16 14 303415 CASAVA_Build 2 136800541 14I TCACCTGAGG --------------/TCAGGAGTTCGAGA TCAGCCTGAC 3070 hom 33 het 18 0 7 11 TCAGGAGTTCGAGA 0 1 303416 CASAVA_Build 2 136817748 1D AAACTACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 10 A 11 10 303417 CASAVA_Build 2 136822199 1D TGTTGTGAGA G/- GGGGGCTCTG 3070 hom 73 het 31 0 23 8 G 6 5 303418 CASAVA_Build 2 136823743 1D TCTATAATTA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 7 6 303419 CASAVA_Build 2 136824976 1D CACTGTTTGC T/- TTTTTTGTGC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 6 303420 CASAVA_Build 2 136827668 1D GGCCAGGTGT G/- GGGGGGGGGC 2922 hom 24 het 12 0 9 3 G 10 9 303421 CASAVA_Build 2 136838545 1D TGTCCCTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 7 het 43 2 29 12 T 9 8 303422 CASAVA_Build 2 136843336 5I AACCACAAAT -----/AAATG GAAAGATATC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 AAATG 0 1 303423 CASAVA_Build 2 136852432 1I GCTTATTGCT -/A AGTAAGTACT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 1 2 303424 CASAVA_Build 2 136857169 2I TTTCCACCCC --/CT GTCAGTCATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CT 0 1 303425 CASAVA_Build 2 136875499 1D GATTTTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 30 2 20 8 T 13 12 303426 CASAVA_Build 2 136886279 5I ATGGGGCAAG -----/TAACT TAACTTCTCT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 TAACT 1 2 303427 CASAVA_Build 2 136886449 1D GGAGATACAG T/- TCAGTCTTAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 2 1 303428 CASAVA_Build 2 136886864 1D CCAGTCAATA C/- TATGACTATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 0 303429 CASAVA_Build 2 136894237 2D CAGAAAGTTT GG/-- CAACCTTTAG 3070 hom 126 het 48 0 43 7 G 2 0 303430 CASAVA_Build 2 136897989 2D CTGTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 hom 108 het 40 0 36 6 TG 1 0 303431 CASAVA_Build 2 136963070 1D GGCCAAGCTT C/- CCCTGGGATG 3070 hom 123 het 48 0 40 10 C 4 3 303432 CASAVA_Build 2 137006792 2I TCTCTGAGTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 239 hom 34 1 30 3 T 12 14 303433 CASAVA_Build 2 137022184 1D ATTAGAAGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 107 het 39 0 35 4 A 10 9 303434 CASAVA_Build 2 137030666 1I GTATTGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1008 hom 40 4 23 13 A 12 13 303435 CASAVA_Build 2 137040161 1D ATCACACTCT G/- GGGACTGTTG 2987 hom 23 het 11 0 9 2 G 4 3 303436 CASAVA_Build 2 137041779 1I TCCTAGAGAG -/A AAAATCAGGA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 4 5 303437 CASAVA_Build 2 137052780 1I GCCTATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 709 hom 42 2 30 10 A 10 11 303438 CASAVA_Build 2 137057390 1D CTGGCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 12 11 303439 CASAVA_Build 2 137059395 11D TTAATTCCTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2582 hom 7 het 25 0 9 16 T 27 16 303440 CASAVA_Build 2 137060556 4D AGGTGATAAC TAAA/---- TAAGATTTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TAAA 1 0 303441 CASAVA_Build 2 137069664 1D ACATTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 10 303442 CASAVA_Build 2 137098824 1I TGAAAGACAA -/C CAGGTTGAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 2 303443 CASAVA_Build 2 137102765 1I CACACTCAGT -/A AGGCTGAAAA 3070 hom 148 het 59 0 50 9 A 1 2 303444 CASAVA_Build 2 137122990 1D GACACTTCAC A/- GTCTTTGCAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 1 0 303445 CASAVA_Build 2 137123925 1D TCAATAGAAA G/- AAAAAGCTAT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 1 0 303446 CASAVA_Build 2 137124107 1I AAAATTGAAA -/C TTAAAAAACC 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 C 0 1 303447 CASAVA_Build 2 137125487 3I CTGGAGCTTT ---/GGA GGTCAAATCG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 GGA 0 1 303448 CASAVA_Build 2 137141533 2D ACCTTGAGAA AC/-- ACTTCTCTAT 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 AC 2 1 303449 CASAVA_Build 2 137145059 1D AGAAGAGAGA T/- TTTTTTAGAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 6 303450 CASAVA_Build 2 137153253 4I ATGACTTCTG ----/TCTT TCAGGTAAAT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 TCTT 0 1 303451 CASAVA_Build 2 137163403 3I8M1I AAAAAAGAAA ---AAAAAAAT-/AAGAAAAAAATA AAGAGGATAG 3070 hom 57 het 22 0 20 5 N/A 0 0 303452 CASAVA_Build 2 137169588 1D CTCGAGAGTC A/- ACAGATAATC 3070 hom 126 het 51 0 40 12 A 2 1 303453 CASAVA_Build 2 137175835 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTA 3070 hom 35 het 39 1 31 7 C 0 1 303454 CASAVA_Build 2 137182153 1I TAGAAAAAAA -/T ATCCCTTCCT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 0 1 303455 CASAVA_Build 2 137183439 2I CTCTCTCTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 36 0 26 10 A 11 13 303456 CASAVA_Build 2 137195723 1D ATTTTATTTA T/- TTATTTATTT 2393 het 209 hom 15 2 7 7 T 3 2 303457 CASAVA_Build 2 137197675 1D TCATCTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 13 12 303458 CASAVA_Build 2 137211216 4D CCCCTGCCAC TCTG/---- TCTATTTTTT 3035 het 3035 ref 33 22 10 4 TCTG 1 0 303459 CASAVA_Build 2 137213480 5D ATGCTTCCAG AATGT/----- AATGTCTTTG 3070 het 3070 hom 41 20 19 4 AATGT 2 1 303460 CASAVA_Build 2 137220249 23D GAGGTGGCAC GATACTGTGTGAGCCCTAAAGCT/----------------------- GATACGATTT 3070 het 3070 ref 40 27 17 4 GATACTGTGTGAGCCCTAAAGCT 1 0 303461 CASAVA_Build 2 137223660 4D TTGATTTGAT TTAG/---- TTAATTACTA 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 TTAG 1 0 303462 CASAVA_Build 2 137228315 1D CTCCTGCCCC T/- GACTGACTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 0 303463 CASAVA_Build 2 137231507 2I AAACTGAGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 10 12 303464 CASAVA_Build 2 137241025 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 TG 6 5 303465 CASAVA_Build 2 137246157 13D AACCACAGAG CCTAGATGTGTAT/------------- CCCAGATTGT 3070 het 3070 hom 37 17 19 3 CCTAGATGTGTAT 1 0 303466 CASAVA_Build 2 137250484 1I TCTCTGGTTT -/A ACTGGTCCAC 3070 het 3070 hom 36 11 24 1 A 1 2 303467 CASAVA_Build 2 137258610 4I TTCATGAAGG ----/AAGT ATTATAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAGT 0 1 303468 CASAVA_Build 2 137259512 1I TCTTGGAGGA -/C CCCAGAAGGA 3070 hom 69 het 25 0 22 3 C 3 4 303469 CASAVA_Build 2 137260214 1I AAGGAAAAAA -/G TCATCATATT 3070 het 3070 hom 49 18 31 0 G 0 1 303470 CASAVA_Build 2 137261879 1D CATTGTGTAG T/- TTCCCCTAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 6 T 3 2 303471 CASAVA_Build 2 137287683 1D TATTCTATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 T 10 9 303472 CASAVA_Build 2 137300207 1I TATAAAATAG -/C TTATAATGAT 3070 het 3070 ref 27 10 13 4 C 0 1 303473 CASAVA_Build 2 137303220 2I TCTAATTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 38 1 33 4 A 12 14 303474 CASAVA_Build 2 137304452 6I CCAGTGATCC ------/TATGAA TATGTTTTTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TATGAA 0 1 303475 CASAVA_Build 2 137325974 2I AATACACAAC --/TA TATATATATA 3070 hom 39 het 21 0 14 7 TA 8 9 303476 CASAVA_Build 2 137328319 1I TATGCATGTA -/T TTTTTGTTCT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 5 6 303477 CASAVA_Build 2 137330036 1D GGAAGTTTTT C/- CCTATCCACC 3070 het 3070 hom 40 13 25 2 C 3 2 303478 CASAVA_Build 2 137331667 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 14 14 9 AC 6 5 303479 CASAVA_Build 2 137337793 4I AGTAGATATT ----/TCTA TCTGTGTTTG 3070 het 3070 hom 42 13 22 7 TCTA 0 1 303480 CASAVA_Build 2 137340314 1D AGTTTATGAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 8 7 303481 CASAVA_Build 2 137340985 1I AGCCCAGTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 9 10 303482 CASAVA_Build 2 137344120 2I TCAAAAAAAA --/AG AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 28 5 17 6 AG 0 1 303483 CASAVA_Build 2 137345058 4D TAGATTGCAA AGGT/---- AGGTGCTGTC 3070 het 3070 hom 55 19 25 12 AGGT 2 1 303484 CASAVA_Build 2 137348215 4I CTCTCTTGCT ----/TCAG TCAGTGGGAG 3070 het 3070 ref 53 28 20 6 TCAG 1 2 303485 CASAVA_Build 2 137349531 1D GCAGCACATA T/- TTTTTAGGAG 3070 hom 110 het 38 0 36 2 T 6 5 303486 CASAVA_Build 2 137351152 2D CTGTCCACTA GG/-- GTTCCAGAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 6 G 3 1 303487 CASAVA_Build 2 137356477 1D AAATAGACTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 8 7 303488 CASAVA_Build 2 137358182 6I AAGATACACA ------/TATAAT TATAGTTATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TATAAT 0 1 303489 CASAVA_Build 2 137365085 1D TATTTTGAAC T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 7 6 303490 CASAVA_Build 2 137366779 1I CATGTATGGA -/T TTTTAAAGTA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 4 5 303491 CASAVA_Build 2 137367549 5D GGTCAGAGTT CAAAA/----- CAAGTCAGAC 3070 het 3070 ref 43 22 20 5 CAAAA 1 0 303492 CASAVA_Build 2 137368290 1D GTTGCAAAAG A/- GTGCTGCACT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 A 1 0 303493 CASAVA_Build 2 137371494 1I TTTGTTCCTT -/C CCAGTGGGTT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 C 2 3 303494 CASAVA_Build 2 137375119 1D ATTCCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 16 2 T 11 10 303495 CASAVA_Build 2 137376202 1I ATTCTAGAAT -/C CATTAAAGGG 3070 het 3070 hom 51 22 23 6 C 1 2 303496 CASAVA_Build 2 137377200 1D CAAAAAGGTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 8 7 303497 CASAVA_Build 2 137378092 10D GTCCCAGCTG TGTCCCCAAA/---------- TGTTCCTCAA 3070 het 3070 hom 23 8 14 4 TGTCCCCAAA 1 0 303498 CASAVA_Build 2 137378618 1D GCTTGGAACC G/- GGCAGAGGTT 3070 het 3070 ref 44 19 14 12 G 3 2 303499 CASAVA_Build 2 137378853 4I GAATAAAAAA ----/AGAG AGAGAGAGAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AG 4 6 303500 CASAVA_Build 2 137395503 1D CATATGCGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 19 2 13 4 T 12 11 303501 CASAVA_Build 2 137398396 2D TAAATCTACT TA/-- TATTCTTACT 3070 hom 39 het 26 0 14 13 TA 2 1 303502 CASAVA_Build 2 137400429 2I CCCTAAACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 10 12 303503 CASAVA_Build 2 137400746 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 11 10 303504 CASAVA_Build 2 137401324 9I GTCTTTTAAA ---------/AACAGCTAT AACATTACCT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 AACAGCTAT 0 1 303505 CASAVA_Build 2 137406515 4D27M9I TTTTGAAACT TAACTAATAGGCTATGGTTGACAGGAAGCTC---------/----TAATAGGCTATGGTTGACAGGAAGCTCTACTGATAA TACTGATAAC 3070 het 3070 ref 31 22 10 3 N/A 0 0 303506 CASAVA_Build 2 137407730 4I ATAATCAATC ----/TCTT TCTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 TCTT 1 2 303507 CASAVA_Build 2 137410864 1I ATGGAAATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 21 8 6 T 8 9 303508 CASAVA_Build 2 137430523 1I CCCTTAAGAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 7 8 303509 CASAVA_Build 2 137438043 4D CCCAACTCTT TGTC/---- TGTCCTCTAG 3070 het 3070 ref 47 25 20 6 TGTC 2 1 303510 CASAVA_Build 2 137440264 1D TTCCTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1550 hom 35 8 14 13 T 12 11 303511 CASAVA_Build 2 137451466 1I GGTTTGTTGA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 7 8 303512 CASAVA_Build 2 137457119 1I GTTTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 11 12 303513 CASAVA_Build 2 137457545 1I AAAATCTGTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 2971 hom 37 16 11 10 A 0 1 303514 CASAVA_Build 2 137460232 1D AATTAAGATT A/- GGGGGGGACT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 1 0 303515 CASAVA_Build 2 137470332 6I GTCAGACTGG ------/TCTCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 TC 5 8 303516 CASAVA_Build 2 137476478 1D CCCCATGCTG T/- TTTCTCTTGC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 4 3 303517 CASAVA_Build 2 137496587 1I AAAATCTTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 10 11 303518 CASAVA_Build 2 137496679 1D TCCTTTTAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 9 10 6 T 10 9 303519 CASAVA_Build 2 137497962 1I GTCCTTCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 22 22 8 T 12 13 303520 CASAVA_Build 2 137500892 1I TGTCCTTTTT -/A ATCTCGGCAG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 1 2 303521 CASAVA_Build 2 137505256 1D TGGTGGCGGG T/- TGCCTGTAAT 3070 hom 22 het 14 0 12 2 T 2 1 303522 CASAVA_Build 2 137505872 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2588 het 1041 hom 40 7 14 19 T 16 17 303523 CASAVA_Build 2 137507180 1D AACTCAGTGG C/- CCTAAAAATA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 3 2 303524 CASAVA_Build 2 137509603 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 897 het 897 ref 44 38 3 3 T 11 10 303525 CASAVA_Build 2 137511546 1I ATCTAGTATA -/T TTTTTCCATG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 5 6 303526 CASAVA_Build 2 137512023 1D TAGCAAAAAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 41 0 33 8 A 9 8 303527 CASAVA_Build 2 137514440 1D CTTCCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 28 0 17 11 T 12 11 303528 CASAVA_Build 2 137535468 1I AAGGACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 10 11 303529 CASAVA_Build 2 137558146 1I TCAGGGTAGA -/T TTAGCTCTCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 3 303530 CASAVA_Build 2 137574150 1I CTAGACATCC -/T TTTTTTCTTG 3070 hom 107 het 39 0 36 3 T 6 7 303531 CASAVA_Build 2 137574947 1I AAAATCTGTC -/T TGTCATTGGT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 1 2 303532 CASAVA_Build 2 137576406 1D ACATCCACAC A/- AAAACCCCAT 3070 het 3070 hom 21 7 11 4 A 5 4 303533 CASAVA_Build 2 137583796 11I AAGCTTCACT -----------/TGCTCATCTGC TGCTCACCTG 3070 het 3070 hom 43 16 15 12 TGCTCATCTGC 0 1 303534 CASAVA_Build 2 137586404 1I CTGAGGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 A 10 11 303535 CASAVA_Build 2 137596422 1I AGGTTTGGGG -/A TAAGAAAGCT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 0 1 303536 CASAVA_Build 2 137610014 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAGGATG 3070 het 3070 hom 44 14 24 7 A 6 5 303537 CASAVA_Build 2 137611949 1D ATGAATATTC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 33 20 7 7 T 8 7 303538 CASAVA_Build 2 137614640 1I TTATTCTTAA -/T TTTTTTGCCA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 6 7 303539 CASAVA_Build 2 137621508 1I TCCTTCCTTT -/A AAAAAAAAAA 2312 het 2312 ref 30 16 7 7 A 11 12 303540 CASAVA_Build 2 137623420 1I GTCCCCACCA -/G GGCACTGCCT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 G 2 3 303541 CASAVA_Build 2 137625567 1D TTAAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 461 hom 29 2 19 9 A 12 11 303542 CASAVA_Build 2 137626047 4D GCTACCTTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 29 3 10 18 T 20 16 303543 CASAVA_Build 2 137661983 1D ATCAAATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 21 15 10 A 10 9 303544 CASAVA_Build 2 137674476 1D TTGTCAAGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 T 8 7 303545 CASAVA_Build 2 137674896 28D ATATTGAAGA GATGGGGACTCCTATGTTGCCCAGACTG/---------------------------- GTCTCCAACT 3070 het 3070 ref 35 24 15 3 GATGGGGACTCCTATGTTGCCCAGACTG 1 0 303546 CASAVA_Build 2 137677092 4I ATGGATAAAC ----/AGAT AGTATTTTGT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 AGAT 0 1 303547 CASAVA_Build 2 137678329 1D GTAAAGGGAC A/- AAAAGAGCAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 5 4 303548 CASAVA_Build 2 137678865 1D AATTTCATCC A/- GAACTCAGAT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 1 0 303549 CASAVA_Build 2 137679529 5D GATTCAATCC TTTAA/----- TTTAATTATG 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 TTTAA 2 1 303550 CASAVA_Build 2 137679947 2D GAATAATGTC AG/-- TGGTAGATTG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AG 1 0 303551 CASAVA_Build 2 137680084 1D ACAGTGATTA T/- CCTTTTTTTT 3070 het 1148 hom 30 6 13 12 T 1 0 303552 CASAVA_Build 2 137682478 1I TAAGAATTCC -/T TTTTTATTTT 3070 het 2562 hom 21 7 10 4 T 5 6 303553 CASAVA_Build 2 137684846 6D ATTATGTTCT AGTTAA/------ AGTTAAAAAA 3070 het 882 hom 29 5 14 13 AGTTAA 2 1 303554 CASAVA_Build 2 137685788 1I TCTACAAGTA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 25 8 7 T 7 8 303555 CASAVA_Build 2 137687414 2I TATATAATAG --/TA TATATATGTT 1446 het 1446 ref 11 6 3 2 TA 3 4 303556 CASAVA_Build 2 137692581 3D GTACGGTTTG TTC/--- TTCTTTAGAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 TTC 2 1 303557 CASAVA_Build 2 137693023 1D TGAGTTTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 10 9 303558 CASAVA_Build 2 137693852 3D GCAGTCTCAC CTT/--- CATCATGGTG 3070 het 3070 hom 42 16 23 4 CTT 1 0 303559 CASAVA_Build 2 137694252 2I32M2D AAATTAAAAC --TTTCTCTGCAGAAGACACTGTTTAGAAAATGGAA/TTTTTCTCTGCAGAAGACACTGTTTAGAAAATGG-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 21 15 6 N/A 0 0 303560 CASAVA_Build 2 137694839 1D GAGAATGAAT A/- AACAAAACCT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 3 2 303561 CASAVA_Build 2 137695464 2D GATACAAGAC TG/-- TGCATTTGCC 3070 het 3070 ref 31 13 16 3 TG 2 1 303562 CASAVA_Build 2 137696279 1I GCCCTTTCCT -/C CACTTATGGC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 1 2 303563 CASAVA_Build 2 137698869 4I GAACTTTGTA ----/TAGC TACCCAGTTA 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 TAGC 0 1 303564 CASAVA_Build 2 137699823 1I CTTTATGTAT -/C TTCCTATATG 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 C 0 1 303565 CASAVA_Build 2 137705628 2D ATAATTAGAC TA/-- TGTTTAGTAA 3070 hom 138 het 52 0 44 9 TA 1 0 303566 CASAVA_Build 2 137744213 1I GCAATACAGA -/G GATGGAATCT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 G 1 2 303567 CASAVA_Build 2 137763097 2D TTTTTGATAC TT/-- TTTTACCAGT 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 T 6 4 303568 CASAVA_Build 2 137773528 1I GGGAGGGGCC -/A GGGGTGGAGT 3070 het 2710 hom 27 9 12 6 A 0 1 303569 CASAVA_Build 2 137810157 9D ACAATTAACA GTACTAAAG/--------- TGTCAGAGAA 3070 het 3070 ref 38 21 17 2 GTACTAAAG 1 0 303570 CASAVA_Build 2 137813323 1D ATCACTGGAG C/- CAGGTGTGTT 3070 hom 83 het 34 0 27 8 C 2 1 303571 CASAVA_Build 2 137816436 1D CTAACAGGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 10 9 303572 CASAVA_Build 2 137828324 1D ATGCAGTCAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 8 7 303573 CASAVA_Build 2 137828872 1D TGAGCAGCTG T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 32 20 4 9 T 11 10 303574 CASAVA_Build 2 137840109 1D CCATAAAAAA G/- GACAAATTCT 1183 het 1183 ref 17 11 3 4 G 2 1 303575 CASAVA_Build 2 137842091 2I TAGTTCAAGA --/CT CTAAAGGACT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CT 1 2 303576 CASAVA_Build 2 137844023 1I AAATTGGAAG -/A AAAAAATCTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 6 7 303577 CASAVA_Build 2 137882388 1I GATCTTTTTC -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 7 8 303578 CASAVA_Build 2 137884309 1I GCAGAAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 T 11 12 303579 CASAVA_Build 2 137895090 3I CTTTTGACTC ---/CTT CTTATAAAAA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 CTT 1 2 303580 CASAVA_Build 2 137898003 4D ATAAGGAGAA ACAT/---- ATAGATTAAT 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 ACAT 1 0 303581 CASAVA_Build 2 137898159 1D TATGCCAATG A/- ATGTAGCTTG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 2 1 303582 CASAVA_Build 2 137905948 1I AGAAAAACTC -/T TAAGAAATAT 2588 het 2588 ref 31 20 7 4 T 1 2 303583 CASAVA_Build 2 137907404 1I TTTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1592 hom 26 5 13 10 T 11 12 303584 CASAVA_Build 2 137907788 4D ATTTACATTA AAAT/---- AAATAAAATG 3070 het 3070 ref 29 14 12 5 AAAT 2 1 303585 CASAVA_Build 2 137913567 2I ACAGAAGTCT --/AA AAATGTAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 A 3 5 303586 CASAVA_Build 2 137919042 1I ACAGATGTAT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 7 8 303587 CASAVA_Build 2 137929049 1I ATACTGTTCA -/T AAAAATATTG 3070 hom 117 het 48 0 39 9 T 0 1 303588 CASAVA_Build 2 137931312 1I TTTTACTATA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 6 7 303589 CASAVA_Build 2 137970063 4I ATTATTGGGG ----/TCTT TATCTGTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TCTT 0 1 303590 CASAVA_Build 2 137972376 2D CAGTAAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 13 11 18 T 14 12 303591 CASAVA_Build 2 137975472 1D CCACTTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 10 9 303592 CASAVA_Build 2 137990757 2I TGCCATTGAC --/AT ATTTAGCAGC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 AT 1 2 303593 CASAVA_Build 2 137995913 19D GCATGCATCC CTCAGCTGTTGAGTAACCT/------------------- CTCAGCTGTT 3070 het 3070 ref 52 24 18 14 CTCAGCTGTTGAGTAACCT 2 1 303594 CASAVA_Build 2 137997212 3I ATAGGTTGCA ---/GTT GTTATTTTGT 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 GTT 1 2 303595 CASAVA_Build 2 138003534 1D AGGAGTTGAA C/- CTTGAAAGAG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 C 2 1 303596 CASAVA_Build 2 138003641 1I AGAATCTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 2796 hom 30 15 11 4 A 0 1 303597 CASAVA_Build 2 138053574 2D ACACACGCGC GT/-- GCGCACACAC 1131 het 1131 ref 41 27 5 9 GT 1 0 303598 CASAVA_Build 2 138054329 1D AGATTTTTTT C/- ATCACTATTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 C 1 0 303599 CASAVA_Build 2 138058225 1I TGCACATTGA -/T TTTTGTATCC 3070 het 3070 hom 22 7 11 4 T 4 5 303600 CASAVA_Build 2 138063311 3D AATCCATATT CTA/--- CTTAGAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 CTA 1 0 303601 CASAVA_Build 2 138064065 2D TTTAAGTTCA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 T 10 8 303602 CASAVA_Build 2 138067604 1I ATGGGTCATT -/A AGATATCTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 303603 CASAVA_Build 2 138071509 1I AAAAAACCTG -/T TTTTTTTTTT 2137 het 2137 ref 31 11 10 10 T 13 14 303604 CASAVA_Build 2 138085046 7I TAATAATAAT -------/AAATAAA AAATAAAAAA 1956 het 363 hom 7 3 4 0 AAATAAA 2 3 303605 CASAVA_Build 2 138089855 1I AGTTTCTTCC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 T 7 8 303606 CASAVA_Build 2 138091072 1I TTTCTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 A 11 12 303607 CASAVA_Build 2 138093641 20D ATCATTAATC TACAACTCCCAATAGGTGAG/-------------------- CATTGTTTAT 3070 het 3070 ref 33 20 15 2 TACAACTCCCAATAGGTGAG 1 0 303608 CASAVA_Build 2 138102628 4D TCATTGAAAC AGTT/---- GGTTGCGCCT 3070 het 3070 ref 34 21 11 5 AGTT 1 0 303609 CASAVA_Build 2 138122431 1I CTCACCCCTA -/G CGTTCCTTGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 0 1 303610 CASAVA_Build 2 138137104 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1190 het 1190 ref 24 16 4 5 A 15 14 303611 CASAVA_Build 2 138142487 2I GGTCATTTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 12 14 303612 CASAVA_Build 2 138144529 1D TTTAAAATAG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 8 7 303613 CASAVA_Build 2 138145518 2D AGTTCTATAT AG/-- GGCTGGAGAG 3070 hom 36 het 24 0 13 11 AG 1 0 303614 CASAVA_Build 2 138147304 2I AAGAGGTAAC --/TT TTTAAAATGT 3070 hom 163 het 58 0 55 3 T 3 5 303615 CASAVA_Build 2 138148325 3D CTTACCCCTC TCT/--- TCTTCTTTGC 3070 hom 114 het 43 0 38 6 TCT 3 2 303616 CASAVA_Build 2 138149355 1D AAAATCTTTG T/- TTTTTACGTT 3070 hom 80 het 30 0 27 3 T 6 5 303617 CASAVA_Build 2 138152741 1I CTTTCATTCA -/T TTTAAGCAAA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 3 4 303618 CASAVA_Build 2 138154898 1D TATTAATGAT A/- ACTTGTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 1 303619 CASAVA_Build 2 138155526 2D ACTTATAGAT AG/-- AGACTAGGGA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AG 2 1 303620 CASAVA_Build 2 138164039 5I AAATACAGTT -----/TTTTC TTTCTTTTTC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTTTC 0 1 303621 CASAVA_Build 2 138164135 1D TTTGAACCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 30 0 25 5 T 11 10 303622 CASAVA_Build 2 138165068 1I AAATTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 30 0 27 3 A 10 11 303623 CASAVA_Build 2 138165351 6D GATAATTAAA TATAAT/------ TATATACAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TATAAT 1 0 303624 CASAVA_Build 2 138168232 1D GTTTACATGG A/- AACAGTCACC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 3 2 303625 CASAVA_Build 2 138169366 8D CACAGGTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTGA 1501 hom 10 het 6 0 4 3 T 16 8 303626 CASAVA_Build 2 138171863 2D GACAGACAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 619 hom 41 6 24 12 A 16 14 303627 CASAVA_Build 2 138178101 4I CAAATTTTTA ----/AAAT AAATATATTG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAAT 1 2 303628 CASAVA_Build 2 138184050 1I ACCACTGATC -/A GGGGGGTCAT 3070 hom 115 het 47 0 32 15 A 0 1 303629 CASAVA_Build 2 138191453 1D GACTTCAAAC A/- AAATCTGATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 4 3 303630 CASAVA_Build 2 138193468 1D TGCTTCTTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 9 303631 CASAVA_Build 2 138195950 3D ATAAATACTA AAT/--- AAGTAAATAT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AAT 1 0 303632 CASAVA_Build 2 138204611 2D AACTAGGAAT TA/-- GGTGGCTGAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TA 1 0 303633 CASAVA_Build 2 138205602 1I ATTCCATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 781 hom 24 3 18 3 T 13 14 303634 CASAVA_Build 2 138206468 2D ATCCCAATGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 T 12 10 303635 CASAVA_Build 2 138214307 5I CCATCTGTCA -----/TTTCT TTTCTTTAAT 3070 hom 73 het 30 0 23 7 TTTCT 1 2 303636 CASAVA_Build 2 138215049 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 10 9 303637 CASAVA_Build 2 138223569 1D ATAATAATAA T/- AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 46 2 32 13 T 1 0 303638 CASAVA_Build 2 138235106 1I ATAGATGCAG -/A AAAGGCTTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 3 4 303639 CASAVA_Build 2 138239682 1I CCAAGGCAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 9 10 303640 CASAVA_Build 2 138266547 2I TAAAGTAACC --/AG AGAGTTTTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AG 2 3 303641 CASAVA_Build 2 138268458 1D TGGGTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 23 7 T 13 12 303642 CASAVA_Build 2 138278232 1D TTTTAACTAG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 7 6 303643 CASAVA_Build 2 138287492 1I ATTTGTACTT -/A CAACTTCCTC 3070 hom 129 het 49 0 41 8 A 0 1 303644 CASAVA_Build 2 138295882 1I CCTGTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 T 13 14 303645 CASAVA_Build 2 138299735 1I AACAAGAAAC -/A AAGTTCTGAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 2 3 303646 CASAVA_Build 2 138311490 1I TTCTTGATAT -/A AAACCTGTAC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 3 4 303647 CASAVA_Build 2 138312776 1I TTCTTTTTTT -/G GGGGGGGGTA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 G 8 9 303648 CASAVA_Build 2 138315784 2I ATTTTCTGTC --/TG CCACCATCCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TG 0 1 303649 CASAVA_Build 2 138322988 2D AATATGAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 26 1 20 6 A 12 10 303650 CASAVA_Build 2 138323907 1I ATAAATTGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 303651 CASAVA_Build 2 138327662 1I AGGCCAGCAT -/G GCTGCAGCCA 3070 hom 103 het 38 0 34 4 G 1 2 303652 CASAVA_Build 2 138328977 1I GTTACCTCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 9 10 303653 CASAVA_Build 2 138329250 2I TTCCAACCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 35 0 24 11 T 12 14 303654 CASAVA_Build 2 138337060 1D CAGGACAAAA T/- TTCAACATGA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 3 2 303655 CASAVA_Build 2 138337478 1I ATCTCTTCTC -/G AATTGTAATC 3070 hom 160 het 60 0 54 6 G 0 1 303656 CASAVA_Build 2 138344357 1I CACTGAATGA -/T ATTGCTGCTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 0 1 303657 CASAVA_Build 2 138354347 4I CCTCAAGAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 104 het 40 0 33 7 AAAC 3 4 303658 CASAVA_Build 2 138356656 1I GGTATGAGGA -/G GGGGTCAAAA 3070 hom 116 het 43 0 39 4 G 4 5 303659 CASAVA_Build 2 138359486 4D ACACACATAT ACAC/---- ACACACACGC 3070 hom 79 het 32 0 26 7 AC 6 4 303660 CASAVA_Build 2 138359807 1D TTAAAAAATG T/- TTTTGTGACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 5 4 303661 CASAVA_Build 2 138360231 1D TTTTTTTACT A/- AAAAAATTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 7 6 303662 CASAVA_Build 2 138367628 3D ATTATCTTAT GAC/--- ATTTTTCAGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 GAC 1 0 303663 CASAVA_Build 2 138369211 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAGA 3070 hom 77 het 28 0 27 1 G 0 1 303664 CASAVA_Build 2 138373221 1I TTTACATGAA -/T TTTTCTATGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 4 5 303665 CASAVA_Build 2 138380134 1I ATCTATGTTG -/T TTTATGTAAC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 3 4 303666 CASAVA_Build 2 138380628 26D TGTGTCTGTG AATACTTGGAGCCCTGGGTAGCTTTC/-------------------------- AACATTGGAC 3070 hom 93 het 31 0 31 5 AATACTTGGAGCCCTGGGTAGCTTTC 1 0 303667 CASAVA_Build 2 138385651 1I TTTGTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 0 1 303668 CASAVA_Build 2 138387953 1I TTATCAGTGC -/A AGTCAGCTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 2 303669 CASAVA_Build 2 138389007 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 183 hom 27 1 22 4 A 11 12 303670 CASAVA_Build 2 138392066 1I ATTCAACCGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 98 het 40 0 33 7 A 8 9 303671 CASAVA_Build 2 138395040 1I AAGAATTATA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 55 het 24 0 19 5 T 7 8 303672 CASAVA_Build 2 138397723 1I AAAGAAAAAT -/G GGGGAAGAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 4 5 303673 CASAVA_Build 2 138400492 1D AATACTTTTT A/- AATTATTTTT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 3 2 303674 CASAVA_Build 2 138402424 3D AGACTGTGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 25 0 17 9 A 16 13 303675 CASAVA_Build 2 138404428 4I TATCCCCATT ----/AAAC AACTCCTCAT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 AAAC 0 1 303676 CASAVA_Build 2 138412858 2I TCATTGTGTC --/AT ATATATATAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AT 5 6 303677 CASAVA_Build 2 138421895 1I TTTTATCCTG -/T TTTTATCCCT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 4 5 303678 CASAVA_Build 2 138434958 1D GAAAGCCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 29 0 21 8 A 11 10 303679 CASAVA_Build 2 138438413 2D AAGCTTAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 38 1 19 19 T 17 15 303680 CASAVA_Build 2 138445847 1D TGTTTGCCTT A/- TTTTTAAGTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 1 0 303681 CASAVA_Build 2 138462591 1D TTGACCCCCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 8 7 303682 CASAVA_Build 2 138463517 1D TTGTTTGTTC T/- TTTACTTATC 3070 het 3070 ref 67 43 16 9 T 4 3 303683 CASAVA_Build 2 138473959 1D TTTTTCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 743 hom 22 3 13 7 A 12 11 303684 CASAVA_Build 2 138474508 1I TAATCTGACA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 43 16 19 8 T 7 8 303685 CASAVA_Build 2 138474608 1D TCCAGTTGAT A/- AAAATCTTAA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 5 4 303686 CASAVA_Build 2 138478175 1I AATTTAAGGT -/A ATCTTCTATG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 1 2 303687 CASAVA_Build 2 138479344 2I TGAAAGAAGC --/TT TTATATATTT 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 T 2 4 303688 CASAVA_Build 2 138479968 2D TTGATTTTAG AT/-- ACACAGCAGA 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 AT 1 0 303689 CASAVA_Build 2 138480912 1D CATTCATCAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 A 8 7 303690 CASAVA_Build 2 138484359 1I ATATACATCC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 7 8 303691 CASAVA_Build 2 138494232 3D TTGCTGTCTT TAA/--- TAATGTTGAC 3070 het 3070 ref 23 10 9 5 TAA 2 1 303692 CASAVA_Build 2 138504269 1I TATCCCCACT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 8 9 303693 CASAVA_Build 2 138517811 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAGGATG 3070 het 2008 hom 17 5 10 4 A 6 5 303694 CASAVA_Build 2 138529547 4I AAAAAAAAAA ----/AAAT AAAAAAAAAT 3070 het 717 hom 31 8 14 9 AAAT 0 1 303695 CASAVA_Build 2 138539394 1I CACAGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 10 11 303696 CASAVA_Build 2 138545862 1I GTTTTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2145 hom 26 8 9 9 T 13 14 303697 CASAVA_Build 2 138555828 2D GTTTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1385 hom 35 9 12 15 T 18 16 303698 CASAVA_Build 2 138567382 1I AAATGTCACC -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 T 7 8 303699 CASAVA_Build 2 138577093 1I GAATTATGAT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 A 7 8 303700 CASAVA_Build 2 138599223 2I GGTGGTGGTC --/GG GGGGGGACGG 1668 het 1393 hom 14 5 6 3 G 6 8 303701 CASAVA_Build 2 138601554 2D ACAGCTCCTC TT/-- TGTTTTCACC 3070 hom 108 het 40 0 36 6 T 3 1 303702 CASAVA_Build 2 138601762 2I AACAAGTACT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 AC 7 8 303703 CASAVA_Build 2 138604726 1I AGTGCATAAT -/A AAAAAATGTC 3010 het 2823 hom 19 7 7 5 A 6 7 303704 CASAVA_Build 2 138616859 1D GGTAAAATTG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 2505 hom 20 6 10 4 A 8 7 303705 CASAVA_Build 2 138617350 1I CTACAGTCAT -/C CACTGTGATA 3070 het 3070 ref 50 24 14 12 C 1 2 303706 CASAVA_Build 2 138625069 2D GAAAATAAGT GG/-- GGGAGACCAG 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 G 5 3 303707 CASAVA_Build 2 138625779 4D AACAGAAAAT TAAA/---- TAAATAAAGT 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 TAAA 3 2 303708 CASAVA_Build 2 138645692 1I GGCATACAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 A 8 9 303709 CASAVA_Build 2 138656644 1I GAGCTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 A 10 11 303710 CASAVA_Build 2 138659920 2I GGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 TG 6 7 303711 CASAVA_Build 2 138662205 3I CAATAAGACC ---/TGA CTTTAAACAG 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 TGA 0 1 303712 CASAVA_Build 2 138665669 4D GAAGACATTG TTAT/---- TTGAGAAATA 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 TTAT 1 0 303713 CASAVA_Build 2 138665748 4D AGAGACCTGA TTTG/---- TTTAACTCAG 3070 het 3070 ref 46 25 19 3 TTTG 1 0 303714 CASAVA_Build 2 138686079 28D AGATTGTGTG TGTGTGTATATATATATATATATATATA/---------------------------- TATATATATT 2641 hom 18 het 11 0 7 4 TGTGTGTATATATATATATATATATATA 1 0 303715 CASAVA_Build 2 138696844 1I AAGTACCCCA -/T TAGAAGATTA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 T 1 2 303716 CASAVA_Build 2 138702937 1D GAAATGCATC G/- AATGTTTAGT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 G 1 0 303717 CASAVA_Build 2 138711016 1I TAGAAGCATA -/T TTTTTTTTCT 2928 het 2928 ref 18 10 6 2 T 8 9 303718 CASAVA_Build 2 138713541 17D ACACAGACAC AAAAATACTAAGAGGGA/----------------- AAACACTCCA 3070 het 3070 ref 30 18 12 1 AAAAATACTAAGAGGGA 1 0 303719 CASAVA_Build 2 138714626 1I CAAGAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 10 11 303720 CASAVA_Build 2 138719799 3D TGAATCTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TTG 4 3 303721 CASAVA_Build 2 138720832 23D CTGAGTTTAT TTGGTTTTTAATTTAAATTTAAA/----------------------- TAGCTACATG 3070 hom 21 het 7 0 8 1 TTGGTTTTTAATTTAAATTTAAA 1 0 303722 CASAVA_Build 2 138721420 1I GGTTTTCCAG -/T GCATAATAAA 3070 hom 68 het 26 0 23 3 T 0 1 303723 CASAVA_Build 2 138723352 1I AATTTTAATA -/T TATTGTGTTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 1 2 303724 CASAVA_Build 2 138725674 23D ACATGTAGCT ATTTAAATTTAAATTAAAAACCA/----------------------- AATAAACTCA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 ATTTAAATTTAAATTAAAAACCA 1 0 303725 CASAVA_Build 2 138727404 1I CAATTCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 922 hom 20 2 14 4 T 11 12 303726 CASAVA_Build 2 138728598 1I AACACTCACC -/G GTGAGGGACC 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 G 1 2 303727 CASAVA_Build 2 138753534 1I AAGAGGAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2454 hom 45 6 28 11 A 11 12 303728 CASAVA_Build 2 138759183 1D TTTGGACTTC T/- AAACAGTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 1 0 303729 CASAVA_Build 2 138759422 1D27M1D GTATCTCATA TTTTTTTATTTTCAGATTAGGAATATTCA/-TTTTTTATTTTCAGATTAGGAATATTC- ACCAGTATGT 3070 hom 66 het 24 0 23 6 N/A 0 0 303730 CASAVA_Build 2 138760781 3D TATATATATA TAT/--- TTATTATACT 3070 het 1827 hom 16 5 7 4 TAT 1 0 303731 CASAVA_Build 2 138780227 1I TTACTGTTTC -/T TTTTTACCAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 5 6 303732 CASAVA_Build 2 138785394 1I ATTCATTCAA -/T TTTATTTAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 3 4 303733 CASAVA_Build 2 138809637 1D AAAATGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 42 1 26 16 T 12 11 303734 CASAVA_Build 2 138816421 1D TAACATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1093 het 1093 ref 38 26 3 9 T 12 11 303735 CASAVA_Build 2 138817790 1I CAATCATCTA -/T TAGGAGAAGT 3070 hom 157 het 59 0 53 6 T 1 2 303736 CASAVA_Build 2 138835941 1I GATATATGGT -/G ATATATGATC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 303737 CASAVA_Build 2 138842108 1I TTCTTTCCTG -/A AACCCGGCTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 3 303738 CASAVA_Build 2 138868654 2I TATTAAAAAC --/AA AAGAGGATAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 4 303739 CASAVA_Build 2 138881259 1I GATTTTGTGT -/C CTGAAACTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 C 1 2 303740 CASAVA_Build 2 138884074 2D TACAATATTC TT/-- TGTTTATCTT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 3 1 303741 CASAVA_Build 2 138884144 1D GCTGTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 2059 het 2059 ref 35 26 5 4 T 12 11 303742 CASAVA_Build 2 138884629 1I ATAATACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 18 5 T 11 12 303743 CASAVA_Build 2 138906613 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 21 10 A 11 10 303744 CASAVA_Build 2 138912451 3D TAATTGTATT TTA/--- TTATTTTTTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTA 2 1 303745 CASAVA_Build 2 138923490 1I AATTCCAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1504 hom 19 5 9 5 T 13 14 303746 CASAVA_Build 2 138932655 1I ATCAAGACAG -/A AAAGTCAAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 3 4 303747 CASAVA_Build 2 138942977 2I CAATAACCCC --/CT GACTACCCTG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CT 0 1 303748 CASAVA_Build 2 138945346 4D ACCAATTGAA AAAC/---- AAGCAAAGTG 3070 hom 124 het 53 0 42 11 AAAC 1 0 303749 CASAVA_Build 2 138946945 3I CAGCCTCCTG ---/AGT AGTAGCTGGG 3070 hom 18 het 11 0 7 4 AGT 1 2 303750 CASAVA_Build 2 138953243 1I TCAAAGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 728 hom 35 2 30 3 A 10 11 303751 CASAVA_Build 2 138963293 1I TCGCTTAGCA -/T GTTTGCAAGG 3070 hom 118 het 42 0 40 2 T 0 1 303752 CASAVA_Build 2 139019641 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 12 0 10 3 T 11 10 303753 CASAVA_Build 2 139039613 4D TTTCCCTTCT CTTA/---- CTTTTCATGA 3070 hom 84 het 30 0 28 3 CTTA 1 0 303754 CASAVA_Build 2 139052127 6I TAGTACTATT ------/TAAATC TATATGTTTA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TAAATC 0 1 303755 CASAVA_Build 2 139099497 1I AAAAACAACT -/A AAAGAAACAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 3 4 303756 CASAVA_Build 2 139102281 2D ATGGAAAAAC AT/-- GTGTATAGAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AT 1 0 303757 CASAVA_Build 2 139103861 1D CTCACTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 39 3 15 21 T 17 16 303758 CASAVA_Build 2 139119591 1D GATTTAAATA T/- TTTAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 T 4 3 303759 CASAVA_Build 2 139122969 1D AACCATCCTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 A 9 8 303760 CASAVA_Build 2 139124691 3D GTCTCTGCTC CTT/--- CTGCCAAAGT 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 CTT 1 0 303761 CASAVA_Build 2 139127403 1I AATTTAAATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 8 9 303762 CASAVA_Build 2 139132318 1I TCCCCTTCCT -/C CCCCCCCCAT 3070 het 2936 hom 30 9 10 11 C 8 9 303763 CASAVA_Build 2 139134223 1D AAACCTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 T 10 9 303764 CASAVA_Build 2 139134354 1D ACACATATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 T 15 14 303765 CASAVA_Build 2 139138800 4D AATCCCAGCT ACTC/---- AGGAGGCTGA 2666 het 1653 hom 18 6 6 6 ACTC 1 0 303766 CASAVA_Build 2 139142131 21I TTGGATATAA ---------------------/GGATTTAACCTGACTTACTTT GGATTTATCC 3070 hom 90 het 38 0 31 8 GGATTTAACCTGACTTACTTT 0 1 303767 CASAVA_Build 2 139152527 2D TGGTTTAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 251 hom 38 1 10 28 T 12 10 303768 CASAVA_Build 2 139160584 5D TTGTTATTTA TTTAT/----- TTTATTTTAT 3070 het 979 hom 22 4 15 3 TTTAT 3 2 303769 CASAVA_Build 2 139164766 1D TACTTGGGGG A/- CACCCCCATA 3070 het 3070 ref 54 29 21 4 A 1 0 303770 CASAVA_Build 2 139179842 1I AGTGATTCTT -/C CATAAAATAA 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 C 1 2 303771 CASAVA_Build 2 139186281 6D TGCATTACAT GAGTAA/------ AACAGTCTCT 3070 het 3070 hom 56 25 29 2 GAGTAA 1 0 303772 CASAVA_Build 2 139217299 1I CCACCTTAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 A 9 10 303773 CASAVA_Build 2 139225149 3D TAGAGACTTA CTG/--- CTATTTTCTA 1817 het 1817 ref 23 17 4 2 CTG 1 0 303774 CASAVA_Build 2 139256540 1D AGGTACAGCT C/- GAAGAGGAGA 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 C 1 0 303775 CASAVA_Build 2 139257807 1D TAGAGGAGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 36 1 17 18 T 13 12 303776 CASAVA_Build 2 139261143 1D GGATTTGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 10 9 303777 CASAVA_Build 2 139291988 1D GGAAATGTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2839 hom 31 8 20 3 A 10 9 303778 CASAVA_Build 2 139301608 2D CTCACCACTC TT/-- TATCACTGTT 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 T 3 1 303779 CASAVA_Build 2 139308301 1D CAATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 359 hom 26 1 12 13 T 13 12 303780 CASAVA_Build 2 139309295 1I CAGGTGGGCC -/G GGAGAAGGGA 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 G 2 3 303781 CASAVA_Build 2 139314053 1I CTATTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 11 303782 CASAVA_Build 2 139316195 3D GTTTTACATG TTC/--- AATTTACTAG 3070 het 3070 ref 49 31 16 2 TTC 1 0 303783 CASAVA_Build 2 139320286 5D AATGAAAACT TAATC/----- TAAATTCCAT 3070 het 3070 ref 40 22 18 1 TAATC 1 0 303784 CASAVA_Build 2 139321326 1I GTGAAATAAG -/A AAAAAAAAAA 2502 het 2502 ref 20 8 6 6 A 10 11 303785 CASAVA_Build 2 139323254 8D ATTGAATGTT GATTAGTA/-------- GAGGCTAGGA 3070 het 3070 hom 46 13 15 21 GATTAGTA 1 0 303786 CASAVA_Build 2 139323298 1D GGGATAAAGT G/- GGGGAGATTG 3070 hom 78 het 37 0 26 11 G 5 4 303787 CASAVA_Build 2 139325809 2D GACACTAGTC AT/-- AAGGTTAGAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 8 AT 1 0 303788 CASAVA_Build 2 139326673 1D CATTATCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 T 13 12 303789 CASAVA_Build 2 139328821 1D TTTCTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 9 8 T 11 10 303790 CASAVA_Build 2 139337790 3I AGGATGGTCA ---/TCT TCTTCAGTGA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 TCT 1 2 303791 CASAVA_Build 2 139352195 2D TGTATATATG GT/-- GTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 GT 2 1 303792 CASAVA_Build 2 139359590 1D TGCACCCTCG A/- ACTTGTGGGC 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 2 1 303793 CASAVA_Build 2 139369093 1D TTCCAGAGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 T 10 9 303794 CASAVA_Build 2 139369162 3D CAGAAAAGTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 28 5 8 16 A 17 14 303795 CASAVA_Build 2 139371808 1D AACTTCCTCC T/- TGGAGGAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 1 303796 CASAVA_Build 2 139397030 1D AAAATCTCCG T/- GATGCAAAGC 3070 het 3070 hom 42 16 24 3 T 1 0 303797 CASAVA_Build 2 139420575 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1900 het 1900 ref 35 11 9 16 A 17 16 303798 CASAVA_Build 2 139438322 1D TCACCTGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2477 hom 36 9 15 12 A 15 14 303799 CASAVA_Build 2 139443376 1I ATAATACATG -/C AAAAAATTTG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 0 1 303800 CASAVA_Build 2 139450402 1I AGGGATAACA -/T TTTTTTTTTT 2385 hom 18 het 15 0 7 8 T 12 13 303801 CASAVA_Build 2 139457984 1D AACCAAATGC A/- AAAAATCCCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 6 5 303802 CASAVA_Build 2 139460061 1I TGGTTGGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 23 5 T 10 11 303803 CASAVA_Build 2 139474515 1I TGTATAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 9 12 3 A 10 11 303804 CASAVA_Build 2 139474764 1I TCTCATATTT -/A AGTCTGAGTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 1 2 303805 CASAVA_Build 2 139479746 1D AGTGAATGTC A/- ATTTACTGCT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 A 2 1 303806 CASAVA_Build 2 139482881 1D AGATTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 34 1 24 9 T 12 11 303807 CASAVA_Build 2 139486219 7I CAACACCCTC -------/ACCAACA TTTGTTATTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 ACCAACA 0 1 303808 CASAVA_Build 2 139487306 1I CTATGTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 10 11 303809 CASAVA_Build 2 139488319 7D TGGGTTAGGT TTTTTTA/------- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 10 TTTTTTA 3 2 303810 CASAVA_Build 2 139492471 1I TGGCCGTGGG -/C CTAGGGAGAA 2981 het 2288 hom 29 9 11 9 C 1 2 303811 CASAVA_Build 2 139510409 1D AGAGACTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2628 hom 34 9 21 5 A 11 10 303812 CASAVA_Build 2 139510535 48D ATTTCTAATA TTTTAAAACTTTTATATTTGTATTTAGAACTAGGAGCAATTTGAATAT/------------------------------------------------ TTATTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 23 16 3 TTTTAAAACTTTTATATTTGTATTTAGAACTAGGAGCAATTTGAATAT 1 0 303813 CASAVA_Build 2 139512624 1D AAACCTAGTA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 33 8 17 9 T 9 8 303814 CASAVA_Build 2 139519629 1D AAATAAGGAC T/- TTTCTTCACA 3070 hom 95 het 38 0 32 6 T 4 3 303815 CASAVA_Build 2 139524936 1I ATCGAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 10 11 303816 CASAVA_Build 2 139528309 1I GTATTAGGCA -/C CTGTGGTGGT 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 C 1 2 303817 CASAVA_Build 2 139530229 1I AAATAAAAAG -/A AAAAAATAAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 6 7 303818 CASAVA_Build 2 139532781 1I CAATGCCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 226 hom 37 1 32 4 T 9 10 303819 CASAVA_Build 2 139532879 4I TGTTCTGTGT ----/TTAC TTATTTTATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTAC 0 1 303820 CASAVA_Build 2 139544433 2I TAAATACATC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TG 7 8 303821 CASAVA_Build 2 139550438 1I31M1D CATGTGTATA -GGTAGGACAAAACAAAATCCAAATTCATGTCT/GGGTAGGACAAAACAAAATCCAAATTCATGTC- TTTTTTGTGA 3070 hom 78 het 21 0 27 1 N/A 0 0 303822 CASAVA_Build 2 139555073 1I CCAATCCAAG -/C CAAAAGGCCT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 1 2 303823 CASAVA_Build 2 139561146 1I CTTTCCGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 35 1 25 9 T 12 13 303824 CASAVA_Build 2 139565354 1D TATATAAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 8 303825 CASAVA_Build 2 139568049 1D AATTGAAAAT C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 11 10 303826 CASAVA_Build 2 139569378 1I TTTGATATTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 30 het 32 1 28 3 A 8 9 303827 CASAVA_Build 2 139576319 4D TGTATATATG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 TA 8 6 303828 CASAVA_Build 2 139578922 1I AATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 29 1 27 1 T 11 12 303829 CASAVA_Build 2 139658808 50D CTAGCCCCAT TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------------------- TATATATATA 3070 hom 51 het 21 0 18 4 TA 30 5 303830 CASAVA_Build 2 139673032 1D TAAACAAAGC A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 7 6 303831 CASAVA_Build 2 139678655 10I TAATATACTA ----------/GTTGTGTCTC AACTAAACAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 GTTGTGTCTC 0 1 303832 CASAVA_Build 2 139680588 18D TTTTAAATTG GATATTGTGAAATAGAAA/------------------ GCATTGTGAA 3070 hom 81 het 27 0 28 4 GATATTGTGAAATAGAAA 1 0 303833 CASAVA_Build 2 139692626 1D GAATGCTGTG A/- AAGTTGCATG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 3 2 303834 CASAVA_Build 2 139695731 1I CCTCACTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 48 1 36 11 T 10 11 303835 CASAVA_Build 2 139696873 1I GAGTTTTCTT -/G GGCTGCCAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 G 2 3 303836 CASAVA_Build 2 139711376 1D GAGAATCATT A/- AAAAAATTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 7 6 303837 CASAVA_Build 2 139712120 1D AAATCATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 26 1 15 10 A 14 13 303838 CASAVA_Build 2 139717567 3D CTAGATCTAA TCT/--- TCTTGATGTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TCT 2 1 303839 CASAVA_Build 2 139718206 1D TTGCTAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 12 11 303840 CASAVA_Build 2 139729194 1D ATTTTAATTT A/- AAAAATACAC 3070 het 3070 ref 26 13 11 4 A 6 5 303841 CASAVA_Build 2 139743416 1I AAGCATTCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 40 1 31 8 T 10 11 303842 CASAVA_Build 2 139749004 1I AAATAGACTG -/A TATAAATATT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 0 1 303843 CASAVA_Build 2 139751256 1I TTTCCCACAC -/T TTATTTGTCA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 T 2 3 303844 CASAVA_Build 2 139769015 1I TGACTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 11 12 303845 CASAVA_Build 2 139781935 4I TTAATGTTTT ----/AAGA AAAAATCCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AAGA 0 1 303846 CASAVA_Build 2 139790006 1I TGACTTTGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 421 hom 32 1 27 4 A 9 10 303847 CASAVA_Build 2 139791302 1D72M1D TCTTTGAAGA TTTTTTTTTTTTTATTTCTTATTTTTCAGTGACCTTAGGTTTCTCCCCTGGGTGGGAATTTTTTTTTATTTGAT/-TTTTTTTTTTTTATTTCTTATTTTTCAGTGACCTTAGGTTTCTCCCCTGGGTGGGAATTTTTTTTTATTTGA- TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 14 5 12 16 N/A 0 0 303848 CASAVA_Build 2 139792110 1I GGGATACAGT -/G GTCTTGGAAA 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 G 1 2 303849 CASAVA_Build 2 139792700 1D TGATAATGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 T 10 9 303850 CASAVA_Build 2 139793927 2I CCAAAATCTT --/TA TATATATATA 3070 hom 9 het 26 1 16 9 TA 6 7 303851 CASAVA_Build 2 139794912 1D GCCTGGGTAA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 8 7 303852 CASAVA_Build 2 139801241 17D GGTGATTTTT ATTGCTCATTAAGGGAC/----------------- AGGACCTCAT 3070 hom 60 het 20 0 21 4 ATTGCTCATTAAGGGAC 1 0 303853 CASAVA_Build 2 139801631 3D AGATACAGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 30 1 18 12 A 17 14 303854 CASAVA_Build 2 139805273 1I AAGGTAAAAT -/A AAATTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 3 4 303855 CASAVA_Build 2 139813972 2I GAGAGAGGAG --/AC AGAGAGAGAG 3070 het 887 hom 32 4 16 12 AC 0 1 303856 CASAVA_Build 2 139814474 6D CTGTTCATTA AACTTT/------ GTCAAGCTAC 3070 het 3070 hom 30 15 15 3 AACTTT 1 0 303857 CASAVA_Build 2 139816056 1D GAGTACAAAT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 7 6 303858 CASAVA_Build 2 139816627 1I AGAACACCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 8 9 303859 CASAVA_Build 2 139818982 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 8 9 A 11 10 303860 CASAVA_Build 2 139819220 2I TTATTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 AG 1 2 303861 CASAVA_Build 2 139822809 9I TTGCATCCCA ---------/GGTTCACTT GGGATAAAAC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 GGTTCACTT 0 1 303862 CASAVA_Build 2 139823445 1D GTTTGAAGGG T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 T 7 6 303863 CASAVA_Build 2 139839758 1D TCTATTGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 11 13 6 T 9 8 303864 CASAVA_Build 2 139848923 1D CAGATACAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 A 9 8 303865 CASAVA_Build 2 139858128 1I AGAAGAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 9 10 303866 CASAVA_Build 2 139865775 1D ATATATATAT A/- ATATGTGTGT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 2 1 303867 CASAVA_Build 2 139866112 1I ATCCTCTTAA -/C GGGATTTGTG 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 C 0 1 303868 CASAVA_Build 2 139882664 1I GCTAGATTCC -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 6 7 303869 CASAVA_Build 2 139890035 1D TGTTTTCATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 10 9 303870 CASAVA_Build 2 139893351 1I CACTCCTAAA -/C TTAATAATAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 C 0 1 303871 CASAVA_Build 2 139896199 1D TAAATTCCAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 25 9 9 7 T 9 8 303872 CASAVA_Build 2 139901823 1I GGTACTTGAG -/T GACATGAAGG 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 0 1 303873 CASAVA_Build 2 139914198 15D TTTCTTTGTC CTCCCTCTTTCTCTT/--------------- CTCCCTTTCT 3070 het 3070 ref 35 23 12 7 CTCCCTCTTTCTCTT 1 0 303874 CASAVA_Build 2 139926244 1D TGAGGTCTTA C/- CATTTATGTA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 C 2 1 303875 CASAVA_Build 2 139936532 1D AAGATGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 11 10 303876 CASAVA_Build 2 139937307 1I GGCATTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 884 hom 39 2 28 9 T 10 11 303877 CASAVA_Build 2 139951676 1D AATGGACAAA G/- GGAGAATATG 3070 hom 132 het 47 0 43 4 G 3 2 303878 CASAVA_Build 2 139952805 1D ATAAATAAAT A/- AAAAGTAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 6 A 5 4 303879 CASAVA_Build 2 139952907 1I ACAAGAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 35 0 31 8 A 8 9 303880 CASAVA_Build 2 139964088 1D TTTATCCTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 12 20 11 T 10 9 303881 CASAVA_Build 2 139964288 2D AACCGTGGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 741 hom 41 6 12 23 A 16 14 303882 CASAVA_Build 2 139966478 4I ATTTTGTCAT ----/ATGA GATATTTTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATGA 0 1 303883 CASAVA_Build 2 139972465 1I AAGTGTCTGC -/G AACCAATTGG 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 G 0 1 303884 CASAVA_Build 2 139975200 2D GACACACATG CA/-- CACACACACA 1335 het 1335 ref 55 40 3 12 CA 9 8 303885 CASAVA_Build 2 139978545 1I GACATTGAGT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 A 7 8 303886 CASAVA_Build 2 139981541 4I AATTTGAAAT ----/ATAC ATACATACAT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 ATAC 3 4 303887 CASAVA_Build 2 139984715 1D CCAAAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 33 0 24 9 A 13 12 303888 CASAVA_Build 2 139991111 1I ATACATCCAG -/T AAGTAATGTA 3070 hom 160 het 57 0 54 3 T 0 1 303889 CASAVA_Build 2 139996577 4D ATCAAGCCAA TGCC/---- TGCCTATTCC 3070 het 3070 ref 41 24 13 9 TGCC 2 1 303890 CASAVA_Build 2 140001639 2I AGAAAAATGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 9 11 6 A 12 14 303891 CASAVA_Build 2 140003321 1I TCTTATCAGG -/T TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 2 3 303892 CASAVA_Build 2 140028595 1I TCTGTATATC -/T GAAAAATGAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 0 1 303893 CASAVA_Build 2 140028732 1D TCTTCCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 11 10 303894 CASAVA_Build 2 140032089 3I GCTTTCTATA ---/TTC TTTTTCATTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTC 0 1 303895 CASAVA_Build 2 140033774 1D GATGGATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 29 1 22 6 A 11 10 303896 CASAVA_Build 2 140034352 1I CATCTCGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 54 het 27 0 18 9 A 8 9 303897 CASAVA_Build 2 140041406 1D TATTCTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 36 3 28 5 A 13 12 303898 CASAVA_Build 2 140044547 2D TTTTACAAAC AG/-- AGGTCAAAGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AG 2 1 303899 CASAVA_Build 2 140044768 2I GTGTTATAAA --/AC ACATACACAC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AC 1 2 303900 CASAVA_Build 2 140046377 1D CAAGAAAATG A/- AAAAAAATGC 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 8 7 303901 CASAVA_Build 2 140049741 1D GGGAGATTTG T/- TTTTTTTTTT 1547 het 1547 ref 49 35 4 11 T 12 11 303902 CASAVA_Build 2 140051860 1I TATAAATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 29 2 22 5 A 11 12 303903 CASAVA_Build 2 140074126 1I TCTTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 903 hom 32 3 25 4 A 13 14 303904 CASAVA_Build 2 140080893 1D ATATTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 29 0 28 2 T 10 9 303905 CASAVA_Build 2 140091399 1I GGAATTATTA -/T TTATTTTTTT 3070 het 297 hom 46 1 41 4 T 2 3 303906 CASAVA_Build 2 140096357 4D TTCAATAGTT TAAA/---- TAAGATATTC 3070 hom 166 het 59 0 54 5 TAAA 1 0 303907 CASAVA_Build 2 140103677 1D TTACTAAGTC T/- TTTTTTTTTC 1383 het 1383 ref 32 26 3 4 T 10 9 303908 CASAVA_Build 2 140115826 1D GATTTGTATA T/- TTTTTTATTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 6 303909 CASAVA_Build 2 140120836 1I CTATCAACTG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 8 9 303910 CASAVA_Build 2 140122733 1D TGTACATTGA T/- TTTTTTATCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 7 6 303911 CASAVA_Build 2 140128852 1I CTGTATTTGA -/T TTTTTTACTA 3070 hom 61 het 27 0 21 6 T 6 7 303912 CASAVA_Build 2 140130900 1I CATACGGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 846 hom 30 5 18 7 T 13 14 303913 CASAVA_Build 2 140131101 4I AAATAATAGC ----/GCTG CCTATCAGCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GCTG 0 1 303914 CASAVA_Build 2 140133033 1D CATAAACACA T/- TTTTAATAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 5 4 303915 CASAVA_Build 2 140150208 1I GTATCTCTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 103 het 44 0 35 9 T 7 8 303916 CASAVA_Build 2 140156814 3D CTCAACAGAA TTC/--- TTCTCTCACC 3070 het 3070 ref 50 26 20 5 TTC 2 1 303917 CASAVA_Build 2 140200599 1I AAAAAAAAAA -/C ACACACACAA 2848 het 2050 hom 17 6 9 2 C 0 1 303918 CASAVA_Build 2 140325908 1D TATCTCTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 10 9 303919 CASAVA_Build 2 140344895 1I TGGGATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 11 12 303920 CASAVA_Build 2 140380159 1I TCCTTCACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2779 hom 28 11 11 6 A 10 11 303921 CASAVA_Build 2 140388479 4I AAAAAACAAA ----/AAAG AGAGGATATT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 AAAG 0 1 303922 CASAVA_Build 2 140390487 1D TCTAACACCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 A 10 9 303923 CASAVA_Build 2 140390847 1D CTTCAGAACT C/- TGAGAAATAA 3070 het 3070 ref 52 25 21 7 C 1 0 303924 CASAVA_Build 2 140391546 1D GGCAATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 T 12 11 303925 CASAVA_Build 2 140401830 1I GGTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2387 het 875 hom 15 2 6 7 T 10 11 303926 CASAVA_Build 2 140407099 4D ATTTAGGATT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 114 het 53 0 38 17 TG 10 8 303927 CASAVA_Build 2 140407304 4D AGTGAGTAGA GTGC/---- ATAGTTGAGT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 GTGC 1 0 303928 CASAVA_Build 2 140408345 1I TAAAATGGGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 52 22 21 9 T 8 9 303929 CASAVA_Build 2 140408717 1D ACTTTTAATG T/- TTTCACTCTC 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 4 3 303930 CASAVA_Build 2 140409462 3D GCTCCCCTAC GTT/--- GTTATTTCCC 3070 het 3070 ref 34 20 11 6 GTT 2 1 303931 CASAVA_Build 2 140409570 1I TTCCAGTGTG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 7 8 303932 CASAVA_Build 2 140413074 1D TGCCTGGAAA G/- CTCTTCCCAG 3070 het 3070 hom 49 22 24 4 G 1 0 303933 CASAVA_Build 2 140415606 2D CTTGTAATGG TA/-- TGTTTCCAAT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 TA 1 0 303934 CASAVA_Build 2 140416341 1D ATTCTAGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 11 10 303935 CASAVA_Build 2 140437838 1I CTCCGTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 11 12 303936 CASAVA_Build 2 140453975 2D ACATGATCTC TT/-- TACTTCTCTT 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 T 3 1 303937 CASAVA_Build 2 140456982 3D TTCACTATGA TGT/--- TGTGAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 TGT 2 1 303938 CASAVA_Build 2 140460623 1D GTTTAATTTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 89 hom 13 1 12 0 T 8 7 303939 CASAVA_Build 2 140462619 1I TTTCCTTTTA -/T TTTTTCTTTT 3070 het 343 hom 32 1 25 6 T 5 6 303940 CASAVA_Build 2 140463175 1D GTTTTGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 11 10 303941 CASAVA_Build 2 140474033 2I TTAGGAGGTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 12 14 303942 CASAVA_Build 2 140475220 2I AAATTGAGAC --/AG ATATTTGAGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AG 0 1 303943 CASAVA_Build 2 140479047 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 10 9 303944 CASAVA_Build 2 140481149 2I AGTGTTACAC --/AA AAGTCATTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 4 303945 CASAVA_Build 2 140484266 1D ATCTCAATAG T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 T 6 5 303946 CASAVA_Build 2 140488837 1D GTGAAATGCC A/- TCTCTACGCT 3070 het 3070 ref 55 27 25 4 A 1 0 303947 CASAVA_Build 2 140495017 1I ACAATTTGAT -/A AAAAATACAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 5 6 303948 CASAVA_Build 2 140498157 5I TGACCATATC -----/TTTGA TTTATTTCTT 3070 hom 150 het 55 0 50 5 TTTGA 0 1 303949 CASAVA_Build 2 140500209 1I ACTAATATTC -/T TTTTTTTTTT 2648 het 1478 hom 25 6 9 10 T 14 15 303950 CASAVA_Build 2 140508326 1D TTATTTAGTG T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 7 6 303951 CASAVA_Build 2 140520593 2I CATAATGATA --/CT CTCTGCTATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 CT 2 3 303952 CASAVA_Build 2 140522005 1D GTACTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 13 12 303953 CASAVA_Build 2 140538527 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 10 9 303954 CASAVA_Build 2 140542280 4I CTCATAACAC ----/TTTA TTTGTTTTAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TTTA 0 1 303955 CASAVA_Build 2 140546327 2I CTGTCTGCCC --/CT CTCTCTCCTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 CT 3 4 303956 CASAVA_Build 2 140547198 4D GCAGATTAAC CTAT/---- CTATCATCTC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 CTAT 2 1 303957 CASAVA_Build 2 140552973 2D GTCTCAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 5 A 14 12 303958 CASAVA_Build 2 140553487 1D TTATATGTGT G/- GGGGGGATTT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 G 7 6 303959 CASAVA_Build 2 140554439 4I AAATAAAAAT ----/AAAA AAGAGAGAGA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 2 6 303960 CASAVA_Build 2 140554524 6D TATATTTTCC ATATAT/------ ATATATATAT 2582 hom 21 het 12 0 8 5 AT 13 10 303961 CASAVA_Build 2 140563153 2D GCTATCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 33 0 24 10 T 15 13 303962 CASAVA_Build 2 140571076 1D CCAAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 11 10 303963 CASAVA_Build 2 140575602 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1302 het 1302 ref 35 26 3 6 A 10 11 303964 CASAVA_Build 2 140579125 4I ATTAGTTTAT ----/TATC TATCTATCTC 3070 hom 114 het 39 0 39 1 TATC 2 3 303965 CASAVA_Build 2 140580472 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 9 8 303966 CASAVA_Build 2 140584738 1I AAACTGGAGA -/C CTGTGATTTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 C 1 2 303967 CASAVA_Build 2 140588056 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1922 hom 15 het 9 0 6 3 T 1 0 303968 CASAVA_Build 2 140595760 1I CAGCAGAGAA -/G GGAGAGAAGA 1795 het 1795 ref 26 17 5 4 G 2 3 303969 CASAVA_Build 2 140597641 1D TGTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 A 10 9 303970 CASAVA_Build 2 140605244 2D TACATAGATG TA/-- TATAGTTAGC 3070 hom 87 het 35 0 29 7 TA 3 2 303971 CASAVA_Build 2 140614688 1D CCGAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 38 1 31 7 A 12 11 303972 CASAVA_Build 2 140626067 1D CTGTTGATGC A/- AAAAAAAAAG 1206 het 1206 ref 37 27 3 7 A 10 9 303973 CASAVA_Build 2 140635145 1D TATATTTCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 59 hom 25 1 19 5 A 10 9 303974 CASAVA_Build 2 140639175 1D ATTTGTTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 16 17 10 T 10 9 303975 CASAVA_Build 2 140647628 1D GATTTCTTGG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 A 8 7 303976 CASAVA_Build 2 140658701 1D TCTTTGTTGT A/- AAGATCTTAT 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 A 3 2 303977 CASAVA_Build 2 140659176 1D CTTAAATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 9 21 8 T 10 9 303978 CASAVA_Build 2 140659579 1I CTCTTCAATA -/C CAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 24 1 21 2 C 1 2 303979 CASAVA_Build 2 140660516 1D CTTTCTGTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 10 9 303980 CASAVA_Build 2 140674717 3I CTTTCCCTAA ---/TTC TTCTTTCCAA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 TTC 1 2 303981 CASAVA_Build 2 140675345 1D GTTTCTCCCA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 T 9 8 303982 CASAVA_Build 2 140677982 1D TCAACAGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 A 14 13 303983 CASAVA_Build 2 140700419 3D CAAAATTAAT AAA/--- AAAAGATTTG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 7 4 303984 CASAVA_Build 2 140700844 1D TAATTTAAAA T/- TTTTCCCAAA 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 T 5 4 303985 CASAVA_Build 2 140701859 2D AGTTGTAAAA AG/-- AGAAAAACTA 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 AG 2 1 303986 CASAVA_Build 2 140702778 1I GCAGAAGAAA -/C CCACAGCTGA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 C 2 3 303987 CASAVA_Build 2 140703032 3D6M4D ATTGCAGCCA CATAAGTATAACG/---ATTTAT---- TCTGCTAGAG 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 N/A 0 0 303988 CASAVA_Build 2 140704753 1I CCCCAGGGTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 8 9 303989 CASAVA_Build 2 140706245 1D TTGCCCTTTG T/- TTTTTGACCT 3070 het 3070 hom 51 18 30 3 T 6 5 303990 CASAVA_Build 2 140709409 5D TTTTCTTCAC ATGTA/----- ATGTAATTTA 3070 het 3070 ref 40 25 12 6 ATGTA 2 1 303991 CASAVA_Build 2 140720566 1I ATGGCTGCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 31 0 19 13 A 9 10 303992 CASAVA_Build 2 140720624 6D ACCAATACTT TAAAGA/------ TAAAGAAGCA 3070 hom 75 het 32 0 26 9 TAAAGA 2 1 303993 CASAVA_Build 2 140723085 1D CATTTAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 10 9 303994 CASAVA_Build 2 140724562 1I CTTTGACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 T 11 12 303995 CASAVA_Build 2 140727645 4D AAACGATGAC TAAA/---- TATATATTTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 5 TAAA 1 0 303996 CASAVA_Build 2 140738211 1I CTTACAAAGA -/C CACCAGTCAG 3070 het 3070 hom 47 15 28 4 C 1 2 303997 CASAVA_Build 2 140739000 1I GTTATGCAGT -/G GAGTATATGT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 G 1 2 303998 CASAVA_Build 2 140739320 1D ACACATTAGA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 41 20 17 5 T 7 6 303999 CASAVA_Build 2 140741983 1I CAAAAAGTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 9 10 304000 CASAVA_Build 2 140747376 13I CATGATTTGG -------------/ATAGTTTATATGA ACGCATGTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 7 ATAGTTTATATGA 0 1 304001 CASAVA_Build 2 140748843 5I TCCTCTGGCT -----/AAGAG AAGAGAGCTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AAGAG 1 2 304002 CASAVA_Build 2 140750594 1I AACAGCAGTC -/T TATGTGATCA 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 T 1 2 304003 CASAVA_Build 2 140752076 2D ACATATACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 184 hom 41 3 13 25 AC 10 9 304004 CASAVA_Build 2 140756038 1D TAAGGAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 9 8 304005 CASAVA_Build 2 140757595 4I ATCATCTTGA ----/TCAG TCAGTGACAT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 TCAG 1 2 304006 CASAVA_Build 2 140758118 1I CCATTTGCCA -/T TATTTAGGCC 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 T 1 2 304007 CASAVA_Build 2 140758348 1D CCTCCCCCCC A/- AAAAAAAACC 1948 het 1574 hom 18 8 6 5 A 9 8 304008 CASAVA_Build 2 140758766 1D TTGCTTCTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 30 het 26 0 11 17 T 10 9 304009 CASAVA_Build 2 140758947 10I ATCTATATAC ----------/CTACCTATAT CTATATACCT 3032 het 546 hom 24 5 10 9 CTACCTATAT 0 1 304010 CASAVA_Build 2 140759046 2I TACCTAGATA --/TC TCTCTCTGTG 3070 het 1652 hom 25 6 15 4 TC 3 4 304011 CASAVA_Build 2 140759326 4D TGATAGCAAG ATAT/---- ATATAGATAG 2119 het 2119 ref 38 18 8 15 AT 4 2 304012 CASAVA_Build 2 140759895 1D TACTCTTTCA T/- TGTGTATAGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 1 304013 CASAVA_Build 2 140761934 18D CTTTTATTTG TTGGAACTTTCACTTTAT/------------------ TTGGAAAATG 797 het 797 ref 29 8 3 22 TTGGAACTTTCACTTTAT 1 0 304014 CASAVA_Build 2 140762191 1I AATTTGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 11 12 304015 CASAVA_Build 2 140769845 4I TGACTGTGAT ----/AGAA AGCAATTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AGAA 0 1 304016 CASAVA_Build 2 140770673 3I GAAAAATTTA ---/AAT AATATAGATA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AAT 1 2 304017 CASAVA_Build 2 140772357 2I TATTCTACTC --/AT ATGTGATAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 2 304018 CASAVA_Build 2 140783968 2I TAAATTTTGT --/TC TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 TC 0 1 304019 CASAVA_Build 2 140795276 1D CTGTTTTGTG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 8 7 304020 CASAVA_Build 2 140798910 1D GGATCTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2312 hom 37 8 16 13 T 15 14 304021 CASAVA_Build 2 140802516 1D AAAATGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 11 10 304022 CASAVA_Build 2 140804738 1D AAAGCAATTG T/- TAACAAGAAA 3070 het 3070 ref 35 23 10 3 T 2 1 304023 CASAVA_Build 2 140809234 2I TGTGCATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2880 hom 27 9 11 7 TA 5 6 304024 CASAVA_Build 2 140810427 1D AGTTTAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 308 hom 46 8 17 21 T 13 12 304025 CASAVA_Build 2 140830210 4I GCTTAGCTCC ----/ACAA ACAAACAAGC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 ACAA 2 3 304026 CASAVA_Build 2 140845652 1D GTTACATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2911 hom 24 9 13 2 T 11 10 304027 CASAVA_Build 2 140864607 1D ACAGTAAAAT A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 A 7 6 304028 CASAVA_Build 2 140865535 3D CATCAAACGG AAT/--- AAGAGCTGTG 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 AAT 1 0 304029 CASAVA_Build 2 140869975 1I TGAAGTGAGT -/G GGGGGGGAAG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 G 7 8 304030 CASAVA_Build 2 140909307 2D AAGTATTTAA CT/-- CTGATTTTTT 3070 het 3070 ref 29 19 8 3 CT 2 1 304031 CASAVA_Build 2 140909709 1D GTTAAGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 319 hom 36 1 27 9 A 13 12 304032 CASAVA_Build 2 140910639 4D TATTATACTG CTCA/---- CTGTCTTTTT 732 het 732 ref 32 15 7 11 CTCA 1 0 304033 CASAVA_Build 2 140916182 2D GGATTTAAGC AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 A 10 8 304034 CASAVA_Build 2 140919641 5I ATAATGCATT -----/TTATC TTATCATATT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 TTATC 1 2 304035 CASAVA_Build 2 140920094 2I CCATAGAAAT --/AA GAGAGTTCTA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 0 2 304036 CASAVA_Build 2 140921012 1D CAATAGTAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 9 8 304037 CASAVA_Build 2 140922112 1D AATAGTAATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 47 27 18 2 A 9 8 304038 CASAVA_Build 2 140925810 1I AGGCTCAACA -/T TTTTTTTTTG 2338 het 2338 ref 26 16 6 4 T 9 10 304039 CASAVA_Build 2 140927707 4I ACTTTTTTCC ----/TAAT TAAAATGATT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 TAAT 0 1 304040 CASAVA_Build 2 140928913 1D AATGCTGTGA T/- TTTGTTCTAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 T 4 3 304041 CASAVA_Build 2 140962284 3D GCTCTTGTCC CAA/--- CAACAATATA 3070 het 3070 ref 43 23 16 7 CAA 3 2 304042 CASAVA_Build 2 140967621 1D TTTTAACATC T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 8 7 304043 CASAVA_Build 2 140979311 1I TGAAGTGACC -/T TTTTCAAGGT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 4 5 304044 CASAVA_Build 2 140980158 1I CTGAATTATG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 8 9 304045 CASAVA_Build 2 140985729 1D GTTGACAAAT C/- CCCCCCGTAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 7 6 304046 CASAVA_Build 2 140987536 1I GATTACTGAC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 7 8 304047 CASAVA_Build 2 140987673 23D TACTTTCAAG AATATCTCCAATTTCATATTACT/----------------------- AAAGAGAACT 3070 hom 78 het 28 0 27 3 AATATCTCCAATTTCATATTACT 1 0 304048 CASAVA_Build 2 140996718 1D CTAGATTAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 300 hom 33 1 30 3 A 10 9 304049 CASAVA_Build 2 140997598 1D GAGAAAGAAA T/- TTAAAGGCAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 3 2 304050 CASAVA_Build 2 140998168 1I AATAAGAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 8 9 304051 CASAVA_Build 2 141001041 3I CATTAATATT ---/TAA TAATATAATA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 TAA 1 2 304052 CASAVA_Build 2 141001723 1D CGGAAAAAAG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 8 7 304053 CASAVA_Build 2 141010756 1D TAGCTGCAAG A/- AAAAAAAAAA 1175 het 1175 ref 33 25 4 4 A 13 12 304054 CASAVA_Build 2 141012606 1I AAAGATATAT -/A TTCTTTTCTC 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 A 0 1 304055 CASAVA_Build 2 141012857 1I TTTTCCAATG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 6 7 304056 CASAVA_Build 2 141014784 1I TAGTGCACAA -/C CAGGAGGGTA 3070 het 3070 ref 58 30 21 7 C 1 2 304057 CASAVA_Build 2 141016192 3D TTATTTAAAA TGT/--- TGTAGTCATT 3070 het 3070 ref 39 19 13 8 TGT 2 1 304058 CASAVA_Build 2 141017414 1D AAAAACTGGG T/- TTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 T 7 6 304059 CASAVA_Build 2 141030775 1I AAACAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 10 11 304060 CASAVA_Build 2 141033800 1I TAAATAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 A 11 12 304061 CASAVA_Build 2 141037469 1I TAAAAAATTT -/A ATGAAGCATT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 2 304062 CASAVA_Build 2 141045669 1D ACCAATGACA T/- TTTTTTACAG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 7 6 304063 CASAVA_Build 2 141051461 1D CACTACTGAA T/- TTTTTTTTTT 2639 het 250 hom 11 3 7 1 T 15 14 304064 CASAVA_Build 2 141052302 1D ACACTTACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 10 9 304065 CASAVA_Build 2 141054717 1I TTATACAGTC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 7 8 304066 CASAVA_Build 2 141055584 1I TGTCTTCACG -/T TTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 6 7 304067 CASAVA_Build 2 141062887 1D AGTCCCAGCT A/- ACTCGGGAGG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 2 1 304068 CASAVA_Build 2 141075125 1D ATTAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 17 12 A 14 13 304069 CASAVA_Build 2 141075347 1D GCTCTTACAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 10 9 304070 CASAVA_Build 2 141076244 1I CTAATGAGAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 9 10 304071 CASAVA_Build 2 141076780 1D11M1D TTTTTTCATA TTTTTTTATTTCT/-TTTTTTATTTC- TTTTTTACAT 3070 het 2752 hom 21 9 16 3 N/A 0 0 304072 CASAVA_Build 2 141078268 1D ACTTGCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2889 hom 39 11 17 11 A 15 14 304073 CASAVA_Build 2 141089808 18I ACATGCCTTC ------------------/CTTATACTAGGCTCTTCT CTCACCTCTT 3070 hom 123 het 45 0 42 4 CTTATACTAGGCTCTTCT 0 1 304074 CASAVA_Build 2 141094738 3D CTTTCAAAAT AAG/--- AAGAATATCT 3070 het 3070 ref 28 16 12 0 AAG 2 1 304075 CASAVA_Build 2 141100741 4D GCTTCCATTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2114 hom 20 8 7 5 A 16 12 304076 CASAVA_Build 2 141102577 1I CTCTGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 2785 het 2785 ref 30 12 10 8 A 15 16 304077 CASAVA_Build 2 141144734 1D TACAAAAAAA T/- ATAAGAGCAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 0 304078 CASAVA_Build 2 141150008 1I TTGATGCAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 A 8 9 304079 CASAVA_Build 2 141151758 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 65 het 26 0 22 4 A 8 9 304080 CASAVA_Build 2 141154399 1I ATAAGCTCCC -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 T 6 7 304081 CASAVA_Build 2 141162505 1I CAGATAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 8 9 304082 CASAVA_Build 2 141164426 1I AGGTCTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 10 11 304083 CASAVA_Build 2 141166897 5I GAAATCTGTT -----/CTTAC CTTACCCTGA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 CTTAC 1 2 304084 CASAVA_Build 2 141173664 1I AAGAAGATGG -/T TTTTTGTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 5 6 304085 CASAVA_Build 2 141173957 1I TGCCCACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1778 hom 20 6 8 7 A 10 11 304086 CASAVA_Build 2 141174797 1I GCTGGTCAAT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 6 7 304087 CASAVA_Build 2 141179740 1I GTAAAAAAAA -/T ATGCATAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 0 1 304088 CASAVA_Build 2 141182546 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 1437 het 1437 ref 14 9 3 4 TA 6 5 304089 CASAVA_Build 2 141182624 2D TTTTTCATTT TA/-- TATATGTGTT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 TA 3 2 304090 CASAVA_Build 2 141183803 1D AAGTACTGTA C/- TTTATTCCTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 4 C 1 0 304091 CASAVA_Build 2 141185633 3D TTATCAAGTG TTA/--- TTATTCAATG 3070 het 3070 hom 42 21 19 2 TTA 2 1 304092 CASAVA_Build 2 141189880 1D GAATATAAAC A/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 A 1 0 304093 CASAVA_Build 2 141190873 1I TAAGACACAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 8 9 304094 CASAVA_Build 2 141192895 1I TCTTCACATA -/T TTTTTTTTTC 1461 het 1461 ref 35 22 5 8 T 9 10 304095 CASAVA_Build 2 141193452 2D TCTTTACAAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 22 hom 35 1 19 15 A 11 9 304096 CASAVA_Build 2 141197586 7D CATATCCATT TAAATTA/------- TGTTAGCATA 3070 het 3070 hom 43 17 24 4 TAAATTA 1 0 304097 CASAVA_Build 2 141198835 2I11M1I GACTTGTTTT --AATTATCGAGA-/CAAATTATCGAGAT TAAAAAAATA 3070 het 668 hom 23 2 14 10 N/A 0 0 304098 CASAVA_Build 2 141202197 1D ACTTGTTATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 10 9 304099 CASAVA_Build 2 141206738 1D GATGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 13 1 A 11 10 304100 CASAVA_Build 2 141208776 1D6M3D CTCAGCTAAT GACTGTGTGA/-ACTGAG--- AGCAGATACT 1658 het 1658 ref 46 23 9 17 N/A 0 0 304101 CASAVA_Build 2 141213402 3D GCAAAGAGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2871 het 49 hom 22 2 7 14 A 14 11 304102 CASAVA_Build 2 141220074 7D AAATCCTTAA AATGAGG/------- AATGAGGATG 3070 het 3070 ref 53 29 19 6 AATGAGG 2 1 304103 CASAVA_Build 2 141223416 1D CTTTTAAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 10 9 304104 CASAVA_Build 2 141224480 3I TATATTTTTG ---/TTA TTATATATCC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TTA 1 2 304105 CASAVA_Build 2 141225031 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1580 het 318 hom 26 3 7 16 T 18 16 304106 CASAVA_Build 2 141226409 1D GTCGCCCAGG T/- TTGGAGTGCA 3070 hom 39 het 24 0 13 11 T 3 2 304107 CASAVA_Build 2 141228809 1D TAAGAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 5 A 11 10 304108 CASAVA_Build 2 141229055 1I40M1I ATACAGAAAT -AAAAAAAGAAATATAAGGGAATACCATGAATAACTATATG-/AAAAAAAAGAAATATAAGGGAATACCATGAATAACTATATGC CAAAAATTAC 3070 het 3070 hom 29 17 27 4 N/A 0 0 304109 CASAVA_Build 2 141232323 1I ATGTTAGAAT -/G GTAAGTAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 G 1 2 304110 CASAVA_Build 2 141234062 1D TAAAAACTTC A/- AAGAATGGTT 3070 het 3070 hom 37 13 20 5 A 3 2 304111 CASAVA_Build 2 141240242 1D AAGGTCATGA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 23 8 T 3 2 304112 CASAVA_Build 2 141243071 1I TTTTACTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 408 hom 38 1 32 6 T 9 10 304113 CASAVA_Build 2 141243874 5I TTTAGATTTC -----/TTAAA TTAAGAAATT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TTAAA 0 1 304114 CASAVA_Build 2 141247711 4I TAAATAATAA ----/AATT AATATATTTC 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 AATT 0 1 304115 CASAVA_Build 2 141251957 1I AAATGGTAGG -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 6 7 304116 CASAVA_Build 2 141252106 1D ATTGATCAAT A/- AAAACTATTA 3070 het 3070 hom 50 18 27 5 A 5 4 304117 CASAVA_Build 2 141253129 2D TTTTTAAGAC TA/-- TAAAATGGTC 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 TA 2 1 304118 CASAVA_Build 2 141256095 3D CTCACATTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 58 29 17 14 TTG 4 3 304119 CASAVA_Build 2 141257412 1I TAGGATATAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 8 9 304120 CASAVA_Build 2 141257558 1D AGATGAAGAA T/- AGGAGAGAAG 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 1 0 304121 CASAVA_Build 2 141258769 2D AAGAAAAGGT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 88 hom 34 2 14 19 A 11 9 304122 CASAVA_Build 2 141265862 1I ATCAGGATAT -/G CCTCCCAAAA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 G 0 1 304123 CASAVA_Build 2 141270231 1D AAAATTTAGC A/- GTTTACAAAG 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 A 1 0 304124 CASAVA_Build 2 141275622 2D ATCTTACTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 42 3 14 25 T 16 14 304125 CASAVA_Build 2 141278111 1D GTAAGCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 6 A 11 10 304126 CASAVA_Build 2 141280104 4I GAGAGCTCTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 2472 het 2472 ref 27 14 7 6 TC 5 7 304127 CASAVA_Build 2 141284243 1I TTCAAAGAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 8 9 304128 CASAVA_Build 2 141284512 1D TTTTTCATTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 9 8 304129 CASAVA_Build 2 141284606 3D GAGGTTTTGA AAG/--- AAGGAGAACC 3070 het 3070 ref 26 14 9 5 AAG 2 1 304130 CASAVA_Build 2 141287927 1I ATTTGAGGGG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 A 7 8 304131 CASAVA_Build 2 141291858 4D AAAAATTAAG AATT/---- AAGGCTTCCA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 AATT 1 0 304132 CASAVA_Build 2 141292171 2D ATTTTGCTGG AA/-- AGAGTATCAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 3 1 304133 CASAVA_Build 2 141293264 1I CCTTTCAAGC -/T TAAGGCTCTA 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 1 2 304134 CASAVA_Build 2 141294638 1D AACGAAATTA T/- TTTTTAAGTG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 6 5 304135 CASAVA_Build 2 141297338 4D CTCTTCTTAA TTGT/---- TTAATTTTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TTGT 1 0 304136 CASAVA_Build 2 141298169 1I TTAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 31 het 27 0 21 6 A 9 10 304137 CASAVA_Build 2 141299467 1D TAGGAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 1509 het 1509 ref 65 50 5 10 T 11 10 304138 CASAVA_Build 2 141302022 1I TTACTGAAAG -/A AAAAAAGCTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 7 304139 CASAVA_Build 2 141306918 5I CAAAATAGCT -----/AGAAG AGAAGAGATG 3070 hom 135 het 55 0 46 9 AGAAG 1 2 304140 CASAVA_Build 2 141311653 1I TTAAAAATAT -/C ACTTGGTGAG 3070 het 2760 hom 30 7 17 6 C 0 1 304141 CASAVA_Build 2 141314944 1I TTAAAAAAAA -/T AATCATACTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 0 1 304142 CASAVA_Build 2 141315966 5I AGCATTTGAT -----/TACTC TACCTTGATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TACTC 0 1 304143 CASAVA_Build 2 141321815 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAAGAAA 3070 het 2997 hom 36 14 15 8 AG 1 0 304144 CASAVA_Build 2 141329364 3D ATTACATACA GTT/--- GTTGTCTTTG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 GTT 2 1 304145 CASAVA_Build 2 141345397 11D TGATAGAGAA TAAATATTTTT/----------- TAAAGGAAAA 3070 het 3070 hom 52 20 30 6 TAAATATTTTT 1 0 304146 CASAVA_Build 2 141346122 2D GGACCTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 2393 het 371 hom 21 4 6 11 T 16 14 304147 CASAVA_Build 2 141348664 1I TTAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2957 hom 23 9 13 1 T 10 11 304148 CASAVA_Build 2 141353029 2D CTCTGTTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 20 1 12 8 A 16 14 304149 CASAVA_Build 2 141355618 2I TGAATTAGTA --/CT GTTATCCAAA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 CT 0 1 304150 CASAVA_Build 2 141357599 1I CCACATTTAG -/A AAAAAAAAAA 2200 het 2200 ref 26 11 10 5 A 13 14 304151 CASAVA_Build 2 141360664 1D GGATTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 11 10 304152 CASAVA_Build 2 141362618 1D AAATAAAAAA C/- AGATGAGTAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 C 1 0 304153 CASAVA_Build 2 141364141 2D TTTATTAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 28 4 11 13 A 12 10 304154 CASAVA_Build 2 141364223 3D AAATGTTGCT TAA/--- AAACACAAAC 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 TAA 1 0 304155 CASAVA_Build 2 141368571 2D CCTGAAGACC AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 12 22 5 A 10 8 304156 CASAVA_Build 2 141370838 2I GCTATCATCA --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 9 11 304157 CASAVA_Build 2 141374853 1I ACATAAAAAG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 A 6 7 304158 CASAVA_Build 2 141378486 4I ATTGAAGCAA ----/TATT TATTTATATA 3070 hom 97 het 36 0 33 3 TATT 1 2 304159 CASAVA_Build 2 141381012 2I CACATATGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 14 16 304160 CASAVA_Build 2 141382715 2I GGCGACTAAC --/AT ATGTATAGAC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 AT 1 2 304161 CASAVA_Build 2 141384136 7I GAATCTTACC -------/AAAAAAA AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 A 4 11 304162 CASAVA_Build 2 141389532 1D TACTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1393 hom 16 5 9 2 A 11 10 304163 CASAVA_Build 2 141396321 2D CTATTTGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 AC 8 7 304164 CASAVA_Build 2 141408004 1D TCTTGGAAAA C/- AAAAAGAGGT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 C 1 0 304165 CASAVA_Build 2 141412859 1I CGGGCATTTA -/T TTGCTAAATG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 3 304166 CASAVA_Build 2 141416752 1D GAGAAATAAA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 8 7 304167 CASAVA_Build 2 141423624 1D TATTCCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 10 9 304168 CASAVA_Build 2 141431548 1I AAGTGCAAGG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 6 7 304169 CASAVA_Build 2 141434074 1D AAATGAGTAA T/- TTTTTTATCA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 7 6 304170 CASAVA_Build 2 141437299 1D ATTTCAATTG A/- AAAAAAAAAC 2444 het 2444 ref 18 9 5 5 A 10 9 304171 CASAVA_Build 2 141439398 1D TTAAAATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 T 11 10 304172 CASAVA_Build 2 141439600 3I TTTTCTTTTA ---/ATT ATTTTTTTAT 3070 het 29 hom 33 2 16 16 ATT 1 2 304173 CASAVA_Build 2 141439929 1I GAACTCATCC -/T TTTTTTTATG 1398 hom 10 het 6 0 4 2 T 7 8 304174 CASAVA_Build 2 141441379 4I TTTGGCTCTC ----/TGTT TGTCTGTTAT 1924 hom 10 het 4 0 4 0 TGTT 0 1 304175 CASAVA_Build 2 141443517 3I TGACTCTTTA ---/TCC AATTTGCCAG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TCC 0 1 304176 CASAVA_Build 2 141446636 1I AGGAAACATG -/A GGAAAAATGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 304177 CASAVA_Build 2 141446758 9I TTGTTAAAAC ---------/AATAGTTTG AATAGTTTGT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AATAGTTTG 1 2 304178 CASAVA_Build 2 141446983 2D CAGCTTTTTG AT/-- ATATATATAT 2172 hom 15 het 11 0 6 5 AT 8 7 304179 CASAVA_Build 2 141451638 1D AGTAATTGCG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 304180 CASAVA_Build 2 141456899 1I CCTTAAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 11 12 304181 CASAVA_Build 2 141459307 3D TCAAAGCATT CTA/--- CTTAGTTTTA 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 CTA 1 0 304182 CASAVA_Build 2 141460150 1D TCAATTTAGT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 G 2 1 304183 CASAVA_Build 2 141460650 1D GACAGTGCTT C/- CTTTAAGAAG 3070 het 3070 hom 39 14 21 5 C 2 1 304184 CASAVA_Build 2 141464236 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 1808 hom 23 6 11 6 A 8 9 304185 CASAVA_Build 2 141464600 1D TGTATTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 12 11 304186 CASAVA_Build 2 141474954 6I AATATCTTTC ------/CTATAT CTATATCAAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 CTATAT 1 2 304187 CASAVA_Build 2 141475360 1D GCTGTCCATC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 10 9 304188 CASAVA_Build 2 141476267 1D ATTACTAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 18 17 4 A 9 8 304189 CASAVA_Build 2 141481533 1I TAATACAGGG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 7 8 304190 CASAVA_Build 2 141485244 1D ATCCATAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 11 10 304191 CASAVA_Build 2 141491255 3D GTAATTCTAT GTA/--- GTTAGGTATA 3070 hom 45 het 28 0 16 12 GTA 1 0 304192 CASAVA_Build 2 141491455 1D ATGGCAACAT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 G 1 0 304193 CASAVA_Build 2 141495421 4I CATTACAGTG ----/AATC AATCAGATAT 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 AATC 1 2 304194 CASAVA_Build 2 141507580 1D CCTGTCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 845 hom 40 10 15 15 A 13 12 304195 CASAVA_Build 2 141509392 3D CTTGAAGTAC AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 17 7 8 2 AAT 7 6 304196 CASAVA_Build 2 141512179 1I AAAAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 31 1 24 6 A 10 11 304197 CASAVA_Build 2 141512422 3D ACAGTTCTGT CTA/--- CTACTACCTA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 CTA 3 2 304198 CASAVA_Build 2 141515865 2I ATCATGTATG --/TA TATGTACAAA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 TA 1 2 304199 CASAVA_Build 2 141517279 4D ATAAATAAAC AAAT/---- AAATAAATAA 822 hom 12 het 6 0 5 1 AAAT 4 3 304200 CASAVA_Build 2 141519490 1D TTAATTAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 14 0 14 1 A 10 9 304201 CASAVA_Build 2 141524984 1I AGAAAAAACC -/A AAAAACATCA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 5 6 304202 CASAVA_Build 2 141526007 4D TCTGCTCTTA TTGT/---- TTAATTTTAG 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 TTGT 1 0 304203 CASAVA_Build 2 141537345 8D3M9I TAACAGTATG GGGTATCTTTA---------/--------TTAGATAGCCAG AAGCTTAAAC 2637 het 2637 ref 35 26 6 5 N/A 0 0 304204 CASAVA_Build 2 141551305 4D ACAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 42 16 22 6 AAAC 4 3 304205 CASAVA_Build 2 141552343 1D GTCCAGTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 140 het 52 0 47 5 T 10 9 304206 CASAVA_Build 2 141552661 6D CAAGAGGGAG AGAGAA/------ AGAGAAAGAG 3070 hom 120 het 47 0 41 10 AGAGAA 3 2 304207 CASAVA_Build 2 141555746 1I AATAGAAAAA -/T TTAGGCTACA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 2 3 304208 CASAVA_Build 2 141556170 5D AAGACAATTC TTATT/----- TTAATTTTTG 3070 hom 126 het 43 0 43 0 TTATT 1 0 304209 CASAVA_Build 2 141556399 1I GATTTGGATA -/G AAAGCTGGGC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 0 1 304210 CASAVA_Build 2 141561229 13I ATACTAGTGA -------------/GTATGTATTTGGT GTATTATGCT 3070 hom 141 het 52 0 48 6 GTATGTATTTGGT 0 1 304211 CASAVA_Build 2 141561927 6I ATGCCTCATT ------/TTTAAC TGTTGTCTCA 3070 hom 117 het 40 0 39 1 TTTAAC 0 1 304212 CASAVA_Build 2 141569531 1D TAGAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 11 10 304213 CASAVA_Build 2 141577748 1I AAGGCTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 23 0 19 4 T 12 13 304214 CASAVA_Build 2 141583706 1D ACAACCTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 498 hom 44 2 28 15 A 15 14 304215 CASAVA_Build 2 141585406 2I CCTCATTATT --/CA CAGATTTCAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 CA 1 2 304216 CASAVA_Build 2 141587792 1I TTTTAAATGC -/A AAAAAGCTAT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 5 6 304217 CASAVA_Build 2 141588918 1I ATACTAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 35 0 30 5 A 11 12 304218 CASAVA_Build 2 141589196 1I TTTCTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 173 hom 46 1 41 4 A 10 11 304219 CASAVA_Build 2 141590768 1D ATCTGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 11 10 304220 CASAVA_Build 2 141599955 7I GCAAAATTCT -------/GTGATTG GTGATTGTTA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 GTGATTG 1 2 304221 CASAVA_Build 2 141600077 1D CTTCCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 28 2 10 16 T 13 12 304222 CASAVA_Build 2 141601814 1D AAACTGGTTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 A 8 7 304223 CASAVA_Build 2 141603831 3I ATAAACAAAT ---/AAC AGAGTTAGAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAC 0 1 304224 CASAVA_Build 2 141605713 1D GGGAATCCAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 A 9 8 304225 CASAVA_Build 2 141611076 1I TCATTATTCG -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 7 8 304226 CASAVA_Build 2 141612612 2I TGCAATATAA --/AT ATGTCATTTT 3070 hom 18 het 33 1 19 13 AT 1 2 304227 CASAVA_Build 2 141616129 1D CTGGTATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 11 10 304228 CASAVA_Build 2 141619437 4I TTCATTCGTA ----/TATT TAGATTACAT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 TATT 0 1 304229 CASAVA_Build 2 141629514 3D TATTTTTTTC TTT/--- TTATTATTAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 5 2 304230 CASAVA_Build 2 141640923 2D TAGAAAAATG TT/-- TTGTTTTTCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 4 2 304231 CASAVA_Build 2 141647095 1D CTTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 893 hom 36 2 27 8 A 13 12 304232 CASAVA_Build 2 141658644 1D ATGTTACATT A/- AAAAAAAAAA 1690 het 1690 ref 44 32 5 7 A 12 11 304233 CASAVA_Build 2 141665720 1I AAAAATAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 41 2 33 6 T 11 12 304234 CASAVA_Build 2 141676786 1I TTTTGCCCAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 304235 CASAVA_Build 2 141677621 1D ACACAATAAT G/- GGGGGGGAGG 3070 het 75 hom 30 2 25 3 G 8 7 304236 CASAVA_Build 2 141679728 1I TCAAATACTC -/A AAGCTGTAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 3 304237 CASAVA_Build 2 141680626 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 10 11 304238 CASAVA_Build 2 141684290 1I GAAATATAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 304239 CASAVA_Build 2 141684411 5I AACTCAGAAA -----/TTATT TTATTAGGCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TTATT 1 2 304240 CASAVA_Build 2 141695328 4D CAACAAAGAT AAAA/---- AAAAAAAAAA 2914 het 173 hom 26 4 12 11 A 20 16 304241 CASAVA_Build 2 141698205 2I ACACACACAC --/AA AAACATTAAA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 3 5 304242 CASAVA_Build 2 141700163 1I TTTTCCCCCC -/A CAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 0 1 304243 CASAVA_Build 2 141733939 1D ATCATAATCA T/- TTTTTATCAG 3070 hom 93 het 41 0 30 13 T 6 5 304244 CASAVA_Build 2 141734540 4I TAGAAGTTGG ----/CAAA CAGTTTCCAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 CAAA 0 1 304245 CASAVA_Build 2 141745811 1D AAACCATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 35 0 25 11 A 13 12 304246 CASAVA_Build 2 141749949 2I TGTAATGTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 1899 hom 38 6 25 7 AT 7 8 304247 CASAVA_Build 2 141762278 1D GAATAATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 31 4 A 11 10 304248 CASAVA_Build 2 141799260 3I CAAATTATCC ---/ACA ACAAGGAAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ACA 1 2 304249 CASAVA_Build 2 141802401 2I TAAATGAGAC --/TG TATCTATAGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TG 0 1 304250 CASAVA_Build 2 141804042 1D TATTATAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 A 11 10 304251 CASAVA_Build 2 141804400 2I TTAACAACTC --/TT ATTAACCAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 2 304252 CASAVA_Build 2 141804484 1I ATTTGAAACA -/T TTAAAGGAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 3 304253 CASAVA_Build 2 141806488 1I TATCTAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1121 hom 28 3 19 6 A 13 14 304254 CASAVA_Build 2 141806758 4D TTTTGCCTTA TTTT/---- TTTATATATA 279 hom 19 het 11 0 5 7 T 7 3 304255 CASAVA_Build 2 141806854 1I TTAAAAATGC -/A AAAAAAAAAA 1638 hom 19 het 23 0 6 17 A 11 12 304256 CASAVA_Build 2 141811532 4I TTTTGTCTCA ----/GTCT GTCTGTAGCT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 GTCT 1 2 304257 CASAVA_Build 2 141813252 1I ATGTCTATAA -/T ATTTTTTCCC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 0 1 304258 CASAVA_Build 2 141813345 5I AACGCAAAAA -----/AAAAG AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 AAAAG 0 1 304259 CASAVA_Build 2 141813806 9D TATTTTTCTC TTTTATTTA/--------- TTTATTTATT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTTTATTTA 1 0 304260 CASAVA_Build 2 141815008 1I AGTTTTGATC -/T GCACAGACAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 304261 CASAVA_Build 2 141818438 4D TGCCTTTTGT TAAC/---- TAAGTAAGCT 3070 hom 120 het 44 0 40 5 TAAC 1 0 304262 CASAVA_Build 2 141819166 1I ATGATGGAAG -/A AGGCCATAGT 3070 hom 124 het 45 0 40 5 A 1 2 304263 CASAVA_Build 2 141833685 1D ATCCCAGCTA C/- TTGGGAGGCT 3070 hom 42 het 15 0 13 2 C 1 0 304264 CASAVA_Build 2 141833798 5D TCGGCCCCCG CGCCC/----- CGCCCCGCCC 1682 hom 15 het 8 0 6 3 CGCCC 5 4 304265 CASAVA_Build 2 141838451 2I TTAAATCATA --/AC ACACACACAC 3070 hom 84 het 36 0 28 8 AC 8 9 304266 CASAVA_Build 2 141847637 1I CATAATCACC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 8 9 304267 CASAVA_Build 2 141859648 1D CTTCTAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 42 0 30 14 A 12 11 304268 CASAVA_Build 2 141864331 1I TTTAATAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 9 10 304269 CASAVA_Build 2 141873484 1I AGTCACTGTT -/A TCCTCCCTTT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 0 1 304270 CASAVA_Build 2 141881179 1I AAATAGAAAC -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 73 het 31 0 28 3 T 7 8 304271 CASAVA_Build 2 141882727 4I GTTATTTTAG ----/TTTA TTTATCTCTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTTA 1 2 304272 CASAVA_Build 2 141893261 4D TTTTTGGATC TTAT/---- TTATTAAGGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTAT 2 1 304273 CASAVA_Build 2 141897865 1I CCTGTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 A 11 12 304274 CASAVA_Build 2 141906641 5I TCAACCTCTT -----/TAGTG TAGTCTATTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 TAGTG 0 1 304275 CASAVA_Build 2 141908503 1D CTTTCTTATG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 T 8 7 304276 CASAVA_Build 2 141908793 3I TGATAGGTCA ---/GTT GTTGTTATTT 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 GTT 2 3 304277 CASAVA_Build 2 141910619 21I TTACTGTTTT ---------------------/CTTGGGGAAAGGGTATGCTAA CTCTCTTCTG 3070 hom 66 het 25 0 22 5 CTTGGGGAAAGGGTATGCTAA 0 1 304278 CASAVA_Build 2 141917985 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 22 7 13 2 T 9 8 304279 CASAVA_Build 2 141923662 1D TATGTGCAAG A/- AAAAAACCAC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 7 6 304280 CASAVA_Build 2 141927281 1I ATCTCAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 9 10 304281 CASAVA_Build 2 141929544 1D ATGACGTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 T 10 9 304282 CASAVA_Build 2 141931692 1D ACATGTCTGT G/- GGGGCACCTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 5 4 304283 CASAVA_Build 2 141932684 1D CCCTATCTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 10 9 304284 CASAVA_Build 2 141933141 4D AGCTGAACAG GACA/---- GTATGTTCAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 GACA 1 0 304285 CASAVA_Build 2 141936861 4I AATAAAATAT ----/TTTG TTTAATTGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTTG 0 1 304286 CASAVA_Build 2 141937003 3D AAGAGGAAAA CTT/--- CTGACAATTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 CTT 1 0 304287 CASAVA_Build 2 141937912 3D ATATATAATA TAT/--- ATCATTTTAT 1576 het 1266 hom 9 4 4 2 TAT 1 0 304288 CASAVA_Build 2 141938459 1D TTGCTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1795 hom 26 5 11 10 T 11 10 304289 CASAVA_Build 2 141941134 30D CACACACATA TATATGTGTATATATATATATATATATATC/------------------------------ TATATATATA 2372 het 56 hom 12 2 7 6 TATATGTGTATATATATATATATATATATC 1 0 304290 CASAVA_Build 2 141942754 2D GGAGAATTCT CA/-- GAGTCATTTA 3070 het 3070 ref 32 21 11 2 CA 1 0 304291 CASAVA_Build 2 141943080 1D TGGTTTCAAG A/- TTTTTCTTAA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 A 1 0 304292 CASAVA_Build 2 141943540 3D AGGGCCCATT TTA/--- TTATGGCTCA 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 TTA 2 1 304293 CASAVA_Build 2 141945316 11I TATTTTTTTT -----------/TTTTGTTTTTG TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 29 2 17 10 TTTTGTTTTTG 0 1 304294 CASAVA_Build 2 141946839 1I TAGTAGGCAG -/T TTTACACCAT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 3 4 304295 CASAVA_Build 2 141947079 4D AGGTATTTAC TTAG/---- TTAGCTAGCT 3070 het 3070 hom 46 18 24 7 TTAG 2 1 304296 CASAVA_Build 2 141947206 1D AGATGTCTGC A/- AAAAAAGCAT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 A 7 6 304297 CASAVA_Build 2 141947847 13D AACATTGCAA GTGTTATGCAACT/------------- ATATACCTCT 3070 het 3070 ref 44 30 11 6 GTGTTATGCAACT 1 0 304298 CASAVA_Build 2 141947974 4I13M3D AAGATTAATT ----AAGTAAAATTAAAAAC/GATAAAGTAAAATTAAA--- AACAATAAAG 3070 het 3070 ref 33 19 10 6 N/A 0 0 304299 CASAVA_Build 2 141948450 1D ACCCCCAGGA T/- TTTTTTTAGC 3070 het 406 hom 24 5 17 2 T 8 7 304300 CASAVA_Build 2 141951181 2D24M1D ACAAACAAAC AAAAAAAACCCCAAAAAACAAACAAAC/--AAAAAACCCCAAAAAACAAGCAAA- AAAAAAACCA 2178 het 2177 ref 13 8 7 12 N/A 0 0 304301 CASAVA_Build 2 141952003 1D TCCTACTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 40 0 29 11 A 12 11 304302 CASAVA_Build 2 141960847 1I TTGCCTACTG -/A AAAAAATTTA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 A 6 7 304303 CASAVA_Build 2 141962222 1I CATTTATTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 7 8 304304 CASAVA_Build 2 141963013 1I TGTTTTTTTT -/G TGTTTGTTTG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 0 1 304305 CASAVA_Build 2 141963302 4D ACTGGAATTA CAGG/---- CATGAGCCAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 CAGG 1 0 304306 CASAVA_Build 2 141964970 7D GGTTAAAATG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 27 4 18 6 T 23 16 304307 CASAVA_Build 2 141965536 1D CTGTTCTAAC T/- GGGTGATAGC 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 1 0 304308 CASAVA_Build 2 141968879 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 AC 7 6 304309 CASAVA_Build 2 141969313 11D TCCTCCATCA AATCTTCTTTC/----------- AGATATATTT 3070 hom 84 het 30 0 28 4 AATCTTCTTTC 1 0 304310 CASAVA_Build 2 141972024 1D ACTAAAACTT A/- ACGTTAGTAT 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 A 2 1 304311 CASAVA_Build 2 141972309 3D CTGAAATGAA CTC/--- CTTCATCTAC 3070 het 3070 ref 45 27 15 6 CTC 1 0 304312 CASAVA_Build 2 141975954 1D CAACTATGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 T 10 9 304313 CASAVA_Build 2 141977986 1D CTCCATGTGT A/- CACAGGAATA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 1 0 304314 CASAVA_Build 2 141979277 3D ATTCTTTGAT CTC/--- CTGCTCCCTG 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 CTC 1 0 304315 CASAVA_Build 2 141981443 1I CAATAGTTTT -/A AAAAAATGAT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 A 6 7 304316 CASAVA_Build 2 141982128 1I CCATCCCCCC -/T CCCAAAAAAA 3070 het 525 hom 24 3 19 2 T 0 1 304317 CASAVA_Build 2 141982689 2D CACATCTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 24 0 20 4 T 12 10 304318 CASAVA_Build 2 141986810 1I ATCTTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 12 14 A 10 11 304319 CASAVA_Build 2 141989049 2D ACCAGGATAA AG/-- AAATATTCCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AG 1 0 304320 CASAVA_Build 2 141989610 1I TGCCAATAAG -/A AAAATTGACA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 4 5 304321 CASAVA_Build 2 141992162 2D GGTTATCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1135 hom 35 10 17 10 A 12 10 304322 CASAVA_Build 2 141993080 6I ACTTGAGAAA ------/ACCGTG ATCGCTTTAA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 ACCGTG 0 1 304323 CASAVA_Build 2 141995557 1I TTGGAAGTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 T 8 9 304324 CASAVA_Build 2 141996486 1I CAATACATCA -/G GTTTCCCGGA 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 G 1 2 304325 CASAVA_Build 2 142005345 2D GTTCTGACTC TT/-- TAATTTAACC 3070 het 3070 hom 43 15 23 6 T 3 1 304326 CASAVA_Build 2 142005895 1D ACAAGTGTGT G/- GGGTGGAGGC 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 G 4 3 304327 CASAVA_Build 2 142006357 14D ACATTGTATG AACTTAAATAAATT/-------------- CTGTTGCTCT 3070 het 3070 ref 45 31 15 4 AACTTAAATAAATT 1 0 304328 CASAVA_Build 2 142007380 4I TATAGAGAGA ----/AAGC AAGCAAGCAT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 AAGC 2 3 304329 CASAVA_Build 2 142008083 4D AAGGAAAAAG AGAA/---- AGAGAGTGTG 3070 het 3070 hom 40 16 21 4 AGAA 1 0 304330 CASAVA_Build 2 142012708 2D CACAGTCTCG CT/-- CTGTCACCCA 1772 het 1648 hom 18 6 5 7 CT 2 1 304331 CASAVA_Build 2 142013248 3D GGAAGTTATT ATC/--- ATAGATTTAA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 ATC 1 0 304332 CASAVA_Build 2 142016104 1I TGTTCTATTC -/T TTTTTGCGAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 5 6 304333 CASAVA_Build 2 142021489 1I TTTCCCAGTA -/C AAAACTCTTT 3070 het 3070 ref 66 31 30 5 C 0 1 304334 CASAVA_Build 2 142040196 1I ACATTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 11 12 304335 CASAVA_Build 2 142042960 1I GCCCAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 1075 het 1075 ref 12 4 5 3 T 13 14 304336 CASAVA_Build 2 142046949 7D TTCTAAATAT CTATGCC/------- CTATGCCCTA 3070 hom 12 het 26 1 20 10 CTATGCC 2 1 304337 CASAVA_Build 2 142050229 3I CCAAATACCT ---/ATC AATGATAGAC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 ATC 0 1 304338 CASAVA_Build 2 142053255 3I AGATTCAGTG ---/AAT AATAATAACT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 AAT 2 3 304339 CASAVA_Build 2 142056653 1D TATTTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 T 13 12 304340 CASAVA_Build 2 142063299 4D TTATGTACTC TGTT/---- TGTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 49 24 20 7 TGTT 2 1 304341 CASAVA_Build 2 142072125 1D GTGCTTTTTT A/- TGATATATAA 1925 het 1925 ref 14 7 4 3 A 1 0 304342 CASAVA_Build 2 142073813 3D CTCAAAAACA ACT/--- AAGAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 19 20 1 ACT 1 0 304343 CASAVA_Build 2 142079991 1D AATGCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 8 23 8 A 11 10 304344 CASAVA_Build 2 142080271 3D TATTGATAAA TGT/--- TGTGTTATTA 3070 hom 86 het 32 0 29 5 TGT 2 1 304345 CASAVA_Build 2 142081196 2D TTACTTTGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 29 1 12 17 A 13 11 304346 CASAVA_Build 2 142089601 5D ATTTTATATT TAATA/----- TAATTCTTGA 3070 het 2366 hom 21 5 13 3 TAATA 1 0 304347 CASAVA_Build 2 142090328 2D TCAAGAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 11 8 A 13 11 304348 CASAVA_Build 2 142091931 1D AATTATTTTA T/- TTTAAGGCTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 4 3 304349 CASAVA_Build 2 142094999 1I TAAAAAAAAA -/G AGGTATATTT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 G 0 1 304350 CASAVA_Build 2 142097776 1D AAGATTAGGG C/- CAAGCGGGGT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 C 2 1 304351 CASAVA_Build 2 142107824 4D TTCACATGCA CACT/---- CAAACTACAT 3070 hom 129 het 47 0 44 7 CACT 1 0 304352 CASAVA_Build 2 142114849 1D TAAAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 11 10 304353 CASAVA_Build 2 142115236 8I TAGCTGGGTA --------/CAGTGGGT GCTCAGTTGG 3070 hom 39 het 18 0 14 4 CAGTGGGT 0 1 304354 CASAVA_Build 2 142121743 2I AACCTTCTAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 13 15 304355 CASAVA_Build 2 142130138 1D GTGACTTGCT A/- AAGTCGCATT 3070 het 3070 hom 43 15 21 9 A 3 2 304356 CASAVA_Build 2 142137450 1I CTGGTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 33 1 24 8 A 11 12 304357 CASAVA_Build 2 142149570 1I TGCCTTAGTA -/T TTTTGCATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 4 5 304358 CASAVA_Build 2 142162050 1D ATGATTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 11 10 304359 CASAVA_Build 2 142189355 1I AACAAAAGTC -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 6 7 304360 CASAVA_Build 2 142191009 1D ATGATCCACA G/- GGGGGGGTCG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 G 8 7 304361 CASAVA_Build 2 142193012 4I CTGGGTATTT ----/TGCC TGCCTGGGGT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 TGCC 1 2 304362 CASAVA_Build 2 142199886 1I GATAATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 10 11 304363 CASAVA_Build 2 142206399 1D TTTTTTTCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 8 304364 CASAVA_Build 2 142209543 1I AGCAAACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 37 1 30 6 T 10 11 304365 CASAVA_Build 2 142215543 3I TAACTGGTGA ---/GAT GATATCTTAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 GAT 1 2 304366 CASAVA_Build 2 142217998 4I AACTTTTTGT ----/TTGA TTGATTCTTT 3070 hom 50 het 24 0 17 7 TTGA 1 2 304367 CASAVA_Build 2 142221029 1D CCTTCATGTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 7 304368 CASAVA_Build 2 142230031 5D AGAAAAAAGA TAAAG/----- TAAACAAAAG 3070 het 3070 hom 31 11 19 4 TAAAG 1 0 304369 CASAVA_Build 2 142231929 11I CCATAGCTTA -----------/TTAGTCAATTT TTAATTCAGC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 TTAGTCAATTT 0 1 304370 CASAVA_Build 2 142235399 1D53M4D ATCCTAAGTC AAAAAAAAAAAATACATTGAAGTCTAGTTTATTATGTAGAAGTACAAATAACTTAATA/-AAAAAAAAAAATACATTGAAGTCTAGTTTATTATGTAGAAGTACAAATAACTT---- AATATTTATA 3070 hom 87 het 24 0 30 3 N/A 0 0 304371 CASAVA_Build 2 142237935 2I TCCTGAAGGA --/AT AGAGAATAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 0 1 304372 CASAVA_Build 2 142238735 1I GTCTATGGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2401 hom 27 8 14 5 T 9 10 304373 CASAVA_Build 2 142243849 22I TACTATACGC ----------------------/CTTAAAGTTGATCTACCACAAA TGGGGTTACT 3070 het 3070 ref 54 27 24 5 CTTAAAGTTGATCTACCACAAA 0 1 304374 CASAVA_Build 2 142245304 1I TTAATTAGCC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 8 9 304375 CASAVA_Build 2 142252606 5I GTGGTAAGTC -----/ACAGT ACAGCCATTT 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 ACAGT 0 1 304376 CASAVA_Build 2 142255890 3D TGAGAACAAA GAT/--- GATGATGATG 3070 het 3070 ref 45 19 13 14 GAT 5 4 304377 CASAVA_Build 2 142264365 1D AGCATTTTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2956 hom 17 6 10 2 A 10 9 304378 CASAVA_Build 2 142264705 1I CTTTTGTAAT -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 A 6 7 304379 CASAVA_Build 2 142266088 1I TTTTCAAGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 9 10 304380 CASAVA_Build 2 142272271 1I ACAGATGAAG -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 A 6 7 304381 CASAVA_Build 2 142277256 1D GCAATCGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 18 10 T 13 12 304382 CASAVA_Build 2 142281309 1D TTCATAACGC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 T 9 8 304383 CASAVA_Build 2 142283778 4D GGATAAAGTT TCTA/---- TCTATCTTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 6 TCTA 2 1 304384 CASAVA_Build 2 142293157 1I GCACACCTGT -/A ATCCCAGCTA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 1 2 304385 CASAVA_Build 2 142300290 4D CCATTTTACT TAAA/---- TATTTTAAAT 3070 het 3070 ref 24 12 12 1 TAAA 1 0 304386 CASAVA_Build 2 142307784 1I TAGCCAACGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 9 10 304387 CASAVA_Build 2 142314972 1I GCATCTAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 27 9 A 13 14 304388 CASAVA_Build 2 142319167 1D CATTTTCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 10 9 304389 CASAVA_Build 2 142325159 3D TTTTCAGTCT TTA/--- TTATAAAGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TTA 2 1 304390 CASAVA_Build 2 142348441 5I ATGACAAACC -----/AAATG AAATAAGATG 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AAATG 0 1 304391 CASAVA_Build 2 142353699 1I GCCATGACTT -/C CAGATACAGT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 1 2 304392 CASAVA_Build 2 142361004 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 15 14 304393 CASAVA_Build 2 142366539 1D ACAATAATGC A/- TTGAAGCTTC 3070 het 3070 hom 31 13 14 5 A 1 0 304394 CASAVA_Build 2 142367535 1I CCACCACTGA -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 T 6 7 304395 CASAVA_Build 2 142376004 1I GTATCTTTCT -/G TCATACCTAG 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 G 0 1 304396 CASAVA_Build 2 142376112 1I ACAAAAAATT -/A ATAGTTAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 1 2 304397 CASAVA_Build 2 142377187 1I TGTCTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 T 10 11 304398 CASAVA_Build 2 142397437 2I AAATTATCTC --/TT TGTCACTATA 532 het 532 ref 11 7 3 1 T 1 3 304399 CASAVA_Build 2 142409099 1D TCTCCTCTAT A/- AAAAATGACA 3070 het 3070 hom 46 21 20 6 A 6 5 304400 CASAVA_Build 2 142411122 1I TGAAAGATAT -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 A 6 7 304401 CASAVA_Build 2 142412798 2D TCTCCATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 TG 7 6 304402 CASAVA_Build 2 142416433 4I CTCTTCAAAA ----/CTGT CTGGTTCTTG 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 CTGT 0 1 304403 CASAVA_Build 2 142421856 1I TAAATATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 10 11 304404 CASAVA_Build 2 142432729 1I GAAAAGCTTT -/A AAAATAGAGG 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 A 4 5 304405 CASAVA_Build 2 142434888 4D GGCTCAAAAC CATT/---- CAAAGAACAC 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 CATT 1 0 304406 CASAVA_Build 2 142436303 2I TCTAATAATC --/AT AGGGCCAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AT 0 1 304407 CASAVA_Build 2 142443152 1D GTTGTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2647 hom 33 7 17 9 T 12 11 304408 CASAVA_Build 2 142444358 4D CCAATGTATC CATT/---- ATTTTAGATC 3070 het 3070 ref 50 26 21 4 CATT 1 0 304409 CASAVA_Build 2 142446627 2D ATGCAGGTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 A 13 11 304410 CASAVA_Build 2 142447837 4I AAAATCATAG ----/ATAA ATAATGACTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 ATAA 1 2 304411 CASAVA_Build 2 142457220 1D ACAGAAGTAG A/- AAAAATATCT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 A 6 5 304412 CASAVA_Build 2 142458201 1D AATATCTGAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 28 het 20 0 12 8 T 8 7 304413 CASAVA_Build 2 142459549 1I AGAATTTTTA -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 7 8 304414 CASAVA_Build 2 142461199 1I CATTTTGGTT -/A TGACTGTATC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 0 1 304415 CASAVA_Build 2 142461945 2D CTGTAAAGCA AT/-- GATTTCATAG 3070 hom 111 het 45 0 38 8 AT 1 0 304416 CASAVA_Build 2 142463318 4D AAGCAATAAC TGTA/---- TGTTATTCTC 3070 het 3070 hom 32 11 20 4 TGTA 1 0 304417 CASAVA_Build 2 142467469 4I GAGCAGGAAA ----/TTTT TTTTTCCCCT 3070 hom 96 het 35 0 30 5 T 5 9 304418 CASAVA_Build 2 142467647 2D TATTATCCTA TT/-- TTCTTTATTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 4 2 304419 CASAVA_Build 2 142467955 1D AAGGTTTATG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 148 het 56 0 50 6 T 8 7 304420 CASAVA_Build 2 142470452 2D CTACAGATCT CA/-- GTTACCACAT 3070 hom 123 het 46 0 41 7 CA 1 0 304421 CASAVA_Build 2 142470753 1I TTTTTTCTTT -/C CCCCCCCCCT 3070 het 2695 hom 28 9 12 7 C 9 10 304422 CASAVA_Build 2 142471235 1D GATTTTGCAC T/- TTTTTCACCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 6 5 304423 CASAVA_Build 2 142471417 2I ATATCCAAGA --/TG TGTGTGTGTG 2265 hom 27 het 12 0 10 2 TG 6 7 304424 CASAVA_Build 2 142471688 2D CACCCAGCCC AT/-- ATATATATAT 2080 het 30 hom 15 1 7 7 AT 10 9 304425 CASAVA_Build 2 142474066 5D TATATATACT ATATA/----- ATATATGTGA 2010 het 2010 ref 19 12 6 2 ATATA 2 1 304426 CASAVA_Build 2 142504076 1D CCTTTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 39 2 24 13 A 13 12 304427 CASAVA_Build 2 142513510 1I GTTCTGGTCC -/T GAAAACAGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 304428 CASAVA_Build 2 142517000 4I GATTTAAATT ----/GATA GATACATTTA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 GATA 1 2 304429 CASAVA_Build 2 142518831 2I AACATGAAAA --/TG TTAACGGTTA 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 TG 0 1 304430 CASAVA_Build 2 142519182 2D CCCAAGGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 2228 het 2228 ref 27 15 8 8 A 14 12 304431 CASAVA_Build 2 142522105 2D ACTATTCTAC TA/-- TATCATAAGT 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 TA 2 1 304432 CASAVA_Build 2 142525511 9D TGTTTTTTTG TTTTTTTGT/--------- TTTTTTTTTG 2659 het 2659 ref 27 12 9 6 TTTTTTTGT 1 0 304433 CASAVA_Build 2 142530342 1I ATAGGACTGG -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 A 6 7 304434 CASAVA_Build 2 142530789 5D2M1D ATTATAATCA GCTGTTGT/-----TG- TTAATTTAAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 N/A 0 0 304435 CASAVA_Build 2 142530961 2D GTTTATACTC TG/-- TTACCTTTTC 3070 het 3070 ref 40 20 18 4 TG 1 0 304436 CASAVA_Build 2 142533581 1I GTTTTTATTG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 7 8 304437 CASAVA_Build 2 142539037 1I AAAATTAAAC -/A AAAATAATAA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 A 4 5 304438 CASAVA_Build 2 142540319 4I AGTCCAGTTT ----/TTTG TTTGTTTAAC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 TTTG 1 2 304439 CASAVA_Build 2 142542314 1D ACCATAGGTG C/- TTTTACATTT 3070 het 3070 ref 48 29 15 4 C 1 0 304440 CASAVA_Build 2 142543537 5I TCCCCCACCT -----/CCACC CTGAACCATA 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 CCACC 0 1 304441 CASAVA_Build 2 142543883 3D TGCAATCATG ACT/--- ACATTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 13 13 2 ACT 1 0 304442 CASAVA_Build 2 142552918 1D GTTGTAATCT A/- GATGCTGTAG 3070 het 3070 ref 27 14 12 2 A 1 0 304443 CASAVA_Build 2 142553539 1D TTTCTTTCTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 18 18 7 T 9 8 304444 CASAVA_Build 2 142554138 1D ATGAGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 2677 het 2677 ref 29 14 9 7 A 11 10 304445 CASAVA_Build 2 142563272 3I CTGCAACTAT ---/TTA TTAAGAATCT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 TTA 1 2 304446 CASAVA_Build 2 142566380 1I AGTTTTTGGA -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 52 19 27 6 T 7 8 304447 CASAVA_Build 2 142571104 4I TGCAAAAAAA ----/AAAC AAACCCCGGT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 AAAC 1 2 304448 CASAVA_Build 2 142571459 1D ATACATGTGC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 8 7 304449 CASAVA_Build 2 142576599 2D AAATAAAAAA AT/-- AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 AT 1 0 304450 CASAVA_Build 2 142579620 2D GCTGATAAAC AT/-- ATGGTTCACA 3070 het 3070 ref 38 22 16 0 AT 2 1 304451 CASAVA_Build 2 142582464 1I ATCAATAGAT -/G GTTCAATAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 G 1 2 304452 CASAVA_Build 2 142587528 3I CAGTTGCCAC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 A 11 14 304453 CASAVA_Build 2 142589497 4D AGTCTATACC TATA/---- TATATATATT 1064 het 550 hom 8 2 5 1 TA 6 4 304454 CASAVA_Build 2 142595939 1D ATTCAGCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2166 hom 28 6 15 7 A 10 9 304455 CASAVA_Build 2 142598930 1D CCAGTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 T 11 10 304456 CASAVA_Build 2 142601107 4D ATCTAGCACC CTTT/---- CTAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 CTTT 1 0 304457 CASAVA_Build 2 142611665 1I TTTCCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1037 hom 21 4 12 5 T 11 12 304458 CASAVA_Build 2 142612607 1D TAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 12 7 T 11 10 304459 CASAVA_Build 2 142614640 2D AAAACTTACT GC/-- GTTTAATTTT 3070 het 3070 ref 32 13 13 7 GC 1 0 304460 CASAVA_Build 2 142617087 1D TAGATTTTGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 13 18 7 A 9 8 304461 CASAVA_Build 2 142626120 1D GATATAACTT C/- CCAAATGTTC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 C 3 2 304462 CASAVA_Build 2 142626658 2D TTTCTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 TC 7 6 304463 CASAVA_Build 2 142631111 3D GACAGGTCAA ATC/--- ATCATATTAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 ATC 2 1 304464 CASAVA_Build 2 142634760 1I GCCTACCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 A 10 11 304465 CASAVA_Build 2 142636103 1I ACAAAAACAA -/G GCAATGGGGA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 1 2 304466 CASAVA_Build 2 142645698 2D ATATATAAAC AT/-- ATATATATAT 1035 hom 12 het 10 0 5 5 AT 8 7 304467 CASAVA_Build 2 142647477 1I TAAATAGTTG -/T TTTTTTGACA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 6 7 304468 CASAVA_Build 2 142648703 1I ACCTTTTATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 86 het 34 0 29 5 T 9 10 304469 CASAVA_Build 2 142649455 1I GTTTTGTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 9 10 304470 CASAVA_Build 2 142649838 1I CATTCTTAGT -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 6 7 304471 CASAVA_Build 2 142650804 1I GTTTGTTGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 20 21 8 T 9 10 304472 CASAVA_Build 2 142657216 1I GTCGATTAAA -/C CTCTTTCCTT 3070 het 3070 ref 68 45 18 5 C 1 2 304473 CASAVA_Build 2 142659876 1I AGACTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 10 11 304474 CASAVA_Build 2 142668719 5I AACATCAAAT -----/AAAAC AAAGCAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 AAAAC 0 1 304475 CASAVA_Build 2 142669010 1I TTTCTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 33 4 11 18 T 13 14 304476 CASAVA_Build 2 142676587 3I TAACATTAGT ---/AGA AGAAGAAGTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AGA 2 3 304477 CASAVA_Build 2 142677786 7D GAATTATTAA CATATTT/------- CATGCCTTTT 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 CATATTT 1 0 304478 CASAVA_Build 2 142681318 1I GGAAAAAAAA -/T ATTACTTAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 1 304479 CASAVA_Build 2 142696979 1I AAAGTAGCAC -/T TAGTGTTGGA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 T 1 2 304480 CASAVA_Build 2 142702501 4D AATATATCAA TAAT/---- TAATACCAGT 3070 het 3070 ref 34 16 12 8 TAAT 2 1 304481 CASAVA_Build 2 142709035 4I CTGAAAAGTT ----/CAGA CAGTGACCAT 3070 hom 121 het 47 0 39 8 CAGA 0 1 304482 CASAVA_Build 2 142710400 1I ACTTGGCACC -/A AAAAAAAAAA 2435 het 2435 ref 42 12 12 18 A 15 16 304483 CASAVA_Build 2 142729802 1D ATGTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 706 hom 38 8 14 16 T 11 10 304484 CASAVA_Build 2 142747760 4D GATTTATTTT CTTG/---- CTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 28 18 9 3 CTTG 1 0 304485 CASAVA_Build 2 142748294 1I AACTAAGTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 22 9 8 T 8 9 304486 CASAVA_Build 2 142769061 1D GTGTTTAGTG T/- GTTCATTGCT 3070 het 3070 ref 46 23 18 6 T 1 0 304487 CASAVA_Build 2 142772319 1I ACCTGTTCAT -/A AAAAAAAAAA 2007 het 2007 ref 34 11 7 16 A 15 16 304488 CASAVA_Build 2 142805507 1I CTCAAAAGAC -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 7 8 304489 CASAVA_Build 2 142809788 1D AGACTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 30 0 17 13 A 13 12 304490 CASAVA_Build 2 142830924 1I AACCTTTCTA -/G ACATTGGCTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 0 1 304491 CASAVA_Build 2 142834987 4I GCTCCCTATA ----/TAAT TAATGTTTTA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TAAT 1 2 304492 CASAVA_Build 2 142841488 2D CAGTGTTTCC CT/-- GTCTCCTGCC 1792 het 1792 ref 15 9 4 2 CT 1 0 304493 CASAVA_Build 2 142858229 2D CCACAGACAA AC/-- TTATAGCGTC 3070 het 3070 ref 34 16 14 6 AC 1 0 304494 CASAVA_Build 2 142864420 1I GTCCTCTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 13 12 16 T 11 12 304495 CASAVA_Build 2 142886415 3I AACAAACATT ---/GCA TTTTAATTTG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 GCA 0 1 304496 CASAVA_Build 2 142916343 1I ATTTATTTAT -/A TTTTTTTTGA 2712 het 2314 hom 15 7 7 1 A 0 1 304497 CASAVA_Build 2 142917213 1D GTGCTTTTTG T/- TGCTGATTGT 3070 het 3070 hom 53 25 24 5 T 2 1 304498 CASAVA_Build 2 142922046 2D ACATGTCTAC CT/-- CTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 CT 2 1 304499 CASAVA_Build 2 142936263 1D TTATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 11 10 304500 CASAVA_Build 2 142952193 4I ACCATATCTT ----/ACTC ACCCTAAAAT 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 ACTC 0 1 304501 CASAVA_Build 2 142953727 1D GTCAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 12 11 A 13 12 304502 CASAVA_Build 2 142954655 3D AGGTATGATT TCC/--- TCTTCTACCC 3070 het 3070 ref 34 20 14 2 TCC 1 0 304503 CASAVA_Build 2 142969349 6I TGATGGCTTA ------/GCTTGG GCTCAGAGGC 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 GCTTGG 0 1 304504 CASAVA_Build 2 142996491 1D AGATTTGATC T/- TTATTTCTCA 3070 het 3070 ref 45 24 20 1 T 3 2 304505 CASAVA_Build 2 143002144 1D TCTTCTCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 19 18 4 T 10 9 304506 CASAVA_Build 2 143005588 1D TTGTGATAAG C/- CAGTAAATGT 3070 het 3070 hom 55 22 24 10 C 2 1 304507 CASAVA_Build 2 143008361 4D TTTAAGATTT AGAG/---- AGAAACGAAA 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 AG 3 1 304508 CASAVA_Build 2 143010258 1D TGCAACATTA C/- TGACTGACAT 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 C 1 0 304509 CASAVA_Build 2 143012221 1D TTATTTTTTT C/- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 C 1 0 304510 CASAVA_Build 2 143031470 3I GTAGGAAGTC ---/GTT GTTGAAACTT 3070 het 3070 hom 57 19 28 10 GTT 1 2 304511 CASAVA_Build 2 143041570 1D CATCAAGCTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 13 23 1 T 8 7 304512 CASAVA_Build 2 143042761 1I TTTAGGTATC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 7 8 304513 CASAVA_Build 2 143043032 1I TTTAATATAC -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 25 8 16 1 T 6 7 304514 CASAVA_Build 2 143050426 3D CTCAACAGTC ATA/--- ATGTCTGTTG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 ATA 1 0 304515 CASAVA_Build 2 143053436 2D AGTTTGATAT AC/-- CATTTGAGAA 3070 het 3070 ref 55 27 22 6 AC 1 0 304516 CASAVA_Build 2 143053779 1I CTAAAGAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 A 9 10 304517 CASAVA_Build 2 143054843 2I TCCCTTTCCT --/TC TATAAGAGCC 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 TC 0 1 304518 CASAVA_Build 2 143057359 4D GATGGCTAAG TTAA/---- TTGTTTCCTT 3070 het 3070 ref 33 18 15 2 TTAA 1 0 304519 CASAVA_Build 2 143067985 3D GGATTAATGA TAT/--- TATCATGGGA 3070 het 3070 ref 51 28 17 8 TAT 2 1 304520 CASAVA_Build 2 143068406 1D ATGAAGGCTT A/- ACGTTCTTAC 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 A 2 1 304521 CASAVA_Build 2 143070024 1D TTAGCTTTTC A/- AAAATATACA 3070 het 3070 hom 57 23 28 7 A 5 4 304522 CASAVA_Build 2 143070459 1I TACATACTGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 8 9 304523 CASAVA_Build 2 143072734 1D AAAACAAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1959 hom 45 8 28 9 T 10 9 304524 CASAVA_Build 2 143072758 1D CCAGTACCTA T/- TTTGTTATAG 3070 het 2241 hom 43 7 23 13 T 4 3 304525 CASAVA_Build 2 143077342 1I AGTTGTATTA -/T TTTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 5 6 304526 CASAVA_Build 2 143078418 7D ACATAGAATC TTAGAGT/------- TATAGGATAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 5 TTAGAGT 1 0 304527 CASAVA_Build 2 143078935 4I TTGTAAAAGC ----/TATT TATTTCCATT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TATT 1 2 304528 CASAVA_Build 2 143081726 1D TCTATATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 11 10 304529 CASAVA_Build 2 143088134 1D ACTTGAAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 9 8 304530 CASAVA_Build 2 143088484 3D AGTATATAAT AAC/--- AAGACAGTAG 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 AAC 1 0 304531 CASAVA_Build 2 143088937 5I AAAGTTAGAA -----/TAAAC TAAGTTAATG 3070 hom 45 het 22 0 16 6 TAAAC 0 1 304532 CASAVA_Build 2 143089150 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTGAGAC 2190 het 2190 ref 19 7 5 7 T 6 5 304533 CASAVA_Build 2 143090364 1D AAGGGGGATT C/- CCCCACACAG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 C 5 4 304534 CASAVA_Build 2 143091516 2I GGTCACCCAC --/AA AGAGAAGCCC 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 A 1 3 304535 CASAVA_Build 2 143095462 1D TTCTCAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 10 9 304536 CASAVA_Build 2 143097623 1I AGAAAATATA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 T 6 7 304537 CASAVA_Build 2 143105267 3I GCCTCACAAT ---/AAG AAGAAGAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 AAG 2 3 304538 CASAVA_Build 2 143105726 1D52M3I TTGTGTCTGA TTTTTTCATTCGGCTTTCTTGTGATTTTCTGTATCTCTTTTTGTGCAAAGCTC---/-TTTTTCATTTGGCTTTCTTGTGATTTTCTGTATCTCTTTTTGTGCAAAGCTCCTT CTGTCTTTAT 3070 het 3070 ref 30 28 12 8 N/A 0 0 304539 CASAVA_Build 2 143106578 1D CATTTTTAAA T/- TGGCAAAACT 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 T 2 1 304540 CASAVA_Build 2 143107529 1I TTATGTGGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 9 10 304541 CASAVA_Build 2 143124633 1I GAGGATCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 32 0 21 11 T 12 13 304542 CASAVA_Build 2 143128296 1I ATTCCTCCAG -/C TTTGTCCTTT 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 C 0 1 304543 CASAVA_Build 2 143174021 1D AATGCTAAGC A/- AAAAAAAACA 3070 het 16 hom 24 2 21 1 A 9 8 304544 CASAVA_Build 2 143183751 1I ATATATTTTC -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 40 18 18 5 T 6 7 304545 CASAVA_Build 2 143210987 3D TTATCAACAG AAT/--- AATGTTATTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 9 AAT 2 1 304546 CASAVA_Build 2 143223662 1D TTTCTATTGC T/- TTTTTTTTTA 1252 het 1252 ref 30 23 3 4 T 10 9 304547 CASAVA_Build 2 143240992 1I CCAAGAGGAT -/A AATATTAAGC 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 A 2 3 304548 CASAVA_Build 2 143264573 1D AACAAAAAAA G/- AAAACTTCAG 3070 het 3070 ref 34 17 9 9 G 1 0 304549 CASAVA_Build 2 143270461 2I GAGCTTGGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 30 0 21 9 A 10 12 304550 CASAVA_Build 2 143271143 2D ATTTTTCCAC AT/-- GTTTGTCACC 3070 hom 111 het 43 0 38 6 AT 1 0 304551 CASAVA_Build 2 143277447 5D AATCACAATC TGTTT/----- ACACATTCAC 3070 hom 90 het 35 0 31 6 TGTTT 1 0 304552 CASAVA_Build 2 143280300 1D ATAATAGTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 101 hom 11 1 9 2 T 10 9 304553 CASAVA_Build 2 143296397 1I TTAGAGACTG -/T TAATATCATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 1 2 304554 CASAVA_Build 2 143301134 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 20 3 A 13 12 304555 CASAVA_Build 2 143304061 4I GCTCTCTGCT ----/TGTC TGTCTGTTGT 3070 het 3070 hom 20 7 12 1 TGTC 1 2 304556 CASAVA_Build 2 143309249 4I AGATAGATAC ----/ATAG ATAGATGATT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 ATAG 1 2 304557 CASAVA_Build 2 143309291 24D AGATAGGTAA ATAGATAGATAGGTAGATAGATAG/------------------------ ATAGATAGAT 3070 hom 69 het 32 0 24 13 ATAGATAGATAGGTAGATAGATAG 1 0 304558 CASAVA_Build 2 143349032 1D GATCTTAATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 9 8 304559 CASAVA_Build 2 143360628 3D AGAAGAAAAA TCT/--- TCTAGGTCAT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 TCT 2 1 304560 CASAVA_Build 2 143363604 1D AGGCCCTCTC A/- AATCTCCTTC 3070 het 3070 ref 41 28 9 4 A 3 2 304561 CASAVA_Build 2 143365959 1D ACATTGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 8 8 T 12 11 304562 CASAVA_Build 2 143372510 1D AGTTCAAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 10 9 304563 CASAVA_Build 2 143373697 1I CTAGGAGGCT -/G GTCCAGGGGC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 G 1 2 304564 CASAVA_Build 2 143377591 1I CAGATCTGGA -/G GACAGTTGTC 3070 hom 36 het 13 0 12 1 G 1 2 304565 CASAVA_Build 2 143382535 1I GGTTGTGGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 8 9 304566 CASAVA_Build 2 143391505 1D ACCTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 13 12 304567 CASAVA_Build 2 143400318 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 A 10 9 304568 CASAVA_Build 2 143401498 5D AAAAGAAAAT AAAAG/----- AAATTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 18 3 AAAAG 1 0 304569 CASAVA_Build 2 143411528 1D ACACACTGTT A/- AAAAAAAAAA 1207 het 1207 ref 37 31 3 3 A 11 10 304570 CASAVA_Build 2 143412857 1D ACCTATTAAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 2611 hom 28 6 15 7 T 8 7 304571 CASAVA_Build 2 143433006 5D ATTAATGACA TTCTT/----- TTCTTTATAT 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 TTCTT 2 1 304572 CASAVA_Build 2 143435790 1I TATTTATTTG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 8 9 304573 CASAVA_Build 2 143441017 1I CACTAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2534 hom 25 8 17 0 A 11 12 304574 CASAVA_Build 2 143454369 3I ATTTGGCCAG ---/CTT CTTTACTCAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CTT 1 2 304575 CASAVA_Build 2 143457144 17D10M21D GTAGGACTTG GCTGGAGGGGTTCTGCAAGTCTCAGCTGAGCTCATTCATGTTTCTGTG/-----------------ATGCTCACCT--------------------- GCAAACTGCA 3070 het 3070 ref 46 37 22 10 N/A 0 0 304576 CASAVA_Build 2 143470684 1I CAGTAACTGT -/G GGGTAGCCCT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 G 3 4 304577 CASAVA_Build 2 143474693 1D GAAGCTGGCA T/- ATCTCTAACT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 1 0 304578 CASAVA_Build 2 143477462 5D AAATCATAAT AATAA/----- AATAAAATAG 3070 het 2069 hom 26 6 18 7 AATAA 2 1 304579 CASAVA_Build 2 143484835 4D AACCTGAGAA AAAC/---- AAGCAATGGG 1371 hom 7 het 3 0 3 0 AAAC 1 0 304580 CASAVA_Build 2 143486103 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1494 hom 14 het 8 0 5 3 A 15 14 304581 CASAVA_Build 2 143499669 1I CTTTAGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 11 9 2 T 10 11 304582 CASAVA_Build 2 143500778 7D TAGCTCTGCT GTCCGCA/------- GTCCGCAGTC 3070 het 3070 hom 32 11 13 10 GTCCGCA 4 3 304583 CASAVA_Build 2 143504833 3D AGCTGAAAAT ATC/--- ATAAGTAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 ATC 1 0 304584 CASAVA_Build 2 143511060 1D TTAATATGGC T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 T 7 6 304585 CASAVA_Build 2 143521977 14I AGCTCACTGC --------------/AACCTCTGCCTCCT GGGTTCAAGC 3070 hom 51 het 17 0 17 2 AACCTCTGCCTCCT 0 1 304586 CASAVA_Build 2 143541552 4D ATTAGAAAAA TACT/---- TAGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 24 7 TACT 1 0 304587 CASAVA_Build 2 143554468 1D CACATCCTCA C/- TTCCCATCTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 7 C 1 0 304588 CASAVA_Build 2 143555004 3D AATAAGTTAC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 TAT 5 4 304589 CASAVA_Build 2 143557841 1I TTTTTTTTTT -/C CAGTTTCTGG 1729 het 1729 ref 27 8 6 13 C 1 2 304590 CASAVA_Build 2 143592876 1D CATATTATTG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 8 7 304591 CASAVA_Build 2 143608841 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 1115 hom 15 3 10 3 T 9 8 304592 CASAVA_Build 2 143617466 1D CAGTTTAAGT A/- ATGTGAACTG 3070 het 3070 hom 41 13 26 2 A 2 1 304593 CASAVA_Build 2 143630074 1D ATGAATTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 11 10 304594 CASAVA_Build 2 143658892 2I TTCTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2238 het 1626 hom 21 6 8 7 T 11 13 304595 CASAVA_Build 2 143668749 4I CTGAGAAAAC ----/TGTT AGAGAGAAAC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TGTT 0 1 304596 CASAVA_Build 2 143676803 1D ATGTTGATAG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 8 7 304597 CASAVA_Build 2 143713233 1D AAAATGGAAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 48 14 27 9 A 8 7 304598 CASAVA_Build 2 143728648 1D CAAGGAGATA C/- CCCCTTATTA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 C 5 4 304599 CASAVA_Build 2 143728907 1D CACTCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 36 0 26 10 A 12 11 304600 CASAVA_Build 2 143740269 11D ATAAATTTTC TCACTTCATAT/----------- AAAATGCCCT 3070 het 3070 ref 35 22 14 2 TCACTTCATAT 1 0 304601 CASAVA_Build 2 143764611 1D TTTAGAAAAC T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 T 8 7 304602 CASAVA_Build 2 143765492 3I TTTGTGTGTG ---/TTC TTCTAATGCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TTC 1 2 304603 CASAVA_Build 2 143766157 1I CTTTTCTGTA -/C TATAAGCACA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 0 1 304604 CASAVA_Build 2 143769471 2I TGTTGAGGAG --/AA AAGAGACCCT 3070 het 3070 ref 50 21 23 6 A 2 4 304605 CASAVA_Build 2 143784632 1D AATGAATTTA T/- TTTTGCAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 5 4 304606 CASAVA_Build 2 143787996 1I AGGAGAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 30 1 23 6 T 11 12 304607 CASAVA_Build 2 143794042 1I CTTATCTACA -/T TTTTTTCAGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 7 304608 CASAVA_Build 2 143796119 4D TTTTAAAATT TCTC/---- TCTCCTGCAC 3070 hom 117 het 44 0 38 6 TC 4 2 304609 CASAVA_Build 2 143810620 1D TTAAAAAAAA G/- TGCAGTGATA 3070 hom 91 het 38 0 31 7 G 1 0 304610 CASAVA_Build 2 143811282 2D CTGGAGAGAA AG/-- AGCAGAAGAA 3070 hom 105 het 41 0 35 8 AG 2 1 304611 CASAVA_Build 2 143814567 2I ATTTTTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 11 13 304612 CASAVA_Build 2 143819292 3I TATGAAATCA ---/GAG AAGAGCTACA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 GAG 0 1 304613 CASAVA_Build 2 143821854 1D GACTTCGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 822 hom 35 5 13 17 T 17 16 304614 CASAVA_Build 2 143828071 3D TCCCTTGCAT TGG/--- TGGCCTCAGT 3070 hom 105 het 43 0 36 9 TGG 2 1 304615 CASAVA_Build 2 143837287 2D TCTTCTGTCT AG/-- AAAACTCTTG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 AG 1 0 304616 CASAVA_Build 2 143844563 2I CTATTGTATC --/AA AAGTCATACT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 2 4 304617 CASAVA_Build 2 143847103 4I ACAGATAAAG ----/AGAA AGAAAATAGC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 AGAA 1 2 304618 CASAVA_Build 2 143855499 1D CAAAAGATTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 105 het 42 0 35 8 A 9 8 304619 CASAVA_Build 2 143858605 1D TTTTAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 515 hom 33 2 22 10 A 15 14 304620 CASAVA_Build 2 143872816 1I AAAATCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 25 1 15 9 T 11 12 304621 CASAVA_Build 2 143873398 1D GCACTGAGGC A/- AAAAAATAAA 3070 het 2787 hom 26 9 12 5 A 7 6 304622 CASAVA_Build 2 143885284 4I GAAAGGGTAC ----/ATTA ATTAAGATAC 3070 hom 87 het 30 0 30 0 ATTA 1 2 304623 CASAVA_Build 2 143885467 4D TTTTCTATCA AAAC/---- AAACAAAGTT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 AAAC 2 1 304624 CASAVA_Build 2 143886412 4I AAATGTATTG ----/ATAA ATATATATAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 ATAA 0 1 304625 CASAVA_Build 2 143886784 1D GTTCTCAGCC A/- TTAGGTTTAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 1 0 304626 CASAVA_Build 2 143890538 2I TGGTCTCCCC --/CT GTTGTTCTTT 3070 hom 94 het 38 0 31 7 CT 0 1 304627 CASAVA_Build 2 143893190 1I AAATTCTAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 9 10 304628 CASAVA_Build 2 143893501 21I GGGTTTATTT ---------------------/ATCATGACAAAATGTGGAAAC AACTAAATTG 3070 hom 87 het 27 0 30 2 ATCATGACAAAATGTGGAAAC 0 1 304629 CASAVA_Build 2 143895822 20D TATATATATA TATATATATATATATATATG/-------------------- TGTGTGTTTC 3070 het 58 hom 26 3 18 14 TATATATATATATATATATG 1 0 304630 CASAVA_Build 2 143897397 1D CTACATTTCA T/- AAGCCTTTCA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 1 0 304631 CASAVA_Build 2 143899802 2I ATAGTTAGTT --/TA TCATTCCTAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TA 0 1 304632 CASAVA_Build 2 143901077 1I AAAGTGAGGT -/A AAAGTATGTG 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 3 4 304633 CASAVA_Build 2 143913573 1I CTTTGAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 9 10 304634 CASAVA_Build 2 143917468 1D GGGTCACTCA C/- CCTTTTTTTT 3070 hom 74 het 30 0 23 7 C 3 2 304635 CASAVA_Build 2 143926697 1D CCCCTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 2019 het 2019 ref 32 13 10 9 T 17 16 304636 CASAVA_Build 2 143927839 1D ATCCAATCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 11 10 A 13 12 304637 CASAVA_Build 2 143930661 1I CTTCAAGACA -/T GTTATATGTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 0 1 304638 CASAVA_Build 2 143930881 2I TTTGAAAGAC --/AG AGATTTGTGC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AG 1 2 304639 CASAVA_Build 2 143939746 3I AGCAAGAAAA ---/AAT ATAAGTTTTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAT 0 1 304640 CASAVA_Build 2 143941373 1I TACCTTGTCT -/G GAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 G 1 2 304641 CASAVA_Build 2 143944199 1I CTTAAAAAAA -/C ATTTAACTTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 0 1 304642 CASAVA_Build 2 143944332 1D AAGGTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 944 het 944 ref 41 28 3 10 A 15 14 304643 CASAVA_Build 2 143944837 2D ACAGGTTGGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 44 13 24 8 AT 7 6 304644 CASAVA_Build 2 143945003 2I GTGTATCATA --/TG TGTGTGTACA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 TG 3 4 304645 CASAVA_Build 2 143952746 6D TAGTCATTAT TATAAA/------ TATGACATTA 3070 het 3070 hom 42 15 26 3 TATAAA 1 0 304646 CASAVA_Build 2 143953914 1D CCTGTGACGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 11 10 304647 CASAVA_Build 2 143966644 1D ACAAAAAGTG A/- AAAAAAGTTA 3070 hom 69 het 26 0 21 5 A 7 6 304648 CASAVA_Build 2 143967097 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 2122 hom 27 7 14 6 A 9 11 304649 CASAVA_Build 2 143980500 3I CTTCAGATTA ---/ATT ATAGTAAGTT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 ATT 0 1 304650 CASAVA_Build 2 143980921 1I ATTAGGGTAT -/A TTTCCTTAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 0 1 304651 CASAVA_Build 2 143982070 1D TATCATGTCA C/- CCCCCCCTCC 3070 het 3070 ref 38 14 11 13 C 8 7 304652 CASAVA_Build 2 143982771 2D TCATGCGCAC AG/-- TGTCCCATTT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 AG 1 0 304653 CASAVA_Build 2 143989155 1D TGGTCTTCGT A/- ACATCTTTCC 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 A 2 1 304654 CASAVA_Build 2 143998253 1D AGCTGTTATA T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 7 304655 CASAVA_Build 2 143999502 1D TATGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 11 10 304656 CASAVA_Build 2 144004670 1D CCCCCTAGGT A/- ATCTTTCACC 3070 hom 151 het 54 0 50 5 A 2 1 304657 CASAVA_Build 2 144005167 16I GTGTGTGCGC ----------------/GTGCGTGTGTGTGCGT GCATGTGTGT 3070 hom 86 het 33 0 28 5 GTGCGTGTGTGTGCGT 0 1 304658 CASAVA_Build 2 144008591 1D GAATGCCATG A/- AATATTCACG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 3 2 304659 CASAVA_Build 2 144019549 1D AATAATGTTA T/- TTTTTAAGTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 5 304660 CASAVA_Build 2 144021608 1D CTCCAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 28 3 A 12 11 304661 CASAVA_Build 2 144031828 1D GCTCTAAAAG A/- AGTCTATTAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 2 1 304662 CASAVA_Build 2 144035555 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2456 het 300 hom 19 2 7 10 T 14 13 304663 CASAVA_Build 2 144043211 1I TAATTTAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 9 10 304664 CASAVA_Build 2 144047502 4D ATTTAATAAT AAAG/---- AAAATGCCGA 3070 het 3070 hom 39 16 21 4 AAAG 1 0 304665 CASAVA_Build 2 144052323 1I CATTGAAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 A 8 9 304666 CASAVA_Build 2 144055287 1I AGAAGCTGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 60 hom 39 1 34 4 T 8 9 304667 CASAVA_Build 2 144057569 1D AGACAAAAAT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 G 8 7 304668 CASAVA_Build 2 144060803 1D CCCTTCTTCC T/- TTTTACTTGG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 5 4 304669 CASAVA_Build 2 144065977 2D ATTTTTATAA CT/-- CTATTTTGAG 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 CT 2 1 304670 CASAVA_Build 2 144072125 1D TTGAGGGTTG T/- TTCCAACAAT 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 T 3 2 304671 CASAVA_Build 2 144076692 4I AAGAAGGAAA ----/GAAG GAAGGAAGGG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 GAAG 2 3 304672 CASAVA_Build 2 144087194 4D AAAAGGATCT TAAG/---- TAAGTAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 8 TAAG 2 1 304673 CASAVA_Build 2 144093038 1D CTTTTTGTTA T/- TTTTTTTTTT 2805 het 458 hom 19 3 10 6 T 11 10 304674 CASAVA_Build 2 144105901 6D CTTCACGTGG ACTAAT/------ ACTATTTTCT 3070 het 3070 ref 32 19 9 8 ACTAAT 1 0 304675 CASAVA_Build 2 144111144 1D AACTTTGTTG C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 C 8 7 304676 CASAVA_Build 2 144117467 2D CCTCCACCCA CC/-- CCCCCCCACC 3070 het 1918 hom 33 8 17 9 C 9 7 304677 CASAVA_Build 2 144121399 1D CCAAGTAGTT A/- AAAAAAAAAA 2371 het 2371 ref 42 14 10 18 A 17 16 304678 CASAVA_Build 2 144126935 1I GCTGGATACA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 58 30 22 6 T 8 9 304679 CASAVA_Build 2 144153181 1D CACAAAGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 14 11 A 12 11 304680 CASAVA_Build 2 144156342 1D AATAAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 11 10 304681 CASAVA_Build 2 144157474 1I TCTGCTTTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 9 10 304682 CASAVA_Build 2 144158113 4I TGCACACATT ----/TATC TATCTCCTAA 3070 hom 138 het 50 0 46 4 TATC 1 2 304683 CASAVA_Build 2 144160310 21I CTGGGTGGAG ---------------------/TGGCACACGTCTGTAATCCCA GCTATTCAGG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TGGCACACGTCTGTAATCCCA 0 1 304684 CASAVA_Build 2 144183651 17D CATTGAAAGT AGAAACTGTTGAGCCCC/----------------- AGAAACTGTT 3070 hom 81 het 29 0 28 3 AGAAACTGTTGAGCCCC 1 0 304685 CASAVA_Build 2 144184194 5D TTTTACTCTC TCTTT/----- TCTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 7 TCTTT 2 1 304686 CASAVA_Build 2 144200464 1D AAAAACAACC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 10 9 304687 CASAVA_Build 2 144203944 1I AGTTTAGGGA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 6 7 304688 CASAVA_Build 2 144212298 1I GGAAGTTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 4 het 33 1 27 5 T 9 10 304689 CASAVA_Build 2 144216223 1I ACACTAATTA -/T TAGCAGATCT 3070 het 3070 ref 53 29 20 4 T 1 2 304690 CASAVA_Build 2 144229314 1D CAGCATATAT G/- GGGGGGGGGG 2990 het 1377 hom 20 5 9 6 G 11 10 304691 CASAVA_Build 2 144258504 5I AGTCCCCAAT -----/CAGCC CTGAAAGAGA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 CAGCC 0 1 304692 CASAVA_Build 2 144270507 1I TAAATTACTC -/A GTCTCAGGTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 0 1 304693 CASAVA_Build 2 144277753 1D TTGTGTCCTT C/- CCCTTGCCTT 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 C 4 3 304694 CASAVA_Build 2 144299372 29D GTGCTATGGG CTTTCCTCTTCTTCCTTAATACAGATTTC/----------------------------- CTTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 36 23 17 9 CTTTCCTCTTCTTCCTTAATACAGATTTC 1 0 304695 CASAVA_Build 2 144301437 1I AAAAATCTGC -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 6 7 304696 CASAVA_Build 2 144319581 1I ATAGTTGAAG -/A AAAAAAAAAA 974 het 974 ref 52 40 3 9 A 11 12 304697 CASAVA_Build 2 144322720 1D CAAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 T 1 0 304698 CASAVA_Build 2 144322874 3D CTGTCTCTAA AAC/--- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 AAC 1 0 304699 CASAVA_Build 2 144341628 1I AAATGGAAGT -/A AACAGTGAAG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 A 2 3 304700 CASAVA_Build 2 144345199 1D GTGCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 12 11 304701 CASAVA_Build 2 144364106 6I GGCAAGTCAT ------/AATAAC AATAAAAATA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AATAAC 0 1 304702 CASAVA_Build 2 144366611 1I TGGTGATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 A 10 11 304703 CASAVA_Build 2 144369507 1D TCTCAAATTT A/- AAAAAAAAAA 1446 het 1446 ref 39 26 5 8 A 15 14 304704 CASAVA_Build 2 144371404 12D TCTTAAATAT AATAAATAAATA/------------ AATAAATAAA 3070 het 2746 hom 15 6 10 2 AATA 6 3 304705 CASAVA_Build 2 144378440 1D CTGCTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 13 12 A 12 11 304706 CASAVA_Build 2 144388497 1I CTCCCAACGA -/T TTTTTTTTTT 3006 het 3006 ref 37 23 10 4 T 11 12 304707 CASAVA_Build 2 144389079 1D CCGCTCAGCA T/- TTTTTGGCCT 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 T 6 5 304708 CASAVA_Build 2 144389244 1I TGAGGCTGAA -/G GCCTCCTTGG 3070 hom 138 het 51 0 45 6 G 1 2 304709 CASAVA_Build 2 144397424 1I CACTGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 11 12 304710 CASAVA_Build 2 144552052 1I AAATTATTTA -/G ATGTTTATTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 G 0 1 304711 CASAVA_Build 2 144651126 1I CAGCACCAAA -/G GGGGAAATCC 3070 hom 53 het 25 0 18 7 G 4 5 304712 CASAVA_Build 2 144759163 1D AAAACAAAGG A/- AAAAAAAAAG 881 het 881 ref 31 24 3 4 A 10 9 304713 CASAVA_Build 2 144784084 1I CAAAATATAC -/A GTAAGTTCAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 0 1 304714 CASAVA_Build 2 144787018 1D GTGTGAAAAT G/- GGACTATGAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 3 2 304715 CASAVA_Build 2 144822913 1D CAGACCAAGG A/- AAAAAAAAAA 1242 het 1242 ref 29 19 3 7 A 13 12 304716 CASAVA_Build 2 144851934 1I ATTCAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 645 hom 44 2 35 7 A 11 12 304717 CASAVA_Build 2 144885217 2D TGTATATAAC AT/-- AAATTATGTA 1778 het 1103 hom 19 4 4 11 AT 1 0 304718 CASAVA_Build 2 144930155 1D TGTTCCATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 T 12 11 304719 CASAVA_Build 2 144942713 1D ACAGTACAAC A/- GGGGGTGAGG 3070 hom 123 het 45 0 41 8 A 1 0 304720 CASAVA_Build 2 144945829 1D ATCACTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 T 12 11 304721 CASAVA_Build 2 144946884 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAGATT 3070 hom 131 het 48 0 43 6 A 7 6 304722 CASAVA_Build 2 144956789 1I CTGATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 30 1 27 2 T 10 11 304723 CASAVA_Build 2 144978132 4D AAAAAAAAAA CAAC/---- AAAAAAAACA 1021 hom 24 het 31 0 13 18 CAAC 1 0 304724 CASAVA_Build 2 144990474 1I CAAACTCTCA -/C CCCCCCCCTT 1993 hom 28 het 14 0 7 7 C 8 9 304725 CASAVA_Build 2 144990646 1I GGCCTGGGGG -/C CAGAGCCTGC 3070 hom 49 het 18 0 14 4 C 1 2 304726 CASAVA_Build 2 145001685 1I TAAGGGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 31 1 25 5 T 10 11 304727 CASAVA_Build 2 145002607 1I CCCATGTGAA -/C ATTATTTTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 1 304728 CASAVA_Build 2 145019676 1D TTGTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 30 1 26 3 T 12 11 304729 CASAVA_Build 2 145029549 1D TTGCAGAAGC A/- CATAAATAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 6 A 1 0 304730 CASAVA_Build 2 145053664 1D GTAGCTCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 11 10 304731 CASAVA_Build 2 145063854 1D CGATTCTCTT G/- CCTCTGCCTC 3070 het 2870 hom 23 9 11 3 G 1 0 304732 CASAVA_Build 2 145067169 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 507 hom 24 2 14 9 T 15 14 304733 CASAVA_Build 2 145069386 1D CCATACTGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 147 het 66 0 49 17 T 10 9 304734 CASAVA_Build 2 145076239 4I TAGAGATAAA ----/CGTG CCGCTGGAAG 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 CGTG 0 1 304735 CASAVA_Build 2 145084114 1D TGGGCCAGTT A/- ACTTGATGTA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 2 1 304736 CASAVA_Build 2 145086411 1D ATGCATTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 42 1 34 7 A 11 10 304737 CASAVA_Build 2 145088646 1I GCTATAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 12 13 304738 CASAVA_Build 2 145114473 1I GTCTGGATTA -/G AACCTGCAAT 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 G 0 1 304739 CASAVA_Build 2 145115047 1D GGGTGTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 17 11 A 13 12 304740 CASAVA_Build 2 145115203 3I AAGAGTAGAG ---/AGA AGATTTTGAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AGA 1 2 304741 CASAVA_Build 2 145116047 18I ACTATTATTA ------------------/TTTGCTGTGTACATATGG TTTAGTTAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TTTGCTGTGTACATATGG 0 1 304742 CASAVA_Build 2 145124828 1D GCTATTTATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 9 8 304743 CASAVA_Build 2 145126740 1I CATGCCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 16 12 T 12 13 304744 CASAVA_Build 2 145127950 1D TGTTCTTTAT A/- AAATACACAT 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 A 4 3 304745 CASAVA_Build 2 145133408 1I GCAATAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 803 hom 46 3 35 8 A 12 13 304746 CASAVA_Build 2 145137073 41D TCTACTTCTG TTTATGAAGATGCAAAGTCACATGGCAAATTATCAATATTT/----------------------------------------- TTTATGAAGA 3070 hom 63 het 30 0 22 15 TTTATGAAGATGCAAAGTCACATGGCAAATTATCAATATTT 1 0 304747 CASAVA_Build 2 145138311 1D GACCAGTAAT G/- TGTTAACACA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 G 1 0 304748 CASAVA_Build 2 145141058 1D GAGAAGTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 3 A 11 10 304749 CASAVA_Build 2 145142491 1I AAATAGCCGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 681 hom 34 3 23 8 T 13 14 304750 CASAVA_Build 2 145144654 1I AGACATATAT -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 0 1 304751 CASAVA_Build 2 145172937 3I TCAACAGGAC ---/TTA TTGATGGCAT 3070 het 3070 hom 56 22 24 10 TTA 0 1 304752 CASAVA_Build 2 145177356 1I TGTTCAAAAC -/T TTTTTGTCCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 5 6 304753 CASAVA_Build 2 145182031 1D CCATGTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3045 het 3045 ref 34 15 11 8 T 16 15 304754 CASAVA_Build 2 145185634 1I TTGTTGAAGT -/A AAAAAAAAAA 2566 het 1170 hom 21 4 8 9 A 14 15 304755 CASAVA_Build 2 145186592 2I CCACCCCCCC --/CG CCAACCCCTG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 CG 0 1 304756 CASAVA_Build 2 145188591 1I ACTAACCTAC -/T GTTTGAGAGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 0 1 304757 CASAVA_Build 2 145189210 4I GGTAAAAAAT ----/GGAC GGTGAAAATA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 GGAC 0 1 304758 CASAVA_Build 2 145200746 2I ATATATATAC --/TA TATATATATA 2134 het 1133 hom 11 3 5 3 TA 6 7 304759 CASAVA_Build 2 145202633 2D AAGGGGTAAC AA/-- GAGAACAGAA 1326 het 1326 ref 24 15 4 6 A 2 0 304760 CASAVA_Build 2 145206603 1D TTCTTCCATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 A 10 9 304761 CASAVA_Build 2 145223369 1I TGTAGTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 16 18 12 A 11 12 304762 CASAVA_Build 2 145226937 1I CAACAAGATA -/C GCAATTACAT 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 C 0 1 304763 CASAVA_Build 2 145235978 6I TGAATTAAGG ------/ACTTAA ACTTAAGACC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 ACTTAA 1 2 304764 CASAVA_Build 2 145246882 1D GTTATGTACT A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 7 6 304765 CASAVA_Build 2 145248322 1D TGAAAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 11 10 304766 CASAVA_Build 2 145257535 1I TAATACAAAA -/C TGTTGAAACC 3070 het 3070 hom 50 18 26 6 C 0 1 304767 CASAVA_Build 2 145265534 1I GGTTCATGGT -/G CCCCACGACA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 G 0 1 304768 CASAVA_Build 2 145268270 4D ATTCTCTTGG TTCT/---- TTGTCTTCCA 3070 het 3070 ref 49 25 15 13 TTCT 1 0 304769 CASAVA_Build 2 145269544 1D TAAAATGATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 A 10 9 304770 CASAVA_Build 2 145276648 1D TAAAATGACA T/- TTTTTATCAT 3070 het 3070 hom 67 27 36 4 T 6 5 304771 CASAVA_Build 2 145277425 2D TGGAAGTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 A 14 12 304772 CASAVA_Build 2 145295231 1I GCAGTTATAT -/A AAAATGGTGC 3070 het 364 hom 39 1 34 4 A 4 5 304773 CASAVA_Build 2 145299701 1D AATGGACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 22 21 6 A 10 9 304774 CASAVA_Build 2 145304263 1I ATTGGATGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 T 9 10 304775 CASAVA_Build 2 145305022 5I TACAGAAGAG -----/CATAC CATATTAGGA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 CATAC 0 1 304776 CASAVA_Build 2 145308024 2D AAGTATTTAA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 207 hom 33 2 16 19 T 10 8 304777 CASAVA_Build 2 145313664 1D TTTCAGGAAT A/- AAAAAGATAA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 6 5 304778 CASAVA_Build 2 145318915 1I AATACCACTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 9 10 304779 CASAVA_Build 2 145323073 3D AGGAACAATT AAG/--- AAGATTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 8 AAG 2 1 304780 CASAVA_Build 2 145345499 1I GACGTGAAGT -/C CATCCTGGTG 3070 hom 123 het 50 0 41 9 C 1 2 304781 CASAVA_Build 2 145354835 1D TTTCAAAAAA G/- AAAAAAAATG 1775 het 1775 ref 25 10 9 6 G 1 0 304782 CASAVA_Build 2 145356673 3D CTGGTCAGAG AAC/--- AACAGTGTGA 3070 het 3070 ref 57 27 25 6 AAC 2 1 304783 CASAVA_Build 2 145357538 5D CCTTGTCAGC TTGTA/----- TTACATATAG 3070 het 3070 ref 41 18 17 7 TTGTA 1 0 304784 CASAVA_Build 2 145365685 1D CCATTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2420 hom 39 12 15 12 A 17 16 304785 CASAVA_Build 2 145391009 43D GTGCCATTAC TTCAATTTTCTAGATATTTTTCTAGATATTTTTCTAGATATTT/------------------------------------------- TTCAATTTTC 3070 hom 63 het 26 0 22 7 TTCAATTTTCTAGATATTTTTCTAGATATTTTTCTAGATATTT 1 0 304786 CASAVA_Build 2 145441901 1I TTGAAAAGAT -/G GGCCCATGCC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 2 3 304787 CASAVA_Build 2 145447107 1D AAAATATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 35 0 30 6 A 13 12 304788 CASAVA_Build 2 145470817 4I TATCTCATTA ----/TTTG TTTATCAGTC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTTG 0 1 304789 CASAVA_Build 2 145476452 1I AAAGGCGTTT -/C CCGACTTACC 3070 hom 129 het 48 0 42 6 C 2 3 304790 CASAVA_Build 2 145488991 1I TTAAGAAATG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 8 9 304791 CASAVA_Build 2 145490382 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 51 het 51 ref 28 9 1 18 T 20 18 304792 CASAVA_Build 2 145493828 1D TTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 45 1 36 9 A 11 10 304793 CASAVA_Build 2 145511879 1D CAAAACATTT G/- AAAAACTACC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 G 1 0 304794 CASAVA_Build 2 145513668 1D CTCTCTTCTG T/- TGTGTCACAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 2 1 304795 CASAVA_Build 2 145517262 1I CTCTGGATTA -/G GGGGGGAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 6 7 304796 CASAVA_Build 2 145546181 3D TAGGCCTGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 25 1 15 9 T 17 14 304797 CASAVA_Build 2 145547041 1D CCATAGTTTA C/- CTAACAAATC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 2 1 304798 CASAVA_Build 2 145556622 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2304 het 1207 hom 24 6 10 8 A 17 18 304799 CASAVA_Build 2 145576676 2D ATAAGGAAAC AT/-- AGTCTTTCAA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 AT 1 0 304800 CASAVA_Build 2 145588560 4D TCATTGACTC AGAT/---- AGACAAGTAA 3070 het 3070 ref 44 26 15 4 AGAT 1 0 304801 CASAVA_Build 2 145590971 1I TTTTAGTACC -/A AAAAAAAAAA 1807 het 1807 ref 27 17 6 4 A 13 14 304802 CASAVA_Build 2 145593074 8D TCTCTCTCTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 42 0 36 8 T 18 10 304803 CASAVA_Build 2 145595009 1I ATCATTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 10 11 304804 CASAVA_Build 2 145602379 1D TGGAAAAAAA C/- ATGCAAATTA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 1 0 304805 CASAVA_Build 2 145608521 4D TAAAAGTGAC AAAG/---- AACTCAAAGT 3070 hom 120 het 42 0 41 3 AAAG 1 0 304806 CASAVA_Build 2 145621657 1I GTATCAATAG -/T TTCATTCCTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 2 3 304807 CASAVA_Build 2 145622647 4D TTTAATTGAT AGTC/---- AATAGATTTA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 AGTC 1 0 304808 CASAVA_Build 2 145625445 1D GCTTTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 41 1 35 5 T 12 11 304809 CASAVA_Build 2 145627419 1I CATCCTCTTT -/C AACTCTTTCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 0 1 304810 CASAVA_Build 2 145628055 2I TGTTGAGTAC --/TT TTTACCCAGT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 3 5 304811 CASAVA_Build 2 145637300 1I GGCCAGAGAA -/G TTTGGTAATT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 304812 CASAVA_Build 2 145669401 3D ATTAATAGTT GAA/--- GTGGCTTTTA 3070 hom 117 het 46 0 40 7 GAA 1 0 304813 CASAVA_Build 2 145670215 5I18M5I2M2I6M1D3M1D12M3I9M7D ATAATTTTAA -----AAAGATTTTTTTCTAAAT-----TA--TTTCATACATAGAACATTTTATA---AATTCTTGGCACAAAC/GCATCATAGTTTTTGTTTTACCTCCTTGTAGCTTTAAT-CAT-GTGTATTTACTAGTTATCTATTGG------- TGTTAGTTCT 3070 het 3070 ref 33 29 17 1 N/A 0 0 304814 CASAVA_Build 2 145672118 1D GCGATAATGT A/- AATCAGATTT 3070 hom 114 het 40 0 39 2 A 3 2 304815 CASAVA_Build 2 145672365 4D TATTGTAAAC TTAT/---- TTGTTAGGAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTAT 1 0 304816 CASAVA_Build 2 145675253 1D AGATTTAATT A/- AAAAAAATCC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 8 7 304817 CASAVA_Build 2 145679743 1D AAATTTCTTG C/- CCATGTACAC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 C 3 2 304818 CASAVA_Build 2 145689036 1I GTAATTTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 A 9 10 304819 CASAVA_Build 2 145692637 1I ATGTATTTAA -/G GAAAGAGTGG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 G 1 2 304820 CASAVA_Build 2 145724866 1D TGCACATGTA G/- TCCTAACTAT 3070 het 3070 hom 53 25 25 3 G 1 0 304821 CASAVA_Build 2 145768129 5D ATTTTAAAAT AAAAG/----- AAAAGGAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AAAAG 2 1 304822 CASAVA_Build 2 145780279 1I AAAGAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 T 10 11 304823 CASAVA_Build 2 145783758 1I TACCACTCAC -/T TGACTCAACC 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 1 2 304824 CASAVA_Build 2 145805039 4I AGCATGAGGG ----/CTGA CTATCTCTGC 3070 hom 144 het 56 0 49 7 CTGA 0 1 304825 CASAVA_Build 2 145806962 1D TTGTTTTCAG T/- TTTATATTTA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 T 4 3 304826 CASAVA_Build 2 145812812 3D TTAAAAAATT AAC/--- AACTCGGTAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 6 AAC 2 1 304827 CASAVA_Build 2 145839570 2I ATATATACAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 5 6 304828 CASAVA_Build 2 145887078 1I ATTATTATGC -/A AAGGAGATTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 2 3 304829 CASAVA_Build 2 145898696 1I AAAGGAGAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 8 9 304830 CASAVA_Build 2 145944826 1D TGTAGCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 41 1 25 16 T 12 11 304831 CASAVA_Build 2 145947143 1D TCAATGGATG T/- TTCTTGGTAC 3070 hom 72 het 27 0 24 4 T 3 2 304832 CASAVA_Build 2 145974838 2I TCAGAGATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AT 5 6 304833 CASAVA_Build 2 145975263 4I TCTGATACAT ----/TGAA TATTACCGCA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TGAA 0 1 304834 CASAVA_Build 2 145976464 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1642 hom 40 8 21 13 TA 10 9 304835 CASAVA_Build 2 145981253 1I AGCATAGGAT -/G TTATCAGCAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 304836 CASAVA_Build 2 146019303 1D TTTTATGGAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 7 304837 CASAVA_Build 2 146046238 2D AGACTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 4 A 14 12 304838 CASAVA_Build 2 146049532 1D GCTCTATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 373 hom 34 1 25 8 T 12 11 304839 CASAVA_Build 2 146073925 2I TCTCTAAATT --/TG TGATCTCACT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TG 1 2 304840 CASAVA_Build 2 146076647 1I TCAAATATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 50 16 16 18 T 9 10 304841 CASAVA_Build 2 146081446 4I AATTTTCATC ----/CTGA CTACTTTCAA 3070 hom 137 het 51 0 46 5 CTGA 0 1 304842 CASAVA_Build 2 146098689 1I ATTATCATCA -/T TCTATTCTGA 3070 het 3070 ref 47 27 19 1 T 1 2 304843 CASAVA_Build 2 146104721 1I AATAGATAAG -/A AAAAAAGGCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 7 304844 CASAVA_Build 2 146116422 1D ACAGATATAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 8 7 304845 CASAVA_Build 2 146131282 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 A 11 10 304846 CASAVA_Build 2 146134040 3I CATATACTGT ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 9 12 304847 CASAVA_Build 2 146137693 4D TCTTTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCAC 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 TC 6 4 304848 CASAVA_Build 2 146144136 4I AAACCGAGGC ----/TCAA TCAGTGGTCT 3070 het 3070 hom 63 28 30 5 TCAA 0 1 304849 CASAVA_Build 2 146152531 1D GAGGCTGAGG C/- ACGAGAATTG 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 C 1 0 304850 CASAVA_Build 2 146154285 4D TTCTTAAAGA ATCC/---- ATTTTCATTT 3070 het 3070 ref 59 30 26 4 ATCC 1 0 304851 CASAVA_Build 2 146161086 1I CAGGGAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 31 1 26 4 T 10 11 304852 CASAVA_Build 2 146165473 1I TTGAGTTATC -/T TTTTCCTTTA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 4 5 304853 CASAVA_Build 2 146167552 1I CAACTTTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 9 10 304854 CASAVA_Build 2 146167663 1D AATCACAGAT C/- CTTTCGTTGT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 2 1 304855 CASAVA_Build 2 146171920 1D GTGGGGGAAT G/- GGGGAGGGAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 G 5 4 304856 CASAVA_Build 2 146173364 1D TTTACACTGG C/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 C 1 0 304857 CASAVA_Build 2 146180892 2D TTTTTATGTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 22 0 18 5 T 11 9 304858 CASAVA_Build 2 146181488 1I AATTTTACTG -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 6 7 304859 CASAVA_Build 2 146181989 6I TTACTTGCAG ------/TGTCCT TGTTTGGCTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TGTCCT 0 1 304860 CASAVA_Build 2 146182616 1I TAAGGTCTTT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 9 304861 CASAVA_Build 2 146189347 12D ATGTATATAC ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 2854 hom 20 het 9 0 7 3 AT 14 8 304862 CASAVA_Build 2 146190426 4I ACATGGTAAC ----/ACTT AATTAATTTT 3070 hom 87 het 37 0 27 10 ACTT 0 1 304863 CASAVA_Build 2 146192266 17D CTCCGTCTCC AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 23 2 18 6 A 27 10 304864 CASAVA_Build 2 146199094 1I AAACAAACTT -/G GGGGGGGCAT 3070 hom 88 het 32 0 30 2 G 7 8 304865 CASAVA_Build 2 146201402 1I ATGGATAAGT -/G GACACCACCC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 1 2 304866 CASAVA_Build 2 146203739 1I CACTTCAGCG -/A AATGGAAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 2 3 304867 CASAVA_Build 2 146204758 6I TACTTTGAAA ------/ATCTTC ATCAATTAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ATCTTC 0 1 304868 CASAVA_Build 2 146208315 1I GTCCTAGAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 304869 CASAVA_Build 2 146230530 10D TATACATACC ATATATATAT/---------- ATATATATAT 3066 het 220 hom 12 1 8 4 AT 11 6 304870 CASAVA_Build 2 146236183 2D GCTTCATCTA TG/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1810 hom 40 13 14 13 TG 1 0 304871 CASAVA_Build 2 146243027 4I TTAACTTATT ----/TATC TAATAAATTC 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 TATC 0 1 304872 CASAVA_Build 2 146250422 1D CTTCTTTTGG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 A 7 6 304873 CASAVA_Build 2 146255602 1D CAATAACCCA G/- GGGCAAACTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 G 4 3 304874 CASAVA_Build 2 146256783 5I3M1D3M4D CAGGTACCAC -----TGGCAGCAGGA/GCCCATGG-AGC---- CTTGCTCACT 3070 het 2587 hom 27 11 11 5 N/A 0 0 304875 CASAVA_Build 2 146283591 1I AGATATTCTG -/C TTCCTATGCA 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 C 0 1 304876 CASAVA_Build 2 146285913 1D TTTACTTGTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 192 hom 50 1 40 9 T 9 8 304877 CASAVA_Build 2 146290039 1D AGCATATGAT G/- ATCATTTAAA 3070 het 3070 hom 60 28 29 5 G 1 0 304878 CASAVA_Build 2 146290807 1I ACTTAAGAGC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 8 9 304879 CASAVA_Build 2 146298851 1D GTCAGAAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1699 hom 23 4 14 5 A 10 9 304880 CASAVA_Build 2 146299543 3I TGATTAGACT ---/TGA TGACGTTTAT 3070 hom 85 het 32 0 29 3 TGA 1 2 304881 CASAVA_Build 2 146310976 1D AGGTTCCCTG T/- TTTTTTTTTA 1379 het 1379 ref 43 33 4 6 T 10 9 304882 CASAVA_Build 2 146344598 2I TCAATAAATA --/TT TGTTGTTATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 3 304883 CASAVA_Build 2 146345624 1I GAGTTTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 899 hom 28 2 21 5 A 11 12 304884 CASAVA_Build 2 146346831 1D AAGGGGAGTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 8 304885 CASAVA_Build 2 146352923 1I TCTGAGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 254 hom 41 2 27 12 A 14 15 304886 CASAVA_Build 2 146368977 2I GTTCACGCAC --/TA TATACCTTGC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 TA 2 3 304887 CASAVA_Build 2 146374860 1I GCAGTTCAAT -/A AAGGGAAGAG 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 A 2 3 304888 CASAVA_Build 2 146375075 1D GACTTCTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 12 11 304889 CASAVA_Build 2 146392512 1D TGGTGGCTTT C/- CCAGCTCTAA 3070 het 3070 ref 53 25 20 9 C 3 2 304890 CASAVA_Build 2 146394949 1I TGCCCTTTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 9 10 304891 CASAVA_Build 2 146438384 1I TTTAGCATCT -/C CAGAACCAGA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 C 1 2 304892 CASAVA_Build 2 146444721 1D CCTCTACATT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 9 8 304893 CASAVA_Build 2 146445201 1I AATAAACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 19 6 T 11 12 304894 CASAVA_Build 2 146453369 1D ACAAAGAAGG A/- AAAAAAATGC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 8 7 304895 CASAVA_Build 2 146456944 1D GTACACAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 T 13 12 304896 CASAVA_Build 2 146458453 1I GTTTTTCTAC -/T TGTTCTTGGC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 1 2 304897 CASAVA_Build 2 146472081 1D TAAGCTTTAT C/- AAACATTTAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 C 1 0 304898 CASAVA_Build 2 146474387 1D AGTTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 7 A 12 11 304899 CASAVA_Build 2 146479927 1I TTCTATAGAA -/T CTGGGTGACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 0 1 304900 CASAVA_Build 2 146490177 1D TACAATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 13 12 304901 CASAVA_Build 2 146502561 12D GAGAGAAAGA AAGAAAGAAAAG/------------ AAAGAAAGAA 3070 het 218 hom 12 1 11 0 AAGAAAGAAAAG 1 0 304902 CASAVA_Build 2 146515722 1D CCATTAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 12 11 304903 CASAVA_Build 2 146540963 4D TGGGTGAATG GATA/---- GATAGAGTGA 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 GATA 2 1 304904 CASAVA_Build 2 146542984 1I GGAACATCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 A 9 10 304905 CASAVA_Build 2 146547665 2D GGATTGCATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2645 hom 30 10 12 8 A 16 14 304906 CASAVA_Build 2 146547794 1D TGGAAAAGGG A/- AAAAAAAGCA 2278 het 2278 ref 32 15 7 10 A 8 7 304907 CASAVA_Build 2 146560907 1D TGTTCAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 413 hom 36 1 30 5 A 10 9 304908 CASAVA_Build 2 146582367 1I GTTATATATA -/T AAAAAAAGCA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 0 1 304909 CASAVA_Build 2 146583724 1D CCTCAGCCTT C/- TAAACTGTTG 3070 hom 48 het 19 0 15 5 C 1 0 304910 CASAVA_Build 2 146592407 1D TATGATCAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 10 9 304911 CASAVA_Build 2 146599942 1D AAACCTAAAC A/- AAACAAATGC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 4 3 304912 CASAVA_Build 2 146600960 14D TTTACTAACC AGAAAAGAGAGAGA/-------------- AGAAAAGAGA 3070 hom 144 het 50 0 49 6 AGAAAAGAGAGAGA 1 0 304913 CASAVA_Build 2 146603424 1I GTTCCAGCTG -/C CTTTCAAATT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 1 2 304914 CASAVA_Build 2 146603847 13I AAATTCAGTT -------------/TGGTTCTTTTTTA TGGTTCTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 TGGTTCTTTTTTA 1 2 304915 CASAVA_Build 2 146608625 1D CTTACACTTC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 132 het 49 0 45 5 T 8 7 304916 CASAVA_Build 2 146610510 5I TTAATTAAAC -----/AATTA AATTCAGATC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AATTA 0 1 304917 CASAVA_Build 2 146618159 1I CTGCCCTGAA -/G GGGAATTGTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 3 4 304918 CASAVA_Build 2 146628157 1D CAGAATCCTA G/- GTTTGCCCAG 3070 het 3070 ref 54 33 16 6 G 2 1 304919 CASAVA_Build 2 146630173 4D AGTCAGGTGC CTCT/---- CTCTGTCTGT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 CT 4 2 304920 CASAVA_Build 2 146630826 1I TTGGATTTTG -/C CAGATGAATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 2 304921 CASAVA_Build 2 146631349 1I AGCTTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 1443 het 1443 ref 49 26 4 19 T 11 12 304922 CASAVA_Build 2 146635115 4D AAAATACTTA TTGT/---- TTGTTATGTT 3070 hom 108 het 37 0 37 1 TTGT 2 1 304923 CASAVA_Build 2 146659465 1D CAAAAGCAGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 8 7 304924 CASAVA_Build 2 146662685 1D ACCATTCCAA T/- TTTGATTCAG 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 T 4 3 304925 CASAVA_Build 2 146664032 2I ATTAACATAT --/TA TATATATATA 1884 het 1884 ref 20 8 7 5 TA 6 7 304926 CASAVA_Build 2 146667148 2D TACAAAAAAT TA/-- GCTGGGCGTG 2968 het 1906 hom 17 6 7 4 TA 1 0 304927 CASAVA_Build 2 146668908 47D AAAAAATCAC TGGAAACAACCCAAATGTCCAGCAATAAAGTAGTAGCTTAATGAGTG/----------------------------------------------- TGGTATATTC 3070 hom 51 het 19 0 18 5 TGGAAACAACCCAAATGTCCAGCAATAAAGTAGTAGCTTAATGAGTG 1 0 304928 CASAVA_Build 2 146669565 1I ATGTTATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 12 12 11 T 15 16 304929 CASAVA_Build 2 146675740 5D TGTTAATGTT TAATA/----- TAATATCAGC 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TAATA 2 1 304930 CASAVA_Build 2 146677705 1D TTATACCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 12 11 304931 CASAVA_Build 2 146684377 1D GTTTTCTTAT A/- AAAAATGTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 5 304932 CASAVA_Build 2 146695825 2D AGAAAGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 26 1 23 3 A 15 13 304933 CASAVA_Build 2 146696046 1I CAGTAATCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 9 10 304934 CASAVA_Build 2 146718250 1D TCCTCAGGGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 9 8 304935 CASAVA_Build 2 146720352 1D TCTTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 11 10 304936 CASAVA_Build 2 146724861 1D ACCATATGTT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 A 9 8 304937 CASAVA_Build 2 146729409 1I AACATGTCCA -/G GTTCAAATTC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 G 1 2 304938 CASAVA_Build 2 146737466 4D AACCAAAGTT ATTG/---- ATTATCTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 ATTG 1 0 304939 CASAVA_Build 2 146739150 1D GATGCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 12 11 304940 CASAVA_Build 2 146744086 1D TTTTTTGGGT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 2249 hom 28 9 12 8 G 10 9 304941 CASAVA_Build 2 146764028 1I CCTGAACTGG -/T TTTTCAGGTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 4 5 304942 CASAVA_Build 2 146768039 5I TGCTATAGGC -----/AAATA AAGAATACTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 AAATA 0 1 304943 CASAVA_Build 2 146784043 1D ATAATGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2038 hom 32 6 13 13 T 12 11 304944 CASAVA_Build 2 146792632 1I TTATCACAGA -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 6 7 304945 CASAVA_Build 2 146794578 14I5M4I AATCATATTT --------------GGAAA----/TGTGCTTGATTGACTGAGATTTT GATGTGCTTA 3070 het 3070 ref 32 17 14 4 N/A 0 0 304946 CASAVA_Build 2 146811566 1I ACGGGATTAG -/A TAAGTTGAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 304947 CASAVA_Build 2 146816452 3I CTCTCCCCTC ---/CTT ATGATAAATT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 CTT 0 1 304948 CASAVA_Build 2 146818913 1D AGTATAGAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 9 8 304949 CASAVA_Build 2 146819233 1D CATGCCTGAA T/- TTTTTGATTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 6 5 304950 CASAVA_Build 2 146821035 5D AAATTTGAAG TGATA/----- TGATATATTA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 TGATA 2 1 304951 CASAVA_Build 2 146822010 12D TTAAAGAGAA AAAAATACTTTG/------------ AAAATCATGT 3070 het 3070 hom 32 17 17 4 AAAAATACTTTG 1 0 304952 CASAVA_Build 2 146822561 2I ACATATATAT --/AC ACACACACAC 1282 het 1282 ref 29 12 9 8 AC 7 8 304953 CASAVA_Build 2 146823503 1D TTAATGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3047 het 2231 hom 19 7 8 4 T 13 12 304954 CASAVA_Build 2 146828483 1D CGACATGAAC T/- TTTTTTTTTT 684 het 684 ref 17 7 4 6 T 17 16 304955 CASAVA_Build 2 146829140 1D TTAACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 541 het 541 ref 20 10 2 8 T 11 10 304956 CASAVA_Build 2 146830331 3D TCCAGACGAA AAC/--- AACAAAATCA 3070 het 3070 hom 46 20 23 7 AAC 2 1 304957 CASAVA_Build 2 146853449 1D AAAAAATTCC T/- TTGTCAATGC 3070 het 3070 ref 54 29 18 7 T 3 2 304958 CASAVA_Build 2 146876008 1D TAAAAACAAT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 7 304959 CASAVA_Build 2 146888045 2D TGTTGGCTAT CA/-- CAGTTTATGA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 CA 2 1 304960 CASAVA_Build 2 146907111 2D CTCAAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2253 het 815 hom 26 5 7 14 T 18 16 304961 CASAVA_Build 2 146925089 1D TTTCAACTAC T/- TTTTTTTTTC 1876 het 1876 ref 54 38 5 11 T 10 9 304962 CASAVA_Build 2 146928406 6I AACATAGCAT ------/ATATAA ATATATTCTA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 ATATAA 0 1 304963 CASAVA_Build 2 146937487 1D TGCTTAAGCG T/- TTTTTTTTTG 2040 het 2040 ref 48 29 5 14 T 10 9 304964 CASAVA_Build 2 146940810 1D AAGCAGGGTT A/- AAAAAAAAAA 1893 het 1126 hom 26 6 9 11 A 19 18 304965 CASAVA_Build 2 146956149 1D ATAAAATCCC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 8 7 304966 CASAVA_Build 2 146970827 5D AAGTTATTAC ATTGT/----- ATTTTTAGTT 3070 het 3070 hom 33 16 15 4 ATTGT 1 0 304967 CASAVA_Build 2 147063897 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 14 13 304968 CASAVA_Build 2 147079474 3I CTGCTACTAA ---/AAT AATATTGCAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AAT 1 2 304969 CASAVA_Build 2 147094708 4I GCATGCACTT ----/AATA AATAAATAAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 AATA 3 4 304970 CASAVA_Build 2 147121467 3I TTGTGGAAGA ---/TAG TATGGCGATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TAG 0 1 304971 CASAVA_Build 2 147125326 2I TCAAAAACTT --/TA TGAGTTTCCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 0 1 304972 CASAVA_Build 2 147132171 1I AACATATTGT -/C CTTTAGTCAA 3070 hom 105 het 44 0 35 9 C 1 2 304973 CASAVA_Build 2 147136003 2D GGAAAACACC AA/-- AGTCATCTTC 3070 hom 108 het 38 0 37 2 A 3 1 304974 CASAVA_Build 2 147136853 1D CTCAACAACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 9 8 304975 CASAVA_Build 2 147139117 4D AATCCTATAA TAAT/---- TAGTCTAACA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 TAAT 1 0 304976 CASAVA_Build 2 147156654 1I TCAATGGGGG -/A AAAAACACAG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 5 6 304977 CASAVA_Build 2 147186079 1D CTTATTACTG A/- ATGACATTAA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 2 1 304978 CASAVA_Build 2 147186721 1D AGTGTAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 767 hom 39 2 21 16 T 14 13 304979 CASAVA_Build 2 147188243 1I AAAGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 11 304980 CASAVA_Build 2 147189747 4I ACAATGAAAA ----/ATAG ATAGTTGCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 ATAG 1 2 304981 CASAVA_Build 2 147192126 1D GCCAGGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 12 11 304982 CASAVA_Build 2 147193500 4D TTGAAAACGC CAAA/---- CAAAGAATGT 3070 hom 81 het 30 0 28 4 CAAA 2 1 304983 CASAVA_Build 2 147197611 1D CTGATTCTTT A/- AAAAAAACTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 8 7 304984 CASAVA_Build 2 147199749 1D TACAGGTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 32 2 25 5 A 13 12 304985 CASAVA_Build 2 147200797 1I CATAGAATTG -/T TAACAACAGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 1 2 304986 CASAVA_Build 2 147224288 1D TTTGCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1079 hom 32 3 24 5 A 13 12 304987 CASAVA_Build 2 147229553 1I GGCTGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 977 hom 36 4 22 10 A 13 14 304988 CASAVA_Build 2 147232488 2I TTCTTCAATA --/TC TCTTAAATGT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 TC 1 2 304989 CASAVA_Build 2 147232835 1I TGTGTCCAGC -/A AAACTGCTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 3 4 304990 CASAVA_Build 2 147233787 2D ACTTTCCTTA GG/-- TTTGCTTTGC 3070 hom 108 het 40 0 37 5 G 2 0 304991 CASAVA_Build 2 147236877 1I ATAATCTTTA -/G AAACAGAGAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 0 1 304992 CASAVA_Build 2 147277206 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 23 0 19 4 A 14 13 304993 CASAVA_Build 2 147280787 2D AATTGGTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 42 0 25 17 A 16 14 304994 CASAVA_Build 2 147297488 2D ATGGAGACTG AT/-- ATGGTATGGC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 AT 2 1 304995 CASAVA_Build 2 147311228 1D AGTAAGTCCA C/- CATGATTTGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 2 1 304996 CASAVA_Build 2 147318182 4D GCAAACTAAT AGAG/---- AGTCTTCAAA 3070 het 3070 ref 28 13 13 3 AG 3 1 304997 CASAVA_Build 2 147318306 2D GACAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 43 0 34 12 A 13 11 304998 CASAVA_Build 2 147321062 1D AGGAAAATGA C/- ATTGATAGAG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 C 1 0 304999 CASAVA_Build 2 147330669 1I TTTGTTTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 100 hom 46 2 35 9 T 9 10 305000 CASAVA_Build 2 147354191 3D TCTTTTGGGC GGG/--- GGGGGGGGGG 2203 hom 15 het 14 0 5 11 G 19 16 305001 CASAVA_Build 2 147369771 1I AAAATTAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 9 10 305002 CASAVA_Build 2 147375839 2I AACTTCTGAC --/CT CTCAGGTGAT 3070 hom 57 het 20 0 17 3 CT 1 2 305003 CASAVA_Build 2 147385315 2I ATATTTAATT --/TA TATATATATA 2227 hom 18 het 10 0 7 3 TA 5 6 305004 CASAVA_Build 2 147385519 4D GGAAGGAAGA GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 hom 69 het 30 0 23 8 GAAG 4 3 305005 CASAVA_Build 2 147386192 2D TGTGTCTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TG 8 7 305006 CASAVA_Build 2 147393759 11I CTATCAGATA -----------/TTTTATTTTAT TTTTATTTTA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TTTTATTTTAT 1 2 305007 CASAVA_Build 2 147395740 2I AAAATAAAAC --/TT AGTGTACTTG 3070 hom 45 het 25 0 16 9 T 0 2 305008 CASAVA_Build 2 147397401 1D GAGGTAAACC A/- AAAAAAAAAA 1344 het 1344 ref 35 26 3 6 A 12 11 305009 CASAVA_Build 2 147398808 3I AGATGAAACT ---/AAC ATTATGATAT 3070 het 76 hom 22 1 16 5 AAC 0 1 305010 CASAVA_Build 2 147399814 1D AATATATACA G/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 G 1 0 305011 CASAVA_Build 2 147400016 2D AAGAAGTCAA AT/-- ATATATATAT 2684 het 2684 ref 17 9 6 2 AT 6 5 305012 CASAVA_Build 2 147413442 1D AAAAAGCACT C/- AAATCTTAAG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 C 1 0 305013 CASAVA_Build 2 147417874 1I CACCTACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 16 21 11 A 11 12 305014 CASAVA_Build 2 147432056 1D TAAAGTATCT A/- AAAAATATAG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 6 5 305015 CASAVA_Build 2 147434645 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 20 3 11 6 T 15 14 305016 CASAVA_Build 2 147436460 5D AAAGAAAGTG TCTTC/----- TCTTTCTAAA 3070 het 3070 ref 40 19 18 6 TCTTC 1 0 305017 CASAVA_Build 2 147438032 1D AAACACATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1559 hom 16 4 9 3 T 12 11 305018 CASAVA_Build 2 147444962 1I ATGTCCCACA -/T TTTTTTTTTT 2418 het 1922 hom 13 5 6 2 T 10 11 305019 CASAVA_Build 2 147448746 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2344 het 1857 hom 24 7 6 11 A 15 14 305020 CASAVA_Build 2 147488033 1D TTTCTAGATT A/- AAAAAAAAAC 1338 het 1338 ref 41 34 3 5 A 10 9 305021 CASAVA_Build 2 147488477 1I CATTGGCGAA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 2411 hom 31 12 14 5 G 1 2 305022 CASAVA_Build 2 147489529 3I GAAAGAAAGA ---/AAG AAAGAAAAGA 1959 het 361 hom 17 2 7 8 AAG 0 1 305023 CASAVA_Build 2 147495138 1I GTGAGCAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 A 10 11 305024 CASAVA_Build 2 147539304 4I CTGTCATGAT ----/AGTG AGTGAGTGAG 3070 hom 73 het 28 0 22 6 AGTG 2 3 305025 CASAVA_Build 2 147545822 1D ATAAGAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 13 12 305026 CASAVA_Build 2 147547752 1D ATTAGAATTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 9 8 305027 CASAVA_Build 2 147548632 1D TCTGGTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 37 0 30 7 T 12 11 305028 CASAVA_Build 2 147564335 2I TTTCAGCTTT --/CA CATTTTGGTA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 CA 1 2 305029 CASAVA_Build 2 147564925 1D TCAGGAAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 245 hom 37 1 33 5 A 10 9 305030 CASAVA_Build 2 147585736 6D TTTATTTAAA TTCAGT/------ TTTTTGAGGA 3070 hom 96 het 34 0 33 3 TTCAGT 1 0 305031 CASAVA_Build 2 147588164 1D AGTTCTTTGT A/- AAACCATCCT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 4 3 305032 CASAVA_Build 2 147606976 1I TGATAGTGTT -/A GGGGGGAAAA 3070 hom 137 het 55 0 47 8 A 0 1 305033 CASAVA_Build 2 147635318 1D AAACAAGGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 305034 CASAVA_Build 2 147646117 1D GCAAGGGAGA T/- TTGATTATCC 3070 het 3070 hom 47 20 22 6 T 3 2 305035 CASAVA_Build 2 147659586 1D AAACTGTAGG A/- GATAGAGACA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 1 0 305036 CASAVA_Build 2 147664904 4I AATATATCAT ----/TTTA TATATATATA 1741 hom 10 het 7 0 4 3 TTTA 0 1 305037 CASAVA_Build 2 147671467 1I TGGTGGGGAC -/A GGGGGATAGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 0 1 305038 CASAVA_Build 2 147694220 1I ACATGCCCCT -/A GTTGGGCCCC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 0 1 305039 CASAVA_Build 2 147728363 1D GATTTCCTGA T/- TATTTGTCAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 T 2 1 305040 CASAVA_Build 2 147728961 2I CTCTACTAAA --/AC ACAAAAAATT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 AC 1 2 305041 CASAVA_Build 2 147817877 2D TAGCAGTGTC AA/-- AAGACACTAA 3070 het 3070 hom 40 15 23 2 A 4 2 305042 CASAVA_Build 2 147824445 1D TTAAAAAGTT C/- TTTTTTTTTA 3070 het 2364 hom 30 10 15 5 C 1 0 305043 CASAVA_Build 2 147824576 21D GAACTTCTAG AACTTTTTAATTTGGAATTAA/--------------------- AACTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 20 9 1 AACTTTTTAATTTGGAATTAA 1 0 305044 CASAVA_Build 2 147830638 1D AATCAATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 7 6 A 13 12 305045 CASAVA_Build 2 147841942 1D TGAAAATCTT C/- CTATCTGCAG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 C 2 1 305046 CASAVA_Build 2 147843061 1D ATGCCCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 33 1 20 13 A 15 14 305047 CASAVA_Build 2 147858352 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTAACCAT 3070 het 27 hom 36 1 25 10 C 0 1 305048 CASAVA_Build 2 147859395 1I TATATATATA -/T TTTTTATATA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 5 6 305049 CASAVA_Build 2 147862025 5I AGTTTGCTCC -----/AAATT AAATTAAATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAATT 2 3 305050 CASAVA_Build 2 147869641 1I TCATTCATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 305051 CASAVA_Build 2 147878506 1D TAATGTATGC A/- GAGAAAATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 1 0 305052 CASAVA_Build 2 147882248 1D AGTCCTGTAG A/- AAAAAATTTG 3070 hom 93 het 38 0 29 9 A 7 6 305053 CASAVA_Build 2 147888654 1D TTGTTCATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 26 16 6 T 10 9 305054 CASAVA_Build 2 147895308 1I GTCCTTTACC -/G ATTTTTTTTT 3070 het 160 hom 28 1 24 3 G 0 1 305055 CASAVA_Build 2 147898062 1D CTTCTTAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 10 9 305056 CASAVA_Build 2 147899237 1I AGTTCGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 826 hom 46 3 29 14 T 13 14 305057 CASAVA_Build 2 147900056 1D TCTCAGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 T 11 10 305058 CASAVA_Build 2 147901698 1D TAATACATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 36 1 29 7 T 12 11 305059 CASAVA_Build 2 147911122 1I ATTTATTGAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 7 8 305060 CASAVA_Build 2 147919627 3D AGAGAGAACA TTT/--- GGTCCTTTTG 3070 hom 66 het 29 0 24 7 T 3 0 305061 CASAVA_Build 2 147924411 1D TCTGCCCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 11 10 305062 CASAVA_Build 2 147931968 1I TTGAGTATGC -/T TCATAGATAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 1 2 305063 CASAVA_Build 2 147944844 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTATTTATTG 3070 hom 105 het 39 0 36 5 TTA 2 1 305064 CASAVA_Build 2 147951995 2I TTTTTTCTAT --/TG TATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 TG 0 1 305065 CASAVA_Build 2 147960564 3D CACTAGAGAA AAC/--- AACAACTCGA 3070 hom 93 het 37 0 31 7 AAC 3 2 305066 CASAVA_Build 2 147973140 1I ACTGTATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 9 305067 CASAVA_Build 2 147982288 1I CAAAAAGGTG -/A AAGGTAAGTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 2 3 305068 CASAVA_Build 2 147984522 1I GTCTCCTCCT -/G TCTGGGTGGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 0 1 305069 CASAVA_Build 2 147998252 5I CCCAAGTAAC -----/TGGGA TGGGATCATA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 TGGGA 1 2 305070 CASAVA_Build 2 148003636 5I TCACTCATGT -----/GTCTG GTCCACTGGC 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 GTCTG 0 1 305071 CASAVA_Build 2 148006371 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 A 12 11 305072 CASAVA_Build 2 148020212 7D TTTAAAGTCT CTGCAAA/------- CTGTAACATC 3070 het 3070 ref 50 31 14 9 CTGCAAA 1 0 305073 CASAVA_Build 2 148034510 1D TACCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 11 10 305074 CASAVA_Build 2 148036758 1D TTACATGGTC T/- TTTTTTTAGC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 8 7 305075 CASAVA_Build 2 148043252 4D AAATGGACGA ATGG/---- ATGGATGGAT 3070 hom 103 het 44 0 34 11 ATGG 4 3 305076 CASAVA_Build 2 148053830 2D AGGCAGGTTG TA/-- TGAGTAAGAA 3070 hom 117 het 42 0 38 4 TA 1 0 305077 CASAVA_Build 2 148059327 2D GTTCTCATGC TG/-- TGTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 17 10 7 0 TG 2 1 305078 CASAVA_Build 2 148069175 1I AACTGAGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 9 10 305079 CASAVA_Build 2 148073555 2I GTTCTCCATA --/CT CTCTGCTCCC 3070 het 3070 ref 62 27 28 7 CT 2 3 305080 CASAVA_Build 2 148079529 1D GAGTCAGATA T/- TTTTTATATC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 6 5 305081 CASAVA_Build 2 148080471 8D GTGTGTGTGT GTGTGCGC/-------- GCGTATGTGT 3070 het 19 hom 58 2 53 4 GTGTGCGC 1 0 305082 CASAVA_Build 2 148084360 1D AGTATTTACA T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 7 6 305083 CASAVA_Build 2 148084498 1D AAATAATCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 10 9 305084 CASAVA_Build 2 148089146 4I TGAGTCTGAG ----/CTCA CTCACATTGA 3070 hom 112 het 45 0 40 5 CTCA 1 2 305085 CASAVA_Build 2 148092876 1I TTATTTTTTT -/A AAAAAACTTT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 6 7 305086 CASAVA_Build 2 148093175 4D GCTGGAGTTT TCAC/---- TCACTCACCC 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 TCAC 3 2 305087 CASAVA_Build 2 148110168 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 26 7 14 5 T 7 6 305088 CASAVA_Build 2 148122352 1I TTTAAACACA -/G TGAGAGCCAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 G 0 1 305089 CASAVA_Build 2 148128296 1I CTCAGCTCTT -/A AAACACTACG 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 A 3 4 305090 CASAVA_Build 2 148130694 1D ACAACAACTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 9 8 305091 CASAVA_Build 2 148131035 1I ATACAATTTA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 T 8 9 305092 CASAVA_Build 2 148134585 1I TTGGCACATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 23 22 4 A 9 10 305093 CASAVA_Build 2 148147808 8I AACTCCTGAC --------/CTTGTGAT CTGCCTGCCT 2161 het 1636 hom 20 5 8 7 CTTGTGAT 0 1 305094 CASAVA_Build 2 148149676 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 10 11 305095 CASAVA_Build 2 148164185 1D GGTTTCCTCA T/- TTTTACACCC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 5 4 305096 CASAVA_Build 2 148225991 1I AATCAAGAGC -/T TTTTTTTTTT 991 het 991 ref 46 32 3 11 T 11 12 305097 CASAVA_Build 2 148248030 1I TGGGCTTGGG -/T TTTTTTTTTT 1157 het 1157 ref 37 20 4 13 T 17 18 305098 CASAVA_Build 2 148251114 1D TTTAGCTTCC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 75 het 32 0 25 9 A 8 7 305099 CASAVA_Build 2 148265232 1D AGAGGCAGGG T/- TTTATCATGT 3070 hom 29 het 15 0 10 5 T 4 3 305100 CASAVA_Build 2 148268458 1D CTCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 1503 het 1503 ref 25 16 5 4 A 15 14 305101 CASAVA_Build 2 148281857 1D AGGCTTGGGG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 81 het 32 0 26 6 T 9 8 305102 CASAVA_Build 2 148283239 1I TTTTAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 25 0 19 6 T 10 11 305103 CASAVA_Build 2 148292660 4D AAGGGGCTGG TAAC/---- TAACTAAAGG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 TAAC 2 1 305104 CASAVA_Build 2 148317147 1D ATATAAGTGA G/- AAGACTTGGC 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 G 1 0 305105 CASAVA_Build 2 148331868 1D CATGCGACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 10 9 305106 CASAVA_Build 2 148347700 4D TTTGGGAGAG AGAC/---- AGAAACTGGT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AGAC 1 0 305107 CASAVA_Build 2 148352484 1I AGACTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 31 1 21 9 T 12 13 305108 CASAVA_Build 2 148362704 3I TAGTTCGGGG ---/GCT GCTGCTGCTG 3070 hom 93 het 39 0 29 10 GCT 5 6 305109 CASAVA_Build 2 148366002 1I TCTTTTTTTT -/G GTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 1 2 305110 CASAVA_Build 2 148382099 5D AAAAAGAAAA AAAAG/----- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AAAAG 1 0 305111 CASAVA_Build 2 148420335 1I GCAGGTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1298 hom 51 3 39 9 A 10 11 305112 CASAVA_Build 2 148435478 1D TCTGTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 22 1 18 3 A 13 12 305113 CASAVA_Build 2 148448847 1D TCTTTTCCTT A/- AAAAAAAAAA 2788 het 278 hom 27 1 15 12 A 19 18 305114 CASAVA_Build 2 148449546 1D AAGAAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 28 1 20 7 A 13 12 305115 CASAVA_Build 2 148450019 1I CAAATCCTTT -/A AAAAAAATTG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 7 8 305116 CASAVA_Build 2 148450952 3D TTGTAAAATT CTC/--- CTCAAGTGTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 CTC 2 1 305117 CASAVA_Build 2 148455784 1I GCAAGTAAGT -/G GCAGAGCCAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 1 2 305118 CASAVA_Build 2 148472284 1D TTAATTCTTG A/- AAAAGTCTGA 3070 hom 79 het 40 0 36 5 A 5 4 305119 CASAVA_Build 2 148480350 1I GAAATCCTCC -/A CCCCAAGGAG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 0 1 305120 CASAVA_Build 2 148505379 1D TATGCCTTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 27 0 19 8 A 10 9 305121 CASAVA_Build 2 148511055 1I CGTAGATAAC -/A AAAAGTAATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 4 5 305122 CASAVA_Build 2 148525368 1I TTCTTCCGGG -/T TTTTTTATAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 6 7 305123 CASAVA_Build 2 148526628 5D TAAGTTTTCA TATGT/----- TATGTTTTCG 3070 het 3070 ref 48 27 20 4 TATGT 2 1 305124 CASAVA_Build 2 148527950 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2203 hom 26 8 11 7 T 13 12 305125 CASAVA_Build 2 148531900 3D AACTTACTGA GTT/--- GTTGTTGTTT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 GTT 4 3 305126 CASAVA_Build 2 148533887 1I TCCGTCTCAA -/C AAAAAAAAAA 1501 het 101 hom 8 1 6 1 C 0 1 305127 CASAVA_Build 2 148537593 1D CCAAGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 33 0 25 8 T 12 11 305128 CASAVA_Build 2 148549676 1D CTTGTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 1321 het 1321 ref 38 31 3 4 T 13 12 305129 CASAVA_Build 2 148553662 1D CTTTGGGAGG C/- CTAGGCGGGT 3070 het 2284 hom 25 8 12 6 C 2 1 305130 CASAVA_Build 2 148566853 1D TTTTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 17 0 13 4 A 15 14 305131 CASAVA_Build 2 148569767 1D ATTCTGAGTT A/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 23 24 8 A 1 0 305132 CASAVA_Build 2 148574951 4D TGTGGGATAG GATT/---- GATTGATTGA 3070 het 3070 ref 58 25 20 13 GATT 6 5 305133 CASAVA_Build 2 148579261 1D CGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 30 3 17 10 T 15 14 305134 CASAVA_Build 2 148580150 1D TGTATTCTAC A/- ACTGTTGATG 3070 het 3070 ref 38 20 18 0 A 2 1 305135 CASAVA_Build 2 148590247 3I AGTACTGTTC ---/CTT CTTCCCCCCA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 CTT 1 2 305136 CASAVA_Build 2 148600279 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1826 het 672 hom 12 3 5 4 A 15 14 305137 CASAVA_Build 2 148606371 4D ATATATATAC ATAT/---- ATATATATAT 2463 het 118 hom 13 3 6 4 AT 9 7 305138 CASAVA_Build 2 148615843 1D AAAAAAAAAA T/- GTTTTTAATA 3070 het 1358 hom 21 9 11 1 T 1 0 305139 CASAVA_Build 2 148632743 4D TCCTGTAATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2723 het 2723 ref 29 8 10 11 TTTG 4 3 305140 CASAVA_Build 2 148643940 1D GGGATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 22 4 12 6 T 15 14 305141 CASAVA_Build 2 148648822 1D GACCATTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 677 hom 32 2 28 2 A 12 11 305142 CASAVA_Build 2 148668815 2D AAAAAAAAAA AT/-- TAAAAAAAAA 1878 het 71 hom 10 1 6 3 AT 1 0 305143 CASAVA_Build 2 148677840 1D GTGATTATAA G/- CAATACCTGT 3070 hom 160 het 56 0 54 3 G 1 0 305144 CASAVA_Build 2 148681495 2I AAAAAAGGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 10 12 305145 CASAVA_Build 2 148682695 1D TTATCTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 30 2 19 9 T 15 14 305146 CASAVA_Build 2 148687877 1D TCACCAACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 9 305147 CASAVA_Build 2 148699344 4D CTGTTTACAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 AAAC 3 2 305148 CASAVA_Build 2 148705586 1I ATGAAGGTGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 8 9 305149 CASAVA_Build 2 148713036 2D21M4I TAACTCTATC ATATATATATATATATATTATAT----/--ATATATATATATATATTATATACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 21 13 12 N/A 0 0 305150 CASAVA_Build 2 148714461 1D ATAATTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 12 11 305151 CASAVA_Build 2 148717372 2D AGAAAAATTA TT/-- GTTATACTTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 2 0 305152 CASAVA_Build 2 148719013 6D TTGCCATCTT AAACAA/------ AAGATAAATT 3070 het 3070 hom 41 15 24 5 AAACAA 1 0 305153 CASAVA_Build 2 148719328 2D GCAGTGGCAC TA/-- TCTCAGCTCA 1368 het 398 hom 6 1 3 2 TA 1 0 305154 CASAVA_Build 2 148721702 2I ACAATTAACA --/CT GTCTTTTCCT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 CT 0 1 305155 CASAVA_Build 2 148726536 2D ATACAGACTC AT/-- ATTCTAGTTA 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 AT 2 1 305156 CASAVA_Build 2 148739588 1D TAAAAAACTA T/- TTTTTCATAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 5 305157 CASAVA_Build 2 148739971 1I CAGGAAAGAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 7 8 305158 CASAVA_Build 2 148743116 4D AAATTAAAGA CTTT/---- CTTTCTCTAA 3070 het 3070 ref 43 30 11 3 CTTT 2 1 305159 CASAVA_Build 2 148745817 1I ATTTTTACCA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 6 7 305160 CASAVA_Build 2 148756583 1D GTTAAAAAAA T/- ATGTATATAT 3070 het 3070 ref 35 15 16 6 T 1 0 305161 CASAVA_Build 2 148756937 2D AAGACTTAAC CG/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 CG 1 0 305162 CASAVA_Build 2 148762082 7D6M1I TGGCATTTTT AAGTACCATGAAA-/-------ATGAAAT GTGTGTGTTA 3070 het 3070 ref 21 13 7 6 N/A 0 0 305163 CASAVA_Build 2 148763933 29D ATTAATAGGA CTGTTTTCATTCTTACACTTATTTGTATT/----------------------------- CTCTAATAAT 1819 hom 8 het 6 0 5 4 CTGTTTTCATTCTTACACTTATTTGTATT 1 0 305164 CASAVA_Build 2 148773478 1I AAAGAACTTT -/C TTTAAAGAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 0 1 305165 CASAVA_Build 2 148781442 1I TTTTCACAAA -/C CTTTTACAAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 1 2 305166 CASAVA_Build 2 148781535 2I AGTAGAAAAC --/TA TCCCTTTTTC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TA 0 1 305167 CASAVA_Build 2 148825619 1I ACTTGTGTAC -/A AATATTAGTG 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 A 2 3 305168 CASAVA_Build 2 148829162 1D GGGGTTGTTT G/- TTTTTTTTCT 2413 het 1835 hom 11 4 6 1 G 1 0 305169 CASAVA_Build 2 148831501 1D GGATTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 T 12 11 305170 CASAVA_Build 2 148847686 3D ATTTAAAAAT AAC/--- AACCTCTCTA 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 AAC 2 1 305171 CASAVA_Build 2 148851070 2I ATGTATACAG --/AT ATATATATAT 2089 het 1805 hom 13 5 5 3 AT 6 7 305172 CASAVA_Build 2 148864549 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTATATATG 1936 het 1420 hom 17 6 10 2 TG 1 2 305173 CASAVA_Build 2 148865322 1I AGTATTTACT -/A GGGAAAATAT 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 A 0 1 305174 CASAVA_Build 2 148868760 2D TCAATTTCAT TC/-- TGTCTTTATA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 TC 1 0 305175 CASAVA_Build 2 148877225 1D AATGTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1525 hom 19 5 7 7 T 12 11 305176 CASAVA_Build 2 148878167 1D GCATTATGGG T/- TTTTTTTTTT 2679 het 1424 hom 24 7 10 7 T 12 11 305177 CASAVA_Build 2 148911172 1I CAGGCACGTG -/C CACCGCGCCT 3070 hom 51 het 18 0 17 1 C 1 2 305178 CASAVA_Build 2 148926634 1D GCAAAATGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 25 7 A 10 9 305179 CASAVA_Build 2 148927225 3I TCAGTGAATT ---/AAC AAAGTGTGAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AAC 0 1 305180 CASAVA_Build 2 148950261 1I ATATGCTCCC -/T AGAGCACAGC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 0 1 305181 CASAVA_Build 2 148957128 1D GGGTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 757 hom 43 5 29 10 T 13 12 305182 CASAVA_Build 2 148966214 1D GATGTACTTT A/- AAAAAAAAAA 1581 het 1581 ref 33 24 4 5 A 12 11 305183 CASAVA_Build 2 149025161 1D CATGACCCCA G/- GGATCTCATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 3 2 305184 CASAVA_Build 2 149031011 1I CTAATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1192 hom 28 4 17 7 T 14 15 305185 CASAVA_Build 2 149033309 1D TAATGCTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 29 0 20 9 T 12 11 305186 CASAVA_Build 2 149064874 4D GATTAAAAAC CAGA/---- CAGAGAAGGA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 CAGA 2 1 305187 CASAVA_Build 2 149068742 1D TAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 44 1 34 9 A 12 11 305188 CASAVA_Build 2 149073085 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 1637 hom 15 het 8 0 5 3 T 8 7 305189 CASAVA_Build 2 149082803 1I ATTCCTGCAC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 T 8 9 305190 CASAVA_Build 2 149109424 1D CGTGGTGAGA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 16 hom 22 1 12 9 C 10 9 305191 CASAVA_Build 2 149132647 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TA 12 10 305192 CASAVA_Build 2 149136852 3I AACTTAAAAT ---/ATA ATAATAATAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 ATA 4 5 305193 CASAVA_Build 2 149140909 1D ATTGTTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 45 3 27 15 T 15 14 305194 CASAVA_Build 2 149150905 1I TATTACCCAC -/T TTTTTTTGGG 3070 het 153 hom 36 1 27 8 T 7 8 305195 CASAVA_Build 2 149159290 1D TTTCGTTGAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 5 T 10 9 305196 CASAVA_Build 2 149172869 2I TTTTCTTCCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 12 14 305197 CASAVA_Build 2 149177482 1D ACCTGTTTGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 88 het 38 0 29 9 T 9 8 305198 CASAVA_Build 2 149206421 1D TATTTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 22 9 3 11 T 17 16 305199 CASAVA_Build 2 149250177 2I GAAATTCCTG --/AT TTTTAATTTC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AT 0 1 305200 CASAVA_Build 2 149251257 10I GTAACAAAGA ----------/GTACAAGTTC CTGACCTGGT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 GTACAAGTTC 0 1 305201 CASAVA_Build 2 149256801 5I GATAATAAAT -----/TTCTC TTTTAAGCCA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TTCTC 0 1 305202 CASAVA_Build 2 149277570 2I AATTTTATGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 10 12 305203 CASAVA_Build 2 149278918 2I TGAGATAATC --/AT GTGTGGTTTT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AT 0 1 305204 CASAVA_Build 2 149318905 2I TTGTTGAAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 10 12 305205 CASAVA_Build 2 149322829 1I ACAATATCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 10 305206 CASAVA_Build 2 149326171 1I AAAGAGAGAG -/T TAATAATAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 305207 CASAVA_Build 2 149335697 1D AATTATCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 929 hom 38 3 25 10 T 12 11 305208 CASAVA_Build 2 149359011 1D GTCCTAATTG T/- TTTTTTTTTT 1214 het 203 hom 17 2 6 10 T 17 16 305209 CASAVA_Build 2 149603152 6D CGTTTCTACA TTGGTT/------ TTCTAGGAAG 3070 hom 66 het 24 0 23 2 TTGGTT 1 0 305210 CASAVA_Build 2 149605958 1I TGTTGTAATA -/T TGTTTAGGTT 3070 hom 54 het 26 0 18 8 T 1 2 305211 CASAVA_Build 2 149609602 1D TATTGAATGC T/- TTTTTTACCA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 T 7 6 305212 CASAVA_Build 2 149618700 1I GTACTTCATT -/C CTTTTGATGG 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 C 1 2 305213 CASAVA_Build 2 149622162 1D TTTTTTTTTT A/- ATTACAGTGC 3070 het 2694 hom 23 7 11 5 A 2 1 305214 CASAVA_Build 2 149625959 1D CTGCAGTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 122 hom 27 3 14 11 T 16 15 305215 CASAVA_Build 2 149639576 1I TAAAATACAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 8 9 305216 CASAVA_Build 2 149640267 4I ATAAGATACT ----/GAGA GAGACAAACA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 GA 2 4 305217 CASAVA_Build 2 149642232 3I GGCATGTAAT ---/AAG AAGTGATAAC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 AAG 1 2 305218 CASAVA_Build 2 149642728 1I AGCAACTGCT -/G GCTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 56 28 23 5 G 1 2 305219 CASAVA_Build 2 149649163 1I ATATTTATGA -/T CAGTTACAGG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 0 1 305220 CASAVA_Build 2 149650659 1I ATGGGAAGGC -/A GCCCTTTGCT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 0 1 305221 CASAVA_Build 2 149651768 1I TAAGAAGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 38 2 28 8 T 11 12 305222 CASAVA_Build 2 149652856 1I TCCTGTTGCT -/C CCCCCCACCC 3070 hom 72 het 27 0 23 4 C 6 7 305223 CASAVA_Build 2 149662976 10D ATCTCTAAGA CTTAAATTTT/---------- CTTAAGTTTC 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 CTTAAATTTT 1 0 305224 CASAVA_Build 2 149674647 1I AATTTTTGTA -/T TTTTAATAGA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 T 4 5 305225 CASAVA_Build 2 149677962 4I TGGCTTGTAA ----/AGAC AGTCTTAGTT 3070 hom 144 het 53 0 49 4 AGAC 0 1 305226 CASAVA_Build 2 149694675 3D GTCTGGGAAG GAA/--- GAAGGAGGAG 3070 het 3070 ref 47 22 18 9 GAA 2 1 305227 CASAVA_Build 2 149699911 3D AGGCTGAGAC ACA/--- ACAATTGCTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 ACA 2 1 305228 CASAVA_Build 2 149719246 1D TAAGCCACCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 T 9 8 305229 CASAVA_Build 2 149735248 10D AAATGTGAGA CTGGATTGTC/---------- CTGGATTAAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 CTGGATTGTC 1 0 305230 CASAVA_Build 2 149736133 2D AACAAATAAC AT/-- ATTTTATTAC 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 AT 2 1 305231 CASAVA_Build 2 149748206 1D AAGAAAATAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 9 8 305232 CASAVA_Build 2 149748947 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 13 12 305233 CASAVA_Build 2 149752981 1D CTCTCATTTA C/- TTCTAGATCA 3070 het 3070 ref 43 22 10 12 C 1 0 305234 CASAVA_Build 2 149762794 1D TAAGCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1932 hom 26 8 11 7 T 13 12 305235 CASAVA_Build 2 149763528 1I CTTGATGAGA -/T TTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 T 6 7 305236 CASAVA_Build 2 149765283 1D GGAATATAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 10 9 305237 CASAVA_Build 2 149768812 3D TTGATTCAGC AAG/--- AAGGAGTTCA 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 AAG 2 1 305238 CASAVA_Build 2 149774681 1D CATTTTCAAC A/- GAAATTTATC 3070 het 3070 hom 36 15 20 3 A 1 0 305239 CASAVA_Build 2 149781910 1I CTCAAGCCTA -/C CCCCAATAGC 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 C 4 5 305240 CASAVA_Build 2 149794849 3I GAGACAAAGT ---/CTG CTGGGTGTTT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 CTG 1 2 305241 CASAVA_Build 2 149837989 1I AGAATTAGGC -/T TTAGGTACTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 2 3 305242 CASAVA_Build 2 149856028 1D TCTTTGGCCA C/- CCTGAATATT 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 C 3 2 305243 CASAVA_Build 2 149868638 1I21M1I25M1I TGGAGTCAGT -CCCCTCCAGGAGTCCCAGGTT-GGGTATCATCTCCCAGTGGATGCAG-/CCCCCTCCAGGAGTCCCAGGTTGGGGTATCATCTCCCAGTGGATGCAGT TTTGCAGAAC 3070 hom 75 het 30 0 25 17 N/A 0 0 305244 CASAVA_Build 2 149887122 1I AGTTCTTTGA -/T TTTTACCATG 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 T 4 5 305245 CASAVA_Build 2 149890398 3I TTGCTTTCTT ---/ATC ATTCTTATAT 3070 hom 123 het 52 0 42 10 ATC 0 1 305246 CASAVA_Build 2 149890950 1D TTCAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 11 10 A 12 11 305247 CASAVA_Build 2 149891178 1D TATTGTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 38 1 26 12 T 12 11 305248 CASAVA_Build 2 149929305 1D CAGAGTACAA T/- TTTTTTTTTT 1952 het 1952 ref 35 22 6 7 T 17 16 305249 CASAVA_Build 2 149934685 1D AATACAGCTG A/- AGGAGGGCAT 3070 het 3070 hom 51 21 23 9 A 2 1 305250 CASAVA_Build 2 149942073 1D TAATCACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 11 10 305251 CASAVA_Build 2 149947530 23I AGTAGTAGAT -----------------------/TTGATAGCCTGTTTGCTATCAAA TTGATAGCCT 3070 het 3070 ref 42 19 16 9 TTGATAGCCTGTTTGCTATCAAA 0 1 305252 CASAVA_Build 2 149964477 4I ATATAAATTA ----/TAAG TAAGTATATG 2179 het 1076 hom 10 3 6 1 TAAG 1 2 305253 CASAVA_Build 2 149965390 2I CTTCCTGGTA --/AC ACAATTTTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AC 1 2 305254 CASAVA_Build 2 149977242 1I TTTTTGTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 8 9 305255 CASAVA_Build 2 149980603 1D ATTTTTGTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 9 8 305256 CASAVA_Build 2 149980780 14D AAGCTAACAA TCCCGAGTCAAAGT/-------------- TGCCACAGTT 3070 het 3070 ref 43 23 19 4 TCCCGAGTCAAAGT 1 0 305257 CASAVA_Build 2 149988747 1D CAGCCCTGAT A/- AAAGTATTAC 3070 het 3070 hom 52 20 27 6 A 4 3 305258 CASAVA_Build 2 149988881 2D ATGCGTACAC AT/-- GTCAATATGC 3070 het 3070 hom 42 14 24 8 AT 1 0 305259 CASAVA_Build 2 149997200 2D TCTGTTTCCT GA/-- TCAGAGGTCC 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 GA 1 0 305260 CASAVA_Build 2 150005628 1D GCCTGACTAA T/- TTTTTTTTTT 1191 het 256 hom 6 1 4 1 T 12 11 305261 CASAVA_Build 2 150025104 3D GTAGGGAAAC ATT/--- AATCAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 ATT 1 0 305262 CASAVA_Build 2 150026898 1I TTCTATGTAG -/A AAAATTCCAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 4 5 305263 CASAVA_Build 2 150028874 2D AGGTTAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 47 5 8 36 A 14 12 305264 CASAVA_Build 2 150045293 1I GACCCTGAAC -/T TTCCTTTCAC 3070 hom 138 het 52 0 44 8 T 2 3 305265 CASAVA_Build 2 150049312 1I TCCATAGCTA -/C CCCCCGTAGT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 C 5 6 305266 CASAVA_Build 2 150053919 1I CTTTGGGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 A 13 14 305267 CASAVA_Build 2 150058202 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 418 hom 16 1 15 0 A 10 11 305268 CASAVA_Build 2 150058363 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 24 3 11 12 A 15 14 305269 CASAVA_Build 2 150059305 4D TTCTGTTCCT GTTA/---- GTTTGCTGAG 3070 hom 21 het 8 0 8 3 GTTA 1 0 305270 CASAVA_Build 2 150075035 1I AATACATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 30 0 20 10 T 14 15 305271 CASAVA_Build 2 150097075 1D GCTTTGCAAA T/- TTTTTTTTTT 1720 het 1720 ref 36 20 4 12 T 12 11 305272 CASAVA_Build 2 150098296 3D TAAAGCCAGG ACA/--- ACAACAACAA 3070 hom 102 het 42 0 33 10 ACA 7 6 305273 CASAVA_Build 2 150116751 1D TTATCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 51 1 35 16 T 14 13 305274 CASAVA_Build 2 150116765 1D TTTTTTTTTT A/- ACAAATGCTG 3070 het 124 hom 52 5 30 17 A 2 1 305275 CASAVA_Build 2 150128255 1I ACATAGAAAA -/G GTACAGTAAA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 G 1 2 305276 CASAVA_Build 2 150129843 2I ACATACATAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AC 8 9 305277 CASAVA_Build 2 150130813 1I TAAAAATACA -/T TTTTTCTATA 3070 hom 97 het 36 0 33 3 T 5 6 305278 CASAVA_Build 2 150131934 4I AACCCTCCTT ----/TGGA GTGACAACAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TGGA 0 1 305279 CASAVA_Build 2 150133651 4D TATGATGTGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AT 9 7 305280 CASAVA_Build 2 150138636 1I AAATTAAAAC -/A AAAAAAACCA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 7 8 305281 CASAVA_Build 2 150140138 12D AGGGGAAGAT GGGGAGATGAAG/------------ GGGGAGATGG 3070 hom 49 het 20 0 18 5 GGGGAGATGAAG 1 0 305282 CASAVA_Build 2 150144136 2I TATAATAATC --/AA AAGTCATATA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 2 4 305283 CASAVA_Build 2 150146714 6I CTCTTTTTTC ------/CTTTTT AATACTGTAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CTTTTT 0 1 305284 CASAVA_Build 2 150157677 5D TTGTATCTTT AGTAG/----- AGACCGGTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 5 AGTAG 1 0 305285 CASAVA_Build 2 150158607 2D ACCTGAAGCC AT/-- ATATAGCAAC 3070 hom 109 het 47 0 40 9 AT 3 2 305286 CASAVA_Build 2 150159279 1I TAATAAGAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 8 9 305287 CASAVA_Build 2 150161090 1D TAGTTAGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 423 hom 47 2 32 13 T 10 9 305288 CASAVA_Build 2 150161950 1D TTATTTTTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 9 8 305289 CASAVA_Build 2 150163619 1I TTTTTCAATA -/T TCAGCTCCAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 1 2 305290 CASAVA_Build 2 150165524 1D ATATTGAGGT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 9 8 305291 CASAVA_Build 2 150192740 1D GAATTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1261 hom 42 3 34 6 T 11 10 305292 CASAVA_Build 2 150196270 2D TAAACTAGTA AC/-- ACAGTCATTT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 AC 2 1 305293 CASAVA_Build 2 150198887 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 8 7 305294 CASAVA_Build 2 150209707 1D GAGTTCTGTT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 93 het 32 0 32 1 A 8 7 305295 CASAVA_Build 2 150217746 5D GCATTTTGAC TTCAT/----- TTCATTTCTC 3070 hom 120 het 43 0 40 6 TTCAT 2 1 305296 CASAVA_Build 2 150221454 1D TCATTTATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 26 0 21 6 T 10 9 305297 CASAVA_Build 2 150228667 18D GTGCTCTGCC CTCGTTTCAGCTCACCTA/------------------ CTGTACACAA 3070 hom 96 het 35 0 32 5 CTCGTTTCAGCTCACCTA 1 0 305298 CASAVA_Build 2 150246579 1I ATTTCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 504 hom 34 2 27 5 T 13 14 305299 CASAVA_Build 2 150248187 4I ACACAAAGAA ----/AGAG AGAAAGGTCA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 AG 1 3 305300 CASAVA_Build 2 150253295 3D TCTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 34 1 21 12 T 17 14 305301 CASAVA_Build 2 150269245 1I TATGGCTGAT -/A ACTCTAGCCT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 A 1 2 305302 CASAVA_Build 2 150271581 1I GCAAAAAAAT -/A GACACATAGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 0 1 305303 CASAVA_Build 2 150289832 1D CTTTTATTTG T/- TTTTTTTTTT 1378 het 1378 ref 49 36 4 9 T 11 10 305304 CASAVA_Build 2 150300308 1D ACGGAATTAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 9 8 305305 CASAVA_Build 2 150310254 1D TTGCTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 13 12 305306 CASAVA_Build 2 150310602 1D39M2D AGGCAAAAAT AAAAAAAAAAAAGAAATAAACAGCGGGTCATTTCTGACACGT/-AAAAAAAAAAAGAAATAAACAGCGGGTCATTTCTGACAC-- GTGTCATATT 3070 het 3070 hom 30 19 22 8 N/A 0 0 305307 CASAVA_Build 2 150318029 2D TATATATATA TG/-- TACATATGTA 3070 het 2725 hom 32 11 19 2 TG 1 0 305308 CASAVA_Build 2 150319607 4D GATAGACTGG ATAA/---- ATAAACTGTG 1525 het 1525 ref 23 15 4 4 ATAA 2 1 305309 CASAVA_Build 2 150320473 6D GTTGACCAGG CTGGTA/------ CTGAACTCCT 3070 het 3070 ref 19 10 7 4 CTGGTA 1 0 305310 CASAVA_Build 2 150321300 3D2M3D GGGGTTTCAT GTAACCTT/---AC--- TACTCAATTT 3070 het 3070 ref 33 20 14 3 N/A 0 0 305311 CASAVA_Build 2 150324832 1I TTTAAAATTG -/T TATTTTATCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 1 2 305312 CASAVA_Build 2 150326458 1I ACTATAAATA -/C CCCCAAGTAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 C 4 5 305313 CASAVA_Build 2 150328224 1I ATCAAAGTGA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 7 8 305314 CASAVA_Build 2 150328756 9I TCCCCTTGGC ---------/CTCCTTGGG CACCACTCTG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 CTCCTTGGG 0 1 305315 CASAVA_Build 2 150329660 1I GGCAACCTAA -/T AATAAAAACC 3070 het 2294 hom 27 5 16 6 T 0 1 305316 CASAVA_Build 2 150329742 2I TCCAGGATCC --/TA TGAGTGATAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 TA 0 1 305317 CASAVA_Build 2 150330824 1I TAGAAAAAAA -/T AGTAGATATT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 0 1 305318 CASAVA_Build 2 150332022 4I CTTCATTTTA ----/TTTG TTTATTTGCT 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 TTTG 0 1 305319 CASAVA_Build 2 150332238 2I AATATGGGAG --/GA GAGAGATATA 3070 het 3070 hom 46 13 26 7 GA 3 4 305320 CASAVA_Build 2 150334692 1I CCAGATAAGC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 45 18 20 7 A 7 8 305321 CASAVA_Build 2 150362102 1I AAATCTCAGC -/T TTCCTTTTCT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 2 3 305322 CASAVA_Build 2 150370818 1I TGCTAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 13 14 305323 CASAVA_Build 2 150385127 4I AAATAAAGAA ----/ATAT ATATATATGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AT 4 6 305324 CASAVA_Build 2 150391421 1D TTGTAATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 16 10 A 11 10 305325 CASAVA_Build 2 150402522 2I TAGGTCTCTA --/AG AGAGCTTGTT 3070 het 2954 hom 19 9 8 2 AG 2 3 305326 CASAVA_Build 2 150404681 4D ATCTCAGTGA AGTT/---- AGTTAGTCAA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 AGTT 2 1 305327 CASAVA_Build 2 150404793 1I ATGCTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 T 9 10 305328 CASAVA_Build 2 150405325 2D ACAAAAATAA AC/-- AGATATTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 AC 1 0 305329 CASAVA_Build 2 150414975 4D CTATGTTTCC CAGT/---- CAAACTACTA 3070 het 3070 ref 42 25 13 5 CAGT 1 0 305330 CASAVA_Build 2 150422581 4D TCTCGAGACC TGAT/---- TGATTGTCTT 3070 het 3070 ref 43 21 21 3 TGAT 2 1 305331 CASAVA_Build 2 150425498 1I AAGTTCTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 9 10 305332 CASAVA_Build 2 150430835 31D CAAATCAAAA CCACAATGAGATACCATCTCATGCCAGTTAG/------------------------------- CCACAATGAG 2392 het 2392 ref 13 8 5 7 CCACAATGAGATACCATCTCATGCCAGTTAG 2 1 305333 CASAVA_Build 2 150433105 1I GACCATTATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 A 9 10 305334 CASAVA_Build 2 150449181 1I TGTTGGTTTT -/A AAAAAAGCTT 1741 het 1741 ref 26 12 6 8 A 6 7 305335 CASAVA_Build 2 150452794 5D TTTATGTGAT AATAA/----- AATAATAGAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 5 AATAA 2 1 305336 CASAVA_Build 2 150464208 1D GGTACCTGCT A/- ACAGCTTACT 3070 hom 129 het 51 0 44 8 A 2 1 305337 CASAVA_Build 2 150468734 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTCCCTC 2658 hom 4 het 15 0 11 4 AG 1 2 305338 CASAVA_Build 2 150475394 1I AAAATTCCCT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 305339 CASAVA_Build 2 150494142 1D TATTGGTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 39 0 33 8 T 10 9 305340 CASAVA_Build 2 150497026 1D ACACACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 11 10 305341 CASAVA_Build 2 150500655 4D ATTTTTCATA ATAG/---- ATATGTTTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 ATAG 1 0 305342 CASAVA_Build 2 150556727 2D CAGTATCAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 23 10 A 14 12 305343 CASAVA_Build 2 150566832 1D TTGTACTGGT A/- AAAAAAAAAA 1546 het 1546 ref 51 38 5 8 A 13 12 305344 CASAVA_Build 2 150608370 1D GATACTGCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 34 1 28 5 A 13 12 305345 CASAVA_Build 2 150617524 2D GTATCTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 28 0 19 9 T 13 11 305346 CASAVA_Build 2 150622381 6I AAAGGTTTTC ------/ACACAA ACACAAACAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ACACAA 1 2 305347 CASAVA_Build 2 150630392 1D TTTTATTTCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 8 305348 CASAVA_Build 2 150636201 1I AATTAAAAAG -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 103 het 40 0 35 5 A 7 8 305349 CASAVA_Build 2 150641480 1I TTTGACAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 854 hom 27 2 20 5 T 12 13 305350 CASAVA_Build 2 150645951 2D ACCTGTTCAA AC/-- TTACAGGAAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 AC 1 0 305351 CASAVA_Build 2 150647965 1D CAACAAAAAC G/- GGGGGACAGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 6 5 305352 CASAVA_Build 2 150649087 2I TAATTTTCTT --/AA AGTCAATTTG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 3 305353 CASAVA_Build 2 150652840 3D51M1D ATCTTTTCTC TTATTATTGGATATTTAGCGCTTTGCTCTTACAACAATGCTGCAGTAAACATTCT/---TTATTGGATATTTAGCGCTTTGCTCTTACAACAATGCTGCAGTAAACATTC- TGAAAAAAGA 3070 hom 36 het 14 0 12 12 N/A 0 0 305354 CASAVA_Build 2 150653109 2I TTTTATATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AT 6 7 305355 CASAVA_Build 2 150657007 1I TTCTCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 19 11 A 10 11 305356 CASAVA_Build 2 150687997 1D CATAAGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 11 10 305357 CASAVA_Build 2 150692436 1I TGCCAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 235 hom 36 2 27 7 T 13 14 305358 CASAVA_Build 2 150699659 12I ACACATTTGA ------------/TCAAAATCCCAC TCAAAAAGCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TCAAAATCCCAC 0 1 305359 CASAVA_Build 2 150713629 12D AGATTGGAAG CACCGCCAGAGC/------------ TCTGAGGACT 3070 het 206 hom 30 2 14 19 CACCGCCAGAGC 1 0 305360 CASAVA_Build 2 150828497 5D TTTAATTAAT AAAAA/----- TGAAAATACA 3070 het 3070 ref 38 17 18 4 A 5 0 305361 CASAVA_Build 2 150829893 1D AACAGAACCA C/- CCCACTCCTT 3070 hom 51 het 21 0 17 5 C 4 3 305362 CASAVA_Build 2 150831793 1D27M1D TGCTTACAAT AAAAAAAAATAATTTTCCAATGTAGAAGA/-AAAAAAAATAATTTTCCAATGTAGAAG- AAAAAAAGAT 3070 hom 87 het 24 0 29 8 N/A 0 0 305363 CASAVA_Build 2 150834847 4D ATGTGTTATT TGCC/---- TGTGCATAAT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TGCC 1 0 305364 CASAVA_Build 2 150848505 2D AGAAATACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 AT 6 5 305365 CASAVA_Build 2 150848921 1D CAGTTTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 37 2 29 7 T 13 12 305366 CASAVA_Build 2 150860772 1I GAGGGACTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 305367 CASAVA_Build 2 150861541 1D GAAATACATG A/- CTGAAAGCAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 1 0 305368 CASAVA_Build 2 150867026 4I AATATTATGC ----/AGTT AGTTAGTGCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGTT 1 2 305369 CASAVA_Build 2 150877837 4D AATTTAAACC AACA/---- AAGATAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 6 AACA 1 0 305370 CASAVA_Build 2 150882318 4D TATACATATG TAAC/---- TAACCTGCAC 3070 hom 48 het 17 0 15 2 TAAC 2 1 305371 CASAVA_Build 2 150908123 1I AAGATGTTTC -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 7 8 305372 CASAVA_Build 2 150913758 4I CGCTTTTATA ----/TATG TATTTAAGAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TATG 0 1 305373 CASAVA_Build 2 150933171 1I GAGCTACTGA -/G GGCACCACTA 3070 hom 151 het 56 0 51 5 G 2 3 305374 CASAVA_Build 2 150936581 2I TTTTGTGTGT --/GA CTTTTAAGCT 3070 hom 101 het 41 0 29 12 GA 0 1 305375 CASAVA_Build 2 150943291 1I TTTCAAATTA -/C CCTCCAGGGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 2 3 305376 CASAVA_Build 2 150948549 1D GGCCCTGTGC T/- TTTTTTTTTT 1186 het 179 hom 27 3 9 15 T 14 13 305377 CASAVA_Build 2 150949587 8I TGAATCTGGG --------/AGTTCCAA AGTTCAGTGC 3070 hom 112 het 42 0 38 4 AGTTCCAA 0 1 305378 CASAVA_Build 2 150953590 1I CCACCATCTT -/G GGGGGAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 5 6 305379 CASAVA_Build 2 150961362 4D CCTGCCTCCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 AAAC 4 3 305380 CASAVA_Build 2 150970828 1I GCCCCCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 281 hom 31 2 20 9 A 11 12 305381 CASAVA_Build 2 150977223 4D CCAAAAACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 AAAC 4 3 305382 CASAVA_Build 2 150977777 1D TGTTGATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 12 11 305383 CASAVA_Build 2 150984922 1I AAGAAAGAAA -/G AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 0 1 305384 CASAVA_Build 2 150988568 1D ATGTTACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 11 10 305385 CASAVA_Build 2 150990976 1D GAGAGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 2023 het 2023 ref 51 32 6 13 A 12 11 305386 CASAVA_Build 2 150992931 1D TGTTACTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 12 11 305387 CASAVA_Build 2 151012125 1D CCTAAAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 34 1 21 14 T 11 10 305388 CASAVA_Build 2 151031177 1D TTAGTGCCTA C/- TCACTTTCTT 3070 het 3070 ref 55 24 24 7 C 1 0 305389 CASAVA_Build 2 151031865 2D TACAGCATAT AA/-- AATACTGCCA 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 A 4 2 305390 CASAVA_Build 2 151032990 1I TTATTTGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 9 10 305391 CASAVA_Build 2 151036531 1D ACTATGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 45 1 36 8 A 12 11 305392 CASAVA_Build 2 151077361 3I GGTTTTGGTC ---/TTG TTGTCTGAGA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 TTG 1 2 305393 CASAVA_Build 2 151106475 6D ACTGCTGGCT GGGGGG/------ GGGGGGGGGC 1972 het 68 hom 20 1 9 10 G 15 9 305394 CASAVA_Build 2 151116614 2D AAAACTACAC AT/-- GTGATATCAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 AT 1 0 305395 CASAVA_Build 2 151128847 4D TGTTTGTTTG TTTT/---- TTTTTTTGTT 571 het 571 ref 34 15 5 14 T 11 7 305396 CASAVA_Build 2 151136721 1D AAAAGAAAAG A/- AAAGAAAGAA 3070 het 8 hom 19 1 15 3 A 4 3 305397 CASAVA_Build 2 151163831 1D GAATATTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 809 hom 23 3 11 9 A 17 16 305398 CASAVA_Build 2 151171086 3D GCCCCATGCT TAA/--- TGTGTCTTAT 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 TAA 1 0 305399 CASAVA_Build 2 151196452 1I TATCTATTTC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 8 9 305400 CASAVA_Build 2 151196692 1D ACAAATAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 9 305401 CASAVA_Build 2 151201414 1I GGTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 520 het 30 hom 21 1 11 9 G 0 1 305402 CASAVA_Build 2 151210340 1D CAGTCATTCC A/- ATGGAGAACT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 2 1 305403 CASAVA_Build 2 151223740 1D ACAATCATTC T/- TTTTTTTTTT 2930 het 378 hom 33 2 17 14 T 17 16 305404 CASAVA_Build 2 151264333 1D TCAAATGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 293 hom 35 2 25 9 T 13 12 305405 CASAVA_Build 2 151282226 1I GTAGCTGGGA -/T TACAGGCACA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 T 1 2 305406 CASAVA_Build 2 151286042 1I CAAGAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1460 hom 44 4 33 7 T 10 11 305407 CASAVA_Build 2 151301034 3D GAGGTGGGGA AGG/--- AGAAGTAATT 3070 hom 114 het 40 0 37 3 AGG 1 0 305408 CASAVA_Build 2 151301955 1I GAAAGAAATT -/A AAATGAGAGG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 3 4 305409 CASAVA_Build 2 151310803 1D CACAGATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2202 hom 37 10 14 13 A 13 12 305410 CASAVA_Build 2 151317869 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 639 hom 17 2 12 3 T 13 14 305411 CASAVA_Build 2 151326639 1I TTTGATTGCA -/T TTAGGCCCAC 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 T 2 3 305412 CASAVA_Build 2 151333498 1I AGCACAAGTT -/A AAAAAAAAAA 715 het 715 ref 48 19 2 27 A 13 14 305413 CASAVA_Build 2 151336131 1I CTTGAAATGG -/A AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 A 6 7 305414 CASAVA_Build 2 151341358 2D18M1I CGCCACGGCA ACAGAGTGAGACTCTGTTTC-/--AGAGTGAGACTCTGTCTCA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 7 12 7 N/A 0 0 305415 CASAVA_Build 2 151347979 2D TCTGGAAACA TG/-- TGTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 46 22 19 5 TG 2 1 305416 CASAVA_Build 2 151355130 1I AAAAAGGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2732 hom 23 7 11 5 A 11 12 305417 CASAVA_Build 2 151356102 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 1779 hom 26 5 11 10 TA 7 6 305418 CASAVA_Build 2 151361320 1D CGAAATAAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 8 7 305419 CASAVA_Build 2 151383335 1I TAGGATAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 15 16 305420 CASAVA_Build 2 151388883 1D TAAACTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 11 10 305421 CASAVA_Build 2 151403406 1D CATTGTACGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 T 11 10 305422 CASAVA_Build 2 151407749 1I ACCATCAGTT -/G GGGGCAGGGT 2978 het 2978 ref 26 11 8 7 G 4 5 305423 CASAVA_Build 2 151412577 3D TTATTCTCTT AAG/--- GAGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 AAG 1 0 305424 CASAVA_Build 2 151422613 1D GGGTCCAGAT A/- GCAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 14 22 8 A 1 0 305425 CASAVA_Build 2 151433496 1I CTAAGGAAAC -/A AAAGATAGAG 3070 hom 99 het 46 0 34 12 A 3 4 305426 CASAVA_Build 2 151441870 1D TATTTTGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 30 2 18 10 A 15 14 305427 CASAVA_Build 2 151442351 1D ATGGTCTCAA T/- CTCTGACCTT 3070 het 3070 ref 19 9 7 3 T 1 0 305428 CASAVA_Build 2 151443609 1D TGGAGGTCAG A/- AGCAAGATAA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 2 1 305429 CASAVA_Build 2 151445681 3D GACAGTTGAC AGT/--- AGCATCTCCC 3070 het 3070 hom 27 11 16 0 AGT 1 0 305430 CASAVA_Build 2 151453976 1I CTTTTTCTCA -/C CTTTTTGGAG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 1 2 305431 CASAVA_Build 2 151456348 4D GGAAGGAAGG AAGA/---- AAGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 AAGA 3 2 305432 CASAVA_Build 2 151462585 1I TTGAGATAAA -/G GATTAACTCT 3070 hom 138 het 52 0 46 6 G 1 2 305433 CASAVA_Build 2 151465712 1I ATAAGGAAAA -/G CTTTCATTCC 3070 het 2180 hom 23 6 17 0 G 0 1 305434 CASAVA_Build 2 151476476 9I AAAGTGAGAT ---------/TTGAAATGC ATGAAAAGCT 3070 hom 121 het 45 0 41 4 TTGAAATGC 0 1 305435 CASAVA_Build 2 151480470 2I ATATATATAT --/AG ATAGATAGAT 2984 het 2984 ref 22 10 7 5 AG 0 1 305436 CASAVA_Build 2 151491191 1D ATTTTAACCA T/- TTTTAAATGT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 5 4 305437 CASAVA_Build 2 151493736 1D GTAATCAAGG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 A 7 6 305438 CASAVA_Build 2 151494917 1I TTCTCATCAC -/A AAAAATGATA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 5 6 305439 CASAVA_Build 2 151499116 1D GATTTAAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 10 9 305440 CASAVA_Build 2 151504196 1I TTGTGTATGA -/C AAAAGTAGGA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 C 0 1 305441 CASAVA_Build 2 151509059 16D ATATACATGC ATATATATATATATAT/---------------- ATATATATAT 3070 het 186 hom 14 1 11 6 AT 14 6 305442 CASAVA_Build 2 151509990 4D ATATCATCCT GTCA/---- AATAGCTATA 3070 het 3070 ref 47 24 19 7 GTCA 1 0 305443 CASAVA_Build 2 151510294 2I35M2D GTGTATGTAC --GTATATATAGACACACATATATGTGTGTGTGTGTGTA/GTGTATATATAGACACACATATATGTGTGTGTGTGTG-- TATATATGCA 3070 het 1221 hom 28 8 19 7 N/A 0 0 305444 CASAVA_Build 2 151511213 1I CTTATTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 9 10 305445 CASAVA_Build 2 151514616 1D GCAACAGAAG A/- AAAAAATCCC 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 7 6 305446 CASAVA_Build 2 151516936 1I ATAATCACAT -/A AAATCTAAGG 3070 het 2546 hom 20 7 10 3 A 3 4 305447 CASAVA_Build 2 151518983 6D GGGGCAAGTA CCCCCC/------ CCCCCCCACC 1896 het 112 hom 19 1 6 12 C 13 7 305448 CASAVA_Build 2 151519652 1D TTAATGCTCC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2175 hom 23 6 14 3 T 9 8 305449 CASAVA_Build 2 151519805 1D GAGGCCAGAA G/- GGGCCATCTT 2194 het 2194 ref 19 9 5 5 G 4 3 305450 CASAVA_Build 2 151521419 8I ACAAAACAAA --------/AAACAAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 AAAC 3 5 305451 CASAVA_Build 2 151525045 1I TAGACCCAGA -/G GGCCAGAAGG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 2 3 305452 CASAVA_Build 2 151533276 3D ATCTTCGATA TCC/--- TGGCAGGGCT 3070 hom 69 het 28 0 23 6 TCC 1 0 305453 CASAVA_Build 2 151537990 1D AATTATTAAT A/- AAAAGTTATT 3070 het 3070 ref 35 20 12 5 A 5 4 305454 CASAVA_Build 2 151539136 4I TGACAGAGCT ----/TCTG TCTATTTAGT 3070 hom 154 het 55 0 52 4 TCTG 0 1 305455 CASAVA_Build 2 151539470 4D TTTTAAAAAA TCTT/---- TATTCAGAGG 3070 hom 126 het 48 0 42 9 TCTT 1 0 305456 CASAVA_Build 2 151540579 2I14M1D CCTGAGATGG --AAAAAAAAATTTCCT/AAAAAAAAAAATTTCC- TTTCCCTACA 3070 het 3070 ref 35 25 14 4 N/A 0 0 305457 CASAVA_Build 2 151541284 4D GACCTACAAC ATTA/---- ATTAGCCCTT 3070 hom 123 het 45 0 40 7 ATTA 2 1 305458 CASAVA_Build 2 151547360 5D GGGGTTTTCT TTGTA/----- TTGTATTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 TTGTA 2 1 305459 CASAVA_Build 2 151552469 3D TGAACAAAAT AAA/--- AAATACAACA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 6 3 305460 CASAVA_Build 2 151556708 1D ATGAGAAAGC T/- TAAAAAAAAA 3070 het 555 hom 37 4 25 8 T 2 1 305461 CASAVA_Build 2 151557178 1I TCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1428 hom 17 5 11 1 A 11 12 305462 CASAVA_Build 2 151559429 4D GATTATAAAC ATAA/---- ATAATGTTAA 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 ATAA 2 1 305463 CASAVA_Build 2 151566348 2D TTCTGCATAT TC/-- TTTTATAACT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 TC 1 0 305464 CASAVA_Build 2 151569819 1I AGGTGAGACA -/C CCAAATGGGA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 C 2 3 305465 CASAVA_Build 2 151571821 1D AAGGCTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 9 A 11 10 305466 CASAVA_Build 2 151572738 1D TACTTTGCCT A/- AAACCTCCCA 3070 het 3070 hom 45 21 18 6 A 4 3 305467 CASAVA_Build 2 151574001 4I GCTTTTTGTC ----/TGTT TGTTTATTTG 3070 hom 9 het 32 0 12 20 TGTT 1 2 305468 CASAVA_Build 2 151577893 2I ATGCATTTTT --/TC TTATTACAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TC 0 1 305469 CASAVA_Build 2 151584431 1D CAAAAAAAAA T/- GTTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 T 1 0 305470 CASAVA_Build 2 151589320 5I TTTCTCTCTT -----/ATAAG ATAAGGACAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATAAG 1 2 305471 CASAVA_Build 2 151594734 1D CCCTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 33 1 23 10 A 13 12 305472 CASAVA_Build 2 151599745 1D GTTGCCAAAA G/- TTTGTATTCC 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 G 1 0 305473 CASAVA_Build 2 151600575 1I CTTTTAAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 A 9 10 305474 CASAVA_Build 2 151626485 4I CACCTCTGTG ----/AGGA AGGAAGCCAA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 AGGA 1 2 305475 CASAVA_Build 2 151626835 2D TGCTGTGTCA CT/-- GATAGAACTG 3070 het 3070 hom 49 23 20 6 CT 1 0 305476 CASAVA_Build 2 151628156 4I TGTAAGCAAG ----/TGCT TTCATAGCTG 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 TGCT 0 1 305477 CASAVA_Build 2 151635868 1D ATGTTTTTTT A/- AAAAAAACCA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 8 7 305478 CASAVA_Build 2 151646655 1D TACTCAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 12 11 305479 CASAVA_Build 2 151647674 2D ACTATCAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 30 0 20 11 T 12 10 305480 CASAVA_Build 2 151663494 1I AATGCTGATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 42 0 33 9 A 9 10 305481 CASAVA_Build 2 151665269 1D ATTATTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 36 1 34 2 A 11 10 305482 CASAVA_Build 2 151667002 2I TATATAAAAA --/AC AGTTTGTTCC 3070 hom 134 het 47 0 44 3 AC 0 1 305483 CASAVA_Build 2 151667835 14D ATCAGAATTT GTCCATGGCAGATG/-------------- TGTATCTGTG 3070 hom 105 het 36 0 34 4 GTCCATGGCAGATG 1 0 305484 CASAVA_Build 2 151670165 8I TAACTCAATT --------/CTTTTGTA CTTTTGTACT 3070 hom 135 het 56 0 46 10 CTTTTGTA 1 2 305485 CASAVA_Build 2 151672841 1I ACAACAACAA -/C AAGAAAGCAC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 0 1 305486 CASAVA_Build 2 151674534 4D75M3D TTGTATGAAT CTGACTGTTTTAGATACCTCATATAAATGAAATCATACACAATATTTATCCTTTTGTGACTAATTTATTTTCACTTAGCATA/----CTGTTTTAGATACCTCATATAAATGAAATCATACACAATATTTAACCTTTTGTGACTAATTTATTTTCACTTAGC--- ATGTCTTCAA 3070 hom 148 het 37 0 50 19 N/A 0 0 305487 CASAVA_Build 2 151674886 1I GTAATTTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 309 hom 39 1 34 4 T 9 10 305488 CASAVA_Build 2 151676426 1D TATATATGGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 7 305489 CASAVA_Build 2 151676874 1D TAAAGCCTCT A/- AGGTAGCATA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 2 1 305490 CASAVA_Build 2 151677288 3D GCCTGAACTA GTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 7 GTT 1 0 305491 CASAVA_Build 2 151677841 1I CACACACACA -/C AAGTACACAC 3070 hom 34 het 31 0 13 18 C 0 1 305492 CASAVA_Build 2 151693806 3I TCACGCGGTC ---/AGG AGATCGAGAC 3070 hom 45 het 16 0 15 1 AGG 0 1 305493 CASAVA_Build 2 151697200 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 1323 hom 11 het 8 0 4 4 A 10 9 305494 CASAVA_Build 2 151698593 1I AACACTAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1845 hom 35 5 21 9 A 12 13 305495 CASAVA_Build 2 151699365 2I TCAGAAAAAA --/AG AGCATGAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 AG 1 2 305496 CASAVA_Build 2 151700677 1I AAAAAACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 12 13 305497 CASAVA_Build 2 151701122 2D TCTGTACGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 39 0 28 11 A 13 11 305498 CASAVA_Build 2 151702944 1D TGATCTGTAG A/- ATGCATTTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 1 305499 CASAVA_Build 2 151710436 1I AAAATGGCTC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 6 7 305500 CASAVA_Build 2 151744748 1D CAAAAGAAAG T/- TATTTTCTGG 3070 hom 105 het 39 0 36 5 T 2 1 305501 CASAVA_Build 2 151754453 1D CCATTTGTTT C/- CCCCAACTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 5 4 305502 CASAVA_Build 2 151754677 1D AAGCTCAACG T/- TAAGAAGACA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 1 305503 CASAVA_Build 2 151759192 1D GGATAGGAAA C/- ATTTTTAAAT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 C 1 0 305504 CASAVA_Build 2 151774652 1I TGTTGTTTTT -/A ATTATTATTA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 2 305505 CASAVA_Build 2 151776299 1D AGCTGATGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 10 9 305506 CASAVA_Build 2 151779445 1I AGGATAAAGT -/G GAAAAAAACA 3070 hom 141 het 56 0 48 8 G 1 2 305507 CASAVA_Build 2 151780305 1I AGCAGGGAAA -/G GAGGATCAGA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 1 2 305508 CASAVA_Build 2 151783705 1I CTTATACCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 9 10 305509 CASAVA_Build 2 151786381 1D CCCTGTCTCA G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 2 1 305510 CASAVA_Build 2 151788314 1D ACAACAGGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 477 hom 13 1 9 4 T 10 9 305511 CASAVA_Build 2 151799169 2D8M28D CGAAAAACAG CCTATCAAGTACTATGCTTATTACCCGGCTCACAAAAC/--TATCAAGT---------------------------- ACACCAAACC 3070 hom 96 het 28 0 33 4 N/A 0 0 305512 CASAVA_Build 2 151808215 1D AGAGAGAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 38 0 34 4 A 10 9 305513 CASAVA_Build 2 151811889 1I TACCATATAA -/T TTTTTAATAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 5 6 305514 CASAVA_Build 2 151820178 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 27 0 25 2 A 10 11 305515 CASAVA_Build 2 151826585 1I TTTGGTTTCG -/T TTTTTTGTTC 3070 hom 66 het 26 0 20 6 T 6 7 305516 CASAVA_Build 2 151837763 1I AGTTCTAGAG -/A ATGGATAGTG 3070 hom 135 het 46 0 45 1 A 1 2 305517 CASAVA_Build 2 151837876 1D TATCACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1011 hom 28 3 20 6 A 14 13 305518 CASAVA_Build 2 151841917 1I GGAGGAAGAG -/A AAAAAAGGGC 3070 hom 136 het 51 0 45 6 A 6 7 305519 CASAVA_Build 2 151851382 1D AGAACAATTA C/- CTCTAGTCCC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 C 2 1 305520 CASAVA_Build 2 151855621 2I ATTTCTAAGT --/AA AAAAAAAACG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 8 10 305521 CASAVA_Build 2 151855928 1I AGACATGTAC -/T TAACAGTCTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 1 2 305522 CASAVA_Build 2 151864484 2D ATACAGCCCC TT/-- TTATGTGGCC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 4 2 305523 CASAVA_Build 2 151868536 1I CCGCGTCCAG -/T TATCTTCTGC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 305524 CASAVA_Build 2 151869791 1D TTTACCATAA T/- TAAAAAATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 305525 CASAVA_Build 2 151881981 1D GAAAAAAAAA T/- ATATATAAAA 3070 hom 4 het 16 1 15 0 T 1 0 305526 CASAVA_Build 2 151902631 5D TCTGATGAAA TAACT/----- TAATCATATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TAACT 1 0 305527 CASAVA_Build 2 151906070 2I ATATATATAT --/AA ACCACAGATT 1586 het 1586 ref 22 12 6 4 A 1 3 305528 CASAVA_Build 2 151907269 1I TGTCTCTACT -/A AAAAATACAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 5 6 305529 CASAVA_Build 2 151911009 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 11 12 305530 CASAVA_Build 2 151938505 1I TGTAAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2861 hom 52 10 22 20 A 16 17 305531 CASAVA_Build 2 151940011 1D AGAAACTGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2748 hom 22 7 10 5 A 10 9 305532 CASAVA_Build 2 151942236 8D GCCATTTTTG TGTTTGTT/-------- TGTTTGTTTG 1413 het 1413 ref 13 6 3 5 TGTT 7 5 305533 CASAVA_Build 2 151948359 4I AAAGCATGTG ----/TTTC TTTATTAATG 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 TTTC 0 1 305534 CASAVA_Build 2 151950138 1D AGAGTCAGAG A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 114 het 42 0 36 6 A 8 7 305535 CASAVA_Build 2 151952608 1D TTGGAGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 27 1 20 6 T 11 10 305536 CASAVA_Build 2 151970564 1D TCTCGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 12 11 305537 CASAVA_Build 2 151972620 26I GGTAGAGGCA --------------------------/GGCAATAAAAAGACCACATACAGCCC GGCGTGGTGG 3070 hom 42 het 15 0 15 1 GGCAATAAAAAGACCACATACAGCCC 0 1 305538 CASAVA_Build 2 151973577 1D GCTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1871 het 508 hom 14 2 7 5 A 13 12 305539 CASAVA_Build 2 151974004 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TC 0 1 305540 CASAVA_Build 2 151975968 1D TTTGAGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 31 1 29 1 T 11 10 305541 CASAVA_Build 2 151976144 1I GGTAGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 28 2 22 4 T 11 12 305542 CASAVA_Build 2 151977021 4I ATCTCCAAAG ----/TTTC TTTGAGTTCT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 TTTC 0 1 305543 CASAVA_Build 2 151977082 3D TGTTTTTATT ATG/--- ACCTTGTTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 ATG 1 0 305544 CASAVA_Build 2 151979435 6D TTATTCCTTG TTTATT/------ TTTATTTTTA 3070 hom 111 het 49 0 38 12 TTTATT 3 2 305545 CASAVA_Build 2 151995532 1D CCCACCTCAG C/- CCCCCCAAGT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 C 7 6 305546 CASAVA_Build 2 152000416 1D TTGAAGTAGG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 9 8 305547 CASAVA_Build 2 152000528 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2302 het 2302 ref 41 26 5 10 T 12 11 305548 CASAVA_Build 2 152014509 1I TTTGTCTTTA -/C ATACATTGAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 0 1 305549 CASAVA_Build 2 152014605 1I CTTTGATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 141 hom 25 2 16 7 T 15 16 305550 CASAVA_Build 2 152020422 2D GATTTAAAAC AT/-- ATGGGAGGAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AT 2 1 305551 CASAVA_Build 2 152022794 1I ACTTTGATTC -/A AAATAATCTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 3 4 305552 CASAVA_Build 2 152025287 9D CACCTATGTT CTTATCAAC/--------- TAGCTCATGC 3070 hom 102 het 36 0 35 3 CTTATCAAC 1 0 305553 CASAVA_Build 2 152034974 1I TTATTTTTCC -/T TTTTTGTCAG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 5 6 305554 CASAVA_Build 2 152043681 1D TGCAACCCAT G/- GTCTATCCTA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 G 2 1 305555 CASAVA_Build 2 152045733 3I AGTCAAAAGA ---/AGG AGGACATTTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AGG 1 2 305556 CASAVA_Build 2 152046785 1D TGACTGTTGA G/- GGGGGGCAGA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 7 6 305557 CASAVA_Build 2 152055798 1D CATAATATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 41 3 27 12 T 15 14 305558 CASAVA_Build 2 152059150 2I TGGAAAGTAG --/TA TATGTTTCCT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 TA 1 2 305559 CASAVA_Build 2 152060208 10I CGTTATTCTG ----------/ATGCGTGCTA ATGCGTGCTA 3070 hom 108 het 48 0 37 11 ATGCGTGCTA 1 2 305560 CASAVA_Build 2 152060498 4D CTTTCATTTT TAAG/---- TAAGTAAATT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TAAG 2 1 305561 CASAVA_Build 2 152063652 4I ATAAGGTGCT ----/AAAA AAAAAAAAGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 8 12 305562 CASAVA_Build 2 152063792 4I CCAAAGCAGT ----/ATAA ATAAATGTGG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 ATAA 1 2 305563 CASAVA_Build 2 152065184 4I TGTATATAAT ----/AGAC ACACAAATAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AGAC 0 1 305564 CASAVA_Build 2 152067148 1D ATCTAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 507 hom 25 2 20 3 A 13 12 305565 CASAVA_Build 2 152068383 1D ATAGTAAAAA T/- TTTTACTACT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 5 4 305566 CASAVA_Build 2 152084800 1D AATGCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 573 hom 36 3 19 14 A 15 14 305567 CASAVA_Build 2 152096662 1D TTGATCTAAA T/- TGTGGAAGAG 3070 hom 108 het 44 0 36 9 T 2 1 305568 CASAVA_Build 2 152097507 1D CTCAATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 43 0 35 9 T 11 10 305569 CASAVA_Build 2 152104973 1I TTTTCTCTTT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 7 8 305570 CASAVA_Build 2 152121540 1I TTAACACCTC -/A CTGTCGACAC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 0 1 305571 CASAVA_Build 2 152125558 1I CTCACACACT -/C CCCTACTAAC 3070 hom 151 het 56 0 51 5 C 3 4 305572 CASAVA_Build 2 152133180 1I TATTTAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1507 hom 34 5 22 7 A 13 14 305573 CASAVA_Build 2 152156092 1I TCCGGTTGGG -/C AAGGAGGAGC 3070 het 3070 ref 63 32 25 6 C 0 1 305574 CASAVA_Build 2 152170495 1I CACAGAGAAA -/G GGAACAAGGT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 G 2 3 305575 CASAVA_Build 2 152170571 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTTGA 2397 hom 12 het 6 0 5 1 T 8 9 305576 CASAVA_Build 2 152171263 1I GGATGAGATG -/C AATTCTATGC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 C 0 1 305577 CASAVA_Build 2 152221608 1I ACAGAAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 10 11 305578 CASAVA_Build 2 152228782 1D TTTTACTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 11 10 305579 CASAVA_Build 2 152238493 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1027 het 83 hom 16 2 5 9 T 19 18 305580 CASAVA_Build 2 152272275 3D ATTTACAAGT AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 AGG 4 3 305581 CASAVA_Build 2 152282149 3I CTTCAAGGGA ---/GGC GGCAATGTCC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 GGC 1 2 305582 CASAVA_Build 2 152293829 1D TTTCACCTTG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 320 hom 58 1 49 8 A 10 9 305583 CASAVA_Build 2 152322966 1I TATTGTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 10 11 305584 CASAVA_Build 2 152323013 1D GAGAGCACTA T/- TTTTTTTTTT 1337 hom 10 het 12 0 4 8 T 11 10 305585 CASAVA_Build 2 152323057 16D AACAAGCCTA TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 2125 hom 18 het 9 0 7 3 T 28 12 305586 CASAVA_Build 2 152340452 24I CTTGAACTCC ------------------------/TGGCCTCAAGCGATCTCCTCGCTT TGGCCTCCCA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TGGCCTCAAGCGATCTCCTCGCTT 0 1 305587 CASAVA_Build 2 152341652 1I GATGTTATGA -/C GAGTCAAGTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 0 1 305588 CASAVA_Build 2 152359797 4D ATATATTCAC TATT/---- TAAACAGAGC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TATT 1 0 305589 CASAVA_Build 2 152365005 3I TGCTGTAGTG ---/ACA ACAAGAAATG 3070 hom 138 het 48 0 47 1 ACA 1 2 305590 CASAVA_Build 2 152369981 1I TAATGAACAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 118 hom 47 1 42 4 T 9 10 305591 CASAVA_Build 2 152373226 1I ATGTAAAATA -/T TTTATATAAC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 3 4 305592 CASAVA_Build 2 152467460 1D TATTTTCTCT G/- ATCTTGATAT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 G 1 0 305593 CASAVA_Build 2 152469220 1I ACCAGGTGGG -/A AAAAAAATCC 3070 hom 91 het 34 0 30 4 A 7 8 305594 CASAVA_Build 2 152474223 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAAATGGG 2311 hom 47 het 18 0 14 4 C 1 0 305595 CASAVA_Build 2 152477235 1D AATTGTGTGG T/- TTTGAGTGAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 4 3 305596 CASAVA_Build 2 152480743 44D CACCTCCCTT GGCTGGGGGGAGGGGGTTCCCCTGCCCCGTGTGGCTCTCAGCTG/-------------------------------------------- GGCTGCGGTA 2907 hom 24 het 12 0 9 6 GGCTGGGGGGAGGGGGTTCCCCTGCCCCGTGTGGCTCTCAGCTG 1 0 305597 CASAVA_Build 2 152481095 2D AACCCCTCTC TT/-- TGTTATAGAG 3070 hom 60 het 26 0 21 7 T 3 1 305598 CASAVA_Build 2 152481245 1D TCCATTTATG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 9 8 305599 CASAVA_Build 2 152511090 1D ACTCTGTCGC A/- AAAAAAAAAA 1408 het 1408 ref 17 11 4 2 A 13 12 305600 CASAVA_Build 2 152514249 1I CAGTTAGTTC -/G GTAGCCAAAA 3070 hom 152 het 54 0 48 6 G 1 2 305601 CASAVA_Build 2 152520678 1D TAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 29 2 21 6 A 13 12 305602 CASAVA_Build 2 152522211 11D CAAGCAAGGG TAGGGTAAGGA/----------- TAGGGAGATG 3070 hom 51 het 14 0 18 3 TAGGGTAAGGA 1 0 305603 CASAVA_Build 2 152526661 1D CAAAAAAAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 219 hom 38 1 33 5 A 8 7 305604 CASAVA_Build 2 152529707 1I TTTCTGTGCT -/C CCCTACCTTA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 3 4 305605 CASAVA_Build 2 152530507 1I ATTTTTTTTT -/C TTAGAGATGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 0 1 305606 CASAVA_Build 2 152531029 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTCTTTT 487 het 146 hom 27 3 2 22 TTC 1 0 305607 CASAVA_Build 2 152532434 1I AGAACTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 626 hom 34 2 29 3 T 11 12 305608 CASAVA_Build 2 152533002 1I AATGAATGTA -/T TTTTTTCTAG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 6 7 305609 CASAVA_Build 2 152539576 9D CTGGTCAACC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 25 5 A 19 10 305610 CASAVA_Build 2 152542955 2I CGGAGCTCAG --/AC CTTACCAACT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AC 0 1 305611 CASAVA_Build 2 152545841 1I ACTTCTCCAA -/C CCCCTCAGAC 3070 hom 114 het 48 0 36 12 C 4 5 305612 CASAVA_Build 2 152546105 4D CTCCATCATA ATGC/---- ATGCAGCCTA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 ATGC 2 1 305613 CASAVA_Build 2 152561691 1I GGTGTTTAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 9 305614 CASAVA_Build 2 152562294 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 9 10 305615 CASAVA_Build 2 152566479 1D GTCTCGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 23 1 16 6 A 15 14 305616 CASAVA_Build 2 152588198 1D TGAGAGGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 19 8 T 11 10 305617 CASAVA_Build 2 152591140 1D CTCTAGTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 13 12 305618 CASAVA_Build 2 152591673 1I ATTATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 38 1 27 12 T 12 13 305619 CASAVA_Build 2 152597716 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 10 9 305620 CASAVA_Build 2 152601496 1D TTTCTGGGTT A/- CTTTAGGCTA 3070 hom 114 het 44 0 36 8 A 1 0 305621 CASAVA_Build 2 152607453 1I ATTTTATTTA -/T TTTTATTTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 4 5 305622 CASAVA_Build 2 152610379 2D ACCACATTTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 92 het 52 1 40 14 A 11 9 305623 CASAVA_Build 2 152641486 1I CCAGATACTG -/A ATCTCAAAAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 1 2 305624 CASAVA_Build 2 152695756 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 17 1 12 4 A 15 14 305625 CASAVA_Build 2 152697546 2D ATCAATTGAC TA/-- TGTTATGAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 6 TA 1 0 305626 CASAVA_Build 2 152701381 4I CCATATAGAA ----/ACAG ACAGACACAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACAG 1 2 305627 CASAVA_Build 2 152705899 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 8 5 A 17 16 305628 CASAVA_Build 2 152728248 3I TTTGAATAAT ---/AAG AAATCTGATT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AAG 0 1 305629 CASAVA_Build 2 152742341 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 8 9 305630 CASAVA_Build 2 152746326 1I AAAGAAGTAA -/T TTTTTTATAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 6 7 305631 CASAVA_Build 2 152746835 1I ATTAACAAAG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 8 9 305632 CASAVA_Build 2 152747429 1I CCCTAGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 33 4 17 12 T 12 13 305633 CASAVA_Build 2 152747811 1I CAAATTGTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 9 10 305634 CASAVA_Build 2 152748119 3D GTTTTAGAAG TTT/--- TTTTTTTTTT 2019 het 384 hom 33 7 8 19 T 19 16 305635 CASAVA_Build 2 152748272 4D TTGATTCTTT CTTA/---- GAGTTTCTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTTA 1 0 305636 CASAVA_Build 2 152754441 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 9 10 305637 CASAVA_Build 2 152758593 1D TTCAACCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 17 0 11 6 T 12 11 305638 CASAVA_Build 2 152770400 4D CATCTCTTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AAAT 6 5 305639 CASAVA_Build 2 152774998 2D ATGTTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 71 het 34 0 23 11 TC 10 9 305640 CASAVA_Build 2 152786217 3I GACACATAAC ---/TTA ACAGCTTGGT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TTA 0 1 305641 CASAVA_Build 2 152793161 1I AAGACTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 39 1 29 9 A 14 15 305642 CASAVA_Build 2 152797131 1I CTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 2642 hom 24 het 11 0 9 2 C 0 1 305643 CASAVA_Build 2 152803960 1D TTTTGCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 13 12 305644 CASAVA_Build 2 152811295 1D TGCAGAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 28 2 21 5 T 12 11 305645 CASAVA_Build 2 152814675 1I AATATATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 25 1 16 8 T 11 12 305646 CASAVA_Build 2 152815096 1I TCAGTGTTGT -/C CTGTGAACAG 3070 hom 84 het 34 0 24 10 C 1 2 305647 CASAVA_Build 2 152838882 1D GCCAGATTTT G/- GGGGGGCCTG 3070 het 247 hom 20 1 17 2 G 7 6 305648 CASAVA_Build 2 152847439 1D GTAGATTACA T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 91 het 35 0 31 5 T 6 5 305649 CASAVA_Build 2 152852406 2I TATTACGCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 16 8 T 13 15 305650 CASAVA_Build 2 152854993 1D ATGGATCCTT A/- AAAAGATCGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 5 4 305651 CASAVA_Build 2 152878239 1I ATTATTAGAC -/T TTTTTCCTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 5 6 305652 CASAVA_Build 2 152886896 1I CACTCTGTTG -/C CCAGGCTGGA 3070 hom 57 het 25 0 17 8 C 2 3 305653 CASAVA_Build 2 152890101 1D GGCCTTTTTC T/- TTTCTTCAAT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 4 3 305654 CASAVA_Build 2 152891505 2D GAGTGAGACC CT/-- GTCTCAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 CT 1 0 305655 CASAVA_Build 2 152893173 1I CATTTTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 21 1 15 5 T 10 11 305656 CASAVA_Build 2 152899356 1D TTTTTTTTTT A/- AATTGAATTG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 3 2 305657 CASAVA_Build 2 152903955 1I TATTTCATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 374 hom 44 2 37 5 T 9 10 305658 CASAVA_Build 2 152904030 1D TTCTTCTTCC A/- AGTGTGGCCC 3070 het 26 hom 45 1 38 6 A 2 1 305659 CASAVA_Build 2 152908333 1D TGGGATTACA G/- GCATAAGCCA 3070 hom 75 het 29 0 25 5 G 2 1 305660 CASAVA_Build 2 152908607 1D GACATCACTT G/- GCGATCCTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 2 1 305661 CASAVA_Build 2 152911851 2I ATTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1356 het 11 hom 26 0 10 16 A 12 14 305662 CASAVA_Build 2 152917618 1I GTGGTAAGCC -/T TTTGCTCAGC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 3 4 305663 CASAVA_Build 2 152918665 1D TGAAGCAGGG C/- CCCCAGAACG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 5 4 305664 CASAVA_Build 2 152918797 3I CCCACTTGGA ---/TAT TTTATGTTGA 3070 hom 123 het 43 0 40 3 TAT 0 1 305665 CASAVA_Build 2 152924255 2I TTTTTTTTTT --/TC CACATAACAG 3070 hom 68 het 44 0 31 13 TC 0 1 305666 CASAVA_Build 2 152931235 3I AAATGTTTGC ---/CAA CAACAACAAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CAA 5 6 305667 CASAVA_Build 2 152933228 1I ATTTTAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 T 11 12 305668 CASAVA_Build 2 152933684 1D ACATTTGTGG T/- TTTTTGTGTG 3070 hom 96 het 37 0 32 7 T 6 5 305669 CASAVA_Build 2 152936131 2D TCCAAAACTC AT/-- GTCGAAATGT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 AT 1 0 305670 CASAVA_Build 2 152938476 1I CTTGTGGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 9 20 9 T 12 13 305671 CASAVA_Build 2 152946571 2I AAAGCAGAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 37 0 24 13 T 12 14 305672 CASAVA_Build 2 152951280 3I TTAACTCATT ---/CAA CAAACTCTAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 CAA 1 2 305673 CASAVA_Build 2 152951941 1I CAAAGCCCAA -/G CTGTTATCTA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 0 1 305674 CASAVA_Build 2 152953816 1I ATCTAAATGC -/T TGTTTTTCAA 3070 hom 122 het 45 0 40 5 T 1 2 305675 CASAVA_Build 2 152959482 3D AACTGTTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 39 0 33 7 T 14 11 305676 CASAVA_Build 2 152962149 1D AGTTAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 34 1 20 14 A 11 10 305677 CASAVA_Build 2 152977403 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAATAC 2588 het 2588 ref 25 10 6 9 A 8 7 305678 CASAVA_Build 2 152983737 1D TGTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 15 14 305679 CASAVA_Build 2 152983911 1D TTTCAAAGGA C/- TTTTTTTGTT 3070 het 2773 hom 28 7 16 5 C 1 0 305680 CASAVA_Build 2 152989061 1D GCGTTTTGGT G/- GGAGGAAAAT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 G 3 2 305681 CASAVA_Build 2 152991442 1I GATACTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 T 13 14 305682 CASAVA_Build 2 153006595 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 8 8 A 11 12 305683 CASAVA_Build 2 153017298 1D TTGCACTCCT C/- CCCCCCCTAG 3070 hom 58 het 31 0 23 8 C 8 7 305684 CASAVA_Build 2 153018880 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTT 3070 het 1135 hom 18 3 12 3 A 7 8 305685 CASAVA_Build 2 153019230 1D AAAATATCTC T/- TTTGGGTGGG 3070 het 3070 ref 47 20 22 6 T 4 3 305686 CASAVA_Build 2 153021644 3I GTTGCAGTGA ---/GCC GCCAAGATTG 3070 het 1931 hom 21 4 8 9 GCC 1 2 305687 CASAVA_Build 2 153026126 1D ACTTTTTTTT A/- AACATATGAA 3070 het 1826 hom 27 7 18 2 A 3 2 305688 CASAVA_Build 2 153036233 3D CTGTACCTAG CAC/--- TTGACTGCAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 8 CAC 1 0 305689 CASAVA_Build 2 153049480 1D CATGATGGTG C/- CCCTGCACTC 3070 het 3070 hom 17 8 8 1 C 4 3 305690 CASAVA_Build 2 153060581 5I AGAACTAGAG -----/AATGA AATGACGTGG 3070 het 3070 ref 50 25 23 2 AATGA 1 2 305691 CASAVA_Build 2 153060764 4I TTTCAGACTT ----/AAAA AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 A 7 11 305692 CASAVA_Build 2 153061666 1D TTATCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 T 11 10 305693 CASAVA_Build 2 153066466 1I TTTGCGTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 16 15 T 12 13 305694 CASAVA_Build 2 153069899 2D TATATTTACT AA/-- GTCAGAAGAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 2 0 305695 CASAVA_Build 2 153071198 5D TAATACCTGA TATAG/----- TATAAATGTT 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 TATAG 1 0 305696 CASAVA_Build 2 153071607 1I TGAGGAAAAA -/C ACTCATTTTA 3070 het 5 hom 30 1 14 15 C 0 1 305697 CASAVA_Build 2 153081762 1D AATTATGGAT A/- AAAACCAAAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 5 4 305698 CASAVA_Build 2 153085042 1I TCAGCTTTGA -/G GGGGGGGTGA 2808 het 2471 hom 16 6 7 3 G 7 8 305699 CASAVA_Build 2 153096239 1I ATGTAAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 11 12 305700 CASAVA_Build 2 153102420 2D TTTTAAAAAG TT/-- TAATTCTTTG 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 T 3 1 305701 CASAVA_Build 2 153102652 2I CCTTACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 48 17 20 11 AC 8 9 305702 CASAVA_Build 2 153103035 1D TTATATGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 12 11 305703 CASAVA_Build 2 153114017 1I TTACTTACTG -/C CCCAAGAATC 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 C 3 4 305704 CASAVA_Build 2 153117364 1D AGAAAATTAA T/- TTTCTTTGAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 T 4 3 305705 CASAVA_Build 2 153120351 1I AAACAGTGAC -/T TGTTGGCATT 3070 het 3070 hom 47 14 22 11 T 1 2 305706 CASAVA_Build 2 153125085 1D TAATAACCTC A/- AAAAATGTCA 3070 hom 108 het 37 0 37 1 A 6 5 305707 CASAVA_Build 2 153128921 1D GCACAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 8 T 11 10 305708 CASAVA_Build 2 153135620 1I GTTGAATTAA -/G GCCCTCTGAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 1 2 305709 CASAVA_Build 2 153135944 3D TTTCCTCCTT CTC/--- CTCTCCTGGC 3070 het 2438 hom 48 12 21 16 CTC 2 1 305710 CASAVA_Build 2 153136657 1I ACTGCTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 305711 CASAVA_Build 2 153137383 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 9 8 305712 CASAVA_Build 2 153140211 2D CCAACCAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 39 hom 30 1 17 12 A 11 9 305713 CASAVA_Build 2 153160603 6D TGAGTCTAAT GTGACA/------ GAGTGGGTAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 GTGACA 1 0 305714 CASAVA_Build 2 153165492 1I TAGTTGGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 11 12 305715 CASAVA_Build 2 153166064 3D TTCTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2505 het 988 hom 23 6 7 10 T 15 12 305716 CASAVA_Build 2 153168160 1D TTTAAGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 11 5 T 17 16 305717 CASAVA_Build 2 153173738 1D AAGCAGCCCC T/- ATTGCTTTAG 3070 hom 114 het 43 0 36 8 T 1 0 305718 CASAVA_Build 2 153203820 1D CTCCCTGTGA T/- TTTTCACAGC 3070 het 3070 hom 52 24 24 5 T 5 4 305719 CASAVA_Build 2 153207645 2D GGCTGGTGTC TG/-- TAATCCCAGC 2739 het 1873 hom 16 5 7 4 TG 1 0 305720 CASAVA_Build 2 153207769 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 2856 hom 25 8 15 2 A 9 8 305721 CASAVA_Build 2 153218146 1I TGCACACAGG -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 7 8 305722 CASAVA_Build 2 153222890 5D TAGAGAGATG AAATA/----- AAATGTGAAT 3070 het 3070 ref 33 21 11 2 AAATA 1 0 305723 CASAVA_Build 2 153240701 1D CATAAACTGC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 1251 hom 29 4 18 7 T 8 7 305724 CASAVA_Build 2 153242910 1D AACTCTTTAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 8 7 305725 CASAVA_Build 2 153248678 1D TTATGCTAAT A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 A 7 6 305726 CASAVA_Build 2 153249156 3I TTATTTATAA ---/TAT TATTACGTGT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 TAT 1 2 305727 CASAVA_Build 2 153249897 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2772 het 1023 hom 19 3 8 8 A 15 14 305728 CASAVA_Build 2 153250354 4D TAATCAAATG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 14 10 305729 CASAVA_Build 2 153250650 3D CTTGCCTTTA CTG/--- CTATTTTTAC 3070 het 3070 ref 51 24 23 6 CTG 1 0 305730 CASAVA_Build 2 153254989 2D TAACAAAAGG GT/-- TTTTTAAATT 3070 het 3070 hom 27 14 13 0 GT 1 0 305731 CASAVA_Build 2 153262308 1I CATTTAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 T 10 11 305732 CASAVA_Build 2 153268202 2I GATATATAAC --/AA AAAAAAAAAG 2960 het 2960 ref 31 17 11 3 A 9 11 305733 CASAVA_Build 2 153269209 1D CAAGGTAAAA C/- CCCCCGGGGA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 C 6 5 305734 CASAVA_Build 2 153270429 1D CTATTCCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 13 6 A 12 11 305735 CASAVA_Build 2 153272368 1I CACGTCGAAG -/A CAGCTCTCCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 305736 CASAVA_Build 2 153274653 1I ACCTAGGCAT -/G GTGGCACGCA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 G 1 2 305737 CASAVA_Build 2 153274966 5D2M1I GCTGAGATGA CAGGTGT-/-----GTA GCGCCACCAT 3070 het 1955 hom 16 7 10 3 N/A 0 0 305738 CASAVA_Build 2 153284827 4I CAATGTTTCA ----/TTTC TTTATCATTC 2051 het 2051 ref 42 31 7 4 TTTC 0 1 305739 CASAVA_Build 2 153288561 1I TAGAAGTGTT -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 A 7 8 305740 CASAVA_Build 2 153289658 1D AACCTGACAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 10 9 305741 CASAVA_Build 2 153291127 2I CCATGCACTC --/TG TGCACCCACT 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 TG 1 2 305742 CASAVA_Build 2 153294660 1I AATTCTTTCT -/A AAGGGCTTAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 2 3 305743 CASAVA_Build 2 153299127 2D AAAACTGTAA AG/-- AGGGGATACC 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 AG 2 1 305744 CASAVA_Build 2 153300587 4D GTTATTCTAA TACT/---- TACTATTGTT 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 TACT 2 1 305745 CASAVA_Build 2 153307862 16I CTAAATCAAA ----------------/ATCTGTTCTTAACATC AGACTTTCTC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 ATCTGTTCTTAACATC 0 1 305746 CASAVA_Build 2 153315410 1I TTACACAATG -/A TACCTCTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 0 1 305747 CASAVA_Build 2 153315961 1D CACGTTTGAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 9 8 305748 CASAVA_Build 2 153319075 1I ATCGTACAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 55 30 18 7 T 9 10 305749 CASAVA_Build 2 153324076 4D GTGCAAACAG AACA/---- AATACTTGAA 3070 het 3070 hom 46 17 24 7 AACA 1 0 305750 CASAVA_Build 2 153328793 2I CTGTACACTC --/TT TGCTGGTCAG 3070 hom 131 het 47 0 43 4 T 1 3 305751 CASAVA_Build 2 153330017 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1899 hom 39 9 18 12 A 13 12 305752 CASAVA_Build 2 153330383 13D AAGTGTGGGT CCATCTGACTACC/------------- CCACCATCCT 3070 het 3070 ref 41 26 14 6 CCATCTGACTACC 1 0 305753 CASAVA_Build 2 153332871 3I CGCAAATACA ---/TTC TTCTTCATAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TTC 2 3 305754 CASAVA_Build 2 153344466 4D TATAACTGAC AAAT/---- AAAAATTACA 3070 het 3070 ref 34 19 13 4 AAAT 1 0 305755 CASAVA_Build 2 153363780 2D GAATTGCAAT AG/-- AGAGTTTTAT 3070 het 3070 hom 21 8 9 5 AG 3 2 305756 CASAVA_Build 2 153381169 2I TGCTTTTATA --/CG CACGCGCGCG 3070 het 55 hom 24 3 14 7 CG 0 1 305757 CASAVA_Build 2 153407889 1I ATTTGAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 770 hom 44 2 30 12 T 11 12 305758 CASAVA_Build 2 153418604 1I TACCCAACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 40 0 37 3 T 9 10 305759 CASAVA_Build 2 153422601 2D AATACTGTAT AC/-- ACACACACGT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 AC 5 4 305760 CASAVA_Build 2 153451583 6I TGTAACTAAC ------/TAACAT CTGCACATTG 3070 hom 36 het 13 0 13 2 TAACAT 0 1 305761 CASAVA_Build 2 153452685 1I TTGTAGTTCA -/T TTTTTTTTTT 1106 het 1106 ref 31 22 4 5 T 10 11 305762 CASAVA_Build 2 153453778 1D GCAGACAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 39 1 25 13 A 13 12 305763 CASAVA_Build 2 153454805 1I CCCTGGAGTT -/A AAAGATGAAA 3070 hom 125 het 50 0 41 9 A 3 4 305764 CASAVA_Build 2 153455822 1I AGAAACCTTA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 7 8 305765 CASAVA_Build 2 153469742 1D TCTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 15 1 A 12 11 305766 CASAVA_Build 2 153471606 1D ATATTAAAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 390 hom 44 1 38 5 A 9 8 305767 CASAVA_Build 2 153473741 1D TTTTGAGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 10 9 305768 CASAVA_Build 2 153476236 1D TCACATTAAC A/- AAAAAAAAGA 2670 het 1949 hom 16 5 7 4 A 9 8 305769 CASAVA_Build 2 153476292 1I AAAAAAATAA -/T AATAAAATAA 275 hom 9 het 16 0 3 13 T 0 1 305770 CASAVA_Build 2 153479236 1D ATATCTACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 21 20 8 T 10 9 305771 CASAVA_Build 2 153481453 4I TTCATTTTTC ----/AGTT AGTTCAGCTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 AGTT 1 2 305772 CASAVA_Build 2 153483985 1D TACCCAGCCT A/- AGGTGTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 A 2 1 305773 CASAVA_Build 2 153486486 1I TAATAACAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 10 305774 CASAVA_Build 2 153494305 5I ATGCTATAAT -----/ATATA ATATATTTTA 1255 hom 7 het 3 0 3 0 ATATA 1 2 305775 CASAVA_Build 2 153496873 2D TCTGAACGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 25 7 A 18 16 305776 CASAVA_Build 2 153497140 1D CACGTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 44 0 34 10 T 11 10 305777 CASAVA_Build 2 153504021 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 22 0 11 12 T 15 14 305778 CASAVA_Build 2 153510289 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 23 2 14 9 A 15 14 305779 CASAVA_Build 2 153511543 3I GCAGTATTAA ---/ATG ATGATTATTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATG 1 2 305780 CASAVA_Build 2 153520487 1D CAGTTTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 10 9 305781 CASAVA_Build 2 153524293 4D AACCCTGTCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CAAA 4 3 305782 CASAVA_Build 2 153537203 1D CCTTTTGGTA G/- TCAGAGTATC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 G 1 0 305783 CASAVA_Build 2 153544154 1I AAAATTTGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 43 0 35 8 T 9 10 305784 CASAVA_Build 2 153567317 1I AACACACACT -/G GGGGGCTGTC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 G 5 6 305785 CASAVA_Build 2 153571979 1I AGTTATAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 27 1 24 2 T 10 11 305786 CASAVA_Build 2 153579042 6I AAAAATAAAA ------/AAAAAT AAAAATAAAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AAAAAT 1 2 305787 CASAVA_Build 2 153580194 2D ATTTTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 35 1 26 8 T 16 14 305788 CASAVA_Build 2 153588045 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 24 0 20 4 A 13 14 305789 CASAVA_Build 2 153591798 4I GTGAGGTGTC ----/TATT TATATATTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TATT 0 1 305790 CASAVA_Build 2 153594271 1D GAGAACTACA G/- GTGGGAAATG 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 G 2 1 305791 CASAVA_Build 2 153602741 2I ATTTAAAAAT --/TA TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 TA 0 1 305792 CASAVA_Build 2 153610284 4I TTTACTGTAA ----/TTTC TTTAATCAGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 TTTC 0 1 305793 CASAVA_Build 2 153619185 2I CATGACCTAC --/AG TAAGAAAGAC 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 AG 0 1 305794 CASAVA_Build 2 153630004 1I ACAGAATTAC -/A AAAAGTGACA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 A 4 5 305795 CASAVA_Build 2 153641437 1D ATGGATTGTA T/- TTAAATGTTC 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 3 2 305796 CASAVA_Build 2 153644754 1I GCAAGTTGTA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 7 8 305797 CASAVA_Build 2 153667060 1I CATTCATTCC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 7 8 305798 CASAVA_Build 2 153690845 15D TTAAATAAAA CTGATTGTTATTTTC/--------------- CTGATTGTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 CTGATTGTTATTTTC 2 1 305799 CASAVA_Build 2 153692312 1D GAACCTGGGG A/- ACCGTAATCT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 2 1 305800 CASAVA_Build 2 153694529 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1811 het 1811 ref 21 11 4 6 A 11 10 305801 CASAVA_Build 2 153698542 3I GGCCTCTTCT ---/CGA CGATGACATG 3070 het 3070 ref 50 26 19 5 CGA 1 2 305802 CASAVA_Build 2 153715084 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 T 8 7 305803 CASAVA_Build 2 153732329 4I GGCTCCTTTA ----/GATG GATGGCTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 GATG 1 2 305804 CASAVA_Build 2 153733775 1D ACTATAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 14 14 12 A 12 11 305805 CASAVA_Build 2 153739228 2D ACATTTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2601 hom 43 14 13 16 T 16 14 305806 CASAVA_Build 2 153739667 1D AATTCCAAAG T/- CACTTTCACA 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 T 1 0 305807 CASAVA_Build 2 153741299 1D TGGCTTACCA G/- TAGACTGGAC 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 G 1 0 305808 CASAVA_Build 2 153741531 1D GCCTGAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 22 2 12 9 A 17 16 305809 CASAVA_Build 2 153741855 1D50M3I AGGTAAGTAC AAATAGCATTGATTAATACAATAAAATTACCTTGTAACATATGCAAAACAT---/-AATAGCATTGATTAATACAATAAAATTACCTTGTAACATATGCAAAACATGTG GGAGTAAAAT 3070 het 3070 hom 27 10 11 25 N/A 0 0 305810 CASAVA_Build 2 153743629 1I CCGAGTAGCT -/G GGACCAGAGG 2306 hom 18 het 7 0 7 0 G 2 3 305811 CASAVA_Build 2 153745981 2D CATTTGTCTC AA/-- GATATTTTTA 3070 het 3070 hom 23 12 10 4 A 2 0 305812 CASAVA_Build 2 153746118 1D CATTACTGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 10 9 305813 CASAVA_Build 2 153758413 1I TCATTTTAAT -/A AAAAAAAAAA 2427 het 2427 ref 18 9 6 3 A 11 12 305814 CASAVA_Build 2 153758727 1D AGTCTGCTGC T/- AGTCTGGCGG 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 1 0 305815 CASAVA_Build 2 153766421 2I ATTTATCTCA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 AC 7 8 305816 CASAVA_Build 2 153769436 3D TTGGTTCTTC CTT/--- CTTCTTTATG 3070 het 3070 ref 42 19 17 7 CTT 3 2 305817 CASAVA_Build 2 153772822 103D AATACAAATA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGGACATGAGGATGATTTATTTGGCAGTCAGATCTTAAGAGGGCAGCAGAACTAGCAAATGGCCAACCCTGAGCCCAAATG/------------------------------------------------------------------------------------------------------- TTTTTAAGTT 3070 hom 30 het 14 0 14 5 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAGGACATGAGGATGATTTATTTGGCAGTCAGATCTTAAGAGGGCAGCAGAACTAGCAAATGGCCAACCCTGAGCCCAAATG 1 0 305818 CASAVA_Build 2 153780521 1I CTTTCTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 10 11 305819 CASAVA_Build 2 153782429 4D AGCATTTCCG TTAA/---- TTATTTCTTA 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 TTAA 1 0 305820 CASAVA_Build 2 153789255 1I AAAAGTTGAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 8 9 305821 CASAVA_Build 2 153798242 1I TAATACCTTA -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 74 het 28 0 25 3 T 5 6 305822 CASAVA_Build 2 153803363 2I TTCCCCAGTG --/TA TATTGCTCTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 TA 1 2 305823 CASAVA_Build 2 153809099 1D ATCAAATTAT A/- AATTGTGTTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 A 3 2 305824 CASAVA_Build 2 153813273 1I AATTCAACAT -/C CCTTTATGTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 2 3 305825 CASAVA_Build 2 153824066 1I TTTTCATTTT -/A ATGTGTCTCT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 1 2 305826 CASAVA_Build 2 153826511 4I ACCCAGGCTT ----/GTGA GTGAGCTGGC 3070 het 3070 ref 39 15 12 12 GTGA 1 2 305827 CASAVA_Build 2 153831334 2I AAGGTGGCAG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 403 hom 24 1 19 4 GA 6 7 305828 CASAVA_Build 2 153834493 2I GTTTAATTGA --/CT CACACTTCTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 CT 0 1 305829 CASAVA_Build 2 153837175 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 11 10 305830 CASAVA_Build 2 153840389 2D TCTCTCTCTT TC/-- TCTCTCATGA 3070 het 3070 hom 50 19 26 7 TC 4 3 305831 CASAVA_Build 2 153841465 1D AATTGAATAT C/- CCCCTCTTAT 3070 hom 123 het 42 0 42 0 C 5 4 305832 CASAVA_Build 2 153844354 1D TATTGAAAGA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 7 6 305833 CASAVA_Build 2 153846081 1D GAGCCTTGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 T 11 10 305834 CASAVA_Build 2 153857065 5D GTAACTTATC TGTAA/----- TTTTGTTTTA 3070 hom 114 het 41 0 39 4 TGTAA 1 0 305835 CASAVA_Build 2 153858887 2D CTGGCCTATC TT/-- TTCTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 4 2 305836 CASAVA_Build 2 153874289 1D CTTGAAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 41 0 32 9 T 12 11 305837 CASAVA_Build 2 153880720 1D CAGTAATAAG A/- AAAAAGAATC 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 6 5 305838 CASAVA_Build 2 153890205 1I TTCAAAAAAA -/G CAGCTCCTGG 2303 het 2303 ref 18 11 5 2 G 0 1 305839 CASAVA_Build 2 153895989 1I TTGGCCTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 36 0 26 10 T 11 12 305840 CASAVA_Build 2 153896199 2I TAGGATGGAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 AT 5 6 305841 CASAVA_Build 2 153916331 2D TTTTAGAATC AT/-- AGAGAGTTGT 3070 het 3070 hom 45 19 23 5 AT 1 0 305842 CASAVA_Build 2 153918344 1I TAGCTGTAGG -/T TTTTTTGTAG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 6 7 305843 CASAVA_Build 2 153931777 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 970 hom 46 3 34 9 A 10 11 305844 CASAVA_Build 2 153934189 1D TCTAAAAAAA T/- AAGAGAGAAC 3070 hom 29 het 34 0 12 24 T 1 0 305845 CASAVA_Build 2 153937120 3I TCAAGAAAGC ---/AGA AGAAGAGGCC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 AGA 2 3 305846 CASAVA_Build 2 153948764 4D TTGAATTCAC ATCA/---- GAACTTTGAA 3070 het 3070 hom 48 22 21 6 ATCA 1 0 305847 CASAVA_Build 2 153950628 5I AAAATTAAAG -----/ATAAA ATAAAATAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 ATAAA 2 3 305848 CASAVA_Build 2 153978305 1D TTCCAGACAA T/- AAATTCCTTT 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 T 1 0 305849 CASAVA_Build 2 153986663 1I GCTCCCGGCA -/G GCATTGCCAA 3070 hom 105 het 46 0 34 12 G 1 2 305850 CASAVA_Build 2 153987408 2D CAGATTAATA AG/-- AGAGAGAGGC 3070 het 3070 ref 30 13 14 4 AG 5 4 305851 CASAVA_Build 2 153998196 3I TTTGGCAATC ---/CTT CTCTTATCCT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 CTT 0 1 305852 CASAVA_Build 2 154031211 1I TTTCTAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 11 305853 CASAVA_Build 2 154031221 1I TTTTTTTTTT -/A AATATATCTG 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 2 3 305854 CASAVA_Build 2 154035340 2I AGATGGAGAA --/AG AGTCTGAGTG 3070 het 3070 hom 58 16 33 9 AG 1 2 305855 CASAVA_Build 2 154036197 5I CTCCACAGAG -----/AAGAA AAGAGAAATA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 AAGAA 0 1 305856 CASAVA_Build 2 154037007 12D ATTGGTGAGG GTACAAAGCAAA/------------ TATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 14 7 GTACAAAGCAAA 1 0 305857 CASAVA_Build 2 154037212 1D CCAGTGTTTT G/- TGGTTCAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 G 1 0 305858 CASAVA_Build 2 154039648 3I CCTGCCTGTT ---/TGA AAATTTATGT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TGA 0 1 305859 CASAVA_Build 2 154043980 1I CCGGCTGAGG -/C CACCCGCCCA 3070 hom 82 het 30 0 25 5 C 1 2 305860 CASAVA_Build 2 154047529 1D GCACCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 2431 het 2431 ref 40 13 10 17 T 15 14 305861 CASAVA_Build 2 154057292 2D GAGACATAAA CT/-- CTCAGCATTA 3070 het 3070 ref 54 24 23 8 CT 2 1 305862 CASAVA_Build 2 154057680 4D TTAGAAATTT AACA/---- AACAATTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 6 AACA 2 1 305863 CASAVA_Build 2 154061753 2D ATTTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2309 het 22 hom 21 1 10 11 A 20 18 305864 CASAVA_Build 2 154065472 13D CTATCTTTAG AAGAGGATCAAAC/------------- AAGAGGATCA 3070 hom 78 het 34 0 27 11 AAGAGGATCAAAC 1 0 305865 CASAVA_Build 2 154065835 1I AAAAAAAAAA -/T ATATATAAAT 3070 het 2112 hom 22 6 13 3 T 0 1 305866 CASAVA_Build 2 154075521 1I TGGTCTAAAA -/G TAGGAGGGAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 305867 CASAVA_Build 2 154089081 1D ATTCCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2633 het 1817 hom 46 14 9 23 T 17 16 305868 CASAVA_Build 2 154094182 1D GTTATAAAAA G/- TCTCTTAGGA 3070 het 3070 ref 38 19 13 7 G 1 0 305869 CASAVA_Build 2 154118727 1I CTGGGGATGA -/G GGTTCCCCTG 3070 hom 95 het 38 0 32 6 G 2 3 305870 CASAVA_Build 2 154123796 2D AAAATCCAAC AT/-- GTGTTACCTT 3070 het 3070 hom 56 24 24 8 AT 1 0 305871 CASAVA_Build 2 154131583 1D ATCTTAAAAT A/- TATGCCTATA 3070 het 3070 ref 49 22 20 7 A 1 0 305872 CASAVA_Build 2 154134286 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 388 hom 27 1 22 4 A 8 9 305873 CASAVA_Build 2 154138337 1I TTAATTTCTC -/A ACGTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 1 2 305874 CASAVA_Build 2 154160019 1D TTTGATGGGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 8 7 305875 CASAVA_Build 2 154180898 1I TCTAGTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 10 11 305876 CASAVA_Build 2 154223543 1D CTTTGCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 26 1 20 5 T 11 10 305877 CASAVA_Build 2 154242837 1D AACAAAAAAA C/- AAAAGAAACT 3070 het 353 hom 25 1 20 4 C 1 0 305878 CASAVA_Build 2 154248197 1D ACGTAAATGG A/- AAAACCTCAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 5 4 305879 CASAVA_Build 2 154249735 1D9M1I CCTGCAAAGG ATATGAGCTC-/-TATGAGCTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 22 10 N/A 0 0 305880 CASAVA_Build 2 154252115 1D AATTACTTCC T/- GGTTCAGTCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 0 305881 CASAVA_Build 2 154260486 4D AAATGTTGAT TAAC/---- TAAATTGGAA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TAAC 1 0 305882 CASAVA_Build 2 154261378 3D TAGAGTAATT ACA/--- ACAATATGTT 3070 hom 120 het 44 0 40 6 ACA 2 1 305883 CASAVA_Build 2 154308281 4D AAGCTTTTTG TTTA/---- TTTATCTATT 3070 hom 69 het 24 0 23 2 TTTA 2 1 305884 CASAVA_Build 2 154332553 1D CTTTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 1214 het 1214 ref 56 41 5 10 T 12 11 305885 CASAVA_Build 2 154348169 4D TTTTTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 5 TTGT 4 3 305886 CASAVA_Build 2 154358414 1D ATTTTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 31 1 25 5 A 15 14 305887 CASAVA_Build 2 154371440 1D GTCAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 2970 het 2970 ref 35 14 9 12 A 17 16 305888 CASAVA_Build 2 154398754 3D ATTTCTTAAC AAT/--- GTTACTGATA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAT 1 0 305889 CASAVA_Build 2 154407824 1D ATAGGGGATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 9 8 305890 CASAVA_Build 2 154413254 4D TATGAGTAGA AATT/---- AATGACTCAG 3070 hom 96 het 34 0 32 4 AATT 1 0 305891 CASAVA_Build 2 154413745 1I AGGACTTTAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 9 305892 CASAVA_Build 2 154414937 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 1096 het 18 hom 18 0 5 13 A 12 11 305893 CASAVA_Build 2 154421008 4I ATAAAGCTGT ----/GATA GATAGGTAGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GATA 1 2 305894 CASAVA_Build 2 154427124 1D ATTCTATTTC T/- TTATAAATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 3 2 305895 CASAVA_Build 2 154431071 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 9 10 305896 CASAVA_Build 2 154445599 3D TTGTTCTTTG TTC/--- TTCTTTCCAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 TTC 2 1 305897 CASAVA_Build 2 154447763 4I AGAAACACAC ----/AATT AGAGGACCAT 3070 het 3070 ref 17 8 7 2 AATT 0 1 305898 CASAVA_Build 2 154449036 1I AATTTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 A 10 11 305899 CASAVA_Build 2 154450938 1D TTCTGAACTG A/- AAAAAAAAAA 2477 het 2477 ref 18 8 7 3 A 12 11 305900 CASAVA_Build 2 154453868 1I GGAAAGTTGA -/T TTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 T 5 6 305901 CASAVA_Build 2 154456275 1D TTTATAAGAA T/- TTGCCTGGAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 T 3 2 305902 CASAVA_Build 2 154456596 1D CCAAATGACC T/- TTTTTGGCCT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 6 5 305903 CASAVA_Build 2 154458357 3D AAATTATGTC ATT/--- ATTTACAAAA 3070 het 3070 ref 42 23 17 4 ATT 2 1 305904 CASAVA_Build 2 154459238 3D GATCGAAAAT ATC/--- ATGAGATCAT 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 ATC 1 0 305905 CASAVA_Build 2 154467046 1I GGATGAGAAT -/G AAGAGATGAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 0 1 305906 CASAVA_Build 2 154468465 11D AAAAGTTATG TTTATTAAAAT/----------- TTATCTCAGG 3070 het 3070 ref 44 25 20 7 TTTATTAAAAT 1 0 305907 CASAVA_Build 2 154473539 1I TACCATGCCA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 7 8 305908 CASAVA_Build 2 154480464 1D GTTCTTTTCC A/- CAGTCTTAGC 3070 het 3070 ref 48 27 14 8 A 1 0 305909 CASAVA_Build 2 154481285 2I ATACAGAACT --/AG ATTCTGATCT 3070 hom 148 het 59 0 50 9 AG 0 1 305910 CASAVA_Build 2 154481888 1I ATTCTGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 10 11 305911 CASAVA_Build 2 154482658 2I GGCAGTTATC --/TG TGTTAATCAT 3070 hom 16 het 41 1 27 13 TG 1 2 305912 CASAVA_Build 2 154482740 2D TCTACTTCCT TC/-- TCTCTGTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 20 7 TC 3 2 305913 CASAVA_Build 2 154508259 1D TATGTATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 12 11 305914 CASAVA_Build 2 154511450 1D GACTTAATCA C/- CCCCCAAAGG 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 C 6 5 305915 CASAVA_Build 2 154511733 1I AATTTTCACA -/T TTTTAGGTCT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 4 5 305916 CASAVA_Build 2 154512289 1I TTTTTGGTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 9 10 305917 CASAVA_Build 2 154513001 1D TAATGGGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 22 1 13 8 A 12 11 305918 CASAVA_Build 2 154513750 6D CCCTGAACTT AAAATA/------ AAAGTTAAAC 3070 het 3070 ref 39 24 14 2 AAAATA 1 0 305919 CASAVA_Build 2 154514832 1I CTGCAAAAAA -/T ATTGATAAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 1 305920 CASAVA_Build 2 154517166 1D GTCTGAAGTG A/- ATGATTATAT 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 A 2 1 305921 CASAVA_Build 2 154517522 1D AAGCCAGTCC G/- AGTCCCAAAA 2161 het 2161 ref 35 25 5 5 G 1 0 305922 CASAVA_Build 2 154521558 1I CCCACCAGAC -/A ACTGGCATTC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 1 2 305923 CASAVA_Build 2 154528826 1D TTAAAGTTCC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 8 7 305924 CASAVA_Build 2 154533727 1I CTTTTTTTAG -/T TTTTTTCACA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 6 7 305925 CASAVA_Build 2 154547602 1I CTGTCTGGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 11 9 9 A 8 9 305926 CASAVA_Build 2 154548833 2D CATTCAGTGC TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 8 305927 CASAVA_Build 2 154553825 1I TACTGTTACA -/T TTTTTCCAGT 3070 hom 94 het 42 0 33 9 T 5 6 305928 CASAVA_Build 2 154558083 3D AGTGGAATAA AGT/--- AGTAGTAGTA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 AGT 4 3 305929 CASAVA_Build 2 154559529 1D GGTTGTTTTG T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 7 6 305930 CASAVA_Build 2 154559871 1I TACAACTAAG -/A AAACAATTAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 3 4 305931 CASAVA_Build 2 154568976 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 2892 het 2594 hom 14 7 7 0 T 8 9 305932 CASAVA_Build 2 154570474 1I CTTCGATTTA -/T TTTTTTTTTT 1220 het 1220 ref 36 28 3 5 T 10 11 305933 CASAVA_Build 2 154574696 1I AATGGGATTA -/T TGTTCTTGAT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 1 2 305934 CASAVA_Build 2 154575984 16I TGTGATGTAG ----------------/CGATTAGTGCTGTAAA CTTTCTTCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 CGATTAGTGCTGTAAA 0 1 305935 CASAVA_Build 2 154578081 1I GGCCGGGAAG -/C CCCCAGCTGT 3070 hom 47 het 21 0 13 8 C 4 5 305936 CASAVA_Build 2 154590307 1I GAAGGCATGG -/T TTTTATTCAG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 4 5 305937 CASAVA_Build 2 154593948 2D TTTGTAAATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 28 4 10 15 A 16 14 305938 CASAVA_Build 2 154594921 1I ATTTAATGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 51 31 16 4 A 7 8 305939 CASAVA_Build 2 154608171 1I CTATAAGGAC -/G TTTTATATAT 2425 hom 21 het 16 0 8 8 G 0 1 305940 CASAVA_Build 2 154608832 7D CTCTGTCTCA AAAAAAT/------- AAAAAATAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 5 AAAAAAT 3 2 305941 CASAVA_Build 2 154611699 1D AGTCTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 352 hom 40 1 38 1 T 11 10 305942 CASAVA_Build 2 154614275 2D TTTTAAATAT TA/-- TATATATATA 2530 het 461 hom 12 1 6 6 TA 8 7 305943 CASAVA_Build 2 154618142 1D TTCACTTAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 10 9 305944 CASAVA_Build 2 154624490 1D TTCCAGTATG T/- TAAATACATT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 2 1 305945 CASAVA_Build 2 154625800 9I TCTTCTTAGC ---------/TTCTTAGCT TTATATATAT 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TTCTTAGCT 0 1 305946 CASAVA_Build 2 154626505 1I CAACATGGAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 7 8 305947 CASAVA_Build 2 154627612 1I ACATGGAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 40 1 30 9 T 10 11 305948 CASAVA_Build 2 154631256 4D GAAAAGAGAC AAAT/---- AACATACAAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 AAAT 1 0 305949 CASAVA_Build 2 154632699 4I CCCACAGAAT ----/GGGA GGAAGTATTT 3070 hom 104 het 38 0 35 3 GGGA 0 1 305950 CASAVA_Build 2 154637988 4D CTTGTGCGAC TGTT/---- TGAGTTGCAA 3070 hom 156 het 53 0 52 3 TGTT 1 0 305951 CASAVA_Build 2 154648313 1I GCATGGAATG -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 T 6 7 305952 CASAVA_Build 2 154661778 4D AGTAAGTAAG TAAA/---- TAAATAAATA 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TAAA 3 2 305953 CASAVA_Build 2 154662451 1I CTTGGCTCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 A 9 10 305954 CASAVA_Build 2 154663669 1I TATATAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 10 11 305955 CASAVA_Build 2 154665698 1I TATCAAGTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 12 23 8 T 8 9 305956 CASAVA_Build 2 154672450 1I GCAATAGATA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 6 7 305957 CASAVA_Build 2 154673447 1I TATTCCGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 9 10 305958 CASAVA_Build 2 154677991 1I TGGGGGCCTG -/C CAAAGGCTCC 3070 hom 81 het 33 0 26 7 C 1 2 305959 CASAVA_Build 2 154679342 3D GTGTAGTGGG GTC/--- CTTCCTTAAG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 GTC 1 0 305960 CASAVA_Build 2 154684843 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 53 21 28 4 T 7 8 305961 CASAVA_Build 2 154689008 13D ACAGATGTGA TTAAAAAAAGAAG/------------- TTAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 TTAAAAAAAGAAG 1 0 305962 CASAVA_Build 2 154697101 2I TTCATTTAAC --/TT TTGTTTTTCC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 4 305963 CASAVA_Build 2 154698294 32D CAGACCATTT TATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------- TATATATATA 2858 het 450 hom 9 1 7 4 TA 25 9 305964 CASAVA_Build 2 154707582 2D CCTGTGCATA TG/-- TGTGTGTGTG 2874 het 2874 ref 23 8 9 7 TG 8 7 305965 CASAVA_Build 2 154708308 1D TAGCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 29 1 22 7 T 12 11 305966 CASAVA_Build 2 154711559 2D CCTGCATTAC AG/-- AGTTTCCCAC 3070 het 3070 ref 37 24 8 6 AG 2 1 305967 CASAVA_Build 2 154726543 1I ATCAAGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 555 hom 29 2 19 8 T 12 13 305968 CASAVA_Build 2 154731900 6D AAAATGAAAA TAAAAT/------ TAAAAAGAAA 3070 het 2135 hom 17 6 10 1 TAAAAT 1 0 305969 CASAVA_Build 2 154745290 1I AATAGATTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 T 7 8 305970 CASAVA_Build 2 154762491 1D GCATCCAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 10 9 305971 CASAVA_Build 2 154762717 1I AAACCGTAAT -/G AAACCCCATT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 G 0 1 305972 CASAVA_Build 2 154778374 1I TTAGAGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 A 12 13 305973 CASAVA_Build 2 154780122 1D CAAACCCCTC T/- TGCTTTATTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 1 305974 CASAVA_Build 2 154792630 1D TATTATTATA T/- TTGCATGGCT 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 3 2 305975 CASAVA_Build 2 154821013 1I ACCAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 10 11 305976 CASAVA_Build 2 154823253 1D CCCTTATGTT A/- AAAAAAATAC 1986 het 1986 ref 30 21 6 4 A 8 7 305977 CASAVA_Build 2 154874070 4I AAATCCATTC ----/ATTT GTCTTCATTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 ATTT 0 1 305978 CASAVA_Build 2 154874662 1I CCATGAACAT -/G GCCAAAAAGG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 1 2 305979 CASAVA_Build 2 154876964 1D AAGAAATTAC A/- AAAGTATTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 4 3 305980 CASAVA_Build 2 154878630 1I AGTCTAATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 9 10 305981 CASAVA_Build 2 154881213 4I TTACAAGTTC ----/CTGA CTAAGTTTTC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 CTGA 0 1 305982 CASAVA_Build 2 154887268 1I TGTAACTGTA -/T AACTACATAT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 0 1 305983 CASAVA_Build 2 154888555 1D TATTCTAGGT A/- AAAGCAGCAT 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 A 4 3 305984 CASAVA_Build 2 154894545 1D GCTGGTTGTT A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 50 16 27 8 A 8 7 305985 CASAVA_Build 2 154898578 1I AGAGAAAATG -/A TAGTAGTTCT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 0 1 305986 CASAVA_Build 2 154898834 1I CATGGATGAC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 8 305987 CASAVA_Build 2 154899153 4D TGAAATCAAT AGAC/---- AGCCTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 5 AGAC 1 0 305988 CASAVA_Build 2 154899350 24D TTTGCTTGCA TCAGAAAACTTGCCATCATTCTTC/------------------------ TCAGTTACAA 3070 het 3070 hom 34 20 21 5 TCAGAAAACTTGCCATCATTCTTC 1 0 305989 CASAVA_Build 2 154900001 2I AAAAAAAGAC --/TG GAGTCACGAT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TG 0 1 305990 CASAVA_Build 2 154906481 1D CCTGTTCTGG A/- AAAAGGAGTG 3070 het 3070 ref 51 25 24 2 A 5 4 305991 CASAVA_Build 2 154911791 3I TCCAGTTAAA ---/AAT AATATTACCT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 AAT 1 2 305992 CASAVA_Build 2 154919378 2I AATCTCACTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 480 hom 43 4 18 21 TC 0 1 305993 CASAVA_Build 2 154919694 4I TTTTCTCTGA ----/CACT CACTAACTTT 3070 het 3070 hom 44 23 17 4 CACT 1 2 305994 CASAVA_Build 2 154925250 2D TACCACAGAC TG/-- TGTTTTATCC 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 TG 2 1 305995 CASAVA_Build 2 154926884 9D GTCCACAGGA ACTGGTGGC/--------- ACCCTATTTT 3070 het 3070 ref 37 23 11 5 ACTGGTGGC 1 0 305996 CASAVA_Build 2 154927773 1I ACTGTTTTGC -/T TTTCTCATTT 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 3 4 305997 CASAVA_Build 2 154929227 3D AAAGTGTGAT CAC/--- GGGCAGTTAG 3070 het 3070 ref 57 31 23 5 CAC 1 0 305998 CASAVA_Build 2 154931932 3I AACCATAAAT ---/GAG GAGATGAAAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 GAG 1 2 305999 CASAVA_Build 2 154932920 1D TAAAATATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 10 9 306000 CASAVA_Build 2 154936214 3D GAAAAGTATA TGT/--- TGTTATTACT 3070 het 3070 ref 55 30 20 6 TGT 2 1 306001 CASAVA_Build 2 154936519 1I GGCCTTAAGC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 982 hom 31 4 23 4 T 7 8 306002 CASAVA_Build 2 154937102 1I ATCCTCTAAT -/C CCCCAGATGT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 C 4 5 306003 CASAVA_Build 2 154937573 1I CATACATTGC -/T TCTATATTTG 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 T 1 2 306004 CASAVA_Build 2 154939980 1D TCTACTGACC T/- TGTGATCCGC 3070 het 2912 hom 15 7 8 0 T 2 1 306005 CASAVA_Build 2 154942047 1D TGTTCATTGT C/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 1 0 306006 CASAVA_Build 2 154947546 1D TCTTAAAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 12 11 306007 CASAVA_Build 2 154948657 2D TAAAACATAC AT/-- ATATATGTGT 3070 het 2941 hom 32 11 16 5 AT 4 3 306008 CASAVA_Build 2 154949790 1D CTACAATAAA G/- TTGCTTTCTC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 G 1 0 306009 CASAVA_Build 2 154952291 4I CGTGTTTCTC ----/CTGT CTATCTGAAA 3070 het 3070 ref 58 27 25 6 CTGT 0 1 306010 CASAVA_Build 2 154953253 5I TTCTCCTGTG -----/TTTTC TTTTAGTACT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TTTTC 0 1 306011 CASAVA_Build 2 154953450 3D TAACAATGGC TTA/--- TTATTATATT 3070 het 3070 ref 25 11 11 5 TTA 3 2 306012 CASAVA_Build 2 154963274 1I CTATCTTCTA -/C AATGGATCAG 3070 het 3070 hom 36 8 23 5 C 0 1 306013 CASAVA_Build 2 154965690 2I AGGCTTTCTG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 A 9 11 306014 CASAVA_Build 2 154972362 1D TGAACAGGTA C/- CGGGTTTTGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 2 1 306015 CASAVA_Build 2 154976076 26D AATTGCACAT ACACACACACACACACACACACACAC/-------------------------- ACACACACAC 3022 het 1683 hom 17 5 8 8 AC 21 8 306016 CASAVA_Build 2 154979266 1I GTGTATTATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 10 11 306017 CASAVA_Build 2 154986369 4I TTTTTTTCCA ----/AATT AATCTATTCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AATT 0 1 306018 CASAVA_Build 2 154996589 1D AGTTTCCCTG C/- ACACGCTCTC 3070 het 3070 hom 42 16 16 11 C 1 0 306019 CASAVA_Build 2 155006805 2D ATAATTAGAT TC/-- TCTTTCAGTG 3070 het 3070 ref 40 21 19 0 TC 2 1 306020 CASAVA_Build 2 155011742 1I GGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 T 8 9 306021 CASAVA_Build 2 155020354 2I AAATCAGCCC --/CT CTTATGTATA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CT 1 2 306022 CASAVA_Build 2 155020907 2D TCTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 39 0 32 7 T 13 11 306023 CASAVA_Build 2 155028014 1D TATCATAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 33 0 20 14 A 15 14 306024 CASAVA_Build 2 155038045 2D GCCAATTAAT AA/-- GAGCTCTTTC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 2 0 306025 CASAVA_Build 2 155044746 1I GTGCATTTGT -/A AAAAAAAAAA 2929 het 1579 hom 24 5 11 8 A 15 16 306026 CASAVA_Build 2 155047347 1I TACAATTATC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 8 9 306027 CASAVA_Build 2 155050293 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2302 hom 25 8 11 6 A 12 13 306028 CASAVA_Build 2 155061120 4I TTAAGCCAGT ----/GTTA GTTAATTATT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 GTTA 1 2 306029 CASAVA_Build 2 155061772 1D AAAATCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 16 8 T 13 12 306030 CASAVA_Build 2 155066086 2D GTGAGGGTTC AT/-- ATGTTTGTTG 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 AT 2 1 306031 CASAVA_Build 2 155068835 1I CATCTTAATT -/A TAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 0 1 306032 CASAVA_Build 2 155069088 23D GGGTTCCTAT GCTGTATGCGACCTAGGAACTTG/----------------------- GTGCTCTGAG 1939 het 1939 ref 33 29 7 5 GCTGTATGCGACCTAGGAACTTG 1 0 306033 CASAVA_Build 2 155073421 4I CTCAATACAC ----/AATG AATCCTATAA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 AATG 0 1 306034 CASAVA_Build 2 155073796 1D CCACTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3005 hom 34 8 19 7 A 13 12 306035 CASAVA_Build 2 155096511 1D TGGCCAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 12 11 306036 CASAVA_Build 2 155096831 1I TTGAACCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 12 13 306037 CASAVA_Build 2 155109920 1I TTGTAGGCAG -/A AAAATCCTTA 3070 het 3070 hom 52 18 25 9 A 4 5 306038 CASAVA_Build 2 155115587 1I AGCTTGGCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 10 11 306039 CASAVA_Build 2 155122585 1I GGTATACAGG -/A AGAAACCAAT 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 1 2 306040 CASAVA_Build 2 155126067 1D GTTCTTACTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 A 9 8 306041 CASAVA_Build 2 155132256 1I AACATCAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2867 hom 32 9 17 6 A 9 10 306042 CASAVA_Build 2 155133873 4I TATCAAATTG ----/ACAA ACAAACAACA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 ACAA 2 3 306043 CASAVA_Build 2 155135141 1D CATTTAAATG T/- TTTTTTCAAT 3070 het 2811 hom 14 6 7 1 T 7 6 306044 CASAVA_Build 2 155137775 1D TTGGGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 13 12 306045 CASAVA_Build 2 155162974 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2124 het 2064 hom 22 10 6 6 T 12 11 306046 CASAVA_Build 2 155167817 1I ATCTATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 45 1 31 13 A 13 14 306047 CASAVA_Build 2 155172473 5I TTTACTATTT -----/CTTAG CTTAGCACTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTTAG 1 2 306048 CASAVA_Build 2 155194530 3D AACTTTTGTA TTC/--- TTCTTTGTGT 3070 het 3070 ref 42 27 13 3 TTC 2 1 306049 CASAVA_Build 2 155234022 2D AAAAATATCC CT/-- CTTTCCAACA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 CT 2 1 306050 CASAVA_Build 2 155251115 1D AATTCCTCTC T/- CTCTCCTGCC 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 1 0 306051 CASAVA_Build 2 155255144 1D TTTCTGGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 T 11 10 306052 CASAVA_Build 2 155256475 1D GAGCTTGCCC T/- TTCACCTGGA 3070 hom 101 het 38 0 31 7 T 3 2 306053 CASAVA_Build 2 155267902 1I TTCTTTGATA -/C ACTGTTCGAG 3070 het 3070 ref 40 20 20 0 C 0 1 306054 CASAVA_Build 2 155272896 1I CAGCCACACA -/C CAAGTTAGAG 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 C 1 2 306055 CASAVA_Build 2 155285822 1I TTTTAAAAAA -/T ATCCTTCATT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 0 1 306056 CASAVA_Build 2 155286889 1I ACTACAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 967 hom 39 3 29 7 T 12 13 306057 CASAVA_Build 2 155288055 5I AAATAAAAAG -----/ATAAA ATAAAATAAA 3070 hom 59 het 25 0 20 5 ATAAA 2 3 306058 CASAVA_Build 2 155288379 4D TTATGTTTTG TGTT/---- TGTTTTGTCC 3070 hom 114 het 40 0 39 2 TGTT 2 1 306059 CASAVA_Build 2 155296472 1I CTTGCTCTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 432 hom 35 1 27 7 A 9 10 306060 CASAVA_Build 2 155300033 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2159 het 291 hom 8 1 6 1 T 13 12 306061 CASAVA_Build 2 155301627 1D ACTGCTTATA C/- TTTTTTCCAG 3070 hom 123 het 46 0 42 5 C 1 0 306062 CASAVA_Build 2 155302233 1I AAAAGTAACC -/A GGCATTCAAA 3070 hom 138 het 53 0 46 7 A 0 1 306063 CASAVA_Build 2 155306195 1D TTTTGATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 11 10 306064 CASAVA_Build 2 155318474 2I GAAGGGCTGA --/CT CTGTGGCATT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 CT 1 2 306065 CASAVA_Build 2 155319458 1D GCTTACAGGA T/- TTTTTTCAGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 6 306066 CASAVA_Build 2 155323018 3I GAATTTATAC ---/TTG TTGTTGATTT 3070 hom 73 het 30 0 23 7 TTG 2 3 306067 CASAVA_Build 2 155324122 1I TTTTTACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 292 hom 37 1 29 7 T 12 13 306068 CASAVA_Build 2 155327450 1D TATACAAAAT A/- ATATGGTAAG 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 2 1 306069 CASAVA_Build 2 155329463 1D TAATCTAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 9 8 306070 CASAVA_Build 2 155331954 1I CTTTTTTTTT -/A AAAATTATAC 3070 het 2277 hom 22 6 13 4 A 4 5 306071 CASAVA_Build 2 155339149 3I CATTGCTTCA ---/TGC AGTGTTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TGC 0 1 306072 CASAVA_Build 2 155340764 1I GAAGTGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 16 11 T 13 14 306073 CASAVA_Build 2 155347300 4I ACACACACAT ----/ACTC ACACGCAGGC 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 ACTC 0 1 306074 CASAVA_Build 2 155353530 1D AGTGTGAGTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 G 1 0 306075 CASAVA_Build 2 155356020 2D AGCATATGCC CA/-- AAATTTGGTC 3070 het 3070 hom 47 22 24 1 CA 1 0 306076 CASAVA_Build 2 155374647 2D TAGAAAATAT TA/-- TATATATATA 2229 het 2229 ref 23 7 10 6 TA 8 7 306077 CASAVA_Build 2 155375593 2I GGCTAAAGAC --/TG ATATCTAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TG 0 1 306078 CASAVA_Build 2 155382716 2D AAATAAGAAA TT/-- TTCTTATTTC 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 T 4 2 306079 CASAVA_Build 2 155383105 1I TAGATACATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 25 22 7 T 9 10 306080 CASAVA_Build 2 155391520 2D TTTGTTACAC AT/-- GTTTAGATCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 AT 1 0 306081 CASAVA_Build 2 155392470 1I GAAATTATTA -/T TTTTTTGGCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 6 7 306082 CASAVA_Build 2 155392849 3I CCGCATTGTA ---/GTT GTTATGCTAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 GTT 1 2 306083 CASAVA_Build 2 155395534 3D CATTCTACTG GCT/--- GCTAAGACTG 3070 het 3070 hom 46 22 22 3 GCT 2 1 306084 CASAVA_Build 2 155397447 1I TGGAGCTTAT -/A AGAGTGTATA 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 A 1 2 306085 CASAVA_Build 2 155399629 3I66M4D ACTTAATAAT ---AACTTCTCATTCCACCCTTAATAGTAAATTTTAAAAGTTTAAAATACCCTTAATTATAGCTTTATGAATT/AACAACTTCTCATTCCACCCTTAATAGTAAATTTTAAAAGTTTAAAATACCCTTAATTATAGCTTTATG---- ATTTTAATCA 3070 het 3070 ref 24 23 11 9 N/A 0 0 306086 CASAVA_Build 2 155400098 3I AAATTATTTT ---/CTA CTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 CTA 0 1 306087 CASAVA_Build 2 155400966 14D16M4D AGACTGTCTC AAAAAAAAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAC/--------------AAAAAAACACAAAAAA---- AAAAAAAAAC 2617 het 992 hom 12 5 8 2 N/A 0 0 306088 CASAVA_Build 2 155401187 1I TGATTTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 9 10 306089 CASAVA_Build 2 155401373 3D CATGTACTAA AAT/--- AATATATATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAT 2 1 306090 CASAVA_Build 2 155402029 4I TTTTGTGCAA ----/AAGT AATTCATGAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AAGT 0 1 306091 CASAVA_Build 2 155402150 4I CATGAGTTGA ----/ATTG ATTAACATAT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 ATTG 0 1 306092 CASAVA_Build 2 155403462 15D TATATAAATG TAACATTGTAAAGCA/--------------- TGACATTGTA 3070 het 3070 ref 29 16 15 3 TAACATTGTAAAGCA 1 0 306093 CASAVA_Build 2 155403678 1I GGATGTTTCA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 7 8 306094 CASAVA_Build 2 155405484 2I CATGATTTGG --/CT CTTTGTTGGT 3070 het 3070 ref 22 15 7 0 CT 1 2 306095 CASAVA_Build 2 155406447 1D AATTTATCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 9 8 306096 CASAVA_Build 2 155410730 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2850 het 2850 ref 24 10 8 6 A 12 13 306097 CASAVA_Build 2 155410980 5I ATATTCCAGA -----/TAAAT TAAATATAGA 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 TAAAT 1 2 306098 CASAVA_Build 2 155411537 3D GTTAAAAATC TAT/--- TATTTCTTCT 3070 het 3070 hom 26 11 15 1 TAT 2 1 306099 CASAVA_Build 2 155412346 1I ATTTTCAGGA -/T TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 T 6 7 306100 CASAVA_Build 2 155420375 1D TATATTCTGG A/- AAAAAAATAT 873 het 873 ref 17 10 2 5 A 8 7 306101 CASAVA_Build 2 155422728 1I CTGTGTGGAA -/T TAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 T 1 2 306102 CASAVA_Build 2 155426810 7I TTTCATTTTT -------/CAGGAGC CAGGTAACAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 CAGGAGC 0 1 306103 CASAVA_Build 2 155427281 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 72 het 32 0 25 8 TA 9 7 306104 CASAVA_Build 2 155428141 4D CTTTCCCTTG TAAT/---- TAATTGTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 TAAT 2 1 306105 CASAVA_Build 2 155444347 1I AGGTTTAATT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 7 8 306106 CASAVA_Build 2 155455870 1I GCTGTATTGC -/A ATCAAATGAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 1 2 306107 CASAVA_Build 2 155473351 1I TGTCAGAATG -/T TATCAGGCTG 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 T 1 2 306108 CASAVA_Build 2 155474970 6D CACCTGTATG TGTATA/------ TGTATATGTG 3070 het 3070 ref 42 27 13 5 TGTATA 2 1 306109 CASAVA_Build 2 155478055 6D GAAGAAAAGA AACAAC/------ AACAACAACA 3070 het 3070 hom 36 18 15 3 AAC 6 4 306110 CASAVA_Build 2 155481361 1I CCTGCAAAGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 37 11 20 6 T 7 8 306111 CASAVA_Build 2 155481847 4I TTGTGGGCTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 TTTG 2 3 306112 CASAVA_Build 2 155490954 1D AGTCTTACCA T/- TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 37 25 4 8 T 12 11 306113 CASAVA_Build 2 155491815 3D CTATATACTT GAA/--- GAAGAGTATG 3070 hom 70 het 27 0 24 6 GAA 2 1 306114 CASAVA_Build 2 155497412 2D TGTTGAGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 134 hom 24 4 12 8 T 13 11 306115 CASAVA_Build 2 155498112 4D ATTTGGATCT TCTC/---- TCTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 TC 4 2 306116 CASAVA_Build 2 155498593 2I TGGTATGATT --/TC TGTTTTTTTT 3070 hom 69 het 37 0 23 14 TC 0 1 306117 CASAVA_Build 2 155500227 2D AGATCTGCAC AG/-- AGTGTGCTGG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 AG 2 1 306118 CASAVA_Build 2 155507204 1D CATACAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 27 20 6 A 10 9 306119 CASAVA_Build 2 155508150 6D GTTTGTAAAT ATAAGA/------ ATAATAGTGC 3070 het 3070 hom 31 10 20 1 ATAAGA 1 0 306120 CASAVA_Build 2 155519310 4D GATGCTGCTT TATC/---- AACTAAGTTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 TATC 1 0 306121 CASAVA_Build 2 155524463 1I TAGATTTCTC -/T TTTCTAGCTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 3 4 306122 CASAVA_Build 2 155531061 1D CAATAAGTAA T/- TAAAATTTAG 3070 het 3070 hom 39 19 19 2 T 2 1 306123 CASAVA_Build 2 155537781 1I ATTTTGAAGA -/T TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 3 4 306124 CASAVA_Build 2 155539658 4D CATAACTATA ATTT/---- ATTTCTCCTC 3070 het 3070 hom 31 12 15 7 ATTT 2 1 306125 CASAVA_Build 2 155542529 1D TAAAGGTTTT A/- TATGGATATT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 1 0 306126 CASAVA_Build 2 155544842 1I GGGATGGAGT -/A AAACAGTGAC 3070 het 2256 hom 29 6 18 5 A 3 4 306127 CASAVA_Build 2 155547794 1D TAATAAGTCA T/- TTTCTAACTG 3070 het 3070 hom 45 21 23 1 T 4 3 306128 CASAVA_Build 2 155551491 2D GAATTTTAAC AG/-- AAAGTTTGAG 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 AG 1 0 306129 CASAVA_Build 2 155555814 1D TTTTTATTTC A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 28 1 21 6 A 1 0 306130 CASAVA_Build 2 155557135 9D AAATAAAACA TTATTGTCT/--------- TTATTGTCTT 3070 het 3070 hom 38 12 19 10 TTATTGTCT 2 1 306131 CASAVA_Build 2 155560589 1D TTCCCAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 42 1 25 18 A 13 12 306132 CASAVA_Build 2 155565925 1I TACAATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 11 12 306133 CASAVA_Build 2 155577517 29D GGGAAATGTC TGAGACAAAGAGTGCTATATTGTCCTGTG/----------------------------- CCAAGACAAT 3070 het 3070 ref 24 15 11 2 TGAGACAAAGAGTGCTATATTGTCCTGTG 1 0 306134 CASAVA_Build 2 155582254 4I GGGATTTTCT ----/ATTA TGCTTTTGTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ATTA 0 1 306135 CASAVA_Build 2 155582366 1D TTTTTATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 14 7 A 10 9 306136 CASAVA_Build 2 155596155 1I GATTCTAATT -/A GATCATGTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 1 306137 CASAVA_Build 2 155598076 3D GGGAAAGAAA TAG/--- TAGGGAGACT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 TAG 2 1 306138 CASAVA_Build 2 155600329 1I GTAAAACCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 22 16 11 A 9 10 306139 CASAVA_Build 2 155604073 1I AGTGTGGAAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 8 9 306140 CASAVA_Build 2 155613035 1D GATATGTAGG A/- ATGCAATTAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 1 306141 CASAVA_Build 2 155620962 1D AACTCATTGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 9 8 306142 CASAVA_Build 2 155622091 1D GTGCCTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 15 14 306143 CASAVA_Build 2 155629122 2D ACATTTTTTC AT/-- ATGTTTGTTG 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 AT 2 1 306144 CASAVA_Build 2 155630644 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1749 hom 20 5 10 5 T 10 11 306145 CASAVA_Build 2 155631750 1D GTGTTTAGTG C/- CTATAAACTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 2 1 306146 CASAVA_Build 2 155655748 1D TTCATCAGAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 8 7 306147 CASAVA_Build 2 155667855 3D CTTCAGTTAC CAA/--- CAAGTTCCTC 3070 het 3070 ref 43 26 12 6 CAA 2 1 306148 CASAVA_Build 2 155671992 1D CACATACACA T/- GAATGTTCAT 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 T 1 0 306149 CASAVA_Build 2 155679570 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1898 het 978 hom 10 3 5 3 A 13 12 306150 CASAVA_Build 2 155719063 4D GTGCACACAG ACAA/---- ACAAAAGCTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 ACAA 2 1 306151 CASAVA_Build 2 155724962 1I CAAATAATAG -/T TTTTTTCCTG 1983 het 1983 ref 11 6 5 0 T 6 7 306152 CASAVA_Build 2 155726980 1D TCACACCCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 15 8 6 T 10 9 306153 CASAVA_Build 2 155728474 2D GAATGTACAC AT/-- ATGTTTATAT 3070 het 3070 hom 44 17 22 7 AT 2 1 306154 CASAVA_Build 2 155734378 1I TGATTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 10 11 306155 CASAVA_Build 2 155735204 2I TACGTATATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 54 24 22 13 TA 5 6 306156 CASAVA_Build 2 155735945 1D ATTTTGAGTC T/- TGGGTTTTTG 3070 het 3070 hom 53 24 22 8 T 2 1 306157 CASAVA_Build 2 155745828 1D AGCAAAATAT A/- AATCACATTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 5 A 3 2 306158 CASAVA_Build 2 155746231 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 A 8 9 306159 CASAVA_Build 2 155752437 1D GTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 1401 het 1401 ref 42 34 4 4 A 10 9 306160 CASAVA_Build 2 155754870 1I AAAATAATAT -/A AAAAATAAGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 5 6 306161 CASAVA_Build 2 155755978 3D CTGTACAGTC TTT/--- TTTTTAATTT 2332 het 486 hom 9 1 6 2 T 8 5 306162 CASAVA_Build 2 155758613 1D TCCTCTACTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 9 8 306163 CASAVA_Build 2 155793407 1D ATTTTTGATG T/- TTTTTTTTTC 878 het 878 ref 57 48 3 6 T 10 9 306164 CASAVA_Build 2 155794075 3D ATCTGTAGAT TTC/--- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 TTC 1 0 306165 CASAVA_Build 2 155801058 4D AGATGATAAA AGTC/---- AGAAAAGATC 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 AGTC 1 0 306166 CASAVA_Build 2 155801472 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 814 hom 30 5 15 10 A 17 16 306167 CASAVA_Build 2 155804418 1D GCTGAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1577 hom 24 4 10 10 A 15 14 306168 CASAVA_Build 2 155809573 1D TCATGATTTC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 20 4 T 7 6 306169 CASAVA_Build 2 155815083 2D AGGAAACAAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 48 15 26 8 GT 6 5 306170 CASAVA_Build 2 155824538 1D AGTCTTTCAT C/- AATGAGGGTA 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 C 1 0 306171 CASAVA_Build 2 155846691 1D TTTTGTGTGT G/- TTTTTAGTAG 3070 het 3070 ref 22 13 9 0 G 1 0 306172 CASAVA_Build 2 155853935 1I GTCTTATAGA -/G GAGGTACAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 1 2 306173 CASAVA_Build 2 155860609 1D ATTGGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 31 0 26 5 A 11 10 306174 CASAVA_Build 2 155871914 4I TCTTCCACTT ----/AAAA AAATCATTAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 3 7 306175 CASAVA_Build 2 155875200 1D AGAGTGGGTA G/- CAATTAATGA 3070 het 3070 ref 44 18 17 10 G 1 0 306176 CASAVA_Build 2 155893483 1D TCACTAATCA T/- CAGAGAAATG 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 T 1 0 306177 CASAVA_Build 2 155905828 1I AGGCTGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2424 hom 29 9 10 10 T 14 15 306178 CASAVA_Build 2 155914699 1D GCCTTTAACA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 7 6 306179 CASAVA_Build 2 155933586 1I TTTTCATAGC -/T TTTTTTTTTT 1766 het 1766 ref 21 7 6 8 T 13 14 306180 CASAVA_Build 2 155939937 4D TAACAAATAT AGAA/---- AGAAAGCAAC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AGAA 2 1 306181 CASAVA_Build 2 155945892 2D TAAAGAAGTC TA/-- TATTTTTAAT 3070 het 2997 hom 25 7 16 3 TA 2 1 306182 CASAVA_Build 2 155959456 1I AACATATCCC -/T TTTTTTCACT 3070 hom 86 het 35 0 30 5 T 6 7 306183 CASAVA_Build 2 155963021 3I TATCTTCTGG ---/TAA TAATTCTACC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 TAA 1 2 306184 CASAVA_Build 2 155971514 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1904 het 1090 hom 17 7 7 3 A 19 18 306185 CASAVA_Build 2 155974674 1D CCAAAAGGCC T/- TCACTCTTCT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 T 2 1 306186 CASAVA_Build 2 155981077 4D AAAAACTGAT AAAC/---- AAATGAACAT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AAAC 1 0 306187 CASAVA_Build 2 155983059 16D GCCCCTCCCC CACTTCCCTCCTCCCT/---------------- CAGTAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 21 16 4 CACTTCCCTCCTCCCT 1 0 306188 CASAVA_Build 2 155990538 1D CACCCAGTAC T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 T 7 6 306189 CASAVA_Build 2 155994225 1D CATAATGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 13 12 306190 CASAVA_Build 2 156001034 4D TTTAATTTCT TAAA/---- TAAATATGAA 2661 het 2661 ref 20 11 7 4 TAAA 2 1 306191 CASAVA_Build 2 156008577 1I CATAATAGGC -/T TTTTTTTTTT 1138 het 1138 ref 18 11 4 3 T 11 12 306192 CASAVA_Build 2 156016255 1I GTCAAGCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 T 15 16 306193 CASAVA_Build 2 156039941 4D GAGAATTGTC TGTT/---- CGTGTCCTTT 3070 het 3070 ref 28 17 11 2 TGTT 1 0 306194 CASAVA_Build 2 156044693 4I AAAGTATAAT ----/ATAA ATAAATAAAT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 ATAA 4 5 306195 CASAVA_Build 2 156054908 1I AATTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 888 hom 44 8 21 15 C 0 1 306196 CASAVA_Build 2 156055614 1D TAAAATTTAC A/- AATCTTTTAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 3 2 306197 CASAVA_Build 2 156058559 4D CCTCCCTGCT TGCC/---- TGCCTCCTTC 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 TGCC 2 1 306198 CASAVA_Build 2 156062433 1D AAAAATCGAT A/- ACACAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 A 2 1 306199 CASAVA_Build 2 156065122 1D GCTAGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 13 12 306200 CASAVA_Build 2 156075234 3I TAAAATTATG ---/AAC AACATGTTCT 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 AAC 1 2 306201 CASAVA_Build 2 156076179 1I ATGGCTGACA -/T TTTTTTGTCC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 6 7 306202 CASAVA_Build 2 156078032 2I CTTAGTTTTT --/TA GGATCTTGCT 3070 hom 96 het 41 0 32 9 TA 0 1 306203 CASAVA_Build 2 156081714 1I TACATTTAAT -/A AAAAGAATGA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 4 5 306204 CASAVA_Build 2 156082518 1D AATAGAAAAG A/- AAAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 A 7 6 306205 CASAVA_Build 2 156082816 1D CAACATTGTT G/- TTATAGGACA 3070 het 3070 hom 43 18 24 1 G 1 0 306206 CASAVA_Build 2 156085542 3D TAAGTGATTA TTT/--- AAGTTAGACT 3070 het 3070 hom 34 16 18 2 T 3 0 306207 CASAVA_Build 2 156087262 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 A 11 10 306208 CASAVA_Build 2 156092110 4I ATTAAGGGTT ----/TTTA TTTATTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 TTTA 1 2 306209 CASAVA_Build 2 156094091 3I CTGATTTTTT ---/CTG CTGAATTGTA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 CTG 1 2 306210 CASAVA_Build 2 156104326 2D AGAAAACCCT AA/-- AGACTCCTCC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 3 1 306211 CASAVA_Build 2 156112043 3D AAGGTAACTG TCT/--- TCTTCACAGG 3070 het 3070 ref 50 26 18 9 TCT 2 1 306212 CASAVA_Build 2 156121757 2I AATAATCATC --/AG AGAGTATTAT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 AG 2 3 306213 CASAVA_Build 2 156127874 1D GGAAGAATTT G/- TATTAAAATG 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 G 1 0 306214 CASAVA_Build 2 156129451 16D CTATTTATTT TTCCCTCCCTCCCTCC/---------------- TTCCCTCCCT 3070 het 3070 ref 40 19 14 14 TTCCCTCCCTCCCTCC 1 0 306215 CASAVA_Build 2 156130632 1D TCTGTCTCCG A/- AAAAAAAAAA 1216 het 1216 ref 36 21 8 7 A 17 16 306216 CASAVA_Build 2 156135329 1D GAACTCATCA T/- TTTTTTTGGC 2416 het 2416 ref 20 15 5 0 T 8 7 306217 CASAVA_Build 2 156143296 2D AGTATGAAGA CT/-- CTCTAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 CT 3 2 306218 CASAVA_Build 2 156144499 2D ATGAGATAAC TT/-- CCTCATGTCA 3070 het 3070 hom 31 9 20 3 T 2 0 306219 CASAVA_Build 2 156149270 1D AGAACAGCCA C/- CCTACCCATG 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 C 3 2 306220 CASAVA_Build 2 156152902 1D TTTCAATCTC A/- GAGTGTTCTT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 1 0 306221 CASAVA_Build 2 156153558 1I ACTTTATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 13 14 306222 CASAVA_Build 2 156160796 4D GGTAAATTCT AACA/---- AACATTTAAA 3070 het 3070 ref 38 17 20 2 AACA 2 1 306223 CASAVA_Build 2 156163144 2I GGATTTAAAA --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 AT 4 5 306224 CASAVA_Build 2 156167357 1D GTGAAATGTA G/- GAAATTAGTG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 2 1 306225 CASAVA_Build 2 156168024 6D TGTGTGTGTG TGTATA/------ TATATATATA 2528 het 276 hom 15 2 7 6 TGTATA 1 0 306226 CASAVA_Build 2 156168365 1D TTTTCTTTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 9 8 306227 CASAVA_Build 2 156180351 2I TTCTACACAA --/AT ATGCAGAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 AT 1 2 306228 CASAVA_Build 2 156192616 1I TTAGAGATGT -/A AAAATGTTGA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 A 4 5 306229 CASAVA_Build 2 156211013 4I ACTTGTAGTC ----/TTTG TTTATTTTAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TTTG 0 1 306230 CASAVA_Build 2 156235003 1I CTAGACCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 421 hom 27 1 20 6 T 10 11 306231 CASAVA_Build 2 156242197 1I CAATGGCAAG -/A AAAAAAGTAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 306232 CASAVA_Build 2 156245695 2I TATAAATTAA --/CT CTCTTAATGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CT 2 3 306233 CASAVA_Build 2 156250561 2I GCCAAAACAT --/TA TATATATATA 1286 hom 7 het 4 0 3 1 TA 7 8 306234 CASAVA_Build 2 156258677 1I ACCTATCACC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 8 9 306235 CASAVA_Build 2 156259344 1D AAAAGTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 183 hom 20 2 12 7 A 13 12 306236 CASAVA_Build 2 156282383 1D TAATAATGAA G/- AAATGATATC 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 G 1 0 306237 CASAVA_Build 2 156282662 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 28 0 20 8 T 11 10 306238 CASAVA_Build 2 156282831 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 2893 het 423 hom 8 1 7 0 T 8 9 306239 CASAVA_Build 2 156284840 1D AAATAATATG T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 7 6 306240 CASAVA_Build 2 156289682 1I AATAATATTT -/A AAAAAAAAAA 2710 het 1400 hom 21 3 8 10 A 13 14 306241 CASAVA_Build 2 156290434 5I TTAAAAGGTA -----/AATTT AATTTTCATT 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 AATTT 1 2 306242 CASAVA_Build 2 156295442 1D ATCAGTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 T 15 14 306243 CASAVA_Build 2 156296749 1D AAAGTTTGGA T/- ATTTGAGGGC 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 T 1 0 306244 CASAVA_Build 2 156320045 1D AATTGTGTGG T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 6 306245 CASAVA_Build 2 156321261 2D TCCGACTTTG AT/-- ACAAGCCAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AT 1 0 306246 CASAVA_Build 2 156326996 2I AAATAGAAAA --/CT CTGTAGAGTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CT 1 2 306247 CASAVA_Build 2 156341583 1D CTTTAAAAAT A/- TTTTCCCATT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 1 0 306248 CASAVA_Build 2 156355144 2I TATTATTTAC --/AG ATGAATTAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AG 0 1 306249 CASAVA_Build 2 156365006 101D CAGTTTCCTC TCTTGGGGTGGAAGTAGAATATTGATTAGAAACGGGATGAGGGAATTTTCTGGGATACAGGTAGTGACCTACCTGATAGCGGGCTGGGTTATACAAACATA/----------------------------------------------------------------------------------------------------- TGCATTCATC 3070 hom 39 het 15 0 14 7 TCTTGGGGTGGAAGTAGAATATTGATTAGAAACGGGATGAGGGAATTTTCTGGGATACAGGTAGTGACCTACCTGATAGCGGGCTGGGTTATACAAACATA 1 0 306250 CASAVA_Build 2 156375902 11D TGTGTACTTC TGTGTACTTTA/----------- TGAGTTTTTC 3070 hom 135 het 46 0 45 5 TGTGTACTTTA 1 0 306251 CASAVA_Build 2 156376775 2I TCTCAATTAA --/AT ATATATATAT 2665 het 295 hom 10 1 7 2 AT 7 8 306252 CASAVA_Build 2 156379356 1D TTCCTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 29 1 20 8 A 11 10 306253 CASAVA_Build 2 156386369 7D TATACACCAA TAATGAC/------- TAAGCTGAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 5 TAATGAC 1 0 306254 CASAVA_Build 2 156387772 10D CTGTATATGT ACACACAAAC/---------- ACACACAAAC 3070 hom 63 het 33 0 22 15 ACACACAAAC 2 1 306255 CASAVA_Build 2 156404608 2D GGCAAGAAAT AA/-- AGTCAGTGAG 3070 het 3070 ref 51 25 22 6 A 3 1 306256 CASAVA_Build 2 156424866 1D ATAACAGACC A/- AAAAAAAAAA 1874 het 1874 ref 31 13 7 11 A 17 16 306257 CASAVA_Build 2 156475265 1I GTTTTTTTTT -/G TGTTTTTTTT 3070 het 360 hom 30 5 16 9 G 0 1 306258 CASAVA_Build 2 156480637 1I TTAATTTGTT -/A ACCCTCTTTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 1 2 306259 CASAVA_Build 2 156497950 1D CTATTTGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 934 hom 37 3 29 5 A 13 12 306260 CASAVA_Build 2 156501830 1I TGCTGTTGAA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 7 8 306261 CASAVA_Build 2 156503461 1D TTTAAAAGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 9 8 306262 CASAVA_Build 2 156508800 1I ATTACATTGC -/A AAAAGAAATC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 4 5 306263 CASAVA_Build 2 156521466 1D AAGACATTAT A/- AAAAGGTTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 5 4 306264 CASAVA_Build 2 156523555 1D AGGCCTCTCT A/- ATTCCCTGAG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 2 1 306265 CASAVA_Build 2 156528263 1D TCATTCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 44 1 35 8 T 11 10 306266 CASAVA_Build 2 156530056 1I TTTGATTTAG -/A ACTATTATGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 1 2 306267 CASAVA_Build 2 156541123 1I GAATAGGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 225 hom 32 1 26 5 A 11 12 306268 CASAVA_Build 2 156552094 3D GACTGCAACT TTC/--- TTCTTCTTCA 3070 hom 148 het 57 0 50 9 TTC 4 3 306269 CASAVA_Build 2 156559051 3I AATTTTTCAC ---/TTA TTATTGAAGT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TTA 1 2 306270 CASAVA_Build 2 156560423 1I TGCAGTGGCA -/T TGAGTCTCAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 2 306271 CASAVA_Build 2 156562071 1D TTCTTACCTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 135 het 46 0 46 0 T 8 7 306272 CASAVA_Build 2 156569762 1D AAAAAAAAAA T/- GTACAGGCTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 1 0 306273 CASAVA_Build 2 156573768 4D ACTTATAAAC ACAG/---- ACAAATACTG 3070 hom 114 het 41 0 39 3 ACAG 1 0 306274 CASAVA_Build 2 156573971 4I ATGCAGTATC ----/TATT CCTGATTTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TATT 0 1 306275 CASAVA_Build 2 156577510 1D GGCACACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 134 hom 29 1 25 3 T 11 10 306276 CASAVA_Build 2 156583571 1D TCTTCATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 32 1 27 4 A 11 10 306277 CASAVA_Build 2 156585782 2D AGAAAAAGAA AG/-- AGAATGAGAT 3070 hom 117 het 45 0 39 7 AG 2 1 306278 CASAVA_Build 2 156586746 1D AACAAACAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 10 9 306279 CASAVA_Build 2 156587735 1D AAAAAATATG C/- CCAAGTCCTA 3070 hom 135 het 48 0 46 3 C 3 2 306280 CASAVA_Build 2 156589353 1D TGTAAGAAGA C/- CATTCTTATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 2 1 306281 CASAVA_Build 2 156593056 1I CACACAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 786 hom 40 2 28 10 T 10 11 306282 CASAVA_Build 2 156594958 1I TTGAAATTAG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 9 306283 CASAVA_Build 2 156596451 1I TTATTATATT -/A AAAAAAGGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 306284 CASAVA_Build 2 156602020 2D CAGGTGTAGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 99 het 44 0 34 11 GA 7 6 306285 CASAVA_Build 2 156610581 2D AGTGAACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 8 7 306286 CASAVA_Build 2 156623126 1D GCAAAGAGGG A/- AAAAAAAAAA 1867 het 1867 ref 45 26 6 13 A 15 14 306287 CASAVA_Build 2 156645277 1I TTAGCTAGTA -/T TTTTTTTGAG 2906 het 2906 ref 24 14 6 4 T 7 8 306288 CASAVA_Build 2 156645502 1I AGTCCTGGAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 8 9 306289 CASAVA_Build 2 156650744 1I TTTCAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 A 10 11 306290 CASAVA_Build 2 156668045 1D AGTCCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 11 10 306291 CASAVA_Build 2 156668585 1D CTTGAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 1929 het 1242 hom 17 4 6 7 T 11 10 306292 CASAVA_Build 2 156675939 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 A 8 7 306293 CASAVA_Build 2 156678104 1D CCAATTTCCC T/- TTTTTTTTTT 2922 het 1845 hom 33 8 12 13 T 14 13 306294 CASAVA_Build 2 156680809 6D TACTAACCTC AACTTT/------ GTATGATTTC 3070 het 3070 ref 57 34 20 5 AACTTT 1 0 306295 CASAVA_Build 2 156684014 1I AACTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2163 het 2163 ref 41 16 9 16 T 14 15 306296 CASAVA_Build 2 156689152 5D TTGCTAAAAC TTTAA/----- TTTGAGTTTA 3070 het 3070 ref 31 15 14 4 TTTAA 1 0 306297 CASAVA_Build 2 156697301 1D TACAGAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 11 10 306298 CASAVA_Build 2 156710907 5I TGCATTCTTT -----/GAAAA GAAAAGTCCA 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 GAAAA 1 2 306299 CASAVA_Build 2 156711242 1D TCTCATGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 10 9 306300 CASAVA_Build 2 156715370 4D TCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 111 het 43 0 38 6 AAAC 4 3 306301 CASAVA_Build 2 156722044 6D TGGTTTTTCC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2971 het 72 hom 23 1 13 10 T 17 11 306302 CASAVA_Build 2 156722464 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 A 9 8 306303 CASAVA_Build 2 156734601 1I AATTACAAAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 390 hom 47 1 38 8 T 8 9 306304 CASAVA_Build 2 156742031 1D TTAGTAGAGA T/- TAGGGTTTCG 3070 het 3070 hom 22 10 8 5 T 2 1 306305 CASAVA_Build 2 156743044 2D AATTTACTGA AC/-- AGTTTATTTT 3070 het 3070 hom 58 26 28 5 AC 1 0 306306 CASAVA_Build 2 156760598 4I ATTGAAATTA ----/GTTT GACTCTTATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GTTT 0 1 306307 CASAVA_Build 2 156763349 1D TCAACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 11 10 306308 CASAVA_Build 2 156768074 25D AAATACATTG TTTTTTTCGCTTAATTGAACAGAAT/------------------------- TTTCGCTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 5 TTTTTTTCGCTTAATTGAACAGAAT 1 0 306309 CASAVA_Build 2 156768462 4I TGCCAAAATG ----/AATA AATAAAGATG 3070 hom 77 het 28 0 26 2 AATA 1 2 306310 CASAVA_Build 2 156784851 2D ATAATAAAAC AG/-- AAAATTCTGG 3070 het 3070 ref 24 11 7 6 AG 1 0 306311 CASAVA_Build 2 156796885 3D ACATTATATA ATG/--- ATAAAAGGAC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 ATG 1 0 306312 CASAVA_Build 2 156799979 1I TTTAAAATTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 A 8 9 306313 CASAVA_Build 2 156809547 1I AAACATCACA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 50 26 14 10 T 6 7 306314 CASAVA_Build 2 156813077 1D AATATTGATA G/- GGCATGAAGA 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 G 3 2 306315 CASAVA_Build 2 156826298 2D GGAGCCGTTA TC/-- CTTAGCAAAC 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 TC 1 0 306316 CASAVA_Build 2 156833568 4D CTTTACACTG TTTT/---- TTATTATCAC 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 6 2 306317 CASAVA_Build 2 156844545 1I CATGAGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 735 hom 37 2 23 12 T 11 12 306318 CASAVA_Build 2 156846255 6I CTTATACGCT ------/CTATGG CATGATTCTT 3070 hom 132 het 50 0 45 6 CTATGG 0 1 306319 CASAVA_Build 2 156852964 1D TCTTGTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 11 10 306320 CASAVA_Build 2 156854456 1D ATGGATCCTG C/- TCTTGGCATC 3070 het 3070 ref 40 25 13 4 C 1 0 306321 CASAVA_Build 2 156860159 15I GAAAACCAGT ---------------/TTGTTCTAACTGTCC TTGTTATATA 3070 hom 103 het 38 0 33 5 TTGTTCTAACTGTCC 0 1 306322 CASAVA_Build 2 156869796 1D CAGGTTGTTT G/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 27 12 6 G 1 0 306323 CASAVA_Build 2 156878825 1D GTTACTGTTA T/- TAGCTAGAGG 3070 het 3070 ref 39 22 11 7 T 2 1 306324 CASAVA_Build 2 156891458 1D TGGATTGTCT C/- CCTCCCTCCC 3070 het 3070 hom 36 12 14 11 C 3 2 306325 CASAVA_Build 2 156895202 1I CTCCCTCATA -/C CCCCCCCACT 3070 het 3070 hom 47 18 14 15 C 7 8 306326 CASAVA_Build 2 156897864 1I AGGCCGGCGT -/G GGCCAGGTAG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 G 2 3 306327 CASAVA_Build 2 156919988 1I CAAAAAAAAA -/G AAAGTTTACT 3070 het 2496 hom 29 7 14 8 G 0 1 306328 CASAVA_Build 2 156925033 1D TGTCAAGATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 T 10 9 306329 CASAVA_Build 2 156926194 11D CTTTTTTCAT TATTATTCTGA/----------- TGTTATTCTC 3070 hom 69 het 26 0 24 4 TATTATTCTGA 1 0 306330 CASAVA_Build 2 156926745 18D ATGCTTGCTA GCATCACTTTAAATTCTG/------------------ GCTATAAATC 3070 het 3070 ref 38 17 18 7 GCATCACTTTAAATTCTG 1 0 306331 CASAVA_Build 2 156946164 5I GGTTTTATAC -----/TTTAT TTTATTCCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTTAT 1 2 306332 CASAVA_Build 2 156981111 1D AAAATATTTC T/- TTTTTTTTTT 1464 het 1464 ref 46 28 4 14 T 13 12 306333 CASAVA_Build 2 156988961 1I TTAAATAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 609 hom 28 2 20 6 A 12 13 306334 CASAVA_Build 2 156991584 1D GGAGAAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 14 12 8 A 10 9 306335 CASAVA_Build 2 157010866 1I CACACACTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 T 8 9 306336 CASAVA_Build 2 157012878 1I CAATTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 2643 het 2643 ref 35 14 9 12 T 13 14 306337 CASAVA_Build 2 157014775 1D TCTCAAAGAG A/- AAAAAGCATA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 6 5 306338 CASAVA_Build 2 157020518 1D ATCATTTTTG T/- TTGTGTTAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 2 306339 CASAVA_Build 2 157023765 6D TAAAATAGAA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 het 273 hom 30 4 15 12 AT 10 7 306340 CASAVA_Build 2 157030031 2D TTTTAATCTT AA/-- GACAGACATT 3070 het 3070 ref 28 14 11 5 A 2 0 306341 CASAVA_Build 2 157038720 1D TTGATATAGC A/- AAGGGACAGT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 3 2 306342 CASAVA_Build 2 157045390 7D AAGGTGTGGT GGCTTTG/------- GGCTTTGTGA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 GGCTTTG 2 1 306343 CASAVA_Build 2 157046245 1I TTTTAATACC -/A AACAGTTCTA 3070 het 3070 ref 48 21 17 10 A 2 3 306344 CASAVA_Build 2 157055686 49D TAAAGTGCAG TAAAATTTACCCTTTATAATTTACAATTCTATGAGTTTTGATAAGTTTA/------------------------------------------------- TAAAATTTAC 3070 het 3070 ref 39 17 10 24 TAAAATTTACCCTTTATAATTTACAATTCTATGAGTTTTGATAAGTTTA 1 0 306345 CASAVA_Build 2 157061428 13D AAAAGAAAAC TATATTTTATGAG/------------- TTTATATTTT 3070 hom 36 het 17 0 13 6 TATATTTTATGAG 1 0 306346 CASAVA_Build 2 157061628 1I ATCATCTCTT -/C CAGTGAAATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 2 306347 CASAVA_Build 2 157061718 4D TCTCAGTCAT TCTG/---- TCTATTAGTG 3070 het 3070 ref 34 19 13 5 TCTG 1 0 306348 CASAVA_Build 2 157064569 1D TTTTGGGTGG T/- TTTTTTTTTT 2018 het 2018 ref 25 16 5 4 T 12 11 306349 CASAVA_Build 2 157066863 2D TATATATGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 57 het 24 0 19 7 TG 10 9 306350 CASAVA_Build 2 157067621 1I TCCATTTACA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 9 306351 CASAVA_Build 2 157068881 4I AAACATAGAA ----/ATAG ATAAATAACC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 ATAG 0 1 306352 CASAVA_Build 2 157072085 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 20 2 12 6 T 13 12 306353 CASAVA_Build 2 157078888 1D ATGTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 28 12 T 15 14 306354 CASAVA_Build 2 157085114 1D CCTCCTGTCC A/- ATATCACTAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 2 1 306355 CASAVA_Build 2 157087442 1D TTTTTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 244 hom 30 1 19 10 T 15 14 306356 CASAVA_Build 2 157087707 1D TTTAGAGAAA T/- TTTAGGTTCA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 4 3 306357 CASAVA_Build 2 157091360 6I AATTAATTGT ------/AGTTTA AGTTTAAGAT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AGTTTA 1 2 306358 CASAVA_Build 2 157096772 1D TTATTTTTAC T/- TTTTTAAGTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 6 5 306359 CASAVA_Build 2 157099010 3I CTCTTCTCTC ---/CTT CTCTGCTGTG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 CTT 0 1 306360 CASAVA_Build 2 157104708 1I CAAGTTCCAC -/T TTGTGGCTCG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 T 2 3 306361 CASAVA_Build 2 157106740 1D GTTTAAATGT G/- GTTTCATTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 2 1 306362 CASAVA_Build 2 157111679 4I TTTCAATACC ----/TGTT TGTTTAACAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TGTT 1 2 306363 CASAVA_Build 2 157115967 1D TTAAAAAAAA T/- ATTGTAGCAA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 1 0 306364 CASAVA_Build 2 157125059 1D TGGCATACCT G/- GTTGGTCCAT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 G 2 1 306365 CASAVA_Build 2 157127343 1D GAAAAAAAAA C/- CCCCAAAACA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 5 4 306366 CASAVA_Build 2 157134361 11D AGTGACAGAA CTGGCAGCAAT/----------- CAGGTCTCCC 3070 het 3070 hom 36 16 22 2 CTGGCAGCAAT 1 0 306367 CASAVA_Build 2 157138974 1I ACATTTAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 15 10 A 11 12 306368 CASAVA_Build 2 157141225 1D AAGCTGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 34 0 25 9 A 14 13 306369 CASAVA_Build 2 157144088 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2634 het 911 hom 17 5 9 3 T 15 14 306370 CASAVA_Build 2 157146070 1I CCAAATGTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 T 7 8 306371 CASAVA_Build 2 157151001 2D TTTTACAAAC TG/-- TGTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 TG 2 1 306372 CASAVA_Build 2 157167784 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 10 306373 CASAVA_Build 2 157169613 4D CTACTTACTT TATA/---- TATATATATA 3070 het 101 hom 20 2 9 9 TA 8 6 306374 CASAVA_Build 2 157187344 1I TGTTCTATTT -/G GGGGGGTCAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 6 7 306375 CASAVA_Build 2 157190669 1D TTTTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 1797 het 1797 ref 32 21 6 5 T 11 10 306376 CASAVA_Build 2 157190749 4D CCTCAAGTGA GTGT/---- ATTTAATGTG 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 GT 2 0 306377 CASAVA_Build 2 157212740 1D ACAATTCTTG T/- TTTGGTTTAA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 4 3 306378 CASAVA_Build 2 157217334 2D GTTGTTGAGT AA/-- AGACAGTCCC 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 A 3 1 306379 CASAVA_Build 2 157218275 1I ATTAACTGTA -/T ATTAGCAGAG 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 0 1 306380 CASAVA_Build 2 157223803 1D GGTTTTTTCT C/- CCAGTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 C 3 2 306381 CASAVA_Build 2 157249653 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 16 26 9 T 10 11 306382 CASAVA_Build 2 157264386 1D GGCTTTAAAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 T 9 8 306383 CASAVA_Build 2 157284341 1D CCATTACTTT G/- GGAGGTCCAG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 G 3 2 306384 CASAVA_Build 2 157291210 1I TATGGAAATA -/C AAAATAACAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 0 1 306385 CASAVA_Build 2 157299334 1D CATTTTTTTT A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 A 8 7 306386 CASAVA_Build 2 157312163 1I TTTGAGATCA -/C CCTTATTGTG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 2 3 306387 CASAVA_Build 2 157316602 1D CAGAACTATT C/- CATTCTGTCA 3070 hom 135 het 49 0 46 5 C 2 1 306388 CASAVA_Build 2 157332054 1I ACAAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 10 11 306389 CASAVA_Build 2 157360106 1D CAAGAAAGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 T 10 9 306390 CASAVA_Build 2 157361744 5D2M6D CACTATCTTG GCTCACTACAAAC/-----CT------ TCCACCTCCT 3070 het 3070 ref 50 26 23 5 N/A 0 0 306391 CASAVA_Build 2 157366550 3I GGGAAAAAAT ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 AAC 3 4 306392 CASAVA_Build 2 157383077 2I CTTGCTTGGC --/CA TAGCTTGTAC 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 CA 0 1 306393 CASAVA_Build 2 157384362 4D AGCAAAACTT AAAG/---- AAAGAAGGAT 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 AAAG 2 1 306394 CASAVA_Build 2 157393184 1D GAGAAATTCA C/- CTTAAGAGAG 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 C 2 1 306395 CASAVA_Build 2 157394886 1I AGAATCACAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 8 9 306396 CASAVA_Build 2 157414020 1I ACTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1681 hom 45 7 21 17 A 15 16 306397 CASAVA_Build 2 157420489 1D CCTAATACAC A/- TGAGCCCCTC 3070 het 3070 hom 50 20 21 9 A 1 0 306398 CASAVA_Build 2 157424306 2D ATTTTAATAC AT/-- ATGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 AT 2 1 306399 CASAVA_Build 2 157433103 2I TTATTTCTAC --/CA CATTATATAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 CA 1 2 306400 CASAVA_Build 2 157446324 1I ATACCCTGTC -/T TTTTTTTTTT 2888 het 1529 hom 29 9 12 8 T 12 13 306401 CASAVA_Build 2 157448478 2D GTGTAGCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 33 0 24 9 T 14 12 306402 CASAVA_Build 2 157449810 2D GGAGAAAGAG AA/-- AAAGCAGCAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 5 3 306403 CASAVA_Build 2 157456372 1D AGTCAGTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 44 0 34 10 A 11 10 306404 CASAVA_Build 2 157457353 1D ACTTGTATAT G/- GGTGAAAGGG 3070 hom 115 het 44 0 36 8 G 3 2 306405 CASAVA_Build 2 157457987 1D AAAAGAAAAC T/- GTCAGGACGA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 1 0 306406 CASAVA_Build 2 157461940 10D AGAGGGAATA ATCCCATTTT/---------- ATCCCATTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 8 ATCCCATTTT 2 1 306407 CASAVA_Build 2 157479435 1D TTAACACATC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 10 9 306408 CASAVA_Build 2 157481728 1D TGTGTATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 23 11 A 11 10 306409 CASAVA_Build 2 157488552 1I GATAGAAAAG -/A AAAACTCATT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 4 5 306410 CASAVA_Build 2 157494311 1D AATTTAAGTG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 9 het 19 0 11 8 C 11 10 306411 CASAVA_Build 2 157494761 1I AAAACCAAAG -/T TTTCAAGTTA 3070 hom 138 het 49 0 46 3 T 3 4 306412 CASAVA_Build 2 157502698 1D TTGTTTATAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 144 het 54 0 49 7 A 9 8 306413 CASAVA_Build 2 157592131 1D GAATTAACTT A/- AGATGCCCAT 3070 het 3070 hom 47 23 21 3 A 2 1 306414 CASAVA_Build 2 157617047 5D CTTTTTACTT AAATA/----- AAAGATGCAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 AAATA 1 0 306415 CASAVA_Build 2 157630369 1I AATAGAGTAA -/T TAAAATTCCA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 T 1 2 306416 CASAVA_Build 2 157649230 1I GAGGCAGGAG -/A AATTGCTTGG 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 2 3 306417 CASAVA_Build 2 157687398 1D GCCCATTAGG A/- AAAGAAGAAA 3070 het 3070 hom 52 21 23 9 A 4 3 306418 CASAVA_Build 2 157695788 1D TTGAAAAAAA T/- ATATATATAT 1900 het 284 hom 18 3 6 9 T 1 0 306419 CASAVA_Build 2 157719438 3I CACAGATAGA ---/GAT GATAAGTGGA 3070 hom 108 het 46 0 36 10 GAT 1 2 306420 CASAVA_Build 2 157736583 1D AATTGAGGAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 A 8 7 306421 CASAVA_Build 2 157737618 1D CATACCTTAC T/- TTTTTTTTTT 1625 het 1625 ref 45 29 5 12 T 12 11 306422 CASAVA_Build 2 157741525 1D CTCATGGTAG A/- TGAATCAGTC 3070 het 3070 ref 37 23 11 3 A 1 0 306423 CASAVA_Build 2 157754248 4D CCTTGTTGGC CTGT/---- CTCTCTCAAG 3070 het 3070 ref 60 30 24 9 CTGT 1 0 306424 CASAVA_Build 2 157754540 1D AACCATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 A 12 11 306425 CASAVA_Build 2 157765168 1I TGTAAAATGC -/A AAAACTATCA 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 A 4 5 306426 CASAVA_Build 2 157798188 1D TTCTCTCCTC T/- TAGACTTTGA 2947 het 2947 ref 33 17 9 7 T 2 1 306427 CASAVA_Build 2 157859724 1I TTTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 27 2 22 3 T 10 11 306428 CASAVA_Build 2 157860293 1D ACGAATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 32 3 22 7 A 13 12 306429 CASAVA_Build 2 157860904 1I TGCTCTTGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 40 0 32 8 T 8 9 306430 CASAVA_Build 2 157863693 8D ATACCCTTGA CGGAAGAC/-------- CGGAAGACCG 3070 hom 41 het 26 0 14 12 CGGAAGAC 4 3 306431 CASAVA_Build 2 157867341 1I CGCTGAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 512 hom 35 2 27 6 A 12 13 306432 CASAVA_Build 2 157871769 1D AAATAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 39 1 29 9 T 13 12 306433 CASAVA_Build 2 157873662 1I TGACAAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 48 1 42 5 T 10 11 306434 CASAVA_Build 2 157904265 1I AAAAAAACTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 288 hom 35 1 31 3 A 9 10 306435 CASAVA_Build 2 157925244 2D ACACTGCAAC CT/-- ATATGAAGGA 3070 het 3070 hom 56 24 24 12 CT 1 0 306436 CASAVA_Build 2 157957715 1I GAATAAACTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 9 10 306437 CASAVA_Build 2 157983358 1I CTGTGAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1959 hom 25 5 12 8 A 17 18 306438 CASAVA_Build 2 157990587 1D TGTTTACCCC T/- CATAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 1 0 306439 CASAVA_Build 2 158004217 1D TTGCACTTTG A/- AAAAAAAAAA 2100 het 2100 ref 44 30 7 7 A 13 12 306440 CASAVA_Build 2 158005849 3D TTCTGAAGAC TAA/--- TAATTTGAAA 3070 het 3070 ref 37 18 16 7 TAA 2 1 306441 CASAVA_Build 2 158007231 1D AGTCTCCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1150 hom 52 7 19 26 A 17 16 306442 CASAVA_Build 2 158008097 1D TCATCTATCC A/- AAAAAAAAAA 1274 het 1274 ref 47 35 3 10 A 12 11 306443 CASAVA_Build 2 158019736 4D ATATCTCATA TATT/---- TATTTATTTC 1696 hom 18 het 15 0 7 10 TATT 3 2 306444 CASAVA_Build 2 158023225 2D GTTTAAACAG CT/-- CTCTTTCTAA 3070 hom 71 het 29 0 21 8 CT 3 2 306445 CASAVA_Build 2 158024849 1D AGCAGAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 31 0 22 10 T 15 14 306446 CASAVA_Build 2 158073595 1D ATCTGCCCCT A/- AGAGTGGTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 2 1 306447 CASAVA_Build 2 158090453 1D CCCAAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 11 10 306448 CASAVA_Build 2 158114761 1D ATTACGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1192 het 213 hom 8 1 5 2 A 15 14 306449 CASAVA_Build 2 158118155 1D CATTTACTAC T/- TTTTTTTTTT 1602 het 1602 ref 33 19 5 9 T 13 12 306450 CASAVA_Build 2 158197102 1D TTGTTTGGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 10 9 306451 CASAVA_Build 2 158197421 1D TTTTTTTTTT C/- TTCTTAATTT 3070 hom 75 het 36 0 31 6 C 1 0 306452 CASAVA_Build 2 158209031 1D GCCATTACTA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 7 6 306453 CASAVA_Build 2 158210846 1I ATAATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 10 11 306454 CASAVA_Build 2 158213381 3I TCTCCTTATT ---/AGA AGCATTCTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AGA 0 1 306455 CASAVA_Build 2 158222174 1D TTGAAGTCTC T/- TTTGTTTCTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 4 3 306456 CASAVA_Build 2 158222845 4D ACATGGAAGC TTTG/---- TTTGATGGCA 3070 hom 114 het 41 0 39 4 TTTG 2 1 306457 CASAVA_Build 2 158229912 1D GAATCGCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 29 8 A 13 12 306458 CASAVA_Build 2 158232058 1D GACAAGCTCC T/- TTGATGGCCC 3070 hom 90 het 32 0 29 4 T 3 2 306459 CASAVA_Build 2 158234910 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 57 hom 30 1 26 3 A 9 8 306460 CASAVA_Build 2 158240022 1I GCCTTTTGAC -/T CTTGCCCTAA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 0 1 306461 CASAVA_Build 2 158241465 1I CAGGAAAACT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 8 9 306462 CASAVA_Build 2 158244738 1D CAAACACTTT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 A 8 7 306463 CASAVA_Build 2 158253779 1D AGGGTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 2588 het 256 hom 15 5 6 4 T 18 17 306464 CASAVA_Build 2 158284577 1I AGTCAACAGC -/T CTATGGGGGA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 0 1 306465 CASAVA_Build 2 158287177 1I AATGAACTTG -/A AAACACAGCA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 3 4 306466 CASAVA_Build 2 158299062 9D TGTAAGTTTC CTGAGGCCT/--------- CCCCAGCCAT 3070 het 1728 hom 19 6 11 4 CTGAGGCCT 1 0 306467 CASAVA_Build 2 158339650 1D AGAAAAGGGT G/- GGGGGGGTCC 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 G 8 7 306468 CASAVA_Build 2 158341227 1I TATATCTAAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 8 9 306469 CASAVA_Build 2 158365247 1D TTTTAAAATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 9 8 306470 CASAVA_Build 2 158375919 1D GTATCTTTAC T/- TTTAATGCTT 3070 hom 95 het 35 0 31 4 T 4 3 306471 CASAVA_Build 2 158432438 1D AGCAACCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 37 2 25 10 T 13 12 306472 CASAVA_Build 2 158435030 1I CAAGGTTATA -/T TTTTGGAGGG 3070 hom 123 het 51 0 41 10 T 4 5 306473 CASAVA_Build 2 158444743 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 25 1 20 4 A 14 13 306474 CASAVA_Build 2 158449205 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGAAAGAA 1889 hom 16 het 9 0 5 4 AAG 0 1 306475 CASAVA_Build 2 158462744 2I GTGAACTATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 15 0 9 6 A 10 12 306476 CASAVA_Build 2 158462962 1D CTCAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2606 hom 18 het 11 0 7 4 A 7 6 306477 CASAVA_Build 2 158470551 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1973 hom 27 het 15 0 9 6 T 13 14 306478 CASAVA_Build 2 158488173 1I AAGGTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 25 1 20 4 T 12 13 306479 CASAVA_Build 2 158500307 1I TTCATTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 257 hom 40 2 30 8 T 10 11 306480 CASAVA_Build 2 158511454 4D TATTTATTCT TTTA/---- TTTATTTATT 1235 het 1235 ref 15 5 6 4 TTTA 3 2 306481 CASAVA_Build 2 158528489 1D TTTTTATTTT A/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 A 1 0 306482 CASAVA_Build 2 158531296 1I ATCACTTCTA -/G GAGCTTTCTT 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 G 1 2 306483 CASAVA_Build 2 158538697 1I CAATTAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 11 12 306484 CASAVA_Build 2 158588519 1I TACACAAGCA -/G GCCACTCTTC 3070 hom 73 het 28 0 23 5 G 1 2 306485 CASAVA_Build 2 158608130 1D AAAGGGCATC A/- GGGGTTGACC 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 A 1 0 306486 CASAVA_Build 2 158615314 3D CAAGCTACTT AGG/--- AGGCTGAGGC 3070 het 3070 hom 27 12 15 1 AGG 2 1 306487 CASAVA_Build 2 158622339 1I AAGTTTTCCC -/A TTATTAATAT 3070 het 3070 ref 53 30 16 7 A 0 1 306488 CASAVA_Build 2 158623060 24D CAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG/------------------------ AAGAAGAAGA 1167 het 1167 ref 10 5 5 2 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 1 0 306489 CASAVA_Build 2 158627288 1I AAACCCTGCT -/G TTCCAGATTC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 0 1 306490 CASAVA_Build 2 158628360 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2273 het 2273 ref 22 10 7 6 T 12 11 306491 CASAVA_Build 2 158632416 1D ACCATGCCCA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 7 6 306492 CASAVA_Build 2 158632687 2I ATTATGTCAC --/AT ATGTTATATT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 AT 1 2 306493 CASAVA_Build 2 158684769 1D ACCTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2932 hom 16 7 8 1 A 12 11 306494 CASAVA_Build 2 158688113 1I TCGAAACCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 19 19 9 T 9 10 306495 CASAVA_Build 2 158694472 1I AAACAGAGGT -/A AAAAAAAAAA 1806 het 1806 ref 20 11 5 4 A 11 12 306496 CASAVA_Build 2 158705700 1D TTTAAATATT A/- TTTTTTATTA 3070 het 2056 hom 19 5 12 3 A 1 0 306497 CASAVA_Build 2 158716585 2I AATTGACATT --/TG CACAAGGGCA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 TG 0 1 306498 CASAVA_Build 2 158727899 1I CTGACTAGCC -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 A 7 8 306499 CASAVA_Build 2 158730465 1I CAGAATAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2735 hom 26 7 13 6 A 9 10 306500 CASAVA_Build 2 158735933 1I TGGATTGGGC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 0 1 306501 CASAVA_Build 2 158740097 3I CAACCTATTT ---/TTG TTGTTGTTAT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 TTG 2 3 306502 CASAVA_Build 2 158743591 1I CTTAGAAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 8 9 306503 CASAVA_Build 2 158769487 1D TACTTGACTC T/- GTCCAAATTC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 0 306504 CASAVA_Build 2 158770281 1I ATATACATCA -/T TTTCCTTTAA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 3 4 306505 CASAVA_Build 2 158770403 1I ACTCCACATT -/A AAAAAAGACA 3070 hom 153 het 57 0 50 7 A 6 7 306506 CASAVA_Build 2 158773857 2I TGTATGTATG --/TA TATATATATA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TA 5 6 306507 CASAVA_Build 2 158793748 1I AAAATGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 10 306508 CASAVA_Build 2 158800959 15D TTATGTGAGC ATTTTCCCATAGCAA/--------------- AGCTTCCCAC 3070 hom 105 het 37 0 35 5 ATTTTCCCATAGCAA 1 0 306509 CASAVA_Build 2 158831613 4D TGTGTGTGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 2448 hom 24 het 11 0 9 3 TG 7 5 306510 CASAVA_Build 2 158877131 2D CAGGAGGTCA AG/-- AGATCGAGAC 3070 hom 54 het 23 0 16 9 AG 2 1 306511 CASAVA_Build 2 158877321 2I GCCTGGCGAC --/AG AGTGAGAATC 2734 hom 5 het 13 0 9 4 AG 1 2 306512 CASAVA_Build 2 158880247 1D AAAGGACTTG A/- AAAAAGTTTG 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 6 5 306513 CASAVA_Build 2 158897649 1I CCCTATAACA -/T TGTTTTTTTG 3070 het 422 hom 19 1 14 4 T 1 2 306514 CASAVA_Build 2 158906068 1D TACATACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 475 hom 29 2 14 14 T 16 15 306515 CASAVA_Build 2 158906396 1D AATATAGTCA T/- TTTTTTAGAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 7 6 306516 CASAVA_Build 2 158913196 1I GCAAATCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 11 12 306517 CASAVA_Build 2 158957354 2D AGCATTTTGG AT/-- AAAGGATACT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AT 1 0 306518 CASAVA_Build 2 158967944 1I TATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 612 het 612 ref 45 32 3 10 T 10 11 306519 CASAVA_Build 2 158968446 2D CCTGTCTCAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 48 het 36 0 17 19 AC 10 9 306520 CASAVA_Build 2 158978362 1I TTCTCTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 552 hom 37 2 28 7 T 10 11 306521 CASAVA_Build 2 158979338 1I TTAAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 37 1 29 7 A 10 11 306522 CASAVA_Build 2 158983471 2I TTATCACTAT --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 777 hom 29 3 12 14 T 10 12 306523 CASAVA_Build 2 158989478 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 8 9 306524 CASAVA_Build 2 158990256 2I CTTTGCTATC --/TA TGTTATGACT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 TA 0 1 306525 CASAVA_Build 2 158993394 4D19M5I TCAGGAAACA ACAGGTGCTGGAGAGGATGTAGA-----/----GGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCT GAAATAGGAA 1392 hom 12 het 7 0 4 3 N/A 0 0 306526 CASAVA_Build 2 158996247 1D GGTGTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 13 12 306527 CASAVA_Build 2 158998064 2I AAAGAAAAAC --/TT AATACAGTGG 2494 hom 15 het 9 0 6 3 T 0 2 306528 CASAVA_Build 2 158999467 1I AACCCACTGC -/A AAAGAAGCTA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 A 3 4 306529 CASAVA_Build 2 159004100 1D TGGATGAAGC T/- GGAAACCATC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 1 0 306530 CASAVA_Build 2 159006302 3I GTTTTCCTCT ---/TAA TAACATATTT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TAA 1 2 306531 CASAVA_Build 2 159008963 2I ATACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 447 hom 26 1 19 6 AT 5 6 306532 CASAVA_Build 2 159010568 1I TAAGTACAAG -/A AAAAAATATA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 6 7 306533 CASAVA_Build 2 159011109 1I AACTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 36 1 26 9 A 11 12 306534 CASAVA_Build 2 159013104 1I TTCCATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 10 11 306535 CASAVA_Build 2 159014749 1I GTCATCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 32 1 22 9 T 13 14 306536 CASAVA_Build 2 159020390 6I GAGGGGTAGT ------/AACATA AACATAGTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AACATA 1 2 306537 CASAVA_Build 2 159023694 1D AGTTTGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 11 10 306538 CASAVA_Build 2 159027136 1I TTTTCTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 212 hom 31 1 29 1 A 10 11 306539 CASAVA_Build 2 159037060 6I TAAAAAATTT ------/AAAATC AAAATGAATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AAAATC 0 1 306540 CASAVA_Build 2 159041819 1D AATTGGACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 9 306541 CASAVA_Build 2 159042037 1D TGGTCCCTGA G/- GGTCAACATG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 G 3 2 306542 CASAVA_Build 2 159048137 1D TTTTTTTTTT A/- AATCATTTTG 3070 het 572 hom 41 2 37 2 A 3 2 306543 CASAVA_Build 2 159048547 1D ATGTTCTGCT C/- TAAGGAAATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 1 0 306544 CASAVA_Build 2 159059148 1I TACAGCGTTA -/T TTTGCAATGA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 T 3 4 306545 CASAVA_Build 2 159059636 1D CATTGCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 28 1 23 5 T 11 10 306546 CASAVA_Build 2 159060109 1D CTGGAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2890 hom 36 13 14 9 A 15 14 306547 CASAVA_Build 2 159060930 1I AGTAGAGACA -/G GGTTTCGCCA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 G 2 3 306548 CASAVA_Build 2 159069434 1D AAATATCCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 34 0 27 7 A 10 9 306549 CASAVA_Build 2 159070183 1I AGCTTAGGGG -/A AAATCGGGAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 4 306550 CASAVA_Build 2 159087201 4D TAAGATTAAG ATAC/---- ATACATGCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 ATAC 2 1 306551 CASAVA_Build 2 159097399 3I CAAGAACCTA ---/TTC TTCTATCATA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TTC 1 2 306552 CASAVA_Build 2 159119168 2D20M1I GTATTCACTC AGAAATAATTATTATTATTATT-/--AAATAATTATTATTATTATTA TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 11 0 12 3 N/A 0 0 306553 CASAVA_Build 2 159121282 1D TCTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2938 het 792 hom 32 7 11 14 T 15 14 306554 CASAVA_Build 2 159128473 1D AATATTTACC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 9 8 306555 CASAVA_Build 2 159141577 2I ATTAAAAGAC --/TG TATATCAAAC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 TG 0 1 306556 CASAVA_Build 2 159143265 4I ATAATTCGTT ----/AAGG AAGTTAAAAC 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 AAGG 0 1 306557 CASAVA_Build 2 159161386 1I TTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 13 14 306558 CASAVA_Build 2 159162745 1I TGCCCGGCAA -/T TTTTTTTTTT 1504 het 1504 ref 24 15 5 4 T 10 11 306559 CASAVA_Build 2 159171097 1I ACTCCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 11 12 306560 CASAVA_Build 2 159176776 1I ATGCTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 13 14 306561 CASAVA_Build 2 159177585 6D CCCCGGACCA TCATGC/------ TAATTAACTC 3070 het 3070 ref 43 28 12 6 TCATGC 1 0 306562 CASAVA_Build 2 159181258 1I CAAAATGTTG -/C CCCTCTGGGT 3070 hom 156 het 57 0 49 8 C 3 4 306563 CASAVA_Build 2 159194476 1D GGGAGCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 11 10 306564 CASAVA_Build 2 159199652 1I GTAGACAGCA -/T TTTTTATTAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 5 6 306565 CASAVA_Build 2 159199808 1I AATTTTAAGC -/A GCTTTAGTGT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 A 0 1 306566 CASAVA_Build 2 159200685 8D TTGAAGTAAT TCACTACA/-------- AGTTTTATTC 3070 het 3070 hom 37 17 20 1 TCACTACA 1 0 306567 CASAVA_Build 2 159208410 2D GTTGAGGCTG CA/-- CAGTGAGCCA 3070 hom 64 het 25 0 22 3 CA 2 1 306568 CASAVA_Build 2 159209344 2I TACACATAAC --/AT AGATACATGC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AT 0 1 306569 CASAVA_Build 2 159213651 6D AGCTACTAGA GAGTCT/------ GAGGCAGGAA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 GAGTCT 1 0 306570 CASAVA_Build 2 159215573 2D CAGAGAACAC AG/-- GGGTGAGCAA 3070 het 3070 hom 61 26 28 7 AG 1 0 306571 CASAVA_Build 2 159216201 1I GGCCTCACCC -/A CCTCCCTGGG 3070 het 3070 hom 47 14 18 15 A 0 1 306572 CASAVA_Build 2 159218007 1I ATGTTTTGTT -/G TTTTTTAATA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 306573 CASAVA_Build 2 159220166 1I CAGAAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 9 10 306574 CASAVA_Build 2 159220328 2D TTATAGTATG AT/-- ATAGACTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 AT 2 1 306575 CASAVA_Build 2 159221125 1I TGCCTTCTAA -/C CGGGACCCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 2 306576 CASAVA_Build 2 159229705 2I TGATGATAAT --/AA AAAAGACAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 4 6 306577 CASAVA_Build 2 159231798 1D ATTTCCACCC T/- GGGCAGGGGC 3070 het 3070 ref 38 19 12 9 T 1 0 306578 CASAVA_Build 2 159237607 1D TTGGGAAGAT A/- ACGGAGTAGA 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 A 2 1 306579 CASAVA_Build 2 159242145 4I TTTTAAGAAT ----/AACA AACAAAAATA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AACA 1 2 306580 CASAVA_Build 2 159248871 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 350 hom 23 3 11 10 A 15 14 306581 CASAVA_Build 2 159249507 7I CATGGTTGCC -------/CGTGGGG CTAGGTATTG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 CGTGGGG 0 1 306582 CASAVA_Build 2 159249887 4D AACTCTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 51 het 18 0 18 4 AAAC 4 3 306583 CASAVA_Build 2 159250102 1D TTTTTTTTTT C/- CCCATTGAGA 3070 het 246 hom 24 3 16 5 C 4 3 306584 CASAVA_Build 2 159250194 3I CAGGTTCAAG ---/TGA TGATTCTCCT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TGA 1 2 306585 CASAVA_Build 2 159256839 1D CTGAAGGTGC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 8 7 306586 CASAVA_Build 2 159263917 3I AGGACAGGAT ---/GAG GAGGAGGAGG 3070 het 171 hom 34 1 17 16 GAG 5 6 306587 CASAVA_Build 2 159268460 1D CTTATCATGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 A 10 9 306588 CASAVA_Build 2 159278292 1I ACTTTCAAGA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 6 7 306589 CASAVA_Build 2 159278571 5D TTCTTTCCAG TTTGT/----- TTTCTCTCTG 3070 het 3070 hom 46 22 21 6 TTTGT 1 0 306590 CASAVA_Build 2 159278764 2I GTTGAGAGTT --/TC TTTTTTCACT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TC 0 1 306591 CASAVA_Build 2 159295199 13D GTGGAGCATA GGGGAGAGGAGCC/------------- GGGGAGAGGA 3070 hom 84 het 35 0 26 11 GGGGAGAGGAGCC 2 1 306592 CASAVA_Build 2 159300634 1D ACTATGCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 217 hom 28 2 14 13 A 16 15 306593 CASAVA_Build 2 159303136 1D ACTGCACCGC T/- TAATCACTGT 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 T 2 1 306594 CASAVA_Build 2 159324265 1I TGAATGATTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 54 27 20 7 T 7 8 306595 CASAVA_Build 2 159333723 3D AGTAGGGTAA TCT/--- TCAACAACAT 3070 het 3070 ref 51 26 22 5 TCT 1 0 306596 CASAVA_Build 2 159334643 1D TCTAGTCTTG C/- CCCCCAACAG 3070 hom 88 het 31 0 29 3 C 6 5 306597 CASAVA_Build 2 159339275 1D CCTCCATCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 A 10 9 306598 CASAVA_Build 2 159344764 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2185 het 27 hom 14 1 9 4 T 10 11 306599 CASAVA_Build 2 159345627 4I TTCCCCCACC ----/CAAT TTCTATTTTA 3070 hom 62 het 23 0 21 2 CAAT 0 1 306600 CASAVA_Build 2 159351299 2I ACAAGGTCAG --/GA GATCGAGACC 1608 het 1608 ref 12 7 4 1 GA 1 2 306601 CASAVA_Build 2 159362550 1D ACCCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1507 hom 20 7 10 4 A 13 12 306602 CASAVA_Build 2 159368892 1D AAATATATAT A/- TTTTTTATTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 1 0 306603 CASAVA_Build 2 159370994 1I AACCATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 A 11 12 306604 CASAVA_Build 2 159385664 3D CTGCAGAGAA CCT/--- CCACCAACAA 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 CCT 1 0 306605 CASAVA_Build 2 159476518 1D TCTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 10 9 306606 CASAVA_Build 2 159508733 1D TTAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 10 9 306607 CASAVA_Build 2 159521278 1D TGGAAATAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2982 hom 34 11 15 8 T 10 9 306608 CASAVA_Build 2 159540332 1I CCACAATTAC -/T TTTTTTTTTT 2549 het 2549 ref 35 12 9 14 T 13 14 306609 CASAVA_Build 2 159546788 1D GCTATTTACA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 9 8 306610 CASAVA_Build 2 159557709 2D7M7I CGTGTGTTCT CCATCACAG-------/--TTTACTGCCTTTTA CCGCGTTAGT 3070 het 3070 ref 41 20 21 8 N/A 0 0 306611 CASAVA_Build 2 159574649 1D TTTACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 A 12 11 306612 CASAVA_Build 2 159575427 4D TCAAGGATGT GGAC/---- GGACAGGAGA 3070 het 3029 hom 22 7 14 4 GGAC 2 1 306613 CASAVA_Build 2 159581802 3D TCCTAGGAGT ATA/--- AAAGTAATTG 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 ATA 1 0 306614 CASAVA_Build 2 159583768 1D TGAGCACTTT G/- CAGATAATAA 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 G 1 0 306615 CASAVA_Build 2 159597548 1I GGGGTTAGGA -/G GTTCCCTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 G 1 2 306616 CASAVA_Build 2 159614097 18I TCCAAACTTA ------------------/GTTATCAGAGACCTAAAT GTTCAGATTT 3070 het 3070 hom 43 14 25 5 GTTATCAGAGACCTAAAT 0 1 306617 CASAVA_Build 2 159623221 1D ATTTAAAGAC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 9 8 306618 CASAVA_Build 2 159623863 1I GTAGAATAGA -/G GTTCAGCTTG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 G 1 2 306619 CASAVA_Build 2 159638908 1I CAGGCTAGTT -/A ATACCTCATC 3070 het 3070 hom 52 19 23 10 A 1 2 306620 CASAVA_Build 2 159648015 1D ACCTGGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2341 hom 26 8 13 6 T 13 12 306621 CASAVA_Build 2 159660603 1I CTCCTAACAC -/A AAAAAACAAG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 6 7 306622 CASAVA_Build 2 159676892 11D GAGCAGATAT GTGCACTCAGA/----------- GTTGAATGAA 3070 het 3070 ref 44 30 14 1 GTGCACTCAGA 1 0 306623 CASAVA_Build 2 159689927 5D GGAGTTCTGC CCATA/----- CAGATTTATT 3070 het 3070 ref 39 24 13 8 CCATA 1 0 306624 CASAVA_Build 2 159692991 1I TTTCATACAA -/G GCCCCAGGCC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 G 1 2 306625 CASAVA_Build 2 159695780 1I33M5D TTCTTGGGGT -GGGGGGTCCCCAACTATGATTATCTTTAGGCCTTCTTC/AGGGGGGTCCCCAACTATGATTATCTTTAGGCCT----- TCTTGATGAG 3070 het 3070 ref 38 19 19 9 N/A 0 0 306626 CASAVA_Build 2 159698119 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTGTCT 1491 het 1491 ref 49 25 10 14 T 7 6 306627 CASAVA_Build 2 159702902 7I CCTGAGCTTT -------/CTGATTC CTGATTCGGC 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 CTGATTC 1 2 306628 CASAVA_Build 2 159717752 1I TAGACCCCTC -/T TTACATGTTC 3070 het 3070 ref 56 27 19 10 T 2 3 306629 CASAVA_Build 2 159721593 3I TCTCTGGAGA ---/CTT CTTCTCAGTT 3070 hom 93 het 36 0 29 7 CTT 1 2 306630 CASAVA_Build 2 159728588 3I CTCTCGGTTT ---/TTG TTGTTTTAAG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 TTG 1 2 306631 CASAVA_Build 2 159735834 1I GCCAGTGAGG -/C CTGATCAAGT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 C 1 2 306632 CASAVA_Build 2 159746965 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 9 10 306633 CASAVA_Build 2 159747584 1I GATCCATCAG -/T TTTTTTGGGG 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 T 6 7 306634 CASAVA_Build 2 159770819 1D TAGTGGGCAT G/- GAAGTCCAGA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 G 2 1 306635 CASAVA_Build 2 159778882 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 854 het 73 hom 13 1 3 9 A 17 16 306636 CASAVA_Build 2 159780665 3D AAGCTTGCTA ATG/--- ATGATGATGA 3070 het 3070 ref 59 29 23 9 ATG 5 4 306637 CASAVA_Build 2 159782847 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTACTA 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 T 7 6 306638 CASAVA_Build 2 159785034 1I ACCTGGTTGC -/T TTTTTTTTTT 2237 het 2237 ref 21 11 7 3 T 11 12 306639 CASAVA_Build 2 159786160 4D AATAAAAGTT ATTA/---- ATTCTAGTTG 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 ATTA 1 0 306640 CASAVA_Build 2 159791924 4I ATTGAGTTGA ----/GAGT GTGTATTGTT 3070 hom 141 het 49 0 48 1 GAGT 0 1 306641 CASAVA_Build 2 159796414 4I TTTATAGCAC ----/CTTT TTTTGGAACC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 CTTT 0 1 306642 CASAVA_Build 2 159799546 4I CCCTACAAGA ----/AAAG AAAGAATACA 3070 het 2905 hom 36 7 22 7 AAAG 1 2 306643 CASAVA_Build 2 159800339 4I ATTTAATCAT ----/AAAC AAACAATCTA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 AAAC 1 2 306644 CASAVA_Build 2 159800634 1D AGTCCATGTG T/- TTTTTAAAGA 3070 het 3070 hom 45 17 22 7 T 6 5 306645 CASAVA_Build 2 159801413 4D CTTAGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 51 20 19 16 TTTG 4 3 306646 CASAVA_Build 2 159810698 1D GGCAGGCTAC A/- AGACCAAGAG 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 A 2 1 306647 CASAVA_Build 2 159812753 3I TAGGTCTGTT ---/AAC AACACTTAGA 2885 het 1991 hom 11 4 6 1 AAC 1 2 306648 CASAVA_Build 2 159816899 1I TTTTAAAAAT -/A TAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 19 9 10 0 A 0 1 306649 CASAVA_Build 2 159817063 2I CTGAAAAAAC --/AG AGCAACCAGA 3070 het 3070 ref 39 25 12 2 AG 1 2 306650 CASAVA_Build 2 159820257 4D TAAATTAAAT TAAA/---- TAAAGAAAAG 2052 het 2051 ref 12 5 7 1 TAAA 2 1 306651 CASAVA_Build 2 159820829 3D GGCCATAATC AAG/--- AAGATGGGTC 3070 het 3070 ref 41 25 13 4 AAG 2 1 306652 CASAVA_Build 2 159835600 2I ATATAAAAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 16 13 15 AC 7 8 306653 CASAVA_Build 2 159839433 7D AGAAGGGCCA ACTACCC/------- ACCTCCTCAT 3070 het 3070 ref 44 25 17 5 ACTACCC 1 0 306654 CASAVA_Build 2 159840001 1D GTGAATAAAT A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 A 7 6 306655 CASAVA_Build 2 159840443 1I AACACTGAAA -/C CCCCCCCAAA 2825 het 2825 ref 28 14 11 3 C 7 8 306656 CASAVA_Build 2 159846825 1I TCTTACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 10 11 306657 CASAVA_Build 2 159848419 2D CTCCGCCTTC AA/-- AAAAAAAAAA 2973 het 2147 hom 21 7 9 6 A 13 11 306658 CASAVA_Build 2 159850172 1I TCTACCAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2776 hom 28 9 15 4 A 9 10 306659 CASAVA_Build 2 159850293 2D CAAGACCCCA TC/-- TCTCTAAAAA 2298 het 2298 ref 22 9 6 7 TC 3 2 306660 CASAVA_Build 2 159856653 1D TTTAACCTGA T/- TATCTGGAAT 3070 het 3070 hom 47 19 24 6 T 2 1 306661 CASAVA_Build 2 159862068 1D CTAAAAAAAT A/- AAAAAAGGAG 3070 hom 94 het 35 0 31 4 A 7 6 306662 CASAVA_Build 2 159862924 1I GTGAGACGAC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 41 25 9 7 T 7 8 306663 CASAVA_Build 2 159864478 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2091 het 153 hom 24 3 5 16 A 13 11 306664 CASAVA_Build 2 159875274 1I CCAATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 1471 het 1471 ref 18 9 4 6 A 10 11 306665 CASAVA_Build 2 159876401 5D TCATTATGTA ATGTT/----- ATATCAATTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 ATGTT 1 0 306666 CASAVA_Build 2 159886193 4D ATCAGTTTAT GAAA/---- GAGATATTTG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 GAAA 1 0 306667 CASAVA_Build 2 159895458 1I CTACAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 11 12 306668 CASAVA_Build 2 159900301 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2667 hom 38 het 21 0 12 10 A 20 18 306669 CASAVA_Build 2 159903966 1D TCCAATGCCC T/- CCCCGTCCCT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 1 0 306670 CASAVA_Build 2 159905999 3D AGATAAAAAA AAC/--- AAACAAACAA 37 het 37 ref 30 16 1 13 AAC 1 0 306671 CASAVA_Build 2 159909292 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3021 hom 27 het 15 0 10 5 A 13 14 306672 CASAVA_Build 2 159909969 1I ACTTGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2935 het 1911 hom 23 12 9 2 A 13 14 306673 CASAVA_Build 2 159910103 1D TTCTTAACAG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 84 het 38 0 28 10 A 8 7 306674 CASAVA_Build 2 159910494 3I AAATTTAAAC ---/CAG CAGCAAGCAG 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 CAG 1 2 306675 CASAVA_Build 2 159934317 2D GTAGTGTTGC AA/-- AGAGACTGAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 3 1 306676 CASAVA_Build 2 159944767 2I TCATATACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 AC 8 9 306677 CASAVA_Build 2 159950245 2I CTTTATTCAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 9 11 306678 CASAVA_Build 2 159956537 2D AGTCATATCG AT/-- ATTTATGATA 3070 hom 132 het 48 0 45 6 AT 2 1 306679 CASAVA_Build 2 159958385 1D ACTTCTGTTT C/- TTTTTGCTTA 3070 hom 123 het 44 0 41 4 C 1 0 306680 CASAVA_Build 2 159962612 1D ATTAACATCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 9 8 306681 CASAVA_Build 2 159963912 2I AAGCTTTGTT --/AA AAGTCTGAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 4 306682 CASAVA_Build 2 159969976 1D ATAATTATTA C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 28 0 19 9 C 1 0 306683 CASAVA_Build 2 159970480 1D TTTAAGTACA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 7 306684 CASAVA_Build 2 159997141 3I TCTGAATGAC ---/TAT GACTATAATT 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 TAT 0 1 306685 CASAVA_Build 2 160002674 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2707 hom 29 10 13 6 A 12 11 306686 CASAVA_Build 2 160006283 2D AGAAATAGGG AA/-- AAAAGATGGG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 6 4 306687 CASAVA_Build 2 160006414 1I ATTTAAAACA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 T 7 8 306688 CASAVA_Build 2 160028729 1D CCAAAGTGCT G/- GGATTACAAG 3070 het 2473 hom 17 6 10 1 G 3 2 306689 CASAVA_Build 2 160032455 3I TGGTAATGGT ---/GGA GGAGTGAGGT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 GGA 1 2 306690 CASAVA_Build 2 160032526 1I GCCCCCTGAA -/G ATACTGGAAA 3070 het 3070 ref 20 8 9 3 G 0 1 306691 CASAVA_Build 2 160045821 1I ACACATACCC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 7 8 306692 CASAVA_Build 2 160059653 2D TTTATACTCT AG/-- AGTAGGTTGG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AG 2 1 306693 CASAVA_Build 2 160060550 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 2456 het 2456 ref 24 11 7 6 AG 2 1 306694 CASAVA_Build 2 160067090 1D TAAAGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 31 3 13 15 A 11 10 306695 CASAVA_Build 2 160067225 1D CTCAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1687 het 1103 hom 28 8 9 11 A 17 16 306696 CASAVA_Build 2 160073369 1D TGCCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 11 10 306697 CASAVA_Build 2 160090355 2I AGATATCTCA --/TT TTATATATAT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 2 4 306698 CASAVA_Build 2 160094069 1D TCTTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1270 het 1270 ref 43 32 4 8 A 13 12 306699 CASAVA_Build 2 160110319 1I ACTAAAAGGC -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 ref 49 23 16 10 A 6 7 306700 CASAVA_Build 2 160113274 1D AATGATATAT C/- TTTTAAAATT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 C 1 0 306701 CASAVA_Build 2 160133314 1D CTGAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 32 1 25 6 A 12 11 306702 CASAVA_Build 2 160133790 1I GCACTGGCAG -/C CATTTACTAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 C 1 2 306703 CASAVA_Build 2 160135405 4D ATTTTTCACC CTTT/---- CTCTGTCTCT 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 CTTT 1 0 306704 CASAVA_Build 2 160139059 3I TCAAAACCAC ---/AAT GAGATGGCAC 3070 hom 107 het 49 0 36 13 AAT 0 1 306705 CASAVA_Build 2 160146821 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ATA 1 2 306706 CASAVA_Build 2 160148885 1D TGATTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 17 12 T 13 12 306707 CASAVA_Build 2 160151278 1D CCTACTGAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 1615 hom 19 5 10 4 A 9 8 306708 CASAVA_Build 2 160152690 1D GTAATGCCTG T/- TAATACCAAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 2 1 306709 CASAVA_Build 2 160155350 4D CTCCGACTCA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 6 AAAT 5 4 306710 CASAVA_Build 2 160160753 1I TTCGTGAATT -/G TTCTTTGCTC 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 G 0 1 306711 CASAVA_Build 2 160165564 2D CTTGGGACAC AT/-- GTTTGCAGAG 3070 het 3070 hom 27 11 14 4 AT 1 0 306712 CASAVA_Build 2 160168841 3I TTTAATTTTA ---/AAG AAGAAAAGTC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 AAG 1 2 306713 CASAVA_Build 2 160171072 2D TGACCCACAA CT/-- CTGTCAGTTA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 CT 2 1 306714 CASAVA_Build 2 160177825 4D TTCTAGAAAG AAAA/---- AACCTGCATA 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 A 6 2 306715 CASAVA_Build 2 160178217 4D20M3I CTGATTTTCT AAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTCT---/----AAAAAAAAAAAAAAGACTCTTCA TCATCATCGT 3070 het 2020 hom 34 12 12 20 N/A 0 0 306716 CASAVA_Build 2 160179053 4D AATGGCTGAC AAAG/---- AGTTTATAGC 3070 het 3070 hom 32 12 19 3 AAAG 1 0 306717 CASAVA_Build 2 160187804 3D GAGGAAAGAA AAG/--- AAAGGAAGAG 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 AAG 1 0 306718 CASAVA_Build 2 160197910 1D CCAGAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 15 14 306719 CASAVA_Build 2 160200651 1I CTGTCTCTAT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 A 6 7 306720 CASAVA_Build 2 160203472 1I GAGACAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 8 9 306721 CASAVA_Build 2 160205766 1I AAGAAAAAAA -/C CCAAATAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 C 2 3 306722 CASAVA_Build 2 160217703 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 10 9 306723 CASAVA_Build 2 160218224 6D AGAATATATC AAAGAA/------ AAAGAGTTGG 3070 hom 99 het 37 0 34 5 AAAGAA 1 0 306724 CASAVA_Build 2 160226536 1D AACCATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 T 12 11 306725 CASAVA_Build 2 160231853 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 10 306726 CASAVA_Build 2 160238789 1D ACATAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 25 0 22 3 T 11 10 306727 CASAVA_Build 2 160239094 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2408 het 67 hom 16 2 7 7 A 14 13 306728 CASAVA_Build 2 160240047 1D TTCTTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 1133 het 1133 ref 31 26 3 2 A 11 10 306729 CASAVA_Build 2 160240958 1D CCTAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 20 6 T 12 11 306730 CASAVA_Build 2 160246203 1D CAGTTTGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 16 10 A 12 11 306731 CASAVA_Build 2 160247667 1D TGCCACCCCT C/- CCCCCCCCCA 1617 het 1617 ref 38 18 7 13 C 10 9 306732 CASAVA_Build 2 160251373 1I GAGGGATATT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 A 7 8 306733 CASAVA_Build 2 160252964 1I ACCCAGCTAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 8 9 306734 CASAVA_Build 2 160255637 4D CTGATTCCTC TTGT/---- TTAACTGTAT 3070 het 3070 ref 50 27 20 6 TTGT 1 0 306735 CASAVA_Build 2 160256229 4I AGAAAATCAT ----/AAGG GAGAGAAAAT 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 AAGG 0 1 306736 CASAVA_Build 2 160257949 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTGTGC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 6 306737 CASAVA_Build 2 160261975 1D TGCCTGCTTG T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 8 7 306738 CASAVA_Build 2 160265199 4D ATTGTATTCT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2628 hom 21 8 10 3 TTTG 4 3 306739 CASAVA_Build 2 160268252 1D TACCCCCCGC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 50 het 19 0 16 3 A 9 8 306740 CASAVA_Build 2 160274748 1I TACAGAAAGG -/T TATGTCAGAG 3070 het 3070 hom 52 22 27 3 T 1 2 306741 CASAVA_Build 2 160274970 1I GCAAAATGTC -/T TTTTTTTTTT 1836 het 322 hom 15 2 6 7 T 14 15 306742 CASAVA_Build 2 160281024 1I CAGAAGCAGA -/T TTTTTTTTTT 2167 het 2167 ref 37 15 9 13 T 11 12 306743 CASAVA_Build 2 160281401 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2754 hom 25 9 8 9 A 11 10 306744 CASAVA_Build 2 160281953 2D TCACAGTCCA TT/-- CTCTTAGTCA 3070 het 3070 hom 47 20 24 4 T 2 0 306745 CASAVA_Build 2 160282278 2D TGATAAAAAC TT/-- TAAGTCATAC 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 T 3 1 306746 CASAVA_Build 2 160294430 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2767 het 2767 ref 26 13 9 4 A 13 14 306747 CASAVA_Build 2 160295683 2D GATCTCACTC TG/-- TTACCCAGGC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 TG 1 0 306748 CASAVA_Build 2 160297857 3D TACTGTTACC ATT/--- ATTATTTCCT 400 het 400 ref 19 12 3 5 ATT 3 2 306749 CASAVA_Build 2 160299160 7D CCAGTGGTCA TTAATTT/------- TTAAAACTAC 3070 het 3070 hom 22 7 11 5 TTAATTT 1 0 306750 CASAVA_Build 2 160306217 3I TCAGTTACCA ---/TCT TCTTTGACTC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 TCT 1 2 306751 CASAVA_Build 2 160307005 1D GATGTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 2237 het 2237 ref 35 22 5 8 T 12 11 306752 CASAVA_Build 2 160307306 2I AAGTGTTTAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 9 11 306753 CASAVA_Build 2 160307694 4D ACTCAGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAGA 3070 het 1430 hom 23 5 14 6 A 12 8 306754 CASAVA_Build 2 160318308 1D ACTCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 2989 het 2988 ref 21 9 8 4 A 13 12 306755 CASAVA_Build 2 160320055 1D GAACTGAGTT G/- GTGACTGAGG 3070 het 3070 hom 38 17 16 6 G 2 1 306756 CASAVA_Build 2 160321653 6I TGGGAGTTAG ------/TTTGTT TTTGTTTTTG 3070 het 2189 hom 23 6 12 5 TTTGTT 2 3 306757 CASAVA_Build 2 160324261 1D AATTTCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 13 12 306758 CASAVA_Build 2 160325785 1D AACCATTTAA T/- TTTTTTTTTT 1292 het 1292 ref 29 14 4 11 T 17 16 306759 CASAVA_Build 2 160329601 1I ACATTAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 11 12 306760 CASAVA_Build 2 160329964 2I TGGTAGTGGG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 21 15 10 T 9 11 306761 CASAVA_Build 2 160334401 2I AGACTCCATC --/AT ATATATATAT 2706 het 2706 ref 22 14 7 1 AT 7 8 306762 CASAVA_Build 2 160334884 1D ATACGCCATA T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 51 20 20 11 T 8 7 306763 CASAVA_Build 2 160336456 2D ACCTAAAGAC TT/-- TTCACAGCAG 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 T 4 2 306764 CASAVA_Build 2 160338616 1I GAAATCCTGT -/C TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 0 1 306765 CASAVA_Build 2 160338844 4I GGCAACTAGA ----/TTGT TTGTTAGCCG 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 TTGT 1 2 306766 CASAVA_Build 2 160340649 1I CTTATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 T 10 11 306767 CASAVA_Build 2 160342811 2D16M6D TAAAAATAAA CCCTTTTATTAGTAGCTTAATATC/--CTTTTATTAGTAGCTT------ AATATATTCA 3070 het 3070 ref 30 22 13 1 N/A 0 0 306768 CASAVA_Build 2 160344387 1D ATTCCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 T 11 10 306769 CASAVA_Build 2 160344577 3I CTCAAGCTGG ---/TCT TCTTCAACTC 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 TCT 1 2 306770 CASAVA_Build 2 160346648 2D ATAATAAATG TA/-- TATGATTTTG 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 TA 2 1 306771 CASAVA_Build 2 160350435 1I ACCTTCTTTG -/A AAAATCTGGC 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 A 4 5 306772 CASAVA_Build 2 160352972 4D ATTTAAGATG TACA/---- TAGTCATGCA 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 TACA 1 0 306773 CASAVA_Build 2 160353780 1D GTAACTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 19 8 T 13 12 306774 CASAVA_Build 2 160353928 1D ATTTGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 27 1 19 7 T 11 10 306775 CASAVA_Build 2 160354316 1D CTTAGGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2277 hom 32 8 17 7 T 12 11 306776 CASAVA_Build 2 160354738 3D AGATTTTCTA GTT/--- GTTCTTAATG 3070 het 3070 ref 51 29 18 5 GTT 2 1 306777 CASAVA_Build 2 160365112 17I TTAGAAGTGG -----------------/TAGGGGTCATCTTCATT TACTAGTAAG 3070 hom 84 het 29 0 29 2 TAGGGGTCATCTTCATT 0 1 306778 CASAVA_Build 2 160377043 1D CTTCCAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2907 hom 31 15 11 5 T 15 14 306779 CASAVA_Build 2 160383574 2D AAATAAAGAA AG/-- AAAGAAATTG 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 AG 1 0 306780 CASAVA_Build 2 160384163 1D AAGCCTTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 22 11 9 3 T 10 9 306781 CASAVA_Build 2 160384692 1I AGAAGAAACA -/T TTTTTTCCTA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 6 7 306782 CASAVA_Build 2 160385973 2D ATCCACATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 26 1 18 7 A 16 14 306783 CASAVA_Build 2 160389614 1I CCTGAATGAC -/T ACTGGGTAAA 2306 hom 15 het 6 0 5 1 T 0 1 306784 CASAVA_Build 2 160391258 1D TGGATAGGTA G/- AATCAATATC 2206 hom 12 het 5 0 5 0 G 1 0 306785 CASAVA_Build 2 160394407 5I AAAAATTAAA -----/TATTT TATAAGTATA 3070 hom 71 het 33 0 24 9 TATTT 0 1 306786 CASAVA_Build 2 160396835 1D TTAAAGGTAA T/- TTTTCAGTTG 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 5 4 306787 CASAVA_Build 2 160407715 1I AGATACTGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 256 hom 33 1 28 4 A 9 10 306788 CASAVA_Build 2 160408248 1D ATAATGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 33 0 25 8 T 13 12 306789 CASAVA_Build 2 160409547 2D GCTGTCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 17 8 T 17 15 306790 CASAVA_Build 2 160410724 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTA 1404 het 1404 ref 27 23 4 0 T 10 9 306791 CASAVA_Build 2 160427426 5D CGTGAATGTA TTTAT/----- TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 TTTAT 2 1 306792 CASAVA_Build 2 160435201 2I AAACAAGACT --/CC GTCTCAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 C 0 2 306793 CASAVA_Build 2 160440503 1I GAGAGAGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 10 11 306794 CASAVA_Build 2 160446104 3I AAGAGCCTTT ---/GTA GTAGTATTCT 3070 het 3070 ref 46 19 20 7 GTA 2 3 306795 CASAVA_Build 2 160454398 1D ATAAATGGTC T/- TTTAAAGTTT 2983 het 2983 ref 26 14 7 6 T 4 3 306796 CASAVA_Build 2 160462233 1I GATGAAAAGG -/A AAACCCTATC 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 A 3 4 306797 CASAVA_Build 2 160468875 1D AGTGAAATCC G/- GGAATCGTGG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 G 3 2 306798 CASAVA_Build 2 160475230 1D TCTACCGAAC A/- GTGACAGCAG 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 A 1 0 306799 CASAVA_Build 2 160478070 1D AGCCAATCTC T/- TAAGTGGCTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 2 1 306800 CASAVA_Build 2 160482286 3D TTTAATCCAT ATA/--- ATAACTATTA 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 ATA 2 1 306801 CASAVA_Build 2 160488788 4I GGCAGGGCTG ----/TGCT CGCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 43 23 19 2 TGCT 0 1 306802 CASAVA_Build 2 160489487 2D TCTGGGGGCT GG/-- GGGGGGGGCG 2034 het 1439 hom 24 6 10 8 G 10 8 306803 CASAVA_Build 2 160489954 1I ATAAAAAAAA -/C ACAAACAAAC 3070 hom 48 het 36 1 31 4 C 0 1 306804 CASAVA_Build 2 160491163 1D TATAATAACC T/- TTTCTTTAGT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 4 3 306805 CASAVA_Build 2 160494244 7I CATAACCAAA -------/AAAATAT AAAATATAAA 2433 het 2433 ref 26 12 6 8 AAAATAT 1 2 306806 CASAVA_Build 2 160497757 1D TCATGATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 272 hom 23 1 15 7 T 13 12 306807 CASAVA_Build 2 160507872 1D GATTACGGGT G/- TGTGCCATCA 3070 het 3070 hom 26 12 12 3 G 1 0 306808 CASAVA_Build 2 160512647 4D TATGACTCCC AGAG/---- AGAGTGGCAG 3070 het 3070 ref 41 23 17 2 AG 4 2 306809 CASAVA_Build 2 160521731 1D CATTTAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 A 13 12 306810 CASAVA_Build 2 160540289 4I AATAATGTAC ----/TCTT TCTTGTAAGA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 TCTT 1 2 306811 CASAVA_Build 2 160541105 2I AGGAATTTGA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 51 24 14 13 AC 6 7 306812 CASAVA_Build 2 160542358 1I ATATTTAGCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 7 8 306813 CASAVA_Build 2 160548211 1D ACTGGGACTC T/- TTTTTTTTTT 2872 het 2872 ref 36 19 8 9 T 15 14 306814 CASAVA_Build 2 160548617 1D GGGATACTCA C/- CCCTCAGAAG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 4 3 306815 CASAVA_Build 2 160574462 6D14M1D ATGTGTGTTT TACGTATATTTTACCACAATA/------TATTTTACCACAAT- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 34 20 16 5 N/A 0 0 306816 CASAVA_Build 2 160576717 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTCTGTTT 3070 het 3070 hom 48 20 18 16 GT 3 2 306817 CASAVA_Build 2 160577380 2D TGTTAAATAA TG/-- TGTTTTGGCT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 TG 2 1 306818 CASAVA_Build 2 160578992 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2536 het 1354 hom 32 9 10 13 T 15 14 306819 CASAVA_Build 2 160581236 2D GAAGGGGGGG GT/-- GCGAGGAGAG 3049 het 3049 ref 34 11 16 7 GT 1 0 306820 CASAVA_Build 2 160581541 1I CAATTCTTAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 A 8 9 306821 CASAVA_Build 2 160599613 1D ATTGCTTGAG C/- CCAGGAGTTC 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 C 3 2 306822 CASAVA_Build 2 160601655 1I AAAATGGAAC -/A GGGGGAGGTG 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 A 0 1 306823 CASAVA_Build 2 160607813 1D37M1I GAACAAGTGA GGGGGTGAATGAAGAAGAGGAAGGAGGCCCTCTGGGTA-/-GGGGTGAATGAAGAAGAGGAAGGAGGCCCTCTGGGTAG GGGAGCCAGG 3070 het 3070 ref 28 17 13 13 N/A 0 0 306824 CASAVA_Build 2 160608902 1I TGTAACTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 51 17 26 8 T 9 10 306825 CASAVA_Build 2 160630139 2D GCAAAATGGC AT/-- ATAATGAAAC 3070 het 3070 hom 49 21 23 8 AT 2 1 306826 CASAVA_Build 2 160635546 2D TTTAGGCAAA AC/-- ACACACACAC 1337 het 1337 ref 40 27 3 10 AC 8 7 306827 CASAVA_Build 2 160656861 1D ATTTCTGCCC T/- TTTTTTTTTT 1665 het 1311 hom 23 6 5 12 T 15 14 306828 CASAVA_Build 2 160665387 1D ACTGATGGAT C/- CCTAATTTGC 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 C 3 2 306829 CASAVA_Build 2 160666596 1D GGTTCCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 206 hom 42 1 32 9 A 12 11 306830 CASAVA_Build 2 160667555 1D CTATGGCAAC A/- GTCTGGGTCC 3070 het 3070 hom 55 22 25 10 A 1 0 306831 CASAVA_Build 2 160669708 1I GCCTGACTGT -/C CCCTATTGTC 2739 het 2739 ref 32 19 7 6 C 3 4 306832 CASAVA_Build 2 160675862 3D11M1I18M1D GCTCAGTAAT GAGGAGGCATTTAG-CCAAGGCATGTTTCACTGA/---GAGGCATTTAGCCCAAGGCATGTTTCACTG- AAAAAAAAAA 3070 het 1777 hom 31 6 25 13 N/A 0 0 306833 CASAVA_Build 2 160676990 1D TAGGTTAAAC A/- AGATTCCAAA 3070 het 3070 hom 43 13 30 0 A 2 1 306834 CASAVA_Build 2 160686535 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2983 hom 28 10 11 7 A 11 12 306835 CASAVA_Build 2 160689902 1I CCACTAGACT -/C CCAGCACCTG 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 C 2 3 306836 CASAVA_Build 2 160690567 5I CATATGATAT -----/AAAAG AAAACACAAT 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 AAAAG 0 1 306837 CASAVA_Build 2 160693032 1I TAGACAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 A 13 14 306838 CASAVA_Build 2 160695961 1D ACAATAACTG T/- TAAGTGCATA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 T 2 1 306839 CASAVA_Build 2 160732743 1I GGGGGTATTT -/A TAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 0 1 306840 CASAVA_Build 2 160742643 1I ATCTATCTTA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 T 7 8 306841 CASAVA_Build 2 160753364 1I CATTCAATTC -/T TTTTTTTTTT 1203 het 1203 ref 30 16 4 10 T 13 14 306842 CASAVA_Build 2 160766215 1D TAAAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 12 11 306843 CASAVA_Build 2 160768054 1I AAAAGTTCTT -/C AAAAAAAAAA 3003 het 3003 ref 31 13 9 9 C 0 1 306844 CASAVA_Build 2 160786584 1D TTTCCAGGCC T/- GGGAGTCTCC 2463 het 2463 ref 32 17 9 6 T 1 0 306845 CASAVA_Build 2 160823465 2D TGGGTACAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 31 0 19 13 T 13 11 306846 CASAVA_Build 2 160838527 1I TCAAGTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 12 0 9 3 T 11 12 306847 CASAVA_Build 2 160852802 1I CATTAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 2103 het 493 hom 16 2 8 6 A 14 15 306848 CASAVA_Build 2 160864270 1I GGCTTTGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 701 hom 43 2 39 2 A 10 11 306849 CASAVA_Build 2 160865879 1I AATACTAGTC -/A ATTTTAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 306850 CASAVA_Build 2 160869148 4D AATCTACTTC CTAT/---- CTAAGTTTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 CTAT 1 0 306851 CASAVA_Build 2 160875471 1D AGTGTGCCCT A/- AAAGTCCTGC 3070 hom 114 het 40 0 38 4 A 4 3 306852 CASAVA_Build 2 160892285 1D TGCTATTATA G/- TTTAGTATCA 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 G 1 0 306853 CASAVA_Build 2 160895376 1D TGAAAATATG T/- TTTTTTTTTT 1179 het 1179 ref 32 26 3 4 T 12 11 306854 CASAVA_Build 2 160904459 2D TGCAATTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AT 7 6 306855 CASAVA_Build 2 160942902 3D TGCTTTAAAG AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 39 0 37 4 A 12 9 306856 CASAVA_Build 2 160943375 1D CTCTATCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 578 hom 29 2 17 11 A 15 14 306857 CASAVA_Build 2 160951298 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2944 het 544 hom 20 3 9 9 A 15 14 306858 CASAVA_Build 2 160952587 1D ATTAGACAGG A/- AAAAAAAAAA 895 het 895 ref 36 29 4 4 A 11 10 306859 CASAVA_Build 2 160955649 1I AACAACCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 30 3 21 6 A 12 13 306860 CASAVA_Build 2 160964283 1D TCCTGTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 32 8 T 13 12 306861 CASAVA_Build 2 160966896 3I TAGAAGGATT ---/AAC AACAACTACC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAC 2 3 306862 CASAVA_Build 2 160985379 1I TGTCAGTCAG -/T TAGTTCTCGG 3070 hom 120 het 44 0 39 5 T 1 2 306863 CASAVA_Build 2 160991612 1D GGAGCATGTC A/- GGGGGAAAAG 3070 hom 106 het 40 0 34 6 A 1 0 306864 CASAVA_Build 2 160992312 5D ATACATAGAG ATTTC/----- ATATAGATCC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 ATTTC 1 0 306865 CASAVA_Build 2 160993278 1D AGAAGAAGAA G/- AAAAAAACTC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 G 1 0 306866 CASAVA_Build 2 160999249 1I GACAGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2931 het 2931 ref 35 17 9 9 A 11 12 306867 CASAVA_Build 2 161002720 1I CCTTGTTCAT -/A CCACTTTTAC 3070 hom 135 het 48 0 44 4 A 0 1 306868 CASAVA_Build 2 161007104 1I TAAAATTTCA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 7 8 306869 CASAVA_Build 2 161014587 1D AATAAATACT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 9 8 306870 CASAVA_Build 2 161017856 3I TATGATGATG ---/GTT ATGATGATGA 1881 het 385 hom 46 7 15 24 GTT 0 1 306871 CASAVA_Build 2 161021714 1I AAACAACAAC -/A AAAAAACCTG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 6 7 306872 CASAVA_Build 2 161055868 1D TAAGGGAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 39 0 33 6 A 10 9 306873 CASAVA_Build 2 161061933 2D AACAAATAAC TT/-- TTTAAAACAT 3070 het 3070 hom 39 12 23 5 T 5 3 306874 CASAVA_Build 2 161068356 1D ATTCCTCTTT G/- TCACTGATAG 3070 hom 105 het 36 0 35 1 G 1 0 306875 CASAVA_Build 2 161068670 3D TTGCCAGGAC TTT/--- TTGTGTTTGG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 5 2 306876 CASAVA_Build 2 161070929 1I GATTCAGACC -/T TGATGAGCAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 306877 CASAVA_Build 2 161084073 1I GGATCCTACA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 T 7 8 306878 CASAVA_Build 2 161107451 4D ATCATTGTGT ATTA/---- ATTAATTAAC 3070 het 3070 ref 46 21 19 8 ATTA 3 2 306879 CASAVA_Build 2 161146629 1D CTGATTTTTT A/- AAAAAAGTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 7 6 306880 CASAVA_Build 2 161147642 1I CTGTGTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 11 12 306881 CASAVA_Build 2 161147870 6D TTTCCTCCTC CTTCTT/------ CTTCTTCTTT 3070 het 3070 hom 46 20 20 9 CTT 5 3 306882 CASAVA_Build 2 161151820 6D TGTAGGTAAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 hom 33 het 29 0 12 18 AAAAAC 3 2 306883 CASAVA_Build 2 161154275 4I TTTTCCCCTC ----/TCTT TCTTTTTAAA 3070 hom 34 het 16 0 12 4 TCTT 1 2 306884 CASAVA_Build 2 161154899 1D AAGGCTCCTT A/- GGGGGGGTAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 1 0 306885 CASAVA_Build 2 161156861 1I TTATTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 824 hom 41 2 32 7 A 11 12 306886 CASAVA_Build 2 161169808 2I TTGTCTGTAC --/TT TTTTGTCTTG 3070 hom 103 het 41 0 35 6 T 4 6 306887 CASAVA_Build 2 161171142 1I GTTCTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 462 hom 40 2 34 4 T 10 11 306888 CASAVA_Build 2 161175170 1D AAGTCAGTTT C/- CAAATATAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 C 2 1 306889 CASAVA_Build 2 161180167 1I ATCCCAGCTT -/G GGTGACAGAG 3070 hom 84 het 30 0 27 3 G 2 3 306890 CASAVA_Build 2 161183337 1D GAATTATCCT A/- AAGATATAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 3 2 306891 CASAVA_Build 2 161185981 1D ACATTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 37 1 24 12 T 15 14 306892 CASAVA_Build 2 161186768 1D ATCTCTGTGG T/- TAAGTGATGC 3070 het 3070 ref 54 27 24 3 T 2 1 306893 CASAVA_Build 2 161187153 4D CAAGCACCTC TATA/---- TATATATACA 3070 hom 75 het 28 0 26 5 TA 6 4 306894 CASAVA_Build 2 161193783 1I GCCTGTTCCA -/C ATGCCTAACG 3070 hom 138 het 54 0 46 8 C 0 1 306895 CASAVA_Build 2 161203638 4D TTTTTTCAAA AATT/---- AATTTTTATG 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 AATT 2 1 306896 CASAVA_Build 2 161206031 1D CAAATAACTG T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 9 8 306897 CASAVA_Build 2 161207226 4I TATTTTTATT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TTTA 2 3 306898 CASAVA_Build 2 161216488 1I CCAGACAAAT -/G ATCCTGTATG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 0 1 306899 CASAVA_Build 2 161219011 1D TTTCTTATTC T/- TTTTTTTTTT 2242 het 2242 ref 24 10 9 5 T 12 11 306900 CASAVA_Build 2 161222001 4D AAAGAATAAT AGAA/---- AGAAAAATAA 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 AGAA 2 1 306901 CASAVA_Build 2 161222918 1I AAAAAATACT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 7 8 306902 CASAVA_Build 2 161223845 1D ATATGGTAGA T/- TTTAAACTCA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 4 3 306903 CASAVA_Build 2 161225292 1I AGGAATACTT -/C CCCAAAATGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 3 4 306904 CASAVA_Build 2 161230801 1I GGTAAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 10 11 306905 CASAVA_Build 2 161232874 6D CTTCTTCTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2679 hom 25 het 22 0 11 11 T 22 16 306906 CASAVA_Build 2 161234893 1I GATTTGCCCA -/C CTCAGCCTCC 2695 hom 43 het 17 0 8 9 C 1 2 306907 CASAVA_Build 2 161240992 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 13 12 306908 CASAVA_Build 2 161246561 1D TTGATTTGTG A/- GAGAGATATG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 0 306909 CASAVA_Build 2 161249215 1I AGCCAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 9 10 306910 CASAVA_Build 2 161249761 2D TAAAAGATAA CT/-- CTGAAGAGCA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 CT 2 1 306911 CASAVA_Build 2 161252612 1D GTTTGGAAAA T/- ATCAGCTTAC 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 1 0 306912 CASAVA_Build 2 161257258 1I ACATGGAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 11 12 306913 CASAVA_Build 2 161264500 1I GGAAATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 89 hom 35 1 29 5 A 11 12 306914 CASAVA_Build 2 161264592 2D GTTATTTCTG TC/-- TCTATGAATT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TC 2 1 306915 CASAVA_Build 2 161272750 1D GAATTTTATA G/- TAGTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 G 1 0 306916 CASAVA_Build 2 161285711 1I TTTATCTAGA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 58 het 36 1 32 3 T 8 9 306917 CASAVA_Build 2 161290214 3I TATTTGCATA ---/GAG GTGTTTATAA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 GAG 0 1 306918 CASAVA_Build 2 161290339 1D AACCCATTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 56 het 26 0 19 7 T 10 9 306919 CASAVA_Build 2 161291565 1I AACAAACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 661 hom 28 2 19 7 A 13 14 306920 CASAVA_Build 2 161296069 4I GGCAGACAAA ----/CTCT CTGTCTTTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CT 1 3 306921 CASAVA_Build 2 161308892 3I TTGGTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 TTG 3 4 306922 CASAVA_Build 2 161313154 1I TTAATTTATA -/G TACAAAGAAG 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 G 0 1 306923 CASAVA_Build 2 161328335 1I GACCTACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 T 13 14 306924 CASAVA_Build 2 161330651 2I CTTCCCCATT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 41 13 14 14 CA 6 7 306925 CASAVA_Build 2 161331256 4I ATATCTGGGG ----/GGGT GGGGGGTGGA 3070 het 252 hom 23 4 12 7 GGGT 0 1 306926 CASAVA_Build 2 161339995 1D CTTCTATTAG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 7 6 306927 CASAVA_Build 2 161348422 4D TACCAGCAAG AATT/---- AATTAGAAGA 3070 het 3070 ref 35 20 15 3 AATT 2 1 306928 CASAVA_Build 2 161348771 1I CTTGTTTACT -/A CAAGAGGCAC 3070 het 3070 ref 50 27 15 8 A 0 1 306929 CASAVA_Build 2 161349593 1I TCTCTACAGA -/T TTTTTTTTTT 2671 het 1976 hom 34 10 9 15 T 14 15 306930 CASAVA_Build 2 161350430 1D GGGTGGACAA C/- AGTGTTCCTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 C 1 0 306931 CASAVA_Build 2 161351022 1I CTAGACTCTT -/A ATGTGTCTGA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 1 2 306932 CASAVA_Build 2 161352592 2I ACTAGCAAAC --/AT GTGGAGCAAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 AT 0 1 306933 CASAVA_Build 2 161356086 3D CAAACACTGA CTT/--- CTTCAAGAAT 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 CTT 2 1 306934 CASAVA_Build 2 161356669 1I CATATGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 23 1 A 10 11 306935 CASAVA_Build 2 161361122 1D TAATGGGTAC A/- AAAAAAATAT 3070 het 2627 hom 17 6 10 2 A 8 7 306936 CASAVA_Build 2 161361996 3D GTTTTCATGC CTG/--- CTAACAGCAT 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 CTG 1 0 306937 CASAVA_Build 2 161372466 1D CTATCTCTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 14 17 11 A 10 9 306938 CASAVA_Build 2 161375129 1D TCCACCAGGT A/- GAGGTTGATT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 1 0 306939 CASAVA_Build 2 161379888 1D TATCATGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 11 10 306940 CASAVA_Build 2 161383623 2I ATCTTCTGTG --/CT CTGTCTATTC 3070 het 3070 hom 62 28 30 4 CT 1 2 306941 CASAVA_Build 2 161393239 1D GGTTTCACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 17 13 T 11 10 306942 CASAVA_Build 2 161400287 1D ATTCAGATAT G/- GTGGCTGCAG 3070 het 3070 ref 43 19 15 10 G 2 1 306943 CASAVA_Build 2 161408361 1I CCAGATGAAG -/A ATTCAGAAGG 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 A 1 2 306944 CASAVA_Build 2 161423289 1I CATGCAAACA -/T TTTCTATGGA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 T 3 4 306945 CASAVA_Build 2 161434175 3D TTTTTTCTTT ATC/--- ATCTCTTTAC 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 ATC 2 1 306946 CASAVA_Build 2 161436290 2I CTCTTTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 525 hom 27 5 16 6 TC 0 1 306947 CASAVA_Build 2 161455012 1D ACTAATTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 7 306948 CASAVA_Build 2 161461423 1I ACAAATTTTG -/C TTTAGAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 C 0 1 306949 CASAVA_Build 2 161461731 2D TTTCTTTATG TA/-- TAGATCCAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TA 2 1 306950 CASAVA_Build 2 161466162 1I ATTAAATGAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 7 8 306951 CASAVA_Build 2 161469372 20D CCTCTATACT TTAAATCATCTCTAGATTAC/-------------------- TTATAATACT 3070 het 3070 ref 25 16 9 3 TTAAATCATCTCTAGATTAC 1 0 306952 CASAVA_Build 2 161470736 1D ATTACATACT C/- CCCCCCCCTA 3070 het 3070 hom 32 11 18 5 C 9 8 306953 CASAVA_Build 2 161483335 4D AATAGTACTG AAGA/---- AAGATAGAGG 3070 hom 129 het 51 0 43 8 AAGA 2 1 306954 CASAVA_Build 2 161484511 4D TTTTTTTTAA TGTC/---- TGTTTGTAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 TGTC 1 0 306955 CASAVA_Build 2 161487689 17I CCGTATCTTT -----------------/TCCAAATGAGAAGTGTC TCCAAATGAG 3070 het 3070 ref 52 28 19 6 TCCAAATGAGAAGTGTC 0 1 306956 CASAVA_Build 2 161498292 1D AAAATTGTGA T/- TTTTGTAGAC 3070 hom 111 het 41 0 35 6 T 5 4 306957 CASAVA_Build 2 161498951 1I TTGCATTCCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 9 10 306958 CASAVA_Build 2 161504390 3I GGGGTTTGCA ---/GTT GTTGTGATAG 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 GTT 1 2 306959 CASAVA_Build 2 161507341 5I TAAGACATAG -----/GGAAC GGAACGTCTT 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 GGAAC 1 2 306960 CASAVA_Build 2 161517616 1I AATGAATATA -/T TTCTGGTTCA 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 T 2 3 306961 CASAVA_Build 2 161530148 1D74M4D TTTCTTTTTC TTTTTTTTTTATTAATTTGAGCAGGACATCATTATCCAAGCCCAGCCTTGAATATGTGCTATACACAAAACAATTTATC/-TTTTTTTTTATTAATTTGAGCATGACATCATTATCCAAGCCCAGCCTTGAATATGTGCTATACACAAAACAATT---- TACTAGAGTT 3070 hom 178 het 40 0 60 5 N/A 0 0 306962 CASAVA_Build 2 161530519 2I TCCCTGTATT --/AA AAGTCATCAC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 2 4 306963 CASAVA_Build 2 161531174 1D AAGGTGTGCA G/- CAGGGGAGGA 3070 hom 126 het 44 0 42 3 G 1 0 306964 CASAVA_Build 2 161531893 1D AGGTCAAGGC A/- GCATTGAGCC 3070 hom 59 het 23 0 19 4 A 1 0 306965 CASAVA_Build 2 161534129 2D TATAACAACA TT/-- TAATATAAGG 3070 hom 78 het 31 0 27 6 T 3 1 306966 CASAVA_Build 2 161545127 3I CAGACAGTAG ---/TAA TATTTGCTCG 3070 hom 75 het 27 0 25 2 TAA 0 1 306967 CASAVA_Build 2 161557493 1I AATTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 24 1 14 9 T 13 14 306968 CASAVA_Build 2 161558226 6D TTTATTATTA TACTTT/------ AAGTTTTAGG 3070 hom 131 het 50 0 43 8 TACTTT 1 0 306969 CASAVA_Build 2 161562143 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2828 het 412 hom 12 1 7 4 A 13 12 306970 CASAVA_Build 2 161573360 2D CGTTTAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 23 9 A 12 10 306971 CASAVA_Build 2 161583813 1I GCAATGCCTT -/C AAATTGAATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 0 1 306972 CASAVA_Build 2 161591894 10D ATAAAGACAC ATGCACACAT/---------- ATGCACACAT 3070 het 3070 ref 18 8 8 4 ATGCACACAT 2 1 306973 CASAVA_Build 2 161596397 5D AGCCACTTCT AAAAG/----- AATAGAACAG 3070 het 3070 ref 42 23 17 6 AAAAG 1 0 306974 CASAVA_Build 2 161602145 1D AGTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 59 27 18 16 A 11 10 306975 CASAVA_Build 2 161617481 1I GGATGGAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 10 11 306976 CASAVA_Build 2 161618451 7I ATCAAAATCC -------/CTAAAGT CTAAAGTCCC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 CTAAAGT 1 2 306977 CASAVA_Build 2 161619506 1I TACATTGTGC -/T GGCTGGCAAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 0 1 306978 CASAVA_Build 2 161622019 2I GTATACAAAA --/AG GCACAGAGTC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 AG 0 1 306979 CASAVA_Build 2 161623413 1D TGTATATATG A/- AAAAAAGGTC 3070 het 3070 ref 46 21 20 6 A 7 6 306980 CASAVA_Build 2 161630462 1D TCAGTAGGTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 9 8 306981 CASAVA_Build 2 161631291 2D AAAAAGTGAA AG/-- AGCTTGAGTT 3070 het 3070 ref 52 25 20 9 AG 2 1 306982 CASAVA_Build 2 161639617 2D ATAAAATGTT TC/-- TGTCTTGCTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 5 TC 1 0 306983 CASAVA_Build 2 161665451 1D AAGCAAGAGG A/- AAAAAAAAAG 1153 het 1153 ref 22 16 3 3 A 10 9 306984 CASAVA_Build 2 161668614 1D ATAATAAAAT A/- AAAAAATAAA 1582 het 1582 ref 15 8 4 4 A 7 6 306985 CASAVA_Build 2 161679579 1D AGGAAAAGAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 51 28 21 2 A 9 8 306986 CASAVA_Build 2 161712195 1I GGAGGCTAGG -/C CCTGGTGGTG 3070 hom 87 het 34 0 27 7 C 2 3 306987 CASAVA_Build 2 161721423 1D TGATGCTATT A/- AGTTCTTCAG 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 A 2 1 306988 CASAVA_Build 2 161728170 2D TTTCCCCCCT AC/-- ACACAACTTT 3070 het 3070 ref 41 21 18 4 AC 3 2 306989 CASAVA_Build 2 161734522 1I TGTGCTTTAG -/C CAACAGAGAC 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 C 1 2 306990 CASAVA_Build 2 161779271 1I TTTTTGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 T 12 13 306991 CASAVA_Build 2 161786420 1D AACCGTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 34 16 4 14 T 15 14 306992 CASAVA_Build 2 161818576 1I TATTTGATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 9 10 306993 CASAVA_Build 2 161820350 4I ACAGATTGAT ----/AGAG AGATATATAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AG 1 3 306994 CASAVA_Build 2 161835632 1I ATAGCAACAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 8 9 306995 CASAVA_Build 2 161838895 4D CTAATAATCT AACA/---- AACAAAATGA 3070 het 3070 ref 36 19 16 4 AACA 2 1 306996 CASAVA_Build 2 161839884 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1505 het 145 hom 8 1 5 3 A 17 16 306997 CASAVA_Build 2 161843294 3I2M1I AAGAGAAGAA ---AG-/TTGAGT GGCTTTTACT 3070 het 3070 ref 75 36 34 7 N/A 0 0 306998 CASAVA_Build 2 161858175 1D ATATGGACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1029 hom 20 5 14 2 T 10 9 306999 CASAVA_Build 2 161864573 1D TCCCTCCCCC A/- AATCCCACAT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 3 2 307000 CASAVA_Build 2 161878096 4D AATTTTTATT TTAA/---- TTAATTAATT 1528 het 1528 ref 14 6 6 2 TTAA 4 3 307001 CASAVA_Build 2 161888698 1I TCTTTATAAC -/A AACTCCACCT 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 A 2 3 307002 CASAVA_Build 2 161909391 3D ATTTCTGGTG TTC/--- TTCTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 TTC 2 1 307003 CASAVA_Build 2 161919266 4I GTGCTTGGTC ----/CTTA CTTGTTGCAG 3070 het 3070 hom 56 22 30 4 CTTA 0 1 307004 CASAVA_Build 2 161920805 1I GCCAAAGGAT -/G TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 G 0 1 307005 CASAVA_Build 2 161921834 4I GGCAAATGCC ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 T 12 16 307006 CASAVA_Build 2 161922661 1I CTTCCTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 9 7 T 12 13 307007 CASAVA_Build 2 161926216 1I CACGGATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 10 11 307008 CASAVA_Build 2 161927027 1I CCAGAATAGT -/A AAAGTCAACA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 3 4 307009 CASAVA_Build 2 161932440 1I ATAAAAGGAG -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 5 6 307010 CASAVA_Build 2 161949305 2I TATAGAAATA --/CT CTGTTACTTA 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 CT 1 2 307011 CASAVA_Build 2 161967456 1D TAAAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 39 1 27 12 A 11 10 307012 CASAVA_Build 2 161979067 2D TCTGGCTCTC TT/-- TTTATCCCAG 3070 het 1800 hom 23 6 9 8 T 5 3 307013 CASAVA_Build 2 161997519 1I ATAGGAAGGG -/T TTCTACAATT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 2 3 307014 CASAVA_Build 2 162019987 3I GTGCCCGGCC ---/GAG GAGATTGTTC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 GAG 1 2 307015 CASAVA_Build 2 162034898 1D GAAAAGAACA C/- CCCACTGGGC 3070 hom 111 het 43 0 37 7 C 4 3 307016 CASAVA_Build 2 162073485 1I ACTGGTTGTA -/C CAGTCTATAT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 C 1 2 307017 CASAVA_Build 2 162078327 13I AAAGCCCCTG -------------/GGAAGTTTGAACT GGGCAGAGCA 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 GGAAGTTTGAACT 0 1 307018 CASAVA_Build 2 162082531 1I CAGTTATACA -/T AAACATATAT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 0 1 307019 CASAVA_Build 2 162087041 1I TATTTTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 T 13 14 307020 CASAVA_Build 2 162094274 1I AAGCTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 1833 het 1833 ref 14 8 4 2 T 10 11 307021 CASAVA_Build 2 162099910 1D GGATGGAAGT G/- GGGCAAGGCT 3070 het 3070 hom 50 21 24 7 G 4 3 307022 CASAVA_Build 2 162109126 1D TTCACCATAT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 8 7 307023 CASAVA_Build 2 162109365 1I AAAGAAAATG -/A AAAAAAAAAA 2066 het 2066 ref 22 12 5 5 A 10 11 307024 CASAVA_Build 2 162110370 1D TGGAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2688 het 2688 ref 37 18 9 11 T 12 11 307025 CASAVA_Build 2 162127680 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTATAG 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 T 6 7 307026 CASAVA_Build 2 162130588 1I TGTTATCCCT -/C CCCCCTCCCC 1454 het 395 hom 8 3 4 1 C 5 6 307027 CASAVA_Build 2 162142815 1I CATCTATTAC -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 T 7 8 307028 CASAVA_Build 2 162164337 1D CTCTGTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 31 0 24 8 T 11 10 307029 CASAVA_Build 2 162173682 1I CTTTTTAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2230 hom 20 6 11 3 T 12 13 307030 CASAVA_Build 2 162188576 2I ATATTTTCTT --/TC TCTGTCATTT 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 TC 1 2 307031 CASAVA_Build 2 162195173 2D ATTGTTGACA CC/-- CCATTATTTT 3070 het 3070 ref 39 21 18 2 C 4 2 307032 CASAVA_Build 2 162203633 1I TTTTTAAGAT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 A 7 8 307033 CASAVA_Build 2 162209249 3I CAAAAACAAA ---/AAC AAACTAGTAA 168 het 168 ref 28 16 2 10 AAC 0 1 307034 CASAVA_Build 2 162209986 1I ATTTCCAATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 9 21 8 T 8 9 307035 CASAVA_Build 2 162214556 1D TAAATAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 7 7 T 11 10 307036 CASAVA_Build 2 162216588 1I GCCCTTGGCA -/G GGTGTGGGAT 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 G 2 3 307037 CASAVA_Build 2 162217616 4I CATTCTTTTC ----/TTTT TTTTAAGTAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 T 4 8 307038 CASAVA_Build 2 162221879 1D AGCATTTTAG A/- ATAATTTTCC 3070 het 3070 hom 40 14 18 9 A 2 1 307039 CASAVA_Build 2 162229468 1I TTTTTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 10 11 307040 CASAVA_Build 2 162231612 1D TTAAAATGCC A/- TGAACCATTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 A 1 0 307041 CASAVA_Build 2 162235058 1I TTTCATCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 17 13 16 T 11 12 307042 CASAVA_Build 2 162235338 1I GTTTATAAAT -/A ACTAACAAGG 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 1 2 307043 CASAVA_Build 2 162238773 1I AGTTCATTAA -/C AAATATATTT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 C 0 1 307044 CASAVA_Build 2 162241114 1I TTGAAATGCC -/A TTTAAAATAA 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 A 0 1 307045 CASAVA_Build 2 162259229 1D GCAGATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 7 A 13 12 307046 CASAVA_Build 2 162266601 3D AATCAAAACC ACA/--- ACGAGATACC 3070 het 3070 ref 42 20 18 7 ACA 1 0 307047 CASAVA_Build 2 162401411 1D AAATTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 15 7 3 A 11 10 307048 CASAVA_Build 2 162403040 1I TGCAAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 9 10 307049 CASAVA_Build 2 162426255 1I GATCTTTCTA -/T TTATGTGAGC 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 T 2 3 307050 CASAVA_Build 2 162436157 1D CATTTCACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 10 9 307051 CASAVA_Build 2 162446885 2D ACACTGTGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 9 A 12 10 307052 CASAVA_Build 2 162449687 1D TAATCCCAGC A/- CTTTGGGAGG 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 A 1 0 307053 CASAVA_Build 2 162450043 1D TACTTTGGTT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 8 7 307054 CASAVA_Build 2 162452152 1D GCCACACTGT C/- TTTCACAATC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 C 1 0 307055 CASAVA_Build 2 162461970 1D AGCATTGCTA T/- TTTTTAGGGT 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 T 6 5 307056 CASAVA_Build 2 162465028 17D TCCTTTTACA ACAGTCTTTGGCACTCT/----------------- ATGAGTTAGA 3070 het 3070 ref 47 23 23 4 ACAGTCTTTGGCACTCT 1 0 307057 CASAVA_Build 2 162465628 5D ACCTGAAATT AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 AAAAC 3 2 307058 CASAVA_Build 2 162473355 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2148 het 519 hom 10 3 7 0 A 12 11 307059 CASAVA_Build 2 162474458 1D AAAATCAATC T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 52 18 27 10 T 8 7 307060 CASAVA_Build 2 162477690 1I AGCTATTTTT -/G GTGCCTGATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 1 2 307061 CASAVA_Build 2 162479410 1D TCATGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 11 10 307062 CASAVA_Build 2 162480184 1D TTTTCAAAAC T/- TTTGTGCCTG 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 4 3 307063 CASAVA_Build 2 162497886 10I TTCCTGCCTG ----------/TTTTTCTTTC TTTTTCTTTC 3070 het 7 hom 29 2 25 2 TTTTTCTTTC 1 2 307064 CASAVA_Build 2 162511453 1D TTCCTGGAGG A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 34 22 11 2 A 7 6 307065 CASAVA_Build 2 162522857 1I TAGCTTCATT -/C TTTAATCCAC 3070 hom 80 het 30 0 26 4 C 0 1 307066 CASAVA_Build 2 162526304 1D TCTTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 2574 het 2574 ref 32 14 11 7 T 15 14 307067 CASAVA_Build 2 162535737 17D GGCCTACATT GTTTCTTCCCACCTGGA/----------------- GTTTCTTCCC 3070 het 3070 ref 45 21 17 13 GTTTCTTCCCACCTGGA 2 1 307068 CASAVA_Build 2 162536976 1D TGTCTTACTT A/- ATGTAGCTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 2 1 307069 CASAVA_Build 2 162537961 1I TATACATCTT -/A AAAATTCCAT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 4 5 307070 CASAVA_Build 2 162548953 1D TTCTGCAGAG T/- TTTTTTTTTC 1142 het 1142 ref 38 34 3 1 T 10 9 307071 CASAVA_Build 2 162553819 1D TGTAAGCACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 10 9 307072 CASAVA_Build 2 162574731 1D TCAAAAGAAA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 T 9 8 307073 CASAVA_Build 2 162577900 1D TTTAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 2703 het 2703 ref 25 10 7 8 A 12 11 307074 CASAVA_Build 2 162605826 2D ATATATTTTC AG/-- AGTTATATGA 3070 het 3070 hom 31 13 16 5 AG 2 1 307075 CASAVA_Build 2 162632434 4D ATAATAAAAC AGTT/---- AGTTCTAATT 3070 het 3070 ref 46 28 15 4 AGTT 2 1 307076 CASAVA_Build 2 162654432 7I TTCGAATCTC -------/TGCCACA TGCTAAGTGA 3070 het 3070 ref 56 29 19 8 TGCCACA 0 1 307077 CASAVA_Build 2 162706759 1I24M4I GTTGTAAGGC -AAAAAAACAGTTATAATCAAAGAC----/AAAAAAAACAGTTATAATCAAAGACTTCT TTAAGAAATG 3070 het 3070 hom 43 18 28 4 N/A 0 0 307078 CASAVA_Build 2 162709228 4I GAGATTATTA ----/ATTT GTCTGTAATT 3070 het 3070 hom 50 24 24 2 ATTT 0 1 307079 CASAVA_Build 2 162709846 4D TAATATATAA ATAT/---- ATGTTGATCA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 AT 3 1 307080 CASAVA_Build 2 162773581 1D AATAGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 1434 het 1434 ref 37 26 4 7 T 13 12 307081 CASAVA_Build 2 162825175 1D AAAAAAACAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 9 8 307082 CASAVA_Build 2 162899021 1I CAATTATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 11 12 307083 CASAVA_Build 2 162942021 1D CCAAACGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 13 12 307084 CASAVA_Build 2 162994634 1I AAAAAACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 11 12 307085 CASAVA_Build 2 163125809 1D TGAAATAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 T 13 12 307086 CASAVA_Build 2 163129049 2I GATATGACCC --/AG AGAGTTTAAA 2713 het 2713 ref 20 11 7 2 AG 2 3 307087 CASAVA_Build 2 163141277 1I ATGAAATTAG -/C TACTCCTTCC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 C 0 1 307088 CASAVA_Build 2 163141414 1D TTTTTTGGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 T 9 8 307089 CASAVA_Build 2 163146358 1I TCTTTTAAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 8 9 307090 CASAVA_Build 2 163158992 4D CCAGTAAGTA TTCC/---- TTCCTTTGGA 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 TTCC 2 1 307091 CASAVA_Build 2 163175084 1D TAAATGAGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 T 9 8 307092 CASAVA_Build 2 163184217 1D CTCAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 A 12 11 307093 CASAVA_Build 2 163192658 3D GTTGCTAGTC AGA/--- AGAAGGACAG 3070 het 3070 hom 29 8 19 3 AGA 2 1 307094 CASAVA_Build 2 163320071 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2903 het 321 hom 10 2 7 1 A 8 9 307095 CASAVA_Build 2 163327149 1I GACTAACACT -/G GGGACAGGGA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 G 3 4 307096 CASAVA_Build 2 163350310 1D CTTCACTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 10 9 307097 CASAVA_Build 2 163366039 1I AATATTTCCC -/T TCTTAACCTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 2 307098 CASAVA_Build 2 163385676 1D TAATTCATTA T/- TTTTTATTGT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 6 5 307099 CASAVA_Build 2 163387995 1I CTAAAAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 316 hom 38 2 33 3 A 9 10 307100 CASAVA_Build 2 163390772 4I ACTTTGACAG ----/AGAC AGACAGAGAG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AGAC 1 2 307101 CASAVA_Build 2 163392289 4I TCTGCCTGAT ----/AGAG ATTCATTTTG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AG 0 2 307102 CASAVA_Build 2 163394538 1D TAAGAAAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 5 A 10 9 307103 CASAVA_Build 2 163397788 1I GCATAATGGC -/A AAAATACAGG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 4 5 307104 CASAVA_Build 2 163398042 1D TAACTAAAAT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 33 0 11 22 A 1 0 307105 CASAVA_Build 2 163409208 1D GCACAGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 37 1 31 5 T 11 10 307106 CASAVA_Build 2 163411375 1I CAGATAAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 29 0 24 5 A 9 10 307107 CASAVA_Build 2 163412568 3D AAGGAAAAAG ATA/--- ATAAACAAAT 3070 hom 79 het 31 0 27 6 ATA 2 1 307108 CASAVA_Build 2 163413165 1D GGCTGCACAC A/- GCAACTGGGT 3070 hom 78 het 29 0 21 9 A 1 0 307109 CASAVA_Build 2 163420506 1D TTTATTTTCC T/- GTGCAGAAGC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 1 0 307110 CASAVA_Build 2 163428310 1I CAAAGCAGGG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 8 9 307111 CASAVA_Build 2 163434144 2D AGGGAAGAGA AC/-- AAGAGTCTCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AC 1 0 307112 CASAVA_Build 2 163437172 4I AAGAGCAAAC ----/AAAA CCCAAAATTA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 0 4 307113 CASAVA_Build 2 163437274 1I AAAAAGTTGA -/T TTTTTTGAAA 2999 hom 21 het 16 0 8 8 T 6 7 307114 CASAVA_Build 2 163444812 1I AAGTATATAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 9 307115 CASAVA_Build 2 163444978 1I TACATTTTTT -/G TGTGTGTATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 307116 CASAVA_Build 2 163449279 1D TGGCCCGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 11 10 307117 CASAVA_Build 2 163471137 1D TATTTGAAAA G/- CTTAACAACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 0 307118 CASAVA_Build 2 163488234 1I CATTTGCGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 37 2 30 5 T 11 12 307119 CASAVA_Build 2 163492688 1D CATTTTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 21 1 20 1 A 11 10 307120 CASAVA_Build 2 163494004 1D ATTTTTGCGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 10 9 307121 CASAVA_Build 2 163499506 1I AGAAAAGATG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 8 9 307122 CASAVA_Build 2 163512021 2I GTTTAGCCAT --/GG AGTGGAAAGG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 0 2 307123 CASAVA_Build 2 163513317 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 12 1 8 4 A 13 12 307124 CASAVA_Build 2 163513391 2I CAGCAAGAGC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 47 het 22 0 16 6 A 9 11 307125 CASAVA_Build 2 163522871 1D TGTGATCTTT C/- TTTTTGTACC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 C 1 0 307126 CASAVA_Build 2 163525910 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 55 het 22 0 18 4 A 10 9 307127 CASAVA_Build 2 163527287 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 10 307128 CASAVA_Build 2 163533045 1I GCTACTGTTG -/T TTTTTTATAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 6 7 307129 CASAVA_Build 2 163561477 2D ACACCACATC TG/-- TGTGTGTGTG 1567 het 1567 ref 61 38 5 19 TG 10 9 307130 CASAVA_Build 2 163584065 1D AGGACTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 199 hom 42 1 29 12 A 12 11 307131 CASAVA_Build 2 163630733 1D AAATTACATT A/- AAATGGCCAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 4 3 307132 CASAVA_Build 2 163652973 1I ACGCTTATAA -/T TTTTTTTTTT 1918 het 1918 ref 37 17 6 14 T 15 16 307133 CASAVA_Build 2 163708491 1D CCCTGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 2701 het 2701 ref 56 40 7 9 T 12 11 307134 CASAVA_Build 2 163736707 1D AGACGGATTC A/- AAAGCCCAGC 3070 hom 140 het 56 0 46 11 A 4 3 307135 CASAVA_Build 2 163758992 1I TTTCTGTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 50 0 45 5 T 9 10 307136 CASAVA_Build 2 163781036 2D GACAATTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 23 5 T 13 11 307137 CASAVA_Build 2 163785509 1I TCTTTGCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 9 10 307138 CASAVA_Build 2 163785582 1D CTCCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 32 0 28 5 A 12 11 307139 CASAVA_Build 2 163786724 2I GCACAAAGTT --/TG TGTGTGTGGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TG 4 5 307140 CASAVA_Build 2 163786994 2I CAATTCTTTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 9 11 307141 CASAVA_Build 2 163797153 1I TATGTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 1659 het 1659 ref 35 15 5 15 T 17 18 307142 CASAVA_Build 2 163801678 3D AATAAGCATG CTT/--- TTTTTATTAT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 CTT 1 0 307143 CASAVA_Build 2 163802024 1I GAACTCATCC -/T TTTTTATGGC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 5 6 307144 CASAVA_Build 2 163844483 1D AATGTCTGAG A/- AAAAAAAAAA 1560 het 1560 ref 29 19 4 7 A 12 11 307145 CASAVA_Build 2 163965346 1D TTTTAGTGGG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 8 7 307146 CASAVA_Build 2 163967544 1I TCATTTGACG -/C CCTCTTAGTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 C 2 3 307147 CASAVA_Build 2 163967818 1I AGGATGTCTG -/C CCTTTAGCCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 2 3 307148 CASAVA_Build 2 163976623 1I TAAAAATTGT -/C AGAGTATTGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 307149 CASAVA_Build 2 163986323 1I TTGATAAAGT -/G GGGGGGGGGC 2850 het 2850 ref 31 13 9 9 G 9 10 307150 CASAVA_Build 2 163998311 11D AGAGACAAGA AACAAAAGAGG/----------- AACAAAAGAG 2584 het 2584 ref 34 19 10 6 AACAAAAGAGG 2 1 307151 CASAVA_Build 2 164000348 2D GCTGGACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 22 19 2 AC 6 5 307152 CASAVA_Build 2 164001786 1I CACCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 10 11 307153 CASAVA_Build 2 164005445 1I AGTGTCTAAG -/T TGGGGGGGGG 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 1 2 307154 CASAVA_Build 2 164021020 2I GTATTCATTA --/AT TGGAGAATAG 3070 hom 75 het 27 0 24 3 AT 0 1 307155 CASAVA_Build 2 164035014 2D CCAAATCCTC TT/-- TTTTTTTAAA 561 het 561 ref 23 9 3 11 T 9 7 307156 CASAVA_Build 2 164038873 1D TGGGTAGAGT G/- GGGGTGGGCA 3070 het 3070 hom 42 17 23 3 G 5 4 307157 CASAVA_Build 2 164043756 1I GGGATCTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 19 18 10 T 9 10 307158 CASAVA_Build 2 164058158 1I TGTTTTATCT -/A AACAGTCGCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 2 3 307159 CASAVA_Build 2 164060343 1I AGAAAGAAAT -/A AAGGGTATTC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 2 3 307160 CASAVA_Build 2 164071668 1D ATAGAAATGC A/- AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 4 A 7 6 307161 CASAVA_Build 2 164078477 4I CAGGGGCAGC ----/ACAA ACATTCAGTT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 ACAA 0 1 307162 CASAVA_Build 2 164079177 4I CGGAATTTGT ----/ACAA ACAACCTCTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 ACAA 1 2 307163 CASAVA_Build 2 164089096 4I TCACGTTTTC ----/TTTG TTTGTTGTGT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TTTG 1 2 307164 CASAVA_Build 2 164093004 1I TAGAGACTCC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 8 9 307165 CASAVA_Build 2 164099363 1I TTTCTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 26 1 19 6 T 12 13 307166 CASAVA_Build 2 164100218 1I GTTTGACTGA -/T TCCAGAAAAA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 1 2 307167 CASAVA_Build 2 164105065 1D TGATTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 11 10 307168 CASAVA_Build 2 164108514 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTGTATT 1915 het 440 hom 7 1 6 0 T 5 6 307169 CASAVA_Build 2 164125329 1I CATGTATCTC -/T TTTTTCACCT 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 5 6 307170 CASAVA_Build 2 164138955 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 635 hom 14 2 10 3 T 8 7 307171 CASAVA_Build 2 164142897 1I GTTTAGAAGT -/C CCAAGATCAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 C 2 3 307172 CASAVA_Build 2 164144012 1D ATAAAAAAAA C/- CAAATATTCT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 C 2 1 307173 CASAVA_Build 2 164151809 1I TATATATAAA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 7 8 307174 CASAVA_Build 2 164163834 2I ATTATATAAT --/AA AGTATTTTAC 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 A 1 3 307175 CASAVA_Build 2 164170654 1D CTAATTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 T 14 13 307176 CASAVA_Build 2 164188822 5D AGGCATGATT TGATA/----- TGAGGTTACC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TGATA 1 0 307177 CASAVA_Build 2 164211294 1I GATTTTATTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 T 7 8 307178 CASAVA_Build 2 164217238 1I ATATCCTACC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 8 9 307179 CASAVA_Build 2 164229755 1I TGAACTATAG -/T TTTTGTATAG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 4 5 307180 CASAVA_Build 2 164231658 1I CAAATTCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 9 12 5 A 13 14 307181 CASAVA_Build 2 164247151 3D GTAATCCAAC ACA/--- ACAAGTATTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 ACA 2 1 307182 CASAVA_Build 2 164259827 2D GAGCTCGGTG TC/-- TCTGTCTCTT 3070 het 3070 hom 54 21 25 8 TC 2 1 307183 CASAVA_Build 2 164264267 9I CATTCCAAGT ---------/GTACTGGAG TCTACATGTT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 GTACTGGAG 0 1 307184 CASAVA_Build 2 164272111 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 36 0 23 13 A 11 9 307185 CASAVA_Build 2 164293011 1I ATTTCTACAT -/A AAAAATACTC 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 A 5 6 307186 CASAVA_Build 2 164299098 1D CACTTACCCG C/- CCCCCCCAAA 3070 het 1918 hom 29 6 14 9 C 8 7 307187 CASAVA_Build 2 164319134 1D TAGGCTGAAG A/- ATAAAAATGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 1 307188 CASAVA_Build 2 164332337 1D TTCTTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 39 1 27 12 T 15 14 307189 CASAVA_Build 2 164347281 32I AAATCTAGCT --------------------------------/AGTAAGTCATTCTTTTTTGGTTATGTGAATGA AAATCACTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 AGTAAGTCATTCTTTTTTGGTTATGTGAATGA 0 1 307190 CASAVA_Build 2 164369946 1I CATTAAAATT -/A ACATAAAGGT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 A 1 2 307191 CASAVA_Build 2 164372489 2I GAATGTTGAC --/TG TGCTAGGCAG 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 TG 1 2 307192 CASAVA_Build 2 164372845 5I CTTTATCCGA -----/CAGTT CAGGAAATGG 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 CAGTT 0 1 307193 CASAVA_Build 2 164374877 2D TGCATTTGAA TC/-- TCTGTCTCAG 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 TC 2 1 307194 CASAVA_Build 2 164396391 1D CTTACCTTTC A/- CAGGTTACAA 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 A 1 0 307195 CASAVA_Build 2 164429040 1D TTTGGTAGCA T/- TTTAGTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 4 3 307196 CASAVA_Build 2 164433162 1I CCATAAAAAC -/A GAATGAGATT 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 A 0 1 307197 CASAVA_Build 2 164452319 1I TTCACATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 13 14 307198 CASAVA_Build 2 164462107 1I AGTAAAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 12 13 307199 CASAVA_Build 2 164465241 1I CTAGACTAAT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 7 8 307200 CASAVA_Build 2 164471475 1D TATAAAAACA T/- TGTCCCCAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 2 1 307201 CASAVA_Build 2 164488739 1D TATTCATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 12 11 307202 CASAVA_Build 2 164496421 1I TATTTTGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2892 hom 18 8 10 0 A 9 10 307203 CASAVA_Build 2 164511869 1I ATGGAAATGG -/A AAAAAAAAAA 2564 het 2564 ref 29 17 7 5 A 13 14 307204 CASAVA_Build 2 164555929 2D GATTGGAGAC AG/-- AGTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 AG 2 1 307205 CASAVA_Build 2 164621076 1D ACTACAGTGC T/- TTTTTTTTTT 2075 het 2075 ref 37 21 6 10 T 15 14 307206 CASAVA_Build 2 164625371 1I GGAAATTATG -/A AAAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 5 6 307207 CASAVA_Build 2 164625476 1I CTAAGGGATC -/T TAGAGGTTTC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 1 2 307208 CASAVA_Build 2 164665678 2D CATAAAAATG CT/-- TTTTTGACAT 3070 het 3070 hom 59 21 34 5 CT 1 0 307209 CASAVA_Build 2 164672277 1I CTCCGTATTC -/T TGGTTCATTA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 1 2 307210 CASAVA_Build 2 164688440 1D AGATTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2810 het 2810 ref 15 8 6 3 A 13 12 307211 CASAVA_Build 2 164691234 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1990 het 1914 hom 29 14 5 10 T 17 16 307212 CASAVA_Build 2 164696473 9D CCCAGTGAAA CTATGTAGC/--------- CTTAGAGGAC 3070 het 3070 ref 46 26 16 9 CTATGTAGC 1 0 307213 CASAVA_Build 2 164701006 1D CTCAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 557 het 557 ref 24 13 4 7 A 17 16 307214 CASAVA_Build 2 164706264 1D TTAAATCAGG T/- TTTTTTTTTT 1815 het 1815 ref 44 35 4 5 T 13 12 307215 CASAVA_Build 2 164709891 1D GCTGGACAAA T/- TTTTTTTTTT 1927 het 1927 ref 35 19 5 11 T 13 12 307216 CASAVA_Build 2 164747894 1D AGTTAAAGTT G/- TTCAATAAGA 3070 het 3070 hom 64 31 31 2 G 1 0 307217 CASAVA_Build 2 164760163 1D GCCCGTGGAT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 7 6 307218 CASAVA_Build 2 164779907 1I CAATATCAGA -/T TGGCTAAATA 3070 het 3070 hom 59 26 27 6 T 1 2 307219 CASAVA_Build 2 164787385 1D GCCATGCTGG T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 T 8 7 307220 CASAVA_Build 2 164791332 1I CTTTTCACAT -/A AACATTTTAT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 2 3 307221 CASAVA_Build 2 164797642 1D GAGTGAGCTG A/- ATAAACTAGA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 1 307222 CASAVA_Build 2 164804300 1D GGGTTTTTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 T 9 8 307223 CASAVA_Build 2 164819937 3D GTCAGATTAC AAT/--- AATAATATGT 3070 het 3070 hom 47 16 24 10 AAT 3 2 307224 CASAVA_Build 2 164822986 1D AGTGGATGTA T/- TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 7 6 307225 CASAVA_Build 2 164824504 1D GCAAGACTCC T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 14 4 T 4 3 307226 CASAVA_Build 2 164825897 4D CTAGAAAATG GATA/---- GATTCAATGG 3070 het 3070 ref 38 22 13 5 GATA 1 0 307227 CASAVA_Build 2 164833936 3D TCCTTGCCTT CCA/--- CCACGATGGT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 CCA 2 1 307228 CASAVA_Build 2 164845952 1I TTTGTTCTTG -/T TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 6 7 307229 CASAVA_Build 2 164864117 3D CCTTCTACAA AAC/--- AACAACTCCT 1940 het 990 hom 7 2 5 0 AAC 3 2 307230 CASAVA_Build 2 164868505 2D TAAACATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 9 A 14 12 307231 CASAVA_Build 2 164872854 1D TACATCAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 10 9 307232 CASAVA_Build 2 164880597 1I GGGTCTTGGT -/G ATAGGAACCA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 G 0 1 307233 CASAVA_Build 2 164881748 1D ATAGTATCCA G/- AGTAATGAAC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 G 1 0 307234 CASAVA_Build 2 164888880 1I TTCTCTTTCT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 2529 hom 21 7 10 4 C 8 9 307235 CASAVA_Build 2 164893351 2I TCATGAGATG --/CT CTCTGATGTC 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 CT 2 3 307236 CASAVA_Build 2 164895134 1D TCTTTGTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 29 11 2 A 10 9 307237 CASAVA_Build 2 164898054 7I AACTCTTAAT -------/ATTTAAC ATTTAACTTT 3070 het 3070 ref 37 13 13 11 ATTTAAC 1 2 307238 CASAVA_Build 2 164906406 1D TATTTGCCTA T/- TTTTGTTAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 T 5 4 307239 CASAVA_Build 2 164976738 4I ATTTGTGACA ----/AAGT AATAGGAAAT 3070 hom 123 het 47 0 41 6 AAGT 0 1 307240 CASAVA_Build 2 165003673 1D AAACCTCTTT C/- CTTTATAAAT 3070 het 2604 hom 23 7 14 2 C 2 1 307241 CASAVA_Build 2 165007457 2D ACTGGATTAA GC/-- GCCAAGAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 GC 2 1 307242 CASAVA_Build 2 165033764 1D CTATTTGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 810 hom 49 10 18 22 A 15 14 307243 CASAVA_Build 2 165047308 1I TTTTTATGGG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 7 8 307244 CASAVA_Build 2 165048886 1D CTGGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 13 14 T 17 16 307245 CASAVA_Build 2 165055654 2D AATATTTACT AG/-- AGAGTCTACT 3070 het 3070 ref 45 21 21 6 AG 3 2 307246 CASAVA_Build 2 165057366 3D AATTGATAAG TTA/--- TTATCATATT 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 TTA 2 1 307247 CASAVA_Build 2 165058087 1D TATCTACTTG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 8 7 307248 CASAVA_Build 2 165059710 1D TTAGAATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 11 10 307249 CASAVA_Build 2 165060158 1D TGCTTTAAGT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 8 7 307250 CASAVA_Build 2 165080560 1I ACTTAGTGAG -/A AAAAAAAAAA 3026 het 3026 ref 30 11 8 11 A 13 14 307251 CASAVA_Build 2 165089614 1D CCTGGGTGCA T/- TTTTTTTTTA 1206 het 1206 ref 25 16 3 6 T 10 9 307252 CASAVA_Build 2 165104232 1I TCCATCTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 10 11 307253 CASAVA_Build 2 165113808 1I TAATTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 2140 het 2140 ref 15 6 6 3 T 9 10 307254 CASAVA_Build 2 165115483 1D ATCCAACAAT A/- AAAAAAAAAA 1720 het 1720 ref 39 29 6 5 A 11 10 307255 CASAVA_Build 2 165121695 1D TATTAGTGAA T/- TCCAAAATGG 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 T 2 1 307256 CASAVA_Build 2 165130049 4I CACACACACA ----/CACG CACACACACA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 CACG 0 1 307257 CASAVA_Build 2 165141582 1D TTAAAACTTG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 9 8 307258 CASAVA_Build 2 165148349 1D AGTAACTACC A/- AAAAAAATCC 1012 het 1012 ref 37 29 3 5 A 8 7 307259 CASAVA_Build 2 165164065 1D CCAAAGTATC G/- TATGGGTAAA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 G 1 0 307260 CASAVA_Build 2 165185275 1I GAAAATCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 9 10 307261 CASAVA_Build 2 165192062 1D TTATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 12 11 307262 CASAVA_Build 2 165210174 1I GTATGCAGCT -/G GGTAATACAC 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 G 2 3 307263 CASAVA_Build 2 165217162 4D TGTTTTTGTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2964 het 2964 ref 30 10 9 11 TTTC 5 4 307264 CASAVA_Build 2 165221312 1D GTGGTGGGGC A/- AAAACCCCAC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 5 4 307265 CASAVA_Build 2 165252820 2D ATAGTATATG AA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 2 0 307266 CASAVA_Build 2 165253620 2I GATAAATATC --/AA AATATCATTC 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 2 4 307267 CASAVA_Build 2 165285034 1D GCAACATACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 A 11 10 307268 CASAVA_Build 2 165298628 1D CCAAACCAAA T/- TTTTTATTCA 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 T 6 5 307269 CASAVA_Build 2 165317186 6I AATAAACAAA ------/AACAAC AACAACAAGT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 AAC 2 4 307270 CASAVA_Build 2 165318207 1D GTGCACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 177 hom 25 6 13 7 A 12 11 307271 CASAVA_Build 2 165341940 1D TGTAGCTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 10 9 307272 CASAVA_Build 2 165350679 1D AAAAGGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2639 hom 30 8 15 7 T 13 12 307273 CASAVA_Build 2 165352234 1D CAGTGGTAAT C/- ATTTTACAAT 3070 het 3070 hom 49 22 22 6 C 1 0 307274 CASAVA_Build 2 165356236 4D TCAGATAGAT AGAC/---- AGACAGACAG 3070 het 3070 ref 49 23 18 10 AGAC 4 3 307275 CASAVA_Build 2 165359510 1I GCAATTTCAA -/C CCCCCTCATG 3070 het 3070 ref 53 30 14 9 C 5 6 307276 CASAVA_Build 2 165365610 1D TTCAAACTAC A/- GTGACAAAGA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 1 0 307277 CASAVA_Build 2 165367305 1I GAAGATTGTG -/T GCACAGCTTC 3070 het 3070 hom 45 15 24 6 T 0 1 307278 CASAVA_Build 2 165374680 1D CAATTTTAAC A/- AAAAAGCCCT 3070 het 3070 hom 32 13 14 7 A 6 5 307279 CASAVA_Build 2 165377800 2D AATTTTTTTT TA/-- AAACCACAAC 3070 het 3070 hom 28 8 17 4 TA 1 0 307280 CASAVA_Build 2 165382431 1D TGAATGAGTT C/- CTACAGTATA 3070 het 3070 hom 57 23 27 7 C 2 1 307281 CASAVA_Build 2 165391653 1D CTTTGTTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2942 hom 26 8 11 7 T 11 10 307282 CASAVA_Build 2 165404155 1I TTCGGATCAA -/C CTAGGCAACA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 1 2 307283 CASAVA_Build 2 165406962 1I CCCACCGCTA -/G GGCTGCGCTT 3070 hom 47 het 17 0 14 3 G 2 3 307284 CASAVA_Build 2 165424462 1I TTAACCTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 9 10 307285 CASAVA_Build 2 165434502 1D TCTCTAAAAT G/- GGAATAATAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 G 3 2 307286 CASAVA_Build 2 165440642 1D TTAATTTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 9 8 307287 CASAVA_Build 2 165444307 4I TCTAAGAAAT ----/ACAA AAGAAAGATT 3070 hom 75 het 33 0 29 4 ACAA 0 1 307288 CASAVA_Build 2 165444432 9D AGTCAAAATT ACCAAAATA/--------- ACCCAAGAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 ACCAAAATA 1 0 307289 CASAVA_Build 2 165444952 1D CATTGCCCGG A/- AAATAAGTTT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 4 3 307290 CASAVA_Build 2 165447555 1D GTCCACAGTA T/- CAGAAGGAAC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 1 0 307291 CASAVA_Build 2 165465618 1I TGTGATATTC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 8 307292 CASAVA_Build 2 165467955 2I TGTGTGTGTG --/TC TGTGTATGTG 3070 het 272 hom 39 1 33 5 TC 0 1 307293 CASAVA_Build 2 165469876 1D ATTATTATTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 T 9 8 307294 CASAVA_Build 2 165478426 1I ACAAAAAAGG -/T TTATGTCTTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 2 3 307295 CASAVA_Build 2 165485302 3D AGAGATATCC GAG/--- GAGAAGACAC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 GAG 2 1 307296 CASAVA_Build 2 165501595 1D ACATTTTACC T/- CACCAAATAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 1 0 307297 CASAVA_Build 2 165511011 2D AGAGACACTC TA/-- TGAAATTTTG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TA 1 0 307298 CASAVA_Build 2 165513951 2D TCGGATTCTA AT/-- TTAATGTGAT 2923 het 2471 hom 15 5 7 3 AT 1 0 307299 CASAVA_Build 2 165516740 3D TTGATCATTG CCA/--- CCACCTCTTT 3070 het 3070 ref 43 23 14 8 CCA 2 1 307300 CASAVA_Build 2 165517385 2D AGTTGCAGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 14 18 8 TG 9 8 307301 CASAVA_Build 2 165520709 1I TCCTGGTAAC -/T TTTTAGAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 4 5 307302 CASAVA_Build 2 165522446 1D GTGAATTTCA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 9 8 307303 CASAVA_Build 2 165527132 1I ATCCCCTCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 16 21 15 T 10 11 307304 CASAVA_Build 2 165528949 2I TCATTAAGAA --/AT AACCATAAAA 3053 het 3053 ref 27 18 8 1 AT 0 1 307305 CASAVA_Build 2 165536316 1D CTAGGAATTT C/- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 C 1 0 307306 CASAVA_Build 2 165554095 9D TATTAGGAAG TGATTGAGA/--------- TCGGTATTAA 3070 hom 54 het 22 0 19 7 TGATTGAGA 1 0 307307 CASAVA_Build 2 165554329 1I AGAAAGTACA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 1061 hom 33 4 19 10 T 7 8 307308 CASAVA_Build 2 165555678 3D TGCCTCTACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 24 1 17 6 A 13 10 307309 CASAVA_Build 2 165691260 4D CTTTCTTTCC TTCT/---- TTTTTTCTCT 3070 hom 47 het 24 0 22 2 TTCT 1 0 307310 CASAVA_Build 2 165693559 2D TTTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 37 0 24 14 TG 8 7 307311 CASAVA_Build 2 165712040 2D TCTTTTTTTT GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 50 het 22 0 16 6 G 12 10 307312 CASAVA_Build 2 165713936 1D ACTTCCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 23 0 11 12 T 15 14 307313 CASAVA_Build 2 165753428 6D CCTGTAATCC CAGGTA/------ CAGGTACTCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 CAGGTA 2 1 307314 CASAVA_Build 2 165852271 1I GGTTCAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 12 13 307315 CASAVA_Build 2 165863687 1D AATCAGATAC A/- AAAAAAGTGA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 7 6 307316 CASAVA_Build 2 165870377 2D GGAAGATAAC TT/-- AATGCTAAGG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 2 0 307317 CASAVA_Build 2 165875928 6D TTTAGTTTGA TTATAT/------ TTAAGGTATG 3070 hom 169 het 62 0 57 7 TTATAT 1 0 307318 CASAVA_Build 2 165891912 2D CTTCCACAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 37 0 12 25 T 12 10 307319 CASAVA_Build 2 165905074 2I AACAAAAAAG --/AA AAAAGTCTAG 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 A 4 6 307320 CASAVA_Build 2 165914313 6I AAATATCAAG ------/TACTTA TACTTATGGT 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 TACTTA 1 2 307321 CASAVA_Build 2 165915476 3I GATCCGCCCG ---/CCT AGGCCTCCCA 2349 hom 18 het 7 0 7 0 CCT 0 1 307322 CASAVA_Build 2 165916330 1D TTAGACTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2809 hom 39 8 27 4 A 12 11 307323 CASAVA_Build 2 165929816 1D TACAGAAGAT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 633 hom 20 4 9 9 G 10 9 307324 CASAVA_Build 2 165930196 2I CATTTATTTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 T 9 11 307325 CASAVA_Build 2 165941696 1D AGTCAGGAAA G/- GGGAAGAGCC 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 G 4 3 307326 CASAVA_Build 2 165943084 1I ATTCCTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 16 12 T 11 12 307327 CASAVA_Build 2 165945117 1D GGGTGAAATT G/- TCTATAATCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 G 1 0 307328 CASAVA_Build 2 165946271 1D AAAATACATA C/- ATACATAATG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 C 1 0 307329 CASAVA_Build 2 165969935 1D TTTTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 33 4 17 12 T 11 10 307330 CASAVA_Build 2 165971243 1I ACTGCAGCTT -/A AAGGCTGAGG 3070 hom 174 het 67 0 57 10 A 2 3 307331 CASAVA_Build 2 165972256 1I TATCCTAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 9 10 307332 CASAVA_Build 2 165977726 6D ATAAATGGAA AGTATT/------ AGTATAAGTG 3070 het 3070 hom 39 15 21 8 AGTATT 1 0 307333 CASAVA_Build 2 165991614 1I CTGTGCCTTC -/A GGGGGGCCTG 3070 hom 86 het 36 0 24 12 A 0 1 307334 CASAVA_Build 2 165993168 1D TTCTGTGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 8 8 A 12 11 307335 CASAVA_Build 2 165993445 1D ACAAGGGTAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 40 0 29 11 T 8 7 307336 CASAVA_Build 2 165996317 4D GTCTTCCCCT AGTA/---- AGTGTCTATT 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 AGTA 1 0 307337 CASAVA_Build 2 165998453 4D CCCTTCACTC CCTT/---- CCTCATTCTG 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 CCTT 1 0 307338 CASAVA_Build 2 166004991 1D GCTTTGGAGA G/- GGGGGTACCA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 G 6 5 307339 CASAVA_Build 2 166006650 1I CAGTGCTAGG -/C CCCCATGAAG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 C 4 5 307340 CASAVA_Build 2 166006932 1D TGGAAAATAA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 2062 hom 30 5 20 5 T 8 7 307341 CASAVA_Build 2 166013622 1I CAAATTTTCC -/T TTTTTTAAAC 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 6 7 307342 CASAVA_Build 2 166024197 1D AATCTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 523 hom 32 2 20 10 T 16 15 307343 CASAVA_Build 2 166029270 5I TACTGTATAC -----/ATAAT ATATGTTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 ATAAT 0 1 307344 CASAVA_Build 2 166031955 1D GCAAGATCTA T/- TTTTTAGGAC 3070 het 3070 ref 42 24 15 4 T 6 5 307345 CASAVA_Build 2 166032259 2D TTTCTCTACA CT/-- CTCTCCAACA 3070 het 3070 ref 39 24 14 2 CT 3 2 307346 CASAVA_Build 2 166035771 1D16M1I TTTATTGTAC TTTTTTTGTTTGAGAGA-/-TTTTTTGTTTGAGAGAT TTTTGTCTTT 3070 het 3070 ref 25 14 13 5 N/A 0 0 307347 CASAVA_Build 2 166043089 1D TCAATTACAT A/- TGTGTTCATT 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 A 1 0 307348 CASAVA_Build 2 166046187 2D CTTTGACAAG AC/-- ACAGGATCAC 3070 hom 144 het 54 0 47 7 AC 2 1 307349 CASAVA_Build 2 166047022 1I AGAGATGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 32 1 16 15 T 13 14 307350 CASAVA_Build 2 166049759 2I TAATTCAAAC --/TG TGATTATTCT 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 TG 1 2 307351 CASAVA_Build 2 166079920 1D CTAAAGATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 10 9 307352 CASAVA_Build 2 166082149 1D TTTTATAATT A/- AATAGTTTCC 3070 het 3070 ref 25 15 10 2 A 3 2 307353 CASAVA_Build 2 166084029 1I ATTGCCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 10 11 307354 CASAVA_Build 2 166105420 1D GCACCAGTTC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 98 het 36 0 32 4 T 8 7 307355 CASAVA_Build 2 166129072 1D ATATTCTGTT A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 7 6 307356 CASAVA_Build 2 166130966 1D CTATCGAGAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 112 het 48 0 38 11 A 9 8 307357 CASAVA_Build 2 166140176 2I TGCATCTGTC --/TG TATTACAGGT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 TG 0 1 307358 CASAVA_Build 2 166145621 1I GTGTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 T 10 11 307359 CASAVA_Build 2 166161497 3D ACTAGTAGTG ATA/--- ATAACATCAT 3070 het 3070 hom 42 13 27 3 ATA 2 1 307360 CASAVA_Build 2 166164132 4I CTGAGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 TTTG 3 4 307361 CASAVA_Build 2 166164554 3D CTTTCAGAAA TAT/--- TATTATTGAT 3070 het 3070 hom 31 16 14 2 TAT 3 2 307362 CASAVA_Build 2 166164689 1D ATTGGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 13 12 307363 CASAVA_Build 2 166173546 1D TAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1875 hom 14 het 16 0 10 6 A 13 12 307364 CASAVA_Build 2 166174299 1I TAAATACTGA -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 1 2 307365 CASAVA_Build 2 166175617 1D CATGTGAGAG C/- TTTTATGAGT 3070 het 3070 ref 43 26 16 2 C 1 0 307366 CASAVA_Build 2 166180298 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 13 14 307367 CASAVA_Build 2 166215549 1D CTAAATAAAT A/- AATTCAAAAC 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 3 2 307368 CASAVA_Build 2 166217254 1I ACTCAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2798 hom 21 7 10 4 A 13 14 307369 CASAVA_Build 2 166225144 5I ATGGATTCTA -----/TTATC TTATTACTTC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TTATC 0 1 307370 CASAVA_Build 2 166235606 1I TTAAATCACA -/T TTTTTTGCAG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 6 7 307371 CASAVA_Build 2 166249374 1D TTACTTTTTC T/- GAAATCTGCT 3070 hom 120 het 42 0 40 3 T 1 0 307372 CASAVA_Build 2 166251270 1I AAAAGAGAAG -/A AAAAAATAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 6 7 307373 CASAVA_Build 2 166261847 1I TAATTTTAAT -/A ATTAAAACCA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 A 1 2 307374 CASAVA_Build 2 166266292 1I TACAGGCAAT -/A ATCCTCTAGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 1 2 307375 CASAVA_Build 2 166268699 1D AGAAAAGCAA G/- GAGACAAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 G 2 1 307376 CASAVA_Build 2 166270181 1D CAGAATCTCA T/- TTCTTTTTAC 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 3 2 307377 CASAVA_Build 2 166296349 1D AATAGAAGAG T/- GAGTTCAGAA 3070 hom 89 het 37 0 29 8 T 1 0 307378 CASAVA_Build 2 166308199 1D TAAAATATTG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 8 7 307379 CASAVA_Build 2 166310186 19D TACACACTAC ACACACACACATACACACT/------------------- ACACACACAC 3070 hom 105 het 35 0 36 4 ACACACACACATACACACT 1 0 307380 CASAVA_Build 2 166312284 1D GACGAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 35 0 24 11 A 11 10 307381 CASAVA_Build 2 166319219 1D AGTAAAAACC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 34 het 18 0 16 2 A 9 8 307382 CASAVA_Build 2 166326320 4D GGAATCAAGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 43 het 19 0 14 6 AAAC 6 5 307383 CASAVA_Build 2 166330254 1D ACTTTATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 22 0 17 5 T 13 12 307384 CASAVA_Build 2 166333229 1D TGAAAGGAAC T/- ATAATGTGCC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 1 0 307385 CASAVA_Build 2 166343692 1D GGGCCCCGAG T/- TTGGCATGTG 3070 hom 90 het 34 0 29 7 T 3 2 307386 CASAVA_Build 2 166347149 1D AAAGAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 40 2 31 7 A 14 13 307387 CASAVA_Build 2 166354461 2D CTTGTCTCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 44 0 32 14 A 15 13 307388 CASAVA_Build 2 166358669 7I GCCACCTGGA -------/CCGTAGC CCGTAGCCCT 2993 hom 33 het 13 0 11 2 CCGTAGC 1 2 307389 CASAVA_Build 2 166386313 2I TCTAGGTACC --/CA AAGAATACCA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 CA 0 1 307390 CASAVA_Build 2 166390660 1D AAGAGCTTTT A/- AAAAATTTAT 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 A 6 5 307391 CASAVA_Build 2 166403650 18I GCTTCCTGAG ------------------/GCCACCCCAGAAGCAGAT GCTGCTATTC 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 GCCACCCCAGAAGCAGAT 0 1 307392 CASAVA_Build 2 166404938 6D TCTGAATGAG ATTATT/------ ATTCGAAGCA 3070 het 3070 ref 37 22 15 4 ATT 3 1 307393 CASAVA_Build 2 166412190 2I TGCACTTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 T 12 14 307394 CASAVA_Build 2 166433592 1I ATTTACTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 27 2 22 3 T 10 11 307395 CASAVA_Build 2 166434743 1I GTCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 2687 het 977 hom 9 2 6 1 T 6 7 307396 CASAVA_Build 2 166440029 1D GAGATGCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 11 10 307397 CASAVA_Build 2 166452170 1I TGAGGGAAGG -/A AAAACAGTAT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 4 5 307398 CASAVA_Build 2 166453677 5D GCTTGAACAG GTAAA/----- GTAATTTTCT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 GTAAA 1 0 307399 CASAVA_Build 2 166456557 1D AAGTATGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 10 9 307400 CASAVA_Build 2 166460886 2I3M6I GCTCTGAGCA --CAG------/GGCAGCTCTGA ATGCCTAGGG 3070 hom 111 het 40 0 35 7 N/A 0 0 307401 CASAVA_Build 2 166461307 1D AAAACAGGAT A/- AAGGGACAGA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 3 2 307402 CASAVA_Build 2 166468932 1I TTTAAAAGTC -/T ACCTTTACCA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 0 1 307403 CASAVA_Build 2 166470623 15D AATTGTGGTT ACAGTAATGTTAGAA/--------------- ACACATTATT 3070 hom 129 het 46 0 44 8 ACAGTAATGTTAGAA 1 0 307404 CASAVA_Build 2 166488373 2I GCTAATTTCT --/TG TGTTTTTAGT 2944 hom 18 het 7 0 7 0 TG 1 2 307405 CASAVA_Build 2 166488683 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 7 8 307406 CASAVA_Build 2 166489489 1I ATATTTACCT -/A AAAATAAACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 4 5 307407 CASAVA_Build 2 166489711 1D CAAGTGGGTA T/- TATCTATTCA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 2 1 307408 CASAVA_Build 2 166492120 1D ATTTTATATA T/- ATATATATAT 343 het 3 hom 3 0 1 2 T 1 0 307409 CASAVA_Build 2 166494777 6I GAATTAAAAA ------/TTTTAT TTTTAAAGAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TTTTAT 0 1 307410 CASAVA_Build 2 166499498 1I AGATTGCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 10 11 307411 CASAVA_Build 2 166500713 2D GGATATTGAC AA/-- ACTCATCCTA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 A 3 1 307412 CASAVA_Build 2 166510553 4D TATAGTGGTA CTGT/---- CTAATAGAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 CTGT 1 0 307413 CASAVA_Build 2 166513019 2I TATAAACTCA --/TT TGTTTCATTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 1 3 307414 CASAVA_Build 2 166514881 2D AGGTTTCTTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 35 het 31 1 27 6 A 11 9 307415 CASAVA_Build 2 166517123 2I TTTTGAACAA --/TG GCCAATTAGA 3070 hom 123 het 47 0 39 8 TG 0 1 307416 CASAVA_Build 2 166518680 1D GACCCGGAGG T/- GAGGGCTGCG 2123 hom 16 het 10 0 6 4 T 1 0 307417 CASAVA_Build 2 166524169 1D ATGAGATTGA T/- TTTTTTAGCT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 T 7 6 307418 CASAVA_Build 2 166528755 1I GAATTATTGG -/T TTTTTGCATT 3070 hom 107 het 41 0 36 5 T 5 6 307419 CASAVA_Build 2 166534511 1I ATGAACATTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 8 307420 CASAVA_Build 2 166541208 1D TCAAGCTACC A/- TTGACTTTCT 3070 hom 42 het 15 0 13 2 A 1 0 307421 CASAVA_Build 2 166542398 1D ATATAGCCAT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 7 6 307422 CASAVA_Build 2 166568635 1I TGCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 261 hom 40 1 32 7 A 9 10 307423 CASAVA_Build 2 166577549 4D ATGTTTCTCA ACAG/---- ACATACAGTG 3070 het 3070 ref 31 17 11 5 ACAG 1 0 307424 CASAVA_Build 2 166595163 1D CCTGAATTAC T/- AAGGACCTCA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 T 1 0 307425 CASAVA_Build 2 166598226 1I CCAGCACTTT -/C GGGAGGCTGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 0 1 307426 CASAVA_Build 2 166598730 6I GAAACAATTT ------/TATAAA TATAAAGACA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TATAAA 1 2 307427 CASAVA_Build 2 166598869 2D AAACAGTCTA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 10 8 307428 CASAVA_Build 2 166600691 3D ATCATAAAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 34 0 30 5 A 15 12 307429 CASAVA_Build 2 166602367 4D41M1I AATAATCATA GTTTGTTTTTCTTTTTGACAAAACAGTCACCATTAAATTATACTC-/----GTTTTTCTTTTTGACAAAACAGTCACCATTAAATTATACTCT TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 26 0 24 14 N/A 0 0 307430 CASAVA_Build 2 166604159 2D GAATTTGGTG CT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 36 11 17 8 CT 1 0 307431 CASAVA_Build 2 166609478 1D GAGTTCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 11 10 307432 CASAVA_Build 2 166610144 1D TTCTTTGAAA G/- GGCTGAAGTA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 3 2 307433 CASAVA_Build 2 166610235 1D TAAGAGGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 10 9 307434 CASAVA_Build 2 166614215 2I TAAGTATAAC --/TT ATATTCTCAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 0 2 307435 CASAVA_Build 2 166615302 1D CCTACTGGCA T/- TCGTATCACC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 2 1 307436 CASAVA_Build 2 166617376 1I GTGAAAAAAA -/T AAAAAACCCA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 307437 CASAVA_Build 2 166619116 4D TGTGTTCATA TGTG/---- TGTGTGTTTG 3070 hom 146 het 55 0 49 9 TG 5 3 307438 CASAVA_Build 2 166619949 1I TTAGCACGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 301 hom 30 1 21 8 T 11 12 307439 CASAVA_Build 2 166659559 28I GGGTACAGGG ----------------------------/CTCAATAATAACATTCAGAATGTTATTC CTATCAGAGA 3070 hom 138 het 50 0 45 6 CTCAATAATAACATTCAGAATGTTATTC 0 1 307440 CASAVA_Build 2 166678324 5I AATCATAAAT -----/ATAAA ATAAAATAAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 ATAAA 1 2 307441 CASAVA_Build 2 166681332 41D ATAATCTGAT AATTCATCAGATTCAGTGTCCCAGAATCTGATGAATTATCA/----------------------------------------- AATTCATCAG 3070 hom 21 het 24 0 7 22 AATTCATCAGATTCAGTGTCCCAGAATCTGATGAATTATCA 2 1 307442 CASAVA_Build 2 166682719 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 11 12 307443 CASAVA_Build 2 166695825 1D CATTTTATTT A/- TTTTTTTGTA 3070 het 164 hom 33 1 31 1 A 1 0 307444 CASAVA_Build 2 166697135 1D TTCCTAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 52 2 42 8 T 11 10 307445 CASAVA_Build 2 166697699 1D AATAATTGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 T 9 8 307446 CASAVA_Build 2 166700140 2D ATATGTAGTT TC/-- TGTTTCCCTA 3070 hom 154 het 59 0 52 8 TC 1 0 307447 CASAVA_Build 2 166706064 2D TCGCTGTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 13 11 307448 CASAVA_Build 2 166706483 10D TCTTTCTTCC TTTTCTTTTT/---------- TTTTTTTCTA 3070 het 338 hom 28 4 19 8 TTTTCTTTTT 1 0 307449 CASAVA_Build 2 166706694 1I CATAAGAAAC -/T TGTTTCCATC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 1 2 307450 CASAVA_Build 2 166709610 1D AGGATCATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 16 15 307451 CASAVA_Build 2 166710006 1I GTGTTAGCCA -/G CCTGGTCTCG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 0 1 307452 CASAVA_Build 2 166711850 1I TCCCTAGAGC -/T TTCTGACTCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 2 3 307453 CASAVA_Build 2 166737084 6D TTGGAGTACC ATAAAA/------ ATAAAAACTC 3070 het 3070 hom 37 18 17 4 ATAAAA 2 1 307454 CASAVA_Build 2 166738758 1D TGTTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 15 9 T 12 11 307455 CASAVA_Build 2 166740093 1D TAATAAAACA G/- GGTTAGAGTT 3070 het 3070 hom 41 15 25 1 G 3 2 307456 CASAVA_Build 2 166746567 1D44M1D TAAAAATTCT CCCAGTGCACATTGCTGGTGAAATCCAATGCAGGAATCTAGCCACA/-CCAGTGCACATTGCTGGTGAAATCCAATGCAGGAATCTAGCCAC- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 24 12 12 N/A 0 0 307457 CASAVA_Build 2 166747073 2D AAAAACAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 2432 het 2432 ref 31 23 6 4 A 11 9 307458 CASAVA_Build 2 166760802 11D ACCTGGTCAC TTAAAAAAGTT/----------- TTTAGAAAAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 7 TTAAAAAAGTT 1 0 307459 CASAVA_Build 2 166763181 4I CAAAAAACTG ----/AATC AATCACTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 AATC 1 2 307460 CASAVA_Build 2 166767190 2I ACATCTATAT --/AA GTCTTAATAT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 0 2 307461 CASAVA_Build 2 166769227 4D CAAGGTAAAG AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 13 0 AAAC 2 1 307462 CASAVA_Build 2 166773299 6I TATATATTTG ------/TATAAC TATATCATGT 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 TATAAC 0 1 307463 CASAVA_Build 2 166774375 4I ACCAAGAAAA ----/AAAC AAACAACCCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AAAC 1 2 307464 CASAVA_Build 2 166775276 1I GATGGACACC -/A AAAAAAAAAA 951 het 951 ref 11 5 6 0 A 15 16 307465 CASAVA_Build 2 166775829 1I GAAAAAAAAG -/A AAAGAAAGTC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 3 4 307466 CASAVA_Build 2 166776284 1D TTATATAAAT C/- ATTTATAATT 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 C 1 0 307467 CASAVA_Build 2 166777363 2D ATAAACAAAC TG/-- TGGATTTGAA 3070 het 3070 hom 60 26 29 6 TG 2 1 307468 CASAVA_Build 2 166785235 12D TTGTGCCATG TGTATCATAACA/------------ TGATACCTTA 3070 hom 141 het 49 0 47 5 TGTATCATAACA 1 0 307469 CASAVA_Build 2 166793326 2D60M2D ACTGGCACTG TTTTAAAAACCACACAGTATTTTATCTTCAATTTATAATTAATATACTATTTAAAGAATAACTT/--TTAAAAACCACACAGTATTTTATCTTCAATTTATAATTAATAGACTATTTAAAGAATAAC-- ATATCCTTCG 3070 het 3070 ref 24 16 11 14 N/A 0 0 307470 CASAVA_Build 2 166797960 4I TATATATGTA ----/TATG TATGTACACA 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 TATG 1 2 307471 CASAVA_Build 2 166806439 4I AAATTGCAAG ----/CAGA CAGTTGTTCT 3070 het 3070 ref 69 32 29 8 CAGA 0 1 307472 CASAVA_Build 2 166815763 1I TTTGCTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 13 10 A 13 14 307473 CASAVA_Build 2 166820239 4I TGGTTAATGC ----/TAGT TAGTTATTTA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 TAGT 1 2 307474 CASAVA_Build 2 166820448 1D TTCACACAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 A 9 8 307475 CASAVA_Build 2 166824692 1D GAGTGCTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 8 7 307476 CASAVA_Build 2 166835047 1D CAGTGATTTA C/- TTTTACATTA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 C 1 0 307477 CASAVA_Build 2 166835959 1D TTTGCGGTTC A/- AAAATGAGAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 5 4 307478 CASAVA_Build 2 166838206 1D TTAATGTGAC T/- TTTAAAGCAC 3070 het 3070 hom 43 18 17 9 T 4 3 307479 CASAVA_Build 2 166847878 2D AAATGAAGAA AC/-- TTCATTAAAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 AC 1 0 307480 CASAVA_Build 2 166881909 4I GATTATTTTT ----/ATGA ATGTCTTTAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 ATGA 0 1 307481 CASAVA_Build 2 166884106 1I AAGGTAGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2063 hom 40 6 25 9 A 12 13 307482 CASAVA_Build 2 166886279 3D ACCCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 16 13 307483 CASAVA_Build 2 166886550 3D TGGCAAAATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 21 0 13 9 T 19 16 307484 CASAVA_Build 2 166892431 2I CTATACAATC --/CT CTCTTTCCTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 CT 2 3 307485 CASAVA_Build 2 166894323 1I TGTTATTGTT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 946 hom 38 4 22 12 G 9 10 307486 CASAVA_Build 2 166910067 1D CATAACTTAG A/- AAAAAATATG 3070 hom 107 het 39 0 36 4 A 7 6 307487 CASAVA_Build 2 166912973 4D TTTTCCTACA AACT/---- AAGAATAGAA 3070 hom 75 het 29 0 25 6 AACT 1 0 307488 CASAVA_Build 2 166922748 1I ATTTCATAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 8 9 307489 CASAVA_Build 2 166924530 1I TGATAGGGAC -/T TATTTCTAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 2 307490 CASAVA_Build 2 166925969 2D ACATTGTAAC TG/-- TTATTATTAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TG 1 0 307491 CASAVA_Build 2 166928388 2I ATCTCTGGGG --/AC ACAATGGGTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AC 1 2 307492 CASAVA_Build 2 166936838 4D ACCATACAAA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 114 het 44 0 37 7 GT 10 8 307493 CASAVA_Build 2 166979476 2D CCTCTGCCAC TA/-- TATATATATA 2117 hom 15 het 11 0 6 5 TA 9 8 307494 CASAVA_Build 2 167000179 2I TTTTTGCGTT --/AA GAGAGAAAAG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 0 2 307495 CASAVA_Build 2 167022249 1D TGTTTGGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 10 9 307496 CASAVA_Build 2 167026420 4I AGATATGTTC ----/TTTA TTTAGTGATT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTTA 1 2 307497 CASAVA_Build 2 167036482 2D CAGAAAATGT GG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 G 11 9 307498 CASAVA_Build 2 167053103 1D AATGCATTGC T/- TTTTTTAATT 3070 hom 84 het 34 0 30 4 T 7 6 307499 CASAVA_Build 2 167075128 6I TTGATTCCAC ------/TAATGA TACGTGTGTA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TAATGA 0 1 307500 CASAVA_Build 2 167077881 1D AATCCACCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 10 9 307501 CASAVA_Build 2 167078212 1I GAATAGAATT -/G TCCTCCAGGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 0 1 307502 CASAVA_Build 2 167078342 1D CCAGCTGGGA T/- TAAAAAAACT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 1 307503 CASAVA_Build 2 167078863 1I CTGTAAAAAA -/T AGATAATAAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 307504 CASAVA_Build 2 167083392 2I TCATTTCATG --/GA GAGTTAGTTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GA 1 2 307505 CASAVA_Build 2 167091447 2D AATATTATGA AT/-- ATGTCTAGAC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AT 2 1 307506 CASAVA_Build 2 167104397 1I AAATTCTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 929 hom 36 3 28 5 T 10 11 307507 CASAVA_Build 2 167106063 2I ATGTTATAAC --/AT AGTAAATGTT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AT 0 1 307508 CASAVA_Build 2 167107746 1I4M9D1M2I TTATATCATA -TATATATACCCTTA--/CTACA---------AGG TATGTATATA 3070 hom 75 het 28 0 26 6 N/A 0 0 307509 CASAVA_Build 2 167107975 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 25 0 17 8 A 15 14 307510 CASAVA_Build 2 167109263 1I TATTTCTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 31 1 22 8 T 11 12 307511 CASAVA_Build 2 167111427 3I GCACATCAAA ---/CTT CTTATTAAAA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 CTT 1 2 307512 CASAVA_Build 2 167114207 4I ATGATGGAGG ----/TGTT TGTTAAATGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TGTT 1 2 307513 CASAVA_Build 2 167117105 1D AACATAACTT A/- ATACATCCAT 3070 hom 144 het 58 0 49 9 A 2 1 307514 CASAVA_Build 2 167128708 1D TTTTAAGCCA C/- CCCGTTTGTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 C 4 3 307515 CASAVA_Build 2 167133578 3D AAATTTATGT TTG/--- TTAACATCAT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 TTG 1 0 307516 CASAVA_Build 2 167134049 4D AAATAAAAAA TATG/---- TGTGTACATA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 TATG 1 0 307517 CASAVA_Build 2 167140546 1D ACTAGAACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 10 9 307518 CASAVA_Build 2 167143339 2I CTTTCAATAA --/TT TTTTTTGTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 6 8 307519 CASAVA_Build 2 167143634 3I TGAACAAAGC ---/TAG TAGTTTGACT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TAG 1 2 307520 CASAVA_Build 2 167143972 3I AATGTGATGT ---/ATC ATGTTTATTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 ATC 0 1 307521 CASAVA_Build 2 167144420 2D GTCCAGGAAC AT/-- ATTCATTTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 4 AT 2 1 307522 CASAVA_Build 2 167149787 1I CCACCATGAT -/A AGAGTCGGCT 2422 hom 15 het 8 0 6 2 A 1 2 307523 CASAVA_Build 2 167152378 1D AGAAGTTAGA T/- TTTTTTGAAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 6 307524 CASAVA_Build 2 167153188 1D AAAACAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 676 hom 38 2 31 5 A 13 12 307525 CASAVA_Build 2 167154079 7I AGGATTTGTG -------/GCGGGGC GGGGGGTACA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 GCGGGGC 0 1 307526 CASAVA_Build 2 167154295 2D57M1I CATTCTGTAG TCTCCCCCATTAAGTATAATGTTAGCTGTAGGCTTTTTGTAGATGTTAAAAAAAGAAAG-/--TCCCCCATTAAGTATAATGTTAGCTGTAGGCTTTTTGTAGATGTTAAAAAAAGAAAGA AACAACAACA 3070 hom 58 het 18 0 20 20 N/A 0 0 307527 CASAVA_Build 2 167154776 14I TCAAAACAAC --------------/AACAACAACAACAA AACAACAAAA 3070 hom 92 het 38 0 30 8 AACAACAACAACAA 0 1 307528 CASAVA_Build 2 167155137 3D TGATCTGTAC TTT/--- TTTTTTCCTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 9 6 307529 CASAVA_Build 2 167155313 4D GGCCCTGGAA ATTT/---- ATTGTTTGAT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 ATTT 1 0 307530 CASAVA_Build 2 167156219 2D ATTGTAATGG AC/-- CACAAAAGTT 2280 hom 12 het 8 0 5 3 AC 1 0 307531 CASAVA_Build 2 167157591 4I AATATATGAT ----/AAAC AAACAAAACC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 AAAC 1 2 307532 CASAVA_Build 2 167158214 2D TTTCACTGAC TT/-- TATCTCTGCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 1 307533 CASAVA_Build 2 167158829 1D ATAATCCTGA T/- TTTTTCACCT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 6 5 307534 CASAVA_Build 2 167160355 6I TAGACACATT ------/AAGAAA AAGAGCAAGA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AAGAAA 0 1 307535 CASAVA_Build 2 167160852 3D AACTAAATGG AAC/--- AACACATTCA 3070 hom 57 het 21 0 19 4 AAC 2 1 307536 CASAVA_Build 2 167161917 2I AAAGAGTGAA --/GG GGGGGAAGTG 3070 hom 92 het 34 0 30 4 G 5 7 307537 CASAVA_Build 2 167163738 2I ACTTATAAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 hom 83 het 32 0 29 3 A 9 11 307538 CASAVA_Build 2 167165498 3D TTTTTTTTTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 35 1 22 12 A 15 12 307539 CASAVA_Build 2 167166557 2I TTTAAAATAA --/TG TGTGTATATA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TG 2 3 307540 CASAVA_Build 2 167166635 5I CAGGCTAATA -----/TTAAT TTAAATAGCT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TTAAT 0 1 307541 CASAVA_Build 2 167166913 4D CTAAAAAGTA TAAC/---- TAACTCCCAG 3070 hom 126 het 44 0 43 3 TAAC 2 1 307542 CASAVA_Build 2 167169510 4D AATGAAAATT AAAC/---- AAAATGAAAA 3070 hom 66 het 23 0 23 1 AAAC 1 0 307543 CASAVA_Build 2 167170313 1D TACTTGAGAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 7 307544 CASAVA_Build 2 167171688 2D TATGACAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 11 9 307545 CASAVA_Build 2 167178035 1D TTATTTACCC T/- TTTTTTTTTT 1733 het 1733 ref 32 18 8 7 T 11 10 307546 CASAVA_Build 2 167181575 2D GTGGTTGCCC AA/-- AAGTTTGCAA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 4 2 307547 CASAVA_Build 2 167181931 1I TAGGATGGTA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 6 7 307548 CASAVA_Build 2 167191264 1D TAATTTTTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 10 9 307549 CASAVA_Build 2 167194663 3I ATGACATTAT ---/TAA TAATAAATAG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 TAA 2 3 307550 CASAVA_Build 2 167198756 1D TTGTTGGAGT G/- GGGGGGCATC 3070 hom 102 het 40 0 35 6 G 7 6 307551 CASAVA_Build 2 167199861 1D TAAGCAAATG A/- AAAAAATTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 7 6 307552 CASAVA_Build 2 167206496 3D CAAGGCAATG TCA/--- TCATCAGTTA 3070 hom 66 het 23 0 22 2 TCA 3 2 307553 CASAVA_Build 2 167212020 1D TTGGCTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 34 0 28 6 T 11 10 307554 CASAVA_Build 2 167241052 1I TATTTTTACA -/T TTTTTACCTA 3070 hom 77 het 33 0 26 7 T 5 6 307555 CASAVA_Build 2 167245488 1D AATAAAATAG A/- AACTCCTCTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 3 2 307556 CASAVA_Build 2 167247482 1I TTAACATTAG -/A AAAAAAATGT 3070 hom 102 het 39 0 33 7 A 7 8 307557 CASAVA_Build 2 167253042 4I CCAGATTCAT ----/AAAG AAAGTCCTTA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AAAG 1 2 307558 CASAVA_Build 2 167256663 7D17M1D ACATGTACCC TAGAACTTAAAGTATAATAAAACTA/-------TAAAGTATAATAAAACT- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 27 0 28 3 N/A 0 0 307559 CASAVA_Build 2 167257078 1D TTGAAAGTAG T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 134 het 53 0 45 8 T 7 6 307560 CASAVA_Build 2 167258472 4D5M4I TGGGTGTACA CCTCCGGCT----/----CAGCTTTTG ATATGGGGAG 1856 hom 12 het 7 0 5 2 N/A 0 0 307561 CASAVA_Build 2 167259268 1D ATTATCCTCT C/- CCCCCCCTGC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 8 7 307562 CASAVA_Build 2 167259571 2I ATCACCCCCC --/CA GCTCCGGATA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 CA 0 1 307563 CASAVA_Build 2 167260111 4I AGCGTTATTG ----/TTTC TTTATTAACA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TTTC 0 1 307564 CASAVA_Build 2 167261918 1I CTAATATCCT -/G GGGGGGGGAG 3070 het 263 hom 22 1 16 5 G 8 9 307565 CASAVA_Build 2 167267165 2I CTTATCTAAC --/AT TGATCATCTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AT 0 1 307566 CASAVA_Build 2 167267473 4D GTCATTGATT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TTTC 2 1 307567 CASAVA_Build 2 167279023 1D TTCTTTTATG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 7 307568 CASAVA_Build 2 167282246 1D TATTATTATT A/- TTTTTTTTTT 1062 hom 9 het 15 0 4 11 A 1 0 307569 CASAVA_Build 2 167285737 1I CAGCATGGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 265 hom 32 1 30 1 A 9 10 307570 CASAVA_Build 2 167286495 4D TGTGTGTGTG CGTA/---- CGTGTGTGTG 3070 hom 67 het 25 0 23 4 CGTA 1 0 307571 CASAVA_Build 2 167286588 1D TTCATGCTGC T/- GATAAAGACA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 1 0 307572 CASAVA_Build 2 167286929 1I ATTTCACCCC -/T GGCCTCTCCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 0 1 307573 CASAVA_Build 2 167302160 1I TAATGAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 937 hom 34 2 18 14 T 15 16 307574 CASAVA_Build 2 167367251 1I AGAACCTCAA -/C AAAAGCCGTA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 C 0 1 307575 CASAVA_Build 2 167405409 1I AGATTAAAGG -/T TTTTTTTTTT 1611 het 1611 ref 34 21 4 9 T 15 16 307576 CASAVA_Build 2 167534510 1D CTTTGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 910 het 910 ref 31 26 3 2 A 12 11 307577 CASAVA_Build 2 167619153 2D TCAAAAGGAA AG/-- AGAGGCTGGG 2983 het 2944 hom 20 10 10 0 AG 3 2 307578 CASAVA_Build 2 167704805 4I AAGGAGAAAG ----/AGAA TTCATGTTGG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AGAA 0 1 307579 CASAVA_Build 2 167742793 1D CAGTAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1609 het 1609 ref 35 27 5 4 A 13 12 307580 CASAVA_Build 2 167841910 4I AGTGTGTTAA ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 104 het 43 0 34 9 TC 7 9 307581 CASAVA_Build 2 167872726 4D CAAAACTTGA AAAT/---- AAAGTTAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAAT 1 0 307582 CASAVA_Build 2 167887863 4I TATGATTGCT ----/CAAA CATTCGTTGC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 CAAA 0 1 307583 CASAVA_Build 2 167888193 4I AATGCATTAT ----/TAAA TAAATAAATG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TAAA 2 3 307584 CASAVA_Build 2 167890844 1D CCAATATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 30 1 26 5 T 11 10 307585 CASAVA_Build 2 167891037 4D CTTAATTGGA TTGT/---- TTGTTTTTTC 3070 hom 123 het 44 0 42 4 TTGT 2 1 307586 CASAVA_Build 2 167894569 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 11 10 307587 CASAVA_Build 2 167903237 4I TGACTGGAAT ----/TAAA TAGACATTCA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TAAA 0 1 307588 CASAVA_Build 2 167911503 1I TGTGTGTGTG -/T GGGGGGGGGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 0 1 307589 CASAVA_Build 2 167917489 4D AAAGAAAAAA AAAC/---- AAACAAACTG 3070 hom 99 het 37 0 34 5 AAAC 3 2 307590 CASAVA_Build 2 167923393 4D TTAAGAATCC TTTA/---- TTTAAGTGTG 3070 hom 72 het 27 0 25 5 TTTA 2 1 307591 CASAVA_Build 2 167935142 1D TCTTTGATGA T/- TTCATTCAAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 3 2 307592 CASAVA_Build 2 167936571 1D TTAAGATGAT A/- TTTTTTGCTA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 1 0 307593 CASAVA_Build 2 167950354 1I AGCTTTCACT -/G AATAACTTGC 3070 hom 96 het 35 0 31 4 G 0 1 307594 CASAVA_Build 2 167962048 1D CTTCTATTCC T/- TTTTTTTCCA 3070 het 298 hom 39 1 27 11 T 8 7 307595 CASAVA_Build 2 167968034 1I CGGTGTTTGG -/T TTTTTTGTCC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 6 7 307596 CASAVA_Build 2 167971792 2D GCCACAGAAT AC/-- ATGTTATTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 4 AC 1 0 307597 CASAVA_Build 2 167972322 1D TTGAAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 21 9 A 11 10 307598 CASAVA_Build 2 167976888 4D ACGGTAGAAC AAAT/---- AAATAAGTAA 3070 hom 105 het 40 0 36 7 AAAT 2 1 307599 CASAVA_Build 2 167995389 1D ATGTCAGAGG A/- AAAAAAGAGG 3070 hom 157 het 56 0 53 4 A 7 6 307600 CASAVA_Build 2 167999280 1D AGTACTCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 19 1 11 7 A 17 16 307601 CASAVA_Build 2 168014980 1D TCCTGGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 11 10 307602 CASAVA_Build 2 168043325 1I GTTATTATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 9 10 307603 CASAVA_Build 2 168053730 1D ATGATATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 29 1 22 6 A 13 12 307604 CASAVA_Build 2 168068927 1I GGTATACTTG -/A ATCACATTGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 1 2 307605 CASAVA_Build 2 168088636 3D TAATGGATTC ATA/--- ATAGTCCATT 3070 hom 63 het 27 0 22 6 ATA 2 1 307606 CASAVA_Build 2 168153003 1I CCTGTGAGCT -/C AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 C 0 1 307607 CASAVA_Build 2 168153710 1I TCCCTCCTTG -/T TTTTTTAGAG 2088 het 1262 hom 13 5 8 0 T 6 7 307608 CASAVA_Build 2 168160274 1D GGGGACTTAC A/- AAAATAATCT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 A 5 4 307609 CASAVA_Build 2 168170242 1I TCAGATGGCA -/T TGTCAACCCG 3070 hom 89 het 34 0 28 6 T 1 2 307610 CASAVA_Build 2 168171404 1I TTGAAACTCA -/T TTTGTAAGTA 3070 het 3070 hom 48 19 27 2 T 3 4 307611 CASAVA_Build 2 168175680 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AGAGAGAGAG 3070 het 817 hom 27 7 12 11 AAAAG 1 0 307612 CASAVA_Build 2 168180841 3D ACAAAGAAAA AAG/--- AAGAAGGGAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 AAG 3 2 307613 CASAVA_Build 2 168185486 1I TACTGTAAAC -/A AATGTCCTTT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 2 3 307614 CASAVA_Build 2 168200389 1D AATACAACTT A/- AAAAGGGATG 3070 hom 30 het 15 0 11 4 A 5 4 307615 CASAVA_Build 2 168204358 4D ACTGGAGACT TAGA/---- TAGACAGAGA 3070 het 3070 hom 36 10 22 6 TAGA 2 1 307616 CASAVA_Build 2 168205312 1I ATTTTTTTTT -/C CCCCCTCAGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 5 6 307617 CASAVA_Build 2 168212118 13D CTTCCCTCAA AGCAGCAGCTTAC/------------- ATGCTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 23 23 9 AGCAGCAGCTTAC 1 0 307618 CASAVA_Build 2 168222799 1I TGCCAATGAT -/A AAAAGGCTCT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 4 5 307619 CASAVA_Build 2 168227692 1D TGTCACTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 9 8 307620 CASAVA_Build 2 168243233 1I CACCTTATTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 8 9 307621 CASAVA_Build 2 168243330 1I AATGCTGTTG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 43 20 19 7 A 7 8 307622 CASAVA_Build 2 168253915 2D AAAAAAAAAA AT/-- CCTTGAAAGC 3070 het 317 hom 40 4 20 16 AT 1 0 307623 CASAVA_Build 2 168268257 5I AGGATTAAAA -----/TTATC TTAAGGTTAA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 TTATC 0 1 307624 CASAVA_Build 2 168272264 1D ATTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 44 0 32 13 T 10 9 307625 CASAVA_Build 2 168282241 1D TTATACATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 10 9 307626 CASAVA_Build 2 168283041 1D GTTCATAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 731 hom 41 6 14 21 A 12 11 307627 CASAVA_Build 2 168288284 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3068 hom 35 12 16 7 T 11 10 307628 CASAVA_Build 2 168291860 1D GGCATCTTTA C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 29 20 4 C 1 0 307629 CASAVA_Build 2 168292667 11D AGCTAGAAGC TTTTGATACAT/----------- TGGTGTCTGA 3070 het 3070 ref 41 27 13 5 TTTTGATACAT 1 0 307630 CASAVA_Build 2 168297897 3D GAGAATCTGA TCT/--- TCTTACTAGC 3070 het 3070 ref 37 19 13 7 TCT 2 1 307631 CASAVA_Build 2 168298176 1D TTTATTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 T 12 11 307632 CASAVA_Build 2 168302858 1I AAAAGAACTT -/A ACAATGACAG 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 A 1 2 307633 CASAVA_Build 2 168303554 4I TCTTTGTATA ----/CTTT CTTTTGTGGG 3070 het 3070 ref 36 17 18 1 CTTT 1 2 307634 CASAVA_Build 2 168309961 4I1M2D AGTCTGATAT ----TCC/AGAGT-- TCAATATATT 1361 het 1361 ref 46 22 3 22 N/A 0 0 307635 CASAVA_Build 2 168317273 1D ACTCTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2389 hom 19 6 10 3 T 11 10 307636 CASAVA_Build 2 168325404 2D CCTTCTAAAC AT/-- AAGAAAATTA 3070 het 3070 ref 52 25 22 10 AT 1 0 307637 CASAVA_Build 2 168334362 7I GCAGAACTAG -------/TCTCTGT TCTCTGTTCC 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 TCTCTGT 1 2 307638 CASAVA_Build 2 168336884 1D ATTATGTTGG T/- AAACTAAACT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 1 0 307639 CASAVA_Build 2 168343907 26I ACTCACTTTT --------------------------/CTTCACCCATTCATAGAATGTTACTA CATATATGCC 3070 hom 87 het 30 0 30 4 CTTCACCCATTCATAGAATGTTACTA 0 1 307640 CASAVA_Build 2 168349105 1I AGCCATGTCA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 T 7 8 307641 CASAVA_Build 2 168356646 1D CTGCTCCTAG A/- AAAAAAAAAA 1567 het 1567 ref 40 28 5 7 A 12 11 307642 CASAVA_Build 2 168525213 1I TGTTAATCTG -/T TTTATGTCGG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 3 4 307643 CASAVA_Build 2 168529862 3D16M1I ACAAAACAAA GAGGAGAGGTAGTGGGGAG-/---GAGAGGTAGTGGGGAGA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 3 N/A 0 0 307644 CASAVA_Build 2 168545807 1I GCCACAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 11 12 307645 CASAVA_Build 2 168562867 1D AGGGAAGGTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 9 8 307646 CASAVA_Build 2 168575270 1D GCCTTAAATC T/- CACAAGATTG 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 1 0 307647 CASAVA_Build 2 168578785 2D CCAGAGAAAC TG/-- TGGTATTCTG 3070 het 3070 ref 41 21 19 5 TG 2 1 307648 CASAVA_Build 2 168600979 1D CCATACAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 21 17 11 A 12 11 307649 CASAVA_Build 2 168603206 1I AAAATGATTT -/A AAAAAAAAAA 2985 het 2985 ref 33 14 9 10 A 11 12 307650 CASAVA_Build 2 168608066 1I CATTGATGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 9 10 307651 CASAVA_Build 2 168619443 1I AAGTTAAGAC -/G GGTAAACCCC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 2 3 307652 CASAVA_Build 2 168619534 1D TGAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 8 A 11 10 307653 CASAVA_Build 2 168626221 1D TATGATTTCC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 37 17 17 5 A 8 7 307654 CASAVA_Build 2 168627953 1D CTTACATTGT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 9 18 4 A 9 8 307655 CASAVA_Build 2 168652820 1I ATGACCCGAG -/A AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 A 6 7 307656 CASAVA_Build 2 168655048 4D ATACATTTGT TGAA/---- TGAATGAATG 3070 het 3070 hom 42 16 16 12 TGAA 6 5 307657 CASAVA_Build 2 168661663 1I ATAAGCATAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 9 10 307658 CASAVA_Build 2 168662496 2D TCTCAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 1604 het 1604 ref 39 19 8 12 A 14 12 307659 CASAVA_Build 2 168664579 1I AACATACCAG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 7 8 307660 CASAVA_Build 2 168666888 1I TCATGTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 44 0 32 12 T 12 13 307661 CASAVA_Build 2 168679550 1I AAGCATCTAC -/A AACCAGAAGC 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 A 2 3 307662 CASAVA_Build 2 168698613 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 12 4 A 10 11 307663 CASAVA_Build 2 168699914 1D GGTGTGTAAA T/- CAATAAGAGT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 1 0 307664 CASAVA_Build 2 168737411 1D AGGAAAGAGA T/- TTTTGTTACT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 5 4 307665 CASAVA_Build 2 168754168 1I AGCAACAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 846 hom 25 2 20 3 A 12 13 307666 CASAVA_Build 2 168780901 2I TAGGCCTCCC --/GG GTGCTTCCTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 G 1 3 307667 CASAVA_Build 2 168784637 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTGCAAA 3070 het 838 hom 34 2 26 6 C 0 1 307668 CASAVA_Build 2 168786157 1I TAGCATTTAA -/C CCATGTTTGT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 2 3 307669 CASAVA_Build 2 168786588 10I GAGATGGAGG ----------/ATAATTAACC ATAATTAACC 3070 het 3070 ref 52 27 17 8 ATAATTAACC 1 2 307670 CASAVA_Build 2 168791064 1I AACTTTTCCA -/G GGATGCTAGA 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 G 2 3 307671 CASAVA_Build 2 168794141 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1765 hom 19 7 10 2 A 15 16 307672 CASAVA_Build 2 168797668 1I ATGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 8 9 2 A 11 12 307673 CASAVA_Build 2 168798393 1I AAAGGAAAAG -/A AGGGACTATG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 1 2 307674 CASAVA_Build 2 168799574 2D TGATTCCTAC AT/-- ATTTTTACTC 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 AT 2 1 307675 CASAVA_Build 2 168845508 2D TTTTTGAGAC AG/-- GGGCTTGCTA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 AG 1 0 307676 CASAVA_Build 2 168849322 1D TCTTGTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 11 10 307677 CASAVA_Build 2 168849399 2D TCATCTCTAT TC/-- TCTCTCTCTC 2813 het 2813 ref 22 12 8 2 TC 8 7 307678 CASAVA_Build 2 168860263 1D AACTACTCCC T/- TGACTTTTCA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 T 2 1 307679 CASAVA_Build 2 168865681 1D AGATTTTATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 T 11 10 307680 CASAVA_Build 2 168869762 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 10 9 307681 CASAVA_Build 2 168902665 2D GAACCAATTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 48 15 21 13 TG 7 6 307682 CASAVA_Build 2 168906779 2I GGAACTTCTT --/CC CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 C 8 10 307683 CASAVA_Build 2 168909308 1D CCCCCAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 885 hom 33 2 27 4 A 11 10 307684 CASAVA_Build 2 168910393 1I TTATATACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 13 15 20 T 12 13 307685 CASAVA_Build 2 168910926 2D GCATTACTGC CT/-- CTGAGCTCTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CT 2 1 307686 CASAVA_Build 2 168911354 1D CCTTAAAACA T/- TTTTTCAGGA 3070 het 3070 hom 26 12 11 4 T 6 5 307687 CASAVA_Build 2 168914766 1D ATCACATTTA T/- TTTTTGTCAC 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 T 6 5 307688 CASAVA_Build 2 168922875 1I AGAGAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 2401 het 2401 ref 34 13 9 12 A 14 15 307689 CASAVA_Build 2 168924382 2D TCCAAAAAAA AC/-- TTTTTTTTTT 2719 het 2719 ref 27 15 7 5 AC 1 0 307690 CASAVA_Build 2 168925423 1I GCTTTCCATG -/T TTTTTATCCC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 5 6 307691 CASAVA_Build 2 168925817 3D GAAGAGACTG TAT/--- AATGATTGCC 3070 het 3070 hom 47 20 21 7 TAT 1 0 307692 CASAVA_Build 2 168928448 1D TTTTGGTTTA T/- TTTATTTTAT 3070 het 463 hom 19 2 12 5 T 4 3 307693 CASAVA_Build 2 168929205 1D TTAGGTAGCT G/- GGGGCAAGGG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 G 5 4 307694 CASAVA_Build 2 168939992 1I AAGGTCAGTG -/A AAAAAAAAAC 1856 het 1856 ref 23 15 6 2 A 9 10 307695 CASAVA_Build 2 168946044 1I AAGTCTTCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 9 10 307696 CASAVA_Build 2 168956115 1D CAAAACTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 11 10 307697 CASAVA_Build 2 168957445 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2390 hom 22 het 15 0 7 8 T 14 12 307698 CASAVA_Build 2 168979140 1I ATGGGAGCTA -/C ATTTAAAGAT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 C 0 1 307699 CASAVA_Build 2 168984384 1I GGGCCGCCTC -/T TTTTTTTTTT 2737 het 2164 hom 23 7 9 7 T 12 13 307700 CASAVA_Build 2 168995536 1D TCCCCAGGTT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 44 16 22 8 A 8 7 307701 CASAVA_Build 2 168998748 19D TAATCTGAAT GAATCCCAGATTCTACACA/------------------- GTACATATTC 3070 hom 126 het 43 0 42 5 GAATCCCAGATTCTACACA 1 0 307702 CASAVA_Build 2 169007104 1D TTTATTGTGA C/- ATCTAAAGTC 3070 hom 69 het 25 0 23 3 C 1 0 307703 CASAVA_Build 2 169017209 2D ACATTATCTT AG/-- TTTAGCTCCT 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AG 1 0 307704 CASAVA_Build 2 169024389 1D AGTATGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 T 11 10 307705 CASAVA_Build 2 169030876 1D AGAAGGAAGG T/- TTTTAAACCC 3070 hom 76 het 31 0 24 8 T 5 4 307706 CASAVA_Build 2 169033654 1I CTCATGTAAT -/G CACTTTGCTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 G 0 1 307707 CASAVA_Build 2 169039395 1D TAACAAGACA T/- TTTGCCACTC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 4 3 307708 CASAVA_Build 2 169042847 1D TCATTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 53 1 47 5 T 11 10 307709 CASAVA_Build 2 169048040 1D TACATAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 12 11 307710 CASAVA_Build 2 169093407 23I GAAGAACTAG -----------------------/AGGAATTTGCAAACAAATTTGTT AGGTTCATAG 3070 hom 111 het 38 0 38 4 AGGAATTTGCAAACAAATTTGTT 0 1 307711 CASAVA_Build 2 169099164 1D TTTGTGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2496 hom 39 12 15 13 T 14 13 307712 CASAVA_Build 2 169105877 4I TGCCAGGTTC ----/TTTT TTTTAATAAA 3070 hom 77 het 31 0 24 7 T 4 8 307713 CASAVA_Build 2 169107445 19D CATGGTTTTC TTTTTTTTGGGGGGTGTTA/------------------- TTTTTTTTGG 2847 het 2847 ref 22 13 7 5 TTTTTTTTGGGGGGTGTTA 1 0 307714 CASAVA_Build 2 169108266 1I GGACCATGAT -/A AGTCAGTGAT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 1 2 307715 CASAVA_Build 2 169109559 1D TGGTGCTGGG A/- ACAGTTGGAT 3070 hom 110 het 49 0 41 8 A 2 1 307716 CASAVA_Build 2 169133342 1D GTCGTATTTT A/- TACAGGTGCC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 1 0 307717 CASAVA_Build 2 169139474 1I AAGGGCTGCC -/A AAATGAATTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 3 4 307718 CASAVA_Build 2 169151901 1I TGCCAGTGCA -/C GCTGGGCTGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 0 1 307719 CASAVA_Build 2 169160839 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 14 1 12 1 A 14 15 307720 CASAVA_Build 2 169187030 1I AAAAAATCAC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 A 7 8 307721 CASAVA_Build 2 169187216 3D TGTTGTGTTT AAA/--- ACACTACATA 3070 het 3070 hom 32 10 18 5 A 4 1 307722 CASAVA_Build 2 169188228 1I GTAAAGCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 A 9 10 307723 CASAVA_Build 2 169195857 1D TATATCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 42 0 33 9 T 11 10 307724 CASAVA_Build 2 169202820 1I GTTTGGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 10 11 307725 CASAVA_Build 2 169203186 1I ACATCGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 11 12 307726 CASAVA_Build 2 169206016 2I GGAAATGTCA --/TT TTTTTTTAGA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 7 9 307727 CASAVA_Build 2 169206651 1D GTAATGGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 26 1 20 5 A 12 11 307728 CASAVA_Build 2 169206870 1I GGCACACACC -/T ATAATCCCAG 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 0 1 307729 CASAVA_Build 2 169207969 4D TTGAAGCTAT AAAG/---- AAATTGATAA 3070 het 3070 hom 39 14 23 3 AAAG 1 0 307730 CASAVA_Build 2 169210632 1I GCTCTTGTTC -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 6 7 307731 CASAVA_Build 2 169215429 1I TTCCGGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 11 12 307732 CASAVA_Build 2 169223600 1I CTATTAAACA -/G GGTGTCCCAG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 G 2 3 307733 CASAVA_Build 2 169228528 1I TATATACTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 9 307734 CASAVA_Build 2 169276710 1I CAAACCAAAC -/A AAAAAAATAA 2664 het 2664 ref 35 21 7 7 A 7 8 307735 CASAVA_Build 2 169284826 4D TGAGACTACA GCAC/---- GCACCACCAG 2167 het 2167 ref 13 8 5 2 GCAC 2 1 307736 CASAVA_Build 2 169288321 1I CAAATCATCT -/G GGAACATTGC 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 G 2 3 307737 CASAVA_Build 2 169292009 1I TTCTACAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 9 10 307738 CASAVA_Build 2 169298644 1D TGAACCCATT A/- GGGGGAAAAA 3070 hom 134 het 49 0 45 4 A 1 0 307739 CASAVA_Build 2 169300335 3D AACAGCACTT AAG/--- AAGTATTTTG 3070 het 3070 hom 42 18 18 7 AAG 2 1 307740 CASAVA_Build 2 169306130 3D TTGGAGAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 29 4 A 22 19 307741 CASAVA_Build 2 169308301 2I TGAGGCGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 1 2 307742 CASAVA_Build 2 169310004 1I AGTTTAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 13 14 307743 CASAVA_Build 2 169312048 1D TCTCAACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 171 hom 32 1 22 9 T 15 14 307744 CASAVA_Build 2 169315085 1D CATACATGTT A/- ATTATAGTTA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 2 1 307745 CASAVA_Build 2 169322114 1D CTTTTGGAGG A/- AAAAAAAAAA 2164 het 2164 ref 39 19 6 15 A 17 16 307746 CASAVA_Build 2 169327665 1D TCTCTCACTC T/- TGTCGCCCAG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 2 1 307747 CASAVA_Build 2 169341343 5D ATTTTTTAAT TAAAA/----- AAAAAATTAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 TAAAA 1 0 307748 CASAVA_Build 2 169350508 1D GCTCTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 22 0 15 7 T 15 14 307749 CASAVA_Build 2 169352632 2D CTGAAGCACA AG/-- AGGGTAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 AG 2 1 307750 CASAVA_Build 2 169352997 1D ATCCTACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 889 hom 35 4 15 16 A 17 16 307751 CASAVA_Build 2 169377771 1D AAAAGAGAAA C/- ATTTTAAATA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 C 1 0 307752 CASAVA_Build 2 169382314 1D TTCTTGTCCA C/- TTTACCTGAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 C 1 0 307753 CASAVA_Build 2 169383598 1I TATTAAAAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 8 307754 CASAVA_Build 2 169383803 1I GAATGGAAAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 318 hom 48 1 39 8 A 7 8 307755 CASAVA_Build 2 169387104 1D GTACTAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 9 307756 CASAVA_Build 2 169390977 8I CTAAGGAATG --------/AGAGGTAT AGGGGTGTAG 3070 het 491 hom 40 5 26 9 AGAGGTAT 0 1 307757 CASAVA_Build 2 169398573 1D AAACAATCTC A/- AATCGTGGCC 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 A 3 2 307758 CASAVA_Build 2 169406050 4D AATGCTTTAA ATAT/---- ATATATATAA 1327 het 1327 ref 12 4 3 7 AT 6 4 307759 CASAVA_Build 2 169409150 1I TTTTAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 A 10 11 307760 CASAVA_Build 2 169409846 1I AACAAATGAG -/A AAAAAATTCC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 6 7 307761 CASAVA_Build 2 169413317 1D ACTATATACC A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 6 5 307762 CASAVA_Build 2 169415509 10D TCTCTACTGA AATTCTCTGG/---------- AATTCTCTGG 3070 het 3070 ref 37 22 11 6 AATTCTCTGG 2 1 307763 CASAVA_Build 2 169421331 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 997 hom 15 3 8 4 A 11 12 307764 CASAVA_Build 2 169427300 4D TCAACTTAGT GTAA/---- GTAAGTGCAA 3070 het 3070 ref 34 19 14 4 GTAA 2 1 307765 CASAVA_Build 2 169427513 8I AGCCTCAACC --------/TTCTTTAT TTCTTTATGT 3070 het 3070 hom 42 11 22 9 TTCTTTAT 1 2 307766 CASAVA_Build 2 169427784 4D TGTGAATAAA AGAC/---- AGACATACTT 3070 hom 62 het 37 1 34 2 AGAC 2 1 307767 CASAVA_Build 2 169429263 1D GCTGGTCTCG A/- AACTCCTGAC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 3 2 307768 CASAVA_Build 2 169436126 1I TAAAAACAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 7 8 307769 CASAVA_Build 2 169436316 3D CTGACACTAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 37 0 24 13 A 14 11 307770 CASAVA_Build 2 169436741 1I AACAATTTTC -/T TTTTTTTTTG 1517 het 1517 ref 32 18 5 9 T 9 10 307771 CASAVA_Build 2 169442715 2I TCAGCCTCTC --/AA AAAGTGCTGG 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 3 5 307772 CASAVA_Build 2 169481959 1I GTTTTTGGAC -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 7 8 307773 CASAVA_Build 2 169483943 4D CTGCTTTAGA TCAG/---- TATTAAGCTT 3070 het 3070 ref 27 12 12 4 TCAG 1 0 307774 CASAVA_Build 2 169485303 1D AATCCTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 12 11 307775 CASAVA_Build 2 169497865 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2149 het 489 hom 11 2 7 2 A 15 16 307776 CASAVA_Build 2 169498505 5I TAGTTCCACT -----/TTTTG TTTTGTTTTG 2931 het 2931 ref 31 14 8 11 TTTTG 3 4 307777 CASAVA_Build 2 169503842 4I ACTCTTTTTC ----/TGTT TGTTGATGGA 3070 het 3070 hom 41 20 20 1 TGTT 1 2 307778 CASAVA_Build 2 169506979 6I ATAGTGGGAC ------/ATATTA ATATAACTAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 ATATTA 0 1 307779 CASAVA_Build 2 169507264 1D CAAAGGGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 33 1 25 7 A 11 10 307780 CASAVA_Build 2 169508520 4I29M1I GGAGTTGAGA ----CTACAGTACAGCACTATCAGTCCAGTGAG-/CGTGCTACAGTACAGCACTATCAGTCCAGTGAGT TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 29 14 19 1 N/A 0 0 307781 CASAVA_Build 2 169509039 1D CCCACCCCCT G/- GGGGGCAGTA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 G 6 5 307782 CASAVA_Build 2 169512105 1I CTCACATCCA -/T TTTTTTTTTT 2055 het 2055 ref 37 23 8 6 T 11 12 307783 CASAVA_Build 2 169513257 2I GATGAGTGGG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 9 11 307784 CASAVA_Build 2 169518209 1I TTATCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 17 16 12 T 13 14 307785 CASAVA_Build 2 169518983 1I TCTTTTTCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 23 9 10 T 8 9 307786 CASAVA_Build 2 169525727 1D CAGCACTTTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 8 7 307787 CASAVA_Build 2 169532888 4I AAACACAGAT ----/TTTC TTTTTTTAAA 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TTTC 0 1 307788 CASAVA_Build 2 169532986 1I ATGAGAAGCT -/A AACCAAAAAC 3070 hom 148 het 53 0 50 3 A 2 3 307789 CASAVA_Build 2 169533494 1D52M1I GAAACAGGTA TTTTTTTTTAGCATAAATCATAAAAAGTTTAAGAGAAGTCCATCAGAAGTAGC-/-TTTTTTTTAGCATAAATCATAAAAAGTTTAAGAGAAGTCCATCAGAAGTAGCA AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 34 0 42 8 N/A 0 0 307790 CASAVA_Build 2 169535868 1I TGTCTTTACC -/A ATTTACTTGT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 1 2 307791 CASAVA_Build 2 169537085 7D TTTTGATTCC AGTAAAG/------- AGTAGAGACA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AGTAAAG 1 0 307792 CASAVA_Build 2 169537215 2D GATTTATAGT AA/-- GTCTTACTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 7 A 2 0 307793 CASAVA_Build 2 169537929 4D TTCACTGAAG AGGC/---- AGCAATAGCA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 AGGC 1 0 307794 CASAVA_Build 2 169538057 2D ATTTAGATGG TA/-- TATATATATT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TA 5 4 307795 CASAVA_Build 2 169540466 2D ATGTTTACCT TC/-- TCTCTGTATA 683 hom 5 het 5 0 2 3 TC 3 2 307796 CASAVA_Build 2 169540649 3I ATAACAGAAA ---/TAT TATTAAGAGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TAT 1 2 307797 CASAVA_Build 2 169543415 1D GCTCAGGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 43 0 32 11 T 12 11 307798 CASAVA_Build 2 169544954 1D TACCACTTTA T/- TTTTTTACTG 3070 hom 138 het 48 0 47 1 T 7 6 307799 CASAVA_Build 2 169563360 5D TAACAATAAA TAACT/----- TAAATTTCCT 3070 hom 138 het 49 0 46 4 TAACT 1 0 307800 CASAVA_Build 2 169563581 2D CACTCCTGCG GT/-- GTCTCTGAAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 4 GT 2 1 307801 CASAVA_Build 2 169564036 1D ACTTTTTACC T/- TTTTTTTTTT 1304 het 1304 ref 50 42 3 6 T 11 10 307802 CASAVA_Build 2 169611162 1D GTCCACACAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 10 9 307803 CASAVA_Build 2 169690669 1I AAAATCCTAG -/A AAAAAAACCT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 7 8 307804 CASAVA_Build 2 169692509 1I TTAACTGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 34 1 21 12 T 12 13 307805 CASAVA_Build 2 169698353 1D AAAAGGAGCA T/- TAGGTGTTAA 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 2 1 307806 CASAVA_Build 2 169700482 1I CAGGGTACAG -/C CCATTTAAGC 2940 hom 15 het 7 0 6 1 C 2 3 307807 CASAVA_Build 2 169709202 4D ATCAGCTGCC GGAG/---- GGAGATGCTT 3070 hom 33 het 12 0 12 1 GGAG 2 1 307808 CASAVA_Build 2 169712697 1D GCACTATGTT A/- AAAAAAAAAA 2619 het 1026 hom 19 3 9 7 A 13 12 307809 CASAVA_Build 2 169713109 2I TAGGGTGATG --/AA AAAATGCTTT 3070 het 3070 ref 52 28 15 9 A 4 6 307810 CASAVA_Build 2 169720439 1I TCTTTCTCTG -/T TTTTATTAGG 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 4 5 307811 CASAVA_Build 2 169723108 4D AATAAGAACA TTTG/---- TTTGTAAACA 3070 het 3070 hom 38 17 18 7 TTTG 2 1 307812 CASAVA_Build 2 169725447 4I TTAAAAAAAA ----/AAAC AAAAACCTGC 3070 hom 40 het 26 0 14 12 AAAC 0 1 307813 CASAVA_Build 2 169740400 1D TTTCCTCCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 433 hom 33 2 14 17 A 10 9 307814 CASAVA_Build 2 169744477 1D TTTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 A 11 10 307815 CASAVA_Build 2 169746482 25D TCTGTAGAGC AGACTGCATTCTGAATTCTTTTCTG/------------------------- CATTCAGAAA 3070 hom 101 het 26 0 30 11 AGACTGCATTCTGAATTCTTTTCTG 1 0 307816 CASAVA_Build 2 169749529 1I GTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 8 9 307817 CASAVA_Build 2 169754559 1I ACAAACAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 48 17 20 11 T 9 10 307818 CASAVA_Build 2 169777752 1I ACATGCAGTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 A 7 8 307819 CASAVA_Build 2 169779820 1I CAGAAACCAT -/A ACCATGTAAC 3070 hom 193 het 74 0 65 9 A 1 2 307820 CASAVA_Build 2 169784579 1I GAAATTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 8 9 307821 CASAVA_Build 2 169786471 3I CACATATATC ---/CTT CTTCTTTCCC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 CTT 2 3 307822 CASAVA_Build 2 169786694 5D TAGGCTTCAC TACAA/----- AATTCAGCTA 3070 het 3070 ref 44 23 18 5 TACAA 1 0 307823 CASAVA_Build 2 169793068 1D CTGCAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2765 hom 33 9 14 10 A 17 16 307824 CASAVA_Build 2 169796966 2D TTTTTGCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 43 0 33 10 A 13 11 307825 CASAVA_Build 2 169800000 1D TTGAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1993 hom 22 7 12 3 T 14 13 307826 CASAVA_Build 2 169804866 1D ATGCAAAGAC A/- CTTAAAATTG 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 A 1 0 307827 CASAVA_Build 2 169806945 2I GAAAACTTAC --/TT TTTTTTGGTC 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 T 6 8 307828 CASAVA_Build 2 169808602 3D ATGACTCTAG ACC/--- AAAGCCAAGC 3070 het 3070 ref 51 31 15 6 ACC 1 0 307829 CASAVA_Build 2 169812901 1D TACTAATGTT A/- GAATGATGCT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 1 0 307830 CASAVA_Build 2 169820282 1D AAGGTTGACG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 35 16 16 5 A 8 7 307831 CASAVA_Build 2 169820725 1I GTCTAAATAT -/A ATAGCACCAT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 A 1 2 307832 CASAVA_Build 2 169824502 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 27 2 13 13 A 13 11 307833 CASAVA_Build 2 169825627 1I GGTACACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 11 12 307834 CASAVA_Build 2 169841950 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2565 het 56 hom 22 1 11 10 A 19 18 307835 CASAVA_Build 2 169850050 1D ACCCTATCAC A/- AAAAAACAGG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 6 307836 CASAVA_Build 2 169852400 3D TCCGCTGAAG AAT/--- AATAATAATA 2976 hom 21 het 13 0 7 8 AAT 7 6 307837 CASAVA_Build 2 169856465 1I TACACTTACC -/A ATCCCCAGCT 3070 hom 122 het 46 0 39 7 A 1 2 307838 CASAVA_Build 2 169859652 4D GACAGACATT AATC/---- AAATAAGACA 3070 het 3070 hom 33 10 21 3 AATC 1 0 307839 CASAVA_Build 2 169860599 1D TCACAAATGT G/- GATATCTTCC 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 G 2 1 307840 CASAVA_Build 2 169865192 1I AGTGGGTTCT -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 7 8 307841 CASAVA_Build 2 169866924 1D GGCTAAGCCT C/- ATTTAATCTT 3070 het 3070 hom 44 22 19 3 C 1 0 307842 CASAVA_Build 2 169867500 1I GTGACCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 34 1 21 12 T 11 12 307843 CASAVA_Build 2 169871461 8I ACCTGTTACT --------/AGATAATG AGATAATGAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AGATAATG 1 2 307844 CASAVA_Build 2 169888610 1D CTGCCTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1254 hom 21 3 14 6 A 15 14 307845 CASAVA_Build 2 169910511 1D GGGGGCGGTC A/- AAAAAAAAAA 1423 het 1423 ref 41 24 6 11 A 17 16 307846 CASAVA_Build 2 169925190 3D TATTATTATA TAT/--- TATTATCATA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 TAT 3 2 307847 CASAVA_Build 2 169941548 1D TTTTAATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 21 2 11 8 T 12 11 307848 CASAVA_Build 2 169944084 1D TGGTGAATGC A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 51 20 25 7 A 8 7 307849 CASAVA_Build 2 169975120 1D GTTCCTTGAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 9 8 307850 CASAVA_Build 2 169976926 1I CCTTCCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 23 20 10 T 10 11 307851 CASAVA_Build 2 169977944 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 35 1 21 15 A 16 15 307852 CASAVA_Build 2 169982075 1I ATATGAAAGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 A 7 8 307853 CASAVA_Build 2 169985120 1D CTTTGTCTCT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 9 8 307854 CASAVA_Build 2 169986138 1D GGTCTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 11 10 307855 CASAVA_Build 2 169999017 2D GTGGATATAT AA/-- AATGATAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 11 8 A 4 2 307856 CASAVA_Build 2 170001283 1D CCAAAAAAAA T/- GAAAAGATAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 T 1 0 307857 CASAVA_Build 2 170004754 1D TCACAAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2787 hom 44 12 22 10 T 12 11 307858 CASAVA_Build 2 170006375 1I GAAGGAAACT -/G GAAAATTCTG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 G 1 2 307859 CASAVA_Build 2 170009507 1I GAATTTACCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 11 12 307860 CASAVA_Build 2 170009685 1D TAAATCTAAC A/- AAAATTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 5 4 307861 CASAVA_Build 2 170010544 1D TAAGAGAATG A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 8 7 307862 CASAVA_Build 2 170012307 2I TTAGTGTGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 10 12 307863 CASAVA_Build 2 170012317 1I AAAAAAAAAA -/C TGCACATTAG 1456 het 459 hom 32 6 8 18 C 0 1 307864 CASAVA_Build 2 170046380 1I TTTTGCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2930 hom 37 10 17 10 T 11 12 307865 CASAVA_Build 2 170046831 1I TCCAGGCCCC -/A ACTGATCTTC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 1 2 307866 CASAVA_Build 2 170071921 1D AATACATCAA C/- CCCCCCCTTT 3070 het 3070 hom 46 15 19 12 C 8 7 307867 CASAVA_Build 2 170083749 2I AATAATTGTC --/TA TGTGTAGATG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TA 0 1 307868 CASAVA_Build 2 170093213 2I GCCTGCTGAG --/CA CACAAAACCA 3070 het 3070 ref 43 23 19 1 CA 2 3 307869 CASAVA_Build 2 170097532 4I CCCAATTTGG ----/ACAA ACAAACTATA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 ACAA 1 2 307870 CASAVA_Build 2 170100721 1D CTAAACATCC T/- TTTTTTTTTT 1306 het 1306 ref 36 25 4 7 T 13 12 307871 CASAVA_Build 2 170101752 1D CTGACCTTAA T/- TTTTTTTTTT 1667 het 1667 ref 27 13 7 8 T 17 16 307872 CASAVA_Build 2 170121771 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 32 1 26 5 A 11 10 307873 CASAVA_Build 2 170122144 1I AACAAATAGG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 8 9 307874 CASAVA_Build 2 170127402 1D TCAGAGGCCA T/- TTTCAGTGGG 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 4 3 307875 CASAVA_Build 2 170137309 1D ATATATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 T 11 10 307876 CASAVA_Build 2 170139120 1I CTTGACACTT -/A AAAAAAAAAA 2143 het 2143 ref 23 13 6 4 A 10 11 307877 CASAVA_Build 2 170144158 1D CAGCCCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 12 11 307878 CASAVA_Build 2 170147180 7I TTTATTTTTA -------/TTTAACT TTTAAGTTGT 2390 het 2390 ref 19 10 5 4 TTTAACT 0 1 307879 CASAVA_Build 2 170152903 2I CCTGGGAAAC --/AA GAGCGAAACT 3070 hom 87 het 30 0 29 1 A 0 2 307880 CASAVA_Build 2 170156856 1D CTAATTGTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 10 9 307881 CASAVA_Build 2 170159081 2I GTTGATAGGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 27 1 18 8 A 13 15 307882 CASAVA_Build 2 170159382 2D CTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1664 het 206 hom 20 6 7 8 T 21 19 307883 CASAVA_Build 2 170161792 1D GTTGATAGAT A/- CTTAAGTTAC 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 A 1 0 307884 CASAVA_Build 2 170165694 1I TTCAAACCTT -/A ATACGTAAAG 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 1 2 307885 CASAVA_Build 2 170174203 2D GGGATTACAC AT/-- GTGAGCTATG 2886 het 2886 ref 23 14 9 0 AT 1 0 307886 CASAVA_Build 2 170176200 3D TGTGCATTAT TAA/--- TCTTATTTTG 3070 het 3070 ref 29 17 8 6 TAA 1 0 307887 CASAVA_Build 2 170194898 1D AAACTCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2316 hom 37 9 19 9 T 13 12 307888 CASAVA_Build 2 170204175 1D CAGTTAAATA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 2983 hom 17 6 9 2 T 8 7 307889 CASAVA_Build 2 170209628 1D CTAAGAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 10 9 307890 CASAVA_Build 2 170220359 1I TTTATAATAC -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 6 7 307891 CASAVA_Build 2 170224840 1D GTTTATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2717 hom 24 10 8 6 A 11 10 307892 CASAVA_Build 2 170241123 1D TCTGTGTTAC A/- AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 41 31 4 6 A 13 12 307893 CASAVA_Build 2 170258729 6D TTTTAGGTCA GCTGGG/------ GCTGGGGGTG 3070 het 3070 ref 25 10 9 8 GCTGGG 2 1 307894 CASAVA_Build 2 170272242 3I TATCTATCTA ---/TTC TTCTATGTAG 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 TTC 1 2 307895 CASAVA_Build 2 170278457 4D GGCCACACAT TAAA/---- TACCCAGGGA 3070 het 3070 hom 32 11 14 8 TAAA 1 0 307896 CASAVA_Build 2 170280896 1I TCAAAAGCAC -/T TCGGGGGCAA 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 T 1 2 307897 CASAVA_Build 2 170282594 1D ATGTTGGTCA G/- GCTGGTCTTA 3070 het 1856 hom 21 6 11 4 G 2 1 307898 CASAVA_Build 2 170286089 1D GTTACTTAGC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 A 8 7 307899 CASAVA_Build 2 170289503 1D TCCTGCCTCA C/- GCCTCCCAAG 3070 hom 92 het 35 0 30 5 C 1 0 307900 CASAVA_Build 2 170297101 2D CTATTTATTC AG/-- AGTTTGCTGT 3070 het 3070 hom 28 9 14 6 AG 2 1 307901 CASAVA_Build 2 170313423 3I GGAAGAAGGG ---/AGA AGAAGTAGAG 3070 hom 87 het 32 0 28 4 AGA 1 2 307902 CASAVA_Build 2 170322878 1D TAGGTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 37 1 31 5 A 11 10 307903 CASAVA_Build 2 170332643 2I TCCCCCAAGA --/TG TGTGTCTTCC 3070 het 3070 ref 50 21 17 12 TG 2 3 307904 CASAVA_Build 2 170334899 1I GTCATAATAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 12 11 10 T 8 9 307905 CASAVA_Build 2 170338853 1D GTGCCACTAC A/- ACTCCAGCCT 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 A 2 1 307906 CASAVA_Build 2 170339504 1D GATCTCGGCT C/- CACTGCAAGC 3070 het 2011 hom 19 7 8 4 C 2 1 307907 CASAVA_Build 2 170341207 1I GCCTGCCCAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 38 20 11 8 A 8 9 307908 CASAVA_Build 2 170341270 1I80M1D CACAGAAAAT -AGGAACCTGCCTGACTGTGGACATCAAATGAATTTCAAGGCCTGGAACCTGGATAGCATGGTTCACTGAGTCTAAGAATGA/AAGGAACCTGCCTGACTGTGGACATCAAATGAATTTCAAGGCCTTGAACCTGGATAGCATGGTTCACTGAGTCTAAGAATG- ATCACCTTAT 3070 het 3070 hom 25 12 17 28 N/A 0 0 307909 CASAVA_Build 2 170343203 1I ATTTTATATC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 145 hom 40 1 31 8 T 8 9 307910 CASAVA_Build 2 170343576 1D AACTACCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 506 hom 28 3 10 16 T 17 16 307911 CASAVA_Build 2 170344859 2D CTATTTCCAC TG/-- TGTCACCATA 3070 het 3070 ref 50 27 20 3 TG 2 1 307912 CASAVA_Build 2 170346457 2I AGAGCCATTG --/TA TATATCACAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 TA 2 3 307913 CASAVA_Build 2 170346514 1D AATGCAACTT A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 hom 31 9 11 12 A 6 5 307914 CASAVA_Build 2 170347792 3D AGGAGGATTG GTT/--- GAGGCCAGGT 3070 het 3070 hom 41 11 19 11 GTT 1 0 307915 CASAVA_Build 2 170348544 2I CAGAACGAGA --/CT CTGTCTCAAA 332 het 332 ref 25 5 2 18 CT 1 2 307916 CASAVA_Build 2 170352398 3I ACAGAATAAT ---/CTC CACTGATTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 CTC 0 1 307917 CASAVA_Build 2 170353880 1I ACCTTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 1935 het 1935 ref 25 13 7 5 A 15 16 307918 CASAVA_Build 2 170355117 1D GCCTTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 524 hom 21 2 12 7 T 16 15 307919 CASAVA_Build 2 170355572 1D ATTCCAGTTA G/- TGGACTAGTT 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 G 1 0 307920 CASAVA_Build 2 170355703 1I GATTAGGGAG -/A AAAGAAGCCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 4 307921 CASAVA_Build 2 170356469 9I ATGTACATGT ---------/TAAGACATC TGCACTGGTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TAAGACATC 0 1 307922 CASAVA_Build 2 170362638 9D CCTCCACACT TGGGGATTA/--------- TGGGGATTAC 3070 hom 81 het 35 0 25 10 TGGGGATTA 2 1 307923 CASAVA_Build 2 170369580 1I GCCTGGCCCC -/T GTCCCTTATT 2729 hom 20 het 9 0 8 1 T 0 1 307924 CASAVA_Build 2 170377884 2D TCTGAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 811 het 364 hom 19 5 2 13 T 18 16 307925 CASAVA_Build 2 170384727 1D TATGCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 27 3 18 6 T 12 11 307926 CASAVA_Build 2 170386102 1I AAATTAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 10 11 307927 CASAVA_Build 2 170387073 2D CTGTGCCCAG TC/-- TCTGAGGTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TC 2 1 307928 CASAVA_Build 2 170390417 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 15 0 11 4 A 11 10 307929 CASAVA_Build 2 170395409 1D ATGTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 17 2 T 11 10 307930 CASAVA_Build 2 170399894 1D TAATGCCACT A/- AAACTGTACA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 4 3 307931 CASAVA_Build 2 170404268 5D CAAAATAGCT AGAAG/----- AGAAGAATTT 3070 het 495 hom 34 6 19 9 AGAAG 2 1 307932 CASAVA_Build 2 170410780 3D AAAAAAGCGC TTA/--- TTATTCTGTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 TTA 2 1 307933 CASAVA_Build 2 170410839 3D AGTTGGTTGA TAT/--- TGTTGTTCAG 3070 het 3070 hom 36 10 19 10 TAT 1 0 307934 CASAVA_Build 2 170412675 2D AGGAGCACTC TG/-- TGTAGATTTC 3070 het 3070 hom 50 22 25 4 TG 2 1 307935 CASAVA_Build 2 170413465 1D AGTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2018 hom 22 7 7 8 T 15 14 307936 CASAVA_Build 2 170418533 1D AGGGACTTCG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 10 9 307937 CASAVA_Build 2 170439753 3I30M1D GTTGTCCAAG ---CTTTTCTTTCTCTCCATCTCTATTTGCCTGT/CTTCTTTTCTTTCTCTCCATCTCTATTTGCCTG- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 21 11 3 N/A 0 0 307938 CASAVA_Build 2 170450913 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2114 het 1091 hom 18 4 10 4 A 17 18 307939 CASAVA_Build 2 170452540 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1058 hom 17 4 8 5 T 10 11 307940 CASAVA_Build 2 170461022 1I CAGGCTTGGG -/C GACAGAGCAA 3070 hom 77 het 31 0 24 7 C 0 1 307941 CASAVA_Build 2 170463288 1D TGTGATCTTA C/- AGCTCTGAGT 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 C 1 0 307942 CASAVA_Build 2 170467297 1D CCATCACTAG T/- TTTATCTGGT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 4 3 307943 CASAVA_Build 2 170471204 1I AATGCTTCTT -/G TCTTTCAAGG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 0 1 307944 CASAVA_Build 2 170476973 1I TTTTTAACTT -/A AAAAAAGGAG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 6 7 307945 CASAVA_Build 2 170479605 6D TTTTATCTCT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 36 16 12 11 TG 12 9 307946 CASAVA_Build 2 170479996 1D GGACAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3039 het 1405 hom 18 4 7 7 T 12 11 307947 CASAVA_Build 2 170488296 6I TATGTGACTG ------/TTATTC TTATTACTGT 3070 hom 119 het 48 0 47 1 TTATTC 0 1 307948 CASAVA_Build 2 170490757 10D GGGTTTCTGC AGGAAAGGCA/---------- AGGAAAGGCA 3070 het 3070 ref 38 16 13 13 AGGAAAGGCA 2 1 307949 CASAVA_Build 2 170496833 1D AGCTCATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1764 hom 18 8 7 3 T 15 14 307950 CASAVA_Build 2 170510804 5D CCTTGTCATC AAGAG/----- AAGAGTGTCA 3070 het 3070 hom 26 13 13 1 AAGAG 2 1 307951 CASAVA_Build 2 170512836 1D TTTATGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 12 11 307952 CASAVA_Build 2 170515389 1I AAAAATGGGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 7 8 307953 CASAVA_Build 2 170522849 1D TGTTAGTCTC T/- TGCTAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 T 2 1 307954 CASAVA_Build 2 170527506 1D AGGGTGTTTC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 T 8 7 307955 CASAVA_Build 2 170535153 1D TATGTATACA T/- TGTGTCATGC 3034 hom 18 het 7 0 7 0 T 2 1 307956 CASAVA_Build 2 170549773 1I AAGACTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 A 11 12 307957 CASAVA_Build 2 170555622 1I GAAGAATTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 9 10 307958 CASAVA_Build 2 170561878 3D AAATTTACTA TTT/--- AGACTTTATT 3070 het 3070 hom 26 12 13 3 T 3 0 307959 CASAVA_Build 2 170568233 1I TTCCTTCAGC -/A AATATTTATT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 2 3 307960 CASAVA_Build 2 170575675 1I ATCTCAGAAC -/T TTGAGAGACC 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 T 2 3 307961 CASAVA_Build 2 170579728 1D TATGTTGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3067 hom 25 8 10 8 T 13 12 307962 CASAVA_Build 2 170580351 9I AAGTGACGAG ---------/GTTTATACT GTTTCAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 GTTTATACT 0 1 307963 CASAVA_Build 2 170580864 4D TGAAAAATGA ATAT/---- ATATTCTCAA 3070 het 3070 hom 30 9 16 6 AT 4 2 307964 CASAVA_Build 2 170583927 1D GTTAGTCAAG A/- AGAGGATAAG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 2 1 307965 CASAVA_Build 2 170588168 1D TTTATGAAAA T/- TTTTTTTTTT 2799 het 2548 hom 28 10 10 8 T 16 15 307966 CASAVA_Build 2 170597020 6D TGTGCTTGTT AAAAAC/------ AAAAACAAAA 2916 het 2916 ref 39 30 7 3 AAAAAC 3 2 307967 CASAVA_Build 2 170597193 1D TGTAGACCTA T/- TCAGATTTTG 3070 het 3070 hom 34 11 20 5 T 2 1 307968 CASAVA_Build 2 170610721 5D TTCTTGTAAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1696 hom 29 het 19 0 9 10 T 23 18 307969 CASAVA_Build 2 170611949 2D GTGGCGGTGT CG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 78 het 27 0 22 5 CG 1 0 307970 CASAVA_Build 2 170626230 1D AAGAGGGAGC T/- TTTTTTTTTT 2442 het 219 hom 18 2 6 10 T 12 11 307971 CASAVA_Build 2 170631269 2I GATTATCTAG --/CC CCCCCCCACC 3070 het 3009 hom 24 9 11 4 C 7 9 307972 CASAVA_Build 2 170632527 1D AAGGAAATAA T/- TTTTTTTTTT 2864 het 1677 hom 37 14 10 14 T 19 18 307973 CASAVA_Build 2 170634477 1D CAGATTCATT C/- ATGTTGTGAT 3070 het 3070 ref 45 29 16 0 C 1 0 307974 CASAVA_Build 2 170638488 1I GATTAAATTG -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 6 7 307975 CASAVA_Build 2 170640670 1D ACTATGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 A 15 14 307976 CASAVA_Build 2 170647939 3I ATGATAAAAT ---/ATA ATGTCAGATC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 ATA 0 1 307977 CASAVA_Build 2 170664336 1I GTCTCAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 C 0 1 307978 CASAVA_Build 2 170665748 1D CCAGAGATAC T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 8 7 307979 CASAVA_Build 2 170665989 1D TATACACATT A/- AAAAAACTCT 3070 hom 76 het 31 0 26 6 A 7 6 307980 CASAVA_Build 2 170666765 1D TCTACTACTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 98 het 39 0 32 9 A 10 9 307981 CASAVA_Build 2 170668831 1D TTGGTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 11 10 307982 CASAVA_Build 2 170670505 1D ATAATGGGGC T/- TCTATAAGAT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 2 1 307983 CASAVA_Build 2 170675110 1D AATTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 1597 het 1597 ref 21 6 5 10 T 13 12 307984 CASAVA_Build 2 170675296 1D TTAGTAGAGA C/- GGGGTTTCAC 25 hom 5 het 5 0 2 3 C 1 0 307985 CASAVA_Build 2 170688707 1D CTGCCCTTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 10 9 307986 CASAVA_Build 2 170698406 1D ACTTGGAACC A/- ACCCAAATGT 3070 het 2461 hom 21 5 16 0 A 2 1 307987 CASAVA_Build 2 170698947 2I AAACAGAAAC --/AT ATTTACAACT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 2 307988 CASAVA_Build 2 170703380 5I CTGAATACTC -----/TTTCT TTTCTTTATG 2690 het 2690 ref 32 19 7 6 TTTCT 1 2 307989 CASAVA_Build 2 170703437 5D AATAATTCAG CTTTT/----- CTTTTATCAC 3070 het 3070 hom 29 12 13 8 CTTTT 2 1 307990 CASAVA_Build 2 170708330 3D GTGAACAGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 1374 het 1374 ref 33 15 5 16 T 19 16 307991 CASAVA_Build 2 170711341 1I TTGTAAGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 76 het 33 0 26 7 A 9 10 307992 CASAVA_Build 2 170711514 1D TTTGTAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 19 9 T 15 14 307993 CASAVA_Build 2 170720207 1I TTTTTCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 T 12 13 307994 CASAVA_Build 2 170727135 2D CCACCTTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 39 2 16 21 A 20 18 307995 CASAVA_Build 2 170728840 1D TTTAGAAAAG A/- AAAAATAATT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 6 5 307996 CASAVA_Build 2 170736490 1I AACACTGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 A 9 10 307997 CASAVA_Build 2 170748647 5I TCTAAAAATT -----/AAAAC AGATATTAAA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 AAAAC 0 1 307998 CASAVA_Build 2 170749808 3D GTTGTTTGAT CTC/--- CTTATATATT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 CTC 1 0 307999 CASAVA_Build 2 170750615 1D GAGATCTTTC A/- TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 A 1 0 308000 CASAVA_Build 2 170751063 1I CTATACCCAG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 T 8 9 308001 CASAVA_Build 2 170757058 1D TTGGGTTCAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 T 8 7 308002 CASAVA_Build 2 170777393 1D GGAGAAAAGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 8 7 308003 CASAVA_Build 2 170780881 12I AGAATGTCCG ------------/CAGTGAACACAA CAGTCATCCC 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 CAGTGAACACAA 0 1 308004 CASAVA_Build 2 170786505 1I ATTTTTTTTT -/A AAAAGATGGG 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 4 5 308005 CASAVA_Build 2 170792236 1D AGACAGGGTT C/- CATCATGTTG 3070 hom 65 het 30 0 21 9 C 2 1 308006 CASAVA_Build 2 170803432 11D3M13D TGGAGTCAGG GAAGAAGTGACTTTCACAAGTTAAAAA/-----------TTT------------- AAGATTTATG 3070 het 3070 hom 33 20 18 5 N/A 0 0 308007 CASAVA_Build 2 170805887 1I TATTTATTTG -/T TTTTTTTTTT 2703 het 2703 ref 34 14 12 8 T 11 12 308008 CASAVA_Build 2 170806452 2I GGTAGTGGGG --/CT CAGATGGGCA 3070 hom 129 het 46 0 41 5 CT 0 1 308009 CASAVA_Build 2 170812080 1I CAGGTGTCCA -/T TCTGGGCAAG 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 T 1 2 308010 CASAVA_Build 2 170831869 1I39M11D TGAAAGTTTA -TTTTTTGTTCACAGAAAACTCAAACAGCAGCTGGGGGTAGGGTGGGAATT/TTTTTTTGTTCACAGAAAACTCAAACAGCAGCTGGGGGTA----------- GGGTTCTGCA 3070 hom 94 het 27 0 29 11 N/A 0 0 308011 CASAVA_Build 2 170838508 2I GATTGGACTC --/AT GTGTAATTAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AT 0 1 308012 CASAVA_Build 2 170844220 1D TTGTCCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 8 5 A 11 10 308013 CASAVA_Build 2 170845438 3D CCAGCTTCAG TCT/--- TCTGCATTTG 2888 het 2888 ref 21 14 6 2 TCT 2 1 308014 CASAVA_Build 2 170850129 1D GTCTGTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 12 11 308015 CASAVA_Build 2 170850562 1I TAATGTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 13 14 308016 CASAVA_Build 2 170852155 1D TGTTATTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 11 10 308017 CASAVA_Build 2 170852991 1D AAATTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 41 1 31 9 T 12 11 308018 CASAVA_Build 2 170856076 1D TTAACTGCAT C/- CCCCCCAAAT 3070 het 3070 hom 48 20 21 8 C 7 6 308019 CASAVA_Build 2 170858563 1D CAAAGAAGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 T 10 9 308020 CASAVA_Build 2 170858735 2I AATTTCGTTC --/TT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 T 8 10 308021 CASAVA_Build 2 170859725 2D TTAAACATAA TT/-- CTCACCATGC 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 T 2 0 308022 CASAVA_Build 2 170860129 1I ATTGTTTCTC -/T TTTTCCCCCA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 4 5 308023 CASAVA_Build 2 170862086 4D ACATGCACCC ACAG/---- ACAGTTAAGG 3070 het 2564 hom 26 9 12 6 ACAG 2 1 308024 CASAVA_Build 2 170864909 13D CACAGGGTAG ATTGTACTTACCT/------------- GTACCTTTGA 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 ATTGTACTTACCT 1 0 308025 CASAVA_Build 2 170871433 2D GCGTGTCCAT CC/-- CCACGTCAGA 3070 het 3070 ref 54 31 22 2 C 4 2 308026 CASAVA_Build 2 170874476 1D TGTAGACATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 T 10 9 308027 CASAVA_Build 2 170880254 1D TAGAGGTGGG T/- TTTCACCAAG 3070 het 2351 hom 19 7 9 3 T 4 3 308028 CASAVA_Build 2 170882060 2I ACTACATAAG --/AC TCTGTTTCCC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 AC 0 1 308029 CASAVA_Build 2 170882224 2D GGGCTGTAAA CT/-- CTGTTTTGAA 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 CT 2 1 308030 CASAVA_Build 2 170883589 2D AATCTGTGTC AT/-- GTGTCGAAAT 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 AT 1 0 308031 CASAVA_Build 2 170891310 3D ATTGGCTCAG ACA/--- ACGAGCCACA 3070 het 3070 ref 57 32 22 4 ACA 1 0 308032 CASAVA_Build 2 170894160 1D CTATTGGGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 9 7 T 10 9 308033 CASAVA_Build 2 170895606 16D GTTGGAATTT GCTGATTTCCGAAAGA/---------------- GCTGTTCCAT 3070 het 3070 ref 40 25 20 4 GCTGATTTCCGAAAGA 1 0 308034 CASAVA_Build 2 170929051 1D ACTTTTTTTT A/- ACCCTAGCTC 3070 hom 96 het 41 0 32 9 A 2 1 308035 CASAVA_Build 2 170931783 2D GGAGGAAGGT AG/-- AGAGGCAGCT 3070 hom 148 het 52 0 50 4 AG 3 2 308036 CASAVA_Build 2 170938601 1D AAAAAAAAAA C/- TTAGCAAGGT 3070 het 809 hom 43 11 23 9 C 1 0 308037 CASAVA_Build 2 170942834 1I CTCAATAAAA -/T TTAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 2 3 308038 CASAVA_Build 2 170945039 2D GTAATGTGTG TA/-- GTTATGCAAA 3070 het 3070 ref 63 28 28 10 TA 1 0 308039 CASAVA_Build 2 170947543 1D TTGAGATGAG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 39 0 29 11 T 9 8 308040 CASAVA_Build 2 170964230 3D ACTCTATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1955 het 377 hom 9 1 5 3 A 15 12 308041 CASAVA_Build 2 170968031 1D TGTATCTCTT C/- TACTTTATTT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 C 1 0 308042 CASAVA_Build 2 170971445 4I TCTTCTTGAC ----/TCTT TCTTACTATT 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 TCTT 1 2 308043 CASAVA_Build 2 170972041 1D CACAGTGAAA C/- CCCATCTCTG 3070 het 480 hom 10 1 8 1 C 4 3 308044 CASAVA_Build 2 170975764 1D CACAGTGACA C/- CCCCCATCTC 3070 hom 48 het 20 0 15 5 C 6 5 308045 CASAVA_Build 2 170980933 5D TGAACCTGCT AACTC/----- AACTCTGCTT 3070 het 3070 ref 62 34 20 9 AACTC 2 1 308046 CASAVA_Build 2 170981380 9D TCCAAACTCC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTG 2861 het 2299 hom 26 10 8 10 T 18 9 308047 CASAVA_Build 2 170990836 1I TAATCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 800 hom 34 3 23 8 T 13 14 308048 CASAVA_Build 2 170991774 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 A 11 12 308049 CASAVA_Build 2 171002726 4D GAAATCTCTC TTTT/---- TAAGTATACA 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 T 5 1 308050 CASAVA_Build 2 171010746 1D TTACCAATGG A/- AAAATCACAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 5 4 308051 CASAVA_Build 2 171035808 1I TTGTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 26 0 18 8 T 10 11 308052 CASAVA_Build 2 171040830 1I TGTTCCCTGT -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 94 het 35 0 28 7 C 8 9 308053 CASAVA_Build 2 171060337 2I AACAGTTGCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 11 13 308054 CASAVA_Build 2 171062019 2D GGTAATAAAC TA/-- TTTTTTCGAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TA 1 0 308055 CASAVA_Build 2 171064298 6D CTATAAACTT TATTTA/------ TATCATTGTT 3070 hom 144 het 52 0 48 8 TATTTA 1 0 308056 CASAVA_Build 2 171065667 4D TATTAGTGTT ACAC/---- ACAACATTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AC 3 1 308057 CASAVA_Build 2 171065850 4I GGAGGAACAA ----/AGAG AGACATTATG 3070 hom 142 het 53 0 47 6 AG 1 3 308058 CASAVA_Build 2 171067357 6D TGTCCACTGT GGGTGC/------ GGGTGCCAGG 3070 hom 81 het 29 0 23 8 GGGTGC 2 1 308059 CASAVA_Build 2 171072505 1D GAAATGTCTA G/- GGGGAAAGCA 3070 hom 99 het 40 0 33 10 G 5 4 308060 CASAVA_Build 2 171073777 1D ACTGGGGGGG A/- AAAAAGTCTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 6 5 308061 CASAVA_Build 2 171074553 1I CTAAATATCA -/C CCAGATTTGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 2 3 308062 CASAVA_Build 2 171076985 1I AGGGCTGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 905 hom 35 2 29 4 A 10 11 308063 CASAVA_Build 2 171104380 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 24 1 13 10 T 13 12 308064 CASAVA_Build 2 171106852 2D CCAAAGTCAC AT/-- GTTTGTTGTG 3070 hom 66 het 30 0 22 8 AT 1 0 308065 CASAVA_Build 2 171115780 1D TCAGCCTCCT A/- AGTAACTGGG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 2 1 308066 CASAVA_Build 2 171116406 1D AAAGAAGACA G/- ATTATAGTTG 3070 hom 102 het 36 0 34 7 G 1 0 308067 CASAVA_Build 2 171116672 1I TGTAGCACTT -/C CCCCCTTCTC 3070 hom 87 het 34 0 28 6 C 5 6 308068 CASAVA_Build 2 171118333 3D CAGGCTTATA GGT/--- GGAAGGGACT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 GGT 1 0 308069 CASAVA_Build 2 171119808 4D CTTCTTTTTA TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 7 TGTT 3 2 308070 CASAVA_Build 2 171141865 1D TGGAACCATT G/- TTGCATCCCT 3070 hom 99 het 42 0 33 9 G 1 0 308071 CASAVA_Build 2 171145680 1I TCTCTTTTTT -/A ATTGTCATTT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 1 2 308072 CASAVA_Build 2 171175025 1D GAACCCCGGA G/- GGTGGAGCTT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 G 3 2 308073 CASAVA_Build 2 171202372 4I ATTTTATGCA ----/TTAT TTATTTCCGT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TTAT 1 2 308074 CASAVA_Build 2 171216737 1D CCCTTTGATC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 8 7 308075 CASAVA_Build 2 171224610 1I TACTTTTTTT -/C TTTTTTTGAG 3070 het 831 hom 18 5 9 4 C 0 1 308076 CASAVA_Build 2 171240589 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 761 het 761 ref 21 12 3 8 A 12 11 308077 CASAVA_Build 2 171247441 6D TCTTAGCAAC GCTTAG/------ CAAAGCACCT 3070 het 3070 hom 46 21 24 2 GCTTAG 1 0 308078 CASAVA_Build 2 171249378 2D CTCAAAAAAA AT/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1973 hom 27 6 18 4 AT 1 0 308079 CASAVA_Build 2 171249685 1D TAAATTTTGG C/- CTATAAATTT 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 C 2 1 308080 CASAVA_Build 2 171252608 4D AACAAACAAA CAAG/---- CAAACACTGG 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 CAAG 1 0 308081 CASAVA_Build 2 171253204 1I TGTTGTGGCC -/G GGTACGGTGG 3070 het 2603 hom 21 9 9 3 G 2 3 308082 CASAVA_Build 2 171256862 3D TTTCCAACAC AAT/--- AATAATAAGC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AAT 3 2 308083 CASAVA_Build 2 171266419 2I AACAGCCATT --/TC AATGTGCTCA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TC 0 1 308084 CASAVA_Build 2 171276439 1D TTAAAAAATC T/- AGCTTGAGAG 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 T 1 0 308085 CASAVA_Build 2 171288647 1D AATAGGGTCA T/- TTAGGTAGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 3 2 308086 CASAVA_Build 2 171288762 1D TTGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 274 hom 29 2 17 10 T 11 10 308087 CASAVA_Build 2 171290077 1I GATCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 23 1 17 5 A 12 13 308088 CASAVA_Build 2 171290883 2I GATTCTATGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 12 14 308089 CASAVA_Build 2 171293822 1I TACCACACCC -/T TGTGATGCAC 3070 hom 157 het 59 0 53 6 T 1 2 308090 CASAVA_Build 2 171295829 1I ACCTCTGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 127 hom 36 1 26 9 A 12 13 308091 CASAVA_Build 2 171300115 4D CCCTGAAAAA CTAT/---- CTATCTCTGT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 CTAT 2 1 308092 CASAVA_Build 2 171302040 1I GCTTCCCTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 108 het 48 0 37 11 T 7 8 308093 CASAVA_Build 2 171306857 1I GTATTCAAGC -/A AACAGCAAGG 3070 hom 153 het 56 0 51 5 A 2 3 308094 CASAVA_Build 2 171311892 1D TAAAAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 12 11 308095 CASAVA_Build 2 171314659 1I AGGATGGGGG -/A AACCACCCCA 3070 hom 68 het 32 0 23 9 A 2 3 308096 CASAVA_Build 2 171322762 5I GGAAGAAAAT -----/AAAAG AGAAAATCTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 AAAAG 0 1 308097 CASAVA_Build 2 171322944 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 23 het 11 0 8 3 A 9 8 308098 CASAVA_Build 2 171326189 1D ATGGGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 26 0 22 7 A 12 11 308099 CASAVA_Build 2 171326964 1D TCTAAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 25 1 21 3 T 12 11 308100 CASAVA_Build 2 171328965 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 21 1 11 9 A 17 16 308101 CASAVA_Build 2 171331998 1D TACTCAACAA T/- TTTTTTTTTT 2334 het 605 hom 25 3 11 11 T 19 18 308102 CASAVA_Build 2 171339321 4D GAGCCCCATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 24 0 21 3 T 19 15 308103 CASAVA_Build 2 171339894 6I AGGACTGCTC ------/TAAATA TAAAGGTGGG 3070 hom 64 het 29 0 19 10 TAAATA 0 1 308104 CASAVA_Build 2 171340632 2I AAATAAAAAC --/TT AATACGAAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 2 308105 CASAVA_Build 2 171341522 1D AGAGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 25 2 20 3 T 13 12 308106 CASAVA_Build 2 171342594 1D AATTGTTACT A/- TAGATAGAAG 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 1 0 308107 CASAVA_Build 2 171347888 4D TTAAAAATAA AAAT/---- AAATAAAAAT 3070 hom 21 het 12 0 8 4 AAAT 2 1 308108 CASAVA_Build 2 171350348 4D GTAACAAAAG TTAT/---- TTATTAAGTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TTAT 2 1 308109 CASAVA_Build 2 171350885 1D TGGATCATAG C/- TTTCTGTAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 C 1 0 308110 CASAVA_Build 2 171351069 1D ATTGCCAAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 10 9 308111 CASAVA_Build 2 171353697 4D ATTCTTCTTC TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 TTCT 5 4 308112 CASAVA_Build 2 171364340 11D GAGAATGTAA CACCCATGAAG/----------- CAGAACTTTA 3070 hom 81 het 28 0 28 3 CACCCATGAAG 1 0 308113 CASAVA_Build 2 171384048 4D CATCTCAGAG AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 42 het 22 0 14 8 AAAT 6 5 308114 CASAVA_Build 2 171392979 14D TCCTCACCCC TCCTCTTTCTGCTG/-------------- TCCTCACCCC 1985 hom 27 het 14 0 6 12 TCCTCTTTCTGCTG 1 0 308115 CASAVA_Build 2 171399208 5D ATAAATTAAT AAAAG/----- ACTTCTTTTA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 AAAAG 1 0 308116 CASAVA_Build 2 171426688 4D CAATATTCTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 54 het 26 0 19 8 TG 11 9 308117 CASAVA_Build 2 171428106 1I AGTAGAGGGG -/A AATTTCTGTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 2 3 308118 CASAVA_Build 2 171428917 2D ACACCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 13 11 308119 CASAVA_Build 2 171440584 2I CCCTGACATT --/GG GTTCTTTCAT 3070 hom 104 het 43 0 33 10 G 1 3 308120 CASAVA_Build 2 171442808 1D CATGCCCAGC T/- GGACTTTCTT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 1 0 308121 CASAVA_Build 2 171443168 1I11M2D GACAGTTATT -ATAAGAACTGGCT/AATAAGAACTGG-- CTGAAGTTTA 3070 hom 129 het 42 0 44 4 N/A 0 0 308122 CASAVA_Build 2 171452131 3I ATTGAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 AAG 5 6 308123 CASAVA_Build 2 171462354 1I ATTTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 2965 het 2581 hom 20 6 8 6 T 11 12 308124 CASAVA_Build 2 171462969 1D TCAAAAAAAA T/- GTTTTTTTTT 1780 het 1780 ref 13 6 5 2 T 1 0 308125 CASAVA_Build 2 171463417 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 21 1 15 5 A 12 13 308126 CASAVA_Build 2 171464233 1I TAGCTGACAC -/T TTTTTTTTTT 2299 het 939 hom 25 3 8 14 T 15 16 308127 CASAVA_Build 2 171471147 1I AATTTATCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 298 hom 31 2 26 3 T 9 10 308128 CASAVA_Build 2 171477082 1D ATTTCTTCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 308129 CASAVA_Build 2 171478379 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 659 hom 26 2 19 5 T 11 12 308130 CASAVA_Build 2 171498464 5D TTCCACACTT AAAAG/----- AGATGGGGAA 3070 hom 105 het 37 0 36 3 AAAAG 1 0 308131 CASAVA_Build 2 171498743 1I AATTACTTCT -/A ATAGAAAATG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 1 2 308132 CASAVA_Build 2 171504763 3D GGAGAGTGTT AGA/--- AGAGATGATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AGA 2 1 308133 CASAVA_Build 2 171521499 3D CCACGTCTCT AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 20 0 20 1 A 12 9 308134 CASAVA_Build 2 171532065 1D GCCCAGTACC A/- GCCAGTTTTG 3070 hom 67 het 25 0 20 7 A 1 0 308135 CASAVA_Build 2 171532909 4D ACACGATGTA AGAG/---- AGAGTTTCCC 3070 hom 102 het 38 0 33 9 AG 4 2 308136 CASAVA_Build 2 171540226 4D TGGGGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 77 het 29 0 25 4 TTTG 3 2 308137 CASAVA_Build 2 171541276 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 12 0 11 4 A 12 11 308138 CASAVA_Build 2 171542129 5D ACTCCGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 13 8 308139 CASAVA_Build 2 171548509 4D CTCTTTCCTT AAAC/---- AAACACAAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AAAC 2 1 308140 CASAVA_Build 2 171554018 4I TTTCTTAAAA ----/TAAT TAATTAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TAAT 1 2 308141 CASAVA_Build 2 171555762 1I GTGAGTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 A 14 15 308142 CASAVA_Build 2 171556656 1D CCATGTAGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 107 hom 43 1 32 10 T 10 9 308143 CASAVA_Build 2 171569529 1I TTTTGTTGTT -/A AAAAAAAAAA 1194 het 1194 ref 44 34 3 7 A 11 12 308144 CASAVA_Build 2 171573595 1D CAAAAGTCCT C/- ACCTATGAGG 3070 hom 102 het 37 0 35 3 C 1 0 308145 CASAVA_Build 2 171575382 1D CATAAAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 39 0 28 12 A 15 14 308146 CASAVA_Build 2 171586025 1D ATATCTGGCA C/- ACTTGTCTTA 3070 hom 69 het 27 0 23 5 C 1 0 308147 CASAVA_Build 2 171593709 3I GAGAGGTGAC ---/CTT CATCTAAATA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CTT 0 1 308148 CASAVA_Build 2 171595071 1D CTTAAGAGCC A/- AAAAAATTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 7 6 308149 CASAVA_Build 2 171595775 1I TTACAATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 29 2 18 9 A 14 15 308150 CASAVA_Build 2 171600098 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 12 10 308151 CASAVA_Build 2 171612946 13D CTCAGGTGAT CCTCCCAACTCGG/------------- CCTCCCAAAG 3070 hom 47 het 16 0 15 5 CCTCCCAACTCGG 1 0 308152 CASAVA_Build 2 171613383 6D TGCAGAATTG AAACCC/------ AAACTCTCTA 3070 het 728 hom 28 5 22 5 AAACCC 1 0 308153 CASAVA_Build 2 171615324 4D TGAGTTTTCC TCTA/---- TCTCTTATAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 TCTA 1 0 308154 CASAVA_Build 2 171621454 2D GGTCCAGAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 44 2 37 5 A 12 10 308155 CASAVA_Build 2 171632083 1I ACCCAGCTTG -/T TTTTTTTTGT 2618 hom 23 het 11 0 8 3 T 8 9 308156 CASAVA_Build 2 171632370 1I CCAATACAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 9 10 308157 CASAVA_Build 2 171635007 26D ATTTTGATAC AGTTGTTACAAACAACTGTAACACAA/-------------------------- AGGTGTTACA 3070 hom 60 het 18 0 21 3 AGTTGTTACAAACAACTGTAACACAA 1 0 308158 CASAVA_Build 2 171638638 2I TCCCCCCCCC --/CG CCTCCTTTTT 3070 hom 37 het 15 0 11 4 CG 0 1 308159 CASAVA_Build 2 171658416 1D TGAAACCATT A/- AAAAAAAAAA 1135 het 1135 ref 47 37 3 8 A 12 11 308160 CASAVA_Build 2 171720193 1I TCCTCAGAGG -/A AAAAGCACAA 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 A 4 5 308161 CASAVA_Build 2 171764267 3D AGACCTGGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 41 0 30 11 A 15 12 308162 CASAVA_Build 2 171765638 2D AGATCCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 991 het 67 hom 19 1 7 11 T 18 16 308163 CASAVA_Build 2 171773120 1I AATCATTGAA -/G GGATTTTAAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 G 2 3 308164 CASAVA_Build 2 171776312 1D AAATGGATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 T 11 10 308165 CASAVA_Build 2 171777417 1I TCTTAACTGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 308166 CASAVA_Build 2 171777658 2I GTTTTTTTTT --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 10 308167 CASAVA_Build 2 171780081 1I TCATAGGAAA -/C GAGGATGGCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 0 1 308168 CASAVA_Build 2 171780191 3D1M4I GGGAATCAAG TCTG----/---GGAAC CATTCAGGCT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 N/A 0 0 308169 CASAVA_Build 2 171812095 3I AGCTAATAAA ---/CAC CACAACATCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CAC 1 2 308170 CASAVA_Build 2 171813080 6D AGTAAAGAGG AAGTCA/------ AAGTGGAAAG 3070 het 3070 hom 49 20 28 6 AAGTCA 1 0 308171 CASAVA_Build 2 171822932 1D TGAAACTGAT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 8 7 308172 CASAVA_Build 2 171843411 1D CAGCCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 A 11 10 308173 CASAVA_Build 2 171844061 1I TTACTACCAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 8 9 308174 CASAVA_Build 2 171844378 3I TGCGTATTTT ---/TCA TCATGTTTAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TCA 1 2 308175 CASAVA_Build 2 171849810 4D CAGCTTTAGG TCTC/---- TCTAAGAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 TC 3 1 308176 CASAVA_Build 2 171856425 1I ATTTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 744 hom 28 2 19 7 A 12 13 308177 CASAVA_Build 2 171865552 1I TTCATACATT -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 6 7 308178 CASAVA_Build 2 171866108 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 48 het 18 0 17 3 A 10 9 308179 CASAVA_Build 2 171866792 4D TGTACAGAGG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 34 11 20 5 AAAC 3 2 308180 CASAVA_Build 2 171869911 2I AAACAAACAA --/AC AAAAAAAACA 3070 het 434 hom 14 3 9 2 AC 0 1 308181 CASAVA_Build 2 171890397 1I TTTAAAGCAG -/T TTTAACTGGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 3 4 308182 CASAVA_Build 2 171897787 3D3M3D ATGGAATTTA TTTAGCTAA/---AGC--- ATAAATATGC 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 N/A 0 0 308183 CASAVA_Build 2 171919620 1I ATTTGTCTAA -/T TTTTTTTTTC 2868 het 2868 ref 16 8 6 2 T 9 10 308184 CASAVA_Build 2 171951884 4I GATACAGAAA ----/GCCT TCTGTCTTTA 3070 hom 123 het 44 0 38 6 GCCT 0 1 308185 CASAVA_Build 2 171966598 1I GTCTATCTCT -/G GACTTCTTGC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 1 2 308186 CASAVA_Build 2 171983778 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1287 het 1287 ref 42 28 4 10 A 15 14 308187 CASAVA_Build 2 171986206 1D26M2D ACCTTACTTC AAAAAAAAAATACATACACACATCCATAC/-AAAAAAAAATACATACACACATCCAT-- ACACACACAC 3070 hom 62 het 43 1 34 16 N/A 0 0 308188 CASAVA_Build 2 171996591 1D CTAAAAGAGC T/- GTTAGCATGC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 1 0 308189 CASAVA_Build 2 171998058 3D TTATTTTTTC TCA/--- TCAAGTTATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 TCA 2 1 308190 CASAVA_Build 2 172008106 1I TAATCTTGTT -/A TTTTTTTATA 2395 het 2395 ref 26 16 8 2 A 0 1 308191 CASAVA_Build 2 172013186 3I ATAAAATAAT ---/AAC TAATTCATAA 3070 het 2993 hom 26 8 16 2 AAC 0 1 308192 CASAVA_Build 2 172013422 1I TTTATATCTC -/T TCTTTTTTTT 2963 het 2963 ref 32 18 11 3 T 1 2 308193 CASAVA_Build 2 172019887 7D TTCCCTCCTC CCACCCT/------- CCACCCTCCA 3070 het 2674 hom 23 8 10 9 CCACCCT 3 2 308194 CASAVA_Build 2 172022891 1D TAAAGTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 21 5 T 11 10 308195 CASAVA_Build 2 172031346 3I TTTCATTGAG ---/AAT AATATTAGAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAT 1 2 308196 CASAVA_Build 2 172031708 1I CATGCCTTTT -/G TCCCTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 G 0 1 308197 CASAVA_Build 2 172031978 1D TGCCACAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 10 9 308198 CASAVA_Build 2 172032492 1I TCAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 32 5 13 14 C 0 1 308199 CASAVA_Build 2 172038322 1I CTATAAAGCA -/T TCAAACGCAG 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 T 1 2 308200 CASAVA_Build 2 172038380 1D TTGGGTTATT A/- ACTCCTGTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 A 2 1 308201 CASAVA_Build 2 172040906 1D TCTGCTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 11 10 308202 CASAVA_Build 2 172042210 1I TTTTAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 10 11 308203 CASAVA_Build 2 172050931 1I TTGGCTACAC -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 70 het 30 0 23 7 T 7 8 308204 CASAVA_Build 2 172051483 3I CCCAAGACAA ---/CCT CCTCGGATCT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 CCT 1 2 308205 CASAVA_Build 2 172051756 4I CGAGGTATAA ----/TTCT TTGTATGGAC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TTCT 0 1 308206 CASAVA_Build 2 172059974 1D CTCTATCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 36 1 20 15 A 13 12 308207 CASAVA_Build 2 172060854 1D AAAATTAGCC T/- GGCGTGGTGG 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 1 0 308208 CASAVA_Build 2 172061932 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 958 hom 31 6 12 13 A 17 16 308209 CASAVA_Build 2 172063372 9I CTGTTTTGTA ---------/GTTGTTGTT GTTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 GTT 3 6 308210 CASAVA_Build 2 172074617 4D TATAAAATTG AACT/---- AACTATCTTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 4 AACT 2 1 308211 CASAVA_Build 2 172081519 1D AGTGGTGAAG A/- ACCAGGGACA 3070 het 3070 ref 53 28 20 5 A 2 1 308212 CASAVA_Build 2 172082725 2D TTTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 26 3 20 3 T 25 23 308213 CASAVA_Build 2 172085553 7D TTACTGGGTT TTTTTTG/------- TTTTTTGTTT 3070 hom 69 het 33 0 23 11 TTTTTTG 3 2 308214 CASAVA_Build 2 172088490 2I TAGTGCCTCT --/CA CAATGTCCTG 3070 hom 93 het 33 0 30 3 CA 1 2 308215 CASAVA_Build 2 172088932 19D AGGCTTCCCT GGTGTGAGATCGGCATCAG/------------------- GGTGTGAGAT 3070 hom 119 het 52 0 39 20 GGTGTGAGATCGGCATCAG 2 1 308216 CASAVA_Build 2 172092851 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 8 9 308217 CASAVA_Build 2 172093268 1D GCTGGTTCTT C/- CTCATCTTCC 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 C 2 1 308218 CASAVA_Build 2 172098527 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2771 het 2771 ref 26 12 11 3 T 17 16 308219 CASAVA_Build 2 172112866 2D TGGTTAGATT TA/-- TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 31 9 20 3 TA 1 0 308220 CASAVA_Build 2 172115620 2D GGAATGAGAA AT/-- ATATGTTTCT 3070 het 3070 hom 39 15 19 6 AT 3 2 308221 CASAVA_Build 2 172117631 3I TTAGTGATTT ---/AAA AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 6 9 308222 CASAVA_Build 2 172118037 1D ATTGCTTTTT A/- AATAATTTAA 3070 het 3070 hom 46 14 27 7 A 3 2 308223 CASAVA_Build 2 172121083 1D TATTTTGAGC T/- TTGGGTTCTC 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 T 3 2 308224 CASAVA_Build 2 172124547 1D TTAAGACAAA T/- TTCTGCCCTG 2920 het 2920 ref 28 17 8 3 T 3 2 308225 CASAVA_Build 2 172125977 16D TGTATATATA TTTACCCTTTTTCCTT/---------------- TTTACCCTTT 2197 het 2197 ref 16 14 7 1 TTTACCCTTTTTCCTT 2 1 308226 CASAVA_Build 2 172126642 3I TGGTTAGGGC ---/CTT CTTTAGGGCC 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 CTT 1 2 308227 CASAVA_Build 2 172134077 1D CATGGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 512 hom 36 2 26 8 T 11 10 308228 CASAVA_Build 2 172136041 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 20 0 13 7 T 9 10 308229 CASAVA_Build 2 172136113 1D CTCACTACAG C/- CTTGACTTCC 3070 het 3070 ref 42 24 16 4 C 2 1 308230 CASAVA_Build 2 172136507 3I GGCAAAAAGG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 11 14 308231 CASAVA_Build 2 172164482 2D TTCATCCAAC CT/-- TCCCTCCTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 CT 1 0 308232 CASAVA_Build 2 172175999 1D TGGCACCTTT C/- CCCCTCCTTC 3070 het 3070 hom 47 15 24 9 C 5 4 308233 CASAVA_Build 2 172181946 1D TCAACTATTA T/- TTATACTCAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 3 2 308234 CASAVA_Build 2 172189274 1D CTACCCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1422 hom 26 7 14 7 T 12 11 308235 CASAVA_Build 2 172189435 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2736 het 1517 hom 21 6 8 7 T 12 13 308236 CASAVA_Build 2 172191129 1I AGCAGGAGCT -/G GAAACAGGCA 3070 hom 61 het 26 0 19 7 G 1 2 308237 CASAVA_Build 2 172196950 1I GGCCGCAGTG -/C CTCACATCTG 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 1 2 308238 CASAVA_Build 2 172206032 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2683 hom 19 7 8 4 T 8 9 308239 CASAVA_Build 2 172215242 1D TTGGTTTTTA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 7 6 308240 CASAVA_Build 2 172216575 7I TTTTTATTCC -------/TTTTTCT TTTTTCTCCT 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 TTTTTCT 1 2 308241 CASAVA_Build 2 172217307 3D ACCCCTGGGG CCA/--- CCACCACTGG 2258 het 2258 ref 23 11 7 9 CCA 3 2 308242 CASAVA_Build 2 172219590 1I GCTTTTCCTT -/G GACAACAGGG 2700 het 2700 ref 28 16 7 5 G 1 2 308243 CASAVA_Build 2 172223787 1I ATAAAAGTTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 8 9 308244 CASAVA_Build 2 172227267 1I TTGAGCAGTA -/C CCCCTCACAC 919 het 919 ref 31 16 4 11 C 4 5 308245 CASAVA_Build 2 172234475 1I AGGGAGAGGG -/A AAAACTAAGA 3070 hom 94 het 36 0 31 5 A 4 5 308246 CASAVA_Build 2 172250203 1I AAATGAATCT -/G GGGGGGCAAA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 G 6 7 308247 CASAVA_Build 2 172267320 4I AATGTACTCC ----/TTAT TTATTAAATA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TTAT 1 2 308248 CASAVA_Build 2 172269089 1D ATGGTTTAGC T/- TTTTTTTTTT 2993 het 2035 hom 36 12 11 13 T 13 12 308249 CASAVA_Build 2 172277381 1D TTGTTTTCGA T/- TTTTTTTTTT 1618 het 1618 ref 51 38 4 9 T 12 11 308250 CASAVA_Build 2 172278197 1I TGTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 13 14 T 10 11 308251 CASAVA_Build 2 172281661 1D GACTCCGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 13 12 308252 CASAVA_Build 2 172283968 1D AGCTATCCTT A/- ACCCTTTGGA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 A 2 1 308253 CASAVA_Build 2 172290528 4I ATTCCTTTTA ----/TTAC TTATGTATTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTAC 0 1 308254 CASAVA_Build 2 172296555 1D ACCTTGAACT G/- GGAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 36 20 12 6 G 3 2 308255 CASAVA_Build 2 172314599 2D TAATAGCAAA AG/-- AGAAAGTATT 3070 het 3070 hom 40 13 21 7 AG 2 1 308256 CASAVA_Build 2 172322785 10I TATTCTCTGA ----------/TGGTAGTTTG TGGTAGTTTG 2867 het 2867 ref 15 8 6 1 TGGTAGTTTG 1 2 308257 CASAVA_Build 2 172326577 1D TCCTGGGTAA G/- GCAACGCCCC 3070 hom 50 het 19 0 17 2 G 2 1 308258 CASAVA_Build 2 172356846 1D CCCATGTCCT A/- AATAGCAGAC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 3 2 308259 CASAVA_Build 2 172359347 1D ACTAGTAGAG A/- AAAAAAAAAA 1387 het 1387 ref 35 25 3 7 A 12 11 308260 CASAVA_Build 2 172369871 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 12 11 308261 CASAVA_Build 2 172375467 12I ACCCAGATTT ------------/TGCCACAAACTA TGCTACCTAC 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TGCCACAAACTA 0 1 308262 CASAVA_Build 2 172377376 1I CAAAGACAAC -/G GGGGGGTGGG 2804 het 1779 hom 25 5 13 7 G 6 7 308263 CASAVA_Build 2 172377556 1I AGGGTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2687 het 747 hom 23 3 10 10 T 17 18 308264 CASAVA_Build 2 172389435 1I14M2D TAATTTTATT -AAAAATTTTTCACATT/AAAAAATTTTTCACA-- CTTTCCTTTT 3070 het 3070 ref 15 8 7 1 N/A 0 0 308265 CASAVA_Build 2 172391708 1I ATCTTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 14 11 A 11 12 308266 CASAVA_Build 2 172392059 1D TGAGGGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 11 15 15 T 13 12 308267 CASAVA_Build 2 172396655 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1700 het 1700 ref 26 15 4 7 A 13 14 308268 CASAVA_Build 2 172401649 1I CGGGAAAAGA -/T TAACTCACCA 3070 het 3070 ref 50 27 21 2 T 1 2 308269 CASAVA_Build 2 172403236 2I CTCCCTGTCT --/TA TATATCTTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TA 2 3 308270 CASAVA_Build 2 172408188 1I CCAGGAGTTC -/A AGACCAGCCT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 1 2 308271 CASAVA_Build 2 172419323 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 A 9 10 308272 CASAVA_Build 2 172420132 4I TTCAGAGAAC ----/ACTA ACTAATTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ACTA 1 2 308273 CASAVA_Build 2 172420271 1D ATTGTTTCAT G/- TTGTTCAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 G 1 0 308274 CASAVA_Build 2 172420354 1I TTAGGAATGT -/G AAAGTGTCAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 0 1 308275 CASAVA_Build 2 172421512 1D TAAACAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 A 11 10 308276 CASAVA_Build 2 172424523 1D GATACAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 39 hom 32 2 20 10 T 12 11 308277 CASAVA_Build 2 172426160 4D GTTCCAGAAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 37 18 12 9 TTTA 4 3 308278 CASAVA_Build 2 172427631 4D GGTAGAAAAT AGAA/---- AGAGGGAGAA 3070 het 3070 hom 52 17 34 2 AGAA 1 0 308279 CASAVA_Build 2 172443154 2D GAAATAGTTA CT/-- GTAAAATGCT 3070 het 3070 ref 48 23 21 5 CT 1 0 308280 CASAVA_Build 2 172457488 1I TAAAATCCCC -/A AAGGCTTAAG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 2 3 308281 CASAVA_Build 2 172457739 1I TAAGTCATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 10 11 308282 CASAVA_Build 2 172462502 1D CAGAAATATA T/- AACTGGGAGA 3070 het 3070 hom 29 10 15 6 T 1 0 308283 CASAVA_Build 2 172465710 1D AATGATCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 10 4 A 13 12 308284 CASAVA_Build 2 172481976 9I TGGTGAAACC ---------/TCATCTCTA CTAAAATTAC 3041 het 1819 hom 14 5 7 2 TCATCTCTA 0 1 308285 CASAVA_Build 2 172487936 3D TTACAACATT TAA/--- TAATGTATAA 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 TAA 2 1 308286 CASAVA_Build 2 172489777 1D TAGTTTATAA G/- CCTGTATCTC 3070 het 2808 hom 17 6 11 0 G 1 0 308287 CASAVA_Build 2 172508909 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1961 hom 34 8 17 10 A 15 14 308288 CASAVA_Build 2 172510264 2D CTATCTATAA TT/-- TTTTTTTTTT 1851 het 213 hom 16 2 6 8 T 20 18 308289 CASAVA_Build 2 172516438 1I TTCCAGTGAT -/C CCCCCCCGCC 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 C 7 8 308290 CASAVA_Build 2 172521284 4D TGTCTCCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 96 het 44 0 32 14 AAAC 5 4 308291 CASAVA_Build 2 172526349 4I AAATCCTACA ----/TACT TCCAGAAATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TACT 0 1 308292 CASAVA_Build 2 172529605 1I AATATGTATA -/T TTTTAAGTTA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 4 5 308293 CASAVA_Build 2 172536970 1D TTTTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 868 hom 31 3 21 7 T 12 11 308294 CASAVA_Build 2 172539860 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1644 het 665 hom 27 4 9 14 T 17 16 308295 CASAVA_Build 2 172551735 4D CATCCTTCTC TGAG/---- TCAGTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 TGAG 1 0 308296 CASAVA_Build 2 172552966 5D AACTCCATCT GAAAA/----- GAAAAGAAAA 1672 het 1672 ref 20 6 4 11 GAAAA 5 4 308297 CASAVA_Build 2 172557175 4D TCCCACTTGT TAAG/---- TAAGAACATA 3070 het 3070 ref 47 33 9 8 TAAG 2 1 308298 CASAVA_Build 2 172569973 4I TATTACAAAC ----/TATA TACAAATTTA 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 TA 1 3 308299 CASAVA_Build 2 172578086 1I TCTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 10 11 308300 CASAVA_Build 2 172579341 1D ATAGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 20 2 9 9 T 13 12 308301 CASAVA_Build 2 172581863 1D ATATCTTTTT G/- CACTGTGCTC 3070 het 3070 ref 45 26 15 5 G 1 0 308302 CASAVA_Build 2 172590792 2D GATAGTCTTC AA/-- AGATTAACAG 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 A 3 1 308303 CASAVA_Build 2 172612832 1I ACTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTG 2825 het 232 hom 15 2 9 4 G 0 1 308304 CASAVA_Build 2 172616092 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTTT 329 het 329 ref 7 1 2 4 A 0 1 308305 CASAVA_Build 2 172617871 1D TCAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 1 0 308306 CASAVA_Build 2 172623409 1I ACTATATCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 9 10 308307 CASAVA_Build 2 172624045 5I TATAAAGATG -----/AATTT AATTTAAATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AATTT 1 2 308308 CASAVA_Build 2 172628252 1I TGTTGTAACA -/T TTGGTGGTAG 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 T 2 3 308309 CASAVA_Build 2 172630910 1D TTGTGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 1793 het 1793 ref 26 14 5 7 T 15 14 308310 CASAVA_Build 2 172632086 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1329 het 1329 ref 16 9 3 4 T 13 12 308311 CASAVA_Build 2 172634945 1D TGTTTTAGAG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 57 het 26 0 20 7 A 8 7 308312 CASAVA_Build 2 172649160 1I CTCTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 A 10 11 308313 CASAVA_Build 2 172649294 1D CTGTTCCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 31 2 25 4 A 13 12 308314 CASAVA_Build 2 172655687 2D GGACAAATGG GA/-- GAGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 GA 2 1 308315 CASAVA_Build 2 172668579 2D GAACTCCCGC GG/-- GGGGGGAAGG 3070 hom 41 het 19 0 10 9 G 8 6 308316 CASAVA_Build 2 172688601 1D CAACTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 11 10 308317 CASAVA_Build 2 172694358 1D TGGGATTACA G/- GTGTGTGCCA 3070 hom 66 het 23 0 20 3 G 2 1 308318 CASAVA_Build 2 172702474 1I GGGTTGACAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 8 9 308319 CASAVA_Build 2 172710460 1I AAGCCTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 10 11 308320 CASAVA_Build 2 172731680 1I GTGATTATGG -/A GGGAAGCAGA 3070 hom 98 het 37 0 27 10 A 0 1 308321 CASAVA_Build 2 172738288 3I CACCAAACAG ---/GCT GCTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 54 24 24 6 GCT 1 2 308322 CASAVA_Build 2 172749131 1I AATTTTTATA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 6 7 308323 CASAVA_Build 2 172749681 1D CTATTTCTAA T/- TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 T 8 7 308324 CASAVA_Build 2 172750634 1D AATTTTCGTG T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 8 7 308325 CASAVA_Build 2 172752752 8D CCAGGCTGGA GTGCAGTG/-------- GTGCAGTGGT 2315 het 2315 ref 21 11 5 5 GTGCAGTG 3 2 308326 CASAVA_Build 2 172753364 2D TGCTCATATC CG/-- ATGTAATTCC 3070 het 3070 ref 49 22 19 9 CG 1 0 308327 CASAVA_Build 2 172755096 4I CCTGGGGTTC ----/TCTG TCTGGGACAC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 TCTG 1 2 308328 CASAVA_Build 2 172759471 3I TGTTGTTGTC ---/ATT GTTGTTGCTG 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 ATT 0 1 308329 CASAVA_Build 2 172759649 2D AATATATCTG TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 T 10 8 308330 CASAVA_Build 2 172767980 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 11 10 308331 CASAVA_Build 2 172771407 1I CTAAGTGCAG -/C CCTGGGGAGG 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 C 2 3 308332 CASAVA_Build 2 172771807 1D CAAAATTGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 18 19 9 A 10 9 308333 CASAVA_Build 2 172774702 1I ACATGTACAT -/A AAAAATCAAT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 5 6 308334 CASAVA_Build 2 172774821 4I ACAGTTGTGG ----/GTTA GTTAATTAAT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 GTTA 1 2 308335 CASAVA_Build 2 172776795 3I TTTTCTTTTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3033 het 1346 hom 21 5 9 7 T 13 16 308336 CASAVA_Build 2 172777677 1I TGTGCCCCCC -/T AAACCACGAT 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 T 0 1 308337 CASAVA_Build 2 172780415 1I TCTTCTTCTT -/A CTTATTTATT 83 het 83 ref 34 12 1 22 A 0 1 308338 CASAVA_Build 2 172791849 1I TTTGAGACAG -/T AGTCTTGGTC 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 T 0 1 308339 CASAVA_Build 2 172796359 6D TCTCTGAAAG AAAAAA/------ AAAAAAAGAA 321 het 321 ref 32 14 5 19 A 13 7 308340 CASAVA_Build 2 172815754 1D TTCTCAACTC T/- TTTTTTTTTT 1864 het 1864 ref 33 23 4 6 T 12 11 308341 CASAVA_Build 2 172816416 1D GAGGTGAACA T/- TTTTTTTTTT 738 het 738 ref 48 35 3 10 T 11 10 308342 CASAVA_Build 2 172823353 12D CTGCCATTAC AGCATCTGCCTA/------------ TGCCACAATC 3070 hom 164 het 54 0 48 13 AGCATCTGCCTA 1 0 308343 CASAVA_Build 2 172823698 2I GCCATCCCAT --/AG ATACCTCATT 3070 hom 156 het 55 0 49 6 AG 0 1 308344 CASAVA_Build 2 172826181 6I GGGTGCTCTC ------/TGTGTA TGTGTATGTG 3070 hom 112 het 48 0 38 10 TGTGTA 2 3 308345 CASAVA_Build 2 172830868 4D CATCTTAGAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 35 0 28 8 AAAC 5 4 308346 CASAVA_Build 2 172831220 2D TTTCTTGACA TT/-- TTTTTTTCAT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 T 9 7 308347 CASAVA_Build 2 172831396 1D GCTCCACCCC T/- CCGGGTTCAC 1798 hom 15 het 7 0 5 3 T 1 0 308348 CASAVA_Build 2 172833713 1I TGTATTGAAC -/A TGTACAGACT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 0 1 308349 CASAVA_Build 2 172837021 1D ATTTTGGGTG T/- TTAAAATAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 3 2 308350 CASAVA_Build 2 172837672 4I CGGTGTCACG ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TTTA 2 3 308351 CASAVA_Build 2 172842086 4I GCAACCTGAC ----/CTTT CTTTCTGGCT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 CTTT 1 2 308352 CASAVA_Build 2 172844748 1I GCACCCAGCT -/A AGATTTCTTA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 1 2 308353 CASAVA_Build 2 172846621 1D CTTTAGCTTT A/- AAAATGTATT 3070 het 3070 hom 20 8 9 4 A 5 4 308354 CASAVA_Build 2 172856286 57D3M1I CAGAGTAGGC ATAATTAATGAGGGTGTTATTTCAGGAACAATGATAGGGATTGTGAATAGTCAAGATTCA-/---------------------------------------------------------TCAT TTCTAGAATG 3070 het 3070 ref 24 25 10 3 N/A 0 0 308355 CASAVA_Build 2 172861990 2D TACACTATGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2223 hom 36 9 14 13 T 16 14 308356 CASAVA_Build 2 172868227 9D GACAAAAAAT GAGAGTATA/--------- GAGAGTATAT 3070 het 3070 ref 36 20 16 5 GAGAGTATA 2 1 308357 CASAVA_Build 2 172870425 8I AGGTGGGGAA --------/AATAACCT ACCGTCTCTA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 AATAACCT 0 1 308358 CASAVA_Build 2 172871422 2D CTACTGAAAC AT/-- ATGCCTGACT 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 AT 2 1 308359 CASAVA_Build 2 172875788 1D TCTAGTAATG T/- TAAACTAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 2 1 308360 CASAVA_Build 2 172876956 4I ATCTAGTAAG ----/TATT TATTAAGCAC 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 TATT 1 2 308361 CASAVA_Build 2 172880480 1I ATACCTGTGC -/T GGTCAAATGT 2614 het 2614 ref 40 15 7 18 T 0 1 308362 CASAVA_Build 2 172880665 14D TACATCCTGC TAATTTTTTATTTG/-------------- TAATTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 13 8 TAATTTTTTATTTG 1 0 308363 CASAVA_Build 2 172882329 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 946 hom 19 5 8 6 T 11 12 308364 CASAVA_Build 2 172883791 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 10 11 308365 CASAVA_Build 2 172894343 1I37M1D AAAATAAAAG -AAAAAAAAAGAATCTTTTCTTTGTCTTCCTTTTATTTA/AAAAAAAAAAGAATCTTTTCTTTGTCTTCCTTTTATTT- AAAAAAATCA 1670 hom 10 het 4 0 4 6 N/A 0 0 308366 CASAVA_Build 2 172896883 1I TTCAGATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 26 1 18 7 T 13 14 308367 CASAVA_Build 2 172905488 4D CCCTGTAAAT ACAC/---- ACACACACAC 176 het 176 ref 33 5 4 27 AC 8 6 308368 CASAVA_Build 2 172907120 4I ATTAATAAAA ----/TAAT AAATATGTAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TAAT 0 1 308369 CASAVA_Build 2 172922927 6D AAAAATAAAT AAATAA/------ AAATAAAACA 3070 het 3070 ref 27 13 14 0 AAATAA 2 1 308370 CASAVA_Build 2 172926686 11I TCTTGTGCTC -----------/TGGCCTCTGGT TGGCCCCTCG 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 TGGCCTCTGGT 0 1 308371 CASAVA_Build 2 172927019 1D TGTTGATGGC T/- TTTTTTTTTT 2085 het 233 hom 10 1 6 3 T 13 12 308372 CASAVA_Build 2 172927069 24D TGTTGATGGC TATATATATATATATATATATATA/------------------------ TATATATATA 1884 het 293 hom 10 1 5 4 TA 21 9 308373 CASAVA_Build 2 172930315 1I TTTTCATGTG -/T TTTTGCATGG 3070 het 3070 ref 51 30 18 3 T 4 5 308374 CASAVA_Build 2 172931396 1D GACCTTATTT G/- GAAGAAGGGT 2785 het 2785 ref 33 23 7 3 G 2 1 308375 CASAVA_Build 2 172946486 1D TCTTCCTGGA C/- CCCCCTCCAG 3070 hom 88 het 36 0 28 8 C 6 5 308376 CASAVA_Build 2 172948570 4D GTTATTTGAC CATT/---- CATTCAAAAA 3070 hom 135 het 51 0 46 8 CATT 2 1 308377 CASAVA_Build 2 172959691 2D CCTCAGATTT AC/-- ACAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 AC 2 1 308378 CASAVA_Build 2 172973201 1I TGAATTGGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 T 9 10 308379 CASAVA_Build 2 172979150 1I AAGTGTTTCC -/T TTTTCTCTGC 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 T 4 5 308380 CASAVA_Build 2 172979795 1I CATTCCTAAT -/A AAAAAAAAAA 2668 het 2668 ref 34 14 10 10 A 10 11 308381 CASAVA_Build 2 172990457 11D GGTTTTGTCG GTGCTCTTCTC/----------- CCCACCAACA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 GTGCTCTTCTC 1 0 308382 CASAVA_Build 2 172995544 1D AAGCAATGAA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 T 7 6 308383 CASAVA_Build 2 172996025 1I AAAATGTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 22 8 T 10 11 308384 CASAVA_Build 2 172996862 9D CAGGCATGAG CCACCACGT/--------- CCGGCCTAAT 3070 het 3070 hom 27 11 16 2 CCACCACGT 1 0 308385 CASAVA_Build 2 173011731 2D TGTAGCTCTC TT/-- ATCTTTTCAG 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 T 2 0 308386 CASAVA_Build 2 173014042 1D CCCTGCTTCC T/- TTAGACCCAT 3070 het 3070 hom 47 15 26 7 T 3 2 308387 CASAVA_Build 2 173027066 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1528 het 593 hom 15 4 6 5 T 12 11 308388 CASAVA_Build 2 173037919 1D AACTGGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 16 10 A 12 11 308389 CASAVA_Build 2 173040937 3D AAGAAAAAAA AAG/--- AAGAAGTAAT 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 AAG 3 2 308390 CASAVA_Build 2 173055585 18D CACCTCCCAT ACTTTTGCTGTGAGGGGC/------------------ ACTTTTGCTG 3070 het 3070 ref 34 18 11 13 ACTTTTGCTGTGAGGGGC 2 1 308391 CASAVA_Build 2 173061247 1I AAAGCTGACA -/T TATACTAGGT 3070 het 3070 hom 55 18 31 6 T 1 2 308392 CASAVA_Build 2 173066055 1D AATTTTTCAG T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 8 7 308393 CASAVA_Build 2 173072915 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTGAAG 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 7 6 308394 CASAVA_Build 2 173078936 1I CTGTGTTACT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 54 23 24 7 A 8 9 308395 CASAVA_Build 2 173079637 4D TTCTTCAGCA AAAG/---- AAAGATTTTA 3070 het 3070 hom 25 11 14 1 AAAG 2 1 308396 CASAVA_Build 2 173079867 4D CCTGAATAAA TGTC/---- TGTCTAATAT 3070 het 2823 hom 21 7 9 5 TGTC 2 1 308397 CASAVA_Build 2 173083239 1I ATAGAACCAT -/A AAATCTTAAA 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 A 3 4 308398 CASAVA_Build 2 173098701 1D CTGCATTCCC A/- GGGGAGGTCT 3070 het 3070 ref 28 13 9 7 A 1 0 308399 CASAVA_Build 2 173108106 1D ACTTAATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 15 20 14 T 12 11 308400 CASAVA_Build 2 173108933 1D AACTCCTTTG A/- AAAAAAAAAA 2865 het 2202 hom 38 14 11 13 A 16 15 308401 CASAVA_Build 2 173109327 6D GGTAAAACAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3064 het 3064 ref 25 10 10 9 AAAAAG 3 2 308402 CASAVA_Build 2 173117834 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAATAA 3070 het 2500 hom 29 8 13 8 ATA 3 4 308403 CASAVA_Build 2 173125918 1I AGTTTCTGGA -/G GGGGGCCACA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 5 6 308404 CASAVA_Build 2 173128271 4D AATAAATCCC ATTT/---- ATTATCTGGT 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 ATTT 1 0 308405 CASAVA_Build 2 173137743 4D AAGTTCCATT TAGG/---- TAGGAAATTT 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 TAGG 2 1 308406 CASAVA_Build 2 173149357 1I TTGAGTCTTC -/T TTTTTTTTTC 2240 het 2240 ref 26 16 5 5 T 9 10 308407 CASAVA_Build 2 173170086 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1928 het 1928 ref 43 30 7 6 T 12 11 308408 CASAVA_Build 2 173172131 1D GTATAACTGT A/- AAAAAAAAAA 1897 het 1897 ref 33 19 7 7 A 17 16 308409 CASAVA_Build 2 173203607 1D TCTAATGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 29 1 14 14 T 15 14 308410 CASAVA_Build 2 173204514 1I AGAGGTTAGC -/T CATGTGGTAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 308411 CASAVA_Build 2 173206186 1D TTGGCTAATT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 8 7 308412 CASAVA_Build 2 173206550 3I TGTTTTGCTT ---/GTA GTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 GTA 0 1 308413 CASAVA_Build 2 173207747 2D CTTAAAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 29 0 22 7 A 16 14 308414 CASAVA_Build 2 173213954 4D31M2D4M3D TTTCTTTCTG TTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTC/----TTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTCTTTCTTTC--TCTT--- TTTTTCTTTC 3070 hom 33 het 11 0 12 3 N/A 0 0 308415 CASAVA_Build 2 173217120 2I5M3D TGGCCACAGC --AAACACCT/AGAAAGA--- GCTGTAGGTA 2471 het 2471 ref 26 17 8 1 N/A 0 0 308416 CASAVA_Build 2 173219480 1I CATCGAAGGC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 9 10 308417 CASAVA_Build 2 173220809 1D TCTAAGGGAA G/- GTACTGTAAC 3070 hom 117 het 41 0 39 2 G 2 1 308418 CASAVA_Build 2 173228331 1I GTGGTTTTTA -/G TCACACATTC 3070 hom 138 het 55 0 47 8 G 0 1 308419 CASAVA_Build 2 173238129 1I CCAAAGAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 10 11 308420 CASAVA_Build 2 173256319 1D AAACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 13 1 11 1 A 17 16 308421 CASAVA_Build 2 173260104 1D TAGAAGTTGT A/- AAGAGAAACA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 3 2 308422 CASAVA_Build 2 173261773 2I GTGTGAACAC --/TG TGTTGAATCC 3070 hom 148 het 57 0 46 11 TG 1 2 308423 CASAVA_Build 2 173274606 1D GTTTATCCTG T/- TTTTTTTTTT 2222 het 586 hom 27 5 12 10 T 11 10 308424 CASAVA_Build 2 173287593 4D TAAATTTGAT AATC/---- AATAAAGATA 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 AATC 1 0 308425 CASAVA_Build 2 173301433 1I ACTCTGAACG -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 6 7 308426 CASAVA_Build 2 173301625 1D GTTCAAACCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 25 11 4 T 8 7 308427 CASAVA_Build 2 173305678 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGGGGTCT 2375 het 1885 hom 18 5 6 7 G 8 7 308428 CASAVA_Build 2 173310434 4I TTTTTAGATA ----/ATAG ATAACATATT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 ATAG 0 1 308429 CASAVA_Build 2 173312340 6D TGTTTAAGTT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 TTTTTG 3 2 308430 CASAVA_Build 2 173317792 1D CATGTAGTTG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 9 8 308431 CASAVA_Build 2 173337227 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 42 1 32 9 A 13 12 308432 CASAVA_Build 2 173340153 1D AAACACTCTA T/- TTTTTTTTTT 1331 het 1039 hom 16 4 5 7 T 17 16 308433 CASAVA_Build 2 173360324 3I TAATTTTATG ---/TCA TCAGAAATAT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TCA 1 2 308434 CASAVA_Build 2 173374629 1D CCAAGGTCAT A/- AAGCTGCTGG 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 A 3 2 308435 CASAVA_Build 2 173376564 3D GTCCTAGAGA CAT/--- TTTCCCCATT 3070 het 3070 ref 21 14 7 0 CAT 1 0 308436 CASAVA_Build 2 173393762 2D TGTTTATGAC TG/-- TCTCTATTCC 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 TG 1 0 308437 CASAVA_Build 2 173408631 5I TAACCTGATA -----/TTAAC TTAAATATGT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTAAC 0 1 308438 CASAVA_Build 2 173411827 1I CGCGTTAGAG -/A AAAACCAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 A 4 5 308439 CASAVA_Build 2 173416717 1I GATTTTGAGA -/T TCTAGATCTG 3070 hom 151 het 54 0 51 3 T 1 2 308440 CASAVA_Build 2 173431963 1I AGAAATGCAG -/A ATGTCATTAG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 1 2 308441 CASAVA_Build 2 173433168 1D CTTGACCATG T/- TGCCTGAGTA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 2 1 308442 CASAVA_Build 2 173456075 1D AATATGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 6 A 11 10 308443 CASAVA_Build 2 173470858 7I TGTACTGTAC -------/TTTATAG TTTGTAAAGC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TTTATAG 0 1 308444 CASAVA_Build 2 173476687 1D ATACTGTATG C/- CCCCCGGGGG 3070 hom 95 het 37 0 31 8 C 6 5 308445 CASAVA_Build 2 173487617 4D AAAGAAATAT AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 43 19 14 12 AGAA 3 2 308446 CASAVA_Build 2 173500610 1I CCTTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 A 10 11 308447 CASAVA_Build 2 173501343 1D CATTTTTAGG A/- ATGACGTGTA 3070 het 3070 ref 46 25 16 6 A 2 1 308448 CASAVA_Build 2 173507718 1D TGGTTGCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 169 hom 39 2 26 11 A 15 14 308449 CASAVA_Build 2 173510775 1D TTATTCTGTC A/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 1 0 308450 CASAVA_Build 2 173519058 1D GCACATTGAC A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 A 8 7 308451 CASAVA_Build 2 173544073 2I CCAGTAGAAA --/TG TGTGCATTTT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 TG 2 3 308452 CASAVA_Build 2 173546082 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1221 het 415 hom 27 3 9 16 T 15 13 308453 CASAVA_Build 2 173556447 1I TCCATATTCC -/T TTTTTTTTTT 2307 het 2307 ref 41 13 13 15 T 13 14 308454 CASAVA_Build 2 173567833 1I AAGTAGACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 10 11 308455 CASAVA_Build 2 173568093 1D ACAATATGTT A/- AGAGTTACTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 2 1 308456 CASAVA_Build 2 173573935 11D TATGGTACTG CCCACATGTGA/----------- CCCTTTAAGT 3070 het 3070 hom 39 19 19 3 CCCACATGTGA 1 0 308457 CASAVA_Build 2 173574223 1I TCCTTTTCTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 T 7 8 308458 CASAVA_Build 2 173576107 1I TGCGCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 11 12 308459 CASAVA_Build 2 173576679 2D CTTTTTTTTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 TC 6 5 308460 CASAVA_Build 2 173578095 1D GGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 9 308461 CASAVA_Build 2 173578954 1I ATTACTCGGT -/C ATTCTAGCCA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 C 0 1 308462 CASAVA_Build 2 173581044 1I TCGGGTGTGG -/C CCCCCCCATG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 C 7 8 308463 CASAVA_Build 2 173584827 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2905 het 2905 ref 28 14 7 7 A 13 14 308464 CASAVA_Build 2 173593299 1D AGATAAATAG C/- CAAGTGCGGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 2 1 308465 CASAVA_Build 2 173595428 1D TACCTGCCTC A/- CATAACTGTG 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 1 0 308466 CASAVA_Build 2 173610265 1D GTGATCATAG C/- CTCACTATAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 C 2 1 308467 CASAVA_Build 2 173632910 2D GTTGTATTAT AG/-- GCTTATTGTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AG 1 0 308468 CASAVA_Build 2 173643151 3D GGGCAGAATA AAG/--- AAGACAGTCC 3070 het 3070 ref 56 28 24 4 AAG 2 1 308469 CASAVA_Build 2 173647190 1D GCATTATACA T/- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 7 6 308470 CASAVA_Build 2 173652646 1D TTTGTTTTGC T/- TCTTAAACTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 2 1 308471 CASAVA_Build 2 173653766 6D TCTCCTGCTT TGAGTA/------ TAAGTGTTTC 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 TGAGTA 1 0 308472 CASAVA_Build 2 173657399 1I CAAAAAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 9 9 A 13 14 308473 CASAVA_Build 2 173660826 2D ATGGGAGATA TG/-- TGTGTCATCA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 TG 3 2 308474 CASAVA_Build 2 173662411 2D ATCCATCTAT AA/-- AGCAAAAATA 3070 het 3070 hom 35 17 16 4 A 3 1 308475 CASAVA_Build 2 173663458 2I TTTTGGAGTC --/TA AACGTTTATT 3070 hom 144 het 51 0 47 4 TA 0 1 308476 CASAVA_Build 2 173668381 1D TTACTTTAGA C/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 C 1 0 308477 CASAVA_Build 2 173669319 1I TCTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 28 1 18 9 T 13 14 308478 CASAVA_Build 2 173672274 4D TTCTGTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2351 het 2351 ref 35 11 8 17 TTTG 3 2 308479 CASAVA_Build 2 173681112 2I8M1I TTTTTATTTT --TTTTTTTA-/TATTTTTTTAT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 N/A 0 0 308480 CASAVA_Build 2 173688988 1I GAGTCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 14 11 A 15 16 308481 CASAVA_Build 2 173696753 1I ACCCAGTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 11 12 308482 CASAVA_Build 2 173700711 1D ATGTTAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 A 13 12 308483 CASAVA_Build 2 173703592 3D AGAATTAAAT ATG/--- ATATGAGAAT 3070 het 3070 hom 40 14 20 10 ATG 1 0 308484 CASAVA_Build 2 173714187 5I TTTATACTAA -----/ATTAT ATTCTCGTGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 ATTAT 0 1 308485 CASAVA_Build 2 173717533 1D AGCTGGGAGT G/- GGGGGGCATG 3070 het 2909 hom 28 9 11 8 G 7 6 308486 CASAVA_Build 2 173722481 1I AAAAAGTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 267 hom 27 4 21 2 T 9 10 308487 CASAVA_Build 2 173745305 1D TTTGAGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 T 13 12 308488 CASAVA_Build 2 173750857 1I AAGAAGAAAA -/G TCTGAAGTGG 3070 het 3058 hom 19 7 9 3 G 0 1 308489 CASAVA_Build 2 173752366 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1764 het 1313 hom 22 6 7 9 A 15 16 308490 CASAVA_Build 2 173759523 3I ATAATTAAAA ---/TAG TAGAAGAATA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 TAG 1 2 308491 CASAVA_Build 2 173767740 1I AAAAAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 10 11 308492 CASAVA_Build 2 173769063 2D ACACGGCGTG TT/-- TATCATACCT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 3 1 308493 CASAVA_Build 2 173769930 1D TTTGGGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 27 0 17 10 T 12 11 308494 CASAVA_Build 2 173785246 2I CAGGGCATGT --/GG GGAGCTCTCC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 G 2 4 308495 CASAVA_Build 2 173787176 3I GACCTAATAA ---/ATG ATGATAGGAA 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 ATG 1 2 308496 CASAVA_Build 2 173795187 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 A 8 9 308497 CASAVA_Build 2 173797952 3I GTACATTTAG ---/AGA AGGTTAAAAG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 AGA 0 1 308498 CASAVA_Build 2 173798109 1D ATGAGACCCT C/- CCTAGTCATT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 3 2 308499 CASAVA_Build 2 173798883 1I TTCCACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 A 12 13 308500 CASAVA_Build 2 173801790 3I CCAAACTCAA ---/CTT CTTTTTTTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 CTT 1 2 308501 CASAVA_Build 2 173834995 1D CTGTCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2353 hom 23 9 10 5 A 13 12 308502 CASAVA_Build 2 173835580 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 11 12 308503 CASAVA_Build 2 173838004 6D AATAAAATAC ACACAT/------ ACACACAACA 3070 het 3070 hom 45 13 28 7 ACACAT 1 0 308504 CASAVA_Build 2 173841520 4D AGACCCTGTC TCAA/---- TCAATCAATC 3070 het 3070 ref 49 17 14 21 TCAA 6 5 308505 CASAVA_Build 2 173851703 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 676 hom 27 5 12 10 A 19 18 308506 CASAVA_Build 2 173852504 1D GGGAGAGAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 A 8 7 308507 CASAVA_Build 2 173854831 9I TTCGGCAGCG ---------/TTCGGCGTT TCTTCCTCCT 3070 het 1812 hom 21 7 10 4 TTCGGCGTT 0 1 308508 CASAVA_Build 2 173856416 1I TTTTTTTTTT -/C AAGTTTGTTC 3070 het 433 hom 32 3 24 5 C 0 1 308509 CASAVA_Build 2 173860343 2D CAGAGTCTTG CT/-- CTGTTGCCCA 3070 het 2341 hom 14 6 7 1 CT 2 1 308510 CASAVA_Build 2 173860924 5D AAAGAGTTTG TTGTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 12 10 TTGTT 1 0 308511 CASAVA_Build 2 173863641 1I CTTTTCAAGT -/G TCAAGTCCCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 0 1 308512 CASAVA_Build 2 173869124 4D CAAACAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 AAAC 4 3 308513 CASAVA_Build 2 173880099 1I ACAATTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 10 11 308514 CASAVA_Build 2 173881451 1I AGTGACCTGA -/T TTTTTCCTGG 3070 het 3070 ref 42 24 17 1 T 5 6 308515 CASAVA_Build 2 173883443 3D TGAAGCAATA GAG/--- GATTATGGAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 6 GAG 1 0 308516 CASAVA_Build 2 173883655 1D TTGGGTGGGT G/- GGTTGTGGTG 3070 het 2396 hom 24 8 14 2 G 3 2 308517 CASAVA_Build 2 173884127 4D TGTGTGTGTG TGTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 20 hom 28 2 19 7 TGTC 1 0 308518 CASAVA_Build 2 173887952 1D GTTTGTTTAC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 9 8 308519 CASAVA_Build 2 173899858 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 31 1 15 15 T 15 14 308520 CASAVA_Build 2 173905952 1D TTTAGAGAAC T/- TTTTTTAGCC 3070 het 2814 hom 25 9 10 6 T 7 6 308521 CASAVA_Build 2 173907975 1I ACCTAGCTAA -/T TTTTTTAATT 3070 hom 43 het 21 0 14 7 T 6 7 308522 CASAVA_Build 2 173911051 1D CTAGGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1681 hom 46 4 26 16 T 15 14 308523 CASAVA_Build 2 173920257 2D ACAGGGAAAC TG/-- TGGATGGTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TG 2 1 308524 CASAVA_Build 2 173920713 1I AAGCAGGCAC -/T TGGAGACGTA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 1 2 308525 CASAVA_Build 2 173935724 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 316 hom 15 1 13 1 T 9 10 308526 CASAVA_Build 2 173937574 3I CTGGGCTTGG ---/TAT TATTACAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TAT 1 2 308527 CASAVA_Build 2 173939230 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 36 0 28 9 T 8 9 308528 CASAVA_Build 2 173942187 2D CCATTCAAAC AT/-- ATATTAAATG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 AT 3 2 308529 CASAVA_Build 2 173947618 1I ACTCCGTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 27 1 20 6 A 10 11 308530 CASAVA_Build 2 173954434 1D TCTCTCCATT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 802 hom 28 3 23 2 C 1 0 308531 CASAVA_Build 2 173954615 4I TAAAAAAGAA ----/AAAC AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 27 0 26 1 AAAC 0 1 308532 CASAVA_Build 2 173962294 2D GTTTGGAGTC TG/-- TGGAGTCAGC 3070 het 3070 hom 49 22 25 2 TG 2 1 308533 CASAVA_Build 2 173964023 2D GGTCCTGTGC TT/-- TTTTAAAAAA 371 het 371 ref 35 14 6 16 T 6 4 308534 CASAVA_Build 2 173968308 2I AGAGGGAGTT --/AA TATTATGATT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 0 2 308535 CASAVA_Build 2 173969480 1D TTTCTCTTTT C/- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 16 4 C 1 0 308536 CASAVA_Build 2 173988343 1I TTGAAAACCT -/G GGTGACATAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 G 2 3 308537 CASAVA_Build 2 173993508 1D CTGACATCCC A/- GGGGACTATT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 1 0 308538 CASAVA_Build 2 174008061 1D ATGTCCGTTA G/- GGGAGTTTTC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 4 3 308539 CASAVA_Build 2 174013181 4I CCATTATTAT ----/TAAC TAAAGTCCAT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 TAAC 0 1 308540 CASAVA_Build 2 174016155 1D CCACAGATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 11 10 308541 CASAVA_Build 2 174023738 1I GAGCAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 2094 het 353 hom 36 4 12 20 A 10 11 308542 CASAVA_Build 2 174031421 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 8 7 308543 CASAVA_Build 2 174044719 1I ACAAAAAAAA -/T ATTAGCTGGG 3070 hom 110 het 40 0 37 3 T 0 1 308544 CASAVA_Build 2 174044868 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 157 het 157 ref 29 3 3 24 A 19 18 308545 CASAVA_Build 2 174051257 1I GGGAATTCCA -/T AGTCCAGGCC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 T 0 1 308546 CASAVA_Build 2 174051687 24D TGTGTGTGTG TGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATA/------------------------ TATATATATA 3070 het 11 hom 13 1 10 4 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATA 1 0 308547 CASAVA_Build 2 174056312 1D AAGATGATTG A/- AGACCCTCTT 3070 hom 120 het 41 0 41 2 A 2 1 308548 CASAVA_Build 2 174059872 12I CTCCTTTTCC ------------/GTGCAAAATATA GTGCAAAATA 3070 hom 116 het 46 0 39 7 GTGCAAAATATA 1 2 308549 CASAVA_Build 2 174064860 1I ACAGTCCAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 7 8 308550 CASAVA_Build 2 174065976 2D CATCCTACTT TC/-- TGTTTCTAGG 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 TC 1 0 308551 CASAVA_Build 2 174088505 2D TCGCACACAC AT/-- GTACTTACAT 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 AT 1 0 308552 CASAVA_Build 2 174099701 1I AAAATTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 T 12 13 308553 CASAVA_Build 2 174100262 1D GTTGCAGTTC T/- TTTTTTTTTT 2115 het 2115 ref 15 6 5 4 T 12 11 308554 CASAVA_Build 2 174100357 1D CTGGTGCGCT G/- CACCCACTAA 3070 het 1418 hom 11 3 8 0 G 1 0 308555 CASAVA_Build 2 174108860 5D TTCAAATTTT GTATA/----- GTCATTATTT 3070 het 3070 hom 35 13 20 3 GTATA 1 0 308556 CASAVA_Build 2 174114917 1D TTTTAGTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 28 12 3 A 11 10 308557 CASAVA_Build 2 174139722 6D TTCATAGTGT TTAATA/------ TAGACATTAC 3070 het 3070 ref 38 26 11 2 TTAATA 1 0 308558 CASAVA_Build 2 174142010 1D TCCAAAAGAA T/- TTTTCCAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 22 2 T 5 4 308559 CASAVA_Build 2 174142814 1D TTGCACTGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1481 hom 18 3 14 2 A 10 9 308560 CASAVA_Build 2 174149363 1D TGGGCCGGGA C/- TGTCCAACTT 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 C 1 0 308561 CASAVA_Build 2 174160403 1I AAATTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 10 11 308562 CASAVA_Build 2 174182378 1I CCCATTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 11 12 308563 CASAVA_Build 2 174183159 1D AAAGAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 2444 het 2444 ref 44 21 9 14 A 10 9 308564 CASAVA_Build 2 174185511 2I CCGGAGAGCT --/AC ACACACACAG 3070 het 2375 hom 22 8 11 3 AC 4 5 308565 CASAVA_Build 2 174186733 1D TGGAATTTTT C/- CTATACTCGT 3070 het 3070 hom 36 14 18 6 C 2 1 308566 CASAVA_Build 2 174188852 1D AATTGTGCCA G/- GCACAGAGCT 3070 het 3070 ref 65 32 27 6 G 2 1 308567 CASAVA_Build 2 174194762 1D GTTTGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 36 0 30 7 T 11 10 308568 CASAVA_Build 2 174208083 2D ACTTTCGCAC TG/-- TGTTCTTACA 3070 het 3070 ref 58 28 28 2 TG 2 1 308569 CASAVA_Build 2 174210203 2I AACTCTACAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 TA 8 9 308570 CASAVA_Build 2 174226886 5I TTTTAAAAAA -----/ATTAT TTATTCAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 ATTAT 0 1 308571 CASAVA_Build 2 174229588 2D TGCCTACCTC AG/-- AGTGTGATAA 3070 het 3070 hom 54 21 26 8 AG 2 1 308572 CASAVA_Build 2 174236744 1D ACAAAAAGTG C/- TAGAATTTAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 C 1 0 308573 CASAVA_Build 2 174241859 3I TGCTTCAATT ---/AAA AAATTTTAGT 3070 het 3070 ref 33 21 7 5 A 3 6 308574 CASAVA_Build 2 174244961 1D ATTTGATAAG C/- TTTGACATAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 C 1 0 308575 CASAVA_Build 2 174250753 1I TCTCAGTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2485 hom 37 9 21 7 T 13 14 308576 CASAVA_Build 2 174258605 2D TACTTTTGCA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 T 10 8 308577 CASAVA_Build 2 174283233 1D TACTCTGAAA T/- TTTTTTTTTT 1928 het 1928 ref 33 18 5 10 T 15 14 308578 CASAVA_Build 2 174310648 1D AATGAGAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 15 16 6 A 10 9 308579 CASAVA_Build 2 174374740 1I ACCCTGTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 36 1 28 7 T 11 12 308580 CASAVA_Build 2 174380959 1D GGAGAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 23 1 14 8 T 15 14 308581 CASAVA_Build 2 174392463 1I TAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 95 het 37 0 31 6 A 9 10 308582 CASAVA_Build 2 174396055 5I CAGGGTGAGC -----/TTCCT CTGTGTAGAT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TTCCT 0 1 308583 CASAVA_Build 2 174417065 1D GTTTTGTTGA T/- TTTTTTTTTG 2273 het 2273 ref 49 37 5 9 T 10 9 308584 CASAVA_Build 2 174420949 1I25M2D TCAATAACAG -AAAAAAAAATGCAGTGGAACCCCACAT/AAAAAAAAAATGCAGTGGAACCCCAC-- GTTTGGAAAT 3070 het 3070 ref 39 23 16 7 N/A 0 0 308585 CASAVA_Build 2 174436471 1D CAGAATTAAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 9 8 308586 CASAVA_Build 2 174439695 9D TGGCGTTGCT CCTGAGTCA/--------- CCTGGACCAG 3070 hom 102 het 37 0 33 7 CCTGAGTCA 1 0 308587 CASAVA_Build 2 174449565 1D AAACTATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 9 8 308588 CASAVA_Build 2 174450571 1D AACCCTTTAT G/- GGATAGAAGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 3 2 308589 CASAVA_Build 2 174451798 1I CATTATATAT -/A TACCACCCAG 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 0 1 308590 CASAVA_Build 2 174454968 1D ACGTACAGTC A/- AAATGATATA 3070 hom 129 het 46 0 44 3 A 4 3 308591 CASAVA_Build 2 174459258 3D35M4D ATAAATATTT ATGATATCAATAAATTTTATTTTTTCAACAAATAAGTGAACA/---ATATCAATAAATTTTATTTTTTCAACAAATAAGTG---- AATAAACAGA 3070 het 3070 ref 33 21 17 2 N/A 0 0 308592 CASAVA_Build 2 174460041 1I TCCAAAAGAG -/T TTTTTTTTTT 2799 het 371 hom 27 2 15 10 T 11 12 308593 CASAVA_Build 2 174462369 1D TAGAGGCCTA G/- GAGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 G 2 1 308594 CASAVA_Build 2 174474168 4D62M3D TGAATTAACA AGATAAATAGAAAGGCAAAATCATAAAATTTTTAGACAAAAATTTTTATGACAGTAGGTAAAGAATTTC/----AAATAGAAAGGCAAAATCATAAAATTTTTAGACAAAAATTTTTATGACAGTAGGTAAAGAAT--- TTAAGACACA 3070 het 3070 hom 34 16 27 3 N/A 0 0 308595 CASAVA_Build 2 174485709 1D AAGAGGAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 33 11 19 5 A 8 7 308596 CASAVA_Build 2 174485946 2D GTATTTTAAA TC/-- GATTCAGTTC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 TC 1 0 308597 CASAVA_Build 2 174487146 1D CTTTTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 21 0 17 5 A 11 10 308598 CASAVA_Build 2 174490295 5D AACAAAACTT TAAAC/----- TAATTACAAT 3070 het 3070 ref 46 25 20 4 TAAAC 1 0 308599 CASAVA_Build 2 174506217 1D TTCATGAAAT G/- TTTTACATTC 2968 het 2968 ref 28 19 7 2 G 1 0 308600 CASAVA_Build 2 174506965 1I CCAGTTACTT -/G GGAGGCAGAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 2 3 308601 CASAVA_Build 2 174509776 1D TATTCTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3028 hom 43 10 19 14 T 12 11 308602 CASAVA_Build 2 174520425 4D TTAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAAACAC 3070 het 3070 ref 36 19 16 4 AG 4 2 308603 CASAVA_Build 2 174521736 6D CAGAAAATAA ATAATT/------ ATAAGTCTCA 3070 het 3070 ref 34 16 15 5 ATAATT 1 0 308604 CASAVA_Build 2 174531557 1D ACGATGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 11 10 A 13 12 308605 CASAVA_Build 2 174547495 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 A 9 10 308606 CASAVA_Build 2 174560396 4D AAAATTAAAT AAGC/---- AAGCATATGA 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 AAGC 2 1 308607 CASAVA_Build 2 174560566 1I CCAATGTCAA -/T TTTTTTTTTT 1594 het 1594 ref 19 10 7 2 T 11 12 308608 CASAVA_Build 2 174579536 1D TAGAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 22 21 308609 CASAVA_Build 2 174583415 3D AACTTTGTAA GTT/--- GTTGTGTGTG 3070 hom 108 het 41 0 36 6 GTT 2 1 308610 CASAVA_Build 2 174583508 4D AAAATAATAG TAAA/---- TAAATAAAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 5 TAAA 3 2 308611 CASAVA_Build 2 174602628 1I ATTGCCGGAG -/C CCCCTAGAAG 3070 hom 100 het 36 0 33 3 C 4 5 308612 CASAVA_Build 2 174606260 12I TATTTTGGAG ------------/GACTCTTAATCA GTTGCTTATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 GACTCTTAATCA 0 1 308613 CASAVA_Build 2 174612034 1I AGGATGTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 26 1 19 6 A 11 12 308614 CASAVA_Build 2 174617483 1D GGAAGAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 10 9 308615 CASAVA_Build 2 174626677 1I CTGATCGGAC -/G GGAAACAAAG 3070 hom 78 het 29 0 25 4 G 2 3 308616 CASAVA_Build 2 174629180 1D CAAACAAGGA C/- CCCCAATTAG 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 C 5 4 308617 CASAVA_Build 2 174635021 1D ATTTTCAAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 56 het 27 0 18 9 A 9 8 308618 CASAVA_Build 2 174640162 2I GTATTCTAAA --/AT ATCTTATTAA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 AT 1 2 308619 CASAVA_Build 2 174648230 3I CATTTCATGG ---/AGT GGGGGGGGGG 83 het 83 ref 15 4 2 9 AGT 0 1 308620 CASAVA_Build 2 174664384 2D GAAGATTTTA TC/-- TGTCATCATC 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 TC 1 0 308621 CASAVA_Build 2 174666443 1I ACCTCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 39 1 31 7 A 10 11 308622 CASAVA_Build 2 174676158 9D ATCATGTGTA CATGTGTAT/--------- CATGTGTATT 3070 het 3070 ref 48 25 21 5 CATGTGTAT 2 1 308623 CASAVA_Build 2 174677128 1I AATACAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 A 11 12 308624 CASAVA_Build 2 174678990 3I TAACCAATAC ---/TTG TTGTTGAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 TTG 2 3 308625 CASAVA_Build 2 174701711 1D AACTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1224 hom 21 4 13 4 A 14 13 308626 CASAVA_Build 2 174706757 1D TTTAATTTTT A/- AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 7 6 308627 CASAVA_Build 2 174714664 1I TCCTTAACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 8 9 308628 CASAVA_Build 2 174719132 1D GATGGAAGAT A/- AAGAGTTTAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 3 2 308629 CASAVA_Build 2 174724090 1I TCTTCTAGTC -/A ATAGGGAGCC 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 A 1 2 308630 CASAVA_Build 2 174726546 10I AAAATTCTGC ----------/CTAACAGTTA CTGGTATTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 CTAACAGTTA 0 1 308631 CASAVA_Build 2 174727525 2I TTAGTTTCCC --/CT CATTTACAAG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 CT 0 1 308632 CASAVA_Build 2 174732784 1D ATGTTGGAAC A/- CCAGACTAAA 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 1 0 308633 CASAVA_Build 2 174739306 18D TCTGAGAAGC AGTTTCTTAGACAGATTG/------------------ AGTTTCTTAG 2695 het 2695 ref 33 20 10 8 AGTTTCTTAGACAGATTG 1 0 308634 CASAVA_Build 2 174741363 1D ATACAAAACC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 9 8 308635 CASAVA_Build 2 174745318 13I TGAGAGTGGC -------------/GAAAAGAACCAGG GAAAAGAGTG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 GAAAAGAACCAGG 0 1 308636 CASAVA_Build 2 174746306 1I AAGTACTTGC -/T TTTCGTCGAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 3 4 308637 CASAVA_Build 2 174746667 1I ATGAACAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 9 10 308638 CASAVA_Build 2 174747262 1I CTTTAAAATA -/T TTTTTAGCAA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 5 6 308639 CASAVA_Build 2 174759644 1I TTACTCGCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 9 10 308640 CASAVA_Build 2 174763073 1D AAGAAAGAGG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 7 6 308641 CASAVA_Build 2 174768214 1D TACTATGCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 A 10 9 308642 CASAVA_Build 2 174770325 1D GATTAGCATT C/- CCCCCTACTA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 C 6 5 308643 CASAVA_Build 2 174770407 1D TGGTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 T 12 11 308644 CASAVA_Build 2 174777716 1D TAATATTCAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 24 12 10 4 A 9 8 308645 CASAVA_Build 2 174779589 1I GACCACCATG -/A AATGAATATA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 A 2 3 308646 CASAVA_Build 2 174780749 2D AAAATCAAAC AG/-- AAATTAAATT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AG 1 0 308647 CASAVA_Build 2 174782541 1I CAGGGAGAGA -/T TTAAAAACTC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 2 3 308648 CASAVA_Build 2 174792387 1I ACTTACTCCA -/T TTTTATTTCC 533 het 533 ref 25 11 4 10 T 4 5 308649 CASAVA_Build 2 174794241 1D AAATTCATTT C/- CCCCCCCACA 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 C 8 7 308650 CASAVA_Build 2 174810158 1I AAATGTGTGC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 7 8 308651 CASAVA_Build 2 174819274 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 15 1 12 2 A 12 13 308652 CASAVA_Build 2 174822008 1I TCTCCCTTTT -/C CTATAACTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 C 1 2 308653 CASAVA_Build 2 174823430 3D GCCAGTATTC ATA/--- ATAAAATTGC 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 ATA 2 1 308654 CASAVA_Build 2 174831426 1I GTAGATTGGA -/C TAGGGATAGA 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 C 0 1 308655 CASAVA_Build 2 174833923 4D15M1D ACAATGCAAT CTGACTAACAGTATAGATGA/----CTAACAGTATAGATG- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 40 25 17 8 N/A 0 0 308656 CASAVA_Build 2 174839961 1D TCTTTTTTTT G/- GGGGGGGGTT 2841 het 1983 hom 18 7 8 3 G 9 8 308657 CASAVA_Build 2 174860279 1D GGCACAAGAA T/- TTTTTTTTTA 1335 het 1335 ref 22 14 3 5 T 10 9 308658 CASAVA_Build 2 174876975 13D TGTTGGGTAT TTTTTTGTTTTTG/------------- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 TTTTTTGTTTTTG 1 0 308659 CASAVA_Build 2 174905951 25D AGCCTTCTCG TTCTCTTCTCCTCTGTTCCTTCTCT/------------------------- TTCTCTTCTC 1808 het 1808 ref 32 13 7 17 TTCTCTTCTCCTCTGTTCCTTCTCT 2 1 308660 CASAVA_Build 2 174907296 1D TCCTCTCGGA G/- GAGCTGTCCC 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 G 2 1 308661 CASAVA_Build 2 174911861 1I TTAAAAACAA -/T CTGTGAAAGG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 0 1 308662 CASAVA_Build 2 174918333 3I GTGCCAAGAT ---/TTC TTTAAAGGAA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 TTC 0 1 308663 CASAVA_Build 2 174941210 5D TACTAACATT AATAG/----- AATACTTCCT 3070 het 3070 hom 48 23 24 5 AATAG 1 0 308664 CASAVA_Build 2 174946274 1I CTTATTCTAT -/A AAGACTGAGA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 2 3 308665 CASAVA_Build 2 174946803 1D27M3I ACTATCCCCC TGTGTGTGTGTGTGTATGTTTTGCCTGT---/-GTGTGTGTGTGTGTATGTTTTGCCTGTTTC TTCTCACAAG 3070 het 770 hom 23 3 8 21 N/A 0 0 308666 CASAVA_Build 2 174956341 5D AAATATACTT AAAAA/----- CAACAAACAC 3070 het 3070 ref 40 18 15 8 A 5 0 308667 CASAVA_Build 2 174966665 1I CACTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 873 het 873 ref 29 16 2 11 A 15 16 308668 CASAVA_Build 2 174993148 1D TAAGCAGAGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 47 25 11 11 T 9 8 308669 CASAVA_Build 2 175003489 7D TCCCCCAGGC TGGAGTG/------- TGGAGTGCAA 3070 hom 35 het 16 0 11 6 TGGAGTG 2 1 308670 CASAVA_Build 2 175006605 1I GAGGGTGGAG -/C CCTATTGAGT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 C 2 3 308671 CASAVA_Build 2 175013997 2D TTCATTTAAC TT/-- TATGTAATAG 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 T 3 1 308672 CASAVA_Build 2 175028358 1D TCGGAGAGGG A/- ATATGGCTGG 3070 hom 82 het 38 0 24 14 A 2 1 308673 CASAVA_Build 2 175034010 1I CCTAGATACG -/T TTTTGTCCTG 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 4 5 308674 CASAVA_Build 2 175036101 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 26 0 15 11 T 12 11 308675 CASAVA_Build 2 175040826 1D TCTTGTGCCT C/- CAGCCACCCA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 2 1 308676 CASAVA_Build 2 175056194 4I TACTTATACT ----/TAAA TAAACCTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TAAA 1 2 308677 CASAVA_Build 2 175061628 1I ACTTAGCAGG -/A AAAAATGAGC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 5 6 308678 CASAVA_Build 2 175066155 1I AGCAAGACTC -/T TGTCTAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 T 1 2 308679 CASAVA_Build 2 175068142 1D CCTTCCCTCT A/- AAAAAAAAAA 1294 het 114 hom 19 1 8 10 A 19 18 308680 CASAVA_Build 2 175069398 1I TATGTCTTTT -/A TTTTTTAAGA 2914 het 2914 ref 29 18 8 3 A 0 1 308681 CASAVA_Build 2 175074450 2D CCCAGGAAGC TT/-- TTTGTCAGTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 T 5 3 308682 CASAVA_Build 2 175076598 1D ACTAGGAGTC A/- AGTGTTCCTT 3070 het 3070 hom 50 24 24 2 A 2 1 308683 CASAVA_Build 2 175077155 1I CACGCCCAGC -/T TATTTTTGTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 2 308684 CASAVA_Build 2 175077648 2D14M9I CAGAGCGAGA CTCTGTCTCAAGAAAA---------/--CTGTCTCAAGAAAAAAATAAAAT AAAATAAATA 3070 hom 24 het 7 0 8 2 N/A 0 0 308685 CASAVA_Build 2 175078256 1D CCGGAAGTCC G/- GAGGGAGCTT 3070 hom 101 het 36 0 30 7 G 2 1 308686 CASAVA_Build 2 175079022 1D GCAAACCTTT G/- GGGGGGCCCT 3070 hom 58 het 25 0 20 5 G 7 6 308687 CASAVA_Build 2 175079508 2D GAGGAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 12 10 308688 CASAVA_Build 2 175082496 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTG 2827 het 166 hom 13 2 9 2 T 10 9 308689 CASAVA_Build 2 175082713 1D ACCTTGGCAT C/- CCAAAGTGCT 2012 het 444 hom 7 1 5 1 C 3 2 308690 CASAVA_Build 2 175084956 1D CTGACTCCTT C/- CCCCCGGGCT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 C 6 5 308691 CASAVA_Build 2 175086932 1I CGGGGATCTA -/T TTTTTTGTCT 3070 hom 89 het 42 0 33 9 T 6 7 308692 CASAVA_Build 2 175092446 1I ACTTCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2695 het 2695 ref 32 13 10 9 A 13 14 308693 CASAVA_Build 2 175099646 1I AATAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 11 12 308694 CASAVA_Build 2 175101429 2D TGAACAGCAC TG/-- TGAATGTACA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 TG 2 1 308695 CASAVA_Build 2 175103708 1I ACGTATTCTA -/T TTTTTTTTTT 2394 het 770 hom 18 2 7 9 T 13 14 308696 CASAVA_Build 2 175103743 1I CACTCTGTTG -/C CCAGGCTGGA 3070 hom 15 het 21 0 9 12 C 2 3 308697 CASAVA_Build 2 175122228 1D CTGTGGCTCA C/- CCCTGTAATC 1692 het 1546 hom 13 3 4 6 C 4 3 308698 CASAVA_Build 2 175125941 1I CTCTGTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 A 12 13 308699 CASAVA_Build 2 175129006 5I TGATTTGAAT -----/AAGTA AATGTACAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAGTA 0 1 308700 CASAVA_Build 2 175129984 4D TAGAAGCCAA CCCC/---- CCCCCCCCCG 3070 hom 48 het 17 0 15 2 C 13 9 308701 CASAVA_Build 2 175140237 4D ACAGAATGAA AGAG/---- AGAGAGAACC 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 AG 5 3 308702 CASAVA_Build 2 175162606 1D AACTTGTATG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 8 7 308703 CASAVA_Build 2 175162727 1I TCACGTGATA -/T TTTCACATCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 3 4 308704 CASAVA_Build 2 175179089 1I TAGTGGCAAT -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 6 7 308705 CASAVA_Build 2 175185754 1I ATCTGGATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 A 9 10 308706 CASAVA_Build 2 175186120 2I ACATGCAGAC --/AT GTGTAAACTT 3070 hom 157 het 57 0 53 4 AT 0 1 308707 CASAVA_Build 2 175220624 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 25 0 19 6 A 14 13 308708 CASAVA_Build 2 175246799 1I CACTAATATT -/A AAAAAAAAAA 2185 het 2185 ref 30 13 7 10 A 15 16 308709 CASAVA_Build 2 175273085 1D TTGGAGTGTT A/- ATGTGCATGA 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 A 2 1 308710 CASAVA_Build 2 175280129 1D ACGATATCAT G/- GGGGGGGTGT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 G 8 7 308711 CASAVA_Build 2 175292028 3I TGCTCCTGCC ---/CAT ATGAGCCTGG 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 CAT 0 1 308712 CASAVA_Build 2 175293325 2I TTTCATTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1321 het 1321 ref 17 10 3 4 A 16 18 308713 CASAVA_Build 2 175298350 1D GTCCTTGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 426 hom 32 1 24 7 T 10 9 308714 CASAVA_Build 2 175306840 1D AACATGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2754 hom 25 6 10 9 T 11 10 308715 CASAVA_Build 2 175309021 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 9 10 308716 CASAVA_Build 2 175324313 1D GACTTTCCCT G/- GGCTGGCCTT 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 G 3 2 308717 CASAVA_Build 2 175330425 1D CCACCATCCT G/- GGTGATTTAA 3070 hom 60 het 22 0 21 3 G 3 2 308718 CASAVA_Build 2 175331617 1D GCATTTTGGG A/- AAGGAGTACT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 A 3 2 308719 CASAVA_Build 2 175332354 1D TTCATCCTGG A/- AAAAAAAATA 1751 het 1751 ref 25 14 6 5 A 9 8 308720 CASAVA_Build 2 175336802 2I AAAAAATATT --/TC TGTCTCTGTG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TC 0 1 308721 CASAVA_Build 2 175337666 1I GATCTTAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 351 hom 51 1 41 9 A 9 10 308722 CASAVA_Build 2 175342740 1D TATGAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2182 hom 28 5 16 7 A 11 10 308723 CASAVA_Build 2 175352289 15I GTGTGTGCCA ---------------/TGTGTGTGCCAGGTG TGTGGCTTGG 3070 hom 108 het 38 0 36 3 TGTGTGTGCCAGGTG 0 1 308724 CASAVA_Build 2 175352696 1D CTACAAAACC T/- TTTTTTTTTT 2074 het 2074 ref 56 25 7 24 T 15 14 308725 CASAVA_Build 2 175358041 1D CAATGCCCAT C/- AACAGTTATA 3070 hom 141 het 53 0 48 6 C 1 0 308726 CASAVA_Build 2 175361541 15I TAATGATACC ---------------/GAAGGGAAGTGCTGA GAAGGGAAGA 2627 hom 22 het 11 0 8 3 GAAGGGAAGTGCTGA 0 1 308727 CASAVA_Build 2 175362747 1D TTTATTTTTA T/- TTTTATTTTT 1898 hom 23 het 9 0 8 1 T 5 4 308728 CASAVA_Build 2 175369178 1I TATGCCCTCT -/G GGGTGTGCCC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 G 3 4 308729 CASAVA_Build 2 175370136 1D GGGATGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2887 hom 42 10 15 17 T 17 16 308730 CASAVA_Build 2 175388564 1D GGATATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1636 het 1636 ref 36 23 5 8 T 15 14 308731 CASAVA_Build 2 175406770 1D CATACACATC T/- TTTTTTTTTT 2428 het 581 hom 22 4 9 9 T 16 15 308732 CASAVA_Build 2 175412579 1D CACTTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2520 hom 39 19 11 9 T 17 16 308733 CASAVA_Build 2 175498981 2I GCATAAATGT --/TA TATATGCTAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 TA 2 3 308734 CASAVA_Build 2 175577498 4D ACCTCGTTCA AAAT/---- AAATAAACTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 7 AAAT 2 1 308735 CASAVA_Build 2 175599898 1D ATGCTAATAA T/- TTTTTTTTTT 1854 het 454 hom 20 4 7 9 T 19 18 308736 CASAVA_Build 2 175600325 1I TGAGAAGCAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 7 8 308737 CASAVA_Build 2 175606095 1D CATCTGGTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 9 8 308738 CASAVA_Build 2 175621925 1I GTTCCCTCAG -/C TTTTGTTTGT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 0 1 308739 CASAVA_Build 2 175672077 1D ATTAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1620 het 1554 hom 31 13 7 11 T 19 18 308740 CASAVA_Build 2 175697061 5I AGTCAAATTA -----/AAGTT TATTCCAAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AAGTT 0 1 308741 CASAVA_Build 2 175697257 1D GGAAAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 43 2 33 8 A 11 10 308742 CASAVA_Build 2 175701895 1I CAACAAACAC -/A ATGAAAAAAG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 1 2 308743 CASAVA_Build 2 175721052 1I TCTTACTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 11 12 308744 CASAVA_Build 2 175734738 1D AAAGTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 15 14 308745 CASAVA_Build 2 175735096 1D AAAACTGCAT G/- AAATCTAAGA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 1 0 308746 CASAVA_Build 2 175736644 2I ATGATGCTGG --/GT GTGGTGGCTC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 GT 1 2 308747 CASAVA_Build 2 175738106 1I TAAGGTGGGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 T 8 9 308748 CASAVA_Build 2 175743316 4I AAAATGTTAA ----/TAAG TAAATATCAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TAAG 0 1 308749 CASAVA_Build 2 175746655 1D CAGTCATATT A/- AAAAAAAAAA 1392 het 1392 ref 28 18 3 7 A 12 11 308750 CASAVA_Build 2 175748052 4I TTTATGGCAG ----/TAAA TAAAGTAGAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAAA 1 2 308751 CASAVA_Build 2 175749340 5I TGTATTAAAT -----/AGTAC AGTAGTTTCA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AGTAC 0 1 308752 CASAVA_Build 2 175750626 8D GCTGCTAGTT GGACTGAG/-------- CCTGTTCTGA 3070 hom 120 het 42 0 41 4 GGACTGAG 1 0 308753 CASAVA_Build 2 175758646 5D AAAAAATTGT TGAAA/----- TGAAAATCAG 3070 hom 54 het 20 0 19 3 TGAAA 2 1 308754 CASAVA_Build 2 175758788 1I CTGAACCTGC -/A ACTAGTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 1 2 308755 CASAVA_Build 2 175760240 1I AATTTAACAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 385 hom 46 1 39 6 A 8 9 308756 CASAVA_Build 2 175769820 1I GGAAAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 764 hom 41 3 31 7 A 10 11 308757 CASAVA_Build 2 175770134 1D ACTCCGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 A 14 13 308758 CASAVA_Build 2 175782528 1D TGATAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 45 0 36 9 T 11 10 308759 CASAVA_Build 2 175788569 2D TTTTCTTTTT TA/-- TATATATATA 1175 het 1175 ref 10 3 4 3 TA 10 9 308760 CASAVA_Build 2 175796389 4D TCTCTCTTCC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 51 het 20 0 17 4 TCTT 4 3 308761 CASAVA_Build 2 175796484 8D TCTCTTTCTT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 2623 het 23 hom 20 1 14 5 TC 13 9 308762 CASAVA_Build 2 175797562 1I TTTGTAAATA -/T CTTTTTTGCA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 0 1 308763 CASAVA_Build 2 175798823 1I AGGGTAAGGG -/A AGAATTTCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 1 2 308764 CASAVA_Build 2 175800280 2I GGAGAGAGAG --/AT ATATAAAGAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 2 3 308765 CASAVA_Build 2 175802913 1I ATTTTGGGTC -/A GGGGGACAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 1 308766 CASAVA_Build 2 175807186 1D CCAGCAGTTA G/- CTAAGTAAAG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 1 0 308767 CASAVA_Build 2 175814342 4I TACTTCTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 71 het 30 0 22 8 TTTG 3 4 308768 CASAVA_Build 2 175822575 1D AGTATCTTTT C/- CATAATAAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 C 2 1 308769 CASAVA_Build 2 175824966 1I TTGTCTATTA -/C AGCCACATGA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 0 1 308770 CASAVA_Build 2 175827373 1D TAAAATTGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 10 9 308771 CASAVA_Build 2 175831882 12D TGGTTATTCT GGTTCAAGAGAA/------------ CCAGAACTAA 3070 het 3070 ref 39 25 14 5 GGTTCAAGAGAA 1 0 308772 CASAVA_Build 2 175857475 1I TATCAATGTT -/A AGTAGGGAGA 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 A 1 2 308773 CASAVA_Build 2 175859413 2D GGAGTGACTC TG/-- TGTGTGTGTG 849 het 849 ref 56 44 2 12 TG 9 8 308774 CASAVA_Build 2 175887882 4I AAGGATCTCA ----/TTCT TTCTTTGGCT 2354 het 2354 ref 30 20 6 4 TTCT 1 2 308775 CASAVA_Build 2 175897339 2D AGACTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 855 het 855 ref 21 8 4 9 A 20 18 308776 CASAVA_Build 2 175901669 21D GGGTTTGTGT TAGCTGCTATGGGGTTAGTTA/--------------------- GCTGCTAAAT 3070 het 3070 ref 45 32 19 2 TAGCTGCTATGGGGTTAGTTA 1 0 308777 CASAVA_Build 2 175904706 3D TAAAAATACC AAA/--- AAAAAAAAAA 2525 het 489 hom 13 5 6 2 A 17 14 308778 CASAVA_Build 2 175908843 1D TGTGTCCTTT G/- CCCATTTTCA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 G 1 0 308779 CASAVA_Build 2 175910995 1I CTCTCATTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 A 8 9 308780 CASAVA_Build 2 175914206 1D TTCTTCTTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 410 hom 26 1 20 5 T 10 9 308781 CASAVA_Build 2 175919209 1D AGCTACTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 13 12 308782 CASAVA_Build 2 175920735 1D TGGCTTTAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 17 15 5 A 9 8 308783 CASAVA_Build 2 175925425 1D CTCCAATCTT C/- CAACCCATTT 3070 het 3070 hom 42 12 24 6 C 2 1 308784 CASAVA_Build 2 175938538 1D AAATAAATGA T/- CATCAAATAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 T 1 0 308785 CASAVA_Build 2 175953664 6I GAAAGATAAA ------/ATGTTT TAATAATTGA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 ATGTTT 0 1 308786 CASAVA_Build 2 175967665 3D AGAGATTTTC TGT/--- TGTTGGGAAT 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 TGT 2 1 308787 CASAVA_Build 2 175974366 3I ACTCCTGCCG ---/ATA ATGATGACTC 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 ATA 0 1 308788 CASAVA_Build 2 175981551 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3018 hom 28 11 12 5 AC 9 8 308789 CASAVA_Build 2 175992498 4I ATTAAAAATG ----/AAAC AAACAAATAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 AAAC 1 2 308790 CASAVA_Build 2 175993295 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1491 hom 20 6 10 4 A 10 11 308791 CASAVA_Build 2 175999813 1D TAAAATACTG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 29 11 14 6 A 9 8 308792 CASAVA_Build 2 176003448 1D CATAAAAGTG A/- ATTTGTATAA 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 A 2 1 308793 CASAVA_Build 2 176016170 1I ACAAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 10 11 308794 CASAVA_Build 2 176016476 1I ATTTTTACAG -/A GGTGGAAATA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 0 1 308795 CASAVA_Build 2 176021526 20I TCTTGTAAGA --------------------/ACGGAGTGACTTACGAACCT ATTAAGTAAC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 ACGGAGTGACTTACGAACCT 0 1 308796 CASAVA_Build 2 176026500 1I AGATATGTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 9 10 308797 CASAVA_Build 2 176031788 1I TGGCAAAGAA -/C ATCTGTTCCC 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 C 0 1 308798 CASAVA_Build 2 176032463 1D CCATGACTTC T/- TTTTTTTTTT 1518 het 1518 ref 27 9 7 11 T 15 14 308799 CASAVA_Build 2 176040027 2D AAATTTTCAC AT/-- GAGAAGAAGG 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 AT 1 0 308800 CASAVA_Build 2 176042966 1D CTCACAAAAA T/- GAGACTTCCT 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 T 1 0 308801 CASAVA_Build 2 176050779 1I TCCTCTCATC -/T ATAGTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 0 1 308802 CASAVA_Build 2 176054109 3I TAATTTTTGA ---/AGG AGTTTTTATT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 AGG 0 1 308803 CASAVA_Build 2 176061303 3I TATTATTATT ---/ATC ATCATCATCA 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 ATC 3 4 308804 CASAVA_Build 2 176061435 1I AATTGTGCTT -/A AAAAATGTAA 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 A 5 6 308805 CASAVA_Build 2 176062234 10D19M7I AGGGGGGAGC TTTAATATTATTTAATATTATTTATCACA-------/----------TTTAATATTATTTATCACATTCTAGT TCTTATGTTG 3070 hom 81 het 24 0 28 7 N/A 0 0 308806 CASAVA_Build 2 176066191 3D GGAAAAGGAT GAG/--- GAGCAAAGAG 3070 het 3070 hom 36 16 16 6 GAG 2 1 308807 CASAVA_Build 2 176072976 2I TCATCTTTTT --/TA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TA 0 1 308808 CASAVA_Build 2 176081433 1I AGATTTAAAT -/A ATTAGACCTA 2435 het 2435 ref 14 8 5 1 A 1 2 308809 CASAVA_Build 2 176084167 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 A 6 7 308810 CASAVA_Build 2 176086262 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 21 17 10 A 12 11 308811 CASAVA_Build 2 176090328 1I TATATAATCA -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 41 22 19 0 T 5 6 308812 CASAVA_Build 2 176093777 1D TTTAAAAAGC A/- GCATATTTTC 3070 het 3070 ref 28 16 9 5 A 1 0 308813 CASAVA_Build 2 176095503 1D CTCATTAAGC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 50 27 19 6 A 8 7 308814 CASAVA_Build 2 176106037 6D AATAAAAGTC AAAATT/------ AAAATTTTAA 2976 het 2976 ref 29 16 8 8 AAAATT 2 1 308815 CASAVA_Build 2 176106581 1D TTGAGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2928 hom 24 8 11 5 A 11 10 308816 CASAVA_Build 2 176106652 1I GATTATTTGG -/A GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 0 1 308817 CASAVA_Build 2 176126521 2D CTCAGTTTGA GT/-- GTGTGTGTGT 1367 het 1367 ref 56 42 4 10 GT 9 8 308818 CASAVA_Build 2 176133531 8D AGATTTATAA AGAGACAG/-------- AGAGACAGAG 3070 het 3070 ref 37 17 13 9 AGAGACAG 2 1 308819 CASAVA_Build 2 176143636 1I TTCCTTCTGA -/T TAGTCACAGA 3070 het 3070 ref 51 31 18 2 T 1 2 308820 CASAVA_Build 2 176152293 3D GATGCAGCTT ACC/--- ACTTAAAACT 3070 het 3070 hom 59 25 29 5 ACC 1 0 308821 CASAVA_Build 2 176158116 2I AGGCTATATT --/TC TCTCTATATA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 TC 2 3 308822 CASAVA_Build 2 176178105 1D GGAGCTGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 13 12 308823 CASAVA_Build 2 176190408 1I TTTTTAATTT -/G GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 8 9 308824 CASAVA_Build 2 176193793 1I TGCAGTGGGG -/A GGGGGGGGTC 3070 het 730 hom 20 2 11 7 A 0 1 308825 CASAVA_Build 2 176200982 1I CAGAGTTTTT -/A AAAAAAACTT 3070 het 2086 hom 28 6 17 5 A 7 8 308826 CASAVA_Build 2 176227122 1D CCAGGAGCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 13 hom 25 1 16 8 T 10 9 308827 CASAVA_Build 2 176235646 5I AAGAGAGCCA -----/AGCAC AGGGTATTAG 3070 hom 84 het 36 0 24 12 AGCAC 0 1 308828 CASAVA_Build 2 176238882 5I ATAACACCTC -----/CCAAA TGGTCAAATA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 CCAAA 0 1 308829 CASAVA_Build 2 176263229 4I TGCCCAAGGC ----/ATTT ATTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 ATTT 1 2 308830 CASAVA_Build 2 176299240 1I TGTTCAAAAA -/T GTTCAATTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 308831 CASAVA_Build 2 176301966 2I ATATAATAAC --/AT ATTTAATACT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AT 1 2 308832 CASAVA_Build 2 176304581 5I GAATTCAAAA -----/TACTC TACTCTATGG 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 TACTC 1 2 308833 CASAVA_Build 2 176306238 1I AGCACTCCAC -/T TTTACTCTCA 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 T 3 4 308834 CASAVA_Build 2 176306349 2I GAAATAACAC --/AT GTCAGAGCAC 3070 hom 126 het 52 0 43 9 AT 0 1 308835 CASAVA_Build 2 176309021 1I TCATTACTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 378 hom 47 1 41 5 T 8 9 308836 CASAVA_Build 2 176324306 3I GGAACAAACT ---/TAA TATTCCTAAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TAA 0 1 308837 CASAVA_Build 2 176326435 1I AGTAGTTAAG -/T TTTTGGAGAG 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 4 5 308838 CASAVA_Build 2 176329374 1D CCCCAGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 T 11 10 308839 CASAVA_Build 2 176340645 10D TGGCAGGACT CACCTAGCTC/---------- CACCTAGCTC 3070 het 3070 hom 32 10 16 8 CACCTAGCTC 2 1 308840 CASAVA_Build 2 176365152 2I GCTTTTTTTG --/TT TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 42 17 15 10 T 7 9 308841 CASAVA_Build 2 176376948 6D TATCTTAAAT ACTCTA/------ ACTGAAATGT 3070 het 3070 hom 51 22 30 4 ACTCTA 1 0 308842 CASAVA_Build 2 176379648 3D GTGTTCTTAC AGG/--- AGATTTGATT 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 AGG 1 0 308843 CASAVA_Build 2 176379724 1D ACATTGAACA T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 T 7 6 308844 CASAVA_Build 2 176381891 1I TTAAAAAGTC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 8 9 308845 CASAVA_Build 2 176384345 1D GGAAACAGAT A/- TTTCCTTCCC 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 A 1 0 308846 CASAVA_Build 2 176389433 1D ATTTTACCAA C/- CTTTGAAGAT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 C 2 1 308847 CASAVA_Build 2 176390181 6D AATAAATAAA GTCTGG/------ GTCTGGAAAC 3070 het 3070 ref 26 15 10 4 GTCTGG 2 1 308848 CASAVA_Build 2 176394042 1I TCTATCCTTC -/A GAAGTCGCTT 3070 het 3070 hom 45 13 25 7 A 0 1 308849 CASAVA_Build 2 176438844 2D CAGGAACATC AG/-- AGTTGGAAGT 3070 het 3070 ref 46 24 15 10 AG 2 1 308850 CASAVA_Build 2 176454883 1D AATAAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2827 hom 34 11 11 12 A 15 14 308851 CASAVA_Build 2 176458858 1D AAATCCCGGG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 9 8 308852 CASAVA_Build 2 176486530 2I ACAGTCAGGC --/CT CTCTTCTGCA 3070 het 3070 hom 26 13 10 3 CT 2 3 308853 CASAVA_Build 2 176487264 2I GGCTTTGGCC --/CT GTTTCCAGGG 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 CT 0 1 308854 CASAVA_Build 2 176491735 4I TTTCTATCAA ----/TCTG TCTAATATTA 3070 het 3070 ref 52 25 13 14 TCTG 0 1 308855 CASAVA_Build 2 176500734 1I ATTTTACTAA -/T GTTTCAACCA 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 0 1 308856 CASAVA_Build 2 176514826 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2403 hom 27 8 15 5 A 10 9 308857 CASAVA_Build 2 176516189 1D ATTTTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 2891 het 2891 ref 33 16 11 7 A 12 11 308858 CASAVA_Build 2 176519985 1D TCTATGCCTT A/- AAAAAAAAAA 1046 het 1046 ref 41 34 3 5 A 12 11 308859 CASAVA_Build 2 176525054 4I TTTGATGGGA ----/TTGT TTGTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 TTGT 1 2 308860 CASAVA_Build 2 176538776 1D TTAGAGTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 11 10 308861 CASAVA_Build 2 176547985 1D AGGTTTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1988 hom 30 7 13 10 T 17 16 308862 CASAVA_Build 2 176555177 1I AGGCTGGAAG -/A GAGGACTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 A 0 1 308863 CASAVA_Build 2 176557156 1I AACAAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 2921 het 2732 hom 25 8 10 7 T 13 14 308864 CASAVA_Build 2 176579601 2D TAGAGAAAAC AA/-- AACACTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 A 4 2 308865 CASAVA_Build 2 176582370 4D ACTCCATCTC GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 GAAA 6 5 308866 CASAVA_Build 2 176583414 1I TCTTACAATT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 7 8 308867 CASAVA_Build 2 176585413 1D CCATCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2572 hom 18 7 10 1 A 12 11 308868 CASAVA_Build 2 176587859 2I ATTTTGATGT --/TA TATATTTTTA 3070 het 3070 ref 45 19 21 5 TA 2 3 308869 CASAVA_Build 2 176589476 8D TTCGAACTCC TGACCTCA/-------- TGATCCGCCC 2199 het 1676 hom 16 9 5 2 TGACCTCA 1 0 308870 CASAVA_Build 2 176594514 2I AAATTAATGT --/AG AGTTTTATGT 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 AG 1 2 308871 CASAVA_Build 2 176598624 1D CCAAGGGTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 11 11 2 T 10 9 308872 CASAVA_Build 2 176602800 1I AATTCTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 9 10 308873 CASAVA_Build 2 176630472 1D ACGAATTATC A/- ACTTATGGCC 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 A 2 1 308874 CASAVA_Build 2 176651238 4I TACATATGTA ----/TTTG TTTAAGAGCA 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 TTTG 0 1 308875 CASAVA_Build 2 176659288 1D TGGGGGTGGG A/- AGTGGTGCGA 3070 hom 66 het 29 0 19 11 A 2 1 308876 CASAVA_Build 2 176659701 1I ATGTCAGAGA -/C CATGTCAGCG 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 C 1 2 308877 CASAVA_Build 2 176769197 3D CAAATCTCTC CTT/--- CTTTCCATTA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 CTT 2 1 308878 CASAVA_Build 2 176772549 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 20 1 13 6 A 17 16 308879 CASAVA_Build 2 176780050 3D CCTCCTCTTA AGG/--- AGAAGATTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AGG 1 0 308880 CASAVA_Build 2 176781257 1I AAAGAAGTTT -/C CTCAGACCTC 3070 hom 30 het 11 0 10 1 C 1 2 308881 CASAVA_Build 2 176782287 17D TTTTTGAGAT GGAGTCTCACTCTGTCA/----------------- CATGGCTGGA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 GGAGTCTCACTCTGTCA 1 0 308882 CASAVA_Build 2 176788539 1D GAGATTTTTT C/- TTCCTGGAGT 3070 het 3070 ref 52 31 17 4 C 1 0 308883 CASAVA_Build 2 176805785 1D CAAGGTAGAG A/- AAAAAGAATA 3070 het 2889 hom 31 7 21 3 A 6 5 308884 CASAVA_Build 2 176807561 1I CATATTTTGG -/C CCCATTTATT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 C 3 4 308885 CASAVA_Build 2 176808069 1D ACTCAGCTGC A/- AAGGTGAACT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 3 2 308886 CASAVA_Build 2 176809080 1I AAATTAATAG -/A AAAAAAAAAA 2624 het 2624 ref 28 13 9 6 A 10 11 308887 CASAVA_Build 2 176811674 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 31 3 15 13 T 17 16 308888 CASAVA_Build 2 176817107 2D CAAAAAAAAA AC/-- AAAAAACAAA 2962 het 2622 hom 41 13 12 16 AC 1 0 308889 CASAVA_Build 2 176823954 3I GATGATGACA ---/ATG ATAAGGATGC 3070 hom 84 het 32 0 24 8 ATG 0 1 308890 CASAVA_Build 2 176826507 1I TTACAAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1959 hom 18 4 11 3 T 13 14 308891 CASAVA_Build 2 176833294 1I ATTTTAAAAA -/C CTACTGAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 308892 CASAVA_Build 2 176898970 1D ATTGAAAAGG A/- ACAGGAAGAA 3070 het 3070 ref 49 25 24 0 A 2 1 308893 CASAVA_Build 2 176900066 2D TTTTTTCCTC TA/-- TTAATGTCAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 TA 1 0 308894 CASAVA_Build 2 176902743 1D AACCTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 2027 het 2027 ref 24 14 5 5 T 15 14 308895 CASAVA_Build 2 176908020 1I CACAATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 10 11 308896 CASAVA_Build 2 176912994 1D TAATGATGTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 7 6 308897 CASAVA_Build 2 176913637 1D TGACGTCTCG T/- TTTCGTGATT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 4 3 308898 CASAVA_Build 2 176919086 3I AAAACAGGTT ---/TTA TTATGAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 TTA 1 2 308899 CASAVA_Build 2 176922089 1I CAATTAAATC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 7 8 308900 CASAVA_Build 2 176927775 1D GATTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 36 3 19 14 T 17 16 308901 CASAVA_Build 2 176952757 1D CTCTTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 8 308902 CASAVA_Build 2 176952853 1D TTTGCTAATT C/- CACCATTTCT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 2 1 308903 CASAVA_Build 2 176961402 1I TGGAAACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 11 308904 CASAVA_Build 2 176968757 1I ATTTTGTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1738 hom 46 4 30 12 A 12 13 308905 CASAVA_Build 2 176973263 2I GGAAAACTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 50 0 39 11 T 10 12 308906 CASAVA_Build 2 176981422 1I TGTCGAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 187 hom 35 2 26 7 T 11 12 308907 CASAVA_Build 2 176985797 1I AGTTACTTTG -/T CTTTCATATG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 308908 CASAVA_Build 2 177001776 1I CCTTATAGCA -/T TTTTTTTACT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 7 8 308909 CASAVA_Build 2 177004802 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 19 1 13 5 T 12 13 308910 CASAVA_Build 2 177024569 1I TGCCAGGCTA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 7 8 308911 CASAVA_Build 2 177039382 1I CATTGCTCCA -/T TTCTTTTTGG 3070 hom 120 het 47 0 39 8 T 2 3 308912 CASAVA_Build 2 177046740 1I TCTTCCTCTG -/C ACCCCCGCCC 1143 het 1143 ref 25 17 3 5 C 0 1 308913 CASAVA_Build 2 177054035 1D AGCCATTCAT A/- AAAATGCGGG 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 A 5 4 308914 CASAVA_Build 2 177072318 1D TTCCCATTGT C/- TGAGAGTTCT 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 C 1 0 308915 CASAVA_Build 2 177080093 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTA 2009 het 611 hom 11 2 6 3 T 10 9 308916 CASAVA_Build 2 177086715 1I GGCAGTAACA -/C CCCATGGAGC 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 C 3 4 308917 CASAVA_Build 2 177088732 6D TTGGCAACAC TCAGTG/------ TTATCAGTAT 3070 het 3070 hom 42 19 21 5 TCAGTG 1 0 308918 CASAVA_Build 2 177089788 2I ACCTTTATTG --/AA AAAATCTGTT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 4 6 308919 CASAVA_Build 2 177089900 4I AGCGTGTGTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 TG 7 9 308920 CASAVA_Build 2 177092685 1I CTTCTTGAGC -/A AACACAGAGT 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 A 2 3 308921 CASAVA_Build 2 177099266 3D ATTTATTTAT TTA/--- TTTATTTTTT 583 het 583 ref 22 11 2 9 TTA 1 0 308922 CASAVA_Build 2 177099595 1I ATGCTTAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 A 9 10 308923 CASAVA_Build 2 177108119 1I GTTGGCATTA -/G GAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 G 1 2 308924 CASAVA_Build 2 177110221 1I TTTTTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 11 12 308925 CASAVA_Build 2 177113799 1D CATAAGAACA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 8 7 308926 CASAVA_Build 2 177115927 1D CATTAGGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 11 10 308927 CASAVA_Build 2 177171920 1D ACTGGCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 44 1 34 10 T 12 11 308928 CASAVA_Build 2 177179030 1I AAAACCACTG -/A AAACAAAACA 3070 hom 163 het 60 0 54 6 A 3 4 308929 CASAVA_Build 2 177186637 1I TGACCAGCAA -/T TTTCTCTCGT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 3 4 308930 CASAVA_Build 2 177189225 1I GAATTTCACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 9 10 308931 CASAVA_Build 2 177192705 3D AGCTGGTTTC TAT/--- TATTATTGGA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TAT 3 2 308932 CASAVA_Build 2 177204473 1I TTGGAGAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 9 10 308933 CASAVA_Build 2 177212870 2I TCCATCACAC --/AT GTGTGTTCTC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AT 0 1 308934 CASAVA_Build 2 177217201 4I GTAGGAAAAA ----/AGAG AGATAAGATA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 AG 1 3 308935 CASAVA_Build 2 177220564 1D GAGAAATGAG A/- AAAAAAAAAA 2313 het 2313 ref 46 30 5 11 A 14 13 308936 CASAVA_Build 2 177225427 1D TCTGGAGCTA T/- TTATCTGGTA 3070 hom 99 het 36 0 32 5 T 3 2 308937 CASAVA_Build 2 177232810 1I GTGAGCAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 509 hom 36 2 29 5 A 10 11 308938 CASAVA_Build 2 177233841 1D ATGTATCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 51 1 43 7 A 11 10 308939 CASAVA_Build 2 177237267 2I TAGAAAACAG --/AT ATATATATAT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 AT 6 7 308940 CASAVA_Build 2 177238537 1I TAGGTGGATC -/A ACGAGGTCAG 3070 hom 57 het 22 0 18 8 A 1 2 308941 CASAVA_Build 2 177240428 1D TACTGTAATC T/- TTGGTGGGGT 3070 hom 95 het 41 0 30 11 T 3 2 308942 CASAVA_Build 2 177245579 3I TCAAAAAATT ---/TAA AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 TAA 0 1 308943 CASAVA_Build 2 177245649 1D AGGCCTATCC A/- AAAAAAAAAA 273 het 273 ref 33 24 3 6 A 15 14 308944 CASAVA_Build 2 177260247 18D TATATATATA TATATATATATGTGTGTG/------------------ TGTGAAATGC 3070 hom 74 het 33 0 29 7 TATATATATATGTGTGTG 1 0 308945 CASAVA_Build 2 177275356 1I ATGCACTTCT -/G GCAGCTATGC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 1 2 308946 CASAVA_Build 2 177276847 9I CCCCAACTCA ---------/TAGGGCTAT TAGGGCTATT 3070 hom 108 het 49 0 37 13 TAGGGCTAT 1 2 308947 CASAVA_Build 2 177280990 2I TTCACCCATG --/TC TCTCTCTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TC 3 4 308948 CASAVA_Build 2 177282502 1I TTGGTGCCCC -/A GAGTTTCCAT 3070 hom 132 het 50 0 43 7 A 0 1 308949 CASAVA_Build 2 177312052 2D GACTCAGGGA TT/-- TTTTTTTTTT 2970 hom 30 het 20 0 9 11 T 16 14 308950 CASAVA_Build 2 177319226 1D TTGAGTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 15 14 308951 CASAVA_Build 2 177328598 6D CTGAAGAGAG CTGCCC/------ CTGCCCTGCA 3070 hom 99 het 36 0 33 7 CTGCCC 2 1 308952 CASAVA_Build 2 177348382 4D TACAAACACC CTCT/---- CTTTTTCAGG 3070 het 3070 hom 34 16 17 6 CT 3 1 308953 CASAVA_Build 2 177348626 1I AAACTATGTC -/T TTTTTTTTTT 2469 het 1849 hom 27 7 14 6 T 13 14 308954 CASAVA_Build 2 177352022 3D TAAAAATATC AGA/--- AGGAGCTGGC 3070 het 3070 hom 57 28 26 5 AGA 1 0 308955 CASAVA_Build 2 177354898 1D TCCCATATTT A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 45 22 20 3 A 6 5 308956 CASAVA_Build 2 177356000 1D ATCACAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 A 11 10 308957 CASAVA_Build 2 177356332 2I TGGTCAGCCC --/CT CACTCCACCT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 CT 0 1 308958 CASAVA_Build 2 177358532 1D CTTTAACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 A 11 10 308959 CASAVA_Build 2 177363466 1I TGAAGAGAGA -/C CCCCCACCCC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 C 5 6 308960 CASAVA_Build 2 177376040 4I ACCTTTCCAA ----/TTGT TTAAGTCTAA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 TTGT 0 1 308961 CASAVA_Build 2 177387036 4D GTTTTAGTAA AAGG/---- AAAGAAACTA 3070 hom 72 het 30 0 24 9 AAGG 1 0 308962 CASAVA_Build 2 177387292 1I GAATTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 28 1 21 6 T 10 11 308963 CASAVA_Build 2 177387637 4D GTGCTCATTA TAAT/---- TAATACACAA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 TAAT 2 1 308964 CASAVA_Build 2 177391769 1D CAAATGCTCC G/- GGGTCACTTG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 G 4 3 308965 CASAVA_Build 2 177398019 1D CTTTAGGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 29 1 21 9 A 12 11 308966 CASAVA_Build 2 177399236 1I ATTGTGTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 32 0 24 8 A 10 11 308967 CASAVA_Build 2 177401248 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2359 hom 22 9 9 4 A 11 10 308968 CASAVA_Build 2 177401974 1I TCCTGCACAT -/C TAGGAAGTGT 3070 hom 135 het 49 0 44 5 C 0 1 308969 CASAVA_Build 2 177413115 1I CCAGTTTTCC -/T TTGGTCTTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 2 3 308970 CASAVA_Build 2 177416987 1I TCTCGCTCAA -/C CTCCCTTAGC 3070 hom 132 het 46 0 45 1 C 1 2 308971 CASAVA_Build 2 177422381 2I TGCCATTGTG --/GT GGGTGGTTTC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 GT 0 1 308972 CASAVA_Build 2 177429630 4I TAAAAAAACC ----/CTTT CTTTCTTTCT 3070 hom 99 het 45 0 32 13 CTTT 3 4 308973 CASAVA_Build 2 177436713 1D ACATATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 16 11 T 15 14 308974 CASAVA_Build 2 177438128 3D ATCCCTGAGC ATG/--- ATATGTTTCT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 ATG 1 0 308975 CASAVA_Build 2 177444135 2I TGAATTCTCT --/CA GTTATTTGTT 3070 hom 132 het 49 0 44 5 CA 0 1 308976 CASAVA_Build 2 177450410 5I AAGAAAAGAA -----/TTATT TAATATGAAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTATT 0 1 308977 CASAVA_Build 2 177456110 2D CCTTAAGTAC AT/-- ATATATATAT 1196 het 1196 ref 25 19 3 3 AT 8 7 308978 CASAVA_Build 2 177468378 1I ATTATCCAAA -/C CATACACACC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 1 2 308979 CASAVA_Build 2 177472195 1D AACTTTAGGA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 126 het 48 0 42 7 T 8 7 308980 CASAVA_Build 2 177472807 1I TTGTTTAATC -/T TTTTCTCTGC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 4 5 308981 CASAVA_Build 2 177473568 1I AATTTTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 30 2 25 3 A 12 13 308982 CASAVA_Build 2 177501426 1D TGCTGTTCAG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 8 7 308983 CASAVA_Build 2 177502074 1D AACAGATGAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 120 het 42 0 41 2 A 9 8 308984 CASAVA_Build 2 177502312 1D TAATACACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 31 0 22 9 T 11 10 308985 CASAVA_Build 2 177513861 4I AAAAAAAAAT ----/AAAC AAACTTGAGA 3070 hom 150 het 52 0 50 2 AAAC 1 2 308986 CASAVA_Build 2 177533131 4I CTCTCATTAA ----/AACT AACTCTTTTG 3070 hom 132 het 49 0 44 5 AACT 1 2 308987 CASAVA_Build 2 177536912 8D GAAGTGACTG AGGAAGGA/-------- AGGAAGGAAG 3070 hom 84 het 44 0 28 16 AGGA 7 5 308988 CASAVA_Build 2 177565406 1I ACACAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 14 15 308989 CASAVA_Build 2 177570609 1I TTTAGACATA -/C TTTCATTTTC 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 C 0 1 308990 CASAVA_Build 2 177584473 1I ATATATATCT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 8 9 308991 CASAVA_Build 2 177586348 1I TTTTCTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 118 het 48 0 45 3 T 9 10 308992 CASAVA_Build 2 177590815 1D AAAGGTTTGG C/- CCCCTCATCT 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 C 5 4 308993 CASAVA_Build 2 177591881 1I CTGCAGGAAA -/G ACAGTGTTTG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 0 1 308994 CASAVA_Build 2 177597795 1I GGTCCCACTA -/C CCATGCTTCT 3070 het 3070 ref 50 24 16 10 C 2 3 308995 CASAVA_Build 2 177604494 1D ACACAAAGCT C/- CCCCCCACTG 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 C 7 6 308996 CASAVA_Build 2 177605078 2I TGTGGAAATG --/TC TTCAGGAAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TC 0 1 308997 CASAVA_Build 2 177607652 3I ATCCCTCCCC ---/CCG CCCCCCATCC 1137 hom 7 het 3 0 3 0 CCG 0 1 308998 CASAVA_Build 2 177615498 1D AAGCAAGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 52 het 27 0 22 5 A 10 9 308999 CASAVA_Build 2 177631613 1I TAAATCAATG -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 6 7 309000 CASAVA_Build 2 177633053 1I CACACTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 887 hom 45 2 38 5 A 10 11 309001 CASAVA_Build 2 177633506 7I GATGGTAAGG -------/TCCCACA TACTGCATTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TCCCACA 0 1 309002 CASAVA_Build 2 177645112 1D GGGGTGTGTG T/- GTGGGGGGGG 2692 het 1779 hom 19 9 8 4 T 1 0 309003 CASAVA_Build 2 177646759 1I GGGTCAAATC -/T TTTGGCTTCT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 3 4 309004 CASAVA_Build 2 177661960 3I TTCCCCTAAC ---/AGA AGAAGTAGTT 3070 hom 123 het 48 0 40 8 AGA 1 2 309005 CASAVA_Build 2 177663500 1D ATTATCTATC T/- TTTTTTTTTT 1663 hom 9 het 21 0 6 15 T 17 16 309006 CASAVA_Build 2 177683430 1I CTACAGTTTT -/A AAAAACCGAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 5 6 309007 CASAVA_Build 2 177684701 2D CATCTGAAGA CT/-- CTGCCATCCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 CT 2 1 309008 CASAVA_Build 2 177685809 1D AGTCAAGCCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 23 7 11 5 T 9 8 309009 CASAVA_Build 2 177686145 4D AGAGATTTCA ACAC/---- ACTTTCAGAA 3070 het 3070 hom 29 8 16 6 AC 3 1 309010 CASAVA_Build 2 177688791 1I TTAAAGACCT -/A AATGTGAAAG 3070 hom 66 het 32 0 23 9 A 2 3 309011 CASAVA_Build 2 177710643 2D ATACTATATA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1896 hom 11 4 7 0 AT 6 5 309012 CASAVA_Build 2 177736099 2I AAGCTGTTTT --/AA AAGAGTATAA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 A 2 4 309013 CASAVA_Build 2 177768069 1D ACTAGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1747 het 1747 ref 31 15 6 10 A 17 16 309014 CASAVA_Build 2 177769786 1I GTGTGAACTT -/G GGAGGCAGAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 2 3 309015 CASAVA_Build 2 177772866 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1693 het 1693 ref 37 9 8 20 T 19 18 309016 CASAVA_Build 2 177780651 1D AAACTTACAA T/- CATGGCAGAA 3070 hom 66 het 29 0 22 8 T 1 0 309017 CASAVA_Build 2 177782635 5I TCAGATGCTT -----/AAAAG AAAACATTAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AAAAG 0 1 309018 CASAVA_Build 2 177790209 1D ATCAGAAGAT G/- GGTTACACAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 3 2 309019 CASAVA_Build 2 177797150 4D TAGTAAATAG AAAC/---- AAACTAGGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 6 AAAC 2 1 309020 CASAVA_Build 2 177806334 1D GGAATGACAC A/- AAGGAAAACA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 3 2 309021 CASAVA_Build 2 177807711 5D GATAACTCTC AAGTT/----- AAAGTGTCAA 3070 het 3070 ref 63 34 26 5 AAGTT 1 0 309022 CASAVA_Build 2 177825635 1I GGATGAGTAT -/C TTTTAAAGCA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 C 0 1 309023 CASAVA_Build 2 177833782 4I AGAAAAAAGG ----/CAAA CAGTTTCTGA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 CAAA 0 1 309024 CASAVA_Build 2 177842304 1D GACTGATGAC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 T 8 7 309025 CASAVA_Build 2 177849343 7I AAATATATAC -------/TCTATAT ATCCTAAATA 2619 het 2200 hom 15 5 8 2 TCTATAT 0 1 309026 CASAVA_Build 2 177849395 1I TGTATAAATA -/T TACTCATATG 2359 het 2359 ref 17 7 5 5 T 1 2 309027 CASAVA_Build 2 177850983 1D TTTAATTTGG T/- TTTTCACATT 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 T 5 4 309028 CASAVA_Build 2 177851577 1I AAGTATTTTA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 6 7 309029 CASAVA_Build 2 177857273 1I ATATTTTTTT -/C CCCCTGCCCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 4 5 309030 CASAVA_Build 2 177862857 1I TACAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 9 10 309031 CASAVA_Build 2 177869875 1I ATTTTACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 19 8 8 3 T 9 10 309032 CASAVA_Build 2 177876392 3D AAAACAAACA AAC/--- AAAAAAACCA 476 het 476 ref 23 11 3 12 AAC 1 0 309033 CASAVA_Build 2 177877144 5D GAGTCATGAA AAGAG/----- AAGAGAGTCC 3070 hom 72 het 28 0 24 5 AAGAG 2 1 309034 CASAVA_Build 2 177878884 1I AGAAAGTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 9 10 309035 CASAVA_Build 2 177882565 3D CCACTTCAGC TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 60 het 27 0 21 7 TAT 4 3 309036 CASAVA_Build 2 177894316 1I CAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 23 9 A 11 12 309037 CASAVA_Build 2 177895330 1D GGTCAGGTTT G/- AATGTGCAAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 G 1 0 309038 CASAVA_Build 2 177901016 1D GACAGGGTGA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 7 6 309039 CASAVA_Build 2 177903352 1I ATTGAAAGAA -/C CTCCCTCTAG 3070 hom 168 het 62 0 55 7 C 1 2 309040 CASAVA_Build 2 177919907 1I TGGAAATTAA -/T TAACAACTGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 2 309041 CASAVA_Build 2 177923920 7D ATCAGCTGGG GTGGTGT/------- GTGTGTGTGT 3070 het 462 hom 24 4 13 7 GTGGTGT 1 0 309042 CASAVA_Build 2 177924445 2I GTGTGTGTGT --/GA GAGAGAGAGA 1115 het 796 hom 9 3 3 3 GA 6 7 309043 CASAVA_Build 2 177949308 1I GAAAAGTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 718 hom 25 2 16 7 A 14 15 309044 CASAVA_Build 2 177964983 2I ACACCGGCTG --/AA AAACAGGTGA 3070 hom 144 het 55 0 49 6 A 3 5 309045 CASAVA_Build 2 177969912 7I CTTCTTTTTC -------/TTTTCTT TTTTCTTTTT 3070 hom 43 het 32 0 19 13 TTTTCTT 1 2 309046 CASAVA_Build 2 177978821 1I TTGGGGGAAC -/T TTTAAGTTAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 3 4 309047 CASAVA_Build 2 177980767 1D ACAAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1197 hom 30 4 16 10 T 17 16 309048 CASAVA_Build 2 177982130 1D GTAGAAGGGG C/- TACTGCTGAT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 C 1 0 309049 CASAVA_Build 2 177982206 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTCT 2266 het 2266 ref 26 16 7 3 T 9 8 309050 CASAVA_Build 2 177991771 1D TTTTGGCACC A/- AAAAAAAAAA 2119 het 2119 ref 36 20 7 9 A 13 12 309051 CASAVA_Build 2 177997427 1D AATAGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 10 11 T 11 10 309052 CASAVA_Build 2 178017592 12D CAACTGCTAT TTTTGTATTGTA/------------ TTTTGTATTG 3070 hom 86 het 33 0 28 11 TTTTGTATTGTA 1 0 309053 CASAVA_Build 2 178019124 1D TGACTGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 24 10 T 13 12 309054 CASAVA_Build 2 178024936 1D TATATATGTT A/- TTTAGTTCCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 1 0 309055 CASAVA_Build 2 178028753 1D ATTTCTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 T 11 10 309056 CASAVA_Build 2 178038313 1D ATTTTGAACA C/- TTTTAACATC 3070 hom 95 het 37 0 32 5 C 1 0 309057 CASAVA_Build 2 178040056 38D TGCCACCCCC ACTGCAGCCAATGTCTTTGCAGCAGCCACTCCAGATGG/-------------------------------------- GCTGCTGGTG 3070 het 3070 ref 36 21 14 9 ACTGCAGCCAATGTCTTTGCAGCAGCCACTCCAGATGG 1 0 309058 CASAVA_Build 2 178056985 1D AGCTAGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 518 hom 35 3 20 12 T 15 14 309059 CASAVA_Build 2 178065709 1D TACTGTGGAT A/- AAATACAGTA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 4 3 309060 CASAVA_Build 2 178065891 3I GTTAACTTAT ---/AAA GTTTGTATTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 0 3 309061 CASAVA_Build 2 178075225 1D TGAGGTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 28 0 19 9 T 12 11 309062 CASAVA_Build 2 178075855 1I ACTCTTCCCA -/C CCTCAATCCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 2 3 309063 CASAVA_Build 2 178077294 2I TTTGAAACTT --/TA GGAGGCTTTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TA 0 1 309064 CASAVA_Build 2 178079194 1I CTGGGGTTAC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 7 8 309065 CASAVA_Build 2 178086060 3D TAATTGAATC ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 69 het 34 0 24 10 ATT 7 6 309066 CASAVA_Build 2 178088925 1D GCTTAGTAGT G/- GCTAAGGAGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 2 1 309067 CASAVA_Build 2 178107810 9D TGGGCTTAAA TGATCTTCC/--------- CACCTCAGCC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TGATCTTCC 1 0 309068 CASAVA_Build 2 178108428 1D TTTCTGAATG C/- CCAGCAGTAC 3070 hom 148 het 50 0 50 0 C 3 2 309069 CASAVA_Build 2 178115016 1I GGGTCTAATA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 80 het 34 0 27 7 T 8 9 309070 CASAVA_Build 2 178147935 1D ACCTCCTTCT C/- TAACCTATGC 3070 het 3070 ref 31 15 12 5 C 1 0 309071 CASAVA_Build 2 178151688 1D ACGTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 33 8 12 13 A 15 14 309072 CASAVA_Build 2 178155046 4D ATTCATTCAT TCAC/---- TCACTCATTC 3070 het 3070 ref 46 23 21 5 TCAC 2 1 309073 CASAVA_Build 2 178158034 2I GTAAATTCTG --/GT TTTGTTTTTT 1192 het 1192 ref 39 17 8 14 GT 0 1 309074 CASAVA_Build 2 178162086 1D GGCAGTGTCC G/- GGCTTCTTGT 3070 het 3070 ref 35 16 12 9 G 3 2 309075 CASAVA_Build 2 178170462 1D TTCCTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 2472 het 2472 ref 19 9 6 5 T 11 10 309076 CASAVA_Build 2 178176636 1I AATTATAAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 41 het 31 1 28 2 T 8 9 309077 CASAVA_Build 2 178182710 2I TATCTACAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 10 12 309078 CASAVA_Build 2 178183523 4I TAAATAAAAT ----/TTGC TTGCTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 TTGC 1 2 309079 CASAVA_Build 2 178192350 3D AACAGAAATC CTT/--- CTTATTTTGG 3070 het 3070 ref 47 25 15 8 CTT 2 1 309080 CASAVA_Build 2 178192460 1I TTTCCATGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 10 11 309081 CASAVA_Build 2 178192873 3I TAAGTATTAC ---/ATT ATTAATTAAA 3070 het 3070 hom 42 14 23 5 ATT 1 2 309082 CASAVA_Build 2 178195485 1D AGCAGCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 44 0 37 7 A 12 11 309083 CASAVA_Build 2 178196746 1I GCGTATACAA -/T AAATGACATT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 309084 CASAVA_Build 2 178202420 3I CACTGGCAGG ---/GGA GGAGGATGAG 3070 het 3070 ref 56 22 17 17 GGA 2 3 309085 CASAVA_Build 2 178203664 1I CTTATTTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 T 9 10 309086 CASAVA_Build 2 178204105 2D ATGGAATCTT TC/-- TATTATGTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TC 1 0 309087 CASAVA_Build 2 178221308 4D TATGGGAAAA GTTT/---- GTTTGTGTAG 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 GTTT 2 1 309088 CASAVA_Build 2 178227912 1D TATGCTCTCT A/- AAAAAACTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 6 309089 CASAVA_Build 2 178232236 1D ATTCTATCTC A/- GGGGGAAAAA 643 hom 21 het 22 0 7 16 A 1 0 309090 CASAVA_Build 2 178235812 4D AGTATTCTAA GTTT/---- GTTTGTTTTC 3070 hom 66 het 28 0 23 7 GTTT 3 2 309091 CASAVA_Build 2 178236802 1I CCTTTTCTGA -/T TTCAGTCAGA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 T 2 3 309092 CASAVA_Build 2 178239714 5D ATCTTTTAAA TTGAG/----- TTATCTTTCT 3070 hom 57 het 23 0 20 5 TTGAG 1 0 309093 CASAVA_Build 2 178240569 1I GCTTGATGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 A 8 9 309094 CASAVA_Build 2 178243356 1D GCTAAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 41 0 35 7 T 11 10 309095 CASAVA_Build 2 178243463 1D ACTACAGTGT G/- CATCTAGGAC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 G 1 0 309096 CASAVA_Build 2 178243850 2I CCTTTCAAGA --/AT TCAACCACAA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 AT 0 1 309097 CASAVA_Build 2 178244252 1D GCTCCTTTCA C/- AGCTTAACTT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 C 1 0 309098 CASAVA_Build 2 178254432 12I CAGCAACTCG ------------/CTTGCTGTACAA CTTTGGAAAG 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 CTTGCTGTACAA 0 1 309099 CASAVA_Build 2 178255709 1I AGATGTTCCT -/G GCCAAGTAGG 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 G 1 2 309100 CASAVA_Build 2 178269632 4D GTAGACAGTA AAAG/---- AAAGGTAAAT 3070 het 3070 ref 47 24 20 4 AAAG 2 1 309101 CASAVA_Build 2 178271326 1D TGTCTTTAGT A/- AAGTGAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 3 2 309102 CASAVA_Build 2 178273377 2D TCCTGGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 21 4 11 6 A 16 14 309103 CASAVA_Build 2 178278205 2I ATAAAATATG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 9 11 309104 CASAVA_Build 2 178279870 1I TCGGTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 T 9 10 309105 CASAVA_Build 2 178281211 3D ATCAATGACA TTT/--- GATTGAATTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 T 3 0 309106 CASAVA_Build 2 178285991 1I GACAATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 T 10 11 309107 CASAVA_Build 2 178298279 1I GGAGAAGATA -/C CTTACGTTAG 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 C 1 2 309108 CASAVA_Build 2 178310030 1I GCCTGACAAA -/C ATGGAGAAAC 2164 het 1230 hom 14 4 7 3 C 0 1 309109 CASAVA_Build 2 178311114 1I CGGTGCTCCA -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 T 6 7 309110 CASAVA_Build 2 178317315 1I TGTTTCATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 16 11 T 12 13 309111 CASAVA_Build 2 178321611 1I GACAGCAGTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 0 1 309112 CASAVA_Build 2 178364509 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 2311 het 857 hom 15 4 7 4 A 15 14 309113 CASAVA_Build 2 178373158 1D AAAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 28 0 24 4 T 12 11 309114 CASAVA_Build 2 178373458 1I AACAGTCTAA -/T TTTAAAGCCT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 3 4 309115 CASAVA_Build 2 178374976 1I ATAAAGAACT -/C CTTCCAGTCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 2 309116 CASAVA_Build 2 178377685 2I AAGAAAATGT --/TA TATATATATA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TA 5 6 309117 CASAVA_Build 2 178386932 3D AGACAACACA AGG/--- AGAAGAGGAA 3070 hom 99 het 38 0 32 7 AGG 1 0 309118 CASAVA_Build 2 178425366 1I CAAATATTGA -/T TTTTTGATCT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 5 6 309119 CASAVA_Build 2 178426109 1I ATCTGGGTGG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 7 8 309120 CASAVA_Build 2 178436691 1D GTGGAGAAAA G/- AGAACTCTTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 G 1 0 309121 CASAVA_Build 2 178450977 1D TTAAATATTT A/- AAAAAGCTTT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 6 5 309122 CASAVA_Build 2 178460433 1D GTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 24 1 16 7 A 12 11 309123 CASAVA_Build 2 178462640 2D TTATTTCTTC TT/-- GTTTTTAATC 3070 het 3070 ref 37 21 15 2 T 2 0 309124 CASAVA_Build 2 178477658 1I CTCCCGAGTA -/T GCTGGGACTA 3070 het 1458 hom 22 5 13 4 T 0 1 309125 CASAVA_Build 2 178482775 2I TTTTGTATGA --/AT ATATGTTTAT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 AT 2 3 309126 CASAVA_Build 2 178483599 10D CACTTTTCGG CTTGAAAGCA/---------- CTTTATGAAC 3070 het 3070 ref 45 27 17 6 CTTGAAAGCA 1 0 309127 CASAVA_Build 2 178501491 2I AAAGAGAGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AG 6 7 309128 CASAVA_Build 2 178504148 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2195 hom 26 7 14 6 AAAC 4 3 309129 CASAVA_Build 2 178515381 2I TTAAAATTAT --/TA TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 24 1 19 4 TA 0 1 309130 CASAVA_Build 2 178522245 4D TAGTTTAAAA TCTT/---- TATTTTAATT 3070 het 3070 ref 38 17 17 6 TCTT 1 0 309131 CASAVA_Build 2 178523198 1I CTCCTTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 10 11 309132 CASAVA_Build 2 178535818 1D AAAGCTAAAG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 A 8 7 309133 CASAVA_Build 2 178536656 3D CTGCAGAAAT ATG/--- ATATCTGAAA 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 ATG 1 0 309134 CASAVA_Build 2 178537127 1D GTTTGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 100 hom 31 1 26 4 T 11 10 309135 CASAVA_Build 2 178553866 3I AAGAGCAATT ---/CTC CTTTAAATAG 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 CTC 0 1 309136 CASAVA_Build 2 178569205 2D CGTCTCAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 13 11 309137 CASAVA_Build 2 178573196 4I TTCAGAAAAG ----/AAGA AAGGGAAAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AAGA 0 1 309138 CASAVA_Build 2 178578112 2I CACAGTTTAC --/AT ATGAACACCT 3017 het 3017 ref 37 15 7 15 AT 1 2 309139 CASAVA_Build 2 178579797 2D GTCAAAACAA GG/-- GGGGGGGGGG 3070 hom 60 het 22 0 21 2 G 12 10 309140 CASAVA_Build 2 178582536 2D CAGGCAGAGG CT/-- GGATGACTAT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 CT 1 0 309141 CASAVA_Build 2 178587853 1I TGATCCTGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 10 309142 CASAVA_Build 2 178595455 1D ACATAGACGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 47 0 35 12 T 11 10 309143 CASAVA_Build 2 178603556 1D GTATTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 1861 het 1861 ref 32 22 4 7 A 11 10 309144 CASAVA_Build 2 178615451 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 206 hom 39 3 17 19 A 15 14 309145 CASAVA_Build 2 178615784 4D CAGAAGTTAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 45 22 16 9 AAAC 4 3 309146 CASAVA_Build 2 178649970 2I GGATAACCTG --/TC CTTCCTTACA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TC 0 1 309147 CASAVA_Build 2 178650234 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2964 het 389 hom 28 7 13 8 T 23 19 309148 CASAVA_Build 2 178651445 6I AAGCCCACCT ------/ACATTC ATAGTTGTAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ACATTC 0 1 309149 CASAVA_Build 2 178658513 1I TAGTTGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 35 0 28 7 A 11 12 309150 CASAVA_Build 2 178664753 1I GTAAGTGGGT -/G GGGGGGGCTC 3070 hom 90 het 32 0 29 3 G 7 8 309151 CASAVA_Build 2 178676157 1D CATTTCCAGT G/- GGGGGGGAAG 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 G 8 7 309152 CASAVA_Build 2 178678832 1D GTTTCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 800 hom 34 2 27 5 A 12 11 309153 CASAVA_Build 2 178682181 2D TGAAACAAAC AT/-- GTGTGCACAT 3070 het 3070 hom 36 12 20 7 AT 1 0 309154 CASAVA_Build 2 178686293 4D CTTTAAACTG GGGA/---- GGGACCTCTG 3070 hom 112 het 40 0 38 3 GGGA 2 1 309155 CASAVA_Build 2 178687992 1D AAGTTTCAGA G/- GATCTGTAAG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 G 2 1 309156 CASAVA_Build 2 178698694 1D AGACAGAGTG A/- AAAATGGATT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 5 4 309157 CASAVA_Build 2 178699188 2D ATTTTAAAAC AT/-- ATTGAGTAAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 AT 2 1 309158 CASAVA_Build 2 178707544 1I GCTTGCTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 24 0 17 7 T 9 10 309159 CASAVA_Build 2 178712590 2I TCTCAAATGG --/AA TAGTTTACAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 0 2 309160 CASAVA_Build 2 178714597 1D CTTGTACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 30 0 22 8 A 13 12 309161 CASAVA_Build 2 178717528 1D ACAACCATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 45 0 30 16 T 13 12 309162 CASAVA_Build 2 178732605 7D GCAGTGTATA AGAGTAG/------- CTGTTTTCAT 3070 het 3070 ref 38 19 18 4 AGAGTAG 1 0 309163 CASAVA_Build 2 178738499 14D ATCATACCCA TCCAAATAGCAGAT/-------------- TAAAAAATTT 2781 het 2781 ref 22 19 7 3 TCCAAATAGCAGAT 1 0 309164 CASAVA_Build 2 178743957 1I TTTGAGTGTT -/C TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 C 0 1 309165 CASAVA_Build 2 178744036 1D CTTTTTCCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 T 10 9 309166 CASAVA_Build 2 178745273 1I TTTCTCTTGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 61 hom 20 1 18 1 T 8 9 309167 CASAVA_Build 2 178748414 1D CCTGTTCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 T 10 9 309168 CASAVA_Build 2 178768780 1D TCAGTTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 19 7 10 2 T 10 9 309169 CASAVA_Build 2 178787926 4D CCATGTCTCT AAAC/---- AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 AAAC 2 1 309170 CASAVA_Build 2 178798230 5D AAAAAAAAGG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 1792 hom 23 8 11 7 AAAGA 4 3 309171 CASAVA_Build 2 178817414 1D ACAAAACAAG T/- TCTTTTGGTT 3070 hom 138 het 50 0 47 5 T 2 1 309172 CASAVA_Build 2 178819988 2D TGCCCCTCCC CA/-- CCCCCCCATG 2035 het 31 hom 13 1 5 9 CA 1 0 309173 CASAVA_Build 2 178830773 1I TTTTAATTCC -/T TTTTTTTTTT 2566 het 2566 ref 35 18 12 5 T 13 14 309174 CASAVA_Build 2 178831734 1D CTGTTTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 29 1 20 8 T 12 11 309175 CASAVA_Build 2 178835063 1I GATATATGTG -/T TCATGCACAG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 1 2 309176 CASAVA_Build 2 178859946 1I AAATTCATGC -/A GTAATGTTTC 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 0 1 309177 CASAVA_Build 2 178860937 1D AACAGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 T 13 12 309178 CASAVA_Build 2 178863398 1D ATTGTAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 11 13 T 17 16 309179 CASAVA_Build 2 178865979 1I CAAATGTCTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 T 8 9 309180 CASAVA_Build 2 178917641 1I AATTATATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 9 10 309181 CASAVA_Build 2 178945674 3D ACAGCTACTA CTG/--- CTGCTGCTGC 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 CTG 5 4 309182 CASAVA_Build 2 178945862 5D AGTATATGGG CTAAA/----- CTAAACTTAA 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 CTAAA 2 1 309183 CASAVA_Build 2 178946306 1I TTCTCTTACA -/T TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 T 6 7 309184 CASAVA_Build 2 178952306 4D AAGGAAAGGA AGGG/---- AGGGAGGGAG 998 hom 6 het 5 0 3 2 AGGG 6 5 309185 CASAVA_Build 2 178952387 2D AGGGAAAGAA AG/-- AGAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 AG 2 1 309186 CASAVA_Build 2 178967228 1D GCAAATGAGG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 8 7 309187 CASAVA_Build 2 178976403 6D CAAAAAATAG TAATAA/------ TAATAATAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 2 TAA 5 3 309188 CASAVA_Build 2 178981731 4D AAACTGTGTT CAAA/---- CAGAGAAATC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CAAA 1 0 309189 CASAVA_Build 2 178983421 4D TAAACAAACG AACA/---- AACAGCACAC 3070 hom 153 het 57 0 50 9 AACA 2 1 309190 CASAVA_Build 2 178985447 2D GAAAAGTGTT AA/-- GAGTCTAGCA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 2 0 309191 CASAVA_Build 2 178985558 1D TTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2400 hom 29 9 12 8 T 13 12 309192 CASAVA_Build 2 178997496 4D TATAGTGACC TTCT/---- TTGTCTCTTT 3070 het 3070 ref 44 22 18 6 TTCT 1 0 309193 CASAVA_Build 2 178998063 4D CATTTTGACT TTTG/---- TTTGTCTCAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 7 TTTG 2 1 309194 CASAVA_Build 2 178998932 5I ATTCTGTGGT -----/TGAAA TCATCTAATT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 TGAAA 0 1 309195 CASAVA_Build 2 179011309 2D ACATCAACAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 AT 6 5 309196 CASAVA_Build 2 179014275 4D TGAATGAATG AACA/---- AACAAAGGGA 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 AACA 2 1 309197 CASAVA_Build 2 179018332 1I TTCCTCAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 10 11 309198 CASAVA_Build 2 179020687 3I TAAAAATATG ---/TAC TACGTTATAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 TAC 1 2 309199 CASAVA_Build 2 179022190 4I GAATTCTTCC ----/TGAT TATCTAGAAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 TGAT 0 1 309200 CASAVA_Build 2 179029286 1D CTAGAATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 A 11 10 309201 CASAVA_Build 2 179038715 1D GTAAATAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 A 11 10 309202 CASAVA_Build 2 179052249 1I TTTTTGTACC -/A ATCCCATGGG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 1 2 309203 CASAVA_Build 2 179054816 1D CAGATTTTTT G/- GGGGGGGGGG 2376 het 1385 hom 33 8 8 17 G 12 11 309204 CASAVA_Build 2 179059568 4I TAAGTGTTGT ----/CTTA CTTTTAATGT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 CTTA 0 1 309205 CASAVA_Build 2 179060395 4D TCTTTTTTTC TTTT/---- TTTTCTTTTC 747 het 747 ref 37 16 6 15 T 8 4 309206 CASAVA_Build 2 179069488 2I CAAATTTAGT --/TA TATGAGATTT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 TA 1 2 309207 CASAVA_Build 2 179072054 1I AAAGATTAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 T 9 10 309208 CASAVA_Build 2 179079167 1I TAGTAGTCCC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 T 8 9 309209 CASAVA_Build 2 179082452 1I CTACTATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1958 hom 32 6 14 12 T 15 16 309210 CASAVA_Build 2 179090024 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1239 het 1239 ref 31 19 4 8 A 13 12 309211 CASAVA_Build 2 179096274 4D TGGAGCGCCT CTGA/---- CTGACTTCCC 3070 het 3070 ref 41 22 10 10 CTGA 2 1 309212 CASAVA_Build 2 179097825 1D AGCATGGGCT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 2209 hom 14 6 8 0 G 1 0 309213 CASAVA_Build 2 179099886 1I ACAAAACTAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 8 9 309214 CASAVA_Build 2 179108832 1D ACTGTATCAG A/- AAAAAAAAAA 2244 het 2244 ref 52 31 7 14 A 15 14 309215 CASAVA_Build 2 179168259 1D AACCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 A 11 10 309216 CASAVA_Build 2 179170548 1I TTCTTTCTCC -/G GCTTCATTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 1 2 309217 CASAVA_Build 2 179173383 22D AATTATTACC ATATATATATATATATATATAT/---------------------- ATATATATAC 3070 het 399 hom 17 1 16 3 AT 15 4 309218 CASAVA_Build 2 179185578 1D AACAAATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 20 6 T 11 10 309219 CASAVA_Build 2 179239324 4I ATGAAAAAAA ----/ATGT ATGATGCTTG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 ATGT 0 1 309220 CASAVA_Build 2 179249648 1I GACTCGCTGA -/G GAGTAATACA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 G 1 2 309221 CASAVA_Build 2 179271245 4I GTACAAAATC ----/TTAG TTAGACAGAA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 TTAG 1 2 309222 CASAVA_Build 2 179271336 2D CAAAATCGCT AA/-- GAGTAAATTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 2 0 309223 CASAVA_Build 2 179303834 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTTAAGG 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 3 2 309224 CASAVA_Build 2 179307144 2I AGACCAGGTG --/AA AAAGTTACTG 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 A 3 5 309225 CASAVA_Build 2 179325016 1D ATAATTCTGG A/- AAAAAAAAAA 2873 het 2873 ref 27 12 7 8 A 15 14 309226 CASAVA_Build 2 179328199 2I AGTTATTACT --/TC TGCCCAGACA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 TC 0 1 309227 CASAVA_Build 2 179336907 1I AAAACACTAA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 8 309228 CASAVA_Build 2 179342622 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 19 0 14 5 TA 8 7 309229 CASAVA_Build 2 179354556 1I TTGTTCGTTA -/T TTTTTCTCAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 5 6 309230 CASAVA_Build 2 179368696 1D GCTTAAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 T 11 10 309231 CASAVA_Build 2 179370215 1I AGACTGAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 T 9 10 309232 CASAVA_Build 2 179380722 2D TACAAAAGAG CC/-- CCAAACCTGA 3070 het 3070 hom 60 27 25 9 C 4 2 309233 CASAVA_Build 2 179386352 3I TTTTTTTTTT ---/AAC TTTTTTGCAA 3070 hom 68 het 37 0 24 13 AAC 0 1 309234 CASAVA_Build 2 179387928 1D AAAAATAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 11 10 309235 CASAVA_Build 2 179396161 1I ATTTTTTCTC -/T TGAGTTGGAG 3070 hom 63 het 33 0 27 6 T 1 2 309236 CASAVA_Build 2 179400315 2D TGGAATATTC TA/-- TGTGTCAATT 3070 het 3070 hom 58 24 25 9 TA 1 0 309237 CASAVA_Build 2 179410823 2I CAACCTACAA --/GG GGTTAAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 2 4 309238 CASAVA_Build 2 179415938 2I TCAGGATTAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 TG 7 8 309239 CASAVA_Build 2 179423547 12I CCTGTATTTT ------------/ATCTCCAGCCAA ATCTCCAGCC 3070 hom 114 het 48 0 37 11 ATCTCCAGCCAA 1 2 309240 CASAVA_Build 2 179431416 3I TATAATAAGT ---/ACC ACATCTGAGG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 ACC 0 1 309241 CASAVA_Build 2 179434141 1D ATGTTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 1510 het 1510 ref 40 25 6 9 T 12 11 309242 CASAVA_Build 2 179445442 1D AGAGGCACAG T/- TCAGCTCTCG 3070 het 3070 hom 51 20 28 3 T 2 1 309243 CASAVA_Build 2 179446269 1I TGGCAACTCC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 7 8 309244 CASAVA_Build 2 179452927 10I GTGCTGGGAT ----------/AAAACTGGCC AAAACTGGCC 3070 het 3070 hom 64 17 34 13 AAAACTGGCC 1 2 309245 CASAVA_Build 2 179462182 2D ACTTGTTGAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 197 hom 35 6 16 14 A 11 9 309246 CASAVA_Build 2 179463864 3D ACATGCCACT TTG/--- TTAAGTGCAT 3070 het 3070 hom 52 19 28 6 TTG 1 0 309247 CASAVA_Build 2 179464544 4D CTGGCTTTTC TAAG/---- TAATGCAATG 3070 het 3070 ref 48 23 19 7 TAAG 1 0 309248 CASAVA_Build 2 179465186 2D TTATCATGTG TA/-- GTTTGGCTCA 3070 het 3070 hom 49 19 26 7 TA 1 0 309249 CASAVA_Build 2 179497460 1I CTGCTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 12 13 309250 CASAVA_Build 2 179502527 4I TGAAGATAAA ----/CAGT CAGAACATTT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 CAGT 0 1 309251 CASAVA_Build 2 179504704 1D TATTCTGAAC T/- AGGTAGCCAT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 1 0 309252 CASAVA_Build 2 179507072 1D GACATCAGTA T/- TTTTTTCAAC 3070 hom 99 het 39 0 32 7 T 7 6 309253 CASAVA_Build 2 179514762 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 A 10 11 309254 CASAVA_Build 2 179525848 5D AGGAATTTTT TTCTC/----- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 13 11 2 TTCTC 1 0 309255 CASAVA_Build 2 179529856 1D ATGAGAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2650 hom 29 7 16 6 T 13 12 309256 CASAVA_Build 2 179531685 1D TTTTTTCCCC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 8 7 309257 CASAVA_Build 2 179534084 1D AAAGCTTTTT G/- GACCAAAGAC 3070 het 3070 hom 41 16 24 1 G 2 1 309258 CASAVA_Build 2 179536879 3D CAACCAGGTG AGA/--- AGAATGGGAG 3070 het 3070 ref 40 17 20 3 AGA 2 1 309259 CASAVA_Build 2 179554369 1D TACGAATATA C/- TCTCAGACCA 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 C 1 0 309260 CASAVA_Build 2 179563228 1D CAGCTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 8 A 11 10 309261 CASAVA_Build 2 179569059 1D TTTAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 1433 het 1433 ref 35 20 4 11 T 15 14 309262 CASAVA_Build 2 179571086 4I TAAGAATATT ----/TGTA TGTATATTGA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 TGTA 1 2 309263 CASAVA_Build 2 179578287 1I TGGAGAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 462 hom 35 1 21 13 A 9 10 309264 CASAVA_Build 2 179604177 2D TTTTCACTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 11 9 309265 CASAVA_Build 2 179612971 1D GATGATAAAA C/- TACTAGTTAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 C 1 0 309266 CASAVA_Build 2 179617944 1I GGGGTTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 34 0 26 8 T 9 10 309267 CASAVA_Build 2 179618893 2I GCTGTCAAAC --/AG GGGAATAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AG 0 1 309268 CASAVA_Build 2 179642337 1I CATTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 23 0 21 2 A 11 12 309269 CASAVA_Build 2 179657450 1I TGTTACTGCC -/T TTTTTTTTTT 742 het 742 ref 26 15 3 8 T 13 14 309270 CASAVA_Build 2 179659959 8D CTTCTCTCTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 2043 hom 27 10 10 8 T 19 11 309271 CASAVA_Build 2 179679094 11D CTGCTTAGCT ATGTTCCAGCC/----------- ATGTTTTTAA 3070 het 3070 ref 57 28 24 11 ATGTTCCAGCC 1 0 309272 CASAVA_Build 2 179686939 1D TACACAGGGT G/- GGGGGAGCTT 3070 het 3070 hom 41 21 18 2 G 6 5 309273 CASAVA_Build 2 179689276 1D TTTTCACCAC A/- AAAAAGTTCT 3070 het 2867 hom 27 10 10 7 A 6 5 309274 CASAVA_Build 2 179690371 4D TTCTTCAACA AGAT/---- AGATAAACTA 3070 het 3070 ref 43 29 11 3 AGAT 2 1 309275 CASAVA_Build 2 179696641 1I AATGATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 32 1 20 11 A 13 14 309276 CASAVA_Build 2 179705423 1D TGAGATAACA T/- TTTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 33 20 8 6 T 6 5 309277 CASAVA_Build 2 179714479 1D ATTGTAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 13 12 309278 CASAVA_Build 2 179714721 3D AGGGTAGATT CAG/--- ATTATTTGGG 3070 het 3070 hom 39 16 16 9 CAG 1 0 309279 CASAVA_Build 2 179716042 9I AATGTCTCCC ---------/TTTAGTATT TTTAGTATTT 3070 het 2740 hom 27 6 15 6 TTTAGTATT 1 2 309280 CASAVA_Build 2 179717087 1D ATACATACGG T/- TTATATTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 3 2 309281 CASAVA_Build 2 179732806 1I GGCAAAGAAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 2758 hom 34 8 21 5 A 7 8 309282 CASAVA_Build 2 179757830 1I TCAGGGCTAT -/A ATTTAAATCC 3070 het 3070 hom 42 13 26 3 A 1 2 309283 CASAVA_Build 2 179762768 1D ACTGAGAGCC A/- AAATAAAGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 4 3 309284 CASAVA_Build 2 179791270 1D AAAATACCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 27 0 19 8 A 10 9 309285 CASAVA_Build 2 179791537 1I AAGAAGCACC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 8 9 309286 CASAVA_Build 2 179792027 14I GCTTTTCCTT --------------/CAAAGGAGCTCCCA CCAGCTGTCT 3070 het 3070 ref 44 24 12 8 CAAAGGAGCTCCCA 0 1 309287 CASAVA_Build 2 179793067 6D ACTATATTTA AAATTC/------ AAAAGTCTAC 3070 het 3070 hom 29 9 16 6 AAATTC 1 0 309288 CASAVA_Build 2 179802755 6D ATACTCAAAT ACACAC/------ ACACACACAC 1342 het 1342 ref 12 6 4 3 AC 17 14 309289 CASAVA_Build 2 179804488 1I CTAAATATCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 9 10 309290 CASAVA_Build 2 179804691 1D CCAAAAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 A 15 14 309291 CASAVA_Build 2 179805219 1I TACATTTTCC -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 28 15 7 6 A 7 8 309292 CASAVA_Build 2 179809133 7I TTGAATTACT -------/TAAGATA TAATATGAAC 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 TAAGATA 0 1 309293 CASAVA_Build 2 179809899 1I AAGGATCATC -/T TTTTTGGTCA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 5 6 309294 CASAVA_Build 2 179812364 1I GGAAGTACAA -/G GGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 G 2 3 309295 CASAVA_Build 2 179814598 1I TCTCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 21 0 15 6 A 10 11 309296 CASAVA_Build 2 179817448 1I ACAAACCAAC -/A AAAAAAAAAA 2821 het 2062 hom 29 8 13 8 A 12 13 309297 CASAVA_Build 2 179823677 1I ATCACTTTTT -/G AAAAGACCTG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 G 0 1 309298 CASAVA_Build 2 179826893 1D CAACATGGCA T/- AAACCCTGAG 3070 het 3070 hom 34 12 14 9 T 1 0 309299 CASAVA_Build 2 179836611 1I CCGCGATGTC -/T TGTGTGTAAG 3070 het 3070 ref 49 20 21 8 T 1 2 309300 CASAVA_Build 2 179841627 1D AAATCAGTCC A/- AAAAAAAAAA 2685 het 1850 hom 23 8 7 8 A 13 12 309301 CASAVA_Build 2 179843246 1D TATGTTTCCT A/- AAAAAAAAAA 2722 het 1187 hom 19 3 8 8 A 15 14 309302 CASAVA_Build 2 179844415 1D CTTCAATCAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 T 9 8 309303 CASAVA_Build 2 179851724 6D AAACAAAAAC AAACAA/------ AAACAAACAA 1430 het 1265 hom 9 5 4 2 AAACAA 2 1 309304 CASAVA_Build 2 179869624 2D CTAATAGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2672 hom 24 10 10 4 A 14 12 309305 CASAVA_Build 2 179872928 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2485 het 1409 hom 19 6 8 6 T 12 13 309306 CASAVA_Build 2 179874068 1I TAGTAGATAA -/T TTTTTTTTTT 2022 het 1795 hom 29 7 9 13 T 17 18 309307 CASAVA_Build 2 179874582 7I CAGCAGATCA -------/CTTAAGC CAAGGAGTTC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 CTTAAGC 0 1 309308 CASAVA_Build 2 179883772 1I AAGCTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 36 1 28 7 A 10 11 309309 CASAVA_Build 2 179884933 4I TTAAATAAAT ----/ACTC ACAAACACTC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 ACTC 0 1 309310 CASAVA_Build 2 179885711 1I TATAACATCA -/T TTTACAACTA 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 T 3 4 309311 CASAVA_Build 2 179894728 1D TTGCATGTTA T/- TTTTGTGTTA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 5 4 309312 CASAVA_Build 2 179903764 2D CCATGACCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 34 3 19 12 A 16 14 309313 CASAVA_Build 2 179904273 1I ATTAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 8 9 309314 CASAVA_Build 2 179911521 1I ATCAGGATAC -/T TTTTTTGCTA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 6 7 309315 CASAVA_Build 2 179914437 2I TCTAAATTAT --/GC CTCTTGAGGA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 GC 0 1 309316 CASAVA_Build 2 179926270 1D GCCATATATA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 7 6 309317 CASAVA_Build 2 179930653 4D ATTGAGCAAG TTAA/---- TTAACCTTTC 3070 het 3070 hom 41 16 17 10 TTAA 2 1 309318 CASAVA_Build 2 179942525 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 T 10 11 309319 CASAVA_Build 2 179944478 1I TAACAAATGC -/T TAGATCTATT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 T 1 2 309320 CASAVA_Build 2 179957477 2I TCAGCAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 A 12 14 309321 CASAVA_Build 2 179958696 6D TATATATTTC ATATAT/------ ATATACATAG 3070 het 2446 hom 22 8 11 5 AT 5 2 309322 CASAVA_Build 2 179969277 1I GTGTATCACC -/T TTTTTTTTTT 2307 het 2202 hom 19 7 6 6 T 11 12 309323 CASAVA_Build 2 179970204 2I ATACACATAT --/AC ACACATGTAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AC 2 3 309324 CASAVA_Build 2 179975399 1D CCTCTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 29 1 23 5 A 11 10 309325 CASAVA_Build 2 179979818 7D CTATTCTTTC TCCTTTT/------- TCCTAATAGT 3070 het 3070 ref 32 19 13 2 TCCTTTT 1 0 309326 CASAVA_Build 2 179988371 1I TCATTTTTAG -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 A 6 7 309327 CASAVA_Build 2 179990252 1D ATAATCTCCT A/- AAAATGTTAT 3070 het 3070 hom 38 16 21 2 A 5 4 309328 CASAVA_Build 2 179992756 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 7 8 309329 CASAVA_Build 2 179994054 7I CACATTTTGT -------/TTATCCA TTATCCATTC 3070 het 3070 ref 45 22 12 11 TTATCCA 1 2 309330 CASAVA_Build 2 180003181 2D TGTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 43 2 28 13 T 13 11 309331 CASAVA_Build 2 180016125 1D GTGGGTGAAT G/- GGGGGTACTG 3070 hom 60 het 23 0 21 3 G 6 5 309332 CASAVA_Build 2 180020951 2D ATTTCCATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 T 14 12 309333 CASAVA_Build 2 180027482 1I TTCCATTTAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 A 7 8 309334 CASAVA_Build 2 180036325 1D TCTCTATTTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 T 8 7 309335 CASAVA_Build 2 180041836 4I CTTTATGGAC ----/CTAA CTACGTACTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 CTAA 0 1 309336 CASAVA_Build 2 180117422 1I CCTACAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 11 12 309337 CASAVA_Build 2 180135969 1D CTATTAGGCC T/- GAAGAATTTG 3070 het 3070 ref 49 23 18 10 T 1 0 309338 CASAVA_Build 2 180148760 2D CTTAAAAGAC TT/-- TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 4 2 309339 CASAVA_Build 2 180150775 1I TGTCTTTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 39 0 35 4 A 9 10 309340 CASAVA_Build 2 180153181 5D CTCTACAAAC ATCAT/----- TTTATCACAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 5 ATCAT 1 0 309341 CASAVA_Build 2 180155152 4D TTACACTAAT AGAG/---- AGAAAAGACT 3070 het 3070 ref 29 15 11 5 AG 3 1 309342 CASAVA_Build 2 180160671 2I TCTAAGTAAA --/AG AGGTTTAAAA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AG 1 2 309343 CASAVA_Build 2 180167770 1I AGGTAAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 490 hom 43 2 31 10 T 13 14 309344 CASAVA_Build 2 180184395 1I ATTTTTATCA -/T TTGTCATTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 2 3 309345 CASAVA_Build 2 180197943 1I CTAAATGTTC -/T AAGTGATATT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 0 1 309346 CASAVA_Build 2 180210470 1I AGTTACCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 44 1 35 8 A 11 12 309347 CASAVA_Build 2 180214057 1I ACCACTGCAT -/A AAAAAAGATT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 6 7 309348 CASAVA_Build 2 180214174 2D AGCCATCTGC TA/-- TAAAACGTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 TA 2 1 309349 CASAVA_Build 2 180214670 1I ACCCTTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 32 1 28 3 A 10 11 309350 CASAVA_Build 2 180216208 3I TTAAATACAT ---/TGA TGATGATGTC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TGA 2 3 309351 CASAVA_Build 2 180228465 1D AAAAGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 28 0 18 10 A 12 11 309352 CASAVA_Build 2 180237081 1D TCTCTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 8 15 T 11 10 309353 CASAVA_Build 2 180239871 3D TACCTGTAGC TGT/--- TGTTGTTGTT 2640 het 2640 ref 25 18 6 2 TGT 4 3 309354 CASAVA_Build 2 180240739 1I CAACATACAG -/T TGCAGAGATG 3070 het 3070 hom 65 23 34 8 T 1 2 309355 CASAVA_Build 2 180241516 1I TCTATTTTTG -/T TTTGCACATA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 3 4 309356 CASAVA_Build 2 180241595 1D AACACCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2393 het 597 hom 31 3 11 17 T 17 16 309357 CASAVA_Build 2 180248764 1D CTGACAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 37 1 22 14 T 15 14 309358 CASAVA_Build 2 180255747 1I CACACAGACA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 6 7 309359 CASAVA_Build 2 180258668 1I AGAAAGTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 A 11 12 309360 CASAVA_Build 2 180271154 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 650 hom 29 2 25 2 A 11 12 309361 CASAVA_Build 2 180272090 2I TTGTGTTAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 AT 6 7 309362 CASAVA_Build 2 180273031 2D35M1I AAACAGAAAA ACACACACACACACACACAAACAAAACAGATCTTGCC-/--ACACACACACACACACAAACAAAACAGATCTTGCCA AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 22 0 14 15 N/A 0 0 309363 CASAVA_Build 2 180273451 1D AGTAAATGTT G/- CTTTCTTTAA 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 G 1 0 309364 CASAVA_Build 2 180367382 7I ATTCTAAAAC -------/TTAATGA TAGAAATTCT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTAATGA 0 1 309365 CASAVA_Build 2 180370034 1I AATGGGGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 A 9 10 309366 CASAVA_Build 2 180397851 1D AGTCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 1346 het 1346 ref 37 30 3 4 A 12 11 309367 CASAVA_Build 2 180427439 1I AGGCTGCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2702 hom 35 10 19 6 A 11 12 309368 CASAVA_Build 2 180435287 4I AGATGATTGA ----/CACT CACTACGTAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 CACT 1 2 309369 CASAVA_Build 2 180487393 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 16 1 14 1 T 11 12 309370 CASAVA_Build 2 180492917 1I AGCCTTCTTG -/A AAAATTAAAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 4 5 309371 CASAVA_Build 2 180493927 4I TTAAAATGAT ----/AAAG AAAGAGACTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAAG 1 2 309372 CASAVA_Build 2 180509726 1D AAAGATGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 10 9 309373 CASAVA_Build 2 180514758 1D TGAATTTTTT G/- GGGGGGGGGA 3070 hom 39 het 21 0 14 7 G 10 9 309374 CASAVA_Build 2 180517660 1D TCCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 927 hom 32 2 25 5 A 12 11 309375 CASAVA_Build 2 180521370 1I CATTAGGTGA -/T TTTTTTAACC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 6 7 309376 CASAVA_Build 2 180530815 1D TATACATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 38 2 30 6 A 11 10 309377 CASAVA_Build 2 180530826 1D AAAAAAAAAA C/- AGAAGAAAGA 3070 het 90 hom 35 3 29 3 C 1 0 309378 CASAVA_Build 2 180540719 2I TGTTAAAGAC --/AT ATATATACAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 3 4 309379 CASAVA_Build 2 180549479 1I CATTTGCAAA -/C CATACACCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 1 2 309380 CASAVA_Build 2 180549607 2D TACAAATAGC AT/-- ATATATATAT 1897 het 1897 ref 31 23 4 5 AT 7 6 309381 CASAVA_Build 2 180552255 3I TAACACATTA ---/AAC AACAAGAACT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 AAC 1 2 309382 CASAVA_Build 2 180565977 2D CCATGTGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 134 hom 46 1 41 6 AC 7 6 309383 CASAVA_Build 2 180569804 1I52M1I GTTAAAAGAT -AAAAAAAAAAGTTAACGTAGAATTCCAGCAAAAACAATCTTTAAAGGAAGAC-/AAAAAAAAAAAGTTAACGTAGAATTCCAGCAAAAACAATCTTTAAAGGAAGACA AAAATGAAGA 3070 het 189 hom 23 1 19 18 N/A 0 0 309384 CASAVA_Build 2 180583661 1D ATTTTTCTAC T/- TTTTTTTTTA 1179 het 1179 ref 35 26 4 5 T 10 9 309385 CASAVA_Build 2 180584116 1D CACCTCTGCT C/- CATATGGTCA 3070 hom 72 het 33 0 25 9 C 2 1 309386 CASAVA_Build 2 180584681 1I TATGGATGAG -/A AAAAATATTT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 5 6 309387 CASAVA_Build 2 180595208 2D TTATTTAGCA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 11 9 309388 CASAVA_Build 2 180602657 1D TATCAAACAC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 39 18 15 7 T 9 8 309389 CASAVA_Build 2 180609935 1D TGGCTACCAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 2844 hom 26 7 16 4 A 9 8 309390 CASAVA_Build 2 180611155 1D CTTTTGTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 11 14 6 T 10 9 309391 CASAVA_Build 2 180620353 1I TTAAAAAGAG -/C CCTCAATAAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 C 2 3 309392 CASAVA_Build 2 180622734 2D CACACATATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 43 19 20 6 CA 7 6 309393 CASAVA_Build 2 180623046 1I AGTTGATGGA -/T TGTCCCATTC 3070 het 3070 ref 56 28 22 6 T 1 2 309394 CASAVA_Build 2 180627118 1I GCACAGCAGG -/A AAAAAAAAAA 2842 hom 21 het 12 0 8 4 A 13 14 309395 CASAVA_Build 2 180629545 23D GTCTTTGGAA TGTTTCTAGACTTGCTGGCTCCT/----------------------- TGTTTCTAGC 3070 het 3070 ref 49 26 21 7 TGTTTCTAGACTTGCTGGCTCCT 1 0 309396 CASAVA_Build 2 180630528 1D20M3I CTATAGTTGC AAAATTAAAACCTGGAACAAT---/-AAATTAAAACCTGGAACAATTGG TGGTGCTATA 3070 het 391 hom 35 2 16 24 N/A 0 0 309397 CASAVA_Build 2 180632874 2D AGCACGGTCT TC/-- TCAGTCTTAC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 TC 2 1 309398 CASAVA_Build 2 180633419 2D CCTCGATTTG CT/-- CTCTCTATGC 2981 het 2981 ref 30 17 8 5 CT 4 3 309399 CASAVA_Build 2 180636558 1D AAATGAGGTG A/- AGCCCTACAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 2 1 309400 CASAVA_Build 2 180641590 7I TTTTGATAAC -------/TTATAAG TTATAAACTA 3070 hom 57 het 29 0 19 10 TTATAAG 0 1 309401 CASAVA_Build 2 180642739 1D AATGAACATA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 8 7 309402 CASAVA_Build 2 180644733 2D CAGGGCTCAA AG/-- AGAGGCAGTT 3070 het 3070 ref 51 31 18 4 AG 3 2 309403 CASAVA_Build 2 180655636 3I AGGCATTCAG ---/CTT CTTCTTCTGT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 CTT 2 3 309404 CASAVA_Build 2 180666190 1D AGTCCAAGAT C/- CAAGGCATCA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 C 2 1 309405 CASAVA_Build 2 180668710 5D AAAACCATAC AAAGA/----- AAAGAATCAC 3070 het 3070 hom 40 19 19 5 AAAGA 2 1 309406 CASAVA_Build 2 180669006 1D AATAAGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 9 11 5 A 11 10 309407 CASAVA_Build 2 180669461 4D CCTTCATGTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 A 14 10 309408 CASAVA_Build 2 180670214 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 A 8 7 309409 CASAVA_Build 2 180670328 1D ATTAAGGATT C/- CCCATTCAAT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 C 4 3 309410 CASAVA_Build 2 180674119 2D TCCAAGCTCA CG/-- AGAGAAGTTA 3070 het 3070 ref 24 12 9 5 CG 1 0 309411 CASAVA_Build 2 180678093 4I ATTTTATCTA ----/TTTC TTGTTATCAG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 TTTC 0 1 309412 CASAVA_Build 2 180678184 4I CCAAATTGAC ----/AGAG AGAAATGATA 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 AG 1 3 309413 CASAVA_Build 2 180679589 1I GGCTGAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 13 7 T 10 11 309414 CASAVA_Build 2 180681481 1D TTTCTTTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 20 2 T 10 9 309415 CASAVA_Build 2 180685713 2D TTATGCCTTT TC/-- TTTCATATGA 3070 hom 132 het 47 0 45 4 TC 1 0 309416 CASAVA_Build 2 180686192 3I CCATTTCCTT ---/AAG AAACTGCAGA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAG 0 1 309417 CASAVA_Build 2 180686849 5I TATCATATTA -----/AATAT AATACTAACA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AATAT 0 1 309418 CASAVA_Build 2 180691760 4I AGCACAAATT ----/CTTA CTTTTTGCTA 3070 hom 129 het 51 0 43 8 CTTA 0 1 309419 CASAVA_Build 2 180693123 1I CCTGGAGAGT -/G GGGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 G 7 8 309420 CASAVA_Build 2 180699347 2D TATGACAGAA GG/-- GGGCATCATC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 5 3 309421 CASAVA_Build 2 180700246 2I ATAGGGAATC --/AG AGATTTCTTT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 AG 1 2 309422 CASAVA_Build 2 180702183 1I ATTTCTCCTC -/T TTTGTAATGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 3 4 309423 CASAVA_Build 2 180707161 1D CTCTGTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 15 14 309424 CASAVA_Build 2 180710288 1D GAAAATATTG A/- GAGGATTATA 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 A 1 0 309425 CASAVA_Build 2 180715560 1I TCCTAGAATC -/T TTTTTTTTTT 2202 het 1004 hom 36 4 11 21 T 16 17 309426 CASAVA_Build 2 180716346 1I CAAAAACCCA -/T TTTTTACAGG 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 T 5 6 309427 CASAVA_Build 2 180719317 1I AGGCAGATTT -/A AAACCTGCTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 3 4 309428 CASAVA_Build 2 180725233 1D GGGGGGTATG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 T 8 7 309429 CASAVA_Build 2 180730640 1D ACCTCATTGA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 76 het 32 0 26 6 T 8 7 309430 CASAVA_Build 2 180734004 1I ATATATTTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 121 hom 18 1 14 3 A 9 10 309431 CASAVA_Build 2 180740286 1D TTAAACCTAA T/- TTTTTAGGGG 3070 het 3070 hom 46 22 19 6 T 6 5 309432 CASAVA_Build 2 180745364 2D TTCTCAAAAG AT/-- AAAATCAACA 3070 hom 43 het 22 0 13 10 AT 1 0 309433 CASAVA_Build 2 180746259 1D CCATAATATC A/- AAAACCAGAC 3070 hom 120 het 42 0 41 2 A 5 4 309434 CASAVA_Build 2 180753410 2D AATTTTTCTC CG/-- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 CG 1 0 309435 CASAVA_Build 2 180762208 4I GTCATAATGA ----/TTTG TTTGTTTTCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTTG 1 2 309436 CASAVA_Build 2 180762832 3I GAGCTAACTT ---/AAG AAGGGGACAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 AAG 1 2 309437 CASAVA_Build 2 180763401 2D TTAGTGAAAC TG/-- TGAGAATAGC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 TG 2 1 309438 CASAVA_Build 2 180764314 1I ACCTTCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 33 2 27 4 T 11 12 309439 CASAVA_Build 2 180767048 1I ATTTATTAAA -/T AGGGAATCCT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 0 1 309440 CASAVA_Build 2 180773227 1I TAGTTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 332 hom 49 1 37 11 T 10 11 309441 CASAVA_Build 2 180780494 6I TTTGAATTAA ------/TAAAAT TAAAACAATG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAAAAT 0 1 309442 CASAVA_Build 2 180785774 1I AAAATGTTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2779 hom 24 8 8 8 T 13 14 309443 CASAVA_Build 2 180795733 1D TTATTATAAT G/- GTAACTTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 G 2 1 309444 CASAVA_Build 2 180800231 4I ACTCATGCAT ----/CTTA CTTGTGCTTT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 CTTA 0 1 309445 CASAVA_Build 2 180817114 6I TAGGAGAATG ------/GTATCT GTATCTTGAC 3070 het 3070 ref 54 25 22 7 GTATCT 1 2 309446 CASAVA_Build 2 180821817 1D CATTGTTCTT A/- GAGCTGAGAA 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 A 1 0 309447 CASAVA_Build 2 180823907 3D GCAGGAAGGT GGA/--- GAATTCCCAG 3070 het 3070 hom 51 21 27 4 GGA 1 0 309448 CASAVA_Build 2 180839444 2I CAGAGGAGGT --/GA GAGAGATGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 GA 3 4 309449 CASAVA_Build 2 180852392 1I CTCCATTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 28 1 20 7 T 10 11 309450 CASAVA_Build 2 180862637 1I AAAGAACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1390 hom 46 3 35 8 T 11 12 309451 CASAVA_Build 2 180875994 1D AAACCACTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 8 309452 CASAVA_Build 2 180881088 4I ACTAAAATAC ----/CAAA CAAATTGAGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CAAA 1 2 309453 CASAVA_Build 2 180885132 1I GTAGAAGGAA -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 6 7 309454 CASAVA_Build 2 180919874 1D AATCAGTTGA C/- CACATGTATG 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 C 2 1 309455 CASAVA_Build 2 180925589 1D AAAGCTTCCC T/- GGTGAGGGCA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 T 1 0 309456 CASAVA_Build 2 180930230 1I GTTTGTAATA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 7 8 309457 CASAVA_Build 2 180933747 1I TGGTTCTTTG -/A AGAAAAGTTC 3070 hom 114 het 41 0 37 4 A 1 2 309458 CASAVA_Build 2 180939404 1I TTAATTCATA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 7 8 309459 CASAVA_Build 2 180940626 1I AAAGATCAAT -/A AAAAATTATT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 5 6 309460 CASAVA_Build 2 180946784 4I ATTTTTCATT ----/TTTA TTTATTTGGG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TTTA 1 2 309461 CASAVA_Build 2 180947306 4I CTGCAAATAT ----/TTTG TTTGTTTGTC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TTTG 2 3 309462 CASAVA_Build 2 180969050 1D TTGATTTTGA T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 35 15 13 8 T 7 6 309463 CASAVA_Build 2 180980961 4D TATATCTGAT ACAC/---- ACACAAATAT 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 AC 4 2 309464 CASAVA_Build 2 180981090 5I TACACATATT -----/TATAA TATATATGTA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TATAA 0 1 309465 CASAVA_Build 2 180986221 4D AAGAAAAAAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 1206 hom 27 5 15 7 AGAA 4 3 309466 CASAVA_Build 2 180992702 6I AAGTAAAAGT ------/TAAACA TAAACAAGTA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TAAACA 1 2 309467 CASAVA_Build 2 180992848 5I TTATTTTATG -----/TTAAC TTAATAGTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTAAC 0 1 309468 CASAVA_Build 2 180995666 2D TGCTTTTATC TA/-- TGTTATATGA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 TA 1 0 309469 CASAVA_Build 2 181003041 1I GGATGTCCAG -/T TTCACCACTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 309470 CASAVA_Build 2 181016990 7D ACTTCCTATG TGGTAAA/------- TGGTCTTCTG 3070 het 3070 ref 51 23 24 7 TGGTAAA 1 0 309471 CASAVA_Build 2 181042185 1I ACCCAGTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1225 hom 34 7 18 9 A 13 14 309472 CASAVA_Build 2 181048089 1I CAGTATTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 T 9 10 309473 CASAVA_Build 2 181057003 1D GAGGGGACAA T/- CATTCAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 T 1 0 309474 CASAVA_Build 2 181058597 2I TAAGATAGAC --/AA ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 1 3 309475 CASAVA_Build 2 181065854 1D TTTTTGATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2351 hom 20 6 7 7 T 13 12 309476 CASAVA_Build 2 181081590 1I TACATTCCCA -/C CAACAGTGTA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 C 1 2 309477 CASAVA_Build 2 181082419 1D GTAAATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2929 hom 28 9 12 7 A 11 10 309478 CASAVA_Build 2 181099696 1D TCTTTGATGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 T 10 9 309479 CASAVA_Build 2 181123158 1D TAAATTAATA T/- TTTAACAGTT 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 T 4 3 309480 CASAVA_Build 2 181129261 1D ACAACAGCAT C/- AACAAAATGT 3070 het 3070 ref 52 28 18 7 C 1 0 309481 CASAVA_Build 2 181132208 4I TTTAAATGTG ----/ATGA ATAAGCAGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 ATGA 0 1 309482 CASAVA_Build 2 181149676 1I GTATGTTGAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 T 8 9 309483 CASAVA_Build 2 181153006 6I TGAAGTTCTC ------/AAACTT AAAGGTATGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAACTT 0 1 309484 CASAVA_Build 2 181167995 1I ACATTATCAG -/A AAAAATGTGA 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 5 6 309485 CASAVA_Build 2 181172408 1D ATCCTTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 A 12 11 309486 CASAVA_Build 2 181175759 1D GATTCCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 263 hom 34 1 29 4 T 11 10 309487 CASAVA_Build 2 181180779 11D AAGCTGTCAT TTAGCTTGACA/----------- AAAGAAAGGG 3070 het 3070 ref 51 21 22 16 TTAGCTTGACA 1 0 309488 CASAVA_Build 2 181181931 1I AGCCGACCAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 A 8 9 309489 CASAVA_Build 2 181183198 2I TCTGTCACTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 TC 7 8 309490 CASAVA_Build 2 181190575 1D TTGATAGTTA C/- TCAAGAATAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 2 C 1 0 309491 CASAVA_Build 2 181196829 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTGTTTTT 2111 het 631 hom 13 3 9 1 T 5 4 309492 CASAVA_Build 2 181198858 1I3M12I AAATTTTGCA -TCT------------/TTCTATAATATTTATA ATGCCATGAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 5 N/A 0 0 309493 CASAVA_Build 2 181200766 1I AGATGGAGAT -/A AGAGATTTAT 2704 het 2704 ref 35 13 7 15 A 1 2 309494 CASAVA_Build 2 181202582 1I ATCTTTTCAG -/A GGCAATCAAG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 0 1 309495 CASAVA_Build 2 181215067 1I AAAGACATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 9 10 309496 CASAVA_Build 2 181220550 2D AAAGCTAAGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 T 11 9 309497 CASAVA_Build 2 181223153 1D GCCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1484 het 1484 ref 38 29 6 3 T 13 12 309498 CASAVA_Build 2 181226307 1I CAGCTGCTTG -/T TTTTTTTTTT 2522 het 2522 ref 27 13 8 6 T 10 11 309499 CASAVA_Build 2 181227105 5D TTTTGTTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 TTTGT 4 3 309500 CASAVA_Build 2 181229154 2I GAAAGAAAGA --/AG AGAGAGCATT 3070 het 3070 ref 54 26 19 9 AG 3 4 309501 CASAVA_Build 2 181232915 4I ACCCTTGCAT ----/CTTA CTTCTGTTCT 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 CTTA 0 1 309502 CASAVA_Build 2 181233481 1I GATTTTTATC -/T TTTCTATCTT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 3 4 309503 CASAVA_Build 2 181251727 1I ACAGGAAGAG -/A AATTCTTAAA 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 2 3 309504 CASAVA_Build 2 181263839 2D TCTCTCTCCC TG/-- TGTGTGTGTG 2458 het 1847 hom 27 8 10 10 TG 10 9 309505 CASAVA_Build 2 181270423 1D GCTTATTAAA T/- GAGATTTGGG 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 T 1 0 309506 CASAVA_Build 2 181285443 1I CTCAGCAACA -/T TTTTTTTTTT 2261 het 2261 ref 40 19 7 14 T 11 12 309507 CASAVA_Build 2 181302685 1D ATTTTTTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 13 2 A 10 9 309508 CASAVA_Build 2 181303160 1I ACTCCAGCCT -/G GGCAACAGAG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 G 2 3 309509 CASAVA_Build 2 181304421 19D GTGTCAACTT GAAAGCAGAGAGAAAGCGA/------------------- GAAAGCAGAG 3070 het 3070 hom 44 22 21 10 GAAAGCAGAGAGAAAGCGA 1 0 309510 CASAVA_Build 2 181307169 1I TAATCAACAC -/A TAGCTATTGA 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 A 0 1 309511 CASAVA_Build 2 181312595 3I CTCTTCTAGA ---/ATC ATCACAAAAC 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 ATC 1 2 309512 CASAVA_Build 2 181319323 1D CTGTCATCTA G/- GTTTTAAGCC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 G 2 1 309513 CASAVA_Build 2 181327212 12D CCATGTAGGG CACTTACATGAA/------------ TGGAGAATGC 3070 het 3070 ref 37 22 13 5 CACTTACATGAA 1 0 309514 CASAVA_Build 2 181328118 1I GGTTTGCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 10 11 309515 CASAVA_Build 2 181342885 2I TAGATAATCC --/AT ATATATATAT 3070 het 251 hom 35 1 22 12 AT 6 7 309516 CASAVA_Build 2 181342897 4I ATATATATAT ----/ATAC ACACACACAC 3070 het 393 hom 32 1 21 10 ATAC 0 1 309517 CASAVA_Build 2 181345301 1I CAACATGGTG -/A AAACCCTGTC 3070 het 3070 hom 18 9 8 1 A 3 4 309518 CASAVA_Build 2 181357616 1D GTCAAAGGCC T/- TTTTCTGTAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 5 4 309519 CASAVA_Build 2 181362004 1I TCATCTGTTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 8 9 309520 CASAVA_Build 2 181368173 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2202 het 1678 hom 14 6 5 3 T 13 12 309521 CASAVA_Build 2 181425779 2D TTTCCGTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 43 3 29 12 A 14 12 309522 CASAVA_Build 2 181426598 4D AATTTTTAAA AATT/---- AATTAATTCA 3070 het 3070 hom 34 10 21 4 AATT 3 2 309523 CASAVA_Build 2 181427637 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 19 0 13 6 A 15 14 309524 CASAVA_Build 2 181428660 2D TTATTTTTAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TA 6 5 309525 CASAVA_Build 2 181435062 1I TTTTTATGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 T 8 9 309526 CASAVA_Build 2 181437820 3D GGATTGTCTA TAT/--- TATTATTATT 3070 het 1947 hom 25 5 14 6 TAT 6 5 309527 CASAVA_Build 2 181442771 1I GCCAGGTATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 T 8 9 309528 CASAVA_Build 2 181445668 1I TCAGAGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 15 12 T 10 11 309529 CASAVA_Build 2 181446608 1D AGGCTATTTG A/- AAATATCCAC 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 4 3 309530 CASAVA_Build 2 181451164 2D TACAAGGAGC TA/-- TCAAACAATT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TA 1 0 309531 CASAVA_Build 2 181451476 1D AGAGTTCCTC A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 A 7 6 309532 CASAVA_Build 2 181460254 2D CACTGGTGAA AG/-- AAACTAAAGG 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 AG 1 0 309533 CASAVA_Build 2 181461136 2D CAGGCATATG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 2453 hom 19 6 11 2 A 11 9 309534 CASAVA_Build 2 181461392 1D TATCCAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 10 9 309535 CASAVA_Build 2 181461612 2D TATATATTGA AT/-- ATATATATAT 2824 het 1573 hom 19 7 8 6 AT 8 7 309536 CASAVA_Build 2 181463158 1D CAATAGTTTG A/- AAAAAGTGCG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 6 5 309537 CASAVA_Build 2 181463300 1D AATTATTTTG A/- AAAAGAACCA 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 A 5 4 309538 CASAVA_Build 2 181476805 1I TATGAAAGAA -/C AGAATGTAAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 309539 CASAVA_Build 2 181477036 1D TTTGGGTCTT C/- CCCCCCCCCC 2450 het 541 hom 24 2 8 14 C 12 11 309540 CASAVA_Build 2 181481890 3I TACCTATATA ---/ATC ATTTTACATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATC 0 1 309541 CASAVA_Build 2 181484327 1I GGTAGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 10 11 309542 CASAVA_Build 2 181490598 1D AATGCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1650 hom 49 8 11 30 A 13 12 309543 CASAVA_Build 2 181491685 1D CTCGGGGGGC G/- GGGGGGCCCT 2220 het 921 hom 17 3 8 6 G 7 6 309544 CASAVA_Build 2 181494823 1I AATGTTATAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 411 hom 38 1 31 6 T 9 10 309545 CASAVA_Build 2 181496450 5D ACATCATAAA TATAT/----- TATAAGGCAA 3070 het 3070 ref 32 22 9 3 TATAT 1 0 309546 CASAVA_Build 2 181498528 1D CAGAAACTTA C/- TGCCAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 C 1 0 309547 CASAVA_Build 2 181503195 3D TTCAATCCAA GAT/--- GATTAGTGTT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 GAT 2 1 309548 CASAVA_Build 2 181503786 1I CTATCCTCAA -/C CCCCCTCCCA 3070 hom 55 het 28 0 19 9 C 5 6 309549 CASAVA_Build 2 181506144 1I AAGTTAAGTT -/C TTTCCTCAAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 0 1 309550 CASAVA_Build 2 181532858 8I CATAATTGAC --------/AATTTGAT AACCTTACAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AATTTGAT 0 1 309551 CASAVA_Build 2 181538684 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 10 11 309552 CASAVA_Build 2 181544973 1D GTACTCAATA T/- TTGTTTGCTG 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 T 3 2 309553 CASAVA_Build 2 181558924 1D CGGAATGTTT C/- CTCAAGGTCA 3070 het 3070 ref 52 31 15 6 C 2 1 309554 CASAVA_Build 2 181564122 3I AAACCTTTGA ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 19 21 8 T 9 12 309555 CASAVA_Build 2 181564797 1I AAGCCCAAGT -/G GGATGGAGCA 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 G 2 3 309556 CASAVA_Build 2 181565231 2D TCAAATACTC TT/-- TTAATCATTC 3070 het 3070 hom 44 14 21 11 T 4 2 309557 CASAVA_Build 2 181565512 2D AGCTCTTCTC TG/-- TGTTGACTTA 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 TG 2 1 309558 CASAVA_Build 2 181565808 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 T 10 9 309559 CASAVA_Build 2 181570084 1I CAAACTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 T 11 12 309560 CASAVA_Build 2 181575164 1D AATGGATTTC T/- TTTTTTACTG 3070 het 3070 ref 51 22 19 10 T 7 6 309561 CASAVA_Build 2 181576437 1D AAGAACTTCC A/- GGGGGGATGA 3070 het 3070 ref 30 19 9 4 A 1 0 309562 CASAVA_Build 2 181579357 1D TGATTTCAGA T/- TTTTGTTGCC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 5 4 309563 CASAVA_Build 2 181580473 4D AGTATAATTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1126 hom 36 7 16 13 T 14 10 309564 CASAVA_Build 2 181581879 2D CAGTATGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 42 1 24 19 T 16 14 309565 CASAVA_Build 2 181582586 9D AAATATATTT CAGTATACA/--------- CCAAAATAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 CAGTATACA 1 0 309566 CASAVA_Build 2 181586450 29D CCTCACTGGC TGTTGGCAAATGGCCCTAGTTTCTTGACT/----------------------------- TGTTGGCCTA 3070 het 3070 ref 37 20 14 14 TGTTGGCAAATGGCCCTAGTTTCTTGACT 1 0 309567 CASAVA_Build 2 181590173 1I AGGGATCGGG -/A AGTATGGAAG 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 A 1 2 309568 CASAVA_Build 2 181590624 1I CCTTGATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 26 6 T 11 12 309569 CASAVA_Build 2 181591157 1D AATGTATAAT A/- AAAACAGTTA 3070 het 3070 hom 36 12 18 7 A 5 4 309570 CASAVA_Build 2 181591571 5D AATTTCTGTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 2269 hom 35 11 16 8 T 18 13 309571 CASAVA_Build 2 181593182 4I GTGGACAGGG ----/CCGT CCGTGCTCCC 3070 het 3070 ref 35 14 9 12 CCGT 1 2 309572 CASAVA_Build 2 181593884 17D TTTTTAGAGT TAGGGAATGGTAGAGGA/----------------- TAGGAAAGGG 3070 het 3070 ref 40 25 13 5 TAGGGAATGGTAGAGGA 1 0 309573 CASAVA_Build 2 181594330 1I TTTTCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2385 het 124 hom 15 1 8 6 T 10 11 309574 CASAVA_Build 2 181594351 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTCCTC 3070 hom 24 het 13 0 9 4 T 7 6 309575 CASAVA_Build 2 181598370 1I3M3D TTGAAGATAT -TATCTA/CTAT--- TTTTTTCCCT 3070 het 1126 hom 40 4 21 16 N/A 0 0 309576 CASAVA_Build 2 181598474 4I CAGGTATATT ----/TGCC TGGGATATAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TGCC 0 1 309577 CASAVA_Build 2 181599290 1D TGTAATCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 17 5 T 10 9 309578 CASAVA_Build 2 181599487 1I CTTTCAACTA -/T TTTTTTTTTT 2086 het 2086 ref 23 8 6 9 T 15 16 309579 CASAVA_Build 2 181599846 3D TATTGATCAT ATA/--- ATATTTTGTG 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 ATA 2 1 309580 CASAVA_Build 2 181602755 8D TCATCTTTAA TATTGATG/-------- TTTGGCGTGG 2027 het 2027 ref 32 24 5 4 TATTGATG 1 0 309581 CASAVA_Build 2 181603713 1D AACTACAAGT C/- CCATCTCTAT 3070 het 3070 hom 41 16 17 9 C 3 2 309582 CASAVA_Build 2 181607660 5I AAAAAAATTA -----/AAAAG AAAAGAAATT 3070 het 3070 hom 22 12 9 1 AAAAG 1 2 309583 CASAVA_Build 2 181608909 1D GAACTCTATA G/- GTATAAAGTA 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 G 2 1 309584 CASAVA_Build 2 181612254 3D2M2I AATGGTGAAT AAATT--/---TTTA TTATAAATAA 2718 het 2718 ref 17 9 6 3 N/A 0 0 309585 CASAVA_Build 2 181612623 1D TATGATAAAA T/- TTCTAATAGT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 3 2 309586 CASAVA_Build 2 181613897 1I AGGTTCCTTC -/G TGATGCTTCA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 0 1 309587 CASAVA_Build 2 181614420 1I ACATAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 11 12 309588 CASAVA_Build 2 181614678 4D AGAGTGCTGG GATT/---- GATTACAGGT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 GATT 2 1 309589 CASAVA_Build 2 181620765 3I AGAGCAGCCT ---/GAG GAGGAGGCCT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 GAG 2 3 309590 CASAVA_Build 2 181620926 1I CATTAGGTCG -/T TTTCATTGTA 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 T 3 4 309591 CASAVA_Build 2 181625039 3I TGAATCATTG ---/TGC TGAAGTGTCT 3070 het 3070 hom 42 12 24 6 TGC 0 1 309592 CASAVA_Build 2 181626572 2I ACCCCTTGTA --/TC TCTCTGCCCC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TC 2 3 309593 CASAVA_Build 2 181634478 1D TATGCTTTTA G/- GCAACTACTT 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 G 2 1 309594 CASAVA_Build 2 181635556 1D TCAAAATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 11 10 309595 CASAVA_Build 2 181639666 1I GTTTTGAAAA -/G AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 G 0 1 309596 CASAVA_Build 2 181642246 2I TGTGTGTGTG --/TT TGTGCGTACG 3070 het 780 hom 40 5 25 10 T 1 3 309597 CASAVA_Build 2 181643511 5D CTTGATTGAA TAAAG/----- TAACAAGGAA 3070 het 3070 ref 46 24 20 4 TAAAG 1 0 309598 CASAVA_Build 2 181644583 2I GGACATAGTG --/AC ACCAATTTCT 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 AC 1 2 309599 CASAVA_Build 2 181644899 4D TACTTAACTT AGAA/---- AGCCAAGAGT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 AGAA 1 0 309600 CASAVA_Build 2 181645210 1D ATATCATAAT G/- TAAGAAAGTT 3070 het 3070 hom 46 18 25 4 G 1 0 309601 CASAVA_Build 2 181646512 4I CTTCGTTATC ----/AGTA AGACTCCTGG 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 AGTA 0 1 309602 CASAVA_Build 2 181646620 9D GGGTCACCTG TTTGGCCAC/--------- TTTGGCCACA 3070 hom 75 het 30 0 25 6 TTTGGCCAC 2 1 309603 CASAVA_Build 2 181647770 6I CAGCAGCCTT ------/CCCTAC AGTTCCAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 CCCTAC 0 1 309604 CASAVA_Build 2 181649460 5D GTACTGTACC TGATA/----- TGATATGATT 3070 het 3070 ref 35 20 13 4 TGATA 2 1 309605 CASAVA_Build 2 181653119 2I ATTTTCACTC --/AT GTAATCTAAA 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 AT 0 1 309606 CASAVA_Build 2 181653910 1I CTAACAAGTT -/C CCAGGTGGTG 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 C 2 3 309607 CASAVA_Build 2 181655303 5I TAAATAGCAA -----/AGCAT TGCTATTCTG 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 AGCAT 0 1 309608 CASAVA_Build 2 181655334 1D CCAAAGCATA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 13 11 16 T 8 7 309609 CASAVA_Build 2 181664409 2D CAAATTGGAT AA/-- AGAGTCAAGA 3070 het 3070 hom 31 12 15 6 A 3 1 309610 CASAVA_Build 2 181671421 7I AAAAAAAAAT -------/AAAGATC AGAGCAGAAA 3070 hom 17 het 17 0 15 2 AAAGATC 0 1 309611 CASAVA_Build 2 181673289 1D CAATAGTTAT A/- AACCTCTAAC 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 A 3 2 309612 CASAVA_Build 2 181684150 2D ATATCTCCTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 17 16 8 T 11 9 309613 CASAVA_Build 2 181707931 1D TTTCTAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 13 12 309614 CASAVA_Build 2 181723193 1I CTACAATGTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 32 10 20 2 T 7 8 309615 CASAVA_Build 2 181736086 3D GAATCTGTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 2969 het 2165 hom 23 12 8 3 T 14 11 309616 CASAVA_Build 2 181757153 2D CAACAGAGAG AC/-- AGAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 AC 1 0 309617 CASAVA_Build 2 181763532 2I TTTGTAGAGA --/CT CTGTATTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 CT 1 2 309618 CASAVA_Build 2 181766664 3D AAACCCTATT ATA/--- ATGGCCAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 ATA 1 0 309619 CASAVA_Build 2 181774073 14D AGTTCTCTGT CAAGCTCCCTTAGC/-------------- CGGATGCCAT 3070 het 3070 hom 38 17 20 6 CAAGCTCCCTTAGC 1 0 309620 CASAVA_Build 2 181785448 4D ATGAAAAAAT ACTC/---- AACATAACTA 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 ACTC 1 0 309621 CASAVA_Build 2 181800190 9I TAAACTCCCC ---------/CCAGTTTAT CCAGTTTATT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 CCAGTTTAT 1 2 309622 CASAVA_Build 2 181816993 1D ATGTGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 563 hom 29 4 14 11 T 17 16 309623 CASAVA_Build 2 181822547 2D TGGATTTTGC AG/-- AGTCTTCTCT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 AG 2 1 309624 CASAVA_Build 2 181833190 9I GTGGCTCATT ---------/AAACCGACA GACTTCAAGG 3070 het 3070 ref 44 27 15 3 AAACCGACA 0 1 309625 CASAVA_Build 2 181849541 1D TTTGTAATGC A/- AAAAAGCATT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 A 6 5 309626 CASAVA_Build 2 181853134 1I TTTAAGGGAG -/A AAAAAATTTT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 6 7 309627 CASAVA_Build 2 181854039 7I TTTGACAGTC -------/TTTATAG TTTATATTTA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 TTTATAG 0 1 309628 CASAVA_Build 2 181854672 2I TCAGTCTCTA --/AT AGTTAAGTAA 3070 het 3070 ref 55 33 19 3 AT 0 1 309629 CASAVA_Build 2 181858174 2D GGTTGGTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 12 10 309630 CASAVA_Build 2 181858656 1D AAATGCAGCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 10 9 309631 CASAVA_Build 2 181864675 4I TTTTTTGTTC ----/TTTG TTTGCGTGAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 TTTG 1 2 309632 CASAVA_Build 2 181866127 1D TAAATTCATA T/- TTTTTCTGTC 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 T 6 5 309633 CASAVA_Build 2 181869864 1I ATAGATACAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 32 8 18 6 A 6 7 309634 CASAVA_Build 2 181870785 1I AAATTTATTG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 7 8 309635 CASAVA_Build 2 181871011 1D AAGTCAAATG A/- AAAAAAAAAT 2585 het 2585 ref 21 12 6 3 A 10 9 309636 CASAVA_Build 2 181871613 2D CATTTAGGAC AG/-- AGAAAACATT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AG 2 1 309637 CASAVA_Build 2 181873381 1I GGGCCTGTCA -/G GGGGTGGGCG 3070 het 2301 hom 22 8 13 1 G 4 5 309638 CASAVA_Build 2 181886030 1I AAAAAAAAAA -/T AAAGTCTCAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 T 0 1 309639 CASAVA_Build 2 181891879 1D AGACACTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 13 11 A 11 10 309640 CASAVA_Build 2 181913097 3D GTTTTTTCTC AAT/--- AAATATCTAG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 AAT 1 0 309641 CASAVA_Build 2 181913290 1I AAGGCATTTT -/C AGTCCTTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 C 0 1 309642 CASAVA_Build 2 181913443 1I TTTGTAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 8 9 309643 CASAVA_Build 2 181916028 1D TGTACCCTTA T/- CCTCTTCCCT 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 T 1 0 309644 CASAVA_Build 2 181920830 1I AATAAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 9 10 309645 CASAVA_Build 2 181922430 1D TCAATGAATA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 9 8 309646 CASAVA_Build 2 181931877 1D TAATGTGAAA T/- TTTTTCCAAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 6 5 309647 CASAVA_Build 2 181932241 1I AATAGTAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2593 hom 35 6 20 9 T 9 10 309648 CASAVA_Build 2 181938145 1I AAGTTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 A 11 12 309649 CASAVA_Build 2 181955094 11I AAATTATAGC -----------/ACATTTGCTAT AAATGGGCCA 3070 het 1544 hom 19 5 10 7 ACATTTGCTAT 0 1 309650 CASAVA_Build 2 181958740 1D AATATTTACC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 11 10 7 A 10 9 309651 CASAVA_Build 2 181959964 2D ATTTCCTAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 A 12 10 309652 CASAVA_Build 2 181960350 3I CGTTTCTCCA ---/AAG GAGATCTGCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AAG 0 1 309653 CASAVA_Build 2 181961733 1I TATCTTTTTG -/A AAAACAGAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 4 5 309654 CASAVA_Build 2 181962835 5D TTTTGGAGAC TTAAA/----- TTAATATTCA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 TTAAA 1 0 309655 CASAVA_Build 2 181962968 1D ACAATAAACC A/- AAAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 A 7 6 309656 CASAVA_Build 2 181964604 1D ATTAAGGTGT A/- AAATATAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 4 3 309657 CASAVA_Build 2 181965292 2D GCAGGAACAC TG/-- TTTCGTGATA 3070 het 3070 ref 55 32 19 5 TG 1 0 309658 CASAVA_Build 2 181965858 1I TTTCATGATT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 8 309659 CASAVA_Build 2 181966963 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 2295 hom 14 5 8 1 A 7 8 309660 CASAVA_Build 2 181967309 1D CAAAAATTTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 24 9 10 6 T 7 6 309661 CASAVA_Build 2 181982158 1D CAGATGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 23 2 17 4 A 12 11 309662 CASAVA_Build 2 182010007 1D CATTGACTTG C/- ATGGCATCCC 3070 het 3070 ref 54 26 23 5 C 1 0 309663 CASAVA_Build 2 182013792 1D ATTCACAGAG A/- AAGAATGACT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 3 2 309664 CASAVA_Build 2 182032288 1I AAATTAAGTG -/T AATGGTTTAA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 0 1 309665 CASAVA_Build 2 182032432 2D TATAGTAGTC TT/-- TGCTCTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 6 T 3 1 309666 CASAVA_Build 2 182039269 1I AGAATAAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 9 10 309667 CASAVA_Build 2 182040198 1I GCTTCAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 10 11 309668 CASAVA_Build 2 182044978 1D CCCAGAGAGC T/- GAGAGGCACT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 1 0 309669 CASAVA_Build 2 182052461 6D TGCTTTCTTC AGTTTA/------ AGTTGACTTT 3070 het 3070 ref 36 22 12 4 AGTTTA 1 0 309670 CASAVA_Build 2 182053092 1I ATAATAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2135 hom 21 5 12 4 T 10 11 309671 CASAVA_Build 2 182062364 1I CAAAAGCATG -/A AAAAAATCGG 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 6 7 309672 CASAVA_Build 2 182062514 4D GACTATATGT CTGA/---- ATATTTTTAG 3070 het 3070 ref 42 24 17 3 CTGA 1 0 309673 CASAVA_Build 2 182064656 1D AGCCCTGATT A/- AAATAAATTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 4 3 309674 CASAVA_Build 2 182065529 1D AACTGTAGAA T/- ATTATTTTTC 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 T 1 0 309675 CASAVA_Build 2 182066904 1D CAGTGCCTAG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 26 11 10 6 A 8 7 309676 CASAVA_Build 2 182075046 2D AAAATCAACA GT/-- GTGGCATCCT 3070 het 3070 ref 48 26 18 5 GT 2 1 309677 CASAVA_Build 2 182075177 1D TTGGTGGTGG T/- GACAACAGCA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 1 0 309678 CASAVA_Build 2 182076797 1I TAAGTATATG -/A AAAATCTTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 4 5 309679 CASAVA_Build 2 182083688 2D CTACACCCTC AT/-- ATGAAAATAT 3070 het 3070 hom 37 16 20 3 AT 2 1 309680 CASAVA_Build 2 182084178 4D TTCTGAAACC CTTA/---- CTTATTTAAT 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 CTTA 2 1 309681 CASAVA_Build 2 182088984 4I CTCTCATCTC ----/TTCA TTAAGTTGAG 3070 hom 166 het 62 0 56 6 TTCA 0 1 309682 CASAVA_Build 2 182096204 2I ATATACATAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 35 18 17 0 AT 4 5 309683 CASAVA_Build 2 182097932 3I ACTATTTGTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 17 5 A 13 16 309684 CASAVA_Build 2 182102224 2D ATATATTGTT TA/-- TGTCTCCTAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 TA 1 0 309685 CASAVA_Build 2 182106024 2D CAACAAAAAC AT/-- ATTTAAATTT 3070 het 2635 hom 28 6 16 7 AT 2 1 309686 CASAVA_Build 2 182107576 1D ATAGATTGGA G/- GAAAAGTCAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 G 2 1 309687 CASAVA_Build 2 182111468 12D AGTCAGTTAT GCCTCTAGAACA/------------ CCCATGTCTA 3070 het 3070 ref 41 23 16 7 GCCTCTAGAACA 1 0 309688 CASAVA_Build 2 182112038 1I CTGGTTGACA -/T ATAAGCGGTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 0 1 309689 CASAVA_Build 2 182113034 2I TCAATGAAAC --/AT AGTTTTAAAA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 AT 0 1 309690 CASAVA_Build 2 182115603 1D AATTCTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 10 6 A 14 13 309691 CASAVA_Build 2 182116040 1D TTAAGTTCTC A/- AATAGAGGTA 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 A 3 2 309692 CASAVA_Build 2 182117476 1D TTCATCATTC A/- AAAAAGGCCA 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 A 6 5 309693 CASAVA_Build 2 182120969 2I AAGTAAAAAC --/GT GTACAATTTT 3070 hom 78 het 33 0 28 5 GT 1 2 309694 CASAVA_Build 2 182121302 2I AGGGAGAGAC --/AG AGGGGGAAGG 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 AG 1 2 309695 CASAVA_Build 2 182125846 3D GTAAAAAATA TAT/--- TATTTTTAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 8 TAT 2 1 309696 CASAVA_Build 2 182136557 27D ATCAAAATGC CATAGCATTTTGGGGTTAACCTTCTCT/--------------------------- CATCTCTGCA 3070 het 3070 ref 35 25 12 6 CATAGCATTTTGGGGTTAACCTTCTCT 1 0 309697 CASAVA_Build 2 182141643 1D GAGTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2637 het 208 hom 21 2 8 11 T 15 14 309698 CASAVA_Build 2 182145623 1I TCACAAACAT -/G AAAGGTTAAC 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 G 0 1 309699 CASAVA_Build 2 182149292 6D AATATTTATA TATTCT/------ TAAACTCTGT 3070 het 3070 ref 55 29 24 4 TATTCT 1 0 309700 CASAVA_Build 2 182151229 1D TATATGTGTG T/- GGGGGGGTAT 3070 het 2349 hom 34 7 18 10 T 1 0 309701 CASAVA_Build 2 182157491 1I CTCAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 10 11 309702 CASAVA_Build 2 182171845 1D CCTCAAGGGG A/- AAAAAAAAAA 1602 het 1602 ref 37 23 4 10 A 13 12 309703 CASAVA_Build 2 182186091 4D ACTTATTCAT TCTG/---- TCTAACTGAA 3070 het 3070 hom 39 14 24 3 TCTG 1 0 309704 CASAVA_Build 2 182197683 3D GCAACAGGAT TTG/--- TTGATAGGTT 3070 het 3070 hom 50 20 26 6 TTG 2 1 309705 CASAVA_Build 2 182201072 1D TTTTTGTGTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 132 het 52 0 44 9 A 9 8 309706 CASAVA_Build 2 182202052 1D AATTAACTCA T/- TTTAGTCCTT 3070 het 3070 hom 31 12 19 0 T 4 3 309707 CASAVA_Build 2 182202606 1D AGTCATAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 853 hom 30 3 24 3 A 13 12 309708 CASAVA_Build 2 182215385 2D TCACCAACTC TT/-- GTTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 T 2 0 309709 CASAVA_Build 2 182217785 1I TGTAAACATG -/T AATCATTCAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 0 1 309710 CASAVA_Build 2 182224880 1I TTTATAGTAC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 141 het 50 0 48 2 T 6 7 309711 CASAVA_Build 2 182225144 1D GCAGAACCAC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 31 15 16 1 A 8 7 309712 CASAVA_Build 2 182227706 7D TAACATTTAA ATATATC/------- ATCTCTTAAT 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 ATATATC 1 0 309713 CASAVA_Build 2 182228161 1I ATGTATTTTA -/G AACTCTACTG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 0 1 309714 CASAVA_Build 2 182247779 3D AAATGGGAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1877 hom 50 13 17 21 A 14 11 309715 CASAVA_Build 2 182248623 1D TGCCAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 12 10 T 13 12 309716 CASAVA_Build 2 182257953 3D GTGTGTGCAT ATA/--- ATGAGTGTGT 3070 het 3070 ref 71 36 26 10 ATA 1 0 309717 CASAVA_Build 2 182258684 4I ACAAAAACAA ----/ACAG ACAAACAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 ACAG 0 1 309718 CASAVA_Build 2 182261293 1D GATCCGCCCA C/- CTCGGCCTCC 1756 het 1110 hom 9 3 4 2 C 2 1 309719 CASAVA_Build 2 182264531 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 21 1 18 2 T 13 14 309720 CASAVA_Build 2 182265258 1D TAACTTTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 10 9 309721 CASAVA_Build 2 182268269 4I TAATTCACTA ----/AGAC AGAAAAAATG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AGAC 0 1 309722 CASAVA_Build 2 182268601 1I CCCACCTCAG -/C TCCTGAGTAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 0 1 309723 CASAVA_Build 2 182276388 1D TTAAAACTCC A/- AAGTAATCTC 3070 het 3070 hom 55 21 23 11 A 3 2 309724 CASAVA_Build 2 182289939 2I CTTACAACAC --/TG AGCAGAAGCA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 TG 0 1 309725 CASAVA_Build 2 182290466 1D ATTTTGTCTT A/- AGTTTAGGTT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 2 1 309726 CASAVA_Build 2 182293742 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2613 het 1467 hom 25 11 7 8 A 16 15 309727 CASAVA_Build 2 182311302 1D AGAACATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1054 hom 25 4 11 10 A 17 16 309728 CASAVA_Build 2 182361509 2I AAGAACAAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2499 hom 28 7 11 10 T 14 16 309729 CASAVA_Build 2 182362292 1D GCTGAAGACC A/- AGGATTTCTT 3070 het 3070 hom 46 16 23 9 A 2 1 309730 CASAVA_Build 2 182362644 6D TTTTAAATTA GTAATT/------ GTATTATTTC 3070 het 3070 ref 40 22 17 5 GTAATT 1 0 309731 CASAVA_Build 2 182364327 4I TATAAAAGTT ----/AATG AATGACTCAC 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 AATG 1 2 309732 CASAVA_Build 2 182365615 3D TATCTAAGTA CTT/--- TTAAATGGAC 3070 het 3070 hom 26 7 16 4 CTT 1 0 309733 CASAVA_Build 2 182366048 1D TGAATGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2254 hom 46 18 17 12 A 18 17 309734 CASAVA_Build 2 182431529 1D AAGATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2161 het 2161 ref 30 14 7 9 T 15 14 309735 CASAVA_Build 2 182438721 1D AGATTGAGAC T/- TGCCCAAGAT 3070 het 3070 hom 40 12 22 7 T 2 1 309736 CASAVA_Build 2 182439459 11D AACGGAGAGA ACTCCTTCTAG/----------- ACTCCTTCTA 3070 hom 60 het 28 0 21 9 ACTCCTTCTAG 2 1 309737 CASAVA_Build 2 182450843 2D GCTAATAAAC AT/-- ATGTTATTCC 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 AT 2 1 309738 CASAVA_Build 2 182450985 4D TATGTGTTTG TGTA/---- TGTATGTGTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 8 TGTA 2 1 309739 CASAVA_Build 2 182455175 1I ATAAAAGCAG -/T TTAAAAATAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 3 309740 CASAVA_Build 2 182477231 2I ATGAAGAAAG --/GT CAATGTAGCA 3070 het 2333 hom 22 5 12 5 GT 0 1 309741 CASAVA_Build 2 182477469 4I AACAATGGAT ----/AAAG AAAGGAAATA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 AAAG 1 2 309742 CASAVA_Build 2 182479726 4I AATGAAATAA ----/AAAG AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 AAAG 0 1 309743 CASAVA_Build 2 182480419 1D GGTTTAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1936 hom 35 7 9 20 T 15 14 309744 CASAVA_Build 2 182498786 1D GTCTTGCTAC A/- GAGTTTTCTA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 1 0 309745 CASAVA_Build 2 182500651 1I GTGTTAGGTT -/A GAACAATATG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 0 1 309746 CASAVA_Build 2 182505150 1D GTAAAGTCTT A/- AAAGTAGTCA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 4 3 309747 CASAVA_Build 2 182506465 2I CTGCCGATTC --/TA TGATATAGCA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 TA 0 1 309748 CASAVA_Build 2 182519909 5D TTTCCAACTT AACTA/----- AACACTTATC 3070 het 3070 hom 41 17 19 8 AACTA 1 0 309749 CASAVA_Build 2 182520979 1I ACTGACACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 16 17 10 A 12 13 309750 CASAVA_Build 2 182525214 19I AGGACTTTAC -------------------/AGGGAAGATTTTTTTTTTA AGCAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 AGGGAAGATTTTTTTTTTA 0 1 309751 CASAVA_Build 2 182543108 1D CCTTATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 T 13 12 309752 CASAVA_Build 2 182563121 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1783 hom 20 7 12 1 T 10 11 309753 CASAVA_Build 2 182566998 3D AGAAAAAAAA AAG/--- ATCTATAGTA 3070 het 3070 ref 40 22 16 3 AAG 1 0 309754 CASAVA_Build 2 182570448 1D CTAATAATAA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 T 7 6 309755 CASAVA_Build 2 182575167 1D CATCAAGGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 9 8 309756 CASAVA_Build 2 182579014 1D AAGAATATTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 T 7 6 309757 CASAVA_Build 2 182581070 3I TAAAAAAATA ---/AAT AAATAAAATG 3070 hom 33 het 18 0 12 6 AAT 0 1 309758 CASAVA_Build 2 182583107 1D TTTAGGATAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 26 10 6 T 10 9 309759 CASAVA_Build 2 182618413 1D TGTTAGTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 254 hom 25 2 18 5 A 13 12 309760 CASAVA_Build 2 182624975 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1390 het 1390 ref 22 13 3 7 A 13 12 309761 CASAVA_Build 2 182646070 1D GGCCTCTATG C/- TTTTGTTCTG 3070 het 3070 ref 34 14 15 6 C 1 0 309762 CASAVA_Build 2 182653697 1I CTTTAAGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 56 22 21 13 A 9 10 309763 CASAVA_Build 2 182657316 1I TCTTTGCCTA -/G GCCAATGTCC 2392 het 2392 ref 30 18 5 7 G 1 2 309764 CASAVA_Build 2 182668275 1I CATCTCAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 7 8 309765 CASAVA_Build 2 182678453 8D GAGTACCACA GAAGAGAG/-------- AAGGGCAAAG 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 GAAGAGAG 1 0 309766 CASAVA_Build 2 182687375 2I AACATCAAAT --/GG GGGGGTTTAA 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 G 5 7 309767 CASAVA_Build 2 182690665 6D TTAGACATGA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 15 20 12 GT 10 7 309768 CASAVA_Build 2 182691632 1I GGAGCTATAA -/G AGAATGCAGT 3070 het 3070 hom 35 11 23 1 G 0 1 309769 CASAVA_Build 2 182694337 3I TAATTGGTAT ---/ATA TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 ATA 0 1 309770 CASAVA_Build 2 182695192 1I GGGTATTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2020 hom 21 5 10 6 A 9 10 309771 CASAVA_Build 2 182701612 4D GCATATGTAT GTAC/---- GTATGTATAT 3070 het 3070 hom 48 23 24 4 GTAC 1 0 309772 CASAVA_Build 2 182704176 2I TTGAGCAGTG --/TT TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 1 3 309773 CASAVA_Build 2 182705679 1I TAATTTAGCC -/T TTCCTCTCAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 2 3 309774 CASAVA_Build 2 182706618 1I CTGCTCTGAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 393 hom 46 1 37 8 A 8 9 309775 CASAVA_Build 2 182709660 1D CATCCAAAGT C/- AAGGATTTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 1 0 309776 CASAVA_Build 2 182709868 4I TGTGTGTTTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 94 het 39 0 32 7 TG 7 9 309777 CASAVA_Build 2 182711492 2I TTTGAGTAGC --/AA AAGTGTAGAG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 2 4 309778 CASAVA_Build 2 182713857 4I TATAGCAGAT ----/AGAA AGAGAGAGAT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 AGAA 0 1 309779 CASAVA_Build 2 182716284 1D CCACAATTTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 9 8 309780 CASAVA_Build 2 182734380 5I GATCCTGATG -----/GAGCT GGGGGCATTG 3070 hom 93 het 38 0 30 8 GAGCT 0 1 309781 CASAVA_Build 2 182738552 3D GGAAACTACA ACC/--- ACTCAATATA 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 ACC 1 0 309782 CASAVA_Build 2 182740802 1D TAAAAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 11 10 309783 CASAVA_Build 2 182741266 1D CTTGCTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 9 14 A 12 11 309784 CASAVA_Build 2 182746531 3D AATATATAAT ATA/--- ATAATTTAAT 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 ATA 2 1 309785 CASAVA_Build 2 182746676 4I TGTTTTCCTC ----/TGTT TGATTATTTG 3070 hom 42 het 20 0 15 5 TGTT 0 1 309786 CASAVA_Build 2 182746964 1D ATGGAAGAGT G/- AGGCCCACTG 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 1 0 309787 CASAVA_Build 2 182747336 1I TAAAGGTGGT -/A ACTCAGATAG 3070 het 3070 hom 58 24 29 5 A 1 2 309788 CASAVA_Build 2 182750726 1D TGTCTTTTTT G/- TTGCTCAGTT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 G 1 0 309789 CASAVA_Build 2 182756680 1D TCAAGACAAG T/- TTTTTAAATA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 6 5 309790 CASAVA_Build 2 182757234 1D TAGAATACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 23 0 18 6 A 11 10 309791 CASAVA_Build 2 182762577 5D GTGCATAAAC TTATT/----- TTAATGTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 21 1 TTATT 1 0 309792 CASAVA_Build 2 182764674 1D TATATTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 23 1 13 9 T 15 14 309793 CASAVA_Build 2 182770336 1D TTGCATTTTC T/- TAGTAGTGCC 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 2 1 309794 CASAVA_Build 2 182777112 2I GAATAACAAC --/AG AAATTAATAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 0 1 309795 CASAVA_Build 2 182783873 1D GTAATTTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 34 1 26 8 A 12 11 309796 CASAVA_Build 2 182785175 4I41M2D AAATTATATA ----TATTACGTACGAGATAATGTCTTGAAACATATATATCTTTCTA/TATTTATTACGTACGAGATAATGTCTTGAAACATATATATCTTTC-- TATATATATA 3070 hom 42 het 14 0 15 7 N/A 0 0 309797 CASAVA_Build 2 182791400 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAACAAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 7 6 309798 CASAVA_Build 2 182795708 1I TATTAATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 51 22 20 9 A 9 10 309799 CASAVA_Build 2 182802753 1D TTTGGGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 111 hom 29 2 10 17 T 13 12 309800 CASAVA_Build 2 182804564 1I GCAGTTTGGC -/A TAAAGTTTTG 3070 hom 87 het 34 0 28 9 A 0 1 309801 CASAVA_Build 2 182809283 1D CTATACAAGA T/- CTAGAATAAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 1 0 309802 CASAVA_Build 2 182812582 1D AGAAATGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 A 11 10 309803 CASAVA_Build 2 182812680 1D GGCAGAGGAA G/- GCCTAAGTGA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 G 2 1 309804 CASAVA_Build 2 182817340 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAACTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 6 309805 CASAVA_Build 2 182817555 1I AATTGTATTA -/T TTTTTTCTAC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 6 7 309806 CASAVA_Build 2 182818683 2D TTGCTAAATA AT/-- ATTCTATTGT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 AT 2 1 309807 CASAVA_Build 2 182818845 1D ATGGTATCAT A/- AGTGTTTAGT 3070 het 3070 ref 42 24 14 5 A 2 1 309808 CASAVA_Build 2 182821351 3I GGTGTTTGAT ---/ACG ACTTTAGTTT 3070 hom 71 het 29 0 24 5 ACG 0 1 309809 CASAVA_Build 2 182822713 3D ACCCCCCCCC CAA/--- AAAAAACAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 CAA 1 0 309810 CASAVA_Build 2 182823529 1D ATCTCAATAG C/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 C 1 0 309811 CASAVA_Build 2 182824377 1I TCTGTTTCTC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 7 8 309812 CASAVA_Build 2 182825478 14D TGTGATAAGT CAGAGTAAAGTTTC/-------------- CAGAGTAAAG 3070 hom 96 het 34 0 32 5 CAGAGTAAAGTTTC 2 1 309813 CASAVA_Build 2 182835203 4I TTTCTTTCTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 hom 51 het 21 0 17 5 TCTT 3 4 309814 CASAVA_Build 2 182851512 4D GTCATTTTGA TTAT/---- TTAGCAGTTC 3070 het 3070 ref 47 32 15 0 TTAT 1 0 309815 CASAVA_Build 2 182852396 1D AAGAGCAACC T/- TCCTTGTAGA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 2 1 309816 CASAVA_Build 2 182862998 1D ATTTTGCTAG A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 30 16 14 1 A 7 6 309817 CASAVA_Build 2 182870259 1D CCCATTAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 11 10 309818 CASAVA_Build 2 182878158 2D TTACTTCCAC TT/-- TATAAACAAA 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 3 1 309819 CASAVA_Build 2 182882000 1I GTCTTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 41 0 32 9 A 13 14 309820 CASAVA_Build 2 182886735 3D AGGATGAAAC ATT/--- AGTAGGTTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 ATT 1 0 309821 CASAVA_Build 2 182887784 2D AAATGTATAC TT/-- TTTATGCATG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 5 3 309822 CASAVA_Build 2 182905880 1I AAAGCAAGAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 716 hom 27 2 21 4 A 8 9 309823 CASAVA_Build 2 182909747 4D ATATATATAT ATAA/---- GTCCCTATGA 3070 hom 44 het 17 0 14 3 ATAA 1 0 309824 CASAVA_Build 2 182909940 12D CCCTTTTTTT TTTTTTTTTAAA/------------ TAAAGAATAA 2161 het 127 hom 20 2 9 11 TTTTTTTTTAAA 1 0 309825 CASAVA_Build 2 182916846 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 29 1 21 7 T 13 12 309826 CASAVA_Build 2 182917702 4D TTTCTCTCTG TCTC/---- TCTGTCTCTC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TC 3 1 309827 CASAVA_Build 2 182919595 2I CTCCCATCTC --/TT GACACCTGCA 3070 hom 154 het 57 0 52 5 T 0 2 309828 CASAVA_Build 2 182920100 1D AAAAGCTGAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 34 0 31 4 T 10 9 309829 CASAVA_Build 2 182933502 1D CAGTTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 1157 het 1157 ref 36 19 3 14 T 17 16 309830 CASAVA_Build 2 182939607 3I CATTTCACAT ---/GAA GAGACATTTT 3070 het 3070 ref 53 28 20 5 GAA 0 1 309831 CASAVA_Build 2 182955677 1D TACTGTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 17 9 A 11 10 309832 CASAVA_Build 2 182965570 3D GTCCAAAGTC TCA/--- TCTGTAACAA 3070 het 3070 ref 41 26 14 1 TCA 1 0 309833 CASAVA_Build 2 182966355 1D CCACAGAACC T/- TTTTTTTTTT 2480 het 2265 hom 27 10 7 11 T 13 12 309834 CASAVA_Build 2 182967543 1I ACACTGGCTC -/T GAGCTGACAT 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 T 0 1 309835 CASAVA_Build 2 182977019 1D TAGGAACAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 10 9 309836 CASAVA_Build 2 182979346 1D GGCTCACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 13 12 309837 CASAVA_Build 2 182980308 5I ATAATTTGAG -----/TTTGC TTTAAGTACA 3070 het 3070 ref 28 18 10 0 TTTGC 0 1 309838 CASAVA_Build 2 182985030 1D ACTCCATCTC G/- AAAAAAAAAA 1859 het 572 hom 19 5 6 8 G 1 0 309839 CASAVA_Build 2 183004094 4D AAAAAACATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 1042 het 797 hom 14 8 5 3 A 20 16 309840 CASAVA_Build 2 183013560 2D TTATTAAAAC AA/-- GATATATTCT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 2 0 309841 CASAVA_Build 2 183019912 2D AAGTGAGATA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 AT 8 7 309842 CASAVA_Build 2 183021305 1I ATCATTTAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 9 10 309843 CASAVA_Build 2 183023529 1I ATGTTTTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 A 11 12 309844 CASAVA_Build 2 183045734 2D CTATTAAATT CA/-- CAGACCTTCT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 CA 2 1 309845 CASAVA_Build 2 183051320 1D TGCTATGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 11 10 309846 CASAVA_Build 2 183062788 4I AACTGTAGTT ----/TTTA AAGTCTGGAG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 TTTA 0 1 309847 CASAVA_Build 2 183062956 74D AAATTCCAAT GTGTAAAAATAAGGAGAAATCATCAAAGAAAACTGAGAAGGAGTAGCCAATGAAATAGATGGAGAACCAATAAA/-------------------------------------------------------------------------- GTGTTATTCT 3070 hom 57 het 16 0 20 5 GTGTAAAAATAAGGAGAAATCATCAAAGAAAACTGAGAAGGAGTAGCCAATGAAATAGATGGAGAACCAATAAA 1 0 309848 CASAVA_Build 2 183064738 6I TATTCTCATA ------/CTGTTT CTTTTTCCTT 3070 hom 163 het 65 0 55 10 CTGTTT 0 1 309849 CASAVA_Build 2 183065555 1I ACGGTTATAG -/A ATCATATTAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 1 2 309850 CASAVA_Build 2 183065957 1D TTATGGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 41 2 34 5 A 11 10 309851 CASAVA_Build 2 183067271 1I TGGATTCTAC -/A AAAAAAAAAA 390 het 53 hom 27 1 3 23 A 10 11 309852 CASAVA_Build 2 183067297 5D AAAAAGAAAC TGTGT/----- AGACTATGGA 1151 hom 10 het 25 0 4 21 TGTGT 1 0 309853 CASAVA_Build 2 183067411 1D CCCTTAGCCC A/- GATAATACAA 3070 hom 90 het 34 0 28 6 A 1 0 309854 CASAVA_Build 2 183067560 1I CCCCTGGATG -/A AATCCACCTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 3 309855 CASAVA_Build 2 183073460 2I GAGCTGAGAA --/AG AAGTTTAATC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AG 0 1 309856 CASAVA_Build 2 183103304 6D4M2I GATGAAAAGA TGCCAGATGA--/------ATAAAG AAAGCAGGGG 3070 hom 84 het 28 0 27 5 N/A 0 0 309857 CASAVA_Build 2 183103877 2I TTTTATAAAT --/TC TGTTTAAAAG 3070 hom 99 het 41 0 34 7 TC 0 1 309858 CASAVA_Build 2 183105084 1I CCATTTTGGT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 8 9 309859 CASAVA_Build 2 183108044 1I CCTTATCAAA -/C AGTATTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 309860 CASAVA_Build 2 183108322 3I ATTTAAAACT ---/AGA CATGTCTAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AGA 0 1 309861 CASAVA_Build 2 183172620 4I CAGAAATAAC ----/AAAT AAAAATACAG 3070 hom 60 het 28 0 21 7 AAAT 0 1 309862 CASAVA_Build 2 183177990 1I21M2D AGTCTCTGGG -TGGGGGCCTGAGGGGAGTGGATT/TTGGGGGCCTGAGGGGAGTGGA-- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 23 0 24 9 N/A 0 0 309863 CASAVA_Build 2 183182816 1I ATCCCAGCAC -/T TTGGGAGGCC 3070 hom 74 het 26 0 22 4 T 2 3 309864 CASAVA_Build 2 183203528 1I CCTCTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 964 het 964 ref 30 20 3 7 A 13 14 309865 CASAVA_Build 2 183221675 1D CTGTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1216 het 1216 ref 25 9 6 10 A 19 18 309866 CASAVA_Build 2 183235203 1I TGAAATATCC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 309867 CASAVA_Build 2 183239581 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 971 hom 28 3 21 5 A 15 14 309868 CASAVA_Build 2 183244594 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2308 het 197 hom 18 2 9 7 T 17 18 309869 CASAVA_Build 2 183244782 2D TAGTAGAGAC AG/-- AGTTTCACCA 3070 hom 35 het 15 0 11 5 AG 2 1 309870 CASAVA_Build 2 183247548 4D TCACAGATAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AT 8 6 309871 CASAVA_Build 2 183267807 2I TGGGGGGGGG --/GA GCAACAGTTG 3070 hom 45 het 19 0 14 5 GA 0 1 309872 CASAVA_Build 2 183273336 4D CTGAGGTCAG GAGT/---- GAGTTCGAGA 3070 hom 39 het 14 0 13 2 GAGT 2 1 309873 CASAVA_Build 2 183274009 3D TTTTTTGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 54 het 28 0 19 10 TTG 4 3 309874 CASAVA_Build 2 183274174 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 7 6 309875 CASAVA_Build 2 183274443 1D ACTTGCACCT C/- CCGGGTTCAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 3 2 309876 CASAVA_Build 2 183280547 4I AATTACTAAC ----/ACTG ACTCAAAAAG 3070 hom 85 het 42 1 38 3 ACTG 0 1 309877 CASAVA_Build 2 183295521 5I TTGTACAGTA -----/ATAAT ATAATAGGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATAAT 1 2 309878 CASAVA_Build 2 183301697 1D TATGTTAGAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 37 0 31 8 T 9 8 309879 CASAVA_Build 2 183302608 1I GAGGAACCTG -/A AACGATTATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 2 3 309880 CASAVA_Build 2 183307060 1I GCTTTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 561 hom 26 3 20 3 T 13 14 309881 CASAVA_Build 2 183309052 3I TAAATTTATT ---/AAG AAGTAATTTA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 AAG 1 2 309882 CASAVA_Build 2 183312136 2D AATGTTTATG AT/-- ATATATATAT 1968 hom 15 het 9 0 6 3 AT 8 7 309883 CASAVA_Build 2 183330565 5D TCACTGATAA ATAAT/----- ATAATAACTG 3070 hom 113 het 41 0 38 5 ATAAT 2 1 309884 CASAVA_Build 2 183335143 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AGAGAGAGAG 3070 het 515 hom 53 3 36 14 AAG 0 1 309885 CASAVA_Build 2 183347790 1D TGAGACAACA C/- CCCCCCCAAT 3070 hom 78 het 31 0 22 10 C 8 7 309886 CASAVA_Build 2 183351555 5D ACTTTATCCT GCTCA/----- CCAGTATTTC 3070 hom 93 het 35 0 31 5 GCTCA 1 0 309887 CASAVA_Build 2 183353943 1D GCAACTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 12 11 309888 CASAVA_Build 2 183358267 1I AATAGCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 11 12 309889 CASAVA_Build 2 183363762 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1363 hom 24 5 16 3 A 17 16 309890 CASAVA_Build 2 183372584 1D TTATTGAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 10 9 309891 CASAVA_Build 2 183374275 1I TTAACTTCTA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 602 hom 34 2 27 5 T 2 3 309892 CASAVA_Build 2 183382381 1D GACGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 A 11 10 309893 CASAVA_Build 2 183384816 1I AAATGAAGGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 A 8 9 309894 CASAVA_Build 2 183408292 1D ACAAATGGAA G/- GATTTACACA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 G 2 1 309895 CASAVA_Build 2 183414555 1I TAGATATTAG -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 A 6 7 309896 CASAVA_Build 2 183421044 1D TCAACATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 39 2 27 11 A 18 17 309897 CASAVA_Build 2 183423159 2D AATATCAAGT TA/-- TAGGGTAATA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TA 2 1 309898 CASAVA_Build 2 183436659 1I GTTGAATAAG -/A AAAAAAACCT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 7 8 309899 CASAVA_Build 2 183440699 1D GATTGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 490 hom 21 2 14 5 A 15 14 309900 CASAVA_Build 2 183463755 1D TCCCAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 26 1 18 7 T 14 13 309901 CASAVA_Build 2 183471183 6I TTGTCTTATT ------/ATAGTA ATAGTAAAAT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 ATAGTA 1 2 309902 CASAVA_Build 2 183484842 8I TATTAGAAAG --------/CAGTAACT CAGTAACTGC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CAGTAACT 1 2 309903 CASAVA_Build 2 183487474 1I CCAATTAAAA -/C AATTAAAAGA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 C 0 1 309904 CASAVA_Build 2 183493863 1I ACACATGCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 34 1 25 8 A 10 11 309905 CASAVA_Build 2 183518221 1D AATAAAAAAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 62 het 24 0 21 3 A 9 8 309906 CASAVA_Build 2 183519713 1I TAAACCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 734 hom 44 4 28 12 A 14 15 309907 CASAVA_Build 2 183527237 2I AGCATATAAA --/AC ACAGTTCTGT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AC 1 2 309908 CASAVA_Build 2 183538251 1I AACCACTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 10 11 309909 CASAVA_Build 2 183543424 4I ACATATGCAC ----/ATGA ATAAGGACAA 3070 het 3070 hom 51 22 21 8 ATGA 0 1 309910 CASAVA_Build 2 183543846 2I AACCTAAAGA --/CT CTATTAAAAC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 CT 1 2 309911 CASAVA_Build 2 183557034 4D GAAGGCAAAA ACTG/---- ACTAACTGTA 3070 hom 33 het 14 0 12 4 ACTG 1 0 309912 CASAVA_Build 2 183576897 1D GAGGGAAATG T/- TGAAAGACAA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 2 1 309913 CASAVA_Build 2 183581514 3D ATTGGTCTTC CTG/--- CTGTGTTTGC 3070 hom 126 het 47 0 43 6 CTG 2 1 309914 CASAVA_Build 2 183600019 11D GCCTAAACAT CTAAATACAGC/----------- CTAAATACAG 3070 hom 126 het 44 0 43 5 CTAAATACAGC 2 1 309915 CASAVA_Build 2 183607356 2D GTTGTATGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 26 1 17 8 T 13 11 309916 CASAVA_Build 2 183616642 10D AGAAAGAAAA AGAAAGAAAG/---------- AGAAAGAAAA 3070 hom 36 het 13 0 12 4 AGAAAGAAAG 1 0 309917 CASAVA_Build 2 183631840 1I TTTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 10 11 309918 CASAVA_Build 2 183636849 16D TTTGTTTCCC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 1229 het 16 hom 8 0 4 6 T 29 13 309919 CASAVA_Build 2 183649978 2I AGCCTGAGCT --/TA TATATATATA 1653 het 1653 ref 19 8 5 6 TA 7 8 309920 CASAVA_Build 2 183662538 1D CTGTCTATAC T/- GTGGACACCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 T 1 0 309921 CASAVA_Build 2 183669517 1D31M1I CCTCATTTTG TTTTTTTCAATTCTGTTATCGGCATTTCTTTC-/-TTTTTTCAATTCTGTTATCGGCATTTCTTTCT TTTTTTTTTT 3070 het 1441 hom 33 4 18 25 N/A 0 0 309922 CASAVA_Build 2 183672024 2D AATACTTGGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 T 11 9 309923 CASAVA_Build 2 183674072 1I CTTTTGGGTA -/T TTTATCAATG 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 3 4 309924 CASAVA_Build 2 183676796 1I TTTACTATTT -/A TTTTTTTCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 0 1 309925 CASAVA_Build 2 183682023 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1047 het 1047 ref 31 17 6 8 T 13 12 309926 CASAVA_Build 2 183683763 1D53M3D ACTCCATGTC AAAAAAAAAAATAAATAAAAATAAAAAACAAAATAAAATAAACCTTATAGATAATAT/-AAAAAAAAAATAAATAAAAATAAAAAACAAAATAAAATAAACCTTATAGATAA--- TATATTTAAT 3070 het 2296 hom 8 7 10 8 N/A 0 0 309927 CASAVA_Build 2 183684420 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 9 10 309928 CASAVA_Build 2 183684969 1D TTTCCATAGG C/- CAAAAAAAAA 3070 het 1108 hom 30 7 12 11 C 2 1 309929 CASAVA_Build 2 183689188 1D TTTTCATTGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 63 het 22 0 20 2 T 8 7 309930 CASAVA_Build 2 183692987 7D AGGTGACAAT GTATATA/------- GTATAATGAA 3070 het 3070 ref 35 19 10 8 GTATATA 1 0 309931 CASAVA_Build 2 183695868 1D ATGTTACCTT A/- TATGGCAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 23 4 A 1 0 309932 CASAVA_Build 2 183699616 1D ATTGAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 T 11 10 309933 CASAVA_Build 2 183702191 1I AAGGAAACTT -/G GGGGGGGAGG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 7 8 309934 CASAVA_Build 2 183706612 1D TGATTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2566 het 516 hom 28 2 10 16 T 17 16 309935 CASAVA_Build 2 183711764 3I AACTAGAATC ---/ATT ATTTGTGTTA 3070 het 3070 hom 58 25 28 5 ATT 1 2 309936 CASAVA_Build 2 183715618 1I ATGCTGGGCT -/A ACTTTTTGTA 3070 het 1210 hom 21 4 16 2 A 1 2 309937 CASAVA_Build 2 183717562 6I CATAAAGGGT ------/AATAAG AATAAGGTCT 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 AATAAG 1 2 309938 CASAVA_Build 2 183719579 1D TTTTTTGACC T/- TTTTTTTTTT 1333 het 1333 ref 22 17 3 4 T 11 10 309939 CASAVA_Build 2 183721584 18D AAAATGTCTA TTCATGTTCTTTGCCCAC/------------------ TTCTTTAACA 3070 het 3070 ref 36 22 16 5 TTCATGTTCTTTGCCCAC 1 0 309940 CASAVA_Build 2 183725183 2I TAATAGAAAC --/AG AGTATGACAG 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 AG 1 2 309941 CASAVA_Build 2 183731022 3I TACAATAAAC ---/ATT ATATTTTGAG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 ATT 0 1 309942 CASAVA_Build 2 183739999 4I AATGGTTAAT ----/ACTG AGTGTCAACT 1687 het 1687 ref 19 12 5 2 ACTG 0 1 309943 CASAVA_Build 2 183761914 1D TAGGAAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 9 8 309944 CASAVA_Build 2 183765743 1I TGGATTCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 A 8 9 309945 CASAVA_Build 2 183772634 1I ACTCAATAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 393 hom 40 1 37 2 A 8 9 309946 CASAVA_Build 2 183773274 2I TGAAATAAAC --/AG AATACAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 AG 0 1 309947 CASAVA_Build 2 183773845 1D TCTTACCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1165 hom 16 4 10 2 A 13 12 309948 CASAVA_Build 2 183775412 1D AAAAATAAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 10 9 309949 CASAVA_Build 2 183779641 9D GGCAAAATGA GAGTGTTAT/--------- GTCTTCTGAG 3070 het 3070 ref 56 30 23 7 GAGTGTTAT 1 0 309950 CASAVA_Build 2 183789786 5I CTTTAAAAAA -----/TTATC TTATTTTATC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TTATC 0 1 309951 CASAVA_Build 2 183790409 5D ACAATTTACT TGACA/----- TAACAATTTT 3070 het 3070 hom 44 21 21 5 TGACA 1 0 309952 CASAVA_Build 2 183790969 1D ATGAAAGTCA T/- TTAAGCAAGG 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 T 3 2 309953 CASAVA_Build 2 183791732 5I GCTGGTAAAC -----/TAGAA TAGTTAGAAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TAGAA 0 1 309954 CASAVA_Build 2 183791788 4D TATAGAAAAT CTAA/---- CTATAGTATA 3070 het 2267 hom 24 7 13 7 CTAA 1 0 309955 CASAVA_Build 2 183793794 1I TCTTCCCTGT -/A AACTTCAGTA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 A 2 3 309956 CASAVA_Build 2 183795946 1I CCAAAGCATG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 62 29 24 9 T 7 8 309957 CASAVA_Build 2 183797036 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 2414 het 1407 hom 19 6 7 6 A 9 10 309958 CASAVA_Build 2 183802705 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 11 12 309959 CASAVA_Build 2 183802880 1I TGAGAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 16 6 T 14 15 309960 CASAVA_Build 2 183808886 4D TTAAAAACTA TCTT/---- ATTGCTCAAA 3070 het 3070 ref 43 21 21 3 TCTT 1 0 309961 CASAVA_Build 2 183832537 3I TGTTTTTATT ---/AGC AGAGTGAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AGC 0 1 309962 CASAVA_Build 2 183837230 3D CTAAATGCTG CCC/--- CCCCCCCCCC 2517 hom 33 het 13 0 9 4 C 13 10 309963 CASAVA_Build 2 183837450 1I ACATTAGTTT -/G GGGGGGCCCT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 6 7 309964 CASAVA_Build 2 183842802 1I TTCCTAGATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 9 10 309965 CASAVA_Build 2 183847068 1I GTTTTTTTTT -/A ATCAGTGGAT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 1 2 309966 CASAVA_Build 2 183848016 1I TTCAAAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 10 11 309967 CASAVA_Build 2 183905691 1D GTCGGGGTGT G/- GGGGGGGTTA 3070 hom 34 het 16 0 12 4 G 8 7 309968 CASAVA_Build 2 183909311 1I GACTGCTTTT -/C CTGCACCTCA 3070 hom 62 het 23 0 21 2 C 1 2 309969 CASAVA_Build 2 183909725 1D GTTAAAAGTC G/- AGGAGAGGAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 0 309970 CASAVA_Build 2 183911188 1I CTTCACTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 30 1 22 7 A 10 11 309971 CASAVA_Build 2 183927680 1D ATGTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 9 8 309972 CASAVA_Build 2 183929374 1D TAGGCAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 21 0 15 7 T 12 11 309973 CASAVA_Build 2 183939637 1D ATTCTTTCTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 8 309974 CASAVA_Build 2 183955530 2D CCACTCTGAT AC/-- AGAGAAGCTT 3070 hom 79 het 29 0 24 5 AC 1 0 309975 CASAVA_Build 2 183967961 1I TGGAATAGTT -/G GGGGGGGGGC 1891 het 132 hom 20 1 7 12 G 9 10 309976 CASAVA_Build 2 183982733 1D CCCAACCTCC T/- TTTTTTTTTT 1414 het 1414 ref 35 23 4 8 T 12 11 309977 CASAVA_Build 2 183990556 3D ACAAAAATGA CCC/--- CCCCCCCCGC 3070 hom 72 het 29 0 23 6 C 11 8 309978 CASAVA_Build 2 183990657 1I CAAAAATGCT -/A AAAATTCCAA 3070 hom 102 het 38 0 33 7 A 4 5 309979 CASAVA_Build 2 183992087 1I ACAGGACTCT -/C CACCCTGAAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 1 2 309980 CASAVA_Build 2 184007729 1D AAGTTTCTGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 9 8 309981 CASAVA_Build 2 184010986 4D GTGGGTGTCA TCCT/---- TCCTTTCTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TCCT 2 1 309982 CASAVA_Build 2 184015064 11D ATTTACTTTC TAGCTGGTCTA/----------- TTACAGAAAA 3070 hom 117 het 39 0 40 4 TAGCTGGTCTA 1 0 309983 CASAVA_Build 2 184040338 2D ACAGGAAGAC TT/-- TGGCTTTTTC 3070 hom 135 het 52 0 45 8 T 3 1 309984 CASAVA_Build 2 184053282 8I ACCACGTCTG --------/GTTTATTT GTTTATTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GTTTATTT 1 2 309985 CASAVA_Build 2 184053638 1D12M1I AGTAGGACAT AAATTTTTAGTAC-/-AATTTTTAGTACA AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 15 13 7 N/A 0 0 309986 CASAVA_Build 2 184055239 1D AGAGAAATCA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 C 11 10 309987 CASAVA_Build 2 184056250 3D AGTTGTTGTA ATT/--- ATTATTTTTG 3070 het 3070 ref 36 20 14 4 ATT 3 2 309988 CASAVA_Build 2 184056954 2D CTCTCACCCC CT/-- GTTTACCTTC 3070 het 3070 ref 47 31 12 6 CT 1 0 309989 CASAVA_Build 2 184057390 1D TGTTTGGCAT A/- GAGGTTGTAC 3070 het 3070 hom 33 11 16 7 A 1 0 309990 CASAVA_Build 2 184058741 4I AAAGATAAAA ----/AATG TGGTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AATG 0 1 309991 CASAVA_Build 2 184060098 1D GGAGACATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 24 15 14 T 12 11 309992 CASAVA_Build 2 184061339 3D TATATTTGCT AAA/--- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 12 9 309993 CASAVA_Build 2 184062630 1I GTGCATTTCT -/A ACTCTATTGC 3070 het 3070 hom 27 14 13 0 A 1 2 309994 CASAVA_Build 2 184062917 1D AATATGAACA T/- TTTGAAAACA 3070 het 3070 hom 47 17 27 3 T 4 3 309995 CASAVA_Build 2 184078095 1I TAAGGGGGGT -/C CCAAAGGGGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 2 3 309996 CASAVA_Build 2 184085788 1I CTGCTGGCAT -/G GGGGGGCCAG 2611 hom 15 het 14 0 6 8 G 6 7 309997 CASAVA_Build 2 184086847 2D TAGAGATCAC TG/-- TATGTAATTC 3070 het 3070 hom 23 10 13 2 TG 1 0 309998 CASAVA_Build 2 184089143 1D GCCAATTTTT G/- TCTGTCTGAT 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 G 1 0 309999 CASAVA_Build 2 184092090 1I ATCTCACTCA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 6 7 310000 CASAVA_Build 2 184093374 3D GCCTGGTTTT AGG/--- AGGAGTGGCA 3070 het 3070 hom 46 19 21 7 AGG 2 1 310001 CASAVA_Build 2 184093711 4D GTTTTAAGCC ACTA/---- ACTAACTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 ACTA 2 1 310002 CASAVA_Build 2 184094241 1D TTATAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 11 10 310003 CASAVA_Build 2 184095304 5I GAGATTGAAG -----/TGCTT TGCTTTGCAG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 TGCTT 1 2 310004 CASAVA_Build 2 184095537 2D CAACTAAAAC TT/-- TTTTCCTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 26 5 T 6 4 310005 CASAVA_Build 2 184095678 1I AATTGATTTG -/T TTTTTAGTGT 3070 het 3070 ref 46 19 19 8 T 5 6 310006 CASAVA_Build 2 184096792 1D AGTTAGACAA G/- TTGCTTCTAA 3070 het 3070 ref 33 15 8 10 G 1 0 310007 CASAVA_Build 2 184097872 15D AGGTGCAAAG TGTATATGTAGTTGT/--------------- TGTATATGTA 3070 hom 105 het 40 0 36 7 TGTATATGTAGTTGT 2 1 310008 CASAVA_Build 2 184098476 1D CTAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 9 310009 CASAVA_Build 2 184098750 16I TTGGCCATCA ----------------/GCTCTATGAAGCATTT GCTCTATGAA 3070 het 2608 hom 27 6 10 11 GCTCTATGAAGCATTT 1 2 310010 CASAVA_Build 2 184099561 4D ATGGAAAACC AAAT/---- AAATACTACA 3070 hom 105 het 37 0 35 6 AAAT 2 1 310011 CASAVA_Build 2 184100357 4D AATGGAATTT TATC/---- TATCTCATTC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 TATC 2 1 310012 CASAVA_Build 2 184100682 1D TGACTTTTTG T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 131 het 48 0 43 5 T 8 7 310013 CASAVA_Build 2 184101681 11I TTGCTTCCCC -----------/TTCCATCATTA TTCCATCATT 3070 het 3070 ref 32 12 8 12 TTCCATCATTA 1 2 310014 CASAVA_Build 2 184101833 3D TATTTAAATA AAT/--- AATGAGATAA 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 AAT 2 1 310015 CASAVA_Build 2 184105213 1D AGATATTTTT C/- CTCAGTTGGC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 C 2 1 310016 CASAVA_Build 2 184109948 1D TTTTTAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2363 hom 26 6 14 6 T 15 14 310017 CASAVA_Build 2 184127607 1I TTACAGAAAA -/C CTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 C 1 2 310018 CASAVA_Build 2 184134065 4D TCTCTTGTTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 973 hom 47 5 25 22 TC 8 6 310019 CASAVA_Build 2 184143961 1D TGGAGGGACC T/- GGTGGGAGGT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 1 0 310020 CASAVA_Build 2 184147435 1I AGATCAAAAA -/G GTCCAATTTC 3070 hom 129 het 46 0 43 3 G 1 2 310021 CASAVA_Build 2 184208248 1I TTCGCAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 428 hom 40 2 23 15 T 14 15 310022 CASAVA_Build 2 184233801 1I AGGCAAAGAT -/A ATGAAAATAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 1 2 310023 CASAVA_Build 2 184234533 4I GTAAATATAA ----/ATAG ATAGATAGAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 ATAG 2 3 310024 CASAVA_Build 2 184238147 1D GTTCATAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 A 10 9 310025 CASAVA_Build 2 184249855 1D TATATAATTT C/- AGATACAGAA 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 C 1 0 310026 CASAVA_Build 2 184253739 3D ACAGAAAATA TAC/--- TACATCAGCA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 TAC 2 1 310027 CASAVA_Build 2 184254441 3I CTCATATAAT ---/CAC CACAACTGAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 CAC 1 2 310028 CASAVA_Build 2 184255202 50D10M15D6M45D TTATAATACA TATATTATATATACATATAATATATAATACATATATATACATATACATATATATACATATAATATATAATACATATAATAATATATAATATAATACATATATTATATTATATAATATATAAGTATT/--------------------------------------------------GGCTACAGCT---------------TGGCAA--------------------------------------------- ATAATACTCC 3070 hom 36 het 13 0 12 6 N/A 0 0 310029 CASAVA_Build 2 184255719 1D ATAGTTGCCC A/- ATTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 53 22 21 10 A 2 1 310030 CASAVA_Build 2 184262721 2D TTTTATCATA CT/-- CTCTATGTCC 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 CT 3 2 310031 CASAVA_Build 2 184266122 1I71M1I TTGCCAACAA -TTTTTTTGGGCCCTTAGTAATTTTAAAAGTTTAATTTATTGCCTACATTTTAAATGTAGAGAAGCTTTTTT-/TTTTTTTTGGGCCCTTAGTAATTTTAAAAGTTTAATTTATTGCCTACATTTTAAATGTAGAGAAGCTTTTTTA AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 22 0 35 7 N/A 0 0 310032 CASAVA_Build 2 184271630 1I AAATTAAAAA -/G GTTTTAAAAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 1 2 310033 CASAVA_Build 2 184276589 1I AAGATAAATT -/A GAGACTTAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 0 1 310034 CASAVA_Build 2 184294850 1D AATTGCATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 15 17 10 A 11 10 310035 CASAVA_Build 2 184300215 1I GCATCACAGA -/C CAGAGCTGAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 1 2 310036 CASAVA_Build 2 184302358 1I AAATGAACAC -/T TTTATTTTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 3 4 310037 CASAVA_Build 2 184318731 1I TCTTAAAAGG -/T TTTTTTGTCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 7 310038 CASAVA_Build 2 184323462 1I TTTTTCTCTA -/C CCCACTAATA 3070 hom 148 het 58 0 47 11 C 3 4 310039 CASAVA_Build 2 184327487 30D TAACCCAGGT TAAGCCCTTAGAAGACTACTAGTGAATGGG/------------------------------ AAGTACTCAA 3070 hom 105 het 31 0 35 4 TAAGCCCTTAGAAGACTACTAGTGAATGGG 1 0 310040 CASAVA_Build 2 184331659 5D TTATTTATTT GTAGG/----- GTCTCCCAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GTAGG 1 0 310041 CASAVA_Build 2 184335460 1D ACTTTGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 645 hom 30 2 18 10 T 13 12 310042 CASAVA_Build 2 184341463 4D TATTCAACAC TTTA/---- TTTTTCTATG 3070 hom 160 het 60 0 54 8 TTTA 1 0 310043 CASAVA_Build 2 184342235 1I CCCTGGGAGA -/C CAGGGTGAGT 3070 hom 75 het 26 0 23 3 C 1 2 310044 CASAVA_Build 2 184347521 1D27M1I AAAAGTAAAG AAAAAAGTCTTCTTTTTAAGAAAAATAC-/-AAAAAGTCTTCTTTTTAAGAAAAATACT TTTTTTTTTT 3070 het 186 hom 26 2 28 2 N/A 0 0 310045 CASAVA_Build 2 184355551 1I GTGGGCCAGG -/C CCAGGGCCCT 3070 hom 49 het 21 0 15 6 C 2 3 310046 CASAVA_Build 2 184357036 2I AGTGCGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 TA 5 6 310047 CASAVA_Build 2 184359173 15D AGTGGTATGT GGAGCAAGTATCTTA/--------------- GAGGTATCTT 3070 hom 93 het 31 0 32 1 GGAGCAAGTATCTTA 1 0 310048 CASAVA_Build 2 184363435 1D TTCAACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 12 11 310049 CASAVA_Build 2 184371017 1D GCAATAAACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 9 8 310050 CASAVA_Build 2 184375659 1I TTGACAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 41 2 28 11 T 11 12 310051 CASAVA_Build 2 184398696 1I AACTCTATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 10 310052 CASAVA_Build 2 184401601 1D GAGCAGTAAT A/- AAACTGATAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 4 3 310053 CASAVA_Build 2 184405022 3I TTTTGAAAAA ---/GAT TATGCTTTGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GAT 0 1 310054 CASAVA_Build 2 184415624 1I CTGGTGGGTG -/C CCCTCCGGGA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 C 3 4 310055 CASAVA_Build 2 184422680 1I AGCAGGGCGA -/G GCATTGCCTC 3070 het 211 hom 13 2 9 2 G 1 2 310056 CASAVA_Build 2 184435796 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 29 1 17 11 T 12 13 310057 CASAVA_Build 2 184439933 2D GTTCTCTCTA TC/-- TCTGTGTATT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 TC 2 1 310058 CASAVA_Build 2 184441056 2I GGTTTTTATC --/CA CACTAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CA 1 2 310059 CASAVA_Build 2 184458365 1D ACAATATAAT C/- CCCTAGAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 4 3 310060 CASAVA_Build 2 184471487 1I CCTGCCCGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 332 hom 31 1 26 4 A 10 11 310061 CASAVA_Build 2 184474401 1I TTAAAGGAAT -/A AAAAATGGTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 5 6 310062 CASAVA_Build 2 184484234 4I AAAATGGAAG ----/TAAA TAAAGAAATT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 TAAA 1 2 310063 CASAVA_Build 2 184492022 1I CTTAAGAGAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 39 0 33 6 T 8 9 310064 CASAVA_Build 2 184498257 2D ATTCCTACTG TA/-- TATAGCCTAG 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TA 3 2 310065 CASAVA_Build 2 184500740 4I CATAGTTAAC ----/AGTA AGTAATAGGC 3070 hom 102 het 36 0 34 2 AGTA 1 2 310066 CASAVA_Build 2 184511713 3D AGTTCAAAAC AAT/--- GATATTAAAG 3070 hom 99 het 36 0 34 4 AAT 1 0 310067 CASAVA_Build 2 184516193 1I GTGCAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 45 1 41 3 A 10 11 310068 CASAVA_Build 2 184528495 1I TCTGATATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 32 1 25 6 A 12 13 310069 CASAVA_Build 2 184539144 1D ATTATTTTGA G/- GTTTTTTTTT 3070 het 770 hom 27 9 14 4 G 2 1 310070 CASAVA_Build 2 184567652 1I TGCTTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 44 1 34 9 A 11 12 310071 CASAVA_Build 2 184571567 1D GCATTGGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 11 10 310072 CASAVA_Build 2 184573529 1I CTGAAAAAAA -/C AAACTTAATT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 C 0 1 310073 CASAVA_Build 2 184575836 1I GACACAAATC -/T AAATCATATC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 0 1 310074 CASAVA_Build 2 184585392 1D TCTGAAAGAT A/- AAAAATATTA 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 6 5 310075 CASAVA_Build 2 184585528 3I TTAAAAGTAT ---/AGA AGAAGAAACA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 AGA 2 3 310076 CASAVA_Build 2 184586351 1I TGAGCAAACA -/G TGTGGAAATA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 G 0 1 310077 CASAVA_Build 2 184589268 1I AAATAGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 10 11 310078 CASAVA_Build 2 184591321 2I TGCGAGCCTC --/AA GTCTTGGCAA 3070 het 2078 hom 32 8 15 9 A 0 2 310079 CASAVA_Build 2 184611378 1I TAAGAAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 8 9 310080 CASAVA_Build 2 184621485 1I AATTGGAGTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 1045 hom 40 3 32 5 T 0 1 310081 CASAVA_Build 2 184626671 2D TCCATGAAGG TT/-- TTGAATATAT 3070 het 3070 hom 42 20 19 4 T 4 2 310082 CASAVA_Build 2 184640184 1D AGGAGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 T 11 10 310083 CASAVA_Build 2 184642862 1D CTAAGTTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 22 9 9 5 T 9 8 310084 CASAVA_Build 2 184643669 2D CTTTTCATTC TT/-- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 59 21 29 9 T 10 8 310085 CASAVA_Build 2 184648535 1I CTTAACCTCC -/A ATGAGATCAT 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 A 1 2 310086 CASAVA_Build 2 184662314 1I CTGAAATAAT -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 6 7 310087 CASAVA_Build 2 184672924 1I CCATGCAGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 16 hom 29 1 25 3 T 9 10 310088 CASAVA_Build 2 184679383 1I CAATGTTGTT -/A AGTGTTATAA 3070 het 3070 hom 53 20 30 3 A 1 2 310089 CASAVA_Build 2 184690300 4D CATTTCTAAT TTTG/---- TTTTACCACC 3070 het 3070 ref 29 14 9 9 TTTG 1 0 310090 CASAVA_Build 2 184690731 3D GAAGTGACTT GTC/--- GTGGACATTA 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 GTC 1 0 310091 CASAVA_Build 2 184691977 5D GTTGAAATTT ATAAG/----- ATAATTCATA 2673 het 2673 ref 26 15 9 6 ATAAG 1 0 310092 CASAVA_Build 2 184698395 1D ATTCTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 2730 het 2730 ref 29 12 9 8 T 11 10 310093 CASAVA_Build 2 184707280 1I GCTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 9 10 310094 CASAVA_Build 2 184712170 3I ATAGGTAAAC ---/ACG ACTTCTCCCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ACG 0 1 310095 CASAVA_Build 2 184712600 2D TTTTCGTGTT AA/-- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 A 9 7 310096 CASAVA_Build 2 184713030 1I AAATTTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 T 10 11 310097 CASAVA_Build 2 184716299 1D GAGGGAAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 A 8 7 310098 CASAVA_Build 2 184719488 1D TAATTCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 11 10 310099 CASAVA_Build 2 184725460 1I29M1D ACTTTTTTTT -AACCACTTTACTGAGGTATAATTGACATGA/AAACCACTTTACTGAGGTATAATTGACATG- AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 24 1 23 7 N/A 0 0 310100 CASAVA_Build 2 184726608 1I CTATCAAAGC -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 97 het 41 0 33 8 A 7 8 310101 CASAVA_Build 2 184727352 2D TTTTAATCAC AT/-- AGAGTGATTT 3070 hom 123 het 43 0 42 2 AT 1 0 310102 CASAVA_Build 2 184727915 2D TAGCTGGCTC AA/-- GAGCATAATA 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 A 2 0 310103 CASAVA_Build 2 184729361 4D CTCTTACAAT ATTA/---- ATTATTATTC 3070 hom 144 het 53 0 48 7 ATTA 2 1 310104 CASAVA_Build 2 184729827 2D CAGATTTATA TG/-- TGTGTATATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TG 3 2 310105 CASAVA_Build 2 184730557 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 9 310106 CASAVA_Build 2 184741037 1D GGTAGTTTGA T/- TAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 T 2 1 310107 CASAVA_Build 2 184742343 1I TTGAAGGATG -/C CTAGATGGCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 2 310108 CASAVA_Build 2 184747180 2I12M1I TCAAATATCA --ATGTTTTAAAAA-/ATATGTTTTAAAAAT AATTTCTGGT 3070 hom 81 het 29 0 28 4 N/A 0 0 310109 CASAVA_Build 2 184749489 2D TGCGGACCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 774 hom 39 4 17 18 T 13 11 310110 CASAVA_Build 2 184755043 1I AAAATATAGG -/T TAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 23 1 22 0 T 1 2 310111 CASAVA_Build 2 184755132 1I CATACTACTT -/A AAGTGATCTA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 2 3 310112 CASAVA_Build 2 184759006 4D TTTCTAAAAC TGAG/---- TGAGTGTCTA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 TGAG 2 1 310113 CASAVA_Build 2 184760025 1I TCAAAAACTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 9 10 310114 CASAVA_Build 2 184760319 10I CAGTGAAGAC ----------/TCAGGAAACT AGAGGTCAAC 3070 het 3070 hom 37 11 21 6 TCAGGAAACT 0 1 310115 CASAVA_Build 2 184764979 4D GGGCATAGAT AGAA/---- AGAGAGAGAT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 AGAA 1 0 310116 CASAVA_Build 2 184772480 8D TGCTAGTTGT TTTTTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 TTTTTTTG 1 0 310117 CASAVA_Build 2 184779897 1I TGTTTTCACT -/A AAAAAAAAAA 2851 het 2851 ref 19 9 7 3 A 11 12 310118 CASAVA_Build 2 184786464 8I CTTTTTCTGC --------/ATCCATGG ATCCATGGAG 3070 het 3070 hom 27 8 9 10 ATCCATGG 1 2 310119 CASAVA_Build 2 184787989 1D ATCTTTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 T 10 9 310120 CASAVA_Build 2 184792371 1I CTCCTGCTTT -/G TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 G 0 1 310121 CASAVA_Build 2 184795744 6D AATTTTTAGC TATATA/------ TATATATATA 2349 het 740 hom 13 2 8 3 TA 12 9 310122 CASAVA_Build 2 184798189 1I AATTCTTAAG -/A TAATTTATTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 0 1 310123 CASAVA_Build 2 184811041 1D TCTCAAGCTA C/- CAGCTTGTGA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 C 2 1 310124 CASAVA_Build 2 184813682 2I TATAAACATA --/TT TTAATAAGCA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 2 4 310125 CASAVA_Build 2 184813850 21D TTCATATCAA TCAAAATTCAATTCATATCAG/--------------------- TCAAAATTGA 3070 het 3070 ref 32 18 13 6 TCAAAATTCAATTCATATCAG 1 0 310126 CASAVA_Build 2 184814699 1D TAGGCAAAAC A/- AGAAAAACAC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 2 1 310127 CASAVA_Build 2 184821392 1I ACTTGAGATT -/A AAAGTCTAGA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 3 4 310128 CASAVA_Build 2 184826047 1I GGTTGAATAA -/C AATCAACAGG 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 C 0 1 310129 CASAVA_Build 2 184833957 1D AGCTCTGAAG A/- ACCTCAGCAT 3070 het 3070 ref 46 21 18 8 A 2 1 310130 CASAVA_Build 2 184842267 1D AGAAGGAAAC T/- TGTTGGCCTC 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 T 2 1 310131 CASAVA_Build 2 184850510 1I AAGCAGGATT -/G GGCAAAGGAT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 G 2 3 310132 CASAVA_Build 2 184850858 4D AGTTGATATA TTAT/---- TTAAAGATTT 3070 het 3070 ref 42 23 17 6 TTAT 1 0 310133 CASAVA_Build 2 184897263 1I TTCGATCGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 11 12 310134 CASAVA_Build 2 184900192 3D TTTCTTAAAG ATA/--- ATAACTTTTA 3070 het 3006 hom 21 8 11 3 ATA 2 1 310135 CASAVA_Build 2 184909119 1D TTTTTGTGCA T/- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 6 5 310136 CASAVA_Build 2 184918879 3D ACAAAATATC AAA/--- GAAGGGATTT 3070 het 3070 ref 43 20 21 4 A 3 0 310137 CASAVA_Build 2 184921137 11D ACTTTGTCTG TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTGG 3070 het 2453 hom 29 10 14 6 T 19 8 310138 CASAVA_Build 2 184921186 1D ATATAATTCC T/- TTTTTTCTTA 2270 het 2270 ref 28 9 5 14 T 7 6 310139 CASAVA_Build 2 184933176 1D AAAATCAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 10 9 310140 CASAVA_Build 2 184933380 1I TTTAGGAGAG -/A AAAATAGGAT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 A 4 5 310141 CASAVA_Build 2 184933514 1I GGAAGGACAT -/A AAAAGTGAAT 3070 het 3070 hom 52 20 29 3 A 4 5 310142 CASAVA_Build 2 184934074 1D CTACAAAGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 10 9 310143 CASAVA_Build 2 184940721 20D5M29D AAAATTTCTG TCCATGTCTTCTGCCCATTTTCTAATTGGATTGTTTACTTTTTTACTGTTGAAT/--------------------TCTAA----------------------------- TTCAGTCTGT 3070 het 3070 ref 27 30 14 7 N/A 0 0 310144 CASAVA_Build 2 184942788 1D14M2D TGGAATAGCT AAAAAAAAAAGAAACAA/-AAAAAAAAAGAAAC-- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 35 14 18 7 N/A 0 0 310145 CASAVA_Build 2 184944305 1I GCTACATGAG -/A AAAAAAAAAA 1298 het 1298 ref 45 36 3 6 A 10 11 310146 CASAVA_Build 2 184946489 3D AATAAAATCT AAC/--- AACAATATAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AAC 2 1 310147 CASAVA_Build 2 184947540 4D TATTAATCTT AGTG/---- AGGAAGGCAT 3070 het 3070 ref 43 27 15 5 AGTG 1 0 310148 CASAVA_Build 2 184962043 1I AAAAAAGAAA -/G ATAATACCGG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 G 0 1 310149 CASAVA_Build 2 184967311 2D CATAAAGTCA GT/-- GTATTTTCAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 GT 2 1 310150 CASAVA_Build 2 184980928 4D CAGGCAACAA AAAC/---- AAACAGACAA 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 AAAC 2 1 310151 CASAVA_Build 2 184998080 5D TCTTTTCTTC TTATG/----- TTAATTTCAG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TTATG 1 0 310152 CASAVA_Build 2 185005010 1I CCCTAGAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 3 het 37 2 31 4 A 9 10 310153 CASAVA_Build 2 185007269 1I ATCTCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 126 het 52 0 43 9 T 10 11 310154 CASAVA_Build 2 185030709 1D GCTAGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 830 hom 42 3 31 8 A 12 11 310155 CASAVA_Build 2 185036349 1D AGTCTCCCTG T/- TCCCCCATCC 3070 hom 123 het 44 0 42 3 T 2 1 310156 CASAVA_Build 2 185037207 1I TCCTGTACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1364 hom 40 4 25 11 A 14 15 310157 CASAVA_Build 2 185053600 1D CCCAGAGACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 6 A 10 9 310158 CASAVA_Build 2 185057340 3I GAAAAATAAC ---/AAT GATGAAATAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AAT 0 1 310159 CASAVA_Build 2 185079967 1D TTATAATTAT A/- AAAATATGAT 2365 hom 12 het 5 0 5 0 A 5 4 310160 CASAVA_Build 2 185083676 1D TTAATTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 51 2 44 5 A 19 18 310161 CASAVA_Build 2 185100378 2D GGAAAACAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 29 0 22 7 T 12 10 310162 CASAVA_Build 2 185101807 1D TGGTGTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 31 0 23 8 A 11 10 310163 CASAVA_Build 2 185119568 1I TTATCTCATC -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 6 7 310164 CASAVA_Build 2 185121188 4D TTTTGTAGAA TGTT/---- TGGTGAATAT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TGTT 1 0 310165 CASAVA_Build 2 185183480 1D TGTGTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 983 het 983 ref 42 32 3 7 T 11 10 310166 CASAVA_Build 2 185193271 2D TCCTACAAAT AA/-- GAGTTAAAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 2 0 310167 CASAVA_Build 2 185195364 1D ATTTGAACTT A/- ACAATGTTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 2 1 310168 CASAVA_Build 2 185210649 18I GCAGGCATAA ------------------/TACATTCTTCTCTCTATT TTTAGAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TACATTCTTCTCTCTATT 0 1 310169 CASAVA_Build 2 185217207 2D GCTATATATC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AT 7 6 310170 CASAVA_Build 2 185223667 5I GCTAAAACTG -----/AAACA AAACAAAACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAACA 3 4 310171 CASAVA_Build 2 185241421 3D CAGTATCATC ATT/--- GATTATATAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 ATT 1 0 310172 CASAVA_Build 2 185241960 1D CTGAGGAAAT A/- ACTGAGCCTC 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 2 1 310173 CASAVA_Build 2 185242741 6I CACACGCACA ------/CACACT CACACACACA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 CACACT 0 1 310174 CASAVA_Build 2 185247768 1D TTCCAAGTCT A/- AAAAAAGTAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 7 6 310175 CASAVA_Build 2 185249268 1I CTTGCTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 10 11 310176 CASAVA_Build 2 185263164 1I AAGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 27 1 23 3 A 13 14 310177 CASAVA_Build 2 185267080 1I TTATTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 2703 het 14 hom 18 1 9 8 T 13 14 310178 CASAVA_Build 2 185267182 1D TGGCCTCCAG A/- AGTGCTGGGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 2 1 310179 CASAVA_Build 2 185277128 1D TCAGGAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 38 1 23 14 T 13 12 310180 CASAVA_Build 2 185283164 1D TATGTACTTA C/- AAAATTGTGT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 0 310181 CASAVA_Build 2 185297439 9D AGGCAAAGAA TCAGAGAGT/--------- TCAGAGAGTT 3070 hom 105 het 42 0 35 9 TCAGAGAGT 2 1 310182 CASAVA_Build 2 185297541 1I GATACTACTG -/A TATTATTAGA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 0 1 310183 CASAVA_Build 2 185301089 4I ATGAAAATCT ----/ATTA ATTAAAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 ATTA 1 2 310184 CASAVA_Build 2 185303305 1D CAACAACCCC T/- ACCAGAGTAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 0 310185 CASAVA_Build 2 185303820 1I AATTTGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 723 hom 47 3 33 11 T 12 13 310186 CASAVA_Build 2 185309677 1I AACTTAAATT -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 8 310187 CASAVA_Build 2 185309824 4D AGAACTCGTA TTTC/---- TTCTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 TTTC 1 0 310188 CASAVA_Build 2 185315639 1D TATTTGTAAA T/- TATTTGTTGG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 1 310189 CASAVA_Build 2 185319407 1D ATAGTAGGTG T/- ATATATTTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 1 0 310190 CASAVA_Build 2 185321260 1D CTAACATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 T 11 10 310191 CASAVA_Build 2 185331349 5D ATTTACAAGT CACTA/----- CACTACTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 CACTA 2 1 310192 CASAVA_Build 2 185333642 2D GAAGGAGACT AC/-- AGACACCCCA 3070 hom 171 het 61 0 57 4 AC 1 0 310193 CASAVA_Build 2 185337178 1I CTTTTATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 37 1 31 5 T 10 11 310194 CASAVA_Build 2 185344581 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGATGTCTA 3070 hom 84 het 31 0 29 6 AAG 2 1 310195 CASAVA_Build 2 185345944 2D CATATATATG TA/-- TATATATATG 3070 hom 17 het 17 0 10 7 TA 5 4 310196 CASAVA_Build 2 185349454 1I ATAAACCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 49 1 36 12 T 12 13 310197 CASAVA_Build 2 185356119 2I AGTTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3016 het 8 hom 20 1 12 7 TG 0 1 310198 CASAVA_Build 2 185360494 1D ACATCGGTTG T/- TTTTTTGACT 3070 hom 113 het 41 0 39 3 T 7 6 310199 CASAVA_Build 2 185360799 1D TCTTTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 197 hom 28 1 19 8 T 11 10 310200 CASAVA_Build 2 185368923 1I TGTCGAATGC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 9 10 310201 CASAVA_Build 2 185380069 1I GAATATTTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 44 1 38 5 A 9 10 310202 CASAVA_Build 2 185384422 4I TTAGTATCAT ----/GGTC TATTAGATAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 GGTC 0 1 310203 CASAVA_Build 2 185405649 1D TATCTTTTTC A/- TCCCCCAAAT 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 A 1 0 310204 CASAVA_Build 2 185408637 2I GGAAGGCATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 45 0 31 14 A 12 14 310205 CASAVA_Build 2 185409052 1I TCCTTTCCCT -/A ATCTATAAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 1 2 310206 CASAVA_Build 2 185409670 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 10 9 310207 CASAVA_Build 2 185411090 1D TGAAATAGCA G/- GTTGGAGTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 2 1 310208 CASAVA_Build 2 185417147 1I CCTAATTATA -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 36 het 34 0 18 16 C 9 10 310209 CASAVA_Build 2 185426598 1I TTTAGTTAAA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 7 8 310210 CASAVA_Build 2 185426797 1D TTTTTCCACC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 8 7 310211 CASAVA_Build 2 185427386 1I CAGGCCAGAT -/A ATGCCAACAA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 1 2 310212 CASAVA_Build 2 185435638 1I AGTTATTAAC -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 0 1 310213 CASAVA_Build 2 185436527 1D CAAACTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 28 1 21 6 A 12 11 310214 CASAVA_Build 2 185437412 1D ATGAGATTTA G/- AAGGGAAAAT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 G 1 0 310215 CASAVA_Build 2 185439665 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAGGC 513 het 513 ref 23 11 4 9 A 9 7 310216 CASAVA_Build 2 185464550 4I GTAGGAAACC ----/ACTA ACTGTTATTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 ACTA 0 1 310217 CASAVA_Build 2 185466507 5I GTATTTAAAC -----/TTTTA TTTTATAAAT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TTTTA 1 2 310218 CASAVA_Build 2 185471376 3I GGTAAAAATT ---/ACA ACATCACCTG 3070 hom 110 het 39 0 36 3 ACA 1 2 310219 CASAVA_Build 2 185478066 2D TTAGAGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 105 het 51 0 35 16 TG 10 9 310220 CASAVA_Build 2 185480246 1D CCTGTATTTG T/- TATGTTAAAC 3070 hom 160 het 59 0 54 7 T 2 1 310221 CASAVA_Build 2 185499257 2D CTAGGGTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 13 11 310222 CASAVA_Build 2 185517890 1D TGCATTTTAA T/- TTTTTACAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 4 T 6 5 310223 CASAVA_Build 2 185518068 4D TCTAGACTGT ATTG/---- ATTAAGACTA 3070 hom 57 het 21 0 20 3 ATTG 1 0 310224 CASAVA_Build 2 185519695 1I AAAGTGGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 44 0 37 7 A 9 10 310225 CASAVA_Build 2 185536080 1D GATTAAAGGG T/- TTTTTATTTC 3070 hom 111 het 42 0 38 6 T 6 5 310226 CASAVA_Build 2 185555948 2I AAATAATAAC --/TT ATGTTTGAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 2 310227 CASAVA_Build 2 185558584 1D TGTGTGTGTG T/- GGGGGGGTGC 3070 het 183 hom 11 1 8 2 T 1 0 310228 CASAVA_Build 2 185558760 3I CAAAAGAACT ---/TAG TAGGGAAATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TAG 1 2 310229 CASAVA_Build 2 185562759 11I CCATTTTCCT -----------/CTGCAGAGTTG CTGCAGAGGA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 CTGCAGAGTTG 0 1 310230 CASAVA_Build 2 185577803 1D GGTCCTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2652 hom 24 9 7 8 T 17 16 310231 CASAVA_Build 2 185591788 4D TTTTTCTTGC TTTG/---- TTTGTCTACA 3070 hom 57 het 24 0 20 6 TTTG 2 1 310232 CASAVA_Build 2 185596186 1D TTTTATTCTT A/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 36 0 26 10 A 1 0 310233 CASAVA_Build 2 185597332 1I CCATAGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 25 1 21 3 T 11 12 310234 CASAVA_Build 2 185606486 1D AGGTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 36 1 25 10 T 13 12 310235 CASAVA_Build 2 185625089 1D AGGAGCTTCC A/- ACAGTATTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 2 1 310236 CASAVA_Build 2 185709149 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 33 1 19 13 A 16 15 310237 CASAVA_Build 2 185714631 2D CAATAAAATC TT/-- TGTCATTTGT 3070 het 3070 ref 41 19 21 1 T 3 1 310238 CASAVA_Build 2 185730044 1I GATGTAGAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 21 0 16 5 A 9 10 310239 CASAVA_Build 2 185762262 1I TCTCTGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 25 1 19 5 T 11 12 310240 CASAVA_Build 2 185763118 1I TTTCAGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 594 hom 34 3 18 13 A 16 17 310241 CASAVA_Build 2 185775033 2D TTTTATACAC AT/-- GTTTTACAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 AT 1 0 310242 CASAVA_Build 2 185789546 1D GTATTTGGGA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 9 8 310243 CASAVA_Build 2 185791838 1I GTATCGTAAT -/C ACATCTCACA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 0 1 310244 CASAVA_Build 2 185802281 2I GAGAGAGAGA --/CT CTGTAGCTGA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 CT 1 2 310245 CASAVA_Build 2 185823743 1I CTTACAAGCT -/A TTGAGAGCAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 0 1 310246 CASAVA_Build 2 185824105 1I TTCTATATAG -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 6 7 310247 CASAVA_Build 2 185841615 1I GACACTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 539 hom 29 2 13 14 A 11 12 310248 CASAVA_Build 2 185860914 1I GTGCCAACTA -/G ATAGTCACAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 G 0 1 310249 CASAVA_Build 2 185863980 5I AGAAAATACT -----/TAAAA TAAGAATAGT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TAAAA 0 1 310250 CASAVA_Build 2 185872886 1I GGTCTTGGGC -/A GCCCCCTCCA 3070 hom 129 het 50 0 41 9 A 0 1 310251 CASAVA_Build 2 185873937 1D GGTCGTGGGA C/- CCCATAGAGT 3070 hom 66 het 29 0 21 8 C 4 3 310252 CASAVA_Build 2 185875388 3D GACTCCATCT CAA/--- CAACAACAAC 3070 hom 81 het 39 0 28 12 CAA 7 6 310253 CASAVA_Build 2 185877364 4I TTCTCGTGAC ----/AGTG AGTGAGTTTT 3070 hom 82 het 33 0 27 6 AGTG 1 2 310254 CASAVA_Build 2 185886363 1I ACACCAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 10 11 310255 CASAVA_Build 2 185890544 1D GAAATTATTG T/- TTTTTTTGGA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 8 7 310256 CASAVA_Build 2 185892241 1I TATATTAGAT -/A ACAGAGACAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 310257 CASAVA_Build 2 185896802 1D TAGGCTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 46 2 40 5 T 11 10 310258 CASAVA_Build 2 185897981 3D ATCAAATCAG TGT/--- TGTTGGGATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TGT 2 1 310259 CASAVA_Build 2 185899668 1D AGTAAGACCT A/- AAAAAAAAAA 1425 het 1425 ref 31 22 4 6 A 12 11 310260 CASAVA_Build 2 185911207 1D TAAGGTCCAA G/- GGATCTTTAG 3070 hom 102 het 43 0 34 10 G 3 2 310261 CASAVA_Build 2 185918370 2I CAAAGATGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TA 5 6 310262 CASAVA_Build 2 185924730 10I AGATCCCATG ----------/CTGTTAACTA CTACATTATG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 CTGTTAACTA 0 1 310263 CASAVA_Build 2 185925396 2D GAGAGAGCAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 90 het 44 0 30 16 GT 6 5 310264 CASAVA_Build 2 185928954 1D TGAAATGTGA C/- CCCCAGTGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 C 5 4 310265 CASAVA_Build 2 185930322 1I CCCCTGTGCT -/A AATTTTTAAT 3070 hom 63 het 28 0 23 5 A 2 3 310266 CASAVA_Build 2 185933183 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 446 hom 20 1 19 0 A 8 9 310267 CASAVA_Build 2 185943771 1I TGGAAAGAAA -/C AAATAACAGA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 0 1 310268 CASAVA_Build 2 185944913 12D AAAAAGTGAA ATGTATAAACAC/------------ ATTTTACTAT 3070 hom 105 het 34 0 36 1 ATGTATAAACAC 1 0 310269 CASAVA_Build 2 185948875 1D ATATATTAGG A/- GAAGTTGATA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 1 0 310270 CASAVA_Build 2 185978951 1I CTTAAAGAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 10 310271 CASAVA_Build 2 185989879 1D ATTTCAATAG T/- TTTTTTTTTT 1102 het 1102 ref 29 23 3 4 T 13 12 310272 CASAVA_Build 2 186002791 1D ATAAATGAGA G/- GGTCAAAGCA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 G 3 2 310273 CASAVA_Build 2 186011243 1I AGGGTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 452 hom 34 3 22 9 A 15 16 310274 CASAVA_Build 2 186061932 4D TAAGTTTCTC TGTT/---- TATTTTCTTA 3070 het 3070 ref 34 18 15 3 TGTT 1 0 310275 CASAVA_Build 2 186063201 1D AAAATACTTT A/- AAAAATATGT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 6 5 310276 CASAVA_Build 2 186077872 1I TTTATTTTTT -/A TTTATTTTTT 570 het 570 ref 11 7 4 4 A 0 1 310277 CASAVA_Build 2 186118682 1D TGGCAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 12 11 310278 CASAVA_Build 2 186121155 1D CAACATACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 37 1 29 8 T 11 10 310279 CASAVA_Build 2 186122627 5D TTCAAATTTC TTATA/----- TTATAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 14 17 8 TTATA 2 1 310280 CASAVA_Build 2 186123704 1D GGTTAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 36 0 26 10 A 11 10 310281 CASAVA_Build 2 186123941 1I ACTGTGACAG -/A AAAAAACGTA 3070 het 3070 hom 51 23 26 2 A 6 7 310282 CASAVA_Build 2 186130705 2I GTCTACACTC --/AT GTGTGTATGT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 AT 0 1 310283 CASAVA_Build 2 186139275 1D TCGATGAGGG T/- TTTTATATGC 3070 hom 83 het 34 0 27 8 T 5 4 310284 CASAVA_Build 2 186145712 1D CTTTGCAATA T/- TTTTAGTTAA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 5 4 310285 CASAVA_Build 2 186165613 1I AATTGTATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 9 10 310286 CASAVA_Build 2 186175231 1I TGAATCAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1485 hom 25 5 16 4 A 13 14 310287 CASAVA_Build 2 186189068 1D CTTTTGTATC T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 8 7 310288 CASAVA_Build 2 186210925 1D ATAAACAGTG A/- AAAAAACCAA 3070 hom 100 het 37 0 35 2 A 7 6 310289 CASAVA_Build 2 186224793 5D CATAAAAGAG AAGAA/----- AATAAGTGAT 3070 hom 105 het 36 0 36 3 AAGAA 1 0 310290 CASAVA_Build 2 186225289 9I ATGACAAAAC ---------/AGAATACTG AAAAACTAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AGAATACTG 0 1 310291 CASAVA_Build 2 186239559 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2615 het 493 hom 15 2 9 4 A 14 15 310292 CASAVA_Build 2 186250184 1D TTTGAATTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 28 0 23 6 A 10 9 310293 CASAVA_Build 2 186261348 1I CTTTGGCTTG -/C CCTCCGGTTG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 C 2 3 310294 CASAVA_Build 2 186276426 1I TATTTAACAC -/A GTATTTTATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 0 1 310295 CASAVA_Build 2 186279972 1I AAATTCTCTG -/A AATTAATGAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 2 3 310296 CASAVA_Build 2 186296813 3I GTTAACCAAG ---/AGA AGGAGATAGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AGA 0 1 310297 CASAVA_Build 2 186298234 1I TTCTTTATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 193 hom 36 1 32 3 A 12 13 310298 CASAVA_Build 2 186313926 1I TTTGTTTCTG -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 75 het 33 0 29 4 A 7 8 310299 CASAVA_Build 2 186333381 1I AGTAAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 9 10 310300 CASAVA_Build 2 186333891 4D TTATTGTACT TTGA/---- TTGTACTTTC 3070 hom 84 het 31 0 28 4 TTGA 1 0 310301 CASAVA_Build 2 186347476 4I TATAGTCTTC ----/TAAT TAATTTTCTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TAAT 1 2 310302 CASAVA_Build 2 186358542 4I TAGATTTTAA ----/TATT TATTTATTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TATT 2 3 310303 CASAVA_Build 2 186392597 1D GCAGCTTAAT G/- AAAATTTGAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 0 310304 CASAVA_Build 2 186422259 4I AGATCAACAA ----/ATAG ATAGACCACT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 ATAG 1 2 310305 CASAVA_Build 2 186423378 1D GCTAAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 1264 het 1264 ref 29 19 3 7 A 12 11 310306 CASAVA_Build 2 186435412 1I TTCTGATTAG -/T TTTTTTAATT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 6 7 310307 CASAVA_Build 2 186450704 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 10 9 310308 CASAVA_Build 2 186451402 3I GCAACTAGCT ---/AAC AACATTATGA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AAC 1 2 310309 CASAVA_Build 2 186462800 3D CTATCCCAAA AAG/--- AAGGAGAAGA 3070 hom 84 het 29 0 29 2 AAG 2 1 310310 CASAVA_Build 2 186469889 12D GAGGGAGGGG GAGAGGAAGAGA/------------ GAGAGGGAGA 110 het 110 ref 25 10 3 18 GAGAGGAAGAGA 1 0 310311 CASAVA_Build 2 186484760 1D GGTTTAGAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 134 het 52 0 45 8 T 9 8 310312 CASAVA_Build 2 186495791 2I TTATTATAAC --/AT AAATTATAAA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 AT 0 1 310313 CASAVA_Build 2 186501111 1I TGTATTTAAG -/A AAAAAAGGAA 3070 het 42 hom 40 1 36 3 A 6 7 310314 CASAVA_Build 2 186502311 3D ACGGTGCATA AGG/--- AGTTTATGTC 3070 hom 96 het 37 0 33 5 AGG 1 0 310315 CASAVA_Build 2 186512437 5D GTGCTCTCTC TTCTT/----- TTCTTTGTTA 3070 het 3070 hom 38 17 20 2 TTCTT 2 1 310316 CASAVA_Build 2 186527378 3I AGGGATAGCA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 45 het 24 0 16 8 AAT 3 4 310317 CASAVA_Build 2 186532627 17D TTAAAACGGT AAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 30 2 20 8 A 30 13 310318 CASAVA_Build 2 186534668 1D TCAAGTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 237 hom 30 1 27 2 A 12 11 310319 CASAVA_Build 2 186569780 1D36M1D AAAAGAACAG TTTTTTTTAATATTTCTATAGTTAATTCAAAAACTTTG/-TTTTTTTAATATTTCTATAGTTAATTCAAAAACTTT- TAACTGATTA 3070 hom 105 het 22 0 36 3 N/A 0 0 310320 CASAVA_Build 2 186599717 1I73M1I AAATTAATTT -AAAAAAAAGAGATGGCTATTTTAGAGGATTTGAGGTAATATAAATTGGCATAGAAGAGTTCCTGGGACAAAAA-/AAAAAAAAAGAGATGGCTATTTTAGAGGATTTGAGGTAATATAAATTGGCATAGAAGAGTTCCTGGGACAAAAAT TTTAGTCTGT 3070 hom 57 het 20 0 19 22 N/A 0 0 310321 CASAVA_Build 2 186601517 1D ATCATCATTT A/- AAATTGATAC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 4 3 310322 CASAVA_Build 2 186618492 1I TATTTTGGTA -/T TTCCCATTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 2 3 310323 CASAVA_Build 2 186619597 2D ATTCTCCTGC CT/-- CTCAGCCTCC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CT 2 1 310324 CASAVA_Build 2 186622741 4I AAAGGCATTT ----/AATA AATAAATATT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AATA 2 3 310325 CASAVA_Build 2 186630022 26D TGTGTGCATG CATATACACACATGTATATATATACA/-------------------------- CATATACACA 3070 hom 99 het 33 0 34 6 CATATACACACATGTATATATATACA 1 0 310326 CASAVA_Build 2 186635143 1D GGCTGACCAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 9 8 310327 CASAVA_Build 2 186638462 2D CAGTTGGGGG TA/-- TAGGGGTAGG 3070 hom 120 het 47 0 41 8 TA 2 1 310328 CASAVA_Build 2 186644581 2D AAATTAAAGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 54 het 24 0 19 6 AG 9 8 310329 CASAVA_Build 2 186654492 1D TATATAATGG A/- AATAAAGATG 3070 het 3070 ref 23 11 11 2 A 3 2 310330 CASAVA_Build 2 186662099 2I TTAAACTAAG --/AC ACACACACAC 3070 hom 51 het 24 0 18 6 AC 5 6 310331 CASAVA_Build 2 186668745 1D AGCTTGAGGA T/- TTTTAGACTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 5 4 310332 CASAVA_Build 2 186670152 1D AATCAAGTTT A/- GTGAGAAAAG 3070 het 3070 hom 47 21 21 6 A 1 0 310333 CASAVA_Build 2 186674872 4D GATTTTACAG GAGT/---- GAGGATAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 18 1 GAGT 1 0 310334 CASAVA_Build 2 186696720 1D CAATTTCTGT A/- AAAAAAAAAT 1142 het 1142 ref 45 35 3 7 A 10 9 310335 CASAVA_Build 2 186737848 1I AGTTTCTATC -/A AAAAAAAAAA 1461 het 1461 ref 32 18 5 9 A 13 14 310336 CASAVA_Build 2 186749462 1I AAAACTTCTC -/T TTTTTTTTTT 855 het 855 ref 34 18 3 13 T 11 12 310337 CASAVA_Build 2 186755429 1I CTTAGAGATT -/A AAAAAAATGC 2202 het 2202 ref 15 7 6 2 A 7 8 310338 CASAVA_Build 2 186801329 3D ACTATAAAAC GAT/--- GAGCCAAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 GAT 1 0 310339 CASAVA_Build 2 186835664 1D CCAATGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 44 0 38 7 A 11 10 310340 CASAVA_Build 2 186836391 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTGTGA 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 CT 1 2 310341 CASAVA_Build 2 186866468 2D TCTGAAACAT TA/-- TATTGGCAAC 3070 het 3070 ref 32 20 12 1 TA 2 1 310342 CASAVA_Build 2 186868285 1D TAAAGGGTGC T/- TGGGAGTTCA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 2 1 310343 CASAVA_Build 2 186896464 2D GCTGGGAAAA AG/-- ACGGATACCC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 1 0 310344 CASAVA_Build 2 186908962 1D GTGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 40 1 35 4 A 11 10 310345 CASAVA_Build 2 186909923 3I TAGAGTATAT ---/AAC AATATAATTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAC 0 1 310346 CASAVA_Build 2 186910342 1I AAAATTGGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 T 9 10 310347 CASAVA_Build 2 186911255 2I AGTTCTTTTG --/TT TTGTGCAGAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 2 4 310348 CASAVA_Build 2 186924485 1I TGGTATTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 12 13 310349 CASAVA_Build 2 186926589 1I CACACAGAGT -/C CCTACTGGGG 3070 hom 63 het 23 0 20 3 C 2 3 310350 CASAVA_Build 2 186930943 18D CCACCACGAC CACACACACACACACACA/------------------ CACACACACA 3070 hom 102 het 36 0 29 11 CA 16 7 310351 CASAVA_Build 2 186934532 4D GGGGTGTGAG AAGA/---- ACCAGAAAAG 3070 het 3070 ref 47 23 17 9 AAGA 1 0 310352 CASAVA_Build 2 186938482 30D AGTCTGATCT GATGTAAAAATTATAATAGCCTGAGGATGA/------------------------------ GGACAACGGA 3070 hom 54 het 18 0 18 4 GATGTAAAAATTATAATAGCCTGAGGATGA 1 0 310353 CASAVA_Build 2 186947226 1D TGATGTCTGT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 8 7 310354 CASAVA_Build 2 186953817 1D TCAAAAAACC A/- AAAACCCTAA 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 5 4 310355 CASAVA_Build 2 186968572 1D AGTACATTCA C/- AATGTTTCAC 3070 het 3070 ref 47 22 21 5 C 1 0 310356 CASAVA_Build 2 186973070 1D CCATTAACAA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 8 7 310357 CASAVA_Build 2 186981749 1I AATCGGTCCT -/A AAAAAACAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 6 7 310358 CASAVA_Build 2 186985888 2I AACTCCTTTA --/AT TACCTGACCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 0 1 310359 CASAVA_Build 2 187013451 6D TGTTTATACA TGAATG/------ TGAATGTTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TGAATG 2 1 310360 CASAVA_Build 2 187017276 3I GTTTTTCCCT ---/ACA ACACTAGGTA 3070 hom 132 het 50 0 43 7 ACA 1 2 310361 CASAVA_Build 2 187020518 1D AGTGGAATAG A/- ATTAAGAGTC 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 A 2 1 310362 CASAVA_Build 2 187023202 16D ATTATGAAAT TATATATATATATATA/---------------- TATATATATA 3070 het 316 hom 16 2 8 7 TA 17 9 310363 CASAVA_Build 2 187035403 1I AACCCAGCTG -/T GTTTCTTCTC 3070 hom 132 het 47 0 43 4 T 0 1 310364 CASAVA_Build 2 187036427 1D TGACTCCTAT A/- TTTATCTGAG 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 1 0 310365 CASAVA_Build 2 187037587 1D CTATTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 41 2 33 6 A 11 10 310366 CASAVA_Build 2 187055703 1I GGTAGATAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 435 hom 29 1 23 5 T 9 10 310367 CASAVA_Build 2 187059590 2I TGACGCTAGC --/TG TCTCTCATTA 3070 hom 46 het 17 0 14 3 TG 0 1 310368 CASAVA_Build 2 187059685 10D CACCCGGGTG CGAAATGACC/---------- CCTCGGGACT 1974 het 1974 ref 23 14 8 3 CGAAATGACC 1 0 310369 CASAVA_Build 2 187061796 2I GTGGTGTGTC --/TA TATTTCTCTG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 TA 1 2 310370 CASAVA_Build 2 187072285 1I AACAGTTGAG -/T AGAACTCTGT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 T 0 1 310371 CASAVA_Build 2 187074689 1I AATAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2704 hom 25 7 10 8 T 12 13 310372 CASAVA_Build 2 187077259 1I CTTACCACTT -/G GGGGCAATAG 3070 hom 42 het 34 0 21 13 G 4 5 310373 CASAVA_Build 2 187082222 1D ATGGAACTTC T/- TTTATCTGAC 3070 het 3070 ref 53 28 21 4 T 4 3 310374 CASAVA_Build 2 187088664 1D CAGATGTCAT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 71 het 36 0 21 16 C 10 9 310375 CASAVA_Build 2 187089949 2D GGTATATTTG AC/-- ACAATAAACT 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 AC 2 1 310376 CASAVA_Build 2 187097821 6D GGGTTGTTTG TTTTGC/------ TTTGTTTTGT 845 het 845 ref 47 7 8 34 TTTTGC 1 0 310377 CASAVA_Build 2 187109962 1I CCCAGATAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 9 10 310378 CASAVA_Build 2 187113084 3I CTTCTTGATG ---/TTC TTTTTTTCTT 3070 het 13 hom 21 1 14 6 TTC 0 1 310379 CASAVA_Build 2 187116329 1I TTTTTTTTTT -/C TTTCTTTTAA 2171 hom 27 het 13 0 9 4 C 0 1 310380 CASAVA_Build 2 187130300 6I GATAATAGCT ------/ATAATA ATAATAAGTC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 ATA 2 4 310381 CASAVA_Build 2 187136156 1D GTGCTGAAGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 815 hom 25 2 21 2 A 9 8 310382 CASAVA_Build 2 187138021 1D AAAGTAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 10 9 310383 CASAVA_Build 2 187141214 1D GATGGTTAAT G/- GGTACAAAAA 3070 hom 104 het 39 0 31 8 G 3 2 310384 CASAVA_Build 2 187147640 1D GAGGTGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 9 310385 CASAVA_Build 2 187152819 1D TTTCATTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 34 0 23 11 T 13 12 310386 CASAVA_Build 2 187153530 4D GAGATAATAT GTAA/---- GTAAGTATAA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 GTAA 2 1 310387 CASAVA_Build 2 187158738 2D25M1I ATTCAAGAAC AGAGACTTAGGGAATCCTAGCATTGAA-/--AGACTTAGGGAATCCTAGCATTGAAT GGGGTAGTTT 3070 hom 169 het 51 0 57 7 N/A 0 0 310388 CASAVA_Build 2 187161234 1I ATTTAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 T 10 11 310389 CASAVA_Build 2 187165547 1D ACTTTAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2437 hom 28 9 13 6 T 12 11 310390 CASAVA_Build 2 187166434 1I TCGCATTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 9 10 310391 CASAVA_Build 2 187166759 1I TAGGTTGGTG -/T TGAGTAGAGG 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 T 1 2 310392 CASAVA_Build 2 187168661 1D TCCAGTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 11 10 310393 CASAVA_Build 2 187186121 1D TGGGATTGGC T/- TTTTTTTTTT 874 het 874 ref 33 18 4 12 T 17 16 310394 CASAVA_Build 2 187190010 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 21 19 7 T 11 10 310395 CASAVA_Build 2 187191717 1D GCATAGAAGG C/- AACTCAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 C 1 0 310396 CASAVA_Build 2 187192539 1D TTCCCAACAC A/- AAAAAACGTG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 7 6 310397 CASAVA_Build 2 187197925 1I AACTATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 32 1 28 3 A 10 11 310398 CASAVA_Build 2 187198651 4D GTGTGTGTGT GAGA/---- GAGAGAGATA 3070 het 254 hom 26 3 17 7 GA 6 4 310399 CASAVA_Build 2 187207433 1I TTCTTTGTAG -/A AAAACATGCT 3070 hom 154 het 52 0 52 0 A 4 5 310400 CASAVA_Build 2 187251182 4D TTATGCATAT AGTA/---- AGTATTACAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 AGTA 2 1 310401 CASAVA_Build 2 187252468 1D AATGGTGGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 9 8 310402 CASAVA_Build 2 187259065 4D GTGGGACAAT CTAA/---- CTAGGTGGAA 3070 het 3070 ref 41 23 14 6 CTAA 1 0 310403 CASAVA_Build 2 187262028 1I CATAAAACAA -/G GTTTTATATT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 G 1 2 310404 CASAVA_Build 2 187267293 3I GCAGCAGCAG ---/CAA CAACAACAAC 3070 hom 10 het 32 1 16 15 CAA 5 6 310405 CASAVA_Build 2 187268968 2D GACTACTGTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 19 11 8 AT 7 6 310406 CASAVA_Build 2 187269848 1D AATAAGCCTG T/- TTTTCCCTTG 3070 hom 115 het 43 0 37 7 T 5 4 310407 CASAVA_Build 2 187273049 1I AATTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 T 10 11 310408 CASAVA_Build 2 187281328 1D GATTTCACTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 15 25 4 T 9 8 310409 CASAVA_Build 2 187284624 1I TAAATTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 9 10 310410 CASAVA_Build 2 187287094 1I GCAGATGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 13 14 310411 CASAVA_Build 2 187291169 4D CAGTTTCTGA CTGT/---- CTAAGGCCAT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 CTGT 1 0 310412 CASAVA_Build 2 187294863 1I TAGTCATTTG -/A AAAAAAAAAA 2990 het 2990 ref 56 29 10 17 A 13 14 310413 CASAVA_Build 2 187297205 2D ATTGATGATG AT/-- ATTTTATATA 3070 het 3070 ref 50 22 23 6 AT 2 1 310414 CASAVA_Build 2 187305141 1I ACTATTATAA -/C CTTTTTTTTG 3070 hom 74 het 33 0 26 7 C 1 2 310415 CASAVA_Build 2 187316348 1I AGCATTTGTT -/C CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 C 7 8 310416 CASAVA_Build 2 187329143 14D GTTCCAGATT ATTTGTTGGAAAAG/-------------- ATGTTGTTTG 3070 het 3070 ref 29 19 13 3 ATTTGTTGGAAAAG 1 0 310417 CASAVA_Build 2 187331110 1D GAGTGCTTAT C/- GTGAGCCAAG 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 C 1 0 310418 CASAVA_Build 2 187338664 2I TCACACATTC --/AT TTATAAGGCG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AT 0 1 310419 CASAVA_Build 2 187356285 1D AACTCTGATA C/- CAAAACAGAT 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 C 2 1 310420 CASAVA_Build 2 187357073 1D AATAGTTACC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 A 9 8 310421 CASAVA_Build 2 187396757 3I CGGGCAAGAA ---/GTT GTTATCATAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 GTT 1 2 310422 CASAVA_Build 2 187397253 3I TATGCCTTTG ---/AAA AAAAACAACT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 5 8 310423 CASAVA_Build 2 187398231 4D CATTACTGTA TTAG/---- TTAATTTCTA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 TTAG 1 0 310424 CASAVA_Build 2 187401767 1D GTGAAACTTT A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 8 7 310425 CASAVA_Build 2 187403675 3D TATGTTAATA GTC/--- TAACTCTAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 GTC 1 0 310426 CASAVA_Build 2 187403788 1I GTAAAACAGA -/T ACAACAAATC 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 0 1 310427 CASAVA_Build 2 187404316 4I CATATACATG ----/TGTA TGTATGTATA 3070 het 3070 ref 26 18 8 0 TGTA 2 3 310428 CASAVA_Build 2 187408476 3D GGGAAGATTT TAA/--- TAATTAACAC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 TAA 2 1 310429 CASAVA_Build 2 187413018 1D TCTGGAAAGA C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 C 8 7 310430 CASAVA_Build 2 187413705 1D CTATTGATAC T/- ATGGAAGAAA 3070 het 3070 ref 38 21 15 3 T 1 0 310431 CASAVA_Build 2 187414325 4I GCTGTTAATA ----/TCTT TCTTTGTATG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 TCTT 1 2 310432 CASAVA_Build 2 187419783 2D ACACACACAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 49 het 28 0 22 7 AT 8 7 310433 CASAVA_Build 2 187430806 1I TCTTTTCTAT -/A AATATAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 2 3 310434 CASAVA_Build 2 187442822 1D AACACCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 11 10 310435 CASAVA_Build 2 187445154 1D ATAAAACTAT A/- AAAAAACTAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 7 6 310436 CASAVA_Build 2 187447453 1D TATAGTACTC T/- TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 T 7 6 310437 CASAVA_Build 2 187447871 2D CACATAAAAC AT/-- ATTCTGAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 AT 2 1 310438 CASAVA_Build 2 187448940 1D ATCCATTTGT A/- AACTGCTGAT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 A 3 2 310439 CASAVA_Build 2 187474801 20D TGGAGGATGC CCCTCAGCAATGGCAGACGA/-------------------- CCCTCAGCAA 3070 hom 60 het 28 0 19 10 CCCTCAGCAATGGCAGACGA 1 0 310440 CASAVA_Build 2 187482818 1I CACCCAGCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 8 9 310441 CASAVA_Build 2 187493622 1I ATAGTTTTTT -/G GGTAACATCT 3070 hom 141 het 52 0 47 5 G 2 3 310442 CASAVA_Build 2 187496946 4D GGGCTTGAGG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAAC 5 4 310443 CASAVA_Build 2 187501864 1D AATTGGGGGG A/- AAAAAACCCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 7 6 310444 CASAVA_Build 2 187504060 1I TGTCATTCTT -/C CCCCAAATTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 4 5 310445 CASAVA_Build 2 187519891 1D AAAAAAAAAA T/- ATTGTTTTTA 3070 het 13 hom 31 1 24 7 T 1 0 310446 CASAVA_Build 2 187520175 1I GCTGCTGGGG -/C CCAGGCCACA 3070 hom 63 het 26 0 17 9 C 2 3 310447 CASAVA_Build 2 187521194 3D CTATTTGTCT GAA/--- GAAGGAGTAG 3070 hom 132 het 48 0 43 7 GAA 2 1 310448 CASAVA_Build 2 187522688 10I TCCAGAGTCT ----------/GAGGTGGGAA GAGGTGGGAA 3070 hom 72 het 31 0 23 8 GAGGTGGGAA 1 2 310449 CASAVA_Build 2 187522881 2D AACAAATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 34 0 17 18 A 16 14 310450 CASAVA_Build 2 187523363 1D GGGCATTAGC T/- TTTTTTTTTT 1603 het 1603 ref 33 20 4 10 T 15 14 310451 CASAVA_Build 2 187551410 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 22 2 18 2 A 12 11 310452 CASAVA_Build 2 187552693 1I AAGTTGTCAC -/G GTGAAGAAAG 3070 hom 120 het 43 0 39 4 G 1 2 310453 CASAVA_Build 2 187573727 1I ACAGGTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 10 11 310454 CASAVA_Build 2 187575623 2D TGTCATCCTC AG/-- GGGTGCCCAC 3070 het 3062 hom 34 10 14 10 AG 1 0 310455 CASAVA_Build 2 187577719 3I AATTATGTAT ---/TAA TAATATTTAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TAA 1 2 310456 CASAVA_Build 2 187588593 1D AGATTTTTAA T/- TTTAATTAAT 3070 hom 67 het 27 0 23 4 T 4 3 310457 CASAVA_Build 2 187590836 1I TTGAACTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 T 9 10 310458 CASAVA_Build 2 187591947 18D TTTTTTTTTT GTGCCAAACATTGATGAG/------------------ GTGAAGTTAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 10 GTGCCAAACATTGATGAG 1 0 310459 CASAVA_Build 2 187594375 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 34 2 17 15 A 19 18 310460 CASAVA_Build 2 187600550 1I CATAAAAGTT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 8 310461 CASAVA_Build 2 187600809 5D GGTGGGAGAC AAGAG/----- AAGAGAGCTT 3070 hom 24 het 13 0 9 8 AAGAG 2 1 310462 CASAVA_Build 2 187623522 1I GTTGAGGAGG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 7 8 310463 CASAVA_Build 2 187630728 2I GGACATGTCA --/CT CTGCCTGTAT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 CT 1 2 310464 CASAVA_Build 2 187648966 7D ATTAATAAAA AGAAGAC/------- AGAAGACAGA 3070 hom 114 het 43 0 39 8 AGAAGAC 2 1 310465 CASAVA_Build 2 187649930 8I TTATTGATGA --------/ATATTCGT ATTTCTAGTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 ATATTCGT 0 1 310466 CASAVA_Build 2 187665454 7D ATGATATAAT TTGTCAC/------- TTAAACGAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 6 TTGTCAC 1 0 310467 CASAVA_Build 2 187669754 1D TCACTGAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 9 8 310468 CASAVA_Build 2 187681096 2D TATAGCATTT TA/-- TATATATATA 2069 hom 15 het 6 0 6 0 TA 8 7 310469 CASAVA_Build 2 187711155 1D GTTTCAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 30 0 27 4 T 11 10 310470 CASAVA_Build 2 187713815 1D TTTGATTCTT A/- AAAAAAAAAA 2688 het 2688 ref 30 17 9 5 A 17 16 310471 CASAVA_Build 2 187723033 1D CTGAGACAAA G/- GGGGAAAAAG 3070 hom 82 het 32 0 28 5 G 5 4 310472 CASAVA_Build 2 187724894 4D AAATAGCAAA ACAG/---- ACAGATAATA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 ACAG 2 1 310473 CASAVA_Build 2 187727577 1D TACCTCTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 27 1 18 8 T 12 11 310474 CASAVA_Build 2 187730760 1D TGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 814 hom 36 4 19 13 A 13 12 310475 CASAVA_Build 2 187741817 1I ACCAATGTTA -/T TTTTTATGTC 3070 het 111 hom 45 1 34 10 T 5 6 310476 CASAVA_Build 2 187742434 1D CAAACACTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 31 0 25 6 T 9 8 310477 CASAVA_Build 2 187744163 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1437 het 546 hom 16 3 5 8 A 17 16 310478 CASAVA_Build 2 187748323 1D CTGGTGTTTT G/- GGGCTTGTGT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 4 3 310479 CASAVA_Build 2 187770707 1D GATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 855 het 855 ref 23 15 3 5 T 13 12 310480 CASAVA_Build 2 187779413 1I GGTAAGTAAA -/C TTTTACTAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 0 1 310481 CASAVA_Build 2 187780288 1I CTTTAAGGGA -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 6 7 310482 CASAVA_Build 2 187785639 4I TACAAAAGAT ----/AAAG AAAGGCATTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAAG 1 2 310483 CASAVA_Build 2 187789942 2I AAACAGAATT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 962 hom 39 3 29 7 TC 8 9 310484 CASAVA_Build 2 187837137 2I AAGAAATAGT --/CA CACACACACA 3070 hom 93 het 39 0 30 9 CA 5 6 310485 CASAVA_Build 2 187838423 2D TTGCTCTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 7 A 12 10 310486 CASAVA_Build 2 187839962 1D GCACACGCGT G/- TACAGTGAGC 3070 hom 135 het 49 0 44 5 G 1 0 310487 CASAVA_Build 2 187842097 4I TTATGTGTGT ----/ATGC ATGTGTGTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATGC 0 1 310488 CASAVA_Build 2 187842227 2D ATTAAATGTG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 99 het 40 0 34 7 AC 8 7 310489 CASAVA_Build 2 187846446 1D CCCTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 32 1 23 8 T 12 11 310490 CASAVA_Build 2 187849837 2D GACTCCACCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 27 1 19 7 A 12 10 310491 CASAVA_Build 2 187850412 1I GAGAACCCAC -/A AAATAAAGCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 3 4 310492 CASAVA_Build 2 187852760 1D ATTTGTATAT C/- TTTTTTCATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 1 0 310493 CASAVA_Build 2 187854682 12I GTCTCTTCAC ------------/TTTCTTGATTGT TTCCTTTGCT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TTTCTTGATTGT 0 1 310494 CASAVA_Build 2 187874443 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 9 310495 CASAVA_Build 2 187875515 3I ATTTGGTAAT ---/AAC AAGAATTATA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AAC 0 1 310496 CASAVA_Build 2 187884020 1D ATGCTATATT A/- AAAAATGACT 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 6 5 310497 CASAVA_Build 2 187892140 1D TAATTACTGT C/- ATAGCTTTGA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 C 1 0 310498 CASAVA_Build 2 187926929 3I ACAATAGAGT ---/TAA TTATTCTATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TAA 0 1 310499 CASAVA_Build 2 187930806 1D GAAAAAAAAA G/- ACCCAAATGA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 1 0 310500 CASAVA_Build 2 187934155 1I ACTTGAAAAG -/T TTTGCATATT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 3 4 310501 CASAVA_Build 2 187937157 1I GTTCACATAG -/A AAGTAGATTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 2 3 310502 CASAVA_Build 2 187987862 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 11 9 310503 CASAVA_Build 2 187997418 3I CAAATACTTT ---/CTC ACATAGAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 CTC 0 1 310504 CASAVA_Build 2 188001881 2D AAAAAAAAAA AT/-- TACTGTAAGC 2852 het 111 hom 12 1 9 2 AT 1 0 310505 CASAVA_Build 2 188002844 7I CTCAAACATG -------/TTATAAT TTATAAGTTG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TTATAAT 0 1 310506 CASAVA_Build 2 188004734 1I TTATAAGGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 808 hom 45 2 40 3 A 9 10 310507 CASAVA_Build 2 188010299 1I CTGATCACGA -/G GATCAGGAAA 3070 hom 48 het 21 0 14 7 G 1 2 310508 CASAVA_Build 2 188025678 1I AATCTTCTTT -/C CCAGAAGAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 2 3 310509 CASAVA_Build 2 188030270 1D TGTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 13 12 310510 CASAVA_Build 2 188031245 1I CATTAACAAC -/T TAACTTGGTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 1 2 310511 CASAVA_Build 2 188033326 1I CATCTCTCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 439 hom 25 1 21 3 T 9 10 310512 CASAVA_Build 2 188034061 2D AGCTTAGAGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 11 9 310513 CASAVA_Build 2 188060308 4I AAATTGTAAG ----/TACA TACATTTAGT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TACA 1 2 310514 CASAVA_Build 2 188060637 16D CCCTGATCCA TTGATAACATTTTTTC/---------------- TTGTGCTGAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTGATAACATTTTTTC 1 0 310515 CASAVA_Build 2 188064190 1D TTTTCATAGA T/- TTAGGGGCTA 3070 het 3070 hom 29 8 18 4 T 3 2 310516 CASAVA_Build 2 188077539 2D GCCAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 1765 het 885 hom 39 10 5 25 A 14 12 310517 CASAVA_Build 2 188078101 2I TTTTGAACAC --/AT GTTTTTCAGA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AT 0 1 310518 CASAVA_Build 2 188101832 1I TAGTGTTGGT -/A AAAAAAAAAA 1505 het 1505 ref 39 18 5 16 A 15 16 310519 CASAVA_Build 2 188119404 1D TTAAGAGGGG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 7 310520 CASAVA_Build 2 188120082 1D AACTTTCTGC T/- TCTGATGATC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 2 1 310521 CASAVA_Build 2 188125124 1D TTACTTTGCA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 8 7 310522 CASAVA_Build 2 188126167 1D ATTGTCACAA C/- TTTCCCCCTT 3070 hom 60 het 24 0 21 4 C 1 0 310523 CASAVA_Build 2 188128441 1I ATAAATTATC -/T GATTTAATTC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 0 1 310524 CASAVA_Build 2 188170185 1D AGTTACATAA C/- ATAATATTAC 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 C 1 0 310525 CASAVA_Build 2 188207826 1I TACAAAATAT -/A AAAAAATTAG 3070 hom 103 het 43 0 35 8 A 6 7 310526 CASAVA_Build 2 188208173 1I CCTTAGATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 883 hom 34 2 22 10 A 10 11 310527 CASAVA_Build 2 188209027 4I ATAAACAAAC ----/AAAT AAAAAATTAA 3070 hom 63 het 32 0 22 10 AAAT 0 1 310528 CASAVA_Build 2 188231814 1D GAGGATAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 995 hom 35 6 18 11 T 17 16 310529 CASAVA_Build 2 188236637 1I TTTTTGGAAG -/A AAAAATCTAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 5 6 310530 CASAVA_Build 2 188242501 1D TATTGCAATA G/- TCACTTTATA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 G 1 0 310531 CASAVA_Build 2 188255415 1D CTGATCAAAG T/- TAACACCTTG 3070 hom 119 het 47 0 40 7 T 2 1 310532 CASAVA_Build 2 188265635 3D TCTATATAAT AAC/--- AGTAATTTAT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 AAC 1 0 310533 CASAVA_Build 2 188272000 1D TTATAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 25 2 10 13 A 11 10 310534 CASAVA_Build 2 188278629 1D AAGAGAAAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 9 8 310535 CASAVA_Build 2 188286366 1I ATGATCTAAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 A 7 8 310536 CASAVA_Build 2 188287769 1I AATCTGAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2054 hom 31 6 16 9 A 13 14 310537 CASAVA_Build 2 188288945 1I TCAAAAAAAA -/T GTGACTCTAT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 0 1 310538 CASAVA_Build 2 188294205 4I TCAGATTGTT ----/GTAA GTGTGTGGCT 3070 hom 83 het 33 0 28 5 GTAA 0 1 310539 CASAVA_Build 2 188296601 1D TGTGCAGATG A/- AAAAATGTAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 A 6 5 310540 CASAVA_Build 2 188303391 2I TAATATACAC --/AT ATGTGTATAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 1 2 310541 CASAVA_Build 2 188330850 4I TTCTTCTTTC ----/ATTT GTCTCCTCTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 ATTT 0 1 310542 CASAVA_Build 2 188337077 2D TCTTTTATAT TA/-- TGAGTTTCTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 TA 1 0 310543 CASAVA_Build 2 188340312 2D AACCAAAGAC AA/-- AGAGACAATT 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 3 1 310544 CASAVA_Build 2 188345446 5D ACTGTGCTGT GCTGC/----- GCTGCGCTGT 3070 hom 97 het 39 0 32 13 GCTGC 2 1 310545 CASAVA_Build 2 188348007 1I CACTCGTATG -/T TGAACACAGC 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 1 2 310546 CASAVA_Build 2 188348821 1D GATATAGGTA C/- TTGCTCACAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 0 310547 CASAVA_Build 2 188351515 7D GCATCAATAA TTAATAT/------- TTAAGGGGAC 3070 hom 96 het 38 0 33 7 TTAATAT 1 0 310548 CASAVA_Build 2 188353726 48D28M6I AAGAATCTAA GCTTTTAATAAGAAAGTTTCCATTTATTCTATAAAACACAGGAATATTAATAGAAAAAATATTTGACTACTAACAT------/------------------------------------------------TATAGAAAAAATATTTGACTACTAACATGTTGGC ATAAGTGTTG 3070 het 3070 ref 21 18 8 0 N/A 0 0 310549 CASAVA_Build 2 188355881 1D ACCAAGAACA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 7 6 310550 CASAVA_Build 2 188358463 1D TATGCCATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 9 8 310551 CASAVA_Build 2 188365775 1D TGAAAAGGAT G/- TTTTAAATTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 5 G 1 0 310552 CASAVA_Build 2 188368296 1D AAAAACAAGC A/- AAAAACTGGT 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 A 6 5 310553 CASAVA_Build 2 188368483 1D TAACAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 11 10 310554 CASAVA_Build 2 188369471 4D AAACTGGGGG AATC/---- AATCACATTA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 AATC 2 1 310555 CASAVA_Build 2 188397096 4I ACCTAGGTAT ----/TAAG TCTACTACCC 3070 hom 87 het 31 0 28 3 TAAG 0 1 310556 CASAVA_Build 2 188411002 13D AAAAATAAAT TAGTATAACTCTA/------------- TATTGATATG 3070 hom 75 het 27 0 26 4 TAGTATAACTCTA 1 0 310557 CASAVA_Build 2 188412845 4I CCAGATTCTA ----/ACTT ACTTACTAAA 3070 hom 76 het 31 0 26 5 ACTT 1 2 310558 CASAVA_Build 2 188414506 1D AATAAATATT A/- AAATCTATTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 3 310559 CASAVA_Build 2 188450277 2D ATGAGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 44 0 34 10 T 12 10 310560 CASAVA_Build 2 188462406 3D TCAAATAGCT AGA/--- AGAAATATAT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 AGA 2 1 310561 CASAVA_Build 2 188467949 1D TATAAAGACT A/- AGGTAACATA 3070 hom 138 het 53 0 47 7 A 2 1 310562 CASAVA_Build 2 188483580 4D TGTTTAAAAC TTTT/---- TTTTAATTTA 3070 hom 30 het 12 0 11 2 T 8 4 310563 CASAVA_Build 2 188499749 4I GTTCCCCAAA ----/TATT TTTTTTCCAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TATT 0 1 310564 CASAVA_Build 2 188503755 1I CATAGATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 35 2 28 5 T 10 11 310565 CASAVA_Build 2 188514206 1I TTCTAACTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 20 18 12 T 9 10 310566 CASAVA_Build 2 188536587 1I GCTCTCTACT -/A AAAAAACGTA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 6 7 310567 CASAVA_Build 2 188542898 4D AATGAAAAAG TAAT/---- TATTAGTGTA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 TAAT 1 0 310568 CASAVA_Build 2 188557757 2I AATAGATATT --/AA GAGTTTTGTA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 0 2 310569 CASAVA_Build 2 188561969 2I ACAAATTAAC --/AA TATGTTACAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 0 2 310570 CASAVA_Build 2 188575226 2D TGATAAAAAA TT/-- GTTGTGAATC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 2 0 310571 CASAVA_Build 2 188576127 4D TGAACTTCAG AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 5 AATA 3 2 310572 CASAVA_Build 2 188577794 3I TAAATTTTTG ---/ATA ATGATTGCAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 ATA 0 1 310573 CASAVA_Build 2 188578060 4D CGGGTTTCTA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 39 het 21 0 16 5 TTTC 3 2 310574 CASAVA_Build 2 188578985 1I CTATGTCTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 39 0 26 13 A 9 10 310575 CASAVA_Build 2 188582695 1I ATGGTTTTAA -/T TTTTCACTGA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 4 5 310576 CASAVA_Build 2 188583326 5D ACATCTCCTC TCATT/----- TATGTGAGGG 3070 hom 151 het 53 0 51 4 TCATT 1 0 310577 CASAVA_Build 2 188584657 4I GGGAGAAAGG ----/ACAA ACAAAGAGGT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 ACAA 1 2 310578 CASAVA_Build 2 188587322 1I TTATTAATAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 9 10 310579 CASAVA_Build 2 188587591 1D TTGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 29 0 19 10 A 11 10 310580 CASAVA_Build 2 188589738 1I GTGTCTTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 101 het 38 0 34 4 T 9 10 310581 CASAVA_Build 2 188591638 2D GTAACTTCCC CT/-- GTTTGCACTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 CT 1 0 310582 CASAVA_Build 2 188635779 4I ATTGTATCTT ----/TCTC TCTGAACACA 3070 hom 108 het 47 0 36 11 TC 1 3 310583 CASAVA_Build 2 188638247 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1325 het 504 hom 16 6 4 6 A 17 16 310584 CASAVA_Build 2 188642194 2D ATTTTAACTC TT/-- TTAAAACTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 4 2 310585 CASAVA_Build 2 188643761 1D TATGTGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 44 1 35 8 T 12 11 310586 CASAVA_Build 2 188645753 1D CAGGAACCCA C/- CCCGTAGATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 4 3 310587 CASAVA_Build 2 188654222 21D ATTTATTAAT CTTACATATCTGCTTATATTA/--------------------- CCTATAATAC 3070 hom 111 het 36 0 36 7 CTTACATATCTGCTTATATTA 1 0 310588 CASAVA_Build 2 188655515 2D TTTTTTTTTT TA/-- GGGAAATTAT 3070 het 17 hom 36 3 30 4 TA 1 0 310589 CASAVA_Build 2 188655814 10D GCTGGGAAGT GATGAGGTAA/---------- GATACTAGAG 3070 hom 105 het 37 0 35 4 GATGAGGTAA 1 0 310590 CASAVA_Build 2 188661873 4D GTCCTTTACC AAGT/---- AAGTGAGGTA 3070 hom 88 het 34 0 29 8 AAGT 2 1 310591 CASAVA_Build 2 188662486 1D CTATTAAAAT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 310592 CASAVA_Build 2 188662732 1I GTGAAATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 24 1 17 6 A 10 11 310593 CASAVA_Build 2 188673563 1D TTATAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 11 10 310594 CASAVA_Build 2 188676968 1D TAGGATTTAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 108 het 44 0 37 9 A 9 8 310595 CASAVA_Build 2 188702481 6D ATGTACCCTA AAACTT/------ AAAGTATAAT 3070 hom 27 het 10 0 10 4 AAACTT 1 0 310596 CASAVA_Build 2 188703912 2D GTGACTGGAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 84 het 37 0 29 9 AT 11 10 310597 CASAVA_Build 2 188706429 2D TTTTAACCCC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AT 7 6 310598 CASAVA_Build 2 188709075 1D TGTATAGAAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 A 8 7 310599 CASAVA_Build 2 188715417 3D GATCTTCAAA CCT/--- CCTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 CCT 2 1 310600 CASAVA_Build 2 188716127 1I GTTGTGTTCG -/A ATCAAATGTT 3070 hom 118 het 48 0 40 8 A 1 2 310601 CASAVA_Build 2 188723276 1D GATGTGAGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 46 het 28 0 24 5 T 9 8 310602 CASAVA_Build 2 188727567 1D60M1D ACATACACTT AACATACACTATGTAAGTATTGTAAAATATATTAAGGTAATCTTTAGAATGTTTTTTTGTGT/-ACATACACTATGTAAGTATTGTAAAATATATTAAGGTAATCTTTAGAATGTTTTTTTGTG- TTTTTTTTTG 3070 hom 68 het 26 0 23 19 N/A 0 0 310603 CASAVA_Build 2 188738923 1D AGCAATAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 34 1 23 10 T 13 12 310604 CASAVA_Build 2 188769168 1D TTGCTAGATC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 9 8 310605 CASAVA_Build 2 188770080 1D GTCTCACTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 98 het 40 0 33 7 A 10 9 310606 CASAVA_Build 2 188773559 3D36M1I CAGTAAAACG ACAACAAGGCAATGGGTCTCTTTTGGATGTGCACACATT-/---ACAAGGCAATGGGTCTCTTTTGGATGTGCACACATTG GAGGAAATGA 3070 hom 138 het 35 0 47 1 N/A 0 0 310607 CASAVA_Build 2 188774151 1D TCATCCAGAA G/- GAGACTACTT 3070 hom 157 het 60 0 53 7 G 2 1 310608 CASAVA_Build 2 188774683 1D CTATATAACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 31 0 21 10 T 10 9 310609 CASAVA_Build 2 188779214 3D ACTACTAGAG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 T 15 12 310610 CASAVA_Build 2 188780087 3I AAAGCATGAG ---/AGA AGAACAAAAG 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 AGA 1 2 310611 CASAVA_Build 2 188781019 1I TCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2702 het 2702 ref 23 12 7 5 T 7 8 310612 CASAVA_Build 2 188781807 1I AGATAGAAAT -/G GTTTTCTGTC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 G 1 2 310613 CASAVA_Build 2 188790249 2D ACCCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1235 het 313 hom 18 6 5 8 A 18 16 310614 CASAVA_Build 2 188797971 4D TGACAAATGT GTAA/---- GTATCAAAGG 3070 hom 147 het 54 0 49 6 GTAA 1 0 310615 CASAVA_Build 2 188798083 4D CCTCTTCATG CTGT/---- CTAACACCAG 3070 het 3070 ref 58 31 25 2 CTGT 1 0 310616 CASAVA_Build 2 188799332 1D TATTAAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 414 hom 35 1 29 5 A 10 9 310617 CASAVA_Build 2 188828270 1D TCATTTTTCT A/- AAAAAAAAAG 751 het 751 ref 52 44 3 5 A 10 9 310618 CASAVA_Build 2 188845774 2D AGTAGATTTG AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 75 hom 31 3 14 15 A 10 8 310619 CASAVA_Build 2 188855157 3D TGACTGTAAA AAG/--- AGAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 AAG 1 0 310620 CASAVA_Build 2 188863095 4I GAATCGAGAG ----/TTCT TTATTATAAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TTCT 0 1 310621 CASAVA_Build 2 188869555 2I CTTAAAAATA --/GT GTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 GT 1 2 310622 CASAVA_Build 2 188881043 35I ACTCAGCTCT -----------------------------------/CTCAAGAGTTATTTCATTTTTCAATCCAATAACTA TGATCATGAT 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 CTCAAGAGTTATTTCATTTTTCAATCCAATAACTA 0 1 310623 CASAVA_Build 2 188884684 4D TATAAAAATG TTTA/---- TTTATATTTA 3070 het 767 hom 11 3 8 0 TTTA 2 1 310624 CASAVA_Build 2 188885943 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTTCCT 2578 het 2578 ref 16 8 6 2 T 7 8 310625 CASAVA_Build 2 188911252 1D GGGAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 1739 het 1739 ref 32 15 4 13 T 17 16 310626 CASAVA_Build 2 188919942 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2670 hom 25 7 10 8 A 15 14 310627 CASAVA_Build 2 188937768 3D ACATATACAT ATC/--- ATATATACAT 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 ATC 1 0 310628 CASAVA_Build 2 188944978 1D ACATCATTGA T/- TTTTCCAATG 3070 het 3070 ref 62 36 21 8 T 5 4 310629 CASAVA_Build 2 188946057 2D AGGGAATGAT TA/-- TATATATATA 3031 het 3031 ref 25 12 10 3 TA 7 6 310630 CASAVA_Build 2 188965280 1I AGGGTTTTTA -/T TTTCTTCTTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 3 4 310631 CASAVA_Build 2 189006906 1I ACCTTATACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 10 11 310632 CASAVA_Build 2 189014057 1I AGATAGCACT -/G GTCCAATTTG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 1 2 310633 CASAVA_Build 2 189019827 3I CACTTTCATT ---/GTA GAGTGATATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GTA 0 1 310634 CASAVA_Build 2 189026293 1I GTTTAAAATG -/T TAATGTTATT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 1 2 310635 CASAVA_Build 2 189033396 1I ATGGGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 22 1 14 7 T 13 14 310636 CASAVA_Build 2 189060605 5I CAAATATAGA -----/AATAT AATATAACGC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AATAT 1 2 310637 CASAVA_Build 2 189066271 1D TCTCCTGTAG A/- AAAAAATCTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 7 6 310638 CASAVA_Build 2 189075160 11I TATAAAACTG -----------/GGACAGTTCTA GTAAGAAGAG 3070 hom 120 het 45 0 40 5 GGACAGTTCTA 0 1 310639 CASAVA_Build 2 189081860 1I ACCCACACAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 42 0 35 7 T 8 9 310640 CASAVA_Build 2 189082685 4D AACAATAATC ACTT/---- ACAGCTAGAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 7 ACTT 1 0 310641 CASAVA_Build 2 189085826 1D GAAGTCTTTG T/- TTTCATTTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 4 3 310642 CASAVA_Build 2 189096530 1D TTATCACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 26 10 T 11 10 310643 CASAVA_Build 2 189105877 1D CAGGTGACAG T/- GTGAGACTGT 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 T 1 0 310644 CASAVA_Build 2 189109901 1D AGGTATTTTA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 8 7 310645 CASAVA_Build 2 189122140 1D GAAAGCATTC T/- TTTTTTATCA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 7 6 310646 CASAVA_Build 2 189123465 5D GCTTTTAATA TAATT/----- TAAAGAGTAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TAATT 1 0 310647 CASAVA_Build 2 189128875 1I TACTGAAAAT -/A CAAAAATTAG 3070 hom 47 het 18 0 14 4 A 0 1 310648 CASAVA_Build 2 189148728 1D AGGATTGGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 114 het 49 0 39 10 T 9 8 310649 CASAVA_Build 2 189150592 3D TTAGCCTCTC CTT/--- CTTTCAGTTT 3070 het 3070 hom 44 19 23 3 CTT 2 1 310650 CASAVA_Build 2 189182421 2D AAAGGAAGAC AG/-- AGGGGAGAGG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 AG 2 1 310651 CASAVA_Build 2 189188294 3I TCTAATATTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 hom 61 het 32 0 21 11 TTG 2 3 310652 CASAVA_Build 2 189203232 1D CTGTCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 11 10 310653 CASAVA_Build 2 189215611 1D GTGATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 41 0 29 12 T 13 12 310654 CASAVA_Build 2 189218986 1I ACTCTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 278 hom 40 3 26 11 A 14 15 310655 CASAVA_Build 2 189223696 4I CTTTCCACAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTTA 3 4 310656 CASAVA_Build 2 189223871 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 12 1 10 1 T 13 12 310657 CASAVA_Build 2 189244326 2I TATATATATA --/TG AAGAAAATAA 3070 het 2257 hom 21 7 13 1 TG 0 1 310658 CASAVA_Build 2 189293277 1D GTATGTAATA T/- TTTTTAAGCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 6 5 310659 CASAVA_Build 2 189294144 2D ATTTTAAAAC AT/-- GTGTGACTTC 3070 hom 115 het 45 0 38 9 AT 1 0 310660 CASAVA_Build 2 189296032 1I TTTCTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 10 11 310661 CASAVA_Build 2 189301385 1D CTAGAAGACG A/- AGGTATGAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 8 A 2 1 310662 CASAVA_Build 2 189308259 1I AAATTTTCCG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 9 310663 CASAVA_Build 2 189311509 1D TTATATCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 25 7 T 15 14 310664 CASAVA_Build 2 189312668 1I AACAACATTT -/G GGGAGAGGCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 3 4 310665 CASAVA_Build 2 189316815 2I AGGGGAACAT --/CA CACAACAGGG 2759 hom 24 het 11 0 7 4 CA 2 3 310666 CASAVA_Build 2 189324927 6D CAGTTTTGTG TGAGTA/------ ATCTTTGAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TGAGTA 1 0 310667 CASAVA_Build 2 189329367 4I TAGGAGTGGT ----/GGGA GGGAGTGGGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 GGGA 1 2 310668 CASAVA_Build 2 189330897 1I AAATCACAGA -/T TTTTTTGAAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 6 7 310669 CASAVA_Build 2 189331353 1D CTACACATTG A/- AAAAAAAAAG 1095 het 1095 ref 63 51 3 9 A 10 9 310670 CASAVA_Build 2 189336576 1D TTTGAGAAAT G/- GTTCTCAAAA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 G 2 1 310671 CASAVA_Build 2 189337762 1D TTCTATATTT G/- GGGGGAATAG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 G 6 5 310672 CASAVA_Build 2 189350905 2I GACTATTTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 10 12 310673 CASAVA_Build 2 189364705 4D ACAACAGAAA TCAT/---- TCATAGTACA 3070 hom 91 het 33 0 31 3 TCAT 2 1 310674 CASAVA_Build 2 189365563 2D CCAGCACTTT GA/-- GAGGCCGAGG 2840 hom 21 het 8 0 8 0 GA 2 1 310675 CASAVA_Build 2 189373542 1I TAGCCACATT -/C TGGCATCGGT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 C 0 1 310676 CASAVA_Build 2 189382167 1I AAGAGAAAAA -/T ATTTTAATCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 0 1 310677 CASAVA_Build 2 189386256 1D ATTGGTATGG T/- TTTTTTTTTA 1367 het 1367 ref 38 32 3 3 T 10 9 310678 CASAVA_Build 2 189415484 1D TCTATATGTA T/- TAAGAAAATT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 2 1 310679 CASAVA_Build 2 189422746 1D TATTTTCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 34 1 28 5 A 11 10 310680 CASAVA_Build 2 189447140 1I AAAAAATATA -/T ATCAATGGCT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 0 1 310681 CASAVA_Build 2 189447538 1D ATAAAAAAAA T/- ATAATAAGTA 1811 het 1232 hom 11 3 7 1 T 1 0 310682 CASAVA_Build 2 189465051 1D TGTTTCTTTT A/- AAAAAAACCT 3070 hom 95 het 40 0 31 9 A 8 7 310683 CASAVA_Build 2 189468319 1D AAAACTATTA T/- TTTTCAATGT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 5 4 310684 CASAVA_Build 2 189473473 1D CTACCACATT A/- AATGCTAAAA 3070 het 3070 hom 47 21 23 4 A 3 2 310685 CASAVA_Build 2 189477361 4D AGCCTGTATT AGTC/---- AGGCTTCTCC 1893 het 1893 ref 12 5 5 2 AGTC 1 0 310686 CASAVA_Build 2 189485197 1D TGTAGTTGAT A/- TAGTGATTAT 3070 het 3070 ref 46 19 17 12 A 1 0 310687 CASAVA_Build 2 189486515 1I AGGAAGTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 10 11 310688 CASAVA_Build 2 189493913 2D ATGTTGGCTC TT/-- ATTATTTATA 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 T 2 0 310689 CASAVA_Build 2 189499214 4D CCTAAAACTT AAAG/---- TATAATAAAG 3070 het 908 hom 12 3 9 2 AAAG 1 0 310690 CASAVA_Build 2 189508621 1I ACATTTGCAG -/T TTTATTCCAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 3 4 310691 CASAVA_Build 2 189509039 1D CAACAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 12 11 310692 CASAVA_Build 2 189514081 3D ACCAATAAAT ATG/--- ATAACAAGCA 3070 het 3070 hom 39 15 22 5 ATG 1 0 310693 CASAVA_Build 2 189527080 3D TTTCTGTAAG TTT/--- TTATCTATCT 1918 het 1918 ref 21 16 4 2 T 5 2 310694 CASAVA_Build 2 189528966 1D AAAGAGAAAG A/- AAAAGGGAAA 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 A 5 4 310695 CASAVA_Build 2 189582469 1I GTAACATATC -/A TTTTTTTCTC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 310696 CASAVA_Build 2 189590858 1D ATTACGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 24 8 A 15 14 310697 CASAVA_Build 2 189597085 1I TACAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 27 1 21 5 A 10 11 310698 CASAVA_Build 2 189599175 1I AAACAGGGGG -/A AAAAAGTGTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 5 6 310699 CASAVA_Build 2 189622018 1I ATAATAACAA -/G GGGAAAGATG 3070 hom 138 het 48 0 47 1 G 3 4 310700 CASAVA_Build 2 189623252 7D CTCCTCTAGC TCCGGGA/------- TCTTTTTAAT 3070 hom 102 het 36 0 35 3 TCCGGGA 1 0 310701 CASAVA_Build 2 189631876 1D TATAAACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 33 0 27 6 T 12 11 310702 CASAVA_Build 2 189637245 5I ACTTGCTAAC -----/AAGTA AAGTTATAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AAGTA 0 1 310703 CASAVA_Build 2 189651367 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 919 hom 33 2 21 12 A 12 11 310704 CASAVA_Build 2 189681941 1D CTTTATTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 23 1 13 9 T 15 14 310705 CASAVA_Build 2 189684560 1I TGCAAAAATT -/A AGACTTCCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 310706 CASAVA_Build 2 189690084 1I ATATTAGGTA -/C TACTTAAGTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 0 1 310707 CASAVA_Build 2 189690704 3D ATTCTTACTC TTT/--- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 12 9 310708 CASAVA_Build 2 189691914 1D TAGAATCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 10 9 310709 CASAVA_Build 2 189695941 1D AAGTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 329 hom 35 2 21 12 T 12 11 310710 CASAVA_Build 2 189706267 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 5 4 310711 CASAVA_Build 2 189707949 2D TAAAGTTTTG AA/-- AAGTTATCTT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 4 2 310712 CASAVA_Build 2 189709487 2I TTTTTTATAA --/AT ATATATATGT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 AT 4 5 310713 CASAVA_Build 2 189717474 4D CAATGCTGAA TGAG/---- TGAGAACAAA 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 TGAG 2 1 310714 CASAVA_Build 2 189728339 4D TTGCTCCTTT GGGA/---- GGCCTTTCAC 3070 hom 117 het 43 0 38 6 GGGA 1 0 310715 CASAVA_Build 2 189739022 1I CTTTTCCAAA -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 6 7 310716 CASAVA_Build 2 189762656 2I TGTGTGCATG --/TA TATATATATA 3070 het 246 hom 20 1 13 6 TA 6 7 310717 CASAVA_Build 2 189771707 2I AAACATATAT --/AA GTTTTCATTT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 0 2 310718 CASAVA_Build 2 189792845 1D AGATAGAGTG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 4 hom 27 1 19 7 C 10 9 310719 CASAVA_Build 2 189793442 1D GTGTATTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 12 11 310720 CASAVA_Build 2 189802413 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 A 10 11 310721 CASAVA_Build 2 189804767 1I TTATGTTCTA -/T TTTTTCCATT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 5 6 310722 CASAVA_Build 2 189806797 13D GAATTTTTTG GATATTGTGTTTC/------------- TCATGCCATC 3070 het 3070 ref 49 28 22 3 GATATTGTGTTTC 1 0 310723 CASAVA_Build 2 189810375 1I CAATAACAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 A 9 10 310724 CASAVA_Build 2 189825724 3I CTATTAAAGT ---/ATA ATAATAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 ATA 2 3 310725 CASAVA_Build 2 189827264 1D GTTTATCCTG A/- TTGAGTCACA 3070 het 3070 ref 54 28 22 4 A 1 0 310726 CASAVA_Build 2 189841674 4D ACCTCTTTTT AACA/---- AACAATATTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AACA 2 1 310727 CASAVA_Build 2 189846980 2I TTCTTACCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 10 12 310728 CASAVA_Build 2 189850687 8I TACAGATACT --------/CATAGATC CATAGATCCA 3070 het 2001 hom 22 5 13 4 CATAGATC 1 2 310729 CASAVA_Build 2 189881442 1D ATGGCCCTGC A/- AAGCTATCTC 3070 het 3070 hom 28 8 15 6 A 3 2 310730 CASAVA_Build 2 189883711 1D CTATCAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 39 1 31 9 A 11 10 310731 CASAVA_Build 2 189889756 1D ACTTAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2952 hom 34 9 14 11 A 15 14 310732 CASAVA_Build 2 189895976 1I TGGGATGCAA -/G GCTGGTTCAA 3070 het 119 hom 20 1 18 1 G 1 2 310733 CASAVA_Build 2 189910792 2D CCATCCTAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 26 3 15 8 A 16 14 310734 CASAVA_Build 2 189928488 1I TTGAATTGAT -/C CCTTTACCAT 3070 hom 62 het 23 0 21 2 C 2 3 310735 CASAVA_Build 2 189931827 1D GCCTTCTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 10 9 310736 CASAVA_Build 2 189934516 1I TTGGGTCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 9 10 310737 CASAVA_Build 2 189949521 2D ACCCAGGTAC AG/-- AGTCTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 19 22 7 AG 2 1 310738 CASAVA_Build 2 189970598 3I GTATTTCATC ---/ATT GTTTTAATGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 ATT 0 1 310739 CASAVA_Build 2 189972224 2D TATTTTACGA TT/-- TTTTTTTTTT 1927 het 363 hom 16 1 5 10 T 16 14 310740 CASAVA_Build 2 189974025 5I CATTCTTTTC -----/TTTTT TTATTTCCAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 2 7 310741 CASAVA_Build 2 189978203 4D ATTAAATGCC TTTT/---- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 T 8 4 310742 CASAVA_Build 2 189984633 2D AACATCTGAC TA/-- TTACTGCAAG 3070 het 3070 hom 33 14 17 4 TA 1 0 310743 CASAVA_Build 2 189990411 1I CTTACTATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 9 10 310744 CASAVA_Build 2 190003671 1D ACTGGGTGGA G/- GCCCACTGCA 3070 hom 51 het 24 0 15 9 G 2 1 310745 CASAVA_Build 2 190017068 1I GATTTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 10 11 310746 CASAVA_Build 2 190023051 1D AAACCATTAG T/- TACCATTCTG 3070 het 3070 hom 39 18 19 4 T 2 1 310747 CASAVA_Build 2 190023340 1D TTGGTTTTGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 9 8 310748 CASAVA_Build 2 190026775 1D CATATATGTG T/- ACCCTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 1 0 310749 CASAVA_Build 2 190027500 1I ATTTCTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2632 het 2632 ref 24 13 8 3 T 11 12 310750 CASAVA_Build 2 190028212 1I ACTTTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 10 11 310751 CASAVA_Build 2 190045541 1I TTCCATTACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3039 hom 31 8 16 7 T 9 10 310752 CASAVA_Build 2 190045878 1D ATGCTAGAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 A 10 9 310753 CASAVA_Build 2 190051727 1D CTTCTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 505 hom 35 3 17 16 T 13 12 310754 CASAVA_Build 2 190052518 1D GAAAAATCAC T/- GTGTAAGTGT 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 T 1 0 310755 CASAVA_Build 2 190064496 2I CCCAGAGAGT --/GA GAGTTCTGAG 3070 hom 63 het 25 0 20 5 GA 1 2 310756 CASAVA_Build 2 190064798 1I CCCATCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1302 hom 22 3 15 4 T 10 11 310757 CASAVA_Build 2 190080058 1I TTATGAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 9 10 310758 CASAVA_Build 2 190085740 1D TGAAAGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 33 2 18 15 T 15 14 310759 CASAVA_Build 2 190088095 21D GAAACCTCAA AGTTGGCAGAGAATATTATCT/--------------------- AGAAGGCAAT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 AGTTGGCAGAGAATATTATCT 1 0 310760 CASAVA_Build 2 190103022 1I AGGTATATAA -/T TTTTTTTTTT 894 het 894 ref 19 10 3 7 T 17 18 310761 CASAVA_Build 2 190118236 2I GGGATTACAG --/CC CCGTGAGCTA 3070 het 2390 hom 16 7 9 0 C 2 4 310762 CASAVA_Build 2 190121412 3D GCTTCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2251 het 156 hom 34 4 11 19 T 19 16 310763 CASAVA_Build 2 190130304 1D CAACCACCAA G/- TTGATTTTGA 3070 het 3070 hom 40 18 22 0 G 1 0 310764 CASAVA_Build 2 190144417 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2393 hom 27 9 13 5 A 12 11 310765 CASAVA_Build 2 190145728 1I CACACTGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 A 11 12 310766 CASAVA_Build 2 190150835 6I GAATCCTCCT ------/GCCTCA GCCTCCCAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 GCCTCA 0 1 310767 CASAVA_Build 2 190153131 4D GGGTTGGTTG GTTT/---- GTTTGTTTTG 3070 hom 138 het 48 0 47 3 GTTT 3 2 310768 CASAVA_Build 2 190171863 2I AGCCCGGGCT --/AC ACACACACAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AC 8 9 310769 CASAVA_Build 2 190176358 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 9 8 310770 CASAVA_Build 2 190188188 2I GAATTTTGGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 43 het 35 0 20 15 GT 8 9 310771 CASAVA_Build 2 190200492 1I CTGGGTGTGG -/T TGGCGGACAC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 1 2 310772 CASAVA_Build 2 190201692 1I AAGCACATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1317 hom 26 5 13 8 A 12 13 310773 CASAVA_Build 2 190203052 1D TCTTCAAGAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 72 het 26 0 24 3 A 8 7 310774 CASAVA_Build 2 190205207 1I CTCTTTTTTT -/C TTTTTTGATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 310775 CASAVA_Build 2 190206070 2D TTCTTTGAGG AT/-- AGAGACCATT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 AT 1 0 310776 CASAVA_Build 2 190207885 1D TTTACCTTTG A/- CATACAAATA 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 A 1 0 310777 CASAVA_Build 2 190214223 7D TTGCAGGAAG AAGTGAC/------- AAGTGACAAG 3070 het 3070 ref 39 21 17 2 AAGTGAC 2 1 310778 CASAVA_Build 2 190217046 1D CTACAAAACT G/- ATTTCAGTTG 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 G 1 0 310779 CASAVA_Build 2 190223659 1D AGAGGTGAAG C/- CAGCTGGACT 2562 het 2562 ref 22 12 6 4 C 2 1 310780 CASAVA_Build 2 190226018 1I ACTGCAACCT -/C CCTGCCTGAT 3070 hom 47 het 18 0 14 4 C 2 3 310781 CASAVA_Build 2 190237805 2I TTCAAAACTA --/TC TAACACTTTG 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 TC 0 1 310782 CASAVA_Build 2 190241324 1I CACTTCTACT -/A AAAAATACAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 5 6 310783 CASAVA_Build 2 190241483 1D CTGTTTCCAC A/- AAAAAACAGA 3070 hom 87 het 31 0 30 3 A 7 6 310784 CASAVA_Build 2 190245721 5D ATTCCAGGTG CTACT/----- CTACTCTATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTACT 2 1 310785 CASAVA_Build 2 190246063 1I AAATCTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 13 6 A 10 11 310786 CASAVA_Build 2 190246259 1D TGGCCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 717 hom 37 2 28 7 T 11 10 310787 CASAVA_Build 2 190248172 1I41M5D ACAAGCTAAA -TTTTGAGAACCACTATATAATAGAGACCAATCAGATGAAATAAATC/TTTTTGAGAACCACTATATAATAGAGACCAATCAGATGAAAT----- AAACCATTAT 3070 het 3070 hom 30 9 20 10 N/A 0 0 310788 CASAVA_Build 2 190253981 1I AGCCTTGACA -/T TTCTGACGAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 2 3 310789 CASAVA_Build 2 190257248 1I CCACACCACT -/C GTCCACTTTC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 C 0 1 310790 CASAVA_Build 2 190259815 1I TTATTTTAAA -/T TTTTGTGGGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 4 5 310791 CASAVA_Build 2 190261917 1I GCTCTAGTTA -/C GGCGTAGGGG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 0 1 310792 CASAVA_Build 2 190264683 2I TATATTTGAG --/AT ATATATATAT 2082 het 1779 hom 13 5 6 2 AT 7 8 310793 CASAVA_Build 2 190270874 1D CGTTGTCAGG T/- TGCATATGAC 3070 hom 102 het 37 0 34 4 T 2 1 310794 CASAVA_Build 2 190278247 1D AGGCAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 35 0 27 9 A 10 9 310795 CASAVA_Build 2 190283269 1D ATTTAAAGTA T/- CTTTTTTATA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 1 0 310796 CASAVA_Build 2 190285129 1D CCCCACATCT G/- GGGGGGCAGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 7 6 310797 CASAVA_Build 2 190291062 4I TATAATAAAA ----/AAAT AAATAAAATA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AAAT 1 2 310798 CASAVA_Build 2 190300343 1D ATTCCTCTAC A/- AAAAACACAA 3070 hom 102 het 39 0 34 6 A 6 5 310799 CASAVA_Build 2 190301414 5D CCTTATTTTA TTTTT/----- ATTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 45 20 22 3 T 5 0 310800 CASAVA_Build 2 190304648 1I AGGCTGTTTC -/T TTTTTTAATC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 6 7 310801 CASAVA_Build 2 190306838 1I AGAATCTAAT -/C CGGGGTCTCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 1 2 310802 CASAVA_Build 2 190310110 1I TTCTTTCTGT -/G TGTAATACAT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 G 0 1 310803 CASAVA_Build 2 190310388 1D TGAATTTAAG A/- GATTGATATG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 0 310804 CASAVA_Build 2 190311447 1I CAAAAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 10 11 310805 CASAVA_Build 2 190311911 1I AACCCTTAAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 8 9 310806 CASAVA_Build 2 190315526 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTAAA 2985 het 1528 hom 12 4 8 0 T 7 8 310807 CASAVA_Build 2 190322673 3D ATTATATAGA TTT/--- TAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 33 10 17 8 T 4 1 310808 CASAVA_Build 2 190323422 1D ACATCAAATA G/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 G 1 0 310809 CASAVA_Build 2 190324802 5I TATTCCAGAA -----/TTAAC TTAAAACAGA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TTAAC 0 1 310810 CASAVA_Build 2 190333668 2D AGGCTGAGAC AG/-- GGGAATCGTT 1322 het 1322 ref 14 9 5 1 AG 1 0 310811 CASAVA_Build 2 190334001 4I CAGTGTATTA ----/TTAT TTATTTAAGT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TTAT 1 2 310812 CASAVA_Build 2 190344272 2I TACATAAAAC --/AA GAGAAATATG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 0 2 310813 CASAVA_Build 2 190353478 1I AATCTGGTGA -/T TAAAAATAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 1 2 310814 CASAVA_Build 2 190354644 1D ATACAATGAG A/- AAAAAAAAAG 854 het 854 ref 35 28 2 5 A 10 9 310815 CASAVA_Build 2 190354917 1D TCTTAGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 15 14 310816 CASAVA_Build 2 190358703 4I GGAAGAAAGG ----/CTTT CTTGAAGAGT 3070 hom 139 het 56 0 45 11 CTTT 0 1 310817 CASAVA_Build 2 190369850 1I TTACTTCTTT -/G GGGGTATATA 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 G 4 5 310818 CASAVA_Build 2 190378785 1I TTGTTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 A 11 12 310819 CASAVA_Build 2 190379054 2D TTATTGAAAC AT/-- ATAAAACATA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 AT 2 1 310820 CASAVA_Build 2 190434813 1D CTGTTTTTTT C/- CTCTTTATTT 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 C 2 1 310821 CASAVA_Build 2 190443027 1D AAACTGACTT G/- ATTTGATTGG 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 G 1 0 310822 CASAVA_Build 2 190472567 1D ATAAATTTGA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 106 het 41 0 35 6 T 8 7 310823 CASAVA_Build 2 190472776 4I TATATTTCTT ----/TCTC TACTTTTTAC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 TC 0 2 310824 CASAVA_Build 2 190482287 2I ATTTCAGTCA --/CT CTGTATCTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 CT 1 2 310825 CASAVA_Build 2 190485070 2D GTTGGTATAC CA/-- CACAGCATGT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 CA 3 2 310826 CASAVA_Build 2 190497090 1I TAATGAAGAT -/C GGGGGGATGA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 C 0 1 310827 CASAVA_Build 2 190502528 1D TTATTGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 32 1 26 5 T 11 10 310828 CASAVA_Build 2 190504155 15D TGAAACAGTT ATGGTGGTTTGTGAA/--------------- ATGGTGGTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 8 ATGGTGGTTTGTGAA 1 0 310829 CASAVA_Build 2 190506354 4D TTGTTGAATA AATG/---- AATAATACCC 3070 het 3070 ref 39 25 12 5 AATG 1 0 310830 CASAVA_Build 2 190521337 1I CATATGCCTG -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 8 9 310831 CASAVA_Build 2 190522480 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 28 0 21 7 A 11 10 310832 CASAVA_Build 2 190526089 1I CTGGCCAGAT -/A TTTTGTTCAG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 A 0 1 310833 CASAVA_Build 2 190554245 2D CTTCTTTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 2927 het 378 hom 36 5 12 19 T 18 16 310834 CASAVA_Build 2 190559340 1D ATGGGGGAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 102 hom 34 2 27 5 A 10 9 310835 CASAVA_Build 2 190562252 1D CCTTCCCCGC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 123 het 47 0 42 6 A 9 8 310836 CASAVA_Build 2 190565509 1I TTTTAGGATT -/A TTTTTTGTAG 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 0 1 310837 CASAVA_Build 2 190577450 6I CCTTATCACC ------/TATTAT TATTATTATT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 TAT 3 5 310838 CASAVA_Build 2 190585286 2I TGTACAGACA --/GT GTTTTGCATA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 GT 1 2 310839 CASAVA_Build 2 190595738 1D TATTCTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 T 11 10 310840 CASAVA_Build 2 190604535 2I TAATTATCAT --/AA GACTTTATTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 0 2 310841 CASAVA_Build 2 190607090 1D TTATAAAGTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 9 8 310842 CASAVA_Build 2 190609570 1D TTTGGTAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 10 9 310843 CASAVA_Build 2 190647623 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 29 1 23 6 A 12 11 310844 CASAVA_Build 2 190651978 1I TGAAAAAAAA -/C CATTTCATTT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 C 1 2 310845 CASAVA_Build 2 190656326 2D GCTGGGCGAC AG/-- AGATCCTGTC 3070 het 3070 ref 33 15 11 8 AG 2 1 310846 CASAVA_Build 2 190666232 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2902 het 878 hom 15 3 9 4 A 15 14 310847 CASAVA_Build 2 190666404 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1725 hom 19 4 12 3 A 10 9 310848 CASAVA_Build 2 190674649 1D TTCATTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 A 12 11 310849 CASAVA_Build 2 190698292 2D TGACTGAAAC AT/-- AGTTATATGG 3070 het 3070 ref 64 31 23 11 AT 1 0 310850 CASAVA_Build 2 190700164 1D CCCTGACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2313 hom 29 11 10 9 A 15 14 310851 CASAVA_Build 2 190708577 1D CAGTGTTGTC T/- TGAGTTTGAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 1 310852 CASAVA_Build 2 190709700 2D CACATTTAAC TG/-- TGAGAAATAG 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 TG 2 1 310853 CASAVA_Build 2 190711997 1D CTATGTGCTA G/- GCACTTTTTA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 2 1 310854 CASAVA_Build 2 190718803 4I TATATATGTA ----/TATG TATGTATGTG 3070 hom 33 het 16 0 12 4 TATG 2 3 310855 CASAVA_Build 2 190718951 1D TCCATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 11 10 310856 CASAVA_Build 2 190720650 2D TTCTATCAGC AG/-- AGTTTTGTAG 3070 hom 87 het 32 0 30 4 AG 2 1 310857 CASAVA_Build 2 190721925 10D CTTTTCTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1442 hom 15 het 10 0 6 6 T 27 17 310858 CASAVA_Build 2 190724987 2D AAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 19 1 8 10 A 12 10 310859 CASAVA_Build 2 190739858 11D GCCAGCAAAA AAAGAAAAAAG/----------- AAAGAAAAAA 3070 hom 75 het 36 0 26 12 AAAGAAAAAAG 2 1 310860 CASAVA_Build 2 190744205 1D AAAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 34 0 27 7 A 11 10 310861 CASAVA_Build 2 190744456 1D CATTGTAAAG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 T 8 7 310862 CASAVA_Build 2 190747972 9I ATACATAGAT ---------/TACATAGAG TACATGGAGT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TACATAGAG 0 1 310863 CASAVA_Build 2 190748062 3D ACCATAAAAG ACA/--- ACAACAACAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 10 ACA 5 4 310864 CASAVA_Build 2 190763565 4D GGTTCACAGG GTAA/---- GTGTGTGGTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GTAA 1 0 310865 CASAVA_Build 2 190769033 4I CTTTCAATTG ----/TTAT TTATTTTTAG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 TTAT 1 2 310866 CASAVA_Build 2 190794064 6D CTTGTTTCAT ACACAC/------ ACAAACACAC 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 AC 4 1 310867 CASAVA_Build 2 190838962 1D ATTTTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 T 11 10 310868 CASAVA_Build 2 190840814 1I TCAGGAACTA -/G GATAGCCTAG 3070 hom 105 het 36 0 35 1 G 1 2 310869 CASAVA_Build 2 190842439 1I CAAACATATG -/A AAAAAAGCTC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 6 7 310870 CASAVA_Build 2 190846676 1D CAGTTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 24 hom 25 1 18 6 A 10 9 310871 CASAVA_Build 2 190851596 3D GAACCTGTAG AGC/--- AGCAGTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 AGC 2 1 310872 CASAVA_Build 2 190853611 1D AGCAAGGGGG A/- AAATGCCTCA 3070 hom 59 het 35 0 20 15 A 4 3 310873 CASAVA_Build 2 190862194 3D GTAATTATTT TCA/--- TCAATTCATA 1579 het 1579 ref 19 13 5 2 TCA 2 1 310874 CASAVA_Build 2 190866269 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 6 5 310875 CASAVA_Build 2 190866425 4D ACTCCGTCTC AAAA/---- AAAAAAATAA 3070 hom 36 het 14 0 12 3 A 11 7 310876 CASAVA_Build 2 190872925 1I TTGCTAAGGA -/T TGATGGCCTC 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 1 2 310877 CASAVA_Build 2 190875095 2D ATAAATTTGG AA/-- AAGAGAGCTT 3070 het 3070 ref 43 18 16 10 A 4 2 310878 CASAVA_Build 2 190876411 1D GGAAATGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1460 hom 54 4 29 23 A 16 15 310879 CASAVA_Build 2 190877949 4D TTAAGTCTCT CTAA/---- CTGTGTGGTC 3070 hom 72 het 27 0 25 6 CTAA 1 0 310880 CASAVA_Build 2 190880685 1D GAGAAAGAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 9 8 310881 CASAVA_Build 2 190883885 1D GAACAAAAAG T/- TTTAAAAGGT 3070 het 3070 hom 53 22 27 5 T 4 3 310882 CASAVA_Build 2 190886204 4I AGCCTATTCC ----/CCTT CCTTATTTAA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 CCTT 1 2 310883 CASAVA_Build 2 190903348 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 7 8 310884 CASAVA_Build 2 190905998 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 28 1 26 1 A 10 11 310885 CASAVA_Build 2 190913223 1D AACACTTTTT A/- AAAACTTGCC 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 5 4 310886 CASAVA_Build 2 190922713 1I ACACAGCAGA -/T AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 1 310887 CASAVA_Build 2 190938829 16D TGTCTCTCTC GCTCTCTGTCTCTCTT/---------------- GCTCTGTCTC 3070 het 3070 ref 51 37 15 6 GCTCTCTGTCTCTCTT 1 0 310888 CASAVA_Build 2 190944906 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 23 0 18 6 A 15 14 310889 CASAVA_Build 2 190945729 2D TACATTTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 123 het 48 0 42 8 TG 6 5 310890 CASAVA_Build 2 190948012 1I ATTAAAAAGT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 8 9 310891 CASAVA_Build 2 190949441 2I TATAGAAGTT --/AC AATTTGTCTT 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 AC 0 1 310892 CASAVA_Build 2 190955062 1I GAGTTGAGTT -/A AGTTTCCTGC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 1 2 310893 CASAVA_Build 2 190967960 2D TTTAATAGAC AT/-- GTGCATATTT 3070 het 3070 hom 44 17 22 6 AT 1 0 310894 CASAVA_Build 2 190974667 1D GTCTCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1542 hom 30 11 10 9 A 15 14 310895 CASAVA_Build 2 190979303 1D AGTGGCTCAC A/- CCTGTAATCC 3070 het 2565 hom 22 7 8 7 A 1 0 310896 CASAVA_Build 2 190983824 1I GTCAGGAGTT -/C CAAGACCAGC 3070 het 2336 hom 16 6 8 2 C 1 2 310897 CASAVA_Build 2 190993029 2D CTATATTTTC AA/-- GTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 A 2 0 310898 CASAVA_Build 2 190993144 34D ATAACAAAAT ATATAGCAACCATATATAGCATATATATATAGCA/---------------------------------- ACCATATATA 3070 hom 102 het 30 0 35 4 ATATAGCAACCATATATAGCATATATATATAGCA 1 0 310899 CASAVA_Build 2 190994466 4I TGTTTACAAG ----/GTTT GTTACAAACC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GTTT 0 1 310900 CASAVA_Build 2 191008609 2D GAAACTATAA AC/-- AGTGTTTATT 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 AC 1 0 310901 CASAVA_Build 2 191011187 1I TTTTAGTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 11 12 310902 CASAVA_Build 2 191018471 1I AGAACACGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 19 1 10 8 T 10 11 310903 CASAVA_Build 2 191018774 3D GATTCATAAC GTG/--- GTAATATGGA 3070 het 3070 hom 27 10 13 6 GTG 1 0 310904 CASAVA_Build 2 191020070 1I TAAAAAAAAA -/T AACTTGAAAG 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 0 1 310905 CASAVA_Build 2 191028252 4D TCATAGCTCT ATTA/---- ATTAAATTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 6 ATTA 2 1 310906 CASAVA_Build 2 191031436 2D GATTTTGGAC TT/-- TTGGCTCCCA 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 4 2 310907 CASAVA_Build 2 191050918 1D ATTCCAGCAT G/- GGGGAAGAGC 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 G 5 4 310908 CASAVA_Build 2 191051807 1I GGTCTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 316 hom 38 1 27 10 A 10 11 310909 CASAVA_Build 2 191053352 4D TCATGTACTA TAGT/---- TAGTAGTTTA 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 TAGT 2 1 310910 CASAVA_Build 2 191055030 3D CAGAAATGAT AGG/--- AGGAAAGGAT 3070 het 3070 ref 53 28 21 5 AGG 2 1 310911 CASAVA_Build 2 191055371 1I GAAGCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1032 het 1032 ref 40 22 5 13 T 15 16 310912 CASAVA_Build 2 191062904 2I CAAATGCCCC --/CT GAGAAGCCTA 3070 hom 78 het 30 0 24 6 CT 0 1 310913 CASAVA_Build 2 191063069 2D TGTTTGTTTG TT/-- TTCTTTTATA 3070 het 1987 hom 31 8 18 5 T 4 2 310914 CASAVA_Build 2 191068171 1I CTGCTGTACA -/C CCAACAGTGA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 C 2 3 310915 CASAVA_Build 2 191081487 2I TTTTCCAAAC --/AT GTGTTCCAAG 3070 hom 141 het 54 0 48 6 AT 0 1 310916 CASAVA_Build 2 191096590 1D AAAAAAAATG T/- TATGATTCCA 3070 hom 157 het 60 0 53 7 T 2 1 310917 CASAVA_Build 2 191104951 1I TCATATGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 14 14 12 A 8 9 310918 CASAVA_Build 2 191106746 1I TTATGAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 11 12 310919 CASAVA_Build 2 191107029 4I AAGGTCACAA ----/CAGC CAGTCAGGGG 3070 hom 102 het 37 0 31 6 CAGC 0 1 310920 CASAVA_Build 2 191108831 1D GCCCTGATCC A/- ATTCTTTCCT 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 A 2 1 310921 CASAVA_Build 2 191111157 1I TAAGATCCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 50 27 8 15 T 9 10 310922 CASAVA_Build 2 191114152 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2606 hom 27 10 10 7 TA 7 8 310923 CASAVA_Build 2 191114842 1I TGGATAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 32 1 23 8 T 11 12 310924 CASAVA_Build 2 191118106 1D AAAAAGTAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 4 A 9 8 310925 CASAVA_Build 2 191118217 1D CGATCTCACC A/- ACTCCACTTC 3070 hom 80 het 29 0 25 6 A 2 1 310926 CASAVA_Build 2 191126221 1D TCTTCGTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 10 9 310927 CASAVA_Build 2 191126725 1D ATTTCTCAAA C/- ATTTACTCCT 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 C 1 0 310928 CASAVA_Build 2 191135691 1I TTAAGGCATA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 T 7 8 310929 CASAVA_Build 2 191138131 1I GAAATACGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2481 hom 38 7 22 9 T 10 11 310930 CASAVA_Build 2 191139687 3D25M1I GAGGGAAGAA AAGAAAGAAAGAAGGAAAGAAAGAAAAG-/---AAAGAAAGAAGGAAAGAAAGAAAAGA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 27 10 5 N/A 0 0 310931 CASAVA_Build 2 191142371 7I GACAAATTTT -------/AAATAAA AAATAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AAATAAA 1 2 310932 CASAVA_Build 2 191148303 1I TTTTTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 11 12 310933 CASAVA_Build 2 191152363 1D ATATTATTCT A/- CATATTCAAG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 1 0 310934 CASAVA_Build 2 191185917 2D AAATAATGAA AT/-- ATCTGTTGTT 3070 het 3070 ref 35 22 11 3 AT 2 1 310935 CASAVA_Build 2 191190296 1I GGCTGAGTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 8 9 310936 CASAVA_Build 2 191214106 1I CATTTTTTTT -/C AGGGGAGCCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 0 1 310937 CASAVA_Build 2 191227626 2I TTTCTTTCTC --/TA TGCACTGGTG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 TA 0 1 310938 CASAVA_Build 2 191245784 1I CCCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 28 0 21 7 A 11 12 310939 CASAVA_Build 2 191246909 8I CCTTCCTTTC --------/TTTTTGTT TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 TTTTTGTT 1 2 310940 CASAVA_Build 2 191254398 5I CAGTCTAAAT -----/AAATA AGAAAACTTA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 AAATA 0 1 310941 CASAVA_Build 2 191265085 6D GTGTAGAAAT AGTATG/------ AGTACGATTT 3070 hom 67 het 30 0 23 8 AGTATG 1 0 310942 CASAVA_Build 2 191266830 4I TTGGGTCTCA ----/AAAT AAATAGTTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAAT 1 2 310943 CASAVA_Build 2 191267651 1D30M5I ACCTATGACA TTTTTTTTTTTGTGATCACCTCAAAGGTGTT-----/-TTTTTTTTTTGTGATCACCTCAAAGGTGTTTTTTA TTTTTTGTGC 3070 hom 60 het 22 0 19 10 N/A 0 0 310944 CASAVA_Build 2 191272780 1I AGATTTTCTT -/A ACAGCTGTTT 3070 het 3070 hom 43 19 23 1 A 1 2 310945 CASAVA_Build 2 191277923 4D GGGTTTTGTT GAAA/---- GAAAGAAAGG 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 GAAA 3 2 310946 CASAVA_Build 2 191282078 1D ATTTTTGCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 619 hom 27 2 17 9 T 13 12 310947 CASAVA_Build 2 191287613 1I AGAATAGGCA -/T TTTCATGTAC 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 3 4 310948 CASAVA_Build 2 191292886 1I AGAAGGTATC -/T TTTTTTTTTT 1288 het 1288 ref 29 15 5 9 T 15 16 310949 CASAVA_Build 2 191294195 4D GATATTATTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 99 het 49 0 33 18 TG 11 9 310950 CASAVA_Build 2 191304127 1D TGCCTACTGT G/- GGTTTCAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 G 3 2 310951 CASAVA_Build 2 191305067 1D GAGATAAAGC T/- TGCTGTTTTA 3070 hom 144 het 53 0 47 6 T 2 1 310952 CASAVA_Build 2 191313065 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 32 1 22 9 A 14 13 310953 CASAVA_Build 2 191330660 6D GTTTTGGGAT CACACA/------ CACACACACA 3070 hom 60 het 30 0 21 10 CA 12 9 310954 CASAVA_Build 2 191332549 6D AGTGTTTTTG TTTTTA/------ TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 30 12 11 8 TTTTTA 3 2 310955 CASAVA_Build 2 191343716 53D ATGATGCATG ATGTGCATGATGCTTATCTATGGGATGTCCCTCGAGCATGCAGGCACTGCTGC/----------------------------------------------------- ATCTGGAACA 1996 het 1996 ref 34 38 10 10 ATGTGCATGATGCTTATCTATGGGATGTCCCTCGAGCATGCAGGCACTGCTGC 1 0 310956 CASAVA_Build 2 191353209 1I TACGCTGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2343 hom 26 8 14 4 A 12 13 310957 CASAVA_Build 2 191357148 1I TTATATGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 9 10 310958 CASAVA_Build 2 191358265 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2494 hom 21 het 8 0 8 0 A 13 12 310959 CASAVA_Build 2 191366321 5D GTTTCTAAGT GTAAC/----- GTATGAAATC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 GTAAC 1 0 310960 CASAVA_Build 2 191372399 1I TCAAATCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1426 hom 33 4 26 3 T 12 13 310961 CASAVA_Build 2 191378055 3I TGGGAAGACT ---/GAG GCATGAAGAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 GAG 0 1 310962 CASAVA_Build 2 191379620 1I CTCTCTCTCC -/T TTTTTTTTTT 2709 het 295 hom 36 2 16 18 T 15 16 310963 CASAVA_Build 2 191383793 2I5M2I AAAGGAAAGG --AAAGG--/CAAAAGGCA AAAGGAAAGG 2432 het 92 hom 21 1 9 11 N/A 0 0 310964 CASAVA_Build 2 191387378 1D CTACCCGTGG T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 97 het 40 0 31 10 T 7 6 310965 CASAVA_Build 2 191389025 95D TACTCAAGGA GGAACTCTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC/----------------------------------------------------------------------------------------------- GGAACTCTCT 3070 hom 39 het 18 0 12 8 GGAACTCTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 1 0 310966 CASAVA_Build 2 191394173 1I TCTGTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 35 1 23 11 T 12 13 310967 CASAVA_Build 2 191395291 1D ATCCAGTGCC T/- TTCCAGCTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 3 2 310968 CASAVA_Build 2 191399422 2I GGACAATGTC --/AT ATGTAAGTGG 3070 hom 70 het 30 0 21 9 AT 1 2 310969 CASAVA_Build 2 191401913 1I ATATTTGAAA -/T AAGTTTATAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 0 1 310970 CASAVA_Build 2 191404019 1D AGTTATCAAA G/- TTTATTAATC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 G 1 0 310971 CASAVA_Build 2 191404940 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 A 9 10 310972 CASAVA_Build 2 191407718 4D TTCTTCTTCC TCCT/---- TCCTTCCTTC 3070 hom 35 het 29 0 14 16 TCCT 4 3 310973 CASAVA_Build 2 191417827 1D CCGCAGGGGG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 9 8 310974 CASAVA_Build 2 191444939 1I TGGCAATTAA -/T TTTTTTTTTT 898 het 294 hom 17 2 4 11 T 17 18 310975 CASAVA_Build 2 191464003 1I TTAGTAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 10 11 310976 CASAVA_Build 2 191467319 1D TGAATGTACG T/- TTTTTTATTT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 7 6 310977 CASAVA_Build 2 191467923 1D GTGTTAATGA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 8 7 310978 CASAVA_Build 2 191473002 2D AAGCATATCA AC/-- AGACATTTCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AC 1 0 310979 CASAVA_Build 2 191482187 1I AATTGACAGA -/T TAAAAATTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 310980 CASAVA_Build 2 191486014 1D CTATTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 11 10 310981 CASAVA_Build 2 191514541 3I ACAATAAGAA ---/GAC CTTGTTTTGT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GAC 0 1 310982 CASAVA_Build 2 191514701 3D GAGAAGGGGA AAG/--- AAGAAGGCAA 3070 hom 120 het 42 0 39 4 AAG 3 2 310983 CASAVA_Build 2 191517168 1I ATGGCCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 12 13 310984 CASAVA_Build 2 191518042 4I ACCCAGTAGA ----/TAGT TAGTAGTTGC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TAGT 1 2 310985 CASAVA_Build 2 191519605 5D TAAATAGTTG AAGTA/----- AAGTGTAAAA 3070 het 3070 hom 51 19 28 5 AAGTA 1 0 310986 CASAVA_Build 2 191528045 1I AACAAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 10 11 310987 CASAVA_Build 2 191533511 7I AATTTATTTA -------/TTTATTT TTTATTTTTT 3070 hom 36 het 22 0 13 9 TTTATTT 2 3 310988 CASAVA_Build 2 191544676 2I CTCTTTTCTT --/TC TTTCTTTCTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TC 0 1 310989 CASAVA_Build 2 191547182 1D TACTAAAAAA G/- CACCCTCCAA 3070 hom 123 het 48 0 41 9 G 1 0 310990 CASAVA_Build 2 191548598 1D GGTTTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2879 hom 39 12 23 4 T 15 14 310991 CASAVA_Build 2 191552515 1D TCAAGAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 T 12 11 310992 CASAVA_Build 2 191554031 1I CCTTTTAATG -/C CCTCTTCATG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 C 2 3 310993 CASAVA_Build 2 191576666 1D TGCTTCCTGT A/- ACAGCCTGCA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 2 1 310994 CASAVA_Build 2 191581212 1I TTCACAAAGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 A 8 9 310995 CASAVA_Build 2 191582401 3D TAAATTAGCA AAT/--- AATAAATTTT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 AAT 2 1 310996 CASAVA_Build 2 191586361 1D ATTTTGGGGT G/- GGGGGTCTGC 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 6 5 310997 CASAVA_Build 2 191599772 1I AGTCTGCTGC -/G GGGGCAGAGC 3070 hom 69 het 26 0 19 7 G 4 5 310998 CASAVA_Build 2 191602126 1D TAAATTATTA T/- TTTTTTAACC 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 T 7 6 310999 CASAVA_Build 2 191630553 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2178 het 335 hom 31 5 15 11 T 14 13 311000 CASAVA_Build 2 191632026 1I GCCAGGTCAG -/A AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 39 29 3 7 A 10 11 311001 CASAVA_Build 2 191651073 1I TTCCATTGTT -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 7 8 311002 CASAVA_Build 2 191652207 16I CTTGTCAAGT ----------------/CACACACACACACACA CACGCACACA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CA 1 9 311003 CASAVA_Build 2 191689769 1I CCCCAACATA -/T ACTTGTTGAA 3070 hom 158 het 61 0 51 10 T 0 1 311004 CASAVA_Build 2 191697045 14D GCAATAATGA CATGACATTTGATC/-------------- CATTTAGTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 5 CATGACATTTGATC 1 0 311005 CASAVA_Build 2 191701067 14I TTAAACAGCA --------------/CAACACAGAGTTCT CTAACCTTTC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 CAACACAGAGTTCT 0 1 311006 CASAVA_Build 2 191703928 1I TATTAAAAAA -/G GGATGAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 2 3 311007 CASAVA_Build 2 191708993 2D AAAAAAAAAA AC/-- CAAAAAACAA 2986 het 49 hom 33 2 20 12 AC 1 0 311008 CASAVA_Build 2 191709689 4D ACCACTGAAC TCTA/---- TCTAGTCTGG 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TCTA 2 1 311009 CASAVA_Build 2 191709995 1D CTCTACAAGG A/- AAACTACAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 4 3 311010 CASAVA_Build 2 191731814 1D TGTTGGAAAT C/- TATTCAATTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 1 0 311011 CASAVA_Build 2 191738292 12I GTGAAAGCCA ------------/ACTCTCGGAGCG ACTAAAAACC 3070 hom 105 het 42 0 36 7 ACTCTCGGAGCG 0 1 311012 CASAVA_Build 2 191740775 4D AAAGAGAGCA ACAG/---- ACAAACAGTA 3070 het 3070 ref 34 15 16 5 ACAG 1 0 311013 CASAVA_Build 2 191745864 1I TGAGATAACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 A 9 10 311014 CASAVA_Build 2 191746306 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2814 hom 31 11 8 12 T 11 10 311015 CASAVA_Build 2 191748526 4D AGTGACAGGT CATA/---- CATAGGTCAT 3070 het 3070 ref 48 25 20 4 CATA 2 1 311016 CASAVA_Build 2 191770057 1D AAGGCCTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 10 9 311017 CASAVA_Build 2 191777983 1I CACACCCAGT -/A AAAGACAACT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 3 4 311018 CASAVA_Build 2 191790005 1I AGCAACCCTG -/T TTTTTTTTTT 2183 het 2183 ref 33 15 7 11 T 13 14 311019 CASAVA_Build 2 191795968 1D66M3D TGGCTCAGAG AAAAAAAAGAAGTGTTTCTCTGACTTGAGTTCAAATATATAAAGCCTACAGGGAACAAGGCATTCTCAGG/-AAAAAAAGAAGTGTTTCTCTGACTTGAGTTCAAATATATAAAGCCTACAGGGAACAAGGCATTCTC--- AGAAGTTAGT 3070 hom 202 het 45 0 68 13 N/A 0 0 311020 CASAVA_Build 2 191796631 1I TTCCTAGCAT -/C TTGATCCCCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 0 1 311021 CASAVA_Build 2 191798723 1D CAACCATATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 11 10 311022 CASAVA_Build 2 191801006 1I GGGTGCGGGA -/G GGGGGGGGAC 3070 hom 75 het 34 0 23 11 G 8 9 311023 CASAVA_Build 2 191805187 1I AACAAACATT -/A ACTAAAGAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 1 2 311024 CASAVA_Build 2 191819522 1D GTGAAAGAAG C/- CCCCCCCCCT 2634 het 102 hom 28 1 8 20 C 10 9 311025 CASAVA_Build 2 191826033 1I AGTAAGTTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 9 10 311026 CASAVA_Build 2 191828059 2D CTCCACACCC CA/-- CTCATTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 12 11 CA 1 0 311027 CASAVA_Build 2 191828779 3D AGTATTGCCA CTG/--- CTGCTGCCAT 3070 het 3070 hom 35 11 15 10 CTG 3 2 311028 CASAVA_Build 2 191829918 1D TTTCTGTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 10 9 311029 CASAVA_Build 2 191844490 1D ATTTAAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 33 1 26 6 A 12 11 311030 CASAVA_Build 2 191856305 1I GGTTTGATTT -/G GAAGAAATTA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 1 2 311031 CASAVA_Build 2 191860838 1D GATCTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 39 1 22 16 T 16 15 311032 CASAVA_Build 2 191869304 1I45M4I TTTTTGTCAG -TTTTTTTTAAAAAGTTTGATAAAAGTATGAAGACTTTAATTGTTA----/TTTTTTTTTAAAAAGTTTGATAAAAGTATGAAGACTTTAATTGTTATTCT TTATTTTAAA 3070 hom 114 het 32 0 39 6 N/A 0 0 311033 CASAVA_Build 2 191870120 5I TACTGAGTTT -----/AAAGA AAAGGAAAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AAAGA 0 1 311034 CASAVA_Build 2 191873264 2D CTTTGAAAAC TT/-- TGCCAATTAA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 3 1 311035 CASAVA_Build 2 191874237 3D4M1D CAGGGAGGAC ATTTCAGA/---TGAG- AACATTTCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 7 N/A 0 0 311036 CASAVA_Build 2 191874401 1I TAAATGATCC -/A AAATCAGAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 3 4 311037 CASAVA_Build 2 191877557 3I ACAACAACAG ---/CAA CAACAACAAC 3070 hom 84 het 35 0 28 7 CAA 4 5 311038 CASAVA_Build 2 191905239 2I TGGCCTATTA --/AT TCCCTCTTAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AT 0 1 311039 CASAVA_Build 2 191937494 2D CTAGCCCGTG GT/-- GTATGATCAG 3070 hom 70 het 29 0 23 7 GT 2 1 311040 CASAVA_Build 2 191950812 1I TCACAAGAGA -/G GGTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 G 2 3 311041 CASAVA_Build 2 191958501 2D TTCTGCTTTT AG/-- ATTTCTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 AG 1 0 311042 CASAVA_Build 2 191959490 3I TTTTTTAAAA ---/AAG CACTTATTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAG 0 1 311043 CASAVA_Build 2 191972737 1I ACATGTAGAG -/T TAAGTGAAAC 3070 hom 98 het 35 0 30 5 T 1 2 311044 CASAVA_Build 2 191985817 1D TTTGTTTGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 44 0 33 12 A 10 9 311045 CASAVA_Build 2 191991302 11D TGTTGAAAAC CACATGCAGTT/----------- TAGTGACTAA 3070 hom 54 het 20 0 17 4 CACATGCAGTT 1 0 311046 CASAVA_Build 2 191994042 1D AGTGTGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 135 hom 39 2 17 20 T 17 16 311047 CASAVA_Build 2 192020356 1I ACTATTTATA -/G ATTGAGAGTA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 0 1 311048 CASAVA_Build 2 192023946 1D ACCTTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 31 1 22 8 T 12 11 311049 CASAVA_Build 2 192028710 2I GGATGGTCTC --/TA TCTCTTTACC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TA 0 1 311050 CASAVA_Build 2 192032805 1I CTTAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 11 311051 CASAVA_Build 2 192038128 1I AGTCAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 646 hom 34 3 16 15 T 13 14 311052 CASAVA_Build 2 192038715 1D AATCTGTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 120 hom 24 1 18 5 A 10 9 311053 CASAVA_Build 2 192045590 1I ACCTAAAAAA -/C CATTTTTTGG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 1 2 311054 CASAVA_Build 2 192067203 21D TCTCTGCTGT GCTGCTCTTCCACTCTTCTGC/--------------------- GCTGCTCTTC 3070 hom 131 het 50 0 42 10 GCTGCTCTTCCACTCTTCTGC 2 1 311055 CASAVA_Build 2 192069119 13I CATTAAATCT -------------/ACTTGATCAAACC AAGGTCATAT 3070 hom 111 het 43 0 37 7 ACTTGATCAAACC 0 1 311056 CASAVA_Build 2 192083032 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGTTTCAC 2265 het 763 hom 7 2 5 0 G 5 4 311057 CASAVA_Build 2 192083599 3D GCCCAGCTAA TTG/--- TTGTATTTTT 2363 het 1826 hom 15 7 7 1 TTG 2 1 311058 CASAVA_Build 2 192103672 1I TCTATCTTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 9 10 311059 CASAVA_Build 2 192105573 1D TGTCACATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 11 10 311060 CASAVA_Build 2 192110072 1I TCTTGCTTTA -/T TTTTCTTCCT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 4 5 311061 CASAVA_Build 2 192115889 1D TAGGTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2734 het 114 hom 29 3 12 14 T 15 14 311062 CASAVA_Build 2 192123309 5D GTTACCAGTC TCTTT/----- TCTTATGCAC 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 TCTTT 1 0 311063 CASAVA_Build 2 192125786 1I ATGTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1384 hom 17 4 9 4 A 14 15 311064 CASAVA_Build 2 192134311 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 17 1 10 6 A 15 16 311065 CASAVA_Build 2 192150906 1D TAAAATTAGT A/- ATGATAAAGA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 2 1 311066 CASAVA_Build 2 192155616 2I GGTGAGCTTG --/GA AGGCATTTGA 3070 het 3070 hom 66 27 32 7 GA 0 1 311067 CASAVA_Build 2 192161311 1I21M1D AAAATAAAAA -AAAAAAAAATAAAAAAAAAAAC/TAAAAAAAAATAAAAAAAAAAA- ACCTGTGCTG 1839 het 867 hom 22 8 14 7 N/A 0 0 311068 CASAVA_Build 2 192163059 5D CATTTAAATG AACAA/----- AACCTGAATT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 AACAA 1 0 311069 CASAVA_Build 2 192166479 2D AAAAACCAAC AA/-- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 30 10 18 3 A 10 8 311070 CASAVA_Build 2 192166757 11D AGCATGATTA ACTCAGGGTGG/----------- ACTCAGGGTG 3070 het 3070 ref 45 20 13 14 ACTCAGGGTGG 2 1 311071 CASAVA_Build 2 192175581 1D TTGCTAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 9 18 10 A 10 9 311072 CASAVA_Build 2 192184467 1I ATATTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 10 11 311073 CASAVA_Build 2 192190046 1I CAGATATTTC -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 6 7 311074 CASAVA_Build 2 192196767 1D TCTATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 10 17 11 T 11 10 311075 CASAVA_Build 2 192197259 3D GGAAAGAATT AAC/--- AACAATTCCT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 AAC 2 1 311076 CASAVA_Build 2 192199227 1D GCTATACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 T 12 11 311077 CASAVA_Build 2 192200140 1I AGTATATGAG -/A AGTATATTTT 3070 het 3070 hom 48 22 20 6 A 1 2 311078 CASAVA_Build 2 192201887 1I GCAAACTGGC -/A AAAAAAATTA 3070 het 1533 hom 27 4 8 15 A 7 8 311079 CASAVA_Build 2 192204625 1D AGAGCCAGAA C/- CCAAGTTTCT 3070 hom 84 het 38 0 28 10 C 3 2 311080 CASAVA_Build 2 192206274 16I TCATGTTTCT ----------------/TTTTTACATCGGCCGA ACTCGACTAT 3070 hom 75 het 27 0 25 4 TTTTTACATCGGCCGA 0 1 311081 CASAVA_Build 2 192207634 1D CAATGCCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 10 6 T 12 11 311082 CASAVA_Build 2 192211114 1D AAAAGGGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 14 17 4 A 10 9 311083 CASAVA_Build 2 192216160 1D ACCAAGGGTG A/- AAAAATTCTA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 6 5 311084 CASAVA_Build 2 192219478 1D TTCCCCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2181 hom 35 8 19 8 T 13 12 311085 CASAVA_Build 2 192224751 1D GAATCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 A 11 10 311086 CASAVA_Build 2 192229697 1D GGTTAGAGCC T/- ATATTCAGGG 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 T 1 0 311087 CASAVA_Build 2 192233045 7I TTAGTTCAGA -------/GTCTCAT GTTTTCCATC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 GTCTCAT 0 1 311088 CASAVA_Build 2 192233315 1D TTTTTACCAG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 T 9 8 311089 CASAVA_Build 2 192246177 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 2405 hom 12 het 6 0 5 1 T 1 0 311090 CASAVA_Build 2 192257087 1D TTTGTTAATT A/- AAAAAAAAAA 1268 het 1268 ref 34 19 7 8 A 15 14 311091 CASAVA_Build 2 192302053 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 979 hom 39 4 22 13 T 17 16 311092 CASAVA_Build 2 192313841 3D TTTTGATAAA TTG/--- TTATTTTATT 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 TTG 1 0 311093 CASAVA_Build 2 192325786 1I TTTATTAAAG -/T TTTTTTGGGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 6 7 311094 CASAVA_Build 2 192330101 1D CCTAAATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 27 1 15 11 A 17 16 311095 CASAVA_Build 2 192333617 3D TATCAGGCAA AAG/--- AAGTATCTCA 3070 het 3070 ref 37 18 18 3 AAG 2 1 311096 CASAVA_Build 2 192341483 1D TGAGTCTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 10 9 311097 CASAVA_Build 2 192344749 2D TCATCTCAGA AT/-- ATAGTATGTT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 AT 2 1 311098 CASAVA_Build 2 192383625 2I TGTATATAAA --/TT TTAAATAAAA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 2 4 311099 CASAVA_Build 2 192393813 4I GTGAGGGCCA ----/TAAT TAATTTTGTG 3070 hom 141 het 54 0 47 7 TAAT 1 2 311100 CASAVA_Build 2 192395113 1D GTCCAATGTC T/- TCATGTTTAC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 2 1 311101 CASAVA_Build 2 192407885 1I AATAGTATGA -/G GCTAAGTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 G 1 2 311102 CASAVA_Build 2 192425631 3D CCCGTATTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 35 1 18 18 T 19 16 311103 CASAVA_Build 2 192444121 3D CAAAGAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 37 4 16 20 A 19 16 311104 CASAVA_Build 2 192447345 1D CATATTATGA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 311105 CASAVA_Build 2 192452940 2D AAGAAGTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 38 2 24 12 T 18 16 311106 CASAVA_Build 2 192453394 3D2M7D GGTGTGCCAA GATTGCCTTACA/---TG------- GAAATGGAAA 3070 het 3070 hom 30 11 18 5 N/A 0 0 311107 CASAVA_Build 2 192456038 2I CATCTAGCCT --/TC TCTTTCTCCA 3070 hom 117 het 43 0 37 6 TC 1 2 311108 CASAVA_Build 2 192471408 1D TATCTAGTTG A/- TCAGATTTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 1 0 311109 CASAVA_Build 2 192481871 2I AAATAATGGA --/AT ATATATATAT 1942 het 1942 ref 20 8 4 8 AT 7 8 311110 CASAVA_Build 2 192487137 1D GCTATTATTC T/- TGTATTCTTT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 2 1 311111 CASAVA_Build 2 192491239 10I20M2D GCCTGATATT ----------TCATTACCTCCGTTTTTTTTTG/TCAGTTTATCTCATTACCTCCGTTTTTTTT-- TTTTTGTTTT 2411 het 2411 ref 30 16 8 9 N/A 0 0 311112 CASAVA_Build 2 192513552 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAAAT 1092 het 1092 ref 44 26 4 15 AAC 1 0 311113 CASAVA_Build 2 192516571 2D CTTAAAGGAA TG/-- TACATGATTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TG 1 0 311114 CASAVA_Build 2 192521908 4D CGAGTATTTT AAAC/---- AAACATCATT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 AAAC 2 1 311115 CASAVA_Build 2 192521988 1I TGGAGTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1932 hom 17 5 9 3 T 10 11 311116 CASAVA_Build 2 192523595 6D AACACAGGCA GAAGTT/------ GAAGAGGAAG 3070 het 3070 hom 39 16 16 9 GAAGTT 1 0 311117 CASAVA_Build 2 192524031 16D GAAAGTTCAT ATAAAATTCTATTATA/---------------- ATAATCTGTG 3070 het 3070 ref 33 23 14 5 ATAAAATTCTATTATA 1 0 311118 CASAVA_Build 2 192524137 2I TGTGTATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 TG 6 7 311119 CASAVA_Build 2 192529056 12I TTTTTTTTAG ------------/TGTGTGAATGCT TGTGTGAGTA 3070 het 3070 hom 51 25 22 4 TGTGTGAATGCT 0 1 311120 CASAVA_Build 2 192532596 4I AGTATGTACA ----/TGTG TGTGTGTGTA 3070 hom 161 het 58 0 54 4 TG 4 6 311121 CASAVA_Build 2 192534485 1I ATTTTACCCT -/C CCCCGACTTA 3070 het 3070 hom 47 14 22 11 C 4 5 311122 CASAVA_Build 2 192542049 2D TTTCCAGGTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TA 8 7 311123 CASAVA_Build 2 192545120 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 452 hom 30 1 16 13 T 15 14 311124 CASAVA_Build 2 192546575 1D GAGAACTCCA G/- AAGCCATGTG 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 G 1 0 311125 CASAVA_Build 2 192552513 1D AACGCTATAC A/- AAACTCTCCC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 4 3 311126 CASAVA_Build 2 192554307 1I GTCTATAACA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 53 25 15 13 T 6 7 311127 CASAVA_Build 2 192555106 6D CAGGATTCTA CCATAT/------ CCATATTTAT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 CCATAT 2 1 311128 CASAVA_Build 2 192555476 4D GAAAACAGGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 774 hom 41 9 14 18 A 15 11 311129 CASAVA_Build 2 192560384 1D TTCTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 45 0 35 10 T 12 11 311130 CASAVA_Build 2 192561625 1D TTAAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 8 T 11 10 311131 CASAVA_Build 2 192561772 3I GAGGTTTTTT ---/TTG TTTTTTGTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTG 0 1 311132 CASAVA_Build 2 192568995 1I GTAAGATAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 A 9 10 311133 CASAVA_Build 2 192570300 13D CTAAGAGATT TCAGATCTCTATA/------------- TTAACTAATT 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 TCAGATCTCTATA 1 0 311134 CASAVA_Build 2 192570700 4I TAATTTTGCA ----/TGTC TGTCTGAGAA 3070 het 3070 hom 31 8 20 3 TGTC 1 2 311135 CASAVA_Build 2 192572397 1I GATAAAAAAT -/G AAAAGGAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 0 1 311136 CASAVA_Build 2 192574735 1D ACCTTTCACC T/- TCTGCCATGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 2 1 311137 CASAVA_Build 2 192583494 1I TTACTGCCAC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 40 het 44 1 40 3 T 8 9 311138 CASAVA_Build 2 192591857 6D TATGCTGAGA TCTTAT/------ TCTTAATTTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TCTTAT 1 0 311139 CASAVA_Build 2 192602088 1I CACCTCTTCT -/C CCCCCTCCCC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 5 6 311140 CASAVA_Build 2 192615172 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 34 3 23 8 A 12 13 311141 CASAVA_Build 2 192621130 1D CTCAAACGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 12 11 311142 CASAVA_Build 2 192624202 2I TTTTTCTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 29 1 22 6 T 11 13 311143 CASAVA_Build 2 192625609 1I TTTATAAGCC -/A ATTCTTCTTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 2 311144 CASAVA_Build 2 192631943 1D CTCTTCATTT C/- TTTTTTGTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 1 0 311145 CASAVA_Build 2 192635057 3I AATTAGTGTT ---/GAG GAGTGCATAT 3070 hom 107 het 43 0 34 9 GAG 1 2 311146 CASAVA_Build 2 192635940 2D TCCGGGAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 T 12 10 311147 CASAVA_Build 2 192645557 5I TAGATAAAAT -----/GAATA GAAGTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GAATA 0 1 311148 CASAVA_Build 2 192655776 1D TGCACTTGAG T/- TAACAGTTTA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 2 1 311149 CASAVA_Build 2 192666395 4I TTGGGACTCC ----/CAAA CAGACTCTTT 3070 hom 144 het 54 0 49 5 CAAA 0 1 311150 CASAVA_Build 2 192668007 1D AGGATTTTTG A/- AAAATTTATA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 5 4 311151 CASAVA_Build 2 192672841 1I AGATCAGTGG -/A AAAAAATATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 6 7 311152 CASAVA_Build 2 192687439 4D CAAGGAAAAG AAAA/---- AAAAAGGGCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 5 311153 CASAVA_Build 2 192689915 5D GAACAATGAC ATCTT/----- ATTTATATAG 3070 hom 117 het 45 0 40 8 ATCTT 1 0 311154 CASAVA_Build 2 192700654 2I ATTATGTAAC --/TT TGTTTGTTTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 3 311155 CASAVA_Build 2 192701124 1D TCTGTCACAA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 6 311156 CASAVA_Build 2 192702341 1D TGTTTAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 39 1 24 16 A 13 12 311157 CASAVA_Build 2 192718525 1I ACTACATGAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 8 9 311158 CASAVA_Build 2 192719683 5D TTTTAAATCT AAGAA/----- AAGAAAAAAT 3070 hom 117 het 40 0 40 1 AAGAA 2 1 311159 CASAVA_Build 2 192723667 1I ACACTTCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1036 hom 37 5 13 19 T 15 16 311160 CASAVA_Build 2 192723808 1I CAAGTTTACA -/T TTTTCATTCT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 4 5 311161 CASAVA_Build 2 192731349 3I TATTTTTAAT ---/GTG AAAGCTAGAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 GTG 0 1 311162 CASAVA_Build 2 192737698 3D ACTTCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 30 1 17 15 A 17 14 311163 CASAVA_Build 2 192738716 1D TCTCCGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 31 0 19 15 A 15 14 311164 CASAVA_Build 2 192742951 1I GATGCACTAT -/A TTAACTGTAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 1 311165 CASAVA_Build 2 192744960 1I TCAGCTACTT -/A AGAGTATTTC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 1 2 311166 CASAVA_Build 2 192745178 1I GCTGTGTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 869 hom 42 6 30 6 T 11 12 311167 CASAVA_Build 2 192763860 1I GTTCTATATC -/T ATTTTTATTC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 T 0 1 311168 CASAVA_Build 2 192772952 1D GCCAGTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 13 12 311169 CASAVA_Build 2 192775732 4D TGAGAGTATG TTAT/---- TTGTGTTTTG 3070 het 3070 ref 49 27 18 7 TTAT 1 0 311170 CASAVA_Build 2 192779792 4I GTCATGTGAT ----/AGAA AGATAAGGGT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 AGAA 0 1 311171 CASAVA_Build 2 192780773 2I AATATAAAAC --/TG TGTTGAATGC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TG 1 2 311172 CASAVA_Build 2 192781366 2I TTTTAGTGAA --/TG TGAAAATATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TG 1 2 311173 CASAVA_Build 2 192784613 2I ATGCCTTTTA --/TC TCTCATCGGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TC 2 3 311174 CASAVA_Build 2 192787007 1I ATGGAGGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 9 10 311175 CASAVA_Build 2 192787225 1I AAAATGCGGA -/T AGTAAAAGGA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 0 1 311176 CASAVA_Build 2 192790500 3I AAATTAATAA ---/ATT AATAATTTAG 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 ATT 0 1 311177 CASAVA_Build 2 192793829 1D AGTTTGAGGG T/- TTTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 T 8 7 311178 CASAVA_Build 2 192794204 1I AAGACACATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 9 10 311179 CASAVA_Build 2 192794631 4I TTGTATATTG ----/TCTA TCTATCAATC 3070 hom 51 het 25 0 18 7 TCTA 1 2 311180 CASAVA_Build 2 192815976 1D AGTGCTTAAG A/- AAAAAAGGGA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 7 6 311181 CASAVA_Build 2 192826147 1D64M1I ATATACTGCC AAAAAAAAAAAGGCCCAAGGGCTTTTGGTTTCCACTTATATATGAAACAATAGGAATTATATTGA-/-AAAAAAAAAAGGCCCAAGGGCTTTTGGTTTCCACTTATATATGAAACAATAGGAATTATATTGAG GATGCTTTAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 26 N/A 0 0 311182 CASAVA_Build 2 192831998 1D TTTCTTCCTG T/- TTTCTTCTTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 4 3 311183 CASAVA_Build 2 192832934 1D TTTCTAAAAC T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 T 7 6 311184 CASAVA_Build 2 192833280 5D ATTCTAGATA TTAAG/----- TTAATATTTG 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 TTAAG 1 0 311185 CASAVA_Build 2 192838411 1D TGTATTCTTT G/- ATTTTGCCAT 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 G 1 0 311186 CASAVA_Build 2 192848059 1D AAGTAATTTA T/- TTTGTGATTC 3070 het 3070 hom 45 19 21 6 T 4 3 311187 CASAVA_Build 2 192862066 1I ATGTTTAAAG -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 7 8 311188 CASAVA_Build 2 192866303 1D AATTTTTGGT G/- GGGGGCAGAC 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 G 6 5 311189 CASAVA_Build 2 192866512 1D ATTGCTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 788 hom 28 2 13 13 T 13 12 311190 CASAVA_Build 2 192868591 3D AAAATGAAAT AAG/--- AAGTACACTT 3070 het 3070 hom 61 30 30 3 AAG 2 1 311191 CASAVA_Build 2 192870636 9I GACCAAGTTT ---------/CCAAAGATA TTTACTTACC 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 CCAAAGATA 0 1 311192 CASAVA_Build 2 192872159 2I TATTGAGAAT --/GA GAGTGTCCAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 GA 1 2 311193 CASAVA_Build 2 192873097 8I20M1D CAGCAGGACC --------GACTACATAATTTGCGGGACA/GACTACATGACTACATAATTTGCGGGAC- CAGTATGAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 12 N/A 0 0 311194 CASAVA_Build 2 192874703 4I TATTTAGGAT ----/TCTA TCTAAAATAA 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 TCTA 1 2 311195 CASAVA_Build 2 192874982 1D TCCTATTTAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2453 hom 19 7 9 3 A 10 9 311196 CASAVA_Build 2 192878368 1D TTTCCCACAG C/- CACACTGATT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 C 2 1 311197 CASAVA_Build 2 192883384 4I AGTTATTACT ----/GGAA TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 GGAA 0 1 311198 CASAVA_Build 2 192885474 2D AAAATATTAC CT/-- GTTAATACTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 CT 1 0 311199 CASAVA_Build 2 192888943 2D CTACTTTAAC TT/-- GTAATATTGA 3070 het 3070 hom 57 26 28 3 T 2 0 311200 CASAVA_Build 2 192897503 2D TTCCTTCATG AT/-- ATGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 AT 2 1 311201 CASAVA_Build 2 192900515 1D GGATGCATTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 7 6 311202 CASAVA_Build 2 192916897 2I CAATGGACAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 10 12 311203 CASAVA_Build 2 192951376 4D TAAGAATCCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 65 het 29 0 22 8 TTTA 6 5 311204 CASAVA_Build 2 192955073 1I TGAATTTTAA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 7 8 311205 CASAVA_Build 2 192959313 1I GTTTTTATTG -/T TGGTTCTGTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 1 2 311206 CASAVA_Build 2 192963486 1I CAATTAGCTG -/C CTACATCTCT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 C 1 2 311207 CASAVA_Build 2 192965388 2I GTAATATTCA --/CT GTTATTCTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CT 0 1 311208 CASAVA_Build 2 192967194 3I AAACAAATCT ---/ACA ACAACAACAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ACA 3 4 311209 CASAVA_Build 2 192968560 1I TTATAATCTT -/C TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 0 1 311210 CASAVA_Build 2 192971337 1I AACTGTCTCA -/C CCCCCTGGAA 3070 hom 132 het 51 0 44 7 C 5 6 311211 CASAVA_Build 2 192975519 2I TACTAAACTA --/TG TGTGTGTATG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TG 3 4 311212 CASAVA_Build 2 192989583 2D AAAATTGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 32 0 26 6 A 15 13 311213 CASAVA_Build 2 192990485 1I TGTAGGTGGG -/C ACCAGCCAAT 3070 hom 114 het 46 0 38 8 C 0 1 311214 CASAVA_Build 2 192991953 1I TTTTAAATAG -/T TTATTTTTTT 3070 het 80 hom 21 1 17 3 T 2 3 311215 CASAVA_Build 2 192992160 1D TGGATAATTC A/- GTTAATTTTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 1 0 311216 CASAVA_Build 2 193001983 1I AAAGCAAAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 104 hom 23 1 17 5 A 9 10 311217 CASAVA_Build 2 193010356 1D CTGACTTTTT G/- TGTTACAGGT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 G 1 0 311218 CASAVA_Build 2 193024889 1D CTCTTTGTCC A/- AAAATGACAA 3070 hom 105 het 37 0 35 2 A 5 4 311219 CASAVA_Build 2 193036998 1D ATTTAAGAAG A/- ATATTTAAGA 3070 het 3070 hom 36 9 24 3 A 2 1 311220 CASAVA_Build 2 193047313 1I AAGCAATAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 22 9 0 A 8 9 311221 CASAVA_Build 2 193065352 1D25M2I TTAAAGAGTT ATGCAAAATAAGTGAATTTGACACTC--/-TGCAAAATAAGTGAATTTGACACTCTT GTTTCACTGC 3070 hom 105 het 26 0 36 4 N/A 0 0 311222 CASAVA_Build 2 193070506 1D GCTAAAAATA T/- TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 7 6 311223 CASAVA_Build 2 193072954 5I TTTGTTTTGT -----/TTTGC TTTGCTTTCT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 TTTGC 1 2 311224 CASAVA_Build 2 193088229 4I GGTAGAGGAC ----/TATA TTTTAAAGGA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 TA 0 2 311225 CASAVA_Build 2 193117315 1D ATGACTTTTT C/- CACTCTTCCC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 2 1 311226 CASAVA_Build 2 193121886 1I TTTCCTGTTG -/T TTTTTTCTCA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 6 7 311227 CASAVA_Build 2 193131026 2D TTTTCTATAA CT/-- CTTGTTATAT 1876 het 1876 ref 13 7 4 2 CT 2 1 311228 CASAVA_Build 2 193131199 1D ACATGCTTTC A/- ATGGCCTTGT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 2 1 311229 CASAVA_Build 2 193139995 1D CCACCCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 38 0 25 13 A 15 14 311230 CASAVA_Build 2 193180230 5D TTTGAATTTG TTAAT/----- TTAAACATAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 TTAAT 1 0 311231 CASAVA_Build 2 193191028 1D AATTAAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 37 2 33 2 T 11 10 311232 CASAVA_Build 2 193191868 1I AACCACACAG -/T TTTTTTTTTT 1752 het 1752 ref 42 27 8 7 T 15 16 311233 CASAVA_Build 2 193210233 1I GTTAATGAGC -/A ATAAGAAATC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 1 2 311234 CASAVA_Build 2 193213433 1D AATAAACTCA T/- TTTTTACAAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 6 5 311235 CASAVA_Build 2 193213859 1I CTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 20 8 9 3 A 10 11 311236 CASAVA_Build 2 193254576 1I TCTAATTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 9 10 311237 CASAVA_Build 2 193256391 2D GTGTATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 AT 6 5 311238 CASAVA_Build 2 193261299 1I GGGTTTATTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 T 7 8 311239 CASAVA_Build 2 193267625 2I AATAACATTA --/GG AGATCTGTCA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 G 0 2 311240 CASAVA_Build 2 193268205 1I TAAGGGAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 9 10 311241 CASAVA_Build 2 193280189 1I AAGTTCACAC -/A AAATAGAAAT 3070 het 3070 hom 56 21 27 8 A 3 4 311242 CASAVA_Build 2 193281379 3I CTCTCTGGAA ---/TTC TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 TTC 1 2 311243 CASAVA_Build 2 193281852 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 C 0 1 311244 CASAVA_Build 2 193290317 1D AATATCAAGA T/- TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 8 7 311245 CASAVA_Build 2 193299027 1I ATTCTGTTGG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 6 7 311246 CASAVA_Build 2 193300496 1I CAAAAAAATG -/A AAAAACTACA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 5 6 311247 CASAVA_Build 2 193303966 1I CCTTATCATT -/A AAAAAAAAAA 2371 het 2371 ref 47 10 10 27 A 16 17 311248 CASAVA_Build 2 193308151 1I ATTCAACTGT -/C CATTGGACAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 C 1 2 311249 CASAVA_Build 2 193323685 1D TTCTGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 T 11 10 311250 CASAVA_Build 2 193328450 4D AGTGTGCAGA GATG/---- GGTAATGCAT 3070 het 3070 ref 47 21 19 9 GATG 1 0 311251 CASAVA_Build 2 193344917 2I AAATGTACAC --/AT GTGTTTTGGT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 AT 0 1 311252 CASAVA_Build 2 193347290 1I ATTTTCATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 24 16 12 A 11 12 311253 CASAVA_Build 2 193349224 1I GATGAACAAA -/C CCCACAAAAG 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 C 3 4 311254 CASAVA_Build 2 193350097 1D AAGCTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 1429 het 1242 hom 25 7 4 14 T 15 14 311255 CASAVA_Build 2 193359271 4I ATGAGTATGT ----/GAAA GAAAGAGAGT 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 GAAA 1 2 311256 CASAVA_Build 2 193364256 1D AGCTTAATAC A/- AGCAATCAGA 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 A 2 1 311257 CASAVA_Build 2 193377357 2D AAGATATCAA AG/-- GGGATATATA 3070 het 3070 hom 43 20 21 3 AG 1 0 311258 CASAVA_Build 2 193378598 5I GACTCAAAAC -----/AAAAG AAAATTATTA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 AAAAG 0 1 311259 CASAVA_Build 2 193381885 1D GTTGAGGCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 T 10 9 311260 CASAVA_Build 2 193386924 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 TG 8 7 311261 CASAVA_Build 2 193389363 4D CACTAAAATT AAAC/---- AAGCAGCCCA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 AAAC 1 0 311262 CASAVA_Build 2 193393051 3I TAACTCATTT ---/GGC AACAGACTTC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 GGC 0 1 311263 CASAVA_Build 2 193395245 1I TTGAGACTAA -/T GAACAATACA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 0 1 311264 CASAVA_Build 2 193397315 1D ATAAATCCAC A/- TATTTACAAC 3070 het 3070 hom 35 11 17 8 A 1 0 311265 CASAVA_Build 2 193406819 1D AAAGCATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 12 11 311266 CASAVA_Build 2 193411328 2I GTTGAACAGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 T 10 12 311267 CASAVA_Build 2 193411524 1I AGCATTGGGG -/A AAAAATCAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 5 6 311268 CASAVA_Build 2 193434069 1D GTAAAGGGAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 30 18 9 4 A 8 7 311269 CASAVA_Build 2 193435032 1D TTGTAAATTT G/- TTCGAGTTCA 3070 het 2575 hom 16 7 9 0 G 1 0 311270 CASAVA_Build 2 193436201 1D32M1I AAAAAAAAAG AAAAAAAATAAACAAAAGAAAGTAAAAATGTGG-/-AAAAAAATAAACAAAAGAAAGTAAAAATCTGGA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 16 15 2 N/A 0 0 311271 CASAVA_Build 2 193437167 1D CATTCATCTC T/- TTTTTTCCTT 936 het 936 ref 38 16 8 14 T 7 6 311272 CASAVA_Build 2 193442069 1I TGGGGCAATT -/A TAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 0 1 311273 CASAVA_Build 2 193442769 3I TAATTTACAT ---/ATA ATCTGTTTAC 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 ATA 0 1 311274 CASAVA_Build 2 193448032 1I ACTTTTATCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 7 8 311275 CASAVA_Build 2 193509442 1I CCCTTTAGCA -/T TTCTTGTAGT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 2 3 311276 CASAVA_Build 2 193510676 6D CACTCCAACT CACTAC/------ CACTACCACT 3070 het 3070 ref 48 27 15 10 CACTAC 2 1 311277 CASAVA_Build 2 193520344 3I TAAATCTAAA ---/GAT GATGATTTAT 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 GAT 2 3 311278 CASAVA_Build 2 193528318 2I CCCACAACAA --/CC CTTGAACTGC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 C 1 3 311279 CASAVA_Build 2 193535210 1I TTCCCTGAAT -/G GGCATTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 G 2 3 311280 CASAVA_Build 2 193537453 1D TATATATATA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 T 8 7 311281 CASAVA_Build 2 193541603 1D TTTTTTTTTT G/- ATTATTGATC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 G 1 0 311282 CASAVA_Build 2 193542479 3D AAAGAAATAG AAT/--- AATACAGCAA 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 AAT 2 1 311283 CASAVA_Build 2 193549633 1I TGCTTAACAG -/T TTTGTTATTT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 3 4 311284 CASAVA_Build 2 193575570 2D AATCAGCAAC AA/-- ACTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 3 1 311285 CASAVA_Build 2 193603839 4D TATTTATATA TATT/---- TATTTATTTA 2423 het 1779 hom 12 5 7 0 TATT 3 2 311286 CASAVA_Build 2 193613912 3I TTTAACAACA ---/ACG ACAATAACAA 3070 het 2981 hom 37 9 23 5 ACG 0 1 311287 CASAVA_Build 2 193619024 1D GTTTACAATC T/- TTGCCTAAAT 3070 het 3070 ref 45 26 18 1 T 3 2 311288 CASAVA_Build 2 193629545 1I TGTCTGTGTG -/T TGTGTGTATA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 1 2 311289 CASAVA_Build 2 193643083 1D CATGGTTTTT A/- TTTTTTTTTA 2436 het 2436 ref 40 23 12 6 A 1 0 311290 CASAVA_Build 2 193657419 1D ATATGAAGAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 2843 hom 21 8 8 6 A 9 8 311291 CASAVA_Build 2 193707632 1D CTTTAAATTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 A 9 8 311292 CASAVA_Build 2 193709853 3D AGCACTCAGA TAT/--- TATACAAAGC 3070 het 3070 ref 57 30 24 4 TAT 2 1 311293 CASAVA_Build 2 193712983 1D AATTCAAAAT G/- GGGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 G 4 3 311294 CASAVA_Build 2 193713855 1D TCTTTTCTAC T/- GCATTGTCAG 3070 het 3070 ref 47 21 21 6 T 1 0 311295 CASAVA_Build 2 193716126 1I CTCCCCACTA -/T TACCCTATTG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 1 2 311296 CASAVA_Build 2 193762178 1I CAAAGTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 51 2 40 9 T 12 13 311297 CASAVA_Build 2 193814669 2D TGTGCATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 TA 8 7 311298 CASAVA_Build 2 193818052 1I TTTTTACTTG -/T TTGTCTTAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 311299 CASAVA_Build 2 193837093 1I ACAACTTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 11 12 311300 CASAVA_Build 2 193847665 2I TTAAAGCTGT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 9 11 311301 CASAVA_Build 2 193853753 5I AGAAATTCTA -----/TATTT TATTTGCCAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 TATTT 1 2 311302 CASAVA_Build 2 193856804 1D ACTTTCACTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 21 3 A 10 9 311303 CASAVA_Build 2 193857371 1D TCTGTAAACA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 T 8 7 311304 CASAVA_Build 2 193858384 1I GATGGGATTA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 6 7 311305 CASAVA_Build 2 193859268 1I TTCCTAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 T 10 11 311306 CASAVA_Build 2 193865814 3D ATGTTTATTC TCA/--- TCAGCTTAAC 3070 het 3070 hom 41 18 20 5 TCA 2 1 311307 CASAVA_Build 2 193883318 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 10 11 311308 CASAVA_Build 2 193898346 4D TAATTAACAT TTGC/---- TTGATGACTA 3070 het 3070 hom 50 23 24 7 TTGC 1 0 311309 CASAVA_Build 2 193900837 1D TCATTTGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 T 11 10 311310 CASAVA_Build 2 193904871 1D CGTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2555 het 2245 hom 30 6 10 14 T 17 16 311311 CASAVA_Build 2 193913119 3D AATAAGAAAT AAC/--- AAACTTCTGA 3070 het 3066 hom 21 9 11 1 AAC 1 0 311312 CASAVA_Build 2 193919033 1I ATTTGGATGA -/T TTTCCCCCAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 3 4 311313 CASAVA_Build 2 193919553 1D ATTTACAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 A 9 8 311314 CASAVA_Build 2 193921534 1D AGTTACTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 12 11 311315 CASAVA_Build 2 193939752 1D TTGAAACAAC A/- AAAATTTATT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 5 4 311316 CASAVA_Build 2 193941790 1D ATTATGTTTG A/- AAGATTAAAT 3070 het 3070 ref 28 17 9 3 A 3 2 311317 CASAVA_Build 2 193948834 1I GTTTCTTTAG -/T TTTTTTCTAC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 6 7 311318 CASAVA_Build 2 193949252 3I TTGTTAAGAC ---/TTG TTGTATGGCC 3070 hom 132 het 53 0 45 8 TTG 1 2 311319 CASAVA_Build 2 193951766 1D GCTCTTCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 10 9 311320 CASAVA_Build 2 193953493 6D CAAAAGTAGT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 TC 11 8 311321 CASAVA_Build 2 194040800 3I AAAACAGTGA ---/CCT CCTCACATTG 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 CCT 1 2 311322 CASAVA_Build 2 194047681 1I TATAAACACT -/C CCTCCAGAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 2 3 311323 CASAVA_Build 2 194054185 1D ATTACCTGAT C/- GTGTAAAGAA 3070 het 3070 ref 47 30 14 3 C 1 0 311324 CASAVA_Build 2 194067118 22D AAATAGAAAG CACACACACACACACACACACA/---------------------- CACACACACA 3070 het 1970 hom 39 8 21 17 CA 17 6 311325 CASAVA_Build 2 194077315 2D CACACATGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 CA 6 5 311326 CASAVA_Build 2 194077398 4I TGTATTTTAA ----/CTTG CTTCTATAAT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 CTTG 0 1 311327 CASAVA_Build 2 194078940 2I TTACAAAGAC --/AG GGGGATTTCT 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 AG 0 1 311328 CASAVA_Build 2 194081477 1D AACTTCATCT G/- TATATACAGC 3070 het 3070 ref 38 18 9 11 G 1 0 311329 CASAVA_Build 2 194083869 1I ATAAAGGAAG -/T TTTTAGAAGC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 4 5 311330 CASAVA_Build 2 194085025 4I TAGAAAGTTT ----/ATTA ATTAAAATAA 2995 het 2995 ref 22 10 8 4 ATTA 1 2 311331 CASAVA_Build 2 194086040 5D CCTAATAAAA TAAAT/----- TAGTCCTTTG 3070 het 3070 hom 42 18 23 2 TAAAT 1 0 311332 CASAVA_Build 2 194086517 1I GAGATAAGTT -/A AATCAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 2 3 311333 CASAVA_Build 2 194092269 1I ATTGCAGGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 9 10 311334 CASAVA_Build 2 194092531 3I CCATAACTAA ---/TCT TCTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 TCT 1 2 311335 CASAVA_Build 2 194093042 2D TAAGAATTTT TA/-- GGAAAACTGT 2569 het 2569 ref 32 22 6 4 TA 1 0 311336 CASAVA_Build 2 194093119 1I CCCATCTATC -/T TGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 1 2 311337 CASAVA_Build 2 194129249 2D CAAGAAAATC AT/-- ATTGTTTCTA 2449 het 2449 ref 12 6 5 1 AT 2 1 311338 CASAVA_Build 2 194157616 1I CTTGGCATAG -/C CCCATTCAGC 3070 hom 132 het 51 0 44 7 C 3 4 311339 CASAVA_Build 2 194163483 4I CTATAAATGC ----/ATAT ATATATATAT 2028 het 2028 ref 15 6 5 4 AT 7 9 311340 CASAVA_Build 2 194171270 3D AATCTGAGGC AGA/--- AGACTTGCTT 3070 het 3070 ref 19 9 7 3 AGA 2 1 311341 CASAVA_Build 2 194171491 1D AAACTCTTTC A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 7 6 311342 CASAVA_Build 2 194172305 6I TAACCACAAA ------/TAAAAT TAAATGCCTA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 TAAAAT 0 1 311343 CASAVA_Build 2 194173957 4D AACAATAGTT AGAA/---- AGAATAAATA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 AGAA 2 1 311344 CASAVA_Build 2 194175702 4D GTGGAATTGA GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 1485 hom 20 7 12 1 GTTT 4 3 311345 CASAVA_Build 2 194176060 1I TCCCATAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 10 11 311346 CASAVA_Build 2 194201374 1I GAAAAGCATC -/G GGAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 G 2 3 311347 CASAVA_Build 2 194203847 3I ATAGACTAAA ---/AAT AAAGGGACAG 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 AAT 0 1 311348 CASAVA_Build 2 194210771 4D CACTTATATT ATAA/---- ATGATTGTAA 3070 het 3070 ref 36 18 17 2 ATAA 1 0 311349 CASAVA_Build 2 194211021 2I TGTTATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 AC 8 9 311350 CASAVA_Build 2 194215946 1I AAGATTCTCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 7 8 311351 CASAVA_Build 2 194218225 1I TACAGGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 10 11 311352 CASAVA_Build 2 194224184 1D TTAAAACATT A/- AAGAGGTCAA 3070 het 3070 hom 41 12 22 8 A 3 2 311353 CASAVA_Build 2 194231316 4D ACAAAAAAGG AAGA/---- AAGAGTGGTA 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 AAGA 2 1 311354 CASAVA_Build 2 194237903 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1097 het 1097 ref 36 24 3 9 A 12 11 311355 CASAVA_Build 2 194238782 3I CAAAAGAAAA ---/ACT ACTAATTGGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 ACT 1 2 311356 CASAVA_Build 2 194239885 1D ACAAATATCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 9 8 311357 CASAVA_Build 2 194257325 1D AGGCAACCTC T/- TCTCTCATTC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 2 1 311358 CASAVA_Build 2 194270520 5I ATATAAAATA -----/TATAT TATATTATGT 1820 het 1494 hom 9 3 4 2 TATAT 1 2 311359 CASAVA_Build 2 194272366 1D AGAAACCCCT C/- CCCCCCCAAA 2753 het 2136 hom 24 10 7 7 C 8 7 311360 CASAVA_Build 2 194306247 2I CATTTTACAG --/AA ATGAATAGAA 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 A 1 3 311361 CASAVA_Build 2 194319336 1I TTCTAGTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 9 10 311362 CASAVA_Build 2 194322837 2D AGCTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3022 hom 29 9 13 7 A 12 10 311363 CASAVA_Build 2 194325446 4I TTTGATATAA ----/TCAT TGATTTTCCT 3070 hom 80 het 29 0 27 2 TCAT 0 1 311364 CASAVA_Build 2 194325762 2D ACATCTTTTG AA/-- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 10 8 311365 CASAVA_Build 2 194330532 1D ATTTCTAAAA T/- TTCCATTTAA 3070 het 3070 hom 47 21 19 8 T 3 2 311366 CASAVA_Build 2 194331767 1D ATCCCACCTT A/- AAAAAAAAAA 3016 het 1411 hom 29 8 10 11 A 17 16 311367 CASAVA_Build 2 194334418 2D TCATAAGTGG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 26 hom 31 2 23 6 T 11 9 311368 CASAVA_Build 2 194343572 2D TAATTTTAAC TT/-- AATATTTTAT 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 T 2 0 311369 CASAVA_Build 2 194344139 3D ATTCACATGT TAA/--- TAAACTATCA 3070 het 3070 hom 26 12 12 4 TAA 2 1 311370 CASAVA_Build 2 194369667 2D CTAAATGTTG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 AT 6 5 311371 CASAVA_Build 2 194381122 2D TAGAAATAAC AT/-- ATCTATATAT 1180 het 1180 ref 12 7 3 2 AT 2 1 311372 CASAVA_Build 2 194402213 12I TTTACGCTTG ------------/ACTTTACGCTAA ACTGTATTTG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ACTTTACGCTAA 0 1 311373 CASAVA_Build 2 194414863 1D TTTATATCTC T/- TGTTTCTAGT 3070 hom 102 het 41 0 35 9 T 2 1 311374 CASAVA_Build 2 194416516 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 2855 het 2855 ref 25 16 7 2 A 10 9 311375 CASAVA_Build 2 194422459 2D ATTTTAGAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 27 0 22 5 A 14 12 311376 CASAVA_Build 2 194425548 1D ATAAGTAACC T/- TTATTTGTCC 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 T 3 2 311377 CASAVA_Build 2 194440048 1I CAACACACCT -/A AAAAAAAAAA 2791 het 180 hom 22 1 12 9 A 10 11 311378 CASAVA_Build 2 194442686 12I ATGTTATGGG ------------/TGCCAGTAAATA TACAAGGTGG 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 TGCCAGTAAATA 0 1 311379 CASAVA_Build 2 194443410 1D GGTAATATTT A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 A 8 7 311380 CASAVA_Build 2 194448680 1I TAGAAGGCCA -/T TTTTTTTTAA 2724 het 2724 ref 30 17 9 4 T 8 9 311381 CASAVA_Build 2 194455828 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3041 hom 20 9 9 2 A 11 12 311382 CASAVA_Build 2 194458706 5I GAGAGCAAAG -----/AATAA AATAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 AATAA 1 2 311383 CASAVA_Build 2 194461523 1D AATGGAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1312 hom 27 7 13 8 A 17 16 311384 CASAVA_Build 2 194461841 1D AGAGACAAAT A/- ACGAAAAAAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 2 1 311385 CASAVA_Build 2 194468130 1I CTGTAGTTCT -/C AGCTTATTCT 3070 het 3070 ref 55 28 22 5 C 0 1 311386 CASAVA_Build 2 194473635 1D ATATATAGTT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 159 hom 28 4 13 12 C 13 12 311387 CASAVA_Build 2 194484698 1D TTTATTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 T 12 11 311388 CASAVA_Build 2 194493777 1D GTGGGAGTGT A/- AATTAGTTCA 3070 het 3070 ref 44 29 11 6 A 3 2 311389 CASAVA_Build 2 194496104 1I ATTGCACACA -/T TGCGCAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 1 2 311390 CASAVA_Build 2 194496562 2I TGAGTCCTGA --/CT CTGTCAGTTA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 CT 1 2 311391 CASAVA_Build 2 194506352 2D GTATATAATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 TG 11 10 311392 CASAVA_Build 2 194512135 11D TCTTGCATGT TCCCTTAAGTA/----------- TCCCTTAAGT 3070 het 3070 ref 40 20 14 9 TCCCTTAAGTA 2 1 311393 CASAVA_Build 2 194519068 1D CATAATAGCC A/- AAAACTAGTG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 5 4 311394 CASAVA_Build 2 194534431 1D ACAAGTCATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 T 10 9 311395 CASAVA_Build 2 194541835 2I CTTTTTTCTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 T 9 11 311396 CASAVA_Build 2 194544629 1I AATTTCTATT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 6 7 311397 CASAVA_Build 2 194551504 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 12 0 11 2 A 10 9 311398 CASAVA_Build 2 194554836 1I AAGAAGCAGG -/T TTTTACCCTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 4 5 311399 CASAVA_Build 2 194570696 1I TCTGATCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 A 10 11 311400 CASAVA_Build 2 194573006 4D ATCTGTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 35 0 29 8 T 16 12 311401 CASAVA_Build 2 194608131 1D TTTGGCAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 12 3 A 11 10 311402 CASAVA_Build 2 194609509 2D AAGCCAGCAG AA/-- ATGGTGAGCA 3070 hom 105 het 40 0 35 8 A 3 1 311403 CASAVA_Build 2 194610567 2D AAGCATATGC AT/-- ATATGTGTGT 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 AT 3 2 311404 CASAVA_Build 2 194612546 1I CTTTGAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 496 hom 32 2 21 9 A 12 13 311405 CASAVA_Build 2 194614012 2D AAACATACTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 21 0 13 9 TA 9 8 311406 CASAVA_Build 2 194622786 8D ACATATATAC ATGTGCAT/-------- ATATACATGT 316 het 316 ref 9 4 3 5 ATGTGCAT 1 0 311407 CASAVA_Build 2 194623661 1I TACAGAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 A 10 11 311408 CASAVA_Build 2 194627712 1D60M1D CAGGGTCTTT AAAAAAAATAGTACAATAAAAATAAAGGTTATTAGTCTGTCTTGTGACTTTTGTCCAGACTC/-AAAAAAATAGTACAATAAAAATAAAGGTTATTAGTCTGTCTTGTGACTTTTGTCCAGACT- AAAAAGACTG 3070 het 305 hom 39 1 49 6 N/A 0 0 311409 CASAVA_Build 2 194628315 1I AATAAGGTAT -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 7 8 311410 CASAVA_Build 2 194628903 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 21 0 16 6 A 15 14 311411 CASAVA_Build 2 194640847 1D TCCTAACATA C/- TTGATGCACT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 C 1 0 311412 CASAVA_Build 2 194649644 2I TATCAAAAAA --/AC ACATATACTC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AC 1 2 311413 CASAVA_Build 2 194653184 1D GTTGTTTATA T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 7 6 311414 CASAVA_Build 2 194659419 1D CCTCTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 505 hom 42 4 25 13 T 12 11 311415 CASAVA_Build 2 194664626 2D AACGAATGAC TG/-- TATTTTACAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 TG 1 0 311416 CASAVA_Build 2 194664866 9I TCTTTTTTGA ---------/GTTATATTT GTATGGATAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 GTTATATTT 0 1 311417 CASAVA_Build 2 194664949 6I ATTATCTGTC ------/ATAATT ATAGTTATGC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATAATT 0 1 311418 CASAVA_Build 2 194668802 3I ACAACAACAA ---/CAG CAACAACAAA 3070 hom 137 het 54 0 46 8 CAG 0 1 311419 CASAVA_Build 2 194671376 1D TTACAATTAA T/- TTTTTTTTTT 2144 het 2144 ref 28 17 5 6 T 13 12 311420 CASAVA_Build 2 194672597 4D CTCTCGTTAA TCTG/---- TCTTTGTTGT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 TCTG 1 0 311421 CASAVA_Build 2 194689579 1I CATAAAGAAT -/A AAATTTTTCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 3 4 311422 CASAVA_Build 2 194701663 1I AGCTGAAAAA -/G CACCATAAGT 3070 hom 106 het 44 0 34 10 G 0 1 311423 CASAVA_Build 2 194710121 1I AATGAAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 10 11 311424 CASAVA_Build 2 194711003 1I ATATGTAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 616 hom 34 2 28 4 T 9 10 311425 CASAVA_Build 2 194726955 1I TTGAGATTTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 311426 CASAVA_Build 2 194736408 2D73M2I TGGGCAAAAA AGAGGGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAGATAAAAAAGTACATTTGGAGAAAATAGACAAAGCAGAGAAGAGTAAAC--/--AGGGGGAGAGAGAGAAAGAGAGAAGATAAAAAAGTACATTTGGAGAAAATAGACAAAGCAGAGAAGAGTAAACTT TTGAAATATT 3070 hom 57 het 32 1 52 10 N/A 0 0 311427 CASAVA_Build 2 194737228 2D TGTGCTCTAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 108 het 48 0 37 12 AC 8 7 311428 CASAVA_Build 2 194738628 4I TCTAAACAAT ----/GTCA GTCATAGAAC 3070 hom 72 het 33 0 25 8 GTCA 1 2 311429 CASAVA_Build 2 194738976 1I AATATGAAGC -/A ATAGAGCATG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 1 2 311430 CASAVA_Build 2 194739323 2I ACACACACAG --/AC ACACACATAC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AC 3 4 311431 CASAVA_Build 2 194740256 2I CAAATGTCAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 AT 6 7 311432 CASAVA_Build 2 194742165 11I CAGCCTGCCC -----------/TCTAAGATCTT TCATTCGTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TCTAAGATCTT 0 1 311433 CASAVA_Build 2 194743439 1D TTTTTCTGAA C/- TTTTAATGTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 1 0 311434 CASAVA_Build 2 194744138 4D ATACTTCAAA TACT/---- TACTAGTATG 3070 hom 90 het 33 0 31 4 TACT 2 1 311435 CASAVA_Build 2 194744338 1D AATGTCTTTG A/- AAAAAATCAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 7 6 311436 CASAVA_Build 2 194745181 2I CCAGTGAATT --/TG ATATATAATG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TG 0 1 311437 CASAVA_Build 2 194746957 4I AAGTATAATA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AAAT 2 3 311438 CASAVA_Build 2 194747271 2D GAACTGAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 35 0 24 11 T 14 12 311439 CASAVA_Build 2 194750482 1D CTTTAAATGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 T 9 8 311440 CASAVA_Build 2 194752927 2D ATGTAATGTG TT/-- TATTTATAAA 2896 hom 15 het 6 0 6 0 T 3 1 311441 CASAVA_Build 2 194753208 4I ATATACACAC ----/ATAA ATATATATAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 ATAA 0 1 311442 CASAVA_Build 2 194755036 1D ATAATTCTTC T/- TTTGACCTCG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 3 311443 CASAVA_Build 2 194757666 4D AATTAATAAT AAAG/---- AAAATGCCTT 3070 hom 36 het 20 0 13 8 AAAG 1 0 311444 CASAVA_Build 2 194761408 1I CTACCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 27 1 21 5 A 10 11 311445 CASAVA_Build 2 194761549 2D TTAATGTAGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 35 0 28 7 T 11 9 311446 CASAVA_Build 2 194762385 2D TTTGGAAGAC TT/-- TTATTGCTGA 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 T 4 2 311447 CASAVA_Build 2 194763382 2D53M2D TAATATTTGC TATATATATATATATATATATATCTATATATATAGATAGATATACACACACATACAT/--TATATATATATATCTATATATCTATATATATAGATAGATATACACACACATAC-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 20 0 17 13 N/A 0 0 311448 CASAVA_Build 2 194764407 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 14 13 311449 CASAVA_Build 2 194772158 1D GGAAGAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 11 10 311450 CASAVA_Build 2 194775123 1D CTCCTACCTT C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 59 het 30 0 21 9 C 9 8 311451 CASAVA_Build 2 194776487 1D AAATTCTGTG A/- AAAAATGACT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 6 5 311452 CASAVA_Build 2 194778171 1I CAGAAGCAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 29 2 17 10 T 13 14 311453 CASAVA_Build 2 194779563 1I TAAAAAAAAA -/T ATTGTTTCTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 311454 CASAVA_Build 2 194783532 1I TCATTGGAAT -/A AATAACTCAA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 2 3 311455 CASAVA_Build 2 194790177 1D ACTTTGAGTG A/- ATCAAAAGTA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 2 1 311456 CASAVA_Build 2 194794366 1I CATTTTATTC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 311457 CASAVA_Build 2 194795947 4I AACTTTCTTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TTTC 2 3 311458 CASAVA_Build 2 194796859 3D TAATAATAAC ATA/--- ATAATTATTA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 ATA 2 1 311459 CASAVA_Build 2 194811406 1D TTCATTTCCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 254 hom 41 1 37 5 T 10 9 311460 CASAVA_Build 2 194822998 1I ACTATTATTA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 7 8 311461 CASAVA_Build 2 194830916 1D CGTCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 2694 het 1549 hom 20 11 7 2 A 16 15 311462 CASAVA_Build 2 194853409 1I TGCCATAAGA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 7 8 311463 CASAVA_Build 2 194863632 4D AGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 1709 het 438 hom 27 7 5 16 TA 9 7 311464 CASAVA_Build 2 194875170 1D AGAGAAGGCC A/- AAACAACTGC 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 A 4 3 311465 CASAVA_Build 2 194890096 1D AACTTTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 11 10 311466 CASAVA_Build 2 194914211 1I AAACTCCCAG -/T TGTTAAGTGG 3070 het 3070 ref 59 31 20 8 T 1 2 311467 CASAVA_Build 2 194915879 2I12M2I TTTTTTTTTC --TTTTTTTTGTAC--/TTTTTTTTTTGTACAT ATGTCTTCAC 3070 hom 72 het 32 0 25 12 N/A 0 0 311468 CASAVA_Build 2 194927875 12D3M3D AAAATAGCTG TTTTGAGGAAACTCAAAG/------------TCA--- AAATTCAAGG 3070 hom 93 het 31 0 32 4 N/A 0 0 311469 CASAVA_Build 2 194929641 3D TCTGAGCAAG AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAC 5 4 311470 CASAVA_Build 2 194931234 3D AAAAAAAAAT ATG/--- TTTTTTTTTT 3070 het 300 hom 16 2 9 6 ATG 1 0 311471 CASAVA_Build 2 194934905 1D GGTTCTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 13 12 0 T 11 10 311472 CASAVA_Build 2 194938849 2D AAGGTGAAAC AT/-- GGGAAGGAAA 3070 het 3070 ref 32 22 8 4 AT 1 0 311473 CASAVA_Build 2 194956286 4D CATGTAAAAC TGTT/---- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TGTT 2 1 311474 CASAVA_Build 2 194962571 4I AAGGACTGAA ----/TCTT TCTTTGGTAC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 TCTT 1 2 311475 CASAVA_Build 2 194987859 1I CTACAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 296 hom 36 1 28 7 A 11 12 311476 CASAVA_Build 2 194989778 2D TTTTTAACTC TG/-- TATGCATTTT 2661 het 2661 ref 18 11 6 1 TG 1 0 311477 CASAVA_Build 2 195009770 2D ACACACACAC AT/-- GTATATATAT 3070 hom 102 het 37 0 32 6 AT 1 0 311478 CASAVA_Build 2 195011970 1D CAAAACTGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 10 9 311479 CASAVA_Build 2 195014669 1D TTTAAAATAG T/- TTTTTTTTTT 2021 het 2021 ref 29 20 5 5 T 12 11 311480 CASAVA_Build 2 195015017 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 37 2 25 10 A 13 12 311481 CASAVA_Build 2 195043121 1I GCCTTCTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 460 hom 27 1 20 6 A 10 11 311482 CASAVA_Build 2 195048751 1D ATGTTCTTTG A/- AAAACAACGA 3070 hom 33 het 15 0 12 4 A 5 4 311483 CASAVA_Build 2 195050161 1I CTGTTTTTCC -/G TATGATTTTA 3070 hom 113 het 40 0 36 4 G 0 1 311484 CASAVA_Build 2 195053181 1D CTTTTGGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 37 2 30 5 A 12 11 311485 CASAVA_Build 2 195055256 1D CCTTAAACTG T/- TAAGTGGGAG 3070 hom 111 het 44 0 37 8 T 2 1 311486 CASAVA_Build 2 195060721 2D ACATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 16 0 12 5 AT 7 6 311487 CASAVA_Build 2 195061803 1I GATAGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 26 1 16 9 A 11 12 311488 CASAVA_Build 2 195064314 1I TTGATACATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 487 hom 36 2 31 3 A 10 11 311489 CASAVA_Build 2 195064901 2I TATGTATGCT --/TA TGTGTGTGTG 2690 het 2690 ref 39 17 16 6 TA 0 1 311490 CASAVA_Build 2 195074498 2I AGCCTGGTGA --/GT GTGTATATGT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 GT 2 3 311491 CASAVA_Build 2 195082590 1D CCAAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2449 hom 23 8 9 6 T 13 12 311492 CASAVA_Build 2 195083416 1D TTCAAATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 40 3 10 28 T 17 16 311493 CASAVA_Build 2 195089993 2I AATGTTGTAC --/AT ATATATATGA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 AT 4 5 311494 CASAVA_Build 2 195094151 10I CCCTTCCTTT ----------/GACACTGTCC GACACTGTCC 2229 het 2229 ref 26 11 7 8 GACACTGTCC 1 2 311495 CASAVA_Build 2 195104571 1D TGGTGATGAT A/- ACAACAACAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 A 2 1 311496 CASAVA_Build 2 195119481 1D TGTAACAAAA T/- ATCACATGTA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 1 0 311497 CASAVA_Build 2 195140939 1I CCTGAAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2887 hom 29 7 16 6 T 10 11 311498 CASAVA_Build 2 195146840 1D CTTTTGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 25 0 9 16 T 11 10 311499 CASAVA_Build 2 195174645 9D TTAGGTTTTT CTATTGTTA/--------- CTATTGTTAA 3070 het 3070 hom 30 14 11 8 CTATTGTTA 2 1 311500 CASAVA_Build 2 195175270 1D AATTTTTTCT G/- GGGTCCCCTT 3070 het 3070 hom 32 10 14 9 G 4 3 311501 CASAVA_Build 2 195178839 7I GCCCAGGACC -------/CCATAAG CCATAAGCCT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 CCATAAG 1 2 311502 CASAVA_Build 2 195180561 1D TTAAAGAAAA G/- AATAAAAGCT 1833 het 1833 ref 25 15 6 4 G 1 0 311503 CASAVA_Build 2 195185451 3I ATCATGAGTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 49 16 20 13 TTG 5 6 311504 CASAVA_Build 2 195191208 3D GTTGGTAACT ACC/--- ACAACAGAGC 3070 het 3070 ref 42 23 18 2 ACC 1 0 311505 CASAVA_Build 2 195194510 1I AGGGTGGAGT -/G GGAGTGGCTT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 G 2 3 311506 CASAVA_Build 2 195196139 2I GTTTCTTCTG --/TT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 8 10 311507 CASAVA_Build 2 195196353 1I TGAAGCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 7 17 6 A 10 11 311508 CASAVA_Build 2 195198397 1I AAAAAAACAA -/G CTCACGCTGA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 G 0 1 311509 CASAVA_Build 2 195202270 2D TTTTATTTTT TA/-- TGTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 TA 1 0 311510 CASAVA_Build 2 195206032 1I CATCTGCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 10 11 311511 CASAVA_Build 2 195209629 4D TTAAAAAGAT AATA/---- AATAGACTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AATA 2 1 311512 CASAVA_Build 2 195212986 6D3M3I CCAAGGGAGC TAAAAAACT---/------ATTGGG TGAAAAAAGA 2448 het 2448 ref 18 8 8 2 N/A 0 0 311513 CASAVA_Build 2 195223134 2D TTGTTTCTGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 93 het 43 0 31 12 TC 8 7 311514 CASAVA_Build 2 195230981 1D TGATTGCTTA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 T 8 7 311515 CASAVA_Build 2 195238669 3I GACTCTGATT ---/TTC TTCTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTC 1 2 311516 CASAVA_Build 2 195249589 1D TGCATATAAT A/- ATTATAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 2 1 311517 CASAVA_Build 2 195253729 1I GCATGTTATG -/T TTTATTCCCA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 T 3 4 311518 CASAVA_Build 2 195256243 1I TCTTATCCTG -/T TTTTTGGACA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 5 6 311519 CASAVA_Build 2 195262054 2D GATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 47 het 22 0 15 9 TA 8 7 311520 CASAVA_Build 2 195264444 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAATCCC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 7 6 311521 CASAVA_Build 2 195265894 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 50 het 20 0 18 2 A 7 8 311522 CASAVA_Build 2 195269230 1D TTTTTCAATT C/- CCCCAACAGT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 C 5 4 311523 CASAVA_Build 2 195274192 1D CAGGTATATG A/- AAAAAATGTC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 A 7 6 311524 CASAVA_Build 2 195277428 4I TAGTTTAAAC ----/AATA AATTGCAATT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AATA 0 1 311525 CASAVA_Build 2 195278180 1D TAATGAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 33 0 22 11 T 14 13 311526 CASAVA_Build 2 195283851 1D CAAAAAAACG A/- AAAAAAAAAA 2068 het 2068 ref 51 38 7 6 A 11 10 311527 CASAVA_Build 2 195297297 1I TATTAAACAG -/A AAAAAAAAAA 1793 het 1793 ref 41 32 4 5 A 11 12 311528 CASAVA_Build 2 195335964 1I CCATGCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1192 hom 29 4 13 12 T 15 16 311529 CASAVA_Build 2 195351515 2I TAAAAATACC --/TA TGTCTCTATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TA 0 1 311530 CASAVA_Build 2 195353448 1I CTAAGATATG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 8 9 311531 CASAVA_Build 2 195364946 1D CAGTTATGGT A/- AAAAAAAAAA 1796 het 1796 ref 40 30 5 5 A 11 10 311532 CASAVA_Build 2 195368324 1I CTTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 33 1 27 5 A 10 11 311533 CASAVA_Build 2 195368638 4D TCAAAATTTC ATAA/---- ATAATCTCCT 3070 hom 96 het 35 0 33 5 ATAA 2 1 311534 CASAVA_Build 2 195381013 1D AAGATACTAA C/- ATGAGCGGAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 1 0 311535 CASAVA_Build 2 195382145 1I TAGATGCAAT -/A AAAAAATGAT 1471 hom 7 het 3 0 3 0 A 6 7 311536 CASAVA_Build 2 195396028 4I TATAGACTTT ----/TTTA TTTATTATTT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TTTA 1 2 311537 CASAVA_Build 2 195397314 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAGCCAT 3070 hom 13 het 30 1 29 0 A 6 5 311538 CASAVA_Build 2 195407341 1I AAAAAAGAGG -/A AAGAAAAGAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 3 311539 CASAVA_Build 2 195411477 2D CAGATGGGTC TT/-- TTTTTTTTCA 3070 hom 144 het 52 0 49 4 T 10 8 311540 CASAVA_Build 2 195420590 1D ATCAAAAAGC A/- TGTGCAAGAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 1 0 311541 CASAVA_Build 2 195422510 3D TGGGATTACA GGC/--- GTGAGCCACC 3070 hom 36 het 16 0 13 4 GGC 1 0 311542 CASAVA_Build 2 195424381 1D GGTTGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 T 11 10 311543 CASAVA_Build 2 195445145 4D GTACCTTGTT AGAA/---- AGAATTAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 6 AGAA 2 1 311544 CASAVA_Build 2 195446272 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 575 hom 26 2 20 4 A 12 13 311545 CASAVA_Build 2 195454206 5D GCAAAATGTG TACCA/----- TACATCAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 11 9 TACCA 1 0 311546 CASAVA_Build 2 195464057 4I TCTGTCTCCA ----/TTTG TGGAATCACC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TTTG 0 1 311547 CASAVA_Build 2 195472959 1I TAAATGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 20 18 14 A 10 11 311548 CASAVA_Build 2 195476645 1D CCATGTAGAA G/- TTGACTTAGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 G 1 0 311549 CASAVA_Build 2 195478415 1I ATGTTTTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 13 27 3 T 7 8 311550 CASAVA_Build 2 195481849 1D TACTAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1923 hom 28 4 18 6 A 12 11 311551 CASAVA_Build 2 195489791 1D CAAATGTCTT A/- ACCTTTGATT 3070 hom 93 het 40 0 32 9 A 2 1 311552 CASAVA_Build 2 195490801 1I CCTTGCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2876 hom 26 9 11 6 A 11 12 311553 CASAVA_Build 2 195504538 1I AAAGTAACAC -/A ATATGATATC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 1 2 311554 CASAVA_Build 2 195508275 7D GGGTTTTAAG ACACTTT/------- ACACTTTATA 3070 hom 150 het 54 0 50 6 ACACTTT 2 1 311555 CASAVA_Build 2 195511672 5I TATTTCTGCC -----/TTCAT TTCATTATTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TTCAT 1 2 311556 CASAVA_Build 2 195513757 1I CTCAGGATAC -/A AAATCACTGT 2140 het 2140 ref 16 11 5 0 A 3 4 311557 CASAVA_Build 2 195514616 1I TCTGCACAGC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 A 8 9 311558 CASAVA_Build 2 195516293 4I GCTTATAGAC ----/ATTT ATCCATTCAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ATTT 0 1 311559 CASAVA_Build 2 195520480 1I AATTGTATGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 9 10 311560 CASAVA_Build 2 195538600 1D TAGATACCCT A/- ACCATCTCTC 1929 het 1929 ref 15 7 5 3 A 2 1 311561 CASAVA_Build 2 195542792 1D TTTATTTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 10 9 311562 CASAVA_Build 2 195546138 1I AGACTCTTTT -/G GTTGCCATTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 G 1 2 311563 CASAVA_Build 2 195568400 1I ATGTTGAGCA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 7 8 311564 CASAVA_Build 2 195572987 1I TGGCACTCCT -/C CTAAGTATAC 3070 het 3070 ref 42 21 20 1 C 1 2 311565 CASAVA_Build 2 195573095 1I ACAGCCATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 9 10 311566 CASAVA_Build 2 195576989 4D AAAATGAATG CAGT/---- CAGTATTTCA 3070 het 3070 ref 39 17 16 9 CAGT 2 1 311567 CASAVA_Build 2 195583552 2I GCAAAATGGG --/TT TATTACTAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 1 3 311568 CASAVA_Build 2 195588099 1D AGAAAAGAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 A 9 8 311569 CASAVA_Build 2 195590316 1D CTGTCACATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 10 9 311570 CASAVA_Build 2 195592704 15D ATGTGTGCCC CCCAACTTTCTCCTA/--------------- CACAATAGTG 3070 het 3070 ref 25 13 11 10 CCCAACTTTCTCCTA 1 0 311571 CASAVA_Build 2 195595951 2D TATGTAATAT TA/-- TATATATATG 3070 het 1413 hom 26 8 11 7 TA 5 4 311572 CASAVA_Build 2 195599523 7I CTTAGCTATG -------/GTGCTCA ATTCATCATT 3070 het 3070 hom 57 26 26 5 GTGCTCA 0 1 311573 CASAVA_Build 2 195638100 1I CTAAAAAAAA -/T AAATAAATAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 0 1 311574 CASAVA_Build 2 195640486 1D TCCATATTTC T/- TTTTTTTTTT 2156 hom 15 het 6 0 6 0 T 15 14 311575 CASAVA_Build 2 195657015 3D CTTATCAGTA CTT/--- CTTCTCATCA 3070 hom 102 het 37 0 34 5 CTT 2 1 311576 CASAVA_Build 2 195662996 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 10 11 311577 CASAVA_Build 2 195664952 2D TGTAGTTAAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 84 het 32 0 29 5 AT 6 5 311578 CASAVA_Build 2 195666920 1D AAGCCATTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 T 9 8 311579 CASAVA_Build 2 195671978 1D GCACATTCAA C/- AAAAATGAAA 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 C 1 0 311580 CASAVA_Build 2 195678002 4D GCCATAGATC TTAG/---- TTGAGAAGCT 3070 het 3070 hom 46 17 25 8 TTAG 1 0 311581 CASAVA_Build 2 195688623 1D CATTTTTCCC T/- GCCCTTGTTA 3070 hom 159 het 58 0 52 6 T 1 0 311582 CASAVA_Build 2 195699968 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 10 11 311583 CASAVA_Build 2 195702956 9I AAGCGCTTTA ---------/AACACTAAT AACACTAATA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 AACACTAAT 1 2 311584 CASAVA_Build 2 195706562 1I ATAATTTTGC -/A AAAAAGCTAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 5 6 311585 CASAVA_Build 2 195712229 1D CTGCCTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 35 0 28 7 A 13 12 311586 CASAVA_Build 2 195712918 4I TCTACCTGAT ----/AGAC AGGTGTTAGA 3070 hom 150 het 55 0 50 5 AGAC 0 1 311587 CASAVA_Build 2 195727606 1D AAGATAAATG A/- ATGAATAAAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 2 1 311588 CASAVA_Build 2 195731026 1D GGCCTGTTGT G/- GGGTGGGGGG 2299 hom 12 het 6 0 5 1 G 4 3 311589 CASAVA_Build 2 195733311 4D AAATGGTAAC ATAT/---- GTGTGTGATG 3070 hom 84 het 31 0 28 4 AT 2 0 311590 CASAVA_Build 2 195742439 2D CGTCTATCTA TC/-- TCTGTTAACA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TC 2 1 311591 CASAVA_Build 2 195745185 2D3M1I CAAAAATTAT AAGTC-/--GTCT AATTATGATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 N/A 0 0 311592 CASAVA_Build 2 195745948 16I CACTTCACAT ----------------/AATTCCTCAATGTTGG AATACTCTCC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 AATTCCTCAATGTTGG 0 1 311593 CASAVA_Build 2 195746425 3I CCATTTAACC ---/CAG CAACCCCATT 3070 hom 105 het 47 0 36 11 CAG 0 1 311594 CASAVA_Build 2 195746991 2D GAATGTGTAC AG/-- ACTTTTTCTT 3070 hom 57 het 23 0 20 6 AG 1 0 311595 CASAVA_Build 2 195748349 1D CACCACATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 9 8 311596 CASAVA_Build 2 195753124 4D ATATTTCTTC TCTT/---- TTTTTCTTTG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TCTT 1 0 311597 CASAVA_Build 2 195754608 2I TAAATTGCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TC 0 1 311598 CASAVA_Build 2 195756428 1I CCAAGGGGGG -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 8 311599 CASAVA_Build 2 195759168 4I TTATAAATCA ----/CACT CACTCTTTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 CACT 1 2 311600 CASAVA_Build 2 195760473 1D ACATCTGCAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 93 het 38 0 31 8 A 9 8 311601 CASAVA_Build 2 195762003 1D TCTCTTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 10 9 311602 CASAVA_Build 2 195765194 1D TGACACCAAA C/- AAAAAGATTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 1 0 311603 CASAVA_Build 2 195766129 2I AGACTCCCCT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 41 het 21 0 13 8 A 9 11 311604 CASAVA_Build 2 195766446 5I AACAACTGGA -----/ACAAG ACAAGGACAC 3070 hom 129 het 45 0 43 2 ACAAG 1 2 311605 CASAVA_Build 2 195768574 4I GCAATCCCAC ----/TATT TATATGTACC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TATT 0 1 311606 CASAVA_Build 2 195769579 1D AATTTATCTA G/- ACAAATTAAC 3070 hom 102 het 41 0 34 8 G 1 0 311607 CASAVA_Build 2 195769684 1D TACCAAAATG T/- TGTTAGTTCT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 2 1 311608 CASAVA_Build 2 195770370 1D GATGAGTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 582 hom 29 2 19 8 A 13 12 311609 CASAVA_Build 2 195783013 2D CCTTAAAGGC AG/-- AGAGAGAGAG 928 het 928 ref 39 25 3 12 AG 9 8 311610 CASAVA_Build 2 195792192 1D TCTTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1849 het 1849 ref 28 17 6 6 T 17 16 311611 CASAVA_Build 2 195795315 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 30 1 22 7 A 12 13 311612 CASAVA_Build 2 195829019 1D TTCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 278 hom 28 1 16 11 T 14 13 311613 CASAVA_Build 2 195829520 4D TTCATCAAAG AATT/---- AATTATTTAT 3070 hom 90 het 33 0 30 5 AATT 2 1 311614 CASAVA_Build 2 195837292 1D TATACCCAGT A/- ATGGGGTCAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 2 1 311615 CASAVA_Build 2 195865350 1I TCATGGAGAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 7 8 311616 CASAVA_Build 2 195880248 1D CTGGAGCTAC A/- GTGACAACAT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 A 1 0 311617 CASAVA_Build 2 195888276 4I TGCCACACAT ----/CATA CATAGGCTAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 CATA 1 2 311618 CASAVA_Build 2 195892929 3D ATTTGTTTAT ACC/--- ACCATTACCG 3070 hom 144 het 52 0 49 3 ACC 2 1 311619 CASAVA_Build 2 195902615 9I CAATCTTTAA ---------/AAAGTCAGG AAACAACAGA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AAAGTCAGG 0 1 311620 CASAVA_Build 2 195952374 1D AAATTTTTTG A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 7 6 311621 CASAVA_Build 2 195957186 3D TATGAGAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 31 9 18 5 AAG 5 4 311622 CASAVA_Build 2 195959289 1I TTGAGGTCTG -/A AACAGCAAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 2 3 311623 CASAVA_Build 2 195961266 1D TCACAGGCCC A/- AGAGGCCAGG 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 A 2 1 311624 CASAVA_Build 2 195968017 1D AGTGGTCAAC A/- AGGATTAGGG 3070 het 3070 ref 36 21 10 6 A 2 1 311625 CASAVA_Build 2 195970889 1D TTCTGTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 27 1 22 4 T 11 10 311626 CASAVA_Build 2 195975572 1D ACTTACTGGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 9 8 311627 CASAVA_Build 2 195981177 1D AAACATCAAG A/- TTTCATATCC 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 A 1 0 311628 CASAVA_Build 2 195995711 2I TCATGTCTCC --/AT AAAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AT 0 1 311629 CASAVA_Build 2 195997191 1D ACTCTATGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 10 9 311630 CASAVA_Build 2 196007838 1D TCTTAGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 12 11 311631 CASAVA_Build 2 196020857 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2686 het 1019 hom 18 6 7 5 A 15 14 311632 CASAVA_Build 2 196025711 1D AGCTTTTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 T 10 9 311633 CASAVA_Build 2 196027123 1I TCCCGTGGTA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 T 7 8 311634 CASAVA_Build 2 196029535 1I AAAATCTTGA -/T TTTTTAAAAA 3070 het 529 hom 25 3 17 5 T 5 6 311635 CASAVA_Build 2 196036181 74D ACTTAGCACA GTGCCCAGCACATAGTAAGTGCTTAATAAACATTATCATTTATTGTTATTGTAATTGGTCTGGCATCCAGCAGG/-------------------------------------------------------------------------- GTATTTACCA 3070 het 3070 ref 47 44 13 11 GTGCCCAGCACATAGTAAGTGCTTAATAAACATTATCATTTATTGTTATTGTAATTGGTCTGGCATCCAGCAGG 1 0 311636 CASAVA_Build 2 196040281 2D TTATTCTATC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 11 9 311637 CASAVA_Build 2 196042764 1I GCTGTCTCCA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 41 11 16 14 T 8 9 311638 CASAVA_Build 2 196046204 1D GGATTAACAA T/- TTTTTTTTTT 1230 het 1230 ref 26 8 3 15 T 19 18 311639 CASAVA_Build 2 196053643 1D TAGATTCACC A/- AAAAAAAAAA 1720 het 1720 ref 40 30 4 6 A 12 11 311640 CASAVA_Build 2 196059387 3I AAAGGCCATG ---/ACT GGGATCCTTT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 ACT 0 1 311641 CASAVA_Build 2 196068252 1D TTTCTCTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 10 9 311642 CASAVA_Build 2 196078949 1D TTCGGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1860 het 1860 ref 31 16 7 8 T 11 10 311643 CASAVA_Build 2 196080632 13D TCCTGGGTGG GGGCCACAGGACT/------------- GGTTGTCAGG 3070 het 3070 ref 46 29 17 3 GGGCCACAGGACT 1 0 311644 CASAVA_Build 2 196118599 3D CATCTCTACT AAA/--- AATACAAAAA 3070 het 2003 hom 19 5 13 1 A 5 2 311645 CASAVA_Build 2 196122871 1I TTTGGGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 921 hom 39 9 21 9 G 0 1 311646 CASAVA_Build 2 196123826 1I TATGTATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 10 11 311647 CASAVA_Build 2 196131430 1I TTTTGCCACT -/C CTCACCACCA 3070 het 3070 ref 63 32 21 10 C 1 2 311648 CASAVA_Build 2 196152579 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1088 hom 21 4 12 5 A 12 13 311649 CASAVA_Build 2 196162202 1D TACTAGAGAT G/- GGGTTTCGCC 2410 het 2410 ref 18 10 7 1 G 4 3 311650 CASAVA_Build 2 196167952 4D TTTTTTAAAG ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 40 20 12 10 ACAA 5 4 311651 CASAVA_Build 2 196177384 1I AGTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 T 11 12 311652 CASAVA_Build 2 196179216 1D AGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1888 hom 33 9 15 9 T 15 14 311653 CASAVA_Build 2 196184062 1D CTTTTTCTAA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 53 het 21 0 18 4 T 7 6 311654 CASAVA_Build 2 196185304 1I GGGTGGATCA -/T TGAGGTCAAG 3070 het 294 hom 17 3 9 5 T 1 2 311655 CASAVA_Build 2 196187741 4D TGAAAAAAAT AGTC/---- AGGCATGGTG 3070 hom 81 het 31 0 27 7 AGTC 1 0 311656 CASAVA_Build 2 196205740 4I CCTCTAAAAT ----/AATC AATTCTGATG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AATC 0 1 311657 CASAVA_Build 2 196223274 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAATTG 1709 het 512 hom 20 3 11 6 A 7 8 311658 CASAVA_Build 2 196223888 2D25M2D AAAGGAGTTT AAAAAAAAAAAAAATCCCAGCTACTGTGG/--AAAAAAAAAAAATCCCAGCTACTGT-- GTGGGGAAGG 3070 hom 78 het 22 0 25 6 N/A 0 0 311659 CASAVA_Build 2 196225632 4I10M1D AGAATAAATT ----GTGTTTCTTAC/GTAAGTGTTTCTTA- CAGACTTTAA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 N/A 0 0 311660 CASAVA_Build 2 196227868 1I AGTATGCAGA -/T GAATCATTTA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 T 0 1 311661 CASAVA_Build 2 196231780 2D TACTGGAAAC AT/-- ATAATATCAG 3070 hom 96 het 35 0 30 6 AT 2 1 311662 CASAVA_Build 2 196235471 2I TCTCAAACTC --/TT GAACTCAAGT 3070 hom 63 het 23 0 21 3 T 0 2 311663 CASAVA_Build 2 196236682 4D AAAAAAAAAG AAAT/---- AAGAGAAAAG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AAAT 1 0 311664 CASAVA_Build 2 196237105 21D AGTTCTTTAA ATTCACTGTAAATATAATTTC/--------------------- ATGGAATATA 3070 hom 62 het 22 0 21 5 ATTCACTGTAAATATAATTTC 1 0 311665 CASAVA_Build 2 196243201 1D CCCTAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 829 hom 31 2 20 9 T 13 12 311666 CASAVA_Build 2 196247835 4D AGTAAATATT TGTA/---- TGTTTAAACA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 TGTA 1 0 311667 CASAVA_Build 2 196249930 3D AATAACATCT TAA/--- TAAGTTTTTC 3070 hom 96 het 33 0 33 2 TAA 2 1 311668 CASAVA_Build 2 196250513 4D AAAAACAAAC AAAA/---- AAAAATCCAC 3070 hom 61 het 26 0 23 4 A 9 5 311669 CASAVA_Build 2 196252218 2D TTTGTAATGA TG/-- TGTGAGGTAA 3070 hom 90 het 39 0 31 9 TG 3 2 311670 CASAVA_Build 2 196256070 2D53M1I TTTTCTGCGT TGTTTTGTTTTTTATTATTTTTTTCTTTCTCCTCTTTAATCAGTTTTAAGCTTAC-/--TTTTGTTTTTTATTATTTTTTTCTTTCTCCTCTTTAATCAGTTTTAAGCTTACT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 28 N/A 0 0 311671 CASAVA_Build 2 196260310 2D AAGGCTTCTG AA/-- AAGATTCTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 2 311672 CASAVA_Build 2 196272371 1D ATCTTACTTG T/- TTTTTTCATG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 7 6 311673 CASAVA_Build 2 196280561 1D ATGGCATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 164 het 62 0 53 9 T 13 12 311674 CASAVA_Build 2 196289541 6I CTGCTATTCT ------/GTCTAG GTTTAAATTA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 GTCTAG 0 1 311675 CASAVA_Build 2 196296716 1D CATTTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 86 hom 34 1 26 9 A 12 11 311676 CASAVA_Build 2 196297005 3D TAAGATTTTC ATA/--- ATGTGTTAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 ATA 1 0 311677 CASAVA_Build 2 196300503 1I TCTTTCTGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 421 hom 34 1 27 6 A 9 10 311678 CASAVA_Build 2 196301896 1D GGACATTTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 10 9 311679 CASAVA_Build 2 196310000 4I CCCAGTTTTA ----/AAAT AAATAAATGC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 AAAT 2 3 311680 CASAVA_Build 2 196310573 2D TCAAATGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 49 0 40 9 T 12 10 311681 CASAVA_Build 2 196310694 4I TTCTTTAGTC ----/TTTA TTTATTTCAG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TTTA 1 2 311682 CASAVA_Build 2 196310828 3I TAAGTAGTAA ---/AAT AATATGCTTT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 AAT 1 2 311683 CASAVA_Build 2 196316770 1D GAAACGTATA T/- TGTGCATTGG 3070 hom 81 het 29 0 28 2 T 2 1 311684 CASAVA_Build 2 196346390 1D GTGCCTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 12 11 311685 CASAVA_Build 2 196347450 3D CCACATTATC CTT/--- CTAATTTTTA 3070 hom 135 het 48 0 46 3 CTT 1 0 311686 CASAVA_Build 2 196354047 1D AGCCCTTGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 10 9 311687 CASAVA_Build 2 196354640 2D AACTAGCAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 114 het 48 0 39 10 AC 8 7 311688 CASAVA_Build 2 196374243 1D CCAAAAGTAC T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 7 6 311689 CASAVA_Build 2 196377036 1D GGGAAGGAGA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 C 8 7 311690 CASAVA_Build 2 196379077 1D CTAATGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 31 1 22 9 T 12 11 311691 CASAVA_Build 2 196398241 1I ATAAATAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 39 0 28 11 A 11 12 311692 CASAVA_Build 2 196408351 2D TGACTGAGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 26 3 13 11 A 19 17 311693 CASAVA_Build 2 196414647 1D TTATTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 10 9 311694 CASAVA_Build 2 196417075 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAACCCA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 6 7 311695 CASAVA_Build 2 196428468 1D CAGACTGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 T 12 11 311696 CASAVA_Build 2 196434233 1I CCAGAACATT -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 7 8 311697 CASAVA_Build 2 196464781 1D CCCCTTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 381 hom 33 1 24 9 A 11 10 311698 CASAVA_Build 2 196497670 1D TCCCTCTAGT A/- ACTCTCACAT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 2 1 311699 CASAVA_Build 2 196501713 4I CATATTTAAC ----/AGAA AGAAACATTA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AGAA 1 2 311700 CASAVA_Build 2 196509350 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 1735 hom 25 7 15 3 A 7 8 311701 CASAVA_Build 2 196608789 1D CCTAGATACA G/- AAAAGCCTGT 3070 hom 87 het 32 0 29 4 G 1 0 311702 CASAVA_Build 2 196616923 6D ACACTGCTAG TGGGAA/------ TGTAAACTAC 3070 hom 48 het 16 0 17 0 TGGGAA 1 0 311703 CASAVA_Build 2 196621761 1D AAACCACCCT A/- GATTGCTCTG 3070 hom 99 het 44 0 34 11 A 1 0 311704 CASAVA_Build 2 196626010 4I TAGAGGAGGT ----/ACAG ACAGTTATTT 3070 hom 147 het 54 0 48 6 ACAG 1 2 311705 CASAVA_Build 2 196640433 4D ATCTGAACTT TTTG/---- TTTTTTGCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 7 TTTG 1 0 311706 CASAVA_Build 2 196643775 2I ACATACATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 197 hom 27 1 21 5 AT 5 6 311707 CASAVA_Build 2 196646487 4D AAAGTCAGTA AAGT/---- ACTAGGGGGT 3070 het 3070 hom 42 17 18 8 AAGT 1 0 311708 CASAVA_Build 2 196653349 1I TCATGCCCTA -/T TTTCATAGCT 3070 het 3070 hom 44 15 18 11 T 3 4 311709 CASAVA_Build 2 196658798 1I AATTGTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 11 12 311710 CASAVA_Build 2 196660920 5D TTACTACTTG GATTT/----- ATTTAAGCCA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 GATTT 1 0 311711 CASAVA_Build 2 196680013 1D TCGAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1711 het 1711 ref 29 14 6 9 T 17 16 311712 CASAVA_Build 2 196695488 1I AGGAAATATA -/T AGTGATTGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 0 1 311713 CASAVA_Build 2 196696457 2D TCTCTGTCAC AG/-- AGAGAGGGGT 3070 hom 80 het 32 0 26 7 AG 4 3 311714 CASAVA_Build 2 196697593 1I CTAAAAAAAA -/T AAAAATAAAA 3070 hom 45 het 16 0 15 1 T 0 1 311715 CASAVA_Build 2 196702947 1D TTCCCTAAGG T/- CCTGTAATGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 6 T 1 0 311716 CASAVA_Build 2 196704837 1I AACAGCAAAC -/T TTTGACCTGC 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 3 4 311717 CASAVA_Build 2 196705222 1D CATTTGAGTC T/- TTTAAGACCG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 4 3 311718 CASAVA_Build 2 196708851 6D TGTATCTATC TATAGA/------ TATATACATA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TATAGA 1 0 311719 CASAVA_Build 2 196713451 1D GGCTAGCTAC A/- AAAACTCATA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 5 4 311720 CASAVA_Build 2 196714889 1D GCTAGAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 15 het 18 0 10 8 A 10 9 311721 CASAVA_Build 2 196716358 5I TACTTTTATT -----/CAATA CATTTCATTT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 CAATA 0 1 311722 CASAVA_Build 2 196716991 1D GCTGAGACTT A/- AAAGAGTATG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 4 3 311723 CASAVA_Build 2 196717165 1D TTAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 12 0 8 4 A 11 10 311724 CASAVA_Build 2 196720272 4I TCAAGAACAG ----/TATC TATCTAGCAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TATC 1 2 311725 CASAVA_Build 2 196731713 10D AGACGTGGTG GCTCATGCCT/---------- GTAATACCAG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 GCTCATGCCT 1 0 311726 CASAVA_Build 2 196755792 1I AAAATCCCCT -/G CTAGTAGCTC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 G 0 1 311727 CASAVA_Build 2 196758910 3I CATGCCCAGC ---/TTT TTTTTTTTTT 1178 het 1178 ref 11 7 3 1 T 11 14 311728 CASAVA_Build 2 196763255 1D TCTCATGGTG T/- TTTTTGGTTT 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 T 6 5 311729 CASAVA_Build 2 196782735 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1419 het 246 hom 17 2 7 9 T 16 14 311730 CASAVA_Build 2 196783758 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 716 het 475 hom 6 1 4 1 T 13 14 311731 CASAVA_Build 2 196785167 1I TGCAATGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 36 1 32 3 T 10 11 311732 CASAVA_Build 2 196799666 1I AGAATTTCTC -/T AATACAAACT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 0 1 311733 CASAVA_Build 2 196800288 1D CAAGCAAACA G/- GGGTTATACA 3070 hom 103 het 40 0 34 8 G 4 3 311734 CASAVA_Build 2 196800536 1D ACCATCAATG C/- CCCCAGGTCA 3070 hom 99 het 35 0 32 3 C 5 4 311735 CASAVA_Build 2 196804750 1D AAGGTCAGGA C/- CATCGAGACC 3070 hom 57 het 23 0 18 6 C 2 1 311736 CASAVA_Build 2 196813736 4I GAATCATTGG ----/TAAA TAGAGTACCC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 TAAA 0 1 311737 CASAVA_Build 2 196813809 1I TTTATCCCAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 9 311738 CASAVA_Build 2 196813983 1I AACAAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 11 311739 CASAVA_Build 2 196822436 1I TGAGGAAAAG -/C GGGGAAAGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 0 1 311740 CASAVA_Build 2 196827942 3D TCTGGTTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 2914 het 381 hom 35 5 14 16 T 17 14 311741 CASAVA_Build 2 196830249 1I TGGAGGGTGA -/G GGGGCGGGGG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 4 5 311742 CASAVA_Build 2 196830405 1I GCAAAAGGGG -/A ACAAAACATA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 A 1 2 311743 CASAVA_Build 2 196831050 1D TTGCCTTCAA G/- GGGGGGGATC 3070 hom 114 het 47 0 37 10 G 8 7 311744 CASAVA_Build 2 196834991 1I TTCAAGTTTA -/T TAATGTATAC 3070 hom 78 het 37 0 27 10 T 1 2 311745 CASAVA_Build 2 196835992 1I TCTTGCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 31 9 T 10 11 311746 CASAVA_Build 2 196843679 1D CCTTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 272 hom 20 1 16 3 T 10 9 311747 CASAVA_Build 2 196844420 1I GCTCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 T 9 10 311748 CASAVA_Build 2 196845863 1D GTAATAACAT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 8 311749 CASAVA_Build 2 196854221 2I CCTGGGAGAA --/AG AGGGTGCTCA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AG 1 2 311750 CASAVA_Build 2 196857834 1I AAAAAAGAAA -/T AATATGGAAA 3070 hom 126 het 53 0 43 10 T 0 1 311751 CASAVA_Build 2 196858495 1I GGAAGTGCTC -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 A 7 8 311752 CASAVA_Build 2 196862269 1D TCATCACTGT G/- GGAAAATAAC 3070 het 3070 ref 41 20 12 10 G 3 2 311753 CASAVA_Build 2 196868264 1I GCAGTGTCAG -/A AAAAAACCTA 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 A 6 7 311754 CASAVA_Build 2 196872135 1I ATGGATCATC -/T TTTTTAGCTA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 5 6 311755 CASAVA_Build 2 196873144 1I TGTCTAGACT -/A GGGGTGGGCA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 0 1 311756 CASAVA_Build 2 196873836 1I TCAGTTGCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 9 10 311757 CASAVA_Build 2 196882591 1I CAATTACCCC -/T ATCTCATTCC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 311758 CASAVA_Build 2 196890665 1D AACAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 11 8 A 11 10 311759 CASAVA_Build 2 196901029 1I TGTACACCAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 7 8 311760 CASAVA_Build 2 196905117 3I GAGAAAAGAG ---/ACC ACCACATGAT 3070 het 3070 hom 44 12 25 7 ACC 1 2 311761 CASAVA_Build 2 196909898 4I AACCACACAC ----/ACAG GCTGGTCACT 3070 het 3070 ref 56 29 21 6 ACAG 0 1 311762 CASAVA_Build 2 196909984 3I TTCAGCAGGA ---/CAT CATCAGTGAA 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 CAT 1 2 311763 CASAVA_Build 2 196913901 1D CGGAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 11 14 A 12 11 311764 CASAVA_Build 2 196915493 4D AAAAATGTAC TGAG/---- TATTTACTAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 5 TGAG 1 0 311765 CASAVA_Build 2 196915939 4I ACCATACATT ----/CATA ATGTATATGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CATA 0 1 311766 CASAVA_Build 2 196916040 2I TGTGTATGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1675 hom 21 7 10 4 TG 8 9 311767 CASAVA_Build 2 196925565 6I AAGCAGGGAG ------/TGGGGC CCAACTGGAG 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 TGGGGC 0 1 311768 CASAVA_Build 2 196931323 8D CAGGTGGATC ACTTGAGT/-------- ACTTGAGTTC 1084 het 1084 ref 19 6 4 10 ACTTGAGT 2 1 311769 CASAVA_Build 2 196948141 4I AAAAAAAAAG ----/AAAA AAAGAAAAAA 3070 het 990 hom 17 2 11 4 A 3 7 311770 CASAVA_Build 2 196955766 1I AGGGTAGCTC -/G CATGATAACC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 0 1 311771 CASAVA_Build 2 196967557 2I GATCTCTCCA --/AT ATCCTGTCTC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 AT 1 2 311772 CASAVA_Build 2 196969798 3I AAAAAAAAAA ---/AAC TGGCCGGGTG 2798 hom 27 het 10 0 9 1 AAC 0 1 311773 CASAVA_Build 2 196971063 1D47M1D AGTGAGTGTA GGGGAAAGGTGGCTGGATGGGTTTGTGGGTGGGTGGGGGAGTTAGGGGA/-GGGAAAGGTGGCTGGATGGGTTTGTGGGTGGGTGGGGGAGTTAGGGG- AAATGGCCTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 15 N/A 0 0 311774 CASAVA_Build 2 196972238 2D AAGTTACATT AA/-- GTTATTCAAT 3070 het 3070 hom 55 25 26 4 A 2 0 311775 CASAVA_Build 2 196976217 3I AACTAAATGC ---/AGT TGTATTTTGA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 AGT 0 1 311776 CASAVA_Build 2 196977961 1I TCCCGGCAAA -/T TTTTTTTTTT 1771 het 112 hom 9 2 6 1 T 13 14 311777 CASAVA_Build 2 196988503 6I TGTTTGCTGC ------/TTCCTG TTCCTGTGGT 3070 het 3070 hom 48 22 19 7 TTCCTG 1 2 311778 CASAVA_Build 2 196988581 1I GCTGAGCTTT -/C CGTGCATGAC 3070 hom 147 het 57 0 49 13 C 1 2 311779 CASAVA_Build 2 196997960 4D AAGAACAGAT TGAC/---- TCTCTTGTTA 3070 het 3070 ref 46 22 23 4 TGAC 1 0 311780 CASAVA_Build 2 196998195 1D TACTGCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 529 hom 41 3 23 15 A 15 14 311781 CASAVA_Build 2 197000113 1D CTTCAGATGA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 8 7 311782 CASAVA_Build 2 197002210 1I TCCTGAGCCT -/G GGGGGGGGCC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 G 8 9 311783 CASAVA_Build 2 197002496 1I GAACTTCCGC -/T TTCAGGCCTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 2 3 311784 CASAVA_Build 2 197003398 1D ATGGTCAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 10 9 311785 CASAVA_Build 2 197009718 1I AAGAGTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 34 2 26 6 T 13 14 311786 CASAVA_Build 2 197017261 3D GGTGGGAAAG TCT/--- TCTTTGCAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TCT 2 1 311787 CASAVA_Build 2 197030786 1I CCCGCTACTA -/C CACAAAACCT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 C 1 2 311788 CASAVA_Build 2 197033456 4D CGATTAAACC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2754 het 2754 ref 32 15 7 10 T 15 11 311789 CASAVA_Build 2 197033746 18D CACCTGGCAA TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 3070 het 2914 hom 21 10 9 4 T 29 11 311790 CASAVA_Build 2 197054753 1D ACCATGGTCA T/- TAAGATTGCT 3070 het 3070 ref 56 26 21 9 T 2 1 311791 CASAVA_Build 2 197062435 1I AGAAGAAAGA -/T CCAAAGAACC 3070 het 3070 hom 51 21 28 2 T 0 1 311792 CASAVA_Build 2 197069378 2D TCCATATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 21 12 7 3 TA 7 6 311793 CASAVA_Build 2 197083566 1D TTATAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 T 11 10 311794 CASAVA_Build 2 197088931 1D CCTCTCTACT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1141 hom 27 6 15 6 A 10 9 311795 CASAVA_Build 2 197089379 2D ACACACACAC TT/-- TTTCAAGGAA 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 T 5 3 311796 CASAVA_Build 2 197102384 1I GATTCTGGTC -/T TTCCACCACT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 2 3 311797 CASAVA_Build 2 197106590 4D TGGAAAAGGA ATAT/---- ATATATAGGT 3070 het 3070 ref 49 22 21 8 AT 5 3 311798 CASAVA_Build 2 197107252 1D TTTGTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 8 22 10 A 13 12 311799 CASAVA_Build 2 197114701 1D CATTTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 8 6 T 11 10 311800 CASAVA_Build 2 197119790 1D GAAGGACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 9 12 A 15 14 311801 CASAVA_Build 2 197157558 1D CCTATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 A 13 12 311802 CASAVA_Build 2 197173560 5I AGTATAAGAA -----/AAGAG AAGAAGATAG 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 AAGAG 0 1 311803 CASAVA_Build 2 197179164 1D ACCCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2158 hom 29 11 12 6 A 15 14 311804 CASAVA_Build 2 197184008 1I AGATTTGGAT -/G GGGACACAGC 3070 hom 64 het 26 0 20 6 G 3 4 311805 CASAVA_Build 2 197190896 1I TTGCTACCCC -/T ACAGTTAGCA 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 0 1 311806 CASAVA_Build 2 197193648 6D CTGCCCTCCA GCCTTG/------ GCAACAGAAT 3070 het 3070 ref 32 16 12 7 GCCTTG 1 0 311807 CASAVA_Build 2 197201971 2I GTTATAACAC --/TT CACTCAGACA 3070 het 3070 ref 42 28 12 2 T 0 2 311808 CASAVA_Build 2 197203681 1D GGTACTGGCA T/- TAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 T 2 1 311809 CASAVA_Build 2 197204228 4D CAAAATATGT AAGG/---- AACTCATAAA 2668 het 2668 ref 26 12 7 8 AAGG 1 0 311810 CASAVA_Build 2 197207276 4D TCATAGGCAC CTAA/---- CTGTCATTTA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 CTAA 1 0 311811 CASAVA_Build 2 197208497 1I TTGTTTATGT -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 7 8 311812 CASAVA_Build 2 197208645 1D TTTGAAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 152 hom 27 2 11 15 A 10 9 311813 CASAVA_Build 2 197209287 3D CTGTATGGCC TTT/--- AGGCAAGTTA 3070 het 3070 hom 51 20 28 3 T 3 0 311814 CASAVA_Build 2 197213948 1I CTGTTTTTTG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 7 8 311815 CASAVA_Build 2 197214132 1I TATTTTTAGT -/A GAGACGGGGT 3039 het 1314 hom 15 4 8 3 A 0 1 311816 CASAVA_Build 2 197216385 1I TTGGACCTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 8 9 311817 CASAVA_Build 2 197219801 2D AAAAAGAGAC AT/-- ATTAAGGTTA 3070 het 3070 hom 34 15 19 1 AT 2 1 311818 CASAVA_Build 2 197236455 3D TACTATTGAT AAG/--- AAGGTAATAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 6 AAG 2 1 311819 CASAVA_Build 2 197239764 1D GCCCAGGAAC A/- AAAAAAAAAA 1208 het 1208 ref 48 40 3 6 A 11 10 311820 CASAVA_Build 2 197244572 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 het 3070 ref 17 8 8 1 T 6 5 311821 CASAVA_Build 2 197247628 1D AAACACCTTG C/- CGATTTCTCC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 2 1 311822 CASAVA_Build 2 197248592 2I AACAGTTATA --/GT GTGCTTCTGC 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 GT 1 2 311823 CASAVA_Build 2 197264046 1D GCAGATAAGC T/- TTTCGATATG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 4 3 311824 CASAVA_Build 2 197290860 5D ATTCAGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 30 14 12 6 A 12 7 311825 CASAVA_Build 2 197291920 1D TAATGTGGTG T/- AAGATTTCTA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 1 0 311826 CASAVA_Build 2 197295412 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 11 9 T 15 14 311827 CASAVA_Build 2 197304361 1D CAAATCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 609 hom 30 3 14 13 T 17 16 311828 CASAVA_Build 2 197327395 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTGTTAT 3070 het 3070 ref 32 19 12 2 TGTT 1 0 311829 CASAVA_Build 2 197344338 4D ATCATTTTAA AAAT/---- AAATAGGCCT 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 AAAT 2 1 311830 CASAVA_Build 2 197418558 1I GTGAAATGTT -/A AAAAAAAAAA 1059 het 1059 ref 36 24 4 8 A 15 16 311831 CASAVA_Build 2 197441396 1D TACTAAACTT A/- ACAATCATAA 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 2 1 311832 CASAVA_Build 2 197462662 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAATAG 2958 hom 18 het 7 0 7 0 A 8 7 311833 CASAVA_Build 2 197502828 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 8 9 311834 CASAVA_Build 2 197507494 4I TGAGTTAATG ----/GATA GATAGATGGC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 GATA 1 2 311835 CASAVA_Build 2 197509301 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 33 2 24 7 A 13 12 311836 CASAVA_Build 2 197516432 2D TCTCATCCAC AT/-- AGTGATGTGC 3070 hom 84 het 34 0 29 7 AT 1 0 311837 CASAVA_Build 2 197520405 1D AACATATTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 9 311838 CASAVA_Build 2 197520939 2D TTGTAACTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 343 hom 40 3 22 15 A 16 14 311839 CASAVA_Build 2 197520954 2D AAAAAAAAAA AC/-- AGAAAAAACC 3070 het 623 hom 39 7 21 11 AC 1 0 311840 CASAVA_Build 2 197531908 1I TACTCCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 528 hom 27 2 16 9 A 12 13 311841 CASAVA_Build 2 197548583 1D TGTCACACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 19 1 13 6 T 12 11 311842 CASAVA_Build 2 197562248 1D CTAGTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 2216 het 2216 ref 43 24 7 12 A 15 14 311843 CASAVA_Build 2 197562479 2I CTGATGAACT --/AC ACACACACAC 3070 het 658 hom 41 2 27 12 AC 7 8 311844 CASAVA_Build 2 197564733 1D CTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 12 11 311845 CASAVA_Build 2 197570778 1I CCACTATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 33 1 25 7 A 10 11 311846 CASAVA_Build 2 197580973 4I ACATTCTCTT ----/TCTC TCTCCCATTC 3070 hom 90 het 36 0 30 6 TC 2 4 311847 CASAVA_Build 2 197589406 2I ATACAGAAAC --/TT TAACAAAATG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 1 3 311848 CASAVA_Build 2 197611304 2D TTAGAAAAAT AA/-- AAGTCTTATA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 A 4 2 311849 CASAVA_Build 2 197618062 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 596 hom 36 3 26 7 T 12 11 311850 CASAVA_Build 2 197619611 1I CGAGACTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1531 hom 29 4 16 9 A 13 14 311851 CASAVA_Build 2 197619994 1I ACAGAATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 24 1 16 8 T 11 12 311852 CASAVA_Build 2 197627356 1D AACTTCCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 125 het 49 0 43 7 A 10 9 311853 CASAVA_Build 2 197632003 1D ATAATTTTCA T/- CTAGATGATA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 T 1 0 311854 CASAVA_Build 2 197634753 3I TATCCATGCC ---/TTT TTTTTTTTTT 2526 het 6 hom 18 1 13 4 T 13 16 311855 CASAVA_Build 2 197647372 1I GTAGTTTTCC -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 71 het 41 0 30 11 T 6 7 311856 CASAVA_Build 2 197661618 5D CAGACAACTT AAGTC/----- AAGTCAATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AAGTC 2 1 311857 CASAVA_Build 2 197665823 1I AGAAACATTC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 8 9 311858 CASAVA_Build 2 197671235 2D GTTCAACTTA AG/-- ATGTTGGACA 3070 hom 114 het 43 0 38 6 AG 1 0 311859 CASAVA_Build 2 197682697 1D CTGCCAGATT G/- ACCTGGAATA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 G 1 0 311860 CASAVA_Build 2 197682951 1I AGCCTGTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 35 0 25 11 T 13 14 311861 CASAVA_Build 2 197684674 1D AATTCCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 43 het 18 0 15 3 A 10 9 311862 CASAVA_Build 2 197685677 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1516 het 1331 hom 17 10 5 2 A 15 14 311863 CASAVA_Build 2 197685956 1D ATCTTAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 34 1 30 3 A 11 10 311864 CASAVA_Build 2 197690162 1D ACCACCTTTC T/- TTGCCGGATT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 3 2 311865 CASAVA_Build 2 197692146 1D TGTTTAAGAC T/- TTTTTGTAGT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 6 5 311866 CASAVA_Build 2 197696178 1D CTGATAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 8 311867 CASAVA_Build 2 197697937 4D TCTTTTCTTC CTTT/---- CTTTTTGTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 5 CTTT 2 1 311868 CASAVA_Build 2 197699826 2D TGTTGTGGAC CT/-- CTCTAAATCC 3070 hom 76 het 28 0 24 4 CT 3 2 311869 CASAVA_Build 2 197699957 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1006 het 1006 ref 32 25 3 4 A 11 12 311870 CASAVA_Build 2 197724093 4D GAAAATATGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 32 0 23 11 A 17 13 311871 CASAVA_Build 2 197730145 1I TACGTAAAGT -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 7 8 311872 CASAVA_Build 2 197739640 11I GCTCAGAATG -----------/GGTAGGAACTA GGATATCCCC 3070 hom 151 het 53 0 51 3 GGTAGGAACTA 0 1 311873 CASAVA_Build 2 197748880 11I TTGCTTTCAT -----------/AATAGGAACCC AATAGGAACC 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 AATAGGAACCC 1 2 311874 CASAVA_Build 2 197752042 1D CCTGACTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 7 A 10 9 311875 CASAVA_Build 2 197753930 1D TATAGTGTCT A/- TTTTTTTTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 A 1 0 311876 CASAVA_Build 2 197755652 1D ATATTCAAGT C/- CCTGAGTTGG 3070 hom 159 het 63 0 53 10 C 3 2 311877 CASAVA_Build 2 197799631 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 97 het 37 0 33 4 A 10 9 311878 CASAVA_Build 2 197802607 1D TGCCAGGCAC T/- TCCCTAAAGT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 2 1 311879 CASAVA_Build 2 197811298 1I ACTCTACCGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 387 hom 36 1 34 1 A 9 10 311880 CASAVA_Build 2 197834527 3D ATCTTTTCTT AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 hom 53 het 27 0 18 11 A 12 9 311881 CASAVA_Build 2 197835849 1D ACTCCAGCCT G/- GGAAACACAG 3070 het 6 hom 19 1 17 1 G 3 2 311882 CASAVA_Build 2 197836315 1I GGGGCTGGGG -/C CGCCACAGTT 3070 hom 55 het 23 0 14 9 C 1 2 311883 CASAVA_Build 2 197836772 1D CAGGATCCAT C/- TTCTCTCTCC 3070 hom 116 het 44 0 37 7 C 1 0 311884 CASAVA_Build 2 197836928 1I GTTCTTAAAA -/G GAAAGGAGGC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 1 2 311885 CASAVA_Build 2 197859350 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2977 hom 37 12 14 11 T 10 11 311886 CASAVA_Build 2 197867373 1D TCGCTAACCA G/- TTCAAGGTGC 3070 het 3070 hom 43 13 21 9 G 1 0 311887 CASAVA_Build 2 197885706 1D TACAAATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 14 9 A 13 12 311888 CASAVA_Build 2 197893759 1I TATTTTGAAA -/C TATTGTGCCC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 C 0 1 311889 CASAVA_Build 2 197909483 1D AAGAACGAAA G/- GGATTGGCTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 G 3 2 311890 CASAVA_Build 2 197915358 1D CCCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2058 hom 18 5 9 5 A 11 10 311891 CASAVA_Build 2 197926779 11I TTTTTTATTT -----------/CGAAGTTATGC CCAAGTTATG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 CGAAGTTATGC 0 1 311892 CASAVA_Build 2 197934650 2I TGATTTTTCC --/AA AGACTGCTGA 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 A 1 3 311893 CASAVA_Build 2 197945385 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTAATGGC 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 4 5 311894 CASAVA_Build 2 197947232 6D ACACTCTGAT ACTCAC/------ AGTCACCTCA 1994 het 1994 ref 27 13 7 7 ACTCAC 1 0 311895 CASAVA_Build 2 197963741 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3018 het 860 hom 10 3 7 0 T 5 6 311896 CASAVA_Build 2 197965545 2I GAGTTGGGGG --/GC GGGGGGAACC 3070 het 175 hom 27 3 17 7 GC 0 1 311897 CASAVA_Build 2 197965898 1I AGTATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2957 hom 37 10 21 6 A 12 13 311898 CASAVA_Build 2 197976016 2I TGAAAAAGAG --/AA AAAAGAGAAG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 4 6 311899 CASAVA_Build 2 198006693 1D TCCAACCTTT C/- CAGATTCATT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 C 2 1 311900 CASAVA_Build 2 198013692 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2588 hom 26 10 12 4 A 9 10 311901 CASAVA_Build 2 198016693 1I TCTATCCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2070 hom 27 7 14 6 T 10 11 311902 CASAVA_Build 2 198019830 2D CTCCTTTTTT GG/-- GGGGGGGGGT 3070 het 153 hom 33 4 14 17 G 11 9 311903 CASAVA_Build 2 198024495 1D TAACACTCAC A/- AGTGAGGGTC 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 2 1 311904 CASAVA_Build 2 198036266 1D CATGGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 3070 het 833 hom 16 2 11 3 C 4 3 311905 CASAVA_Build 2 198056462 1I TTTGGAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 16 5 T 11 12 311906 CASAVA_Build 2 198062826 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 11 12 311907 CASAVA_Build 2 198063381 2I GTTTGGTTTT --/TG TGTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 TG 2 3 311908 CASAVA_Build 2 198067513 2I AAAAAAAGCA --/CT GTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 CT 0 1 311909 CASAVA_Build 2 198077451 1D CATTACCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 T 12 11 311910 CASAVA_Build 2 198084923 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 12 11 311911 CASAVA_Build 2 198098248 2D CTGGGAGGCA GT/-- GAGCCTGCAG 1183 het 1093 hom 7 3 3 1 GT 1 0 311912 CASAVA_Build 2 198108209 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAATTA 1763 het 1763 ref 36 13 10 13 G 0 1 311913 CASAVA_Build 2 198114904 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAATAA 2620 het 2620 ref 16 7 8 3 A 8 7 311914 CASAVA_Build 2 198124974 5I AGGATAATTT -----/TGAAA TGAAGATGAA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 TGAAA 0 1 311915 CASAVA_Build 2 198144554 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAGA 844 het 844 ref 35 25 3 7 A 9 8 311916 CASAVA_Build 2 198147506 1D TCAGATGAGA C/- TTTGGACTGT 3070 het 2947 hom 16 6 10 0 C 1 0 311917 CASAVA_Build 2 198151341 2D TTCTGTACCA AC/-- ACACACTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 5 AC 4 3 311918 CASAVA_Build 2 198193967 4D GAAAAATGAA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 18 7 AAAC 2 1 311919 CASAVA_Build 2 198203178 4D CAGTTAAGGT AATA/---- AATACTAGGC 3070 het 3070 ref 45 27 9 11 AATA 2 1 311920 CASAVA_Build 2 198218430 1D ATTAATTAAA G/- GGTTGTGTAA 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 G 3 2 311921 CASAVA_Build 2 198226302 1I GGTCTGGAGA -/C CCTGACGGGT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 2 3 311922 CASAVA_Build 2 198226519 1D CTGGTTAGTT A/- AAAAAAAAAA 1057 het 1057 ref 33 26 3 5 A 13 12 311923 CASAVA_Build 2 198229995 1D TTAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2221 hom 29 10 17 3 A 11 10 311924 CASAVA_Build 2 198231422 2D TGTATTATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2131 hom 29 10 14 5 T 14 12 311925 CASAVA_Build 2 198232774 1D CAAAAAGAGC A/- AAAACTCTGT 3070 het 1243 hom 16 3 9 4 A 5 4 311926 CASAVA_Build 2 198248947 1D GCACACAATT C/- TTTTTCTGTT 3070 het 3070 hom 37 18 15 5 C 1 0 311927 CASAVA_Build 2 198249256 1D ACAGCCCTTT A/- AGTCTTTAGT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 2 1 311928 CASAVA_Build 2 198274981 5D GTATATTGCT GAGTA/----- GAGTGTAAAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 GAGTA 1 0 311929 CASAVA_Build 2 198280322 3I CCTGCTCCTA ---/TTC TTCATTTCTC 3070 het 3070 hom 53 23 23 7 TTC 1 2 311930 CASAVA_Build 2 198284665 1D GTGTGAGATG T/- TCAAGATGTT 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 T 2 1 311931 CASAVA_Build 2 198286845 2D GTATATAGTC AT/-- AAATTCATGA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 AT 1 0 311932 CASAVA_Build 2 198287711 1D AGGCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1566 het 1566 ref 29 14 4 12 T 13 12 311933 CASAVA_Build 2 198289781 5I TTGCCTAAAA -----/TAAAT TAGCTAAGAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TAAAT 0 1 311934 CASAVA_Build 2 198301705 1D AGGCTAGCAA T/- TTAGGAGGGC 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 3 2 311935 CASAVA_Build 2 198334881 1I ATAACAATGT -/A AATACATATG 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 2 3 311936 CASAVA_Build 2 198348455 1I TTTCCCAGCC -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 7 8 311937 CASAVA_Build 2 198353750 1D ATAAGGAAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 T 10 9 311938 CASAVA_Build 2 198362286 1D ATCCCCCCCC T/- ACCAGCCCCC 3070 het 3070 ref 24 8 8 8 T 1 0 311939 CASAVA_Build 2 198380378 39I AGCCTAGAGG ---------------------------------------/GTAGTCTAAGGTCATTGTGATGAATAAACTAATCTTCAA GGGTAATCTG 3070 het 3070 hom 28 11 17 1 GTAGTCTAAGGTCATTGTGATGAATAAACTAATCTTCAA 0 1 311940 CASAVA_Build 2 198383843 1I TGTATATTTT -/A AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 6 7 311941 CASAVA_Build 2 198390191 1D CTTAAAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 T 10 9 311942 CASAVA_Build 2 198396751 7D CTTTGATTTG AGTTGAT/------- ATAGTAAGTA 3070 het 3070 ref 52 27 21 6 AGTTGAT 1 0 311943 CASAVA_Build 2 198400567 4I GGTTAAAAAA ----/TAAT TAAATCCATT 3070 het 3070 ref 47 27 14 6 TAAT 0 1 311944 CASAVA_Build 2 198400932 1I AGCAAATATG -/T TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 54 19 30 5 T 6 7 311945 CASAVA_Build 2 198432150 2I CCACTAGCTC --/TG TGCCTGAAAT 3070 het 3070 hom 55 24 29 2 TG 1 2 311946 CASAVA_Build 2 198435096 1I TTACATGGAT -/G TTTAATAATT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 G 0 1 311947 CASAVA_Build 2 198501006 1I GATGGTATGA -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 7 8 311948 CASAVA_Build 2 198517209 1D GAAGAGACAA T/- TTTGTCTCTT 3070 het 3070 hom 41 15 24 3 T 4 3 311949 CASAVA_Build 2 198519485 1I TTAAAAACAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 27 14 11 2 T 8 9 311950 CASAVA_Build 2 198531886 5I CACTAATCTG -----/TGCTC TATTGCCTCT 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 TGCTC 0 1 311951 CASAVA_Build 2 198534609 5I ACTGTAGTCT -----/TATAA TATTAATATT 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 TATAA 0 1 311952 CASAVA_Build 2 198548249 1D AAGGTAGGTA T/- TTTTATTTCC 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 5 4 311953 CASAVA_Build 2 198555185 2I TATATATATG --/TA TATATATATA 1773 het 1773 ref 16 6 7 3 TA 6 7 311954 CASAVA_Build 2 198577108 1D TATATTTAGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 10 9 311955 CASAVA_Build 2 198597732 1D AATCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 A 13 12 311956 CASAVA_Build 2 198606885 2I CTCGTGTTTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2598 hom 27 8 13 6 TG 6 7 311957 CASAVA_Build 2 198614368 1I AACCACAGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 T 8 9 311958 CASAVA_Build 2 198628491 2I TTTTATTTTG --/CT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 CT 0 1 311959 CASAVA_Build 2 198649140 1I AAATGGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 9 12 T 10 11 311960 CASAVA_Build 2 198664942 1I TCCAGCCTCA -/C CTGCCTCTCC 1806 het 1806 ref 25 8 5 12 C 1 2 311961 CASAVA_Build 2 198667478 2D ACACTCTCCC CT/-- GTCTTAGCAC 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 CT 1 0 311962 CASAVA_Build 2 198692199 4D GTAAGAAAAT TTAA/---- TTAAATTCAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 TTAA 2 1 311963 CASAVA_Build 2 198716865 1D AGTTTACCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 45 2 17 26 T 12 11 311964 CASAVA_Build 2 198736428 1D CTTTAGTCTG T/- TTTTCTCCAC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 5 4 311965 CASAVA_Build 2 198748674 1D TTAATTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1150 hom 28 6 12 11 T 13 12 311966 CASAVA_Build 2 198776362 16D CTCTTTTTCC CTCTCTCTCTCTCTCT/---------------- CTCTCTCTCT 3070 hom 66 het 25 0 23 4 CT 13 5 311967 CASAVA_Build 2 198783253 1I GTGATACTAC -/T TCCACATTTT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 T 1 2 311968 CASAVA_Build 2 198789930 1I TTTGAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 11 12 311969 CASAVA_Build 2 198790082 3D ATTTTATGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 35 0 22 13 T 15 12 311970 CASAVA_Build 2 198791535 1I GAGGAGGGAG -/A AAATAATATT 3070 hom 23 het 25 1 21 3 A 3 4 311971 CASAVA_Build 2 198794657 1D TTTCTTTCCA C/- CCCCCCCCTC 3070 hom 62 het 28 0 20 8 C 9 8 311972 CASAVA_Build 2 198795556 1I AAGAAAAAAA -/G AAAATCCAAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 0 1 311973 CASAVA_Build 2 198799377 1D TGTGTATATG T/- TTTTTTTACC 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 8 7 311974 CASAVA_Build 2 198816367 12D CTATGGTGTC TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 85 het 47 0 29 21 TG 15 9 311975 CASAVA_Build 2 198818411 3D CATATAACCT TCA/--- TCTATATTCT 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 TCA 1 0 311976 CASAVA_Build 2 198820576 3D ATTGGGAGAT AAG/--- AAGTTTTATT 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 AAG 2 1 311977 CASAVA_Build 2 198842550 1D CCCAAAAAAC A/- AAACAAAAAA 3070 hom 92 het 35 0 30 6 A 4 3 311978 CASAVA_Build 2 198850013 1I GTAGGTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 11 12 311979 CASAVA_Build 2 198857932 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 12 11 311980 CASAVA_Build 2 198860778 1D TGATAGGATA T/- GTTAAGTCCA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 1 0 311981 CASAVA_Build 2 198874501 2D TTCCTGAACA TC/-- TGTCTTGTGA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 TC 1 0 311982 CASAVA_Build 2 198890716 1D AATAATTACT A/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 1 0 311983 CASAVA_Build 2 198917213 1D GTAGAAAAAT A/- AAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 A 7 6 311984 CASAVA_Build 2 198917563 1I ACAGTGTGTT -/A ATCCAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 1 2 311985 CASAVA_Build 2 198930248 3I75M1I TAGTCAGAGA ---TATATTATAAAGACTAAATGCTTATACATTTAAATGCTTTGTGTTGCTAACATTTTGAATTTAACTCTTACTGTC-/TATTATATTATAAAGACTAAATGCTTATACATTTAAATGCTTTGTGTTGCTAACATTTTGAATTTAACTCTTACTGTCT TTTTTTTTTC 3070 het 128 hom 36 3 31 29 N/A 0 0 311986 CASAVA_Build 2 198934463 1D AATCAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 23 12 T 15 14 311987 CASAVA_Build 2 198934574 1I CCTCTGTAAC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 6 7 311988 CASAVA_Build 2 198938019 2I TCAATTATAG --/AT ATTTCTGATG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AT 1 2 311989 CASAVA_Build 2 198948013 1D GTGAAATATT G/- AATTTAAGAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 0 311990 CASAVA_Build 2 198962091 1I CCCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 456 hom 30 2 15 13 A 16 17 311991 CASAVA_Build 2 198962333 1D TTTCATGTAG T/- AGGTAGTCTA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 1 0 311992 CASAVA_Build 2 198989976 2I TACAATAAAC --/TG TGTATTTTTC 3070 hom 138 het 55 0 47 8 TG 1 2 311993 CASAVA_Build 2 198991388 1D AATACAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 44 0 35 10 A 13 12 311994 CASAVA_Build 2 199014572 1D TTTTTAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 32 1 26 5 T 11 10 311995 CASAVA_Build 2 199015694 12D TGAAGGAATA TGGAGCATGTAG/------------ TGGAGGCACA 3070 hom 96 het 35 0 32 5 TGGAGCATGTAG 1 0 311996 CASAVA_Build 2 199022779 9I ATTTATTTTG ---------/TTTATTTTA TTTATTTTTA 3070 het 1217 hom 20 3 13 4 TTTATTTTA 0 1 311997 CASAVA_Build 2 199028588 1D TGCTTTGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 14 8 A 13 12 311998 CASAVA_Build 2 199029014 1D AGGGAAGGTG A/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 6 5 311999 CASAVA_Build 2 199035305 1I CTGGGTGGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 9 10 312000 CASAVA_Build 2 199037999 1D CTCTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2679 hom 28 10 13 5 A 12 11 312001 CASAVA_Build 2 199040600 4D TTGACATTCA TTTG/---- TTTGTTTAAC 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 TTTG 2 1 312002 CASAVA_Build 2 199048287 5D TATTTTTTAA CTTTT/----- CTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 CTTTT 3 2 312003 CASAVA_Build 2 199048929 1D TGCTAGAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 10 9 312004 CASAVA_Build 2 199049059 4D TCCAATGTTG TTAC/---- TTACTACTGC 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 TTAC 2 1 312005 CASAVA_Build 2 199052192 4I GCTGTCAAAC ----/AAAG AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 AAAG 0 1 312006 CASAVA_Build 2 199057700 1I TAAGTTTTTT -/G GGGGGCAGCC 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 G 5 6 312007 CASAVA_Build 2 199066449 1I TATTACTTGC -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 6 7 312008 CASAVA_Build 2 199069491 3I AACTAGAACA ---/ATT ATTTAATTAA 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 ATT 1 2 312009 CASAVA_Build 2 199069522 3D ATATAATGTA AAT/--- AATTTTTAAT 3070 het 2594 hom 36 6 19 11 AAT 2 1 312010 CASAVA_Build 2 199070212 1D ACCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 11 10 312011 CASAVA_Build 2 199070992 2D CAGGAGACTC TT/-- TTGAGAGAAT 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 T 4 2 312012 CASAVA_Build 2 199072878 1I TACTGGGGGG -/A AAAAAATGAA 3070 hom 94 het 40 0 36 4 A 6 7 312013 CASAVA_Build 2 199086442 4D TTTTTTTACC TATT/---- TATTTATTTT 3070 het 3070 ref 25 10 12 3 TATT 3 2 312014 CASAVA_Build 2 199096485 4I GGTCTCTAGA ----/ATAT CTAAGCCAAA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AT 0 2 312015 CASAVA_Build 2 199097607 2D GTGAGTGTGA AG/-- AGAGACATCA 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 AG 3 2 312016 CASAVA_Build 2 199099198 2D GTGCCATGAA CC/-- CCACTTATTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 C 4 2 312017 CASAVA_Build 2 199099487 1D TTCATTCTAT A/- GCCCTAATCT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 1 0 312018 CASAVA_Build 2 199101094 4I ATTCATTATT ----/TTAA TTAATTTCAT 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 TTAA 1 2 312019 CASAVA_Build 2 199104344 1I GTCGGGGGTT -/G GGGGACAAGG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 4 5 312020 CASAVA_Build 2 199108959 4I CTCATCAGAA ----/AGTG AGCAAAGGAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AGTG 0 1 312021 CASAVA_Build 2 199109981 1D TTTTTCTAAT A/- AGATTTCTAA 3070 het 3070 ref 42 25 17 2 A 2 1 312022 CASAVA_Build 2 199123964 1I GATTGAGAAT -/G GATAAATTTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 1 2 312023 CASAVA_Build 2 199124222 3D CTAAACAAGT ATA/--- AAATTATAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 ATA 1 0 312024 CASAVA_Build 2 199124329 4I ACATATACAC ----/ATAT ATTAATGTAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 1 3 312025 CASAVA_Build 2 199125014 1D30M2I TAACTAGTAT AAAAATATAGATGACCAAATATTATTACAAA--/-AAAATATAGAGGACCAAATATTATTACAAACT CTAGTAAAAC 3070 hom 66 het 16 0 23 2 N/A 0 0 312026 CASAVA_Build 2 199130805 1I TTCTCACCAG -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 59 24 24 11 A 6 7 312027 CASAVA_Build 2 199141467 1D CAATAAGGTA T/- TTTTAAATTA 3070 het 3070 hom 41 19 22 0 T 5 4 312028 CASAVA_Build 2 199146994 1D TAAAACATCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 312029 CASAVA_Build 2 199150322 1D CTTTGGGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 20 9 T 15 14 312030 CASAVA_Build 2 199151162 1I AGACAGTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 10 312031 CASAVA_Build 2 199168241 1I AATGCTATGA -/T TTTTCAATCT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 4 5 312032 CASAVA_Build 2 199190946 2D AAATTTGTTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 TA 7 6 312033 CASAVA_Build 2 199192561 3D AAATAATGAT AAG/--- AAGTATTGAC 3070 hom 99 het 36 0 34 5 AAG 2 1 312034 CASAVA_Build 2 199194325 1D TACTTTTTTT C/- CTTACATTTC 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 C 2 1 312035 CASAVA_Build 2 199196186 2D TATTATCGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 40 0 30 12 A 12 10 312036 CASAVA_Build 2 199199167 1D GTCCTGTTCA T/- TTTTTTGGCT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 7 6 312037 CASAVA_Build 2 199217774 1I TGTTCGTACT -/A AAACACAAAG 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 A 3 4 312038 CASAVA_Build 2 199222683 1D ATGTAAAACT A/- AAATTTAAGA 3070 het 3070 hom 36 9 24 3 A 4 3 312039 CASAVA_Build 2 199235646 1I TTTCTTCTAA -/G TTTAAAGATA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 G 0 1 312040 CASAVA_Build 2 199237082 1D GTAAAACCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 11 10 312041 CASAVA_Build 2 199243269 1I CAGTGTAAAG -/T TTTTCCTGTT 2279 het 2279 ref 24 16 6 2 T 4 5 312042 CASAVA_Build 2 199246035 4D ATGTGCTACC CTAA/---- CTAAGCAGTC 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 CTAA 2 1 312043 CASAVA_Build 2 199246191 9I AGGTTCAAAC ---------/GATTCTCCA GCCTCAGCCT 3070 het 2444 hom 20 10 9 3 GATTCTCCA 0 1 312044 CASAVA_Build 2 199247448 1D CTGCTGTGTT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 39 17 18 5 A 9 8 312045 CASAVA_Build 2 199251592 1D TCTCAAAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 15 13 4 A 9 8 312046 CASAVA_Build 2 199261687 1D AACAAAATTC A/- ACATCACTTC 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 A 2 1 312047 CASAVA_Build 2 199267852 1D ACACAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 827 hom 30 2 21 7 T 12 11 312048 CASAVA_Build 2 199271826 4I TTAAAAATGT ----/TTTA TTTGAGAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 TTTA 0 1 312049 CASAVA_Build 2 199273956 1D ATGTCAAGGA T/- TTGCCAGAGC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 3 2 312050 CASAVA_Build 2 199275968 2D AAGTACTGTG CT/-- CACTGGGGTG 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 CT 1 0 312051 CASAVA_Build 2 199276611 3D TCACAGAGGG AGT/--- AGTAACACTT 3070 het 3070 ref 60 28 25 9 AGT 2 1 312052 CASAVA_Build 2 199281965 1D GAACTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 T 12 11 312053 CASAVA_Build 2 199296493 14D TTCTTATTTA AACCAATGGATGTG/-------------- AACCAGAAAG 331 het 331 ref 41 25 4 15 AACCAATGGATGTG 1 0 312054 CASAVA_Build 2 199301422 1I CCTTTTGAGC -/T TTTTTCCTTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 5 6 312055 CASAVA_Build 2 199310990 1I TGGTTTTGAG -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 T 7 8 312056 CASAVA_Build 2 199316533 1D AATTTTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 12 11 312057 CASAVA_Build 2 199316898 3D AAATAAAATT AAC/--- AAAGAGAATT 3070 het 3070 ref 25 17 7 1 AAC 1 0 312058 CASAVA_Build 2 199317046 2I ACTTTTCTAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 A 9 11 312059 CASAVA_Build 2 199319397 1D TACAACACAG C/- CCCCCCAGTG 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 C 7 6 312060 CASAVA_Build 2 199323706 1D ATGTGGAAAT A/- AAAAAAAACG 3070 hom 120 het 43 0 40 5 A 9 8 312061 CASAVA_Build 2 199329702 1D ATGATCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 15 6 T 11 10 312062 CASAVA_Build 2 199329960 4D ACACACCTAA AAAC/---- AAACAAACAA 2888 het 2888 ref 34 20 11 5 AAAC 4 3 312063 CASAVA_Build 2 199337945 1I AGGCCAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 T 11 12 312064 CASAVA_Build 2 199339198 1D TGTAGACACA G/- GGGGTTAGCT 3070 het 3070 ref 46 23 19 6 G 5 4 312065 CASAVA_Build 2 199347902 1D AGACTACTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 A 10 9 312066 CASAVA_Build 2 199360119 1D TTATGCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 12 11 312067 CASAVA_Build 2 199361250 1D TTCTAATTAA G/- AAGGAAGCCC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 G 1 0 312068 CASAVA_Build 2 199365531 2D TGATTTCAAC TA/-- TATGATATTC 3070 hom 87 het 31 0 29 3 TA 2 1 312069 CASAVA_Build 2 199366897 1D TGTAGAAATT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 A 8 7 312070 CASAVA_Build 2 199370560 1D AAAAAAAAAA C/- CTCAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 C 2 1 312071 CASAVA_Build 2 199373155 1I TTTTTTCTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 8 9 312072 CASAVA_Build 2 199374895 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 2533 het 1613 hom 18 5 6 7 A 15 14 312073 CASAVA_Build 2 199381868 2D TAACTGCTTG TT/-- TTTTTTATTG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 8 6 312074 CASAVA_Build 2 199384651 1D TTCAAGGCCA T/- ATGGGTCAAA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 1 0 312075 CASAVA_Build 2 199386435 4D AGAATAGATT CTCA/---- CTAAGAATCT 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 CTCA 1 0 312076 CASAVA_Build 2 199395264 1D CAATATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 A 12 11 312077 CASAVA_Build 2 199404611 1D CATATGCTCA G/- AAATAGAGAA 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 G 1 0 312078 CASAVA_Build 2 199405569 1D GGTGAAAAAA T/- AATTCCCAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 T 1 0 312079 CASAVA_Build 2 199405938 3D GCATACCTAC AAA/--- AAAAAAAACA 862 het 862 ref 30 11 7 14 A 11 8 312080 CASAVA_Build 2 199407102 2D52M1I TCCAAATGAG AAAAAAAAAAATGTATTTTTAGCACATGGTGTTGAAATAACTGGCTACTGATAT-/--AAAAAAAAATGTATTTTTAGCACATGGTGTTGAAATAACTGGCTACTGATATA GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 23 18 7 N/A 0 0 312081 CASAVA_Build 2 199415304 1I CTACATGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 14 18 8 T 12 13 312082 CASAVA_Build 2 199415635 1D TGTGATAGGT A/- GTATGTTAAA 3070 hom 87 het 35 0 34 1 A 1 0 312083 CASAVA_Build 2 199422810 2D CATAATTCCA TT/-- TTATATATAT 1442 het 1442 ref 11 7 3 1 T 4 2 312084 CASAVA_Build 2 199432182 3D AAAATCTCTT GAG/--- TAACACCCCA 3070 het 3070 ref 26 17 9 0 GAG 1 0 312085 CASAVA_Build 2 199446569 1I CTTTTTTCTC -/T ACTATATAGT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 0 1 312086 CASAVA_Build 2 199458238 1D AACTCCTCAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 9 8 312087 CASAVA_Build 2 199459654 2D CTATTACTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 138 het 60 0 45 15 AC 10 9 312088 CASAVA_Build 2 199471210 5I AAAAAAGAAA -----/GAAAG GAAAGGAAAG 3070 hom 55 het 25 0 18 7 GAAAG 3 4 312089 CASAVA_Build 2 199497978 1D ACTGACTCAA G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 G 2 1 312090 CASAVA_Build 2 199499492 1I AAATCTTCAT -/A ACCTCACGTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 1 2 312091 CASAVA_Build 2 199501571 2D TCTTAATCTG CT/-- CTATTAAGAT 3070 hom 148 het 52 0 50 2 CT 2 1 312092 CASAVA_Build 2 199502392 1D TTCAGTTGCC T/- TGTACAATGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 2 1 312093 CASAVA_Build 2 199503962 2I AAGTCTGGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 34 1 22 11 T 14 16 312094 CASAVA_Build 2 199504377 1I TATAGCACAG -/A AAAAATATTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 5 6 312095 CASAVA_Build 2 199508202 1D TAAAAAAAAA T/- AAATTTAAAA 2349 hom 15 het 7 0 5 2 T 1 0 312096 CASAVA_Build 2 199508971 1D TTTAATAATT A/- AAAAAGTGGT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 6 5 312097 CASAVA_Build 2 199509393 2I AACCAATAAG --/AT ATATATATAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AT 5 6 312098 CASAVA_Build 2 199512891 1I GTATATCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 40 2 29 9 A 10 11 312099 CASAVA_Build 2 199520227 9D TCCCAACACC AATTGGTGG/--------- AATTGGTGGA 3070 hom 112 het 47 0 36 15 AATTGGTGG 2 1 312100 CASAVA_Build 2 199521143 1I TTATTCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 35 1 26 8 A 10 11 312101 CASAVA_Build 2 199523498 1D GGGTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 11 10 312102 CASAVA_Build 2 199531730 1D TCCCTGTTAA C/- AGAGAGAGTA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 C 1 0 312103 CASAVA_Build 2 199534109 2D CAACCCCATG AT/-- AGCCCAGTCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AT 1 0 312104 CASAVA_Build 2 199539494 10D GTCCTTGATC CTGCTCTCTT/---------- CTGCTATATT 3070 hom 78 het 25 0 25 5 CTGCTCTCTT 1 0 312105 CASAVA_Build 2 199556765 2D TCACAGAACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 13 11 312106 CASAVA_Build 2 199567607 5I TGAGCTTATC -----/TTATT TTATCAGCAG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TTATT 0 1 312107 CASAVA_Build 2 199569542 1I TTAACCAAGT -/C CCCCAAGGGC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 4 5 312108 CASAVA_Build 2 199572198 1D CATGTGGATA T/- TTTTACACCA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 T 5 4 312109 CASAVA_Build 2 199572475 1D ACATTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 712 hom 40 2 27 12 A 14 13 312110 CASAVA_Build 2 199573993 1D ACCTAACAAC A/- GTAGAATATA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 1 0 312111 CASAVA_Build 2 199579753 5I ATTTATTTCC -----/GTTTT GTTTTATTTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 GTTTT 1 2 312112 CASAVA_Build 2 199589571 1D CAACAACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 36 0 31 5 A 11 10 312113 CASAVA_Build 2 199596574 1I GCATGTTACC -/T TTTTTTTTTT 972 het 972 ref 34 23 3 8 T 11 12 312114 CASAVA_Build 2 199634179 1D TGCCTACACC A/- AAAAAAAAAA 746 het 746 ref 31 24 4 4 A 13 12 312115 CASAVA_Build 2 199635386 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 8 312116 CASAVA_Build 2 199637227 1D TATTCAACCA T/- TAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 1 312117 CASAVA_Build 2 199638238 3D AATTGTAGAG AGA/--- AATTCCAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 AGA 1 0 312118 CASAVA_Build 2 199647525 4D ATGAGAACAA AGAC/---- ACAACGTACC 3070 hom 48 het 17 0 17 1 AGAC 1 0 312119 CASAVA_Build 2 199655118 4D GCCTCACTAC TAAT/---- TAAAGATATG 3070 het 3070 ref 33 16 14 7 TAAT 1 0 312120 CASAVA_Build 2 199656200 3D ATGGCTTAGA TAT/--- TATGCTATAA 2566 het 2256 hom 21 7 7 9 TAT 2 1 312121 CASAVA_Build 2 199659883 1D AAGAGAATCA T/- TTTTCTAAGA 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 5 4 312122 CASAVA_Build 2 199669665 2I TTTCTTTGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 41 0 36 5 T 10 12 312123 CASAVA_Build 2 199675396 4I TAGACTATAA ----/CTAT GTATCTATAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CTAT 0 1 312124 CASAVA_Build 2 199681653 1D AAGTAGCTGC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 8 312125 CASAVA_Build 2 199707676 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 289 hom 42 1 31 10 T 9 10 312126 CASAVA_Build 2 199727981 4I CTGAACTGCA ----/GGAG GGAGGGGAGG 3070 hom 98 het 40 0 31 9 GGAG 1 2 312127 CASAVA_Build 2 199730989 1I CCAGGAGCTG -/C TTTTTTTTGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 0 1 312128 CASAVA_Build 2 199732960 4D ATTTTCCTGA AATT/---- AATTAATTAC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AATT 3 2 312129 CASAVA_Build 2 199758282 1I GTAACAGAAG -/A AATCACAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 2 3 312130 CASAVA_Build 2 199764286 1I TTGTTCTATG -/T GGCTGGTTGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 0 1 312131 CASAVA_Build 2 199767040 1D AATAAGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 27 0 20 7 A 11 10 312132 CASAVA_Build 2 199774141 1I AGAAACCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 98 het 42 0 31 11 T 10 11 312133 CASAVA_Build 2 199843479 1I AGCACAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2161 hom 30 6 14 10 A 16 17 312134 CASAVA_Build 2 199844440 1D TTCACTTCAC T/- TTTTTTTTTT 803 het 803 ref 37 28 3 6 T 12 11 312135 CASAVA_Build 2 199848457 1D GCTATTTGGA T/- TCAAGATTGA 3070 hom 104 het 40 0 35 6 T 2 1 312136 CASAVA_Build 2 199849727 1D CCTTTTTCCC T/- TTTTTCAAAA 3070 hom 98 het 37 0 33 4 T 6 5 312137 CASAVA_Build 2 199854851 1D ATTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2917 hom 22 het 17 0 8 9 T 17 16 312138 CASAVA_Build 2 199859104 2D TAGTTTGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 27 9 A 12 10 312139 CASAVA_Build 2 199862184 1D TATGGACAGA C/- TTTTGCTTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 1 0 312140 CASAVA_Build 2 199870767 1D TTTTAAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 13 12 312141 CASAVA_Build 2 199870901 1D AATAACTTTT A/- AAAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 35 18 14 3 A 7 6 312142 CASAVA_Build 2 199872604 1I TGAAATTTTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 27 10 3 T 8 9 312143 CASAVA_Build 2 199885011 1I AGTATCAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 12 13 312144 CASAVA_Build 2 199894051 3I AGAAAAATAA ---/AAG AAGGAGGGAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAG 1 2 312145 CASAVA_Build 2 199894379 1D ACACACAGAT A/- CACCTTATGG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 1 0 312146 CASAVA_Build 2 199902397 1D TTTCTTATGC A/- AAAAAAAAAA 2735 het 126 hom 32 2 12 18 A 17 16 312147 CASAVA_Build 2 199904185 1I TTGTTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 37 1 32 4 T 11 12 312148 CASAVA_Build 2 199911353 1D AACAAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 11 4 A 12 11 312149 CASAVA_Build 2 199913940 4D GAGAATAGTT TATC/---- TATTAAGGAA 3070 het 3070 hom 42 19 23 1 TATC 1 0 312150 CASAVA_Build 2 199928293 4D TACATATGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 179 hom 5 het 9 0 2 7 TG 10 8 312151 CASAVA_Build 2 199929298 1I CTACAAATGT -/A AAAAAAGGAC 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 6 7 312152 CASAVA_Build 2 199929529 1I AGAGAAATTT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 6 7 312153 CASAVA_Build 2 199943216 1D GTCTGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1108 het 1108 ref 34 24 3 7 T 13 12 312154 CASAVA_Build 2 199952851 1D TAAATGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2248 het 2248 ref 22 11 6 5 T 13 12 312155 CASAVA_Build 2 199961930 1D CTATGCTTTG T/- TAAAGAAATT 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 T 2 1 312156 CASAVA_Build 2 199965385 1I AATACCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 A 11 12 312157 CASAVA_Build 2 199981648 1D TTTAGTCCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1085 hom 46 6 22 18 A 15 14 312158 CASAVA_Build 2 199982969 2D TGACTTTTTT TC/-- TTTCTTTTGG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 TC 1 0 312159 CASAVA_Build 2 199995271 1D AAATTTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 11 10 312160 CASAVA_Build 2 200015925 1D ACTCTACCAT A/- ATTTATGAAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 2 1 312161 CASAVA_Build 2 200024832 1D TGATTTTTTT C/- CCCCTTGCAA 3070 hom 112 het 40 0 36 4 C 5 4 312162 CASAVA_Build 2 200032814 6D CTGCCTTCCA CTCGCC/------ CTCGCCGCAT 3070 hom 70 het 27 0 15 12 CTCGCC 2 1 312163 CASAVA_Build 2 200093511 1D AGATATTGTG A/- AAAAAATTTC 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 A 7 6 312164 CASAVA_Build 2 200101328 6D TCATTAAAAA AATTCT/------ AATTCTAATT 3070 het 3070 ref 29 15 14 1 AATTCT 2 1 312165 CASAVA_Build 2 200138933 1D TACAGTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 27 0 16 11 T 11 10 312166 CASAVA_Build 2 200148165 1I TTTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 12 13 312167 CASAVA_Build 2 200148492 7I AGTTTGCCTA -------/GTTTCTT GTTAACATGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GTTTCTT 0 1 312168 CASAVA_Build 2 200150692 2D CCTGGAAGAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 77 het 34 0 25 9 A 11 9 312169 CASAVA_Build 2 200155506 1I CTTAGCCATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 70 het 32 0 23 9 T 9 10 312170 CASAVA_Build 2 200161881 1D CCCCACTGTA T/- TAAGCATTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 1 312171 CASAVA_Build 2 200168475 1I AACCTTCTTT -/A AAAATGCAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 4 5 312172 CASAVA_Build 2 200169658 1D GAAATCCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 28 10 T 11 10 312173 CASAVA_Build 2 200171092 1D GGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 T 10 9 312174 CASAVA_Build 2 200177407 1D ATTTGACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 37 1 31 6 A 13 12 312175 CASAVA_Build 2 200182112 1I ACCTGATTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 603 hom 37 3 26 8 T 9 10 312176 CASAVA_Build 2 200185146 2D CCCATTAGAC TG/-- TAAGATTCAT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 TG 1 0 312177 CASAVA_Build 2 200185746 3D AAAATCCTCC TTT/--- TGCAAGAGCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 4 1 312178 CASAVA_Build 2 200189155 3I TCAGGCACAA ---/TTC TTCTTGATGT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TTC 1 2 312179 CASAVA_Build 2 200192696 3I GCCTGTCTAT ---/ACC AGTCTGTAGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ACC 0 1 312180 CASAVA_Build 2 200197325 1I TCAAAAAAAA -/T ATTTCCTTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 0 1 312181 CASAVA_Build 2 200201587 1I CTGAAATTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 9 10 312182 CASAVA_Build 2 200206389 1D GTTACTTTCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 9 8 312183 CASAVA_Build 2 200206792 1D AGGAGATACA C/- AGCTGAGGTA 3070 hom 90 het 33 0 29 4 C 1 0 312184 CASAVA_Build 2 200211095 1D GTTGAGTTTA T/- TAGGCACCTC 3070 hom 63 het 22 0 21 1 T 2 1 312185 CASAVA_Build 2 200230262 1I TTCTGTTCTG -/T TTTTTTCAGT 3070 hom 113 het 43 0 38 5 T 6 7 312186 CASAVA_Build 2 200238865 2I GATTGTGTTA --/CT CTGTTTTGTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 CT 1 2 312187 CASAVA_Build 2 200259188 4I CACATTTATT ----/TTTC TTTGTTATGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TTTC 0 1 312188 CASAVA_Build 2 200272972 2D CAAGGATGCC CT/-- CTCTCACCAC 3070 hom 63 het 25 0 21 5 CT 3 2 312189 CASAVA_Build 2 200281083 1D TTTTTCTGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 33 0 23 10 T 9 8 312190 CASAVA_Build 2 200315072 1D TCTGCCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 30 1 22 7 T 11 10 312191 CASAVA_Build 2 200318828 1I ACTGAGTTTA -/C CCCGTAATTA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 C 3 4 312192 CASAVA_Build 2 200322512 1D ATCTCCCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 42 1 35 6 A 11 10 312193 CASAVA_Build 2 200324851 1D TGAATCAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 10 9 312194 CASAVA_Build 2 200333216 1I ACCAAACAGT -/A AAGGCAAAGC 3070 hom 112 het 44 0 36 8 A 2 3 312195 CASAVA_Build 2 200341281 6I TGAGCTTCTT ------/ATATTC ATAAGAACAC 3070 hom 96 het 33 0 32 1 ATATTC 0 1 312196 CASAVA_Build 2 200341543 1D TTGAGATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 11 10 312197 CASAVA_Build 2 200354742 4D TTTCTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 54 het 30 0 19 11 TTTG 5 4 312198 CASAVA_Build 2 200366511 3I TATGAATTTT ---/CAC CACAAAATCA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CAC 1 2 312199 CASAVA_Build 2 200380446 1D TTTCTACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 7 A 11 10 312200 CASAVA_Build 2 200386364 1D AGTGTTTCAC T/- TTAGGAGTGC 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 T 3 2 312201 CASAVA_Build 2 200398675 11D TGAGTAAGAG CTTCCTAAGCC/----------- TTTACCAGAA 3070 het 3070 hom 50 22 28 6 CTTCCTAAGCC 1 0 312202 CASAVA_Build 2 200400640 1D AAAGAAAAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 A 9 8 312203 CASAVA_Build 2 200401065 13D ACTGCAATCC AAGGGCCTATAGT/------------- AAGTAGGTAT 3070 het 3070 hom 38 20 19 4 AAGGGCCTATAGT 1 0 312204 CASAVA_Build 2 200416921 1D GGAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 38 0 30 8 A 11 10 312205 CASAVA_Build 2 200431650 2D CACAGTTTTA GT/-- GTTCTGTAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 GT 2 1 312206 CASAVA_Build 2 200437023 1D TGAGAACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 13 12 312207 CASAVA_Build 2 200437730 1D ATCCACCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 14 13 312208 CASAVA_Build 2 200439533 1I CTGAAAGCAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 56 het 23 0 19 4 T 8 9 312209 CASAVA_Build 2 200489359 1D ATTCCACCCC T/- AGCCCCTCCC 3070 hom 81 het 29 0 27 3 T 1 0 312210 CASAVA_Build 2 200500534 1I TCTAAATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 660 hom 39 5 24 10 T 15 16 312211 CASAVA_Build 2 200502173 1D GGGGAGGGGG A/- AGGGATAGCA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 2 1 312212 CASAVA_Build 2 200503738 4I CACATTAGGG ----/AGAA AGAATGGAGA 3070 hom 123 het 42 0 39 3 AGAA 1 2 312213 CASAVA_Build 2 200504995 5I AGGTATAAAT -----/TAAAA TATTTATTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TAAAA 0 1 312214 CASAVA_Build 2 200537454 1I ACATTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 19 0 15 4 T 10 11 312215 CASAVA_Build 2 200543854 25D CTGTGTTGGT GTGAGGAACACCACACAGAGGAACA/------------------------- AACAGAGGAA 3070 hom 57 het 20 0 20 2 GTGAGGAACACCACACAGAGGAACA 1 0 312216 CASAVA_Build 2 200581390 16D GAATGATGCA ATACAAAAAAAACTTG/---------------- ACATGCTGTT 3070 hom 108 het 41 0 37 7 ATACAAAAAAAACTTG 1 0 312217 CASAVA_Build 2 200666549 2D GAACACATGA AC/-- ACACACACAC 1719 het 1719 ref 64 40 5 19 AC 9 8 312218 CASAVA_Build 2 200706117 2I TGTTAACCAC --/AT GTCAAAGTAC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AT 0 1 312219 CASAVA_Build 2 200719652 1D TGGCTACAAT A/- AAAAAAGACA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 7 6 312220 CASAVA_Build 2 200742945 4D GCTTATTAAA TATT/---- TATTTGTGTA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 TATT 2 1 312221 CASAVA_Build 2 200762329 1I AAAAAAAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 620 hom 42 3 24 15 A 11 12 312222 CASAVA_Build 2 200766524 1D ATGAAATTAT C/- AACGATAAAC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 C 1 0 312223 CASAVA_Build 2 200771152 1I TTACAGTCGA -/T TTTTTTTTTT 1622 het 1622 ref 22 10 5 7 T 10 11 312224 CASAVA_Build 2 200771478 1D CAAAAGTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 11 10 312225 CASAVA_Build 2 200781853 4I ATGTATGTGT ----/GTGC GTGTGTGTCT 3070 hom 154 het 60 0 37 23 GTGC 0 1 312226 CASAVA_Build 2 200782224 2D CGTGTGTATC TG/-- TGTGTGTGCA 3070 het 270 hom 60 4 34 23 TG 5 4 312227 CASAVA_Build 2 200792011 2D GATAGATTGT TG/-- GGGGGGGGGG 2705 het 13 hom 28 1 14 15 TG 1 0 312228 CASAVA_Build 2 200793562 3I CTCCCTTTCC ---/TCT TCTTCTTCTC 3070 hom 97 het 41 0 33 8 TCT 3 4 312229 CASAVA_Build 2 200801393 4I CAAAATTCAT ----/ATTA ATTACAAAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 ATTA 1 2 312230 CASAVA_Build 2 200827217 1D ATGTAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 25 1 19 5 T 11 10 312231 CASAVA_Build 2 200859325 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2214 het 142 hom 14 1 7 6 A 13 12 312232 CASAVA_Build 2 200905130 6D GTGAGAGAGA GAGAGG/------ GAGAGGGAGA 3070 hom 33 het 22 0 16 6 GAGAGG 3 2 312233 CASAVA_Build 2 200908362 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 447 hom 21 1 19 1 A 10 11 312234 CASAVA_Build 2 200924681 1I TAGATTGAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 9 10 312235 CASAVA_Build 2 200931962 1D CCTGACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 26 1 20 5 A 11 10 312236 CASAVA_Build 2 200936269 5D TGCTTATTAT AGTGC/----- AGTGCTATAC 3070 hom 117 het 40 0 40 0 AGTGC 2 1 312237 CASAVA_Build 2 200940677 2D TGAATTCCAA TT/-- TTTATGCTAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 5 3 312238 CASAVA_Build 2 200942068 4I AAAAGAAGAG ----/AGAT AGTTATGGCT 3070 hom 51 het 27 0 20 7 AGAT 0 1 312239 CASAVA_Build 2 200961581 1D TTTTGAGATG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 60 het 24 0 18 6 C 10 9 312240 CASAVA_Build 2 200973091 14D GATTAAAATA CCAAAAACAAAATG/-------------- CCAAAAACAA 3070 het 3032 hom 39 9 19 18 CCAAAAACAAAATG 2 1 312241 CASAVA_Build 2 200973137 1I GAAGATAACA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 35 9 12 14 T 7 8 312242 CASAVA_Build 2 200983381 1D ACAAAACAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 82 het 34 0 28 6 A 9 8 312243 CASAVA_Build 2 200984452 1I TACTCTAGTA -/T TTCTCAGTAG 3070 hom 148 het 56 0 50 6 T 2 3 312244 CASAVA_Build 2 200986263 4D CAGTTTATCT TATC/---- TATCTCTAAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 TATC 2 1 312245 CASAVA_Build 2 200995493 4D CAGCAGAGTG AGTA/---- AGACTCCTCA 3070 hom 31 het 31 0 14 20 AGTA 1 0 312246 CASAVA_Build 2 200997292 1D TTATCTCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 8 10 6 A 10 9 312247 CASAVA_Build 2 201001020 2I21M1D CCTGGGTGAC --AGCGAGACCGTGTCTCAAAAAC/AGAGCGAGACCGTGTCTCAAAAA- AAAAAAAAAA 2517 het 2517 ref 22 13 9 6 N/A 0 0 312248 CASAVA_Build 2 201011287 1I GAACCTGGCC -/T TTCAAGAGCA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 2 3 312249 CASAVA_Build 2 201018821 2D CTGGCTTTTC TG/-- TGTGTCCTTT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 TG 3 2 312250 CASAVA_Build 2 201031702 1D ACACACTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 7 A 12 11 312251 CASAVA_Build 2 201034994 1D AATTATTTTA T/- TCTTATGAAA 3070 het 3070 hom 44 16 24 6 T 2 1 312252 CASAVA_Build 2 201036011 1I ATATGTGTGC -/A AAAAAGGGAA 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 A 5 6 312253 CASAVA_Build 2 201037746 1D TGCGCCTGGC A/- ACAGAATTAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 2 1 312254 CASAVA_Build 2 201055000 1D GCAAAAGACC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 8 312255 CASAVA_Build 2 201059903 1I GAATCGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 19 10 T 10 11 312256 CASAVA_Build 2 201060120 1D CAAGTTATGT A/- ACTGTTATGG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 2 1 312257 CASAVA_Build 2 201065800 1I TCTAAATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 T 10 11 312258 CASAVA_Build 2 201065891 1D CCACTAGTAA T/- TTTAGAATCA 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 T 4 3 312259 CASAVA_Build 2 201068016 1D AAAAACTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 71 het 32 0 25 8 T 9 8 312260 CASAVA_Build 2 201095553 4I TGCAAACCTC ----/ACTT AACATCTACA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 ACTT 0 1 312261 CASAVA_Build 2 201102479 12D TTTCGTTTTG TTTTGTTTTGTT/------------ TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 9 TTTTGTTTTGTT 1 0 312262 CASAVA_Build 2 201114003 1I GAAGGTGGAA -/G GGCAAGAAAG 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 G 2 3 312263 CASAVA_Build 2 201143600 2D ACATACAAAC AT/-- ATATTAATAT 2746 het 2746 ref 17 8 8 1 AT 3 2 312264 CASAVA_Build 2 201148667 3I GTTCCCAGTT ---/CTA CTACTACTGT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 CTA 2 3 312265 CASAVA_Build 2 201149185 1D CCAAGGGGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 125 hom 37 2 16 19 T 10 9 312266 CASAVA_Build 2 201156529 1I AATGAAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 12 11 T 10 11 312267 CASAVA_Build 2 201158133 1I CAAGTGAAAA -/G AAGCCTGGAA 3070 hom 59 het 22 0 20 2 G 0 1 312268 CASAVA_Build 2 201158293 1D ATTTTCCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 37 1 33 4 T 11 10 312269 CASAVA_Build 2 201165518 1I TGCTGCTATG -/C TGCCAGGCTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 312270 CASAVA_Build 2 201166454 1I CTTTAGAATT -/A AGAGTCACAA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 A 1 2 312271 CASAVA_Build 2 201173444 1D TGTATGTGGC G/- GGGGGGGACA 3070 het 2111 hom 38 12 16 12 G 8 7 312272 CASAVA_Build 2 201174601 1I TTTACTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 24 1 22 1 A 10 11 312273 CASAVA_Build 2 201178479 4D GTCTTATTGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 15 11 312274 CASAVA_Build 2 201181703 1I TCTATCATTA -/C CCCCACCTTC 3070 hom 161 het 58 0 52 6 C 4 5 312275 CASAVA_Build 2 201183045 1I TAAAACTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 24 1 16 7 T 13 14 312276 CASAVA_Build 2 201184676 1I AATTAGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1187 hom 32 5 17 10 T 15 16 312277 CASAVA_Build 2 201187983 1D TTTTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 11 10 312278 CASAVA_Build 2 201190179 1D AATATGTCTG C/- CACATAGATG 3070 het 3070 ref 57 27 21 11 C 2 1 312279 CASAVA_Build 2 201229282 1I TGTTAATTAT -/A AAAAACATGT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 5 6 312280 CASAVA_Build 2 201259266 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1775 het 1775 ref 35 25 4 7 A 13 12 312281 CASAVA_Build 2 201264207 1I AGATTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 32 1 23 8 A 11 12 312282 CASAVA_Build 2 201271979 1D TGGCCTCCCC T/- GATGAGAGGA 3070 hom 84 het 29 0 29 2 T 1 0 312283 CASAVA_Build 2 201282346 1D TTATAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 35 0 29 7 T 17 16 312284 CASAVA_Build 2 201320145 1D AGCCTGTATG A/- AAAAAAAAAA 1282 het 1282 ref 26 15 4 7 A 13 12 312285 CASAVA_Build 2 201327058 1D CAGGGGGAAG A/- AAAAAAAAAC 1642 het 1642 ref 51 42 4 5 A 10 9 312286 CASAVA_Build 2 201354108 1I ATCGAGACCA -/T CCTGGCTAAC 3070 het 1605 hom 15 4 9 2 T 0 1 312287 CASAVA_Build 2 201356534 22I TAATAAGCCC ----------------------/CTTGTTATTAAGGCTACTTAGA CCATATGGAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 5 CTTGTTATTAAGGCTACTTAGA 0 1 312288 CASAVA_Build 2 201358883 1I GAATTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2682 hom 28 8 15 5 T 11 12 312289 CASAVA_Build 2 201360216 1D TTAAAAAAAA T/- ATATATTTAG 3070 het 3070 ref 35 13 15 9 T 1 0 312290 CASAVA_Build 2 201367091 1I TTGTCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 2224 het 2224 ref 27 14 6 7 T 10 11 312291 CASAVA_Build 2 201368524 1D AATTGTATTT C/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 36 21 14 2 C 1 0 312292 CASAVA_Build 2 201390610 1D TTTTTGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2668 hom 35 10 16 9 T 12 11 312293 CASAVA_Build 2 201399596 93D ATTTTAGTAA CCTTGAATCAGAACCTCAGTTGTTAAAGGCTTAACTGCTTGTGGCAACTACTATAGTGCTCTAGTGGGGACAGTGGTTAAAATCTGCAGAATC/--------------------------------------------------------------------------------------------- CCTTGCTTTG 3070 het 3070 ref 22 34 8 4 CCTTGAATCAGAACCTCAGTTGTTAAAGGCTTAACTGCTTGTGGCAACTACTATAGTGCTCTAGTGGGGACAGTGGTTAAAATCTGCAGAATC 1 0 312294 CASAVA_Build 2 201399909 5D AGTTTACAGC TTTTT/----- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 30 10 15 6 T 12 7 312295 CASAVA_Build 2 201408518 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 8 9 312296 CASAVA_Build 2 201410217 1D CCACCCCATC T/- GGGCTGGAGT 2604 het 1447 hom 22 5 7 15 T 1 0 312297 CASAVA_Build 2 201428589 1D CAAGACTCCG C/- CCCCCCCCCA 2873 het 767 hom 13 2 7 4 C 10 9 312298 CASAVA_Build 2 201436112 1I GCTACAATTC -/T TTTTTTTTTT 2881 het 1477 hom 19 5 7 7 T 10 11 312299 CASAVA_Build 2 201440003 2D GCTCCCCCAA AC/-- ACACACTAGG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 AC 4 3 312300 CASAVA_Build 2 201443952 4I ACACAATATT ----/TTAA TTAATTAATT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 TTAA 2 3 312301 CASAVA_Build 2 201446164 1D TATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2035 het 1888 hom 20 7 7 6 T 15 14 312302 CASAVA_Build 2 201454635 1I ACAGACCTAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 6 7 312303 CASAVA_Build 2 201457119 9I GTGGCTTTGG ---------/CCTGTAATC GCAGCACTTT 1136 het 1136 ref 19 9 4 6 CCTGTAATC 0 1 312304 CASAVA_Build 2 201463923 1D TTAAACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1290 hom 27 6 10 11 T 17 16 312305 CASAVA_Build 2 201471139 4D TTCAGAGAGA TAAG/---- TAACTTTATT 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 TAAG 1 0 312306 CASAVA_Build 2 201475552 4I AATTAACAAT ----/ATAA ATAAATTAAA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 ATAA 1 2 312307 CASAVA_Build 2 201477631 4D TTTTTCTCTT TTTG/---- TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 TTTG 1 0 312308 CASAVA_Build 2 201501270 3D GTTGCAGAGA GCT/--- GAGATCACAT 2909 het 2909 ref 14 8 6 1 GCT 1 0 312309 CASAVA_Build 2 201518432 20I ACTGAGGAAA --------------------/GGAAGCTGAGAAGCTTCCTG GGAAGCTGAG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 GGAAGCTGAGAAGCTTCCTG 0 1 312310 CASAVA_Build 2 201526394 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAAAAGGAAA 3070 het 3026 hom 44 12 29 4 TA 1 0 312311 CASAVA_Build 2 201529468 1D AATTAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 11 10 312312 CASAVA_Build 2 201538185 3I CATTATAAAT ---/AAG AAGAATTTGG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 AAG 1 2 312313 CASAVA_Build 2 201538458 1I AAGAAATTTG -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 7 8 312314 CASAVA_Build 2 201552497 1D GCTAGGTGTG A/- AAAAAAAAAA 1547 het 1547 ref 37 26 5 6 A 11 10 312315 CASAVA_Build 2 201556635 2D AATTATATTC AT/-- ATGATACATT 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 AT 2 1 312316 CASAVA_Build 2 201564723 4I TAAAAATAAA ----/AAAT AAATTTAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 AAAT 1 2 312317 CASAVA_Build 2 201587292 2I AAACACAGTG --/AT ATATATAACA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AT 3 4 312318 CASAVA_Build 2 201620764 12D TAGAATAACA CTGTTAAAGGGC/------------ CAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 28 13 13 3 CTGTTAAAGGGC 1 0 312319 CASAVA_Build 2 201681219 3I GTTATTTGGT ---/ATC ATCATTTAAG 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 ATC 1 2 312320 CASAVA_Build 2 201693607 1D ATAGTTACTT A/- ACTCCAAGGT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 2 1 312321 CASAVA_Build 2 201700085 1D CTGGCTAGGG A/- AAAGTAAACT 3070 het 3070 hom 33 10 17 7 A 4 3 312322 CASAVA_Build 2 201704923 1D TGTGAAGTAC T/- TTTTAAACTG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 5 4 312323 CASAVA_Build 2 201705400 1D GGGGGAAAAA T/- ATATATATAT 970 het 493 hom 14 4 3 7 T 1 0 312324 CASAVA_Build 2 201708675 3I ACTGCTCACT ---/ACA GCCTTGACCT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 ACA 0 1 312325 CASAVA_Build 2 201713724 8D TATCTGTATG TATGTATA/-------- TATATATATA 3070 het 1557 hom 24 8 14 4 TATGTATA 1 0 312326 CASAVA_Build 2 201714671 2D ATGAGCATAA GT/-- GTATCATATA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 GT 2 1 312327 CASAVA_Build 2 201724531 3I TAAGTGTCTT ---/CTC CTTTTCAGCC 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 CTC 0 1 312328 CASAVA_Build 2 201741650 2I AGTAAAACTG --/TC TGTTTGCAGA 3070 het 3070 ref 41 22 19 0 TC 0 1 312329 CASAVA_Build 2 201743383 2D GAATTCTAAC AA/-- GAGGAATTCC 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 2 0 312330 CASAVA_Build 2 201744648 4D TAGAGAATAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 31 0 26 7 A 15 11 312331 CASAVA_Build 2 201768511 2I CTAAAGGACT --/AA AAAGAGTAGG 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 3 5 312332 CASAVA_Build 2 201774575 1I TTGGCCACGG -/C CACATGCAGT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 C 1 2 312333 CASAVA_Build 2 201786324 5I GTATGAGTAT -----/TAGTA TAGTATGTTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 TAGTA 1 2 312334 CASAVA_Build 2 201793297 1D AGAGGGAGGT G/- GGGGGGTGGG 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 G 7 6 312335 CASAVA_Build 2 201804139 1I CTTAAAGATA -/T AAATGTTAAA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 T 0 1 312336 CASAVA_Build 2 201805777 6D TCACGCAGCT AGTAAG/------ TGGCAGAGCA 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 AGTAAG 1 0 312337 CASAVA_Build 2 201811415 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2360 het 2360 ref 24 11 8 5 T 10 11 312338 CASAVA_Build 2 201827050 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1623 het 471 hom 20 1 5 14 A 16 17 312339 CASAVA_Build 2 201831725 8D TAAGTACTTT ATTCTGTC/-------- ATTCTGTCGA 3070 hom 89 het 29 0 28 7 ATTCTGTC 2 1 312340 CASAVA_Build 2 201831963 4I GATCTCAGGC ----/AAGT AAGTAATTCC 3070 hom 76 het 33 0 26 7 AAGT 1 2 312341 CASAVA_Build 2 201838348 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 12 11 312342 CASAVA_Build 2 201879755 1I TATATCTGGC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 A 8 9 312343 CASAVA_Build 2 201885703 1D GCTCCCACTC G/- GATGGACAGA 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 G 2 1 312344 CASAVA_Build 2 201887664 1I CACTTGAGAA -/C ATTTATCACA 3070 het 3070 ref 35 20 15 0 C 0 1 312345 CASAVA_Build 2 201892378 1D TAAGAATCCT A/- GAAGAAAACC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 1 0 312346 CASAVA_Build 2 201899196 1D GAAAAAAGTT G/- AAAGCATTCC 3070 het 3070 ref 41 18 17 8 G 1 0 312347 CASAVA_Build 2 201907154 1I TTTTTTCATG -/T GTCTTTTGGC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 0 1 312348 CASAVA_Build 2 201908238 2D TTCTAGACTC TA/-- TTTCATTTAT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 TA 1 0 312349 CASAVA_Build 2 201914504 2D TATATGTATG TA/-- TATATATATA 1229 het 1229 ref 20 16 3 1 TA 7 6 312350 CASAVA_Build 2 201920611 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2104 hom 30 9 14 7 A 8 9 312351 CASAVA_Build 2 201921393 1I TCTTAGGGGA -/T TCCCTAGGAT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 1 2 312352 CASAVA_Build 2 201929484 3D CTTCTCATAG CTT/--- CTTAAGTGGG 3070 het 3070 ref 52 27 20 7 CTT 2 1 312353 CASAVA_Build 2 201930772 1D GGTTTTCCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 11 10 312354 CASAVA_Build 2 201932910 1I TCTTATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 11 12 312355 CASAVA_Build 2 201935291 1I GAGTTTTTTT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 7 8 312356 CASAVA_Build 2 201938007 17D AGGTCAATGC TAAAGAAAATATATATA/----------------- TATATATTTT 3070 het 3070 ref 29 13 14 8 TAAAGAAAATATATATA 1 0 312357 CASAVA_Build 2 201940570 1I TGGGCAACAT -/G GTGAAAACCT 2516 het 1757 hom 12 5 6 1 G 1 2 312358 CASAVA_Build 2 201949572 1D CAGGGATGGA G/- GGGGGAAAGG 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 G 6 5 312359 CASAVA_Build 2 201952275 1D CAGTTTGAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 9 8 312360 CASAVA_Build 2 201954190 2D CCCAGAGCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2492 hom 33 14 11 9 A 17 15 312361 CASAVA_Build 2 201954741 1I TGAGAAATAA -/T AAACTTCTAA 3070 het 3070 ref 35 20 15 0 T 0 1 312362 CASAVA_Build 2 201955474 1D ATATATTGTA T/- TCCCAGTCTC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 2 1 312363 CASAVA_Build 2 201962534 1I AGAGAAGAGA -/C ATGTATGTGC 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 C 0 1 312364 CASAVA_Build 2 201965212 5D CTTGGAACTT TACTC/----- TAAGTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 TACTC 1 0 312365 CASAVA_Build 2 201968149 1D ATGATTAAAA C/- AGCAATCAGA 3070 het 3070 ref 62 31 25 8 C 1 0 312366 CASAVA_Build 2 201970930 2D CCTGCTACTA TC/-- CACTTTTCAG 3070 het 3070 ref 53 30 19 6 TC 1 0 312367 CASAVA_Build 2 201973112 3I GCTGGTGGTA ---/ATG ATGCAGGGAA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 ATG 1 2 312368 CASAVA_Build 2 201976047 1I TTAAGGATAT -/A AAAAACAACT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 5 6 312369 CASAVA_Build 2 201984342 1D GAAGGTCTGC T/- CCAATGTGGC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 1 0 312370 CASAVA_Build 2 201988068 2I TGTCTCCTTC --/AT ATGTCCATTT 3070 het 3070 ref 59 30 25 4 AT 1 2 312371 CASAVA_Build 2 201990020 4D3M5D2M7D2M6D ATCTGTGGAG TTAAATGTAACTCCACATTAACTACACAG/----ATG-----CC-------CT------ TTAAATGTAA 3070 hom 42 het 15 0 15 6 N/A 0 0 312372 CASAVA_Build 2 201992482 5I ACAAGCAAAC -----/TTAAT TTAAAGTGGC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 TTAAT 0 1 312373 CASAVA_Build 2 201994537 1I CCCCTGGGGT -/G GGGGGGGGCA 3012 het 3012 ref 26 10 10 6 G 8 9 312374 CASAVA_Build 2 202028401 3D TAATGAGTAG ACC/--- ACGTGTAGTG 3070 het 3070 ref 32 21 10 2 ACC 1 0 312375 CASAVA_Build 2 202029554 1D CTTTTTTTCC T/- TAAACGAGAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 2 1 312376 CASAVA_Build 2 202032851 6D CTGAAATTCT TCCTCA/------ TCCATAAAGA 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 TCCTCA 1 0 312377 CASAVA_Build 2 202040940 1I TGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 11 12 312378 CASAVA_Build 2 202041054 11D TTTTTTTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 17 13 7 T 23 12 312379 CASAVA_Build 2 202052425 1D AATATAAAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 411 hom 32 1 28 3 T 10 9 312380 CASAVA_Build 2 202057738 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 1513 het 88 hom 11 1 7 3 A 15 16 312381 CASAVA_Build 2 202069096 5I ATCTATATAC -----/ATATA ATATTATATA 2967 het 2967 ref 24 16 8 0 ATATA 0 1 312382 CASAVA_Build 2 202071890 35D AACGATTGCT GAGACTCACACTTCCAAATTAGATACCTAAAAGGG/----------------------------------- GATTTGAAAA 3070 het 3070 ref 35 23 19 8 GAGACTCACACTTCCAAATTAGATACCTAAAAGGG 1 0 312383 CASAVA_Build 2 202075864 1I TGATACTGTG -/T TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 2 3 312384 CASAVA_Build 2 202076729 1I GATTGATAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 9 10 312385 CASAVA_Build 2 202092910 1D ATCACTTCAC T/- GTCAAACACT 3070 het 3070 ref 42 21 17 6 T 1 0 312386 CASAVA_Build 2 202094400 2D AGAGACAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 2821 het 537 hom 23 6 10 9 AG 10 9 312387 CASAVA_Build 2 202096622 1I CTGAAATGCC -/T GAAATGACAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 0 1 312388 CASAVA_Build 2 202100126 1I TCCCATTCAC -/A ATAGCCAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 1 2 312389 CASAVA_Build 2 202103548 1D TAAGGGATTT A/- AAATTTAATG 3070 hom 123 het 45 0 42 4 A 4 3 312390 CASAVA_Build 2 202107750 2I TAAGCAAAAG --/AA TGTTAATTTC 3070 hom 148 het 52 0 50 2 A 0 2 312391 CASAVA_Build 2 202110496 2D AAAACAATAA AC/-- ACATATGTAT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 AC 2 1 312392 CASAVA_Build 2 202112529 1I AACGAGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2455 hom 32 8 14 10 T 10 11 312393 CASAVA_Build 2 202115141 1I CCTAGGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 55 23 26 6 A 9 10 312394 CASAVA_Build 2 202123564 4I ATTTCACTCC ----/CAAA CATTCTATTC 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 CAAA 0 1 312395 CASAVA_Build 2 202125190 1I GAACTCAGGG -/A ATCCTCTCCT 3070 hom 60 het 24 0 19 5 A 1 2 312396 CASAVA_Build 2 202129804 3D AAAAAATATA AAT/--- AATAAATAAA 519 het 519 ref 10 2 2 6 AAT 2 1 312397 CASAVA_Build 2 202137402 1I AAACTAAGAG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 37 26 9 2 A 7 8 312398 CASAVA_Build 2 202138273 1D GCCTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 31 6 11 14 A 15 14 312399 CASAVA_Build 2 202138925 2I TTTGAACCCT --/TC TCTCTTTTAC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 TC 2 3 312400 CASAVA_Build 2 202139175 1D TTTAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1456 hom 14 5 7 2 T 11 10 312401 CASAVA_Build 2 202139602 1I GTTCCAAGTC -/T TTGCTATTGT 2314 het 2314 ref 15 10 5 0 T 2 3 312402 CASAVA_Build 2 202144999 1D CTGAAAAAAA T/- GTAAGTGTAT 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 T 1 0 312403 CASAVA_Build 2 202150218 1I TTCCAACATC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 9 10 312404 CASAVA_Build 2 202173724 1D AATGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 188 hom 34 3 16 15 T 14 13 312405 CASAVA_Build 2 202174019 1I CGCCCAGCCA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 6 7 312406 CASAVA_Build 2 202180017 1I AAGTACACAC -/A AAAACAAGAA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 A 4 5 312407 CASAVA_Build 2 202184666 1I ATCAACAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 10 11 312408 CASAVA_Build 2 202192249 1I TGGCTGGAGG -/C CAGCTTTGGA 3070 hom 56 het 23 0 16 7 C 1 2 312409 CASAVA_Build 2 202201129 2D TAGAAAATAT AA/-- AAGTTTCTTG 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 4 2 312410 CASAVA_Build 2 202202876 1D CTGGTAGCCA T/- TTTTTTTTTT 2611 het 1461 hom 22 6 10 6 T 11 10 312411 CASAVA_Build 2 202208731 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 1689 het 226 hom 21 2 11 8 A 15 16 312412 CASAVA_Build 2 202214624 2I52M2D GTACGATAAA --ATATATTTATATGCTATATTTAAGACATATCTTGTATACATATCGTGTGTGCAT/ATATATATTTATATGCTATATTTAAGACATATCTTGTATACATATCGTGTGTGC-- ATATATATAT 2972 het 2972 ref 23 23 7 14 N/A 0 0 312413 CASAVA_Build 2 202217983 1I GAGGTAAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 8 9 312414 CASAVA_Build 2 202220094 1D ACGCAACCGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 A 8 7 312415 CASAVA_Build 2 202231757 1I AGTTTATTAA -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 T 6 7 312416 CASAVA_Build 2 202232184 1D GTGTTTATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 312417 CASAVA_Build 2 202237076 1I TCATCTATGA -/T TTTTTCATGG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 5 6 312418 CASAVA_Build 2 202242525 8I TTTATAAATC --------/AAGGTATT AATGACTATC 3070 hom 27 het 15 0 10 5 AAGGTATT 0 1 312419 CASAVA_Build 2 202245741 1I CCTACCAACC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 358 hom 24 1 20 3 A 8 9 312420 CASAVA_Build 2 202246546 1I ATTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2100 hom 23 7 11 5 A 9 10 312421 CASAVA_Build 2 202253328 1I CTGGCGAGGG -/C CCACTCCGTG 3070 hom 114 het 42 0 37 5 C 2 3 312422 CASAVA_Build 2 202271116 4I TTGTTTTAAA ----/AGTC AGTATTTCCA 3070 hom 172 het 60 0 58 2 AGTC 0 1 312423 CASAVA_Build 2 202279362 2D TCAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2715 hom 19 het 11 0 8 4 A 13 11 312424 CASAVA_Build 2 202281848 1D TGTATAGTTG A/- AAAAAACTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 6 312425 CASAVA_Build 2 202283152 1I AATACTTTAA -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 138 het 54 0 47 7 T 7 8 312426 CASAVA_Build 2 202283402 1I CCCCATATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 24 1 14 9 A 12 13 312427 CASAVA_Build 2 202284830 4D TCAGAAACAC CTAA/---- CTAACAACAG 3070 hom 87 het 35 0 29 8 CTAA 2 1 312428 CASAVA_Build 2 202302175 1D ATTAAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 1466 het 1466 ref 33 23 4 6 A 13 12 312429 CASAVA_Build 2 202313505 3D GAATCACAGA AAC/--- AACAAAATCT 3070 hom 54 het 25 0 19 9 AAC 2 1 312430 CASAVA_Build 2 202320430 1D CACTCGGTCG C/- TTTTTTTTTT 1453 het 228 hom 13 5 4 4 C 1 0 312431 CASAVA_Build 2 202321619 4D TTGCAATATC TTTG/---- TTTGTGATAA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TTTG 2 1 312432 CASAVA_Build 2 202322187 1D ATCTAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 200 hom 36 1 26 9 A 14 13 312433 CASAVA_Build 2 202323560 1D ACAGACAAAA G/- AAACTAGATT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 1 0 312434 CASAVA_Build 2 202329503 1I TATAGCCCAT -/G GGCCAAACAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 2 3 312435 CASAVA_Build 2 202340674 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1036 het 1036 ref 11 8 3 1 A 13 12 312436 CASAVA_Build 2 202343419 1D CCACCACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 107 het 46 0 37 9 T 11 10 312437 CASAVA_Build 2 202356454 1D AAGAATTTCA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 116 het 44 0 39 8 T 7 6 312438 CASAVA_Build 2 202360300 1D CGTCTCTACT A/- AAAAATACAA 2815 hom 18 het 7 0 7 0 A 6 5 312439 CASAVA_Build 2 202361244 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 12 11 312440 CASAVA_Build 2 202363058 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 11 10 312441 CASAVA_Build 2 202371559 1D GTGCAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 40 1 23 16 T 13 12 312442 CASAVA_Build 2 202381893 4D ATTATTTATA TATT/---- TATTTATTTA 2402 hom 15 het 7 0 6 1 TATT 5 4 312443 CASAVA_Build 2 202397381 1D TACTTATTGC T/- GTAATAAGTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 1 0 312444 CASAVA_Build 2 202398472 1D AAAGAGAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 501 hom 35 2 23 10 A 11 10 312445 CASAVA_Build 2 202401520 1I ATACTCTTGA -/C TGCATTGACC 3070 hom 150 het 55 0 50 5 C 0 1 312446 CASAVA_Build 2 202406022 1D GGGAACCTAG T/- TAATGGCTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 1 312447 CASAVA_Build 2 202416875 2I4M4D5M8D GGACACTAAG --GAATTGTGTAACAAAATGACT/CAGGAT----TAACA-------- TCTTGGTTCC 3070 het 3070 ref 36 26 12 5 N/A 0 0 312448 CASAVA_Build 2 202418127 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 32 1 28 3 A 11 10 312449 CASAVA_Build 2 202418814 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 AG 10 8 312450 CASAVA_Build 2 202426700 1D ATTATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 293 hom 24 1 17 6 A 13 12 312451 CASAVA_Build 2 202430266 1I TTTTAAAAAA -/T TTTTCTGTTG 2161 het 2161 ref 13 6 6 1 T 4 5 312452 CASAVA_Build 2 202440550 1I CTGTGATCAT -/G GCTCATGCCA 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 G 1 2 312453 CASAVA_Build 2 202441655 1D ATAAGTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3066 het 2639 hom 19 8 8 4 A 12 11 312454 CASAVA_Build 2 202443490 1I CAGCCTGGAC -/A AAAAAAAAAA 1571 het 1571 ref 25 11 6 8 A 12 13 312455 CASAVA_Build 2 202446082 1D CTGAAAATAT G/- GTAGAATTTA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 G 2 1 312456 CASAVA_Build 2 202453845 1D GGTTTCTTTG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 102 het 36 0 33 4 A 8 7 312457 CASAVA_Build 2 202461020 1D TTTTTTTTTT G/- CTTGTGCTTT 1662 het 1662 ref 48 19 10 19 G 1 0 312458 CASAVA_Build 2 202473169 1D TTTGGCTTTG T/- TTTTTCATAT 3070 het 3070 hom 54 20 23 12 T 6 5 312459 CASAVA_Build 2 202475878 2I ACTCCCTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2373 het 668 hom 10 2 6 2 A 10 12 312460 CASAVA_Build 2 202494131 25D ATCTCTCTTC CCAGACCCCTGGAGGGAGCCTGGCA/------------------------- CCAGACCCCT 3070 het 3070 hom 34 19 20 6 CCAGACCCCTGGAGGGAGCCTGGCA 1 0 312461 CASAVA_Build 2 202504353 3I ATAGCAAAAC ---/TCA TCATGGAGAA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 TCA 1 2 312462 CASAVA_Build 2 202506059 22I ATGCATGCCT ----------------------/GTGTGTGTGCGCGCGCACGCGC GTGTGTGTGT 3070 hom 80 het 35 0 23 12 GTGTGTGTGCGCGCGCACGCGC 0 1 312463 CASAVA_Build 2 202508197 2D TCCTTCTCCC CT/-- GATTCTTCCC 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 CT 1 0 312464 CASAVA_Build 2 202513674 1I TTCCCAGTGA -/G GTTGGCTGAG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 G 1 2 312465 CASAVA_Build 2 202516351 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 10 11 312466 CASAVA_Build 2 202517044 1D TACTAAGAAT A/- AGAATAAGAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 1 312467 CASAVA_Build 2 202531793 3D GCAATTCAGA TTT/--- TTTTTTTTAT 3070 het 1604 hom 27 6 17 5 T 11 8 312468 CASAVA_Build 2 202559508 3I TCCACCTGTG ---/AGA AGGAGTTGCA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 AGA 0 1 312469 CASAVA_Build 2 202565369 3D AAGCAACCAA TGT/--- TGTTACAAAT 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 TGT 2 1 312470 CASAVA_Build 2 202569568 1I AAAGGAGGGA -/T TTTTTTTTTT 1429 het 1429 ref 38 15 8 15 T 15 16 312471 CASAVA_Build 2 202570723 1D ATTCAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 T 11 10 312472 CASAVA_Build 2 202573129 1D GTGGGTAAAT C/- AGACAGCTAT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 C 1 0 312473 CASAVA_Build 2 202578154 1D TTGCTTCCCT G/- GCCCCAAACA 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 G 2 1 312474 CASAVA_Build 2 202593216 1I ACAGCCAGCA -/G GCACAGCCAG 3070 hom 72 het 27 0 22 5 G 1 2 312475 CASAVA_Build 2 202599825 2D CTCTCTCTCT CA/-- CACACACACA 3070 hom 166 het 71 0 55 17 CA 10 9 312476 CASAVA_Build 2 202604701 1D AAGCATGAAA T/- TTTGATTTAG 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 T 4 3 312477 CASAVA_Build 2 202613567 1D TCACTGAAAA G/- GCAGGTGGCT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 G 2 1 312478 CASAVA_Build 2 202627311 16D AAAGGAAGAA AGAAGGAAGGAAGGAG/---------------- AGAAGGAAGG 3070 het 3070 ref 38 23 13 7 AGAAGGAAGGAAGGAG 1 0 312479 CASAVA_Build 2 202634129 2D TATATGTTTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 1906 hom 28 10 17 2 TG 12 11 312480 CASAVA_Build 2 202665576 1D GAGGGGTGGG C/- CCATTGGGAA 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 C 3 2 312481 CASAVA_Build 2 202678096 1D GAAAAGGAAA G/- GGGAAAAAGG 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 G 4 3 312482 CASAVA_Build 2 202679672 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 2254 het 2254 ref 20 11 9 0 T 8 9 312483 CASAVA_Build 2 202680211 2D CAAAAAAAAA AT/-- AAAAAAAGAA 3070 het 148 hom 30 2 18 10 AT 1 0 312484 CASAVA_Build 2 202687615 3I TGTCAATATG ---/ACA ATGCTTCAGT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 ACA 0 1 312485 CASAVA_Build 2 202688718 1I TGTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 903 hom 38 4 17 17 A 15 16 312486 CASAVA_Build 2 202688883 1I CTTCAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 11 12 312487 CASAVA_Build 2 202691569 1D GGGCAGTTTC T/- GTTCTGGGCT 3070 het 3070 hom 52 17 24 11 T 1 0 312488 CASAVA_Build 2 202692243 1D CCGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 8 A 12 11 312489 CASAVA_Build 2 202700082 1I GAGAAGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 40 0 29 11 A 10 11 312490 CASAVA_Build 2 202701408 2D TTTTTGGGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1091 hom 31 8 13 10 T 12 10 312491 CASAVA_Build 2 202716520 1D TTTCCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 T 15 14 312492 CASAVA_Build 2 202718008 1D GTGCAGACTC G/- GGGATGTCAC 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 G 4 3 312493 CASAVA_Build 2 202737911 1I TGGCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2975 hom 33 11 14 8 T 11 12 312494 CASAVA_Build 2 202741386 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1818 het 151 hom 13 3 6 4 A 17 16 312495 CASAVA_Build 2 202744174 2D GACACACATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 44 het 22 0 17 6 CA 9 8 312496 CASAVA_Build 2 202763056 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1152 het 1152 ref 30 26 3 1 A 11 10 312497 CASAVA_Build 2 202764522 1D ATCTCTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 35 0 29 6 A 11 10 312498 CASAVA_Build 2 202777726 2D CAGAAATAAA AC/-- AGTCAAACAC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 AC 1 0 312499 CASAVA_Build 2 202785782 1D AGTTTTTTTT A/- ATGTGAGTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 1 312500 CASAVA_Build 2 202792631 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 644 hom 22 2 17 3 A 12 11 312501 CASAVA_Build 2 202796671 1D TGTAATGTGG T/- TTTATGCCCC 3070 hom 132 het 49 0 44 5 T 4 3 312502 CASAVA_Build 2 202812959 1D CTTTTAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 12 11 312503 CASAVA_Build 2 202846086 1D GAGCGAGACT C/- CGTCTCAATA 3070 het 1217 hom 12 3 8 1 C 2 1 312504 CASAVA_Build 2 202847984 1I ATAGCTTCTA -/C CACCTTCATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 2 312505 CASAVA_Build 2 202853604 1D CTGGCCATCA T/- TTTTTTTTTT 1484 het 1484 ref 18 9 4 5 T 12 11 312506 CASAVA_Build 2 202929865 1D CAGGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 23 1 18 4 T 12 11 312507 CASAVA_Build 2 202958698 1D ATTATATCTG T/- TTTTTTTACA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 T 8 7 312508 CASAVA_Build 2 202967859 1D CTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 22 2 16 4 T 13 12 312509 CASAVA_Build 2 202969762 2I AGCAAGAAAC --/TT TATTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 1 3 312510 CASAVA_Build 2 203001374 1D TTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 C 1 0 312511 CASAVA_Build 2 203002317 3D GCATCATTTC CTA/--- CTACTACTCC 3070 hom 96 het 36 0 32 5 CTA 3 2 312512 CASAVA_Build 2 203026174 1I ATATACTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 783 hom 34 3 25 6 T 12 13 312513 CASAVA_Build 2 203121053 1D ATTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 210 hom 31 1 24 6 A 12 11 312514 CASAVA_Build 2 203132272 1D TCCATCCCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 203 hom 30 1 22 7 A 16 15 312515 CASAVA_Build 2 203141353 3I AACTGGCAAG ---/TGA TGAGATTGTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TGA 1 2 312516 CASAVA_Build 2 203155911 1D CTCTTTTGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 50 24 22 5 T 10 9 312517 CASAVA_Build 2 203158559 1I TAATATGCTA -/G GGGGATATTA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 G 4 5 312518 CASAVA_Build 2 203166317 1D AGCTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1130 het 1130 ref 41 22 4 15 T 15 14 312519 CASAVA_Build 2 203167302 1D CTGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 1357 het 1357 ref 12 7 4 2 A 17 16 312520 CASAVA_Build 2 203173432 4D CCCATTGATG ACCT/---- ACCTCATTTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 ACCT 2 1 312521 CASAVA_Build 2 203186489 1D CTAGGGAATT A/- AAAAAAAAAA 1919 het 1919 ref 25 9 8 8 A 15 14 312522 CASAVA_Build 2 203198153 23D AAGTACAATG TCAATAAACCAAAAGAGGAAGGA/----------------------- TCAATAAACC 3070 het 3070 hom 31 13 17 15 TCAATAAACCAAAAGAGGAAGGA 2 1 312523 CASAVA_Build 2 203198881 2D GTCTCTTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 2157 het 2157 ref 39 17 10 13 A 16 14 312524 CASAVA_Build 2 203214610 1D TTTTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 22 2 14 6 T 15 14 312525 CASAVA_Build 2 203235349 3D GAGGCTGGAA GAG/--- GAGGTGATAG 3070 het 3070 hom 43 20 20 9 GAG 2 1 312526 CASAVA_Build 2 203238155 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1943 het 1943 ref 32 13 6 13 T 13 12 312527 CASAVA_Build 2 203263950 1D CGACTTATTC T/- TTTTAATTTC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 5 4 312528 CASAVA_Build 2 203264470 1D ATTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 7 A 11 10 312529 CASAVA_Build 2 203292360 5D TTTAAAAACT TTTTA/----- TTTTGAGAAA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TTTTA 1 0 312530 CASAVA_Build 2 203293573 1D CCAATATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 12 11 312531 CASAVA_Build 2 203300031 1I CAAAGAACAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 26 12 7 7 T 8 9 312532 CASAVA_Build 2 203316595 4I AAAAGAACAC ----/AAAT AAACAATACA 3070 het 3070 hom 44 19 19 6 AAAT 0 1 312533 CASAVA_Build 2 203318029 2I GCAGGCAGAT --/CA CTTGTGGTCA 3070 hom 27 het 12 0 9 3 CA 0 1 312534 CASAVA_Build 2 203319467 1D TGCCTCCATT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 8 312535 CASAVA_Build 2 203319917 1D CCACCACCGG A/- AAAAAAAACA 1511 hom 43 het 36 0 13 23 A 9 8 312536 CASAVA_Build 2 203322411 1D GTATAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 702 hom 32 2 26 4 A 12 11 312537 CASAVA_Build 2 203332526 2D GCCTGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1633 het 69 hom 22 2 6 14 T 18 16 312538 CASAVA_Build 2 203341039 1I GTAGAGGAAG -/T TTAAAAACAA 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 T 2 3 312539 CASAVA_Build 2 203358804 1D TGAAAACAAT A/- TAAAGTGATC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 1 0 312540 CASAVA_Build 2 203359524 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 10 9 312541 CASAVA_Build 2 203359721 1I ACATGCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1905 hom 36 4 23 9 T 13 14 312542 CASAVA_Build 2 203363129 4I CCAATTGAGG ----/TCTT TCTTTAAATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TCTT 1 2 312543 CASAVA_Build 2 203371674 1I GCTATCAAAC -/T TTGATACATT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 2 3 312544 CASAVA_Build 2 203373988 1I TGAATATAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 406 hom 22 1 18 3 A 8 9 312545 CASAVA_Build 2 203401247 3D AAAAAAAAAA AAC/--- AGACTTTTTA 3070 het 127 hom 24 3 15 6 AAC 1 0 312546 CASAVA_Build 2 203408184 7D GATTTCTTCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1162 het 43 hom 18 1 5 13 T 23 16 312547 CASAVA_Build 2 203419701 4D CAAAAGTGAG TCAT/---- TCATTCATTC 3070 hom 87 het 43 0 30 15 TCAT 6 5 312548 CASAVA_Build 2 203420664 4D ATATGGGAAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 TA 7 5 312549 CASAVA_Build 2 203450067 2D TCCCAGATGG TA/-- TATATATATA 3070 het 73 hom 21 2 11 10 TA 8 7 312550 CASAVA_Build 2 203450082 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 1667 hom 23 4 12 7 A 1 0 312551 CASAVA_Build 2 203456790 1I TTTGTAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 10 11 312552 CASAVA_Build 2 203457638 3I TTATTTCTTC ---/TTT CTTTACAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 3 312553 CASAVA_Build 2 203460271 2I GGGTTACAGG --/CA TGCCCCACTG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 CA 0 1 312554 CASAVA_Build 2 203462866 1I CCTCTCAAAA -/G GGGGGGAAAG 3070 hom 76 het 32 0 26 6 G 6 7 312555 CASAVA_Build 2 203471047 1D AACCACCCCC A/- CCCAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 A 1 0 312556 CASAVA_Build 2 203501989 1D TGAGCCATCA C/- GCCTGGCCTG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 1 0 312557 CASAVA_Build 2 203517776 1I TTTTTTCCAA -/C AGGAAGATCA 3070 hom 67 het 32 0 24 8 C 0 1 312558 CASAVA_Build 2 203531953 2D TTTAGTAATC TT/-- TTATTTTTTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 4 2 312559 CASAVA_Build 2 203532205 2I ATATTTTGAT --/AA AGAGTTGTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 1 3 312560 CASAVA_Build 2 203532784 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 25 2 18 5 A 14 13 312561 CASAVA_Build 2 203543828 1D TCTACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2104 het 2104 ref 41 20 5 17 T 15 14 312562 CASAVA_Build 2 203573095 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1107 het 1107 ref 16 12 3 1 A 13 12 312563 CASAVA_Build 2 203591241 1I CTTTTAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1681 hom 38 4 31 3 T 10 11 312564 CASAVA_Build 2 203591416 1I ACAAGACTTA -/C CTCTTTGGGT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 1 2 312565 CASAVA_Build 2 203620710 4D TTTCTTTCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 928 het 312 hom 25 6 3 16 T 20 16 312566 CASAVA_Build 2 203630721 1I AGAAAAGTTA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 6 7 312567 CASAVA_Build 2 203681365 1D GCTGGTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 22 0 16 6 T 12 11 312568 CASAVA_Build 2 203687824 2D GGTTCAAGTG TT/-- TCTTGTGCTT 3070 hom 69 het 27 0 23 5 T 3 1 312569 CASAVA_Build 2 203690428 1I GAGACTCCAT -/C TCAAAAGAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 C 0 1 312570 CASAVA_Build 2 203691263 2D CTAATATATA CT/-- CTGTGTTCAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 CT 2 1 312571 CASAVA_Build 2 203691934 1D TAAAGTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 34 1 24 11 T 15 14 312572 CASAVA_Build 2 203696105 1I GTAAATCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 901 hom 35 2 24 9 A 13 14 312573 CASAVA_Build 2 203710959 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 28 1 23 4 A 15 14 312574 CASAVA_Build 2 203714207 1I GATGAAATTT -/C CCTAAACAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 2 3 312575 CASAVA_Build 2 203727204 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 497 het 497 ref 16 10 5 1 A 17 16 312576 CASAVA_Build 2 203744646 1I AAAGACAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 12 13 312577 CASAVA_Build 2 203750987 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 2 A 12 11 312578 CASAVA_Build 2 203791299 2I TATATAGTGT --/TA TAAATGTTGT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 TA 1 2 312579 CASAVA_Build 2 203792835 1I CAAAGAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 26 0 22 4 A 8 9 312580 CASAVA_Build 2 203799723 1I GGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 11 12 312581 CASAVA_Build 2 203816361 2I CCACTCTCGC --/CT CTCTTTCTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 CT 2 3 312582 CASAVA_Build 2 203817701 2D GAAATAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2883 hom 32 het 18 0 10 8 T 18 16 312583 CASAVA_Build 2 203819644 4D ATTGATACAG TTAA/---- TTCAGAGTCA 3070 hom 123 het 46 0 42 7 TTAA 1 0 312584 CASAVA_Build 2 203825343 2D TATGTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 331 hom 28 2 24 3 TA 8 7 312585 CASAVA_Build 2 203827077 1D ACCATGCCCA G/- CTCATTTTTT 1560 hom 10 het 6 0 4 2 G 1 0 312586 CASAVA_Build 2 203829134 3D CGTGTGTCTC ATT/--- ATGTTTCCTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATT 1 0 312587 CASAVA_Build 2 203830118 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1146 het 1146 ref 22 14 3 5 A 11 10 312588 CASAVA_Build 2 203837686 1D TACTTTTATA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 8 7 312589 CASAVA_Build 2 203850323 5I CTCAAAAAAA -----/AAAAG AAAAGAAAAA 3070 het 53 hom 14 1 9 4 AAAAG 1 2 312590 CASAVA_Build 2 203859399 21I ATATTCATAG ---------------------/CAGTATTATTCAAAATAGCCC CAAATTGGAA 3070 hom 63 het 22 0 22 5 CAGTATTATTCAAAATAGCCC 0 1 312591 CASAVA_Build 2 203860675 4I TATCTCTTAA ----/AAAT AAATAAGTAA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 AAAT 1 2 312592 CASAVA_Build 2 203893650 19D TGATTGTCTT TTTTAAATTATTTGTGCTA/------------------- TTTTAAATTA 3070 hom 42 het 15 0 15 4 TTTTAAATTATTTGTGCTA 1 0 312593 CASAVA_Build 2 203894945 1I TAATCTAACA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 9 312594 CASAVA_Build 2 203903174 5D ATTTGAGAAT GACCC/----- GAACCACTGT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 GACCC 1 0 312595 CASAVA_Build 2 203929817 1D TTTTACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 13 12 312596 CASAVA_Build 2 203930012 3D GTTTTTAAAA TTT/--- TTGTCTGTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 T 5 2 312597 CASAVA_Build 2 203932814 1D GTACATTTTT G/- GGGGGGGGAC 3070 hom 53 het 26 0 19 7 G 9 8 312598 CASAVA_Build 2 203936121 1D CTTTTACATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 9 8 312599 CASAVA_Build 2 203942882 1D AGGATTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 12 11 312600 CASAVA_Build 2 203965936 1I CCTTTGCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 26 1 21 4 T 10 11 312601 CASAVA_Build 2 203967369 1I CTAAGAAGAG -/A GTAGGGTCTG 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 0 1 312602 CASAVA_Build 2 203976614 2I ATCATTTTCT --/TA TATATCTTAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TA 2 3 312603 CASAVA_Build 2 203985586 1D TATAATTAGG T/- TGATTTCATA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 2 1 312604 CASAVA_Build 2 203986866 3I TATAGTGACC ---/CAG CAGTTATACT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CAG 1 2 312605 CASAVA_Build 2 203995237 1I ACTGCCTGGG -/C GACAGTAAGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 0 1 312606 CASAVA_Build 2 204008338 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 13 0 11 4 A 15 14 312607 CASAVA_Build 2 204009996 2I GGTTAAAATG --/AC AGTCTCCTCC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AC 0 1 312608 CASAVA_Build 2 204034529 5I TAGGCTAAAA -----/ATCAG ATCAGACATC 3070 hom 89 het 33 0 30 3 ATCAG 1 2 312609 CASAVA_Build 2 204044786 3I CCATTCTTTA ---/TTT AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 T 0 3 312610 CASAVA_Build 2 204062108 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 60 het 28 0 20 8 A 9 8 312611 CASAVA_Build 2 204065743 1D TAATGCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 208 hom 27 1 18 9 T 15 14 312612 CASAVA_Build 2 204069338 5I AAAAATAAAT -----/AAATA AAATAAAATA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AAATA 2 3 312613 CASAVA_Build 2 204091508 1I ACAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 934 hom 19 2 13 4 A 10 11 312614 CASAVA_Build 2 204117558 2I TTGCAATGAC --/TA TTCATTCCCT 3070 hom 147 het 53 0 49 4 TA 0 1 312615 CASAVA_Build 2 204123711 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 720 hom 36 2 26 8 T 11 12 312616 CASAVA_Build 2 204126182 1I TGTCTCAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 11 12 312617 CASAVA_Build 2 204132090 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 2131 het 2033 hom 32 10 14 8 A 9 10 312618 CASAVA_Build 2 204148195 1I CAAATATAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 50 21 18 11 T 9 10 312619 CASAVA_Build 2 204150622 2D AGGATTTTGC TA/-- TGTTTCCCAG 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 TA 1 0 312620 CASAVA_Build 2 204153261 1I ATATGCCTGC -/A AATTCTGTTT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 2 3 312621 CASAVA_Build 2 204159585 5I TCATTTGTGA -----/TTTAT TTTATTATCC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 TTTAT 1 2 312622 CASAVA_Build 2 204172474 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2289 hom 26 9 13 4 A 15 14 312623 CASAVA_Build 2 204175805 7D AGTAAGGAAA TTCTGCC/------- TGCCTTGCGT 3070 het 3070 hom 43 19 21 6 TTCTGCC 1 0 312624 CASAVA_Build 2 204177835 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 987 het 532 hom 7 3 4 0 A 15 14 312625 CASAVA_Build 2 204237347 1D TAATTCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 11 10 312626 CASAVA_Build 2 204242206 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 1103 het 1103 ref 25 21 3 2 A 10 9 312627 CASAVA_Build 2 204256416 1D TTTGGCCCCC T/- ATACTGATTC 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 T 1 0 312628 CASAVA_Build 2 204267185 1D TAGCATAGTG T/- TTTTTTTTTT 1274 het 1274 ref 38 26 3 9 T 15 14 312629 CASAVA_Build 2 204285169 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 312630 CASAVA_Build 2 204298262 1D CCGTCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 27 3 13 12 A 15 14 312631 CASAVA_Build 2 204300592 1I GGACTACAGG -/T GCCCGCCACC 1122 het 20 hom 6 0 3 3 T 0 1 312632 CASAVA_Build 2 204320781 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 14 0 11 3 A 13 12 312633 CASAVA_Build 2 204321527 1I CATAAGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 794 hom 36 4 28 4 T 10 11 312634 CASAVA_Build 2 204368994 3D TCAAAAGTGA TAT/--- TATGTGTATT 3070 hom 93 het 35 0 32 5 TAT 2 1 312635 CASAVA_Build 2 204378607 1D GTATTGGACT G/- CTTAAAGGTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 1 0 312636 CASAVA_Build 2 204378751 1I ACCCAGTGTA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 7 8 312637 CASAVA_Build 2 204407895 1I AAGTTGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 924 hom 40 3 26 11 A 11 12 312638 CASAVA_Build 2 204416009 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 8 7 312639 CASAVA_Build 2 204417626 1I AATTAGCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 34 het 27 1 23 3 T 9 10 312640 CASAVA_Build 2 204418582 3D GAAGCCTACT ACA/--- AAAGTCCACG 3070 hom 101 het 38 0 33 5 ACA 1 0 312641 CASAVA_Build 2 204448692 4D TGTGGATGAC AAGG/---- GAGCCGGATA 3070 hom 101 het 36 0 33 5 AAGG 1 0 312642 CASAVA_Build 2 204452427 2D ATGGGTGTTG AT/-- ATATCAGCCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AT 3 2 312643 CASAVA_Build 2 204457940 1D TTGCTGGGGT G/- GGGGTGGAGG 3070 het 2961 hom 35 11 18 7 G 5 4 312644 CASAVA_Build 2 204458860 1D AGTTTGCCCA T/- TTTTTCCACT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 6 5 312645 CASAVA_Build 2 204478477 1D CTTATCTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 43 1 35 8 A 11 10 312646 CASAVA_Build 2 204488068 1D TTAGATGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 39 1 28 11 T 12 11 312647 CASAVA_Build 2 204490528 1I TGTCACTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 25 2 14 9 T 16 17 312648 CASAVA_Build 2 204495219 1D TAATTAAAAA T/- TTTTTTCATC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 6 312649 CASAVA_Build 2 204503497 15I AAGCCCACCT ---------------/CTTGCATCAGCATAC CATGGATATG 3070 hom 99 het 33 0 33 2 CTTGCATCAGCATAC 0 1 312650 CASAVA_Build 2 204516294 1I GTTCTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 10 11 312651 CASAVA_Build 2 204518019 2D GAAAGCATTT TG/-- TGTCAAGCCA 3070 hom 84 het 33 0 28 7 TG 2 1 312652 CASAVA_Build 2 204519378 1D CTTCTTCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 27 1 21 5 T 13 12 312653 CASAVA_Build 2 204527662 2D ATGAGGTTTG GA/-- GAAAATACAT 3070 het 3070 ref 24 12 12 0 GA 2 1 312654 CASAVA_Build 2 204531750 1I AGTTAATACC -/G TAGCTTTGAC 3070 het 3070 ref 48 21 22 5 G 0 1 312655 CASAVA_Build 2 204543101 1I TTGCTATACA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 T 6 7 312656 CASAVA_Build 2 204543723 1I AAAACAAAAA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 6 7 312657 CASAVA_Build 2 204563446 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1693 hom 25 6 13 6 A 12 11 312658 CASAVA_Build 2 204572284 1D TCAGGGTGTT A/- AAAAGCTTCA 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 A 5 4 312659 CASAVA_Build 2 204588879 1D AGAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 11 10 312660 CASAVA_Build 2 204592371 1D ACTTTATCTC T/- TTATTACCTG 3070 het 3070 hom 42 16 23 4 T 3 2 312661 CASAVA_Build 2 204593638 1D TATGGTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2417 hom 44 9 25 10 T 13 12 312662 CASAVA_Build 2 204640898 1D TAGGTACTCC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 10 9 312663 CASAVA_Build 2 204641552 2I GGTTTTAAAC --/AG GGGAAAAAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AG 0 1 312664 CASAVA_Build 2 204644260 2D AATAAATGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 27 2 15 10 T 13 11 312665 CASAVA_Build 2 204646773 6D ATTGGTTAGC ATCGTG/------ ATCGTGTAGA 3070 hom 124 het 43 0 39 7 ATCGTG 2 1 312666 CASAVA_Build 2 204650608 2I TCTCTATGGG --/GT GGGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 GT 0 1 312667 CASAVA_Build 2 204653109 17I TAGTGCCAAA -----------------/CACAGCAAGCATAGGTG CACCATGTAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 CACAGCAAGCATAGGTG 0 1 312668 CASAVA_Build 2 204654172 4D GAATTTGGTA ACTT/---- ACTTTTACTG 3070 het 3070 ref 22 12 8 3 ACTT 2 1 312669 CASAVA_Build 2 204657103 1D GTTTAAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 29 1 20 8 T 12 11 312670 CASAVA_Build 2 204663520 1D ATACAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 10 9 312671 CASAVA_Build 2 204674457 2I AATATGAAAC --/TA TTTGCATCCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TA 0 1 312672 CASAVA_Build 2 204674821 11D5M5D TCTTAAATAG AAAAAAAAATTATCTTAAAAA/-----------GGGTT----- TTATCCAAAT 3070 hom 96 het 32 0 32 4 N/A 0 0 312673 CASAVA_Build 2 204676710 1I TTTGCAAACA -/T TTTTGAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 4 5 312674 CASAVA_Build 2 204678227 1D TTCCCCACTG C/- CCCCCACACT 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 C 6 5 312675 CASAVA_Build 2 204679355 1D TTTCTGTGAA G/- TTTTACAACT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 G 1 0 312676 CASAVA_Build 2 204679970 1I AATTTTTTTT -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 6 7 312677 CASAVA_Build 2 204680680 7I GGGAACAAAA -------/TAAGGTT TAAGGTTTAG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TAAGGTT 1 2 312678 CASAVA_Build 2 204703815 2I ACCCATCTTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 38 10 19 9 TC 8 9 312679 CASAVA_Build 2 204706162 1D TGGTCAAGAT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 A 8 7 312680 CASAVA_Build 2 204721484 3D ATGTAAAAAT TAG/--- TAGCATTTCA 3070 hom 51 het 25 0 18 8 TAG 2 1 312681 CASAVA_Build 2 204734355 1D TGTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1492 het 1492 ref 25 17 5 3 A 12 11 312682 CASAVA_Build 2 204737219 5I GTGGGGAGAG -----/GAAAT GAAATAATAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 GAAAT 1 2 312683 CASAVA_Build 2 204740069 3I GAAATAGCTG ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 11 20 10 T 9 12 312684 CASAVA_Build 2 204787638 1I ATCTTACAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 30 hom 38 1 31 6 T 9 10 312685 CASAVA_Build 2 204793589 6D ATATATATAT ATATAC/------ ACACACATAT 1965 hom 12 het 6 0 5 3 ATATAC 1 0 312686 CASAVA_Build 2 204809313 1D AGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 31 1 22 8 T 11 10 312687 CASAVA_Build 2 204824444 2I TGGAACTGAC --/AA AAAAATGCAT 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 A 5 7 312688 CASAVA_Build 2 204826617 1I TCCTGCCCCC -/T TGCCCCCAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 1 2 312689 CASAVA_Build 2 204845196 1I TGACCCTGTA -/G GGCAGATCAG 3070 hom 111 het 44 0 36 8 G 2 3 312690 CASAVA_Build 2 204865358 5I TTTCAGTGTC -----/TTTAA TTTAACAATC 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 TTTAA 1 2 312691 CASAVA_Build 2 204893500 64D TCTCAAGTAA ACAGTGATTGTTGGTCACCCTATGGGTGCAGGTGTATAGGATGGAGAGGGAAGGGAAAGGCAAG/---------------------------------------------------------------- CCAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 29 23 14 3 ACAGTGATTGTTGGTCACCCTATGGGTGCAGGTGTATAGGATGGAGAGGGAAGGGAAAGGCAAG 1 0 312692 CASAVA_Build 2 204907121 1D CCTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 2872 het 1881 hom 24 8 8 10 A 13 12 312693 CASAVA_Build 2 204915202 3I AACAACAAAT ---/ATG ATAGAAATTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATG 0 1 312694 CASAVA_Build 2 204917540 2I ACTTTATAAC --/AA AAAGAGTGAA 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 A 3 5 312695 CASAVA_Build 2 204944225 1I ATAATTGTCC -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 5 6 312696 CASAVA_Build 2 204972282 1D AGGTGAATTT A/- AAAAACCCCA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 6 5 312697 CASAVA_Build 2 205013584 1I AACCTAGTCA -/T TTTTTTTTTT 2994 het 2994 ref 41 18 11 12 T 13 14 312698 CASAVA_Build 2 205016074 1I AGTCCCAGCA -/G GGCTGAGACT 3070 hom 71 het 26 0 23 3 G 2 3 312699 CASAVA_Build 2 205021755 1D CACACCACTG C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 9 8 312700 CASAVA_Build 2 205030038 4I TGGGCTCAAA ----/CGAT CGATCCTCCC 3070 hom 107 het 42 0 34 8 CGAT 1 2 312701 CASAVA_Build 2 205051305 1I TCAGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 748 hom 27 2 18 7 A 13 14 312702 CASAVA_Build 2 205058838 18I GCCTTAATAA ------------------/TTCTGTTGGCCCCGCAAT CCTTGGCACC 3070 hom 114 het 40 0 38 6 TTCTGTTGGCCCCGCAAT 0 1 312703 CASAVA_Build 2 205060142 4D ATCGTATCAG AGAC/---- AGAGAGAGTA 3070 het 3070 ref 55 24 24 8 AGAC 1 0 312704 CASAVA_Build 2 205060292 4I ACACACCAAT ----/AAAG ACTCAATTCT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AAAG 0 1 312705 CASAVA_Build 2 205062347 1D ATGTGTGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 T 10 9 312706 CASAVA_Build 2 205068414 3I TTGCAAAGAC ---/AAT AACACTCTAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AAT 0 1 312707 CASAVA_Build 2 205069337 1I CTTTCCAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 11 12 312708 CASAVA_Build 2 205072424 1I TCTTTCCTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 23 2 19 2 A 0 1 312709 CASAVA_Build 2 205082456 1D TTTTAATATG A/- AAAATGTAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 5 4 312710 CASAVA_Build 2 205082688 1D AAGCTCCGCC T/- TCCCGGGTTC 2457 hom 15 het 6 0 6 0 T 2 1 312711 CASAVA_Build 2 205082913 4D GCTTTGCATT TTTA/---- AAGTTCGTTT 3070 hom 27 het 12 0 10 4 TTTA 1 0 312712 CASAVA_Build 2 205122895 1D TTTTCTCATT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 8 312713 CASAVA_Build 2 205134001 1I GCCACCCAGG -/C CTGGGGTTCC 3070 hom 103 het 39 0 33 6 C 1 2 312714 CASAVA_Build 2 205148003 1D TTTGCTGATG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 101 het 40 0 34 6 T 9 8 312715 CASAVA_Build 2 205155472 1I GATTGAGGTT -/C CCCCCCCCTC 3070 het 403 hom 28 2 22 4 C 8 9 312716 CASAVA_Build 2 205166130 1I ACGTTTCATG -/T TAAGATTATG 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 1 2 312717 CASAVA_Build 2 205184819 2D TATCTATATC TA/-- TATATATGTG 3070 hom 123 het 43 0 41 4 TA 4 3 312718 CASAVA_Build 2 205186135 1D CAGGAGATAT A/- TTTTTTTTGA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 A 1 0 312719 CASAVA_Build 2 205226253 2D AGTTAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 13 11 312720 CASAVA_Build 2 205265470 1D GTTAAACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 39 1 27 11 T 12 11 312721 CASAVA_Build 2 205286803 1D TTGCCTTGTG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 105 het 43 0 36 8 T 8 7 312722 CASAVA_Build 2 205288453 1D GCTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1531 het 1531 ref 33 20 4 9 T 15 14 312723 CASAVA_Build 2 205301581 1D GCTCACTTGA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 7 6 312724 CASAVA_Build 2 205305052 1D ATAATTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 24 7 T 13 12 312725 CASAVA_Build 2 205306448 2D CTTGACAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 24 2 12 10 T 18 16 312726 CASAVA_Build 2 205322071 1D TAACACCCCC A/- AACTGATCTG 3070 het 3070 hom 37 12 17 9 A 3 2 312727 CASAVA_Build 2 205334567 1D TAAAAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 12 11 312728 CASAVA_Build 2 205339776 1D TTTGTAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 22 1 13 8 A 12 11 312729 CASAVA_Build 2 205355355 2D TATGTATTAC AT/-- ATGTTATATA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 AT 2 1 312730 CASAVA_Build 2 205364092 1I AAAAAAGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 10 11 312731 CASAVA_Build 2 205400266 1D GTGATAGAAA T/- GCATGAAATT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 T 1 0 312732 CASAVA_Build 2 205414864 4D TTAAAATAAC AAAT/---- AATAAGAGAA 3070 hom 66 het 23 0 23 1 AAAT 1 0 312733 CASAVA_Build 2 205467024 1I TATTTTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 A 13 14 312734 CASAVA_Build 2 205467413 1D GCATTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1568 het 1568 ref 34 25 4 5 T 11 10 312735 CASAVA_Build 2 205489394 2D AAATTGTTTA AT/-- GTTTTAAAAT 3070 hom 87 het 31 0 30 3 AT 1 0 312736 CASAVA_Build 2 205513445 1D AACTTGAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 39 2 28 9 T 14 13 312737 CASAVA_Build 2 205513898 1D ACAGTACAAG A/- AAAAAGTAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 6 5 312738 CASAVA_Build 2 205517003 3D ATTTAAAAAG GAA/--- GAAGAAGAGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GAA 3 2 312739 CASAVA_Build 2 205518864 1I GTTGGTTGGC -/T TTTTTGCAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 5 6 312740 CASAVA_Build 2 205546475 1I CCTTTAAGAT -/A TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 0 1 312741 CASAVA_Build 2 205546542 1I ATGGGCAGGC -/A AAAAAAAAAA 2482 het 1902 hom 24 6 9 9 A 14 15 312742 CASAVA_Build 2 205570931 2I AGTGTATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 235 hom 23 2 19 2 TA 6 7 312743 CASAVA_Build 2 205581259 1D ACAAATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 39 1 27 11 T 15 14 312744 CASAVA_Build 2 205615846 1I TAACTGTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 31 1 22 8 A 13 14 312745 CASAVA_Build 2 205618739 2I CTCCATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AC 8 9 312746 CASAVA_Build 2 205626800 2D AGAGCAAAAC AG/-- GGGGAGAAAT 3070 het 3070 hom 53 21 30 3 AG 1 0 312747 CASAVA_Build 2 205629881 10D ACACACACAC ACATATATAT/---------- ATATATATAT 3070 hom 90 het 30 0 31 5 ACATATATAT 1 0 312748 CASAVA_Build 2 205634763 1I TTTTAATTTC -/A AAAAAAAAAA 1561 het 1561 ref 42 25 5 12 A 16 17 312749 CASAVA_Build 2 205638790 1I CCAGAAGCCA -/G GGCCATGCCC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 2 3 312750 CASAVA_Build 2 205641550 1D AATGAAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 39 0 35 5 T 11 10 312751 CASAVA_Build 2 205644955 1D GTGAATTAGC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 8 7 312752 CASAVA_Build 2 205656303 1I TTAAGAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 30 1 21 8 A 12 13 312753 CASAVA_Build 2 205661462 1D GGAAAGAAAA C/- CCAAGCAGTT 3070 hom 83 het 38 0 28 10 C 3 2 312754 CASAVA_Build 2 205686593 7I TGAAAACCCT -------/GATTTGA GATTTGAGCT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 GATTTGA 1 2 312755 CASAVA_Build 2 205707460 1I TGCCACTGCA -/C TCTAGCCTGG 3070 hom 87 het 31 0 28 3 C 0 1 312756 CASAVA_Build 2 205718298 1D CCGCCCCCGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 431 hom 27 1 23 3 A 10 9 312757 CASAVA_Build 2 205728031 1D ATTTCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 11 10 312758 CASAVA_Build 2 205729513 1I AGGAAAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 11 12 312759 CASAVA_Build 2 205743761 1I TTTTTTTTTT -/C CTTTTACTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 1 2 312760 CASAVA_Build 2 205748868 1I GGAAATATAG -/T GGGGGGAACC 3070 hom 135 het 49 0 44 5 T 0 1 312761 CASAVA_Build 2 205749612 1D CTTTTTATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 25 1 15 9 A 15 14 312762 CASAVA_Build 2 205752855 1D AGTGCATGCT A/- AAAAATACAA 3070 hom 154 het 56 0 52 4 A 6 5 312763 CASAVA_Build 2 205768799 1I GTTCAAAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 312764 CASAVA_Build 2 205774302 1I TCGAAAAGGA -/T TAACAGTGAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 2 312765 CASAVA_Build 2 205785175 1I TCAGTGAAAC -/T TAACAGATTG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 1 2 312766 CASAVA_Build 2 205787459 1I AGGTGATACC -/A AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 40 21 6 13 A 15 16 312767 CASAVA_Build 2 205789993 1D TGTTTCAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 145 het 56 0 47 10 A 11 10 312768 CASAVA_Build 2 205792048 1D GACTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1289 het 1289 ref 26 12 5 9 A 15 14 312769 CASAVA_Build 2 205792569 1I GCCAAGAACA -/G AAGCAGCTAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 0 1 312770 CASAVA_Build 2 205794694 2I CCTAGCACTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 212 hom 46 1 33 12 TC 6 7 312771 CASAVA_Build 2 205795149 1D CTTCCAATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 38 1 28 9 A 13 12 312772 CASAVA_Build 2 205795833 1I GTCAGGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 42 1 29 12 A 10 11 312773 CASAVA_Build 2 205809394 1D GAATTGATGT A/- AAAATTTGGC 3070 hom 108 het 41 0 36 6 A 5 4 312774 CASAVA_Build 2 205819209 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 32 1 24 7 T 12 11 312775 CASAVA_Build 2 205828715 1D GGAAGAGATG A/- ATAGAACAAG 3070 het 3070 ref 54 31 20 3 A 2 1 312776 CASAVA_Build 2 205829151 1D CTCTCAGGAT G/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 1 0 312777 CASAVA_Build 2 205847513 4I ATTGCTTTTT ----/TTAA TTAATAACCC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTAA 1 2 312778 CASAVA_Build 2 205855477 2I TATTTATGTG --/TA TATATATATA 2315 hom 30 het 13 0 11 2 TA 6 7 312779 CASAVA_Build 2 205868063 2I AAAATCAAAC --/AT AGAAAATTTT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 AT 0 1 312780 CASAVA_Build 2 205871466 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 45 0 33 12 T 11 10 312781 CASAVA_Build 2 205872515 43D AAGATAATCC TGCTAATATTATATATTATATATATATATATAATATATATATA/------------------------------------------- TAATGCTGCT 3070 hom 51 het 17 0 18 3 TGCTAATATTATATATTATATATATATATATAATATATATATA 1 0 312782 CASAVA_Build 2 205882058 1D TGCAACTTAT A/- AATATGGGAA 3070 hom 126 het 49 0 42 8 A 3 2 312783 CASAVA_Build 2 205882863 16D CTTCTTATCC ATCTATCTATCTATCT/---------------- ATCTATCTAT 3070 hom 72 het 31 0 25 8 ATCT 8 4 312784 CASAVA_Build 2 205902976 29D ATAAATAAAT AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA/----------------------------- AAATAAAATA 1002 hom 7 het 4 0 3 2 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 1 0 312785 CASAVA_Build 2 205908612 1D AAGACTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 40 1 32 7 A 11 10 312786 CASAVA_Build 2 205909946 2D TATTTCTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 21 7 A 15 13 312787 CASAVA_Build 2 205912922 1D AATAAACAGG A/- AAATGTATCT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 4 3 312788 CASAVA_Build 2 205920894 1I TTGAGGGGCA -/T TACCTGGGGA 3070 hom 114 het 41 0 37 4 T 1 2 312789 CASAVA_Build 2 205924771 1D CAGAAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 16 8 A 12 11 312790 CASAVA_Build 2 205927439 1I AAAAAAAATG -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 33 het 13 0 12 5 A 7 8 312791 CASAVA_Build 2 205928513 1I TCTGACTCTC -/T GCATGTTGCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 312792 CASAVA_Build 2 205930630 1I GTTTCATGAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 8 9 312793 CASAVA_Build 2 205931155 1D GTTTTCAGAA C/- TGTATACGTG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 C 1 0 312794 CASAVA_Build 2 205933235 1I TTTTCTTTTG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 7 8 312795 CASAVA_Build 2 205933410 1I TCTATGTCAC -/A AAAAAATACT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 6 7 312796 CASAVA_Build 2 205934811 1D CCCAAACACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 8 312797 CASAVA_Build 2 205934971 1I TAGAGTAATA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 82 hom 26 1 24 1 T 8 9 312798 CASAVA_Build 2 205941830 1D TTGGGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 135 het 48 0 42 7 A 14 13 312799 CASAVA_Build 2 205947150 1I AGGAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 18 1 10 7 A 13 14 312800 CASAVA_Build 2 205959634 4D TTTTTTTTTT GTTG/---- TTGAAGGATT 3070 hom 72 het 30 0 23 8 GTTG 1 0 312801 CASAVA_Build 2 205976922 4D GTGCTCACTC AATT/---- AAGGGAATAT 3070 hom 48 het 18 0 17 3 AATT 1 0 312802 CASAVA_Build 2 205991420 3I AGACCAATAC ---/ACA ACTAATTATA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 ACA 0 1 312803 CASAVA_Build 2 205992301 1I TTCTTGCCTT -/C CGCCATGATG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 2 312804 CASAVA_Build 2 205995819 21I AAAAGAATAG ---------------------/GCTTAGCTTAGGTCTGTTGGT CTTGGTGAAG 3070 hom 132 het 47 0 45 4 GCTTAGCTTAGGTCTGTTGGT 0 1 312805 CASAVA_Build 2 206006502 3D ACTCTGTGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 25 1 12 13 A 21 18 312806 CASAVA_Build 2 206011675 1I ATAGGCAAGG -/C CCCTTAACGG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 3 4 312807 CASAVA_Build 2 206060433 1D CCTCTAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 9 8 312808 CASAVA_Build 2 206072286 1D CCCCCACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 659 hom 25 2 15 8 A 15 14 312809 CASAVA_Build 2 206084111 3D TGAATTATCA CTC/--- CTCTTAATTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CTC 2 1 312810 CASAVA_Build 2 206085959 1I TTTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 2772 het 222 hom 26 1 9 16 T 13 14 312811 CASAVA_Build 2 206087581 4D AGAAATATAA AGAT/---- AGATACAGAC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AGAT 2 1 312812 CASAVA_Build 2 206101838 4D TCTTTTGGTG TCTT/---- TCTTTGACAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 TCTT 2 1 312813 CASAVA_Build 2 206106186 5D AATTTTTGTA TTCTC/----- TTCTCCCAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 8 TTCTC 2 1 312814 CASAVA_Build 2 206107025 2I TGAAAAAGCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 32 0 23 9 A 14 16 312815 CASAVA_Build 2 206112574 1I6M1D CTGTCACAAC -TGATGAC/TTCGTGA- CAGCTGTTTT 3070 hom 78 het 33 0 22 12 N/A 0 0 312816 CASAVA_Build 2 206123946 10D ATATATATAT ACACACACAC/---------- ACACACACAC 763 het 17 hom 5 0 4 3 AC 13 8 312817 CASAVA_Build 2 206125993 3D GTTTTAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 78 het 37 0 25 13 AAG 7 6 312818 CASAVA_Build 2 206127962 1I CCCAAGGGAC -/A AGTTACATTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 1 2 312819 CASAVA_Build 2 206133447 5I AAGAGAATCC -----/TGTTT TGTTAGAACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TGTTT 0 1 312820 CASAVA_Build 2 206136621 1I TACGGGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 45 1 40 4 A 11 12 312821 CASAVA_Build 2 206142143 1D ATTAGAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 10 312822 CASAVA_Build 2 206150223 1I ATGAAGACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 9 10 312823 CASAVA_Build 2 206163350 1D AGGCTTACTT C/- CCCCTCTTCT 3070 het 3070 ref 47 24 18 6 C 5 4 312824 CASAVA_Build 2 206164165 1I AGGACAAGAC -/A AAAAAACTGT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 6 7 312825 CASAVA_Build 2 206168132 1I CCAGTCTTCA -/C CCTCTGAGTT 3070 hom 147 het 54 0 49 5 C 2 3 312826 CASAVA_Build 2 206169711 5D GCCAAATAGG GTACC/----- GTAATCCAAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 GTACC 1 0 312827 CASAVA_Build 2 206189858 2D GGAAGTGAAT GA/-- GAGAGAGAGA 1767 het 1767 ref 37 20 6 12 GA 10 9 312828 CASAVA_Build 2 206201478 5D TGACTATCTC TACTT/----- TACAGACAAG 3070 het 3070 ref 42 19 20 5 TACTT 1 0 312829 CASAVA_Build 2 206202498 1I TCAATTTTCA -/T TTTTTTTTTC 2965 het 2177 hom 20 6 9 5 T 9 10 312830 CASAVA_Build 2 206204161 1I GACTGGTGTT -/G GCGGGGGAAT 3070 hom 73 het 28 0 25 3 G 1 2 312831 CASAVA_Build 2 206223352 1I GAGATTATAG -/C CTTCGGTCCA 3070 hom 135 het 51 0 42 9 C 1 2 312832 CASAVA_Build 2 206232128 5D TCACATAGTA AGCAG/----- AGCAGAGCAT 3070 hom 117 het 45 0 39 7 AGCAG 2 1 312833 CASAVA_Build 2 206260408 2D CCAGTAAACA TT/-- TTTCCCCCGT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 5 3 312834 CASAVA_Build 2 206261831 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 8 9 312835 CASAVA_Build 2 206281643 1I CCATTTTCTT -/C GCCTTCAAGG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 0 1 312836 CASAVA_Build 2 206290108 4I GCTACACTCA ----/GTGT AGCTCTCCCA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 GT 0 2 312837 CASAVA_Build 2 206290176 1I AGGGAAGCAT -/G GTCCTCCAGT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 G 1 2 312838 CASAVA_Build 2 206293232 7D TTTTTCTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2910 het 1779 hom 33 10 11 13 T 21 14 312839 CASAVA_Build 2 206297123 2D TCTTTAAAAA AT/-- ATATATATGT 3070 het 3070 hom 57 24 26 8 AT 5 4 312840 CASAVA_Build 2 206330867 2D TTCTTTACCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 41 0 28 16 T 13 11 312841 CASAVA_Build 2 206340115 1I AGACTGAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1193 hom 30 8 13 9 A 15 16 312842 CASAVA_Build 2 206361527 1D AGGTGCCATG T/- TTGAAAGCAT 3070 het 3070 hom 47 17 23 8 T 3 2 312843 CASAVA_Build 2 206376364 3I CTGCCTGTGC ---/ATA ATAAGTATTT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 ATA 1 2 312844 CASAVA_Build 2 206386394 2I CCCTATAGTT --/AG ATCTTTAATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AG 0 1 312845 CASAVA_Build 2 206396397 4I AGCGAGAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AG 5 7 312846 CASAVA_Build 2 206396809 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 15 14 312847 CASAVA_Build 2 206400527 1I TCAGCAACTT -/C CCCCCCCACC 3070 hom 88 het 35 0 27 8 C 7 8 312848 CASAVA_Build 2 206411521 1I GGTTGAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2109 hom 24 5 18 1 A 13 14 312849 CASAVA_Build 2 206417033 12D GGAAGGAGAG AGAGAGAAAGAA/------------ AGAGAGAAAG 2180 hom 12 het 5 0 5 0 AGAGAGAAAGAA 2 1 312850 CASAVA_Build 2 206418433 1D TAATAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 844 het 844 ref 25 18 3 4 A 12 11 312851 CASAVA_Build 2 206430595 1I TAGGATCAAA -/T AAAAAAAAAA 2740 het 108 hom 31 2 18 11 T 0 1 312852 CASAVA_Build 2 206451572 12D GGGAGGGGCC AACCTCACACTA/------------ AACCTCACAC 3070 hom 75 het 26 0 26 3 AACCTCACACTA 2 1 312853 CASAVA_Build 2 206452093 2I GGAGGAATTT --/AC ACTCTGTTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AC 1 2 312854 CASAVA_Build 2 206455891 1D TAAAAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 11 10 312855 CASAVA_Build 2 206485770 2I CTGCGCCCCC --/CA CCCCACCAAA 3070 hom 59 het 30 0 20 10 CA 0 1 312856 CASAVA_Build 2 206489496 2I CAAAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 CT 1 2 312857 CASAVA_Build 2 206507700 2D CAGAGATGTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 18 0 9 9 TA 10 9 312858 CASAVA_Build 2 206507719 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTA 1445 het 531 hom 14 3 3 8 A 1 0 312859 CASAVA_Build 2 206509305 1D AAATAAAAGG C/- CCCCCCCAAG 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 C 8 7 312860 CASAVA_Build 2 206514030 2D CTTGCAGACA GC/-- GCTTCCTTCT 3070 hom 135 het 50 0 44 7 GC 2 1 312861 CASAVA_Build 2 206525621 1D TACAAAAGTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 11 14 9 A 9 8 312862 CASAVA_Build 2 206528326 11D GGGGTTGAGG GTGCAGTGAGC/----------- CTGCAGTGAG 3070 het 3070 hom 23 12 10 4 GTGCAGTGAGC 1 0 312863 CASAVA_Build 2 206534457 1D AACTGCTGTG C/- CCTGCTGCTG 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 C 3 2 312864 CASAVA_Build 2 206537790 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AC 8 7 312865 CASAVA_Build 2 206539925 4D TCTTTCTTTC TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 hom 68 het 39 0 23 19 TTCT 5 4 312866 CASAVA_Build 2 206541129 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2029 het 1975 hom 19 6 7 6 A 13 14 312867 CASAVA_Build 2 206541292 1D ATCTATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 A 13 12 312868 CASAVA_Build 2 206541740 1I CCCAGCTAAA -/T TTTTGCATTT 1280 het 1280 ref 13 10 3 0 T 4 5 312869 CASAVA_Build 2 206542174 1D TATGAGCTCT G/- GGTGGCCTTT 2254 het 2254 ref 29 13 6 10 G 3 2 312870 CASAVA_Build 2 206542885 1I TTTATTGGAT -/A TAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 A 0 1 312871 CASAVA_Build 2 206556464 1D GAATGGACTC A/- AGAGACCGGG 3070 hom 117 het 45 0 40 7 A 2 1 312872 CASAVA_Build 2 206557667 1D AAAAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 11 10 312873 CASAVA_Build 2 206564109 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2984 hom 24 8 12 4 A 11 12 312874 CASAVA_Build 2 206564665 1I CCACAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 11 12 312875 CASAVA_Build 2 206565100 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 33 2 21 10 A 15 16 312876 CASAVA_Build 2 206566115 2I AATATATATA --/TC TCCAGGCGGG 2033 het 2033 ref 17 10 6 1 TC 1 2 312877 CASAVA_Build 2 206569890 1I GATCTAAAAA -/C AAAATCCCAA 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 C 0 1 312878 CASAVA_Build 2 206572527 1D AAAAACTAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 13 21 7 A 9 8 312879 CASAVA_Build 2 206582328 1I AGTCAGTTTC -/A GCGTCTGTTC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 0 1 312880 CASAVA_Build 2 206592841 1D AGAGAATTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 T 9 8 312881 CASAVA_Build 2 206593059 1I AGTATGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 36 1 31 4 T 11 12 312882 CASAVA_Build 2 206602561 3D AGTGATATTA TTC/--- TTCTTTCCTT 3070 het 3070 hom 44 18 24 3 TTC 2 1 312883 CASAVA_Build 2 206603432 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 12 13 312884 CASAVA_Build 2 206608356 3D TTGGTATAAA AAT/--- GGGCACACAG 3070 het 3070 hom 35 13 17 8 AAT 1 0 312885 CASAVA_Build 2 206614178 1D TAAACCCAAT A/- AATATCAATA 3070 hom 123 het 51 0 42 9 A 3 2 312886 CASAVA_Build 2 206616740 1I ACAGGCGTGA -/G CGACTGTGCC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 G 0 1 312887 CASAVA_Build 2 206619437 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 23 9 A 10 11 312888 CASAVA_Build 2 206625761 1I AACCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 14 15 312889 CASAVA_Build 2 206627577 1D CCACCTCCCA G/- GTTCACGCAA 2118 het 2118 ref 16 8 5 3 G 2 1 312890 CASAVA_Build 2 206637787 1D CTGTAGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 A 11 10 312891 CASAVA_Build 2 206639919 2D AGTTGATCTC AT/-- AGAAGCTAAA 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 AT 1 0 312892 CASAVA_Build 2 206640567 1D TGTGTCCATT A/- AAATTTTTTA 3070 het 2232 hom 18 5 12 2 A 4 3 312893 CASAVA_Build 2 206648408 1I TACCTTATAA -/T TTTTTTTTTT 1896 het 1896 ref 25 9 6 11 T 15 16 312894 CASAVA_Build 2 206657044 1I TGTTTATCAC -/T TTTTTTTTTT 2679 het 2679 ref 26 11 7 8 T 13 14 312895 CASAVA_Build 2 206659761 1D AGACAATTGT A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 ref 40 25 13 3 A 7 6 312896 CASAVA_Build 2 206667166 9I ATACCCGGAT ---------/AATTTATAG AATTTTAAGT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 AATTTATAG 0 1 312897 CASAVA_Build 2 206668302 4I TCCAAGATGA ----/TTAG TTAGCAAAAT 3070 het 3070 ref 41 27 11 3 TTAG 1 2 312898 CASAVA_Build 2 206671870 1I ATGTTAAGTC -/T TTTTTTTTTT 2905 het 2143 hom 24 9 9 6 T 10 11 312899 CASAVA_Build 2 206672485 7I CTTGAAGCAC -------/ACTAACT ACTAACTCTT 3070 hom 47 het 20 0 17 3 ACTAACT 1 2 312900 CASAVA_Build 2 206684476 2D TGAGCCTGCA GT/-- GAGTCATGAT 3070 het 2787 hom 20 7 9 6 GT 1 0 312901 CASAVA_Build 2 206689400 1D AGGCAGGGCG C/- GGCAGGTGCC 3070 het 1947 hom 25 7 13 6 C 1 0 312902 CASAVA_Build 2 206698065 1I TCTGCCCCCC -/T TCAGCCTCCC 3070 het 1109 hom 20 4 10 6 T 1 2 312903 CASAVA_Build 2 206711684 1D ACAAAATGTT A/- AAAGCACAGA 3070 het 3070 hom 46 17 24 6 A 4 3 312904 CASAVA_Build 2 206714768 1I CCGTCCCACC -/A AAAAAAAAAA 1485 het 1081 hom 25 4 8 13 A 17 18 312905 CASAVA_Build 2 206716921 1I ACATCCCCCC -/T CTTCATGGCA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 T 0 1 312906 CASAVA_Build 2 206722585 2I CAATTATATG --/AC ACATGTGTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AC 1 2 312907 CASAVA_Build 2 206729544 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 10 11 312908 CASAVA_Build 2 206735602 1D AGGCTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1231 het 1231 ref 45 28 4 13 T 11 10 312909 CASAVA_Build 2 206735653 1I TCAACCTTTC -/T CTACAAGACT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 0 1 312910 CASAVA_Build 2 206742013 4D GCCATGGCTT CAGA/---- CAGAGGGTGC 3070 het 1049 hom 21 5 10 7 CAGA 2 1 312911 CASAVA_Build 2 206785360 1I TCCCTTGGCC -/T TTTTTTTTTT 1308 het 1308 ref 46 33 4 9 T 11 12 312912 CASAVA_Build 2 206795123 3I TTTTTATTTA ---/CTT CTTCTTATTA 3070 hom 85 het 32 0 29 3 CTT 2 3 312913 CASAVA_Build 2 206797741 6I TTATTGCCAC ------/CCTAGA ACACAAAAGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CCTAGA 0 1 312914 CASAVA_Build 2 206807765 1I GAAAAGTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 9 10 312915 CASAVA_Build 2 206808845 3I TGATCTTTCA ---/TCT TCTTCAATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TCT 1 2 312916 CASAVA_Build 2 206809462 1I ATCATGATAG -/A AAAAAGAAGA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 5 6 312917 CASAVA_Build 2 206812340 1D TGTGGAGGGG A/- GGGGGGAAGG 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 A 1 0 312918 CASAVA_Build 2 206813399 8I GTCCCTACTG --------/TTTTCTCC TTTTCTCCCT 3070 het 3070 hom 50 16 29 5 TTTTCTCC 1 2 312919 CASAVA_Build 2 206827855 1D TCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 29 2 24 5 T 13 12 312920 CASAVA_Build 2 206830907 1D TTTCACCATG T/- TGGCCAGGCT 3070 hom 51 het 18 0 16 2 T 2 1 312921 CASAVA_Build 2 206838524 1D GGACCATACG A/- AAAAAATTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 6 A 7 6 312922 CASAVA_Build 2 206846731 1I AATAGGCAAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 7 8 312923 CASAVA_Build 2 206848426 1D AAAACGTTTG A/- TTTTTGTGTT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 1 0 312924 CASAVA_Build 2 206850425 3D TGAATGAAAT AAG/--- AAGGTGAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAG 2 1 312925 CASAVA_Build 2 206853711 1D TTAATGAAGC T/- TTTTTCCCCT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 6 5 312926 CASAVA_Build 2 206859532 1I TATGTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 11 10 A 13 14 312927 CASAVA_Build 2 206862448 3D AGTGGCTTCA CTT/--- CTTCTTGGTT 3070 hom 105 het 44 0 30 15 CTT 3 2 312928 CASAVA_Build 2 206876098 1D ATTTCCTTAG T/- TTTACTACTT 3070 het 3070 ref 46 29 16 1 T 4 3 312929 CASAVA_Build 2 206890254 6D TTGGCATTGA CCAGTC/------ CCTCCACTTT 3070 het 3070 hom 49 22 23 6 CCAGTC 1 0 312930 CASAVA_Build 2 206895981 2D AAACAAAAAC AA/-- AAAAAAACCT 354 het 354 ref 33 19 3 13 A 9 7 312931 CASAVA_Build 2 206909134 1D ACATAGTGAT A/- ATGATACAAG 3070 hom 148 het 56 0 50 6 A 2 1 312932 CASAVA_Build 2 206915777 1I CACTTTATTT -/C TTAAAAGACA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 C 0 1 312933 CASAVA_Build 2 206948943 1I TCCAGACTTT -/C CTCATGAGAA 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 C 1 2 312934 CASAVA_Build 2 206949787 3D TTGTTTTTGT TTG/--- TTGTTTGTTG 3070 het 3070 hom 41 17 18 9 TTG 2 1 312935 CASAVA_Build 2 206965028 4D TGGCAAAAAC AGAT/---- AGAAATAAAC 3070 het 3070 hom 43 18 20 6 AGAT 1 0 312936 CASAVA_Build 2 206983501 9I ACAGACCACC ---------/CTGGTCTTG ACCTTGAACC 741 het 741 ref 49 31 5 13 CTGGTCTTG 0 1 312937 CASAVA_Build 2 206991195 1D AAGATGGAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 47 22 19 7 A 9 8 312938 CASAVA_Build 2 207045585 1I ATCTCAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 14 11 A 13 14 312939 CASAVA_Build 2 207086348 1D AAAGTTTTAA T/- GTTCTGGATA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 1 0 312940 CASAVA_Build 2 207095774 1I TTGTGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 14 13 T 13 14 312941 CASAVA_Build 2 207096274 1D TCTCTTGTTA C/- CCCCAAAGAA 3070 het 3070 ref 49 22 24 3 C 5 4 312942 CASAVA_Build 2 207102789 1I TATATATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 9 8 T 10 11 312943 CASAVA_Build 2 207107451 1D CATAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 1608 het 1608 ref 38 25 5 9 T 12 11 312944 CASAVA_Build 2 207117583 1D GAGAGTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1757 het 110 hom 30 3 10 17 T 19 18 312945 CASAVA_Build 2 207139822 1D AAACAGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 A 12 11 312946 CASAVA_Build 2 207149241 4D ATATGGTTTT AAAA/---- ACTTCTGTGT 3070 het 3070 hom 41 15 22 5 A 5 1 312947 CASAVA_Build 2 207151529 2D GCATTCCATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 16 15 11 AT 7 6 312948 CASAVA_Build 2 207160397 1D CATTGGAAAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 11 20 5 T 9 8 312949 CASAVA_Build 2 207160550 1I AGATTAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2208 hom 25 7 10 8 A 11 12 312950 CASAVA_Build 2 207180852 1I CCATGGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 10 11 312951 CASAVA_Build 2 207187385 11I CTGTAATCCC -----------/AGCACTTTGGT AGGCTGAGGT 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 AGCACTTTGGT 0 1 312952 CASAVA_Build 2 207192479 1D TTCTCTAATG C/- CCCCCCCCTT 2962 het 1024 hom 28 9 9 10 C 9 8 312953 CASAVA_Build 2 207195432 1D AGACATGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 A 10 9 312954 CASAVA_Build 2 207203108 3I AGAGAAAGGG ---/AGA AGAAGTGTGG 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 AGA 1 2 312955 CASAVA_Build 2 207213476 3I AGCATAAATC ---/ATT ATATATTATG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 ATT 0 1 312956 CASAVA_Build 2 207228217 2D GATTGTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2890 hom 26 12 10 5 T 16 14 312957 CASAVA_Build 2 207287661 4D CTGAGTGGGG GAAT/---- GAATGGCTGC 3070 hom 116 het 46 0 37 10 GAAT 2 1 312958 CASAVA_Build 2 207299129 1I GAAGAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 266 hom 39 1 23 15 A 10 11 312959 CASAVA_Build 2 207376930 3I GGCCTTCAGA ---/AGG AGGTTAGAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AGG 1 2 312960 CASAVA_Build 2 207384984 3I AGAAGAGAGT ---/AAG AAGACGCCGT 3070 hom 55 het 22 0 17 5 AAG 1 2 312961 CASAVA_Build 2 207433258 1I CGTGTGCCAT -/G GGTGGTTTGC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 2 3 312962 CASAVA_Build 2 207444533 1I TAAGTGCTAG -/T TGGAGCTGCT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 1 2 312963 CASAVA_Build 2 207451970 4I TATATATGTA ----/TTAT TTATTTAACA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 TTAT 1 2 312964 CASAVA_Build 2 207452091 1D AGTTATCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 30 18 10 T 11 10 312965 CASAVA_Build 2 207461876 1I TGGTGGTGAG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 50 19 20 11 A 7 8 312966 CASAVA_Build 2 207464030 1I CTATGACAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 54 24 18 12 A 8 9 312967 CASAVA_Build 2 207464360 1D TATCACAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 A 11 10 312968 CASAVA_Build 2 207469818 1D CTGGTCCTGA C/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 C 1 0 312969 CASAVA_Build 2 207473980 1D TTAAGGTATG T/- TCCTTCTATA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 T 2 1 312970 CASAVA_Build 2 207476479 1I GTAGTTATTA -/T TTTTGATAGG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 T 4 5 312971 CASAVA_Build 2 207477496 1I AGTTCTAGGG -/T TACATGTGCA 2923 het 2923 ref 18 9 6 3 T 1 2 312972 CASAVA_Build 2 207522041 2D ATAAACCATT GC/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3064 hom 29 10 11 8 GC 1 0 312973 CASAVA_Build 2 207524071 1I GGGTGGAACC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 23 7 13 3 A 8 9 312974 CASAVA_Build 2 207527376 2I AAAGCATAAC --/AA GAGTCACCTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 0 2 312975 CASAVA_Build 2 207536124 2I GCAGGGAAAC --/TG TGTTTGGTCT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 TG 1 2 312976 CASAVA_Build 2 207536791 5I TGTGCACTTC -----/TCTCT TAAGACTCTG 3070 het 3070 ref 55 22 20 13 TCTCT 0 1 312977 CASAVA_Build 2 207539211 1D TGCAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 38 2 26 10 A 11 10 312978 CASAVA_Build 2 207545677 1I ATATGTTATT -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 5 6 312979 CASAVA_Build 2 207570280 2D TGGAAACTAT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 10 8 312980 CASAVA_Build 2 207598475 1I GCTGACTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 32 1 26 5 T 10 11 312981 CASAVA_Build 2 207604644 1I CAACAAGGGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 7 8 312982 CASAVA_Build 2 207605991 3I AAGAAATAAA ---/GAG GAGACTTGCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GAG 1 2 312983 CASAVA_Build 2 207608001 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 715 hom 25 4 12 9 T 14 15 312984 CASAVA_Build 2 207621720 1I GGTTTTGAGC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 140 het 54 0 47 7 A 8 9 312985 CASAVA_Build 2 207625225 3D TAGAGGAAAT AAC/--- AACAGGAGCT 3070 hom 162 het 57 0 53 5 AAC 2 1 312986 CASAVA_Build 2 207630947 1I GTACTAGGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 444 hom 25 1 20 4 T 9 10 312987 CASAVA_Build 2 207631289 1I TCCAAAGCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 354 hom 48 1 37 10 T 9 10 312988 CASAVA_Build 2 207632968 5D GGGTGTTACC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2551 het 54 hom 22 1 12 9 A 21 16 312989 CASAVA_Build 2 207633092 1D TTTTTTTTTT A/- AATTATTATT 3070 hom 39 het 19 0 13 6 A 3 2 312990 CASAVA_Build 2 207635069 2D CAATGAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 14 12 312991 CASAVA_Build 2 207641834 4I TTACCTGAAC ----/AGCT AGCTGCCTTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AGCT 1 2 312992 CASAVA_Build 2 207644134 15I GGGGAAAGGC ---------------/TAAGGCTTCCTTGGA ACAGTCAAGA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 TAAGGCTTCCTTGGA 0 1 312993 CASAVA_Build 2 207652035 1D TATTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 221 hom 21 2 11 8 T 11 10 312994 CASAVA_Build 2 207673115 4I CAAAAAAAAG ----/AAGA AAGAGCCCAA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 AAGA 1 2 312995 CASAVA_Build 2 207692393 1I36M1I ACTATTAAGA -TTTTTAAAAATTGATTTTTGCTGAGAATGAGCATAG-/TTTTTTAAAAATTGATTTTTGCTGAGAATGAGCATAGT TTTTTTTTTT 3070 het 1613 hom 30 5 33 4 N/A 0 0 312996 CASAVA_Build 2 207702714 2I TTCCTCTCCA --/TT TGTTTATTTA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 T 1 3 312997 CASAVA_Build 2 207703106 4D ACCTAAAGGG TTTC/---- TTTCCTTCAC 3070 het 3070 ref 49 27 21 2 TTTC 2 1 312998 CASAVA_Build 2 207708286 1D TTGAGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 13 17 A 11 10 312999 CASAVA_Build 2 207717050 1D AGGCAACTGC T/- TGTGTAAGCG 3070 het 3070 hom 29 9 15 6 T 2 1 313000 CASAVA_Build 2 207726596 1D ATTAAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 40 0 32 8 T 11 10 313001 CASAVA_Build 2 207729070 3D GAGCTCTGAG CTC/--- CTCTCCTGAT 3070 hom 135 het 48 0 45 4 CTC 2 1 313002 CASAVA_Build 2 207730399 1D GAGGAAGAGG A/- AAAAGGCTAA 3070 hom 102 het 42 0 34 9 A 5 4 313003 CASAVA_Build 2 207733558 3D GGAAATTGTA TTC/--- TTCTTTCCTC 3070 hom 93 het 33 0 31 3 TTC 2 1 313004 CASAVA_Build 2 207741057 2I GAGAAACACT --/CC AGGGCAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 C 0 2 313005 CASAVA_Build 2 207751111 1D GATATACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 94 het 41 0 35 10 A 10 9 313006 CASAVA_Build 2 207772982 2D GCATGGGAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 44 1 39 6 T 12 10 313007 CASAVA_Build 2 207773810 1I TAATAGAGTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 285 hom 64 1 52 11 A 8 9 313008 CASAVA_Build 2 207774846 1I TACATTTTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 417 hom 36 1 29 6 T 9 10 313009 CASAVA_Build 2 207775517 5D TCATCATACC AATAT/----- AATATGTTGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AATAT 2 1 313010 CASAVA_Build 2 207778121 1I TTTGAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1090 hom 38 4 25 9 A 11 12 313011 CASAVA_Build 2 207786044 5D TTTTTTATTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 27 2 9 17 A 17 12 313012 CASAVA_Build 2 207795068 1I CACTTTCCAC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 7 8 313013 CASAVA_Build 2 207804466 1I TGCTACTGTT -/A AAAAAAAAAG 3017 het 1782 hom 24 6 12 6 A 9 10 313014 CASAVA_Build 2 207813498 2I AGAGAGAGAC --/AG AGAGAGGTTG 3070 hom 131 het 47 0 42 5 AG 3 4 313015 CASAVA_Build 2 207816928 2D AATAATGGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 132 hom 36 2 17 18 T 14 12 313016 CASAVA_Build 2 207832884 1D AATTCATTCC A/- ATAACAACAA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 2 1 313017 CASAVA_Build 2 207836576 1D TATGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2729 hom 37 12 12 13 A 15 14 313018 CASAVA_Build 2 207843395 2D GATGAAGAAA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 42 18 15 9 TC 6 5 313019 CASAVA_Build 2 207866285 1I ATAAATGTCT -/G GTTGTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 G 1 2 313020 CASAVA_Build 2 207894577 1D ATCTTGGAAC A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 A 8 7 313021 CASAVA_Build 2 207899025 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 216 hom 21 2 13 6 A 12 11 313022 CASAVA_Build 2 207902677 1I TATGGCTGTC -/A AGTGTTTCTG 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 A 1 2 313023 CASAVA_Build 2 207904564 1I AATGGTAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 906 hom 42 2 33 7 A 9 10 313024 CASAVA_Build 2 207905396 1I AACAGGTTGT -/C CCCAAAAATT 3070 het 3070 ref 38 15 16 7 C 3 4 313025 CASAVA_Build 2 207908258 2I AGGCGGAGTC --/AG TTGGTTGGAG 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 AG 0 1 313026 CASAVA_Build 2 207913743 1D TCGTGCCCCC T/- GGGAGACATG 3070 het 3070 ref 46 24 16 7 T 1 0 313027 CASAVA_Build 2 207914105 1D ACTGGGAATT A/- AATATGGAGG 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 A 3 2 313028 CASAVA_Build 2 207921113 1D CAGAGACACA C/- ACAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 1 0 313029 CASAVA_Build 2 207927469 1I AACATTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 818 hom 35 2 24 9 A 10 11 313030 CASAVA_Build 2 207934157 1D GCCTCCTGGG T/- TCAAGCAATT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 2 1 313031 CASAVA_Build 2 207938192 1I CTAGAGCTCT -/A AAATTCTTTC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 3 4 313032 CASAVA_Build 2 207942150 1I CTACAATGAG -/C ATCCACATAG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 0 1 313033 CASAVA_Build 2 207946690 4D GAAAAGACTC AAAT/---- AAAATCAGAA 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 AAAT 1 0 313034 CASAVA_Build 2 207951866 1I CTGGATTCAG -/T TTTGCCAGTA 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 T 3 4 313035 CASAVA_Build 2 207954144 1I CTGGCTTCAG -/C CCCCTTTCCA 3070 hom 52 het 25 0 21 4 C 4 5 313036 CASAVA_Build 2 207962102 1I TAAGGACCAG -/A AGATCTTAGA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 1 2 313037 CASAVA_Build 2 207962309 1I ATCACAGTAA -/T TTTTTTTTTT 1315 het 1315 ref 49 35 3 11 T 11 12 313038 CASAVA_Build 2 207963148 1I TTAAACTATG -/C CTTTGGGCCC 3070 het 3070 hom 37 15 13 9 C 1 2 313039 CASAVA_Build 2 207963315 1I CACTGCTTCC -/A AAGAGTCTGA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 2 3 313040 CASAVA_Build 2 207964477 1I AAAGATTTAG -/A GGTAATAGAG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 0 1 313041 CASAVA_Build 2 207966280 1D ATTATCACTG T/- TTTTGTATGG 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 5 4 313042 CASAVA_Build 2 207966938 1D TTGAATGATT G/- ATCAGCACAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 G 1 0 313043 CASAVA_Build 2 207969359 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2535 hom 21 6 13 2 A 11 10 313044 CASAVA_Build 2 208012149 3I CAAGTTTAGC ---/AGG AGGTTTAAAA 3070 hom 132 het 48 0 42 6 AGG 1 2 313045 CASAVA_Build 2 208039501 1I ACCTAGATAA -/T TTTTTTTTTT 1481 het 1481 ref 26 12 6 8 T 12 13 313046 CASAVA_Build 2 208044194 1D ATTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 5 T 12 11 313047 CASAVA_Build 2 208055714 1D ATGACTGCTC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 9 8 313048 CASAVA_Build 2 208058235 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 32 het 20 0 13 7 A 10 9 313049 CASAVA_Build 2 208058499 2I CAGAGAGAGG --/AT AACTTCCTGG 3070 hom 141 het 51 0 46 5 AT 0 1 313050 CASAVA_Build 2 208063879 1I TAATCATTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 597 hom 43 2 33 8 A 9 10 313051 CASAVA_Build 2 208065325 1I TTTATTCTTA -/T TTTACTATTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 3 4 313052 CASAVA_Build 2 208083949 2D TGTCTCTAGG TC/-- TCTCTTCACC 3070 het 3070 hom 45 20 19 7 TC 3 2 313053 CASAVA_Build 2 208110023 3D ACAAAGTGCT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 TTG 7 6 313054 CASAVA_Build 2 208119698 1I ACCCTATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 A 10 11 313055 CASAVA_Build 2 208125494 3I ACAAAGGAGG ---/TAT TATGATACAT 3070 hom 77 het 30 0 25 5 TAT 1 2 313056 CASAVA_Build 2 208126474 2D GATAATAACC AG/-- AGTTATTTGA 2829 het 2829 ref 23 12 7 6 AG 2 1 313057 CASAVA_Build 2 208161109 3I CACAGACTTC ---/TTT GTTTTCCTCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 3 313058 CASAVA_Build 2 208161698 1D TGTTTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 600 hom 38 5 16 17 T 14 13 313059 CASAVA_Build 2 208165881 21I ACTCCATCTC ---------------------/AAAAAAGAAAAAAAAAAAGAA AAAAAAGAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AAAAAAGAAAAAAAAAAAGAA 0 1 313060 CASAVA_Build 2 208171820 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 8 7 313061 CASAVA_Build 2 208173957 2D CATAAATTGG TC/-- TCTGTTTATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TC 2 1 313062 CASAVA_Build 2 208177459 4D TTTCTCCACA TCTT/---- TCTTAAGTGC 3070 hom 123 het 46 0 41 6 TCTT 2 1 313063 CASAVA_Build 2 208181388 1D TTTCTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 449 hom 20 1 17 3 T 11 10 313064 CASAVA_Build 2 208187350 1D ACCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 39 0 28 11 A 14 13 313065 CASAVA_Build 2 208192749 1D GAAAAAGCAG T/- TACTCAGAGA 3070 hom 166 het 58 0 56 2 T 2 1 313066 CASAVA_Build 2 208207825 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3060 het 3060 ref 28 11 9 8 A 13 14 313067 CASAVA_Build 2 208208901 1I GTCATGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 11 12 313068 CASAVA_Build 2 208242407 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2296 het 321 hom 16 1 6 9 T 11 12 313069 CASAVA_Build 2 208246975 1I GCATAATAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 9 10 313070 CASAVA_Build 2 208253358 1D GATTATATTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 9 8 313071 CASAVA_Build 2 208278739 1D GACTCCATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 A 11 10 313072 CASAVA_Build 2 208311201 1I TTTTATTTGG -/T TTTTTTTTGA 2873 het 2272 hom 21 5 8 8 T 8 9 313073 CASAVA_Build 2 208315121 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1052 het 1052 ref 19 8 3 8 A 17 16 313074 CASAVA_Build 2 208325884 3I GGCACATGCC ---/TGT TGTAATCCTA 3070 het 1718 hom 15 4 11 0 TGT 1 2 313075 CASAVA_Build 2 208327191 1I CCCTACTGTT -/A ACCATTGAAG 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 A 1 2 313076 CASAVA_Build 2 208358702 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 2928 het 262 hom 18 3 7 8 A 10 9 313077 CASAVA_Build 2 208378037 1D AGAACAGTTC T/- TTTTTTTTTT 2962 het 1059 hom 18 5 8 5 T 13 12 313078 CASAVA_Build 2 208380048 1I GGGGACTTGC -/T TTTCTGTGAT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 3 4 313079 CASAVA_Build 2 208381588 1D CAGGAGGTAC T/- CAAAGGCTGG 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 T 1 0 313080 CASAVA_Build 2 208407100 1I TTTCTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1934 het 1462 hom 26 7 7 12 T 15 16 313081 CASAVA_Build 2 208427051 1D CAGCCCTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 10 9 313082 CASAVA_Build 2 208434497 1D TGAGGCCCAA C/- AAATGGGGAA 3070 het 3070 ref 56 30 20 6 C 1 0 313083 CASAVA_Build 2 208441246 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTTT 2313 het 2313 ref 27 11 7 9 A 0 1 313084 CASAVA_Build 2 208466095 1D GTTGGAAAAC A/- AAAAAAGCGT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 A 7 6 313085 CASAVA_Build 2 208469343 1D TCTAAAGATG C/- CATACATCTT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 2 1 313086 CASAVA_Build 2 208486693 1D TAAGAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 T 11 10 313087 CASAVA_Build 2 208493549 1D AAAATGAGAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 A 9 8 313088 CASAVA_Build 2 208520831 1D TCCATGAATG A/- AAGTATCACA 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 A 3 2 313089 CASAVA_Build 2 208521951 1D CGGTCCAGAT C/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 17 8 7 2 C 1 0 313090 CASAVA_Build 2 208526133 1I CTAATGCGGA -/T TAGTATGGCA 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 T 1 2 313091 CASAVA_Build 2 208526360 1D TTCATCAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 10 9 313092 CASAVA_Build 2 208555548 1D ATTGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 27 2 14 11 T 17 16 313093 CASAVA_Build 2 208556560 1D CATGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 43 3 30 11 A 13 12 313094 CASAVA_Build 2 208556573 1D AAAAAAAAAA C/- AGAACTATTT 3070 het 621 hom 42 6 27 9 C 1 0 313095 CASAVA_Build 2 208564573 1D GAGCCTCTGG A/- AAAAAAGACC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 7 6 313096 CASAVA_Build 2 208566471 1D CAAATTTGGC T/- TTTTTTTTTT 1122 het 1122 ref 30 10 9 11 T 15 14 313097 CASAVA_Build 2 208577387 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 40 0 27 13 A 15 14 313098 CASAVA_Build 2 208578010 8D GCCAGGCTGG TCTTGAAC/-------- TCTTGAACTC 3070 hom 59 het 21 0 19 5 TCTTGAAC 2 1 313099 CASAVA_Build 2 208581488 8D AAAAAAAAAA AAAAAAAC/-------- AGACAAAAAA 2603 het 525 hom 25 11 10 8 AAAAAAAC 1 0 313100 CASAVA_Build 2 208588445 1I GTTAATTTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 9 10 313101 CASAVA_Build 2 208591341 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 31 2 17 13 A 13 12 313102 CASAVA_Build 2 208592107 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 29 1 25 3 A 12 11 313103 CASAVA_Build 2 208596843 1D TATATATTTA T/- TAACAAACAT 3070 hom 65 het 24 0 22 2 T 2 1 313104 CASAVA_Build 2 208600568 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 10 12 A 15 14 313105 CASAVA_Build 2 208601681 2I AGGCTGAGGC --/AG AGAGAATCAC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AG 2 3 313106 CASAVA_Build 2 208601774 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 14 0 9 5 A 16 14 313107 CASAVA_Build 2 208615511 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 305 hom 21 1 15 5 A 17 16 313108 CASAVA_Build 2 208617859 1I AACTATCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 769 hom 33 2 24 7 T 10 11 313109 CASAVA_Build 2 208619767 1D GCCTGGCCTG T/- TTTTTTTTTT 2594 het 229 hom 24 3 11 10 T 17 16 313110 CASAVA_Build 2 208625653 1D CGCTCATTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 10 9 313111 CASAVA_Build 2 208629833 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1737 het 1737 ref 30 18 7 5 A 15 16 313112 CASAVA_Build 2 208633499 5I GTTGACCAGG -----/CTGGT CTCGAACTCC 3070 hom 69 het 27 0 22 5 CTGGT 0 1 313113 CASAVA_Build 2 208640212 1I CATAAGTTAT -/C CTACATTTCC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 2 313114 CASAVA_Build 2 208642812 1I ATAGAAACTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 48 1 39 9 G 0 1 313115 CASAVA_Build 2 208662648 1D GATTTATTAC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 54 het 22 0 19 4 A 9 8 313116 CASAVA_Build 2 208667690 1D3M3I TGAGCCACCG CGCC---/-GCCTGG CGGCCCAGTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 N/A 0 0 313117 CASAVA_Build 2 208675072 10I TCTATTTGTG ----------/ATTTTGGAAA AGGCTTTTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 ATTTTGGAAA 0 1 313118 CASAVA_Build 2 208678938 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 9 313119 CASAVA_Build 2 208680800 2D ACAAATACTT AA/-- ACATAGTGGT 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 3 1 313120 CASAVA_Build 2 208687347 1I ATGTCAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 30 1 25 4 A 11 12 313121 CASAVA_Build 2 208688251 13D CTTTCCTTGT TATACCCTGTGGG/------------- TATACCCTGT 2751 hom 18 het 18 0 7 11 TATACCCTGTGGG 2 1 313122 CASAVA_Build 2 208714766 1I TACTAGAAAT -/A AAAAAAAATT 3008 het 3008 ref 21 10 8 3 A 8 9 313123 CASAVA_Build 2 208715018 7D CCACAAAGCA CATATAG/------- CGAAAACACA 2808 het 2808 ref 33 21 9 9 CATATAG 1 0 313124 CASAVA_Build 2 208716494 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCGCTG 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 AG 2 1 313125 CASAVA_Build 2 208719023 1D GAGTGATTGG C/- CCCCACTGAG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 C 5 4 313126 CASAVA_Build 2 208719483 2D GTGGTGTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 58 het 30 0 19 12 TG 10 9 313127 CASAVA_Build 2 208726176 2D AGAAAAAAAA AT/-- AATCCCATTA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 AT 1 0 313128 CASAVA_Build 2 208728066 3D TCAATATATA AAG/--- AAGAAGTTAG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 AAG 3 2 313129 CASAVA_Build 2 208729945 1D ATCCATATGA C/- CCCTCCTCAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 C 4 3 313130 CASAVA_Build 2 208730593 7D CTTCCTTTTC TTTTGTT/------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 31 13 14 8 TTTTGTT 2 1 313131 CASAVA_Build 2 208731081 1D TATGTAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 53 23 27 3 A 10 9 313132 CASAVA_Build 2 208731298 1I TATGGATTTT -/A AAAATCAGCT 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 A 4 5 313133 CASAVA_Build 2 208734431 1I TTACAAATGT -/G TGGGATTGCA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 G 0 1 313134 CASAVA_Build 2 208735593 18I TTGGGAGGCC ------------------/GAGGTGGGTGGATCACCT GAGGTCGGGA 2987 hom 23 het 11 0 8 5 GAGGTGGGTGGATCACCT 0 1 313135 CASAVA_Build 2 208737224 1I AGCCAGACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 9 10 313136 CASAVA_Build 2 208742205 2D GAGATCTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 42 het 21 0 15 6 TG 7 6 313137 CASAVA_Build 2 208744703 9I CCAGTGTGAG ---------/CCACTCCAT CCAGCCCACT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 CCACTCCAT 0 1 313138 CASAVA_Build 2 208746596 6D TCCATCTCAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 hom 70 het 26 0 24 3 AAAAAC 3 2 313139 CASAVA_Build 2 208749152 1I TCTAGAGACA -/T TTTTTTTTTT 1357 het 1357 ref 37 25 3 9 T 11 12 313140 CASAVA_Build 2 208752673 1D CAGAACACCC T/- TTTTTTTTTT 3017 het 3017 ref 28 12 9 7 T 13 12 313141 CASAVA_Build 2 208757148 1I CGCGGGGGCG -/C CCCCCCTCAC 2689 het 1235 hom 26 4 6 16 C 6 7 313142 CASAVA_Build 2 208758075 1I CTTTTTTTTT -/C TCCCATCCCT 3070 hom 59 het 31 0 22 9 C 0 1 313143 CASAVA_Build 2 208765418 1I CAAACAAACC -/A AAAAAAACAG 3070 hom 54 het 37 0 19 18 A 7 8 313144 CASAVA_Build 2 208766155 4D AAATAAACAT AAAA/---- AACCCACAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 6 2 313145 CASAVA_Build 2 208767763 7D CCCTGCAAGC TAAAGCT/------- TATTCCTTGT 3070 hom 75 het 29 0 25 6 TAAAGCT 1 0 313146 CASAVA_Build 2 208768325 23I GAGATGTGGT -----------------------/AAAGAAGCTGGTTAAAACCTGCC AAAACCGTAC 3070 hom 51 het 17 0 18 0 AAAGAAGCTGGTTAAAACCTGCC 0 1 313147 CASAVA_Build 2 208775084 1D GATCCACTTG C/- CTTGGCCTCC 3070 het 3070 hom 24 12 12 1 C 2 1 313148 CASAVA_Build 2 208775173 1D GTTCTTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 11 10 313149 CASAVA_Build 2 208777259 1D TATAAAGTAC A/- AAAAATGGTA 3070 hom 135 het 51 0 45 6 A 6 5 313150 CASAVA_Build 2 208777597 3I GATTAGATCC ---/CAT CATCTCTAGA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 CAT 1 2 313151 CASAVA_Build 2 208782250 1D TCTCACCTCT C/- TTTCACTGCT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 C 1 0 313152 CASAVA_Build 2 208797101 8D TTCTTTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 1397 hom 26 6 16 4 T 18 10 313153 CASAVA_Build 2 208802330 1D TCTGAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 1004 het 1004 ref 33 22 3 9 A 11 10 313154 CASAVA_Build 2 208810151 1D AACGGGAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 23 5 A 10 9 313155 CASAVA_Build 2 208810363 2I GCAGTAGAGA --/CT CAGCCATACA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 CT 0 1 313156 CASAVA_Build 2 208823270 1I CCTAAGATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 33 1 21 11 T 11 12 313157 CASAVA_Build 2 208823349 16I TATTTATATC ----------------/TTATCATGATTTCTAT TTATCATGAT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 TTATCATGATTTCTAT 0 1 313158 CASAVA_Build 2 208834777 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 7 8 313159 CASAVA_Build 2 208840214 1I TTTGAGCCCC -/T TTTTTTGGCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 6 7 313160 CASAVA_Build 2 208841548 1I GCCTGGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 11 12 313161 CASAVA_Build 2 208851264 1D TGTCTGCTCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 9 8 313162 CASAVA_Build 2 208852676 4D TCAAATGTCT GTAA/---- GTGTGTGATT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 GTAA 1 0 313163 CASAVA_Build 2 208858036 5D GGGATATACA TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 39 het 26 0 14 13 TTTTG 4 3 313164 CASAVA_Build 2 208860064 8D TAATTAATAT AAAATTTA/-------- AAAATTTAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 5 AAAATTTA 2 1 313165 CASAVA_Build 2 208860910 1D GGCATTATGA T/- TTTTTTATAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 7 6 313166 CASAVA_Build 2 208865890 22D GGTGATTACT GATGTAGTTAGAGTAATCCCTG/---------------------- CCGTATTTGT 3070 hom 105 het 37 0 36 5 GATGTAGTTAGAGTAATCCCTG 1 0 313167 CASAVA_Build 2 208866645 1D ACAGGTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1076 hom 29 4 17 8 T 15 14 313168 CASAVA_Build 2 208880542 1D GATAGATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 23 1 19 4 T 16 15 313169 CASAVA_Build 2 208885743 11I ACAAAAGGAG -----------/AATAGAAAAGT ATTAGCCTTC 3070 hom 135 het 53 0 46 8 AATAGAAAAGT 0 1 313170 CASAVA_Build 2 208888480 4I TGCTGTCTGC ----/TTTG TTTGTTAGCA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TTTG 1 2 313171 CASAVA_Build 2 208890400 1I CACAATGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 10 11 313172 CASAVA_Build 2 208896924 4D TTTGATGGGG TTGT/---- TTGTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TTGT 2 1 313173 CASAVA_Build 2 208903737 3I TTTCCTGAGG ---/AGA AGGTTTCCTA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AGA 0 1 313174 CASAVA_Build 2 208914288 1I TTTAATATAG -/T TTTTTTTCTT 2805 het 2805 ref 17 8 6 3 T 7 8 313175 CASAVA_Build 2 208914923 1I ATGGTGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 34 1 27 6 T 10 11 313176 CASAVA_Build 2 208917690 1D ACATTTTTTT C/- CCCTTAAAGT 3070 hom 84 het 32 0 26 6 C 4 3 313177 CASAVA_Build 2 208926507 2I ACTATTTGCA --/TC TCTCTCTCTT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TC 4 5 313178 CASAVA_Build 2 208933120 1D GCAGTTTGTC A/- ACCAGCATAG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 2 1 313179 CASAVA_Build 2 208940995 4D TCTCTCAAAG ACAA/---- ACAATTACGT 3070 hom 111 het 40 0 38 5 ACAA 2 1 313180 CASAVA_Build 2 208952611 1D GGGCGGATCA C/- TTGAGGTCAG 3070 hom 48 het 17 0 16 1 C 1 0 313181 CASAVA_Build 2 208966270 2D CAACTGAATC AG/-- GGGATAAAGA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 AG 1 0 313182 CASAVA_Build 2 208983733 2D GATAAAAGAT TG/-- TGTGTGTGTG 1102 het 1102 ref 57 40 3 15 TG 9 8 313183 CASAVA_Build 2 209009259 1D AAGGAGGTAA G/- GGAATAAGTC 3070 hom 60 het 33 0 29 4 G 3 2 313184 CASAVA_Build 2 209011119 1I CATTGTTTAC -/A TTGCATTATA 3070 hom 132 het 52 0 45 7 A 0 1 313185 CASAVA_Build 2 209045866 1D AAGGTTATGT A/- ACTTGCCTGA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 2 1 313186 CASAVA_Build 2 209047245 1I CCTATAATAC -/A GGCAGTAATA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 0 1 313187 CASAVA_Build 2 209054190 1D ATTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3065 het 108 hom 23 1 11 11 T 17 16 313188 CASAVA_Build 2 209054266 8I TCGGCTCACT --------/GCAACCTC CGCCTCCCGG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 GCAACCTC 0 1 313189 CASAVA_Build 2 209061902 1D CTCTGCTAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 720 hom 42 2 35 6 T 10 9 313190 CASAVA_Build 2 209066891 1I TGATTGTTCA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 7 8 313191 CASAVA_Build 2 209068183 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 240 hom 25 2 18 5 A 11 12 313192 CASAVA_Build 2 209071975 1D TTTTCACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 11 10 313193 CASAVA_Build 2 209076202 3D TCCAGCTTTG TTC/--- TTCTCCCTCA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 TTC 2 1 313194 CASAVA_Build 2 209080148 5D TATAACTGTG GGTTT/----- GATTTGCATT 3070 hom 21 het 12 0 8 5 GGTTT 1 0 313195 CASAVA_Build 2 209092222 1D ATTGTTATGA T/- TTTTTTATTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 7 6 313196 CASAVA_Build 2 209097884 1I TTGTCCCAGA -/G GGGCACCTGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 3 4 313197 CASAVA_Build 2 209129312 4D TGCAGAGAGA TTCT/---- TTCTTTCTTC 3070 hom 62 het 27 0 21 6 TTCT 3 2 313198 CASAVA_Build 2 209130857 1I ACTGTTATAA -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 6 7 313199 CASAVA_Build 2 209150767 1D CTTTTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 11 10 313200 CASAVA_Build 2 209155448 1D45M3D CAGTAAATAA TTGTTAAATGAGTTTATTTTGAGTGAATGCAGAAAATATTGCACTTATC/-TGTTAAATGAGTTTATTTTGAGTGAATGCAGAAAATATTGCACTT--- ATGCTCATAT 3070 hom 163 het 44 0 55 6 N/A 0 0 313201 CASAVA_Build 2 209161440 1D CCCCACATCC A/- ATATGGTTGG 3070 hom 105 het 40 0 36 7 A 2 1 313202 CASAVA_Build 2 209162736 1I AAATTGAAAT -/A AAAATTTGAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 4 5 313203 CASAVA_Build 2 209166518 1D TGAACATAAA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 48 het 30 0 25 5 C 10 9 313204 CASAVA_Build 2 209176562 2I ATAGTTTAAC --/TG TACATTTTAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TG 0 1 313205 CASAVA_Build 2 209178931 3D AGCCTCCTGC CTG/--- CGTGCAGCCC 3070 hom 93 het 34 0 29 6 CTG 1 0 313206 CASAVA_Build 2 209192690 1D CCATTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 1736 het 1736 ref 40 26 4 10 T 12 11 313207 CASAVA_Build 2 209193232 1I TCAAGGGGAT -/C CCCATTAGGG 3070 hom 112 het 47 0 34 13 C 3 4 313208 CASAVA_Build 2 209223644 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 4 T 11 10 313209 CASAVA_Build 2 209249079 4I ACAGGTATGT ----/TAAA TAAGTAAATT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 TAAA 0 1 313210 CASAVA_Build 2 209292877 1D TTCAATTTGT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 9 8 313211 CASAVA_Build 2 209300181 10D ATTAGTGATG TTGAGCATTT/---------- TTTTCATATG 3070 het 3070 ref 28 18 9 5 TTGAGCATTT 1 0 313212 CASAVA_Build 2 209341053 22I TACTGACTCA ----------------------/ATTTTTGTGATACCTTAGAACC ATTTTATAAA 3070 het 3070 ref 42 22 19 3 ATTTTTGTGATACCTTAGAACC 0 1 313213 CASAVA_Build 2 209363732 1I TTGCTTCTTC -/A AGCTACTGTC 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 1 2 313214 CASAVA_Build 2 209401675 1I TTCTCTCGGC -/A AAAAAGAAGT 3070 het 3070 hom 55 24 24 7 A 5 6 313215 CASAVA_Build 2 209407987 3D AGACTAAACC AGG/--- AGAAGCTGAA 3070 het 3070 ref 18 10 7 1 AGG 1 0 313216 CASAVA_Build 2 209414536 1D CTGTGTTTAA T/- TTTAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 10 17 5 T 4 3 313217 CASAVA_Build 2 209417802 5D TACTAAAAAT AAAAA/----- AAAGTATGCA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 8 3 313218 CASAVA_Build 2 209418595 1D CTTGACATGC A/- AAAAAAAAAA 2522 het 2522 ref 29 20 6 3 A 13 12 313219 CASAVA_Build 2 209422293 1D GTGAGCTACC G/- CGCCCGGCCG 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 G 1 0 313220 CASAVA_Build 2 209437835 4D TACAAGAAAA AAAC/---- AAACAACCCC 3070 het 2448 hom 13 5 8 0 AAAC 2 1 313221 CASAVA_Build 2 209438784 2D CCTTTCTATC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 25 13 12 3 A 10 8 313222 CASAVA_Build 2 209439703 1I ATATTTATGG -/A TTGTTATATA 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 A 0 1 313223 CASAVA_Build 2 209441991 2D AAATGAATAT AA/-- GTTACTTTCC 3070 het 3070 hom 49 20 25 5 A 2 0 313224 CASAVA_Build 2 209444052 1I TCTACAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 9 10 313225 CASAVA_Build 2 209445610 2D TTCATTTCAT GA/-- GAGAGAAAAA 3070 het 3070 hom 56 25 27 5 GA 4 3 313226 CASAVA_Build 2 209445855 1I GGATGGCAAG -/A AAAAGGCTAT 3070 het 3070 ref 61 27 27 7 A 4 5 313227 CASAVA_Build 2 209453032 1I CCTGACTTGG -/A AAAAAAAAAA 1849 het 1849 ref 24 7 11 6 A 16 17 313228 CASAVA_Build 2 209461522 2D TTTTATTCTC TT/-- ATTAGGAAAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 T 2 0 313229 CASAVA_Build 2 209466529 1D GAGAATCCTT C/- CTTTCCTATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 C 2 1 313230 CASAVA_Build 2 209481415 1I CATTAAATAC -/A AGAGGCTCAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 1 2 313231 CASAVA_Build 2 209497201 1I TGGATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 11 12 313232 CASAVA_Build 2 209509430 6I4M13I ACTGTAATTA ------GGCA-------------/CAGTAGGGTAATTACAAAGTGTT CAACAACAAA 3070 het 3070 ref 33 22 10 2 N/A 0 0 313233 CASAVA_Build 2 209514659 5D AACTGAAATG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 27 16 9 3 AAACA 3 2 313234 CASAVA_Build 2 209518690 2D CTAAAAATAC TA/-- TATATATATA 1764 het 1119 hom 13 5 5 3 TA 8 7 313235 CASAVA_Build 2 209523994 1I TAGGAAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 9 9 T 9 10 313236 CASAVA_Build 2 209525662 1D GGAAATGTGA T/- TTTTATATAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 T 5 4 313237 CASAVA_Build 2 209525903 3D ATTTTCCTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 A 13 10 313238 CASAVA_Build 2 209525972 1D CTATAAATCT A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 A 7 6 313239 CASAVA_Build 2 209527433 1I41M1I CAATTTTTCT -CTATTCAATTTACCTTGGAGGTACAGTGTTACCCAGAGCCT-/CCTATTCAATTTACCTTGGAGGTACAGTGTTACCCAGAGCCTA AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 28 28 14 3 N/A 0 0 313240 CASAVA_Build 2 209528077 1I TTATAACCTT -/C GTAACCAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 0 1 313241 CASAVA_Build 2 209548952 8D TGAATAATTC TTTTTTCT/-------- TTTTTTCTTT 3070 het 1930 hom 24 5 13 6 TTTTTTCT 2 1 313242 CASAVA_Build 2 209555492 2I TAATACTAAA --/AC AGTGTCAGGA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 AC 0 1 313243 CASAVA_Build 2 209560031 1D ATCTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2418 het 838 hom 29 9 7 13 T 17 16 313244 CASAVA_Build 2 209636702 1D TTTTTGCTGG A/- AAAAAAAAAA 2201 het 2201 ref 37 24 6 7 A 13 12 313245 CASAVA_Build 2 209650791 2D ACTACACAAG AC/-- ACACACACAC 1150 het 1150 ref 47 40 3 5 AC 6 5 313246 CASAVA_Build 2 209660637 2D CAGGCCAACT TG/-- TGTGTGTGAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TG 5 4 313247 CASAVA_Build 2 209674892 2I ACACACACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 870 hom 36 2 26 8 AC 7 8 313248 CASAVA_Build 2 209676475 1D AAACAAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 495 hom 30 2 22 6 A 12 11 313249 CASAVA_Build 2 209677661 2D GGCCATAATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 28 1 20 8 A 15 13 313250 CASAVA_Build 2 209678403 1D AAATACACAG A/- AAAAACACAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 6 5 313251 CASAVA_Build 2 209678750 1I ATACTACCAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 259 hom 30 4 19 7 A 8 9 313252 CASAVA_Build 2 209682100 6D CTATACTCTC ATGTTT/------ ATGTTTATTG 3070 hom 99 het 34 0 32 3 ATGTTT 2 1 313253 CASAVA_Build 2 209683086 3I AGAATTCGCC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 19 0 14 5 A 15 18 313254 CASAVA_Build 2 209686813 1D TTTAGACACA T/- TTTTTAGAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 6 5 313255 CASAVA_Build 2 209697245 2D TTCTTAGAAA TG/-- TATGTACTTG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TG 1 0 313256 CASAVA_Build 2 209698007 3D TTATCTGTTC TCT/--- TATTATAAGA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 TCT 1 0 313257 CASAVA_Build 2 209700431 2I TTTCTGTGAA --/AT ATGTCATTGG 3070 hom 129 het 51 0 41 10 AT 1 2 313258 CASAVA_Build 2 209713880 2D CTATATAGTC TT/-- GGGAATACAG 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 2 0 313259 CASAVA_Build 2 209714566 10D CTCATGAAGG GATTAACCTA/---------- GATGTGTAAG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 GATTAACCTA 1 0 313260 CASAVA_Build 2 209717941 2D ATTACATATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 TA 8 7 313261 CASAVA_Build 2 209720787 2D GCTGGGAATC AT/-- GTGGATTTTC 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 AT 1 0 313262 CASAVA_Build 2 209735483 2I AAACAAAAAA --/TG TTTGATGTTT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 TG 0 1 313263 CASAVA_Build 2 209743170 2D CTGGATACTC TT/-- TATCTTTCAA 3070 het 3070 hom 29 14 15 0 T 3 1 313264 CASAVA_Build 2 209749813 1I CAACATTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 10 11 313265 CASAVA_Build 2 209757102 1I GAACATATCC -/A AAAAGTCATT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 4 5 313266 CASAVA_Build 2 209757467 1I ATGCTTCATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 A 9 10 313267 CASAVA_Build 2 209757783 4D CCAAAGAAAT AAAC/---- AAATCACTTG 3070 het 3070 ref 47 22 22 8 AAAC 1 0 313268 CASAVA_Build 2 209759334 1I AAATTGCAAT -/C AGTTATCATT 3070 het 3070 hom 48 24 22 2 C 0 1 313269 CASAVA_Build 2 209760678 2I ATAATCTAGG --/TT TTACTACATA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 2 4 313270 CASAVA_Build 2 209764890 1I AAAAAGCTAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 43 16 17 10 A 8 9 313271 CASAVA_Build 2 209765312 1I62M1D TATTTTGCAA -TTTCAAACTGAAAAATAAAAATATGTTAACATTTATACCTTTATCCAGAATCTGTTTTTGAGC/TTTTCAAACTGAAAAATAAAAATATGTTATCATTTATACCTTTATCCAGAATCTGTTTTTGAG- CCCTTACTAT 3070 hom 148 het 33 0 50 8 N/A 0 0 313272 CASAVA_Build 2 209765856 3D TTTCTATTCA AAC/--- AACAGAGAAT 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 AAC 2 1 313273 CASAVA_Build 2 209773510 3I CACTCCAAAG ---/TCT TCTTGTTGCT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TCT 1 2 313274 CASAVA_Build 2 209775193 1D TTTGTTAGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 10 9 313275 CASAVA_Build 2 209776904 1I ATTGCCAAAA -/C ACTCATAATG 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 C 0 1 313276 CASAVA_Build 2 209777181 4D TTTCATACCC ATTT/---- ATTTGATAAT 3070 het 3070 hom 45 19 23 5 ATTT 2 1 313277 CASAVA_Build 2 209784028 1I ATTTGCACAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 7 8 313278 CASAVA_Build 2 209788075 1I TATTCTGATT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 95 het 37 0 32 5 A 7 8 313279 CASAVA_Build 2 209788726 1D ATAGCATAAA T/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 15 12 2 T 5 4 313280 CASAVA_Build 2 209789910 1D CCAAATTTAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 8 7 313281 CASAVA_Build 2 209795974 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1859 het 1859 ref 32 12 8 12 T 15 14 313282 CASAVA_Build 2 209796932 9D GAAGTTCAAC ACTACATAA/--------- ACTAAAAATA 3070 het 3070 ref 43 28 13 3 ACTACATAA 1 0 313283 CASAVA_Build 2 209798215 9I CTCCATATCC ---------/CTTATAGCT CTTATAGCTA 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 CTTATAGCT 1 2 313284 CASAVA_Build 2 209799442 4I AACCTCTTTT ----/CTAA CTAAGAAGGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 CTAA 1 2 313285 CASAVA_Build 2 209800433 1I CCTAAACATA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 35 18 14 3 T 7 8 313286 CASAVA_Build 2 209801739 1I TTTAAATGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 32 hom 21 1 18 2 T 9 10 313287 CASAVA_Build 2 209803837 1I TTATTTTTTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 8 9 313288 CASAVA_Build 2 209806781 4I TAGATTTGTA ----/TAAC TAACACAGAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TAAC 1 2 313289 CASAVA_Build 2 209808587 3I GACTTAATCA ---/TAT TATTAATTTT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 TAT 1 2 313290 CASAVA_Build 2 209808981 1I CACATAGACA -/T TATATATATA 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 1 2 313291 CASAVA_Build 2 209816293 12I CATATCCAGC ------------/CAAACTAAGCTT CATAAGCAAA 3070 het 3070 ref 19 10 7 2 CAAACTAAGCTT 0 1 313292 CASAVA_Build 2 209816946 2I AGTGGGAGAC --/TT TAACGCCTCA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 1 3 313293 CASAVA_Build 2 209817609 1I AAAACCCTTC -/A AAAAAATCAA 2676 hom 15 het 6 0 6 0 A 6 7 313294 CASAVA_Build 2 209821646 3D AGGCTAGAAA GAG/--- TAGTGGCAGC 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 GAG 1 0 313295 CASAVA_Build 2 209824271 1I TCCAATGGAT -/G TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 0 1 313296 CASAVA_Build 2 209824827 2I AGCAAAAGAA --/AT AATTAACAGT 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 AT 0 1 313297 CASAVA_Build 2 209825068 1I TGGCTATTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 23 8 8 A 9 10 313298 CASAVA_Build 2 209826169 3D AATATAATAT ATA/--- ATAAAATCTT 3070 het 3070 ref 24 12 7 6 ATA 2 1 313299 CASAVA_Build 2 209827376 3I TTAATCATTT ---/TTA ATAGAGCAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 TTA 0 1 313300 CASAVA_Build 2 209831503 1I TTAAAGGGAA -/T TTTTTTTCTA 3020 het 3020 ref 29 21 8 0 T 7 8 313301 CASAVA_Build 2 209832310 1I AGCCAGCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 9 10 313302 CASAVA_Build 2 209837191 1I AAACACACTC -/A AAATCGCTCA 3070 het 20 hom 18 1 15 2 A 3 4 313303 CASAVA_Build 2 209845116 6D TAGATTAGAT TAGATA/------ TAAAGTGCCT 3070 het 3070 ref 24 13 9 5 TAGATA 1 0 313304 CASAVA_Build 2 209848337 2I AGGGTTTGGG --/TT TTTTTTTTGG 2949 het 2949 ref 30 15 9 6 T 8 10 313305 CASAVA_Build 2 209848712 1D TGGGAGAGGG C/- CCCCCCAAGG 3070 het 3070 ref 47 24 17 6 C 7 6 313306 CASAVA_Build 2 209851007 1I ACTGCCTATT -/C CCCCAAAAAC 3070 het 1732 hom 26 5 21 0 C 4 5 313307 CASAVA_Build 2 209855567 2D GAAGATGAAC AG/-- AGTTCGAAGA 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 AG 2 1 313308 CASAVA_Build 2 209860843 4I AAAAGATCTG ----/AACA AATACCTAAC 3070 het 2856 hom 20 7 7 6 AACA 0 1 313309 CASAVA_Build 2 209874912 1D AAAGCGCTCC T/- TTTTAGTTAT 926 het 926 ref 12 6 2 5 T 5 4 313310 CASAVA_Build 2 209885860 11D AAAAAAAAAA AAAAAGAAAAG/----------- AAAAGAAAAG 1967 het 1437 hom 11 4 6 3 AAAAAGAAAAG 1 0 313311 CASAVA_Build 2 209892057 4I CACTGACTCT ----/GTGA GTAATAGCAG 3070 het 3070 hom 53 24 26 3 GTGA 0 1 313312 CASAVA_Build 2 209901186 1I TCCAATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 13 14 313313 CASAVA_Build 2 209904926 1D CTACTCCTTA C/- CTTGAATTAT 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 C 2 1 313314 CASAVA_Build 2 209906568 1I GCTTCTGCAC -/A GCAAAAGAAA 3070 het 2389 hom 24 7 14 3 A 0 1 313315 CASAVA_Build 2 209907259 1I ACAACTATAT -/A AAAAAATTTA 3068 het 3068 ref 30 18 9 3 A 6 7 313316 CASAVA_Build 2 209907960 1I TCAGTCTAGC -/T AAAAAACCTG 3070 het 3070 ref 50 30 18 2 T 0 1 313317 CASAVA_Build 2 209913385 1D TTCAAAATTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 9 8 313318 CASAVA_Build 2 209922726 3I CTGCCTGCCA ---/TAT TATAATTATT 3070 het 3070 hom 55 21 28 6 TAT 1 2 313319 CASAVA_Build 2 209923762 2I TCCCAGCTCA --/AG AGGTCAACTG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 AG 1 2 313320 CASAVA_Build 2 209924085 1D AGGAGGTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 13 12 313321 CASAVA_Build 2 209925382 4D GTAAAATAAG AAAT/---- AAACAGGTAC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 AAAT 1 0 313322 CASAVA_Build 2 209943777 4I CATGTGTAAT ----/GAAA GAGAGAAGAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 GAAA 0 1 313323 CASAVA_Build 2 209944010 2D AGGTATGTAG AA/-- AAAAGAGTTG 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 A 6 4 313324 CASAVA_Build 2 209954196 1D AATATGAGCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 A 10 9 313325 CASAVA_Build 2 209973887 5D GTACTCTTCT GTATG/----- TCAAACTACA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 GTATG 1 0 313326 CASAVA_Build 2 209980817 1D AAAAAAAAAA C/- AAGAAACGAA 3070 het 928 hom 40 8 18 14 C 1 0 313327 CASAVA_Build 2 210001351 1D GGCAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1979 het 1979 ref 34 24 7 3 T 15 14 313328 CASAVA_Build 2 210016540 1D TCTCTTCAAC G/- ACCCACTCCC 3070 hom 111 het 40 0 38 3 G 1 0 313329 CASAVA_Build 2 210038406 4D TTTTCTAGTT TCTA/---- TCATTGTAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 6 TCTA 1 0 313330 CASAVA_Build 2 210041066 4D AGATTTTTGC TTTT/---- TTTTTTCATT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 10 6 313331 CASAVA_Build 2 210047104 1I TAGTGGTTTA -/C CCAAGGGGAG 3070 hom 160 het 59 0 53 6 C 2 3 313332 CASAVA_Build 2 210059209 1I AAATCTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 9 10 313333 CASAVA_Build 2 210065140 4I TCCATCACAT ----/AAAC AAAACCAATG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 AAAC 0 1 313334 CASAVA_Build 2 210069919 1D TGGCTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 40 0 38 2 A 11 10 313335 CASAVA_Build 2 210077236 1I ACTGAACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 29 2 23 4 A 11 12 313336 CASAVA_Build 2 210083000 1D AAGTTATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1407 hom 20 3 14 3 A 13 12 313337 CASAVA_Build 2 210086532 4D TGTGCGTATA TGTG/---- TGTATGTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TG 3 1 313338 CASAVA_Build 2 210107955 1I AGATATGTGC -/A ACCATTGCCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 1 2 313339 CASAVA_Build 2 210123043 1D GAAGCAAACA T/- TTTGTTAATT 3070 het 3070 hom 49 22 25 3 T 4 3 313340 CASAVA_Build 2 210151872 13D AGAAATCACA TATCGGCCCTGGT/------------- TTTCTAATTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TATCGGCCCTGGT 1 0 313341 CASAVA_Build 2 210302963 1I CAATCTTGTC -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 5 6 313342 CASAVA_Build 2 210310632 4I TTTTTATGAC ----/AGTT AGTAATGATA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AGTT 0 1 313343 CASAVA_Build 2 210313227 2I TAGTCGAGAA --/AG AGAAATAAAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AG 1 2 313344 CASAVA_Build 2 210364500 1D GAATCTTCTC T/- TTCCTTCGTC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 3 2 313345 CASAVA_Build 2 210372055 1D AAAATAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 12 11 313346 CASAVA_Build 2 210373461 1D TTTGTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 23 0 16 7 A 13 12 313347 CASAVA_Build 2 210375678 1D CATTTATTAT C/- TTTCGATTTT 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 C 1 0 313348 CASAVA_Build 2 210381263 1D TGGGCGTGGT G/- GTTCACGCCT 3070 het 2387 hom 25 7 11 7 G 2 1 313349 CASAVA_Build 2 210387947 1I CTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 10 11 313350 CASAVA_Build 2 210409316 1D AAAGAAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 10 9 313351 CASAVA_Build 2 210413157 8D TAGGTGAGGT ATAAGTAA/-------- ATGGAAGCTT 3070 het 3070 ref 46 24 22 2 ATAAGTAA 1 0 313352 CASAVA_Build 2 210484155 4D ATAATAAAAC AGAG/---- AGGTGCCAGT 3070 het 3070 hom 19 9 9 3 AG 3 1 313353 CASAVA_Build 2 210537236 3I AACAACTAAT ---/ATC ATAAAAAGAG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 ATC 0 1 313354 CASAVA_Build 2 210538904 1D AACTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 704 het 704 ref 24 11 4 9 A 17 16 313355 CASAVA_Build 2 210544569 1D GGATAACTGA C/- CCATCCGTCG 3070 het 3070 hom 43 15 24 5 C 3 2 313356 CASAVA_Build 2 210556554 1I AGCTATCAGT -/G TATTTTTAAT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 G 0 1 313357 CASAVA_Build 2 210562294 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 329 hom 30 1 21 9 A 15 14 313358 CASAVA_Build 2 210574508 4D AACAAAGTAT AGAC/---- AGCCATGTAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AGAC 1 0 313359 CASAVA_Build 2 210574605 2D CTGGCCTCTC TG/-- TGCAGCATTC 3070 hom 90 het 32 0 29 4 TG 2 1 313360 CASAVA_Build 2 210581566 1D CCGGCCCCGG T/- TTTGTTAAAG 3070 hom 51 het 20 0 16 5 T 4 3 313361 CASAVA_Build 2 210597322 4I GTGCTATTTA ----/TTAT TTATTTTCAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 TTAT 1 2 313362 CASAVA_Build 2 210602629 3D ATCAAATATA TTG/--- TTTTCTAACA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTG 1 0 313363 CASAVA_Build 2 210645649 1D CCACTGATCT G/- ACAGGAGGCA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 1 0 313364 CASAVA_Build 2 210671790 1D AATATCAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 10 9 313365 CASAVA_Build 2 210695811 1D AAATCAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 10 9 313366 CASAVA_Build 2 210703814 1D GTGGTAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 25 0 17 8 T 15 14 313367 CASAVA_Build 2 210712853 1D TGGAACTGCA G/- GTGCACACCA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 G 2 1 313368 CASAVA_Build 2 210731671 1D GTATCCTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 587 hom 32 3 16 13 A 15 14 313369 CASAVA_Build 2 210735699 3I AAAGATCATC ---/ATT GAGATAGGAG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 ATT 0 1 313370 CASAVA_Build 2 210737786 2D AAAAACCAAC TA/-- TGTTTCTTGG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TA 1 0 313371 CASAVA_Build 2 210744965 1I TTTTATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 17 2 13 2 A 13 14 313372 CASAVA_Build 2 210748708 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 24 2 17 6 A 17 16 313373 CASAVA_Build 2 210754386 1I CTATCTGCAG -/T TTTTTTTTTT 2185 het 630 hom 23 2 10 11 T 13 14 313374 CASAVA_Build 2 210754861 2I CGCAGCGTCA --/AC AGACTTAAAC 3070 hom 99 het 34 0 34 0 AC 0 1 313375 CASAVA_Build 2 210759870 12I GTTCAACCAT ------------/TGTGGAAGACAG TGTGGCGATT 2396 hom 20 het 12 0 6 6 TGTGGAAGACAG 0 1 313376 CASAVA_Build 2 210762193 1I GAATAATAGT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 9 313377 CASAVA_Build 2 210762697 3D CCACTGTACA GTT/--- GTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 45 17 24 5 GTT 2 1 313378 CASAVA_Build 2 210769233 1D ATTAAACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 25 1 20 4 T 13 12 313379 CASAVA_Build 2 210776349 12I6M2D TTTAACATAG ------------TTCCTGGT/TTAAACATAACATTCATG-- TTCTTCAAAC 3070 hom 129 het 44 0 44 3 N/A 0 0 313380 CASAVA_Build 2 210787000 5I TTTAAAAAAT -----/AATAA AATAAAATAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AATAA 2 3 313381 CASAVA_Build 2 210790048 1D CAAAATCCTA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 8 7 313382 CASAVA_Build 2 210811668 1D CATAATATCA C/- CATTTACAGA 3070 hom 102 het 40 0 36 4 C 2 1 313383 CASAVA_Build 2 210822407 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 266 hom 15 1 13 1 T 17 16 313384 CASAVA_Build 2 210868796 1D CCTGCCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1520 het 1520 ref 37 18 5 14 A 17 16 313385 CASAVA_Build 2 210881840 5I TTTTTGTTCA -----/TTCTT TTATTTTAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TTCTT 0 1 313386 CASAVA_Build 2 210882245 11I AATTTAGATA -----------/AACAGGAATTG AACAAAACAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 AACAGGAATTG 0 1 313387 CASAVA_Build 2 210900370 1D GGATTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 1850 het 1850 ref 37 27 4 6 T 11 10 313388 CASAVA_Build 2 210916374 1I TTGGCTATGC -/G GGCTCTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 2 3 313389 CASAVA_Build 2 210942074 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 10 9 313390 CASAVA_Build 2 210961691 1I ATTTCTAGGA -/C CCATTTGTTC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 2 3 313391 CASAVA_Build 2 210966445 3I TGTATAGATA ---/ATT ATTATTATAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATT 2 3 313392 CASAVA_Build 2 210977450 4D TCTGAGAGAC TGTT/---- TGTTATGATA 3070 hom 45 het 17 0 16 3 TGTT 2 1 313393 CASAVA_Build 2 210985061 1I ATGTTGTTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 9 10 313394 CASAVA_Build 2 211018138 1D ATTACTGTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 8 7 313395 CASAVA_Build 2 211019204 1I CTGGCGGGTG -/C CCCTCTGGGA 3070 het 408 hom 26 2 20 4 C 3 4 313396 CASAVA_Build 2 211028287 2I GCAATACCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 36 8 A 12 14 313397 CASAVA_Build 2 211032819 1D GTGAACTAGA T/- TTTTTTTTTT 1305 het 1305 ref 37 29 3 5 T 13 12 313398 CASAVA_Build 2 211034353 1I CTGAAATGCT -/G GGCTCTGATG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 2 3 313399 CASAVA_Build 2 211037440 1D GATTTAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 1 0 313400 CASAVA_Build 2 211042939 2I TAACTAGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 11 13 313401 CASAVA_Build 2 211049450 1I AGGGCGGCGG -/C CGGCGCCCAG 2608 hom 35 het 15 0 13 2 C 1 2 313402 CASAVA_Build 2 211055646 2D AGAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 8 het 26 1 17 10 AG 10 9 313403 CASAVA_Build 2 211061132 1D TGCATTATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 30 0 26 6 T 10 9 313404 CASAVA_Build 2 211075348 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTATA 2418 hom 12 het 5 0 5 0 A 1 0 313405 CASAVA_Build 2 211075432 2I ATACATATAG --/AT ATATATATAT 1637 hom 15 het 6 0 6 0 AT 5 6 313406 CASAVA_Build 2 211078558 1I AGCAGGGCGA -/G GCATCGCCTC 3070 hom 89 het 31 0 25 6 G 1 2 313407 CASAVA_Build 2 211078933 1I TCTGGGGGCA -/G GGCATAGCCA 2832 het 2118 hom 19 7 8 4 G 2 3 313408 CASAVA_Build 2 211084505 4D TTATAATAAT AAAC/---- AAAAAGAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAAC 1 0 313409 CASAVA_Build 2 211087755 1I GGAATGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 42 2 20 20 T 13 14 313410 CASAVA_Build 2 211088319 1I GGTTGGTAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 10 313411 CASAVA_Build 2 211203062 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2036 hom 21 6 11 4 A 12 13 313412 CASAVA_Build 2 211223848 1I GAACTTTGCC -/T TAGTCAAACA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 1 2 313413 CASAVA_Build 2 211229473 1D TCTAAAATCC T/- TTTTTTTTTT 2168 het 450 hom 26 1 11 14 T 15 14 313414 CASAVA_Build 2 211236073 1D TTTCTCCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 28 1 21 6 T 12 11 313415 CASAVA_Build 2 211243462 1I CAATTGCAGA -/T TAAAGTAATT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 2 313416 CASAVA_Build 2 211253040 3I ATCTCTCCTA ---/CTC CTATTATTCT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 CTC 0 1 313417 CASAVA_Build 2 211256093 8D CCAGGCTGGA GTGCAGTG/-------- GTGCGATCTT 1588 het 953 hom 10 2 5 3 GTGCAGTG 1 0 313418 CASAVA_Build 2 211259756 2D CAGTGGACTC AG/-- AGGATAGAGA 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 AG 2 1 313419 CASAVA_Build 2 211268992 3I TACATGTGTA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 T 11 14 313420 CASAVA_Build 2 211269154 1I GCCTATTATC -/T GCTGGGTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 0 1 313421 CASAVA_Build 2 211269806 2I TTTCTTCCAT --/TA TATATCCTCT 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 TA 2 3 313422 CASAVA_Build 2 211283439 1D AGAGTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 422 hom 43 2 28 13 A 12 11 313423 CASAVA_Build 2 211284614 1I ATTTTTATGA -/C CCCCCCTCCA 2462 het 2462 ref 37 16 12 9 C 6 7 313424 CASAVA_Build 2 211287350 2D ATGCCCTGTA TC/-- TCCTGTGTTT 3070 het 3070 ref 38 20 17 4 TC 2 1 313425 CASAVA_Build 2 211288310 4D ACAATGTACA TTAT/---- TTATTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 12 16 11 TTAT 2 1 313426 CASAVA_Build 2 211297269 3I CCTGAAATAA ---/AAG AAGACTTAGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AAG 1 2 313427 CASAVA_Build 2 211299700 1D TTTTATTCAG A/- TTTTCTTAGG 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 A 1 0 313428 CASAVA_Build 2 211304364 1D CAACCCAGGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 T 8 7 313429 CASAVA_Build 2 211304702 4D TCTGATAAAC AAAG/---- AAGCAGATTT 3070 het 3070 ref 53 25 24 8 AAAG 1 0 313430 CASAVA_Build 2 211307351 1I GAAAAATTCT -/G AATTATGAAA 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 G 0 1 313431 CASAVA_Build 2 211307720 1I CCATGGACTC -/A AAAAAAAAAT 2603 het 2603 ref 25 11 6 8 A 9 10 313432 CASAVA_Build 2 211308221 1I CCACACTACC -/T TTATGAGCTG 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 2 3 313433 CASAVA_Build 2 211309157 3D TAAACTTTGA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 582 hom 22 4 12 8 T 12 9 313434 CASAVA_Build 2 211313672 1I CTGTATGTAT -/A AAAAAAAAAG 2971 het 2971 ref 19 7 7 9 A 9 10 313435 CASAVA_Build 2 211313740 1D TCCTGTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 10 8 T 11 10 313436 CASAVA_Build 2 211317530 1D ATTCTCCCAG C/- CTTGGCCTCC 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 C 2 1 313437 CASAVA_Build 2 211318885 2D GGCAGAGCAC TG/-- TGTGTTTATT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 TG 3 2 313438 CASAVA_Build 2 211340639 1I TACCTTTAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 590 hom 29 2 25 2 T 9 10 313439 CASAVA_Build 2 211348978 1D CTCTGAAACT A/- CAGAGGGAGT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 1 0 313440 CASAVA_Build 2 211359463 1I TTTAATGATA -/T TTTTTATCAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 5 6 313441 CASAVA_Build 2 211361226 1I CTCTTCCTGG -/A AAAAAATTGC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 6 7 313442 CASAVA_Build 2 211361845 2I TTCTTGATAT --/AA GAGTCATAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 2 313443 CASAVA_Build 2 211370483 1D CTCACCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 12 11 313444 CASAVA_Build 2 211381280 1D TTTTACTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 323 hom 35 2 17 16 A 11 10 313445 CASAVA_Build 2 211384306 1D TTCTGTCTAA T/- AATTCCAATG 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 T 1 0 313446 CASAVA_Build 2 211397339 1I TTCATTTGAT -/C CATGCTGGTT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 C 1 2 313447 CASAVA_Build 2 211399726 1I AGCACCTTTT -/C AAGCAACTTG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 C 0 1 313448 CASAVA_Build 2 211403131 1D TCAGAGCAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 22 0 12 12 T 10 9 313449 CASAVA_Build 2 211417162 1I GATTTATGTG -/C CCTGCGATGA 3070 hom 36 het 23 0 12 11 C 2 3 313450 CASAVA_Build 2 211417202 1I46M1I GTTGGTCAAG -CCTGTTGACAGACCCAGCCTAGTCCAGGGAACAGTGGAGCTAACAT-/CCCTGTTGACAGACCCAGCCTAGTCCAGGGAACAGTGGAGCTAACATC CAGTACATTC 3070 hom 39 het 25 0 14 28 N/A 0 0 313451 CASAVA_Build 2 211419092 1I CTTCCCTGTA -/G GGAAGATCAG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 G 2 3 313452 CASAVA_Build 2 211422694 4D CTAAAAGTCC CTCT/---- CTAAGCAAGA 3070 het 3070 ref 51 26 22 4 CT 3 1 313453 CASAVA_Build 2 211428906 1I GGAAGGTATT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 7 8 313454 CASAVA_Build 2 211432271 1D TTAATGTATT G/- GGGGGGGTCA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 G 8 7 313455 CASAVA_Build 2 211435758 1I TTGGCTAGTC -/T TTTTTTTTTT 1589 het 1589 ref 29 17 6 6 T 10 11 313456 CASAVA_Build 2 211440654 4D CACTAAAAAA ACAC/---- ACTGAAGTAT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AC 3 1 313457 CASAVA_Build 2 211443536 5D GGATAAACTG TTTTA/----- AAATTCATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TTTTA 1 0 313458 CASAVA_Build 2 211444342 1I ATGAGATACC -/A ATCTCATGCC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 1 2 313459 CASAVA_Build 2 211445050 1D CATAACTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1454 hom 25 7 10 8 A 16 15 313460 CASAVA_Build 2 211449459 1D TACGGTTTTT G/- TTTAACCACT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 G 1 0 313461 CASAVA_Build 2 211463189 6D TTTCAGACAG GCAAAT/------ GCTAAGGGAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 6 GCAAAT 1 0 313462 CASAVA_Build 2 211473921 1I ATTTGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 12 13 313463 CASAVA_Build 2 211487029 2I AAGTGAGAAC --/AT GTGGTATTTG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 AT 0 1 313464 CASAVA_Build 2 211487201 1D TGAGCATTTT G/- GTTGAGTCCA 3070 hom 114 het 46 0 38 8 G 2 1 313465 CASAVA_Build 2 211493211 2I TAGCTCTTAA --/AT ATATATATAT 1600 het 1600 ref 11 6 5 0 AT 5 6 313466 CASAVA_Build 2 211500057 1D GAGAAAAAGG A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 A 2 1 313467 CASAVA_Build 2 211517282 2I ATATATATAA --/TT TTTTTTTTTT 2198 hom 18 het 11 0 7 4 T 12 14 313468 CASAVA_Build 2 211529581 1D CTCTTTTTTT C/- ACTACTCGGC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 1 0 313469 CASAVA_Build 2 211533645 1I AAAAAAATTT -/G GGGGGGGGGA 3070 het 2159 hom 32 8 15 9 G 9 10 313470 CASAVA_Build 2 211538481 1I TAGTACTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 9 10 313471 CASAVA_Build 2 211550857 6D TAGAAGTGTT TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 40 12 15 13 TTG 8 6 313472 CASAVA_Build 2 211560670 1I TTCTATTTGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 A 7 8 313473 CASAVA_Build 2 211562911 12I CTCCGTCACC ------------/CAGGTTGGAGTG CAATGGCCCA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 CAGGTTGGAGTG 0 1 313474 CASAVA_Build 2 211564186 1D AGCTAGAAGC A/- GCTTGTTTTC 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 A 1 0 313475 CASAVA_Build 2 211565023 1I TGCTATTTGC -/T TGTGCAGCTA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 1 2 313476 CASAVA_Build 2 211565783 4I GTAAGAGAAG ----/AAGA AAGAAAGAAG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 AAGA 2 3 313477 CASAVA_Build 2 211566023 1D TCTTCTCTCC T/- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 T 7 6 313478 CASAVA_Build 2 211570737 1I GAACAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 12 12 T 10 11 313479 CASAVA_Build 2 211583060 1I CCACTATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 A 10 11 313480 CASAVA_Build 2 211587019 2D CTGTAAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 19 hom 32 1 20 11 A 13 11 313481 CASAVA_Build 2 211587432 1I AGTTTGCTGG -/C CTGACGTTGT 3070 het 3070 ref 51 28 21 3 C 1 2 313482 CASAVA_Build 2 211589412 2I AATTCTCGAG --/AC ACACAGCAGC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 AC 2 3 313483 CASAVA_Build 2 211594868 3D GTTTTTTTGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 1711 hom 27 9 11 8 TTG 5 4 313484 CASAVA_Build 2 211596072 2I GTTGGACAAT --/TC TTTTATCACA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 TC 0 1 313485 CASAVA_Build 2 211600060 10I AATGTTTTCA ----------/ATGATTTTCC ATTACTTGAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 ATGATTTTCC 0 1 313486 CASAVA_Build 2 211600631 1D TACATATATG T/- TTTTTATTAT 2939 het 2939 ref 16 8 7 1 T 6 5 313487 CASAVA_Build 2 211602534 3D GAACACAAAT AGG/--- AGAACATCTA 3070 het 3070 hom 37 17 18 5 AGG 1 0 313488 CASAVA_Build 2 211604480 1I GAAAGAGAGA -/T TTTTTCTAAA 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 T 5 6 313489 CASAVA_Build 2 211605424 17I TCATGGATTT -----------------/CTCTTATCCTTCTTATC CTCTTATCCT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 CTCTTATCCTTCTTATC 0 1 313490 CASAVA_Build 2 211612735 2I ACCGTAGAAC --/TA TATATATATA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 TA 6 7 313491 CASAVA_Build 2 211627276 1I CACTCATAGA -/T TTTTTTGACT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 T 6 7 313492 CASAVA_Build 2 211630540 1I CTTATGTCTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 A 7 8 313493 CASAVA_Build 2 211634368 3D CTCAATTTTA TTC/--- TTCTCATTTG 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 TTC 2 1 313494 CASAVA_Build 2 211635859 1I TTTGAGTAAT -/A AAAAAAACTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 7 8 313495 CASAVA_Build 2 211638022 7D CGAAGTGGTC TCAGTAT/------- TCTTATTAGC 3070 het 3070 hom 42 17 23 4 TCAGTAT 1 0 313496 CASAVA_Build 2 211639635 1D CATTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1874 het 426 hom 26 4 15 8 T 12 11 313497 CASAVA_Build 2 211646505 1D TTTATAAAAA T/- ATATTTTATT 2071 het 2071 ref 14 7 5 2 T 1 0 313498 CASAVA_Build 2 211652873 16I TCTGATGAGT ----------------/GGGCTTAGCTGAAGGA GGGCTTAGCT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 GGGCTTAGCTGAAGGA 0 1 313499 CASAVA_Build 2 211668965 1D GTGTTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 A 11 10 313500 CASAVA_Build 2 211679118 1D CTCCTCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 30 0 23 7 A 11 10 313501 CASAVA_Build 2 211681350 3I AGAAAAAAAA ---/ATT AATTAAGCAG 3070 het 54 hom 27 1 14 12 ATT 0 1 313502 CASAVA_Build 2 211685228 1D ATTAATAAAA G/- TATGTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 9 19 4 G 1 0 313503 CASAVA_Build 2 211686312 1D TTCTGTATTT C/- CCCCCCCCGC 3070 hom 45 het 32 1 28 4 C 9 8 313504 CASAVA_Build 2 211701156 1D AAATAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 26 2 10 14 T 14 13 313505 CASAVA_Build 2 211703093 5D ATTTTCTTGT ATTAA/----- ATTGTGATTT 3070 het 3070 hom 45 18 24 4 ATTAA 1 0 313506 CASAVA_Build 2 211703679 3D AAAGAGTCCC TTT/--- TTTTTTTTTT 2948 het 467 hom 20 4 9 7 T 17 14 313507 CASAVA_Build 2 211705140 1D AAATCCTTGG C/- CAATGAGAAA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 C 2 1 313508 CASAVA_Build 2 211706325 1D TGTATTTACA T/- TTTTTACTCT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 6 5 313509 CASAVA_Build 2 211710774 1D TTGCATTTGG C/- CCATCCTACA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 C 3 2 313510 CASAVA_Build 2 211721412 1D TTGTATCCAT G/- GAATGTTAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 2 1 313511 CASAVA_Build 2 211721867 1D TGTAAAAATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 86 het 30 0 29 1 T 10 9 313512 CASAVA_Build 2 211722090 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 9 313513 CASAVA_Build 2 211727615 9D TTATTCTATC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 1592 hom 24 10 11 4 T 21 12 313514 CASAVA_Build 2 211729186 4D AAATTAAGAA TTTG/---- TTTGTTTCTT 3070 het 3070 ref 21 11 7 3 TTTG 2 1 313515 CASAVA_Build 2 211733510 1I TTTCTCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 9 5 A 11 12 313516 CASAVA_Build 2 211733842 1D TGTTATCCTT G/- GGAGAGCAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 3 2 313517 CASAVA_Build 2 211733962 1D GGGTTTCTAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 9 8 313518 CASAVA_Build 2 211735396 1D TACAACTACA T/- TAAAAATATC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 2 1 313519 CASAVA_Build 2 211737344 1D TACGAATGGA T/- TTTTCTCAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 5 4 313520 CASAVA_Build 2 211741106 1I ATTGATAAAG -/A ATTAATAACC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 1 2 313521 CASAVA_Build 2 211741444 1D GGTGTTCTCT A/- AATACAATCA 3070 het 3070 ref 51 27 19 7 A 3 2 313522 CASAVA_Build 2 211741626 1D CACTGATTTT C/- CCCCCCCAAA 1905 het 1905 ref 29 20 5 4 C 8 7 313523 CASAVA_Build 2 211742159 1I CTGTTAAGTG -/A AAAAAAGCAT 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 A 6 7 313524 CASAVA_Build 2 211743372 4D TCTGAAAGAA TACT/---- TAAACGAGTT 3070 het 1471 hom 15 3 12 0 TACT 1 0 313525 CASAVA_Build 2 211744851 3D CTTTCAATAA AAT/--- AATCAGACAG 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 AAT 2 1 313526 CASAVA_Build 2 211745046 4D TATTAATAAT AATC/---- AAATAATAAC 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 AATC 1 0 313527 CASAVA_Build 2 211745815 6I TTTTATTTAC ------/TTTTAT TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TTTTAT 0 1 313528 CASAVA_Build 2 211746093 1D AATTCTCATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 10 9 313529 CASAVA_Build 2 211746680 1D TGAAAAAAAA T/- GTTAATATAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 T 1 0 313530 CASAVA_Build 2 211748437 3D AAAAGAAAAA AAG/--- AACTTTGCTC 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 AAG 1 0 313531 CASAVA_Build 2 211750136 1D AGTAACAGTG A/- ACTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 2 1 313532 CASAVA_Build 2 211750661 1D ATCAATGAAC T/- TTTTTTCACC 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 T 7 6 313533 CASAVA_Build 2 211751048 1I GAAGATATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 7 8 313534 CASAVA_Build 2 211752027 2D TTCAAGAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 2864 het 26 hom 27 1 11 16 A 18 16 313535 CASAVA_Build 2 211756025 1D TTTCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 T 15 14 313536 CASAVA_Build 2 211758141 1I AGTCATACAA -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 6 7 313537 CASAVA_Build 2 211762962 1D TCTTAGAACA C/- TCAGCCAGAT 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 C 1 0 313538 CASAVA_Build 2 211772399 4D TTAAACTATT AGAG/---- AGCTCTGAAT 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 AG 3 1 313539 CASAVA_Build 2 211811757 1D ATTACTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1518 hom 44 5 28 11 T 14 13 313540 CASAVA_Build 2 211817266 3D GTCTTAAGAG AAT/--- AATACCATTT 3070 hom 89 het 35 0 29 6 AAT 2 1 313541 CASAVA_Build 2 211817875 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2636 hom 11 het 14 0 9 5 A 16 15 313542 CASAVA_Build 2 211860832 1D ATTTTTTTTT A/- CCAGTTTGGG 3070 hom 132 het 52 0 45 8 A 1 0 313543 CASAVA_Build 2 211869850 16D TGTATATACA TACATATGTATGTATG/---------------- TATATACATA 1983 hom 18 het 6 0 7 4 TACATATGTATGTATG 1 0 313544 CASAVA_Build 2 211883191 4I TTAAAAAAAC ----/AATA AATCTTGTAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AATA 0 1 313545 CASAVA_Build 2 211891050 4D CATATATATA TATT/---- CTGGTATATT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TATT 1 0 313546 CASAVA_Build 2 211901643 2I ATGCATATGT --/AC ACACACACAC 3070 hom 138 het 59 0 47 12 AC 6 7 313547 CASAVA_Build 2 211905241 1D AAAATAATGA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 7 6 313548 CASAVA_Build 2 211917794 4I CAATTATGCC ----/TTTG TTTATTTATT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 TTTG 0 1 313549 CASAVA_Build 2 211926366 2D AATTTTCAGC AA/-- AAAAAAAAAA 2544 het 456 hom 24 4 8 13 A 20 18 313550 CASAVA_Build 2 211928689 1I TAAAGCAACT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 A 0 1 313551 CASAVA_Build 2 211951858 2D TATCTGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 7 T 13 11 313552 CASAVA_Build 2 211953007 1I ATAACACTTA -/G AACACTATTC 3070 hom 151 het 57 0 51 6 G 0 1 313553 CASAVA_Build 2 211953336 12I TTTCCATACC ------------/TGAAAATAGGAT TGCCCAAAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TGAAAATAGGAT 0 1 313554 CASAVA_Build 2 211968589 4I TAATTTTAAG ----/ACAA ACAGATATTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ACAA 0 1 313555 CASAVA_Build 2 211976968 4I AACCTAGCAT ----/ACTC ACTCAGTTGA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 ACTC 1 2 313556 CASAVA_Build 2 211985071 1I AGGCTAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 28 3 22 3 A 11 12 313557 CASAVA_Build 2 211991055 1D AAATGCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 T 14 13 313558 CASAVA_Build 2 212008934 1D GTTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 32 0 29 3 T 11 10 313559 CASAVA_Build 2 212020213 1I TTAATACTTT -/C ATCTTTTATG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 0 1 313560 CASAVA_Build 2 212034056 1D AGATTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 29 2 22 5 A 12 11 313561 CASAVA_Build 2 212049541 1D AAAAATGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 23 6 A 12 11 313562 CASAVA_Build 2 212056545 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 3070 het 2695 hom 29 7 18 4 AG 2 1 313563 CASAVA_Build 2 212063271 3D CATGAAACTC ATT/--- ATTTCTTTCT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 ATT 2 1 313564 CASAVA_Build 2 212066549 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 2136 het 2136 ref 23 11 6 6 A 9 10 313565 CASAVA_Build 2 212066646 5I ATTTGAAATA -----/TATAT TATATTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TATAT 1 2 313566 CASAVA_Build 2 212070454 1D GGCAACCTAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 35 10 23 2 A 8 7 313567 CASAVA_Build 2 212072924 1D ATGACAAGAG A/- ATACTAAAGA 3070 het 3070 hom 48 23 21 5 A 2 1 313568 CASAVA_Build 2 212074084 1D AGTATCTACT A/- AAAAAGGTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 6 5 313569 CASAVA_Build 2 212074468 1I CATAAAAATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 85 het 38 0 29 9 A 8 9 313570 CASAVA_Build 2 212078456 4D AAAGAATGAT ACTC/---- ACCATCATAA 1314 het 1314 ref 38 14 7 18 ACTC 1 0 313571 CASAVA_Build 2 212078541 8D AGGCAACTAG CAAACAAA/-------- CAAACAAACA 3070 het 472 hom 35 5 12 25 CAAA 6 4 313572 CASAVA_Build 2 212079529 4I CCATATCAAG ----/TATC TTTCTGTATC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TATC 0 1 313573 CASAVA_Build 2 212079644 3D AAACAACAAC AAT/--- AAAGCAGAAA 3070 het 2533 hom 32 7 16 10 AAT 1 0 313574 CASAVA_Build 2 212079683 2D AAATGAAAAC AG/-- AGACACAACA 3070 het 2471 hom 33 8 16 9 AG 2 1 313575 CASAVA_Build 2 212082125 2D GACACAGGGA GG/-- GGGGAGTATC 3070 hom 42 het 18 0 13 5 G 6 4 313576 CASAVA_Build 2 212085418 2I CCAAAATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 28 1 22 5 A 10 12 313577 CASAVA_Build 2 212091365 2I GAAAAGAGTT --/AG TGTGTAATCC 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 AG 0 1 313578 CASAVA_Build 2 212105122 1I GAAGGGTTGT -/G GGGGGGGGAA 3070 hom 55 het 23 0 18 5 G 8 9 313579 CASAVA_Build 2 212106003 6I ATTATAAATA ------/ATATAT ATAAAGTGGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AT 1 4 313580 CASAVA_Build 2 212108943 1I CATTTCCCTG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 400 hom 24 1 20 3 T 7 8 313581 CASAVA_Build 2 212109354 1I ACCCTAAACT -/G TGAAAGATGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 0 1 313582 CASAVA_Build 2 212110031 4D TATTCAAACA AAGT/---- AAGAGTAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAGT 1 0 313583 CASAVA_Build 2 212110290 4D TCTGGCTCAA TTTG/---- TTTGGAAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTTG 2 1 313584 CASAVA_Build 2 212113706 1I TAGAGAAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 9 10 313585 CASAVA_Build 2 212116762 3D TCTGATTTAA AAG/--- AAGTTTTCAA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 AAG 2 1 313586 CASAVA_Build 2 212117744 1I GTTTGCATGA -/C CTTCAGTGAA 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 C 1 2 313587 CASAVA_Build 2 212119116 1D TAGCCTAATA C/- TTTTAATCAT 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 C 1 0 313588 CASAVA_Build 2 212125944 1D AAATAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1534 hom 22 6 10 6 T 13 12 313589 CASAVA_Build 2 212143503 1I CTGGGCAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1856 hom 32 4 20 8 A 10 11 313590 CASAVA_Build 2 212146676 1D ATAGAAAATA T/- TAAAAAAAAA 2040 hom 12 het 5 0 5 0 T 2 1 313591 CASAVA_Build 2 212149075 1I TTATTTTATA -/T TTTTTAATAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 5 6 313592 CASAVA_Build 2 212156487 4D TTATTTTCCC TAGA/---- TAAATTACTT 3070 hom 83 het 31 0 27 6 TAGA 1 0 313593 CASAVA_Build 2 212165163 4I AGACGCAGGG ----/CTTT CTTTGGGCGT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 CTTT 1 2 313594 CASAVA_Build 2 212170638 13I CAAATTCATC -------------/TTTTACATATTTA TTTTCATTAG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 TTTTACATATTTA 0 1 313595 CASAVA_Build 2 212179418 1I ATTTGGAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 17 0 12 5 T 9 10 313596 CASAVA_Build 2 212185206 1D TAAAACATGG A/- AAAAAAAATC 2784 het 2784 ref 22 12 6 5 A 9 8 313597 CASAVA_Build 2 212193914 1D CAACTCTACT A/- AAAAATAAAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 6 5 313598 CASAVA_Build 2 212199937 2I AAAAAAAAAA --/AT AAGTGTGTGT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 AT 0 1 313599 CASAVA_Build 2 212201135 1D TGAGATATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 24 0 14 10 T 12 11 313600 CASAVA_Build 2 212209071 2D CTGAAAATGC GT/-- GTGTGTGTTT 3070 hom 108 het 38 0 34 5 GT 5 4 313601 CASAVA_Build 2 212214904 1D TCATTTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 T 11 10 313602 CASAVA_Build 2 212217425 1D AATGTAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 109 hom 32 2 23 7 A 10 9 313603 CASAVA_Build 2 212232154 2D AAGTCACTTA TC/-- TCTCTGTCTC 2376 het 2376 ref 30 19 6 6 TC 3 2 313604 CASAVA_Build 2 212237672 1I TGAAAAAGAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 9 22 7 A 8 9 313605 CASAVA_Build 2 212240066 1D CTGATGAGCC A/- AAAAAAAAAA 944 het 944 ref 31 21 3 7 A 13 12 313606 CASAVA_Build 2 212248191 1I GGGAGCTTTG -/T TTCCCTTGGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 2 3 313607 CASAVA_Build 2 212252658 2I AAGTTTTCTC --/TT GTTTGTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 T 0 2 313608 CASAVA_Build 2 212260116 1D AAAAAAAAAA G/- TACAAAAAGT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 0 313609 CASAVA_Build 2 212267532 1I ACTTGAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 12 13 313610 CASAVA_Build 2 212272295 2D ATGTACATCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 14 15 11 TG 6 5 313611 CASAVA_Build 2 212285749 1D GTGTGTGGGT G/- GGGGGGGATG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 G 8 7 313612 CASAVA_Build 2 212292420 1I GTGTCTTTAG -/T TACTGTGTTC 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 1 2 313613 CASAVA_Build 2 212298474 1I CCAACTACTT -/G GGAGACTGAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 2 3 313614 CASAVA_Build 2 212315566 1I TAAGGTTTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 7 8 313615 CASAVA_Build 2 212325462 1I ACCTAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 14 15 313616 CASAVA_Build 2 212325785 1I ACCCACACAC -/A ACAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 A 1 2 313617 CASAVA_Build 2 212326132 5D TATCTGATTA GAGAT/----- ATTTATGAAT 3070 het 3070 ref 49 22 22 11 GAGAT 1 0 313618 CASAVA_Build 2 212326250 1I CCTAGCATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 A 11 12 313619 CASAVA_Build 2 212347416 4I GCATTAATGA ----/ATGC ATTAAAGCTG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 ATGC 0 1 313620 CASAVA_Build 2 212378265 1I CCTCAAATCC -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 6 7 313621 CASAVA_Build 2 212404874 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 916 hom 28 2 21 5 A 11 12 313622 CASAVA_Build 2 212407454 1D TGGGTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3026 het 2312 hom 30 12 11 9 A 12 11 313623 CASAVA_Build 2 212412336 1I AAGATATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 36 0 26 10 A 9 10 313624 CASAVA_Build 2 212417111 1D AAAACACTAA T/- TTTTTTGACT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 6 313625 CASAVA_Build 2 212420603 1I AACATTATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 T 9 10 313626 CASAVA_Build 2 212430130 2I TGTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1950 hom 21 7 10 4 TG 8 9 313627 CASAVA_Build 2 212431562 1I CAAAAAGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 10 11 313628 CASAVA_Build 2 212434857 1I GAAATGCTAA -/T TTTTTTCACT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 6 7 313629 CASAVA_Build 2 212442069 1I GTCCCAACAA -/T TTTTTTCACT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 6 7 313630 CASAVA_Build 2 212445067 4I AATTATTAAT ----/TAAC TTTCTAGACC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TAAC 0 1 313631 CASAVA_Build 2 212450322 1I CAGATTATGC -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 T 7 8 313632 CASAVA_Build 2 212450537 2I TTAAAATGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 11 13 313633 CASAVA_Build 2 212514228 1D TACTCTTAGA T/- TTTTTTTTTT 2983 het 2983 ref 29 10 11 8 T 15 14 313634 CASAVA_Build 2 212518370 1I AAAATATCTG -/A AAAAATGTTC 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 A 5 6 313635 CASAVA_Build 2 212521918 4I CACCTATCAA ----/TGGC TGGCTGAACT 3070 het 3070 hom 60 20 28 12 TGGC 1 2 313636 CASAVA_Build 2 212526844 1D ATGATTTTTT A/- AAAATGACAA 3070 het 3070 hom 38 11 22 6 A 5 4 313637 CASAVA_Build 2 212563232 1D TTATTATAAT A/- AAAAAGCCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 6 5 313638 CASAVA_Build 2 212576293 1I GCTGAATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 A 14 15 313639 CASAVA_Build 2 212578979 3I TGCCACTGAA ---/AAG AAGGAGAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAG 1 2 313640 CASAVA_Build 2 212582000 29D57M4I ACAGCAAAAA ATGTTTTTCTAAACAGAAATTTTAGTTATATGTTTTTCTAAACAGAAATTTTAGTTATATGTTTATCAAAATAAAAATCATTAAAA----/-----------------------------ATGTTTTTCTAAACAGAAATTTTAGTTATATGTTTATCAAAATAAAAATCATTAAAACTTT CTTATTATAA 3070 hom 81 het 20 0 28 11 N/A 0 0 313641 CASAVA_Build 2 212594804 2D AATTTACAAG AA/-- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 35 22 10 4 A 9 7 313642 CASAVA_Build 2 212595119 10D AAATACCATT TGACTCAGCA/---------- TGACTCAGCA 3070 het 3070 hom 32 12 13 12 TGACTCAGCA 2 1 313643 CASAVA_Build 2 212596485 1I TACAAGTTAA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 7 313644 CASAVA_Build 2 212596895 1D AAATATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 9 18 10 T 11 10 313645 CASAVA_Build 2 212597299 1D CAAAGCACAT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 9 8 313646 CASAVA_Build 2 212600630 1D TTAAGCAGTT G/- GCCTGAAAAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 2 1 313647 CASAVA_Build 2 212610084 3I AAGGGTTTTT ---/TTG TTGTTTGTTG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 TTG 1 2 313648 CASAVA_Build 2 212613147 1I GTTGGAAGTA -/C CCTAGATTAT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 C 2 3 313649 CASAVA_Build 2 212613287 1I ATTTTAGTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 9 10 313650 CASAVA_Build 2 212623744 1I TTTTAGCCTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 7 8 313651 CASAVA_Build 2 212643705 2D AAACTATAAA AC/-- ACAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 9 6 AC 2 1 313652 CASAVA_Build 2 212644284 2D AGAAGAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 27 1 13 14 A 12 10 313653 CASAVA_Build 2 212652192 1D AATTGCCAAA T/- TTCACCCCCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 3 2 313654 CASAVA_Build 2 212658826 3I AATAAAGTTG ---/TTA TTATTAGCCT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TTA 2 3 313655 CASAVA_Build 2 212660262 1I ACTTCCACAG -/A AAAGCAAATA 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 3 4 313656 CASAVA_Build 2 212660889 4D TAATAATAAC ACTT/---- ACTTCATAGA 3070 het 3070 ref 46 22 20 6 ACTT 2 1 313657 CASAVA_Build 2 212663204 1D GAACTTAAAC A/- AAAATACAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 5 4 313658 CASAVA_Build 2 212667959 1I CAGCACAATT -/A ACTAAGTTTC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 1 2 313659 CASAVA_Build 2 212669263 10D AGATTGATAA CAGCATAGCC/---------- TTTGTGCAAG 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 CAGCATAGCC 1 0 313660 CASAVA_Build 2 212676692 1D TGATTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 T 12 11 313661 CASAVA_Build 2 212678005 1D ATAATTTCTC A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 A 8 7 313662 CASAVA_Build 2 212682953 1D TTCTGCCAGC T/- TTTGATACAT 3070 het 3070 ref 44 23 15 7 T 4 3 313663 CASAVA_Build 2 212683838 2D AATCTGATTA CT/-- GTTTGAAATA 3070 hom 157 het 54 0 53 1 CT 1 0 313664 CASAVA_Build 2 212684603 1D TTCTCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 12 11 T 11 10 313665 CASAVA_Build 2 212684849 1D CTATACAACC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 10 9 313666 CASAVA_Build 2 212690745 4D TGGTGTTTTC CTCT/---- CTAATGTTTC 3070 het 3070 hom 42 14 25 7 CT 3 1 313667 CASAVA_Build 2 212691531 1D ATCCTCAGAA G/- AATCCCATAC 3070 het 3070 hom 50 19 29 3 G 1 0 313668 CASAVA_Build 2 212694714 1D ATTTATTTGC A/- ATGTATATTC 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 A 2 1 313669 CASAVA_Build 2 212695016 4D ATTTTATATT TATA/---- TATATATATA 3070 het 3042 hom 20 8 10 3 TA 7 5 313670 CASAVA_Build 2 212695351 2D TATAAAAAAG AT/-- ATGTGGAACA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 AT 2 1 313671 CASAVA_Build 2 212698186 1D TATTTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 T 11 10 313672 CASAVA_Build 2 212722140 1I TATAATAATT -/A AAAAAAAAAT 2304 het 1666 hom 12 5 5 2 A 9 10 313673 CASAVA_Build 2 212727629 1D GTGAATCTAA T/- TTGACAATAA 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 3 2 313674 CASAVA_Build 2 212728334 2D AGTCATATCC CA/-- CACCCCAATG 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 CA 2 1 313675 CASAVA_Build 2 212736346 1D AGGAACTAAA C/- AAAACATTGT 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 C 1 0 313676 CASAVA_Build 2 212737267 1I TGATATTTTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 36 het 31 1 24 6 A 7 8 313677 CASAVA_Build 2 212737667 1I AAATAATCCC -/T TTTTTTCTTT 2710 het 2710 ref 18 9 6 3 T 6 7 313678 CASAVA_Build 2 212739028 1I ATCACAATCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 7 18 8 T 9 10 313679 CASAVA_Build 2 212741039 3D AATTAAAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 629 hom 25 4 8 13 A 15 12 313680 CASAVA_Build 2 212744295 2I AACTAACTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 10 12 313681 CASAVA_Build 2 212745268 1D AAAAGGAATG T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 44 16 22 7 T 8 7 313682 CASAVA_Build 2 212748581 3I ATATGTATTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 TTC 0 1 313683 CASAVA_Build 2 212755850 1I TGGGTTGAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 47 het 24 0 18 6 T 9 10 313684 CASAVA_Build 2 212763106 1D ACTGAACTAG A/- AAAATTTTCA 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 A 5 4 313685 CASAVA_Build 2 212764620 4D ATATATAACA CATG/---- CGTTATACAT 1108 het 1108 ref 25 20 4 1 CATG 1 0 313686 CASAVA_Build 2 212768456 4D TTAAATTAAT TAAA/---- TAAAATATGC 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 TAAA 2 1 313687 CASAVA_Build 2 212772853 4I CCTAGCATGG ----/GACT AGTCAGGCCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 GACT 0 1 313688 CASAVA_Build 2 212777680 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 1673 het 1673 ref 23 13 5 5 A 11 12 313689 CASAVA_Build 2 212780905 5D ATTTGTATTA AATTC/----- AATAATTAGA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 AATTC 1 0 313690 CASAVA_Build 2 212783184 4D ATGCTAGTGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 217 hom 44 5 18 21 A 18 14 313691 CASAVA_Build 2 212784546 3D AAAGTCTAAA CAG/--- CAGAAGTTTC 2206 het 2206 ref 32 18 6 11 CAG 2 1 313692 CASAVA_Build 2 212784905 3D TTGTATATGT ACC/--- ACATTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 ACC 1 0 313693 CASAVA_Build 2 212785522 1D TCACAGAATT A/- AAAAAAAAAA 1318 het 1318 ref 37 24 3 10 A 12 11 313694 CASAVA_Build 2 212792926 1D ATCAACCCGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 A 14 13 313695 CASAVA_Build 2 212795587 1I TTCTCTTGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 11 23 7 T 9 10 313696 CASAVA_Build 2 212799381 1I GTAAAGACAT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 3070 ref 49 18 13 18 G 9 10 313697 CASAVA_Build 2 212814845 3I TGATTCAACA ---/TAT TATTAATAAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAT 1 2 313698 CASAVA_Build 2 212816416 1I CATATAAAGA -/C AAAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 C 0 1 313699 CASAVA_Build 2 212818596 1I TCACAAATGA -/T TTTTCCCATT 3070 het 3070 hom 54 22 27 5 T 4 5 313700 CASAVA_Build 2 212840564 11I ATAGTTCTCA -----------/TTTCTTTTTTT TTTCTTTTTT 3070 hom 16 het 20 0 15 5 TTTCTTTTTTT 1 2 313701 CASAVA_Build 2 212858361 1D GGGACTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 520 hom 42 3 22 17 T 14 13 313702 CASAVA_Build 2 212870341 1D CTAGCCAAAA T/- TGACATTTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 5 T 2 1 313703 CASAVA_Build 2 212877447 1I AGAACACATA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 8 9 313704 CASAVA_Build 2 212879687 1I CTGCCACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 64 het 35 0 31 4 T 9 10 313705 CASAVA_Build 2 212880343 1I GACTATTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1441 hom 32 3 21 8 A 10 11 313706 CASAVA_Build 2 212882728 1D TTTGAGGGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 T 10 9 313707 CASAVA_Build 2 212890804 1I GTCTACAATG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 8 9 313708 CASAVA_Build 2 212891505 1D AGAAAAAGAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 A 9 8 313709 CASAVA_Build 2 212895402 1D TAAAAGCTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 9 8 313710 CASAVA_Build 2 212895909 1D CCCTAGCCGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 8 313711 CASAVA_Build 2 212896797 4D ATGCAGATTG AAAA/---- CATTAATAAA 465 het 465 ref 39 14 5 23 A 4 0 313712 CASAVA_Build 2 212897250 1I TAAGAAATTA -/C CTTTACACAT 3070 hom 128 het 44 0 41 3 C 1 2 313713 CASAVA_Build 2 212897441 1I GGAGCAGCGG -/T GTTTTTTGTT 3070 het 403 hom 32 2 22 8 T 0 1 313714 CASAVA_Build 2 212897841 1I TATTCAGTAT -/G GCTCAAAAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 2 313715 CASAVA_Build 2 212897988 1D CAAGCAACCC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 9 8 313716 CASAVA_Build 2 212900833 3I CTCCAAAAAG ---/TTC TTATTTTTTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TTC 0 1 313717 CASAVA_Build 2 212900999 1I AAACAACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 13 14 313718 CASAVA_Build 2 212906497 1D AAAAAATACG A/- AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 30 11 5 14 A 15 14 313719 CASAVA_Build 2 212906663 1D ATTCTGTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 8 15 A 12 11 313720 CASAVA_Build 2 212909812 1I GCAATGTCTC -/T CAAGCTCTAA 3070 hom 151 het 57 0 51 6 T 0 1 313721 CASAVA_Build 2 212910851 1D ATCTGCCTGG T/- TTTTGCCATT 3070 het 3070 hom 55 27 24 5 T 5 4 313722 CASAVA_Build 2 212914587 4I ATAGACTGTC ----/TTTG TTTGACTAAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TTTG 1 2 313723 CASAVA_Build 2 212917588 1I AAGAAAAATG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 98 het 39 0 33 6 T 6 7 313724 CASAVA_Build 2 212919278 1D TCAATGATGG C/- CCCCCCCAAG 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 C 8 7 313725 CASAVA_Build 2 212919565 3D TTCCTGAAAC AAT/--- GATTCAAAAC 3070 het 3070 hom 28 9 18 2 AAT 1 0 313726 CASAVA_Build 2 212920297 3D CCGTTATTCT CTG/--- CTGCTTTTAG 3070 het 3070 ref 29 17 8 5 CTG 2 1 313727 CASAVA_Build 2 212921622 1D GGACAGACTT G/- GTCAGAAATA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 G 2 1 313728 CASAVA_Build 2 212923780 1I GTAAAATAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 47 18 18 11 A 8 9 313729 CASAVA_Build 2 212926623 2D TGTTGAAAAA AG/-- AGGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 41 27 12 4 AG 2 1 313730 CASAVA_Build 2 212926778 1D CCTGTTACAC T/- TGAAACCATG 3070 het 3070 ref 50 29 17 4 T 2 1 313731 CASAVA_Build 2 212929284 10D ATTAATCAAG TTGTACACAC/---------- TTCCATCAGC 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 TTGTACACAC 1 0 313732 CASAVA_Build 2 212929690 1D GAACCCATGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 9 313733 CASAVA_Build 2 212932435 1I TGAATTTGCA -/G GGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 G 2 3 313734 CASAVA_Build 2 212947418 2D TCCCATAATT TC/-- TCTGTGACCA 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 TC 2 1 313735 CASAVA_Build 2 212947890 1I AAATATGGGG -/A AAAAAAGAGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 6 7 313736 CASAVA_Build 2 212952980 1I TAAAGAGTTG -/T TTCAAGTAGT 3070 het 2892 hom 29 7 19 3 T 2 3 313737 CASAVA_Build 2 212959542 1D TTTCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 2299 het 1707 hom 22 7 8 7 A 17 16 313738 CASAVA_Build 2 212960436 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 512 hom 24 2 16 6 T 7 8 313739 CASAVA_Build 2 212971072 6D TACATATATA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TG 10 7 313740 CASAVA_Build 2 212971892 4I TGTCTGAAAA ----/TATT TATATTGTTC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TATT 0 1 313741 CASAVA_Build 2 212983236 6I TTAGTGTGAG ------/TTAGAA TTAGAGAGTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTAGAA 0 1 313742 CASAVA_Build 2 212994270 9I TGAAACTCAT ---------/TAGCCAATG TGGTTTGTAT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 TAGCCAATG 0 1 313743 CASAVA_Build 2 212999472 4I AACCTCAATC ----/TCTT TCTTTATCTC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TCTT 1 2 313744 CASAVA_Build 2 213001039 1I TTATCTCCAT -/C TTTGCAAATA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 C 0 1 313745 CASAVA_Build 2 213002710 1D TAGATTCAAA C/- CTGTCTAGGT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 C 2 1 313746 CASAVA_Build 2 213003417 1I TTTTTTTTTT -/A TTCTTTTCTT 3017 het 3017 ref 25 16 7 2 A 0 1 313747 CASAVA_Build 2 213010462 1D GTTCTGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 461 hom 48 5 27 17 A 15 14 313748 CASAVA_Build 2 213020363 1D TTTCTATTTT A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 7 6 313749 CASAVA_Build 2 213022824 4I GATATAGCTA ----/TAAT TAATATTAAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 TAAT 1 2 313750 CASAVA_Build 2 213025362 1D GTCAGTTTAC A/- AATTACAAAT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 A 3 2 313751 CASAVA_Build 2 213026914 1D ATTCCTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 36 0 21 15 T 15 14 313752 CASAVA_Build 2 213028531 1I CCTTCACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 10 11 313753 CASAVA_Build 2 213029536 1I TTCCTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 A 11 12 313754 CASAVA_Build 2 213032335 5I TGTAAAATAC -----/AAATA AAATAAAATA 3070 het 3070 hom 36 13 13 10 AAATA 2 3 313755 CASAVA_Build 2 213035141 1I AACATTGGAG -/A AAACAACACT 2944 het 2944 ref 38 28 7 3 A 3 4 313756 CASAVA_Build 2 213039937 25D TAGCAAAGGT GACTCTTGTTATGTTTTAGCAAAGA/------------------------- GACTGGCAGG 2858 het 2858 ref 24 19 7 3 GACTCTTGTTATGTTTTAGCAAAGA 1 0 313757 CASAVA_Build 2 213045225 1I AGAGGACGCT -/A AAAATGCACT 3070 het 3070 ref 49 29 17 3 A 4 5 313758 CASAVA_Build 2 213047176 1D AAAATAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1104 het 1104 ref 39 32 3 4 T 13 12 313759 CASAVA_Build 2 213059287 6I AAAAGGCAGA ------/TAACCT TAATGCAAGA 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 TAACCT 0 1 313760 CASAVA_Build 2 213071049 3D CCTACAGGGA AAC/--- AAAAGCCTTT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 AAC 1 0 313761 CASAVA_Build 2 213077470 1D AGAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 18 17 3 A 10 9 313762 CASAVA_Build 2 213093862 7I TAGCTCTGTG -------/AATTTAA AAGTTTATGA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 AATTTAA 0 1 313763 CASAVA_Build 2 213094619 10D GCTATTTTAT ATGCATTTAC/---------- ATGCATTTCA 3070 het 3070 ref 46 24 21 4 ATGCATTTAC 1 0 313764 CASAVA_Build 2 213096542 1I AATGACAATT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 8 9 313765 CASAVA_Build 2 213097655 1I GTTTAAGTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 T 8 9 313766 CASAVA_Build 2 213103145 1I AGAGGATCTT -/G GCAATAACCC 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 G 1 2 313767 CASAVA_Build 2 213105464 1D AACCAATAAA C/- TTTTTTTCTA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 C 1 0 313768 CASAVA_Build 2 213111210 1I GAGGGACTCA -/C GAGTGATTTT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 C 0 1 313769 CASAVA_Build 2 213112593 5I CCCTAGAAAT -----/AAAAG AAAAGTCAAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AAAAG 1 2 313770 CASAVA_Build 2 213114704 1I AGCTTTTGCC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 A 7 8 313771 CASAVA_Build 2 213116185 1I AATTCATATA -/C CTGTGCCCAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 C 1 2 313772 CASAVA_Build 2 213116625 1D CTGTTTCTTC T/- TTGTTTAAGA 3070 het 3070 hom 53 23 25 7 T 3 2 313773 CASAVA_Build 2 213117152 18I TGTTCCCAAG ------------------/ATTATTTTACCTTTGGTT AGTAAGCGTT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 ATTATTTTACCTTTGGTT 0 1 313774 CASAVA_Build 2 213145704 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 2521 het 2521 ref 19 9 7 3 AAG 1 0 313775 CASAVA_Build 2 213154935 1D ATAAGAAAAG A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 38 19 16 3 A 8 7 313776 CASAVA_Build 2 213158515 1I AACCTGGCTG -/A CACCTATAAT 2298 het 2298 ref 21 11 7 3 A 0 1 313777 CASAVA_Build 2 213166365 1I TGTATATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 10 11 313778 CASAVA_Build 2 213178846 1I GTGTGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 17 10 A 11 12 313779 CASAVA_Build 2 213187097 1D ATGTTACCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 12 8 A 12 11 313780 CASAVA_Build 2 213192746 1D AGAGAGTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 A 11 10 313781 CASAVA_Build 2 213198186 2D TGCCCCTCCA AC/-- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 AC 1 0 313782 CASAVA_Build 2 213200598 2D AGTAGGACAC AT/-- GTGGGATGAA 3070 het 3070 hom 55 25 28 3 AT 1 0 313783 CASAVA_Build 2 213201998 1I CACAAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 10 11 313784 CASAVA_Build 2 213208045 1D ACCATGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2780 hom 34 11 13 11 A 15 14 313785 CASAVA_Build 2 213213473 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTCA 2240 het 2240 ref 18 9 6 4 T 9 8 313786 CASAVA_Build 2 213216186 1I GTTGGCTGTG -/A AGTGTGTCAT 3070 het 3070 ref 25 18 7 0 A 1 2 313787 CASAVA_Build 2 213235089 3I CACAGGTGAT ---/GAA GAAGACCTTG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 GAA 1 2 313788 CASAVA_Build 2 213239175 3I CTGAGGATAA ---/TAG TAGTATATCT 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 TAG 1 2 313789 CASAVA_Build 2 213242625 2I CAGGAAAGAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 9 11 313790 CASAVA_Build 2 213244777 1D TTATACTTTG T/- TTTGAAGTAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 T 4 3 313791 CASAVA_Build 2 213246236 4D TGACCACAAT ACCC/---- ACCCAACAGG 3070 het 3070 hom 43 19 16 8 ACCC 2 1 313792 CASAVA_Build 2 213249733 1D ATCTTGTTTA T/- TTTTTTGAAT 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 T 7 6 313793 CASAVA_Build 2 213252706 2D TTAATAACAA TC/-- ACCTATGAGG 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 TC 1 0 313794 CASAVA_Build 2 213253437 1D ACACTAGGGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 A 9 8 313795 CASAVA_Build 2 213255551 1I TAGACTTAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 T 7 8 313796 CASAVA_Build 2 213268908 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 1359 het 1359 ref 21 6 11 5 TA 10 9 313797 CASAVA_Build 2 213282630 1D TTTGCTCAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 10 9 7 T 10 9 313798 CASAVA_Build 2 213286329 1I GGTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1940 het 1940 ref 49 26 6 17 A 14 15 313799 CASAVA_Build 2 213357365 1D CAGAGCTCAG A/- AAAAAAAACG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 9 8 313800 CASAVA_Build 2 213393364 1D GAGAAAAAAG T/- TGCAGGTATT 3070 hom 87 het 40 0 30 11 T 2 1 313801 CASAVA_Build 2 213400409 3D TAAATAACTT GTA/--- GTATATTCCT 3070 het 3070 hom 48 23 22 3 GTA 2 1 313802 CASAVA_Build 2 213438611 1I CCTTTGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 51 1 41 9 T 10 11 313803 CASAVA_Build 2 213439216 5I TAGTTTTCAA -----/TATAT TATATTTCTA 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 TATAT 1 2 313804 CASAVA_Build 2 213440138 5D AGTCAAATAA TTTAT/----- TTGATAGTCT 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 TTTAT 1 0 313805 CASAVA_Build 2 213444737 1D CATTGACATT A/- AAAAAAAGAC 3070 hom 75 het 41 1 38 2 A 8 7 313806 CASAVA_Build 2 213445363 1I TCCTTAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 13 14 313807 CASAVA_Build 2 213448126 1D TCTGTCCTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 T 9 8 313808 CASAVA_Build 2 213448547 2D TTCTAACTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 13 11 313809 CASAVA_Build 2 213478113 3I TTTTGTAAAA ---/GGG GAACTTGAAA 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 G 1 4 313810 CASAVA_Build 2 213480068 1I ATAAGTAGAT -/A TTTTTATAGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 313811 CASAVA_Build 2 213481974 2D CTACGATCAC AT/-- GTTATCACTA 3070 het 3070 ref 38 22 12 6 AT 1 0 313812 CASAVA_Build 2 213490521 1I GGAAAAATTT -/A AAAGTATGAA 3070 het 2564 hom 20 6 10 4 A 3 4 313813 CASAVA_Build 2 213491508 1I TGCAATACTC -/T CTGGATTTAT 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 T 0 1 313814 CASAVA_Build 2 213494096 1I AATCACATTA -/C ACATTCCAGC 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 C 0 1 313815 CASAVA_Build 2 213505173 1I CTCAAATGAC -/A ATATTCTGGA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 1 2 313816 CASAVA_Build 2 213506423 1D AGCTCAAGCC T/- TTTTTTTTTT 929 het 929 ref 32 21 5 6 T 15 14 313817 CASAVA_Build 2 213509194 1I AATTTCTGGG -/T TAGGCTACAT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 1 2 313818 CASAVA_Build 2 213524606 1D GAGCAAACCC A/- AGGCCCCTGA 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 A 2 1 313819 CASAVA_Build 2 213528721 1D CTCTCAAATT A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 A 8 7 313820 CASAVA_Build 2 213539231 1D AGAGACGGGG T/- TTCACCGTGT 2000 het 532 hom 8 3 5 0 T 3 2 313821 CASAVA_Build 2 213546692 3D CATCGGGATA TGT/--- TGTTCATACT 3070 hom 144 het 55 0 49 7 TGT 2 1 313822 CASAVA_Build 2 213548265 1I CATCACTTCC -/A AATTCCTCAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 2 3 313823 CASAVA_Build 2 213552641 1I TCCCACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 36 1 24 11 A 12 13 313824 CASAVA_Build 2 213556010 3I AACAGATTGC ---/ACA ACAACAAATG 3070 hom 150 het 56 0 50 6 ACA 2 3 313825 CASAVA_Build 2 213572216 1I AGCAGTAGTG -/T TATTCTAGTA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 1 2 313826 CASAVA_Build 2 213577506 1D CTTTCTGTAA T/- GTGAAATCTC 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 T 1 0 313827 CASAVA_Build 2 213581099 3D AAAAAAAAAT ACA/--- ACAACATTAG 2290 het 2290 ref 33 14 10 10 ACA 3 2 313828 CASAVA_Build 2 213584158 1D AAATGAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 10 9 313829 CASAVA_Build 2 213584757 1I AATTTTCTCC -/A AAAAGTACCA 3070 het 3070 ref 60 28 25 7 A 4 5 313830 CASAVA_Build 2 213586376 1I TTAATAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 10 11 313831 CASAVA_Build 2 213606637 5I AACAATAGGC -----/TTAAA TTATTCACTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TTAAA 0 1 313832 CASAVA_Build 2 213606809 2D GTCCTACCAA GA/-- GAGTCAGCCT 3070 het 3070 ref 57 24 21 12 GA 2 1 313833 CASAVA_Build 2 213608223 1I GTGGAAAATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 16 13 1 T 9 10 313834 CASAVA_Build 2 213614315 1I TTTTGGGGGG -/T GGTGGGAGGA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 0 1 313835 CASAVA_Build 2 213615197 1I TTAGCAGGGT -/G GTGATGAGCA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 G 1 2 313836 CASAVA_Build 2 213628427 1I AAAAGGAGAT -/A AAAAAACGAA 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 A 6 7 313837 CASAVA_Build 2 213629211 1I CAACCTACAC -/A ACCAGCCACT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 A 1 2 313838 CASAVA_Build 2 213634463 2I TTGAAAAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 12 14 313839 CASAVA_Build 2 213637711 4I TCTTGCACAT ----/CTAA CTGTTTTTGC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 CTAA 0 1 313840 CASAVA_Build 2 213645603 1D CTCTTGAAAG T/- TAAGTCTGTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 2 1 313841 CASAVA_Build 2 213649091 1I CTAAACAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 9 313842 CASAVA_Build 2 213652547 5I ACAGAGAAAG -----/AGAAA AGAAAAGAAA 3070 hom 85 het 33 0 28 5 AGAAA 2 3 313843 CASAVA_Build 2 213657576 1I AAAGAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 41 0 36 5 A 10 11 313844 CASAVA_Build 2 213674522 1I CTGAGATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 30 0 19 11 A 10 11 313845 CASAVA_Build 2 213676774 4I TTACAGAAAT ----/AAAC AAAGCTCAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AAAC 0 1 313846 CASAVA_Build 2 213682463 1I TTAGTATCAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 8 9 313847 CASAVA_Build 2 213685551 2D TTGCCTCAGC CT/-- TCTGCATAGC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 CT 1 0 313848 CASAVA_Build 2 213696911 1I AGTCTTAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 40 0 31 9 A 10 11 313849 CASAVA_Build 2 213718813 2D CTAGTAAGTT AA/-- AAAACTCTCT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 6 4 313850 CASAVA_Build 2 213720982 1D AACCCACAAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 7 313851 CASAVA_Build 2 213722757 1I CCCCCCCCCC -/A AAAAAAAAAC 2863 het 17 hom 19 1 12 6 A 9 10 313852 CASAVA_Build 2 213723672 1D TGAAAGAAAA G/- GGGGGGGGGG 976 het 412 hom 14 3 4 7 G 11 10 313853 CASAVA_Build 2 213725914 1D GTTGTTGAGG T/- TTTTTTTTTC 2617 het 2617 ref 25 9 6 11 T 10 9 313854 CASAVA_Build 2 213726123 1D TTCTTGAAAG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 46 25 20 1 T 8 7 313855 CASAVA_Build 2 213729685 1I GATACAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 15 5 A 10 11 313856 CASAVA_Build 2 213730827 1D GGTAATACTA C/- CCCATTTTTC 3070 het 3070 ref 47 23 20 6 C 4 3 313857 CASAVA_Build 2 213731513 1I TGGTTACGGC -/A TTCTTAAACG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 313858 CASAVA_Build 2 213734021 10D TCATTATTAA TAGTACCCCC/---------- TTTTATTCTT 3070 het 3070 ref 49 32 16 2 TAGTACCCCC 1 0 313859 CASAVA_Build 2 213737850 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 1031 het 1031 ref 29 20 4 5 TTTC 1 0 313860 CASAVA_Build 2 213746643 2D CATCATAATA CT/-- CTGTTTTCAG 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 CT 2 1 313861 CASAVA_Build 2 213748577 1D ACCTTCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 32 2 18 12 T 15 14 313862 CASAVA_Build 2 213750184 12I AGAAGCAAAA ------------/CAAAAAATCTCC CACCTTAGAC 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 CAAAAAATCTCC 0 1 313863 CASAVA_Build 2 213750541 1I CTACACCTAC -/T TTTTTCTATC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 5 6 313864 CASAVA_Build 2 213812727 4D ACAAATACTA TTAG/---- TTAGTTGTTG 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TTAG 2 1 313865 CASAVA_Build 2 213833946 1I TCTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2821 het 1444 hom 16 5 7 4 A 11 12 313866 CASAVA_Build 2 213841025 1D TAACCTTCTG T/- TTTTAAACTA 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 T 5 4 313867 CASAVA_Build 2 213870563 3D CAAGTGACAC CTT/--- CTCTCTGAAC 3070 het 3070 ref 44 26 15 5 CTT 1 0 313868 CASAVA_Build 2 213872407 2D ACCGAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 21 3 9 9 T 14 12 313869 CASAVA_Build 2 213874210 1D ACACACTTAA T/- TTTAGTTAGA 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 4 3 313870 CASAVA_Build 2 213876437 2I AGTCACTCTC --/TT GTGCTATCAA 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 0 2 313871 CASAVA_Build 2 213880237 2I GGTTAGTTAC --/AT ATATGTATAC 959 het 58 hom 4 1 2 1 AT 2 3 313872 CASAVA_Build 2 213887363 5I GATATTTGTT -----/AAAAC AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 AAAAC 3 4 313873 CASAVA_Build 2 213888664 2D TATTGAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 38 2 20 16 T 12 10 313874 CASAVA_Build 2 213896037 3I TGCTCAATGT ---/TAC TACTAATTGT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 TAC 1 2 313875 CASAVA_Build 2 213896410 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 10 9 313876 CASAVA_Build 2 213897227 3D GTACCTCAAG TTA/--- TTATAATATA 3070 het 2644 hom 22 7 13 4 TTA 2 1 313877 CASAVA_Build 2 213900133 1D GTTTGCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 13 12 313878 CASAVA_Build 2 213901336 1I ATCCTTTTTC -/A AAAACAATTT 3070 het 3070 hom 31 14 17 0 A 4 5 313879 CASAVA_Build 2 213908542 4D TCAGCTTATG TTAT/---- TTGTCAAATT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 TTAT 1 0 313880 CASAVA_Build 2 213910797 1D ATTTCCTCAA C/- CTAGCAAGAC 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 C 2 1 313881 CASAVA_Build 2 213919811 1D TAAAATTCTC T/- TTTTTTTTTT 2932 het 1110 hom 14 5 7 3 T 11 10 313882 CASAVA_Build 2 213932371 1I TAGAGGCAGT -/A AGGCCTTGCT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 1 2 313883 CASAVA_Build 2 213934647 2D GAAAAAAAAA CT/-- CAACATAATA 3070 het 3070 ref 43 22 20 2 CT 1 0 313884 CASAVA_Build 2 213936022 1D CTGGATGCGA T/- TTTGAAACAT 3070 het 3070 ref 30 14 15 1 T 4 3 313885 CASAVA_Build 2 213942558 1D GCAAAGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 11 10 313886 CASAVA_Build 2 213944682 4D ACATTAATTG TTAT/---- TTAATCTAAA 3070 hom 81 het 28 0 28 6 TTAT 1 0 313887 CASAVA_Build 2 213945097 1D ATGAGATAAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 T 9 8 313888 CASAVA_Build 2 213951503 1D GTCAGTAAAT C/- CTTATATCAC 3070 hom 125 het 46 0 40 6 C 2 1 313889 CASAVA_Build 2 213954052 2I4M12I CCACTGGGCT --TACC------------/TATACCACAGTATAAGTG GTAAAATAGA 3070 het 3070 ref 47 26 20 5 N/A 0 0 313890 CASAVA_Build 2 213968993 5D GCTTCTGGAC TTTCT/----- TTTATGTTTC 3070 het 3070 ref 42 26 15 1 TTTCT 1 0 313891 CASAVA_Build 2 213990846 1I TGTGTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 199 hom 23 2 15 6 T 14 15 313892 CASAVA_Build 2 213992028 35I AGAGTGATGA -----------------------------------/TTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATC GGACTGGGAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 TTCTCTACTCAGAAACCTGAAACATCGGCATTATC 0 1 313893 CASAVA_Build 2 214049796 20D GCTTGGTGAG CAGGAGTGTTACAGCTCTTT/-------------------- CATTCAAGCA 3070 het 3070 ref 30 15 13 6 CAGGAGTGTTACAGCTCTTT 1 0 313894 CASAVA_Build 2 214084136 1I GTATTCAGAT -/G TTTACACATT 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 G 0 1 313895 CASAVA_Build 2 214089373 1D TATCTTTTTC T/- TAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 26 14 9 5 T 2 1 313896 CASAVA_Build 2 214117077 1D GGCTTTCTGA T/- TTTTTTTTTA 1303 het 1303 ref 39 33 3 4 T 10 9 313897 CASAVA_Build 2 214118578 2I ACATTGAAAC --/AT GTGATCAATT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 AT 0 1 313898 CASAVA_Build 2 214158251 1I TGATGAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 615 hom 24 2 17 5 T 13 14 313899 CASAVA_Build 2 214163888 25D TCAGTGATGG ATTGGTTAAAGAAAATATGTTATCT/------------------------- ATACACCATA 3070 het 3070 hom 56 27 32 4 ATTGGTTAAAGAAAATATGTTATCT 1 0 313900 CASAVA_Build 2 214173098 5D CTTTATATTT TTTAA/----- TTTAATTTGG 3070 het 3070 ref 29 17 10 6 TTTAA 2 1 313901 CASAVA_Build 2 214178238 2D TTGGAATGCA TT/-- TTTTTTTTTT 1278 het 763 hom 28 9 3 16 T 16 14 313902 CASAVA_Build 2 214195816 1I GTGTATTTTT -/A AAAGTATAAG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 3 4 313903 CASAVA_Build 2 214197211 5I TGGTTGAAGA -----/ATAAT TCAGGCTATT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 ATAAT 0 1 313904 CASAVA_Build 2 214216035 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 51 25 20 7 TA 8 7 313905 CASAVA_Build 2 214226078 3D CACTGGGTCA AAG/--- AAGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 12 4 AAG 2 1 313906 CASAVA_Build 2 214237806 2D ATATATATAC AT/-- ATATACACAC 3070 het 3070 ref 45 26 19 1 AT 3 2 313907 CASAVA_Build 2 214241285 1D ATATGGGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 12 11 313908 CASAVA_Build 2 214245225 5D TAGAATTCTC TTCTT/----- TTCCTCACTC 3070 het 3070 hom 30 10 16 7 TTCTT 1 0 313909 CASAVA_Build 2 214252513 2I TTTTAAAAAC --/AT GTGGAGAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 AT 0 1 313910 CASAVA_Build 2 214267746 4D TTTTCCTTCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 het 3070 hom 46 18 20 10 TTCC 4 3 313911 CASAVA_Build 2 214277640 1I TTTTAAGCTA -/C CCTGTTCTCC 3070 het 3070 hom 41 19 16 6 C 2 3 313912 CASAVA_Build 2 214278442 2D GCATCTCTTA AG/-- AGGGAGCTGG 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 AG 2 1 313913 CASAVA_Build 2 214278578 1D ATTAAGAAAA T/- TTTTTTAGGC 3070 het 3070 hom 43 20 21 5 T 7 6 313914 CASAVA_Build 2 214304433 1I CCAGCTGTTT -/G TTTTTTTTTT 2970 het 810 hom 21 4 12 5 G 0 1 313915 CASAVA_Build 2 214306190 1I AATGGGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 15 0 12 6 T 10 11 313916 CASAVA_Build 2 214307686 1D CTTGGACATG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 9 8 313917 CASAVA_Build 2 214307937 1D TTTCTAGATA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 8 313918 CASAVA_Build 2 214315106 1I GTGTTTAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 36 1 29 6 T 10 11 313919 CASAVA_Build 2 214315523 2I TTTCTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 28 0 19 9 TG 0 1 313920 CASAVA_Build 2 214327654 20I TTAGTCAAAA --------------------/TGAAATCTTAAATATAACGT TGAAATAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 3 TGAAATCTTAAATATAACGT 0 1 313921 CASAVA_Build 2 214329739 1I ACTCAAATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 9 hom 33 1 29 3 T 9 10 313922 CASAVA_Build 2 214333480 1D TAATGGCTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 94 het 47 0 32 15 A 10 9 313923 CASAVA_Build 2 214361843 3I TTTATGAGTG ---/ATA ATTCTCAAAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 ATA 0 1 313924 CASAVA_Build 2 214369898 8D TGTTATTTCT CCTAAAGA/-------- CCTTTTAGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CCTAAAGA 1 0 313925 CASAVA_Build 2 214370021 1D AATTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 41 1 34 6 A 11 10 313926 CASAVA_Build 2 214391983 1D ACTAAGTATT A/- AAAGTGTACA 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 A 4 3 313927 CASAVA_Build 2 214404383 1D AATTCAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 42 1 36 6 T 13 12 313928 CASAVA_Build 2 214409146 1D TCATTATTCG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 23 het 25 0 14 11 C 11 10 313929 CASAVA_Build 2 214416922 1D TAAAACTTAT A/- AAAATTTTAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 5 4 313930 CASAVA_Build 2 214428915 1D ATTTCAAAAC A/- CAATCATGTC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 1 0 313931 CASAVA_Build 2 214429817 2I TAACATAAAA --/GT GTATGGTGAA 3070 hom 80 het 29 0 26 3 GT 1 2 313932 CASAVA_Build 2 214430524 1D TACTGTTCAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 9 8 313933 CASAVA_Build 2 214439947 1I38M1D CATTTAAAAA -TTGCAAGTCTTCAAAATACTGCATTGCCTCAAAATAATA/CTTGCAAGTCTTCAAAATACTGCATTGCCTCAAAATAAT- ACTATACACA 3070 hom 138 het 40 0 47 10 N/A 0 0 313934 CASAVA_Build 2 214440448 4D TCTGCAAAAT AGAA/---- AGAATAATGA 3070 hom 86 het 34 0 27 8 AGAA 2 1 313935 CASAVA_Build 2 214440736 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 1313 hom 10 het 6 0 4 2 A 9 8 313936 CASAVA_Build 2 214441219 2D AAAATGAGAA TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 10 8 313937 CASAVA_Build 2 214441319 1D TTTTGATTTG T/- TTTTTTGCAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 7 6 313938 CASAVA_Build 2 214445314 1I GTTATGTTAT -/G CCACTAAGTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 0 1 313939 CASAVA_Build 2 214445947 1I GGATTTGGTG -/T TATTAGTATT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 1 2 313940 CASAVA_Build 2 214446139 1D AAAATTCATC A/- GTGAAGCCAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 1 0 313941 CASAVA_Build 2 214448930 1D CTGTGACATC T/- CAACCTGATC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 1 0 313942 CASAVA_Build 2 214451226 1D AATCATCATA T/- TGTTTTCCAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 1 313943 CASAVA_Build 2 214452105 1D ATTTGAGCTC T/- TTTTTTGATT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 7 6 313944 CASAVA_Build 2 214455818 1D GTGGTTGGTT G/- TTTCTTTGTT 3070 hom 62 het 25 0 20 5 G 1 0 313945 CASAVA_Build 2 214456661 1D TCTGGATGCT C/- CAGTGTTGGG 3070 hom 123 het 46 0 40 6 C 2 1 313946 CASAVA_Build 2 214457099 12D AGTGTGTTTT TGTGGTAGCAGG/------------ TGTCATTCTT 3070 hom 105 het 37 0 36 4 TGTGGTAGCAGG 1 0 313947 CASAVA_Build 2 214463559 2D TAAAGATGAC TG/-- TTATTTATTA 3070 hom 72 het 25 0 25 2 TG 1 0 313948 CASAVA_Build 2 214470584 1I CATCTGCCTA -/T TATTGGTCTC 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 1 2 313949 CASAVA_Build 2 214486452 8D AATATGTGTG TGTGTGTC/-------- TGTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 50 23 17 12 TGTGTGTC 2 1 313950 CASAVA_Build 2 214493126 1D CATCCTTTTA T/- TTTTGAGCCT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 5 4 313951 CASAVA_Build 2 214498110 4I TTATTGTTTT ----/GTTA TTTTTATTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 GTTA 0 1 313952 CASAVA_Build 2 214502603 2I CCCGATCATC --/CA CAGAGCCTAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 CA 1 2 313953 CASAVA_Build 2 214504064 2I ATTTTAATGT --/TC TCTTTTCCCT 3070 hom 147 het 57 0 49 8 TC 1 2 313954 CASAVA_Build 2 214534496 1I TTGTTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 10 11 313955 CASAVA_Build 2 214535300 4I TAGCTGGGAC ----/TACA TACAGGCGCC 3070 het 125 hom 14 1 11 3 TACA 1 2 313956 CASAVA_Build 2 214541067 5I TTTCCTTCTT -----/TTTTC TTTTCTTTTC 3070 hom 93 het 39 0 31 8 TTTTC 3 4 313957 CASAVA_Build 2 214541134 5I CCTCTTCTCT -----/TCTCA TCTCATCTCT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TCTCA 1 2 313958 CASAVA_Build 2 214543258 2D AAAGTTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 25 0 17 8 T 13 11 313959 CASAVA_Build 2 214567547 1D TTTTCCATCC T/- TTTTTTTTTT 2067 het 2067 ref 29 17 7 6 T 17 16 313960 CASAVA_Build 2 214583058 1D TTTTATATAA T/- AAAATGTCAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 1 0 313961 CASAVA_Build 2 214595696 4D AAAAAAAGAA TCTG/---- TCTTACCATG 3070 het 3070 ref 51 32 17 4 TCTG 1 0 313962 CASAVA_Build 2 214596377 1D GGCATTCATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 100 het 47 0 38 9 A 10 9 313963 CASAVA_Build 2 214602587 1D ACACACAAAA G/- AAAAGAATGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 G 1 0 313964 CASAVA_Build 2 214610196 2D TAATATACAC AT/-- ATATGTGTAT 3070 het 3070 hom 31 14 14 7 AT 3 2 313965 CASAVA_Build 2 214611402 1D ATAAAATATT A/- TTACTCCACT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 A 1 0 313966 CASAVA_Build 2 214619876 1D AAACAATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 11 10 313967 CASAVA_Build 2 214623523 3I TTAATGACAT ---/CAG AGAACAGAAT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 CAG 0 1 313968 CASAVA_Build 2 214634673 1D ATGTTTGACC A/- AAAACTGGAT 3070 hom 75 het 36 0 25 11 A 5 4 313969 CASAVA_Build 2 214640604 1D TGTCTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 1097 het 1097 ref 45 35 3 8 A 12 11 313970 CASAVA_Build 2 214651097 1D GTATTCCCAA G/- AAAAAGACCC 3070 hom 93 het 37 0 31 7 G 1 0 313971 CASAVA_Build 2 214654807 1I ACTCATTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 40 0 30 10 T 11 12 313972 CASAVA_Build 2 214660002 1I TTTCTTGTGA -/T TTTTTCATTC 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 T 5 6 313973 CASAVA_Build 2 214661319 9D TGAAAGAGCT CATCAGATA/--------- CAGGTGAAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 6 CATCAGATA 1 0 313974 CASAVA_Build 2 214666499 2D ATGTGTATGT TG/-- TGTGTCCATG 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 TG 3 2 313975 CASAVA_Build 2 214669249 1D TTTTTAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 A 10 9 313976 CASAVA_Build 2 214674077 1D40M1D GTTTTAAAGG TTTTTTTGTCTGAAATATGACTTTTGATGAGTATTACTTAAT/-TTTTTTGTCTTAAATATGACTTTTGATGAGTATTACTTAA- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 35 30 26 5 N/A 0 0 313977 CASAVA_Build 2 214675344 1D GTCAAGTATT G/- GCATCTGTGA 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 G 2 1 313978 CASAVA_Build 2 214675746 6D AGCAGAAAAA GAGACC/------ GAGACCGGGG 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 GAGACC 2 1 313979 CASAVA_Build 2 214676913 2D AGAGGGAAAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 797 hom 37 5 11 22 AG 8 7 313980 CASAVA_Build 2 214676934 4D GAGAGACAGT GAGA/---- GAGGGAGGGA 3070 het 914 hom 37 6 21 14 GA 3 1 313981 CASAVA_Build 2 214681453 1I CACACACCCC -/A CACACACACC 3027 hom 24 het 22 0 8 14 A 0 1 313982 CASAVA_Build 2 214684709 4I TTTTCACAAT ----/ATTG ATTCTTCCTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 ATTG 0 1 313983 CASAVA_Build 2 214696260 1I CAATCACTCC -/T TATAGTCAAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 1 2 313984 CASAVA_Build 2 214704596 1I CTCGGGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 A 10 11 313985 CASAVA_Build 2 214710780 1I ATGTCATGGC -/A AAAAACTGTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 5 6 313986 CASAVA_Build 2 214713228 1I TTATTTTGTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 7 8 313987 CASAVA_Build 2 214717399 3D GGTTCTATAA TTG/--- TTGTTTTAAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 TTG 2 1 313988 CASAVA_Build 2 214719987 1D AAAAAAAAAA T/- TTTCATATTC 3070 het 1615 hom 31 6 19 6 T 4 3 313989 CASAVA_Build 2 214721641 4D ATTATCAATG CTAA/---- CTAACTGTGA 3070 hom 99 het 34 0 32 4 CTAA 2 1 313990 CASAVA_Build 2 214725146 4D AACAAAATTT TCTC/---- TATTTATTAA 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 TC 2 0 313991 CASAVA_Build 2 214730970 2D3M10D ATGTCTCCAT CAGAAAAGGACATTT/--GAA---------- GAATCAGGAA 3070 het 3070 ref 42 24 19 3 N/A 0 0 313992 CASAVA_Build 2 214733165 3D GGGCATTCCT ATA/--- ATATTAGCTA 3070 het 3070 ref 41 23 17 2 ATA 2 1 313993 CASAVA_Build 2 214738164 1I AGTTTGCATG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 A 8 9 313994 CASAVA_Build 2 214749778 2I ATTTATTGAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2207 hom 22 8 11 3 TG 8 9 313995 CASAVA_Build 2 214749834 1D GGCAAAAAAA T/- ATGTGCTATC 3070 het 2631 hom 22 7 10 5 T 1 0 313996 CASAVA_Build 2 214753323 1D TATGTTGCCA C/- AGTGATCTAT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 C 1 0 313997 CASAVA_Build 2 214753557 9D AAATGACAAG TTAGTGCCA/--------- TAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 37 15 20 5 TTAGTGCCA 1 0 313998 CASAVA_Build 2 214754818 4D GGTTGAAAGG CTCT/---- CTATCTACCA 3070 het 3070 hom 45 17 24 6 CT 3 1 313999 CASAVA_Build 2 214759007 5I TGTACCAGGC -----/ATAAA ATAAAATAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 ATAAA 1 2 314000 CASAVA_Build 2 214765606 1I ATTCCTTTAT -/A TTTTTTTGTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 0 1 314001 CASAVA_Build 2 214772502 1D GTCGGGTAAT G/- TGATGCCTCT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 G 1 0 314002 CASAVA_Build 2 214778202 3D AAAAAAAAGA AAG/--- AAGAAGAAGC 3070 het 1769 hom 17 5 9 4 AAG 4 3 314003 CASAVA_Build 2 214779008 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 2585 het 2585 ref 22 13 7 2 A 9 8 314004 CASAVA_Build 2 214783248 1D CCACTTATAC A/- TGGATTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 1 0 314005 CASAVA_Build 2 214792926 13D CAAAACCTGT TGGCAGGTTCATC/------------- CTCTAGAGAT 3070 het 3070 ref 44 26 19 4 TGGCAGGTTCATC 1 0 314006 CASAVA_Build 2 214796126 1D GGATCTTCCT G/- GGGAGACTTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 4 3 314007 CASAVA_Build 2 214805557 1D TGAAGGAGTC G/- GGGGGGGCTC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 G 8 7 314008 CASAVA_Build 2 214807044 1I TGTGTTGTTT -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 C 8 9 314009 CASAVA_Build 2 214814859 1D TAAGTTGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 13 12 314010 CASAVA_Build 2 214819223 2D ACATTGTTTT TC/-- TCTTAGTGGC 3070 het 3070 hom 44 23 20 1 TC 2 1 314011 CASAVA_Build 2 214822709 5D AGTAGTAAAA AGTTT/----- AGTTCAAAGA 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 AGTTT 1 0 314012 CASAVA_Build 2 214824247 1D TTGCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 20 1 A 11 10 314013 CASAVA_Build 2 214827088 13I TGGTGTCTGG -------------/GAATGCTTGCAAT TTTTGCACAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 GAATGCTTGCAAT 0 1 314014 CASAVA_Build 2 214827756 1I ATATTTAGTT -/A GGGGGAAAAC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 0 1 314015 CASAVA_Build 2 214829550 1I TGGGCGAGAG -/T TTTTTGTTGT 3070 het 3070 hom 35 17 18 0 T 5 6 314016 CASAVA_Build 2 214829793 3D ATGTAGCATT ATA/--- ATAAGTCTTA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 ATA 2 1 314017 CASAVA_Build 2 214833518 4I AAGTCTATTA ----/TTTC TTTCTTTGGT 3070 het 3070 hom 39 12 24 3 TTTC 1 2 314018 CASAVA_Build 2 214841714 2I CATCTGAAGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 36 15 12 9 GT 8 9 314019 CASAVA_Build 2 214842931 4I AATTAATGCC ----/AGAG AGAGACAGAA 3070 het 3070 hom 37 14 23 0 AG 2 4 314020 CASAVA_Build 2 214846708 1I TGATACTTCC -/A AGCTTTGTTC 3070 het 3070 ref 20 10 7 3 A 1 2 314021 CASAVA_Build 2 214863367 4D ATATTTACTA TTTC/---- TTTCCTTCTG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 TTTC 2 1 314022 CASAVA_Build 2 214878858 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 10 11 314023 CASAVA_Build 2 214881067 4I ATATTTAGGA ----/TAGT TAGTTAGCTC 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 TAGT 1 2 314024 CASAVA_Build 2 214884114 1D ATCAGCACTG T/- TACCTGCATT 3070 het 3070 hom 55 20 27 8 T 2 1 314025 CASAVA_Build 2 214884545 4I TGTCAGGACT ----/CTAA CTAACTTCCT 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 CTAA 1 2 314026 CASAVA_Build 2 214887723 16I TTAAAAAAAG ----------------/TAGTAGCTAGGTTGAA TGGGTTCACA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 TAGTAGCTAGGTTGAA 0 1 314027 CASAVA_Build 2 214892472 2D GATCCACTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 30 1 18 11 A 16 14 314028 CASAVA_Build 2 214898694 1D ATTGATTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 36 2 16 18 T 11 10 314029 CASAVA_Build 2 214899525 3D AAATCATAAT AAG/--- AAGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 AAG 2 1 314030 CASAVA_Build 2 214902261 4D GCCAAACCTT AAAG/---- AAAGAATTCT 3070 het 3070 hom 61 24 33 5 AAAG 2 1 314031 CASAVA_Build 2 214908439 2D ACATGGAGGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 AT 7 6 314032 CASAVA_Build 2 214915031 1D AAACTCCAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 8 7 314033 CASAVA_Build 2 214920319 1I AATATTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 31 1 24 6 T 10 11 314034 CASAVA_Build 2 214924507 1I CGTTTCTACT -/A AAAAAAATAC 2675 hom 15 het 7 0 6 1 A 7 8 314035 CASAVA_Build 2 214924744 1D60M1D ATTGTATCAA TTTTTTTTTTAGTTTTTAGATTTTTTAACTTCTACAATGAACGTATATTCTATTTGACACAC/-TTTTTTTTTAGTTTTTAGATTTTTTAACTTCTACAATGAACGTATATTCTATTTGACACA- AAAAAAAATA 3070 hom 18 het 10 0 7 19 N/A 0 0 314036 CASAVA_Build 2 214925052 1I AAGCTGCCTT -/G GCACCTGTGT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 G 1 2 314037 CASAVA_Build 2 214929394 1D ATAATTTATC A/- ATCTTCTCTC 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 A 2 1 314038 CASAVA_Build 2 214929546 1D GCCCCACCCC A/- ACCATATTTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 2 1 314039 CASAVA_Build 2 214937092 2D TCTCATTTCT AA/-- AGAGTCACCA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 A 3 1 314040 CASAVA_Build 2 214945440 4I AAACAGAATA ----/AAAC AAACAAGGAA 3070 het 3070 hom 48 23 20 5 AAAC 1 2 314041 CASAVA_Build 2 214950593 4D GGTAACGCTT CCAA/---- CCAACAGTAG 3070 het 3070 ref 55 33 20 2 CCAA 2 1 314042 CASAVA_Build 2 214956892 3I CATGGCAAAC ---/CTT CTTTAAATCT 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 CTT 1 2 314043 CASAVA_Build 2 214990315 1D GAAGAGAGAA G/- GGGGAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 G 5 4 314044 CASAVA_Build 2 214994755 1I TGGATATGTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 8 9 314045 CASAVA_Build 2 215003186 5I ATGAGCAAAC -----/TTTTT TTTACTTGAT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 3 8 314046 CASAVA_Build 2 215005598 2D AATATTTATG AA/-- AGAGTCTCAT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 3 1 314047 CASAVA_Build 2 215009262 3D CTGTTTACGA GAG/--- GAGGTCAGAG 3070 het 3070 ref 54 32 21 4 GAG 2 1 314048 CASAVA_Build 2 215024278 1D GGGTCGGTGT G/- GGGGGGGGGG 2913 het 154 hom 16 4 9 3 G 12 11 314049 CASAVA_Build 2 215029171 3D CCAGCATCTG TTA/--- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 49 27 19 5 TTA 1 0 314050 CASAVA_Build 2 215033767 2D GGTGAATTAT TG/-- TGTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 17 13 3 TG 2 1 314051 CASAVA_Build 2 215039109 4I CTTTTTTGTG ----/TAGA TAGTTGTTCA 3070 het 3070 ref 56 26 25 5 TAGA 0 1 314052 CASAVA_Build 2 215042037 4D TTTTTAAAAC TTCT/---- TTGTTATCAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 TTCT 1 0 314053 CASAVA_Build 2 215048359 1I AGGGATATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 10 22 9 A 10 11 314054 CASAVA_Build 2 215048715 1D ATGTTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 11 7 A 13 12 314055 CASAVA_Build 2 215050436 1D TAAGAGTGTC T/- TTTTTGTTCC 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 T 6 5 314056 CASAVA_Build 2 215053834 10D ATGCCAAGCC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 2731 hom 33 13 15 11 A 24 14 314057 CASAVA_Build 2 215067748 1D CACTAGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 T 12 11 314058 CASAVA_Build 2 215070182 1I ATTGGAAAGG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 141 het 62 0 47 15 A 8 9 314059 CASAVA_Build 2 215076956 1D TATAAGAAGA C/- CACTTATATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 2 1 314060 CASAVA_Build 2 215079949 1I TCTAATTTTT -/A AAAAAATGTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 6 7 314061 CASAVA_Build 2 215082435 2D TTTGCTACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 39 0 30 10 A 12 10 314062 CASAVA_Build 2 215087127 2D ATATCAAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 29 1 14 15 T 12 10 314063 CASAVA_Build 2 215105356 1I TGTACTATGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 51 hom 37 1 31 5 A 8 9 314064 CASAVA_Build 2 215105901 21I AGAGAGAGGG ---------------------/GACCCTGTGCTAGAGAGAGGA GACCCTGACA 3070 hom 88 het 35 0 27 8 GACCCTGTGCTAGAGAGAGGA 0 1 314065 CASAVA_Build 2 215111569 5I ATAATTTTTG -----/TATAA TATATTAATT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TATAA 0 1 314066 CASAVA_Build 2 215114254 1I ACCCAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 20 21 10 A 11 12 314067 CASAVA_Build 2 215137441 1I AAAATTGATG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 80 het 37 0 30 7 T 9 10 314068 CASAVA_Build 2 215142306 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 1587 het 1587 ref 48 33 4 11 AC 8 7 314069 CASAVA_Build 2 215159576 2I TGCTCTTTGA --/CT CTATGAATTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 CT 1 2 314070 CASAVA_Build 2 215159759 4I TAGGTTGCTT ----/CTAA CTTTTAGATA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CTAA 0 1 314071 CASAVA_Build 2 215164369 3D CTCCTAAGTT TAC/--- TACTAAATTT 3070 hom 117 het 42 0 39 4 TAC 2 1 314072 CASAVA_Build 2 215169410 12D CTCAGGTGAT GAGCGCACCAAA/------------ ATCTCACAAA 3070 het 30 hom 17 1 14 2 GAGCGCACCAAA 1 0 314073 CASAVA_Build 2 215172143 5I TTGAATTACC -----/TTGTT TTAACTATAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TTGTT 0 1 314074 CASAVA_Build 2 215173379 1D GTATGTATGG A/- AAAAAAACAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 8 7 314075 CASAVA_Build 2 215176072 2I ACTCTAGCCT --/GG GGGCGACAGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 3 5 314076 CASAVA_Build 2 215185069 2D ATGGAACCCC TG/-- TGTTTCTTTC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 TG 2 1 314077 CASAVA_Build 2 215185848 1I GATTTATTTT -/A AAAAATAAGT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 5 6 314078 CASAVA_Build 2 215187951 8D TACAGAGATT GAATCTTA/-------- GAATGGATAT 3070 het 3070 ref 38 21 16 6 GAATCTTA 1 0 314079 CASAVA_Build 2 215188166 1I GCAAGATAAG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 7 8 314080 CASAVA_Build 2 215190480 3D AATTCCACAA CTT/--- CTTTGCCTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 5 CTT 2 1 314081 CASAVA_Build 2 215190672 4D AAGAATAAGA CAAT/---- CAATCACATC 3070 hom 66 het 24 0 23 3 CAAT 2 1 314082 CASAVA_Build 2 215191496 3I TGTGGTTTGT ---/TTC TTGACTGTCC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 TTC 0 1 314083 CASAVA_Build 2 215193956 4I CATTAAGTAC ----/CAGA CAGATTGTTT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 CAGA 1 2 314084 CASAVA_Build 2 215194681 2D ATTTTTATCA AT/-- ATATATATAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AT 5 4 314085 CASAVA_Build 2 215195184 1I TAGCAGAAGC -/T ACTCCAAGTA 3070 het 3070 hom 22 12 10 0 T 0 1 314086 CASAVA_Build 2 215195395 1I AGGTGTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 11 314087 CASAVA_Build 2 215195487 1I TATACTTTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 8 314088 CASAVA_Build 2 215196173 1I GCTTCCAAAA -/T TTTGCTATTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 3 4 314089 CASAVA_Build 2 215196961 1D AAAAAAAAAA C/- CCCTGGAAGG 3070 het 2874 hom 36 14 20 2 C 4 3 314090 CASAVA_Build 2 215199886 4I AGAGAGAAAT ----/AGAG AGAAAGTGTT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 AG 1 3 314091 CASAVA_Build 2 215200203 1I TCAATTAAAA -/G CAGACTGTAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 0 1 314092 CASAVA_Build 2 215200646 1D15M24D GAAAAACCGG CCCTCATGATTCAATTACCTCCACCTGGGTCCCTCCCACA/-CCACATGATTCAATT------------------------ ACACGTGGGA 3070 het 3070 ref 33 27 13 8 N/A 0 0 314093 CASAVA_Build 2 215201961 3I AAAGAAATTT ---/TTA TTATCTTTAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTA 1 2 314094 CASAVA_Build 2 215209463 6I GGTTTTTGTG ------/TTTTTC TTTTTGTTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 TTTTTC 0 1 314095 CASAVA_Build 2 215212052 1I GCACATATTT -/A TTACAATCCT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 0 1 314096 CASAVA_Build 2 215212462 1I TTTTTCTTAC -/T TTTTTTGTGC 3070 hom 154 het 58 0 52 6 T 6 7 314097 CASAVA_Build 2 215213855 1I AAAAACAAAA -/C CTTTGGAATC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 1 2 314098 CASAVA_Build 2 215221934 1D TTTAGTAATG A/- AATATAATTG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 A 3 2 314099 CASAVA_Build 2 215224015 1I CTAAAATGTG -/A ATTCACAAGT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 1 2 314100 CASAVA_Build 2 215230431 1I CTTAATGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 36 0 25 11 T 9 10 314101 CASAVA_Build 2 215251667 1I GCAGGACAGT -/G GGAAGAAGTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 2 3 314102 CASAVA_Build 2 215253858 1D AATAAAAAAA T/- TAAACCCAGT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 2 1 314103 CASAVA_Build 2 215254347 1D TACTCATCTC A/- AAAAGCATTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 4 314104 CASAVA_Build 2 215262786 2I GAATGAAATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 10 12 314105 CASAVA_Build 2 215275235 1D AAAATAAACC A/- AAAAAATCCC 3070 hom 81 het 34 0 27 7 A 7 6 314106 CASAVA_Build 2 215277765 4I CTGCACAGCA ----/AAGG AAGCAATCAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAGG 0 1 314107 CASAVA_Build 2 215279738 1I AGAGGAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1641 hom 38 5 31 2 T 11 12 314108 CASAVA_Build 2 215286336 1I GAATTCCTAA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 1773 hom 37 10 17 10 T 3 4 314109 CASAVA_Build 2 215292676 2I AAAAACAACC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 29 0 18 11 A 9 11 314110 CASAVA_Build 2 215292863 1D ATAGAAACTT A/- AAAGTAAAGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 4 3 314111 CASAVA_Build 2 215296475 3I TAAGAAAAAA ---/AAC AATCCCATCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAC 0 1 314112 CASAVA_Build 2 215298582 1D TTAGTTGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 42 1 32 9 A 13 12 314113 CASAVA_Build 2 215304107 1I GCTTTGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 57 2 45 10 A 10 11 314114 CASAVA_Build 2 215314896 1D AATCTTTTGT A/- TAATTCTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 1 0 314115 CASAVA_Build 2 215316562 1I TAGTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 9 10 314116 CASAVA_Build 2 215316674 1D TGCCTCAGCC T/- CCCAAGTGGC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 0 314117 CASAVA_Build 2 215319561 2D ATATATGTCC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 35 0 27 9 AT 7 6 314118 CASAVA_Build 2 215321847 4I TTCAGCACAC ----/ACTT ACTGAACACT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 ACTT 0 1 314119 CASAVA_Build 2 215322153 1D TAGTTCCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 589 hom 34 2 12 20 A 15 14 314120 CASAVA_Build 2 215322752 2D AAAAACAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 13 11 314121 CASAVA_Build 2 215334259 1D AGGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2671 hom 30 8 19 3 A 13 12 314122 CASAVA_Build 2 215337927 1I CCTTCATCTG -/C CCCTACTATC 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 C 3 4 314123 CASAVA_Build 2 215339589 2I TCCTCAACCC --/CT GTGATGTCAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 CT 0 1 314124 CASAVA_Build 2 215340281 4I TGTATCATAA ----/AGAG AAAGGGCATG 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 AG 0 2 314125 CASAVA_Build 2 215340370 2D AACTTGACTA TT/-- TTAAAGTCTG 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 4 2 314126 CASAVA_Build 2 215340949 1I ACACATTAAG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 45 20 22 3 A 6 7 314127 CASAVA_Build 2 215341258 1D CATTCTATAC T/- TTTTAAGTAC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 5 4 314128 CASAVA_Build 2 215341408 1D GGCTTTGAAG A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 A 7 6 314129 CASAVA_Build 2 215341552 1I GAATTTCTAG -/T TTACAGGATG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 2 3 314130 CASAVA_Build 2 215346606 1I TATGTTTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 8 9 314131 CASAVA_Build 2 215358041 13D AGAAGCCTTT TCTTCCCTCTACC/------------- TCTTCCCCTT 2976 het 2976 ref 26 12 8 11 TCTTCCCTCTACC 1 0 314132 CASAVA_Build 2 215361156 1I AATCAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 T 10 11 314133 CASAVA_Build 2 215367555 3I TTTAAATTAA ---/TTC TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 TTC 0 1 314134 CASAVA_Build 2 215371209 2D CCCACAATGT TA/-- TTCTCAAGAT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 TA 1 0 314135 CASAVA_Build 2 215376034 1I TGTCAAACTC -/A AGGGTTAAAT 3070 het 1349 hom 14 3 10 1 A 1 2 314136 CASAVA_Build 2 215380707 8I TCCGGAAAAT --------/GAGGCTCA GAGAGATGAA 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 GAGGCTCA 0 1 314137 CASAVA_Build 2 215381464 1I ATCAAAGGGG -/A AAAAAAGTCC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 6 7 314138 CASAVA_Build 2 215381670 3D GAAAAAAAGC AAG/--- AAGTAACACT 3070 het 3070 ref 43 19 20 6 AAG 2 1 314139 CASAVA_Build 2 215394385 6I TCCCCACTGC ------/CTTCTT CCCCAGAGAT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 CTT 0 2 314140 CASAVA_Build 2 215400490 1D AGTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 10 9 314141 CASAVA_Build 2 215401185 1D CACTCTGTCG C/- CCAGGCTGGA 3070 het 2918 hom 15 7 8 0 C 3 2 314142 CASAVA_Build 2 215402531 1I ACCACTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 T 11 12 314143 CASAVA_Build 2 215416846 1D TTTCCAAGTA C/- CATCCTAAGT 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 C 2 1 314144 CASAVA_Build 2 215422522 36D TGTGTGTGTG TATATATGTATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------------ TATATATATA 3070 het 1668 hom 18 7 13 3 TATATATGTATATATATATATATATATATATATATA 1 0 314145 CASAVA_Build 2 215424601 1I AACTCTGACC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 T 7 8 314146 CASAVA_Build 2 215425246 1D GGAAACAGAT A/- ACTCCAGCTC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 2 1 314147 CASAVA_Build 2 215426187 2D TCACAGGTAT CC/-- CCTGGGACAC 3070 het 3070 ref 53 29 20 6 C 4 2 314148 CASAVA_Build 2 215440225 8D CTGTCTCAAA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 19 11 9 0 AAAT 6 4 314149 CASAVA_Build 2 215440486 4I TCGTTCACCG ----/CTAA CTGACAGGTG 3070 het 3070 hom 48 18 27 3 CTAA 0 1 314150 CASAVA_Build 2 215441852 1D CATAGAACAG C/- CCCCCCCCCA 2847 het 2686 hom 23 9 8 6 C 10 9 314151 CASAVA_Build 2 215443100 1D TTCTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 9 8 314152 CASAVA_Build 2 215452138 4I4M6D CTGGGGAAAA ----GGGAATACCC/GGGGGGGA------ AAACATTTCG 3070 het 3070 ref 50 31 17 5 N/A 0 0 314153 CASAVA_Build 2 215453094 2I TTATCACATC --/CT CTCACATCTT 3070 het 3070 hom 75 35 30 10 CT 1 2 314154 CASAVA_Build 2 215459945 1D GAAACTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1531 hom 34 7 13 14 A 15 14 314155 CASAVA_Build 2 215460625 1I TCATTAAAGG -/A AAAAAAACTC 2625 het 1238 hom 12 4 7 1 A 7 8 314156 CASAVA_Build 2 215570993 1D CAAGAGTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 9 314157 CASAVA_Build 2 215576641 1D ATAATAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 13 12 314158 CASAVA_Build 2 215579006 4I TTTACAATAT ----/TAAG TATTTCCTCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TAAG 0 1 314159 CASAVA_Build 2 215587150 2D ACTCTGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 14 6 A 13 11 314160 CASAVA_Build 2 215588138 1D GTTAAAAAAA T/- AATAATTGCA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 1 0 314161 CASAVA_Build 2 215588244 4D ACAAACCGAG AGTT/---- AGTAAGGAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 8 AGTT 1 0 314162 CASAVA_Build 2 215593665 6D ACCACAATTC TTATTT/------ TTATTTTTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TTATTT 3 2 314163 CASAVA_Build 2 215594758 1I ACTACACGTA -/G GTTATAGCAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 1 2 314164 CASAVA_Build 2 215598570 1I AGTGTTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 89 hom 27 1 15 12 T 10 11 314165 CASAVA_Build 2 215602158 1I TGTTCACCCC -/T GACCCCATCC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 0 1 314166 CASAVA_Build 2 215603573 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2407 het 121 hom 14 2 9 3 A 16 15 314167 CASAVA_Build 2 215625562 4D GGCTGTAATC AAAG/---- AAGGAACAGA 3070 het 3070 hom 31 15 16 4 AAAG 1 0 314168 CASAVA_Build 2 215628673 6I TTTATAATTG ------/GAAAAA GAAAAAGAAA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 GAAAAA 2 3 314169 CASAVA_Build 2 215630565 2I TTATGTAACT --/TC TTTATCTGTT 3070 hom 92 het 47 1 40 6 TC 0 1 314170 CASAVA_Build 2 215631578 1I GAAAATTCAA -/C CCTCTGGGTG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 2 3 314171 CASAVA_Build 2 215634720 1D AACTAAAATT A/- AGTAAAGCAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 1 314172 CASAVA_Build 2 215637274 1D TTGTGAAGTT A/- ACCTCCTGGA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 2 1 314173 CASAVA_Build 2 215642159 1D TCTGACTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 32 1 29 3 A 11 10 314174 CASAVA_Build 2 215643128 3I TAATAAAATC ---/AAT AATATTTATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AAT 1 2 314175 CASAVA_Build 2 215652683 2D CATCAGACTC TT/-- TTAATTTTTC 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 4 2 314176 CASAVA_Build 2 215654462 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAGAAAAAA 331 het 51 hom 15 1 5 9 A 5 3 314177 CASAVA_Build 2 215657313 1D TTCAGAACCA C/- CCCCCCACCA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 C 7 6 314178 CASAVA_Build 2 215670219 1I ATCCTATTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 9 10 314179 CASAVA_Build 2 215672982 3D CTCTCTCTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 1872 het 1872 ref 26 15 6 5 CTC 1 0 314180 CASAVA_Build 2 215673540 1I CAAAGTACTG -/T GCCAAGATCT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 0 1 314181 CASAVA_Build 2 215710006 1D TCTTCTGTGC T/- TTTTTTTTTC 1377 het 1377 ref 36 28 3 5 T 10 9 314182 CASAVA_Build 2 215745205 1I GTCAGTAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 9 10 314183 CASAVA_Build 2 215746016 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3035 hom 32 10 14 8 T 11 12 314184 CASAVA_Build 2 215747907 2I TTTTTTTTTT --/TC CCAGCAAAAG 3070 hom 95 het 38 0 32 6 TC 0 1 314185 CASAVA_Build 2 215748535 1D ACAGAATGTG T/- TAATGATCAA 3070 hom 165 het 60 0 55 5 T 2 1 314186 CASAVA_Build 2 215752711 1D AGTAATATAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 28 0 20 9 T 10 9 314187 CASAVA_Build 2 215753252 1D TATCTTTATA T/- ATAGACTATC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 1 0 314188 CASAVA_Build 2 215757855 1I TGTTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 668 hom 31 4 21 6 T 13 14 314189 CASAVA_Build 2 215779240 1D GGACCTTGTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 22 0 21 12 T 9 8 314190 CASAVA_Build 2 215783838 7I GGGCTTTCAT -------/TCCTGGG TCTAAAACAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TCCTGGG 0 1 314191 CASAVA_Build 2 215791663 1D TCTCAAGTGT G/- GAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 36 0 29 7 G 2 1 314192 CASAVA_Build 2 215799302 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2984 hom 24 het 11 0 9 2 A 11 12 314193 CASAVA_Build 2 215799755 2D CCCTCCCCAC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 16 het 24 1 15 9 CT 10 9 314194 CASAVA_Build 2 215800245 1D TCTTATAAAC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 23 0 22 2 T 9 8 314195 CASAVA_Build 2 215801370 2D GAATAGGTTG GA/-- GAGTTTTTTC 3070 hom 138 het 55 0 46 10 GA 2 1 314196 CASAVA_Build 2 215804730 12D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAGAAA 3070 het 56 hom 29 1 24 6 A 18 6 314197 CASAVA_Build 2 215811928 1I ACCTCACTGC -/T TACAACACAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 1 2 314198 CASAVA_Build 2 215813398 2I TTCCTCTCTC --/TA TATATATATA 3070 hom 45 het 23 0 16 7 TA 5 6 314199 CASAVA_Build 2 215819594 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAACTCA 3070 het 245 hom 37 4 24 11 A 7 6 314200 CASAVA_Build 2 215821352 1D AACAAATTGA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 4 T 8 7 314201 CASAVA_Build 2 215825432 3D ATGAATAAAT GGA/--- GGAGAAGAGA 3070 hom 87 het 32 0 29 5 GGA 2 1 314202 CASAVA_Build 2 215827249 1D GAGCTGAAAA C/- CAAGGCACGA 2323 hom 12 het 5 0 5 0 C 2 1 314203 CASAVA_Build 2 215830750 2I GGAACAGAAC --/AG AGCCCTCAGA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AG 1 2 314204 CASAVA_Build 2 215834025 4I TATGATATTG ----/AATA AATATACTGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AATA 1 2 314205 CASAVA_Build 2 215836830 3D CCTTGCTGCC AAT/--- AATTTCTCCT 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 AAT 2 1 314206 CASAVA_Build 2 215839451 23D GGAGGAAGTA GGAATGAGATAAATGTCCCCACC/----------------------- GGAATGAGAT 3070 hom 60 het 32 0 20 15 GGAATGAGATAAATGTCCCCACC 2 1 314207 CASAVA_Build 2 215842962 2I TCCTATACTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 11 13 314208 CASAVA_Build 2 215847184 4D TTACGCAGGC TCTA/---- TCTGTCAATA 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 TCTA 1 0 314209 CASAVA_Build 2 215848238 2D AAACATTTGG AA/-- AAGTTTGACA 3070 het 3070 ref 50 23 22 6 A 4 2 314210 CASAVA_Build 2 215856534 3D AAAGTTTACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 192 hom 34 4 14 18 A 19 16 314211 CASAVA_Build 2 215866644 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2042 hom 18 5 12 1 A 8 9 314212 CASAVA_Build 2 215870074 1I ATTCCGTCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 31 3 10 18 A 12 13 314213 CASAVA_Build 2 215871087 8I CTACTAAAAA --------/TACAAAAT TAGCCGGGTG 3070 het 1594 hom 15 4 7 4 TACAAAAT 0 1 314214 CASAVA_Build 2 215875075 1D TATGATTGTG C/- CACTGCACTC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 2 1 314215 CASAVA_Build 2 215877910 1I TTGTGTCTCA -/T TTTTTTTTTT 956 het 956 ref 29 16 5 8 T 13 14 314216 CASAVA_Build 2 215880719 5I GTGAAGTAAG -----/AAGAA AAGAAATGAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AAGAA 1 2 314217 CASAVA_Build 2 215883323 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1291 het 267 hom 12 2 3 7 A 17 18 314218 CASAVA_Build 2 215894331 2I TCATACCCTG --/TT TTGTTTATCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 2 4 314219 CASAVA_Build 2 215899578 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2230 het 2230 ref 29 19 7 3 A 15 14 314220 CASAVA_Build 2 215901243 1D GTTTTCTCTC G/- GCCTTTCTGG 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 G 2 1 314221 CASAVA_Build 2 215902880 1D CAGGCATGTA C/- CACCAGGCCC 2215 het 989 hom 8 2 5 3 C 2 1 314222 CASAVA_Build 2 215912122 1D AAATGGGATC A/- TGTCTTCCAT 3070 het 3070 ref 49 24 23 2 A 1 0 314223 CASAVA_Build 2 215915312 1D TCCTAATAGC T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 7 6 314224 CASAVA_Build 2 215925553 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2672 het 2672 ref 18 9 6 3 A 12 11 314225 CASAVA_Build 2 215925692 1D CAATGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 2574 het 2312 hom 22 7 7 8 T 10 9 314226 CASAVA_Build 2 215925741 1I CCTGGTACAT -/C CATTGCATTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 1 2 314227 CASAVA_Build 2 215925843 1I GGTCTCATAG -/T TTCCCACGTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 2 3 314228 CASAVA_Build 2 215930661 4D TGAGGATATG GAGT/---- GAGACGATGT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 GAGT 1 0 314229 CASAVA_Build 2 215931184 5I ATAAAATGTA -----/ACAAT ACATTTTATT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 ACAAT 0 1 314230 CASAVA_Build 2 215932704 1D GGAGTTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 11 10 314231 CASAVA_Build 2 215932904 4D TGAATGTCAC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 ATTT 3 2 314232 CASAVA_Build 2 215936729 4I TTCCATTGCT ----/TTTA TTTGAGTTAC 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 TTTA 0 1 314233 CASAVA_Build 2 215937302 1I ACGTTGCCAT -/G GGGACACCTG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 3 4 314234 CASAVA_Build 2 215944437 4I AGGTAGAATA ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 TCTT 2 3 314235 CASAVA_Build 2 215946640 14D CAGGGTATTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1758 hom 24 7 9 9 T 26 12 314236 CASAVA_Build 2 215947216 1I TCATGTCTGC -/T TTCTATTTTC 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 T 2 3 314237 CASAVA_Build 2 215952427 4D GTACAAGAAA GTAC/---- GTACAGTAAG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 GTAC 2 1 314238 CASAVA_Build 2 215962006 2D ATATTAAAAT GA/-- GAGCAGAATA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 GA 2 1 314239 CASAVA_Build 2 215963650 6D ATTCCAGGGT GCTCTA/------ GAACAGAAGC 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 GCTCTA 1 0 314240 CASAVA_Build 2 215966195 1D AAGCAAAGGG A/- GGGGGAGGCA 3070 het 2939 hom 26 9 12 5 A 1 0 314241 CASAVA_Build 2 215966903 4D GCCTATCCTT AGAC/---- AGGCCTTTGC 2885 het 2885 ref 43 24 10 10 AGAC 1 0 314242 CASAVA_Build 2 215985160 1D ATGACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 46 1 34 12 T 13 12 314243 CASAVA_Build 2 215989944 1I ACTGAACAGC -/A ATGGAATTTA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 1 2 314244 CASAVA_Build 2 215993309 6D TCTCTCTCAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 hom 70 het 28 0 23 7 AAAAAC 4 3 314245 CASAVA_Build 2 216013039 1D TTATTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 2069 het 980 hom 29 9 10 10 T 16 15 314246 CASAVA_Build 2 216027733 1I AAGCTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 10 11 314247 CASAVA_Build 2 216029369 5D CGCTTTTGCC ACATA/----- ACATAACATA 3070 hom 123 het 49 0 42 11 ACATA 3 2 314248 CASAVA_Build 2 216039115 5D ATTGAGAAAC AAATT/----- AAAAAGCCAG 3070 het 3070 ref 43 22 19 3 AAATT 1 0 314249 CASAVA_Build 2 216058784 7D TGTGGCTGTA TTTTCTT/------- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 TTTTCTT 2 1 314250 CASAVA_Build 2 216065028 1I TTTTACTATC -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 52 28 16 8 T 7 8 314251 CASAVA_Build 2 216083637 2I TCAGTTAAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 14 8 T 12 14 314252 CASAVA_Build 2 216085408 1D CAAAGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 12 11 314253 CASAVA_Build 2 216101520 1D ATATAAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 T 11 10 314254 CASAVA_Build 2 216110154 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2332 hom 30 8 16 6 A 13 12 314255 CASAVA_Build 2 216118202 4D TAAGATGCGT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 960 hom 35 5 18 12 AC 10 8 314256 CASAVA_Build 2 216120673 1D ACTTTCCCCC T/- CTCCAGATGT 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 T 1 0 314257 CASAVA_Build 2 216127223 5D ATTGCATAAT GTTAA/----- GTTAAGAAAA 3070 hom 151 het 54 0 50 7 GTTAA 2 1 314258 CASAVA_Build 2 216128753 2I GAAAATGTAA --/AG AGAGTAGTGT 3014 het 1091 hom 14 3 8 3 AG 2 3 314259 CASAVA_Build 2 216136050 1D TTTAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 1779 het 1779 ref 38 17 5 16 A 13 12 314260 CASAVA_Build 2 216136710 1D TGAGGCTTCC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 9 8 314261 CASAVA_Build 2 216139416 1I GGCCAGAATA -/G GTTTCCTGGG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 1 2 314262 CASAVA_Build 2 216151839 13D CTTTTTTTTC TTTTTTTTTCTTT/------------- TTTTTGAGAC 2895 het 2895 ref 24 10 9 7 TTTTTTTTTCTTT 1 0 314263 CASAVA_Build 2 216152408 2I CTTGCCGTCC --/TA TTGATTTCAG 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 TA 0 1 314264 CASAVA_Build 2 216158451 1D CTGAACCAAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 A 8 7 314265 CASAVA_Build 2 216158725 1D TACTTGCAGG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 8 7 314266 CASAVA_Build 2 216159669 1I CTGAAAATGG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 154 het 61 0 52 9 A 7 8 314267 CASAVA_Build 2 216166066 8D AAGAAACAGA ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 933 hom 24 2 15 7 AT 11 7 314268 CASAVA_Build 2 216175092 2D TCCAGGTCTC TT/-- TAAATAAATC 3070 het 3070 ref 25 14 8 4 T 3 1 314269 CASAVA_Build 2 216178673 1D CTCCATGTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 9 8 314270 CASAVA_Build 2 216180986 1D GCAGAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 11 10 314271 CASAVA_Build 2 216184475 2D AATGGCTGAT GG/-- GGGGGGGGGC 3070 het 555 hom 25 10 12 3 G 11 9 314272 CASAVA_Build 2 216186924 1D AGAGAATTGC T/- TTGAGCCCAG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 3 2 314273 CASAVA_Build 2 216191968 1D ATTCAGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 11 10 314274 CASAVA_Build 2 216193427 1D AGCCAGCTTA C/- TCTTGATCCA 3070 het 3070 ref 44 22 15 8 C 1 0 314275 CASAVA_Build 2 216194809 1I TGCCAACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 12 13 314276 CASAVA_Build 2 216195762 1D GGAGTTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 T 11 10 314277 CASAVA_Build 2 216197826 1D CTGGGTGCAT A/- AAAACAGAGC 3070 het 3070 hom 56 24 25 7 A 5 4 314278 CASAVA_Build 2 216201550 1D GGCCACATAG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 7 6 314279 CASAVA_Build 2 216213485 1D TCTTTTTCCC T/- CTCTCTGTAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 1 0 314280 CASAVA_Build 2 216215013 1D GTGTTTAAAT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 36 16 16 5 A 8 7 314281 CASAVA_Build 2 216223866 4D GAACAAAATC AATT/---- GTTAACTATT 3070 hom 25 het 16 0 9 7 AATT 1 0 314282 CASAVA_Build 2 216226579 1I TGAAATAGAC -/G TTCAGAAATG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 0 1 314283 CASAVA_Build 2 216227802 2I GTTAAATGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 89 hom 41 2 29 10 A 11 13 314284 CASAVA_Build 2 216242008 2I CCCCACCCCC --/CA CACACAATTT 3070 het 2788 hom 26 8 12 6 CA 3 4 314285 CASAVA_Build 2 216246996 1I GGACCTCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 700 hom 24 3 15 6 A 11 12 314286 CASAVA_Build 2 216250422 1I ATTGGCTCTG -/C CGCAGCGCTT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 C 1 2 314287 CASAVA_Build 2 216259537 1D TTCTTCTTCG T/- TTTTTTTTTT 2623 het 56 hom 24 1 8 15 T 17 16 314288 CASAVA_Build 2 216263473 1I TGTAATCAGC -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 A 7 8 314289 CASAVA_Build 2 216297350 1D TACTTATGTG A/- AAAAAAAAAA 2348 het 2348 ref 45 31 7 7 A 13 12 314290 CASAVA_Build 2 216305209 1D TTTTAAATGT A/- AAAAAACATA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 7 6 314291 CASAVA_Build 2 216344243 1I ATGGATGAAC -/A AATAGCCTCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 3 314292 CASAVA_Build 2 216348455 1I GGATAGACCC -/A GGGGAAAAAA 3070 het 337 hom 31 1 27 3 A 0 1 314293 CASAVA_Build 2 216353667 1D TTGCTTCTTT A/- TATACAAGCA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 1 0 314294 CASAVA_Build 2 216353769 1I TTTAAAGACT -/A AAAACCATAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 4 5 314295 CASAVA_Build 2 216357238 1I TGGCAACACA -/G GGGAAAAAAA 748 het 748 ref 37 18 4 15 G 3 4 314296 CASAVA_Build 2 216357256 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 293 het 293 ref 34 24 3 7 A 12 10 314297 CASAVA_Build 2 216361380 1I CATCTCTATG -/A AAAAAAAAAA 1559 hom 27 het 25 0 8 17 A 13 14 314298 CASAVA_Build 2 216367728 1D ACTGTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 11 10 314299 CASAVA_Build 2 216396574 4D TTAAGCTAAT AAAC/---- AACTTCAGCA 3070 het 3070 hom 23 9 10 6 AAAC 1 0 314300 CASAVA_Build 2 216396930 1I TTAGAAAACA -/C TACTTTAAAT 3070 hom 56 het 21 0 19 2 C 0 1 314301 CASAVA_Build 2 216399656 1D AGGAGTGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 10 12 A 13 12 314302 CASAVA_Build 2 216400488 1D CTTTGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 11 5 T 13 12 314303 CASAVA_Build 2 216404300 4D ATTGGCAGTA CTCT/---- CTGAGAGACT 3070 het 3070 hom 19 9 9 2 CT 3 1 314304 CASAVA_Build 2 216405278 1I TATCTCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 11 12 314305 CASAVA_Build 2 216408426 1I TTTCAACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 9 10 314306 CASAVA_Build 2 216411560 6D ACCGTGTATA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 2188 hom 41 11 10 21 TG 19 16 314307 CASAVA_Build 2 216418445 1D TGTAATTAAG C/- GCTAAATGGG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 C 1 0 314308 CASAVA_Build 2 216435750 1I AAAGCCAAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 8 9 314309 CASAVA_Build 2 216458860 1D TATTCACAGT C/- CCTGGGATTT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 C 3 2 314310 CASAVA_Build 2 216467125 2D AGAGTGAGAG AA/-- AGAAGATATA 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 A 3 1 314311 CASAVA_Build 2 216469037 1D TTGGAGAACC A/- GGCCCGAACA 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 A 1 0 314312 CASAVA_Build 2 216469279 1I AGTGTTCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 18 11 A 12 13 314313 CASAVA_Build 2 216486854 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 296 hom 24 2 14 8 A 17 16 314314 CASAVA_Build 2 216487937 1I TGGGGATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 T 11 12 314315 CASAVA_Build 2 216491763 4D AAAAAGAAAG AAGA/---- AAGAAAGAAA 1109 hom 39 het 16 0 14 2 AAGA 5 4 314316 CASAVA_Build 2 216502825 2D AACCATCACC CT/-- CTCTCAATTC 3070 hom 198 het 70 0 65 6 CT 3 2 314317 CASAVA_Build 2 216508974 1I GAAAACTTTC -/T TTTTTTTTTT 2819 het 1382 hom 29 6 11 12 T 16 17 314318 CASAVA_Build 2 216519206 1D TTCATTGTTT A/- AAAAAAAAAA 899 het 899 ref 29 18 4 8 A 13 12 314319 CASAVA_Build 2 216519429 3I AGCAGGATTA ---/TTT TATAATGTGG 3070 hom 135 het 57 0 45 12 T 1 4 314320 CASAVA_Build 2 216532316 5I CCATCATCCT -----/CCCGC AAGTCACCCT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CCCGC 0 1 314321 CASAVA_Build 2 216534337 2I ATTAGACCTA --/CC CCCATTCAGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 3 5 314322 CASAVA_Build 2 216536408 17D CATCTCAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAC/----------------- AAAAAAACAG 3070 hom 34 het 23 1 21 7 AAAAAAAAAAAAAAAAC 1 0 314323 CASAVA_Build 2 216549076 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 32 3 16 13 A 15 14 314324 CASAVA_Build 2 216560313 1D TCCCAGGTTC A/- AAGCGATTCT 3070 hom 77 het 29 0 24 5 A 3 2 314325 CASAVA_Build 2 216567579 11D AGAAGAAGAG GAAGAAGAAGA/----------- GAAGAAGGAG 3070 hom 54 het 36 0 25 13 GAAGAAGAAGA 1 0 314326 CASAVA_Build 2 216568852 1I TTTAAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 794 hom 45 2 36 7 A 11 12 314327 CASAVA_Build 2 216575838 2D TCTTTGTTTT TC/-- TCTCTCCCTG 3070 hom 91 het 35 0 28 7 TC 4 3 314328 CASAVA_Build 2 216580711 2I ACTTAGCGGC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 19 0 14 5 T 9 11 314329 CASAVA_Build 2 216584690 1D GAGAGCATCT A/- AGATTTTAAA 3070 hom 66 het 25 0 20 5 A 2 1 314330 CASAVA_Build 2 216602437 1I GAGTGAGACT -/C CCATCTCAAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 C 2 3 314331 CASAVA_Build 2 216688144 2D TCGTTTCAAT TG/-- TTTACTTCGA 3070 hom 102 het 39 0 33 7 TG 1 0 314332 CASAVA_Build 2 216688504 3D CAACTGGGAA TTG/--- TTGTGTTGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TTG 2 1 314333 CASAVA_Build 2 216688779 1I ATTTGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 46 1 37 8 T 10 11 314334 CASAVA_Build 2 216693710 4I TTCTTGGTTG ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TTGT 2 3 314335 CASAVA_Build 2 216708064 4D TCATAGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 5 TTTG 5 4 314336 CASAVA_Build 2 216712284 2D AATTGGACTT AC/-- AGTTCCACAT 3070 hom 60 het 22 0 19 3 AC 1 0 314337 CASAVA_Build 2 216720059 1I GTGGTAGAAT -/A GGGGTGGAGG 3070 hom 60 het 23 0 18 5 A 0 1 314338 CASAVA_Build 2 216722580 2I ATTCTCTCTC --/TG TGTGTGTTAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 TG 3 4 314339 CASAVA_Build 2 216730535 3I AAAGAGATAG ---/GCT GCCTATCACA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GCT 0 1 314340 CASAVA_Build 2 216732943 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 35 3 26 6 T 12 11 314341 CASAVA_Build 2 216735376 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 22 0 15 7 T 11 10 314342 CASAVA_Build 2 216736108 1D GGGGAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 23 8 T 12 11 314343 CASAVA_Build 2 216749096 1I AATTTTTTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 8 9 314344 CASAVA_Build 2 216751470 1D TTTGGGAGAA C/- CCTCCATTCC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 3 2 314345 CASAVA_Build 2 216784213 1D GAGCTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 915 het 915 ref 37 28 3 6 A 12 11 314346 CASAVA_Build 2 216788756 1D CTTTTACCCC T/- TTTTTTTTTC 1182 het 1182 ref 41 30 3 8 T 10 9 314347 CASAVA_Build 2 216792324 4I ATTGAACTAG ----/ACAC ACACAGACAC 3070 hom 117 het 46 0 39 7 AC 2 4 314348 CASAVA_Build 2 216796552 3I GTTCTCCCTC ---/TTG TTGGAGCTGA 3070 hom 113 het 41 0 36 5 TTG 1 2 314349 CASAVA_Build 2 216796686 1I CAGCCTCCAT -/A AATCATGTGA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 A 2 3 314350 CASAVA_Build 2 216817832 1I ACAAAGGGCC -/T TTCCAGGCCA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 2 3 314351 CASAVA_Build 2 216828104 2D TATTATCTGG AT/-- ATAACAGCAA 3070 hom 78 het 29 0 26 5 AT 2 1 314352 CASAVA_Build 2 216829557 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 33 0 25 8 T 9 10 314353 CASAVA_Build 2 216843050 1I CCACCAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 907 hom 34 2 21 11 T 13 14 314354 CASAVA_Build 2 216847874 4D AGCTGTCTGA ACTC/---- ACTCCTTAAA 3070 hom 93 het 34 0 30 5 ACTC 2 1 314355 CASAVA_Build 2 216883077 1I AGACCCTGGA -/G GGCACCTACC 3070 hom 114 het 42 0 36 6 G 2 3 314356 CASAVA_Build 2 216885889 1I GTTTTGTTGC -/A TTTGCTTTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 0 1 314357 CASAVA_Build 2 216902598 1I TAGGACAAAT -/A AAAAAATCAG 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 6 7 314358 CASAVA_Build 2 216968074 7I AAGAGGCATG -------/TGAGGAA GAGCAGATGC 3070 hom 92 het 38 0 26 12 TGAGGAA 0 1 314359 CASAVA_Build 2 216970241 1I GTGTTTATCT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 7 8 314360 CASAVA_Build 2 216974524 5I ATCTGTATGA -----/AAGGG AAGGGAAGAT 3070 hom 78 het 36 0 27 9 AAGGG 1 2 314361 CASAVA_Build 2 216975767 1D ATGCTAATGC T/- CTTTCCCAAA 3070 hom 96 het 34 0 32 3 T 1 0 314362 CASAVA_Build 2 216976458 1I ACTCAGCTAG -/A AAAAGAGGAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 4 5 314363 CASAVA_Build 2 216981496 1I GGAAATCAAT -/G TTCTTCCACC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 0 1 314364 CASAVA_Build 2 216988507 1D TTTTCAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 171 hom 47 2 30 15 T 15 14 314365 CASAVA_Build 2 216989396 1D TTTCAGGGCA C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 C 8 7 314366 CASAVA_Build 2 216990331 1I TACAAATTTA -/T TTTTTTACAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 6 7 314367 CASAVA_Build 2 217012293 2D CTTCCATTAT GG/-- GGGGGGGGGA 3070 hom 73 het 41 0 29 12 G 11 9 314368 CASAVA_Build 2 217018286 1D TTCTGGTTTC T/- TTTTCAAAGC 3070 hom 132 het 48 0 45 4 T 5 4 314369 CASAVA_Build 2 217020638 1D CTCCCTGTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 79 het 29 0 25 6 A 10 9 314370 CASAVA_Build 2 217022352 6D CTGCCTTTTT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 hom 26 het 31 1 18 13 TTTTTC 4 3 314371 CASAVA_Build 2 217025458 1I TAAAATGTTA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 8 9 314372 CASAVA_Build 2 217045753 1D AAAAATAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 11 10 314373 CASAVA_Build 2 217081074 2D TCTGTTAGGA CT/-- CTACATTCTA 3070 hom 144 het 53 0 47 7 CT 2 1 314374 CASAVA_Build 2 217141175 1I CAAACTGCTA -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 6 7 314375 CASAVA_Build 2 217155341 13D TCTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTC 3070 hom 46 het 27 0 19 9 T 22 9 314376 CASAVA_Build 2 217158410 3D GGGACACAGA AAT/--- AATGTACAGA 3070 hom 75 het 29 0 26 8 AAT 2 1 314377 CASAVA_Build 2 217166913 1D ACCACTCAGC T/- TTTTTTTTTT 1079 het 1079 ref 37 19 6 12 T 17 16 314378 CASAVA_Build 2 217181771 1I ATCCTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 20 0 14 6 A 11 12 314379 CASAVA_Build 2 217190445 1I GCAGGCACCT -/G TTGTCCACGG 3070 hom 90 het 32 0 29 3 G 0 1 314380 CASAVA_Build 2 217193255 2D AGCTACTGAA AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 8 AG 5 4 314381 CASAVA_Build 2 217193340 2I CCAGCACTTT --/GA GAGGCCGAGG 3070 hom 90 het 31 0 28 3 GA 1 2 314382 CASAVA_Build 2 217197106 2I CTCTAAAAAG --/AA AAAAAAATAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 9 314383 CASAVA_Build 2 217202750 1I GATCGTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2020 hom 32 8 17 7 A 12 13 314384 CASAVA_Build 2 217208576 1D AACGTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 842 hom 39 2 24 14 T 12 11 314385 CASAVA_Build 2 217212531 1I AAAAAGCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 220 hom 25 2 20 3 T 10 11 314386 CASAVA_Build 2 217223080 3D CATGGGGGCC TGG/--- CAATGCCAGA 3070 het 3070 ref 51 33 16 3 TGG 1 0 314387 CASAVA_Build 2 217245493 5D TTCAAAAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 516 het 516 ref 30 24 3 5 AAAAG 1 0 314388 CASAVA_Build 2 217262946 4D TTTTTTAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 AG 8 6 314389 CASAVA_Build 2 217263470 3I TTCCCGCTGG ---/CTT CTTCTTCGCT 3070 hom 47 het 20 0 16 4 CTT 2 3 314390 CASAVA_Build 2 217264392 10D CCCGAAAGCA AACCCAGTAC/---------- TTCCTTGACT 3070 het 3070 ref 47 25 18 6 AACCCAGTAC 1 0 314391 CASAVA_Build 2 217266121 1I TTTATTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 T 13 14 314392 CASAVA_Build 2 217266994 1D ACAAAAGAGA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 41 het 18 0 14 4 T 8 7 314393 CASAVA_Build 2 217270706 1D GCAGCTATTC T/- TTTTTTTTTT 818 het 818 ref 22 9 3 10 T 15 14 314394 CASAVA_Build 2 217284525 1I TAGAAATGTT -/G GGGGGTAGCG 3070 hom 57 het 23 0 16 7 G 5 6 314395 CASAVA_Build 2 217287620 1D CCTGGGTAAT A/- TTTTAGATGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 1 0 314396 CASAVA_Build 2 217300281 31D AGAAAAAACA ATTTTTATTATGATCAGATATTGGGAAGATT/------------------------------- TTTGACATTT 3070 hom 41 het 9 0 13 5 ATTTTTATTATGATCAGATATTGGGAAGATT 1 0 314397 CASAVA_Build 2 217305384 1I TCACCTGCCT -/C CCCAGTCACC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 3 4 314398 CASAVA_Build 2 217308629 1D TAACTCACCC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 66 het 29 0 23 7 A 9 8 314399 CASAVA_Build 2 217310125 1D TTTTGTCTGA T/- TTTTTTTACT 3070 hom 75 het 33 0 24 9 T 8 7 314400 CASAVA_Build 2 217324730 1I GTGAAGTAAG -/T TCAGGAATGG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 1 2 314401 CASAVA_Build 2 217324866 3D GGGATAAAAG ACA/--- ACAAGTATGG 3070 hom 90 het 37 0 31 9 ACA 2 1 314402 CASAVA_Build 2 217329987 1D ACATAAATAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 44 0 37 8 T 9 8 314403 CASAVA_Build 2 217330144 1D TGCTTTGGCC A/- ATGGAATGTT 3070 hom 138 het 51 0 47 5 A 2 1 314404 CASAVA_Build 2 217347986 1D GAGAGGGAGG T/- TTGAGTGAGG 3070 hom 77 het 33 0 25 8 T 3 2 314405 CASAVA_Build 2 217356838 1I AGATGAGCAG -/C CTTGGTTTAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 C 1 2 314406 CASAVA_Build 2 217367586 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 21 2 16 3 A 13 12 314407 CASAVA_Build 2 217372698 1I ACCAAAGCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 9 10 314408 CASAVA_Build 2 217374248 2I GAATAAAATA --/TT TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 T 8 10 314409 CASAVA_Build 2 217375610 4D GGGATCTCTG TGTC/---- TGCACAGCGA 3070 het 3070 ref 51 24 25 3 TGTC 1 0 314410 CASAVA_Build 2 217382157 6I CACTCACACT ------/CTCACA CTCACACTCA 3070 het 107 hom 70 3 28 39 CTCACA 2 3 314411 CASAVA_Build 2 217382252 6I CTCCCACAGA ------/CACACT CACACTCACA 3070 hom 131 het 65 0 50 15 CACACT 1 2 314412 CASAVA_Build 2 217382263 6I ACACTCACAC ------/TCACAT GCCCACAAAG 3070 hom 57 het 67 3 51 13 TCACAT 0 1 314413 CASAVA_Build 2 217383568 3D TCAGTGCCCT GAG/--- GAGAATGCCC 3070 het 2542 hom 31 11 12 9 GAG 2 1 314414 CASAVA_Build 2 217384558 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1380 het 731 hom 9 3 4 2 T 12 11 314415 CASAVA_Build 2 217385171 6D CCTGTCTCAA ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 30 het 14 0 10 4 AT 9 6 314416 CASAVA_Build 2 217418305 4I AGAGAGAGAG ----/AGAA AGGGTGTCTT 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 AGAA 0 1 314417 CASAVA_Build 2 217421080 1D CATTTTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 10 9 314418 CASAVA_Build 2 217431833 2D TCCCACTCTT CA/-- GTCTTGCCCA 3070 het 3070 ref 55 26 24 6 CA 1 0 314419 CASAVA_Build 2 217442190 1I TTAGAGGGAC -/A ACTGGGGGAT 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 A 1 2 314420 CASAVA_Build 2 217452056 4I CTGGAAAGAT ----/AGAC AGGGCTTTTC 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 AGAC 0 1 314421 CASAVA_Build 2 217456878 1D GGCTGTCAGA G/- GGGACGTTCA 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 G 4 3 314422 CASAVA_Build 2 217460244 2I ACGGTATCTA --/AG AGTGATCTGC 3070 het 3070 hom 56 18 28 10 AG 1 2 314423 CASAVA_Build 2 217464955 1D TCTGTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1354 hom 42 10 17 15 T 12 11 314424 CASAVA_Build 2 217470213 1D TATTTGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 31 0 22 10 T 11 10 314425 CASAVA_Build 2 217471955 1I TTGGGACTTC -/T TTTTTTATTC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 6 7 314426 CASAVA_Build 2 217472099 2D CTGCCTTCTC TT/-- ATTTTAATTG 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 2 0 314427 CASAVA_Build 2 217475592 1D GGCACATAGA T/- TTAAGAAACT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 3 2 314428 CASAVA_Build 2 217475792 3D CTTTTACACT CTG/--- CTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 46 28 16 2 CTG 1 0 314429 CASAVA_Build 2 217477214 2D TTTTTGGGGT GG/-- GGGGGGCTTC 3070 het 2672 hom 22 7 11 4 G 8 6 314430 CASAVA_Build 2 217487174 4I GGTGCCTCCT ----/CTCA CTCTCTCTCT 3070 het 2241 hom 39 10 16 13 CTCA 0 1 314431 CASAVA_Build 2 217490975 2D CCTTAGCCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3060 hom 31 13 10 9 A 13 11 314432 CASAVA_Build 2 217495062 4D CAGCATGTCT TAAG/---- TAAGTACCAG 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 TAAG 2 1 314433 CASAVA_Build 2 217495225 1I GTGGCACTGG -/T TTTTCACTTA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 4 5 314434 CASAVA_Build 2 217497839 4D CTAAAAACAG ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 29 13 8 9 ACAA 5 4 314435 CASAVA_Build 2 217504006 1I AGAGCGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 A 11 12 314436 CASAVA_Build 2 217505965 1I GATGGCAGAT -/G GGCCTATATT 3054 het 3039 hom 25 12 8 5 G 2 3 314437 CASAVA_Build 2 217506856 1I CACAGGCGGC -/A ATGAAAGAGG 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 1 2 314438 CASAVA_Build 2 217510878 2D TTCTTCTGCC CT/-- CTCTCTCCCT 3070 het 3003 hom 36 9 18 9 CT 4 3 314439 CASAVA_Build 2 217518211 3I CCAGGTTCTT ---/CTC TTCTGTACTC 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 CTC 0 1 314440 CASAVA_Build 2 217521981 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 15 6 T 11 10 314441 CASAVA_Build 2 217524352 1I ATTCTTTTTT -/A TGGCTGCATA 3070 hom 113 het 42 0 38 4 A 0 1 314442 CASAVA_Build 2 217527342 1I ATGTAAATTC -/T TTTGTTTTTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 3 4 314443 CASAVA_Build 2 217538518 1I ATTCATAGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 A 8 9 314444 CASAVA_Build 2 217558194 4I AAAGAAAAAA ----/AAAT GAGCTTGAGA 3070 het 2383 hom 24 9 10 5 AAAT 0 1 314445 CASAVA_Build 2 217566771 2I CCCAGGACCT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 590 hom 43 2 33 8 GA 8 9 314446 CASAVA_Build 2 217571581 1D GTCTTTTTTA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 97 het 38 0 33 5 T 7 6 314447 CASAVA_Build 2 217595237 1I AGCCGGCCGT -/G GTGGCACGTG 3070 hom 42 het 16 0 13 3 G 1 2 314448 CASAVA_Build 2 217603144 4D TATCTGTCTT TGTC/---- TGTCCTGGAT 3070 hom 113 het 44 0 35 9 TGTC 2 1 314449 CASAVA_Build 2 217604600 1I49M2D CAGCTTACAG -ATACTACCTAGGAATAATGCTTACACTGCAGTAAACAACATAAGGCAGAAT/TGTACTACCTAGGAATAATGCTTACACTGCAGTAAACAACATAAGGCAGA-- ATATATATAT 3070 hom 120 het 44 0 39 24 N/A 0 0 314450 CASAVA_Build 2 217604683 3I ATAACAAAAT ---/GTG GTAAAAGTCA 3070 hom 54 het 37 0 19 18 GTG 0 1 314451 CASAVA_Build 2 217609979 3D TTTTTTTTTT TTA/--- AAATATGGCA 3070 hom 78 het 28 0 27 3 TTA 1 0 314452 CASAVA_Build 2 217610181 13D TCCCCCACAG GCCTGTGCTGAGA/------------- GTGAAATGTG 3070 hom 52 het 19 0 18 2 GCCTGTGCTGAGA 1 0 314453 CASAVA_Build 2 217610888 4D GACACCATCT CACA/---- CACACACATT 3070 hom 99 het 41 0 32 11 CA 6 4 314454 CASAVA_Build 2 217614182 2I GTGCTCCGTG --/GT TTTTTTTTGT 1467 het 63 hom 33 2 13 18 GT 0 1 314455 CASAVA_Build 2 217618574 8D GCCCAGCACT TAGAAGGA/-------- TTCACTTGTG 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TAGAAGGA 1 0 314456 CASAVA_Build 2 217632992 1I AGACCTCGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 36 0 26 10 T 11 12 314457 CASAVA_Build 2 217633305 13I CACAGGCTGA -------------/GATGAAGAGGTAC AACCCACATG 3070 hom 151 het 54 0 51 4 GATGAAGAGGTAC 0 1 314458 CASAVA_Build 2 217635447 3D CTTCTTTAAG CTT/--- CTGCAGTTCT 3070 hom 81 het 30 0 28 4 CTT 1 0 314459 CASAVA_Build 2 217645517 11I CGTCTCTACT -----------/AAAAATACAAA AAAATTAGCC 3070 het 1605 hom 18 5 13 0 AAAAATACAAA 0 1 314460 CASAVA_Build 2 217648691 3I GTGCCTGAAT ---/AAA AAAGACTCAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 3 6 314461 CASAVA_Build 2 217649464 3I TTGGACCTGC ---/CCA CCACCTGCAT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 CCA 1 2 314462 CASAVA_Build 2 217657383 1I TACTTAATAC -/A ATAGTCGCTA 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 1 2 314463 CASAVA_Build 2 217662424 1D ATGAAAGACA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 9 8 314464 CASAVA_Build 2 217662593 2D AAGGCATCTT AA/-- AAAAATACAG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 7 5 314465 CASAVA_Build 2 217665055 1I TCTTCACAGA -/C TATACTGAAA 3070 hom 99 het 35 0 31 4 C 0 1 314466 CASAVA_Build 2 217673914 6D TATATATATA TATATT/------ TTTTTTTTAA 1078 hom 12 het 10 0 5 7 TATATT 1 0 314467 CASAVA_Build 2 217677017 4I TAATGGGCTG ----/CTTA CTTAATAGCT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CTTA 1 2 314468 CASAVA_Build 2 217677180 4D AAGCGTGTGC ATGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 226 hom 43 2 23 20 ATGT 1 0 314469 CASAVA_Build 2 217678513 4I CCCTTACTGA ----/TACT TACTTCCTGG 3070 hom 117 het 42 0 37 5 TACT 1 2 314470 CASAVA_Build 2 217681912 1D GAAGTCCCTC G/- TGGTTGTGGC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 G 1 0 314471 CASAVA_Build 2 217682212 1I ATTTCAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 808 hom 51 2 40 9 T 10 11 314472 CASAVA_Build 2 217683399 3D TCTCTCTCTC ATT/--- ATTTGTCCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 ATT 2 1 314473 CASAVA_Build 2 217688222 5D AGCAGTTTCC AAATA/----- AAATGAAATG 3070 het 3070 hom 49 19 24 10 AAATA 1 0 314474 CASAVA_Build 2 217738485 4I TATCAATTTC ----/TCTA TCTATCTGTC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TCTA 1 2 314475 CASAVA_Build 2 217747444 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1183 het 1183 ref 20 7 4 9 T 19 18 314476 CASAVA_Build 2 217767609 1I GTGGAGGCCA -/G GGACACTCCT 3070 hom 117 het 47 0 39 8 G 2 3 314477 CASAVA_Build 2 217802975 6I GAACCAACCT ------/GAAAAG CTGCTAGCTT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 GAAAAG 0 1 314478 CASAVA_Build 2 217806011 2I CTGATTCTTC --/TG TGTGTATATA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TG 2 3 314479 CASAVA_Build 2 217815059 1D CTTTTATAAA T/- TGTGTTTCCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 2 1 314480 CASAVA_Build 2 217816548 8D AAATACACAC AACACACA/-------- AACACACACA 3070 hom 103 het 51 0 31 24 AACACACA 2 1 314481 CASAVA_Build 2 217843171 1I GTGAGGCTGA -/G GCCTTTGGCT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 G 1 2 314482 CASAVA_Build 2 217846703 1D GTTCTTGCCA T/- TTTTTTTTTA 1266 het 1266 ref 48 38 4 6 T 10 9 314483 CASAVA_Build 2 217851816 2D TTCCATGCTC TT/-- TTAAACAACA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 4 2 314484 CASAVA_Build 2 217854562 2D AACTCCATGC AA/-- AACCATCTTC 3070 hom 108 het 42 0 37 7 A 4 2 314485 CASAVA_Build 2 217857835 1I TTAATTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 902 hom 17 2 11 4 A 11 12 314486 CASAVA_Build 2 217860334 6D TTATTTTGAA ATAATG/------ ATAACGCTTT 3070 het 3070 hom 45 14 29 3 ATAATG 1 0 314487 CASAVA_Build 2 217862167 4D TAGCAAGTGG CTAT/---- CTATCTCTAT 3070 het 3070 hom 40 15 22 5 CTAT 2 1 314488 CASAVA_Build 2 217871613 2I AATAATAAAA --/AT ATGTTATTAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AT 1 2 314489 CASAVA_Build 2 217873782 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3055 het 28 hom 25 1 18 6 A 12 13 314490 CASAVA_Build 2 217883871 1I AAACCAAAGC -/G GAGCACAGCT 3070 hom 129 het 53 0 44 9 G 1 2 314491 CASAVA_Build 2 217884101 4I CTATGGTTCA ----/TTAC TTACTTACAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TTAC 2 3 314492 CASAVA_Build 2 217894237 4D TATTTATTAT TTTC/---- TTTCTTCTAC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TTTC 2 1 314493 CASAVA_Build 2 217894862 1I GTCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 9 10 314494 CASAVA_Build 2 217896973 1D TGGTTGACAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 45 0 39 7 T 10 9 314495 CASAVA_Build 2 217911532 1I AAAAAAAAAG -/A AAAGAAAAAT 2621 het 647 hom 24 3 14 7 A 3 4 314496 CASAVA_Build 2 217911763 1D CCTGATTAGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 7 314497 CASAVA_Build 2 217913754 1D CTCCATTTGT A/- AAAAAATATT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 7 6 314498 CASAVA_Build 2 217924371 1I TTAGGGTGTT -/G GGGGGGCACT 3070 hom 69 het 28 0 22 6 G 6 7 314499 CASAVA_Build 2 217957418 2I AACAGTAAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 10 12 314500 CASAVA_Build 2 217958402 1I AAGCTTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 207 hom 35 1 29 5 T 10 11 314501 CASAVA_Build 2 217960459 1D CACAGAAGTT A/- CTCAGTCACA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 1 0 314502 CASAVA_Build 2 217961365 1D AGCCAGAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 734 hom 28 3 20 5 T 13 12 314503 CASAVA_Build 2 217962202 6D ATTCCAGTCT TATATA/------ TATATATATA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 TA 9 6 314504 CASAVA_Build 2 217971458 21I CAGACAGCTC ---------------------/TAGAAATTCCTTGAGATGAAT TAGAAATTCA 3070 hom 108 het 41 0 35 9 TAGAAATTCCTTGAGATGAAT 0 1 314505 CASAVA_Build 2 217975170 1D TTTGTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 39 0 28 11 A 11 10 314506 CASAVA_Build 2 217976016 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 20 1 7 12 T 13 12 314507 CASAVA_Build 2 217979051 1I AATGCTTCCC -/A CCCCCACCCC 3070 hom 48 het 26 0 17 9 A 0 1 314508 CASAVA_Build 2 217980743 1D CTGCTTCCTC G/- GGCTGTTTCT 3070 hom 103 het 40 0 33 7 G 3 2 314509 CASAVA_Build 2 217983212 1D TCTCTAGTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 43 0 39 6 T 10 9 314510 CASAVA_Build 2 217986749 4D CCCATTACTC TGTT/---- TGTTTACATA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 TGTT 2 1 314511 CASAVA_Build 2 217987678 1I GAGGGATTCA -/C CCCCCATTGC 3070 hom 96 het 40 0 31 9 C 5 6 314512 CASAVA_Build 2 217995403 3D TAGAATAATC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 25 1 19 6 A 14 11 314513 CASAVA_Build 2 218005215 2D CCCCACAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AC 8 7 314514 CASAVA_Build 2 218021494 1D ATTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 28 1 15 12 A 17 16 314515 CASAVA_Build 2 218102231 1D GGAATCAGGA C/- CTGAGAAGGC 3070 het 3070 hom 54 18 29 7 C 2 1 314516 CASAVA_Build 2 218108188 1D CTACCTAGTT A/- AAAAAAAAAA 2714 het 35 hom 27 2 12 13 A 17 16 314517 CASAVA_Build 2 218128184 1I CAGGCTGAGA -/C CTCCGGCTAG 3070 hom 108 het 38 0 32 6 C 1 2 314518 CASAVA_Build 2 218128282 1I ATTTGAATGA -/G GCATGCGCCA 3070 hom 90 het 31 0 29 2 G 1 2 314519 CASAVA_Build 2 218193657 1I CTTAAGAGGT -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 70 het 26 0 18 8 C 9 10 314520 CASAVA_Build 2 218205369 1D ACACAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1053 hom 28 3 16 9 A 13 12 314521 CASAVA_Build 2 218212819 1D AGCTGCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 22 11 A 11 10 314522 CASAVA_Build 2 218213412 2I TTTTAATCTC --/AA AAAAAAAGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 7 9 314523 CASAVA_Build 2 218226987 2D TATCTTCTTT TC/-- TATTTTTTTA 3070 hom 135 het 47 0 46 4 TC 1 0 314524 CASAVA_Build 2 218231123 2D CAAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 28 1 18 10 A 16 14 314525 CASAVA_Build 2 218238831 1I AGAGGAAGAA -/G GGAGCCCCCA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 2 3 314526 CASAVA_Build 2 218246008 1I TGCCAAAAAA -/G GCGGGGGGAA 3070 hom 102 het 44 0 33 11 G 1 2 314527 CASAVA_Build 2 218253876 2I GATTGGAAGT --/AA AAACTTCCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 5 314528 CASAVA_Build 2 218259274 1D TCTAGAATGA C/- AGTGACATTC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 1 0 314529 CASAVA_Build 2 218259423 1I GTTTTCCACC -/A AAAAAAGTCT 3070 het 378 hom 47 1 42 4 A 6 7 314530 CASAVA_Build 2 218295600 1D TTTAAAAAAG A/- AAAAGAAATT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 5 4 314531 CASAVA_Build 2 218300883 1D GTCTCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 786 het 786 ref 33 23 2 8 A 11 10 314532 CASAVA_Build 2 218319591 5I CCTAGAGGAA -----/AACTC AACTCATGTC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 AACTC 1 2 314533 CASAVA_Build 2 218328648 2D ATCAGTTGAC TT/-- ATCACTGTCA 3070 het 3070 ref 58 33 19 8 T 2 0 314534 CASAVA_Build 2 218333027 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 11 10 314535 CASAVA_Build 2 218338500 4I GCAGAGAACT ----/CAAA CAAATCAACA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 CAAA 1 2 314536 CASAVA_Build 2 218339959 1D TTCTCAAGGG A/- AAAAGCAACC 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 A 5 4 314537 CASAVA_Build 2 218341902 5D AACCACAACC AAATT/----- AAATTAGAAA 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 AAATT 2 1 314538 CASAVA_Build 2 218348358 1I ATGTTAAGTG -/A AAAAAAGCCA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 6 7 314539 CASAVA_Build 2 218365124 1I TCTCTGCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3054 hom 34 14 11 9 A 13 14 314540 CASAVA_Build 2 218366034 2I ATGTGGAAAC --/AG AAGCACAGCA 3070 het 3070 hom 66 29 32 5 AG 0 1 314541 CASAVA_Build 2 218378701 12D CCACTGCACA CACCACACATAC/------------ CACCACACAT 3070 hom 76 het 35 0 26 15 CACCACACATAC 2 1 314542 CASAVA_Build 2 218402190 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 260 hom 14 1 13 0 A 15 14 314543 CASAVA_Build 2 218402756 1D CAAGCCCTGC T/- TTGAAAAGCC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 3 2 314544 CASAVA_Build 2 218485422 1D GGCTTGGGGG C/- CAAAAAGACC 3070 het 3070 hom 29 9 15 6 C 2 1 314545 CASAVA_Build 2 218491972 1I AACCCCAGCA -/G GGCCTGAGCC 3070 hom 87 het 30 0 29 1 G 2 3 314546 CASAVA_Build 2 218529398 13I TAACAAGGAC -------------/ACAGAAGAGTCAG GCAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 ACAGAAGAGTCAG 0 1 314547 CASAVA_Build 2 218558036 1D CATTATGAGA T/- TTTTTTTTTT 2223 het 1172 hom 29 12 8 9 T 17 16 314548 CASAVA_Build 2 218602192 1D GCACAAGGCC G/- GGGGGCAAGT 3070 hom 117 het 41 0 38 3 G 6 5 314549 CASAVA_Build 2 218602277 1D GGCATCCCTC A/- CCCCCATCAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 0 314550 CASAVA_Build 2 218618777 2D TACATAGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 45 hom 18 2 10 6 T 14 12 314551 CASAVA_Build 2 218650214 2I TCCGTTTCTC --/CT CTGCTCAGTG 3070 het 3070 ref 65 33 24 8 CT 1 2 314552 CASAVA_Build 2 218655349 3I AGGCGTCTGC ---/CTT CTTCCCTCCA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 CTT 1 2 314553 CASAVA_Build 2 218669808 2D TTTTTTTGAC TT/-- TTGAATTATG 3070 het 3070 ref 56 30 24 2 T 4 2 314554 CASAVA_Build 2 218675576 1I GACTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 10 11 314555 CASAVA_Build 2 218697258 3I CTTACTGAGT ---/TGA TGATTCAGGC 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 TGA 1 2 314556 CASAVA_Build 2 218698545 1D AAGCAATTTG T/- TTTTGTTTTT 916 het 916 ref 37 20 8 9 T 5 4 314557 CASAVA_Build 2 218702686 1I CACTAAATGC -/A AATATTTGTG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 2 3 314558 CASAVA_Build 2 218731440 1D GATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1378 hom 17 4 10 3 T 12 11 314559 CASAVA_Build 2 218731771 1D TAATTCTTTT A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 23 8 11 5 A 7 6 314560 CASAVA_Build 2 218732679 1D TCATAATAAC A/- AAAAAATTGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 7 6 314561 CASAVA_Build 2 218732957 6D GGAGTTCAAG TGATGA/------ ACTGGCCTGG 3070 hom 66 het 24 0 20 6 TGA 2 0 314562 CASAVA_Build 2 218745859 1D CCATTTTCAT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 7 314563 CASAVA_Build 2 218760636 1D TAGCTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 10 8 T 13 12 314564 CASAVA_Build 2 218762683 1D TTTGGTAAAA G/- GTCTGGCAGT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 G 2 1 314565 CASAVA_Build 2 218774814 1I CTTCTATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 28 5 A 10 11 314566 CASAVA_Build 2 218776737 1D GTCTCAAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 A 10 9 314567 CASAVA_Build 2 218782217 1I GGTTGACAGG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 7 8 314568 CASAVA_Build 2 218792809 1I GAAAATCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 9 10 314569 CASAVA_Build 2 218793712 3I ACATTTGATC ---/ATG ATAACCTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATG 0 1 314570 CASAVA_Build 2 218796418 1I TGCCAAAGAG -/A AACCCATGAA 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 A 2 3 314571 CASAVA_Build 2 218797670 2I AGTCACATAT --/AG AGGGCTTTGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AG 1 2 314572 CASAVA_Build 2 218804198 2I TCCTGGTGTC --/AT ATTGGGAGAG 3070 hom 141 het 52 0 46 6 AT 1 2 314573 CASAVA_Build 2 218806642 1I AGAGTCCTGG -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 6 7 314574 CASAVA_Build 2 218808906 1D AAAAATACAG A/- AATTAGCCAG 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 3 2 314575 CASAVA_Build 2 218809061 2D CAGTCTCGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 23 1 17 5 A 14 12 314576 CASAVA_Build 2 218813696 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAATAC 1586 het 465 hom 5 1 4 0 A 7 8 314577 CASAVA_Build 2 218813862 1I ACTCCGACTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 9 10 314578 CASAVA_Build 2 218827364 4D AGTGAGAAGA GAAG/---- GAAGGAAGAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 4 GAAG 3 2 314579 CASAVA_Build 2 218835897 1I TCTGGCATTG -/C CCACATTGCC 3070 hom 80 het 28 0 25 3 C 2 3 314580 CASAVA_Build 2 218845133 2D TACTTAGCTT AA/-- GAGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 21 11 A 2 0 314581 CASAVA_Build 2 218849609 1I GATCCAGAGA -/C CCCCCGCAAG 3070 het 2379 hom 24 8 10 6 C 5 6 314582 CASAVA_Build 2 218852811 2D AGGTGCAAAA AG/-- AGAGGGAACC 3070 het 3070 ref 38 20 9 10 AG 3 2 314583 CASAVA_Build 2 218859828 1D CCCAGAGTGG A/- AAAAAATAGC 3070 hom 78 het 35 0 22 13 A 7 6 314584 CASAVA_Build 2 218866747 4I GTTTTGTTTG ----/GTTT GTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 GTTT 3 4 314585 CASAVA_Build 2 218881087 1D TTAAAAGCAC A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 7 6 314586 CASAVA_Build 2 218887900 1D CAAGTGATCC A/- CCTGCTTCAG 2255 het 2255 ref 17 10 6 1 A 1 0 314587 CASAVA_Build 2 218889239 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 1264 het 91 hom 11 1 6 4 C 0 1 314588 CASAVA_Build 2 218891298 1D CTTGGCAGTG C/- GCCTCAAGCT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 C 1 0 314589 CASAVA_Build 2 218894094 8I CAAGCTCATG --------/CTTGAGCA CTTGAGCATG 3070 het 3070 hom 52 14 26 12 CTTGAGCA 1 2 314590 CASAVA_Build 2 218896016 2I GCCGCCAGCC --/GG GGGCGGAGCC 1941 hom 30 het 13 0 9 4 G 3 5 314591 CASAVA_Build 2 218897133 2I GCCTAGCAAG --/CA CACTGTTCAG 2659 het 1664 hom 21 6 7 8 CA 1 2 314592 CASAVA_Build 2 218900930 3D ACTCCATCTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 24 4 11 10 A 17 14 314593 CASAVA_Build 2 218901870 2I TCCTGACTGC --/TG TCTGTGTTCC 3070 het 3070 ref 23 9 9 5 TG 0 1 314594 CASAVA_Build 2 218902994 1I TCCCCGGCCA -/G GGCCCCACCA 3070 hom 54 het 24 0 18 6 G 2 3 314595 CASAVA_Build 2 218908577 6I ATTGTTGAAG ------/AAATGA AAATGTAAGT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 AAATGA 0 1 314596 CASAVA_Build 2 218921147 3D ATGGTATCTC ATT/--- GTGGTTTTGA 3004 het 1742 hom 14 4 7 4 ATT 1 0 314597 CASAVA_Build 2 218926852 1D CTTAATTTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 2919 hom 21 8 11 2 T 8 7 314598 CASAVA_Build 2 218932775 2D TTGCTGCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 61 hom 18 2 10 6 T 12 10 314599 CASAVA_Build 2 218937328 1I CGCTCCCACA -/C CCCCCCCGCA 3070 het 3070 ref 42 18 11 13 C 7 8 314600 CASAVA_Build 2 218959421 1I CTCTATTTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2334 hom 33 9 10 14 A 15 16 314601 CASAVA_Build 2 218963125 1I TGTTGGCAGA -/T TATCATTCAT 3070 het 3070 hom 52 25 25 2 T 1 2 314602 CASAVA_Build 2 218968263 4I CTTGGGACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 70 het 30 0 23 7 AAAC 3 4 314603 CASAVA_Build 2 218973381 1I AGAGGGAACT -/C CTTCGGGGGT 1250 hom 12 het 7 0 3 4 C 1 2 314604 CASAVA_Build 2 218981690 1D TATATAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 25 5 11 9 T 16 15 314605 CASAVA_Build 2 218984700 14I TTTTCTTTTT --------------/TCTTTTTCTTTTTC CTTTTTTTTT 2829 het 37 hom 10 1 6 3 TCTTTTTCTTTTTC 0 1 314606 CASAVA_Build 2 218989439 2I CCAGCGATTT --/TC TTTTTTTTAA 3070 hom 92 het 32 0 26 6 TC 0 1 314607 CASAVA_Build 2 219000294 1D ATACATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 23 1 14 8 T 15 14 314608 CASAVA_Build 2 219008062 2D CTTGAAAAGA CT/-- CTCTAGTTTC 3070 hom 92 het 34 0 30 5 CT 3 2 314609 CASAVA_Build 2 219021973 1D CATGGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 491 hom 34 2 24 8 A 13 12 314610 CASAVA_Build 2 219024540 8I TAATTTTCAT --------/TATACAAC TATATCCGTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TATACAAC 0 1 314611 CASAVA_Build 2 219028478 2D TCCTCAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 2534 het 754 hom 36 8 7 22 A 18 16 314612 CASAVA_Build 2 219032048 1I AAAAAGGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 522 hom 41 4 19 18 A 13 14 314613 CASAVA_Build 2 219032668 3D TGAACCTGCA GTG/--- GACACTGAAA 2816 het 2816 ref 31 20 8 6 GTG 1 0 314614 CASAVA_Build 2 219034479 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 196 hom 25 1 22 2 A 10 11 314615 CASAVA_Build 2 219042184 1D CAAAAAACAA T/- TATCCTAGAG 3070 het 3070 ref 33 18 11 6 T 2 1 314616 CASAVA_Build 2 219045436 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 32 22 3 7 T 12 11 314617 CASAVA_Build 2 219084768 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 377 hom 17 2 13 2 T 13 12 314618 CASAVA_Build 2 219088930 1I GTCATTAGAG -/A AATGCAAATC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 2 3 314619 CASAVA_Build 2 219090397 2D TGTGGGTAAA CT/-- CTGTTATTAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CT 2 1 314620 CASAVA_Build 2 219095530 1D ACTCCACCAC A/- AAAAAAAAAA 2158 het 71 hom 20 1 9 10 A 17 16 314621 CASAVA_Build 2 219121483 1D AATTTATGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 9 8 314622 CASAVA_Build 2 219158052 5D TTCTCTTCTC TTCTT/----- TTCTTTTCTT 3070 het 2479 hom 30 10 9 12 TTCTT 4 3 314623 CASAVA_Build 2 219158610 3I ATTTTATTTT ---/TTA TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TTA 0 1 314624 CASAVA_Build 2 219219975 5D TAAATGAGAC AACAG/----- AACAGAATGG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 AACAG 2 1 314625 CASAVA_Build 2 219225949 1I TTTTGTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 17 5 A 11 12 314626 CASAVA_Build 2 219277243 4D GTTATTCTGG TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 hom 51 het 25 0 14 11 TGTT 3 2 314627 CASAVA_Build 2 219279968 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 275 hom 27 2 19 6 A 13 14 314628 CASAVA_Build 2 219280808 4D TCTTGACAAC AAAG/---- AATCTCGGGC 3070 hom 66 het 24 0 21 5 AAAG 1 0 314629 CASAVA_Build 2 219302727 1I AAAAAAAAAA -/C AAACAAAAAA 3070 hom 47 het 25 0 21 4 C 0 1 314630 CASAVA_Build 2 219309559 1I ATAAAGTCAC -/T TTTAAGTAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 4 314631 CASAVA_Build 2 219324123 15D CCCTGTAGAC TCATGTTTGGCTCTG/--------------- TCCAGTGGTT 3070 hom 56 het 21 0 18 5 TCATGTTTGGCTCTG 1 0 314632 CASAVA_Build 2 219338517 1I CTGGGCCACA -/G GCATGTGCCA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 G 1 2 314633 CASAVA_Build 2 219339283 4I GCAATTTACT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 63 het 29 0 22 8 TTTA 2 3 314634 CASAVA_Build 2 219339608 1I CTCTGCTTTC -/T TTTTTTTTGG 3017 hom 26 het 13 0 9 4 T 8 9 314635 CASAVA_Build 2 219343745 10D TTTGGCCTGT TTTTGCAGTG/---------- GCTGGTATAG 1926 het 9 hom 5 0 4 1 TTTTGCAGTG 1 0 314636 CASAVA_Build 2 219345674 1I TAGGCTACAC -/G GGGGTCAAGG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 4 5 314637 CASAVA_Build 2 219354595 1D GAATTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 22 2 17 3 A 11 10 314638 CASAVA_Build 2 219360669 11I ACCCACATGC -----------/CCTCTTACCTG TCTGCTTTCT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 CCTCTTACCTG 0 1 314639 CASAVA_Build 2 219374473 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 75 het 27 0 25 3 A 8 9 314640 CASAVA_Build 2 219375299 2I AAAGAAAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 12 14 314641 CASAVA_Build 2 219377039 1D TTATCTATTT A/- AAAAAAATTC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 8 7 314642 CASAVA_Build 2 219378572 17I GCTGTATCCC -----------------/TAGCCCCTTGAACAGTA TAGGAGGAAC 3070 hom 96 het 40 0 32 9 TAGCCCCTTGAACAGTA 0 1 314643 CASAVA_Build 2 219400772 1I TCACCAACAG -/C CCCTTTCCGG 3070 hom 78 het 34 0 22 12 C 3 4 314644 CASAVA_Build 2 219401035 1I CATCCCTGCA -/G GGGAGGGGCG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 3 4 314645 CASAVA_Build 2 219438234 1I GGTGGCCGCA -/G GACGCCTGTC 3070 hom 77 het 28 0 20 8 G 1 2 314646 CASAVA_Build 2 219593535 1I TTGTAGAGAT -/G GGGGTCTTGC 3070 het 2852 hom 22 8 13 1 G 4 5 314647 CASAVA_Build 2 219599628 1I ATACTAAGTC -/T TTGAAATCCA 3070 het 3070 hom 41 12 24 5 T 2 3 314648 CASAVA_Build 2 219606453 9D AAAAAACAAG AAAGAAAGA/--------- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 29 9 14 11 AAAGAAAGA 3 2 314649 CASAVA_Build 2 219613944 2I AAACAAACAC --/AT GTTATAGTAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AT 0 1 314650 CASAVA_Build 2 219616978 10D GCCACTCAGC CTTCTGCGCA/---------- CTTGCGCCTC 3070 het 3070 hom 25 10 12 5 CTTCTGCGCA 1 0 314651 CASAVA_Build 2 219619912 1D GCCAGACTAA T/- TTTTTTTTTT 2932 het 2265 hom 20 7 8 5 T 11 10 314652 CASAVA_Build 2 219631655 3I GCTGACTCTG ---/AGA AGAAGAAGCT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 AGA 2 3 314653 CASAVA_Build 2 219651803 1I TCTTGAGGGG -/T TAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 1 2 314654 CASAVA_Build 2 219653658 2D TATATATGCT TA/-- TATATATATA 1423 het 639 hom 11 2 6 3 TA 6 5 314655 CASAVA_Build 2 219660347 1I TGCAGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 T 10 11 314656 CASAVA_Build 2 219664771 19D AACAAGGGTA TGTGTATATATGAAGTATG/------------------- TGTGTATATA 3070 hom 99 het 42 0 34 13 TGTGTATATATGAAGTATG 2 1 314657 CASAVA_Build 2 219672099 1D AAGTGGCATG T/- TTAAAACTGA 3070 het 3070 hom 53 22 26 6 T 3 2 314658 CASAVA_Build 2 219673414 1D ACTAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 1268 het 1268 ref 35 15 4 16 A 15 14 314659 CASAVA_Build 2 219677676 3D CACCCCCCCA CAC/--- ACACAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 CAC 1 0 314660 CASAVA_Build 2 219686831 1I TTAATACTCC -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 7 8 314661 CASAVA_Build 2 219688982 2D GCTACTCGGA GG/-- GCTGAGGCAG 3070 het 1596 hom 15 4 9 2 G 3 1 314662 CASAVA_Build 2 219691363 1I TCCAGTCTCT -/G GGGGTCCAAA 3070 hom 63 het 27 0 20 7 G 4 5 314663 CASAVA_Build 2 219698090 1I TTTGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 36 3 25 8 A 13 14 314664 CASAVA_Build 2 219703472 1D ACAGAGCGGT A/- AATAGGGCAT 3070 hom 61 het 46 1 40 5 A 3 2 314665 CASAVA_Build 2 219715177 5D CGACTGCAGG GAAGA/----- GAAGAGAAGA 2410 het 2410 ref 37 21 11 5 GAAGA 4 3 314666 CASAVA_Build 2 219732759 4I ATAAAGTCGC ----/CAAA CACTTTCATC 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 CAAA 0 1 314667 CASAVA_Build 2 219743674 2I AGACTGTGTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 A 11 13 314668 CASAVA_Build 2 219749467 2D AGCCTGGTCC AT/-- AGAGGGAGGA 1166 het 1166 ref 18 9 4 5 AT 1 0 314669 CASAVA_Build 2 219750279 4I CCCAGGCGCC ----/TCTG TCTGAGAAAT 2725 hom 29 het 13 0 8 5 TCTG 1 2 314670 CASAVA_Build 2 219750516 1D ACTCAGGGTG T/- TTTTTTTTTT 1395 het 1395 ref 34 26 4 4 T 12 11 314671 CASAVA_Build 2 219760244 1D GAAGGCCTCC T/- TCTCCCTCAT 3070 het 3070 hom 50 15 29 6 T 2 1 314672 CASAVA_Build 2 219766549 4I ATCTCTATTC ----/TTTT TTTTTGAGAC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 5 9 314673 CASAVA_Build 2 219775747 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 20 0 15 5 C 0 1 314674 CASAVA_Build 2 219776537 1I CTGCGAATTT -/A TAGAGGAACC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 0 1 314675 CASAVA_Build 2 219777715 1I CAGCCTCAGA -/T TTTTTTTTTT 2742 het 208 hom 18 2 10 6 T 15 16 314676 CASAVA_Build 2 219797835 1I GGGGTGGGGT -/G GGGGAAGAGA 3070 hom 67 het 25 0 22 3 G 4 5 314677 CASAVA_Build 2 219799497 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 8 7 314678 CASAVA_Build 2 219800482 1D CATCTCAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 10 9 314679 CASAVA_Build 2 219829686 1I CTGGTGCAGT -/G GCTCATGCCA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 G 1 2 314680 CASAVA_Build 2 219842721 1D CATCAGGGGA G/- GGGGATGACT 3070 hom 171 het 62 0 54 9 G 5 4 314681 CASAVA_Build 2 219860332 1I AAAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 2261 het 2261 ref 26 12 6 8 A 10 11 314682 CASAVA_Build 2 219860863 1I CTCTTGCTTC -/A ACCGTCAATC 2500 het 2500 ref 26 8 8 10 A 1 2 314683 CASAVA_Build 2 219874285 1I ACCCATCCTT -/C CCCGATGCCT 3070 het 3070 ref 57 23 22 12 C 3 4 314684 CASAVA_Build 2 219888167 1I ACTCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 6 7 314685 CASAVA_Build 2 219890862 1I TGTAAATTTT -/A ATTGGTTTCT 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 A 1 2 314686 CASAVA_Build 2 219893473 1D TTTGTATTTG T/- TTTTTTTTTG 2939 het 2086 hom 15 6 8 1 T 10 9 314687 CASAVA_Build 2 219893944 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2096 het 2096 ref 24 7 8 9 A 14 15 314688 CASAVA_Build 2 219898700 1D TCTCAAACTA G/- GTGGGCTCAA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 G 2 1 314689 CASAVA_Build 2 219899136 3D GAAACCCAGT TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 50 20 21 10 TTG 3 2 314690 CASAVA_Build 2 219901406 1D GTCTTAGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 10 14 A 13 12 314691 CASAVA_Build 2 219902492 3I GGACCTCTGA ---/ATT ATTCTCACAG 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 ATT 1 2 314692 CASAVA_Build 2 219903280 1I AACATTCATG -/A AAACTCTGCT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 A 3 4 314693 CASAVA_Build 2 219903983 3D CCACTTCAAG TCT/--- TCTTTAATTT 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 TCT 2 1 314694 CASAVA_Build 2 219909443 1D TGAAACAAAG A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 A 7 6 314695 CASAVA_Build 2 219911164 3D ACATTACATA ATG/--- ATAAAAGGGT 3070 het 3070 ref 34 17 14 6 ATG 1 0 314696 CASAVA_Build 2 219919338 1D CCCTAGAAAT G/- GGGTCCTGCT 1375 hom 7 het 5 0 3 2 G 4 3 314697 CASAVA_Build 2 219919824 2I GAGGAATTAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 AC 6 7 314698 CASAVA_Build 2 219920824 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 13 1 9 3 A 15 14 314699 CASAVA_Build 2 219921384 4I TGATGAACTC ----/AGGT GGGAGAAATG 3070 het 3070 hom 51 14 30 7 AGGT 0 1 314700 CASAVA_Build 2 219923803 2D GAAGAAACAA GG/-- GATTTTCAGT 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 G 3 1 314701 CASAVA_Build 2 219929594 1D CATCTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 13 12 314702 CASAVA_Build 2 219934222 1D GGTCCTGAGG C/- CCCAGATGAA 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 C 4 3 314703 CASAVA_Build 2 219936073 4I TGTATATATG ----/GATA GATATATAGC 3070 hom 187 het 68 0 62 6 GATA 1 2 314704 CASAVA_Build 2 219936232 2I TGTGTTTGTA --/TG TGTTGTGCAT 3070 het 2133 hom 76 9 39 28 TG 1 2 314705 CASAVA_Build 2 219936253 2D TGTGCATATA TG/-- TGTATGCCTT 3070 het 1400 hom 63 7 29 28 TG 2 1 314706 CASAVA_Build 2 219951832 3I ATACCTAAGA ---/ATG ATAATAAATG 3070 hom 96 het 40 0 32 10 ATG 0 1 314707 CASAVA_Build 2 219957544 1I TTGTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 314708 CASAVA_Build 2 219959142 1D AGACTAAGCA G/- GGTGGTCCTC 3070 hom 115 het 47 0 36 11 G 3 2 314709 CASAVA_Build 2 219960532 3D GACTCCTCTC TCG/--- CACCCACCTA 2292 hom 35 het 15 0 10 5 TCG 1 0 314710 CASAVA_Build 2 219964839 1I AGCAGTTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 217 hom 31 1 20 10 A 14 15 314711 CASAVA_Build 2 219972788 2I GCCTAGGAAC --/AT GTGTCTGCAC 3070 hom 122 het 43 0 37 6 AT 0 1 314712 CASAVA_Build 2 219980491 1D TGAACCTGGG A/- GGTGGAGGTT 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 1 0 314713 CASAVA_Build 2 219980577 1D AAAAAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 31 2 25 7 A 13 12 314714 CASAVA_Build 2 220003027 1I ACTCTGAACA -/G TCAAGAAGTA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 G 0 1 314715 CASAVA_Build 2 220003905 4I CTGTCACAGC ----/TAGT TAGTGTGGGC 3070 hom 73 het 32 0 22 10 TAGT 1 2 314716 CASAVA_Build 2 220004515 24D GTTCTTTCTT TTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC/------------------------ TTCCTTCCTT 3070 hom 51 het 32 0 16 30 TTCC 15 9 314717 CASAVA_Build 2 220020180 1D ATATCCCTGT G/- GGGGGGGGCC 3070 hom 34 het 17 0 9 10 G 9 8 314718 CASAVA_Build 2 220029860 68D GGGCGACAGT GCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAA/-------------------------------------------------------------------- ATTAATCACT 3070 het 3070 ref 19 19 10 1 GCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAA 1 0 314719 CASAVA_Build 2 220039843 1I GTGTGTTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 100 het 45 0 30 15 T 9 10 314720 CASAVA_Build 2 220049125 1D CATGTGATAT G/- TATGGAGAAT 2619 het 2619 ref 20 11 6 3 G 1 0 314721 CASAVA_Build 2 220049203 4I TATTTGGGGG ----/TTAC TTGTTTGTTC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TTAC 0 1 314722 CASAVA_Build 2 220067540 5I AGCCACACCC -----/CTGCA GTGCCATAGA 3070 hom 59 het 25 0 18 7 CTGCA 0 1 314723 CASAVA_Build 2 220108404 4D TGTATGTGTT TGTG/---- TGTATGTGGG 3070 het 3070 ref 52 34 12 10 TG 3 1 314724 CASAVA_Build 2 220121903 1D GAAGCCTAGC A/- ACCTTCCATA 3070 het 3070 ref 40 21 12 8 A 2 1 314725 CASAVA_Build 2 220123840 2D TGGGGCTGGG GA/-- GAGAAGGGGG 2832 het 2832 ref 27 13 8 6 GA 3 2 314726 CASAVA_Build 2 220128418 1D CTAATTTTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 32 hom 19 1 15 3 T 9 8 314727 CASAVA_Build 2 220134611 1I TTCTCCCAGG -/C CCTCCCTGAC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 2 3 314728 CASAVA_Build 2 220146954 1D AAAAAAAAAA T/- GGTAATATGG 1548 het 133 hom 17 1 10 8 T 1 0 314729 CASAVA_Build 2 220157241 5I TCTTACCTGC -----/CACGT CACGTCAAGG 3070 het 3070 hom 45 18 16 11 CACGT 1 2 314730 CASAVA_Build 2 220162518 1D CTCTGTGTCC A/- AAAAAAAAAA 2473 het 799 hom 16 3 10 3 A 17 16 314731 CASAVA_Build 2 220163023 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 1080 het 1080 ref 44 39 3 2 T 10 9 314732 CASAVA_Build 2 220172703 1D GTGTCCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 31 4 17 10 T 15 14 314733 CASAVA_Build 2 220183365 1D TCTCCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 21 0 12 9 T 11 10 314734 CASAVA_Build 2 220188491 4I ATATCAAGTC ----/AGAG AGGGAGGCAG 3070 hom 78 het 29 0 25 4 AG 1 3 314735 CASAVA_Build 2 220192183 1I GTATTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 1228 het 739 hom 17 4 5 8 T 13 14 314736 CASAVA_Build 2 220192211 3D TAGAAAAATT AAA/--- AACCCTCTGT 3070 hom 36 het 18 0 12 6 A 5 2 314737 CASAVA_Build 2 220195933 1D CATTTCACCA T/- TTTTTCACAG 3070 hom 147 het 52 0 49 3 T 6 5 314738 CASAVA_Build 2 220202849 1D GAGAGAACAA G/- GGGGGGGGGA 1770 het 14 hom 14 0 7 7 G 10 9 314739 CASAVA_Build 2 220210160 6D TTGTAGAGGA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 64 22 25 21 GT 8 5 314740 CASAVA_Build 2 220220411 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2156 het 459 hom 8 1 6 1 T 12 13 314741 CASAVA_Build 2 220226404 3D TGAAGACCTT GCA/--- GCAGACATCA 3070 hom 39 het 16 0 12 6 GCA 2 1 314742 CASAVA_Build 2 220237050 4D AGCACGGGAA AGAC/---- AGGCCCCCAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AGAC 1 0 314743 CASAVA_Build 2 220237791 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 591 hom 28 2 24 2 A 10 11 314744 CASAVA_Build 2 220239620 10D TAGCCGGGCA TGTTGGTGTG/---------- TGTCTATAGT 3070 hom 53 het 17 0 17 2 TGTTGGTGTG 1 0 314745 CASAVA_Build 2 220256420 1I TTTAAAGACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 9 10 314746 CASAVA_Build 2 220257055 15D TAAAGACTTT ATTTAACTGGCCATC/--------------- ATTTAACTGG 3070 het 3070 ref 38 22 12 10 ATTTAACTGGCCATC 1 0 314747 CASAVA_Build 2 220263806 1I CCAATTTTTG -/T ATTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 T 0 1 314748 CASAVA_Build 2 220268287 1I CTGTTGCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2614 hom 37 11 14 12 A 13 14 314749 CASAVA_Build 2 220275567 1D AAATGAATTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 103 het 43 0 35 8 A 9 8 314750 CASAVA_Build 2 220283213 1D GCCTGGCTTA T/- TTTTTTTTGT 1749 hom 10 het 6 0 4 2 T 9 8 314751 CASAVA_Build 2 220285216 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2862 het 908 hom 21 5 10 6 A 17 15 314752 CASAVA_Build 2 220289744 1I CTAATAATAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 7 8 314753 CASAVA_Build 2 220289992 1I TTGTCTTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2648 hom 19 6 9 4 A 10 11 314754 CASAVA_Build 2 220290769 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1946 hom 23 6 13 4 T 13 12 314755 CASAVA_Build 2 220311678 3D CAGCTATCTG GGA/--- GGAGGCTGAG 3070 hom 56 het 20 0 17 3 GGA 2 1 314756 CASAVA_Build 2 220316021 8D TCTAATTGCT TCACAGAA/-------- TCACAGAATG 3070 het 3070 ref 39 17 12 12 TCACAGAA 2 1 314757 CASAVA_Build 2 220320694 1I TTGTTTTGTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 T 7 8 314758 CASAVA_Build 2 220323064 4D GAAAAAAGAT AAGC/---- AAGCAGGAAG 3070 het 3070 hom 27 10 14 5 AAGC 2 1 314759 CASAVA_Build 2 220325251 4D TCTTGTTCAT TCTA/---- TCTAACTACA 3070 het 3070 hom 43 18 23 3 TCTA 2 1 314760 CASAVA_Build 2 220327630 1I AATGTCATTA -/G GGGGAACCCT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 G 4 5 314761 CASAVA_Build 2 220327776 23D TCCACCACCT GGCTAGTCCACAAGGTCTCTCTG/----------------------- GGCTCACCAG 3070 het 3070 ref 43 30 12 9 GGCTAGTCCACAAGGTCTCTCTG 1 0 314762 CASAVA_Build 2 220351910 12D TTTCCAGGAA AGCTCAAGTGGG/------------ AGGAACATAC 3070 het 3070 hom 35 17 17 4 AGCTCAAGTGGG 1 0 314763 CASAVA_Build 2 220352478 3D CAACAACAAC AAG/--- AAGAAGAAAC 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 AAG 3 2 314764 CASAVA_Build 2 220353261 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAACGA 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 A 7 8 314765 CASAVA_Build 2 220364389 1D GTACCAGGTA T/- TTTTGTGTGA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 5 4 314766 CASAVA_Build 2 220364513 1I GTCCTTTATC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 8 9 314767 CASAVA_Build 2 220367150 2D AATCTTTTTT TC/-- TTTTTTTTGG 1320 het 1320 ref 28 17 6 5 TC 1 0 314768 CASAVA_Build 2 220368859 5I ATTTTTAGAT -----/AACAC AGTACACAGG 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 AACAC 0 1 314769 CASAVA_Build 2 220372232 1D TGGGGAAGAC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 314770 CASAVA_Build 2 220372437 1I TGGAGGGGCT -/C CCCCTGGGGC 3070 hom 76 het 30 0 22 8 C 4 5 314771 CASAVA_Build 2 220378749 1D TTTTATTATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 12 11 314772 CASAVA_Build 2 220379555 4D TTAAAAATTG GTTT/---- GTTTATTTAC 3070 hom 142 het 51 0 47 6 GTTT 2 1 314773 CASAVA_Build 2 220381591 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 10 314774 CASAVA_Build 2 220382232 2D GGCTTAGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 30 0 24 9 T 13 11 314775 CASAVA_Build 2 220384059 1I TGTTGGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 10 11 314776 CASAVA_Build 2 220384883 4I TATTTTTTGT ----/TTTA TTCATTGTAT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 TTTA 0 1 314777 CASAVA_Build 2 220390052 4I GTCTCGTTGA ----/TCTG TCTAATGTTG 3070 het 3070 ref 25 18 7 0 TCTG 0 1 314778 CASAVA_Build 2 220392754 1I CCTTTTTTTT -/G TGAATTGCAG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 G 0 1 314779 CASAVA_Build 2 220394086 1I TGATTGGCTT -/C CAGGTACCCT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 C 1 2 314780 CASAVA_Build 2 220395461 1I GCAAAGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 808 hom 31 3 26 2 T 13 14 314781 CASAVA_Build 2 220422150 2D GAAGATGTAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 41 15 17 12 GT 8 7 314782 CASAVA_Build 2 220428406 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1432 het 1432 ref 21 10 8 3 A 15 14 314783 CASAVA_Build 2 220428734 1D CAGGTAAGCT G/- GGGATGGAAG 3070 het 3070 ref 52 29 19 5 G 4 3 314784 CASAVA_Build 2 220436330 1D CATAAGAGTT A/- AAAAAAAACT 1508 het 1508 ref 15 5 4 6 A 9 8 314785 CASAVA_Build 2 220440417 1I TCATGCTCTC -/A AATACCAGGA 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 A 2 3 314786 CASAVA_Build 2 220449531 5D TTGCTTTCAC TTACT/----- TTACTCTATG 3070 het 3070 ref 29 18 10 4 TTACT 2 1 314787 CASAVA_Build 2 220451885 1I GCCATTCTTG -/T TTTTTTGGAA 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 T 6 7 314788 CASAVA_Build 2 220453394 2I GTTTTAAAAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 AC 5 6 314789 CASAVA_Build 2 220474079 1D TTCAGTTTGT A/- AAAAAATGCA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 A 7 6 314790 CASAVA_Build 2 220480670 1I AGATGAGTGC -/A AAAATAAGGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 4 5 314791 CASAVA_Build 2 220485107 1D TACCCTTCTC A/- AAGTTCAGCC 3070 het 3070 ref 32 16 12 6 A 3 2 314792 CASAVA_Build 2 220496743 5D AGTAATAAAA TAATT/----- TAATATAAAA 3070 het 3070 ref 44 25 19 2 TAATT 1 0 314793 CASAVA_Build 2 220503367 3I43M1I TTGAAAATTT ---ATAACTTACCTAGAGGATCACTTGATTTTTTATTGAAGTAATT-/ATAATAACTTACCTAGAGGATCACTTGATTTTTTATTGAAGTAATTA AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 37 21 25 5 N/A 0 0 314794 CASAVA_Build 2 220504559 14I GCAGTGTGAT --------------/GAATTAATACTTTG GAATTAGAAA 3070 het 2333 hom 25 6 16 4 GAATTAATACTTTG 0 1 314795 CASAVA_Build 2 220512613 3I CGCAGCTCAA ---/GCT GCCACTTCAG 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 GCT 0 1 314796 CASAVA_Build 2 220516415 5D GGTTGTGTGC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 1892 het 1821 hom 38 11 8 19 A 23 18 314797 CASAVA_Build 2 220521840 1I GATGGAGAGG -/A TAATTGTATA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 0 1 314798 CASAVA_Build 2 220523366 1D TTAGGGAGTA G/- GGAGATGGAA 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 G 3 2 314799 CASAVA_Build 2 220523987 1D TCGAAAAACT A/- AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 6 5 314800 CASAVA_Build 2 220524704 2I ATCTAAAAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 8 18 7 A 10 12 314801 CASAVA_Build 2 220533033 5D TATAAAACAT ATAAC/----- ATAATTGTAT 3070 het 3070 ref 26 15 11 1 ATAAC 1 0 314802 CASAVA_Build 2 220545417 1D CCCTTTACAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 9 8 314803 CASAVA_Build 2 220546119 1I ACTTAATGCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 T 8 9 314804 CASAVA_Build 2 220546496 2I CATCAAGTGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 9 11 314805 CASAVA_Build 2 220546554 2D TTTGTATATC TG/-- AGAATAATTT 3070 het 3070 hom 35 12 12 12 TG 1 0 314806 CASAVA_Build 2 220549238 3D AAAGTGAATC CTT/--- CTTTCCTTGT 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 CTT 2 1 314807 CASAVA_Build 2 220557739 7D AACAGCCAGC TCTCTTA/------- TCTCTTAACA 3070 het 3070 ref 40 16 16 9 TCTCTTA 2 1 314808 CASAVA_Build 2 220569488 1I ATTTTTTTTT -/A TGGCAAAGGG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 0 1 314809 CASAVA_Build 2 220572374 1I TACCTCTGGT -/G AAGGGAGTAG 3070 het 3070 hom 45 22 19 4 G 0 1 314810 CASAVA_Build 2 220581558 25I TTTCCTGGAG -------------------------/TTTATGTGACCTTACAGAATTTTTT TTTATGTGAC 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 TTTATGTGACCTTACAGAATTTTTT 0 1 314811 CASAVA_Build 2 220585291 2D GCAAGATATA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 44 12 23 9 TG 5 4 314812 CASAVA_Build 2 220586852 1I TTATAAAAGG -/T AAGTGAAGCT 3070 het 3070 hom 47 22 23 2 T 0 1 314813 CASAVA_Build 2 220589312 1D CGTTTCCCCA T/- TTGCTTGTTT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 3 2 314814 CASAVA_Build 2 220609202 2I GCTGCAAGGA --/AG AGAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 56 30 21 5 AG 2 3 314815 CASAVA_Build 2 220609878 1I TGATGGAGCA -/C ATGGTAAAAG 2638 het 2638 ref 28 10 9 9 C 0 1 314816 CASAVA_Build 2 220611693 6D TTTGCCTTTG ATAATA/------ ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 35 9 15 11 ATA 6 4 314817 CASAVA_Build 2 220612268 6I GAAAGTGAAT ------/TTAGAG TTAGAATTGA 3070 hom 132 het 56 0 45 11 TTAGAG 0 1 314818 CASAVA_Build 2 220618489 1D TAACAGAGTC A/- GGGGCGGGCA 2774 het 2774 ref 31 18 7 6 A 1 0 314819 CASAVA_Build 2 220626643 1D TTAAATGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 A 10 9 314820 CASAVA_Build 2 220633568 1I AGATTTGTGT -/C CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 C 7 8 314821 CASAVA_Build 2 220634159 1I GAATGCAATC -/T TGGCCTTAAG 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 1 2 314822 CASAVA_Build 2 220641590 2I GTTTTAAGAA --/AC AATCCTCCCA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AC 0 1 314823 CASAVA_Build 2 220646271 1D CCAATCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2377 het 403 hom 25 8 6 11 T 23 22 314824 CASAVA_Build 2 220649256 1D TTGAGCTCTT A/- ACAATGTTTT 3070 hom 65 het 36 0 31 6 A 2 1 314825 CASAVA_Build 2 220658935 1D TGTAGCAGGC G/- GGGGGGGAAA 3070 hom 108 het 42 0 35 8 G 8 7 314826 CASAVA_Build 2 220668677 1D CCAAACTCAG C/- CAATGGTTCC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 2 1 314827 CASAVA_Build 2 220673480 3D ATTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 21 2 14 5 T 14 11 314828 CASAVA_Build 2 220674159 1I TTTAGAAAGG -/T TTTTTGTCTT 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 T 5 6 314829 CASAVA_Build 2 220675004 2D GGCCTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 37 0 26 12 T 14 12 314830 CASAVA_Build 2 220682169 1D AATGTATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 10 9 314831 CASAVA_Build 2 220689157 1D GAGCAGGAAA G/- GGTCCAAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 3 2 314832 CASAVA_Build 2 220692239 20D GCTATCTCAG CTCACTGCAATCTCCACCTC/-------------------- CTGGGTTCAA 3070 hom 26 het 10 0 8 2 CTCACTGCAATCTCCACCTC 1 0 314833 CASAVA_Build 2 220705644 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 23 1 19 3 C 0 1 314834 CASAVA_Build 2 220709130 1I ACAAAATTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 15 7 4 A 9 10 314835 CASAVA_Build 2 220709989 1D CCATGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 11 10 314836 CASAVA_Build 2 220712868 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2977 het 2977 ref 26 16 8 2 T 11 10 314837 CASAVA_Build 2 220724807 4I GGGGGGTTAC ----/AGTA AGTGTCATGA 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 AGTA 0 1 314838 CASAVA_Build 2 220730228 1I ATGGCTACTT -/A GCACGAGTAC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 0 1 314839 CASAVA_Build 2 220730621 2I ATCTTTAACC --/TA TATATATATA 3070 het 462 hom 27 1 14 12 TA 6 7 314840 CASAVA_Build 2 220730634 1I ATATATATAT -/A TTTTTTTTTG 3070 het 721 hom 27 2 15 10 A 0 1 314841 CASAVA_Build 2 220753957 4D TATGGAATAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 24 8 9 7 AT 7 5 314842 CASAVA_Build 2 220754568 1D GTACATTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2767 hom 34 10 12 12 T 12 11 314843 CASAVA_Build 2 220767387 1D GGCAGGGACC T/- TGGTGGGAGG 3070 het 3070 hom 32 15 13 5 T 2 1 314844 CASAVA_Build 2 220770710 1D AAGACGTGAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 T 9 8 314845 CASAVA_Build 2 220772242 1D TATCTTGCCA T/- CCCCAAACCC 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 1 0 314846 CASAVA_Build 2 220779762 3D TTATACACAC GTT/--- GTCATCACAT 3070 het 3070 hom 47 22 23 3 GTT 1 0 314847 CASAVA_Build 2 220783110 5D CATTCCTTTC TGACT/----- GAAGATACAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 4 TGACT 1 0 314848 CASAVA_Build 2 220795632 4D GGCATCCACC TGTA/---- ATCCAGCCTG 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 TGTA 1 0 314849 CASAVA_Build 2 220797429 1I GAATAGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 11 12 314850 CASAVA_Build 2 220809869 1I GCCTGACTAA -/T TTTTTTTTGT 2695 het 2695 ref 22 11 7 4 T 8 9 314851 CASAVA_Build 2 220831099 1D GAAGAAGGAT C/- TTATTTCATC 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 C 1 0 314852 CASAVA_Build 2 220852547 1I9M1I TCCTGATAGC -ACCTCAGTG-/AACCTCAGTGC CCTTTGGGGG 3070 hom 123 het 41 0 42 2 N/A 0 0 314853 CASAVA_Build 2 220853137 1I TAAAACACTT -/A AAGAACTATA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 2 3 314854 CASAVA_Build 2 220855155 1I ATTTATATTG -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 8 314855 CASAVA_Build 2 220863846 1I TGTGCCTGGC -/T TTTTTTTTTT 2394 het 2394 ref 25 13 5 7 T 10 11 314856 CASAVA_Build 2 220863929 1D CTTTTAAAAA T/- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 T 7 6 314857 CASAVA_Build 2 220864318 3I GGTGAATATC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 16 9 T 11 14 314858 CASAVA_Build 2 220869103 1I GTGGGCTTCC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 85 het 36 0 29 7 T 8 9 314859 CASAVA_Build 2 220874286 1D TTCCAGAATC T/- TTTTTTTTTT 2838 het 241 hom 26 3 13 10 T 17 16 314860 CASAVA_Build 2 220874905 4D TGGATTTTCT TAAA/---- TAATTAAAAG 3070 het 3070 hom 36 16 19 5 TAAA 1 0 314861 CASAVA_Build 2 220879465 4I TGGAAAACTG ----/TATT TATTTTTCTT 3070 hom 118 het 48 0 39 9 TATT 1 2 314862 CASAVA_Build 2 220889911 1I TGGAAAGACA -/T TTTTTGCATT 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 T 5 6 314863 CASAVA_Build 2 220900543 1I TCTATCCTTG -/C CCCCCCCATC 3070 het 2544 hom 35 9 19 7 C 7 8 314864 CASAVA_Build 2 220904829 1I TATAATTTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 T 9 10 314865 CASAVA_Build 2 220910296 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 9 8 314866 CASAVA_Build 2 220923872 10D CCCAAGCCAG GCAGAACTGT/---------- GAGTCAATTA 3070 het 3070 ref 28 19 9 4 GCAGAACTGT 1 0 314867 CASAVA_Build 2 220928081 18D TCCCCATTCC CTCTGTAAAACACAGGTA/------------------ CTTGGTGCTG 3070 het 3070 ref 52 30 18 5 CTCTGTAAAACACAGGTA 1 0 314868 CASAVA_Build 2 220934849 1D GATTTCACCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 32 1 27 4 A 11 10 314869 CASAVA_Build 2 220935544 2D ATAATTGACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 A 12 10 314870 CASAVA_Build 2 220938578 1D GTCACTGGGC T/- TCCTGGTGCC 3070 hom 102 het 38 0 34 5 T 2 1 314871 CASAVA_Build 2 220943005 4I TCTACCTGCC ----/TTAG TTTGTTTTGT 3070 hom 144 het 55 0 48 7 TTAG 0 1 314872 CASAVA_Build 2 220967077 5D ATGTGCCAAG TTTGA/----- TTTGATATTG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TTTGA 2 1 314873 CASAVA_Build 2 220976418 7I GAGACAGGTG -------/AATTGCT AATTGCTTGA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 AATTGCT 1 2 314874 CASAVA_Build 2 220977615 2I AGAAGTAAAC --/AT ATCCTTCTTC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AT 1 2 314875 CASAVA_Build 2 220984200 1D TTTTTTATGC T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 7 6 314876 CASAVA_Build 2 220993953 1D TTGTCTACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 29 8 T 12 11 314877 CASAVA_Build 2 220996723 1D CTCCCAAAGG C/- CCCCCAATAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 6 5 314878 CASAVA_Build 2 220997121 1D TGTCCTAGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 10 9 314879 CASAVA_Build 2 221001680 1D AAGTCATGAG T/- TTTCATGCTT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 4 3 314880 CASAVA_Build 2 221008702 1I GTTTTGCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 31 0 25 6 T 10 11 314881 CASAVA_Build 2 221010228 1D TGGAATATCA C/- CAGATAGGAG 3070 hom 99 het 37 0 33 5 C 2 1 314882 CASAVA_Build 2 221040552 1D TGAATGAGCA G/- GGAGTTGGTC 3070 hom 105 het 38 0 35 4 G 3 2 314883 CASAVA_Build 2 221041283 1D CAGAAATTGC T/- GGCCTGCCTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 1 0 314884 CASAVA_Build 2 221043390 1I TAATACACTG -/C CCACCCCAGC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 2 3 314885 CASAVA_Build 2 221052067 2D ATGGCCCATC AA/-- GAGAGAGAGC 3070 hom 105 het 42 0 36 8 A 2 0 314886 CASAVA_Build 2 221054134 2D GAGGGATTTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TA 1 0 314887 CASAVA_Build 2 221067798 2D TTCTGAAACC AA/-- GACTGTAATC 3070 hom 96 het 34 0 32 5 A 2 0 314888 CASAVA_Build 2 221122823 1D ACTGTGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 170 hom 37 1 31 5 A 11 10 314889 CASAVA_Build 2 221132184 6I CCTCCCTTTC ------/CAGAGT CCCTGATTCT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 CAGAGT 0 1 314890 CASAVA_Build 2 221136635 1I AAAAAAAAAA -/G GCTTTGCACA 3070 het 180 hom 32 2 27 3 G 1 2 314891 CASAVA_Build 2 221146565 2D TATCTCTCTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AT 10 9 314892 CASAVA_Build 2 221153526 2I ACTGGGCATC --/AT GTGGATTTCA 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 AT 0 1 314893 CASAVA_Build 2 221156802 1I TGGTCTAGAC -/T TTTTTCTTTT 3070 hom 120 het 51 0 41 10 T 5 6 314894 CASAVA_Build 2 221157025 1D AGCCACTGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 10 9 314895 CASAVA_Build 2 221161330 2I AGGCAACACT --/TA TACAGCGCTG 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 TA 1 2 314896 CASAVA_Build 2 221167567 1D ACTGACATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 11 10 314897 CASAVA_Build 2 221169371 1I ATTATCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 A 10 11 314898 CASAVA_Build 2 221180606 1I GGCAGCTCTG -/C CCCTGGGGCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 3 4 314899 CASAVA_Build 2 221187075 1I ACTATATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 306 hom 28 1 20 7 A 13 14 314900 CASAVA_Build 2 221206572 9D GATGAAAACA CAAATAACT/--------- CAAATAACTG 3070 het 3070 ref 25 17 9 1 CAAATAACT 2 1 314901 CASAVA_Build 2 221207950 1I TGAAAGGGAA -/T ATTGTATGCA 3070 hom 153 het 55 0 51 4 T 0 1 314902 CASAVA_Build 2 221224107 2I GGCTGAGGTG --/AA GTTTTCAGCA 3070 het 3070 hom 50 23 22 5 A 0 2 314903 CASAVA_Build 2 221231882 1D ATTAAAAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 9 8 314904 CASAVA_Build 2 221236533 1D TTGGAACCAG T/- TTTTTTTTTT 2905 het 2905 ref 31 11 10 10 T 12 11 314905 CASAVA_Build 2 221243983 3I CTTCCTCTAC ---/TCT TCTTCTACCC 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 TCT 2 3 314906 CASAVA_Build 2 221258926 2D TGTGCACACG CA/-- CACACACACA 1621 het 1621 ref 45 28 5 12 CA 8 7 314907 CASAVA_Build 2 221324005 1I TTGGTCTATT -/C AGGAATTCAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 C 0 1 314908 CASAVA_Build 2 221330065 1I AGATCTGTCC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 8 9 314909 CASAVA_Build 2 221332733 1D TTTTTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 T 13 12 314910 CASAVA_Build 2 221399800 2D ATATGACTAT TG/-- TGTGTGAATA 3070 het 2778 hom 20 6 12 2 TG 4 3 314911 CASAVA_Build 2 221399942 3I TTTATTCTTC ---/TTT TTTTTCAATG 3070 het 2304 hom 19 8 11 0 T 5 8 314912 CASAVA_Build 2 221435634 2I AACTCTGTCT --/AA AAAAAAAAAA 1102 het 1102 ref 27 10 12 6 A 16 18 314913 CASAVA_Build 2 221458083 1D CGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 11 10 314914 CASAVA_Build 2 221458782 1D TCACATTTGT G/- GTTCAATCGT 3070 hom 105 het 37 0 36 2 G 2 1 314915 CASAVA_Build 2 221470960 4D CAAAATTGAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 72 het 31 0 23 10 AAAT 4 3 314916 CASAVA_Build 2 221471199 1D AGAGTCCGAC A/- AAAAAAATGC 3070 hom 111 het 45 0 37 9 A 8 7 314917 CASAVA_Build 2 221480249 1D GTTAAATTTC A/- AAATACTCAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 4 3 314918 CASAVA_Build 2 221481863 1D CGGATGTAAT C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 65 het 37 1 34 2 C 9 8 314919 CASAVA_Build 2 221502777 1I TTCTTCCTTA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 7 8 314920 CASAVA_Build 2 221503595 1I CTTTTCTTGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 405 hom 37 1 33 3 A 8 9 314921 CASAVA_Build 2 221516303 1D GCCATGCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1611 hom 30 4 18 8 A 13 12 314922 CASAVA_Build 2 221516660 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAGA 2352 het 2352 ref 19 9 7 4 A 9 8 314923 CASAVA_Build 2 221518337 2I AAATTAATAC --/AT GTTTGCTGTT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 AT 0 1 314924 CASAVA_Build 2 221521657 9I ATGAGTACAT ---------/GTGAGAGAC GTGACCAAAA 3070 hom 99 het 37 0 32 5 GTGAGAGAC 0 1 314925 CASAVA_Build 2 221526891 65D AAGATGCCCA TTGGCCTTACTCAGGTCACATGCCTACGCTGAACCAATCAATGCATTCTGGGGCCTGGCATACAT/----------------------------------------------------------------- TTGGCCTTAC 3070 hom 45 het 51 0 15 38 TTGGCCTTACTCAGGTCACATGCCTACGCTGAACCAATCAATGCATTCTGGGGCCTGGCATACAT 1 0 314926 CASAVA_Build 2 221535375 2D TTAACATTTG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 A 11 9 314927 CASAVA_Build 2 221547967 1D CTGAGATATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 15 7 T 10 9 314928 CASAVA_Build 2 221556579 1I GCAGCTTCTA -/G GGGGAATGGA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 G 4 5 314929 CASAVA_Build 2 221574641 2D CAGTTTATCA AC/-- ACACACACAC 1578 het 1578 ref 46 24 4 21 AC 8 7 314930 CASAVA_Build 2 221580425 5I AGTTTAATTT -----/TATTA TGTTTAATTT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 TATTA 0 1 314931 CASAVA_Build 2 221603289 2D TACAGGGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 12 10 314932 CASAVA_Build 2 221606510 1I TGTGGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 22 0 18 4 G 0 1 314933 CASAVA_Build 2 221607826 1I TTTACAGCAG -/A AAAAAATTTG 3070 hom 77 het 32 0 28 4 A 6 7 314934 CASAVA_Build 2 221611046 4I ATATATATAT ----/ATAC ACACATTATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ATAC 0 1 314935 CASAVA_Build 2 221616264 1D AAGCACTTTG C/- TTTCGTCAAT 3070 hom 80 het 37 0 24 14 C 1 0 314936 CASAVA_Build 2 221618437 4D CTCATCCTAC ATTA/---- ATTAATTAAT 3070 hom 51 het 25 0 18 8 ATTA 6 5 314937 CASAVA_Build 2 221620204 12D TGTCTGTGTG TCTATGTATGTA/------------ TCTATGTATG 3070 hom 93 het 40 0 31 12 TCTATGTATGTA 2 1 314938 CASAVA_Build 2 221620990 4I TATATGTGTG ----/TGTC TGTGTGTGTT 3070 hom 169 het 64 0 57 7 TGTC 0 1 314939 CASAVA_Build 2 221622299 10I TAATTTATCA ----------/GCTTTTAAAT GCTTTTAAAT 3070 hom 79 het 35 0 27 8 GCTTTTAAAT 1 2 314940 CASAVA_Build 2 221622937 1D TTTGGCACTG T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 107 het 40 0 36 4 T 7 6 314941 CASAVA_Build 2 221634918 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 31 0 21 10 A 10 11 314942 CASAVA_Build 2 221637326 1D TCCCAACACT G/- TTGCATTTGG 3070 hom 78 het 37 0 27 10 G 1 0 314943 CASAVA_Build 2 221654124 1D GTCAGGCCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 44 0 39 5 A 10 9 314944 CASAVA_Build 2 221658159 1D TAAAAGTGCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 9 8 314945 CASAVA_Build 2 221665065 4D GTTTTACATA TTCT/---- TTATTAAATT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 TTCT 1 0 314946 CASAVA_Build 2 221665438 2D ATTCCATTAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 80 het 39 0 27 13 TG 10 9 314947 CASAVA_Build 2 221672935 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCCTCCC 2384 het 458 hom 9 1 7 1 C 6 7 314948 CASAVA_Build 2 221673576 1I TGTGTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 T 10 11 314949 CASAVA_Build 2 221678566 1I TAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 11 12 314950 CASAVA_Build 2 221707395 1I TTTAGGGATA -/G ACTAGCTCAC 3070 hom 99 het 46 0 34 12 G 0 1 314951 CASAVA_Build 2 221725759 1I CCAGACCCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 83 het 37 0 25 12 T 9 10 314952 CASAVA_Build 2 221728252 3D GCATGCAATT TAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 3 TAA 1 0 314953 CASAVA_Build 2 221729867 1D GGGGTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 757 het 757 ref 41 31 3 7 T 13 12 314954 CASAVA_Build 2 221749522 4D TCATACTAGC CTAA/---- CTGACACTTT 3070 het 3070 ref 26 16 8 3 CTAA 1 0 314955 CASAVA_Build 2 221760046 1I GCATTTTGGT -/A AGTGTTTTGT 3070 het 2824 hom 30 7 21 2 A 1 2 314956 CASAVA_Build 2 221761436 1I GTTTGCTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 37 0 26 11 A 13 14 314957 CASAVA_Build 2 221764411 1D CCCAGAGCTC A/- AGGCATTGTC 3070 het 3070 ref 43 18 19 7 A 2 1 314958 CASAVA_Build 2 221765971 1D TCTCTTCTGA C/- CCCCAAACTA 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 C 5 4 314959 CASAVA_Build 2 221766502 10I CATTAAAGAC ----------/AACTATAAAT AACTATAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 AACTATAAAT 1 2 314960 CASAVA_Build 2 221767061 1D CAATAGAGGC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 73 het 49 1 36 12 A 9 8 314961 CASAVA_Build 2 221778037 2D TCATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2016 hom 26 5 15 6 AT 9 8 314962 CASAVA_Build 2 221783867 1D CCCTGAACAA T/- GTGGAGGTTG 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 T 1 0 314963 CASAVA_Build 2 221785139 1D AAAGGAGTAT G/- GGTTAACTGA 3070 hom 125 het 49 0 40 11 G 3 2 314964 CASAVA_Build 2 221786055 5D GGCATTCAAA GAGTT/----- GAGTTGTTAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 GAGTT 2 1 314965 CASAVA_Build 2 221794368 1I TCACATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 47 0 32 15 T 10 11 314966 CASAVA_Build 2 221805669 2D TTATGTGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 20 0 10 13 T 16 14 314967 CASAVA_Build 2 221819015 1D CCTGTCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 13 12 314968 CASAVA_Build 2 221831050 3D TATGCACAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 36 1 28 8 A 16 13 314969 CASAVA_Build 2 221833209 1D TTCCCAACAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 10 9 314970 CASAVA_Build 2 221834944 1D GCAAACAGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 995 hom 26 3 20 3 T 11 10 314971 CASAVA_Build 2 221839235 1I ATTCTTATTT -/C CCCCCCCCCT 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 C 9 10 314972 CASAVA_Build 2 221840509 4D AAAATCCTTG GATT/---- GATACAAGCA 3070 het 3070 hom 51 18 29 5 GATT 1 0 314973 CASAVA_Build 2 221855352 4I TAAGATGTTC ----/TTTG TTTGGAGGGT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 TTTG 1 2 314974 CASAVA_Build 2 221865423 1D GCTATTTTAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 A 8 7 314975 CASAVA_Build 2 221867796 1D TAGAAAACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 10 9 314976 CASAVA_Build 2 221872121 1I TCCAAATGAT -/C CTCCATTTCT 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 C 1 2 314977 CASAVA_Build 2 221877409 1I CAAAAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 13 12 A 13 14 314978 CASAVA_Build 2 221907038 2D TGATTCCAAT GA/-- GAGAAGATAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 GA 3 2 314979 CASAVA_Build 2 221911639 3I AAAGTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 45 17 17 11 TTG 3 4 314980 CASAVA_Build 2 221937084 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3009 het 3009 ref 30 14 9 7 A 12 11 314981 CASAVA_Build 2 221944949 1I CTTAAAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 T 10 11 314982 CASAVA_Build 2 221946760 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 8 7 314983 CASAVA_Build 2 222007864 1D TTATTAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 10 9 314984 CASAVA_Build 2 222008378 2D CTTGGAATTC AA/-- AAGAGGACAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 4 2 314985 CASAVA_Build 2 222010862 3D ACTCCAGCCT GGG/--- GGGCGACGAT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 G 6 3 314986 CASAVA_Build 2 222025676 1I GGAAGTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 37 1 26 10 T 10 11 314987 CASAVA_Build 2 222032281 1I CACCCCTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 90 hom 25 1 19 5 T 9 10 314988 CASAVA_Build 2 222034420 2D GCCTAAGTTC AA/-- AAGAGAGTTT 3070 hom 105 het 38 0 34 7 A 4 2 314989 CASAVA_Build 2 222038012 1D GAGAGATGCA T/- TTTTTTTTTC 1264 het 1264 ref 42 30 3 10 T 10 9 314990 CASAVA_Build 2 222051783 1D GCAGGTAGCC A/- GCTGGGCTGC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 1 0 314991 CASAVA_Build 2 222058823 1D GCCTGTAGTT A/- ATACCGAACT 3070 het 3070 ref 44 22 16 8 A 2 1 314992 CASAVA_Build 2 222060104 1D TCATTTATTC A/- AAAAACATTT 3070 het 3070 ref 37 18 18 2 A 6 5 314993 CASAVA_Build 2 222070035 1D ACGCAAGGGT A/- AAAAATCACT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 A 6 5 314994 CASAVA_Build 2 222077504 6D TTGAAAATTT TATATA/------ TATATATATA 2407 het 104 hom 12 1 7 4 TA 12 9 314995 CASAVA_Build 2 222081551 1D TCAAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 11 10 A 15 14 314996 CASAVA_Build 2 222081870 2I TTTTTGATAC --/TG TGTTTCACAA 3070 het 3070 ref 31 20 10 1 TG 1 2 314997 CASAVA_Build 2 222087058 1I AAGCCGGGGG -/A GAGGGGGTTT 2829 het 2829 ref 24 11 9 4 A 0 1 314998 CASAVA_Build 2 222088925 1I ATTTGAAGGG -/A AAAAAAAAAA 2391 het 1830 hom 24 6 8 10 A 15 16 314999 CASAVA_Build 2 222098011 2D TAGCCTTTTG AA/-- AGAGTTTACT 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 A 3 1 315000 CASAVA_Build 2 222104697 4I TACATTCGGC ----/CTAA CTAATTTCTA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 CTAA 1 2 315001 CASAVA_Build 2 222111036 1I CAAAACTGAC -/A AGAGTGCTGA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 1 2 315002 CASAVA_Build 2 222130656 1D AACACGATTT A/- AAAAGGACCC 3070 het 3070 ref 54 31 21 2 A 5 4 315003 CASAVA_Build 2 222142373 4D AAGTATTCTC TCTT/---- TCTCAAGATG 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 TCTT 1 0 315004 CASAVA_Build 2 222143663 1D AGAAAACGAT A/- GATTACACAG 3070 het 3070 ref 40 19 10 11 A 1 0 315005 CASAVA_Build 2 222146056 3I ATGGCCTTGG ---/GCT GCAGGGAACC 3070 hom 24 het 12 0 8 4 GCT 0 1 315006 CASAVA_Build 2 222158143 2D CCTTTGCTTC TA/-- TGAGTTTGAT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 TA 1 0 315007 CASAVA_Build 2 222161387 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 30 3 15 12 A 15 14 315008 CASAVA_Build 2 222163079 2D CAGGGTCTCA CT/-- CTCTGGTCCA 3070 hom 110 het 41 0 36 6 CT 3 2 315009 CASAVA_Build 2 222166435 1D TGATGTGAGG A/- AAACAGTATT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 4 3 315010 CASAVA_Build 2 222179684 1I ATGTAACATG -/T TTTTTTGTAC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 6 7 315011 CASAVA_Build 2 222180072 1D11M1D CTTTTTTTTG TTTTTTTGTTTGT/-TTTTTTGTTTG- TTTTTTTGCT 3070 het 357 hom 25 3 13 10 N/A 0 0 315012 CASAVA_Build 2 222189529 4D AATGCTTAGG CAAA/---- CAGATACCCT 3070 het 3070 hom 33 12 20 4 CAAA 1 0 315013 CASAVA_Build 2 222190552 1D ATATCTTTTC T/- TTTTTTCTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 7 6 315014 CASAVA_Build 2 222206636 1D AAAATGTAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2378 hom 18 7 9 2 T 9 8 315015 CASAVA_Build 2 222242320 1I TAAAGTAAAT -/A AAAATTGACT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 4 5 315016 CASAVA_Build 2 222242934 1D CTCACATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1677 hom 40 4 22 14 T 16 15 315017 CASAVA_Build 2 222257041 2I CAAAAAAGAC --/TT TCTGGAATAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 1 3 315018 CASAVA_Build 2 222257709 1D AAGACTGACC A/- AAATTGCCAC 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 A 4 3 315019 CASAVA_Build 2 222269091 1D TTTTTGAAGG T/- TTTCTATTTA 3070 het 3070 hom 41 18 23 0 T 4 3 315020 CASAVA_Build 2 222283304 6D AAGCTAATCA AACAAT/------ AAAAGTAAAA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 AACAAT 1 0 315021 CASAVA_Build 2 222303892 1I TGTAATTGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 8 9 315022 CASAVA_Build 2 222311011 2D ATCTGACACC CA/-- CACACACACA 1298 het 1298 ref 46 34 4 8 CA 6 5 315023 CASAVA_Build 2 222323256 1I GCATGGGTAG -/A TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 1 315024 CASAVA_Build 2 222340300 1I TTCTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1674 hom 33 10 15 8 T 15 16 315025 CASAVA_Build 2 222341515 1D TAGGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 10 9 315026 CASAVA_Build 2 222349550 7D TCTGTCACCC AGGCTGG/------- AGTGCAGTGG 3070 hom 90 het 38 0 30 8 AGGCTGG 1 0 315027 CASAVA_Build 2 222351973 1D GTGTGTGTGT G/- TTTTTTTTTC 3070 hom 138 het 51 0 45 6 G 1 0 315028 CASAVA_Build 2 222354552 2D CAAGGTTGAC TA/-- TATGCCAGAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TA 2 1 315029 CASAVA_Build 2 222412035 2I CCACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 19 12 11 AC 8 9 315030 CASAVA_Build 2 222429165 3I TTTTTTTCCC ---/TTG TTGTTGAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 TTG 2 3 315031 CASAVA_Build 2 222438739 1D CACAAACTAT A/- TTTTGAAATA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 1 0 315032 CASAVA_Build 2 222487464 1I TCCCAGTCCT -/C CCTAAAGGGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 2 3 315033 CASAVA_Build 2 222489305 1I TGTGGCAAGG -/C CATATGGCCT 3070 hom 68 het 30 0 21 9 C 1 2 315034 CASAVA_Build 2 222500307 1D GGCCTTCAGG A/- AAAAATAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 6 5 315035 CASAVA_Build 2 222506383 1D CATTGGCTGA T/- TTTTCTAGTT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 5 4 315036 CASAVA_Build 2 222527909 6I ACACAGGATC ------/AAGGAA ATGAGAGGAA 3070 hom 108 het 46 0 37 9 AAGGAA 0 1 315037 CASAVA_Build 2 222549894 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1929 hom 19 9 9 1 A 15 14 315038 CASAVA_Build 2 222568080 4D AACTTCATTG CTTT/---- CTATTACGAA 3070 het 3070 ref 43 23 18 3 CTTT 1 0 315039 CASAVA_Build 2 222572812 1I GAAACCGTAA -/G GGCAAACCGC 3070 hom 109 het 48 0 36 12 G 2 3 315040 CASAVA_Build 2 222576598 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 10 9 315041 CASAVA_Build 2 222578479 1I TGGATAACAG -/T TTTTTTTATC 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 7 8 315042 CASAVA_Build 2 222579349 1D CAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 10 9 315043 CASAVA_Build 2 222581241 1I CCAATAAGTC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 7 8 315044 CASAVA_Build 2 222585666 1D GGAGAGCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 12 11 315045 CASAVA_Build 2 222593441 1I TTTGGGTTCT -/G GGGGCAGCAT 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 G 4 5 315046 CASAVA_Build 2 222596952 1I TGAAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 A 11 12 315047 CASAVA_Build 2 222597536 1D ATTCCATGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 18 16 9 A 10 9 315048 CASAVA_Build 2 222601198 1I CTACAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 32 1 24 7 A 12 13 315049 CASAVA_Build 2 222612537 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAAGAAAAG 48 het 48 ref 18 8 2 8 AAG 1 0 315050 CASAVA_Build 2 222612795 1D TAAACTCTTA C/- TATGTATAAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 C 1 0 315051 CASAVA_Build 2 222615026 1I ACACAATACT -/A AAAAAAAAAA 1418 het 1418 ref 25 12 7 6 A 14 15 315052 CASAVA_Build 2 222615925 3I CCTGTTTGTC ---/GTT GTTGTTGTTG 3070 het 3070 hom 48 13 22 13 GTT 5 6 315053 CASAVA_Build 2 222617251 1I TTATTGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 882 hom 41 3 23 15 A 14 15 315054 CASAVA_Build 2 222625804 1I ATATGCCCTT -/C CCTTTCTGCC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 C 2 3 315055 CASAVA_Build 2 222626952 1I CACATTTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 8 9 315056 CASAVA_Build 2 222627738 1D TTTTCTAGTC T/- TTTCCATGGT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 4 3 315057 CASAVA_Build 2 222664277 1I ACTGGCCGGA -/G GGGCACTGCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 3 4 315058 CASAVA_Build 2 222677060 1D AAGAAGGAAA C/- AACTCAGCAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 C 1 0 315059 CASAVA_Build 2 222677660 2I AAAAGAAGAC --/TT TAGATGTCAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 3 315060 CASAVA_Build 2 222678889 1I TACTGCAGGA -/T TTTATGCATC 3070 hom 141 het 52 0 44 8 T 3 4 315061 CASAVA_Build 2 222679231 1D GTCATGTTGC T/- TTCAACAGTA 3070 het 3070 ref 66 33 30 3 T 3 2 315062 CASAVA_Build 2 222679627 1D CATTAATTCC T/- TTTTTTTTTT 1011 het 799 hom 20 4 5 11 T 19 18 315063 CASAVA_Build 2 222682108 1I GAAAAGTAGG -/T TTATATTGTA 3070 hom 99 het 43 0 33 10 T 2 3 315064 CASAVA_Build 2 222685770 1D TGGACACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 23 22 5 T 11 10 315065 CASAVA_Build 2 222687746 1I TTCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 21 1 15 5 T 11 12 315066 CASAVA_Build 2 222691655 2D TAGAACAAAC TT/-- AGTTCTTGGA 3070 het 3070 hom 44 14 26 5 T 2 0 315067 CASAVA_Build 2 222695344 1I GAATGTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1032 hom 36 3 22 11 T 10 11 315068 CASAVA_Build 2 222700482 2I TAAGTGTAAA --/GG GGAGATTTTG 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 G 2 4 315069 CASAVA_Build 2 222702374 1I AAGTGTCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1355 hom 63 5 45 13 A 11 12 315070 CASAVA_Build 2 222705842 1I CAACCCAGTA -/T TGCACATAAT 3070 het 3070 hom 33 8 19 6 T 1 2 315071 CASAVA_Build 2 222708353 1D AGGTGCATAT A/- AATGGTGCTT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 A 3 2 315072 CASAVA_Build 2 222712736 4I TTGTACTTTT ----/AAAG AAATAACCTC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 AAAG 0 1 315073 CASAVA_Build 2 222719482 1I AAAGCTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 41 1 34 6 T 10 11 315074 CASAVA_Build 2 222739599 1I AGAAACATAT -/A AAAATAAACC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 4 5 315075 CASAVA_Build 2 222743456 1D GAGCTTGTGC A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 A 8 7 315076 CASAVA_Build 2 222758533 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2223 het 39 hom 13 1 7 5 A 14 12 315077 CASAVA_Build 2 222760600 1I CACAATTTCA -/T TTTTTTAGAG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 6 7 315078 CASAVA_Build 2 222761118 4D TTAATGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 66 het 30 0 23 9 TTTG 4 3 315079 CASAVA_Build 2 222762486 1D GGTCATGCAC A/- AAAAGAAGGC 3070 hom 129 het 47 0 42 6 A 5 4 315080 CASAVA_Build 2 222764404 1I TTCCTTGAAA -/T TTTAAGGTGT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 3 4 315081 CASAVA_Build 2 222767790 3D81M1I CCTTTACACA ATCATCAAGAGACCCACTAGCGTGCTTGCAAAGGGGAAAAGTGCCCCAAAGAAGAATTTAAACTTGGAGCTCAAAATAGAAGAG-/---ATCAAGAGACCCACTAGCGTGCTTGCAAAGGGGAAAAGTGCCCCAAAGAAGAATTTAAACTTGGAGCTCAAAATAGAAGAGA AAAAAAACCG 3070 het 370 hom 37 3 34 33 N/A 0 0 315082 CASAVA_Build 2 222770455 6D GTCCTGTGTA TTAATT/------ TTAACTCTTA 3070 hom 147 het 52 0 49 5 TTAATT 1 0 315083 CASAVA_Build 2 222781265 1D ATAGCAAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 9 315084 CASAVA_Build 2 222787861 1I AAAACAAAAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 103 het 41 0 35 6 T 9 10 315085 CASAVA_Build 2 222790592 4I AGTTATTCTC ----/AGTT AGCATAACAC 3070 hom 110 het 41 0 37 4 AGTT 0 1 315086 CASAVA_Build 2 222804091 1D CTGTAAAATT C/- TGTAATAGGA 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 C 1 0 315087 CASAVA_Build 2 222812293 3I TTGGGGTGGG ---/TTT TTTTTTTTTC 1486 het 1486 ref 30 15 6 9 T 9 12 315088 CASAVA_Build 2 222818954 2D AAAAAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 2487 het 2487 ref 21 9 7 6 AG 7 6 315089 CASAVA_Build 2 222820336 4I AAAATTAGAA ----/ATAG ATAGTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 ATAG 1 2 315090 CASAVA_Build 2 222820874 5D ATCTTTATAA CTACT/----- CTGTGAGTTG 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 CTACT 1 0 315091 CASAVA_Build 2 222826460 1D GAAATAACAG T/- AAAACAAGTT 3070 het 3070 hom 50 19 29 2 T 1 0 315092 CASAVA_Build 2 222826552 1I GTTTCCCAAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 7 8 315093 CASAVA_Build 2 222827065 1I AAATGACAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 9 10 315094 CASAVA_Build 2 222827352 4I59M2I TGCTTCCTCT ----TGCAATAAGCGTTGTCCAGTGCATCACACATATAAGGTTACCCTAAGGGTCTGAAATTC--/TGCATGCAATAAGCGTTGTCCAGTGCATCGCACATATAAGGTTACCCTAAGGGTCTGAAATTCAG AGTTTCTTAG 3070 het 3070 ref 40 28 23 5 N/A 0 0 315095 CASAVA_Build 2 222830170 1D TGGCTCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 26 2 10 14 T 12 11 315096 CASAVA_Build 2 222831255 1D TATTTACCTC A/- TAGCATTTCT 3070 het 3070 hom 34 11 19 6 A 1 0 315097 CASAVA_Build 2 222831394 1D GGGTAATTTG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 8 7 315098 CASAVA_Build 2 222831896 2I TGCGGTTGAC --/TG TGTGGCACTG 3070 het 3070 hom 50 18 27 5 TG 2 3 315099 CASAVA_Build 2 222833218 1I ACTACATGTG -/A AAAAAAAAAC 2962 het 2962 ref 24 13 8 3 A 9 10 315100 CASAVA_Build 2 222834565 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2267 hom 28 11 15 2 A 14 13 315101 CASAVA_Build 2 222835566 1D TCTCAGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 11 10 315102 CASAVA_Build 2 222835951 1I AAATTAACTG -/A AAAATGGGTC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 4 5 315103 CASAVA_Build 2 222848403 1D TGTCTAGAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 A 10 9 315104 CASAVA_Build 2 222866401 1D ATGGGGGAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 2973 hom 33 11 14 8 T 8 7 315105 CASAVA_Build 2 222866897 1D CTGAAAGTGG T/- TAAGAAAGAA 3070 hom 99 het 36 0 33 4 T 2 1 315106 CASAVA_Build 2 222895976 1D ATTTAAACAT C/- TAAAATCCAA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 C 1 0 315107 CASAVA_Build 2 222903714 1I AGCCTCAAAA -/T TTTTTCTTTT 1042 het 1042 ref 42 30 6 6 T 5 6 315108 CASAVA_Build 2 222952707 1D AACATATACA C/- AATGGAGTAC 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 C 1 0 315109 CASAVA_Build 2 222962081 1I CTTGGTTTAG -/C CCCCGTAATA 3070 hom 116 het 41 0 38 3 C 4 5 315110 CASAVA_Build 2 222982639 1I TGAGTTTTTC -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 7 8 315111 CASAVA_Build 2 222993174 8D AATAGAAATT GTCATCTG/-------- GTGCTCCATT 3070 het 3070 ref 39 24 14 5 GTCATCTG 1 0 315112 CASAVA_Build 2 223003054 1I TGCAAAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 51 17 29 5 A 8 9 315113 CASAVA_Build 2 223004153 1D AACTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 13 12 315114 CASAVA_Build 2 223006049 3D GGGGAGACGA GAG/--- GAGGGAAGGG 3070 het 1350 hom 23 4 10 9 GAG 2 1 315115 CASAVA_Build 2 223006655 1I AGCTTGATGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 7 8 315116 CASAVA_Build 2 223019292 4I ATCAAACACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 AAAC 2 3 315117 CASAVA_Build 2 223024994 1I ATAGATTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 9 10 315118 CASAVA_Build 2 223026082 7I GGACTATCCT -------/AAATATG CAGATCCATG 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 AAATATG 0 1 315119 CASAVA_Build 2 223028181 1I CAATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1723 het 1723 ref 27 13 5 9 A 13 14 315120 CASAVA_Build 2 223031178 1I TGCCTAGCTA -/T TTTTTTTTTT 2045 het 1716 hom 24 11 8 5 T 13 14 315121 CASAVA_Build 2 223033772 2I TCTGCTGGAA --/TG TGTCCCTCTT 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 TG 1 2 315122 CASAVA_Build 2 223038387 1D TGATTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 19 0 8 11 A 12 11 315123 CASAVA_Build 2 223048380 1D AGAAGAAAGG A/- ACCTTTCTAA 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 2 1 315124 CASAVA_Build 2 223051764 1D TTTATGGTTG T/- TATCAAGTGC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 2 1 315125 CASAVA_Build 2 223052784 1I TTTTTCACAC -/A ACAAAAATTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 1 2 315126 CASAVA_Build 2 223074290 1I ATCTTACTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 9 10 315127 CASAVA_Build 2 223087595 4D TGTAAAAGAG AGTT/---- AGGCTCTCAA 3070 hom 126 het 44 0 43 4 AGTT 1 0 315128 CASAVA_Build 2 223095277 1D ATGTCCTAGT A/- AATGATTCTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 2 315129 CASAVA_Build 2 223106755 2I TTCATTTATT --/TA TTTTTTTTTT 1830 het 472 hom 33 3 10 20 TA 0 1 315130 CASAVA_Build 2 223107416 1D TATTCATTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 132 het 56 0 45 12 T 9 8 315131 CASAVA_Build 2 223109921 1I AAATCATAAG -/A AAAAATGTCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 6 315132 CASAVA_Build 2 223122563 14D TTGTTTCCTG TAATGAGAATATAA/-------------- TAAAGCTCAA 3070 hom 51 het 19 0 18 3 TAATGAGAATATAA 1 0 315133 CASAVA_Build 2 223134498 2D TATATCATTT TA/-- TATATATATA 1295 het 1295 ref 12 5 3 5 TA 8 7 315134 CASAVA_Build 2 223134801 5I CATCGGGGTG -----/AAAAA AAAAAGGCAT 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 5 10 315135 CASAVA_Build 2 223139537 4I ATCTTCAGGA ----/TACT TACTTCAGTG 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 TACT 1 2 315136 CASAVA_Build 2 223144429 8I CAGTTATCTC --------/GAACTCAT GAACTCATGC 3070 het 3070 hom 52 21 24 7 GAACTCAT 1 2 315137 CASAVA_Build 2 223153458 1D ACAACATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 16 10 A 13 12 315138 CASAVA_Build 2 223171905 2D TCATTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2064 hom 29 8 13 8 A 13 11 315139 CASAVA_Build 2 223174025 1I ATGAAGTATC -/T TAAGTCATGA 3070 het 3070 ref 50 29 16 5 T 1 2 315140 CASAVA_Build 2 223176643 10D ATTAATATTA TATTATATAT/---------- TATTATATAT 1334 het 620 hom 5 2 3 2 TATTATATAT 2 1 315141 CASAVA_Build 2 223178718 1I CCATCTCTAC -/A AATAAATTAT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 A 2 3 315142 CASAVA_Build 2 223183457 1D ATTCTAAAAA T/- AAAAAATAGA 2030 het 2030 ref 19 13 5 3 T 1 0 315143 CASAVA_Build 2 223197494 1D TTTTTTAATG T/- TTACATTGTG 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 T 3 2 315144 CASAVA_Build 2 223214967 1D ATCCTCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 548 hom 24 2 17 5 T 15 14 315145 CASAVA_Build 2 223217948 1D ATTCCTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 A 13 12 315146 CASAVA_Build 2 223218579 1D AAAGTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 13 12 315147 CASAVA_Build 2 223232438 1I AGCCTGTAGT -/A AAAAGCAGAG 3070 hom 152 het 59 0 51 8 A 4 5 315148 CASAVA_Build 2 223234831 1I AAATACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 98 het 40 0 33 7 A 8 9 315149 CASAVA_Build 2 223249114 1D ACTGATCTCC T/- TTTTTTTTTT 1123 het 1123 ref 28 14 5 9 T 15 14 315150 CASAVA_Build 2 223271075 1I GCAGATGGGG -/T TTTTAGTGAG 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 T 4 5 315151 CASAVA_Build 2 223276794 1D AAAACAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 11 10 315152 CASAVA_Build 2 223276881 1I GCTGTGTATA -/C CCACAAGCCC 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 C 2 3 315153 CASAVA_Build 2 223292013 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2831 het 2647 hom 25 7 8 10 A 14 13 315154 CASAVA_Build 2 223303601 3D TCAGCTGCAA AAC/--- AACCTCAAAT 3070 het 3070 ref 43 21 16 8 AAC 2 1 315155 CASAVA_Build 2 223305793 4I GAAATGAGAC ----/TTGT TTTTCTTTTT 3070 het 2963 hom 27 6 16 5 TTGT 0 1 315156 CASAVA_Build 2 223318845 1D ACCGCCCCCC T/- CCCCACACAC 2376 het 2376 ref 32 12 10 10 T 1 0 315157 CASAVA_Build 2 223323849 1I TTCTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 2026 het 2026 ref 22 12 7 3 T 11 12 315158 CASAVA_Build 2 223339932 2I CTGTCTCTAC --/AA TAAAAATACA 3070 het 2893 hom 18 6 10 2 A 0 2 315159 CASAVA_Build 2 223342486 1D AAGCTAATGA G/- ACATTCGAGG 3070 het 3070 ref 35 15 9 11 G 1 0 315160 CASAVA_Build 2 223350774 17D3M3D4M7D3M18D GATTTTTCTG GGTGGGCATGGTGGTTCACACCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGTGGG/-----------------ACA---GAAA-------AAT------------------ CGGATCATTT 2218 het 2218 ref 21 15 6 3 N/A 0 0 315161 CASAVA_Build 2 223352706 1I GCTTTTCTTG -/A AAATCCTCCT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 A 3 4 315162 CASAVA_Build 2 223357299 1I AAAAAACAAA -/C AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 26 18 5 C 0 1 315163 CASAVA_Build 2 223358825 8D TACATGTGTG TGTGTGTA/-------- TGTGTGTATG 1654 het 1654 ref 27 17 6 6 TGTGTGTA 2 1 315164 CASAVA_Build 2 223364803 1D TTTTCCCACT A/- AAAAAAGTGC 3070 het 3070 ref 32 16 11 6 A 7 6 315165 CASAVA_Build 2 223374141 2I GCCTCAGCCT --/CC CCCGAGTAGC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 3 5 315166 CASAVA_Build 2 223378214 1I TGAAACTAAG -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 39 17 18 4 T 7 8 315167 CASAVA_Build 2 223385087 26D AGAGAAAGAA AGAAAGGAAGGAAGGAAGAAAAAGAG/-------------------------- AGAAAGGAAG 2425 het 2425 ref 18 16 6 5 AGAAAGGAAGGAAGGAAGAAAAAGAG 1 0 315168 CASAVA_Build 2 223391140 1I AACACTCTTA -/T TTTCCAAGTC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 3 4 315169 CASAVA_Build 2 223393944 1I AAGAATGTTT -/A AAAATTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 4 5 315170 CASAVA_Build 2 223422836 1D AGAAAAATGT A/- AAAAAAAAAA 1717 het 1678 hom 22 10 5 7 A 17 16 315171 CASAVA_Build 2 223435486 1I TGCTGATGAG -/T TTGCTCCTGA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 3 315172 CASAVA_Build 2 223435677 1I TGTATAAAAA -/G TATTGGTTTT 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 0 1 315173 CASAVA_Build 2 223440943 1D CTTTCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 2711 het 2237 hom 24 6 10 8 T 13 12 315174 CASAVA_Build 2 223444212 1I GGGAAAGGTG -/A AAAGCAGAGT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 3 4 315175 CASAVA_Build 2 223446848 1I AGTGGAATTG -/T TTTGGTCAAA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 T 3 4 315176 CASAVA_Build 2 223450968 4D GAGAGTAAGT TTAA/---- TTTATTCTTC 3070 het 3070 ref 43 25 16 3 TTAA 1 0 315177 CASAVA_Build 2 223456672 4I TCTTTTTTTC ----/TTTT TATTTCTGGA 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 1 5 315178 CASAVA_Build 2 223459126 3D CCTTTCAACC CAT/--- CATCATCTAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 5 CAT 3 2 315179 CASAVA_Build 2 223465443 2D TCCATTATAA CT/-- CTGAGAGATT 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 CT 2 1 315180 CASAVA_Build 2 223473194 3D GACGCCCTTG AAT/--- ACTTGCTCTG 3070 het 3070 hom 37 15 16 8 AAT 1 0 315181 CASAVA_Build 2 223474464 3I TCCAAGTTTG ---/TTC TTCTTTTTCA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 TTC 1 2 315182 CASAVA_Build 2 223478829 1I CCTTTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 9 8 10 T 13 14 315183 CASAVA_Build 2 223491542 1I AGTAAAAAGA -/G GTTTCTTTGG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 1 2 315184 CASAVA_Build 2 223496752 8I TAAATAATCA --------/GTAGTTTC GTAGTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 GTAGTTTC 1 2 315185 CASAVA_Build 2 223502267 1D GATTTTTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 30 hom 31 1 19 11 T 9 8 315186 CASAVA_Build 2 223504096 5D ACCCTTGCCT TGCCC/----- TGCCCAGGAG 3070 het 3070 hom 33 11 19 6 TGCCC 2 1 315187 CASAVA_Build 2 223509571 1I TCTGCACCCT -/C CCCCCCCCAC 951 het 951 ref 14 5 5 4 C 8 9 315188 CASAVA_Build 2 223510163 3D TTAAATGGTA TTG/--- TTTTCTTAAT 3070 het 3070 ref 33 18 14 3 TTG 1 0 315189 CASAVA_Build 2 223515875 4I TGTGATACAT ----/AGTA AGTCTCTTCA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 AGTA 0 1 315190 CASAVA_Build 2 223516065 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAAAAA 516 het 516 ref 32 13 4 15 AAAC 1 2 315191 CASAVA_Build 2 223516214 3I TTTTCTTGTA ---/TTC TTGTATATTT 3070 het 3070 hom 45 22 22 1 TTC 0 1 315192 CASAVA_Build 2 223518856 3I GGGTTTTTTG ---/TTA TTCTATAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 TTA 0 1 315193 CASAVA_Build 2 223521422 1I TGTATGTGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 T 8 9 315194 CASAVA_Build 2 223524905 4I GTTTCCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AAAC 2 3 315195 CASAVA_Build 2 223529001 2D TATTCAGAAT AG/-- AGTCACTTAA 3070 hom 42 het 20 0 16 4 AG 2 1 315196 CASAVA_Build 2 223533866 1D TAGTACTTCA T/- TTTTTTTGGC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 8 7 315197 CASAVA_Build 2 223539411 1D CTGTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 31 0 26 5 A 11 10 315198 CASAVA_Build 2 223546982 1D GTTAAATGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 17 9 6 T 10 9 315199 CASAVA_Build 2 223551363 1I TCCATCCTTC -/T TTTATCTATG 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 3 4 315200 CASAVA_Build 2 223553911 2D AATATACAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TA 6 5 315201 CASAVA_Build 2 223556844 1D CTCATTGCAA C/- CTCTGCCTCC 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 C 2 1 315202 CASAVA_Build 2 223557550 2D ATATATATGT AC/-- ACACACACGC 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 AC 5 4 315203 CASAVA_Build 2 223560793 1D TTCTGATTTA G/- GTCCGTTTGG 3070 hom 111 het 48 0 38 10 G 2 1 315204 CASAVA_Build 2 223574698 1I TTGGGATTTG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 8 9 315205 CASAVA_Build 2 223592294 1I CAAGATGAGA -/T TTGGTTGGGG 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 T 2 3 315206 CASAVA_Build 2 223594823 1D TATGGAGAGA G/- GGGACATTTG 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 G 4 3 315207 CASAVA_Build 2 223618791 7D GGAACTCTTT TTTTTTA/------- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 TTTTTTA 3 2 315208 CASAVA_Build 2 223628122 1I ACCCGGCCAC -/T TTTTTTTTTT 2434 het 4 hom 19 1 9 9 T 13 14 315209 CASAVA_Build 2 223635508 2D GAGTCACTTA AT/-- ATATATATCC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AT 5 4 315210 CASAVA_Build 2 223655219 1I CCTCTAGTCA -/T TTTTTTTTTT 1530 het 206 hom 38 3 6 29 T 10 11 315211 CASAVA_Build 2 223655710 23I CCACTGGACA -----------------------/TTCACGAGTGGATATCACAGGTG AATAATGATC 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TTCACGAGTGGATATCACAGGTG 0 1 315212 CASAVA_Build 2 223656230 1D AGTAACTGGG A/- ATACAGGCAT 3070 hom 42 het 18 0 15 7 A 2 1 315213 CASAVA_Build 2 223676240 1D TCTCCAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 47 1 42 4 T 11 10 315214 CASAVA_Build 2 223678360 7I AGGATTAAAA -------/AATATTG AATATTGATT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AATATTG 1 2 315215 CASAVA_Build 2 223679506 1I TCCTCACCAA -/C CCTTACCCTC 3070 hom 135 het 51 0 44 7 C 2 3 315216 CASAVA_Build 2 223680435 3D ACCTGAGGTC AGG/--- AGTTCAAGAC 3070 hom 30 het 11 0 10 1 AGG 1 0 315217 CASAVA_Build 2 223683640 14I CAGCTAGTTT --------------/TTTTTTTGTTGTTG TTTTTTTGTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 TTTTTTTGTTGTTG 0 1 315218 CASAVA_Build 2 223683994 1D AGAGCAAGCA G/- CATAAACATT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 G 1 0 315219 CASAVA_Build 2 223690080 3D ATATGATATT AAG/--- AATCATTTAA 3070 hom 102 het 38 0 34 6 AAG 1 0 315220 CASAVA_Build 2 223691944 2D TACTTTTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 39 1 31 8 A 13 11 315221 CASAVA_Build 2 223694931 4I TATATAAAAT ----/GTTA GTGAGAGTCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GTTA 0 1 315222 CASAVA_Build 2 223697411 1I GGGGGAGGGA -/G GGGGGGGATT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 G 7 8 315223 CASAVA_Build 2 223698628 6D CCACTGCAGC AAGCTG/------ CCTCTAAATT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 AAGCTG 1 0 315224 CASAVA_Build 2 223699287 1D ACAGAGAACG A/- ATTGGGCAGA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 2 1 315225 CASAVA_Build 2 223700725 1D GAGAGTGCCT C/- CCACTGGTGA 3070 hom 72 het 27 0 21 7 C 3 2 315226 CASAVA_Build 2 223701472 2D ATTCTTCCTT AA/-- TTCTTCTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 0 315227 CASAVA_Build 2 223706402 3D TCAATCAATA GTT/--- GTTGTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 6 GTT 3 2 315228 CASAVA_Build 2 223708776 2D ACAGAATGAA AT/-- AACAATTTAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AT 1 0 315229 CASAVA_Build 2 223710982 1D ACCTCTGCCT C/- CCAGGTTCAA 3070 hom 72 het 26 0 25 8 C 3 2 315230 CASAVA_Build 2 223712594 1D AAATACTATG T/- GGGAATTTGG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 1 0 315231 CASAVA_Build 2 223717797 1D AAGTATTCAG A/- AAAAAAAAAA 1423 het 189 hom 27 5 10 12 A 12 11 315232 CASAVA_Build 2 223721062 1D ATTTGATGTG A/- AAATTGTTGC 3070 het 3070 hom 51 19 28 4 A 4 3 315233 CASAVA_Build 2 223721333 1D CGGCGGGGGA G/- GGGGGGAGTT 3070 het 2243 hom 23 9 11 4 G 7 6 315234 CASAVA_Build 2 223722711 1D TGTTCAGTAC A/- GCATTTAATT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 1 0 315235 CASAVA_Build 2 223722902 1I GAAATCATGT -/C CTTTGCAGCA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 C 1 2 315236 CASAVA_Build 2 223723220 1D AGTTAAATTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 32 0 24 10 A 9 8 315237 CASAVA_Build 2 223723916 7D GTGGAATCCC TTTTCAG/------- TTTAGAGTTG 3070 hom 108 het 40 0 37 6 TTTTCAG 1 0 315238 CASAVA_Build 2 223726246 1D TAAAGCCATT G/- AGTCTGCCTA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 G 1 0 315239 CASAVA_Build 2 223727744 1D AGTCCTTATA T/- TTTTTGTGTC 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 6 5 315240 CASAVA_Build 2 223728085 1I TGTTTTTTTT -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 A 6 7 315241 CASAVA_Build 2 223728300 1D TTAGAAAACC A/- AAAAAAACTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 8 7 315242 CASAVA_Build 2 223736397 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1219 hom 20 4 10 6 A 11 12 315243 CASAVA_Build 2 223737707 1D GGACAAAAAG A/- AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 32 15 16 1 A 7 6 315244 CASAVA_Build 2 223739501 39D AGCTAGGCCC TTGCAAACAGGCCTTCTGTGGTTTTAAATTCACTTCTCA/--------------------------------------- TTGCAAACAG 1779 het 1779 ref 37 11 5 26 TTGCAAACAGGCCTTCTGTGGTTTTAAATTCACTTCTCA 2 1 315245 CASAVA_Build 2 223742758 1I TAAAAAAATT -/A TAAAAAAAAT 2371 het 1521 hom 13 4 7 2 A 0 1 315246 CASAVA_Build 2 223786014 2D CATTTGCATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TG 6 5 315247 CASAVA_Build 2 223786751 3D ATATAATATG TAA/--- TAATATATAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TAA 2 1 315248 CASAVA_Build 2 223795714 1I TACCAATAAG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 70 het 28 0 24 4 A 8 9 315249 CASAVA_Build 2 223798223 3D GATGTAGAAA GAT/--- GATGAGCTCC 3070 hom 97 het 36 0 32 6 GAT 2 1 315250 CASAVA_Build 2 223799489 3I AGATAGTGAT ---/AAC AACAAGATCA 3070 hom 144 het 56 0 48 8 AAC 1 2 315251 CASAVA_Build 2 223804315 2I GCTGCCAAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 12 315252 CASAVA_Build 2 223841755 1D TATCCCCTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 43 hom 44 1 39 4 T 10 9 315253 CASAVA_Build 2 223864896 1I GTTGAATATT -/G GCCCCCACTC 3070 hom 18 het 9 0 7 2 G 1 2 315254 CASAVA_Build 2 223884802 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2421 hom 21 6 13 2 T 9 10 315255 CASAVA_Build 2 223891333 2D GTTTTGGGGT GG/-- GGGGGGGGCA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 G 10 8 315256 CASAVA_Build 2 223891816 3D GCTTTTATCC CCT/--- GTCTCCATCC 3070 het 3070 ref 39 16 13 11 CCT 1 0 315257 CASAVA_Build 2 223898088 1I TTCTATTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 8 9 315258 CASAVA_Build 2 223904999 1I CTGAAAGTGA -/G GGGGGAGAAT 3070 het 3070 ref 18 11 7 0 G 5 6 315259 CASAVA_Build 2 223908115 5D TGGAAAAAAC TACTT/----- TAAAGTTCAT 3070 het 1483 hom 11 3 8 0 TACTT 1 0 315260 CASAVA_Build 2 223910452 3D CCAGTTACTT ATG/--- ATGTCACACA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 ATG 2 1 315261 CASAVA_Build 2 223926657 1D TTATAATATA T/- TTTTTCTTTG 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 6 5 315262 CASAVA_Build 2 223936009 3I CAGTTTATGG ---/TGC TCTTTTATAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TGC 0 1 315263 CASAVA_Build 2 223936154 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 T 11 12 315264 CASAVA_Build 2 223940498 2I TGCCAGAAAC --/TT TTGTGTGAAT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 2 4 315265 CASAVA_Build 2 223942102 4I CTATGAAAAT ----/AAAC AATGAAATAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 AAAC 0 1 315266 CASAVA_Build 2 223958306 4D TCAGGTCAAC AAGT/---- AAGTATTCCA 3070 het 3070 hom 52 20 26 7 AAGT 2 1 315267 CASAVA_Build 2 223959997 4I ATAGATAGAT ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 2412 hom 37 10 17 10 AG 5 7 315268 CASAVA_Build 2 223965618 1D GTATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 21 0 15 6 T 15 14 315269 CASAVA_Build 2 223969710 1I TCTAGAAGTG -/T TTTTGTTCAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 4 5 315270 CASAVA_Build 2 223977673 1D ATGAAAGTAG C/- TTTTCCCCTA 3070 het 3070 ref 50 32 14 5 C 1 0 315271 CASAVA_Build 2 223982652 3D TTAGCATGTG TTA/--- TTAAACATTT 3070 hom 111 het 44 0 37 9 TTA 2 1 315272 CASAVA_Build 2 223983262 2D CCTTATAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2475 hom 25 9 14 2 AT 6 5 315273 CASAVA_Build 2 224001566 1I ATCTTTTGTA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 T 7 8 315274 CASAVA_Build 2 224005813 4D AAAATATGTG TATA/---- TATATATATA 2496 het 1093 hom 16 3 8 6 TA 11 9 315275 CASAVA_Build 2 224011101 5D TATTTTTACC TTTAT/----- TTTATTTTAT 3022 het 3022 ref 26 11 10 8 TTTAT 4 3 315276 CASAVA_Build 2 224019666 1I GTCTCATGAG -/A TCTGATGGTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 0 1 315277 CASAVA_Build 2 224028120 1I GTAAAAACGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 12 13 315278 CASAVA_Build 2 224031232 1D CAGAATATGA T/- TCCTTATATG 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 T 2 1 315279 CASAVA_Build 2 224044872 1I AATGCCCTGG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 107 het 42 0 36 6 T 8 9 315280 CASAVA_Build 2 224051343 16I CTTTTGTAGC ----------------/AGACAGATATTTGAGA AGACAGATAT 3070 hom 102 het 45 0 34 12 AGACAGATATTTGAGA 1 2 315281 CASAVA_Build 2 224053026 1I TAGCACCCAA -/G GGGGTAGTGC 3070 hom 114 het 49 0 39 10 G 4 5 315282 CASAVA_Build 2 224061303 3D GTTTTGCTTC TTT/--- AACTCAACCT 3070 het 3070 hom 34 15 17 4 T 3 0 315283 CASAVA_Build 2 224064009 1I TTTTTTCCTC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 8 315284 CASAVA_Build 2 224068451 1I CAAAGTACTG -/A AATAGTGAGG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 2 3 315285 CASAVA_Build 2 224070191 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1418 het 1418 ref 22 6 3 13 T 10 11 315286 CASAVA_Build 2 224070223 1D AGACACGAGG T/- TTCACCATGT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 3 2 315287 CASAVA_Build 2 224075949 1I AAAATTTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 11 12 315288 CASAVA_Build 2 224076402 1I AGGAACAATC -/T AGGTATCATT 3070 hom 108 het 38 0 35 3 T 0 1 315289 CASAVA_Build 2 224079463 1D TCAAAAGAGG T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 T 8 7 315290 CASAVA_Build 2 224080971 1D TAATGCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 30 0 21 10 A 12 11 315291 CASAVA_Build 2 224082693 8I CATATGCATG --------/GATATCCA TTTTTGTATG 3070 hom 123 het 46 0 40 6 GATATCCA 0 1 315292 CASAVA_Build 2 224092858 1I CATTTACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2964 hom 23 7 10 6 A 11 12 315293 CASAVA_Build 2 224113281 4D AAAGAAAAGA GAAG/---- GAAGGAAGGA 2566 het 2566 ref 31 15 9 9 GAAG 4 3 315294 CASAVA_Build 2 224118577 3I GAGTAATGAA ---/ATC ATCATTCTAC 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 ATC 1 2 315295 CASAVA_Build 2 224119186 1I GTAAAAACAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 A 8 9 315296 CASAVA_Build 2 224180823 1I TTAATAACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 11 12 315297 CASAVA_Build 2 224186644 1I CCTTCAGATT -/C CCTTTGGGGT 3070 hom 108 het 37 0 36 1 C 2 3 315298 CASAVA_Build 2 224212772 1D CAACCCCCCC A/- AAAAAAACTC 3070 hom 108 het 42 0 36 7 A 8 7 315299 CASAVA_Build 2 224247477 5I CCATTGAGTT -----/TTTTA TTTTAACATC 3070 het 3070 hom 25 10 15 0 TTTTA 1 2 315300 CASAVA_Build 2 224247602 1I TTATATATAC -/T TTATGGCCCC 3070 het 149 hom 25 1 20 4 T 2 3 315301 CASAVA_Build 2 224251185 1I AGGGCGTGGT -/G GCTCAGGCCT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 G 1 2 315302 CASAVA_Build 2 224254111 2I AAGTTTGATA --/AG AGTCTGGTGT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 AG 1 2 315303 CASAVA_Build 2 224259461 3I TAAAATATAC ---/AGA AGAAGTGAAT 2125 het 1839 hom 12 4 5 3 AGA 1 2 315304 CASAVA_Build 2 224286394 10I6M1D CTGAAAAAAA ----------AAAATGT/AAATGTGAATAAAATG- AAATAAAATT 3070 hom 24 het 15 0 9 6 N/A 0 0 315305 CASAVA_Build 2 224294089 3I TTCCTGGCTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TTG 5 6 315306 CASAVA_Build 2 224295001 1I TTCCTTGAAT -/A AATAAAACTA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 2 3 315307 CASAVA_Build 2 224301180 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1830 het 584 hom 13 3 6 4 A 15 16 315308 CASAVA_Build 2 224309762 2D TCATTCTCTC TT/-- GTCTGCCACC 3070 het 2533 hom 27 7 12 8 T 2 0 315309 CASAVA_Build 2 224324647 1D TCTACAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 32 0 23 9 T 12 11 315310 CASAVA_Build 2 224328255 1D AATCTGACTT A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 87 het 30 0 30 1 A 8 7 315311 CASAVA_Build 2 224331105 1D TCCCAATTCT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 7 315312 CASAVA_Build 2 224342575 7I ATATGTTTCA -------/AGCGTTT GCTATGTAGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AGCGTTT 0 1 315313 CASAVA_Build 2 224346697 3D GAATAACAAC AAG/--- AACAAAAAAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 AAG 1 0 315314 CASAVA_Build 2 224347976 25I GGAGGCGCTT -------------------------/TCAGAAATAACAGGACAAGAGTCAG CAGAAATCAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 TCAGAAATAACAGGACAAGAGTCAG 0 1 315315 CASAVA_Build 2 224353713 1D ATAGTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 33 1 25 7 T 12 11 315316 CASAVA_Build 2 224357026 2D ACCCGATCAG CA/-- CCCATCCACT 3070 hom 57 het 22 0 20 4 CA 1 0 315317 CASAVA_Build 2 224360711 2I TGCATATGCA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 65 31 16 18 AC 8 9 315318 CASAVA_Build 2 224391522 1I GCAAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 10 11 315319 CASAVA_Build 2 224441262 1I TGGCTTCCCA -/T TAGACAGCCA 3070 hom 117 het 43 0 36 7 T 1 2 315320 CASAVA_Build 2 224442667 1D GCTGTGAAGG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 7 315321 CASAVA_Build 2 224442783 2D TGATGGTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2032 het 192 hom 24 5 6 13 T 18 16 315322 CASAVA_Build 2 224453727 2I AAATAACTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 12 14 315323 CASAVA_Build 2 224455691 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 10 9 315324 CASAVA_Build 2 224456580 2I GGAGTATCTC --/TG TGAGTAAAAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TG 1 2 315325 CASAVA_Build 2 224457823 4I TTTTCTTCTT ----/CTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 26 6 CTTC 0 1 315326 CASAVA_Build 2 224461051 1D AAATTTACAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 10 9 315327 CASAVA_Build 2 224465540 1D GTCACCATTT A/- AAAAAAAAAT 1416 het 1416 ref 46 35 4 7 A 10 9 315328 CASAVA_Build 2 224469305 1I TACACAAGAT -/A AAAAAATCTA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 6 7 315329 CASAVA_Build 2 224474000 1D TTTCCATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 42 1 33 8 A 11 10 315330 CASAVA_Build 2 224476496 2D AAAACAAAAC AA/-- AACAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 4 2 315331 CASAVA_Build 2 224476588 4I GATGAAAAAT ----/ACAC ACACACACAC 1537 het 1075 hom 28 7 11 10 AC 7 9 315332 CASAVA_Build 2 224477389 1I ATTTTTGTTA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 5 6 315333 CASAVA_Build 2 224481020 1D AGGTCTCACT A/- ATATTGCCCA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 2 1 315334 CASAVA_Build 2 224484780 1D TGAATTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 34 1 20 15 T 15 14 315335 CASAVA_Build 2 224485350 4I TTCTTCAAAG ----/TGAT TGATTAAGAA 3070 hom 144 het 52 0 48 4 TGAT 1 2 315336 CASAVA_Build 2 224490367 1I CATTTTCCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 97 het 40 0 33 7 T 9 10 315337 CASAVA_Build 2 224494559 1I ATTTTAAAGA -/T TTTTTTTTTT 1799 het 1799 ref 35 24 4 7 T 13 14 315338 CASAVA_Build 2 224497845 4I TGTAAATTAG ----/AACT AACTATTTGG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AACT 1 2 315339 CASAVA_Build 2 224502822 2I CTCTCTTATC --/AG AAGATGGTGA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 AG 0 1 315340 CASAVA_Build 2 224506101 3D TCATTTTGTA GAG/--- GAGAATTAGA 3070 hom 93 het 36 0 32 7 GAG 2 1 315341 CASAVA_Build 2 224506308 2D AACCTGCAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 29 1 17 11 T 18 16 315342 CASAVA_Build 2 224506760 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 234 hom 23 1 16 6 A 9 8 315343 CASAVA_Build 2 224507043 4D TTTTCTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 16 4 T 23 19 315344 CASAVA_Build 2 224521911 4D ACAGGAGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2768 hom 53 het 26 0 18 8 TTTG 5 4 315345 CASAVA_Build 2 224523785 1D AATTTAACTC A/- CCTTTATACA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 1 0 315346 CASAVA_Build 2 224526049 12D ATGATAGTCT CATAAAGAATAA/------------ CTTATTCGTA 3070 hom 48 het 19 0 16 7 CATAAAGAATAA 1 0 315347 CASAVA_Build 2 224536413 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 11 315348 CASAVA_Build 2 224541729 1D ATTTGAAAAA T/- TAACTAGTTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 315349 CASAVA_Build 2 224541942 4D GTGTCCACTT AATG/---- AATAGTAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AATG 1 0 315350 CASAVA_Build 2 224542041 4D TGTTAATTGA TTAT/---- TTATTAATAT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TTAT 2 1 315351 CASAVA_Build 2 224545117 1D CACCTAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 20 0 18 2 T 15 14 315352 CASAVA_Build 2 224550908 2D AGCTCTTAGA AC/-- AGTGTTTGCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AC 1 0 315353 CASAVA_Build 2 224556698 6D TGTGTGTATA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 30 het 24 0 11 16 TG 14 11 315354 CASAVA_Build 2 224556929 1I CTTATTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1151 hom 33 3 21 9 A 12 13 315355 CASAVA_Build 2 224558262 1D GAATCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 38 1 31 6 T 16 15 315356 CASAVA_Build 2 224565443 7D CACTTCAGCC TGTATGT/------- TATTAAGGGT 3070 hom 96 het 36 0 33 4 TGTATGT 1 0 315357 CASAVA_Build 2 224566094 6I TCTAAAAAAA ------/AATAAG ATAAGATAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AATAAG 0 1 315358 CASAVA_Build 2 224575263 1I TACTCACCTA -/G GTATGCTTGA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 1 2 315359 CASAVA_Build 2 224578028 15D TATATATATT ATATATATATATATA/--------------- TATATATATA 2318 hom 12 het 5 0 5 1 ATATATATATATATA 1 0 315360 CASAVA_Build 2 224590228 1D GAATTACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 12 11 315361 CASAVA_Build 2 224592225 1D AAATATATTG T/- TTTTTATATA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 6 5 315362 CASAVA_Build 2 224595275 1I CCTGGGTGAT -/A AGAGTGAGAC 2592 het 4 hom 17 1 10 6 A 1 2 315363 CASAVA_Build 2 224602343 1D TAAAATCCTT A/- AAAAAATCCT 3070 hom 114 het 48 0 38 11 A 7 6 315364 CASAVA_Build 2 224604222 1D GGCTGTGTGA C/- CCCCCACATA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 6 5 315365 CASAVA_Build 2 224608078 1I GCAATAACAT -/G GGAAGAGAGT 3070 hom 135 het 50 0 45 5 G 2 3 315366 CASAVA_Build 2 224608341 13I26M2D GTTTTTTTTG -------------TTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTGAGACAG/TTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTGAGAC-- AGTCTCACTC 3070 hom 46 het 19 0 15 4 N/A 0 0 315367 CASAVA_Build 2 224608954 1D AACCACTGCC A/- AAAAAAAACG 3070 hom 126 het 51 0 37 15 A 9 8 315368 CASAVA_Build 2 224615097 1I ACTTCTACCT -/G GCTGTTTCTT 3070 hom 123 het 48 0 41 7 G 1 2 315369 CASAVA_Build 2 224650806 2I TATAGGAGAA --/AG AGTTAATTAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 AG 1 2 315370 CASAVA_Build 2 224652631 4D TTCTCATGAT AGTG/---- AGTGAGCTCT 3070 het 3070 ref 41 19 19 8 AGTG 2 1 315371 CASAVA_Build 2 224656570 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 700 het 482 hom 12 5 4 3 A 19 18 315372 CASAVA_Build 2 224665522 1D GAGAAGGGGT G/- GGGGGTGCTT 3070 hom 57 het 24 0 17 7 G 6 5 315373 CASAVA_Build 2 224673381 1I CAGAATTGTA -/G ACTGCTGCTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 0 1 315374 CASAVA_Build 2 224681169 1D GACAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 19 9 A 13 12 315375 CASAVA_Build 2 224688979 2D GGCCTATAAA AC/-- ACAATAACAC 3070 hom 123 het 42 0 42 1 AC 2 1 315376 CASAVA_Build 2 224693621 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAGAAC 3070 hom 38 het 20 0 14 6 A 6 7 315377 CASAVA_Build 2 224696122 1I TTTTGGTGGA -/T TTTTTTAAGC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 6 7 315378 CASAVA_Build 2 224702765 3I CCTGGAAGAA ---/CTT CTTTTTTCTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 CTT 1 2 315379 CASAVA_Build 2 224703374 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 ATA 6 5 315380 CASAVA_Build 2 224705079 3D AGAGAAGGTG CAA/--- CATCAGAATC 3070 hom 112 het 42 0 37 7 CAA 1 0 315381 CASAVA_Build 2 224707512 4D CTTTGCAAAC TATA/---- TATAGAGTGT 3070 hom 90 het 33 0 30 5 TA 4 2 315382 CASAVA_Build 2 224707775 1I TTGAACTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 28 1 25 2 A 11 12 315383 CASAVA_Build 2 224712908 4I CTGGCTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 42 het 22 0 15 7 TTTG 3 4 315384 CASAVA_Build 2 224713580 1I CTTGACTGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 368 hom 45 1 36 8 T 9 10 315385 CASAVA_Build 2 224714904 1I ATACGCAGAG -/C CTCTTTTGAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 2 315386 CASAVA_Build 2 224723578 3I TATATTACTC ---/CTT CTTCCTGTTC 3070 hom 135 het 48 0 45 3 CTT 1 2 315387 CASAVA_Build 2 224727344 1I TTGTTGAGGG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 125 het 48 0 42 6 T 7 8 315388 CASAVA_Build 2 224798248 4D CACAATACAT AGTC/---- AATAAAATCA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AGTC 1 0 315389 CASAVA_Build 2 224806167 1I AAAAAGACAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 8 9 315390 CASAVA_Build 2 224806634 1I CCAGCTTTTG -/C CCATTCCCCC 3070 het 113 hom 37 1 35 1 C 2 3 315391 CASAVA_Build 2 224819559 1D TAAGCTCTCT C/- CCCTGCCCTG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 C 4 3 315392 CASAVA_Build 2 224822733 1D TGTTTTTCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 T 9 8 315393 CASAVA_Build 2 224838262 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 6 T 11 12 315394 CASAVA_Build 2 224838982 1I ATGTCAATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 34 1 27 6 A 11 12 315395 CASAVA_Build 2 224843767 5D TAATCGCTTG TTAAC/----- TTAACACTAT 3070 het 3070 ref 36 17 16 5 TTAAC 2 1 315396 CASAVA_Build 2 224848953 1D AGGATCTGCA G/- GTTTGCTCCA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 G 2 1 315397 CASAVA_Build 2 224861133 2I GTGGCTTGGG --/TC TCCCAGATGA 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 TC 1 2 315398 CASAVA_Build 2 224862670 1I TTTAGATGTG -/T TTTTTTTTTT 2359 het 2359 ref 26 13 9 4 T 10 11 315399 CASAVA_Build 2 224867415 4I TAGAGAGATT ----/AATA AAGAAAACCC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AATA 0 1 315400 CASAVA_Build 2 224869563 1I AGAGACAGAG -/A AGAGTATAGC 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 1 2 315401 CASAVA_Build 2 224876114 1I CTTCCGAGCC -/A CGTGTCCTGC 3070 het 3070 hom 56 24 28 4 A 0 1 315402 CASAVA_Build 2 224884869 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 9 8 4 A 10 9 315403 CASAVA_Build 2 224887497 2I TTAATTATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 626 hom 26 3 15 8 T 11 13 315404 CASAVA_Build 2 224889227 1D ATAAGAATGT A/- AAATGGTACA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 A 4 3 315405 CASAVA_Build 2 224916830 1D GTGAGGGGAC A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 8 7 315406 CASAVA_Build 2 224917181 1I CTGTTTTGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 27 12 2 A 8 9 315407 CASAVA_Build 2 224933582 2I ACTCTGTCTC --/AG AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 AG 0 1 315408 CASAVA_Build 2 224935254 3D AAGAAGAAAA AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 het 2343 hom 34 9 12 14 AGG 6 5 315409 CASAVA_Build 2 224937434 1D CACATACTCC T/- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 38 18 15 5 T 6 5 315410 CASAVA_Build 2 224959923 5D CAATCTTCTT AAGAG/----- AGGGGAATGT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 AAGAG 1 0 315411 CASAVA_Build 2 224976309 1I CGCATAGTCG -/C TCACGCCTTG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 C 0 1 315412 CASAVA_Build 2 224976903 1D TAAAAGAGGC A/- AATTTATGAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 A 3 2 315413 CASAVA_Build 2 224976983 6I AAATATAACA ------/ACTTTT ACTTTATATA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 ACTTTT 0 1 315414 CASAVA_Build 2 224977249 1D TCATTAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1856 hom 24 5 12 7 T 11 10 315415 CASAVA_Build 2 224979976 2D TGTCTTCCAT GA/-- CACGAGGGGA 2502 het 2502 ref 35 26 7 3 GA 1 0 315416 CASAVA_Build 2 224992927 1I AGAACAGTTA -/G GAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 G 1 2 315417 CASAVA_Build 2 224995796 1D AAGACTCCAT C/- CCCCCCCAAC 3070 het 3042 hom 24 11 9 5 C 8 7 315418 CASAVA_Build 2 224995964 5D GTCTCTAACT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 24 16 8 1 CAAAA 3 2 315419 CASAVA_Build 2 224996874 5I ATATACAAGG -----/AACTC AACTCAATAG 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 AACTC 1 2 315420 CASAVA_Build 2 224998753 6D ACAAGCTCTC TCTCTT/------ TCTCTTTGCC 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 TCTCTT 2 1 315421 CASAVA_Build 2 225005170 7D TTCCTACGCC TGATCCA/------- TGGATCCAGG 3070 het 3070 ref 55 31 18 8 TGATCCA 1 0 315422 CASAVA_Build 2 225008175 5D AATGATGCGG TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 hom 57 het 28 0 18 10 TGTTT 4 3 315423 CASAVA_Build 2 225009079 2I ATTTCATAAC --/TA TAGGAAGGTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TA 1 2 315424 CASAVA_Build 2 225010482 1D GGGGTTGTTG T/- TTCAGATGGA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 3 2 315425 CASAVA_Build 2 225011644 3D CCTCCTCCCA CTT/--- CTTCTTACAA 3070 hom 66 het 27 0 19 9 CTT 3 2 315426 CASAVA_Build 2 225013470 1I TACACCCCCC -/T GGATCATGCA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 0 1 315427 CASAVA_Build 2 225022446 1I ACCTGAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 10 11 315428 CASAVA_Build 2 225025182 2D TTTTTTTAAC AT/-- AATGTTTGAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 1 0 315429 CASAVA_Build 2 225025817 4D42M3I TTCCTCAAAC AATTAATGTCAGAACTTTGATGCAAATTCTCCTTTTCTTAAAACAT---/----AATGTCAGAACTTTGATGCAAATTCTCCTTTTCTTAAAACATCTC CTAATCCAGG 3070 hom 132 het 36 0 45 9 N/A 0 0 315430 CASAVA_Build 2 225031549 3D GTTTTTTTTT TTG/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 33 1 21 11 TTG 1 0 315431 CASAVA_Build 2 225036985 1D GACTTTAGAC T/- AGTGAGACTT 3070 hom 96 het 39 0 31 8 T 1 0 315432 CASAVA_Build 2 225039013 2I TGCAAAAAAC --/AT GTACGCAAAA 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 AT 0 1 315433 CASAVA_Build 2 225050084 1D GTCATAGGAC A/- CTGTCATTTT 3070 het 3070 hom 46 17 23 7 A 1 0 315434 CASAVA_Build 2 225086627 4D TATCACTTGA TAAT/---- TAAATTACAT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 TAAT 1 0 315435 CASAVA_Build 2 225089726 1D TCCTGCCTCA G/- CCGCCCAAGT 1372 hom 7 het 4 0 3 1 G 1 0 315436 CASAVA_Build 2 225091257 1I GTTGTAACAT -/A ACAACAGTAT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 A 1 2 315437 CASAVA_Build 2 225096349 1D GAGTTACTAT A/- AAAAAAAAAA 1373 het 1373 ref 39 30 4 5 A 12 11 315438 CASAVA_Build 2 225115457 2D TCTGGCTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 TG 9 8 315439 CASAVA_Build 2 225117486 6D AAAAAAAGTT AAAAAA/------ TAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 32 20 13 4 A 6 0 315440 CASAVA_Build 2 225131823 17D4M7I CTAATACGGT CTCTACTAAATATACAAAAAA-------/-----------------GAAACCCCGTC TATACTAAAT 1646 het 1646 ref 13 9 5 2 N/A 0 0 315441 CASAVA_Build 2 225153843 1D GTGCTTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2027 hom 30 5 15 10 T 15 14 315442 CASAVA_Build 2 225178158 1I AGCCATACTA -/T TTTCATCAGG 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 T 3 4 315443 CASAVA_Build 2 225186673 1D AAGTTAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 A 13 12 315444 CASAVA_Build 2 225218996 2I GAGGGAGTGT --/AA AAGTGGAAAG 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 A 2 4 315445 CASAVA_Build 2 225223520 1D ACTAATGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2109 hom 29 6 12 11 T 13 12 315446 CASAVA_Build 2 225227274 1D TCACAGAGAT C/- AACCATGCCT 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 C 1 0 315447 CASAVA_Build 2 225239650 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTGT 2415 het 2415 ref 26 16 6 4 A 1 0 315448 CASAVA_Build 2 225241292 1I ACAGTCTCAT -/G GGGGAGAACA 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 G 4 5 315449 CASAVA_Build 2 225259666 1I GAGTGGGACT -/C CCATCTCAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 C 2 3 315450 CASAVA_Build 2 225287370 3I ACTTGAAGTA ---/TTG TTGTTTATTT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 TTG 1 2 315451 CASAVA_Build 2 225295411 1D AAAAGATTAG C/- CACATTAGGC 3070 het 3070 hom 49 15 26 8 C 2 1 315452 CASAVA_Build 2 225303578 4I GGGGTGGGGT ----/GAGA GAGAGAGGGA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 GA 3 5 315453 CASAVA_Build 2 225305496 1D ATATGAATAA T/- TTTTTTTTTT 2944 het 2944 ref 26 13 9 4 T 13 12 315454 CASAVA_Build 2 225317483 1D GAATATAGAC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 22 7 9 6 T 7 6 315455 CASAVA_Build 2 225320540 3D AGTACTGTGG TAT/--- TATAGAAGTT 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 TAT 2 1 315456 CASAVA_Build 2 225338502 1I CTGCTCAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 9 10 315457 CASAVA_Build 2 225340134 1D AATCATGTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 23 18 2 T 10 9 315458 CASAVA_Build 2 225340879 1D TAATTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2363 het 2222 hom 28 11 8 9 T 13 12 315459 CASAVA_Build 2 225344800 1I CTCAGCCCAT -/G GGGGGACACA 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 G 5 6 315460 CASAVA_Build 2 225358045 2I TTCCCGACTC --/AT ATAGCATTTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 AT 1 2 315461 CASAVA_Build 2 225358254 1I CTAAATTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 10 11 315462 CASAVA_Build 2 225370227 1D ACTTGGTCTA T/- TTTTTTTTTT 3053 het 2318 hom 22 10 8 4 T 12 11 315463 CASAVA_Build 2 225371596 1I TGGCTCAATC -/T TTTTTTTTTT 2404 het 1913 hom 34 10 11 13 T 15 16 315464 CASAVA_Build 2 225377411 1D AGATTACTTG T/- TTTTTTTTTT 2471 het 2471 ref 35 23 6 6 T 15 14 315465 CASAVA_Build 2 225401898 10D ATGGTTCCTT TGTCTGTTCC/---------- TGGACCTGAG 3070 het 3070 ref 59 32 27 9 TGTCTGTTCC 1 0 315466 CASAVA_Build 2 225460448 1I TTATAAATGG -/T AAAATAAACC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 1 315467 CASAVA_Build 2 225490000 1D CTGTTCCCCC T/- TTGCAGAAAA 2764 het 2764 ref 24 15 7 2 T 3 2 315468 CASAVA_Build 2 225514805 1I CCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1553 het 1400 hom 29 7 5 17 A 17 18 315469 CASAVA_Build 2 225555760 1I GTGAAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 T 11 12 315470 CASAVA_Build 2 225556470 1I AGATTCAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 9 10 315471 CASAVA_Build 2 225557591 1D GACAAGAAAT A/- AAAAAGATGA 3070 het 3070 hom 35 12 21 3 A 6 5 315472 CASAVA_Build 2 225557802 1D CACAGGAAAC T/- TTTTTTTTTT 1464 het 40 hom 33 1 8 24 T 19 18 315473 CASAVA_Build 2 225571273 4I GCTGCATAAA ----/AATG AATGAACAAG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 AATG 1 2 315474 CASAVA_Build 2 225589845 1D TGAATTTTTA T/- TTTGTATTTT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 4 3 315475 CASAVA_Build 2 225591694 2I22M2I TTTCATGTAA --ATATATATATATACACATACAC--/ATATATATATATATACACATACACAT ATATGTGTAT 2416 hom 12 het 7 0 5 3 N/A 0 0 315476 CASAVA_Build 2 225597689 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2622 het 2046 hom 17 7 6 4 A 13 14 315477 CASAVA_Build 2 225603108 1D CTCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 982 het 676 hom 13 4 4 5 A 18 17 315478 CASAVA_Build 2 225606153 1I GGTACTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 24 1 17 7 T 11 12 315479 CASAVA_Build 2 225608434 1I GATATCACCA -/T TTTTTTTTAA 1576 het 1576 ref 17 9 4 4 T 8 9 315480 CASAVA_Build 2 225611238 1D CCACTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 34 1 22 12 A 13 12 315481 CASAVA_Build 2 225625260 1I ACTTAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 2041 het 792 hom 11 2 6 3 A 12 13 315482 CASAVA_Build 2 225650122 1D AGAAAGTTAT A/- AAAAATCACT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 6 5 315483 CASAVA_Build 2 225698185 1D ACATTTTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 11 10 315484 CASAVA_Build 2 225725378 4D GTTAAGCAAA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 hom 81 het 34 0 27 8 AAAC 2 1 315485 CASAVA_Build 2 225731825 1I TTTTCTTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 9 10 315486 CASAVA_Build 2 225736528 1D TTAAGCTAGC T/- TGGGTTAGAA 3070 hom 121 het 46 0 39 7 T 2 1 315487 CASAVA_Build 2 225740242 2D TAAGTCTAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 40 0 31 9 A 17 15 315488 CASAVA_Build 2 225741523 1I GGGTGAAACC -/A AAGACATCTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 3 315489 CASAVA_Build 2 225743516 1I ATTGCACTGC -/T TTTTTCTTCT 3070 hom 101 het 45 0 41 4 T 5 6 315490 CASAVA_Build 2 225745099 1I71M2I TTGAAAATAC -AAAAAATTGAATATATAAATAAGTAAAAATGCTTGTTTTTGAAATAAAAACTTTTAAAAAGCAAATTTTAA--/AAAAAAATTGAATATATAAATAAGTAAAAATGCTTGTTTTTGAAATAAAAACTTTTAAAAAGCAAATTTTAAAT AGTCTAGTGA 3070 hom 129 het 30 0 44 6 N/A 0 0 315491 CASAVA_Build 2 225752171 1I GAGGCATGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 378 hom 34 1 29 4 T 9 10 315492 CASAVA_Build 2 225753787 2I AGCCTATGCG --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 80 het 37 0 25 12 GA 5 6 315493 CASAVA_Build 2 225754975 2I ACTAAAAACA --/TG TAAAAACATG 366 hom 5 het 8 0 2 6 TG 0 1 315494 CASAVA_Build 2 225755462 4I TACCAAAAAA ----/AAAG AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AAAG 0 1 315495 CASAVA_Build 2 225758711 1I23M1I TTTCACCATA -AATGACATTTGAGGCACCTTCAA-/CAATGACATTTGAGGCACCTTCAAT TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 8 N/A 0 0 315496 CASAVA_Build 2 225758851 1D ATTAAAAAAA T/- AAGCTCAGCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 0 315497 CASAVA_Build 2 225762272 13I TCTTGAAATG -------------/ATTTTTAATTTAC AGTTTGAAAG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATTTTTAATTTAC 0 1 315498 CASAVA_Build 2 225762818 1D CAGAGGTTTC T/- TTCCCCCCAT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 3 2 315499 CASAVA_Build 2 225767320 3D TTTTAAATGC ATA/--- ATAATGATAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 ATA 2 1 315500 CASAVA_Build 2 225767449 2D ACATATATGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AC 6 5 315501 CASAVA_Build 2 225785123 6D ATGCCATGTG AATAAT/------ CAAACTGTCG 3070 het 3070 hom 47 21 23 6 AAT 2 0 315502 CASAVA_Build 2 225829304 2I AATATGGGTG --/TC TCTAAGTAAG 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 TC 1 2 315503 CASAVA_Build 2 225833082 1I GTGCTGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 10 11 315504 CASAVA_Build 2 225835549 3I AAAACATATG ---/ATC ATTTCAATTA 3070 het 3070 ref 47 28 17 2 ATC 0 1 315505 CASAVA_Build 2 225848069 1D ACTTGAGGTA T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 108 het 43 0 37 7 T 7 6 315506 CASAVA_Build 2 225873229 1D TCCTGTCTTT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 81 het 31 0 28 5 A 8 7 315507 CASAVA_Build 2 225873754 1D AGTAAGAAGC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 80 het 30 0 26 5 A 9 8 315508 CASAVA_Build 2 225876301 4D GTCTAGGAAG TAAC/---- TAACCTGTTT 892 hom 7 het 9 0 3 8 TAAC 2 1 315509 CASAVA_Build 2 225876320 1D TGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 484 hom 5 het 10 0 2 8 T 15 14 315510 CASAVA_Build 2 225886330 1D TAAAGCACTC T/- TTTCATCATA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 4 3 315511 CASAVA_Build 2 225898460 1I GCTCCAAGAT -/G GGTCCCCTTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 2 3 315512 CASAVA_Build 2 225900249 1D ATGTTTTTTA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 T 7 6 315513 CASAVA_Build 2 225913364 2D TGATCATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 41 hom 21 1 20 0 TA 6 5 315514 CASAVA_Build 2 225919423 1D TTATTGAGTA T/- TTTTTTTATC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 8 7 315515 CASAVA_Build 2 225929674 4D CCTTTTAGAG GAGT/---- GAGTAATATT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 GAGT 2 1 315516 CASAVA_Build 2 225930474 1I AAACTCAGAA -/T TTATTTTTAT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 2 3 315517 CASAVA_Build 2 225940866 1I GATAGTGTAA -/T TTTTTTACCA 3070 het 3070 hom 35 10 19 6 T 6 7 315518 CASAVA_Build 2 225953846 1D TTTTAAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 T 10 9 315519 CASAVA_Build 2 225973964 3D AGTCACCTTC TGG/--- TTATTGCACT 3070 hom 129 het 49 0 43 7 TGG 1 0 315520 CASAVA_Build 2 225985575 2D AGGTAAAATT TG/-- TGAAAAACCA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 TG 2 1 315521 CASAVA_Build 2 225993572 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 29 0 22 7 T 12 11 315522 CASAVA_Build 2 226003676 1D TAGAATGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 43 0 34 10 T 10 9 315523 CASAVA_Build 2 226006319 3D CTATCTGTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 13 10 315524 CASAVA_Build 2 226017224 1I TCTAACATTC -/T ACACCAACAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 0 1 315525 CASAVA_Build 2 226044937 1D TGAGTACTTA T/- TATATTCCCT 3070 het 3070 ref 46 21 22 3 T 2 1 315526 CASAVA_Build 2 226123264 1I ATAACCATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 311 hom 43 1 35 7 T 9 10 315527 CASAVA_Build 2 226138598 1D GTATAGCAAT A/- ATAATTGATA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 2 1 315528 CASAVA_Build 2 226149980 1D TACATTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 8 T 12 11 315529 CASAVA_Build 2 226150767 1D GAAAAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 559 hom 34 3 18 13 T 15 14 315530 CASAVA_Build 2 226160789 1I TTGGCATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 36 1 30 5 A 11 12 315531 CASAVA_Build 2 226162289 1D TAAATGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 25 2 20 3 T 13 12 315532 CASAVA_Build 2 226180660 4I ATCAGTTGTT ----/TCTC TATCAAAAGA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TC 0 2 315533 CASAVA_Build 2 226201023 1I CAATTGCTGA -/G GGATATTCCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 2 3 315534 CASAVA_Build 2 226209444 1D ATGTGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 13 12 315535 CASAVA_Build 2 226212024 1I CATCAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 41 0 35 6 A 10 11 315536 CASAVA_Build 2 226218855 1I5M1D CATTTAGATG -CACAGA/TTACAG- TCCTAAAGGA 3070 hom 114 het 43 0 38 7 N/A 0 0 315537 CASAVA_Build 2 226220944 6I GTGTGTGTGC ------/GTATAT ATATGTATGT 3070 hom 74 het 28 0 25 3 GTATAT 0 1 315538 CASAVA_Build 2 226221355 1I GAAAATAGAC -/A GTTTTTCATG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 0 1 315539 CASAVA_Build 2 226237679 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2760 hom 22 het 9 0 8 1 A 8 9 315540 CASAVA_Build 2 226243582 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3020 het 257 hom 33 1 21 11 G 0 1 315541 CASAVA_Build 2 226245770 2I GAGGAGAGGA --/AG AGAGATGGGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AG 2 3 315542 CASAVA_Build 2 226246423 2D CAATTTATTT AA/-- AAAAAAATGC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 9 7 315543 CASAVA_Build 2 226252159 4D AAGCAAGTAC TTTA/---- TTTGAGAAAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTTA 1 0 315544 CASAVA_Build 2 226285328 1D TATAGCAGAT A/- AAAATGTATG 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 A 5 4 315545 CASAVA_Build 2 226291410 1I CAGGTGTGTG -/C CACTATACCT 3070 hom 87 het 33 0 27 6 C 1 2 315546 CASAVA_Build 2 226299267 3I ATTTAGTTAT ---/AAG AAGGCAGTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAG 1 2 315547 CASAVA_Build 2 226326838 1I GTATTTTATA -/C ATATGTATTT 3070 het 232 hom 13 1 11 1 C 0 1 315548 CASAVA_Build 2 226327547 1D CTTTTACTCA T/- GGATTAATTA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 1 0 315549 CASAVA_Build 2 226328358 4D20M2I GTCTTACATG TATATATATATATATATACATGTG--/----TATATATATATATACATGTGTA TATATATATA 3070 het 417 hom 13 2 9 2 N/A 0 0 315550 CASAVA_Build 2 226331309 11D TTTCCGGGCG TGGTGGCGGGC/----------- TGGTGGCGGG 1786 hom 27 het 9 0 9 3 TGGTGGCGGGC 2 1 315551 CASAVA_Build 2 226335978 1D ACAAGTGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 266 hom 34 4 17 13 A 19 18 315552 CASAVA_Build 2 226355451 1D CCTTCCTTCC T/- TCCTTCCCTC 522 het 522 ref 35 18 4 13 T 2 1 315553 CASAVA_Build 2 226367950 1I AGGTCTTTTA -/T TTTTTAAAGG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 5 6 315554 CASAVA_Build 2 226398312 3D CGAAGCTTCC AGA/--- AGAAGGAGCA 3070 het 3070 ref 30 16 9 6 AGA 2 1 315555 CASAVA_Build 2 226399858 1D AAATGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2209 het 2209 ref 17 9 5 3 A 12 11 315556 CASAVA_Build 2 226404239 3D ACAGTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 T 14 11 315557 CASAVA_Build 2 226405375 1D GTACTATGCA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 7 6 315558 CASAVA_Build 2 226407564 10D AAGTCTTTAT CCAAGTGTAA/---------- CTAATTACCT 1956 het 1956 ref 49 24 6 27 CCAAGTGTAA 1 0 315559 CASAVA_Build 2 226410348 1D TTGAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 13 12 315560 CASAVA_Build 2 226415905 4I CTTTGTTTGC ----/TTGT TTGTTTAATT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 TTGT 1 2 315561 CASAVA_Build 2 226420657 2D AGTTTATGTA AT/-- AGTCTCCATC 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AT 1 0 315562 CASAVA_Build 2 226422988 1D ATAATAGTAC A/- AGATCAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 2 1 315563 CASAVA_Build 2 226423703 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 48 18 16 14 TG 7 8 315564 CASAVA_Build 2 226426233 1D TCTCATTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 11 A 11 10 315565 CASAVA_Build 2 226426894 1D AATTTTATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 T 9 8 315566 CASAVA_Build 2 226432797 1D TTGTATATTG A/- GTCCAACAAT 3070 het 3070 ref 34 22 12 0 A 1 0 315567 CASAVA_Build 2 226438535 1I AGGCCAAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 22 18 0 A 9 10 315568 CASAVA_Build 2 226449645 5I CACTCTTGAG -----/TCTGT ATGCCTATAT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 TCTGT 0 1 315569 CASAVA_Build 2 226451419 1I AGTTAATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 T 12 13 315570 CASAVA_Build 2 226451926 14I TTGCCCTCAT --------------/GAAGTTCATACTCC ATTAGGGAAG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 GAAGTTCATACTCC 0 1 315571 CASAVA_Build 2 226453553 1I TTTCATACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 10 11 315572 CASAVA_Build 2 226453771 5D TATAATCTAC TTTTA/----- TTTTATGTGA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 TTTTA 2 1 315573 CASAVA_Build 2 226455067 1D CCTGGGACCA C/- CCTTCGGCTC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 C 3 2 315574 CASAVA_Build 2 226463679 4D AAAATAACCA CAAG/---- CAAGCAACCA 3070 het 3070 hom 27 12 14 4 CAAG 2 1 315575 CASAVA_Build 2 226466673 1I CAAAAATTAG -/T TTAAATAGGT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 2 3 315576 CASAVA_Build 2 226467541 2I1M5D GCTCCAGGGG --AGCCAT/GTA----- CCTGCTTCAA 3070 hom 75 het 27 0 25 5 N/A 0 0 315577 CASAVA_Build 2 226467894 1D TAAGGAAAGC T/- CATGGTGTGT 3070 het 3070 ref 45 24 18 5 T 1 0 315578 CASAVA_Build 2 226476589 2D TAATTGGCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 114 hom 31 2 14 16 A 12 10 315579 CASAVA_Build 2 226478740 9I28M1D TTATTAAATG ---------TCAGAGAAACCTTCCCTTACCATGCCTTC/TCAATATACTCAGAGAAACCTTCCCTTACCATGCCTT- CCCCTTTCAA 3070 het 3070 hom 30 18 22 6 N/A 0 0 315580 CASAVA_Build 2 226479888 1I GTTGTAAAAG -/A AAGTTCATAT 3070 het 3070 hom 54 24 24 6 A 2 3 315581 CASAVA_Build 2 226480675 4D CAATTGTTAT TTTA/---- TTTATTAATA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TTTA 2 1 315582 CASAVA_Build 2 226485422 1D TTCACAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 T 11 10 315583 CASAVA_Build 2 226501969 3I AAAATGAAGA ---/AGG ACTAAGCCCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGG 0 1 315584 CASAVA_Build 2 226508996 1D TGGATTTATT C/- ATTATAACAG 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 C 1 0 315585 CASAVA_Build 2 226515912 1I TAAAAATCTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 T 8 9 315586 CASAVA_Build 2 226516225 1D ATATATTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 5 T 10 9 315587 CASAVA_Build 2 226524319 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 52 20 18 14 A 10 11 315588 CASAVA_Build 2 226526797 1D AAAAAAAAAA T/- ATAGGCAAGA 3070 hom 42 het 19 0 15 5 T 1 0 315589 CASAVA_Build 2 226553429 1I CCAAAATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1443 hom 33 4 24 5 T 12 13 315590 CASAVA_Build 2 226567659 4D AAAATTAAAC ATAA/---- ATAAATAAAT 3070 hom 21 het 9 0 8 3 ATAA 6 5 315591 CASAVA_Build 2 226572581 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 32 0 27 6 T 9 8 315592 CASAVA_Build 2 226578931 1D TTAGAGATTT C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 89 het 34 0 29 6 C 9 8 315593 CASAVA_Build 2 226587129 1I GTAGGGACTG -/T TTTTTAGTGT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 5 6 315594 CASAVA_Build 2 226588589 2I GGGGGTGTGA --/AT ATATATATAT 3070 het 941 hom 34 3 25 6 AT 7 8 315595 CASAVA_Build 2 226595898 16D TAAAATAGTG AATGATGTTTAGAAAC/---------------- AATGACATAA 3070 hom 60 het 26 0 21 6 AATGATGTTTAGAAAC 1 0 315596 CASAVA_Build 2 226596005 1I TGCTATTTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 293 hom 29 1 25 3 A 9 10 315597 CASAVA_Build 2 226597990 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 31 1 24 6 A 11 10 315598 CASAVA_Build 2 226602972 1D TAAAATTTAG T/- TTGCTTGTTG 2874 het 2874 ref 22 11 7 4 T 3 2 315599 CASAVA_Build 2 226606847 1D TACATTCTTA C/- CAAAAGCATA 3070 hom 141 het 49 0 47 3 C 2 1 315600 CASAVA_Build 2 226611006 6I AAGTCTCATA ------/ATCATT ATCATATTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATCATT 0 1 315601 CASAVA_Build 2 226621544 1D ACTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 10 12 4 T 13 12 315602 CASAVA_Build 2 226631842 2D AATAGTTCTT AA/-- AAGCACATGA 3070 het 3070 ref 64 31 26 7 A 4 2 315603 CASAVA_Build 2 226643259 2D GTGACACTTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 38 12 14 12 CT 7 6 315604 CASAVA_Build 2 226645577 1I CAAAATAGCA -/T TTTTTTTTAA 2906 het 2906 ref 20 7 9 4 T 8 9 315605 CASAVA_Build 2 226655030 2D ACACATATAC AT/-- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 48 25 15 8 AT 5 4 315606 CASAVA_Build 2 226658923 1D CTATACATGA G/- GAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 G 2 1 315607 CASAVA_Build 2 226659576 4I TCTGAATTTC ----/CAAA CAAACGATAC 3070 het 3070 hom 57 21 30 6 CAAA 1 2 315608 CASAVA_Build 2 226662165 5D CAGCCATAAT TTAGA/----- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 5 TTAGA 1 0 315609 CASAVA_Build 2 226667682 1I AAACTAGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 9 10 315610 CASAVA_Build 2 226667863 1I ATTAAAAAAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 A 7 8 315611 CASAVA_Build 2 226669383 1I GTGCTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 11 12 315612 CASAVA_Build 2 226675095 1D TATTGCAAAA G/- CCAATGTCAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 G 1 0 315613 CASAVA_Build 2 226675226 3D AATTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 11 8 T 17 14 315614 CASAVA_Build 2 226675765 4D TATTCCTGAG TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 25 9 9 7 TTAT 6 5 315615 CASAVA_Build 2 226697133 1I GCTAAATGAT -/A AAAAAAAAAT 2647 het 2647 ref 30 23 6 1 A 9 10 315616 CASAVA_Build 2 226706232 1I GATCCTTTTC -/T GCCCTGTTTT 3070 het 3070 hom 55 22 25 8 T 0 1 315617 CASAVA_Build 2 226717393 1I CAACAACAAC -/A AACAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 A 2 3 315618 CASAVA_Build 2 226719023 5D TTTATGGTAA CTTTT/----- CTTTTCTGTG 3070 het 3070 ref 39 19 14 8 CTTTT 2 1 315619 CASAVA_Build 2 226727296 3D TTACTTTTTC TTG/--- TTGTCCTCCT 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 TTG 2 1 315620 CASAVA_Build 2 226729849 1D CAGCACAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 14 18 14 T 13 12 315621 CASAVA_Build 2 226744943 1D TAGTCAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2447 hom 23 9 10 5 T 12 11 315622 CASAVA_Build 2 226747612 2D TTTGTTTTTG AA/-- AAGTGAATGG 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 A 4 2 315623 CASAVA_Build 2 226748785 1D CTAAGCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 15 14 315624 CASAVA_Build 2 226750026 1I TATCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1257 het 1257 ref 35 27 3 5 A 13 14 315625 CASAVA_Build 2 226756383 1I GCTATTTAAC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 8 9 315626 CASAVA_Build 2 226773770 2D CACCGTATTT TA/-- TACTAAGCAT 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 TA 2 1 315627 CASAVA_Build 2 226775427 3D AAAAGTCTTA TTT/--- TTTACTCAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 6 3 315628 CASAVA_Build 2 226784214 1D TACTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 38 0 27 12 T 11 10 315629 CASAVA_Build 2 226806431 1I TAATTTAAAA -/T CTATTAACTA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 T 0 1 315630 CASAVA_Build 2 226812575 3D TGCCCAGCAC TTT/--- TTTTTTTTTA 2719 het 2719 ref 25 13 8 5 T 12 9 315631 CASAVA_Build 2 226813997 3D GTGTTGCCAA AGG/--- AGATTAACAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 AGG 1 0 315632 CASAVA_Build 2 226841662 1I TCTTGCTACT -/G GGGGGGCTGA 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 G 6 7 315633 CASAVA_Build 2 226849013 1I TAGGCTATTG -/T AACAAAACAC 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 T 0 1 315634 CASAVA_Build 2 226866017 1D ATGTTAAAAT G/- CATTTCTTAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 G 1 0 315635 CASAVA_Build 2 226872272 1D ATACAGCAAG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 8 7 315636 CASAVA_Build 2 226881854 1D ACCTGGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1307 hom 42 7 11 24 A 13 12 315637 CASAVA_Build 2 226903994 13D GCAGTGGAAA CTCTTGGTTCATC/------------- CCTTTGGCTG 3070 het 3070 hom 41 22 23 6 CTCTTGGTTCATC 1 0 315638 CASAVA_Build 2 226909727 5I AAATATTACC -----/ATATG ATATAAGTTT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 ATATG 0 1 315639 CASAVA_Build 2 226913865 8I AACCACTATG --------/CCTGGCTA CCTGGCTAAT 3070 hom 59 het 26 0 19 7 CCTGGCTA 1 2 315640 CASAVA_Build 2 226916480 1I AATTCATGTT -/C CTCTTATATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 1 2 315641 CASAVA_Build 2 226921893 1I TACTATCTGT -/G GGAATTTAGT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 2 3 315642 CASAVA_Build 2 226926590 1I TCTGCAAAGG -/T TTTTTTGTAC 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 6 7 315643 CASAVA_Build 2 226973541 1I TCACCAAATC -/A AAAGGATTCC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 3 4 315644 CASAVA_Build 2 226975548 1D TGCATCACAT A/- AAAAAATGTA 3070 hom 93 het 33 0 31 3 A 7 6 315645 CASAVA_Build 2 226982516 4D ATGCTTTTTC TTAG/---- TTAGTCTGTT 3070 hom 59 het 24 0 17 7 TTAG 2 1 315646 CASAVA_Build 2 226984570 1I CTAAAACTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 132 het 54 0 45 9 A 10 11 315647 CASAVA_Build 2 226986070 2D ACTCCAACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 22 1 14 8 A 14 12 315648 CASAVA_Build 2 226991551 1D AAATTATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1190 hom 24 4 16 4 T 17 16 315649 CASAVA_Build 2 227000900 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 22 0 14 8 A 12 11 315650 CASAVA_Build 2 227004079 3D TCCCTGTTGG CCA/--- CCACCACTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 3 CCA 3 2 315651 CASAVA_Build 2 227026996 1I GCAGGAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 156 hom 27 1 21 5 T 13 14 315652 CASAVA_Build 2 227049167 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 615 hom 28 2 20 7 A 14 13 315653 CASAVA_Build 2 227049500 3I TACGAAAAAT ---/AAA AAATTAACCA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 3 6 315654 CASAVA_Build 2 227050743 1D GCAGACATTT C/- TTTCTCTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 0 315655 CASAVA_Build 2 227059883 4D TTCCTTTCAC ACAG/---- ACAAAGTCAG 3070 hom 138 het 51 0 44 9 ACAG 1 0 315656 CASAVA_Build 2 227071474 5I ACCTAGAATA -----/GGTAC CTTTTTCTAT 3070 hom 142 het 50 0 44 6 GGTAC 0 1 315657 CASAVA_Build 2 227073564 5I GAGGTAACAA -----/GATTG GATAAAAAGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 GATTG 0 1 315658 CASAVA_Build 2 227073755 1D AAGGACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 285 hom 36 2 29 5 A 13 12 315659 CASAVA_Build 2 227074878 2D CACCATACTG TA/-- CTTTCCACAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TA 1 0 315660 CASAVA_Build 2 227084761 1D TTACCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 44 1 25 19 T 11 10 315661 CASAVA_Build 2 227090411 4I TCACTTGATA ----/TATC TATCAAGTTT 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 TATC 1 2 315662 CASAVA_Build 2 227104817 60D AAAGTAAATA TGCTTTATTTGGCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGAATTT/------------------------------------------------------------ TGGCTTTACT 2315 het 1081 hom 12 3 8 7 TGCTTTATTTGGCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGAATTT 1 0 315663 CASAVA_Build 2 227113879 1D AAAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 10 9 315664 CASAVA_Build 2 227180727 4D ACAAACAAAC AAAA/---- AAAAGACCTT 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 A 8 4 315665 CASAVA_Build 2 227192658 8D CAGTACTTTC CTGGACTT/-------- CTGGACTTCC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 CTGGACTT 2 1 315666 CASAVA_Build 2 227195365 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1828 het 1828 ref 31 14 5 12 A 13 12 315667 CASAVA_Build 2 227197174 2D GCACGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 2560 het 2560 ref 30 14 8 8 GT 6 5 315668 CASAVA_Build 2 227202369 5D TTTCTGTTGT TATAA/----- TAGAATACTA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 TATAA 1 0 315669 CASAVA_Build 2 227203014 9I CATTATCCTG ---------/CCTCAGCCT CCCGAGTAGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CCTCAGCCT 0 1 315670 CASAVA_Build 2 227210233 4D CAAATTCTCA AGAG/---- AGAGAGTCTA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 AG 5 3 315671 CASAVA_Build 2 227212404 4D TCACACAGAC AGAT/---- AGACACACTT 3070 hom 151 het 54 0 48 8 AGAT 1 0 315672 CASAVA_Build 2 227215424 2D CAGAGGGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 38 0 34 5 A 13 11 315673 CASAVA_Build 2 227220969 1D TTGTGGAGGG A/- GTGGCACGGG 3070 hom 41 het 15 0 9 6 A 1 0 315674 CASAVA_Build 2 227233223 1I TCAGTCTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 111 het 45 0 35 10 T 8 9 315675 CASAVA_Build 2 227247341 3D TGTTTTCCAT GTG/--- GTTATAGGGT 3070 het 3070 ref 40 24 14 3 GTG 1 0 315676 CASAVA_Build 2 227253130 1I CCTTTTTTTT -/A TTTTTTTGAA 3070 het 2374 hom 38 14 14 10 A 0 1 315677 CASAVA_Build 2 227277760 1D AAAGGATATC A/- AAAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 7 6 315678 CASAVA_Build 2 227279727 1D AAAAAAAAAA C/- ACTTTTATAT 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 C 1 0 315679 CASAVA_Build 2 227345638 1D CATGGACAGT A/- AAAAAAAAAA 2082 het 2082 ref 40 20 8 12 A 19 18 315680 CASAVA_Build 2 227360991 1D AAAAAAAAAA C/- GTCTCTTTGA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 C 1 0 315681 CASAVA_Build 2 227419708 1D ATGCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2124 het 398 hom 26 7 6 14 A 18 17 315682 CASAVA_Build 2 227439076 1D TGGCACCAGG C/- CTGAAGGGCA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 C 2 1 315683 CASAVA_Build 2 227448668 1D TGTTTTGAAA G/- GGGAAGAGAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 4 3 315684 CASAVA_Build 2 227536145 1D AACTTAAGAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 64 het 27 0 21 6 A 8 7 315685 CASAVA_Build 2 227599459 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 961 het 353 hom 13 5 4 4 A 17 16 315686 CASAVA_Build 2 227674543 1I AACATGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 33 0 27 6 A 11 12 315687 CASAVA_Build 2 227675846 23D GTTCAAGCAA CAATATTTCAGCAATAGGGAAAG/----------------------- CAATATTTCA 3070 het 3070 ref 21 11 9 9 CAATATTTCAGCAATAGGGAAAG 1 0 315688 CASAVA_Build 2 227679008 1I GTTTAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 12 13 315689 CASAVA_Build 2 227679086 1I GTCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 T 9 10 315690 CASAVA_Build 2 227682551 1I TACTAAAAAT -/A ACAAAAATTA 3070 het 313 hom 16 1 12 3 A 1 2 315691 CASAVA_Build 2 227705752 2D AAAAATAAAC AA/-- AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 A 8 6 315692 CASAVA_Build 2 227715058 5D TAGTAGATTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1718 hom 41 13 12 18 A 21 16 315693 CASAVA_Build 2 227719244 1D AGATCATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 12 11 315694 CASAVA_Build 2 227722830 4D TGGATGAATG GACA/---- GACAGACAGA 3070 het 3070 hom 49 19 20 13 GACA 3 2 315695 CASAVA_Build 2 227729024 1I GCCATGGAGG -/A AAAAAAAAAA 2777 het 2777 ref 24 13 8 3 A 10 11 315696 CASAVA_Build 2 227729356 1I AACCCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 1367 het 775 hom 34 5 7 22 A 15 16 315697 CASAVA_Build 2 227751248 1I AGGCTGAGGT -/G GGGAGGATCG 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 G 3 4 315698 CASAVA_Build 2 227751499 2I TCATTATTTT --/TA ATTTTATTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 TA 0 1 315699 CASAVA_Build 2 227757763 1D AAGACTCATC T/- TTTTTTCATT 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 T 7 6 315700 CASAVA_Build 2 227765403 10I8M1I AAAACCAACC ----------TTTTCATC-/CCAGGTTTCAGTTTCCTCA TCTACCCTCT 3070 het 3070 ref 34 17 15 5 N/A 0 0 315701 CASAVA_Build 2 227767578 1D TGAGCACATT C/- TTAATAAAAT 2740 het 2740 ref 31 19 7 5 C 1 0 315702 CASAVA_Build 2 227768246 1I CAAATCCTGA -/C AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 C 0 1 315703 CASAVA_Build 2 227768871 2I TATTCTTAAC --/AA AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 22 8 9 5 A 7 9 315704 CASAVA_Build 2 227769452 1I TAATTTTTTG -/T TATTTTTAGT 1097 het 967 hom 5 2 3 0 T 1 2 315705 CASAVA_Build 2 227783836 1D TCACCTGTTT G/- GGGGGAACTC 3070 hom 135 het 49 0 45 4 G 6 5 315706 CASAVA_Build 2 227794406 2D TTTTTTTTTT TC/-- GCATTCATCC 3070 hom 135 het 49 0 45 8 TC 1 0 315707 CASAVA_Build 2 227794654 2I ATTAGTTAAC --/AT GTGTGTATTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AT 0 1 315708 CASAVA_Build 2 227796101 1D AGTGTGGTCT G/- GGGAACCCCT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 4 3 315709 CASAVA_Build 2 227797305 1I TCAACCATTG -/T TCTTTAAAAT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 1 2 315710 CASAVA_Build 2 227804337 1I TATTTAAACA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 T 6 7 315711 CASAVA_Build 2 227804873 1D TTCATTCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 142 hom 30 3 13 15 T 9 8 315712 CASAVA_Build 2 227809388 1I TTTGTGTGGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 7 8 315713 CASAVA_Build 2 227811137 1I ACATTAACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 13 11 16 A 13 14 315714 CASAVA_Build 2 227812206 1D TAATACAAAT A/- AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 7 6 315715 CASAVA_Build 2 227814646 2I AAATATATAC --/AT GTGTGTGTAT 3070 het 428 hom 29 2 23 4 AT 0 1 315716 CASAVA_Build 2 227817871 1I TTTTAAAGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 G 0 1 315717 CASAVA_Build 2 227840753 1D TTTTGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2695 hom 32 9 13 10 A 13 12 315718 CASAVA_Build 2 227848903 1D TCCCTTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 34 0 27 7 A 13 12 315719 CASAVA_Build 2 227850881 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 16 5 A 11 10 315720 CASAVA_Build 2 227851086 1I TATACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 10 11 315721 CASAVA_Build 2 227852211 3D GCTAGTTTTT TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTG 3 2 315722 CASAVA_Build 2 227887959 1D GTCACCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 22 2 15 5 T 15 14 315723 CASAVA_Build 2 227888663 1D TGAGGCAGAA T/- ATTTGTCACT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 0 315724 CASAVA_Build 2 227895609 1D TATTATTCCT A/- AAAATCAATC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 5 4 315725 CASAVA_Build 2 227897950 1D AATTTTCATG C/- CAGATGGTCC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 C 2 1 315726 CASAVA_Build 2 227900468 3I TTAGTAGAAA ---/AGT TCCAGTTACT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 AGT 0 1 315727 CASAVA_Build 2 227902884 1I CTACTGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 245 hom 38 2 27 9 A 11 12 315728 CASAVA_Build 2 227911321 2D CAGAGTGACA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 48 het 22 0 16 7 CT 2 1 315729 CASAVA_Build 2 227913962 3D TTTCTTCCTC ATT/--- AATGTTTTGG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 ATT 1 0 315730 CASAVA_Build 2 227914250 1D TAGAGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 29 0 21 8 T 12 11 315731 CASAVA_Build 2 227917686 1D30M2I GTCATCAATT AAAAAAAAAAAATACTCCCGATTTCGTTTTT--/-AAAAAAAAAAATACTCCCGATTTCGTTTTTGC TGTTTATGGA 3070 hom 105 het 27 0 35 4 N/A 0 0 315732 CASAVA_Build 2 227919736 2D TTTATGGAAT CA/-- CACTTTTGAT 3070 hom 99 het 38 0 34 6 CA 2 1 315733 CASAVA_Build 2 227924370 3D AATTTGTATT GTA/--- GTCAAAATTC 3070 hom 78 het 33 0 27 7 GTA 1 0 315734 CASAVA_Build 2 227936376 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 832 hom 36 3 15 19 A 17 16 315735 CASAVA_Build 2 227948617 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTATAT 3070 het 2396 hom 16 8 8 0 T 6 7 315736 CASAVA_Build 2 227950084 1I TGCTAATACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 T 8 9 315737 CASAVA_Build 2 227951044 4D TCTCTGTCTT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 14 14 10 AC 8 6 315738 CASAVA_Build 2 227957248 1D AACCCCGTCT C/- TATTAAAAAT 2700 het 1415 hom 12 4 8 0 C 1 0 315739 CASAVA_Build 2 227962712 5D GAATTATGTA TTATT/----- TTATTATTTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 TTATT 2 1 315740 CASAVA_Build 2 227969115 1D TCTTATCCTT A/- AAAGTCTCAA 3070 het 3070 ref 57 29 22 6 A 4 3 315741 CASAVA_Build 2 227972588 1I CTTTATTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 1923 hom 26 6 16 4 T 8 9 315742 CASAVA_Build 2 227975315 1I TTAGTCCCAC -/A AAGGCAGTCT 3070 hom 101 het 41 0 31 10 A 2 3 315743 CASAVA_Build 2 227976360 4D TCTCATGCCC CAGA/---- CAAAGGGAAG 3070 hom 120 het 42 0 40 4 CAGA 1 0 315744 CASAVA_Build 2 227989447 1I TAATTCAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 9 10 315745 CASAVA_Build 2 228009782 1D TTTACACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 T 15 14 315746 CASAVA_Build 2 228015046 1I AAATACTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2858 hom 30 9 15 6 T 11 12 315747 CASAVA_Build 2 228019570 1I TTACATTCCA -/T TTTGGGATTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 3 4 315748 CASAVA_Build 2 228021505 1D AACCTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 2266 het 2266 ref 30 15 7 8 A 17 16 315749 CASAVA_Build 2 228021935 3D TGGTTAATCT GGA/--- GTCTTACTAA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 GGA 1 0 315750 CASAVA_Build 2 228022097 1I CTTCGGGGGG -/C CCGAGGTGGG 882 het 483 hom 7 2 3 2 C 2 3 315751 CASAVA_Build 2 228022496 3D AAGCAGCAGG AAA/--- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 39 15 18 7 A 11 8 315752 CASAVA_Build 2 228024837 1D CTTGGAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2299 hom 27 7 12 8 T 11 10 315753 CASAVA_Build 2 228027180 1D TCCATCTCTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 12 18 7 A 9 8 315754 CASAVA_Build 2 228028424 1I ACTTTCTTTT -/G GCAAAATGTT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 G 1 2 315755 CASAVA_Build 2 228029554 8D GTCTCTACAT AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 4 AAAC 5 3 315756 CASAVA_Build 2 228030504 1I GCCTTTTTTT -/C CCCCCCTTTT 2960 het 2242 hom 26 12 10 4 C 6 7 315757 CASAVA_Build 2 228031503 27I AATGCAAAGA ---------------------------/TTAAAATGAATTCTTAAAAAAGAATTC TTAAAATGAA 2251 het 2251 ref 16 7 6 3 TTAAAATGAATTCTTAAAAAAGAATTC 0 1 315758 CASAVA_Build 2 228037126 1D CCTCTAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 16 8 A 10 9 315759 CASAVA_Build 2 228041020 1I AGCTAATCAA -/T TTTTTTTTTT 3055 het 3055 ref 27 12 11 5 T 10 11 315760 CASAVA_Build 2 228051100 1I TCTCGTGCTA -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 T 6 7 315761 CASAVA_Build 2 228058641 2I TAATTCTCTC --/TT TAGTTATGTC 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 T 1 3 315762 CASAVA_Build 2 228064609 1D AAGTAAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 7 T 15 14 315763 CASAVA_Build 2 228094032 1D TACATTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 9 22 3 T 10 9 315764 CASAVA_Build 2 228103624 25D TATTATTTTA AGTATTTCAGTTATTATTCAGATTC/------------------------- ACATAGTTGA 3070 het 3070 ref 25 20 11 3 AGTATTTCAGTTATTATTCAGATTC 1 0 315765 CASAVA_Build 2 228106246 1I TGTGGAGATA -/C CCCCTCCATG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 4 5 315766 CASAVA_Build 2 228115847 3D CTTGAGAGGG TGT/--- TGTATGTGTC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TGT 2 1 315767 CASAVA_Build 2 228121156 1D GGGGCAGCAT G/- GGAAGTGACA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 G 3 2 315768 CASAVA_Build 2 228121972 1I TCAGTTAACC -/T TTTTTTTTTT 2355 het 2355 ref 27 13 7 7 T 11 12 315769 CASAVA_Build 2 228130006 1I AGATTTATTC -/T TAGTTTTATA 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 T 1 2 315770 CASAVA_Build 2 228130553 4D TTAAAACATG TTTA/---- TTTATTTAAG 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 TTTA 3 2 315771 CASAVA_Build 2 228133397 4I AAAATCTCTC ----/TAAT TGACTATCTG 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 TAAT 0 1 315772 CASAVA_Build 2 228135661 1D ATGGATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 33 2 24 7 A 17 16 315773 CASAVA_Build 2 228140321 1I TTTTCTATAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 9 315774 CASAVA_Build 2 228143244 2I GCAGTAGCTC --/TG TGTCAGTTAC 3070 hom 135 het 54 0 46 8 TG 1 2 315775 CASAVA_Build 2 228147427 3D TATTTATATA AAC/--- AACTTTTAGG 3070 het 3070 ref 38 19 15 6 AAC 2 1 315776 CASAVA_Build 2 228149180 1I ATAGACATTT -/C CCTGAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 12 12 16 C 2 3 315777 CASAVA_Build 2 228149404 1I TAGAGAATGG -/C CTGGCAGCTC 3070 het 3070 ref 55 27 25 3 C 1 2 315778 CASAVA_Build 2 228165062 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 482 hom 24 2 11 11 A 6 7 315779 CASAVA_Build 2 228169376 12I TGGTTTCGTT ------------/CCTGACCAATGG CCTGTCCTTT 3070 het 3070 ref 45 22 16 8 CCTGACCAATGG 0 1 315780 CASAVA_Build 2 228172670 1I TCATTAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 26 1 20 5 T 10 11 315781 CASAVA_Build 2 228174065 3I CCACATGATT ---/AAA TGTTGTAACT 3070 hom 124 het 45 0 41 4 A 0 3 315782 CASAVA_Build 2 228174531 1D CCCTGATCTT G/- GCAGGACCAC 3070 het 2942 hom 29 8 18 4 G 2 1 315783 CASAVA_Build 2 228174989 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 9 8 315784 CASAVA_Build 2 228176913 1I CCCAATATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 315785 CASAVA_Build 2 228179010 1D GCAGGACTTA G/- AGGGCTGTAC 3070 hom 135 het 52 0 46 7 G 1 0 315786 CASAVA_Build 2 228179843 1I CCTTAGTCCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 80 hom 39 1 34 4 T 8 9 315787 CASAVA_Build 2 228182496 1I71M2D TATCTTTGCA -TTTTTTTTTTGGTTTGAACATATCTCACATTCTAGAAAATCTTAATCTCTCTTAGAAAGCCTTTGGTGGATGC/TTTTTTTTTTTGGTTTGAACATATCTCACATTCTAGAAAATCTTAATCTCTCTTAGAAAGCCTTTGGTGGAT-- GCAGTGATCG 3070 het 3070 hom 15 10 10 12 N/A 0 0 315788 CASAVA_Build 2 228186797 1D ATCATTGCCC A/- AAAGTGGTCA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 A 4 3 315789 CASAVA_Build 2 228208889 2D GAAATCATGG AT/-- GGTCAACAGT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AT 1 0 315790 CASAVA_Build 2 228209572 1D CAGTAGAATG C/- AAGTTAACTT 3070 hom 90 het 37 0 31 8 C 1 0 315791 CASAVA_Build 2 228213545 1I TCCAGTATTA -/T TTTTTCCTAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 5 6 315792 CASAVA_Build 2 228215380 1I AGACTAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 10 11 315793 CASAVA_Build 2 228217636 1I GTGGGAGCTG -/A AAACCCTCAG 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 3 4 315794 CASAVA_Build 2 228219363 5D AAACTACTTG GTAGT/----- TGGTGTTGAA 3070 hom 84 het 30 0 28 3 GTAGT 1 0 315795 CASAVA_Build 2 228224778 5D ATTAGCCAGG AAATC/----- AAATCTCAAA 3070 het 3070 hom 45 21 22 3 AAATC 2 1 315796 CASAVA_Build 2 228231080 2D CGGAGTGAGA CT/-- CTGTCTAAAA 878 het 429 hom 14 3 4 7 CT 2 1 315797 CASAVA_Build 2 228231345 1D CTGAAAGTTT G/- AGAGAGATTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 G 1 0 315798 CASAVA_Build 2 228241183 1D TGGCCTATCG T/- TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 52 24 24 5 T 7 6 315799 CASAVA_Build 2 228243399 1D TTCTCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 9 T 15 14 315800 CASAVA_Build 2 228247811 4D CGTTCTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 TTTG 3 2 315801 CASAVA_Build 2 228249106 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1756 hom 19 4 12 3 A 11 12 315802 CASAVA_Build 2 228249740 1D CACAGGGAGA C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 C 5 4 315803 CASAVA_Build 2 228250160 1D GAAGCTAAAT A/- ATGTGCATAC 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 A 2 1 315804 CASAVA_Build 2 228250680 1I GTATTGCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 9 10 315805 CASAVA_Build 2 228251495 1D ACAACCCCAT C/- AAAAAGTGGG 2479 het 1989 hom 10 4 6 0 C 1 0 315806 CASAVA_Build 2 228252328 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAGGAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 6 7 315807 CASAVA_Build 2 228254711 2D GAATATGGGG TC/-- TCTCTGTCAG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 TC 3 2 315808 CASAVA_Build 2 228256932 1I CTAATTTTTG -/T TATTTTTTGT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 T 1 2 315809 CASAVA_Build 2 228264972 1I CAACCTATCC -/A GATTGAACCA 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 A 0 1 315810 CASAVA_Build 2 228265566 1D ATTGAATGGG A/- AAAAGCTGAA 3070 het 3070 ref 52 27 23 2 A 5 4 315811 CASAVA_Build 2 228269045 1D ACAGCCCCTG A/- AAAAAAACAT 3070 hom 80 het 29 0 25 5 A 8 7 315812 CASAVA_Build 2 228273332 1D CCCCGTCTAC A/- ACTAAAAACA 1840 het 291 hom 7 1 5 1 A 2 1 315813 CASAVA_Build 2 228274596 2D AAAAACAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 21 1 10 11 A 15 13 315814 CASAVA_Build 2 228276943 1I GGTCAAGCAG -/A AAAAAAACCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 7 8 315815 CASAVA_Build 2 228285344 1D CAATAAGAAT A/- GATGAACAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 1 0 315816 CASAVA_Build 2 228285781 1D CACAAAAAAA T/- GTATGATTTC 3070 hom 84 het 31 0 28 4 T 1 0 315817 CASAVA_Build 2 228286215 1I ATTAAGTAAA -/T TGACTGGGCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 315818 CASAVA_Build 2 228286438 16D GTGCTCATGA ATGAATTAGCTCATTC/---------------- ATGAATTAAT 3070 hom 59 het 22 0 19 6 ATGAATTAGCTCATTC 1 0 315819 CASAVA_Build 2 228286757 1I AGATGATTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 9 10 315820 CASAVA_Build 2 228292521 1I AAACAGAGAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 7 8 315821 CASAVA_Build 2 228293561 3I TTATTGAGTA ---/ACT ACTATGTGCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ACT 1 2 315822 CASAVA_Build 2 228296879 1D AAGAGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 19 1 14 4 T 11 10 315823 CASAVA_Build 2 228311748 8D TTCTTTTTTT TTTCGAGA/-------- TTTCGAGATG 3070 hom 33 het 15 0 11 5 TTTCGAGA 2 1 315824 CASAVA_Build 2 228312814 2I TACTTAATCC --/CT GGAATTTATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CT 0 1 315825 CASAVA_Build 2 228313318 6I TCTCAAAAAA ------/AAAAAG AAAAAAGAAG 3070 hom 62 het 44 1 35 8 AAAAAG 0 1 315826 CASAVA_Build 2 228314254 1I ACAAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 34 1 26 7 A 11 12 315827 CASAVA_Build 2 228317981 1D GCTGGTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 12 11 315828 CASAVA_Build 2 228323828 5D TACATATCCA TATGT/----- TATATGTATA 3070 het 3070 hom 33 15 18 2 TATGT 1 0 315829 CASAVA_Build 2 228325598 1I AAATTACAGA -/T TAGGGGTCAC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 1 2 315830 CASAVA_Build 2 228326592 4D35M4D TCCTTCCTTC CTTTCTTTCTTTCTTCCTTTCTTTCTTTCTCTCTTTCTTTTTC/----CTTTCTTTCTTCCTTTCTTTCTTTCTCTCTTTCTT---- TTTCTTTCTT 1535 het 1535 ref 12 10 6 4 N/A 0 0 315831 CASAVA_Build 2 228337009 9D TAGACTTTTA ATTATTATT/--------- ATTATTATTA 3070 het 1066 hom 21 5 11 5 ATT 9 6 315832 CASAVA_Build 2 228348082 17D TTACAGGAGT TTTCTAAGTTCTTAACA/----------------- TTTCTAATGG 3070 het 3070 ref 38 28 14 5 TTTCTAAGTTCTTAACA 1 0 315833 CASAVA_Build 2 228351760 1D CTTAGGAGAT G/- GGGGTCTCCC 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 G 5 4 315834 CASAVA_Build 2 228353236 1I CTTTGCAGGG -/T TTTTTTTTGC 3007 het 3007 ref 30 16 7 7 T 8 9 315835 CASAVA_Build 2 228353616 1D TGGCTAATAT G/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 G 1 0 315836 CASAVA_Build 2 228358982 3D TGCCTAGGGA TCC/--- AAACAATTTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 8 TCC 1 0 315837 CASAVA_Build 2 228363437 2D CATCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2240 hom 23 8 7 8 T 14 12 315838 CASAVA_Build 2 228371537 1D ACTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1264 het 105 hom 24 1 5 18 T 17 16 315839 CASAVA_Build 2 228387545 1D GCACATTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 650 hom 39 2 29 9 T 13 12 315840 CASAVA_Build 2 228395160 30D ATATATGTAC ATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------ ATATATATAT 3070 hom 60 het 23 0 21 6 AT 21 6 315841 CASAVA_Build 2 228395428 1D GTTTGGCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 33 1 23 9 T 14 13 315842 CASAVA_Build 2 228395442 1D TTTTTTTTTT G/- CTTTTAATCT 3070 het 4 hom 31 2 24 6 G 1 0 315843 CASAVA_Build 2 228407310 1D TAGTTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1800 het 331 hom 21 3 10 8 A 14 13 315844 CASAVA_Build 2 228409105 2D TGAAATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1906 het 1906 ref 18 10 6 4 T 14 12 315845 CASAVA_Build 2 228410465 1D CAATCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 18 0 10 8 T 11 10 315846 CASAVA_Build 2 228418269 1I AAATGGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 34 1 26 7 A 11 12 315847 CASAVA_Build 2 228431212 1I CCTCCCCTGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 9 10 315848 CASAVA_Build 2 228439729 9D GTAGAGATGG GGTTTTTCC/--------- CTGTTGCCCA 3070 het 3070 hom 29 14 13 6 GGTTTTTCC 1 0 315849 CASAVA_Build 2 228441802 1D AAAAAGATGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 10 9 315850 CASAVA_Build 2 228442337 1D TGAGGTATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 10 9 315851 CASAVA_Build 2 228442741 1I TTAAAAGAAC -/A TTTTAAGAAG 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 0 1 315852 CASAVA_Build 2 228448981 2D GGATTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2008 hom 24 9 12 3 T 13 11 315853 CASAVA_Build 2 228451721 1D ATCCCTATCA T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 29 13 8 9 T 7 6 315854 CASAVA_Build 2 228453342 2D ACAAACAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 T 16 14 315855 CASAVA_Build 2 228458612 1I CTAAGGTCTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 A 7 8 315856 CASAVA_Build 2 228503290 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 A 10 11 315857 CASAVA_Build 2 228510155 2I ACAAAAGCAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 T 11 13 315858 CASAVA_Build 2 228512758 1I CGTATGGTGA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 T 7 8 315859 CASAVA_Build 2 228515051 4I TGTGCTATAG ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 54 27 17 10 AAAC 3 4 315860 CASAVA_Build 2 228515839 1I CATTAAGTTA -/T CCCTCTCTTA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 0 1 315861 CASAVA_Build 2 228516796 1I TTCTATAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 56 25 17 14 A 10 11 315862 CASAVA_Build 2 228517387 1I AGAAGAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2052 hom 24 9 11 4 T 10 11 315863 CASAVA_Build 2 228518534 6D GGTGGGTAAG GGGCTA/------ GGGAATGGGT 2673 het 2673 ref 29 17 7 9 GGGCTA 1 0 315864 CASAVA_Build 2 228519248 4I35M2I GGTAGAAGTA ----AGAGTCAGCCATGCTAACTTTCTCTCATTATAGTC--/AGATAGAGTCAGCCATGCTAACTTTCTCTCATTATAGTCTT TGCAAAGGTG 3070 het 3070 ref 38 29 22 5 N/A 0 0 315865 CASAVA_Build 2 228523850 2I CACCCCTTCC --/TG TGCTGCCTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TG 1 2 315866 CASAVA_Build 2 228527971 4I GAAAAAAATT ----/AATG AAGGTAAAAA 2756 het 2756 ref 31 22 6 3 AATG 0 1 315867 CASAVA_Build 2 228528706 1I TAAAGCTTTC -/A AATTGAATAG 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 2 3 315868 CASAVA_Build 2 228529105 4I TTATATAGAC ----/ATAT ATATGTGTGT 517 hom 5 het 9 0 2 7 AT 2 4 315869 CASAVA_Build 2 228542402 5I ATAAAAAATA -----/AAAAT AAAGGTGATT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 AAAAT 0 1 315870 CASAVA_Build 2 228547902 1I TATAGCTACA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 6 7 315871 CASAVA_Build 2 228548241 8D TAAATATATT GGAGAGCC/-------- GGAGAGCCTA 3070 hom 90 het 36 0 29 10 GGAGAGCC 2 1 315872 CASAVA_Build 2 228551931 4D TAACAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 AAAC 5 4 315873 CASAVA_Build 2 228553632 1D TCATGTCAAA C/- ACAAGACCAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 C 1 0 315874 CASAVA_Build 2 228553999 3D TTTATCTTCC TCT/--- TCTTCAGTTG 3070 het 3070 ref 36 16 18 3 TCT 2 1 315875 CASAVA_Build 2 228555012 2D ATCAAGTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 2573 het 2573 ref 33 15 13 5 T 18 16 315876 CASAVA_Build 2 228556589 4D TCAAGAAGAC TGTT/---- TGGAATGTGG 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 TGTT 1 0 315877 CASAVA_Build 2 228560664 1I TTAGGTGCCC -/T CCAACTCCAA 3070 het 3070 ref 59 31 21 7 T 0 1 315878 CASAVA_Build 2 228567213 1I ACCTGGTACC -/T TTTTTTACTG 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 T 6 7 315879 CASAVA_Build 2 228581644 1D TCTGGATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 18 13 T 13 12 315880 CASAVA_Build 2 228584190 2D CAAAGATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 871 hom 32 7 10 15 T 16 14 315881 CASAVA_Build 2 228594658 1D GGCACTAATT G/- GAAAGTTCTC 3070 het 3070 hom 52 17 29 7 G 2 1 315882 CASAVA_Build 2 228599584 4I GCCCTCCCTG ----/CTCT CTCTTTGATG 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 CT 2 4 315883 CASAVA_Build 2 228601909 2I TTTGAAAGAT --/AA AAAAAGACTT 3070 het 3070 ref 55 30 21 4 A 5 7 315884 CASAVA_Build 2 228603415 1D CAGAGGTTGC A/- AGTGAGCCAA 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 A 2 1 315885 CASAVA_Build 2 228612400 1I GAAATACACA -/G GTTTTTTTTA 1883 het 1883 ref 31 23 4 4 G 1 2 315886 CASAVA_Build 2 228614607 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1002 het 305 hom 26 6 8 12 A 19 18 315887 CASAVA_Build 2 228622512 13I CATGTGCACC -------------/TGGGCTTGTTACA TGGGCTTACT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TGGGCTTGTTACA 0 1 315888 CASAVA_Build 2 228627827 1I CTTATGATAT -/A AAAAAGTGGT 3070 hom 85 het 31 0 29 2 A 5 6 315889 CASAVA_Build 2 228642410 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2551 hom 34 het 17 0 10 7 T 15 14 315890 CASAVA_Build 2 228655417 3I AGTAGATAAA ---/GTT GTTGTTATTA 3070 hom 132 het 51 0 44 7 GTT 2 3 315891 CASAVA_Build 2 228666690 4D TGGTGGCGGG TGCC/---- TGTAATCTCA 3070 hom 42 het 18 0 14 4 TGCC 1 0 315892 CASAVA_Build 2 228672815 1D ATTTTTTTTT G/- TTTGTTTTTT 3070 het 397 hom 17 1 14 2 G 1 0 315893 CASAVA_Build 2 228680029 3D TCACGTAGTT ATC/--- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 ATC 1 0 315894 CASAVA_Build 2 228683589 1D CTAAGATGTT A/- TTTGTTCTTT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 A 1 0 315895 CASAVA_Build 2 228686149 1I ATAAGATATA -/T TTTTTCCATA 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 5 6 315896 CASAVA_Build 2 228697279 1I CAATAGCAAA -/G ACTTGGAACC 2929 het 2750 hom 14 6 6 2 G 0 1 315897 CASAVA_Build 2 228697682 21D CCCTAAAACT TAAAGTATAAAAAGAAAAAAG/--------------------- TCTCTAGAGA 3070 het 3070 ref 27 20 9 3 TAAAGTATAAAAAGAAAAAAG 1 0 315898 CASAVA_Build 2 228711875 19I GAAAAGATGG -------------------/GTGAGAACATTTTATTACA GCTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 33 16 16 3 GTGAGAACATTTTATTACA 0 1 315899 CASAVA_Build 2 228717429 2I ACATAGTTTC --/AT ATATATAGAA 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 AT 3 4 315900 CASAVA_Build 2 228722689 1I AAATTTTCCC -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 T 7 8 315901 CASAVA_Build 2 228730115 1D CATTTGAATA T/- TACTCTTATA 3070 het 3070 hom 34 8 24 2 T 2 1 315902 CASAVA_Build 2 228748254 1I26M1D TAAATGAAGG -TTTTTTTTCATATTTCTAATTATTCTA/TTTTTTTTTCATATTTCTAATTATTCT- AAAATATCTG 3070 het 3070 ref 33 21 19 8 N/A 0 0 315903 CASAVA_Build 2 228749936 20D5M1I TTGTAGCTGT AACTCTGTAACACCAAGAAAAAACT-/--------------------AAACTA CAGTTCAAAT 3070 het 3070 ref 32 22 12 5 N/A 0 0 315904 CASAVA_Build 2 228757241 1D TGTATCTGTC A/- AAAGATTTTA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 4 3 315905 CASAVA_Build 2 228762813 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTCTTTT 2965 het 2084 hom 27 9 15 4 T 9 5 315906 CASAVA_Build 2 228779397 1D AATTAACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 31 1 23 7 A 12 11 315907 CASAVA_Build 2 228792830 4D GGGTGTGCCC TTAG/---- TTAGGTATGA 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 TTAG 2 1 315908 CASAVA_Build 2 228794042 2I AAACTGTGAC --/AG AATATAAAAT 3070 hom 62 het 26 0 21 5 AG 0 1 315909 CASAVA_Build 2 228800655 2D TCCCACAAAC AG/-- ATGCTCCAAG 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 AG 1 0 315910 CASAVA_Build 2 228843371 1I CCACCTTGCC -/A ACATTCTATT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 1 2 315911 CASAVA_Build 2 228845130 1I TTGAATTTTT -/A AAATTCAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 3 4 315912 CASAVA_Build 2 228863525 1D TTAAATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 636 hom 39 3 25 11 T 15 14 315913 CASAVA_Build 2 228864179 1I TTATAGGGAG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 7 8 315914 CASAVA_Build 2 228875240 1D GAACCACTTA G/- GACAGACCCA 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 G 2 1 315915 CASAVA_Build 2 228876231 1D TAACTAACAC T/- TTTTTTTTTT 2236 het 2236 ref 25 9 8 9 T 14 13 315916 CASAVA_Build 2 228882575 1I TTAGTTAATA -/T TTCTAGTTTC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 2 3 315917 CASAVA_Build 2 228887131 1D TCATCATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 15 14 315918 CASAVA_Build 2 228890364 1I CTCATGCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 796 hom 32 2 22 8 T 14 15 315919 CASAVA_Build 2 228902117 1I TTTCTTGATG -/C CTTGGCTGGG 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 C 1 2 315920 CASAVA_Build 2 228906001 8D CTTCAGTTGT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 46 13 25 8 AC 13 9 315921 CASAVA_Build 2 228906147 1D CATGCCACTT C/- TTTTTCATTT 3070 het 3070 ref 45 24 16 7 C 1 0 315922 CASAVA_Build 2 228920457 2D TCTTCCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2509 het 253 hom 41 6 10 25 T 20 18 315923 CASAVA_Build 2 228927689 1D53M1D GCATACAAAC TTTTTTTTTTTTAGCCTTTCTTTTAGAACAGGTGTACTTGTGACAAATTGTCTAT/-TTTTTTTTTTTAGCCTTTCTTTTAGAACAGGTGTACTTGTGACAAATTGTCTA- TTTTTTTTTT 3070 het 2481 hom 35 8 30 26 N/A 0 0 315924 CASAVA_Build 2 228928481 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 890 hom 25 2 15 9 A 16 15 315925 CASAVA_Build 2 228929957 1I GATTATCTTA -/T TTTTTTTTTT 2931 het 2289 hom 20 6 11 3 T 12 13 315926 CASAVA_Build 2 228931875 1D GTTATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1193 het 525 hom 7 3 3 1 T 17 16 315927 CASAVA_Build 2 228933955 3I TATTCCTTAA ---/AAC AACTCAATTG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AAC 1 2 315928 CASAVA_Build 2 228939557 12D TGTCTCTCTG TTTCTGTCTCTA/------------ TTTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 37 15 21 7 TTTCTGTCTCTA 1 0 315929 CASAVA_Build 2 228944146 1I CAGGCTGGTC -/T TCGAACTCCT 2591 het 1258 hom 12 4 6 2 T 1 2 315930 CASAVA_Build 2 228949608 1I GTCTTTCTTA -/T CTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 0 1 315931 CASAVA_Build 2 228964745 1D CTGATTATTT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 8 7 315932 CASAVA_Build 2 228966159 1I GGACATGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 33 0 21 12 T 10 11 315933 CASAVA_Build 2 228975220 1D TTTCTATTAG T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 7 6 315934 CASAVA_Build 2 228992936 5I CATATTCCTA -----/TTTCT TTTCTTTTCT 2453 het 955 hom 12 3 6 3 TTTCT 2 3 315935 CASAVA_Build 2 228999622 4D AGCTTACTAA AAAC/---- AAACAAATGA 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 AAAC 2 1 315936 CASAVA_Build 2 229000529 2D TTCACTGTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 34 12 16 8 TG 8 7 315937 CASAVA_Build 2 229001001 1I TTGAGTTGTC -/A AAAGTTGAGC 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 3 4 315938 CASAVA_Build 2 229003724 1D AGTGTTCAAA T/- TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 T 7 6 315939 CASAVA_Build 2 229004176 12D CTGCTGTGTG GTGTGTGTGTGT/------------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 27 12 12 9 GT 13 7 315940 CASAVA_Build 2 229008968 1D CCATGTTCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 7 16 8 T 10 9 315941 CASAVA_Build 2 229012855 1I TAACAGACTC -/T CACCATTATT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 T 0 1 315942 CASAVA_Build 2 229025702 1I CCCACCTCAG -/T TATCTGAGTA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 T 1 2 315943 CASAVA_Build 2 229037172 2I TGTTCATCAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 AC 7 8 315944 CASAVA_Build 2 229038602 2D GCATTGGGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 12 13 A 12 10 315945 CASAVA_Build 2 229040167 1I TCCTCTCCTC -/G TTACTGTAAA 3070 het 3070 hom 54 23 24 7 G 0 1 315946 CASAVA_Build 2 229050203 1D GTGTCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 12 11 315947 CASAVA_Build 2 229052909 1I GCTGTTTTAT -/A AAAAAATTAA 3001 het 3001 ref 29 17 7 5 A 6 7 315948 CASAVA_Build 2 229053506 2D ACACACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 AT 7 6 315949 CASAVA_Build 2 229056130 4I CCTCTTTTCC ----/TAAT TAATTGAATA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TAAT 1 2 315950 CASAVA_Build 2 229056730 4I ATGTTCTATG ----/ATGA ATGAAATATG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 ATGA 1 2 315951 CASAVA_Build 2 229056931 4I GGAGTAATCC ----/AAAG AAAGACAGGC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 AAAG 1 2 315952 CASAVA_Build 2 229058863 3D3M5D GTCTTGTCAT AAGTATAAAAG/---TAT----- AAGTTTGCGA 3070 het 3070 hom 42 19 19 7 N/A 0 0 315953 CASAVA_Build 2 229059099 2I ATTTCTACTG --/TT TTATACTTTC 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 T 2 4 315954 CASAVA_Build 2 229061257 1D TATTCAAGAT A/- AAAAAATTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 7 6 315955 CASAVA_Build 2 229065847 2D CAATGGCTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 23 0 16 7 A 13 11 315956 CASAVA_Build 2 229071199 1I TAAAAAGACG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 A 9 10 315957 CASAVA_Build 2 229074352 2D CTTCAAATTT TC/-- TCTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 TC 2 1 315958 CASAVA_Build 2 229076092 1I CTACGTTGCT -/G TGTTCTGTTC 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 G 0 1 315959 CASAVA_Build 2 229077511 2D TCTTTGTCTC TT/-- GGAGCTTTTG 3070 het 3070 hom 48 24 23 2 T 2 0 315960 CASAVA_Build 2 229082904 2D CCAGGATATA CT/-- AAGACTTTTA 3070 het 3070 ref 36 23 10 5 CT 1 0 315961 CASAVA_Build 2 229087223 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 38 19 17 4 A 8 7 315962 CASAVA_Build 2 229096002 2D CAAAAAAAAA AG/-- AGTGTTTTCA 3070 hom 75 het 30 0 25 6 AG 2 1 315963 CASAVA_Build 2 229097194 1I GTATCTACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 30 2 22 6 A 12 13 315964 CASAVA_Build 2 229110670 1I CTGGAGAGAG -/A AAAAAATGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 6 7 315965 CASAVA_Build 2 229110833 1D TTTTTTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 11 10 315966 CASAVA_Build 2 229113909 4I TAATGAAGTC ----/AGAG AGATTATGCA 3070 hom 156 het 61 0 52 9 AG 1 3 315967 CASAVA_Build 2 229121503 1I CTGCAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2064 hom 55 6 38 11 A 12 13 315968 CASAVA_Build 2 229133998 1D CTCCAGAATA G/- GGAATGTTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 3 2 315969 CASAVA_Build 2 229151539 2D ATTGTTCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 28 1 14 14 T 18 16 315970 CASAVA_Build 2 229154771 1D CTTTCCTCCT C/- CTTTTTTTTT 828 het 322 hom 29 5 4 21 C 2 1 315971 CASAVA_Build 2 229159008 1D ACCAACAAAC A/- AAAAAACTCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 7 6 315972 CASAVA_Build 2 229167508 4D ATAAATAGAA ACTT/---- AGAGTCTAGG 3070 hom 132 het 47 0 42 9 ACTT 1 0 315973 CASAVA_Build 2 229168463 1D TGCTATTGTT A/- AAAAACTCCA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 6 5 315974 CASAVA_Build 2 229168752 1I TACAAAAACA -/C TTTTTTCATG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 C 0 1 315975 CASAVA_Build 2 229170623 1D GAAGGATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 19 8 T 13 12 315976 CASAVA_Build 2 229170741 1I AGTGAGAGAG -/T TTCTCTCTGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 T 2 3 315977 CASAVA_Build 2 229171714 1I TTTTTTTAAA -/T TTTTTTTTAA 2217 hom 21 het 14 0 8 6 T 8 9 315978 CASAVA_Build 2 229182632 1D AGTAAACTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 40 0 32 9 T 10 9 315979 CASAVA_Build 2 229196752 1I TAAAGCTGTT -/A AAAAAATAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 7 315980 CASAVA_Build 2 229206554 3I AAAGACAGCC ---/AGG TTTGAGCTTA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AGG 0 1 315981 CASAVA_Build 2 229226864 1I GATGTCCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 T 9 10 315982 CASAVA_Build 2 229228002 1D CTTAAGAATT A/- AAAAAAGGTC 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 7 6 315983 CASAVA_Build 2 229232343 1I ATAAGTACAC -/T TTTTTTGCAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 6 7 315984 CASAVA_Build 2 229235256 1D TTATTCATTC A/- TAATAAAAAC 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 A 1 0 315985 CASAVA_Build 2 229236798 11I TTATAGAGCT -----------/AATGGGGCCTC AATGCCCAAT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 AATGGGGCCTC 0 1 315986 CASAVA_Build 2 229238883 51I CAGCAAACCA ---------------------------------------------------/CCATGGCACATGTATACCTATGTAATAAACCTGCACGTTCAGCACATGTAT CCCAGAACTT 3070 hom 27 het 15 0 9 7 CCATGGCACATGTATACCTATGTAATAAACCTGCACGTTCAGCACATGTAT 0 1 315987 CASAVA_Build 2 229239766 1I TATATAATAA -/T TTTTTTTTTT 2462 het 1834 hom 26 6 10 10 T 15 16 315988 CASAVA_Build 2 229242852 12D AACCTTTCCA CACCAGTGGATC/------------ AGATACTCAC 3070 het 3070 ref 39 22 17 4 CACCAGTGGATC 1 0 315989 CASAVA_Build 2 229243588 1I GATACTTTAG -/A AAACTGTTAA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 3 4 315990 CASAVA_Build 2 229246404 1I GGGGTACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 9 10 315991 CASAVA_Build 2 229254364 1D CTTTTAAAAT A/- AAACAGTAAT 3070 het 3070 ref 42 18 18 7 A 4 3 315992 CASAVA_Build 2 229256390 1I ACTCTGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 10 11 315993 CASAVA_Build 2 229259501 1D AAATAAATAC T/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 T 7 6 315994 CASAVA_Build 2 229264297 1D TTCTTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 352 hom 31 3 18 10 T 15 14 315995 CASAVA_Build 2 229277577 2I GATTTTGAAA --/AT ATATATATAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 AT 4 5 315996 CASAVA_Build 2 229282590 2D AGATGAAGTG TA/-- TATCATTGTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 TA 2 1 315997 CASAVA_Build 2 229290141 1I TGAAGGAGTT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 A 7 8 315998 CASAVA_Build 2 229317001 1D TAATGAAAAG T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 T 8 7 315999 CASAVA_Build 2 229322533 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2236 het 2236 ref 21 8 5 8 A 11 12 316000 CASAVA_Build 2 229339397 2I CGAAACACCC --/CT GTTTCTTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CT 0 1 316001 CASAVA_Build 2 229342426 2I TACAGGGATC --/TT TTTCTGCTGT 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 3 5 316002 CASAVA_Build 2 229345515 1D GATTTATTTT G/- TTTTAACAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 6 G 1 0 316003 CASAVA_Build 2 229346522 1I CAGGGTGGAT -/G GGGAGGCTTC 3070 hom 153 het 59 0 51 8 G 3 4 316004 CASAVA_Build 2 229350700 2I AACTGGTGAA --/AG AGGGGATGAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 AG 1 2 316005 CASAVA_Build 2 229354954 1D CTTGCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2188 het 2188 ref 31 10 9 12 T 15 14 316006 CASAVA_Build 2 229375151 1D AGAGTAGAGG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 30 10 14 7 A 8 7 316007 CASAVA_Build 2 229426590 1I GTCAATGGAG -/C TTTTATGGTC 3070 het 3070 ref 42 28 11 3 C 0 1 316008 CASAVA_Build 2 229428879 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 1498 het 421 hom 10 1 5 4 A 11 12 316009 CASAVA_Build 2 229437554 1I ATTTCCTGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 A 9 10 316010 CASAVA_Build 2 229440424 10D GGCATGATCT CAGCTCACCA/---------- CAACCTCTGC 3070 het 1074 hom 21 3 13 6 CAGCTCACCA 1 0 316011 CASAVA_Build 2 229447875 5I GGTATACCTT -----/TTTAA GCTCAAAGTA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 TTTAA 0 1 316012 CASAVA_Build 2 229450285 1D TAGATGCCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 15 11 13 T 9 8 316013 CASAVA_Build 2 229465042 1I TTATAATAGA -/T TTTTTTTTTC 2164 het 2164 ref 20 12 5 3 T 9 10 316014 CASAVA_Build 2 229468573 1D TCTATGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 T 12 11 316015 CASAVA_Build 2 229473722 2D GGCCAGGACA CT/-- CTCTGTTTGT 3070 het 3070 ref 53 22 23 8 CT 3 2 316016 CASAVA_Build 2 229474835 1I ACTCTTTAGA -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 T 6 7 316017 CASAVA_Build 2 229488117 1I AATGTGGAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 9 10 316018 CASAVA_Build 2 229491728 4D TTGAAAAATA AAGT/---- ATTACATATC 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 AAGT 1 0 316019 CASAVA_Build 2 229492632 1I GTCCCCACAC -/A AAACCTCATG 3070 het 3070 hom 52 20 28 4 A 3 4 316020 CASAVA_Build 2 229514759 2D GTTTTCTAAA TG/-- ATATAGTATT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 TG 1 0 316021 CASAVA_Build 2 229526095 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 15 5 A 10 9 316022 CASAVA_Build 2 229551877 4I CAATTAAACC ----/TCTT TCTTTCCTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 TCTT 1 2 316023 CASAVA_Build 2 229553181 1D CCTTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 11 10 316024 CASAVA_Build 2 229553314 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 964 hom 18 4 12 2 A 9 10 316025 CASAVA_Build 2 229557196 2D TGCCATTGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 13 14 T 13 11 316026 CASAVA_Build 2 229571138 1D TGACTGGATC A/- ATGGGAGTGG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 2 1 316027 CASAVA_Build 2 229573636 1I GTGCCTGCTT -/C CCCTTCGCCT 3070 het 3070 hom 47 20 15 12 C 3 4 316028 CASAVA_Build 2 229582289 1D TAGTAAAACT A/- GTGGTGAACT 3070 het 3070 hom 64 27 32 5 A 1 0 316029 CASAVA_Build 2 229587550 1D CCGGGATGGG T/- TTCTGTGAAG 3070 het 3070 hom 48 18 22 9 T 3 2 316030 CASAVA_Build 2 229596163 1I TGGTAGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 A 10 11 316031 CASAVA_Build 2 229596590 1D GTCCCATCAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 27 9 12 8 A 8 7 316032 CASAVA_Build 2 229598339 3I TGAGAAAAAT ---/AAG AAGAGAGCCT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AAG 1 2 316033 CASAVA_Build 2 229602234 1D ATCCCTGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 31 0 24 8 A 10 9 316034 CASAVA_Build 2 229603548 4I AGGCACACTT ----/TATC TCTCTCTCTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TATC 0 1 316035 CASAVA_Build 2 229629648 1I TTCCCAATGC -/A ACCACCAAGC 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 A 1 2 316036 CASAVA_Build 2 229629994 8D GAGAAAGAAA TTTTTATT/-------- TTATTATTTT 3070 hom 60 het 21 0 21 2 TTTTTATT 1 0 316037 CASAVA_Build 2 229641405 1D TGTCTTCAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 143 hom 38 1 33 4 A 10 9 316038 CASAVA_Build 2 229657807 93D3M1D TCTTTACTGC TTTAAAGCTTCATAATTCACAGCGAGCAAGCAGTTAGGATACGGCCTAAGAAAAATACTGCTTTATTTTCCTTAGTAGTTCAAAGGAGATAGTTCAT/---------------------------------------------------------------------------------------------TCA- TTCAGTAGAA 3070 het 3070 ref 34 39 12 2 N/A 0 0 316039 CASAVA_Build 2 229658184 1D ATATACTTGT A/- AAAAAAAAAA 1631 het 1631 ref 43 24 5 14 A 17 16 316040 CASAVA_Build 2 229664327 1I TCTGGTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2970 hom 39 13 22 4 A 12 13 316041 CASAVA_Build 2 229666729 1D ATAAAAAAAA G/- AACCCCTCAA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 G 1 0 316042 CASAVA_Build 2 229679977 2D GTTTCCTTAT AA/-- GAGACAGGAG 3070 het 3070 hom 46 16 28 2 A 2 0 316043 CASAVA_Build 2 229681053 3D9M1I AAAACAAGAA AAGAAAAGAAAG-/---AAAAGAAAGA AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 31 11 19 4 N/A 0 0 316044 CASAVA_Build 2 229701101 1I TGGATTGGGA -/T TTTTGTACCA 3070 hom 111 het 47 0 37 10 T 4 5 316045 CASAVA_Build 2 229707894 4D AATTTTATGT ACTA/---- ACCTATTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 17 4 ACTA 1 0 316046 CASAVA_Build 2 229708152 1I CTCCACTTGC -/T TTTTCTCTTG 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 4 5 316047 CASAVA_Build 2 229710560 2I GCAGGTAATG --/CA CACTGTAAAG 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 CA 1 2 316048 CASAVA_Build 2 229711827 1I TAGAAGGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2540 hom 26 9 14 3 A 9 10 316049 CASAVA_Build 2 229714021 4I GTATCTATGT ----/GGCA GGCAGGATGA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 GGCA 1 2 316050 CASAVA_Build 2 229714603 1D CAATCAATGT G/- GGGGGGGAAC 3070 het 3070 ref 62 33 23 6 G 8 7 316051 CASAVA_Build 2 229714838 3I AAACGAATGT ---/ATA ATATTTTCAT 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 ATA 1 2 316052 CASAVA_Build 2 229714966 1D GGATGTAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 10 9 316053 CASAVA_Build 2 229728651 3D CTCTGTGAAT TTA/--- TTTTGTTGGT 3070 het 3070 ref 35 17 16 4 TTA 1 0 316054 CASAVA_Build 2 229730916 1I AAAGTGCACG -/T TATCAAGAAG 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 T 1 2 316055 CASAVA_Build 2 229736462 1I CATGGAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 11 12 316056 CASAVA_Build 2 229736643 2D GTGCGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1092 het 1092 ref 28 14 9 7 GT 7 6 316057 CASAVA_Build 2 229738837 1I TAGATAACCT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 128 het 49 0 43 6 A 8 9 316058 CASAVA_Build 2 229739925 6D AGAAAAGAAA GGAAGG/------ GGAAGGGGAA 3070 hom 61 het 31 0 16 15 GGAAGG 4 3 316059 CASAVA_Build 2 229741698 2D CTGTGTGTGT GC/-- GTCTCATATA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 GC 1 0 316060 CASAVA_Build 2 229747684 2D ATGCATGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 1149 het 497 hom 28 4 4 22 A 16 14 316061 CASAVA_Build 2 229748291 1D GACTATGTTC A/- AATACCAAGA 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 A 3 2 316062 CASAVA_Build 2 229753035 2D CATGCACTTC GT/-- ATACAGGTCC 3070 het 3070 hom 52 18 26 9 GT 1 0 316063 CASAVA_Build 2 229754719 1D ATCATTATCA G/- AGATGTCTCT 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 G 1 0 316064 CASAVA_Build 2 229755218 8D CAAATGTGCC CCTCTGGT/-------- CCTCTGGTGA 3070 het 3070 ref 47 25 19 5 CCTCTGGT 2 1 316065 CASAVA_Build 2 229755375 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 8 9 316066 CASAVA_Build 2 229767887 1D TCATTGCTAT A/- AAAAAATTAC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 A 7 6 316067 CASAVA_Build 2 229778214 2D ATACACACAC AT/-- ACTACATACA 3070 het 3070 hom 34 17 17 1 AT 1 0 316068 CASAVA_Build 2 229779267 1I TAATGGTTAA -/T TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 T 5 6 316069 CASAVA_Build 2 229785064 1D AAGTTAGGTC T/- TTATTATGGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 3 2 316070 CASAVA_Build 2 229787236 4D CTCAAGTCAT CTTA/---- CTTGGGGGTA 3070 het 3070 hom 42 17 17 9 CTTA 1 0 316071 CASAVA_Build 2 229797793 3D GATTCAGAAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 38 0 27 12 A 16 13 316072 CASAVA_Build 2 229801695 1I AAACAAAAAG -/T GTATCTGCTA 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 T 0 1 316073 CASAVA_Build 2 229802437 1D TACAAAAAAA T/- ATATGAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 T 1 0 316074 CASAVA_Build 2 229805608 2D CACATCAATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 25 11 10 5 TG 7 6 316075 CASAVA_Build 2 229807322 1D GAAGAGGGAA G/- AAGACAAGTC 3070 het 3070 ref 50 23 22 7 G 1 0 316076 CASAVA_Build 2 229808456 1D TGTTTATGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 10 9 316077 CASAVA_Build 2 229809122 1D TTGGCTTTTG A/- AAAAAAACAT 3070 hom 135 het 51 0 44 7 A 8 7 316078 CASAVA_Build 2 229824236 2D AGGTACTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 100 het 39 0 34 5 T 13 11 316079 CASAVA_Build 2 229833424 2D AAAAAGTTGC AT/-- ATATATATAT 1823 het 1823 ref 14 8 6 0 AT 8 7 316080 CASAVA_Build 2 229834857 1D CATGGCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 748 hom 33 6 12 15 T 13 12 316081 CASAVA_Build 2 229839231 1I CTTCTCCCCA -/T TTTTTTTTTT 2461 het 2461 ref 31 11 10 10 T 10 11 316082 CASAVA_Build 2 229843956 1I TGGCCCCCGG -/C CTCCCGGGTG 1654 hom 39 het 17 0 9 8 C 1 2 316083 CASAVA_Build 2 229862705 1D ATCTTAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 29 0 19 10 T 15 14 316084 CASAVA_Build 2 229871073 1D GGTTTTCTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 9 8 316085 CASAVA_Build 2 229872269 12D CTCCCCCACT CACACATCCTCA/------------ CACACACCCT 3070 hom 132 het 47 0 41 7 CACACATCCTCA 1 0 316086 CASAVA_Build 2 229881634 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 114 hom 22 1 12 9 A 17 16 316087 CASAVA_Build 2 229891756 3I GATGCTTCCA ---/GAT GATAGTTTCT 3070 hom 129 het 54 0 43 11 GAT 1 2 316088 CASAVA_Build 2 229898525 1I CCAGAAACAC -/A CACTGCTGTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 0 1 316089 CASAVA_Build 2 229923296 1D CAGCCTGGCC G/- GACATGGTGA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 G 2 1 316090 CASAVA_Build 2 229931722 1D CTGTAAAAAC A/- TATTCTATAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 1 0 316091 CASAVA_Build 2 229934179 1I ACTAACAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1530 hom 46 4 30 12 T 11 12 316092 CASAVA_Build 2 229953176 1I CTACATTAGA -/C AAACACTGAG 3070 hom 153 het 59 0 46 13 C 0 1 316093 CASAVA_Build 2 229975104 1I AACCATAAAA -/G GAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 40 0 32 8 G 1 2 316094 CASAVA_Build 2 229977893 3I TGTAATTATG ---/TAA GACTAAAATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAA 0 1 316095 CASAVA_Build 2 229979783 2D CCCTTGACAC TT/-- TTATATCTTG 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 4 2 316096 CASAVA_Build 2 229984517 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 10 11 316097 CASAVA_Build 2 229988123 1D ACTCCATCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2624 hom 19 10 8 2 A 11 10 316098 CASAVA_Build 2 229998945 1I CTGAAGTGAG -/T TGCAGGGCTG 3070 het 3070 hom 52 21 22 9 T 1 2 316099 CASAVA_Build 2 230001632 1D AAGTGATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 14 7 A 13 12 316100 CASAVA_Build 2 230018726 2D TTAAAATAAA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 TC 7 6 316101 CASAVA_Build 2 230026318 1I GGAGGGTTAT -/G GAGTTCAGCT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 1 2 316102 CASAVA_Build 2 230039510 1D GTCACACCCC T/- GATCATACTG 3070 het 3070 hom 30 14 13 5 T 1 0 316103 CASAVA_Build 2 230044010 1I AATTTTATGA -/G GGGTATGTGG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 3 4 316104 CASAVA_Build 2 230044316 1D CTATAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 48 1 42 5 A 11 10 316105 CASAVA_Build 2 230050224 1D CTGAATAAAA C/- AAAATGTACA 3070 het 3070 hom 41 16 19 10 C 1 0 316106 CASAVA_Build 2 230051202 4I AGTGTAACAC ----/TTTA TTTATTTCTA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 TTTA 1 2 316107 CASAVA_Build 2 230054518 2D TCTACACAAA TC/-- TCACCCTTCC 3070 het 3070 ref 28 12 8 10 TC 2 1 316108 CASAVA_Build 2 230057017 8D CTGCCTTGTT TGGAGAGA/-------- AACCTCTGGA 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 TGGAGAGA 1 0 316109 CASAVA_Build 2 230058780 1I CTGAAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 12 11 11 A 11 12 316110 CASAVA_Build 2 230062488 3D GGAAGGTGGT GAG/--- GAGGAGGGGG 2860 het 1870 hom 27 10 11 9 GAG 3 2 316111 CASAVA_Build 2 230065622 1I TCACAACTCA -/T TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 T 6 7 316112 CASAVA_Build 2 230066602 15D CTCATATAGA ATTGTATCTCATTCT/--------------- ATTCACCCAT 3070 het 3070 ref 43 24 20 4 ATTGTATCTCATTCT 1 0 316113 CASAVA_Build 2 230070957 6I AAACTACAGG ------/TCAATA TCCCTGATGA 3070 het 3070 ref 45 30 12 3 TCAATA 0 1 316114 CASAVA_Build 2 230073726 5I GAGTAGGTTA -----/TTTAG TGGCGATATG 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 TTTAG 0 1 316115 CASAVA_Build 2 230086944 1D CCACCCAGTA C/- CCCCCATAAG 3070 het 3070 hom 44 18 20 7 C 6 5 316116 CASAVA_Build 2 230161459 1I CTGGGAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 10 11 316117 CASAVA_Build 2 230163005 2D CAAAAATCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 36 1 16 20 T 13 11 316118 CASAVA_Build 2 230168946 1D CTTTCCTTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 16 9 T 10 9 316119 CASAVA_Build 2 230170044 24D AACATGTGTG CACACATGCACACACACATGCACA/------------------------ CACACATGCA 3070 het 3070 ref 52 33 24 7 CACACATGCACA 3 1 316120 CASAVA_Build 2 230171549 2D AATGCTGAGG GA/-- GAGAATGGAT 3070 het 3070 ref 47 20 19 9 GA 3 2 316121 CASAVA_Build 2 230172398 1D AATTGGATAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 8 7 316122 CASAVA_Build 2 230178685 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 10 11 316123 CASAVA_Build 2 230188754 1D GACTAGCGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 27 0 18 9 A 12 11 316124 CASAVA_Build 2 230189323 1I TTATTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 9 22 8 T 10 11 316125 CASAVA_Build 2 230190509 1D TCTAACACAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 A 9 8 316126 CASAVA_Build 2 230194119 5D TGCAGATATT AAAAC/----- AAAACAAAAG 3070 het 3070 hom 43 19 18 8 AAAAC 2 1 316127 CASAVA_Build 2 230198844 9D CTATGCAACT TTGTTTTTG/--------- TTGTTTTTGT 3070 hom 67 het 34 0 23 11 TTGTTTTTG 2 1 316128 CASAVA_Build 2 230203943 1D TCTTTTTTAT G/- GCTGTGTAGT 3070 hom 108 het 38 0 37 2 G 2 1 316129 CASAVA_Build 2 230224904 4D CTCCGGTGGT AGAG/---- AGAAAGTCAG 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 AG 3 1 316130 CASAVA_Build 2 230230162 1D GTGAGTTTGA T/- TTTTTTAGAC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 7 6 316131 CASAVA_Build 2 230234401 1D ACTACCAAGA C/- CAGGAAATAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 2 1 316132 CASAVA_Build 2 230240442 4D3M5D CAAATAGACA TCCTTAATGACT/----TAA----- ATTACATAAA 3070 het 3070 ref 52 27 25 2 N/A 0 0 316133 CASAVA_Build 2 230267421 3D GACTCAATGA CTT/--- CCGCCTGTGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 CTT 1 0 316134 CASAVA_Build 2 230277569 1D GACGTTCTAG A/- AAAAATGCAA 3070 hom 104 het 40 0 30 10 A 6 5 316135 CASAVA_Build 2 230291985 3D GTGTGATGTA CAT/--- CATGTATGTA 3070 het 3070 ref 64 36 23 8 CAT 2 1 316136 CASAVA_Build 2 230292613 1D TTAAATTCTG T/- TTGAGACAGG 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 T 3 2 316137 CASAVA_Build 2 230295988 1I GGTATGTGCA -/T TTTATAATTT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 3 4 316138 CASAVA_Build 2 230309756 1D ACTCCTCACC A/- AAAAAAAAAA 2301 het 2301 ref 29 19 6 4 A 11 10 316139 CASAVA_Build 2 230327981 1D TGTCTTCCCA T/- TATTAAAATG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 2 1 316140 CASAVA_Build 2 230336498 2D CGATGACTTC AT/-- AGTGTTCCAA 3070 het 3070 hom 47 21 25 2 AT 1 0 316141 CASAVA_Build 2 230347790 1D ACTGTGATCT A/- AAAAAAAAAA 1594 het 1594 ref 29 15 5 9 A 15 14 316142 CASAVA_Build 2 230357494 1I AAAAGATAAA -/C TGGATTTCAT 2953 het 1614 hom 20 6 8 6 C 0 1 316143 CASAVA_Build 2 230363858 1D TGGGAATAAG T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 T 7 6 316144 CASAVA_Build 2 230385783 1D AAAACAGAAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 9 8 316145 CASAVA_Build 2 230396646 2D AAAAAAAAAA AC/-- AACAACAACA 237 het 237 ref 18 8 2 9 AC 1 0 316146 CASAVA_Build 2 230418827 1D AATTACGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 25 9 A 11 10 316147 CASAVA_Build 2 230419635 1I AAATAAATTT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 7 8 316148 CASAVA_Build 2 230446997 5D TTGTAGAAAT TAAAA/----- TAAACCATAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 TAAAA 1 0 316149 CASAVA_Build 2 230463041 1D AGGTTAACTC T/- TTTTTTTTTT 1818 het 471 hom 26 5 8 13 T 17 16 316150 CASAVA_Build 2 230466454 1I ACTGTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 38 0 33 5 T 13 14 316151 CASAVA_Build 2 230474581 1I AGACTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1133 hom 25 3 15 7 A 14 15 316152 CASAVA_Build 2 230480745 2I TCTAAACAAC --/AG AGAGAGACCT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AG 3 4 316153 CASAVA_Build 2 230488592 3I AAGTTAAAAA ---/AAG AAGGGTGAGG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 AAG 1 2 316154 CASAVA_Build 2 230489497 1D CCTGGGTGAC A/- AAAGTGAGAC 3070 het 3070 hom 39 15 24 0 A 4 3 316155 CASAVA_Build 2 230496214 3D GCTCCACAAC AAT/--- AAGACCGAGG 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 AAT 1 0 316156 CASAVA_Build 2 230501934 1I TTTCTTTTCA -/T TTTTTTTTTT 2435 het 1124 hom 19 4 10 5 T 12 13 316157 CASAVA_Build 2 230531177 1I ACCTTTACAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 9 10 316158 CASAVA_Build 2 230546069 3I TAAATTCGTT ---/AGG AAAAATTCTT 3070 het 3070 hom 29 14 11 4 AGG 0 1 316159 CASAVA_Build 2 230548771 1D TTTTTTTGGT G/- GGGGGGCGGG 1775 hom 10 het 5 0 4 1 G 7 6 316160 CASAVA_Build 2 230568442 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 9 8 316161 CASAVA_Build 2 230573316 9D AGACTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 1258 het 1122 hom 18 8 4 9 A 23 14 316162 CASAVA_Build 2 230576498 1D GTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 23 1 13 9 T 13 12 316163 CASAVA_Build 2 230588020 1I AGACTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 2086 het 756 hom 25 5 6 14 A 15 16 316164 CASAVA_Build 2 230588547 3D CAAACATACA AAG/--- AAGAATTGTC 3070 het 3070 ref 38 20 14 8 AAG 2 1 316165 CASAVA_Build 2 230594214 3D CCAAAACTCA CTT/--- CTTCTAAGCT 3070 het 3070 hom 47 20 22 7 CTT 2 1 316166 CASAVA_Build 2 230625582 1I GGCGTTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 589 hom 34 2 26 6 A 10 11 316167 CASAVA_Build 2 230625820 1I ATGTACATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 447 hom 22 1 19 2 A 9 10 316168 CASAVA_Build 2 230625891 4D TCCCTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTTTC 1497 het 1497 ref 17 6 5 6 TC 5 3 316169 CASAVA_Build 2 230626999 1D TTAGGAGCTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 375 hom 31 1 24 6 A 9 8 316170 CASAVA_Build 2 230631599 1D GGTAAAATTA T/- TTTTTTTTTT 2978 het 2119 hom 19 7 9 3 T 12 11 316171 CASAVA_Build 2 230633838 4I ACCTATGATG ----/GTAA GTAGTGGGAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 GTAA 0 1 316172 CASAVA_Build 2 230635131 1I AGGGTGATGT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 7 8 316173 CASAVA_Build 2 230645187 1D TTTGGACAAT C/- TTTGCCTTAA 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 C 1 0 316174 CASAVA_Build 2 230646979 17D ACTACTTTTA ATAGTTACATGGGATAC/----------------- ATAGTTACAT 3070 hom 100 het 44 0 34 11 ATAGTTACATGGGATAC 2 1 316175 CASAVA_Build 2 230649368 2D TATTCCACCT GA/-- GAGAGAGAAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 GA 5 4 316176 CASAVA_Build 2 230654452 1D CTCAGATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 26 3 19 4 T 15 14 316177 CASAVA_Build 2 230657530 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1870 het 1870 ref 23 13 8 2 A 10 11 316178 CASAVA_Build 2 230663194 2I ATCAGAGAAT --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 43 12 18 13 GA 6 7 316179 CASAVA_Build 2 230665514 1D TGCCTTAAAA G/- CTCCTGCAGC 3070 hom 75 het 32 0 26 7 G 1 0 316180 CASAVA_Build 2 230668590 1D CACGAATTGC A/- AAGTGCATGT 3070 hom 129 het 48 0 44 6 A 3 2 316181 CASAVA_Build 2 230669155 6D TTGTCAATTT TTGGTG/------ TTTTTTTTTT 2630 het 2630 ref 24 14 8 2 TTGGTG 1 0 316182 CASAVA_Build 2 230669924 1I TGCTTTTTTT -/C TTGGACAGTC 3070 het 3070 ref 39 24 8 8 C 0 1 316183 CASAVA_Build 2 230669986 1I CTCATTGCAA -/C CTCCTCCTCT 3070 hom 105 het 43 0 35 8 C 1 2 316184 CASAVA_Build 2 230671475 5I AGAAGATCTG -----/ATTTT CTTTTTTTTA 1730 het 761 hom 32 6 8 18 ATTTT 0 1 316185 CASAVA_Build 2 230672892 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1242 het 702 hom 25 7 6 12 T 17 14 316186 CASAVA_Build 2 230683454 4D TATATATGGG ATAT/---- ATAGTCATAG 2909 het 2909 ref 18 11 6 2 AT 3 1 316187 CASAVA_Build 2 230684968 6D TGTGTGTGTA TATGTG/------ TATGTGTATG 2891 het 2891 ref 24 11 7 6 TATGTG 3 2 316188 CASAVA_Build 2 230694615 5I TATGCTCTGA -----/ATCAG ATCAGTGTCC 2317 het 2317 ref 16 6 5 5 ATCAG 1 2 316189 CASAVA_Build 2 230704748 2I CACTCAGTTG --/CT CAGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 CT 0 1 316190 CASAVA_Build 2 230707571 1D TACTGGAGAT A/- AAGGGTTGGT 3070 hom 143 het 53 0 47 6 A 3 2 316191 CASAVA_Build 2 230712529 1I TGCCCAGCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 30 1 23 6 T 10 11 316192 CASAVA_Build 2 230718554 1D TTGTGGGAGT G/- GGGGGATGTT 3070 hom 135 het 54 0 45 11 G 6 5 316193 CASAVA_Build 2 230722591 1D AAAAGAAGAA T/- AATAGTTCAT 3070 het 3070 ref 19 8 10 2 T 1 0 316194 CASAVA_Build 2 230723107 1I ATAAAAAGTG -/A AAAAAACAGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 6 7 316195 CASAVA_Build 2 230739548 4D ATTAAATCTA TAAC/---- AAACAAAAAT 3070 het 2582 hom 24 6 10 8 TAAC 1 0 316196 CASAVA_Build 2 230741364 1I ATAATTATGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 10 316197 CASAVA_Build 2 230741878 5I GAAGTATTAA -----/TTAAT TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 31 0 17 14 TTAAT 0 1 316198 CASAVA_Build 2 230742464 1D TTCAGAGATC G/- GGGTGAGGAG 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 G 4 3 316199 CASAVA_Build 2 230743211 4D TTTTATGTTG TTTA/---- CTTATTTATT 3070 het 3070 ref 40 26 14 2 TTTA 1 0 316200 CASAVA_Build 2 230748347 1I AGAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 A 9 10 316201 CASAVA_Build 2 230751422 1I ACACTATATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 44 2 29 13 A 11 12 316202 CASAVA_Build 2 230755187 2D AACACCACAT GG/-- GTTCTCACTT 2580 het 2580 ref 25 14 7 8 G 3 1 316203 CASAVA_Build 2 230757663 1I CGGATTTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 9 10 316204 CASAVA_Build 2 230762055 1D AACTTCTCTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 9 8 316205 CASAVA_Build 2 230763306 3D GCTACGTAAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2716 het 2716 ref 24 13 6 5 T 13 10 316206 CASAVA_Build 2 230763635 1D TCTTCTAGGG T/- TTTTATGGTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 5 4 316207 CASAVA_Build 2 230767448 2I AGAAAGGAAC --/AG AGAAAGGGAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 AG 1 2 316208 CASAVA_Build 2 230769495 1D TTATAATTTT C/- TTTTTTTTAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 1 0 316209 CASAVA_Build 2 230777981 1I TGGATAGAAC -/T TTAACAATCA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 2 3 316210 CASAVA_Build 2 230791859 1D TGCAATGAAT A/- ATACGATAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 1 316211 CASAVA_Build 2 230804571 1D ACGTGTCAGA G/- GGGGAAGTGG 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 G 5 4 316212 CASAVA_Build 2 230810793 1I GAGTCATAGT -/A GGGGGCTGGT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 0 1 316213 CASAVA_Build 2 230813176 2D AGCTGCTAAA AG/-- AGAAAACATA 3070 het 3070 hom 45 23 20 4 AG 2 1 316214 CASAVA_Build 2 230828500 1D AGGTAAGGAC G/- GGGGGGGGGA 1642 het 1642 ref 31 9 7 15 G 10 9 316215 CASAVA_Build 2 230832730 27D AGTATTCCAT CATATATATATATATATATATATATAC/--------------------------- CACATACATA 1458 het 547 hom 12 3 3 10 CATATATATATATATATATATATATAC 1 0 316216 CASAVA_Build 2 230838306 1D GACCATTTCC A/- GGCTTGAAAA 3070 het 1749 hom 23 8 11 4 A 1 0 316217 CASAVA_Build 2 230869036 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2985 het 2985 ref 39 14 12 13 A 15 14 316218 CASAVA_Build 2 230871702 1I GAAGAGCTTT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 A 7 8 316219 CASAVA_Build 2 230889268 1D GTGTATCCCC T/- CCAAAGCTCC 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 T 1 0 316220 CASAVA_Build 2 230898382 2I AGCTGGTACA --/TT TATGTCAGTG 3070 het 3070 ref 50 26 13 11 T 1 3 316221 CASAVA_Build 2 230915779 1D CCTTTTTTTT A/- AAATCTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 A 4 3 316222 CASAVA_Build 2 230924763 2I ACATCACCAC --/CT ATCTGGCTAA 3070 het 3070 hom 41 10 23 8 CT 0 1 316223 CASAVA_Build 2 230925815 2I ACACACACAC --/AT ATATATGTGT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AT 3 4 316224 CASAVA_Build 2 230926346 4D AAGATTAAAT AATA/---- AATCATTCTT 3070 het 3070 hom 36 18 16 4 AATA 1 0 316225 CASAVA_Build 2 230929861 1I AACCAGAAAC -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 8 9 316226 CASAVA_Build 2 230936481 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2719 het 2719 ref 34 19 7 8 T 11 12 316227 CASAVA_Build 2 230936688 1I TGGTGTCATA -/C CCAAAAACAT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 C 2 3 316228 CASAVA_Build 2 230942720 4D CTACTTTCTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 9 TTTG 3 2 316229 CASAVA_Build 2 230950206 2I AACTCCTGAG --/CT CAAGTGATCC 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 CT 0 1 316230 CASAVA_Build 2 230950812 1I ACATTTACCA -/T TTTTTCCTTT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 T 5 6 316231 CASAVA_Build 2 230951195 6I CCTGAAATCA ------/GGTAGT GGTAGTGTAA 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 GGTAGT 1 2 316232 CASAVA_Build 2 230953132 2D AGGCAAAGAC AG/-- AGTGAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 17 17 11 AG 2 1 316233 CASAVA_Build 2 230953915 1D AGTCTTCCTG T/- TTTTTCATAT 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 T 6 5 316234 CASAVA_Build 2 230954090 1D GGAAACCCAT G/- GGGTTTGCTA 3070 het 2734 hom 32 12 12 9 G 4 3 316235 CASAVA_Build 2 230978223 1I GAGTTCCTCC -/T AAAGGGGACA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 0 1 316236 CASAVA_Build 2 230990779 1I GTGTTTGTCC -/T TTTTTTTCGT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 7 8 316237 CASAVA_Build 2 230990967 1D GCTGACACCC T/- CTGTGAGCAC 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 T 1 0 316238 CASAVA_Build 2 230993695 2I AAAGTAAAAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 AT 7 8 316239 CASAVA_Build 2 230998761 1I TTGCTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 T 11 12 316240 CASAVA_Build 2 230999486 4I TGTCCTTACA ----/TTAT TTATATATTC 3070 het 3070 ref 59 29 23 7 TTAT 1 2 316241 CASAVA_Build 2 231000115 2I CTAAAAGGAG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 TC 6 7 316242 CASAVA_Build 2 231024764 5D CCATTTTGAG TTAAT/----- TTTTTAATAT 3070 het 3070 ref 43 28 14 4 TTAAT 1 0 316243 CASAVA_Build 2 231033977 1I ATAATTTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2349 hom 21 6 14 1 T 8 9 316244 CASAVA_Build 2 231037571 1D TATTAATGGC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 25 11 10 5 A 9 8 316245 CASAVA_Build 2 231039946 1I GGAGGTTTGA -/G GGCACGGACA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 G 2 3 316246 CASAVA_Build 2 231041526 8D CACTTTGGGA GGCTGAGG/-------- GGCTGAGGCA 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 GGCTGAGG 2 1 316247 CASAVA_Build 2 231042749 4D TAAAAAAAAA AAAG/---- AAGAAGAAAC 3070 het 2569 hom 29 8 19 3 AAAG 1 0 316248 CASAVA_Build 2 231043905 4D TATAACATGT ATAC/---- ATACATAAAC 3070 het 3070 hom 50 22 23 7 ATAC 2 1 316249 CASAVA_Build 2 231055535 1D TTAGAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 12 11 316250 CASAVA_Build 2 231055657 2I TGCCATTTAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 AT 7 8 316251 CASAVA_Build 2 231059031 1D AATTTATTTT A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 8 7 316252 CASAVA_Build 2 231083591 14I TCCCTCAGCC --------------/TCCCAAGTAGCTGG CACTACAGGT 1810 het 1810 ref 10 5 4 2 TCCCAAGTAGCTGG 0 1 316253 CASAVA_Build 2 231086478 1D CTTTTTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 20 14 14 A 15 14 316254 CASAVA_Build 2 231105184 1I TAGAAAAAAA -/T TAAATAAATA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 1 2 316255 CASAVA_Build 2 231116108 1I CTAGGTATTG -/A AGGAACATAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 A 1 2 316256 CASAVA_Build 2 231119437 6I70M2D ATATATACAC ------ACACACACACACACATATATGTATACACACATGTATATACATACATATATGTATACACATATGTATATGCAT/ACACATACACACACACACACACGTATGTATACACACATGTATATACATACATATATGTATACACATATGTATATGC-- ATATGTGTGT 2613 het 2613 ref 14 17 7 13 N/A 0 0 316257 CASAVA_Build 2 231119572 12D GAGGTGGCTG AGAGATATATAA/------------ AGAGATATAT 2008 het 2008 ref 23 14 5 5 AGAGATATATAA 3 2 316258 CASAVA_Build 2 231122947 1D CTTGACGTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 10 9 316259 CASAVA_Build 2 231124267 1I CTCAGACTAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 8 9 316260 CASAVA_Build 2 231126627 1D CATATGGAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 9 8 316261 CASAVA_Build 2 231130295 1I AGAGAAAATG -/A AAAAAAAAAA 2106 het 2106 ref 37 12 11 14 A 15 16 316262 CASAVA_Build 2 231131806 3I TATGGTGAGA ---/CCC CCCCCATCTC 3070 het 2047 hom 15 5 8 2 C 5 8 316263 CASAVA_Build 2 231132684 1I GAAAAAAAAA -/T TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 6 7 316264 CASAVA_Build 2 231133493 1I GGGGATCAGC -/A AGTTAAAGTC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 1 2 316265 CASAVA_Build 2 231133647 1D73M1D ATATCTCAGG ATACTATGATCAGCTTTATGCCAAACAATTGGAAAGTTTAAATTAAAAACACAATTTACAATATAGGCAAATGCA/-TACTATGATCAGCTTTATGCCAAACAATTGGAAAGTTTAAATTAAAAACACAATTTACAATATAGGCAAATGC- AAAAATATAA 3070 het 3070 ref 32 30 12 12 N/A 0 0 316266 CASAVA_Build 2 231134274 13D ACAAAAATTA GCCAGGTATGGTG/------------- GCATGCACCT 1762 het 1572 hom 10 5 5 0 GCCAGGTATGGTG 1 0 316267 CASAVA_Build 2 231136180 1D ATAAAAATGT A/- AAAAGATAAA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 A 5 4 316268 CASAVA_Build 2 231136928 1D TAAATTGGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 10 9 316269 CASAVA_Build 2 231137359 3D GTCTTTGGAA AGG/--- AGGAGGAGTC 3070 het 3070 ref 45 22 8 17 AGG 3 2 316270 CASAVA_Build 2 231137498 4I TGTACGCTTT ----/TCAG TTAGTATGTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 TCAG 0 1 316271 CASAVA_Build 2 231141547 2I CTTTTAGGTC --/TT TTCAAATTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 2 4 316272 CASAVA_Build 2 231144394 1D CTAAAGCAGA C/- CTTCTGCCTG 3070 het 3070 hom 39 18 18 4 C 2 1 316273 CASAVA_Build 2 231144837 8I TTCTTTTCTT --------/TTTCTTTC TTTCTTTTTT 3070 het 1531 hom 20 6 11 3 TTTC 1 3 316274 CASAVA_Build 2 231145647 1I AGTGGAGTCT -/C CCTGGGCTCT 1541 het 1541 ref 20 11 6 3 C 2 3 316275 CASAVA_Build 2 231148143 1I GGGCTCTTTG -/C CCTCACAGGA 3070 hom 53 het 32 1 29 2 C 2 3 316276 CASAVA_Build 2 231151930 2D GAGTGCCTCT CA/-- CAGTGTTGCA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 CA 2 1 316277 CASAVA_Build 2 231202828 2D ACATACACAC AT/-- ATATATATGT 1376 het 1376 ref 21 11 8 2 AT 5 4 316278 CASAVA_Build 2 231205181 1I TGGATTCATT -/C GAAGACCTGC 3070 hom 63 het 24 0 21 3 C 0 1 316279 CASAVA_Build 2 231206498 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 17 0 11 6 T 13 14 316280 CASAVA_Build 2 231211146 5I TTGGAGGAGA -----/ATAAG ATGAGTGACT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ATAAG 0 1 316281 CASAVA_Build 2 231224705 1I CATCTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2662 hom 29 12 11 6 A 12 13 316282 CASAVA_Build 2 231256697 1I GCCCTCTATT -/A TGAGCAGAAC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 0 1 316283 CASAVA_Build 2 231279968 1I CTCTCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 10 11 316284 CASAVA_Build 2 231343843 1D AGAGGAAGGG A/- ATTTTCTCAA 3070 het 3070 ref 31 20 9 3 A 2 1 316285 CASAVA_Build 2 231349660 1D TTTTTTTCTT C/- CCCCCCCGAG 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 C 8 7 316286 CASAVA_Build 2 231436673 1D CCCATTCCCT C/- CCCCCAGTTC 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 C 6 5 316287 CASAVA_Build 2 231441545 2D TTCTTACCTC TG/-- TAATTTTCTC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 TG 1 0 316288 CASAVA_Build 2 231453945 1D AAAAGGGCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 T 9 8 316289 CASAVA_Build 2 231460345 1D ACCAGGGGCC A/- ATCATCTGAA 3070 hom 105 het 40 0 35 6 A 2 1 316290 CASAVA_Build 2 231481017 1I TCACGGGTGG -/T GTCTCTGTCT 3070 hom 102 het 45 0 29 16 T 0 1 316291 CASAVA_Build 2 231487512 1D GTAGTAAGAT A/- AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 A 8 7 316292 CASAVA_Build 2 231488802 3D6M7D CGTTCTTCTG GTTGGAAGAACCAGAC/---TAAAGA------- TTGCAGAAAG 3070 het 3070 hom 40 14 25 4 N/A 0 0 316293 CASAVA_Build 2 231493817 1I TTATGCAAAT -/A TTATAAACAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 0 1 316294 CASAVA_Build 2 231495015 2I CTCTGTCACC --/AG AGAGGTATGC 3070 het 3070 hom 63 27 34 2 AG 2 3 316295 CASAVA_Build 2 231518335 4I AATGCACTCC ----/CAAA CAATGACCCA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 CAAA 0 1 316296 CASAVA_Build 2 231522799 1D ACTAAATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1628 hom 26 6 18 2 T 12 11 316297 CASAVA_Build 2 231525227 3D TGGAATGCTC CTT/--- CTATGCTAAA 3070 het 3070 ref 41 26 11 5 CTT 1 0 316298 CASAVA_Build 2 231529881 1I CAGATTAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2950 hom 33 10 14 9 T 13 14 316299 CASAVA_Build 2 231532408 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1233 het 1233 ref 17 12 3 3 A 12 11 316300 CASAVA_Build 2 231532627 1D CACTGCATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 11 10 316301 CASAVA_Build 2 231540136 1D AAACTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1984 hom 21 8 10 3 A 12 11 316302 CASAVA_Build 2 231558422 1D AGGGGAGGAA G/- GGGGGGGGGA 2803 hom 53 het 23 0 13 11 G 10 9 316303 CASAVA_Build 2 231560434 24D GGAGCAGGAT CAGGGCCAGGGCCAGGGCCAGGGC/------------------------ CAGGGCCAGG 2168 het 1992 hom 17 10 7 6 CAGGGC 6 2 316304 CASAVA_Build 2 231562355 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGTCTCAC 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 G 5 4 316305 CASAVA_Build 2 231576377 1I TGAATGGACA -/G GGTTTATTGA 3070 hom 120 het 47 0 38 9 G 2 3 316306 CASAVA_Build 2 231579463 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 12 11 316307 CASAVA_Build 2 231582761 2I ACATTGCAGA --/CT CTCATGAATG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 CT 1 2 316308 CASAVA_Build 2 231592093 1D GCTTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 24 het 10 0 8 2 T 9 8 316309 CASAVA_Build 2 231596670 1I TGTGTCACCT -/C CCACTGTGGA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 C 2 3 316310 CASAVA_Build 2 231607303 1I GCATCTTGCC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2063 hom 31 8 14 9 T 7 8 316311 CASAVA_Build 2 231613997 1I CATTGCTTTA -/G TTTCCTCAAC 3070 het 3070 hom 32 13 19 0 G 0 1 316312 CASAVA_Build 2 231617127 1D AGGCTGGAAG T/- TGCTCTGGGT 3070 het 3070 ref 53 27 18 9 T 2 1 316313 CASAVA_Build 2 231626741 1I GGTTCAGGAT -/G GCTGGAGTGT 2820 hom 54 het 22 0 13 9 G 1 2 316314 CASAVA_Build 2 231631479 1D TATACAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 36 2 20 14 T 15 14 316315 CASAVA_Build 2 231636787 1D ATTTGATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 585 hom 34 4 22 9 T 13 12 316316 CASAVA_Build 2 231637875 1D TTGCCTCGGC T/- TCCCAAGATT 3070 hom 60 het 24 0 19 6 T 2 1 316317 CASAVA_Build 2 231677060 3I TTTCCTGTCA ---/GTT GTTAATGTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 GTT 1 2 316318 CASAVA_Build 2 231678977 1D AATAAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 17 1 10 6 T 15 14 316319 CASAVA_Build 2 231694933 8D CCTGTACAGT ATTTATCA/-------- AATATGCATA 2652 het 299 hom 37 4 8 26 ATTTATCA 1 0 316320 CASAVA_Build 2 231719506 2I TGTATTTTTT --/AC AGACTTAATG 3070 hom 84 het 38 0 29 9 AC 0 1 316321 CASAVA_Build 2 231728466 1D CTCTTTCTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 8 316322 CASAVA_Build 2 231734197 1I CTATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 32 3 20 9 A 14 15 316323 CASAVA_Build 2 231737983 54D TTCTTTGATT TATATATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------------------------------ TATATATATA 3070 hom 57 het 20 0 20 5 TATATATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 316324 CASAVA_Build 2 231746485 1D CCCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 2283 het 368 hom 25 3 11 11 A 17 16 316325 CASAVA_Build 2 231750523 2D ATGAGAAGAC AT/-- GAGCATGGGC 3070 hom 105 het 39 0 36 6 AT 1 0 316326 CASAVA_Build 2 231756581 17D CCTGTCTCAA AAAAAAAAAAAAAAAAG/----------------- AAAAAGAAAA 3070 hom 63 het 23 0 21 3 AAAAAAAAAAAAAAAAG 1 0 316327 CASAVA_Build 2 231758858 1D CTGGAGGGCC A/- GGGCCTTGCT 3070 hom 63 het 23 0 18 5 A 1 0 316328 CASAVA_Build 2 231759432 1I GGCCAGTGTG -/C CCAGGGCCAG 3070 hom 78 het 35 0 25 10 C 2 3 316329 CASAVA_Build 2 231759661 4D GAGCTATTTT GTTA/---- TTGTTATTTT 3070 hom 93 het 35 0 31 5 GTTA 1 0 316330 CASAVA_Build 2 231767030 1D TCTGTCTAAC A/- AAAAAAAAAA 2133 het 884 hom 19 3 8 8 A 17 16 316331 CASAVA_Build 2 231768454 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 977 hom 24 2 15 7 A 13 14 316332 CASAVA_Build 2 231774102 1I AGGTGGGTGT -/C CCCCAGGAGC 3070 hom 118 het 47 0 35 12 C 4 5 316333 CASAVA_Build 2 231774961 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 19 0 14 5 T 16 14 316334 CASAVA_Build 2 231781041 4D AATTGGATTA TTTG/---- TTTGTTTTGC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TTTG 2 1 316335 CASAVA_Build 2 231790945 4D CCACCGCGCC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 66 het 23 0 22 3 TTGT 3 2 316336 CASAVA_Build 2 231792101 1D ATTTATGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 39 2 28 9 T 11 10 316337 CASAVA_Build 2 231804652 1I GAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 2958 hom 29 het 13 0 8 5 T 12 13 316338 CASAVA_Build 2 231834930 1I CAGGCGCCCG -/C CACCACACCC 3070 hom 30 het 11 0 11 1 C 1 2 316339 CASAVA_Build 2 231835957 1D GGAAGTCCTT A/- AGCCCCAGGC 3070 hom 118 het 41 0 39 3 A 2 1 316340 CASAVA_Build 2 231847962 4D TAACTATAGT TAAG/---- TAACAGATAC 3070 hom 81 het 31 0 28 5 TAAG 1 0 316341 CASAVA_Build 2 231850503 2I AAAAATAGCA --/TG TGCAAAAAGT 3070 hom 55 het 24 0 17 7 TG 1 2 316342 CASAVA_Build 2 231851685 2I TTTCTCATCA --/TC TCTAGCCCCC 3070 hom 110 het 42 0 32 10 TC 1 2 316343 CASAVA_Build 2 231888693 1I AATATTCATA -/T TTAATGTAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 3 316344 CASAVA_Build 2 231892270 1I AGTGGCCATT -/G GGCTCTGCCA 3070 hom 141 het 52 0 47 5 G 2 3 316345 CASAVA_Build 2 231893076 2D CACCCACTTA GC/-- TGCTGTATGT 3070 hom 81 het 32 0 25 9 GC 1 0 316346 CASAVA_Build 2 231896147 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 896 het 896 ref 46 28 3 15 A 11 10 316347 CASAVA_Build 2 231904413 1D CTGGCTGTTC T/- ATATGGTGCC 3070 hom 126 het 45 0 41 4 T 1 0 316348 CASAVA_Build 2 231905278 2I GCACAGTGTG --/GA GAGAGAGAGT 3070 hom 100 het 39 0 30 9 GA 4 5 316349 CASAVA_Build 2 231956624 1I CTGGGCAGGG -/C CTCGCGGGCC 3070 hom 75 het 30 0 21 9 C 1 2 316350 CASAVA_Build 2 231960441 15D AGGGCCTTGA TTGACCCAGCTCGGG/--------------- TCACAGGCCC 3070 het 3070 ref 37 25 13 3 TTGACCCAGCTCGGG 1 0 316351 CASAVA_Build 2 231985861 2D AGAAATGATC TT/-- GTTTCACCGG 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 2 0 316352 CASAVA_Build 2 232012664 2I GAAGGCTCCC --/CA CACACACACT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 CA 4 5 316353 CASAVA_Build 2 232015269 1D GACAAAGCTC T/- TTTTTTTTTC 2286 het 2286 ref 26 15 7 4 T 10 9 316354 CASAVA_Build 2 232028865 4D TGCCACTGAT AGAC/---- AGAAAGGAGC 3070 het 3070 ref 45 20 18 8 AGAC 1 0 316355 CASAVA_Build 2 232052750 1D AGTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1926 hom 21 6 11 5 A 15 14 316356 CASAVA_Build 2 232058246 1I GTATTGTAAG -/A ATACAGTATG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 1 2 316357 CASAVA_Build 2 232068696 1I TCTTTACTAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 A 8 9 316358 CASAVA_Build 2 232079006 2D AAAAAAAAAA AT/-- TTTTTTTTTT 1580 het 1580 ref 11 6 5 0 AT 1 0 316359 CASAVA_Build 2 232088406 2I AAGAAAATAT --/TA TATATATATC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 TA 4 5 316360 CASAVA_Build 2 232089275 1I GTGGCAAAGA -/T ATGAAGACAT 3070 het 3070 hom 50 20 27 3 T 0 1 316361 CASAVA_Build 2 232089731 1I GGTTTTTTTT -/G GGGGGGGGTG 2057 het 899 hom 16 4 7 5 G 8 9 316362 CASAVA_Build 2 232102459 1D ATCTACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 19 0 10 9 A 13 12 316363 CASAVA_Build 2 232123971 1D CCCGTTGCTA C/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 33 15 14 7 C 1 0 316364 CASAVA_Build 2 232127668 1I GTCTTCATGC -/T GAGGCCTGGC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 T 0 1 316365 CASAVA_Build 2 232129361 1D TAAACCCACC A/- AGAGTGGAAA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 2 1 316366 CASAVA_Build 2 232133328 1D AATAGGTGTT A/- AAAAAAATAA 1470 hom 7 het 4 0 3 1 A 8 7 316367 CASAVA_Build 2 232142732 1D GCCCCACCCC T/- ATCTCCCTTC 1916 het 1916 ref 19 10 6 3 T 1 0 316368 CASAVA_Build 2 232144158 1I CCTTAGAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 20 7 9 5 A 9 10 316369 CASAVA_Build 2 232147049 1D CTTCCCAGGT C/- CCCCCACCCC 1545 het 1512 hom 25 8 8 9 C 6 5 316370 CASAVA_Build 2 232148500 1D TCTACAAAGA C/- CATTTTGTCC 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 C 2 1 316371 CASAVA_Build 2 232155170 3I CGTTGGCCTG ---/TAA TCTCAGCACT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 TAA 0 1 316372 CASAVA_Build 2 232156974 1D TGGGGCCGCA C/- CCCCCCCGCA 3070 het 32 hom 34 1 14 19 C 8 7 316373 CASAVA_Build 2 232158221 1D GAGAAAGGAG T/- TGAGGGCCAG 2263 het 2263 ref 16 9 6 1 T 2 1 316374 CASAVA_Build 2 232163255 1I ACTCTACCTC -/A AAAAAAAAAA 1625 het 1625 ref 19 6 8 5 A 15 16 316375 CASAVA_Build 2 232174412 1D GTAAGGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 28 1 23 4 T 13 12 316376 CASAVA_Build 2 232176062 2I CCCCATCACT --/TG TGTCCTCCAC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 TG 1 2 316377 CASAVA_Build 2 232190473 4D GATAGCAAAC AGTT/---- AGTATTTGCT 3070 het 3070 ref 49 27 17 8 AGTT 1 0 316378 CASAVA_Build 2 232215693 4I TATCTGTGTG ----/TCTC TGGGTGTGTC 3070 hom 82 het 30 0 27 3 TC 0 2 316379 CASAVA_Build 2 232229369 9I GGCAAGCTTC ---------/TTTTTTATT TTTTTTATTT 3070 hom 33 het 21 0 12 10 TTTTTTATT 1 2 316380 CASAVA_Build 2 232232168 1D CTCTAGAGTC T/- TTTGAAGCAT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 4 3 316381 CASAVA_Build 2 232240179 1I GGGAGGCCGA -/G GGGGGGCAGA 2397 het 2397 ref 21 8 8 5 G 6 7 316382 CASAVA_Build 2 232243556 1D GTTGCAGGTC T/- TTTTTTTTTT 710 het 304 hom 9 2 3 4 T 15 14 316383 CASAVA_Build 2 232256266 1I CCTTCCCTCT -/G GGGATCCCCC 1522 hom 21 het 9 0 6 3 G 3 4 316384 CASAVA_Build 2 232407469 1D GTGTACAGGC T/- CAGTCGCCAC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 1 0 316385 CASAVA_Build 2 232409000 2I CAGAGAATAA --/TC TGCTCCAAAT 2213 het 1933 hom 19 8 6 5 TC 0 1 316386 CASAVA_Build 2 232591243 1I CTGATCAATA -/T TAACAACTCT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 1 2 316387 CASAVA_Build 2 232617104 1D GAAAGGTCTG T/- GTAAGAGAGT 3070 hom 117 het 45 0 38 8 T 1 0 316388 CASAVA_Build 2 232643297 4D TTCCTGCCTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TTTG 3 2 316389 CASAVA_Build 2 232654441 1D ACCGAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 463 hom 41 2 31 8 T 11 10 316390 CASAVA_Build 2 232656023 1I GAAAGACCCA -/C CCCCCCCATG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 C 7 8 316391 CASAVA_Build 2 232657854 5I TTCTGATCGT -----/TAATA TCTTTGTAAT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 TAATA 0 1 316392 CASAVA_Build 2 232674354 1D CCTAGATGTA T/- TTTTTGTATA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 6 5 316393 CASAVA_Build 2 232686866 4D AGGATTCTGA CCCT/---- CCCTCCCTAA 3070 hom 141 het 54 0 47 10 CCCT 3 2 316394 CASAVA_Build 2 232689788 3D AAACAAAAAG AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 68 het 30 0 23 8 AAC 7 6 316395 CASAVA_Build 2 232714170 1I GTTTACAGTT -/C CCAGCTTCTC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 2 3 316396 CASAVA_Build 2 232728187 3D CTCCCCCCTC CTT/--- AATTTTCTAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CTT 1 0 316397 CASAVA_Build 2 232739965 1I CGTCTCAGTC -/A AAAAAAAAAA 1518 het 1518 ref 24 15 4 5 A 15 16 316398 CASAVA_Build 2 232741462 1D GCCAGTTGCC T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 141 het 53 0 46 8 T 9 8 316399 CASAVA_Build 2 232758804 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 20 2 12 6 A 17 16 316400 CASAVA_Build 2 232821420 4I CAGGAGATAC ----/AGAT AGAGATATTC 3070 het 3070 ref 36 24 12 0 AGAT 0 1 316401 CASAVA_Build 2 232824956 1I ATCCAATACA -/G GAAAGAAGTG 3070 hom 144 het 49 0 49 0 G 1 2 316402 CASAVA_Build 2 232839372 2D ATGCTGACTT GA/-- GAGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 13 7 GA 4 3 316403 CASAVA_Build 2 232850118 3I CTGAAGGGAG ---/CTC CTCCGTGGTG 3070 het 3070 hom 56 18 22 16 CTC 1 2 316404 CASAVA_Build 2 232943114 1D TCAATAGGGT C/- CCTTGTCAGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 3 2 316405 CASAVA_Build 2 232946974 1I AGTTTCTTAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 7 8 316406 CASAVA_Build 2 232954050 3D GAGCCTCAGT CTC/--- CTCCTCTGTC 3070 het 3070 hom 20 7 8 5 CTC 3 2 316407 CASAVA_Build 2 233018990 1D CTGTGTCCCC T/- GAAGACAAGG 3070 het 3070 ref 25 11 8 7 T 1 0 316408 CASAVA_Build 2 233022561 5I TCTAAAGGAG -----/GACTT GGTCATTCCC 3070 het 2190 hom 18 6 8 4 GACTT 0 1 316409 CASAVA_Build 2 233070559 1D AGAGGTAATT A/- AAAATCTCTT 2595 hom 27 het 14 0 8 6 A 5 4 316410 CASAVA_Build 2 233079424 12I AGGGAAAGGG ------------/AAGAAGAGAGGA AAGAAGGACA 1585 het 1585 ref 15 7 4 4 AAGAAGAGAGGA 0 1 316411 CASAVA_Build 2 233082813 1I CTAGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 10 11 316412 CASAVA_Build 2 233085756 2I TGCGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 2902 het 2902 ref 34 14 12 8 TG 8 9 316413 CASAVA_Build 2 233089382 1I GTATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2754 het 53 hom 24 1 12 13 T 15 16 316414 CASAVA_Build 2 233106742 1I TGAGGCAAGA -/G AATCACTTGA 2446 het 1286 hom 12 3 6 3 G 0 1 316415 CASAVA_Build 2 233112004 1D TTCAGGAGTT C/- CAAGACTGGC 2827 het 2827 ref 28 10 7 12 C 2 1 316416 CASAVA_Build 2 233116465 1D GGAGGCCTGA G/- GGGGGGCAGC 2129 hom 32 het 22 0 7 15 G 7 6 316417 CASAVA_Build 2 233119921 7I AGGTAGTAAG -------/GCAATAA GCTGGGGTCT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 GCAATAA 0 1 316418 CASAVA_Build 2 233125639 1D ACTTGCCCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 T 9 8 316419 CASAVA_Build 2 233125754 1I GCATTGCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 A 9 10 316420 CASAVA_Build 2 233126177 13D GTAAAACCGT AAGATGCTTTCAC/------------- AAAAACTGCA 3070 het 3070 ref 51 28 23 6 AAGATGCTTTCAC 1 0 316421 CASAVA_Build 2 233126376 1D TAAACGGAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 41 17 16 9 T 9 8 316422 CASAVA_Build 2 233126820 1I GATCAGCAGC -/A AAACCACTAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 3 4 316423 CASAVA_Build 2 233128898 4I CAGGAAGACC ----/ACTG AGGAATTTAT 3070 het 3070 ref 38 24 10 4 ACTG 0 1 316424 CASAVA_Build 2 233129529 1D AACTTGAGAC T/- TTTATTATCT 3070 het 3070 hom 62 23 33 8 T 4 3 316425 CASAVA_Build 2 233149458 1D CCCCCGTGTC T/- TTTTTTATAC 2903 het 1847 hom 23 7 7 9 T 7 6 316426 CASAVA_Build 2 233154504 2D TCCTGTGGGA CT/-- CTCTCCTTCT 3070 het 3070 hom 51 24 22 5 CT 3 2 316427 CASAVA_Build 2 233157095 4D ATCTCCTCTC TCTG/---- TCTATCAGTC 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 TCTG 1 0 316428 CASAVA_Build 2 233159030 24D TGCCAAACGG CAATGGAACTAATCCAGCACCATC/------------------------ CAATGGAACC 3070 het 3070 hom 30 14 16 10 CAATGGAACTAATCCAGCACCATC 1 0 316429 CASAVA_Build 2 233164406 2D CAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAGAA 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 AG 1 0 316430 CASAVA_Build 2 233168948 1D AAGTATGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 26 9 T 12 11 316431 CASAVA_Build 2 233189775 1D AGATGATGGT A/- AATTTTAGCT 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 3 2 316432 CASAVA_Build 2 233194404 4I TCTTTCGTTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TTTC 2 3 316433 CASAVA_Build 2 233195583 3D GCAGATTTCA GAG/--- GAGAAGTAAT 3070 het 2464 hom 25 10 11 4 GAG 2 1 316434 CASAVA_Build 2 233196634 19D GTCCAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAGAAG/------------------- AAGAAGAAGA 2471 het 1268 hom 15 6 8 4 AAAAAAAAAAAAAAAGAAG 1 0 316435 CASAVA_Build 2 233198258 1I AATTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 1917 het 1917 ref 27 8 9 10 T 15 16 316436 CASAVA_Build 2 233198828 1D CTCCTCATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 9 8 316437 CASAVA_Build 2 233199337 1I TCACCTCTAT -/A AAAAAATACA 1469 het 1469 ref 12 5 4 3 A 6 7 316438 CASAVA_Build 2 233204958 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2090 hom 20 5 11 4 A 13 14 316439 CASAVA_Build 2 233224406 1D CTTGTCTTAA G/- GGGCTTTCAC 2884 het 2884 ref 25 17 6 2 G 4 3 316440 CASAVA_Build 2 233224779 4I CCATCTCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 AAAC 2 3 316441 CASAVA_Build 2 233224899 2I AACCCAACTC --/CT CTGGCCATAT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 CT 1 2 316442 CASAVA_Build 2 233228757 11D GTGTGGGGTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 1734 hom 32 10 10 13 T 22 11 316443 CASAVA_Build 2 233231344 4D CCCCATAAGA GCCT/---- GCCTGCTAGA 3070 het 3070 hom 44 21 22 2 GCCT 2 1 316444 CASAVA_Build 2 233234107 6D GTCTCAAAAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 16 7 AAAAAC 2 1 316445 CASAVA_Build 2 233234703 2D TAGTAGAAAC AG/-- GGTTTCACCA 2357 het 1918 hom 10 4 5 1 AG 1 0 316446 CASAVA_Build 2 233243616 1I TTACATGGTT -/A AAAAAAAAAA 2819 het 2665 hom 30 8 15 7 A 11 12 316447 CASAVA_Build 2 233253331 5I TGGGTTTATC -----/TGATA TGATATTATT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TGATA 1 2 316448 CASAVA_Build 2 233259330 1I CCTCATTATA -/C CCTGATTGTC 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 C 2 3 316449 CASAVA_Build 2 233263786 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTTGCTC 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 AG 2 1 316450 CASAVA_Build 2 233286035 1I AAAAAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 773 hom 26 2 15 9 T 13 14 316451 CASAVA_Build 2 233286909 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 31 2 15 14 T 13 12 316452 CASAVA_Build 2 233288535 1D GCTTTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 1471 het 1471 ref 36 22 6 8 A 14 13 316453 CASAVA_Build 2 233288775 1I AAGAATTTCC -/T TTTTTTTTTT 2948 het 642 hom 38 4 14 20 T 15 16 316454 CASAVA_Build 2 233336208 4I ATGGTTATTC ----/TAAG TAAGCTCTCA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 TAAG 1 2 316455 CASAVA_Build 2 233343563 1D CTTTTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 45 1 35 9 T 12 11 316456 CASAVA_Build 2 233349035 1D TTTGGCATTT G/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 G 1 0 316457 CASAVA_Build 2 233349453 2D GGAAATTTAC AG/-- AGTCTGCCTT 3070 het 3070 ref 43 18 16 10 AG 2 1 316458 CASAVA_Build 2 233353413 1I TATTGAATGG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 7 8 316459 CASAVA_Build 2 233356603 1D AAATAATTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 9 8 316460 CASAVA_Build 2 233357476 1D CCTGAGTAGC T/- TGGGACTACA 1657 hom 15 het 6 0 4 2 T 2 1 316461 CASAVA_Build 2 233359982 1D ATTTTAGTGA T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 7 6 316462 CASAVA_Build 2 233360382 1I CTTAAAAAAT -/G GTGGGGGTGG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 G 1 2 316463 CASAVA_Build 2 233360488 1I CACTTTTCTA -/T TTTTTCTGGG 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 5 6 316464 CASAVA_Build 2 233370035 1I ACCTTGACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 11 12 316465 CASAVA_Build 2 233378970 1I AGAATACTCG -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 316466 CASAVA_Build 2 233379790 9D ATCTTTTCAA AACTCGAAT/--------- AACCTGTGCC 3070 het 3070 ref 54 24 24 10 AACTCGAAT 1 0 316467 CASAVA_Build 2 233386286 24D TGGGATTAAT TACGCTATCACACCTGACTGGGTG/------------------------ TACGCTATCA 3070 het 3070 hom 31 13 17 12 TACGCTATCACACCTGACTGGGTG 1 0 316468 CASAVA_Build 2 233387622 1D ATAGCTCATT A/- TGTATATGCA 3070 het 3070 hom 26 9 13 5 A 1 0 316469 CASAVA_Build 2 233388176 1I TGGTGTGCAG -/T TGAGAGGCTG 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 1 2 316470 CASAVA_Build 2 233403772 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 10 9 316471 CASAVA_Build 2 233407787 1D CCTCTAGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 10 9 316472 CASAVA_Build 2 233414416 9D CCACCAGCTA TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 1805 het 14 hom 9 0 6 3 T 23 14 316473 CASAVA_Build 2 233419626 2D GCACCTACCA TG/-- TGTGCTAGGC 3070 hom 123 het 46 0 40 7 TG 3 2 316474 CASAVA_Build 2 233420568 1I GAGGATTAAT -/A ACCTTTAGAT 3070 het 3070 ref 23 11 8 5 A 1 2 316475 CASAVA_Build 2 233421619 1D AATCATTAAC A/- AAAAGCACAA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 5 4 316476 CASAVA_Build 2 233428893 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 21 0 17 5 T 10 9 316477 CASAVA_Build 2 233434885 1I CTTTCCCAAT -/G GGGGGGACTC 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 G 6 7 316478 CASAVA_Build 2 233437687 1D CCACTAATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 142 hom 33 1 25 7 T 10 9 316479 CASAVA_Build 2 233438597 1D AAAGATAGTG T/- TTTGCCATGT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 4 3 316480 CASAVA_Build 2 233445083 13I AGAGCGTTTG -------------/GGAGGCTCTCAGC ACCCCACCCC 3070 het 2241 hom 27 9 11 7 GGAGGCTCTCAGC 0 1 316481 CASAVA_Build 2 233448300 4D TGTTTCAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 2885 hom 33 10 12 13 AG 7 5 316482 CASAVA_Build 2 233452931 1I CCTACACGAG -/C CCCAGGAGAC 1203 het 1203 ref 17 7 6 4 C 3 4 316483 CASAVA_Build 2 233459096 2I CAGTGTGTGC --/TG TGTGTATGCA 1094 het 1094 ref 56 31 9 16 TG 2 3 316484 CASAVA_Build 2 233459577 1D CTTCATTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 10 9 316485 CASAVA_Build 2 233461245 2D CCTGCGTGTG CA/-- CACACGTGCA 3070 het 3070 ref 69 32 26 14 CA 3 2 316486 CASAVA_Build 2 233461327 1I ACATGCACAC -/A CGTGTAGAAA 3070 hom 223 het 80 0 73 7 A 0 1 316487 CASAVA_Build 2 233469006 8I ACCCTCTGAT --------/ACTCCTCG ACTTAGGGCG 3070 hom 102 het 39 0 30 9 ACTCCTCG 0 1 316488 CASAVA_Build 2 233471026 1D CAGCCAGTTT C/- CCAGAAGCTT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 C 3 2 316489 CASAVA_Build 2 233471996 8D ATGAGGGTGG GTGTGGAT/-------- GTGTGGATGT 3070 het 3070 ref 82 45 32 16 GTGTGGAT 2 1 316490 CASAVA_Build 2 233472101 4D GAGTATGAGA GTGT/---- GTGACAGTGG 3070 het 3070 ref 89 49 33 10 GT 3 1 316491 CASAVA_Build 2 233480644 1D AAAAGAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 10 9 316492 CASAVA_Build 2 233481460 1I GTTTATGATT -/G TTAGTGAGTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 0 1 316493 CASAVA_Build 2 233482390 1D TTTTATGTAA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 9 8 316494 CASAVA_Build 2 233488192 1D GTAGTAGCTT A/- TATTTTCCTA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 A 1 0 316495 CASAVA_Build 2 233490427 1I AAAACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 13 14 316496 CASAVA_Build 2 233494926 12D CTGGAGGAGA TGAGGGTCCGGC/------------ TGAGGGTGGC 3070 het 3070 ref 36 21 11 10 TGAGGGTCCGGC 1 0 316497 CASAVA_Build 2 233499293 3D TCACTAGCGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 319 hom 38 6 18 14 T 14 11 316498 CASAVA_Build 2 233503503 1I TCACCATTTC -/G GCCAGGCTGG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 2 316499 CASAVA_Build 2 233505904 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 10 9 316500 CASAVA_Build 2 233507350 1D AGGAAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 21 8 T 11 10 316501 CASAVA_Build 2 233507962 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2191 hom 21 5 12 4 A 12 13 316502 CASAVA_Build 2 233514274 1I CTGCACAACT -/C CTAAGCCATA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 1 2 316503 CASAVA_Build 2 233525907 2D GAGTGCAGAC AA/-- GAGTGAGACA 636 hom 5 het 8 0 2 6 A 2 0 316504 CASAVA_Build 2 233529375 1D GAAGAAACAG T/- TAACTAATAT 3070 hom 72 het 27 0 24 4 T 2 1 316505 CASAVA_Build 2 233532238 1D CGGTGTTTCC T/- GTAAATTCCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 0 316506 CASAVA_Build 2 233539572 1I CCTGACAACT -/C CCCCCAAACA 3070 hom 77 het 30 0 24 6 C 5 6 316507 CASAVA_Build 2 233542239 2D AGTACAGTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 14 0 10 4 T 11 9 316508 CASAVA_Build 2 233543749 1D AGCCTGGGTG A/- AAAAAAAAAA 1047 het 1047 ref 26 13 4 9 A 12 11 316509 CASAVA_Build 2 233564295 1I AGGAATCCAG -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 1 2 316510 CASAVA_Build 2 233567898 2D ATATACACAC AT/-- ATAATACATA 3070 hom 123 het 48 0 42 8 AT 2 1 316511 CASAVA_Build 2 233570106 1I CCTGGGGATC -/A ACCAGGAGGG 3070 hom 108 het 40 0 34 6 A 1 2 316512 CASAVA_Build 2 233620034 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1134 het 1134 ref 33 23 3 7 A 15 14 316513 CASAVA_Build 2 233628872 36D GGCTAGATAG ATAGATGGATGGATGGTTAGCTAGATAGCTAGATAA/------------------------------------ ATGGCTGGAT 3070 hom 99 het 22 0 34 4 ATAGATGGATGGATGGTTAGCTAGATAGCTAGATAA 1 0 316514 CASAVA_Build 2 233629750 4D TGTATGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 hom 42 het 18 0 15 4 TA 10 8 316515 CASAVA_Build 2 233633191 1D GGCCCCCCCC T/- CTCTCTCTTT 1852 het 1133 hom 20 6 7 7 T 1 0 316516 CASAVA_Build 2 233638429 1I ACCGGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 154 hom 16 1 13 2 T 10 11 316517 CASAVA_Build 2 233666505 1D TGGTGGCGAG T/- TGCCTATAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 1 316518 CASAVA_Build 2 233668665 1D38M1D TTTAAAATAA TTTTTTTTTTACATTTAAAAGTTATATCTCAGCTTGGTCA/-TTTTTTTTTACATTTAAAAGTTATATCTCAGCTTGGTC- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 24 12 8 11 N/A 0 0 316519 CASAVA_Build 2 233674770 1I TATAAGTTAA -/T TCAGTTTTAC 2206 hom 15 het 7 0 6 1 T 1 2 316520 CASAVA_Build 2 233683897 1I AAAACAACAA -/C AAAAAAAAAA 2977 het 151 hom 15 2 9 4 C 0 1 316521 CASAVA_Build 2 233684910 1D CCAGGTACTT G/- GGGGGGCTGA 3070 hom 84 het 35 0 26 9 G 7 6 316522 CASAVA_Build 2 233686402 1D TTTGTTTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 10 9 316523 CASAVA_Build 2 233704306 1I AACAAAAAAA -/C ATTCCAGAGC 3070 het 2376 hom 15 6 8 1 C 0 1 316524 CASAVA_Build 2 233710182 3I GGCTTTATCT ---/AGG AGGTCACTCC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AGG 1 2 316525 CASAVA_Build 2 233735066 28D CTGAATATAT AGTATATATACATATGCTAAATATATAC/---------------------------- AGTATATATA 3070 hom 27 het 13 0 10 6 AGTATATATACATATGCTAAATATATAC 1 0 316526 CASAVA_Build 2 233735235 4D ATTGTATATT TATA/---- TACTAAACAC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TA 3 1 316527 CASAVA_Build 2 233737628 1D TGACTGTGTT A/- CCAGTGAGAC 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 1 0 316528 CASAVA_Build 2 233738484 4D GTCTGTGTTT GTGA/---- GTGTGTGTTT 3070 het 3070 ref 57 28 23 7 GTGA 1 0 316529 CASAVA_Build 2 233740761 3I AGAAAAGAAA ---/ATG ATGGGAGCCA 2263 het 2098 hom 15 8 5 2 ATG 1 2 316530 CASAVA_Build 2 233742122 1I GGTAATGGAA -/C TCCTTCCCCC 3070 hom 117 het 46 0 36 10 C 0 1 316531 CASAVA_Build 2 233745293 1I CTTGAAGGGG -/A AAAAAATAGA 3070 hom 141 het 49 0 47 2 A 6 7 316532 CASAVA_Build 2 233746651 1D AAACAAAAAC A/- AAAACCATAA 1515 het 1515 ref 41 18 9 14 A 5 4 316533 CASAVA_Build 2 233752555 3I AGCCACGGCC ---/CCT AGGGCATTGT 3070 het 3070 hom 51 18 23 10 CCT 0 1 316534 CASAVA_Build 2 233763951 1I GCTGGAAACA -/C CAGCTCAGGG 3070 hom 42 het 20 0 14 6 C 1 2 316535 CASAVA_Build 2 233773224 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 8 16 7 A 8 9 316536 CASAVA_Build 2 233778161 8I GCGTGAGTGC --------/GTATGTGT GTATGTGTGT 3070 het 3070 hom 53 19 19 15 GTATGTGT 1 2 316537 CASAVA_Build 2 233779272 1D AAGACCAGCC T/- AACCAATATG 2691 hom 21 het 9 0 8 1 T 1 0 316538 CASAVA_Build 2 233782744 3I TTAGCCAGCT ---/CTC CTCATCAAAG 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 CTC 1 2 316539 CASAVA_Build 2 233784184 1D GGAAGACTAG T/- TTGAAGCCAG 3070 hom 142 het 57 0 42 15 T 3 2 316540 CASAVA_Build 2 233789567 2D CAGTGTGGTG GA/-- GATAGCTGGG 3070 het 3070 ref 28 12 9 8 GA 2 1 316541 CASAVA_Build 2 233798335 1D CTAAGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2425 hom 25 7 9 9 T 15 14 316542 CASAVA_Build 2 233800893 2D CATGACAGTC CA/-- ATTCTTAATT 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 CA 1 0 316543 CASAVA_Build 2 233802140 1D ACAAGAGGTT G/- TTTTATGTCA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 G 1 0 316544 CASAVA_Build 2 233804006 4D GCTAGGAGAC AGAG/---- AGAGACTCTG 1213 het 1213 ref 22 15 4 4 AG 4 2 316545 CASAVA_Build 2 233806040 1I ACCTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 2629 het 2629 ref 23 11 8 4 T 10 11 316546 CASAVA_Build 2 233813765 2D TATATCACTC AT/-- ATATATACAC 2514 het 2514 ref 20 9 8 3 AT 4 3 316547 CASAVA_Build 2 233816572 1D ATGATTTTTT G/- GGGGGGGGCT 3070 het 2361 hom 21 7 10 4 G 9 8 316548 CASAVA_Build 2 233818754 1I AATATTAATA -/G TACCTACATT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 G 0 1 316549 CASAVA_Build 2 233835054 1I2M7D CGGATGTTGG -ATGAGAGGA/TAT------- ACAAGTGTCC 3070 het 3070 hom 35 13 19 5 N/A 0 0 316550 CASAVA_Build 2 233840848 1I ATACTTTTTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 7 8 316551 CASAVA_Build 2 233852755 1I CGGCTGAAAA -/G GAAACGAACA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 G 1 2 316552 CASAVA_Build 2 233864032 1D GGGAAGGCAG A/- ACGCAAAAGT 3070 het 3070 hom 59 23 33 3 A 2 1 316553 CASAVA_Build 2 233867014 1I TTGGTTATGT -/C CCACGTCCTC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 C 2 3 316554 CASAVA_Build 2 233868318 1D GGCTCTCTTT C/- CCCCACAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 C 5 4 316555 CASAVA_Build 2 233869688 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2520 hom 35 7 17 11 A 13 14 316556 CASAVA_Build 2 233892676 1I GATGCCTGCT -/G GGGGGCAGGG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 G 5 6 316557 CASAVA_Build 2 233898844 2I GTTGTTGCAC --/AT GTTTGTGTCT 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 AT 0 1 316558 CASAVA_Build 2 233902538 1I TGTGGGTGTG -/C CCAGGGGCTG 3070 hom 140 het 61 0 49 12 C 2 3 316559 CASAVA_Build 2 233913086 2D TGAGATGTAA TC/-- TCTCACTCTG 3070 het 3056 hom 37 9 18 12 TC 3 2 316560 CASAVA_Build 2 233914137 2D GCAGCCAGCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 TG 9 8 316561 CASAVA_Build 2 233923286 1D GCCCTTGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1944 hom 19 6 12 1 T 10 9 316562 CASAVA_Build 2 233926949 18D CGCTGGACCC CACCCGCCCACCATCCAG/------------------ CAGCCCCCCT 3070 het 2267 hom 24 7 14 7 CACCCGCCCACCATCCAG 1 0 316563 CASAVA_Build 2 233944397 1D TTGGCCTCCC A/- GAGTGCTGGG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 1 0 316564 CASAVA_Build 2 233945437 4I CAGACAGGAT ----/CTCA CTCACTGTCA 3070 het 3070 hom 37 18 15 4 CTCA 1 2 316565 CASAVA_Build 2 233947227 1D TTCTTTAGAT A/- ATGTTCATAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 A 2 1 316566 CASAVA_Build 2 233959301 2I GCACTCTTGT --/TC TATAAATAAA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 TC 0 1 316567 CASAVA_Build 2 233964797 1I GTGTTTTTTT -/C CCCCCCCCAG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 C 8 9 316568 CASAVA_Build 2 233965705 3I CCACTGTGCC ---/TGG TGGCCCTGGG 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 TGG 1 2 316569 CASAVA_Build 2 233969835 12I TGCTGAGTGC ------------/CAAAGTTTCAAT GGTGGGTAGA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 CAAAGTTTCAAT 0 1 316570 CASAVA_Build 2 233984222 1D GTCAGGATAA C/- ATTTCCATCA 3070 het 3070 hom 47 18 23 7 C 1 0 316571 CASAVA_Build 2 233989850 1D TTCAGTGACC A/- AAAAAGTGGA 3070 het 3070 hom 55 22 25 10 A 6 5 316572 CASAVA_Build 2 233992972 1I TGGAATTTTT -/A AAGGTATAGG 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 A 2 3 316573 CASAVA_Build 2 234011831 1D TGTGCTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 11 10 316574 CASAVA_Build 2 234013114 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 T 12 13 316575 CASAVA_Build 2 234014552 6D ATGAGGAGTG AGCAGA/------ AGCGGCACTG 3070 het 3070 ref 37 16 13 9 AGCAGA 1 0 316576 CASAVA_Build 2 234018265 1I CTCCACCGCA -/G GCCTTCATGG 3070 hom 70 het 30 0 20 10 G 1 2 316577 CASAVA_Build 2 234020578 1D TCTCCCCTAG C/- CCCCCGGCTC 2307 hom 41 het 21 0 10 11 C 6 5 316578 CASAVA_Build 2 234024956 1D TCTATAAGCC T/- TTTTTTTTTT 1529 het 1529 ref 32 18 5 10 T 15 14 316579 CASAVA_Build 2 234033379 1D TGTTCTAGGA T/- TTTTTTTTTT 2079 het 2079 ref 26 11 7 8 T 14 13 316580 CASAVA_Build 2 234061746 1D TTTTCTTGAA T/- TTTTTTTCCC 2171 het 2171 ref 29 18 8 3 T 8 7 316581 CASAVA_Build 2 234062935 1I ACTGTTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 10 11 316582 CASAVA_Build 2 234063236 3D AGGGACACAA CAG/--- CAGCCTTCTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 CAG 2 1 316583 CASAVA_Build 2 234067658 1D CAAAATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3000 het 3000 ref 25 13 8 4 T 11 10 316584 CASAVA_Build 2 234077018 1I TATAGGAAAG -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 47 14 30 3 A 7 8 316585 CASAVA_Build 2 234080140 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAATA 2814 het 935 hom 30 10 10 10 G 0 1 316586 CASAVA_Build 2 234081280 2D GCTAAATACC CT/-- GATTTAATCA 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 CT 1 0 316587 CASAVA_Build 2 234087906 3I AAAGCAGATC ---/ACA ACAAGGTTAC 3070 het 3070 ref 55 25 25 5 ACA 1 2 316588 CASAVA_Build 2 234094479 3I AGTGACCCAT ---/TTC TTCTCTTCCT 3070 het 3070 hom 54 25 28 1 TTC 1 2 316589 CASAVA_Build 2 234101244 5D TAATTCTGAG ATTAT/----- ATTATAGTTA 3070 het 3070 hom 34 14 16 6 ATTAT 2 1 316590 CASAVA_Build 2 234102986 1I AGGACTGTCC -/T TAGGAGCTAG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 1 2 316591 CASAVA_Build 2 234107177 1D ACACAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 11 10 316592 CASAVA_Build 2 234112598 1I TAGAAAAGGC -/A AAAAAAAAAA 2743 het 2743 ref 45 26 9 10 A 11 12 316593 CASAVA_Build 2 234114823 1I TGAGGACACA -/G GGAAGAAGAC 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 G 2 3 316594 CASAVA_Build 2 234122787 1D TAAATTAATT G/- ATCTAATGGC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 1 0 316595 CASAVA_Build 2 234123031 1I ATGCATCCCC -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 49 17 27 5 T 7 8 316596 CASAVA_Build 2 234126447 16I TTGATGCCAT ----------------/ATTGGCCATAGGTACA AGAAGCTGAG 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 ATTGGCCATAGGTACA 0 1 316597 CASAVA_Build 2 234127222 4D TGCTTCAGTC CTGA/---- CTTTCTTTTG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 CTGA 1 0 316598 CASAVA_Build 2 234129681 1D CAATTTCTAA T/- TTCCAATTAG 3070 het 3070 hom 36 14 21 2 T 3 2 316599 CASAVA_Build 2 234133069 1D TTTTAATGTG A/- GAAGGAAACA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 1 0 316600 CASAVA_Build 2 234201719 2D TTTTTCAAAC TG/-- TTAGAAATTT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 TG 1 0 316601 CASAVA_Build 2 234220006 2D TGCCAGTCTC TT/-- TGCTAAAACA 3070 hom 91 het 34 0 31 7 T 3 1 316602 CASAVA_Build 2 234222013 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 799 hom 12 het 6 0 4 2 T 10 9 316603 CASAVA_Build 2 234234552 1I AGTTTCAGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 9 10 316604 CASAVA_Build 2 234242641 1I TTGCTCTCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 9 10 316605 CASAVA_Build 2 234268808 3D CGCGCCCGGC CTT/--- CTTCTTCTTC 3070 het 1641 hom 20 6 10 5 CTT 5 4 316606 CASAVA_Build 2 234277193 4D TCTGATAATC TCTG/---- TCTTTTAATT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 TCTG 1 0 316607 CASAVA_Build 2 234278522 1D ACTTCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 A 13 12 316608 CASAVA_Build 2 234314313 1D CCACAAAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 10 9 316609 CASAVA_Build 2 234329326 2D AGTTTTTGCA TC/-- TCTCTCTTTA 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 TC 4 3 316610 CASAVA_Build 2 234333619 2I GGTTTTTGCC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 AT 7 8 316611 CASAVA_Build 2 234339643 14D AGACCGCTCA GTGGCCCGGGCTCG/-------------- GTGGCCCGGG 3070 het 1762 hom 34 10 12 16 GTGGCCCGGGCTCG 2 1 316612 CASAVA_Build 2 234356334 1I TATCAAATAC -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 7 8 316613 CASAVA_Build 2 234373509 1D TGGAGCCCCT G/- GGGAGTGAGG 3070 het 3070 hom 46 23 21 2 G 4 3 316614 CASAVA_Build 2 234381661 1I TGCTGGGATT -/G GAGGGGCTCT 2615 het 2615 ref 35 14 11 10 G 1 2 316615 CASAVA_Build 2 234383303 1D TCCCTTCTCC T/- CCCAGCCCTG 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 T 1 0 316616 CASAVA_Build 2 234389174 5D TCGATTACTG TTATA/----- TTATAATAAG 3070 hom 62 het 33 0 21 13 TTATA 2 1 316617 CASAVA_Build 2 234389247 4D TTTTTTTTTT TTTG/---- CTGCATCTCA 3070 het 223 hom 28 4 17 11 TTTG 1 0 316618 CASAVA_Build 2 234401198 1D TTATAAATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 9 8 316619 CASAVA_Build 2 234405537 4I CCTCCAAAGC ----/AAAA TGTGTGTATC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 0 4 316620 CASAVA_Build 2 234405768 1I GCATGTGGCA -/G AGCTGAGACC 3070 het 2712 hom 31 8 17 6 G 0 1 316621 CASAVA_Build 2 234413475 1D ACAAGGTGCA G/- AAGTTTTAAC 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 G 1 0 316622 CASAVA_Build 2 234415986 1I43M1D TAAAAAAAAA -AAACCAACAGTGATGGGAAAAAACCATAAAATTGAACACAAACA/TAAACCAACAGTGATGGGAAAAAACCATAAAATTGAACACAAAC- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 21 11 9 16 N/A 0 0 316623 CASAVA_Build 2 234416057 5I TTAAATTGAT -----/AACTG AAAGAGAAAA 3070 hom 51 het 36 0 18 18 AACTG 0 1 316624 CASAVA_Build 2 234432193 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCCC 2917 het 1863 hom 22 7 10 8 AG 1 2 316625 CASAVA_Build 2 234432637 2D AGCACCCCTC AT/-- GTGTTTTTAC 3070 het 3070 ref 39 21 11 9 AT 1 0 316626 CASAVA_Build 2 234433677 2I AAAAGATGGC --/AA AAAAAAGATG 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 A 6 8 316627 CASAVA_Build 2 234435864 1D TTAGGCCATG C/- CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 40 20 10 10 C 8 7 316628 CASAVA_Build 2 234451326 2I GTACTCTTTT --/TC CCCCCCCTCC 3070 het 3070 hom 58 23 29 6 TC 0 1 316629 CASAVA_Build 2 234470279 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2800 hom 24 6 12 6 A 11 10 316630 CASAVA_Build 2 234470932 2I AATTTCAGCA --/AT ATGTTTTATT 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 AT 1 2 316631 CASAVA_Build 2 234471826 1I CTTTGGTGTT -/C CATGGCTTGT 3070 hom 93 het 33 0 30 3 C 1 2 316632 CASAVA_Build 2 234509078 1I CTGGCCATGG -/C CCCCTTGAAT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 C 4 5 316633 CASAVA_Build 2 234548574 2I TTTGGTCCTC --/AG GGGCTAGCAC 3070 hom 78 het 30 0 24 6 AG 0 1 316634 CASAVA_Build 2 234551467 2I CAATTTGCTT --/TA TTTTTTTTTT 1386 het 1386 ref 37 13 11 13 TA 0 1 316635 CASAVA_Build 2 234574065 1D AGAAACAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 33 0 23 11 T 13 12 316636 CASAVA_Build 2 234574851 3D AAGGAACATC ATT/--- GAGTTCTGAT 3070 hom 93 het 34 0 30 5 ATT 1 0 316637 CASAVA_Build 2 234591366 4I GATACTCCTC ----/TTAT TTATTATTTT 3070 hom 76 het 28 0 26 2 TTAT 1 2 316638 CASAVA_Build 2 234591448 1I CATAAATTGT -/C CCCCATTACC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 C 4 5 316639 CASAVA_Build 2 234593713 1I TTAATTTAGT -/G GGAATCAGTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 2 3 316640 CASAVA_Build 2 234595853 20I CAGCCCTTGC --------------------/AGCCTGTCTACAAGGTATGA TGGTCATTGT 3070 het 3070 hom 44 12 21 11 AGCCTGTCTACAAGGTATGA 0 1 316641 CASAVA_Build 2 234596081 2I CTCAGCTCAA --/AC AGTCAGGCAG 3070 het 3070 ref 60 29 22 9 AC 0 1 316642 CASAVA_Build 2 234596654 21D ACTTCAAGAA TGAAGCCACAAACCCTCGCAG/--------------------- TGAGTGTTAC 3070 het 3070 hom 21 12 10 9 TGAAGCCACAAACCCTCGCAG 1 0 316643 CASAVA_Build 2 234603828 1D CTCCTATGTT C/- TTTTTTTTAT 3070 het 217 hom 41 1 35 5 C 1 0 316644 CASAVA_Build 2 234605490 1D GGATTCTGGT C/- ACATAGTAAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 0 316645 CASAVA_Build 2 234611871 1D GGAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 37 1 26 11 A 11 10 316646 CASAVA_Build 2 234626563 1D GTGAAAAAAA C/- ATCACAACTG 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 C 1 0 316647 CASAVA_Build 2 234629239 3D AGTTGACTTC TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 2932 hom 19 8 8 3 T 12 9 316648 CASAVA_Build 2 234635573 4I AGGAATTACC ----/CTGA CTATCAGGCA 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 CTGA 0 1 316649 CASAVA_Build 2 234637631 2D CCTTCCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 76 het 27 0 26 2 TC 8 7 316650 CASAVA_Build 2 234641243 1I GCATTCACCA -/T TTTTTTTTTT 2555 het 2555 ref 22 10 6 6 T 10 11 316651 CASAVA_Build 2 234652956 6D TTTATTATTT TATATA/------ TATATATATA 2146 hom 12 het 7 0 5 2 TA 11 8 316652 CASAVA_Build 2 234655989 1D ATGGACTGTG T/- TTACGCTCCT 3070 het 3070 ref 46 23 18 6 T 3 2 316653 CASAVA_Build 2 234659692 1D GTAAAGAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 9 8 316654 CASAVA_Build 2 234659818 2D TGCAACAAAC AG/-- AAAATAGTAA 3070 het 3070 hom 52 23 27 3 AG 1 0 316655 CASAVA_Build 2 234662524 1I ATTCAGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 39 0 34 5 A 10 11 316656 CASAVA_Build 2 234668998 1I CTGAGCTTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 T 9 10 316657 CASAVA_Build 2 234738436 1D GTTCCCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3046 het 3046 ref 28 12 11 6 T 10 9 316658 CASAVA_Build 2 234794283 2I TTTGCAAAAA --/AG AGATTTTGCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AG 1 2 316659 CASAVA_Build 2 234807312 1I CTTTTTCTTC -/T TTCTTTTTTT 3070 het 1061 hom 38 6 21 11 T 2 3 316660 CASAVA_Build 2 234808150 1I ACTCAATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 A 13 14 316661 CASAVA_Build 2 234808512 2I ACTTTGAGTC --/TG TAAATATGGA 3070 het 3070 ref 34 13 15 6 TG 0 1 316662 CASAVA_Build 2 234815837 1D AGCTCACGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 500 hom 40 3 21 16 T 16 15 316663 CASAVA_Build 2 234817171 1D TTTTTTTTTT G/- AATAAGTTGA 2154 het 2154 ref 28 15 5 9 G 1 0 316664 CASAVA_Build 2 234818703 4D ACATTAAAAT TATA/---- TATTTAAGGT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TA 3 1 316665 CASAVA_Build 2 234819752 2D CTAACCACAC AA/-- GAGGATCTCA 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 A 2 0 316666 CASAVA_Build 2 234835419 1D ACTTCTGCCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 48 23 20 5 T 8 7 316667 CASAVA_Build 2 234835979 8D CTTGAACTAT TTGTCTCA/-------- TACCTTTGTC 3070 het 3070 ref 38 20 20 3 TTGTCTCA 1 0 316668 CASAVA_Build 2 234837565 11D GTGCCTGGAA TATAGTTGGAG/----------- CTCAAAAGCC 3070 het 3070 ref 30 18 12 10 TATAGTTGGAG 1 0 316669 CASAVA_Build 2 234850467 2I GCTGAGGCAG --/GA GAGTTGCTTG 2652 het 2652 ref 25 15 7 3 GA 1 2 316670 CASAVA_Build 2 234852938 1D AGGTGGGAGA G/- GGAAGGAGTG 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 G 3 2 316671 CASAVA_Build 2 234858660 1D GATTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 34 0 29 5 A 12 11 316672 CASAVA_Build 2 234861641 1I TGCTTCTGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 8 9 316673 CASAVA_Build 2 234867162 3D TAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 3070 hom 9 het 29 1 23 8 AAG 1 0 316674 CASAVA_Build 2 234869088 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 25 5 14 6 A 13 10 316675 CASAVA_Build 2 234870508 1I AGGAAAGGGA -/T TTTTTTTATC 3070 hom 77 het 33 0 26 7 T 7 8 316676 CASAVA_Build 2 234877517 2I TAATCCTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 575 hom 38 2 29 7 TG 7 8 316677 CASAVA_Build 2 234878946 3I CAAATTAAAG ---/CAA CAACAACAAA 3070 het 3070 ref 51 21 21 9 CAA 3 4 316678 CASAVA_Build 2 234880034 1I CTAGCTTGCA -/G GGAGTGGTTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 2 3 316679 CASAVA_Build 2 234901306 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 9 10 316680 CASAVA_Build 2 234909863 5D AGCAAGACTC CATTT/----- CAAACCAAAC 3070 het 3070 ref 49 28 18 6 CATTT 1 0 316681 CASAVA_Build 2 234934301 1I GATGATACAA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 T 7 8 316682 CASAVA_Build 2 234936255 1D TCCTAAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 25 18 10 A 13 12 316683 CASAVA_Build 2 234937003 3D CTCTGCTTAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 99 het 38 0 33 6 AAC 5 4 316684 CASAVA_Build 2 234940176 5D AAGATTAGTA GGGCT/----- GGGCTTTAGG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 GGGCT 2 1 316685 CASAVA_Build 2 234940804 1I CATTTTTTTT -/G GGGGGGGCTG 3070 hom 71 het 30 0 21 9 G 7 8 316686 CASAVA_Build 2 234946257 1D CAACAAATAA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 9 8 316687 CASAVA_Build 2 234964653 2D TGTGTATGTA TG/-- TGTGTTTTGT 3070 hom 169 het 63 0 57 8 TG 3 2 316688 CASAVA_Build 2 234993370 1I CTTTTTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 17 11 T 11 12 316689 CASAVA_Build 2 234994307 1I TCCTCAATAC -/A AAAAAAAAAT 2496 het 2496 ref 21 9 10 2 A 9 10 316690 CASAVA_Build 2 234995128 1D TGCCAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 33 1 19 13 T 13 12 316691 CASAVA_Build 2 235007649 1D CATGGAGAAA C/- CCCATCTCTA 1479 het 12 hom 6 0 4 2 C 4 3 316692 CASAVA_Build 2 235026283 18I GTGATACACC ------------------/TGCCTCGGCCTCCCAAAG TGCTAGGATT 3070 het 3070 ref 34 22 7 5 TGCCTCGGCCTCCCAAAG 0 1 316693 CASAVA_Build 2 235031523 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1865 het 992 hom 12 4 5 3 A 13 12 316694 CASAVA_Build 2 235031875 2D TCCTTCCCCC CG/-- CCGGTCCCCA 3070 het 3070 hom 31 14 10 7 CG 1 0 316695 CASAVA_Build 2 235067517 4I TCGTGTCCAA ----/GCAT TTTCTACAGG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GCAT 0 1 316696 CASAVA_Build 2 235068373 7D TAATGCCGAT TACACAG/------- TACACAGTAC 3070 hom 84 het 34 0 28 10 TACACAG 2 1 316697 CASAVA_Build 2 235074866 1I AATTCTAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 9 10 316698 CASAVA_Build 2 235081413 1D TGCTGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 24 8 A 13 12 316699 CASAVA_Build 2 235082437 1I AAGCATAACT -/G GGGGACAAGA 3070 hom 135 het 51 0 43 8 G 4 5 316700 CASAVA_Build 2 235088290 3I TGTGTGTGAT ---/GTG GTGTATGTGT 3070 het 26 hom 60 1 40 19 GTG 1 2 316701 CASAVA_Build 2 235089540 1D CCCCTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 21 0 11 10 T 17 16 316702 CASAVA_Build 2 235090092 1D AACACTAAAA G/- TTTTTACAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 0 316703 CASAVA_Build 2 235105617 3D ATAAACAAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 7 A 14 11 316704 CASAVA_Build 2 235113614 1I AGATTAAAGG -/T GATCGTAGGA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 0 1 316705 CASAVA_Build 2 235113908 1I GACAAGACAT -/A AAAAATTGTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 5 6 316706 CASAVA_Build 2 235114445 35D AAATACTGTG TCTCAGTATGAGACACATACACATCTGTATGAGCA/----------------------------------- TGATCTCACT 3070 hom 24 het 11 0 9 4 TCTCAGTATGAGACACATACACATCTGTATGAGCA 1 0 316707 CASAVA_Build 2 235115215 11D TGCTAGTTTT GTGTATTTTTA/----------- GTAGACACAG 3070 hom 63 het 22 0 22 2 GTGTATTTTTA 1 0 316708 CASAVA_Build 2 235119491 1D TGCCTGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 12 11 316709 CASAVA_Build 2 235128002 1I CATCTCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 11 12 316710 CASAVA_Build 2 235137165 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1952 het 1253 hom 12 5 5 2 A 11 12 316711 CASAVA_Build 2 235139775 2D ACCGCGTTAC CA/-- GGGAACAATG 3070 hom 135 het 52 0 45 9 CA 1 0 316712 CASAVA_Build 2 235152072 4D50M2D AGACACAAAT ACACACAGACACAGACACACACATTTACACATACACACAGACACATACATACAAAC/----ACAGACACAGACACACACATTTACACATACACACAGACACATACATACAA-- ACACACGCAT 3070 het 3070 ref 70 59 41 9 N/A 0 0 316713 CASAVA_Build 2 235156253 1I TGTTTCTCTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 8 9 316714 CASAVA_Build 2 235156539 1D GTGAGTCACT G/- GCCCCCTGCC 3070 het 52 hom 12 1 11 0 G 2 1 316715 CASAVA_Build 2 235163142 1I CCCCCCAGCA -/C CCCTGTCTTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 3 4 316716 CASAVA_Build 2 235166917 1D GGGATTTCAC T/- CACATTGGCC 3070 het 2865 hom 18 6 11 1 T 1 0 316717 CASAVA_Build 2 235168541 1D ACCTTGCCCA C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 9 8 316718 CASAVA_Build 2 235170716 3I CATCAGCTGA ---/AGG AGGACAGGAC 3070 hom 121 het 44 0 36 8 AGG 1 2 316719 CASAVA_Build 2 235178169 1D CCTCTGCCAA C/- CCCCATCCTC 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 C 5 4 316720 CASAVA_Build 2 235181183 2I GGCATGACAG --/GA GAGAATGGCA 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 GA 2 3 316721 CASAVA_Build 2 235184436 2D31M1I CTACTAAAGA AGAGAGAGAGAGAGAGATCTGTCTTTTAATCCC-/--AGAGAGAGAGAGAGATCTGTCTTTTAATCCCT AAAACTACAC 3070 het 3070 ref 43 21 11 17 N/A 0 0 316722 CASAVA_Build 2 235184704 1I GAAAGTGCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 9 10 316723 CASAVA_Build 2 235191680 4D CAGTCACTTG GAAT/---- GAACAAGAAT 3070 het 3070 ref 46 24 18 7 GAAT 1 0 316724 CASAVA_Build 2 235206108 2D CAGCCTTGCT AA/-- AAACATTCCA 3070 het 3070 hom 32 10 17 9 A 5 3 316725 CASAVA_Build 2 235206337 2D GGGTTTCATG TT/-- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 T 9 7 316726 CASAVA_Build 2 235209746 1I AACCCATATT -/C GGGGGAGAAA 2554 het 2554 ref 22 13 6 3 C 0 1 316727 CASAVA_Build 2 235210630 1I CTGTACCCCC -/A TTGTATCTAG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 0 1 316728 CASAVA_Build 2 235215950 10D CTAAAAATAC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 1332 hom 17 5 11 1 A 24 14 316729 CASAVA_Build 2 235216195 4I ATTCTAAAAA ----/AAGG AAGTTTAAAA 2703 het 2703 ref 13 7 6 0 AAGG 0 1 316730 CASAVA_Build 2 235217880 1I TGGAAATGAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 8 9 316731 CASAVA_Build 2 235228882 4I GCTTTTCTGA ----/TTCT ATCAGACTCC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 TTCT 0 1 316732 CASAVA_Build 2 235233649 5D ACTACAACTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1656 hom 29 14 13 2 A 24 19 316733 CASAVA_Build 2 235252661 3D CGTTACATTG AAC/--- AACTCGTGGC 3070 het 3070 ref 38 17 15 9 AAC 2 1 316734 CASAVA_Build 2 235254035 1D TAGGTTGACA C/- CTGTGCATAA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 C 2 1 316735 CASAVA_Build 2 235266048 1I TGTCCAAGGA -/T AGCAGGGAGC 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 T 0 1 316736 CASAVA_Build 2 235274767 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 C 1 0 316737 CASAVA_Build 2 235285110 1I AAAAAGAAGG -/A AAGGGGAGAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 2 3 316738 CASAVA_Build 2 235285350 15I GAACCTAGAG ---------------/ACCTCTTGACTTTGA GGATGTCAGA 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 ACCTCTTGACTTTGA 0 1 316739 CASAVA_Build 2 235286497 1D CAAGGCTCTG A/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 hom 39 15 20 5 A 7 6 316740 CASAVA_Build 2 235287665 1D CAGCAGTCCT G/- GGGGGTCAGT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 G 6 5 316741 CASAVA_Build 2 235289081 1D AATGCAAGGA T/- TAATATTTCT 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 T 2 1 316742 CASAVA_Build 2 235323430 1I ATTTCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 12 12 A 10 11 316743 CASAVA_Build 2 235332979 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 9 8 316744 CASAVA_Build 2 235343170 1D GGGTAGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 12 11 316745 CASAVA_Build 2 235351404 1D ATAATGGGAG A/- CTTTAACACC 1523 het 1523 ref 9 5 4 0 A 1 0 316746 CASAVA_Build 2 235359565 1I GCCCCTGAGG -/C CCCCAAGCCA 3070 het 3070 ref 39 16 11 12 C 4 5 316747 CASAVA_Build 2 235388449 2D GTATCCCCCA AC/-- ACACACACAC 3070 het 5 hom 42 3 35 5 AC 6 5 316748 CASAVA_Build 2 235388720 1D CATCTATCAT A/- TTGGAACCCT 3070 het 3070 hom 28 12 16 1 A 1 0 316749 CASAVA_Build 2 235406907 1I GTTTCTCAGG -/C CTGGCCTTGA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 1 2 316750 CASAVA_Build 2 235408354 1I AGTCAAGACT -/G AAAAAAATAA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 G 0 1 316751 CASAVA_Build 2 235422378 1D GGGAGGCCTC T/- TGGCTTTTAA 3070 hom 160 het 56 0 54 3 T 2 1 316752 CASAVA_Build 2 235423232 1I CGGTTTACTT -/C CCTGAGAACT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 2 3 316753 CASAVA_Build 2 235442174 4D GTGGTGGTGT GTGC/---- GTGCCTGTAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 GTGC 2 1 316754 CASAVA_Build 2 235444192 1D TTCCCACAGC T/- TTAATGACCC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 3 2 316755 CASAVA_Build 2 235455741 3D GGAAAGACTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 32 0 27 5 A 18 15 316756 CASAVA_Build 2 235457083 1D ATTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1943 het 1943 ref 18 11 5 2 A 14 13 316757 CASAVA_Build 2 235471483 11D TTGGTTACAG GGCTTATCACA/----------- GGTGGCAAAG 3070 het 3070 ref 50 25 19 9 GGCTTATCACA 1 0 316758 CASAVA_Build 2 235471764 2D TAAGTGACTC TA/-- TATTGATTCT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 TA 2 1 316759 CASAVA_Build 2 235491379 1D TTGTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 937 het 884 hom 24 8 3 13 T 19 18 316760 CASAVA_Build 2 235492439 4I GCACACACAC ----/ATAT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 AT 6 8 316761 CASAVA_Build 2 235505208 4D TCTGTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 363 het 363 ref 28 13 3 13 TTTG 1 0 316762 CASAVA_Build 2 235512210 2I TTGCTGGGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 17 15 11 A 10 12 316763 CASAVA_Build 2 235515142 2I AAAACAGCAA --/TT TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 7 9 316764 CASAVA_Build 2 235518451 1D ATCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 10 9 316765 CASAVA_Build 2 235523194 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1894 het 1894 ref 36 19 8 9 T 11 12 316766 CASAVA_Build 2 235536131 1D AATACTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 11 10 316767 CASAVA_Build 2 235537911 6D GGTTCATGAG GTTGTA/------ GTTGTACTGG 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 GTTGTA 2 1 316768 CASAVA_Build 2 235547752 4D GTCTAAAAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 5 AAAT 3 2 316769 CASAVA_Build 2 235548580 2D AGGGAATTGG TT/-- TCTTGCCTCC 3070 het 3070 hom 51 23 23 6 T 3 1 316770 CASAVA_Build 2 235550138 10I GGAGAAAAAC ----------/ATAAGACAAA CCCCAGCCGA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 ATAAGACAAA 0 1 316771 CASAVA_Build 2 235555091 4D GTGAAGTCAC GACT/---- GACTTTCGGG 3070 het 3070 hom 48 22 22 5 GACT 2 1 316772 CASAVA_Build 2 235556267 1I GGAAGGAGCA -/G GGCACCCTGT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 G 2 3 316773 CASAVA_Build 2 235578034 7D GTGACTGTCT TGTTTTC/------- ACTGCAGACT 3070 het 3070 hom 47 18 25 5 TGTTTTC 1 0 316774 CASAVA_Build 2 235583181 1D CAGGAGAAAA C/- CCTCTACCTT 3070 het 3070 ref 48 25 15 9 C 3 2 316775 CASAVA_Build 2 235583458 25D CCCCGGGATC CCCCAAACTACTGAGGGTGTATCAT/------------------------- CCCCTCCTTG 3070 het 3070 ref 32 13 13 8 CCCCAAACTACTGAGGGTGTATCAT 1 0 316776 CASAVA_Build 2 235602702 1D GGGTTTGGGG C/- AAGCTCCAGA 3070 het 3070 ref 37 15 12 12 C 1 0 316777 CASAVA_Build 2 235602971 7D GCCTGGGAAG GTAGCTA/------- ATGTATGTTT 3070 het 3070 ref 33 18 15 2 GTAGCTA 1 0 316778 CASAVA_Build 2 235638670 1D TCACACCGAC A/- GATCAGCATA 3070 het 3070 ref 40 17 17 7 A 1 0 316779 CASAVA_Build 2 235646337 1D CTATGGAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2600 hom 33 8 20 5 A 10 9 316780 CASAVA_Build 2 235651925 1I42M10D TCAGGACTCA -GGAACCACTAAACAGGGAAAGCTGTCAGGAACAAAGGCAGCGGTGACATCAC/GGGAACCACTAAACAGGGAAAGCTGTCAGGAACAAAGGCAGCG---------- GTTGTGTCTG 3070 het 3070 ref 60 49 26 10 N/A 0 0 316781 CASAVA_Build 2 235652236 2D56M4I GTGTGTGTGA GTGTGTGTATGCATGCGAATGTGTGTATGTGAGTGTATATGCATGAGTATGTGCATTT----/--GTGTGTATGCATGCGAATGTGTGTATGTGAGTGTATATGCATGAGTATGTGCATTTGTGA GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 67 46 43 13 N/A 0 0 316782 CASAVA_Build 2 235652648 9D TGTGAGAGTG TGTGTGTGA/--------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 81 42 24 17 TGTGTGTGA 1 0 316783 CASAVA_Build 2 235652704 2D GTGTATATGT GA/-- GAGGGTGTGT 3070 het 3070 ref 56 34 13 13 GA 2 1 316784 CASAVA_Build 2 235656057 3D ATTTACAGAC AAT/--- AAAACATTAC 3070 hom 147 het 54 0 48 7 AAT 1 0 316785 CASAVA_Build 2 235664564 1D TCTGTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 2134 het 2134 ref 15 7 6 2 T 10 9 316786 CASAVA_Build 2 235673554 1D CGTTCATTTT C/- CCGTGTAAAC 3070 het 3070 hom 45 19 24 2 C 3 2 316787 CASAVA_Build 2 235679166 1D TGTGGCTGGA G/- GAGAAGCCAC 2895 het 2657 hom 29 10 9 11 G 2 1 316788 CASAVA_Build 2 235681196 1I ATTTTGAAAA -/G AGAAGATACA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 G 0 1 316789 CASAVA_Build 2 235699580 1I TAAAATTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 9 10 316790 CASAVA_Build 2 235711489 3I ATCGTACATG ---/AAA AAAATCAGCC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 4 7 316791 CASAVA_Build 2 235716628 3I TGCTACCATT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 het 2915 hom 25 9 11 5 TTC 3 4 316792 CASAVA_Build 2 235722869 2I TTGTGGTCTT --/AG CCATTAATCT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 AG 0 1 316793 CASAVA_Build 2 235726168 4I CTTTCTTTCT ----/TTCC TTCCTTCCTT 2655 het 2655 ref 28 11 8 9 TTCC 2 3 316794 CASAVA_Build 2 235734049 3I CATCACCCCC ---/CCT CCTTCTGTCT 2383 het 2383 ref 32 16 9 7 CCT 1 2 316795 CASAVA_Build 2 235745088 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 1243 het 1243 ref 40 23 8 9 TG 8 9 316796 CASAVA_Build 2 235761220 6D CTTCTCCTCC CCTCTT/------ CCTCTTCCTC 3070 het 3070 ref 43 20 17 8 CCTCTT 3 2 316797 CASAVA_Build 2 235770358 1D AGCTAAGAAA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 7 6 316798 CASAVA_Build 2 235781767 2D CTCAATCATG AC/-- ACATATCTGA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 AC 2 1 316799 CASAVA_Build 2 235790931 1D GGGAATTATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 10 9 316800 CASAVA_Build 2 235793456 2D AGAAGGAAAA AG/-- AGATGACACA 3070 hom 104 het 38 0 33 5 AG 2 1 316801 CASAVA_Build 2 235807427 1D ATTAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 36 1 30 5 A 11 10 316802 CASAVA_Build 2 235807748 1D GGGCAGATCA C/- CTGAGTTTGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 2 1 316803 CASAVA_Build 2 235807960 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 28 1 21 6 A 11 12 316804 CASAVA_Build 2 235815281 1D GCTAACACAG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 8 7 316805 CASAVA_Build 2 235824655 4D AATAAAATCT ACTA/---- ATTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ACTA 1 0 316806 CASAVA_Build 2 235837602 1D AATGTAGGTA T/- GTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 53 29 22 2 T 1 0 316807 CASAVA_Build 2 235847381 1D TGAATAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 33 0 19 14 A 15 14 316808 CASAVA_Build 2 235858318 4D TTAGATGGGT TTCC/---- TTGTTTATCC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 TTCC 1 0 316809 CASAVA_Build 2 235861138 1D AAATAATGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 121 het 48 0 41 7 T 10 9 316810 CASAVA_Build 2 235874867 5D TCCAGGTGAA CTGAT/----- GATCCAGCCC 2660 het 2660 ref 36 19 9 8 CTGAT 1 0 316811 CASAVA_Build 2 235884934 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1126 hom 26 7 14 5 A 12 11 316812 CASAVA_Build 2 235885576 7D ATTTTGGGAG GCTGGTT/------- GCTTGAGGCC 3070 het 3070 ref 40 23 14 5 GCTGGTT 1 0 316813 CASAVA_Build 2 235899716 4D CCAAGTGCTT ATCA/---- ATCAATGAGT 3070 het 3070 ref 46 25 18 4 ATCA 2 1 316814 CASAVA_Build 2 235905589 1I CTGAATTGTG -/C CCCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 C 9 10 316815 CASAVA_Build 2 235917655 2I TTTGCACAGG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 72 20 34 18 CA 5 6 316816 CASAVA_Build 2 235922121 6I GCCTTTTAAG ------/GGATTT GGTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 GGATTT 0 1 316817 CASAVA_Build 2 235932269 1D CCAGCCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 8 11 T 11 10 316818 CASAVA_Build 2 235934478 1I GTCTCCAGCC -/T TGACGGCCCT 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 T 1 2 316819 CASAVA_Build 2 235936338 1D CAGCCACAAT A/- AAAAAAAAAA 2588 het 2588 ref 24 12 7 6 A 12 11 316820 CASAVA_Build 2 235959466 1I TAATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1895 hom 21 7 11 3 T 10 11 316821 CASAVA_Build 2 235983650 1D CACTCTAAAA T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 26 8 15 3 T 8 7 316822 CASAVA_Build 2 235995583 1I CAGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2502 het 2502 ref 35 16 10 9 A 14 15 316823 CASAVA_Build 2 235996066 3D TATTTCATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1353 het 1044 hom 28 10 4 14 T 19 16 316824 CASAVA_Build 2 236003330 3D TGTCTTTAAA ATG/--- ATGATACCTA 2770 het 2770 ref 28 15 7 7 ATG 2 1 316825 CASAVA_Build 2 236015619 3I GTGCTGGGAT ---/TTG TACAGGCATG 1999 het 955 hom 8 3 5 0 TTG 0 1 316826 CASAVA_Build 2 236016503 1D CCATGGGTTC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 8 7 316827 CASAVA_Build 2 236018875 1I CCTGTTTCCT -/C CCATGCTCTG 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 C 2 3 316828 CASAVA_Build 2 236032441 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1935 hom 25 7 11 7 A 10 11 316829 CASAVA_Build 2 236037937 1I TTGACAAATC -/T TTTTTTTTTT 2969 het 2969 ref 29 11 9 9 T 10 11 316830 CASAVA_Build 2 236039596 1D TCATTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 T 7 6 316831 CASAVA_Build 2 236041252 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 13 12 316832 CASAVA_Build 2 236046154 3D CTCCCCAAAT ACC/--- ACCTGACACA 3070 hom 81 het 34 0 27 10 ACC 2 1 316833 CASAVA_Build 2 236050782 1D TTTTTTCACT G/- CAACCTCTGC 3070 hom 95 het 35 0 30 5 G 1 0 316834 CASAVA_Build 2 236056261 1D CCAGAAAAGG C/- AAGGAAACAG 3070 hom 81 het 36 0 28 11 C 1 0 316835 CASAVA_Build 2 236070147 1I CCCTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 37 0 30 7 A 10 11 316836 CASAVA_Build 2 236085415 2I GAGGTGTGAA --/TG TGTGTGTGAA 3070 hom 129 het 50 0 40 10 TG 4 5 316837 CASAVA_Build 2 236100055 2I TACAAAATTA --/CT TTGTGTGTAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 CT 0 1 316838 CASAVA_Build 2 236102270 1I GTGTTGGTCA -/G GCTGGTCTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 1 2 316839 CASAVA_Build 2 236112312 1D TTTAAAGCCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 61 het 26 0 21 5 T 9 8 316840 CASAVA_Build 2 236113532 2D CTCTCTCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 421 het 419 ref 16 6 2 8 T 20 18 316841 CASAVA_Build 2 236148528 1D ACAACAAACC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 9 8 316842 CASAVA_Build 2 236161612 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 15 16 316843 CASAVA_Build 2 236167673 1D CATTCTGGGG T/- TTTTTTTTTT 1907 het 1907 ref 29 16 6 7 T 12 11 316844 CASAVA_Build 2 236177458 1I TATTTGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 10 11 316845 CASAVA_Build 2 236180570 1I AAATCCAGAG -/C CCCCCCCTTC 2490 het 2490 ref 31 10 10 11 C 7 8 316846 CASAVA_Build 2 236186883 2D GAGCAGAAAC TG/-- TGGATTCAGA 3070 het 3070 ref 46 24 19 4 TG 2 1 316847 CASAVA_Build 2 236187392 1D TTTGGTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 49 hom 27 1 20 7 T 12 11 316848 CASAVA_Build 2 236190337 1I CATCTTTAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 77 het 40 0 35 5 T 8 9 316849 CASAVA_Build 2 236203098 1D CAATAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 22 0 19 3 A 15 14 316850 CASAVA_Build 2 236210834 1D TGTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1822 hom 20 5 9 6 T 13 12 316851 CASAVA_Build 2 236215867 1D TTTGGGTCTT G/- GTTTTGCCAG 3070 hom 101 het 39 0 31 8 G 2 1 316852 CASAVA_Build 2 236220695 1D GAGGGTACCC A/- TGTAGCATGA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 1 0 316853 CASAVA_Build 2 236222092 3D CCATCTCTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 18 0 16 2 A 27 24 316854 CASAVA_Build 2 236228455 2D AATGATCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3011 hom 33 12 12 9 T 14 12 316855 CASAVA_Build 2 236262435 4D AAATCTATAA GATT/---- GATTGATTGG 3070 het 3070 hom 34 11 17 8 GATT 3 2 316856 CASAVA_Build 2 236263730 1I GGAGGCCGTG -/C CCCTGGGGGC 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 3 4 316857 CASAVA_Build 2 236271655 5I ATGAAGCTTC -----/GCTTT GCTTTGCTTG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 GCTTT 1 2 316858 CASAVA_Build 2 236272790 2I TGGGGCTGAC --/TT TTTATAACAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 3 5 316859 CASAVA_Build 2 236276200 1D GATCTGGCAA T/- TTTTATGTGG 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 5 4 316860 CASAVA_Build 2 236296275 1I CAAATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 539 hom 31 3 21 7 A 14 15 316861 CASAVA_Build 2 236335180 1D TTTTTTATAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 8 316862 CASAVA_Build 2 236335494 6D ACTCCGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 21 0 10 13 A 20 14 316863 CASAVA_Build 2 236335822 2I TTCTGGAATC --/TG GGGTGAGTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TG 0 1 316864 CASAVA_Build 2 236340652 1I TCATTCTCTC -/T TTAACAGAAT 3070 hom 96 het 33 0 32 1 T 2 3 316865 CASAVA_Build 2 236344094 1I TGGATTTTGA -/G GAAAAAAATT 3070 hom 113 het 46 0 38 8 G 1 2 316866 CASAVA_Build 2 236345549 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 6 7 316867 CASAVA_Build 2 236346355 2D TTCTCCCCTC TG/-- TGTTTTGGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TG 2 1 316868 CASAVA_Build 2 236351900 4D CCCTCACTCA CTCG/---- CTCCTTATCT 3070 het 3070 ref 41 24 16 2 CTCG 1 0 316869 CASAVA_Build 2 236355968 1I ATGCTTGTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 124 het 47 0 42 5 T 7 8 316870 CASAVA_Build 2 236356418 18D TGTGTGTGTG TGTGTGTGTGTGTGTGTC/------------------ TAGGTTGCAG 3070 hom 123 het 38 0 41 5 TGTGTGTGTGTGTGTGTC 1 0 316871 CASAVA_Build 2 236357347 8D AAAATGAAAT GGACGGAC/-------- GGACGGACGG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 GGAC 4 2 316872 CASAVA_Build 2 236357982 2D TTATTAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 33 2 18 14 A 18 16 316873 CASAVA_Build 2 236359291 1D TGGGCCTTTT A/- AAAAAAACGT 3070 hom 85 het 33 0 29 4 A 8 7 316874 CASAVA_Build 2 236361253 16D GCAAGATCAA GAGCGTTCTAGACCAT/---------------- GAGCATTCTG 3070 hom 148 het 50 0 50 6 GAGCGTTCTAGACCAT 1 0 316875 CASAVA_Build 2 236364629 4I TAATTTCTTC ----/TTAA TTAATAAGAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTAA 1 2 316876 CASAVA_Build 2 236375864 1I AGCTGTCCCA -/T TGGCATTAGT 3070 hom 175 het 64 0 59 5 T 1 2 316877 CASAVA_Build 2 236376529 3D ATGGTGATGG TCA/--- TGATGGTGAT 1002 het 1002 ref 71 46 3 24 TCA 1 0 316878 CASAVA_Build 2 236381428 1D CTCCAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 37 0 31 7 A 12 11 316879 CASAVA_Build 2 236416606 1I TCCTTCTTAG -/A AGAGTGGTCT 3070 hom 81 het 31 0 24 7 A 1 2 316880 CASAVA_Build 2 236418853 1I TCAGCCAGCT -/G GGGCGAACCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 3 4 316881 CASAVA_Build 2 236422865 3I GCAGTGACCT ---/CTC CTCCTGCAGT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CTC 1 2 316882 CASAVA_Build 2 236423037 3D GCTAGGCCTG GAT/--- AAGGGTTGCC 3070 hom 86 het 32 0 26 8 GAT 1 0 316883 CASAVA_Build 2 236431789 1D CTTATAAAAA T/- GTCAGCCTGT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 1 0 316884 CASAVA_Build 2 236457836 1D TTTTTCACTG T/- TTTTTTTTTT 1275 het 1275 ref 21 8 5 8 T 17 16 316885 CASAVA_Build 2 236458244 12D GTAATAGTCA CAGCAGCAGCAG/------------ CAGCAGCAGC 3070 hom 57 het 21 0 20 6 CAG 8 4 316886 CASAVA_Build 2 236468739 1I CAGACTGGCC -/A TCTCACCTGC 3070 hom 138 het 53 0 44 9 A 0 1 316887 CASAVA_Build 2 236475264 1D TCCGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 19 0 17 2 A 15 14 316888 CASAVA_Build 2 236483402 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 30 0 28 2 A 11 10 316889 CASAVA_Build 2 236484284 3I CGCGACAGAG ---/TGA TGAGACTCCG 3070 hom 79 het 30 0 25 5 TGA 1 2 316890 CASAVA_Build 2 236488862 4D GTTCAAGACC GATT/---- AATCTAGGCA 3070 hom 62 het 24 0 21 4 GATT 1 0 316891 CASAVA_Build 2 236489552 1D TCTACTCCAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 8 316892 CASAVA_Build 2 236498336 2I ACCCAGAGGA --/AG AGAAGAAACT 3070 hom 99 het 38 0 29 9 AG 1 2 316893 CASAVA_Build 2 236510318 1D TCCCCTCTGC T/- TTTTTTTTTT 2086 het 2086 ref 37 28 5 4 T 12 11 316894 CASAVA_Build 2 236512968 9I CGTCTGTCCT ---------/CGCTGTCCC CAGCTACCAC 3070 hom 104 het 38 0 29 9 CGCTGTCCC 0 1 316895 CASAVA_Build 2 236515233 1I CTTTGTTGTT -/G GGGGGGGTAA 3070 hom 107 het 41 0 36 5 G 7 8 316896 CASAVA_Build 2 236516069 1I AAAAAAAAAA -/C TTACATTTTA 3009 hom 36 het 17 0 11 6 C 0 1 316897 CASAVA_Build 2 236518972 1I TTCCCCTAAT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 7 8 316898 CASAVA_Build 2 236525660 1I TTTGCAGTGG -/C CCCAGCAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 3 4 316899 CASAVA_Build 2 236557877 1I TTTATTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 30 4 16 10 A 15 16 316900 CASAVA_Build 2 236578509 2I CCATGTTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 TG 7 8 316901 CASAVA_Build 2 236579538 8D TGTGGCCCAG ATTATTCC/-------- ACCCGTGGCT 2878 het 2878 ref 22 13 9 4 ATTATTCC 1 0 316902 CASAVA_Build 2 236580473 1I TAAAGGAAGG -/T ATTTCCATAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 0 1 316903 CASAVA_Build 2 236586977 1I GCCTGCCCGT -/C CCAGATAAGT 3070 hom 90 het 37 0 28 9 C 2 3 316904 CASAVA_Build 2 236588101 1I TACTTTGACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 9 11 T 9 10 316905 CASAVA_Build 2 236588771 1D TGGGCTGCTA T/- TTGCTTGTAA 3070 hom 88 het 37 0 28 9 T 3 2 316906 CASAVA_Build 2 236588941 1I ATAAATTGCC -/T TTTTTTTTTA 2175 het 2175 ref 28 18 6 4 T 9 10 316907 CASAVA_Build 2 236589431 4I AAAAAAAGAA ----/AAAG AAAGAAATCT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 AAAG 1 2 316908 CASAVA_Build 2 236590853 4I ACCTCACGTC ----/GTGA GTGTTACACT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 GTGA 0 1 316909 CASAVA_Build 2 236597521 3D TCAAGCAGTT CTC/--- CTGCCTCAGC 3070 het 466 hom 12 1 11 0 CTC 1 0 316910 CASAVA_Build 2 236614768 1I AAATGATGTC -/T TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 2 3 316911 CASAVA_Build 2 236616982 20D TGGTGGCATA TGCCTGTAATCCCGGCTACT/-------------------- TGGGAGGCTG 3070 het 2417 hom 16 9 8 1 TGCCTGTAATCCCGGCTACT 1 0 316912 CASAVA_Build 2 236647319 3D ATCCCAGCTC AAG/--- AACCACCCTC 3070 het 3070 hom 32 14 13 8 AAG 1 0 316913 CASAVA_Build 2 236669280 3D CTCTCCATAG AGA/--- AGAAGTTCAC 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 AGA 2 1 316914 CASAVA_Build 2 236679041 19D CGGGTTCACA CCATTCTCCCGCGTTCACG/------------------- CCATTCTCCC 1958 hom 12 het 6 0 5 2 CCATTCTCCCGCGTTCACG 2 1 316915 CASAVA_Build 2 236683777 1I CCTTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 21 0 18 3 A 13 14 316916 CASAVA_Build 2 236684889 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAAGAAG 3070 hom 61 het 26 0 19 8 AG 4 2 316917 CASAVA_Build 2 236685799 1D ATTCCATCTC G/- AAAAAAAAAA 3070 het 997 hom 21 4 13 5 G 1 0 316918 CASAVA_Build 2 236686286 2D CTCTGCAGCC CT/-- GTCTGGCTGA 3070 het 3070 ref 19 9 8 3 CT 1 0 316919 CASAVA_Build 2 236686642 1D TCTGCCTCAG C/- CCCCCCGAGT 2238 het 465 hom 6 1 5 0 C 7 6 316920 CASAVA_Build 2 236695483 1D CACAGGCATG C/- CACCCCCATG 3070 hom 90 het 36 0 31 7 C 2 1 316921 CASAVA_Build 2 236697087 1I GCTTTCAGTT -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 G 1 2 316922 CASAVA_Build 2 236699362 2D GTGTTCCTCG CT/-- CTCTCGTATG 2957 het 2957 ref 27 12 8 7 CT 3 2 316923 CASAVA_Build 2 236712509 1I TTCATGGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 496 hom 38 2 25 11 A 11 12 316924 CASAVA_Build 2 236717021 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 14 3 A 11 12 316925 CASAVA_Build 2 236717263 9D7M2D17M2I TGACCTATGT TGGAGCACAGTGAGTGGCGTCACCATCTAGCGCTC--/---------GGGAGTG--GTCACCATCTAGCGCTCAG AGGGAGCAGA 3070 hom 87 het 26 0 30 10 N/A 0 0 316926 CASAVA_Build 2 236722733 1I TTTCACCATG -/T TGGCCAGGCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 1 2 316927 CASAVA_Build 2 236724347 1D ATTTGTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 11 10 316928 CASAVA_Build 2 236734002 2I ATGGATACAC --/TG TGAGAGGGAG 3070 hom 45 het 20 0 13 7 TG 1 2 316929 CASAVA_Build 2 236734142 1D CCGGCAAAGC G/- AGGGTTGGAC 3070 hom 96 het 33 0 32 2 G 1 0 316930 CASAVA_Build 2 236738338 1I CTCCTCCTCT -/G GCCGAAGTTT 3070 hom 56 het 23 0 16 7 G 1 2 316931 CASAVA_Build 2 236770449 2D CTCCCATGTA TC/-- CCCGCCCCCC 3070 hom 75 het 27 0 25 3 TC 1 0 316932 CASAVA_Build 2 236773169 1D ATAAAATTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 10 9 316933 CASAVA_Build 2 236774915 5I TTTTCAAATG -----/GTTAT GTTATTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 GTTAT 1 2 316934 CASAVA_Build 2 236775303 1I TAAAAGTACA -/T TTTTTTTTTG 2910 hom 30 het 25 0 10 15 T 9 10 316935 CASAVA_Build 2 236775340 1I CATTCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2344 het 332 hom 20 1 6 13 T 10 11 316936 CASAVA_Build 2 236775702 4I TTGGTAACAG ----/GGTA GGTAGTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 GGTA 1 2 316937 CASAVA_Build 2 236775778 4I ATTCTTTTTG ----/TTTT TTTTCTGCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 4 8 316938 CASAVA_Build 2 236777480 1D TGGGGATGGA T/- TTCCCCCTTC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 3 2 316939 CASAVA_Build 2 236780998 14I CAGCCGGGAG --------------/ACTGTGGAGGGACA ACGTGGAGGG 3070 hom 63 het 23 0 20 3 ACTGTGGAGGGACA 0 1 316940 CASAVA_Build 2 236786569 1D GGAGCACCAC A/- AGACAATTAC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 2 1 316941 CASAVA_Build 2 236788403 1D ACTAAACTGG A/- AAAAAAAAAA 2081 het 118 hom 22 2 8 12 A 19 18 316942 CASAVA_Build 2 236790807 6I AAAAAAAAAA ------/ATAAAT AAATAAATCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATAAAT 0 1 316943 CASAVA_Build 2 236794607 6D CTGAGCAATG CAACAA/------ CAACAACAAC 3070 hom 92 het 41 0 30 16 CAA 8 6 316944 CASAVA_Build 2 236797940 1I AGTTTTTGGG -/A AAAAAAACTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 8 316945 CASAVA_Build 2 236798225 14D CTCTGAGATC TCATTCTTCTCTGA/-------------- GATCTCATTC 3070 het 3070 ref 34 21 13 4 TCATTCTTCTCTGA 1 0 316946 CASAVA_Build 2 236799180 2I GCACAGGTAA --/TT TTTTTTTTTT 1553 het 26 hom 23 1 7 15 T 12 14 316947 CASAVA_Build 2 236801732 4I GCCTGGTGAG ----/CTCT CTGAGTGGAG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CT 1 3 316948 CASAVA_Build 2 236805644 3D CCCATGACTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 9 A 13 10 316949 CASAVA_Build 2 236810007 1I GGCCCCCTGA -/G TCCCCCCTCT 3070 hom 74 het 28 0 22 6 G 0 1 316950 CASAVA_Build 2 236810166 2D TGCGGTTTCT GA/-- GAGAGCCGCG 3070 hom 81 het 29 0 27 2 GA 3 2 316951 CASAVA_Build 2 236836269 1I AAACCAAGGG -/A GGGGGGGCGG 3070 hom 73 het 32 0 18 14 A 0 1 316952 CASAVA_Build 2 236841578 9D AGATTAATGC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 29 1 17 13 T 24 15 316953 CASAVA_Build 2 236845223 1I AAGGAAAATG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 7 8 316954 CASAVA_Build 2 236855224 2D CAATAACTGC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 64 het 24 0 22 2 A 11 9 316955 CASAVA_Build 2 236875151 1I TCCACTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1001 het 1001 ref 43 35 3 5 T 10 11 316956 CASAVA_Build 2 236920891 2D AAAACTGTGC TA/-- TATATATATA 726 het 726 ref 25 17 3 5 TA 9 8 316957 CASAVA_Build 2 236937600 3I CCTTAATACC ---/CTT CTTCTCCCCC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 CTT 1 2 316958 CASAVA_Build 2 237091414 1D AGGATGTTGG T/- TTTTTTTTTA 980 het 980 ref 44 31 3 10 T 10 9 316959 CASAVA_Build 2 237113739 2D CTTTTGTCTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 22 20 6 T 11 9 316960 CASAVA_Build 2 237114465 1D GCTAATCTAT A/- AAAAAGCATT 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 A 6 5 316961 CASAVA_Build 2 237115335 1D ATTAAACCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 10 9 316962 CASAVA_Build 2 237121325 1I TTCATCAATT -/C TGGAAAACTC 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 C 0 1 316963 CASAVA_Build 2 237125798 1D TGTCAACAGT C/- CCCCATCACC 3070 het 3070 hom 44 17 21 8 C 5 4 316964 CASAVA_Build 2 237126582 1D CTCTCCTCCT C/- CCCCCTGCTG 2177 het 1752 hom 19 7 9 3 C 6 5 316965 CASAVA_Build 2 237139926 1I TAGCAGAAGG -/A AAGACAGCAT 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 A 2 3 316966 CASAVA_Build 2 237177374 1I GACGGGCTCG -/C CCTAGGCTTT 3070 hom 52 het 20 0 15 5 C 2 3 316967 CASAVA_Build 2 237208188 4I TGCCTTGCCA ----/GGTG GGTGTGTACC 3070 hom 157 het 62 0 53 9 GGTG 1 2 316968 CASAVA_Build 2 237211736 2D TGAGGCCCTG TC/-- TCTACAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 31 11 TC 2 1 316969 CASAVA_Build 2 237213278 1I GACAGACACA -/C AGAATCCAAG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 0 1 316970 CASAVA_Build 2 237219781 1I TCATGGGTAG -/T TTCACTCTCA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 2 3 316971 CASAVA_Build 2 237229430 2D AAACTAGAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 11 9 316972 CASAVA_Build 2 237230386 2I GGCTTGGGGG --/GT TCTGGTGGAG 2406 het 2406 ref 47 25 9 13 GT 0 1 316973 CASAVA_Build 2 237237579 1D AATCATGGGA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 7 316974 CASAVA_Build 2 237246812 2D GCATTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 67 27 27 13 TG 7 6 316975 CASAVA_Build 2 237255795 1D TCCCAAAACC A/- AAAAAAAAAA 2262 het 2262 ref 32 16 8 8 A 16 15 316976 CASAVA_Build 2 237257128 1I GGTGGGGGCA -/C CCGCAGCACA 3070 hom 76 het 29 0 24 5 C 2 3 316977 CASAVA_Build 2 237265896 1I TTATGCAGGG -/T TTTTTTTTTT 2665 het 2665 ref 28 13 8 7 T 13 14 316978 CASAVA_Build 2 237270361 1I TGGGTGGATA -/T TACTGATGGG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 1 2 316979 CASAVA_Build 2 237275681 6D TTGTTAAAGC AAACCT/------ GACCTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 25 25 3 AAACCT 1 0 316980 CASAVA_Build 2 237280711 5I ATGTTTAATA -----/TTTTG TTTTATTACA 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 TTTTG 0 1 316981 CASAVA_Build 2 237280841 4D TGTTTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 TTTG 5 4 316982 CASAVA_Build 2 237281850 2D ATAGATTTTC CA/-- CACAGAGGAA 3070 het 3070 ref 45 25 12 8 CA 3 2 316983 CASAVA_Build 2 237285986 1D TTAAATTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2754 hom 31 8 12 11 T 15 14 316984 CASAVA_Build 2 237292907 3I CTTCAGGCCC ---/TTG TTGTCCTGTA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 TTG 1 2 316985 CASAVA_Build 2 237296207 1D CTTTTATTAT C/- CTTTTTGCCT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 C 2 1 316986 CASAVA_Build 2 237296621 1I CAATGTGGCA -/T TTCTCCTGAC 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 2 3 316987 CASAVA_Build 2 237303221 1D TTTGTTAAAT A/- AATATATTTA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 3 2 316988 CASAVA_Build 2 237310379 1I CAAATGTCTA -/T CACCTGATGA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 0 1 316989 CASAVA_Build 2 237311406 1I CAAAGCTATG -/C CCTTGGGGCA 3070 hom 107 het 38 0 34 4 C 2 3 316990 CASAVA_Build 2 237315590 3D GCAAGTGCTC CAG/--- CCAGGAAGCT 3070 het 3070 ref 39 16 15 10 CAG 1 0 316991 CASAVA_Build 2 237346835 1I ACACATCCCA -/G GGGGCCTGCA 886 hom 22 het 30 0 5 25 G 4 5 316992 CASAVA_Build 2 237353718 2D GAAGATCAAA GG/-- GCCAGGCAGA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 3 1 316993 CASAVA_Build 2 237356800 1D TTATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 17 10 T 12 11 316994 CASAVA_Build 2 237364607 1I ACAATGATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 39 1 28 10 A 10 11 316995 CASAVA_Build 2 237370074 1D TCTTTCTTTC T/- TTCCTTCTTT 568 het 568 ref 19 10 2 9 T 3 2 316996 CASAVA_Build 2 237370502 2D CCCTTGCATG AC/-- GATACCAGTA 3070 hom 144 het 51 0 49 3 AC 1 0 316997 CASAVA_Build 2 237374423 1I ATTCCTCCCC -/T GCCTCTTCCA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 0 1 316998 CASAVA_Build 2 237374710 1I CATATATTTT -/G GGGGAACATA 3070 hom 141 het 59 0 48 11 G 4 5 316999 CASAVA_Build 2 237379132 1D ACACATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 11 10 317000 CASAVA_Build 2 237385085 7D CAGGCCTCAG GCCTCAA/------- GCTCATGGCC 2929 het 2929 ref 32 21 10 7 GCCTCAA 1 0 317001 CASAVA_Build 2 237397022 1D CAGAGAGTAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 9 8 317002 CASAVA_Build 2 237425303 1I GGGGAAAGAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 A 8 9 317003 CASAVA_Build 2 237429195 1I GGGCCCACCT -/G GATAATCCAG 3070 het 3070 ref 47 24 12 11 G 1 2 317004 CASAVA_Build 2 237436443 3D CCTGCCCTGC CTT/--- CTTCTCAGGG 1939 het 1939 ref 34 15 8 12 CTT 2 1 317005 CASAVA_Build 2 237454655 1D TCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1910 hom 33 12 14 7 T 13 12 317006 CASAVA_Build 2 237455360 1I AACTGTTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1218 hom 37 3 27 7 A 13 14 317007 CASAVA_Build 2 237469406 2D TATATAGCTC TG/-- AAACTATCAC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 TG 1 0 317008 CASAVA_Build 2 237481784 1I GTCAGAGTGT -/G CCATGCGACA 3070 het 3070 hom 31 16 13 2 G 0 1 317009 CASAVA_Build 2 237493842 5I CAAAGTGCTG -----/GGATT GGATTACAGG 3070 het 464 hom 18 2 12 4 GGATT 1 2 317010 CASAVA_Build 2 237513068 3I CTCCATTAAA ---/TGT TGTCCTGAAA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TGT 1 2 317011 CASAVA_Build 2 237532214 1D AAAGTAAGAG T/- TAAGAGGGAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 2 1 317012 CASAVA_Build 2 237541472 1D TTGCCTCTGA T/- TTTTTTTTTT 2931 het 2931 ref 41 24 9 9 T 17 16 317013 CASAVA_Build 2 237586613 1D CAAAAGAATC A/- ATGAGTCTGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 2 1 317014 CASAVA_Build 2 237589434 1D TGGAAAAATC A/- AGTCAGCTTC 3070 het 3070 ref 50 28 20 2 A 2 1 317015 CASAVA_Build 2 237592323 1D AATTTCCCCG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 396 hom 25 2 19 4 C 11 10 317016 CASAVA_Build 2 237596591 1I CCTTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 2970 het 2680 hom 26 8 11 7 A 13 14 317017 CASAVA_Build 2 237603795 1I TACAGCAATC -/A CCAAACTCAA 3057 het 1757 hom 19 7 9 3 A 0 1 317018 CASAVA_Build 2 237608033 6D GTGTGTGTGT TACAGA/------ TACAGACCTC 3070 het 3070 hom 45 20 21 7 TACAGA 2 1 317019 CASAVA_Build 2 237653229 1I GTTCTACCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 9 10 317020 CASAVA_Build 2 237689351 1D GTTTACACAT G/- GGCCAGGCAG 3070 hom 174 het 64 0 58 6 G 3 2 317021 CASAVA_Build 2 237701667 2D CTGCATTCCC CT/-- CTCTACATCA 3070 hom 42 het 16 0 13 4 CT 3 2 317022 CASAVA_Build 2 237702101 2I TTGTGAGCAC --/AT GTGTGTGATG 3070 hom 207 het 84 0 69 15 AT 0 1 317023 CASAVA_Build 2 237702435 4I71M2D GATGCATGTG ----TGTGAGTGCATGAGTATGTGACTGTGCAGGTGATGTGTGAGCATGAGTGCATGTGTCTGTGCATGTGATGAGT/TGTTTGTGAGTGCATGAGTATGTGACTGTGCAGGTGATGTGTGAGCATGAGTGCATGTGTCTGTGCACGTGATGA-- GTGTGAGTGC 3070 het 311 hom 73 3 65 44 N/A 0 0 317024 CASAVA_Build 2 237702531 9D TGTCTGAGTG TGCATGTGA/--------- TGCATGTGAG 3070 hom 90 het 64 0 29 40 TGCATGTGA 2 1 317025 CASAVA_Build 2 237703084 2I AAACAAGTGA --/GT GTATGTGCAT 3070 hom 235 het 86 0 77 13 GT 1 2 317026 CASAVA_Build 2 237703233 4D GTGTGATGTA TAAG/---- TAAGTTTGTG 3070 hom 249 het 89 0 82 12 TAAG 2 1 317027 CASAVA_Build 2 237703354 2I GTGTGTGTGT --/GA GTGTGCATGT 3070 hom 256 het 97 0 82 15 GA 0 1 317028 CASAVA_Build 2 237704045 2D GTGCATGTGA TG/-- TGTCAGTGAT 3070 hom 150 het 79 0 50 30 TG 2 1 317029 CASAVA_Build 2 237704450 2D GTGCATATGA TG/-- TGAGTGTAAT 3070 hom 202 het 75 0 68 8 TG 2 1 317030 CASAVA_Build 2 237704621 4I TGTGATGTTT ----/GTGA GTGTGTGTGA 3070 hom 226 het 88 0 75 13 GTGA 0 1 317031 CASAVA_Build 2 237727983 4I CCACCACCCA ----/AAAC AAACAGAAAA 3070 hom 53 het 21 0 18 3 AAAC 1 2 317032 CASAVA_Build 2 237735888 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1205 het 1205 ref 16 7 4 5 T 19 18 317033 CASAVA_Build 2 237743481 1I TAGGTGAAAA -/C TGAAGCCTAG 3070 hom 129 het 45 0 41 4 C 0 1 317034 CASAVA_Build 2 237760597 1I CACTTTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 981 hom 46 3 36 7 T 11 12 317035 CASAVA_Build 2 237764370 2I GAAATGGCCA --/AG GTTCTGGGAT 3070 hom 126 het 43 0 41 3 AG 0 1 317036 CASAVA_Build 2 237775299 3I TTCCATTTCT ---/TGC TGCTCTAAAC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TGC 1 2 317037 CASAVA_Build 2 237777228 1D GGAGGGTCAC G/- GGAAGGATTC 3070 hom 149 het 54 0 45 9 G 3 2 317038 CASAVA_Build 2 237802907 1I AAGATAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1188 hom 24 3 20 1 A 10 11 317039 CASAVA_Build 2 237805607 1I CAAGTCAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 9 10 317040 CASAVA_Build 2 237808467 3D AAGCAAGTCT GAG/--- TTATTTTTTT 3070 hom 110 het 41 0 36 5 GAG 1 0 317041 CASAVA_Build 2 237813820 1I CTACTCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 35 1 24 10 T 12 13 317042 CASAVA_Build 2 237822529 6D ACTTAGAGGC TCAATG/------ TCAATGTCTC 3070 hom 95 het 37 0 32 6 TCAATG 2 1 317043 CASAVA_Build 2 237842273 1D TTCTCCTGCC T/- CAGCCTCCTG 3070 het 2998 hom 23 8 13 2 T 1 0 317044 CASAVA_Build 2 237845060 4I TGTCTGTCTG ----/TCTA TCTATCTATC 3070 hom 141 het 59 0 47 12 TCTA 3 4 317045 CASAVA_Build 2 237849816 1D GATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 11 10 317046 CASAVA_Build 2 237852766 3D AAAGCCCACC AAG/--- GGTAGCTTAG 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 AAG 1 0 317047 CASAVA_Build 2 237865775 2D AAAACTACTT TA/-- ATTTTTCCAT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 TA 1 0 317048 CASAVA_Build 2 237876283 1D AGAAGAAGAC A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 7 6 317049 CASAVA_Build 2 237878154 1I CATGGCACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 9 10 317050 CASAVA_Build 2 237936526 1D TCTACCAAGG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 57 het 27 0 19 8 C 10 9 317051 CASAVA_Build 2 237941892 1D TTTTTTAACT A/- AAAAAAAAAT 1251 het 1251 ref 35 31 3 1 A 10 9 317052 CASAVA_Build 2 237978738 1I CTCCATTTAT -/A AAAAAAACGA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 7 8 317053 CASAVA_Build 2 238004808 1D AATAAAAGAT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 40 11 23 6 A 8 7 317054 CASAVA_Build 2 238006401 1I GTTCCAGCTA -/C CCCCCCATCC 3070 het 3070 ref 41 17 11 13 C 6 7 317055 CASAVA_Build 2 238018976 1D GCCTTTTTTT A/- AAAAAACTCT 3070 hom 36 het 31 1 28 3 A 7 6 317056 CASAVA_Build 2 238029950 2D TTAGGAAAAC AG/-- AATTACATTT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 AG 1 0 317057 CASAVA_Build 2 238047653 2I CAGAGACACC --/CA CAGTTTCCCA 3070 hom 69 het 24 0 22 2 CA 1 2 317058 CASAVA_Build 2 238049270 2I TGACACACAA --/AC ACACGCGCGT 3070 hom 132 het 49 0 43 6 AC 2 3 317059 CASAVA_Build 2 238052736 1D CTAGATGCTG T/- TTATTCCTAG 3070 hom 111 het 41 0 37 5 T 3 2 317060 CASAVA_Build 2 238055119 1I TTCAAGCACT -/C CATCAAGATG 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 C 1 2 317061 CASAVA_Build 2 238056883 2I AGGGAGGGGA --/CT CTCTGCTGTC 3070 hom 77 het 32 0 25 7 CT 2 3 317062 CASAVA_Build 2 238058439 2D CATCTCCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 29 0 22 7 A 16 14 317063 CASAVA_Build 2 238071077 10D AACGGAAGAT AACTCTTACA/---------- ATAATGAACC 3070 hom 135 het 47 0 45 3 AACTCTTACA 1 0 317064 CASAVA_Build 2 238074809 1D TAGCATTCGC G/- GGTCTATCTG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 G 3 2 317065 CASAVA_Build 2 238102073 4D TAACCACCAC CTCT/---- CTCTAATTCC 3070 hom 90 het 33 0 30 4 CT 4 2 317066 CASAVA_Build 2 238118892 2D AACACACACA CC/-- CTGACAGTGT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 C 3 1 317067 CASAVA_Build 2 238172641 3D ACCCAGTAAG TTC/--- TTCTCTGACT 3070 het 3070 hom 29 14 13 4 TTC 2 1 317068 CASAVA_Build 2 238236811 1D GGAGTTCTTT C/- CCCCCCCATC 3070 hom 61 het 27 0 18 9 C 8 7 317069 CASAVA_Build 2 238239960 2I GGGATTTTCA --/TC TCTCTTCCTG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TC 2 3 317070 CASAVA_Build 2 238247305 3I GTGCAGAGCG ---/CGT CGTCTACAAA 3070 hom 100 het 37 0 32 5 CGT 1 2 317071 CASAVA_Build 2 238257556 1D AAAATTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 85 hom 28 2 12 14 T 16 15 317072 CASAVA_Build 2 238258487 5D TGTCTCCCTA CCCTC/----- CCCCCCCCAC 3070 hom 46 het 29 0 21 8 CCCTC 1 0 317073 CASAVA_Build 2 238261839 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1609 het 107 hom 27 2 8 18 T 17 15 317074 CASAVA_Build 2 238324703 1I AACTTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 A 11 12 317075 CASAVA_Build 2 238325988 1I AAGGTTCTGC -/T CTCTCTGTTT 3070 het 3070 ref 38 20 9 9 T 0 1 317076 CASAVA_Build 2 238326610 1D GGACTGAGGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 9 8 317077 CASAVA_Build 2 238332241 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 8 9 317078 CASAVA_Build 2 238353827 1I TTCCCTATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 9 10 317079 CASAVA_Build 2 238388279 1D TTAACCCCCA C/- CCCCCCCTAC 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 C 8 7 317080 CASAVA_Build 2 238409149 1D ATAAGCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 13 12 317081 CASAVA_Build 2 238411885 1I TTGACTGTAG -/A AAACAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 24 3 A 3 4 317082 CASAVA_Build 2 238412911 1D TTGGCCTCCC A/- AAGTGCTAGG 2014 het 339 hom 8 2 5 1 A 3 2 317083 CASAVA_Build 2 238415029 2I AAAGAAATAT --/TA GAGTTAAAAT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 TA 0 1 317084 CASAVA_Build 2 238445873 1I ATCTGCAGCC -/G GGGCTCCTGG 3070 hom 87 het 33 0 24 9 G 3 4 317085 CASAVA_Build 2 238463586 1I TGGGAAATAA -/T TTTTTTTTTT 1683 het 1683 ref 24 10 7 7 T 15 16 317086 CASAVA_Build 2 238464580 1D ACCCAGAGTG A/- GGGTGCAGTG 935 het 935 ref 19 12 2 5 A 1 0 317087 CASAVA_Build 2 238469117 1I GGCCGGCTGG -/C CTGGGGCTGA 3070 hom 56 het 25 0 16 9 C 1 2 317088 CASAVA_Build 2 238471159 1D TTGGTTTTTT G/- GGGGGGGGTT 3070 het 142 hom 29 2 11 16 G 9 8 317089 CASAVA_Build 2 238473848 1I GGCCTATATT -/A GCTTCTAATA 3070 hom 14 het 21 1 18 2 A 0 1 317090 CASAVA_Build 2 238475242 4I GCCCCCACAT ----/ACTC ACTCACTACA 3070 hom 106 het 42 0 32 10 ACTC 1 2 317091 CASAVA_Build 2 238480935 2I TTCTACTGAC --/AT ATCTTCAATT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 AT 1 2 317092 CASAVA_Build 2 238484136 12D CACAGAAAAT AGTCACACACAC/------------ AGTCACACAC 3070 het 3070 hom 75 33 38 13 AGTCACACACAC 1 0 317093 CASAVA_Build 2 238484619 1D TCGGGCCTTA T/- TTGGCCACCC 3070 het 2186 hom 32 8 14 11 T 3 2 317094 CASAVA_Build 2 238491653 1D AAATAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 1538 het 1538 ref 50 33 4 13 T 13 12 317095 CASAVA_Build 2 238493619 2I ACCCCATCTC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 2405 hom 25 6 11 8 A 9 11 317096 CASAVA_Build 2 238498113 1D TGCTTGTATT A/- AAAAAAAAAA 2360 het 501 hom 24 4 8 12 A 12 11 317097 CASAVA_Build 2 238500312 1D AAATATAAGC T/- TTAGTTAACA 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 T 3 2 317098 CASAVA_Build 2 238508040 1I CCCACGCAGT -/G GCTCATCGCC 3070 hom 69 het 24 0 23 1 G 1 2 317099 CASAVA_Build 2 238514107 1D AAAAGTTCAG T/- TAAAAACATG 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 T 2 1 317100 CASAVA_Build 2 238515060 1I GTTCTGGGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 9 10 317101 CASAVA_Build 2 238518118 1I CCCAGACATA -/G GGGGGTCCCT 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 G 5 6 317102 CASAVA_Build 2 238519915 4D AGAAGAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2073 het 2073 ref 15 8 7 0 AAAG 4 3 317103 CASAVA_Build 2 238519996 4D AAGGAAGGAG GGAA/---- GGAAGGAAGA 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 GGAA 3 2 317104 CASAVA_Build 2 238530253 1D TGTCCCCTCG A/- AATTCATATG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 3 2 317105 CASAVA_Build 2 238533605 3I TCTCAATCCT ---/ATC ATCATCAGAT 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 ATC 2 3 317106 CASAVA_Build 2 238537234 1D AAGCCTGCTA C/- CAGGAGGCTT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 2 1 317107 CASAVA_Build 2 238545127 8I54M3I ATAGTTACTT --------TGTTACAATTAGTGGGATCATAATGTAAGCTGTGGACTTTGAGTTATAATGTGT---/TGTTACAATGTTACAATTAGTGGGATCATAATGTAAGCTGTGGACTTTGAGTTATAATGTGTTAA TAATGTGGGT 3070 het 3070 hom 50 17 38 27 N/A 0 0 317108 CASAVA_Build 2 238550601 17D AGAACAAGAA GGTCTCACAAGGAGAAG/----------------- GGTCTCACAA 3070 hom 109 het 42 0 34 12 GGTCTCACAAGGAGAAG 1 0 317109 CASAVA_Build 2 238558378 1D GGAAAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 2725 het 66 hom 32 1 16 15 A 18 17 317110 CASAVA_Build 2 238572554 1D ATCTCTGCCT C/- CCAGATTCAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 3 2 317111 CASAVA_Build 2 238578987 1I AGTTTTCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 41 0 24 19 T 10 11 317112 CASAVA_Build 2 238580901 1D TATGTATGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 10 9 317113 CASAVA_Build 2 238586899 1D GGGAAGAAGG T/- TGTAGAAGAG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 2 1 317114 CASAVA_Build 2 238590201 1D GTAGAGAATT C/- CGTTTATTCA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 2 1 317115 CASAVA_Build 2 238595561 3I CTTTTCTTTT ---/TTC TTTTTTTGGA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 TTC 0 1 317116 CASAVA_Build 2 238595902 1I ATACAAGTTT -/G GTTTTTTTGT 3070 hom 116 het 44 0 38 6 G 1 2 317117 CASAVA_Build 2 238602305 1D TAAATTATAC T/- TTTTTCAAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 5 317118 CASAVA_Build 2 238602659 1I TTTGAACTTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 247 hom 14 1 12 1 A 7 8 317119 CASAVA_Build 2 238603332 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 T 13 12 317120 CASAVA_Build 2 238609181 2D ACTTCTCTTA CT/-- GTGCCATAAA 3070 het 3070 ref 40 22 12 7 CT 1 0 317121 CASAVA_Build 2 238621185 3D ACTGACACTA ATC/--- ATGAGCTGAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 ATC 1 0 317122 CASAVA_Build 2 238633371 3D AAAAACAAAA AAC/--- AACAAAAAAA 3070 het 168 hom 47 2 22 25 AAC 2 1 317123 CASAVA_Build 2 238634898 10D TTCATTCGGA GCCTTATGGG/---------- GCCTCGGAAG 1922 het 1922 ref 18 10 6 3 GCCTTATGGG 1 0 317124 CASAVA_Build 2 238636637 1D TTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2798 hom 33 13 11 9 T 14 13 317125 CASAVA_Build 2 238638970 1D AATGCAAAAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 8 7 317126 CASAVA_Build 2 238649481 1D ATGATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2373 het 2373 ref 33 11 6 16 T 14 13 317127 CASAVA_Build 2 238649857 1D TTTTAGTATG T/- TGTGTCTTCA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 2 1 317128 CASAVA_Build 2 238655987 3I TTTCTCTAAT ---/GTG GTGATTTCAG 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 GTG 1 2 317129 CASAVA_Build 2 238656301 1D ATTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 T 14 13 317130 CASAVA_Build 2 238658327 1I GGCAGTGATG -/A GTGGCATACC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 0 1 317131 CASAVA_Build 2 238660400 3D ACTCCGTCTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 17 0 13 7 A 14 11 317132 CASAVA_Build 2 238661082 1D AAGACAGTAC A/- AAAAAAATCC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 8 7 317133 CASAVA_Build 2 238667220 3D GTGCATCCAC TTG/--- TTGTGTGTCT 2110 het 2110 ref 33 18 9 7 TTG 2 1 317134 CASAVA_Build 2 238672495 3D CCTTTTGATC ATT/--- ATTAACTCAG 3070 het 3070 hom 26 11 14 2 ATT 2 1 317135 CASAVA_Build 2 238675195 3D AGGGAAGGAG GAA/--- GGAGCTGGAA 2695 het 2695 ref 32 13 7 12 GAA 1 0 317136 CASAVA_Build 2 238685580 4D ACTACTAGGG CTTT/---- CTATTTTTTA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 CTTT 1 0 317137 CASAVA_Build 2 238685869 1I CCAAAAAGCA -/T TTAATTGTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 3 317138 CASAVA_Build 2 238691594 3D GGGCAGATGG AGC/--- AGCAGATGGA 3070 het 3070 ref 41 14 11 17 AGC 2 1 317139 CASAVA_Build 2 238692527 2D ATGGAGGAGG AA/-- TGGATGGAGG 3070 hom 68 het 28 0 19 10 A 2 0 317140 CASAVA_Build 2 238699603 4I TGATTGTGTC ----/TGTG TGTGTCTGTA 3070 hom 156 het 68 0 43 25 TG 2 4 317141 CASAVA_Build 2 238699954 4I TGTTTGTGTG ----/TGTC TGTCTGTGAT 3070 het 3070 hom 87 38 33 16 TGTC 1 2 317142 CASAVA_Build 2 238700477 2D29M10D TGATTGTGTC TGTGTCTGTATGTGATGTGATTGTGTCTGTGTCTGTGTGAT/--TGTCTGTATGTGATGTGATTGTGTCTGTG---------- TGTGTCTGTG 3070 het 3070 ref 62 63 15 15 N/A 0 0 317143 CASAVA_Build 2 238716389 1I CCTTGCAGGT -/G GGAGCGCATG 2227 het 1570 hom 21 6 6 9 G 2 3 317144 CASAVA_Build 2 238760089 1D TATTTCAAGG A/- AAAAAAAAAA 1350 het 1350 ref 32 20 4 8 A 12 11 317145 CASAVA_Build 2 238796487 1I AAACACTGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 9 10 317146 CASAVA_Build 2 238805166 1I AAAAAACAAA -/C AAACAAACAA 1833 het 1833 ref 20 14 4 2 C 0 1 317147 CASAVA_Build 2 238810658 5I CCAGATGATA -----/AAGTT AAGCTGCATC 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 AAGTT 0 1 317148 CASAVA_Build 2 238868659 6D TCTTCTTCTC CTTCTT/------ CTTCTTCTTT 3070 het 2549 hom 42 12 21 12 CTT 5 3 317149 CASAVA_Build 2 238884578 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 29 13 8 A 12 11 317150 CASAVA_Build 2 238893147 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 899 het 899 ref 19 11 3 5 A 13 12 317151 CASAVA_Build 2 238937787 1I CCTGCCAGCG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 25 0 19 6 T 9 10 317152 CASAVA_Build 2 238941360 1I34M4D CTTCCCTTTG -AAAAAAAAAAGGGAAATTTGTGTTTTTAAAAAGTGTTA/AAAAAAAAAAAGGGAAATTTGTGTTTTTAAAAAGT---- GTTAGTATTT 3070 het 3070 hom 24 12 14 13 N/A 0 0 317153 CASAVA_Build 2 238950786 1I TTTTTGTAGG -/T TTCCCCCCCC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 2 3 317154 CASAVA_Build 2 238963034 3D AGGCTGAGGC AGA/--- AGAATCTCTT 1338 hom 7 het 3 0 3 0 AGA 2 1 317155 CASAVA_Build 2 238965955 2D AGTCTGTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 12 10 317156 CASAVA_Build 2 238979460 1I CCGGCCTTCT -/G GGGGTTGTGG 3070 hom 85 het 34 0 23 11 G 4 5 317157 CASAVA_Build 2 238982903 2D TTTCATAATC AG/-- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 AG 1 0 317158 CASAVA_Build 2 238987090 6D AATGTACAAA AGTTGC/------ AGTTTCTCCA 3070 het 3070 hom 38 15 17 9 AGTTGC 1 0 317159 CASAVA_Build 2 239000933 1D GTGGTACAGC G/- GGGGGCAGCC 3070 het 3070 ref 44 19 11 15 G 6 5 317160 CASAVA_Build 2 239025282 3D GCTCTGAAGC AGG/--- AGTTTTCACC 3070 het 3070 ref 39 23 12 5 AGG 1 0 317161 CASAVA_Build 2 239027080 2D TTCCACACAC TG/-- TTTTATTTAT 2347 het 2347 ref 27 21 5 1 TG 1 0 317162 CASAVA_Build 2 239027250 1I GCCTGGCTGA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 2527 hom 25 8 13 4 T 7 8 317163 CASAVA_Build 2 239030185 3I ATGGGTGTTC ---/AGG AGGATGCTGA 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 AGG 1 2 317164 CASAVA_Build 2 239047108 1I TGGCTGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 10 11 317165 CASAVA_Build 2 239081676 1I GGTTTGTGGC -/T TTTTTTTTTT 2598 het 1555 hom 23 8 10 5 T 15 16 317166 CASAVA_Build 2 239149430 1I CTGCTGCCCC -/A TTCCCCTGCG 2395 het 2395 ref 47 23 10 14 A 0 1 317167 CASAVA_Build 2 239151015 1D ATTGGTCAAA G/- CATGGAGCCA 3070 het 3070 ref 54 28 20 6 G 1 0 317168 CASAVA_Build 2 239164230 1I TAAGAAAAAA -/G CACAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 G 0 1 317169 CASAVA_Build 2 239164285 4I AGATAATCTA ----/TAAT TAATGTTTTG 1996 het 1996 ref 31 13 7 11 TAAT 1 2 317170 CASAVA_Build 2 239169110 3I ACAAGAGCTG ---/TTC TTCTTGGTGG 3070 het 3070 ref 59 27 23 9 TTC 1 2 317171 CASAVA_Build 2 239170462 3I GCCCAGCCCT ---/GAA GAACAGAGGC 2507 het 2507 ref 21 10 8 3 GAA 1 2 317172 CASAVA_Build 2 239170818 3I GCTCCGCCAC ---/CTT CTCAAGCTGG 3070 het 1943 hom 24 6 9 9 CTT 0 1 317173 CASAVA_Build 2 239172367 1D GAGTTAGGAA T/- TTCCCCCATG 3070 het 3070 ref 47 27 16 5 T 3 2 317174 CASAVA_Build 2 239176956 1I ATGGAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2747 het 2747 ref 27 10 9 8 A 10 11 317175 CASAVA_Build 2 239179915 1D CTCATCGCCT G/- GAAACAAACT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 2 1 317176 CASAVA_Build 2 239180739 1I AACACCCCCC -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 6 7 317177 CASAVA_Build 2 239184467 1I ATAAAAAAAA -/T AATAGATGTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 0 1 317178 CASAVA_Build 2 239185361 2D TAAGATACAT GA/-- GGAGAAGACC 3070 het 3070 ref 30 15 10 7 GA 1 0 317179 CASAVA_Build 2 239195490 2D CCTACCAAAT AA/-- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 A 10 8 317180 CASAVA_Build 2 239197643 1I AAAAAGCAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 A 8 9 317181 CASAVA_Build 2 239199165 1D TATATTGAGA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 9 8 317182 CASAVA_Build 2 239202860 1I TGAGAGCCTG -/A GGATTTCAGT 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 A 0 1 317183 CASAVA_Build 2 239214519 2I GGCAACACAC --/AT GTTTCAAAGA 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 AT 0 1 317184 CASAVA_Build 2 239218560 1I TTTTTATTTT -/C CTTATTTTAT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 C 1 2 317185 CASAVA_Build 2 239219643 5I AACATTTTAA -----/CTTTC CTTTTATAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 CTTTC 0 1 317186 CASAVA_Build 2 239230426 2D TGGGGAGGGA AG/-- AGCCGAGGAG 3070 het 3070 ref 43 20 15 9 AG 2 1 317187 CASAVA_Build 2 239234835 1I AGGGCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 10 9 10 T 11 12 317188 CASAVA_Build 2 239235199 1I ATAATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 T 11 12 317189 CASAVA_Build 2 239239278 2I CACAAATTTC --/TG TGTGTGTCAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 TG 3 4 317190 CASAVA_Build 2 239249998 1I CACCTCTTTT -/A AAAAAAATTT 2925 het 2925 ref 25 14 7 4 A 7 8 317191 CASAVA_Build 2 239252698 1I ATGTAGGACT -/C CCCCTGAGCA 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 C 4 5 317192 CASAVA_Build 2 239257166 1D CATTTTTTTT C/- CTCCCACAAC 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 C 2 1 317193 CASAVA_Build 2 239262290 1D44M1D TCTATATAAA CGTGAAACTTCCATATGTGACTTGCAAAGGCAAATGAAACACTGAC/-GTGAAACTTCCATATGTGACTTGCAAAGGCAAATGAAACACTGA- GTCACTATTT 3070 het 3070 ref 29 23 17 2 N/A 0 0 317194 CASAVA_Build 2 239282320 6D TCTTTAGCTG TGTCTA/------ TGATTAAATA 3070 het 3070 hom 26 10 17 1 TGTCTA 1 0 317195 CASAVA_Build 2 239283104 1D GTATTTTCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 10 9 317196 CASAVA_Build 2 239286503 1D AGAGGTATTC T/- GTATGTGAAT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 1 0 317197 CASAVA_Build 2 239287016 2I38M2D ACAAAAATAC --CACACACACAAATACCACAGACATGCACAAATACACACCA/CACACACACACAAATACCACAGACATGCACAAATACACAC-- CACACACACC 3070 het 3070 ref 67 41 26 28 N/A 0 0 317198 CASAVA_Build 2 239293842 1I GTGTTCTCTT -/C CCTCTGAAGC 3070 het 3070 hom 47 14 24 9 C 2 3 317199 CASAVA_Build 2 239300843 1I CAAGCTCTTC -/T TTTCCTTAAC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 3 4 317200 CASAVA_Build 2 239326021 1I TTTTTCACTC -/T TTCTAGGCTA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 2 3 317201 CASAVA_Build 2 239328869 1I ATCAAAAAAA -/G GCAGGCTGGT 3070 hom 71 het 27 0 23 4 G 1 2 317202 CASAVA_Build 2 239331189 12I TCCTTTCTTT ------------/CTTCTTTCCTTC CTTCTTTCCT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 CTTCTTTCCTTC 1 2 317203 CASAVA_Build 2 239335186 1I GGCCATATCA -/G GGGGACAGCG 3070 hom 121 het 47 0 39 8 G 4 5 317204 CASAVA_Build 2 239336229 1I AGAGAGAAAG -/A AAAAAGAAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 6 317205 CASAVA_Build 2 239340343 2D TTTCCCTTTT TA/-- TATGTCGACA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 TA 2 1 317206 CASAVA_Build 2 239341803 1D ACATAAGTGT G/- TGTTGATTGC 3070 hom 132 het 48 0 45 4 G 1 0 317207 CASAVA_Build 2 239342618 4D TCTTTCTTCG TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 hom 45 het 23 0 14 9 TTCT 4 3 317208 CASAVA_Build 2 239349745 1D GAGAGCCACA C/- CTGCAGCCTG 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 C 2 1 317209 CASAVA_Build 2 239352320 1D ACCAGCTCAG A/- GCCAAAGCCT 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 A 1 0 317210 CASAVA_Build 2 239359400 1D AAAAGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 11 10 317211 CASAVA_Build 2 239361715 1D AAGCCTCACC A/- AGCAATTTCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 1 317212 CASAVA_Build 2 239363257 3D50M4D GAATGTTGTG TTATTATAACAAAATGGTGGTCTTATTCCTGATGCTTTATTCTGATTGTGGGATTTT/---TTATAACAAAATGGTGGTCTTATTCCTGATGCTTTATTCTGATTGTGGGA---- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 11 N/A 0 0 317213 CASAVA_Build 2 239371524 4I AGATAATGAT ----/AGAC AGAGAAGACA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AGAC 0 1 317214 CASAVA_Build 2 239372754 1I GATAATTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 28 3 23 2 A 0 1 317215 CASAVA_Build 2 239373985 7I AGGTTTATAA -------/AAGAACC GAGGTAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 AAGAACC 0 1 317216 CASAVA_Build 2 239399736 4I CAGAGATGAT ----/TGAC TGTCTAAACT 3070 het 3070 hom 53 23 26 4 TGAC 0 1 317217 CASAVA_Build 2 239401880 1I GCATTACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1664 hom 35 6 21 8 A 10 11 317218 CASAVA_Build 2 239406820 1D GTTTGTTTTG T/- TTTTTTACTA 3070 het 3070 ref 49 22 16 12 T 7 6 317219 CASAVA_Build 2 239412097 2I CGTATACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 51 22 20 9 CA 7 8 317220 CASAVA_Build 2 239418074 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2966 het 1494 hom 30 10 8 12 T 16 14 317221 CASAVA_Build 2 239455633 2I TCTGTTTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 54 21 23 10 TC 6 7 317222 CASAVA_Build 2 239465767 2D CTCAGCGGGT GA/-- GAGACTCCGG 1396 het 1396 ref 21 11 3 9 GA 3 2 317223 CASAVA_Build 2 239498245 10I GCATCACCGG ----------/GAGGGGTCTT GAGCGCCTGT 3070 het 3070 hom 41 11 18 12 GAGGGGTCTT 0 1 317224 CASAVA_Build 2 239593181 4I TCTGTCTCTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 TC 5 7 317225 CASAVA_Build 2 239594527 1D GTCGCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1278 hom 27 6 15 6 A 12 11 317226 CASAVA_Build 2 239624288 1D GAGTGGACCA C/- CAAGAATGGC 3070 hom 75 het 28 0 22 6 C 2 1 317227 CASAVA_Build 2 239626463 1D GGCAGAGGAG T/- TGGGAGGGCT 3070 hom 80 het 30 0 24 6 T 2 1 317228 CASAVA_Build 2 239626563 4I GGTCCCAGCC ----/ACAT ACAGGGGGTT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 ACAT 0 1 317229 CASAVA_Build 2 239629237 1D GGGCCCCTCA T/- TTTCCTTGGA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 T 4 3 317230 CASAVA_Build 2 239633217 4I TTTCAGAGAC ----/AGAG AGAGGAGAAT 3070 hom 84 het 36 0 28 8 AG 2 4 317231 CASAVA_Build 2 239641635 5I CCGTGGTATT -----/TATTA TATAATTTTT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 TATTA 0 1 317232 CASAVA_Build 2 239667227 2D TCTTTAAACG GC/-- GCGCCCTGCG 3070 hom 75 het 31 0 26 6 GC 3 2 317233 CASAVA_Build 2 239674508 1I CAGGTGGGTG -/C CCTGCCCACT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 C 2 3 317234 CASAVA_Build 2 239693376 1I TTCTAAAGGA -/G GGGCAGGCGA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 G 3 4 317235 CASAVA_Build 2 239707634 2D TTTAAATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 12 7 T 15 13 317236 CASAVA_Build 2 239714951 1D CGAGGTGGGT G/- GATCACCTGA 3070 hom 57 het 21 0 19 3 G 2 1 317237 CASAVA_Build 2 239743525 2D ACCTCAACAG AC/-- ACACCTTTTC 3070 hom 95 het 37 0 30 8 AC 3 2 317238 CASAVA_Build 2 239749723 1I TGTGAACTCT -/C CCCCCGAAGG 3070 hom 83 het 33 0 26 7 C 5 6 317239 CASAVA_Build 2 239758928 3D TGAAAAAAAA TAT/--- ATATATATAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TAT 1 0 317240 CASAVA_Build 2 239761037 1D TTCATTCGGC A/- AAAAAAACTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 8 7 317241 CASAVA_Build 2 239769014 2D AATGCAGTCT CA/-- CAGTATCTAC 3070 het 3070 ref 39 19 16 7 CA 2 1 317242 CASAVA_Build 2 239770547 1D AAACTAGGTT C/- CTTTCCGTGT 3070 hom 81 het 30 0 25 6 C 2 1 317243 CASAVA_Build 2 239771667 1D TGTGCCCTAT G/- GGGGGGGTCC 2495 hom 38 het 17 0 10 7 G 8 7 317244 CASAVA_Build 2 239785742 9D TGCTTCCTGC CCCCCACCA/--------- CCCCCACCCC 3070 hom 75 het 30 0 25 7 CCCCCACCA 1 0 317245 CASAVA_Build 2 239795519 2D ATTGAAAGAC TT/-- TTTTTCTTTG 3070 het 2041 hom 21 6 11 4 T 7 5 317246 CASAVA_Build 2 239802824 2D CGCACGTGTT TA/-- TATATATACA 3070 hom 49 het 45 1 40 4 TA 5 4 317247 CASAVA_Build 2 239804813 2D TAAATAACAC AG/-- AGTCACATGA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 AG 2 1 317248 CASAVA_Build 2 239809431 3D GCTTTGTGAT CTC/--- CTTTCGTCCT 3070 hom 118 het 43 0 34 10 CTC 1 0 317249 CASAVA_Build 2 239812377 1I TGGCCACGTA -/C CTGCTACCCA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 C 1 2 317250 CASAVA_Build 2 239815041 2D GAGCTGTCAC TG/-- TGAGAGTTAG 3070 hom 99 het 39 0 32 8 TG 2 1 317251 CASAVA_Build 2 239818096 1I CTGTAGGAGC -/G AGTGGGGGGC 3070 hom 90 het 33 0 23 10 G 0 1 317252 CASAVA_Build 2 239820092 1D CCAAAATCCG A/- AAAAAAAAAA 2046 het 2046 ref 34 21 6 7 A 13 12 317253 CASAVA_Build 2 239870619 1I AGGCCCCGAA -/G GCGCCAAGGG 3070 hom 48 het 18 0 12 6 G 1 2 317254 CASAVA_Build 2 239876223 7I GTCTTTTCTT -------/CTGGACC CTGGAAATCC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 CTGGACC 0 1 317255 CASAVA_Build 2 239895302 1D ACAGGCCTCC G/- GGTGTCCCCC 3070 het 3070 hom 33 12 13 9 G 3 2 317256 CASAVA_Build 2 239905319 1I AACGATTCTG -/A AAAAAAAAAA 2787 het 2787 ref 35 18 8 9 A 13 14 317257 CASAVA_Build 2 239921154 4I CTCCATCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 AAAC 2 3 317258 CASAVA_Build 2 239929493 2D TTGGAGGGAA AC/-- AGCCGCCTAC 2858 het 2858 ref 34 14 9 12 AC 1 0 317259 CASAVA_Build 2 239932890 2I TTTAATACAC --/AA AGACACCCAC 3070 het 3070 ref 86 44 33 9 A 1 3 317260 CASAVA_Build 2 239933179 24D AAACACACAA ACACACCTTCACACACACACACAC/------------------------ ACACACAGAC 3070 het 3070 ref 49 25 21 13 ACACACCTTCACACACACACACAC 1 0 317261 CASAVA_Build 2 239951197 1I GAGCGGTGGC -/G GGGGGGAACA 2680 het 2680 ref 29 16 7 6 G 6 7 317262 CASAVA_Build 2 239957612 8I TTGGAGCCAC --------/CAATAAAG TGATGTGCAG 3070 het 3070 ref 48 23 15 10 CAATAAAG 0 1 317263 CASAVA_Build 2 239963865 3I GCCCCAGCTC ---/AGG AGGCGTCGCC 3070 het 1561 hom 27 7 13 7 AGG 1 2 317264 CASAVA_Build 2 239966976 2D TAAATTATAC AT/-- ATGTTATAAA 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 AT 2 1 317265 CASAVA_Build 2 239984274 1I TAATGCTGCA -/G GCACCATGGC 3070 hom 120 het 47 0 40 7 G 1 2 317266 CASAVA_Build 2 239984715 2I ATCCCCAGCT --/AC AGTCATCAAT 837 het 837 ref 27 11 4 12 AC 0 1 317267 CASAVA_Build 2 239997248 1I TTGGGTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 18 13 11 T 9 10 317268 CASAVA_Build 2 240000551 2D ATTGCAGAGC CT/-- CTTCACCTCT 3070 het 3070 hom 28 9 15 7 CT 2 1 317269 CASAVA_Build 2 240001152 1I CATCTCCCTA -/T TTTTTTTTTT 1036 het 1036 ref 22 8 7 7 T 15 16 317270 CASAVA_Build 2 240001222 2D TGAGCGGGGC AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 10 8 317271 CASAVA_Build 2 240054163 4D GTGTGATATA TGTG/---- TGTGCATGTG 3070 het 3070 ref 88 46 32 13 TG 4 2 317272 CASAVA_Build 2 240058775 1D ACTCTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1913 hom 47 16 17 14 T 17 16 317273 CASAVA_Build 2 240083927 13I AAACCGTCAT -------------/TAGGGCTTCTGAG TAGGGCTTCT 3070 het 3070 hom 38 12 14 13 TAGGGCTTCTGAG 0 1 317274 CASAVA_Build 2 240133313 1D GAGGGGCTGT G/- GGGGGTGCTG 3070 hom 60 het 27 0 17 11 G 6 5 317275 CASAVA_Build 2 240137057 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 3070 hom 47 het 24 0 14 11 CA 10 9 317276 CASAVA_Build 2 240143069 1D TTTTTTTTTT C/- CTTCAACTTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 C 2 1 317277 CASAVA_Build 2 240144106 1D CTCTTTCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 12 11 317278 CASAVA_Build 2 240183506 3D AACAGAACAT GTC/--- GTCACTGTAG 3070 het 3070 ref 36 19 15 6 GTC 2 1 317279 CASAVA_Build 2 240192006 1I TTCAGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 17 13 T 13 14 317280 CASAVA_Build 2 240208705 2D TTTATGAGCC AA/-- AGTGTGTCCC 3070 het 3070 ref 33 16 15 3 A 3 1 317281 CASAVA_Build 2 240208795 1I TATTTTTTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 8 9 317282 CASAVA_Build 2 240208932 2D AAGTAGGTAA TT/-- TTTCAACTCT 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 T 5 3 317283 CASAVA_Build 2 240209519 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1777 het 1065 hom 24 5 10 9 T 15 16 317284 CASAVA_Build 2 240213249 1D GGGGTGTGGA C/- CCCCCCCTGC 1802 hom 16 het 18 0 8 10 C 8 7 317285 CASAVA_Build 2 240231989 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 961 het 961 ref 22 15 3 4 T 11 10 317286 CASAVA_Build 2 240233695 1D TTATTCCTAG A/- GATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 1 0 317287 CASAVA_Build 2 240239462 1I ATTTTTGTAA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 6 7 317288 CASAVA_Build 2 240241657 3D TTGGAATCCA CTT/--- CTTCTCGCTT 3070 het 3070 ref 70 35 27 10 CTT 2 1 317289 CASAVA_Build 2 240258875 1I CTTGATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 18 13 A 14 15 317290 CASAVA_Build 2 240265141 1I TAATATGTAC -/G GCAACTATTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 G 1 2 317291 CASAVA_Build 2 240273749 1D TTATTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 12 11 317292 CASAVA_Build 2 240285856 2I GTGTGTACAC --/AT GTTTGTTTTA 3070 hom 63 het 27 0 18 9 AT 0 1 317293 CASAVA_Build 2 240302794 2D TGCCTGTGTG TA/-- TATGTGTGTG 3070 het 3070 hom 69 30 34 6 TA 2 1 317294 CASAVA_Build 2 240310016 10D AGGCTTTCGT GAGGATGTCA/---------- GGCCTGCTTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 GAGGATGTCA 1 0 317295 CASAVA_Build 2 240310497 8I TGAGCATGTG --------/TGTGTGCA TGTGTGCATG 3070 hom 100 het 81 1 62 19 TGTGTGCA 1 2 317296 CASAVA_Build 2 240325108 2D AGACACACAC AT/-- GTGCATGTGC 3070 het 3070 ref 49 25 13 11 AT 1 0 317297 CASAVA_Build 2 240325611 4D37M4I ACACACACTC ACATATGCTTCACACATACACCCTCACACACGCACTCAAAC----/----ATGCTTCACACATACACCCTCACACACGCACTCAAACACTT ACACACGTAA 3070 het 3070 hom 50 15 32 32 N/A 0 0 317298 CASAVA_Build 2 240348633 1I TGAGACAGAT -/A AGCAAAAGTG 3070 het 3070 hom 51 16 28 7 A 1 2 317299 CASAVA_Build 2 240351163 1D CCCAGTTGCT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 A 9 8 317300 CASAVA_Build 2 240358784 4I TTTTAGAACA ----/CTGT CTGTCAATGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CTGT 1 2 317301 CASAVA_Build 2 240359324 3I ACCAGAACCA ---/CCC CCCAGTCAGT 3070 hom 77 het 51 1 35 15 C 3 6 317302 CASAVA_Build 2 240371109 4D TGGAAATAAA TCTC/---- TCCCCTTATT 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 TC 3 1 317303 CASAVA_Build 2 240377946 1I GGAACCAGAG -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 C 8 9 317304 CASAVA_Build 2 240392631 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1617 het 1617 ref 22 10 7 5 A 13 14 317305 CASAVA_Build 2 240395212 1D GCTGTAGGCG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 9 16 7 T 10 9 317306 CASAVA_Build 2 240395710 1D AATCTTTGAA T/- TTTTATAATA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 5 4 317307 CASAVA_Build 2 240410635 2I TGGTTAACTG --/CT CTGTTAGAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CT 1 2 317308 CASAVA_Build 2 240422147 14D TGAGCGTGGT GGCACGTGCCTGTA/-------------- ATCCTAGCTA 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 GGCACGTGCCTGTA 1 0 317309 CASAVA_Build 2 240428110 1I GGAGCTTCTG -/C TTGTTTCACT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 0 1 317310 CASAVA_Build 2 240437215 1D TCTGACAGGC T/- TTTTTTTTTT 1091 het 1091 ref 32 23 4 6 T 11 10 317311 CASAVA_Build 2 240447232 1D CTAACTTAGC A/- AAAGAGGCTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 3 317312 CASAVA_Build 2 240448854 2I TAAAAAAAAA --/AT ATCCAAATAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 AT 1 2 317313 CASAVA_Build 2 240485597 3I CTTCGTATCC ---/CTT CTTTTCATTT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 CTT 1 2 317314 CASAVA_Build 2 240500683 1I GGTGCCACGT -/G GGGGCTCAGC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 4 5 317315 CASAVA_Build 2 240502968 4D CAGAGATACT CACA/---- CAAACATACA 3070 het 3070 hom 54 27 22 9 CA 3 1 317316 CASAVA_Build 2 240503335 4D17M2I ACACAAACAT ACACACACAACACACACACAT--/----ACACAACACACACACATAC ACAGACACAC 3070 het 3070 hom 60 16 29 20 N/A 0 0 317317 CASAVA_Build 2 240507524 1I TCCTCGAGGG -/C CAGGGGCATC 3070 het 3070 ref 28 11 9 8 C 1 2 317318 CASAVA_Build 2 240514706 1I TCCTACTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 9 10 317319 CASAVA_Build 2 240516131 1D AACACCAGTA C/- CCAGGTAAAG 3070 het 3070 hom 45 20 25 0 C 3 2 317320 CASAVA_Build 2 240533936 1D AGGGCCCACA G/- GGCTCCGGGA 3070 het 1326 hom 24 4 15 5 G 3 2 317321 CASAVA_Build 2 240536206 3D TCAGTTAACG GCA/--- GCAAGGTTCA 3070 het 3070 hom 48 16 27 6 GCA 2 1 317322 CASAVA_Build 2 240542905 8I CCCCAAGTGG --------/GTGGCGCT GTTGGCAGGT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 GTGGCGCT 0 1 317323 CASAVA_Build 2 240547285 1I6M18D CAGGGTCAGA -CGCAAACACAGGGGATGATCAGAG/TCGCAAA------------------ CACCCGAGTC 3070 het 3070 ref 56 34 19 11 N/A 0 0 317324 CASAVA_Build 2 240549281 1D CGGCAGCTGT G/- GGGGAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 G 5 4 317325 CASAVA_Build 2 240557526 15I CCTGCTGCTC ---------------/CTGACCCTGCATCTG CTGACCCTCA 3070 hom 90 het 40 0 29 11 CTGACCCTGCATCTG 0 1 317326 CASAVA_Build 2 240557978 2D ACAAATGGAC AG/-- AGTCACAGGG 3070 het 3070 ref 32 13 10 11 AG 2 1 317327 CASAVA_Build 2 240561299 4D CAAACTTAAT TAAG/---- TAACTTATAA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 TAAG 1 0 317328 CASAVA_Build 2 240567686 2D TCTCGGGAAA AG/-- AGACAGTGCC 3070 hom 50 het 22 0 13 9 AG 2 1 317329 CASAVA_Build 2 240569518 2I ATGTCTACAG --/AA AGAGAAGCAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 1 3 317330 CASAVA_Build 2 240572324 1D ATCGGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 29 1 23 5 A 12 11 317331 CASAVA_Build 2 240575038 1I CAAAACCACA -/T TTGAGGGATA 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 T 2 3 317332 CASAVA_Build 2 240586626 1D CTTGGTTGGC T/- TCTGGAAACT 3070 het 3070 ref 33 11 10 13 T 2 1 317333 CASAVA_Build 2 240593806 1I AATCACACCG -/T TAACAGTCAG 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 T 1 2 317334 CASAVA_Build 2 240602174 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2905 hom 29 het 16 0 10 6 A 12 13 317335 CASAVA_Build 2 240613067 2D CCTCGGGGCC CT/-- GATCACCTCC 3070 hom 43 het 17 0 11 7 CT 1 0 317336 CASAVA_Build 2 240624069 1D GTTCTAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 10 17 11 T 11 10 317337 CASAVA_Build 2 240628082 9D TTCCCTTCAG GTGCTAGCA/--------- GTGCTAGCAG 3070 het 3070 ref 57 18 16 25 GTGCTAGCA 3 2 317338 CASAVA_Build 2 240637376 1D ATAAGTTATA T/- TTTTTTGTAC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 7 6 317339 CASAVA_Build 2 240638171 2I TGACTGGAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 12 14 317340 CASAVA_Build 2 240647189 1I AGTTGCGTCT -/G TTACTGGAAA 3070 het 3070 hom 56 21 25 10 G 0 1 317341 CASAVA_Build 2 240649220 1I TGATGCATCT -/G GAAATATTCT 3070 hom 157 het 57 0 53 4 G 1 2 317342 CASAVA_Build 2 240655418 13I TATTTTAAAA -------------/TTTTTAAATGCTT TTTAAAAATA 3070 het 3070 hom 44 18 18 8 TTTTTAAATGCTT 0 1 317343 CASAVA_Build 2 240659008 1I TTAAAACTTC -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 7 8 317344 CASAVA_Build 2 240660587 3D TTAAATGTCT TAA/--- TGATGCAGGT 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 TAA 1 0 317345 CASAVA_Build 2 240686757 1I CAAATCTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 11 10 T 13 14 317346 CASAVA_Build 2 240693265 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1897 hom 23 5 13 5 A 11 12 317347 CASAVA_Build 2 240695942 4D TCCTGCAGTG GAGA/---- GAGAGAGCCC 3070 het 3070 ref 35 18 11 10 GA 5 3 317348 CASAVA_Build 2 240697404 1D TCAGGAGCCT C/- CCCCTTCCTG 3070 hom 98 het 37 0 31 7 C 5 4 317349 CASAVA_Build 2 240700251 1I CGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 46 het 18 0 15 3 T 8 9 317350 CASAVA_Build 2 240705016 1D TAAAAAATCT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 8 317351 CASAVA_Build 2 240716742 2D AAAATACCTC TT/-- TGTCAGTGTA 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 3 1 317352 CASAVA_Build 2 240723085 9D CTAGGACTGT GAAGCCTAG/--------- GACTGTAAAA 3070 hom 84 het 29 0 27 4 GAAGCCTAG 1 0 317353 CASAVA_Build 2 240723946 17I CCCACACGAG -----------------/GTTGATTCCCCACCCGC GTTATGGAGA 3070 hom 90 het 33 0 27 6 GTTGATTCCCCACCCGC 0 1 317354 CASAVA_Build 2 240724925 2D GGCGGGAGAC GG/-- GGGGGGGCAG 2122 hom 36 het 15 0 8 8 G 9 7 317355 CASAVA_Build 2 240740164 6D GCGTTAGACA GCATCG/------ GCTGAGACAG 3070 het 3070 hom 35 13 20 4 GCATCG 1 0 317356 CASAVA_Build 2 240741330 2D CCAAACCATG AT/-- ATAGCTATAC 3070 hom 168 het 60 0 55 8 AT 2 1 317357 CASAVA_Build 2 240752232 2D ATGCACACAC AT/-- ATACACACAT 3070 hom 181 het 69 0 61 9 AT 2 1 317358 CASAVA_Build 2 240753246 10D GCAGGGACCA GGGCGGATCC/---------- GGGTGGCTTA 3070 hom 68 het 25 0 19 6 GGGCGGATCC 1 0 317359 CASAVA_Build 2 240756782 2D AGCTCGGACG GT/-- CATGCTCGCC 2440 hom 30 het 12 0 8 4 GT 1 0 317360 CASAVA_Build 2 240764094 1D TTGCTCAGAG T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 38 31 4 3 T 11 10 317361 CASAVA_Build 2 240805721 37D CAGTCCCACT CACCTCCACCAACTCCACCCACCCCTTCAGCCCTGAC/------------------------------------- CACCTCCACC 3070 hom 47 het 29 0 13 22 CACCTCCACCAACTCCACCCACCCCTTCAGCCCTGAC 1 0 317362 CASAVA_Build 2 240808781 1I AAATGTCTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 12 13 317363 CASAVA_Build 2 240819921 1I CCTCAGTTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 13 13 12 A 9 10 317364 CASAVA_Build 2 240820722 1I TGAGAACAGT -/C CCCTGGAGGA 2317 het 2317 ref 24 10 6 8 C 3 4 317365 CASAVA_Build 2 240825346 1I TTAAGATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 10 11 317366 CASAVA_Build 2 240833267 3I GATCTTACAT ---/ATC AGCAGCTATA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 ATC 0 1 317367 CASAVA_Build 2 240870454 1I TACAAAATTT -/A AAAAAAATCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 8 317368 CASAVA_Build 2 240873584 2D GAACAGGTGC TT/-- GGCGTCCTCA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 2 0 317369 CASAVA_Build 2 240885716 1I CCATGAGGCC -/G GGGGCTCATT 3070 hom 79 het 30 0 20 10 G 4 5 317370 CASAVA_Build 2 240891621 1D CACTTCCACA T/- TTTACCAGGG 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 4 3 317371 CASAVA_Build 2 240895561 1I TGTCCATTTT -/G GGGGGGGGGG 2028 het 592 hom 23 2 7 14 G 10 11 317372 CASAVA_Build 2 240897196 8D GTGTTTATGA TGTGTGTC/-------- TGTGTGTCTC 532 het 532 ref 100 79 4 26 TGTGTGTC 2 1 317373 CASAVA_Build 2 240897238 8D23M4I TGTCTATATG TGTCTGCATGTCTGTGTGTATCTCTGATGTA----/--------TGTCTGTGTGTGTCTCTGATGTATATC TATTTATGTG 3070 het 3070 ref 99 83 29 21 N/A 0 0 317374 CASAVA_Build 2 240902467 3D TAAATAAATA AAT/--- AAATAAAAAA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 AAT 1 0 317375 CASAVA_Build 2 240903317 1D CCACTGGGGG A/- AAAAATAGCA 3070 hom 88 het 37 0 32 6 A 6 5 317376 CASAVA_Build 2 240904523 1I ACCACAAAGG -/A AAAAAAATAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 7 8 317377 CASAVA_Build 2 240923759 1D TCATTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 17 1 13 3 T 13 12 317378 CASAVA_Build 2 240930389 1D AAGACAGCGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 413 hom 24 1 17 6 A 11 10 317379 CASAVA_Build 2 240931986 1I ATAAATTCAG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 317380 CASAVA_Build 2 240938853 1I AAGAGAGGAC -/A ACTTGTGCTG 3070 hom 135 het 46 0 43 3 A 1 2 317381 CASAVA_Build 2 240939217 8I ATTTTAGCTA --------/ATACAACC ACACTGGAAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 ATACAACC 0 1 317382 CASAVA_Build 2 241023009 1D TGGAGGGTCA C/- CCCCCCAAAA 3070 het 1769 hom 22 7 9 6 C 7 6 317383 CASAVA_Build 2 241029479 1I TGCCGTGCCC -/G GGGCCAGTGA 1963 het 1963 ref 21 13 7 1 G 3 4 317384 CASAVA_Build 2 241036703 6D GGGCCCACAG GAGGTC/------ GAGGTCGGAG 1379 het 1379 ref 25 12 6 8 GAGGTC 2 1 317385 CASAVA_Build 2 241037404 1I CCGGCAGGCG -/C CCCCCCCCCA 1557 het 1207 hom 21 7 4 10 C 9 10 317386 CASAVA_Build 2 241049151 1I ACCTGGATTT -/G GGCCCATGGC 2963 het 2963 ref 25 14 8 3 G 2 3 317387 CASAVA_Build 2 241052629 40D GCACACGTGG TGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT/---------------------------------------- TAACGCCTGT 3070 hom 98 het 34 0 30 11 TGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT 1 0 317388 CASAVA_Build 2 241054074 3I CACCTGGCAC ---/GTG GGGCCCTTAC 3070 hom 72 het 25 0 23 2 GTG 0 1 317389 CASAVA_Build 2 241057730 1D CCCATCACAC G/- GTGCACACAC 2672 het 30 hom 39 1 12 26 G 2 1 317390 CASAVA_Build 2 241057757 3I ATGTGCACTC ---/CTA CACATTTACA 3070 hom 20 het 39 0 11 28 CTA 0 1 317391 CASAVA_Build 2 241059203 1I TCTGGGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 26 1 17 8 A 10 11 317392 CASAVA_Build 2 241059516 5D TCAAAATGAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 21 11 10 2 AAAAT 3 2 317393 CASAVA_Build 2 241060798 1I CTGGAGGCAA -/T CCCTTCAGAG 3070 het 119 hom 44 1 34 9 T 0 1 317394 CASAVA_Build 2 241061101 1I TGTAATCCCA -/G CTACTCAGGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 0 1 317395 CASAVA_Build 2 241062189 1D TAACATGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 11 10 317396 CASAVA_Build 2 241079182 1D TGACTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 2741 het 2741 ref 31 14 7 10 T 17 16 317397 CASAVA_Build 2 241098870 1D AAGTTCCACC T/- GCCAGTCTGT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 1 0 317398 CASAVA_Build 2 241105769 4I GGCCTGGTGG ----/TGCA TGCCTGTAGT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 TGCA 0 1 317399 CASAVA_Build 2 241120266 3D AAAGCAGCCA AAG/--- AAGAGACAGA 3070 het 3070 ref 33 12 11 12 AAG 2 1 317400 CASAVA_Build 2 241145119 1D TTTCCTCAGT A/- GGTTGCTGAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 7 A 1 0 317401 CASAVA_Build 2 241171500 3D TAGGAAAAGG TTC/--- GAGAAGGACC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TTC 1 0 317402 CASAVA_Build 2 241171834 4I TGAACCTGAG ----/AAGT AAGTGGTCAG 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 AAGT 1 2 317403 CASAVA_Build 2 241177091 4I CTAGAGAAAC ----/AGTA AGATTTCCAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AGTA 0 1 317404 CASAVA_Build 2 241186291 1D CCCTATCTGT C/- CTGGCAGACC 1591 het 1591 ref 26 9 8 9 C 2 1 317405 CASAVA_Build 2 241212317 17I AGTGAGGGAT -----------------/GGGAGTTGAGATCGGGC GGATGAAATC 3070 het 2166 hom 21 8 11 2 GGGAGTTGAGATCGGGC 0 1 317406 CASAVA_Build 2 241220060 1I TCTCACAGGA -/C CCCAGGCTCC 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 C 3 4 317407 CASAVA_Build 2 241223557 16D CAGGAGACTT CATGCCCAGGAAGGTC/---------------- CATGCCCAGG 511 het 511 ref 27 19 3 11 CATGCCCAGGAAGGTC 1 0 317408 CASAVA_Build 2 241226660 1D CATCCTGGGG A/- AGGTTCTGGA 3070 het 3070 hom 47 18 22 8 A 2 1 317409 CASAVA_Build 2 241238124 1I TCATAATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 38 0 32 6 A 11 12 317410 CASAVA_Build 2 241242145 1D CAGGAGGTGG A/- GCTTGCAGTG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 1 0 317411 CASAVA_Build 2 241247857 1D GTCTAGATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 10 9 317412 CASAVA_Build 2 241254785 1D ATATAATTTA T/- TTTTTTATAT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 T 7 6 317413 CASAVA_Build 2 241255120 1I AATCTTTTTC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 75 het 35 0 26 9 T 7 8 317414 CASAVA_Build 2 241296483 1I AACTATTTTT -/C TTTTTACTAT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 C 0 1 317415 CASAVA_Build 2 241313169 1D TGCAGGAACC A/- TGGCCTCCAC 2674 hom 32 het 16 0 10 6 A 1 0 317416 CASAVA_Build 2 241323477 23I GGTCCAGCCA -----------------------/CCAGCTGGAGGACCAGCGGGAGG TGAGCCGCTC 3070 het 2133 hom 29 9 12 8 CCAGCTGGAGGACCAGCGGGAGG 0 1 317417 CASAVA_Build 2 241337796 7I AGCATTACAA -------/CGGATCC CGGATCCCGT 3070 hom 97 het 42 0 28 14 CGGATCC 1 2 317418 CASAVA_Build 2 241342443 8I TAGTGCTGGG --------/TGCTCTCC TGCTCTCCTC 2860 hom 37 het 21 0 9 12 TGCTCTCC 1 2 317419 CASAVA_Build 2 241347676 13I CTCCTCTCTG -------------/CCTCCTGATGGGC CCTGGTGCCT 3070 hom 80 het 27 0 24 5 CCTCCTGATGGGC 0 1 317420 CASAVA_Build 2 241389088 6D CTCTACACTC TTTTAT/------ TTTTATTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TTTTAT 3 2 317421 CASAVA_Build 2 241389401 1D TGGAAACTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 11 10 317422 CASAVA_Build 2 241390187 1D AGTCAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1217 hom 36 5 12 19 A 17 16 317423 CASAVA_Build 2 241393755 1D CCTCTCGCAG A/- AAATTAGAGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 4 3 317424 CASAVA_Build 2 241414432 1D GTCCAGCCAA G/- GGGCAGCCCA 829 het 829 ref 29 9 4 16 G 4 3 317425 CASAVA_Build 2 241418256 1D CAGCCTAACC A/- ACATGGAGAA 3070 het 937 hom 19 2 11 6 A 2 1 317426 CASAVA_Build 2 241426865 1D AGATTCTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 A 13 12 317427 CASAVA_Build 2 241430231 1I ACCCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 1943 het 1943 ref 33 12 8 13 A 14 15 317428 CASAVA_Build 2 241470516 1D ATAGGGACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 10 9 317429 CASAVA_Build 2 241486847 1D GACAGACCAC G/- GCGGAGGTAA 3070 het 2713 hom 31 7 21 3 G 2 1 317430 CASAVA_Build 2 241498423 35D GAACCCAGCA CAGAAAGCCCAGTCCCCTCAGAGCTGGGGGCTCCT/----------------------------------- CAGACTCCCG 3070 het 3070 hom 30 14 20 5 CAGAAAGCCCAGTCCCCTCAGAGCTGGGGGCTCCT 1 0 317431 CASAVA_Build 2 241507842 10I ATTGGGGTTC ----------/CAGGTGCTCA GAGGTGGTAG 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 CAGGTGCTCA 0 1 317432 CASAVA_Build 2 241516959 1D GCCCTCTGGA G/- GGTGTATGGC 3070 het 3070 hom 45 18 13 15 G 3 2 317433 CASAVA_Build 2 241524106 1D CTCACTGGAG A/- AAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 A 7 6 317434 CASAVA_Build 2 241527584 5I CAGAGTTGTG -----/CTGGC CTCCTAAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 CTGGC 0 1 317435 CASAVA_Build 2 241528719 1D AGAAAAAGCG T/- TTGACAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 3 2 317436 CASAVA_Build 2 241549677 2D CACATACACT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 97 39 30 29 CA 6 5 317437 CASAVA_Build 2 241561518 1I CTCAGAAAGG -/C CCCCCCATGC 2086 het 2086 ref 19 10 8 1 C 6 7 317438 CASAVA_Build 2 241569842 1D GTGTCGGACC A/- AAAAAAAAAG 2358 het 2358 ref 27 11 7 9 A 10 9 317439 CASAVA_Build 2 241592622 1D TCTGATTTTA T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 36 10 18 10 T 7 6 317440 CASAVA_Build 2 241610053 1D CATCCTGCCA G/- GTGAAAAGTG 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 G 2 1 317441 CASAVA_Build 2 241611575 1I AATATGTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 11 12 317442 CASAVA_Build 2 241612908 1I ATTACTGGTG -/C CTGCCACCAC 3070 het 1404 hom 14 5 8 1 C 1 2 317443 CASAVA_Build 2 241615175 1I ATTTCCCTAC -/T TTTTTTTTTT 1945 het 1945 ref 27 11 8 8 T 13 14 317444 CASAVA_Build 2 241642232 1I TCAAGCCCCA -/G GGTGAGCTCC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 G 2 3 317445 CASAVA_Build 2 241652893 1I AGGGACCCCT -/G GCCACGCCCC 2328 hom 21 het 11 0 7 4 G 1 2 317446 CASAVA_Build 2 241666471 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 21 0 13 8 A 16 15 317447 CASAVA_Build 2 241674456 2I CTCTTCAGTA --/CT CTGCCCCACA 3070 hom 108 het 42 0 32 10 CT 1 2 317448 CASAVA_Build 2 241690140 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 18 1 13 4 A 12 13 317449 CASAVA_Build 2 241691409 1D ATCCGTGTAG A/- AACTAAAGAA 3070 hom 83 het 32 0 26 6 A 3 2 317450 CASAVA_Build 2 241702287 1I GAGGTGACCC -/T TTTTTTGCAG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 6 7 317451 CASAVA_Build 2 241708117 4D TAAATAATAA AATT/---- AATAAAATAA 2917 het 2917 ref 16 10 6 1 AATT 1 0 317452 CASAVA_Build 2 241716950 1D AGACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2684 hom 36 10 12 14 A 11 10 317453 CASAVA_Build 2 241732386 1D TTTACCAATA C/- CCTGTCCTCA 3070 het 3070 ref 51 25 20 8 C 3 2 317454 CASAVA_Build 2 241761358 13D AGACTTTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 19 0 16 7 A 24 11 317455 CASAVA_Build 2 241762005 1I TTTGGCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2077 hom 40 6 27 7 T 13 14 317456 CASAVA_Build 2 241774884 1D ACACAACTTG A/- AAAAACCACC 3070 hom 62 het 23 0 21 2 A 6 5 317457 CASAVA_Build 2 241789928 4I CTGGACACAG ----/CTGA CTGCCAGGCT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 CTGA 0 1 317458 CASAVA_Build 2 241799423 3I CATCGGTCTT ---/CTC TTTCTCTGTC 3070 hom 55 het 24 0 18 6 CTC 0 1 317459 CASAVA_Build 2 241804910 4D TCATCAGGCA GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 1518 hom 16 5 8 4 GTTT 4 3 317460 CASAVA_Build 2 241820945 1I ACTAAAAATT -/A AAAAAATGTA 1763 het 1763 ref 16 8 5 3 A 6 7 317461 CASAVA_Build 2 241821082 2I AGAAGGGGAA --/GG GGGGAAGGGG 2778 het 1951 hom 17 7 8 2 G 4 6 317462 CASAVA_Build 2 241825817 2I GAAAAAAAAC --/AT GTGTGTAAAA 3070 het 3070 ref 56 28 23 5 AT 0 1 317463 CASAVA_Build 2 241838835 1I GATGCACTGA -/G GGGGGGAACA 3070 het 3070 ref 46 24 12 10 G 6 7 317464 CASAVA_Build 2 241847608 10I CTTTTCTGGG ----------/ACAGGCTCTC ACTCTGTCAC 3070 het 3070 hom 46 22 18 6 ACAGGCTCTC 0 1 317465 CASAVA_Build 2 241849128 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 98 hom 34 1 25 8 A 9 10 317466 CASAVA_Build 2 241850545 1I TCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 10 11 317467 CASAVA_Build 2 241866672 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2222 hom 27 9 14 4 A 13 14 317468 CASAVA_Build 2 241867149 1D TAAAATCTAA T/- TAAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 12 5 T 2 1 317469 CASAVA_Build 2 241872436 1D GAAAGCAACT G/- CAAGTGTGGT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 G 1 0 317470 CASAVA_Build 2 241876485 10I AGTTGCCTGC ----------/ACAACCAAGA ACAACTAAGA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 ACAACCAAGA 0 1 317471 CASAVA_Build 2 241881275 1D TAGAAGGAAC A/- AAAAGAATTG 3070 hom 60 het 23 0 21 4 A 5 4 317472 CASAVA_Build 2 241885204 4I TTGGACTTTT ----/TTTG TTTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 TTTG 1 2 317473 CASAVA_Build 2 241890483 1I CCATTTTGAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 8 9 317474 CASAVA_Build 2 241895963 1I CTTGAACTAA -/T TTTTTTTTTT 1750 het 1750 ref 43 21 5 17 T 15 16 317475 CASAVA_Build 2 241898743 2D GTAGAATTCT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 AG 7 6 317476 CASAVA_Build 2 241908124 1I TCCTGGAATC -/T TAATTGCTAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 1 2 317477 CASAVA_Build 2 241913057 1I ATTATTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 10 11 317478 CASAVA_Build 2 241913164 1I ACAGATAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 10 11 317479 CASAVA_Build 2 241921710 6I CCATTCTCCT ------/GCCTCA GCCTCCCGAG 1708 het 543 hom 8 2 5 1 GCCTCA 0 1 317480 CASAVA_Build 2 241927446 1I GGGTGACAGA -/G GCAAGACTCC 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 G 1 2 317481 CASAVA_Build 2 241929483 4D TAAATAGCTT ACTA/---- ACTGTTTCCG 3070 het 3070 ref 38 19 17 4 ACTA 1 0 317482 CASAVA_Build 2 241933526 5D GGGTTTGGGG ACTTT/----- ACTTTAGTGT 3070 het 3070 hom 49 20 23 9 ACTTT 2 1 317483 CASAVA_Build 2 241938337 3I AGTTACTAAC ---/ATT ATTGTGTCAG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 ATT 1 2 317484 CASAVA_Build 2 241961027 1I TTTGTAACAC -/T TTTCTTTTGA 3070 het 3070 hom 42 21 21 0 T 3 4 317485 CASAVA_Build 2 241964615 1D TGGGCAGAGT C/- CCCCTCCTGG 3070 hom 96 het 33 0 31 2 C 5 4 317486 CASAVA_Build 2 241968779 5D ATAATAATAA TATAT/----- TATATTATAT 2824 het 2824 ref 18 9 7 3 TATAT 3 2 317487 CASAVA_Build 2 241988318 2I TAGTTGAAAA --/AG AGGGTACAGC 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 AG 1 2 317488 CASAVA_Build 2 241989907 2I AGTTTCGCTC --/TT GTCGCCCAGG 3070 hom 36 het 15 0 12 4 T 0 2 317489 CASAVA_Build 2 241993751 1I GGCCCGGTGT -/G GGGGCTCATG 3070 hom 63 het 23 0 22 2 G 4 5 317490 CASAVA_Build 2 242005731 1I TTTCTTCTGA -/T TTAAAATTTG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 T 2 3 317491 CASAVA_Build 2 242006583 2D AGTGGAGCAG TC/-- TCTGTGCTGT 3070 het 3070 ref 48 19 22 8 TC 2 1 317492 CASAVA_Build 2 242009807 2D CCCTCCTGGG AT/-- ATAAAGCTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AT 2 1 317493 CASAVA_Build 2 242014016 1I CATTTGGCGA -/T TTTTTTTTTT 2440 het 2440 ref 27 8 11 8 T 10 11 317494 CASAVA_Build 2 242016679 1D GACCCTAATG T/- TTGTATCTTG 3070 het 3070 hom 22 7 14 1 T 3 2 317495 CASAVA_Build 2 242019518 1D AGCGGAGATT G/- GTACCACTGC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 G 2 1 317496 CASAVA_Build 2 242021218 1I CTCTGTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 16 17 16 A 13 14 317497 CASAVA_Build 2 242026881 1I11M1I CCATGCCTGG -TAATTTTTTTT-/CTAATTTTTTTTG TATTTTTCAG 3070 hom 27 het 9 0 10 0 N/A 0 0 317498 CASAVA_Build 2 242032257 3D CCTGCCTTCT TGA/--- TGCTTTAGGG 3070 het 3070 hom 47 19 24 6 TGA 1 0 317499 CASAVA_Build 2 242037604 2D TAAAAATAAC TT/-- TACCTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 16 9 3 T 3 1 317500 CASAVA_Build 2 242042047 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 7 6 317501 CASAVA_Build 2 242048774 1I AGCTCAAAAA -/G GAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 1 2 317502 CASAVA_Build 2 242058931 3D TGCTGCTCTC AGG/--- GGACCCTGTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 AGG 1 0 317503 CASAVA_Build 2 242067823 1D GAGGTAGCAG T/- GTTGCCTTGT 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 T 1 0 317504 CASAVA_Build 2 242068621 1D TTGTGTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 13 6 T 11 10 317505 CASAVA_Build 2 242075094 2D AGCCTGGCCC CT/-- GTGTCCTGGC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 CT 1 0 317506 CASAVA_Build 2 242076255 1I ACTGGAAGTG -/A AAAAACAGAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 5 6 317507 CASAVA_Build 2 242078532 9D CAGCTTACAC CCAGCCCAG/--------- CCAAACACTG 3070 het 3070 ref 33 16 12 8 CCAGCCCAG 1 0 317508 CASAVA_Build 2 242084332 4D GGGTCCAAAC AAGG/---- AAGAGGATGC 2180 het 2180 ref 26 11 8 8 AAGG 1 0 317509 CASAVA_Build 2 242107443 1D CCATCTCAAT A/- AAAAAAAATT 1636 het 1636 ref 22 10 5 7 A 9 8 317510 CASAVA_Build 2 242120827 3D ACGGAGGGAA GAG/--- GAGATGTGGA 3070 hom 67 het 27 0 20 8 GAG 2 1 317511 CASAVA_Build 2 242125303 5I CAAGAACAGT -----/TTTTA TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 TTTTA 0 1 317512 CASAVA_Build 2 242125578 1I GGGAGCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2427 hom 30 11 12 7 T 11 12 317513 CASAVA_Build 2 242130752 1D ATGAAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 14 12 T 11 10 317514 CASAVA_Build 2 242132612 6D AGATATAGAT ATATAC/------ ATATACATAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 5 ATATAC 2 1 317515 CASAVA_Build 2 242133554 4D GAGTAGCAAA ATGG/---- ATGAAGATGA 2858 het 2858 ref 39 28 7 6 ATGG 1 0 317516 CASAVA_Build 2 242133676 3D AGATCCACAA GTC/--- GTCGTCGTAG 3070 het 3070 ref 52 21 15 17 GTC 3 2 317517 CASAVA_Build 2 242133855 3I ACCACAGACA ---/CAC ATCGCACAGA 3070 het 3070 ref 70 36 24 10 CAC 0 1 317518 CASAVA_Build 2 242134376 4D10M4D ATACACACAC ACAGAGACACATACCACA/----AGACACATAC---- CAAACGGATG 3070 het 3070 hom 62 28 26 18 N/A 0 0 317519 CASAVA_Build 2 242142421 1I CCAAGCCTGA -/G GGGCTGGCTT 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 G 3 4 317520 CASAVA_Build 2 242144606 1I CAGGAGGCGG -/A GGTTGCAGTG 1876 het 1876 ref 18 10 4 4 A 0 1 317521 CASAVA_Build 2 242148963 5D CAGAGGGACA CAGCT/----- CAGACCTGCA 3070 het 3070 hom 35 13 14 10 CAGCT 1 0 317522 CASAVA_Build 2 242149226 1D5M1I TGAGATACAG AGCAGC-/-GCTGCT CTTTATCAGC 2738 het 2580 hom 22 9 10 3 N/A 0 0 317523 CASAVA_Build 2 242153663 1I TCTGACCCCC -/G GGTCTTCCTC 3070 hom 37 het 15 0 13 2 G 2 3 317524 CASAVA_Build 2 242154248 4I GGCACATGCC ----/TGTA TGTAATCTCA 3070 het 2336 hom 19 7 10 2 TGTA 1 2 317525 CASAVA_Build 2 242169678 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 2509 hom 15 het 6 0 6 0 A 6 7 317526 CASAVA_Build 2 242230658 1I AATTTACTCG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 425 hom 24 1 18 5 T 9 10 317527 CASAVA_Build 2 242257593 4D GCTCACACTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 65 het 29 0 21 8 TTTG 4 3 317528 CASAVA_Build 2 242260737 1I ATGAATTTCT -/G GGGCGCTCCC 3070 hom 38 het 14 0 11 3 G 3 4 317529 CASAVA_Build 2 242268056 1I GAGACTGTCT -/C CCCCAAAAAA 2075 het 212 hom 27 2 13 12 C 4 5 317530 CASAVA_Build 2 242270866 1I AGAAAAATTA -/G GCCGGGCGTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 G 1 2 317531 CASAVA_Build 2 242275615 3I24M2D GTGTGTGTTT ---TTGTTGTTTTTGTTTGTTTGAGACAG/TTGTTGTTGTTTTTGTTTGTTTGAGAC-- AGTCTCGCTC 3070 hom 86 het 32 0 27 6 N/A 0 0 317532 CASAVA_Build 2 242276389 2I TCAAAGCTGT --/TC TCTGTTTTCA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 TC 1 2 317533 CASAVA_Build 2 242277208 1D TTTAATTTAA T/- TTTTTTTTTG 2869 hom 18 het 7 0 7 1 T 10 9 317534 CASAVA_Build 2 242279631 2I GAATAAAGTC --/TT TCTCACCGTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 3 317535 CASAVA_Build 2 242285763 2I CAGGGGCCTC --/AG GGGAGGGGGA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 AG 0 1 317536 CASAVA_Build 2 242286505 1D TTGAGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1172 het 1172 ref 26 17 4 5 A 13 12 317537 CASAVA_Build 2 242291676 2I TGGGCAGCTC --/AG AGAGAGAACA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 AG 3 4 317538 CASAVA_Build 2 242303880 1D TGACCTAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 10 9 317539 CASAVA_Build 2 242321447 4I TGACAATGGG ----/CAAA CAAACTCCCA 3070 het 3070 hom 57 15 30 12 CAAA 1 2 317540 CASAVA_Build 2 242324521 9I GGCTGCGCTC ---------/CCTCCGCTG CCTCCAAAGC 2847 het 2205 hom 25 8 11 6 CCTCCGCTG 0 1 317541 CASAVA_Build 2 242325585 4I TTTCTCTTTT ----/TTTA TTTATTTTTT 2870 het 1761 hom 23 7 12 4 TTTA 1 2 317542 CASAVA_Build 2 242337116 1I GTCCTGGTGT -/C CCCTCGTGCT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 C 3 4 317543 CASAVA_Build 2 242347561 4D GTGATGCTAA CTTT/---- CTTTTATTTA 3070 het 3070 ref 51 20 22 9 CTTT 2 1 317544 CASAVA_Build 2 242358730 1I TGCCTGCAGA -/G GGGGGGAGGA 2237 het 2237 ref 29 14 10 5 G 6 7 317545 CASAVA_Build 2 242360224 6D CAAGATAAAG AGAGAA/------ AGAGAAAGCA 2912 het 2912 ref 20 11 8 1 AGAGAA 2 1 317546 CASAVA_Build 2 242373217 1I GTGCACTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2318 hom 22 5 12 5 T 9 10 317547 CASAVA_Build 2 242376616 5D TTTGTGCGAG GAACT/----- GAACTGAACT 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 GAACT 3 2 317548 CASAVA_Build 2 242381622 4D ATTGTGTTTA TATG/---- TATGTGTGTA 3070 het 3070 ref 88 47 34 12 TATG 2 1 317549 CASAVA_Build 2 242381716 2D GTGTACATAT TG/-- TGTTTGTGTG 3070 het 3070 ref 97 50 39 8 TG 2 1 317550 CASAVA_Build 2 242381831 2D TGTATATGTA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 63 36 17 12 TG 5 4 317551 CASAVA_Build 2 242398576 4D CACTTCACCC TCAG/---- TCAGTGCTGA 2789 het 2789 ref 20 9 9 3 TCAG 2 1 317552 CASAVA_Build 2 242413468 1I TTTCCTTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 33 0 27 6 T 12 13 317553 CASAVA_Build 2 242415395 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 23 2 13 8 T 13 12 317554 CASAVA_Build 2 242429417 1D TGATGAAAAA G/- GATATTTGAA 3070 hom 160 het 59 0 54 5 G 2 1 317555 CASAVA_Build 2 242429820 2I TAAACATCAA --/TT TTTTTTTTTT 2995 hom 30 het 18 0 10 8 T 14 16 317556 CASAVA_Build 2 242435366 3D TCAATTAGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 2522 het 111 hom 19 2 9 8 T 19 16 317557 CASAVA_Build 2 242453508 1I ATATCTAACA -/T TTTTTTTTTT 1353 het 1353 ref 26 12 4 10 T 12 13 317558 CASAVA_Build 2 242464982 1I CTCAGTGTAG -/C CTCTGGAGGG 3070 hom 64 het 28 0 20 8 C 1 2 317559 CASAVA_Build 2 242466412 4I CAGCCGAGGC ----/AGAG AGAGAGAGGA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 AG 4 6 317560 CASAVA_Build 2 242470049 31I AAACCAAGTC -------------------------------/CACCCAGAGCATGTGAGGCTGAGCACAGGCT TGGGGTTCCC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 CACCCAGAGCATGTGAGGCTGAGCACAGGCT 0 1 317561 CASAVA_Build 2 242478243 1D ATCACCCCTG C/- CCAAGTTTCT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 C 3 2 317562 CASAVA_Build 2 242482029 3D GATATATGTT TTG/--- TTAAGTATGA 3070 hom 75 het 31 0 26 7 TTG 1 0 317563 CASAVA_Build 2 242489439 2D ACAGCAGCAG CC/-- CCTTTTCTGG 3070 hom 53 het 29 0 16 13 C 4 2 317564 CASAVA_Build 2 242499694 1D GACCTCAGAC T/- TCCGGTCCCC 3070 hom 71 het 31 0 21 10 T 2 1 317565 CASAVA_Build 2 242502663 9I CACTCAGGAT ---------/CCCTCCGTG CTCTCCAGAT 3070 hom 75 het 28 0 24 4 CCCTCCGTG 0 1 317566 CASAVA_Build 2 242515376 1I TCCAGGAGAT -/C CCCCCCCACC 3070 hom 80 het 29 0 23 6 C 7 8 317567 CASAVA_Build 2 242536752 16D TGTGCATTGT GTGTGTGTGCATGTAA/---------------- GTGTGCATGT 3070 hom 113 het 43 0 39 11 GTGTGTGTGCATGTAA 1 0 317568 CASAVA_Build 2 242536838 2I TGAGTGTGCA --/TG TGTGTGTGAG 3070 het 1987 hom 65 11 15 39 TG 4 5 317569 CASAVA_Build 2 242536864 12D TTGTGTGTGC GTGCATGTAAGT/------------ GTGCATGTGT 3070 hom 63 het 64 0 12 59 GTGCATGTAAGT 1 0 317570 CASAVA_Build 2 242539087 3D AGCAGTGCTT CGG/--- CGACGTGTCT 3070 hom 95 het 38 0 26 12 CGG 1 0 317571 CASAVA_Build 2 242539399 4D TGTGATGGTA TGTT/---- TGATTGTGCA 3070 hom 175 het 74 0 59 20 TGTT 1 0 317572 CASAVA_Build 2 242539467 2D TGATTGTGTC TG/-- TGTGTGTGAT 3070 hom 151 het 61 0 51 11 TG 5 4 317573 CASAVA_Build 2 242551599 5I ACGTGAACTT -----/AAATA ATAGATATTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AAATA 0 1 317574 CASAVA_Build 2 242564519 3I GTGGGAAGAG ---/AGA AGAAGCACAT 3070 hom 57 het 21 0 16 5 AGA 1 2 317575 CASAVA_Build 2 242566782 1D AGTCATTGGA G/- GGGGGGCAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 G 7 6 317576 CASAVA_Build 2 242568144 1I TGGGCTCATG -/A ATATTTACTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 317577 CASAVA_Build 2 242571526 5I GCTGTGTTGG -----/TCTGC TCAGCGAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TCTGC 0 1 317578 CASAVA_Build 2 242572462 3D GTATTTTATT GAG/--- GAGCGACTAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 GAG 2 1 317579 CASAVA_Build 2 242575102 4D GTAAGATGGC GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 62 het 34 0 20 15 GT 10 8 317580 CASAVA_Build 2 242577089 3D CACCCCCACA CCT/--- CCTATCCTTG 3070 hom 49 het 19 0 17 2 CCT 2 1 317581 CASAVA_Build 2 242583948 1D ATGACAGACA C/- CCCCGTCCCC 2103 hom 29 het 11 0 9 2 C 5 4 317582 CASAVA_Build 2 242585765 2I CACGCACACA --/CG CACATACATA 3070 hom 126 het 55 0 43 12 CG 0 1 317583 CASAVA_Build 2 242585814 2D ACACATACAC AT/-- ATACACACAT 3070 hom 105 het 48 0 33 16 AT 2 1 317584 CASAVA_Build 2 242586830 1D CCAGCCCACC A/- GCCTCCTTCT 3070 hom 66 het 23 0 23 1 A 1 0 317585 CASAVA_Build 2 242590475 5I TCTATGTTGA -----/TATCT TAATGTGGTA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TATCT 0 1 317586 CASAVA_Build 2 242632402 1D CTGCATCCGT C/- CCCAGGGTGC 2969 het 2914 hom 26 10 11 6 C 4 3 317587 CASAVA_Build 2 242732219 1D78M4I GATGTTGAAC TTTTTTTTTGTATGTTTGTTGGCTGCATGCATGTATTCTTTTGAAAAGTGTTCATTCCCTTTGCCCAATTTTAATGGGG----/-TTTTTTGTGTGTGTTTGTTGGCTGCATGCATGTATTCTTTTGAAAAGTGTTCGTTCCCTTTGCCCAATTTTAATGGGGTTGA TTGTTTTTCT 2621 het 2621 ref 47 61 6 11 N/A 0 0 317588 CASAVA_Build 22 14436855 1I CCCTGCTGAG -/A GGGGGGGCGT 2790 het 380 hom 13 1 10 2 A 0 1 317589 CASAVA_Build 22 14449781 1D GAATGAAAAA T/- TTAAAAAAAA 3034 het 213 hom 37 4 15 19 T 3 2 317590 CASAVA_Build 22 14449995 1I TATAAGTGGC -/A AAAAAATTCA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 A 6 7 317591 CASAVA_Build 22 14454126 4I GCCCCCTCCT ----/CTGA CTGTCTCCTC 2315 het 2234 hom 13 5 7 1 CTGA 0 1 317592 CASAVA_Build 22 14459027 4D GTAAGAAAGC AAAG/---- AAAGATAAGC 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 AAAG 2 1 317593 CASAVA_Build 22 14461767 2D CTCTCAGCTA TG/-- TATAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 28 18 3 TG 1 0 317594 CASAVA_Build 22 14462171 1D TCCCAGTAAA T/- CAATGTTGGT 3070 het 3070 hom 53 19 29 5 T 1 0 317595 CASAVA_Build 22 14464057 1D TTTCAGTGTT A/- ATGGGAGAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 2 1 317596 CASAVA_Build 22 14475582 12I TAACCCAGAT ------------/CGTCACCCAGGC GGTCACCCAG 2976 het 2976 ref 43 29 8 6 CGTCACCCAGGC 0 1 317597 CASAVA_Build 22 14476670 3I GCGCGGTTTG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 998 hom 72 9 27 36 T 13 16 317598 CASAVA_Build 22 14479139 1I TATACATGGA -/T TTTTTCTAGT 3070 het 3070 ref 58 38 13 7 T 5 6 317599 CASAVA_Build 22 14490790 2D ACAGTGTGAC TA/-- TAACTCTGTA 3070 het 3070 ref 75 60 10 5 TA 2 1 317600 CASAVA_Build 22 14491424 1I ATTTTCTGTA -/T TTTAAATATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 3 4 317601 CASAVA_Build 22 14492044 1I TTCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 1666 het 1666 ref 31 20 7 4 A 9 10 317602 CASAVA_Build 22 14494229 3D TATAAAAGCA AGG/--- AGGTCAGGTC 1832 het 1832 ref 55 44 4 8 AGG 2 1 317603 CASAVA_Build 22 14497745 1D ACCCAAAATA T/- TTTTTTTTCT 2754 het 2754 ref 54 41 6 7 T 9 8 317604 CASAVA_Build 22 14515363 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2777 het 169 hom 18 3 8 7 A 12 11 317605 CASAVA_Build 22 14523452 1I TTTTCACTGG -/A AAAGAAAGTG 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 3 4 317606 CASAVA_Build 22 14526773 1I TATTTTTTTA -/T AAAAATTTAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 0 1 317607 CASAVA_Build 22 14527893 1D CATGAATATA C/- AGTCATATTA 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 C 1 0 317608 CASAVA_Build 22 14528025 1I TTTAATTGCC -/A AGAAGTAAAA 3070 het 3070 ref 89 64 10 15 A 1 2 317609 CASAVA_Build 22 14531785 6I TAATTGTCTT ------/ATGTAA CTGAGAAACA 1375 het 1375 ref 34 28 3 3 ATGTAA 0 1 317610 CASAVA_Build 22 14533125 1I GATCATAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 939 hom 18 2 14 2 A 9 10 317611 CASAVA_Build 22 14536444 3I GACCCCAGGC ---/GTG AGCTCCAGAA 1450 hom 15 het 8 0 4 4 GTG 0 1 317612 CASAVA_Build 22 14543585 2I ATCAAATCAT --/TA TAATTGCACC 2532 het 2532 ref 59 49 6 4 TA 1 2 317613 CASAVA_Build 22 14544090 1D GACTTCTCTC T/- TGTTCTGGGG 2277 het 2277 ref 58 41 10 7 T 2 1 317614 CASAVA_Build 22 14550336 1I CTTAAAAATT -/G GATGTCCATG 2786 hom 15 het 6 0 6 0 G 1 2 317615 CASAVA_Build 22 14550810 1I AAAAAAAAAA -/G TGTCGTTTTA 2729 het 2018 hom 18 7 7 4 G 0 1 317616 CASAVA_Build 22 14552594 3I TATATGTCTG ---/CTA CTTTGTATTT 3070 hom 36 het 21 0 13 8 CTA 0 1 317617 CASAVA_Build 22 14566026 5D ATCTTAAGGT GATAA/----- GATGTCAGTA 3070 het 3070 ref 60 47 9 20 GATAA 1 0 317618 CASAVA_Build 22 14570055 1I AAAATACAAG -/T GGAAAAAATT 3070 hom 91 het 79 2 63 14 T 0 1 317619 CASAVA_Build 22 14577021 1I CAAAACAAAA -/C AAAAAGAACT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 317620 CASAVA_Build 22 14582743 2I ATCATGCCTG --/GC TATTATATTT 3070 het 3070 ref 39 15 9 15 GC 0 1 317621 CASAVA_Build 22 14588275 7I AGCAGAACTT -------/TGGTAAG GAAGGGTGAA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 TGGTAAG 0 1 317622 CASAVA_Build 22 14609534 1I CTCAGAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 A 10 11 317623 CASAVA_Build 22 14612144 4D TGAGAGAGCG AGGA/---- AGGAAGGAAG 2149 het 2149 ref 27 20 5 2 AGGA 4 3 317624 CASAVA_Build 22 14612841 1I AAGATTTGAA -/C AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 C 0 1 317625 CASAVA_Build 22 14617025 3I32M1I CTTTTTATCC ---TCAAGTTTTTTATATTCCTGTTGTATTTTTTT-/TCTTCAAGTTTTTTATATTCCTGTTGTATTTTTTTC ATAGATAATA 3070 het 3070 ref 50 44 10 6 N/A 0 0 317626 CASAVA_Build 22 14622874 1D GCACGAGCTA C/- CAACTAGCAG 1173 het 1173 ref 34 27 3 4 C 2 1 317627 CASAVA_Build 22 14640307 1D AATCAACAGG A/- AAAAACACAA 3070 het 3070 ref 53 28 21 6 A 6 5 317628 CASAVA_Build 22 14646921 2I ATGTTGCCAC --/AG AGACTTACCT 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 AG 1 2 317629 CASAVA_Build 22 14654147 1I TGAGCACCTT -/A AAAGATGAAA 3070 het 3070 ref 37 26 9 2 A 3 4 317630 CASAVA_Build 22 14661956 2D AAAAAAAAAA AC/-- TGTACCCTCT 1621 het 1621 ref 13 6 4 3 AC 1 0 317631 CASAVA_Build 22 14669276 1D ATAAAATTTG A/- AAAAAAAAAT 2875 het 2875 ref 34 20 7 7 A 10 9 317632 CASAVA_Build 22 14669841 1D TCACAAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 10 11 A 13 12 317633 CASAVA_Build 22 14684868 2I AGGGAAATGC --/AA ATCAAAACCA 3070 het 3070 ref 59 43 8 8 A 1 3 317634 CASAVA_Build 22 14685308 4D CAACCTGGAT TCTC/---- GAGATCGGAG 1835 het 1835 ref 35 30 4 2 TC 2 0 317635 CASAVA_Build 22 14705382 6D TGTATCTCCA AAAAAT/------ AAAAATAAAA 3070 het 2169 hom 28 8 14 6 AAAAAT 3 2 317636 CASAVA_Build 22 14710369 1D GGAGGCCTTA C/- CTAGAAATCT 1690 het 1690 ref 35 24 5 6 C 2 1 317637 CASAVA_Build 22 14726782 1D29M1D CTAGTTCTAG TTTGAGTTAAATAGGTCTCTATGGGACAGGC/-TTGAGTTACATAGGTCTCTATGGGACAGG- CTAGGAAAAG 3070 het 3070 ref 72 60 14 14 N/A 0 0 317638 CASAVA_Build 22 14728782 1I AAGAAAAAAA -/C ATCTAAGCAG 3070 het 3070 ref 49 33 10 6 C 0 1 317639 CASAVA_Build 22 14732456 1I CAAATTGAAG -/A AGACGCATCA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 1 2 317640 CASAVA_Build 22 14736540 1D TTTAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 235 hom 35 1 22 12 T 12 11 317641 CASAVA_Build 22 14750018 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAG 2282 het 2282 ref 16 11 5 0 A 10 9 317642 CASAVA_Build 22 14764532 3D GCTTGCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 76 24 14 41 T 17 14 317643 CASAVA_Build 22 14779596 5D GGAGAATAAA GTAAT/----- GTAAAACTAC 3070 het 3070 ref 36 27 8 2 GTAAT 1 0 317644 CASAVA_Build 22 14782072 3D AGAAAGAAGA AGG/--- AGAAGGAGGA 2895 hom 24 het 10 0 8 2 AGG 1 0 317645 CASAVA_Build 22 14795663 9I GCCAGAAGCT ---------/TATCAAAAA TATTGAATAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TATCAAAAA 0 1 317646 CASAVA_Build 22 14796319 1I GAATTTTATC -/T TTCCTTAAAA 2881 het 2881 ref 23 16 6 1 T 2 3 317647 CASAVA_Build 22 14797045 1D AAAAAAAAAA C/- AGTCAGAACA 2489 het 2489 ref 42 19 8 15 C 1 0 317648 CASAVA_Build 22 14800811 11D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2739 het 1225 hom 11 4 6 1 A 21 10 317649 CASAVA_Build 22 14810529 2D CTCTCTCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 889 hom 17 3 8 6 T 16 14 317650 CASAVA_Build 22 14811065 1D TGACCGCCTG A/- AAAAAACTAA 3070 hom 62 het 23 0 21 2 A 7 6 317651 CASAVA_Build 22 14813096 1D TGAAAAAATG A/- AAAAAGAAGG 3070 het 3070 hom 61 29 25 7 A 6 5 317652 CASAVA_Build 22 14813384 2I GCAGAAACTT --/TC CTGATATCAA 3070 het 3070 hom 63 26 32 5 TC 0 1 317653 CASAVA_Build 22 14838838 1D TGGACACACA G/- GTTGCTTCCA 1385 het 1385 ref 35 25 3 8 G 2 1 317654 CASAVA_Build 22 14883965 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1929 hom 12 het 7 0 4 3 A 12 11 317655 CASAVA_Build 22 14884327 4D TATTAAAAGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2100 het 968 hom 24 5 5 14 A 15 11 317656 CASAVA_Build 22 14896265 1I TCCTTTGTGA -/G GGACAAGCAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 2 3 317657 CASAVA_Build 22 14938060 1D TATGTGTGGG A/- CAAACACTTA 1812 het 1812 ref 39 32 4 3 A 1 0 317658 CASAVA_Build 22 14964096 4D CTGCTGGGTT GTGA/---- GTGTTTGTTT 2432 hom 27 het 11 0 10 1 GTGA 1 0 317659 CASAVA_Build 22 14981841 4D CTGCTGGGTT GTGA/---- GTGTTTGTCA 3070 het 3070 ref 66 37 26 8 GTGA 1 0 317660 CASAVA_Build 22 15009379 3I AAACTGAGTT ---/GGA GACTATTAGG 3070 hom 160 het 55 0 54 1 GGA 0 1 317661 CASAVA_Build 22 15011662 1I CTATTCATTT -/A AAAAAAAAAA 2203 het 2203 ref 28 23 5 0 A 10 11 317662 CASAVA_Build 22 15011966 1D ACACTCTGTG C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 C 9 8 317663 CASAVA_Build 22 15013091 1I GAAAAATGGC -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 38 24 7 7 T 7 8 317664 CASAVA_Build 22 15019453 8I GAAGGTGATT --------/TATATTTA TATATTTATA 2933 het 393 hom 12 2 6 4 TATATTTA 1 2 317665 CASAVA_Build 22 15023520 1D AGTTGAATAC A/- AAAACTATAC 1444 het 227 hom 4 1 3 0 A 5 4 317666 CASAVA_Build 22 15037211 2D TATTTGATTG TA/-- TATATATACC 1893 het 1893 ref 25 18 4 4 TA 5 4 317667 CASAVA_Build 22 15038047 1D AAAAGAGACT G/- TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 1 0 317668 CASAVA_Build 22 15041614 1I CAAAAATACA -/C CTGCACTCGT 1931 hom 10 het 5 0 4 1 C 1 2 317669 CASAVA_Build 22 15043123 1D TTTAAAACTG A/- AAAAAAATGC 2221 het 2221 ref 51 36 5 10 A 8 7 317670 CASAVA_Build 22 15047801 3D ACCAGTAGCT TTG/--- TTGTTTACCT 3070 het 3070 ref 49 34 15 3 TTG 2 1 317671 CASAVA_Build 22 15069171 8I CAAAGTTTGT --------/TTTAGGTC TTTAACTTCT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TTTAGGTC 0 1 317672 CASAVA_Build 22 15071266 2D GGCTAAGACA GG/-- GGCTGTTATA 3070 het 3070 ref 79 56 18 7 G 4 2 317673 CASAVA_Build 22 15230013 1I ATCACAGAAT -/G GAATTGAATG 1608 het 1608 ref 87 36 5 46 G 1 2 317674 CASAVA_Build 22 15232745 23D GAATGTAATA GAATGGAATCATCGAATGCACTC/----------------------- GAATGGAATC 3070 het 88 hom 38 3 19 18 GAATGGAATCATCGAATGCACTC 2 1 317675 CASAVA_Build 22 15232846 1I CGAATGGAAA -/T ATCATCGAAT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 T 0 1 317676 CASAVA_Build 22 15236610 1I AATGAAATTG -/A AAAAAATCAT 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 6 7 317677 CASAVA_Build 22 15236878 23D TGAATAGAAG TGAATGGAATCATCAAATGGAAT/----------------------- CGAATGGAAT 3070 het 608 hom 53 7 36 19 TGAATGGAATCATCAAATGGAAT 1 0 317678 CASAVA_Build 22 15239255 16D CATAAAATGG AATCGAATGGAATCAT/---------------- AATCTAATGG 3070 het 103 hom 28 2 15 20 AATCGAATGGAATCAT 1 0 317679 CASAVA_Build 22 15241755 13D41M3I TCGAATGGAA TCATGGATCGGAGTTGAATGGAATCATCATCAAATTGAATCGAATGGAATCATC---/-------------ATGAAAGGAGTCATCATCTAATGGAATTGCATGGAATCATCATA GAATGGACTC 3070 het 3070 ref 50 81 12 38 N/A 0 0 317680 CASAVA_Build 22 15242336 3D TGAAAAGGAA CAT/--- CATCGAATGG 3070 het 15 hom 46 1 28 17 CAT 2 1 317681 CASAVA_Build 22 15243379 2D TTTAAAACAA CT/-- CTCTTAATTA 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 CT 3 2 317682 CASAVA_Build 22 15243725 4D TTCTTTTCAC CTTT/---- CTTTCTTCTT 1733 het 1733 ref 67 47 8 14 CTTT 2 1 317683 CASAVA_Build 22 15243921 1I GGTTATTTCT -/C CCTTTAATTC 3070 het 3070 hom 54 15 33 6 C 2 3 317684 CASAVA_Build 22 15245597 3I TTTAAAAAAC ---/ACA ACAATTCTGG 3070 het 3070 hom 34 18 11 5 ACA 1 2 317685 CASAVA_Build 22 15245769 2I TCTAAATATC --/AG AGAGATAATT 3070 het 3070 ref 38 23 9 6 AG 2 3 317686 CASAVA_Build 22 15246151 1I TCATATTAAC -/A AAAACTTGGA 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 A 4 5 317687 CASAVA_Build 22 15247180 1D ATACAAAAAA C/- AAATCAGAAT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 C 1 0 317688 CASAVA_Build 22 15249987 2D TTGAATACTT AC/-- AGTTATATCT 2562 het 2562 ref 34 25 8 1 AC 1 0 317689 CASAVA_Build 22 15252714 1I AGTGGGCCTG -/A ACCCCCAAGC 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 1 2 317690 CASAVA_Build 22 15254036 4I GTAGATAATT ----/GATC GATAGATGAT 3070 het 3070 ref 70 36 25 9 GATC 0 1 317691 CASAVA_Build 22 15254364 4D GATAGATCAA TGAT/---- TGATTATAGA 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 TGAT 2 1 317692 CASAVA_Build 22 15255539 1I GGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1416 het 1416 ref 27 6 8 13 A 15 16 317693 CASAVA_Build 22 15256023 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAAGA 2749 het 2749 ref 49 31 7 11 A 8 9 317694 CASAVA_Build 22 15257157 1D GTGAACTTGG A/- AAAAAAGTGG 3070 hom 64 het 25 0 22 3 A 7 6 317695 CASAVA_Build 22 15258450 2D ATAAAGAGAC TG/-- AGGATTTCTC 1279 het 1279 ref 32 26 3 4 TG 1 0 317696 CASAVA_Build 22 15259529 7I CAGAGAAAGG -------/GGAAGCC TAAAGCAAGA 2486 het 2486 ref 26 17 6 3 GGAAGCC 0 1 317697 CASAVA_Build 22 15259602 1D AGCTTAAATT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 32 8 5 A 9 8 317698 CASAVA_Build 22 15260408 2D120M3I AAAACAGAAA ACAAAAACAATGTACAGAGGCAACAAAGAGCATGATGAAAGCAATGGTACCTCACTTTTTAATAGTAATGTTGGTTGTAAATGGCTTAAATGCTCCACTTACAAGATACAGAACCACAGAAT---/--AAAAACAATGTACAGAGGCAACAAAGAGCATGATGAAAACAATGGTACCTCACTTTTTAGTAGTAATGTTGGTTGTAAATGGCTTAAATGCTCCACTTACAAGATACAGAACCACAGAATGGA AAAGAACTCA 2789 het 2789 ref 41 65 7 24 N/A 0 0 317699 CASAVA_Build 22 15263870 1D48M7D TAACCCTAAC ACCTAACCCCAACCCTCACCCTCACCCTAACCCAACCCTAACACCTAATCCCTAAC/-CCTAACCCCAACCCTCACCCTCACCCTAACCCAAACCTAACTCCTAAT------- CCCTAACCTC 2162 het 2162 ref 62 60 5 19 N/A 0 0 317700 CASAVA_Build 22 15265685 1D TTATAGCAAG A/- AAAAATTATA 3070 het 3070 ref 42 26 10 7 A 6 5 317701 CASAVA_Build 22 15266618 5D TTGTGTTTTC ACAGA/----- GATAGACTCT 2289 het 2289 ref 38 29 5 6 ACAGA 1 0 317702 CASAVA_Build 22 15268445 1I TGGTAGTAAG -/C CTGTTGCTTT 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 C 1 2 317703 CASAVA_Build 22 15271809 1D TGAAAACTCG T/- CTCTACAAAA 3070 het 3070 ref 45 30 8 9 T 1 0 317704 CASAVA_Build 22 15272071 1D TAGAGAAAAT G/- GGTAATTTTC 3070 het 3070 ref 42 27 11 4 G 3 2 317705 CASAVA_Build 22 15272167 1I TGTAAAGTGA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 44 28 9 7 T 6 7 317706 CASAVA_Build 22 15273090 1D TATAGAAAAC T/- TTTTTTGGAT 3070 het 3070 hom 63 24 31 8 T 7 6 317707 CASAVA_Build 22 15273293 3D19M1D TTTGCCAAGA AAGAAGATCTATAAGAAAAAAAC/---AAGATCTATAAGAAAAAAA- TATAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 27 13 3 N/A 0 0 317708 CASAVA_Build 22 15274232 1D59M2D AACAAAAAAA GGAAAGAAAACTACCAAATTCCATGTATGATAACCCGTTTTGAAATTCCATAAATTAAACAT/-GAAAGAAAACTACCAAATTCCATGTATGATACCCCATTTTGAAATTACATAAATTAAAC-- GTGTACACAT 3070 het 3070 ref 41 34 18 10 N/A 0 0 317709 CASAVA_Build 22 15274419 2I TGGAGCAAAA --/TT TTTATTAGAA 3070 het 3070 ref 37 25 8 4 T 3 5 317710 CASAVA_Build 22 15276036 4I TGCTATCTGC ----/AAGT AATTGTATAT 3070 het 3070 ref 61 33 21 7 AAGT 0 1 317711 CASAVA_Build 22 15277602 1D CTACAGATTC T/- TATGTAATCT 1813 het 1813 ref 38 31 4 3 T 2 1 317712 CASAVA_Build 22 15282320 2D TCTAAAAAAC AA/-- AGTCTACTAA 3070 het 3070 ref 80 44 30 6 A 3 1 317713 CASAVA_Build 22 15282631 4D GAGGGGATAG ACAA/---- ACAAACTAAA 3070 het 3070 hom 69 32 34 6 ACAA 2 1 317714 CASAVA_Build 22 15283846 2I GCTTAAGTGT --/AC AGAGGCAAAT 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 AC 0 1 317715 CASAVA_Build 22 15285382 2I TAGCAAAGTC --/TT TGTTGGATTA 2175 het 2175 ref 77 65 5 7 T 1 3 317716 CASAVA_Build 22 15285494 1I CTTAAAGATC -/T CTTTGGCAAG 956 het 956 ref 38 29 3 6 T 0 1 317717 CASAVA_Build 22 15285612 1I GAGATGAACA -/G AAAGAAGCTC 2775 het 2775 ref 45 35 6 4 G 0 1 317718 CASAVA_Build 22 15286910 8D CAAGCAAATG TCAGATCT/-------- AACAAATGCA 3070 het 3070 ref 59 45 10 8 TCAGATCT 1 0 317719 CASAVA_Build 22 15287705 4D TTATAATTTC AAAT/---- AAATAACAAC 2932 het 2932 ref 19 12 6 2 AAAT 2 1 317720 CASAVA_Build 22 15288498 2D GTATTTTCTA AG/-- AGTTTTTTCC 1876 het 1876 ref 57 46 5 6 AG 2 1 317721 CASAVA_Build 22 15289152 3D TCTATTACTT AAC/--- ATATTATTTA 3070 het 3070 ref 58 41 12 7 AAC 1 0 317722 CASAVA_Build 22 15289235 1I GTGTTTTACT -/A CCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 80 44 24 12 A 0 1 317723 CASAVA_Build 22 15289977 5D ATGGCTCTGT CAAAA/----- TAAACAAAAT 3070 het 3070 ref 52 36 14 2 CAAAA 1 0 317724 CASAVA_Build 22 15290656 2I TTTAGAATGA --/CT CTACTGGGTC 698 het 698 ref 67 38 7 22 CT 1 2 317725 CASAVA_Build 22 15291004 1I TGCTAGGGCG -/A AAAAAAAAAA 2724 het 2724 ref 27 16 6 5 A 10 11 317726 CASAVA_Build 22 15291127 3D ATTTTTAAGA GAT/--- GATGACGATA 3070 het 3070 ref 41 27 8 8 GAT 2 1 317727 CASAVA_Build 22 15292531 1I AAATGTGTAA -/T TAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 T 1 2 317728 CASAVA_Build 22 15294284 1D TTTTCTAAAA C/- TTTTGAAAGC 3070 het 3070 ref 57 36 13 8 C 1 0 317729 CASAVA_Build 22 15294461 1I ACTAATAGAC -/T TTTTTTTGAA 2098 het 2098 ref 27 19 5 3 T 7 8 317730 CASAVA_Build 22 15294629 19D TGGGATTACA GGCGTGCACTACCACACCT/------------------- GGCTAATTTT 1591 het 1591 ref 28 31 4 3 GGCGTGCACTACCACACCT 1 0 317731 CASAVA_Build 22 15294907 3D TGTCCTTGGT TGG/--- TTTAAAAAAA 1923 het 1923 ref 28 19 4 8 TGG 1 0 317732 CASAVA_Build 22 15296219 4D TGAAGAGATT AAAC/---- CCAGTCTCAG 3070 het 3070 ref 59 23 15 21 AAAC 1 0 317733 CASAVA_Build 22 15296246 2I GGGTTTAATT --/TC TTTTTTTAAA 1728 het 1728 ref 56 20 4 32 TC 0 1 317734 CASAVA_Build 22 15296470 1D TTTACCATTT A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 42 23 10 9 A 7 6 317735 CASAVA_Build 22 15297023 2D TGTATGTGTG TA/-- TGTGTATATA 3070 het 3070 ref 66 30 20 17 TA 1 0 317736 CASAVA_Build 22 15297359 1I15M1D AAAATTATAT -CAATATATACATAACA/GCAATATATACATAAC- AAGGATCAGT 3070 het 3070 ref 65 40 7 26 N/A 0 0 317737 CASAVA_Build 22 15298981 1D AAATATATGC A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 56 29 18 9 A 7 6 317738 CASAVA_Build 22 15299229 5I TTAAATATAT -----/AATAC AAGATTTGAC 3070 het 3070 ref 53 31 13 9 AATAC 0 1 317739 CASAVA_Build 22 15299972 1I TTAATATTTT -/G GAAAAAAATG 2857 het 2857 ref 45 35 8 2 G 1 2 317740 CASAVA_Build 22 15300048 1D AATATCGAAC A/- AAAAAATCCC 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 A 7 6 317741 CASAVA_Build 22 15300416 1D TCCCCTTACA T/- TAGCCAATTT 3066 het 3066 ref 49 39 7 3 T 2 1 317742 CASAVA_Build 22 15302911 1I TCTTGGAGCC -/A GAGGCTGCAT 2947 het 2947 ref 49 35 10 4 A 0 1 317743 CASAVA_Build 22 15304158 2D40M1I CAGAGATAAG GCCTTGCTGGTCTCAAACTCCTAGGATCAAGTGATCCTCCCA-/--CCTGCTGGTCTCAAAATCCTAGGCTCAAGCGATCCTCCCAT TTTGGCCTCT 2456 het 2456 ref 36 37 6 10 N/A 0 0 317744 CASAVA_Build 22 15305098 3I ATAACCAGAC ---/AGA AGATCAACTG 3070 het 3070 ref 64 39 21 4 AGA 1 2 317745 CASAVA_Build 22 15305262 1I ACAAGTTTTT -/A AAAAATTTAA 2736 het 2736 ref 73 62 6 5 A 5 6 317746 CASAVA_Build 22 15307421 2D CATTTTTTCC AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 53 21 24 11 A 10 8 317747 CASAVA_Build 22 15307706 1I TTATCTTGTC -/A ATCAACATTT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 1 2 317748 CASAVA_Build 22 15311130 1D ACAGAGACAC A/- AAAAAACCCT 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 A 7 6 317749 CASAVA_Build 22 15317200 1D38M1D TATATATATG AAAGGGAGTTTATTAAAGAGAATTGAATCACACCATCACA/-AAGGGAGTTTATTAAGGAGAATTGAATCACACCATCAC- AAGTGAAGTC 2550 het 2550 ref 21 34 6 7 N/A 0 0 317750 CASAVA_Build 22 15317808 5D GGCGGCAGTG GAGAA/----- GAGAAGAGTT 3070 het 3070 ref 65 37 25 3 GAGAA 2 1 317751 CASAVA_Build 22 15321248 1D CAAAATGTGT G/- TAAATAAGAT 3070 het 3070 ref 77 51 20 8 G 1 0 317752 CASAVA_Build 22 15323298 1I TCTGAACAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 56 38 13 5 A 8 9 317753 CASAVA_Build 22 15323493 2D TCCCCCTTTT TC/-- TCTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 69 58 7 4 TC 2 1 317754 CASAVA_Build 22 15323844 1D ACTGGAAAAC A/- TTATAAAATT 3070 het 3070 ref 84 62 12 11 A 1 0 317755 CASAVA_Build 22 15324687 5I9M1I TCCAGAAATG -----ATTTGATTG-/AAGCCATTTGATTGA AACTACCTTG 3070 het 3070 ref 23 13 11 0 N/A 0 0 317756 CASAVA_Build 22 15325603 3D TTCAGCATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1166 hom 41 10 14 17 T 17 14 317757 CASAVA_Build 22 15325750 3D TACAGGTGCG CAC/--- CACAACACCC 2639 het 2639 ref 22 16 6 2 CAC 2 1 317758 CASAVA_Build 22 15326636 3D CCAGCTCATA TGC/--- AACAATACCC 3070 het 3070 ref 73 52 15 8 TGC 1 0 317759 CASAVA_Build 22 15327048 3D AACACTCCAC CCA/--- ACAACAACAG 3070 het 3070 hom 78 31 40 8 CCA 1 0 317760 CASAVA_Build 22 15327133 6D AAATTATTTT CAATAA/------ ATTAAAAGAA 3070 het 3070 ref 90 80 10 4 CAATAA 1 0 317761 CASAVA_Build 22 15327482 1I AAACAAGAGG -/A AAAGAAACCC 1490 het 1490 ref 57 47 4 6 A 3 4 317762 CASAVA_Build 22 15327640 1D AGACCAATAA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 69 35 22 13 G 2 1 317763 CASAVA_Build 22 15327992 1D GAAATTATTC T/- GAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 T 1 0 317764 CASAVA_Build 22 15328973 1I TCACAGGATT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 58 29 13 16 A 8 9 317765 CASAVA_Build 22 15331631 1D TCAAAAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 9 8 317766 CASAVA_Build 22 15332304 1I AATTACCACT -/A AAAATATTTT 3070 het 3070 ref 56 33 16 7 A 4 5 317767 CASAVA_Build 22 15334133 1D TGCATAATTC A/- TTTTAAAAGG 1314 het 1314 ref 45 39 4 2 A 1 0 317768 CASAVA_Build 22 15335063 3D TATGTCTCTC ATT/--- ATTTTGGTAA 3070 het 3070 ref 58 34 18 11 ATT 2 1 317769 CASAVA_Build 22 15337310 17I ACACACACAC -----------------/ACACACATACAGTAAAT ACACACATGA 2306 het 2306 ref 39 20 5 14 ACACACATACAGTAAAT 0 1 317770 CASAVA_Build 22 15339564 1D ATGAGCAAAA G/- TTAACAGATA 3070 het 3070 ref 73 58 11 5 G 1 0 317771 CASAVA_Build 22 15344402 1I AGACTTTACC -/A CATACAACTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 0 1 317772 CASAVA_Build 22 15344476 2D GAGTATTACT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 937 hom 23 5 15 6 A 11 9 317773 CASAVA_Build 22 15345009 1D22M2D CATACTCTGG AAAAAAAAGCAGTGAATAGAAACTG/-AAAAAAAGCAGTGAATAGAAAC-- TCTCAATTCA 2374 het 2374 ref 62 40 6 27 N/A 0 0 317774 CASAVA_Build 22 15347102 1D TTGCTTACTT A/- TTTTTTTTCC 2493 het 2493 ref 32 18 7 7 A 1 0 317775 CASAVA_Build 22 15349709 1D AAGGAAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 46 23 18 7 A 9 8 317776 CASAVA_Build 22 15351560 1I TGGATACCTG -/T GGCCTTTCCA 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 0 1 317777 CASAVA_Build 22 15353662 1D CAGAATCCAA C/- CCACATAAAT 3070 het 3070 ref 48 31 10 7 C 3 2 317778 CASAVA_Build 22 15360685 2I65M1D TCTGAGGAAT --AAGTCATTATGTAAAGACATGTATGCATGTAACAATTCAACCGTAAAATATATGAAGCACAAATTG/AAAAGTCATTATGTAAAGACACGTATGCATGTAACAATTCAACCATAAAATATATGAAGCACAAATT- GCAGAATTAC 3070 het 3070 ref 46 46 17 14 N/A 0 0 317779 CASAVA_Build 22 15361815 2I GAAGTGTAAC --/AT AAAATATGAG 3070 het 3070 ref 42 29 9 4 AT 0 1 317780 CASAVA_Build 22 15364431 1I TACAACCTGT -/A CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 32 12 3 A 0 1 317781 CASAVA_Build 22 15366174 3D TTTTCTTGTA CTT/--- CTTCGTCTCA 3070 het 3070 ref 49 29 14 7 CTT 2 1 317782 CASAVA_Build 22 15367140 2D GTGACCACTC TG/-- TTTGGCTTCA 3070 het 3070 ref 66 45 18 4 TG 1 0 317783 CASAVA_Build 22 15378955 1D AAGTCAGTGG T/- ACCATAAGAT 3070 het 3070 ref 73 40 27 6 T 1 0 317784 CASAVA_Build 22 15382618 1D TTTGTGATTG T/- TTTTAATGCC 1258 het 1258 ref 50 44 3 3 T 5 4 317785 CASAVA_Build 22 15383263 2D CTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3020 het 3020 ref 24 10 10 6 T 11 9 317786 CASAVA_Build 22 15385508 1D AGCCTCCCAG A/- AAGTGTTGGG 3070 het 3070 ref 34 22 9 4 A 3 2 317787 CASAVA_Build 22 15387414 1I GAATGCGGCA -/G GGCACGCAGT 1471 het 1471 ref 18 12 5 1 G 2 3 317788 CASAVA_Build 22 15395007 13D AATGATGACT TGAGATGAAATGA/------------- TGAGATGAAA 3070 het 2250 hom 16 6 8 5 TGAGATGAAATGA 2 1 317789 CASAVA_Build 22 15395597 17D45M5I TGAAATAATG AAATGAGATGAAATGAAAAATGAAATTGAAATGAGATGAGAAGAAATGATGAGATGAAATGT-----/-----------------AAATGAAATTGAAATGAGATGAGAAGAAATGATGAGATGAAATGTTGAAA TGAAAGGAGG 1197 het 1197 ref 34 47 3 11 N/A 0 0 317790 CASAVA_Build 22 15398513 4I TGAATACAAC ----/CTTT CTAATGACTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CTTT 0 1 317791 CASAVA_Build 22 15401675 4D TAGCACTTAG TAGA/---- TACTCAAAAA 2328 het 2328 ref 16 11 5 0 TAGA 1 0 317792 CASAVA_Build 22 15407848 1I GCCCCTTTTG -/T TTCTTTTATT 1078 het 1078 ref 26 17 3 6 T 2 3 317793 CASAVA_Build 22 15408429 1D TCTAGGGGCT C/- CCAGCTTCTA 2895 hom 21 het 10 0 7 4 C 3 2 317794 CASAVA_Build 22 15409469 2D ACAGAAAAGT GA/-- GAGAGTCCTG 3070 het 1149 hom 37 6 26 7 GA 3 2 317795 CASAVA_Build 22 15410478 4D ACGGAACCTC AAAT/---- AAATCTTAAA 3070 het 3070 ref 36 24 8 9 AAAT 2 1 317796 CASAVA_Build 22 15411511 4D AGGTCAAAGC TTTA/---- TTTAGAAAGG 3070 hom 90 het 31 0 30 3 TTTA 2 1 317797 CASAVA_Build 22 15412407 2D CCAGGATGAC TG/-- TGACTTAAAG 3070 het 3070 ref 38 26 10 3 TG 2 1 317798 CASAVA_Build 22 15418361 2I GTGTGCTGAC --/CT CAGTGGGGTG 1622 het 1622 ref 35 22 6 7 CT 0 1 317799 CASAVA_Build 22 15436068 1I CAATGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 2377 het 69 hom 13 1 9 3 T 10 11 317800 CASAVA_Build 22 15438973 1I GCTGTTTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 9 10 317801 CASAVA_Build 22 15443085 2I TGTGGTACAC --/TG TGTAGCATAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TG 1 2 317802 CASAVA_Build 22 15443941 1D CAATGGCATC T/- TGCTATTATT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 2 1 317803 CASAVA_Build 22 15444219 1D TTATTGCTTA C/- AATATTTGTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 1 0 317804 CASAVA_Build 22 15455747 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 343 hom 17 1 12 4 T 13 14 317805 CASAVA_Build 22 15460326 1I CTGCCTTTTT -/G CTTTCGTAAT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 G 0 1 317806 CASAVA_Build 22 15464861 6I CGCGCACACG ------/CGCACA CTCACACGCA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 CGCACA 0 1 317807 CASAVA_Build 22 15468226 2I CAGAGCAAGA --/CT CTCTAAATAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 CT 2 3 317808 CASAVA_Build 22 15468588 1D TCTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2751 het 1268 hom 27 8 9 10 T 13 12 317809 CASAVA_Build 22 15473526 2I CAACACCGCA --/AC ACCGCTTGGC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 AC 1 2 317810 CASAVA_Build 22 15481210 1I AGATGAGCTG -/T GTATAACTCC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 0 1 317811 CASAVA_Build 22 15482426 2D ACATTTTCCC CT/-- GTTATAATTT 3070 het 3070 hom 15 7 7 1 CT 1 0 317812 CASAVA_Build 22 15496621 1D GTCTTTGCTA T/- TTGTAAATAG 3070 hom 27 het 11 0 10 2 T 3 2 317813 CASAVA_Build 22 15501698 1D ATTTCAATCA G/- GAAAGATAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 G 2 1 317814 CASAVA_Build 22 15504971 1D CATCTAGTCT A/- AAAAAAACAG 1786 het 1786 ref 45 35 5 5 A 8 7 317815 CASAVA_Build 22 15505139 1D GCATTTCGTG C/- TGTAAACTTT 3070 het 3070 ref 58 35 22 2 C 1 0 317816 CASAVA_Build 22 15508477 20I TTCTTCCCTG --------------------/ATTCCCTGTCTTCTCTCCCC ATTTTGTCCT 3070 hom 93 het 32 0 32 2 ATTCCCTGTCTTCTCTCCCC 0 1 317817 CASAVA_Build 22 15511537 3I GCCCACTCTT ---/CTG CTGGTCTCAT 3070 het 3070 ref 34 13 10 11 CTG 1 2 317818 CASAVA_Build 22 15514585 3D TGAGACAGAA AAC/--- AAATATTTTG 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 AAC 1 0 317819 CASAVA_Build 22 15516288 1D AAATATTTAA T/- TTTTTTTTTT 2272 het 2272 ref 24 12 6 6 T 13 12 317820 CASAVA_Build 22 15519340 4D TGTATACATG TGTA/---- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 62 31 28 4 TGTA 1 0 317821 CASAVA_Build 22 15521437 4I GTGCATGAGC ----/CGAA CGAAGCAGGG 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 CGAA 1 2 317822 CASAVA_Build 22 15540216 4I TTCTGATGCT ----/CTAA CTGTGATTTG 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 CTAA 0 1 317823 CASAVA_Build 22 15540294 1D GAAATTTTAC T/- TTTAAGTCGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 4 3 317824 CASAVA_Build 22 15541298 1I TGCTGTTCAC -/A AAGTGCCCAG 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 2 3 317825 CASAVA_Build 22 15548266 1I ACTAACAATG -/A ACCTGTCCAC 1740 het 1740 ref 39 32 4 3 A 1 2 317826 CASAVA_Build 22 15554900 1D GGTGGTCCCT C/- AGACTCTACC 3070 het 3070 ref 44 30 9 8 C 1 0 317827 CASAVA_Build 22 15566227 1D ATAATAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 17 3 A 10 9 317828 CASAVA_Build 22 15609159 1D GCTTTGGGGG A/- ACTCACCCGA 1723 het 1723 ref 33 22 4 8 A 2 1 317829 CASAVA_Build 22 15609562 1D GTAGGGGGCG T/- TTATGGGACT 893 het 893 ref 26 12 2 13 T 3 2 317830 CASAVA_Build 22 15610311 2I CAAGTAGAAG --/AC AGGTCTGCTG 3070 het 3070 ref 71 44 17 10 AC 0 1 317831 CASAVA_Build 22 15610520 1D TTTGTCTTCA G/- GGACTAAAAG 2331 het 2331 ref 66 43 5 20 G 3 2 317832 CASAVA_Build 22 15610582 1I CAAAATACTT -/A AATGCTTCTA 3070 het 3070 ref 62 40 12 10 A 2 3 317833 CASAVA_Build 22 15610696 1I GCTGAAGGTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 55 32 16 8 A 7 8 317834 CASAVA_Build 22 15611899 2D CTTTAAAAAA AC/-- ATTGTTTTAT 2048 het 2048 ref 34 23 6 7 AC 1 0 317835 CASAVA_Build 22 15613411 1D CAGGCCATGG C/- CTTGAGAGTG 1446 het 1446 ref 33 23 6 4 C 2 1 317836 CASAVA_Build 22 15615341 1D AATGTTTGTA T/- ATAGAGTGAA 1772 het 1772 ref 61 53 4 4 T 1 0 317837 CASAVA_Build 22 15615717 1I CAGCTAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 10 317838 CASAVA_Build 22 15616376 5I ATCTCCCTGC -----/ATCTT TTCTTTAGCA 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 ATCTT 0 1 317839 CASAVA_Build 22 15617188 1I AAATGCTAGC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 73 46 21 6 T 5 6 317840 CASAVA_Build 22 15617376 1D AGTATTTTCG A/- GACGGAATTT 3070 het 3070 ref 79 66 8 5 A 1 0 317841 CASAVA_Build 22 15618279 2D TGGTCAGCCA TG/-- AAAGAACAGG 3070 het 3070 ref 74 34 33 7 TG 1 0 317842 CASAVA_Build 22 15619410 1I CCACCGCACC -/T GGCCAGATTG 3070 het 3070 ref 33 15 16 3 T 0 1 317843 CASAVA_Build 22 15619920 1I TATTGCACAC -/T TAATTGACTA 3070 het 3070 ref 74 52 14 9 T 1 2 317844 CASAVA_Build 22 15621781 1D16M5I AAATAGGCCC TTTTTGTTTTTATTGAT-----/-TTTTGTTTTTATTGATACATG ACAATTATAA 1795 het 1795 ref 49 47 4 7 N/A 0 0 317845 CASAVA_Build 22 15623201 2I9M2D ATTTATTAGG --ACTGATACATG/ACACCGATACA-- TGTGAATATA 1324 het 1324 ref 46 37 4 10 N/A 0 0 317846 CASAVA_Build 22 15623317 2I TTTCCAAAAA --/AT AAGTATTGCA 3070 het 3070 ref 42 30 10 2 AT 0 1 317847 CASAVA_Build 22 15626374 1D TTCCTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 31 2 15 14 A 13 12 317848 CASAVA_Build 22 15633523 2D TGGTTAATTT TG/-- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 TG 2 1 317849 CASAVA_Build 22 15635922 3D TCCTCAGGAA TTC/--- TTCTTCTTTC 3070 het 3070 ref 60 28 22 12 TTC 3 2 317850 CASAVA_Build 22 15636058 1D AGACAGAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 48 1 22 26 T 15 14 317851 CASAVA_Build 22 15636884 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2960 hom 25 9 12 4 A 9 10 317852 CASAVA_Build 22 15637480 3D TTCTACAAAT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 TTG 4 3 317853 CASAVA_Build 22 15651798 1I AAAAAAAAAA -/G GAATATGGAG 3070 het 359 hom 36 1 28 7 G 1 2 317854 CASAVA_Build 22 15652804 3D TTTCTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 12 9 317855 CASAVA_Build 22 15656866 1D CAAAAAAAAA G/- GGACCAGAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 G 3 2 317856 CASAVA_Build 22 15661098 1I TATTTATGGT -/A AGTTCTTCCC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 1 2 317857 CASAVA_Build 22 15663382 1I CCAGTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 T 10 11 317858 CASAVA_Build 22 15663968 2I CTCAATTGAC --/AT ATATATATAT 3070 het 421 hom 40 1 27 12 AT 7 8 317859 CASAVA_Build 22 15672010 1D CACTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1963 hom 32 9 12 11 T 17 16 317860 CASAVA_Build 22 15677211 1D45M4D CAGAAATTTA TTTTTTCCTGCTTTTGACATTAATTACCATATTTTTACACTTTCTGTAGT/-TTTTTCCTGCTTTTGACATTAATTACCATATTTTTACACTTTCTG---- TATTCATTTT 3070 het 3070 ref 23 16 16 6 N/A 0 0 317861 CASAVA_Build 22 15678244 4I GAACGTCCAC ----/CAAT CAATCAGTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CAAT 1 2 317862 CASAVA_Build 22 15681527 9D CTTGTTGACA TACATAGTC/--------- TCCATCTCCA 3070 het 3070 hom 51 19 26 7 TACATAGTC 1 0 317863 CASAVA_Build 22 15682416 1D CTGATGAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 10 9 317864 CASAVA_Build 22 15683282 2D AATTAAAAAA AT/-- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 AT 1 0 317865 CASAVA_Build 22 15684697 1D TACTAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 42 1 34 7 T 12 11 317866 CASAVA_Build 22 15686942 3I TTCAACACTT ---/AAC AAAGCCAAGG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 AAC 0 1 317867 CASAVA_Build 22 15689258 1I AACTTGAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 10 317868 CASAVA_Build 22 15695921 1I AAATGTGTTC -/T TTTTCAACTG 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 4 5 317869 CASAVA_Build 22 15700141 5I ACCAATAGGA -----/TAGAC TAGAGAGTTG 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 TAGAC 0 1 317870 CASAVA_Build 22 15700668 4D GTCTCAAAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 449 het 449 ref 28 18 5 5 AAAC 1 0 317871 CASAVA_Build 22 15705893 1D CCTCATCCCC A/- TATCAGCTGG 3070 het 3070 ref 44 25 15 6 A 1 0 317872 CASAVA_Build 22 15716224 1D CAGAATTAGG A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 8 7 317873 CASAVA_Build 22 15717188 1I TCCTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 1205 het 1205 ref 19 14 3 2 A 10 11 317874 CASAVA_Build 22 15725760 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 21 11 8 3 A 9 8 317875 CASAVA_Build 22 15730889 6I TTTTCCTCCT ------/GAGGGA TTAGTGCTGA 3061 het 3061 ref 42 27 7 8 GAGGGA 0 1 317876 CASAVA_Build 22 15733692 3D TTTGGATTTA TTG/--- TTATTTAATT 3070 het 3070 ref 80 69 9 3 TTG 1 0 317877 CASAVA_Build 22 15733884 1I TTGCTTAATT -/A AAAAAAAATT 1455 het 1455 ref 56 38 6 12 A 8 9 317878 CASAVA_Build 22 15734791 1I CACCCAGATC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 89 45 17 27 T 7 8 317879 CASAVA_Build 22 15736750 1I AGGTTATCCA -/C CCACCTTGGC 3070 het 3070 hom 42 12 26 4 C 2 3 317880 CASAVA_Build 22 15738002 2I41M1D CTAACCAACA --CACACACACATCTACTTTCCCAAATTCTTTCCTCCTGTATGA/CTCACACACACACCTACTTTCCCAAATTCTTTCCTCCTGTATG- AAAAAACTTA 3070 het 3070 hom 77 24 54 19 N/A 0 0 317881 CASAVA_Build 22 15738499 1D GGTCTTCAGA G/- GTTTACCCTC 3070 het 3070 ref 81 55 21 5 G 2 1 317882 CASAVA_Build 22 15740344 4D ACTTCGGAAA CAAG/---- CAATGGAGGG 2813 het 2813 ref 88 69 8 15 CAAG 1 0 317883 CASAVA_Build 22 15740379 1D CCTGGGCCCT G/- GGGGCAAAGG 2248 het 2248 ref 86 67 6 13 G 5 4 317884 CASAVA_Build 22 15740680 6D ATGTGTGGAC TTAAAA/------ TTAAATTGTT 2863 het 2863 ref 86 66 10 18 TTAAAA 1 0 317885 CASAVA_Build 22 15742109 1D AAAGACAAAC T/- TTTTTCCTGT 1169 het 1169 ref 36 30 3 3 T 6 5 317886 CASAVA_Build 22 15742992 1I ATTTACAAAA -/G CTATATCTGG 3070 het 3070 hom 64 32 31 1 G 0 1 317887 CASAVA_Build 22 15744702 1D CATGGAATTG T/- TTCGTGTGGA 2306 het 2306 ref 60 49 5 7 T 3 2 317888 CASAVA_Build 22 15744888 1I TTTAAAAAAA -/T AATAATAACG 3070 het 3070 ref 52 36 11 5 T 0 1 317889 CASAVA_Build 22 15745839 1D CACAGCAGAA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 84 30 24 31 T 8 7 317890 CASAVA_Build 22 15746162 3I CAGAATTTCA ---/TTC TTCTTTGTAT 3070 het 3070 ref 82 46 35 1 TTC 1 2 317891 CASAVA_Build 22 15746689 1D TTTAACTATT A/- TTTTTTTAGA 1349 het 1349 ref 34 31 3 0 A 1 0 317892 CASAVA_Build 22 15747085 3D7M3D AAAAAAAAAA AAGAAAAGAAAAG/---AAAAGAA--- AAAAAAGAAA 3070 het 1949 hom 30 11 12 10 N/A 0 0 317893 CASAVA_Build 22 15747154 4D AATCAGATTT TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 het 3070 ref 43 32 10 3 TTTG 2 1 317894 CASAVA_Build 22 15747361 1D GGTCTTACGC A/- AAAAAAATCT 3070 hom 134 het 52 0 46 7 A 8 7 317895 CASAVA_Build 22 15750735 1D AGCATCTGTC A/- AGTCTGTCTG 3070 hom 138 het 75 1 70 7 A 2 1 317896 CASAVA_Build 22 15751548 1D22M2I ACAGAGATCC AGAAAAGACCCTCCTTATATTTT--/-GAAAAGACCCTTCTTATATTTTAA TTTTGTGCAT 1300 het 1300 ref 25 8 4 20 N/A 0 0 317897 CASAVA_Build 22 15751598 1D CTTTTTAGTG A/- AAAAAAAAAC 1404 het 240 hom 41 4 3 35 A 10 9 317898 CASAVA_Build 22 15751967 2D CATGAGGTTT AA/-- GTTATAATAC 3070 het 3070 ref 59 50 7 4 A 2 0 317899 CASAVA_Build 22 15752644 2D GCATCCTTGT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 63 28 18 19 TA 1 0 317900 CASAVA_Build 22 15753540 1D GCACGCACCA C/- CATGGCCAGC 2122 het 2122 ref 84 65 6 14 C 2 1 317901 CASAVA_Build 22 15753711 1I TAGAGAAGCC -/T TTTTTTTCTT 2882 het 2882 ref 87 59 8 20 T 7 8 317902 CASAVA_Build 22 15753814 3D TTTGTCTCCG ATA/--- ATAATAATTG 3070 het 3070 ref 66 43 17 7 ATA 3 2 317903 CASAVA_Build 22 15754056 2D AACCTGAAGA CT/-- CTACCAGAAA 1243 het 1243 ref 69 59 3 9 CT 2 1 317904 CASAVA_Build 22 15754777 1I AAAATCAACT -/G CAAGTATCTC 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 G 0 1 317905 CASAVA_Build 22 15755622 1D AATCAACCTA G/- GTTTCCAACA 1776 het 1776 ref 59 50 6 3 G 2 1 317906 CASAVA_Build 22 15756693 1I TTCTTAATTT -/C TTTAATAAAA 3070 het 3070 hom 48 15 28 5 C 0 1 317907 CASAVA_Build 22 15758591 1I CCTCAAATTT -/A AAAAAATTAT 2410 het 2410 ref 85 60 6 19 A 6 7 317908 CASAVA_Build 22 15759882 3I AGCCTACATC ---/TTT TTTCTCCCAT 3070 het 3070 ref 60 41 10 9 T 3 6 317909 CASAVA_Build 22 15760084 4I TATATACCCT ----/GTTA GTTCTGTCCC 3070 het 3070 ref 64 29 19 16 GTTA 0 1 317910 CASAVA_Build 22 15760592 1D TAATTACCCC T/- AACATAATAA 3070 het 3070 ref 67 34 20 14 T 1 0 317911 CASAVA_Build 22 15764415 2D6M4I ATGGTTTCTT TAGAGTTG----/--GTATTGTAAC CTCCATGAGG 3070 het 3070 ref 65 47 14 7 N/A 0 0 317912 CASAVA_Build 22 15767196 1D CTCTCTATGG C/- CCTTTCTCCC 3070 het 3070 ref 59 29 19 14 C 3 2 317913 CASAVA_Build 22 15768172 1I GTGATGGAGG -/T AAGGGCCATG 3070 het 3070 ref 64 40 13 11 T 0 1 317914 CASAVA_Build 22 15769302 1D TCTTTCCTGG T/- TTTTATAGGT 3070 het 3070 ref 84 42 34 8 T 5 4 317915 CASAVA_Build 22 15771144 1I TCAGTCTCAA -/G GGTCTCTGTC 3070 het 3070 ref 83 58 9 16 G 2 3 317916 CASAVA_Build 22 15786230 1I TCAGACTAAC -/A GTGGATCTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 0 1 317917 CASAVA_Build 22 15795407 17D GCTAAATATA TTTCAGTATTTAAATAC/----------------- TTTCAGTATT 3070 het 3070 ref 37 19 14 8 TTTCAGTATTTAAATAC 1 0 317918 CASAVA_Build 22 15795719 1I CTTAAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 9 10 317919 CASAVA_Build 22 15797227 1D CACAAAGATG T/- TTTTTAAGAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 6 5 317920 CASAVA_Build 22 15801679 5D TAATAAATTC ATATG/----- ATATATGTGA 3070 het 3070 hom 30 13 16 2 ATATG 1 0 317921 CASAVA_Build 22 15802201 3D ATCTATGACT TAA/--- TAAAGTTTTC 3070 het 3070 ref 30 16 10 7 TAA 2 1 317922 CASAVA_Build 22 15805380 3I CTGCCTTCAT ---/AAG ATACAGTAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAG 0 1 317923 CASAVA_Build 22 15806188 6I TATTCCACAG ------/ATGTAA ATGTAAACTG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 ATGTAA 1 2 317924 CASAVA_Build 22 15818072 1D TTTAACAACT G/- GAACAGCAAA 3070 het 3070 hom 68 22 29 18 G 2 1 317925 CASAVA_Build 22 15820050 7D TTGCGCCACT GCAGTCC/------- GCAGTCCGCA 1538 het 802 hom 10 2 6 2 GCAGTCC 3 2 317926 CASAVA_Build 22 15836880 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 28 16 5 A 9 10 317927 CASAVA_Build 22 15838883 5I TGAGAACAAA -----/GACAC GACACAATGT 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 GACAC 1 2 317928 CASAVA_Build 22 15838963 1D CCCATAAGAG A/- AAGCAGGGAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 3 2 317929 CASAVA_Build 22 15868824 1I CCCACTGCCC -/G CACTCACAAA 1881 hom 21 het 8 0 6 2 G 0 1 317930 CASAVA_Build 22 15875480 1D TAATGGCTTA T/- TTTTCCTTTT 3070 het 3070 ref 80 47 23 10 T 5 4 317931 CASAVA_Build 22 15875776 4I25M1I TTATTGGTTA ----AATGATTTCGGCAATTTCCCTTTTT-/AATGAATGATTTTGGCAATTTCGCTTTTTA AATTATTTTT 3070 het 3070 ref 54 29 28 10 N/A 0 0 317932 CASAVA_Build 22 15877780 1I CCTGGCTAAC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 7 8 317933 CASAVA_Build 22 15880327 1I GAAGGAATAC -/A GGGAGGAGAA 3070 het 3070 ref 59 34 15 10 A 0 1 317934 CASAVA_Build 22 15881734 3I CACCACAAAA ---/AAC AATAACTTTT 2165 het 2165 ref 34 27 6 1 AAC 0 1 317935 CASAVA_Build 22 15883540 1I AAAAAATGAC -/T TCATATCATC 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 T 1 2 317936 CASAVA_Build 22 15884140 4D GTATTTCCAG TATC/---- TAAGAACTTG 898 het 898 ref 85 68 4 15 TATC 1 0 317937 CASAVA_Build 22 15886465 1I AAGTTTAGAG -/A AAAAAAGAGT 1645 het 1645 ref 50 42 5 3 A 6 7 317938 CASAVA_Build 22 15892174 1D CTCTAACTCC T/- GTTAAGGCTT 3070 het 3070 ref 50 36 7 7 T 1 0 317939 CASAVA_Build 22 15892349 1I AATTTTCCAA -/T TTTTTTTTTT 1860 het 1860 ref 37 12 8 17 T 15 16 317940 CASAVA_Build 22 15895322 2I GCCTAGGGTG --/TA TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 41 22 11 8 TA 0 1 317941 CASAVA_Build 22 15896636 1D TTATCTTGTG A/- TTTTTTTTTG 1875 het 1875 ref 37 30 4 4 A 1 0 317942 CASAVA_Build 22 15901877 1D TTAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1966 het 1966 ref 27 9 7 11 T 14 13 317943 CASAVA_Build 22 15902786 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 907 hom 26 8 12 6 A 17 16 317944 CASAVA_Build 22 15903707 1I ATTTTCTTCA -/T TAGTTACTAT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 1 2 317945 CASAVA_Build 22 15918355 1I GTCAACGACT -/C CATAGTCTTT 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 C 1 2 317946 CASAVA_Build 22 15922391 2I GGAGAATATT --/GA GAGATGGAGC 3070 het 3070 hom 54 19 26 9 GA 2 3 317947 CASAVA_Build 22 15925490 2I CCTGTATTCC --/CA CAGAGACTGG 2615 het 2615 ref 21 13 7 1 CA 1 2 317948 CASAVA_Build 22 15942463 1D TACTTTCCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 A 10 9 317949 CASAVA_Build 22 15947263 1D TATGTCGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 12 8 A 13 12 317950 CASAVA_Build 22 15963790 1D CCAGCAGTTT G/- GGAGGCCAAG 3070 het 2432 hom 21 8 11 2 G 3 2 317951 CASAVA_Build 22 15966716 4D CCCCGCCGCA TCAC/---- TCACGCTGTT 2188 het 2188 ref 23 9 9 6 TCAC 2 1 317952 CASAVA_Build 22 15973048 2D CGTAGAGCAC AT/-- GTTCCCATCT 3070 het 3070 ref 54 24 21 9 AT 1 0 317953 CASAVA_Build 22 15973889 2D GTTTTTTTTT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 TG 1 0 317954 CASAVA_Build 22 15977057 5I AACTGCCTAG -----/AAGGA AAGGGCCAAG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AAGGA 0 1 317955 CASAVA_Build 22 15986331 1D AAAAAAACCA T/- TTTTTTTTTT 2006 het 1172 hom 23 8 10 5 T 11 10 317956 CASAVA_Build 22 15989154 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2439 hom 23 10 10 3 T 13 14 317957 CASAVA_Build 22 16003881 1I GACTCCAAGG -/C CCCCTTGCTG 3070 hom 81 het 40 0 32 8 C 4 5 317958 CASAVA_Build 22 16009545 1I CTAGGGAAGG -/A AAAAAACCCG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 6 7 317959 CASAVA_Build 22 16010802 2D TAAATAGAAA AT/-- AGAGAAATCC 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 AT 1 0 317960 CASAVA_Build 22 16012239 1I GCTATTTTTC -/T TTTGTTGGTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 4 317961 CASAVA_Build 22 16013181 3I AGTTAACTGA ---/AAG AAGACCAGGT 3070 hom 110 het 44 0 37 7 AAG 1 2 317962 CASAVA_Build 22 16015278 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AGG 0 1 317963 CASAVA_Build 22 16017041 2D GAAGAAAGCA CT/-- GTTATCGCAG 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 CT 1 0 317964 CASAVA_Build 22 16020400 3I GCACGGCCTG ---/GGC GGCGGCGGCG 1424 hom 21 het 9 0 8 1 GGC 3 4 317965 CASAVA_Build 22 16028345 2D AAAAAAAAAA AG/-- GAAAAAGTAA 3070 hom 54 het 22 0 18 5 AG 1 0 317966 CASAVA_Build 22 16028718 2D CCCAGTCCAC TG/-- TATCCACGTT 3070 hom 80 het 31 0 25 6 TG 1 0 317967 CASAVA_Build 22 16032082 4D TCTACCCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 54 het 21 0 19 5 TTTG 3 2 317968 CASAVA_Build 22 16032765 1I CTCCCAGGGA -/G GGAAGGGACA 2460 hom 18 het 10 0 7 3 G 2 3 317969 CASAVA_Build 22 16034342 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 31 0 28 3 A 9 8 317970 CASAVA_Build 22 16035100 1I TTTAGTAGGG -/A ACGGGGTTTC 2398 hom 23 het 12 0 7 5 A 1 2 317971 CASAVA_Build 22 16035626 1I CTAGGGAGGG -/T TGAGGTAGGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 1 2 317972 CASAVA_Build 22 16036595 2D CCAGAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 21 1 17 3 A 19 17 317973 CASAVA_Build 22 16036775 1I CCAGGAGGTG -/T TTTTTTGTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 6 7 317974 CASAVA_Build 22 16037077 4D AGATCATAAA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 84 het 30 0 26 5 TTTG 3 2 317975 CASAVA_Build 22 16038600 1I CGAGTGGTTA -/G AAAAAAATAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 317976 CASAVA_Build 22 16047280 1D AGACCAGCCT G/- GGCCAACATG 3070 hom 36 het 15 0 10 5 G 3 2 317977 CASAVA_Build 22 16067281 21D CGGGAGGCAG AGGCTGCTGTGAGCCAAGATC/--------------------- AGGCTGCTGT 2437 het 2437 ref 21 11 7 9 AGGCTGCTGTGAGCCAAGATC 2 1 317978 CASAVA_Build 22 16076257 7D TTGGGAGGCC GAGGCAG/------- GAGGCAGGTG 1469 het 1469 ref 12 7 5 0 GAGGCAG 2 1 317979 CASAVA_Build 22 16082186 1D TTTTTGTGGG T/- TTTTTTTATA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 T 8 7 317980 CASAVA_Build 22 16083298 2I59M4D GATTCTCTGA --CCCAGAGTTAAGAAAATGGAAATAATAATTGCTAAGGCATATTAAGAATTATATATGTATGTG/CCCCCAGAGTTAAGAAAATGGAAATAATAATTGCTAAGGCATATTAAGAATTATATATGTA---- TGTGTGTATA 3070 het 34 hom 31 1 26 13 N/A 0 0 317981 CASAVA_Build 22 16083469 8I36M1D CAAATATGTG --------TGTGTATGTGTGTGTGTGTATATATACTCATTTAATC/TGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATACTCATTTAAT- CTTGCAGCAA 3070 hom 33 het 18 0 12 12 N/A 0 0 317982 CASAVA_Build 22 16084185 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 10 9 317983 CASAVA_Build 22 16101847 2I AATGATTAAC --/TG TGAACAGTTT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 TG 1 2 317984 CASAVA_Build 22 16102332 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2666 hom 23 9 12 2 A 12 11 317985 CASAVA_Build 22 16105366 4I GAGATCGAGA ----/CCAT CCATCCTGGC 1147 het 545 hom 9 2 4 3 CCAT 1 2 317986 CASAVA_Build 22 16114304 1I ATCCCAACAC -/T TTTGGAAGAC 2646 het 1175 hom 18 6 9 3 T 3 4 317987 CASAVA_Build 22 16116278 1D GTGAGCTGAG C/- ATCACGCCAC 2651 het 72 hom 13 1 7 5 C 1 0 317988 CASAVA_Build 22 16116325 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 18 2 12 5 A 15 14 317989 CASAVA_Build 22 16116340 1D AAAAAAAAAA C/- AGGTTAAAAC 2310 het 277 hom 20 5 7 8 C 1 0 317990 CASAVA_Build 22 16120872 8D ACAAACAAAC AAAAAGAA/-------- AAAAAGAAAG 2653 hom 32 het 11 0 8 4 AAAAAGAA 2 1 317991 CASAVA_Build 22 16123895 7D TGGCTATAGT GCAGCAG/------- GCACTGTGCT 3070 het 3070 ref 37 21 13 4 GCAGCAG 1 0 317992 CASAVA_Build 22 16125924 3D CACTCCTCGT TTA/--- GAGAGACAAG 3070 het 3070 ref 39 23 12 7 TTA 1 0 317993 CASAVA_Build 22 16139042 1D CAATGCACTC T/- TTTTTTTTTT 1830 het 886 hom 13 6 6 1 T 13 12 317994 CASAVA_Build 22 16149794 1I TTGAGCATCC -/T GATAGGGCCA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 0 1 317995 CASAVA_Build 22 16152086 1D CCTGTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 24 1 15 9 A 13 12 317996 CASAVA_Build 22 16167880 4D AATAGAGAGT ACTA/---- ACTAACAGGA 3070 hom 99 het 39 0 34 7 ACTA 2 1 317997 CASAVA_Build 22 16171160 1I GGCTCCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2199 hom 35 12 15 8 T 10 11 317998 CASAVA_Build 22 16175170 7D GACAAAATAA TTATTAC/------- TTATGTTGGT 3070 het 3070 hom 32 12 16 7 TTATTAC 1 0 317999 CASAVA_Build 22 16180984 2D TAAGGAACTC TG/-- TGCAAACACC 3070 het 3070 ref 57 30 23 4 TG 2 1 318000 CASAVA_Build 22 16183033 2D AATAATTACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2993 hom 38 14 13 11 A 17 15 318001 CASAVA_Build 22 16187224 1I ACTCCATTTG -/A AAAAAAAAAA 2304 het 2304 ref 21 13 5 3 A 11 12 318002 CASAVA_Build 22 16192836 2I GCAACAGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 45 het 21 0 14 7 CT 1 2 318003 CASAVA_Build 22 16196837 1D ATACATACAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 T 9 8 318004 CASAVA_Build 22 16197072 1I AGAGAAAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 381 hom 31 1 26 4 T 9 10 318005 CASAVA_Build 22 16206910 1D CCTTGCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 12 11 318006 CASAVA_Build 22 16208147 4I GCTTTGTTTT ----/ATTC GTTAGGTACA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 ATTC 0 1 318007 CASAVA_Build 22 16210882 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1190 het 905 hom 16 4 6 6 T 15 16 318008 CASAVA_Build 22 16212883 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTGTATT 998 het 998 ref 15 7 3 5 T 6 5 318009 CASAVA_Build 22 16223441 1I TTTTAGTTCA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 T 7 8 318010 CASAVA_Build 22 16223937 1D TTCCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1064 het 816 hom 15 3 7 5 T 12 11 318011 CASAVA_Build 22 16236737 1D ATGTGCCATC A/- TGCCTGGCTA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 1 0 318012 CASAVA_Build 22 16237375 1I TCTTACTTCA -/T TTTTTTTTTT 1109 het 1109 ref 41 22 4 15 T 15 16 318013 CASAVA_Build 22 16243104 1D GAGGCGGAGT A/- TTGCAGTGAG 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 1 0 318014 CASAVA_Build 22 16243745 55I AGTAGCTGGG -------------------------------------------------------/ATTACAGACATGCACCACCACGTCTGGCTAATTTTCTTTTTTTTGGATTTTTACT ATAGACAGGG 2354 hom 21 het 7 0 5 3 ATTACAGACATGCACCACCACGTCTGGCTAATTTTCTTTTTTTTGGATTTTTACT 0 1 318015 CASAVA_Build 22 16278754 26I GCGAGCTGGA --------------------------/GGCTGTTTCCTCCTTCGTAGCGTGCT GCTAGAGAGC 3070 het 3070 ref 30 20 11 1 GGCTGTTTCCTCCTTCGTAGCGTGCT 0 1 318016 CASAVA_Build 22 16284787 1I GATAGACCAA -/G GGGTCTAATC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 G 3 4 318017 CASAVA_Build 22 16285325 7I1M4D TCCATAGTGG -------TCCTC/GAAAAAAT---- CCTACTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 16 4 N/A 0 0 318018 CASAVA_Build 22 16287549 3I AGAGAAACTT ---/ATC ATCAAACATT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 ATC 1 2 318019 CASAVA_Build 22 16290815 12I TATCCCTCGT ------------/ATTTTTTCACAG ATTTTTTTTT 2333 het 2333 ref 24 14 6 4 ATTTTTTCACAG 0 1 318020 CASAVA_Build 22 16297391 2D TTCTCATCAC AT/-- GTTTTGGGTT 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AT 1 0 318021 CASAVA_Build 22 16299115 1I GATTACATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 A 10 11 318022 CASAVA_Build 22 16309967 1I CTGGATTATT -/A CAGTTCTCTA 3070 hom 169 het 65 0 57 8 A 0 1 318023 CASAVA_Build 22 16326836 4D AAAGAAAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 114 het 42 0 39 4 AG 8 6 318024 CASAVA_Build 22 16329735 1I TGCAAAACCC -/T TACTGACTGT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 1 2 318025 CASAVA_Build 22 16338071 1I TAGCAATCAG -/T TTTCTTATAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 3 4 318026 CASAVA_Build 22 16338623 1I4M1I CTGAGTTCAT -CCTC-/CCCTCT TAATTTGTCC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 N/A 0 0 318027 CASAVA_Build 22 16348915 2D TAGCTTGCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 4 T 13 11 318028 CASAVA_Build 22 16349929 1I TTTCCTCCCA -/C CCCACTTCCC 3070 hom 115 het 48 0 39 9 C 3 4 318029 CASAVA_Build 22 16350088 4D GAATCAGTAC TTCA/---- TTCATTTTTA 3070 hom 135 het 50 0 44 9 TTCA 2 1 318030 CASAVA_Build 22 16355149 1I AACTATCTTC -/A AAATTTTAAT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 3 4 318031 CASAVA_Build 22 16357813 3I GCTCACATAA ---/AAC AACAACCGCT 3070 hom 66 het 27 0 21 6 AAC 2 3 318032 CASAVA_Build 22 16372953 2I TAAAATTTCT --/TC TTTTATTCTT 3070 hom 105 het 36 0 35 1 TC 0 1 318033 CASAVA_Build 22 16375312 1D ATTTATTATA T/- TTATATGTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 3 2 318034 CASAVA_Build 22 16375662 9D AGACGGAGTT TTGCTGTTG/--------- TTGCCCAGAC 3070 hom 63 het 21 0 20 3 TTGCTGTTG 1 0 318035 CASAVA_Build 22 16376286 4I TCTGGCTCTA ----/TCTC TCTTGCTTCG 3070 hom 96 het 34 0 30 4 TC 1 3 318036 CASAVA_Build 22 16377165 3I TCAGTCTCTT ---/CTA CTTCCTTTCT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 CTA 0 1 318037 CASAVA_Build 22 16410097 1D TGACCAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2675 hom 49 15 14 21 A 17 16 318038 CASAVA_Build 22 16415853 3I TCCGCCTCTC ---/CTT CATCACCAGC 3070 het 3070 ref 44 18 20 6 CTT 0 1 318039 CASAVA_Build 22 16419220 6D ACTCCGTCTC AAAAAT/------ AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 18 6 AAAAAT 2 1 318040 CASAVA_Build 22 16426994 5I CAACACAGAC -----/AACTT AAGTAACTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AACTT 0 1 318041 CASAVA_Build 22 16434299 1D TCTTGTCCCC A/- TGAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 1 0 318042 CASAVA_Build 22 16498652 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 5 4 318043 CASAVA_Build 22 16517832 1D TTAAATTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 328 hom 30 2 25 3 T 10 9 318044 CASAVA_Build 22 16520135 5D CATCTTCTCT ACTTA/----- ACTCTACTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 5 ACTTA 1 0 318045 CASAVA_Build 22 16534332 1D GCTACATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 621 hom 27 2 19 7 A 15 14 318046 CASAVA_Build 22 16536128 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 30 1 16 13 T 18 16 318047 CASAVA_Build 22 16536300 1D TGCCTGGCAA T/- TTTTTTTTTT 2694 het 62 hom 15 1 9 5 T 17 16 318048 CASAVA_Build 22 16537653 3I AATGTGGCTT ---/ATA ATGATGCATA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATA 0 1 318049 CASAVA_Build 22 16537842 2D ACATATGTAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 298 hom 36 1 25 13 AC 8 7 318050 CASAVA_Build 22 16539072 1D TACTAAAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 9 8 318051 CASAVA_Build 22 16550084 11D TGGATTCAAG TTTTATTTTAT/----------- TTTTATTTAA 3070 hom 78 het 27 0 26 6 TTTTATTTTAT 1 0 318052 CASAVA_Build 22 16553096 1I CATCTGAAAG -/A AAAAAAATTT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 7 8 318053 CASAVA_Build 22 16554125 2D ATAATCTTTT TG/-- TCCTGGCTGG 3070 hom 58 het 23 0 19 4 TG 1 0 318054 CASAVA_Build 22 16567880 1I TTGATTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 23 0 19 4 A 10 11 318055 CASAVA_Build 22 16583936 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 12 11 318056 CASAVA_Build 22 16592777 1D TAGTAGGAGG C/- CATTCCTTCC 3070 hom 80 het 30 0 26 4 C 2 1 318057 CASAVA_Build 22 16601943 3D CCAGCTGAAA TCT/--- TCTGCAAGGC 3070 hom 108 het 39 0 35 5 TCT 2 1 318058 CASAVA_Build 22 16605041 3D AGGCCGGCAT GGA/--- GAAGAGCGAG 3070 hom 42 het 16 0 14 2 GGA 1 0 318059 CASAVA_Build 22 16615438 1I CAATGGGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 31 2 23 6 T 12 13 318060 CASAVA_Build 22 16621685 1D TTACCACGAT A/- AAAAAATATA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 7 6 318061 CASAVA_Build 22 16625362 8D TGTCAAGCAG GCTAGAGT/-------- GCAGTAGCAC 1932 het 1303 hom 8 3 4 1 GCTAGAGT 1 0 318062 CASAVA_Build 22 16645818 2D ATGGAGAAGC GG/-- GGGGGGGGGG 3070 het 611 hom 24 3 9 12 G 12 10 318063 CASAVA_Build 22 16651960 1D GAAGGAAGGG C/- GGGAGTCGCT 3070 het 3070 hom 43 17 13 13 C 1 0 318064 CASAVA_Build 22 16664828 1D ATGTAAACAA T/- TTTTTTTTTT 2311 het 2311 ref 30 12 8 10 T 17 16 318065 CASAVA_Build 22 16671218 1I AGGGGGTCTG -/T GGGGTGCAGG 2128 het 2128 ref 27 11 8 8 T 0 1 318066 CASAVA_Build 22 16679780 9D CCAGCCCCTC CTGGTAGCA/--------- CTGCCCTCTG 3070 hom 44 het 16 0 13 4 CTGGTAGCA 1 0 318067 CASAVA_Build 22 16686374 2I CACCTAAAAT --/TC TGTTTCATGC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TC 0 1 318068 CASAVA_Build 22 16688251 1I TGCCCCACCG -/C CCCTAGGGAC 3070 hom 60 het 24 0 17 7 C 3 4 318069 CASAVA_Build 22 16692661 3D TTGCGCCTGA CTG/--- TCTGGGCAGG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 CTG 1 0 318070 CASAVA_Build 22 16694020 3D CCAGCAAGTC CCT/--- CCTCATCACT 3070 het 3070 ref 41 21 16 6 CCT 2 1 318071 CASAVA_Build 22 16696077 3I GAGGCCTTGC ---/CTG CTGCAGTGAG 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 CTG 1 2 318072 CASAVA_Build 22 16701265 1D TCCGGGCATC A/- AGGCTTCGTC 3070 hom 132 het 47 0 42 6 A 2 1 318073 CASAVA_Build 22 16709163 1I ATGGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 34 2 29 3 A 10 11 318074 CASAVA_Build 22 16716991 1D AGCTTGGGGA G/- GGGGGTGCTA 3070 hom 80 het 32 0 24 8 G 6 5 318075 CASAVA_Build 22 16722896 1D TCAAGAGAAA G/- GGAAGGAAAA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 G 3 2 318076 CASAVA_Build 22 16730001 4D TATACTTTCT CAGA/---- CAGAATGTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 6 CAGA 2 1 318077 CASAVA_Build 22 16739368 1I GACTCAGTAG -/C CCCCCTGGGG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 C 5 6 318078 CASAVA_Build 22 16744321 1D TTTCCAGGTG C/- CAGGGAGCAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 C 2 1 318079 CASAVA_Build 22 16751211 1D GAAAGAAGCC A/- AGAGAATGCA 3070 hom 166 het 59 0 56 4 A 2 1 318080 CASAVA_Build 22 16754023 1D ATAGGAGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 11 10 318081 CASAVA_Build 22 16773793 1D GGGCTGGGGG A/- GGAAGAGGAG 3070 het 2616 hom 29 10 14 6 A 1 0 318082 CASAVA_Build 22 16774102 1D TTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 A 11 10 318083 CASAVA_Build 22 16777034 1I GAATGGCATT -/G GGGTGGAGGG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 G 3 4 318084 CASAVA_Build 22 16777198 15I ACCTCCATTT ---------------/TGCAGATGGGGAAAG TGCAGATGGG 3070 het 3070 ref 59 17 16 26 TGCAGATGGGGAAAG 1 2 318085 CASAVA_Build 22 16777873 1I GGAGAATCCC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 A 8 9 318086 CASAVA_Build 22 16822613 1D AAGGGTACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 52 22 22 9 A 10 9 318087 CASAVA_Build 22 16823010 16D GGGCTCCGTG CTAGGCAGTGAGCTCA/---------------- CTGGGGGTCA 3070 het 3070 ref 46 24 19 8 CTAGGCAGTGAGCTCA 1 0 318088 CASAVA_Build 22 16825023 3I AGCAAACATG ---/ACA TCCTCAACTG 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 ACA 0 1 318089 CASAVA_Build 22 16829645 1I TTGGAGGTTA -/G GGGTTATCTG 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 G 3 4 318090 CASAVA_Build 22 16830124 1D CATACCCTGC A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 8 7 318091 CASAVA_Build 22 16830641 2I TGAAACCCTG --/TC TCTACTAAAA 2858 hom 24 het 9 0 8 1 TC 1 2 318092 CASAVA_Build 22 16830842 1D AAAATTAAAT A/- AAAATAATTA 1266 het 1266 ref 15 5 5 5 A 5 4 318093 CASAVA_Build 22 16838815 1D ACTGGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2925 hom 31 9 9 13 A 11 10 318094 CASAVA_Build 22 16840831 1D AATAAAAAAA T/- ATACACCTAC 2739 het 2524 hom 14 8 6 0 T 1 0 318095 CASAVA_Build 22 16841646 1D TGTTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2575 het 954 hom 12 4 7 1 A 11 10 318096 CASAVA_Build 22 16842551 1D TTAAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 1706 hom 17 5 10 2 A 9 8 318097 CASAVA_Build 22 16842872 1D TAGGATTACA G/- GGGTGAACCA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 G 4 3 318098 CASAVA_Build 22 16844053 1D CTTTCCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 8 8 T 15 14 318099 CASAVA_Build 22 16844878 2D CTCAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 2126 het 1273 hom 15 7 5 3 A 13 11 318100 CASAVA_Build 22 16851191 1D AGCCTGCAGG C/- CAAAGAATGG 3070 het 3070 hom 39 12 17 10 C 2 1 318101 CASAVA_Build 22 16856018 1D CCCAGATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 11 10 318102 CASAVA_Build 22 16856605 1D GAAGCGGTGA C/- CCCCCAGGAC 2234 het 2234 ref 24 15 7 2 C 6 5 318103 CASAVA_Build 22 16860695 1D TTCCGCTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 10 6 A 12 11 318104 CASAVA_Build 22 16860842 4I CCAAGGAGGG ----/TGAA TGAATCACCT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 TGAA 1 2 318105 CASAVA_Build 22 16871975 1I GTAACTCGCA -/G GAAGACTCCT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 G 1 2 318106 CASAVA_Build 22 16898224 4I AAATAAATAA ----/ATAC ATAAATAAAT 1423 het 489 hom 6 1 4 1 ATAC 0 1 318107 CASAVA_Build 22 16906585 1D CCCTGTTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 15 12 A 15 14 318108 CASAVA_Build 22 16908773 4I TAATTATTAC ----/ATAA ATAAAGTGAC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 ATAA 1 2 318109 CASAVA_Build 22 16920050 10D CAACTTCTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTG 3070 het 2113 hom 29 11 12 9 T 19 9 318110 CASAVA_Build 22 16923464 1I CTGTTTCTTT -/A AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 7 8 318111 CASAVA_Build 22 16943918 10D AGTATTCCAT TATATATATA/---------- TATATATATA 3070 hom 58 het 24 0 16 9 TA 12 7 318112 CASAVA_Build 22 16944843 1I TTTTTTTTTT -/C TTCTGCTGTT 3070 het 495 hom 27 3 18 6 C 0 1 318113 CASAVA_Build 22 16952372 4I CACTGTGTCC ----/TTGG TTGGTGTTGA 3070 hom 105 het 42 0 32 10 TTGG 1 2 318114 CASAVA_Build 22 16954245 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAATG 3070 hom 73 het 28 0 24 4 A 10 8 318115 CASAVA_Build 22 16956986 1I GAAAAAAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 21 7 T 10 11 318116 CASAVA_Build 22 16961414 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 36 het 17 0 13 5 A 9 8 318117 CASAVA_Build 22 16968264 6D TCGCCAAGAG TCTTTT/------ CCTGGGTGAT 3070 hom 111 het 39 0 37 3 TCTTTT 1 0 318118 CASAVA_Build 22 16977165 1D ATCATCTGAG C/- CCCCTCTCGC 3070 hom 93 het 34 0 30 5 C 5 4 318119 CASAVA_Build 22 17045661 1D CTTGGGCCTA C/- CAACTGGGGG 1115 hom 7 het 3 0 3 0 C 2 1 318120 CASAVA_Build 22 17049670 1D GAGCAGAGAT A/- GGGGGGCTGC 3070 het 3070 ref 76 48 16 16 A 1 0 318121 CASAVA_Build 22 17093228 1I CCAGCTTGCC -/A AAGAAGGCAC 3070 het 3070 ref 74 54 8 12 A 2 3 318122 CASAVA_Build 22 17104787 9D CATAAGACAG CCTCATGAT/--------- CTCATAATCC 1950 het 1950 ref 12 7 5 2 CCTCATGAT 1 0 318123 CASAVA_Build 22 17106382 1D CTCCTCTGCA C/- CCCCTGCAGG 2786 het 2786 ref 43 32 8 3 C 5 4 318124 CASAVA_Build 22 17112359 2I CCACTCTCTC --/TT GTATGAATTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 0 2 318125 CASAVA_Build 22 17118433 3D CATCGCTAAT GAG/--- GACACCATAT 2538 het 2538 ref 51 42 6 6 GAG 1 0 318126 CASAVA_Build 22 17132119 1D TTGTAAGCTC T/- AAAATAATCC 2870 het 2870 ref 40 31 6 3 T 1 0 318127 CASAVA_Build 22 17147986 1I ATTCTCAATA -/T TTTTTTTTGT 2345 het 2345 ref 16 8 5 3 T 8 9 318128 CASAVA_Build 22 17151548 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 59 28 16 15 T 10 11 318129 CASAVA_Build 22 17154225 1I TTTTTTTCCA -/T TTTTTTGTAG 1221 het 1221 ref 53 46 3 4 T 6 7 318130 CASAVA_Build 22 17155136 3I TTTTCCTAGA ---/AGG AGAAGCAGGT 977 het 977 ref 57 40 4 13 AGG 0 1 318131 CASAVA_Build 22 17156768 1D ATTAATAACA T/- TTTTTTTTTC 2699 het 2699 ref 15 7 6 2 T 10 9 318132 CASAVA_Build 22 17167327 1D ACAGGCATGA G/- CCACTGAACC 3070 het 3070 ref 56 29 13 15 G 1 0 318133 CASAVA_Build 22 17171062 2I GGACAGAAAC --/TG TGAGGGAGAG 3070 het 3070 hom 85 34 41 10 TG 1 2 318134 CASAVA_Build 22 17172137 1I CTCCAGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 76 44 15 17 A 10 11 318135 CASAVA_Build 22 17174296 2D CTGGGAGACC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 58 26 12 22 T 11 9 318136 CASAVA_Build 22 17187173 1I AAGCATCTGG -/A GCAAAGAACA 3070 het 3070 ref 63 30 24 9 A 0 1 318137 CASAVA_Build 22 17187355 1I AATTATCAAA -/T TTTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 3 4 318138 CASAVA_Build 22 17187774 1I CTCACATCTG -/A CTTTTGATTT 3070 het 3070 hom 52 22 21 9 A 0 1 318139 CASAVA_Build 22 17187850 1I AAAGAATTAT -/C CTTAAGTGGG 3070 hom 154 het 54 0 52 2 C 1 2 318140 CASAVA_Build 22 17189312 4I GGCTTTGACA ----/CGCG CGCGGCAGAT 3070 het 3070 ref 53 23 17 13 CG 2 4 318141 CASAVA_Build 22 17211584 1I GCTCAGCATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 21 13 14 A 9 10 318142 CASAVA_Build 22 17220762 2D GTTGCCAGAC AG/-- AGCCGCACTG 1021 het 1021 ref 73 63 3 9 AG 2 1 318143 CASAVA_Build 22 17221916 2D TCAAGATACA AC/-- AGTGAGGGAA 3070 het 3070 ref 76 61 8 10 AC 1 0 318144 CASAVA_Build 22 17221999 2D TTTTAGACTC TA/-- TAAGTTAAGT 2681 het 2681 ref 86 71 6 10 TA 2 1 318145 CASAVA_Build 22 17222473 1D AGCTGCTGGT G/- GGGAGGTCTT 3070 het 3070 hom 64 20 35 9 G 4 3 318146 CASAVA_Build 22 17242533 2I AAACTCTCAT --/AA CACACATTTA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 0 2 318147 CASAVA_Build 22 17247155 1D TGGGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 11 10 318148 CASAVA_Build 22 17247829 1I AATAATCACA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 3070 ref 48 31 9 8 T 6 7 318149 CASAVA_Build 22 17249312 3D AAAAGTAATA AAC/--- AACATCACAG 1884 het 1884 ref 13 9 4 0 AAC 2 1 318150 CASAVA_Build 22 17255877 1I TTATGTTCTT -/G ACTTGTCCCC 1516 het 1516 ref 47 24 6 17 G 0 1 318151 CASAVA_Build 22 17255907 3D GCTCACAGAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1273 hom 46 11 13 22 T 15 12 318152 CASAVA_Build 22 17256060 2D TCCCAAGTGT TG/-- TCCTCCAACT 3070 het 3070 ref 64 42 16 7 TG 1 0 318153 CASAVA_Build 22 17257187 2I GAGAACAAAG --/TC ACACAATACA 1454 het 1454 ref 52 39 4 9 TC 0 1 318154 CASAVA_Build 22 17258720 1I14M1D GAGGGCACCC -CAAATATATATATAT/ACAAATATAAATATA- AATTATATAT 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 N/A 0 0 318155 CASAVA_Build 22 17265489 1D TTGTGAATAA T/- TTCCCCCATT 3070 het 3070 ref 58 46 9 3 T 3 2 318156 CASAVA_Build 22 17265760 1I CAGTTTTTTG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 55 33 11 11 T 6 7 318157 CASAVA_Build 22 17266724 1I TTTGCTAAGG -/A GAACGGAACA 3070 het 3070 ref 45 28 14 3 A 0 1 318158 CASAVA_Build 22 17266792 1D CAGGAGGGAA T/- TTTTCTCTGA 3070 het 3070 ref 37 14 10 14 T 5 4 318159 CASAVA_Build 22 17268468 1D TTGAGCACCT C/- TCTTAGTGAT 1958 het 1958 ref 25 15 5 16 C 1 0 318160 CASAVA_Build 22 17281864 1D CTCTGTCCTG T/- CTTCACACCA 3070 hom 76 het 28 0 25 4 T 1 0 318161 CASAVA_Build 22 17290285 1D ACGGTGCCCA C/- CCCCTCACAA 2991 hom 5 het 21 1 13 7 C 5 4 318162 CASAVA_Build 22 17290451 1D CTGCAGCTGC A/- AACGCAGGCC 3070 het 1849 hom 16 5 10 1 A 3 2 318163 CASAVA_Build 22 17299198 1D TTTTTCAATG T/- TTTGTTCCCT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 T 4 3 318164 CASAVA_Build 22 17316130 1D GGTATATAAA T/- TTCCCTCATC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 3 2 318165 CASAVA_Build 22 17320199 1D GTGGGAACAG C/- CCCCAGGACC 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 C 5 4 318166 CASAVA_Build 22 17348996 1I TTCCTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2912 hom 29 7 15 7 T 10 11 318167 CASAVA_Build 22 17352871 1D TCTTAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3032 hom 34 12 17 6 A 11 10 318168 CASAVA_Build 22 17354666 1I ATCTCTATTT -/A AAAAAAAAAT 1707 het 1707 ref 21 14 4 3 A 9 10 318169 CASAVA_Build 22 17355140 4I AAAAAATTAA ----/TAAT TAATAAAAAA 1778 het 706 hom 9 2 4 3 TAAT 1 2 318170 CASAVA_Build 22 17355874 9D CGTCTTTACT AAAAAATAC/--------- AAAAAATTAG 1027 het 1027 ref 12 5 4 3 AAAAAATAC 1 0 318171 CASAVA_Build 22 17356027 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 978 het 978 ref 16 8 5 3 A 11 12 318172 CASAVA_Build 22 17357576 65D CCTCCAACCC TGATCACATTTCAACATGAGATTTGGAGGGGCCAGACCTCAAAACTGCATCAGATACATTCATGT/----------------------------------------------------------------- TTAAGCAGTC 3070 het 3070 ref 28 29 10 5 TGATCACATTTCAACATGAGATTTGGAGGGGCCAGACCTCAAAACTGCATCAGATACATTCATGT 1 0 318173 CASAVA_Build 22 17364087 2I TAATAGAGAC --/AT GTGCAGCTGG 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 AT 0 1 318174 CASAVA_Build 22 17372511 2I AATGAGTAAC --/AG AGAAAGAACT 2696 het 2696 ref 18 9 6 3 AG 1 2 318175 CASAVA_Build 22 17379410 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2147 het 603 hom 12 3 7 2 A 17 16 318176 CASAVA_Build 22 17379909 1I TCTTTTTTTT -/G GGGGGGGCAG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 G 7 8 318177 CASAVA_Build 22 17381488 1D CGTCTCCACT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2360 hom 18 7 10 1 A 9 8 318178 CASAVA_Build 22 17382714 1D CCCCAATTTG A/- AAAAAAAAAA 1294 het 1294 ref 27 15 6 6 A 17 16 318179 CASAVA_Build 22 17388613 1I TGCCCGTGTC -/G GTCTCCCAAA 2957 het 2957 ref 24 14 8 2 G 1 2 318180 CASAVA_Build 22 17390197 1D TCTAGAAGAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 8 7 318181 CASAVA_Build 22 17391039 1I CTGGAAATAA -/C AAAGCCGTCA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 C 0 1 318182 CASAVA_Build 22 17395247 1I AATCCCCCCC -/A CCAACACATG 2229 het 2229 ref 22 10 8 4 A 0 1 318183 CASAVA_Build 22 17402379 18D TGCACCGCAA GGCGAGCATGATGCCAGG/------------------ GGCGTGCGTG 2283 het 2283 ref 26 15 8 8 GGCGAGCATGATGCCAGG 1 0 318184 CASAVA_Build 22 17404976 1I GTGCTGCCCC -/T GCTGGTCTGG 3070 het 2429 hom 37 11 14 12 T 0 1 318185 CASAVA_Build 22 17407413 3D TTTGTGGAGA AGG/--- AGGTCTCACA 3070 het 3070 ref 40 17 12 13 AGG 2 1 318186 CASAVA_Build 22 17412510 1D AATTTGTCTG T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 T 8 7 318187 CASAVA_Build 22 17413748 1D TGTGCACATA T/- TTTATATTAT 3070 het 3070 hom 27 8 11 8 T 4 3 318188 CASAVA_Build 22 17425275 4I CAGCTCCTGC ----/CTGT CTAAGCCAGG 2686 het 2686 ref 34 14 9 11 CTGT 0 1 318189 CASAVA_Build 22 17425629 2D TCTTTTGGAG CT/-- CTGTTTATAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 CT 2 1 318190 CASAVA_Build 22 17458538 1I ATAAAAGAAT -/A AAAAAAGATA 3070 hom 38 het 21 0 14 7 A 6 7 318191 CASAVA_Build 22 17459857 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 2715 het 2358 hom 23 9 9 5 A 13 14 318192 CASAVA_Build 22 17460411 3D GAAAAATGAA GAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 3070 ref 38 19 13 8 GAG 5 4 318193 CASAVA_Build 22 17461531 4D AAAAAAAAAT AATA/---- AATAAAATAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 AATA 2 1 318194 CASAVA_Build 22 17463174 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1359 het 1359 ref 24 11 7 6 A 17 16 318195 CASAVA_Build 22 17463251 4I TCAATAAGGC ----/TTTT TTTTTTTAAC 2081 het 2081 ref 21 13 5 3 T 7 11 318196 CASAVA_Build 22 17464138 1D GACTAATGCA G/- GAAAAAGGAA 3070 het 2345 hom 31 8 19 7 G 2 1 318197 CASAVA_Build 22 17468960 4D GTCGCTTCAA AAGT/---- AAATGTGGGG 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 AAGT 1 0 318198 CASAVA_Build 22 17471895 1I8M3D GCCTTGTTTC -AAGGCTGTCTC/AAATTATGT--- AAACTGAGCT 3070 het 3070 ref 45 25 16 5 N/A 0 0 318199 CASAVA_Build 22 17473224 1I CCTGCGTCAG -/C ACAGAGAGCA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 0 1 318200 CASAVA_Build 22 17492361 1D TGCCCTGGGA G/- CCCAGCCAGG 2907 het 2907 ref 30 14 10 7 G 1 0 318201 CASAVA_Build 22 17513374 1D CAACTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1452 hom 14 het 9 0 4 5 A 15 14 318202 CASAVA_Build 22 17524284 1D TTTACTTTTT C/- CTTTTCTTTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 2 1 318203 CASAVA_Build 22 17526309 1I AGTGTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 T 11 12 318204 CASAVA_Build 22 17526820 1D TGGGCCCTGG T/- GATTCTCTTG 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 1 0 318205 CASAVA_Build 22 17538632 1I CACATGCACA -/C GGGCCAGGCA 3070 het 2326 hom 26 8 11 7 C 0 1 318206 CASAVA_Build 22 17543396 34I ATGAAACACA ----------------------------------/GGCACAGGGTTCACAGTAAGCACATGGACAAGTG GGCACAGGGT 3070 hom 82 het 29 0 23 8 GGCACAGGGTTCACAGTAAGCACATGGACAAGTG 0 1 318207 CASAVA_Build 22 17543578 2I CACTGGAATC --/AT GTGAGACAAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 AT 0 1 318208 CASAVA_Build 22 17552460 1I TACTTCCGCA -/G GCCCCTGCTC 3070 hom 80 het 30 0 25 5 G 1 2 318209 CASAVA_Build 22 17554118 1D ATTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1415 het 1415 ref 27 10 6 11 T 11 10 318210 CASAVA_Build 22 17554455 1I TCCTCAAATC -/T TTTTTTTTTT 2223 het 2223 ref 21 8 9 4 T 13 14 318211 CASAVA_Build 22 17562932 1I AGGCTGAAGG -/C CTCACCTGGC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 1 2 318212 CASAVA_Build 22 17563052 4D GACTGTGACA AGTT/---- AGTTACCCAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 8 AGTT 2 1 318213 CASAVA_Build 22 17563158 1I CATACAGAGC -/T TGGAGAGGGG 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 T 1 2 318214 CASAVA_Build 22 17569004 1I CGGTCTCCAA -/C CTACGGATAA 3070 hom 159 het 58 0 51 7 C 1 2 318215 CASAVA_Build 22 17573440 1I CCAACCATTG -/T TTTTTTTTTT 2564 het 1435 hom 24 7 8 9 T 14 15 318216 CASAVA_Build 22 17574104 1D AGTTCATTTT G/- GTTATTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 2 1 318217 CASAVA_Build 22 17576674 1I AGTCAGCTCC -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 44 26 9 9 A 6 7 318218 CASAVA_Build 22 17578602 1I CTTGCAAAAC -/T TTTATACAAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 3 4 318219 CASAVA_Build 22 17579287 1I7M1I AAAAAAAAAA -AAAAAAC-/CAAAAAACA AAAAACAAAA 1379 het 547 hom 11 4 4 4 N/A 0 0 318220 CASAVA_Build 22 17580154 1I15M1I AAAGAGAAAG -AAAAAAGAAAGAAAG-/AAAAAAAGAAAGAAAGA AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 21 12 11 2 N/A 0 0 318221 CASAVA_Build 22 17580635 1D AAAACTCAAC N/- CCTAANCCAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 N 1 0 318222 CASAVA_Build 22 17580815 1D TGGCTAAGAT A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 7 6 318223 CASAVA_Build 22 17581255 1D CTAGTGTGGC G/- GGGTGGTAGC 3070 het 3070 hom 49 21 17 12 G 4 3 318224 CASAVA_Build 22 17584114 1I AGACACCGCA -/G GGGCTTCCAG 3070 hom 107 het 38 0 30 8 G 3 4 318225 CASAVA_Build 22 17588277 14D CCTATTCATG TCTGGATTTTTAGA/-------------- TCTGGATTTT 3070 hom 80 het 32 0 27 7 TCTGGATTTTTAGA 2 1 318226 CASAVA_Build 22 17594072 1I TGGGTCCCAA -/G ATCCCTGGCT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 G 0 1 318227 CASAVA_Build 22 17597307 2I TCTGCAAACC --/CA CAGAGAGGTG 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 CA 1 2 318228 CASAVA_Build 22 17602454 1I GTCACACAGA -/T TAAGTGTGAT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 1 2 318229 CASAVA_Build 22 17609518 1I CAGGCTGGAG -/T TGCAGTGGCG 1541 hom 10 het 7 0 4 3 T 1 2 318230 CASAVA_Build 22 17610085 1I CCAAAGTGTT -/G GGATTACAGG 3070 het 1045 hom 21 5 9 7 G 2 3 318231 CASAVA_Build 22 17618079 1I TTTTTTTAAC -/T TTTTTTAATT 3070 hom 19 het 27 1 21 5 T 6 7 318232 CASAVA_Build 22 17621229 1I TATAACCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1834 hom 25 8 10 7 T 13 14 318233 CASAVA_Build 22 17636057 1I AGAACTGGGC -/A AAATATTTAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 3 4 318234 CASAVA_Build 22 17637469 1D TAAAGTAAAA T/- TAAAAAAAAA 2713 het 635 hom 22 3 11 8 T 2 1 318235 CASAVA_Build 22 17640878 1D TCTTACACTT C/- CCCCACGGAA 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 C 5 4 318236 CASAVA_Build 22 17643541 4D1M2I ATCAACTCTC CTTGA--/----AAG GAGATTACCA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 N/A 0 0 318237 CASAVA_Build 22 17648818 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2615 het 302 hom 14 2 9 4 A 17 16 318238 CASAVA_Build 22 17653967 1I ACATTTTACA -/C TGGGATGCAA 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 C 0 1 318239 CASAVA_Build 22 17663367 9I GAAATTCTAG ---------/AACTGAAAT AACTGAAATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AACTGAAAT 1 2 318240 CASAVA_Build 22 17667413 1I AAAAAAAAAA -/T TAATTAATTA 1207 het 867 hom 7 2 4 1 T 1 2 318241 CASAVA_Build 22 17669702 3I TGTCTCCCAG ---/GCT GGAGTGCAGT 3070 hom 39 het 16 0 14 3 GCT 0 1 318242 CASAVA_Build 22 17671127 10D GTGTATCGGA GTCTCGCTTT/---------- GTTGCCAGGC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 GTCTCGCTTT 1 0 318243 CASAVA_Build 22 17671600 1D AGCCTGTCTA T/- TTTTTTTTTT 2519 het 2519 ref 24 12 7 5 T 11 10 318244 CASAVA_Build 22 17672391 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAACCAA 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 7 6 318245 CASAVA_Build 22 17680857 2D ACTCTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2236 het 113 hom 19 2 8 9 A 18 16 318246 CASAVA_Build 22 17681088 3D CCACCATATT AAC/--- AAGCTAAGTA 3070 het 3070 ref 36 19 16 3 AAC 1 0 318247 CASAVA_Build 22 17682982 1D TCAAAAAAAA T/- AATAATAATA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 1 0 318248 CASAVA_Build 22 17690506 4D AAAGAAAGAA AGAC/---- AGACAGACAG 3070 het 3070 ref 37 16 18 5 AGAC 4 3 318249 CASAVA_Build 22 17691759 1I ATTAGGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1249 hom 40 3 27 10 A 10 11 318250 CASAVA_Build 22 17693524 1I GCAAAGATGT -/G GGAAAAATTG 3070 hom 94 het 35 0 32 3 G 2 3 318251 CASAVA_Build 22 17694217 1D AGTAAAGCCG T/- TTTTTTTTTT 1934 het 1934 ref 40 28 5 8 T 13 12 318252 CASAVA_Build 22 17694870 3I TCCTGAGCCA ---/TCC TCCTCCTGAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TCC 2 3 318253 CASAVA_Build 22 17697708 1I AGAACTAATA -/G GATATATATG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 1 2 318254 CASAVA_Build 22 17705932 1D TAACAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 131 het 48 0 42 6 A 12 11 318255 CASAVA_Build 22 17734892 2D CAATGTACCA TT/-- TTTTTTTTTT 2381 het 87 hom 21 2 7 12 T 16 14 318256 CASAVA_Build 22 17786115 4I AGATCGCGCC ----/ACCA TGTTCCAGCC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 ACCA 0 1 318257 CASAVA_Build 22 17787995 4I CAAAAAAAAA ----/AAAC AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 21 0 14 7 AAAC 0 1 318258 CASAVA_Build 22 17801294 1I TTGATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 T 10 11 318259 CASAVA_Build 22 17805516 1D ACTCCCCATC A/- AAAAAAAAAA 3012 het 3012 ref 30 14 8 8 A 13 12 318260 CASAVA_Build 22 17808944 2D CGGATACATA TT/-- GTTTTGTATT 3070 het 3070 ref 33 21 11 2 T 2 0 318261 CASAVA_Build 22 17814686 2D CCACTCTACA CC/-- CCCTCCTCGC 3070 hom 78 het 29 0 24 5 C 5 3 318262 CASAVA_Build 22 17817762 1I ATTTAAAGCC -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 7 8 318263 CASAVA_Build 22 17839675 3I CAACAAAGAA ---/AAC AACCACAACC 3070 hom 79 het 29 0 22 7 AAC 1 2 318264 CASAVA_Build 22 17845218 1I AACCACAACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 9 10 318265 CASAVA_Build 22 17846211 1D34M1D CCCCAAGAGC GGGGGATGCCCACTACGGATTCTCCCTGGGGAGCGC/-GGGGATGCCCACTACGGATTCTCCCTGGGGAGCG- CCTGATTCTG 3070 hom 69 het 26 0 21 7 N/A 0 0 318266 CASAVA_Build 22 17852460 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2712 hom 28 8 14 6 T 10 11 318267 CASAVA_Build 22 17860950 5D TCTTACTTTG TTTTT/----- TTTTTTTTGT 823 het 193 hom 36 3 7 26 T 13 8 318268 CASAVA_Build 22 17864411 3I TGCTGAGGCC ---/CCT CCTCCCTCTT 3070 het 1811 hom 26 8 12 6 CCT 1 2 318269 CASAVA_Build 22 17865537 1D CCAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 1657 het 1657 ref 21 10 6 5 A 11 10 318270 CASAVA_Build 22 17897670 1D TGCCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 11 10 318271 CASAVA_Build 22 17921016 1D TATTGGTCTG T/- ATTTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 1 0 318272 CASAVA_Build 22 17921193 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 11 10 318273 CASAVA_Build 22 17928764 17I TGGTGTGGGG -----------------/TTAATAACATGTGATCA TATCTTCTTT 3070 het 3070 hom 22 11 10 2 TTAATAACATGTGATCA 0 1 318274 CASAVA_Build 22 17929554 1D TATTTTATAA T/- TTTTTTTTTT 1384 het 1384 ref 34 21 3 10 T 15 14 318275 CASAVA_Build 22 17943987 1D AATCCCAGTT A/- ACTCGGTAGG 3070 hom 51 het 18 0 18 1 A 2 1 318276 CASAVA_Build 22 17949282 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1634 het 1634 ref 16 9 4 4 A 13 12 318277 CASAVA_Build 22 17968111 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3066 hom 21 het 11 0 8 3 A 12 11 318278 CASAVA_Build 22 17968289 9D AAAAAAAAGA AAGAAAAAG/--------- AAAAAAAAAC 428 hom 10 het 15 0 4 13 AAGAAAAAG 1 0 318279 CASAVA_Build 22 17969817 1D GAAAGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 29 1 28 0 T 11 10 318280 CASAVA_Build 22 18012453 1I TGGCGAGGAG -/T TGCCTGGACC 3070 het 3070 hom 64 20 36 8 T 1 2 318281 CASAVA_Build 22 18015004 1D AAGAGAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 13 12 318282 CASAVA_Build 22 18016611 2I ACACAGCTAT --/AC ACACGCACAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AC 2 3 318283 CASAVA_Build 22 18019328 2I ATAAATGCAG --/AA AAAGCATCTA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 A 3 5 318284 CASAVA_Build 22 18019799 1I ATGAAAAAAA -/G TAAAATACTT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 G 0 1 318285 CASAVA_Build 22 18020232 3D TCTCAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 AAG 4 3 318286 CASAVA_Build 22 18021580 4I TTGATCAAAG ----/ACTA ACTAAGTATA 3070 hom 52 het 23 0 18 5 ACTA 1 2 318287 CASAVA_Build 22 18023647 4I CACACAGATT ----/AGAA AGAAGGGAAG 3070 het 3070 hom 61 21 32 8 AGAA 1 2 318288 CASAVA_Build 22 18031940 1I TTCCTTTTGG -/T TTTCAACTGT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 3 4 318289 CASAVA_Build 22 18033786 2I1M3D GCTGCGGTGA --AAGT/TCA--- CACCCGGTCC 2747 het 2747 ref 27 15 7 7 N/A 0 0 318290 CASAVA_Build 22 18057949 1D CTGGCTGACC G/- GCCCCGTGTC 2642 het 2642 ref 26 12 8 7 G 2 1 318291 CASAVA_Build 22 18078793 1I AAAAATAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 14 10 11 T 9 10 318292 CASAVA_Build 22 18117411 1I AGCTGTGTCA -/G GGGGTACTGC 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 G 4 5 318293 CASAVA_Build 22 18123249 1D CGTCCAAATA G/- GGCGCTGTAA 2559 hom 33 het 15 0 10 5 G 3 2 318294 CASAVA_Build 22 18127736 1D AAGACTTTAG T/- TTTTTTTTTT 2377 het 2377 ref 26 12 8 6 T 13 12 318295 CASAVA_Build 22 18149088 4D CCAGTTTGTC TATT/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 18 3 TATT 1 0 318296 CASAVA_Build 22 18149499 16I AAAATATCAC ----------------/TGGATCATATACATGA TGGTTTATTT 3070 het 2362 hom 24 8 16 1 TGGATCATATACATGA 0 1 318297 CASAVA_Build 22 18151094 4D TTAAAAGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 33 13 13 9 AAAC 4 3 318298 CASAVA_Build 22 18152932 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 1263 het 1263 ref 40 25 3 12 A 11 12 318299 CASAVA_Build 22 18153359 2I AGCTGAGACC --/CT GTTTCTTCTT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 CT 0 1 318300 CASAVA_Build 22 18171267 2D GCGGGGAACA CT/-- CTGCATCCCA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 CT 2 1 318301 CASAVA_Build 22 18203919 1D ATCCTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 686 hom 41 5 17 19 A 11 10 318302 CASAVA_Build 22 18208333 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1922 het 1922 ref 22 10 5 7 A 13 12 318303 CASAVA_Build 22 18215143 8I TGGTACCGAA --------/CCATGACC CCATGACCAC 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 CCATGACC 1 2 318304 CASAVA_Build 22 18226320 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 2894 het 2894 ref 19 7 7 5 T 11 12 318305 CASAVA_Build 22 18228311 1I GTCTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3000 hom 36 12 18 6 A 13 14 318306 CASAVA_Build 22 18231721 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2426 het 1300 hom 27 5 8 14 T 15 16 318307 CASAVA_Build 22 18231907 1I TAATAGAGAT -/G GGGTCTTACC 3070 hom 48 het 20 0 16 4 G 3 4 318308 CASAVA_Build 22 18243157 1D CCAGGAGCCT G/- GGGGGGGGTG 1721 het 1721 ref 28 13 7 8 G 9 8 318309 CASAVA_Build 22 18248256 1D GGAAGGCACA G/- GGGGGCCACG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 G 6 5 318310 CASAVA_Build 22 18248926 1D ACATCCCGGC G/- GGCGGCGCAC 3070 het 2381 hom 24 9 9 6 G 3 2 318311 CASAVA_Build 22 18256406 1I ATTTATCTTC -/T TTTTTTTTTT 1260 het 744 hom 16 5 4 7 T 15 16 318312 CASAVA_Build 22 18295638 1D TTTTTTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 24 0 20 6 A 12 11 318313 CASAVA_Build 22 18297341 1I ATGCACACAT -/C AAGAATGATC 3070 hom 129 het 51 0 41 10 C 0 1 318314 CASAVA_Build 22 18310188 1D GTAGGAGCTG C/- CCTGCAGAGC 3070 hom 81 het 30 0 28 3 C 3 2 318315 CASAVA_Build 22 18311425 1D AGGAGCTGGA G/- GGGGGGTCTT 3070 hom 65 het 27 0 21 7 G 7 6 318316 CASAVA_Build 22 18313097 2D AGGCCGGAAG AA/-- AAAGATAATT 3070 hom 62 het 24 0 21 4 A 5 3 318317 CASAVA_Build 22 18344558 1D CCAGGCAGAT G/- GGGGGCTGCC 3070 hom 81 het 31 0 24 7 G 6 5 318318 CASAVA_Build 22 18375515 2D TTGACTACAC AG/-- AGAGACGGAA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 AG 3 2 318319 CASAVA_Build 22 18383491 2I CAAACCGAGC --/AG AGTCTCCCTC 3070 hom 45 het 16 0 14 2 AG 1 2 318320 CASAVA_Build 22 18390819 1D AGTGCCCCCC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 26 0 18 8 T 9 8 318321 CASAVA_Build 22 18393921 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 27 2 17 8 A 15 14 318322 CASAVA_Build 22 18401718 3I GCAAAAACAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 AAC 4 5 318323 CASAVA_Build 22 18406449 1D GGCCACTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 20 1 17 2 T 12 11 318324 CASAVA_Build 22 18406624 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3024 het 2062 hom 21 7 8 6 T 13 12 318325 CASAVA_Build 22 18409680 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 T 10 11 318326 CASAVA_Build 22 18420822 1I GCTGACTCTT -/G GCGGCAGTCA 3070 het 3070 ref 39 16 12 11 G 1 2 318327 CASAVA_Build 22 18425554 1I CATTGCCTTT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 0 1 318328 CASAVA_Build 22 18439850 1I AGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2011 hom 26 6 11 9 T 11 12 318329 CASAVA_Build 22 18450890 2I ATCTAGGATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 GT 7 8 318330 CASAVA_Build 22 18465339 1D ACTTTAATTC T/- TTTTTTTTTT 1478 het 415 hom 13 1 7 5 T 17 16 318331 CASAVA_Build 22 18476169 1I TAAGTGGCGT -/G GGTGTGGGCA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 G 2 3 318332 CASAVA_Build 22 18476315 25I ACCCTGGGCG -------------------------/CGCCTACCTTGCCAGACCCTGGGCA CGCCTGCCTT 3070 hom 94 het 36 0 27 9 CGCCTACCTTGCCAGACCCTGGGCA 0 1 318333 CASAVA_Build 22 18489079 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 T 9 10 318334 CASAVA_Build 22 18492344 1I GTGTTGGGTT -/C CCCTTAGGAA 1667 het 1667 ref 23 10 5 8 C 3 4 318335 CASAVA_Build 22 18495142 14D ATGCACGACT GTGGGCTGGGCAGC/-------------- GTGGGCTCTG 3070 het 3070 ref 29 21 11 1 GTGGGCTGGGCAGC 1 0 318336 CASAVA_Build 22 18540330 10D GAGTCTTTTA AAATTAAATT/---------- AAATTAAATT 2432 het 201 hom 15 2 6 8 AAATT 5 3 318337 CASAVA_Build 22 18544319 1I ACTGGGGTCA -/G GCAGTGCAGG 3070 hom 54 het 21 0 15 6 G 1 2 318338 CASAVA_Build 22 18554562 1D CAGGGGGTGT G/- GGGACCCTCC 1510 het 1510 ref 27 13 5 11 G 4 3 318339 CASAVA_Build 22 18562567 1D TGCAGGCCCT C/- CCCTGGGAGC 1831 het 238 hom 14 2 6 6 C 4 3 318340 CASAVA_Build 22 18562655 1I GGCCTAGGGT -/G GGGGTGGCCC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 G 4 5 318341 CASAVA_Build 22 18565700 3I GTTTCTGCTG ---/TCT TCTTCTCTGA 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 TCT 2 3 318342 CASAVA_Build 22 18577216 1I CAGGGTGAGA -/C AGGGCCCCTG 2425 hom 29 het 12 0 8 4 C 0 1 318343 CASAVA_Build 22 18584303 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2716 het 2716 ref 18 9 7 2 A 13 14 318344 CASAVA_Build 22 18588348 1I GCCAGACCTG -/C TTCTTCAGCC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 C 0 1 318345 CASAVA_Build 22 18593927 21D CAGCAGTGCA GGGAGTGGAGACGTGAAGATG/--------------------- GGGAGTGGAG 3070 hom 51 het 26 0 15 12 GGGAGTGGAGACGTGAAGATG 2 1 318346 CASAVA_Build 22 18595377 4I CCTGGTACTG ----/TGTC TGAGAAGCCA 3070 hom 56 het 22 0 18 4 TGTC 0 1 318347 CASAVA_Build 22 18631544 1I GGTTGTCAAA -/G GCCTCAGTGG 2229 hom 31 het 18 0 10 8 G 1 2 318348 CASAVA_Build 22 18640112 1I GGCACCTGGA -/C CCCTGGTCCG 3070 hom 62 het 24 0 16 8 C 3 4 318349 CASAVA_Build 22 18640559 9D CTCCCAGTGG GGCAGGGAA/--------- GGCAGGGAAG 3070 hom 62 het 27 0 19 9 GGCAGGGAA 2 1 318350 CASAVA_Build 22 18640732 1D CCCCTGGGTT C/- CCCACTCTGG 3070 hom 63 het 29 0 19 10 C 4 3 318351 CASAVA_Build 22 18647024 1I GCAAGGGGGA -/C AGAATCTCCC 3070 hom 63 het 24 0 20 4 C 0 1 318352 CASAVA_Build 22 18655729 1D TCACCCAGAG C/- CCCCCTTGCT 1896 het 1896 ref 14 9 4 1 C 6 5 318353 CASAVA_Build 22 18676197 2D TTATTGTAAC AG/-- GGACTCGCTG 3070 het 3070 ref 41 27 10 6 AG 1 0 318354 CASAVA_Build 22 18697007 1D GGAGAAACTC T/- TGTCTCTACT 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 2 1 318355 CASAVA_Build 22 18697799 4I TCTACTAAAC ----/TATT TATTTTATAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TATT 1 2 318356 CASAVA_Build 22 18700985 1I CCAAGAAATT -/A AGGATTCGTT 3070 het 3070 ref 44 17 15 12 A 1 2 318357 CASAVA_Build 22 18701428 1D CCAGCTTGCC A/- AAGAAGGCAC 1795 het 1795 ref 33 26 4 4 A 3 2 318358 CASAVA_Build 22 18702912 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 het 474 hom 13 1 10 2 A 9 8 318359 CASAVA_Build 22 18703131 1D TGTATTTAAA T/- TTTTTCTTTC 1824 het 1824 ref 20 14 4 2 T 6 5 318360 CASAVA_Build 22 18703567 1D ACTACACTCT A/- AAAATATGAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 A 5 4 318361 CASAVA_Build 22 18707429 1D CTTAGTCAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1766 hom 17 4 10 3 T 10 9 318362 CASAVA_Build 22 18713932 4I TTGAGACTTC ----/TTCT TTAACCCATG 3070 het 1405 hom 17 3 12 2 TTCT 0 1 318363 CASAVA_Build 22 18723449 3D CATCGCTAAT GAG/--- GACACCATAT 2167 het 2167 ref 80 71 5 8 GAG 1 0 318364 CASAVA_Build 22 18736453 5D GGTTTAAAAT AAATA/----- AAACATACTG 1388 het 1388 ref 32 25 3 4 AAATA 1 0 318365 CASAVA_Build 22 18741477 1I CCCACCCACA -/C CCCCACACAC 3070 het 3070 ref 74 38 19 17 C 4 5 318366 CASAVA_Build 22 18754714 2D CTAATTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 244 het 244 ref 27 15 2 10 TG 1 0 318367 CASAVA_Build 22 18765740 4D AGAACTTGAT TGTC/---- TGGCCGCGAA 3070 het 3070 ref 44 25 15 6 TGTC 1 0 318368 CASAVA_Build 22 18766535 1I CAGGTAGCCT -/C GGACACACAT 1524 het 1524 ref 34 23 4 7 C 0 1 318369 CASAVA_Build 22 18862037 1I TCCCCTCAAT -/C CCCCCCCCCA 729 het 729 ref 23 9 4 10 C 9 10 318370 CASAVA_Build 22 18885262 1D AGGTTTTTAC T/- TTATAAACTT 1667 het 1667 ref 23 14 4 5 T 3 2 318371 CASAVA_Build 22 18942110 1I GATTATTCCC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 8 9 318372 CASAVA_Build 22 18956771 1D GCACAGAGCA C/- CCCCAGCTCA 2828 het 2828 ref 43 32 7 4 C 5 4 318373 CASAVA_Build 22 18956983 1I TTATTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 1324 het 1324 ref 25 21 3 1 T 9 10 318374 CASAVA_Build 22 18971721 11I ACACGAAATA -----------/GTCTACAAGTG GCCTTGAACT 3070 het 1865 hom 51 5 41 5 GTCTACAAGTG 0 1 318375 CASAVA_Build 22 18972427 5D AAAGTTAAAT AAAAA/----- AAAAAAAAGG 3070 het 521 hom 18 4 9 5 A 13 8 318376 CASAVA_Build 22 18976989 1D TGGGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 19 9 A 11 10 318377 CASAVA_Build 22 18981833 1I TCCTTGACCT -/C CCCAGTATGA 1219 het 1219 ref 30 25 3 2 C 3 4 318378 CASAVA_Build 22 18989351 2I TGATATATAT --/AA TATATATAAT 954 hom 5 het 4 0 2 2 A 0 2 318379 CASAVA_Build 22 18989439 2I TACTATATAT --/TA TATATCATAC 1461 het 495 hom 5 1 3 1 TA 2 3 318380 CASAVA_Build 22 19062015 1I AAACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 25 1 16 8 A 11 12 318381 CASAVA_Build 22 19062537 1D TTTGGAGGGG T/- AAGGGAGGGC 3070 het 3070 hom 46 17 21 9 T 1 0 318382 CASAVA_Build 22 19067335 1D CAAATTCAAC T/- TTTTTTTTTT 1928 het 26 hom 15 1 7 7 T 15 14 318383 CASAVA_Build 22 19080458 1D TTGGGTTTTT G/- TTTTTTTTTT 1805 het 1265 hom 29 7 12 10 G 1 0 318384 CASAVA_Build 22 19081362 6I TTTGTTTTTC ------/TTTCTT TTTCTTTTTC 1747 het 1747 ref 23 16 5 2 TTTCTT 2 3 318385 CASAVA_Build 22 19083105 1D TCAGCGTTGT A/- AATTTCTAAG 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 A 3 2 318386 CASAVA_Build 22 19083201 15D TTCCCTAGTG ATGTATTCTTCAGCC/--------------- ATATGTTATT 3070 het 3070 hom 43 18 24 5 ATGTATTCTTCAGCC 1 0 318387 CASAVA_Build 22 19083671 1D GCACTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 11 10 318388 CASAVA_Build 22 19083862 1I TTACATGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2410 hom 26 9 12 5 T 13 14 318389 CASAVA_Build 22 19086794 2I GCGGATAGAC --/TT TTCTAAAGCT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 2 4 318390 CASAVA_Build 22 19088146 1I GGCTGCCCTC -/T TGAGTCAGGC 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 1 2 318391 CASAVA_Build 22 19093085 10I TTCCTGTGTC ----------/CATGTGTTCT CATTGTTCAA 2644 het 2187 hom 18 10 6 2 CATGTGTTCT 0 1 318392 CASAVA_Build 22 19093398 1D CTAAATTTTT G/- GGGGGGGCAG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 G 8 7 318393 CASAVA_Build 22 19095034 2I ATAAGCACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 9 hom 38 1 32 5 AC 7 8 318394 CASAVA_Build 22 19102048 1I CGCCGAAGTT -/C CCCCCAGGCT 2510 het 2510 ref 25 14 8 3 C 5 6 318395 CASAVA_Build 22 19106974 3D TCTGCTTGTA ACC/--- ACCAGGCTGG 3070 hom 82 het 29 0 24 6 ACC 2 1 318396 CASAVA_Build 22 19124805 2I TCTTCAGGTT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 21 11 10 AC 5 6 318397 CASAVA_Build 22 19127641 1I ACAAGAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 33 1 26 6 A 11 12 318398 CASAVA_Build 22 19154066 1I ACTTGAGTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 109 het 40 0 36 4 T 9 10 318399 CASAVA_Build 22 19167035 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 439 hom 22 1 16 5 T 9 10 318400 CASAVA_Build 22 19186215 2D GTATGCATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 AT 7 6 318401 CASAVA_Build 22 19190795 1I CTATCCCCCC -/G CCCCTCAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 G 0 1 318402 CASAVA_Build 22 19191406 1I TACAGCCATT -/G GTGAGATGTG 3070 hom 126 het 50 0 41 9 G 1 2 318403 CASAVA_Build 22 19199751 1D CTGACGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 30 1 24 5 A 12 11 318404 CASAVA_Build 22 19200289 4I CTCTGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AAAC 2 3 318405 CASAVA_Build 22 19215475 8D CCTAGGAAGC TCAGTTTG/-------- CCAGTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 31 9 TCAGTTTG 1 0 318406 CASAVA_Build 22 19252561 3I GTCAGTGCTT ---/GTG GTGATAGCTG 3070 hom 109 het 40 0 36 4 GTG 1 2 318407 CASAVA_Build 22 19273592 1I AGGAACAATA -/G GGGGCCAGGG 1508 het 1508 ref 20 7 9 4 G 4 5 318408 CASAVA_Build 22 19282803 5D CTAGGCTGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 1332 hom 21 4 8 11 TTTTG 4 3 318409 CASAVA_Build 22 19282970 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTTTTTTT 2380 het 57 hom 16 1 9 6 C 1 0 318410 CASAVA_Build 22 19283520 3D TGGTGACTGA CCC/--- TCGGCTTGAC 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 C 3 0 318411 CASAVA_Build 22 19286663 2D CGTGGTGGTT TC/-- TGTCAGTGAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 TC 1 0 318412 CASAVA_Build 22 19287910 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3009 het 103 hom 9 1 8 0 A 14 15 318413 CASAVA_Build 22 19289350 1D TGCTGGCGGT A/- GGGGGATGAC 3070 hom 56 het 27 0 18 11 A 1 0 318414 CASAVA_Build 22 19290568 1I CAGGACCTGT -/G GGGGGAGGTG 3070 hom 46 het 23 0 12 11 G 5 6 318415 CASAVA_Build 22 19293076 1D CTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2859 hom 20 het 23 0 11 12 T 17 16 318416 CASAVA_Build 22 19300322 12D CACGAGAGAC GGACACCAAGAG/------------ ACCGCAACAA 3070 het 3070 ref 35 20 14 5 GGACACCAAGAG 1 0 318417 CASAVA_Build 22 19303452 1D GTCTATGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 13 12 318418 CASAVA_Build 22 19305598 3D GGACAGTGAG GGT/--- GGTGGCAGGC 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 GGT 2 1 318419 CASAVA_Build 22 19305867 4D AAGCATATGT AATA/---- CTCGAACGGA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 AATA 1 0 318420 CASAVA_Build 22 19309306 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2082 het 1566 hom 22 5 9 9 A 14 13 318421 CASAVA_Build 22 19309348 2D CAACAACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 AC 9 8 318422 CASAVA_Build 22 19312464 1D CATCTCTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2243 hom 19 7 10 2 A 11 10 318423 CASAVA_Build 22 19316700 1I AGGAAGGTGC -/G GGGCTGGCTG 2437 het 2437 ref 22 10 9 3 G 3 4 318424 CASAVA_Build 22 19324648 1D5M4D TCCAATCACC TCAAACGTGA/-CAGAC---- TAGATCAATA 3070 het 3070 hom 29 14 15 4 N/A 0 0 318425 CASAVA_Build 22 19327220 1D ACTCTACCCA T/- TTATAGGACC 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 T 3 2 318426 CASAVA_Build 22 19333346 17I CCCTGCAAAG -----------------/GAAGTGATCAGCTTAGA GAACATTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 6 GAAGTGATCAGCTTAGA 0 1 318427 CASAVA_Build 22 19342124 3I GGTTGGGAAA ---/ACG ACGACGGAAA 1706 het 564 hom 14 3 6 5 ACG 2 3 318428 CASAVA_Build 22 19343801 1D TCTCTCCCCG C/- CCCCCCCCCT 3070 het 759 hom 29 6 8 15 C 10 9 318429 CASAVA_Build 22 19343959 1D TTTAGGCTGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 9 8 318430 CASAVA_Build 22 19345870 2I CTTTTTTTGT --/TC TTTCTCCTTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TC 0 1 318431 CASAVA_Build 22 19346613 3I ACAACTATAG ---/TAT TATTCTAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 TAT 1 2 318432 CASAVA_Build 22 19347042 1D CTTGGCATAG T/- TTTTTTTTTT 2388 het 2206 hom 30 8 8 14 T 15 14 318433 CASAVA_Build 22 19348913 1D GGCACCGGCC A/- TGGAATCAAG 3070 hom 77 het 31 0 24 7 A 1 0 318434 CASAVA_Build 22 19350283 5D GTGCATAATC TATTT/----- TATATGTTTC 3070 het 3070 hom 30 14 14 6 TATTT 1 0 318435 CASAVA_Build 22 19351873 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2420 het 1456 hom 18 7 9 3 T 12 11 318436 CASAVA_Build 22 19392924 2D CCTCCTAGTC TG/-- TGAATGTGGT 2908 het 2908 ref 21 10 7 4 TG 2 1 318437 CASAVA_Build 22 19410722 1I GGCACAAGCT -/G GGTGTGGAAC 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 G 2 3 318438 CASAVA_Build 22 19414568 4D ATTTATTTAC TTAT/---- TTATTTTTGA 3070 het 3070 ref 25 10 12 4 TTAT 2 1 318439 CASAVA_Build 22 19423912 10D AAAAAGAAAC TGACCCAAGA/---------- TGACTCAAAT 3070 het 3070 ref 27 18 12 0 TGACCCAAGA 1 0 318440 CASAVA_Build 22 19424746 1D CCTAGGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 12 11 318441 CASAVA_Build 22 19428735 1D ACAAGTAACT G/- GTCATTAACA 3070 het 3070 hom 52 22 22 9 G 2 1 318442 CASAVA_Build 22 19445365 1I CACACTTGAG -/C CATAGATAGT 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 C 1 2 318443 CASAVA_Build 22 19457588 1I GGCAGGAGAA -/T CGCTTGAACT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 0 1 318444 CASAVA_Build 22 19467271 5D TGAACAAGTT ACTTC/----- ACTTCTTTGT 3070 het 3070 ref 54 31 20 7 ACTTC 2 1 318445 CASAVA_Build 22 19482083 1I GGAGAGAATC -/T CAGAGGAAGG 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 0 1 318446 CASAVA_Build 22 19497606 3I AATTTTACTG ---/ACA ACATATCCAT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 ACA 1 2 318447 CASAVA_Build 22 19498468 1I CCAAAATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 A 9 10 318448 CASAVA_Build 22 19506675 2D TCTTCTTTCG CA/-- CCTGCTTCTC 3070 het 3070 ref 45 24 19 3 CA 1 0 318449 CASAVA_Build 22 19507581 2D TTATTCATAG AA/-- AAAAGCCCTT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 A 6 4 318450 CASAVA_Build 22 19511187 2D TTTAACGGGG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 T 10 8 318451 CASAVA_Build 22 19514641 4I CCCGTGTTGG ----/ATAC ATATAGTCAA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 ATAC 0 1 318452 CASAVA_Build 22 19521347 1I TGGTAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 10 11 318453 CASAVA_Build 22 19523496 2D CACAACAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 32 9 21 3 CT 2 1 318454 CASAVA_Build 22 19524120 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 11 10 318455 CASAVA_Build 22 19527724 8D AGCAGGTTAA GGCTGCAG/-------- TGAGCTGTGA 3070 het 3070 ref 40 25 14 2 GGCTGCAG 1 0 318456 CASAVA_Build 22 19535478 2I TGAGACCCTA --/TC TCTATTTTTT 2241 het 2241 ref 29 17 5 7 TC 1 2 318457 CASAVA_Build 22 19535625 3I TGGGTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 TTG 5 6 318458 CASAVA_Build 22 19539025 20D AAATAGAAGC AAAGAGAAGGGGAAGAGGGA/-------------------- AGAGAGAAGG 3070 het 3070 hom 28 14 16 3 AAAGAGAAGGGGAAGAGGGA 1 0 318459 CASAVA_Build 22 19547603 3I AACTTAGGTG ---/CCT CCTGGTTACC 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 CCT 1 2 318460 CASAVA_Build 22 19552904 1I GAATATATCT -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 6 7 318461 CASAVA_Build 22 19556698 1D TGGCTAATTC T/- TTTTTTTTGA 1402 het 1172 hom 10 3 4 3 T 9 8 318462 CASAVA_Build 22 19581815 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2555 het 2555 ref 17 8 6 3 A 10 11 318463 CASAVA_Build 22 19591187 3D ACTGGGCTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 32 16 13 6 TTG 4 3 318464 CASAVA_Build 22 19599694 1D GTATCAGAAT A/- AAAAAAAAAA 2393 het 960 hom 28 4 12 12 A 15 14 318465 CASAVA_Build 22 19602719 1D AGAGGATGCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 30 0 25 5 T 12 11 318466 CASAVA_Build 22 19605804 18I AGATCAATAT ------------------/ACAGGAGGGACCTGTATA ACAGGAGGGA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 ACAGGAGGGACCTGTATA 0 1 318467 CASAVA_Build 22 19608845 1D TGATTCAGAG A/- AAAATACAAG 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 A 5 4 318468 CASAVA_Build 22 19623696 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1319 hom 12 het 5 0 5 0 T 11 10 318469 CASAVA_Build 22 19623975 2D GTGTGGACTT AA/-- AAGTGCATGG 3070 het 3070 ref 31 20 7 6 A 4 2 318470 CASAVA_Build 22 19628118 1I CCCACGTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 A 9 10 318471 CASAVA_Build 22 19629226 2D CATGATCTTG GC/-- GCCTCCCAAA 3070 het 2696 hom 19 8 9 2 GC 2 1 318472 CASAVA_Build 22 19631022 1I AAAAAAAAAA -/C AACAGATTGA 3070 het 3069 hom 40 13 19 8 C 0 1 318473 CASAVA_Build 22 19631452 1D TAGCTCCTTG A/- ATCCTGTGCT 3070 het 3070 ref 54 33 18 4 A 2 1 318474 CASAVA_Build 22 19634617 1I AAAATCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 11 318475 CASAVA_Build 22 19639857 1D GAGAAGTCTG T/- CTTGAAATAT 3070 het 3070 ref 21 11 10 0 T 1 0 318476 CASAVA_Build 22 19646357 1D TGGGCTCCAG A/- GGGGCGACAG 3070 hom 51 het 20 0 16 5 A 1 0 318477 CASAVA_Build 22 19647162 11I CTGACAGTAG -----------/AGGGTACATGA AGGGTACATG 3070 het 3070 ref 42 15 10 17 AGGGTACATGA 0 1 318478 CASAVA_Build 22 19654275 1D TTCCTGGGTT C/- CCCTCTGTGC 3070 hom 126 het 47 0 39 9 C 4 3 318479 CASAVA_Build 22 19661505 1I TCTGTCAAAT -/G GGGAACCCCC 3003 hom 68 het 28 0 19 9 G 3 4 318480 CASAVA_Build 22 19662395 2I TCCTGGACAC --/TG TGTTAGGCAT 3070 hom 93 het 34 0 28 6 TG 1 2 318481 CASAVA_Build 22 19662580 1I AACCTGTGCA -/G TTACCCTGGG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 G 0 1 318482 CASAVA_Build 22 19668905 3I AGTAAGGAGG ---/GGC GGGGGGGGGC 1646 hom 24 het 10 0 8 2 GGC 0 1 318483 CASAVA_Build 22 19670822 4D ATGACAGATC GATA/---- GATAGATGAT 3070 het 3070 hom 53 21 26 8 GATA 2 1 318484 CASAVA_Build 22 19683089 9I AGCCATGTGG ---------/GCCAGGTGC GCCAGGTGCA 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 GCCAGGTGC 1 2 318485 CASAVA_Build 22 19687625 3D AATATCCTTT GAC/--- GACTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 GAC 2 1 318486 CASAVA_Build 22 19687910 2I TCTGTCTCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 26 0 19 7 A 13 15 318487 CASAVA_Build 22 19688920 4D GCCACCATGC CTGA/---- CTAATTTTTG 1887 het 1887 ref 11 6 5 2 CTGA 1 0 318488 CASAVA_Build 22 19691708 3D GAAAAAGAGA GAT/--- GATCTGTGTC 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 GAT 2 1 318489 CASAVA_Build 22 19703069 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2980 hom 27 het 12 0 10 2 T 15 14 318490 CASAVA_Build 22 19708426 4D TATATTTTGG TAGA/---- TAGAGATGGG 2438 het 2438 ref 16 8 6 3 TAGA 2 1 318491 CASAVA_Build 22 19747838 1D TCAAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 13 12 318492 CASAVA_Build 22 19759578 1I GGCTACCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 19 0 16 3 A 11 12 318493 CASAVA_Build 22 19760690 1I TTGCAATCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 10 318494 CASAVA_Build 22 19761217 3I GACCCTCACC ---/ACA ACAAGCATTG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 ACA 1 2 318495 CASAVA_Build 22 19783501 1D GTGTGTGCCA C/- CACACCCAGC 3070 het 541 hom 14 2 10 2 C 2 1 318496 CASAVA_Build 22 19787913 1D TCTAGTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 16 15 318497 CASAVA_Build 22 19789751 1D ATTCCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 17 12 T 13 12 318498 CASAVA_Build 22 19791531 2D TGATGTTCCC CT/-- CTCTGTGTCC 3070 het 3070 hom 40 13 18 11 CT 3 2 318499 CASAVA_Build 22 19798739 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAATC 2297 het 1483 hom 13 4 5 4 A 8 9 318500 CASAVA_Build 22 19799149 1I CCACCATTGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 11 26 5 A 8 9 318501 CASAVA_Build 22 19813629 1I CTCAAAAAAA -/G AAAAAGAGAG 3070 het 2027 hom 43 11 13 19 G 0 1 318502 CASAVA_Build 22 19815874 6I AGGAAAACAA ------/AAAGTT AAAGAGGAAA 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 AAAGTT 0 1 318503 CASAVA_Build 22 19834363 2D TATTTGTAGT AG/-- AGAGACGGGG 2339 het 2338 ref 14 7 5 2 AG 3 2 318504 CASAVA_Build 22 19860673 4D AAAAAAAAAA AAAT/---- CAAGGAAGAT 1636 het 1636 ref 54 21 6 27 AAAT 1 0 318505 CASAVA_Build 22 19866814 1I ATGAGGGAAC -/T CTGTCACTAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 0 1 318506 CASAVA_Build 22 19881145 1I CACGCAGGGA -/T TTTTTTTTTC 1674 het 1674 ref 15 10 4 1 T 9 10 318507 CASAVA_Build 22 19886406 2D AGGAGGGGCT GG/-- GGGGGGGTGG 3070 het 32 hom 21 1 13 7 G 9 7 318508 CASAVA_Build 22 19887348 2D CACATACCCA CC/-- CCCCCATACT 3070 het 3070 ref 40 17 10 14 C 7 5 318509 CASAVA_Build 22 19901598 1I GGGCTCCCTT -/C CCTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 79 46 22 12 C 2 3 318510 CASAVA_Build 22 19905319 1I CGCCATACCT -/A GCTAATTTTT 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 A 0 1 318511 CASAVA_Build 22 19913596 2D AATTAAAACA CT/-- CTGTGGTAAA 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 CT 2 1 318512 CASAVA_Build 22 19915929 1D GGGGAGCTTT A/- AAAAAAATAA 1622 het 1622 ref 33 25 4 4 A 8 7 318513 CASAVA_Build 22 19915988 1I TTAATTAGGG -/T TTTTTTTTGA 2007 het 2007 ref 26 8 6 12 T 8 9 318514 CASAVA_Build 22 19918424 1D ACAGGCATGA G/- CCACTGAACC 3070 het 3070 hom 25 8 15 2 G 1 0 318515 CASAVA_Build 22 19921940 3I GCTGTGAGGG ---/GGC GGCCCAAGGC 2048 het 2048 ref 42 26 6 10 GGC 1 2 318516 CASAVA_Build 22 19930526 7I CCTTAGAACC -------/AAAAATA AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 9 17 AAAAATA 1 2 318517 CASAVA_Build 22 19933359 1D AACAGAGCTC A/- AAAAATATTA 3070 het 3070 hom 71 10 48 13 A 6 5 318518 CASAVA_Build 22 19935655 1D GAGTTGGGTA C/- CATTCCATCC 3070 het 3070 ref 39 26 9 4 C 2 1 318519 CASAVA_Build 22 19938606 1I AATTATCAAA -/T TTTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 37 12 24 1 T 3 4 318520 CASAVA_Build 22 19940560 4I GGCTTTGACA ----/CGCG CGCGGCAGAT 2710 het 2710 ref 68 55 7 6 CG 2 4 318521 CASAVA_Build 22 19963227 6I TATTTTTCCT ------/CTTTAA CTTTTTGTTT 3070 het 457 hom 10 1 8 1 CTTTAA 0 1 318522 CASAVA_Build 22 19973633 1D CCTCTGCCTG C/- CCCAAGCCCC 2283 het 2283 ref 69 48 5 17 C 4 3 318523 CASAVA_Build 22 19974638 2D TCAAGATACA AC/-- AGTGAGGGAA 1112 het 1112 ref 18 11 3 4 AC 1 0 318524 CASAVA_Build 22 19979095 1D GCGGCCAGAA C/- CCCTGCGAAT 3070 het 3070 ref 57 45 11 2 C 4 3 318525 CASAVA_Build 22 20008416 5D TTACTACAAA TATAT/----- TAAAGTAAAT 1686 het 1686 ref 11 7 4 2 TATAT 1 0 318526 CASAVA_Build 22 20012805 5I ATATCATATA -----/CTAAG TTAAGTTTGG 3070 het 2225 hom 16 6 10 0 CTAAG 0 1 318527 CASAVA_Build 22 20013284 2D GTGTTATTAT CA/-- AAGAATCAAA 3070 het 3070 ref 58 45 9 4 CA 1 0 318528 CASAVA_Build 22 20013350 4I TGAACTTGTT ----/AAAG AAAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 8 15 AAAG 1 2 318529 CASAVA_Build 22 20134518 1D CCAGGATTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 19 0 11 8 A 10 9 318530 CASAVA_Build 22 20136792 2I ATAGATTTAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AT 6 7 318531 CASAVA_Build 22 20159278 2D CTTGACATAA AT/-- AGAGGCCCCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AT 1 0 318532 CASAVA_Build 22 20159514 4D AGAGCTTGAT TGTC/---- TGGCCGCGAA 2363 het 706 hom 11 2 7 2 TGTC 1 0 318533 CASAVA_Build 22 20330621 1D CCCTGGGCAT C/- CCCCTGTCCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 C 5 4 318534 CASAVA_Build 22 20348815 2D ACTCCATGTC AA/-- AAAAAAAAAG 1978 het 389 hom 10 1 7 2 A 11 9 318535 CASAVA_Build 22 20351260 11I AGAATTTCGA -----------/CCCCAGAACTG CCCCAGAACT 3070 hom 79 het 34 0 24 10 CCCCAGAACTG 1 2 318536 CASAVA_Build 22 20373914 1I GTCACGCTTA -/G TCACCAAAAG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 0 1 318537 CASAVA_Build 22 20375410 1I TTTTTTGTAC -/T TTTAGTAGAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 3 4 318538 CASAVA_Build 22 20376354 5D TCTTCCATCG TTTTC/----- TTTTCAGCCT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TTTTC 2 1 318539 CASAVA_Build 22 20386311 13D GACCCTGTCT CAAAAAACAACAA/------------- CAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 40 23 13 6 CAAAAAACAACAA 1 0 318540 CASAVA_Build 22 20399102 2D GGCAGCAGCA TC/-- TCATTGTGGC 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 TC 2 1 318541 CASAVA_Build 22 20402253 1I GTCTCTACGC -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 A 7 8 318542 CASAVA_Build 22 20403244 12I CTTGTGCCAA ------------/TTTTAAGTCATC TCCTGAAATT 3070 het 2730 hom 25 6 17 3 TTTTAAGTCATC 0 1 318543 CASAVA_Build 22 20405715 10D CCTTTTTTTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTGAGA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 16 6 318544 CASAVA_Build 22 20406750 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATAG 1943 het 1943 ref 16 8 5 3 A 7 8 318545 CASAVA_Build 22 20408862 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2536 hom 33 het 17 0 9 8 T 15 14 318546 CASAVA_Build 22 20410125 1D CTACCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 697 hom 30 3 15 12 A 15 14 318547 CASAVA_Build 22 20415621 1D ACCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 1988 het 1568 hom 21 9 7 5 A 12 11 318548 CASAVA_Build 22 20415823 2D GGCAAGAGAA GG/-- GGGGAAAAAA 1350 het 1350 ref 40 8 12 20 G 6 4 318549 CASAVA_Build 22 20423017 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1306 hom 23 4 13 6 A 15 16 318550 CASAVA_Build 22 20424555 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 961 het 961 ref 39 28 3 8 A 12 11 318551 CASAVA_Build 22 20439251 1I TCCTTATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 10 11 318552 CASAVA_Build 22 20456553 10D CAAGGCACTA GGACTGTCTT/---------- GGGGAGAACA 3070 het 3070 ref 48 33 9 10 GGACTGTCTT 1 0 318553 CASAVA_Build 22 20460540 2D CCTCGTGAAA CT/-- CTGACCCTGA 3070 het 3070 ref 37 17 17 4 CT 2 1 318554 CASAVA_Build 22 20472389 1D CACTGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2673 hom 31 12 16 5 A 11 10 318555 CASAVA_Build 22 20481262 3I TCCCTGGAGG ---/TTA GTAATAGAGA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 TTA 0 1 318556 CASAVA_Build 22 20483012 1I ATCTCAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 1611 hom 19 8 9 2 G 0 1 318557 CASAVA_Build 22 20494664 13I AAAGATGGTT -------------/CATTAAAAAGAAA CATTAAAAAA 3070 het 1218 hom 21 6 12 3 CATTAAAAAGAAA 0 1 318558 CASAVA_Build 22 20494727 22D GGGAGGCCAA GGCAGGCGGATCATGAGGTCAC/---------------------- GGCAGGCGGA 1753 het 1753 ref 16 9 6 2 GGCAGGCGGATCATGAGGTCAC 2 1 318559 CASAVA_Build 22 20501594 1I GAAAAGTGTA -/G GTCTGTACCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 1 2 318560 CASAVA_Build 22 20510965 3D GGGCATGGTG GCA/--- GGCGCCTGTG 3070 het 967 hom 14 4 10 3 GCA 1 0 318561 CASAVA_Build 22 20515164 1I TACATCCCCT -/A AAGATGTCTA 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 A 2 3 318562 CASAVA_Build 22 20523668 4I AACAAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 1473 het 1473 ref 16 9 4 3 AAAC 2 3 318563 CASAVA_Build 22 20532420 1I TATGACCTTA -/C CCCCCAACCC 1505 het 1505 ref 17 9 5 3 C 5 6 318564 CASAVA_Build 22 20537621 1D ACTCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 2810 het 381 hom 19 3 8 9 A 17 16 318565 CASAVA_Build 22 20553009 1D GAGAGATACA T/- TTGCGTTCAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 3 2 318566 CASAVA_Build 22 20556712 4D GTGCTGAGAC TGTT/---- TGAATCTTGG 3070 het 3070 ref 46 21 22 6 TGTT 1 0 318567 CASAVA_Build 22 20560881 1I CTAATCAGAA -/T CACAGACATT 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 0 1 318568 CASAVA_Build 22 20563308 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 1032 het 1032 ref 33 18 3 12 T 15 14 318569 CASAVA_Build 22 20572035 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 9 6 A 12 11 318570 CASAVA_Build 22 20572915 2D AGGTGGGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1580 het 1580 ref 25 10 6 10 T 18 16 318571 CASAVA_Build 22 20595585 6I AGAGAGAGAA ------/AGAGAC AGAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 AGAGAC 0 1 318572 CASAVA_Build 22 20598946 1I CCATCTCGAA -/C AAAACAAACA 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 C 0 1 318573 CASAVA_Build 22 20607315 1I GACGGGCTGC -/G GGGGGGTGTC 882 het 882 ref 17 10 3 4 G 6 7 318574 CASAVA_Build 22 20613232 1I CCTCATCCTG -/C CCAGGTCCTT 3070 het 2598 hom 34 9 18 7 C 2 3 318575 CASAVA_Build 22 20632707 1I ACCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 1605 het 1547 hom 21 6 6 9 A 9 10 318576 CASAVA_Build 22 20634761 1D TTGTAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 1259 het 1259 ref 32 23 4 6 T 13 12 318577 CASAVA_Build 22 20639171 2D ACCTGAGCCT CA/-- GTTTCTTGAT 3070 het 3070 ref 49 26 13 11 CA 1 0 318578 CASAVA_Build 22 20655665 2I GCGACCCATA --/GG GAACAACAGT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 G 1 3 318579 CASAVA_Build 22 20656327 1D CCTCCACCTG C/- CACACAGCAC 3070 het 3070 hom 43 21 19 4 C 2 1 318580 CASAVA_Build 22 20664220 25D GGCTGAGGCA GGAGAATGGTGTGAACCCGGGAAGC/------------------------- GGAGAATGGT 1897 hom 12 het 5 0 4 1 GGAGAATGGTGTGAACCCGGGAAGC 2 1 318581 CASAVA_Build 22 20719298 1D CACCTGCACC T/- TTTCCCAGTG 3070 hom 140 het 50 0 45 6 T 4 3 318582 CASAVA_Build 22 20726640 1D AAATTTAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 10 9 318583 CASAVA_Build 22 20739610 1I CTGATGGGTC -/T TGACTCTTTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 1 2 318584 CASAVA_Build 22 20740263 3D CTGAAGAGGG TTT/--- TTTTTTTTTG 143 het 143 ref 17 9 2 6 T 12 9 318585 CASAVA_Build 22 20742453 1I AAACTTGCCA -/C CCCCCCCAAA 3070 hom 85 het 35 0 28 7 C 7 8 318586 CASAVA_Build 22 20746210 1D AGGCCAGGCC T/- TCTAGGGAGT 3070 hom 99 het 39 0 32 11 T 2 1 318587 CASAVA_Build 22 20750238 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2513 het 2513 ref 31 11 11 9 T 13 14 318588 CASAVA_Build 22 20752633 1D ATGGCTTTAG T/- TCCCCCCACT 3070 het 3070 hom 48 21 26 1 T 2 1 318589 CASAVA_Build 22 20760051 1D AGGCTTACTA T/- TACTGTATGA 3070 het 3070 ref 28 13 13 3 T 2 1 318590 CASAVA_Build 22 20761689 1I ATTTATGGGG -/T TTATGAGATG 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 T 2 3 318591 CASAVA_Build 22 20763086 1I AGGCTTTGCA -/C CCTCTGCAGA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 C 2 3 318592 CASAVA_Build 22 20797299 1D ATACACATGT C/- CCAAACTAGG 3070 hom 160 het 58 0 53 5 C 3 2 318593 CASAVA_Build 22 20814248 1I TTACTCAGGA -/C AATGGACTCC 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 C 0 1 318594 CASAVA_Build 22 20814842 3D ACTTGCCATA TTC/--- TTCTTTATCC 3070 hom 141 het 49 0 48 4 TTC 2 1 318595 CASAVA_Build 22 20815064 1D AGAGTGAAAT A/- AAACATAATG 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 4 3 318596 CASAVA_Build 22 20816225 1I ATGATATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 29 2 13 14 T 10 11 318597 CASAVA_Build 22 20818195 1I CTCCGGGACA -/C CCCCACTAAG 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 C 4 5 318598 CASAVA_Build 22 20820559 4D GAGAAACAAG CTAT/---- CTGTCGAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 CTAT 1 0 318599 CASAVA_Build 22 20820692 1D GAGTTCTTAC A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 8 7 318600 CASAVA_Build 22 20821864 6I GAGCCCTTAT ------/AGGAGC TGGAGCATAT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 AGGAGC 0 1 318601 CASAVA_Build 22 20822660 1D AACAGCTTCC A/- AAACACTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 A 4 3 318602 CASAVA_Build 22 20824021 1I TTTGAAACAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 9 10 318603 CASAVA_Build 22 20825323 11I ATTCATCTTT -----------/AGTTAATTTTA AGTTAATTTT 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 AGTTAATTTTA 1 2 318604 CASAVA_Build 22 20825812 2I ACTGTTAGAC --/TG TGGGCAGGTC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 TG 1 2 318605 CASAVA_Build 22 20826459 5I TCCAATTAAT -----/AAATG GGTTAGAGAC 3070 het 3070 ref 45 19 19 8 AAATG 0 1 318606 CASAVA_Build 22 20826538 1I CCTCGTTAAT -/C AGAGAAATGC 3070 het 3070 ref 63 33 20 10 C 0 1 318607 CASAVA_Build 22 20826693 1D ATAACAAAAT G/- ATCACCATAC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 G 1 0 318608 CASAVA_Build 22 20827137 1D CTAAATTGAT A/- AGAGATCTGT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 2 1 318609 CASAVA_Build 22 20831450 10D CAGAAGTTCA CATACCTAAT/---------- CAAAGGACCT 3070 het 3070 ref 46 31 14 3 CATACCTAAT 1 0 318610 CASAVA_Build 22 20831552 6I41M8D TCCCCTTCTA ------AAATAGAAGGCAAAAGATCATCAGTCATTTGAGCAAAATTTCAGCATGA/AAATATAAATAGAAGGCAAAAGATCATCAGTCATTTGAGCAAAATTT-------- CAGCATGAGT 3070 hom 138 het 33 0 47 4 N/A 0 0 318611 CASAVA_Build 22 20835033 5I CCTGGAATAT -----/GAAAA GAAAACAGGA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 GAAAA 1 2 318612 CASAVA_Build 22 20835144 5D AGAAAAACAG AAGAA/----- AAGAAGAAGG 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 AAGAA 2 1 318613 CASAVA_Build 22 20838010 9D ATCTAGGATT CATAGAAAA/--------- CATTTGCAAA 3070 het 3070 ref 22 16 8 1 CATAGAAAA 1 0 318614 CASAVA_Build 22 20838940 4I GCTGAGAACA ----/GTCT TAGAGGCCCC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 GTCT 0 1 318615 CASAVA_Build 22 20839358 1I GAAGGGGCCA -/G GGAGGAGCTC 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 G 2 3 318616 CASAVA_Build 22 20841913 2I AGGACATTGA --/TG TGTGTAACAC 3070 het 3070 hom 46 15 23 8 TG 2 3 318617 CASAVA_Build 22 20841995 1D CTGACCCCTC A/- AGGGGCCCAG 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 A 2 1 318618 CASAVA_Build 22 20844542 1D CAATATCATG A/- AAATGGCCAT 3070 het 758 hom 22 2 17 3 A 4 3 318619 CASAVA_Build 22 20846145 3D AATAATAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1076 hom 15 4 10 1 A 13 10 318620 CASAVA_Build 22 20851131 3D CCCTCCTAGT CAA/--- CAACACCCTG 3070 hom 138 het 50 0 47 5 CAA 2 1 318621 CASAVA_Build 22 20854469 4D TCTCCATGGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 26 2 18 7 A 19 15 318622 CASAVA_Build 22 20854929 1D AATGTTCTAA G/- GGAGACTCTG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 G 3 2 318623 CASAVA_Build 22 20863247 6D AGCAGCCCCT CCTCTG/------ CTGGGGGTTG 3070 hom 97 het 35 0 29 11 CCTCTG 1 0 318624 CASAVA_Build 22 20867665 31D GCATGTCGAT ACATTGTCACCACATGGGAACTGCAAGGACA/------------------------------- TTTTTCCCTG 3070 hom 30 het 11 0 11 2 ACATTGTCACCACATGGGAACTGCAAGGACA 1 0 318625 CASAVA_Build 22 20868104 1D TTTTTTCTCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 262 hom 28 1 19 8 A 10 9 318626 CASAVA_Build 22 20870350 1I CCTATTTTTT -/G TTGGACATTT 3070 hom 147 het 55 0 49 6 G 0 1 318627 CASAVA_Build 22 20871381 1D ATTCTTGGGT A/- AAGTATCAGC 3070 hom 93 het 32 0 32 1 A 3 2 318628 CASAVA_Build 22 20872133 1I GCAGTAATGG -/T TTTTTTGTAA 3070 hom 104 het 40 0 35 5 T 6 7 318629 CASAVA_Build 22 20874807 4D TCAACAAGAC AGAA/---- AGTTAACAAG 3070 hom 45 het 21 0 15 7 AGAA 1 0 318630 CASAVA_Build 22 20887807 1D GCGAAGCTGC A/- GGTGAAGACG 3070 het 3070 hom 27 12 11 5 A 1 0 318631 CASAVA_Build 22 20888416 1I ACTCAAAAGC -/A AAAGGCAACG 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 3 4 318632 CASAVA_Build 22 20889435 1I TTGTGGGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 21 9 T 10 11 318633 CASAVA_Build 22 20889535 1D TAGATTGATG T/- TTAGAGCAGA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 3 2 318634 CASAVA_Build 22 20892345 1I30M1D CTGGGTCTGT -TCTGAGGGGCCACCCGACTTGGGATCGGAGC/GTCTGAGGGGCCACCCGACTTGGGATCGGAG- CCAGCAGGGG 3070 hom 75 het 29 0 25 15 N/A 0 0 318635 CASAVA_Build 22 20895775 4I TCCTGCCATC ----/CAGG CAGAAGTCCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 CAGG 0 1 318636 CASAVA_Build 22 20897203 1I AATTTAATTC -/A AAAAATATGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 5 6 318637 CASAVA_Build 22 20898669 1I TTAGTGAGAA -/G GGCACTGCTT 3070 hom 90 het 37 0 29 8 G 2 3 318638 CASAVA_Build 22 20902123 1D ATTTTTAAAA T/- TTTTAACTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 3 T 5 4 318639 CASAVA_Build 22 20905263 2D ACCTGAGCCT CA/-- GTTTCTTGAT 1578 het 367 hom 7 1 5 1 CA 1 0 318640 CASAVA_Build 22 20905767 1D CAAGGCTGCA C/- CCCCTGGCTA 75 hom 7 het 9 0 2 7 C 5 4 318641 CASAVA_Build 22 20911116 1D GTCTATCCCT G/- GAGACAGTCC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 G 2 1 318642 CASAVA_Build 22 20926731 1D CCAGGAGTTC G/- GAGGCTGCAG 3070 hom 80 het 28 0 26 3 G 2 1 318643 CASAVA_Build 22 20926800 1D CCTTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 25 3 13 9 A 16 15 318644 CASAVA_Build 22 20928157 1D ATTCTCATTT A/- TTTTTTTGAG 3070 hom 79 het 29 0 24 5 A 1 0 318645 CASAVA_Build 22 20935515 4D CACTGGTTGC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 21 0 14 7 TA 10 8 318646 CASAVA_Build 22 20937581 1I ATAATATCAA -/T TTTATATACT 3070 hom 24 het 15 0 9 6 T 3 4 318647 CASAVA_Build 22 20937730 4D TACATATAAC TTTA/---- TTTATATAAA 1471 hom 7 het 16 0 3 15 TTTA 2 1 318648 CASAVA_Build 22 20937778 1D TAATAAAATA T/- ATTTATATCA 3070 het 3070 hom 35 7 27 1 T 1 0 318649 CASAVA_Build 22 20938679 1D TTTGTGTGGG A/- GGGTTGCTTA 2967 het 2967 ref 43 31 7 5 A 1 0 318650 CASAVA_Build 22 20944149 1I85M3D ATCACTTGAA -CCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGACTGCACTCCAGCATGGGCAATAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAACAAAAAC/CCCGGGAGGCGGAGGTTTCAGTGAGCCGAGATTGCTACTGCACTCCAGCATGGGCAATAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAACAAA--- AAACAAACAA 2516 het 2516 ref 18 18 6 13 N/A 0 0 318651 CASAVA_Build 22 20945603 1I ATTCCATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 27 3 16 8 A 10 11 318652 CASAVA_Build 22 20949879 2D AGGGTCAGGA CT/-- CTCTCACTTT 1741 het 1741 ref 35 25 5 6 CT 3 2 318653 CASAVA_Build 22 20955891 3D AGTTTAGCAT AGA/--- AGAACTGTAA 1911 hom 12 het 7 0 5 3 AGA 2 1 318654 CASAVA_Build 22 20957228 1D GACCACTTAA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 422 hom 16 2 11 4 T 8 7 318655 CASAVA_Build 22 20957359 5I TTTGGAATTA -----/TTATT TTATATGTGC 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 TTATT 0 1 318656 CASAVA_Build 22 20957532 4D AATTTTTGAG TATC/---- TACTAAGTGC 3070 het 3070 ref 23 14 9 1 TATC 1 0 318657 CASAVA_Build 22 20967358 4D TTCAAAATCT TTTA/---- TTTTAGTTAT 3070 het 419 hom 8 1 7 0 TTTA 1 0 318658 CASAVA_Build 22 20967982 1D CCTTAACACA G/- AAGGACATAA 3070 het 3070 ref 48 28 18 2 G 1 0 318659 CASAVA_Build 22 20969395 3I TCATATCATC ---/TCA TCATTTCATC 49 het 49 ref 28 21 1 6 TCA 1 2 318660 CASAVA_Build 22 20969436 4D CCATTTCATT TTCA/---- TTATTTCATT 2605 het 2605 ref 72 35 6 42 TTCA 1 0 318661 CASAVA_Build 22 20969639 5I CATTTCCTCC -----/TTTCT TTTCAACATT 3070 het 3070 ref 57 27 25 5 TTTCT 0 1 318662 CASAVA_Build 22 20970534 5I TCTCGTCATT -----/TCATC TCATCTCATC 3070 hom 60 het 29 0 21 8 TCATC 2 3 318663 CASAVA_Build 22 20970544 9D9M1I TCATCTCATC ATTTCCATTTCATCATTT-/---------TCATCATTTC CATTTCATCA 3070 het 3070 ref 29 17 17 6 N/A 0 0 318664 CASAVA_Build 22 20970895 3D4M8D CATCTCATCA TTTCATCATTTTATT/---CATC-------- TCATCATCTC 3070 hom 33 het 23 0 11 13 N/A 0 0 318665 CASAVA_Build 22 20971166 5I CATTTCATCA -----/CATCT CATCTCATCG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CATCT 1 2 318666 CASAVA_Build 22 20971560 10D TCATCTCATT ATTGCATCTC/---------- ATTTCATCTC 3070 het 3070 hom 64 13 15 42 ATTGCATCTC 1 0 318667 CASAVA_Build 22 20971586 5D TCTCATCTCA TCATT/----- TCATTTCATC 3070 hom 87 het 53 0 29 26 TCATT 2 1 318668 CASAVA_Build 22 20971843 5I25M2I TCATTTCATT -----ATTTCATTTCATCTCATCATTTCAT--/ATTTCATTTCATTTCATCTCATCATTTCATGG CTCGTTTCAT 3070 het 3070 ref 59 28 13 37 N/A 0 0 318669 CASAVA_Build 22 20971983 3D TTTCATCTCA TCG/--- TTTCTACTCA 3070 het 3070 ref 56 32 13 11 TCG 1 0 318670 CASAVA_Build 22 20972669 1I CCATGCCTGG -/C CTAAAAATAG 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 C 1 2 318671 CASAVA_Build 22 20974316 2D GCAGGACCAA GG/-- GGAAGGGCCA 3070 hom 105 het 38 0 30 10 G 4 2 318672 CASAVA_Build 22 20976094 1I GGCAGAGGTA -/G GGCCAGAGCC 2259 hom 21 het 8 0 6 2 G 2 3 318673 CASAVA_Build 22 20980613 4I AGAACTAGTA ----/AAGT AAGAACAAAC 2515 het 2515 ref 19 11 6 2 AAGT 0 1 318674 CASAVA_Build 22 20985365 1I ATCCAGTTAG -/A TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 0 1 318675 CASAVA_Build 22 20986047 19D TTATTTCTAG AGTTTGGGTTACATTTCTT/------------------- AGGAGGGTAT 1259 het 1259 ref 44 46 4 4 AGTTTGGGTTACATTTCTT 1 0 318676 CASAVA_Build 22 20987416 4D ATGATGAAAT ACTA/---- ACTGTTTTAC 3070 het 3070 ref 46 10 8 31 ACTA 1 0 318677 CASAVA_Build 22 20993621 1D GGTTTGAGCA G/- CATTTATTGA 1279 het 1279 ref 61 51 3 7 G 1 0 318678 CASAVA_Build 22 20994062 2D TATATGATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 57 27 18 13 TG 8 7 318679 CASAVA_Build 22 20996674 1D ATCTTTGGAG T/- TTTTTTACGT 2342 het 2342 ref 45 36 6 3 T 7 6 318680 CASAVA_Build 22 20998678 1D TGACCGTCCT G/- GTTTTCTGTG 2492 het 2492 ref 45 33 9 4 G 2 1 318681 CASAVA_Build 22 21003684 2D AATCTAGCTC AG/-- GGGGTGACAT 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 AG 1 0 318682 CASAVA_Build 22 21012302 10I TCCCCCATGG ----------/TCCAGGGGCA TCCAGGGGCA 3070 het 2088 hom 45 8 14 23 TCCAGGGGCA 1 2 318683 CASAVA_Build 22 21014409 2D CATAAGTAAC AT/-- GTGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 AT 1 0 318684 CASAVA_Build 22 21021916 1I ATTCCAATAA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 7 8 318685 CASAVA_Build 22 21034660 4D ATATAAAAAT GCAA/---- ATATATATAT 3051 het 3051 ref 50 33 12 6 GCAA 1 0 318686 CASAVA_Build 22 21034925 1I AATAAACTGC -/A TAATATGGGT 2695 het 2695 ref 45 36 6 5 A 0 1 318687 CASAVA_Build 22 21034995 1D AGATATCCTT C/- CTTCACAATA 3070 het 3070 ref 46 25 16 7 C 2 1 318688 CASAVA_Build 22 21035262 1D CATCTGCAAA T/- TGTTAACATT 3070 het 3070 ref 55 36 16 4 T 2 1 318689 CASAVA_Build 22 21037223 1I CTCCTCTGCA -/G AGGGTGGGAA 3070 het 3070 ref 58 32 16 10 G 0 1 318690 CASAVA_Build 22 21042022 5I GTCAAAAACC -----/CGGGG GGGGGGATCT 3070 hom 46 het 18 0 14 4 CGGGG 0 1 318691 CASAVA_Build 22 21042625 1D GTGCTCCAGG C/- CCAGGGGGAA 2287 het 2287 ref 30 22 5 3 C 3 2 318692 CASAVA_Build 22 21044876 1D TCCAGGTTTA T/- TTCTTTCACA 3070 hom 45 het 17 0 16 2 T 3 2 318693 CASAVA_Build 22 21044990 7D TTTGTTGTTG TTGTTGT/------- TTGTTTGTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 5 TTGTTGT 1 0 318694 CASAVA_Build 22 21046012 1D TTATGTCCTT C/- CCCTCATTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 5 C 4 3 318695 CASAVA_Build 22 21050440 9I TTTGGTGCAG ---------/TTTCTCTAC TTACAAGAAC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TTTCTCTAC 0 1 318696 CASAVA_Build 22 21054136 1D TATATGTCTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 8 7 318697 CASAVA_Build 22 21058924 1D GTAGATGTGG C/- TAAATTGAGA 3070 het 3070 ref 77 54 13 10 C 1 0 318698 CASAVA_Build 22 21059070 4I AGCACAATGC ----/AAAG AATTTGTATA 1835 het 1835 ref 52 43 4 5 AAAG 0 1 318699 CASAVA_Build 22 21059871 3D GCATGATAGA AGC/--- AGTGTCTGGG 2148 het 2148 ref 39 29 5 5 AGC 1 0 318700 CASAVA_Build 22 21062101 1I AGAAAGATCT -/G CCCCACTCAT 3070 het 2261 hom 27 7 17 3 G 0 1 318701 CASAVA_Build 22 21064534 2D CCACAGGATC CA/-- CAGAGGAAGG 3070 hom 69 het 29 0 22 7 CA 2 1 318702 CASAVA_Build 22 21065214 1D CTTCAGCTGT G/- GGTAGAGAAG 1031 het 1031 ref 42 32 4 6 G 3 2 318703 CASAVA_Build 22 21065733 1D GCTCCAGGCC A/- ATAGGGAACT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 2 1 318704 CASAVA_Build 22 21066724 4I TATTTATTTA ----/TTTG TTTATTTATT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 TTTG 0 1 318705 CASAVA_Build 22 21070397 1I GTAGGTTGTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 66 hom 28 1 21 6 T 8 9 318706 CASAVA_Build 22 21080067 2D GTTTTATATG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 40 0 31 12 A 11 9 318707 CASAVA_Build 22 21082084 2I CAAAAAAATC --/AG AGTCTTTGAT 3070 hom 119 het 43 0 39 4 AG 1 2 318708 CASAVA_Build 22 21090021 1I AGAATAGGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 A 9 10 318709 CASAVA_Build 22 21102442 1D CTTATACATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 A 10 9 318710 CASAVA_Build 22 21102549 1I GAGACGGGGG -/A ATCATCTGAG 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 1 2 318711 CASAVA_Build 22 21104304 1D AGGTATGAAG T/- TTTGGTTTGG 3070 het 3070 hom 44 20 18 9 T 4 3 318712 CASAVA_Build 22 21107589 1I AATATGACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 T 9 10 318713 CASAVA_Build 22 21110918 1I AACAGAGCCC -/A AATCGGTCAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 2 3 318714 CASAVA_Build 22 21114103 1D AGACATACTT G/- GGGAGGCTGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 4 3 318715 CASAVA_Build 22 21128350 1D GGATCTAGAA C/- CAGATATACC 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 C 2 1 318716 CASAVA_Build 22 21137072 1I ACAGTAAGTA -/C CTCTTCAAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 1 2 318717 CASAVA_Build 22 21162154 1I CTTAGTAATC -/T TTTTTTTTTT 1413 het 1413 ref 28 16 3 9 T 11 12 318718 CASAVA_Build 22 21166075 8D TTATATAACA TTTGTCTG/-------- TTTTTTTGAG 3070 hom 54 het 21 0 18 4 TTTGTCTG 1 0 318719 CASAVA_Build 22 21168154 1I CGTCTCTTCT -/A AAAAAAATAT 2514 hom 21 het 8 0 8 0 A 7 8 318720 CASAVA_Build 22 21168738 11D ATGGTGGAAA GACAATACAGC/----------- AACAATACAG 3070 hom 60 het 19 0 19 2 GACAATACAGC 1 0 318721 CASAVA_Build 22 21170123 4I TCTCCAGACC ----/TATG TATGTCTACA 3070 hom 78 het 31 0 23 8 TATG 1 2 318722 CASAVA_Build 22 21174004 1I ATTCCATTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 34 1 30 3 A 10 11 318723 CASAVA_Build 22 21184676 2I AACAAAATAT --/TA TATATATATA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TA 6 7 318724 CASAVA_Build 22 21190372 4I AGAAGGCCCA ----/CAAG ATTCATTGAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CAAG 0 1 318725 CASAVA_Build 22 21191874 1I CCTGATGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 43 1 35 7 T 12 13 318726 CASAVA_Build 22 21196891 2D ATACCTGATT CA/-- CACAGTTTCC 3070 het 3070 hom 36 15 21 0 CA 3 2 318727 CASAVA_Build 22 21197809 1I AGTGCAAACT -/C CCCCCTCCCA 3070 het 1939 hom 22 7 11 4 C 5 6 318728 CASAVA_Build 22 21200621 12D ACAAATCACA ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AC 16 10 318729 CASAVA_Build 22 21202213 4D CATCTGATGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 30 0 16 14 A 19 15 318730 CASAVA_Build 22 21203126 3D AGACTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 A 17 14 318731 CASAVA_Build 22 21205933 1D TCTACAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 10 9 318732 CASAVA_Build 22 21209186 2I TTTTACTGAC --/TT ATTTTAATTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 0 2 318733 CASAVA_Build 22 21209902 1D GTCAGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 T 13 12 318734 CASAVA_Build 22 21214264 1I CTACTCGGGA -/G GCTGAAGCAG 3070 hom 39 het 15 0 13 2 G 1 2 318735 CASAVA_Build 22 21215956 1D CAGTCTCAAG T/- TATTTTGTTA 2370 hom 12 het 10 0 5 5 T 2 1 318736 CASAVA_Build 22 21217673 1D AAGAGATGGA G/- GGGGGGTCTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 G 7 6 318737 CASAVA_Build 22 21224065 4I ATAAAAAAAA ----/AAAC AACATTCTGA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AAAC 0 1 318738 CASAVA_Build 22 21226521 1D TTTCCGTCAC A/- AAAAATTGAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 6 5 318739 CASAVA_Build 22 21229639 3I GCCTACGCCA ---/CTG CTGCCTGGGC 1686 hom 22 het 21 0 7 14 CTG 1 2 318740 CASAVA_Build 22 21229663 1I CCCAACCCCC -/A AGCACCTTCA 2635 hom 24 het 19 0 7 12 A 1 2 318741 CASAVA_Build 22 21231232 1I GCCGGTTCCA -/G GGTCCCCTGA 879 hom 10 het 5 0 4 1 G 2 3 318742 CASAVA_Build 22 21231325 1D TTTACCTACT G/- TCTGTAACCC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 G 1 0 318743 CASAVA_Build 22 21231980 1D GAAAGGGGTC G/- GGGGGGGGAC 2779 het 1320 hom 29 6 14 9 G 9 8 318744 CASAVA_Build 22 21232987 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 19 0 11 8 T 12 11 318745 CASAVA_Build 22 21233109 1I CTCCCAAGTA -/G CTGGGACTAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 0 1 318746 CASAVA_Build 22 21233176 1I CAGGGTTTCA -/C CGTGTTAGCC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 1 2 318747 CASAVA_Build 22 21235749 1I GACAAGAGAT -/A ACTTTAAGAC 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 1 2 318748 CASAVA_Build 22 21239649 4I AAGGCTGGTA ----/GGGG GGGTAGCCTG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 G 3 7 318749 CASAVA_Build 22 21243724 16D TGATAGACCT GCTGCAGAACTAAGGA/---------------- GCTGCAGAAC 3070 hom 77 het 33 0 23 13 GCTGCAGAACTAAGGA 2 1 318750 CASAVA_Build 22 21244330 12D AAAAAGAAAG AAAGAGAGAGAA/------------ AGAGAGAGAG 3070 hom 48 het 21 0 16 8 AAAGAGAGAGAA 1 0 318751 CASAVA_Build 22 21244383 4D GAGAGAAAGA AAGG/---- AAGGAAGGAA 2294 hom 35 het 20 0 10 13 AAGG 4 3 318752 CASAVA_Build 22 21246158 1I TCCAGGGACT -/C CAAAGGGGAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 1 2 318753 CASAVA_Build 22 21255573 2D ATCTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 42 1 18 23 T 16 14 318754 CASAVA_Build 22 21257740 1I TGGCTTGCAG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 8 9 318755 CASAVA_Build 22 21260020 1D AAAAGCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 21 10 A 12 11 318756 CASAVA_Build 22 21269743 1I TCTCCACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 11 12 318757 CASAVA_Build 22 21276997 1D TTTTATACCC T/- TCTATAAGCC 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 2 1 318758 CASAVA_Build 22 21278022 19D TTGACAACAG AAAAAAGATTAGCTGCAAA/------------------- AAAAAAGATT 3070 hom 57 het 35 0 20 20 AAAAAAGATTAGCTGCAAA 2 1 318759 CASAVA_Build 22 21278875 1D CAACCTTGAA T/- TTTTTTAATA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 6 318760 CASAVA_Build 22 21280459 1D TCACAGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 35 1 28 6 T 12 11 318761 CASAVA_Build 22 21297737 2I CCTAATTCCA --/TT TTTTTTTTGA 508 hom 12 het 7 0 4 3 T 8 10 318762 CASAVA_Build 22 21304570 1D GTGATTCGCA G/- GGGTTCTGGC 3070 het 3070 ref 59 32 17 10 G 4 3 318763 CASAVA_Build 22 21306952 3D TGGGTGTGAC GAT/--- GATGACAAGC 1458 het 1458 ref 16 12 4 3 GAT 2 1 318764 CASAVA_Build 22 21310184 2D CCCAGTGCGG CT/-- CTGTCTGGCA 2578 het 2578 ref 27 15 6 6 CT 2 1 318765 CASAVA_Build 22 21311873 3D GCAATGCCCA CAT/--- CAGCCGTCAG 1008 het 1008 ref 31 26 3 2 CAT 1 0 318766 CASAVA_Build 22 21317605 1D GTCATGATCC G/- CCCTCCCAAA 1703 hom 10 het 4 0 4 0 G 1 0 318767 CASAVA_Build 22 21317886 1I TATTTTTTTT -/A ATACGTGCAC 1792 het 1344 hom 21 6 4 11 A 1 2 318768 CASAVA_Build 22 21324907 2I GTGTGTAAGC --/AT GTGTGTGTGT 3070 hom 47 het 22 0 13 9 AT 0 1 318769 CASAVA_Build 22 21327453 1I TGATCCTTGT -/A AAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 A 6 7 318770 CASAVA_Build 22 21331633 1I TCTCTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2601 hom 32 7 16 9 A 11 12 318771 CASAVA_Build 22 21334931 1I ACCTGAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 26 10 8 T 10 11 318772 CASAVA_Build 22 21335431 6D GTGACTAGAC TAGCCT/------ AGTGGGATTC 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 TAGCCT 1 0 318773 CASAVA_Build 22 21336031 1I GCTTTTTGAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 A 8 9 318774 CASAVA_Build 22 21344047 1D ATCAGCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 T 12 11 318775 CASAVA_Build 22 21346694 1I CTCACAGCTC -/T TCCCCACCAG 3070 hom 63 het 31 0 26 5 T 1 2 318776 CASAVA_Build 22 21347738 1D CACCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1761 het 802 hom 17 4 5 8 T 12 11 318777 CASAVA_Build 22 21350678 1I CCGTTTTTAA -/T TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 54 40 8 6 T 5 6 318778 CASAVA_Build 22 21353445 1I TTCTGTGCAA -/T TCCCCCACCC 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 T 1 2 318779 CASAVA_Build 22 21365172 1D GCTCTTCCCC T/- AACACTGCCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 1 0 318780 CASAVA_Build 22 21371982 1D TGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 12 11 318781 CASAVA_Build 22 21372545 1I CTTAAGGATC -/T GGTTAAGATG 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 T 0 1 318782 CASAVA_Build 22 21377146 7I1M2D AGGCCAGGCC -------CCT/TGATATAC-- GAGTTGGTGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 N/A 0 0 318783 CASAVA_Build 22 21380256 2I TCTAATAGAT --/AG AGAGGTTCTT 3070 het 3070 ref 45 35 9 1 AG 2 3 318784 CASAVA_Build 22 21380775 1D CAGCAGGACT G/- TTTCCATGCA 3070 het 3070 ref 46 25 15 7 G 1 0 318785 CASAVA_Build 22 21384208 2I TGGGGCCTGT --/AG ACCTGTCCAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 AG 0 1 318786 CASAVA_Build 22 21386640 1D GTTCCTTGAA T/- TTTTATGGAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 5 4 318787 CASAVA_Build 22 21387100 2D AATAAATAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AT 7 6 318788 CASAVA_Build 22 21404911 1I AAAGTGATAC -/T ATTTTGATAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 318789 CASAVA_Build 22 21405784 1D ATCCCAGCCA G/- GGGACACTGA 2977 het 2977 ref 19 9 7 3 G 4 3 318790 CASAVA_Build 22 21409636 1I ATCAGCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 11 318791 CASAVA_Build 22 21412321 1D GACTCCCTGA T/- TGCCTTAATC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 2 1 318792 CASAVA_Build 22 21412513 4I CAAAAATTAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AAAC 3 4 318793 CASAVA_Build 22 21413332 4D AGCTATTCAA GATG/---- AAGTACAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 GATG 1 0 318794 CASAVA_Build 22 21421283 17D ACATGCCAAT GCTAGTAAGGAAAAAGA/----------------- GCTGTCTCTC 3070 hom 105 het 34 0 35 5 GCTAGTAAGGAAAAAGA 1 0 318795 CASAVA_Build 22 21422346 1D AAAATAAGTA G/- GGGGGGGGGC 3070 hom 69 het 30 0 19 12 G 10 9 318796 CASAVA_Build 22 21426007 4I TTTCACTGTT ----/TCTC TCTCTATATA 3070 hom 109 het 42 0 36 6 TC 2 4 318797 CASAVA_Build 22 21429605 2D CCATGCAAAG TA/-- TATATATAAG 3070 het 2113 hom 50 5 39 6 TA 5 4 318798 CASAVA_Build 22 21433566 1D TATCAAATAG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 6 318799 CASAVA_Build 22 21434748 1I TATCTTCAAG -/C CCCCCTCTCC 3070 hom 59 het 24 0 18 6 C 5 6 318800 CASAVA_Build 22 21436402 6D ATAGTAACAA AATAGT/------ AATAGTAATA 3070 hom 47 het 21 0 16 6 AATAGT 3 2 318801 CASAVA_Build 22 21436497 4D AATTTTAGAT TGTG/---- TGCATGTGTA 3070 het 3070 ref 23 11 10 3 TG 3 1 318802 CASAVA_Build 22 21438662 9I ATGGAAAGAA ---------/TTGTGTACT AAGCACCATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTGTGTACT 0 1 318803 CASAVA_Build 22 21439588 1I AAATCTTTGG -/A TGAACCACGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 0 1 318804 CASAVA_Build 22 21440264 4D CGTGGAAATG GAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 1819 hom 37 13 13 11 GAAA 1 0 318805 CASAVA_Build 22 21441096 2I AACTCAACTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 64 24 19 21 TC 7 8 318806 CASAVA_Build 22 21442643 1D ACTGTCACCT C/- CTTCTCCACA 3070 het 3070 hom 32 12 13 8 C 2 1 318807 CASAVA_Build 22 21442847 2D CTGACAGTGT AG/-- AGTGGCCACC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AG 2 1 318808 CASAVA_Build 22 21443870 3D AGGATGGAAT GGA/--- GGAGGGGACT 3070 het 3070 hom 36 18 16 4 GGA 2 1 318809 CASAVA_Build 22 21444141 2I TCACCCCTTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 42 17 16 9 TC 6 7 318810 CASAVA_Build 22 21446953 1D GACACTCACA C/- CCCCGCCTGC 3070 het 3070 hom 40 14 16 11 C 5 4 318811 CASAVA_Build 22 21451338 4D AAATTTTATG CTAT/---- CTTTTAATCT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 CTAT 1 0 318812 CASAVA_Build 22 21451625 4D GAAATGGAAA CTAT/---- CTACACATTA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 CTAT 1 0 318813 CASAVA_Build 22 21459148 2D ACACTGACAC AG/-- AGTTATTCTG 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 AG 2 1 318814 CASAVA_Build 22 21478644 1I30M2D ATTCTTACTG -TTTTTTTGTGTATTTATTTTGTAGGTCTGTGA/TTTTTTTTGTGTATTTATTTTGTAGGTCTGT-- GAGAGAGAGC 3070 het 2604 hom 34 9 13 18 N/A 0 0 318815 CASAVA_Build 22 21491844 2D TGCTCATGGT CC/-- CCTGAGGACA 3070 het 3070 hom 37 12 15 11 C 4 2 318816 CASAVA_Build 22 21494825 1I GATGGGACGA -/G GCTGCCGCTG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 G 1 2 318817 CASAVA_Build 22 21495106 1I TAGACAATCA -/G GGACTTTAGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 2 3 318818 CASAVA_Build 22 21495243 1I CTGAGGCAGA -/G GGGATAAGAC 3070 hom 72 het 28 0 21 7 G 3 4 318819 CASAVA_Build 22 21495840 1I GGCTCTCAGG -/C CCCCTTCTTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 4 5 318820 CASAVA_Build 22 21496255 4D2M24D CCTCCTAGCT GGTCTATTCCTCTGCACCTGGGTCCTGAAG/----TA------------------------ CAGTGACCAC 3070 het 3070 ref 36 21 17 8 N/A 0 0 318821 CASAVA_Build 22 21497646 1D AAAATGTTAT C/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 C 1 0 318822 CASAVA_Build 22 21499420 1D GAGGGTTGTG T/- TCACCAGTCA 3070 het 1054 hom 16 3 12 1 T 2 1 318823 CASAVA_Build 22 21499958 1I CTGAAGTGTG -/C CCCGAGAATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 3 4 318824 CASAVA_Build 22 21500016 1I GGAACATAGG -/T TCTTTAATGG 3070 hom 54 het 28 0 17 11 T 1 2 318825 CASAVA_Build 22 21500289 1I GGTAGTTGTT -/A AAACTGTCTC 3070 hom 78 het 32 0 23 9 A 3 4 318826 CASAVA_Build 22 21509385 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 59 het 26 0 19 8 T 9 8 318827 CASAVA_Build 22 21514615 1D TTAACTTTTC T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 99 het 36 0 33 4 T 8 7 318828 CASAVA_Build 22 21524010 1I25M1I CCACACAACG -TAAGTGTAAACCCAGGGAGCAGTGC-/TTAAGTGTAAACCCAGGGAGCAGTGCT TAGAGCAAGA 3070 hom 147 het 44 0 47 7 N/A 0 0 318829 CASAVA_Build 22 21527295 1D GCAGAGCCCC T/- AGTCCATCTC 2795 het 2341 hom 16 6 7 3 T 1 0 318830 CASAVA_Build 22 21533029 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 A 10 9 318831 CASAVA_Build 22 21546003 1D AATGTCTGTC A/- ACTTTAAAAA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 2 1 318832 CASAVA_Build 22 21555562 1I CCTCGGGGCC -/T TGTATTGGGT 3070 hom 87 het 31 0 25 6 T 1 2 318833 CASAVA_Build 22 21555653 4D CCTCTGAGGT GTGA/---- GTGAGTCCAA 3070 hom 95 het 35 0 31 9 GTGA 2 1 318834 CASAVA_Build 22 21569754 1I TGAGGGTTCT -/A GTTGCCACAG 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 A 0 1 318835 CASAVA_Build 22 21571214 1I GGCCAGATTC -/A GGGGTGCAGG 2652 het 2652 ref 25 10 6 9 A 0 1 318836 CASAVA_Build 22 21571754 1I GGCTGGGGCT -/A GGGGCATCCC 3070 het 2413 hom 27 9 9 9 A 0 1 318837 CASAVA_Build 22 21573490 1D TCAACCCTCA C/- CCCCCACCAC 2688 het 2688 ref 27 12 8 7 C 6 5 318838 CASAVA_Build 22 21580918 3D ATAAAAAAAC AGG/--- AGGATAATAC 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 AGG 2 1 318839 CASAVA_Build 22 21581175 3I CCTGTGTTTG ---/TGT TGTTGTTATT 3070 het 3070 hom 42 21 19 2 TGT 2 3 318840 CASAVA_Build 22 21587373 1I GGGTACAAAC -/A AGAGTTCTTA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 1 2 318841 CASAVA_Build 22 21590272 1D GCAGGGGGTT G/- GGGGGCGGGG 2877 het 2560 hom 25 9 10 6 G 6 5 318842 CASAVA_Build 22 21599182 5I GCTGCCCCTC -----/CCTCT CCTCTCTCCT 1844 het 1844 ref 32 13 8 11 CCTCT 1 2 318843 CASAVA_Build 22 21605849 1D GGGTGTGTTA G/- GGGGTGAGTG 3070 het 3070 hom 42 12 22 8 G 5 4 318844 CASAVA_Build 22 21614399 19D GGGCTCCAGC ACCCCAAGACTCCACATTG/------------------- ACCCCAAGAC 2442 het 2442 ref 25 8 8 15 ACCCCAAGACTCCACATTG 2 1 318845 CASAVA_Build 22 21622820 4D CAGATAGATT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 33 11 16 8 GA 7 5 318846 CASAVA_Build 22 21627217 13D CCATATATAT ATATATATATATA/------------- TATATATATA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 ATATATATATATA 1 0 318847 CASAVA_Build 22 21636337 2I ATTTTCCTAT --/AG AGTCGTTTGA 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 AG 1 2 318848 CASAVA_Build 22 21666919 1I TGTAATAATT -/A ATACTGTGTG 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 1 2 318849 CASAVA_Build 22 21667628 1I GCTGATTAAG -/A AAAAAAAAAA 1277 het 1277 ref 40 23 9 8 A 15 16 318850 CASAVA_Build 22 21682441 1I CAGATGTTTC -/A AAAATCAGTG 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 A 4 5 318851 CASAVA_Build 22 21685658 1D GGGCAGTCAT G/- GATGGAGTTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 G 2 1 318852 CASAVA_Build 22 21693202 1I CAGCTGAAGG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 8 318853 CASAVA_Build 22 21695487 4D TTCTTACAGT CTTA/---- CTTGTTTCCC 3070 hom 96 het 34 0 33 2 CTTA 1 0 318854 CASAVA_Build 22 21712366 1D CATCAGGTTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 8 7 318855 CASAVA_Build 22 21712452 2D GGTCTGTTCT AG/-- GATATATTTG 3070 hom 93 het 33 0 32 3 AG 1 0 318856 CASAVA_Build 22 21773493 1I ATTCCAGTGG -/C CCCCCCTCTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 C 6 7 318857 CASAVA_Build 22 21789431 2I GATGGGGAAT --/GA GAGAGGGGCT 3070 hom 107 het 44 0 33 11 GA 2 3 318858 CASAVA_Build 22 21796387 1I ATTTTTTTTT -/G TGTTTTGTTT 3070 het 519 hom 30 2 25 3 G 0 1 318859 CASAVA_Build 22 21804753 2I CATCAGGGAA --/AT ATATAAATTA 3070 hom 115 het 45 0 38 7 AT 2 3 318860 CASAVA_Build 22 21809759 1I TTTCCTGCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 8 9 318861 CASAVA_Build 22 21811811 4D CCATCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 54 het 24 0 18 8 AAAT 6 5 318862 CASAVA_Build 22 21816462 10D CTTCCCGCAG TGGACTCCAA/---------- TTTCCCTGAG 2386 het 2386 ref 29 19 7 5 TGGACTCCAA 1 0 318863 CASAVA_Build 22 21818569 1I AATTTTTTTG -/T GTTTTTTTTT 2156 het 2156 ref 30 16 7 7 T 0 1 318864 CASAVA_Build 22 21819559 1I CTTGCTCTGT -/C CACCCAGGCT 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 C 1 2 318865 CASAVA_Build 22 21858204 1D GCGTGAGCCA C/- CCGCGCAAGG 3070 hom 50 het 19 0 16 4 C 3 2 318866 CASAVA_Build 22 21860952 1I CTCAAGTAGG -/T TTTTTTTTTT 2964 het 2964 ref 21 10 9 2 T 10 11 318867 CASAVA_Build 22 21880604 1I TGATTTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 10 11 318868 CASAVA_Build 22 21891210 1I GAAGGCCTGC -/G GCTTCCAGCC 3070 hom 52 het 20 0 16 4 G 1 2 318869 CASAVA_Build 22 21892092 9I TGCCTCCTTC ---------/CTGCACCAT CTGGGCTCCC 3070 hom 78 het 34 0 23 11 CTGCACCAT 0 1 318870 CASAVA_Build 22 21897379 1D TCTGTGGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 36 1 16 19 T 15 14 318871 CASAVA_Build 22 21897565 4I CTTCTTAGAC ----/CCTG CCTGCGGCAG 3070 hom 65 het 26 0 16 10 CCTG 1 2 318872 CASAVA_Build 22 21906001 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2785 het 168 hom 30 2 13 15 A 11 10 318873 CASAVA_Build 22 21911100 2D AGTCTCAAAC TG/-- TCCTCTGTCG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TG 1 0 318874 CASAVA_Build 22 21924812 1I AGAGATGGGG -/T TTCACCATAT 3070 hom 39 het 14 0 13 1 T 2 3 318875 CASAVA_Build 22 21926757 1I TGGACCCACG -/C CCCCCCCTCA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 C 7 8 318876 CASAVA_Build 22 21961814 1I GGAAGGTGGG -/C CCCCCCCGTT 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 C 7 8 318877 CASAVA_Build 22 21962778 1I TGTGGAATTG -/T TTTTTCCCGG 3060 het 1915 hom 27 7 12 8 T 5 6 318878 CASAVA_Build 22 21968294 1I TGGGCGTGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 G 1 2 318879 CASAVA_Build 22 21983976 4I TACCGCGTGT ----/CCGG CCGGTGTGGC 2476 het 2476 ref 39 20 8 11 CCGG 1 2 318880 CASAVA_Build 22 21988275 3I14M3D ATTCTTGGCT ---TTCTTTTTCTTTCCAGA/TGCTTCTTTTTCTTTCC--- AGGATTTTTG 1752 het 1752 ref 39 35 4 7 N/A 0 0 318881 CASAVA_Build 22 21989420 2I AGCAGAAAAC --/AG AGCCACTTGA 3070 het 3070 ref 36 22 8 6 AG 1 2 318882 CASAVA_Build 22 21992658 2I AGATCACCTA --/TT AGGTCAGGAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 0 2 318883 CASAVA_Build 22 21994870 1D TCCCCTCTCG T/- TGAGTCTTGC 3070 hom 55 het 24 0 17 7 T 2 1 318884 CASAVA_Build 22 21997369 1I CCAGGTAGCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 74 het 30 0 23 7 G 2 3 318885 CASAVA_Build 22 21999819 1D CAGCCTAAAC T/- TTTTTTTTTT 2290 het 501 hom 21 2 11 9 T 17 16 318886 CASAVA_Build 22 22014446 1D CTACAAGAAT G/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 41 28 7 6 G 1 0 318887 CASAVA_Build 22 22016000 3I TCATGGACTA ---/TTG TTGTTTCAGA 3070 het 3070 ref 68 46 12 10 TTG 1 2 318888 CASAVA_Build 22 22016244 1D ATCTCTGCCT G/- GGGGGGCTCT 1977 het 749 hom 10 3 6 1 G 7 6 318889 CASAVA_Build 22 22016764 3I GATCCATCCA ---/CCT CGGCCTCCCA 1375 hom 7 het 3 0 3 0 CCT 0 1 318890 CASAVA_Build 22 22019002 2D ACCCTGTTTC AA/-- AAAAAAAAGG 2392 het 2392 ref 33 17 6 10 A 10 8 318891 CASAVA_Build 22 22040824 1D CCCCTACTTA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 54 het 29 0 19 10 T 8 7 318892 CASAVA_Build 22 22046694 1D GCTGTCAGGA T/- GATGAATGGA 3070 hom 102 het 39 0 32 7 T 1 0 318893 CASAVA_Build 22 22050743 1D TGCTCAATGA G/- GTGAGGGAGC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 G 2 1 318894 CASAVA_Build 22 22051582 4D CAGTTATTAA TAAT/---- TAATTATTAT 3070 hom 45 het 17 0 16 5 TAAT 2 1 318895 CASAVA_Build 22 22053200 3D AAGCGGTGAT GGG/--- GGTGGTGATG 3070 hom 70 het 48 0 27 26 G 5 2 318896 CASAVA_Build 22 22060594 2D AGAGTCCCCC CG/-- ACCTTCTCGG 3014 hom 28 het 13 0 8 7 CG 1 0 318897 CASAVA_Build 22 22062829 2I ATTTTAAAAC --/AG AGTCTGGCTC 3070 het 2390 hom 15 6 9 0 AG 1 2 318898 CASAVA_Build 22 22063221 4D GGCCCAACAT CTGA/---- CTGACAGGAG 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 CTGA 2 1 318899 CASAVA_Build 22 22063544 10D GTCCCGTGAG GCCTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1133 het 1133 ref 21 8 3 12 GCCTTTTTTT 1 0 318900 CASAVA_Build 22 22063597 4D CCAGGCTGGA GTGC/---- GTGCAGTGGC 1816 het 1816 ref 19 9 6 4 GTGC 2 1 318901 CASAVA_Build 22 22065826 2I CCCCACCCTC --/AG AACGAGCTGC 1394 hom 18 het 8 0 5 3 AG 0 1 318902 CASAVA_Build 22 22081781 1I TGCACCAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 9 10 318903 CASAVA_Build 22 22085405 1D GCCACAGCAA C/- CCCCCCCACA 3070 het 2590 hom 24 9 11 6 C 8 7 318904 CASAVA_Build 22 22089152 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGTGCCC 3070 hom 27 het 15 0 11 4 C 1 2 318905 CASAVA_Build 22 22089524 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 307 hom 21 2 10 9 A 10 9 318906 CASAVA_Build 22 22094121 8I AATCCCCCCT --------/GCTCCCTG GCTCCCTGAG 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 GCTCCCTG 1 2 318907 CASAVA_Build 22 22096239 3D TGTCTCCAAA AAT/--- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 34 22 8 5 AAT 1 0 318908 CASAVA_Build 22 22098290 1I CAGCTCAAGC -/A AAATGGCCTG 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 A 3 4 318909 CASAVA_Build 22 22101495 5D TTTTCAAATA ATCTT/----- ACACTAGTTA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 ATCTT 1 0 318910 CASAVA_Build 22 22117294 1I TTAAATTTGT -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 ref 38 27 9 2 A 6 7 318911 CASAVA_Build 22 22117366 7I ACACGGCGAA -------/TTGGCTT ATGTGAGCAC 1818 het 1818 ref 35 28 4 3 TTGGCTT 0 1 318912 CASAVA_Build 22 22133148 2I GGCTGGGGTG --/CC CCCCCCCACC 3053 hom 52 het 20 0 12 8 C 7 9 318913 CASAVA_Build 22 22134247 4D CAAAAACGGT AAAA/---- AAAAGATAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 8 4 318914 CASAVA_Build 22 22136571 3D GACTTGCTCA ACC/--- TTATAGCCAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ACC 1 0 318915 CASAVA_Build 22 22147184 3I CCAAAAATCT ---/ACA ACAACAAACT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 ACA 2 3 318916 CASAVA_Build 22 22148132 8I TGTACCTCCA --------/ACACGTCC ACACACACCA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 ACACGTCC 0 1 318917 CASAVA_Build 22 22148926 1D CCTGGGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2757 hom 32 10 18 4 A 12 11 318918 CASAVA_Build 22 22150829 2D AAAATGTGAC TT/-- GACAAGATTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 2 0 318919 CASAVA_Build 22 22156428 1I GCCCCCCCCC -/A AAAAAAATCA 3028 het 1154 hom 13 4 8 1 A 7 8 318920 CASAVA_Build 22 22157637 1I TAGAAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 44 1 38 5 A 10 11 318921 CASAVA_Build 22 22160328 1I AATGGGGCTG -/T TTTTTGCTTG 3070 hom 48 het 20 0 15 5 T 5 6 318922 CASAVA_Build 22 22164466 5D GGTTACTTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 TTTTG 1 0 318923 CASAVA_Build 22 22164918 4I CAGCCAGGAC ----/TCCA TCCAGTTCAG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 TCCA 1 2 318924 CASAVA_Build 22 22168952 1I ATTATTTTAA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 6 7 318925 CASAVA_Build 22 22175686 1D CCCTGCAGGC T/- TTTTTGTTGC 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 T 6 5 318926 CASAVA_Build 22 22196134 11D AGAGCATCCG CCACCCCCATC/----------- CCACCCCCAA 3070 het 1818 hom 24 8 10 6 CCACCCCCATC 1 0 318927 CASAVA_Build 22 22196238 1I GATACCCCCC -/A TCCACTCCCA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 0 1 318928 CASAVA_Build 22 22197305 1D GCTGATGTCA T/- TTAAGTTATG 3070 hom 59 het 35 1 29 6 T 3 2 318929 CASAVA_Build 22 22197559 24D CTCCAGAACA GCAAGAGAATCATCTGTGTTGTTT/------------------------ GAAGGCACCA 3070 het 3070 ref 46 43 9 6 GCAAGAGAATCATCTGTGTTGTTT 1 0 318930 CASAVA_Build 22 22213309 3I AGGGTAGGCC ---/TTA TTTGAGGGAG 1886 het 1886 ref 21 13 4 4 TTA 0 1 318931 CASAVA_Build 22 22213398 1D TCAGTTAGTG A/- TCAGCTCCAC 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 1 0 318932 CASAVA_Build 22 22213874 4I AAGGGACTAG ----/GAAA GAAAGAAGTC 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 GAAA 1 2 318933 CASAVA_Build 22 22214144 15I AGATGGCGTA ---------------/TGCTAACTGAGCCAT TAATGCCGTA 3070 het 3070 ref 23 9 8 6 TGCTAACTGAGCCAT 0 1 318934 CASAVA_Build 22 22217017 9I AGTGGAATGT ---------/CACTCAGGC CACAGATAAA 3070 het 3070 ref 51 30 17 4 CACTCAGGC 0 1 318935 CASAVA_Build 22 22217592 2D TAGGAAAAAC AT/-- AGTTATTAAA 3070 het 3070 hom 44 21 21 4 AT 1 0 318936 CASAVA_Build 22 22261680 2D TATATATATA TG/-- TGTGTATGTG 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 TG 3 2 318937 CASAVA_Build 22 22264580 1D GAGCAAGACT G/- GGGGGGGGCG 3070 het 2826 hom 38 12 20 6 G 9 8 318938 CASAVA_Build 22 22265892 3I AGGCTGAGGC ---/AGA AGAACTGCTT 2339 hom 18 het 7 0 6 1 AGA 1 2 318939 CASAVA_Build 22 22266890 2D GATCCCTAAC AT/-- AGAAACGAAC 3070 hom 62 het 22 0 19 4 AT 1 0 318940 CASAVA_Build 22 22268607 3D GCACCCCCGT TTA/--- TTTTTATTTT 3070 het 1568 hom 19 4 11 6 TTA 1 0 318941 CASAVA_Build 22 22275411 1I ATTTTTATGA -/T TTTTTCATAC 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 T 5 6 318942 CASAVA_Build 22 22283080 1D ATGGGCAAAA T/- TTTTTTTTTT 799 het 799 ref 24 16 3 5 T 17 16 318943 CASAVA_Build 22 22299026 1I GAAGGAACCA -/C CTTTTAACTT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 C 1 2 318944 CASAVA_Build 22 22304866 1I AGGCTGAGCG -/T GGGGGGGTGG 1086 het 1086 ref 14 6 4 4 T 0 1 318945 CASAVA_Build 22 22307815 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2505 het 2261 hom 17 7 7 3 A 11 12 318946 CASAVA_Build 22 22318013 1D ATGATGTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 9 9 8 T 10 9 318947 CASAVA_Build 22 22322367 5I GTTTTCTTAC -----/TGTTT TGTTTTTATT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 TGTTT 1 2 318948 CASAVA_Build 22 22323725 4D CCCTATCTCA AAAG/---- AAAGAAAAAA 3070 het 2819 hom 24 8 15 4 AAAG 2 1 318949 CASAVA_Build 22 22324336 1D TAGTAAAGAT A/- AAGAGTTTCA 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 A 3 2 318950 CASAVA_Build 22 22326181 1D CACTATGAAG A/- GGGGGAAACT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 1 0 318951 CASAVA_Build 22 22326517 1I CACTGGGTGA -/C CCCTTACTCC 3070 het 3070 hom 45 14 20 11 C 3 4 318952 CASAVA_Build 22 22328883 4I GTTTGTGTTG ----/GTTT GTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 GTTT 2 3 318953 CASAVA_Build 22 22330098 4D21M1I TTCTGCTCCG TTTCTTTTTCCTCCTCCTTTTTTTT-/----TTTTTCCTCCTCCTTTTTTTTC CCCCTCCTCC 3070 het 2758 hom 24 8 13 10 N/A 0 0 318954 CASAVA_Build 22 22330276 6D TTCTTTTTTC TCCTCT/------ TCCTCTTCCT 1229 het 1229 ref 23 14 5 7 TCCTCT 2 1 318955 CASAVA_Build 22 22335016 13I CAGCCAGGCA -------------/TGGTGGCACACGC TGGTAGTCCC 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 TGGTGGCACACGC 0 1 318956 CASAVA_Build 22 22342225 1I CTGTCTCGGG -/A AAAAAAAAAA 1887 het 815 hom 9 2 5 2 A 10 11 318957 CASAVA_Build 22 22343007 3D TCAGTGTCTC CTT/--- CTCGCCTCCC 3070 het 3070 hom 36 15 13 9 CTT 1 0 318958 CASAVA_Build 22 22354242 1D ATGAACAGGT A/- AAAAAAAAAA 832 het 832 ref 61 48 3 11 A 11 10 318959 CASAVA_Build 22 22355806 1D GTTGCAGAGA C/- AAGGGGCACA 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 C 1 0 318960 CASAVA_Build 22 22361481 1D GGGTGGGGGT G/- GGGGGGGTGC 1867 het 1759 hom 15 6 6 3 G 8 7 318961 CASAVA_Build 22 22374298 1D TTACACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 A 12 11 318962 CASAVA_Build 22 22380443 4I TGAAACAAAC ----/AAAA AAAGGCATCC 3070 het 3070 hom 54 20 30 4 A 3 7 318963 CASAVA_Build 22 22381844 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 58 22 22 14 TG 6 5 318964 CASAVA_Build 22 22384883 71D TCAGGGTGAA CCGTGTATTTTGGACTTCACGATCTTTTTTTAGATGGGGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGTCTCAGCCTC/----------------------------------------------------------------------- CCGAGTACCT 3070 het 3070 ref 34 33 10 4 CCGTGTATTTTGGACTTCACGATCTTTTTTTAGATGGGGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGTCTCAGCCTC 1 0 318965 CASAVA_Build 22 22393627 8I TCCTGACCTC --------/CTGACAGA AGTTGATCTA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 CTGACAGA 0 1 318966 CASAVA_Build 22 22395058 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1810 het 1810 ref 25 11 8 6 A 15 14 318967 CASAVA_Build 22 22396976 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1261 het 968 hom 18 3 4 11 A 17 16 318968 CASAVA_Build 22 22414434 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2584 hom 25 7 12 6 A 10 11 318969 CASAVA_Build 22 22424331 1I GCCCATGACA -/C CCCCCCCCTC 1332 het 1332 ref 27 14 7 6 C 8 9 318970 CASAVA_Build 22 22431673 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2484 het 1884 hom 28 10 12 6 A 15 14 318971 CASAVA_Build 22 22448421 1I CATGGGCATA -/G GCAGGGCTGG 3070 hom 105 het 45 0 32 13 G 1 2 318972 CASAVA_Build 22 22456455 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 29 1 20 8 T 13 12 318973 CASAVA_Build 22 22487139 2D CCTGGGCAAC AA/-- GAGCAAAACT 2626 het 1098 hom 20 6 8 7 A 2 0 318974 CASAVA_Build 22 22488827 1D AGGAAGGCCA C/- CCCCAGTGCC 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 C 5 4 318975 CASAVA_Build 22 22490015 5I AACAACTAAA -----/TATCT TATCTTATTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TATCT 1 2 318976 CASAVA_Build 22 22490922 1I TTTACATTCC -/T TAAGGGAATC 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 1 2 318977 CASAVA_Build 22 22491942 1I GGTGGCTGCA -/C CCTTTTATAT 3070 hom 45 het 23 0 15 8 C 2 3 318978 CASAVA_Build 22 22492523 1I GCACTTTGGG -/A AGACCGAGGC 3070 het 1581 hom 19 6 13 1 A 1 2 318979 CASAVA_Build 22 22492821 4D GGCTTTTCTT TGTC/---- AGGAAGATTT 2584 het 2584 ref 32 21 7 5 TGTC 1 0 318980 CASAVA_Build 22 22492890 14I AATACAAATT --------------/TGTTTCCCATAACC TGTTTCAGTT 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 TGTTTCCCATAACC 0 1 318981 CASAVA_Build 22 22493599 4I GAGCTGGGTA ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 TTTC 2 3 318982 CASAVA_Build 22 22495045 1I TGGACTTTCT -/C CCCCCTCCCT 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 C 5 6 318983 CASAVA_Build 22 22497658 2I CTGTTTTGAG --/AA AAAGACTTCT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 3 5 318984 CASAVA_Build 22 22497745 3D GTTTGCTCCG TCC/--- TCCTCCTGCC 3070 het 3070 hom 36 12 19 8 TCC 3 2 318985 CASAVA_Build 22 22504402 1D CAACCTTGAG C/- CACCCACTAC 3070 hom 131 het 46 0 41 5 C 2 1 318986 CASAVA_Build 22 22504866 1I GGTGACGGGA -/G CCACTGCATG 2462 het 2462 ref 34 15 10 9 G 0 1 318987 CASAVA_Build 22 22506960 1D GGCTCAGGGC A/- AGAGGCTCTC 3070 hom 49 het 25 0 14 11 A 2 1 318988 CASAVA_Build 22 22508048 4D GAAGGCTGGG CCCT/---- CACTCCTGAC 3070 het 3070 ref 41 17 11 13 CCCT 1 0 318989 CASAVA_Build 22 22510124 1D TGGAATTCTT C/- CCCTCATCTC 3070 het 3070 hom 42 17 15 13 C 4 3 318990 CASAVA_Build 22 22512175 10I GGGATACCTC ----------/TGGGAAGATG TAAAGTTTGT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 TGGGAAGATG 0 1 318991 CASAVA_Build 22 22512915 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 18 1 12 6 A 13 12 318992 CASAVA_Build 22 22519554 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 318 hom 23 2 16 5 A 13 12 318993 CASAVA_Build 22 22525464 10D GTTTGAAGTT AGGTTTTTGC/---------- ATTAGGTTTG 1802 het 1802 ref 18 12 6 4 AGGTTTTTGC 1 0 318994 CASAVA_Build 22 22531680 1D ACATTCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 35 2 20 13 T 13 12 318995 CASAVA_Build 22 22532916 2I CAAAACTCCG --/TC TCTCTTTTTT 2068 hom 27 het 12 0 9 3 TC 2 3 318996 CASAVA_Build 22 22533862 1D AGATTCCTGG A/- GCCTGGCCAC 3070 het 2306 hom 33 10 15 8 A 1 0 318997 CASAVA_Build 22 22534626 1I ACCTAGTGAT -/G GGGGGGTCAG 2720 het 2720 ref 39 22 8 9 G 6 7 318998 CASAVA_Build 22 22537603 4I AACTCCATCT ----/CAAA CAAAAACAAA 2650 het 2650 ref 21 9 6 6 CAAA 1 2 318999 CASAVA_Build 22 22539388 1D ACTCTTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2745 hom 24 9 11 4 T 12 11 319000 CASAVA_Build 22 22541675 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2070 hom 20 7 8 7 A 13 11 319001 CASAVA_Build 22 22543463 2D CATGGTGGTG GA/-- GACGCCTGTA 1686 het 1686 ref 14 8 5 1 GA 2 1 319002 CASAVA_Build 22 22553510 2I GCTGTCCATG --/TC TCTTGTCATC 3070 hom 108 het 42 0 34 8 TC 1 2 319003 CASAVA_Build 22 22553698 1D GAGGAACTGC A/- AAATCACACA 3070 het 3070 ref 52 24 19 11 A 4 3 319004 CASAVA_Build 22 22561649 4D GGAGCCCCTC AGTT/---- AGGGAGAGGA 3070 het 3070 hom 25 8 12 6 AGTT 1 0 319005 CASAVA_Build 22 22563719 6D TCTCCCTATT ATGCAC/------ AGATGCATAA 3070 hom 144 het 54 0 48 9 ATGCAC 1 0 319006 CASAVA_Build 22 22569946 4I CGCCAGCCTC ----/CATT CAGACCCCAC 1273 het 741 hom 12 3 6 3 CATT 0 1 319007 CASAVA_Build 22 22586693 1D CTTTATGTAA T/- TATTGACTAC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 2 1 319008 CASAVA_Build 22 22588984 5D AAAGAAAGGA AAGGG/----- AAGGGAAGGG 1984 het 244 hom 17 2 6 10 AAGGG 3 2 319009 CASAVA_Build 22 22589324 1I CCCAGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 10 24 7 A 11 12 319010 CASAVA_Build 22 22590217 9D CTTTTTGGCC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2274 het 1840 hom 26 9 9 8 T 23 14 319011 CASAVA_Build 22 22593560 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2788 hom 24 8 10 6 A 14 13 319012 CASAVA_Build 22 22597079 1D CTTTGGGGTA C/- TCGTTAAAAT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 C 1 0 319013 CASAVA_Build 22 22598497 1I GGGTAGATCA -/T TTGAGCCCAG 3070 het 1769 hom 31 5 16 10 T 2 3 319014 CASAVA_Build 22 22598724 12D CAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAG/------------ AAAGAAAGAA 1961 het 1961 ref 13 9 5 4 AAAAAAAAAAAG 1 0 319015 CASAVA_Build 22 22601006 2D CTCAGGGCAT AA/-- AACTCCTCAT 3070 het 3070 hom 45 17 17 12 A 4 2 319016 CASAVA_Build 22 22603326 1D TTCTAAAATT G/- GCTTAGTCCA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 G 2 1 319017 CASAVA_Build 22 22660427 3D GATCACAGTT CTC/--- CTCTGCTCAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 CTC 2 1 319018 CASAVA_Build 22 22670651 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2001 het 1572 hom 16 7 6 3 T 13 12 319019 CASAVA_Build 22 22674471 4D ATGGACAATG AGGT/---- GGCGGGCCAG 1594 hom 21 het 10 0 6 4 AGGT 1 0 319020 CASAVA_Build 22 22715785 1I AGGAGAATCG -/C TTGAACTCTA 1580 hom 12 het 6 0 4 2 C 0 1 319021 CASAVA_Build 22 22716002 1D TGTGTGGGTT G/- GTTCGTTTGT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 2 1 319022 CASAVA_Build 22 22718104 14I AGCCTCCCAA --------------/AGTGCTGGGATTAC AGGCATGAGC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AGTGCTGGGATTAC 0 1 319023 CASAVA_Build 22 22740872 1D CTGGCCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1020 hom 33 5 18 10 T 14 13 319024 CASAVA_Build 22 22794908 1I ATGTTCTCGA -/G GGGGGGCCGA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 G 6 7 319025 CASAVA_Build 22 22798185 1I CACATCTGAG -/C AGTGGGGGTG 3070 hom 148 het 60 0 50 10 C 0 1 319026 CASAVA_Build 22 22804905 3D CATACTAAAT ATC/--- ATATAGTATG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATC 1 0 319027 CASAVA_Build 22 22813879 1D TGTAGACAAA T/- TTAGGGACAG 3070 hom 105 het 38 0 34 5 T 3 2 319028 CASAVA_Build 22 22852966 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1089 het 1089 ref 21 15 3 3 A 16 15 319029 CASAVA_Build 22 22975778 2I GGAACAGACA --/GT CTTAGGTCCT 3070 het 3070 ref 75 62 9 4 GT 0 1 319030 CASAVA_Build 22 22987560 3D TTTAGGCTTG TCA/--- TCATCGTCAC 1469 het 1469 ref 34 26 4 5 TCA 2 1 319031 CASAVA_Build 22 22995251 4D AATTTTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTA 2084 het 2084 ref 20 15 5 0 T 13 9 319032 CASAVA_Build 22 23003194 1I TGGTCTTTTA -/T TTTTTTGTCT 1449 het 1449 ref 26 19 5 2 T 6 7 319033 CASAVA_Build 22 23023746 1D ACACCTGGAA G/- ATGAGTCCTC 2279 het 2279 ref 70 58 5 8 G 1 0 319034 CASAVA_Build 22 23044886 1I ACAGAGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2234 het 2234 ref 35 16 7 12 A 15 16 319035 CASAVA_Build 22 23119939 1D CTCCTTTCAC T/- TAGCACATTG 3070 het 3070 ref 48 26 18 5 T 2 1 319036 CASAVA_Build 22 23222780 1I GGGCAGGACA -/G GGAAAGAAGC 3070 hom 148 het 53 0 50 3 G 2 3 319037 CASAVA_Build 22 23237749 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 31 het 13 0 12 1 T 9 8 319038 CASAVA_Build 22 23252048 1I TACCTCAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 A 11 12 319039 CASAVA_Build 22 23253325 1D GCCTATCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1012 hom 33 8 15 10 A 11 10 319040 CASAVA_Build 22 23261928 1I ACAAGCAAAA -/C CCCCCCCACA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 C 7 8 319041 CASAVA_Build 22 23282345 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 877 hom 24 6 12 6 T 13 12 319042 CASAVA_Build 22 23283480 1I GGAGCTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 213 hom 54 1 38 15 T 12 13 319043 CASAVA_Build 22 23286775 1D AGCTCACTGC A/- AACCTCCGTC 2409 hom 15 het 6 0 6 0 A 3 2 319044 CASAVA_Build 22 23289969 1D GGAAAACCAG T/- TTTTTAAACT 3070 hom 111 het 44 0 38 8 T 6 5 319045 CASAVA_Build 22 23293735 1D GGGGGGGAGC A/- CTCATACCCA 3070 hom 87 het 31 0 27 4 A 1 0 319046 CASAVA_Build 22 23315737 2D GCTCTGTTGG CC/-- CCCCTGTCCA 3015 het 1913 hom 33 9 9 16 C 6 4 319047 CASAVA_Build 22 23316579 1I CTTCTTATGA -/C CCCTCAAATT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 3 4 319048 CASAVA_Build 22 23319370 1I TAGGCGGGGT -/G GGGGGGGTTC 3070 het 2415 hom 19 7 9 3 G 7 8 319049 CASAVA_Build 22 23341923 1I CAAAAAACGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2826 hom 32 12 19 1 A 9 10 319050 CASAVA_Build 22 23345543 4D CTCAAAACAG ACAA/---- ACAAACAAAA 3070 het 3070 ref 47 27 10 11 ACAA 3 2 319051 CASAVA_Build 22 23346004 3D AATTAAAATT AAA/--- AAATAAATTT 1871 het 1871 ref 27 18 4 5 A 6 3 319052 CASAVA_Build 22 23346170 2I AAAAAAAAAA --/AT ATCTTTCCTC 1598 het 1598 ref 37 22 7 8 AT 1 2 319053 CASAVA_Build 22 23347543 1I TTTTTGTCAC -/T GTTTCATGGA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 0 1 319054 CASAVA_Build 22 23358350 2D TGGTCACCCT GG/-- GGGGGGTTGG 1242 het 1242 ref 37 26 3 8 G 8 6 319055 CASAVA_Build 22 23373062 4I TACCGCGTGT ----/CCGG CCGGTGTGGC 3070 het 3070 hom 67 29 25 13 CCGG 1 2 319056 CASAVA_Build 22 23394280 1I TTGGGATTAG -/A AAGAAACCCC 2784 het 2784 ref 24 11 8 5 A 2 3 319057 CASAVA_Build 22 23394624 1D CTGTGGTTCA T/- TCTCAGATTT 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 T 2 1 319058 CASAVA_Build 22 23397171 1I GAAAAGCAGA -/T TTTTTTTTTC 1634 het 1634 ref 17 9 5 3 T 9 10 319059 CASAVA_Build 22 23397975 1D GTCCTAGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 T 11 10 319060 CASAVA_Build 22 23403268 1D CATTAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 282 hom 20 1 17 2 T 11 10 319061 CASAVA_Build 22 23407081 1D ACAATTTGAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 39 14 22 5 T 8 7 319062 CASAVA_Build 22 23418364 1I CGTATTTGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 278 hom 26 1 21 4 A 9 10 319063 CASAVA_Build 22 23419257 1D AGAACTTACT A/- AAAAATGCAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 6 5 319064 CASAVA_Build 22 23424333 1I GTCACACAGC -/T TTCTAGGTAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 2 3 319065 CASAVA_Build 22 23424641 10D CCTTTCCTTT CCTTTTTCCG/---------- TTCCTTTTTC 1877 het 861 hom 43 6 12 25 CCTTTTTCCG 1 0 319066 CASAVA_Build 22 23424793 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 13 11 319067 CASAVA_Build 22 23425558 10D ACATGAGCCC TGTGGGGTGG/---------- GTGGAGCAGA 3070 het 3070 ref 46 26 17 7 TGTGGGGTGG 1 0 319068 CASAVA_Build 22 23428414 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1338 het 246 hom 9 3 3 3 A 19 18 319069 CASAVA_Build 22 23435633 3D CATTTTTCAT ATA/--- CCTGTTGGCT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 ATA 1 0 319070 CASAVA_Build 22 23436314 1I AATTTCCACC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 7 8 319071 CASAVA_Build 22 23436693 1I AATAGAAAAA -/C CCATCCAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 C 2 3 319072 CASAVA_Build 22 23437985 1I GTTTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 1018 het 695 hom 11 2 4 5 T 11 12 319073 CASAVA_Build 22 23443680 2D ATGAACACTC AG/-- AAAGTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 AG 1 0 319074 CASAVA_Build 22 23468353 1I ATAGAACTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 23 hom 19 1 16 2 A 9 10 319075 CASAVA_Build 22 23472602 1I TAACGACTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 30 1 20 9 A 12 13 319076 CASAVA_Build 22 23481528 3D GGTATGAGAC AAA/--- GAACGGGCAT 3070 hom 108 het 43 0 36 8 A 3 0 319077 CASAVA_Build 22 23481891 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 10 9 319078 CASAVA_Build 22 23482199 1I CAAATAGAAT -/A AAAAAAAAAA 2253 het 6 hom 31 1 8 22 A 10 11 319079 CASAVA_Build 22 23484891 4D CAGACGGAGT CTAA/---- CTGTCACCCA 3070 hom 96 het 34 0 28 6 CTAA 1 0 319080 CASAVA_Build 22 23487376 18D TCAACTGTGC CAACTAAAAGTGAAGAGG/------------------ CAAGTCTGAG 3070 hom 81 het 29 0 27 8 CAACTAAAAGTGAAGAGG 1 0 319081 CASAVA_Build 22 23501135 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 8 7 319082 CASAVA_Build 22 23508134 1D AAAACCATCT G/- GGCCAGACAT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 G 3 2 319083 CASAVA_Build 22 23528505 1D TTTTTTTTTT C/- TCTCTTTTTT 2872 het 1583 hom 30 9 16 5 C 1 0 319084 CASAVA_Build 22 23539626 1D CCACCCGATG C/- GTTTTGATGC 2985 het 2985 ref 39 25 10 4 C 1 0 319085 CASAVA_Build 22 23543319 1I GATCCTCAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1931 hom 21 7 10 4 T 9 10 319086 CASAVA_Build 22 23545122 1I AAAAAAAAAA -/C AAAACAATAA 3070 het 467 hom 20 6 10 4 C 0 1 319087 CASAVA_Build 22 23549265 12I GAGCATGCAG ------------/CAGCTGCTGTGC CAAATGTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 CAGCTGCTGTGC 0 1 319088 CASAVA_Build 22 23550582 1I AATGTCCTTA -/C ATCTGTTCCT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 0 1 319089 CASAVA_Build 22 23555005 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 1424 het 43 hom 6 1 4 1 A 9 8 319090 CASAVA_Build 22 23556024 8I GTTCGGAGGA --------/GTGTGTGG GTGTGTGGCC 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 GTGTGTGG 1 2 319091 CASAVA_Build 22 23558242 1D GTAACTCCCT G/- GGGGCATATG 3070 het 3070 ref 49 28 15 6 G 5 4 319092 CASAVA_Build 22 23558908 1D AAATTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1606 hom 33 8 14 11 T 12 11 319093 CASAVA_Build 22 23560726 3D CTAAATTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 14 12 T 15 12 319094 CASAVA_Build 22 23564897 2I ATGTTTCTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 A 10 12 319095 CASAVA_Build 22 23588871 1I GGCATTCCCA -/G GGGGTCTGCA 3070 het 3070 ref 39 22 10 7 G 4 5 319096 CASAVA_Build 22 23601609 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 13 12 319097 CASAVA_Build 22 23611059 13I GGGATTACAG -------------/GCATGCGCCACCA TGCCTGGCCA 3070 het 76 hom 18 1 16 1 GCATGCGCCACCA 0 1 319098 CASAVA_Build 22 23612365 5I GCTCTGTCTC -----/AAAAA AAAGAGAAGA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 3 8 319099 CASAVA_Build 22 23613654 4D TGCCTTTAGT CTCA/---- CTCAGCAAGA 3070 het 3070 ref 51 25 22 7 CTCA 2 1 319100 CASAVA_Build 22 23629632 1I GGTGGTGACC -/T TTTGAGATGG 3070 het 3070 ref 22 13 7 2 T 3 4 319101 CASAVA_Build 22 23633491 3D CCTTTGTTTT TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 7 TTG 3 2 319102 CASAVA_Build 22 23634299 4D CCAAAAACAT AAAG/---- AAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 15 6 AAAG 2 1 319103 CASAVA_Build 22 23638033 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1861 het 630 hom 19 7 8 5 A 15 14 319104 CASAVA_Build 22 23642010 1D CCACCATCTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 9 8 319105 CASAVA_Build 22 23652818 1D TGTGAATCTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 T 9 8 319106 CASAVA_Build 22 23655252 1I GATGTTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 11 12 319107 CASAVA_Build 22 23655531 2D CTCTCTCATC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 2856 hom 30 10 16 4 T 11 9 319108 CASAVA_Build 22 23659496 1D CAGAGCTTAT A/- TATTCTAAGT 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 A 1 0 319109 CASAVA_Build 22 23691069 3D GTAGGCTCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 2840 het 1151 hom 28 8 10 12 A 17 14 319110 CASAVA_Build 22 23697431 1D TGTTCTTGAG A/- AAAGCTCCTT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 4 3 319111 CASAVA_Build 22 23717469 1I TTGCTTTGTC -/A CCCAGGCTGG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 0 1 319112 CASAVA_Build 22 23727203 4I TGTGTGTGTA ----/TATG TATGTGTGTG 3070 hom 108 het 39 0 36 3 TATG 1 2 319113 CASAVA_Build 22 23749912 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 35 1 29 5 A 12 13 319114 CASAVA_Build 22 23770603 1D CTTTGATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 6 A 11 10 319115 CASAVA_Build 22 23773718 6D GGGATTACAG GCATGA/------ GCTACTGCGC 1371 het 1371 ref 12 5 4 5 GCATGA 1 0 319116 CASAVA_Build 22 23776904 1I CAAAGGTGAT -/G GGGAGAGAAG 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 G 3 4 319117 CASAVA_Build 22 23782286 1I GACGCCCAAC -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 5 6 319118 CASAVA_Build 22 23783371 6D GGGACACCTG TTCCTT/------ GCAAAGCCTC 2905 het 2905 ref 28 18 9 2 TTCCTT 1 0 319119 CASAVA_Build 22 23783497 2I CAGGAGAGTG --/TT AACCTTTTCC 2220 het 2220 ref 40 19 9 12 T 0 2 319120 CASAVA_Build 22 23786800 3I CCACATTTCG ---/TTT TTAATTTGCT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 2 5 319121 CASAVA_Build 22 23788015 1D CCTTCTGCAC T/- TTTTTTTTTC 2578 het 2578 ref 19 8 6 5 T 10 9 319122 CASAVA_Build 22 23789303 1I TGATTTAAAG -/A AAACGTGGCA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 3 4 319123 CASAVA_Build 22 23789534 1D GGGGAAGGTT G/- GGAGGTGGGT 2466 het 2466 ref 30 20 7 3 G 3 2 319124 CASAVA_Build 22 23807587 1D GGGCAGCTGC T/- TTTTTTTTTT 2744 het 2744 ref 43 16 9 18 T 12 11 319125 CASAVA_Build 22 23825189 3I GTCAGAGCAT ---/ATA ATGTTACCAC 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 ATA 0 1 319126 CASAVA_Build 22 23825505 22D AAAATGTGGG TTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTT/---------------------- TTTTTTTTTT 1182 het 1182 ref 27 14 5 8 TTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTT 1 0 319127 CASAVA_Build 22 23831787 2D GTATGAAGTT GG/-- GGGGGGGGGG 2935 het 208 hom 31 4 15 12 G 12 10 319128 CASAVA_Build 22 23868651 4D CCAGCCTGAC TGAT/---- ATGGTGAAAC 2257 het 2257 ref 16 8 6 2 TGAT 1 0 319129 CASAVA_Build 22 23906504 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 12 11 319130 CASAVA_Build 22 23907373 1I TTTCCTTCTA -/T TTCCCTGACT 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 T 2 3 319131 CASAVA_Build 22 23913442 1D ATAAACGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 10 9 319132 CASAVA_Build 22 23920765 8D GGTCAAGAGC GACCCTCT/-------- TTCACGTGGG 3070 het 3070 ref 44 23 18 6 GACCCTCT 1 0 319133 CASAVA_Build 22 23921805 1D GAGTAAGTGA T/- GGGGAGACAT 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 T 1 0 319134 CASAVA_Build 22 23927712 2I TTCTGGAAAC --/AT GGCTCTGAGC 3070 het 2880 hom 28 8 15 5 AT 0 1 319135 CASAVA_Build 22 23932215 1D CACATCCTCT G/- GCCCTCAAAA 3070 het 2667 hom 29 7 20 3 G 2 1 319136 CASAVA_Build 22 23942114 1D CTTGAATCCA T/- TCATTTACTC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 2 1 319137 CASAVA_Build 22 23958562 42D CAGAGCTTTG ATGTTTCTACTCAGGAAGATGGGAGAGAAATAGTACCTTCCT/------------------------------------------ AACGCGGTTG 3070 hom 105 het 31 0 35 3 ATGTTTCTACTCAGGAAGATGGGAGAGAAATAGTACCTTCCT 1 0 319138 CASAVA_Build 22 23967406 1D GGGAGGGTTT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3037 hom 27 11 14 2 A 8 7 319139 CASAVA_Build 22 23968019 1D TATAAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 9 8 319140 CASAVA_Build 22 23970301 1D CCCCAGCAGC A/- CTTCTCACAG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 1 0 319141 CASAVA_Build 22 23970938 1D GGTGTGAGCC T/- ACTACACCTG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 1 0 319142 CASAVA_Build 22 23971809 1I AACTTCACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1309 hom 32 3 17 12 T 11 12 319143 CASAVA_Build 22 23974160 1D AGTTATGAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 9 319144 CASAVA_Build 22 23975867 1D ATTCTGTGAT G/- TTTTGTACAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 G 1 0 319145 CASAVA_Build 22 23976282 7D TATGTACAAG TATTAAA/------- TATTTGTTTG 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 TATTAAA 1 0 319146 CASAVA_Build 22 23978076 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 22 1 14 7 T 15 16 319147 CASAVA_Build 22 23983852 1I GAAAGCCAGA -/T TTTTCTGTGG 1780 het 1780 ref 18 9 4 5 T 4 5 319148 CASAVA_Build 22 23984026 5I GGTGCTGGGA -----/TCAGC TGAGCTCAGC 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 TCAGC 0 1 319149 CASAVA_Build 22 23985508 2D GTAAATACTA CC/-- ATCATGGCCA 3070 het 3070 ref 32 19 11 3 C 2 0 319150 CASAVA_Build 22 23985903 1D CCCCAAAATC T/- TTTTTTAAAA 2636 het 2636 ref 19 10 7 2 T 7 6 319151 CASAVA_Build 22 23992328 1I GGCCTCCCAA -/T AATGCTAGGA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 0 1 319152 CASAVA_Build 22 23994438 1D TGAGACAGGG A/- AAGAAAGGAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 3 2 319153 CASAVA_Build 22 23995866 1I GAGCGGGTTG -/A ACTTAATGAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 1 2 319154 CASAVA_Build 22 23997079 4D TCAGTTGTTT TTAA/---- TTATAAAAAC 3070 hom 30 het 15 0 11 6 TTAA 1 0 319155 CASAVA_Build 22 23999930 1D TGCAACACCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 26 0 17 9 A 9 8 319156 CASAVA_Build 22 24006817 1D TAGAATGAGG T/- TAAGAGATTG 3070 hom 75 het 26 0 25 1 T 2 1 319157 CASAVA_Build 22 24010255 2I CATCACATGA --/TT TTTTTTTTAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 8 10 319158 CASAVA_Build 22 24011654 1I GCGGGTAGAG -/T TTTTAAGAGG 2498 het 2498 ref 29 19 6 4 T 4 5 319159 CASAVA_Build 22 24014022 4D AGTAAGAATG AATC/---- TTCTATCCAT 2426 hom 12 het 7 0 5 4 AATC 1 0 319160 CASAVA_Build 22 24014613 4I GGGTGTTTCC ----/CACT CAGGAGGAAG 2860 hom 24 het 10 0 8 2 CACT 0 1 319161 CASAVA_Build 22 24015123 2I TGTGGGTGAC --/TT TTTCATTTGT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 3 5 319162 CASAVA_Build 22 24018005 3I TCTGTGTGCT ---/TGA TGAGTGGTTT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 TGA 1 2 319163 CASAVA_Build 22 24018255 1I CTGCAGCCTC -/A AAACCCCTGG 3070 het 2508 hom 18 6 8 4 A 3 4 319164 CASAVA_Build 22 24025674 1I TTTTTAAAAA -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 27 1 21 5 T 1 2 319165 CASAVA_Build 22 24028718 1D CCTTGGATCT G/- GTCAGGAGAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 7 G 2 1 319166 CASAVA_Build 22 24029521 6D TGTATGTATA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 2265 het 2265 ref 22 13 6 4 TG 12 9 319167 CASAVA_Build 22 24029810 5I TTTTTTTTTT -----/TTTTC ACTCTTGGTT 2354 het 2354 ref 23 10 7 6 TTTTC 0 1 319168 CASAVA_Build 22 24042997 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2520 hom 31 10 17 5 A 12 11 319169 CASAVA_Build 22 24043871 1I AAGTCAGCCT -/G CCTTGACTGG 1754 het 1754 ref 30 22 5 3 G 0 1 319170 CASAVA_Build 22 24046774 3D TCTGAGCTCT CCA/--- GGAACCAGTG 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 CCA 1 0 319171 CASAVA_Build 22 24052251 2I AAGAAGAAAC --/AG AGCGAGAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 AG 1 2 319172 CASAVA_Build 22 24058295 8D ACTCTGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 2080 hom 24 9 10 7 A 22 14 319173 CASAVA_Build 22 24058836 1D ACTTCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2451 hom 29 10 11 8 A 13 12 319174 CASAVA_Build 22 24070583 1I GCTGTGCTAG -/C CAATGAGCGA 2797 het 937 hom 16 2 8 6 C 1 2 319175 CASAVA_Build 22 24075895 4I AAATAAGCTC ----/TTCT TTCTTCCATG 3070 het 3070 ref 50 31 15 4 TTCT 1 2 319176 CASAVA_Build 22 24080815 6I TGGATGGGCC ------/AGGGCA AGGGCCATGC 3070 het 2845 hom 34 9 12 13 AGGGCA 0 1 319177 CASAVA_Build 22 24081717 4D CCACAGACAC GTGA/---- GTGAGTCCCT 2742 het 2742 ref 30 15 7 9 GTGA 2 1 319178 CASAVA_Build 22 24082240 1D AGAGCACCTC A/- AAAAAACTGC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 7 6 319179 CASAVA_Build 22 24086797 2I GAGCTAACAC --/AG AGTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 AG 1 2 319180 CASAVA_Build 22 24087749 1I TATGACCCCC -/G CAGTTGGGAT 3070 het 2819 hom 24 8 13 3 G 0 1 319181 CASAVA_Build 22 24089514 4I AAAAATCATT ----/AAAG AACACAATTT 2342 het 2342 ref 34 17 9 8 AAAG 0 1 319182 CASAVA_Build 22 24097393 1D CCTTTCCCTC T/- TTTAGTCCTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 4 3 319183 CASAVA_Build 22 24116519 1I GCCTGGCCCC -/A ACTATCCCTG 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 1 2 319184 CASAVA_Build 22 24120048 1I AATGCACTCC -/A AGCCTGGGCA 1518 het 1518 ref 22 10 6 6 A 1 2 319185 CASAVA_Build 22 24127839 1D CCACAAAAAA C/- AACGATGTAT 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 C 1 0 319186 CASAVA_Build 22 24129272 6I TCAGCCCTGC ------/TGGCCT TGGCCTTGGC 3070 het 2690 hom 24 8 10 6 TGGCCT 2 3 319187 CASAVA_Build 22 24133705 1D GCAAATCATA C/- CCCCCCACCG 2423 het 2423 ref 30 13 9 8 C 7 6 319188 CASAVA_Build 22 24139631 9D GGAGGCTGCC AAGCCTTCT/--------- AAGCCTTCTA 3070 het 3070 ref 48 22 19 15 AAGCCTTCT 2 1 319189 CASAVA_Build 22 24212772 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 756 het 756 ref 22 13 3 6 T 15 14 319190 CASAVA_Build 22 24247887 1I AAATGTATTT -/G GCTCATGATT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 G 1 2 319191 CASAVA_Build 22 24251977 1I GAGCGGGCTG -/A ACTTAATGAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 1 2 319192 CASAVA_Build 22 24261975 1D CCACCTCTAC A/- AAAAAAAATT 2594 het 2271 hom 23 11 7 7 A 9 8 319193 CASAVA_Build 22 24310708 1D TATAGGATTC T/- TATACTATCT 3070 het 3070 ref 47 27 9 12 T 2 1 319194 CASAVA_Build 22 24311357 3I ATAGGTAGAA ---/GAG TGTAATGGTT 2262 het 2262 ref 42 28 6 9 GAG 0 1 319195 CASAVA_Build 22 24311454 6I ACCTCATATA ------/TATAAT TATGTCATGT 1834 het 1834 ref 42 29 4 9 TATAAT 0 1 319196 CASAVA_Build 22 24334162 1D AAAAGTAGCT G/- GCACTTAACC 1815 het 1815 ref 40 32 4 4 G 2 1 319197 CASAVA_Build 22 24401426 1D TGGGGGAACA T/- TTTTTTTTTT 1073 het 1073 ref 40 26 4 10 T 11 10 319198 CASAVA_Build 22 24464347 2I TCTCTCTCTT --/AC ACACACACAC 2801 het 2801 ref 37 18 8 11 AC 8 9 319199 CASAVA_Build 22 24471679 1D AGTGAGTTTA C/- CCCTTGGCCA 3070 het 3070 ref 31 15 10 8 C 4 3 319200 CASAVA_Build 22 24483554 1D ACTGCATATC A/- AAAAAAAAAA 1753 het 1753 ref 24 16 4 4 A 12 11 319201 CASAVA_Build 22 24505757 1I CTAGCCCTGG -/C CCCTTCTAGA 3070 hom 84 het 34 0 26 8 C 3 4 319202 CASAVA_Build 22 24512460 1I ATCCTGGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2076 hom 46 6 34 6 A 14 15 319203 CASAVA_Build 22 24515604 2I CTGTCTCAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 10 12 319204 CASAVA_Build 22 24516126 3I TCTCAAAAAA ---/AAC AAACAACAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AAC 0 1 319205 CASAVA_Build 22 24517130 4I CAAGCTGGAG ----/AGAT AGATATGTGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AGAT 1 2 319206 CASAVA_Build 22 24522198 1D CATAAATCTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 8 319207 CASAVA_Build 22 24525934 2D AAAATGTGAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 93 het 41 0 30 13 AT 6 5 319208 CASAVA_Build 22 24547271 1D TAAGAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 2209 het 2209 ref 46 25 5 16 T 13 12 319209 CASAVA_Build 22 24564116 2D ATTAAATTAT AC/-- ACACACACAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AC 5 4 319210 CASAVA_Build 22 24564841 2D CATGTTTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 150 het 63 0 49 15 TA 8 7 319211 CASAVA_Build 22 24583446 9D TGTGAATTCA TCTCAAGAG/--------- TCTTTATCTG 3070 het 3070 ref 35 22 11 5 TCTCAAGAG 1 0 319212 CASAVA_Build 22 24586270 1D ATTTCACTGA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 44 21 21 2 T 8 7 319213 CASAVA_Build 22 24597946 1D TGATCATTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 10 9 319214 CASAVA_Build 22 24601473 1I CTGTTCTGGT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 185 hom 34 2 20 12 C 9 10 319215 CASAVA_Build 22 24605292 4D TGTGTATCAA CATG/---- CATGTATTGC 3070 hom 126 het 45 0 43 3 CATG 2 1 319216 CASAVA_Build 22 24608325 1I ATGTAGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1874 hom 46 5 33 8 A 12 13 319217 CASAVA_Build 22 24614617 1D AGAGAAAGCT C/- CCATGCTGGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 3 2 319218 CASAVA_Build 22 24615145 1D TGGGGATATA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 8 7 319219 CASAVA_Build 22 24620244 1D TTTCATTATC T/- TGTACAAAGT 3070 het 3070 ref 50 24 15 13 T 2 1 319220 CASAVA_Build 22 24622670 16D TCCCTCGTCT ACATTCTAACCAGTTC/---------------- ACACTCTAAC 3070 het 3070 hom 32 14 18 3 ACATTCTAACCAGTTC 1 0 319221 CASAVA_Build 22 24631023 1I TGTTTTTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 8 9 319222 CASAVA_Build 22 24657808 1I GCCCTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1671 het 1671 ref 25 12 8 5 T 15 16 319223 CASAVA_Build 22 24661556 3D GAAAGGAGAA AAG/--- AAGAGAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 34 6 AAG 2 1 319224 CASAVA_Build 22 24663054 1I TTCAGGAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 23 1 15 7 T 11 12 319225 CASAVA_Build 22 24666260 3I TCACGAGATC ---/TGA TGGTTTTATA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TGA 0 1 319226 CASAVA_Build 22 24670076 1I TTTTGCCCTG -/C CTGCCTTCAG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 C 1 2 319227 CASAVA_Build 22 24676312 1D TATATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 32 1 24 7 T 11 10 319228 CASAVA_Build 22 24696787 6I AGAGAGACTT ------/ATAAAC AAACACTCAG 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 ATAAAC 0 1 319229 CASAVA_Build 22 24698925 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1949 het 1697 hom 29 10 8 11 A 19 18 319230 CASAVA_Build 22 24711643 4I TCACCTAGGC ----/TGGA TGGAGTGCAG 3070 hom 23 het 10 0 8 2 TGGA 1 2 319231 CASAVA_Build 22 24716997 4D TCGGATCTAT TCCG/---- TTTGCTTCAT 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TCCG 1 0 319232 CASAVA_Build 22 24717881 5I GGACAGACTT -----/GAAAG GAAACTATCT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 GAAAG 0 1 319233 CASAVA_Build 22 24719871 1I CGGGTGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 10 11 319234 CASAVA_Build 22 24720498 1I ACTTTGTCTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 A 8 9 319235 CASAVA_Build 22 24726225 1I GTAGAATTCG -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 T 6 7 319236 CASAVA_Build 22 24729974 1D GGGGTCTTGA G/- GGACAGGGTC 2364 het 2364 ref 15 10 5 1 G 3 2 319237 CASAVA_Build 22 24739076 3I TTTCGATATT ---/ATG TTTTCAAGAT 3070 het 3070 hom 47 14 28 5 ATG 0 1 319238 CASAVA_Build 22 24740870 1I TTTTAATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 12 5 T 10 11 319239 CASAVA_Build 22 24787860 1I GCTGAAAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 A 8 9 319240 CASAVA_Build 22 24796517 1I TTCTGGAATG -/T GATGAAGAGG 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 T 0 1 319241 CASAVA_Build 22 24812719 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2752 het 607 hom 33 7 10 17 T 19 18 319242 CASAVA_Build 22 24874583 1D ATAGAAAAAA G/- TAATAGAATC 3070 het 3070 hom 24 11 11 3 G 1 0 319243 CASAVA_Build 22 24876005 2D TGAGTTTTGC AA/-- AGTCAGTACA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 A 3 1 319244 CASAVA_Build 22 24883689 1D CAATGTTGAC T/- CCCCATCTCC 3070 het 3070 ref 56 26 25 6 T 1 0 319245 CASAVA_Build 22 24893139 1I GGTTGTTTGG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 7 8 319246 CASAVA_Build 22 24970708 1I TTCTTTTATA -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 86 het 34 0 28 6 T 5 6 319247 CASAVA_Build 22 24974906 3D TTCTCCTGAT AAG/--- AACTGTCTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 9 AAG 1 0 319248 CASAVA_Build 22 24977305 5D TTGTTGAAAG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 28 2 21 5 T 16 11 319249 CASAVA_Build 22 25006238 2D ATTTATACAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AT 5 4 319250 CASAVA_Build 22 25017424 1D AGTTGGGGGA G/- GGGAGAGCAT 2978 het 2978 ref 25 14 8 3 G 4 3 319251 CASAVA_Build 22 25044376 1I CCCCTCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 24 1 21 2 A 12 13 319252 CASAVA_Build 22 25051735 1I TCTTCGAGTT -/C CTGAGATGAT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 C 1 2 319253 CASAVA_Build 22 25056217 15D GATTCCGGCT CTGCTATATAACCAG/--------------- CTGCTTGAGC 3070 het 3070 ref 44 19 20 6 CTGCTATATAACCAG 1 0 319254 CASAVA_Build 22 25064536 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTGA 2934 het 2934 ref 24 12 9 3 T 8 9 319255 CASAVA_Build 22 25067239 1D CAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 15 15 9 A 10 9 319256 CASAVA_Build 22 25087995 1I ACCCTGCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 9 10 319257 CASAVA_Build 22 25097636 1I CAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2896 het 2896 ref 26 14 8 4 A 10 11 319258 CASAVA_Build 22 25102173 1I TCATTTGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 7 5 A 11 12 319259 CASAVA_Build 22 25105609 1D AATCAAACTA C/- CCCCCATGTT 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 C 6 5 319260 CASAVA_Build 22 25111006 1D TAAATTTTTA T/- TTTTTTTTTA 1055 het 1055 ref 29 22 3 4 T 10 9 319261 CASAVA_Build 22 25124587 1D TTCAATCTGT A/- AAAAAATCAG 3070 hom 117 het 47 0 40 8 A 7 6 319262 CASAVA_Build 22 25131811 8I CTGGGCATGG --------/TGGCAGGT GCCTGTAGCC 3070 hom 98 het 38 0 31 7 TGGCAGGT 0 1 319263 CASAVA_Build 22 25133721 2D AGACTCCGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 19 0 15 4 A 16 14 319264 CASAVA_Build 22 25151715 4D CCTCCCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 48 het 24 0 17 9 TCTT 4 3 319265 CASAVA_Build 22 25157384 1D TGTGGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1003 hom 32 5 17 10 A 15 14 319266 CASAVA_Build 22 25159339 2I TTTATGCTGA --/TT TTTTTTTTTT 1686 het 680 hom 35 2 8 25 T 10 12 319267 CASAVA_Build 22 25166243 1D CCCACTGGCC G/- GTTGAAGCAT 3070 hom 63 het 24 0 21 4 G 2 1 319268 CASAVA_Build 22 25175620 2D AAAGGCTCCC CT/-- GTGCCCCGCG 3070 hom 39 het 14 0 13 2 CT 1 0 319269 CASAVA_Build 22 25182678 8D GACTACGTGG ACTAATAT/-------- ACACATTGCC 3070 hom 39 het 17 0 14 6 ACTAATAT 1 0 319270 CASAVA_Build 22 25186340 2D TTTGAACAGA TG/-- TGTGTGTGTG 1267 het 1267 ref 50 39 3 11 TG 6 5 319271 CASAVA_Build 22 25188093 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 26 1 19 7 A 18 17 319272 CASAVA_Build 22 25195677 2D AGAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 2804 hom 37 het 18 0 12 7 AT 6 5 319273 CASAVA_Build 22 25201653 4D TATGCATGAT AGAG/---- AGAGTATCTG 3070 hom 60 het 21 0 20 4 AG 4 2 319274 CASAVA_Build 22 25204732 1I CTCACTGCAA -/C CTCTGCCTCC 3070 hom 35 het 15 0 11 4 C 1 2 319275 CASAVA_Build 22 25216954 1D AATCATGGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 427 hom 45 2 36 7 T 10 9 319276 CASAVA_Build 22 25223973 2D ATAAAGAAAC TG/-- TGGTATAAAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TG 2 1 319277 CASAVA_Build 22 25237307 5D GCCCACACAG ATTGA/----- ATTGAGGGTG 3070 hom 90 het 32 0 29 6 ATTGA 2 1 319278 CASAVA_Build 22 25241454 1I CCTAGAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 35 0 26 9 A 11 12 319279 CASAVA_Build 22 25274512 1D AAGGAGAAAG A/- AAAAAGAGAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 6 5 319280 CASAVA_Build 22 25274581 1I GCTCATCAGA -/G CATTTTGGAG 3070 hom 62 het 27 0 21 6 G 0 1 319281 CASAVA_Build 22 25274691 3D CACTTTGAGG GCT/--- GAGGCAGGAG 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 GCT 1 0 319282 CASAVA_Build 22 25274774 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 9 8 319283 CASAVA_Build 22 25277120 1D GCTTGATGAT A/- ATACACCCAT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 A 2 1 319284 CASAVA_Build 22 25280895 2D CACAGCAAGA CT/-- CTGTCTCACA 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 CT 2 1 319285 CASAVA_Build 22 25285435 2D GTACACTCAC AG/-- AGTTTTCGTA 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 AG 2 1 319286 CASAVA_Build 22 25287516 12I TAATTGCAAA ------------/GTGTTTTGTTGC AAGAAAAAGT 3070 het 2924 hom 29 6 20 4 GTGTTTTGTTGC 0 1 319287 CASAVA_Build 22 25293299 1I GGTAGGAAAT -/G GGCCTTGCTC 3070 hom 138 het 54 0 46 8 G 2 3 319288 CASAVA_Build 22 25296683 29D GTCCTTTCCC CAGCATACCCCACCTGCAGCTGGTAGCAG/----------------------------- CAGCATACCC 3070 hom 77 het 36 0 23 21 CAGCATACCCCACCTGCAGCTGGTAGCAG 2 1 319289 CASAVA_Build 22 25301429 1D CAAAGACCAT C/- TCCTTCCTGC 3070 het 3070 ref 55 30 22 3 C 1 0 319290 CASAVA_Build 22 25302261 4D TGGACTTTGA AAGT/---- AACATTCCTG 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 AAGT 1 0 319291 CASAVA_Build 22 25307304 1I GTGCAGGGCT -/G GGACCCCATC 3070 hom 100 het 42 0 32 10 G 2 3 319292 CASAVA_Build 22 25311318 1I GTGGGCACTG -/C CCTCTGAGGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 2 3 319293 CASAVA_Build 22 25314164 1I CGAAGTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 31 2 18 11 A 13 14 319294 CASAVA_Build 22 25330117 1D GAGTGATGCC G/- GACCTCAGTG 3070 hom 105 het 41 0 36 7 G 2 1 319295 CASAVA_Build 22 25336021 1I CCATGCCCAA -/G GTCCCCCTAA 3070 hom 123 het 49 0 40 9 G 1 2 319296 CASAVA_Build 22 25345968 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2678 hom 23 8 12 3 T 13 12 319297 CASAVA_Build 22 25351872 1I TTTTGTGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 10 11 319298 CASAVA_Build 22 25355699 10D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 2074 het 1337 hom 10 5 7 3 A 22 12 319299 CASAVA_Build 22 25357608 1D CCCTTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1951 hom 31 13 9 9 T 17 16 319300 CASAVA_Build 22 25359051 1I ATCTGACCAC -/T TGCTTGACAC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 1 2 319301 CASAVA_Build 22 25370195 1I TTACCCCCTC -/T TTTTTTTTTT 2959 het 2959 ref 30 10 9 11 T 11 12 319302 CASAVA_Build 22 25372580 1I GTTGTGTCTG -/T TTTATCTTCA 3070 het 3070 hom 43 14 21 8 T 3 4 319303 CASAVA_Build 22 25375876 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 10 12 8 A 10 9 319304 CASAVA_Build 22 25384023 1I ACGGGCAGAG -/C CCAGAGGGTC 3070 hom 45 het 19 0 13 6 C 2 3 319305 CASAVA_Build 22 25384115 1I CCCGACCCAA -/C CCCCCCGAGC 1000 hom 14 het 11 0 7 4 C 6 7 319306 CASAVA_Build 22 25391042 1I CTCTACTACT -/A AAAAAAAAAA 3034 het 3034 ref 20 10 9 1 A 10 11 319307 CASAVA_Build 22 25392699 1I TGGGGTGCCT -/G GGCCCAGCCT 3070 hom 64 het 28 0 16 12 G 2 3 319308 CASAVA_Build 22 25393297 6D CCTGGGAGCA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 46 14 15 27 GT 10 7 319309 CASAVA_Build 22 25393601 1I CCTGCCTGGT -/G GGGTATTCTC 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 G 3 4 319310 CASAVA_Build 22 25410176 7D TGTAATGTTG AAGGGGC/------- AAGCCAGGGT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 AAGGGGC 1 0 319311 CASAVA_Build 22 25419420 1I GGGCTTGGAG -/C CTCAGGAAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 1 2 319312 CASAVA_Build 22 25420989 1I GAGGCTACTG -/C CACATGGCCC 3070 hom 78 het 32 0 22 10 C 1 2 319313 CASAVA_Build 22 25430062 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1384 het 492 hom 13 4 4 5 A 17 16 319314 CASAVA_Build 22 25434248 1D CTAATTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 15 14 319315 CASAVA_Build 22 25439026 2I AAAATTGTCA --/CT CTATTTTCAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 CT 1 2 319316 CASAVA_Build 22 25443914 1D AATATATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 11 10 319317 CASAVA_Build 22 25447004 1I TGGGGGTTGC -/G GGGGAGCACC 3070 het 1438 hom 25 7 14 4 G 4 5 319318 CASAVA_Build 22 25459851 2D GCTCTTTAGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 90 het 43 0 27 16 TC 6 5 319319 CASAVA_Build 22 25462770 3D TCCCATCCCA CCC/--- CATATCCTTT 2706 het 462 hom 10 2 8 1 C 4 1 319320 CASAVA_Build 22 25466844 1I GGGAGGGGGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 A 8 9 319321 CASAVA_Build 22 25467886 3I CTTCTCCTTC ---/TCT TCTCTCCCCC 2783 het 2783 ref 35 17 9 9 TCT 1 2 319322 CASAVA_Build 22 25480189 2I GCAGCTTGCC --/AG AGGGGCACTG 3070 het 2758 hom 20 7 10 3 AG 1 2 319323 CASAVA_Build 22 25482569 1D ATTTAGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2333 hom 24 10 8 6 T 12 11 319324 CASAVA_Build 22 25504179 1D TGTAGTGACA G/- GGTTCTTGTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 G 3 2 319325 CASAVA_Build 22 25505436 1I CCAAAATGTA -/T TTTTTTTTTT 1640 het 1640 ref 41 12 12 17 T 16 17 319326 CASAVA_Build 22 25516493 1I CTTTTTAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 T 9 10 319327 CASAVA_Build 22 25517302 1D CCTTCCCACT G/- GCCCATTGTT 3070 het 3070 hom 53 27 22 5 G 2 1 319328 CASAVA_Build 22 25520978 3D CGTGTTCACA CCT/--- CCTCACTCCC 3070 hom 59 het 23 0 19 4 CCT 2 1 319329 CASAVA_Build 22 25559311 1I CCAGAGCAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 8 9 319330 CASAVA_Build 22 25563982 1D GGCCAGCTTA C/- CCAAGAGATC 3070 hom 156 het 58 0 51 7 C 3 2 319331 CASAVA_Build 22 25565810 1D CTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2540 hom 36 11 19 6 A 12 11 319332 CASAVA_Build 22 25569907 3I TGAGTGTGTC ---/GAT GAGTGGGTGG 3070 hom 175 het 67 0 58 9 GAT 0 1 319333 CASAVA_Build 22 25573141 1I AAGAAGCCTG -/A ACGCACTCTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 1 2 319334 CASAVA_Build 22 25574168 2D ATGCTGCAGT AG/-- AGTGTTCCCT 3070 het 3070 ref 56 25 23 9 AG 2 1 319335 CASAVA_Build 22 25578692 2D CAGTTAGCTC TA/-- TGATTGCTTG 3070 het 3070 hom 41 14 21 9 TA 1 0 319336 CASAVA_Build 22 25587923 4D TATTAATAGA ATTT/---- ATTTAAACAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 ATTT 2 1 319337 CASAVA_Build 22 25590654 1D AGAGTCAGTA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 T 8 7 319338 CASAVA_Build 22 25591763 1I TTTGCAGATA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 T 6 7 319339 CASAVA_Build 22 25596770 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 11 11 A 14 16 319340 CASAVA_Build 22 25601633 1I AGATTTTCTA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 T 7 8 319341 CASAVA_Build 22 25615435 1D TCTCCATTTG T/- GGGAGCAGAG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 1 0 319342 CASAVA_Build 22 25626093 1D AAAATGTGTT G/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 G 1 0 319343 CASAVA_Build 22 25626174 1D GGGAAAAAAG A/- AAAAAAAACT 2353 het 2353 ref 25 17 6 2 A 9 8 319344 CASAVA_Build 22 25631184 2D AAAGGGAGAG AA/-- AAGAGGAGAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 4 2 319345 CASAVA_Build 22 25631257 2I AAGAACAGAG --/GA GAGAGAAGAG 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 GA 3 4 319346 CASAVA_Build 22 25631640 1D AGTAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 12 11 319347 CASAVA_Build 22 25632545 3D TTTCAGAGAC TTT/--- TATGCGAGTG 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 T 4 1 319348 CASAVA_Build 22 25632785 1I GCAAGAGACG -/T TAAGTGGGAA 3070 het 3070 ref 47 20 15 12 T 1 2 319349 CASAVA_Build 22 25633640 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGCCTCGGC 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 CTC 1 0 319350 CASAVA_Build 22 25645531 2I GGGAGGCAGA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 AG 5 6 319351 CASAVA_Build 22 25648222 2I2M3I CACTTACTGC --TA---/AGTAAGT GCTTTTAATA 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 N/A 0 0 319352 CASAVA_Build 22 25652438 3D CAGCAGGACA TCT/--- TCTTTGAGAG 3070 het 3070 ref 52 30 19 3 TCT 2 1 319353 CASAVA_Build 22 25652644 3I TGCTGAGGAT ---/GTG GTGGGAAAGA 3070 het 3070 ref 50 24 18 8 GTG 1 2 319354 CASAVA_Build 22 25654566 2D CTTTAATCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 9 T 12 10 319355 CASAVA_Build 22 25657265 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 31 16 9 6 T 8 7 319356 CASAVA_Build 22 25657523 2I TATATATATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 272 hom 31 1 19 11 GT 7 8 319357 CASAVA_Build 22 25667782 1I ACTTTACCTC -/T TGTTTCCCCA 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 1 2 319358 CASAVA_Build 22 25669198 1D CTTGATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 39 0 16 23 T 17 16 319359 CASAVA_Build 22 25676231 1D TCCCTCTGCT G/- GGGTCACGCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 G 4 3 319360 CASAVA_Build 22 25691284 1I CTTAGCAGGA -/T TTTTTTTTTT 2882 het 2882 ref 30 13 8 9 T 10 11 319361 CASAVA_Build 22 25692294 2D GATGCACATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 59 24 21 16 TG 7 6 319362 CASAVA_Build 22 25693100 2D ACTAAGTTCA AG/-- AGAGGGGTTG 3070 het 3070 ref 58 30 25 3 AG 3 2 319363 CASAVA_Build 22 25704740 1I ACATCCCCTT -/G GGGAGCACCT 155 het 155 ref 43 32 3 8 G 3 4 319364 CASAVA_Build 22 25735124 1D CTCAATCAAA T/- TAAAAGGGGT 3070 hom 107 het 42 0 31 12 T 2 1 319365 CASAVA_Build 22 25735311 1D CTAGGCACTT G/- GGCACACCAG 3070 het 3070 ref 37 24 9 5 G 3 2 319366 CASAVA_Build 22 25737074 1I AGAAACTTTC -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 A 6 7 319367 CASAVA_Build 22 25739117 2I TATGAGAGAC --/TG TGTGCACAGA 3070 hom 126 het 70 0 48 22 TG 2 3 319368 CASAVA_Build 22 25741982 1I TTAGTTGTAG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 8 9 319369 CASAVA_Build 22 25748975 3D TGGGAGAAGG AGA/--- AGAAGGTGGA 3070 hom 90 het 36 0 30 7 AGA 2 1 319370 CASAVA_Build 22 25749349 1I TCCTTCACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 260 hom 19 1 13 5 T 9 10 319371 CASAVA_Build 22 25757436 1I GGTATGGGCA -/G GGGTGGGCTC 3070 het 3070 ref 42 14 13 15 G 3 4 319372 CASAVA_Build 22 25760964 3D TTTTTTTTTT TTA/--- ACAGAGTTTC 3070 het 2008 hom 22 10 8 4 TTA 1 0 319373 CASAVA_Build 22 25764859 1I TGGAGCGATG -/C CCCTGGCTGC 3070 hom 119 het 45 0 40 5 C 3 4 319374 CASAVA_Build 22 25770666 1I GGGGCCGAGG -/C CTAGGGCAGC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 C 1 2 319375 CASAVA_Build 22 25782232 1I CATTCTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 T 12 13 319376 CASAVA_Build 22 25799372 1I AAGCCAATTA -/G TAAGAACGAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 G 0 1 319377 CASAVA_Build 22 25800351 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2994 hom 17 het 25 0 11 14 T 14 13 319378 CASAVA_Build 22 25801191 4D AAAGAAGGAT GGAA/---- GGAAGGAAGG 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 GGAA 3 2 319379 CASAVA_Build 22 25810378 1D TATGGGCTCT G/- AATGTAGAGT 3070 het 3070 hom 52 18 23 12 G 1 0 319380 CASAVA_Build 22 25815266 1I ACTTCTTCGA -/G GCTCTTAGCC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 1 2 319381 CASAVA_Build 22 25817123 4I AGGGTGGTAC ----/TGGA TGGAGTTCGG 3070 hom 108 het 42 0 34 8 TGGA 1 2 319382 CASAVA_Build 22 25818522 1I CATGGCAGCT -/A AAAATGTCTA 3070 hom 125 het 47 0 41 6 A 4 5 319383 CASAVA_Build 22 25818702 2I CACCACATAG --/CA CACACACACA 3070 het 892 hom 77 4 53 20 CA 6 7 319384 CASAVA_Build 22 25818863 1D ACACACCCCC G/- CCATACATAC 3070 het 3070 hom 84 34 43 8 G 1 0 319385 CASAVA_Build 22 25819109 2D TCACGCAACT CA/-- CACATAGTAC 3070 het 3070 hom 87 27 49 12 CA 3 2 319386 CASAVA_Build 22 25821932 1D TTTCATAGAT G/- GGGATCTGAG 3070 het 3070 hom 43 20 19 5 G 4 3 319387 CASAVA_Build 22 25851800 2I GCAGAAATCG --/AT AGAGTAAAAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AT 0 1 319388 CASAVA_Build 22 25863216 3D2M2I TTTCACAGGG GTCTG--/---AGAA TCTCAGTGAC 3070 hom 153 het 54 0 51 4 N/A 0 0 319389 CASAVA_Build 22 25865035 1I CCTTTATAAC -/A AAAAAGGCCC 3070 hom 98 het 38 0 32 6 A 5 6 319390 CASAVA_Build 22 25866399 1I TTCAAAGCAT -/G GCTGTCTGCC 3070 hom 90 het 40 0 30 10 G 1 2 319391 CASAVA_Build 22 25869979 1D AAATAGTTTC T/- TTTTTCAAAG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 6 5 319392 CASAVA_Build 22 25870707 2D TTCTTGGGGT GG/-- GGGGGGGGTG 2450 het 144 hom 16 2 6 8 G 10 8 319393 CASAVA_Build 22 25879682 1D CTTTTCATTG C/- CTGAGTAGTA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 C 2 1 319394 CASAVA_Build 22 25882274 1I GGAAACTTAT -/A AACAAAAATC 3070 hom 169 het 61 0 57 4 A 2 3 319395 CASAVA_Build 22 25899802 1I TTCCTTCCCA -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 7 8 319396 CASAVA_Build 22 25901040 1I ACCTTCCCCT -/C CCTGCTCCAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 C 2 3 319397 CASAVA_Build 22 25913803 1D AATTTCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 11 10 319398 CASAVA_Build 22 25939785 1I GGACCGTGGG -/C CTTCTGGGGT 3070 hom 75 het 34 0 25 9 C 1 2 319399 CASAVA_Build 22 25941145 12I TGTGGTGACA ------------/GCCCACTGGATG GCGTGACCCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GCCCACTGGATG 0 1 319400 CASAVA_Build 22 25959161 1I TGAAATTTTC -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 T 6 7 319401 CASAVA_Build 22 25974270 1D CCAGAGACTT C/- CCGCTTGCAG 3070 het 3070 hom 39 13 24 2 C 3 2 319402 CASAVA_Build 22 25975161 7D GCAGAGACCC CAGGCAT/------- CAAGGCCACA 3070 hom 117 het 41 0 36 6 CAGGCAT 1 0 319403 CASAVA_Build 22 25997147 1D GCGGAAGGGG A/- TGCACCATCC 3070 het 3070 hom 40 16 13 12 A 1 0 319404 CASAVA_Build 22 26010903 1D CAGGGGGGGG A/- AAAGAAAACC 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 A 4 3 319405 CASAVA_Build 22 26026410 1D TCACAGCACA G/- GGGGGAAGAC 2500 het 2500 ref 18 9 7 3 G 6 5 319406 CASAVA_Build 22 26046392 1D GGGCTGATTT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 A 8 7 319407 CASAVA_Build 22 26050852 4I TAGGTAGGTT ----/GATA GATGGACGGG 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 GATA 0 1 319408 CASAVA_Build 22 26075559 3I GAGTTTCCCC ---/CTT CTTCTCTTCC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 CTT 1 2 319409 CASAVA_Build 22 26077379 1D TGAGTCTGTA T/- TTACAAAGGT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 3 2 319410 CASAVA_Build 22 26078021 2D CTCTCTAGCA TG/-- TGATAGCTTA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 TG 2 1 319411 CASAVA_Build 22 26079666 1D GTCTGGCTAG T/- TTTTTAAATT 2706 het 2706 ref 23 15 6 2 T 6 5 319412 CASAVA_Build 22 26093114 2I ATCGCACGTC --/TG TATTCCAGCT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 TG 0 1 319413 CASAVA_Build 22 26103789 1D TCAGGGGGGA G/- GGGGGATGAA 3070 het 1062 hom 20 5 9 6 G 6 5 319414 CASAVA_Build 22 26107447 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 31 0 18 13 T 11 10 319415 CASAVA_Build 22 26111669 1I TTGATGGAGT -/C CCCCACACCC 3070 hom 141 het 49 0 45 4 C 4 5 319416 CASAVA_Build 22 26114833 1D CCATCACAGT G/- GGGGTATAGC 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 G 5 4 319417 CASAVA_Build 22 26123490 3D TAACCCCCAT AGG/--- AGAAGAGTGG 2958 het 2958 ref 41 29 8 4 AGG 1 0 319418 CASAVA_Build 22 26129555 1D CTCAAAAAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 33 0 22 12 T 9 8 319419 CASAVA_Build 22 26130629 8D GCTGGGCCAC AAAGGGGA/-------- AAATTACTGA 3070 hom 84 het 29 0 29 2 AAAGGGGA 1 0 319420 CASAVA_Build 22 26133615 1I CCCTCCCAGC -/A AGGGGCCTGG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 2 319421 CASAVA_Build 22 26212166 1I TTTTCTTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 9 10 319422 CASAVA_Build 22 26219921 1D ACATCAACGG T/- TGGCAAACCA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 2 1 319423 CASAVA_Build 22 26221315 13D GAGTGATGAG TGATGAGCAAAAC/------------- CTGGGCAATG 3070 hom 63 het 25 0 22 4 TGATGAGCAAAAC 1 0 319424 CASAVA_Build 22 26221955 1I AAGTGGGGCT -/G GGGGGGAGGT 3070 hom 48 het 21 0 14 7 G 6 7 319425 CASAVA_Build 22 26224755 4D TTGATGGTCT CTAA/---- CTAACAGTTT 3070 hom 105 het 39 0 33 6 CTAA 2 1 319426 CASAVA_Build 22 26231698 1D ATCAGTCCTT G/- GCTGAGGCTC 3070 hom 111 het 38 0 36 2 G 2 1 319427 CASAVA_Build 22 26232027 1D AATCCTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 28 4 10 14 T 17 16 319428 CASAVA_Build 22 26245948 1I CCCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 9 10 319429 CASAVA_Build 22 26257416 1I ATTTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 20 8 A 11 12 319430 CASAVA_Build 22 26259179 1I GAGAAAGAAT -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 A 6 7 319431 CASAVA_Build 22 26261699 1I TAATGATTTC -/A AAAAAAAAGA 1769 het 1769 ref 30 15 6 12 A 8 9 319432 CASAVA_Build 22 26273253 2D ATTATACATC AT/-- ATATATATAT 1563 het 559 hom 12 3 6 3 AT 9 8 319433 CASAVA_Build 22 26281808 15I AAGACTTCTC ---------------/TGAGAAGTGGTGTTT AGAGGTGGTG 3070 hom 105 het 39 0 33 7 TGAGAAGTGGTGTTT 0 1 319434 CASAVA_Build 22 26293500 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 9 10 319435 CASAVA_Build 22 26316964 2I GGAAGGATGG --/GA GAGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 GA 4 5 319436 CASAVA_Build 22 26319820 1I TTTTCCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 24 8 6 A 10 11 319437 CASAVA_Build 22 26323529 1D GCTGAAGCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 A 12 11 319438 CASAVA_Build 22 26339270 1I CTGGGGCAGA -/G GGGGGTGCAG 3070 het 2688 hom 27 9 13 5 G 5 6 319439 CASAVA_Build 22 26339536 1D TCTCGGGGGC A/- GGGGGAAAAG 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 A 1 0 319440 CASAVA_Build 22 26351467 1D CAAAAAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 66 hom 21 1 14 6 T 13 12 319441 CASAVA_Build 22 26355959 2D GAAAAAAAGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 AT 7 6 319442 CASAVA_Build 22 26369278 2I CAAAAAAATC --/AA AAAAAATTAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 6 8 319443 CASAVA_Build 22 26381514 2I GGATAGGAGG --/AA AAGGGTGTAG 3070 hom 131 het 47 0 41 6 A 2 4 319444 CASAVA_Build 22 26381796 20D TTGAAGGAGT GATGGATGGATGGATGGATG/-------------------- GATGGATGGA 3070 hom 78 het 32 0 24 13 GATG 10 5 319445 CASAVA_Build 22 26389996 1D AGATTGTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 10 9 319446 CASAVA_Build 22 26394814 1D CCCTGCCCTG C/- CCCCACCCAC 3070 hom 47 het 20 0 15 5 C 5 4 319447 CASAVA_Build 22 26397873 1D TACAGGGCCC T/- TTTTTTTTTC 1761 hom 10 het 5 0 4 1 T 10 9 319448 CASAVA_Build 22 26400610 2I CCTTTTCCCT --/TC TCTCTTTTCC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 TC 2 3 319449 CASAVA_Build 22 26486498 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 A 8 9 319450 CASAVA_Build 22 26496436 9D TGGGCAGAGA ATCATGTGG/--------- ATTCAGGATC 3070 het 3070 ref 30 12 12 8 ATCATGTGG 1 0 319451 CASAVA_Build 22 26501937 1I AAAGGGAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 66 het 23 0 21 2 A 8 9 319452 CASAVA_Build 22 26511735 2D AACAGGTGTG CC/-- CCCCCCCCAT 2180 het 86 hom 15 1 6 9 C 10 8 319453 CASAVA_Build 22 26548316 1I ATTTTTTTTG -/T TTTTTTGTTT 2638 het 2638 ref 16 9 6 1 T 6 7 319454 CASAVA_Build 22 26579924 1I ATAACTTAAA -/T TTTTTTTTTT 1159 het 1159 ref 36 23 3 10 T 13 14 319455 CASAVA_Build 22 26581028 1I TGAAGTGATG -/T TTCATAACCA 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 T 2 3 319456 CASAVA_Build 22 26646592 1I GGCAGTCCCT -/G GGAGTCACCG 3070 hom 37 het 16 0 11 5 G 2 3 319457 CASAVA_Build 22 26782599 4I CCATAATACA ----/TTTG TTTATGGTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 TTTG 0 1 319458 CASAVA_Build 22 26884737 1D CTTGTCGTAT C/- TAAAAATCAC 1201 het 1201 ref 34 27 3 4 C 1 0 319459 CASAVA_Build 22 26961209 1I TATTGTTTTG -/T TTTTTTATTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 6 7 319460 CASAVA_Build 22 26980481 1I TTAATGGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 38 1 20 17 A 12 13 319461 CASAVA_Build 22 27007387 1D ATCAATGACT A/- ATTTGATTTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 2 1 319462 CASAVA_Build 22 27014801 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1810 hom 21 6 11 4 A 15 16 319463 CASAVA_Build 22 27050417 1D GGAGAGACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 12 11 319464 CASAVA_Build 22 27051058 1I CCTCCTTGTA -/C CTCTGGTTGA 2122 hom 12 het 6 0 5 1 C 1 2 319465 CASAVA_Build 22 27060002 1D CCCCCACCCC A/- CAACAGACCC 1061 het 1028 hom 9 2 3 4 A 1 0 319466 CASAVA_Build 22 27068569 1I TCTCATAGAT -/A AAAAATGGAC 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 A 5 6 319467 CASAVA_Build 22 27069518 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 108 hom 22 2 14 6 A 14 15 319468 CASAVA_Build 22 27099808 1I AAACATAAAA -/T AGCAGTTAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 0 1 319469 CASAVA_Build 22 27130978 1D ATAGTGTGTG T/- TGTTGAGACA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 2 1 319470 CASAVA_Build 22 27135917 1D GTGCTAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 15 0 12 3 T 11 10 319471 CASAVA_Build 22 27136999 9I TGGTAATTTG ---------/AAAATGAAA AAAATGAAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 8 AAAATGAAA 1 2 319472 CASAVA_Build 22 27139738 1I GCTAAAAGTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 8 9 319473 CASAVA_Build 22 27142646 1D TGACTTGGCT C/- AGTTTCGTCA 3070 het 3070 ref 49 24 23 2 C 1 0 319474 CASAVA_Build 22 27178670 1I GAATGGGACA -/G GGGGCGGTTA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 G 4 5 319475 CASAVA_Build 22 27215292 1D ATTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 12 11 319476 CASAVA_Build 22 27232040 1I CTTCCTTAAG -/T GGGACCTCAA 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 T 0 1 319477 CASAVA_Build 22 27255240 3I ATGGCACACC ---/AGG AGATTATATC 3070 hom 33 het 13 0 11 2 AGG 0 1 319478 CASAVA_Build 22 27292088 1D TGGGTCAATA C/- CCCTGCTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 18 10 C 4 3 319479 CASAVA_Build 22 27310961 1I GACTACAAAT -/A ATAGACTATT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 1 2 319480 CASAVA_Build 22 27346338 1I TCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2273 hom 27 10 9 8 A 13 14 319481 CASAVA_Build 22 27367311 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2876 hom 32 8 15 11 A 12 11 319482 CASAVA_Build 22 27410557 1D AGAGAAAATT A/- AGAGTGAGGT 1646 het 1646 ref 36 27 5 5 A 2 1 319483 CASAVA_Build 22 27410681 3D TGATTGGCTT ACA/--- ACAACACAGA 1272 het 1272 ref 37 27 3 9 ACA 3 2 319484 CASAVA_Build 22 27412752 1D TCTTTGCACA G/- GGCCTCCCTG 3070 het 3070 hom 35 10 13 12 G 3 2 319485 CASAVA_Build 22 27413809 1D TACAAACTAT A/- AAAAAACAGA 2161 het 2161 ref 27 21 5 1 A 7 6 319486 CASAVA_Build 22 27454963 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 82 het 35 0 28 7 A 8 9 319487 CASAVA_Build 22 27460348 1I TCTGTAAGTG -/T TTTTTCTGAA 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 T 5 6 319488 CASAVA_Build 22 27462753 1D CATAGTGGGA C/- CCCCCCCGCC 3070 het 1963 hom 27 8 11 8 C 8 7 319489 CASAVA_Build 22 27463463 1D TGATTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1410 het 1410 ref 28 11 5 12 T 17 16 319490 CASAVA_Build 22 27480134 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 9 8 319491 CASAVA_Build 22 27489477 1D CCCTGCCTGG A/- AAAAAAAAAG 1634 het 1634 ref 38 27 4 8 A 10 9 319492 CASAVA_Build 22 27495935 1D CTAAATACCA C/- CCTACCCTAA 3070 het 3070 hom 38 19 18 1 C 3 2 319493 CASAVA_Build 22 27605938 2I CTGGTATGTG --/TT TGCATGTGGG 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 T 1 3 319494 CASAVA_Build 22 27613397 4D TGTCAGTGTC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 38 13 17 9 AG 8 6 319495 CASAVA_Build 22 27630074 1D TCTAAACTGG A/- AAAAAAAAAT 944 het 944 ref 37 29 3 5 A 10 9 319496 CASAVA_Build 22 27637680 1D TTTCTGAGAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 T 9 8 319497 CASAVA_Build 22 27638651 3D CTTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1119 het 164 hom 16 3 5 8 T 19 16 319498 CASAVA_Build 22 27644823 1D AGCACAGCAG C/- CTAAAAGAAC 3070 hom 90 het 33 0 29 4 C 2 1 319499 CASAVA_Build 22 27670743 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 968 hom 10 het 4 0 4 0 A 19 18 319500 CASAVA_Build 22 27675950 1I CCACGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 44 2 33 9 T 10 11 319501 CASAVA_Build 22 27704723 1I TCCCAGAGGC -/A AACCATTTTC 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 A 2 3 319502 CASAVA_Build 22 27710120 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAAAACCT 3070 het 2347 hom 26 10 11 6 A 8 7 319503 CASAVA_Build 22 27727788 4I AAGTCTGGTT ----/TATC TATCTATTTT 3070 het 2562 hom 21 8 11 2 TATC 1 2 319504 CASAVA_Build 22 27733466 1I TCTCTACAAA -/T TTTTTTTTTT 1573 het 1573 ref 23 10 5 8 T 13 14 319505 CASAVA_Build 22 27742417 3D TTCCTTTGTT CTA/--- CTAAGTAAAG 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 CTA 2 1 319506 CASAVA_Build 22 27768755 1I TTGGGGCACA -/G GGGGGCATTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 G 5 6 319507 CASAVA_Build 22 27770281 1D TTTTAAAGGG A/- AAAAAAAAAG 1205 het 1205 ref 37 27 3 7 A 10 9 319508 CASAVA_Build 22 27780841 1D TATCCCATTT C/- CCCCACGGAA 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 C 5 4 319509 CASAVA_Build 22 27783443 1I ACATGACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 17 23 10 A 10 11 319510 CASAVA_Build 22 27791419 1D AAGAACAAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 49 18 27 5 A 9 8 319511 CASAVA_Build 22 27795796 1D GCTTGCACAC A/- AATTTCTGAG 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 A 3 2 319512 CASAVA_Build 22 27804483 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 2599 het 1642 hom 21 5 7 9 AAG 5 6 319513 CASAVA_Build 22 27806465 1D GTGCATGGCC A/- ATGCAGAGCT 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 A 2 1 319514 CASAVA_Build 22 27808080 1D5M22I TGGATTATAT CCAGTT----------------------/-CAGTTTATCTCCTTTTCATCTAACTGA GACCTTCAGA 3070 het 3070 ref 36 20 14 5 N/A 0 0 319515 CASAVA_Build 22 27810318 1I TGCCTAAACT -/G GGGATGTATC 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 G 3 4 319516 CASAVA_Build 22 27811959 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 11 9 A 11 12 319517 CASAVA_Build 22 27815306 1D ATCACTACTC A/- GCTGGTTGCT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 1 0 319518 CASAVA_Build 22 27837673 1I TTTACTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3027 hom 19 9 8 2 A 12 13 319519 CASAVA_Build 22 27838939 1I ACAAGTCAGA -/G GGCAGTGGCC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 2 3 319520 CASAVA_Build 22 27841432 2I ATAAAAAAAA --/AC AAAAAACCAG 3070 het 3070 hom 41 19 13 9 AC 0 1 319521 CASAVA_Build 22 27852104 1D GGAGGCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 41 1 27 14 A 13 12 319522 CASAVA_Build 22 27859637 2D CTTCTTTGTC TG/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 17 17 9 TG 1 0 319523 CASAVA_Build 22 27876210 1D AGCAACTGGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 46 het 23 0 11 13 G 11 10 319524 CASAVA_Build 22 27881099 1D ATAAGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 25 0 20 5 T 12 11 319525 CASAVA_Build 22 27882533 17D TCCAGGCCTT GGAATGCTCTCCGCACA/----------------- GGAATGCTCT 3070 hom 58 het 27 0 17 12 GGAATGCTCTCCGCACA 2 1 319526 CASAVA_Build 22 27883133 1I CTATGCCAAG -/C TCAGAGGAGC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 0 1 319527 CASAVA_Build 22 27885640 4D ATAAATAAAT AAAC/---- AAACATTCAG 3070 hom 90 het 33 0 29 7 AAAC 2 1 319528 CASAVA_Build 22 27886978 4D CTAGATTAAC AAAG/---- AAAGAGAGAT 3070 hom 130 het 48 0 44 5 AAAG 2 1 319529 CASAVA_Build 22 27894624 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 24 1 21 3 A 11 10 319530 CASAVA_Build 22 27899017 3D TGCAGAAGAA GAG/--- AAGGCCATGT 3070 hom 93 het 37 0 28 11 GAG 1 0 319531 CASAVA_Build 22 27905920 6I CTCCGTCTCA ------/AAAAAG AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 14 0 12 2 AAAAAG 0 1 319532 CASAVA_Build 22 27921975 1D GGCCGGGGGT G/- GGGGGAAACC 3070 hom 56 het 22 0 16 6 G 6 5 319533 CASAVA_Build 22 27923560 1D CTGATGGATG T/- TATTTAATTT 3070 het 352 hom 31 3 26 2 T 2 1 319534 CASAVA_Build 22 27924629 1I AAACAGTCCA -/T TAAGGCTGGG 3070 hom 90 het 34 0 30 5 T 1 2 319535 CASAVA_Build 22 27925125 1I19M2I TAAAAATATG -AAAAAAAAATTTTAAAAAG--/AAAAAAAAAATTTTAAAAAGAA AATGTTATTA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 N/A 0 0 319536 CASAVA_Build 22 27928197 1I AAGGCTGTGG -/C CTTACACGGT 3070 hom 39 het 23 0 14 9 C 1 2 319537 CASAVA_Build 22 27947239 3D TTGAGGCTAG GGA/--- GGAGCCCTTC 2394 hom 53 het 21 0 15 6 GGA 2 1 319538 CASAVA_Build 22 27956326 1D TCCATCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 28 1 19 9 A 12 11 319539 CASAVA_Build 22 27967783 1I TCCCCAAACA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 59 het 27 0 23 4 T 7 8 319540 CASAVA_Build 22 27969136 1D GCTTGAGCTC T/- TGTTTTGCCA 3070 hom 120 het 42 0 40 3 T 2 1 319541 CASAVA_Build 22 27970747 5I CGTGGGGGAA -----/AGACG AGACGAGGAC 3070 hom 84 het 29 0 27 2 AGACG 1 2 319542 CASAVA_Build 22 27974808 1D CCAACCTGGG C/- GACAGAGCAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 1 0 319543 CASAVA_Build 22 27976551 1I TTATTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 10 11 319544 CASAVA_Build 22 27981021 4D GAGCCAGGCC CTCA/---- CTCACCCCAG 3070 hom 54 het 21 0 17 4 CTCA 2 1 319545 CASAVA_Build 22 28001058 1D ATTCCTAACC T/- CTTCTAGGGT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 T 1 0 319546 CASAVA_Build 22 28007358 1D GTACGCGATC T/- AACAGCTCAC 3070 hom 27 het 13 0 9 4 T 1 0 319547 CASAVA_Build 22 28007399 1D CCCCAGCAGT C/- CCTCCCACCT 1787 hom 15 het 14 0 5 10 C 3 2 319548 CASAVA_Build 22 28009684 1D CTGGCAAAAA T/- TTTTTTTTTT 1524 het 1524 ref 16 7 5 4 T 11 10 319549 CASAVA_Build 22 28021522 1D TCAGTTTTTA G/- GGTATCACGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 3 2 319550 CASAVA_Build 22 28028186 1D CATTGAGAGG C/- CTGAATTGAG 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 C 2 1 319551 CASAVA_Build 22 28030689 2D TGGTTTCCTC TG/-- AGGCTCCAGC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TG 1 0 319552 CASAVA_Build 22 28043071 5D TCCGCTTTCA CTCCT/----- CTCCTCAGCC 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 CTCCT 2 1 319553 CASAVA_Build 22 28093328 3I TGGTGCAGAG ---/GGA GGAGGAGAAG 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 GGA 2 3 319554 CASAVA_Build 22 28100275 4I CATCCAGAGG ----/AAAT AAAGTCTTTG 2326 het 2326 ref 25 16 6 3 AAAT 0 1 319555 CASAVA_Build 22 28106404 1D CAGAACCCCC G/- GGCACACATG 3070 het 3043 hom 35 10 18 8 G 3 2 319556 CASAVA_Build 22 28129148 2D TCATAGACAT AG/-- AGAGATCCCA 2090 het 2090 ref 45 31 5 9 AG 3 2 319557 CASAVA_Build 22 28129259 1D GGAATTCCTG A/- AATGGGAACA 1784 het 1784 ref 35 26 5 4 A 3 2 319558 CASAVA_Build 22 28134951 1I CCAAGTGAAT -/A AAAGGCCTTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 3 4 319559 CASAVA_Build 22 28140204 12I ACATTCCTTT ------------/TTATATAAATTC TGCACCCCCA 1735 het 1735 ref 21 9 4 8 TTATATAAATTC 0 1 319560 CASAVA_Build 22 28149005 2D TTCCTGCCAC AT/-- GTTTCCAGGC 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 AT 1 0 319561 CASAVA_Build 22 28164086 1D TGATCTCAAA C/- TCCTTGGCTC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 C 1 0 319562 CASAVA_Build 22 28167567 3D GCCAACAACT TCC/--- TCCTCATTTC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 TCC 2 1 319563 CASAVA_Build 22 28168949 1D CTAACAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 881 hom 18 2 12 4 A 15 14 319564 CASAVA_Build 22 28170811 1I GACTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 19 11 A 13 14 319565 CASAVA_Build 22 28175339 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1914 het 1068 hom 15 5 5 5 A 17 16 319566 CASAVA_Build 22 28178163 1D TCTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2236 het 1005 hom 9 2 5 2 T 12 11 319567 CASAVA_Build 22 28193605 15D ACTCCCCCAG TGCCCAGACTGGTGC/--------------- TGCCCAGACT 3070 het 3070 ref 38 18 14 12 TGCCCAGACTGGTGC 2 1 319568 CASAVA_Build 22 28199347 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1343 het 1343 ref 31 14 4 13 T 15 14 319569 CASAVA_Build 22 28219325 3D CAAAATACTT ATA/--- ATGATGACAG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 ATA 1 0 319570 CASAVA_Build 22 28220308 4I ACCAAAAATT ----/AAAC AAACAAACTA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 AAAC 2 3 319571 CASAVA_Build 22 28224103 1D ACCTGCTCAT C/- CCTGGAGCTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 3 2 319572 CASAVA_Build 22 28252043 7D AAAAACTAAC TACTAGG/------- TATTATGCCC 3070 hom 114 het 42 0 38 5 TACTAGG 1 0 319573 CASAVA_Build 22 28272542 10D CCTCAGGCTT GGAGATTACA/---------- GTGGGTAGCT 2004 hom 15 het 8 0 6 3 GGAGATTACA 1 0 319574 CASAVA_Build 22 28285237 1D ATTTTTAGTG T/- TAACACTTCC 3070 hom 102 het 39 0 34 6 T 2 1 319575 CASAVA_Build 22 28292131 1I19M1I GAATTTTTTC -TTTTTAAAATCTTTTCTTC-/TTTTTTAAAATCTTTTCTTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 28 0 24 4 N/A 0 0 319576 CASAVA_Build 22 28302003 1I ACACTTGGCC -/T TTTTTTTTTT 826 het 119 hom 9 1 3 5 T 13 14 319577 CASAVA_Build 22 28344456 1D CTGCAGAGAT A/- GGGGGAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 1 0 319578 CASAVA_Build 22 28367169 1I GTTGCTTTTT -/C CCCCCCTCTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 C 6 7 319579 CASAVA_Build 22 28398769 1D CACATCCAGC T/- TTTTTTTTTT 2831 het 1538 hom 13 4 8 2 T 12 11 319580 CASAVA_Build 22 28500856 1D TTAAGAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1312 het 1312 ref 42 33 3 6 T 12 11 319581 CASAVA_Build 22 28510154 1I GAAAGAACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 11 12 319582 CASAVA_Build 22 28511883 9D TCCCATGTCA CTACCAAGT/--------- CTACCAAGTC 3070 hom 66 het 26 0 23 4 CTACCAAGT 2 1 319583 CASAVA_Build 22 28535843 1I TATACTAATT -/A AAAAAAAAAC 2489 het 2489 ref 21 7 7 7 A 9 10 319584 CASAVA_Build 22 28556568 1I CCAGGCCAAA -/G GCCTCCCTGC 3070 hom 93 het 35 0 26 9 G 1 2 319585 CASAVA_Build 22 28590078 1I CCGGGCCCTG -/C CCTATGTAGC 3070 hom 60 het 26 0 16 10 C 2 3 319586 CASAVA_Build 22 28598050 19D TCTGTGTGCC TTGACCTCTGCAAAAACAA/------------------- TTGACCTCTG 3070 hom 70 het 33 0 22 14 TTGACCTCTGCAAAAACAA 2 1 319587 CASAVA_Build 22 28604423 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 17 16 319588 CASAVA_Build 22 28606123 1I TTTTTTTTTT -/C TTTCTTAATT 3070 hom 71 het 31 0 24 7 C 0 1 319589 CASAVA_Build 22 28611368 1D AAACTTAAAG A/- GATGCAAATT 3070 het 3070 ref 49 29 18 2 A 1 0 319590 CASAVA_Build 22 28617107 1D AGAGAAAAAG A/- AAAAAATTGA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 7 6 319591 CASAVA_Build 22 28617401 2I TATATATAAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AT 5 6 319592 CASAVA_Build 22 28630810 8D GTGTGTGTGT TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 hom 132 het 51 0 44 9 TG 10 6 319593 CASAVA_Build 22 28632485 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 22 0 13 9 T 12 11 319594 CASAVA_Build 22 28642557 4I CAGTTCGGTG ----/CTGT CTATTGTTCA 3070 hom 138 het 52 0 47 6 CTGT 0 1 319595 CASAVA_Build 22 28645680 1I CCTAGCTAAT -/A AAAAAAAAAA 788 het 788 ref 41 23 4 14 A 13 14 319596 CASAVA_Build 22 28747457 1I AGGTTCTCAA -/G GGAGGTGCTT 3070 hom 120 het 46 0 39 7 G 2 3 319597 CASAVA_Build 22 28756331 5D CTAGCTTATA AGATT/----- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 17 8 AGATT 1 0 319598 CASAVA_Build 22 28763172 1D TGTGTAATGG T/- TTAAATCGAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 3 2 319599 CASAVA_Build 22 28767415 1D TTTCATGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 12 11 319600 CASAVA_Build 22 28771827 1I CATTCCTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 302 hom 21 1 14 6 A 12 13 319601 CASAVA_Build 22 28777791 1D AATATGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 16 15 319602 CASAVA_Build 22 28783798 1D TCTCTATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 26 1 17 8 T 13 12 319603 CASAVA_Build 22 28802912 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 14 6 A 12 13 319604 CASAVA_Build 22 28817256 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2318 het 102 hom 16 2 6 8 T 18 17 319605 CASAVA_Build 22 28818335 1I GATCCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 2007 het 125 hom 34 3 13 18 T 17 18 319606 CASAVA_Build 22 28826099 1D GAACCAAAAA G/- GAGCCCATAT 3070 hom 48 het 18 0 17 2 G 2 1 319607 CASAVA_Build 22 28846948 2D GGAATTGTAT AC/-- ACACTGTCTT 3070 hom 144 het 59 0 47 13 AC 3 2 319608 CASAVA_Build 22 28859456 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 24 het 14 0 9 5 AT 5 6 319609 CASAVA_Build 22 28884070 1I TAGGGCAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 30 het 25 1 20 4 A 9 10 319610 CASAVA_Build 22 28896609 1D TCTTTTCATG T/- TTCATTGTCT 3070 het 3070 hom 53 18 25 10 T 3 2 319611 CASAVA_Build 22 28904124 7D AGCACTACTG AGTAATT/------- AGTTAATCTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AGTAATT 1 0 319612 CASAVA_Build 22 28911996 1D TGTTTTTCTT G/- GGGGGGGAGG 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 8 7 319613 CASAVA_Build 22 28914389 1D ATCTCTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 11 10 319614 CASAVA_Build 22 28915310 1D TCCAAAGAGA C/- TCCTTCAAGG 3070 hom 42 het 23 0 14 9 C 1 0 319615 CASAVA_Build 22 28924014 1I AAAATATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 10 11 319616 CASAVA_Build 22 28924498 1D AGCACAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 40 1 20 19 T 12 11 319617 CASAVA_Build 22 28929230 1D CAAAATATAC A/- AAAATTAGCT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 5 4 319618 CASAVA_Build 22 28937924 3D TAGCGGGGCA TGG/--- TGGTGGTGGT 3070 hom 87 het 33 0 30 5 TGG 4 3 319619 CASAVA_Build 22 28939259 4D TTCTCTCCTG CATT/---- CATTCATTCA 3070 hom 71 het 26 0 22 7 CATT 3 2 319620 CASAVA_Build 22 28949252 7D ATGTACTAAG GGACTGA/------- GGACTGAGGC 1832 het 1832 ref 20 9 7 6 GGACTGA 2 1 319621 CASAVA_Build 22 28951952 2I TGCCTCGAGC --/CT CTCTCTCCCT 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 CT 3 4 319622 CASAVA_Build 22 28958250 2I GGCAAGATCG --/TC TCTCTGACCG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 TC 2 3 319623 CASAVA_Build 22 29049960 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 55 het 24 0 18 6 A 10 9 319624 CASAVA_Build 22 29087830 2D ACCTGCCCCT TC/-- TCTCCCCTCC 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 TC 3 2 319625 CASAVA_Build 22 29100893 1D TGTCCAAAAC G/- GGGGGGCCTT 3070 hom 54 het 26 0 15 12 G 7 6 319626 CASAVA_Build 22 29119342 1I TAGAGGGCAC -/G GGCCAGCAGC 3070 hom 114 het 43 0 36 7 G 2 3 319627 CASAVA_Build 22 29143553 1I CTGCTACACT -/G GGGGTATCTC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 4 5 319628 CASAVA_Build 22 29152921 1I AAGTCCCTGT -/G GGACACTCCA 3070 hom 81 het 33 0 24 9 G 2 3 319629 CASAVA_Build 22 29163686 1I CATGTGAGCC -/G GGGGTGGCGG 3070 hom 68 het 26 0 22 4 G 4 5 319630 CASAVA_Build 22 29167985 1D GTCGATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2802 het 2802 ref 39 17 9 13 A 17 16 319631 CASAVA_Build 22 29168884 1I TGGTCAGACT -/G GTCTCGAACT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 G 1 2 319632 CASAVA_Build 22 29183674 1D CTGGCCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 819 hom 40 3 23 14 T 14 13 319633 CASAVA_Build 22 29184836 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 93 het 35 0 32 6 A 7 6 319634 CASAVA_Build 22 29186682 1I TAAGTGTGGT -/G GCACATGCCT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 G 1 2 319635 CASAVA_Build 22 29192694 1D TGCTGAAGTA T/- CCCTACATTG 3070 hom 81 het 34 0 28 7 T 1 0 319636 CASAVA_Build 22 29195306 1I CAAAAAAAAA -/G AAAAAAAAGC 3070 hom 39 het 39 1 35 3 G 0 1 319637 CASAVA_Build 22 29203907 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 73 hom 24 1 13 11 A 12 11 319638 CASAVA_Build 22 29208624 1I TTCCATTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 898 hom 39 7 22 10 T 13 14 319639 CASAVA_Build 22 29215728 1D GCACACCCCC T/- GAAGCTGGAA 3070 hom 108 het 39 0 32 8 T 1 0 319640 CASAVA_Build 22 29222278 1D TTTTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3035 hom 30 het 15 0 11 4 T 12 11 319641 CASAVA_Build 22 29228841 2D TCTGGCTTGT TA/-- TTATTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TA 1 0 319642 CASAVA_Build 22 29230319 1D TGGGATCACA G/- GCGTGAGCCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 2 1 319643 CASAVA_Build 22 29237102 1D ATCTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 2565 hom 12 het 20 0 8 13 A 17 16 319644 CASAVA_Build 22 29238789 4I CTTCGTCTCA ----/AAAC AAACAAAACA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AAAC 1 2 319645 CASAVA_Build 22 29247821 3I TCCTTCTTTC ---/TCT TCTTTTCTTT 3070 hom 48 het 29 0 16 14 TCT 1 2 319646 CASAVA_Build 22 29259191 1D AAAACCTATA C/- CCCCCTACAA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 6 5 319647 CASAVA_Build 22 29259586 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 17 0 12 6 A 15 14 319648 CASAVA_Build 22 29267191 3I AAAAAAATTT ---/TTG TTATTTATTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TTG 0 1 319649 CASAVA_Build 22 29283775 1D ACTTATTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 11 10 319650 CASAVA_Build 22 29289903 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 18 1 14 3 A 14 13 319651 CASAVA_Build 22 29296774 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 185 hom 22 1 16 6 A 13 12 319652 CASAVA_Build 22 29318951 1D TTTTAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 13 12 319653 CASAVA_Build 22 29325293 1D TTGGTCAAAG T/- TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 7 6 319654 CASAVA_Build 22 29327529 1D CAAACTCTTG C/- CCCTCAAGTG 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 C 4 3 319655 CASAVA_Build 22 29330624 1D TCAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 T 1 0 319656 CASAVA_Build 22 29335577 2D GAGGTGAGGA GG/-- GGGGCAGATG 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 G 6 4 319657 CASAVA_Build 22 29341505 2D GGGAACAGTC AG/-- GGGTGGAGTG 2939 het 2939 ref 41 22 11 8 AG 1 0 319658 CASAVA_Build 22 29344260 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 11 10 319659 CASAVA_Build 22 29347458 3I TCATTTGTTG ---/TTA TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 TTA 0 1 319660 CASAVA_Build 22 29349235 1I GAAGCCTTAG -/C AATTTTTATG 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 C 0 1 319661 CASAVA_Build 22 29350524 3I CAAAAAAGCA ---/TTC TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 TTC 1 2 319662 CASAVA_Build 22 29351390 2D TTTTTAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 12 10 319663 CASAVA_Build 22 29353604 1D AAACACTCTC A/- AAAAAAAAAA 2419 het 2419 ref 31 14 8 9 A 15 14 319664 CASAVA_Build 22 29354450 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2391 het 2391 ref 27 10 6 11 A 13 12 319665 CASAVA_Build 22 29354766 32D CGTGTTGAGT GCGTGGCCTGATAACAGGGTAAGAGTCCAGAG/-------------------------------- GCCCTCCATC 3070 het 3070 ref 33 24 15 5 GCGTGGCCTGATAACAGGGTAAGAGTCCAGAG 1 0 319666 CASAVA_Build 22 29358745 1D ACCCGGGGTC G/- GGGGGTGTCA 2294 het 364 hom 10 1 7 2 G 6 5 319667 CASAVA_Build 22 29365968 2D ATGAAATCTT CA/-- CAATTTATGT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 CA 2 1 319668 CASAVA_Build 22 29370967 2D TATTAGCAGG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 10 8 319669 CASAVA_Build 22 29379973 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2214 het 1367 hom 27 6 8 13 T 12 13 319670 CASAVA_Build 22 29386299 1I GAGAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2192 hom 23 5 15 5 T 10 11 319671 CASAVA_Build 22 29387590 1D CACCCAGCTG T/- TAAAAGAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 2 1 319672 CASAVA_Build 22 29396076 2I TAGTAGAGAT --/GG GGGGTTTCAC 3070 het 1611 hom 22 4 15 3 G 4 6 319673 CASAVA_Build 22 29396510 1I CCAAACTCTT -/C ACTTTTATTT 2283 het 2283 ref 17 7 7 3 C 0 1 319674 CASAVA_Build 22 29398909 10I TCTCGTCTCG ----------/TCCCGTCCCA TCCCGTCCCA 3070 het 3070 ref 52 18 19 15 TCCCGTCCCA 1 2 319675 CASAVA_Build 22 29405643 4I ATGAAAAAAA ----/AGAC AGTTTGAGAG 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AGAC 0 1 319676 CASAVA_Build 22 29406038 2I CCCCACACCC --/CT GTCTTCACAC 3070 het 3070 ref 40 26 11 3 CT 0 1 319677 CASAVA_Build 22 29417159 8I GCGACAGAGC --------/AAATAAAT AAATAAATAA 1874 hom 10 het 10 0 4 6 AAAT 3 5 319678 CASAVA_Build 22 29419959 1I CTCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1247 hom 22 5 14 3 A 13 14 319679 CASAVA_Build 22 29437197 2D GAGCTAGGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AT 8 7 319680 CASAVA_Build 22 29441541 1D AATTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 1693 hom 12 het 10 0 4 6 T 15 14 319681 CASAVA_Build 22 29451005 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2278 hom 12 het 5 0 5 0 A 9 8 319682 CASAVA_Build 22 29493533 1I TCAGAATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1107 hom 33 6 20 7 T 15 16 319683 CASAVA_Build 22 29502103 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 24 1 18 5 T 14 13 319684 CASAVA_Build 22 29502579 1D CTGTGCTCAC T/- TTTTTTTTTT 1387 het 1387 ref 42 31 4 8 T 12 11 319685 CASAVA_Build 22 29523570 4I CACCTGGCCC ----/TATT TATTTATTTT 1342 het 1342 ref 15 10 4 1 TATT 2 3 319686 CASAVA_Build 22 29537152 1D GTATACACAA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 36 het 18 0 12 6 C 10 9 319687 CASAVA_Build 22 29538802 1D TGAATGAAAA G/- GCATTTCCTT 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 G 2 1 319688 CASAVA_Build 22 29538926 1D CCATTGTTAC T/- CTGGATATTT 3070 het 3070 hom 48 15 29 5 T 1 0 319689 CASAVA_Build 22 29546377 1I CCCCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 205 hom 12 2 8 2 A 10 11 319690 CASAVA_Build 22 29577225 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 820 hom 18 3 10 5 T 12 11 319691 CASAVA_Build 22 29580965 1D GGTGAAAGCC A/- ACTTATAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 A 2 1 319692 CASAVA_Build 22 29588950 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 15 0 13 2 A 14 13 319693 CASAVA_Build 22 29589950 1D AGCCATCATG T/- TTTTTTTTTG 2854 het 2853 ref 23 11 10 2 T 10 9 319694 CASAVA_Build 22 29590900 1D CGAAACAAGC A/- AGCAAGTGGG 3056 het 3056 ref 31 13 9 9 A 2 1 319695 CASAVA_Build 22 29592734 2D AAAAAACAGG AA/-- AAAAAAAAAA 2493 het 2493 ref 21 12 6 5 A 12 10 319696 CASAVA_Build 22 29597669 3D CCCCCAAACT AGG/--- AGGTTAGACC 3070 het 3070 hom 30 13 13 6 AGG 2 1 319697 CASAVA_Build 22 29609757 19D GAGGCACCCA GAGGGATACCGTCCCCCTG/------------------- CCTCCGCCAC 3070 het 3070 ref 37 24 15 3 GAGGGATACCGTCCCCCTG 1 0 319698 CASAVA_Build 22 29628098 1D GCAATATAAG A/- AAAAAAAAAA 1094 het 1094 ref 35 11 10 14 A 14 13 319699 CASAVA_Build 22 29631735 2I CGACCCGGGA --/GG GGAGACACCG 3070 hom 41 het 16 0 13 3 G 2 4 319700 CASAVA_Build 22 29636813 4D TTCTAGAAAC AGAA/---- AGGCAGCTTG 3070 het 3070 ref 32 19 12 2 AGAA 1 0 319701 CASAVA_Build 22 29639010 1I ATTAAAACAT -/A ACAGAATACA 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 A 1 2 319702 CASAVA_Build 22 29659961 20D TGGATGGTAT AGACTGCTGATGGGGGGTGC/-------------------- AGACTGCTGG 2194 het 2194 ref 32 17 11 10 AGACTGCTGATGGGGGGTGC 1 0 319703 CASAVA_Build 22 29661658 2I AGGGAGGCAT --/GC ATAAAACATC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 GC 0 1 319704 CASAVA_Build 22 29690905 4D TATAGAGTAA CACT/---- CACCATTCAC 3070 het 3070 ref 49 26 19 7 CACT 1 0 319705 CASAVA_Build 22 29701927 1I GCTCAATATC -/T TATCATTCGT 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 T 1 2 319706 CASAVA_Build 22 29705723 1I CACTTTTTTT -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 6 7 319707 CASAVA_Build 22 29708716 4I AAAATCTGCT ----/CTCC CTCCAGTGTT 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 CTCC 1 2 319708 CASAVA_Build 22 29721461 1I CAGTGTAACC -/G ATTTCCTTTT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 G 0 1 319709 CASAVA_Build 22 29722898 2D CATAGTAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 A 12 10 319710 CASAVA_Build 22 29730336 8D ACTCTGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 1464 het 1464 ref 22 11 6 9 A 22 14 319711 CASAVA_Build 22 29747927 3D CTTCTTGCCC TCT/--- TCTGAGACCT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 TCT 2 1 319712 CASAVA_Build 22 29756132 1I CGCTATTCAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 8 9 319713 CASAVA_Build 22 29764368 1D AGCTTACTGT A/- GCCTCAAACT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 1 0 319714 CASAVA_Build 22 29768898 1D TACACTTACT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 A 8 7 319715 CASAVA_Build 22 29771197 1D TGGCAGCCGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 17 4 T 11 10 319716 CASAVA_Build 22 29771857 1I CTGCACCCCC -/T GGCTGAATCC 3070 hom 111 het 47 0 37 10 T 0 1 319717 CASAVA_Build 22 29772750 1D TTTCCTGTGG C/- CGAGAGGCAG 3070 het 3070 hom 33 12 10 11 C 2 1 319718 CASAVA_Build 22 29778912 2I GAAGAAAGAA --/AG AAAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 AG 0 1 319719 CASAVA_Build 22 29790991 1I AGCCTCTCGC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 7 8 319720 CASAVA_Build 22 29803382 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 11 10 319721 CASAVA_Build 22 29846616 4D CTTGCTGTGC CAGG/---- CAGGCTCTAT 3070 hom 108 het 37 0 36 4 CAGG 2 1 319722 CASAVA_Build 22 29880334 1D AGACTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 2792 hom 20 het 16 0 10 7 A 17 16 319723 CASAVA_Build 22 29885698 3I TCTCTCTCTC ---/TCT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 TCT 0 1 319724 CASAVA_Build 22 29892001 1D TTTTAGAGAT G/- GAGTCTTGCT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 G 2 1 319725 CASAVA_Build 22 29899237 1D GGTAATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 29 0 24 5 A 13 12 319726 CASAVA_Build 22 29906510 1I TGTTAAAGAC -/T TTTTTTTTTT 2584 het 899 hom 27 3 16 8 T 15 16 319727 CASAVA_Build 22 29910967 1I TTTTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 1839 het 442 hom 16 3 7 6 T 15 16 319728 CASAVA_Build 22 29913903 2D CGGATTTTGG TT/-- TTTTGTGTGT 3070 hom 96 het 36 0 31 6 T 6 4 319729 CASAVA_Build 22 29915738 10I ATTACAGGTG ----------/CACACCACCA CACCCAGCTA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 CACACCACCA 0 1 319730 CASAVA_Build 22 29919787 4I TTCGAGAAAA ----/AAAG AAAACCAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 AAAG 0 1 319731 CASAVA_Build 22 29933488 2I TAGAACAATC --/AT AGGTTACTCA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 AT 0 1 319732 CASAVA_Build 22 29939351 1I GGGTGGCCCA -/C CCTCTGGGTC 3070 hom 55 het 26 0 17 9 C 2 3 319733 CASAVA_Build 22 29943247 1I AGCCGGGCAT -/G GGGGGCAGGT 3070 hom 56 het 21 0 18 3 G 5 6 319734 CASAVA_Build 22 29963929 1I TGTCTCTGCT -/A AAAAAAAAAA 1909 hom 27 het 11 0 9 2 A 14 15 319735 CASAVA_Build 22 29972745 1D ACCCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 2569 het 631 hom 34 5 18 11 A 13 12 319736 CASAVA_Build 22 29978574 2D AGATAAATAA AG/-- GTCATTTTAG 3070 hom 54 het 21 0 19 4 AG 1 0 319737 CASAVA_Build 22 30007586 1D ATGTGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 28 1 20 7 T 13 12 319738 CASAVA_Build 22 30007798 2I CCACTAACCC --/CT GTCTCCACAT 3070 hom 95 het 35 0 31 4 CT 0 1 319739 CASAVA_Build 22 30014361 1D65M4D CGAGACCCTG AAAAAAAAAAATCAAAGAAAGGAAGGAAAGAAAGGGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGAAAGG/-AAAAAAAAAATCAAAGAAAGGAAGGAAAGAAAGGGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGA---- AAGGAAAAAT 3070 het 680 hom 21 2 19 10 N/A 0 0 319740 CASAVA_Build 22 30017793 1D TTTAAAAGGC A/- AATACTCCCT 3070 hom 91 het 37 0 26 12 A 3 2 319741 CASAVA_Build 22 30018845 1D GGAGTAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 17 1 14 2 T 13 12 319742 CASAVA_Build 22 30019648 1D AAATGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1721 het 1721 ref 38 25 4 9 T 12 11 319743 CASAVA_Build 22 30032340 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1442 het 515 hom 17 2 7 8 T 17 16 319744 CASAVA_Build 22 30034940 1D CTAGATTTAA T/- TTTTTTTTTT 2451 het 572 hom 27 4 9 14 T 19 18 319745 CASAVA_Build 22 30054973 1D TCCTTCCCCC A/- ACTCCTCTCC 3070 hom 77 het 30 0 25 5 A 2 1 319746 CASAVA_Build 22 30056282 4D TTTTACAGAT AAAG/---- AAATAAGAGG 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAAG 1 0 319747 CASAVA_Build 22 30079136 1I CACAAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 447 hom 26 1 19 6 A 9 10 319748 CASAVA_Build 22 30106781 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 621 het 621 ref 32 9 4 20 TTC 1 0 319749 CASAVA_Build 22 30113897 1I AACCACCGTG -/C CCGGCAAGAT 3070 hom 47 het 21 0 16 5 C 2 3 319750 CASAVA_Build 22 30114990 1I TTCAAGTAAC -/T TTTTTTTTTT 2888 het 1315 hom 34 5 13 16 T 16 17 319751 CASAVA_Build 22 30169406 9I GACCTTCCTT ---------/CTGCGAAAG GACATTTCAA 3070 hom 138 het 48 0 46 3 CTGCGAAAG 0 1 319752 CASAVA_Build 22 30176080 1I CTTTGTCAAC -/T TTTTTTAGCC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 6 7 319753 CASAVA_Build 22 30184435 1D TAACCACACA T/- TTTTTAAGTG 3070 hom 117 het 47 0 40 8 T 6 5 319754 CASAVA_Build 22 30185739 10I TAGTTTTTAA ----------/TGTTTTTATT TGTTTTTATT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 TGTTTTTATT 1 2 319755 CASAVA_Build 22 30192402 1D CTGTCTCGGT G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 G 6 5 319756 CASAVA_Build 22 30201254 1D CAAAATTCTG A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 8 7 319757 CASAVA_Build 22 30205674 1D TGGAAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 2032 het 2032 ref 38 15 10 13 T 19 18 319758 CASAVA_Build 22 30207172 2D CCTTTGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 AG 2 1 319759 CASAVA_Build 22 30213057 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 12 11 319760 CASAVA_Build 22 30231722 1I AATAAAAAAT -/A AAGCTGAGCA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 2 3 319761 CASAVA_Build 22 30232118 2I TCACTGCAAC --/CT CTGCCTCACG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 CT 1 2 319762 CASAVA_Build 22 30237451 6D ATAGTTTCTG TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 1777 het 1777 ref 31 18 9 5 T 22 16 319763 CASAVA_Build 22 30259565 1D AAAAAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 11 10 319764 CASAVA_Build 22 30259821 2D TTGTCAGAAT TC/-- TCTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 TC 3 2 319765 CASAVA_Build 22 30263029 3D AGGGGATTTA CTT/--- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 CTT 2 1 319766 CASAVA_Build 22 30270412 1D TTTTAGTAAT A/- AAAATATTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 5 4 319767 CASAVA_Build 22 30272830 1I ATATATATGA -/T TTTTTTTTTT 2965 het 2965 ref 28 12 10 6 T 10 11 319768 CASAVA_Build 22 30282143 3D ATATCATGAT TTC/--- TTCTTCTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 TTC 3 2 319769 CASAVA_Build 22 30286247 1D AATTAGTAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 A 10 9 319770 CASAVA_Build 22 30288621 1D GGTTTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 2994 het 2404 hom 19 7 7 5 T 9 8 319771 CASAVA_Build 22 30289567 3I CTTTTCTTGT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 40 15 17 9 TTG 3 4 319772 CASAVA_Build 22 30297888 1D ATCTTGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 T 11 10 319773 CASAVA_Build 22 30301173 3I TTCCAGCTCA ---/TCT TCTAACCTTA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 TCT 1 2 319774 CASAVA_Build 22 30306452 1D TTTAAAAAAA C/- TTTTTGTGCT 3070 het 3070 ref 42 25 10 7 C 1 0 319775 CASAVA_Build 22 30325127 1D CCTCCCTAAG A/- AATATTTGCT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 3 2 319776 CASAVA_Build 22 30325317 1I TTGAAAAGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 9 10 319777 CASAVA_Build 22 30334634 4D ACAGAGAAAT AAAG/---- AAAAGAAGCT 3070 het 3070 ref 35 14 12 12 AAAG 1 0 319778 CASAVA_Build 22 30353504 2D CCCAGGAAAC AG/-- GGGTGATAGC 3070 het 3070 ref 28 11 12 6 AG 1 0 319779 CASAVA_Build 22 30353951 4D CTGGAGAGAC TAAG/---- AACCATCCTG 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 TAAG 1 0 319780 CASAVA_Build 22 30355368 2I GTGTAGGTGT --/GA GAGTGTGTTA 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 GA 1 2 319781 CASAVA_Build 22 30369109 6D AAAAAAGAAA ATAGAG/------ ATAAAGACAG 1906 het 1906 ref 27 14 9 8 ATAGAG 1 0 319782 CASAVA_Build 22 30391677 1D GATATCACTT A/- ACCTCATGGA 2565 het 2565 ref 25 17 6 2 A 2 1 319783 CASAVA_Build 22 30408388 2I GCTACATGTC --/TT TTCACCGTAC 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 2 4 319784 CASAVA_Build 22 30412591 1I TTAAAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 10 11 319785 CASAVA_Build 22 30419114 10D TTATGTCAGA GCTCACCCTT/---------- GTTGTTGTCT 3070 het 3070 ref 56 35 24 1 GCTCACCCTT 1 0 319786 CASAVA_Build 22 30428202 3I CTATTCCTGC ---/TGT TTTTTTTATT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TGT 0 1 319787 CASAVA_Build 22 30434139 1I CCATCTCAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 9 10 319788 CASAVA_Build 22 30445239 1I AATTTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2869 het 2869 ref 27 9 10 8 A 11 12 319789 CASAVA_Build 22 30459374 14I CACTGCAACC --------------/TCCGCCTTCCACCT TCCGCCTTTG 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TCCGCCTTCCACCT 0 1 319790 CASAVA_Build 22 30466217 1I AATTTTTTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 7 8 319791 CASAVA_Build 22 30472782 1D CCCAGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 822 het 296 hom 15 4 3 8 T 19 18 319792 CASAVA_Build 22 30474437 2I GGAGTGAAAC --/TG TGGAAAATGC 3070 hom 96 het 42 0 32 10 TG 1 2 319793 CASAVA_Build 22 30495373 1D AAGGAAGTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 A 10 9 319794 CASAVA_Build 22 30500999 1D CAAAGGAGTA T/- GAAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 42 19 16 8 T 1 0 319795 CASAVA_Build 22 30502956 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 1845 het 1845 ref 15 5 5 5 T 11 10 319796 CASAVA_Build 22 30511266 4D AAACTCCACA AAGT/---- AAGTATTAGA 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 AAGT 2 1 319797 CASAVA_Build 22 30519438 1D GATTCATCTG T/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 T 7 6 319798 CASAVA_Build 22 30520872 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 A 8 9 319799 CASAVA_Build 22 30522690 1D GTGAGTGCTC T/- TTTTTTTTTT 2666 het 2666 ref 21 7 7 7 T 11 10 319800 CASAVA_Build 22 30537972 1D CTTGGCGGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 10 9 319801 CASAVA_Build 22 30547353 20I TTGGGAGCCA --------------------/GAGGGTCCCTTGTATAATGT CCCTCTGTGG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 GAGGGTCCCTTGTATAATGT 0 1 319802 CASAVA_Build 22 30549519 10D ACTCCATCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 het 1381 hom 27 7 16 5 A 22 12 319803 CASAVA_Build 22 30550962 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 866 het 280 hom 11 3 3 5 A 17 16 319804 CASAVA_Build 22 30553668 1I GCTGCTTGTT -/A ACGCTCAGTC 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 A 1 2 319805 CASAVA_Build 22 30557031 1D TCAGCCAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1687 hom 42 6 19 18 T 15 14 319806 CASAVA_Build 22 30563267 3D GAACGATATA GAG/--- GAGATTAGCA 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 GAG 2 1 319807 CASAVA_Build 22 30565505 1I GCTAACAAGA -/C CCCCCCCTCC 3070 hom 60 het 27 0 20 7 C 7 8 319808 CASAVA_Build 22 30571850 1I CATGCTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 14 15 319809 CASAVA_Build 22 30580945 1I GTCTTGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 13 13 T 16 17 319810 CASAVA_Build 22 30581853 2D CTATGGAAAC AT/-- ATTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 38 25 11 3 AT 2 1 319811 CASAVA_Build 22 30584333 3D AAGTACAATA AAG/--- AAGCCAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 3 AAG 2 1 319812 CASAVA_Build 22 30586798 1D CATCTGGCTG C/- CCATGTTTAG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 C 3 2 319813 CASAVA_Build 22 30607278 1D TCCATCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2493 het 2493 ref 32 13 10 9 A 17 16 319814 CASAVA_Build 22 30620294 1I CATACTACTT -/A ACATTGCATT 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 A 1 2 319815 CASAVA_Build 22 30633977 4D CACTCCACTT GTCA/---- GTCAGTCTTT 3070 het 3070 ref 50 27 16 9 GTCA 2 1 319816 CASAVA_Build 22 30638807 1D CTCTGTGCTC T/- TTTTTTTTTT 1187 het 1187 ref 31 26 3 2 T 12 11 319817 CASAVA_Build 22 30644089 1D CATAGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 2929 het 1471 hom 12 3 7 2 C 4 3 319818 CASAVA_Build 22 30644281 4I AAATAGAATA ----/AAAT AAATAAAAAG 2469 het 2198 hom 16 6 6 4 AAAT 1 2 319819 CASAVA_Build 22 30652996 1D TGCTCTTTGC A/- AAAAAAAAAA 1797 het 556 hom 24 6 7 11 A 19 18 319820 CASAVA_Build 22 30657916 5I CACAGGTCTT -----/GAAAG GAAGTGATGA 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 GAAAG 0 1 319821 CASAVA_Build 22 30661039 4D AGAAAAAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 37 17 12 9 AG 8 6 319822 CASAVA_Build 22 30667081 1I GACCCCAACA -/G GGGAGTCACA 3070 hom 123 het 44 0 40 4 G 3 4 319823 CASAVA_Build 22 30671668 4D GTTTTCTGTA AATG/---- AATATTTCCT 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 AATG 1 0 319824 CASAVA_Build 22 30672931 1D TGGTGATAAA C/- CCATTTCTCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 3 2 319825 CASAVA_Build 22 30673614 4I TATCTTCAAG ----/CTCT CTCTATCTCA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 CT 2 4 319826 CASAVA_Build 22 30679825 1I GGAGAGACTT -/A TGCCTGTGTT 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 A 0 1 319827 CASAVA_Build 22 30689790 1D ATGCAGCCTT G/- GGCTTGGCTC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 G 3 2 319828 CASAVA_Build 22 30697161 4D TTTCCTTCCT TCTC/---- TCTCTATTTC 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 TC 4 2 319829 CASAVA_Build 22 30700316 3D AACGGGGTTG CAC/--- CACTGCACTC 3070 het 3070 ref 24 15 8 2 CAC 2 1 319830 CASAVA_Build 22 30702643 1D TGGAGTGCAG T/- GGTGCGATCT 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 T 1 0 319831 CASAVA_Build 22 30705762 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCT 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 A 5 4 319832 CASAVA_Build 22 30709602 1I TTATTTTTTT -/A TTTTTTTGAT 3070 het 2366 hom 26 11 11 4 A 0 1 319833 CASAVA_Build 22 30711316 11D GTTATTTATT TTTATTATTTA/----------- TTTATTATTT 1900 het 1900 ref 19 6 6 9 TTTATTATTTA 2 1 319834 CASAVA_Build 22 30712321 4I ATTTACATAT ----/ATAA ATACATATAC 2848 het 1051 hom 9 3 6 0 ATAA 0 1 319835 CASAVA_Build 22 30712415 2D TATATGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 2294 het 2294 ref 19 10 8 1 TG 6 5 319836 CASAVA_Build 22 30712608 1I AGGGAGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 10 11 319837 CASAVA_Build 22 30715795 2I ACCGTGATAA --/TT TAGGTGGAGG 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 T 1 3 319838 CASAVA_Build 22 30715934 2D CAGCCTGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 17 10 T 12 10 319839 CASAVA_Build 22 30718068 3I GTAGCCCTAG ---/AGA CAAATGAATG 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 AGA 0 1 319840 CASAVA_Build 22 30718617 3D TTTTATTATT ATA/--- ATACCTTAAG 3070 het 3070 hom 27 7 19 1 ATA 2 1 319841 CASAVA_Build 22 30722167 1I ATGAGCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 T 10 11 319842 CASAVA_Build 22 30725074 3D TGCCGATACC ATG/--- ATAAGTAAGA 3070 het 3070 ref 43 21 19 4 ATG 1 0 319843 CASAVA_Build 22 30725966 2I ATCAGTGTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 1720 hom 19 7 10 2 TG 0 1 319844 CASAVA_Build 22 30731183 1I TTTCCTTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 T 9 10 319845 CASAVA_Build 22 30732432 1I TGCCTCGCTA -/T TTTTTTTTTT 2822 het 2822 ref 39 15 14 10 T 10 11 319846 CASAVA_Build 22 30733246 10I TGTGTGTGTA ----------/TGTGTGTGTG TGTGTGTATA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 TG 3 8 319847 CASAVA_Build 22 30735677 1I CTGGGCATGG -/C CGTGCACCTG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 C 1 2 319848 CASAVA_Build 22 30735928 1I AAGTATAAAA -/T TGACCATAGG 3070 het 3070 hom 46 15 25 6 T 1 2 319849 CASAVA_Build 22 30739316 1D ACCCTCTCAG T/- TTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 T 5 4 319850 CASAVA_Build 22 30739383 1D GGTTGGTAGG T/- TTTTTTTTTT 1700 het 1700 ref 35 15 5 15 T 11 10 319851 CASAVA_Build 22 30740696 2D CAAAAAAAAA TT/-- TTTGTGTGTG 1277 het 1277 ref 18 8 7 3 T 5 3 319852 CASAVA_Build 22 30741923 1I GTAGAATGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 8 9 319853 CASAVA_Build 22 30744123 2D TGAGGGAGGT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 48 15 26 7 AG 6 5 319854 CASAVA_Build 22 30745471 1I GTTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 1325 het 263 hom 14 6 7 1 G 0 1 319855 CASAVA_Build 22 30763601 2D GAAATTGTGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 TA 8 7 319856 CASAVA_Build 22 30770036 2D GAGAGGGAAA TG/-- TGTGTGTCTC 3070 het 3070 ref 41 18 14 10 TG 4 3 319857 CASAVA_Build 22 30774693 2D TGAAATACTG CT/-- CTCTCTGTAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 CT 4 3 319858 CASAVA_Build 22 30779380 2D TCTCTTTCCC CT/-- CTCTTCTCTT 3070 het 3070 hom 37 12 20 6 CT 3 2 319859 CASAVA_Build 22 30789911 1I CATTCTGATA -/C CCCGAACTCT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 C 3 4 319860 CASAVA_Build 22 30791844 2I TGGCATAATC --/TG TCTTTTGGGA 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 TG 0 1 319861 CASAVA_Build 22 30804238 4I ACTTCTGCGG ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 TTAT 3 4 319862 CASAVA_Build 22 30808973 1I AAGGCCAGCA -/G GAAGTAGAGG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 1 2 319863 CASAVA_Build 22 30817107 1I TATATGTTCT -/G TATATTAGAC 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 G 0 1 319864 CASAVA_Build 22 30820000 2I TTAAGGTATG --/TC CTTTTATGCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TC 0 1 319865 CASAVA_Build 22 30865933 1D AATATCTTGG T/- TTAGGAAGGG 3070 het 681 hom 15 2 9 4 T 3 2 319866 CASAVA_Build 22 30873007 8D TGTCTTTACT TTAATCTC/-------- TTAATCTTGT 3070 het 3070 ref 27 17 9 8 TTAATCTC 1 0 319867 CASAVA_Build 22 30875639 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1214 het 1214 ref 7 3 3 1 T 1 0 319868 CASAVA_Build 22 30875850 1I ACTTGGTGAC -/A GTAGAAAACA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 0 1 319869 CASAVA_Build 22 30877862 17D GTGTGGGAGT TGGGAAAGACAGAGGAG/----------------- TGACTACTAG 3070 het 3070 hom 26 11 13 5 TGGGAAAGACAGAGGAG 1 0 319870 CASAVA_Build 22 30878207 1I AAGTCACTGG -/C CCCCCAAATA 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 C 5 6 319871 CASAVA_Build 22 30883485 1D TTTGTTCCCA T/- TTCAGGAATT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 3 2 319872 CASAVA_Build 22 30887719 1I AAGCTTTCAT -/C CCCCCCCCCC 1496 het 1496 ref 20 8 7 5 C 10 11 319873 CASAVA_Build 22 30906424 1D ACCTGAACCC T/- GCTGCATCCC 3070 het 3070 ref 32 13 11 10 T 1 0 319874 CASAVA_Build 22 30909850 2I AGCACTTAAT --/TC TTTCATATGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 TC 0 1 319875 CASAVA_Build 22 30910120 1I CATATATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 22 1 10 11 T 11 12 319876 CASAVA_Build 22 30910136 4I TTTTTAAAAA ----/AAAG GTTCTTGTAT 3070 het 862 hom 26 7 13 6 AAAG 0 1 319877 CASAVA_Build 22 30921452 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2938 het 2938 ref 31 19 8 4 T 9 10 319878 CASAVA_Build 22 30929717 1I TCCCCACCAT -/G GGCACTGATG 1551 het 1551 ref 24 15 5 4 G 2 3 319879 CASAVA_Build 22 30975897 1D TTTTTGGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 T 10 9 319880 CASAVA_Build 22 30989060 1D CGGCCCTACA T/- TTTTTTTTTT 1639 het 925 hom 12 4 4 5 T 11 10 319881 CASAVA_Build 22 31003999 4I GAAATGAAAG ----/CAGA CAGACAGCTT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 CAGA 1 2 319882 CASAVA_Build 22 31013448 6I TCTCTCCGTT ------/TAAAAG TAAAAGTGTT 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 TAAAAG 1 2 319883 CASAVA_Build 22 31013993 4D AGACCCTCAA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 2432 hom 32 10 15 7 TTTC 3 2 319884 CASAVA_Build 22 31016057 8D AGGGCCTGGG TTTTTCTT/-------- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 44 24 13 12 TTTTTCTT 2 1 319885 CASAVA_Build 22 31020659 6I TGGCTTTTTC ------/TTTTTT TTTTTATTAT 2021 het 1538 hom 9 4 5 0 T 5 11 319886 CASAVA_Build 22 31027830 1D TTTAAAGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 96 hom 22 1 11 10 A 13 12 319887 CASAVA_Build 22 31028247 2I44M1D GTTTTTTTTT --TTTGTGTCTAGCTACTAGTCCTTTGCTGGGTATGTGGTTTGAAAT/TGTGTGTGTCTAGCTACTAGTCCTTTGCTGGGTATGTGGTTTGAAA- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 15 11 17 N/A 0 0 319888 CASAVA_Build 22 31029592 2I AATATGCATC --/TG TGTTTCCTCC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 TG 1 2 319889 CASAVA_Build 22 31030431 8D GCCCAGCTTG TTTTTTCT/-------- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 11 6 TTTTTTCT 1 0 319890 CASAVA_Build 22 31030838 1I AGTTCTACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 9 10 319891 CASAVA_Build 22 31032330 1D CAGGTGCCTG C/- TAGTCCCAGC 1079 het 582 hom 7 2 3 2 C 1 0 319892 CASAVA_Build 22 31032518 3I TGAAAAACTC ---/GTT ATTATTGTTA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 GTT 0 1 319893 CASAVA_Build 22 31033156 4D CCTACTGGAG GGTT/---- GTGAACCCTG 3070 het 3070 ref 47 25 19 6 GGTT 1 0 319894 CASAVA_Build 22 31033922 2D GGATTCTTAC AT/-- GTTTCCAACC 3070 het 3070 hom 46 19 23 6 AT 1 0 319895 CASAVA_Build 22 31034310 2I CCTTGAATGG --/CA CAGTCTCTGA 3070 hom 61 het 25 0 19 6 CA 1 2 319896 CASAVA_Build 22 31034751 4D ATGAAATCAC ATGT/---- ATGTGTGTGA 3070 het 3070 ref 53 23 20 12 ATGT 2 1 319897 CASAVA_Build 22 31036499 2I2M11D AACATGGGCC --TGGGGGGTGCCCT/ATTG----------- GGGATTGCTC 3070 het 3070 hom 31 11 18 6 N/A 0 0 319898 CASAVA_Build 22 31037693 2D TGACTCATCT TC/-- TGTCCCCATC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 TC 1 0 319899 CASAVA_Build 22 31039809 1D CATAAATCCA G/- GGGAAGATGA 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 G 4 3 319900 CASAVA_Build 22 31040599 1I GGGCAGATGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 7 8 319901 CASAVA_Build 22 31041272 2I GAAACAAAAC --/AG AGAACTGGCA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 AG 1 2 319902 CASAVA_Build 22 31042516 1I GCATTAGTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 T 9 10 319903 CASAVA_Build 22 31042684 1D GCTCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2688 het 2688 ref 24 12 6 6 T 13 12 319904 CASAVA_Build 22 31046724 4I TGCTTTAAAA ----/AAAC AAAATCTATT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AAAC 0 1 319905 CASAVA_Build 22 31047274 4I ACTCCGTCTC ----/TAAA TAAATAAATA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TAAA 2 3 319906 CASAVA_Build 22 31053740 1D GGACACAGTT G/- GGAGTGTCCT 3070 hom 77 het 30 0 23 7 G 3 2 319907 CASAVA_Build 22 31056192 4I TGTTGGGCCC ----/TGTG TGTGTGTATT 3070 hom 41 het 17 0 13 4 TG 3 5 319908 CASAVA_Build 22 31056355 2I GTGTTGGGGA --/CT CTGGTGTGTG 919 hom 5 het 17 0 5 12 CT 1 2 319909 CASAVA_Build 22 31061805 1I TCCCCCAGCA -/C CCTCTGGGAC 3070 hom 70 het 29 0 20 9 C 2 3 319910 CASAVA_Build 22 31066129 3D TCTCTCCGAG CCT/--- CCTCGGTGTC 3070 hom 107 het 45 0 35 10 CCT 2 1 319911 CASAVA_Build 22 31136710 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 33 1 20 12 T 15 14 319912 CASAVA_Build 22 31138538 1D GGAAAAAGAT A/- ACGCCAGCAG 3070 hom 136 het 49 0 44 5 A 2 1 319913 CASAVA_Build 22 31152879 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 22 0 16 6 A 12 11 319914 CASAVA_Build 22 31160070 2I AAGTTTTAGT --/TA TATATATATA 3070 het 500 hom 12 1 8 3 TA 7 8 319915 CASAVA_Build 22 31160980 3I ACAGGGAATA ---/ATG ATGATGACAA 3070 hom 106 het 42 0 36 6 ATG 2 3 319916 CASAVA_Build 22 31162900 1D GACTCTGGTG A/- GTGAAATATG 3070 het 3070 ref 44 26 15 5 A 1 0 319917 CASAVA_Build 22 31165610 1D TATTTTTCAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 12 8 5 T 10 9 319918 CASAVA_Build 22 31166291 1D CTGGCTAATT A/- AAAAAAAATT 1971 het 1971 ref 15 8 6 2 A 9 8 319919 CASAVA_Build 22 31179929 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 528 hom 35 2 24 9 C 1 0 319920 CASAVA_Build 22 31205389 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2299 het 574 hom 17 4 8 5 T 15 14 319921 CASAVA_Build 22 31207870 1I GGTGCTCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 37 1 31 5 T 10 11 319922 CASAVA_Build 22 31212223 1I AAAATGTTGG -/T TTTTTTTTTT 2690 het 2690 ref 27 11 7 9 T 11 12 319923 CASAVA_Build 22 31216720 1D TCTAAGCGTT A/- ACAGGAGCAG 3070 het 3070 ref 56 29 22 5 A 2 1 319924 CASAVA_Build 22 31217824 2I TTAGCTTCTC --/TT ATTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 T 0 2 319925 CASAVA_Build 22 31242206 1D TATGCAAATA T/- TTTTTATTTG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 6 5 319926 CASAVA_Build 22 31242796 1D TTATTTAATC T/- TTTCTTTGCT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 4 3 319927 CASAVA_Build 22 31257671 1D CTCTTCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 T 11 10 319928 CASAVA_Build 22 31257982 1D TGAACACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 T 13 12 319929 CASAVA_Build 22 31258923 1I GCCAGAGGGG -/C CTTTTCAGGG 2119 hom 26 het 10 0 8 2 C 1 2 319930 CASAVA_Build 22 31261768 1I TTGGAGAATC -/G GGGGGGGGGG 844 het 367 hom 24 5 3 16 G 10 11 319931 CASAVA_Build 22 31262418 3D ACTTGGGTAT TAC/--- TACTGCTTTC 3070 het 3070 hom 63 21 31 13 TAC 2 1 319932 CASAVA_Build 22 31264393 2D AACTTTGGCC TG/-- TTTTTGAGGA 3070 het 3070 ref 37 21 13 5 TG 1 0 319933 CASAVA_Build 22 31264714 1D CTGCTCATCC T/- TCAGGTTTCA 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 T 2 1 319934 CASAVA_Build 22 31265308 1D AAAAAAGTGG A/- ATAGATGGTG 3070 het 3070 ref 47 26 16 7 A 2 1 319935 CASAVA_Build 22 31265778 3I AATCCTCAAG ---/AAA AAAAAAAAAA 1765 het 1765 ref 23 10 8 5 A 11 14 319936 CASAVA_Build 22 31272930 4I CTCCCCTTTC ----/CTCT CTCTAACACT 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 CT 2 4 319937 CASAVA_Build 22 31277514 1D AATGACAAGG A/- AAAAAAAAAA 2379 het 2379 ref 29 10 9 10 A 12 11 319938 CASAVA_Build 22 31279605 1D TCACCCATGT A/- TTATATAACA 3070 het 3070 ref 48 31 11 6 A 1 0 319939 CASAVA_Build 22 31295524 16D AATCAATCAA TCTCTCTCTCTCTCTC/---------------- TCTCTCTCTC 2439 het 2420 hom 16 6 6 4 TC 17 9 319940 CASAVA_Build 22 31308364 4D GAGACCGGGT CTCA/---- CTCTGTTGCC 3070 het 902 hom 16 2 8 7 CTCA 1 0 319941 CASAVA_Build 22 31311885 34D TATATACGTA TATATGTGTATGTATACATATATGTGTATATACG/---------------------------------- TATATGTGTA 2146 het 2146 ref 40 25 7 18 TATATGTGTATGTATACATATATGTGTATATACG 2 1 319942 CASAVA_Build 22 31314108 3I TATTATTGTG ---/ATT ATTATTATTG 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 ATT 3 4 319943 CASAVA_Build 22 31319324 3I TCTTTATTTC ---/CTT CTTTTTATGT 3070 het 3070 ref 38 15 17 6 CTT 1 2 319944 CASAVA_Build 22 31335638 1I AATTAAAAAA -/T AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 0 1 319945 CASAVA_Build 22 31391344 1D TGATGAGTGA G/- GAACATATGA 3070 hom 72 het 26 0 25 3 G 2 1 319946 CASAVA_Build 22 31392352 1I15M1I GAGCCTGACA -CCTTCAGGCATTCAG-/GCCTTCAGGCATTCAGC CACCAGGGCC 3070 hom 99 het 36 0 34 5 N/A 0 0 319947 CASAVA_Build 22 31402246 1I GCGTATCCCA -/G GGGCTGGAAG 3070 hom 108 het 43 0 29 14 G 3 4 319948 CASAVA_Build 22 31405322 1I CAGGCATGAG -/C CACCGCGCCT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 C 1 2 319949 CASAVA_Build 22 31408750 1I TGTTATTTTT -/C CACCAATAGG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 1 2 319950 CASAVA_Build 22 31411286 1D GTGATAACAT C/- CCAAAATTAG 3070 hom 144 het 55 0 49 6 C 3 2 319951 CASAVA_Build 22 31413196 1I GCCGCCCAGG -/C TGGAGTGCAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 0 1 319952 CASAVA_Build 22 31413435 1I CAGGCATGAG -/C CACCACGCCC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 2 319953 CASAVA_Build 22 31413739 1I AGGACTTTGT -/C CATGCCTCCC 3070 hom 96 het 39 0 31 8 C 1 2 319954 CASAVA_Build 22 31413941 1I CACAGCAATC -/G GCACAGCCAT 3070 hom 138 het 51 0 46 5 G 1 2 319955 CASAVA_Build 22 31414715 1I TTCCCTGCCT -/G GGGGCTGTCC 3070 hom 75 het 28 0 24 4 G 4 5 319956 CASAVA_Build 22 31418759 1I TGTAGAGTCT -/G CCATTATGGC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 G 0 1 319957 CASAVA_Build 22 31425588 1I AGTCACATTG -/C CTCTCGGGGC 3070 hom 144 het 51 0 48 3 C 1 2 319958 CASAVA_Build 22 31459959 1I CCAAAAGCCA -/G GGCTGAGCCA 3070 hom 141 het 51 0 47 4 G 2 3 319959 CASAVA_Build 22 31480448 1I TCTTTCTTTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 8 9 319960 CASAVA_Build 22 31483836 1D CAGGAATGAA G/- GTTTGGGTCA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 G 2 1 319961 CASAVA_Build 22 31485599 1D ACCCTCGACC T/- GCCTGATTCC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 1 0 319962 CASAVA_Build 22 31488616 1I CCAGGGTCGC -/G GAAACCCAGT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 1 2 319963 CASAVA_Build 22 31489129 3D GATCTATTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 2246 hom 28 7 20 1 TTG 4 3 319964 CASAVA_Build 22 31493384 6D CACACACACA TACATG/------ CACACACACA 62 het 62 ref 64 38 2 26 TACATG 1 0 319965 CASAVA_Build 22 31494634 1I TTTTATCTTA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 T 6 7 319966 CASAVA_Build 22 31495232 2I CTGGATTCTG --/CT CTCTCTCTTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 CT 4 5 319967 CASAVA_Build 22 31498813 1I AAGGGAGGAT -/G GCCCTGCCAA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 G 1 2 319968 CASAVA_Build 22 31499215 1D CAACACAGTG A/- AAACCCTGTC 3070 hom 58 het 21 0 19 2 A 4 3 319969 CASAVA_Build 22 31501695 6I CACTTCCTGG ------/ATGTGA CCCTTTGAGA 3070 het 3070 ref 63 28 26 9 ATGTGA 0 1 319970 CASAVA_Build 22 31503382 1D CTTTTTTTTT A/- ATCCAATTAT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 A 2 1 319971 CASAVA_Build 22 31504450 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2059 hom 21 6 14 1 T 10 11 319972 CASAVA_Build 22 31506083 1D AAAAAAAGAG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 43 het 20 0 15 5 A 8 7 319973 CASAVA_Build 22 31518230 1I CAAAGAAGGA -/T TAAAACTCAG 3070 het 3070 hom 56 24 29 3 T 1 2 319974 CASAVA_Build 22 31539650 1I TAACACCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 T 13 14 319975 CASAVA_Build 22 31550264 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2630 het 1712 hom 34 7 18 9 A 15 16 319976 CASAVA_Build 22 31550345 1D CAGATTACTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 10 9 319977 CASAVA_Build 22 31553595 1I CTTTTACAAG -/C CCACTCCCCT 3070 het 3070 hom 40 13 15 12 C 2 3 319978 CASAVA_Build 22 31560310 1I GGCTAATTTA -/T TTTTTTTTTT 1585 het 1585 ref 23 11 6 6 T 11 12 319979 CASAVA_Build 22 31562691 1D TGAGTAGGGG A/- ACACCCGCTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 2 1 319980 CASAVA_Build 22 31563378 2D CCTCTGACCC CT/-- GAGTGGGCTT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 CT 1 0 319981 CASAVA_Build 22 31567683 1I GGGTGGGGTA -/G GGGGAGGGAG 3070 hom 72 het 30 0 22 8 G 4 5 319982 CASAVA_Build 22 31582265 2D GATGTCAGAC AT/-- GTGTAGCCGA 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 AT 1 0 319983 CASAVA_Build 22 31587164 1D ACAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2204 hom 31 11 12 8 A 13 12 319984 CASAVA_Build 22 31587379 3I CAGTGTGAGC ---/AGA AGAAGCTGAT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 AGA 1 2 319985 CASAVA_Build 22 31596314 4I ATACTTTCTT ----/TTAA TTGATTTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 TTAA 0 1 319986 CASAVA_Build 22 31615040 1I GCATCCCAAA -/G GGTGCCAAAC 3070 hom 131 het 50 0 43 7 G 2 3 319987 CASAVA_Build 22 31615405 1D CTCCACAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 18 4 A 12 11 319988 CASAVA_Build 22 31620188 1D TTGGAGAACT G/- TGGAGTAAAG 3070 hom 150 het 52 0 50 3 G 1 0 319989 CASAVA_Build 22 31626628 2D CTGTAAGCTC TA/-- TGAGGCCAAG 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 TA 1 0 319990 CASAVA_Build 22 31629549 1I AGGCCACAAG -/C CATGCGCTTC 3070 hom 74 het 27 0 20 7 C 1 2 319991 CASAVA_Build 22 31649959 1I AGTTTGCTAA -/G GGTAATGGCC 3070 het 229 hom 32 3 23 6 G 2 3 319992 CASAVA_Build 22 31653400 1I ATTTCTGCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 7 8 319993 CASAVA_Build 22 31680404 1D TGGATAGGGC A/- AATGTTCAGA 3070 hom 144 het 52 0 48 5 A 3 2 319994 CASAVA_Build 22 31691229 5I TGCACTGTAC -----/TATAA TATATCAATG 3070 hom 138 het 51 0 47 4 TATAA 0 1 319995 CASAVA_Build 22 31694838 1D AGATAAAGAA C/- CCTTTGAGTG 3070 hom 141 het 52 0 45 8 C 3 2 319996 CASAVA_Build 22 31698833 1D AACAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 1212 het 1212 ref 32 25 3 4 A 11 10 319997 CASAVA_Build 22 31702980 1D TGAGATTCCT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 6 hom 27 1 16 11 G 10 9 319998 CASAVA_Build 22 31709602 1D AAGATTTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 101 het 39 0 34 5 T 10 9 319999 CASAVA_Build 22 31710194 10D AAAAAGAAAA AAAGAGTCCC/---------- AAAGAGTCTG 3070 hom 59 het 27 0 20 8 AAAGAGTCCC 1 0 320000 CASAVA_Build 22 31714985 1I CTACTCACAT -/G GTTGTCAACA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 G 1 2 320001 CASAVA_Build 22 31718092 1I AGGTTGTGGA -/G GGAGAAAACA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 G 2 3 320002 CASAVA_Build 22 31722287 4D TGGGTAGGAC CAAA/---- CAAAGTCACT 3070 hom 134 het 50 0 45 8 CAAA 2 1 320003 CASAVA_Build 22 31736218 1I ACTCTGTCCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 741 hom 24 4 16 4 A 15 16 320004 CASAVA_Build 22 31747770 2D CTGTAACTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 41 1 25 15 T 16 14 320005 CASAVA_Build 22 31750474 1I GGACACTTGT -/C CCCCTAGGGA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 C 4 5 320006 CASAVA_Build 22 31751620 2D CTCCGTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 37 1 23 16 A 16 14 320007 CASAVA_Build 22 31753623 4I ACAGACAGAC ----/AAAG AGAGAGAGAG 2801 hom 41 het 15 0 14 1 AAAG 0 1 320008 CASAVA_Build 22 31764763 4I TTGGAAATCT ----/TGAG TAAGAGTCAG 3070 hom 57 het 23 0 17 6 TGAG 0 1 320009 CASAVA_Build 22 31773255 1D CCAATACATC A/- CCCAGCACTT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 A 1 0 320010 CASAVA_Build 22 31776466 2D AGACTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 2756 hom 6 het 22 0 11 12 A 20 18 320011 CASAVA_Build 22 31777553 1D AAACACAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 10 9 320012 CASAVA_Build 22 31777672 1I CACAAACAAC -/T CAAGGGTCAG 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 0 1 320013 CASAVA_Build 22 31788028 1D TTTTGGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 34 2 17 15 T 15 14 320014 CASAVA_Build 22 31811512 1D TCAACTCAGT A/- TCAACATTGG 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 1 0 320015 CASAVA_Build 22 31815763 1D ATTACAGATA C/- AGAGCCACCA 1825 het 1825 ref 26 18 4 4 C 1 0 320016 CASAVA_Build 22 31815958 1I TGAAATGATT -/A AAAAAAAAAA 2654 het 2654 ref 33 17 11 5 A 11 12 320017 CASAVA_Build 22 31819037 2D ATCGCCACAC TG/-- TCTTCCACAA 3070 het 3070 hom 24 8 13 4 TG 1 0 320018 CASAVA_Build 22 31825254 1D ATTAATTTTT C/- TTGAGAGGGA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 1 0 320019 CASAVA_Build 22 31828150 1D TCCCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 24 1 12 11 T 11 10 320020 CASAVA_Build 22 31833275 1D TCACACTGCA T/- GCAATGGCTC 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 T 1 0 320021 CASAVA_Build 22 31839860 1D AGGGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 18 1 10 7 T 15 14 320022 CASAVA_Build 22 31846004 2D TTGGCTGTTA AT/-- AGTCTCCTTT 3070 het 1210 hom 33 4 17 12 AT 1 0 320023 CASAVA_Build 22 31846029 1D CTTCATATGG C/- CACATGAGCA 3070 het 1410 hom 35 4 14 17 C 2 1 320024 CASAVA_Build 22 31849204 1I AGAGGGCCAT -/A AAAGCCTGCA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 A 3 4 320025 CASAVA_Build 22 31849359 1I GAAAATGAGG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 T 7 8 320026 CASAVA_Build 22 31854671 1I AAAAACAAAA -/C AAAAAAAAAA 850 het 59 hom 7 2 5 0 C 0 1 320027 CASAVA_Build 22 31859814 4D TTTCCACAAC CTCT/---- CTCTCCAGCA 3070 het 3070 hom 34 14 19 3 CT 4 2 320028 CASAVA_Build 22 31866320 1I TGCAGTGGGG -/A AGAAAAGGGG 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 A 1 2 320029 CASAVA_Build 22 31868649 1D AATAAATACT C/- AGTTTTTGGT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 C 1 0 320030 CASAVA_Build 22 31875200 1D TTATTTTTTT A/- ATATTTTTTA 2142 het 1141 hom 9 4 5 0 A 2 1 320031 CASAVA_Build 22 31877938 1D AAAAAAAAAA C/- AAGTTGTGAA 3070 het 3070 hom 38 10 21 7 C 1 0 320032 CASAVA_Build 22 31881952 4D GGTGGAAGCC CCAA/---- CCAAGCCTTG 2552 het 2552 ref 25 14 6 6 CCAA 2 1 320033 CASAVA_Build 22 31883193 3I AAAGTGAGTG ---/AAT AATCATTATG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AAT 1 2 320034 CASAVA_Build 22 31890486 1D TAAGATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 12 11 320035 CASAVA_Build 22 31892324 1I GTAATCATCA -/G GGCCACTTCA 3070 het 3070 hom 56 23 22 11 G 2 3 320036 CASAVA_Build 22 31894577 1D TGCTAATTAA T/- GTTAGTTACT 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 T 1 0 320037 CASAVA_Build 22 31917267 1D TGCTACAACT A/- AAAAAGAATT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 A 6 5 320038 CASAVA_Build 22 31917531 2D GAGATCAGAT AA/-- ATTTAGAACT 3070 het 3070 ref 34 14 15 6 A 3 1 320039 CASAVA_Build 22 31917796 1D TTAAAATCAT A/- AAAATTTAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 A 5 4 320040 CASAVA_Build 22 31919000 1I AATTTTTCCA -/T TTGTCCTACT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 2 3 320041 CASAVA_Build 22 31923194 1I AATATTAAAT -/A ATTTCCCACA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 1 2 320042 CASAVA_Build 22 31923904 2D ATAAACAGAC AT/-- ATGGATCAAT 3070 het 3070 ref 51 25 24 3 AT 2 1 320043 CASAVA_Build 22 31924314 2D ACATAAAATG TA/-- TATATATCTG 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 TA 4 3 320044 CASAVA_Build 22 31924588 1D CTCCCTCCCA C/- CCTCCAAACT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 C 3 2 320045 CASAVA_Build 22 31925201 1I GTTTTTTTTT -/C TTCTTATGGA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 C 0 1 320046 CASAVA_Build 22 31928092 1I ACGGCATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1949 hom 24 7 12 5 A 13 14 320047 CASAVA_Build 22 31956691 1D GGACACACAG T/- TTGTCTGCAC 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 T 3 2 320048 CASAVA_Build 22 31996298 1I CCTTAGGGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 A 8 9 320049 CASAVA_Build 22 32024898 2I AAAAAAGGAA --/AG AGAGAGAGAG 2865 het 2865 ref 25 10 8 7 AG 7 8 320050 CASAVA_Build 22 32050282 1D AAACAAACAA C/- CCCCCCCCCA 1295 het 276 hom 12 1 4 7 C 10 9 320051 CASAVA_Build 22 32050915 1D TGGGGAGAGC T/- TTTGCAGGTT 3070 het 3070 ref 59 28 22 9 T 4 3 320052 CASAVA_Build 22 32051665 8D GACCAATTAA GGAGTCTG/-------- GGAGGCCCCG 3070 het 3070 ref 37 22 11 6 GGAGTCTG 1 0 320053 CASAVA_Build 22 32055302 1D GTCCAGTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 11 24 8 T 10 9 320054 CASAVA_Build 22 32070366 4D ACTTACAACT TAGA/---- TAGAGAGGAA 2514 het 2514 ref 29 20 6 5 TAGA 2 1 320055 CASAVA_Build 22 32072264 3D TCTCTTTCTT TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 TCC 6 5 320056 CASAVA_Build 22 32082033 1I CTCCCCAGTT -/C CCCCATTTTA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 4 5 320057 CASAVA_Build 22 32084288 1I AAACCAACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 125 het 50 0 42 8 T 9 10 320058 CASAVA_Build 22 32084984 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2089 hom 34 11 16 7 A 17 16 320059 CASAVA_Build 22 32133680 1I AAGATCCTAA -/C CCAAGTCTGC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 2 3 320060 CASAVA_Build 22 32135278 3D CTGAGACGGA AGG/--- AGGAGGAGGA 3070 het 3070 ref 43 14 16 19 AGG 5 4 320061 CASAVA_Build 22 32145655 1I TGAATCTTTG -/T TTTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 T 5 6 320062 CASAVA_Build 22 32156916 1D GCCTCCAGGG C/- AGGCTTCACT 3070 het 3070 ref 42 25 12 5 C 1 0 320063 CASAVA_Build 22 32157376 1D ATGCAAGTTT G/- GGGCTAGTAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 5 G 4 3 320064 CASAVA_Build 22 32176629 2I AAATAAATGG --/AT ATCTCAATAT 2255 het 2255 ref 15 6 6 3 AT 1 2 320065 CASAVA_Build 22 32206407 1I AAGCGGGTAT -/A AATCTCCTGC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 2 3 320066 CASAVA_Build 22 32207117 1D ATTGCCCTGC A/- AAAAAAAAAC 1380 het 1380 ref 32 27 3 2 A 10 9 320067 CASAVA_Build 22 32222879 4D AAATTCAACA TTGT/---- TTGGTTTATC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TTGT 1 0 320068 CASAVA_Build 22 32225665 4I ATTGACTTAT ----/AGGC AGGCATGAGG 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 AGGC 1 2 320069 CASAVA_Build 22 32228885 5D GTCCCTGCTA TGCTC/----- TAGGCCTCGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 8 TGCTC 1 0 320070 CASAVA_Build 22 32243618 1I GAACTCCTGA -/C CTTGTGATCC 3070 hom 42 het 15 0 13 2 C 1 2 320071 CASAVA_Build 22 32249666 1D ATATCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 40 0 29 11 T 12 11 320072 CASAVA_Build 22 32265243 1D TGATTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 20 10 A 11 10 320073 CASAVA_Build 22 32265719 12I TGGGACCACA ------------/GGCATGTGCCAC CCCACCTGGC 3070 hom 78 het 30 0 26 5 GGCATGTGCCAC 0 1 320074 CASAVA_Build 22 32273041 1I TTTTTAAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 9 10 320075 CASAVA_Build 22 32273346 3D AGGGTTTGCG CTA/--- CTATGGGAAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 CTA 2 1 320076 CASAVA_Build 22 32278454 1I TTTACAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 9 10 320077 CASAVA_Build 22 32279342 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2979 hom 20 8 9 4 A 12 11 320078 CASAVA_Build 22 32286804 1D TTTATTTAAC T/- TTTTTTTTTT 1669 het 927 hom 32 6 9 17 T 15 14 320079 CASAVA_Build 22 32292078 1D TTGACCTTAC A/- AATACCATGT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 3 2 320080 CASAVA_Build 22 32299918 4I TTTACAACAT ----/GCTA GCTGGCTTCC 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 GCTA 0 1 320081 CASAVA_Build 22 32313722 1D TCCTTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 12 11 320082 CASAVA_Build 22 32318854 1I TGAGACGGAG -/T CTTGCTCTGT 3070 hom 46 het 21 0 16 5 T 0 1 320083 CASAVA_Build 22 32329061 1D14M1D ATCAATTTTA GGCTCAGAATAGATTG/-GCTCAGAATAGATT- GGAATGGCAC 3070 hom 123 het 42 0 42 6 N/A 0 0 320084 CASAVA_Build 22 32337235 1D GATGTGCACC T/- TTGTGCTTGG 3070 hom 87 het 32 0 28 4 T 3 2 320085 CASAVA_Build 22 32340839 2I CTCTTGTTTA --/CT CTCTCTACAA 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 CT 3 4 320086 CASAVA_Build 22 32340931 1I TGTGCCCATG -/C TGTCGCCTTT 3070 hom 126 het 45 0 41 4 C 0 1 320087 CASAVA_Build 22 32341481 1I AATAATTTTT -/A AAAAAACCCT 2903 het 2903 ref 21 11 7 3 A 6 7 320088 CASAVA_Build 22 32343458 1I TGCAGATAAT -/A AAAACTCATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 4 5 320089 CASAVA_Build 22 32346912 1I AATCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 8 9 320090 CASAVA_Build 22 32347437 3I AAAACTGATT ---/TGA TGATGTAATG 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 TGA 1 2 320091 CASAVA_Build 22 32354597 1D ATCGCACCCC G/- GCCTAGAATA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 G 2 1 320092 CASAVA_Build 22 32354787 1I CCAACCCGCA -/G GACATCTGCA 3070 hom 57 het 20 0 18 2 G 1 2 320093 CASAVA_Build 22 32357142 5D CCAGCCAACT GTCTA/----- TTTTTTTTTT 2559 het 912 hom 14 4 6 6 GTCTA 1 0 320094 CASAVA_Build 22 32358514 1D GGTCAGATTT C/- CCCGGCTCCT 981 het 981 ref 34 9 5 21 C 4 3 320095 CASAVA_Build 22 32358544 1D CCAATCACAC A/- AGTTCCAGTC 3070 hom 74 het 39 0 24 15 A 2 1 320096 CASAVA_Build 22 32359194 1D TAGTTAACCA G/- GGAGATCCCA 3070 hom 123 het 44 0 40 4 G 3 2 320097 CASAVA_Build 22 32360605 1D TCAGGGTGAG A/- AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 6 5 320098 CASAVA_Build 22 32363592 2I TTTTACTTCT --/TC TCTGTTTAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 TC 1 2 320099 CASAVA_Build 22 32371211 1D AAAACAGCAT G/- GTACTGGTAC 3070 het 2382 hom 16 5 11 0 G 2 1 320100 CASAVA_Build 22 32372514 1D ACTGTAAACC A/- ACCATGGCAC 3070 hom 55 het 21 0 19 2 A 2 1 320101 CASAVA_Build 22 32378517 1I ATCCTGGGCT -/C CCAGCTACAT 3070 het 3070 hom 62 29 29 4 C 2 3 320102 CASAVA_Build 22 32387204 1I GGTTCTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2910 hom 33 11 9 13 T 16 17 320103 CASAVA_Build 22 32391888 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 10 9 320104 CASAVA_Build 22 32401991 1I GGAGGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 11 12 320105 CASAVA_Build 22 32403744 1I AGCCTCTCCT -/G GTCCAGACCA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 1 2 320106 CASAVA_Build 22 32407034 2D TTAAAAATAT CA/-- CAGTGTTTTA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 CA 2 1 320107 CASAVA_Build 22 32412547 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAACAAA 726 het 607 hom 13 3 3 7 G 0 1 320108 CASAVA_Build 22 32412572 1D7M1D TATGAATAAC TTAACAAGC/-TAACAAG- CTGCACAGGT 3070 hom 15 het 19 1 19 8 N/A 0 0 320109 CASAVA_Build 22 32413372 1D ACCTTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 2184 het 2184 ref 30 11 6 13 T 13 12 320110 CASAVA_Build 22 32415755 1D TACTAAAGAT A/- AAAAAAAATT 2486 het 1732 hom 12 5 6 1 A 9 8 320111 CASAVA_Build 22 32416657 1D AGAGAAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2333 hom 43 13 16 14 A 15 14 320112 CASAVA_Build 22 32418292 1D ATAACAGCAA C/- ATTTATTTTA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 C 1 0 320113 CASAVA_Build 22 32451880 1I TTTGCCCCCC -/T TGCCGCGGAG 3070 hom 80 het 30 0 26 4 T 1 2 320114 CASAVA_Build 22 32466468 1D CTTCAGAAAA G/- GGTCATTATC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 3 2 320115 CASAVA_Build 22 32498320 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 A 10 11 320116 CASAVA_Build 22 32499473 1I GGGGCAGTGG -/C CCCCCTGAGG 3070 het 3070 hom 56 25 24 7 C 5 6 320117 CASAVA_Build 22 32499825 3D ACGATTATCA AAC/--- AACAATATGA 3070 het 3070 ref 49 31 15 5 AAC 2 1 320118 CASAVA_Build 22 32500243 4D TAGGCTTCCT TGGA/---- TAAGACAATG 3070 het 3070 ref 27 15 10 4 TGGA 1 0 320119 CASAVA_Build 22 32501501 1I GGGTAATTTA -/C CCCCAGGGGA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 C 4 5 320120 CASAVA_Build 22 32505394 1D AGTGGAACCA G/- GAAGTACCTA 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 G 2 1 320121 CASAVA_Build 22 32505775 11D CTCTTGTTTC AAAAAAATTAA/----------- AAAAAAATTA 2890 het 2890 ref 17 12 9 1 AAAAAAATTAA 2 1 320122 CASAVA_Build 22 32519776 1I ACCCCCCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2739 hom 32 9 15 8 T 11 12 320123 CASAVA_Build 22 32520695 1I GCAACCTCCG -/C CTCCCGGGTT 3070 hom 53 het 21 0 18 3 C 1 2 320124 CASAVA_Build 22 32520896 9D CGTGAGTCAC CGTGCCCGG/--------- CCTTAAAATG 3070 het 3070 ref 38 24 13 5 CGTGCCCGG 1 0 320125 CASAVA_Build 22 32526067 2D TTGCTATCCC CT/-- GACTCATTCC 3070 het 3070 ref 37 17 15 8 CT 1 0 320126 CASAVA_Build 22 32545252 4D GGTGTGTGAG TACA/---- AAGCTCTTCA 3070 het 3070 hom 52 23 25 5 TACA 1 0 320127 CASAVA_Build 22 32547730 2I GTATACATAC --/AT ATGTGTGTAT 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 AT 1 2 320128 CASAVA_Build 22 32553716 1D CACGGAGACT G/- GGGAAGGAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 4 3 320129 CASAVA_Build 22 32561008 1D AAAGCTATTT C/- CAAAGAATAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 2 1 320130 CASAVA_Build 22 32566664 1D ATTTTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 11 10 320131 CASAVA_Build 22 32568407 2I TTCGGATTTT --/TA TATATATTCA 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 TA 3 4 320132 CASAVA_Build 22 32574405 1I TTTGGCCAGC -/A CCTCTATTTC 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 0 1 320133 CASAVA_Build 22 32580666 1I CAGTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 A 11 12 320134 CASAVA_Build 22 32602508 2I TGCTATACTT --/CC CTATTTAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 1 3 320135 CASAVA_Build 22 32604249 3D CAGTCTCCCA AGT/--- AGTAGCTGGG 3070 hom 48 het 18 0 16 2 AGT 2 1 320136 CASAVA_Build 22 32611208 1I CATGCTTCCT -/A ATACCAGTGA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 1 2 320137 CASAVA_Build 22 32613731 1D ATCTCACAAG A/- AAAAAAAAAA 2886 het 2886 ref 44 27 7 11 A 13 12 320138 CASAVA_Build 22 32617002 28D GGCTCCATAT GGTTCTGTGCATATGGGAAGCTGCATAC/---------------------------- GGTTCTGTGC 3070 het 2881 hom 25 7 12 15 GGTTCTGTGCATATGGGAAGCTGCATAC 2 1 320139 CASAVA_Build 22 32637813 1D TGCTGATCTG A/- AATATCCTTC 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 A 3 2 320140 CASAVA_Build 22 32649699 1D CTGAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 A 11 10 320141 CASAVA_Build 22 32654353 1D GCATGGGCTT C/- CTAGAGGGCC 3070 hom 96 het 33 0 32 1 C 2 1 320142 CASAVA_Build 22 32655136 1D12M1D TAATGGTGTG AAACAGAGGCCTAG/-AACAGAGGCCTA- GATGACCCAC 3070 hom 108 het 44 0 36 11 N/A 0 0 320143 CASAVA_Build 22 32662480 1D5M1D ACTCAGCCTA GGAGTTA/-GAGTT- ACTCCAGTAG 3070 hom 99 het 38 0 32 11 N/A 0 0 320144 CASAVA_Build 22 32667351 1I TTTTATTTTA -/T TTTTCTTTAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 4 5 320145 CASAVA_Build 22 32679948 1D AAGTTCAGAG A/- AAATACTGGT 3070 het 2647 hom 17 6 7 4 A 4 3 320146 CASAVA_Build 22 32682328 1I CCATCCCTGG -/C CCCCTGGGCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 4 5 320147 CASAVA_Build 22 32685353 1I62M1I12M1I GCCTGGCCTA -TTTGGATTCACCCAAATAGGTGAATGTCTAAATTTCAAAAGCACACATCTTGGTTCTTTATT-CAATCCTCTTCT-/TTTTGGATTCACCCAAATAGGTGAATGTCTAAATTTCAAAAGCACACATCTTGGTTCTTTATTCCAATCCTCTTCTC CCTCCTCAGT 3070 hom 60 het 23 0 21 26 N/A 0 0 320148 CASAVA_Build 22 32690320 1D CTTGAAGCTA G/- GGAAAAGGCC 3070 hom 111 het 43 0 38 6 G 3 2 320149 CASAVA_Build 22 32695341 1D CCTTCATCCT C/- CCTTCCTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 3 2 320150 CASAVA_Build 22 32716872 6I GGGGCCAGGA ------/ATCTAC ATTTTTAATA 3070 hom 48 het 22 0 16 6 ATCTAC 0 1 320151 CASAVA_Build 22 32744072 1I GTCAGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2381 hom 38 9 14 15 A 15 16 320152 CASAVA_Build 22 32761042 1I TTGTATCTCC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 203 hom 28 1 23 4 T 8 9 320153 CASAVA_Build 22 32761808 2D TTCTTCCCAC CT/-- CTGGCTATGT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 CT 2 1 320154 CASAVA_Build 22 32792752 1D CTGTTTCAAG A/- AAAAAAAAAA 1196 het 1196 ref 35 26 4 5 A 12 11 320155 CASAVA_Build 22 32795265 1D TCCAGGCTGG A/- AGTGCAGTGG 3070 hom 81 het 30 0 27 5 A 2 1 320156 CASAVA_Build 22 32799156 1D26M1I TAAAACCCTC TTGATGTGCTCACCATGGCCCAGGAGG-/-TGATGTGCTCACCATGGCCCAGGAGGC CCAAACAGTC 3070 hom 114 het 38 0 39 8 N/A 0 0 320157 CASAVA_Build 22 32802268 1I CAAGGATGTC -/G TGAGCTGCCT 3070 hom 150 het 57 0 50 7 G 0 1 320158 CASAVA_Build 22 32807168 1D CCAGCTTCAT C/- CCATGTCCCT 3070 het 198 hom 12 2 9 1 C 3 2 320159 CASAVA_Build 22 32808446 1D TTTACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 24 0 14 13 T 15 14 320160 CASAVA_Build 22 32822006 1D TCTTCTACCC T/- TTTGGTTCAG 3070 hom 146 het 54 0 46 9 T 4 3 320161 CASAVA_Build 22 32822871 1I GTAATCATTG -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 156 het 64 0 48 16 C 8 9 320162 CASAVA_Build 22 32823702 8I AGTGGCCGTG --------/GAGGTGGA GAGGTGGGGA 3070 hom 143 het 53 0 45 8 GAGGTGGA 0 1 320163 CASAVA_Build 22 32824429 1I GACACCACAA -/G GGTCTCACTG 3070 hom 88 het 41 0 34 7 G 2 3 320164 CASAVA_Build 22 32851285 1I TCTAAATACA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 7 8 320165 CASAVA_Build 22 32854691 1I TAAATTGGTC -/T GTTTGCTGTA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 320166 CASAVA_Build 22 32858371 4D GTCACTTGTG TGTT/---- TGTTTACATG 3070 hom 105 het 36 0 36 3 TGTT 2 1 320167 CASAVA_Build 22 32861561 2D GTACAGACTC TT/-- TTCCCAACAC 3070 het 3070 ref 38 18 18 4 T 4 2 320168 CASAVA_Build 22 32865320 5D CACATCTTCA CTATT/----- CTGATACCCA 3070 het 3070 ref 57 25 26 8 CTATT 1 0 320169 CASAVA_Build 22 32870901 1D TCGGATGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 9 13 T 12 11 320170 CASAVA_Build 22 32871804 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 24 0 11 13 A 12 11 320171 CASAVA_Build 22 32873474 1I GCTCCATATA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2990 hom 35 10 17 8 T 8 9 320172 CASAVA_Build 22 32874210 1I TTTAAATTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 9 10 320173 CASAVA_Build 22 32878531 1D GAAAACAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1556 hom 42 4 32 6 A 13 12 320174 CASAVA_Build 22 32895265 1D ATTGATTTAG T/- TTTTTAGAAA 3070 het 3070 ref 27 13 14 0 T 6 5 320175 CASAVA_Build 22 32896570 1D AAAAGCAGAA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 7 6 320176 CASAVA_Build 22 32900727 8I GTAAGGCTTC --------/TAATGGTG CAATGGTGGC 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 TAATGGTG 0 1 320177 CASAVA_Build 22 32903703 4D ATTAAATTTA ACAG/---- ACAAATTATA 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 ACAG 1 0 320178 CASAVA_Build 22 32903839 1I ACCACTGTAA -/T TTTTTATTGT 3070 het 3070 hom 32 14 18 0 T 5 6 320179 CASAVA_Build 22 32916782 1D AACAAATACC T/- TTTTTCAGAA 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 T 6 5 320180 CASAVA_Build 22 32931079 1I TCACTACGAG -/C TCCGCCTCCC 3070 hom 21 het 11 0 9 2 C 0 1 320181 CASAVA_Build 22 32944002 1D ACTTATGTCC T/- TGTGTCCTTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 T 2 1 320182 CASAVA_Build 22 32951741 1D TAGATCAATT A/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 A 1 0 320183 CASAVA_Build 22 32955363 4I GTCTCCCTGA ----/CTCT CTCTGTTTCT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 CT 2 4 320184 CASAVA_Build 22 32956137 1D TGTTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2217 hom 20 9 8 3 T 12 11 320185 CASAVA_Build 22 32964112 3I GCGCACCATC ---/ATT GTGTTAGTCA 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 ATT 0 1 320186 CASAVA_Build 22 32982520 5D TTTATTTTTG TTTCC/----- TTTAACTTTG 3070 het 3070 hom 39 17 12 10 TTTCC 1 0 320187 CASAVA_Build 22 32985817 1I AGCATGGGCT -/G CTGGACTAAG 3070 hom 87 het 37 0 28 9 G 0 1 320188 CASAVA_Build 22 32990236 1I ATACTCGGGG -/A AAGAAGCAAG 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 2 3 320189 CASAVA_Build 22 32992612 2I AGGTAGCCAA --/AG AGAGACACAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 AG 2 3 320190 CASAVA_Build 22 32996483 1I TGTGATGGGA -/G GCGCTGCCAT 3070 hom 41 het 16 0 13 3 G 1 2 320191 CASAVA_Build 22 32998899 1D ATAAAGCTGG C/- CCTACAACAT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 C 3 2 320192 CASAVA_Build 22 33001342 1D TTGAAGTGGC A/- CATATAATCA 3070 het 3070 ref 57 25 26 6 A 1 0 320193 CASAVA_Build 22 33004810 2I ATATGTATTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 33 het 17 0 12 5 TC 5 6 320194 CASAVA_Build 22 33011231 1D TTTTTCTGTC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 8 7 320195 CASAVA_Build 22 33013927 1D TGCTCTATTT G/- ATGTGGGACC 3070 het 3070 hom 57 27 29 2 G 1 0 320196 CASAVA_Build 22 33019614 2I CCTTCCCTAC --/TT TTGAAGTACA 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 T 2 4 320197 CASAVA_Build 22 33023283 1D CAAAACAGAC T/- TAAGACATTA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 2 1 320198 CASAVA_Build 22 33024012 1D ATCAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 24 6 A 11 10 320199 CASAVA_Build 22 33030257 1D CTTTTGCATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 10 9 320200 CASAVA_Build 22 33030636 3I CAACCACAAC ---/AAA AAAAGCAAGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 4 7 320201 CASAVA_Build 22 33034329 4D TCAGCTTGCT AGAG/---- AGAAGGAGAA 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 AG 3 1 320202 CASAVA_Build 22 33034569 3D GAACTGCCTT GAA/--- GAAAAGGAAT 3070 het 3070 hom 52 19 25 9 GAA 2 1 320203 CASAVA_Build 22 33040053 5D TAGTATGCCA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 AAAAC 3 2 320204 CASAVA_Build 22 33041123 1D CCCCCCTCCG C/- CCCCCCAAAT 3070 hom 66 het 23 0 19 4 C 7 6 320205 CASAVA_Build 22 33041857 1D AAGAAATGAC T/- GAAAATTAGA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 1 0 320206 CASAVA_Build 22 33045196 1D AAATCTATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 10 9 320207 CASAVA_Build 22 33048771 2D TCTCAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 12 10 320208 CASAVA_Build 22 33050293 4D CTCCGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 4 AAAC 3 2 320209 CASAVA_Build 22 33051104 1I GCAGCTTCAT -/A TGCCACCATT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 0 1 320210 CASAVA_Build 22 33051453 3D GTGATCGCCA AGG/--- AGGAGACACC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AGG 2 1 320211 CASAVA_Build 22 33051730 1D AAAATGTGGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 T 8 7 320212 CASAVA_Build 22 33053918 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 505 het 505 ref 36 16 8 12 T 11 12 320213 CASAVA_Build 22 33054434 2I TATATATGTG --/TA TATGTCTACA 1663 het 1663 ref 39 14 6 19 TA 1 2 320214 CASAVA_Build 22 33054452 2D CACACCATAC AT/-- ATATGTGTGT 3070 hom 31 het 35 0 19 17 AT 3 2 320215 CASAVA_Build 22 33056143 6D GGAGGATAGC GATACT/------ GATTAACCTT 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 GATACT 1 0 320216 CASAVA_Build 22 33067701 1D CCTATTTTTT C/- TTCCATGAAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 1 0 320217 CASAVA_Build 22 33074896 1D TGTCGCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 25 12 T 11 10 320218 CASAVA_Build 22 33077781 4D AAAAAATAAA AAAT/---- AAAAATATTG 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 AAAT 1 0 320219 CASAVA_Build 22 33081710 6D AAGGCACTAA GAACAG/------ TGGCAGGTAC 3070 het 3070 hom 53 23 27 6 GAACAG 1 0 320220 CASAVA_Build 22 33087651 1I ATTATACTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 8 9 320221 CASAVA_Build 22 33091093 4I GGAGGGAAGT ----/AGTC AGCGTAATTT 3070 het 3070 hom 52 24 24 5 AGTC 0 1 320222 CASAVA_Build 22 33093908 1I ATAATCCTGT -/G GATTTTGCCT 3070 het 3070 ref 38 24 8 6 G 1 2 320223 CASAVA_Build 22 33094104 1I CCCAGAGTTG -/T TTTTTTTTTG 2540 het 2540 ref 41 18 12 11 T 9 10 320224 CASAVA_Build 22 33097046 1I TGTCCTTCTG -/T TTTTATCTCA 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 T 4 5 320225 CASAVA_Build 22 33099248 4I TTTAGACTCC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 het 3070 ref 50 21 16 13 ATTT 2 3 320226 CASAVA_Build 22 33103965 9D CACTCGGTAC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 2533 het 2186 hom 22 11 7 8 A 21 12 320227 CASAVA_Build 22 33105816 2D AAAACCAAAC AA/-- GAGTTCTGAG 3070 het 3070 ref 50 22 20 9 A 2 0 320228 CASAVA_Build 22 33107160 1D GTGGACCTTG A/- AAAGAACTTG 3070 het 3070 ref 47 27 17 5 A 4 3 320229 CASAVA_Build 22 33107887 1I TGAAAGGCAA -/T TGCTGGGGCA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 1 2 320230 CASAVA_Build 22 33112352 1D AGAACTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 2440 hom 18 5 11 8 A 9 8 320231 CASAVA_Build 22 33114011 5D GTTTGTGTCC TCTCT/----- TATTTCCTTG 1934 het 1854 hom 9 5 4 2 TCTCT 1 0 320232 CASAVA_Build 22 33114540 2D CTAGTTTATT GA/-- GAGTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 GA 2 1 320233 CASAVA_Build 22 33115480 1I CTTGTGGGCA -/T TTTAGTGCTA 3070 het 1088 hom 13 3 10 0 T 3 4 320234 CASAVA_Build 22 33116474 2I TGATTGGAGC --/TT TTTTTTTTCA 1947 het 1947 ref 20 9 7 4 T 8 10 320235 CASAVA_Build 22 33117138 1D ACCCCTGTCT A/- ACCAGTCCCA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 A 2 1 320236 CASAVA_Build 22 33117578 1I GTTAAAAAAA -/T AAAGATTTTG 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 T 0 1 320237 CASAVA_Build 22 33119049 5I TTGCTTGGTT -----/AAGAC AAGACAAGGC 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 AAGAC 1 2 320238 CASAVA_Build 22 33125599 1I AATGATGTTG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 7 8 320239 CASAVA_Build 22 33125947 8D AAAAAAAAAT ACACACAC/-------- ACACACAGAC 3070 het 3070 hom 29 10 17 6 AC 7 3 320240 CASAVA_Build 22 33126558 4I TATAGTTTAT ----/CTGA CTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 CTGA 0 1 320241 CASAVA_Build 22 33128855 1D CTTCAACGCT G/- GGGATCAAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 4 3 320242 CASAVA_Build 22 33135614 1I CAGTAGTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 T 9 10 320243 CASAVA_Build 22 33135905 3I ACTATCATGG ---/TAT TATAATTAAT 1572 het 1000 hom 11 4 4 3 TAT 1 2 320244 CASAVA_Build 22 33139567 4D TGTCTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 3070 hom 36 14 17 7 TA 10 8 320245 CASAVA_Build 22 33141301 2D CAATAGGTTT TG/-- TGTGAAGTGT 3070 het 3070 hom 38 17 20 2 TG 3 2 320246 CASAVA_Build 22 33148015 1I ACTGCGATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 9 10 320247 CASAVA_Build 22 33151833 1D ATACTTTTAC T/- TTTCTGTGCC 3070 hom 147 het 53 0 49 4 T 4 3 320248 CASAVA_Build 22 33157299 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 13 4 T 11 10 320249 CASAVA_Build 22 33157920 1I AGTGCCAGCA -/T GTTTGCAGGA 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 0 1 320250 CASAVA_Build 22 33179747 1D17M1D13M1D ATGAAAGTAT CCCTTGAGCAAATCCCTTGGAATAAACCAAGCG/-CCTTGAGCAAATCCCTT-GAATAAACCAAGC- GGGCAACCTT 3070 hom 123 het 34 0 42 5 N/A 0 0 320251 CASAVA_Build 22 33180658 1I GGGGATGAAG -/A AAACAAAGTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 3 4 320252 CASAVA_Build 22 33180759 1D ATCATAAATG C/- CTAATTGCAG 3070 hom 114 het 44 0 37 7 C 2 1 320253 CASAVA_Build 22 33181264 2D CGTGCTGCCT CA/-- CAACATGGCT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 CA 2 1 320254 CASAVA_Build 22 33181665 1D TTTTCCTGCT A/- ATTCCCAGCC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 1 320255 CASAVA_Build 22 33182639 1D CCCTCTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 15 14 320256 CASAVA_Build 22 33187435 2I TTACAGGCGT --/GA GCCACCGCAC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 GA 0 1 320257 CASAVA_Build 22 33201780 1D TGGAAAGGTG C/- ACATTAAAGA 3070 hom 114 het 46 0 39 8 C 1 0 320258 CASAVA_Build 22 33202248 1I TGTTCCTTGG -/A AAAAAAAAAA 2524 het 2524 ref 39 14 12 13 A 13 14 320259 CASAVA_Build 22 33202893 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2661 hom 23 11 8 4 A 13 14 320260 CASAVA_Build 22 33207085 4I TCAAAAAGTT ----/AAAC ATAGTATTAC 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 AAAC 0 1 320261 CASAVA_Build 22 33221931 1D TTTGATCTGA T/- TTTCAGCTTT 3070 het 3070 ref 45 22 16 8 T 4 3 320262 CASAVA_Build 22 33253193 1I TGGGGCATAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 10 320263 CASAVA_Build 22 33256053 1I ATTTTATTTC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 449 hom 38 2 32 4 T 8 9 320264 CASAVA_Build 22 33259793 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3024 hom 25 9 14 2 A 12 11 320265 CASAVA_Build 22 33264833 1I TTTAACTTCA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 T 8 9 320266 CASAVA_Build 22 33268969 4I TGGAGGAAAG ----/TTAT TTAATCTTTC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TTAT 0 1 320267 CASAVA_Build 22 33275605 1D AAAGGGATTC T/- TTTTTTTTTT 2643 hom 30 het 15 0 11 4 T 13 12 320268 CASAVA_Build 22 33275676 1D TTTTTTAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 21 1 18 2 T 11 10 320269 CASAVA_Build 22 33284481 1D AATTCTCTCT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 29 1 23 5 A 1 0 320270 CASAVA_Build 22 33286339 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTAGTAGA 2042 hom 15 het 8 0 6 2 T 4 5 320271 CASAVA_Build 22 33288769 2I TCTGATTTTT --/CA CACACACACA 3070 het 419 hom 30 1 26 3 CA 7 8 320272 CASAVA_Build 22 33291454 5I CATTTCTTTC -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 hom 60 het 32 0 20 12 TTTCT 2 3 320273 CASAVA_Build 22 33295193 1I AATTTTATAA -/T TTTTAGATTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 4 5 320274 CASAVA_Build 22 33295894 4I TCTTTTCCGC ----/TATT TATTCAATAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TATT 1 2 320275 CASAVA_Build 22 33295996 1I ATTATTCCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 8 9 320276 CASAVA_Build 22 33296719 1D TCCTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 19 11 T 13 12 320277 CASAVA_Build 22 33299817 6I TAGTCTATGA ------/TATATC TATATCTATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TATATC 1 2 320278 CASAVA_Build 22 33307460 1D TAGTGATTTG C/- CCTGTCGTAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 3 2 320279 CASAVA_Build 22 33308579 5I AGTATAAATT -----/AATAA AATATATACA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AATAA 0 1 320280 CASAVA_Build 22 33314064 1I AGCAAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 42 0 34 8 A 10 11 320281 CASAVA_Build 22 33314409 16D CTTTGTTTTG TTTTACTTTGTTTTGT/---------------- TTTATTGTGT 3070 hom 7 het 26 0 15 13 TTTTACTTTGTTTTGT 1 0 320282 CASAVA_Build 22 33328202 1D CTGTGTTTTC T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 7 6 320283 CASAVA_Build 22 33341067 1D GATATGTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 48 1 38 9 A 13 12 320284 CASAVA_Build 22 33350936 1D ACGCCCCCCC A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 7 6 320285 CASAVA_Build 22 33354823 12I CAGCAGTTCC ------------/TGCCCCTGCCCT TGCCCCTGCC 3070 hom 78 het 36 0 25 11 TGCCCCTGCCCT 1 2 320286 CASAVA_Build 22 33355245 1D GAGCTAACTT G/- GGGTAGAGGC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 4 3 320287 CASAVA_Build 22 33361303 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 724 hom 31 3 22 6 A 10 9 320288 CASAVA_Build 22 33389126 9D GTAAGGTTGC CGCCCGTGT/--------- AACATGGCAT 3070 hom 169 het 57 0 57 3 CGCCCGTGT 1 0 320289 CASAVA_Build 22 33393509 6D AAGTAGGAAC GAGAGA/------ GAGAGAGAGA 3070 hom 46 het 26 0 16 12 GA 9 6 320290 CASAVA_Build 22 33395520 13D AAGGTGTGAA CAGATATCCTCTT/------------- CTGCGGGAGA 3070 hom 93 het 34 0 31 6 CAGATATCCTCTT 1 0 320291 CASAVA_Build 22 33398139 1I AGAAAAATGC -/A ACTTTTTTAT 3070 hom 107 het 39 0 34 5 A 1 2 320292 CASAVA_Build 22 33411259 6D GACCGTGGAA AGAGGG/------ AGAGGGAGAG 3070 hom 35 het 21 0 12 11 AGAGGG 4 3 320293 CASAVA_Build 22 33412651 1I CTCGGCTCAC -/T TGTAACCTCC 2745 het 850 hom 8 2 6 1 T 1 2 320294 CASAVA_Build 22 33416119 1I AAAGCCATAC -/G GGCAGTTTCT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 2 3 320295 CASAVA_Build 22 33422273 1I AACCACTCTA -/C GACTCAGTTT 3070 hom 148 het 54 0 50 4 C 0 1 320296 CASAVA_Build 22 33444205 1I AAATTTTAGG -/C CAATATCTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 1 2 320297 CASAVA_Build 22 33446601 2D TATAGTATCT TA/-- TATATATGTA 1836 het 1747 hom 8 4 4 0 TA 4 3 320298 CASAVA_Build 22 33449384 1D TCTGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 546 hom 38 3 14 21 T 13 12 320299 CASAVA_Build 22 33449654 2I ATTCAGACAC --/AG TGTGAGGAAC 3070 hom 117 het 47 0 39 8 AG 0 1 320300 CASAVA_Build 22 33451944 1I AAAGAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 10 11 320301 CASAVA_Build 22 33455831 1D TTCTTATCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 11 10 320302 CASAVA_Build 22 33470035 19I CAGGCTGGTC -------------------/TCGAACTCCTGACCTCAGG TGATCCACCC 3070 hom 69 het 24 0 24 1 TCGAACTCCTGACCTCAGG 0 1 320303 CASAVA_Build 22 33486031 4D TTTATGCCTG TTAA/---- TTAAATAAGC 3070 het 3070 hom 44 15 20 10 TTAA 2 1 320304 CASAVA_Build 22 33498299 1D CCCGGTTTGC T/- GCTGAGTCTC 3070 het 3070 ref 34 18 9 8 T 1 0 320305 CASAVA_Build 22 33499326 5I GTTCAAGAGA -----/TCTCT TCTATAACAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TCTCT 0 1 320306 CASAVA_Build 22 33503798 1I AGCCAGATGC -/A GAAATTTGCA 3070 hom 63 het 23 0 20 3 A 0 1 320307 CASAVA_Build 22 33507068 4I TGTATATATA ----/CATT CTTACATACA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 CATT 0 1 320308 CASAVA_Build 22 33522939 1I TTAATTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 10 8 10 T 11 12 320309 CASAVA_Build 22 33529791 1D TATATCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 11 10 320310 CASAVA_Build 22 33535128 1I TCCAAGAAGG -/T TAGAGTTTCA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 T 1 2 320311 CASAVA_Build 22 33541111 1D CTGACTGCAC A/- GGGGGTTGAC 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 A 1 0 320312 CASAVA_Build 22 33548912 2D TTAAAGTATA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1279 hom 16 3 13 1 AT 7 6 320313 CASAVA_Build 22 33549924 1I GGTTCTTGGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 7 8 320314 CASAVA_Build 22 33552277 1I GGAGGGAGTC -/T TCAGAAGAAC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 1 2 320315 CASAVA_Build 22 33556914 3I TTCTAAATCA ---/AAG AAGAATAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 AAG 1 2 320316 CASAVA_Build 22 33566329 6I TGTGTGTCTG ------/ACACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 AC 5 8 320317 CASAVA_Build 22 33568863 18D AGCTCTGGCT TCTTCTGGCTTCTTCCAG/------------------ CTGATGCCAG 3070 het 3070 hom 35 16 18 7 TCTTCTGGCTTCTTCCAG 1 0 320318 CASAVA_Build 22 33571214 1D AATATACTCA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 T 8 7 320319 CASAVA_Build 22 33572419 1I TCTTATGATA -/T GGCAGCAATT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 0 1 320320 CASAVA_Build 22 33574747 5D TGATCTCATC AAAAT/----- AAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 AAAAT 2 1 320321 CASAVA_Build 22 33577637 6D TAGCTTTATG TATGTA/------ TATATATATA 3070 het 2161 hom 21 6 11 7 TATGTA 1 0 320322 CASAVA_Build 22 33580152 1I GCCGTAAGGG -/A AATACAATAC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 2 3 320323 CASAVA_Build 22 33580911 1D GAGAAAAAAA G/- GTCAGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 G 2 1 320324 CASAVA_Build 22 33580998 1I GAAATAATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 9 10 320325 CASAVA_Build 22 33591360 1I TCTACTTGCC -/T TTTCTTGAAC 3070 het 3070 hom 59 19 39 1 T 3 4 320326 CASAVA_Build 22 33619536 1D AGAAACCTGG A/- AAGCAGCCCA 3070 hom 138 het 52 0 45 7 A 3 2 320327 CASAVA_Build 22 33625143 17D AAGCCCATAG ATGACTGCAGAAACTAC/----------------- ATGAGCCCAT 1300 het 1300 ref 49 10 6 35 ATGACTGCAGAAACTAC 1 0 320328 CASAVA_Build 22 33625656 1D AAATGAGGAC A/- ACCCATGGTT 3070 hom 174 het 63 0 58 7 A 2 1 320329 CASAVA_Build 22 33631037 1I CTCTGACCTT -/C CCCTGCCCAC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 3 4 320330 CASAVA_Build 22 33633612 1I CTGAAAAGTC -/T TTTATCACAT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 T 3 4 320331 CASAVA_Build 22 33644250 1I GGAGATGCTA -/G GCCTTGACTC 3070 hom 147 het 52 0 47 5 G 1 2 320332 CASAVA_Build 22 33648069 1D GGGGTGGGGG C/- CAAGGAGAGG 1936 hom 15 het 6 0 6 0 C 2 1 320333 CASAVA_Build 22 33654427 1I AAAACACCCA -/G GGGACTACTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 3 4 320334 CASAVA_Build 22 33666196 4D GGCAAGGCAC CATT/---- CATTGACCCT 3070 hom 72 het 27 0 25 4 CATT 2 1 320335 CASAVA_Build 22 33673115 1D CCTTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 23 0 18 5 A 17 16 320336 CASAVA_Build 22 33673295 1I3M1I GAAGACCTCC -TGA-/TTGAG GTGGTGACAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 N/A 0 0 320337 CASAVA_Build 22 33673396 1I ACATGCTTAG -/A ATACTCAAGG 3070 hom 44 het 38 0 15 23 A 1 2 320338 CASAVA_Build 22 33681722 1D GCGCCTGTAG T/- TCCCAGCTAC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 2 1 320339 CASAVA_Build 22 33688367 1D TAAAAACATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 11 10 320340 CASAVA_Build 22 33698811 1D ACAGTCAGTG T/- TTAGCCAAGA 3070 hom 144 het 51 0 46 6 T 3 2 320341 CASAVA_Build 22 33698938 1I GGTTACTGCA -/G GCAAGCCCAG 3070 hom 113 het 42 0 37 5 G 1 2 320342 CASAVA_Build 22 33707086 1I ACCCTAGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 41 1 32 8 A 10 11 320343 CASAVA_Build 22 33718057 3D TATCATTATC ATT/--- ATTATAAATT 3070 het 3070 hom 28 10 17 2 ATT 2 1 320344 CASAVA_Build 22 33718969 1D CCCTGATAGA C/- CCCCACACCT 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 C 5 4 320345 CASAVA_Build 22 33722989 1I GCGGGCTGGG -/C CAGACACTGT 3070 hom 93 het 36 0 28 8 C 1 2 320346 CASAVA_Build 22 33723947 1D TTACTGTATG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 9 8 320347 CASAVA_Build 22 33725890 1D CCGACAAATC T/- TACTAACACG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 2 1 320348 CASAVA_Build 22 33728304 1D GTGGCTCATG C/- CCTGTAATCC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 C 3 2 320349 CASAVA_Build 22 33741562 2D CCCAAGGTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 22 2 12 9 A 18 16 320350 CASAVA_Build 22 33745294 1D CCAGGCAGGG T/- TTTCTGTGCA 3070 hom 82 het 34 0 25 10 T 4 3 320351 CASAVA_Build 22 33747300 1D GTTCTTTCCT G/- GGACTCATAA 3070 hom 110 het 39 0 32 7 G 3 2 320352 CASAVA_Build 22 33748235 11I CTACAAAATT -----------/TTTTTTAAATG TTTTTTAAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTTTTTAAATG 0 1 320353 CASAVA_Build 22 33750177 1D CCCGCCATCC G/- GACGCCAAGC 3070 hom 36 het 13 0 10 4 G 2 1 320354 CASAVA_Build 22 33761281 1D ACATAGCTAC G/- GAGCCAACCA 3070 hom 147 het 56 0 49 10 G 2 1 320355 CASAVA_Build 22 33765147 1I CTGAGGGGAA -/C CTTTTTCTGA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 1 2 320356 CASAVA_Build 22 33770897 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAGAA 2876 het 1241 hom 28 8 10 10 G 0 1 320357 CASAVA_Build 22 33773476 1I GGATAGTGAT -/A AGCTTGTTTG 3070 hom 87 het 36 0 27 9 A 1 2 320358 CASAVA_Build 22 33775354 24D AAATACCGGT GAGAATCCCTGTGGGAATACTTGA/------------------------ GAGAATCCCT 3070 het 3070 ref 35 22 17 8 GAGAATCCCTGTGGGAATACTTGA 1 0 320359 CASAVA_Build 22 33777318 1D CATCGTGCCT G/- GACAAATTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 2 1 320360 CASAVA_Build 22 33787931 1I TACTTATAAC -/A ATTGTCACTA 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 A 1 2 320361 CASAVA_Build 22 33800864 4I CACACACGTG ----/CACA CACACACACA 3070 het 3070 hom 52 18 24 10 CA 5 7 320362 CASAVA_Build 22 33802093 2D CTCTTAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 17 15 3 A 13 11 320363 CASAVA_Build 22 33804454 1I AATAAATATC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 7 8 320364 CASAVA_Build 22 33804638 3D AAAAATCCAC AAT/--- AGTGAGCGAA 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 AAT 1 0 320365 CASAVA_Build 22 33806732 1D AGTTCAGTTT C/- CCCACACTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 6 C 4 3 320366 CASAVA_Build 22 33815611 1I GTGCGTATAG -/T TTTGTGCGAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 3 4 320367 CASAVA_Build 22 33819001 1D ATGAATACAC A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 8 7 320368 CASAVA_Build 22 33827558 1D GTTGACCGTC A/- TAATAATGTG 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 A 1 0 320369 CASAVA_Build 22 33834949 1D AATGTAAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 12 11 320370 CASAVA_Build 22 33849360 3D AGGTCCATTA GCG/--- GCGGCAAATT 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 GCG 2 1 320371 CASAVA_Build 22 33878732 4I ACCCCTTTTC ----/CTCT CTATCTGCCT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 CT 1 3 320372 CASAVA_Build 22 33878923 4I ATGATATTTG ----/ATAT GACGTTTTAT 3070 hom 114 het 39 0 37 3 AT 0 2 320373 CASAVA_Build 22 33886985 3I AAATATGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TTG 3 4 320374 CASAVA_Build 22 33888371 8D CAATGTCCAG GATCTGTT/-------- GATCTGTTTC 3070 hom 67 het 28 0 25 4 GATCTGTT 2 1 320375 CASAVA_Build 22 33891021 1D TTGCTCCACT C/- CCACTTATGG 3070 hom 101 het 38 0 28 10 C 3 2 320376 CASAVA_Build 22 33895221 1I CCAGAGGTAC -/A AGGAGGAGCT 1441 het 833 hom 7 4 3 0 A 1 2 320377 CASAVA_Build 22 33896605 24I AATGAGTGAT ------------------------/GGGAAAGTTTCTTGGTGGGAAGTG GGGAAAGTTA 3070 hom 108 het 38 0 36 6 GGGAAAGTTTCTTGGTGGGAAGTG 0 1 320378 CASAVA_Build 22 33898846 3D CCCCATGCTG GCT/--- GCTAAGTTTC 3070 hom 65 het 27 0 20 9 GCT 2 1 320379 CASAVA_Build 22 33900431 1D ACTTCTTTTT C/- CCTTCCTTTT 3070 hom 104 het 40 0 31 11 C 3 2 320380 CASAVA_Build 22 33905696 1I AGACTACATA -/C ATTTATAAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 320381 CASAVA_Build 22 33908328 1D TAAAAAAAAA T/- GTTTAATGAT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 1 0 320382 CASAVA_Build 22 33917427 2I GGGCTGTCAG --/AT ATACCCTGAC 3070 hom 89 het 38 0 30 8 AT 1 2 320383 CASAVA_Build 22 33922535 1I23M1I18M1I TAAAGATGCA -CCCCTGGCCTGGAAGAGCATCCA-GCTGCAGCCCCTACCCAT-/GCCCCTGGCCTGGAAGAGCATCCAGGCTGCAGCCCCTACCCATG GGGGAAGAGC 3070 hom 54 het 18 0 19 4 N/A 0 0 320384 CASAVA_Build 22 33924603 2I CCACAGAGAT --/GG GGGGGGGGCA 3070 hom 72 het 31 0 21 10 G 8 10 320385 CASAVA_Build 22 33963964 1D TTCCATTTTT A/- TTTTGTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 A 1 0 320386 CASAVA_Build 22 33972415 3I CTGCAGGTGC ---/CCG CCACCATGCC 3070 hom 27 het 11 0 9 2 CCG 0 1 320387 CASAVA_Build 22 33974794 1D CATGAAGGAT C/- CCCCCCCATG 3070 hom 56 het 22 0 18 5 C 8 7 320388 CASAVA_Build 22 33976655 2D GTTCCAAATG AC/-- AGAGGAGCAA 3070 hom 120 het 42 0 39 5 AC 1 0 320389 CASAVA_Build 22 33977072 2D TTTCTTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 25 5 T 14 12 320390 CASAVA_Build 22 33985551 1D GATCTTATAT A/- AATGTTGCCT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 3 2 320391 CASAVA_Build 22 33993142 9I TGTGTGTGTA ---------/TATATATAT TATATAATAT 3070 hom 21 het 10 0 8 2 TATATATAT 0 1 320392 CASAVA_Build 22 33998359 4D TGACTGACAC AAAG/---- AAGGGAAATT 3070 hom 148 het 52 0 50 5 AAAG 1 0 320393 CASAVA_Build 22 34004651 1I TTTAATATTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 9 10 320394 CASAVA_Build 22 34006139 1I CAAAATCCCC -/T TTGCCATATA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 3 320395 CASAVA_Build 22 34021118 1D CTGAGTTAAC T/- GTGCTTTCTT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 0 320396 CASAVA_Build 22 34023591 12D TGGGACTACA GGCGCCCACCAC/------------ GGCGCCCACC 2987 hom 21 het 8 0 8 0 GGCGCCCACCAC 2 1 320397 CASAVA_Build 22 34025674 1D GCTTCCCGGG C/- CCCGACCCCA 3070 hom 55 het 25 0 19 6 C 4 3 320398 CASAVA_Build 22 34026899 1D TAAAAAAAAA C/- AGTTGTAATA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 1 0 320399 CASAVA_Build 22 34027805 1I TGCCCTCCCC -/T GGACACACAC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 0 1 320400 CASAVA_Build 22 34028456 1D AGCCTCCCAA G/- GTAGCCGGGA 2213 hom 15 het 8 0 5 3 G 2 1 320401 CASAVA_Build 22 34031899 5I TTGGTTAGCA -----/GAGTG GACTAGACCA 3070 hom 69 het 29 0 21 8 GAGTG 0 1 320402 CASAVA_Build 22 34032138 1D CTTCTTCAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 16 het 34 1 27 6 T 10 9 320403 CASAVA_Build 22 34032742 1I ATTCCTGGGA -/C CCCAGTCTAA 3070 hom 125 het 46 0 40 6 C 3 4 320404 CASAVA_Build 22 34040211 2I TCTGGGCAGA --/TG TGTCCCACAG 3070 hom 126 het 45 0 41 4 TG 1 2 320405 CASAVA_Build 22 34097247 2I CCTGGGAGAC --/AG AGGTTGCAGT 3070 het 1508 hom 23 4 14 5 AG 1 2 320406 CASAVA_Build 22 34115669 1I ACTTCTGACC -/T CGTGATGTGC 3070 het 2437 hom 24 7 13 4 T 0 1 320407 CASAVA_Build 22 34117277 18D ACTACTACTA TTTTTTTGGTTTTTTTTT/------------------ TTTCGTTTGA 2107 het 2107 ref 22 14 5 4 TTTTTTTGGTTTTTTTTT 1 0 320408 CASAVA_Build 22 34129935 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 10 11 320409 CASAVA_Build 22 34130524 2D AAGGCCTGAC TG/-- TGTTTCGATT 3070 het 3070 ref 50 22 19 10 TG 2 1 320410 CASAVA_Build 22 34134963 1D CCAGGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 11 10 320411 CASAVA_Build 22 34155286 3I GCCAAATCTT ---/TTC TTTGAAATGC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TTC 0 1 320412 CASAVA_Build 22 34162887 17D TTGCCAGGGG GAGAGTCAGTTCGCAGA/----------------- TGAGGATGGA 2373 het 2373 ref 43 25 8 15 GAGAGTCAGTTCGCAGA 1 0 320413 CASAVA_Build 22 34163224 1I GGTCATGTGA -/C CTGGACTGGC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 C 1 2 320414 CASAVA_Build 22 34168044 16D GAATCTAAAT CTGATCGAGCTACTCC/---------------- CTGCTCAGGA 3070 het 3003 hom 23 8 10 6 CTGATCGAGCTACTCC 1 0 320415 CASAVA_Build 22 34172829 1D CTTTTCTGAA T/- GGGGGGGTTT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 T 1 0 320416 CASAVA_Build 22 34173461 8D TGTATTTATG TATTTATT/-------- TATTTATTTA 3070 hom 66 het 30 0 23 8 TATT 5 3 320417 CASAVA_Build 22 34176324 1I AGGAAAACTG -/C CCCCCGGGAC 3070 hom 90 het 35 0 29 6 C 5 6 320418 CASAVA_Build 22 34176805 1I CAGAGAAAAA -/C CCCGGGTCCA 3070 het 2924 hom 32 12 16 4 C 3 4 320419 CASAVA_Build 22 34177276 2I GAAGAATGAC --/AG GGGAGAACCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AG 0 1 320420 CASAVA_Build 22 34179358 4I53M2I CGTCAGAGAC ----AGGGACAGAAATGGAGACAAAAGACAGAGAAGGAGACACTGACAGAGTGATTC--/AGAGAGGGACAGAAATGGAGACAAAAGACAGAGAAGGAGTCACTGACAGAGTGATTCAG AGAGAGACAC 1967 het 1967 ref 32 36 8 18 N/A 0 0 320421 CASAVA_Build 22 34179427 6I40M2I44M6I ACACAGAGAC ------AGAGACAGGGACAGAGAGATAGAAACAGAGACAGAGAAAG--AGACAGAGGGACAGATACAGAGAGACAGAGATGGGGTAGAGCAT------/AGAGATAGAGACAGGGACAGAGAGATAGAAACAGAGACAGAGAAAGACAGAGACAGGGACAGATACAGAGAGACAGAGATGGGGTAGAGCATCAGAGA CAGAGACAGA 3070 het 3070 ref 45 42 11 23 N/A 0 0 320422 CASAVA_Build 22 34179560 2D AGAGAATGAC AG/-- AGTGAATCAG 3070 het 3070 hom 44 9 23 13 AG 2 1 320423 CASAVA_Build 22 34180489 1D GGTCTTCATC G/- GCAAGAGGTT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 G 2 1 320424 CASAVA_Build 22 34186615 3I TGTCTCGAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 54 het 25 0 18 7 AAC 4 5 320425 CASAVA_Build 22 34187421 1D TCTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 29 1 19 9 T 12 11 320426 CASAVA_Build 22 34190945 1I TTTTACTACC -/T GTGTGACTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 320427 CASAVA_Build 22 34197872 2I TAGTAGGCAA --/AG AGAGAGAGTT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 AG 4 5 320428 CASAVA_Build 22 34201902 1D AAAATTACCC T/- TTTTTTTTTT 2286 het 2286 ref 20 8 7 5 T 13 12 320429 CASAVA_Build 22 34205636 1I CAGCCAACTC -/T TTTTTTTTTT 2377 het 264 hom 20 3 9 8 T 15 16 320430 CASAVA_Build 22 34231210 1I CATGTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2183 hom 28 8 11 9 A 14 15 320431 CASAVA_Build 22 34257039 1D CTTCCAGGCA C/- CCCCCACTTT 3070 het 2536 hom 31 13 14 4 C 6 5 320432 CASAVA_Build 22 34262818 3I TCTGCATTTC ---/CAA CAAGTCCCAG 3070 hom 101 het 36 0 31 5 CAA 1 2 320433 CASAVA_Build 22 34263077 1I TGACGTGTGC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 7 8 320434 CASAVA_Build 22 34295637 18D AACTTAGTGG CTTAAAACAACAATAAAC/------------------ CTTAATTCTT 3070 het 3070 ref 48 28 20 3 CTTAAAACAACAATAAAC 1 0 320435 CASAVA_Build 22 34295907 1I TTAGCCAAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 T 9 10 320436 CASAVA_Build 22 34298345 1I ATTTTTTTTT -/C CCATTTTTTA 3070 het 3070 hom 52 26 23 3 C 2 3 320437 CASAVA_Build 22 34319745 1D GGGGAGGGGG A/- GAGAGAGAGA 3070 het 19 hom 29 1 17 11 A 1 0 320438 CASAVA_Build 22 34326723 1D ATTTCTGTGT A/- AAATAACAGC 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 4 3 320439 CASAVA_Build 22 34327425 2D TGTATGTACA TG/-- TGTGTGTGCA 3070 hom 199 het 76 0 67 11 TG 5 4 320440 CASAVA_Build 22 34336870 1I CCAGGCTCTG -/C CTCCTACCTC 3070 hom 84 het 32 0 27 5 C 1 2 320441 CASAVA_Build 22 34340728 6D TCATCTCTAC CATTAT/------ CATTATCATT 3070 hom 56 het 33 0 17 20 CATTAT 4 3 320442 CASAVA_Build 22 34359686 2D46M2D GCGTGTGTCA GTGTGTGTGCGTGTGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTAAGTGCGTGTGTGCGT/--GTGTGTGCGTGTGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTAAGTGCGTGTGTGC-- GTGTGTTAGT 3070 het 3070 hom 57 17 35 35 N/A 0 0 320443 CASAVA_Build 22 34359812 2I GAGTGTGTGC --/AT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 62 26 24 12 AT 0 1 320444 CASAVA_Build 22 34365868 2D TAATAATAAT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 6 A 11 9 320445 CASAVA_Build 22 34366217 1I TTATTCCCTC -/T TTTTTTTTTT 2301 het 219 hom 20 1 15 4 T 10 11 320446 CASAVA_Build 22 34416292 1D GCTACCTCTT A/- ACCATGTTCA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 2 1 320447 CASAVA_Build 22 34417187 1I CAGAGTGAGA -/C CCCCATCTCT 3070 hom 93 het 38 0 32 8 C 4 5 320448 CASAVA_Build 22 34417492 1D CCTCTCCCCC T/- GAATATAAGA 1452 het 1452 ref 29 20 4 5 T 1 0 320449 CASAVA_Build 22 34417678 1I GGGGTGTACA -/C CCCCTGCGAT 3070 hom 106 het 38 0 35 3 C 4 5 320450 CASAVA_Build 22 34418155 5I GGGAGTAATA -----/TCCTC TCCTCTCCAG 3070 hom 21 het 8 0 8 1 TCCTC 1 2 320451 CASAVA_Build 22 34420254 12I CCACCCGGAG ------------/ATATTGCTCCTA ATATTCAGGG 2334 het 2334 ref 34 16 6 12 ATATTGCTCCTA 0 1 320452 CASAVA_Build 22 34421193 1D CAGGGCGGGA G/- GGGGGGTGGC 2748 het 1184 hom 17 6 7 4 G 7 6 320453 CASAVA_Build 22 34422339 3I GAAAATAATC ---/ATT AATGATTAAT 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 ATT 0 1 320454 CASAVA_Build 22 34422793 3I AAAGGGAGAG ---/GAT GATATTACTC 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 GAT 1 2 320455 CASAVA_Build 22 34423347 1D GGCTCTTACT C/- CCCGCATCGC 2529 het 2529 ref 26 10 7 10 C 4 3 320456 CASAVA_Build 22 34423850 1I AGTATGCTCT -/C CCCTTTGGGA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 3 4 320457 CASAVA_Build 22 34424842 2I AATTAATATT --/AA GTTTAATAAC 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 A 0 2 320458 CASAVA_Build 22 34425803 1I AAAGTGTACA -/C CCCCCAGTGA 3070 het 2485 hom 15 6 9 0 C 5 6 320459 CASAVA_Build 22 34426150 1D CCAGGGAGGG A/- AGAGCATGAG 3070 het 3070 ref 31 14 10 8 A 2 1 320460 CASAVA_Build 22 34432850 5I AAAGAAAAAG -----/AAATT AAATACAAAT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 AAATT 0 1 320461 CASAVA_Build 22 34434026 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAGTA 1583 het 1583 ref 10 5 4 1 A 8 7 320462 CASAVA_Build 22 34442744 1I TATAGTACTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 8 9 320463 CASAVA_Build 22 34442901 3I TTTTCATGTA ---/AAC AACAGTCCCC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AAC 1 2 320464 CASAVA_Build 22 34442987 8D5M1I CACGTTTGTC TGTTGTGTTGTGT-/--------TGTGTA TGTGCCGTTG 3070 het 3070 ref 33 20 14 1 N/A 0 0 320465 CASAVA_Build 22 34445735 4D TAGGGTTGAG TGTT/---- TGCAGCTCCC 3070 het 3070 hom 36 14 14 10 TGTT 1 0 320466 CASAVA_Build 22 34446440 4I TTGTTGTATT ----/CTAA CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 CTAA 0 1 320467 CASAVA_Build 22 34459754 5D GTCCTGTCTT ATCTC/----- ATCCTTGCAA 3070 het 3070 ref 51 26 22 7 ATCTC 1 0 320468 CASAVA_Build 22 34482853 1I AAATGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 10 11 320469 CASAVA_Build 22 34492478 1D AATTAGAACT A/- AAAAAAAAAC 1344 het 1344 ref 45 40 3 2 A 10 9 320470 CASAVA_Build 22 34532297 1D AGGAGATCTT A/- AAAAAAAAAA 1774 het 1774 ref 35 28 4 3 A 11 10 320471 CASAVA_Build 22 34539043 1I GGGGTTATGT -/A ACCTCCCTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 320472 CASAVA_Build 22 34569441 11I CAACTCTTTG -----------/ATTGTTTCCTC AGTGTTTCAT 3070 hom 111 het 43 0 38 6 ATTGTTTCCTC 0 1 320473 CASAVA_Build 22 34578936 1I CAGAGAAAGA -/T TTAAATTCTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 2 3 320474 CASAVA_Build 22 34582045 1D ACTTAGAATG T/- TCTGTTGAAC 3070 hom 101 het 40 0 32 9 T 2 1 320475 CASAVA_Build 22 34622978 1D CTAGTTACAT G/- GGCTCATGCC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 3 2 320476 CASAVA_Build 22 34639121 1D TTGGAAGTAA C/- CAAAATATTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 2 1 320477 CASAVA_Build 22 34649940 1I AGTAAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 13 14 320478 CASAVA_Build 22 34684954 2D TAGAGAAAAC TA/-- TATATATATA 1053 het 1053 ref 24 15 3 6 TA 8 7 320479 CASAVA_Build 22 34694496 1I TCTGTCAGTA -/G AGCTTAAGAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 0 1 320480 CASAVA_Build 22 34720176 1D TAAAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2808 hom 30 9 13 8 A 11 10 320481 CASAVA_Build 22 34760191 1I CTTAGCAATT -/A AAAAAAAAAA 1384 het 1384 ref 44 27 6 11 A 15 16 320482 CASAVA_Build 22 34773723 1D ACATCCGTAC T/- TTTTTTTTTT 798 het 798 ref 36 19 4 13 T 15 14 320483 CASAVA_Build 22 34784414 1D TTTTGTTGAC T/- TTTTTTTTTT 2617 het 2617 ref 31 16 6 9 T 13 12 320484 CASAVA_Build 22 34807252 8D GGCAATACTG ACTTACGC/-------- ACTTCACATA 3070 het 3070 ref 37 18 16 5 ACTTACGC 1 0 320485 CASAVA_Build 22 34808087 4I TTTTTTTTTT ----/GAGA GAGAGAGTCT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 GA 3 5 320486 CASAVA_Build 22 34809330 1I CAAGATATCA -/G GGGGAAGGTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 G 4 5 320487 CASAVA_Build 22 34818141 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2082 het 1081 hom 19 6 8 5 T 13 14 320488 CASAVA_Build 22 34822126 1I GCTAGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 9 10 320489 CASAVA_Build 22 34831956 2I AAGAAATCAA --/TC TCTCTCATTT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 TC 3 4 320490 CASAVA_Build 22 34833281 1D TGTGTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2461 hom 36 12 16 8 T 13 12 320491 CASAVA_Build 22 34835899 1D GCTGATTTTT G/- TATTTTTAGT 3070 het 2681 hom 22 8 10 4 G 1 0 320492 CASAVA_Build 22 34847722 1I TAAAATGTTT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 G 1 2 320493 CASAVA_Build 22 34856781 1I TCTATCGTGG -/C CCCTGAATGG 3070 hom 96 het 38 0 31 7 C 3 4 320494 CASAVA_Build 22 34858600 1I TCTAGCCCCC -/T GGGACCCATC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 0 1 320495 CASAVA_Build 22 34869131 1I CCCCTGTAAC -/A ACAATCCTGA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 1 2 320496 CASAVA_Build 22 34885875 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1339 het 1339 ref 37 23 3 11 T 12 11 320497 CASAVA_Build 22 34887853 1D AGAAAAAGGT G/- GGGGGGTGAT 3070 hom 78 het 31 0 25 6 G 7 6 320498 CASAVA_Build 22 34894669 39D CCACATCCCA CATCAGGAACCCTGCATAGTTAAAGAATGAGGCCAATTT/--------------------------------------- TTTGATGGGG 3064 het 3064 ref 22 22 9 2 CATCAGGAACCCTGCATAGTTAAAGAATGAGGCCAATTT 1 0 320499 CASAVA_Build 22 34895045 1D TCTGAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 1142 het 1142 ref 43 36 3 5 A 10 9 320500 CASAVA_Build 22 34903766 1D TTGCCCTAAT A/- ACTAGCATAG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 2 1 320501 CASAVA_Build 22 34904072 2D CAGCAGTGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 35 1 14 21 A 14 12 320502 CASAVA_Build 22 34907901 1D TCCTTGCTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 A 10 9 320503 CASAVA_Build 22 34910835 1I GGTAGGGAGT -/G GGGAGAATCT 3070 het 3070 ref 52 28 14 10 G 3 4 320504 CASAVA_Build 22 34916207 6D TGTATGAATA GGGTGT/------ GGGTGTGGGT 1651 het 1651 ref 19 11 5 5 GGGTGT 2 1 320505 CASAVA_Build 22 34917792 2I TTTGAGGAAA --/CT CTTTCAAAAA 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 CT 1 2 320506 CASAVA_Build 22 34932854 4D CACCTTCCGT TTGC/---- TTGCAGGGGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTGC 2 1 320507 CASAVA_Build 22 34937081 1I GTGAATTTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 160 hom 24 1 13 10 A 9 10 320508 CASAVA_Build 22 34937688 2I TGTAGGAGCT --/GG GGACTGGGCT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 G 2 4 320509 CASAVA_Build 22 34940540 3D GATCAGGAAA AGT/--- AGTTTGAACA 3070 het 3070 ref 49 29 15 7 AGT 2 1 320510 CASAVA_Build 22 34942597 6D GGATGTGGTG GCCTGT/------ GCCTGTAATC 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 GCCTGT 2 1 320511 CASAVA_Build 22 34944033 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 16 0 8 8 T 13 12 320512 CASAVA_Build 22 34946507 3D GTGAACTAAG AGA/--- AGAAGACACA 3070 het 3070 ref 52 27 18 11 AGA 3 2 320513 CASAVA_Build 22 34946767 2D CGCAGTCGGC TT/-- CTCTGGTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 13 10 T 2 0 320514 CASAVA_Build 22 34947322 1D TCTTTAACAG A/- AAAATCTTAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 5 4 320515 CASAVA_Build 22 34947829 1I TGACTGATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 9 10 320516 CASAVA_Build 22 34952775 1D CCTGCAAGCT C/- CCCCTCTATT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 C 5 4 320517 CASAVA_Build 22 34957468 3D TCTAGTTGGA AAG/--- AAGAAAGGAT 3070 het 3070 ref 51 30 17 4 AAG 2 1 320518 CASAVA_Build 22 34962811 1D AAGACTAAAA G/- GGGGACCCAG 3070 het 2909 hom 25 11 9 5 G 5 4 320519 CASAVA_Build 22 34963601 1I AGACAGCATC -/A TCCTGTGTTG 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 A 0 1 320520 CASAVA_Build 22 34966928 2D CCACCAGTGT AA/-- AAGTTTTCCC 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 A 4 2 320521 CASAVA_Build 22 34967251 1D GATGGGATTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 T 10 9 320522 CASAVA_Build 22 34981303 2D GAGGCACCAG CT/-- CTCTCTACCC 2377 het 2377 ref 29 21 6 3 CT 4 3 320523 CASAVA_Build 22 35001201 4I AGGCACTGAA ----/AAGG AAGGAAGATT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 AAGG 1 2 320524 CASAVA_Build 22 35001437 1D AAATAGTAAT A/- AAAAAATTAT 2426 het 648 hom 9 2 6 2 A 7 6 320525 CASAVA_Build 22 35002897 4D AACAACTGTC TGTT/---- TAACCTTGAG 3070 het 3070 ref 33 19 12 6 TGTT 1 0 320526 CASAVA_Build 22 35007500 1D TGTTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2594 hom 29 8 15 6 A 12 11 320527 CASAVA_Build 22 35034708 1I GCCAAGGCAA -/G GGGGGGGCGC 3070 het 208 hom 24 1 17 6 G 7 8 320528 CASAVA_Build 22 35035088 1I GTGTGCGCAA -/G GGCAGTGGCC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 G 2 3 320529 CASAVA_Build 22 35037996 8D ACTCCACCTC TCCTGTGA/-------- AGATCTGGCC 3070 het 3070 ref 46 25 13 9 TCCTGTGA 1 0 320530 CASAVA_Build 22 35038347 1I CAGGAGAAGC -/A AAAGCACTGT 2398 het 2398 ref 19 10 6 3 A 3 4 320531 CASAVA_Build 22 35039659 1D CTGGTTTTAT G/- GGGGGGATGA 3070 het 3070 hom 47 20 25 3 G 7 6 320532 CASAVA_Build 22 35040632 1D TAATACATTG T/- TTTTTTTTTT 787 het 787 ref 23 15 3 5 T 12 11 320533 CASAVA_Build 22 35041739 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 432 hom 21 1 18 2 A 10 9 320534 CASAVA_Build 22 35042347 1D TTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2331 het 2298 hom 25 8 8 9 A 13 12 320535 CASAVA_Build 22 35045818 1D AGAGGGCTCA C/- CCCCTCCTGG 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 C 5 4 320536 CASAVA_Build 22 35046149 1I CTGATGCCCC -/T GAGGCCGTGG 2933 het 1526 hom 28 7 11 10 T 0 1 320537 CASAVA_Build 22 35052785 1D GGCAGAAAAC G/- GGACTGCCAC 2778 het 2778 ref 40 22 9 9 G 3 2 320538 CASAVA_Build 22 35055274 1I CAAAAAACAC -/A GAGTCCTTCA 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 A 0 1 320539 CASAVA_Build 22 35079765 1D TTTCTCTTTC T/- TTTCGTGGTC 2528 het 2528 ref 23 15 7 1 T 4 3 320540 CASAVA_Build 22 35103054 1I ACCCTACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2234 hom 33 12 15 6 A 13 14 320541 CASAVA_Build 22 35104103 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 533 het 533 ref 14 7 2 5 A 15 14 320542 CASAVA_Build 22 35115524 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1840 het 1797 hom 14 7 6 2 A 14 13 320543 CASAVA_Build 22 35134332 1I CTGTTTTTTT -/C TTTTTTGTTG 3070 het 2611 hom 28 9 15 4 C 0 1 320544 CASAVA_Build 22 35152462 1I CTCCTGTCCA -/C CCAGGCAGCC 3070 het 2017 hom 22 8 10 4 C 2 3 320545 CASAVA_Build 22 35160672 2I CCACAGAAAC --/AG ATAGAGATAC 2943 het 2943 ref 29 12 10 7 AG 0 1 320546 CASAVA_Build 22 35164501 1D GGAATCTCAC T/- ATATTGCCCG 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 1 0 320547 CASAVA_Build 22 35166697 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 8 A 12 11 320548 CASAVA_Build 22 35195403 2D GGTCCAGAAA CT/-- CAGGGACTTC 3070 het 3070 hom 51 21 21 12 CT 1 0 320549 CASAVA_Build 22 35201229 1I AAAATTAGCC -/G GGCGTGGTGG 3070 het 1320 hom 21 3 13 5 G 2 3 320550 CASAVA_Build 22 35225689 8D CAAATAGACT CACCTAAC/-------- CACCTAACTG 3070 het 3070 ref 32 20 12 3 CACCTAAC 2 1 320551 CASAVA_Build 22 35228989 1I CAGCCATCTC -/T TTTTTTTTTT 2814 het 2814 ref 26 15 7 4 T 11 12 320552 CASAVA_Build 22 35265596 3D AGTGGTTTAA AAC/--- AACAACAGTC 3070 het 3070 hom 54 19 30 8 AAC 3 2 320553 CASAVA_Build 22 35271854 1I CTTCTTGTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 T 9 10 320554 CASAVA_Build 22 35273573 1D TAACAGATGC A/- GTAGGAAAGA 3070 hom 138 het 50 0 46 6 A 1 0 320555 CASAVA_Build 22 35274022 1D GTTGCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 550 hom 32 2 13 17 T 15 14 320556 CASAVA_Build 22 35275292 11I CTTTTTGATG -----------/CACAAACGGCT CATTGAGGAT 3070 hom 78 het 27 0 25 2 CACAAACGGCT 0 1 320557 CASAVA_Build 22 35280942 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTCTTTTC 1770 hom 36 het 17 0 12 5 T 5 4 320558 CASAVA_Build 22 35282037 1D CACCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 40 1 27 12 T 12 11 320559 CASAVA_Build 22 35297881 1I AAAACAAAAA -/C AAAAAAAAAA 2923 het 1412 hom 17 6 8 3 C 0 1 320560 CASAVA_Build 22 35309172 2I TCACACCTAT --/AA TCGCAGCACT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 0 2 320561 CASAVA_Build 22 35312724 1I CCTGAGAACC -/T TCGGCTTTGC 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 T 1 2 320562 CASAVA_Build 22 35312937 1I GCGGGGGAAG -/A AAAAAATCTC 3070 het 56 hom 28 1 22 5 A 6 7 320563 CASAVA_Build 22 35314996 2D TTTTTTTTTT CC/-- CCCTGAAATG 918 het 655 hom 22 6 4 12 C 5 3 320564 CASAVA_Build 22 35320825 2D GTGTACATCG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 81 31 31 21 GT 6 5 320565 CASAVA_Build 22 35325259 1D CACTGGACAG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 52 27 20 5 A 7 6 320566 CASAVA_Build 22 35326444 1D CCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 664 hom 21 5 10 6 A 11 10 320567 CASAVA_Build 22 35342044 1D CCAAAGACCC T/- CAACTCAGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 0 320568 CASAVA_Build 22 35344389 1I GACTGGCTTT -/C CCCTTCCTGG 3070 hom 108 het 41 0 35 6 C 3 4 320569 CASAVA_Build 22 35344904 2I24M11D CAGAGCGAGA --CTGTTTCAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAGC/CTCTGTTTCAAAAAACAAAAAACAAA----------- AAACAAACAA 3070 hom 57 het 17 0 18 4 N/A 0 0 320570 CASAVA_Build 22 35357734 3I GCAACTCTTT ---/TTA TTTTTTTTTT 2600 het 1010 hom 29 10 12 7 TTA 0 1 320571 CASAVA_Build 22 35390167 1I ATAGGGGAGA -/G GAACATAACT 3070 hom 132 het 47 0 43 4 G 1 2 320572 CASAVA_Build 22 35392746 1D AGGCTCTTCA C/- TGCCTTCAGA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 C 1 0 320573 CASAVA_Build 22 35396269 1I GGCCAGTTCA -/T TTTTTGAAAC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 5 6 320574 CASAVA_Build 22 35396624 8I TTTTTGTTTT --------/TTTGTTTG TTTGTTTTGT 573 het 573 ref 32 14 5 14 TTTG 1 3 320575 CASAVA_Build 22 35405006 1I GTTACTGCAG -/C CCCTGGCATG 3070 hom 117 het 45 0 36 9 C 3 4 320576 CASAVA_Build 22 35407540 1D TCCATTTTTT G/- GGGGGCAGCC 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 G 6 5 320577 CASAVA_Build 22 35416363 1I TTCCCCCCAA -/G GGAACCAAAA 3070 het 1125 hom 27 5 22 0 G 2 3 320578 CASAVA_Build 22 35417300 1D GCAGAAGGCA G/- GGGGAGAGGG 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 G 5 4 320579 CASAVA_Build 22 35431320 1I ATAGGCTAAG -/C CTTTTGGGGG 3070 hom 144 het 52 0 47 5 C 1 2 320580 CASAVA_Build 22 35435899 1I CCCTGGGGGA -/G GTGGCACTGG 3070 hom 92 het 34 0 28 6 G 1 2 320581 CASAVA_Build 22 35437930 1I AATACAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 G 0 1 320582 CASAVA_Build 22 35438544 1D TTAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 13 12 320583 CASAVA_Build 22 35440902 1I TGTGGTACAC -/A GAGAATGCTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 320584 CASAVA_Build 22 35444895 1I TTTTAGGTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 18 19 9 A 9 10 320585 CASAVA_Build 22 35450332 1I GACAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 A 12 13 320586 CASAVA_Build 22 35452714 1D TAAGGGAAAC A/- AATACTGGTG 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 A 3 2 320587 CASAVA_Build 22 35454205 2I GTGTGCATGC --/AT GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 77 36 28 13 AT 0 1 320588 CASAVA_Build 22 35455886 1I ATTAAAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1617 hom 17 5 10 2 T 9 10 320589 CASAVA_Build 22 35461051 2D CTTTCCTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1869 het 536 hom 27 5 7 15 T 20 18 320590 CASAVA_Build 22 35470591 1I GGACTGGTGT -/C CCTAGGGAGG 3070 hom 87 het 37 0 28 9 C 2 3 320591 CASAVA_Build 22 35472482 16I GGAGGGAGGA ----------------/CTCCAGTGAAGCCCGC CTCCCTCCTC 3070 het 3070 ref 41 16 13 12 CTCCAGTGAAGCCCGC 0 1 320592 CASAVA_Build 22 35473295 1I CGGCTGGAAA -/C CTCTTTTCCC 3070 hom 48 het 21 0 14 7 C 1 2 320593 CASAVA_Build 22 35474035 1I GCAGACTCCA -/C CCCCTGGGAT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 C 4 5 320594 CASAVA_Build 22 35474614 1D CACAGGGGTT C/- AAGCCCCTGC 3070 hom 41 het 15 0 14 1 C 1 0 320595 CASAVA_Build 22 35476293 1I CCAGGGGGCA -/C CCAGAGCTCT 3070 hom 27 het 11 0 9 2 C 2 3 320596 CASAVA_Build 22 35483521 2D ATCCTGATGT AA/-- AAGGTGGTGA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 4 2 320597 CASAVA_Build 22 35492919 1I GTACTTATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1612 hom 46 5 28 13 T 13 14 320598 CASAVA_Build 22 35500644 1D TTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 89 hom 14 1 13 0 A 9 8 320599 CASAVA_Build 22 35501251 1I AGGTCGGGGG -/A AAAAATCCCA 3070 hom 131 het 49 0 43 6 A 5 6 320600 CASAVA_Build 22 35511592 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1772 het 1772 ref 31 23 4 4 A 12 11 320601 CASAVA_Build 22 35548919 1I TGAGTAGCTA -/G GCAGATGCCG 3070 hom 81 het 37 0 27 10 G 1 2 320602 CASAVA_Build 22 35553304 1I AATGAACTGA -/G GCAGCAGAAC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 G 1 2 320603 CASAVA_Build 22 35553471 1I TACAGGATTA -/G GGGGCCCTTA 3070 hom 83 het 33 0 26 7 G 4 5 320604 CASAVA_Build 22 35554926 1D CATAGACCAC T/- GTGACAATGG 3070 het 3070 ref 53 25 21 8 T 1 0 320605 CASAVA_Build 22 35559552 1I GCCCCTCTGA -/G GGCTGGAGGG 3070 hom 110 het 42 0 30 12 G 2 3 320606 CASAVA_Build 22 35562916 1I TTCTTGGGTG -/C GGGGGAGATG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 C 0 1 320607 CASAVA_Build 22 35564718 1I GCACTTTTGG -/C CCAGCCTCGG 3070 hom 70 het 29 0 20 9 C 2 3 320608 CASAVA_Build 22 35573484 1I CAGGTGACCT -/C CCACCAGGGG 3070 hom 156 het 57 0 48 9 C 2 3 320609 CASAVA_Build 22 35577922 13I AGCTCTTTTT -------------/AACCCTCTCTGTG AACTGTCGCA 3070 hom 113 het 42 0 34 9 AACCCTCTCTGTG 0 1 320610 CASAVA_Build 22 35585182 4I ATAACCCTGC ----/TCTT TCTGTGTTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TCTT 0 1 320611 CASAVA_Build 22 35599851 2D TGAAATCGCA AC/-- CACTTGTGTA 3070 hom 129 het 50 0 44 8 AC 1 0 320612 CASAVA_Build 22 35615537 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 12 6 A 13 12 320613 CASAVA_Build 22 35634953 1D TGACATTTTA T/- TTATTTATTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 3 2 320614 CASAVA_Build 22 35645556 1D TGGCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 2922 het 40 hom 23 1 14 8 T 15 14 320615 CASAVA_Build 22 35647100 2I TGTCTGTGTA --/TG TGTGTGCCTC 3070 hom 187 het 69 0 63 6 TG 3 4 320616 CASAVA_Build 22 35647263 10D TGCATGTTTG TGTGTGTATA/---------- TGTGTGTATA 3070 hom 185 het 64 0 62 9 TGTGTGTATA 2 1 320617 CASAVA_Build 22 35652928 1D GGCTGTCATT G/- GGAGTCTCAG 3070 hom 95 het 36 0 28 10 G 3 2 320618 CASAVA_Build 22 35661950 1D GGCTCACAGA G/- GGGGTTCCTG 3070 hom 72 het 30 0 24 7 G 5 4 320619 CASAVA_Build 22 35676798 1I ACTGAAGAAG -/C CTCCGGGTCT 3070 hom 108 het 43 0 35 8 C 1 2 320620 CASAVA_Build 22 35683209 1D TTTATTTTAG T/- TTTTTTTTAT 1798 het 1798 ref 18 8 4 6 T 9 8 320621 CASAVA_Build 22 35696934 8I GGCAAATGCC --------/AGGGGCAA ACTCCAAGAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AGGGGCAA 0 1 320622 CASAVA_Build 22 35698348 1I AAATTTCCAC -/A TTCTAATTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 320623 CASAVA_Build 22 35698917 3D CCGGTTCTAC AAG/--- AAGAATCTAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 AAG 2 1 320624 CASAVA_Build 22 35700498 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 45 het 18 0 16 3 T 8 7 320625 CASAVA_Build 22 35703760 1I GATGAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 30 1 19 10 A 10 11 320626 CASAVA_Build 22 35725290 1I GCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2467 hom 27 het 13 0 10 3 A 13 14 320627 CASAVA_Build 22 35740086 1I CGCGGTGGCT -/C ACGCCTGTAA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 0 1 320628 CASAVA_Build 22 35740600 1D CAGCATTGCT G/- GGGGAGCCCA 3070 hom 96 het 39 0 31 8 G 5 4 320629 CASAVA_Build 22 35760338 1I CAAAGGGCAG -/C CTCCGGAGCA 3070 hom 71 het 28 0 22 6 C 1 2 320630 CASAVA_Build 22 35762783 1D GGCATGGTGG T/- TGCACACCTG 3070 hom 75 het 29 0 25 5 T 2 1 320631 CASAVA_Build 22 35764358 1I TGAAACCCCC -/T CTCTACTAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 0 1 320632 CASAVA_Build 22 35767760 1D TAATTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 24 0 17 8 A 15 14 320633 CASAVA_Build 22 35804166 1D GGGGTGTCCC T/- TCCCACAGTC 3070 hom 99 het 42 0 32 10 T 2 1 320634 CASAVA_Build 22 35804684 5D6M10D GAAGAGGAAG AGGAAGAGGAAGGAGGAGGCG/-----GAGGAA---------- GAGGAGAAGA 1456 hom 12 het 5 0 5 1 N/A 0 0 320635 CASAVA_Build 22 35805402 4D GGATAGATGC ATGG/---- ATGGATGGAT 3070 hom 89 het 41 0 28 14 ATGG 6 5 320636 CASAVA_Build 22 35823084 2I ATCTCCAACT --/AC ACAGCGCTGC 3070 hom 83 het 33 0 26 7 AC 1 2 320637 CASAVA_Build 22 35828025 1D CTGGTTCCAG A/- CACTCCCAAC 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 A 1 0 320638 CASAVA_Build 22 35830949 3I TCTGCTTGAG ---/AAA AAAAAAAAAA 1509 het 1509 ref 20 10 7 3 A 11 14 320639 CASAVA_Build 22 35848688 3I CTGGGTTCAA ---/CTC CTTGCTCCAC 3070 hom 135 het 50 0 42 8 CTC 0 1 320640 CASAVA_Build 22 35881757 1I TCCTCCACGA -/G GCTCCACGCC 3070 hom 121 het 46 0 41 5 G 1 2 320641 CASAVA_Build 22 35886716 1D ATGCCTGTAA T/- TCCCAGCTAT 3070 hom 41 het 21 0 12 9 T 2 1 320642 CASAVA_Build 22 35896415 1I GGCCAGCAGC -/G GGGGGCAGAC 2738 het 2738 ref 34 12 14 8 G 5 6 320643 CASAVA_Build 22 35898047 4I CTCCTGGGAC ----/AGAT AGATGCTCGG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 AGAT 1 2 320644 CASAVA_Build 22 35913560 2D TAAAAGACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1134 hom 29 8 11 13 A 16 14 320645 CASAVA_Build 22 35913679 1I TTGGCCCCAG -/C CGGATGGGAG 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 C 1 2 320646 CASAVA_Build 22 35916685 4D AAAAAAAAAG AAGA/---- AAGAAGGAAA 2156 het 2156 ref 24 11 9 4 AAGA 2 1 320647 CASAVA_Build 22 35920123 1D GCAAGGACGT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 9 8 320648 CASAVA_Build 22 35932530 1I TTTCCCCAGG -/C CCCTACAGGT 3070 hom 79 het 33 0 22 11 C 3 4 320649 CASAVA_Build 22 35934900 1D GCCAAGGGGG T/- AATGTCAGGC 3070 hom 83 het 33 0 25 8 T 1 0 320650 CASAVA_Build 22 35941999 1I AATAAAACAA -/T TATAACAATA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 1 2 320651 CASAVA_Build 22 35943311 2D CTAATTTTTT TA/-- TTATTATTAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TA 1 0 320652 CASAVA_Build 22 35943658 1I CTCTCTCCTG -/T TTTTTTATTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 6 7 320653 CASAVA_Build 22 35944650 3I CATCGAATTG ---/ACA ACATCTCCAA 3070 hom 105 het 46 0 35 11 ACA 1 2 320654 CASAVA_Build 22 35945393 4I TGGGAACTGT ----/ATTG ATTGAATTTT 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 ATTG 1 2 320655 CASAVA_Build 22 35950176 4I ATCATGACTT ----/TGTC TGAGCTGAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TGTC 0 1 320656 CASAVA_Build 22 35955247 1D AGCTGAGGCA G/- GGGGCAGGGG 3070 hom 51 het 18 0 16 3 G 5 4 320657 CASAVA_Build 22 35958000 1I GAGCAAGCGA -/G GGTTGCTAGT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 G 2 3 320658 CASAVA_Build 22 35966530 1D TGTGGTCCTT C/- CCACGATGTC 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 C 3 2 320659 CASAVA_Build 22 35971767 3I TGTTAATTTA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 AAT 5 6 320660 CASAVA_Build 22 35981573 4D AAAGAGGAAG AAGA/---- AAGAAAGAAA 3070 hom 26 het 25 1 20 4 AAGA 4 3 320661 CASAVA_Build 22 35983266 1I TTCCCCAACA -/G GGGGTTTGCT 3070 hom 106 het 40 0 35 5 G 4 5 320662 CASAVA_Build 22 35989092 1D CGTGTTTTTA G/- GGGGAACTGC 3070 hom 92 het 36 0 31 5 G 5 4 320663 CASAVA_Build 22 35992299 21I CTTGGGACAA ---------------------/GGCATTGAACGACCCCTCGGT GGCATCTGGC 3070 hom 99 het 35 0 32 4 GGCATTGAACGACCCCTCGGT 0 1 320664 CASAVA_Build 22 35995939 1D CAACAGGAAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 9 8 320665 CASAVA_Build 22 35996019 1D GCCAACAGAT A/- ACATGAAAAA 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 2 1 320666 CASAVA_Build 22 36009174 2I GACGCTGCCT --/AG AGAGCCAGGG 3070 hom 78 het 30 0 24 6 AG 2 3 320667 CASAVA_Build 22 36012097 1D AGGGGTTGGG T/- GGGGGCAACT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 1 0 320668 CASAVA_Build 22 36014571 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2228 het 584 hom 15 3 8 4 A 13 14 320669 CASAVA_Build 22 36029144 1I GTGGACCTTC -/G GGGGCCTTGC 2959 het 2959 ref 33 14 14 5 G 4 5 320670 CASAVA_Build 22 36068018 1I GGCACAGGGG -/A TGGCCTGCCA 3070 hom 137 het 57 0 39 18 A 0 1 320671 CASAVA_Build 22 36071122 1D CCCTTCTGGG C/- CCACCAATCT 3070 hom 39 het 24 0 18 6 C 3 2 320672 CASAVA_Build 22 36072972 1D TTCATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 30 0 28 3 T 11 10 320673 CASAVA_Build 22 36075430 1I TTTGGAGGTT -/C CTGAGAGGCC 2145 hom 23 het 9 0 7 2 C 1 2 320674 CASAVA_Build 22 36080531 2I AAAAAAAGAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 42 11 16 15 AC 7 8 320675 CASAVA_Build 22 36081585 1D7M1I CTCCCCACCC AAAGGGCT-/-AAGGGCTC CCCTTCCCAA 1157 het 1157 ref 28 11 9 12 N/A 0 0 320676 CASAVA_Build 22 36083116 1D TGCCCCATAA G/- GGCTGCTGGA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 G 3 2 320677 CASAVA_Build 22 36091892 6I CACGATATCT ------/GAGCAC GAGCACGTGT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 GAGCAC 1 2 320678 CASAVA_Build 22 36098704 1D TAGCCCCAGA C/- CCCCCAGACC 1916 hom 15 het 6 0 6 0 C 6 5 320679 CASAVA_Build 22 36102389 2D GCAGACAGCT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 72 het 31 0 22 10 AC 8 7 320680 CASAVA_Build 22 36106323 2I CTCCGAGCCT --/CA GTTTCTCCCC 3070 hom 87 het 36 0 28 8 CA 0 1 320681 CASAVA_Build 22 36107307 1D TTTCTGCCCC T/- GTCAGAGGAA 3070 hom 93 het 35 0 29 6 T 1 0 320682 CASAVA_Build 22 36108281 1D CTGGTTCTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 36 het 27 0 19 8 T 10 9 320683 CASAVA_Build 22 36116594 1I CAGATCCGCA -/G GCTGCAAAGG 3070 hom 62 het 25 0 17 8 G 1 2 320684 CASAVA_Build 22 36128611 1D AAGGTGAGAG T/- GCAGCCACCA 2320 het 2320 ref 28 13 8 7 T 1 0 320685 CASAVA_Build 22 36130507 1I GGAGGACAGA -/G GCAGAGCCCG 3070 hom 111 het 41 0 33 8 G 1 2 320686 CASAVA_Build 22 36133170 1I CAAGAGGGCT -/C CGGGACTGGG 3070 het 3070 hom 53 21 22 10 C 1 2 320687 CASAVA_Build 22 36137566 1I11M1I CACAGCAAGC -GGAGGCAGGAA-/GGGAGGCAGGAAG GGGCAACATA 3070 hom 99 het 32 0 30 7 N/A 0 0 320688 CASAVA_Build 22 36139389 2D CCGTCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 2318 het 1769 hom 25 8 10 9 A 12 10 320689 CASAVA_Build 22 36141171 3D TCACTCTCAG TCC/--- TCCCTTGCCT 3070 het 3070 hom 45 20 17 10 TCC 2 1 320690 CASAVA_Build 22 36146694 1I ATGATGCAGA -/G GGGGCGTTCT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 G 4 5 320691 CASAVA_Build 22 36150530 1I CAGCCAGAGA -/C CTCTTGGCCT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 C 1 2 320692 CASAVA_Build 22 36150666 1I GAGGGCGGCG -/T GGGGGGGGAT 3070 het 282 hom 25 1 15 9 T 0 1 320693 CASAVA_Build 22 36154662 3I CAGCTAAAGA ---/AGG AGGAGAAGGG 3070 het 3070 ref 39 16 11 12 AGG 1 2 320694 CASAVA_Build 22 36156343 4D ATCCAAACAC TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 ref 32 13 10 10 TATT 5 4 320695 CASAVA_Build 22 36161447 1I GGCGGTGATA -/G GGACTTCCCC 3070 hom 84 het 30 0 27 3 G 2 3 320696 CASAVA_Build 22 36176737 1I GCAGAATTTG -/C CTTCCTGGCC 3070 hom 59 het 24 0 19 5 C 1 2 320697 CASAVA_Build 22 36214384 1I CCAAGTCACA -/G GGCCCCTGCC 3070 hom 51 het 21 0 17 4 G 2 3 320698 CASAVA_Build 22 36284866 7D AGCCAGTGGA AGAGGCC/------- TAGCCCCTGG 3070 het 3070 ref 50 27 22 6 AGAGGCC 1 0 320699 CASAVA_Build 22 36290695 1D CAGTTTCCCC T/- CTCTAATCTC 3070 het 3070 hom 32 9 19 5 T 1 0 320700 CASAVA_Build 22 36299095 1D GTGGTGGCAC G/- CATCTATAGT 3070 het 3070 hom 23 10 11 3 G 1 0 320701 CASAVA_Build 22 36299684 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 253 hom 45 1 39 6 T 11 10 320702 CASAVA_Build 22 36303470 1D ATCTGTCTAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2578 hom 20 6 10 4 T 9 8 320703 CASAVA_Build 22 36310178 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 10 11 320704 CASAVA_Build 22 36320901 2I ACGCGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 43 17 10 16 GT 7 8 320705 CASAVA_Build 22 36321359 4D AAGAGGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 TTTG 4 3 320706 CASAVA_Build 22 36327190 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 16 0 12 4 A 14 15 320707 CASAVA_Build 22 36362709 1D CCTGCTTCCG A/- CCCCCGTTAC 3070 hom 77 het 34 0 24 11 A 1 0 320708 CASAVA_Build 22 36364489 17D GAGAGGCGCC CAGTCTGCACCGGCACA/----------------- CAGTCTGCAC 3070 het 3070 ref 36 18 10 13 CAGTCTGCACCGGCACA 2 1 320709 CASAVA_Build 22 36364622 5I TCTTCCCCAC -----/GCCTG GCCTGCGGCT 3070 hom 79 het 31 0 19 12 GCCTG 1 2 320710 CASAVA_Build 22 36366318 2I GCCTCCTGCT --/TC TCTGTCTCGT 1271 het 447 hom 7 1 4 2 TC 1 2 320711 CASAVA_Build 22 36371142 1I GTGGCCTGGA -/C CTAGGACAGA 3070 hom 78 het 29 0 22 7 C 1 2 320712 CASAVA_Build 22 36390192 1D31M4I CCAGCTTTTC TTTTTTTTTTTAATTTTTTAAATATATATGTA----/-TTTTTTTTTTAATTTTTTAAATATATATGTATATT TATTTAAGTA 3070 hom 24 het 10 0 9 3 N/A 0 0 320713 CASAVA_Build 22 36393001 2D TCCTGTTCCT GA/-- GTGTCTTCTG 2030 het 741 hom 31 4 8 19 GA 1 0 320714 CASAVA_Build 22 36393034 2D ACTTTGAGTC AA/-- GAGTGCTTTA 3070 hom 55 het 29 0 18 12 A 2 0 320715 CASAVA_Build 22 36409837 1D GATCACAGCT G/- CAGTGCAGCC 3070 het 3070 ref 26 17 8 1 G 1 0 320716 CASAVA_Build 22 36420208 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1225 het 749 hom 16 2 11 3 A 15 16 320717 CASAVA_Build 22 36424762 4I GCCACTGCAC ----/TCCA TCCAGCCTGG 3070 hom 36 het 14 0 11 3 TCCA 1 2 320718 CASAVA_Build 22 36428141 1D CTAACTTGAG A/- GTGTTTTCTT 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 A 1 0 320719 CASAVA_Build 22 36428954 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 9 10 320720 CASAVA_Build 22 36430411 12D ACAGGGAGAA GGAGGGGAAGGG/------------ GGAGGGGAAG 1246 het 31 hom 13 0 3 12 GGAGGGGAAGGG 2 1 320721 CASAVA_Build 22 36436690 1I GCTCCTTGGG -/C CCCACAGGAA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 C 3 4 320722 CASAVA_Build 22 36442369 6D GCCTAGCCTG TTATTA/------ TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 31 16 10 7 TTA 6 4 320723 CASAVA_Build 22 36448155 1D ATTTGGATAC A/- AAAAAACAGG 3070 hom 90 het 36 0 29 7 A 7 6 320724 CASAVA_Build 22 36449701 3D CAGAACCACT CAA/--- CGAGAGAATT 3070 het 3070 hom 41 15 20 8 CAA 1 0 320725 CASAVA_Build 22 36450122 3D AATCCCAGAG CCT/--- CCTCTCCCAA 2357 het 2357 ref 79 54 7 19 CCT 2 1 320726 CASAVA_Build 22 36455720 1D GTTTTCATAA T/- TTTACTGAAT 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 T 4 3 320727 CASAVA_Build 22 36458230 1D AACTGGAACT A/- GACTTTTTAC 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 A 1 0 320728 CASAVA_Build 22 36464287 11I GTCAGATGAT -----------/AGATGGTGGAC AGATGTTGGA 3070 hom 177 het 71 0 57 14 AGATGGTGGAC 0 1 320729 CASAVA_Build 22 36465391 1D CAGCATAGCG C/- CCCCCAAGTA 3070 hom 100 het 38 0 26 12 C 6 5 320730 CASAVA_Build 22 36474533 1I TGATAACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 58 het 25 0 18 7 A 9 10 320731 CASAVA_Build 22 36486003 2I TTGTTCTAAC --/AT GTGTGCTGGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 0 1 320732 CASAVA_Build 22 36495170 1D GGGGGGACAC G/- GGTGGGTCCC 2483 het 968 hom 25 6 11 8 G 3 2 320733 CASAVA_Build 22 36513637 2I CACCTGAATC --/AG GGGAGGTTGA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 AG 0 1 320734 CASAVA_Build 22 36521738 3D CCTCTTCCTT CCA/--- CCCCCACGGC 3070 het 3070 ref 35 15 12 9 CCA 1 0 320735 CASAVA_Build 22 36543965 1I CCTGGCGACC -/T TTGTGGACCC 3070 hom 54 het 23 0 15 8 T 2 3 320736 CASAVA_Build 22 36545976 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1375 het 37 hom 13 1 6 6 T 15 14 320737 CASAVA_Build 22 36574623 13D TGTAGGGATT ACAGGCGTGAGCC/------------- ATCGCGCCCG 2232 het 2232 ref 17 9 6 2 ACAGGCGTGAGCC 1 0 320738 CASAVA_Build 22 36578807 3I GTTAGTTAGT ---/AAG GAGGAGAGAG 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 AAG 0 1 320739 CASAVA_Build 22 36597825 7D CTGTCTCGGG GAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2294 het 2002 hom 18 10 7 3 GAAAAAA 1 0 320740 CASAVA_Build 22 36599388 1I AGTAGCTGGG -/A CTACAGGCGC 1289 het 176 hom 5 1 4 0 A 0 1 320741 CASAVA_Build 22 36609879 4D TAAATAAATA GAAT/---- GAATGAATGA 3070 het 3070 hom 35 13 17 9 GAAT 5 4 320742 CASAVA_Build 22 36629151 1I CTGGCCTTGG -/C CTCCCAAAGT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 1 2 320743 CASAVA_Build 22 36637995 4D GCTCTGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 1312 hom 28 7 16 6 TG 11 9 320744 CASAVA_Build 22 36685671 1D GAAAAACGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 A 13 12 320745 CASAVA_Build 22 36685924 3D GCCTAACTAA TTG/--- TTGTGTTTTT 876 het 876 ref 15 10 3 2 TTG 2 1 320746 CASAVA_Build 22 36713443 1I TGTTCCCCCA -/C CTGGGTCCCT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 C 1 2 320747 CASAVA_Build 22 36717170 6I CACCTCCTGT ------/GCCCAA GCAATTCTCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 GCCCAA 0 1 320748 CASAVA_Build 22 36730132 1D GTAGAGATGT G/- GGGGGGGTCT 3070 het 457 hom 27 1 15 11 G 8 7 320749 CASAVA_Build 22 36746692 1D GAGACTGTCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 10 9 320750 CASAVA_Build 22 36775221 2I GCATACACAC --/AT GTGTGCACAC 3070 het 3070 ref 62 25 22 15 AT 0 1 320751 CASAVA_Build 22 36779767 1I TGTCTTCCTC -/T TTTTTAACCA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 5 6 320752 CASAVA_Build 22 36783152 1D GCAGGGCAAA G/- GGCGGGGTTA 2318 het 1025 hom 21 6 8 8 G 3 2 320753 CASAVA_Build 22 36783595 1I31M1I CCACTCCAGA -GGGAAGAGGAGGGCACTGCTGTCCCGTATGA-/GGGGAAGAGGAGGGCACTGCTGTCCCGTATGAG GGTGGTGGAG 3070 hom 66 het 24 0 21 11 N/A 0 0 320754 CASAVA_Build 22 36787297 6I CCGTCTCAAA ------/AATAAT AATAATAATA 1322 het 1322 ref 22 12 4 6 AAT 4 6 320755 CASAVA_Build 22 36788204 1D ATTTCCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 24 0 15 9 T 17 16 320756 CASAVA_Build 22 36788637 3D GTGGAGAATA TCC/--- TCCTGTAGCT 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 TCC 2 1 320757 CASAVA_Build 22 36805033 6D CCTCCACCTC TTGCTG/------ TTGCCATGTA 2956 het 2608 hom 20 9 9 5 TTGCTG 1 0 320758 CASAVA_Build 22 36810695 4D AAGAGTTCTC CAAA/---- CAAACAAACA 1868 het 1868 ref 31 17 10 4 CAAA 3 2 320759 CASAVA_Build 22 36816471 3I GATCGCTCCC ---/TCT TCTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 TCT 1 2 320760 CASAVA_Build 22 36818735 7I TCTAGTGGGA -------/GGTGGTG GGTGATGGGG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 GGTGGTG 0 1 320761 CASAVA_Build 22 36823952 13D CCCAGGGCCC GGTCTCGCCCCGA/------------- GGTCTGCCCA 1605 het 1106 hom 10 4 6 1 GGTCTCGCCCCGA 1 0 320762 CASAVA_Build 22 36884996 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 233 hom 9 1 8 0 A 7 8 320763 CASAVA_Build 22 36886395 6I TAGAATGAGT ------/AACTAA AACTGTGATA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 AACTAA 0 1 320764 CASAVA_Build 22 36900355 4I TCTCAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 2518 het 553 hom 15 2 7 6 AAAG 3 4 320765 CASAVA_Build 22 36905445 1D TTCTAAACTC T/- TAAGTTTGAG 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 T 2 1 320766 CASAVA_Build 22 36911809 1I CTTTCTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1922 hom 28 11 10 7 C 0 1 320767 CASAVA_Build 22 36920844 2D GGGGTGGGGA GG/-- GGGGGGAGGT 3070 hom 55 het 24 0 18 6 G 8 6 320768 CASAVA_Build 22 36923408 1D TCCCGACTAA T/- TTTTTTTTTT 2268 het 1478 hom 12 4 7 2 T 13 12 320769 CASAVA_Build 22 36927259 7I TAGGGAGCCT -------/ATCTATC CGGAGGCTGC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 ATCTATC 0 1 320770 CASAVA_Build 22 36931377 2I CATTTTTTCC --/CT CTGTCCTCAC 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 CT 1 2 320771 CASAVA_Build 22 36932470 2D AATTTTTGCA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 1997 hom 25 9 13 4 T 11 9 320772 CASAVA_Build 22 36942465 1D37M3I AGAGAATAAA TGTGTATCCTGGACTATGTTTTTTGGCGAGGGGTGTCT---/-GTGTATCCTGGACTATGTTTTTTGGCGAGGGGTGTCTAAA AAAATGGGGT 3070 het 3070 hom 34 18 19 12 N/A 0 0 320773 CASAVA_Build 22 36943798 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 941 het 713 hom 15 6 7 2 AAAG 1 0 320774 CASAVA_Build 22 36953350 1I CTGAGGAGAT -/G GGCAGGGCCA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 G 2 3 320775 CASAVA_Build 22 36959700 1I GATGGTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 9 10 320776 CASAVA_Build 22 36960037 2I TGCATTTTCT --/AA AGACTGCCAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 3 320777 CASAVA_Build 22 36967965 1I TACAAGCATA -/T TTTTAGGTCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 4 5 320778 CASAVA_Build 22 37005333 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 21 1 14 6 T 14 15 320779 CASAVA_Build 22 37012241 1I TAGAGACGGA -/G TTTCACCATG 3070 hom 43 het 33 0 31 2 G 0 1 320780 CASAVA_Build 22 37012631 2D CGATTTCTCC CT/-- GTCTCTCATT 3070 het 3036 hom 26 11 10 5 CT 1 0 320781 CASAVA_Build 22 37012926 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 535 hom 30 3 17 11 A 12 11 320782 CASAVA_Build 22 37024535 1I CGCCCTGCCT -/G GGCCCTGCTG 3070 hom 71 het 27 0 23 4 G 2 3 320783 CASAVA_Build 22 37028201 1D TGATCCCGTG T/- TAATTCCCAT 1817 het 1817 ref 22 9 5 8 T 2 1 320784 CASAVA_Build 22 37031384 1D AAAGCCATTT A/- AAAAAAAAAA 2439 het 1865 hom 27 11 12 4 A 17 16 320785 CASAVA_Build 22 37031419 7I CTCTCCAAAA -------/AAAAAAG AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 AAAAAAG 1 2 320786 CASAVA_Build 22 37037433 4I AGCCATGGGC ----/CTCT CTGTCTCCTG 3070 het 3070 hom 41 17 15 9 CT 1 3 320787 CASAVA_Build 22 37050024 6D CTTTTTTCAT TTTGTG/------ TTTGTTTCTT 2288 het 2288 ref 24 14 8 3 TTTGTG 1 0 320788 CASAVA_Build 22 37080249 2I AGCCTGGGCA --/AC AGAGTGAGAC 3070 het 2388 hom 23 6 11 6 AC 0 1 320789 CASAVA_Build 22 37096008 1D TTTAGCCACC A/- AAAAAAAAAA 1190 het 1190 ref 27 15 4 9 A 12 11 320790 CASAVA_Build 22 37096803 3D TCTGTTCAGG TTT/--- TTTTCTATTT 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 T 7 4 320791 CASAVA_Build 22 37097038 3D TTTTTTAAAC CTG/--- CTTTTTGTTG 1552 het 1552 ref 39 34 5 0 CTG 1 0 320792 CASAVA_Build 22 37101728 1D GCTTCAACTT A/- AAAGTCACCA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 4 3 320793 CASAVA_Build 22 37102911 2I ATATGTTTAC --/AT ATATATATAT 2353 het 2353 ref 25 13 6 6 AT 6 7 320794 CASAVA_Build 22 37103014 16I CTATATATAG ----------------/ATATGTATATATAGAT ATATATATAC 2168 het 2168 ref 34 26 5 3 ATATGTATATATAGAT 0 1 320795 CASAVA_Build 22 37103151 2I TATATCTGTG --/TA TATATATATA 2752 het 2752 ref 37 10 12 15 TA 5 6 320796 CASAVA_Build 22 37108082 1D CTGGTATGAG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 T 8 7 320797 CASAVA_Build 22 37112586 2I GAGAAAACAA --/AT AGTTGTACAT 3070 het 3070 hom 45 18 17 10 AT 0 1 320798 CASAVA_Build 22 37113559 4I AGGATAGAGA ----/GAGT GAGTGGGTAT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 GAGT 1 2 320799 CASAVA_Build 22 37117902 1I TAAGGTATTC -/A AAGTCCTCAA 3070 het 3070 hom 20 8 8 4 A 2 3 320800 CASAVA_Build 22 37118711 4D TTTAAAAACT TTAA/---- TTAAGCAAGA 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 TTAA 2 1 320801 CASAVA_Build 22 37121566 3I CGTTAGAAAA ---/GTG ATGTGAAGAC 1305 het 1305 ref 43 39 3 1 GTG 0 1 320802 CASAVA_Build 22 37123277 1I GCGCGCCCCG -/C CTGTCGGGTC 1409 hom 26 het 12 0 9 3 C 1 2 320803 CASAVA_Build 22 37130365 2D CCCACACTCG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 21 0 17 5 T 12 10 320804 CASAVA_Build 22 37132926 1D TTATATCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 659 hom 16 3 11 2 T 13 12 320805 CASAVA_Build 22 37152363 1D AAGAAACGCA C/- CCCCCCCTCC 2277 hom 21 het 10 0 7 3 C 8 7 320806 CASAVA_Build 22 37160226 1D ATGTGACTGG C/- CTGAGGTCAC 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 C 2 1 320807 CASAVA_Build 22 37175012 1D CCAATGTCTC A/- TCTGGGGCAC 3070 hom 53 het 20 0 17 6 A 1 0 320808 CASAVA_Build 22 37180024 2D GTGGGGGAGA AC/-- ACACACACAC 1224 het 1224 ref 36 22 3 11 AC 7 6 320809 CASAVA_Build 22 37183678 1I TGGCCACGGG -/C CTGACCTGGT 3070 hom 104 het 38 0 30 8 C 1 2 320810 CASAVA_Build 22 37187571 3D CAGCCTCTCC CCT/--- CCTCGTTTGG 2047 het 957 hom 14 4 6 5 CCT 2 1 320811 CASAVA_Build 22 37188988 1D ACTGAGGGGC G/- GGGGGGCAGG 2870 het 564 hom 15 5 9 3 G 7 6 320812 CASAVA_Build 22 37210196 1D TCTGTAAGAT G/- GGGGGGGGAC 3070 het 2000 hom 21 6 9 6 G 9 8 320813 CASAVA_Build 22 37226926 1I TACAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2765 het 1753 hom 21 5 10 6 A 15 16 320814 CASAVA_Build 22 37229376 1I CATTCATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 9 10 320815 CASAVA_Build 22 37246324 1I TTTATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 12 13 320816 CASAVA_Build 22 37249721 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 6 A 11 10 320817 CASAVA_Build 22 37252633 4D ATAATAATAA TAAC/---- TAAGATTTAC 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 TAAC 1 0 320818 CASAVA_Build 22 37256302 1I TGGTTAAAAA -/C AAAAAGGGTA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 0 1 320819 CASAVA_Build 22 37267970 1D CATTTATGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 10 9 320820 CASAVA_Build 22 37272244 1I GGGAGGCTGA -/C GGAGGAGAAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 0 1 320821 CASAVA_Build 22 37306048 4I ATTTTTACTT ----/TTTA TTTTTGTAGA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 TTTA 0 1 320822 CASAVA_Build 22 37313041 2D CAAAAACATA AC/-- ACAATAAAAC 3070 het 3070 hom 41 17 15 10 AC 2 1 320823 CASAVA_Build 22 37329439 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1695 het 175 hom 19 2 6 11 A 17 18 320824 CASAVA_Build 22 37336479 2I CATTTATCCC --/CT CAGTCTATTA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 CT 0 1 320825 CASAVA_Build 22 37351782 1I GTAATCCCAG -/C TACTCAGGAG 2709 het 1390 hom 15 3 7 5 C 0 1 320826 CASAVA_Build 22 37357712 1D AAACTGGACA G/- GGGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 18 10 G 5 4 320827 CASAVA_Build 22 37367077 2D AGAAAGAGGG GA/-- GAGAAAGGAT 3070 het 3070 hom 42 13 24 6 GA 3 2 320828 CASAVA_Build 22 37367651 4I GTAGCGACTT ----/GTTG GTTGGTTGAC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 GTTG 2 3 320829 CASAVA_Build 22 37369267 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1935 het 1935 ref 26 11 7 8 A 13 14 320830 CASAVA_Build 22 37371039 8D TCTGTCTCAA AAATAAAT/-------- AAATAAAGTT 1472 het 1472 ref 20 12 5 5 AAAT 3 1 320831 CASAVA_Build 22 37386758 1I ACACGATCTC -/G CCTCACCGCA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 0 1 320832 CASAVA_Build 22 37400291 2D AACAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 1776 het 564 hom 13 3 4 6 A 14 12 320833 CASAVA_Build 22 37404526 1D CTTAAACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 13 10 T 12 11 320834 CASAVA_Build 22 37407099 1I GCCTAGCCAA -/C ATGGTGAAAC 2737 hom 27 het 10 0 8 2 C 0 1 320835 CASAVA_Build 22 37409867 1D ATAATTTGGA T/- TTTTTTTTTT 1319 het 1319 ref 44 30 6 8 T 15 14 320836 CASAVA_Build 22 37410755 1D GGGGACAGAA T/- TTTTTTTTTT 1922 het 1922 ref 37 14 8 15 T 19 18 320837 CASAVA_Build 22 37432952 11D CTGGGTTCCC TTTCCTGCCCT/----------- ACCATCGAAA 3070 het 3070 ref 44 25 18 7 TTTCCTGCCCT 1 0 320838 CASAVA_Build 22 37467901 1D AGACCAGCCT G/- GCCAACTTGG 3070 het 3070 ref 26 10 12 4 G 2 1 320839 CASAVA_Build 22 37481004 1D AACGCTCATC G/- GAAAGCATCC 3070 het 2452 hom 20 7 10 3 G 2 1 320840 CASAVA_Build 22 37553208 14D TCTTTTTTTC TTTCTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTGAG 2786 het 2615 hom 19 9 11 0 TTTCTTTTTTTTTT 1 0 320841 CASAVA_Build 22 37554158 1D GTTAGCCTCC G/- GGGAGCATGG 3055 het 3055 ref 33 16 9 8 G 4 3 320842 CASAVA_Build 22 37555642 1I CTTAGGCCCC -/A AGACACGAAC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 1 2 320843 CASAVA_Build 22 37577266 1D ACCAGGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 T 11 10 320844 CASAVA_Build 22 37589490 1I AGGAAGGAGG -/C CTCCACTCAC 3070 hom 67 het 26 0 18 8 C 1 2 320845 CASAVA_Build 22 37612764 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 29 0 17 12 T 15 14 320846 CASAVA_Build 22 37615145 1D GAGTGCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 25 1 20 4 T 13 12 320847 CASAVA_Build 22 37616858 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 11 10 320848 CASAVA_Build 22 37619695 1I AAAAGTAAGT -/A ACGTAATTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 2 320849 CASAVA_Build 22 37620601 6I3M7I CTGGAGTGCA ------AGA-------/GTGGCGAGATCTTGGC TCACTGCAAC 3070 hom 45 het 17 0 16 7 N/A 0 0 320850 CASAVA_Build 22 37621123 1D ATTTTGTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 194 hom 37 1 29 7 T 10 9 320851 CASAVA_Build 22 37622325 4D TTTCCTTATT TTTC/---- TTTTTTTGTT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TTTC 1 0 320852 CASAVA_Build 22 37622414 4I ATCTTTAACT ----/CATA CAGACATTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 CATA 0 1 320853 CASAVA_Build 22 37622701 3D CTTGTGGTGC CTT/--- CTTCTTCTAT 3070 hom 96 het 37 0 32 7 CTT 3 2 320854 CASAVA_Build 22 37629114 1D CTTTGTGTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 9 8 320855 CASAVA_Build 22 37630379 1D TTGGGATTAA G/- GGTGTGCACC 3070 hom 90 het 32 0 31 2 G 3 2 320856 CASAVA_Build 22 37631872 1D TTGATTGCTT A/- AAAAAACTGA 3070 hom 75 het 26 0 26 1 A 7 6 320857 CASAVA_Build 22 37662883 2D ATGTGCATGC GT/-- GTGTACGAAC 3070 het 3070 hom 42 17 20 6 GT 3 2 320858 CASAVA_Build 22 37663743 1I51M18D GGGGGTGTGT -GCATGTGTGTGCATGTGTGTGAGTGTGTGTATGTGGGTGTGTGCATGTGTGTGCATGTGGGTGGGCGCA/GGCATGTGTGTGCATGTGTGTGAGTGTGTGTATGTGGGTGTGTGCATGTGTG------------------ TGTGTGGGTG 3070 het 3070 ref 68 58 15 23 N/A 0 0 320859 CASAVA_Build 22 37663844 2I TGAGTGTGCA --/TG TGTGTGTGCG 3070 het 3070 ref 54 28 16 11 TG 4 5 320860 CASAVA_Build 22 37671581 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 2326 het 1648 hom 16 6 6 4 A 9 10 320861 CASAVA_Build 22 37672490 1D AAAAGTAATA T/- TTTTAGGTTT 3070 hom 53 het 27 0 16 12 T 5 4 320862 CASAVA_Build 22 37674596 1I CCCTGGTCAG -/A AGGGACAGGC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 1 2 320863 CASAVA_Build 22 37684828 1I CTTTCTTTTG -/C TGCTGCCTCC 3070 het 2725 hom 23 7 12 4 C 0 1 320864 CASAVA_Build 22 37699219 1I ATTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2159 hom 32 het 13 0 9 4 A 13 14 320865 CASAVA_Build 22 37702441 1D AGCCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 3 2 320866 CASAVA_Build 22 37703850 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1549 hom 15 het 7 0 6 1 T 15 14 320867 CASAVA_Build 22 37712892 1D GGCTGGGGAC G/- GGGGGGGTCC 2559 hom 31 het 12 0 8 4 G 8 7 320868 CASAVA_Build 22 37726981 1I ACTACAGGCG -/C CCCGCCACCA 1636 het 871 hom 9 2 6 1 C 3 4 320869 CASAVA_Build 22 37727794 1D CAAGCAGCAC A/- AGGGGAGCAG 3070 hom 109 het 41 0 32 9 A 2 1 320870 CASAVA_Build 22 37734821 1D AGGTCAGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 868 hom 32 6 15 11 T 12 11 320871 CASAVA_Build 22 37761558 1I GCTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2765 het 477 hom 11 1 9 1 A 13 14 320872 CASAVA_Build 22 37766029 1D AAAAAAACAC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 9 A 7 6 320873 CASAVA_Build 22 37774958 3D AAACAAAAAA AAC/--- AAAAAGAGTA 3070 hom 59 het 24 0 20 5 AAC 1 0 320874 CASAVA_Build 22 37777488 1D ACTCAGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 18 1 A 15 14 320875 CASAVA_Build 22 37781373 2D GCTGGAGTGC TA/-- AATAGCAGAA 3070 hom 40 het 17 0 15 2 TA 1 0 320876 CASAVA_Build 22 37793762 2D TATTGAGGAC AA/-- AGAGTGTACG 3070 hom 99 het 38 0 32 7 A 3 1 320877 CASAVA_Build 22 37812188 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1004 het 1004 ref 32 23 3 6 A 12 11 320878 CASAVA_Build 22 37828320 1D GGCTGGTCTT A/- GAACTCTTGG 3070 hom 51 het 22 0 16 6 A 1 0 320879 CASAVA_Build 22 37828426 3D TTTTTGTGTT CTC/--- CTCTCGCACC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 CTC 2 1 320880 CASAVA_Build 22 37838478 9I GGAGGGCCTG ---------/GAAGAAAAA GATCTAGCTA 2867 het 2867 ref 19 12 6 1 GAAGAAAAA 0 1 320881 CASAVA_Build 22 37848186 1I GTACCCCAGT -/A AGCACCTCTA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 1 2 320882 CASAVA_Build 22 37861464 7I TTCTCCTGCC -------/ACCTGCT ACCTGCTACC 3070 het 3001 hom 33 11 16 6 ACCTGCT 1 2 320883 CASAVA_Build 22 37866519 1I CCTTGCTCTG -/A GGCTCCAGGT 3070 hom 45 het 19 0 14 5 A 0 1 320884 CASAVA_Build 22 37869246 1I TTTTAAAATT -/A AAAAAAAACT 2187 hom 15 het 8 0 6 2 A 8 9 320885 CASAVA_Build 22 37873173 1D CATCACCATG C/- CTGGCTAATT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 C 2 1 320886 CASAVA_Build 22 37874989 6I CTAGCTCATT ------/CCCTCC CCCTCCCAAC 3070 hom 65 het 27 0 21 6 CCCTCC 1 2 320887 CASAVA_Build 22 37877835 1I GTGCTCGGGT -/G GGCGTAGAGG 1317 hom 7 het 3 0 3 0 G 2 3 320888 CASAVA_Build 22 37882344 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1947 het 42 hom 11 1 7 3 A 14 15 320889 CASAVA_Build 22 37883297 1D GCCTGGGCAA C/- AGAGTGAGAC 2042 het 623 hom 9 2 5 3 C 1 0 320890 CASAVA_Build 22 37883407 3D AAAACCAAAC ATT/--- ATTTCTGTGA 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 ATT 2 1 320891 CASAVA_Build 22 37884459 1D AACTCCACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 49 hom 27 2 12 13 A 18 17 320892 CASAVA_Build 22 37890346 1D AATTTTTGCA T/- TTTTTTTGTA 2846 het 2846 ref 20 10 8 3 T 8 7 320893 CASAVA_Build 22 37891316 1D ATGGCCATTG T/- TAAGTGGTGT 3070 hom 75 het 29 0 26 6 T 2 1 320894 CASAVA_Build 22 37893859 1I TAATTTTGAG -/A AAGTGAAAGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 3 320895 CASAVA_Build 22 37895764 1I CAAGCCAGGT -/A ACCCAAGGAG 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 A 1 2 320896 CASAVA_Build 22 37913814 2D ACCATGCTGG TA/-- TATAGCCTGC 3070 hom 57 het 20 0 20 2 TA 3 2 320897 CASAVA_Build 22 37923728 1D AACTCAAAAC A/- AGGAACTAAT 1833 het 1833 ref 18 10 4 4 A 2 1 320898 CASAVA_Build 22 37925236 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1806 hom 19 6 8 5 A 13 12 320899 CASAVA_Build 22 37926145 1I CCTCAACAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 A 9 10 320900 CASAVA_Build 22 37933421 1I TGTGGGAGAA -/G ACCCCCAAGA 3070 hom 69 het 30 0 20 10 G 0 1 320901 CASAVA_Build 22 37934032 2I TCACGCACTC --/AA AAAGTCACCA 3070 hom 84 het 31 0 26 5 A 3 5 320902 CASAVA_Build 22 37934738 1D CAAGAGTCTC A/- CTCTCTGGCC 1109 het 419 hom 10 1 4 12 A 1 0 320903 CASAVA_Build 22 37936199 1D CAGGAGCAGG T/- TTTTTTTTTT 2590 het 2090 hom 20 8 6 6 T 11 10 320904 CASAVA_Build 22 37954118 4D ACACCGTCAT ACTC/---- AACCAAAATA 3070 het 3070 hom 43 19 21 8 ACTC 1 0 320905 CASAVA_Build 22 37964939 1I AGGAAAGAGC -/A AAGGGCTCCA 3070 het 3070 ref 25 12 7 6 A 2 3 320906 CASAVA_Build 22 37966457 1I CTCTCAAGAT -/G GGGGGGCTTT 3070 hom 72 het 27 0 23 4 G 6 7 320907 CASAVA_Build 22 37993217 1D ATTCCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 27 0 22 5 T 11 10 320908 CASAVA_Build 22 37993525 1I AGACTCCGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 10 320909 CASAVA_Build 22 38001532 1I ACTCTGTCTC -/A AAATAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 3 4 320910 CASAVA_Build 22 38005547 1I CTTTGCTTTG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 70 het 45 1 32 12 A 9 10 320911 CASAVA_Build 22 38022276 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 13 6 A 12 11 320912 CASAVA_Build 22 38023063 1D CTCCCACGGG C/- CCGCTGGGAG 3070 hom 28 het 26 1 13 12 C 3 2 320913 CASAVA_Build 22 38027980 1I CACTGCCTGC -/T GTGCCTGAAG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 0 1 320914 CASAVA_Build 22 38028894 8D TTGCCATTCA TTATTTAT/-------- TTATTTATTT 3070 hom 29 het 19 0 10 9 TTAT 7 5 320915 CASAVA_Build 22 38037170 1D GGGTGGACAG A/- CACACGTGGG 3070 hom 88 het 34 0 26 8 A 1 0 320916 CASAVA_Build 22 38051509 4I AAAAGAGAGA ----/GAGG GAGGGAGGGA 3070 hom 68 het 27 0 22 5 GAGG 3 4 320917 CASAVA_Build 22 38054759 1I GCCACCAACA -/T TATCTCTTAG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 1 2 320918 CASAVA_Build 22 38057017 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 34 2 23 9 A 12 11 320919 CASAVA_Build 22 38057716 1D AGAGCACAGG C/- AGAGTAGACG 3070 hom 84 het 32 0 29 5 C 1 0 320920 CASAVA_Build 22 38062810 1I ATACTTGGGA -/G GCCGAGGCAG 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 1 2 320921 CASAVA_Build 22 38063074 1D GATCCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 9 8 320922 CASAVA_Build 22 38063330 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 14 1 13 0 T 14 12 320923 CASAVA_Build 22 38063541 2D TTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 37 3 18 16 T 16 14 320924 CASAVA_Build 22 38066638 1D AGTCTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 33 5 22 6 T 12 11 320925 CASAVA_Build 22 38066762 2D TTTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 22 0 15 7 T 17 15 320926 CASAVA_Build 22 38082150 12I CCTGAGTAGA ------------/TGGGATTACAGG TGTCCGCCAC 3070 het 2377 hom 16 6 10 0 TGGGATTACAGG 0 1 320927 CASAVA_Build 22 38122735 4I TTCTATCTTC ----/TCTG TCTGCTCAAT 3070 hom 114 het 47 0 38 9 TCTG 1 2 320928 CASAVA_Build 22 38130510 1I CACAGCAAGA -/C CCTGTTTAAA 3070 hom 86 het 38 0 27 11 C 2 3 320929 CASAVA_Build 22 38145920 3I GGGTGGAGTT ---/GAG GAGCTGGGCC 3070 hom 84 het 31 0 27 4 GAG 1 2 320930 CASAVA_Build 22 38166033 2I CATGTTCCGC --/CT CTGCCTCCCA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 CT 1 2 320931 CASAVA_Build 22 38166919 2I ATCCCAGCAC --/TT TGGGAGGCTG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 1 3 320932 CASAVA_Build 22 38167021 1D AAAATTACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 12 11 320933 CASAVA_Build 22 38168766 2I ATTCAGCCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 10 12 320934 CASAVA_Build 22 38173818 2D GTCACATAAT AG/-- AGTGAGAGAG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 AG 2 1 320935 CASAVA_Build 22 38212096 1D AGACCTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 32 0 15 17 T 19 18 320936 CASAVA_Build 22 38257284 16D TTTGGCTTAA GTTGTATTTCCTCCTT/---------------- GGAATTCATA 3070 het 3070 ref 39 28 12 6 GTTGTATTTCCTCCTT 1 0 320937 CASAVA_Build 22 38271951 4I GTTGGCGTGC ----/GGTT GGTTGGCTCA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 GGTT 1 2 320938 CASAVA_Build 22 38285675 7I GTGCCTGCCC -------/CAGGGCT CACAATGGGA 1976 het 1976 ref 20 9 6 5 CAGGGCT 0 1 320939 CASAVA_Build 22 38289301 4I TTGTGTGTAT ----/GTGA GTGTGTCTGT 3070 het 3070 hom 73 33 30 10 GTGA 0 1 320940 CASAVA_Build 22 38296365 1D GCCAATAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 A 10 9 320941 CASAVA_Build 22 38301584 1D AGTGGCCATG C/- CCCCCATCAG 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 C 6 5 320942 CASAVA_Build 22 38301732 1D TTTTCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 2785 het 2542 hom 18 7 7 4 T 12 11 320943 CASAVA_Build 22 38303962 12D TGCTGAGTGG CAGCTGTGTGTA/------------ CACTGGAGCT 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 CAGCTGTGTGTA 1 0 320944 CASAVA_Build 22 38305600 1D TTTCAAGCTC T/- TTTTTTTTTT 2855 het 2855 ref 31 9 8 14 T 15 14 320945 CASAVA_Build 22 38321577 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 311 hom 24 2 20 2 A 15 14 320946 CASAVA_Build 22 38328505 1I CTTTAAGTAG -/A TTTTTTTTTA 3070 hom 103 het 41 0 34 7 A 0 1 320947 CASAVA_Build 22 38335036 3I TTCTCTGATG ---/CCT CCTCCAGGAG 3070 hom 111 het 39 0 34 5 CCT 1 2 320948 CASAVA_Build 22 38339793 1D GGATCCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 23 0 15 8 T 13 12 320949 CASAVA_Build 22 38347310 1I CCATTCCTTT -/A ATTCCTAGCC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 A 1 2 320950 CASAVA_Build 22 38373114 3D GATCGGCCTC GGA/--- GGAAGCCACA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 GGA 2 1 320951 CASAVA_Build 22 38381222 1I TCCCGGGGGG -/C CAGCTGACCT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 C 1 2 320952 CASAVA_Build 22 38400697 4I CCTCAGGCAC ----/ATTT ATTTATTCAT 3070 het 3070 hom 42 13 18 11 ATTT 1 2 320953 CASAVA_Build 22 38416656 1D GACTGGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 9 8 9 A 12 11 320954 CASAVA_Build 22 38421765 3D AAATAATAAA TGT/--- TGTTGTTTTA 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 TGT 3 2 320955 CASAVA_Build 22 38433933 1I AATTTCTGTT -/A CGGGAGCTGG 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 0 1 320956 CASAVA_Build 22 38434641 1I ATGAGTCCAG -/C CCCCAGCCAC 2263 het 2263 ref 21 11 8 2 C 4 5 320957 CASAVA_Build 22 38470479 10D TTATCAATAT TCATCTTGAC/---------- TCATCTTGAC 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 TCATCTTGAC 2 1 320958 CASAVA_Build 22 38474538 1D CGCCCGGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2788 hom 24 9 10 5 T 10 9 320959 CASAVA_Build 22 38511084 4I GTGAACTGAA ----/AGAT AGATGCAAAG 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 AGAT 1 2 320960 CASAVA_Build 22 38513005 2I TTCATGTCTC --/TG TGTCATATTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 TG 1 2 320961 CASAVA_Build 22 38534148 1D ACTATCATCA C/- CCATCCCTCT 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 C 3 2 320962 CASAVA_Build 22 38537248 1D AGTGAGGACC A/- AAGCAAACAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 A 3 2 320963 CASAVA_Build 22 38545332 1D AAAACAAAAA C/- AAAAAAAGAA 1473 het 1473 ref 20 9 8 3 C 1 0 320964 CASAVA_Build 22 38566545 4D ATTTTTAGTA ACAG/---- ACAGATATAT 3070 het 3070 hom 32 15 14 6 ACAG 2 1 320965 CASAVA_Build 22 38592757 1I GACATCCACG -/A AGTCCAGACT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 1 2 320966 CASAVA_Build 22 38612009 1D CTCAATAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 11 10 320967 CASAVA_Build 22 38625521 3D AGTAGCAAGA TGT/--- TGTTATTTTT 2595 het 2595 ref 20 10 8 2 TGT 2 1 320968 CASAVA_Build 22 38640433 2D GTCCTGTGGA TT/-- TTTCATTTCG 3070 hom 108 het 41 0 37 7 T 5 3 320969 CASAVA_Build 22 38648990 1I AGATTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 2761 het 1162 hom 20 4 12 4 A 17 18 320970 CASAVA_Build 22 38653617 1D AAGGCATGAC T/- TTTTTTTTTC 737 het 737 ref 52 34 2 17 T 10 9 320971 CASAVA_Build 22 38659095 1I TTTGTTTAAG -/T TAAGAAGAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 2 320972 CASAVA_Build 22 38659792 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 2730 het 2730 ref 43 27 8 8 A 13 12 320973 CASAVA_Build 22 38692947 2D TGCACACACT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 50 17 27 9 CA 9 8 320974 CASAVA_Build 22 38714659 1I AGGGAGGAGT -/G GGGGAGTGGC 3070 het 3070 hom 39 18 15 6 G 4 5 320975 CASAVA_Build 22 38715459 1I GTCGTTCAGT -/C CCTAGGATCT 3070 het 3070 ref 42 19 12 11 C 2 3 320976 CASAVA_Build 22 38719576 1D TGATTATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 A 11 10 320977 CASAVA_Build 22 38753848 1D GCCTCCCCTG T/- TTAACGATCT 1663 het 1663 ref 16 5 6 5 T 3 2 320978 CASAVA_Build 22 38759043 1I AATTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 10 11 320979 CASAVA_Build 22 38775632 3I TGGCTCGCTG ---/CAA CAACTTCTGC 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 CAA 1 2 320980 CASAVA_Build 22 38833263 1I CTTAGCTAAC -/T TTATTAGTAC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 2 3 320981 CASAVA_Build 22 38850272 1D TCTTTTTACC T/- TTTTTTTTTT 501 het 501 ref 24 7 3 14 T 19 18 320982 CASAVA_Build 22 38863021 2D GTCAAGAAAA GT/-- GTTACACAGA 3070 het 3070 ref 52 32 16 4 GT 2 1 320983 CASAVA_Build 22 38863933 5D ACTGTATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2692 het 1543 hom 14 5 6 3 A 17 12 320984 CASAVA_Build 22 38867710 6D TTTTTCTTGT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 2555 het 2376 hom 28 6 8 14 TTTTTG 4 3 320985 CASAVA_Build 22 38868176 2D GCCTAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2582 het 892 hom 25 7 10 9 T 18 16 320986 CASAVA_Build 22 38868817 1I GAGGAACTGG -/A ATAACCACAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 1 2 320987 CASAVA_Build 22 38875744 1I TGTCAAAACT -/A AAAAATTGTA 1533 het 1533 ref 19 11 5 3 A 5 6 320988 CASAVA_Build 22 38875945 1I43M1I GAAAGCCAAC -AAAAAATTGAAAATAGTTTCGGTGGGGTGGAAAAAGTAGAGTC-/AAAAAAATTGAAAATAGTTTCGGTGGGGTGGAAAAAGTAGAGTCA AAAAAGGTTT 3070 het 3070 ref 26 20 14 5 N/A 0 0 320989 CASAVA_Build 22 38879500 1I ACTAAGCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 11 12 320990 CASAVA_Build 22 38883257 1I GCCAGTGATT -/C ATGGAATTTA 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 C 0 1 320991 CASAVA_Build 22 38885628 4I AAAAAAAAAG ----/AAAT AAAGGTGAAA 1888 het 1888 ref 15 7 4 4 AAAT 0 1 320992 CASAVA_Build 22 38896546 7D ATATATTATA TATAGTT/------- TATATATATC 367 hom 5 het 3 0 2 1 TATAGTT 1 0 320993 CASAVA_Build 22 38897976 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 9 10 320994 CASAVA_Build 22 38909022 2I CATCTAGAAC --/AG GGCTTGGCAG 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 AG 0 1 320995 CASAVA_Build 22 38922575 25D TTTTAGATTA TGGAACTCTTGCTGATGTTTTTTTC/------------------------- TGGAACTCTT 3070 het 3070 ref 36 13 13 14 TGGAACTCTTGCTGATGTTTTTTTC 2 1 320996 CASAVA_Build 22 38932417 2D AGCTTTGTCA TG/-- TTCATGGTTA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 TG 1 0 320997 CASAVA_Build 22 38935214 1D CTTATACCTG C/- CCCCTTTCTA 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 C 5 4 320998 CASAVA_Build 22 38935968 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1416 het 1416 ref 24 8 4 12 A 15 14 320999 CASAVA_Build 22 38937064 3D TTCTTCTTCA TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 10 TCT 4 3 321000 CASAVA_Build 22 38937334 1I CGGCCTGTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 8 9 321001 CASAVA_Build 22 38940961 2D TTTCTGTGCA AT/-- GATTTGTTTT 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 AT 1 0 321002 CASAVA_Build 22 38941057 3D GATGTATCTT AAC/--- AATTCATGGA 3070 het 3070 ref 35 15 12 10 AAC 1 0 321003 CASAVA_Build 22 38941235 1I GCTAGCTACA -/T TTTTTCATGT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 5 6 321004 CASAVA_Build 22 38949402 5D TTTTTGTTTT GTTTC/----- AAGGAATCTC 3070 het 3070 ref 22 11 9 5 GTTTC 1 0 321005 CASAVA_Build 22 38955524 1I CACCACCCTC -/T TGTCTCCTCT 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 T 1 2 321006 CASAVA_Build 22 38957476 1D ATATGGAATC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 9 T 7 6 321007 CASAVA_Build 22 38976884 1D AGTGGAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 43 1 18 25 T 18 17 321008 CASAVA_Build 22 38979770 3D TGTAAATCTC CTT/--- CTTCTTCTCT 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 CTT 3 2 321009 CASAVA_Build 22 38981794 12D GTTTGTTTGC TTGTTTGTTTGT/------------ TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 TTGT 6 3 321010 CASAVA_Build 22 38985183 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 10 11 321011 CASAVA_Build 22 38997939 1D GAAGTTTAGC T/- TTATCTCTCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 3 2 321012 CASAVA_Build 22 39007446 1I TAAACCTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 11 12 321013 CASAVA_Build 22 39014226 3I TCCCAGGTCT ---/CCA CCAGTCTTCT 3070 het 3070 ref 62 28 23 11 CCA 1 2 321014 CASAVA_Build 22 39021425 1D CTCCATTTCC A/- AAAAAAAAAA 1526 het 408 hom 15 3 6 6 A 17 16 321015 CASAVA_Build 22 39041174 1I CTCATGTGTA -/T TTTGTCAACA 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 3 4 321016 CASAVA_Build 22 39041636 19I GTATAAGGCA -------------------/AAGGGACCCAAGAACTCCC AAGGGACAGA 3070 hom 129 het 46 0 40 8 AAGGGACCCAAGAACTCCC 0 1 321017 CASAVA_Build 22 39058492 3D CATGCAGCAA TTC/--- TTCTTGTTGA 3070 het 3070 hom 44 22 22 0 TTC 2 1 321018 CASAVA_Build 22 39060974 1D CCTTTAAGTG T/- TTTTTTTTTC 1769 het 1769 ref 40 27 4 10 T 10 9 321019 CASAVA_Build 22 39061319 4D TCACTTAAAA AAAC/---- AAACAATAAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 7 AAAC 2 1 321020 CASAVA_Build 22 39064136 1I GCATTGCTGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 A 8 9 321021 CASAVA_Build 22 39065310 1D TAAAAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 2572 het 1686 hom 25 8 8 9 T 17 16 321022 CASAVA_Build 22 39084773 4D TGATTTAAGG TCTC/---- GGTCTGAGAC 3070 het 3070 hom 41 14 25 2 TC 2 0 321023 CASAVA_Build 22 39102663 5I CTAAAGATTG -----/GTGGA GTGGAGTCAG 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 GTGGA 1 2 321024 CASAVA_Build 22 39111976 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2136 het 1395 hom 12 4 8 0 T 11 10 321025 CASAVA_Build 22 39136042 4I AAATAAACTG ----/TGTC TGTCTGTCTT 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 TGTC 2 3 321026 CASAVA_Build 22 39136886 1I CACAGGGAAT -/G AGGGGGTAGA 2200 het 2200 ref 22 8 9 5 G 0 1 321027 CASAVA_Build 22 39140885 2I TGGGTTCTGG --/CC CCCCCCCTGT 3070 hom 54 het 20 0 16 4 C 7 9 321028 CASAVA_Build 22 39157735 1I TATGTCCAGC -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 ref 35 21 14 0 A 6 7 321029 CASAVA_Build 22 39158638 1D GAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2414 hom 30 7 18 7 A 13 12 321030 CASAVA_Build 22 39176573 1I AGCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 198 hom 23 1 15 7 T 13 14 321031 CASAVA_Build 22 39192918 2I ATATTATGCA --/TG TGTATATATA 3070 het 204 hom 38 1 32 5 TG 1 2 321032 CASAVA_Build 22 39264528 1I AAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 2949 het 2685 hom 16 8 7 1 A 10 11 321033 CASAVA_Build 22 39277038 1I CGACCTCAGG -/A GATCCGCCCG 2717 het 1198 hom 17 3 8 6 A 0 1 321034 CASAVA_Build 22 39288167 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 916 het 327 hom 23 7 4 12 A 17 16 321035 CASAVA_Build 22 39351901 4I TTCTCATAAA ----/AAGT GATGATCACA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AAGT 0 1 321036 CASAVA_Build 22 39360045 1D TTTATCAGGA T/- TTTTTTTTTT 2442 het 2442 ref 44 27 6 11 T 15 14 321037 CASAVA_Build 22 39360982 1D ACTACAGATA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 7 6 321038 CASAVA_Build 22 39361301 1D AATAAGTCTT A/- ACGTTACAGG 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 A 2 1 321039 CASAVA_Build 22 39370787 2D TAGGAAACAC TG/-- TGAGTAATAA 3070 het 3070 ref 46 26 17 4 TG 2 1 321040 CASAVA_Build 22 39371167 1D GCAATAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 A 10 9 321041 CASAVA_Build 22 39372309 3I GCTGGGGAAT ---/ATC ATTCCTGGAG 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 ATC 0 1 321042 CASAVA_Build 22 39373559 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2737 het 366 hom 18 1 10 7 A 13 12 321043 CASAVA_Build 22 39378377 1D TTCCCGGGAT G/- GGGCACACAG 1288 het 886 hom 17 7 4 6 G 4 3 321044 CASAVA_Build 22 39379265 1I CTGAGCTGGG -/T CTCAGGTCTA 2187 het 2187 ref 15 9 5 1 T 0 1 321045 CASAVA_Build 22 39379960 3D ACTCTGTCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 2003 het 2003 ref 18 11 5 2 A 15 12 321046 CASAVA_Build 22 39380398 1I AGAGTTATAT -/A AGTAACTCAG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 1 2 321047 CASAVA_Build 22 39383287 1I GCATCTTTGT -/A AAAAAAAAAA 2318 het 1482 hom 13 4 7 2 A 11 12 321048 CASAVA_Build 22 39400633 1I GGAGTGGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 11 11 12 T 12 13 321049 CASAVA_Build 22 39410513 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 69 het 25 0 22 3 A 7 8 321050 CASAVA_Build 22 39420191 1D GTAATTTGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 9 8 321051 CASAVA_Build 22 39427092 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 656 hom 33 3 19 11 T 15 14 321052 CASAVA_Build 22 39430177 6D TTTATTTATT GAGACA/------ GAGTCTCACT 3070 het 1175 hom 17 3 14 0 GAGACA 1 0 321053 CASAVA_Build 22 39434458 1D CCAGGGGAGC G/- GTGGCATCCT 3070 het 3070 hom 41 12 16 13 G 2 1 321054 CASAVA_Build 22 39444059 1I CATTCACCTA -/T TTTTTTTTTC 1299 het 909 hom 13 2 4 7 T 9 10 321055 CASAVA_Build 22 39444319 3I GCCCATTCGC ---/AGA AGATTAGTCG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 AGA 1 2 321056 CASAVA_Build 22 39448504 1I ATTAAAATTC -/T TTTTTTTTTT 2063 het 2063 ref 20 8 5 7 T 11 12 321057 CASAVA_Build 22 39450777 1I GTTTTTTTTT -/G TTTGTTTTTT 3065 het 2094 hom 24 10 11 3 G 0 1 321058 CASAVA_Build 22 39458367 1I AAGGGCTGGG -/A ATTCAAGGTG 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 A 1 2 321059 CASAVA_Build 22 39459138 2D TCACCCTTTA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 CT 6 5 321060 CASAVA_Build 22 39464947 1I ATAACAAACA -/G GACGCAACTG 3070 het 3060 hom 26 7 13 6 G 1 2 321061 CASAVA_Build 22 39466277 3D ATGAAGAAAT AAC/--- AATGTAAGAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 AAC 1 0 321062 CASAVA_Build 22 39467532 1D AGAGTCTCTT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 A 8 7 321063 CASAVA_Build 22 39469781 2D TTCCTGAGAC AG/-- AGTTTTGCTC 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 AG 2 1 321064 CASAVA_Build 22 39472771 1I TGGCTATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 T 11 12 321065 CASAVA_Build 22 39505856 1I TGAAATGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 9 10 321066 CASAVA_Build 22 39513168 1I AAATAAGCAG -/T TAAGACTGTT 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 T 1 2 321067 CASAVA_Build 22 39518197 2D AAAGGGAAAA GG/-- GGAGTTTAAT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 G 4 2 321068 CASAVA_Build 22 39525138 11I CTGGAGTGCA -----------/GTGGCATGGTT GTGGTTTACG 3070 het 3023 hom 31 11 11 9 GTGGCATGGTT 0 1 321069 CASAVA_Build 22 39534032 2I ACTGTTGTGC --/GA GAGAGGCATA 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 GA 2 3 321070 CASAVA_Build 22 39537210 1I TTAATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 11 12 321071 CASAVA_Build 22 39538115 1D AAAGTGCTAT G/- ATTACAGGCG 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 G 1 0 321072 CASAVA_Build 22 39544488 1I GCCAGACCCC -/A AAAAATTTTT 3070 het 2470 hom 27 8 11 8 A 5 6 321073 CASAVA_Build 22 39566286 1D CTACTACTAC T/- TTTTTTTTTT 2845 het 2845 ref 46 22 8 16 T 17 16 321074 CASAVA_Build 22 39571756 1D TTCCTTAGTC A/- AAAAAAAAAA 869 het 869 ref 43 35 2 7 A 12 11 321075 CASAVA_Build 22 39573243 1I CAAACACTTT -/G GGAGGCCAAG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 G 2 3 321076 CASAVA_Build 22 39575863 1I GAAAATTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1266 hom 23 4 12 7 A 13 14 321077 CASAVA_Build 22 39628822 2D GTGCAGACTC CT/-- CTGTTTTTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 CT 2 1 321078 CASAVA_Build 22 39644743 2D GTTTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 771 het 667 hom 24 5 5 15 TG 1 0 321079 CASAVA_Build 22 39674226 1D ACCTGAGACT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 33 2 19 14 G 1 0 321080 CASAVA_Build 22 39678665 4I TGGTAAGAAT ----/CAAA CAAAATTCTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CAAA 1 2 321081 CASAVA_Build 22 39680221 1I TCAAAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1023 hom 16 4 10 2 A 14 15 321082 CASAVA_Build 22 39731829 2I CAGAGAGAGA --/CT CTGTCTCAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 1 2 321083 CASAVA_Build 22 39735224 12D GTTTTGTTGG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 30 1 23 10 T 22 10 321084 CASAVA_Build 22 39740418 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2206 het 564 hom 31 6 6 19 T 17 16 321085 CASAVA_Build 22 39748802 1D CTGCCCCGCT G/- GGAGCGCAAG 3070 hom 66 het 25 0 20 5 G 3 2 321086 CASAVA_Build 22 39758228 1D TCAGCTTATC T/- TTTTTTTTTT 1226 het 1226 ref 20 9 4 7 T 13 12 321087 CASAVA_Build 22 39761852 1I CTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 9 10 321088 CASAVA_Build 22 39765397 1D GTCTCTCTCT A/- AAAAAAAAAA 171 het 171 ref 9 1 1 7 A 11 10 321089 CASAVA_Build 22 39765558 1I AAAAAAAAAA -/G AATGAAAAAA 2360 het 6 hom 11 0 7 4 G 0 1 321090 CASAVA_Build 22 39768753 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 42 23 11 8 TA 6 7 321091 CASAVA_Build 22 39768871 8D TGTATATATG TGTGTATA/-------- TGTGTATATA 2227 het 2227 ref 27 16 5 6 TGTGTATA 2 1 321092 CASAVA_Build 22 39769682 6I AAACTTACAA ------/TGCAAT GTAAGAATTT 2378 het 2378 ref 14 7 5 2 TGCAAT 0 1 321093 CASAVA_Build 22 39770927 6D GCCTCCCAAA GTGCTG/------ GGATTACAGA 2366 het 2366 ref 22 13 7 2 GTGCTG 1 0 321094 CASAVA_Build 22 39779777 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 13 0 9 5 A 10 11 321095 CASAVA_Build 22 39809256 2D CAGGAGTATA TG/-- TGTGTGAATG 3070 hom 59 het 23 0 20 3 TG 4 3 321096 CASAVA_Build 22 39809873 4D CTTCTAACCC TTTA/---- TTTATTTATT 2050 hom 15 het 15 0 6 9 TTTA 5 4 321097 CASAVA_Build 22 39826274 2D AAAATGAAAC GG/-- GGTAAGGATG 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 G 4 2 321098 CASAVA_Build 22 39829918 1I TGTTCAAGAT -/C CCATGCTTGG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 C 2 3 321099 CASAVA_Build 22 39832721 1I AATTTTTAAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 71 het 27 0 22 5 T 7 8 321100 CASAVA_Build 22 39833373 1D CCTTTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 23 0 19 4 A 14 13 321101 CASAVA_Build 22 39833859 4D TTTCCGTGTT AGTC/---- AGGCTGGTCT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AGTC 1 0 321102 CASAVA_Build 22 39836910 1D GTTATAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1560 hom 28 10 12 7 T 17 16 321103 CASAVA_Build 22 39838657 4I AATTTTTATA ----/TTAT TTGTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 TTAT 0 1 321104 CASAVA_Build 22 39840775 1I GATTGGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 41 1 32 8 A 11 12 321105 CASAVA_Build 22 39844758 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AACCTTGATG 3070 hom 55 het 26 0 21 6 AAAG 1 0 321106 CASAVA_Build 22 39849707 4D GGCTTCAAAC TTTG/---- TTTGGGATAT 3070 hom 105 het 39 0 35 7 TTTG 2 1 321107 CASAVA_Build 22 39855119 1I CGCCACCATG -/C GCGGCTAATT 2490 hom 21 het 11 0 8 3 C 0 1 321108 CASAVA_Build 22 39859106 1I AGATTATCCC -/G CCCCCCCACC 1677 hom 10 het 4 0 4 0 G 0 1 321109 CASAVA_Build 22 39875277 3D TTCTGAACAT GAA/--- GAGATTATTC 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 GAA 1 0 321110 CASAVA_Build 22 39876840 1I AACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 873 het 873 ref 25 11 4 10 A 17 18 321111 CASAVA_Build 22 39878721 1I TTCTTTTTTG -/T TTTGGAATCG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 3 4 321112 CASAVA_Build 22 39882385 1I TTAAACTGTT -/A ACTTGGCCGG 2041 hom 21 het 9 0 6 3 A 1 2 321113 CASAVA_Build 22 39898751 4D ATATTGGCTT AGAG/---- AGGTTATTAG 3070 het 3070 hom 46 21 24 2 AG 3 1 321114 CASAVA_Build 22 39900092 1I ATAAAAACAC -/T TGACTGTTCG 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 T 1 2 321115 CASAVA_Build 22 39901223 2I CTGGCCAGAG --/AC ACTGTGAGTG 3070 hom 100 het 38 0 33 5 AC 1 2 321116 CASAVA_Build 22 39904916 3D GAGACACCTT GTA/--- GTATTTTGGG 3070 het 3070 hom 35 12 17 8 GTA 2 1 321117 CASAVA_Build 22 39915027 4D AGTTTGGCCA TTTC/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 TTTC 1 0 321118 CASAVA_Build 22 39915177 1I ACAGGTATGC -/A ATCACCATGC 2835 het 2246 hom 11 5 6 0 A 1 2 321119 CASAVA_Build 22 39947107 1I CAGTGGAGGT -/G TTGTCAGTCT 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 G 0 1 321120 CASAVA_Build 22 39957422 2D CCCCAAAGAC TG/-- TGAGTTCCCC 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 TG 2 1 321121 CASAVA_Build 22 39975447 1D AAAGTCACCT G/- GGGGGGCCCC 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 G 7 6 321122 CASAVA_Build 22 39988551 1I ACAGCCATCC -/T TTGAGGAACA 3070 het 3070 ref 49 24 15 10 T 2 3 321123 CASAVA_Build 22 39989971 2D CTGTTACTTC TG/-- TGTCCCCAGC 3070 het 3070 hom 41 18 20 5 TG 2 1 321124 CASAVA_Build 22 39990239 1D TGTGACGGTG C/- CCCCCCTGAG 3070 het 3070 ref 31 15 11 6 C 7 6 321125 CASAVA_Build 22 39992203 17I ACTGACCTCT -----------------/AGCCCTGAAGCAACCAC AGCTGCTCAA 2716 het 2716 ref 25 11 8 6 AGCCCTGAAGCAACCAC 0 1 321126 CASAVA_Build 22 39996890 1D CTAATGAGCT G/- AACAGTCAGC 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 G 1 0 321127 CASAVA_Build 22 40009847 2D TACTTGCCAC AT/-- AGAGCCTGGC 3070 het 3070 ref 42 19 20 3 AT 1 0 321128 CASAVA_Build 22 40039140 4D GCGATATCAG CTCA/---- CTACAACCTC 2250 het 1629 hom 11 4 5 2 CTCA 1 0 321129 CASAVA_Build 22 40065576 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1083 het 1083 ref 18 11 3 4 A 13 12 321130 CASAVA_Build 22 40091330 6D ATTAAATGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 TG 9 6 321131 CASAVA_Build 22 40133582 2I ATAGGAAAAC --/TG AGGTTCAGAA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 TG 0 1 321132 CASAVA_Build 22 40135632 1I CAACAAGAGC -/A AAAAAAAAAA 166 hom 7 het 9 0 3 6 A 13 14 321133 CASAVA_Build 22 40147253 1I TGAAAGTCTC -/A AAAAATAAAA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 A 5 6 321134 CASAVA_Build 22 40151910 1I AGAGTCACTT -/A ACACTTGCTG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 1 2 321135 CASAVA_Build 22 40161429 2D CAAACCAAAT AC/-- ACACACACAC 1288 het 1288 ref 46 33 4 11 AC 7 6 321136 CASAVA_Build 22 40166069 11D TTTTTCTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTGAGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 17 6 321137 CASAVA_Build 22 40166209 5I CTGGGATTAC -----/AGGCG AGGCGTGCAC 2236 hom 15 het 7 0 6 1 AGGCG 1 2 321138 CASAVA_Build 22 40166820 1I TCCAGCCTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 62 het 27 0 21 6 T 9 10 321139 CASAVA_Build 22 40177470 2D CTCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1762 het 45 hom 10 1 4 5 A 16 14 321140 CASAVA_Build 22 40187344 1I TATGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 2373 het 441 hom 21 1 10 10 T 13 14 321141 CASAVA_Build 22 40192987 1D AACAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 26 0 19 7 T 13 12 321142 CASAVA_Build 22 40193628 20D TCCTGCCATG GGGAAATATACTAGTCTCCT/-------------------- GGGAAATACA 3070 het 3070 hom 40 14 19 9 GGGAAATATACTAGTCTCCT 1 0 321143 CASAVA_Build 22 40195790 4D TTTCTCATTT GATA/---- GATGATAAAG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 GATA 1 0 321144 CASAVA_Build 22 40197052 4I CTGAATCCAT ----/TGTC TGTCCATTGG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 TGTC 1 2 321145 CASAVA_Build 22 40212055 2I TCCTGCCCCT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 41 20 10 11 TG 7 8 321146 CASAVA_Build 22 40239565 1I ACATTATGTT -/C CCAGCATCTG 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 C 2 3 321147 CASAVA_Build 22 40263233 3D TCTATTACTG TTA/--- TTATACTGTG 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 TTA 2 1 321148 CASAVA_Build 22 40278527 40I GTAGTATTGA ----------------------------------------/GATCACAGCTCACTGCAGCCTCTACCTCCTAGGCTCAAGT GATCCTCCCA 3070 hom 54 het 18 0 17 5 GATCACAGCTCACTGCAGCCTCTACCTCCTAGGCTCAAGT 0 1 321149 CASAVA_Build 22 40325168 3D GTGAAGTGGC AAG/--- AAGTTGTGGC 3070 het 3070 ref 50 23 21 9 AAG 2 1 321150 CASAVA_Build 22 40338465 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 23 1 16 6 A 14 15 321151 CASAVA_Build 22 40361659 1I AATTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 83 hom 31 2 18 11 T 9 10 321152 CASAVA_Build 22 40367256 1D ATTAAACTTA C/- GCTTTTTAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 0 321153 CASAVA_Build 22 40374956 3I TGGAGGCTGA ---/AAC AGGAGGATCA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAC 0 1 321154 CASAVA_Build 22 40375800 1D AAAAAAAAAA T/- AATAATAAAT 2260 hom 15 het 8 0 6 2 T 1 0 321155 CASAVA_Build 22 40378197 3D CTAGACCCTA TCT/--- TCTTTTGTGC 3070 hom 114 het 39 0 37 2 TCT 2 1 321156 CASAVA_Build 22 40378649 2I GTTTTGAAAC --/AG AGTCTCACTC 3070 hom 77 het 30 0 22 8 AG 1 2 321157 CASAVA_Build 22 40393770 2D TATTTATTTA TT/-- TGTTTGTTTG 3070 hom 50 het 27 0 15 12 T 3 1 321158 CASAVA_Build 22 40405629 2D GAAAAACAGC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 11 9 321159 CASAVA_Build 22 40407941 1D AATTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 24 1 19 4 T 11 10 321160 CASAVA_Build 22 40417541 1D TCTCTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 2 A 11 10 321161 CASAVA_Build 22 40420974 2I CAGGGAGATA --/AG AGAGAAGGAT 3070 hom 114 het 44 0 38 6 AG 2 3 321162 CASAVA_Build 22 40440667 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 15 14 321163 CASAVA_Build 22 40442306 24D CCATTCATTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 36 0 20 16 T 38 14 321164 CASAVA_Build 22 40447515 1D AATTAAAAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 34 het 18 0 12 6 T 9 8 321165 CASAVA_Build 22 40449169 1D TCTGACTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 T 12 11 321166 CASAVA_Build 22 40452701 1D TTTCTTTTAT A/- AAAGAGAACA 3070 hom 50 het 21 0 17 4 A 4 3 321167 CASAVA_Build 22 40453562 1D AAAGGTTCCC A/- AAGACTACCC 3070 hom 130 het 47 0 42 6 A 3 2 321168 CASAVA_Build 22 40457472 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 7 8 321169 CASAVA_Build 22 40469408 1D CTAAGCCTAG A/- ACAGTAAATT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 2 1 321170 CASAVA_Build 22 40470615 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 712 het 106 hom 4 1 3 0 T 7 8 321171 CASAVA_Build 22 40470747 4I CGCGCCCGGC ----/TTTG CTATGATTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TTTG 0 1 321172 CASAVA_Build 22 40474459 1I TACAGTGAGA -/C CCCCATCTCT 3070 hom 48 het 31 0 24 7 C 4 5 321173 CASAVA_Build 22 40475230 1D GATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 17 0 12 5 T 13 12 321174 CASAVA_Build 22 40489481 3I GGAGGAAGAG ---/ATT ATTATTTGCA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 ATT 2 3 321175 CASAVA_Build 22 40495427 1I TATTAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 21 1 16 4 T 13 14 321176 CASAVA_Build 22 40497561 1I AATTTTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 17 9 T 10 11 321177 CASAVA_Build 22 40503109 1I TTAAAAATAA -/T TTTTTTTTTT 2974 het 531 hom 35 3 15 17 T 15 16 321178 CASAVA_Build 22 40504252 1I TACTATTACA -/T TTGGGGGTTA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 3 321179 CASAVA_Build 22 40527024 4I AGAGGCTGAA ----/AAAG AAAGTGAGTT 1770 het 1770 ref 23 6 8 9 AAAG 1 2 321180 CASAVA_Build 22 40557753 1D GGATTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 11 11 T 11 10 321181 CASAVA_Build 22 40560296 2D ACTTCTTCCT CA/-- CAACAATCCT 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 CA 2 1 321182 CASAVA_Build 22 40563809 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2861 het 456 hom 15 2 8 5 A 17 16 321183 CASAVA_Build 22 40573871 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTTT 3044 het 907 hom 13 3 8 2 T 13 14 321184 CASAVA_Build 22 40576701 6D TTTTTCTTTC TTTTTG/------ TTTTTTTTGA 2121 het 2121 ref 15 11 6 1 TTTTTG 1 0 321185 CASAVA_Build 22 40610011 1I CCCAACATGT -/G GTTCAGCTGT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 G 1 2 321186 CASAVA_Build 22 40679033 1D CACTTTGGAT A/- ATCAGTGCAC 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 A 2 1 321187 CASAVA_Build 22 40686258 1I AGCTACCAGT -/C CCTTGCTCTG 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 C 2 3 321188 CASAVA_Build 22 40716532 1I CGTCTCTACT -/A AAAAATACAA 926 hom 7 het 3 0 3 0 A 5 6 321189 CASAVA_Build 22 40717062 1I TCAAATAGAA -/C AATGAAGAGG 3070 hom 96 het 40 0 31 9 C 0 1 321190 CASAVA_Build 22 40728796 5D GGATAGAAAC TACTT/----- TAAAGAACCA 3070 het 3070 ref 28 15 10 7 TACTT 1 0 321191 CASAVA_Build 22 40729163 2D TCTCTCCAGA GG/-- GGTAACCTGC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 4 2 321192 CASAVA_Build 22 40733800 1D TGAATAGTGC T/- GCTATCAACA 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 T 1 0 321193 CASAVA_Build 22 40742272 1I CCTCATCAGT -/C CCCGGGAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 C 3 4 321194 CASAVA_Build 22 40749140 4D AAAAGTGGTG TTTT/---- TTTTTTTTGG 3070 het 460 hom 29 3 13 13 T 12 8 321195 CASAVA_Build 22 40762128 1I ATATGTTCTA -/T TTTTTTTTTT 1329 het 1329 ref 36 23 3 10 T 11 12 321196 CASAVA_Build 22 40763410 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 2789 het 2789 ref 26 18 7 1 T 10 11 321197 CASAVA_Build 22 40769682 1D TGGAGCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 13 12 321198 CASAVA_Build 22 40772487 4D GTTTTATGAA TTTT/---- TTGTCACATC 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 6 2 321199 CASAVA_Build 22 40782237 1D AAAATTTTGC T/- TCTTATATAG 3070 hom 99 het 34 0 34 1 T 2 1 321200 CASAVA_Build 22 40783502 1D AGAATTCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 T 12 11 321201 CASAVA_Build 22 40784440 1D TATTTAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 46 0 35 11 A 11 10 321202 CASAVA_Build 22 40817560 1I GGTAGGTACC -/A TCAGCATCCC 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 A 0 1 321203 CASAVA_Build 22 40852082 3I GGGAGGTGAC ---/TGT TGTGATGGTG 3070 hom 90 het 34 0 27 7 TGT 1 2 321204 CASAVA_Build 22 40860041 1I ATTTTTTAAA -/T TTTTTTGTAG 3024 het 3024 ref 26 12 9 5 T 6 7 321205 CASAVA_Build 22 40861009 3D AAAAAACAAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 6 AAC 3 2 321206 CASAVA_Build 22 40864809 2D ATTAGCACTC TG/-- TATCTAGCTA 3070 het 2948 hom 24 7 16 2 TG 1 0 321207 CASAVA_Build 22 40885056 1I AAACTACTTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 7 8 321208 CASAVA_Build 22 40893470 1D ACAAGGTACA T/- TTTGGTTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 T 4 3 321209 CASAVA_Build 22 40899077 1D AGAGTAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 A 12 11 321210 CASAVA_Build 22 40899192 1I AATACATTAA -/T TTAAAAAAAA 2404 het 1651 hom 22 9 11 2 T 2 3 321211 CASAVA_Build 22 40902329 1D CTGGAAGGAA G/- GGGGGGGCAG 3070 het 3070 hom 52 18 23 11 G 8 7 321212 CASAVA_Build 22 40916742 3I TACACTTTAT ---/TGA TGATGTTTAA 3070 hom 163 het 63 0 55 8 TGA 1 2 321213 CASAVA_Build 22 40925917 4I CTCTGGGTTT ----/TTTC TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 TTTC 0 1 321214 CASAVA_Build 22 40944768 3I TTCTTAGGTC ---/TGT TGTTCTCAGC 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 TGT 1 2 321215 CASAVA_Build 22 40944849 1D TATGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 12 11 321216 CASAVA_Build 22 40948439 1I CACCATCACA -/C CCCCCCCATA 3070 het 3070 ref 46 21 13 12 C 7 8 321217 CASAVA_Build 22 40965429 1I TCTCTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 378 hom 19 1 12 6 A 13 14 321218 CASAVA_Build 22 40970867 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 2397 hom 32 7 22 3 A 9 8 321219 CASAVA_Build 22 40978062 1I TCTACCTGTA -/T TTTTTTTTTG 2380 het 874 hom 10 2 6 2 T 9 10 321220 CASAVA_Build 22 40994107 5I ATAAATAAGT -----/AAATA AAATAAAAGG 3070 het 2311 hom 18 5 11 2 AAATA 1 2 321221 CASAVA_Build 22 40999078 2I GGGAGGCCAA --/GG GGGGGGTGTA 2588 het 2588 ref 21 8 10 3 G 6 8 321222 CASAVA_Build 22 40999586 1I AAAGAACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 11 12 321223 CASAVA_Build 22 41008850 3I GCCAAATAAA ---/GCG GCCCCACGCC 2560 het 1498 hom 21 7 9 5 GCG 0 1 321224 CASAVA_Build 22 41042613 2I GTCCTGAACT --/CC TGACTTCAAG 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 C 0 2 321225 CASAVA_Build 22 41064383 1I GGGGTGCCCA -/G GGGGGCCTCA 3070 hom 47 het 19 0 13 6 G 5 6 321226 CASAVA_Build 22 41085990 4I GGCACTTAAG ----/CCTT CCTTCCCCAA 3070 hom 84 het 40 0 29 11 CCTT 1 2 321227 CASAVA_Build 22 41096728 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 3 A 11 10 321228 CASAVA_Build 22 41099759 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 40 het 24 0 21 3 T 9 8 321229 CASAVA_Build 22 41103133 1D TCCTGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 35 1 24 10 A 11 10 321230 CASAVA_Build 22 41114162 1I CGGCTCTGAC -/T TGCGCCAGCC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 1 2 321231 CASAVA_Build 22 41121902 1I CCTTTACCCT -/A AAAACCTTAT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 4 5 321232 CASAVA_Build 22 41122434 4D TTTCTTCTTT TATA/---- TATATATATA 3070 het 166 hom 35 3 14 18 TA 9 7 321233 CASAVA_Build 22 41136609 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2994 het 1773 hom 20 7 8 5 A 15 14 321234 CASAVA_Build 22 41147148 1I CGCCTGTAAT -/C CCCAGCACTC 3070 hom 45 het 20 0 13 7 C 3 4 321235 CASAVA_Build 22 41147830 11I CGATCGGGGC -----------/TGTTGGTTTTA TCTCAGAGCC 3070 hom 90 het 34 0 28 6 TGTTGGTTTTA 0 1 321236 CASAVA_Build 22 41151222 1D ATTCCAGTCT C/- CCTCAGCCTT 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 C 3 2 321237 CASAVA_Build 22 41161299 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 596 het 461 hom 19 4 4 13 T 16 14 321238 CASAVA_Build 22 41192748 18D TTTTTTTGTA TTTTTAGTAGAGACGGGG/------------------ TTTTGCCATG 1226 het 1226 ref 8 4 4 0 TTTTTAGTAGAGACGGGG 1 0 321239 CASAVA_Build 22 41198049 3D TGCCAGGCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2579 het 1194 hom 15 5 8 2 T 14 11 321240 CASAVA_Build 22 41200955 2D7M1D TAGAGTGAGA CTCTGTCTCA/--CTGTCTC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 5 N/A 0 0 321241 CASAVA_Build 22 41215557 2D ACTCCGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 1550 het 18 hom 13 1 5 7 A 16 14 321242 CASAVA_Build 22 41223617 1D AACAGGTTTC A/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 A 1 0 321243 CASAVA_Build 22 41254850 1I TCTGCTCCAA -/G GGGTAGACAC 3070 het 2300 hom 29 6 14 9 G 3 4 321244 CASAVA_Build 22 41257164 1D TCAGTATGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 16 14 8 A 10 9 321245 CASAVA_Build 22 41266556 2D ACAAGGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 1228 het 1228 ref 26 15 4 7 TG 8 7 321246 CASAVA_Build 22 41289945 1I ATCGCTTGAA -/C CCGGGAGGTG 3070 hom 62 het 23 0 20 3 C 2 3 321247 CASAVA_Build 22 41290910 4I ACCATGCTCG ----/GCGC GCGCGCGCGT 357 het 357 ref 36 15 4 17 GC 4 6 321248 CASAVA_Build 22 41294163 1D TGTAGAGACA G/- GGTCTTGCCA 3070 het 1834 hom 24 5 15 4 G 3 2 321249 CASAVA_Build 22 41294297 13I TCTAGATGAA -------------/CAGCTAGTTATTC CAATACCAGC 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 CAGCTAGTTATTC 0 1 321250 CASAVA_Build 22 41295114 1I CATTTCACAA -/G TTTTCGTATC 3070 hom 35 het 21 0 14 7 G 0 1 321251 CASAVA_Build 22 41308532 5D GCTCCTGAGT AGCTG/----- AGCTAATTTT 3070 het 3070 ref 41 25 13 5 AGCTG 1 0 321252 CASAVA_Build 22 41310362 1I TCTGGTTTTT -/C TTCACTGGGC 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 C 0 1 321253 CASAVA_Build 22 41312291 1I TTTTGTGGGG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 7 8 321254 CASAVA_Build 22 41315865 1I ACAATGAAAC -/A GCACTTAAAC 3070 hom 80 het 32 0 27 5 A 0 1 321255 CASAVA_Build 22 41320944 14D TGCAGAAGAG TGAAGCAGCTGGGC/-------------- TGACTGCTAT 3070 het 3070 ref 34 22 12 7 TGAAGCAGCTGGGC 1 0 321256 CASAVA_Build 22 41329339 21D GGGCTGGCAA GTTTTATTCCTAGTTAAGAGT/--------------------- GTTTTGCTTC 3070 het 3070 ref 36 18 18 4 GTTTTATTCCTAGTTAAGAGT 1 0 321257 CASAVA_Build 22 41343231 4D TCCCAAAAAT AATA/---- AATAAAGGTG 3070 het 3070 ref 33 21 8 7 AATA 2 1 321258 CASAVA_Build 22 41343648 3D CCCCGTCCCC TCT/--- TCTTCCCCAC 1482 het 1482 ref 28 9 5 14 TCT 2 1 321259 CASAVA_Build 22 41348026 1I GCACGCGACA -/C CACGCCCAGC 3070 het 1109 hom 15 4 10 1 C 1 2 321260 CASAVA_Build 22 41349001 15D GCTCCAATTT ACCGCAGTTGCCGCC/--------------- ACTCCCTAGT 3070 het 3070 hom 39 15 18 11 ACCGCAGTTGCCGCC 1 0 321261 CASAVA_Build 22 41352777 4D CAGCAGGCCA GGGC/---- GGGCAGGCAG 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 GGGC 2 1 321262 CASAVA_Build 22 41360148 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1149 het 1149 ref 14 4 4 6 A 14 15 321263 CASAVA_Build 22 41365794 2D CTTGATTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 51 0 37 15 T 14 12 321264 CASAVA_Build 22 41368067 1D ATAAGAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 37 1 23 13 T 13 12 321265 CASAVA_Build 22 41373524 29I ATGGCGAAGC -----------------------------/CCTGTCTCTACTAAAAGTACAAAAAATAG CCAGGTGTGA 3070 hom 27 het 11 0 9 2 CCTGTCTCTACTAAAAGTACAAAAAATAG 0 1 321266 CASAVA_Build 22 41374152 25D TTTTGCCTGG ATCCCCAAGGAGGAGACTCCAGGTC/------------------------- CTCCCCAAGG 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 ATCCCCAAGGAGGAGACTCCAGGTC 1 0 321267 CASAVA_Build 22 41374228 6D ATGCCAGGCA TAGAGG/------ TAGAGGTGGA 3070 hom 67 het 26 0 22 5 TAGAGG 2 1 321268 CASAVA_Build 22 41374803 2I CACACACACA --/CC CCCCATCACA 3070 het 3070 ref 40 17 11 12 C 4 6 321269 CASAVA_Build 22 41378897 1I TCTCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 1589 het 1197 hom 14 4 6 4 A 13 14 321270 CASAVA_Build 22 41380275 1D CTAGCTATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 10 9 321271 CASAVA_Build 22 41393022 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 A 11 12 321272 CASAVA_Build 22 41394950 5D35M1I ATATATATTT TTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTCCTTTTCTTTTTTTTTT-/-----TTTTCTTTTCTTTTCTTTCCTTTTCTTTTTTTTTTC TTCTCTTTTT 1463 het 1146 hom 22 9 8 11 N/A 0 0 321273 CASAVA_Build 22 41402935 1D CTCCGTCTCG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 A 10 9 321274 CASAVA_Build 22 41407565 1D TCCCAGCTAA T/- TTTTTTGTAT 1165 het 1026 hom 7 3 3 1 T 7 6 321275 CASAVA_Build 22 41408919 2D ATTTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 2913 hom 21 8 11 3 T 11 9 321276 CASAVA_Build 22 41410291 1D2M1D3M1D GAGACAGAGG TGCTCTAT/-GC-CTA- GGACAGAGGA 1632 het 1632 ref 42 26 6 13 N/A 0 0 321277 CASAVA_Build 22 41413643 27D TAAATGGGCC AGGATCCAGCTGGCCAGAAATAAGAGT/--------------------------- AGGATCCAGC 1675 het 1675 ref 14 10 4 4 AGGATCCAGCTGGCCAGAAATAAGAGT 2 1 321278 CASAVA_Build 22 41421141 2I CCATCGACTC --/AG TGACTTCTAC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 AG 0 1 321279 CASAVA_Build 22 41424890 6D AATGCCATCG CAACGT/------ CAGGAAGTTA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 CAACGT 1 0 321280 CASAVA_Build 22 41430445 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAATAA 1805 het 1805 ref 17 7 5 5 A 8 7 321281 CASAVA_Build 22 41432745 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1127 hom 18 4 13 2 A 13 12 321282 CASAVA_Build 22 41436975 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 13 12 321283 CASAVA_Build 22 41440696 1I TACAGGCTGG -/A AAAAAAGAAA 2040 het 2040 ref 16 6 6 4 A 6 7 321284 CASAVA_Build 22 41447320 1I CATCTTCACA -/G CATATTGCTA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 G 0 1 321285 CASAVA_Build 22 41457472 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1572 het 1572 ref 28 12 5 11 A 11 12 321286 CASAVA_Build 22 41457758 2D AATTATACTC TT/-- GTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 30 0 25 6 T 2 0 321287 CASAVA_Build 22 41466363 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 12 11 321288 CASAVA_Build 22 41481645 1I GCAAAACTCC -/A TCTCAAAAAA 3070 het 506 hom 26 2 18 6 A 0 1 321289 CASAVA_Build 22 41483426 1I TCTCAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1018 het 1018 ref 20 11 5 4 A 13 14 321290 CASAVA_Build 22 41487752 1D TTTATTATTA T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 8 7 321291 CASAVA_Build 22 41489296 1I31M2I ACTCCAGCCT -GGTGACAGACCGAGACTCTGTCTCAAAAAAC--/GGGTGACAGACCGAGACTCTGTCTCAAAAAACAG ACAAACGCAA 3070 hom 48 het 17 0 17 7 N/A 0 0 321292 CASAVA_Build 22 41489432 1D GCTTTTTACA T/- TTTTTGCAGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 6 5 321293 CASAVA_Build 22 41489598 4I11M1D TTAACTTTTC ----TCTTTTTTTTCT/TTCTTCTTTTTTTTC- TTTTTTTTGA 3070 hom 39 het 13 0 14 0 N/A 0 0 321294 CASAVA_Build 22 41494129 1I TGCTTGGACT -/A TTGGAAAAGG 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 0 1 321295 CASAVA_Build 22 41494249 2I GGGAAGATGT --/TA TGTTACAAGA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 TA 0 1 321296 CASAVA_Build 22 41496457 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 9 8 321297 CASAVA_Build 22 41501500 1I GACAGAGTCT -/C ACTCTGTCCC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 0 1 321298 CASAVA_Build 22 41511696 3D CTTCCACCTC CTT/--- CTCTCTGCAT 3070 het 2287 hom 23 6 10 7 CTT 1 0 321299 CASAVA_Build 22 41512018 1D TGTAGCCCTC A/- ACGTGAAATG 3070 het 3070 ref 41 20 13 9 A 2 1 321300 CASAVA_Build 22 41532282 1I GTCAGGGGGA -/T GGGGAAGTCG 3070 het 3041 hom 26 10 13 3 T 0 1 321301 CASAVA_Build 22 41542409 2D TCACAGGTTC AT/-- TTTGTGCCTT 3070 het 3070 ref 51 24 20 8 AT 1 0 321302 CASAVA_Build 22 41546694 3I ACCCTCCGCC ---/CTT CTTCTCTCCT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 CTT 1 2 321303 CASAVA_Build 22 41549438 15D AATAAGTATA ACATTAATCTCTTTG/--------------- ACATTAATCT 3070 het 2052 hom 22 6 12 7 ACATTAATCTCTTTG 2 1 321304 CASAVA_Build 22 41549886 1D AGAAAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 T 11 10 321305 CASAVA_Build 22 41549962 1I AGGAGCATTT -/A AAAAAATATA 3070 het 133 hom 14 3 10 1 A 6 7 321306 CASAVA_Build 22 41553040 2I TCAGTGCTAC --/AT ATCTTATCCA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 1 2 321307 CASAVA_Build 22 41555497 1D AAAAGAATGT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 16 6 G 2 1 321308 CASAVA_Build 22 41556223 1I GTGCACAACC -/A TGCCTGGCTA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 0 1 321309 CASAVA_Build 22 41575431 1D GCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2254 hom 29 11 15 3 T 10 9 321310 CASAVA_Build 22 41578178 1D CTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 5 T 11 10 321311 CASAVA_Build 22 41580908 1I TACAGAATAT -/A AAATTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 17 13 6 A 3 4 321312 CASAVA_Build 22 41583931 2I CGCCCGACTC --/TT TTTTTAATTC 3070 hom 56 het 24 0 17 7 T 5 7 321313 CASAVA_Build 22 41590449 1D GATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 992 het 992 ref 29 20 3 6 T 10 9 321314 CASAVA_Build 22 41591659 2D CCTGGCTGTC TT/-- TGCCCAGAAG 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 T 3 1 321315 CASAVA_Build 22 41597281 1I CCGCCTCCGT -/C CCCCCCGCTG 3070 hom 55 het 23 0 16 7 C 6 7 321316 CASAVA_Build 22 41597886 2I TCCAGGCTGC --/GA GAGGGGAAGG 3070 hom 82 het 32 0 27 5 GA 1 2 321317 CASAVA_Build 22 41599749 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 44 1 30 13 T 13 14 321318 CASAVA_Build 22 41601749 1D GCCTCCCAAA G/- GTGCTGGGAT 3070 hom 42 het 18 0 15 4 G 2 1 321319 CASAVA_Build 22 41606774 1I GCCCCTCTTT -/G GGGTATAATG 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 G 3 4 321320 CASAVA_Build 22 41613570 1I CACACCCCCC -/A AGCCCTCACC 2702 het 1670 hom 23 5 8 10 A 1 2 321321 CASAVA_Build 22 41630668 1D GCTTCCACAG C/- CCCCCCATAC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 C 7 6 321322 CASAVA_Build 22 41634320 4D CAGAGCCTAC TGAA/---- TGAAGGTAAG 3070 hom 56 het 22 0 18 6 TGAA 2 1 321323 CASAVA_Build 22 41648363 1D ACATTCTGAG T/- AAAAAGACCA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 T 1 0 321324 CASAVA_Build 22 41652795 1D CCTATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2789 hom 32 12 12 8 A 13 12 321325 CASAVA_Build 22 41660850 1D CTTTCTTTTC T/- TTTCTTTCTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 4 3 321326 CASAVA_Build 22 41667170 4I TGCAGCATGT ----/GTCA GTATTTCACT 3070 hom 122 het 47 0 37 10 GTCA 0 1 321327 CASAVA_Build 22 41671176 1D TGACAGAAGC A/- AAATCAGTGG 3070 hom 87 het 34 0 27 8 A 4 3 321328 CASAVA_Build 22 41683371 1I CTCCCCAAGG -/T TATTTTAAGG 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 T 1 2 321329 CASAVA_Build 22 41689797 1I ATTTCTACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 9 10 321330 CASAVA_Build 22 41689887 2I TATAATTCAC --/AT GTCACACAGT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AT 0 1 321331 CASAVA_Build 22 41693064 1D TCCGTAACAG A/- AACTAGGCAG 3070 hom 108 het 39 0 32 8 A 3 2 321332 CASAVA_Build 22 41695873 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 658 hom 33 2 21 10 A 10 9 321333 CASAVA_Build 22 41699378 1D TACCACACTG T/- TTTTTGTCAA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 6 5 321334 CASAVA_Build 22 41701562 1I ATAAGTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 10 11 321335 CASAVA_Build 22 41702413 12I CAGGATCATC ------------/TGGGGGTTCACA GATTTGAGGC 3070 hom 129 het 52 0 40 12 TGGGGGTTCACA 0 1 321336 CASAVA_Build 22 41703125 6D ATTTTTACAA AGAAAT/------ AGAAATAGAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 7 AGAAAT 3 2 321337 CASAVA_Build 22 41711567 2D TTTGCAAAAC AT/-- AAAGATAACA 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 AT 1 0 321338 CASAVA_Build 22 41714837 1D GTCAAAGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 8 T 11 10 321339 CASAVA_Build 22 41715819 1D GAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 2096 het 401 hom 16 3 7 6 T 1 0 321340 CASAVA_Build 22 41715966 38D ACATATATAT ACACACATATGTATATATATGTATATATATATATATAC/-------------------------------------- ACACACATAT 3070 hom 51 het 13 0 17 5 ACACACATATGTATATATATGTATATATATATATATAC 1 0 321341 CASAVA_Build 22 41716092 1D AAATGAATGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 7 6 321342 CASAVA_Build 22 41734961 1D TCACATACAG A/- AAAGGTGTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 4 3 321343 CASAVA_Build 22 41754156 1I GCTGAGTGAT -/G GGGCCGGGCC 3070 hom 136 het 53 0 42 11 G 3 4 321344 CASAVA_Build 22 41807903 2D GGGATCAAGC GA/-- GATTCTCCTG 2932 het 813 hom 16 4 7 5 GA 2 1 321345 CASAVA_Build 22 41812080 1I GCTTCCTCCT -/A AAAACAGAAA 3070 het 3070 hom 47 18 19 10 A 4 5 321346 CASAVA_Build 22 41814454 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1067 hom 10 het 5 0 4 1 T 13 12 321347 CASAVA_Build 22 41815843 1D CGCCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 1155 hom 18 6 9 3 C 3 2 321348 CASAVA_Build 22 41816821 1I AAAAAAAGTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 23 13 10 0 A 8 9 321349 CASAVA_Build 22 41817632 1I GTCTAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 A 8 9 321350 CASAVA_Build 22 41821663 2D GCATGGGTGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 156 het 61 0 51 10 TG 6 5 321351 CASAVA_Build 22 41826781 1D CTGATAGACC A/- GGGGAAGGTT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 A 1 0 321352 CASAVA_Build 22 41833772 1D CACACATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 27 0 18 9 T 15 14 321353 CASAVA_Build 22 41839568 1I AACCGTGTAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 9 10 321354 CASAVA_Build 22 41842415 1D ATTAAATGCA T/- TTTTTTTTTT 2984 het 2984 ref 28 13 8 7 T 13 12 321355 CASAVA_Build 22 41853866 2I TGCCTTGACA --/CT CTGGGGCTAT 3070 hom 83 het 30 0 23 7 CT 1 2 321356 CASAVA_Build 22 41854432 2D TCCCCCCATC CT/-- CTTTGTCTAT 3070 het 1899 hom 25 8 14 3 CT 2 1 321357 CASAVA_Build 22 41856075 1I CCTGGGCCTT -/G GCCTCGTGCC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 G 1 2 321358 CASAVA_Build 22 41870070 3D GCTCTCTTTT ATA/--- ATGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 8 ATA 1 0 321359 CASAVA_Build 22 41891089 1I TTATTTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2661 hom 19 7 10 2 T 9 10 321360 CASAVA_Build 22 41932602 3I AGGTGGGGGA ---/AAG AAGAAGGGGC 1686 het 1686 ref 16 8 4 4 AAG 2 3 321361 CASAVA_Build 22 41941870 2I CACACACATG --/CA CACACGTGTG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 CA 2 3 321362 CASAVA_Build 22 41943981 3D ACTCCTTGTC CCT/--- CCTCAGACTG 3070 het 3070 ref 28 11 12 6 CCT 2 1 321363 CASAVA_Build 22 41948577 1D TGGACAGGCC G/- GGGGGGTTAC 3070 het 2947 hom 28 12 9 7 G 7 6 321364 CASAVA_Build 22 42026302 6I CTCATTATGG ------/TTTTGA TTTTGATTTT 3070 het 3070 ref 27 10 11 6 TTTTGA 1 2 321365 CASAVA_Build 22 42030487 2I TCTAAGCCAC --/AT GAGGACCAGT 3070 hom 187 het 64 0 61 3 AT 0 1 321366 CASAVA_Build 22 42033909 1D GGCTGGCAGG A/- AGAACCATCT 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 A 2 1 321367 CASAVA_Build 22 42034026 1D AAGGTCTGAA C/- CAGTCTGCCT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 C 2 1 321368 CASAVA_Build 22 42040970 1D GAAATATTGA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 93 het 43 0 31 12 T 8 7 321369 CASAVA_Build 22 42054224 2I CGTTGGCGCG --/TC TGTGAGATGG 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 TC 0 1 321370 CASAVA_Build 22 42062908 2D TGTGTATGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 57 18 27 12 TG 9 8 321371 CASAVA_Build 22 42066586 1I GATGAGGAAA -/C TGAGGCCCAG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 C 0 1 321372 CASAVA_Build 22 42070385 2I CTCTTTTCTC --/TT TTTTTGTCCA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 T 5 7 321373 CASAVA_Build 22 42088274 1D ACACAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 620 hom 37 2 24 11 T 15 14 321374 CASAVA_Build 22 42094257 2I TTCCCCTCCG --/AA ATGTGAAATT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 A 1 3 321375 CASAVA_Build 22 42108127 8I AGAGGAGTGT --------/TTATAAGA TTATAATCTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 8 TTATAAGA 0 1 321376 CASAVA_Build 22 42125052 2D GCTCACCCTC TA/-- TCTCTCCCTG 3070 hom 70 het 28 0 20 9 TA 1 0 321377 CASAVA_Build 22 42145533 1I AGGTGCTGAG -/C TTCACCTGAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 0 1 321378 CASAVA_Build 22 42148975 1I TTAGTGGAGA -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 G 4 5 321379 CASAVA_Build 22 42150626 1D CTGTGGGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 33 0 24 9 T 10 9 321380 CASAVA_Build 22 42159627 1I ATATTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 10 11 321381 CASAVA_Build 22 42175720 1D AGTTCCAGGC G/- GATGCAGCAT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 G 2 1 321382 CASAVA_Build 22 42176568 1I GATGGTAGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 9 10 321383 CASAVA_Build 22 42186134 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 1798 hom 17 6 9 2 A 8 9 321384 CASAVA_Build 22 42195277 21D CTGGGAATCG TATCTATGTTCGGGTTGGTAA/--------------------- GAACTGCAGG 1947 het 1947 ref 40 25 7 15 TATCTATGTTCGGGTTGGTAA 1 0 321385 CASAVA_Build 22 42204441 1D AGACTTGAGA G/- GGCCTGGGGC 2380 het 2380 ref 26 9 8 10 G 3 2 321386 CASAVA_Build 22 42206651 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 922 het 922 ref 27 18 3 6 T 15 14 321387 CASAVA_Build 22 42214083 1D CCCCCCAAGG C/- CCCAGCACTC 2568 het 2492 hom 23 7 10 6 C 4 3 321388 CASAVA_Build 22 42232175 3D ATGGTGGTGG TGA/--- TGATAAAGGT 3070 hom 212 het 76 0 61 18 TGA 2 1 321389 CASAVA_Build 22 42235001 1D GTGGCTGTAA T/- TTTTTTTTTT 2337 het 2337 ref 38 18 7 14 T 17 16 321390 CASAVA_Build 22 42248125 1I ATCACCAGAA -/T TTGATCTTAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 2 3 321391 CASAVA_Build 22 42259794 1D GTCTAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 24 0 19 5 T 15 14 321392 CASAVA_Build 22 42272201 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 10 9 321393 CASAVA_Build 22 42300685 1I GTGGCTTATG -/C CTGTAATCCC 3070 hom 80 het 34 0 26 8 C 1 2 321394 CASAVA_Build 22 42302401 2D TTGTTGTTGT TG/-- TTGTTTGTTT 620 het 285 hom 25 2 5 18 TG 1 0 321395 CASAVA_Build 22 42310826 1I CCTTTTAGCA -/G GCGAGGCCTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 2 321396 CASAVA_Build 22 42316494 50D ACTTCATGTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTACAG/-------------------------------------------------- GTACATTCAC 3070 hom 63 het 18 0 22 3 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTACAG 1 0 321397 CASAVA_Build 22 42317622 2I GAAATATTAT --/AA GTCTGTATCA 3070 hom 135 het 54 0 46 8 A 0 2 321398 CASAVA_Build 22 42320280 2I AGGAGGAGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 26 9 A 12 14 321399 CASAVA_Build 22 42327862 1D TTTAGCAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 10 9 321400 CASAVA_Build 22 42332808 1D GTGAGCTGAG A/- ATCGTGCCAC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 A 2 1 321401 CASAVA_Build 22 42340145 1I AACAGATGCT -/G GTAAAGTTGC 2046 hom 19 het 9 0 6 3 G 1 2 321402 CASAVA_Build 22 42343830 1D TGAGCTGAGA T/- TCGTGCCATT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 2 1 321403 CASAVA_Build 22 42345533 1D GGGGAGACTT C/- GTCAGGAAGA 3070 hom 99 het 39 0 32 8 C 1 0 321404 CASAVA_Build 22 42346124 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 32 1 20 11 T 13 12 321405 CASAVA_Build 22 42348303 2D CACTATGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 2692 hom 28 het 20 0 8 12 T 17 15 321406 CASAVA_Build 22 42352321 5D TAATATAGAC AAAAT/----- AAAACCTATG 3070 hom 65 het 26 0 22 6 AAAAT 1 0 321407 CASAVA_Build 22 42355570 1D TAGCACTGGA C/- CCCCTCTCCC 3070 het 2887 hom 26 9 13 4 C 5 4 321408 CASAVA_Build 22 42369271 1D CTCCTGCCTC A/- AGCCTCCTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 2 1 321409 CASAVA_Build 22 42380032 1D GAAATACCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 10 9 321410 CASAVA_Build 22 42382734 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 923 hom 31 4 17 10 A 16 15 321411 CASAVA_Build 22 42384340 1I CTGTTTCTAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 566 hom 35 2 29 4 A 8 9 321412 CASAVA_Build 22 42394168 1I TTTTTTGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 27 1 17 9 A 11 12 321413 CASAVA_Build 22 42400097 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 447 hom 22 1 19 2 A 9 10 321414 CASAVA_Build 22 42413199 1D TTTAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 12 11 321415 CASAVA_Build 22 42428833 2D AGGAAATAAC AT/-- ATTATTTAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AT 2 1 321416 CASAVA_Build 22 42431138 1D GAAGCAGAAG A/- AAAAAAGCCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 7 6 321417 CASAVA_Build 22 42439552 1I CTGAATTCAA -/T TTTTTTCCTG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 6 7 321418 CASAVA_Build 22 42441746 1I AAGGATCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 37 1 30 6 A 11 12 321419 CASAVA_Build 22 42447383 1D AATAAAGATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 10 9 321420 CASAVA_Build 22 42465594 2D CACATATATT CA/-- CACACACATG 3070 hom 181 het 72 0 60 17 CA 5 4 321421 CASAVA_Build 22 42487429 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAAAAGAAA 196 hom 14 het 8 0 5 6 AAAAG 1 0 321422 CASAVA_Build 22 42487869 1D AGTAGGTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 701 hom 32 4 13 15 T 17 16 321423 CASAVA_Build 22 42492143 1I ACTTTCCAAT -/G AACAACATTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 0 1 321424 CASAVA_Build 22 42495039 1I TTGCGATGAT -/C AGTCTCCAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 0 1 321425 CASAVA_Build 22 42498142 1D TTTAAGTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 29 1 25 3 A 10 9 321426 CASAVA_Build 22 42512775 1D TAAAAAGAAG A/- AAATCTCAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 4 3 321427 CASAVA_Build 22 42522800 1D TGCATCTTCC T/- TGCAGAGTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 1 321428 CASAVA_Build 22 42539256 3I ATCACCACCC ---/CTT CTTCGTCCCT 3070 hom 66 het 31 0 21 10 CTT 1 2 321429 CASAVA_Build 22 42540531 2I GCACTCTGAC --/TG TACTTCACTG 3070 hom 123 het 50 0 40 10 TG 0 1 321430 CASAVA_Build 22 42543771 3D CTACAATGAT TAG/--- TCAGGCGTGG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TAG 1 0 321431 CASAVA_Build 22 42552899 4I TATAAAATAC ----/AATA AATAATACGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AATA 1 2 321432 CASAVA_Build 22 42587538 1I CCAGATGGGG -/C CCCTCTCGGC 3070 hom 97 het 36 0 28 8 C 3 4 321433 CASAVA_Build 22 42587915 1D CTGGGCTACC A/- GAAGTCCACT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 A 1 0 321434 CASAVA_Build 22 42623870 1I TCTACGCCGC -/A CCCCCCCCCC 1361 hom 21 het 12 0 8 4 A 0 1 321435 CASAVA_Build 22 42624037 3D TATTTATTTA TTT/--- AAAAAAAATT 442 het 442 ref 15 6 1 8 T 3 0 321436 CASAVA_Build 22 42629517 11D CAGGGGTCCT GGTCTCAAGGG/----------- GAAGATGCAT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 GGTCTCAAGGG 1 0 321437 CASAVA_Build 22 42667004 2D ACTCCAGCCT GG/-- GGGCAACAAG 3070 het 3070 hom 20 7 12 3 G 5 3 321438 CASAVA_Build 22 42674573 2I AGTCTGACTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 12 14 321439 CASAVA_Build 22 42677286 7D CTCCATCTCA AAAAAAT/------- AAAAAATAAA 2320 het 1940 hom 11 5 6 3 AAAAAAT 4 3 321440 CASAVA_Build 22 42692943 1I ATTCTCTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 9 10 321441 CASAVA_Build 22 42694953 1I GACTCCCTTT -/C CACCTGCAGG 3070 hom 142 het 59 0 43 16 C 1 2 321442 CASAVA_Build 22 42700062 1I ACCACTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2824 hom 34 9 10 15 T 12 13 321443 CASAVA_Build 22 42701238 1D GATAACCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 33 0 23 11 T 11 10 321444 CASAVA_Build 22 42717013 4D AAGAAAAATC TGTT/---- TGTCTATTTA 3070 het 3070 ref 40 22 15 5 TGTT 1 0 321445 CASAVA_Build 22 42719266 2I CACCCCAGCC --/TA TGTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 TA 0 1 321446 CASAVA_Build 22 42729221 9D GGCATTTGTG TTTCCCTCC/--------- CCAAGCACAG 3070 hom 108 het 40 0 37 5 TTTCCCTCC 1 0 321447 CASAVA_Build 22 42741259 2D AAGACCTCCA TC/-- TCTGTTTGAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 TC 2 1 321448 CASAVA_Build 22 42781998 1D GGTCAGGAGT C/- TTGAGACCAG 3070 het 2662 hom 16 6 8 2 C 1 0 321449 CASAVA_Build 22 42795328 1I CAGAACTGGG -/A ATTGTCAGTT 3070 hom 96 het 35 0 29 6 A 1 2 321450 CASAVA_Build 22 42799619 2D GGAAGAGCCG AC/-- AGTTTGCCCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 AC 1 0 321451 CASAVA_Build 22 42836292 1D TTAAGTTCTG T/- TTTCTTCCTC 3070 hom 84 het 32 0 28 5 T 4 3 321452 CASAVA_Build 22 42839911 4D ATACATTGTT ACTA/---- ACTAAGGCCC 960 hom 12 het 8 0 4 4 ACTA 2 1 321453 CASAVA_Build 22 42845047 1I TGAGATCATT -/G TATTAGTTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 0 1 321454 CASAVA_Build 22 42858347 2D TTTCTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 1705 hom 12 het 5 0 5 0 TC 10 9 321455 CASAVA_Build 22 42897898 1D CGCCCCCCCC T/- CCCCCAGCTC 3070 hom 61 het 25 0 20 5 T 1 0 321456 CASAVA_Build 22 42900754 1I CCACGCTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 9 10 321457 CASAVA_Build 22 42901772 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 16 0 12 5 A 11 9 321458 CASAVA_Build 22 42903800 1D ACACATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 12 11 321459 CASAVA_Build 22 42903858 1I GAGCAAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 33 0 18 15 T 10 11 321460 CASAVA_Build 22 42906341 1D CGTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 11 10 321461 CASAVA_Build 22 42920435 1D AAACGTGACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 A 10 9 321462 CASAVA_Build 22 42938558 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 19 11 T 11 10 321463 CASAVA_Build 22 42947881 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 2130 het 2018 hom 14 6 6 2 A 10 11 321464 CASAVA_Build 22 42952126 1I CTCTACTCCT -/G TCCTCTGCTT 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 G 0 1 321465 CASAVA_Build 22 42969907 1I TTATGTACTT -/C TAAAAAAAAA 2473 het 2473 ref 17 8 7 2 C 0 1 321466 CASAVA_Build 22 42979494 3D AGTCAACTAA AAT/--- AACTTGATAG 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 AAT 1 0 321467 CASAVA_Build 22 42979866 4D AAGACTGATC ACAA/---- ACAAAGGCAC 653 het 653 ref 22 10 4 9 ACAA 2 1 321468 CASAVA_Build 22 42984733 1I TGAATTTCCA -/C CCTTCCTCCC 1423 het 1423 ref 65 53 4 8 C 2 3 321469 CASAVA_Build 22 42988440 3D AGGGCCTCTT AAC/--- AACAGAACTG 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 AAC 2 1 321470 CASAVA_Build 22 42999216 14D CATTTTAATT AAGATTCCAAACTA/-------------- AAGATTCCAA 3070 het 3070 ref 35 15 16 7 AAGATTCCAAACTA 1 0 321471 CASAVA_Build 22 43031497 3I ACTTCGGAGC ---/GAG GAGATGGGGC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 GAG 1 2 321472 CASAVA_Build 22 43036125 1D CTACTGTCAT G/- GGGGGCGGGA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 G 6 5 321473 CASAVA_Build 22 43041577 1D GCTGTGTGAT C/- CTGGGCATGT 3070 het 3070 ref 24 11 9 5 C 2 1 321474 CASAVA_Build 22 43044930 20I AGGGCAGACC --------------------/CCCTGACACCAGACTTAGAA CCCAGAACTG 3070 hom 114 het 42 0 33 9 CCCTGACACCAGACTTAGAA 0 1 321475 CASAVA_Build 22 43051236 20D CAGGAGGAGT GGAGACTGGGATTTGAAATC/-------------------- GGAGACTGGG 3070 hom 81 het 31 0 27 9 GGAGACTGGGATTTGAAATC 2 1 321476 CASAVA_Build 22 43109303 4D GTGTGTTATA TATG/---- TATGTTATGT 3070 het 3070 ref 66 30 28 10 TATG 2 1 321477 CASAVA_Build 22 43109440 2D TGTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 65 29 27 9 TG 5 4 321478 CASAVA_Build 22 43109771 2I TGGGGATGTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 63 28 20 15 GT 7 8 321479 CASAVA_Build 22 43110376 4D TGTGTGTGTG TGCA/---- TGCATGTGTG 3070 het 3070 ref 71 32 31 12 TGCA 2 1 321480 CASAVA_Build 22 43142849 1D GTGTTGGCCA G/- GCTGGTCTCA 2540 het 973 hom 16 3 6 7 G 2 1 321481 CASAVA_Build 22 43149805 1D GGAACAAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 A 10 9 321482 CASAVA_Build 22 43153539 1I ACACTTGACA -/G TCCATCAATC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 0 1 321483 CASAVA_Build 22 43168577 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCAAAAT 3070 het 2191 hom 22 6 13 3 CT 1 2 321484 CASAVA_Build 22 43169690 3D AGAAGCCCCA CGG/--- CGGCGGCGCG 2987 het 1086 hom 22 5 10 10 CGG 3 2 321485 CASAVA_Build 22 43189781 3I GAAAGCATAC ---/TTA TTATTATTTC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 TTA 2 3 321486 CASAVA_Build 22 43191422 2D AGATTGACAG TT/-- TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 9 7 321487 CASAVA_Build 22 43196855 6I TTTTGTTTTC ------/TTTGGT TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 10 4 TTTGGT 0 1 321488 CASAVA_Build 22 43204604 5D AGCGTTATTC TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 TGTTT 3 2 321489 CASAVA_Build 22 43206138 6D GGCTCACACC TCTAAT/------ TCTAACAGTT 3036 het 2866 hom 16 8 8 0 TCTAAT 1 0 321490 CASAVA_Build 22 43206235 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 11 1 10 2 A 13 12 321491 CASAVA_Build 22 43210973 1I AACTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2140 hom 28 6 13 9 T 10 11 321492 CASAVA_Build 22 43216350 1I GCAGAGGGAG -/C CCCCCAGGAG 2648 het 593 hom 20 4 11 5 C 5 6 321493 CASAVA_Build 22 43218155 1I GTCTGCGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2845 hom 26 9 12 5 T 10 11 321494 CASAVA_Build 22 43221864 1I ATTTTTTTTT -/G TTGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 G 0 1 321495 CASAVA_Build 22 43224209 9I TTTGTCTATT ---------/AAACACAGA AAATGCTCCC 3070 het 3070 hom 33 10 16 8 AAACACAGA 0 1 321496 CASAVA_Build 22 43255103 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2022 het 1420 hom 19 8 6 5 A 16 15 321497 CASAVA_Build 22 43259872 1D GTTTCTGAAA T/- TTTTTTTTTT 1718 het 944 hom 19 2 7 10 T 15 14 321498 CASAVA_Build 22 43268564 1D ACATTAAGTT A/- GTCCCAGGGT 3070 het 3070 hom 51 17 30 6 A 1 0 321499 CASAVA_Build 22 43269007 1I GGCAAGCCCC -/T GACCCTCTCT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 0 1 321500 CASAVA_Build 22 43270092 3D GTCCTTCAGA AGG/--- AGGACATGCA 3070 het 3070 ref 53 28 22 7 AGG 2 1 321501 CASAVA_Build 22 43270206 1I GAGGCAGACA -/C CCCCCCCCGG 3030 het 1319 hom 31 6 8 17 C 8 9 321502 CASAVA_Build 22 43287468 1I GTTAATTTGG -/A AAATTATAGT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 3 4 321503 CASAVA_Build 22 43298979 4I CCCAGCAGTT ----/CTCA CTATGATTTG 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 CTCA 0 1 321504 CASAVA_Build 22 43302226 24D TTCTCTCCCT TTCTTTCTTTCCTTTCTTTCTTTC/------------------------ TTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 33 11 14 12 TTCTTTCTTTCCTTTCTTTCTTTC 1 0 321505 CASAVA_Build 22 43302630 1D CACACAGGCT G/- GGAGTGTAGT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 G 3 2 321506 CASAVA_Build 22 43307601 4I GAGGAGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TTTG 2 3 321507 CASAVA_Build 22 43307876 1I CTCAAGCAAT -/C CCCCACTCCT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 C 4 5 321508 CASAVA_Build 22 43309389 1D GGAGGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2067 het 945 hom 19 7 7 5 T 15 14 321509 CASAVA_Build 22 43310223 8I TCCAGGTATT --------/GTGCAGAG GTGCAGAGGA 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 GTGCAGAG 1 2 321510 CASAVA_Build 22 43322269 1I ATTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 916 hom 22 2 17 3 T 11 12 321511 CASAVA_Build 22 43322408 4I ATTACAGGCA ----/CCCG CCACCATGCC 3070 hom 48 het 19 0 17 6 CCCG 0 1 321512 CASAVA_Build 22 43323841 5D CCCACAGCAG TAAAT/----- TAGAGATCAG 3070 hom 119 het 43 0 38 12 TAAAT 1 0 321513 CASAVA_Build 22 43343183 1D CTCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 822 het 822 ref 28 20 3 5 A 15 14 321514 CASAVA_Build 22 43364249 1I CCATAGAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 26 0 20 6 T 9 10 321515 CASAVA_Build 22 43379411 2D TATCACATGT CA/-- CACACACACA 3070 hom 193 het 70 0 62 8 CA 6 5 321516 CASAVA_Build 22 43379483 7I50M2D CATATCACAT -------ACACACCACACACACATCACACATCACACACACATCAAACACACACACACCA/ACACACCACACACCACACACACATCACACATCACACACACATCAAACACACACACAC-- CACACACACA 3070 het 352 hom 49 4 37 33 N/A 0 0 321517 CASAVA_Build 22 43385249 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2955 het 2151 hom 18 6 7 5 A 7 6 321518 CASAVA_Build 22 43387737 1I AGATGGCAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 2 3 321519 CASAVA_Build 22 43388591 1I TGGTAAATTA -/G GGTATATTCA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 G 2 3 321520 CASAVA_Build 22 43389254 13D AGACTCTATC AAAAAAAAAAAAG/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 14 11 8 AAAAAAAAAAAAG 1 0 321521 CASAVA_Build 22 43390008 1D CCGCGGCTGC A/- TGGGAAGTTG 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 1 0 321522 CASAVA_Build 22 43394132 2D GTACTGTGGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 27 hom 56 2 27 28 GT 7 6 321523 CASAVA_Build 22 43394170 4D GCGTGGTGTG TGTC/---- TGTGTGAGGT 1390 het 1390 ref 58 18 8 36 TGTC 1 0 321524 CASAVA_Build 22 43422535 1D ACAAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 1810 het 1810 ref 17 7 6 4 T 13 12 321525 CASAVA_Build 22 43424016 6D CTCAGGAGTT GGAGAC/------ CAGCCTAGGC 3070 het 3070 hom 25 10 13 4 GGAGAC 1 0 321526 CASAVA_Build 22 43449794 1D ACGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 A 10 9 321527 CASAVA_Build 22 43458002 1D AGAGGGCCCA G/- ACCTAGGTTA 2810 het 2315 hom 20 7 8 5 G 1 0 321528 CASAVA_Build 22 43460809 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAGAAGTT 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 A 5 4 321529 CASAVA_Build 22 43461905 1I ATCCAGAGCG -/T TTTTATAATT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 4 5 321530 CASAVA_Build 22 43474479 1D GTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 522 hom 30 2 21 8 T 11 10 321531 CASAVA_Build 22 43507332 3D TGCACGCACA TAC/--- TACATGTGCA 3070 het 3070 hom 76 16 45 19 TAC 2 1 321532 CASAVA_Build 22 43507376 3D TGCACGCACA TAC/--- TACACACGTG 606 het 606 ref 62 19 4 42 TAC 2 1 321533 CASAVA_Build 22 43513278 2D GGCTTTCTGA CT/-- CTGCTGAGCC 1775 het 1775 ref 20 9 5 7 CT 2 1 321534 CASAVA_Build 22 43517423 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 70 het 31 0 23 8 T 9 8 321535 CASAVA_Build 22 43524665 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 8 9 321536 CASAVA_Build 22 43530633 19D CTTCCACGCT GAAGGCCAAGGCCAAACAG/------------------- TTCTTTCTTC 3070 hom 102 het 32 0 32 5 GAAGGCCAAGGCCAAACAG 1 0 321537 CASAVA_Build 22 43536986 1I TCTCTAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 9 10 321538 CASAVA_Build 22 43549998 1D ATTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 11 10 321539 CASAVA_Build 22 43553498 3I TTTCACCCAT ---/GCC AATGAGTGAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 GCC 0 1 321540 CASAVA_Build 22 43556234 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2411 hom 15 het 6 0 5 1 T 7 6 321541 CASAVA_Build 22 43564910 5D AAGGAAGAGT TTAAA/----- TTAAGAGAAG 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 TTAAA 1 0 321542 CASAVA_Build 22 43565727 3D CTGGGAGGGA TGT/--- TGTTGTGGGA 3070 het 3070 ref 37 19 13 7 TGT 3 2 321543 CASAVA_Build 22 43573074 1D GGGACTTGCG T/- TTTTTTTTTT 2579 het 648 hom 32 6 10 16 T 15 14 321544 CASAVA_Build 22 43590710 2I AAGCCCACTC --/AT GTGGCTCTGA 3070 hom 83 het 30 0 22 8 AT 0 1 321545 CASAVA_Build 22 43594635 1I CTGGGTCTCG -/C CCAGACCTCC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 C 2 3 321546 CASAVA_Build 22 43595974 2I CTCCATCTCG --/GA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 GA 0 1 321547 CASAVA_Build 22 43599179 2D TCTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 20 2 9 9 T 16 14 321548 CASAVA_Build 22 43603161 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1985 hom 18 5 10 3 T 8 9 321549 CASAVA_Build 22 43605042 1I GCGAGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 1132 het 1132 ref 10 5 3 2 T 10 11 321550 CASAVA_Build 22 43609388 1D GCATGATGAT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 138 het 50 0 47 4 A 8 7 321551 CASAVA_Build 22 43610771 1D GATCTGTACC T/- TTTTTTTTTC 1234 het 1234 ref 48 32 3 14 T 10 9 321552 CASAVA_Build 22 43613453 3D TGCACCTCCC TTG/--- TTGTTTAATA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 TTG 2 1 321553 CASAVA_Build 22 43615234 1D GCCTGGTTGG A/- ATGATTTTTG 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 A 2 1 321554 CASAVA_Build 22 43615786 1D GTATTTTTTC T/- TTTTTAGAAT 3070 het 3070 hom 58 23 29 6 T 6 5 321555 CASAVA_Build 22 43620556 1D GAAGTGAGTG C/- CCCCCCCCAT 3070 het 2134 hom 24 9 14 2 C 9 8 321556 CASAVA_Build 22 43622906 2D GGGAAGCTGG TT/-- TTTTTTATCT 1584 het 1584 ref 27 14 6 8 T 8 6 321557 CASAVA_Build 22 43632490 4I GAGGGACCAC ----/AGTG AGAGCTGAGG 3070 hom 49 het 36 0 13 23 AGTG 0 1 321558 CASAVA_Build 22 43633294 1I GTCTCAGAGT -/G GGGGGCCAGT 1814 het 1814 ref 29 10 10 9 G 5 6 321559 CASAVA_Build 22 43634563 1D GCTGCTGCGG A/- CCTCCTGCCT 1972 het 1972 ref 24 12 8 4 A 1 0 321560 CASAVA_Build 22 43635095 5I TGAGATCCTC -----/AACTT AACGACAGCT 3070 hom 87 het 30 0 27 3 AACTT 0 1 321561 CASAVA_Build 22 43635183 2D TCAATCTACT AC/-- ACACCAGGCT 3070 het 3070 hom 40 17 15 10 AC 3 2 321562 CASAVA_Build 22 43635303 2D TGCAGCCAAC AG/-- GGGAAGGTTC 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 AG 1 0 321563 CASAVA_Build 22 43635541 3D AAACTAAACT CTC/--- CTAATTCTCT 3070 het 3070 hom 25 7 17 2 CTC 1 0 321564 CASAVA_Build 22 43636067 2D TCAACAGATC TG/-- TGAGGGTGGT 3053 het 3053 ref 31 13 8 11 TG 2 1 321565 CASAVA_Build 22 43638361 3I14M2D TCCTCGCTGG ---CCTCCCTCTTCACTTG/CCTCCTCCCTCTTCACT-- TGTGTCTTCC 2538 het 393 hom 29 2 10 19 N/A 0 0 321566 CASAVA_Build 22 43650119 3D ATATTTAGGT TTC/--- TTTTTTCTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 3 TTC 1 0 321567 CASAVA_Build 22 43650843 1I TGATGATGAT -/A TTGCAAAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 0 1 321568 CASAVA_Build 22 43656449 1I AACCTCCCGA -/G GCCACCGCCC 3070 hom 43 het 20 0 11 9 G 1 2 321569 CASAVA_Build 22 43658348 3D TTGGGCAAAT AAC/--- AACCTCCCCG 3070 hom 68 het 31 0 23 9 AAC 2 1 321570 CASAVA_Build 22 43698624 1I GGGGAGGGAA -/G GAGGGGAGGA 1255 het 29 hom 7 1 4 2 G 1 2 321571 CASAVA_Build 22 43703565 3D CGGCCTTGCT CTC/--- CTCCTCTCCA 3070 hom 59 het 25 0 18 8 CTC 3 2 321572 CASAVA_Build 22 43705331 1I GCTGGCCAAG -/C CCCTGAAAGG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 C 3 4 321573 CASAVA_Build 22 43706187 1I GTGATCTTGG -/T GGGGGGGGTG 3070 het 222 hom 28 1 23 4 T 0 1 321574 CASAVA_Build 22 43710176 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 22 0 19 3 A 10 9 321575 CASAVA_Build 22 43757447 1D AAGCCAGCAG A/- GATTATGAAA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 A 1 0 321576 CASAVA_Build 22 43757778 9D ACTCTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 19 10 321577 CASAVA_Build 22 43764979 1D GGATGAATGG A/- TAAACAGCAC 3070 hom 176 het 64 0 56 9 A 1 0 321578 CASAVA_Build 22 43772510 1D CCACAGCTGG C/- CCCCTACCCT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 C 5 4 321579 CASAVA_Build 22 43786201 1D TACGTAGGTT A/- AATATGTGGG 3070 hom 84 het 32 0 29 5 A 3 2 321580 CASAVA_Build 22 43788632 2D AGTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 16 6 A 16 14 321581 CASAVA_Build 22 43789854 1I TTTTTTTAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 245 hom 18 1 14 3 T 9 10 321582 CASAVA_Build 22 43826504 1I CCTCCTTCAA -/G CCTCCTCAGG 3070 hom 105 het 41 0 32 9 G 0 1 321583 CASAVA_Build 22 43829733 2I AAACAAACAA --/AC AAAAAAAAAC 3070 hom 30 het 22 0 14 8 AC 0 1 321584 CASAVA_Build 22 43839232 1D TTCGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 41 1 32 8 T 10 9 321585 CASAVA_Build 22 43842044 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 506 hom 23 2 10 11 A 12 11 321586 CASAVA_Build 22 43847335 1I TACACATGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 8 9 321587 CASAVA_Build 22 43865434 1D AAAAGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2175 hom 37 7 23 7 A 11 10 321588 CASAVA_Build 22 43869678 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1337 hom 20 4 14 2 T 13 12 321589 CASAVA_Build 22 43873223 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2785 het 1528 hom 21 9 10 2 A 13 14 321590 CASAVA_Build 22 43873870 1I GGGAGGTAGA -/G GGTTGCAGTG 2787 het 479 hom 16 1 7 8 G 2 3 321591 CASAVA_Build 22 43875255 1D CTGCCCCCCA C/- CCCAGGGCCT 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 C 4 3 321592 CASAVA_Build 22 43883490 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 913 het 913 ref 37 27 4 6 A 12 11 321593 CASAVA_Build 22 43893660 2D ATATATACAC AT/-- GTCTCCAAGA 3070 het 3070 hom 50 21 23 8 AT 1 0 321594 CASAVA_Build 22 43895288 2I TTGTTGGTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 12 14 321595 CASAVA_Build 22 43895561 1I GATTACAGGC -/G TGAGCCACTG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 G 0 1 321596 CASAVA_Build 22 43899523 1D CAACTGGTAA C/- CTTTTGCTTG 3070 het 3070 hom 23 9 10 6 C 2 1 321597 CASAVA_Build 22 43901570 1I CCATACAGAT -/C TATGGAAACA 3070 het 3070 ref 33 16 16 1 C 0 1 321598 CASAVA_Build 22 43905757 1D GTTTTAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 964 hom 22 6 11 5 T 15 14 321599 CASAVA_Build 22 43905930 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 1790 het 1790 ref 10 5 5 0 T 9 8 321600 CASAVA_Build 22 43906941 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 het 3070 hom 29 8 16 5 T 6 5 321601 CASAVA_Build 22 43913467 1D CGTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 1248 het 1248 ref 13 8 3 2 A 15 14 321602 CASAVA_Build 22 43913556 1I TGATATATAT -/C CATATATATA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 1 2 321603 CASAVA_Build 22 43914434 3D TGACATCATC ATT/--- GTCACTGTCA 3070 het 3070 hom 42 17 20 7 ATT 1 0 321604 CASAVA_Build 22 43918728 4D AGAGATCAGA AGAC/---- AGTGTAAGAA 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 AGAC 1 0 321605 CASAVA_Build 22 43925728 3D CACTCTTCTT AAG/--- AAGACAGGAT 3070 het 3070 hom 30 10 18 3 AAG 2 1 321606 CASAVA_Build 22 43933570 1I TTGATCAGTT -/A AAAAAAAAAA 2844 het 2844 ref 23 13 7 3 A 10 11 321607 CASAVA_Build 22 43949509 1I TCCAGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2437 hom 26 9 12 5 T 13 14 321608 CASAVA_Build 22 43952360 2D GAACACATAC TT/-- TTTGAGCGGT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 T 5 3 321609 CASAVA_Build 22 43955388 1I GTCCCCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 13 14 321610 CASAVA_Build 22 43955681 3D CTTCTGGCAT CCC/--- CCCCCCCCCC 2060 het 715 hom 20 4 7 9 C 14 11 321611 CASAVA_Build 22 43956037 38D TGCCTGCTCT CAAGTGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTA/-------------------------------------- AAAATCCAGT 3070 het 3070 ref 41 26 16 6 CAAGTGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTA 1 0 321612 CASAVA_Build 22 43959234 2I TATTGCCAAG --/TT TTGCTGCTGC 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 2 4 321613 CASAVA_Build 22 43960410 2I AAATTTCCAC --/TT TGAGTCCTCA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 1 3 321614 CASAVA_Build 22 43981247 1D TGGCTTCCAA T/- TTTTTTTTTT 2334 het 2121 hom 34 12 9 13 T 15 14 321615 CASAVA_Build 22 43983866 1D GCTTTTGCCA G/- GGGGGGTCTC 1843 het 1696 hom 19 7 8 4 G 7 6 321616 CASAVA_Build 22 43992393 1D CCAGCTGTCT C/- CCCTGCCTCA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 C 4 3 321617 CASAVA_Build 22 43992725 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 AG 2 1 321618 CASAVA_Build 22 43992975 1D GTGATCCACC T/- GCCTCAGCCT 3070 het 671 hom 14 2 10 2 T 1 0 321619 CASAVA_Build 22 43993586 4I GCACACTGAA ----/AAGG AAGGGAAACT 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 AAGG 1 2 321620 CASAVA_Build 22 44003972 3I AGGCATCCGT ---/CTA CTCTGAGCTG 1778 het 1778 ref 20 6 7 7 CTA 0 1 321621 CASAVA_Build 22 44008888 1D TGAAACGCCA G/- GGGGAGAGCT 3070 hom 99 het 37 0 34 5 G 5 4 321622 CASAVA_Build 22 44009545 1I TGCATGTGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 83 het 32 0 27 5 T 9 10 321623 CASAVA_Build 22 44016910 1D GTCCCCCCCC A/- AAAAAAAAGA 1377 hom 15 het 19 0 8 11 A 9 8 321624 CASAVA_Build 22 44016930 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAATG 1962 hom 22 het 21 0 8 13 A 9 8 321625 CASAVA_Build 22 44022464 3D GGAATGCTAA GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 50 29 15 9 GTT 5 4 321626 CASAVA_Build 22 44022754 1I ACAGACACCC -/A AGCCCTGGAA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 1 2 321627 CASAVA_Build 22 44023319 15D TGGGAGAACA GGTAGGGTGGGCCAG/--------------- GGCAGGGAGA 3070 het 3070 hom 34 15 16 9 GGTAGGGTGGGCCAG 1 0 321628 CASAVA_Build 22 44025788 3D TCACCTTTTG ACA/--- ACATTTTGCA 3070 het 3070 ref 26 11 10 6 ACA 2 1 321629 CASAVA_Build 22 44025870 3D GTAAGCGCTG AGA/--- AGAAGGCGGT 3070 het 3070 ref 34 19 10 8 AGA 2 1 321630 CASAVA_Build 22 44045163 1I TGTTTGTCCT -/C CCCCCCCATC 3070 het 3070 ref 58 27 15 16 C 7 8 321631 CASAVA_Build 22 44051757 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 1929 het 236 hom 7 1 5 1 A 9 8 321632 CASAVA_Build 22 44052569 1I ATAAACAAAC -/A AAAAAACGGA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 A 6 7 321633 CASAVA_Build 22 44058535 7D GCTGAGCTAA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 25 0 15 11 T 19 12 321634 CASAVA_Build 22 44058862 1D CCATCCCTTT G/- GAGGCAGCCC 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 2 1 321635 CASAVA_Build 22 44068959 1I CCCTGGTACA -/C CCCCCCCCGG 2477 het 2071 hom 25 7 11 7 C 8 9 321636 CASAVA_Build 22 44080092 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 7 6 321637 CASAVA_Build 22 44088905 5D AAACTGTAGA AAACT/----- AAACTGTGCC 3070 hom 108 het 37 0 36 1 AAACT 2 1 321638 CASAVA_Build 22 44105917 1I CTCTGTGAGG -/T TTTTATTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 4 5 321639 CASAVA_Build 22 44112787 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 6 7 321640 CASAVA_Build 22 44123269 4D GACTGTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 1118 het 1082 hom 29 6 9 14 TTTG 1 0 321641 CASAVA_Build 22 44126949 1I GAAGGTCCCC -/T TGGCTTCTGC 3070 hom 84 het 35 0 26 9 T 1 2 321642 CASAVA_Build 22 44127835 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 21 0 13 9 A 11 10 321643 CASAVA_Build 22 44130276 1I GAGAAAAAGT -/G GCCACGCCCT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 G 1 2 321644 CASAVA_Build 22 44130707 1D CTGTTCTCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 10 9 321645 CASAVA_Build 22 44132174 3D ACAGAAACTT TTC/--- TTCTTTGGCT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TTC 2 1 321646 CASAVA_Build 22 44135518 1D TGCCAGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 949 hom 45 5 16 25 T 16 15 321647 CASAVA_Build 22 44138256 1I AATTCTTTTT -/A TAAAAAAGAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 0 1 321648 CASAVA_Build 22 44153205 5D TAATTCAACC AAACT/----- AAACACTTAA 3070 het 3070 ref 31 15 15 2 AAACT 1 0 321649 CASAVA_Build 22 44157190 1I TGACTAAAAA -/G TCAAATGAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 0 1 321650 CASAVA_Build 22 44188943 1I AGACATGAAA -/C CTTTGGTGAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 1 2 321651 CASAVA_Build 22 44199669 8D CGTCTCAAAA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 558 hom 14 3 11 3 AAAC 5 3 321652 CASAVA_Build 22 44206802 1D TTTGCTGACC T/- TTTTTTTTTC 1285 het 1285 ref 41 26 3 13 T 10 9 321653 CASAVA_Build 22 44212858 1I TTGGGATTAC -/G GGCATGAGCC 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 2 3 321654 CASAVA_Build 22 44235265 1I GAGGACCCCC -/A GGGGGGGTTA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 0 1 321655 CASAVA_Build 22 44235673 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 56 het 25 0 20 5 A 6 5 321656 CASAVA_Build 22 44246448 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 10 9 321657 CASAVA_Build 22 44265415 1I GTAGGGGTAA -/C CCTATGCCCC 3070 hom 102 het 36 0 34 2 C 2 3 321658 CASAVA_Build 22 44285702 1I TCTTCCCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1434 hom 24 5 11 8 T 14 15 321659 CASAVA_Build 22 44293095 1I GCAGAGTGAC -/T TAAGGGATGT 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 T 1 2 321660 CASAVA_Build 22 44294169 1I ACTCTAACTC -/A AAAAAAAAAA 1446 het 1446 ref 21 10 7 4 A 17 18 321661 CASAVA_Build 22 44295025 1I TTTGGATTAC -/A AGCCTGCCCT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 1 2 321662 CASAVA_Build 22 44299724 4D18M4D AAAGGGAGAA AGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAA/----AGAGAGAGAGAGAAAGAG---- AGAAAGAAAG 3070 het 1693 hom 24 11 13 10 N/A 0 0 321663 CASAVA_Build 22 44301100 1I TCCCGTTCCT -/A TTTAGGAAGG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 0 1 321664 CASAVA_Build 22 44302666 1I ATGTGATCGT -/G GGGGCTGGCA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 G 4 5 321665 CASAVA_Build 22 44308259 1D GTATTAGGAT G/- GGTCGTTCTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 G 3 2 321666 CASAVA_Build 22 44318636 1D CTCTAACTTC T/- TTTTTTTTTT 2167 het 2167 ref 21 11 7 3 T 13 12 321667 CASAVA_Build 22 44327429 1I TCCCACAGCC -/T TTCATGGGGC 3070 hom 57 het 27 0 18 9 T 2 3 321668 CASAVA_Build 22 44333212 2I TGCTGGAGTA --/AC ACACTCAAAC 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 AC 2 3 321669 CASAVA_Build 22 44345164 1D CAAAATCTGT A/- AGAAGATCTG 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 2 1 321670 CASAVA_Build 22 44348527 3I GTAGCCTCTT ---/CTC CTGCCTCCCC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CTC 0 1 321671 CASAVA_Build 22 44360576 1I CTTGGTAGCA -/T TTAATGGGGT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 2 3 321672 CASAVA_Build 22 44363208 1D TCCAGAGCCT C/- CCGCAGGAAT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 C 3 2 321673 CASAVA_Build 22 44363358 1D CAAAATTAGC A/- AAAAAAAAAA 2426 het 2385 hom 23 8 8 7 A 15 14 321674 CASAVA_Build 22 44370579 1D ACGCTCGGCT A/- ATTTTTTGTA 778 het 778 ref 7 4 3 0 A 2 1 321675 CASAVA_Build 22 44371680 1D CTGAGTAGCT G/- GGACTATAAG 3070 het 2891 hom 22 7 11 4 G 3 2 321676 CASAVA_Build 22 44375377 1D ATTTTGGCAC T/- TTTTTTTTTT 1052 het 1052 ref 29 14 3 12 T 15 14 321677 CASAVA_Build 22 44384137 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1882 hom 27 7 12 8 A 11 12 321678 CASAVA_Build 22 44388717 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1491 hom 26 8 11 7 A 11 10 321679 CASAVA_Build 22 44412989 1D GCAAACATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 10 9 321680 CASAVA_Build 22 44417711 5D CAGAAATGCT CTAAG/----- CTAAGTGGGC 3070 het 3070 ref 48 24 22 5 CTAAG 2 1 321681 CASAVA_Build 22 44429593 1D TAGCTTTTGG T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 8 7 321682 CASAVA_Build 22 44461363 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 19 2 13 5 A 17 16 321683 CASAVA_Build 22 44470039 1I GGCATATTTC -/T TTTTTTTTTT 2961 hom 5 het 18 0 8 10 T 13 14 321684 CASAVA_Build 22 44474012 1I AGTAGAAATC -/T TTTTTTTTTT 1955 het 1419 hom 28 10 11 7 T 11 12 321685 CASAVA_Build 22 44481243 30I CACATATTTG ------------------------------/TTTATTTTCTAAATGTCCTTTTGTTACGGT TTTCTAATTT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TTTATTTTCTAAATGTCCTTTTGTTACGGT 0 1 321686 CASAVA_Build 22 44489822 1D TGTTTAAGGT A/- GGGGGTAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 1 0 321687 CASAVA_Build 22 44498591 2D TTCCATTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 TA 7 6 321688 CASAVA_Build 22 44517378 1D ACTACTGATT C/- CCCCCTTGGG 3070 hom 129 het 50 0 44 7 C 6 5 321689 CASAVA_Build 22 44521217 1I ACCTTCATAC -/T TTTCCCTGAG 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 3 4 321690 CASAVA_Build 22 44523655 22D GCAAACTAAC TAGGCTCCAGGCCCTTGACCTG/---------------------- TGCTTCATCG 3070 hom 162 het 56 0 54 6 TAGGCTCCAGGCCCTTGACCTG 1 0 321691 CASAVA_Build 22 44525484 1I TACTTTCCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 9 10 321692 CASAVA_Build 22 44554631 1D CTGCATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 24 0 14 10 T 15 14 321693 CASAVA_Build 22 44575067 1D ACTACTTTGG A/- AAAATACTGT 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 5 4 321694 CASAVA_Build 22 44621139 1D ATTTAAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 11 10 321695 CASAVA_Build 22 44633968 1D GGGTGCGGAG C/- CCCAGTCTGC 3070 het 3070 ref 34 13 13 9 C 4 3 321696 CASAVA_Build 22 44634506 1I GACTGGTGAC -/T TAGGCAATAG 3070 hom 65 het 26 0 22 4 T 1 2 321697 CASAVA_Build 22 44634760 3D GTCTGCAAAT GTA/--- GTCACATTCT 3070 het 3070 hom 35 12 18 6 GTA 1 0 321698 CASAVA_Build 22 44639005 3I GAAAAACATT ---/AAG AAGGAGGGGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 AAG 1 2 321699 CASAVA_Build 22 44644063 2D CTTGCGCGCG CA/-- CACACACACA 3070 hom 57 het 30 0 20 12 CA 10 9 321700 CASAVA_Build 22 44649750 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 806 hom 31 2 21 8 A 10 11 321701 CASAVA_Build 22 44717400 2I GAGTGGGTGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 288 hom 47 1 29 17 TG 8 9 321702 CASAVA_Build 22 44728268 1D GCTATGATTT A/- AAAAAAAAAA 1088 het 1088 ref 38 20 8 10 A 17 16 321703 CASAVA_Build 22 44741999 51D TAGTTCTGGG GCTCCCACTGCATGTGGCCCCTTCCAATTGGGAAGTCCTCCAGAATGCACT/--------------------------------------------------- GGCTCCGCAC 3070 hom 75 het 17 0 23 6 GCTCCCACTGCATGTGGCCCCTTCCAATTGGGAAGTCCTCCAGAATGCACT 1 0 321704 CASAVA_Build 22 44744976 10D GGTACACTGG GCACCACCTT/---------- GCCCCAGAGG 2218 hom 33 het 12 0 10 2 GCACCACCTT 1 0 321705 CASAVA_Build 22 44748443 1I GTGGCCCCCC -/T GTGTAATTAA 3070 hom 93 het 35 0 29 6 T 0 1 321706 CASAVA_Build 22 44754274 3D CACACCACAC ACA/--- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 79 28 35 17 ACA 2 1 321707 CASAVA_Build 22 44765845 2D CGGAAAGCTC AG/-- AGAGTGCTGG 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 AG 3 2 321708 CASAVA_Build 22 44768567 1I TGATGGAGGT -/A GGGGGGTTGA 3070 het 3070 hom 55 15 16 24 A 0 1 321709 CASAVA_Build 22 44768612 3D GGTGGAGGTG ATA/--- ATAATGATGG 3070 het 1350 hom 43 9 18 21 ATA 2 1 321710 CASAVA_Build 22 44779141 1D GGCACTTGGG T/- TTAGTGGCTG 3070 het 3070 ref 34 23 8 4 T 3 2 321711 CASAVA_Build 22 44794865 2D TATGGTTTCA TT/-- TTTTTTTTTG 2719 het 2719 ref 18 10 7 1 T 11 9 321712 CASAVA_Build 22 44795028 1D TCCCTTATTT A/- AAAAAAAAAA 1286 het 1286 ref 29 18 3 9 A 13 12 321713 CASAVA_Build 22 44795760 4D GACCAACAGT GAAA/---- GAAAGGAGTC 3070 het 3070 hom 44 16 19 11 GAAA 2 1 321714 CASAVA_Build 22 44803870 3D GTCTCCACAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 2533 hom 31 7 19 5 AAT 7 6 321715 CASAVA_Build 22 44808632 13I GTAACACTCC -------------/ATCGTATATATAT ATCGTATATA 3070 het 3070 ref 51 20 16 15 ATCGTATATATAT 1 2 321716 CASAVA_Build 22 44829444 4D GTTCAGAAGG TATC/---- TATCTGGTCA 3070 het 3070 hom 28 9 14 6 TATC 2 1 321717 CASAVA_Build 22 44835443 4I GTATCAGATT ----/AATA AATTGTGGTC 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 AATA 0 1 321718 CASAVA_Build 22 44896878 1D GGCGTGGCCA G/- GGCAGGTGCA 2095 het 2095 ref 27 15 9 3 G 3 2 321719 CASAVA_Build 22 44904694 1I CCGTGGACTC -/T TAAGTCAGCA 3070 het 3070 ref 47 16 16 15 T 1 2 321720 CASAVA_Build 22 44999533 1D CTAGAATGCT G/- GGGGGGGGCC 3070 hom 33 het 15 0 11 4 G 9 8 321721 CASAVA_Build 22 45004120 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1040 het 1040 ref 27 15 3 9 A 15 14 321722 CASAVA_Build 22 45023646 1I ATGTTCATGG -/T TTGGGTCTTG 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 2 3 321723 CASAVA_Build 22 45058515 1D ATAAATTCTC T/- TTTTTTTTTT 704 het 704 ref 38 30 3 5 T 13 12 321724 CASAVA_Build 22 45076046 1I TTATTTTTAA -/T TACTTTTTTT 3070 het 453 hom 18 2 13 3 T 1 2 321725 CASAVA_Build 22 45105046 1I CCTGTCTTGG -/A AAAAAAAAAA 2092 het 2092 ref 21 10 7 4 A 13 14 321726 CASAVA_Build 22 45117761 1D TTTAGTGAAC T/- TTTTTTTTTT 1523 het 1523 ref 43 24 4 15 T 15 14 321727 CASAVA_Build 22 45124658 1I AAAATCCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 11 12 321728 CASAVA_Build 22 45134076 33I AGCAGCTGCG ---------------------------------/GTCACCCCTGTTACCTGGGCCGAAGCAGCTGTA GTCACCCCTG 3070 hom 88 het 41 0 24 17 GTCACCCCTGTTACCTGGGCCGAAGCAGCTGTA 0 1 321729 CASAVA_Build 22 45143846 13I CCGATCAATG -------------/TCAGGTCGCCGAC TCTTCTCTCT 3070 hom 96 het 36 0 28 8 TCAGGTCGCCGAC 0 1 321730 CASAVA_Build 22 45145872 1I ACTGGCCCCA -/G GGTGGCTGCT 3070 hom 61 het 25 0 17 8 G 2 3 321731 CASAVA_Build 22 45152634 1I TTCATCTGCA -/G GCCCACAATG 3070 hom 47 het 17 0 11 6 G 1 2 321732 CASAVA_Build 22 45181448 1I AGCAAAAGAA -/G GCCCAGAGCC 3070 hom 110 het 40 0 33 7 G 1 2 321733 CASAVA_Build 22 45191030 1I TGGACCTGGT -/C CACTCAGGCC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 C 1 2 321734 CASAVA_Build 22 45194954 4D TGCACTCACC CACA/---- CATTTACACG 3070 het 3070 hom 85 40 33 15 CA 3 1 321735 CASAVA_Build 22 45196666 1D TTTTTGTTTA T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 8 7 321736 CASAVA_Build 22 45198796 2D ACCCGGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 13 11 321737 CASAVA_Build 22 45200268 6D AAAGATTTTG TTAATC/------ TTAAAGAATC 3070 het 3070 hom 43 19 22 5 TTAATC 1 0 321738 CASAVA_Build 22 45242947 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 15 14 321739 CASAVA_Build 22 45250221 1I AGAAACGAAT -/G GGGGGGGGAA 3070 het 238 hom 43 1 34 8 G 8 9 321740 CASAVA_Build 22 45251424 3I GAGAGGTTGC ---/ACA ACATCGTGAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ACA 1 2 321741 CASAVA_Build 22 45254177 1D TGGACTTTTT G/- GGGGGGGGCC 2803 hom 26 het 12 0 8 5 G 9 8 321742 CASAVA_Build 22 45265756 2I ACATGGCCAC --/AT GTCTCCTAGG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 AT 0 1 321743 CASAVA_Build 22 45272531 4D CTGGTGGGGC CAGG/---- CACGGTGGCT 3070 het 2004 hom 24 7 14 3 CAGG 1 0 321744 CASAVA_Build 22 45278438 1D AACTAAAAAA T/- TTTAAAAGTA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 4 3 321745 CASAVA_Build 22 45282426 1I AGGAGGCACT -/G GGGGGGCTGC 3070 hom 69 het 29 0 21 8 G 6 7 321746 CASAVA_Build 22 45283856 3D CAAGGCAGCT CTC/--- ATCACGGCTT 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 CTC 1 0 321747 CASAVA_Build 22 45284090 46I AGTGGGGGAG ----------------------------------------------/AGGGGCTAGGGGACATTTGGCAAGGTCTGAAACATTTTGGGTCATC TCAACTGGAC 3070 hom 149 het 40 0 42 13 AGGGGCTAGGGGACATTTGGCAAGGTCTGAAACATTTTGGGTCATC 0 1 321748 CASAVA_Build 22 45285812 2D TGATTCACAC AG/-- AGAAAAAGCA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 AG 2 1 321749 CASAVA_Build 22 45289687 1D GCAGAGCCAA C/- CCCCCCCGGG 3070 hom 59 het 25 0 20 6 C 8 7 321750 CASAVA_Build 22 45292466 1I GTCCCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 33 4 19 10 T 15 16 321751 CASAVA_Build 22 45294977 1I CCTTCTAGCA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 7 8 321752 CASAVA_Build 22 45300002 2D AAAAGCAAAA CT/-- CTGTCTCAAA 862 het 285 hom 18 2 7 9 CT 2 1 321753 CASAVA_Build 22 45302655 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTCAAA 2441 hom 52 het 24 0 11 13 CT 1 2 321754 CASAVA_Build 22 45306521 2D ACTGAGACTG GA/-- TGACTACATA 3070 hom 93 het 36 0 29 8 GA 1 0 321755 CASAVA_Build 22 45312595 1I GGCCGGGGAG -/C CCCCCCCCCA 1430 het 15 hom 14 1 6 7 C 9 10 321756 CASAVA_Build 22 45325723 1I CTCAGGAGGC -/T TGAGGCCAGA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 1 2 321757 CASAVA_Build 22 45326514 30D CTCAAAATGG CCTCCCTTAGCCCCTGCCTTTCTTCTTCTT/------------------------------ CCTCTCTCTG 3070 hom 110 het 36 0 31 9 CCTCCCTTAGCCCCTGCCTTTCTTCTTCTT 1 0 321758 CASAVA_Build 22 45328947 1I GGGAGACAGA -/C CCCCCCCAAG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 7 8 321759 CASAVA_Build 22 45333399 5D TAAATAAATT AAGTA/----- AAGTCTCAAG 3070 hom 123 het 44 0 42 5 AAGTA 1 0 321760 CASAVA_Build 22 45334257 4I AAATAAAGCC ----/AAAT ACTTACAGCC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AAAT 0 1 321761 CASAVA_Build 22 45334705 1I AATCAGCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 58 het 25 0 20 5 A 9 10 321762 CASAVA_Build 22 45335006 1I GACTCTATCT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 7 8 321763 CASAVA_Build 22 45339151 1D TGAGCAGAGA G/- GGGGGCAGGC 3070 hom 55 het 22 0 17 5 G 6 5 321764 CASAVA_Build 22 45346310 1I AGGGACAAAC -/T GCGTAAGGGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 321765 CASAVA_Build 22 45347178 10D TTTATTAAAA ATACAAAAAT/---------- TAGCCAGGCA 3070 hom 36 het 15 0 14 5 ATACAAAAAT 1 0 321766 CASAVA_Build 22 45363291 1I CCCTCTCCAT -/C CCCCGGGGTC 3070 het 1599 hom 23 6 11 6 C 4 5 321767 CASAVA_Build 22 45365632 7I AAAGAAAAAG -------/AAAAAGA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 AAAAAGA 0 1 321768 CASAVA_Build 22 45366504 1I TGATATCAGT -/G GGACATTGGG 1733 het 1321 hom 13 6 6 1 G 2 3 321769 CASAVA_Build 22 45381762 1D TCGTGTCTTT A/- AAAAGGGGGG 3070 hom 82 het 36 0 26 11 A 5 4 321770 CASAVA_Build 22 45386682 1D CTCCTGCCTC A/- GTCTTCTGAG 3070 hom 36 het 13 0 13 1 A 1 0 321771 CASAVA_Build 22 45388416 3I TCAGGAACTC ---/TCG TTTTGCATTT 3070 hom 69 het 26 0 19 7 TCG 0 1 321772 CASAVA_Build 22 45390599 5D TCCCCCATGT GTAGG/----- TTCCCCTGTG 2560 hom 30 het 12 0 9 6 GTAGG 1 0 321773 CASAVA_Build 22 45414094 2D TAGTTAACCC TG/-- TGTGTGTGTG 1007 het 1007 ref 76 56 3 20 TG 7 6 321774 CASAVA_Build 22 45439049 1I GGAGTACCTC -/A CAAGGGCATG 2190 het 2190 ref 27 10 8 9 A 0 1 321775 CASAVA_Build 22 45459638 1I TTTTTTTGTT -/G GGGGGGGGCG 3070 het 13 hom 26 1 14 11 G 8 9 321776 CASAVA_Build 22 45502007 4I TGCCCAGCTG ----/TTTC TTTCTTTTTT 2387 hom 48 het 21 0 13 8 TTTC 1 2 321777 CASAVA_Build 22 45507147 1D AGGATATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1158 hom 28 4 13 11 T 17 16 321778 CASAVA_Build 22 45514785 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 24 0 23 2 A 10 9 321779 CASAVA_Build 22 45550961 1I TGTGGCTGTG -/T TGGTGGGGTG 3070 het 2491 hom 42 8 15 19 T 1 2 321780 CASAVA_Build 22 45551821 1I AGGACATGGG -/C CCAGTGAGAG 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 C 2 3 321781 CASAVA_Build 22 45558153 2D GCAGGAGCAG TT/-- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 47 18 15 15 T 10 8 321782 CASAVA_Build 22 45558209 1I TTTCGCATTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 36 9 22 5 A 6 7 321783 CASAVA_Build 22 45569184 2D CCATTCTGGT GA/-- GAGGGACAGA 3070 het 3070 hom 41 20 16 7 GA 2 1 321784 CASAVA_Build 22 45573601 1I CTTATGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 T 9 10 321785 CASAVA_Build 22 45582926 1D TTAAAAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2689 hom 24 10 9 7 A 9 8 321786 CASAVA_Build 22 45585016 1I AAAAAAAAAA -/T GTATATATTT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 0 1 321787 CASAVA_Build 22 45591822 1I TAGGTTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2801 hom 32 12 12 8 T 11 12 321788 CASAVA_Build 22 45593440 1I ATGGAATGTG -/T TTTTCCTTTG 3070 het 3070 ref 44 27 17 0 T 4 5 321789 CASAVA_Build 22 45606519 1I AAGGTCCTTT -/C CCCCCCTCAT 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 C 6 7 321790 CASAVA_Build 22 45623450 1D CACCATGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 15 11 17 T 14 13 321791 CASAVA_Build 22 45625783 1I AGAGGCTCTG -/C CCTCAAAGAG 3070 hom 89 het 38 0 30 8 C 2 3 321792 CASAVA_Build 22 45633022 1I GTGGCAAACA -/C CCCCCCCCAG 3070 het 1576 hom 27 6 15 6 C 8 9 321793 CASAVA_Build 22 45635545 1I ATAAATTAAT -/G TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 G 0 1 321794 CASAVA_Build 22 45643503 1D AGGAGTAGGT G/- GGGGGTGCCC 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 G 6 5 321795 CASAVA_Build 22 45676269 1D TAACTCACAT G/- GGGGGGGGAT 3070 hom 23 het 43 1 34 8 G 9 8 321796 CASAVA_Build 22 45676509 4I AGATTGTTTA ----/TAAG TAAACGTGAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TAAG 0 1 321797 CASAVA_Build 22 45702687 1D AACAGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 754 hom 45 4 27 14 A 15 14 321798 CASAVA_Build 22 45702702 1D AAAAAAAAAA C/- AAAGATTAGG 3070 het 1048 hom 42 8 24 11 C 1 0 321799 CASAVA_Build 22 45713066 1I CTTAATGGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 209 hom 28 1 23 4 T 9 10 321800 CASAVA_Build 22 45722309 1I AGTGGGAGGT -/G GGCAGAGACG 3070 hom 78 het 31 0 24 7 G 2 3 321801 CASAVA_Build 22 45728047 1I TAATTTCCTG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 8 9 321802 CASAVA_Build 22 45755208 1D15M1D35M1I CTGAAAATAT GGGCAGATTAAGACATGGAAAGATAGAATTTAAAAAATAGAACTAGAAAGAG-/-GGCAGATTAAGACAT-GAAAGATAGAATTTAAAAAATAGAACTAGAAAGAGA AAATGTACTA 3070 hom 48 het 17 0 17 12 N/A 0 0 321803 CASAVA_Build 22 45809037 3I CCGTGGTGAT ---/GAG GATGAAGAGG 3070 het 2826 hom 27 11 11 5 GAG 0 1 321804 CASAVA_Build 22 45825677 2D GGTCATTGCA GG/-- GGGACCTCTC 2688 het 2688 ref 16 8 7 3 G 5 3 321805 CASAVA_Build 22 45826631 1I GGCTCTCACT -/G GGGCCTCCTG 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 G 3 4 321806 CASAVA_Build 22 45837492 1I AACGAGTTAG -/C TTGGTACTGC 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 C 0 1 321807 CASAVA_Build 22 45850358 2D TTCATGATTG AC/-- ACACACACAC 865 het 865 ref 32 23 3 6 AC 9 8 321808 CASAVA_Build 22 45854712 4D TTGAAGGGAG TAGA/---- TAAACTAGTT 3070 het 3070 ref 49 25 19 7 TAGA 1 0 321809 CASAVA_Build 22 45855186 1D CCTGTAAAAA T/- ATATATATAT 1857 het 1857 ref 20 12 4 5 T 1 0 321810 CASAVA_Build 22 45856974 2D GATAGATAAT AG/-- AATAATAGAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 AG 1 0 321811 CASAVA_Build 22 45857803 1I ATATTCAATT -/A GCAAGACTCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 0 1 321812 CASAVA_Build 22 45862659 3I TAATAATAAT ---/AAA AAATTTAAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 3 6 321813 CASAVA_Build 22 45867413 1D CCAAGAACAT C/- CTTGACAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 C 2 1 321814 CASAVA_Build 22 45870184 2I GGATTTCCCC --/CT GTCTCCCAAC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 CT 0 1 321815 CASAVA_Build 22 45879040 5D GGATCACCTG AGGTC/----- AGGAGTTTAA 3070 het 2832 hom 20 7 9 4 AGGTC 1 0 321816 CASAVA_Build 22 45889757 7D CTCTGGAGGA TTGCCAC/------- TTTGCCACCT 2101 het 2101 ref 19 11 6 3 TTGCCAC 1 0 321817 CASAVA_Build 22 45910882 32D CAGGAGGTGA GGCTGTGGACCCAGTTCCTTGGAGCCAACCCT/-------------------------------- GGGCCATGTG 538 het 538 ref 36 25 3 15 GGCTGTGGACCCAGTTCCTTGGAGCCAACCCT 1 0 321818 CASAVA_Build 22 45922644 1D CAAAAGATGT A/- AAAAAAAAAA 2775 het 990 hom 24 6 10 8 A 15 14 321819 CASAVA_Build 22 45933638 2D ACACATGTAT AC/-- ACACACACCA 3070 het 3070 ref 84 44 28 15 AC 5 4 321820 CASAVA_Build 22 45934218 2D CACCACACAC AT/-- GTGCCACATA 3070 het 3070 hom 57 23 28 8 AT 1 0 321821 CASAVA_Build 22 45935259 4D GAGGGACCCC GGGG/---- GCCTTGGCTG 1483 het 1483 ref 19 9 5 5 G 5 1 321822 CASAVA_Build 22 45935649 1I CTCTTGGTAT -/A GGGGGGCACT 3070 het 1784 hom 26 8 11 7 A 0 1 321823 CASAVA_Build 22 45961348 1I AAATGCTTGA -/G GGGTGGACAC 3070 hom 68 het 30 0 23 7 G 3 4 321824 CASAVA_Build 22 46001746 1D GTGACCATCG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1753 hom 26 7 16 3 T 10 9 321825 CASAVA_Build 22 46003699 1I AGATACAGTA -/G ACTATTATTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 321826 CASAVA_Build 22 46005536 1I TCATCATTTT -/C AGCATTTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 0 1 321827 CASAVA_Build 22 46012103 1D TTATATTCTA T/- TTGTCCCCAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 3 2 321828 CASAVA_Build 22 46013109 3D GTCCCTAGTT CTC/--- CTTCCTCAGA 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 CTC 1 0 321829 CASAVA_Build 22 46028494 6D TGTGATGACT TTAACA/------ TTAAATATGA 3070 het 3070 hom 42 17 25 2 TTAACA 1 0 321830 CASAVA_Build 22 46033790 2I CAAAGATGTG --/CA CACACACACA 3070 hom 182 het 67 0 57 10 CA 5 6 321831 CASAVA_Build 22 46034617 1I GGAAATCCTT -/C CCCTTATCTC 3070 hom 110 het 41 0 36 5 C 3 4 321832 CASAVA_Build 22 46036135 1I AGTCACGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 40 1 29 10 A 10 11 321833 CASAVA_Build 22 46040186 1I AATGTTTAAA -/T GTTTTTTTGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 0 1 321834 CASAVA_Build 22 46043508 1I AAGGAGCTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 670 hom 45 3 34 8 A 0 1 321835 CASAVA_Build 22 46049389 1D TCTGGTTCTT G/- TATGTGACCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 1 0 321836 CASAVA_Build 22 46051068 10I ACAGCCGGTG ----------/GGCCAAATTT GGCCCGTGGT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 GGCCAAATTT 0 1 321837 CASAVA_Build 22 46062355 2D TCTCTGTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 1140 het 1140 ref 62 42 4 16 TG 7 6 321838 CASAVA_Build 22 46065272 1I GGTAGAGCCA -/G GCCATGTGCT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 1 2 321839 CASAVA_Build 22 46078365 1D GGTGTGTGTG T/- GGGGGGGTAT 3070 hom 115 het 44 0 38 6 T 1 0 321840 CASAVA_Build 22 46081471 2D TCCTTCACTC TT/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 89 het 32 0 30 3 T 3 1 321841 CASAVA_Build 22 46089137 1I TTTAGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 1824 het 1380 hom 25 5 7 13 T 17 18 321842 CASAVA_Build 22 46091628 1I AAAGCTGGGG -/T TTTTTTTTTT 690 het 690 ref 43 31 2 11 T 11 12 321843 CASAVA_Build 22 46097671 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 35 2 24 9 T 11 10 321844 CASAVA_Build 22 46104212 15I AGAGAAGGAT ---------------/GAGGAGGAAAGGGTG GAGGAGGAAA 3070 hom 66 het 29 0 17 12 GAGGAGGAAAGGGTG 0 1 321845 CASAVA_Build 22 46104474 1D AACCCTTCCC T/- TTTTTTGGTT 3070 hom 85 het 35 0 28 7 T 7 6 321846 CASAVA_Build 22 46109317 1I GGCACTCTCA -/G GGCCCCTGGG 3070 hom 105 het 39 0 33 6 G 2 3 321847 CASAVA_Build 22 46112095 1I TTGTATTTTC -/T TTTTTTATAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 6 7 321848 CASAVA_Build 22 46116069 1I AGAAAGATGA -/T TAAAGAGGCT 3070 hom 116 het 46 0 37 9 T 1 2 321849 CASAVA_Build 22 46119474 6I TCCACGAGGA ------/GGAGAC AGAGGCAGAT 1577 het 1577 ref 31 19 5 7 GGAGAC 0 1 321850 CASAVA_Build 22 46129812 1I GAGAGGGGGT -/G GGGCTTCTTG 1279 hom 10 het 4 0 4 0 G 3 4 321851 CASAVA_Build 22 46137446 3I CGTATTATTC ---/TTT TATTATTCAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 4 321852 CASAVA_Build 22 46146349 6D ATGCGGGGCT TGGCCC/------ TGGCCCTGGC 3070 het 3070 hom 32 17 12 4 TGGCCC 3 2 321853 CASAVA_Build 22 46150891 1I CATCTTTGCC -/T TTTTTTCCCG 2874 het 2874 ref 33 15 7 11 T 6 7 321854 CASAVA_Build 22 46157320 1I TGCATGCAAC -/T AAGACCCCTG 3070 het 3070 ref 46 30 12 4 T 0 1 321855 CASAVA_Build 22 46159198 9D CACCCCTGAG GACCAGGCA/--------- GTCCAGGCAT 3070 het 3070 ref 51 26 19 8 GACCAGGCA 1 0 321856 CASAVA_Build 22 46161058 1I CAGCCTCTGA -/C CTGCTGCTAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 C 1 2 321857 CASAVA_Build 22 46161219 1D CCAGTGGGAG T/- TTTTCTGGAA 1742 het 1742 ref 15 7 6 2 T 5 4 321858 CASAVA_Build 22 46166816 3I30M2I CACATGCACA ---AACAGGCACTGCACACATATGCACACACAC--/CACAACAGGCACTGCACACATATGCACACACACAT GTGTACACAC 3070 het 3070 ref 82 48 46 17 N/A 0 0 321859 CASAVA_Build 22 46173753 3D AATCCCATGG CCA/--- CCAAGAGCCC 3070 het 2088 hom 25 8 9 8 CCA 2 1 321860 CASAVA_Build 22 46197340 1D TGCCCCGCAG C/- CCCCCCCCGG 3070 hom 59 het 26 0 21 5 C 9 8 321861 CASAVA_Build 22 46206559 8D AGTAGAGTAA TATTTATT/-------- TATTTATTTA 3070 hom 42 het 23 0 15 8 TATT 6 4 321862 CASAVA_Build 22 46208487 4I TCATCCAATA ----/CAAT CAGTGTCCTT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 CAAT 0 1 321863 CASAVA_Build 22 46211818 1D TGCTATTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 8 5 T 11 10 321864 CASAVA_Build 22 46213272 1I CCCTTTTGGT -/G GGGAAGGGGG 3070 het 3070 hom 43 19 16 8 G 3 4 321865 CASAVA_Build 22 46213431 1I TTAATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 369 hom 30 1 24 5 T 12 13 321866 CASAVA_Build 22 46215199 1I CACTTCAGGG -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 T 7 8 321867 CASAVA_Build 22 46219234 1I AGAGAAGTCA -/G GCTGAGGCCA 3070 hom 78 het 33 0 26 7 G 1 2 321868 CASAVA_Build 22 46243112 7I GAGGAAAAGT -------/ACACCCC ACACCCAGAG 3070 het 3070 hom 51 21 22 8 ACACCCC 0 1 321869 CASAVA_Build 22 46250293 1I AACCATATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 T 9 10 321870 CASAVA_Build 22 46250402 2I TCAGCGTATT --/CA CAGAGTTGTG 3070 hom 124 het 47 0 38 9 CA 1 2 321871 CASAVA_Build 22 46251355 1I TTTTTCTTAA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 6 T 6 7 321872 CASAVA_Build 22 46252102 4D ATGCCTATTT CTCA/---- CTGAGTGTTA 3070 het 3070 hom 41 20 19 3 CTCA 1 0 321873 CASAVA_Build 22 46252629 6D ATGCCTGGCA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 2370 hom 39 12 16 13 T 19 13 321874 CASAVA_Build 22 46253914 2I TTCAACAGTT --/TA TGTTTTTTTA 3070 hom 76 het 36 0 26 10 TA 0 1 321875 CASAVA_Build 22 46253963 2D AATTTGTTAG CA/-- CACACTTGTT 2026 het 2026 ref 28 15 5 8 CA 3 2 321876 CASAVA_Build 22 46254841 1I GCACCATGTG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 8 9 321877 CASAVA_Build 22 46255108 2D AGAGTAAAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 96 het 38 0 33 7 TA 7 6 321878 CASAVA_Build 22 46257275 1D CTAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 44 4 16 25 A 15 14 321879 CASAVA_Build 22 46265270 1D TGATATAAGG A/- TATCATTTCA 3070 het 3070 ref 51 25 17 9 A 1 0 321880 CASAVA_Build 22 46270469 1I CTATATTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 9 10 321881 CASAVA_Build 22 46276370 1D GCTGAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 A 13 12 321882 CASAVA_Build 22 46277039 3D AGTCAGACAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 5 AAC 3 2 321883 CASAVA_Build 22 46282329 1I CTATATAGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 9 10 321884 CASAVA_Build 22 46288660 1I GAAAGAACAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 9 10 321885 CASAVA_Build 22 46289559 1I TACAAAAAAA -/G CATGCTTACA 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 G 0 1 321886 CASAVA_Build 22 46297656 5D AAAATGAAAC AAGTA/----- AATAGACCCA 3070 het 3070 hom 39 15 22 4 AAGTA 1 0 321887 CASAVA_Build 22 46300561 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 572 hom 17 2 11 4 A 13 12 321888 CASAVA_Build 22 46312586 3I GTGGGGAAAT ---/AAG AACACTTTTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAG 0 1 321889 CASAVA_Build 22 46325070 2D TGTGGGGGCT GG/-- GGGGGGTCTC 1878 het 1735 hom 25 6 7 12 G 8 6 321890 CASAVA_Build 22 46347962 4I TGCTTGAATG ----/TGTA TGTGCACATG 3070 hom 167 het 59 0 56 3 TGTA 0 1 321891 CASAVA_Build 22 46361684 1I ACACGGACAA -/C CATCAGCTGA 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 C 1 2 321892 CASAVA_Build 22 46377353 4D GGCCTGGAGG GAAA/---- GAAAAGCCCT 3070 het 3070 hom 43 18 20 6 GAAA 2 1 321893 CASAVA_Build 22 46378689 1D ATTCTATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 11 10 321894 CASAVA_Build 22 46391684 11D ACTTCTGTTC CCTTTTACTTT/----------- CCTTTTACTT 3070 het 3070 ref 33 21 10 10 CCTTTTACTTT 2 1 321895 CASAVA_Build 22 46398555 2I GGGTAGCGGC --/TA TGTTTCAGCC 3070 het 2839 hom 38 12 21 5 TA 0 1 321896 CASAVA_Build 22 46402669 2D TGTTGTGGGG GT/-- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 ref 74 34 32 11 GT 5 4 321897 CASAVA_Build 22 46403647 1I CTTCATGCAC -/A AGCTGCCTGT 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 A 1 2 321898 CASAVA_Build 22 46404763 3D CCTCAACCCC CTT/--- CTTCTTCAGC 3070 het 3070 ref 31 14 11 7 CTT 3 2 321899 CASAVA_Build 22 46412847 1D TCCTTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 48 1 36 11 A 12 11 321900 CASAVA_Build 22 46429013 28D6M15D TGGTGGTGAT GGTGGTGATGGGTAATGGTAATGATAGAAATGATGGTGATTATAGTGAA/----------------------------AATAAT--------------- GATGGTGATG 555 het 555 ref 25 13 7 15 N/A 0 0 321901 CASAVA_Build 22 46457189 1D GCTTCCTTAT G/- TGCTATTGAG 3070 het 3070 ref 45 19 13 14 G 1 0 321902 CASAVA_Build 22 46458234 1I GACCAGTACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 T 9 10 321903 CASAVA_Build 22 46461894 7I CACACACGTA -------/AGGTCCG AGGCGATTTC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 AGGTCCG 0 1 321904 CASAVA_Build 22 46463514 20I AAAAGGAGTT --------------------/CCACACCCATTGGCAACCAC CCCTCATTCC 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 CCACACCCATTGGCAACCAC 0 1 321905 CASAVA_Build 22 46469209 2I ATTACCTGCC --/AA AAGTTTCTGC 3070 hom 63 het 24 0 20 4 A 2 4 321906 CASAVA_Build 22 46472148 1D CCGCCCCCCC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 9 8 321907 CASAVA_Build 22 46475432 1I TCACTCTAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 8 9 321908 CASAVA_Build 22 46482330 1D TTTTTTTTTT A/- ATCAGAATCT 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 A 2 1 321909 CASAVA_Build 22 46483560 1D CCATGTTGCC T/- TGTGTTTTCA 3070 hom 108 het 37 0 37 2 T 2 1 321910 CASAVA_Build 22 46484222 1D TTTGTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 6 T 11 10 321911 CASAVA_Build 22 46487790 1I CTTGCACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 13 14 T 13 14 321912 CASAVA_Build 22 46494918 1I TTACTGTTGA -/G CAGATGTTCT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 G 0 1 321913 CASAVA_Build 22 46497698 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAGGCT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 6 7 321914 CASAVA_Build 22 46497844 2D TCAGAATGAA AG/-- AGAGGATATT 2877 het 2877 ref 37 22 7 11 AG 3 2 321915 CASAVA_Build 22 46505514 1D CAGCCTGGGT G/- GACAGAGCAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 2 1 321916 CASAVA_Build 22 46512497 1I TTGTACCAAG -/C TTCCCACTAG 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 C 0 1 321917 CASAVA_Build 22 46539876 1I CACACTTATG -/C CCCCATTGAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 C 4 5 321918 CASAVA_Build 22 46548669 1D GTGCTACACA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 106 het 41 0 33 8 T 8 7 321919 CASAVA_Build 22 46550353 1I CCCGGGGAAA -/G GTAAACTTGT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 1 2 321920 CASAVA_Build 22 46557562 2I ACGTTTTTTT --/TA TTTTGAGATG 3070 het 2765 hom 35 12 16 7 TA 0 1 321921 CASAVA_Build 22 46566461 1I TATTAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 2918 het 446 hom 22 1 11 10 T 16 17 321922 CASAVA_Build 22 46576982 1D CTTCCCTGTG C/- TAGTCATCTG 3070 het 3070 ref 44 22 12 10 C 1 0 321923 CASAVA_Build 22 46594250 1I AGCTCTCTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 9 10 321924 CASAVA_Build 22 46595078 1I TGTATTTTTA -/G TAGACACGGG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 0 1 321925 CASAVA_Build 22 46597236 1D ACTGGAGGGG C/- AAAAGCATTT 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 C 1 0 321926 CASAVA_Build 22 46601701 1I AGTAAAACTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 8 9 321927 CASAVA_Build 22 46602575 3I CCTTCTGAAA ---/GAG GAGATCATTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 GAG 1 2 321928 CASAVA_Build 22 46608760 1I AGGCCTGAGA -/C CCCCCCCTCC 3070 hom 65 het 25 0 21 4 C 7 8 321929 CASAVA_Build 22 46624785 1D ATGTCAGTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 83 hom 32 3 16 13 G 10 9 321930 CASAVA_Build 22 46625402 1D TCAGGAGGTA G/- GAAAATCCTA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 G 2 1 321931 CASAVA_Build 22 46641667 2D TAAATTGCAG TA/-- TATATATATA 1762 het 1314 hom 21 7 9 5 TA 9 8 321932 CASAVA_Build 22 46641755 4D CACAATACAA ATAT/---- ATATATTTGT 3070 het 1434 hom 13 4 9 1 AT 5 3 321933 CASAVA_Build 22 46646944 1I AATCTGGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 T 9 10 321934 CASAVA_Build 22 46652228 1D CCTAACTCTG T/- TTGCTTTGTG 3070 hom 106 het 43 0 36 7 T 3 2 321935 CASAVA_Build 22 46659999 4I GTGTGCCTGC ----/CTCA CTCACAACAT 3070 hom 82 het 34 0 28 6 CTCA 1 2 321936 CASAVA_Build 22 46676068 2I AGAGACAGAC --/AA AGAGTCGAAG 3070 hom 151 het 55 0 51 4 A 1 3 321937 CASAVA_Build 22 46683497 8I CCTCCCAAAG --------/TGCTGGGA TAATAGGCCC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TGCTGGGA 0 1 321938 CASAVA_Build 22 46684350 4D ATAAAGTATT TGAA/---- TGAATATTTA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 TGAA 2 1 321939 CASAVA_Build 22 46690966 4D TTATATATAT ATAG/---- ATAGATATAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 ATAG 2 1 321940 CASAVA_Build 22 46692232 13I TTCCTCCCTG -------------/TCCTTCCTCCCTC TCCTTCCTCC 3070 hom 66 het 34 0 18 16 TCCTTCCTCCCTC 0 1 321941 CASAVA_Build 22 46707213 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 34 1 25 8 A 10 11 321942 CASAVA_Build 22 46709006 1I ATTTTAAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 922 hom 27 2 19 6 A 9 10 321943 CASAVA_Build 22 46709534 1I AGTCTGGGTC -/T TTTTTTTTTT 2742 het 402 hom 25 1 12 12 T 11 12 321944 CASAVA_Build 22 46711960 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1315 het 1315 ref 17 11 3 3 A 11 12 321945 CASAVA_Build 22 46713858 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 831 hom 17 2 11 4 A 14 13 321946 CASAVA_Build 22 46714091 1D TACACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 327 hom 36 1 29 7 A 11 10 321947 CASAVA_Build 22 46717695 3I GATTTGGAAG ---/GTT GTTGTTACTC 3070 hom 152 het 57 0 49 8 GTT 2 3 321948 CASAVA_Build 22 46774607 1D TAGTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 A 11 10 321949 CASAVA_Build 22 46775363 1I GAGATTTCTC -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 46 15 25 7 A 6 7 321950 CASAVA_Build 22 46779919 5I CAAGATACTA -----/TAATG TAATAGATTT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 TAATG 0 1 321951 CASAVA_Build 22 46780105 1D TTAATAACTC T/- TTCCACCCAA 3070 het 3070 hom 29 15 14 0 T 3 2 321952 CASAVA_Build 22 46784667 3I TCTGCAGTTT ---/TTC TTCTTGTTAC 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 TTC 1 2 321953 CASAVA_Build 22 46797718 5D ATAAAAGTGA TAAAT/----- TAGGTAGTAT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TAAAT 1 0 321954 CASAVA_Build 22 46803110 1I TGTGTTTTAC -/A AACAAGGTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 2 3 321955 CASAVA_Build 22 46810978 10I TCTGTTAATG ----------/TTTATTTTTA TTTATTTTTA 1924 het 1924 ref 23 14 4 5 TTTATTTTTA 1 2 321956 CASAVA_Build 22 46818803 4D ATAGACGGAT AGAC/---- AGGCGGATAG 3070 het 2926 hom 34 14 15 6 AGAC 1 0 321957 CASAVA_Build 22 46831266 1D CCTTTGCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 23 22 9 A 11 10 321958 CASAVA_Build 22 46832930 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAGGCT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 7 6 321959 CASAVA_Build 22 46837723 3I AAGAGAAAGA ---/AAG AAAATAAATT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AAG 0 1 321960 CASAVA_Build 22 46849122 1D GCCCCTCAGC T/- TTGACAACAC 3070 hom 147 het 58 0 48 10 T 3 2 321961 CASAVA_Build 22 46851414 1D CCAGGGGAGG A/- AAAGACATGT 3070 hom 76 het 41 0 31 10 A 4 3 321962 CASAVA_Build 22 46859512 7D GCTGAGGGAG GGAGCCA/------- GGAGCCAGGA 3070 hom 56 het 25 0 17 8 GGAGCCA 3 2 321963 CASAVA_Build 22 46860160 1D GTACCTGATT G/- GAGGTGAGGG 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 G 2 1 321964 CASAVA_Build 22 46861496 2I ACGCATGGAC --/AT AGTGGTGTGG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AT 0 1 321965 CASAVA_Build 22 46864282 1D CAGCAGGTCT C/- CCACCCTCCT 3070 hom 105 het 44 0 34 12 C 3 2 321966 CASAVA_Build 22 46865314 4I TGGAATACAT ----/GGAC GGACTTGATC 2518 het 2518 ref 29 18 6 5 GGAC 1 2 321967 CASAVA_Build 22 46870978 1I CTGTGGATCA -/G GCCTAGTGAG 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 G 1 2 321968 CASAVA_Build 22 46872122 1I AGGCACCGGA -/G GACTCATGGC 3070 hom 89 het 34 0 28 6 G 1 2 321969 CASAVA_Build 22 46913249 1I CAAAAATTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 A 9 10 321970 CASAVA_Build 22 46915386 15I AGTGGAGGGC ---------------/CCTTCTATACTCTCT CTGCTGGAGT 3070 hom 93 het 32 0 31 2 CCTTCTATACTCTCT 0 1 321971 CASAVA_Build 22 46916664 9D TAACTCATAA AGATGGTGC/--------- AGCCTGCAGG 2277 het 2277 ref 28 10 10 11 AGATGGTGC 1 0 321972 CASAVA_Build 22 46916729 2D CTTTGCAGCC TG/-- ATCCACAACA 3070 hom 93 het 36 0 30 8 TG 1 0 321973 CASAVA_Build 22 46917405 1D ATAACCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 T 11 10 321974 CASAVA_Build 22 46919308 1D TCTGATTCTA C/- CCCCCCCAGT 3070 hom 125 het 45 0 40 5 C 8 7 321975 CASAVA_Build 22 46930010 1D TCAGGCTGAA G/- GGGGGTTTTC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 6 5 321976 CASAVA_Build 22 46935985 16D TAATGAACTT GGTGGAAGTGGGCAAG/---------------- GCTGAAAGCC 3070 het 3070 ref 39 22 17 4 GGTGGAAGTGGGCAAG 1 0 321977 CASAVA_Build 22 46942005 4D TTTTATCACC TTCT/---- TTCTATTAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 4 TTCT 2 1 321978 CASAVA_Build 22 46948717 2D ATTAAAAATA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 AC 9 8 321979 CASAVA_Build 22 46957787 1D TCTCTGTAGC A/- GGGGGGTGCA 1840 het 1840 ref 31 15 9 8 A 1 0 321980 CASAVA_Build 22 46984249 1I46M1I ACATCCCAAT -GGCAAAGCCATTCCCAGGGACGGGTCCTGGGTGGAGGTTAGCCCTG-/GGGCAAAGCCATTCCCAGGGACGGGTCCTGGGTGGAGGTTAGCCCTGC CCACCATGGG 3070 hom 113 het 24 0 35 5 N/A 0 0 321981 CASAVA_Build 22 46985313 2I CTGAGATGTT --/GA GTTACTTGAA 3070 het 3070 hom 47 16 24 7 GA 0 1 321982 CASAVA_Build 22 47007958 1D AAACAACAGG T/- TTTAGACTTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 4 3 321983 CASAVA_Build 22 47011091 1I CAGGGAACCT -/A AAAAAAATTA 1512 het 1512 ref 16 7 5 4 A 7 8 321984 CASAVA_Build 22 47027921 1D TGCCAAGGGT G/- GGGGGGGGAG 2701 het 2618 hom 26 10 9 8 G 9 8 321985 CASAVA_Build 22 47035641 3D TCATCGCCAA CAT/--- CATCATCTTC 3070 hom 207 het 88 0 64 27 CAT 3 2 321986 CASAVA_Build 22 47047715 1D ATGTGCTATA G/- GTGTCACTAA 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 G 2 1 321987 CASAVA_Build 22 47048511 4I TTCCATTCAT ----/CCAC CCACCCACCC 3070 hom 76 het 40 0 20 20 CCAC 3 4 321988 CASAVA_Build 22 47049485 8D ACCAGATGAC GCCTGTGG/-------- GCTGAACCCA 3070 hom 154 het 56 0 51 9 GCCTGTGG 1 0 321989 CASAVA_Build 22 47054932 2D GCAACTTGTA GG/-- GGAACACTAA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 G 4 2 321990 CASAVA_Build 22 47055811 4D TAAGAATCAA AAGG/---- AAGGAAATGG 3070 hom 113 het 40 0 38 4 AAGG 2 1 321991 CASAVA_Build 22 47064371 1D CATGGCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 40 2 28 10 T 11 10 321992 CASAVA_Build 22 47067004 2D CATGAACTTC AT/-- ATGTTTCCCC 3070 het 3070 hom 62 21 30 12 AT 2 1 321993 CASAVA_Build 22 47067236 1I ACCTAGGACA -/C CCCCCAGGAA 2766 het 2766 ref 32 14 9 9 C 5 6 321994 CASAVA_Build 22 47067575 2I AAACGAAAAC --/TG GGAATTCACC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TG 0 1 321995 CASAVA_Build 22 47067997 2D TAAAACCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1847 hom 35 10 15 10 A 12 10 321996 CASAVA_Build 22 47070454 4D TCTATATTGA TTCG/---- TTTATTATAA 3070 het 3070 ref 41 23 14 6 TTCG 1 0 321997 CASAVA_Build 22 47084068 1D CCTCCTTCCT C/- CGCCTTACCA 3070 hom 54 het 25 0 18 8 C 2 1 321998 CASAVA_Build 22 47091461 16D TTGGGGTCGA ACACCAAGAGGGATCC/---------------- ACAACAGAGT 3070 het 3070 ref 31 19 12 3 ACACCAAGAGGGATCC 1 0 321999 CASAVA_Build 22 47125428 3D AAAAAAAAAA AAC/--- CAAATATCAG 3070 het 3070 hom 33 14 13 9 AAC 1 0 322000 CASAVA_Build 22 47128376 7D GGGTTAATCA CATTATT/------- CATTATTCAC 3070 het 3070 ref 48 22 19 11 CATTATT 2 1 322001 CASAVA_Build 22 47138774 1I CTGACGGAAG -/C CTCCCAGGCC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 C 1 2 322002 CASAVA_Build 22 47144107 1D ACAAAAGGGG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 34 12 14 10 A 7 6 322003 CASAVA_Build 22 47145368 2I CCAGTCTTAG --/AT ATTTCCTGGA 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 AT 1 2 322004 CASAVA_Build 22 47146468 1I CATCTTTAAG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 T 7 8 322005 CASAVA_Build 22 47149277 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1142 het 1142 ref 17 13 4 0 T 13 12 322006 CASAVA_Build 22 47160371 1D CATAAAACTA C/- CCTAACATTG 3070 hom 108 het 44 0 37 8 C 3 2 322007 CASAVA_Build 22 47164223 1D GGTTGAAACT C/- CCAACTCCCA 3070 het 3070 ref 55 27 14 15 C 3 2 322008 CASAVA_Build 22 47173875 2I ATTACAGGCA --/CC CACGACCACG 2104 het 2104 ref 14 9 5 0 C 1 3 322009 CASAVA_Build 22 47177891 1D GGCCCACTCA T/- TATGACCTCA 2998 het 2998 ref 30 16 7 7 T 2 1 322010 CASAVA_Build 22 47178399 1D TGGGTCCCCC T/- CCTCATTGTT 2967 het 1846 hom 24 5 11 9 T 1 0 322011 CASAVA_Build 22 47178878 3I AGGGGCTCAC ---/CTT CTCCCAGGCT 3070 het 3070 hom 36 9 21 6 CTT 0 1 322012 CASAVA_Build 22 47181411 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 1620 hom 20 5 14 1 T 5 6 322013 CASAVA_Build 22 47188491 3I TCCTTAATAC ---/CAT CATCACGCTT 3070 het 3070 hom 43 13 27 3 CAT 1 2 322014 CASAVA_Build 22 47195810 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2474 het 1629 hom 20 8 9 3 A 12 11 322015 CASAVA_Build 22 47200752 20I GCAGGGCCTC --------------------/CCTGGCCTTCTGGTGGCCCA CCTGTCCCAG 3070 het 3070 hom 41 14 13 14 CCTGGCCTTCTGGTGGCCCA 0 1 322016 CASAVA_Build 22 47205430 1I GCGTTTGACA -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 T 7 8 322017 CASAVA_Build 22 47207410 1I AAAAGAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2069 hom 24 8 11 5 A 9 10 322018 CASAVA_Build 22 47208296 1D GCTGTGTCTC G/- GGAATCTCCT 3070 het 3070 ref 37 16 12 10 G 3 2 322019 CASAVA_Build 22 47208913 2D CGGGAAGACT CC/-- GTAGCAGAGG 3070 het 3070 ref 31 17 8 8 C 2 0 322020 CASAVA_Build 22 47210071 1D TTGCTGAAAA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 97 het 37 0 31 7 T 7 6 322021 CASAVA_Build 22 47210580 3I TCTCATGTGA ---/AAG AAGGAGACAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAG 1 2 322022 CASAVA_Build 22 47212560 3D CACCGTCCTG AAC/--- AACAGCAATG 3070 het 3070 ref 30 13 10 9 AAC 2 1 322023 CASAVA_Build 22 47214904 1I CAATCCATCG -/C CGCCGTCTTC 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 C 1 2 322024 CASAVA_Build 22 47225616 1D ATAAACTTCA G/- GGCTGGGCAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 3 2 322025 CASAVA_Build 22 47228187 4D TAAAGAGCAT CTCG/---- CTGGCCTCTG 3070 hom 87 het 31 0 30 3 CTCG 1 0 322026 CASAVA_Build 22 47236459 2I TTTAAATATC --/AT AGGAATTAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 AT 0 1 322027 CASAVA_Build 22 47239387 1D AAAATACATG A/- AAAAATCATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 6 5 322028 CASAVA_Build 22 47240176 1I AATGAAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 11 12 322029 CASAVA_Build 22 47241974 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1507 hom 10 het 4 0 4 0 T 15 14 322030 CASAVA_Build 22 47252227 1I AAAATTCCTT -/A AAAAAAAAAA 2134 het 720 hom 23 2 14 7 A 15 16 322031 CASAVA_Build 22 47254332 1D AAAGTGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 32 1 20 11 A 12 11 322032 CASAVA_Build 22 47255461 1D CTTTATCCAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 7 322033 CASAVA_Build 22 47265303 3D ACAGACACCA CCT/--- CCTCCAGAGC 1665 hom 12 het 7 0 5 2 CCT 2 1 322034 CASAVA_Build 22 47276888 10I TGGGGGAGCT ----------/GAGCCTTCCC GGGAGTACTT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 GAGCCTTCCC 0 1 322035 CASAVA_Build 22 47308248 1D TCCCCAAACC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 7 het 33 1 23 11 T 9 8 322036 CASAVA_Build 22 47335062 1D3M2D ATTATTATTA TTATTA/-TAT-- TATTATTATT 1794 hom 10 het 4 0 4 0 N/A 0 0 322037 CASAVA_Build 22 47345306 1D ATAGCAGAAA G/- AAGATTTCTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 G 1 0 322038 CASAVA_Build 22 47367857 8D CACACCACAC ACAAAAAA/-------- ATACACCACA 48 het 48 ref 19 7 2 16 ACAAAAAA 1 0 322039 CASAVA_Build 22 47372075 5I GAAGCAAACA -----/GACAG GAGAGGGGGC 3070 hom 74 het 27 0 21 6 GACAG 0 1 322040 CASAVA_Build 22 47372215 1D CCAAGACACC T/- TGATTTCCAA 3070 hom 82 het 34 0 25 9 T 2 1 322041 CASAVA_Build 22 47382943 2D GTGTGATTTC GT/-- GTGTGTGTGC 3070 hom 134 het 52 0 43 9 GT 5 4 322042 CASAVA_Build 22 47387796 9D ATGGTGAGGA TGGTGGTGG/--------- TGGTGGTGGT 3070 het 3070 ref 64 19 15 34 TGG 8 5 322043 CASAVA_Build 22 47390145 1D CTGCAGCAGG C/- AGACCCAAAG 3070 het 2087 hom 16 6 9 2 C 1 0 322044 CASAVA_Build 22 47398976 1D GCATTTTGCC T/- GCGCATGGAA 3070 het 3070 hom 50 21 19 11 T 1 0 322045 CASAVA_Build 22 47400230 1D GGAGGTGCAC A/- AGCACATATG 3070 hom 96 het 35 0 27 8 A 2 1 322046 CASAVA_Build 22 47407360 1I CCCTGTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3024 hom 39 10 18 11 A 12 13 322047 CASAVA_Build 22 47413049 3I GGCTGTGGGG ---/CTT CTTTTGTTTC 2922 hom 32 het 13 0 9 4 CTT 1 2 322048 CASAVA_Build 22 47416744 8D CCTTGACTCC TTTACTCA/-------- TTTACTCATT 3070 hom 141 het 55 0 47 12 TTTACTCA 2 1 322049 CASAVA_Build 22 47416925 4D ACTGAGTCAC TCAG/---- TCAATCACTC 3070 het 3070 hom 53 20 28 6 TCAG 1 0 322050 CASAVA_Build 22 47417018 12D GTCACTCAGC CACTCATTTAGT/------------ CACTCACTCA 617 het 617 ref 55 20 11 31 CACTCATTTAGT 1 0 322051 CASAVA_Build 22 47420604 3D GGCAATACCA CCC/--- CCCCCCCGAC 1362 het 65 hom 16 1 7 8 C 10 7 322052 CASAVA_Build 22 47421472 1I TGGGGACCTG -/C CCCCCGGGCC 1787 het 1787 ref 21 8 8 5 C 5 6 322053 CASAVA_Build 22 47431075 4I GACTCTGTCT ----/CAGA CAAAAAAACA 2787 het 2173 hom 14 7 6 1 CAGA 0 1 322054 CASAVA_Build 22 47435059 16D GAGGCACCCT CTCCACTGCTTAGGGG/---------------- CATGGACATG 3070 hom 74 het 22 0 20 6 CTCCACTGCTTAGGGG 1 0 322055 CASAVA_Build 22 47436147 3D GTAGATAAGT TGC/--- TGATTTTTGA 3070 hom 121 het 47 0 37 12 TGC 1 0 322056 CASAVA_Build 22 47442005 4D6M2I GGGGCTTGGC CTTTTTGGTG--/----TGTGTGCA GGGAACAAGG 3070 hom 51 het 17 0 17 2 N/A 0 0 322057 CASAVA_Build 22 47444736 7I TGTGATGGGG -------/GTGATTC GTGATTCAAG 1875 het 1875 ref 19 6 8 5 GTGATTC 1 2 322058 CASAVA_Build 22 47445350 2I GCTGGGCCCC --/TG TGGGTGTCTT 3070 hom 67 het 36 0 30 6 TG 1 2 322059 CASAVA_Build 22 47445594 1D CTGCATCTTT A/- TAGGTCCTGT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 1 0 322060 CASAVA_Build 22 47447799 1I TTCTGATTAA -/T GTTCCATGTG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 0 1 322061 CASAVA_Build 22 47449336 5I TACTTGGAGA -----/GGTAG GGTAGCACCC 2545 het 2545 ref 23 10 7 6 GGTAG 1 2 322062 CASAVA_Build 22 47455565 2D CCTCTGTGTG TC/-- TCTGCTTCCT 3070 het 3070 ref 33 16 11 8 TC 2 1 322063 CASAVA_Build 22 47456599 1D CAGCGGTTCC T/- TTCTGGCACC 3070 hom 106 het 41 0 29 12 T 3 2 322064 CASAVA_Build 22 47462814 3I TAAGAGGTGA ---/TGG CGGCAGCACA 2994 het 2994 ref 24 12 8 4 TGG 0 1 322065 CASAVA_Build 22 47470330 1D GATTAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 42 0 34 8 T 11 10 322066 CASAVA_Build 22 47470427 1D TGTTTTGGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 9 8 322067 CASAVA_Build 22 47472369 12I GAGGTGGGCT ------------/TGGCTGGGGGGC TGGCTGGGGT 3070 hom 62 het 23 0 16 7 TGGCTGGGGGGC 0 1 322068 CASAVA_Build 22 47479690 3D TGATAATGAT GAC/--- GATGATGATG 3070 het 3070 ref 72 35 25 13 GAC 1 0 322069 CASAVA_Build 22 47479784 3I ATGGTGGTGG ---/TGA TATTTATGAT 3070 het 3070 hom 75 31 38 6 TGA 0 1 322070 CASAVA_Build 22 47489831 13D GGTGCTAAAT TCCTGACCATCTG/------------- TCCTGGGGCA 2207 het 2207 ref 23 15 9 2 TCCTGACCATCTG 1 0 322071 CASAVA_Build 22 47501732 1D GCCCAGAAAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 2797 hom 31 9 14 9 A 9 8 322072 CASAVA_Build 22 47504495 1I CACGTTCTGC -/G CATGTACCCC 3070 het 3070 hom 33 15 15 7 G 0 1 322073 CASAVA_Build 22 47512204 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2682 het 1815 hom 17 7 6 4 A 10 11 322074 CASAVA_Build 22 47535751 1D TCTCTCCCTC T/- TAGTGAGGTC 3070 hom 98 het 36 0 28 8 T 2 1 322075 CASAVA_Build 22 47535939 2D CAGTTCAGAC TG/-- TGGATGGGAT 3070 het 3070 ref 44 17 13 15 TG 2 1 322076 CASAVA_Build 22 47536098 2D TGCGTGTGAA TG/-- TGTGTGTGCC 3070 het 3070 hom 83 24 33 27 TG 5 4 322077 CASAVA_Build 22 47539388 1I TTTGCCAGGG -/A GCTGACCTTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 0 1 322078 CASAVA_Build 22 47540566 1I GGTGTCACCA -/C CTGCCACAGC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 C 1 2 322079 CASAVA_Build 22 47541570 2D CGCACATGCG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 31 15 11 7 CA 7 6 322080 CASAVA_Build 22 47544180 11I AACAACGCTT -----------/AGAAGAATAAA AGACATTTCA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 AGAAGAATAAA 0 1 322081 CASAVA_Build 22 47548517 1I CATCGCACAA -/C TTTTGATCTG 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 C 0 1 322082 CASAVA_Build 22 47554945 1D TGCTGGCTTC T/- TTTTTTTTTT 1065 het 1065 ref 20 8 4 8 T 17 16 322083 CASAVA_Build 22 47557011 1D TCTGTCATTT A/- AAAAATTGTA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 6 5 322084 CASAVA_Build 22 47557203 10I TAACTGTGTG ----------/TGTTGCTAAC TTACCTGTGT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TGTTGCTAAC 0 1 322085 CASAVA_Build 22 47558451 3I TAGTTATGTA ---/ATT ATTTCTATAT 3070 het 3070 hom 50 23 25 2 ATT 1 2 322086 CASAVA_Build 22 47559163 1D ATTATAACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 10 9 322087 CASAVA_Build 22 47575893 2D GCGTGTGTGT GC/-- GCGTGTGCGT 2222 hom 48 het 29 0 17 12 GC 2 1 322088 CASAVA_Build 22 47576031 12D31M4D GTGCGTGTGC GTGTGTGCGTGTGCGTGCGTGTGTGTGCGTGCATGTCTGGGCGTGTA/------------GCGTGCGTGTGCGTGTGTGCACGTGTGTGCG---- TGTGCGTGTG 3070 het 1423 hom 28 10 15 16 N/A 0 0 322089 CASAVA_Build 22 47583698 1I GCTGAACCAA -/T TGTTCATCTT 3070 het 3070 hom 50 19 21 10 T 1 2 322090 CASAVA_Build 22 47595300 1I CATTCTTGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 9 9 T 9 10 322091 CASAVA_Build 22 47598259 2D GCACCAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 707 hom 34 4 15 15 A 12 10 322092 CASAVA_Build 22 47601483 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 12 11 322093 CASAVA_Build 22 47605518 2D TAGCAATAGC AA/-- AAAAAAAAAA 2920 het 628 hom 28 6 12 11 A 18 16 322094 CASAVA_Build 22 47610472 33I GCTCCGAGCA ---------------------------------/TGGGCCCCCTGAGCCTCCAGATGCACCCGAGCT TGCATTCTGG 3070 hom 50 het 21 0 14 7 TGGGCCCCCTGAGCCTCCAGATGCACCCGAGCT 0 1 322095 CASAVA_Build 22 47612684 1I ACATATCAAT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 87 het 39 0 34 5 A 6 7 322096 CASAVA_Build 22 47619273 2D CCTTACTCAC AT/-- GTGTCCTCAC 3070 het 3070 ref 72 35 26 13 AT 1 0 322097 CASAVA_Build 22 47619449 2I ACATGCACAC --/AT GTGTCCTCCC 3070 het 3070 ref 68 29 26 13 AT 0 1 322098 CASAVA_Build 22 47624093 1I CTAAAATACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 T 10 11 322099 CASAVA_Build 22 47628595 1D29M4D ACTTTGTTTC TTTTTTTTGTTTGTTTTTTGTTTGTTTTATTTTA/-TTTTTTTGTTTGTTTTTTGTTTGTTTTAT---- TTTTTTTTTT 2646 het 2646 ref 23 13 10 3 N/A 0 0 322100 CASAVA_Build 22 47629891 15D CATTGAATGT GCACACCTGTGGGAG/--------------- GCACACCTGT 3070 het 3070 ref 32 22 10 8 GCACACCTGTGGGAG 2 1 322101 CASAVA_Build 22 47640066 2I AGCTCAGACC --/CT CTCTGCTCTA 3070 het 2384 hom 30 8 17 5 CT 2 3 322102 CASAVA_Build 22 47654629 3I TTGCCAAAGG ---/CTT CTTCTTCTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 CTT 2 3 322103 CASAVA_Build 22 47657822 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 9 10 322104 CASAVA_Build 22 47659030 8D TCCTCTCTCC CTCTCCCT/-------- CTCTGGTAGA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 CTCTCCCT 1 0 322105 CASAVA_Build 22 47659505 4D CTGTCATCTG GTAA/---- GTGTGTTTAA 3070 het 3070 hom 60 24 31 5 GTAA 1 0 322106 CASAVA_Build 22 47661137 10I TCTCTTTCTT ----------/TTCTCCCTTA GTCTTGACTA 3070 hom 96 het 35 0 33 4 TTCTCCCTTA 0 1 322107 CASAVA_Build 22 47661310 3I ACCAATGAAT ---/ATA ATATTTTCAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ATA 1 2 322108 CASAVA_Build 22 47661404 1D TCCTATGAGA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 T 8 7 322109 CASAVA_Build 22 47662073 2I CGTACGTATA --/TG TGTGTGTATA 2375 het 2375 ref 28 13 6 9 TG 3 4 322110 CASAVA_Build 22 47668172 1I CTCCTTTTTT -/A ATTGACCAGC 3070 het 2712 hom 27 11 11 5 A 1 2 322111 CASAVA_Build 22 47680879 1I TGCCCAGAGT -/G GCTTTCCGGG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 G 1 2 322112 CASAVA_Build 22 47681188 2D ATCTTGTCCC CT/-- GTTCCATGCT 3070 het 3070 ref 48 23 18 8 CT 1 0 322113 CASAVA_Build 22 47690651 1D AATGACGCCA G/- CAACTTGGCA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 G 1 0 322114 CASAVA_Build 22 47690763 1D GTAGGAGCTA T/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 T 7 6 322115 CASAVA_Build 22 47691909 1D GTGTAATCTT A/- AATCTATGAG 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 3 2 322116 CASAVA_Build 22 47694609 1I TCTCCCCCCC -/T CCGCCACACC 1292 hom 11 het 8 0 4 4 T 0 1 322117 CASAVA_Build 22 47695160 5I ATATTTATAT -----/TCTTA TCTTCTATTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TCTTA 0 1 322118 CASAVA_Build 22 47697850 2I TTAAATTATC --/TT GACACCTTTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 0 2 322119 CASAVA_Build 22 47699490 1D AGTAATTAGA T/- TTTTTTTTTT 2570 het 2570 ref 29 15 9 6 T 11 10 322120 CASAVA_Build 22 47702401 6I AGAAAGAGAG ------/AGAGAC AGAGACAGAG 3070 hom 95 het 38 0 31 7 AGAGAC 1 2 322121 CASAVA_Build 22 47707748 3D TGAGATTAAA TTC/--- TTCTTATGTG 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 TTC 2 1 322122 CASAVA_Build 22 47710279 2I GTGTGTAGGC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 37 16 12 9 AT 4 5 322123 CASAVA_Build 22 47710647 4D TAATTTACTT ACTG/---- ACTATTTTTG 3070 het 3070 ref 38 18 14 9 ACTG 1 0 322124 CASAVA_Build 22 47718994 1D AAGTAAGGAT A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 A 7 6 322125 CASAVA_Build 22 47720008 7D10M1D11M3D AAAAAAAAAA AAAGAGGAAAGAAAGAGAAAAAAAGAGAAAAG/-------AGAGAAAAAG-AAAAAAGAGAA--- AAGGAAAATC 1812 het 1812 ref 19 23 5 2 N/A 0 0 322126 CASAVA_Build 22 47720511 4D46M4I CTTTTCTGTT TTTCTTTATTTGCACAGCAGCCCTGAACTTCAAGGTCATAATCTCTATAA----/----TTTATTTGCACAGCAGCCCTGAACTTCAAGGTCATAATCTCTATAATCAG TCAGAGTAAG 3070 het 3070 ref 45 26 21 10 N/A 0 0 322127 CASAVA_Build 22 47720612 4I AAGAGCTTTA ----/ACAC ACAAAGCACA 3070 het 3070 ref 40 15 10 15 AC 1 3 322128 CASAVA_Build 22 47730996 1I ACTCCAGCAT -/C CCCCCCCTCC 1484 hom 24 het 13 0 6 7 C 7 8 322129 CASAVA_Build 22 47731675 2D CTTTGGGGAG AC/-- ACAATGAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 18 10 AC 2 1 322130 CASAVA_Build 22 47733331 2D AAAAAATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 164 hom 28 3 12 13 A 13 11 322131 CASAVA_Build 22 47733872 1I ATTTCTGGTA -/C CCCCTTCTCT 2533 het 2533 ref 24 10 8 6 C 4 5 322132 CASAVA_Build 22 47738341 4D10M3I ATACACTTAC CACACACACAAAGT---/----CACACAAAGTCAC CACATCGCAA 3070 het 3070 ref 61 47 15 11 N/A 0 0 322133 CASAVA_Build 22 47738488 5D8M1D8M1D5M6D14M4D10M2I36M4D ACACACAACA ACCACCACATACCACACACACACAGCATACACAGACACAAACTACAGCATAAACATACACAC--ACACCACAACCACATTCACACCACACCCACACACAACAAC/-----CACATACC-CATACACA-AGCAT------AAACACACTACATC----ACATACACACATACACCAGAACCATACCCACACTGCACTCACATACAA---- CACCACATAC 1619 het 1619 ref 61 81 5 40 N/A 0 0 322134 CASAVA_Build 22 47738658 12D9M4D9M1I CACCACACAC ACCACCAACCAAAACCACACAACCCCCCCACACA-/------------AACCACACA----CCACAAACAT CACACCACAC 3070 het 3070 ref 44 19 11 26 N/A 0 0 322135 CASAVA_Build 22 47738753 3I ACACATCACA ---/CAC CACACATGCA 3070 het 3070 ref 55 23 19 13 CAC 1 2 322136 CASAVA_Build 22 47746081 3D CCAACCTATC AAT/--- AATCAACTGA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AAT 2 1 322137 CASAVA_Build 22 47747263 1I AAAAGCTCTC -/A AAATCAGTAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 3 4 322138 CASAVA_Build 22 47748498 4I ATACAGATTG ----/AAAA GAAATAAAAG 3070 het 8 hom 27 2 24 2 A 0 4 322139 CASAVA_Build 22 47749338 1D AGAAAATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 13 12 322140 CASAVA_Build 22 47753149 2D ATCAGAAAAA CT/-- CTTTTAGAAT 3070 het 3070 ref 23 12 11 2 CT 2 1 322141 CASAVA_Build 22 47757357 1I AGTGAGAAAC -/G TCTTCCTCTG 3070 het 3070 hom 28 9 11 8 G 0 1 322142 CASAVA_Build 22 47761256 1I AATCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 36 1 26 9 A 11 12 322143 CASAVA_Build 22 47767491 6I15M2I9M1I4M3D TTGCGTGCTT ------TGTATTTTGTGTGTG--ATGTACTGT-GTGTGCG/GTGGAGTGTATTTTGTATGTGATATGTGCTGTGGTGT--- GTGATGTGTG 2752 hom 24 het 9 0 9 0 N/A 0 0 322144 CASAVA_Build 22 47785096 2D GTTTGCCTGC CT/-- CTATAAATAA 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 CT 2 1 322145 CASAVA_Build 22 47787383 4D TGTATGTTCA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 64 31 16 20 TG 11 9 322146 CASAVA_Build 22 47795340 3D ATGAAAATAA ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 2346 hom 24 7 12 5 ATT 7 6 322147 CASAVA_Build 22 47805620 1D AGCTCAAGGC T/- GGACCCAGCA 3070 het 2415 hom 31 9 12 10 T 1 0 322148 CASAVA_Build 22 47811702 3I ACCCAGCTAA ---/TTC TTCTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 TTC 1 2 322149 CASAVA_Build 22 47815250 2I GGGGGTAATT --/AG AGTCGACGTA 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 AG 1 2 322150 CASAVA_Build 22 47816273 1I AGCTGTGCAT -/G GTGACATGCA 3070 het 3013 hom 22 8 11 3 G 1 2 322151 CASAVA_Build 22 47817436 1I GGGGAGCAAC -/A GTGACATAGA 3070 het 2745 hom 30 8 8 14 A 0 1 322152 CASAVA_Build 22 47818494 1D AAATGCCCTC G/- GGTTCTTGCA 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 G 3 2 322153 CASAVA_Build 22 47875971 1I17M1D ATGGAAGGGA -GGGGTATGGACGGTGTGC/GGGGGTATGGACGGTGTG- CCCAGGTACC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 N/A 0 0 322154 CASAVA_Build 22 47888198 1D TCTGGAGGAA G/- CCCAGGCTTT 3070 hom 89 het 33 0 29 4 G 1 0 322155 CASAVA_Build 22 47905952 1I AATCATCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 830 hom 38 2 26 10 T 13 14 322156 CASAVA_Build 22 47909155 1I TCACAATCAT -/G GCAGAAGGTG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 1 2 322157 CASAVA_Build 22 47909883 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 A 9 10 322158 CASAVA_Build 22 47910041 1I AGCGAGACTC -/A AAAAAAAAAA 1212 het 1212 ref 20 10 3 7 A 11 12 322159 CASAVA_Build 22 47928409 1D GGGTAAGCCA G/- GGTCCACTCA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 G 3 2 322160 CASAVA_Build 22 47934226 1I GGTCTCTGCC -/A GGGGGGAGGC 2253 het 907 hom 19 6 6 7 A 0 1 322161 CASAVA_Build 22 47934630 6I GGTGCAAAGA ------/TGCACC TGCCACCCAG 2362 het 2138 hom 16 7 7 2 TGCACC 0 1 322162 CASAVA_Build 22 47938110 30D ACATGATATC CACAGCCCCTCCTACTCTGCACACAATTCA/------------------------------ CACAGCCCCT 2068 het 2068 ref 37 26 6 15 CACAGCCCCTCCTACTCTGCACACAATTCA 1 0 322163 CASAVA_Build 22 47947160 4I GCCAACAACC ----/ATCT GCAGTGAGGG 3012 het 3012 ref 31 16 9 6 ATCT 0 1 322164 CASAVA_Build 22 47949020 4D TAGAGGACAG CCTC/---- CCTCCCTCCC 1133 het 726 hom 16 2 5 9 CCTC 6 5 322165 CASAVA_Build 22 47981965 1I CAGATTTTTA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3002 hom 23 7 12 4 T 6 7 322166 CASAVA_Build 22 47992190 2D TGCCATAAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 33 het 17 0 12 6 TA 9 8 322167 CASAVA_Build 22 47994780 1I GAGGGGTGTG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 6 7 322168 CASAVA_Build 22 47998351 1D ACACTTCTAG A/- ATGGTAATTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 A 2 1 322169 CASAVA_Build 22 48000153 1D CGTCATCATT A/- AAATGCTTTT 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 A 4 3 322170 CASAVA_Build 22 48012494 1D CTCTGTCCTG C/- CCCAGAGGCC 3070 hom 95 het 34 0 31 3 C 4 3 322171 CASAVA_Build 22 48019589 3I CCTCTCCCTC ---/CCT CCCTCCCTCC 1789 hom 18 het 9 0 6 3 CCT 0 1 322172 CASAVA_Build 22 48028946 1I AAAAACCCCC -/A ATGAACTCAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 322173 CASAVA_Build 22 48037248 1D GCTCAGCCTC G/- GGGGGGCAGT 3070 het 938 hom 22 6 11 5 G 7 6 322174 CASAVA_Build 22 48037567 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTCCC 2812 het 2812 ref 25 15 8 2 T 7 8 322175 CASAVA_Build 22 48038348 1D CCCTGTAAGG A/- AAGCAAAAAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 3 2 322176 CASAVA_Build 22 48040775 2D GCCCCAAACA CG/-- CTCCCCGTAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 7 CG 1 0 322177 CASAVA_Build 22 48044830 8D ACTCCATCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAG 3070 het 1310 hom 19 7 13 1 A 17 9 322178 CASAVA_Build 22 48057001 20D13M2I TCCTGTTCCT CTGGAACCGTCCCGGGACAGGCAATGCCTGGTC--/--------------------GCACTGAATGGACCA AGCGGCCACA 909 het 909 ref 27 28 3 3 N/A 0 0 322179 CASAVA_Build 22 48067154 1I CTGCAGGAGA -/G GCAATTCAAT 3070 hom 81 het 29 0 25 4 G 1 2 322180 CASAVA_Build 22 48075387 1I TTGTGCTGGA -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 49 21 15 13 T 6 7 322181 CASAVA_Build 22 48080000 1I TCCAGGAAGA -/G GCGTAGCCTG 3070 hom 30 het 16 0 11 5 G 1 2 322182 CASAVA_Build 22 48083269 1I GAGGCAGGGA -/G GGGCCCAGAG 3070 hom 129 het 46 0 39 7 G 3 4 322183 CASAVA_Build 22 48092501 9D CGGGGAGTCA CCAACAGGT/--------- CCCTGCATGA 3070 hom 81 het 32 0 25 7 CCAACAGGT 1 0 322184 CASAVA_Build 22 48094838 1I TCTAAATCAG -/T TTTTTTTAGG 3070 hom 96 het 41 0 32 9 T 7 8 322185 CASAVA_Build 22 48095221 4D AGCCATGAAG AATA/---- AATATACACA 3070 hom 135 het 50 0 46 11 AATA 2 1 322186 CASAVA_Build 22 48098564 5D TTCTTTCACT TAAAG/----- TAATGTTTTC 3070 hom 135 het 46 0 44 7 TAAAG 1 0 322187 CASAVA_Build 22 48098766 1I TTGCATAGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 629 hom 43 2 36 5 T 9 10 322188 CASAVA_Build 22 48099968 1D AAGCTGGGTA T/- TTTCTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 4 3 322189 CASAVA_Build 22 48100543 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 602 hom 42 3 30 9 T 13 12 322190 CASAVA_Build 22 48108803 6D CTCTCCCAGC CTCTGT/------ CTCTGTCTCT 3070 hom 95 het 39 0 30 12 CTCTGT 2 1 322191 CASAVA_Build 22 48117548 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 1465 het 543 hom 18 6 5 7 AG 1 0 322192 CASAVA_Build 22 48127513 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2493 hom 21 het 12 0 8 4 A 18 16 322193 CASAVA_Build 22 48133014 1I42M1I GAGCCCTAGA -GCATCAAATTTACAGAGACAGAAAGAAGAATGGGGGATGCCA-/GGCATCAAATTTACAGAGACAGAAAGAAGAATGGGGGATGCCAG GGGCTGGCGG 3070 hom 54 het 39 1 48 6 N/A 0 0 322194 CASAVA_Build 22 48141289 29D ATGGCAGGGA CTGGTGTAGAAAATGTCTTACCCTCTGAT/----------------------------- CTGGTGTAGA 1826 het 1826 ref 32 20 4 18 CTGGTGTAGAAAATGTCTTACCCTCTGAT 2 1 322195 CASAVA_Build 22 48141787 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 10 9 322196 CASAVA_Build 22 48151482 1I CCTCGGACTC -/G GGCAGCCTTG 3070 hom 74 het 29 0 23 6 G 2 3 322197 CASAVA_Build 22 48155323 1I AAGTCCCGGT -/C CCTGCAGGAG 3070 hom 84 het 34 0 25 9 C 2 3 322198 CASAVA_Build 22 48157265 9D TTTTCTTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 21 2 15 4 T 19 10 322199 CASAVA_Build 22 48159434 28D GATGTTAGTC GGCTCTGGGACTTGAGGAAAGTTGACCT/---------------------------- GGCTCTGGGA 3070 het 3070 ref 31 12 10 14 GGCTCTGGGACTTGAGGAAAGTTGACCT 2 1 322200 CASAVA_Build 22 48160114 1I TCGGCAGGGT -/G GGGTACACCC 3070 hom 71 het 31 0 21 10 G 3 4 322201 CASAVA_Build 22 48178024 1I AGCATCGGCC -/G GCTAGTGCCC 3070 hom 53 het 19 0 15 4 G 1 2 322202 CASAVA_Build 22 48187907 10I GGTGGGGCAG ----------/AGAGAGACAC AGAGAGACAC 3070 hom 60 het 29 0 18 11 AGAGAGACAC 1 2 322203 CASAVA_Build 22 48189747 13D CATCCATTGA CAGCGTGCATCCC/------------- CATTCTTACT 3070 het 3070 ref 26 16 11 2 CAGCGTGCATCCC 1 0 322204 CASAVA_Build 22 48191756 8I AGAACATGGT --------/GAGGAAGA GAGGAAGAGA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 GAGGAAGA 1 2 322205 CASAVA_Build 22 48198036 3D GAGAAGACCA GAG/--- GAGAGCCTGA 2790 het 2790 ref 27 13 9 8 GAG 2 1 322206 CASAVA_Build 22 48200977 1I TATGGAAAAC -/A AAAAGGCATT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 4 5 322207 CASAVA_Build 22 48203959 5I TTGAAAACTC -----/GTAGA GTAAACATGT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 GTAGA 0 1 322208 CASAVA_Build 22 48205821 1D TTCTTCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 11 10 322209 CASAVA_Build 22 48206098 1I ATTGATACGA -/T ATTTGCACCT 3070 hom 75 het 31 0 24 7 T 0 1 322210 CASAVA_Build 22 48206718 2I68M4I ATGTATGTAA --TGTGTCCATGTGTGTGTGTGCGTATGTGTGCATGTGTCCATGTATGTGTGCACGTGCGTCTCTGCACA----/TGTGTGTCCATGTGTGTATGTGCGTATGTGTGCATGTGTCCATGTATGTGTGCACGTGCGTCTCTGCACATATC TCTGTGTGCA 3070 het 3070 ref 74 69 34 32 N/A 0 0 322211 CASAVA_Build 22 48207076 3D CTTTCTGAAA AAC/--- AACATCATGG 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 AAC 2 1 322212 CASAVA_Build 22 48209898 1I AGGTGATCTA -/C CTGCCCTGGC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 C 1 2 322213 CASAVA_Build 22 48210180 1I TGTAAATGGA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 55 28 23 4 T 6 7 322214 CASAVA_Build 22 48213056 1I GGGGAGCTGA -/G GCAGTGGCCG 1973 hom 17 het 12 0 6 6 G 1 2 322215 CASAVA_Build 22 48214742 1I CCAGAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 6 7 322216 CASAVA_Build 22 48214884 28D GCAACAAGTG AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAA/---------------------------- AAAGAATCCA 3070 hom 33 het 12 0 11 3 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 322217 CASAVA_Build 22 48216636 5D TGAATTAAGG GATCT/----- GACCTCCACA 3070 het 3070 ref 40 22 16 5 GATCT 1 0 322218 CASAVA_Build 22 48218781 2I GGGAGAAAAC --/TT TTTTTTTTTT 2387 het 2387 ref 27 11 9 7 T 12 14 322219 CASAVA_Build 22 48220123 3D CACTTCTTAC TTG/--- TTGGGTGTGT 3070 het 3070 ref 36 18 14 6 TTG 2 1 322220 CASAVA_Build 22 48225424 1I CAAGGGAACT -/G CCCTTTATAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 G 0 1 322221 CASAVA_Build 22 48225944 6D GAATGCCAGG TCTCTC/------ TCTCCAGCTG 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 TC 5 2 322222 CASAVA_Build 22 48228946 2D ATACACACAA AC/-- ACACACACTC 3070 het 3070 hom 68 17 35 19 AC 5 4 322223 CASAVA_Build 22 48230091 2I ATGGAAAGAC --/AT GTCGTCGAAG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AT 0 1 322224 CASAVA_Build 22 48237837 1I CGAGGCCTGG -/C CCAGGATGGG 3070 hom 146 het 55 0 44 11 C 2 3 322225 CASAVA_Build 22 48241516 1I GTGGGCGGTG -/C CGCAGGAGCG 3070 hom 35 het 16 0 12 4 C 1 2 322226 CASAVA_Build 22 48261820 2D CATGTAACAC TA/-- TATCTCCCAC 2093 het 2093 ref 27 11 10 6 TA 2 1 322227 CASAVA_Build 22 48280337 3D TCACCATCAC CAT/--- CATCATCACC 3070 het 3070 ref 74 35 32 12 CAT 3 2 322228 CASAVA_Build 22 48296628 1I TGTGCCCCTT -/G GGCCCTGGCC 3070 hom 80 het 30 0 25 5 G 2 3 322229 CASAVA_Build 22 48298242 1D CAGGCTCCCC G/- GGGGAAAACC 2580 hom 31 het 15 0 9 6 G 5 4 322230 CASAVA_Build 22 48298450 1I TCCCCGATGA -/G GGGCCCTGCC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 G 3 4 322231 CASAVA_Build 22 48298585 1I TGGAACGAAG -/A GACTGTTTCA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 0 1 322232 CASAVA_Build 22 48298752 4D AGCATTTAGC AAGA/---- AACGCGGGAA 3070 het 3070 hom 25 9 16 1 AAGA 1 0 322233 CASAVA_Build 22 48299792 6D ATAGCTGGCT GTGGTG/------ GTGGGTGCCT 2394 het 2394 ref 17 9 6 2 GTG 3 1 322234 CASAVA_Build 22 48299931 2D ACTCTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2400 het 1406 hom 25 11 8 6 A 18 16 322235 CASAVA_Build 22 48299997 1I CTCTGGAGAG -/A AAAAGAGGAG 3016 het 3016 ref 28 14 8 6 A 4 5 322236 CASAVA_Build 22 48304710 2I ACACGTACAC --/AT AGACAAACAC 3070 hom 168 het 60 0 55 5 AT 0 1 322237 CASAVA_Build 22 48316122 1D CCCAGGCCAT C/- CCTTTGTGAG 3070 hom 75 het 28 0 22 6 C 3 2 322238 CASAVA_Build 22 48321432 26D CCGCCATCCT CCCTGTGTCCAGCCCACTGTCTGCTG/-------------------------- CCCTGTGTCC 1997 hom 47 het 22 0 11 13 CCCTGTGTCCAGCCCACTGTCTGCTG 1 0 322239 CASAVA_Build 22 48321817 1I CCCGAAGCCT -/G GCCCCAGGCA 2283 hom 44 het 21 0 8 13 G 1 2 322240 CASAVA_Build 22 48349054 2I GGCTCAGGCC --/CT GACTTGGCTG 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CT 0 1 322241 CASAVA_Build 22 48366240 2D GCATGTTTAG CA/-- CAGAGTCACT 3070 hom 132 het 49 0 42 7 CA 2 1 322242 CASAVA_Build 22 48375253 6D TGATGGTGAC GATGAT/------ GGTGATGGTG 3070 hom 83 het 63 1 55 16 GAT 2 0 322243 CASAVA_Build 22 48376406 1I ATATACATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1154 hom 43 3 31 9 A 11 12 322244 CASAVA_Build 22 48384612 1D TATCGATAGG A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 100 het 44 0 32 12 A 8 7 322245 CASAVA_Build 22 48389644 4I TTGTGTCTGT ----/TTAA TTATGTACCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TTAA 0 1 322246 CASAVA_Build 22 48408845 1D GCTGCTGTGT G/- GGTCCCTGTT 3070 hom 33 het 17 0 11 6 G 3 2 322247 CASAVA_Build 22 48411505 2D TGGGGCACAC AT/-- GTGTTTCAGG 3070 hom 78 het 42 0 27 18 AT 1 0 322248 CASAVA_Build 22 48413155 1D TGGGTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 1211 hom 11 het 14 0 7 7 G 12 11 322249 CASAVA_Build 22 48416804 1I CCTTGCTCGT -/A AGCACACGGG 3070 hom 99 het 41 0 29 12 A 1 2 322250 CASAVA_Build 22 48418405 6I AAATAATGCA ------/TTCTAT TTAAAAACGT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 TTCTAT 0 1 322251 CASAVA_Build 22 48419367 6D TGGTGGCTGG TGCCCA/------ TGCCACAGGC 3070 hom 69 het 27 0 18 11 TGCCCA 1 0 322252 CASAVA_Build 22 48428509 1D GCGTTTCCCG C/- CCCCCCCCCC 1426 hom 20 het 8 0 7 1 C 13 12 322253 CASAVA_Build 22 48431067 16I TGGATCCGTT ----------------/GAGGTCAGGAGTTCGA GACCAGCCTG 3070 hom 89 het 30 0 25 8 GAGGTCAGGAGTTCGA 0 1 322254 CASAVA_Build 22 48443396 1D CAATTAACAT A/- AAAGCGCGGG 3070 hom 75 het 28 0 23 5 A 4 3 322255 CASAVA_Build 22 48445256 3D ATGACAAAAT AAA/--- AAACTCTGGC 3070 hom 66 het 29 0 23 8 A 6 3 322256 CASAVA_Build 22 48445321 1D AAAAACTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 989 hom 28 3 19 6 A 13 12 322257 CASAVA_Build 22 48455048 1I6M2D AAAAGAAAGA -AAAGAAAG/GAAAGAA-- AGAAAGAAAG 1648 het 576 hom 13 2 6 6 N/A 0 0 322258 CASAVA_Build 22 48468389 1I GGTGCCTGGC -/G GGGGCTCTTG 3070 hom 51 het 22 0 17 5 G 4 5 322259 CASAVA_Build 22 48475573 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 967 het 444 hom 23 8 7 8 A 19 18 322260 CASAVA_Build 22 48479617 1D GGACAGACTC A/- GGGGCATCTG 3070 het 3070 ref 38 16 11 12 A 1 0 322261 CASAVA_Build 22 48490965 1D TCAAAACAAT A/- AAGAAAGAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 3 2 322262 CASAVA_Build 22 48497102 3D ATGTGAAGGG GTC/--- ATCATATACA 860 het 860 ref 16 7 4 5 GTC 1 0 322263 CASAVA_Build 22 48497136 4I ACATGCACAC ----/ACAG ACACATGCAT 2871 hom 27 het 18 0 8 10 ACAG 0 1 322264 CASAVA_Build 22 48500483 1D GGTATGGAGG C/- CTAAACATGG 3070 het 3070 ref 39 21 13 7 C 2 1 322265 CASAVA_Build 22 48503015 4I ATAAATACAT ----/AATA AATAAACAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 3 AATA 1 2 322266 CASAVA_Build 22 48532617 1D ACGAGACCTC G/- GGGGGGGTCT 2587 het 2587 ref 31 11 9 11 G 8 7 322267 CASAVA_Build 22 48566570 1D CACAGCGAGA C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 ref 29 11 11 7 C 5 4 322268 CASAVA_Build 22 48571830 1D AGCCACTGAT A/- AAAAAAAAAA 3044 het 3044 ref 26 11 8 7 A 11 10 322269 CASAVA_Build 22 48580590 1I TGCTGGGAGG -/C ACAGGCCAGC 3070 hom 63 het 24 0 17 7 C 0 1 322270 CASAVA_Build 22 48587680 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 A 10 11 322271 CASAVA_Build 22 48601257 4D CACTTAAAAC TTCT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 7 TTCT 1 0 322272 CASAVA_Build 22 48609006 4D TTGTGACGTG ACGA/---- CTCAAGGGCA 2720 het 2720 ref 23 11 7 7 ACGA 1 0 322273 CASAVA_Build 22 48612020 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 810 het 375 hom 13 3 4 6 A 19 18 322274 CASAVA_Build 22 48612110 1D GTTTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 13 12 322275 CASAVA_Build 22 48615810 2D TTTCTAAATT AC/-- ACAATCTGCT 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 AC 2 1 322276 CASAVA_Build 22 48622628 1D TACCATGGGA C/- CCAGCAGTTG 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 C 3 2 322277 CASAVA_Build 22 48630863 1D TTGCAGACTG A/- AAAAAAAAAA 1063 het 1063 ref 30 20 3 7 A 12 11 322278 CASAVA_Build 22 48631255 2D ATTTCTGCAC AT/-- GAGTGCCAGG 3070 het 3070 hom 35 16 15 5 AT 1 0 322279 CASAVA_Build 22 48640654 3I TGGTCTCGAT ---/CTC CTGAGCTCAG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 CTC 0 1 322280 CASAVA_Build 22 48645789 5I GCCCAAAGGA -----/TTTCT TTTAAGTCTA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 TTTCT 0 1 322281 CASAVA_Build 22 48650596 1D AAAAGATAGA T/- TTTTTTTTTT 2380 het 1618 hom 25 11 7 7 T 15 14 322282 CASAVA_Build 22 48653511 1I GTAGGTTGGA -/G GCGAGGAGCG 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 G 1 2 322283 CASAVA_Build 22 48659787 1I GAGGCTGGCG -/T TTTAAGCTGT 3070 het 2837 hom 23 7 13 3 T 3 4 322284 CASAVA_Build 22 48674788 3D TAAACCCACT TCA/--- TTATTTTATA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TCA 1 0 322285 CASAVA_Build 22 48676628 1I ATTCCCAGTC -/A AAAAAAAAAA 2897 het 2897 ref 23 9 10 4 A 11 12 322286 CASAVA_Build 22 48676779 4I CTTCATTCAC ----/TTAG TAATATGCAT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 TTAG 0 1 322287 CASAVA_Build 22 48683039 2D ATGGTCTCCC CT/-- GAGAGGGGGT 2261 het 1040 hom 15 5 9 1 CT 1 0 322288 CASAVA_Build 22 48692526 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 9 10 322289 CASAVA_Build 22 48701909 38D GTGGATCGAT AGTCAGGACCGGCCTCTCCGATTCTTACGCCCCTCAGC/-------------------------------------- AGTCAGGACC 1508 het 1508 ref 24 17 6 11 AGTCAGGACCGGCCTCTCCGATTCTTACGCCCCTCAGC 1 0 322290 CASAVA_Build 22 48703414 2I AGTTTTTCAA --/AT CTTATAAACT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AT 0 1 322291 CASAVA_Build 22 48718596 1I CAGCCCCTGT -/G GGGGGGCTTC 2535 het 2067 hom 32 8 9 15 G 6 7 322292 CASAVA_Build 22 48722008 4D CATTTAATGG TGAA/---- TGAATGAATG 3070 het 3070 ref 49 26 14 11 TGAA 3 2 322293 CASAVA_Build 22 48726083 1I ACTCCATCAC -/A AAAAAAAAAA 906 het 906 ref 20 17 2 1 A 11 12 322294 CASAVA_Build 22 48744141 1D AGAGACGTGC G/- GGGGGGTGGG 1199 het 696 hom 13 4 4 5 G 7 6 322295 CASAVA_Build 22 48774872 10I ACCATGTGAC ----------/ACTGACCTTA GCTGACCTCA 3070 hom 102 het 36 0 33 3 ACTGACCTTA 0 1 322296 CASAVA_Build 22 48778974 3I TCCAGCGCAG ---/TCC TCCTATGGGT 3070 hom 99 het 38 0 29 9 TCC 1 2 322297 CASAVA_Build 22 48781883 2I CCTGGGGCTG --/CA CAGTCTTTGC 2402 het 2402 ref 23 12 8 3 CA 1 2 322298 CASAVA_Build 22 48786381 5I AGAAAATAAA -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 het 2856 hom 19 6 9 4 AAAAT 2 3 322299 CASAVA_Build 22 48788094 1I ACTCAGTTAA -/T TTTTTTTGGG 2630 het 2630 ref 25 11 9 5 T 7 8 322300 CASAVA_Build 22 48788410 4I AAGTAAAAAT ----/AAAC AAAATAGTTT 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 AAAC 0 1 322301 CASAVA_Build 22 48794382 1I GCGGCAGGGG -/C CTGCTGTGAC 2746 hom 30 het 12 0 9 3 C 1 2 322302 CASAVA_Build 22 48813748 1D AGGTCGCCCA C/- CGCACTGACC 3070 het 2477 hom 36 9 13 14 C 2 1 322303 CASAVA_Build 22 48830932 1D CAATATGTCC T/- TTTTTTTTTT 2746 het 1456 hom 34 7 11 17 T 15 14 322304 CASAVA_Build 22 48840771 1I TGGAAAGTAA -/T TTATCAAAGT 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 2 3 322305 CASAVA_Build 22 48856248 2I CCTGGGCAAC --/AG AGCAGGACTC 3070 hom 105 het 39 0 34 5 AG 1 2 322306 CASAVA_Build 22 48857111 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2594 het 780 hom 23 3 9 11 A 16 15 322307 CASAVA_Build 22 48912279 1D TACCTTTGTG A/- AAAAAAAAAA 1620 het 1620 ref 38 28 5 5 A 13 12 322308 CASAVA_Build 22 48925006 2D ATTCTCACTC TG/-- TGTGAGTTAT 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 TG 3 2 322309 CASAVA_Build 22 49045700 2I GCCTCAGCAC --/AG AGTCTGGGAG 3070 hom 49 het 20 0 16 4 AG 1 2 322310 CASAVA_Build 22 49081966 4I GCGCTCGGGG ----/CACA CACACGAGGC 3070 hom 65 het 26 0 19 7 CA 2 4 322311 CASAVA_Build 22 49094120 1D CTGAGAGGGG A/- TGGGTGAGCC 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 1 0 322312 CASAVA_Build 22 49096625 4D GCACACACAT ACTC/---- ACACACAGAT 3070 het 3070 hom 61 26 28 8 ACTC 1 0 322313 CASAVA_Build 22 49138036 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 22 0 10 12 A 12 11 322314 CASAVA_Build 22 49142229 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2682 het 1631 hom 14 5 7 2 A 10 11 322315 CASAVA_Build 22 49144821 1D CTGTGGAGTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2035 hom 22 5 14 3 T 9 8 322316 CASAVA_Build 22 49152206 1I TCTTTTGTTT -/C CCTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 C 2 3 322317 CASAVA_Build 22 49154138 2I CTGTTTAGGG --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 40 18 9 13 AC 4 5 322318 CASAVA_Build 22 49154600 1I AAGTGGGCTG -/A AAAGCCTATT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 3 4 322319 CASAVA_Build 22 49173474 2I TTTTAGGATT --/TA AAAAAAAAAA 2445 het 2104 hom 19 8 9 2 TA 0 1 322320 CASAVA_Build 22 49174852 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 29 0 13 16 T 15 14 322321 CASAVA_Build 22 49175294 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 27 1 23 4 T 11 10 322322 CASAVA_Build 22 49177244 1D TGATTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 298 hom 27 1 12 15 A 17 16 322323 CASAVA_Build 22 49179731 1D CTCTATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 14 2 T 11 10 322324 CASAVA_Build 22 49182843 1I CTGGGGGGCA -/G GGGGGCCTGT 3070 hom 57 het 22 0 18 4 G 5 6 322325 CASAVA_Build 22 49189984 1I TCCACCTGCC -/T CACCCTCCCA 3070 het 3070 ref 41 25 15 1 T 0 1 322326 CASAVA_Build 22 49192571 8I GAACCTGGGA --------/GGCAGAGG GGCAGAGGTT 2778 het 379 hom 11 1 6 4 GGCAGAGG 1 2 322327 CASAVA_Build 22 49192640 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 8 9 322328 CASAVA_Build 22 49199999 1D GTGCGGGAGT C/- CCCCCCCGTT 3070 het 3027 hom 30 12 11 7 C 8 7 322329 CASAVA_Build 22 49201619 1D CTAGGCTGGA T/- TTTTTTTTTC 2268 het 1077 hom 25 6 10 9 T 10 9 322330 CASAVA_Build 22 49204006 1D TAAAAAAAAA G/- AAAAAGTATT 1642 het 1642 ref 36 21 7 9 G 1 0 322331 CASAVA_Build 22 49227868 2D TGTTTGAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 1189 het 1189 ref 13 7 3 3 AG 2 1 322332 CASAVA_Build 22 49232760 2D TGGAGGAGGC CA/-- CAGAGTCAGC 3070 hom 48 het 18 0 14 5 CA 2 1 322333 CASAVA_Build 22 49235088 1I ACACGAGGCC -/A AACTGTCAAC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 2 3 322334 CASAVA_Build 22 49270642 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2957 hom 29 12 12 5 A 12 11 322335 CASAVA_Build 22 49272299 3D ACTGGCCAGC CCT/--- CCTCCTCCGT 1856 het 1423 hom 21 8 9 4 CCT 3 2 322336 CASAVA_Build 22 49276559 3D CTTCCCTTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 23 1 16 7 T 17 14 322337 CASAVA_Build 22 49277132 1D ACAATCTTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 A 10 9 322338 CASAVA_Build 22 49281168 1D TTTGCTCCTG T/- CCCAATCCGC 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 T 1 0 322339 CASAVA_Build 22 49285480 1I GTTTTATTCC -/T TTTTTTTTTT 2604 het 176 hom 15 2 11 2 T 15 16 322340 CASAVA_Build 22 49286490 1I ATAAGTAAAT -/A AAATGGACTC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 3 4 322341 CASAVA_Build 22 49286775 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 2238 hom 17 het 7 0 6 1 A 10 9 322342 CASAVA_Build 22 49297839 2D TTGTCCTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2014 hom 35 11 18 6 T 13 11 322343 CASAVA_Build 22 49310191 16D CAGCAGAAAA CCTGCACGACCTACCC/---------------- CCGGAGCTCA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 CCTGCACGACCTACCC 1 0 322344 CASAVA_Build 22 49318173 1I AAATATTCGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 A 8 9 322345 CASAVA_Build 22 49328945 1D GCCCCACTAA T/- TTTTTTTTTT 1592 hom 16 het 11 0 7 4 T 15 14 322346 CASAVA_Build 22 49331283 9D GGGCAGGAGC TGGTGGGGT/--------- GCTTGCAGAG 2941 het 2941 ref 33 13 8 15 TGGTGGGGT 1 0 322347 CASAVA_Build 22 49343033 3I AGATAAATAA ---/TGT TGTAAGAGCT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 TGT 1 2 322348 CASAVA_Build 22 49345850 1I AGTAAAAATA -/T TTTCATGAAT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 T 3 4 322349 CASAVA_Build 22 49352230 1I ACTTTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 1902 het 1562 hom 25 8 9 8 T 13 14 322350 CASAVA_Build 22 49391666 18I10M4I AGCAGCCCAG ------------------GGCGGGTGAG----/CATCTGAGAGCTCCCTCAAGCTTGTGTGGCCA GTCTCTGTTC 3070 het 3070 ref 31 13 14 6 N/A 0 0 322351 CASAVA_Build 22 49400757 2D GTCCCGGCTA CT/-- CGGGAAGCTG 2633 het 1342 hom 14 5 7 2 CT 1 0 322352 CASAVA_Build 22 49417977 1I CTTTCTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2942 het 2942 ref 28 12 8 8 T 10 11 322353 CASAVA_Build 22 49425123 1D GACACGGTTC A/- AGACAGTTAC 2893 het 2893 ref 18 11 6 1 A 2 1 322354 CASAVA_Build 22 49425414 1D TCTTGCCACT G/- GTCACCTGAT 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 G 2 1 322355 CASAVA_Build 22 49433551 1D GTTATATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 12 11 322356 CASAVA_Build 22 49436329 1D AAAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 15 14 322357 CASAVA_Build 22 49441046 2D GGTCAAAGTC CA/-- GTCTTTCAGG 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 CA 1 0 322358 CASAVA_Build 22 49443720 1I CTTTTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 11 12 322359 CASAVA_Build 22 49453548 6D GTGCAAAGTT TAAGTG/------ TATTTATAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 TAAGTG 1 0 322360 CASAVA_Build 22 49462692 2I GGGCGGTCTC --/TG GAGCTCAGGA 3070 hom 91 het 34 0 26 8 TG 0 1 322361 CASAVA_Build 22 49466395 2I CAGATGACTC --/TG TACAGTGATT 3070 hom 125 het 46 0 40 6 TG 0 1 322362 CASAVA_Build 22 49485945 1I GGGGACCACG -/A GGGTGGTCAG 3070 hom 92 het 35 0 28 7 A 0 1 322363 CASAVA_Build 22 49510878 1I GATCTGGTCC -/T TTGTGTGCCC 3070 hom 20 het 32 1 14 17 T 2 3 322364 CASAVA_Build 22 49520330 1I ACCTGACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 10 11 322365 CASAVA_Build 22 49521411 1D AATCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 866 hom 22 3 11 8 T 12 11 322366 CASAVA_Build 22 49528246 1D GTCTGTGGGA C/- CCCTTGAAAA 2983 hom 24 het 18 0 8 11 C 4 3 322367 CASAVA_Build 22 49540271 1I CCTGACGCTC -/T TTTAGTTTCA 2079 het 2079 ref 30 21 5 4 T 3 4 322368 CASAVA_Build 22 49551437 1D GGAGTGGGGG A/- AGGCATTTCC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 2 1 322369 CASAVA_Build 22 49575792 3I GGGACCGTCA ---/ATG AGATCCCCAT 2339 het 2339 ref 19 12 5 2 ATG 0 1 322370 CASAVA_Build 22 49576466 3I GAGCTTTGTT ---/CTC CTCAGGACCC 2197 het 1812 hom 17 6 7 4 CTC 1 2 322371 CASAVA_Build 22 49582880 1I GGATATTCGA -/T TTTTTTCTGT 2658 het 2658 ref 19 10 7 2 T 6 7 322372 CASAVA_Build 22 49589936 1I TTTGTTAGCA -/T TTTTTTTTTT 2736 het 2736 ref 62 16 8 38 T 11 12 322373 CASAVA_Build 21 9725725 1D ACAAAAAACC A/- AACACCGCAT 2326 het 2326 ref 53 45 5 4 A 3 2 322374 CASAVA_Build 21 9726006 2I AAGAAATAAA --/AT AAAGTGTTGA 332 het 332 ref 32 2 2 28 AT 0 1 322375 CASAVA_Build 21 9729566 1D AGAACATGTG A/- GTGTTTGGTT 1238 het 1238 ref 104 92 5 7 A 1 0 322376 CASAVA_Build 21 9730041 1D AAATAGAGAC A/- AAAAAAAACC 1798 hom 3 het 6 0 5 1 A 9 8 322377 CASAVA_Build 21 9730592 4D AATATCCTTG ATGA/---- ACATCGATGC 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 ATGA 1 0 322378 CASAVA_Build 21 9732474 1D TGAAGCTTTC T/- TTTGATTGAG 487 het 487 ref 90 67 3 22 T 4 3 322379 CASAVA_Build 21 9745302 1I TCTGTTTAGC -/T TTTATGCAAA 3070 het 3070 ref 68 41 19 11 T 3 4 322380 CASAVA_Build 21 9747079 1D TCCTACAAAA T/- AGAGTGTTTC 1171 het 1171 ref 102 68 3 33 T 1 0 322381 CASAVA_Build 21 9747296 2I TCAAATCTGT --/GA GAGATGAATG 3070 het 3070 ref 106 59 23 24 GA 2 3 322382 CASAVA_Build 21 9749254 1I ATTTCCTTTT -/C CACATTAGGA 3070 hom 169 het 63 0 57 6 C 1 2 322383 CASAVA_Build 21 9749819 1I CTGAAAAAAC -/A GTGTATCAAA 3070 het 3070 ref 106 74 21 11 A 0 1 322384 CASAVA_Build 21 9750952 2I TGTGATGATA --/TT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 97 34 38 25 T 8 10 322385 CASAVA_Build 21 9751377 1D CTATTTAATC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 73 35 26 12 A 9 8 322386 CASAVA_Build 21 9752777 1I CACACATCAT -/A AAAAAGTTGC 3070 het 3070 ref 90 58 20 13 A 5 6 322387 CASAVA_Build 21 9753026 1D AAAGCACTCC A/- AATGTCCACT 1284 het 1284 ref 67 47 3 20 A 3 2 322388 CASAVA_Build 21 9754000 1D TCTTCTGTCT C/- ATTTTTTATG 3070 het 3070 ref 106 56 40 11 C 1 0 322389 CASAVA_Build 21 9756304 1I ACTGCTCTAT -/A CAAAGAAAGT 3070 het 3070 ref 73 43 12 18 A 0 1 322390 CASAVA_Build 21 9756680 1I ATGAACCCTC -/T ACATTGCAAA 3070 het 3070 ref 84 53 25 10 T 0 1 322391 CASAVA_Build 21 9758504 4I TTGGGTTTTA ----/TTTC TTTTCTTTAT 3070 het 379 hom 28 2 15 11 TTTC 0 1 322392 CASAVA_Build 21 9758549 3I ATTTATTTAC ---/TTA TTTATTATTA 1775 hom 15 het 11 0 6 5 TTA 0 1 322393 CASAVA_Build 21 9767248 3D AATCTGAAAA TCT/--- TCTCTCTGAT 3070 het 3070 ref 61 44 10 7 TCT 2 1 322394 CASAVA_Build 21 9767325 1D CTCTCTTTTT G/- TAGAATCTGC 3070 het 474 hom 40 5 28 8 G 1 0 322395 CASAVA_Build 21 9767355 1D TTTGGGGCGC T/- TTGAGGCCTA 2701 het 2701 ref 57 31 6 21 T 3 2 322396 CASAVA_Build 21 9767802 1D GAGTTAAACC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 84 59 11 14 T 9 8 322397 CASAVA_Build 21 9768600 1D AAAACTAGAC A/- AAAAAATTCT 1489 het 1489 ref 56 46 4 7 A 7 6 322398 CASAVA_Build 21 9769039 2I TTTTTAAAGA --/GT ATCTGCAAGT 3070 het 3070 ref 71 45 14 12 GT 0 1 322399 CASAVA_Build 21 9773005 1D CCCTATGGTG A/- AAAACGAAAT 3070 het 3070 ref 62 39 9 14 A 5 4 322400 CASAVA_Build 21 9775244 1D TGTCTTCACA C/- TAAAAACTAG 1544 het 1544 ref 84 71 4 10 C 1 0 322401 CASAVA_Build 21 9778449 2D TTCTATAAAA AG/-- AGTGTTTCCA 3070 het 3070 ref 83 35 18 35 AG 2 1 322402 CASAVA_Build 21 9778777 10D GTCCGCTAGC AGAATCTATA/---------- AGAATCTATA 3070 hom 128 het 60 0 44 20 AGAATCTATA 2 1 322403 CASAVA_Build 21 9778825 4I TGCTGTATCA ----/AAAG AAAGATTCAA 3070 het 3070 ref 67 35 17 24 AAAG 1 2 322404 CASAVA_Build 21 9779094 1D TTTCTAACAT G/- GGCCACAAGG 3070 het 3070 ref 51 31 13 14 G 3 2 322405 CASAVA_Build 21 9779308 2D TTCCACAAAA AG/-- AGAGTTTCAA 3070 het 3070 ref 104 72 19 18 AG 3 2 322406 CASAVA_Build 21 9779661 6D GAGTTTCAAA TCAAAC/------ TCTGTACAAT 1166 het 1166 ref 61 51 4 9 TCAAAC 1 0 322407 CASAVA_Build 21 9783563 22D32M3D TATTTCCTTT TCCACCATAGGCCACAAAGCCCTCCAAATATCCACTTTCAGATTCTACAAAAAGAGA/----------------------TCCAAATATCCACTTGCAGATTCTACAAAAAG--- ATTTCAAAAC 3070 het 3070 ref 80 77 20 25 N/A 0 0 322408 CASAVA_Build 21 9783707 1I TGCTTCTGTC -/T AGATTTTATG 3070 het 3070 ref 99 42 50 12 T 0 1 322409 CASAVA_Build 21 9784462 1I CAGATTGTAC -/A AAAATAGTGT 2071 het 2071 ref 106 82 6 18 A 4 5 322410 CASAVA_Build 21 9786270 1I TGTGTAGTTT -/C TATTTGAAGA 3070 het 3070 ref 104 59 42 3 C 0 1 322411 CASAVA_Build 21 9787923 5D AATCCGTGAG TTGAA/----- TGCACACCTC 2840 het 2840 ref 106 92 7 10 TTGAA 1 0 322412 CASAVA_Build 21 9794701 3I GTTTTTATTT ---/GAA GAAGATATTT 3070 het 3070 hom 95 30 33 32 GAA 1 2 322413 CASAVA_Build 21 9795547 4I TTCTGTGTAG ----/GGTT TTTTTATGTG 2244 het 2244 ref 70 55 5 10 GGTT 0 1 322414 CASAVA_Build 21 9800129 10I CGGAGTGGGA ----------/TGGAATGGAC TGGAATGGAA 3070 het 1026 hom 104 17 76 12 TGGAATGGAC 0 1 322415 CASAVA_Build 21 9803780 10I GGAGTGGAGG ----------/GGAGTGGAAT GGAATGGAAT 2001 het 2001 ref 95 73 5 19 GGAGTGGAAT 0 1 322416 CASAVA_Build 21 9806841 5D AGTGGAATGC AATGG/----- AATGGAATGG 3070 het 193 hom 104 4 59 48 AATGG 4 3 322417 CASAVA_Build 21 9808004 5I34M5D GAATTGAATT -----AAATGAAATGGAATCAAATGAAATGGACACGAAAGGAAT/AAATGAAATGAAATGGAATCAAATGAAATGGACACGAAA----- GGAATGGAAT 3070 het 3070 ref 88 69 25 34 N/A 0 0 322418 CASAVA_Build 21 9810957 5D TGGAATTGAA TGGAG/----- TGGAGTGGAG 3070 het 3070 ref 74 41 15 24 TGGAG 4 3 322419 CASAVA_Build 21 9812657 1I GAATGGAATC -/A ATTTGAAAGG 3070 het 3070 ref 105 58 21 26 A 1 2 322420 CASAVA_Build 21 9812718 5D GTGAAGTGGC GTGGA/----- GTGGAGTGGA 3070 het 27 hom 103 4 74 35 GTGGA 4 3 322421 CASAVA_Build 21 9813091 3D83M5D GAATGGAGTG AGTGGAATGGAATGGAATGGAGGGGAATGGAATGTGGTTGACAGGAGAGGAATTTAACTGATTGGAGTGGAGAGGAGTTGAATGCTATAGA/---GGAATGGAATGGAATGGAGGGAAATGGAATGGGGTTGACAGGAGTGGAATTTAACTGATTGGAGTGGAGCGGAGTTGAATGCT----- ATGGAATGGA 1740 het 1740 ref 104 171 9 29 N/A 0 0 322422 CASAVA_Build 21 9813934 10D GATTTGAAAG GAATGGGAAC/---------- GAATGGAATC 3070 het 3070 ref 100 81 20 21 GAATGGGAAC 1 0 322423 CASAVA_Build 21 9816448 1D AATGGAATCG A/- ATGAAATGAA 3070 het 3070 hom 93 40 30 23 A 2 1 322424 CASAVA_Build 21 9827806 10D TGGAGTGCAG TGGAGTGGAA/---------- TGGAGTGGAA 3070 het 1322 hom 101 16 53 40 TGGAGTGGAA 2 1 322425 CASAVA_Build 21 9830429 15D TGGAATCATG TGGAATGGAATCGAA/--------------- TGGAATGGAA 3070 het 693 hom 98 12 72 42 TGGAATGGAATCGAA 2 1 322426 CASAVA_Build 21 9835840 55D CCGAATGGAG TGGAATGGAATGGAATGCACTCAAATGGAATGAAAGGGAATGGAACCGAATGGAA/------------------------------------------------------- TGGAATGGAA 3070 het 1367 hom 56 17 17 64 TGGAATGGAATGGAATGCACTCAAATGGAATGAAAGGGAATGGAACCGAATGGAA 1 0 322427 CASAVA_Build 21 9838911 1I GGCATGGACT -/C GAATGGAATG 3070 hom 204 het 75 0 68 7 C 0 1 322428 CASAVA_Build 21 9839220 15D AATGTTATGG AATGGACTCGTATGT/--------------- AATGGAATGC 3070 het 3070 hom 75 33 41 16 AATGGACTCGTATGT 1 0 322429 CASAVA_Build 21 9846334 5D GAATGGACTT GAATG/----- GAATGGAATG 3070 het 179 hom 100 5 69 30 GAATG 4 3 322430 CASAVA_Build 21 9848868 5I GAATGGAATG -----/GAATC GAATGGAATG 3070 het 332 hom 79 9 57 13 GAATC 0 1 322431 CASAVA_Build 21 9849719 5D ACTCGACTGG AATTT/----- AATGGAATGG 2254 het 2254 ref 54 45 5 5 AATTT 1 0 322432 CASAVA_Build 21 9858536 15D GGAATAGAAT GGAATGGAATCGAAA/--------------- GGAATGGAAT 3070 het 122 hom 86 4 58 30 GGAATGGAATCGAAA 2 1 322433 CASAVA_Build 21 9859101 4D GAATAGAATG GAAT/---- GAATGGAATG 3070 het 3070 ref 61 36 11 16 GAAT 2 1 322434 CASAVA_Build 21 9860488 25D GAATCGAATG GAATGCAATGGACTCGAATGGAATA/------------------------- GAATGGGATG 3070 het 360 hom 61 7 55 25 GAATGCAATGGACTCGAATGGAATA 1 0 322435 CASAVA_Build 21 9861302 5D GACACGAATT GAATG/----- GAATGGAATG 3070 hom 157 het 87 0 62 29 GAATG 4 3 322436 CASAVA_Build 21 9862938 30D AATATAATGA ACTCGAAAGTAATGGAATGGAACTGAATGG/------------------------------ ACTCGAAAGT 3070 het 176 hom 69 4 32 43 ACTCGAAAGTAATGGAATGGAACTGAATGG 2 1 322437 CASAVA_Build 21 9864257 1I AATGGAATGG -/A ATGGACTCGA 1318 het 244 hom 41 3 3 35 A 1 2 322438 CASAVA_Build 21 9864281 1I AATGGAATGG -/A ATGGACTCGA 2685 hom 21 het 42 0 6 36 A 1 2 322439 CASAVA_Build 21 9864589 5D GAACGTACTC GAATG/----- GAATGGAATG 3070 het 3070 ref 83 58 9 22 GAATG 4 3 322440 CASAVA_Build 21 9867756 10D GAATGGAATG AAAAGGACTC/---------- GATGAGAATG 3070 het 3070 ref 71 47 17 16 AAAAGGACTC 1 0 322441 CASAVA_Build 21 9871368 5D36M10D TGTCAAATGG AATACAATGGAATGGAATGGAACCAAAAGGAGTAGAATGGAAGGGACTCGT/-----AAGGGAATGGAATGGTCTCAAATGGAATAGAATGGA---------- ATGGAATGGA 3070 het 3070 ref 47 56 15 14 N/A 0 0 322442 CASAVA_Build 21 9876473 10D GAAGTTGACT ATGGAATGGA/---------- ATGGAATGGA 3070 hom 168 het 70 0 56 21 ATGGA 5 3 322443 CASAVA_Build 21 9877399 5I GATTGGACTC -----/GAATG GAATGGAATG 3070 hom 190 het 87 0 64 23 GAATG 3 4 322444 CASAVA_Build 21 9879056 5D37M1D GAATGGAATA GAATGGAATGGAATGGAATGGAATTGACTCCAATGGAAGGGGT/-----GAATGGAATGGAATGGAATTGACTCCAATGGAAGGGG- TTGAATGGAA 3070 het 514 hom 92 7 45 65 N/A 0 0 322445 CASAVA_Build 21 9887656 1I AACCTAAGAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 8 9 322446 CASAVA_Build 21 9887951 1I TTTGTCTAAC -/A AAAAAAACGA 3070 hom 130 het 54 0 40 14 A 7 8 322447 CASAVA_Build 21 9890420 1I TTTTAGAGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 9 10 322448 CASAVA_Build 21 9897108 2D TGCTGATTTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 56 hom 27 1 22 6 T 11 9 322449 CASAVA_Build 21 9906111 2D TGGAAATGTC CG/-- TGAATCTTCT 806 het 806 ref 62 52 2 11 CG 1 0 322450 CASAVA_Build 21 9910360 1D126M4D GCTTATGTTT GGGGTTATCTCTTTACTTAGAGTGACTATAAATCTCGAAAGAGGATTAAAGGGAGAAATAACCATATCAACTCACATGGTAAGGGTATTTAAACATCTCTTAGTAATTGAGAAAATTGAAAGAAAAGAAAA/-GGGTAATCTCTTTACTTAGAGTGACTGTAAATCTCAAAAGAGGATTAAACGGAGAAATAACCATATCAACTCACATGGTAAGGGTATTTAAACATCTCTTAGTAATGGAGAAAATTGAAAGAAAAG---- AAGAGAAAGG 3070 het 3070 ref 64 71 13 22 N/A 0 0 322451 CASAVA_Build 21 9910575 3D GAAAAGTAAA AAG/--- GAGGAGGAGG 3070 het 3070 ref 90 30 20 50 AAG 1 0 322452 CASAVA_Build 21 9911812 1I ACAGAAAAAA -/C AAAAGTCTTT 3070 het 3070 ref 64 41 17 6 C 0 1 322453 CASAVA_Build 21 9912672 20D TAGCTATGAC CAAAAAGCGGGAAAAGCTAT/-------------------- GACCAAAAGC 3070 het 3070 ref 77 62 17 6 CAAAAAGCGGGAAAAGCTAT 1 0 322454 CASAVA_Build 21 9913553 1D CGGCTTCATG C/- CATTCTTCAG 3070 het 3070 ref 58 32 9 17 C 2 1 322455 CASAVA_Build 21 9916560 1D TTTTCAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 67 23 22 22 A 11 10 322456 CASAVA_Build 21 9916709 3I48M2D CCTCTTTCTT ---TTTTTTCTTTTCCTTTCTTTTCTTTCTTTTCTCCTTCCTTCCTTCTTTCC/TTCTTTTTTCTTTTCCTTTCTTTTCTTTCTTTTCTCCTTCCTTCCTTCTTT-- TTCTTTCTTT 3070 het 99 hom 27 2 18 17 N/A 0 0 322457 CASAVA_Build 21 9916797 4I CTCCCCCCAC ----/CCTT CCTTTCTCCC 3070 hom 65 het 29 0 22 7 CCTT 1 2 322458 CASAVA_Build 21 9916925 3D TTCCTTCCTT CTC/--- CTCTTTATTT 3070 hom 66 het 32 0 22 12 CTC 2 1 322459 CASAVA_Build 21 9919021 2I AAATCCACCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2728 hom 42 10 17 15 A 15 17 322460 CASAVA_Build 21 9919986 4D GAAGAAAAAC TCAT/---- TCACTTATGT 3070 het 3070 ref 56 43 9 5 TCAT 1 0 322461 CASAVA_Build 21 9920110 1D TTTTAAGCTT A/- TTTCAAGATT 3070 het 3070 ref 43 31 7 6 A 1 0 322462 CASAVA_Build 21 9927994 1I CCTTCAGAGT -/C CCCCCAAGCT 3070 hom 91 het 36 0 29 7 C 5 6 322463 CASAVA_Build 21 9928129 3D AAGATTACTT ATC/--- TTCATATTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 ATC 1 0 322464 CASAVA_Build 21 9946118 1D CTTTCTTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 15 13 A 13 12 322465 CASAVA_Build 21 9961213 1D ATGATCCTTT A/- CAGGTGAAGT 3070 het 3070 ref 38 19 8 11 A 1 0 322466 CASAVA_Build 21 9961528 1I CACGTTTGTG -/T TTTTTGACAA 3070 het 3070 ref 59 37 15 7 T 5 6 322467 CASAVA_Build 21 9966700 3D TCCCCCCTGC AAG/--- AAGAGATAGG 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 AAG 2 1 322468 CASAVA_Build 21 9970790 4D GTAAAAAGAA AACT/---- AATAAAAACT 3070 het 3070 ref 40 25 8 9 AACT 1 0 322469 CASAVA_Build 21 9980456 1I TTATTACTAA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 43 28 13 2 T 6 7 322470 CASAVA_Build 21 9982605 1D ATGAGGTCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 49 34 11 4 T 9 8 322471 CASAVA_Build 21 9982886 1I AAAAATATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 T 10 11 322472 CASAVA_Build 21 9990142 4I CTGTAAAATC ----/TCAT TCATTTTGCA 2603 het 2603 ref 61 46 6 9 TCAT 1 2 322473 CASAVA_Build 21 10001157 9I TAGATTGAGA ---------/AGATTGAGG AACTTACCCA 3070 het 3070 ref 59 49 7 3 AGATTGAGG 0 1 322474 CASAVA_Build 21 10006117 1I GTATACACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1315 hom 36 6 19 11 T 11 12 322475 CASAVA_Build 21 10006474 3D ATCTTTGCTT CTC/--- CTCAAATAGG 3070 het 3070 ref 52 34 12 9 CTC 2 1 322476 CASAVA_Build 21 10008297 1I ACCAAAAAGG -/T TAAGAATTTG 1800 het 1800 ref 64 54 4 6 T 1 2 322477 CASAVA_Build 21 10011016 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 8 9 322478 CASAVA_Build 21 10014320 6D ATAAGTCAGG CTCCCT/------ CTCTTAGGAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CTCCCT 1 0 322479 CASAVA_Build 21 10015729 4D TCCTTGGGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 135 het 64 0 45 21 TTTG 7 6 322480 CASAVA_Build 21 10017866 1I CATAAAAAAA -/G AAAAAATTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 322481 CASAVA_Build 21 10023764 3D AACAAAACTC AGT/--- AGCGGGAGAT 3070 hom 48 het 20 0 15 6 AGT 1 0 322482 CASAVA_Build 21 10024460 1D AAACAATGCA C/- CACAAGGACA 3070 hom 154 het 58 0 52 7 C 2 1 322483 CASAVA_Build 21 10025364 3D AAATAAAAGG CAT/--- CAGCAGAAAA 2327 het 2327 ref 21 14 5 4 CAT 1 0 322484 CASAVA_Build 21 10025962 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAACAGA 3070 hom 106 het 40 0 34 7 A 7 6 322485 CASAVA_Build 21 10026605 1I GCATAGCAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 76 59 8 9 A 9 10 322486 CASAVA_Build 21 10026725 1D ACTCAGTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1359 hom 47 9 22 17 A 11 10 322487 CASAVA_Build 21 10027021 2I GAGTTTCCTT --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 86 57 19 10 A 8 10 322488 CASAVA_Build 21 10027388 1I AATCAGTTTT -/G TCATACTTTT 3070 hom 49 het 24 0 19 5 G 0 1 322489 CASAVA_Build 21 10034862 3D CACTGAAATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 32 7 5 A 13 10 322490 CASAVA_Build 21 10035489 1D GACCATATTT G/- TACATTTTTT 3070 het 3070 ref 50 35 11 6 G 1 0 322491 CASAVA_Build 21 10037753 1I TGATACATAA -/T TTGAAAATAC 2746 het 2746 ref 60 43 6 11 T 2 3 322492 CASAVA_Build 21 10037817 1I AAAAAATACC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 49 31 14 4 A 7 8 322493 CASAVA_Build 21 10046797 1I ACTCAGAAGG -/C CTGAGGCAGG 3070 het 3070 ref 84 46 29 9 C 1 2 322494 CASAVA_Build 21 10047986 12D TTCAAGGGTG TATATATATATA/------------ TATATATATA 3070 het 683 hom 45 4 17 27 TA 12 6 322495 CASAVA_Build 21 10048033 5D AATTGTACAT GTCAA/----- GTCAAATATA 2332 het 2332 ref 62 32 5 30 GTCAA 2 1 322496 CASAVA_Build 21 10048161 1I AACAATTTCA -/C CTGTCTCCTA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 C 1 2 322497 CASAVA_Build 21 10048302 4I ATAACATGAT ----/AGTA AGCAAATATC 3070 het 3070 ref 82 48 26 8 AGTA 0 1 322498 CASAVA_Build 21 10048470 5I AGGCTCAAAA -----/AAAAG AAAAGTAGGA 3070 het 3070 ref 71 23 9 39 AAAAG 1 2 322499 CASAVA_Build 21 10048516 5I TATATGACTC -----/ATAAG ATCAAAATAA 3070 het 3070 hom 81 22 54 5 ATAAG 0 1 322500 CASAVA_Build 21 10050575 2I GAGTTTGTTT --/TG TGTTATTAAA 3070 het 3070 hom 62 21 35 7 TG 1 2 322501 CASAVA_Build 21 10050967 1D TTCAAAGTAA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 88 44 33 12 T 8 7 322502 CASAVA_Build 21 10051179 1I AAGTTTTATG -/A TATCATGAAT 3070 het 3070 hom 87 37 43 7 A 0 1 322503 CASAVA_Build 21 10057245 3D8M1D TCTATAAAAA AATAAAAAATAT/---AAAAAATA- TTTTAAATGC 2603 het 2603 ref 85 76 7 18 N/A 0 0 322504 CASAVA_Build 21 10066985 1I GCATAAACTG -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 ref 82 55 16 11 A 6 7 322505 CASAVA_Build 21 10067065 4D AAGTTCTTAT AGCC/---- AGCCTAAAAG 3070 het 3070 hom 85 15 65 8 AGCC 2 1 322506 CASAVA_Build 21 10067241 4D TTAATCGAAT CAAA/---- CAGAGAAAAG 3070 het 3070 ref 96 77 14 7 CAAA 1 0 322507 CASAVA_Build 21 10067384 9I AGAGAAAAAT ---------/AGAAAGAAA AGAAAAATTT 3070 het 3070 hom 82 19 41 22 AGAAAGAAA 0 1 322508 CASAVA_Build 21 10074234 1D TGAAATTTAG T/- TTTTCTGCTG 3070 het 3070 ref 81 64 9 9 T 5 4 322509 CASAVA_Build 21 10080674 2I ATAAATAGTT --/AA AGACTCACAA 453 het 453 ref 78 11 3 64 A 1 3 322510 CASAVA_Build 21 10080688 3I65M1D TCACAAAAAA ---AAAACTACATACTTCAATGTAGCAATCAACTTCAAATTTCTTAACAAAAGATGGAAATGTGGGGGA/AACAAAACTACATACTTCAATGTAGCAATCAACTTCAAATTTCTTAACAAAAGATGGAAATGTGGGGG- AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 105 136 77 122 N/A 0 0 322511 CASAVA_Build 21 10084618 2I TATTATCTAT --/TA TTTTTTTTTT 2327 het 2327 ref 40 12 11 17 TA 0 1 322512 CASAVA_Build 21 10084936 12D GTATATATAT ATATATACATAC/------------ ATATATATTC 3070 het 2374 hom 78 18 25 51 ATATATACATAC 1 0 322513 CASAVA_Build 21 10085102 3I CAAGTCAAAG ---/ATA ATAATTTATA 3070 het 1870 hom 100 8 38 54 ATA 1 2 322514 CASAVA_Build 21 10086739 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2792 hom 64 14 17 34 A 14 11 322515 CASAVA_Build 21 10086794 1D CCGGCCACTT G/- GGAGGCTGAG 3070 het 3070 ref 58 36 12 10 G 3 2 322516 CASAVA_Build 21 10099437 8I AAATAAATAA --------/ATACATAC ATAAATAAAT 3070 het 1472 hom 49 13 12 24 ATAC 0 2 322517 CASAVA_Build 21 10099532 1D TTTGCCACTC A/- AAAAAGTCCT 3070 het 3070 hom 93 10 75 8 A 6 5 322518 CASAVA_Build 21 10111454 1D TCCAAGCACA C/- CCCTTCTTGT 3070 het 3070 ref 63 40 18 6 C 4 3 322519 CASAVA_Build 21 10113042 1I22M1D6M1D AAATAAAATA -TTTTTTAAAAAAATGGTAAAGAGAAAAAGT/TTTTTTTTAAAAAATGGTAAAGA-AAAAAG- ATTAAATGAC 3070 het 3070 ref 95 77 13 15 N/A 0 0 322520 CASAVA_Build 21 10118414 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCCCTC 968 het 968 ref 75 17 5 66 AG 2 1 322521 CASAVA_Build 21 10120548 40D CAGGCTGTAC TCCTACCACTCCAGCCGCCATCTTACCACTCCAGCCGCCA/---------------------------------------- TCTTACTGCT 3070 het 3070 ref 66 48 35 19 TCCTACCACTCCAGCCGCCATCTTACCACTCCAGCCGCCA 1 0 322522 CASAVA_Build 21 10121575 1I GATTTTGAGT -/A GATGGAGGGG 3070 het 3070 hom 98 20 54 24 A 0 1 322523 CASAVA_Build 21 10122600 1D29M1D GATTTCAGGG TTTTTTTTGTTTTGGTTTAGTTTGGTTTGGT/-TTTTTTTGTTTTGTTTTGGTTTGGTTTGG- TTTTTGAGAT 3070 het 3070 ref 83 46 25 30 N/A 0 0 322524 CASAVA_Build 21 10123258 1I CTATTTTTTT -/G TATGTTTGGT 3070 hom 135 het 71 0 45 26 G 0 1 322525 CASAVA_Build 21 10126112 1D CATCTCTATT A/- AAAAATACCA 3070 hom 135 het 53 0 46 9 A 6 5 322526 CASAVA_Build 21 10127596 2D20M1I CTGTTTTAAC ATAAAATAAATGTCATTCATAA-/--AAAATAAATGTCATTCATAAT TTCTTATACA 3070 het 3070 ref 64 35 13 34 N/A 0 0 322527 CASAVA_Build 21 10128837 1D CTGTGGTGGA C/- CCGGCTGGAT 3070 het 3070 ref 90 61 14 16 C 3 2 322528 CASAVA_Build 21 10129613 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2871 het 2871 ref 64 41 13 11 A 7 6 322529 CASAVA_Build 21 10152937 1I TCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1722 het 1722 ref 45 39 5 1 T 6 7 322530 CASAVA_Build 21 10155615 6D GAGGGGAGAG AGAGAC/------ AGAGAGGAGA 2339 het 2339 ref 68 17 10 50 AGAGAC 1 0 322531 CASAVA_Build 21 10156511 4I TCCTAAAAAT ----/ACAA ACAATTAGCC 3070 het 3070 hom 57 19 35 4 ACAA 1 2 322532 CASAVA_Build 21 10156681 1D60M1D AGAAAAAAAA TTTTGGAGAGATGGGGCCTCACTGTATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCCAGTG/-ATTGGAGAGATGGGGCCTCACTGTATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCCAGT- ATCCTTCTAC 3070 het 3070 ref 92 161 13 79 N/A 0 0 322533 CASAVA_Build 21 10157872 10D TGGGATTACA GGCACCTGCC/---------- ACCACCCCCG 3070 het 3070 ref 58 38 15 32 GGCACCTGCC 1 0 322534 CASAVA_Build 21 10157936 1D TCACCATGTT G/- GCCAGGCTGG 3070 het 3070 hom 78 19 48 11 G 2 1 322535 CASAVA_Build 21 10160940 1D GTATTTATTT A/- TTTTTTTGAG 3070 het 2896 hom 63 8 35 20 A 1 0 322536 CASAVA_Build 21 10161119 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 3070 het 3070 ref 53 29 14 10 G 3 4 322537 CASAVA_Build 21 10171120 1D TCACTGCAAG C/- TCTGCCTCCT 3070 het 3070 ref 45 16 14 15 C 1 0 322538 CASAVA_Build 21 10171206 1I CCTGGCTAAC -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 76 34 30 12 T 7 8 322539 CASAVA_Build 21 10181774 3D AAGGAAAGAG AGA/--- AGAATCAAAT 2997 het 2997 ref 81 70 7 4 AGA 2 1 322540 CASAVA_Build 21 10181907 1I AGAAACGGAT -/A AATTCCTCGA 3070 het 3070 hom 89 42 44 3 A 2 3 322541 CASAVA_Build 21 10199988 2D AGAAAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 52 11 31 13 AT 8 7 322542 CASAVA_Build 21 10209363 5D TATAATGTAC TTATA/----- TTATGATATA 1034 hom 9 het 7 0 3 4 TTATA 1 0 322543 CASAVA_Build 21 13261430 7I GAGCTGAATG -------/CGCACAT CACACAGAAG 2151 het 2151 ref 73 63 5 5 CGCACAT 0 1 322544 CASAVA_Build 21 13262521 4I GTGGTCTAAA ----/TATC TATTTGCACA 3070 het 3070 ref 103 71 18 17 TATC 0 1 322545 CASAVA_Build 21 13263074 1D AAAACTGCTC T/- CTCAAAAGTA 3070 het 3070 ref 93 63 21 9 T 1 0 322546 CASAVA_Build 21 13263319 1D CTTGTGTCTG T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 99 71 15 13 T 7 6 322547 CASAVA_Build 21 13263439 2D GGTTCAACTC TG/-- TGAGTTTAAT 3070 het 3070 ref 81 60 10 11 TG 2 1 322548 CASAVA_Build 21 13265103 2I TTCTGCAAAA --/AG AGTGTTTCAA 3070 het 3070 ref 101 66 18 17 AG 1 2 322549 CASAVA_Build 21 13266487 1I AACTGCTCTA -/T GATAAAGTAT 3070 het 3070 ref 83 68 11 4 T 0 1 322550 CASAVA_Build 21 13267683 5I CGTGCACTAT -----/CAAAA CAAAAGTTCA 3070 het 3070 ref 101 72 12 17 CAAAA 1 2 322551 CASAVA_Build 21 13268896 1D TGCAAACGTC A/- CAAATAAGTT 3070 het 3070 ref 61 40 18 4 A 1 0 322552 CASAVA_Build 21 13272231 3I AACTTGTAGA ---/TCC TACAAAAAGA 3070 het 3070 ref 72 34 34 5 TCC 0 1 322553 CASAVA_Build 21 13274493 2D GGTTCAACCC TG/-- TGAGATGAAT 3070 het 3070 ref 91 68 16 8 TG 2 1 322554 CASAVA_Build 21 13274651 1D AATCATGAGA C/- AAAATTCATC 3070 het 3070 ref 87 60 17 10 C 1 0 322555 CASAVA_Build 21 13275806 2I CAGATTCTGC --/AA AAAGAGAGAT 1479 het 1479 ref 63 44 4 16 A 3 5 322556 CASAVA_Build 21 13280780 1I CCAAACTGCT -/C CAATCAAAAG 2711 het 2711 ref 72 55 6 11 C 1 2 322557 CASAVA_Build 21 13280908 1D GCGCTCCTAA T/- TTCCACTTGC 3070 het 3070 ref 84 65 11 8 T 3 2 322558 CASAVA_Build 21 13281807 4D TCAAAGCCGC TCAG/---- TCAAAAAATG 3070 het 3070 ref 103 81 11 18 TCAG 1 0 322559 CASAVA_Build 21 13282536 1D CCCAAACATC A/- CAAAGAAGTT 2928 het 2928 ref 96 81 7 9 A 1 0 322560 CASAVA_Build 21 13282755 4I4M22I TGTGAGATGA ----ACAC----------------------/ATGCACACAGCAGAAAGAAGTTTCTCAGAT TGCTTCTGTC 3070 het 3070 ref 101 83 11 10 N/A 0 0 322561 CASAVA_Build 21 13283595 2D GAATGCACAC AT/-- AGCAAAGCAA 2412 het 2412 ref 104 96 6 7 AT 1 0 322562 CASAVA_Build 21 13283735 1I TCCATCCAAA -/C AAAAGTTCAA 3070 het 3070 ref 103 76 12 17 C 0 1 322563 CASAVA_Build 21 13284304 4I TCAGAATTCT ----/TCTG TCTATTTTTT 3070 het 3070 ref 101 75 15 11 TCTG 0 1 322564 CASAVA_Build 21 13284381 2D TAGATTCTAC AG/-- AAAGAGTGTT 2620 het 2620 ref 84 68 6 12 AG 1 0 322565 CASAVA_Build 21 13285227 2I TGCCGATCCT --/AC AAAAAATGAT 2529 het 2529 ref 65 50 6 9 AC 0 1 322566 CASAVA_Build 21 13285752 2D TTCTACAAAA AG/-- AGAGTTTCAA 3070 het 3070 ref 81 65 7 9 AG 3 2 322567 CASAVA_Build 21 13288259 2I CTTTAATAAC --/AT AGGTCGCAAA 2195 het 2195 ref 74 59 5 10 AT 0 1 322568 CASAVA_Build 21 13290181 2I TACTGCAAAA --/AG AGTGTTTCAA 1758 het 1758 ref 75 69 4 2 AG 1 2 322569 CASAVA_Build 21 13290370 2D AAACCTGCTC TA/-- TCAAAAGAAA 1643 het 1643 ref 68 54 4 14 TA 1 0 322570 CASAVA_Build 21 13307721 1D TGATCCATCC T/- CCTCAGCCTC 3070 het 3070 ref 46 29 9 8 T 1 0 322571 CASAVA_Build 21 13310305 2D TGGTGAAACC CT/-- GTTTCTACTA 3070 het 3070 ref 41 30 7 5 CT 1 0 322572 CASAVA_Build 21 13310823 1I15M1I TTCACATATC -GTAGAACTTTTTCAC-/AGTAGAACTTTTGCACA AAAAATGGGC 1962 het 1962 ref 76 70 5 12 N/A 0 0 322573 CASAVA_Build 21 13310926 1D TTAAAGTTAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 50 22 18 11 T 8 7 322574 CASAVA_Build 21 13313878 2I TCATTGTCTT --/TC CCACCTTCAT 3070 het 3070 ref 48 30 13 5 TC 0 1 322575 CASAVA_Build 21 13315336 3D AACAAAAAAA AAT/--- ATCTTCTTGG 3070 het 3070 ref 57 40 12 7 AAT 1 0 322576 CASAVA_Build 21 13316139 1I AATATTGTCA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 58 45 7 6 T 6 7 322577 CASAVA_Build 21 13317161 1I CACTGCTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 59 39 10 10 T 9 10 322578 CASAVA_Build 21 13318096 2D GCTCACAAAA AC/-- ATGTGTTGTA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 AC 1 0 322579 CASAVA_Build 21 13319466 1I TAGTTCTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 64 42 12 10 T 9 10 322580 CASAVA_Build 21 13319672 1I TTCAAAACCC -/T TCTGGCTAAT 3070 het 3070 ref 62 34 17 11 T 1 2 322581 CASAVA_Build 21 13321593 13I TAGGCAAAGG -------------/ATAGATAATTGAT ACTTGAATAG 2362 het 2362 ref 35 24 5 6 ATAGATAATTGAT 0 1 322582 CASAVA_Build 21 13328335 1D TACTATATGT A/- AAAAAAAAAA 1942 het 1942 ref 41 19 6 16 A 15 14 322583 CASAVA_Build 21 13328787 2I TGACGCATGA --/AT ATATATATAT 3044 het 3044 ref 38 22 8 8 AT 5 6 322584 CASAVA_Build 21 13330243 2D ACTAAGACGG TC/-- TCTAGAACCA 3070 hom 187 het 69 0 63 8 TC 2 1 322585 CASAVA_Build 21 13334074 1I CAGTAGAAAA -/T CCAGAAACAC 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 T 0 1 322586 CASAVA_Build 21 13334230 1I ATAGATTAAA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 63 30 23 10 T 7 8 322587 CASAVA_Build 21 13334500 1D TTAAATCAAC A/- AAAAAACCCT 3070 het 3070 ref 50 29 16 5 A 7 6 322588 CASAVA_Build 21 13334974 4D CATTATACAT ACAC/---- ACAGACTTGC 1927 het 1927 ref 45 33 5 16 AC 3 1 322589 CASAVA_Build 21 13335354 4I ATAATTATAG ----/ATTA ATTAGTGTAG 3070 het 3070 ref 40 23 9 8 ATTA 1 2 322590 CASAVA_Build 21 13335401 4D AATATAAGTG CTTT/---- ATTTATAGCA 839 het 839 ref 50 41 2 11 CTTT 1 0 322591 CASAVA_Build 21 13336037 2I GATGCCTCCT --/TA TATTTATGTA 3070 het 3070 ref 59 31 26 2 TA 1 2 322592 CASAVA_Build 21 13337405 1D CCCACCCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 12 6 T 11 10 322593 CASAVA_Build 21 13339894 1D TTATCCCAGC A/- ACTTTGGGAG 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 2 1 322594 CASAVA_Build 21 13341856 1D GATGACATAG A/- AATCTGTAAG 3070 het 3070 ref 89 77 8 4 A 3 2 322595 CASAVA_Build 21 13342267 1D ACATCTATTA G/- TTTTCTGCCC 2734 het 2734 ref 39 31 6 2 G 1 0 322596 CASAVA_Build 21 13344581 4D ACTAAAAAAG TAAC/---- TATCTTTAGA 3070 het 3070 ref 69 45 20 8 TAAC 1 0 322597 CASAVA_Build 21 13347841 3D CACGCTGTTA CTC/--- CTCCTTACAA 3070 het 3070 ref 49 27 19 6 CTC 2 1 322598 CASAVA_Build 21 13350499 1I TAGACCACTT -/G TTAAGTGCAG 1296 het 1296 ref 67 59 3 5 G 0 1 322599 CASAVA_Build 21 13355496 1I TTTGTTCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 15 13 T 9 10 322600 CASAVA_Build 21 13357203 33D TTATTATACC ACTTGAGTAAGGGGTTTAGAAATTTTAGGCTCT/--------------------------------- ACTTGGGAAT 2907 het 2907 ref 54 50 10 8 ACTTGAGTAAGGGGTTTAGAAATTTTAGGCTCT 1 0 322601 CASAVA_Build 21 13358308 10I TGATTTTTAT ----------/AGTAGAATAG AGTTGAGTTA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 AGTAGAATAG 0 1 322602 CASAVA_Build 21 13359007 1D TTCCTTCCCT G/- TTTGCTCAAC 2146 het 2146 ref 96 77 6 13 G 1 0 322603 CASAVA_Build 21 13360123 1D AACAAATTAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 49 30 12 7 T 8 7 322604 CASAVA_Build 21 13360362 2I ATATTCAACA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 TC 5 6 322605 CASAVA_Build 21 13361097 1I ATATTAAATG -/A AAAAATTAGG 3070 het 3070 ref 39 25 9 5 A 5 6 322606 CASAVA_Build 21 13364235 1D CAGAGAGGCA T/- TTATAGTATT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 T 3 2 322607 CASAVA_Build 21 13366152 5I AAGAAAAGAC -----/AAGTT AAAGTGGGAG 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 AAGTT 0 1 322608 CASAVA_Build 21 13385258 4I TTGCAAAACA ----/ATTG AACTCTAACA 2270 het 2270 ref 29 20 5 4 ATTG 0 1 322609 CASAVA_Build 21 13387807 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2062 hom 18 het 10 0 6 4 A 13 12 322610 CASAVA_Build 21 13393423 1D TAAATAAAAT C/- AGAAAAAAAT 2367 het 2367 ref 38 33 5 1 C 1 0 322611 CASAVA_Build 21 13393741 1I AAGCTGCAAT -/C ATGCCACTGT 2713 het 2713 ref 38 28 6 4 C 0 1 322612 CASAVA_Build 21 13398357 1D GAAAAAGTAG T/- TAGAGGGGTT 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 T 2 1 322613 CASAVA_Build 21 13411323 1D TTCTTGTGAC T/- TGTGGAGTAA 3070 het 3070 ref 35 21 10 5 T 2 1 322614 CASAVA_Build 21 13424634 1D TGTGAGGAAC A/- AACACTCAGA 1844 het 1844 ref 35 29 5 1 A 3 2 322615 CASAVA_Build 21 13439706 2I11M3D12M1D AATATTTTTA --AGTTACATTATTAATATTAGATAATAT/ACAGTTACATTAT---TATTAGATAATA- TTATAATTGT 2296 het 2296 ref 29 42 5 12 N/A 0 0 322616 CASAVA_Build 21 13439910 4D ATATATATAT ATAC/---- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 35 19 8 8 ATAC 1 0 322617 CASAVA_Build 21 13450059 1I TATAACCACA -/C AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 75 50 22 3 C 0 1 322618 CASAVA_Build 21 13451010 3I TTTTGACTGA ---/CCT CCTTATAGAG 3070 het 3070 hom 52 15 36 1 CCT 1 2 322619 CASAVA_Build 21 13451162 8I CTTACCATCT --------/GCACACAC ACACACACCA 3070 het 3070 ref 75 31 19 25 GCACACAC 0 1 322620 CASAVA_Build 21 13461744 1D GTCAAAAAAA C/- GCTTCACATG 3070 het 3070 ref 51 42 7 2 C 1 0 322621 CASAVA_Build 21 13486221 2I TTTCACTTAC --/AA AAAAAAAAAA 1205 het 1205 ref 44 32 3 9 A 12 14 322622 CASAVA_Build 21 13487455 3D CATATGAGAA GTG/--- GTGGTGGAGG 3070 het 3070 ref 34 20 8 7 GTG 3 2 322623 CASAVA_Build 21 13491089 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 924 het 924 ref 13 4 4 5 A 15 14 322624 CASAVA_Build 21 13515881 2D ATATGTAAAC AT/-- ATATATATAA 3070 het 3070 ref 54 34 14 8 AT 5 4 322625 CASAVA_Build 21 13531147 2I TCAAAGATGT --/AA AAAAAATGCA 2883 het 2883 ref 35 28 6 1 A 6 8 322626 CASAVA_Build 21 13561579 1D GTGAATGGTA T/- TTTTTTTCTG 1389 het 1389 ref 22 18 3 1 T 8 7 322627 CASAVA_Build 21 13577461 4D CAGATGAATG AATA/---- AAGAAAATGT 3070 het 3070 ref 55 38 10 10 AATA 1 0 322628 CASAVA_Build 21 13593068 1D TCTAGGACTT A/- AGAGTGGGGG 3070 het 3070 ref 25 14 7 5 A 2 1 322629 CASAVA_Build 21 13625372 1I CAATGTGGCA -/C TTATATTCAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 322630 CASAVA_Build 21 13629814 4I TGTAATAGTG ----/GATA GATACATGGC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 GATA 1 2 322631 CASAVA_Build 21 13630814 2D TCTCTTTCTC TG/-- TGTTTATGTA 3070 het 3070 ref 59 38 20 1 TG 2 1 322632 CASAVA_Build 21 13639921 2D TAGTTAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 2222 het 568 hom 26 4 6 16 T 16 14 322633 CASAVA_Build 21 13646563 9D TAGGTCAACA AAACAATAG/--------- ATTCATTTAA 2159 het 2159 ref 15 8 5 2 AAACAATAG 1 0 322634 CASAVA_Build 21 13646659 8D ACTCCTGGGA GAGAGCAT/-------- GAATGGTATT 477 het 477 ref 23 17 3 5 GAGAGCAT 1 0 322635 CASAVA_Build 21 13647140 4I CTATTTTTAA ----/ATTT ATTATGCAAA 1413 het 1413 ref 27 17 3 7 ATTT 0 1 322636 CASAVA_Build 21 13651873 1D AAATGATACC A/- ATCCTTTCAC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 2 1 322637 CASAVA_Build 21 13652945 3D ACTCCCTCTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3042 het 575 hom 31 6 12 13 A 19 16 322638 CASAVA_Build 21 13656592 3D ATCATAAACA TTT/--- TCCTTGTATT 3070 het 3070 ref 37 26 8 4 T 4 1 322639 CASAVA_Build 21 13658613 1D TATGCAGCCT G/- GGGTGGACCT 2874 het 2874 ref 29 16 7 6 G 4 3 322640 CASAVA_Build 21 13665355 7I AGGGCACCCT -------/CCAGAGA CCAGAGACTG 3070 het 3070 hom 68 14 27 28 CCAGAGA 1 2 322641 CASAVA_Build 21 13665411 3I CACCTCCACC ---/ACT GTCACTGAGG 3070 het 3070 hom 72 19 37 18 ACT 0 1 322642 CASAVA_Build 21 13666208 1D ACTCTGTGCA C/- CCTCTGCACT 1503 het 1503 ref 28 16 6 6 C 3 2 322643 CASAVA_Build 21 13667796 1D GAGTCAGGCT A/- TTCCAGGTTC 2432 het 2432 ref 75 63 8 4 A 1 0 322644 CASAVA_Build 21 13668761 1I GGTGGCAGGG -/A AAAAATTGGG 2486 het 2486 ref 33 19 7 7 A 5 6 322645 CASAVA_Build 21 13669159 1I GGCAGTGGGG -/A AAAAATGGTG 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 5 6 322646 CASAVA_Build 21 13669245 3I GGGAAAATAT ---/TCC TCCTGTTACT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TCC 1 2 322647 CASAVA_Build 21 13669990 1D GATACCATCT A/- TTTTTTTGTA 1774 het 1774 ref 58 40 4 14 A 1 0 322648 CASAVA_Build 21 13677229 1I CTGAAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 10 11 322649 CASAVA_Build 21 13678967 1I AAGTTCTTGG -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 56 28 24 4 T 6 7 322650 CASAVA_Build 21 13679610 1I CTCAGAATTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 9 12 10 A 9 10 322651 CASAVA_Build 21 13681238 4I CCTTTAGAAC ----/AAGA AAGAGTGTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AAGA 1 2 322652 CASAVA_Build 21 13682283 1I GATTAAACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 9 10 322653 CASAVA_Build 21 13682680 1I TGAAAAACAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 17 7 4 A 9 10 322654 CASAVA_Build 21 13682952 1I ATGTAAGCCA -/G GAAACTACCT 1382 het 1382 ref 33 25 3 5 G 1 2 322655 CASAVA_Build 21 13685468 1I AAGCAATGTG -/A AAAGAATTCC 3070 hom 18 het 8 0 7 1 A 3 4 322656 CASAVA_Build 21 13692079 1D GATTAATTGA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 8 7 322657 CASAVA_Build 21 13693199 1D TTCTTTTCTT C/- CTAATTCTGA 2090 het 2090 ref 11 6 5 1 C 2 1 322658 CASAVA_Build 21 13693369 1I GCAGGTTCAG -/A AAAAAAAAGA 2060 het 2060 ref 20 14 5 1 A 8 9 322659 CASAVA_Build 21 13696602 2D TTAAAATTAC AT/-- GTTATATTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 AT 1 0 322660 CASAVA_Build 21 13703053 3I AGAAAACTGT ---/ATA ATTATTAGAA 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 ATA 0 1 322661 CASAVA_Build 21 13704378 1I CTTGGACGCC -/A GAAATATTAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 0 1 322662 CASAVA_Build 21 13706195 1D ATAGAAATTA T/- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 6 5 322663 CASAVA_Build 21 13712975 4I GGCATTTAGG ----/AATC AATCCTATGT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 AATC 1 2 322664 CASAVA_Build 21 13715490 2D CCTCTCTGTA CT/-- CTCTGTCTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 CT 3 2 322665 CASAVA_Build 21 13716305 1D ATGATCATAG A/- ATTGTTTAGT 1693 het 1693 ref 47 43 4 0 A 2 1 322666 CASAVA_Build 21 13716488 5D TAAATGCAGT AAGAA/----- AAGAAATTAT 1358 het 1358 ref 40 35 3 7 AAGAA 2 1 322667 CASAVA_Build 21 13721196 2I ATAGAAAGAC --/TG TGTTTCTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TG 1 2 322668 CASAVA_Build 21 13727073 1D GTATAAAAGG A/- AAAAAAAACG 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 9 8 322669 CASAVA_Build 21 13729416 2D TGCCAGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 15 13 T 12 10 322670 CASAVA_Build 21 13731664 1I AGATCCTCTT -/G TGGATCACCC 1782 het 1782 ref 39 32 4 3 G 0 1 322671 CASAVA_Build 21 13736289 1I CCAACTTACT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 57 34 17 6 A 8 9 322672 CASAVA_Build 21 13736384 2I ACGGCCTAAC --/AT GTGTATACAC 3070 het 3070 ref 51 30 12 9 AT 0 1 322673 CASAVA_Build 21 13737224 1D ACACATAGAT A/- AAAAAATTAA 1374 het 1374 ref 37 30 3 4 A 7 6 322674 CASAVA_Build 21 13742390 1I ATGATTAAAA -/T TTTTGGACCC 3070 het 3070 ref 49 40 7 2 T 4 5 322675 CASAVA_Build 21 13753222 3I AGTCAAGAAA ---/AAC AACCATTAAG 2280 het 2280 ref 47 37 6 4 AAC 1 2 322676 CASAVA_Build 21 13755149 2D AGCCTGGGCA AT/-- ATATTAAGAC 3070 het 3070 ref 36 15 15 7 AT 3 2 322677 CASAVA_Build 21 13791000 1I TGATGGACTA -/T TTATCAACTT 1339 het 1339 ref 33 27 3 3 T 2 3 322678 CASAVA_Build 21 13805160 3I GGAGAGAAAT ---/AAC AAAAGAAAAA 2371 het 2371 ref 43 32 5 6 AAC 0 1 322679 CASAVA_Build 21 13805328 4I GCCTACAAGA ----/AACT AACTCAGTTC 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 AACT 1 2 322680 CASAVA_Build 21 13812339 2I ATTTTCCTAG --/CA CAGTTTATTG 3070 het 3070 ref 52 37 8 7 CA 1 2 322681 CASAVA_Build 21 13813699 3D GTTTCTGTCA TCT/--- TCTTAAATTA 1524 het 1524 ref 26 18 4 6 TCT 2 1 322682 CASAVA_Build 21 13817629 2D ATATATTTAC AT/-- ATACCTATAT 3070 het 3070 ref 45 28 13 7 AT 2 1 322683 CASAVA_Build 21 13817796 1I AAATCTTAGC -/A CTTGATTTAG 3070 het 3070 ref 40 27 8 5 A 0 1 322684 CASAVA_Build 21 13825353 3I CAAATGCCAT ---/CCC CCCCATCAGT 3070 het 3070 ref 41 25 10 6 C 4 7 322685 CASAVA_Build 21 13828804 1D TAGCCATGTA T/- TTTTTATTTG 2454 het 1879 hom 10 4 5 1 T 6 5 322686 CASAVA_Build 21 13833273 5I CTCTTCAAAC -----/TTTTT TTTTTTTAAC 1829 het 1829 ref 49 40 4 5 T 7 12 322687 CASAVA_Build 21 13840023 1D ACTGAAATAT G/- AACTTTTGCT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 1 0 322688 CASAVA_Build 21 13842927 3I TTTACTTCTA ---/AAC AAGACAGAAG 3070 het 3070 ref 44 32 8 4 AAC 0 1 322689 CASAVA_Build 21 13844472 1I CAGAAATACC -/T TTAATCAGGG 1317 het 1317 ref 51 43 3 5 T 2 3 322690 CASAVA_Build 21 13845536 2D TGAAATCTAC AG/-- AGTCAGATAT 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 AG 2 1 322691 CASAVA_Build 21 13849685 1I ATTACGTAAG -/T TTTTTGCTTT 1984 het 1984 ref 38 30 5 3 T 5 6 322692 CASAVA_Build 21 13852654 1D TGTTTTCAAA T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 6 322693 CASAVA_Build 21 13853611 1I AGGAAAGTAA -/C TAAAGGGTGA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 C 0 1 322694 CASAVA_Build 21 13863972 1I TGCATTAAAA -/T TTCAATACGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 2 3 322695 CASAVA_Build 21 13868688 1D TGAGAAAAAA G/- GGGGAATCAA 3070 het 3070 ref 45 29 12 4 G 5 4 322696 CASAVA_Build 21 13875710 1I AAATAGAGGG -/T AAAAACTAAT 1272 het 1272 ref 65 56 3 6 T 0 1 322697 CASAVA_Build 21 13876242 2D ACAAAATTAC AG/-- AGTTTGAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 AG 2 1 322698 CASAVA_Build 21 13882943 5D TTTTTGTTGG TTTGT/----- TTTGTTTTCT 1858 het 1858 ref 43 34 4 8 TTTGT 2 1 322699 CASAVA_Build 21 13883554 6D TTTGTTTTGC TTTGTT/------ TTTGTTTTTG 1368 het 1368 ref 37 31 4 7 TTTGTT 3 2 322700 CASAVA_Build 21 13887083 4I AATTTGGTAC ----/TTTG TTTATCACAA 2810 het 2810 ref 19 11 6 2 TTTG 0 1 322701 CASAVA_Build 21 13887683 4I AAGAAGAAAG ----/GAGA GAGAGAGAAG 2729 het 2729 ref 20 11 7 2 GA 4 6 322702 CASAVA_Build 21 13890619 5D TCTTTTTCCT AAATA/----- AAAAGGAACG 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 AAATA 1 0 322703 CASAVA_Build 21 13891913 1D GAATTACAGA C/- AGCACACATA 3070 het 3070 ref 27 17 9 2 C 1 0 322704 CASAVA_Build 21 13892018 2I TGTTATTTGG --/AA AAAAAACATT 2792 het 2792 ref 32 22 6 5 A 6 8 322705 CASAVA_Build 21 13892285 1D CATGCCATAA T/- TTATCTAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 3 2 322706 CASAVA_Build 21 13894870 1I CAGGAAGAAA -/T TTAGGGACTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 2 3 322707 CASAVA_Build 21 13894921 1I GAATATATAT -/A TTTTCTCTCT 3070 het 3070 ref 27 11 7 9 A 0 1 322708 CASAVA_Build 21 13895315 1I AGTCAGCTTG -/T TCTTCAGCCT 2171 het 2171 ref 41 34 5 2 T 1 2 322709 CASAVA_Build 21 13902118 3I CATGAAAATG ---/ATA ATAAAGGAAT 2872 het 2872 ref 38 27 6 5 ATA 1 2 322710 CASAVA_Build 21 13906301 2I ATAGGAAAAC --/AT AGCATTCCTG 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 AT 0 1 322711 CASAVA_Build 21 13908717 1I ATCATGAATT -/A ATAAGTGGTA 1317 het 1317 ref 27 23 3 1 A 1 2 322712 CASAVA_Build 21 13910046 1I CCCTGCCAAG -/T TTTTTTTTCC 2462 het 2462 ref 30 17 7 6 T 8 9 322713 CASAVA_Build 21 13912409 1I GTGGGAAAGT -/A ACAGAAGAGT 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 A 1 2 322714 CASAVA_Build 21 13918153 2D GAGCTGTCTC TA/-- TTTCATTTCT 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 TA 1 0 322715 CASAVA_Build 21 13920437 1D ACACAGTGTG T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 8 7 322716 CASAVA_Build 21 13923880 4D TTAATTTTAA TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 2537 hom 15 6 8 1 TTAT 3 2 322717 CASAVA_Build 21 13924913 3I GTCAAACAGC ---/TGG AATCAAGCAA 2205 het 2205 ref 39 29 5 5 TGG 0 1 322718 CASAVA_Build 21 13928367 2I TCTTGACTCA --/TC TCTCTCTCTC 2545 het 2545 ref 32 11 8 13 TC 8 9 322719 CASAVA_Build 21 13931450 3I AGTGTATAAC ---/TCT TCTTTTTTCA 1815 het 1815 ref 19 13 4 2 TCT 1 2 322720 CASAVA_Build 21 13931829 4D TAATTAGGTC TTTA/---- TTTATTTATT 2554 het 2554 ref 24 8 8 9 TTTA 5 4 322721 CASAVA_Build 21 13940875 1D TGTCTTAAAA T/- TTTTCCTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 5 4 322722 CASAVA_Build 21 13941521 1D ACATACGTAT A/- CACATGCTAT 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 A 1 0 322723 CASAVA_Build 21 13948327 4D TGACTCAAAA CAAT/---- CAAGGTATTC 2907 het 2141 hom 13 6 6 1 CAAT 1 0 322724 CASAVA_Build 21 13949355 3I ATTTGTCATT ---/ATC ATTAATTCTC 3070 het 1819 hom 12 4 7 1 ATC 0 1 322725 CASAVA_Build 21 13950001 1D TTACTTTTTT A/- AAAAAAAATT 2921 het 2921 ref 18 9 8 2 A 9 8 322726 CASAVA_Build 21 13954360 1D TAAACTAATA T/- CAAAGTCTTC 1286 het 1286 ref 34 24 4 7 T 1 0 322727 CASAVA_Build 21 13954518 6D CTAGTAGTTT AGAGAA/------ AATGTCAAAA 1851 het 1851 ref 47 38 4 7 AGAGAA 1 0 322728 CASAVA_Build 21 13955069 2I TAATATACTC --/TT TATTTCTATA 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 T 1 3 322729 CASAVA_Build 21 13956143 1D TTAATGGAGG A/- AAAAAATAAA 2533 het 2533 ref 37 26 8 3 A 7 6 322730 CASAVA_Build 21 13956546 3D AACGTTACAG TAA/--- TACTTAAGAC 2744 het 2744 ref 38 28 7 5 TAA 1 0 322731 CASAVA_Build 21 13956806 4D TTCATGGTGA TTGT/---- TTAATGGGCA 2175 het 2175 ref 32 27 5 2 TTGT 1 0 322732 CASAVA_Build 21 13959107 4I ACATGGATAC ----/ACAA ACACACTGTC 3070 het 3070 ref 65 35 20 10 ACAA 0 1 322733 CASAVA_Build 21 13970603 3I TGTTGCAAAT ---/AAG AAGATTCAGC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 AAG 1 2 322734 CASAVA_Build 21 13972851 1I TAATATCTTT -/G GGTGCTGTGG 3070 het 3070 hom 33 17 15 1 G 2 3 322735 CASAVA_Build 21 13992577 4D ACTAAACCTT TGAC/---- TGAAACCATC 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 TGAC 1 0 322736 CASAVA_Build 21 13993447 4D ATTTCTTTCT CTGA/---- CTGAAAGAAG 3070 het 3070 ref 27 17 10 1 CTGA 2 1 322737 CASAVA_Build 21 13993798 1I TTCTTGTTAG -/A AAAAAAAAAA 2099 het 1985 hom 14 5 5 4 A 10 11 322738 CASAVA_Build 21 13996541 2D TTGCATAATT CA/-- CAGTCTTCTC 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 CA 2 1 322739 CASAVA_Build 21 14001652 1D AAAAAAAAAA C/- TATGTCAGGC 3070 het 597 hom 26 5 14 7 C 1 0 322740 CASAVA_Build 21 14003622 1D ACGGTTGCCA G/- GTAGCCTGAG 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 G 2 1 322741 CASAVA_Build 21 14043988 2D GCAAAAGAGT AC/-- TCAACGTCTC 1796 het 1796 ref 37 29 4 4 AC 1 0 322742 CASAVA_Build 21 14070802 3I TTAAAGAAGC ---/AGA AGAAGTCTTT 1359 het 1359 ref 38 33 3 2 AGA 1 2 322743 CASAVA_Build 21 14088937 8D TGGGAACAAC GTCTGTGG/-------- GTCTGTGGGA 3070 hom 49 het 27 0 16 12 GTCTGTGG 2 1 322744 CASAVA_Build 21 14090718 1I CAAACACGCA -/T ATTTTACAAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 0 1 322745 CASAVA_Build 21 14092253 1I AATTAAGAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 9 10 322746 CASAVA_Build 21 14094179 1D TGGAGAGCCA G/- GGCTCCATAG 2368 het 2368 ref 38 30 5 3 G 3 2 322747 CASAVA_Build 21 14095763 4I CAACAGAAAT ----/AAAA AAAGTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 3 7 322748 CASAVA_Build 21 14108402 1I ACACGAGAAA -/G CACATCATAA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 G 0 1 322749 CASAVA_Build 21 14111926 1I ATTTCAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 10 11 322750 CASAVA_Build 21 14117796 1D AAAGCTGAAA T/- TTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 39 15 22 3 T 6 5 322751 CASAVA_Build 21 14118828 1I CTCTGTTCCC -/A TGAAGAATCA 3070 het 3070 ref 60 47 7 6 A 0 1 322752 CASAVA_Build 21 14121936 1I GGAGCGTCTG -/T TGAGTAGCAG 1931 het 1931 ref 28 13 6 9 T 1 2 322753 CASAVA_Build 21 14123875 1I GTAAAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 11 12 322754 CASAVA_Build 21 14125204 1D GTTTGGGAAT A/- AAAAACTAGA 1978 het 1978 ref 20 14 5 2 A 6 5 322755 CASAVA_Build 21 14128851 1I AAACTAGAAA -/G ATCATGTGGT 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 G 0 1 322756 CASAVA_Build 21 14133821 4D TGGAAAGCCT TTCA/---- TTCATCTTCA 1788 het 1788 ref 36 28 4 5 TTCA 2 1 322757 CASAVA_Build 21 14140159 1I CTCAGAGTCA -/T CCCACCCAAA 3070 het 3070 ref 52 19 14 19 T 0 1 322758 CASAVA_Build 21 14145701 1D CCTCACTGAC A/- AAGTCCCAAC 3070 het 3070 ref 56 32 14 12 A 3 2 322759 CASAVA_Build 21 14146464 2D ATGCCTTTTC AA/-- AAGTTTCCAA 3070 het 3070 ref 56 43 9 6 A 4 2 322760 CASAVA_Build 21 14146579 5D GATTTCTTTT CCTTC/----- AAGGTACAAT 3070 het 3070 ref 51 44 7 4 CCTTC 1 0 322761 CASAVA_Build 21 14153988 1I TCTCTCATCC -/A GATCACAGGA 2934 het 1840 hom 23 6 7 10 A 0 1 322762 CASAVA_Build 21 14162096 1I CACACCCCCA -/T GTATCGAAAA 2633 het 2633 ref 32 18 6 8 T 0 1 322763 CASAVA_Build 21 14165709 1D CCTTGACCCC A/- CCAAATCTCA 3070 het 1052 hom 13 3 8 2 A 1 0 322764 CASAVA_Build 21 14165753 1D AAATCGTGCC T/- TTTCAAAGTT 2226 het 321 hom 12 1 5 7 T 4 3 322765 CASAVA_Build 21 14175014 1D AGAGCCTCTT G/- GAAAACCTCT 1023 het 1023 ref 35 25 4 6 G 2 1 322766 CASAVA_Build 21 14175111 3D ATAGGCCCAC CAA/--- CAACTCACGC 2054 het 2054 ref 19 10 5 7 CAA 2 1 322767 CASAVA_Build 21 14180811 1I AAAGCAAAAC -/A AAAAAACCTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 6 7 322768 CASAVA_Build 21 14181654 1I ACAGCTCACA -/C CCCCATGTAC 1849 het 1849 ref 24 16 5 3 C 4 5 322769 CASAVA_Build 21 14182656 1I GCTACTGTGC -/T TTTTTTTTTA 2655 het 2655 ref 26 17 6 3 T 9 10 322770 CASAVA_Build 21 14193414 2I CCCCAGGGCC --/TG TGACAGCAAG 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 TG 1 2 322771 CASAVA_Build 21 14198853 1I CTACAGTCTC -/T TTTGCCTATG 3070 het 3070 ref 54 23 28 3 T 3 4 322772 CASAVA_Build 21 14200843 1I TCTCTTACCA -/G AGTCCTTCTC 3070 hom 55 het 25 0 17 8 G 0 1 322773 CASAVA_Build 21 14201913 1I GATGAGAAAA -/G ATGCAGAATG 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 G 0 1 322774 CASAVA_Build 21 14203237 1I GGTCCCAAAT -/G ACTAGGTCCT 1969 het 1969 ref 22 15 5 2 G 0 1 322775 CASAVA_Build 21 14206539 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1141 het 302 hom 11 4 4 3 A 17 16 322776 CASAVA_Build 21 14211607 1D ACAGATGCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2403 hom 17 7 7 3 T 9 8 322777 CASAVA_Build 21 14212585 1I CATAGTGAGG -/C CCCCATCTCT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 4 5 322778 CASAVA_Build 21 14218182 1D TGTTACCCAG T/- CCCCCCAAAT 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 1 0 322779 CASAVA_Build 21 14221521 4I AATATGAAAA ----/CCAT CCATACCCAG 1216 het 1216 ref 29 22 3 4 CCAT 1 2 322780 CASAVA_Build 21 14224192 1I CCAGGTGTTT -/A ACTGGGGACT 3070 het 1896 hom 16 4 8 4 A 1 2 322781 CASAVA_Build 21 14224508 2I CATGACCAGC --/AA AGACAGGCTA 1407 het 1407 ref 36 13 4 19 A 1 3 322782 CASAVA_Build 21 14224541 1D GAAAACCCTG C/- GACTCTATTG 3070 hom 57 het 27 0 18 9 C 1 0 322783 CASAVA_Build 21 14233163 1I ACTGGGAACA -/G AATCTTTATC 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 G 0 1 322784 CASAVA_Build 21 14234413 1I CTAATTTACC -/A ATTTCATATA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 1 2 322785 CASAVA_Build 21 14235683 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2433 het 2433 ref 25 10 7 8 T 12 13 322786 CASAVA_Build 21 14243312 1I CAAAAACTTC -/A AAAAAAAATT 2551 het 2551 ref 21 12 8 1 A 8 9 322787 CASAVA_Build 21 14257718 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 A 11 12 322788 CASAVA_Build 21 14258597 2D TATAATATTA TG/-- TGTTATTAAA 1285 het 1285 ref 30 25 3 3 TG 2 1 322789 CASAVA_Build 21 14260058 2I TATTCTAGCC --/TA TAGGCAACAT 2502 het 2502 ref 24 13 6 5 TA 1 2 322790 CASAVA_Build 21 14261354 1I TAAGTTAGCT -/A TAACTACCTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 0 1 322791 CASAVA_Build 21 14265067 1I ATTGCATCTC -/A AAAAAAAACT 2327 het 2327 ref 19 9 5 5 A 8 9 322792 CASAVA_Build 21 14265342 4I GGTTTTATTT ----/TTAA AAAAAGAACT 3070 het 3070 ref 63 42 11 11 TTAA 0 1 322793 CASAVA_Build 21 14265617 4D CTCTGTGCTT TCTG/---- ATGTGCTGCT 3070 het 3070 ref 52 31 17 4 TCTG 1 0 322794 CASAVA_Build 21 14266327 1D AGTCCATGGG T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 7 6 322795 CASAVA_Build 21 14266812 2I TATAAAGAAA --/AG AGTTTCAAAA 2893 het 2893 ref 36 25 6 5 AG 1 2 322796 CASAVA_Build 21 14267918 1I TCAGGCTAAT -/A TTACTGAAAA 3070 het 3070 ref 61 29 17 16 A 0 1 322797 CASAVA_Build 21 14268347 4I ATTAGTGCAG ----/CAGA CAATCACTTC 3070 het 3070 ref 79 61 11 7 CAGA 0 1 322798 CASAVA_Build 21 14268836 2I AACTAAGAGA --/AG AAAAAAAAAA 1659 het 1659 ref 50 27 7 16 AG 0 1 322799 CASAVA_Build 21 14270216 3I37M1I AATAGTTCCT ---ACAACTCAATAATTGTAAGATTTTTGTTTTTTGAGAC-/ACAACAACTCAATAATTGTAAGATTTTTGTTTTTTGAGACT AAGTCTCACT 3070 hom 75 het 31 0 26 10 N/A 0 0 322800 CASAVA_Build 21 14271573 1I CAATAATGAT -/A AAAAATAGAA 3070 het 3070 hom 70 20 42 9 A 5 6 322801 CASAVA_Build 21 14271799 4D27M1D ATAGTATGTT TGTGTGTATGTATAATTTAATTGATTTTTTTC/----TGTATGTATAACTTAATTGATTTTTTT- CTCACTAGCT 3070 het 3070 ref 59 38 23 20 N/A 0 0 322802 CASAVA_Build 21 14272879 3D AAGCTCTCTT TTG/--- TTATTTTTTT 3070 hom 31 het 15 0 11 4 TTG 1 0 322803 CASAVA_Build 21 14289457 8I GGACCCTCCA --------/AGCCAGGC AGCCAGGCAT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 AGCCAGGC 1 2 322804 CASAVA_Build 21 14292771 1D TCATTCTATT G/- ATGTGGTGTA 3070 hom 42 het 19 0 15 7 G 1 0 322805 CASAVA_Build 21 14294830 2D TCCATCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2103 het 125 hom 16 2 7 7 A 18 16 322806 CASAVA_Build 21 14296206 1I CTAAACTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 25 12 6 A 11 12 322807 CASAVA_Build 21 14296559 1D GATACATTGA C/- TTGCCACCTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 C 1 0 322808 CASAVA_Build 21 14303193 1D GGCAAGAGGA G/- GGGCAAAAGA 2898 hom 23 het 14 0 8 7 G 4 3 322809 CASAVA_Build 21 14305054 3D GCAGACCATG ACA/--- ACAACATCAA 2981 het 2981 ref 33 23 7 5 ACA 3 2 322810 CASAVA_Build 21 14315674 2D ATTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 17 0 14 4 TA 6 5 322811 CASAVA_Build 21 14317770 1I CAAAATCAGG -/T TTTTAAATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 4 5 322812 CASAVA_Build 21 14319194 1D CTAGAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 265 hom 30 4 12 14 A 12 11 322813 CASAVA_Build 21 14322877 1D GTTTCTCCTT G/- TATCCTCCCT 1702 het 1702 ref 20 14 4 2 G 1 0 322814 CASAVA_Build 21 14327466 1I ATTTCATATG -/A TCATTAGAAA 3070 het 3070 ref 60 43 13 5 A 0 1 322815 CASAVA_Build 21 14343140 1I ATGGAGGGAA -/G GGATTGGGAA 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 G 2 3 322816 CASAVA_Build 21 14347770 1D ACATACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 11 5 A 11 10 322817 CASAVA_Build 21 14348558 4I GTTTCAGAGC ----/TCAT TCATTATCAG 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 TCAT 1 2 322818 CASAVA_Build 21 14354825 3D GGCCATCTTC TTT/--- GACTACAAAA 1914 het 1914 ref 15 9 4 3 T 3 0 322819 CASAVA_Build 21 14354929 4D AATGACTAGT CTTA/---- GTATCAATGA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 CTTA 1 0 322820 CASAVA_Build 21 14359361 4D TAATTTCTAC AATT/---- AATTGTTTAC 2249 het 2249 ref 34 26 6 5 AATT 2 1 322821 CASAVA_Build 21 14360239 5D ATATACCATA TATAT/----- TATTACAGAT 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 TATAT 1 0 322822 CASAVA_Build 21 14360830 2D24M4D AGCTAGCGAG GAAAAAAAATCAGTTAAATTATACATACAC/--AAAAAAATCAATTAAGTTATACAT---- ACAAATATAC 3070 het 3070 ref 54 49 9 13 N/A 0 0 322823 CASAVA_Build 21 14361084 1I TCGCTTTCTA -/T TTTTTATCAT 3070 het 1741 hom 48 6 35 7 T 5 6 322824 CASAVA_Build 21 14361778 1D9M3D TAATTTTTTT AAAAAAATGCATT/-AAAAAATGC--- ATTGTTATTT 2879 het 2879 ref 39 26 7 13 N/A 0 0 322825 CASAVA_Build 21 14362102 3I GTTTTTGTTA ---/AGT AGTAGTAATA 3070 het 3070 ref 50 30 9 11 AGT 2 3 322826 CASAVA_Build 21 14362258 4I CAAAAATTTT ----/TAAA TAAATAGCTG 3070 het 3070 hom 55 22 28 5 TAAA 1 2 322827 CASAVA_Build 21 14362404 1I5M1I26M3I AGTGAGACTT -GTCTC-AAAAACAAAAATCTTACAATTATTGA---/AGTCTCAAAAAATAAAAATCTTACAATTATTGAGTT GTTGTAGGAA 3070 het 3070 ref 27 17 14 7 N/A 0 0 322828 CASAVA_Build 21 14363064 1I GTATTTTGAA -/T TTCTTGGAAT 3070 het 3070 hom 76 26 43 7 T 2 3 322829 CASAVA_Build 21 14363673 3I TTGCTGCTGC ---/TGA TAATTTTCTG 2247 het 2247 ref 34 22 6 6 TGA 0 1 322830 CASAVA_Build 21 14363820 2I TTTTTTTTTT --/TC TTCTCTTAGT 2879 het 2879 ref 41 22 7 12 TC 0 1 322831 CASAVA_Build 21 14370991 9I AAAGACAACT ---------/TGTGGCACG TGGGAGTTTG 3070 hom 80 het 31 0 24 7 TGTGGCACG 0 1 322832 CASAVA_Build 21 14371103 4D ATCCAGACAA AGAC/---- AGACAGAGGA 3037 het 3037 ref 31 16 9 8 AGAC 2 1 322833 CASAVA_Build 21 14371400 4D22M7D AGGCAGAAAG AAGAAAGGAAAGAAAGGAAAGGAAGGAAGAAGA/----AAGGAAAGAAAGGAAAGGAAGG------- AAGGAAGGAA 1336 het 1336 ref 21 6 5 12 N/A 0 0 322834 CASAVA_Build 21 14372362 1I GAGAAAGATG -/A AAAAAAAAAA 2842 het 2842 ref 26 10 8 8 A 10 11 322835 CASAVA_Build 21 14379335 9D CATGGGGAAC ACACACAGT/--------- AAAACTAACA 3070 het 3070 ref 53 22 22 12 ACACACAGT 1 0 322836 CASAVA_Build 21 14382949 3I TTAGCTACTT ---/AAA AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 7 10 322837 CASAVA_Build 21 14383735 1D GGTGCATATA T/- ATTTAGAATT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 T 1 0 322838 CASAVA_Build 21 14388613 1D TAAAAAAATA T/- TTTTTTTTTA 2059 het 1644 hom 16 8 6 2 T 10 9 322839 CASAVA_Build 21 14388748 7I CATGAAAAAA -------/ATAAAAC ATAAAAACAT 3070 het 2731 hom 24 9 11 4 ATAAAAC 0 1 322840 CASAVA_Build 21 14391464 1D CATTTCCTTC T/- TTTTTATTTT 3070 het 510 hom 18 4 11 3 T 6 5 322841 CASAVA_Build 21 14393130 15D TTTGTATTTG GTTCCTGAGAATCAC/--------------- GTTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 38 25 15 3 GTTCCTGAGAATCAC 1 0 322842 CASAVA_Build 21 14394242 2I TGATCTTGAA --/TC TCTGATTTAC 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 TC 1 2 322843 CASAVA_Build 21 14396862 1D GAAAAAAAAA G/- AAGGGCTCCC 1901 het 1901 ref 20 10 8 2 G 1 0 322844 CASAVA_Build 21 14398132 3I AATTTTGAAT ---/TTC TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 TTC 0 1 322845 CASAVA_Build 21 14401792 4D ATTGTATGAG ACTC/---- ACTCACTATC 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 ACTC 2 1 322846 CASAVA_Build 21 14402660 1I CAGTATTTGA -/C CCATAGGTTA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 C 2 3 322847 CASAVA_Build 21 14404068 1D GTTCATCTAG T/- TATCACTGTC 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 2 1 322848 CASAVA_Build 21 14404297 2D GATAAAGTAT AA/-- GATTGATCTA 3020 het 3020 ref 20 11 7 2 A 2 0 322849 CASAVA_Build 21 14406046 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 6 322850 CASAVA_Build 21 14406810 5I AATTGTGTTC -----/TTGAT TTATTTTTCA 3070 het 1894 hom 22 6 12 4 TTGAT 0 1 322851 CASAVA_Build 21 14409625 2D GGGCTCAGAC TT/-- TTCTGGACAC 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 T 4 2 322852 CASAVA_Build 21 14410197 10D CCACCCCAAC TGGGAGTGTG/---------- TGGGAGTGTG 3070 het 3070 ref 42 17 12 16 TGGGAGTGTG 2 1 322853 CASAVA_Build 21 14411524 1D CCTGGGCTGA C/- CTGCAAGCAG 3070 hom 62 het 29 0 18 11 C 2 1 322854 CASAVA_Build 21 14419917 1D GCCTACGTAA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 7 6 322855 CASAVA_Build 21 14422868 5I GATATATCTT -----/AAATC AAGTGTGTCA 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 AAATC 0 1 322856 CASAVA_Build 21 14432393 1I TAAACATAGA -/C TAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 C 0 1 322857 CASAVA_Build 21 14435579 3D ACTTTAGTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 17 10 T 13 10 322858 CASAVA_Build 21 14439320 19I TGTGTTTTTT -------------------/AGACCCTTTAACAACTATC ACAGTTCCTT 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 AGACCCTTTAACAACTATC 0 1 322859 CASAVA_Build 21 14457285 2D GTTCAGACTG TA/-- TATATATATA 2629 het 2629 ref 18 9 7 4 TA 8 7 322860 CASAVA_Build 21 14457897 1D TTACAATAAC A/- ACTCTTAAAT 3070 het 3070 hom 29 9 16 6 A 2 1 322861 CASAVA_Build 21 14469387 5D TGGTTACATA CCTAG/----- GAGTGGAATT 3070 het 3070 hom 50 23 26 5 CCTAG 1 0 322862 CASAVA_Build 21 14470873 1I GAGAATATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 439 hom 21 1 14 6 T 9 10 322863 CASAVA_Build 21 14472122 3D GTTTCTCTCC AGT/--- TTAAATTTGT 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 AGT 1 0 322864 CASAVA_Build 21 14485569 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2499 het 119 hom 11 1 6 4 A 17 16 322865 CASAVA_Build 21 14485713 1D AAAAATAAAC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 7 6 322866 CASAVA_Build 21 14488817 17D GTAGGATTGT GGTTGCCCTGGGCTGAG/----------------- GGAAAAGGGG 3070 het 3070 ref 38 21 16 4 GGTTGCCCTGGGCTGAG 1 0 322867 CASAVA_Build 21 14489577 1I CCTTAATAAA -/C TGCAGGGACA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 0 1 322868 CASAVA_Build 21 14490365 4I AAAAACAAAA ----/CAAT CAAGAAGTAT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 CAAT 0 1 322869 CASAVA_Build 21 14500771 1D GATTTAACCC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 15 16 6 T 9 8 322870 CASAVA_Build 21 14502813 6D AAGTTGTATT CGTGCA/------ CGTGCACATG 3070 het 3070 ref 41 22 17 5 CGTGCA 2 1 322871 CASAVA_Build 21 14504442 1I TAATATTGAT -/A AAACTTTATT 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 A 3 4 322872 CASAVA_Build 21 14505693 3I16M3I TGTTTACTTA ---ATTATCTTCTTTTCTT---/ATTATTATCTTCTTTTCTTACC AGCAATGGAC 3070 het 3070 ref 33 20 14 2 N/A 0 0 322873 CASAVA_Build 21 14507121 1D GCTAAAAAAC A/- GTATTATATA 3070 het 3070 hom 23 12 10 1 A 1 0 322874 CASAVA_Build 21 14509002 1D AAGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 15 12 2 A 11 10 322875 CASAVA_Build 21 14512394 1I ATGCTTTGAA -/T TATCTAAATT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 1 2 322876 CASAVA_Build 21 14516996 1D TCTAAAATGA G/- GATAAAACTT 3070 hom 121 het 42 0 41 2 G 2 1 322877 CASAVA_Build 21 14527876 9D4M3D TCTACTGGTA TCAAGTCACTTGACCT/---------TTGA--- TGACTTGATA 3070 hom 102 het 35 0 34 6 N/A 0 0 322878 CASAVA_Build 21 14529546 1D AAAAAAAAAG A/- GAGAGAGAGA 2412 het 1694 hom 39 13 9 17 A 1 0 322879 CASAVA_Build 21 14532396 3D CTAATCCTTA GAT/--- ATAGACTAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 GAT 1 0 322880 CASAVA_Build 21 14536813 3D AGATTTTAAA TGT/--- TGTCACCACA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TGT 2 1 322881 CASAVA_Build 21 14537941 2D GCTAGGAAAG AA/-- AGAGAGAAAC 3070 hom 85 het 33 0 28 6 A 3 1 322882 CASAVA_Build 21 14539143 1D ATTTTTTTTT G/- TGTGTGTGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 1 0 322883 CASAVA_Build 21 14541449 8D TATTTGAAAG TGGTTAGC/-------- TGGTTAGCTT 3070 hom 75 het 26 0 25 4 TGGTTAGC 2 1 322884 CASAVA_Build 21 14541644 2I TTCACAAAAG --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 9 11 322885 CASAVA_Build 21 14547063 1D ATCTAAACAT A/- AAAAAATACA 3070 hom 93 het 39 0 32 8 A 7 6 322886 CASAVA_Build 21 14547582 4D CCAGTTCCAT TAAA/---- TAAATAAAAC 1927 het 90 hom 40 1 11 28 TAAA 3 2 322887 CASAVA_Build 21 14551300 4D ATAAATATAA ATTT/---- ATTTATACTA 2637 hom 15 het 6 0 6 0 ATTT 2 1 322888 CASAVA_Build 21 14551886 1I ATTTACTGTA -/G GCCACCACAG 3070 hom 111 het 46 0 38 8 G 1 2 322889 CASAVA_Build 21 14553027 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAACAAAAAA 825 het 62 hom 35 2 6 28 AAAC 2 1 322890 CASAVA_Build 21 14556734 5I ATAATTGACA -----/TTACT TTATTAAATT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTACT 0 1 322891 CASAVA_Build 21 14557003 6I AAATGTTTTT ------/TAATTC ATAAAATAGG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TAATTC 0 1 322892 CASAVA_Build 21 14557591 1D CCTGTTGTGA C/- CTTTTTTTTA 3070 hom 144 het 52 0 48 4 C 2 1 322893 CASAVA_Build 21 14562085 1D TCTGGCAAAG A/- AATTCTTAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 3 A 3 2 322894 CASAVA_Build 21 14562228 3D ATGCATAAAA TAT/--- ATATATATAT 2915 het 1328 hom 10 3 6 1 TAT 1 0 322895 CASAVA_Build 21 14567083 4I AGAGGAAGAC ----/AAAT GAATAGTGTT 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 AAAT 0 1 322896 CASAVA_Build 21 14569735 2I29M1D ACACTATCTC --AAAAAAAAATTGATGGCTTCAAAATGTATA/AAAAAAAAAAATTGATGGCTTCAAAATGTAT- AAAAAACCTC 3070 het 3070 hom 32 16 16 6 N/A 0 0 322897 CASAVA_Build 21 14580574 1I AAGAGTCTGT -/G GGGGAAAAAA 2375 het 270 hom 22 3 10 9 G 4 5 322898 CASAVA_Build 21 14589417 2I ATGTCTGTGT --/AC ACACACACAC 3070 hom 43 het 48 1 37 11 AC 6 7 322899 CASAVA_Build 21 14590655 1D GGGATTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 21 0 18 3 A 15 14 322900 CASAVA_Build 21 14591273 4D CTTTCTTTTA TTTG/---- TTTATTTACT 925 hom 10 het 5 0 4 1 TTTG 1 0 322901 CASAVA_Build 21 14601757 4D AAAAATTGAT AAAG/---- AAAATATACA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AAAG 1 0 322902 CASAVA_Build 21 14611211 2D ATAAAATATA TG/-- TCTCAGTAAA 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 TG 1 0 322903 CASAVA_Build 21 14615120 4D AGCATGGATG TGCT/---- TGCTACACAA 3070 hom 83 het 30 0 26 5 TGCT 2 1 322904 CASAVA_Build 21 14617462 1D TTTCTCAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 10 9 322905 CASAVA_Build 21 14618116 1I CTTTGGACAT -/A AAACATTTCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 3 4 322906 CASAVA_Build 21 14618393 1I AGGAGACAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 9 322907 CASAVA_Build 21 14628155 5D TTCGTTAGTT ATATC/----- TAATTAGGAA 3070 hom 111 het 41 0 37 6 ATATC 1 0 322908 CASAVA_Build 21 14634550 1I TTGACCATGA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 8 322909 CASAVA_Build 21 14648758 1I GAAAATATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 11 12 322910 CASAVA_Build 21 14663446 1D GCCCAGCCAA C/- ATGGCAAAAC 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 C 1 0 322911 CASAVA_Build 21 14664868 3I GGCTCATCTT ---/AGA AGATTACATT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 AGA 1 2 322912 CASAVA_Build 21 14673387 2D AATCAAATCT CA/-- TTTACATTCT 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 CA 1 0 322913 CASAVA_Build 21 14674630 1I TGATCTCACT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 A 8 9 322914 CASAVA_Build 21 14690491 1D TCCTTCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 13 12 T 13 12 322915 CASAVA_Build 21 14690935 3I ATGTGGTGTT ---/TTC TTGACTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 9 8 TTC 0 1 322916 CASAVA_Build 21 14700001 4D AACTATTTAC TTAT/---- TTATTTTTAT 2006 het 2006 ref 21 13 7 4 TTAT 2 1 322917 CASAVA_Build 21 14700463 1I GTTAAACCTC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 47 23 23 1 T 7 8 322918 CASAVA_Build 21 14706540 1D TCTTTGCTTA C/- TTCATAAGTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 C 1 0 322919 CASAVA_Build 21 14707731 4I CTATTTTTAT ----/TTTA TTTATTTTAC 2414 het 2414 ref 16 7 6 3 TTTA 1 2 322920 CASAVA_Build 21 14723451 2D ATCCTAACAC TT/-- TGGGAGGCCG 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 3 1 322921 CASAVA_Build 21 14723825 1I CAGAGCAAAA -/G TAAACCAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 0 1 322922 CASAVA_Build 21 14727583 2I ATTGCTTAAG --/TT TTTTCTGATC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 4 6 322923 CASAVA_Build 21 14727971 1I ACAAACAAAC -/A AAACCCATAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 3 4 322924 CASAVA_Build 21 14733605 2D66M2I GCCTGGCCAA TTTTTTGTATTTTTATTAGAGAGAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTGGATCTCCTGACCTC--/--TTTTGTATGTTTCGTAGAGACAGGGTTTCTCCAAATTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAG GTGATCCGCC 2550 het 1595 hom 10 5 6 5 N/A 0 0 322925 CASAVA_Build 21 14735414 1D TAAATACTTT C/- TGCCTGTAGT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 C 1 0 322926 CASAVA_Build 21 14750074 1I ATGTCGTACA -/G TGATTTCTTG 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 G 0 1 322927 CASAVA_Build 21 14750166 4D TATCTAAAAA TTTC/---- TTTATTTTAC 3070 het 1700 hom 23 5 16 2 TTTC 1 0 322928 CASAVA_Build 21 14756923 1I CAGGCAAGAA -/G GGGGTCTTTT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 4 5 322929 CASAVA_Build 21 14761430 1D ATTCGCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 13 12 322930 CASAVA_Build 21 14795868 5D CATCTAAAAT AAAGA/----- AATTTTGCAG 3070 het 3070 hom 37 15 20 3 AAAGA 1 0 322931 CASAVA_Build 21 14796449 6I ATCTGTTAGG ------/CTGGGT CTTTCTGCCT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 CTGGGT 0 1 322932 CASAVA_Build 21 14804337 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1098 hom 23 6 15 2 A 12 11 322933 CASAVA_Build 21 14804870 2I AATCTGGCCA --/CT CTCTCCTCTA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 CT 2 3 322934 CASAVA_Build 21 14806846 3I TTTAATAGAC ---/AAG ACATATTTTA 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 AAG 0 1 322935 CASAVA_Build 21 14807713 2D TTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 GT 6 5 322936 CASAVA_Build 21 14812014 1D ATATTATGTG A/- TATATATTAC 3070 het 3070 ref 31 19 9 4 A 1 0 322937 CASAVA_Build 21 14812638 1I ACGTTGCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 9 10 322938 CASAVA_Build 21 14816093 1I AAGTTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 13 14 322939 CASAVA_Build 21 14818568 1I AAATAAGCAG -/C TGTCAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 C 0 1 322940 CASAVA_Build 21 14859479 1D GACTCTATCC A/- AAAAAAAAAA 1258 het 1258 ref 22 12 6 4 A 17 16 322941 CASAVA_Build 21 14874343 4D GGGTTCTAAC AGAG/---- AGAATTCACA 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 AG 3 1 322942 CASAVA_Build 21 14879220 1I GTCAGAGGAA -/G CCCTACCTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 322943 CASAVA_Build 21 14883063 1D TTTTCTTTTC A/- CTTTTGTCTT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 1 0 322944 CASAVA_Build 21 14884458 2I AATTGGGAGA --/TT ATTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 0 2 322945 CASAVA_Build 21 14884787 3D AAATTCTATA AAC/--- AACTACAAAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 AAC 2 1 322946 CASAVA_Build 21 14887178 13D TGAGAAATAG CAAGGGCAGATCT/------------- CAATAATTTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 6 CAAGGGCAGATCT 1 0 322947 CASAVA_Build 21 14909513 1I AATAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 9 10 322948 CASAVA_Build 21 14921470 1I AAGTATAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 327 hom 16 2 12 2 A 9 10 322949 CASAVA_Build 21 14928394 1I CCAAAACTAT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 8 9 322950 CASAVA_Build 21 14933944 1D AATATGTTAG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 8 322951 CASAVA_Build 21 14934848 1D TTAAAATACC T/- TGATTTAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 T 2 1 322952 CASAVA_Build 21 14935203 4D ATTTACTTAA ATGT/---- GTGAGACATT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 ATGT 1 0 322953 CASAVA_Build 21 14946292 1I CAATTTTGTT -/A AAAATGTCCA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 4 5 322954 CASAVA_Build 21 14955626 4I CTTATTCTTC ----/CTGT CTAACTAAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CTGT 0 1 322955 CASAVA_Build 21 14971279 1D ATGCCTGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 13 10 A 11 10 322956 CASAVA_Build 21 14978418 1I ACACTGAGCT -/A ACTTCTTGTG 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 1 2 322957 CASAVA_Build 21 14987301 1I ACCCAGCATC -/T TTTTTTTTTT 840 het 489 hom 11 1 3 7 T 13 14 322958 CASAVA_Build 21 14988818 1I CTACTAAAAA -/T AAAAAAATTA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 0 1 322959 CASAVA_Build 21 14994453 1I TGGGCAAATA -/T TTTGGTCTCC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 3 4 322960 CASAVA_Build 21 14995518 1D TTTTACATTA T/- TTTTTGTGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 6 5 322961 CASAVA_Build 21 14998603 4D ACAGAAGACT ACTA/---- ACTATTTCTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 ACTA 2 1 322962 CASAVA_Build 21 15000019 4I AGTGGCACAT ----/AGAG AGAGAACTCT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 AG 2 4 322963 CASAVA_Build 21 15018223 4I AAAGTTTAAC ----/AATT AATTTCTAAC 2796 het 2796 ref 19 10 6 3 AATT 1 2 322964 CASAVA_Build 21 15025477 1D CATATTACAT A/- AATTAAGAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 3 2 322965 CASAVA_Build 21 15025721 1D ATCACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2690 het 23 hom 24 1 12 11 T 19 18 322966 CASAVA_Build 21 15033546 1I TTTTCCAGAG -/A AAAACATATG 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 4 5 322967 CASAVA_Build 21 15034984 1D TACCCTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 11 10 322968 CASAVA_Build 21 15039121 4D TCGTCTGAGA CAAG/---- CAAGCCAAGT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CAAG 2 1 322969 CASAVA_Build 21 15044677 2D AAAGACTGGT CA/-- CAGTTTTATT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 CA 2 1 322970 CASAVA_Build 21 15045026 1D TACAACCTGC A/- CTAAGCATAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 1 0 322971 CASAVA_Build 21 15045918 1D AGAAAAAAGG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 67 het 31 0 23 8 A 8 7 322972 CASAVA_Build 21 15047493 1D TTGAATTGAG T/- TAAGAAGAGC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 2 1 322973 CASAVA_Build 21 15048775 1I GCTCAAAATG -/A AAAAAAGAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 6 7 322974 CASAVA_Build 21 15049924 36I AAGTATGGGG ------------------------------------/GAAGTGAGTAAAAGTTAAGCGTTTTTGTATGGAATT GAAGTTATCA 3070 hom 48 het 16 0 17 0 GAAGTGAGTAAAAGTTAAGCGTTTTTGTATGGAATT 0 1 322975 CASAVA_Build 21 15054782 1D AATAAATAAA T/- AAAAAAATTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 1 0 322976 CASAVA_Build 21 15061109 1D TCTATAAAGT A/- AAAATAGAGC 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 A 5 4 322977 CASAVA_Build 21 15070029 1I TCATTGATTT -/A TCCCAATCAG 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 0 1 322978 CASAVA_Build 21 15085019 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 3 T 11 10 322979 CASAVA_Build 21 15101066 1D TAATTGGGTG T/- TTGTTTTACA 3070 hom 105 het 42 0 36 9 T 3 2 322980 CASAVA_Build 21 15102754 4I AATAGAGGAA ----/AAAC AAACAAACTT 3070 hom 85 het 33 0 29 4 AAAC 2 3 322981 CASAVA_Build 21 15112792 1D TAACGTTAAT A/- AAAAAAACCC 3070 hom 111 het 48 0 43 7 A 8 7 322982 CASAVA_Build 21 15119683 1D AATAAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3058 hom 21 het 9 0 8 1 A 12 11 322983 CASAVA_Build 21 15132103 4D ACAAATAAAT ACAC/---- AATATGTCAT 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 AC 2 0 322984 CASAVA_Build 21 15147953 23D AAAACACAGA TTTGAAGATGTTATGCTGTTAGC/----------------------- TTTGAAGATG 3070 het 3070 ref 49 21 13 22 TTTGAAGATGTTATGCTGTTAGC 2 1 322985 CASAVA_Build 21 15156341 1D GATATACCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 10 9 322986 CASAVA_Build 21 15164051 1D ATATAGAATA T/- TTTCCCTAAG 3070 het 3070 hom 47 19 21 8 T 4 3 322987 CASAVA_Build 21 15177211 11D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 2563 hom 27 12 12 6 A 21 10 322988 CASAVA_Build 21 15179470 3I TTATAAGAAG ---/AGA AGGAGACATC 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 AGA 0 1 322989 CASAVA_Build 21 15189309 1I GATTTTTAGA -/T TAAGGGGACT 3070 het 3070 hom 41 12 22 7 T 1 2 322990 CASAVA_Build 21 15191815 2D CTCATTTGGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 AT 6 5 322991 CASAVA_Build 21 15197154 79D AGGCGGAGCT TGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACGCCAGCCTGGGGACAGAGCAAGACGCTGTTTCAAAAAAAAAAAATAATAA/------------------------------------------------------------------------------- TAATATTACC 3004 het 3004 ref 11 19 8 4 TGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACGCCAGCCTGGGGACAGAGCAAGACGCTGTTTCAAAAAAAAAAAATAATAA 1 0 322992 CASAVA_Build 21 15198255 1I CAACAGCCAT -/A AAAGAAAAGA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 3 4 322993 CASAVA_Build 21 15204932 4D TTTTGGATCA TCTG/---- TCTGAGAGTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 8 TCTG 2 1 322994 CASAVA_Build 21 15205751 1D GCCACAAGAC A/- AAGCTCTTAC 3070 het 3070 hom 36 15 12 9 A 3 2 322995 CASAVA_Build 21 15233288 1D TGGAGTTTGC T/- TGGAGGTCCA 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 T 2 1 322996 CASAVA_Build 21 15258366 1D AATAAACACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 8 hom 29 1 24 4 T 10 9 322997 CASAVA_Build 21 15271768 7I TATTATCAAT -------/TAAAAGA TAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 TAAAAGA 0 1 322998 CASAVA_Build 21 15273880 1I AGTATGTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 5 T 8 9 322999 CASAVA_Build 21 15278560 1D TTGTTGCGGG T/- TTTTTTTTTT 1952 het 1952 ref 34 12 7 16 T 15 14 323000 CASAVA_Build 21 15282710 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2194 het 2194 ref 16 7 6 3 TA 8 9 323001 CASAVA_Build 21 15287428 1I AGTAATGACC -/A AAAAAAAAAA 1435 het 1435 ref 41 22 5 14 A 15 16 323002 CASAVA_Build 21 15289327 4D CACATTCATG CAGA/---- CAGACAACCA 3070 het 3070 ref 45 21 19 7 CAGA 2 1 323003 CASAVA_Build 21 15289433 1D TGTCATTTGC T/- TACCAGTATT 3070 het 3070 hom 57 25 26 6 T 2 1 323004 CASAVA_Build 21 15290705 4D TGACTTTAGG CAAA/---- CAGTCTCCCC 3070 het 3070 hom 52 20 26 10 CAAA 1 0 323005 CASAVA_Build 21 15293737 2I ATACCAGGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 10 12 323006 CASAVA_Build 21 15309020 1D TGTATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 A 14 13 323007 CASAVA_Build 21 15331857 1I AGTAGGGTTC -/A AAAAGACATC 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 A 4 5 323008 CASAVA_Build 21 15348604 2I TTTGCTAAAC --/AT GTTTTCTAAT 3070 het 3070 hom 41 12 26 3 AT 0 1 323009 CASAVA_Build 21 15351362 1I TAGGGTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 22 16 11 A 10 11 323010 CASAVA_Build 21 15361167 2I ACCATTATAC --/AA AGATTTTTCT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 3 323011 CASAVA_Build 21 15361867 1I TCAACCCCAC -/A AAAAATCCAA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 5 6 323012 CASAVA_Build 21 15402511 1I TCCCTTGTGC -/T TTTTTTTTTT 1681 het 1681 ref 42 24 7 11 T 13 14 323013 CASAVA_Build 21 15424986 1D TCCTTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 2251 het 2251 ref 37 24 7 6 A 13 12 323014 CASAVA_Build 21 15448737 1I TTGGAACAAA -/G GGACTTGCCC 3070 hom 126 het 51 0 43 8 G 2 3 323015 CASAVA_Build 21 15471298 1D TGTTTTCTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 16 15 11 T 9 8 323016 CASAVA_Build 21 15491896 1I60M1D TAAAAACTGG -AGGGCAGCATGGCACTGTGGAGTCTCTTTGATTGTAGTAATTTCCCTTACCAAGTGACTTA/AAGGGCAGCATGGCACTGTGGAGTCTCTTTGATTGTAGTAATTTCCCTTACCAAGTGACTT- AGTCAAAGTC 3070 hom 84 het 34 0 29 15 N/A 0 0 323017 CASAVA_Build 21 15521039 2D CTAATACGAC AA/-- AGTCTTCTTT 3070 hom 117 het 46 0 40 7 A 3 1 323018 CASAVA_Build 21 15526684 1D CAAGGGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 45 0 31 14 T 11 10 323019 CASAVA_Build 21 15528116 1D CCTCCAGTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 8 7 323020 CASAVA_Build 21 15529265 1D ATGGGGGAAG T/- TTCCCCCATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 2 323021 CASAVA_Build 21 15533588 1I GTGTGATGTG -/C CTACTCCCGC 3070 hom 99 het 37 0 31 6 C 1 2 323022 CASAVA_Build 21 15609176 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2910 hom 29 15 8 6 A 15 14 323023 CASAVA_Build 21 15626523 1D CAACTACTCT A/- AAAAAAAAAA 1077 het 1077 ref 35 30 3 4 A 11 10 323024 CASAVA_Build 21 15639937 1I TGTTCGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 942 hom 47 4 29 14 T 13 14 323025 CASAVA_Build 21 15682135 1I CAGAGTGAGA -/C CCCCCCAATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 6 7 323026 CASAVA_Build 21 15729273 6I TAATTCATTA ------/ATAGAC ATAGACCTTA 3070 hom 99 het 41 0 33 8 ATAGAC 1 2 323027 CASAVA_Build 21 15730944 1D ACAAAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 10 T 12 11 323028 CASAVA_Build 21 15736129 6D TTGCAGACTA AATCTT/------ AATCTATCTG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 AATCTT 1 0 323029 CASAVA_Build 21 15739932 2D GAAAAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 2533 het 228 hom 28 4 6 20 A 13 11 323030 CASAVA_Build 21 15742191 1I CTGATACTCT -/A ACCATTGAGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 1 2 323031 CASAVA_Build 21 15747009 1I GATTTATTGA -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 7 8 323032 CASAVA_Build 21 15749374 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 397 hom 24 1 22 1 TA 7 8 323033 CASAVA_Build 21 15751670 1D TTTTTTCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 13 1 A 12 11 323034 CASAVA_Build 21 15768599 3D TAAAAAATAA GAT/--- GATAATAAAA 2146 het 2146 ref 18 10 5 4 GAT 2 1 323035 CASAVA_Build 21 15771595 1I CTACATGTTT -/A AAAAAATGGT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 6 7 323036 CASAVA_Build 21 15844886 1D TCTGCCTCCC T/- CTTCCACTTT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 T 1 0 323037 CASAVA_Build 21 15868631 1D ATGTAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 12 10 9 A 10 9 323038 CASAVA_Build 21 15869741 1D GTTACTCTAA G/- AATGCAAGGT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 G 1 0 323039 CASAVA_Build 21 15872299 6D GTTAGCCGAA ATACGG/------ ATTCCAAGAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 ATACGG 1 0 323040 CASAVA_Build 21 15877198 2I TAATAAGCTC --/AT ATATATATAT 2077 het 2077 ref 20 11 6 3 AT 6 7 323041 CASAVA_Build 21 15880388 1D AGACCACTAG A/- AAAAAAAAAG 2311 het 2311 ref 23 15 6 2 A 10 9 323042 CASAVA_Build 21 15881668 2D TGTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2567 hom 32 8 15 9 T 13 11 323043 CASAVA_Build 21 15881924 1I ACCTGCCTCT -/G GCCTCCCAAA 3070 het 3070 hom 21 8 7 6 G 1 2 323044 CASAVA_Build 21 15882887 5I GCCCACACTT -----/TTTAA TTTAATTTTA 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 TTTAA 1 2 323045 CASAVA_Build 21 15900427 1I CAGATAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2516 hom 19 7 9 3 T 11 12 323046 CASAVA_Build 21 15900806 4D3M3D TATGATCTTG CCCTTCTCAA/----TGT--- GTAATTAGAA 3070 het 3070 hom 34 15 18 5 N/A 0 0 323047 CASAVA_Build 21 15911666 5I TACAGGCATG -----/CACCA CACCACCACA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 CACCA 1 2 323048 CASAVA_Build 21 15920675 1D TTTTCATGAG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 T 9 8 323049 CASAVA_Build 21 15922786 1D TTTTAAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 11 10 323050 CASAVA_Build 21 15924110 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAACC 2703 het 2703 ref 23 13 7 5 A 9 8 323051 CASAVA_Build 21 15924429 1I GCAACAAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 9 10 323052 CASAVA_Build 21 15926502 1D CTTTGCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 A 11 10 323053 CASAVA_Build 21 15937327 2I CTCATGACTC --/TT TTCTCCATCT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 2 4 323054 CASAVA_Build 21 15939553 2D AGATTACCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1763 hom 17 5 8 4 T 13 11 323055 CASAVA_Build 21 15946057 1D CTTGGTAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 10 9 323056 CASAVA_Build 21 15947558 4D CTCTTATCGC CAAT/---- CAATCTTTCC 3070 het 3070 hom 31 12 17 5 CAAT 2 1 323057 CASAVA_Build 21 15950035 3D TTTAAAGAGA TGT/--- TGTTATGTTA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 TGT 2 1 323058 CASAVA_Build 21 15950443 17I AACTCCAAGG -----------------/CTACTTTGGATACTCCA AAGTATCTTT 2558 het 2558 ref 33 20 6 7 CTACTTTGGATACTCCA 0 1 323059 CASAVA_Build 21 15961203 1I AAAATGATTG -/A TCATGATTAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 0 1 323060 CASAVA_Build 21 15963477 2D GAGATGGGAG AA/-- GAGAGTGGAT 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 2 0 323061 CASAVA_Build 21 16073654 1D TAAAATTATA T/- TTTTGTTTAT 3070 het 3070 hom 28 11 15 3 T 5 4 323062 CASAVA_Build 21 16100620 1D TTCTGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 40 0 24 16 T 12 11 323063 CASAVA_Build 21 16160393 2D TGATTTACAA AT/-- ATATATATAT 1417 het 1417 ref 36 24 4 8 AT 9 8 323064 CASAVA_Build 21 16187786 1D TAATTTACTC T/- TAGATGAAGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 2 1 323065 CASAVA_Build 21 16257325 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1683 het 901 hom 18 7 5 6 A 19 18 323066 CASAVA_Build 21 16306230 3I AGGTGGTAGA ---/GAT TAATAGTCTT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 GAT 0 1 323067 CASAVA_Build 21 16311876 7D ATATTTACAC TGTCAAA/------- TGTCCCTGAA 3070 het 3070 ref 46 28 16 5 TGTCAAA 1 0 323068 CASAVA_Build 21 16312349 2D TACACAACAC AT/-- GTTTAATAAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 AT 1 0 323069 CASAVA_Build 21 16336197 6D CCTTTAGATT CAAACA/------ GCCTCAGGGT 3070 het 3070 ref 28 16 12 2 CAAACA 1 0 323070 CASAVA_Build 21 16338982 1I CAATGTTTCA -/G GGTTATCTGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 2 3 323071 CASAVA_Build 21 16340623 1D CTACTCGGGA G/- GGCTGAGGCA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 3 2 323072 CASAVA_Build 21 16351332 2I ATAAACAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 21 5 A 10 12 323073 CASAVA_Build 21 16351587 1I GTTTTCTCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 T 9 10 323074 CASAVA_Build 21 16357166 4I ATCTGCTTTA ----/GAAT GAATGCTATT 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 GAAT 1 2 323075 CASAVA_Build 21 16361334 7D CTTTAAAATT CTTATGC/------- CTTTCACATC 3070 het 3070 ref 49 25 21 7 CTTATGC 1 0 323076 CASAVA_Build 21 16368847 4D TCAGCTTAAG TCTT/---- TATTTTGTAA 3070 het 3070 ref 32 14 16 3 TCTT 1 0 323077 CASAVA_Build 21 16387944 1I ACCTCCGCTT -/C CCAGATTCAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 C 2 3 323078 CASAVA_Build 21 16389463 1D ACTGCGTGAC T/- TTTTTTTTTT 1030 het 1030 ref 47 36 3 8 T 11 10 323079 CASAVA_Build 21 16390186 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 554 hom 25 2 15 8 A 14 15 323080 CASAVA_Build 21 16391045 1I TAACCCTCTT -/G GCTAAATATC 3070 het 3070 hom 48 14 26 8 G 1 2 323081 CASAVA_Build 21 16394561 1D TTCCTAGGTA T/- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 8 7 323082 CASAVA_Build 21 16407461 1D ATGATTAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 6 A 10 9 323083 CASAVA_Build 21 16410916 1D ACCCTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 2990 het 2990 ref 22 9 7 6 T 11 10 323084 CASAVA_Build 21 16455783 2D GACCAGACTC TT/-- TTTAATGTTT 3070 het 3070 ref 33 19 14 0 T 5 3 323085 CASAVA_Build 21 16474397 1I TTTTTATCTG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 123 het 50 0 41 9 T 8 9 323086 CASAVA_Build 21 16476940 1I CTGGCTAATG -/C TTTTTGGTAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 0 1 323087 CASAVA_Build 21 16479862 1I GTGTGAGCCA -/C CGTGCCCAGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 1 2 323088 CASAVA_Build 21 16481754 1I TTTTAGTGGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 333 hom 25 1 18 6 T 7 8 323089 CASAVA_Build 21 16482046 8I CTTGCTTCCT --------/TCCTTCCC TCCTTCCCTC 3070 hom 72 het 36 0 23 13 TCCTTCCC 1 2 323090 CASAVA_Build 21 16483037 1I AAAGTATCAC -/T TGAGAATCGT 3070 het 3070 ref 44 22 20 2 T 1 2 323091 CASAVA_Build 21 16484777 1I TCCTTACTTC -/G ATTTTTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 0 1 323092 CASAVA_Build 21 16487169 1I TTATTCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1189 hom 34 4 23 7 T 12 13 323093 CASAVA_Build 21 16497206 1I AAAAGTAGAC -/A AATATATAGA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 2 3 323094 CASAVA_Build 21 16499382 1D CAATATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 T 11 10 323095 CASAVA_Build 21 16508066 1D TGACTGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 A 11 10 323096 CASAVA_Build 21 16511174 4I AAGTTTTCTC ----/TCTT TCGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 TCTT 0 1 323097 CASAVA_Build 21 16527630 2D AGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3008 het 291 hom 13 1 10 3 TA 9 8 323098 CASAVA_Build 21 16531452 2D TGAATATGAT AA/-- GTGTTTTGTC 3070 hom 72 het 26 0 25 2 A 2 0 323099 CASAVA_Build 21 16538707 1D TTCCATTGCC T/- TTGCTCAGAA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 T 3 2 323100 CASAVA_Build 21 16543202 1I TTTCGGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 966 hom 40 4 27 9 T 12 13 323101 CASAVA_Build 21 16546566 1D TTGCGTGCAA G/- GACAGAGTAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 2 1 323102 CASAVA_Build 21 16548304 1I TTTCAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 40 1 35 4 T 11 12 323103 CASAVA_Build 21 16551153 1I GTTTTTTTTT -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 6 7 323104 CASAVA_Build 21 16573694 5I ATATTGTATA -----/TTATT TATGATAAAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TTATT 0 1 323105 CASAVA_Build 21 16580671 1I TATTTTCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 10 11 323106 CASAVA_Build 21 16580752 1D ATAGTAGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 11 10 323107 CASAVA_Build 21 16597799 1I ATGACATAGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 8 323108 CASAVA_Build 21 16598715 4I GATTAAAAAT ----/AGAA AGAATTCTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 AGAA 1 2 323109 CASAVA_Build 21 16613875 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 592 hom 34 2 25 7 T 9 10 323110 CASAVA_Build 21 16616686 1I TATCATGTAG -/T TTTTTTAAAC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 6 7 323111 CASAVA_Build 21 16619822 2I CAGAAAGCTG --/TA TATATATATA 3070 hom 45 het 26 0 16 10 TA 6 7 323112 CASAVA_Build 21 16625857 1D55M1I ACGAGGACAT AAAAAAAAAACAAAGACTCTGGATAAAATTAATAATATGATAAACCTGTTCTGGGG-/-AAAAAAAAACAAAGACTCTGGATAAAATTAATAATATGATAAACCTGTTCTGGGGA AAAATAGGCC 3070 hom 175 het 40 0 59 8 N/A 0 0 323113 CASAVA_Build 21 16628655 1D CTCTAAGAAT A/- AATAATAATC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 3 2 323114 CASAVA_Build 21 16632997 1I GGAAACAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 11 323115 CASAVA_Build 21 16637721 1I TCCAAATCTG -/A AAACAATGTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 3 4 323116 CASAVA_Build 21 16640174 1D ATAGTAAAGC T/- TTTAATGTAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 4 3 323117 CASAVA_Build 21 16643836 1D AAGAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 31 1 29 1 A 12 11 323118 CASAVA_Build 21 16647068 1D ATGTACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 A 12 11 323119 CASAVA_Build 21 16657306 1D TCCCAAATGT G/- TTGGGTCTGT 3070 hom 154 het 56 0 52 6 G 1 0 323120 CASAVA_Build 21 16657765 1I GTAGATAAGC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 7 8 323121 CASAVA_Build 21 16662299 1I GTAAACTGAG -/A CGCAGCAAGA 3070 hom 129 het 53 0 44 9 A 0 1 323122 CASAVA_Build 21 16662927 1I TTCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1157 hom 24 4 13 7 A 17 18 323123 CASAVA_Build 21 16665315 3D CTTCAAAACT TTG/--- TTGTTGATAA 3070 hom 84 het 31 0 29 4 TTG 3 2 323124 CASAVA_Build 21 16666863 3D CTATTGTAAT AAG/--- AAGAGAACCC 3070 hom 104 het 42 0 33 11 AAG 2 1 323125 CASAVA_Build 21 16667055 2D CCTATAATGC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 114 het 43 0 37 7 T 11 9 323126 CASAVA_Build 21 16667194 9D TTGATTTTCT TCGTATCAC/--------- TCGTATCACT 3070 hom 123 het 44 0 39 8 TCGTATCAC 2 1 323127 CASAVA_Build 21 16667879 1D GAGGTACATT C/- CGGGGGGGGG 3070 hom 87 het 36 0 26 10 C 2 1 323128 CASAVA_Build 21 16673926 2I GGCAGGCACA --/GT TGTACATGTT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 GT 0 1 323129 CASAVA_Build 21 16675666 1I13M1I ATGTAGTATG -TTCTCAGAAAGGC-/TTTCTCAGAAAGGCT TTTTAGGTAC 3070 hom 105 het 33 0 36 2 N/A 0 0 323130 CASAVA_Build 21 16681564 2I ACATTTTGAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 34 1 24 9 T 12 14 323131 CASAVA_Build 21 16683590 3I CATCACAGTC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 36 0 21 15 T 13 16 323132 CASAVA_Build 21 16683846 2I CCAGTGTGCC --/TT TCTCTCTCAA 3070 hom 138 het 49 0 46 3 T 1 3 323133 CASAVA_Build 21 16687491 3D GACATCTTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 39 het 20 0 14 6 TTA 9 8 323134 CASAVA_Build 21 16690160 3I TTTTGGTGGG ---/GGT GGGGGGCAGC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GGT 0 1 323135 CASAVA_Build 21 16694624 1D CTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2568 het 217 hom 23 2 9 12 T 17 16 323136 CASAVA_Build 21 16701524 1I TGTTTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 46 hom 37 2 29 6 A 12 13 323137 CASAVA_Build 21 16707653 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2862 het 2862 ref 29 13 11 5 A 13 14 323138 CASAVA_Build 21 16709197 1I AGATTCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 A 11 12 323139 CASAVA_Build 21 16731502 1D CAAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 A 13 12 323140 CASAVA_Build 21 16735582 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 821 het 453 hom 4 1 3 0 A 9 8 323141 CASAVA_Build 21 16739014 7I TTTAAAGTAA -------/TAGTAAT TAGTTTGTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TAGTAAT 0 1 323142 CASAVA_Build 21 16743970 1D TAAAGCCTGA C/- TTTTCTTCGT 3070 hom 60 het 21 0 21 1 C 1 0 323143 CASAVA_Build 21 16788301 1I GAGCAAGACT -/C CCATCAAAAA 1943 het 1943 ref 30 8 9 13 C 2 3 323144 CASAVA_Build 21 16797771 1I AAACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 29 1 20 8 A 13 14 323145 CASAVA_Build 21 16805088 1I22M1I AAAAGTTATG -TGTCGAATATATCCTTTAAACA-/TTGTCGAATATATCCTTTAAACAT TGTCAGATAT 3070 het 100 hom 53 1 59 3 N/A 0 0 323146 CASAVA_Build 21 16847995 1I GGACTGCCAG -/T TTTAGCAAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 3 4 323147 CASAVA_Build 21 16849964 1D AAGTCAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 12 11 323148 CASAVA_Build 21 16903860 1I TATTTGGTCA -/C ATACAATACT 3070 hom 147 het 55 0 49 6 C 0 1 323149 CASAVA_Build 21 16904444 1D ATGTTTCTTT G/- GCTACATTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 2 1 323150 CASAVA_Build 21 16909715 1D TAAAACCAGC A/- AAAAAAAAAA 2584 hom 21 het 9 0 7 2 A 15 14 323151 CASAVA_Build 21 16912842 2D TACTGGACAG TC/-- TGAATTTGTG 3070 hom 93 het 36 0 31 6 TC 1 0 323152 CASAVA_Build 21 16917124 1D ACTTCCTCAT A/- CTACTGAGGG 3070 hom 60 het 28 0 20 8 A 1 0 323153 CASAVA_Build 21 16917638 1I TCCAGGAATT -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 8 9 323154 CASAVA_Build 21 16919654 3I AGTCCTTTGA ---/GTT GTTGTGAATA 3070 hom 113 het 45 0 38 7 GTT 1 2 323155 CASAVA_Build 21 16920144 2I TTTTCTAAAC --/AT AGTAAAAATG 3070 hom 40 het 38 1 29 8 AT 0 1 323156 CASAVA_Build 21 16921804 1I AAGTATCCAG -/A AAAGCTCTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 3 4 323157 CASAVA_Build 21 16924211 1D AATTTGGCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 A 10 9 323158 CASAVA_Build 21 16927316 1D ATATCTTAAA T/- TTTCTTCTCT 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 T 4 3 323159 CASAVA_Build 21 16927713 2I ATCTGGGAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 A 10 12 323160 CASAVA_Build 21 16927924 1D AAAAACCCCA T/- AGTGCAGGGT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 1 0 323161 CASAVA_Build 21 16952607 1I TTATGAAAAT -/A ATAACAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 2 323162 CASAVA_Build 21 16953451 1I14M1I TGAAGAAGGC -AATTTAGAAGACTT-/AAATTTAGAAGACTTA ATCAAACATC 3070 hom 99 het 32 0 34 3 N/A 0 0 323163 CASAVA_Build 21 16953902 1I TACTGAGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1282 hom 39 4 32 3 A 12 13 323164 CASAVA_Build 21 16957437 1D AAAGAGATGC A/- AAAAAAAAAA 2972 het 2243 hom 22 6 8 8 A 13 12 323165 CASAVA_Build 21 16957608 1I TCTAACTTTG -/T TAATGAGTAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 1 2 323166 CASAVA_Build 21 16962360 3D GACAGCAAAA CTC/--- CTCTATGATG 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 CTC 2 1 323167 CASAVA_Build 21 16966025 11D GTAAACAACA CCATATTCTAT/----------- CCATATTCTA 3070 het 3070 hom 32 13 18 4 CCATATTCTAT 2 1 323168 CASAVA_Build 21 16980113 1I TACTGCCCGG -/T TTACATTGGA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 2 3 323169 CASAVA_Build 21 16980983 3D TACACAGATA CAT/--- CATACTTTGG 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 CAT 2 1 323170 CASAVA_Build 21 16981360 4D GATTAACAAA AACT/---- AACACTGATT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AACT 1 0 323171 CASAVA_Build 21 16983804 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2595 het 1613 hom 12 6 6 1 A 7 6 323172 CASAVA_Build 21 16994561 1I GATATTTTAG -/T TTCTTTGCAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 3 323173 CASAVA_Build 21 16998037 1D GTGCCACAAT A/- AAACATATGG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 4 3 323174 CASAVA_Build 21 16998203 1D TTTTAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 40 1 36 4 T 11 10 323175 CASAVA_Build 21 17013503 1D AAATATACAC A/- AAAATGGAGT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 5 4 323176 CASAVA_Build 21 17015453 1D AAATATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 21 1 18 2 A 11 10 323177 CASAVA_Build 21 17021110 1I CAGACCTCAT -/C AGCCATCAAC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 C 0 1 323178 CASAVA_Build 21 17023078 1I AGATGTGTTA -/T TTGATGCTAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 3 323179 CASAVA_Build 21 17027983 1I TGGAAATCAT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 A 7 8 323180 CASAVA_Build 21 17037377 1I TTAGAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 13 20 13 A 11 12 323181 CASAVA_Build 21 17046779 1D AAACACTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 T 11 10 323182 CASAVA_Build 21 17049822 1I CATGGTGAAA -/C CCCTTCTCTA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 C 3 4 323183 CASAVA_Build 21 17058578 4D ATATAGGTAA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 2952 hom 25 7 12 7 GT 10 8 323184 CASAVA_Build 21 17068944 1D TATTTGCACA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 7 6 323185 CASAVA_Build 21 17093100 1D AGCCAAATCA C/- CCCTGGCTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 4 3 323186 CASAVA_Build 21 17112055 1D CTTGCTTCAG C/- CCTCCCGAGT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 C 3 2 323187 CASAVA_Build 21 17120047 6D AGATAGATAG AGATAT/------ AGATATAGAT 3070 het 2228 hom 26 8 13 6 AGATAT 2 1 323188 CASAVA_Build 21 17121399 1D ACACATTCAT G/- GGGCAGTGGT 3070 hom 102 het 38 0 35 5 G 4 3 323189 CASAVA_Build 21 17122572 1D9M1I40M1I GTCTTCTGTG TTTTCTTTTA-CTCCAAACAACATCACCACGTATATGCCGATGAAAAACCC-/-TTTCTTTTACCTCCAAACAACATCACCACGTATATGCCGATGAGAAACCCA ATATATGCTT 3070 hom 175 het 36 0 59 5 N/A 0 0 323190 CASAVA_Build 21 17129497 1D GAATGGTAAT C/- CCCCCCAACA 3070 het 3070 hom 54 20 22 13 C 7 6 323191 CASAVA_Build 21 17131629 1I ACTATAAAGG -/T TTCCTATAAC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 2 3 323192 CASAVA_Build 21 17133008 1D AATATTTCAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 9 8 323193 CASAVA_Build 21 17139652 1I AGGCAGGGCC -/T TGGATCAAAT 3070 hom 126 het 47 0 42 5 T 1 2 323194 CASAVA_Build 21 17144892 14D AAAGCATCTA CATTACTGATTTAT/-------------- CAACTTTGAA 3070 hom 60 het 22 0 21 4 CATTACTGATTTAT 1 0 323195 CASAVA_Build 21 17152623 3D ATGTGTACTT AAC/--- AACAGGACCC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AAC 2 1 323196 CASAVA_Build 21 17153507 1I GCGTGAACCC -/T GAGAGGCGGA 2079 hom 21 het 8 0 7 1 T 0 1 323197 CASAVA_Build 21 17154464 1I TAACATCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 11 12 323198 CASAVA_Build 21 17161768 1I AAAAAAATAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 9 323199 CASAVA_Build 21 17168825 1I ATTATTCCAG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 8 9 323200 CASAVA_Build 21 17201447 1D AATTAAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 9 8 323201 CASAVA_Build 21 17222156 1I CTTACACAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 417 hom 18 1 13 4 A 9 10 323202 CASAVA_Build 21 17222475 5I AATCAAATTA -----/TTAAC TTAATAGATA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTAAC 0 1 323203 CASAVA_Build 21 17224283 1D TTTTAATTAT A/- AAAGTATAAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 4 3 323204 CASAVA_Build 21 17224816 3D TCTTTCCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 70 het 31 0 24 7 T 14 11 323205 CASAVA_Build 21 17224906 1D AGAGTTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 32 1 24 7 A 12 11 323206 CASAVA_Build 21 17229323 3D CAGGAGAAAC ATT/--- ATCTACAGAA 3070 het 3070 ref 47 22 22 3 ATT 1 0 323207 CASAVA_Build 21 17232277 1I TTGAGTTTGA -/G GTCCTCATAT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 G 1 2 323208 CASAVA_Build 21 17245889 1I GACACATAGA -/C CAATGGAAAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 1 2 323209 CASAVA_Build 21 17246312 1I33M1I ACAAAATGGG -AAATATATTTGCAAACTATCCATCTGACAAAGG-/AAAATATATTTGCAAACTATCCATCTGACAAAGGA TTAATAACCA 3070 hom 114 het 34 0 39 7 N/A 0 0 323210 CASAVA_Build 21 17246993 1I ACAGAAAGAC -/A AACTTCCCAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 2 3 323211 CASAVA_Build 21 17260912 2I TAATGGAGAG --/AT ATAGATGGGG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 1 2 323212 CASAVA_Build 21 17268904 2I AAGGGAGGAA --/CC TTAATTCAAA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 0 2 323213 CASAVA_Build 21 17288295 5D AGATCTTATC TAATA/----- TAACAACAGA 3070 hom 102 het 35 0 34 5 TAATA 1 0 323214 CASAVA_Build 21 17289996 18D GCTCCCCTTG GGGCTTCGTCATGAGCAT/------------------ GAGCATGATT 3070 hom 72 het 22 0 25 2 GGGCTTCGTCATGAGCAT 1 0 323215 CASAVA_Build 21 17290998 2I AGAGAGAGAT --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 61 het 41 1 32 8 AG 6 7 323216 CASAVA_Build 21 17292502 1I AATGAAATAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 8 9 323217 CASAVA_Build 21 17293163 1D AAAGAAAGTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 84 hom 34 1 30 3 A 9 8 323218 CASAVA_Build 21 17295250 1D AGATTATGCA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 T 7 6 323219 CASAVA_Build 21 17296468 2D TCCAGATACC AT/-- ATATTTTAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 4 AT 3 2 323220 CASAVA_Build 21 17298381 2D TCTCTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 26 0 22 5 T 13 11 323221 CASAVA_Build 21 17303389 1I ACCAATTGTG -/A AAAAAAATCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 7 8 323222 CASAVA_Build 21 17314814 1I AGTGAGAAGA -/T GTCTTCCTAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 323223 CASAVA_Build 21 17314993 1I TTAAAATCAG -/C TTCATCCTTA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 0 1 323224 CASAVA_Build 21 17323150 1D AATCTTACTG A/- AAAAATGAAC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 A 6 5 323225 CASAVA_Build 21 17353952 1D AGAAGGCCCA G/- GGTGGGAAGC 3070 hom 72 het 30 0 24 6 G 3 2 323226 CASAVA_Build 21 17355160 1I GCAAAGAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 15 22 0 A 9 10 323227 CASAVA_Build 21 17358522 1I TGAGACAGAT -/A TATAACCTCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 A 0 1 323228 CASAVA_Build 21 17358623 1I TATTATTTCC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 A 7 8 323229 CASAVA_Build 21 17363541 1I CTTAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3005 het 2533 hom 21 7 9 5 A 10 11 323230 CASAVA_Build 21 17373948 2I AAATGCAAAA --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 AT 4 5 323231 CASAVA_Build 21 17378177 1I40M1D AATAATCTTC -TTTTTTTTTTAATAAATTACCCAGCCTTGGATATTCTGTTA/TTTTTTTTTTTAATAAATTACCCAGCCTTGGATATTCTGTT- ACAGCAATAA 3070 het 3070 ref 31 18 12 12 N/A 0 0 323232 CASAVA_Build 21 17390713 1D TATAATTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 13 12 323233 CASAVA_Build 21 17397665 1D TTCAGTTACA T/- TTTTGCTGTC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 5 4 323234 CASAVA_Build 21 17422039 1I GAAGTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 12 13 323235 CASAVA_Build 21 17422924 1D CATAAAACAG A/- GTAACACAGA 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 A 1 0 323236 CASAVA_Build 21 17424882 2D CTTTAAATTT TA/-- TATATATATA 2935 het 2295 hom 13 5 6 4 TA 7 6 323237 CASAVA_Build 21 17429448 1D AAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3033 hom 33 11 18 4 A 11 10 323238 CASAVA_Build 21 17430478 1D GGATAAACTT C/- TGGACACACA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 C 1 0 323239 CASAVA_Build 21 17437047 3I TGAAAATATC ---/AGA AGAACTATCA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 AGA 1 2 323240 CASAVA_Build 21 17439457 1D CTGCTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 14 11 15 T 15 14 323241 CASAVA_Build 21 17441677 1D AGTCAGAGAA G/- GCCAAAAAAA 3070 het 2686 hom 23 9 13 1 G 2 1 323242 CASAVA_Build 21 17455626 1D CTAGGCTGCC T/- TTTTGGCCTA 3070 het 3070 ref 64 31 22 12 T 5 4 323243 CASAVA_Build 21 17463225 1I AAATAAATTT -/A AAAAAATAAA 2553 het 1973 hom 14 5 7 2 A 6 7 323244 CASAVA_Build 21 17466529 2D GAATGTGTAG TA/-- TATATGGCTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 TA 3 2 323245 CASAVA_Build 21 17470186 1D ATACAAAAAA C/- AACTTTAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 C 1 0 323246 CASAVA_Build 21 17470808 4I CCAAAAAAAA ----/ATAG AAGATGAGAA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 ATAG 0 1 323247 CASAVA_Build 21 17473119 4D AAAAAAAAAA AAAC/---- AAGGTATTCA 2903 het 2556 hom 36 14 12 12 AAAC 1 0 323248 CASAVA_Build 21 17479028 1D CTGTGACCCA G/- GGGGGGTCAC 3070 het 3070 ref 45 16 17 12 G 7 6 323249 CASAVA_Build 21 17481052 4I CACATACTCA ----/AAGT AAGAGTAAGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAGT 0 1 323250 CASAVA_Build 21 17484937 1D CATCTGTTTA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 54 het 19 0 19 1 C 9 8 323251 CASAVA_Build 21 17485488 1I TGTTCTGTTG -/T TCTCTTCTCT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 323252 CASAVA_Build 21 17486569 1I TTTCTTATGG -/C ATTTTTTTTT 3070 hom 88 het 34 0 28 6 C 0 1 323253 CASAVA_Build 21 17493208 1D TAAAATTGCA T/- GGCTTAAAGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 0 323254 CASAVA_Build 21 17493307 1D18M1I AAATGGAGGA GTTTGCAATATATTACTGG-/-TTTGTAATATATTACTGGT ATCCTTTCTT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 N/A 0 0 323255 CASAVA_Build 21 17493382 1D5M1I13M1I38M1D10M1D AGACTTGATT AGGATT-GCACTGGAGCCGG-ACTCAGCACTGCAGATTAGTGTAGAGCACGTTTTATCCAAAGCTAGCACG/-GGATTGGTACTGGAAATGGTAAACAACACTGCAAAATAATGAAGAGAACATTTTATCC-AAGTTAGCAC- CAATGAATAA 3070 hom 18 het 8 0 7 3 N/A 0 0 323256 CASAVA_Build 21 17493532 1D17M1I GTTCACATTA TGAAAAGTCATTGGTAGG-/-GAAAAGTCATTGGTAGGA ACCAACAATA 3070 hom 72 het 23 0 24 8 N/A 0 0 323257 CASAVA_Build 21 17494168 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 1231 het 1231 ref 42 33 3 7 AC 8 7 323258 CASAVA_Build 21 17495577 1D AAATACCAAA T/- TTTTGATTTT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 5 4 323259 CASAVA_Build 21 17509568 1I TATTCTAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 184 hom 35 1 26 8 A 9 10 323260 CASAVA_Build 21 17521792 1D AATAATACAA C/- CCACTATAAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 3 2 323261 CASAVA_Build 21 17531157 1I AATCATCAAG -/A ATACATGCAA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 A 1 2 323262 CASAVA_Build 21 17539290 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAACTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 323263 CASAVA_Build 21 17540860 1I ATAGGTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 28 0 15 13 A 10 11 323264 CASAVA_Build 21 17541148 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 10 11 323265 CASAVA_Build 21 17548418 1D TTAAGCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 32 0 22 10 A 11 10 323266 CASAVA_Build 21 17548678 1D AGAACTCCAG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 A 8 7 323267 CASAVA_Build 21 17553184 1I AAGATAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 10 11 323268 CASAVA_Build 21 17559969 1I TAACAAAGGA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 9 323269 CASAVA_Build 21 17560503 1D AAATAAAACC A/- AACATACATG 3070 hom 105 het 41 0 36 6 A 3 2 323270 CASAVA_Build 21 17591164 1D CAGCGGGGAC T/- TTGGGGAACT 3070 hom 45 het 19 0 14 9 T 3 2 323271 CASAVA_Build 21 17631080 1I33M1I TATATCCAAT -AAGTATTGTTAATTATAGTTTGCCTACTGTACT-/AAAGTATTGTTAATTATAGTTTGCCTACTGTACTA CCAAATACTA 2671 hom 15 het 5 0 6 1 N/A 0 0 323272 CASAVA_Build 21 17631906 1I4M2I ATAACAAAGC -AACT--/AAACTAC CAAGAAAAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 N/A 0 0 323273 CASAVA_Build 21 17643176 1D TTATTTGGGG T/- TTTTTGTGTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 6 5 323274 CASAVA_Build 21 17652529 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 71 het 37 0 32 8 A 7 8 323275 CASAVA_Build 21 17656614 2D CTTTTTTGGT AC/-- AGGAGTGGAG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AC 1 0 323276 CASAVA_Build 21 17656735 1D AAAATTAAAA T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 7 6 323277 CASAVA_Build 21 17667015 6D ATTATGAAAA AAGAAG/------ AAGAAGAAGA 3070 het 422 hom 45 6 23 20 AAG 8 6 323278 CASAVA_Build 21 17667645 1I TGTAGGTATC -/A GTGATTGAAG 3070 hom 78 het 37 0 26 11 A 0 1 323279 CASAVA_Build 21 17668460 2I CAAATTGGAT --/AA AGAGTCAAGA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 1 3 323280 CASAVA_Build 21 17669402 2D TGAAAGAGAC AG/-- AGACACAAAC 2700 het 2700 ref 15 8 6 3 AG 2 1 323281 CASAVA_Build 21 17679117 1I GGGTTGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 T 10 11 323282 CASAVA_Build 21 17681873 2I CGCATGCTCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2860 hom 26 7 12 7 A 12 14 323283 CASAVA_Build 21 17687959 1I6M1I ATTCATCTAC -ACAGAC-/AACAGACA ATATGGATAG 3070 hom 96 het 33 0 32 3 N/A 0 0 323284 CASAVA_Build 21 17688618 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 1579 hom 19 4 13 2 T 5 6 323285 CASAVA_Build 21 17692718 1D AAATAAAGGG A/- AAAAAAACCA 3070 hom 77 het 38 0 33 6 A 8 7 323286 CASAVA_Build 21 17693393 1D GGCCTATAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 28 0 21 7 T 10 9 323287 CASAVA_Build 21 17696188 1I CACTGGTTGA -/C CCTGCGGGGC 3070 hom 100 het 46 0 36 10 C 2 3 323288 CASAVA_Build 21 17701471 1D AAAATTTGGG A/- AAAAAAAAAA 2781 hom 19 het 13 0 7 6 A 11 10 323289 CASAVA_Build 21 17710090 1I ACTCCAGCCT -/G GGTGACAGAG 3070 hom 66 het 24 0 21 3 G 2 3 323290 CASAVA_Build 21 17716833 1D TTGTTTGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 32 hom 40 1 36 3 T 10 9 323291 CASAVA_Build 21 17717526 1I GATCCTTAGG -/T TAGAGGCATC 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 1 2 323292 CASAVA_Build 21 17717605 1I TTTTGGAGTC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 685 hom 26 3 19 4 A 0 1 323293 CASAVA_Build 21 17720145 1D ACCAAACCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 12 11 323294 CASAVA_Build 21 17720511 1D GTAGGGGTTT C/- CTTGTGAGCA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 C 2 1 323295 CASAVA_Build 21 17723200 1D CATTTTGTTT A/- GCTGATAAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 1 0 323296 CASAVA_Build 21 17723722 1D69M1I ATTGGCTGGG CCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAAGAAA-/-CATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCTGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAAGAAAT CAAGACCATC 3070 hom 44 het 16 0 14 8 N/A 0 0 323297 CASAVA_Build 21 17723962 1I41M3I ACGCCGCTGC -CTCCAGCCTGGGCGACAGAGGGAGACTCCGTCTCAAAAAAA---/ACTCCAGCCTGGGCGACAGAGGGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAG AAAAAATTAA 3070 hom 24 het 9 0 9 2 N/A 0 0 323298 CASAVA_Build 21 17724072 1I AAATCTGTAG -/A AAGGCTGAAG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 2 3 323299 CASAVA_Build 21 17727748 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 15 13 323300 CASAVA_Build 21 17730074 1I CCAGTCAAGC -/T TTTTTTTTTT 1732 het 1732 ref 48 41 4 3 T 11 12 323301 CASAVA_Build 21 17735417 1I AGAAGTATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 58 het 23 0 20 3 T 9 10 323302 CASAVA_Build 21 17735556 1D GGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 8 323303 CASAVA_Build 21 17736118 1I ACTGCTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 801 hom 49 4 38 7 T 12 13 323304 CASAVA_Build 21 17736940 1I CTTTAGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 577 hom 22 2 17 3 A 10 11 323305 CASAVA_Build 21 17749843 1I CAAAGTTCAG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 109 het 43 0 36 7 A 7 8 323306 CASAVA_Build 21 17751152 1D AGCCCGTGTC T/- TTTTTTTTTT 2597 het 1528 hom 20 5 8 7 T 11 10 323307 CASAVA_Build 21 17752957 1D GGCGCATGCC T/- TGTGGTCCCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 2 1 323308 CASAVA_Build 21 17753126 1I ACAAACACAG -/A AATTAGCCAG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 2 3 323309 CASAVA_Build 21 17755854 1I ATTATTGGCT -/G GGCGTGGTGA 3070 hom 62 het 24 0 21 3 G 2 3 323310 CASAVA_Build 21 17757020 1D TCCTTCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 48 hom 28 1 20 8 A 12 11 323311 CASAVA_Build 21 17760413 2I ATAATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 TA 6 7 323312 CASAVA_Build 21 17764588 4D CATCTCTGTG TTGT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 639 hom 22 4 12 7 TTGT 1 0 323313 CASAVA_Build 21 17770298 1D AGAGTGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 19 4 13 2 A 13 12 323314 CASAVA_Build 21 17774101 1I TTTGAATTGG -/C CCCCCCTAAG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 C 6 7 323315 CASAVA_Build 21 17774296 1I CATTATCCTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 T 8 9 323316 CASAVA_Build 21 17779233 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 9 8 323317 CASAVA_Build 21 17781811 2I AATGTCAAAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 92 het 41 0 31 10 AC 5 6 323318 CASAVA_Build 21 17794217 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3022 hom 10 het 10 0 8 2 A 13 12 323319 CASAVA_Build 21 17796862 4I TGGAAATGCC ----/CTAT CTTAGATATT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 CTAT 0 1 323320 CASAVA_Build 21 17800198 1D TAAACTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 4 T 12 11 323321 CASAVA_Build 21 17801834 2I ATTTAAAAGG --/TT TTTAAAAAAA 1807 het 812 hom 27 3 17 7 T 3 5 323322 CASAVA_Build 21 17802362 1I CAGCCTGGTG -/A CAGAGTGAGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 0 1 323323 CASAVA_Build 21 17805532 5D ATATATATAC ATATA/----- TAGATAGATA 2410 het 2410 ref 17 10 5 2 ATATA 1 0 323324 CASAVA_Build 21 17808755 1D GTTCTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 18 0 15 3 A 14 13 323325 CASAVA_Build 21 17809336 1I TCAGTTTAAG -/A AACAGCTGAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 2 3 323326 CASAVA_Build 21 17811005 2D TGGATTTTAA GT/-- GTTCTCACCA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 GT 2 1 323327 CASAVA_Build 21 17826697 1D TCCTGTTGCA G/- CTCCCCAAAA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 G 1 0 323328 CASAVA_Build 21 17832410 1D GGATGGTCTC A/- GATCTCCTGA 3070 hom 53 het 21 0 17 4 A 1 0 323329 CASAVA_Build 21 17835807 1D CATCTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 31 4 12 15 T 17 16 323330 CASAVA_Build 21 17841952 1I TTTAAATTTA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 9 323331 CASAVA_Build 21 17848481 1D TTGGGTGGTA G/- GGGATGGCAC 3070 hom 123 het 46 0 41 6 G 4 3 323332 CASAVA_Build 21 17851942 2D GTTCCAGAAG AA/-- GAGCTAATCT 3070 hom 108 het 46 0 37 10 A 2 0 323333 CASAVA_Build 21 17852271 2D TCAGATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 25 8 T 13 11 323334 CASAVA_Build 21 17853546 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAATGTGT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 6 5 323335 CASAVA_Build 21 17854161 1D GCCTGGCGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 18 1 15 3 T 12 11 323336 CASAVA_Build 21 17855433 2I AAGTTAACAC --/AT GTGATGAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AT 0 1 323337 CASAVA_Build 21 17856342 1I TACCCCAATT -/A AAAAAATATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 6 7 323338 CASAVA_Build 21 17862052 1I CTTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 474 hom 17 1 10 6 T 11 12 323339 CASAVA_Build 21 17862747 1D AGTTCTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 252 hom 29 2 19 8 T 17 16 323340 CASAVA_Build 21 17866464 1I GGAGGCTGAA -/G TGGGATGATT 3070 hom 33 het 12 0 12 2 G 0 1 323341 CASAVA_Build 21 17866947 1D AGTGTGGTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 92 het 35 0 32 3 A 10 9 323342 CASAVA_Build 21 17868573 1D ATCCTGAATA T/- TTTATTTTAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 4 3 323343 CASAVA_Build 21 17869317 8I ATGAAGTGTC --------/TCATTCTA TCATTCTATC 3070 hom 69 het 32 0 24 8 TCATTCTA 1 2 323344 CASAVA_Build 21 17874074 1I GTATTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 36 1 14 21 A 11 12 323345 CASAVA_Build 21 17875845 1D CCAGCCAGGG C/- CAACATAGTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 2 1 323346 CASAVA_Build 21 17875959 1D ACTTGAGCCC A/- AGAAGATTGA 1322 hom 12 het 6 0 5 1 A 2 1 323347 CASAVA_Build 21 17876209 1D GGCTCACTGC A/- AACCTCTGCC 1513 hom 18 het 7 0 6 1 A 3 2 323348 CASAVA_Build 21 17876316 1D13M1D4M1D6M1D AGCTAGGAGT GGGAATCTAGGTCTCCCTGAATTCCTG/-GGAATCTAGGTCT-CCTG-ATTCCT- GGTCTAGCCG 1855 hom 12 het 6 0 5 2 N/A 0 0 323349 CASAVA_Build 21 17876663 1D CTGGTTCAAC A/- CTGACTTATC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 323350 CASAVA_Build 21 17877801 1I CACACACTCG -/A AAATCCACTT 3070 hom 108 het 43 0 36 7 A 3 4 323351 CASAVA_Build 21 17879717 1I TTAATTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 9 10 323352 CASAVA_Build 21 17883772 1D AGGCATACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 29 1 21 7 T 11 10 323353 CASAVA_Build 21 17885794 1D TTACTAAAAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 12 15 10 T 9 8 323354 CASAVA_Build 21 17886589 1D AAAATTTGTA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 7 6 323355 CASAVA_Build 21 17887064 5I TTAAAAACTG -----/ACTTT ACATTTTCAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 ACTTT 0 1 323356 CASAVA_Build 21 17888596 4D CTCATTAAAG ACAA/---- ACAAAGTTAC 3070 hom 144 het 51 0 49 5 ACAA 2 1 323357 CASAVA_Build 21 17888978 3D GTGGGAGGTA ATG/--- ATAAGAACTT 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 ATG 1 0 323358 CASAVA_Build 21 17891929 1D AAAAAATGAG A/- AAACCAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 4 3 323359 CASAVA_Build 21 17893251 4D CTTTCCCTTA TTTT/---- CTTTCTACTA 3070 het 3070 hom 24 9 11 5 T 4 0 323360 CASAVA_Build 21 17902563 1I ACAATACCAC -/A AAAAAAAAAA 3065 het 3065 ref 33 15 12 6 A 12 13 323361 CASAVA_Build 21 17911490 9D GGTGCCATTA TTGTTGTTG/--------- TTGTTGTTGT 3070 hom 105 het 44 0 36 12 TTG 7 4 323362 CASAVA_Build 21 17916736 1I TGACAGAACA -/T TTTTTGTCAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 5 6 323363 CASAVA_Build 21 17917558 1I TAAATGTTTT -/A AACAATATTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 2 3 323364 CASAVA_Build 21 17919415 1I TAAGGAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 29 1 23 5 T 12 13 323365 CASAVA_Build 21 17924018 4D ACAAATAAGC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 AAAT 5 4 323366 CASAVA_Build 21 17926517 2D TGTGAAAAAC AA/-- AGTTTAAGAG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 3 1 323367 CASAVA_Build 21 17932243 1I TCAAATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 11 15 T 15 16 323368 CASAVA_Build 21 17938415 2I AGACAATGGT --/AA AAGACCAGAG 3070 hom 102 het 44 0 34 10 A 2 4 323369 CASAVA_Build 21 17944060 1I TTAAATCCAA -/T TTTTAAACTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 4 5 323370 CASAVA_Build 21 17944940 1D TATGTATGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 6 T 8 7 323371 CASAVA_Build 21 17948487 4D TTGCTCCCCA TCTT/---- TCTAAGGTGG 3070 het 3070 ref 33 17 16 0 TCTT 1 0 323372 CASAVA_Build 21 17952306 1D TATCTCTAAG A/- AAAAAATGGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 7 6 323373 CASAVA_Build 21 17957742 1I AGAGCCCTGT -/A AATTTCAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 2 3 323374 CASAVA_Build 21 17965743 1D GTATTATACC T/- TTTTTGCCCC 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 6 5 323375 CASAVA_Build 21 17976331 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAAGCA 2240 het 2240 ref 25 12 8 5 A 0 1 323376 CASAVA_Build 21 17978163 1I ACATGCATGT -/G CAAGTATCTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 G 0 1 323377 CASAVA_Build 21 17978540 1D GGATTGTTAG T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 7 6 323378 CASAVA_Build 21 17979498 2D GTTTGTTTTG TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 45 21 10 14 T 10 8 323379 CASAVA_Build 21 17979975 1I TTTTGTCAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 T 9 10 323380 CASAVA_Build 21 17982631 1D TTCTTGTATC A/- GTTTTTTGGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 1 0 323381 CASAVA_Build 21 17985489 3I GTTGTTCCTC ---/CTT CTTGCACGTG 3070 het 3070 ref 25 14 7 4 CTT 1 2 323382 CASAVA_Build 21 17986298 1I TATTCATGTG -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 7 8 323383 CASAVA_Build 21 17986455 1D TATTTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 15 14 323384 CASAVA_Build 21 17995059 2I AAGAGTCTAA --/CT CTGTAAAATA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 CT 1 2 323385 CASAVA_Build 21 18002762 1I ACGTATAAAA -/C CAAGTTGTAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 1 2 323386 CASAVA_Build 21 18007463 1D ATTTTTTGAA C/- CTTCTATGCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 2 1 323387 CASAVA_Build 21 18017784 1D CATCCATTCC T/- TTTTTTTTTT 1705 het 1705 ref 46 25 7 14 T 15 14 323388 CASAVA_Build 21 18028558 1I AATTCGGAAT -/A AAAATGCAGT 3070 hom 147 het 55 0 49 6 A 4 5 323389 CASAVA_Build 21 18029804 1I CTGAACCTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 9 10 323390 CASAVA_Build 21 18075623 3I TATTCTTTTC ---/CAA CAACTGTGTA 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 CAA 1 2 323391 CASAVA_Build 21 18081677 1I GTCCTATGAT -/G ACATTAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 G 0 1 323392 CASAVA_Build 21 18082774 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 11 12 323393 CASAVA_Build 21 18085263 5D CTCTTGTTAG AACTC/----- AACTCTGTAC 3070 het 3070 hom 35 14 17 5 AACTC 2 1 323394 CASAVA_Build 21 18100170 1I AAAGTTTCCT -/A ATGATAGACA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 1 2 323395 CASAVA_Build 21 18120966 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1891 het 1891 ref 28 10 7 11 A 17 18 323396 CASAVA_Build 21 18126798 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 A 11 10 323397 CASAVA_Build 21 18145007 1D CTTTAATCAG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 9 8 323398 CASAVA_Build 21 18147543 1I11M1I12M1I21M1I ACTGCAACTT -TCCCTCCCAGG-TCAAGCGATTCT-GGGCCTCAGCCTCCCCAATAG-/CTCCCTCCCAGGCTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAATAGT TGTGACTACA 3070 hom 30 het 8 0 11 1 N/A 0 0 323399 CASAVA_Build 21 18148959 1I TTTTATGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 12 13 323400 CASAVA_Build 21 18153377 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 A 8 7 323401 CASAVA_Build 21 18153543 1D ATCACCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 29 1 17 11 A 13 12 323402 CASAVA_Build 21 18153671 1D TTTCTCTTTC T/- GATGATGCTC 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 1 0 323403 CASAVA_Build 21 18157812 2D TTTTAAATCC TT/-- TTTTTTTTTT 2963 het 100 hom 27 2 15 10 T 16 14 323404 CASAVA_Build 21 18162134 1D ACTAAAGAGC T/- TCTGTACAGC 2682 het 2682 ref 23 12 6 5 T 2 1 323405 CASAVA_Build 21 18162954 1D AGGGTCTACT G/- GGGGGGTGGG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 7 6 323406 CASAVA_Build 21 18163087 1I TTTAGAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 9 10 323407 CASAVA_Build 21 18165684 1I ATGAACCAGT -/G TGATATCTTG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 0 1 323408 CASAVA_Build 21 18166351 1D CCCTATTGAT C/- ACCTGAACTT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 C 1 0 323409 CASAVA_Build 21 18178429 1I AATGGCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 274 hom 18 2 14 2 T 13 14 323410 CASAVA_Build 21 18189875 1D GGACTGTTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 8 7 323411 CASAVA_Build 21 18190740 1D TTCCCAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2955 hom 34 9 16 9 T 12 11 323412 CASAVA_Build 21 18195459 1D CCCTGTGGTG T/- TTTTCCCCCG 3070 het 1277 hom 19 5 10 4 T 5 4 323413 CASAVA_Build 21 18199775 1I CTCTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 A 11 12 323414 CASAVA_Build 21 18205586 1I ACAAGCCCGT -/C CCCCCACCAC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 C 5 6 323415 CASAVA_Build 21 18210742 1D CTTGTTACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2207 hom 27 7 17 3 T 10 9 323416 CASAVA_Build 21 18216182 1I ACAATAAAGG -/A AAAGTTATGA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 3 4 323417 CASAVA_Build 21 18217589 1D TAAAAAGATG T/- TAACAACTTT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 T 2 1 323418 CASAVA_Build 21 18224005 11D TGCAGTGCCA GGAGGGAGTGG/----------- GGAGGGAGTG 2789 het 2789 ref 31 19 10 5 GGAGGGAGTGG 2 1 323419 CASAVA_Build 21 18224592 3I ATGACCAGAT ---/CCA CCACCACTGT 3070 het 3070 hom 60 22 27 11 CCA 2 3 323420 CASAVA_Build 21 18226794 1D TATATATACT C/- CCGTGAAATG 3070 hom 90 het 32 0 31 2 C 3 2 323421 CASAVA_Build 21 18227858 4D ATCCGATCTC TCTT/---- TCTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 24 10 12 3 TCTT 2 1 323422 CASAVA_Build 21 18228423 1D CTATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 A 12 11 323423 CASAVA_Build 21 18230260 1D TGACAACTCA T/- TATCATATCG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 2 1 323424 CASAVA_Build 21 18238287 4I TATTCTTCCT ----/AGCC AGCTTAAGAA 3070 het 3070 ref 55 24 20 11 AGCC 0 1 323425 CASAVA_Build 21 18239243 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 2269 hom 9 het 8 0 7 1 A 8 9 323426 CASAVA_Build 21 18240850 3D TATGTAATGA TCT/--- TCTTTGTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 21 5 TCT 2 1 323427 CASAVA_Build 21 18242506 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 2821 hom 36 8 25 4 A 9 8 323428 CASAVA_Build 21 18257252 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 154 het 154 ref 11 3 1 7 A 12 11 323429 CASAVA_Build 21 18261080 1I TTTCCTGAGC -/T TTTTTTTTTT 652 het 652 ref 25 14 4 7 T 13 14 323430 CASAVA_Build 21 18282257 1I AGTCATTATG -/T AAAATATAAT 3070 het 3070 ref 54 26 18 10 T 0 1 323431 CASAVA_Build 21 18282591 2I TCCTTTTTTT --/TA TTATTATTAT 1189 het 1038 hom 11 4 3 4 TA 0 1 323432 CASAVA_Build 21 18287402 1I ATGTTCTTTC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 6 7 323433 CASAVA_Build 21 18288346 1I TTGGGTTTTG -/T TTCTTCTTGT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 3 323434 CASAVA_Build 21 18299021 1D AAAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 13 12 323435 CASAVA_Build 21 18305478 1D GTTGCCCCCA T/- TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 7 6 323436 CASAVA_Build 21 18307123 1D ATAAATGCGT A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 7 6 323437 CASAVA_Build 21 18307484 1D42M1D AATAAGACAA TTTTTTTTTTCTAGGATACAACTTTATCTCTAGTTGTCTGCCCG/-TTTTTTTTTCTAGGATACAACTTTATCTCTAGTTGTCTGCCC- TGGTCATTCA 3070 het 2898 hom 35 11 18 13 N/A 0 0 323438 CASAVA_Build 21 18307591 1I45M1D AGTGCTGCCA -TTTGGTCATATATCCCTGTAACTGCTTCAACTTCTCTCTGTCTCAG/TTTTGGTCATATATCCCTGTAACTGCTTCAACTTCTCTCTGTCTCA- GGACTTGGTC 3070 hom 108 het 29 0 37 11 N/A 0 0 323439 CASAVA_Build 21 18315967 1D31M1D8M1D TCATGAGTGG AAAAAGGGTAGGAGAATGTATGATATTGGAGGAAAAGAGAAC/-AAAAGGGTAGGAGAATGTATGATATTGGAGG-AAAGAGAA- CCAAGTCATT 3070 hom 129 het 34 0 44 3 N/A 0 0 323440 CASAVA_Build 21 18320628 1I GTAGGGGTTC -/T GACAAGCTTG 3070 hom 87 het 31 0 30 4 T 0 1 323441 CASAVA_Build 21 18321092 1D TGAAGGATGT C/- GATAGTTAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 0 323442 CASAVA_Build 21 18321305 1I TATTACTATG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 10 323443 CASAVA_Build 21 18344468 1D GATCCTTGAA G/- GGGGCATCAG 3070 het 3070 hom 59 21 29 9 G 5 4 323444 CASAVA_Build 21 18350666 1I ATTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 17 8 T 13 14 323445 CASAVA_Build 21 18352677 1I AAAATGTGGC -/A ATATATACAC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 1 2 323446 CASAVA_Build 21 18403247 1I TAAGGAAGGA -/C TAAACGTATT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 0 1 323447 CASAVA_Build 21 18407538 1I AGTCTGGGGG -/T ACCTCAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 0 1 323448 CASAVA_Build 21 18421350 1I GAGAATGAGG -/A ATAATGATGA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 1 2 323449 CASAVA_Build 21 18432343 1I CTGACTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 12 13 323450 CASAVA_Build 21 18445271 7D ACTCTGTGTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1322 hom 6 het 7 0 5 5 A 23 16 323451 CASAVA_Build 21 18457985 1I GTTTTCTGTG -/A TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 A 0 1 323452 CASAVA_Build 21 18458879 14I ATTTCCTCAT --------------/CTAGTCATTTCCTC CTAGTCATTT 3070 hom 102 het 42 0 35 11 CTAGTCATTTCCTC 1 2 323453 CASAVA_Build 21 18465304 1I CAGAATTTGT -/G TTTTTTTTTT 3007 hom 24 het 14 0 8 6 G 0 1 323454 CASAVA_Build 21 18465925 2D TTCTCTTCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 34 2 17 15 T 13 11 323455 CASAVA_Build 21 18466760 2D GATTCAGCCA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 10 8 323456 CASAVA_Build 21 18469918 4D GTACTGAGAT AGAG/---- AGTATCAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 5 AG 3 1 323457 CASAVA_Build 21 18470055 4D AGAAAGGCAT GAAA/---- GAAAGACCCT 3070 hom 89 het 34 0 29 8 GAAA 2 1 323458 CASAVA_Build 21 18506761 4I TACAATAATT ----/AATA AATAAAGCCA 1870 het 1870 ref 19 11 4 4 AATA 1 2 323459 CASAVA_Build 21 18509388 1D CTCAAACATG A/- AAAAAAAAAA 1157 het 1157 ref 45 33 3 10 A 13 12 323460 CASAVA_Build 21 18511361 1I ACTCAGCAAT -/G GGGGGTGCTG 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 G 5 6 323461 CASAVA_Build 21 18514884 1D TGGCTCACAG T/- TTTTTTTTTT 1323 het 1323 ref 40 28 3 9 T 11 10 323462 CASAVA_Build 21 18526756 1D CCACCTCTTA G/- GTACCCACAA 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 G 2 1 323463 CASAVA_Build 21 18536707 31D TAAGACAACT CAAACTGTGATCTCTGAACTCAGTGATGACC/------------------------------- CATCCAGATG 3070 het 3070 ref 28 15 13 9 CAAACTGTGATCTCTGAACTCAGTGATGACC 1 0 323464 CASAVA_Build 21 18548323 1I GTTTGAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 T 11 12 323465 CASAVA_Build 21 18548907 4D TTATCGTCTG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 ref 42 21 13 9 TCTA 4 3 323466 CASAVA_Build 21 18552668 5D TTGTATTATA TTTAT/----- TTTATTTTTG 3070 het 3070 ref 38 24 9 6 TTTAT 2 1 323467 CASAVA_Build 21 18560722 2D TTAAAGAAAC TT/-- ATTACTGTTG 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 2 0 323468 CASAVA_Build 21 18561410 4I GGTTTGCTTG ----/AGAT AGATAGAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 AGAT 1 2 323469 CASAVA_Build 21 18561653 3I CTCTTTAAGT ---/AAG AAGTGTGGTA 3070 het 3070 ref 51 24 21 6 AAG 1 2 323470 CASAVA_Build 21 18562069 3D GCAAAAGCAG CAA/--- ATAATCAATG 3070 het 3070 ref 47 23 16 11 CAA 1 0 323471 CASAVA_Build 21 18562259 1I TTGGGAAATG -/A AAAAATACAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 5 6 323472 CASAVA_Build 21 18562357 2D TTCAGGTACT AA/-- AAAACAAATA 2476 het 2476 ref 31 17 8 7 A 6 4 323473 CASAVA_Build 21 18562611 3D AAAGGAAATG GAA/--- GAAGTTCTCC 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 GAA 2 1 323474 CASAVA_Build 21 18563126 4D15M3D TTTAACCTTA CTCTCTCTCTCTTCTATTAAAT/----CTCTCTCTTCTATTA--- AATTGTCCCA 3070 het 3070 hom 47 21 23 7 N/A 0 0 323475 CASAVA_Build 21 18572535 1I TATTGAGGTT -/G GGGGACACTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 4 5 323476 CASAVA_Build 21 18572800 1D TCCCAGCTAC T/- TTGGGAGGCT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 3 2 323477 CASAVA_Build 21 18573691 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 859 hom 7 het 3 0 3 0 T 13 12 323478 CASAVA_Build 21 18575214 1D CTAAGAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 12 11 323479 CASAVA_Build 21 18579189 1D AACTCTGCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 12 11 323480 CASAVA_Build 21 18584535 10D TGAAATTAGT TAAATAGAAA/---------- TAAGGTTTCT 3070 hom 114 het 42 0 38 5 TAAATAGAAA 1 0 323481 CASAVA_Build 21 18585026 1D AATTGTTCAG A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 7 323482 CASAVA_Build 21 18585941 1D GGCATTAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 290 hom 41 1 35 5 A 10 9 323483 CASAVA_Build 21 18594305 1D3M1D3M7D ATCTATAGCT CGTCTCTTGGATATA/-ATC-CTT------- TCCCCCGTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 N/A 0 0 323484 CASAVA_Build 21 18594983 1I TTGACAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 11 9 9 T 9 10 323485 CASAVA_Build 21 18600314 1D AAAGGTTACA T/- TTTTTTTTTA 1136 het 1136 ref 29 25 3 1 T 10 9 323486 CASAVA_Build 21 18605122 3D CCACTGATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 187 hom 34 4 19 11 T 21 18 323487 CASAVA_Build 21 18605379 1I ATGGCTTGAG -/T TAAGCCCATA 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 T 1 2 323488 CASAVA_Build 21 18607538 4I TCTCTCTCTC ----/TCTA TATATATATA 3070 het 2402 hom 25 8 16 1 TCTA 0 1 323489 CASAVA_Build 21 18608312 1D ATTGTTTACC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 40 21 12 8 T 8 7 323490 CASAVA_Build 21 18609630 1I TGTATACACA -/T ATAACAAACC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 323491 CASAVA_Build 21 18610213 2D GTATAATAAA AT/-- ATATATATAT 2902 het 1564 hom 12 5 7 0 AT 8 7 323492 CASAVA_Build 21 18621916 1I GATAAAACAC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 8 323493 CASAVA_Build 21 18623293 2D TTAAGAAACG CT/-- CTTTCCATCA 3070 het 3070 hom 40 14 23 4 CT 2 1 323494 CASAVA_Build 21 18623651 1D TTTTTTTTTT G/- GTAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 G 2 1 323495 CASAVA_Build 21 18628049 3I AATGTAAAAA ---/ATC ATCAACTATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ATC 1 2 323496 CASAVA_Build 21 18630128 1D GTTAAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 256 hom 44 2 28 14 T 15 14 323497 CASAVA_Build 21 18631087 1I ACACACTGAT -/A CAACTAAGCA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 0 1 323498 CASAVA_Build 21 18632929 4I AGAGAGAGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 51 27 17 7 AG 6 8 323499 CASAVA_Build 21 18634913 27D TCTTAAAATT ACTCCTTAAGAAGCCCACAAAAACCTC/--------------------------- AAGGCACCCT 3070 het 3070 ref 21 12 11 3 ACTCCTTAAGAAGCCCACAAAAACCTC 1 0 323500 CASAVA_Build 21 18646263 2I CTTTTCACTG --/TT TTTTTTTGTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 7 9 323501 CASAVA_Build 21 18653740 2D AGGAGAGGAC AA/-- TGTTAAAACG 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 A 2 0 323502 CASAVA_Build 21 18653818 1D GAAGCAATTG T/- TTTTTTTTTA 1019 het 1019 ref 36 30 3 4 T 10 9 323503 CASAVA_Build 21 18656072 1D GTAGGTTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 10 9 323504 CASAVA_Build 21 18657753 2D CAGATTAGTT AC/-- AGTCTTTCCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AC 1 0 323505 CASAVA_Build 21 18670389 1I ACAAATCTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1736 hom 29 4 22 3 T 12 13 323506 CASAVA_Build 21 18704787 1D TGAATAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1909 hom 18 6 10 2 A 11 10 323507 CASAVA_Build 21 18714635 1I ATATTTGGAA -/G GTATAATAAA 3070 hom 142 het 51 0 46 5 G 1 2 323508 CASAVA_Build 21 18721561 1D TGCCTTACTT A/- ACTATTACAT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 2 1 323509 CASAVA_Build 21 18722043 1I CTTTGATAAG -/T TCTTATTTCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 1 2 323510 CASAVA_Build 21 18729015 11I CATTTAAAAA -----------/CTCATCTATTG CTCATAAATT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 CTCATCTATTG 0 1 323511 CASAVA_Build 21 18740988 1D TGAAAATGAA T/- TTGAAGACCT 3070 hom 89 het 40 0 33 9 T 3 2 323512 CASAVA_Build 21 18741093 1D ATATAACCCC A/- AAAAACATAG 3070 het 3070 ref 38 16 18 4 A 6 5 323513 CASAVA_Build 21 18742942 1D TATCATTTTT G/- TAGTTGTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 G 1 0 323514 CASAVA_Build 21 18745198 4D GATAATCCAC AATT/---- AATCACTGGC 3070 het 3070 ref 40 20 18 5 AATT 1 0 323515 CASAVA_Build 21 18746955 5I AATAGAAATC -----/ATTTT ATTTATTTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATTTT 0 1 323516 CASAVA_Build 21 18762723 1D TTTTTCAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 13 8 A 10 9 323517 CASAVA_Build 21 18765177 1I ATTAGGATAA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 7 8 323518 CASAVA_Build 21 18765666 1D TTCAGTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 11 10 323519 CASAVA_Build 21 18766031 1I AGATGAGGGC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 50 20 19 11 A 8 9 323520 CASAVA_Build 21 18766314 1D AGATGGAAAG T/- TTAGGTTATA 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 T 3 2 323521 CASAVA_Build 21 18779941 1D TAAAGACATA C/- CCCAAGACTC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 C 4 3 323522 CASAVA_Build 21 18821689 1D TACATAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2869 hom 38 14 13 11 T 17 16 323523 CASAVA_Build 21 18847729 1D CTTTAGTAAT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 7 323524 CASAVA_Build 21 18849639 2D CTGATAAAAC AT/-- GTGAAATATC 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 AT 1 0 323525 CASAVA_Build 21 18850062 1D AGCAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 1 0 323526 CASAVA_Build 21 18852695 4I TCTTAAAGAA ----/ATAG ATAATGGTAG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 ATAG 0 1 323527 CASAVA_Build 21 18852794 4I AAAAATTTCG ----/TTAT TTAAGTATTC 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 TTAT 0 1 323528 CASAVA_Build 21 18864853 1I CTTTTTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 T 11 12 323529 CASAVA_Build 21 18867605 1I TGATGCTGGA -/T TTTTATCTAA 3070 het 3070 hom 57 26 27 4 T 4 5 323530 CASAVA_Build 21 18878578 8D TGTCCACTGG CACACTCA/-------- CACACTCACT 3070 het 3070 ref 47 26 12 14 CACACTCA 2 1 323531 CASAVA_Build 21 18883948 7I TTTCCCAATA -------/TCTGGTC ACCCCCTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 TCTGGTC 0 1 323532 CASAVA_Build 21 18885656 1D CCAGCGACTA T/- TTTTTACTAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 6 5 323533 CASAVA_Build 21 18894471 3I TGTAAGACTA ---/CTT CTTCTGAATG 3070 het 3070 hom 46 15 27 4 CTT 1 2 323534 CASAVA_Build 21 18895455 1D TTGGTAGCTG T/- TAACTTTAAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 T 2 1 323535 CASAVA_Build 21 18896203 14D AAGCATGTCA AAAAAATTCATGTC/-------------- AAGTATTAGC 3070 het 3070 ref 36 23 15 4 AAAAAATTCATGTC 1 0 323536 CASAVA_Build 21 18897068 1I CTATTTTGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 8 9 323537 CASAVA_Build 21 18897318 3I AAGTAATTGT ---/CCC ACCTCAGCCT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 C 0 3 323538 CASAVA_Build 21 18899941 1D AGGCTTCAAG A/- AGTGACCCAT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 2 1 323539 CASAVA_Build 21 18914182 1D ATGTATCATC A/- AATTAAAAGG 3070 het 2924 hom 29 7 19 3 A 3 2 323540 CASAVA_Build 21 18927678 4D TTTAGATAAA TAAT/---- CTCAAAATAG 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 TAAT 1 0 323541 CASAVA_Build 21 18928531 2I TGGAAAACAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 A 9 11 323542 CASAVA_Build 21 18931114 1I AAAATAGCCA -/T ATTTCCCAAA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 0 1 323543 CASAVA_Build 21 18935831 2I TGCATTTTGC --/CA CAGTTGTCTG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 CA 1 2 323544 CASAVA_Build 21 18942879 1D ATGTCCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 11 10 323545 CASAVA_Build 21 18944055 3D TGTGTCCATA AAT/--- AATGTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 AAT 2 1 323546 CASAVA_Build 21 18945880 1I TGTTCCCCAG -/C CATTCCTGTG 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 C 1 2 323547 CASAVA_Build 21 18950778 1D TGGTAACAGT C/- TTTAAGTTCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 1 0 323548 CASAVA_Build 21 18956008 1I TCTTTTTTCC -/T TTTTCTTTTG 1388 het 1388 ref 17 10 4 3 T 4 5 323549 CASAVA_Build 21 18962912 1I CACTGCAGGA -/T TTTTTTTTTT 2995 het 1835 hom 15 6 7 2 T 10 11 323550 CASAVA_Build 21 18967156 1I GTCTGTAACC -/T TAAGACTGTT 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 T 1 2 323551 CASAVA_Build 21 18973686 2I TATGTAACAC --/TT AAGTTAAATG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 0 2 323552 CASAVA_Build 21 18976960 1D GCCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2224 het 255 hom 12 1 7 4 T 12 11 323553 CASAVA_Build 21 18985370 4I TTTGGCTCTC ----/TGTT TGTCTGTTAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TGTT 0 1 323554 CASAVA_Build 21 18993155 1D CTGGCTTTTC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 8 7 323555 CASAVA_Build 21 18995186 1I TTGTATGTGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 8 9 323556 CASAVA_Build 21 19000003 1D ATTAGTACGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 32 2 27 4 A 11 10 323557 CASAVA_Build 21 19000849 1D TATATATTGT A/- ATGATAAGAT 3070 hom 108 het 38 0 37 4 A 2 1 323558 CASAVA_Build 21 19001177 6D9M1D TCTCCTTCTC CTTTTTCTTCTTCTAT/------CTTCTTCCA- TTTTTTTTTG 1008 het 33 hom 7 1 3 3 N/A 0 0 323559 CASAVA_Build 21 19004288 1D CAAGAATGTA T/- TACATGTATC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 1 323560 CASAVA_Build 21 19007370 2D GGCCAATTTG TC/-- TCTCCTTTGG 3070 hom 48 het 23 0 17 7 TC 3 2 323561 CASAVA_Build 21 19007657 1D CCATCTTGAA T/- TTTAATCCCC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 4 3 323562 CASAVA_Build 21 19008319 1I TGCCTGTAAT -/C CCCAGCACTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 3 4 323563 CASAVA_Build 21 19008649 1D CAAAATCAAG T/- TATGTGTTAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 2 1 323564 CASAVA_Build 21 19009052 1I TATATATGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 7 8 323565 CASAVA_Build 21 19010867 1I AGAACAGAAG -/A AAGGAAGGAA 1395 het 317 hom 21 2 9 10 A 2 3 323566 CASAVA_Build 21 19014116 20D CAATCCATTC TAGCGTGGCATGAAAGGCCT/-------------------- ATTGAATCTC 3070 hom 111 het 36 0 38 3 TAGCGTGGCATGAAAGGCCT 1 0 323567 CASAVA_Build 21 19015654 2D TGTTTAACTC TT/-- TTACTTAATA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 4 2 323568 CASAVA_Build 21 19016538 1D TGATGCTTTT C/- TTTAAGTGCA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 C 1 0 323569 CASAVA_Build 21 19021771 5I CTCCACCAAA -----/AAAAG AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAAG 0 1 323570 CASAVA_Build 21 19025108 1I TGGACATGTT -/A AAAAAATCCT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 6 7 323571 CASAVA_Build 21 19025880 2I TCCAATTATA --/CT CTTTCAGTTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CT 1 2 323572 CASAVA_Build 21 19026452 4I TTTCACTTGG ----/CTCT CTCTCTTTAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 CT 3 5 323573 CASAVA_Build 21 19043450 2D CACTTTTTCC AA/-- AAAGAGTTTT 3070 hom 110 het 42 0 37 5 A 5 3 323574 CASAVA_Build 21 19046239 1D TAAGGAGACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 39 0 32 8 T 9 8 323575 CASAVA_Build 21 19050763 2D ATCTTTTTTT AA/-- AGTGTCCTTG 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 3 1 323576 CASAVA_Build 21 19050884 1I AGCGGTGGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 38 het 17 0 13 4 T 9 10 323577 CASAVA_Build 21 19060492 1I CATACATTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 30 0 21 9 T 9 10 323578 CASAVA_Build 21 19060550 2D TAAAGTCAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 11 9 T 13 11 323579 CASAVA_Build 21 19065352 1I CACACTGTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 A 9 10 323580 CASAVA_Build 21 19068997 4D TGCCCATCTT TGAG/---- TGGTACATTT 3070 het 3070 hom 51 19 26 8 TGAG 1 0 323581 CASAVA_Build 21 19072502 1D TAGCATTTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 het 2585 hom 25 7 15 3 T 8 7 323582 CASAVA_Build 21 19079125 1D AATACAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 10 323583 CASAVA_Build 21 19079626 1D TAAATATTTA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 7 6 323584 CASAVA_Build 21 19080625 1I GACTTTGTAA -/T TTTCATTATG 3070 het 3070 hom 64 23 34 7 T 3 4 323585 CASAVA_Build 21 19082074 1D TGACCATTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 T 10 9 323586 CASAVA_Build 21 19097021 1I AAAAGAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 11 12 323587 CASAVA_Build 21 19111600 1D TATAAGACTT A/- ACTTTCTTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 2 1 323588 CASAVA_Build 21 19112803 1D AGTTGGCTTA G/- GAAAATAATT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 G 2 1 323589 CASAVA_Build 21 19118788 23I2M1D CTTTTTTGTT -----------------------CAC/AGTCAGTATTTCCTCAAGCTAGACA- TATTTTGTTC 3070 hom 108 het 35 0 37 3 N/A 0 0 323590 CASAVA_Build 21 19128539 3D TTTACATTCC CAT/--- CAACTGTGTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CAT 1 0 323591 CASAVA_Build 21 19129278 5I GGGATCTAAT -----/TAAAC TAAAGAGTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TAAAC 0 1 323592 CASAVA_Build 21 19129346 2I ATGAGGGAAA --/AT ATTTTTGCAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AT 1 2 323593 CASAVA_Build 21 19130149 1D CCTTTGCCCA T/- TTTTTAAAAG 3070 hom 99 het 40 0 32 8 T 6 5 323594 CASAVA_Build 21 19135738 4I AATAAGTTTG ----/TATC TATCAAAAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TATC 1 2 323595 CASAVA_Build 21 19139303 4D TAGGTAATAC ATTT/---- ATTTATCTCT 3070 hom 94 het 36 0 32 5 ATTT 2 1 323596 CASAVA_Build 21 19140498 1D AAATAGCTAA G/- ATTCATATGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 1 0 323597 CASAVA_Build 21 19141408 1D TTATCTGAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 15 15 5 A 9 8 323598 CASAVA_Build 21 19142225 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2077 het 2077 ref 25 14 6 6 A 14 12 323599 CASAVA_Build 21 19142624 6D GTAAAAAATT AATTGG/------ AATTGTGCCT 3070 het 3070 ref 38 21 15 4 AATTGG 1 0 323600 CASAVA_Build 21 19143238 15D TTGCCAAATC ACATTTTAATCTCAG/--------------- ACATTTTAAT 3070 het 3070 ref 61 33 20 15 ACATTTTAATCTCAG 2 1 323601 CASAVA_Build 21 19144111 1D ATGAATTCTC A/- AAAAAAGATG 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 7 6 323602 CASAVA_Build 21 19146385 1D ATGAAAATTC A/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 1 0 323603 CASAVA_Build 21 19146611 1I TTTGGGAAAG -/A AAAAAATATC 3070 hom 51 het 25 0 18 7 A 6 7 323604 CASAVA_Build 21 19149804 2I AAATATACTC --/TG TCAGATAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 21 1 TG 0 1 323605 CASAVA_Build 21 19151069 1I ATACTGTTCA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 8 9 323606 CASAVA_Build 21 19151820 1I AGATCTGCAT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 7 8 323607 CASAVA_Build 21 19161830 1D AGTTTGGCTC T/- TTTTTTTTTT 2869 het 2869 ref 37 17 9 11 T 11 10 323608 CASAVA_Build 21 19185313 1I ACAAAAAAAA -/T ATACAACTAA 3070 hom 82 het 35 0 28 7 T 0 1 323609 CASAVA_Build 21 19190565 1I ATTGATACAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 A 8 9 323610 CASAVA_Build 21 19190875 2D GTATGTAGAG TA/-- TACCTCAATG 3070 het 3070 ref 43 22 15 7 TA 2 1 323611 CASAVA_Build 21 19209205 5D TCAATCAAAC AAATT/----- AAAGGCATTT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 AAATT 1 0 323612 CASAVA_Build 21 19209397 1I TTCTCTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 28 1 23 4 T 12 13 323613 CASAVA_Build 21 19215111 1D AAAAATGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 11 10 323614 CASAVA_Build 21 19222061 1D ATTATTTTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 11 7 A 10 9 323615 CASAVA_Build 21 19222903 4I5M1I ATAAAGTGAT ----AAAGT-/AAACAAAGTA AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 N/A 0 0 323616 CASAVA_Build 21 19226991 1D GCAGAGGTTG C/- AGTGAGCAGA 2937 het 651 hom 15 2 7 8 C 1 0 323617 CASAVA_Build 21 19229676 1I TACTTTACCA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 7 8 323618 CASAVA_Build 21 19236539 4D TCAAATCTCC CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 37 10 13 14 CT 10 8 323619 CASAVA_Build 21 19240975 2I CTGTGGAGAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 33 18 8 7 TA 6 7 323620 CASAVA_Build 21 19257326 1D AATTATATCA T/- TTTTAGCCTT 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 T 5 4 323621 CASAVA_Build 21 19259533 2I TATACCTCAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 AT 6 7 323622 CASAVA_Build 21 19261799 1I GGCGGAGCTT -/G GCAGTGAGCT 1937 het 426 hom 19 2 8 10 G 1 2 323623 CASAVA_Build 21 19261860 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 14 1 A 11 10 323624 CASAVA_Build 21 19261968 1D TGAATTACAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 A 8 7 323625 CASAVA_Build 21 19262290 8D AAAATCTAAG AAACTGTA/-------- GAATTGTAGA 3070 het 3070 hom 24 11 14 1 AAACTGTA 1 0 323626 CASAVA_Build 21 19264052 1I CTTAAGCCAT -/G GGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 G 2 3 323627 CASAVA_Build 21 19269244 1I AAATTTAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 8 9 323628 CASAVA_Build 21 19276173 4D ATTTATAGGG AATA/---- ACATTCCCAT 3070 het 3070 hom 42 19 20 6 AATA 1 0 323629 CASAVA_Build 21 19279213 1D GTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1173 het 1173 ref 59 43 3 13 T 13 12 323630 CASAVA_Build 21 19283838 1D TTCTAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 1360 het 1360 ref 54 42 4 8 T 11 10 323631 CASAVA_Build 21 19287339 1D ATTACTAAAT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 G 1 0 323632 CASAVA_Build 21 19308210 1D GGTTTCTATG A/- AGTGTTATAA 3070 hom 120 het 43 0 41 3 A 2 1 323633 CASAVA_Build 21 19310778 1I TATTTAGAAG -/T TTTTTTCTCA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 6 7 323634 CASAVA_Build 21 19317588 1D TCTATGGCAG T/- TTTTTCACAT 3070 hom 132 het 52 0 45 9 T 6 5 323635 CASAVA_Build 21 19320688 1I CAATCTTCAC -/T TCAGGTCACC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 1 2 323636 CASAVA_Build 21 19329018 1I ACCTGGTCTC -/T TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 39 28 4 7 T 11 12 323637 CASAVA_Build 21 19331198 1I CTTGAAATTT -/G TTCCTCACAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 G 0 1 323638 CASAVA_Build 21 19334246 9I TTTCCTCTCT ---------/TATCTCTAC TATCTCTACT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 TATCTCTAC 1 2 323639 CASAVA_Build 21 19341573 1I15M1I GTAAGAGAAT -ATAGAGAGCAAAAGT-/AATAGAGAGCAAAAGTA AACAGCATAT 3070 hom 105 het 34 0 36 1 N/A 0 0 323640 CASAVA_Build 21 19343599 1I TCCATCTAGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 7 8 323641 CASAVA_Build 21 19360838 1D TTTATCTAAT A/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 17 16 3 A 1 0 323642 CASAVA_Build 21 19360983 1I GCCATAGATA -/T TTTTCTGTGT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 4 5 323643 CASAVA_Build 21 19363366 1D TGGCCAAGAA C/- CCCCCCCCCA 2880 het 1631 hom 15 5 9 1 C 10 9 323644 CASAVA_Build 21 19363958 2D TTATTCACAC AT/-- GTTTATAGCA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 AT 1 0 323645 CASAVA_Build 21 19371923 1I GTGGGCTGTG -/C CCAGGGTCTC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 2 3 323646 CASAVA_Build 21 19374705 1I CAGAAGGCAA -/G GGGGGAGCAA 3070 het 3070 ref 41 15 16 10 G 5 6 323647 CASAVA_Build 21 19388962 1I ATCTGACCGT -/C CCCTCTTGAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 3 4 323648 CASAVA_Build 21 19389049 1I AATGTAAAGT -/A CACAGTGTCA 3070 hom 128 het 47 0 39 8 A 0 1 323649 CASAVA_Build 21 19389986 4I GAGAAGAATA ----/AAGG AAGGAAGGAA 1205 het 1205 ref 20 13 3 4 AAGG 3 4 323650 CASAVA_Build 21 19402398 4D ACATTTTTAG ATAA/---- ATAAACTCAT 3070 hom 78 het 28 0 27 2 ATAA 2 1 323651 CASAVA_Build 21 19412530 1D ACTCACTCAC T/- TATTATGAGA 3070 hom 165 het 61 0 55 7 T 2 1 323652 CASAVA_Build 21 19424399 1I TCTAAAGTGT -/A ACACAAAACT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 1 2 323653 CASAVA_Build 21 19433751 1D ACCTGTCACC A/- AGTGTATTAG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 1 323654 CASAVA_Build 21 19437371 1I54M1I TGGATTTTGT -AACTTCGTGTTTCTCTTCTATAATATAATCCACTTTGTGGGTAGGTGTCACTTG-/AAACTTCGTGTTTCTCTTCTATAATATAATCCACTTTGTGGGTAGGTGTCACTTGT TCTTTTTGCC 3070 hom 154 het 33 0 52 5 N/A 0 0 323655 CASAVA_Build 21 19441631 1I ATTGAGTAAT -/A ACTTAAAAGG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 1 2 323656 CASAVA_Build 21 19451314 1I5M1I TGGCCTGTAG -TTTCA-/TTTTCAT TTTTTCTTGT 3070 hom 117 het 40 0 40 3 N/A 0 0 323657 CASAVA_Build 21 19451488 1D TCATACAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 T 11 10 323658 CASAVA_Build 21 19453027 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 11 10 323659 CASAVA_Build 21 19456334 1I TCCATCTTTT -/G GAAAGGCCTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 1 2 323660 CASAVA_Build 21 19464470 1D TCTGTACATA T/- TTGGGAGAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 3 2 323661 CASAVA_Build 21 19464789 33D TAAATACTAT GAGCCCTGCCAGTGACAATTTTAAACAAGTTTA/--------------------------------- GAGGTAGTAC 3070 hom 81 het 22 0 28 1 GAGCCCTGCCAGTGACAATTTTAAACAAGTTTA 1 0 323662 CASAVA_Build 21 19468709 3D CTCTGTAACT TTA/--- TTTTTTATGT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTA 1 0 323663 CASAVA_Build 21 19468946 2I ACAGAATATT --/GG GTAGGTGGGG 3070 hom 80 het 29 0 25 6 G 1 3 323664 CASAVA_Build 21 19469943 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAACGC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 8 7 323665 CASAVA_Build 21 19470512 4I TACACAACTT ----/AGTA AGAGGGATAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AGTA 0 1 323666 CASAVA_Build 21 19471157 13I GCTGAATAGG -------------/GCTAACGAATAAA GCTAAGCAGA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 GCTAACGAATAAA 0 1 323667 CASAVA_Build 21 19478180 1D CTCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 967 het 79 hom 12 2 6 4 A 19 18 323668 CASAVA_Build 21 19479453 1D TCTGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 723 het 723 ref 47 36 3 8 A 11 10 323669 CASAVA_Build 21 19489086 1D TCACCTTTCT A/- AACTTCTTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 3 2 323670 CASAVA_Build 21 19492717 1I CTTGCTGCCG -/T TTTTTTCTCC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 6 7 323671 CASAVA_Build 21 19492858 1D AAGCATACAC A/- GTTAAATTCT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 1 0 323672 CASAVA_Build 21 19497699 1I TCTAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 32 1 29 2 A 11 12 323673 CASAVA_Build 21 19498848 1D CCAACATGGC T/- GAAACCCCGT 3070 hom 75 het 28 0 23 5 T 1 0 323674 CASAVA_Build 21 19510310 1I ATGCCAAGAG -/A ACCGCACTTA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 1 2 323675 CASAVA_Build 21 19519343 4D TAAGAACACA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 32 1 21 10 T 16 12 323676 CASAVA_Build 21 19527413 1I ATTTAGCTAG -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 7 8 323677 CASAVA_Build 21 19540315 1D CCCCTGACTT A/- ACAACGAAAC 3070 hom 108 het 41 0 33 8 A 2 1 323678 CASAVA_Build 21 19553741 1I21M1I GAGAACGGCC -AAAGAAAATTCAAACTACAAG-/AAAAGAAAATTCAAACTACAAGA ATAACATCCA 3070 hom 45 het 22 0 16 11 N/A 0 0 323679 CASAVA_Build 21 19554456 1D TGCTCAATGG T/- TTTTACTTTC 3070 hom 111 het 39 0 34 5 T 5 4 323680 CASAVA_Build 21 19565921 1D GGCTCAGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 27 1 19 7 T 13 12 323681 CASAVA_Build 21 19578121 4D AAAAAATAGA TTAT/---- TTAGGAAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTAT 1 0 323682 CASAVA_Build 21 19578407 1D TAGCATCTAA T/- TTTTTTGTTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 7 6 323683 CASAVA_Build 21 19580966 1I GCTTCACTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 545 hom 37 2 29 6 T 9 10 323684 CASAVA_Build 21 19594102 2D TTACCTTGTT AA/-- ATATACATGT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 3 1 323685 CASAVA_Build 21 19596563 3I TTTCTTTTCT ---/TTC TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 TTC 0 1 323686 CASAVA_Build 21 19599118 1I ACATACTTCC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 T 7 8 323687 CASAVA_Build 21 19599425 1D ATCAAAAGCC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 9 8 323688 CASAVA_Build 21 19607950 17D10M20D TGACATACAA GGTCACTTGTATGTATGTATTGTATTGACATACAATATTTGTGTTGA/-----------------TATTGTGTTG-------------------- AAAAAATATA 3070 hom 75 het 21 0 26 5 N/A 0 0 323689 CASAVA_Build 21 19609379 1I TACAAATATA -/T TTAAAAAATC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 3 323690 CASAVA_Build 21 19609589 2D CTATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 48 het 25 0 15 10 AC 10 9 323691 CASAVA_Build 21 19618643 1D TACTCAATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 94 het 36 0 32 4 A 10 9 323692 CASAVA_Build 21 19621042 1D TTTCACTGAC G/- GAACTGCCAC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 G 2 1 323693 CASAVA_Build 21 19622351 1D GACCTATCTG T/- TTTTATGATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 5 4 323694 CASAVA_Build 21 19623932 1I TTGTTGTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 32 1 25 6 T 11 12 323695 CASAVA_Build 21 19631665 2I TTTAAACTAT --/AC AGCTTTCTTG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 AC 0 1 323696 CASAVA_Build 21 19643864 1D TGCAAGAGGA T/- TTTTTTTTTT 2233 het 2233 ref 43 18 11 14 T 17 16 323697 CASAVA_Build 21 19655707 1I CAATGGACTC -/T TTTTTTTTTT 1007 het 1007 ref 46 31 7 8 T 14 15 323698 CASAVA_Build 21 19666735 1D AATTTAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 12 11 323699 CASAVA_Build 21 19677961 1D CATAATAATA T/- ACAAATTTGG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 0 323700 CASAVA_Build 21 19681563 2D TTTTAAGTTC TA/-- TATAACCCTC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TA 3 2 323701 CASAVA_Build 21 19684119 1D GGACATGAAG C/- TTTTGGTCTA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 C 1 0 323702 CASAVA_Build 21 19689846 1I AAATTGCATA -/T TTTTTCCATT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 5 6 323703 CASAVA_Build 21 19691110 4I ATGATTACAA ----/TGAT TCCAGCAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TGAT 0 1 323704 CASAVA_Build 21 19691967 11D CTGTAAGACC TTATTTCACTT/----------- TTGTGCAATT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 TTATTTCACTT 1 0 323705 CASAVA_Build 21 19699780 4D AACATACAGT TAGA/---- TAGAAGGTAT 3070 het 3070 ref 40 19 18 7 TAGA 2 1 323706 CASAVA_Build 21 19707552 2I CACACAGAGT --/GC CCCCATTGGA 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 GC 0 1 323707 CASAVA_Build 21 19713134 4D GGTTTAAAAC AGTT/---- GGTTGTTTCT 3070 het 3070 ref 26 16 8 4 AGTT 1 0 323708 CASAVA_Build 21 19725060 1D TGATCCACCC G/- CCTCGGCCTC 2955 hom 27 het 11 0 10 1 G 1 0 323709 CASAVA_Build 21 19743125 1D CTATACCTAG A/- AAAAAAACAT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 A 8 7 323710 CASAVA_Build 21 19745185 1D AGTAAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 9 8 323711 CASAVA_Build 21 19746778 1D AAAGGCAAAA G/- CAAACTTGGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 G 1 0 323712 CASAVA_Build 21 19757643 2D CAACAAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 66 het 30 0 23 8 AT 8 7 323713 CASAVA_Build 21 19771181 1D CCACCATTCT G/- GGGGGTCTTG 3070 hom 69 het 27 0 21 6 G 6 5 323714 CASAVA_Build 21 19782317 1I TGATTAAAGG -/T TTAAGAGTTG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 2 3 323715 CASAVA_Build 21 19785380 2D TTCCTCACGA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 45 16 16 15 TC 9 8 323716 CASAVA_Build 21 19795679 2D TTCACAAATT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 17 16 12 AC 9 8 323717 CASAVA_Build 21 19796818 1I AATATTTGTC -/T TTTTATGCCT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 4 5 323718 CASAVA_Build 21 19797756 1D TCTAGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 11 10 323719 CASAVA_Build 21 19798199 1I TGTGCTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 10 11 323720 CASAVA_Build 21 19801504 1I TAATAATACC -/T CTGAATTCTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 0 1 323721 CASAVA_Build 21 19819862 1I AAATGACAGG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 114 het 51 0 39 12 T 8 9 323722 CASAVA_Build 21 19822564 4D ACACTTCAAC TGGT/---- TACCAAGCAA 3070 het 3070 hom 40 15 22 4 TGGT 1 0 323723 CASAVA_Build 21 19826775 1D AATAAAATCA C/- CATATATTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 4 C 2 1 323724 CASAVA_Build 21 19829365 1I ATAAGCTAAT -/A CTTGCAAATA 3070 hom 129 het 51 0 44 7 A 0 1 323725 CASAVA_Build 21 19831149 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTTTTA 2847 hom 18 het 10 0 7 3 T 11 9 323726 CASAVA_Build 21 19832023 1I ATGTGAACTT -/A TATCTAGAGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 0 1 323727 CASAVA_Build 21 19835715 23D AAAATGTTTT AATGCTCATATAGAAGCATCAAG/----------------------- AATGCTTCAT 3070 het 855 hom 33 2 21 14 AATGCTCATATAGAAGCATCAAG 1 0 323728 CASAVA_Build 21 19836982 6I ATGATGATTA ------/TTAATG TTAATGTGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTAATG 1 2 323729 CASAVA_Build 21 19840190 2D TGTCTTTTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 TG 7 6 323730 CASAVA_Build 21 19840551 2D GCAAATATCA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 het 328 hom 40 4 22 14 C 11 9 323731 CASAVA_Build 21 19840639 2D CAGCCTTTTC AA/-- AAAATATGTT 3070 het 3070 hom 31 10 20 2 A 6 4 323732 CASAVA_Build 21 19841270 1I TTTGAATTAT -/G GGGGTGGATC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 4 5 323733 CASAVA_Build 21 19844545 1D GTATTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 13 12 323734 CASAVA_Build 21 19844898 1I ATGTTTTCTT -/G GTTGTAGGAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 1 2 323735 CASAVA_Build 21 19845215 1I TATGGTTTAC -/G ATAACGATTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 0 1 323736 CASAVA_Build 21 19845644 1I TGACATCATG -/A AACTACCTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 2 3 323737 CASAVA_Build 21 19846091 6I CCCTCACCCA ------/GGAACT GGCTAAGCAC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 GGAACT 0 1 323738 CASAVA_Build 21 19846188 2D CCAAAAACTC TG/-- AGCTTTTGGG 3070 hom 75 het 44 0 32 14 TG 1 0 323739 CASAVA_Build 21 19848095 1D GATTAGGAAG C/- CTGTTTTTTC 3070 hom 126 het 49 0 43 8 C 2 1 323740 CASAVA_Build 21 19848477 1D TAAACTTAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 112 het 45 0 37 8 A 9 8 323741 CASAVA_Build 21 19849560 1I ATAAAGAGAA -/T TTATGATTTT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 T 2 3 323742 CASAVA_Build 21 19853285 1D GGTTGTACTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 21 7 11 3 A 9 8 323743 CASAVA_Build 21 19853790 3D CATTTTCCTT TAA/--- TCATTTGTGT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 TAA 1 0 323744 CASAVA_Build 21 19854754 1I ATGGTGCTTC -/T TTACAGTGCC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 2 3 323745 CASAVA_Build 21 19859576 3D TGTTTGTAAA GTT/--- AATATGCATG 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 GTT 1 0 323746 CASAVA_Build 21 19860368 1I AATTTGAGAT -/A AAAATGGCAG 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 A 4 5 323747 CASAVA_Build 21 19865541 3I TTTCCCTTCC ---/TCT TCTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 TCT 2 3 323748 CASAVA_Build 21 19868221 2D TTTATTTTCA AT/-- AAATAAGACT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 AT 1 0 323749 CASAVA_Build 21 19868439 1D CTGGGACTAC A/- AGCCTCCCAC 165 het 4 hom 9 0 1 8 A 2 1 323750 CASAVA_Build 21 19871315 1D TATTTTATGG A/- TCGGCTTTAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 0 323751 CASAVA_Build 21 19901753 1I AAATATGTTC -/T TGTAGAGAGG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 1 2 323752 CASAVA_Build 21 19903096 1D TTTTATGTTT A/- TACATCAAAA 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 A 1 0 323753 CASAVA_Build 21 19905481 1I GCTTTACCTA -/C CCTTTCAGGA 3070 hom 129 het 50 0 43 7 C 2 3 323754 CASAVA_Build 21 19905623 1I TTACCTAACC -/A AAAATAATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 4 5 323755 CASAVA_Build 21 19906257 15D AGCAATAGAC AGTAGAGGATAGAGT/--------------- AGTAGAGGAT 3070 hom 96 het 45 0 31 17 AGTAGAGGATAGAGT 2 1 323756 CASAVA_Build 21 19928440 1D TCACGGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 A 12 11 323757 CASAVA_Build 21 19936515 1D TTTTGCTGTG T/- CCCCACCCAA 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 T 1 0 323758 CASAVA_Build 21 19943903 1D GCGTGAACCC G/- GGAGGCGGAG 1288 hom 10 het 4 0 4 0 G 3 2 323759 CASAVA_Build 21 19959727 10I TATTTGGGTA ----------/GTCTTCATTT GTCTTCATAT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 GTCTTCATTT 0 1 323760 CASAVA_Build 21 19969037 1D CGAAAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 12 11 323761 CASAVA_Build 21 19969630 3D AATTGGAATT CTC/--- CTCTTTTCAA 3070 hom 120 het 44 0 40 5 CTC 2 1 323762 CASAVA_Build 21 19977723 1I CATGAGTTTG -/T CTGGTTTTGA 3070 hom 122 het 46 0 41 5 T 0 1 323763 CASAVA_Build 21 19984895 4D CATTATATAA CTCT/---- CTCTCCTTTC 3070 het 3070 ref 44 22 20 3 CT 4 2 323764 CASAVA_Build 21 19987088 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTGTTTTT 617 het 617 ref 31 7 5 20 T 5 4 323765 CASAVA_Build 21 19987917 1D AATCACTGCT G/- GGTGTATTCA 3070 het 3070 hom 48 20 19 9 G 3 2 323766 CASAVA_Build 21 19993454 3D GTAAAAGCTA TTT/--- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 T 11 8 323767 CASAVA_Build 21 20024486 1D TTTCTTTTGA T/- CCAATTTGTC 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 1 0 323768 CASAVA_Build 21 20033193 1D AGCAAAAATG C/- CCTCTATGTA 3070 het 3070 hom 34 10 19 6 C 3 2 323769 CASAVA_Build 21 20037318 5D AAATAAAAAA ATAAG/----- ATATAATTTA 891 het 891 ref 10 5 5 0 ATAAG 1 0 323770 CASAVA_Build 21 20037368 1D GTTGGCATTT A/- AAAAAATAGT 3070 het 2393 hom 17 6 7 4 A 7 6 323771 CASAVA_Build 21 20039380 3I ACATCTTCTT ---/TTG TTAGAAAGCA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 TTG 0 1 323772 CASAVA_Build 21 20039828 4I AAACATAAAC ----/ACAT ACACACATTT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 ACAT 0 1 323773 CASAVA_Build 21 20051616 4D TATTGAGAGT ATAA/---- CTGTACTTCT 3070 het 3070 ref 30 14 14 5 ATAA 1 0 323774 CASAVA_Build 21 20057397 1D AGTCTTGCTC T/- GTCGCCCAGG 3070 het 54 hom 16 2 9 5 T 1 0 323775 CASAVA_Build 21 20058180 1I CAATAGAAAT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 6 7 323776 CASAVA_Build 21 20087595 2I TTCTTACCTC --/TT TAACTTTAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 1 3 323777 CASAVA_Build 21 20089790 1D GCCCAGCAGA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 60 het 27 0 21 7 T 9 8 323778 CASAVA_Build 21 20095974 1I TTATTTTCCG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 8 9 323779 CASAVA_Build 21 20100155 3I GGTAAATGAT ---/ACA ACTTTAATAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ACA 0 1 323780 CASAVA_Build 21 20100704 3D AGAGCTCAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 590 hom 39 7 23 9 A 13 10 323781 CASAVA_Build 21 20101430 1D TTAGGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 2966 het 2433 hom 38 13 11 14 T 17 16 323782 CASAVA_Build 21 20104464 2I CAAAATAAAC --/TT GATAAACTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 0 2 323783 CASAVA_Build 21 20112619 1I ATATGAAGTT -/A AAATACTATT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 3 4 323784 CASAVA_Build 21 20116454 1I CAGTAAAAAC -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 6 7 323785 CASAVA_Build 21 20117797 1D ACATACATGT G/- GCACACACAC 3070 het 3070 hom 53 23 26 4 G 2 1 323786 CASAVA_Build 21 20118336 1I TTGTATTTTC -/T TTTTTTTAGT 1683 het 1683 ref 16 6 6 4 T 7 8 323787 CASAVA_Build 21 20124294 1D TTTATGTCAC A/- GATTTGTTTA 3070 hom 105 het 39 0 34 6 A 1 0 323788 CASAVA_Build 21 20129296 1D ATTTGTACAT C/- CTGCTCTCCT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 2 1 323789 CASAVA_Build 21 20130778 1I CTGAAAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 34 2 22 10 T 13 14 323790 CASAVA_Build 21 20134797 20I ACATTATAAA --------------------/TATATTTAATAACAGGGAAC TATACACTTA 3070 hom 108 het 38 0 37 4 TATATTTAATAACAGGGAAC 0 1 323791 CASAVA_Build 21 20136110 1D GAGTTTTATA T/- TTTTTTATAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 7 6 323792 CASAVA_Build 21 20142265 1D AACATTCTAG A/- AAAAAAAAAA 1597 het 1597 ref 34 26 4 4 A 15 14 323793 CASAVA_Build 21 20205262 9D TGTGAATTGC TAAAAAATT/--------- TAAAAATAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 5 TAAAAAATT 1 0 323794 CASAVA_Build 21 20205330 19D AGGCCAAGGG AGGAGGATCGTTTGAGTCC/------------------- AGGAGTTAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AGGAGGATCGTTTGAGTCC 1 0 323795 CASAVA_Build 21 20217352 2D TGTGTGTGAG TA/-- TATATATATA 2077 hom 18 het 7 0 7 0 TA 7 6 323796 CASAVA_Build 21 20217443 8I TGGCAGTGAG --------/TGTATTTT TGTGTGTATT 2509 hom 15 het 11 0 6 5 TGTATTTT 0 1 323797 CASAVA_Build 21 20220066 1D ACTTGAAAGC A/- AAAAAATGAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 7 6 323798 CASAVA_Build 21 20221625 4D AAAAGAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AAAG 3 2 323799 CASAVA_Build 21 20226709 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 1061 hom 31 4 23 4 TA 7 8 323800 CASAVA_Build 21 20233746 3D GTACCAAAAC TTT/--- TTATTAGTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 5 2 323801 CASAVA_Build 21 20235741 1I ATGGCGTGAA -/C CCCGGGAGGC 3070 hom 24 het 10 0 7 3 C 3 4 323802 CASAVA_Build 21 20267028 5D TTGTAGCTTC ATATA/----- ATATATGAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 6 ATATA 2 1 323803 CASAVA_Build 21 20268859 1D ATAGTCAATG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 303 hom 61 1 53 10 T 9 8 323804 CASAVA_Build 21 20270151 1D GTTGCCTAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 9 8 323805 CASAVA_Build 21 20270251 3I ACTTAAAGCG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 10 13 323806 CASAVA_Build 21 20271404 1D CTGAGATATC T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 6 323807 CASAVA_Build 21 20272415 3I TACCTTTTAT ---/TTC TTATCTCTAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TTC 0 1 323808 CASAVA_Build 21 20273597 7I ATTGTTACGA -------/ATAAAAT ATAAGTTAGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATAAAAT 0 1 323809 CASAVA_Build 21 20288626 4D TGGAGGTAAA GCTC/---- AGGAAAGAGT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 GCTC 1 0 323810 CASAVA_Build 21 20306748 1D ACTTTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 18 1 13 4 A 15 14 323811 CASAVA_Build 21 20310735 1D TTGTACAGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 9 8 323812 CASAVA_Build 21 20312577 1I GAATTGTCCA -/G GGCTCCTCCA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 G 2 3 323813 CASAVA_Build 21 20312686 1D CATCTTGCAG T/- ATTTCCTGAC 3070 hom 90 het 33 0 28 5 T 1 0 323814 CASAVA_Build 21 20312791 1I CGGGCGCGGT -/G GCTCATGCCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 2 323815 CASAVA_Build 21 20315579 1I TTGTTAGGAA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 7 8 323816 CASAVA_Build 21 20321211 4D40M4D AAATATTTTC GAAAGAAAGAAAGAAAAGAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGGGAGGAAAGG/----GAAAGAAAGAAAAGAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGGGAGGA---- AAGAAAGAAA 3070 het 232 hom 16 2 16 0 N/A 0 0 323817 CASAVA_Build 21 20327700 1I AATTTGCTAG -/A ATTTGCATAC 3070 hom 132 het 47 0 44 3 A 1 2 323818 CASAVA_Build 21 20334122 1I CCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1492 het 29 hom 7 1 4 2 T 11 12 323819 CASAVA_Build 21 20341412 1D CAACAAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 30 1 22 7 A 14 13 323820 CASAVA_Build 21 20352670 1I TAATACTAAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 8 9 323821 CASAVA_Build 21 20353450 1D CTTATATAAG T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 7 6 323822 CASAVA_Build 21 20353942 1I TTACCATATC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 51 0 41 10 A 9 10 323823 CASAVA_Build 21 20354854 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2230 hom 31 8 16 7 A 12 11 323824 CASAVA_Build 21 20355544 1D CCACTTCACA C/- CCCATATATG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 4 3 323825 CASAVA_Build 21 20363628 1I ATGCAAAAAA -/G AAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 34 0 26 8 G 0 1 323826 CASAVA_Build 21 20378639 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 2628 het 2628 ref 15 6 7 2 T 10 9 323827 CASAVA_Build 21 20382407 1D GCAATATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 10 9 323828 CASAVA_Build 21 20410495 2D CCATATTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 13 11 323829 CASAVA_Build 21 20413432 1I CGATCTCGGC -/T AACTGCAACC 2771 het 2771 ref 20 11 7 2 T 0 1 323830 CASAVA_Build 21 20415177 2I TAACGATTTC --/TT TCTCATATAA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 1 3 323831 CASAVA_Build 21 20421763 1I GGTCCTGGAC -/T TTTTTTTGGT 3070 het 2348 hom 13 5 8 0 T 7 8 323832 CASAVA_Build 21 20423637 3D CCCAAGGCAA TTC/--- TTCTTCTTCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TTC 4 3 323833 CASAVA_Build 21 20427838 1I CTTACATATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 9 10 323834 CASAVA_Build 21 20428288 1I GATAAAGAAA -/T GTAGGTCTAG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 0 1 323835 CASAVA_Build 21 20435826 2D AGAATATTTT TA/-- TATTTATGCA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 TA 2 1 323836 CASAVA_Build 21 20439113 2I AAGAAAAAAA --/TC TCTCTCTCTA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TC 4 5 323837 CASAVA_Build 21 20460546 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2705 hom 26 9 13 4 A 13 12 323838 CASAVA_Build 21 20469245 1I TAGTTTGTAC -/T TTTTGTATTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 4 5 323839 CASAVA_Build 21 20478208 2I TGAAACAAAC --/AT ATATTTCATG 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 AT 2 3 323840 CASAVA_Build 21 20482751 1D GCGGTCAGAT C/- CACGAGGTCA 2878 het 1550 hom 13 5 6 2 C 2 1 323841 CASAVA_Build 21 20485228 2D CCAGAAACTT AA/-- GTTTCATTTT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 2 0 323842 CASAVA_Build 21 20486572 1I GGGGAATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 37 1 32 4 A 10 11 323843 CASAVA_Build 21 20489880 8I GAGTCTCTGA --------/CCTATTTG CCTTTCAGGT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 CCTATTTG 0 1 323844 CASAVA_Build 21 20493474 1I16M1I11M1I AAAACTAGGT -AAGGGTAAAAGATGTC-TTTGGTATTTA-/AAAGGGTAAAAGATGTCTTTTGGTATTTAT TTCTTACAAG 3070 hom 93 het 39 0 32 12 N/A 0 0 323845 CASAVA_Build 21 20497390 1D ACTGAATGAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 21 0 15 7 A 9 8 323846 CASAVA_Build 21 20515247 1I TTGCTAAAGC -/A AAACTATGTT 3070 hom 69 het 30 0 23 7 A 3 4 323847 CASAVA_Build 21 20534904 2D GGATGCCTCA AG/-- AAGCTTCTAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AG 1 0 323848 CASAVA_Build 21 20547385 1I CATTAAATCT -/G GGGGGGGGGC 1462 het 1462 ref 29 9 11 9 G 9 10 323849 CASAVA_Build 21 20548519 1I CTAAAAATAC -/A AAATTAGCCG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 3 4 323850 CASAVA_Build 21 20549097 3I CCTTACCAAA ---/AAT TTTCGAGTTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 AAT 0 1 323851 CASAVA_Build 21 20563885 1D ATGGATGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 8 T 11 10 323852 CASAVA_Build 21 20567145 1I AGGCAAGTGC -/A AAACCCACAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 3 4 323853 CASAVA_Build 21 20569444 1D TCCCTCCACC A/- ATGATAGCCC 3070 hom 117 het 42 0 40 4 A 2 1 323854 CASAVA_Build 21 20569808 1D TTGAAGCACA G/- GCACAAGCCT 3070 hom 116 het 44 0 37 7 G 2 1 323855 CASAVA_Build 21 20571957 1D ACTTGCAAAA G/- TATTTTAAGG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 G 1 0 323856 CASAVA_Build 21 20575871 1D ATAATTTATC A/- AAATTTACTC 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 A 4 3 323857 CASAVA_Build 21 20577168 1I AATACACCCA -/G GGATGTGGAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 2 3 323858 CASAVA_Build 21 20578137 1I AGAGCAACAA -/T TTTGGTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 3 4 323859 CASAVA_Build 21 20580201 1D GTATGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1527 hom 38 10 14 14 T 17 16 323860 CASAVA_Build 21 20583334 4I TTTATAAAAT ----/AGAA GGAAGGAAAA 1086 het 1086 ref 25 11 4 10 AGAA 0 1 323861 CASAVA_Build 21 20585536 1I AAGACTTTGC -/A AAGTTCAAGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 2 3 323862 CASAVA_Build 21 20587707 1I TTGAGATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 42 1 33 8 T 10 11 323863 CASAVA_Build 21 20587717 1I TTTTTTTTTT -/A AAATTAGAGT 3070 hom 48 het 47 1 39 7 A 3 4 323864 CASAVA_Build 21 20589738 1D TAGGTAGGTA T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 T 6 5 323865 CASAVA_Build 21 20590263 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 het 285 hom 26 2 10 14 G 0 1 323866 CASAVA_Build 21 20590721 1D ATACTTGTTT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 42 16 20 7 A 8 7 323867 CASAVA_Build 21 20591967 2D TCTTTTTATC TG/-- TCTTTCATTA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 TG 1 0 323868 CASAVA_Build 21 20592322 1I TGCTAAACAG -/T TCTGTCTCCT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 1 2 323869 CASAVA_Build 21 20594579 4D23M13D AATCCATGGG GAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATA/----AAAAAAAATATATATATATATAT------------- AAGTTTAGAA 2738 het 286 hom 9 1 7 3 N/A 0 0 323870 CASAVA_Build 21 20594713 1D GACTATTTTG T/- TTGTTGATGT 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 T 3 2 323871 CASAVA_Build 21 20598034 1D CAGGGGAGAA C/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 C 1 0 323872 CASAVA_Build 21 20599678 3D TTTAATCTGC TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 32 13 17 2 TTA 6 5 323873 CASAVA_Build 21 20600629 1D TAATGTAGAA T/- TCATTTGGGA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 2 1 323874 CASAVA_Build 21 20609665 1D TTGGATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 11 10 323875 CASAVA_Build 21 20618367 1D TTTTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 38 6 10 22 T 14 13 323876 CASAVA_Build 21 20625406 1I AAGATCAAGA -/T CGTCAAGAAG 3070 hom 127 het 48 0 41 7 T 0 1 323877 CASAVA_Build 21 20628024 2D CAAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 582 het 582 ref 27 16 3 8 AT 1 0 323878 CASAVA_Build 21 20635432 1I13M1I CTTCAAGGTC -TTTTTTTTTCCTA-/TTTTTTTTTTCCTAT TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 45 25 17 9 N/A 0 0 323879 CASAVA_Build 21 20642993 1I TTAGTTAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 9 10 323880 CASAVA_Build 21 20647956 1D CTAGCAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 10 9 323881 CASAVA_Build 21 20661231 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 T 12 11 323882 CASAVA_Build 21 20661561 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 37 0 27 10 T 9 8 323883 CASAVA_Build 21 20671490 4D CTATCTATCC ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 hom 42 het 15 0 15 1 ATCT 5 4 323884 CASAVA_Build 21 20684281 1I AATTTAGAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 T 9 10 323885 CASAVA_Build 21 20695870 5D TTTCTCAGTT ATAAG/----- AGATTGGTTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 6 ATAAG 1 0 323886 CASAVA_Build 21 20696069 1I TTTCTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2350 hom 32 7 19 6 A 10 11 323887 CASAVA_Build 21 20697100 1D AAAGGTGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 269 hom 33 1 24 8 A 11 10 323888 CASAVA_Build 21 20699918 1D TTGTAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 41 1 28 12 T 11 10 323889 CASAVA_Build 21 20701533 1I TTTAAGGGGG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 7 8 323890 CASAVA_Build 21 20709847 1D TTCTTTTATA C/- TGTTTTTCTT 3070 hom 99 het 37 0 33 5 C 1 0 323891 CASAVA_Build 21 20713185 1I TCTTAAATGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 103 het 46 0 34 12 T 9 10 323892 CASAVA_Build 21 20725497 10D TATATATAAA ATATATAAAT/---------- ATATATAAAT 2086 hom 12 het 9 0 5 4 ATATATAAAT 2 1 323893 CASAVA_Build 21 20726590 1D AGAACAACAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 9 8 323894 CASAVA_Build 21 20729339 1I GTTGAAAGGC -/A CAAAATGGCA 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 A 0 1 323895 CASAVA_Build 21 20730878 8D AGGAAGAAGT TGAATCCC/-------- TGAATAGAAT 3070 het 3070 hom 39 15 23 4 TGAATCCC 1 0 323896 CASAVA_Build 21 20738426 1I GGTTATGCTA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 T 6 7 323897 CASAVA_Build 21 20740422 3D TTTTTCCCAC TTG/--- TTGTATTCTC 3070 hom 123 het 46 0 42 5 TTG 2 1 323898 CASAVA_Build 21 20742361 1D TGGTATTTTT G/- TTTATAAAAC 3070 hom 106 het 39 0 35 4 G 1 0 323899 CASAVA_Build 21 20744930 1D ATCCCTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 11 10 323900 CASAVA_Build 21 20748776 1I CTGAATTCTA -/G GGTTTACATT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 2 3 323901 CASAVA_Build 21 20749479 1D AGTTACTTTC A/- AATTTGGGGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 3 2 323902 CASAVA_Build 21 20750339 3D TGACTTTGTC CTT/--- CTTCAATATT 3070 hom 96 het 36 0 33 6 CTT 2 1 323903 CASAVA_Build 21 20750751 1I GTTCTAGGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 424 hom 33 1 26 6 T 9 10 323904 CASAVA_Build 21 20751667 2I TTCTTTTATT --/TA TTTTTTTTAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TA 0 1 323905 CASAVA_Build 21 20752866 8D TTATGGTAAG CAATTTGC/-------- CCAAGCTCTT 3070 hom 93 het 34 0 32 5 CAATTTGC 1 0 323906 CASAVA_Build 21 20753148 1D ATGCCTTCTA T/- TAAAACAATT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 1 323907 CASAVA_Build 21 20756008 1I TGGTTATCAC -/T AAAGACAGGA 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 0 1 323908 CASAVA_Build 21 20759787 6D TAAAACTTTG ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AT 12 9 323909 CASAVA_Build 21 20761116 1D CGTAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 41 1 33 7 A 12 11 323910 CASAVA_Build 21 20763886 2I TCAATAGACA --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 11 323911 CASAVA_Build 21 20765162 2D AATGATAAAC AT/-- ATTTTATCCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AT 2 1 323912 CASAVA_Build 21 20765389 1D ATTAGATTCC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 8 7 323913 CASAVA_Build 21 20766662 1I GTTTTTTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 251 hom 25 1 21 3 A 7 8 323914 CASAVA_Build 21 20770002 2D GTGAGTCGAG AT/-- CACGCCACTG 2171 het 116 hom 11 1 5 5 AT 1 0 323915 CASAVA_Build 21 20770939 3D ATTTCAATCT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 66 het 31 0 23 10 TTA 6 5 323916 CASAVA_Build 21 20772098 1I AGCACAAAAG -/A TTAATGTTGT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 0 1 323917 CASAVA_Build 21 20775027 29I TTCTGTTTTA -----------------------------/TGTGCATATTGCATTTTCTTTACCCGCTC TCACAGCACT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TGTGCATATTGCATTTTCTTTACCCGCTC 0 1 323918 CASAVA_Build 21 20775276 2D TCACCTTAGG TT/-- TTTTTTTATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 9 7 323919 CASAVA_Build 21 20776711 1D TAATTCATTC T/- TTTTAAAAAA 3070 het 157 hom 36 1 32 3 T 5 4 323920 CASAVA_Build 21 20783102 1D AGAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 41 2 29 12 A 14 13 323921 CASAVA_Build 21 20787017 1D TCATTTTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 T 10 9 323922 CASAVA_Build 21 20790615 1D ACTTCTGATT A/- AAATAAAATA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 4 3 323923 CASAVA_Build 21 20791949 1D TTTTTAACAC T/- GTTTACATAG 3070 hom 105 het 37 0 36 3 T 1 0 323924 CASAVA_Build 21 20792986 1D CTTTTCTATC A/- CATATTCAGG 3070 hom 75 het 29 0 26 5 A 1 0 323925 CASAVA_Build 21 20806122 1D CAGAGGAAAC T/- GCCAGACACT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 0 323926 CASAVA_Build 21 20806674 1D AAGGTAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 715 hom 40 3 26 11 A 13 12 323927 CASAVA_Build 21 20807642 2D TTCAGAACTT TA/-- AGAAAAGTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 TA 1 0 323928 CASAVA_Build 21 20808219 1I TAGCCTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 11 323929 CASAVA_Build 21 20808386 1D AATTTGCCAC T/- TACAAAAACC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 1 323930 CASAVA_Build 21 20810573 3I AATAAAGCAG ---/AAT TACTTCAGTA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 AAT 0 1 323931 CASAVA_Build 21 20811661 1I ATTGCTTCCT -/G GACATCACTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 1 2 323932 CASAVA_Build 21 20826016 1D AGCGACACTC A/- AAAAAAAAAG 1116 het 1116 ref 38 32 3 3 A 10 9 323933 CASAVA_Build 21 20828322 1D ACAATAGTTC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 8 7 323934 CASAVA_Build 21 20828728 1D AGAAGGGGTC A/- ATGAGCTGAG 3070 het 3070 hom 53 19 25 10 A 2 1 323935 CASAVA_Build 21 20847213 1D TTATGTCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 A 11 10 323936 CASAVA_Build 21 20860247 1I TGTTTTACAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 T 8 9 323937 CASAVA_Build 21 20861375 33D TGATGTCCAG ATATTACGAATGATAATTTAGGGTCCAAAAGTA/--------------------------------- ATAGTTAAGT 3070 het 3070 ref 41 21 20 6 ATATTACGAATGATAATTTAGGGTCCAAAAGTA 1 0 323938 CASAVA_Build 21 20865702 1I GGGTCATATA -/T AAAAATCGCA 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 T 0 1 323939 CASAVA_Build 21 20882799 2D66M2D CCGGGAGGGG TATATGTGTGTGTATATATATACCCAGGAGTTGGTATATGTGTATGTATATATACCCTATATAAAAAAAT/--TATGTGTGTGTATATATATACCCAGGAGTTGGTATATGTGTATGTATATATACCCTATATAAAAAA-- ATATAGATAT 2921 het 483 hom 8 1 7 8 N/A 0 0 323940 CASAVA_Build 21 20883308 5D TATAATTATC ATAAT/----- ATAATATATA 1517 het 833 hom 7 2 4 1 ATAAT 2 1 323941 CASAVA_Build 21 20883835 1I ACTATGAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 226 hom 46 1 28 17 A 9 10 323942 CASAVA_Build 21 20889501 1D ATTTTCTCTG T/- TTTTTTTTTG 2393 het 2393 ref 27 16 6 6 T 10 9 323943 CASAVA_Build 21 20903482 2D AAAAAAAAAC AG/-- TGAAAAAAAA 3058 het 3058 ref 27 11 11 5 AG 1 0 323944 CASAVA_Build 21 20908972 1D5M1D AAATCTCCTC TTGCACT/-TGCAC- GTAATCCCCA 3070 het 3070 ref 39 24 12 6 N/A 0 0 323945 CASAVA_Build 21 20910874 23D AATACATATA AATCCACATATGTATTCATATAC/----------------------- ATATATGTAT 3070 het 3070 ref 28 17 12 3 AATCCACATATGTATTCATATAC 1 0 323946 CASAVA_Build 21 20911945 1I GGATTTCATA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 46 18 20 8 T 8 9 323947 CASAVA_Build 21 20927221 4D GAAATGCATG TATC/---- TATCTATCTA 3070 het 3070 ref 33 13 15 9 TATC 3 2 323948 CASAVA_Build 21 20930900 1I AAAAGAAACC -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 8 9 323949 CASAVA_Build 21 20931296 5I ATAATAATAA -----/TAAAG TAAATAAATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TAAAG 0 1 323950 CASAVA_Build 21 20933165 1I TAAAGATACT -/A AAAAATGAAG 3070 hom 151 het 57 0 51 6 A 5 6 323951 CASAVA_Build 21 20935493 1I ACAATCTTTC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 8 323952 CASAVA_Build 21 20936865 1D GTACAATAAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 8 323953 CASAVA_Build 21 20939130 1D ATTTTTTTTT C/- CTTACTATCC 3070 hom 120 het 45 0 39 6 C 2 1 323954 CASAVA_Build 21 20943828 1D AAATTGAGCT C/- CCTTAATATA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 C 3 2 323955 CASAVA_Build 21 20944451 1I GTGTGTGGAA -/G GCAGGGAATA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 1 2 323956 CASAVA_Build 21 20945420 1I TATACTATTC -/A AAAAAATTTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 6 7 323957 CASAVA_Build 21 20945514 1I14M1I TTTGGTTTTA -TTTACAAAATTTGG-/TTTTACAAAATTTGGT TTGGTAATTA 3070 hom 84 het 28 0 29 2 N/A 0 0 323958 CASAVA_Build 21 20954898 5D AATCAATCAA TAAAG/----- TAAGGAGTAG 3070 hom 105 het 42 0 36 7 TAAAG 1 0 323959 CASAVA_Build 21 20965892 1D CATAGCAACT G/- GAATCAGTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 2 1 323960 CASAVA_Build 21 20975843 1D TTGATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 14 1 8 5 T 13 12 323961 CASAVA_Build 21 20982908 1I18M1I GAGTAGATTT -GGGACTGCTTGCTCTAGA-/GGGGACTGCTTGCTCTAGAT TTATTAAAAT 3070 hom 114 het 36 0 39 2 N/A 0 0 323962 CASAVA_Build 21 20987675 1D CTTAAACCAG A/- AGGGATGGGA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 2 1 323963 CASAVA_Build 21 20994933 2D AACATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 25 hom 24 1 16 8 TA 10 9 323964 CASAVA_Build 21 21002240 1D TCCTGGCTTT A/- AATGGCCTTT 3070 hom 132 het 48 0 44 4 A 3 2 323965 CASAVA_Build 21 21003766 1D ACACTCATTA G/- GGAAACATTT 3070 hom 39 het 14 0 14 1 G 3 2 323966 CASAVA_Build 21 21010910 1I34M1I TCAATGGAGG -CAGTGATTGCAACTATAGAGCTTTGTTGATTGGT-/ACAGTGATTGCAACTATAGAGCTTTGTTGATTGGTG GGCCATATTC 3070 hom 120 het 46 0 40 11 N/A 0 0 323967 CASAVA_Build 21 21011018 1D15M1I38M1D AATAAAGCCC TTGGAGGAGACACCCA-GGCAAGGCAGCTAATAGACAATGGTTCACATGCATGTAT/-TGGAGGAGACACCCAGGGCAAGGCAGCTAATAGACAATGGTTCACATGCATGTA- TTGTCCAGAA 3070 hom 113 het 29 0 36 4 N/A 0 0 323968 CASAVA_Build 21 21011159 1D GTTGGGGGAA G/- GGCCTCAGAG 3070 hom 79 het 33 0 29 4 G 3 2 323969 CASAVA_Build 21 21013157 1D ACTTCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 485 het 485 ref 33 24 2 7 A 11 10 323970 CASAVA_Build 21 21014078 1I CCTACAAAGA -/T TGCACTTGAA 3070 hom 123 het 49 0 40 9 T 1 2 323971 CASAVA_Build 21 21015159 1D TGGTCACCAG A/- AAAGACCAAT 3070 hom 101 het 37 0 31 6 A 4 3 323972 CASAVA_Build 21 21016933 1D CATTCAGTCT C/- CCAGAATATA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 3 2 323973 CASAVA_Build 21 21035150 1D CTGAAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 44 1 32 12 T 12 11 323974 CASAVA_Build 21 21036840 1D GAGCACACTA G/- GGGAGATGAG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 G 4 3 323975 CASAVA_Build 21 21038678 1I ATGTATTTCC -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 7 8 323976 CASAVA_Build 21 21042737 1I GATAATATTG -/T TTGCAGACTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 3 323977 CASAVA_Build 21 21043783 1I TAAGAATATA -/T TTTTAGTATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 4 5 323978 CASAVA_Build 21 21044054 1D TCTCTCCTCC T/- TTTCAAGCAT 3070 hom 80 het 35 0 27 8 T 4 3 323979 CASAVA_Build 21 21045334 3D GGCCATCTGT TAA/--- TAAATTCTCA 3070 hom 63 het 23 0 22 2 TAA 2 1 323980 CASAVA_Build 21 21046272 1D GAAAGATTCT C/- AACATGATTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 1 0 323981 CASAVA_Build 21 21051807 1D CAATTGCACA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 123 het 43 0 41 3 T 7 6 323982 CASAVA_Build 21 21052768 1I ATTTTTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 268 hom 22 1 15 6 T 13 14 323983 CASAVA_Build 21 21053407 2D ATCTTATGTG TA/-- TATATATGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TA 4 3 323984 CASAVA_Build 21 21054501 1D AAATATAAAG A/- AAAAAACGGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 6 323985 CASAVA_Build 21 21056121 1D GGACACCAGA C/- CCCCCCCATA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 C 8 7 323986 CASAVA_Build 21 21066858 1I ACTGCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 13 0 9 4 A 14 15 323987 CASAVA_Build 21 21071065 1D AAAAGAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 41 2 26 13 T 15 14 323988 CASAVA_Build 21 21080348 1I TTCATATCTG -/A ATTTGTCAAT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 A 1 2 323989 CASAVA_Build 21 21081972 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 31 0 26 5 A 12 11 323990 CASAVA_Build 21 21122416 1I GCCTTCCTTC -/A CCTTGCCAAA 3070 het 3070 hom 50 23 20 7 A 0 1 323991 CASAVA_Build 21 21126016 8D ATTAAAAGAT AGAGACTG/-------- AGAAACACAA 3070 het 3070 ref 40 28 11 4 AGAGACTG 1 0 323992 CASAVA_Build 21 21126990 1D GCTTTCCTTC A/- AAAAAAACTC 2982 het 2982 ref 23 12 8 3 A 8 7 323993 CASAVA_Build 21 21140075 1D CCGCCACCAC A/- GACCAGCTAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 1 0 323994 CASAVA_Build 21 21145413 1I ATAAAATCTT -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 A 7 8 323995 CASAVA_Build 21 21153208 1D GAGATATTCC A/- AAAAAGTGAA 3070 het 3070 hom 43 13 18 12 A 6 5 323996 CASAVA_Build 21 21163016 2D CATGCACGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 CA 10 9 323997 CASAVA_Build 21 21164399 1I TCTTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2305 hom 25 8 11 6 T 10 11 323998 CASAVA_Build 21 21179148 1D TGAGAATGGA G/- GGGGGCAACA 3070 het 3070 ref 61 32 24 6 G 6 5 323999 CASAVA_Build 21 21180683 1D GGTAGAATGA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 43 25 9 9 T 9 8 324000 CASAVA_Build 21 21184992 4I TCCATACTCT ----/CAAA CAAACACTTC 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 CAAA 1 2 324001 CASAVA_Build 21 21185740 1D TTGTAATTGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 8 7 324002 CASAVA_Build 21 21189869 1I GGTATATCTG -/T TTATTTCTAA 3070 hom 116 het 47 0 39 8 T 2 3 324003 CASAVA_Build 21 21193562 1I ACAAGTTGAT -/G GGGTTACACC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 3 4 324004 CASAVA_Build 21 21194169 2I GAGTGTGTGG --/GT GTGTGTGTGT 2642 het 2642 ref 29 15 7 7 GT 6 7 324005 CASAVA_Build 21 21196256 1D TTTTTATAAT C/- CTACTTTTAC 2490 het 756 hom 19 6 7 6 C 2 1 324006 CASAVA_Build 21 21196325 1I TTATTAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2231 hom 17 5 10 2 T 10 11 324007 CASAVA_Build 21 21197690 2D GCCAGATGTT AA/-- AAAAAAAGTT 3070 het 84 hom 33 3 19 11 A 9 7 324008 CASAVA_Build 21 21203449 1I AAAATTATGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 7 8 324009 CASAVA_Build 21 21214852 3D AAGTATGGTA GTT/--- GTTGAAGAAA 3070 het 3070 ref 48 27 21 1 GTT 2 1 324010 CASAVA_Build 21 21215112 1D CATTAGGTAT A/- TCTCCTAATG 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 1 0 324011 CASAVA_Build 21 21215308 1I CTACAAAGGA -/C ATGAACTCAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 C 0 1 324012 CASAVA_Build 21 21229464 1I GCACTTACCT -/C CCCGGGAGAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 C 3 4 324013 CASAVA_Build 21 21239553 3D ATTTTTTAAA AAT/--- AATAATAATC 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 AAT 4 3 324014 CASAVA_Build 21 21249366 1I TATGTTGTCC -/T TTTTTTTTTT 1631 het 408 hom 29 4 8 17 T 17 18 324015 CASAVA_Build 21 21264792 1I ACCACAGTTA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 T 7 8 324016 CASAVA_Build 21 21266304 1D TTAGAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2434 hom 27 7 13 8 A 12 11 324017 CASAVA_Build 21 21270749 1D AAATTCTGCC A/- AAAAAAAAAA 2589 het 2589 ref 37 15 9 14 A 15 14 324018 CASAVA_Build 21 21276020 1D56M1D ATGTGCCTTT AAAAAGGATCTTTTTGGGTGGAAAATATTCGATGAATTTTTAAGCTTTCTGTATCTGA/-AAAAGGATCTTTTTGGGTGGAAAATATTCGATGAATTTTTAAGCTTTCTGTATCTG- AAAGTCTGCT 3070 hom 96 het 35 0 32 18 N/A 0 0 324019 CASAVA_Build 21 21276447 3I ATATATATAT ---/GGA AGTTCTAACT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 GGA 0 1 324020 CASAVA_Build 21 21277429 1D GCTTCACTTT C/- CCTCTTCCTG 3070 hom 114 het 42 0 38 5 C 3 2 324021 CASAVA_Build 21 21278711 1D TACCCCAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 321 hom 31 1 19 12 A 12 11 324022 CASAVA_Build 21 21283004 2D CCAAAAGTTG TA/-- TGTTAAAACT 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 TA 1 0 324023 CASAVA_Build 21 21284419 1I ACAGGGAATC -/A AAGAAGTAGC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 2 3 324024 CASAVA_Build 21 21285232 1D AGTGGGACTT G/- CCTGGATCCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 1 0 324025 CASAVA_Build 21 21289579 2D CTTCCCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 66 het 32 0 22 11 TC 10 9 324026 CASAVA_Build 21 21296676 1I TGAGGCTAGT -/A ACCAAGCTGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 1 2 324027 CASAVA_Build 21 21302357 1I GCTTTTGATT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 A 7 8 324028 CASAVA_Build 21 21305343 1I CTCTGCAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 T 9 10 324029 CASAVA_Build 21 21307970 3D ACTGCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 10 6 A 13 10 324030 CASAVA_Build 21 21310618 4D AACTTTTGAG ATTA/---- ATTATCTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 30 1 ATTA 2 1 324031 CASAVA_Build 21 21311403 1D CACTAGGTTA G/- AGAGATCTAG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 G 1 0 324032 CASAVA_Build 21 21313036 3I AATATTTAGA ---/GAG GAGCTTTCCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GAG 1 2 324033 CASAVA_Build 21 21319822 1D TCTCCTATGT A/- CCCAGGAATT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 A 1 0 324034 CASAVA_Build 21 21320982 1D TTTATTTTCA C/- CCATTTTCTT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 3 2 324035 CASAVA_Build 21 21326374 3D TAACTCTATA AAT/--- AATATTTTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAT 2 1 324036 CASAVA_Build 21 21327139 13D CTTTCTTTTT TTTTTTTTTTTTG/------------- AGACAGAGTT 1276 het 94 hom 14 1 5 9 TTTTTTTTTTTTG 1 0 324037 CASAVA_Build 21 21328242 1I GATAGGCAAA -/G GGGGGGGGGG 2922 het 2921 ref 27 10 8 9 G 10 11 324038 CASAVA_Build 21 21329043 1I TTATTTGCAG -/A AAGTATAGTA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 2 3 324039 CASAVA_Build 21 21332327 1D TTTCTGCTGC T/- ACTGTTAACT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 1 0 324040 CASAVA_Build 21 21338992 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAATAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 5 6 324041 CASAVA_Build 21 21341237 2D33M1D3M1D CAGCTTATTT TCCTTTTTTTTGAGAGGGGTGTGTGACATCACTTGTGTTG/--CCTTTTTTTGAAAGGGGTTTGTGACATCACTTG-GTT- TGTACGAGTT 3070 hom 96 het 31 0 33 3 N/A 0 0 324042 CASAVA_Build 21 21343676 1D AAAGAGCATG A/- AAAATTAGAG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 5 4 324043 CASAVA_Build 21 21345452 4D GTCCCCATGA AGCT/---- AGCTAGCCAA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 AGCT 2 1 324044 CASAVA_Build 21 21348134 1D TAAGCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 19 1 16 2 T 11 10 324045 CASAVA_Build 21 21352400 1D15M1D AAGGGCAAAG AAAAAAAACAAGATATA/-AAAAAAACAAGATAT- AAACAGCAGT 3070 hom 111 het 32 0 38 1 N/A 0 0 324046 CASAVA_Build 21 21372259 1I TATTATACTG -/T GGATATAGCT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 0 1 324047 CASAVA_Build 21 21375835 1D CCAAAACTAC A/- AAACGTAGCC 3070 hom 51 het 19 0 17 7 A 4 3 324048 CASAVA_Build 21 21377590 15D ATCTAGACCC AAGCTGAACACTATA/--------------- AATCATCTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 6 AAGCTGAACACTATA 1 0 324049 CASAVA_Build 21 21384176 1D ACAACAAATA C/- GGTAGGGATG 3070 hom 153 het 55 0 49 7 C 1 0 324050 CASAVA_Build 21 21386867 1D AATACGCTAG A/- AAAATCTAGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 5 4 324051 CASAVA_Build 21 21387203 1D7M2D10M1D TCTCATGAGC TTTCATAAACTTTCGTCAAAC/-TTCATAA--CTTCGTCAAA- CCCAAAGAGA 3070 hom 66 het 24 0 23 5 N/A 0 0 324052 CASAVA_Build 21 21390895 2D TTCTTTACTC TT/-- TTAATATCAT 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 4 2 324053 CASAVA_Build 21 21393646 1D ATCATGATGG A/- AAGGCCCCTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 3 2 324054 CASAVA_Build 21 21395225 1D TGAGGACACA C/- CTGTGTATGT 3070 hom 105 het 46 0 36 12 C 2 1 324055 CASAVA_Build 21 21396863 1I ATGATTTTTT -/A AAAATTAATG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 4 5 324056 CASAVA_Build 21 21397433 1I ATAGTATTTA -/T GGTTAGTCAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 0 1 324057 CASAVA_Build 21 21397671 1D TATGTACTGG A/- AGAAATATGT 3070 hom 93 het 37 0 32 7 A 2 1 324058 CASAVA_Build 21 21399954 1I CTCTAAAGCC -/A ATCTGCAAAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 324059 CASAVA_Build 21 21400504 1D TCTCAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 23 0 16 7 A 15 14 324060 CASAVA_Build 21 21407317 1I TATAGCTTTC -/A GGGGTTCTGT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 0 1 324061 CASAVA_Build 21 21409021 1I CTGACTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 0 1 324062 CASAVA_Build 21 21411503 1I ATACACTATC -/T GGTATATTCA 3070 hom 87 het 44 0 29 15 T 0 1 324063 CASAVA_Build 21 21413759 2I GAAAATGTAT --/AC CAACTAATTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AC 0 1 324064 CASAVA_Build 21 21416361 1I CCTTTTAACC -/A GAGGAATTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 0 1 324065 CASAVA_Build 21 21417358 1D CTGATGTGGG C/- CGGATCATGA 3070 hom 74 het 28 0 24 4 C 2 1 324066 CASAVA_Build 21 21418278 1D CTCATGATCC G/- GCCCACCTCG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 2 1 324067 CASAVA_Build 21 21422434 1D TTTGTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 40 1 35 5 T 12 11 324068 CASAVA_Build 21 21424924 1D AAATTACCAA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 9 8 324069 CASAVA_Build 21 21426584 1I CTGTAAAGTC -/T TTTTTTTTTT 2030 het 281 hom 33 1 6 26 T 10 11 324070 CASAVA_Build 21 21426996 1I ATAATGAATA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 6 7 324071 CASAVA_Build 21 21428900 1D TATTGCAGCC T/- TTTTTTTTTT 2210 hom 24 het 26 0 8 19 T 15 14 324072 CASAVA_Build 21 21430129 1I CCATGTATTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 53 21 22 11 A 8 9 324073 CASAVA_Build 21 21431091 1D AAATAATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 526 hom 34 3 17 14 T 12 11 324074 CASAVA_Build 21 21432032 2I CGTCACTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 10 12 324075 CASAVA_Build 21 21432127 2I AGGTGACACT --/GC GGATTTGTGT 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 GC 0 1 324076 CASAVA_Build 21 21432657 4I GCTACATCTC ----/TATT TAGTGTATTT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 TATT 0 1 324077 CASAVA_Build 21 21433980 4I AATGTATGAA ----/TATT TAGTTCTATG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TATT 0 1 324078 CASAVA_Build 21 21434947 1I TTTTCAACAA -/T TTTAATATGT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 3 4 324079 CASAVA_Build 21 21438796 1D AATGTCTGTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 468 hom 32 4 14 14 T 9 8 324080 CASAVA_Build 21 21439289 1I TACATCAAAG -/C CATTTTATTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 C 1 2 324081 CASAVA_Build 21 21439569 1D TAGCTAATTT G/- AAATTGAGTA 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 G 1 0 324082 CASAVA_Build 21 21441489 1I ACAACATGCT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 A 8 9 324083 CASAVA_Build 21 21441992 2I AATTTATTGA --/AT ATATATATAT 3041 het 2901 hom 16 8 7 1 AT 5 6 324084 CASAVA_Build 21 21445172 1D TAAAAATATA T/- ATATATTTTT 3070 het 2993 hom 20 7 10 3 T 1 0 324085 CASAVA_Build 21 21447486 1D TTAAATGTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 T 10 9 324086 CASAVA_Build 21 21451241 1I TTCCTACAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 20 8 9 T 9 10 324087 CASAVA_Build 21 21462877 5D TAAAACACAT TACTA/----- TATTAATACT 3070 het 3070 hom 25 12 11 4 TACTA 1 0 324088 CASAVA_Build 21 21465024 1D TGTTCCTAGA G/- GGGGGAAGGC 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 G 6 5 324089 CASAVA_Build 21 21465139 1I ATTGATTGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 A 9 10 324090 CASAVA_Build 21 21466038 1I CAACAGAATT -/A TTTTTTTTCG 3070 hom 58 het 29 0 25 4 A 0 1 324091 CASAVA_Build 21 21471556 1I TATTTATTCA -/T TATCTTTAAA 1716 hom 21 het 26 0 8 18 T 1 2 324092 CASAVA_Build 21 21480153 1D CAAAGTGAGG A/- AAGCAGATTG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 3 2 324093 CASAVA_Build 21 21494923 1D AAATAGGTCT A/- AATTAATGGG 3070 hom 8 het 21 0 8 13 A 3 2 324094 CASAVA_Build 21 21501680 1I4M1D61M1I ACTGTAACAC -AGAGAAACAAAACAGGAATGTAAACTATTTGAACTAAGGTGTAAGTTGGGGCTTTCCCACAGAGAA-/AAGAG-AACAAAACAGGAATGTAAACTATTTGAACTAAGGTGTAAGTTGGGGCTTTCCCACAGAGAAT TTAATAAGGT 3070 hom 126 het 28 0 43 4 N/A 0 0 324095 CASAVA_Build 21 21503886 4D AAGCTCTGAT TGTC/---- TGCTCTGTGT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 TGTC 1 0 324096 CASAVA_Build 21 21509935 4D ATAAATAAAT AAAC/---- AGAGTAAACG 3070 het 3070 hom 36 13 22 2 AAAC 1 0 324097 CASAVA_Build 21 21511506 1D CCCAGAGCAC T/- GAAGTCCAAA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 1 0 324098 CASAVA_Build 21 21514252 1D TCAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 A 10 9 324099 CASAVA_Build 21 21515546 2D5M2D10M1D12M1D13M1D CAGAAGTGAT TCTCACCCAAATTTTCCCAGGGAAGTCATGTGAAAAAGACAAGATAG/--TCACC--AAATTTCCCA-GGAAGTCATGTG-AAAAGACAAGATA- GGCTGAAAGC 3070 hom 75 het 30 0 26 5 N/A 0 0 324100 CASAVA_Build 21 21515653 1I12M1I6M1I AAGGAGAGTT -TTGGAGGAAACT-AAAATG-/ATTGGAGGAAACTAAAAATGT TACTCCATTT 3070 hom 72 het 25 0 25 4 N/A 0 0 324101 CASAVA_Build 21 21515774 1D TGGTAATATT C/- CCCTTAAGCC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 4 3 324102 CASAVA_Build 21 21526218 1I CCTAACTCAG -/A ACCACCCCTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 A 1 2 324103 CASAVA_Build 21 21530354 4D TTATCCAAGC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 43 17 16 10 AAAT 4 3 324104 CASAVA_Build 21 21530491 1D AATTGTGTCA T/- TTTTCCCTCT 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 T 5 4 324105 CASAVA_Build 21 21532744 1I5M1I ACAGTGAACA -TTTAG-/TTTTAGT TTTGGGGGGA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 N/A 0 0 324106 CASAVA_Build 21 21532819 1I GCCAATACTC -/T TTTTCTTCTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 4 5 324107 CASAVA_Build 21 21534564 2D CTAAAATGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2963 hom 35 10 16 11 A 13 11 324108 CASAVA_Build 21 21535502 1I32M1I TTTATCAATG -AAAAAATCCTTGTCTAAATTATTCTAAATGAG-/AAAAAAATCCTTGTCTAAATTATTCTAAATGAGA AAAACATACA 3070 hom 147 het 41 0 49 7 N/A 0 0 324109 CASAVA_Build 21 21535927 1I7M1I ACATAATCTG -AGTTTGG-/TAGTTTGGT ACAAAAGGCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 N/A 0 0 324110 CASAVA_Build 21 21536352 1I ACTAAAAAAG -/A AAACCTCCCT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 3 4 324111 CASAVA_Build 21 21536445 3I GTGATACAAC ---/GTA ATGCTTTGAT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 GTA 0 1 324112 CASAVA_Build 21 21537229 1D AAGGTTTCAT A/- AAATAATTAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 4 3 324113 CASAVA_Build 21 21540050 3I TAAGGAAGAT ---/AAG GAGGATAAGG 3070 hom 159 het 62 0 52 10 AAG 0 1 324114 CASAVA_Build 21 21541217 1I TAATATGTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 236 hom 27 1 20 6 A 8 9 324115 CASAVA_Build 21 21542314 1I TACATGTATA -/T TGGAATTCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 324116 CASAVA_Build 21 21543890 1D TGTTTAAGTA T/- TTTTTGTCTG 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 6 5 324117 CASAVA_Build 21 21546478 1D ACAAGATAAC A/- AATGTGTATC 3070 hom 48 het 22 0 17 6 A 3 2 324118 CASAVA_Build 21 21553651 1D GCCCCTTCTC T/- TGAGACCTCA 3070 hom 138 het 49 0 42 7 T 2 1 324119 CASAVA_Build 21 21558934 28D CATAAGTGTG TATATATATACATATATATATATTCCAC/---------------------------- TATATATATA 3070 het 2832 hom 25 6 8 19 TATATATATACATATATATATATTCCAC 2 1 324120 CASAVA_Build 21 21566700 4D CGCGCGCGCG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 83 het 32 0 26 9 CA 12 10 324121 CASAVA_Build 21 21568256 1D CTTGGGAGGC T/- TGAGGCAGGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 2 1 324122 CASAVA_Build 21 21578281 1D TGTTACATAA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 8 7 324123 CASAVA_Build 21 21585201 1I43M1I TAATCAAGCC -ACAGATAGGGAAAAAAGCAGTACACATTGGAACAGGCCCAAAG-/AACAGATAGGGAAAAAAGCAGTACACATTGGAACAGGCCCAAAGA GTAAACAATA 3070 hom 93 het 39 0 32 26 N/A 0 0 324124 CASAVA_Build 21 21586090 1D TTCTTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 2862 het 2862 ref 37 21 6 10 A 11 10 324125 CASAVA_Build 21 21587480 2D GGTGATCTAA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 9 17 10 T 11 9 324126 CASAVA_Build 21 21589446 1I TACTCTTTTG -/T TTCACCAATT 3070 hom 99 het 38 0 34 7 T 2 3 324127 CASAVA_Build 21 21590634 4D ATCCAAGCAC CTAA/---- CTGTGATTGA 3070 het 3070 hom 44 13 28 6 CTAA 1 0 324128 CASAVA_Build 21 21591926 1I TGTACTACTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 9 10 324129 CASAVA_Build 21 21592574 1D TACAATATAT A/- AATTTACCCA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 3 2 324130 CASAVA_Build 21 21594353 1D CCCTATTCTT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 8 7 324131 CASAVA_Build 21 21594726 1I11M1I ACTCCATTCC -ACAGCCTCTTT-/AACAGCCTCTTTA ACAATGTACC 3070 hom 60 het 22 0 21 2 N/A 0 0 324132 CASAVA_Build 21 21594971 3I TCATAATTAT ---/TAC TACTTAGTTT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 TAC 1 2 324133 CASAVA_Build 21 21595562 2D12M2D GTTTGGGGTC TTTTTTTTTTTCTATT/--TTTTTTTTTCTA-- TTTTTTTTTT 1817 het 237 hom 13 2 5 7 N/A 0 0 324134 CASAVA_Build 21 21598520 1D GTTTGTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 10 9 324135 CASAVA_Build 21 21599791 1D AATTACTGAG T/- TTTTTTTATC 3070 hom 84 het 39 0 36 3 T 8 7 324136 CASAVA_Build 21 21601260 1I ACAGTTGTGG -/T TTTTTTAATC 3070 hom 123 het 49 0 41 8 T 6 7 324137 CASAVA_Build 21 21604035 1I CACCTCATTT -/C CCCCCCATAT 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 C 6 7 324138 CASAVA_Build 21 21605975 1D ACATTTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 29 13 12 5 A 8 7 324139 CASAVA_Build 21 21606765 1D26M1D CAGGAAAAAG AAAAAAAAACTTAATGTTGATATATTTC/-AAAAAAAACTTAATGTTGATATATTT- CTATTTACAG 3070 het 2186 hom 31 8 12 18 N/A 0 0 324140 CASAVA_Build 21 21611742 1I TAATTAATTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 8 9 324141 CASAVA_Build 21 21615590 1D TTTGCTGTGC A/- AAAGCTGTTT 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 A 4 3 324142 CASAVA_Build 21 21618753 1D GAACAGTATT G/- GGGATCTTAA 3070 hom 118 het 41 0 39 2 G 4 3 324143 CASAVA_Build 21 21619192 3I CTCATCAAAT ---/GAG GAAATTCTGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GAG 0 1 324144 CASAVA_Build 21 21621065 1I CTTGTATCTG -/T ACATATAGAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 1 324145 CASAVA_Build 21 21622825 5D ATATATCCTT ATAAA/----- ATAAACAATA 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 ATAAA 2 1 324146 CASAVA_Build 21 21631500 5D AAAATTTTAC ATGTT/----- ATGTTATTGT 3070 het 3070 ref 41 22 18 2 ATGTT 2 1 324147 CASAVA_Build 21 21642806 1I TTATATGGAA -/C CACAAAAGAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 1 2 324148 CASAVA_Build 21 21649032 1I GCACTAAATG -/A TTCTTTTAGG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 0 1 324149 CASAVA_Build 21 21660173 1D TTTAGGCAGG A/- AAAAAGGTGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 6 5 324150 CASAVA_Build 21 21663320 1D ACCTCCCATT C/- CCCTTGCCTG 3070 hom 45 het 30 0 14 16 C 4 3 324151 CASAVA_Build 21 21672367 1D AGGTACAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 T 12 11 324152 CASAVA_Build 21 21675578 1I TTATATTCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 T 8 9 324153 CASAVA_Build 21 21680976 1D AAGGAACTTT A/- GGAAATATTC 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 A 1 0 324154 CASAVA_Build 21 21681710 1I TATTCAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 A 10 11 324155 CASAVA_Build 21 21686011 1D GTACAAGTTA T/- TTTTATGATA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 T 5 4 324156 CASAVA_Build 21 21690353 2D AATCAGCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 14 14 A 13 11 324157 CASAVA_Build 21 21695489 1D TTCACCTCAC A/- ATACTCAGCC 3070 hom 111 het 40 0 37 4 A 2 1 324158 CASAVA_Build 21 21699901 1I TGCTAGGGAG -/T ACAATTTTGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 0 1 324159 CASAVA_Build 21 21707846 1D CATGATGTAT A/- AAAAGGTCTA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 A 5 4 324160 CASAVA_Build 21 21712298 2D ATATATATAC AT/-- GTATACATAA 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 AT 1 0 324161 CASAVA_Build 21 21715544 1I34M1I AAAATTAAAG -TTTTCATCAAAGCTGAGTTAGAAAATATTGGAAA-/TTTTTCATCAAAGCTGAGTTAGAAAATATTGGAAAT TTTTTTGAAT 3070 hom 60 het 21 0 21 4 N/A 0 0 324162 CASAVA_Build 21 21719837 1I GTATAAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 A 10 11 324163 CASAVA_Build 21 21725364 1I TCCCTCTCTG -/A AAAAAAAATT 2928 het 2928 ref 18 8 6 4 A 8 9 324164 CASAVA_Build 21 21730951 1I CAGAAGCAAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 9 10 324165 CASAVA_Build 21 21731120 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 T 11 10 324166 CASAVA_Build 21 21735953 1D CCAGGCAGAG T/- TAAGCTGCTA 3070 het 3070 hom 50 21 25 5 T 2 1 324167 CASAVA_Build 21 21744618 1D CACTGAAGCC T/- TCCAAAACCT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 T 2 1 324168 CASAVA_Build 21 21755124 1D TCACCTGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 A 12 11 324169 CASAVA_Build 21 21758838 1D AGGCTTTACA T/- TCTTAAAGAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 2 1 324170 CASAVA_Build 21 21763565 4I TAGAGTGACA ----/CTAT CTATGGACAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 CTAT 1 2 324171 CASAVA_Build 21 21776974 4I TTTTCATTTT ----/TTAA TTCTTATTAA 3070 het 3070 hom 21 7 10 4 TTAA 0 1 324172 CASAVA_Build 21 21782475 1I ACCATTATAA -/T TTAATTATAA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 2 3 324173 CASAVA_Build 21 21784128 5I ATTCCTTCTA -----/CATGT TATACTTACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CATGT 0 1 324174 CASAVA_Build 21 21789100 1I TTTTAGCCAA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 137 hom 24 1 16 7 T 7 8 324175 CASAVA_Build 21 21794733 1D TTCATTTTCC T/- TTTTTTCTAC 3070 het 3070 ref 33 18 15 0 T 7 6 324176 CASAVA_Build 21 21795810 1D TTAATGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 31 1 17 13 T 13 12 324177 CASAVA_Build 21 21798640 1I CCTAAGTAAT -/A AAACCATGAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 3 4 324178 CASAVA_Build 21 21804793 1D TATAGACACA T/- TTTGTCTTGG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 4 3 324179 CASAVA_Build 21 21804945 1D ATATTTCTGC A/- TTTTTTGCTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 0 324180 CASAVA_Build 21 21813779 1I TTTGTCCACC -/A ACACCTCTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 2 324181 CASAVA_Build 21 21818110 2D ACAAATATAG TA/-- TATATATTAA 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 TA 4 3 324182 CASAVA_Build 21 21825733 1I9M1I TTAGGTCTGA -ACACCTCCC-/TACACCTCCCT TTAAACATTA 3070 hom 75 het 29 0 26 7 N/A 0 0 324183 CASAVA_Build 21 21826114 1I9M1D GAACCCAGGA -GCGGAGCTTG/GGCGGAGCTT- GCAGTGAGCC 2603 hom 30 het 11 0 10 3 N/A 0 0 324184 CASAVA_Build 21 21826185 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 2328 het 2328 ref 15 8 6 1 A 9 10 324185 CASAVA_Build 21 21831813 4D GTTTTTACTC TCTT/---- TTAGATCTTT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 TCTT 1 0 324186 CASAVA_Build 21 21832516 1I AAAAAAAACG -/T TGAGCTACAT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 1 2 324187 CASAVA_Build 21 21835317 4D ATTAATCAAA TTAT/---- TTATTTGTGT 3070 het 3070 hom 28 11 13 7 TTAT 2 1 324188 CASAVA_Build 21 21835595 5D TACTGTATAA TTTAC/----- TTTAATTCAT 3070 het 3070 hom 21 10 11 1 TTTAC 1 0 324189 CASAVA_Build 21 21837206 1D AGGTTTTTTT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 A 9 8 324190 CASAVA_Build 21 21846350 4D ACATAATCTG TTGT/---- TTAAGTTATC 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 TTGT 1 0 324191 CASAVA_Build 21 21850575 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 36 0 26 10 T 11 10 324192 CASAVA_Build 21 21862112 1D AGTAAATACC T/- TTTTGGAAAG 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 T 5 4 324193 CASAVA_Build 21 21862578 1D GGACCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1055 het 1055 ref 32 16 4 12 A 17 16 324194 CASAVA_Build 21 21862962 1I AAATACAGTG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 7 8 324195 CASAVA_Build 21 21868627 1I GGTTAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 11 12 324196 CASAVA_Build 21 21886521 1D AAACAAATAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 A 10 9 324197 CASAVA_Build 21 21897825 1I TTACCACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 10 11 324198 CASAVA_Build 21 21902940 9I TACACAAGAC ---------/TTTTTTTTT TTTATTTGAT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 T 3 12 324199 CASAVA_Build 21 21903042 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAGGG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 8 324200 CASAVA_Build 21 21906183 1D TACAAAGTTG T/- TTAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 3 2 324201 CASAVA_Build 21 21908725 2I GTTCAATGAC --/TG TGTTCTTACT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TG 1 2 324202 CASAVA_Build 21 21909111 1D GATACAGTCG T/- TTGCTCCCCT 3070 hom 93 het 39 0 32 8 T 3 2 324203 CASAVA_Build 21 21909745 1D CAGAATTTAT C/- CCCTGTGGAT 3070 het 3070 ref 37 20 11 7 C 4 3 324204 CASAVA_Build 21 21912663 2I GTGACTTATT --/TG TGTACTGCTA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 TG 1 2 324205 CASAVA_Build 21 21915457 1D ATTTCAGTGA C/- TTTTCCAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 C 1 0 324206 CASAVA_Build 21 21930846 4I TTAATTTAAC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 ATTT 4 5 324207 CASAVA_Build 21 21933665 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 17 0 12 5 A 13 14 324208 CASAVA_Build 21 21935488 1D TTTGCTGTTT A/- AAAATGTTCC 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 A 5 4 324209 CASAVA_Build 21 21935882 1D TATAATTTGG A/- AATCTTGTGG 3070 het 3070 ref 40 24 10 6 A 3 2 324210 CASAVA_Build 21 21942311 1I TTTAGAAAAT -/A AAATATTTTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 3 4 324211 CASAVA_Build 21 21946907 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 2453 het 1270 hom 13 7 6 0 A 8 7 324212 CASAVA_Build 21 21950734 1I TTTTGTACAT -/C CATATATCTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 C 1 2 324213 CASAVA_Build 21 21966533 1I TGAGAGTTTC -/T TGTATTAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 324214 CASAVA_Build 21 21971640 4D TCAGAACCAG AAGA/---- AAGAGACAGG 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 AAGA 2 1 324215 CASAVA_Build 21 21972451 1D GATGGTAGAA C/- AATTTATATT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 C 1 0 324216 CASAVA_Build 21 21978004 1I TATTTTTCTC -/T ATGGAGATGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 324217 CASAVA_Build 21 21980717 1D AACTATATCA T/- TGATCAAAGC 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 2 1 324218 CASAVA_Build 21 21983609 1D TCTGAGATGC T/- TTTTTGTCAT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 T 6 5 324219 CASAVA_Build 21 21984156 1I ACTATTATTA -/T TTTTATTAAT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 4 5 324220 CASAVA_Build 21 21986776 1I TTTTCCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 942 hom 35 3 27 5 T 13 14 324221 CASAVA_Build 21 21992413 2I TTTTTTTTTT --/TC TTTTTTTTAA 3070 het 1592 hom 31 13 14 4 TC 0 1 324222 CASAVA_Build 21 21995806 1D TTAAATGTTA G/- GGTTTTATTT 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 G 3 2 324223 CASAVA_Build 21 21996249 1D CTAATTTTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 10 9 324224 CASAVA_Build 21 21997212 3D AGCATAATTT ATC/--- ATCATCATCA 3070 hom 135 het 53 0 46 7 ATC 6 5 324225 CASAVA_Build 21 21998779 1D GACTTTGATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 A 10 9 324226 CASAVA_Build 21 22004829 1I AAATTTGAAA -/T TTGCTCTCTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 2 3 324227 CASAVA_Build 21 22006877 1I TGACTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3069 het 3069 ref 35 18 10 7 A 12 13 324228 CASAVA_Build 21 22008780 1D ACATTCGGTA T/- TTTGTTGCTC 3070 het 3070 ref 51 24 22 6 T 4 3 324229 CASAVA_Build 21 22012631 1I GTGTATAGTG -/T AGTATAGTAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 324230 CASAVA_Build 21 22014104 1I TTAGTCTTAA -/T TTTTTTTTTT 1398 het 1398 ref 52 43 4 5 T 11 12 324231 CASAVA_Build 21 22019295 1I CATTAATGTA -/T ACAGGTAATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 1 324232 CASAVA_Build 21 22028126 5D CATTTGTCTC AAGAT/----- AATTGTATTG 3070 het 3070 ref 40 21 15 6 AAGAT 1 0 324233 CASAVA_Build 21 22031019 1I TGCCCAGATA -/T TTTTAAAACT 3070 het 3070 hom 42 12 20 10 T 4 5 324234 CASAVA_Build 21 22033084 1I GACAATGGTG -/T TGTCAATGTA 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 T 1 2 324235 CASAVA_Build 21 22034734 1D16M1D TGATACTTCT GGTTTTTATTGCCCGTTA/-GTTTTTATTGCCCGTT- AAATGTGGCC 3070 hom 75 het 26 0 26 1 N/A 0 0 324236 CASAVA_Build 21 22049868 1D ATTGTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 11 10 324237 CASAVA_Build 21 22056504 1D TCAAGGGGGG A/- AAAAGGAATA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 5 4 324238 CASAVA_Build 21 22060024 1D ACTCATAGAA G/- TAAAATAATA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 G 1 0 324239 CASAVA_Build 21 22073936 1D TTGTGGGGTG T/- TTACTCAAGA 3070 het 3070 ref 31 20 10 2 T 3 2 324240 CASAVA_Build 21 22078523 1I AAAAAGACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 9 10 324241 CASAVA_Build 21 22094309 1D TAAAATCAAC A/- ACCATGGATG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 2 1 324242 CASAVA_Build 21 22102537 1D GTACGGTGCT A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 A 7 6 324243 CASAVA_Build 21 22106816 1D TAGGATTACC A/- AAAAAGTCAT 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 A 6 5 324244 CASAVA_Build 21 22109222 2D TCTGCAAAAC AG/-- AGATATCAGT 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 AG 2 1 324245 CASAVA_Build 21 22109432 6D AATGATCAAA GCACAT/------ GCCTGAGTAT 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 GCACAT 1 0 324246 CASAVA_Build 21 22112547 1I AAAACAGTAG -/A AAAAAATGTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 6 7 324247 CASAVA_Build 21 22118288 1D AGCCAAACTA G/- AACAGCAGGA 3070 het 3070 hom 46 14 28 5 G 1 0 324248 CASAVA_Build 21 22119615 1I CCCAAAGTGC -/T TGGGATTACA 1901 het 1478 hom 14 4 5 5 T 1 2 324249 CASAVA_Build 21 22120101 1D CACTCATTAA T/- TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 T 7 6 324250 CASAVA_Build 21 22120191 1D CTTTTTATAA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 7 6 324251 CASAVA_Build 21 22125776 3D TGATGAGAGA TAT/--- TATTATGGTG 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 TAT 3 2 324252 CASAVA_Build 21 22132181 1I TTTCCCAGCA -/C CATTTATTAA 3070 hom 56 het 20 0 19 1 C 1 2 324253 CASAVA_Build 21 22136175 4I CCAAAAACAC ----/TTGA TTAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TTGA 0 1 324254 CASAVA_Build 21 22141905 4D AATCAGCTTC TTTG/---- TTTGCTTGAT 3070 het 3070 hom 38 18 19 6 TTTG 2 1 324255 CASAVA_Build 21 22143045 1I GACTTTCTTC -/T TTTCTTCCTA 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 3 4 324256 CASAVA_Build 21 22149389 1I TATGGCATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 10 11 324257 CASAVA_Build 21 22153848 1D CATGAACCAG T/- TTCTAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 3 2 324258 CASAVA_Build 21 22159083 1D TGAGATAAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 8 7 324259 CASAVA_Build 21 22163977 1I TTCTAATAGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 8 9 324260 CASAVA_Build 21 22172860 1D GGAGAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 12 11 324261 CASAVA_Build 21 22180357 1D ATTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2754 hom 43 10 18 16 T 15 14 324262 CASAVA_Build 21 22183464 5D TCTTCTTACT GTTGA/----- GTTATTTGAG 3070 het 3070 ref 44 21 20 6 GTTGA 1 0 324263 CASAVA_Build 21 22198934 5I ACATTTATCT -----/TATCA TGTTATATCA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TATCA 0 1 324264 CASAVA_Build 21 22203087 1I GTTAACATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 10 11 324265 CASAVA_Build 21 22205586 1D TCTCTGACAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 40 3 18 20 A 11 10 324266 CASAVA_Build 21 22207698 1I TTGGGAGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 A 10 11 324267 CASAVA_Build 21 22208908 1I AGAGAGGGGC -/A AAAGACGCAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 3 4 324268 CASAVA_Build 21 22214440 1D TATAGCCAGG A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 8 7 324269 CASAVA_Build 21 22215438 1D ATTAAGAACT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 A 9 8 324270 CASAVA_Build 21 22215913 1D TGCTGCGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2627 hom 40 9 20 12 A 11 10 324271 CASAVA_Build 21 22243080 1D TATGTTCTAC T/- TTTTTATTTT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 T 6 5 324272 CASAVA_Build 21 22243155 1I ACTACCAAAA -/G GGAATGGGAA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 G 2 3 324273 CASAVA_Build 21 22252118 2I TTTTCAAAAG --/AC AGTTTAAAAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AC 0 1 324274 CASAVA_Build 21 22254119 1D TCTTGTCTTC T/- AGCTTTCTTG 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 T 1 0 324275 CASAVA_Build 21 22256899 1I GATCTTTTGT -/A ACTTTAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 324276 CASAVA_Build 21 22266209 1D AGGGAATGAC T/- TTTTTTTTTG 2098 hom 48 het 34 0 16 18 T 10 9 324277 CASAVA_Build 21 22266359 4D GAGTCAGTTG TTGC/---- TTGCTACTTG 3070 hom 102 het 36 0 35 4 TTGC 2 1 324278 CASAVA_Build 21 22267754 1D AAATGCTAAT A/- AAAACATAAT 3070 hom 114 het 42 0 39 5 A 5 4 324279 CASAVA_Build 21 22268038 1D TCCTTAAAGG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 8 324280 CASAVA_Build 21 22268455 18D TAAATGTGTT GGAGCACAAAATGCAGAA/------------------ GGCTAATAAT 3070 het 3070 hom 36 13 21 6 GGAGCACAAAATGCAGAA 1 0 324281 CASAVA_Build 21 22269406 1D ATACAGCGAA C/- CTTAGTATTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 C 2 1 324282 CASAVA_Build 21 22269891 4D TGCCTAGAAG AATA/---- AATAAAGAGA 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 AATA 2 1 324283 CASAVA_Build 21 22273197 4I CGCAAAAAAC ----/TCAA TCAGTGTCAG 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 TCAA 0 1 324284 CASAVA_Build 21 22274833 7I CGAACAAAGT -------/AACAACA CTCAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AACAACA 0 1 324285 CASAVA_Build 21 22276521 1I TGCCTGTAAT -/C CCAGCACTTT 3070 het 3070 ref 20 8 9 3 C 2 3 324286 CASAVA_Build 21 22276785 2I AAAAAAAGAA --/AG AAAAAAGAAG 1385 het 1385 ref 20 7 9 4 AG 0 1 324287 CASAVA_Build 21 22283311 4I ATAAAAACGT ----/TAAA TAAATAAAGA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 TAAA 2 3 324288 CASAVA_Build 21 22290931 2D TTTGATGCAA TT/-- TTTTTAGATC 3070 het 3070 ref 41 27 11 4 T 7 5 324289 CASAVA_Build 21 22315993 2I AGCAATAAAC --/AT GTTATTTTGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AT 0 1 324290 CASAVA_Build 21 22321587 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2975 hom 27 het 11 0 10 1 A 16 14 324291 CASAVA_Build 21 22321707 2D CTTATAACAC AT/-- GTCAGGTTGC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 AT 1 0 324292 CASAVA_Build 21 22322277 2I ATTGATATAT --/AA AGGTGAGCTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 3 324293 CASAVA_Build 21 22322348 1I AATGAAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 612 hom 28 2 19 7 T 11 12 324294 CASAVA_Build 21 22339790 4D ACAGAAAGAC AATT/---- AACTGTAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AATT 1 0 324295 CASAVA_Build 21 22343354 3I TGTGAGTAAT ---/AAC AAATTTGAAA 3070 hom 137 het 54 0 47 7 AAC 0 1 324296 CASAVA_Build 21 22347509 8D AGGGGGAAAT AGGGAAAA/-------- AGGAAGGGAC 3070 het 3070 ref 35 20 13 7 AGGGAAAA 1 0 324297 CASAVA_Build 21 22348783 1I TAAGATGCTG -/T GACAAATGGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 0 1 324298 CASAVA_Build 21 22379993 1I GATGAAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 49 3 38 8 T 11 12 324299 CASAVA_Build 21 22401238 1D AATCAGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 10 324300 CASAVA_Build 21 22407341 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 18 1 13 4 A 16 15 324301 CASAVA_Build 21 22423085 4D GCAATTTTAG AAGA/---- AAGATCAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 4 AAGA 2 1 324302 CASAVA_Build 21 22424354 1D AGTCTAAGTC T/- TTCTGTATTT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 3 2 324303 CASAVA_Build 21 22429754 1I CTTCAGCTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 88 het 35 0 30 5 T 8 9 324304 CASAVA_Build 21 22431451 1I AAACAAAAAC -/A AAACAATAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 3 4 324305 CASAVA_Build 21 22432428 1D ATGATATAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 9 324306 CASAVA_Build 21 22433259 4I AGAAACACAT ----/GGGG GGGGGGGGTT 2089 hom 38 het 16 0 9 7 G 8 12 324307 CASAVA_Build 21 22434631 1D AAGGTTATAA C/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 C 1 0 324308 CASAVA_Build 21 22456542 1I ATATCTGTAG -/A AAAAAATTTA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 6 7 324309 CASAVA_Build 21 22467672 2D TTTAGGGGTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 130 hom 43 1 31 12 AT 10 9 324310 CASAVA_Build 21 22475968 1D TTTGCTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 741 hom 28 3 17 8 T 16 15 324311 CASAVA_Build 21 22477164 1D CAGCAAACAT C/- ATTCTCAGCA 3070 hom 72 het 29 0 25 6 C 1 0 324312 CASAVA_Build 21 22477693 1I AAATCAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 800 hom 34 3 28 3 T 10 11 324313 CASAVA_Build 21 22482029 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1905 hom 15 het 7 0 6 1 T 11 12 324314 CASAVA_Build 21 22484991 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1520 het 390 hom 12 4 5 3 A 17 16 324315 CASAVA_Build 21 22489908 1D TTTCAACGAC A/- AAAAAAAAAC 1021 het 1021 ref 25 21 3 1 A 10 9 324316 CASAVA_Build 21 22503982 1D ATATTGCACT G/- GTTGGGTTTT 3070 hom 62 het 25 0 21 4 G 2 1 324317 CASAVA_Build 21 22516229 4D GAGAGAAAAA AAAG/---- AGAGAGAAAA 3070 hom 90 het 31 0 31 1 AAAG 1 0 324318 CASAVA_Build 21 22519498 1I GTAGAAGCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 53 het 36 1 29 6 A 9 10 324319 CASAVA_Build 21 22522885 1D ATCTCAAACC A/- AATTACTTAA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 3 2 324320 CASAVA_Build 21 22527701 1I TTGAGCACAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 39 0 35 4 A 8 9 324321 CASAVA_Build 21 22535094 1D AATTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 1039 het 1039 ref 27 19 3 7 A 11 10 324322 CASAVA_Build 21 22560186 1I ATTGGTGGTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 20 1 16 3 T 0 1 324323 CASAVA_Build 21 22560893 9D CAAATACATG TCAAAATCT/--------- TTTTTAGCTC 3070 hom 108 het 36 0 36 3 TCAAAATCT 1 0 324324 CASAVA_Build 21 22561156 1I AATTTTTGCC -/A AAACCTTATT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 3 4 324325 CASAVA_Build 21 22564168 2I TTATAGGAAG --/TA TATATATATA 3070 het 646 hom 16 2 7 7 TA 8 9 324326 CASAVA_Build 21 22564408 1D CTAAAGTTAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 9 8 324327 CASAVA_Build 21 22564648 1I GGGAACTCAT -/C CAGTTTGTTG 3070 hom 106 het 42 0 36 6 C 1 2 324328 CASAVA_Build 21 22568207 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 21 0 18 3 A 10 11 324329 CASAVA_Build 21 22575602 4D TGTGGGAAAA TGTC/---- TGATAAGAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TGTC 1 0 324330 CASAVA_Build 21 22579872 2I ACCTATATAG --/AT ATATATATAT 3070 hom 117 het 48 0 38 10 AT 5 6 324331 CASAVA_Build 21 22581759 2D ACACTGTTCC CT/-- GTGTCCCAGC 3070 hom 69 het 24 0 23 2 CT 1 0 324332 CASAVA_Build 21 22583058 1D TGGGTAATTT C/- TTTTAGCATA 3070 hom 96 het 38 0 33 6 C 1 0 324333 CASAVA_Build 21 22584769 2I TACACATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 18 hom 32 1 30 1 TG 6 7 324334 CASAVA_Build 21 22585605 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 204 hom 17 2 14 1 A 13 14 324335 CASAVA_Build 21 22586435 1I GCAAGAAAGC -/A CAAAAAAAAA 3070 het 596 hom 38 2 28 8 A 0 1 324336 CASAVA_Build 21 22591736 1D AACTCTTTAC A/- ATCTTAAAAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 2 1 324337 CASAVA_Build 21 22592114 4D TAGCCTTACT TAGA/---- TAGGTAGAAC 3070 hom 66 het 28 0 22 6 TAGA 1 0 324338 CASAVA_Build 21 22593718 4D GAGAAATCTT CAAA/---- CAATTTACAG 3070 hom 87 het 32 0 30 4 CAAA 1 0 324339 CASAVA_Build 21 22595520 1I GAAGAAAAAA -/T ATTTGAAAGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 0 1 324340 CASAVA_Build 21 22596403 4I CATATATGTC ----/TGTG TGTGTGTGCA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TG 4 6 324341 CASAVA_Build 21 22603412 1D CCACTGCACT C/- CAGCTTAGGC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 2 1 324342 CASAVA_Build 21 22603736 1I AGGGAAACAT -/A AAAATCAACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 4 5 324343 CASAVA_Build 21 22606899 1D CTGTCACTTG C/- ATTCAATGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 0 324344 CASAVA_Build 21 22607263 4I GTGTGAACTC ----/AGAG AGAGAGCTTA 3070 hom 144 het 53 0 46 7 AG 3 5 324345 CASAVA_Build 21 22610025 1D AATAACAATA T/- GTGAATATGT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 1 0 324346 CASAVA_Build 21 22614809 1D TCAAATAATA T/- TTTATAAGTA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 4 3 324347 CASAVA_Build 21 22616450 1I GAGCTTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 32 1 24 7 T 11 12 324348 CASAVA_Build 21 22638544 1I AACAGAGACC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 52 het 29 0 26 3 A 9 10 324349 CASAVA_Build 21 22654328 17D AGTCAGCGGT GGGTCTGTGACAGCGGC/----------------- GGGTCTGTGA 3070 hom 87 het 37 0 29 14 GGGTCTGTGACAGCGGC 2 1 324350 CASAVA_Build 21 22670911 1D ATGAATTATG A/- AAAAAATCAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 7 6 324351 CASAVA_Build 21 22682760 4D CTAGAGAACC CTAA/---- CTAATACAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CTAA 2 1 324352 CASAVA_Build 21 22686682 1D TCTGCACTGC A/- AAAGACTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 4 3 324353 CASAVA_Build 21 22694029 1I TTCTCCAAAA -/C TTGTAAACTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 0 1 324354 CASAVA_Build 21 22697795 1D TTATTTGTAC T/- TCACATTTTG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 T 2 1 324355 CASAVA_Build 21 22706045 1D GGTTATCTAG T/- TTTTCAAGCA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 5 4 324356 CASAVA_Build 21 22706322 1I CATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 10 324357 CASAVA_Build 21 22707153 4D CCGTGAACCA AGAT/---- AGATTGCGCC 3070 hom 54 het 24 0 19 5 AGAT 2 1 324358 CASAVA_Build 21 22710239 1D AAAATTTTTC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 87 het 30 0 30 1 T 8 7 324359 CASAVA_Build 21 22711296 1I CTCTTCCCCC -/T GTCTCTCTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 0 1 324360 CASAVA_Build 21 22712123 1D AAATTTAATG T/- TTTTTTATGT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 7 6 324361 CASAVA_Build 21 22713581 1D GGTCTGTATG T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 157 het 55 0 53 4 T 6 5 324362 CASAVA_Build 21 22714471 4D TTTATGTGTG TATA/---- TATATAAAGT 3070 hom 51 het 18 0 18 1 TA 5 3 324363 CASAVA_Build 21 22715339 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 6 A 11 10 324364 CASAVA_Build 21 22719224 1I AATATACATG -/A CCACATATAC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 0 1 324365 CASAVA_Build 21 22726060 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 6 7 324366 CASAVA_Build 21 22734713 1D CCAATTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1043 hom 24 4 13 7 A 17 16 324367 CASAVA_Build 21 22738113 4I TATTAAAAAA ----/TACT TATTTATGCC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TACT 0 1 324368 CASAVA_Build 21 22739664 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TTTTTGTATA 3070 hom 90 het 34 0 31 5 TCTT 1 0 324369 CASAVA_Build 21 22743261 1D CTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 T 11 10 324370 CASAVA_Build 21 22750825 1I TATATATATA -/G TATATATAGA 1652 hom 10 het 7 0 4 3 G 0 1 324371 CASAVA_Build 21 22754532 1D AAGCAAACAG A/- AAAAAATCGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 6 324372 CASAVA_Build 21 22754794 2D GACAAGCCAA AT/-- ATATATATAT 2229 hom 18 het 11 0 7 4 AT 7 6 324373 CASAVA_Build 21 22767355 1D GTGAAATTGG A/- AAATAGTAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 4 3 324374 CASAVA_Build 21 22768820 4I GGGCTTTATC ----/TAAA TAATTGAAAA 3070 hom 129 het 50 0 44 6 TAAA 0 1 324375 CASAVA_Build 21 22769441 4D ATCTATTGAG TGTT/---- AGTTATGTAT 3070 hom 93 het 33 0 32 3 TGTT 1 0 324376 CASAVA_Build 21 22770419 1D TGATATCTGG C/- TATTTCGTCC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 C 1 0 324377 CASAVA_Build 21 22770748 3I ACAGACACAC ---/ATT ATTTTTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATT 1 2 324378 CASAVA_Build 21 22790692 1D AATTCATAAC T/- GCTAAATGCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 1 0 324379 CASAVA_Build 21 22799809 1I AGGTGCAAGG -/T ACATTAGGCT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 0 1 324380 CASAVA_Build 21 22846615 1I AGCCAGCAGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 7 8 324381 CASAVA_Build 21 22847101 1I TTTTGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 10 11 324382 CASAVA_Build 21 22848500 2D AGGAGAATGG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 11 9 324383 CASAVA_Build 21 22851342 1I TAAAAATCCT -/G TAACAAAAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 324384 CASAVA_Build 21 22856499 3I CTCCGGCTGG ---/AGA AGAAGAACTG 3070 hom 82 het 34 0 26 8 AGA 2 3 324385 CASAVA_Build 21 22856798 1I TTTGAAATAT -/C AGGAAAAATT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 324386 CASAVA_Build 21 22858323 4I ATAATTTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTTG 2 3 324387 CASAVA_Build 21 22858802 1D CTGGTCCATG A/- AAAAAATGAA 3070 hom 93 het 41 0 31 12 A 7 6 324388 CASAVA_Build 21 22859798 1I TCCTATTCAG -/T TCTGGAGAGT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 1 2 324389 CASAVA_Build 21 22860406 1I TTCCAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 10 11 324390 CASAVA_Build 21 22860658 3D TTCTCTCTCA CTT/--- TTTTTTTTTT 606 het 606 ref 31 11 4 16 CTT 1 0 324391 CASAVA_Build 21 22861019 2D AATTAATTGA TT/-- TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 6 T 9 7 324392 CASAVA_Build 21 22862318 2I GGCCTAAAGG --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 8 10 324393 CASAVA_Build 21 22862524 1D CCAAATTATC A/- AAAAATAGAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 6 5 324394 CASAVA_Build 21 22867594 3I CTATGCAGTA ---/ATT ATAATCATGG 3070 hom 54 het 25 0 19 6 ATT 0 1 324395 CASAVA_Build 21 22868347 1I TTATTTTACA -/T TTTTTTATTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 6 7 324396 CASAVA_Build 21 22868888 2D CAGAAACATT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 11 9 324397 CASAVA_Build 21 22872829 1I CCGTCTCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 15 0 12 3 A 10 11 324398 CASAVA_Build 21 22874443 1D ACAGAGTCTT G/- GCTCTGTCAC 3070 hom 78 het 32 0 27 6 G 2 1 324399 CASAVA_Build 21 22881220 1D ATACTCAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 514 hom 34 3 23 8 A 13 12 324400 CASAVA_Build 21 22884746 4I AGTCATGGTT ----/TCTC TCTTAGAGGC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TC 1 3 324401 CASAVA_Build 21 22891837 1I AGGTGGCAAC -/G GTGCTAGCAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 1 2 324402 CASAVA_Build 21 22894507 1I TAAGTCTGGG -/T TTGGTCCATT 3070 hom 126 het 48 0 40 8 T 2 3 324403 CASAVA_Build 21 22895560 1D TTCAACTCAC T/- TATTATTTCA 3070 hom 93 het 36 0 32 6 T 2 1 324404 CASAVA_Build 21 22910114 1D AAATAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 36 1 24 11 A 13 12 324405 CASAVA_Build 21 22918654 1D ATGCTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 468 hom 39 2 27 11 A 12 11 324406 CASAVA_Build 21 22925342 1D CAAGCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 40 1 29 10 A 11 10 324407 CASAVA_Build 21 22927269 1D AAAAGTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 848 hom 29 3 23 3 A 12 11 324408 CASAVA_Build 21 22932027 2D TCTTCCCTTA CT/-- CTCTTCCTTT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 CT 3 2 324409 CASAVA_Build 21 22932137 1D CCGCCATCTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 A 8 7 324410 CASAVA_Build 21 22934839 1I CTTCTAGAAG -/A AAACATAGAG 3070 het 3070 ref 43 18 20 5 A 3 4 324411 CASAVA_Build 21 22936560 2D TCTTATTTAT TC/-- TCTCTTACTT 789 het 789 ref 24 8 5 12 TC 3 2 324412 CASAVA_Build 21 22939778 1D CAGCTTTCAA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 8 7 324413 CASAVA_Build 21 22941336 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 T 15 14 324414 CASAVA_Build 21 22943345 2I GCCATGGCAT --/GA GAGAGAACAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 GA 3 4 324415 CASAVA_Build 21 22944005 1I AAATAAGTTG -/A AAAGATAGAA 3070 het 3070 hom 56 24 24 8 A 3 4 324416 CASAVA_Build 21 22948184 2I GGGAAGACCC --/TG TCTCTACAGA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 TG 0 1 324417 CASAVA_Build 21 22951844 1D ACATAACATT G/- GAACAAAAGA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 2 1 324418 CASAVA_Build 21 22952377 1I AATCCTTTCA -/C ATATTTACTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 0 1 324419 CASAVA_Build 21 22960518 1I TCAGTTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 10 17 11 A 10 11 324420 CASAVA_Build 21 22965064 8D AAAGCACCAT ATTTCAGA/-------- ATTTCAGAAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 ATTTCAGA 2 1 324421 CASAVA_Build 21 22990623 1D CTCCATGAGA T/- TTTTTTTTTT 2235 het 1792 hom 37 13 6 18 T 17 16 324422 CASAVA_Build 21 23030479 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 9 8 324423 CASAVA_Build 21 23042525 1D ACATGTTTAG T/- TATAATTAAC 3070 hom 126 het 48 0 43 7 T 2 1 324424 CASAVA_Build 21 23072164 1D ATGAGCTTAC T/- TTTGAGTAAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 4 3 324425 CASAVA_Build 21 23073332 1I GTCATTATAT -/A AAGATGCTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 3 324426 CASAVA_Build 21 23073575 2I CCTTTTCTCC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 9 11 324427 CASAVA_Build 21 23094876 1I TCCACCACCA -/T TGCCCGGCTA 3070 hom 50 het 22 0 15 7 T 1 2 324428 CASAVA_Build 21 23096244 1D GATGGCCAGC T/- TTTTTTTTTT 2007 het 2007 ref 37 25 5 7 T 15 14 324429 CASAVA_Build 21 23120022 3D ATACATCAAA CAT/--- CATATTTAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CAT 2 1 324430 CASAVA_Build 21 23137777 10D CCGACTGGTT AAAAAAAAAC/---------- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 29 0 22 9 AAAAAAAAAC 2 1 324431 CASAVA_Build 21 23145440 1D AAGCACTATC A/- AATTGTAAGA 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 A 3 2 324432 CASAVA_Build 21 23149238 1D AGAAAAGGGG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 31 17 9 7 A 8 7 324433 CASAVA_Build 21 23158404 1I TTGAGAGAAG -/T TACAATCTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 2 324434 CASAVA_Build 21 23158720 1I TATGTTTTGG -/T TAATACTATG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 1 2 324435 CASAVA_Build 21 23159778 1D CATGCAGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 T 10 9 324436 CASAVA_Build 21 23161272 1I TGAAACCCTG -/A CTCATAAAAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 0 1 324437 CASAVA_Build 21 23165950 1D ACTTGGTATC T/- TTTTGCGGGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 5 4 324438 CASAVA_Build 21 23173812 1D AGTAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 203 het 203 ref 25 14 4 7 A 19 18 324439 CASAVA_Build 21 23174996 1D TGGAAACCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 10 9 324440 CASAVA_Build 21 23179856 4D TTTAAGAAAA AATG/---- AATGATAATA 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 AATG 2 1 324441 CASAVA_Build 21 23183563 1I TCTACATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 11 12 324442 CASAVA_Build 21 23194126 1D ATTTTAACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 10 9 324443 CASAVA_Build 21 23199861 1D ATCATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 12 11 324444 CASAVA_Build 21 23200792 1D TGATTGAATT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 8 7 324445 CASAVA_Build 21 23211898 1I ACTACCCTAA -/C AAAATTGACC 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 C 0 1 324446 CASAVA_Build 21 23224632 1D TCAGCCTCCC A/- AAGTAGCTGG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 3 2 324447 CASAVA_Build 21 23230012 6D GTATTTTCTT TTTTCC/------ TTTCATATTG 2678 het 2678 ref 20 13 7 2 TTTTCC 1 0 324448 CASAVA_Build 21 23234533 2D GTACATAGAC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 TA 8 7 324449 CASAVA_Build 21 23242474 2D TCAGCCTCCC AA/-- AGTGTTGGGA 2876 het 733 hom 17 3 10 4 A 3 1 324450 CASAVA_Build 21 23246874 4D ACTTAACCTA TGTG/---- TGTGTGTTTG 3070 het 3070 ref 36 16 17 4 TG 5 3 324451 CASAVA_Build 21 23253821 1D AAATGACAAT C/- ACAAATAAAC 3070 het 3070 hom 55 23 28 5 C 1 0 324452 CASAVA_Build 21 23256072 1D AAATAGCCCT A/- AAAGTTTCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 4 3 324453 CASAVA_Build 21 23262451 1D TTCATTTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 10 9 324454 CASAVA_Build 21 23276474 3D ACCGAAGGGT ACA/--- ACACTTTGTG 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 ACA 2 1 324455 CASAVA_Build 21 23280323 1D AATCAGCAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 35 8 20 7 A 8 7 324456 CASAVA_Build 21 23283756 1I AATGGAAGGA -/G GGGGCAGGGA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 G 4 5 324457 CASAVA_Build 21 23285296 2I GGTTTACCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 14 11 A 11 13 324458 CASAVA_Build 21 23286006 1D ACTACATAGT G/- CATCATACTA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 1 0 324459 CASAVA_Build 21 23286418 21D CACACCCACA ATCTCATCAAGATAATCTCAC/--------------------- ATCTATTTGG 3070 het 3070 ref 27 17 11 2 ATCTCATCAAGATAATCTCAC 1 0 324460 CASAVA_Build 21 23296617 1D TCGGGCTGAT A/- TAAATGACTT 2694 het 2694 ref 29 17 7 6 A 1 0 324461 CASAVA_Build 21 23298163 1I CTTAATTAAG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 6 7 324462 CASAVA_Build 21 23299606 1I AATCCAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 9 10 324463 CASAVA_Build 21 23302802 3D AAAATAAACC TAA/--- TGTTTCTTTT 3005 het 3005 ref 29 20 8 2 TAA 1 0 324464 CASAVA_Build 21 23310325 1D GCTATTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 8 T 11 10 324465 CASAVA_Build 21 23311917 3I TTTTTTTTTG ---/TTT TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 T 6 9 324466 CASAVA_Build 21 23316824 1D TCCTGACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 T 11 10 324467 CASAVA_Build 21 23317370 1I AGCAACTCCC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 T 8 9 324468 CASAVA_Build 21 23317633 1I CCAGTAAGCC -/A AATCTCCCTG 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 A 2 3 324469 CASAVA_Build 21 23319990 1I TGCAGAATTT -/G TAAGGTATCT 3070 het 3070 hom 33 9 21 3 G 0 1 324470 CASAVA_Build 21 23321696 1D TAATAAAGCC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 9 8 324471 CASAVA_Build 21 23323066 2I ATTCATATAA --/CT CTATTTATAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 CT 1 2 324472 CASAVA_Build 21 23325491 1I TATATAGTCA -/C CCTGTTGTGC 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 C 2 3 324473 CASAVA_Build 21 23328575 1D AATTGTTTTC T/- TTCCCTAGGT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 3 2 324474 CASAVA_Build 21 23330845 1D GCATGATCTT G/- GCTCACTGCG 2738 het 2738 ref 17 8 7 2 G 2 1 324475 CASAVA_Build 21 23332437 4I GCCTTCGGCA ----/TTGC TTGGCCAAAA 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 TTGC 0 1 324476 CASAVA_Build 21 23340937 2D AAACTGAAAG AA/-- GAGCAAAACA 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 A 2 0 324477 CASAVA_Build 21 23349591 1D33M1D TAAAGTGTTC TTTTTTTTTTTTAAATGCATTAAGGGCAGAAAAGA/-TTTTTTTTTTAAAATGCATTAAGGGCAGAAAAG- AAAAAAAAAA 3070 het 1592 hom 27 5 17 13 N/A 0 0 324478 CASAVA_Build 21 23352812 4I AAAAACAAAT ----/AAAG AAACAGACAA 3070 hom 149 het 58 0 48 10 AAAG 0 1 324479 CASAVA_Build 21 23357277 2D GGTAAAATTC AA/-- AATATCTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 15 4 A 4 2 324480 CASAVA_Build 21 23358082 1D TACTGGAGCA C/- AAATGCTATT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 C 1 0 324481 CASAVA_Build 21 23359916 1D GCGGTAGCTT G/- GAAACCTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 G 2 1 324482 CASAVA_Build 21 23360687 1D TCCTAGTGTC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 17 hom 38 1 34 3 T 7 6 324483 CASAVA_Build 21 23365266 1D GGTTATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 11 10 324484 CASAVA_Build 21 23368313 3D TTAGCCAGGC ATG/--- GTGGTGGGTG 2773 hom 24 het 9 0 9 1 ATG 1 0 324485 CASAVA_Build 21 23372518 3I ACACAAAATT ---/AAA AAAGAAATAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 6 324486 CASAVA_Build 21 23398470 1D CGGTATTTGG T/- TTTCTGTTCC 3070 hom 113 het 44 0 38 6 T 4 3 324487 CASAVA_Build 21 23399302 2D AGTTATACAA AC/-- ACATATCTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 5 AC 2 1 324488 CASAVA_Build 21 23399470 1D TTGTAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 12 11 324489 CASAVA_Build 21 23413204 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 45 het 16 0 15 1 T 7 8 324490 CASAVA_Build 21 23416538 2D AGTTATCTTC TT/-- TTTTATGGTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 6 4 324491 CASAVA_Build 21 23419112 3I GTTTTGCTCT ---/AAC TGTTGCCCAA 3070 hom 84 het 32 0 27 6 AAC 0 1 324492 CASAVA_Build 21 23419819 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 9 8 324493 CASAVA_Build 21 23420313 1D CATGGGTGCA C/- CAGATATCCC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 C 2 1 324494 CASAVA_Build 21 23420668 2D TATTCAACTC TT/-- TTGTTCATTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 4 2 324495 CASAVA_Build 21 23428305 1I TAAGCCTAGC -/T TTTTTTTTTT 784 het 784 ref 43 28 3 12 T 13 14 324496 CASAVA_Build 21 23434176 1D AGAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 80 het 33 0 26 7 A 10 9 324497 CASAVA_Build 21 23451271 1D TATTTTTCTC T/- TTGTCATGTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 3 2 324498 CASAVA_Build 21 23454660 1I GTTATTGGCC -/A TTGATCAGTT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 A 0 1 324499 CASAVA_Build 21 23457886 3I TTTTGATTGA ---/GTT GTTGATATTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 GTT 1 2 324500 CASAVA_Build 21 23464100 1D AGTATAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 32 1 26 5 A 12 11 324501 CASAVA_Build 21 23483120 4I TGTTGAAAAG ----/AAAC AAAATCAACA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AAAC 0 1 324502 CASAVA_Build 21 23487828 1I CAACTAAATC -/A ACAATGCACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 2 324503 CASAVA_Build 21 23492596 14D AAAAATCCAA AACACTTCTGGTCT/-------------- AAAGCATTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 9 AACACTTCTGGTCT 1 0 324504 CASAVA_Build 21 23492756 3I ATATGCAGGC ---/TTT TTTTTTTTAC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 8 11 324505 CASAVA_Build 21 23493118 3D TTCATGGAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 AAC 4 3 324506 CASAVA_Build 21 23493213 1D CCTTTTGTGA T/- TTTTTAAGTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 6 5 324507 CASAVA_Build 21 23493396 4I CTTTAACTAA ----/CTAG GTAGAGTCTA 3070 hom 92 het 36 0 31 5 CTAG 0 1 324508 CASAVA_Build 21 23494584 2I CGTTACTGAG --/TA TATATACCCA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TA 3 4 324509 CASAVA_Build 21 23494812 1I TTATCCTAAG -/A ATCAACACAT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 A 1 2 324510 CASAVA_Build 21 23500330 1D GATCTTATAA T/- TTTTTTCAAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 6 324511 CASAVA_Build 21 23507617 1D TGCAAAAACC A/- TTTTTCTCTC 3070 hom 87 het 31 0 28 4 A 1 0 324512 CASAVA_Build 21 23515090 1I TCTGTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 10 11 324513 CASAVA_Build 21 23520219 1D61M17I CATGACCCCC AAAAAAGTAATCTTATGTAATATGCTATGCTGGGTCACAAAAGACAATTCAGCTCCTTTCTG-----------------/-AAAAATTAATCTTATGTAATATGCTATGCTGGGTCACAAAAGACAATTCAGCTCCTTTCTGGATCTCTTTGTTTTCTC ACGGATCAAC 3070 hom 156 het 46 0 47 18 N/A 0 0 324514 CASAVA_Build 21 23521040 1D TTTTTCTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 18 0 12 6 A 11 10 324515 CASAVA_Build 21 23521520 1I TGAAGTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 8 9 324516 CASAVA_Build 21 23521985 1D AATTTTCCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 T 10 9 324517 CASAVA_Build 21 23525868 3D AACAGAATAC AGA/--- ACCAGGAAAC 3070 hom 108 het 37 0 37 2 AGA 1 0 324518 CASAVA_Build 21 23530755 1D TGAATATTGG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 A 8 7 324519 CASAVA_Build 21 23533089 1D GTAAATGCCC T/- TTTATATAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 4 3 324520 CASAVA_Build 21 23542380 1I CAAATTATCA -/T TTTTAAAGAG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 4 5 324521 CASAVA_Build 21 23545825 4D CCTCTGAGAA AAAC/---- AGACTATCAG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 AAAC 1 0 324522 CASAVA_Build 21 23546874 4I TCAAATTATA ----/AACT AACTAACTGG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AACT 2 3 324523 CASAVA_Build 21 23547815 1D TTAATGAAAA G/- GAACTCTTCT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 G 2 1 324524 CASAVA_Build 21 23550046 1I ATTCCCCTTT -/A AAATACTAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 3 4 324525 CASAVA_Build 21 23555836 2I ATTAAACCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 10 12 324526 CASAVA_Build 21 23580779 1D TTCCAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 35 0 26 9 A 13 12 324527 CASAVA_Build 21 23591326 1I AAAGAAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 10 11 324528 CASAVA_Build 21 23592506 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 17 0 9 8 A 18 17 324529 CASAVA_Build 21 23596522 8D GTAGCTGGGA CTACAGGC/-------- CTACAGGCGC 972 hom 15 het 6 0 4 3 CTACAGGC 2 1 324530 CASAVA_Build 21 23597028 3I CAAAATACTT ---/CTC ATGATTATGG 3070 hom 68 het 25 0 22 5 CTC 0 1 324531 CASAVA_Build 21 23597080 5D2M2D5M1I GCAGGTCTAG CAACCTGCCACTGG-/-----TG--TCTGGT GAAGCCCTGC 3070 hom 72 het 28 0 25 9 N/A 0 0 324532 CASAVA_Build 21 23598581 1D GAAATGGAAA C/- CCTGGCCTCT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 C 3 2 324533 CASAVA_Build 21 23600347 1I AAACTTAGGT -/A AGTCTTGTAA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 A 1 2 324534 CASAVA_Build 21 23607643 1I CAAATACTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 T 9 10 324535 CASAVA_Build 21 23609153 1I AGTTCAGGGG -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 6 7 324536 CASAVA_Build 21 23613737 2D CTATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 25 het 39 2 32 6 AT 6 5 324537 CASAVA_Build 21 23629399 1D TTTATAAATT A/- CCTAGTCTCA 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 A 1 0 324538 CASAVA_Build 21 23631278 2D ACTTTACTCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 63 27 26 10 TC 8 7 324539 CASAVA_Build 21 23647106 9I TCAGCATCCA ---------/GAATAAGCC GAATAAGCCA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 GAATAAGCC 1 2 324540 CASAVA_Build 21 23657021 4I AAGTAAGTGG ----/TTGA TTATTTAAGG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TTGA 0 1 324541 CASAVA_Build 21 23669398 1D TTTTAACTCT C/- CCTCAACATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 3 2 324542 CASAVA_Build 21 23675705 1I TGCATTTAAT -/A CCCACCTCTA 3070 hom 83 het 37 0 27 10 A 0 1 324543 CASAVA_Build 21 23679746 1D TTGAGAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 11 10 324544 CASAVA_Build 21 23686806 1I AAGGCCTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 A 10 11 324545 CASAVA_Build 21 23694128 1I GCATAAAACC -/A AAATCAAACC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 3 4 324546 CASAVA_Build 21 23699347 1I AGTAGAGACA -/G GGGTTTCACC 3070 hom 111 het 40 0 34 6 G 3 4 324547 CASAVA_Build 21 23707271 3D TTTCATCAGT ATA/--- ATAGTTAGGG 3070 het 3070 ref 29 18 9 3 ATA 2 1 324548 CASAVA_Build 21 23713420 1I TTCTGTTTTG -/T TTTCCTTTCT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 3 4 324549 CASAVA_Build 21 23713621 1I ATTAAAGACT -/A CAGAGAAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 0 1 324550 CASAVA_Build 21 23714056 1D AATATGGGTT A/- AAATAGGGGA 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 A 4 3 324551 CASAVA_Build 21 23716796 1D GACTGACTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 10 9 324552 CASAVA_Build 21 23728451 2D ATTTAAAAAA GT/-- GTGCTTGATA 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 GT 2 1 324553 CASAVA_Build 21 23731818 2D CATTGTACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 13 11 324554 CASAVA_Build 21 23731901 6I GTAACTAGAT ------/TAACTC TAACATTATT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TAACTC 0 1 324555 CASAVA_Build 21 23732361 1I TCTGTTTATA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 7 8 324556 CASAVA_Build 21 23732848 1D GCAGAACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 T 11 10 324557 CASAVA_Build 21 23733694 2D GACAATTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 13 11 324558 CASAVA_Build 21 23734022 1D AATAAATTCC A/- AAAAAACCCA 2939 het 2939 ref 16 9 6 1 A 7 6 324559 CASAVA_Build 21 23735319 4I ATTAGCTAGC ----/ATTT ATTTTAATCT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 ATTT 1 2 324560 CASAVA_Build 21 23736785 1I GACGTCACTG -/A GAGTCTGTGT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 A 0 1 324561 CASAVA_Build 21 23739740 1I TCATGCCTGT -/A ACAATTCAAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 1 2 324562 CASAVA_Build 21 23752257 5D TGGTTTGGGA TTTTT/----- TTTATGAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 12 8 T 8 3 324563 CASAVA_Build 21 23755179 1D TGCTCGTATA T/- TTTTTGGGTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 6 5 324564 CASAVA_Build 21 23756111 1I CTGTCTTAAA -/T ACTGTCAGAA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 0 1 324565 CASAVA_Build 21 23756610 4I TTCTGTTCTC ----/TCTT CATTTATAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TCTT 0 1 324566 CASAVA_Build 21 23757556 1I ATTACTATTA -/T TTTAATTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 T 3 4 324567 CASAVA_Build 21 23759720 1I TTTGGTAAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 451 hom 29 2 23 4 A 9 10 324568 CASAVA_Build 21 23759887 5D TCACAGTGAA CTTCT/----- CTTAGTCCTA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 CTTCT 1 0 324569 CASAVA_Build 21 23760345 1D16M1D7M1D TGTAGTTCCA GGCTACTTGGGAGGCAGAAGGTGAGA/-GCTACTTGGGAGGCAG-AGGTGAG- AGAATCGTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 N/A 0 0 324570 CASAVA_Build 21 23760689 2D TCCAAAACAC AT/-- GTTAACATTT 3070 het 3070 ref 52 26 25 3 AT 1 0 324571 CASAVA_Build 21 23761826 1I TTTTAGCATG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 A 8 9 324572 CASAVA_Build 21 23764197 1I GACTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 A 16 17 324573 CASAVA_Build 21 23773142 1I CAAAATGTAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 15 het 36 1 30 5 A 8 9 324574 CASAVA_Build 21 23777783 1D ACCGAAGGTC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 7 6 324575 CASAVA_Build 21 23777854 1D47M1D AAATTAAAAA TACCATCCCATTTACAACGGCATTAAAAAACAAATAAAATGATATTAAG/-ACCATCCCATTTACAACAGCATTAAAAAACAAATAAAATGATAATAA- TAATAACTTT 3070 het 3070 hom 16 13 14 9 N/A 0 0 324576 CASAVA_Build 21 23778122 1I ACAGAAATAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 A 9 10 324577 CASAVA_Build 21 23786780 1D AGCAGAAATG A/- AAAAAAAAAA 1394 het 1394 ref 39 25 4 10 A 12 11 324578 CASAVA_Build 21 23787709 5D AGATACAGAT TTGTC/----- TTGTCTTGCC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTGTC 2 1 324579 CASAVA_Build 21 23787954 1I TTCTCTTTAT -/A AAAATAACTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 4 5 324580 CASAVA_Build 21 23788023 3D CAGAACTTAT AGG/--- AGAACTCTCA 3070 het 3070 ref 28 13 12 5 AGG 1 0 324581 CASAVA_Build 21 23793225 1I TCTACACTGC -/T CTAGCAGAGG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 0 1 324582 CASAVA_Build 21 23796142 5D ATTTACCCTG GGTCC/----- CAAAGCTCCA 3070 hom 120 het 43 0 41 6 GGTCC 1 0 324583 CASAVA_Build 21 23797054 1I TTTTCTTACA -/T TTGCTTTTGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 3 324584 CASAVA_Build 21 23798691 1D TTTTAAATGA T/- TGTAGTTTAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 T 2 1 324585 CASAVA_Build 21 23807597 5I CTAGTGAGCA -----/GAGAT ATCTGTATGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 GAGAT 0 1 324586 CASAVA_Build 21 23815139 5D ATAGAAATTA AATTG/----- AATCTGTAAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 5 AATTG 1 0 324587 CASAVA_Build 21 23822983 1I AAAAAATGTC -/A AAAAAATAGT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 6 7 324588 CASAVA_Build 21 23835381 2I CTTCTTAAAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 10 12 324589 CASAVA_Build 21 23839961 5D AAGGATGAGC ACAGG/----- ACAGAGGCAA 3070 hom 80 het 29 0 27 2 ACAGG 1 0 324590 CASAVA_Build 21 23841265 1D GACCACTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2989 hom 28 8 11 9 T 11 10 324591 CASAVA_Build 21 23844953 1I TGCTCATCTG -/A AGTTTGTAAA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 1 2 324592 CASAVA_Build 21 23856965 1D ATCTCTCCCA G/- GTTTTGGTAT 3070 hom 71 het 30 0 24 6 G 2 1 324593 CASAVA_Build 21 23869557 1D TTGCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 12 11 324594 CASAVA_Build 21 23870858 3D ATAAGCAATA CTT/--- CTTATTAATA 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 CTT 2 1 324595 CASAVA_Build 21 23872207 1D AATGATATCA T/- TAGTGATATA 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 T 2 1 324596 CASAVA_Build 21 23878296 1D CCTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2162 hom 25 6 10 9 A 12 11 324597 CASAVA_Build 21 23883112 6D ACACACCATA AAAATT/------ AATTGTAATG 3070 het 3070 hom 30 14 14 5 AAAATT 1 0 324598 CASAVA_Build 21 23890115 1D ACTAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 1838 het 1709 hom 28 9 6 13 A 15 14 324599 CASAVA_Build 21 23897545 1D CAATTAGACA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 12 het 34 1 17 17 T 9 8 324600 CASAVA_Build 21 23898313 1I CTGACTATCA -/T TTCCACTAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 2 3 324601 CASAVA_Build 21 23898516 1I CTTGAATTGT -/A CTCCCGTAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 0 1 324602 CASAVA_Build 21 23899688 1I CAACAAATTT -/A AAAAAAAAAA 2951 het 2951 ref 31 13 8 10 A 11 12 324603 CASAVA_Build 21 23903843 1D AGCCATTCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 10 9 324604 CASAVA_Build 21 23905044 1D11M1D GTGAGCCACC AGCACCTGGCCCA/-GCACCTGGCCC- GACCATGAAG 3070 hom 26 het 20 1 18 2 N/A 0 0 324605 CASAVA_Build 21 23905429 1D GGTGGCTCAC T/- GCCTGTAATC 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 1 0 324606 CASAVA_Build 21 23905474 1D AGTGGATCAC T/- GAGGTCAAGA 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 1 0 324607 CASAVA_Build 21 23906839 1I ACAAAATAGT -/A AAAGGTCTAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 3 4 324608 CASAVA_Build 21 23908533 1D TTTCTCATAT C/- ATCATGATCG 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 C 1 0 324609 CASAVA_Build 21 23911340 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 2822 het 2484 hom 15 5 7 3 A 9 10 324610 CASAVA_Build 21 23956219 1D GATGTTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 10 8 3 A 13 12 324611 CASAVA_Build 21 23956416 1I TATAAGCCAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 405 hom 27 1 23 3 A 8 9 324612 CASAVA_Build 21 23971373 1I AACACAAGCT -/C CTTGTCCTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 C 1 2 324613 CASAVA_Build 21 23973744 1I TTTATAATTG -/A AAACTCCATC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 3 4 324614 CASAVA_Build 21 23975737 1I GGGAATGTGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 8 9 324615 CASAVA_Build 21 23976484 2I TATATCACAA --/AT ATATATATAT 2283 het 2262 hom 20 6 6 8 AT 6 7 324616 CASAVA_Build 21 23977531 1I19M1I TTATGACTGA -TAAATTATTTGGTTGAAAG-/TTAAATTATTTGGTTGAAAGA AAAAATATGT 3070 hom 132 het 45 0 45 2 N/A 0 0 324617 CASAVA_Build 21 23978305 1I AGAACTAATA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 7 8 324618 CASAVA_Build 21 24013036 1I TCTGGCTTAC -/T TTTTTTGGAC 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 T 6 7 324619 CASAVA_Build 21 24017727 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 12 11 324620 CASAVA_Build 21 24021674 3D ACAATTTTAT TTC/--- TTATTTTAAT 1851 het 1851 ref 21 15 4 2 TTC 1 0 324621 CASAVA_Build 21 24022942 1I GCGCATATGT -/A CCCTAAAACT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 0 1 324622 CASAVA_Build 21 24024987 1D CTCAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 650 hom 15 3 10 2 A 10 9 324623 CASAVA_Build 21 24026037 1D ACTGTCATGG A/- AAATAAATCT 3070 hom 77 het 42 0 26 18 A 4 3 324624 CASAVA_Build 21 24026081 1D12M1I8M1D20M1D CGGGTTAGTT AATTAAAGCTTAG-CCACTTGAGGGACAGAGGAACTGCCATTAT/-ATTAAAACTTAGCCCACTTGA-GGACACAAGAACTGCCATTA- TGGTTTAAGT 3070 hom 51 het 27 0 18 24 N/A 0 0 324625 CASAVA_Build 21 24041966 9I TTTAATTTAC ---------/CATGTATAA TCAGAAATTC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 CATGTATAA 0 1 324626 CASAVA_Build 21 24052738 1I AATACATTTT -/G AAAAAAACAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 0 1 324627 CASAVA_Build 21 24060791 1I AGGTTACTAA -/C CTTTTCTCAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 1 2 324628 CASAVA_Build 21 24062828 1D28M1I AGTATTCTAG AAAAAAAATCAATCTATAAAAGTAGTAAT-/-AAAAAAATCAATCTATAAAAGTAGTAATA AATTATTTGG 3070 hom 72 het 21 0 25 2 N/A 0 0 324629 CASAVA_Build 21 24063808 1I ATTTAATAGC -/T TTTTCCTTTG 1999 hom 12 het 5 0 5 0 T 4 5 324630 CASAVA_Build 21 24063886 29D29M6I AAAATATATA ATGTTATATAAAAATATTATATATATAATGTTATATAAAAATATTATTTTACATAATT------/-----------------------------GTTATATAAAAATATTATTTTACATAATTAACATG ACATATTATT 1471 hom 7 het 3 0 3 2 N/A 0 0 324631 CASAVA_Build 21 24063960 1I TATTTATGTA -/T TATAGTTTAT 1310 hom 7 het 5 0 3 2 T 1 2 324632 CASAVA_Build 21 24064862 25D CTGCTTCTAA TTTATGCCCCCAATTCACCTTCTGG/------------------------- TTTATGCCCC 3070 hom 72 het 27 0 25 7 TTTATGCCCCCAATTCACCTTCTGG 2 1 324633 CASAVA_Build 21 24065908 4D TTCAGCATAA TTGT/---- TTGTGTTTGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTGT 2 1 324634 CASAVA_Build 21 24066484 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2826 hom 26 10 13 5 A 12 13 324635 CASAVA_Build 21 24067350 1D TAAATCTCAC A/- GTTACCTTCT 3070 hom 138 het 51 0 47 7 A 1 0 324636 CASAVA_Build 21 24073575 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2276 het 879 hom 9 2 6 1 A 13 14 324637 CASAVA_Build 21 24075399 1I GAAAGGTAAA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 7 8 324638 CASAVA_Build 21 24077849 2I TGAATGATAA --/AT ATATATATAT 1408 het 1408 ref 23 14 3 6 AT 8 9 324639 CASAVA_Build 21 24080410 1D CCCTCCTCTG A/- AAAAGTCTCT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 5 4 324640 CASAVA_Build 21 24082984 9D GTTTTTCCCC CCTAGGAGT/--------- TGTACAGTGT 3070 het 3070 ref 27 14 13 1 CCTAGGAGT 1 0 324641 CASAVA_Build 21 24103545 2D TTTCTCCAAG TT/-- TTTGCCGTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 5 3 324642 CASAVA_Build 21 24105003 1D ATAAAGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 32 7 A 11 10 324643 CASAVA_Build 21 24108396 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 8 324644 CASAVA_Build 21 24108706 2I TGAAAGTGTC --/TA TGTCTTCGTA 3070 hom 80 het 33 0 26 7 TA 0 1 324645 CASAVA_Build 21 24113837 1I ACAACAACAA -/T TAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 1 2 324646 CASAVA_Build 21 24119618 4D AAGTTTTAAA TAAT/---- TCTTTTTGGA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TAAT 1 0 324647 CASAVA_Build 21 24119886 5D CGTGAGAGCA TTCAG/----- TTCAGTTTCT 3070 hom 108 het 42 0 36 10 TTCAG 2 1 324648 CASAVA_Build 21 24120821 1I GAAATTATTA -/C CCTGAATTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 2 3 324649 CASAVA_Build 21 24126364 1D AAGGCTTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 9 8 324650 CASAVA_Build 21 24126520 1D CTTAACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 600 hom 32 2 24 6 T 15 14 324651 CASAVA_Build 21 24130335 2D AGTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 36 hom 21 1 11 9 A 18 16 324652 CASAVA_Build 21 24131189 1D TTGTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 28 4 12 12 T 17 16 324653 CASAVA_Build 21 24131727 1I AATCTAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 112 het 39 0 38 1 T 9 10 324654 CASAVA_Build 21 24137192 8D GTCACTCTAC ACTCTAAG/-------- ATATATGCTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 ACTCTAAG 1 0 324655 CASAVA_Build 21 24138811 1I TAGGTAATTT -/A ATTTTAAAAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 2 324656 CASAVA_Build 21 24146001 2D TAGAGTCTGG AA/-- AAGACATTGA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 4 2 324657 CASAVA_Build 21 24147745 1I TTGATCAATA -/G TATCAGAAGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 0 1 324658 CASAVA_Build 21 24148067 2D ATGAGAGAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 57 het 30 0 19 13 GA 9 8 324659 CASAVA_Build 21 24168059 1I TAGGAAATGT -/C CACAAGTACT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 C 1 2 324660 CASAVA_Build 21 24180606 1I TGGTCTAATC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 8 9 324661 CASAVA_Build 21 24180733 4I TTTAATTAAC ----/TATT TATTAAATTA 2813 het 2813 ref 22 11 6 5 TATT 1 2 324662 CASAVA_Build 21 24186598 1I ACCCGGGAGG -/T GGAGGTTGCA 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 0 1 324663 CASAVA_Build 21 24200101 1I TTTTCAATTC -/T TTTGTGATTT 3070 het 3014 hom 29 7 16 6 T 3 4 324664 CASAVA_Build 21 24206088 4D AGTCATAATT TACA/---- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TACA 1 0 324665 CASAVA_Build 21 24215910 1I CACATGGTAA -/T TCTCAGAGAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 1 2 324666 CASAVA_Build 21 24217030 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 17 1 12 5 A 14 13 324667 CASAVA_Build 21 24217631 1I CCTCCTCAAT -/G CTAATTTCTC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 G 0 1 324668 CASAVA_Build 21 24220467 3I4M1I TTTATTTTAT ---TTTA-/TTATTTAT TTTTATTTTA 1543 het 1543 ref 15 6 6 5 N/A 0 0 324669 CASAVA_Build 21 24224036 1I AAATTTGCAA -/T GCTGCGGAAC 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 0 1 324670 CASAVA_Build 21 24230401 1I TTCTGTGGGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 7 8 324671 CASAVA_Build 21 24238257 3I ACTCTCAGTT ---/CTC CTCTCTTTGA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 CTC 1 2 324672 CASAVA_Build 21 24251683 1D TAGTAAGAAA C/- CCCATTGGGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 4 3 324673 CASAVA_Build 21 24253858 1D GTATTTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 12 11 324674 CASAVA_Build 21 24257532 6D CAAATTTTTG TTATTA/------ TTATAATTAA 3070 het 3070 hom 45 14 29 5 TTA 3 1 324675 CASAVA_Build 21 24260063 1I TACACTTGAG -/A TGCATGACGG 3070 hom 102 het 41 0 31 10 A 0 1 324676 CASAVA_Build 21 24260321 1I CACATGGTTT -/G GCCCCAAATG 3070 hom 74 het 33 0 24 9 G 1 2 324677 CASAVA_Build 21 24268212 1D CTTTTTAACA T/- TTTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 46 27 18 1 T 5 4 324678 CASAVA_Build 21 24268503 1D TGCTAGGTAT A/- ATGTGCTAAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 2 1 324679 CASAVA_Build 21 24269281 1I ACTGCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 11 12 324680 CASAVA_Build 21 24273619 1I CATGGGATGA -/C CCTCACTAGA 1764 het 1764 ref 14 10 4 0 C 2 3 324681 CASAVA_Build 21 24278322 1I CTGACACTGA -/C TTTTATGCTA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 C 0 1 324682 CASAVA_Build 21 24278730 1I CCTTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1087 het 1087 ref 51 39 3 9 A 10 11 324683 CASAVA_Build 21 24280662 1I ATTATCTCTT -/G ACTGCAGCCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 324684 CASAVA_Build 21 24283155 1D TAAAAACTGT A/- AAAAGCACTT 2552 het 1833 hom 12 4 6 2 A 5 4 324685 CASAVA_Build 21 24287343 4D AACACACATG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 34 15 17 3 CA 7 5 324686 CASAVA_Build 21 24288684 4I TCTATCGATC ----/ATCT ATCTATCATC 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 ATCT 1 2 324687 CASAVA_Build 21 24291618 4D ATCTATCAAG CAAT/---- CAGACTATCG 3070 het 3070 ref 54 28 24 7 CAAT 1 0 324688 CASAVA_Build 21 24315231 1D16M14D TTGGCTGTGT CCCCCCCCCAAATATCATCTTGAATTATAGC/-CCCCCCCCAAATATCA-------------- TCTCATAATC 3070 het 3070 ref 36 20 16 7 N/A 0 0 324689 CASAVA_Build 21 24316071 1I AGACTCTAAA -/T GAAGGTGGCT 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 0 1 324690 CASAVA_Build 21 24319307 1I TAGACTCGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 A 9 10 324691 CASAVA_Build 21 24319912 1I AGTCCATTGA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 7 8 324692 CASAVA_Build 21 24322198 1D ATGGTTGTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 12 21 5 T 9 8 324693 CASAVA_Build 21 24323832 3D TCCTCCTGCC TCA/--- TCATCTTCCT 3070 het 3070 ref 39 19 17 6 TCA 2 1 324694 CASAVA_Build 21 24324152 1D CTGATTTTTT A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 36 21 12 6 A 7 6 324695 CASAVA_Build 21 24325958 1D ATCGTTAGAA T/- TGTGGGAATG 3070 het 3070 ref 47 23 19 7 T 2 1 324696 CASAVA_Build 21 24326738 3D CACATGATAC ATA/--- ATAACTACTC 3070 het 3070 ref 42 23 16 6 ATA 2 1 324697 CASAVA_Build 21 24327191 1D TAGGGGTTTT C/- CCCCTCATGT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 C 5 4 324698 CASAVA_Build 21 24327932 1D CCAAGCCTAC A/- AAACCTCAGT 3070 het 3070 hom 60 19 36 5 A 4 3 324699 CASAVA_Build 21 24328381 3D TTAATTGAAG AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 AAC 3 2 324700 CASAVA_Build 21 24328853 1D AAAATAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1526 hom 29 4 23 2 T 11 10 324701 CASAVA_Build 21 24329042 4D AATAACTGTT AATA/---- AATAAATAAA 3070 het 2482 hom 18 6 10 2 AATA 5 4 324702 CASAVA_Build 21 24330337 6D TAACTCAATC AGACAA/------ AGACAAAGAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 4 AGACAA 2 1 324703 CASAVA_Build 21 24331002 1D GACACAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 20 12 8 A 10 9 324704 CASAVA_Build 21 24331664 4D ATCACTGAAC TAAG/---- TAAGTTTTCA 3070 het 3070 hom 27 10 15 3 TAAG 2 1 324705 CASAVA_Build 21 24331785 3I GCAAAATTTA ---/TTC TTCAAAAAAC 3070 het 3070 hom 16 7 7 2 TTC 1 2 324706 CASAVA_Build 21 24331915 1I TATGAAAAAA -/T GTATGCTAAT 2363 het 2363 ref 16 8 5 3 T 0 1 324707 CASAVA_Build 21 24332768 1I GGAATCGTGT -/A AACCTTTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 3 324708 CASAVA_Build 21 24337657 1D ATGAACCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2003 hom 30 9 13 9 T 16 15 324709 CASAVA_Build 21 24342038 1I TCCATGTGAT -/G TTTTTAGCGT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 324710 CASAVA_Build 21 24342427 2D AAAGCTTACA CT/-- TTCTTGATAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CT 1 0 324711 CASAVA_Build 21 24345455 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 1075 het 1075 ref 26 12 3 11 A 15 14 324712 CASAVA_Build 21 24346173 1I CATGGGTAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 8 9 324713 CASAVA_Build 21 24351688 1I CTTCTTGAAA -/T TTGTCCTCTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 2 3 324714 CASAVA_Build 21 24360435 1D ATTAGAGTAA C/- CGACATCCAG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 C 2 1 324715 CASAVA_Build 21 24360703 1I ATAAGAGGTG -/T CCCAGTAATC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 0 1 324716 CASAVA_Build 21 24362804 4I ATTGATAGAT ----/TGAG TGAAGAAGAT 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 TGAG 0 1 324717 CASAVA_Build 21 24363177 3I GATTATAGAG ---/AAA AAAAATTAAT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 5 8 324718 CASAVA_Build 21 24371100 2D AGTCTTTCTC TT/-- TCCACCGAAT 3070 het 3070 ref 41 21 19 3 T 3 1 324719 CASAVA_Build 21 24372569 4D ATCATGACTC TAAG/---- TGTCTTATTT 3070 het 3070 ref 36 21 15 1 TAAG 1 0 324720 CASAVA_Build 21 24373386 1D TTTTAGATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 9 11 A 11 10 324721 CASAVA_Build 21 24373784 3I TGAAAAATCT ---/AGA AGAAATCAAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 AGA 1 2 324722 CASAVA_Build 21 24375258 5D TAATTTAATT ATAAC/----- ATAACAAACC 3070 het 3070 ref 19 9 8 3 ATAAC 2 1 324723 CASAVA_Build 21 24376370 1I CATCAAATCC -/T TGGTGATTAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 1 2 324724 CASAVA_Build 21 24384613 3D AGCAACATAT AGA/--- AGAATGAAAC 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 AGA 2 1 324725 CASAVA_Build 21 24385488 1I CAGCCATAAG -/A AAAAAATGAA 2501 het 2501 ref 27 16 7 4 A 6 7 324726 CASAVA_Build 21 24386495 1D AGTATATTCC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 15 13 3 A 9 8 324727 CASAVA_Build 21 24388106 1I CTAATATAAT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 8 324728 CASAVA_Build 21 24388472 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 7 8 324729 CASAVA_Build 21 24389142 1D TTTCGGTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 T 10 9 324730 CASAVA_Build 21 24389408 2I GTTAGAAGCT --/TC TCTTTCTTCT 3070 het 3070 hom 36 12 23 4 TC 1 2 324731 CASAVA_Build 21 24390182 1D TGGAGCCCTG A/- ACACTAGCCC 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 A 2 1 324732 CASAVA_Build 21 24390688 1I AAAATGCAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 2931 hom 33 9 21 3 T 8 9 324733 CASAVA_Build 21 24394411 6I GGTTACTTAT ------/TATTTC GGTGCAGTCA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TATTTC 0 1 324734 CASAVA_Build 21 24394507 2D ATTTAACACA TT/-- TTTTTTTTCA 3070 hom 54 het 32 0 19 16 T 10 8 324735 CASAVA_Build 21 24395337 1D GTTTTTTGTC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 52 21 22 10 T 8 7 324736 CASAVA_Build 21 24397251 12D TTATTCATCC ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 4 AT 12 6 324737 CASAVA_Build 21 24398608 1I CATTAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 10 11 324738 CASAVA_Build 21 24403683 1D TTTAATAGGA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 T 8 7 324739 CASAVA_Build 21 24403949 1D TGTAGATTTT A/- ATCTGTTGGG 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 2 1 324740 CASAVA_Build 21 24408473 2I GATTAAAGAC --/TT ATATCTAGCC 1853 het 1853 ref 18 9 6 3 T 0 2 324741 CASAVA_Build 21 24408603 1D TACTAAAAAT A/- CAAAAAAAAT 2908 hom 21 het 8 0 8 0 A 1 0 324742 CASAVA_Build 21 24408902 8I CAAAGCAAAA --------/ATGAACAG ATGAGATCAT 3070 hom 73 het 31 0 27 4 ATGAACAG 0 1 324743 CASAVA_Build 21 24411540 1D4M8I TTGGACAAAG ATAGA--------/-GAGATGTTGTTT CAGTCCCTAG 3070 het 3070 hom 38 20 18 4 N/A 0 0 324744 CASAVA_Build 21 24414899 1D CTGTCCTTAA G/- CAGGTGGTTA 3070 het 3070 ref 49 26 21 2 G 1 0 324745 CASAVA_Build 21 24416287 1D ACTGATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1204 hom 49 12 25 14 T 15 14 324746 CASAVA_Build 21 24420017 1I TCAGGTCACT -/G CAACCTCCGC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 0 1 324747 CASAVA_Build 21 24421428 3D TATATTTATG TTA/--- TTATAATTTT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 TTA 2 1 324748 CASAVA_Build 21 24421677 5I TGTTACTGAT -----/TACTC TGCTCTGTAC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 TACTC 0 1 324749 CASAVA_Build 21 24423515 1D ATAGTTTTTT A/- AAATGTTTTA 3070 hom 36 het 23 0 13 10 A 4 3 324750 CASAVA_Build 21 24425971 1D GATGCAGTTG T/- TTGGAGACTT 3070 hom 96 het 36 0 33 6 T 3 2 324751 CASAVA_Build 21 24426113 2D GATAAGAAAC AG/-- AGTACTGAAC 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 AG 2 1 324752 CASAVA_Build 21 24428899 1I TATTTTTACA -/T TTTTTTTATT 3070 hom 75 het 31 0 24 7 T 7 8 324753 CASAVA_Build 21 24436700 1I31M1I ATCAAGATAA -TAATGATAATTTTATGAATAATTACTGCAAA-/CTAATGATAATTTTATGAATAATTACTGCAAAC GATCAGCTCA 3070 hom 129 het 37 0 44 6 N/A 0 0 324754 CASAVA_Build 21 24466817 1I TTTACTAATT -/G CCTTAATATA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 G 0 1 324755 CASAVA_Build 21 24468446 1I ATTGCTGCTG -/T TAACAATTTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 1 2 324756 CASAVA_Build 21 24492966 2I TATATATCAC --/AT GTGTTACATA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 324757 CASAVA_Build 21 24508760 5D AATAAAAAAC AAAAG/----- AAAGGGAGGG 2362 hom 20 het 8 0 6 5 AAAAG 1 0 324758 CASAVA_Build 21 24509976 2D CTTTTCTAAC AT/-- GTGTTATTCC 3070 het 3070 hom 39 13 22 6 AT 1 0 324759 CASAVA_Build 21 24516358 2I TAGATAAAAG --/AT ATACCATGTA 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 AT 1 2 324760 CASAVA_Build 21 24524707 1D AGAGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2043 hom 32 8 10 14 T 15 14 324761 CASAVA_Build 21 24526825 5I GGCTTGCAAA -----/TTAAT TTAATAAATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTAAT 1 2 324762 CASAVA_Build 21 24529092 1D TTTGTTGCAT G/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 G 1 0 324763 CASAVA_Build 21 24577734 5I CTACAACTAA -----/ATAAG ATAAGCTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATAAG 1 2 324764 CASAVA_Build 21 24577982 5I ATAATATTTA -----/AAATG AAATTAAGTG 3070 hom 76 het 28 0 26 2 AAATG 0 1 324765 CASAVA_Build 21 24584673 1I GTCAGATTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 79 het 34 0 28 6 T 9 10 324766 CASAVA_Build 21 24585454 4I TTATTTTCTA ----/AATT AATAAATTAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 AATT 0 1 324767 CASAVA_Build 21 24586089 4I TTTCTCTCTC ----/TATT TATTTCCTAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TATT 1 2 324768 CASAVA_Build 21 24588021 1I GCTTCAGTCC -/T TTTCCTCTTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 3 4 324769 CASAVA_Build 21 24591164 1D TTTTTTTAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 7 324770 CASAVA_Build 21 24604547 1D CCGCCACCAC G/- GCCCGGCTAA 2282 hom 23 het 9 0 7 2 G 2 1 324771 CASAVA_Build 21 24616359 1D CCACCAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 113 het 42 0 37 5 T 11 10 324772 CASAVA_Build 21 24632442 4I ACAAACAAAT ----/AAAC AAAAACTAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AAAC 0 1 324773 CASAVA_Build 21 24635244 2D TACCCCTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 34 0 21 14 T 13 11 324774 CASAVA_Build 21 24638173 2I CAATTTGTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 142 hom 43 2 31 10 GT 7 8 324775 CASAVA_Build 21 24641209 1D ACACTAATAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 9 8 324776 CASAVA_Build 21 24643189 3D GGCGGATCAC GAG/--- GTCAGGAGAT 3070 hom 36 het 18 0 12 6 GAG 1 0 324777 CASAVA_Build 21 24643757 2I TTTTGTTAAT --/TA TATTTTCTGT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TA 1 2 324778 CASAVA_Build 21 24645054 4D TTAAAGAAAG AAAT/---- AGAGAACTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 3 AAAT 1 0 324779 CASAVA_Build 21 24652026 2D TGTGTGCGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 86 het 33 0 28 6 TA 7 6 324780 CASAVA_Build 21 24660438 1D TAACAATAAT G/- GGAATTAAAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 3 2 324781 CASAVA_Build 21 24663911 1I TCTGATTATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1709 hom 43 4 37 2 A 9 10 324782 CASAVA_Build 21 24666354 1I GAACCAAAAA -/T CTATCTTTAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 0 1 324783 CASAVA_Build 21 24667575 1I8M1I5M1I TTTGTCACAG -AAAAAATG-ACATT-/AAAAAAATGAACATTA ATAGTAAATG 3070 hom 75 het 25 0 26 5 N/A 0 0 324784 CASAVA_Build 21 24668140 1D5M3D CTTTTTTTTT CCACTGTGT/-CACTG--- TGTTATTTTA 3070 hom 144 het 49 0 49 3 N/A 0 0 324785 CASAVA_Build 21 24668974 1I ATACTGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1472 hom 37 4 23 10 T 11 12 324786 CASAVA_Build 21 24671331 1D GCTTTCAGTA C/- ACAAAGGGTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 1 0 324787 CASAVA_Build 21 24680253 1I GATGACCCAG -/A AAAATATTTG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 4 5 324788 CASAVA_Build 21 24686829 1I AATTAAAAAC -/A TCATAGTGTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 1 324789 CASAVA_Build 21 24690703 1I GAAACGGGGG -/A AAACAATGAC 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 3 4 324790 CASAVA_Build 21 24691030 1I ATTTAAAATC -/A TTTTTTTAGA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 0 1 324791 CASAVA_Build 21 24691433 1I6M1I CAGAATTTGT -GACCAC-/GGACCACA AAGAGATACA 3070 hom 129 het 46 0 44 5 N/A 0 0 324792 CASAVA_Build 21 24697273 2I AATTTAAAAA --/AG TAGGCAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AG 0 1 324793 CASAVA_Build 21 24697346 1D TTCCACTCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 10 9 324794 CASAVA_Build 21 24709585 1D ACTTTCTGCC T/- TTTTTCTGCA 3070 hom 153 het 55 0 51 4 T 6 5 324795 CASAVA_Build 21 24710623 1I TCAGCCCTTG -/T TTAGCATATC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 2 3 324796 CASAVA_Build 21 24728578 1D CCAGATGTGT G/- CTCTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 1 0 324797 CASAVA_Build 21 24744257 1I TTAGGCAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 369 hom 33 1 28 4 A 9 10 324798 CASAVA_Build 21 24763887 4D AAAAAAAAAA AGAC/---- AGAAATCAGA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 AGAC 1 0 324799 CASAVA_Build 21 24799875 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 962 hom 19 2 11 6 T 15 14 324800 CASAVA_Build 21 24805099 1I TTTTAGAAAC -/T TCCCAGGTTA 3070 hom 79 het 29 0 26 3 T 1 2 324801 CASAVA_Build 21 24816524 1I GGTAGATTGG -/T TTTTCCTTTA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 4 5 324802 CASAVA_Build 21 24817201 1D GACCTTGGCC G/- GGACACCAGA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 3 2 324803 CASAVA_Build 21 24819230 3I AAATAAAAAG ---/CTT CTGTACAACA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 CTT 0 1 324804 CASAVA_Build 21 24827714 3D TACTAAAGAC CTA/--- CTGTTGACTG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 CTA 1 0 324805 CASAVA_Build 21 24832494 1D TTTCTGTCCC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 8 7 324806 CASAVA_Build 21 24838180 5D TTTTCCTCTT ATATC/----- AGTTAGAAGC 3070 het 3070 hom 40 17 23 1 ATATC 1 0 324807 CASAVA_Build 21 24839754 1D AAGTATTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1020 hom 28 7 9 12 A 12 11 324808 CASAVA_Build 21 24844135 2I TTTTTTTTTT --/CA TTCTTATTTG 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 CA 0 1 324809 CASAVA_Build 21 24846499 1I ATAAAAATTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 7 8 324810 CASAVA_Build 21 24846661 1D TCAAAAAAAA T/- ATATTCTTTA 3070 het 3070 hom 46 20 22 5 T 1 0 324811 CASAVA_Build 21 24846974 1D GTGTTGCTCT A/- TGCCTACGCT 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 1 0 324812 CASAVA_Build 21 24851519 1I CTTAGAAACC -/T GCAAAGAGAC 3070 het 3070 ref 39 23 15 2 T 0 1 324813 CASAVA_Build 21 24852894 1D AATCAATGAC A/- AAAACAACGT 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 A 5 4 324814 CASAVA_Build 21 24857307 1I TCCAATTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 823 hom 50 3 38 9 T 11 12 324815 CASAVA_Build 21 24864054 1I GGGGAAGATT -/A TGATAAGAAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 0 1 324816 CASAVA_Build 21 24864389 4I ATCATTTTCA ----/TTGT TTAAGTTAAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TTGT 0 1 324817 CASAVA_Build 21 24885307 9D TAATTGTGTA TTTATTTTG/--------- TTTCAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 4 TTTATTTTG 1 0 324818 CASAVA_Build 21 24892299 1D AATTGCATTA T/- TTTTTGTCAA 3070 hom 49 het 35 1 29 5 T 6 5 324819 CASAVA_Build 21 24894083 2I GTTTTATTTT --/TA TATCATAGCA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 TA 1 2 324820 CASAVA_Build 21 24894295 1I AATGAATCCC -/A AAGGTAAACA 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 A 2 3 324821 CASAVA_Build 21 24896386 1D GTTGGCTGTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 9 8 324822 CASAVA_Build 21 24897952 29I GTATAACATA -----------------------------/CTTCTTTTTATAGAATAAAAAGAAGGATC CTTCTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 CTTCTTTTTATAGAATAAAAAGAAGGATC 0 1 324823 CASAVA_Build 21 24899101 1I ATCTGGAGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2504 hom 18 7 10 1 A 9 10 324824 CASAVA_Build 21 24904591 1I GCTCAAATTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 T 8 9 324825 CASAVA_Build 21 24906468 2I ATCATGGAGG --/AA GGCAAGGAGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 2 324826 CASAVA_Build 21 24912073 1D TCTCCAATGC A/- AAAAAAAAAA 2679 het 2679 ref 26 11 9 6 A 12 11 324827 CASAVA_Build 21 24924084 3I GTATAAAAGT ---/ATA ATATTTTGTA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 ATA 1 2 324828 CASAVA_Build 21 24925173 2D AACAGTAGGA TG/-- TGTGTGTGTG 3045 het 3045 ref 35 13 10 15 TG 10 9 324829 CASAVA_Build 21 24925871 1I GGGAATTGAT -/C AAGAGGTTGT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 0 1 324830 CASAVA_Build 21 24930838 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 708 het 708 ref 5 2 3 0 A 1 0 324831 CASAVA_Build 21 24931375 1D AATGTTTGCT A/- AAAAAAAAAA 1273 het 1273 ref 38 28 4 6 A 11 10 324832 CASAVA_Build 21 24935032 1I TTTGAGATGT -/C CCCCCCATTC 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 C 6 7 324833 CASAVA_Build 21 24938590 1I AGCCACTGCA -/C CCGGCCCTCT 3070 hom 47 het 20 0 16 4 C 2 3 324834 CASAVA_Build 21 24980576 1D AAAAAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 13 12 324835 CASAVA_Build 21 24982421 1D GATACAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 13 21 15 T 13 12 324836 CASAVA_Build 21 24992020 1D GATTCTTTTT G/- CCATAAATGA 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 G 1 0 324837 CASAVA_Build 21 24992709 3I TGAAAAAAAT ---/TAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TAA 0 1 324838 CASAVA_Build 21 24994299 15I CTATTAACCT ---------------/TAAATGTAAATAGTC TAAATGCCTC 3070 het 342 hom 34 2 19 14 TAAATGTAAATAGTC 0 1 324839 CASAVA_Build 21 24998772 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 20 14 3 A 10 9 324840 CASAVA_Build 21 25010000 3D AGACCCTGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 753 het 401 hom 20 4 5 15 A 19 16 324841 CASAVA_Build 21 25013647 1I GTCTTACCTC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 8 9 324842 CASAVA_Build 21 25027440 7I GACCCAGAGC -------/AAAGAAA TCCCCCCAGA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 AAAGAAA 0 1 324843 CASAVA_Build 21 25030246 1D GCCATTCTAA T/- TTGGTGTGAG 3070 het 1972 hom 14 5 7 2 T 3 2 324844 CASAVA_Build 21 25032074 1I ATTGAAACGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 A 9 10 324845 CASAVA_Build 21 25047205 1D ATCAGTGCCA T/- TTTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 45 19 20 7 T 6 5 324846 CASAVA_Build 21 25061543 2D AATCCCACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 7 6 T 12 10 324847 CASAVA_Build 21 25062453 4I ACCTGCCATT ----/TCTC TCTATCAATA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TC 1 3 324848 CASAVA_Build 21 25067483 1D GTGATGGGGG A/- ATTTGTGTAA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 2 1 324849 CASAVA_Build 21 25068437 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATATTA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 T 0 1 324850 CASAVA_Build 21 25069960 4I AGCAATGAAG ----/TGTT TGTTAAGTCT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 TGTT 1 2 324851 CASAVA_Build 21 25070435 1I TTAATTACAA -/T TGTGCAAACT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 324852 CASAVA_Build 21 25071004 1I AAAATTACTA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 50 33 13 4 T 6 7 324853 CASAVA_Build 21 25072590 1I AATCAAAAGA -/C CCAATTTCTT 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 C 2 3 324854 CASAVA_Build 21 25074839 1I GAAACAATTA -/T TTTTTTCCTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 7 324855 CASAVA_Build 21 25075450 1D CTGCTCTGAC A/- GTCTTCTAAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 1 0 324856 CASAVA_Build 21 25080923 1I CAAAACAATT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 A 8 9 324857 CASAVA_Build 21 25085662 1D CAATGTGCGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 17 15 12 T 10 9 324858 CASAVA_Build 21 25089043 1I TCATTCTAGA -/T TTCTCCTATG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 3 324859 CASAVA_Build 21 25094694 1I ACAATATTTT -/G TAAGCCAGTA 3070 het 3070 ref 40 19 19 2 G 0 1 324860 CASAVA_Build 21 25100296 1D CACAGCCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 11 10 324861 CASAVA_Build 21 25104043 2I GGGATCAAAG --/GA GAGAGTTAGT 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 GA 2 3 324862 CASAVA_Build 21 25105085 1I TTTATTCCAC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 6 7 324863 CASAVA_Build 21 25106067 1I AAGTCTCTCC -/T TTTTTTTTTT 1053 het 1053 ref 37 10 8 19 T 17 18 324864 CASAVA_Build 21 25106761 1D GGTCTGAGGC T/- TTTTTGGAGG 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 T 6 5 324865 CASAVA_Build 21 25117513 7D AGCTGTGCCC ACCTCCT/------- TCCTTGCGGT 3070 het 3070 hom 39 18 18 7 ACCTCCT 1 0 324866 CASAVA_Build 21 25119327 1I GTCTATAAAG -/A AGCAATTTCC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 1 2 324867 CASAVA_Build 21 25121063 1D CTGGAATCCC A/- ATACAGCGAT 3070 het 3070 ref 41 22 11 9 A 2 1 324868 CASAVA_Build 21 25125604 1D GACCACAAAA C/- CCCCTCACAC 3070 het 3070 hom 55 23 27 5 C 5 4 324869 CASAVA_Build 21 25130546 1I AGGAGGCGGA -/G CTTGTAGTGA 2184 hom 12 het 6 0 5 1 G 0 1 324870 CASAVA_Build 21 25130608 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1379 het 1129 hom 8 3 3 2 A 11 10 324871 CASAVA_Build 21 25133953 1I TCCTTCCGTA -/G GTTTGTGGTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 G 1 2 324872 CASAVA_Build 21 25137563 1D AAACTCCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 19 16 6 T 10 9 324873 CASAVA_Build 21 25140293 44D CCATGGTGTG ATTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------------- ATATATATAT 3070 het 61 hom 11 1 8 3 ATTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 324874 CASAVA_Build 21 25149638 1D AGATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 13 12 324875 CASAVA_Build 21 25150212 1I TTCTCTCCTT -/G GGTTGCAGAC 3070 het 3070 ref 54 22 17 15 G 2 3 324876 CASAVA_Build 21 25153876 2D TATTAGATGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 AT 9 8 324877 CASAVA_Build 21 25162468 2D CATAGAACAA GT/-- GTGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 GT 3 2 324878 CASAVA_Build 21 25165685 2I CAACTAAATC --/TT TGTGTTTTAG 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 T 1 3 324879 CASAVA_Build 21 25166314 3D TTACTCCCCT TTC/--- TTCTTCTCCT 3070 het 3070 hom 54 21 26 8 TTC 3 2 324880 CASAVA_Build 21 25170255 1I TCAATTATAA -/C CCCTTGCGCT 3070 het 3070 ref 52 28 22 2 C 3 4 324881 CASAVA_Build 21 25184107 4D TATGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 1416 hom 22 4 13 5 TA 9 7 324882 CASAVA_Build 21 25189829 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 8 9 324883 CASAVA_Build 21 25208790 1D GTTGAGCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 10 9 324884 CASAVA_Build 21 25211754 1D GGTTCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 23 0 20 3 T 11 10 324885 CASAVA_Build 21 25222405 1D GAGCCCTCAT G/- GGGAACCTCT 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 G 4 3 324886 CASAVA_Build 21 25222863 1I AGTAACTAAC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 8 9 324887 CASAVA_Build 21 25226397 2D CGCTTTCCAA AG/-- AGAGCATGTT 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 AG 3 2 324888 CASAVA_Build 21 25226602 1D TTAATTTTAG T/- TGTCAATTTG 3070 het 3070 hom 46 21 22 4 T 2 1 324889 CASAVA_Build 21 25233435 1D GCAAGACAAA G/- GATTGTGTCC 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 G 2 1 324890 CASAVA_Build 21 25246412 3I AAGCTCTGAA ---/TTC TTCTTGTTCT 3070 het 3070 ref 50 21 22 7 TTC 1 2 324891 CASAVA_Build 21 25247477 3D TCCCGAAAGT TGA/--- TTGGTGCGGT 3070 het 3070 hom 41 14 22 9 TGA 1 0 324892 CASAVA_Build 21 25249109 1I CCGGCACGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 78 het 27 0 23 5 G 1 2 324893 CASAVA_Build 21 25263924 49D TGAGGAGTGG GTCTTAAAGGGGGATTTGATAAGCAGGCTGTCCTTACAGTGAGGAGTGA/------------------------------------------------- GTCTTAAAGG 3070 het 3070 ref 61 38 19 30 GTCTTAAAGGGGGATTTGATAAGCAGGCTGTCCTTACAGTGAGGAGTGA 1 0 324894 CASAVA_Build 21 25275244 1I ATAGTAGGAC -/A AAACTTACTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 3 4 324895 CASAVA_Build 21 25275507 1I ACTCCTGAAA -/G GGCCAGAGAT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 2 3 324896 CASAVA_Build 21 25277816 1I TAGGAACCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 A 9 10 324897 CASAVA_Build 21 25282499 2D ATTTGTATGA GT/-- GTGTGTGGTT 548 het 548 ref 27 17 4 6 GT 4 3 324898 CASAVA_Build 21 25295625 1I TTAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 9 10 324899 CASAVA_Build 21 25296900 1I ATGGCTAAAA -/G GAAACAGAAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 1 2 324900 CASAVA_Build 21 25298361 1I TGGTGGCTCA -/C ACCTGTACTC 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 C 0 1 324901 CASAVA_Build 21 25304850 1D CAACAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 13 12 324902 CASAVA_Build 21 25314308 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAATAGCT 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 A 6 5 324903 CASAVA_Build 21 25316383 3D TGTGTGTTAT GGG/--- GGGGGGGGGG 2702 hom 31 het 21 0 8 13 G 13 10 324904 CASAVA_Build 21 25317767 4I TAAAATTTTC ----/ATTT ATTTATTTAT 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 ATTT 3 4 324905 CASAVA_Build 21 25327906 1I CTGTTGCCCA -/T TTTTTCCTCC 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 5 6 324906 CASAVA_Build 21 25337136 3I GTTTTTTAAA ---/GAT GATGATATCT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 GAT 2 3 324907 CASAVA_Build 21 25339304 1I CAGCCTCACA -/G GGATTTGAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 2 3 324908 CASAVA_Build 21 25339442 1I78M1D TCATGACAGT -GCAGATTGAGGAGATGCTGGCAGCCAGAAACTATGTTATAGCACAGTGAAGAGTTTATGAGCATCTAAATAGAAAATTG/GGCAGATTGAGGAGATGCTGGCAGCCAGAAACTATGTTATAGCACAGTGAAGAGTTTATGAGCATCTAAATAGAAAATT- GGCAGAGCCA 3070 het 3070 ref 45 35 14 25 N/A 0 0 324909 CASAVA_Build 21 25355645 1D CCTGAGGGGG T/- TTTTTTTTTT 1780 het 294 hom 20 4 8 8 T 30 29 324910 CASAVA_Build 21 25357351 1I TCTTCTTGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 151 hom 25 1 17 7 T 9 10 324911 CASAVA_Build 21 25369286 4D TTGTTGCTAA TTAC/---- TTGCCATTAT 3070 het 3070 hom 40 15 23 4 TTAC 1 0 324912 CASAVA_Build 21 25382167 1D TGGCTTAGCT A/- AAAAAAAAAA 2244 het 2244 ref 29 20 7 2 A 13 12 324913 CASAVA_Build 21 25384507 2D CTAGAATGGG GA/-- GAGTGTAGAT 3070 het 3070 hom 37 12 21 5 GA 2 1 324914 CASAVA_Build 21 25384622 1D ATTTAAGTAC T/- TTGGTTAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 3 2 324915 CASAVA_Build 21 25397947 1I AAATATCATA -/T ATTCCTTAAT 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 T 0 1 324916 CASAVA_Build 21 25398932 2I CTAGAGGCAA --/TG ATATAGATAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 TG 0 1 324917 CASAVA_Build 21 25399135 1I AAATAACAGT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 8 9 324918 CASAVA_Build 21 25401568 1D GGACTCCAAT G/- GTTTTCTCTG 3070 het 3070 ref 46 23 16 7 G 2 1 324919 CASAVA_Build 21 25401854 3D AAGGTCACTT AAC/--- AATTTCTTTT 3070 het 3070 ref 42 32 9 2 AAC 1 0 324920 CASAVA_Build 21 25402719 1I CTGCTCTATC -/T TTTCCAATAC 3070 het 3070 hom 42 20 21 1 T 3 4 324921 CASAVA_Build 21 25405549 1D ATAATTGATA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 8 7 324922 CASAVA_Build 21 25414777 1I TTAGTTTTAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 22 9 9 4 T 7 8 324923 CASAVA_Build 21 25421854 1D AATTTAACCA G/- CAAAGTAAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 1 0 324924 CASAVA_Build 21 25423571 1D CTAAGTGTTC T/- TATGAAACAT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 2 1 324925 CASAVA_Build 21 25426649 1D TTCAGCCATT A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 32 18 11 4 A 7 6 324926 CASAVA_Build 21 25432106 2D TACACATTAA CT/-- CTATTTTTAA 2853 het 2853 ref 24 15 7 2 CT 2 1 324927 CASAVA_Build 21 25441591 1I TGGGAATTCT -/G GGACATACAA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 G 2 3 324928 CASAVA_Build 21 25447554 14I CCTCATTGCT --------------/GCATGGATGCTTTG GCATTGCAAA 3070 het 3070 ref 51 21 19 12 GCATGGATGCTTTG 0 1 324929 CASAVA_Build 21 25450327 4I GTTTATCATT ----/AAAC AAAATATTAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 AAAC 0 1 324930 CASAVA_Build 21 25450591 1D GGGATGAAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 10 9 324931 CASAVA_Build 21 25451680 1D AAATGCACAC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 9 8 324932 CASAVA_Build 21 25452531 5I TGAAGAGTTG -----/AAGTC AAGAATACCA 3070 het 3070 ref 28 17 11 0 AAGTC 0 1 324933 CASAVA_Build 21 25452643 4D AGAAAAAAGA GAAG/---- GAAGGAAGGG 2281 het 1443 hom 21 4 7 11 GAAG 3 2 324934 CASAVA_Build 21 25454792 1I TTTAAAAGAT -/A TTTTTTCATC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 0 1 324935 CASAVA_Build 21 25455146 4I TAGTATTCAG ----/ACAA ACAACCACTT 3070 het 3070 hom 48 16 26 6 ACAA 1 2 324936 CASAVA_Build 21 25456512 1D GAATTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2483 hom 34 8 23 3 A 11 10 324937 CASAVA_Build 21 25459985 1I TAAAGACATA -/C CCAAGACTGG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 C 2 3 324938 CASAVA_Build 21 25474970 1I CAATGAAAAT -/A AGAGATGAAT 3070 het 3004 hom 27 8 13 6 A 1 2 324939 CASAVA_Build 21 25475219 1D GTTCGATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 11 10 324940 CASAVA_Build 21 25481706 1D ATGTTAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2041 hom 30 8 17 5 T 11 10 324941 CASAVA_Build 21 25487859 1D ATGCATTGCT C/- CACAGTGCCA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 C 2 1 324942 CASAVA_Build 21 25497541 1I GGTAACAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 15 14 A 14 15 324943 CASAVA_Build 21 25500454 1D CAAAATCAGA T/- TAGTTTAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 2 1 324944 CASAVA_Build 21 25501283 1I TAACATAGAT -/A AAAACATTTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 4 5 324945 CASAVA_Build 21 25504276 1I TTGCAAAACT -/A GCCTCAAGAA 3070 hom 75 het 31 0 24 7 A 0 1 324946 CASAVA_Build 21 25504532 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 31 0 15 16 T 16 15 324947 CASAVA_Build 21 25522914 1D ACCCTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 1334 het 1334 ref 27 19 3 5 A 13 12 324948 CASAVA_Build 21 25526237 3I37M2D AAACTCACAC ---AGATTTTTTCTGACTGGTTTAGAAAAAAGAAAAAAAAAC/AGAAGATTTTTTCTGACTGGTTTAGAAAAAAGAAAAAAAA-- AGAACTCACC 3070 hom 120 het 31 0 41 2 N/A 0 0 324949 CASAVA_Build 21 25526690 15I ATAACAAAAG ---------------/CTTATAGATAAAACA CACAAAATGC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 CTTATAGATAAAACA 0 1 324950 CASAVA_Build 21 25528614 1I AATAAGAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 9 10 324951 CASAVA_Build 21 25551260 1D TGTCAAGAAG T/- TCCAGGCTGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 2 1 324952 CASAVA_Build 21 25593435 2I GATCAATAAG --/GA AATGACTAAG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 GA 0 1 324953 CASAVA_Build 21 25605277 1I AAGACCTCTG -/C AAGGAAAACT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 C 0 1 324954 CASAVA_Build 21 25616786 1I TCCAATAAAA -/T TACATTAGCT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 1 2 324955 CASAVA_Build 21 25621766 4D ACTCATTTTA TTGT/---- TTATTTTCTC 3070 het 3070 hom 46 21 23 4 TTGT 1 0 324956 CASAVA_Build 21 25635164 1D TTCCAGTTAC T/- ATGATCCAAT 3070 hom 110 het 41 0 37 4 T 1 0 324957 CASAVA_Build 21 25656363 1I9M1I AGCGGATGGT -GTTCCTGCT-/GGTTCCTGCTG CCCTCAAGGT 2290 hom 24 het 8 0 7 4 N/A 0 0 324958 CASAVA_Build 21 25661343 1I CTCTATCTCT -/G GCCAATTGTA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 1 2 324959 CASAVA_Build 21 25662287 1I CATGGTGAGA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 C 2 3 324960 CASAVA_Build 21 25670374 1D CATCTCATTT A/- ATAATGTCTC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 1 324961 CASAVA_Build 21 25670910 1I CCTTTTTAAA -/T TTGTTGGGAC 3070 hom 105 het 45 0 33 12 T 2 3 324962 CASAVA_Build 21 25681052 1I GCTAAAGCAA -/C CTACGGGACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 1 2 324963 CASAVA_Build 21 25688543 1I AGTGATTACA -/G GCTCACGCCA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 1 2 324964 CASAVA_Build 21 25689649 1D ATTATACAAT A/- AAAACCCAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 5 4 324965 CASAVA_Build 21 25697546 1D TCTCTTTGCC T/- TGCTGCCATC 3070 hom 54 het 23 0 18 6 T 2 1 324966 CASAVA_Build 21 25714342 2D GCCAGGAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 28 0 12 16 A 16 14 324967 CASAVA_Build 21 25715852 1I ATGCCTCCTG -/C CAAGAATTCA 3070 hom 132 het 53 0 44 9 C 1 2 324968 CASAVA_Build 21 25725723 1D CCATTCTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 987 hom 32 4 27 3 A 13 12 324969 CASAVA_Build 21 25745013 1D AGGGCAGGGA T/- AAAATGCTGC 3070 hom 65 het 24 0 22 2 T 1 0 324970 CASAVA_Build 21 25746449 2I ATAATACACA --/TG TGTTTTTGTA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TG 1 2 324971 CASAVA_Build 21 25760640 2D CACCCCATTC AG/-- AGTCACGTGC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 AG 2 1 324972 CASAVA_Build 21 25771986 9I GTAAACTTAA ---------/TAAAACATC TAGCTACAAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TAAAACATC 0 1 324973 CASAVA_Build 21 25785748 1I ACCCTAGCCA -/C ATACTCCTAA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 C 0 1 324974 CASAVA_Build 21 25791017 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 698 hom 30 3 18 9 A 15 16 324975 CASAVA_Build 21 25809752 1D CAAAAAGGGC A/- ATAGACTATA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 2 1 324976 CASAVA_Build 21 25809969 9D TTTAAACAAC TTCAATGTA/--------- TTCAATGTAT 3070 hom 87 het 35 0 30 7 TTCAATGTA 2 1 324977 CASAVA_Build 21 25818871 1D CTATCCTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 31 1 22 8 A 14 13 324978 CASAVA_Build 21 25858258 1D AAGTTAGAGG A/- AAGGCCATCA 3070 hom 105 het 37 0 34 3 A 3 2 324979 CASAVA_Build 21 25861764 3I ACCAGGAGAT ---/GAG GAGAAGCCAG 3070 hom 128 het 52 0 42 10 GAG 1 2 324980 CASAVA_Build 21 25867713 1D TACAAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 28 2 22 4 A 12 11 324981 CASAVA_Build 21 25869010 3I CTTCCTCCAT ---/AAA ATGGGGATAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 4 324982 CASAVA_Build 21 25871214 1D CACATAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 26 2 20 4 T 12 11 324983 CASAVA_Build 21 25871277 1D TTTTTGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 62 hom 23 1 9 13 T 13 12 324984 CASAVA_Build 21 25874794 3D AAAACGGTGT TAC/--- TACAGTGGTA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TAC 2 1 324985 CASAVA_Build 21 25882495 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 92 hom 24 1 20 4 A 11 10 324986 CASAVA_Build 21 25883605 2I CAATAGTAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 14 16 324987 CASAVA_Build 21 25884010 1I AACCATGCCT -/G GACTCAGGCG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 1 2 324988 CASAVA_Build 21 25884566 1I CTAATGAGCT -/A AAAAAAAAAA 993 het 993 ref 30 17 3 10 A 15 16 324989 CASAVA_Build 21 25885263 3D TATAGCCCAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 24 7 A 24 21 324990 CASAVA_Build 21 25885838 1I TGACTAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 51 1 44 6 A 10 11 324991 CASAVA_Build 21 25889882 4D TTGATTACAC TGAG/---- TAACATTTTA 3070 hom 93 het 32 0 32 2 TGAG 1 0 324992 CASAVA_Build 21 25890730 4I AACACACTCA ----/TAAC TAACCCAATA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TAAC 1 2 324993 CASAVA_Build 21 25890858 2D GACTCTGTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 13 11 324994 CASAVA_Build 21 25892442 1D CCATGGAGTC T/- GCAATCAGCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 1 0 324995 CASAVA_Build 21 25893040 2D TACTAAGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 33 0 20 13 A 18 16 324996 CASAVA_Build 21 25893057 2D AAAAAAAAAA AC/-- ACTACAAATT 3070 het 77 hom 32 4 19 9 AC 2 1 324997 CASAVA_Build 21 25893452 2D GATGCTTGAG TA/-- TTAGCTTTGT 3070 hom 148 het 52 0 50 2 TA 1 0 324998 CASAVA_Build 21 25894758 2D TCTACTTCTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 22 3 TA 1 0 324999 CASAVA_Build 21 25895535 6I CAAAAAGACA ------/TATACT TATATGTATA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 TATACT 0 1 325000 CASAVA_Build 21 25903815 3D TTGAGGATCA GGG/--- ATATAGTCAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 3 0 325001 CASAVA_Build 21 25904233 1D TTGGATCAGG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 8 7 325002 CASAVA_Build 21 25925478 6D CCATCAAGCC TCTTTT/------ TCTTTTTCTT 2991 hom 42 het 22 0 15 7 TCTTTT 3 2 325003 CASAVA_Build 21 25931673 5D GTCTTTTCTT ATCTC/----- ATTGCTTTCA 3070 hom 102 het 36 0 35 2 ATCTC 1 0 325004 CASAVA_Build 21 25935398 1D GGAGAAATCG T/- TAACAGAACA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 2 1 325005 CASAVA_Build 21 25935779 1D TATGTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 139 hom 42 1 35 6 T 11 10 325006 CASAVA_Build 21 25955736 1I AAAATATGTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 365 hom 21 1 18 2 T 7 8 325007 CASAVA_Build 21 25956618 1I CAGGCGTGAG -/C CACTGTGACC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 1 2 325008 CASAVA_Build 21 25965486 1I AAAATAATAC -/A AAAAAAATGC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 7 8 325009 CASAVA_Build 21 25977343 1I CCCAGTACTT -/C CCTGTCTCCT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 2 3 325010 CASAVA_Build 21 25981450 1I ATAGTGTCTC -/A TTTAATCTTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 325011 CASAVA_Build 21 25989030 2I AAAAAAAAAA --/AT AAATAAAAAG 3070 het 1092 hom 22 7 12 3 AT 0 1 325012 CASAVA_Build 21 26013305 1I CTCTCCAGTT -/C CAAAGGCTCC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 1 2 325013 CASAVA_Build 21 26014182 3D CACAGTTCTT AAG/--- AAGCTCTTCA 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 AAG 2 1 325014 CASAVA_Build 21 26025589 1D TTTCTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 11 10 325015 CASAVA_Build 21 26036418 1I26M1I TTCAGAATCC -AGGAGAGAACATGGGTAGAAATAGAC-/AAGGAGAGAACATGGGTAGAAATAGACA TTTGGGAGTC 3070 hom 174 het 53 0 58 5 N/A 0 0 325016 CASAVA_Build 21 26036559 1I AGTACTAGAG -/A ATCTCTGTGG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 1 2 325017 CASAVA_Build 21 26039251 4D TTGGTGATGA GCCT/---- GCCACAGTAT 3070 het 3070 hom 44 20 21 4 GCCT 1 0 325018 CASAVA_Build 21 26050374 4D TTTCCCTGAG TTTT/---- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 T 8 4 325019 CASAVA_Build 21 26051628 4D ATTTCTTGTA TTTC/---- TTAGTGTGTT 3070 het 3070 ref 31 15 15 4 TTTC 1 0 325020 CASAVA_Build 21 26054458 4D ATTCACAAGT CTTA/---- CTTCTCAGAA 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 CTTA 1 0 325021 CASAVA_Build 21 26058118 2I TGTTTAAATA --/CT CTCTTTGTCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 CT 2 3 325022 CASAVA_Build 21 26063145 4I AAGAAGTCTC ----/ATTT ATTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 ATTT 1 2 325023 CASAVA_Build 21 26065526 1D TCCCATATGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 T 9 8 325024 CASAVA_Build 21 26067930 1I39M1I11M1I TACATACTGC -AAAAATAAAACTGCAGAAGGCATCAGACATGTTAAAACG-CCTCAAGAATC-/AAAAAATAAAACTGCAGAAGGCATCAGACATGTTAAAACGCCCTCAAGAATCA AAAAGTTATG 3070 hom 135 het 27 0 45 7 N/A 0 0 325025 CASAVA_Build 21 26068532 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGTGCCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 1 2 325026 CASAVA_Build 21 26069365 3D TTCTGCCGCT ACA/--- ACAGCACTCC 3070 hom 76 het 31 0 25 8 ACA 2 1 325027 CASAVA_Build 21 26074431 4D GTTGAATGAA TGAG/---- TAAGGAATAA 3070 het 3070 hom 56 27 27 4 TGAG 1 0 325028 CASAVA_Build 21 26076149 1D TGTGTTTCTG A/- AAAAGTTGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 5 4 325029 CASAVA_Build 21 26079937 3D TTTTCTTTTC TTG/--- TTGTCAGGCT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TTG 2 1 325030 CASAVA_Build 21 26080133 1D ATTACACTTC T/- TAAGTAGATA 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 2 1 325031 CASAVA_Build 21 26080333 2D TGTCTCTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2598 hom 27 9 11 9 A 13 11 325032 CASAVA_Build 21 26081839 1I CAGTGGCTTA -/T TAAACAACAG 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 T 1 2 325033 CASAVA_Build 21 26083010 2D CCTGGTCAGT AG/-- ATATACACGG 3070 het 3070 hom 33 13 15 7 AG 1 0 325034 CASAVA_Build 21 26087153 1I ACAGAAAACG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 A 9 10 325035 CASAVA_Build 21 26088293 2D TATATGAATC AG/-- GGGCTTGGGG 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 AG 1 0 325036 CASAVA_Build 21 26088750 3I15M4I AACCTATGAC ---ATTATAATTTAATAA----/ATTATTATAATTTAATAAATTT ATTAACAGAA 3070 het 3070 hom 35 19 17 5 N/A 0 0 325037 CASAVA_Build 21 26089148 3I CTGTGACATC ---/ATG ATGAGAGAAT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 ATG 1 2 325038 CASAVA_Build 21 26104062 10D CCTCCCTCTC TCTCTCGCTT/---------- TCTCTCTCAC 3070 het 3070 ref 43 23 16 9 TCTCTCGCTT 1 0 325039 CASAVA_Build 21 26104599 1I17M1I ATAAAAAAAT -GCTACGCCACAGAGAGA-/GGCTACGCCACAGAGAGAG CAGCCCTGAG 3070 hom 50 het 18 0 18 3 N/A 0 0 325040 CASAVA_Build 21 26105107 1I GTGTCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 A 10 11 325041 CASAVA_Build 21 26105935 1I ATCCACCTCC -/T GCGTTCAGGC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 0 1 325042 CASAVA_Build 21 26110764 1D TTTTCAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 11 10 325043 CASAVA_Build 21 26118251 3D ATGAGTTCCT AGA/--- AGATTGATCC 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 AGA 2 1 325044 CASAVA_Build 21 26119928 1I ACTCCCAATT -/A AAAAAAAAAA 2140 het 2140 ref 25 13 8 4 A 11 12 325045 CASAVA_Build 21 26131004 1D GGGCTGCCGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 26 10 9 A 10 9 325046 CASAVA_Build 21 26139180 1D TCAAGGAATC T/- ACTCCATATT 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 T 1 0 325047 CASAVA_Build 21 26139662 1D ATGTCTATAC T/- TAGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 40 18 21 1 T 2 1 325048 CASAVA_Build 21 26157549 1I AATAAAATAC -/A TTCACATAGT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 0 1 325049 CASAVA_Build 21 26160725 1D ACTTTAGGAA T/- TTTTTTTTTT 830 het 495 hom 8 1 3 4 T 15 14 325050 CASAVA_Build 21 26165579 3D CCACAGAGGC GTG/--- GTGGTGGCAG 1700 het 1700 ref 25 7 7 12 GTG 3 2 325051 CASAVA_Build 21 26170238 1D TAAATTCAGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 8 7 325052 CASAVA_Build 21 26171025 2I CAAATACAAC --/TA TAAAAAGGTG 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 TA 1 2 325053 CASAVA_Build 21 26172981 1D TCCTACTTTC T/- TTAAAACTTC 3070 hom 78 het 29 0 25 6 T 3 2 325054 CASAVA_Build 21 26173367 4D GGGAGATGAC CGGT/---- CATTTTTTCT 3070 het 3070 hom 44 16 25 4 CGGT 1 0 325055 CASAVA_Build 21 26174313 4I AGAGCGAGAC ----/TCCG TCTCAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TCCG 0 1 325056 CASAVA_Build 21 26178744 1D TAGCACCAAT G/- AATGAGAGAT 3070 hom 135 het 46 0 45 2 G 1 0 325057 CASAVA_Build 21 26180958 1I AGGTTCTGCA -/C CCCCCCCTCA 1837 het 1837 ref 31 15 8 8 C 7 8 325058 CASAVA_Build 21 26181872 3D ACCTTTTCTA GTT/--- TGTTTAGATA 3070 het 3070 ref 43 24 19 0 GTT 1 0 325059 CASAVA_Build 21 26182956 1I TAAACTGACT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 7 8 325060 CASAVA_Build 21 26186343 2I CTACTTTCCC --/CT CACAGGTCAA 3070 hom 86 het 33 0 28 5 CT 0 1 325061 CASAVA_Build 21 26186654 1D62M3D TGTTACCTAC TTTTAGCTATAGTAATTCTGCAGAATTCTAATTAACCTTTAGCAGTGTAATGCTTTTTAAAGCATA/-TTTAGCTATAGTAATTCTGCAGAATTCTAATTAACCTTTAGCAGTGTAATGCTTTTTAAAGC--- ATGTTATTTC 3070 het 3070 ref 45 41 26 6 N/A 0 0 325062 CASAVA_Build 21 26195582 1I TTGGTGGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 11 12 325063 CASAVA_Build 21 26196017 1I TGCATGGCTC -/G GGGTCAAGGA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 G 3 4 325064 CASAVA_Build 21 26197282 1I CGGGCATGGT -/G GCTTATGCCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 1 2 325065 CASAVA_Build 21 26198184 1I GGTCTCCTGG -/C TCTGCTGCTG 3070 hom 126 het 47 0 40 7 C 0 1 325066 CASAVA_Build 21 26200141 1I AGCCACGGAG -/T GTAGGTGCAG 3070 hom 138 het 51 0 46 5 T 0 1 325067 CASAVA_Build 21 26200558 1I5M1I TGGCCTTGGG -ATGCG-/CATGCGC CCACTTCTGT 3070 hom 111 het 41 0 36 6 N/A 0 0 325068 CASAVA_Build 21 26200871 1D TATTTGCAGC A/- ACCTGTAATG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 2 1 325069 CASAVA_Build 21 26202876 1I TGGCTCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 35 0 21 14 A 13 14 325070 CASAVA_Build 21 26203754 1I TTACCAAGGG -/T TTCACAGTGT 3070 hom 120 het 45 0 41 5 T 2 3 325071 CASAVA_Build 21 26218852 1I GCATGCGGAG -/C TTAAAACCTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 0 1 325072 CASAVA_Build 21 26218965 1D GTAAACAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 815 hom 18 3 11 4 A 13 12 325073 CASAVA_Build 21 26219354 1D13M1D17M1I18M1D ACTGTAAATC AAGCGGTCACCCACTTCCAGCTAGGCATTTTG-CCACACCAGGGCTATGAGA/-AGCGGTCACCCAC-TCCAGCTAGGCATTTTGCCCACACCAGGGCTATGAG- AACAGATTTA 3070 hom 57 het 18 0 20 7 N/A 0 0 325074 CASAVA_Build 21 26219943 1I CATGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 3 4 325075 CASAVA_Build 21 26221529 1I ATGGCCAGAA -/G GTTTCACCAA 3070 hom 96 het 37 0 29 8 G 1 2 325076 CASAVA_Build 21 26221869 1I TAACAAACTG -/T CCCTGGAAGG 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 0 1 325077 CASAVA_Build 21 26222392 1I CGGGCATGGT -/G GCAGGCGCCT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 1 2 325078 CASAVA_Build 21 26224760 3I AAGTGTGTAA ---/GAT TAGCACAAAT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 GAT 0 1 325079 CASAVA_Build 21 26225750 1D CTAACCAGAC A/- AAGTCAGCAG 3070 hom 96 het 36 0 33 5 A 3 2 325080 CASAVA_Build 21 26226542 1I GGGTGTCATC -/T TTATTCACCT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 2 3 325081 CASAVA_Build 21 26228209 1D AGATATAAGA T/- TGAGGTCACA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 2 1 325082 CASAVA_Build 21 26228470 2I ATGAGATAAT --/GA GAGAGTATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GA 2 3 325083 CASAVA_Build 21 26230470 1I CCGGGTGCGG -/T GGCTCACGCC 3070 hom 60 het 23 0 19 4 T 0 1 325084 CASAVA_Build 21 26241501 1D18M1D CCACCACTAT GGGGTGAGTTCGACACCTGC/-GGGTGAGTTCGACACCTG- AGGTCTGTAA 3070 hom 186 het 59 0 60 5 N/A 0 0 325085 CASAVA_Build 21 26242765 1D ATGCTAGAAG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 8 7 325086 CASAVA_Build 21 26243009 1I AGAAAACACC -/A ATCATTTTTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 325087 CASAVA_Build 21 26244702 1D AGTAACTGGG A/- ATTACAGGTG 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 2 1 325088 CASAVA_Build 21 26245326 1I GAAGATACAA -/G GGCCAGGGCC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 G 2 3 325089 CASAVA_Build 21 26247299 1D CTTTTTTAAA T/- TAGAGAGGGG 3070 hom 99 het 37 0 32 5 T 2 1 325090 CASAVA_Build 21 26247590 1D GGCATAAAAT G/- GGAAAAAGTG 3070 hom 132 het 48 0 43 5 G 3 2 325091 CASAVA_Build 21 26249041 1D GAAAACTGAC A/- AAACACTGCT 2887 hom 33 het 19 0 12 8 A 4 3 325092 CASAVA_Build 21 26249240 1D10M1I TCTCTTAACA GGACCCTCATG-/-GACCCTCATGC CCTAAATACA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 N/A 0 0 325093 CASAVA_Build 21 26252744 2I7M1D TTACAGGCGT --GCGACCAG/GAGCCACCA- TGCACGGCCA 3070 hom 105 het 34 0 36 1 N/A 0 0 325094 CASAVA_Build 21 26253170 1D TCCCTGGCCC A/- ATGGTTACAC 3070 hom 49 het 21 0 14 7 A 2 1 325095 CASAVA_Build 21 26254306 1I AATTACAAAG -/T TTTCCAGAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 3 4 325096 CASAVA_Build 21 26254386 1I GATTAACTTC -/T TTTAATCCAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 3 4 325097 CASAVA_Build 21 26258269 1I ATCCACTTAG -/T TCATAAGGCC 3070 hom 140 het 53 0 46 7 T 1 2 325098 CASAVA_Build 21 26265426 1I AGAGACGGGG -/T TTCACCATGT 3070 hom 36 het 13 0 12 1 T 2 3 325099 CASAVA_Build 21 26266693 1I AAAGCCAAAC -/A AAAGATTTCA 3070 hom 66 het 34 0 23 13 A 3 4 325100 CASAVA_Build 21 26266828 1I TCAAGTGATC -/T TCCTATCTCA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 1 2 325101 CASAVA_Build 21 26273998 3I10M1I3M1D12M1I3M1I6M2I6M1I6M1I4M1I4M1I5M1I2M1I5M3I AACACACATT ---AAAAAAAATG-CTACAGTGGGTCCACG-ATG-AATGCA--GGTAGC-AGGCTT-CATG-ACTT-GAGGT-CT-CAAGG---/TAAAAAAAAAATGACTA-AGTGGGTCCAAGAATGAAATGCAAGGTTAGCAAGACTTACATGAACTTAGAGGTACTACAAGGATT TTTCTATCCA 3070 hom 64 het 22 0 22 15 N/A 0 0 325102 CASAVA_Build 21 26277130 1I11M1I43M1I AAAAGGTAAA -TGTATGATGTA-TTTAGATAACTGAATTACGAAGACAACCTTCATGAGACAGTAT-/TTGTATGATGTATTTTAGATAACTGAATTACGAAGACAACCTTCATGAGACAGTATG GGAAACACGA 3070 hom 175 het 40 0 59 8 N/A 0 0 325103 CASAVA_Build 21 26283627 1D TTCCTCAGGC T/- TCTGGGGTGA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 2 1 325104 CASAVA_Build 21 26284983 1I TAAAATTATC -/A AGGTATTGAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 1 2 325105 CASAVA_Build 21 26285415 1D CTACTCAGTG A/- AATGGGGACA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 3 2 325106 CASAVA_Build 21 26287485 1D ATAAGGCCAT C/- AAACATAATC 3070 hom 138 het 53 0 47 6 C 1 0 325107 CASAVA_Build 21 26288317 1D GACAGCACCA G/- GAAAAAATGG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 2 1 325108 CASAVA_Build 21 26289607 1I40M1D TGTCAGAACC -AATGCTTAGCCATTTGGTGTGGAGTGCGGCCAAAACGTCAT/AAATGCTTAGCCATTTGGTGTGGAGTGCGGCCAAAACGTCA- TTTGGGTTTC 3070 hom 129 het 39 0 42 12 N/A 0 0 325109 CASAVA_Build 21 26289778 1D TGAAGAAAAA T/- TAAATGATCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 2 1 325110 CASAVA_Build 21 26290598 1D TACTACAATA C/- CATGAATATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 2 1 325111 CASAVA_Build 21 26298632 1I GCACCCGCCA -/C CACACCGGCT 1897 hom 18 het 7 0 6 1 C 1 2 325112 CASAVA_Build 21 26302254 1I ACAAGAGGAT -/G GGTGCTAATT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 G 2 3 325113 CASAVA_Build 21 26303782 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 284 hom 23 2 14 7 T 13 14 325114 CASAVA_Build 21 26304234 1I GGAAGACTGA -/G CATGTACACC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 0 1 325115 CASAVA_Build 21 26305993 1I CATGAAACAT -/C AAGAACCTAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 325116 CASAVA_Build 21 26306279 3I GCAGGCTTGA ---/CCT CCTCACCTGG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 CCT 1 2 325117 CASAVA_Build 21 26306907 1I AAACCAGTAA -/T CCCAGCACTT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 T 0 1 325118 CASAVA_Build 21 26308212 1I AACCCGGGCG -/A AGAGTAGAAG 3070 hom 141 het 55 0 47 8 A 1 2 325119 CASAVA_Build 21 26309452 1I GGAATGATGA -/T TATAACCATA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 1 2 325120 CASAVA_Build 21 26309984 1D GTTAGCAAAT G/- GTTTACTGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 G 2 1 325121 CASAVA_Build 21 26310117 1I ATGGGCTGTG -/T CCTAATAAAA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 T 0 1 325122 CASAVA_Build 21 26311796 1D35M1D CTGAATAAAT GGAACATAAGGAAGAAATGTCCAGTTCCTCTGGACAG/-GAACATAAGGAAGAAATGTCCAGTTCCTCTGGACA- GGCACAATTG 3070 hom 120 het 39 0 39 11 N/A 0 0 325123 CASAVA_Build 21 26313842 2D7M2D8M1D4M1D6M1D7M1D15M1D3M1D7M1D ATCTAATGTT TCAAGTAAAATGGGACACTAAACTGGTTCTATTAAACAGCCCAGCTTGATGGAGATTCACCAAGGACT/--CAGTAAA--TGGACACT-AACT-GTTCTA-TAAACAG-CCAGCTTGATGGAGA-TCA-CAAGGAC- TTCAGTCCCA 3070 hom 102 het 22 0 32 8 N/A 0 0 325124 CASAVA_Build 21 26314844 1D AAAATTCAGT C/- AAGTACATAT 3070 hom 96 het 35 0 32 5 C 1 0 325125 CASAVA_Build 21 26322586 1I ATTGTTGCGA -/G CCAGAGGCAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 325126 CASAVA_Build 21 26325888 1I13M1I TCAATTACCT -CCCCTGGGTCCCT-/CCCCCTGGGTCCCTC CCACAACATG 3070 hom 66 het 24 0 20 6 N/A 0 0 325127 CASAVA_Build 21 26336031 1D5M1D GAGCATTTCT AAATAAG/-AATAA- GACCTCAAAA 3070 hom 129 het 47 0 44 4 N/A 0 0 325128 CASAVA_Build 21 26336135 1D TTTCAGTATA G/- ACAGTCAGAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 1 0 325129 CASAVA_Build 21 26336561 1D AAGTGGAAGA C/- CGGCATGTGC 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 2 1 325130 CASAVA_Build 21 26337965 1I4M1I17M1I6M1I27M2I6M1I7M1I AATACCATCA -GGTC-TTGGACACAATTTTACC-TTTGAG-TTCTGAGCACTTCTAACTACTTGTGGG--CTGATA-TTCTCAC-/GGGTCTTTGGACACAATTTTACCTTTTGAGTTTCTGAGCACTTCTAACTACTTGTGGGGCTTGATATTTCTCACT TTTATCCATT 3070 hom 69 het 26 0 24 12 N/A 0 0 325131 CASAVA_Build 21 26346657 1D CACAAATAAA C/- CTATATAAAT 3070 hom 123 het 46 0 42 6 C 2 1 325132 CASAVA_Build 21 26374800 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 8 10 4 A 9 10 325133 CASAVA_Build 21 26378576 1I CAGGCGCCCG -/C CACCACGCCT 2765 het 90 hom 9 1 7 1 C 1 2 325134 CASAVA_Build 21 26378711 1I17M1I CAGGCGTGAG -CACCGCGCCCGGCCGAA-/CCACCGCGCCCGGCCGAAG GACACCATTT 3070 hom 45 het 16 0 15 4 N/A 0 0 325135 CASAVA_Build 21 26380750 1I CTAGGTCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1002 hom 37 3 29 5 A 12 13 325136 CASAVA_Build 21 26384661 1D7M1D43M1D AGAAAAAGAT AGCAAATGAACAAGCATCTAGCTATTCCATTCAAAATATTAAGCAATGCAACT/-GCAAATG-ACAAGCATCTAGCTATTCCATTCAAAATATTAAGCAATGCAAC- TTTTAATTTA 3070 hom 78 het 30 0 26 14 N/A 0 0 325137 CASAVA_Build 21 26385756 1D TCAGCAAATG A/- AGCAGCTACA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 2 1 325138 CASAVA_Build 21 26390646 1D16M1D ACTGTATTTC AAACTCTGCAGCACCATC/-AACTCTGCAGCACCAT- CCCTATAGCT 3070 hom 135 het 46 0 46 3 N/A 0 0 325139 CASAVA_Build 21 26391704 1D50M1D GGGCTTTTGA GGGAAAGTAAGTATCTCAATGCCTTTCAATATTGTTCTTCCAAGTAGATATG/-GGAAAGTAAGTATCTCAATGCCTTTCAATATTGTTCTTCCAAGTAGATAT- GACAGCTTAT 3070 hom 184 het 44 0 62 2 N/A 0 0 325140 CASAVA_Build 21 26394425 1I TAGAAGAAAT -/C CTACGGTCAG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 C 1 2 325141 CASAVA_Build 21 26397664 1D GGCGTGCACC T/- TGTAATCCCA 3070 het 63 hom 37 1 30 6 T 2 1 325142 CASAVA_Build 21 26401839 1I AAGGTGCTTT -/C CTTCGGTTCT 3070 hom 126 het 49 0 40 9 C 1 2 325143 CASAVA_Build 21 26402802 1D GGCCGGGTGC G/- GGTGGCTCAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 G 3 2 325144 CASAVA_Build 21 26403917 1D AGTAATTTTT G/- GTATGGCCAC 3070 hom 117 het 45 0 40 6 G 2 1 325145 CASAVA_Build 21 26405098 1D ATGCAGTCAC A/- ATGCAGAGAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 2 1 325146 CASAVA_Build 21 26415175 1D GCCACACGTA G/- GCTCCCGCCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 2 1 325147 CASAVA_Build 21 26418175 1D ATTCCTAATC T/- TTTTTTTTTT 1808 het 1808 ref 35 24 4 7 T 13 12 325148 CASAVA_Build 21 26421166 1I CCACAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 2709 het 2709 ref 23 13 8 2 A 12 13 325149 CASAVA_Build 21 26421388 1D GCTTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 12 11 325150 CASAVA_Build 21 26426243 2D TTTTGTAAAC AG/-- AGTCAGTTAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 AG 2 1 325151 CASAVA_Build 21 26426712 1D CTCTACCTTT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 A 8 7 325152 CASAVA_Build 21 26429870 1D AGCCCTAGCT G/- GGAAAGTTAC 3070 hom 120 het 47 0 41 8 G 3 2 325153 CASAVA_Build 21 26432716 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2892 het 163 hom 34 3 9 22 A 17 16 325154 CASAVA_Build 21 26440111 1D AGAGTTTTTT A/- AAGGCTTGCT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 3 2 325155 CASAVA_Build 21 26441796 1D AACTTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 A 10 9 325156 CASAVA_Build 21 26441999 1D TCAGAACATC A/- AAAAAAAAAC 1294 het 1294 ref 26 22 3 1 A 10 9 325157 CASAVA_Build 21 26445438 7D TATCCGTGTA ATCATGT/------- AACCCACTTC 3070 het 3070 hom 44 20 23 5 ATCATGT 1 0 325158 CASAVA_Build 21 26447645 3I CCCCTGTACC ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 TTG 5 6 325159 CASAVA_Build 21 26450791 1D CAAAGCCAGC A/- AAGGTCACCC 3070 het 2840 hom 23 6 15 2 A 3 2 325160 CASAVA_Build 21 26451050 1D CTTCACGGGT G/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 21 7 14 0 G 1 0 325161 CASAVA_Build 21 26454269 4D TCCAACAGAC AGAG/---- GTGGCTTCTA 3070 het 3029 hom 40 16 17 8 AG 2 0 325162 CASAVA_Build 21 26457099 1I AGCATCAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 11 12 325163 CASAVA_Build 21 26457255 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1850 het 1319 hom 16 6 6 4 A 14 15 325164 CASAVA_Build 21 26471478 1D TCAGACGGCA C/- CCGTGCTTGG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 3 2 325165 CASAVA_Build 21 26521744 1I TTGATGTCAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 8 9 325166 CASAVA_Build 21 26529623 1D ACTATGATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 18 0 10 9 T 13 12 325167 CASAVA_Build 21 26530650 1I TCAGAGTTCT -/G GGACTTTCCT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 G 2 3 325168 CASAVA_Build 21 26531090 1D ATGCCCACCC A/- ACCACACTCC 3070 hom 111 het 43 0 36 9 A 2 1 325169 CASAVA_Build 21 26533136 1I ATCAGCTTGG -/A AAAAACTGAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 5 6 325170 CASAVA_Build 21 26536611 3D TTTGTATGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 37 1 26 10 T 16 13 325171 CASAVA_Build 21 26537831 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 12 11 325172 CASAVA_Build 21 26542754 1D AATTCTTAAT A/- GCTGGGCACG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 1 0 325173 CASAVA_Build 21 26558895 1D TTCTGATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 30 0 24 7 T 11 10 325174 CASAVA_Build 21 26563074 2D CATTTAAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 24 4 T 14 12 325175 CASAVA_Build 21 26577505 2D ACTTCACTTA GT/-- GTGTGACCTG 3070 het 3070 ref 48 19 15 15 GT 3 2 325176 CASAVA_Build 21 26605747 2I ATGTGCACAC --/AT ATATACACAC 3070 het 1304 hom 23 6 10 8 AT 2 3 325177 CASAVA_Build 21 26605773 2D GCACACACAT AC/-- ACACATGTGC 3070 het 1425 hom 28 6 14 11 AC 3 2 325178 CASAVA_Build 21 26606551 7D ACTTGCAAGA CAGCCTG/------- CCTATAATGC 3070 het 3070 ref 45 25 18 5 CAGCCTG 1 0 325179 CASAVA_Build 21 26623190 4I TTTTGCTGTG ----/CCTC CAGAAGCTCT 3070 het 3070 hom 17 7 9 1 CCTC 0 1 325180 CASAVA_Build 21 26629817 1D CAGAGGAGAC A/- AAAAAAAAAA 2792 het 2792 ref 30 13 8 9 A 12 11 325181 CASAVA_Build 21 26630409 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 13 12 325182 CASAVA_Build 21 26633877 7D ATTTAGACCA ATGGAAC/------- AGAACAGATA 3070 hom 105 het 36 0 36 3 ATGGAAC 1 0 325183 CASAVA_Build 21 26634536 1D AGTTAAAATG T/- TTTTTATCTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 6 5 325184 CASAVA_Build 21 26650778 1I AAATGTGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 T 12 13 325185 CASAVA_Build 21 26659272 1I TGAGAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 10 11 325186 CASAVA_Build 21 26660003 1D CAATATGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 9 325187 CASAVA_Build 21 26669868 1I TTTAGAGGAC -/A GGGGCAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 0 1 325188 CASAVA_Build 21 26687617 1I CGTCAGTTGG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 7 8 325189 CASAVA_Build 21 26691438 1I GGAAGGTGAA -/G GGGAAGCAAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 G 3 4 325190 CASAVA_Build 21 26702784 1D GATTCTACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 29 5 T 10 9 325191 CASAVA_Build 21 26706355 1D TATTTCACTG A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 8 7 325192 CASAVA_Build 21 26709749 3D AGGGAACAGA AGG/--- AGAAGTGGGA 3070 het 3070 ref 59 30 25 6 AGG 1 0 325193 CASAVA_Build 21 26712316 4I20M14I GTTTTTTGTC ----TGTTTGTTTTGTTTTATTTT--------------/TGTTTGTTTGTTTTGTTTTATTTTGTCTTTTGAGATAA GGCCTGCCTC 3070 hom 90 het 31 0 30 10 N/A 0 0 325194 CASAVA_Build 21 26737026 1D ATAGTCACCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 9 325195 CASAVA_Build 21 26763139 1I CATCTCAAGC -/A AAAAGTACAT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 4 5 325196 CASAVA_Build 21 26768239 1D TTTGTTTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 603 hom 33 4 18 12 T 16 15 325197 CASAVA_Build 21 26774756 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 11 12 325198 CASAVA_Build 21 26777603 1D CTCTCCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 620 hom 31 2 13 16 A 16 15 325199 CASAVA_Build 21 26782107 2D41M4D CATTACTTGC AAAAAAAAAAAAAAATCTGTAAAATCCAAATATGCTAATAATGTTTT/--AAAAAAAAAAAAATCTGTAAAATCCAAATATGCTAATAATG---- TTTATTTTGC 3070 het 68 hom 41 2 31 22 N/A 0 0 325200 CASAVA_Build 21 26786907 1I ATCATATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 22 7 A 11 12 325201 CASAVA_Build 21 26789010 1D TTGAATGTTT A/- AACTGTATTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 2 325202 CASAVA_Build 21 26804335 1I GAAAGGTTTG -/T TAAGTCCCAA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 T 1 2 325203 CASAVA_Build 21 26808257 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 2861 het 1363 hom 12 4 6 2 A 11 10 325204 CASAVA_Build 21 26818818 3I GCCAACCACT ---/TAG TAGTAATGTC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TAG 1 2 325205 CASAVA_Build 21 26818984 1D ACATATTTTG T/- TTTTTTAAGA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 7 6 325206 CASAVA_Build 21 26820194 1D AATGGACACT G/- GGGGCCTTTT 3070 hom 112 het 45 0 37 8 G 5 4 325207 CASAVA_Build 21 26827215 2I TCCAAAATCC --/AA AAAAAATTCT 3070 het 2039 hom 16 5 8 3 A 6 8 325208 CASAVA_Build 21 26839502 1D TGGCTGACTT A/- AGTCATTTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 2 1 325209 CASAVA_Build 21 26842119 5I AAGTAGCTAA -----/ACATT ACGGAGTACC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 ACATT 0 1 325210 CASAVA_Build 21 26852014 3I TCATACCCTA ---/CAG CAGGCTTTTC 3070 hom 151 het 52 0 50 2 CAG 1 2 325211 CASAVA_Build 21 26857808 1I GAGCAAACTG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 8 325212 CASAVA_Build 21 26861364 1D ATTTGGTGAC T/- TTTTTTTACC 3070 hom 81 het 39 0 27 12 T 8 7 325213 CASAVA_Build 21 26877749 2D TGCATGTTTT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 57 het 24 0 20 6 AC 10 9 325214 CASAVA_Build 21 26890807 1D ACTTTATAAC A/- TTTTTCTCTA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 1 0 325215 CASAVA_Build 21 26913512 1I TTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 371 hom 52 1 44 7 T 8 9 325216 CASAVA_Build 21 26914137 1D TTCTCAGTTT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 8 7 325217 CASAVA_Build 21 26915114 2D GTGTGCATGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 108 het 44 0 36 8 GT 8 7 325218 CASAVA_Build 21 26917237 1I CTATGCTGCC -/T TTTTTTTGCC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 7 8 325219 CASAVA_Build 21 26922600 1I TTCATGAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 503 hom 31 2 19 10 T 13 14 325220 CASAVA_Build 21 26923357 1D TTTTTTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 11 10 325221 CASAVA_Build 21 26924879 4D TGTGTGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 1008 hom 33 het 23 0 12 11 TG 8 6 325222 CASAVA_Build 21 26924908 12D1M11I11M1D ATATATATAT TTTTTTATTTTAA-----------ATATATACATAT/------------ACACACACACACACATATACATA- TTTTTTATTT 3070 hom 25 het 14 0 9 8 N/A 0 0 325223 CASAVA_Build 21 26926130 5D TATAATCTTC CTTAA/----- CTTGTTAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CTTAA 1 0 325224 CASAVA_Build 21 26931367 2I TCCTCAATAT --/TA TGTTTGTGAG 3070 hom 126 het 47 0 43 6 TA 0 1 325225 CASAVA_Build 21 26931951 2I CATTTTTATT --/TA TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TA 0 1 325226 CASAVA_Build 21 26932320 32D GGTATATATA TATATATATATACACATATATATATATATATG/-------------------------------- TATATATATC 2133 hom 12 het 4 0 5 0 TATATATATATACACATATATATATATATATG 1 0 325227 CASAVA_Build 21 26934880 4D TTTTAGTCAC TTTA/---- TTTTTCATTT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 TTTA 1 0 325228 CASAVA_Build 21 26938316 1D CCTTTGCAGG A/- AACACGAATG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 3 2 325229 CASAVA_Build 21 26938620 6I ATGTAAAATA ------/AAAGTT AAAAAAAAGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 AAAGTT 0 1 325230 CASAVA_Build 21 26941077 1D TTCCTACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 747 hom 33 2 23 8 A 15 14 325231 CASAVA_Build 21 26946855 2I TATAAAGGGC --/AT ATCACTTGAG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AT 1 2 325232 CASAVA_Build 21 26954810 1D ATATGAAGTA G/- GGGTAAGAAA 3070 hom 157 het 57 0 53 4 G 4 3 325233 CASAVA_Build 21 26959266 1I TTTAAAGTAG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 6 7 325234 CASAVA_Build 21 26959734 4D ATTTGAATAC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 30 het 13 0 11 4 CTTT 4 3 325235 CASAVA_Build 21 26960643 4D AGCTAGTGGC CTAT/---- CTATTTTCTT 2254 het 2254 ref 21 12 5 5 CTAT 2 1 325236 CASAVA_Build 21 26964845 1D AGCAAACAAA T/- CCCAAGAGTG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 T 1 0 325237 CASAVA_Build 21 26965298 1I AGGCTTTAAT -/G GGGGTGCTGC 3070 hom 120 het 44 0 39 5 G 4 5 325238 CASAVA_Build 21 26965483 1I ATGACAGGTG -/A AGGGGTCTGG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 325239 CASAVA_Build 21 26968140 1I CAAAGATTGC -/T TTTTTAAGGA 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 T 5 6 325240 CASAVA_Build 21 26971011 5I GAGTATGCTA -----/AAGAG AAGTATTTGA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AAGAG 0 1 325241 CASAVA_Build 21 26971729 4D TTTAGTAATT ACTA/---- ACCGTAATCT 3070 het 3070 hom 49 24 24 3 ACTA 1 0 325242 CASAVA_Build 21 26971932 1I AGTGTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 10 11 325243 CASAVA_Build 21 26973462 1I TTGTGCGCAC -/A AACACAGCAG 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 A 2 3 325244 CASAVA_Build 21 26973966 1D TAAAATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 34 0 23 11 T 13 12 325245 CASAVA_Build 21 26975574 1I TCAAGTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 848 hom 24 4 13 7 T 13 14 325246 CASAVA_Build 21 26994495 2D TAAAGCAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 12 10 325247 CASAVA_Build 21 26994817 1D TCTGACATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 A 10 9 325248 CASAVA_Build 21 26996997 2I TTTTCCAAAC --/TT TTATCCTCTG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 2 4 325249 CASAVA_Build 21 27011345 1D CATTAAGATC T/- TTTCTAATGC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 4 3 325250 CASAVA_Build 21 27013454 4D ACTCTGTTTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1777 het 1604 hom 24 9 7 9 A 20 16 325251 CASAVA_Build 21 27032961 4I CAATATATAC ----/TTTG TTTAACATCC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TTTG 0 1 325252 CASAVA_Build 21 27039367 4D GTATATTTAT AGAC/---- AGACAGAGAG 3070 hom 90 het 33 0 31 4 AGAC 2 1 325253 CASAVA_Build 21 27046613 1D TCATCTAATT A/- TTGTTAACTT 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 A 1 0 325254 CASAVA_Build 21 27058123 1D ATCTGCACAG T/- TTTTTTTTTT 2046 het 2046 ref 24 15 5 4 T 12 11 325255 CASAVA_Build 21 27058931 3D ATTTTCGGTC TAA/--- TAATTATACC 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 TAA 2 1 325256 CASAVA_Build 21 27062947 2I TATGTTTTTC --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 AT 6 7 325257 CASAVA_Build 21 27064510 1D GAGTTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 37 1 32 6 A 12 11 325258 CASAVA_Build 21 27079238 2D ACAACTAGGA AG/-- AGAGGAAGAA 3070 het 3070 hom 47 17 25 7 AG 3 2 325259 CASAVA_Build 21 27081417 1D TTGGAAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 12 11 325260 CASAVA_Build 21 27088980 1D CACGACTTCA T/- TTTTTTATGG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 T 7 6 325261 CASAVA_Build 21 27090056 2D AGCTGTCATT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 34 11 12 12 A 10 8 325262 CASAVA_Build 21 27098655 1D TAATGGCTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 73 het 36 0 25 12 T 10 9 325263 CASAVA_Build 21 27109312 2I AAACAAAAAA --/CT CTATATAGAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CT 1 2 325264 CASAVA_Build 21 27118263 3D AGCTTTAACA ATT/--- ATTATCATTT 3070 hom 132 het 48 0 45 4 ATT 2 1 325265 CASAVA_Build 21 27119546 1I TGTGGGGCTT -/A GAGCCCAGCC 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 0 1 325266 CASAVA_Build 21 27124516 1D TCCTTTGTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 7 325267 CASAVA_Build 21 27129392 1I TTGCCAGCCG -/C CATCCACGCA 3070 hom 55 het 25 0 16 9 C 1 2 325268 CASAVA_Build 21 27137698 3I10M1D AGCACTGCAC ---AGAGAGAAGGC/ACAAGAGAGAAGG- CGTAGCAGGA 3070 het 3070 hom 47 23 23 3 N/A 0 0 325269 CASAVA_Build 21 27144564 2D TAATATTAAC AT/-- ATTATCTCTA 3070 het 3070 hom 36 17 17 5 AT 2 1 325270 CASAVA_Build 21 27150235 2I AGAAAGACAA --/AG AGGGAGTCAA 1907 het 1907 ref 22 14 5 3 AG 1 2 325271 CASAVA_Build 21 27154294 3D CCAATACCCA TTT/--- GGTAAGATGG 3070 het 3070 ref 31 17 13 2 T 3 0 325272 CASAVA_Build 21 27161885 1I GAACTCACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 9 10 325273 CASAVA_Build 21 27162982 2I TGTCTGCATA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 AT 5 6 325274 CASAVA_Build 21 27168922 1I AACAGTGACC -/T CAGAGTAGTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 0 1 325275 CASAVA_Build 21 27172101 1I CAAAACCATT -/A GATACAATTC 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 0 1 325276 CASAVA_Build 21 27172816 1D AACTTAAATG T/- CTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 1 0 325277 CASAVA_Build 21 27175916 3I ATGTGACCTC ---/CCT CAAGTAAGTA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 CCT 0 1 325278 CASAVA_Build 21 27187425 1I AACAGTCATA -/G GCATGTCATT 3070 het 3070 hom 47 21 26 0 G 1 2 325279 CASAVA_Build 21 27190470 1D GGTAGTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 10 9 325280 CASAVA_Build 21 27197287 1I AAAAAATTCC -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 7 8 325281 CASAVA_Build 21 27201918 4D ATATCTACAA TGTT/---- TGTTCTAGCT 3070 het 3070 hom 33 17 16 0 TGTT 2 1 325282 CASAVA_Build 21 27202928 4D TCTGGAGATG TAGT/---- TAGTGTCTTT 3070 het 3070 ref 59 31 24 5 TAGT 2 1 325283 CASAVA_Build 21 27206701 1I TTTTTTTTCA -/T GGGTAAGGCA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 0 1 325284 CASAVA_Build 21 27209272 1I TTTTCTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 T 10 11 325285 CASAVA_Build 21 27211728 1D TTTCAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1708 hom 20 4 11 5 T 13 12 325286 CASAVA_Build 21 27231395 4I ACGTGTAATG ----/CAAA CAATTTGAAA 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 CAAA 0 1 325287 CASAVA_Build 21 27236227 1D AAAAAGGAAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 9 8 325288 CASAVA_Build 21 27243193 1D TAAATGATAT A/- AAACATGCAA 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 A 4 3 325289 CASAVA_Build 21 27256402 1D CAAATGGTCT A/- AAAAAAAACG 3070 het 3056 hom 36 11 19 6 A 9 8 325290 CASAVA_Build 21 27286633 1I TTTCAAGTTA -/G TTTTTCCAAC 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 G 0 1 325291 CASAVA_Build 21 27291895 2D TGGTAGAGGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 AT 7 6 325292 CASAVA_Build 21 27307340 1D TGTGTCTCTA C/- CCAAATCTCA 3070 het 3070 ref 46 23 21 3 C 3 2 325293 CASAVA_Build 21 27313686 1I GACTCTTCTC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 7 8 325294 CASAVA_Build 21 27314967 4I TTAATTAGCT ----/GTTA GTTATTATTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GTTA 1 2 325295 CASAVA_Build 21 27318353 2D ATCATTTACA TC/-- TCTAGACCCT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 TC 2 1 325296 CASAVA_Build 21 27321425 4I TTTTGTGAAT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 TTTG 2 3 325297 CASAVA_Build 21 27322597 1I AGTTTTGCTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 9 10 325298 CASAVA_Build 21 27331396 1I AGGGATTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 10 11 325299 CASAVA_Build 21 27332923 2I ATATATATAT --/TA TATATATATA 1724 het 1724 ref 13 6 5 2 TA 6 7 325300 CASAVA_Build 21 27334079 1I TAAATGGTTA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 7 8 325301 CASAVA_Build 21 27336102 2D TCATTTACAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 16 9 T 13 11 325302 CASAVA_Build 21 27338073 1D GCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 24 1 19 5 A 12 11 325303 CASAVA_Build 21 27341343 1D TGTTTCGCTT A/- ACTTCAATGG 3070 hom 135 het 50 0 44 7 A 2 1 325304 CASAVA_Build 21 27342076 1D ATATGTTCAG A/- ATATAATGGA 3070 het 3070 hom 48 22 24 3 A 2 1 325305 CASAVA_Build 21 27342890 1D GCTTGAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 36 0 28 8 T 13 12 325306 CASAVA_Build 21 27343867 1D AGAGTTTGAC T/- TGGGGCAGTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 2 1 325307 CASAVA_Build 21 27346481 2I AACTCCCCTT --/TA TATATATATA 2709 het 2709 ref 22 11 10 1 TA 7 8 325308 CASAVA_Build 21 27348066 3D TGTGACCAAT GAG/--- GAGGTGTGTG 3070 hom 45 het 22 0 16 8 GAG 2 1 325309 CASAVA_Build 21 27362330 2I TAAAACTAAA --/AT ATGAGTTGAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AT 1 2 325310 CASAVA_Build 21 27364124 3D GAGAAAGAGA AGG/--- AGAATTGTCC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 AGG 1 0 325311 CASAVA_Build 21 27364290 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAATGATG 3070 het 423 hom 31 1 26 4 A 6 5 325312 CASAVA_Build 21 27364909 1D AAAATCAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 10 9 325313 CASAVA_Build 21 27366761 3I AAATTAAAAA ---/AAT ATATATTATT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AAT 0 1 325314 CASAVA_Build 21 27367156 1I TTTTTTTTTT -/C TGAGACAGAG 3070 hom 31 het 23 0 17 6 C 0 1 325315 CASAVA_Build 21 27378815 1D TTGATTGTCA C/- AGCTGGTGTA 3070 het 3070 ref 45 23 20 3 C 1 0 325316 CASAVA_Build 21 27380990 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAAAA 3070 het 165 hom 20 3 8 9 AAC 1 0 325317 CASAVA_Build 21 27396348 1D TCTAAACTTT A/- ACCACACAAG 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 2 1 325318 CASAVA_Build 21 27403462 1D TAAATGAGGG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 8 7 325319 CASAVA_Build 21 27410536 4I CCTCCTGAGT ----/AGCC GGGACTGCAG 2474 hom 21 het 8 0 6 2 AGCC 0 1 325320 CASAVA_Build 21 27412576 4D CCTTCTGAAA ACAT/---- ACATGAAGAT 3070 het 3070 hom 34 14 19 2 ACAT 2 1 325321 CASAVA_Build 21 27414570 1I TTCCTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 10 11 325322 CASAVA_Build 21 27416937 1I CTCCCTTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 22 23 6 T 10 11 325323 CASAVA_Build 21 27417846 1I GGTCTACAGG -/C CCCCATGCAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 4 5 325324 CASAVA_Build 21 27419827 3I TGGGGACTTG ---/AAA AAACTTGGGT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 3 6 325325 CASAVA_Build 21 27420030 3D GGGCTGATGT AAC/--- AACAAGATAC 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 AAC 2 1 325326 CASAVA_Build 21 27422163 1D AAGCAATGAC T/- AAAAACATGT 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 1 0 325327 CASAVA_Build 21 27426714 18I AGCAACAGCT ------------------/GCTGTGGTAGCAGCAGGA GCTGTGGTAA 2971 het 2971 ref 50 23 16 11 GCTGTGGTAGCAGCAGGA 0 1 325328 CASAVA_Build 21 27433144 4D AATACTATCT AACA/---- AACATATTAT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 AACA 2 1 325329 CASAVA_Build 21 27434041 3D CAAAGAGAAA AAC/--- AACAAGAGTA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 AAC 2 1 325330 CASAVA_Build 21 27436555 5I CTAGCTGCAC -----/AATCT AATCTATCTA 3070 het 3070 ref 55 25 21 9 AATCT 1 2 325331 CASAVA_Build 21 27438266 2I GAATTATCCT --/AA AAGTGCTTTA 3070 het 3070 ref 26 18 8 0 A 2 4 325332 CASAVA_Build 21 27440404 1I AGAACTTTAT -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 6 7 325333 CASAVA_Build 21 27443922 1I CTTTTTTGTT -/A AAAAAAAAAA 1906 het 1906 ref 26 11 6 9 A 12 13 325334 CASAVA_Build 21 27446069 1I CATATGCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 41 1 27 13 T 10 11 325335 CASAVA_Build 21 27459596 1I ATAAAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 463 hom 33 3 22 8 A 12 13 325336 CASAVA_Build 21 27462065 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 12 11 325337 CASAVA_Build 21 27462945 3I CTGAATTCTT ---/CTC CTTCCTTCCA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 CTC 0 1 325338 CASAVA_Build 21 27464851 4I CCATTTTTCT ----/CTTA CTTTGAATCT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 CTTA 0 1 325339 CASAVA_Build 21 27466222 1D AGGGCACAGC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 32 0 25 8 T 9 8 325340 CASAVA_Build 21 27471872 4D TAGTTAGCAT TTAC/---- TTACTTACCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TTAC 3 2 325341 CASAVA_Build 21 27472566 4I TGAATTAGGC ----/AGAT AGATATTCTA 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 AGAT 1 2 325342 CASAVA_Build 21 27476531 2I TATACACAAG --/AT ATATATATAT 1024 het 1024 ref 16 3 3 10 AT 5 6 325343 CASAVA_Build 21 27476635 4D TACAAGATAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 33 het 21 0 12 13 AT 9 7 325344 CASAVA_Build 21 27480191 2I TTTACATATC --/TG TGACGAACAC 3070 hom 89 het 36 0 30 6 TG 1 2 325345 CASAVA_Build 21 27481227 1D TTTGTGCATA C/- CCAGATTTGA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 C 3 2 325346 CASAVA_Build 21 27482885 4D TTCAACACAC ACTT/---- ACGATTAAAA 2636 het 2636 ref 38 23 7 8 ACTT 1 0 325347 CASAVA_Build 21 27483138 5I CTGGAAAATC -----/TAAAG TAATTTCAAA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 TAAAG 0 1 325348 CASAVA_Build 21 27483192 3D TATCAGAATG TAA/--- TAATAATATA 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 TAA 3 2 325349 CASAVA_Build 21 27486161 1I TATTTTGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 24 19 11 T 9 10 325350 CASAVA_Build 21 27486797 1I CCACACACTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 6 7 325351 CASAVA_Build 21 27487018 1D AAATCCTTTG C/- CTTTTAGTTT 3070 het 3070 ref 34 17 15 3 C 2 1 325352 CASAVA_Build 21 27487783 4D ACAAGAGGGT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 81 het 34 0 25 10 GA 11 9 325353 CASAVA_Build 21 27494389 2D AGTAAAAGGT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 88 het 33 0 28 7 A 10 8 325354 CASAVA_Build 21 27497771 12I AGTACCTCAT ------------/AGGATAGACAAA AGCTAAAATG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AGGATAGACAAA 0 1 325355 CASAVA_Build 21 27498919 5D GCCTATTCTT TTTTC/----- CTAATGTGGC 3070 hom 102 het 40 0 35 7 TTTTC 1 0 325356 CASAVA_Build 21 27501264 27D CATGTGAAAA AGAGACTTTGAGAAATACTTTAAAAAT/--------------------------- ATTGATTACC 3070 hom 45 het 17 0 15 6 AGAGACTTTGAGAAATACTTTAAAAAT 1 0 325357 CASAVA_Build 21 27507573 14I CTTTCTCCTC --------------/CTGTGACCACAAAA AGCAGATAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CTGTGACCACAAAA 0 1 325358 CASAVA_Build 21 27513271 25D AGAGGTACTT ATTTGTTCTTTTCTAACAATAACCC/------------------------- ACATGTAAGT 3070 hom 87 het 28 0 30 4 ATTTGTTCTTTTCTAACAATAACCC 1 0 325359 CASAVA_Build 21 27516250 2I ACTAAAAATA --/GG CAAAAATATT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 G 0 2 325360 CASAVA_Build 21 27518977 4D TTTGAAAAAC ACTT/---- ACATTGAAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 ACTT 1 0 325361 CASAVA_Build 21 27520763 1D TGCAACAGAG A/- TAATTTAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 0 325362 CASAVA_Build 21 27522753 1D CTCCCATGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 30 7 A 12 11 325363 CASAVA_Build 21 27532395 2D ATTATGGTAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 34 11 16 8 TA 7 6 325364 CASAVA_Build 21 27546806 1I CACCAACCAC -/A AAAAAAATGG 3070 het 68 hom 38 1 34 3 A 7 8 325365 CASAVA_Build 21 27548108 1I TTCATCCTTC -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 98 het 35 0 32 3 T 6 7 325366 CASAVA_Build 21 27552353 1I CCTTTACTAC -/A ACCTGTTATT 3070 hom 111 het 38 0 38 0 A 1 2 325367 CASAVA_Build 21 27556953 1I AGTTTAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 T 10 11 325368 CASAVA_Build 21 27558307 1I TTAATCTAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 9 10 325369 CASAVA_Build 21 27570986 1I TTTGTTCATT -/C ATCTTTTAAT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 C 0 1 325370 CASAVA_Build 21 27572532 1I ATATAGAGTC -/T TTTTTTTTTT 2805 het 1316 hom 16 4 8 4 T 13 14 325371 CASAVA_Build 21 27585654 4I TCCTGTTACC ----/AATT AATGATCCAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AATT 0 1 325372 CASAVA_Build 21 27586915 1D AATTTGCTGC T/- CTATAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 T 1 0 325373 CASAVA_Build 21 27589489 1I CTTGCAACCA -/C CCCCCCAATA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 C 6 7 325374 CASAVA_Build 21 27589930 1D TTTCTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 12 11 325375 CASAVA_Build 21 27591560 2D CATTCCTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 528 hom 28 8 10 11 T 14 12 325376 CASAVA_Build 21 27594741 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 9 8 325377 CASAVA_Build 21 27595341 1I8M17D CTATATAGTC -TAAAGGTCCCTTCCAATTTTGGGCA/TTAAAGGTC----------------- CCTTTAAGAA 3070 hom 132 het 46 0 45 6 N/A 0 0 325378 CASAVA_Build 21 27596071 2D AAGTTCAGAC AT/-- ATGGTATTAT 3070 het 3070 hom 45 19 24 4 AT 2 1 325379 CASAVA_Build 21 27597021 1I AGGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1761 het 1761 ref 20 8 9 3 A 10 11 325380 CASAVA_Build 21 27602049 1I TCCACTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 A 11 12 325381 CASAVA_Build 21 27607478 3D AGTTTTGGTA TGT/--- TGTTGTCTCT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 TGT 3 2 325382 CASAVA_Build 21 27615450 1I TGACTCATCT -/A AAATTCCAAT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 A 3 4 325383 CASAVA_Build 21 27615848 2D54M2D AGGCTAGACC AAAAAAAAAAAAAGCCATGCCCAGTGATCTGAATACCTTACATATTAGAAAAAGGGCA/--AAAAAAAAAAAGCCATGCCCAGTGACCTGAATACCTTACATATTAGAAAAAGGG-- CAGTCTACAA 3070 hom 87 het 24 0 30 10 N/A 0 0 325384 CASAVA_Build 21 27616887 28D13M4D TGTGTGTGTG TGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATGTAC/----------------------------TACATATATATAT---- ATACATTTTT 3070 hom 75 het 20 0 25 2 N/A 0 0 325385 CASAVA_Build 21 27618055 1I CCTAATAATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 T 9 10 325386 CASAVA_Build 21 27619308 1D TTTTGGAGAA T/- TGCAGCTAAT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 T 2 1 325387 CASAVA_Build 21 27623280 1D TGGGTGCTTC A/- ACTTCTGCTG 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 2 1 325388 CASAVA_Build 21 27623521 1I TTTTTTTTTT -/A AATCACCATT 3070 hom 93 het 37 0 30 7 A 2 3 325389 CASAVA_Build 21 27623772 1I AAATATCAAG -/C TTTTGAATTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 0 1 325390 CASAVA_Build 21 27624606 1I GCCCAGCTTA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 7 8 325391 CASAVA_Build 21 27627293 1D CTTACTATTC A/- ATTATTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 2 1 325392 CASAVA_Build 21 27627497 2D9M1I GGTCTGTTTC TTTTTTTTAAG-/--TTTTTTAAGT TTTTTTTTTT 3070 het 1353 hom 36 8 16 14 N/A 0 0 325393 CASAVA_Build 21 27635717 1I TAATTTTTTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 7 8 325394 CASAVA_Build 21 27636007 1D AGGTAATAAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 8 7 325395 CASAVA_Build 21 27642697 2D TATAAGACCT TC/-- TCTGTTTTAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TC 2 1 325396 CASAVA_Build 21 27647921 2I TGGGTTGCTA --/AG ACTAAAGAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 AG 0 1 325397 CASAVA_Build 21 27649963 5I CATGTATGTA -----/TAGAG TATTTTCATT 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 TAGAG 0 1 325398 CASAVA_Build 21 27650291 3I CATTTCTGAG ---/ATT ATTTCTAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 ATT 1 2 325399 CASAVA_Build 21 27650883 1I TATTTTTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 11 13 7 T 9 10 325400 CASAVA_Build 21 27653259 1I AAGTCTTAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 A 8 9 325401 CASAVA_Build 21 27660371 1D GCCTATTGGG A/- TAAATGTATA 3070 het 3070 hom 47 17 24 7 A 1 0 325402 CASAVA_Build 21 27661097 1I CTAGCATCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 9 10 325403 CASAVA_Build 21 27666323 2D ATGTTTGAGG GA/-- GAAAGCACAG 3070 het 3070 hom 55 23 27 7 GA 2 1 325404 CASAVA_Build 21 27677322 3I ATCTGTTGAT ---/GAA GAACACAGCT 3070 het 3070 ref 65 30 29 6 GAA 1 2 325405 CASAVA_Build 21 27678464 5D GCAAAACAAT AAATA/----- AAATAAAATG 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 AAATA 2 1 325406 CASAVA_Build 21 27683342 1I ATTAACAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 52 27 16 9 T 9 10 325407 CASAVA_Build 21 27684074 4I ACCTGGCCAT ----/ACTC ACTCTGTCAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ACTC 1 2 325408 CASAVA_Build 21 27701081 1D GTTTCTACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 21 20 6 T 10 9 325409 CASAVA_Build 21 27701912 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 het 239 hom 40 1 35 4 AC 5 6 325410 CASAVA_Build 21 27702019 2I TATAACACAT --/TA TATATATTAT 2843 hom 24 het 12 0 9 3 TA 3 4 325411 CASAVA_Build 21 27707056 2D AATGTATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 12 10 325412 CASAVA_Build 21 27710530 1I GCCTGCCTAA -/T TTTTTTTTTG 2975 het 148 hom 9 1 7 1 T 9 10 325413 CASAVA_Build 21 27719264 3I TTTTTTGTTA ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 98 het 34 0 32 2 TTG 3 4 325414 CASAVA_Build 21 27738531 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1123 hom 7 het 3 0 3 0 T 15 16 325415 CASAVA_Build 21 27739758 2I ATATTTTGAC --/AG AGTTAATCGT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AG 1 2 325416 CASAVA_Build 21 27739844 2I TTTCCCAGTT --/TC TGTTTTTCCC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TC 0 1 325417 CASAVA_Build 21 27745891 1D CAATTCCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1186 hom 44 3 26 15 A 15 14 325418 CASAVA_Build 21 27753609 1D GTTTTGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 39 0 30 10 T 15 14 325419 CASAVA_Build 21 27754380 1D CCTTGATAAT A/- GGATAATAGG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 1 0 325420 CASAVA_Build 21 27764194 1D ATTAAATCTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 8 325421 CASAVA_Build 21 27779025 1D TGAGGGTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 14 13 10 T 10 9 325422 CASAVA_Build 21 27795745 1I GCAATCCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 28 0 21 7 T 11 12 325423 CASAVA_Build 21 27798813 1I ACTGATGTTT -/A AAATAAAGAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 3 4 325424 CASAVA_Build 21 27799917 1D69M2I GGATTCTGTG TTTTTTTTTTAAACCAAGAATGTATCATCTTGATCCAATTATTTTCCAAAGGGATTCTGGGGTGAAACTC--/-TTTTTTTTTAAACCAAGAATGTATCATCTTGATCCAATTATTTTCCAAAGGGATTCTGGGGTGAAACTCAG AGGCAGTAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 30 N/A 0 0 325425 CASAVA_Build 21 27805686 1I GATTCTTCCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 17 15 14 T 9 10 325426 CASAVA_Build 21 27808979 2D ACATGTGCAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 16 22 12 AC 8 7 325427 CASAVA_Build 21 27823595 1D CATCCTTGCT G/- GGCCCCAGGA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 G 3 2 325428 CASAVA_Build 21 27835175 1D AACAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 33 0 26 7 T 11 10 325429 CASAVA_Build 21 27839872 1D TTGTCTCTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 10 9 325430 CASAVA_Build 21 27846846 1I TCAGAAGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1326 hom 36 3 30 3 T 13 14 325431 CASAVA_Build 21 27851565 1D AAGATACAGA T/- TTTTAAAGTG 3070 het 3070 hom 49 18 27 4 T 5 4 325432 CASAVA_Build 21 27852414 4D TCAGAAGAGT TTAA/---- TTATTTCTGA 3070 het 3070 hom 39 19 20 2 TTAA 1 0 325433 CASAVA_Build 21 27853312 15D GCTTTTATTC TATTTTATTTTATTT/--------------- TATTTTATTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 11 TATTT 5 2 325434 CASAVA_Build 21 27853635 2D TAGGCATTTA AT/-- ATATGTCAAC 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 AT 3 2 325435 CASAVA_Build 21 27867672 1I TATATTTTAA -/T TTTACTGCAT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 3 4 325436 CASAVA_Build 21 27872910 1I CACCACTCTC -/T GGCTATCATC 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 T 0 1 325437 CASAVA_Build 21 27884420 1D TCTACTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2225 hom 34 7 19 8 A 13 12 325438 CASAVA_Build 21 27902069 1D AGCAGCTCTT A/- AAGTTTAATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 2 325439 CASAVA_Build 21 27902700 1I GAGCATGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 353 hom 32 1 27 4 T 10 11 325440 CASAVA_Build 21 27903009 1D TGTGTGTGTG T/- GTGTGTGTAG 3070 het 1227 hom 33 6 10 17 T 1 0 325441 CASAVA_Build 21 27908174 1I TATTCCCATC -/T TTTATATCTA 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 3 4 325442 CASAVA_Build 21 27908300 1D TTGCTACAAA G/- AACATGATTT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 G 1 0 325443 CASAVA_Build 21 27908944 1I CTGTTGATAG -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 8 9 325444 CASAVA_Build 21 27911989 5I ATCTTTTTAT -----/TTTAA TTTGTGTGTT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TTTAA 0 1 325445 CASAVA_Build 21 27916900 10I AGTTCCACCC ----------/ACCAAAACAT ACCAAAACAT 3070 hom 84 het 35 0 29 6 ACCAAAACAT 1 2 325446 CASAVA_Build 21 27933637 1I TTCACTTTTT -/G TAGTGTAATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 0 1 325447 CASAVA_Build 21 27937407 1D TTCCTTAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 10 9 325448 CASAVA_Build 21 27952111 2I CTAATAAAAC --/AT ATACATTTAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AT 1 2 325449 CASAVA_Build 21 27952254 5D AATTTTCAAG AATAT/----- AATACATTAT 3070 het 3070 hom 28 11 15 4 AATAT 1 0 325450 CASAVA_Build 21 27957779 2I CAAGAAAAAA --/AC ACAAACAAAC 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 AC 1 2 325451 CASAVA_Build 21 27959459 2D GCATTCAGAT CA/-- CATACAAGTG 3070 het 3070 hom 58 24 28 6 CA 2 1 325452 CASAVA_Build 21 27959868 1I AACTCTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 T 11 12 325453 CASAVA_Build 21 27970312 1I CAAAAAAAAA -/T AATAAAATAA 2721 het 22 hom 10 1 6 3 T 0 1 325454 CASAVA_Build 21 27972532 4D ATTCATAAGA AAGC/---- AAAGAAAATA 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 AAGC 1 0 325455 CASAVA_Build 21 27976510 4I CCTGCCCTAT ----/AGTG AGTGATATGA 3070 het 3070 ref 47 29 13 5 AGTG 1 2 325456 CASAVA_Build 21 27981952 1D CATAAATTAA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 T 8 7 325457 CASAVA_Build 21 27982048 1I GTCTTTACTT -/A ATTCTCGCTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 1 2 325458 CASAVA_Build 21 27982188 4I CTCTTCTCTC ----/TCTT TGTGTTTCTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 TCTT 0 1 325459 CASAVA_Build 21 27982965 4D CTAGAAGTTA GTTT/---- GTGTTTATTA 3070 het 3070 hom 24 8 14 3 GTTT 1 0 325460 CASAVA_Build 21 27983097 4I CAGGATTTTT ----/AATA AATAGATTTA 2805 het 568 hom 9 2 7 0 AATA 1 2 325461 CASAVA_Build 21 27988195 1I TCTCTAAAAT -/A AAAAATAAAG 3070 het 2989 hom 21 7 11 3 A 5 6 325462 CASAVA_Build 21 27988533 5D TTGCAAATAT TTTAA/----- TTTATTTAAT 3070 het 3070 ref 20 11 8 3 TTTAA 1 0 325463 CASAVA_Build 21 27989464 2D CTCCCTTCCT TC/-- CTCTCTCTTT 3070 het 2961 hom 22 11 10 2 TC 1 0 325464 CASAVA_Build 21 27989808 4D GCTTTCTCTC TCTT/---- TCTCTTCTTC 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 TCTT 1 0 325465 CASAVA_Build 21 27992833 3I ATTCACTTAG ---/CAT CATGTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 CAT 1 2 325466 CASAVA_Build 21 27997722 1D AAGTATCTTG A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 48 18 22 11 A 8 7 325467 CASAVA_Build 21 28005243 1D ATAATGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 15 2 9 4 T 12 11 325468 CASAVA_Build 21 28007114 2I CAGAAACGTA --/AT ACATCTGAAA 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 AT 0 1 325469 CASAVA_Build 21 28008022 1D AAACAGAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 T 11 10 325470 CASAVA_Build 21 28021609 1D GACTGCCTTT C/- CCCGGCACTG 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 C 4 3 325471 CASAVA_Build 21 28024949 5D AAATTATTTG TATTT/----- TATTTATTAT 2100 het 373 hom 11 4 5 2 TATTT 2 1 325472 CASAVA_Build 21 28025978 1I ACAATTTCTA -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 6 7 325473 CASAVA_Build 21 28034869 4D TATTTGATAA TTTC/---- TTTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 TTTC 3 2 325474 CASAVA_Build 21 28054742 7I TTCTCTCCCC -------/GGCAATT GGCAATTCCT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 GGCAATT 1 2 325475 CASAVA_Build 21 28074388 1I GACGCACCTC -/A GCTCGCTGTA 3070 het 2092 hom 21 6 15 0 A 0 1 325476 CASAVA_Build 21 28079004 1D AGAACACCAA G/- GGGAATATCC 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 G 4 3 325477 CASAVA_Build 21 28080356 1I TTTGAAATGG -/A TATTTTAATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 1 325478 CASAVA_Build 21 28080543 2D TTTTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 42 17 24 4 GT 9 8 325479 CASAVA_Build 21 28092597 2D TTTCTTAGAT AG/-- AGTCTTGCTC 3001 het 2481 hom 17 6 7 5 AG 2 1 325480 CASAVA_Build 21 28099890 1D GAACTCGGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 19 12 15 T 10 9 325481 CASAVA_Build 21 28121576 1I TCTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 695 het 695 ref 22 13 3 7 T 13 14 325482 CASAVA_Build 21 28122197 1I CTGGAATCAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 T 8 9 325483 CASAVA_Build 21 28124825 5D TTGAACATAT TAAAA/----- TAAAAGTAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 TAAAA 2 1 325484 CASAVA_Build 21 28127253 1D CTCAAACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 10 9 325485 CASAVA_Build 21 28128046 1D ATTTCTTTTA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 T 7 6 325486 CASAVA_Build 21 28131840 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2399 hom 34 10 20 4 A 13 12 325487 CASAVA_Build 21 28142816 1D AACAAACATG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 A 8 7 325488 CASAVA_Build 21 28145118 2D27M1I TTCCATAATT TCTGTCTTTTCTTGGTCTGTTTCTATTAA-/--TGTCTTTTCTTGGTCTGTTTCTATTAAT CTTTTTGTCT 1930 het 1930 ref 15 12 4 5 N/A 0 0 325489 CASAVA_Build 21 28145192 2D TGCATTTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 1618 het 1618 ref 18 11 5 3 T 13 11 325490 CASAVA_Build 21 28148937 1D ACATACTTAA T/- TTTTTTTTTT 2791 het 2200 hom 24 7 8 9 T 17 16 325491 CASAVA_Build 21 28150686 1I GTTAGATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 T 10 11 325492 CASAVA_Build 21 28153037 4I TAAGGAAATA ----/TATT TATTAGAGAA 3070 het 2810 hom 21 7 11 3 TATT 1 2 325493 CASAVA_Build 21 28156314 1D ATCCTTTATA C/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 C 1 0 325494 CASAVA_Build 21 28157985 1D ATAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 25 0 21 6 A 11 10 325495 CASAVA_Build 21 28158138 1D GAAAATATAG T/- TTTTCAGTTC 3070 het 3070 ref 26 17 8 1 T 5 4 325496 CASAVA_Build 21 28158527 2D TGACTTGAAA AT/-- ATAAAAGTTA 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 AT 2 1 325497 CASAVA_Build 21 28159047 4D TTTGAGGTAA TTTT/---- ATTTGTCAGC 3070 het 3070 ref 27 19 8 0 T 4 0 325498 CASAVA_Build 21 28171910 4I CAAGAATTAA ----/TAAT TAATTATTCT 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 TAAT 1 2 325499 CASAVA_Build 21 28172779 1I TCGGTCAGAT -/G GTAGCAGAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 2 325500 CASAVA_Build 21 28176700 3D TGCAATCTTC TTT/--- AAGTACTAAG 3070 het 3070 ref 29 18 8 5 T 3 0 325501 CASAVA_Build 21 28178416 3I TTAACATATG ---/GAA GAATAAGAAA 2999 het 2999 ref 25 14 7 4 GAA 1 2 325502 CASAVA_Build 21 28181563 1I ATAAAAAAAA -/T TTTAAATATA 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 T 3 4 325503 CASAVA_Build 21 28190755 5D GATAATTATA TAATT/----- TAATTTTTTT 2433 het 2433 ref 21 14 6 3 TAATT 2 1 325504 CASAVA_Build 21 28192884 1I AAGCAAAAGC -/A AAAAAACATA 1929 het 1929 ref 18 12 4 2 A 6 7 325505 CASAVA_Build 21 28197955 2D ACAAAGATAA AT/-- ATATATATAT 2840 het 1852 hom 26 5 8 13 AT 9 8 325506 CASAVA_Build 21 28199779 3I GTAAAACTAT ---/TAA TAATATGTAG 2935 het 2935 ref 18 11 6 1 TAA 1 2 325507 CASAVA_Build 21 28205838 1I GACTCCATCT -/A AAGAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 15 0 A 2 3 325508 CASAVA_Build 21 28213782 4I TCAAATTTAA ----/TTGT TTATTATTGG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TTGT 0 1 325509 CASAVA_Build 21 28214278 1D ATTTATTGAA T/- TTTTTAATGG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 T 6 5 325510 CASAVA_Build 21 28215985 2I TTTTCTTCTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 T 9 11 325511 CASAVA_Build 21 28217110 4I TTGCCTAACC ----/CAAT CAATGTCTAG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 CAAT 1 2 325512 CASAVA_Build 21 28223443 1I AATCATAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 766 hom 36 2 26 9 A 9 10 325513 CASAVA_Build 21 28224982 1D CATATACCAT G/- GCATATGGAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 2 1 325514 CASAVA_Build 21 28234522 1I TGGGTTCTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 9 10 325515 CASAVA_Build 21 28235565 1I CTCCTTATCA -/T TTCTCTTCAG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 2 3 325516 CASAVA_Build 21 28237173 13I ATCTATTAGA -------------/CCTTGTTAGAGTC CCTCACCCCA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 CCTTGTTAGAGTC 0 1 325517 CASAVA_Build 21 28238012 1I AATTACTAAT -/A GATATTTTGC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 0 1 325518 CASAVA_Build 21 28242407 1I ATTTTATGGG -/T TTTTTTTTTT 2710 het 2710 ref 27 13 9 5 T 13 14 325519 CASAVA_Build 21 28246632 1D86M1I AAATGATGCA TTTTTTTCTGCTTTTCTTAAAATGAATTTCCAAGAAATTAGCAAAAATATGCTAATGACCAATGCAGAGACTATGCACCAGCACCCT-/-TTTTTTCTGCTTTTCTTAAAATGAATTTCCAAGAAATTAGCAAAAATATGCTAATGACCAATGCAGAGACTATGCACCAGCACCCTC CTTGTTCTGA 3070 het 3070 hom 53 25 66 8 N/A 0 0 325520 CASAVA_Build 21 28247113 1I CACAAACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 9 10 325521 CASAVA_Build 21 28251600 1D AAAGAACCTG C/- CTATAAACAG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 C 2 1 325522 CASAVA_Build 21 28251824 1I CTTCGTGATG -/A ATACCAAATT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 1 2 325523 CASAVA_Build 21 28254429 1D TTTATGCCTG T/- TCTTTACTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 2 1 325524 CASAVA_Build 21 28256760 1D ATGAATCACA T/- TTATTTTTGT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 3 2 325525 CASAVA_Build 21 28261194 1D GGTCTTAACT G/- GAAGGTTAAT 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 G 2 1 325526 CASAVA_Build 21 28264462 4I TCTGGGACTC ----/AATT AAGTTACCAT 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 AATT 0 1 325527 CASAVA_Build 21 28268819 1I ACAAAGGTGG -/T GGGGGGAGAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 T 0 1 325528 CASAVA_Build 21 28269355 3I CAGTCTCAGG ---/TAT TATTACTTCA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 TAT 1 2 325529 CASAVA_Build 21 28270249 1D TAATAACTGA T/- TTAATGCTGT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 3 2 325530 CASAVA_Build 21 28272317 1D TCTCAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2092 hom 18 5 8 5 T 11 10 325531 CASAVA_Build 21 28275935 1D CCACCCTAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 A 10 9 325532 CASAVA_Build 21 28277891 1I GCTGAGATGT -/A AAAAAACTGA 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 A 6 7 325533 CASAVA_Build 21 28279104 2I TGGAGGATAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 10 12 325534 CASAVA_Build 21 28285671 2I GAAAATGTGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 TA 5 6 325535 CASAVA_Build 21 28286678 1D CAGCAGCAGA C/- CCACCAAACT 3070 hom 51 het 28 0 18 11 C 3 2 325536 CASAVA_Build 21 28293349 2D CCCTAAACTC TG/-- AACCAGAGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 4 TG 1 0 325537 CASAVA_Build 21 28300225 1I35M5D AGGAAATATT -AAAAAATATTGATTAACAGTGATTTATTAATATTTTAGAA/AAAAAAATATTGATTAACAGTGATTTATTAATATTT----- TAGAAGATTA 3070 het 3070 ref 29 20 11 5 N/A 0 0 325538 CASAVA_Build 21 28300626 1I GTCAGATTTT -/C CCCCAATGAA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 C 4 5 325539 CASAVA_Build 21 28301307 2D ACCAGAGTAT TA/-- TATATATATC 3070 het 3070 ref 37 27 9 2 TA 5 4 325540 CASAVA_Build 21 28302134 1I GAAGAAGGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 150 het 56 0 50 6 T 8 9 325541 CASAVA_Build 21 28307323 3D GTTATGTTGA AGG/--- AGTAGAGAGG 3070 het 3070 ref 33 23 10 0 AGG 1 0 325542 CASAVA_Build 21 28309838 1I TACTTTTTTT -/A AAGCCTGTTT 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 2 3 325543 CASAVA_Build 21 28310219 1I GCACACAGAG -/A AGTCTGTCTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 1 2 325544 CASAVA_Build 21 28311937 1D GTATGGGGTT C/- TTGATATAGC 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 C 1 0 325545 CASAVA_Build 21 28312946 1I TCTGTAGCCA -/G GGTGTCTGGA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 G 2 3 325546 CASAVA_Build 21 28314071 1D TAGCTCTGTC A/- AAGTGGGTCA 1163 het 1163 ref 18 12 3 3 A 3 2 325547 CASAVA_Build 21 28314265 1D TTTTGGTACC A/- ATAAACAGGA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 2 1 325548 CASAVA_Build 21 28324971 1I CCAGAAAAAA -/T ATATATATAT 3064 het 2092 hom 16 6 8 2 T 0 1 325549 CASAVA_Build 21 28334234 3D2M1D ACTCCCACTC CTGAGT/---AG- GGTAATCTTA 3070 het 3070 ref 36 23 11 4 N/A 0 0 325550 CASAVA_Build 21 28352475 1I TCTTGCTATG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 9 10 325551 CASAVA_Build 21 28357450 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 18 0 13 5 AT 9 8 325552 CASAVA_Build 21 28360680 1D GCCTTTTGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 10 9 325553 CASAVA_Build 21 28362673 16D ACCAGCCTGG ATTTGAGCTGAAGCTC/---------------- AAATGGTCAC 3070 het 3070 ref 35 20 15 2 ATTTGAGCTGAAGCTC 1 0 325554 CASAVA_Build 21 28363432 1D GTATGTATGT G/- GGGGGGGCTT 3070 het 3070 hom 51 23 23 5 G 8 7 325555 CASAVA_Build 21 28364500 4I TTATAATACT ----/TTCC TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TTCC 0 1 325556 CASAVA_Build 21 28365595 1I GGCCAACAAG -/A AAAAAACATT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 6 7 325557 CASAVA_Build 21 28366854 1I AAAGTGAATA -/G GGAGAAATTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 2 3 325558 CASAVA_Build 21 28366905 1D CCTGAGAAAG A/- GAATGCATTC 3070 het 2930 hom 23 8 8 7 A 1 0 325559 CASAVA_Build 21 28371621 4I22M1I ATACATATAT ----ACACACACATATATATATAGTG-/ACACACACACACATATATATATAGTGT TTTTGTCATT 3070 het 822 hom 25 6 14 8 N/A 0 0 325560 CASAVA_Build 21 28372175 1D TTTTAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2448 hom 34 6 16 12 A 12 11 325561 CASAVA_Build 21 28374588 1I CAAGACATGC -/A AAAATCTATA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 4 5 325562 CASAVA_Build 21 28388995 3D AATGATAAAA GAT/--- AGATAGATAG 3070 het 200 hom 27 2 19 6 GAT 1 0 325563 CASAVA_Build 21 28390652 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 1919 het 792 hom 12 3 5 4 T 7 8 325564 CASAVA_Build 21 28392744 5D ATTTAATTTT TTTAA/----- TTTAATTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 TTTAA 2 1 325565 CASAVA_Build 21 28394068 1I17M2I ATCAGTTATA -AGAAAACTTCAGCATTT--/CAGAAAACTTCAGCATTTTC TCTCTCTTTC 3070 het 3070 hom 22 10 11 3 N/A 0 0 325566 CASAVA_Build 21 28394277 5D ATATTTAATA AATTT/----- AATTAACTAT 1268 het 1268 ref 9 5 4 0 AATTT 1 0 325567 CASAVA_Build 21 28395025 1D TTATACTCCC A/- CAAGCAATGT 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 A 1 0 325568 CASAVA_Build 21 28395521 3I17M3I10M3D TGAATATTAA ---TATTATTTATATAATAA---ATTATAAAATATA/TATTATTATTTATATAATAAAATATTATAAAAT--- ATATGTATAT 2314 het 2314 ref 15 10 6 3 N/A 0 0 325569 CASAVA_Build 21 28399887 1D ATATTCTATT A/- AAAAAGAGTC 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 6 5 325570 CASAVA_Build 21 28400405 3D TAAAAATACA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 12 9 325571 CASAVA_Build 21 28403173 1I TACAAAAGAG -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 6 7 325572 CASAVA_Build 21 28403358 2D CAAGTCACAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 12 16 1 A 11 9 325573 CASAVA_Build 21 28404400 1D AAAGTTCACT C/- ACATGTCTGG 3070 het 3070 ref 63 33 23 8 C 1 0 325574 CASAVA_Build 21 28406859 1I TTTAAAACAA -/T TGTAAGTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 325575 CASAVA_Build 21 28407335 1I TTATGTGCTC -/T CTCCAGCTCA 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 0 1 325576 CASAVA_Build 21 28408286 1I TTTTTCTTTA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 7 8 325577 CASAVA_Build 21 28409658 1I ATGTATTTGC -/A AGAAAAAAAA 3070 hom 63 het 38 1 32 5 A 1 2 325578 CASAVA_Build 21 28414403 2D AATAAGCAGA AC/-- ACAGAGTTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 AC 2 1 325579 CASAVA_Build 21 28414945 1I ATTTTAGCAG -/A GGGGGGCATT 3008 hom 27 het 23 0 10 13 A 0 1 325580 CASAVA_Build 21 28416063 1D TTTATTTATA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 10 9 325581 CASAVA_Build 21 28421066 1I TGACCATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 9 10 325582 CASAVA_Build 21 28425587 1D GGCAGCAGGG C/- CCTGGGCATG 3070 het 3070 hom 37 12 19 7 C 3 2 325583 CASAVA_Build 21 28427443 1I GATTCTGTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2510 hom 33 6 20 7 A 10 11 325584 CASAVA_Build 21 28436428 1I GTGTTACCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 11 12 325585 CASAVA_Build 21 28436942 5D GGCATCTGAA TAATG/----- TTATTATCTA 3070 het 3070 hom 30 14 14 3 TAATG 1 0 325586 CASAVA_Build 21 28455634 1I TGTCAGGCCT -/C TGAGCCCAAG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 C 0 1 325587 CASAVA_Build 21 28458175 10I GTGGAGACAC ----------/TTTAACTAAA TTATCTGCTT 3070 hom 61 het 25 0 21 4 TTTAACTAAA 0 1 325588 CASAVA_Build 21 28467155 8D AAGGCACATA TTAAGAAG/-------- TAAGATTAAG 3070 het 2734 hom 19 7 10 3 TTAAGAAG 1 0 325589 CASAVA_Build 21 28469155 1D AAAAAGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 11 10 325590 CASAVA_Build 21 28470545 4I GGAGGGAGGG ----/AGGA AGGAAGGAAA 1695 het 1228 hom 15 8 5 2 AGGA 2 3 325591 CASAVA_Build 21 28476295 2D AGCCCGACCC TA/-- TGTTACAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 12 8 TA 1 0 325592 CASAVA_Build 21 28477801 1D AGTTTTGTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 T 10 9 325593 CASAVA_Build 21 28483562 1I TTTTGTTGAG -/T TATTTTTGCA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 1 2 325594 CASAVA_Build 21 28484246 1I ATTTTTCTTC -/T TTTTCTTATA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 4 5 325595 CASAVA_Build 21 28487240 1D TCAGAGCTCC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 2947 hom 42 15 19 8 T 9 8 325596 CASAVA_Build 21 28489194 1I TTTAAAAAAA -/T TTAAATGAAA 3070 het 3070 ref 26 15 11 0 T 2 3 325597 CASAVA_Build 21 28492962 1D CATGAGCCAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 8 7 325598 CASAVA_Build 21 28494035 3I ATTAAAAGTT ---/AAA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 9 12 325599 CASAVA_Build 21 28510400 2D AGAGAAAAAC AT/-- ATAGCTGGAG 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 AT 2 1 325600 CASAVA_Build 21 28511293 2I ATAAGATTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 56 23 21 12 TG 5 6 325601 CASAVA_Build 21 28513211 2D TGAAACCTGG AT/-- ATATAGGAGA 3070 hom 71 het 28 0 22 6 AT 3 2 325602 CASAVA_Build 21 28515377 2D TTTTTCAAAA AT/-- ATATACTTAC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AT 3 2 325603 CASAVA_Build 21 28538908 2D TATCTTTTGA AT/-- ATATATATAT 900 het 900 ref 29 20 2 8 AT 7 6 325604 CASAVA_Build 21 28546561 1D TCATGCAGAT G/- GGAAGCTAAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 3 2 325605 CASAVA_Build 21 28551724 1D AAAGGACAAC A/- AAAGGCTAAC 3070 het 3070 hom 50 14 25 11 A 4 3 325606 CASAVA_Build 21 28557192 1I CCGATCACGA -/G GCATCCCTGG 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 G 1 2 325607 CASAVA_Build 21 28559030 2D CCTATGTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 12 10 1 A 12 10 325608 CASAVA_Build 21 28559339 17I CTGTAGTCTT -----------------/AGTTACTCAGGAGGCTA AGACAGCAAG 3070 het 3070 hom 18 7 7 4 AGTTACTCAGGAGGCTA 0 1 325609 CASAVA_Build 21 28572650 20D TATTAAAATG TACAATATACAATTAAGATA/-------------------- TACAATATAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 12 TACAATATACAATTAAGATA 2 1 325610 CASAVA_Build 21 28579209 2D AAAGAAAGAT TA/-- TATAAGTCTA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 TA 3 2 325611 CASAVA_Build 21 28590348 1I TTTCTTGTGC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 8 9 325612 CASAVA_Build 21 28607182 1I TCCCCAGGCC -/A AAAAAAAAAA 2114 het 1028 hom 40 5 10 25 A 15 16 325613 CASAVA_Build 21 28608253 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 714 hom 36 2 28 6 A 7 8 325614 CASAVA_Build 21 28609093 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 471 hom 16 1 12 3 TA 7 8 325615 CASAVA_Build 21 28610370 1I TTTTATATGA -/T TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 T 6 7 325616 CASAVA_Build 21 28627730 1I CTTTCATCTC -/T TTAAGTTTCT 3070 het 3070 hom 38 10 24 4 T 2 3 325617 CASAVA_Build 21 28634326 1D GGCTTTTATT C/- CCTAAGCTGA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 C 3 2 325618 CASAVA_Build 21 28637305 1I GCAGCGGGGT -/G GGGGGTCCTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 5 6 325619 CASAVA_Build 21 28638016 1D AGAGAAAGAC T/- TTATGTCTAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 3 2 325620 CASAVA_Build 21 28648388 1D GAAATTCTCG C/- AAGGCCATGG 3070 hom 84 het 33 0 27 6 C 1 0 325621 CASAVA_Build 21 28655168 1D TTATATCCAC T/- TTTCTTAGCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 4 3 325622 CASAVA_Build 21 28655977 1D TGTTGTTGAA T/- TTTTGTCAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 4 325623 CASAVA_Build 21 28661331 1I27M1I4M1I TTTGCTCATG -TCTTATCAACTATCCTTCATCACAAAG-TACA-/TTCTTATCAACTATCCTTCATCACAAAGATACAT TAATGGTACT 3070 hom 96 het 31 0 33 5 N/A 0 0 325624 CASAVA_Build 21 28676865 1D CAGTGCTTTA T/- TAATCTGACT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 2 1 325625 CASAVA_Build 21 28677663 1I TAACACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 15 9 A 11 12 325626 CASAVA_Build 21 28700979 8I GCACATCTTA --------/CATGGTGG CAGGGAAGGG 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 CATGGTGG 0 1 325627 CASAVA_Build 21 28704378 6I ATGTTGGCAG ------/TATCTC TAAAAACAAT 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 TATCTC 0 1 325628 CASAVA_Build 21 28707416 3D CATAACATGT ATA/--- ATGTTTTTCC 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 ATA 1 0 325629 CASAVA_Build 21 28711244 1I ATATTGCAAA -/T GGTTGTCCCA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 0 1 325630 CASAVA_Build 21 28712891 4D GTAGAACACA GAAC/---- GATAGCATGA 3070 het 3070 hom 43 21 21 4 GAAC 1 0 325631 CASAVA_Build 21 28722596 1I ACATTGGGGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 A 8 9 325632 CASAVA_Build 21 28729022 1D GCCTGGTTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 2451 hom 22 7 10 5 T 8 7 325633 CASAVA_Build 21 28729756 5I TTTTGCAAAA -----/GCTTT GAACATAGTT 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 GCTTT 0 1 325634 CASAVA_Build 21 28731360 4D TTGTGTGCAG AAAA/---- AAAATCAAGG 3070 hom 99 het 37 0 34 5 A 8 4 325635 CASAVA_Build 21 28731739 1D CCTTCTCCAG C/- CAATAATGGC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 2 1 325636 CASAVA_Build 21 28736972 4D GATACAGCAA GAAG/---- GAAGCTGCAA 3070 het 3070 ref 53 26 23 8 GAAG 2 1 325637 CASAVA_Build 21 28744334 2I TTCCATAGTC --/AA GTTTTAATAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 0 2 325638 CASAVA_Build 21 28748497 2D TATATTTAAA AG/-- GGAATACAGC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 AG 1 0 325639 CASAVA_Build 21 28749518 1I AAAACGAGGG -/A TTTTATCCAA 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 A 0 1 325640 CASAVA_Build 21 28763790 1I AGTAGATTTG -/T TTTCTGTTCA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 3 4 325641 CASAVA_Build 21 28764078 2I TCTTCATGTT --/AA GTTTATTCAT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 0 2 325642 CASAVA_Build 21 28765568 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 11 10 325643 CASAVA_Build 21 28789386 1I CTAAGGCTAG -/T TTTTTTTTTT 3025 het 3025 ref 26 13 8 5 T 11 12 325644 CASAVA_Build 21 28796575 1D TCCTAAGAGG T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 T 8 7 325645 CASAVA_Build 21 28799334 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAA 1321 het 1321 ref 30 17 5 8 A 16 15 325646 CASAVA_Build 21 28814648 1D CTATTTGCCC T/- TCCTGTAGAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 1 325647 CASAVA_Build 21 28834605 2I TGTCATATAC --/TA TATATATATA 1235 het 1235 ref 17 8 3 6 TA 8 9 325648 CASAVA_Build 21 28837953 3D TCATCAAACT GTA/--- TTACAGAGAG 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 GTA 1 0 325649 CASAVA_Build 21 28839113 6I TATACATTAC ------/ATTATT ATTAACTATT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 ATT 1 3 325650 CASAVA_Build 21 28855368 1I AGTGGCATTT -/A AAAAAAAAAA 2731 het 2731 ref 28 16 10 2 A 11 12 325651 CASAVA_Build 21 28857029 2I AAATCAACAC --/AT GTTATTCACT 3070 het 3070 ref 47 34 11 2 AT 0 1 325652 CASAVA_Build 21 28866103 2I ATTTAAAAGC --/TT TGAAGAGACT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 T 1 3 325653 CASAVA_Build 21 28870663 2I TTAAAATATC --/TT AACACAAGTT 3070 het 3070 hom 25 12 12 1 T 0 2 325654 CASAVA_Build 21 28874762 1I TAATGCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 11 12 325655 CASAVA_Build 21 28880075 5D TAAAACAAAT TATAA/----- TATAACCATA 3070 het 3070 ref 45 24 18 6 TATAA 2 1 325656 CASAVA_Build 21 28880742 1I CTCATTTGCA -/T TTTTATAAGC 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 T 4 5 325657 CASAVA_Build 21 28889476 1I TTCGTTCTAG -/T TTTTGTACCC 3070 hom 51 het 21 0 14 7 T 4 5 325658 CASAVA_Build 21 28895950 2I CTGAAGCTAG --/CA CAGACTATTA 3070 het 3070 hom 52 22 22 8 CA 1 2 325659 CASAVA_Build 21 28906367 1D AAAAATCCTC A/- AAAAAAAAAA 1168 het 1168 ref 33 24 3 6 A 15 14 325660 CASAVA_Build 21 28908138 1D ATGACTTTCT C/- CCCACGGTTC 3070 hom 93 het 33 0 31 3 C 4 3 325661 CASAVA_Build 21 28909042 1D AGTGGTTCTC T/- TTTTGAGTTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 5 4 325662 CASAVA_Build 21 28934908 1D CAATCCTCTA G/- GACTTGGCTG 3070 het 3070 ref 58 27 26 5 G 2 1 325663 CASAVA_Build 21 28944052 2I AAATAATAAA --/AT ATAATAAAAT 2149 het 2149 ref 22 11 8 3 AT 1 2 325664 CASAVA_Build 21 28968997 1D ATAGTGGAGG C/- CCTGTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 C 3 2 325665 CASAVA_Build 21 28979540 1D TTTATGTCCC A/- AAAGCCAGTA 3070 het 3070 hom 48 19 25 5 A 4 3 325666 CASAVA_Build 21 28981783 1I GACCAACTTG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 7 8 325667 CASAVA_Build 21 28983329 1D AAAATGGCAG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 45 20 19 7 A 7 6 325668 CASAVA_Build 21 28985448 2I ATGAGAGAGG --/TA GACTGAACGC 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 TA 0 1 325669 CASAVA_Build 21 28985904 3I ATAGTGATGT ---/TAC TACGATTCAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 TAC 1 2 325670 CASAVA_Build 21 28989979 4D CAAAGTAAGT CTTA/---- CTTAACTCAT 1656 het 1656 ref 11 4 4 3 CTTA 2 1 325671 CASAVA_Build 21 28996503 1D CTATTGCAAC A/- AAAAAAAAAA 2919 het 2919 ref 30 15 7 8 A 12 11 325672 CASAVA_Build 21 28998751 1D AGGTTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 883 hom 45 7 20 18 A 21 20 325673 CASAVA_Build 21 28999529 4D CTACTTTTCT TTTC/---- TTTATCTACC 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 TTTC 1 0 325674 CASAVA_Build 21 28999671 1D AAACCAACAT A/- ATATCTCTTG 3070 het 3070 hom 38 15 20 5 A 2 1 325675 CASAVA_Build 21 29000980 1D TCTGAACCAC A/- AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 41 12 24 8 A 7 6 325676 CASAVA_Build 21 29001120 4I ATATACTCTG ----/GTGA GTGAATGAAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 GTGA 1 2 325677 CASAVA_Build 21 29002418 1D TAATGTAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 11 10 325678 CASAVA_Build 21 29010320 1I ATTTGGACTC -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 6 7 325679 CASAVA_Build 21 29012811 1D TCTCCACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 A 11 10 325680 CASAVA_Build 21 29022695 1D GGAAGAACTC T/- TAAGTATGTC 3070 het 3070 hom 47 19 25 4 T 2 1 325681 CASAVA_Build 21 29024396 1I13M1I CATAGTGAGA -CCCCCATTGCCAC-/CCCCCCATTGCCACA AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 25 0 26 2 N/A 0 0 325682 CASAVA_Build 21 29026008 10I GGCTAGAGAG ----------/AAAAGAGAAA AAAAGAGAAG 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 AAAAGAGAAA 0 1 325683 CASAVA_Build 21 29027921 1D AAGCCACTGG T/- TTTTTTTTTT 1379 het 1379 ref 31 21 4 6 T 12 11 325684 CASAVA_Build 21 29035124 1D ATGTAATGCA T/- TTTTTTGGAC 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 7 6 325685 CASAVA_Build 21 29040866 1D GGGCCAATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1087 hom 29 4 18 7 A 15 14 325686 CASAVA_Build 21 29043166 1D CATCACATAC T/- TTTAAGATCT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 4 3 325687 CASAVA_Build 21 29043331 1D CCAGCATTGG C/- CAAAAGAGTG 3070 het 3070 ref 29 15 9 6 C 2 1 325688 CASAVA_Build 21 29047000 3D AAAATGTAAG ATA/--- TTATTGTTGT 3070 het 3070 ref 57 30 20 8 ATA 1 0 325689 CASAVA_Build 21 29049303 3D CCAGGGCAGT AGA/--- AGAATTCGTG 3070 het 3070 hom 43 19 21 6 AGA 2 1 325690 CASAVA_Build 21 29049892 4D ATAGCCATTC AACA/---- AACAGTTACT 3070 het 3070 ref 52 29 19 6 AACA 2 1 325691 CASAVA_Build 21 29055793 1I TCTACAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 13 5 T 13 14 325692 CASAVA_Build 21 29056628 1I ACTATAAAAA -/G CAAGGCCTCT 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 G 0 1 325693 CASAVA_Build 21 29058125 1I GTCCTCAACC -/A GTGACTGAAA 3070 het 3070 ref 71 35 26 10 A 0 1 325694 CASAVA_Build 21 29061754 5D GGCAAGAGCA ACAAC/----- ATTATGCTAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 ACAAC 1 0 325695 CASAVA_Build 21 29065200 2D TAAGATTAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 AC 7 6 325696 CASAVA_Build 21 29067857 1D AAGGTCTCTA G/- GCCATGCATG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 G 2 1 325697 CASAVA_Build 21 29068782 1I CCCTGCTTCT -/A AAAAAAAAAG 3014 het 3014 ref 23 13 8 2 A 9 10 325698 CASAVA_Build 21 29075678 1D TCTTGAAGGA T/- TTCACAGAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 3 2 325699 CASAVA_Build 21 29081636 1I AGAGTGGGAG -/A AAACCTTCAC 3070 hom 48 het 22 0 16 6 A 3 4 325700 CASAVA_Build 21 29087650 5D AGGAAAACCA ACTTC/----- ACTTCACGAT 3070 het 3070 hom 46 20 25 3 ACTTC 2 1 325701 CASAVA_Build 21 29089959 1D TTTGGAGCAC A/- AGGTTTGAAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 A 2 1 325702 CASAVA_Build 21 29112000 1I AAACACAGAT -/G GGGCTCAGGT 3070 hom 117 het 45 0 37 8 G 3 4 325703 CASAVA_Build 21 29113738 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1289 het 862 hom 22 6 7 9 T 19 18 325704 CASAVA_Build 21 29131004 1I TAAAGCGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 11 12 325705 CASAVA_Build 21 29138992 1I TTCCTTATTA -/G TAACAAACTT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 G 0 1 325706 CASAVA_Build 21 29139893 6D TTTTTCTCAC TTCTAT/------ TTCTAAGTAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 TTCTAT 1 0 325707 CASAVA_Build 21 29140826 1D CCTTTGTCAA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 8 7 325708 CASAVA_Build 21 29145162 19I ACTTACTTGT -------------------/GCCCTCTGGACCTGCTCGA GCCCAGATGC 3070 het 3070 ref 36 17 17 3 GCCCTCTGGACCTGCTCGA 0 1 325709 CASAVA_Build 21 29148649 1I GTATTAGTCA -/G GGTTCTCTAG 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 2 3 325710 CASAVA_Build 21 29158623 1I ATGTATGTCC -/T AAAAGAGCAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 0 1 325711 CASAVA_Build 21 29160002 2D TAGGATGTAT TA/-- TATACTTCAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TA 3 2 325712 CASAVA_Build 21 29160642 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAATAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 6 7 325713 CASAVA_Build 21 29163574 1I AGTTTTCTTC -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 6 7 325714 CASAVA_Build 21 29169696 9D TGAAACACCA CTGGATCTG/--------- CTGGATCATA 3070 hom 39 het 18 0 14 5 CTGGATCTG 1 0 325715 CASAVA_Build 21 29171334 2D AGAGAAGAGA AG/-- AGAGAGAGAG 1724 het 914 hom 7 2 5 0 AG 6 5 325716 CASAVA_Build 21 29171601 7I3M1I GAAGAAAAAA -------AAG-/AGAAAAGAAGA AAGGAAGGAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 N/A 0 0 325717 CASAVA_Build 21 29171775 4D AGAAGAAAGG AAGA/---- AAGAAAGATG 3070 hom 76 het 29 0 22 7 AAGA 3 2 325718 CASAVA_Build 21 29176807 1I ACAGGAAATG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 8 9 325719 CASAVA_Build 21 29177738 11I4M3I AGAATTAAAA -----------GGTC---/TAATAATTCTTTGTCCTG CCCCAATAAT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 N/A 0 0 325720 CASAVA_Build 21 29180094 1I TCTGGCTCCG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1084 hom 43 3 36 4 T 9 10 325721 CASAVA_Build 21 29188785 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 70 het 26 0 23 4 A 10 9 325722 CASAVA_Build 21 29200400 2D ATTAATTTCA CT/-- CTGAGTGCCC 3070 het 3070 hom 45 15 26 5 CT 2 1 325723 CASAVA_Build 21 29202234 1D GCCAAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2417 hom 19 8 9 2 T 11 10 325724 CASAVA_Build 21 29208736 5D TGGGGGGTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 28 15 8 7 TTTTG 3 2 325725 CASAVA_Build 21 29212595 1D GTCAGATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 21 10 T 13 12 325726 CASAVA_Build 21 29214437 1D TTTCAAAAAT A/- AAAACTTTTG 2895 het 2895 ref 28 14 11 3 A 5 4 325727 CASAVA_Build 21 29214856 1I ATTTGTAGTG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 8 9 325728 CASAVA_Build 21 29222071 1I TCAAAATGGC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 A 7 8 325729 CASAVA_Build 21 29222745 11I CGCTGTACAG -----------/ATAAAACTTTA ATGTGGTATT 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 ATAAAACTTTA 0 1 325730 CASAVA_Build 21 29227403 1I TCATGATAGC -/A TCATTTTAAA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 0 1 325731 CASAVA_Build 21 29236969 1I GTGCCCTCAT -/A ACATGCTATC 3070 het 3070 ref 40 26 9 5 A 1 2 325732 CASAVA_Build 21 29249287 1I GCAAGAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 9 10 325733 CASAVA_Build 21 29249604 1D AAAACGATAT G/- GAAGTATTTC 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 G 2 1 325734 CASAVA_Build 21 29254124 1I AGCAAGTTTG -/C TACACTGAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 C 0 1 325735 CASAVA_Build 21 29256207 1I CCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 10 11 325736 CASAVA_Build 21 29260165 1I TGGGGTTTTG -/C TATGTTGCCC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 C 0 1 325737 CASAVA_Build 21 29269178 1I GCCTCCTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1585 hom 35 5 23 7 A 10 11 325738 CASAVA_Build 21 29278310 1I TGTTCTTATT -/C TTTGGCCCAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 0 1 325739 CASAVA_Build 21 29283661 1I ATGGCACTTA -/T TTTTTTTTTT 1793 het 1793 ref 34 24 4 6 T 11 12 325740 CASAVA_Build 21 29290206 1D GACTTACCCA G/- GGGGAAAAAA 1537 het 1537 ref 29 7 7 15 G 5 4 325741 CASAVA_Build 21 29291140 1D GTTGGGAGTT A/- AAAAAAAAAA 1251 het 1251 ref 27 9 5 14 A 17 16 325742 CASAVA_Build 21 29293937 1I TGTTTTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 11 10 T 10 11 325743 CASAVA_Build 21 29300063 1I CTTGGCCCTT -/C CGTCGTGGTT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 C 1 2 325744 CASAVA_Build 21 29303010 1D CAACATACTG A/- GACCATCTAT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 1 0 325745 CASAVA_Build 21 29306963 1D ATGATCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 11 4 A 12 11 325746 CASAVA_Build 21 29311160 1I TAAAAAAACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 10 325747 CASAVA_Build 21 29332070 1D GAGCCACCAT G/- CCTGGCCAAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 G 1 0 325748 CASAVA_Build 21 29336120 4D ATTTTAGAGT TAGA/---- TAGGTAAGTA 3070 het 3070 ref 30 16 13 3 TAGA 1 0 325749 CASAVA_Build 21 29351848 5D GATAATATAT ATATG/----- ATATATGTAT 2207 het 2207 ref 12 6 5 1 ATATG 1 0 325750 CASAVA_Build 21 29360274 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 759 het 759 ref 27 7 6 15 A 20 18 325751 CASAVA_Build 21 29377500 3D GCAGCACATT CCC/--- ATTTAGATAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 3 C 3 0 325752 CASAVA_Build 21 29377761 2D CCATGGTTTT TA/-- TATTTTATGG 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 TA 2 1 325753 CASAVA_Build 21 29405465 3D GAAAAAACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 37 17 16 5 AAC 7 6 325754 CASAVA_Build 21 29412071 3I CCTTCCACAG ---/GAA GAAGAAGAGA 3070 het 3070 ref 51 21 22 8 GAA 2 3 325755 CASAVA_Build 21 29412559 2D CTTTTCTCCA TG/-- TGTGTCCCTG 3070 het 3070 hom 36 10 18 8 TG 3 2 325756 CASAVA_Build 21 29421818 1D TTTAGATGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 16 13 6 T 9 8 325757 CASAVA_Build 21 29422498 1I TTCAATTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 22 4 12 6 T 15 16 325758 CASAVA_Build 21 29426484 1D CTGCAGGATG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 8 7 325759 CASAVA_Build 21 29454018 2D TTCTCACGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2415 hom 36 7 19 13 A 12 10 325760 CASAVA_Build 21 29456504 1I TATGTGTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 T 12 13 325761 CASAVA_Build 21 29461731 1D AGATTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 11 10 325762 CASAVA_Build 21 29464814 2D TTAAAGCATG TC/-- TCTCTCTCTT 3015 het 3015 ref 29 13 12 4 TC 5 4 325763 CASAVA_Build 21 29466201 2D TATGCATATA TG/-- TGTGTCATCA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TG 3 2 325764 CASAVA_Build 21 29477243 1I53M5D CACTGTATTA -TCAGGGTCTTGGGAGGAAAGAGAAGCACACTTAAGAAGGCATGATAAAAAGAGAAAGT/GTCAGGGTCTTGGGAGGAAAGAGAAGCACACTTAAGAAGGCATGATAAAAAGAG----- AATGAAGGGA 3070 hom 226 het 65 0 75 7 N/A 0 0 325765 CASAVA_Build 21 29483483 2D GTGGGGCAAC AG/-- GAGTTGGAAG 3070 het 3070 ref 45 24 18 7 AG 1 0 325766 CASAVA_Build 21 29501598 1I TTATATGTGG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 7 8 325767 CASAVA_Build 21 29502010 1D AAAGGTTCCA C/- CTTCCAATAC 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 C 2 1 325768 CASAVA_Build 21 29508038 10D CATATAACAT ACAGACACAC/---------- ACACAGACAC 3070 het 3070 ref 53 39 8 13 ACAGACACAC 1 0 325769 CASAVA_Build 21 29514951 1D TATTCACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 919 hom 36 5 11 21 A 15 14 325770 CASAVA_Build 21 29519870 1I TTTGCTTTAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 8 9 325771 CASAVA_Build 21 29525744 1D ATCACAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 264 hom 21 3 8 10 T 15 14 325772 CASAVA_Build 21 29530756 1I TACATCACAT -/G ATTGATTTTC 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 G 0 1 325773 CASAVA_Build 21 29539094 4D CGCACTGCTC ACAA/---- ACAGAGCGTA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 ACAA 1 0 325774 CASAVA_Build 21 29552165 2D CACCTGCCTC TT/-- TGTTCAAGAA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 3 1 325775 CASAVA_Build 21 29563053 1I AAAAATAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 9 10 325776 CASAVA_Build 21 29564189 1I CTGGGGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 A 11 12 325777 CASAVA_Build 21 29565397 1D ACTTTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2034 hom 26 10 13 3 T 15 14 325778 CASAVA_Build 21 29570266 1D AATATATTTC T/- TTTTATATTG 3070 het 3070 hom 40 13 23 5 T 5 4 325779 CASAVA_Build 21 29571263 4D AAATTCACTT ATTA/---- ATTCTAGTAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 ATTA 1 0 325780 CASAVA_Build 21 29584600 1I AGTCATTCAA -/G GGAAGGTGGA 3070 het 3070 hom 43 13 21 9 G 2 3 325781 CASAVA_Build 21 29598008 8D ACAGGTTAGA AAATATTC/-------- AAATATTCAT 3070 het 3070 hom 39 14 18 11 AAATATTC 2 1 325782 CASAVA_Build 21 29605557 4D CTTTTGTTTA CTAT/---- CTATTTAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 21 2 CTAT 2 1 325783 CASAVA_Build 21 29617219 5I TCATTCTTTC -----/TAATT TAATGTGTAA 3070 het 3070 hom 55 23 28 4 TAATT 0 1 325784 CASAVA_Build 21 29640470 1D ATCATGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 A 13 12 325785 CASAVA_Build 21 29641055 1I ATCGGGAGAA -/G GATGGTCTCT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 1 2 325786 CASAVA_Build 21 29643436 1I CAAGGGCCAC -/G AGTGGCCTGG 2270 het 2270 ref 33 17 6 10 G 0 1 325787 CASAVA_Build 21 29644045 3I TGAGTGTCTC ---/ATT ATTAATGCTG 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 ATT 1 2 325788 CASAVA_Build 21 29648504 1D TATGATAAAG T/- TTGACATTTA 3070 hom 141 het 54 0 45 9 T 3 2 325789 CASAVA_Build 21 29651043 10D ACTACTTCTA TCTCTCTCTT/---------- TCTCTCTCTT 3070 hom 27 het 12 0 10 3 TCTCTCTCTT 2 1 325790 CASAVA_Build 21 29662180 1D AATGCAAAGC T/- TTTTTAGGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 6 5 325791 CASAVA_Build 21 29662494 5D GTGATAATAA TAAAT/----- TAAAGGGACA 3070 het 3070 hom 40 18 19 5 TAAAT 1 0 325792 CASAVA_Build 21 29665864 1I CTATGAGGCA -/T TTGCTGAACC 3070 hom 150 het 57 0 48 9 T 2 3 325793 CASAVA_Build 21 29668875 2I AGGAGTTGAG --/CA AGCTGCGTCT 3070 het 3070 ref 53 26 21 6 CA 0 1 325794 CASAVA_Build 21 29672412 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2412 hom 27 6 20 1 A 10 11 325795 CASAVA_Build 21 29679516 9D TTCCTTGGTT CCCTGTCTC/--------- CCCTGTCTCC 3070 hom 114 het 48 0 39 9 CCCTGTCTC 2 1 325796 CASAVA_Build 21 29736020 1D GAAAATGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 11 10 325797 CASAVA_Build 21 29742542 1I GAATTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 9 10 325798 CASAVA_Build 21 29743397 1I TATTCTATCC -/T TTTTACCATC 3070 hom 157 het 57 0 53 4 T 4 5 325799 CASAVA_Build 21 29767030 1I CAGGCGTGAG -/C CACCGCGCCT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 1 2 325800 CASAVA_Build 21 29771876 3D AAAAAAAACA TGT/--- TGTAGAATCA 2727 hom 36 het 25 0 12 14 TGT 2 1 325801 CASAVA_Build 21 29774460 1D AGTTTCCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 9 T 11 10 325802 CASAVA_Build 21 29777498 1I GATTTTCTTT -/C CCCCCCGGCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 6 7 325803 CASAVA_Build 21 29785170 1I ATTTTTTTTT -/A TAAAAACTTA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 0 1 325804 CASAVA_Build 21 29788453 3I10M2I ATATTTTTGT ---GGGGGGGGGC--/TGGGGGGGGGGGCTT TTTTTTTTTA 3070 hom 47 het 19 0 15 4 N/A 0 0 325805 CASAVA_Build 21 29788720 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 7 6 325806 CASAVA_Build 21 29788999 2D AAGTGTATGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 92 het 36 0 31 6 GT 7 6 325807 CASAVA_Build 21 29791877 12D AGTATGTGTG TGTATATATATA/------------ TATATATATA 3070 hom 63 het 25 0 22 6 TGTATATATATA 1 0 325808 CASAVA_Build 21 29793300 6D GAGATAAAAA AATATT/------ AAAAAGGAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 5 AATATT 1 0 325809 CASAVA_Build 21 29799580 1D GAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 11 10 325810 CASAVA_Build 21 29800491 1I ACAATGCTTC -/T GACACCGAGG 3070 hom 117 het 42 0 38 4 T 0 1 325811 CASAVA_Build 21 29814790 1D GGAATTGCTG C/- CACCGTAGGA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 C 2 1 325812 CASAVA_Build 21 29835911 1I CCCATAGGTG -/T TTAAAACATA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 2 3 325813 CASAVA_Build 21 29836013 1I TTGTGCTTTA -/G TACATAGGCA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 G 0 1 325814 CASAVA_Build 21 29836225 4D ATAATGTAGA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 34 14 11 10 GT 11 9 325815 CASAVA_Build 21 29836576 2I GAATATAAAT --/TA TATATCTTCT 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 TA 2 3 325816 CASAVA_Build 21 29839294 3D GGTGCTCCAG AGC/--- AGCTAAAACA 3070 het 3070 ref 46 27 12 9 AGC 2 1 325817 CASAVA_Build 21 29842753 4D GAAAATAGTC TAAT/---- AAGTAAGACT 3070 het 3070 ref 40 18 18 5 TAAT 1 0 325818 CASAVA_Build 21 29857076 4I GCTTCATTAT ----/CTTA CTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 CTTA 0 1 325819 CASAVA_Build 21 29857426 1I AAATGGAATA -/C CTGCGGAGTC 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 1 2 325820 CASAVA_Build 21 29859777 1D GCACCTGCTA C/- CATGCCCAGC 3070 het 1638 hom 28 5 17 6 C 2 1 325821 CASAVA_Build 21 29864693 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2169 het 1685 hom 19 10 6 3 A 15 14 325822 CASAVA_Build 21 29865035 1I TTAGAGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 12 14 T 13 14 325823 CASAVA_Build 21 29868304 2I AAATAAATTT --/TG TGTTTAGACT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TG 1 2 325824 CASAVA_Build 21 29874679 2D ATTTCCACAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 TC 6 5 325825 CASAVA_Build 21 29881919 1I TGGTTCTAAT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 A 8 9 325826 CASAVA_Build 21 29883789 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 1647 het 1647 ref 19 10 5 4 T 9 8 325827 CASAVA_Build 21 29888377 4D GAACTGTGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 62 26 26 10 TG 10 8 325828 CASAVA_Build 21 29896137 1I TAATTTGTGT -/A TTTTACTTTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 0 1 325829 CASAVA_Build 21 29905551 1I TTTAACTCAG -/C ATATTCATTT 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 C 0 1 325830 CASAVA_Build 21 29913775 4D CCACTAAATA ACTT/---- ACTTATGTAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 ACTT 2 1 325831 CASAVA_Build 21 29926866 1I CAGACTGTAT -/A AAAAGCAAAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 4 5 325832 CASAVA_Build 21 29927455 1I CACTTTAGGA -/G GCTGAGGTGG 1564 het 1564 ref 13 5 5 3 G 1 2 325833 CASAVA_Build 21 29928817 1I TCTTACGGTG -/C CTGAGTGAAG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 C 1 2 325834 CASAVA_Build 21 29934353 1D AGAATAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2269 hom 28 7 15 6 A 12 11 325835 CASAVA_Build 21 29984977 1I ACTGAGAGAA -/T TTAGAATATT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 2 3 325836 CASAVA_Build 21 29997075 1D TCTGGCCTCT G/- GGGATCTGTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 4 3 325837 CASAVA_Build 21 30004824 2I CTATTTCAAT --/AA GACTATTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 0 2 325838 CASAVA_Build 21 30013168 5D TTGCTTCAAC TTCTG/----- TTCTGGTCAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTCTG 2 1 325839 CASAVA_Build 21 30018545 3I TGAGATACGA ---/TTG TTGTTGGGCA 3070 hom 162 het 58 0 54 4 TTG 2 3 325840 CASAVA_Build 21 30030037 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2151 het 207 hom 15 4 6 5 A 20 18 325841 CASAVA_Build 21 30030395 6D TGGTATTGTT ATTATG/------ ATTATGATTA 3070 hom 78 het 36 0 25 13 ATTATG 4 3 325842 CASAVA_Build 21 30041713 1I ATAGTATCAG -/T TTGTTGAAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 3 325843 CASAVA_Build 21 30057574 1I ATTACCCCAT -/C TCAGGCATTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 C 0 1 325844 CASAVA_Build 21 30074409 1I TTTCCTGAAA -/G GTACTTATGG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 G 1 2 325845 CASAVA_Build 21 30078616 1I TTCTACCAAC -/A AGGGATCAGA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 1 2 325846 CASAVA_Build 21 30091164 1D CAAACAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 235 hom 29 1 23 8 A 12 11 325847 CASAVA_Build 21 30093685 4D CCCAGGTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 92 het 46 0 29 18 TTTG 4 3 325848 CASAVA_Build 21 30104485 2D ACTCTGTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 28 0 16 13 A 16 14 325849 CASAVA_Build 21 30104617 1I TGCCGATAGG -/C TTGCTCAATG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 325850 CASAVA_Build 21 30114861 1D AGTTCTCCCT C/- CTAGTGCTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 C 2 1 325851 CASAVA_Build 21 30122655 1I AGGAATGGTG -/C AAAGCACTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 C 0 1 325852 CASAVA_Build 21 30127155 1D GACAAACATA G/- GTTGCTAGAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 2 1 325853 CASAVA_Build 21 30130201 2D TGGGAGAAAC TG/-- TTCCTTGGAA 3070 hom 93 het 38 0 32 7 TG 1 0 325854 CASAVA_Build 21 30139370 1D TAGGAAACAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 T 9 8 325855 CASAVA_Build 21 30140440 1I AGCCGGGCGC -/G GTGGCGCATG 3070 hom 20 het 9 0 7 2 G 1 2 325856 CASAVA_Build 21 30155498 1I GTACTTACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 325857 CASAVA_Build 21 30156672 1I TAAAACAGGA -/T TTATTAGCTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 325858 CASAVA_Build 21 30158288 1D ATTTAACAGA T/- TTTTTTTTTT 986 het 986 ref 37 29 3 6 T 13 12 325859 CASAVA_Build 21 30159494 1I TTTCTCACAT -/C CCCACTCCAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 3 4 325860 CASAVA_Build 21 30164228 3D TTAGTTTATG CCC/--- TATGTTCCTC 3070 hom 66 het 24 0 23 2 C 3 0 325861 CASAVA_Build 21 30183099 1D GGAAAGGTTT C/- CCTTTTTATA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 C 3 2 325862 CASAVA_Build 21 30204972 1I AATTTTACAC -/A GATCTATTTA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 0 1 325863 CASAVA_Build 21 30205775 1D TCATGTGTTG A/- AAACCCTAAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 4 3 325864 CASAVA_Build 21 30228152 1I TCCACTACTC -/T TTTCCTCTAG 2959 het 2959 ref 29 15 7 7 T 3 4 325865 CASAVA_Build 21 30228189 9I AAATTTTAGA ---------/ATATAAATG ATATTTCCTA 2311 het 2311 ref 29 15 5 9 ATATAAATG 0 1 325866 CASAVA_Build 21 30233038 2D CATGTGGAAG AA/-- TCCAACTTAG 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 A 2 0 325867 CASAVA_Build 21 30242309 1D CTTTCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1824 hom 25 7 13 5 T 13 12 325868 CASAVA_Build 21 30265676 3D TGATGAACAA ATC/--- ATCATCATAT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 ATC 3 2 325869 CASAVA_Build 21 30281573 1I CTGCTTATAT -/A ACATTTACCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 1 2 325870 CASAVA_Build 21 30284987 1D TTAAATAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 T 12 11 325871 CASAVA_Build 21 30294209 2I ACTTACTCAC --/AT GTCTTTTCCC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 AT 0 1 325872 CASAVA_Build 21 30294872 1I AAATTATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1225 hom 33 3 22 8 A 12 13 325873 CASAVA_Build 21 30313541 1D GTCCATAATT G/- GAAAACCTAT 3070 hom 108 het 42 0 36 7 G 2 1 325874 CASAVA_Build 21 30314090 8I3M7I TAGCCATAGA --------CAT-------/GAGAAAGCCATAGAGAGA TTCATGGTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 4 N/A 0 0 325875 CASAVA_Build 21 30316178 5D CTTAGAATAA TAAAG/----- TAAATTATGA 3070 het 3070 hom 47 24 23 0 TAAAG 1 0 325876 CASAVA_Build 21 30320716 1I GGCTAGGGTT -/A AGTGGAAGGG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 1 2 325877 CASAVA_Build 21 30322292 1D CTGATTTGCC T/- TTTTTTTTTT 1769 het 1769 ref 38 22 6 10 T 12 11 325878 CASAVA_Build 21 30328926 1D GGAAGGATAG A/- TCCCACCACT 3070 hom 110 het 41 0 31 11 A 1 0 325879 CASAVA_Build 21 30333850 1I ACACAGGAGG -/A ATGAAGGAAG 3070 hom 141 het 51 0 47 4 A 1 2 325880 CASAVA_Build 21 30339880 1D AGAATGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 20 1 18 1 T 12 11 325881 CASAVA_Build 21 30384400 1I GCCAGAATAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 8 9 325882 CASAVA_Build 21 30468503 1D AATAAAAGAT A/- AAAAATGGCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 6 5 325883 CASAVA_Build 21 30471979 1D TTCTTTTTTA T/- TTTTTGGAGA 3070 hom 68 het 29 0 24 5 T 6 5 325884 CASAVA_Build 21 30472708 1I CTATGAGATA -/T TTTTTAGGGC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 5 6 325885 CASAVA_Build 21 30475663 1D TTTTATGGGG A/- ATCATAAAAG 3070 het 3070 hom 29 15 13 1 A 2 1 325886 CASAVA_Build 21 30478739 2D AAACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 13 11 325887 CASAVA_Build 21 30483989 1D ATTTTTGAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 10 9 325888 CASAVA_Build 21 30520019 1I ACTTGGCAAT -/G GAAAAATCCC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 G 1 2 325889 CASAVA_Build 21 30525876 1D TCTCCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 546 het 546 ref 27 15 3 12 A 11 10 325890 CASAVA_Build 21 30532855 1I GTCATCTTTT -/G GGGGGCATCT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 G 5 6 325891 CASAVA_Build 21 30533832 1D AAAATACCCT A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 A 7 6 325892 CASAVA_Build 21 30535443 1D AATCTGTTTG T/- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 3 2 325893 CASAVA_Build 21 30540057 1D19M2D TAGATGTAAA TTTTTTTATTTTTTTGAGACAG/-TTTTTTATTTTTTTGAGAC-- AGTCTTGCTG 3070 het 3070 ref 30 16 16 5 N/A 0 0 325894 CASAVA_Build 21 30540224 4D TTAATGTATC ACAA/---- ACAAATTGTG 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 ACAA 2 1 325895 CASAVA_Build 21 30540303 1I TACATGAAGG -/A AAAAAGGAAG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 5 6 325896 CASAVA_Build 21 30541036 4I AAAAAAAAAT ----/AGAA AGAGAAAAAA 3070 het 2468 hom 37 7 23 7 AGAA 0 1 325897 CASAVA_Build 21 30541922 1I TGATAAGAGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 8 9 325898 CASAVA_Build 21 30543712 7D GTGGGAAGAG GTTGAAA/------- CTAATGACTA 3070 het 3070 ref 37 24 13 2 GTTGAAA 1 0 325899 CASAVA_Build 21 30543915 1D CCCATTTAAA C/- TTGTCATTGA 3070 het 3070 ref 29 18 7 4 C 1 0 325900 CASAVA_Build 21 30545321 1I CTAATTACTA -/T TTTTTAAGTG 3070 het 3070 hom 58 22 28 8 T 5 6 325901 CASAVA_Build 21 30548609 1D TTCAAAAAAG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 8 7 325902 CASAVA_Build 21 30565255 1D ACAACAACAA C/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 C 1 0 325903 CASAVA_Build 21 30566204 2I TTTTAGAGAC --/AG AGTCTTGTTC 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 AG 1 2 325904 CASAVA_Build 21 30588947 2I TTTTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 T 9 11 325905 CASAVA_Build 21 30592954 1D TACAATGAAG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 8 7 325906 CASAVA_Build 21 30622208 2I TCTTCAGTGC --/AG AGTCACTGGC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 AG 1 2 325907 CASAVA_Build 21 30632173 1I CAAGCTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2491 hom 48 13 16 19 T 15 16 325908 CASAVA_Build 21 30635926 1I AAAATAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1171 hom 22 3 13 6 T 15 16 325909 CASAVA_Build 21 30641486 1D CCATCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 11 12 A 13 12 325910 CASAVA_Build 21 30656912 1I ACTCAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 9 A 13 14 325911 CASAVA_Build 21 30661465 3D TGATGACATA TTT/--- TTTTTTTTTT 2469 het 1900 hom 24 9 7 8 T 17 14 325912 CASAVA_Build 21 30675780 1D TTAAAACATG C/- CTTTCGCCCT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 C 2 1 325913 CASAVA_Build 21 30676862 4I GTAACAGAGT ----/GAAC TACTGTGTTC 3070 het 3070 ref 60 29 24 7 GAAC 0 1 325914 CASAVA_Build 21 30681731 1I GCTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 10 11 325915 CASAVA_Build 21 30682712 1D TTGATGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 11 10 325916 CASAVA_Build 21 30688945 1D TGGCAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 14 13 A 12 11 325917 CASAVA_Build 21 30698183 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 9 10 325918 CASAVA_Build 21 30700452 6I ATAGTGAAGC ------/ATGCTT ATGCTTACAC 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 ATGCTT 1 2 325919 CASAVA_Build 21 30703515 4I GAACAGGAAT ----/TCTG TCTGGCACCA 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 TCTG 1 2 325920 CASAVA_Build 21 30704286 8I AAAGACAAGG --------/AATTCCAA AATTCCAATC 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 AATTCCAA 1 2 325921 CASAVA_Build 21 30705676 2I GAATATTTAT --/AC AGAGAATCAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 AC 0 1 325922 CASAVA_Build 21 30706418 1D AAAAACCCTC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 A 8 7 325923 CASAVA_Build 21 30707668 1D CCTATGGAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 49 19 27 3 A 9 8 325924 CASAVA_Build 21 30728846 4I ATTTAACAAT ----/TGAA TGAAGTAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 TGAA 1 2 325925 CASAVA_Build 21 30739446 1I GTGAAAAGCA -/C CCTGTAAAAT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 C 2 3 325926 CASAVA_Build 21 30746233 1I ACCTACTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 9 10 325927 CASAVA_Build 21 30747015 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2410 hom 36 7 20 10 A 13 12 325928 CASAVA_Build 21 30749611 4I ACATAATTTT ----/ATTG ATTAACTCCC 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 ATTG 0 1 325929 CASAVA_Build 21 30751296 1D TCTATCTCAA T/- TCAATCAACG 3070 hom 120 het 44 0 41 5 T 2 1 325930 CASAVA_Build 21 30755177 1D TATTTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 2388 het 2388 ref 39 28 6 5 A 12 11 325931 CASAVA_Build 21 30762096 2I TTAATATGGA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 16 18 6 T 9 11 325932 CASAVA_Build 21 30776408 1I CAAGTCACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 21 16 15 T 13 14 325933 CASAVA_Build 21 30778716 3I ATCCTTCAGT ---/ATA ATAATGATGA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 ATA 1 2 325934 CASAVA_Build 21 30779189 1D AGACCTAAAT A/- GAACTAAATG 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 A 1 0 325935 CASAVA_Build 21 30782651 1I TGAACAGCAG -/T TCAAAGATAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 1 2 325936 CASAVA_Build 21 30784538 1I AAATAAAATA -/T TATTTAATAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 1 2 325937 CASAVA_Build 21 30788020 2I AATGAATTCT --/AA AGTTCTTACA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 1 3 325938 CASAVA_Build 21 30797927 1D AGACTGTTTG T/- TAACTCAACA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 2 1 325939 CASAVA_Build 21 30800165 4D TCCCCATTGC TTGT/---- TTTTGTCAGG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 TTGT 1 0 325940 CASAVA_Build 21 30801349 1D TGGCCTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 T 12 11 325941 CASAVA_Build 21 30807019 1D AAAAACTAAG A/- ATATATACAT 3070 het 3070 ref 30 18 8 5 A 2 1 325942 CASAVA_Build 21 30811497 1I ACTCTGGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 A 9 10 325943 CASAVA_Build 21 30813588 1D AAGATGAGGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 A 9 8 325944 CASAVA_Build 21 30828573 1D TAGAAAGTTA T/- TTTTCTAAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 5 4 325945 CASAVA_Build 21 30830354 2D ATTAACAAAC AT/-- GTTTTATATC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 AT 1 0 325946 CASAVA_Build 21 30831517 1I27M1I TGTCTGTCAG -AGCCATATGCATAGCCTCCATAGCCAG-/CAGCCATATGCATAGCCTCCATAGCCAGA ACCATAGTCC 3070 hom 117 het 41 0 39 12 N/A 0 0 325947 CASAVA_Build 21 30835484 2I GAGGCAAAAC --/AT TGTTGAAATA 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 AT 0 1 325948 CASAVA_Build 21 30835853 1D TTTTTTAGTA G/- AATCCAGAGA 3070 het 3070 ref 43 17 17 9 G 1 0 325949 CASAVA_Build 21 30837784 1D GATTATTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 17 11 T 10 9 325950 CASAVA_Build 21 30843739 1I TGTGGTTTTT -/G TTTTTAGTAC 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 G 0 1 325951 CASAVA_Build 21 30846058 1D TGAGACTCCG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 10 9 325952 CASAVA_Build 21 30851059 2D TATCACAGAC AG/-- AGTCTTTCAA 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 AG 2 1 325953 CASAVA_Build 21 30852141 2I GAATATTCTA --/AC ACATTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 AC 1 2 325954 CASAVA_Build 21 30852203 1D GAATGGAATT G/- GCTGTGTCAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 2 1 325955 CASAVA_Build 21 30854589 7D TATGTGCAAG CTAAAAC/------- CTTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 29 16 13 2 CTAAAAC 1 0 325956 CASAVA_Build 21 30856570 32D CTGCTATATA TATATATATATGTATATATATATATATACATG/-------------------------------- TATGTATGTA 3070 het 449 hom 15 2 10 6 TATATATATATGTATATATATATATATACATG 1 0 325957 CASAVA_Build 21 30856892 1I AGAATGGTGG -/T TTCCAGCTTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 2 3 325958 CASAVA_Build 21 30857894 10D TGAGTGAAAT AACCATCTAA/---------- AACCATCTAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 6 AACCATCTAA 2 1 325959 CASAVA_Build 21 30875193 2I CCAGACCAGC --/AG ATCTACAGCT 3070 het 3070 ref 55 32 19 4 AG 0 1 325960 CASAVA_Build 21 30895517 18I TTTCTTCCCG ------------------/TGTTATTTATAATAATGA TGTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 TGTTATTTATAATAATGA 0 1 325961 CASAVA_Build 21 30903636 1I GGTGTCTGGG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 7 8 325962 CASAVA_Build 21 30905641 4D TAAAAGTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 TTTG 4 3 325963 CASAVA_Build 21 30911263 1I TTTCTACTTG -/T AGCTTGACAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 0 1 325964 CASAVA_Build 21 30911987 4I GCCAGTTCTT ----/AAAC AAAATTTTCT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 AAAC 0 1 325965 CASAVA_Build 21 30939090 1D CAAATAAAGA T/- TTTTCCTGGC 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 5 4 325966 CASAVA_Build 21 30940679 1I TGAAGAAATT -/A CTCTAATACA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 0 1 325967 CASAVA_Build 21 30941515 1D TTTGTATTGC T/- TTACTTATTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 3 2 325968 CASAVA_Build 21 30942631 1I ACCTACATGG -/T TTAAGCATAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 2 3 325969 CASAVA_Build 21 30977039 2D GTATTCTGCG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 45 13 15 17 GT 9 8 325970 CASAVA_Build 21 30980718 4I ATTCACAGAC ----/AAAT AAAGTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 AAAT 0 1 325971 CASAVA_Build 21 30981328 2D TTATATACAC AT/-- GTTTATGTGT 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 AT 1 0 325972 CASAVA_Build 21 30981562 3I TATGGAGATA ---/TCC TCCTATATTT 3070 het 3070 ref 40 21 12 7 TCC 1 2 325973 CASAVA_Build 21 30985083 1D TTTGAAATTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 9 8 325974 CASAVA_Build 21 30985293 1D AAGCAGATAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 T 8 7 325975 CASAVA_Build 21 30987189 5I13M1I CCATTTTTAA -----TTATTTGTTTGGG-/TTGAGTTATTTGTTTGGGT TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 48 35 15 6 N/A 0 0 325976 CASAVA_Build 21 30988492 1I CAGGTGTGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 1 2 325977 CASAVA_Build 21 30989098 1D GAATTTGGCC A/- AAAAATTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 A 6 5 325978 CASAVA_Build 21 30989243 1I AGCTTGAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 9 10 325979 CASAVA_Build 21 30991409 3D6M1I TATGCTATGC ACAGTAACA-/---GTAACAT AGCCATCAGT 3070 het 3070 hom 35 10 23 5 N/A 0 0 325980 CASAVA_Build 21 30992138 1D ATGACCTATG T/- TAAGTCACAA 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 T 2 1 325981 CASAVA_Build 21 30992823 1D7M2D TACAAATGTG AAATTCTATG/-AATTCTA-- TATTAGTTTG 3070 het 3070 hom 45 22 23 2 N/A 0 0 325982 CASAVA_Build 21 30996724 1D TATGCTTAAA T/- TCTCAGTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 T 2 1 325983 CASAVA_Build 21 30998202 2I CAGATCTCTT --/TC CCTTTCTTAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TC 0 1 325984 CASAVA_Build 21 30999661 4D TAATGGGTTT TTTG/---- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 25 22 7 TTTG 2 1 325985 CASAVA_Build 21 31000120 1I TGTTGAAGAT -/C AGATGGTTAT 3070 het 3070 ref 47 20 20 7 C 0 1 325986 CASAVA_Build 21 31009040 1D ATCTAACTAG A/- AAGGACATTT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 A 3 2 325987 CASAVA_Build 21 31015749 1D TTATTGTGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 9 8 325988 CASAVA_Build 21 31022123 2D AAAGAAGAAA AG/-- AGAGAAGAAG 3070 het 3070 hom 21 9 12 4 AG 3 2 325989 CASAVA_Build 21 31026052 1D ATGTTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 17 8 A 11 10 325990 CASAVA_Build 21 31030228 1D TGTTTTTGCC T/- ATTATTTTAT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 1 0 325991 CASAVA_Build 21 31072876 1I CAATTAGGCC -/A AAAAAAAAAA 1338 het 1338 ref 41 30 3 8 A 10 11 325992 CASAVA_Build 21 31083509 1D TCTTGCCACC A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 43 20 20 4 A 8 7 325993 CASAVA_Build 21 31085787 3I TCTCGACTAA ---/GTC ATCAGCTTCT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 GTC 0 1 325994 CASAVA_Build 21 31093760 3I TATCCCCACA ---/CTT CTTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 CTT 1 2 325995 CASAVA_Build 21 31107680 1I TTCCCTTCCT -/A AAAAAAAAAA 2610 het 1838 hom 22 8 8 6 A 13 14 325996 CASAVA_Build 21 31111268 1I CCATAGATGC -/A AAAAATACTA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 5 6 325997 CASAVA_Build 21 31113981 6I3M2I GAAACAGGAC ------ACA--/AACAGGACATG GCAGTGCAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 N/A 0 0 325998 CASAVA_Build 21 31115264 1I CAGTCTCAAA -/G AAAAAAAAAT 3070 het 2775 hom 31 13 11 7 G 0 1 325999 CASAVA_Build 21 31115449 9I GTAAACCAGA ---------/GTGTCCCCC ACTTCCCATC 3070 het 3070 hom 67 27 32 8 GTGTCCCCC 0 1 326000 CASAVA_Build 21 31123841 1D GGTCCCATAG A/- ATAGGGTATC 3070 hom 103 het 42 0 31 12 A 2 1 326001 CASAVA_Build 21 31131836 3I ACCAACTACT ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 63 26 27 10 CAA 5 6 326002 CASAVA_Build 21 31141606 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 A 12 11 326003 CASAVA_Build 21 31142852 1I TGCTAGGGAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 8 9 326004 CASAVA_Build 21 31189771 1I TGGTAAGAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 9 10 326005 CASAVA_Build 21 31204391 1D TGGTCATTAA T/- TTTGGATTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 4 3 326006 CASAVA_Build 21 31204526 1I TTCTTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 A 10 11 326007 CASAVA_Build 21 31215875 2D TTTTTAACTG AA/-- AAAAAAAACT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 10 8 326008 CASAVA_Build 21 31217930 1D TTCTGTTTTA T/- TTTGTTTTGC 3070 het 3070 hom 29 11 17 2 T 4 3 326009 CASAVA_Build 21 31226341 1I ATACAAAATC -/A ACCTACAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 2 326010 CASAVA_Build 21 31226684 1I AAAATAAACT -/G GGTGTGGTGG 3070 hom 84 het 31 0 27 4 G 2 3 326011 CASAVA_Build 21 31231481 3I TTCAGAGAAA ---/ATC ATCATCATTT 3070 het 3070 ref 64 30 31 3 ATC 2 3 326012 CASAVA_Build 21 31234519 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 18 3 14 1 T 22 21 326013 CASAVA_Build 21 31242143 1D ATAAAAAATT A/- AAACGAGAGA 3070 het 3070 ref 48 25 15 8 A 4 3 326014 CASAVA_Build 21 31243830 1I TAATAAAGAA -/C CAATAAGAAC 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 C 1 2 326015 CASAVA_Build 21 31253633 1I CTAACATCAC -/A AAAAAAAAAA 2384 het 2384 ref 29 13 9 7 A 11 12 326016 CASAVA_Build 21 31291495 1D GACTCTAGGA G/- GAGAATCCAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 G 2 1 326017 CASAVA_Build 21 31294489 1I CTCAAGGCAC -/T TTTTGCCAGG 3070 hom 123 het 47 0 40 7 T 4 5 326018 CASAVA_Build 21 31305538 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 180 hom 31 3 18 10 A 17 16 326019 CASAVA_Build 21 31320834 3I TGAAAAAGAT ---/AAC AACAGTACTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AAC 1 2 326020 CASAVA_Build 21 31326654 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 642 het 642 ref 16 11 2 4 A 13 12 326021 CASAVA_Build 21 31352487 1D GTTTGTTTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 10 9 326022 CASAVA_Build 21 31353903 1D AATGTATACA C/- TTTTGTAACC 3070 het 3070 ref 52 26 20 6 C 1 0 326023 CASAVA_Build 21 31354752 1I TTAAATTTTT -/A AAAAAATTTT 3070 het 910 hom 19 5 12 2 A 6 7 326024 CASAVA_Build 21 31358652 1D TATGACTCCC A/- AAAATTCATG 3070 het 3070 hom 25 9 12 5 A 5 4 326025 CASAVA_Build 21 31364897 1D AAGTGCATAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 31 10 16 6 A 8 7 326026 CASAVA_Build 21 31365726 4I TGGGTGGATC ----/TCAA ACTTGAGATC 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 TCAA 0 1 326027 CASAVA_Build 21 31366246 1D CAAAATGTGC A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 6 5 326028 CASAVA_Build 21 31369034 1I CTTTAGCCTC -/A AGAGTGAAGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 2 326029 CASAVA_Build 21 31381159 6I CCAAAATGGT ------/CACTAC CACTACTGGT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 CACTAC 1 2 326030 CASAVA_Build 21 31382039 2I CGTCTGGAGT --/TG TTCGTTCCTT 3070 het 3070 hom 27 10 10 7 TG 0 1 326031 CASAVA_Build 21 31383609 2I24M1D TGTGTGTGTG --TATATATATATTTTTTTTTATTTAT/TATATATATATATTTTTATTTATTTA- TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 22 3 13 11 N/A 0 0 326032 CASAVA_Build 21 31384882 1I TTTGAGTGAA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 8 9 326033 CASAVA_Build 21 31385682 1D TTATTCCTTC T/- ATTTAATGTA 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 T 1 0 326034 CASAVA_Build 21 31385884 1I TTCATCCATG -/C TGGCACAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 0 1 326035 CASAVA_Build 21 31391298 1D CAAGCTGAGG T/- GGCAAGGAAG 2498 het 2498 ref 18 10 7 1 T 1 0 326036 CASAVA_Build 21 31392488 4D TTACTGAGAT GACG/---- GAAGAAGATA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 GACG 1 0 326037 CASAVA_Build 21 31392851 21D CAAAATATGA CGTCCAAGGGTCCTTCTACGT/--------------------- CCATTCTGGT 3070 het 3070 hom 48 23 22 7 CGTCCAAGGGTCCTTCTACGT 1 0 326038 CASAVA_Build 21 31420490 1I CAGACGTGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 G 1 2 326039 CASAVA_Build 21 31452049 1I GCAGAGCACA -/C CTTTTATCAT 3070 hom 184 het 65 0 62 3 C 1 2 326040 CASAVA_Build 21 31463959 1I ACTTGGGGGC -/A AAAAAAAAAA 1217 het 1217 ref 38 31 3 4 A 11 12 326041 CASAVA_Build 21 31479335 1I ATACATATTA -/T TTTGCCACTT 3070 hom 162 het 58 0 53 5 T 3 4 326042 CASAVA_Build 21 31494098 1D ACATCACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1727 hom 28 8 14 7 A 15 14 326043 CASAVA_Build 21 31501058 1D TCTAGAAGAC A/- TACAAACATG 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 A 1 0 326044 CASAVA_Build 21 31528970 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 75 het 26 0 26 2 A 9 8 326045 CASAVA_Build 21 31553327 1I TTTTTTTTCC -/T TTTTTCTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 5 6 326046 CASAVA_Build 21 31553427 1I AGGCTGAAGC -/A ATCCTCTCAC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 1 2 326047 CASAVA_Build 21 31555450 1D AGCCAAGTCC T/- TTTTTTTTTT 1656 het 1656 ref 30 14 6 10 T 15 14 326048 CASAVA_Build 21 31572638 1I GCCTGAAGGG -/C CTCTTTGGGT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 C 1 2 326049 CASAVA_Build 21 31615748 1I ATGTTGGCCA -/G GCTGGTCTCA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 1 2 326050 CASAVA_Build 21 31629892 5I CTCTGTCTCC -----/AAAAA AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 9 14 326051 CASAVA_Build 21 31642283 4D AGCTTGCTCA CTCT/---- CTCTCTCTAT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 CT 6 4 326052 CASAVA_Build 21 31645995 5I GGCTCATGCC -----/TATAA TATAATCCTA 3070 hom 85 het 31 0 28 3 TATAA 1 2 326053 CASAVA_Build 21 31650022 1I CAGGCGTGAG -/C CACTGCGCGC 3070 hom 69 het 26 0 22 4 C 1 2 326054 CASAVA_Build 21 31663621 1D GATAAGGAAA G/- GTTGCTTAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 G 2 1 326055 CASAVA_Build 21 31667972 1I CTAATTCAAG -/A AAATGATCAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 3 4 326056 CASAVA_Build 21 31669680 1I13M1I TTCGTCCACC -TTTCTGTTTTTTC-/TTTTCTGTTTTTTCA AACTTCCCAC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 N/A 0 0 326057 CASAVA_Build 21 31670223 1D AAAAAAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 10 9 326058 CASAVA_Build 21 31676997 1I ACAACGACCC -/A TGTGTCATTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 0 1 326059 CASAVA_Build 21 31679902 1D TGGAAGATTT A/- AAAAAAAAAA 2285 hom 18 het 11 0 7 4 A 15 14 326060 CASAVA_Build 21 31700707 1I GCCCTACAGC -/A AGCATGTGTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 1 2 326061 CASAVA_Build 21 31703297 4D TCTCCTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2463 het 2463 ref 30 15 8 8 T 16 12 326062 CASAVA_Build 21 31703904 1I CTCCTCCAGT -/G GCCTTGCGGC 3070 hom 71 het 25 0 19 6 G 1 2 326063 CASAVA_Build 21 31704283 2I GTGTGTGTGT --/GA GTGTGAGGTT 3070 het 3070 hom 59 12 31 16 GA 0 1 326064 CASAVA_Build 21 31704702 2I TGTATGTGAG --/AC AGTGCATGAG 3070 hom 147 het 81 0 48 33 AC 0 1 326065 CASAVA_Build 21 31708506 2D TTATGTACAC AT/-- GTCTTCTGCA 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 AT 1 0 326066 CASAVA_Build 21 31717199 3I TCACTGTCAC ---/CTA ACAGAGTCAC 3070 hom 72 het 29 0 24 5 CTA 0 1 326067 CASAVA_Build 21 31724010 1I ACTGGCTCCG -/C CTACTCCACA 3070 hom 71 het 28 0 21 7 C 1 2 326068 CASAVA_Build 21 31724825 1D GTTCTTAAAG T/- TTTCTGTAGA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 4 3 326069 CASAVA_Build 21 31735642 1D CTGCAAGCAC T/- TTCCCCTTCT 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 T 3 2 326070 CASAVA_Build 21 31738527 1D ATTTAAAAAT A/- AAATCAGTAA 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 A 4 3 326071 CASAVA_Build 21 31739199 1I AAAGGAAAAC -/A AAAGAACAGA 3070 hom 54 het 32 0 19 13 A 3 4 326072 CASAVA_Build 21 31739357 2D AATGTGAGAA AC/-- AGTCTATGAT 3070 het 3070 ref 39 23 15 2 AC 1 0 326073 CASAVA_Build 21 31740410 1D CAGGTGTGAG C/- CACCTCGCCC 2000 het 1258 hom 18 5 5 8 C 2 1 326074 CASAVA_Build 21 31748001 1I AAGAGGGGGG -/A AAATAATTGT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 3 4 326075 CASAVA_Build 21 31763488 2D TCTCATTATG TT/-- GCCCAGGCTG 3070 het 3052 hom 22 9 11 3 T 2 0 326076 CASAVA_Build 21 31765650 1D AGTATCAGAG C/- TCTTCTCTGT 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 C 1 0 326077 CASAVA_Build 21 31766149 6I AGTCCACAGG ------/GAGCCC GAGCCCTACA 2393 het 2393 ref 15 7 6 2 GAGCCC 1 2 326078 CASAVA_Build 21 31776345 1D ACAAACATCC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2739 hom 21 6 11 4 T 9 8 326079 CASAVA_Build 21 31779296 1I GAATAATTTC -/T ATTCTTTCAG 3070 het 3070 ref 38 19 13 9 T 0 1 326080 CASAVA_Build 21 31783191 2I CTACAATCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 11 13 326081 CASAVA_Build 21 31783874 1I ACACCTGTAA -/G GGATCCGGTC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 2 3 326082 CASAVA_Build 21 31784625 3D TAGCCTTTAC ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 ATA 5 4 326083 CASAVA_Build 21 31787166 2D TAGTTATGTA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 7 T 10 8 326084 CASAVA_Build 21 31788110 1D11M2D TTTCTTTTTT AAAAAAAAAGACAG/-AAAAAAAAGAC-- AGTGTCACTC 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 N/A 0 0 326085 CASAVA_Build 21 31789026 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 8 9 326086 CASAVA_Build 21 31790152 1D TGAGGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1402 het 1402 ref 20 10 4 7 A 12 11 326087 CASAVA_Build 21 31790571 20I TTACTTGGGA --------------------/GGCTGAGGTGGGAGAATCGC CTGAATCCAG 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 GGCTGAGGTGGGAGAATCGC 0 1 326088 CASAVA_Build 21 31792627 1I GGGACCCCGC -/A AGCACCCCCA 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 A 1 2 326089 CASAVA_Build 21 31794637 1I ACATCAGGCC -/A AGCACACAAG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 1 2 326090 CASAVA_Build 21 31796072 1I CAGGCGTGAG -/C CACTGCGCCC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 1 2 326091 CASAVA_Build 21 31798771 3D GCTGGTAAAG CTC/--- CTACTTCCCA 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 CTC 1 0 326092 CASAVA_Build 21 31823013 2D CAAACAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 4 A 12 10 326093 CASAVA_Build 21 31823964 5I TCATCTCTCC -----/TCTTT TAACTCCAGA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 TCTTT 0 1 326094 CASAVA_Build 21 31829941 1D CAGGTGAGTG T/- TTTTTGGCTG 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 T 6 5 326095 CASAVA_Build 21 31831627 3D AAGAAATCGC AAA/--- AAAAAAAAAA 1108 het 1108 ref 29 11 3 16 A 17 14 326096 CASAVA_Build 21 31837696 7I ACACAGAAAA -------/GAGTCAT GAAACATTGT 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 GAGTCAT 0 1 326097 CASAVA_Build 21 31838110 1I ATAGGCAGTC -/T TAAGACCCAG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 1 2 326098 CASAVA_Build 21 31840254 1I TTTTAATTTA -/T TTTTAAAAAA 3070 het 1740 hom 17 6 11 0 T 4 5 326099 CASAVA_Build 21 31841143 2D CCAAAATAGT GG/-- GGGGGGGCTG 3070 het 2369 hom 29 12 13 4 G 9 7 326100 CASAVA_Build 21 31842760 1I GCAAACTCTG -/C CTCCTGGGCT 3070 het 2977 hom 24 7 12 5 C 1 2 326101 CASAVA_Build 21 31843658 1I ACTTATTAAT -/A AAAAAAAAAT 2961 het 2961 ref 36 21 7 8 A 9 10 326102 CASAVA_Build 21 31849371 1D GAATTTGTTC T/- TTTTTTTTTT 1615 het 1615 ref 30 16 4 11 T 15 14 326103 CASAVA_Build 21 31850796 4D TTATTTTGTG TTGT/---- TTATTTCTAT 3070 het 3070 ref 41 20 20 2 TTGT 1 0 326104 CASAVA_Build 21 31856759 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 29 het 30 1 21 8 AAAG 3 4 326105 CASAVA_Build 21 31865901 2I TGTCACCCAG --/GC GCTGGAGTGC 2455 het 961 hom 18 3 7 8 GC 1 2 326106 CASAVA_Build 21 31869649 1D ACATAGTGAG T/- TGGGGAACGC 3070 het 3070 hom 37 18 16 5 T 2 1 326107 CASAVA_Build 21 31871253 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 8 9 326108 CASAVA_Build 21 31873834 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2816 het 748 hom 11 2 8 1 A 10 11 326109 CASAVA_Build 21 31880705 1I CCAAGTGCAT -/A AAAAATAACT 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 A 5 6 326110 CASAVA_Build 21 31882940 1I CACTAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3058 het 3058 ref 27 10 11 6 A 10 11 326111 CASAVA_Build 21 31886166 24I GTCTGGTGTG ------------------------/TGTACGGAGGAAACAGGGCTTCTT TGTACGTGAA 3070 het 3070 ref 42 20 20 2 TGTACGGAGGAAACAGGGCTTCTT 0 1 326112 CASAVA_Build 21 31886475 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 8 10 A 12 13 326113 CASAVA_Build 21 31887832 1D ATTGGGTTAT C/- TTAAATATAC 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 C 1 0 326114 CASAVA_Build 21 31889664 1D TCCGATTATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 9 8 326115 CASAVA_Build 21 31889739 28D AGTGCAATGG CTGGGATTACAGGCACATGTCACCAAGC/---------------------------- CTGGGATTAC 3070 hom 48 het 28 0 16 21 CTGGGATTACAGGCACATGTCACCAAGC 2 1 326116 CASAVA_Build 21 31904761 4D GAGATACTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 15 22 3 TTTG 4 3 326117 CASAVA_Build 21 31905229 2D CCACCTTAGA GT/-- GTGGCAGGGG 2284 het 2284 ref 28 13 9 6 GT 2 1 326118 CASAVA_Build 21 31910656 2I CTACAAAAAA --/AT ATACAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 AT 1 2 326119 CASAVA_Build 21 31911050 4I ATTTTTTCTT ----/TTTC TTTATTTTTT 3070 het 1446 hom 20 6 11 3 TTTC 0 1 326120 CASAVA_Build 21 31925902 3D ATTAATTAAT TAA/--- TTTTTTTTTT 287 het 287 ref 17 4 2 11 TAA 1 0 326121 CASAVA_Build 21 31927829 1D TTAGAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 34 1 26 7 T 12 11 326122 CASAVA_Build 21 31943302 4I ATGACTAAGA ----/AAAT AAATTTTTAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAAT 1 2 326123 CASAVA_Build 21 31958686 3D CCAAAAAAAG AGA/--- AGAAGATCAA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 AGA 3 2 326124 CASAVA_Build 21 31962198 1D ATACTGTTGC T/- TAAAGTATTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 2 1 326125 CASAVA_Build 21 32007941 1I GGGGTGGGGT -/G GGGGGGGGCA 2877 hom 27 het 11 0 9 2 G 8 9 326126 CASAVA_Build 21 32022117 1D TACCCTTTTC A/- ATCTTTCACA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 326127 CASAVA_Build 21 32032853 1I ATATAATTTA -/T TACTTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 1 2 326128 CASAVA_Build 21 32033354 1D TGTTAATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1919 hom 20 6 10 4 A 13 12 326129 CASAVA_Build 21 32036666 1I TTAAAGTGGA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 7 8 326130 CASAVA_Build 21 32039631 1I AACACAAATA -/T TGTGTTTTAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 1 2 326131 CASAVA_Build 21 32040711 1I GTCTAGAGTA -/G GTGGTTTCTG 3070 hom 117 het 47 0 39 8 G 1 2 326132 CASAVA_Build 21 32057020 2D TAAGTAGATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 39 0 30 9 TG 8 7 326133 CASAVA_Build 21 32072152 1D GAGTGAGCAG A/- AGTCATTGTG 3070 het 3070 ref 55 31 19 5 A 2 1 326134 CASAVA_Build 21 32074180 1D GGCTTCTCAA T/- TTTTTTTTTT 1187 het 524 hom 20 5 5 10 T 17 16 326135 CASAVA_Build 21 32090507 1D AATGGGTGGG T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 7 6 326136 CASAVA_Build 21 32100647 1I AGATGTCAGC -/A GGGTTGGTTC 3070 hom 114 het 44 0 36 8 A 0 1 326137 CASAVA_Build 21 32106467 3I TGAAGTATGA ---/CCC ACTGATCTTG 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 C 0 3 326138 CASAVA_Build 21 32115769 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1119 het 1119 ref 12 4 5 3 A 11 12 326139 CASAVA_Build 21 32127676 1D CCACTTAGGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 45 14 24 8 A 9 8 326140 CASAVA_Build 21 32129335 4D CCATAAACAC ATTA/---- ATTAATTAAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 ATTA 6 5 326141 CASAVA_Build 21 32136294 1D GGGTGTTGGG C/- CATTCTTCAC 3070 hom 102 het 38 0 34 5 C 2 1 326142 CASAVA_Build 21 32137131 5D TTTATTAATC TCTTT/----- TCTTGGTAGA 3070 het 3070 ref 18 9 8 2 TCTTT 1 0 326143 CASAVA_Build 21 32153108 1D AAAGCTTGAA T/- TTTTTTTTTT 2078 het 1076 hom 21 6 5 10 T 19 18 326144 CASAVA_Build 21 32157929 1I TCTTGAAAGG -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 A 7 8 326145 CASAVA_Build 21 32159191 4I CCCTTCCTTT ----/CTTC CTTCCTTCCT 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 CTTC 3 4 326146 CASAVA_Build 21 32169722 1I CTAGTCCGCA -/G GGAGCGAGGC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 2 3 326147 CASAVA_Build 21 32181759 1D AAGGCTTTTT G/- GTAAGTCGTC 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 G 2 1 326148 CASAVA_Build 21 32182653 1I TGGACGCAGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 G 1 2 326149 CASAVA_Build 21 32184419 1D TTTAGATACC T/- TTTTTTTTTT 2097 het 2097 ref 46 24 6 16 T 12 11 326150 CASAVA_Build 21 32187146 1D TCTCACTATT C/- CTGGCTTCTC 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 C 2 1 326151 CASAVA_Build 21 32190256 1D TGCACGAAGG C/- CACAGTGAGA 3070 hom 127 het 49 0 41 9 C 2 1 326152 CASAVA_Build 21 32192100 1I CTCACCTCCT -/C CCCTGCCCTG 3070 hom 94 het 38 0 28 10 C 3 4 326153 CASAVA_Build 21 32192388 1D AACCCCACCT G/- GGCAAAACCA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 G 3 2 326154 CASAVA_Build 21 32193317 1I GCAACGACTT -/C CCTGCTGCAC 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 C 2 3 326155 CASAVA_Build 21 32193967 1D CTGCTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 2157 het 2157 ref 29 16 5 8 T 12 11 326156 CASAVA_Build 21 32200170 1I GTTATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 T 11 12 326157 CASAVA_Build 21 32206089 1D30M1I CTGCAGCAGG AAAAGGCTGGACGGCAAGCAGGGACGATAGT-/-AAAGGCTGGACGGCAAGCAGGGACGATAGTC CACTGCCTTG 3070 hom 97 het 37 0 28 19 N/A 0 0 326158 CASAVA_Build 21 32208921 1D TGTGCAGGCT C/- AGAGACAGAG 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 C 1 0 326159 CASAVA_Build 21 32209238 1D AGATTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1067 hom 24 4 9 12 T 17 16 326160 CASAVA_Build 21 32220108 1D ACCAGAAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1238 hom 27 5 14 8 T 15 14 326161 CASAVA_Build 21 32220647 1I ATTACCCCCC -/G GCAAAAGAAA 1937 het 1937 ref 15 6 7 2 G 1 2 326162 CASAVA_Build 21 32221179 4D TTTCTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTT 1424 het 852 hom 9 3 5 3 TC 6 4 326163 CASAVA_Build 21 32223430 1D AGTAGGTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 20 21 9 G 1 0 326164 CASAVA_Build 21 32226196 2D ATGTGCAAAC AT/-- GTGTACATTC 3070 het 3070 ref 55 28 19 11 AT 1 0 326165 CASAVA_Build 21 32235494 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 2924 het 2924 ref 21 8 9 4 C 0 1 326166 CASAVA_Build 21 32237054 2I TACCTGCCCC --/GA GAGAGAGACC 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 GA 4 5 326167 CASAVA_Build 21 32246209 2I AAGTACGAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 10 12 326168 CASAVA_Build 21 32246788 1D CCAGGGAGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 9 8 326169 CASAVA_Build 21 32249506 1I CGGGCGCGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 42 het 15 0 15 1 G 1 2 326170 CASAVA_Build 21 32255415 1I ATCTGAGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 51 1 37 13 T 10 11 326171 CASAVA_Build 21 32257847 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 73 het 28 0 24 4 T 8 9 326172 CASAVA_Build 21 32271700 1D GAACTAGTTC T/- TTCAGGTGCT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 3 2 326173 CASAVA_Build 21 32290283 1I AGGTTGCCTG -/A AGCACAGTCC 3070 hom 120 het 48 0 38 10 A 1 2 326174 CASAVA_Build 21 32294061 1I TTTCCAAAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 326175 CASAVA_Build 21 32302422 10D TACTACTTTT AAAACAAAAC/---------- AAAACAAAAC 3070 hom 72 het 31 0 25 9 AAAAC 4 2 326176 CASAVA_Build 21 32317355 1D AACCTCTGCC T/- TCCCAGTTTC 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 T 2 1 326177 CASAVA_Build 21 32321802 5I CTGACACCTT -----/TTGTC TTGTCTGCTC 3070 het 3070 hom 53 25 23 5 TTGTC 1 2 326178 CASAVA_Build 21 32325270 1D CTCCTCCCCC T/- CTCTCTTGCT 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 T 1 0 326179 CASAVA_Build 21 32339138 1I GAACCTCTTA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 6 7 326180 CASAVA_Build 21 32341032 1I CAGGCGTGAG -/C CACTGTGCCC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 2 326181 CASAVA_Build 21 32345745 2I ATTGGATCAT --/GG GGGGACAGTT 2620 het 2351 hom 14 5 6 3 G 4 6 326182 CASAVA_Build 21 32348793 2I1M10D GATCCACAAC --TTGCTTCCCTC/AAT---------- AGCAAAGATA 3070 het 3070 hom 48 20 27 9 N/A 0 0 326183 CASAVA_Build 21 32355085 1I GATCTACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 11 12 326184 CASAVA_Build 21 32358881 3I ACTGTGTGAT ---/CAC CACATGTGAT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 CAC 1 2 326185 CASAVA_Build 21 32361462 1D AGATGGATTG T/- TGACCCTGAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 1 326186 CASAVA_Build 21 32361763 1D AGCTTCTGGG A/- ACAATTTGGA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 A 2 1 326187 CASAVA_Build 21 32363316 1I TTACCTTACT -/G TGTGTTATTC 3070 hom 138 het 54 0 47 7 G 0 1 326188 CASAVA_Build 21 32363751 4D48M8I GATGATAGAT AGACAGACAGACAGACAGAGATCTGTATCTATCTCTATCTACCTACCTACCT--------/----AGACAGACAGAGAGAGATCTGTATCTATCTCTATCTACCTACCTACCTACCTATCA ATCAATCTAT 3070 het 3070 ref 53 32 31 17 N/A 0 0 326189 CASAVA_Build 21 32364589 2I ACATATGGTG --/TC GGCTTGCTCC 3070 het 3070 hom 45 18 18 9 TC 0 1 326190 CASAVA_Build 21 32374834 1I ACCTCCCAAA -/T GCCCCATATA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 T 0 1 326191 CASAVA_Build 21 32375958 1I ACTTTCTATG -/T TTTTTGATGA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 5 6 326192 CASAVA_Build 21 32379202 2I GGTATCTCAG --/GC TAATGAGAAG 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 GC 0 1 326193 CASAVA_Build 21 32393425 1I TCTGGTTCAA -/G GCCTTCCAGG 3070 hom 117 het 41 0 39 2 G 1 2 326194 CASAVA_Build 21 32405311 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTAGCC 3070 het 1683 hom 14 4 9 1 A 4 5 326195 CASAVA_Build 21 32409400 1I GGCTTATGGG -/C GGGGGGCCCT 3070 hom 5 het 27 1 16 10 C 0 1 326196 CASAVA_Build 21 32411438 1I12M1D TTCTCTTTTT -AAAACAGGCCAAT/AAAAACAGGCCAA- TTTTTTTTAT 3070 hom 63 het 22 0 21 6 N/A 0 0 326197 CASAVA_Build 21 32411954 1D AATTCAATAG T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 T 7 6 326198 CASAVA_Build 21 32419349 6D AGGAAGCAAA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2053 het 1349 hom 20 7 10 3 T 22 16 326199 CASAVA_Build 21 32421398 1I TATAGCAAGT -/G GTTCACAGAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 1 2 326200 CASAVA_Build 21 32428652 4I CTCCATCTCA ----/AAAC AAACAAGCAA 3070 hom 78 het 28 0 26 3 AAAC 1 2 326201 CASAVA_Build 21 32430789 4D GAAACTGAGG CTAA/---- CTGAGATGAA 3070 het 3070 hom 53 23 22 10 CTAA 1 0 326202 CASAVA_Build 21 32433930 1I GGAGATAATT -/G AATAATGGAG 3070 het 205 hom 14 1 12 1 G 0 1 326203 CASAVA_Build 21 32441159 1D GAAAATTATA C/- CCAAAGTATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 3 2 326204 CASAVA_Build 21 32442288 1D15M1D TTTAATCTTG AAAAAAAAAGGGAGAGA/-AAAAAAAAGGGAGAG- AAAAAAAGGT 3070 hom 85 het 32 0 29 4 N/A 0 0 326205 CASAVA_Build 21 32450136 1I AATTGTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 10 11 326206 CASAVA_Build 21 32451686 1I GGTTATTTTT -/A CAATTTATTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 0 1 326207 CASAVA_Build 21 32453028 3I TTTACTAACC ---/TTA TTATGACTTA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TTA 1 2 326208 CASAVA_Build 21 32455922 1I TGATCTGCCC -/A ACCTTGGCCT 3070 het 1399 hom 24 7 15 2 A 1 2 326209 CASAVA_Build 21 32466777 1D TTTCCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 12 11 326210 CASAVA_Build 21 32467262 1I TTATGACACC -/A AAAGCATAAC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 3 4 326211 CASAVA_Build 21 32468958 4D ACTTCACAAG TGTA/---- TGACATACTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TGTA 1 0 326212 CASAVA_Build 21 32469997 5D CATCTCAAAA AAAAC/----- AAAAACAAAA 66 het 66 ref 20 1 2 20 AAAAC 1 0 326213 CASAVA_Build 21 32470044 1D TATACAAAAA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 33 het 25 0 12 13 T 8 7 326214 CASAVA_Build 21 32470989 1I AAATCAAGTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 699 hom 40 2 34 4 A 9 10 326215 CASAVA_Build 21 32473623 2D TGCACACATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 110 het 40 0 35 6 CA 7 6 326216 CASAVA_Build 21 32475141 1I GGTTAATTTT -/A TGGGTCAACT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 A 0 1 326217 CASAVA_Build 21 32476584 1I GAACAGCATC -/T CCCCCCACAA 3070 het 3070 ref 43 27 14 2 T 0 1 326218 CASAVA_Build 21 32480229 1I TGGGTGACTG -/T TTTAATTTTG 3070 hom 107 het 42 0 35 7 T 3 4 326219 CASAVA_Build 21 32483317 1I GGTGTGCGGA -/G CACCGCCATG 3070 hom 46 het 28 0 19 9 G 0 1 326220 CASAVA_Build 21 32488525 2D CATATGTATG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 AT 6 5 326221 CASAVA_Build 21 32488848 2I GTCTCGAATT --/AA AAAAAAAAAA 2053 het 2053 ref 23 8 6 9 A 11 13 326222 CASAVA_Build 21 32491219 1D CAGCAGGATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 9 8 326223 CASAVA_Build 21 32491460 5D GTAGTTCCTT ATGTC/----- ATGCTATCAC 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 ATGTC 1 0 326224 CASAVA_Build 21 32493090 1D GGCTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1905 het 1129 hom 30 7 8 15 A 15 14 326225 CASAVA_Build 21 32497366 1I CAGAAAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 10 11 326226 CASAVA_Build 21 32508646 1I TTTTATACAT -/A ATGTATGGTT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 1 2 326227 CASAVA_Build 21 32516938 1I CATGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 1783 hom 10 het 4 0 4 0 C 2 3 326228 CASAVA_Build 21 32520464 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 2398 het 379 hom 10 1 7 2 A 10 11 326229 CASAVA_Build 21 32530263 1D TATTTAAAAT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 40 het 16 0 13 3 A 8 7 326230 CASAVA_Build 21 32530660 1D AAAAAATAAA T/- TCAAAATCTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 1 326231 CASAVA_Build 21 32534962 1I38M1I GTGGTTTTGG -TTTTTTTAAAGTACCTACTCAAGGAAATTAGTCCAGCC-/TTTTTTTTAAAGTACCTACTCAAGGAAATTAGTCCAGCCA TCCCTTCTCA 3070 hom 180 het 46 0 60 11 N/A 0 0 326232 CASAVA_Build 21 32535924 1I AGAGGCAAAG -/C CGGTAACATT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 1 2 326233 CASAVA_Build 21 32536091 1I GAGACGGAGT -/C TCGCTCTGTC 3070 hom 48 het 18 0 17 2 C 0 1 326234 CASAVA_Build 21 32547338 1D GCAGATGGTG C/- CCCCCCGCAC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 C 7 6 326235 CASAVA_Build 21 32551094 1D CTTACAGAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 50 13 28 9 A 9 8 326236 CASAVA_Build 21 32551831 1I TAAAAGGAAA -/C CTACGGAGCA 3070 hom 62 het 24 0 20 4 C 1 2 326237 CASAVA_Build 21 32553212 3I CACGCTACCA ---/CAC CTGCTAACTT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 CAC 0 1 326238 CASAVA_Build 21 32554584 2I CAGGTGTGAG --/AC ACAGAGAGTA 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 AC 1 2 326239 CASAVA_Build 21 32564445 1I AGGTCAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 24 1 17 6 A 14 15 326240 CASAVA_Build 21 32565954 1I ATGAGAAATA -/C AAAAGCATGT 3070 het 3070 ref 49 24 13 12 C 0 1 326241 CASAVA_Build 21 32574688 1D TTCCTTCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 30 het 36 1 26 9 T 10 9 326242 CASAVA_Build 21 32576600 1I GGCCACCATG -/C CTAGCTGATT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 1 2 326243 CASAVA_Build 21 32577077 1I TGGGCATGCA -/C CTGGGATTTG 3070 hom 123 het 47 0 38 9 C 1 2 326244 CASAVA_Build 21 32580806 1D TTTACGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1468 hom 34 8 11 15 T 16 15 326245 CASAVA_Build 21 32583407 1D AATCAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 12 13 A 13 12 326246 CASAVA_Build 21 32585742 3D TTTTTTTAAG CTT/--- CTTATTATTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 CTT 2 1 326247 CASAVA_Build 21 32598844 4D CAAACAAACA AAAC/---- AAACCAAAAA 3070 hom 89 het 32 0 30 4 AAAC 2 1 326248 CASAVA_Build 21 32600579 4D GTTTCCTCTT AACA/---- ATCACCCTAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 AACA 1 0 326249 CASAVA_Build 21 32603632 1D AAGAAATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2806 hom 31 10 12 9 T 13 12 326250 CASAVA_Build 21 32610355 1I AAACCCATTG -/C CCTGCGGGGT 3070 hom 105 het 55 1 46 8 C 2 3 326251 CASAVA_Build 21 32613374 1I GCCAGAAGGG -/C CCCCCTGGCG 3070 hom 73 het 30 0 24 6 C 5 6 326252 CASAVA_Build 21 32629858 2D TCTGGCAGGC AG/-- AGAGCCCATG 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 AG 3 2 326253 CASAVA_Build 21 32636218 1D15M1D AGGTTTTGGA TTTTTTTTTTTAACTTA/-TTTTTTTTTTAACTT- AAAAAAATTG 3070 hom 78 het 31 0 27 8 N/A 0 0 326254 CASAVA_Build 21 32655529 1I TCAATGTGGT -/A AAAACGTTAA 3070 hom 126 het 57 0 42 15 A 4 5 326255 CASAVA_Build 21 32658975 1I GAAATAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 9 10 326256 CASAVA_Build 21 32661767 4I ACTGCCAAAG ----/AACT AACAGTAGGT 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 AACT 0 1 326257 CASAVA_Build 21 32662437 10D TAGTAAGAGA CAGGTTTCGT/---------- CACGTTGGCC 3070 het 2691 hom 20 7 9 4 CAGGTTTCGT 1 0 326258 CASAVA_Build 21 32662574 1D AAATATCATG T/- TTTTTTACCT 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 T 7 6 326259 CASAVA_Build 21 32663005 4I AAAAAGTCTC ----/TGAT TGTCCTGCGA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 TGAT 0 1 326260 CASAVA_Build 21 32663255 1I TGGCTGTGGT -/G ACTCACAACT 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 G 0 1 326261 CASAVA_Build 21 32666000 1D TTTTGTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 A 11 10 326262 CASAVA_Build 21 32670750 5D AATGAGATCA TACTT/----- TATAGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 23 2 TACTT 1 0 326263 CASAVA_Build 21 32683229 1I GCACCTGTAG -/T TAAGTGCTAT 3070 het 3070 ref 55 24 20 11 T 1 2 326264 CASAVA_Build 21 32684650 1D TTTGATGGGG T/- TTTTTTTTTT 2096 hom 18 het 7 0 7 0 T 11 10 326265 CASAVA_Build 21 32686202 1I AGACCCTGTC -/T GTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 T 0 1 326266 CASAVA_Build 21 32697189 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1918 hom 19 5 9 5 A 10 11 326267 CASAVA_Build 21 32705740 1I CCCACGGGGA -/C CCTCAGCCGC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 2 3 326268 CASAVA_Build 21 32710308 1I AGGGATCCTC -/T ATATTTTTGC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 326269 CASAVA_Build 21 32713141 1I TGCCTATTGG -/T TTTTCCATCT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 4 5 326270 CASAVA_Build 21 32714375 1I TAGGGTGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 2 3 326271 CASAVA_Build 21 32714732 1D GCCTAGCTAA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 2197 hom 28 10 13 6 T 8 7 326272 CASAVA_Build 21 32717075 1I CTTGGTGAAA -/C CCATGTCTGT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 2 3 326273 CASAVA_Build 21 32720142 1D AAGTGAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 T 11 10 326274 CASAVA_Build 21 32726029 1I TTATATAACC -/A AGGCAATGAT 3070 het 3070 ref 44 32 8 4 A 1 2 326275 CASAVA_Build 21 32735763 8D CAGAAACCCA TACAATGG/-------- TACAATGGAT 3070 het 3070 hom 49 19 25 9 TACAATGG 2 1 326276 CASAVA_Build 21 32741712 1D TATGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 11 13 T 12 11 326277 CASAVA_Build 21 32749492 1I GAAAAAAAAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 6 7 326278 CASAVA_Build 21 32757920 1D48M1D AAAACAAAAC AAAAAAAAAACCTCTTGTAACTTTTAAATATTTTGATTTATAAAAAAAGA/-AAAAAAAAACCTCTTGTAACTTTTAAATATTTTGATTTATAAAAAAAG- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 21 18 8 N/A 0 0 326279 CASAVA_Build 21 32760282 2D TGTGTCTGCA GT/-- GTTAGCTCTT 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 GT 2 1 326280 CASAVA_Build 21 32762189 4I ATAAACTCCC ----/ATAT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 22 12 10 0 AT 0 2 326281 CASAVA_Build 21 32762571 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 A 7 8 326282 CASAVA_Build 21 32764162 1D AAATTAACCA T/- TCACACTCCA 3070 hom 123 het 46 0 42 6 T 2 1 326283 CASAVA_Build 21 32765271 1D ATCTGTCACT A/- ACCCTTCCTA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 2 1 326284 CASAVA_Build 21 32772896 1I TTTTCCCGAA -/G GGCTGGGCCT 3070 hom 93 het 40 0 27 13 G 2 3 326285 CASAVA_Build 21 32774028 1I CCAGCTACTC -/T TTTTTTTTTT 2963 het 2963 ref 28 10 9 9 T 12 13 326286 CASAVA_Build 21 32774497 1D AAAAAAAAAA G/- GTACCGAGTT 2715 het 41 hom 25 2 11 14 G 2 1 326287 CASAVA_Build 21 32775352 1D TTGTAACAGG A/- AAAAAACGAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 6 326288 CASAVA_Build 21 32777552 1I GTTTCTGGCA -/T TTTGGTATAG 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 3 4 326289 CASAVA_Build 21 32781901 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1414 het 857 hom 16 5 6 5 A 15 14 326290 CASAVA_Build 21 32786891 1D TTTTCTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 T 11 10 326291 CASAVA_Build 21 32795430 1I ATGGATACCA -/T TGGGTTTGTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 2 326292 CASAVA_Build 21 32801590 4D AGCATGTGCA TGTG/---- TGTGTATGTG 3070 het 3070 ref 80 40 28 19 TG 4 2 326293 CASAVA_Build 21 32801737 4I GTATGTATGC ----/ATGT GTGTTTTTGT 3070 het 3070 hom 89 39 33 17 ATGT 0 1 326294 CASAVA_Build 21 32801932 2D CATGTGCATA TG/-- TGTTTGCGTG 3070 het 3070 hom 82 36 34 15 TG 2 1 326295 CASAVA_Build 21 32805237 4I TCTCTCTCTC ----/TCTA TCTATCTATA 3070 het 2201 hom 32 14 11 7 TCTA 2 3 326296 CASAVA_Build 21 32845554 1D AGAAAAAACC T/- GGACAGCCAG 3070 het 3070 ref 24 13 8 4 T 1 0 326297 CASAVA_Build 21 32847950 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 30 hom 26 1 22 3 A 10 9 326298 CASAVA_Build 21 32852484 19D CCACAGAAAG ACCCACCCATTGCAGTGAC/------------------- ACTGAAAAGT 3070 het 3070 hom 42 20 21 4 ACCCACCCATTGCAGTGAC 1 0 326299 CASAVA_Build 21 32859318 1I AAAATGTATA -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 6 7 326300 CASAVA_Build 21 32868340 1I TTTATTGACA -/T TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 6 7 326301 CASAVA_Build 21 32876757 4I TTTTCTTTCT ----/TCTG TCTTTCTTTC 2713 het 2713 ref 26 12 9 5 TCTG 0 1 326302 CASAVA_Build 21 32877986 17D CAACAGGGTC CAATGAGGAAGATGGTA/----------------- AAAATCAGGA 3070 het 3070 hom 30 13 15 4 CAATGAGGAAGATGGTA 1 0 326303 CASAVA_Build 21 32879811 1D CCTGCAATTC T/- TAATATAGAA 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 T 2 1 326304 CASAVA_Build 21 32916445 2I CAGGGTGTGC --/AG AGACTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 AG 1 2 326305 CASAVA_Build 21 32925800 6I CAGAACTCAA ------/AGTATT AACATTACTT 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 AGTATT 0 1 326306 CASAVA_Build 21 32931515 1D GGATTAGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 A 10 9 326307 CASAVA_Build 21 32936614 2I GAACTCTCTC --/TT GTGAACCTTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 2 326308 CASAVA_Build 21 32958697 5I AATCCCTGTC -----/CTGTT CTGTTCCATT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 CTGTT 1 2 326309 CASAVA_Build 21 32972809 2D AACAAATAAA AT/-- ATAAAGTGCA 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 AT 2 1 326310 CASAVA_Build 21 32979078 8D GACTTAAGTA CGGCCGGG/-------- CGCGGTGGCT 1898 het 1898 ref 17 5 6 6 CGGCCGGG 1 0 326311 CASAVA_Build 21 32991680 1D TAAGTGAATT A/- AAAAAAAAAA 2864 het 480 hom 24 3 13 8 A 15 14 326312 CASAVA_Build 21 33018950 1D TTTGTTAGCT G/- CTTAAATATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 G 1 0 326313 CASAVA_Build 21 33051525 3I GCAGTACTCT ---/TAA TAAAATGAAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 TAA 1 2 326314 CASAVA_Build 21 33070444 5I CAGTAAAAAG -----/TATAA TATAGTATAG 3070 hom 66 het 23 0 22 1 TATAA 0 1 326315 CASAVA_Build 21 33074595 2D ACCCAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 39 1 30 8 A 16 14 326316 CASAVA_Build 21 33079107 1D CCATGGTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 345 hom 55 1 43 11 T 12 11 326317 CASAVA_Build 21 33087098 2D ATTATTATTA TT/-- TTTTTTTTTT 287 het 280 hom 26 4 1 21 T 14 12 326318 CASAVA_Build 21 33088058 1I TACTATATGA -/T TTTAAGGCTG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 T 3 4 326319 CASAVA_Build 21 33088822 1I CCCAGGCACT -/G GGCAAGCTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 2 3 326320 CASAVA_Build 21 33091188 1I ATTGGTTTGC -/T GGAACATGTG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 0 1 326321 CASAVA_Build 21 33095001 2D CAAAAAAAAA AC/-- CAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 7 AC 1 0 326322 CASAVA_Build 21 33097818 3I CACTATGTAA ---/GAT GATATTTGAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GAT 1 2 326323 CASAVA_Build 21 33122107 3I GGAAAAACAT ---/AAA AAGAAAATAC 3070 het 2934 hom 24 7 14 3 A 2 5 326324 CASAVA_Build 21 33126611 1D TCATAGCTCA G/- CTGCGGCCTC 3070 hom 87 het 30 0 29 2 G 1 0 326325 CASAVA_Build 21 33131198 1I AAATATGGGG -/A AAAATTATTT 3070 het 3070 hom 53 22 26 5 A 4 5 326326 CASAVA_Build 21 33138219 1I CTCTGCGAAG -/C TCTGTCCTCT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 0 1 326327 CASAVA_Build 21 33141962 2D CTATTTATTC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 TA 7 6 326328 CASAVA_Build 21 33146283 1I GCAGCCTCGC -/G GAGAGCTCAG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 G 1 2 326329 CASAVA_Build 21 33153652 1I CTCGGAGCCA -/G GGTCTGGAGT 3070 hom 61 het 26 0 16 10 G 2 3 326330 CASAVA_Build 21 33167324 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1496 het 703 hom 11 4 5 2 A 10 11 326331 CASAVA_Build 21 33175215 1I CTTCCCCAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 9 10 326332 CASAVA_Build 21 33188635 2I GGTTGGAAAC --/AG TGTTGGTGAT 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 AG 0 1 326333 CASAVA_Build 21 33208318 1D CTGTAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 20 8 A 12 11 326334 CASAVA_Build 21 33223857 1D ATAAAAAAGT G/- AAATTACTTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 1 0 326335 CASAVA_Build 21 33226280 8D ACATTCACCC CAAGGTCT/-------- CAAGGCCACC 2386 het 2386 ref 37 25 9 6 CAAGGTCT 1 0 326336 CASAVA_Build 21 33231495 3I TTTCCTGAGG ---/CCT CCTCAGCCCC 3070 het 2449 hom 17 6 8 3 CCT 1 2 326337 CASAVA_Build 21 33241545 1I AGAGAAGCCC -/A AATCAAGGCA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 2 3 326338 CASAVA_Build 21 33241814 2I TAGTATATTC --/AT AGAGTTGGGC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AT 0 1 326339 CASAVA_Build 21 33243175 5D AAACCAAACA GGTTG/----- TAATAAAGAA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 GGTTG 1 0 326340 CASAVA_Build 21 33243647 1D TTTCTACACA T/- TTCTCTACAC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 3 2 326341 CASAVA_Build 21 33247272 1I AAGAAAACAC -/T AGAAACTGTG 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 0 1 326342 CASAVA_Build 21 33248054 1I AGGAATGTGG -/A AAAAATTAGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 5 6 326343 CASAVA_Build 21 33251748 1D TCCCTTCACT A/- GGAAGACAGT 3070 hom 114 het 41 0 39 7 A 1 0 326344 CASAVA_Build 21 33253979 1I CTGTTTTCTA -/G GCAGCCTCCT 3070 hom 147 het 55 0 47 8 G 1 2 326345 CASAVA_Build 21 33259299 2D ATTCTCATTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 AC 10 9 326346 CASAVA_Build 21 33262949 1D ACGAAGTCTC G/- GCTCTGTCGC 3070 hom 23 het 18 0 14 4 G 2 1 326347 CASAVA_Build 21 33273028 2D CGGAGATCTC TT/-- GTGATGCTCT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 T 2 0 326348 CASAVA_Build 21 33276952 2D GGGGTTCTCA CT/-- ATATTGCCCA 2598 het 2598 ref 14 8 6 2 CT 1 0 326349 CASAVA_Build 21 33301259 3D CTTGGGTGAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 46 0 23 24 T 17 14 326350 CASAVA_Build 21 33301451 1D TGCAAGTCCC T/- TAGGTGGGTT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 T 2 1 326351 CASAVA_Build 21 33303721 1D CATGTTAGCT C/- TTGCTTATTA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 C 1 0 326352 CASAVA_Build 21 33307900 1D ACGCCCCCCC A/- ATCCCCGCAA 3070 hom 51 het 19 0 16 3 A 2 1 326353 CASAVA_Build 21 33314284 1I CCGCAGCCCT -/G GGCTAGGACG 2515 hom 39 het 19 0 7 12 G 2 3 326354 CASAVA_Build 21 33325820 17D CTCTGACTAA AAAAAAAGAGAAAAAAT/----------------- AAAAAAAGAA 3070 hom 83 het 28 0 26 5 AAAAAAAGAGAAAAAAT 1 0 326355 CASAVA_Build 21 33339100 1I TTTACCCATG -/A GGAATCGGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 0 1 326356 CASAVA_Build 21 33348180 1I ATTTCTTGAT -/A GCAATAACAT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 A 0 1 326357 CASAVA_Build 21 33372858 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 13 15 12 A 12 13 326358 CASAVA_Build 21 33375504 1I TGCTTCCCAA -/C CCCCCCCATT 2011 het 2011 ref 26 10 7 9 C 7 8 326359 CASAVA_Build 21 33381462 1D AATTTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1956 hom 38 11 18 9 A 15 14 326360 CASAVA_Build 21 33386941 1I GTCTCGAACT -/C CTGTCCTCAA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 C 1 2 326361 CASAVA_Build 21 33390612 4D CAATTAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 AAAC 3 2 326362 CASAVA_Build 21 33395896 2D AGAGAGAGAG AC/-- AAAGACTCAA 3070 hom 61 het 24 0 17 8 AC 1 0 326363 CASAVA_Build 21 33408522 1I TAAGCTGCCC -/T CTTTCTCCCT 3070 hom 132 het 47 0 42 5 T 0 1 326364 CASAVA_Build 21 33413099 1I CCATTTAGCA -/T TTCACCCTTG 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 2 3 326365 CASAVA_Build 21 33414176 1D ATATTGTATT A/- TTTCCATCAA 3070 het 3070 hom 36 10 16 10 A 1 0 326366 CASAVA_Build 21 33431388 1I GGGCAATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 10 11 326367 CASAVA_Build 21 33434568 1I GAGGCTGGCA -/C CCCCCCCAGC 1318 het 1318 ref 24 14 6 4 C 7 8 326368 CASAVA_Build 21 33438535 2I ATGAAAACCA --/CT CTCTAAAGAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 CT 2 3 326369 CASAVA_Build 21 33441821 1D ACTCTTTCAG A/- AAAAAAAAAA 2259 het 1099 hom 16 3 7 6 A 15 14 326370 CASAVA_Build 21 33441902 2D AAAAATTGAA AT/-- AGAGTCTTTA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 AT 1 0 326371 CASAVA_Build 21 33447081 2D CCTCGAAACA AC/-- ACAGTGTTCA 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 AC 2 1 326372 CASAVA_Build 21 33454560 6I TTACATTGAA ------/ACACAC ACACACACAC 3070 hom 92 het 41 0 28 13 AC 6 9 326373 CASAVA_Build 21 33456591 1D AGCCCATAGG C/- ACACATTTGT 3070 hom 105 het 40 0 36 6 C 1 0 326374 CASAVA_Build 21 33457592 1I TGAACCTCAG -/T TTTCCTCATC 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 3 4 326375 CASAVA_Build 21 33459936 1I GGCCTCCTTC -/T TTGTATCCCC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 2 3 326376 CASAVA_Build 21 33462465 1I GCTATAGAGC -/T TGGAATTTAT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 1 2 326377 CASAVA_Build 21 33463300 3I AGGTGACAGC ---/TTG TTGTTGCGGT 3070 hom 91 het 37 0 30 7 TTG 2 3 326378 CASAVA_Build 21 33468859 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 TA 6 7 326379 CASAVA_Build 21 33476827 1D CTCTGAAGTC A/- AACCTTCTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 3 2 326380 CASAVA_Build 21 33479100 1I CTTAGACAGT -/C CCCTCATGGA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 3 4 326381 CASAVA_Build 21 33482146 1D TCAATGAATA T/- TTCATTTATG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 3 2 326382 CASAVA_Build 21 33482293 1I TTAAATTCAA -/T AGCAGTCAGT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 0 1 326383 CASAVA_Build 21 33485287 1D AATGCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 23 4 T 11 10 326384 CASAVA_Build 21 33487492 1D TTACAAGAGG C/- CAATTACTAA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 C 2 1 326385 CASAVA_Build 21 33488647 1I CAGGCACGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 G 1 2 326386 CASAVA_Build 21 33489622 1I AGGGCACGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 111 het 40 0 32 8 G 1 2 326387 CASAVA_Build 21 33490439 1D AGCTTACTTT A/- AAAAATAATT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 A 6 5 326388 CASAVA_Build 21 33491174 5I TCACACTCAC -----/TTTAT TTTAAAATAG 3070 hom 99 het 37 0 31 6 TTTAT 0 1 326389 CASAVA_Build 21 33492463 2I ATTCTTTGTA --/CC CCCCCCCACT 2970 het 2970 ref 32 18 12 2 C 7 9 326390 CASAVA_Build 21 33500308 1D AGTTTTTGCC T/- TTTTCGTCTT 3070 hom 77 het 35 0 25 10 T 5 4 326391 CASAVA_Build 21 33504292 1I AAAGGAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 138 hom 24 1 23 0 A 8 9 326392 CASAVA_Build 21 33504999 4I AGATTCAAGT ----/TTGA TTGAACACTG 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 TTGA 1 2 326393 CASAVA_Build 21 33506476 1D AGCACTTAAT C/- CCTCCTGATA 3070 hom 114 het 44 0 36 8 C 3 2 326394 CASAVA_Build 21 33509407 1I CTCTCCCTGT -/G GGGGACACTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 4 5 326395 CASAVA_Build 21 33511106 2D CAATTTACAC AT/-- GAGTGGAGAG 3070 het 3070 ref 50 24 21 5 AT 1 0 326396 CASAVA_Build 21 33512009 13I GGGTGGGGAG -------------/TTCAGAGGAAGTA TATGGAACTC 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 TTCAGAGGAAGTA 0 1 326397 CASAVA_Build 21 33518966 1I TCTGTCTTTT -/A AATTGGTACA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 2 3 326398 CASAVA_Build 21 33519141 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2393 het 2393 ref 22 9 7 6 T 12 11 326399 CASAVA_Build 21 33522064 4D TCTTTGCATT TGTC/---- TGTCTTTCAG 3070 het 3070 ref 52 24 25 4 TGTC 2 1 326400 CASAVA_Build 21 33523164 1I TTGGATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 10 11 326401 CASAVA_Build 21 33525181 1I TCTTTTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 11 12 326402 CASAVA_Build 21 33528843 9D AAATTGGCAG GGTTTGTCT/--------- GGTCTCAGGG 3070 het 3070 ref 40 25 16 1 GGTTTGTCT 1 0 326403 CASAVA_Build 21 33532856 1I GGGGGGGTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 8 9 326404 CASAVA_Build 21 33534953 1D31M1I TTGCACCACT GGCACTCCAGGCTAGGCAACACAGCAAGACCC-/-GCACTCCAGGCTAGGCAACACAGCAAGACCCT GTCTCAAAAA 3070 hom 56 het 24 0 16 9 N/A 0 0 326405 CASAVA_Build 21 33535806 1D CTTTTCACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 T 10 9 326406 CASAVA_Build 21 33540248 1I CATCCGGCAA -/T TTTTTTTTTT 2227 het 1181 hom 29 4 9 16 T 16 17 326407 CASAVA_Build 21 33549773 1I TGGGGAGTCA -/G GGTGTACCAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 2 3 326408 CASAVA_Build 21 33555177 8D TTGTAAGTGT ATCTGTGC/-------- ATCTGTGCAT 2250 het 2122 hom 14 7 7 1 ATCTGTGC 2 1 326409 CASAVA_Build 21 33567570 1I CGTTATGTCT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 A 7 8 326410 CASAVA_Build 21 33571225 3D AAGGATTCTT GTG/--- GTGAATTTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 7 GTG 2 1 326411 CASAVA_Build 21 33576306 1D AACCATTTTC T/- TCATATATTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 2 1 326412 CASAVA_Build 21 33577957 12D TAGCTTGGAG GAAGGAACGGGA/------------ GAAGGAAAGA 3070 hom 125 het 42 0 38 11 GAAGGAACGGGA 1 0 326413 CASAVA_Build 21 33580851 1I AATAGTGGGA -/C CCCCCATCTC 3070 hom 30 het 13 0 11 2 C 5 6 326414 CASAVA_Build 21 33583618 1I TTCCTCCGCT -/G GCCCTGAGGG 3070 hom 91 het 35 0 29 6 G 1 2 326415 CASAVA_Build 21 33585448 1I TATGAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 T 10 11 326416 CASAVA_Build 21 33594617 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 577 hom 24 6 12 6 A 15 14 326417 CASAVA_Build 21 33606012 2I TCAAAAACAC --/AT GTCTTCATTT 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 AT 0 1 326418 CASAVA_Build 21 33622391 1D CCCACGGAAG C/- CAAAAAGAGT 3070 hom 95 het 37 0 31 7 C 2 1 326419 CASAVA_Build 21 33632560 2D23M1I AATACAAAAA CTTCAGCCGGATGTGGTGGTGCGTG-/--TTAGCCGGATGTGGTGGTGCGTGC CTGTAATCCC 3070 hom 48 het 13 0 17 2 N/A 0 0 326420 CASAVA_Build 21 33638338 1D TCCGTCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 12 11 326421 CASAVA_Build 21 33663663 1I ATATTATGGT -/A ATCTTGTGCT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 1 2 326422 CASAVA_Build 21 33666600 1D GCCCAACTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 48 hom 19 1 13 5 T 9 8 326423 CASAVA_Build 21 33674308 1I GACATGGTGG -/C TCACACCTGT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 0 1 326424 CASAVA_Build 21 33677768 1D CATTTTGGCG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 86 het 39 0 32 8 T 9 8 326425 CASAVA_Build 21 33681558 1D TGATACTTGG T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 111 het 41 0 36 5 T 6 5 326426 CASAVA_Build 21 33688944 1I TAGTACAGAC -/G GGGTTTCACC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 3 4 326427 CASAVA_Build 21 33690951 1I AGACAGAGTC -/T TGCTCTATCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 1 2 326428 CASAVA_Build 21 33691492 2D TCGTATACTT AA/-- AAAGTGTAGG 3070 hom 57 het 21 0 17 4 A 5 3 326429 CASAVA_Build 21 33693460 1I GGACCAATGG -/A TTATCATGGG 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 0 1 326430 CASAVA_Build 21 33695368 1I TTGAGATGAT -/G GCCAGACCAC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 G 1 2 326431 CASAVA_Build 21 33696092 1D AATTTTATTT A/- TTTGTTTGAA 2707 het 2707 ref 24 9 12 4 A 1 0 326432 CASAVA_Build 21 33704293 1I ATACAGGAGG -/T TTCTCAAGAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 2 3 326433 CASAVA_Build 21 33704732 1I GCAACCTCCA -/C CTGCCGGGTT 3070 hom 53 het 19 0 17 2 C 1 2 326434 CASAVA_Build 21 33708521 8I TGATTTAGGA --------/TGTTTGTG TGTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 TGTTTGTG 1 2 326435 CASAVA_Build 21 33708607 1D ACTAAATCTG A/- AAGCTAACGC 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 3 2 326436 CASAVA_Build 21 33719054 9D AGTAGCTAGG ATTACTGGC/--------- ATGGGCCACC 3070 het 3070 ref 24 14 11 0 ATTACTGGC 1 0 326437 CASAVA_Build 21 33720322 1I TGGGCATGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 2 326438 CASAVA_Build 21 33723529 4I CTCTGATTTC ----/TTTT GTTTTGAGAC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 0 4 326439 CASAVA_Build 21 33728709 3D AAAAAAATAA AAT/--- AAATAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 18 13 3 AAT 1 0 326440 CASAVA_Build 21 33730354 1I ACCAACATGG -/A GAAACCCCGT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 0 1 326441 CASAVA_Build 21 33731304 1D GGTGACAAGC T/- TTTTTTTTTT 1477 het 1477 ref 24 10 5 9 T 13 12 326442 CASAVA_Build 21 33736198 4D ATTTGTTTGC TTGT/---- TTGTTTGAAG 3070 het 3070 ref 32 14 15 6 TTGT 2 1 326443 CASAVA_Build 21 33737098 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 10 4 A 11 10 326444 CASAVA_Build 21 33738044 1D TGGGAATCTG A/- AAGGTTATAC 3070 hom 57 het 29 0 19 10 A 3 2 326445 CASAVA_Build 21 33738362 1I TAGGCGTGAG -/C CACCATGCCT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 C 1 2 326446 CASAVA_Build 21 33741400 3D CCCAAGCTTC TTT/--- GACACACACA 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 T 3 0 326447 CASAVA_Build 21 33741518 14I GCACACCTAT --------------/AGTCCTAGCTACTC AGTAGACTGA 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 AGTCCTAGCTACTC 0 1 326448 CASAVA_Build 21 33746022 2I GGCCAAGAAC --/AG AGCTTTAAGA 3070 het 3070 ref 51 27 16 8 AG 1 2 326449 CASAVA_Build 21 33754845 1I ATGATGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 10 11 326450 CASAVA_Build 21 33755980 1I AAACTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 13 14 326451 CASAVA_Build 21 33760038 1D TATTCAGCTT C/- CCCTTCCATT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 C 4 3 326452 CASAVA_Build 21 33760958 1D AAATATGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 19 2 A 11 10 326453 CASAVA_Build 21 33762425 1I AATTAAAGTT -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 A 6 7 326454 CASAVA_Build 21 33764282 1D AGAAAGAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 A 10 9 326455 CASAVA_Build 21 33765526 1D AATATATACT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 A 9 8 326456 CASAVA_Build 21 33771785 2D AGGCCGAGGC GG/-- GGGGGGGTTA 2597 hom 25 het 18 0 12 7 G 9 7 326457 CASAVA_Build 21 33775697 1I CACTTTTTTT -/G GGGGGGGTGG 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 G 7 8 326458 CASAVA_Build 21 33781272 3I TCGGTTTCCC ---/TGT TGTTGTTTAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 TGT 2 3 326459 CASAVA_Build 21 33782620 5D GGATGGGAAC AATTA/----- AATTAAAATC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AATTA 2 1 326460 CASAVA_Build 21 33784795 4D TACTAAAAAT ACAA/---- AAATTAACTG 2732 het 1178 hom 10 3 7 1 ACAA 1 0 326461 CASAVA_Build 21 33785138 1D GTAAAAAAGG A/- GGCTTGCTTA 3070 het 3070 ref 48 28 14 6 A 1 0 326462 CASAVA_Build 21 33787178 1I CGGGCGCGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 51 het 18 0 17 1 G 1 2 326463 CASAVA_Build 21 33806935 1D CTGGCTATTT A/- AAAAATTTTT 3070 hom 14 het 24 1 17 6 A 6 5 326464 CASAVA_Build 21 33818773 5I AGTTTTTTCC -----/ATTTA ATTTGAGTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATTTA 0 1 326465 CASAVA_Build 21 33819564 1I ATAAATACAT -/A AAAATTAAAG 3070 hom 68 het 25 0 23 2 A 4 5 326466 CASAVA_Build 21 33826355 1I TGTAAATCCA -/T TAACTATTTT 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 T 1 2 326467 CASAVA_Build 21 33832580 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 10 11 326468 CASAVA_Build 21 33833797 3D TGAACCTGGT AGG/--- AGGAGATCGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 8 AGG 2 1 326469 CASAVA_Build 21 33837720 1I CTCCCCCTCT -/C CGCCTCCGCG 2013 hom 21 het 8 0 7 1 C 1 2 326470 CASAVA_Build 21 33841815 4D TGAAACAAAC AATT/---- AATAGAAAAT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 AATT 1 0 326471 CASAVA_Build 21 33842292 4D AGAGTAAATA AATC/---- CCATCTGGTT 3070 het 3070 hom 20 10 10 1 AATC 1 0 326472 CASAVA_Build 21 33843360 4I GTTCAAGTGA ----/TTGT TCCGCCTCAG 3070 hom 96 het 33 0 32 1 TTGT 0 1 326473 CASAVA_Build 21 33849622 1I TAAACCTTAA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 50 30 15 5 T 7 8 326474 CASAVA_Build 21 33857575 49D ATGCATTAAC CTCTTTATATTTTAATATTTGCTAAATATTCTAAAATCATGTTTTATAT/------------------------------------------------- ACAGGCCAGA 3070 het 3070 ref 25 17 14 3 CTCTTTATATTTTAATATTTGCTAAATATTCTAAAATCATGTTTTATAT 1 0 326475 CASAVA_Build 21 33860713 3I AATAGTGTAA ---/TAT TATACTTAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAT 1 2 326476 CASAVA_Build 21 33865189 5I AACAGACTTT -----/AAGTA AATAACTTTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AAGTA 0 1 326477 CASAVA_Build 21 33868048 1D TTACAATACT G/- GTTTAGTCTA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 G 2 1 326478 CASAVA_Build 21 33870365 1I14M1I23M1I AGACCTGCTC -TAATTTGCAGTCCC-TTTCCCAAATGATTTGGTTCTTC-/TTAATTTGCAGTCCCTTTTCCCAAATGATTTGGTTCTTCT GGGTTGAGAT 3070 hom 54 het 22 0 19 9 N/A 0 0 326479 CASAVA_Build 21 33871367 1I TGCAGAGGCC -/A AGTACATTTA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 1 2 326480 CASAVA_Build 21 33873267 1D TGAGCCGAGA C/- TCGCGCCGCT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 C 1 0 326481 CASAVA_Build 21 33888988 1I CCGGCCTACA -/T TAACTACCTT 3070 het 2899 hom 23 7 11 5 T 1 2 326482 CASAVA_Build 21 33890476 2D TTTTGCTAAG TA/-- TATGTCAACA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 TA 2 1 326483 CASAVA_Build 21 33893815 1I AGTCAGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 35 2 28 5 T 11 12 326484 CASAVA_Build 21 33899453 4D GTTTTCAATC TCTT/---- TAACAGTATC 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 TCTT 1 0 326485 CASAVA_Build 21 33905097 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 3 4 326486 CASAVA_Build 21 33939661 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2990 hom 29 10 16 3 T 8 9 326487 CASAVA_Build 21 33955418 1I GAGTTCCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 10 11 326488 CASAVA_Build 21 33957572 1I GGCCGTTAGG -/C CATAGCTTTG 3070 hom 92 het 36 0 27 9 C 1 2 326489 CASAVA_Build 21 33960648 1D TAAAAAAAAT A/- AATATTTCGA 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 A 3 2 326490 CASAVA_Build 21 33972076 1I CATGTGGGTG -/T TTATTGTGGT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 3 326491 CASAVA_Build 21 33974867 6D GTCCACCAAA TGTCTG/------ AAGTCCTGCC 3070 hom 87 het 29 0 28 3 TGTCTG 1 0 326492 CASAVA_Build 21 33981411 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2722 het 1963 hom 20 8 8 4 A 13 14 326493 CASAVA_Build 21 33996405 1D ATTCCCCTGC A/- CTCAGCCTCC 3070 hom 33 het 13 0 11 2 A 1 0 326494 CASAVA_Build 21 34002751 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCTCC 1213 hom 7 het 3 0 3 0 G 3 4 326495 CASAVA_Build 21 34007702 1I CAGGCGTGAG -/C CACCACTCCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 1 2 326496 CASAVA_Build 21 34008300 1D CCACCGCCCC T/- GGCCCAGCCT 2319 het 2319 ref 26 11 9 6 T 1 0 326497 CASAVA_Build 21 34008798 6D ATAAAATTAT TATATC/------ TATATCTATA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TATATC 3 2 326498 CASAVA_Build 21 34009449 1D TAGGAAATCT A/- AAGAGATTCA 3070 hom 117 het 42 0 38 4 A 3 2 326499 CASAVA_Build 21 34027795 1I AACTAACAAC -/A AAAAGACATG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 4 5 326500 CASAVA_Build 21 34030615 1I GAAAGGTTTT -/G GGAAGATTTT 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 G 2 3 326501 CASAVA_Build 21 34035912 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 52 hom 16 1 12 3 A 9 8 326502 CASAVA_Build 21 34046534 1D ATATGGGTAA T/- TAGTAAAATC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 2 1 326503 CASAVA_Build 21 34047390 1D TTGTAGGATA C/- AGGTATTTAT 3070 het 3070 hom 51 15 29 7 C 1 0 326504 CASAVA_Build 21 34052724 4D CTTATAAAAT AGAG/---- AGGGATCATT 3070 het 3070 hom 39 12 21 7 AG 3 1 326505 CASAVA_Build 21 34055583 1I TTCCTGCAAC -/T TTTTTTTTTT 1853 het 1853 ref 37 20 6 11 T 13 14 326506 CASAVA_Build 21 34055955 1I TTTTACAAAG -/C CCCTGCGGTA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 C 3 4 326507 CASAVA_Build 21 34071503 11D TGATCTGTCT GTCCTTTACCA/----------- GTACCTCACC 3070 het 3070 ref 38 26 12 7 GTCCTTTACCA 1 0 326508 CASAVA_Build 21 34073286 1I GCTCTATTGA -/T TTTTTTTTTT 2031 het 2031 ref 26 10 8 8 T 13 14 326509 CASAVA_Build 21 34110062 4D GGGATCCGAC AAAG/---- AAGAATGAAG 1963 het 1963 ref 27 17 7 5 AAAG 1 0 326510 CASAVA_Build 21 34113257 1I CCTCTGTAGT -/A ACCTTATTAT 3070 het 3070 ref 62 32 28 2 A 1 2 326511 CASAVA_Build 21 34115469 1D TATTACAGCC A/- ATTTTGAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 2 1 326512 CASAVA_Build 21 34153778 1I AGGGCAGGCT -/C CCAGAGCCTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 C 2 3 326513 CASAVA_Build 21 34170239 4I TTTCTTTCTT ----/TCTC TCTCTTTCTC 2336 het 2336 ref 24 15 7 2 TC 2 4 326514 CASAVA_Build 21 34181774 1I TTTCTTTTTA -/T TTTTTTTTAT 2311 het 2311 ref 22 8 8 6 T 8 9 326515 CASAVA_Build 21 34182118 1D TGGGGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2755 hom 29 11 14 4 T 11 10 326516 CASAVA_Build 21 34188026 3D TAGGAGCCAG AAA/--- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 53 19 25 10 A 11 8 326517 CASAVA_Build 21 34189705 2I GCATGTGTGT --/GC GTGTCTACGT 3070 het 3070 hom 51 18 23 15 GC 0 1 326518 CASAVA_Build 21 34189772 2D22M4D17M2I TGTGAGTGCA TGTGTTTGTGCGTGTGTGCGTATTTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGC--/--TGTTTGTGCGTGTGTGCGTATT----TGTGTGCGTGTGTGTGCGT GTGTGTATGT 3070 het 3070 ref 54 31 34 12 N/A 0 0 326519 CASAVA_Build 21 34200790 2I TTATAGCCCA --/CT CTATCAAGTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CT 1 2 326520 CASAVA_Build 21 34203612 1D GCTAATTTTT G/- TATTTTTAGT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 G 1 0 326521 CASAVA_Build 21 34213994 2D CTGCTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 11 9 326522 CASAVA_Build 21 34228133 1I CACCACCGCA -/C CCAGCTAATT 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 C 2 3 326523 CASAVA_Build 21 34228598 3D TCTGTTTGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1494 het 837 hom 25 6 4 15 T 19 16 326524 CASAVA_Build 21 34233276 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 13 14 326525 CASAVA_Build 21 34243715 1I GCTGACCGCA -/G GGCTTTGGTG 3070 hom 77 het 34 0 25 9 G 2 3 326526 CASAVA_Build 21 34244190 1I TAGGCGTGAG -/C CACTCATCTA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 C 1 2 326527 CASAVA_Build 21 34251420 1D AAAAGGGGAT G/- GGGGAGGGAC 3070 het 3070 hom 34 16 15 4 G 5 4 326528 CASAVA_Build 21 34253771 1I ATTGGTAAAA -/T TAGTAACTTG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 1 2 326529 CASAVA_Build 21 34254184 1I TGATAGAACC -/A AGTGGTAGAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 2 326530 CASAVA_Build 21 34254443 1I GGAAGAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2642 hom 26 8 12 6 T 13 14 326531 CASAVA_Build 21 34257927 4I AGGGTAGGGA ----/TGCT TGCTTATTTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 TGCT 1 2 326532 CASAVA_Build 21 34259638 4I TGAATATAAT ----/AAAC AAATATAATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AAAC 0 1 326533 CASAVA_Build 21 34261634 1I CAAGATTGGT -/G GGTTACACCC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 2 3 326534 CASAVA_Build 21 34267648 1I TCCAGCCTCT -/G GGGGAGAGCT 3070 hom 103 het 38 0 31 7 G 4 5 326535 CASAVA_Build 21 34268726 1D TTGTGGCTTT A/- AAAAAAAGTC 3070 het 2698 hom 23 9 12 2 A 8 7 326536 CASAVA_Build 21 34276614 1D TTATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 21 1 15 5 T 15 14 326537 CASAVA_Build 21 34276907 1D GTGTGGGTTT G/- CCATATTTTG 3070 hom 98 het 37 0 32 5 G 1 0 326538 CASAVA_Build 21 34280649 8I AGAGAATTTT --------/TATCCCCG TATCCAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 TATCCCCG 0 1 326539 CASAVA_Build 21 34285166 5D ATACAATAGG GAACA/----- GAACAGATAA 3070 het 3070 hom 45 17 25 4 GAACA 2 1 326540 CASAVA_Build 21 34287742 2I CAATCTAACC --/CT GGTACTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 27 7 CT 0 1 326541 CASAVA_Build 21 34289152 1D TCAATTTTTT G/- GTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 G 2 1 326542 CASAVA_Build 21 34289424 1D AATCTGATGA T/- TTTCTGTCTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 4 3 326543 CASAVA_Build 21 34294379 1I ATTTGAGGAA -/C TCATAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 C 0 1 326544 CASAVA_Build 21 34302161 1I CATGGTGAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 C 3 4 326545 CASAVA_Build 21 34309128 1D GATGAATAAG T/- GTGTATTAGT 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 T 1 0 326546 CASAVA_Build 21 34311567 1D AAGAAGACAG A/- AAAAAAAAAA 2914 het 2914 ref 31 15 9 7 A 13 12 326547 CASAVA_Build 21 34316585 1D53M1D AAATGTTTTT CTCTTCTGTTTGTTCTGTGTTTCAAGTACTATGTTTCTATCATGATTAAAGTCAT/-TCTTCTGTTTGTTCTGTGTTTCAAGTAATATGTTTCTATCATGATTAAAGTCA- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 12 11 22 N/A 0 0 326548 CASAVA_Build 21 34320882 1D CTATCTATCT A/- ATCTATCTAT 2106 hom 15 het 13 0 6 8 A 2 1 326549 CASAVA_Build 21 34321618 2I CAGACTTATC --/TG TGTTGTTCAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TG 1 2 326550 CASAVA_Build 21 34324667 1I TTTCTGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 14 15 326551 CASAVA_Build 21 34329218 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 19 1 11 7 T 11 10 326552 CASAVA_Build 21 34330856 1I GGGGGAGGGT -/G TGCTCAGCAG 3070 hom 98 het 38 0 31 7 G 0 1 326553 CASAVA_Build 21 34345625 5D AACTAAAAAT AAAAA/----- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 35 21 11 7 A 8 3 326554 CASAVA_Build 21 34347184 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1158 het 315 hom 8 1 3 4 A 16 14 326555 CASAVA_Build 21 34349519 1I GGGCCTGGGG -/C CCAGGAGACA 2572 hom 39 het 21 0 10 11 C 2 3 326556 CASAVA_Build 21 34357242 1D GCTATAACCT C/- CCAAATTTGT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 C 3 2 326557 CASAVA_Build 21 34364561 1D AAAAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 2708 het 2058 hom 22 6 11 5 T 11 10 326558 CASAVA_Build 21 34366285 1I AGTAACCATC -/A GGGGGAAGAG 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 0 1 326559 CASAVA_Build 21 34377163 1I TTAGCAAAAC -/T TTCTTTATTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 3 326560 CASAVA_Build 21 34378446 1I GTCTACCAGG -/A AAGGTGCTTG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 2 3 326561 CASAVA_Build 21 34380984 1D22M2I TGAACTCAAG TTGTAATGGAGAGGTGGAAGAGG--/-TGTAATGGAGAGGTGGAAGAGGGA ATTCTTCATG 3070 hom 132 het 44 0 45 4 N/A 0 0 326562 CASAVA_Build 21 34381442 1I35M1I TTTCCCTTTA -GCCTCTTTAATCTGCATCTCTTGTTGCTTAAAAAA-/GGCCTCTTTAATCTGCATCTCTTGTTGCTTAAAAAAC CCACTGTTGA 3070 hom 190 het 45 0 63 3 N/A 0 0 326563 CASAVA_Build 21 34382373 1I6M1I30M1I TAGATAGAAT -CTATAG-CTGTGATGACTGGGTCAAGTATAGAATACA-/CCTATAGCCTGTGATGACTGGGTCAAGTATAGAATACAC CTTAAGACTT 3070 hom 144 het 46 0 49 12 N/A 0 0 326564 CASAVA_Build 21 34382557 6D TGTATGTGAA GCCTAT/------ GCCTGGGACT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 GCCTAT 1 0 326565 CASAVA_Build 21 34383372 1I GATTTTTGTG -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 62 het 24 0 20 4 T 7 8 326566 CASAVA_Build 21 34385201 1I CAGGTAATTA -/G GTTTTCAGAG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 1 2 326567 CASAVA_Build 21 34386104 1I TGTCTTATAA -/T TTTTACTTGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 4 5 326568 CASAVA_Build 21 34386295 2I GAAGAAAAAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 27 het 16 0 10 6 AT 7 8 326569 CASAVA_Build 21 34386541 1I AATCTAGACA -/C CGACCCACAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 1 2 326570 CASAVA_Build 21 34387408 1I ACTTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 1387 het 1387 ref 35 14 7 14 T 17 18 326571 CASAVA_Build 21 34388911 1I ATTAAAAAAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 8 9 326572 CASAVA_Build 21 34389243 1D AAGACTTTGA C/- CCTGCTGTGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 3 2 326573 CASAVA_Build 21 34389343 1D TGTCATTGGA G/- CGCTATTATT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 G 1 0 326574 CASAVA_Build 21 34391579 1I18M1I GTCTTTGGGG -AAAAAAGTTATGTAACTG-/AAAAAAAGTTATGTAACTGT TGCATCTCTC 3070 hom 148 het 45 0 50 3 N/A 0 0 326575 CASAVA_Build 21 34397485 1I TGAAGGAAGT -/A AAAAAAAAAA 2834 het 2834 ref 45 20 12 13 A 16 17 326576 CASAVA_Build 21 34406596 1I GGATCTTTTC -/G AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 43 15 23 5 G 0 1 326577 CASAVA_Build 21 34408672 1I AAAAAATCTT -/A AGTGTCCAGG 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 1 2 326578 CASAVA_Build 21 34410090 1D TACATAGTCC T/- TTTTTTTTTT 1919 het 1919 ref 45 34 6 5 T 13 12 326579 CASAVA_Build 21 34410785 1I CAGACCCTGG -/C CTACGGATGA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 C 1 2 326580 CASAVA_Build 21 34415953 1D TTTTTCCCCT A/- CTAAGCGTAA 3070 hom 94 het 33 0 32 2 A 1 0 326581 CASAVA_Build 21 34442830 1I TAAGGGACAT -/G GGCTTACAGC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 2 3 326582 CASAVA_Build 21 34443677 1D TTTAGTGCCA T/- TTTTTTTTTT 1267 het 1267 ref 62 50 3 9 T 12 11 326583 CASAVA_Build 21 34450964 4I AAAAAATAAA ----/AAAT AAAAAAATCC 3070 het 2080 hom 23 8 10 5 AAAT 0 1 326584 CASAVA_Build 21 34470266 1D GGTACTGGAA G/- CCAGACAGAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 1 0 326585 CASAVA_Build 21 34472083 2D CAGTCTGTTT CA/-- CAGACCTGAA 3070 het 3070 hom 42 15 22 6 CA 2 1 326586 CASAVA_Build 21 34487130 4I GTGGACACAA ----/ACAC ACACACACTC 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 AC 4 6 326587 CASAVA_Build 21 34491008 2I ATGTTTAAGA --/AT ATATATATAT 2844 het 2140 hom 19 6 8 5 AT 7 8 326588 CASAVA_Build 21 34492676 1D TTTAGCTGCT A/- AAAGGCTGTC 3070 hom 127 het 50 0 42 9 A 4 3 326589 CASAVA_Build 21 34505006 2I ATATATATAT --/AA ATATTTTTGA 3070 het 746 hom 24 3 20 1 A 1 3 326590 CASAVA_Build 21 34520340 1D AGGAATATCT G/- GGGGGGTGGT 3070 hom 126 het 50 0 42 9 G 7 6 326591 CASAVA_Build 21 34524618 2D GGGTGACAAA GT/-- GAGACTCTGT 3070 hom 41 het 15 0 14 1 GT 1 0 326592 CASAVA_Build 21 34524723 1I CTTTTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1158 hom 36 3 25 8 T 10 11 326593 CASAVA_Build 21 34527507 2D GGTCTAACTC TG/-- TGTGTGTGTG 1459 het 1459 ref 46 33 4 9 TG 7 6 326594 CASAVA_Build 21 34528769 1D CAAGACATAG T/- TTTTAAGTGA 3070 hom 99 het 39 0 32 8 T 5 4 326595 CASAVA_Build 21 34532589 1I CCTATATAAC -/A AAATTGCGCA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 3 4 326596 CASAVA_Build 21 34554258 1I GGCCCTTGAG -/A AAACTCTGAG 3070 hom 144 het 56 0 48 8 A 3 4 326597 CASAVA_Build 21 34582717 1I TATAATGGGA -/G GGGCTGCCAT 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 3 4 326598 CASAVA_Build 21 34588077 3I CTGGTTGCAA ---/TTT TAAAAAACTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 1 4 326599 CASAVA_Build 21 34590316 1I AGGAACTGGG -/C CATACAGCAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 2 326600 CASAVA_Build 21 34596469 1I AAATGCTTGG -/T TTTTTTTTTC 2970 hom 52 het 25 0 18 7 T 9 10 326601 CASAVA_Build 21 34597312 1I TGTCCCCAGA -/G GGTACAAAGT 3070 hom 126 het 51 0 40 11 G 2 3 326602 CASAVA_Build 21 34600107 1D CTCCTCCTCC T/- TTTTTTTTTT 1496 het 1496 ref 35 22 4 10 T 13 12 326603 CASAVA_Build 21 34611889 1D ATAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 40 1 32 7 A 13 12 326604 CASAVA_Build 21 34626447 1I ATGAACATCC -/A TTGGTCTCTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 326605 CASAVA_Build 21 34627796 1I AAGCTGCAGG -/C GAGGGAGCTG 3070 hom 105 het 36 0 34 2 C 0 1 326606 CASAVA_Build 21 34635046 1D TGACGGCCAC A/- ACTTTTTTTT 3070 hom 56 het 24 0 17 7 A 2 1 326607 CASAVA_Build 21 34636148 1D TCCATATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 27 2 10 15 A 19 18 326608 CASAVA_Build 21 34636555 1D ACAGGGTGCT C/- CTTCCTGGCC 3070 hom 75 het 28 0 25 5 C 2 1 326609 CASAVA_Build 21 34637373 1I TTTGAGGAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 356 hom 45 1 37 7 T 9 10 326610 CASAVA_Build 21 34649863 1I TGAGACTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 17 2 9 6 A 11 12 326611 CASAVA_Build 21 34649919 20D AGGAAGGAAG GAAAGAAAGAAGGAAAGAAA/-------------------- GAAAGAAAGA 3070 hom 39 het 17 0 13 5 GAAAGAAAGAAGGAAAGAAA 1 0 326612 CASAVA_Build 21 34650539 1I AGCCAGAGGC -/G GTGAGCGGCC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 G 1 2 326613 CASAVA_Build 21 34674406 1I CTGATCCTCA -/G GCTTTCAGCC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 G 1 2 326614 CASAVA_Build 21 34676791 1I GAGGAAGGGG -/T TTCATACCAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 326615 CASAVA_Build 21 34678178 1I AGCTGGGTCA -/G GCCCTGCCTC 3070 hom 94 het 35 0 28 7 G 1 2 326616 CASAVA_Build 21 34678911 1I GGAACTAATA -/T TTGCTTTGAA 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 2 3 326617 CASAVA_Build 21 34681069 1I AAGATTCCCA -/G GCTTCAGCCC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 1 2 326618 CASAVA_Build 21 34681655 1I TTGCTAAGCA -/T TTCATGCACA 3070 hom 159 het 58 0 53 5 T 2 3 326619 CASAVA_Build 21 34683918 1D CTCCCACTTC T/- TCGCAAGACC 3070 hom 126 het 51 0 39 13 T 2 1 326620 CASAVA_Build 21 34684075 1I GTGTCGAACA -/T TGCGTTTTCC 3070 hom 125 het 46 0 41 5 T 1 2 326621 CASAVA_Build 21 34697111 7I AGATGCCACA -------/TGTTCTC TGTTCTCACC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 TGTTCTC 1 2 326622 CASAVA_Build 21 34697408 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 24 11 11 4 A 7 8 326623 CASAVA_Build 21 34697544 1I CTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 9 10 326624 CASAVA_Build 21 34698000 4D TTGATATTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 14 4 T 14 10 326625 CASAVA_Build 21 34699143 4I ACTGCTCAGG ----/CAGA CAGACACCTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 CAGA 1 2 326626 CASAVA_Build 21 34712182 1I TTCTTAAAAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 7 8 326627 CASAVA_Build 21 34717278 4I CATTTGATCG ----/TTGT TTGTTTGTTG 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 TTGT 2 3 326628 CASAVA_Build 21 34722904 1D GACGCTGTTG A/- AACACCGGCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 3 2 326629 CASAVA_Build 21 34725621 1I AATAAACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 11 12 326630 CASAVA_Build 21 34739283 1D CTTCTTTCTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2468 hom 18 7 8 3 T 9 8 326631 CASAVA_Build 21 34741866 1I GCTGGGGCAG -/C CCCTCCGGGT 3070 hom 82 het 33 0 26 7 C 3 4 326632 CASAVA_Build 21 34757401 1I TTTTGTTGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 9 10 326633 CASAVA_Build 21 34763199 4I GATAAAAGAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 128 het 48 0 43 5 AAAC 4 5 326634 CASAVA_Build 21 34770010 1D GTGATACGGG A/- ACTTGTATCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 1 326635 CASAVA_Build 21 34786977 1I ACATTTCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 T 9 10 326636 CASAVA_Build 21 34802202 1D TGTTGGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 11 10 326637 CASAVA_Build 21 34821493 4D CCTGAAAACC TCAA/---- TCAAAGTTTC 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 TCAA 2 1 326638 CASAVA_Build 21 34823124 1D ATATGGATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2825 hom 32 11 10 11 A 13 12 326639 CASAVA_Build 21 34828386 1I TCTCCAACCA -/T GTGTCCATAC 3070 hom 108 het 44 0 32 12 T 0 1 326640 CASAVA_Build 21 34836600 1I CCCATGAAGA -/G GCCCATACAG 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 1 2 326641 CASAVA_Build 21 34836726 1D CGCCAGCCAA G/- GGAAACCCAG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 3 2 326642 CASAVA_Build 21 34845960 1I TGGGCTGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 10 11 326643 CASAVA_Build 21 34853583 1I ACAGCACTTC -/T TTTAACTTTC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 3 4 326644 CASAVA_Build 21 34875347 1D CTCTAATAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 39 0 29 11 T 10 9 326645 CASAVA_Build 21 34877347 1D CGATAGGGCC T/- TTTTTTTTTT 2061 het 760 hom 27 6 10 11 T 19 18 326646 CASAVA_Build 21 34880557 1D CAATAACATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 104 het 39 0 35 4 A 10 9 326647 CASAVA_Build 21 34884373 1I CCCTCCAGGG -/C CCCATCAGCA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 C 3 4 326648 CASAVA_Build 21 34889396 1D TCTAGTAACT G/- GGCACAGAGT 3070 hom 102 het 41 0 35 8 G 3 2 326649 CASAVA_Build 21 34897525 8I29M1I ATATTACCGG --------GTTCCAGCTGGCTTGGACTCCCGAAGTCC-/GTACCCCTGTTCCAGCTGGCTTGGACTCCCGAAGTCCT CCCGGTTTGT 3070 hom 75 het 22 0 24 3 N/A 0 0 326650 CASAVA_Build 21 34901360 1D GAAATATGGT G/- GGGTAACTGC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 4 3 326651 CASAVA_Build 21 34931835 2I AGACAGAAAC --/TG TATTTCCCAG 3070 hom 120 het 41 0 37 4 TG 0 1 326652 CASAVA_Build 21 34940172 2I TCTCCTGCCT --/CA GTCTCCTGAG 3070 het 2180 hom 21 6 12 3 CA 0 1 326653 CASAVA_Build 21 34961079 1I TCCAACCACA -/C CCCCCCCCCA 3070 het 583 hom 35 3 24 8 C 9 10 326654 CASAVA_Build 21 34970188 1D CAGGCCATGT G/- GCTTCATGAG 3070 hom 102 het 39 0 35 6 G 2 1 326655 CASAVA_Build 21 34970461 1D CCATGCTTGA G/- GGCTCAGAGG 3070 hom 87 het 32 0 30 3 G 3 2 326656 CASAVA_Build 21 34972317 1I GAAAAAGTTT -/A CTGGCTGGGT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 0 1 326657 CASAVA_Build 21 34974002 2D TGGGCCCCCA TG/-- TGGCCTTGGA 3070 hom 96 het 38 0 31 7 TG 2 1 326658 CASAVA_Build 21 34990674 1I AATGAGAGAA -/T GGATCCTAGC 3070 hom 140 het 58 0 48 10 T 0 1 326659 CASAVA_Build 21 34998002 1I TTCGGAATGT -/G GTGTCAGAGG 3070 hom 105 het 43 0 34 9 G 1 2 326660 CASAVA_Build 21 35008868 1I AACAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 29 1 23 5 C 0 1 326661 CASAVA_Build 21 35027591 1I AGGAGAAGGA -/C CCGTTTTCTA 3070 hom 88 het 35 0 27 8 C 2 3 326662 CASAVA_Build 21 35029666 1I GTTGTCTCCA -/C CTTACAGGTG 3070 hom 154 het 62 0 49 13 C 1 2 326663 CASAVA_Build 21 35038476 1I TGGCCATAGG -/C CCTTTTCCCA 3070 hom 104 het 41 0 30 11 C 2 3 326664 CASAVA_Build 21 35041591 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1543 het 1244 hom 16 5 5 6 A 15 14 326665 CASAVA_Build 21 35053558 1D TTGAACTGTA T/- TTTTTTAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 6 326666 CASAVA_Build 21 35057802 1I AAACAGTAGA -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 7 8 326667 CASAVA_Build 21 35058644 6I TTTACTCTGA ------/TCTCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 47 het 23 0 16 7 TC 6 9 326668 CASAVA_Build 21 35059553 2D GTCAAGAGAC AT/-- ATATGTACAG 3070 hom 181 het 66 0 61 7 AT 3 2 326669 CASAVA_Build 21 35059692 1I AGACCTGCAA -/G GTGTGTGAGG 3070 hom 151 het 59 0 51 8 G 1 2 326670 CASAVA_Build 21 35096148 1I CACCTCCGAA -/G GGAGGTGATC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 2 3 326671 CASAVA_Build 21 35126252 1I CAAGCCCGTA -/G GGAACTCTAA 3070 hom 96 het 37 0 31 6 G 2 3 326672 CASAVA_Build 21 35134791 1I AGACACCTGG -/C CTGCGGGAGC 3070 hom 93 het 36 0 27 9 C 1 2 326673 CASAVA_Build 21 35138754 4D AATAAATGAA TGAG/---- TGAGTGAGTG 3070 het 3070 ref 54 28 19 10 TGAG 3 2 326674 CASAVA_Build 21 35140774 1I GACTGAGCTA -/G GCAGGGCCAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 2 326675 CASAVA_Build 21 35141642 3D CATGCAAAAC AAT/--- AATAGATTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AAT 2 1 326676 CASAVA_Build 21 35147983 1I CCTTCCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 36 2 23 11 T 15 16 326677 CASAVA_Build 21 35159676 14D CGCCAGTGTG TCCATCCAAATGCC/-------------- AGGGCAAAAT 2357 het 2357 ref 28 21 8 7 TCCATCCAAATGCC 1 0 326678 CASAVA_Build 21 35168291 4D ATATTCTCAT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 TC 11 9 326679 CASAVA_Build 21 35168567 3D ACCCGAGATC AGG/--- AGTTCAAGAC 3070 het 3070 ref 26 11 9 7 AGG 1 0 326680 CASAVA_Build 21 35168845 1D ATTTTTCCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2816 hom 25 9 11 5 A 10 9 326681 CASAVA_Build 21 35171022 7D CTAAAATTTC TTTTTCT/------- TTTTTCTTTT 3070 het 2761 hom 21 7 7 7 TTTTTCT 2 1 326682 CASAVA_Build 21 35185875 3I ATGCAAAATT ---/TAA AAAAAAAAAA 2012 het 2012 ref 33 11 9 13 TAA 0 1 326683 CASAVA_Build 21 35187938 1D TAGTATGCTG T/- TTTTTTTTTT 2750 het 2151 hom 25 11 10 4 T 13 12 326684 CASAVA_Build 21 35190140 7I GATCTGGATT -------/AAGGTAG AAGCAATGGA 3070 het 2040 hom 21 6 11 4 AAGGTAG 0 1 326685 CASAVA_Build 21 35190853 5I CTGTCTCATA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 3070 het 2500 hom 21 6 12 4 AAAAG 3 4 326686 CASAVA_Build 21 35203840 1I TCTGGAAGAC -/T TGCCTTAGGC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 1 2 326687 CASAVA_Build 21 35204551 1D TTCAGAACTG T/- TTTTTTTTTT 660 het 660 ref 42 23 2 17 T 12 11 326688 CASAVA_Build 21 35204599 1D GGGAACTAAG A/- AACAAATGAA 3070 hom 71 het 28 0 23 5 A 3 2 326689 CASAVA_Build 21 35214956 1I TTTTTTCATG -/T TTTTTTCTAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 6 7 326690 CASAVA_Build 21 35215803 1D GACATAATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 41 het 44 2 37 6 T 10 9 326691 CASAVA_Build 21 35218258 1D CAGTGACCCA C/- CCCCCGCCAT 3070 hom 97 het 38 0 30 9 C 6 5 326692 CASAVA_Build 21 35221013 3D TCCCTAAAGA CAT/--- CAGCACCTTA 3070 het 3070 hom 52 20 29 4 CAT 1 0 326693 CASAVA_Build 21 35223129 1D GATTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 1534 hom 34 8 16 10 G 11 10 326694 CASAVA_Build 21 35256749 1I TGTTTGTGTG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 48 24 15 9 T 6 7 326695 CASAVA_Build 21 35259678 1D GAAACAAAAG A/- AAAAAACACG 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 A 7 6 326696 CASAVA_Build 21 35276693 4I TTTATGTTTT ----/AAAA ATATAGCCTC 3070 hom 72 het 27 0 25 4 A 1 5 326697 CASAVA_Build 21 35278604 2D ATAGAACTAT AC/-- ACAGTCTTCC 3070 het 3070 ref 32 21 9 3 AC 2 1 326698 CASAVA_Build 21 35295455 1D TTGGCCTATT A/- TTTTTTTTGA 3070 hom 42 het 26 0 14 13 A 1 0 326699 CASAVA_Build 21 35297697 2D TTTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 57 het 40 0 31 9 TA 1 0 326700 CASAVA_Build 21 35330790 1D ATTATCATGA T/- GTCAGAGGAC 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 T 1 0 326701 CASAVA_Build 21 35335828 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2591 het 23 hom 20 1 12 7 T 17 16 326702 CASAVA_Build 21 35354432 1D CACTTGTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 11 10 326703 CASAVA_Build 21 35358957 1D CTGCTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 38 0 32 6 T 12 11 326704 CASAVA_Build 21 35371244 4D TTTCTATAGA TTCT/---- TTCTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 7 TTCT 2 1 326705 CASAVA_Build 21 35373906 1D ATCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1907 hom 21 het 12 0 8 4 T 15 14 326706 CASAVA_Build 21 35391585 1D ATTTTAGTGA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 T 7 6 326707 CASAVA_Build 21 35398207 20D TTATCTTATC ACCCAGGTATTAAGCCTACT/-------------------- ACCCAACAGT 3070 het 3070 ref 23 17 9 1 ACCCAGGTATTAAGCCTACT 1 0 326708 CASAVA_Build 21 35410614 2D ATACATATAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 1653 hom 24 6 12 7 GT 7 6 326709 CASAVA_Build 21 35420608 2D GAAAATATGG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 46 23 16 8 TA 7 6 326710 CASAVA_Build 21 35424681 1I CATACCATGA -/C CCAAAAACCC 3070 het 3070 ref 51 29 16 6 C 2 3 326711 CASAVA_Build 21 35427782 5I CCTAACACTA -----/CGTCT CGTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 20 11 CGTCT 1 2 326712 CASAVA_Build 21 35433619 1D AATGGAACGG A/- AAAAAAAAAA 2478 het 2478 ref 43 22 7 14 A 15 14 326713 CASAVA_Build 21 35510105 1I TCTAAACTTG -/C CCCTACAGTG 3070 hom 135 het 49 0 44 5 C 3 4 326714 CASAVA_Build 21 35535035 1D GCAGAACAAA G/- GATTGTCACG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 G 2 1 326715 CASAVA_Build 21 35535588 1D TTCTCAATAG C/- AGCCTTAAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 1 0 326716 CASAVA_Build 21 35560535 1I TGTTACCACC -/A AGAAAAAAAA 3070 het 1878 hom 49 10 25 14 A 1 2 326717 CASAVA_Build 21 35577770 1D AATACCTCAG A/- AACTTGAGTA 3070 hom 138 het 49 0 45 5 A 3 2 326718 CASAVA_Build 21 35588107 1I CTTCTCCAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 384 hom 47 1 38 8 A 9 10 326719 CASAVA_Build 21 35592048 2D TCTCACTCTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 56 27 22 9 AC 6 5 326720 CASAVA_Build 21 35594109 2D ATACTTCTTA TT/-- CTCTATGATT 3070 het 3070 hom 38 17 21 1 T 2 0 326721 CASAVA_Build 21 35594216 2D TAGAATAGAG TC/-- TGATAGAAAA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 TC 1 0 326722 CASAVA_Build 21 35599299 4D CTCCAAAATT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 499 hom 43 3 17 25 TG 9 7 326723 CASAVA_Build 21 35604781 1D GCATACTTTC T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 T 2 1 326724 CASAVA_Build 21 35608557 1I TCAATTGATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 A 9 10 326725 CASAVA_Build 21 35613894 14D AAAAGCAGAA GCAGGGAGTTCCGC/-------------- AAGCAACCTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 6 GCAGGGAGTTCCGC 1 0 326726 CASAVA_Build 21 35616469 1D CAGAGAAGAC T/- CAAGAACGTT 3070 het 3070 hom 48 22 21 7 T 1 0 326727 CASAVA_Build 21 35631139 1D GGGTGGGGTG C/- AATGGCGCGG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 C 1 0 326728 CASAVA_Build 21 35632620 21D TTAAAGAACA CTCAAGATAACTCATGTTATC/--------------------- TCATGGTGAG 3070 het 3070 ref 33 22 15 6 CTCAAGATAACTCATGTTATC 1 0 326729 CASAVA_Build 21 35632787 1D CCCCCAAGGA G/- CAAAAAGCGT 3070 het 3070 hom 33 8 23 4 G 1 0 326730 CASAVA_Build 21 35636851 6D GTGAAGCGCT ATGCAA/------ ATGCAATCAG 3070 het 3070 hom 47 20 18 11 ATGCAA 2 1 326731 CASAVA_Build 21 35643951 1D TACAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 2790 het 2790 ref 56 37 8 12 A 13 12 326732 CASAVA_Build 21 35649151 4I TTCTCATGGT ----/AGTG AGTAAGTCTC 3070 het 3070 hom 39 12 26 1 AGTG 0 1 326733 CASAVA_Build 21 35660147 2D GTATAAAAAA AC/-- AGTTTTCATT 3070 het 3070 ref 28 17 11 0 AC 1 0 326734 CASAVA_Build 21 35676709 1I ACTCTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 2140 het 2140 ref 31 13 7 11 A 15 16 326735 CASAVA_Build 21 35678274 4D ACACTAGAGA TAAG/---- TTTTTCGTGG 3070 het 3070 ref 36 16 15 8 TAAG 1 0 326736 CASAVA_Build 21 35680119 1I CCGTCCCCCC -/A AAAAAAAAAA 2761 het 2761 ref 23 14 6 3 A 11 12 326737 CASAVA_Build 21 35681606 13D TTCATATTTA ATAAAATGATTGT/------------- ATAAAATGAT 3070 hom 81 het 35 0 28 11 ATAAAATGATTGT 2 1 326738 CASAVA_Build 21 35701336 1D ACTGATGGGG A/- AAAAAAACTC 3070 hom 85 het 32 0 29 4 A 8 7 326739 CASAVA_Build 21 35701649 5D TCTAAGCACT TGCAC/----- TGCACTAATT 3070 het 3070 ref 51 28 21 4 TGCAC 2 1 326740 CASAVA_Build 21 35704248 1I GGCTTCACTT -/C CCCACATAGA 3070 hom 96 het 42 0 30 12 C 3 4 326741 CASAVA_Build 21 35707716 1I AGGGAACACC -/A AAAACAGTAA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 A 4 5 326742 CASAVA_Build 21 35720415 1I AGTTGAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 528 hom 34 4 20 10 A 13 14 326743 CASAVA_Build 21 35725498 1D TCTACGCATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 10 9 326744 CASAVA_Build 21 35732383 1I GGCTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 11 12 326745 CASAVA_Build 21 35738776 4D CTTTCTCCTC TCTT/---- TCTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 TCTT 2 1 326746 CASAVA_Build 21 35753893 5I CACCATAAAC -----/AAAAT AAAAGGACAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAAAT 0 1 326747 CASAVA_Build 21 35760776 1D TATCCTGAGG C/- CCCCCCCACA 3070 hom 89 het 38 0 24 14 C 8 7 326748 CASAVA_Build 21 35767183 6D TCTTCCTCCA TCTCCC/------ TCTCCCTCTC 3070 het 3070 hom 35 14 14 9 TCTCCC 2 1 326749 CASAVA_Build 21 35784986 1I ATTACACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1003 hom 50 3 42 5 A 10 11 326750 CASAVA_Build 21 35799402 1D AGGGACCCAC A/- AGCCCCACAG 2927 het 2927 ref 29 12 10 7 A 2 1 326751 CASAVA_Build 21 35824481 1I TTCAAACACA -/G GGTCTTCCCT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 G 2 3 326752 CASAVA_Build 21 35839257 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAGAAGAA 3070 het 462 hom 25 4 16 5 A 5 4 326753 CASAVA_Build 21 35839552 1I TTTCTGCATA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 7 8 326754 CASAVA_Build 21 35839674 1D CTGCTCTTGG C/- CCCGACTCCT 3070 hom 90 het 31 0 31 1 C 4 3 326755 CASAVA_Build 21 35843022 14I TCTGCAGAGG --------------/GTAGCTGGGCTAAA GTAGACTGTT 3070 hom 144 het 54 0 49 6 GTAGCTGGGCTAAA 0 1 326756 CASAVA_Build 21 35845191 19D27M1D ACATCACGAA ACATTTTTATTTTGTGCACGAAGGAAGAATTGCTTCATACAGTGGTA/-------------------GAAGGAAGAATTGCTTCATACAGTGGT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 17 N/A 0 0 326757 CASAVA_Build 21 35846468 4D ACTAAAATTC TGTT/---- TGTTGTTTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TGTT 2 1 326758 CASAVA_Build 21 35847200 1D ATTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 33 1 27 5 A 12 11 326759 CASAVA_Build 21 35850111 1I GGCACCATTT -/G GGGGGTCTCA 3070 hom 91 het 41 0 29 12 G 5 6 326760 CASAVA_Build 21 35859987 2I TAGGCAGGCT --/GG GATCAAGGAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 3 326761 CASAVA_Build 21 35929922 4D AAGTGAAAGA AGAC/---- AGGCCCAGAA 3070 het 3070 hom 34 12 20 3 AGAC 1 0 326762 CASAVA_Build 21 35949403 1D GGACCCTGGT A/- ACACAGTGTG 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 2 1 326763 CASAVA_Build 21 35968986 1D CTAATTTTTG T/- TATGTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 22 8 T 2 1 326764 CASAVA_Build 21 35972595 16D GGTTGGATGG ACAGATGGATGGATGA/---------------- ACAGATGGAT 3070 hom 128 het 48 0 41 12 ACAGATGGATGGATGA 1 0 326765 CASAVA_Build 21 35974294 3I GCATACCATC ---/ATG ATATTAGAGA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 ATG 0 1 326766 CASAVA_Build 21 35981116 1I CATCACAGAT -/A TCCAGAATCT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 0 1 326767 CASAVA_Build 21 36004082 2I AGTTTATTAC --/AT AGGTACACAC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AT 0 1 326768 CASAVA_Build 21 36005828 1D TTGGTGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 39 0 31 10 A 19 18 326769 CASAVA_Build 21 36030724 1D TGACTTTTCC A/- AAAAAATAAC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 7 6 326770 CASAVA_Build 21 36045990 4I ATAAACACAG ----/TATC TATCTATCTC 3070 hom 138 het 56 0 47 9 TATC 2 3 326771 CASAVA_Build 21 36059417 1I ATGCACCAGC -/T TTTAGAGTCT 3070 hom 93 het 37 0 30 7 T 3 4 326772 CASAVA_Build 21 36073475 1D GTCTGCTGTT C/- CTGATTTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 12 7 C 2 1 326773 CASAVA_Build 21 36088364 1D GGTTTGTTAC A/- TAAGTATACG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 A 1 0 326774 CASAVA_Build 21 36097846 1D CCACAAAATG A/- GCCTTAATAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 A 1 0 326775 CASAVA_Build 21 36101563 4D TTCAGAGAGA ACAG/---- ACAGGACCCT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 ACAG 2 1 326776 CASAVA_Build 21 36110397 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 9 10 326777 CASAVA_Build 21 36134891 1I CACTAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 2990 het 301 hom 26 4 12 10 T 16 17 326778 CASAVA_Build 21 36203630 6D7M3I ACAAACCCAA AAACATATGTTTT---/------ATGTTTTGGG TGGGACAAAC 2792 het 2792 ref 26 16 8 12 N/A 0 0 326779 CASAVA_Build 21 36211950 1D ATTCATAAGG A/- AAAAAAATGT 1634 het 552 hom 17 2 4 11 A 8 7 326780 CASAVA_Build 21 36217615 1D TGGAAGGCCA C/- CTTTGGAAGC 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 C 2 1 326781 CASAVA_Build 21 36220425 4D TTAATATTAA ATTT/---- ATTTATTTAT 1461 het 297 hom 4 1 3 0 ATTT 3 2 326782 CASAVA_Build 21 36221246 8D CAATGATTGC ACCACTCT/-------- ACTCCAGCCT 3070 het 3070 ref 29 20 9 6 ACCACTCT 1 0 326783 CASAVA_Build 21 36221554 2D CCACTGCAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 21 21 12 A 12 10 326784 CASAVA_Build 21 36230076 2D GGTGGATCAC TT/-- GAGGTCAAGA 3070 het 2024 hom 23 6 10 7 T 2 0 326785 CASAVA_Build 21 36231010 1D AACTTTTCCC T/- TGTGAATTGT 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 T 2 1 326786 CASAVA_Build 21 36235245 3D CAGTCCCAAC ATT/--- AGGCTCACAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 ATT 1 0 326787 CASAVA_Build 21 36237509 2I TTTTATTCTG --/AA AAGAGCTTTG 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 A 2 4 326788 CASAVA_Build 21 36237821 3D TCAACAAGAG AGA/--- AGAACTCTAA 3070 het 3070 hom 48 19 21 9 AGA 2 1 326789 CASAVA_Build 21 36238016 2D TGTAGAGAAG GT/-- GGCAAAGCAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 6 GT 1 0 326790 CASAVA_Build 21 36240399 4D AGGGGGGGAC AGAG/---- AGAGAGAGAA 3070 hom 54 het 23 0 18 10 AG 6 4 326791 CASAVA_Build 21 36241429 3I GTGCCGTGGA ---/AAG AAGGGATATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AAG 1 2 326792 CASAVA_Build 21 36243854 4D TGAATGAATG AATA/---- AATAAATAAA 2025 hom 33 het 40 0 12 30 AATA 3 2 326793 CASAVA_Build 21 36243885 2I ATTTAAAAAA --/AC AATCAAATCT 3070 hom 54 het 41 0 19 22 AC 0 1 326794 CASAVA_Build 21 36244152 1I TGTTTCTTAG -/A AAAAATGTTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 5 6 326795 CASAVA_Build 21 36246479 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2958 hom 25 9 11 5 A 14 15 326796 CASAVA_Build 21 36247622 1I AGCTTCCTGC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 9 10 326797 CASAVA_Build 21 36250225 1I AGAATAATTG -/A AGCTGATTAG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 1 2 326798 CASAVA_Build 21 36253432 1D CCAGAAAACA C/- CCTGCCCTAA 3070 het 3070 ref 44 25 13 7 C 3 2 326799 CASAVA_Build 21 36254001 2I15M4D CCTGAGCAAC --AGTGAGACGCCTCTCAAAT/AGAGTGAGACGCCTCTC---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 25 12 14 3 N/A 0 0 326800 CASAVA_Build 21 36256299 2D TCCCTTTACC CA/-- CACTCTCAAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 CA 2 1 326801 CASAVA_Build 21 36259564 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 2502 het 987 hom 24 10 8 6 AAG 5 4 326802 CASAVA_Build 21 36260618 1I CTCCAGTGTC -/T TGATAAGTCA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 1 2 326803 CASAVA_Build 21 36265365 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2937 het 1673 hom 17 5 9 3 A 14 12 326804 CASAVA_Build 21 36269880 1D TCATTTCGGC G/- GCAGCCTTTC 3070 het 3070 hom 39 13 24 2 G 2 1 326805 CASAVA_Build 21 36270138 4D GAATGAAAAT AATG/---- AATGAATGAA 3070 het 3070 ref 44 17 12 18 AATG 6 5 326806 CASAVA_Build 21 36281527 2D GCATTTTGAA AG/-- ACTCATTGAC 3070 het 3070 hom 32 15 13 5 AG 1 0 326807 CASAVA_Build 21 36287660 3D54M2I CTCTCACACA CACAACTCACACCTCAACTCACACCCCAACTCATATACACCCCAACTCACACACACA--/---AACTCACACCTCAACTCACACCCCAACTCATATACACCCCAACTCACACACACACT CTCACATACC 3070 het 159 hom 29 3 15 23 N/A 0 0 326808 CASAVA_Build 21 36287941 2I CATTCCAACT --/CA CACACACACC 3070 hom 128 het 56 0 40 16 CA 4 5 326809 CASAVA_Build 21 36288093 2D CACACCTCAA CT/-- CTCACACACA 3070 het 3070 ref 57 26 22 9 CT 2 1 326810 CASAVA_Build 21 36288453 2I CACTCCAGCT --/CA CACACACCCC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 CA 3 4 326811 CASAVA_Build 21 36292827 8I GGTGCCCGTT --------/CAGCTAGC CAGCCCCCCA 3070 hom 100 het 41 0 28 13 CAGCTAGC 0 1 326812 CASAVA_Build 21 36302034 6D AATGATTTAC TTTTTA/------ TTTTTAAACT 3070 het 3070 ref 33 19 13 7 TTTTTA 2 1 326813 CASAVA_Build 21 36305829 1D ATGTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 2435 het 749 hom 24 2 9 13 T 15 14 326814 CASAVA_Build 21 36316144 1D AATTTAAAAT G/- GTTAAAATAG 3070 het 3070 hom 30 12 17 2 G 2 1 326815 CASAVA_Build 21 36316501 1D CCGGCTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1114 hom 18 4 8 7 A 11 10 326816 CASAVA_Build 21 36316561 10D CCTGGTATAG AGTTTTCTAT/---------- AACATCAAAG 3070 het 3070 hom 26 13 12 4 AGTTTTCTAT 1 0 326817 CASAVA_Build 21 36330479 4D ATTTCACAGA ACGT/---- ACGTACCTTT 3070 hom 75 het 29 0 25 5 ACGT 2 1 326818 CASAVA_Build 21 36331458 4I CTATAAATAT ----/ATAC ATACAATTTT 3025 het 3025 ref 31 19 7 6 ATAC 1 2 326819 CASAVA_Build 21 36337637 3D AGTGCCAGTG ACA/--- ACGTCTCAGT 3070 het 3070 ref 36 21 14 2 ACA 1 0 326820 CASAVA_Build 21 36346236 1I TAACACGGCG -/T TAATAGAATT 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 T 1 2 326821 CASAVA_Build 21 36356475 4D GCCATTCCAG GAAA/---- GAGTTAAGTC 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 GAAA 1 0 326822 CASAVA_Build 21 36357476 1D GCCGGGTGCT G/- GGGGCAGAGG 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 G 5 4 326823 CASAVA_Build 21 36359504 1I TCGAGACCAG -/C CCTGGCCAAC 2878 het 2878 ref 17 8 7 2 C 2 3 326824 CASAVA_Build 21 36365026 2I ACTAAGTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 37 2 24 11 TG 0 1 326825 CASAVA_Build 21 36370914 1I AAGACTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 23 1 17 5 A 11 12 326826 CASAVA_Build 21 36375303 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 18 10 A 13 12 326827 CASAVA_Build 21 36375878 6D TAATTTTGTA TTGTTT/------ TTAAGTAGAG 3070 hom 60 het 21 0 21 0 TTGTTT 1 0 326828 CASAVA_Build 21 36378530 1D CACAAATCCA G/- GAGGCAGTCC 3070 hom 106 het 43 0 35 9 G 2 1 326829 CASAVA_Build 21 36379351 2D CCATAGTCCC CA/-- CCCCCCCCGA 3070 hom 68 het 24 0 19 6 CA 1 0 326830 CASAVA_Build 21 36392442 1I AATTTTGAAG -/A AAAAGTGGCT 2825 het 2825 ref 30 19 7 4 A 4 5 326831 CASAVA_Build 21 36419036 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 10 11 326832 CASAVA_Build 21 36423367 2I GAGCCACAGG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 9 11 326833 CASAVA_Build 21 36430477 1I ACTCCGTATG -/A AAAAAAAAAA 2126 het 2001 hom 21 7 7 7 A 14 15 326834 CASAVA_Build 21 36449235 2D TGAAGAACCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2841 hom 31 13 9 9 A 14 12 326835 CASAVA_Build 21 36454300 6D TTCTGGAAAA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 3070 hom 40 16 22 4 AAT 7 5 326836 CASAVA_Build 21 36468036 1D AAAGCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 A 14 13 326837 CASAVA_Build 21 36472156 4D AAATTCTCCC AAGA/---- AAGTTAGGAG 3070 het 3070 hom 39 19 17 4 AAGA 1 0 326838 CASAVA_Build 21 36476002 9I TCACCTTCCA ---------/CGCACTGAT TTTAATGGAA 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 CGCACTGAT 0 1 326839 CASAVA_Build 21 36479347 7D GATACTATGT TATTTTA/------- TATTTTTAAT 3070 het 3070 ref 37 21 14 6 TATTTTA 1 0 326840 CASAVA_Build 21 36480586 2D TGTGTAGAGG GT/-- GTGTGTGTGT 1810 het 1810 ref 68 48 4 18 GT 6 5 326841 CASAVA_Build 21 36484564 2D AGTTCATCTC TT/-- TCTTTTTTTT 3070 het 1483 hom 19 7 10 2 T 3 1 326842 CASAVA_Build 21 36485424 2D AACAAGTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 707 hom 40 10 20 10 A 13 11 326843 CASAVA_Build 21 36487032 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTAGTG 1525 het 1525 ref 11 6 5 0 T 7 6 326844 CASAVA_Build 21 36488655 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 2172 hom 54 het 24 0 16 8 C 1 0 326845 CASAVA_Build 21 36500179 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 17 6 A 12 11 326846 CASAVA_Build 21 36500698 1I ACCCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2038 het 893 hom 23 4 8 11 A 16 17 326847 CASAVA_Build 21 36529035 1I GACATGTAAT -/A ATTGTATATA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 1 2 326848 CASAVA_Build 21 36537150 2D TCTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1196 het 220 hom 19 5 5 9 T 16 14 326849 CASAVA_Build 21 36537836 1I TGCTGCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 22 9 T 10 11 326850 CASAVA_Build 21 36541802 1I AAAAGGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 151 hom 36 1 23 12 T 11 12 326851 CASAVA_Build 21 36543824 3I TATAGTTTAG ---/TCT TCTTTGGTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 TCT 1 2 326852 CASAVA_Build 21 36546344 1D GTCCCTATCT A/- AAAAAAAAAA 2904 het 2904 ref 26 12 8 6 A 12 11 326853 CASAVA_Build 21 36548902 13I CAGGGGTCTC -------------/TCTGCAGGTGTTG GCAGGAACAA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 TCTGCAGGTGTTG 0 1 326854 CASAVA_Build 21 36549968 3D CTCTGAGAAA GAG/--- GAGATTTCAT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 GAG 2 1 326855 CASAVA_Build 21 36550931 1D TTCTATATCT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 G 2 1 326856 CASAVA_Build 21 36554328 1D TTGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 12 11 326857 CASAVA_Build 21 36554431 16D AGGAAGGAAG GAAGGAAAGAAAGAAA/---------------- GAAAGAAAGA 3070 het 556 hom 20 5 13 5 GAAGGAAAGAAAGAAA 1 0 326858 CASAVA_Build 21 36560034 2D GTAACCAAAA TG/-- TGTGGGAATT 3070 het 3070 hom 40 15 19 7 TG 3 2 326859 CASAVA_Build 21 36563863 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 351 hom 16 2 11 3 T 8 9 326860 CASAVA_Build 21 36568340 1D GTCAAACTTT A/- AAAACCATCA 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 A 5 4 326861 CASAVA_Build 21 36569126 2D3M3D AATTCTTCTG CCTCAGCC/--TAA--- TCCCAAGTAG 3070 het 1772 hom 18 5 13 1 N/A 0 0 326862 CASAVA_Build 21 36570250 1D ATGGTTAGAA G/- AGAAGAAGGC 2887 het 2887 ref 36 22 9 5 G 1 0 326863 CASAVA_Build 21 36573968 1I GTTATAAATG -/A AAAAGCTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 4 5 326864 CASAVA_Build 21 36577594 2I GCGTTGACTC --/TT GTTAGTCATG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 T 0 2 326865 CASAVA_Build 21 36587374 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 23 1 14 9 A 15 14 326866 CASAVA_Build 21 36599202 1I CCTGGGTGAC -/A AGAGTGAGAC 3070 het 2098 hom 22 7 13 2 A 1 2 326867 CASAVA_Build 21 36625781 4I AAAAAACAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 AAAC 2 3 326868 CASAVA_Build 21 36634807 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1121 hom 21 4 9 8 T 14 15 326869 CASAVA_Build 21 36637262 1D AATATCAAGG T/- TTTTTTGTTT 1267 het 1267 ref 8 4 4 0 T 7 6 326870 CASAVA_Build 21 36650763 5I GAATTTTTTC -----/TTGAA TTGATTTTAT 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 TTGAA 0 1 326871 CASAVA_Build 21 36654699 1D TTAGTGAATA C/- CCCCCCCATT 3070 hom 114 het 43 0 37 6 C 8 7 326872 CASAVA_Build 21 36665615 1I CTAACCTGCC -/T TTAAAGTGCT 3070 het 3070 ref 63 27 26 10 T 2 3 326873 CASAVA_Build 21 36676707 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2838 het 1485 hom 25 8 8 9 T 19 18 326874 CASAVA_Build 21 36676785 9I TTGGCTCACT ---------/GCAACCTCC GCCCTCTGGG 3070 het 2405 hom 18 5 10 3 GCAACCTCC 0 1 326875 CASAVA_Build 21 36699211 5D GAGCCACTGC GCCCA/----- GCCCCAGTAG 3070 hom 45 het 17 0 16 3 GCCCA 1 0 326876 CASAVA_Build 21 36717159 1I GGGGAGTACT -/G CCGTCCAGGC 3070 hom 75 het 27 0 23 4 G 0 1 326877 CASAVA_Build 21 36731082 2D ATACACACAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AT 5 4 326878 CASAVA_Build 21 36734350 2D CCAACCTCTC AT/-- GTGTTAATTC 3070 het 3070 ref 19 9 8 4 AT 1 0 326879 CASAVA_Build 21 36754446 1I CTGACTCTTG -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 26 12 7 7 T 7 8 326880 CASAVA_Build 21 36757055 1D CACTGCACTT C/- ATCCTGGGCG 2124 het 2124 ref 13 6 5 2 C 1 0 326881 CASAVA_Build 21 36762790 2D AAATAAACTC AG/-- GGGAGATTTG 3070 het 3070 ref 39 22 14 6 AG 1 0 326882 CASAVA_Build 21 36763483 2D TATTCCAAAC TT/-- TCTGTAACTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 3 1 326883 CASAVA_Build 21 36765388 1I AACAAACAAA -/C CATAAAAACA 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 C 1 2 326884 CASAVA_Build 21 36766012 3I TGGTTAAAAT ---/GTG GTGTCAAATG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 GTG 1 2 326885 CASAVA_Build 21 36777459 1D GCTGGGTTCA G/- GAGGCCCTGA 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 G 2 1 326886 CASAVA_Build 21 36779713 2D ACGGATCACT TC/-- TGTCACCAGC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 TC 1 0 326887 CASAVA_Build 21 36781537 4D TTCTGCACAT ACTC/---- ACTGTTGTCC 3070 hom 87 het 32 0 29 4 ACTC 1 0 326888 CASAVA_Build 21 36794188 1D ATGTTGTTCA T/- TTATAATGTT 3070 hom 105 het 39 0 35 5 T 3 2 326889 CASAVA_Build 21 36796092 2D TGAAAAGACC TT/-- TTTTTTTTTT 2997 het 117 hom 30 4 10 16 T 14 12 326890 CASAVA_Build 21 36814353 1D TCACATGGCC G/- TCTTCCCTCT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 G 1 0 326891 CASAVA_Build 21 36818283 1D CTGGCTAAGA T/- TTTTTTTTTT 2471 het 1646 hom 28 7 11 10 T 15 14 326892 CASAVA_Build 21 36819559 1I AAGCTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 29 0 23 6 A 10 11 326893 CASAVA_Build 21 36829587 4D TAAAAGTAAA AAAT/---- AAAATACAAA 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 AAAT 1 0 326894 CASAVA_Build 21 36832799 1D AAAAGAGAGA G/- AAAAAAAAGA 3070 het 2838 hom 30 9 16 5 G 1 0 326895 CASAVA_Build 21 36836062 1D TCTTTTGTTA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 10 C 9 8 326896 CASAVA_Build 21 36846898 1I CCTGAATTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 415 hom 35 1 16 18 A 9 10 326897 CASAVA_Build 21 36849463 8I AAATCCCTGG --------/AAAACACA AAAACACAAG 3070 hom 120 het 46 0 37 9 AAAACACA 1 2 326898 CASAVA_Build 21 36852662 2I GCATACAAGA --/CT CTTTTACTTC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CT 1 2 326899 CASAVA_Build 21 36852931 1I CAAGGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 10 11 326900 CASAVA_Build 21 36854989 4I CCCTATCCAC ----/TAGG TAGAAGAGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TAGG 0 1 326901 CASAVA_Build 21 36856866 2D CATTCTGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 23 0 11 14 T 14 12 326902 CASAVA_Build 21 36857255 6I ATCACTAACT ------/TAAAAA TAAAAGTAAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TAAAAA 0 1 326903 CASAVA_Build 21 36864785 2D AATTATGGAC AT/-- ATATATATTA 3070 het 3070 ref 32 17 12 6 AT 5 4 326904 CASAVA_Build 21 36866563 8I TTCCCTCTGC --------/GGAGTCCA GGAGTCCAGG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 GGAGTCCA 1 2 326905 CASAVA_Build 21 36871590 1I ACTTTGCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 33 1 22 10 A 12 13 326906 CASAVA_Build 21 36876373 1I TTCTGAGCAG -/A AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 6 7 326907 CASAVA_Build 21 36884612 1D TAAAAAAAGA T/- TTTTTTGGTG 3070 het 405 hom 26 4 12 10 T 7 6 326908 CASAVA_Build 21 36895943 1D TCCATGTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 33 1 14 18 A 12 11 326909 CASAVA_Build 21 36899368 1D GGCAGAAGTG C/- CCCCCCCCAA 2214 het 2214 ref 29 13 7 11 C 9 8 326910 CASAVA_Build 21 36910115 1I GAAGAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 A 11 12 326911 CASAVA_Build 21 36910646 1D GGAAAAACAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 T 9 8 326912 CASAVA_Build 21 36917230 1D CAGGGATGTA T/- TTTTTTTTTA 2502 het 2502 ref 23 11 7 6 T 10 9 326913 CASAVA_Build 21 36934364 1D32M1I GAAAGGAGGA GGGGGAAAAAAACCCCATGGGATCCTGCAGGCT-/-GGGGAAAAAAACCCCATGGGATCTTGCAGGCTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 17 12 6 N/A 0 0 326914 CASAVA_Build 21 36938225 1D CCCCCCATCT C/- CCATGCGGCC 2254 het 2254 ref 22 8 7 9 C 3 2 326915 CASAVA_Build 21 36938429 1I TTGGAGGACA -/T TTTTTTTAAA 2599 het 2599 ref 19 11 6 2 T 7 8 326916 CASAVA_Build 21 36959267 6D GGCAGGTGTT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 hom 45 het 29 0 18 11 TC 11 8 326917 CASAVA_Build 21 36959284 5D CTCTCTCTCT CTCTC/----- TTTTTTTTTT 1981 het 173 hom 29 3 14 13 CTCTC 1 0 326918 CASAVA_Build 21 36961677 2D CATCGTTCTC AG/-- ATCAATTCCA 3070 hom 102 het 41 0 35 7 AG 1 0 326919 CASAVA_Build 21 36970517 1D AATTTTTGCG T/- TTTGTTTACT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 4 3 326920 CASAVA_Build 21 36970602 1D TCAAGCAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 68 het 26 0 22 4 T 10 9 326921 CASAVA_Build 21 36972914 1D34M1I ATCAAATGGG AAGGAAATGTAAACAATGTGTGAATTTAGGTAGAA-/-AGGAAATGTAAACAATGTGTGAATTTAGGTAGAAG GTACATGAGT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 N/A 0 0 326922 CASAVA_Build 21 36973038 1D TATTTCATTT C/- CCCCCAAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 2 C 6 5 326923 CASAVA_Build 21 36973365 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1208 het 1208 ref 22 12 3 7 A 15 16 326924 CASAVA_Build 21 36986625 1I TTCGTCCTCT -/A AAAAAATGAA 3070 hom 94 het 34 0 32 2 A 6 7 326925 CASAVA_Build 21 36994450 1I TTGGTTTGGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 62 het 28 0 20 8 T 7 8 326926 CASAVA_Build 21 36995684 1D GGAGGGGGCT G/- GAAGCGGACC 1849 hom 15 het 9 0 6 4 G 2 1 326927 CASAVA_Build 21 37004776 1I AAATAATAAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 8 9 326928 CASAVA_Build 21 37009157 1D ATTTTCTAAG T/- AAAGTTGTAG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 1 0 326929 CASAVA_Build 21 37010566 1D ATTTATGAGA C/- ACATAAAAGA 3070 hom 132 het 46 0 45 2 C 1 0 326930 CASAVA_Build 21 37011032 1D ACAACCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 14 13 326931 CASAVA_Build 21 37029746 1I ATAGCTGCTG -/C CTCTCCTCTT 3070 hom 94 het 35 0 31 4 C 1 2 326932 CASAVA_Build 21 37034078 2I CCCAGGAGGC --/AG AGGTTTCAGT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 AG 1 2 326933 CASAVA_Build 21 37036638 2D TGTTGCCCAG GA/-- GCTGGTCTCG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 GA 1 0 326934 CASAVA_Build 21 37069831 1I AGATCTTCTC -/A ACCCCCCTTT 200 het 200 ref 24 7 4 13 A 1 2 326935 CASAVA_Build 21 37069872 1D AATATGTCCA T/- TTTTCTACAA 2512 hom 42 het 20 0 11 9 T 5 4 326936 CASAVA_Build 21 37073331 1I AAAAAATTGG -/C CCTCCATATA 3070 hom 123 het 46 0 40 6 C 2 3 326937 CASAVA_Build 21 37076166 1D GATCTATTAA T/- TTTTTTAATA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 7 6 326938 CASAVA_Build 21 37097926 1D TTTTTTATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 31 1 20 10 A 13 12 326939 CASAVA_Build 21 37104829 1I GGAGGTGGGA -/G GATCTGTCTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 2 326940 CASAVA_Build 21 37158009 1D15M1D TGCTGTGGTG TTGGAACTCAGCTATGT/-TGGAACTCAGCTATG- TGCCACAAAG 3070 hom 123 het 43 0 41 8 N/A 0 0 326941 CASAVA_Build 21 37160302 1I24M1I13M1D9M1I TACATTTTAT -ACCTTTCAATCTGGACCAAATTAG-TTGGTTAGTAGCACCAAAGTAAT-/AACCTTTCAATCTGGACAAAATTAGTTTGGTTAGTAGCA-CAAAGTAATA ATACATGTAT 3070 hom 84 het 30 0 28 11 N/A 0 0 326942 CASAVA_Build 21 37160393 1I GGAATGGTAA -/G GGGAAGGGCA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 3 4 326943 CASAVA_Build 21 37173166 1I CCATGATGAT -/A ACTATCTCAC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 1 2 326944 CASAVA_Build 21 37173291 2I18M2I GATATCTCTT --GAACAAAAATAATTGGAA--/TGGACAAAAAATAATTTGAAAT TATAACATAA 3070 hom 36 het 16 0 13 7 N/A 0 0 326945 CASAVA_Build 21 37227824 2I CAGTATAGAC --/AA AAACAGCATA 3070 het 3070 ref 63 30 25 8 A 3 5 326946 CASAVA_Build 21 37244350 1D ATTCTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 A 11 10 326947 CASAVA_Build 21 37244441 11I ATATATTATG -----------/TCCATTTGCCA TCCAATTTGA 3070 het 3070 hom 49 21 21 8 TCCATTTGCCA 0 1 326948 CASAVA_Build 21 37244808 1D CCTGGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3060 hom 24 9 11 4 T 12 11 326949 CASAVA_Build 21 37249713 1D AAAGAAAATA T/- TTTTTACAGC 2941 het 2941 ref 16 9 6 3 T 6 5 326950 CASAVA_Build 21 37252960 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2675 hom 15 7 8 1 A 10 9 326951 CASAVA_Build 21 37270602 2I AGAAAAATAC --/AA AAGTTAGCTG 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 A 2 4 326952 CASAVA_Build 21 37271041 1D TCAACTTAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 7 hom 40 3 32 7 A 9 8 326953 CASAVA_Build 21 37273147 1D TGCTTAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 1453 hom 19 6 9 4 A 9 8 326954 CASAVA_Build 21 37277352 4D ATACAACCTC TTTT/---- TTATTTTCTT 3070 het 2690 hom 21 8 10 4 T 6 2 326955 CASAVA_Build 21 37278400 1I TTATCCACAA -/G GGGTATGTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 G 3 4 326956 CASAVA_Build 21 37285577 1D AAAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 10 9 326957 CASAVA_Build 21 37286142 1D ATATAACGTA C/- CAATGTTGGT 3070 het 3070 hom 35 11 23 1 C 2 1 326958 CASAVA_Build 21 37289420 2D ACATTGTTCG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 26 0 21 5 A 12 10 326959 CASAVA_Build 21 37297149 1I TATTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 2337 het 1030 hom 13 4 8 2 G 4 5 326960 CASAVA_Build 21 37303405 1D TTTTACTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 13 12 326961 CASAVA_Build 21 37304067 3I AATCCTCACC ---/TAG CCTAGCCCGG 2719 het 2208 hom 25 7 10 8 TAG 0 1 326962 CASAVA_Build 21 37305163 1D ATTTATGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2992 hom 34 10 14 10 T 12 11 326963 CASAVA_Build 21 37319669 2D CCGAGACTTT AG/-- AGTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 AG 2 1 326964 CASAVA_Build 21 37320661 2D CACGAATGGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 87 het 38 0 29 10 GA 7 6 326965 CASAVA_Build 21 37325249 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTC 2378 het 2378 ref 24 10 8 10 T 9 10 326966 CASAVA_Build 21 37326771 5I TTGTTTTCTA -----/TTATT TTATTTTGGA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 TTATT 1 2 326967 CASAVA_Build 21 37334177 1I CCAGCTATTT -/A AAAAAAAAAA 2803 het 848 hom 17 3 8 6 A 11 12 326968 CASAVA_Build 21 37337139 8D TTCTTTCTTA TATTTATT/-------- TATTTATTTA 2529 het 2529 ref 18 7 8 4 TATT 7 5 326969 CASAVA_Build 21 37339272 1I AGTCTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 1414 het 1414 ref 21 8 6 7 A 10 11 326970 CASAVA_Build 21 37339302 2I36M3D ATTGTTTGTC --TTTTTTTAATTTTATTTTTCTAGCAATTCTTTTTTTTTG/TTTTTTTTTAATTTTATTTTTCTAGCAATTCTTTTTTT--- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 23 11 11 8 N/A 0 0 326971 CASAVA_Build 21 37339804 1D GCTCCACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 A 12 11 326972 CASAVA_Build 21 37340243 1I TCCTATATTC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 6 7 326973 CASAVA_Build 21 37350768 4I AAGCTCTCTC ----/TCTT TGCCTGCTGC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 TCTT 0 1 326974 CASAVA_Build 21 37359523 1D CTGACATTGA T/- TTTTTTTTTT 1370 het 1370 ref 33 25 3 5 T 11 10 326975 CASAVA_Build 21 37362181 1I TCATTGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1154 hom 36 4 19 13 T 10 11 326976 CASAVA_Build 21 37362378 1D TGGCCAGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 13 12 326977 CASAVA_Build 21 37367711 1I TGCATGGGTT -/G GGGTCCCGCG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 G 3 4 326978 CASAVA_Build 21 37368826 1I AGTTAGGACA -/T TTTTTTGTTG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 6 7 326979 CASAVA_Build 21 37369337 1I TGCAACTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 13 14 326980 CASAVA_Build 21 37370865 10D AACAAAGGGA TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2361 het 1081 hom 20 5 10 5 T 26 16 326981 CASAVA_Build 21 37371271 1I ATAAAGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 119 hom 27 1 17 9 T 10 11 326982 CASAVA_Build 21 37372777 4I ATATTTTAAC ----/TTAT TTATTGTTAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTAT 1 2 326983 CASAVA_Build 21 37373688 5D TATGGTATGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 28 2 24 3 T 34 29 326984 CASAVA_Build 21 37374539 2D CTTTTTAGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 25 8 T 13 11 326985 CASAVA_Build 21 37380616 1I ATTCTTCAGG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 9 326986 CASAVA_Build 21 37383505 1I TGGTTTTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 T 9 10 326987 CASAVA_Build 21 37384155 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1008 hom 23 3 16 4 A 14 15 326988 CASAVA_Build 21 37394687 5I TGCTTCCTTC -----/AAACA TGGTGGCAGT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AAACA 0 1 326989 CASAVA_Build 21 37395741 1I GGTACACTCG -/C CCAGCTCTGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 2 3 326990 CASAVA_Build 21 37396089 4I GTATATAGTT ----/TATA TATATATATA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TA 6 8 326991 CASAVA_Build 21 37396212 4D GATTATCTTT TTAC/---- TTATGTTTTA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TTAC 1 0 326992 CASAVA_Build 21 37401247 1D ATCTAGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 41 1 22 18 T 15 14 326993 CASAVA_Build 21 37410793 1D CAGCCTGGCC A/- ACATGTGAAA 3070 hom 39 het 16 0 12 4 A 2 1 326994 CASAVA_Build 21 37411223 5I TTTAAATGAA -----/CTTTC CTTTATATTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 CTTTC 0 1 326995 CASAVA_Build 21 37412292 1D GTTATTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 10 9 326996 CASAVA_Build 21 37416575 2D AGCGTGCTGA AT/-- ATATATATAT 40 het 3 hom 14 0 1 13 AT 7 6 326997 CASAVA_Build 21 37417056 1I28M1I AAATTTGAGG -TCCTTACTATCAGCTTAAAGTAAATTTG-/TTCCTTACTATCAGCTTAAAGTAAATTTGA AAATCTTTTA 3070 hom 144 het 48 0 49 10 N/A 0 0 326998 CASAVA_Build 21 37417141 1I GTGTGTGTGA -/T TGACTTTTAT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 T 1 2 326999 CASAVA_Build 21 37419893 1I GCTGCTTCTG -/T TTTCTTACTC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 3 4 327000 CASAVA_Build 21 37420049 1D6M1D CAAGAATTTG TTCGTTGC/-TCGTTG- CATATCATGA 3070 hom 108 het 39 0 37 4 N/A 0 0 327001 CASAVA_Build 21 37448812 1D CCTCCAGCTC A/- ACTGGCAGGA 3070 hom 128 het 46 0 40 6 A 2 1 327002 CASAVA_Build 21 37449366 1I4M1I56M1D CTGGAATTTT -CTTC-AATAAAACGACTATTGGGTGGACTTACATCATGCACATATTTACCATAAGAGAGGTC/ACTTCTCATAAAACGACTATTGGGTGGACTTACATCATGCACATATTTAACATAAGAGAGGT- CAGTTTTTAT 3070 hom 24 het 31 1 28 17 N/A 0 0 327003 CASAVA_Build 21 37449464 1I GGGAGGAAAG -/A GAGGAAAGGA 3070 hom 33 het 23 0 10 13 A 0 1 327004 CASAVA_Build 21 37450439 1I GAACTCCTGG -/C CTCAAGTGAT 3070 hom 61 het 28 0 22 6 C 1 2 327005 CASAVA_Build 21 37450743 1D ATAATCAGCT G/- GCTTTCAGAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 G 2 1 327006 CASAVA_Build 21 37453126 1I GAATCTCCCA -/C TTTTCCGTCT 3070 hom 74 het 29 0 24 5 C 0 1 327007 CASAVA_Build 21 37453427 1I60M1D TACCTCAGAG -CTTCTTTGCCCCTCCTGTGGGCCTCTCCCTTGCAGACTTCAGACTTGAGTCCTTCGTGAGC/TCTTCTTTGCCCCTCCTGTGGGCCTCTCCCTTGCAGACTTCAGACTTGAGTCCTTCGTGAG- CTTTGTTGCC 3070 hom 30 het 36 1 53 9 N/A 0 0 327008 CASAVA_Build 21 37453929 1D9M1I18M1D TAAGTTACTT GGATCACTTG-AATCTTACGTTCTAATCTG/-GATCACTTGAAATCTTACGTTCTAATCT- ATGTTAAACC 3070 hom 111 het 33 0 38 3 N/A 0 0 327009 CASAVA_Build 21 37454063 1I CGTACTATTA -/T TTCATTAGAA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 2 3 327010 CASAVA_Build 21 37454772 1I3M1I6M1I TTAATTTTAG -TAT-ACATTA-/TTATAACATTAG GTATTATTAA 3070 hom 60 het 22 0 21 3 N/A 0 0 327011 CASAVA_Build 21 37455730 1D ACTGTGCCAG A/- AGTAGGGCAC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 2 1 327012 CASAVA_Build 21 37456099 1I ATTTTAATGA -/T TTTTTCTCTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 5 6 327013 CASAVA_Build 21 37456588 1D9M1D ATACTTACTA GGCATTTTTGC/-GCATTTTTG- CTGTAAGAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 8 N/A 0 0 327014 CASAVA_Build 21 37456836 1I11M1I CAGTTAAAAA -TTACGTGGTCA-/TTTACGTGGTCAT TTTCATGGAT 3070 hom 70 het 28 0 26 3 N/A 0 0 327015 CASAVA_Build 21 37456992 1D GCTGGGAAGT C/- CCAAGATCAA 3070 hom 33 het 12 0 12 2 C 3 2 327016 CASAVA_Build 21 37458700 1I TAGTAGAGAA -/G GGGTTTCACC 3070 hom 73 het 26 0 23 3 G 3 4 327017 CASAVA_Build 21 37461707 1I AGTGAATTTT -/A ATTTTTTGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 327018 CASAVA_Build 21 37462900 1D22M1D AAACAACCTC AAAAGCTAGTGGCTTAAAACAGTA/-AAAGCTAGTGGCTTAAAACAGT- AAATATTTCA 3070 hom 105 het 29 0 36 6 N/A 0 0 327019 CASAVA_Build 21 37463259 1I TCACTTCTGC -/T GCATTCTCTT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 T 0 1 327020 CASAVA_Build 21 37470046 1I40M1D GGGTTCCAGC -ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGC/AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGG- TGCACGCCAC 3070 hom 19 het 11 0 7 9 N/A 0 0 327021 CASAVA_Build 21 37479554 1I TTTGAATAAG -/A ATCTCTGGTT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 1 2 327022 CASAVA_Build 21 37482253 1I ATACCCCGAA -/G GCTTTTGATG 3070 hom 120 het 42 0 40 2 G 1 2 327023 CASAVA_Build 21 37484074 1I ATAAGGCTTG -/C CTGGGATTCC 3070 hom 66 het 24 0 21 3 C 1 2 327024 CASAVA_Build 21 37487411 1I CCGTCAGGCG -/C TGCCCTCTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 0 1 327025 CASAVA_Build 21 37499055 1I GCCGCCGTTA -/G GTTAGGAAGT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 G 1 2 327026 CASAVA_Build 21 37500433 2D CTGGATTTTG GT/-- CTGCACTAAG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 GT 1 0 327027 CASAVA_Build 21 37501251 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 A 11 10 327028 CASAVA_Build 21 37502073 1D TGGCAGGCAC T/- TTCAAAGAGA 3070 hom 135 het 51 0 42 9 T 3 2 327029 CASAVA_Build 21 37514322 1I CCCACCTTGT -/G GGGTGTACTT 3070 hom 101 het 39 0 32 7 G 3 4 327030 CASAVA_Build 21 37519961 3D TCAGCCAAAC TTT/--- CAGTGGAGAT 3070 het 3070 ref 43 19 16 9 T 3 0 327031 CASAVA_Build 21 37521805 1D CATGAGGGCT G/- GGAGGCGAGT 3070 hom 86 het 30 0 27 3 G 3 2 327032 CASAVA_Build 21 37523193 1D GCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2502 hom 23 8 11 5 A 11 10 327033 CASAVA_Build 21 37544805 1I TGGGCGCGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 1 2 327034 CASAVA_Build 21 37553460 1D GGGTTTCTCC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 9 8 327035 CASAVA_Build 21 37555825 1I AACTCATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 11 12 327036 CASAVA_Build 21 37561137 1I GATGGGAAGA -/G GCGCAGCCCC 2662 hom 51 het 20 0 12 8 G 1 2 327037 CASAVA_Build 21 37562362 1I GCGCCCCGCG -/C TGAAGGGTGG 3070 hom 46 het 18 0 13 5 C 0 1 327038 CASAVA_Build 21 37570129 1D CACCTAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2403 hom 25 8 16 1 T 12 11 327039 CASAVA_Build 21 37574439 1D TCCATACGGG A/- AAAAAATGAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 6 327040 CASAVA_Build 21 37575504 1I CCGGCGTGAG -/C CACAGCGCCC 3070 hom 45 het 16 0 15 1 C 1 2 327041 CASAVA_Build 21 37575678 1D TCAACCCAGG T/- ATGGAGTTGT 3070 hom 99 het 35 0 32 3 T 1 0 327042 CASAVA_Build 21 37576341 1I CTGGCGTTAG -/C GCCTGAGCTC 3070 hom 42 het 15 0 14 1 C 0 1 327043 CASAVA_Build 21 37587646 1D TTCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 583 het 204 hom 15 5 2 8 T 19 18 327044 CASAVA_Build 21 37588251 1D CAGTGAAAAA G/- GCCTCATGGA 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 G 2 1 327045 CASAVA_Build 21 37589469 8I27M6D GGCGTGGTGG --------CTCATACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCC/CCTAAAATCCCATACCTGTAATCCCAACACTTTGG------ GAGGCTGGTG 3070 hom 90 het 28 0 29 7 N/A 0 0 327046 CASAVA_Build 21 37593389 1I TGTGGCAGCG -/C CTCCCTAACG 3070 hom 99 het 34 0 33 1 C 1 2 327047 CASAVA_Build 21 37594621 2D GTGGTACTGT GA/-- GTGTACAGGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 GA 1 0 327048 CASAVA_Build 21 37598967 1I TGCCAAGGGG -/C AATCCTATTC 3070 hom 137 het 50 0 45 5 C 0 1 327049 CASAVA_Build 21 37601672 3I ATTGCTATCT ---/TAA TAATATTAAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 TAA 1 2 327050 CASAVA_Build 21 37625706 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 501 hom 26 2 18 6 A 12 13 327051 CASAVA_Build 21 37626343 5D ACCCAGCTAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1346 het 18 hom 15 1 6 10 T 23 18 327052 CASAVA_Build 21 37631398 1I TTTCCTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 23 0 20 3 T 10 11 327053 CASAVA_Build 21 37639083 1D TTCCATTTAA T/- TTTTTTTTTT 1075 het 1075 ref 32 24 3 5 T 13 12 327054 CASAVA_Build 21 37647443 1I CTCCTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 2905 het 1734 hom 27 4 8 15 A 10 11 327055 CASAVA_Build 21 37649958 5I5M2I ATGGTGAAGC -----TGTTG--/ATAAGTATAGAA TTCCTTCTAT 3070 het 3070 hom 36 16 19 5 N/A 0 0 327056 CASAVA_Build 21 37650931 3I2M2D CCGCTGGACA ---CTTA/CCGCT-- GGTTGTTTCC 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 N/A 0 0 327057 CASAVA_Build 21 37653578 3D AGGCTGAGGT AGA/--- AGAACTGCTG 2696 het 2696 ref 22 11 6 5 AGA 2 1 327058 CASAVA_Build 21 37654585 1D TACGATTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 10 9 327059 CASAVA_Build 21 37655447 1I AGCAAAACTC -/T TGTCTCAAAA 3070 het 540 hom 25 3 13 9 T 1 2 327060 CASAVA_Build 21 37658126 6I CTAGAGACCC ------/AACTCG AACTCGATTA 3070 het 3070 hom 50 24 21 5 AACTCG 1 2 327061 CASAVA_Build 21 37666467 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 43 het 16 0 13 4 A 10 9 327062 CASAVA_Build 21 37679693 3I CAAGAGGTGT ---/ACC ACATCTTAAC 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 ACC 0 1 327063 CASAVA_Build 21 37680872 1I TGGAATTCCA -/G GGGACAGGCT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 G 3 4 327064 CASAVA_Build 21 37682827 1D TTTTTCTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 T 12 11 327065 CASAVA_Build 21 37684098 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1719 het 1719 ref 31 8 10 13 T 15 16 327066 CASAVA_Build 21 37685509 1D TAGACACTTA T/- TCTGTGGCTT 3070 het 3070 hom 46 14 15 17 T 2 1 327067 CASAVA_Build 21 37688399 1D TTTTAAACCC T/- TTTTTTTTTT 1332 het 1332 ref 22 12 6 4 T 12 11 327068 CASAVA_Build 21 37693328 1I AGTAGAGAGA -/G GCAGAGCCCT 3070 hom 129 het 50 0 42 8 G 1 2 327069 CASAVA_Build 21 37702178 1I TGAATGCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 11 12 327070 CASAVA_Build 21 37708418 1I TTTTTCTCTG -/T TTTTTCCTCC 3070 het 3070 hom 54 16 29 9 T 5 6 327071 CASAVA_Build 21 37714323 4I AAGGAAAATT ----/TAAG TAAGTTTGAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 TAAG 1 2 327072 CASAVA_Build 21 37714657 3D AGCAGTTAGT GGG/--- GGGAATTGTA 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 G 6 3 327073 CASAVA_Build 21 37718640 1D TTTCATGCCA T/- TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 T 7 6 327074 CASAVA_Build 21 37719873 4I AGAGACAGAG ----/TAAC TAACTAGCTC 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 TAAC 1 2 327075 CASAVA_Build 21 37730164 1I GGTTCTGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 9 10 327076 CASAVA_Build 21 37733110 1I TGTATTGATT -/C TTTGGACCCG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 0 1 327077 CASAVA_Build 21 37738801 2I ATTAGTCATG --/GA GGTGAGGATG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 GA 0 1 327078 CASAVA_Build 21 37740280 1D GATGTGCAGG A/- AAATGTATTG 3070 hom 154 het 56 0 51 5 A 4 3 327079 CASAVA_Build 21 37745087 4I AAATAACATT ----/TCAG TCAGTGTTGG 3070 hom 126 het 48 0 42 6 TCAG 1 2 327080 CASAVA_Build 21 37767192 3D AAAACATGTT AAG/--- AAGTTTGCAT 3070 het 3070 ref 36 22 8 8 AAG 2 1 327081 CASAVA_Build 21 37767991 1I ATAAGATGAA -/T TTTGGCAGGA 3070 het 238 hom 46 1 40 5 T 3 4 327082 CASAVA_Build 21 37776400 3D GTTCTGTATT ATC/--- GGGGGAAATT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 ATC 1 0 327083 CASAVA_Build 21 37783806 2I CCTAAAGGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 21 8 A 12 14 327084 CASAVA_Build 21 37789118 1D AGACTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 16 1 12 3 A 15 14 327085 CASAVA_Build 21 37791324 1D GTATTTTAGC G/- GACGCTGCCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 2 1 327086 CASAVA_Build 21 37791433 1D GATGATTTTC T/- TTTAGAATAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 4 3 327087 CASAVA_Build 21 37797252 8I ATTTCCGCAG --------/TTTGACTA TTTGACTATT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TTTGACTA 1 2 327088 CASAVA_Build 21 37801244 2I GAAACCTTTG --/CC CCCTCCCCTT 3070 hom 114 het 39 0 37 2 C 3 5 327089 CASAVA_Build 21 37802811 6I CTGAAGTGAA ------/ATGTAG ATGTAGACTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 ATGTAG 1 2 327090 CASAVA_Build 21 37806837 1I GCAAAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 953 hom 41 3 32 6 T 10 11 327091 CASAVA_Build 21 37807098 1D CATGAGGGTG T/- TTTTTTTTTT 2344 hom 15 het 15 0 9 7 T 12 11 327092 CASAVA_Build 21 37818164 1I CACTTGTATT -/C CCATGCTACA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 C 2 3 327093 CASAVA_Build 21 37825679 1I TGTTCCCGCA -/G GGACCAAGTT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 G 2 3 327094 CASAVA_Build 21 37828518 6I TTGGTTAAAA ------/TAATCT TAATATAGGA 3070 het 3070 ref 45 24 15 6 TAATCT 0 1 327095 CASAVA_Build 21 37839682 2D TGTGATACAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 21 12 7 TG 7 6 327096 CASAVA_Build 21 37849365 2I AGTTATACTC --/AG GGGATAAGGC 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 AG 0 1 327097 CASAVA_Build 21 37859645 1I TCTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 808 het 521 hom 18 3 9 6 T 10 11 327098 CASAVA_Build 21 37871985 1I TATATATATA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 9 10 327099 CASAVA_Build 21 37874812 1D ACATTCTGAT C/- CCCATTCTGC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 C 4 3 327100 CASAVA_Build 21 37879965 1D GTCTCTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 7 6 T 11 10 327101 CASAVA_Build 21 37881337 1I GAAAACTCTG -/A AAGTAGAGGC 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 A 2 3 327102 CASAVA_Build 21 37885804 1I GGGGTTGTTG -/C CCCCCAGAAA 2102 het 1499 hom 17 7 7 3 C 5 6 327103 CASAVA_Build 21 37892506 1I TGTGTGAGGA -/C ACCTGTGGTC 3070 het 3070 hom 46 16 18 12 C 0 1 327104 CASAVA_Build 21 37907020 2D AGAAGGTAAC AT/-- ATAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 AT 2 1 327105 CASAVA_Build 21 37907285 1I AACCCGATTT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 7 8 327106 CASAVA_Build 21 37907714 1I GTGAATGGAT -/A AAATAAACAG 3070 het 3070 hom 52 18 28 6 A 3 4 327107 CASAVA_Build 21 37908130 1I ATGTACCATT -/A GTGGTTTGGC 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 A 0 1 327108 CASAVA_Build 21 37910763 8D CAAAATGTAC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 567 hom 21 4 14 5 AT 13 9 327109 CASAVA_Build 21 37920303 1I TTCCCCCTTC -/T TTTTTTTTTT 1866 het 384 hom 30 3 13 14 T 14 15 327110 CASAVA_Build 21 37921984 2I AGGTTAATGC --/AG AGTTGTAAAG 3070 het 3070 hom 46 14 25 7 AG 1 2 327111 CASAVA_Build 21 37924084 3D TCATTTAAAA AAG/--- GATAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 19 12 5 AAG 1 0 327112 CASAVA_Build 21 37927662 4I AAAATAAGAT ----/AAAG AAATACAATA 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 AAAG 0 1 327113 CASAVA_Build 21 37928101 1I TCTTAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 A 10 11 327114 CASAVA_Build 21 37928934 1D ATACAAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1317 hom 26 5 13 10 T 15 14 327115 CASAVA_Build 21 37935885 1I GGGATGGGCA -/G GGGGAGCTTT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 4 5 327116 CASAVA_Build 21 37936838 1I AAAGCCGTGA -/G GCATCCGACC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 1 2 327117 CASAVA_Build 21 37940070 1D5M1D3M1D56M1I AGTCCCTCAC TTCTTCGGACTTAACAGTGAACAGTTAATAAAACGGGGGTAAAAATCCACTTATGACTCTGTTAAGG-/-TCTTC-GAC-TAACAGTGAACAGTTAATAAAACGGGGGTAAAAATCCACTTATGACTCTGTTAAGGA ACTCTCACCC 3070 hom 111 het 37 0 37 20 N/A 0 0 327118 CASAVA_Build 21 37940872 1I GAGACGGAGT -/C TGGCTCTGTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 0 1 327119 CASAVA_Build 21 37943214 1D TGAGGCAGAA G/- GAATCACCTG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 2 1 327120 CASAVA_Build 21 37957008 1D TTGTGGTTTT G/- GATTTGCATT 3070 hom 81 het 28 0 27 1 G 2 1 327121 CASAVA_Build 21 37957636 1D TTCATGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 12 11 327122 CASAVA_Build 21 37960614 1I TGCTGTCTCA -/G GCAAGTCACC 3070 hom 105 het 36 0 36 0 G 1 2 327123 CASAVA_Build 21 37961359 5D AAAAAAAATT AAATG/----- AGGCAACGCA 700 het 566 hom 17 6 7 7 AAATG 1 0 327124 CASAVA_Build 21 37962096 1I CTGGAGTGGT -/G GTCCTCCTCC 3070 hom 95 het 35 0 29 6 G 1 2 327125 CASAVA_Build 21 37962629 3D TAATCTCCTA TTC/--- TTATAAGGAC 3070 het 3070 ref 31 17 10 7 TTC 1 0 327126 CASAVA_Build 21 37963883 2D GGAAATATGC AG/-- AGACTCTGAA 3070 het 3070 ref 51 25 23 4 AG 2 1 327127 CASAVA_Build 21 37965081 1D ACTTCCTTGG T/- TTGAACTTAG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 3 2 327128 CASAVA_Build 21 37966059 1D AAATTCAACA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 T 9 8 327129 CASAVA_Build 21 37968689 1I CTCACCCACT -/G GGCTCCGCCG 3070 hom 102 het 39 0 31 8 G 2 3 327130 CASAVA_Build 21 37969627 1I GGTTTCTGGT -/G GCGCTGACCG 3070 hom 48 het 19 0 11 8 G 1 2 327131 CASAVA_Build 21 37972128 1D AAGGCAAGCA T/- TTGGAATTGC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 3 2 327132 CASAVA_Build 21 37973876 1D ATTGGCCAGT G/- GAAGTTTGAC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 2 1 327133 CASAVA_Build 21 37974347 2D TGTTTTCAAC TA/-- TATTATTTAC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 TA 2 1 327134 CASAVA_Build 21 37975224 1D CAAGGACACT G/- GGGCCTGAGG 3070 hom 132 het 53 0 46 8 G 4 3 327135 CASAVA_Build 21 37975329 1D GTCAAAGAAT A/- AAAAAGGTTC 3070 hom 150 het 58 0 50 8 A 6 5 327136 CASAVA_Build 21 37975743 4D GCACATGCTT GTTG/---- GTTTCACTCG 3070 het 3070 hom 46 18 27 2 GTTG 1 0 327137 CASAVA_Build 21 37975962 3I CGAAGAGAGG ---/AGA AGTAGAGGGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 AGA 0 1 327138 CASAVA_Build 21 37976722 1D CGTGACCTTC T/- TCTGTGTGTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 2 1 327139 CASAVA_Build 21 37978335 1I AGGCTGGAAG -/C CTGAGATCCA 3070 hom 123 het 45 0 37 8 C 1 2 327140 CASAVA_Build 21 37979790 1D GATACGGAGC T/- TTGCAGTGAG 1934 hom 11 het 5 0 4 1 T 3 2 327141 CASAVA_Build 21 37982544 1I TTTAAAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 10 11 327142 CASAVA_Build 21 37983479 1D22M1D4M1D3M1D14M1D ACTTCAAAAT CCATACATACTAAAAAGTCTGATGGAATGGATAAAGAAGTGTCACTTG/-CATACATACTAAAAAGTCTGAT-GAAT-GAT-AAGAAGTGTCACTT- GAAGCAAATT 3070 hom 124 het 42 0 42 11 N/A 0 0 327143 CASAVA_Build 21 37984261 14D TATGCAATTA AAATTGTTTGATTG/-------------- AAATTGTTTG 3070 hom 57 het 23 0 20 5 AAATTGTTTGATTG 2 1 327144 CASAVA_Build 21 37984810 1I TCAGTGAATA -/G TCTATGGCCA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 0 1 327145 CASAVA_Build 21 37987437 1D TCGTTCAATG C/- CCACATAAGC 3070 hom 130 het 52 0 44 9 C 3 2 327146 CASAVA_Build 21 37988099 1D TTATTTACCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 30 1 23 7 T 10 9 327147 CASAVA_Build 21 37995316 1I TGGGGCTGTG -/C CTGTGGGAAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 1 2 327148 CASAVA_Build 21 37995391 1D ATGTGCAGAA G/- GGAAGCATTG 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 G 3 2 327149 CASAVA_Build 21 37998007 1D GGCTGGCACA G/- GGAACTCAAA 3070 hom 129 het 47 0 37 10 G 3 2 327150 CASAVA_Build 21 38000130 1D AAGGTTATTT C/- CTCAGTCATC 3070 hom 141 het 55 0 47 8 C 2 1 327151 CASAVA_Build 21 38000243 1D CGAGAGCCTT A/- AGAAGTGGGA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 A 2 1 327152 CASAVA_Build 21 38000773 2D AAATAAACCA CT/-- GTTTTCAGCC 3070 het 3070 ref 46 27 16 4 CT 1 0 327153 CASAVA_Build 21 38001281 1I3M1I ATTCATGGCA -GTA-/GGTAG CCCGGGCAGA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 N/A 0 0 327154 CASAVA_Build 21 38001894 2D AGTATCTGTG CA/-- TGTGTGTGTG 1351 het 1351 ref 38 14 12 14 CA 1 0 327155 CASAVA_Build 21 38002744 1D AAAACATATT C/- CATATGTCTT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 C 2 1 327156 CASAVA_Build 21 38003317 1I CAGAAGAACC -/T TTAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 T 2 3 327157 CASAVA_Build 21 38005993 1D TCTAGAAATT A/- AGAAGACTAT 3070 hom 56 het 28 0 17 11 A 2 1 327158 CASAVA_Build 21 38010553 1I AAAGTTTAAA -/T TTTTTTTTTT 1533 het 1533 ref 31 15 8 8 T 17 18 327159 CASAVA_Build 21 38014276 1I AATTTTGGGT -/G GGGGGGGTTC 2607 het 2607 ref 16 9 6 1 G 7 8 327160 CASAVA_Build 21 38022870 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTATATATA 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 TA 0 1 327161 CASAVA_Build 21 38023508 2D TCTTCTTTTT GG/-- GGGGGGGGGC 2256 het 362 hom 22 3 7 12 G 11 9 327162 CASAVA_Build 21 38024091 1I TTCATCCTCC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 T 8 9 327163 CASAVA_Build 21 38026362 1I AGAATGAAGG -/T TCAAAGCGTT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 1 2 327164 CASAVA_Build 21 38030366 1I AGCCCTGTGC -/T TAGGCCCTGG 3070 hom 89 het 38 0 29 9 T 1 2 327165 CASAVA_Build 21 38032516 2D CCATGCTTCT CC/-- CCCCTGGGGC 3070 hom 78 het 31 0 26 6 C 6 4 327166 CASAVA_Build 21 38036691 1I TATTAAAAAG -/A AAAAACACCT 3070 hom 74 het 29 0 25 4 A 5 6 327167 CASAVA_Build 21 38041431 1D AGGGCCAGAA G/- GGGATTTGTG 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 G 4 3 327168 CASAVA_Build 21 38092649 12I ACACAAAAAC ------------/CCATACACAAAT GTCCAAGGCA 3070 hom 166 het 60 0 56 4 CCATACACAAAT 0 1 327169 CASAVA_Build 21 38095905 1I AGCACTGTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 8 9 327170 CASAVA_Build 21 38099799 1I GACTTTATTT -/G GAAATAAGGC 3070 hom 126 het 51 0 43 8 G 1 2 327171 CASAVA_Build 21 38108137 3I AAGTGAAGAG ---/ACA ACAACCCACA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 ACA 1 2 327172 CASAVA_Build 21 38111336 1I CACACAAAGC -/T CTTAGAACAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 0 1 327173 CASAVA_Build 21 38112654 1D GAATCCCATG T/- TTTACCCGAC 3070 het 3070 ref 44 22 16 8 T 4 3 327174 CASAVA_Build 21 38113419 1D ATGCTCTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 11 10 327175 CASAVA_Build 21 38114124 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 8 9 327176 CASAVA_Build 21 38118600 4I TAAATTTATT ----/CTCA CTGTTCTGTA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 CTCA 0 1 327177 CASAVA_Build 21 38127188 2D GCATTTCTTT TC/-- TTTTCTTTTT 3070 hom 116 het 43 0 36 7 TC 1 0 327178 CASAVA_Build 21 38129090 1D AAAGCTGCTG C/- TCTGTTATTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 1 0 327179 CASAVA_Build 21 38131886 1D GTTCTGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2373 hom 45 12 19 15 T 13 12 327180 CASAVA_Build 21 38136905 1D GAGCCTCTTA C/- CACAATGCCG 3070 het 3070 ref 64 38 16 10 C 2 1 327181 CASAVA_Build 21 38141574 1D2M1D TGCACCTGCA CTCT/-TC- CTCAGCCACG 3070 hom 147 het 50 0 48 4 N/A 0 0 327182 CASAVA_Build 21 38145915 1D TGCAGATTGA T/- TTTTTTTTTC 2894 het 2894 ref 30 15 9 6 T 10 9 327183 CASAVA_Build 21 38148916 2D AAAATATCAC AT/-- GAGATATTCA 3070 hom 147 het 56 0 49 9 AT 1 0 327184 CASAVA_Build 21 38159550 1D TGTTTTTTTG C/- CCAGTCGTGT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 C 3 2 327185 CASAVA_Build 21 38160812 1D AGAAAAGTGT G/- GGATCAGAAA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 3 2 327186 CASAVA_Build 21 38166003 1I TTTTCTTCTA -/T TTTTTTAACG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 6 7 327187 CASAVA_Build 21 38185827 11I CCCAGCTGAA -----------/CCTAGGAAGAC CCTAGGGGGC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CCTAGGAAGAC 0 1 327188 CASAVA_Build 21 38187901 1I GGATTATATT -/C CTACGGAAGC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 1 2 327189 CASAVA_Build 21 38192761 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 997 het 997 ref 33 15 6 12 A 14 13 327190 CASAVA_Build 21 38195579 1I AAAAGTGCCA -/T GTGTATGGAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 0 1 327191 CASAVA_Build 21 38226857 1I ACTTTATACC -/A AAAAATTTAT 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 A 5 6 327192 CASAVA_Build 21 38232861 1I AAATATTGTA -/T TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 6 7 327193 CASAVA_Build 21 38233805 1I CAGTATAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 151 hom 40 2 36 2 T 11 12 327194 CASAVA_Build 21 38236837 3I AAAATTCACT ---/TAG TAGTTCTAGT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 TAG 1 2 327195 CASAVA_Build 21 38243828 1I GCATGCTGAC -/T TTTTGCTATT 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 T 4 5 327196 CASAVA_Build 21 38249269 1I TCAGAGTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 10 11 A 13 14 327197 CASAVA_Build 21 38253078 1I TGTTTTCTAA -/G GAATTGTCAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 G 1 2 327198 CASAVA_Build 21 38255516 4D GGGATTAAGT GTAA/---- GTTTCTTTTT 3070 het 2212 hom 41 11 17 15 GTAA 1 0 327199 CASAVA_Build 21 38268769 1I AGTGGTGCAA -/G TCCCGGTCTG 3070 hom 156 het 61 0 52 9 G 0 1 327200 CASAVA_Build 21 38270572 1I TTTTTTCGTA -/T TTTTTAGTAG 2175 hom 15 het 6 0 6 0 T 5 6 327201 CASAVA_Build 21 38272565 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTGAGG 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 6 7 327202 CASAVA_Build 21 38275096 2D TTCTATTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 2723 het 2126 hom 22 10 8 5 A 16 14 327203 CASAVA_Build 21 38282104 1D TAATCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 26 11 T 12 11 327204 CASAVA_Build 21 38284604 4D28M2I AAAGAGAAAG AGGAAGGAAGGAAGGAAGGAGAAAGAAAAGAA--/----AGGAAGGAAGGAAGGAGAAAGAAAAGAAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 69 het 40 0 22 25 N/A 0 0 327205 CASAVA_Build 21 38286254 1I CTATTAAGTT -/A ACAACTTCTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 1 2 327206 CASAVA_Build 21 38288748 1D AGAGCAATGA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 9 8 327207 CASAVA_Build 21 38290430 1I AAAATATTCA -/C ACATAACAAA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 C 0 1 327208 CASAVA_Build 21 38305729 1D ATCACTGCAA T/- TATCTCCCTC 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 2 1 327209 CASAVA_Build 21 38325839 6D TGCTTGGGTC CCTAGG/------ CCTAGGTGTT 3070 hom 67 het 26 0 22 4 CCTAGG 2 1 327210 CASAVA_Build 21 38353797 10D14M3D GTGGTGGTGA TGGTTGGTGGTGGTGATGGTGGTGATA/----------TAGTGATGGTGGTG--- TTGGTGATGG 3070 hom 9 het 32 0 14 23 N/A 0 0 327211 CASAVA_Build 21 38384056 3D2M9D AGATTCTAGT TTGAATCTTCTAGT/---AA--------- TTGAAGGAAA 3070 het 3070 hom 40 17 23 4 N/A 0 0 327212 CASAVA_Build 21 38394043 1I GAAAAATGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 A 9 10 327213 CASAVA_Build 21 38394849 1D AAAACTTGAC A/- GTCTATTCTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 A 1 0 327214 CASAVA_Build 21 38405334 1D TCTTGGTATT G/- TACATTCTAG 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 G 1 0 327215 CASAVA_Build 21 38409909 3D CCTCCACCAT TAC/--- TACTACTAAT 3070 het 3070 hom 70 29 27 16 TAC 3 2 327216 CASAVA_Build 21 38410846 1D ACATTTTTAC A/- AAAAAAAAAA 2690 het 2082 hom 29 13 9 7 A 16 15 327217 CASAVA_Build 21 38418691 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 2820 het 2820 ref 19 9 8 3 A 10 9 327218 CASAVA_Build 21 38424607 1D GCCAGATCTC A/- ATCCGACAGA 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 A 2 1 327219 CASAVA_Build 21 38429841 4I ATAAATAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 AAAC 3 4 327220 CASAVA_Build 21 38432038 1D GAAAAAGCTG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 23 12 9 3 T 8 7 327221 CASAVA_Build 21 38441779 1I CCCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 10 11 327222 CASAVA_Build 21 38443012 1I TGGCTCTCCT -/G GGTCTCCAGC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 2 3 327223 CASAVA_Build 21 38457707 3D43M1D GCTCCTTCTC CTTCTTCTTCATCTCTGTCTTTTTCTTCTCTTCTTCCTCCCACTTCT/---CTTCTTCATCTCTGTCTTTTTCTTCTCTTCTTCCTCCCACTTC- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 19 12 10 N/A 0 0 327224 CASAVA_Build 21 38478018 1D TCACCAGCAA T/- TCTCTCCCCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 2 1 327225 CASAVA_Build 21 38481706 1D GTATACTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 11 10 327226 CASAVA_Build 21 38494781 1I AGGTTGTTTG -/T TGCATGCATA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 327227 CASAVA_Build 21 38496353 1D TTCTCGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 11 10 327228 CASAVA_Build 21 38498349 2I TGGAAATAAA --/AT AGTCATAAGA 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 AT 0 1 327229 CASAVA_Build 21 38512278 1I ATTGAAAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 14 23 13 T 9 10 327230 CASAVA_Build 21 38522035 4I ACTGTAGGGA ----/GGAG GGATTCCTAT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 GGAG 0 1 327231 CASAVA_Build 21 38525447 2D TATTGAATAG TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 44 21 21 2 T 10 8 327232 CASAVA_Build 21 38525930 1D TCATTAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 10 9 T 13 12 327233 CASAVA_Build 21 38533809 4I GCAGCCTCTT ----/AGAG AGCCTCTAGT 3070 het 3070 hom 31 8 19 4 AG 1 3 327234 CASAVA_Build 21 38535107 1D ATCCAAGCCA C/- CCTCCCTCTG 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 C 3 2 327235 CASAVA_Build 21 38537251 8I AGATGGAGTA --------/TCACTCTG TCACCCAGGC 3070 het 3000 hom 24 8 15 1 TCACTCTG 0 1 327236 CASAVA_Build 21 38553976 1I GAAATGAAAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 327237 CASAVA_Build 21 38554881 1D ACTGCAGGGG A/- GGAATGCAAT 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 A 1 0 327238 CASAVA_Build 21 38562228 1D TGGATTTTTT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 8 7 327239 CASAVA_Build 21 38564796 2I GGCAACAACA --/CT CTGATCTGGT 3070 het 3070 hom 46 22 20 4 CT 1 2 327240 CASAVA_Build 21 38568216 1D CTGTCTGTGG A/- AAATGCACGT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 A 4 3 327241 CASAVA_Build 21 38571637 7D CATTCATTCT TTATAGA/------- TTATTAATCC 3070 hom 144 het 52 0 49 6 TTATAGA 1 0 327242 CASAVA_Build 21 38571944 1I CCAGCGGTGC -/T TTTCTATAAC 3070 hom 155 het 61 0 49 12 T 3 4 327243 CASAVA_Build 21 38577632 7D GTAATTTGAT AAGTGAA/------- AAGTGAATTC 3070 hom 105 het 37 0 34 5 AAGTGAA 2 1 327244 CASAVA_Build 21 38584150 1I TGGAAAAGAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 9 327245 CASAVA_Build 21 38587521 4D TAGTCTAAGG AAAA/---- AGTGCTTTTG 3070 het 3070 hom 60 25 28 7 A 5 1 327246 CASAVA_Build 21 38588449 15D GCAATGGGTA CTACCCTTCCATTTC/--------------- CCATTATCCT 3070 het 3070 ref 45 27 14 7 CTACCCTTCCATTTC 1 0 327247 CASAVA_Build 21 38596334 1D TCCATTCCTT A/- AAAAAATATT 3070 hom 99 het 38 0 32 6 A 7 6 327248 CASAVA_Build 21 38598553 1I4M1I21M1I TCACTGCAAG -TCCG-CTTCCAGGTTCACGCCATTCT-/CTCCGCCTTCCAGGTTCACGCCATTCTC CTCCCTCAGC 3070 hom 24 het 8 0 8 2 N/A 0 0 327249 CASAVA_Build 21 38600164 2I CTATTTCCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 40 1 33 6 A 12 14 327250 CASAVA_Build 21 38601068 1I CTCCATCACC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 8 9 327251 CASAVA_Build 21 38603189 1D CAATGTGATA T/- TTTAATACAC 3070 het 3070 ref 30 21 8 1 T 4 3 327252 CASAVA_Build 21 38605072 2D TGCAGCTGGC TG/-- GAATCCGATA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 TG 1 0 327253 CASAVA_Build 21 38616238 3D AACTCCACCA TTC/--- TTCAGATGTC 3070 het 3070 ref 40 22 17 2 TTC 2 1 327254 CASAVA_Build 21 38620788 1D CTGAGTCCCA C/- CGCTACCTTC 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 C 2 1 327255 CASAVA_Build 21 38643768 1I CTAAAGACAC -/A AAAAATTCTG 3070 het 3070 ref 55 27 24 4 A 5 6 327256 CASAVA_Build 21 38651891 4D4M8D TGTTCCCTGT TAAAAAATATGAACCA/----AAAT-------- ATGGACCAAT 3070 hom 96 het 32 0 33 2 N/A 0 0 327257 CASAVA_Build 21 38654669 1D CCTCTTTTCC T/- TTTATAAATT 3070 hom 114 het 41 0 36 5 T 4 3 327258 CASAVA_Build 21 38655579 1I TCCCTGACAA -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 T 6 7 327259 CASAVA_Build 21 38662181 1I TGAGTTTGTT -/A AGTTTCATTA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 1 2 327260 CASAVA_Build 21 38666618 1I CCATTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 10 11 327261 CASAVA_Build 21 38667672 1D TTGTAAACTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 9 8 327262 CASAVA_Build 21 38674592 5D GTTAAAATTG AATAT/----- GATAATCATG 3070 het 3070 ref 50 27 23 0 AATAT 1 0 327263 CASAVA_Build 21 38678366 1D GAGCTATATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 T 9 8 327264 CASAVA_Build 21 38680582 1D TTCAGATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 21 8 T 12 11 327265 CASAVA_Build 21 38680869 1D AAAAAGGGGG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 9 8 327266 CASAVA_Build 21 38707534 4I GTTGCCTCCT ----/GTTA GTTATTCCAT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 GTTA 1 2 327267 CASAVA_Build 21 38708612 1I ATTTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 50 1 40 9 T 10 11 327268 CASAVA_Build 21 38713550 1D TCTTATGGGC T/- TTTTTTTGAC 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 8 7 327269 CASAVA_Build 21 38720723 1I ACTCCATGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 554 hom 16 2 12 2 A 11 12 327270 CASAVA_Build 21 38721973 1I ACCGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 25 0 21 4 A 10 11 327271 CASAVA_Build 21 38723180 8D CATATATATG TACACATA/-------- TACACATGTA 3070 hom 36 het 17 0 13 8 TACACATA 1 0 327272 CASAVA_Build 21 38724756 1I TGATGGAAAT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 138 het 54 0 47 7 A 8 9 327273 CASAVA_Build 21 38729075 1D AGTGTGAATC G/- GAGGTCAGTC 3070 hom 117 het 41 0 38 3 G 2 1 327274 CASAVA_Build 21 38729961 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 10 11 327275 CASAVA_Build 21 38730674 1D TCTTAGTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 590 hom 30 6 17 7 T 10 9 327276 CASAVA_Build 21 38744014 1D AAAAACAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 9 8 327277 CASAVA_Build 21 38750392 2I CCCCATCCCC --/AG ATCATTGTTG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 AG 0 1 327278 CASAVA_Build 21 38756166 1D ATATACACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 8 327279 CASAVA_Build 21 38761111 11D TGCACTGTTG CCTCAAACAAA/----------- CCTCCCTCCT 3070 het 3070 ref 60 34 24 2 CCTCAAACAAA 1 0 327280 CASAVA_Build 21 38768525 1D CTTGGCTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 34 0 27 8 T 13 12 327281 CASAVA_Build 21 38774324 1D AGAAACTGGT A/- ACAGTACTTG 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 2 1 327282 CASAVA_Build 21 38779255 1D ATATACAGTC T/- TTTTTTTTTT 1166 het 208 hom 19 2 3 14 T 17 16 327283 CASAVA_Build 21 38785146 1D TCTTCAGTGC T/- TGATTCTGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 T 2 1 327284 CASAVA_Build 21 38785758 105D TAAGAATTGC TGCCTATGGGATTTTTCCCAGAAGAGTAGATAACATAAAGTAACCAGCGATAATAATTTTCATTATCCAATTATTTCATGTGTCTCCATAACACTTAATACATCA/--------------------------------------------------------------------------------------------------------- TGTTTCTCTG 1746 het 1746 ref 25 46 5 7 TGCCTATGGGATTTTTCCCAGAAGAGTAGATAACATAAAGTAACCAGCGATAATAATTTTCATTATCCAATTATTTCATGTGTCTCCATAACACTTAATACATCA 1 0 327285 CASAVA_Build 21 38793691 4D AAGGAAAAGA AAAG/---- AAAGAGAGTA 2223 het 2223 ref 19 11 7 3 AAAG 2 1 327286 CASAVA_Build 21 38793836 1I AATTCTGTTT -/C CCCCGAAAAT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 C 4 5 327287 CASAVA_Build 21 38796678 1I CCGCCACCAC -/A CCTGGCTAAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 0 1 327288 CASAVA_Build 21 38797163 1I CATAGAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2783 hom 24 8 10 6 T 11 12 327289 CASAVA_Build 21 38797339 1D TGTCTCGGCA T/- TCGGGAAGCC 2726 het 2726 ref 26 14 8 6 T 2 1 327290 CASAVA_Build 21 38799816 1I AGAAATGGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 9 10 327291 CASAVA_Build 21 38806933 1I CAAAAAAAAA -/T AATAATAATA 3070 het 130 hom 21 1 17 3 T 0 1 327292 CASAVA_Build 21 38813836 1I CAACAAAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 9 het 33 2 25 6 A 8 9 327293 CASAVA_Build 21 38816072 1I TCTCAAATGT -/A AAAAAAAAAG 2684 het 2684 ref 22 13 7 2 A 9 10 327294 CASAVA_Build 21 38821646 1D TAGGCACAAC T/- GTGGATCTCA 3070 het 3070 hom 45 13 21 11 T 1 0 327295 CASAVA_Build 21 38821941 3D TTCACATGGC CTT/--- CTCCTCATAT 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 CTT 1 0 327296 CASAVA_Build 21 38828147 14D TTTCTATTGC CAAATGAACACCTG/-------------- TTTCAGAGTC 3070 het 3070 ref 29 21 9 4 CAAATGAACACCTG 1 0 327297 CASAVA_Build 21 38828347 1I TATGAAATAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 8 9 327298 CASAVA_Build 21 38830092 3D AAAGCTGGTC AGT/--- AGTAACACAA 3070 hom 132 het 48 0 44 5 AGT 2 1 327299 CASAVA_Build 21 38830474 2I AACAAGACAA --/TG TGGAAGTCTG 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 TG 1 2 327300 CASAVA_Build 21 38831234 4D CCAGAAAAAA AAAT/---- ATATATATAT 3070 het 127 hom 29 2 15 14 AAAT 1 0 327301 CASAVA_Build 21 38835707 5I CTGGAACGTA -----/AAATT AAATTAAATT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AAATT 3 4 327302 CASAVA_Build 21 38837159 3I GTTTTTTTTT ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 hom 76 het 44 1 39 4 A 9 12 327303 CASAVA_Build 21 38841707 1I CATAAAATGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 A 8 9 327304 CASAVA_Build 21 38846512 1I AAACCCACAG -/C CAACACTGTA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 C 1 2 327305 CASAVA_Build 21 38846781 1I AACAATTTCA -/C CAACGTTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 C 1 2 327306 CASAVA_Build 21 38847681 4D AATAGAGTAT ACAG/---- ACAATGTACA 3070 het 3070 ref 27 14 11 7 ACAG 1 0 327307 CASAVA_Build 21 38847799 1I CAACTTCTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 8 9 327308 CASAVA_Build 21 38851854 3D GCTAAGTTTT GGG/--- GGGGGGTCCT 3070 het 3070 hom 25 8 14 6 G 9 6 327309 CASAVA_Build 21 38860868 1D TCGCCAGACT G/- GGGGGGGGAT 3070 het 3070 hom 43 11 18 15 G 9 8 327310 CASAVA_Build 21 38877283 1D GAATGCATCT C/- CCACATTTAT 3070 hom 90 het 40 0 30 10 C 3 2 327311 CASAVA_Build 21 38879971 40D ATGTTTTGAA ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------------- ATATATATAT 3070 het 175 hom 9 1 8 3 AT 29 9 327312 CASAVA_Build 21 38889851 1D GTGTGGGATT G/- GGGGGGGGGG 2997 hom 32 het 23 0 13 10 G 12 11 327313 CASAVA_Build 21 38899860 4D GATAAATGAT AGAG/---- AGAGAGATGA 3070 hom 107 het 43 0 36 8 AG 5 3 327314 CASAVA_Build 21 38905724 1I GGGCAGGAGG -/A AAAAAAAGCG 3070 hom 68 het 29 0 23 6 A 7 8 327315 CASAVA_Build 21 38914124 1D CTCCCAGGAC G/- TAAAAACAAT 3070 hom 141 het 55 0 46 10 G 1 0 327316 CASAVA_Build 21 38916217 1I ACATATCACA -/C CACACACACA 3070 hom 165 het 58 0 54 4 C 1 2 327317 CASAVA_Build 21 38917116 4D ACATACGCAC CACA/---- CACACACACA 3070 hom 126 het 57 0 42 17 CA 11 9 327318 CASAVA_Build 21 38921299 1D TGCCAGGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 7 A 10 9 327319 CASAVA_Build 21 38935525 1D AATTAGTGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 10 9 327320 CASAVA_Build 21 38936263 12I CACCCCACCC ------------/TGCCCCAGCCAA TAAATCCATA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TGCCCCAGCCAA 0 1 327321 CASAVA_Build 21 38938130 1I TGGGAAGACA -/T TTTTCCTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 4 5 327322 CASAVA_Build 21 38950916 1D GGATAATAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 8 327323 CASAVA_Build 21 38953837 13D AAAGGAAAGG GACCGCTCCTGGC/------------- GCTGAGAGCT 3070 hom 60 het 22 0 20 5 GACCGCTCCTGGC 1 0 327324 CASAVA_Build 21 38956087 1D TCCAGTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 264 hom 26 1 12 13 A 13 12 327325 CASAVA_Build 21 38965635 6D GAGCTAGCTG TCTGTT/------ TCTATGTGAG 3070 hom 92 het 36 0 28 10 TCTGTT 1 0 327326 CASAVA_Build 21 38969948 1I AGGATAATGA -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 6 7 327327 CASAVA_Build 21 38983821 4D TCCCTCCCTC CCTT/---- CCTTCCTTCC 1755 hom 26 het 21 0 11 10 CCTT 4 3 327328 CASAVA_Build 21 38986633 2D AAAAGAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 33 1 23 9 A 16 14 327329 CASAVA_Build 21 38992371 1I ATCTTATGGC -/T GTGGTCATCC 3070 hom 172 het 65 0 58 7 T 0 1 327330 CASAVA_Build 21 39029013 1I AACTCAAAAG -/A AGGCAATCAT 3070 het 1979 hom 25 6 12 7 A 1 2 327331 CASAVA_Build 21 39029620 2D GAACCTCTAA TG/-- GAGTCATAAT 3070 het 3070 ref 44 26 14 6 TG 1 0 327332 CASAVA_Build 21 39029721 1D GAAGAATAAT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 G 2 1 327333 CASAVA_Build 21 39034217 1I CTCTGTAGAT -/A AAAAAATGGT 3070 het 1899 hom 23 5 16 2 A 6 7 327334 CASAVA_Build 21 39060548 1I CTGTGTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 A 9 10 327335 CASAVA_Build 21 39062058 1D AAAAAGATCC A/- AAAAAAAAAA 1624 het 1624 ref 40 29 5 6 A 12 11 327336 CASAVA_Build 21 39066837 3D AAGAGAAGGC AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 109 het 49 0 37 15 AAG 5 4 327337 CASAVA_Build 21 39093119 1D TGGGTTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 462 hom 46 3 34 9 A 12 11 327338 CASAVA_Build 21 39093467 1I TTAAATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 989 hom 20 3 14 3 T 12 13 327339 CASAVA_Build 21 39106566 1I CAGAGTAAGA -/C CCTGTCTCAA 2014 hom 24 het 31 0 8 23 C 2 3 327340 CASAVA_Build 21 39127051 2D TGCACGCATG CA/-- CACACACACA 1565 het 1565 ref 53 40 5 10 CA 8 7 327341 CASAVA_Build 21 39128568 1I TTCTCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 11 12 327342 CASAVA_Build 21 39136021 1I ATTTTTCCCA -/G GGCCTCTTAG 3070 hom 91 het 32 0 30 2 G 2 3 327343 CASAVA_Build 21 39144811 2D TTTTGCGGTA TT/-- TTTTTTTTGG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 10 8 327344 CASAVA_Build 21 39148363 1I AAAAGAACAG -/A AAAAAATATT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 6 7 327345 CASAVA_Build 21 39160422 1D AGGCAGAGAA T/- TTGCTTGAAC 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 T 3 2 327346 CASAVA_Build 21 39163195 1D AGGAAGCACT G/- GGGGGAAGGA 3070 hom 55 het 32 1 28 3 G 6 5 327347 CASAVA_Build 21 39164092 2I TGTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 59 23 27 9 TG 7 8 327348 CASAVA_Build 21 39164230 1D TCAAGATACT G/- ATTTCATTTC 3070 het 3070 ref 47 30 15 3 G 1 0 327349 CASAVA_Build 21 39166354 1I CTCTCAGTCA -/T TCTTTCCTGT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 1 2 327350 CASAVA_Build 21 39167322 2I TGTCCTGATA --/CT CTCCCTCTGT 3070 het 2477 hom 48 8 31 9 CT 1 2 327351 CASAVA_Build 21 39168426 1I AAAAAAAAAT -/A AAAAAATAAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 6 7 327352 CASAVA_Build 21 39172633 1D GGTGCAATTG A/- GAGGAAATTG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 A 1 0 327353 CASAVA_Build 21 39173169 1D ACTACATCAA C/- CCATAACACA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 3 2 327354 CASAVA_Build 21 39180248 1I GCTGCTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 14 9 T 13 14 327355 CASAVA_Build 21 39182922 1I CAAGCCTATA -/G GGTCATTCAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 2 3 327356 CASAVA_Build 21 39183032 1I GATTCGAGAG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 A 6 7 327357 CASAVA_Build 21 39183299 1D ATATTTGGAC A/- AAACTTTCTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 4 3 327358 CASAVA_Build 21 39185938 1I TTTCTTCTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 894 hom 24 2 21 1 T 9 10 327359 CASAVA_Build 21 39186003 1D TGTTTTTAAA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 7 6 327360 CASAVA_Build 21 39191257 1D GACTTGAGAT A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 A 7 6 327361 CASAVA_Build 21 39198241 2I TGGGTGGTCA --/GT GTGTGTGCAG 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 GT 3 4 327362 CASAVA_Build 21 39200842 3D AGACCTTCTC AAG/--- AAGAAATTCT 2851 het 2851 ref 35 20 6 10 AAG 2 1 327363 CASAVA_Build 21 39202819 1D CTAGGTCTCT G/- GACAGGTCCA 3070 het 3070 hom 42 15 19 9 G 2 1 327364 CASAVA_Build 21 39202885 1D CCCTGGAATT G/- CATGCACAAT 3070 het 2757 hom 26 10 12 4 G 1 0 327365 CASAVA_Build 21 39205065 4D TGGAGCCCCG TGTC/---- TGTCTGTGTT 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 TGTC 2 1 327366 CASAVA_Build 21 39206145 1I CCCTGAAAAG -/T TAAGTAATCA 3070 het 3070 ref 46 21 16 9 T 1 2 327367 CASAVA_Build 21 39207680 1D CTACAAACAA G/- CACAATATAC 3070 hom 179 het 71 0 61 11 G 1 0 327368 CASAVA_Build 21 39212495 1I CCTGCACCCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 53 30 14 9 T 8 9 327369 CASAVA_Build 21 39216139 1I CACTAAACTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 T 9 10 327370 CASAVA_Build 21 39218499 1D AAGAATGTCT G/- CCTTTTAATG 3070 het 2074 hom 23 6 12 5 G 1 0 327371 CASAVA_Build 21 39219530 3D CAGTTCTTCT CAA/--- CAACGGGGTG 3070 het 3070 ref 36 18 10 10 CAA 2 1 327372 CASAVA_Build 21 39222677 2I CTTAAGGGGT --/CA CAACAAATCT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 CA 1 2 327373 CASAVA_Build 21 39224382 2D TTTTGGGGGA AG/-- AGAGGGGGCA 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 AG 3 2 327374 CASAVA_Build 21 39225161 3I ATTGCCTTCA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 AAC 3 4 327375 CASAVA_Build 21 39225935 1I TCTTTTTGAG -/A CAGGGTCTCA 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 A 0 1 327376 CASAVA_Build 21 39227179 27D CAGGGCCACT CAGTTGAAGTTCAGTTCAACATAATTA/--------------------------- CAGTTGAAGT 3070 hom 81 het 39 0 25 22 CAGTTGAAGTTCAGTTCAACATAATTA 2 1 327377 CASAVA_Build 21 39227951 1I CATCATAGTG -/A AACCCCATCT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 2 3 327378 CASAVA_Build 21 39228239 1I TTAAATGTGA -/C TGTCCCAGGG 3070 hom 65 het 27 0 19 8 C 0 1 327379 CASAVA_Build 21 39228360 1I GCTCACTGCA -/G GCTCTGCCTC 3070 hom 47 het 19 0 14 5 G 1 2 327380 CASAVA_Build 21 39228468 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 G 3 4 327381 CASAVA_Build 21 39229378 13D TTGGCTACGA TGCATCAACCTGC/------------- TGTAAACACT 3070 het 3070 ref 42 23 19 5 TGCATCAACCTGC 1 0 327382 CASAVA_Build 21 39232461 1I TTGGTGTGGG -/T GTCTTCATCA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 0 1 327383 CASAVA_Build 21 39234363 1I GGCATGAGAG -/A GATAATACAA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 0 1 327384 CASAVA_Build 21 39237544 4I TTAAAAATAA ----/AAAT AAATAAATTA 3070 hom 56 het 22 0 19 3 AAAT 2 3 327385 CASAVA_Build 21 39238213 1D CAGGACTTTA T/- TTTTATTTTA 150 het 150 ref 16 6 2 8 T 5 4 327386 CASAVA_Build 21 39241873 1D GCACCGATTT C/- CCATAAGACA 3070 hom 138 het 55 0 43 12 C 3 2 327387 CASAVA_Build 21 39253587 3I ATAATCCATG ---/GGT GTTGTTTTAC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 GGT 0 1 327388 CASAVA_Build 21 39257439 2I GAAGAGTAGG --/CC CCCCCCAACT 2903 het 2903 ref 23 11 8 4 C 6 8 327389 CASAVA_Build 21 39258944 1D TGTATAAACC A/- AAAAATAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 5 327390 CASAVA_Build 21 39259918 1D TGGCGCTGCG T/- TAAGGTCTTT 2516 het 2516 ref 26 14 7 5 T 2 1 327391 CASAVA_Build 21 39262867 8I AAGCCAGACA --------/CAGCCACC CCCGCAGGCA 3070 het 3070 ref 48 19 18 11 CAGCCACC 0 1 327392 CASAVA_Build 21 39265316 1D TTTTTTTTTC T/- CTTAGTAACC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 1 0 327393 CASAVA_Build 21 39296400 1I CCAGAAGGAA -/C CGTCACAGTG 3070 hom 147 het 58 0 49 9 C 1 2 327394 CASAVA_Build 21 39303836 1D AGTTGGAAAT A/- ACAGCCCCCA 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 2 1 327395 CASAVA_Build 21 39304855 1I ATGCATGTTG -/C TATTTAGTGA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 327396 CASAVA_Build 21 39310076 2D ACCAAATCAA CT/-- CTTTGTTCAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 CT 2 1 327397 CASAVA_Build 21 39312669 1I GCATTGAGAA -/T TTCCCTCAGG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 2 3 327398 CASAVA_Build 21 39313255 1I GTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2754 het 2754 ref 38 15 10 13 A 11 12 327399 CASAVA_Build 21 39320175 1D CTGTGAAGTG T/- GGGGGGAGCA 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 T 1 0 327400 CASAVA_Build 21 39320849 1I CAATTGTTGA -/G GGATTTGCAC 3070 hom 138 het 54 0 45 9 G 2 3 327401 CASAVA_Build 21 39327420 1I ATAATTGTGC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 A 7 8 327402 CASAVA_Build 21 39329094 3D TGGGTCATCG TCA/--- TCATCATCAT 3070 hom 90 het 38 0 31 9 TCA 5 4 327403 CASAVA_Build 21 39335166 1D CTAATATGGT A/- AAAAAAAAAA 1875 het 1875 ref 31 22 4 5 A 11 10 327404 CASAVA_Build 21 39338090 10D AAAAAATCAA ATATATATAT/---------- ATATATATAT 2186 het 1138 hom 13 3 8 2 AT 14 9 327405 CASAVA_Build 21 39341080 1D ATCTAGGGGT A/- GGGGCGGGAT 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 A 1 0 327406 CASAVA_Build 21 39344738 1D CTCTTCCAGG A/- AAAATGTTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 5 4 327407 CASAVA_Build 21 39345981 2I TATACACATC --/AT ATACATATAT 3070 hom 108 het 39 0 35 4 AT 1 2 327408 CASAVA_Build 21 39347531 8D TACATCCCTC CATCTGTT/-------- CATCTGTTCG 3070 hom 116 het 44 0 37 7 CATCTGTT 2 1 327409 CASAVA_Build 21 39347625 11I AGAAAACTAA -----------/TTCATGCCCCT TCCTTTTTTA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TTCATGCCCCT 0 1 327410 CASAVA_Build 21 39353160 1D GTTAGCCTAT G/- CTGACTAACT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 1 0 327411 CASAVA_Build 21 39357427 1I AGAAGAGGTT -/A ATAGCTGCTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 A 1 2 327412 CASAVA_Build 21 39357868 2I TGTCTCTAAA --/AT ATATATATAT 2539 hom 9 het 13 0 8 5 AT 7 8 327413 CASAVA_Build 21 39358146 1I TTCAGCCTGA -/C CCTGTCTCTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 2 3 327414 CASAVA_Build 21 39364684 2I ATAATTTAAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AC 7 8 327415 CASAVA_Build 21 39370905 1I ATGTGGGGAT -/G GGGGGGTCAC 3070 hom 112 het 43 0 37 6 G 6 7 327416 CASAVA_Build 21 39380379 4D TCCGTCTCAG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 21 1 16 10 A 16 12 327417 CASAVA_Build 21 39384049 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 10 9 327418 CASAVA_Build 21 39384249 1D AGAGGCCTTC A/- AAGACTGGGA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 3 2 327419 CASAVA_Build 21 39384484 1I TCAGCAACCT -/G GGGAGGGGAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 3 4 327420 CASAVA_Build 21 39386631 11D TGGCTTACGC CTGTAATCCCA/----------- CTGTAATCCC 1499 het 1499 ref 17 9 4 6 CTGTAATCCCA 2 1 327421 CASAVA_Build 21 39394342 2D ATTGTTTTAT TA/-- TATATATTAC 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 TA 4 3 327422 CASAVA_Build 21 39396215 2I AATCTTCTTA --/TT TGATTGAGGA 2467 het 2467 ref 23 14 7 2 T 1 3 327423 CASAVA_Build 21 39397934 36D GGAAGGAAGG AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA/------------------------------------ AGAAAGAAAG 2860 hom 26 het 12 0 10 7 AGAA 13 4 327424 CASAVA_Build 21 39405936 1I AAAGGGAGGG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 A 7 8 327425 CASAVA_Build 21 39406435 1I CAAGTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2562 het 2562 ref 31 15 10 6 A 15 16 327426 CASAVA_Build 21 39420504 1I TTTGTCCCCT -/G GGGGACATTT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 G 4 5 327427 CASAVA_Build 21 39427551 2I ACAAAGACAC --/AA CCAAAATAAT 3070 hom 144 het 50 0 49 1 A 0 2 327428 CASAVA_Build 21 39433777 1D AAACTGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 20 0 14 6 A 16 15 327429 CASAVA_Build 21 39435086 6D CTAAGTAATT TGAGTA/------ TAAGTGCCAC 3070 het 3070 hom 32 13 18 3 TGAGTA 1 0 327430 CASAVA_Build 21 39439732 1D TCTACATGCT A/- AAAAAAAAAA 1489 het 1489 ref 51 38 4 9 A 11 10 327431 CASAVA_Build 21 39443374 1D ATGAATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 18 1 11 6 T 15 14 327432 CASAVA_Build 21 39447250 1D TTTACAAGAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 9 8 327433 CASAVA_Build 21 39453017 1I GTTTCTAGAA -/C AGGAAAGAAG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 C 0 1 327434 CASAVA_Build 21 39458354 2D GCATGTGACG AA/-- AAAAAGACAT 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 A 7 5 327435 CASAVA_Build 21 39462239 5D TTTCATTTCC TATTT/----- TATTTGGGTC 3070 het 3070 hom 26 8 17 2 TATTT 2 1 327436 CASAVA_Build 21 39462897 6D TTTTGTCTAG ATGATC/------ ATGATCTGAG 3070 het 3070 ref 45 24 20 2 ATGATC 2 1 327437 CASAVA_Build 21 39464628 2I CACCTTAATT --/AA AAAAAAAAAA 230 het 230 ref 27 9 3 15 A 10 12 327438 CASAVA_Build 21 39473815 1I TTTTGTCAAG -/T TAAGTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 T 1 2 327439 CASAVA_Build 21 39479311 2D24M1D GAATTCTTCC CTTTCTCACCTGTGTATCAACATATTG/--TTCTCACCTGTGTATCAACATATT- GGGATCAGTA 3070 het 3070 ref 26 17 17 0 N/A 0 0 327440 CASAVA_Build 21 39479505 3D TCTGTATAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 30 2 15 14 A 13 10 327441 CASAVA_Build 21 39480470 5D TTGAAATTTG TTCAC/----- TTCAAGTTCT 3070 het 3070 ref 45 19 20 6 TTCAC 1 0 327442 CASAVA_Build 21 39484027 1I CTAATTAGAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 T 8 9 327443 CASAVA_Build 21 39486058 5D ACATACTTTA CTTTT/----- CAATCCTTAC 3070 het 3070 hom 37 13 21 5 CTTTT 1 0 327444 CASAVA_Build 21 39486184 1D TTCTCTTCCC A/- AATACTAGGA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 3 2 327445 CASAVA_Build 21 39486677 5I ATTCTTCCTA -----/TTTAG TTTTTAATAT 3070 het 1803 hom 24 4 13 7 TTTAG 0 1 327446 CASAVA_Build 21 39504052 2D GGAAAAGGTT AG/-- AGGACTCTTA 3070 het 3070 ref 35 18 16 2 AG 2 1 327447 CASAVA_Build 21 39507201 22D TGGTACTACA AAGCCAACATTTTCTTCACTTT/---------------------- AAAAATACCA 3070 het 3070 ref 38 30 17 4 AAGCCAACATTTTCTTCACTTT 1 0 327448 CASAVA_Build 21 39508677 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 24 1 17 6 T 15 14 327449 CASAVA_Build 21 39508874 1I ACCATGTTGG -/C TACGCTGGTC 3070 hom 66 het 26 0 21 5 C 0 1 327450 CASAVA_Build 21 39509790 2I AGCAAGACTC --/TA TCTCAAAAAC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 TA 0 1 327451 CASAVA_Build 21 39511153 1D GGGCCTCATG A/- AAGTGCTGGG 3070 hom 60 het 24 0 21 4 A 3 2 327452 CASAVA_Build 21 39512846 1I CAAAATGGAT -/A AAATAATCCC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 3 4 327453 CASAVA_Build 21 39516743 1I CATTTTTGCC -/A AAAAATGCAA 3070 het 667 hom 33 2 19 12 A 5 6 327454 CASAVA_Build 21 39516771 1I TTTAATCCAG -/A AAAAACATCA 3070 het 1393 hom 32 4 20 8 A 5 6 327455 CASAVA_Build 21 39519086 3I ACAGATAAAA ---/AAG AAGCCAAAAG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AAG 1 2 327456 CASAVA_Build 21 39521173 1D TACACCTGTG A/- AAACAGGTAC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 4 3 327457 CASAVA_Build 21 39534697 1I TAAGTAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 11 12 327458 CASAVA_Build 21 39538235 2D CCTCATTTTT AA/-- AAGAGATTAT 3070 het 3070 hom 48 18 22 10 A 4 2 327459 CASAVA_Build 21 39543274 3D ATCAAAACAG AAT/--- AATCATTCAA 3070 het 3070 hom 49 21 22 7 AAT 2 1 327460 CASAVA_Build 21 39546611 1D ACATTCTGGT C/- AATGAGTTAT 3070 het 3070 ref 50 26 22 2 C 1 0 327461 CASAVA_Build 21 39548220 1D AGGGAGCCTT A/- GAAAAGAGGC 3070 hom 108 het 40 0 36 5 A 1 0 327462 CASAVA_Build 21 39553267 1I TTTGTATTTC -/T TTTTTTTTCA 2761 het 978 hom 12 3 8 1 T 8 9 327463 CASAVA_Build 21 39558225 1D GTACAACTTT A/- AAAAAAAAAA 1780 het 74 hom 18 1 8 9 A 19 18 327464 CASAVA_Build 21 39559282 1I TCACTATTCC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 7 8 327465 CASAVA_Build 21 39560083 1D CATAAAAAGG A/- AAAAAATTGT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 7 6 327466 CASAVA_Build 21 39562299 1I ATGTGCCTCC -/T TAATATGATT 3070 het 3070 ref 23 10 7 6 T 1 2 327467 CASAVA_Build 21 39567427 18D GCTACTTGGA AGGCTGAGATGGGGGGAC/------------------ AGGCTGAGAT 3070 het 3027 hom 26 10 9 9 AGGCTGAGATGGGGGGAC 2 1 327468 CASAVA_Build 21 39570551 4D TGGGCTTGGT TAGA/---- TAAACAGGCT 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 TAGA 1 0 327469 CASAVA_Build 21 39573281 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 5 6 327470 CASAVA_Build 21 39575707 2I13M4D TGTATACATG --TATATATATACGTATAC/TATATATATATACGT---- ATACATATAC 3070 het 1259 hom 20 3 11 7 N/A 0 0 327471 CASAVA_Build 21 39585531 2D TTATCTGCCC CT/-- CTCATCACGT 3070 het 3070 hom 57 27 22 8 CT 2 1 327472 CASAVA_Build 21 39586533 1I TTCAACGAAG -/A AAACTGCAAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 3 4 327473 CASAVA_Build 21 39588281 3I GTGAAACCTT ---/GTC TCTACTAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 GTC 0 1 327474 CASAVA_Build 21 39590533 1D AATGATTGGT A/- AAAGATGGAC 3070 hom 64 het 25 0 21 4 A 4 3 327475 CASAVA_Build 21 39593057 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 408 hom 25 2 19 5 T 1 0 327476 CASAVA_Build 21 39593609 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 23 1 15 7 A 13 12 327477 CASAVA_Build 21 39595273 1D GAAACTGAGG C/- CCTCAGTCAA 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 C 3 2 327478 CASAVA_Build 21 39598233 1D ATAGTGAGAC A/- GTCTCTAGAA 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 A 1 0 327479 CASAVA_Build 21 39598416 1I TCTGGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 407 hom 41 1 30 10 A 10 11 327480 CASAVA_Build 21 39610658 1I GGCTAGAGCC -/G GGGGGGGATT 3070 het 3070 ref 32 11 14 7 G 7 8 327481 CASAVA_Build 21 39616061 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 2848 hom 23 8 11 4 A 9 8 327482 CASAVA_Build 21 39619073 1D TGTGAGATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1389 hom 30 13 15 2 T 24 23 327483 CASAVA_Build 21 39620216 1I GTGAGCCACT -/G CGCCCGACTG 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 G 0 1 327484 CASAVA_Build 21 39623330 1D AAAAAAAAAA C/- ACCCCAGCCG 2928 het 533 hom 38 11 13 16 C 1 0 327485 CASAVA_Build 21 39624742 4I TAATAATAAT ----/AATA AGGTGAATTG 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 AATA 0 1 327486 CASAVA_Build 21 39631488 1I GCCCTGCCGA -/T TTTTTTTTTT 1502 het 1502 ref 16 6 5 5 T 10 11 327487 CASAVA_Build 21 39631764 1I AATAGAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 10 11 327488 CASAVA_Build 21 39632069 1I TAATAATTAT -/A AAAAAAAAGT 2141 het 735 hom 9 2 5 2 A 8 9 327489 CASAVA_Build 21 39634184 1D GATTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1735 hom 26 6 14 7 A 12 11 327490 CASAVA_Build 21 39635841 1I AAATATGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3006 hom 33 8 16 9 T 11 12 327491 CASAVA_Build 21 39636120 1I ATATTTTCAT -/A AACTGAGATT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 A 2 3 327492 CASAVA_Build 21 39636425 4I AGGACTACCA ----/CAAC CAAAGATGTT 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 CAAC 0 1 327493 CASAVA_Build 21 39640225 1I TTGTAGTCTG -/A TTTCTAAAGA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 0 1 327494 CASAVA_Build 21 39655096 10I TACTTTGACA ----------/TAGTTGTAAG TGCCTTGAAG 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 TAGTTGTAAG 0 1 327495 CASAVA_Build 21 39656761 1I ACCCAAACAC -/A AATATACACA 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 A 2 3 327496 CASAVA_Build 21 39664943 1D AAATTAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 16 14 19 T 17 16 327497 CASAVA_Build 21 39678361 1D TGGCCGACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 17 1 12 4 T 17 16 327498 CASAVA_Build 21 39686310 1I TGCTAAGAGA -/T TAAGTTTCCG 3070 hom 102 het 40 0 31 9 T 1 2 327499 CASAVA_Build 21 39691482 5I ATAAGTCCTG -----/ATTAA ATTAATCTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATTAA 1 2 327500 CASAVA_Build 21 39693996 1I GTGCTGACAG -/C CCCCCCGGAA 3070 het 382 hom 39 1 31 7 C 6 7 327501 CASAVA_Build 21 39696655 1I TCTCATAATA -/C CTCAGAGATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 1 2 327502 CASAVA_Build 21 39713320 1I GACCCTGTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 30 0 20 10 A 12 13 327503 CASAVA_Build 21 39738895 4I TTCAGCCGTG ----/AAAA AAAACTGGTC 3070 hom 93 het 33 0 30 3 A 4 8 327504 CASAVA_Build 21 39739010 4D GGGGACAAAC ACAG/---- ACAGAGAAGA 3070 hom 76 het 28 0 25 3 ACAG 2 1 327505 CASAVA_Build 21 39743892 1D TTTCTTCAAG T/- AATATTTGGA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 1 0 327506 CASAVA_Build 21 39750737 4D GGTATAAGTG TTAA/---- TTAAATTAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 TTAA 2 1 327507 CASAVA_Build 21 39751045 2D7M3D AAAATCTTAT TATATTATATTG/--TATTATA--- TTATATATAA 254 het 254 ref 5 2 2 2 N/A 0 0 327508 CASAVA_Build 21 39752003 2D GGCTCTTGTG CT/-- CTGTAAAACA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 CT 2 1 327509 CASAVA_Build 21 39760697 1I TCAAAAGGGA -/T TTTTTTTTTT 2580 het 2580 ref 27 17 6 4 T 10 11 327510 CASAVA_Build 21 39763435 1D TCTTTTTTTT A/- AATTTAATTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 3 2 327511 CASAVA_Build 21 39773662 1D TCCGTAGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 351 hom 27 1 23 3 T 10 9 327512 CASAVA_Build 21 39788927 1I TTGAGAATAG -/T TTTAATAGCT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 3 4 327513 CASAVA_Build 21 39789934 1D TTTAGGAGCC G/- TAGTTATTGT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 G 1 0 327514 CASAVA_Build 21 39796782 1I TTCCAAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 29 1 13 15 T 13 14 327515 CASAVA_Build 21 39802089 1D TATCGGACCA T/- TTCTGGGAAG 3070 hom 71 het 27 0 23 4 T 3 2 327516 CASAVA_Build 21 39802752 5D TTAAACGTAC TTGAA/----- TTATGTTTTT 3070 hom 55 het 23 0 19 4 TTGAA 1 0 327517 CASAVA_Build 21 39804895 1D AGAAGGATGA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 8 7 327518 CASAVA_Build 21 39805542 3I CTGCAGAAGG ---/AGA AGAAGAGCCT 3070 hom 88 het 38 0 26 12 AGA 2 3 327519 CASAVA_Build 21 39809490 1D TTACGTCGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 59 1 48 11 T 11 10 327520 CASAVA_Build 21 39825031 2D AGGAAGAGGC AA/-- AGAGGATTCT 3070 hom 93 het 36 0 28 11 A 3 1 327521 CASAVA_Build 21 39826055 1D AACAAGGCTG A/- GAAGACCCAC 3070 het 3070 ref 43 20 15 10 A 1 0 327522 CASAVA_Build 21 39827096 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCACC 3013 het 1979 hom 12 5 7 0 G 3 4 327523 CASAVA_Build 21 39829091 6D ACTGCATCTC AAAAAA/------ AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 9 13 4 A 14 8 327524 CASAVA_Build 21 39831066 2I TAAATTAAAC --/TT TATCACAGGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 3 327525 CASAVA_Build 21 39832562 10D TGGCGCTAGC TGTGACCAAT/---------- TATTATTTTA 3070 hom 89 het 32 0 28 8 TGTGACCAAT 1 0 327526 CASAVA_Build 21 39835481 1D TCTGTACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 21 0 15 6 T 11 10 327527 CASAVA_Build 21 39840700 4D TGCCTGTCTT CTAA/---- CTGTGTCCTC 3070 het 3070 hom 40 16 20 7 CTAA 1 0 327528 CASAVA_Build 21 39841979 1I TCCTGGAATA -/C TCTTACTCAT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 C 0 1 327529 CASAVA_Build 21 39842462 1D CCCTGAACAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 9 8 327530 CASAVA_Build 21 39844713 3D TGCCAGCATC TGT/--- TGTTTGCTGA 2139 hom 15 het 6 0 5 1 TGT 2 1 327531 CASAVA_Build 21 39850559 2D TCCTTTCTAC AG/-- AGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 AG 2 1 327532 CASAVA_Build 21 39851478 10D TTTTGGCTGC ATAAATGTCT/---------- TCTTTTGAGA 2871 het 541 hom 9 2 7 3 ATAAATGTCT 1 0 327533 CASAVA_Build 21 39854922 1D TGTTCACGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 26 2 20 4 A 14 13 327534 CASAVA_Build 21 39859703 1I AGCCACCACA -/C CCGGCCCAAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 C 2 3 327535 CASAVA_Build 21 39859911 11I GTCTATTAAC -----------/AATGACGTAGA AAGGATGTAG 3070 hom 165 het 60 0 54 7 AATGACGTAGA 0 1 327536 CASAVA_Build 21 39864089 3D TTAATTAATG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 24 1 21 4 T 14 11 327537 CASAVA_Build 21 39865890 4D CTGGGGACTT ATTG/---- AAGAATATTT 3070 hom 78 het 27 0 26 2 ATTG 1 0 327538 CASAVA_Build 21 39866441 1D AGTTAGTATC T/- TTTCCCCCTT 3070 hom 159 het 59 0 52 7 T 4 3 327539 CASAVA_Build 21 39866640 1I TGTATTCCCC -/T GCCCTTGGCT 3070 hom 128 het 50 0 41 9 T 0 1 327540 CASAVA_Build 21 39888956 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 47 hom 23 1 17 5 T 8 7 327541 CASAVA_Build 21 39904529 10D GCCCATCTCA CAGTGGTGCT/---------- CACTGGGCTA 3070 hom 141 het 50 0 46 8 CAGTGGTGCT 1 0 327542 CASAVA_Build 21 39918649 1D AAGGCGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 34 2 21 13 T 12 11 327543 CASAVA_Build 21 39920602 1D TTTTGTTGTT G/- ACAGACTCCT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 1 0 327544 CASAVA_Build 21 39938662 3I CCAGGGTCAC ---/CTG AGGCTTCTAC 3070 hom 75 het 28 0 24 4 CTG 0 1 327545 CASAVA_Build 21 39941343 10D ACCTTGCTGG CCACGCTGGT/---------- CCACGCTGGT 3070 hom 39 het 21 0 13 8 CCACGCTGGT 2 1 327546 CASAVA_Build 21 39943453 1D AGGAGACCCC A/- GGGGCGAGGG 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 1 0 327547 CASAVA_Build 21 39944580 1D AGTTTGTTTT G/- CTTAGTAGAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 G 1 0 327548 CASAVA_Build 21 39944774 1I AACCATAAAG -/A AAAAAAAAAA 2906 het 2906 ref 37 15 10 12 A 10 11 327549 CASAVA_Build 21 39945573 1I GTTAAGGCAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 T 8 9 327550 CASAVA_Build 21 39951457 4D TTCTCATCTA TCTG/---- TCTGTCTATC 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 TCTG 2 1 327551 CASAVA_Build 21 39952666 1D CCATTATTAT A/- TTCCTATTGC 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 1 0 327552 CASAVA_Build 21 39959925 2D GGTGCGACTC TG/-- TGACCTGAAA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 TG 2 1 327553 CASAVA_Build 21 39963067 1D ATCTACAGTA T/- TTTTTTTTTT 1290 het 1290 ref 34 23 3 8 T 11 10 327554 CASAVA_Build 21 39994398 1I TGTGTTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 13 14 327555 CASAVA_Build 21 39994705 1I GCTCAAATAA -/T TTCTTTATTC 3070 hom 36 het 23 0 12 11 T 2 3 327556 CASAVA_Build 21 39995412 1D CTGTTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 11 10 327557 CASAVA_Build 21 40001097 1D ACTTATGTGT G/- GGGGCCACAG 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 G 5 4 327558 CASAVA_Build 21 40001681 1D AAAGTTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 12 11 327559 CASAVA_Build 21 40001860 1D TGAGCAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1692 het 1692 ref 20 13 5 2 A 11 10 327560 CASAVA_Build 21 40011894 1D TTTTTTTTTT G/- TGTGTGTCAC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 G 1 0 327561 CASAVA_Build 21 40028066 1I CTGAAAATAC -/A AAAAATTAGC 3047 het 3007 hom 18 7 8 3 A 5 6 327562 CASAVA_Build 21 40038854 1D TAGGGCACAC T/- TTTTTTTTTT 1563 het 1563 ref 30 16 6 9 T 12 11 327563 CASAVA_Build 21 40040468 7D CTGATGGAAC ACAGTTA/------- ACAGTTAACA 3070 het 3070 ref 42 24 10 8 ACAGTTA 2 1 327564 CASAVA_Build 21 40041241 1D CACATGGCCT G/- GGGGGTTCCA 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 G 6 5 327565 CASAVA_Build 21 40041738 1I AAACTCTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2877 hom 34 11 14 9 A 11 12 327566 CASAVA_Build 21 40042618 8I AGTTCCACCA --------/GAAGTAAG GAAAACAGCC 3070 het 3070 ref 47 26 19 3 GAAGTAAG 0 1 327567 CASAVA_Build 21 40044536 1D CCCTCGGGAC T/- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 T 6 5 327568 CASAVA_Build 21 40046145 1D ATTTTATTCC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 T 9 8 327569 CASAVA_Build 21 40047539 1D CTTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 5 T 11 10 327570 CASAVA_Build 21 40047718 1I TTGGTTGGTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 7 8 327571 CASAVA_Build 21 40050840 2I CAGGCACAGT --/CC CCCCCCGAGA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 C 6 8 327572 CASAVA_Build 21 40051074 4I ATTCGGTTGC ----/CTGT CTTTCCTTTT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 CTGT 0 1 327573 CASAVA_Build 21 40051110 1D53M1I GAGGGCAGGA GTTTTTTCTCAGTGATTAGTGATTGAAACGAATGTAATAAGCCCATGATCTGCA-/-TTTTTTCTCAGTGATTAGTGATTGAAACGAATGTAATAAGCCCATGATCTGCAT TTTGGTCAGG 3070 het 3070 ref 34 21 11 24 N/A 0 0 327574 CASAVA_Build 21 40052847 4D ATTCTGACTT CTAA/---- CTGTGTAGAC 3070 het 3070 hom 60 9 31 22 CTAA 1 0 327575 CASAVA_Build 21 40052893 5D TACAAACATA TCTAC/----- TCTATTTTAG 3070 het 3070 hom 53 9 30 16 TCTAC 1 0 327576 CASAVA_Build 21 40054376 1D AAGTCAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 8 7 T 12 11 327577 CASAVA_Build 21 40063863 1D AATTTTTTCA T/- TTCTTAGTTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 3 2 327578 CASAVA_Build 21 40064073 1I TGTTCTTAAT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 7 8 327579 CASAVA_Build 21 40064474 2I TATGTAACTT --/TG TGCTTTCTTG 3070 hom 62 het 24 0 21 3 TG 1 2 327580 CASAVA_Build 21 40068938 1D TACTGAACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 A 10 9 327581 CASAVA_Build 21 40070005 4I ATGTGTATAG ----/ATAT ATATAAAATA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AT 2 4 327582 CASAVA_Build 21 40073983 1D TTATTTGTCT G/- TGTGTTTTAA 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 G 1 0 327583 CASAVA_Build 21 40075005 3I TATTCTCTTC ---/CTT CTTACATGAA 3070 hom 126 het 43 0 43 0 CTT 1 2 327584 CASAVA_Build 21 40075830 1I ATGCATCTAA -/T TTTTATCTTC 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 T 4 5 327585 CASAVA_Build 21 40086337 1I AAAAAAATTG -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 6 7 327586 CASAVA_Build 21 40086807 1I AGCAGCCCCA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 97 het 39 0 30 9 T 8 9 327587 CASAVA_Build 21 40105491 1I CATTGCAAAA -/T AATTGCTATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 0 1 327588 CASAVA_Build 21 40109288 2I TAAAAAACTC --/TT TAAGGCCATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 3 327589 CASAVA_Build 21 40110459 1D TTTTCAAACC T/- ATAGCAGTTA 3070 hom 123 het 45 0 42 4 T 1 0 327590 CASAVA_Build 21 40111310 4I GAAACAAATT ----/AATC AATAAATCTG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AATC 0 1 327591 CASAVA_Build 21 40111412 1I AAATTAGTGC -/A ATGTGACATG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 1 2 327592 CASAVA_Build 21 40113568 3D GGTATAGTTC CTG/--- CTGCCCATCT 3070 hom 108 het 40 0 36 7 CTG 2 1 327593 CASAVA_Build 21 40114620 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 9 8 327594 CASAVA_Build 21 40122235 1I22M1I15M1I GGGGGAAAGC -TTCAACTTTTGCCCATTCAGTA-TATGTTGGCTGTGGG-/TTTCAACTTTTGCCCATTCAGTATTATGTTGGCTGTGGGT TTGTCATAGA 3070 hom 57 het 28 0 20 9 N/A 0 0 327595 CASAVA_Build 21 40144264 2D CAAAGATGAC AG/-- AGGCTGAGAC 3070 het 3070 hom 45 19 18 10 AG 2 1 327596 CASAVA_Build 21 40147548 2D TTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2274 het 949 hom 21 6 10 5 T 17 15 327597 CASAVA_Build 21 40157537 1I TCGCCATGAA -/G GCCAGGCTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 1 2 327598 CASAVA_Build 21 40160965 1D TACTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 39 1 34 4 T 15 14 327599 CASAVA_Build 21 40169058 1I TTTCTCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 28 1 22 5 T 10 11 327600 CASAVA_Build 21 40171820 3I AGAGATTATG ---/TCT TCTTCTATAC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TCT 2 3 327601 CASAVA_Build 21 40176930 1D ACAAGTATTT C/- CTTTGTGTAC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 C 2 1 327602 CASAVA_Build 21 40179124 1I TGGTTGCTAA -/G AAACAACGAG 3070 hom 83 het 35 0 22 13 G 0 1 327603 CASAVA_Build 21 40181134 1I18M1I TTTAACCAAC -TTTTTTTTTGTTTTTTGG-/TTTTTTTTTTGTTTTTTGGT TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 10 N/A 0 0 327604 CASAVA_Build 21 40194711 1D TTTTAAATGG T/- TTTTCTTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 5 4 327605 CASAVA_Build 21 40203596 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2735 het 1545 hom 20 4 8 8 T 12 13 327606 CASAVA_Build 21 40207041 1I GATAGTGTCA -/T TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 T 4 5 327607 CASAVA_Build 21 40209025 1D GTATTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 13 12 327608 CASAVA_Build 21 40220295 1D CTTGGAATCA G/- GAGTGAATTT 3070 hom 132 het 52 0 44 8 G 2 1 327609 CASAVA_Build 21 40221364 1D AGGAATAGAG C/- CCCACTCCCT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 C 4 3 327610 CASAVA_Build 21 40232475 1D TTGATAACCT C/- CCTTGTGGGT 3070 hom 103 het 40 0 30 10 C 3 2 327611 CASAVA_Build 21 40237978 1D CAAAGTCACT A/- AGGTGGGAAA 3070 hom 96 het 41 0 32 11 A 2 1 327612 CASAVA_Build 21 40249362 2I CTATTTTTTT --/TG TTTGTTTTTT 2758 het 2758 ref 21 14 7 0 TG 0 1 327613 CASAVA_Build 21 40249979 2I TGCATAGTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 23 13 15 T 12 14 327614 CASAVA_Build 21 40251177 4I TCTTAGAGAA ----/AATT TAAAGTGCTT 3070 het 3070 hom 40 15 22 4 AATT 0 1 327615 CASAVA_Build 21 40258805 1I TGGGGGAAAA -/G CACATTCAAT 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 G 0 1 327616 CASAVA_Build 21 40259374 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 43 16 13 14 CA 9 8 327617 CASAVA_Build 21 40260549 3D TAAATTCAAG GGT/--- GGTGGGTTCA 3070 het 3070 ref 40 19 18 7 GGT 2 1 327618 CASAVA_Build 21 40260798 2I TTTGGGGAAC --/TG TGTGGGGCTG 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 TG 2 3 327619 CASAVA_Build 21 40264713 4D TTCATTAAAT ACAC/---- ACATACAAGT 3070 het 3070 ref 44 25 16 7 AC 3 1 327620 CASAVA_Build 21 40265162 1D ATAAAAAAAA T/- AAAAATGTTA 3070 het 346 hom 42 1 37 4 T 1 0 327621 CASAVA_Build 21 40265411 1I AATTCTTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 8 9 327622 CASAVA_Build 21 40276131 2D TCTTACATCC TA/-- TAGCACCACA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 TA 2 1 327623 CASAVA_Build 21 40277599 4D CCTTCCTTCT TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTCC 5 4 327624 CASAVA_Build 21 40279482 20D ACACACTCAC CACCCACGCAAATGTACATA/-------------------- CACCACATCA 3070 hom 138 het 45 0 42 9 CACCCACGCAAATGTACATA 1 0 327625 CASAVA_Build 21 40279771 2D CTCACATATA AC/-- ACAAACACAC 3070 hom 177 het 68 0 55 15 AC 2 1 327626 CASAVA_Build 21 40286270 1I GGGAAGAATC -/A AAATCATGCT 3070 hom 131 het 49 0 43 6 A 3 4 327627 CASAVA_Build 21 40287203 1D TTTATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 32 1 25 6 T 12 11 327628 CASAVA_Build 21 40290984 3D GGTGAAGAGG TGA/--- TGATGTTCAG 3070 hom 87 het 32 0 30 3 TGA 2 1 327629 CASAVA_Build 21 40306537 1D TTTAATTAAT C/- CCCCCCATGC 3070 hom 103 het 38 0 33 5 C 7 6 327630 CASAVA_Build 21 40306705 2I GTATTTTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 22 9 T 12 14 327631 CASAVA_Build 21 40309215 2D CTCTTGACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 29 0 18 11 T 14 12 327632 CASAVA_Build 21 40311830 7I TTCCTGAAAG -------/ATGAAAT AATTTGAGTT 3070 het 3070 hom 44 22 18 4 ATGAAAT 0 1 327633 CASAVA_Build 21 40322950 20I GTGGCTTCCA --------------------/ATTCTTTGATTACAGTACCC ATTCTTGGTT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 ATTCTTTGATTACAGTACCC 0 1 327634 CASAVA_Build 21 40332968 4D GTATAATAAT AAAG/---- AAAAGAAAAG 3070 het 3012 hom 20 7 12 2 AAAG 1 0 327635 CASAVA_Build 21 40333183 4D TGTCCTTTTG TATT/---- TATTTGACTA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 TATT 2 1 327636 CASAVA_Build 21 40334725 2D CAACAACACG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 30 9 A 12 10 327637 CASAVA_Build 21 40335296 1I CTAAGACCCC -/A ATTTCCACTT 3070 het 3070 hom 57 18 28 11 A 1 2 327638 CASAVA_Build 21 40340220 1I CTTCATTAGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 T 8 9 327639 CASAVA_Build 21 40340910 1D GCCCTCAGTT C/- TGTACTGCGC 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 C 1 0 327640 CASAVA_Build 21 40342148 4I ATGCCTGTGT ----/CAGA CAGACACTGT 3070 het 3070 hom 52 23 21 8 CAGA 1 2 327641 CASAVA_Build 21 40342776 1D ATGAAAAAAA T/- GATCCAGCAG 3070 het 3070 hom 54 26 22 7 T 1 0 327642 CASAVA_Build 21 40344243 1I CAGTTCACAA -/G GGGAGAAGCC 3070 het 2265 hom 21 8 10 3 G 3 4 327643 CASAVA_Build 21 40344285 1I CCCTTGAATC -/T TTTTTTTTTT 2004 het 1374 hom 21 5 7 10 T 12 13 327644 CASAVA_Build 21 40357914 2D ACTTACAAAG TA/-- TATATATATA 3070 het 937 hom 25 5 8 13 TA 8 7 327645 CASAVA_Build 21 40375121 1D AAATAAAGCA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 24 het 52 1 43 9 T 8 7 327646 CASAVA_Build 21 40395254 1D TGGAAGACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 16 12 10 T 10 9 327647 CASAVA_Build 21 40395889 3I CTTGGCAAAC ---/AGA AGATTAATTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 AGA 1 2 327648 CASAVA_Build 21 40400698 1I ATCTATTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 10 11 327649 CASAVA_Build 21 40422916 2I CCACAGGCAG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 53 28 12 13 GT 5 6 327650 CASAVA_Build 21 40427415 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 9 8 327651 CASAVA_Build 21 40431060 1D AATTAACATT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 787 hom 18 3 11 5 G 10 9 327652 CASAVA_Build 21 40434732 1D CAAGGAGGGC G/- GGGGGGGGTC 1872 het 1872 ref 30 12 6 14 G 9 8 327653 CASAVA_Build 21 40436100 1D CATAATTAGG A/- AAATACATCC 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 4 3 327654 CASAVA_Build 21 40436559 1D GCAAAGCAAT A/- ACCGAAAAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 1 327655 CASAVA_Build 21 40437902 2D ACAATGAAAA AT/-- AAAATAAATT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AT 1 0 327656 CASAVA_Build 21 40439471 1D GTGAAACCCC G/- TCTCTGCTAA 3070 het 416 hom 12 1 9 3 G 1 0 327657 CASAVA_Build 21 40439648 1I TCTCAAAAAG -/A TAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 0 1 327658 CASAVA_Build 21 40439774 4I CACATACATG ----/TGTA TGTATGTATG 3070 hom 125 het 55 0 42 13 TGTA 3 4 327659 CASAVA_Build 21 40441336 1I ATAAAGCTTA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 6 7 327660 CASAVA_Build 21 40445914 1D AAGCATATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1333 hom 26 5 17 4 A 11 10 327661 CASAVA_Build 21 40449854 5D CCCACCCTAT ATATA/----- ATATAATTTA 2211 het 1204 hom 13 3 7 3 ATATA 2 1 327662 CASAVA_Build 21 40451495 7D15M2I TTCTTTTTTC TTTTTTTTTTTTTTCCTGAGAC--/-------TTTTTTTCCTGAGACAG AGTCTCGCCT 3070 hom 63 het 31 0 20 11 N/A 0 0 327663 CASAVA_Build 21 40455220 1D TTTTTTTTTT A/- AAAGCACCAC 3070 hom 129 het 47 0 41 6 A 4 3 327664 CASAVA_Build 21 40475016 6D TTCTTCCTAG TTATAT/------ TTATATCTCA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTATAT 2 1 327665 CASAVA_Build 21 40487153 1D TTTCTCATAC G/- GGAAAGAGGC 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 G 3 2 327666 CASAVA_Build 21 40495175 1D CATTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 11 10 327667 CASAVA_Build 21 40499063 1D AGTGCATGCT G/- GGGGCCTTAG 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 G 5 4 327668 CASAVA_Build 21 40509161 2D TACGTGTACC CT/-- CTGAGCCTAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 CT 2 1 327669 CASAVA_Build 21 40509276 1I ACCCAGCCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 A 9 10 327670 CASAVA_Build 21 40509738 1D CTTCTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3045 hom 41 16 15 10 A 15 14 327671 CASAVA_Build 21 40516478 4I CTAAAAATAG ----/TTTT TTTATTAAGA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 T 3 7 327672 CASAVA_Build 21 40517344 1D CTAAGTTACC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 8 7 327673 CASAVA_Build 21 40553071 3I CTTTAATGAA ---/CTT CTCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 14 10 CTT 0 1 327674 CASAVA_Build 21 40560040 1D AAAACGTGTG A/- AAAAACTGCT 3070 het 3070 hom 52 22 23 7 A 6 5 327675 CASAVA_Build 21 40573166 1I GAAACATATG -/A AAAAAAAGCT 2889 het 2889 ref 24 13 6 5 A 7 8 327676 CASAVA_Build 21 40574906 1I CTACAGAAAT -/G GGAAGCTATT 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 G 2 3 327677 CASAVA_Build 21 40585858 1D GAAGCCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 12 11 327678 CASAVA_Build 21 40588981 1D AGGTTATTGG A/- AAAAAAAAAA 1891 het 1891 ref 44 36 5 4 A 11 10 327679 CASAVA_Build 21 40648646 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 1695 het 1695 ref 17 8 6 6 A 25 14 327680 CASAVA_Build 21 40651659 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAC 1445 het 1445 ref 16 7 4 5 A 9 10 327681 CASAVA_Build 21 40664053 1I CTTTTACTTT -/A AAAAAAAAAA 1298 het 1298 ref 39 23 3 13 A 15 16 327682 CASAVA_Build 21 40665220 1I AAGGAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 15 15 A 13 14 327683 CASAVA_Build 21 40667854 7I TAAATTTCAA -------/ATATCTC ATCACAAAAA 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 ATATCTC 0 1 327684 CASAVA_Build 21 40681944 2I AAGAACCGAC --/AG AGTTTGCCAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 AG 1 2 327685 CASAVA_Build 21 40691078 13I GATTGGATCA -------------/TGAGGGTCACTCC TGAGGGTCAC 3070 het 3070 ref 34 21 8 5 TGAGGGTCACTCC 1 2 327686 CASAVA_Build 21 40696474 1D TTTTTATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 13 12 327687 CASAVA_Build 21 40696767 1I CAAGATTATA -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 C 7 8 327688 CASAVA_Build 21 40699232 1D ACATGGCATT G/- GTCTGGGCAA 3070 het 3070 ref 34 18 10 7 G 2 1 327689 CASAVA_Build 21 40710551 1I TGATATGTCT -/A AGGAGAGGTA 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 A 1 2 327690 CASAVA_Build 21 40711359 4I GAAGAAAAAT ----/AAAG AGATATACAG 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 AAAG 0 1 327691 CASAVA_Build 21 40714020 1I ACAATGCCAA -/T TTTTCATTTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 4 5 327692 CASAVA_Build 21 40730648 4D CTTGCTGAAA CAAT/---- CAATTTATAG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 CAAT 2 1 327693 CASAVA_Build 21 40733867 1I AAAGCAACCT -/G GGGTCTTCTG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 G 3 4 327694 CASAVA_Build 21 40734292 22D GGCCCAGGTC TGAGTCTTGGCTGTGTGTGACA/---------------------- TGAGTCTTGG 3070 hom 30 het 13 0 11 3 TGAGTCTTGGCTGTGTGTGACA 2 1 327695 CASAVA_Build 21 40734515 22D GGCCCAGGTC TGAGTCTTGGCTGTGTGTGACA/---------------------- TGAGTCTTGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TGAGTCTTGGCTGTGTGTGACA 2 1 327696 CASAVA_Build 21 40734902 1I CAAACACATA -/G GAATATGAAG 3070 het 50 hom 43 1 41 1 G 1 2 327697 CASAVA_Build 21 40750460 25D ACTTCACAAT AATACAAAAATTATTGTGAATACAC/------------------------- AATACAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 9 AATACAAAAATTATTGTGAATACAC 1 0 327698 CASAVA_Build 21 40768113 1I AATAAATATT -/A AAAAAAAAAC 2743 het 2743 ref 16 6 6 4 A 9 10 327699 CASAVA_Build 21 40778426 1D TCATGGGTGG T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 47 26 12 9 T 8 7 327700 CASAVA_Build 21 40786486 4I GAACAGAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 AAAG 2 3 327701 CASAVA_Build 21 40846111 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 A 11 10 327702 CASAVA_Build 21 40846764 1D AGCTTTCTAA T/- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 44 25 16 4 T 7 6 327703 CASAVA_Build 21 40850462 2I GAGAGAGAGA --/GG GGGGAGGTAC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 G 4 6 327704 CASAVA_Build 21 40851337 13D ATTTTTAGTA GAGACCAAGATGG/------------- TCTCGATCTC 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 GAGACCAAGATGG 1 0 327705 CASAVA_Build 21 40851846 6D GCATAGATAA TATAAG/------ TATACTTCCA 2630 het 2630 ref 24 17 7 1 TATAAG 1 0 327706 CASAVA_Build 21 40852251 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1384 hom 17 4 11 2 A 13 14 327707 CASAVA_Build 21 40852969 10I TCTCCAGTTA ----------/AAGATAGTAC AAGTAGGCCG 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 AAGATAGTAC 0 1 327708 CASAVA_Build 21 40855588 1D GATGCAGAGG C/- CAACACTGGC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 C 2 1 327709 CASAVA_Build 21 40856912 2D GGAGAGCCAC CA/-- CATCTCAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 CA 2 1 327710 CASAVA_Build 21 40858682 1D GTGCCAGCAA G/- GTGTGCTGTA 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 G 2 1 327711 CASAVA_Build 21 40867884 1D TCCTTCACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 52 25 15 12 T 10 9 327712 CASAVA_Build 21 40868817 1D TTCACATACA C/- ACTCAGATGT 3070 het 3070 hom 21 7 10 4 C 1 0 327713 CASAVA_Build 21 40869889 2I TGCCATCCCA --/CT CTTAGTATTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 CT 1 2 327714 CASAVA_Build 21 40873072 1I AAGCAGATCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 9 10 327715 CASAVA_Build 21 40873625 1I GACCTTCACC -/A ACAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 A 1 2 327716 CASAVA_Build 21 40880892 1I ACAAACATAC -/A AAAAAAGGCT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 A 6 7 327717 CASAVA_Build 21 40882942 1D TTTTTCTCAT G/- GGGAATAATC 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 G 4 3 327718 CASAVA_Build 21 40884900 4D ACGAGATCAC ATTT/---- TTTTTAGGTG 3070 het 3070 hom 32 10 17 8 ATTT 1 0 327719 CASAVA_Build 21 40887118 1I GATGTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 12 13 327720 CASAVA_Build 21 40888527 4D GATAAAAACT TGAC/---- TGTCTACAGT 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 TGAC 1 0 327721 CASAVA_Build 21 40889180 5I GTCTCAAAAA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 2763 het 2514 hom 35 12 10 13 AAAAG 3 4 327722 CASAVA_Build 21 40889337 10D GTGCTTAAAG GCCCAGCCAA/---------- GCTCTGCCCT 3070 het 3070 ref 32 18 14 2 GCCCAGCCAA 1 0 327723 CASAVA_Build 21 40891298 12D AGTAATAGGC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 1516 hom 20 9 10 4 T 23 11 327724 CASAVA_Build 21 40896772 1D ATGTTATAAG T/- TTTCTGTGAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 4 3 327725 CASAVA_Build 21 40901030 2D GTTAATCAGC AA/-- AAAGAACTAA 3070 hom 87 het 35 0 30 7 A 5 3 327726 CASAVA_Build 21 40905639 10I GGATGCTAAG ----------/ACAGGATATT ACAGGGAAGC 3070 het 3070 hom 55 19 31 5 ACAGGATATT 0 1 327727 CASAVA_Build 21 40906289 1I CTCTACAAAT -/C CCCAAGTCAG 3070 hom 129 het 46 0 43 3 C 3 4 327728 CASAVA_Build 21 40909262 3I AGTGATCTCT ---/TCA TCATTATCTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TCA 1 2 327729 CASAVA_Build 21 40913640 1D GCATGTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 A 12 11 327730 CASAVA_Build 21 40915737 1I AGGAAGGAAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 76 het 31 0 23 8 A 6 7 327731 CASAVA_Build 21 40916083 1I GGAGGTGTAC -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 7 8 327732 CASAVA_Build 21 40916668 1I TACATGATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 A 14 15 327733 CASAVA_Build 21 40917035 1D AGCTATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 11 10 327734 CASAVA_Build 21 40918555 12D TGTGTGCATA CACATCCAAAAG/------------ CACATCCACA 3070 het 3070 ref 32 17 12 5 CACATCCAAAAG 1 0 327735 CASAVA_Build 21 40926102 1I TTCTGTAAAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 A 7 8 327736 CASAVA_Build 21 40935826 4I CTGGGTGACA ----/GAGT GAGACTCTGT 667 het 667 ref 23 12 3 8 GAGT 0 1 327737 CASAVA_Build 21 40945974 1D GGGAAGGAGA G/- GATCAGGAAG 2767 het 2767 ref 23 15 7 1 G 2 1 327738 CASAVA_Build 21 40947896 1D ATCTCAAAAA G/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 G 1 0 327739 CASAVA_Build 21 40949243 4I TCTGTCTCTC ----/TTTT TTTTTTTTTT 1997 het 1626 hom 35 7 14 14 T 14 18 327740 CASAVA_Build 21 40953471 4D GTCTATCTGC CTAT/---- CTGTCTATCT 3070 het 3070 ref 40 16 15 11 CTAT 1 0 327741 CASAVA_Build 21 40955919 1I18M3D TTACGTTGTT -AAAACAAACAAACAAACAAAC/AAAAACAAACAAACAAACA--- AAAAACACAA 3070 het 78 hom 28 1 22 14 N/A 0 0 327742 CASAVA_Build 21 40956051 4D CTAATCCTGG CTAT/---- CTTTTACCTT 3070 het 3070 hom 46 17 27 4 CTAT 1 0 327743 CASAVA_Build 21 40956863 4I83M1D GTGCGCACCT ----GTGTGTATGCCAGTATGTGTAGTATGTATGTGTGTGGTGTGTATGTGTGAGTGTATGTCATGTGGTGTGTGCATGTATGCATGT/GTGAGTGTGTATGCCAGTATGTGTAGTATGTATGTGTGTGGTGTGTATGTGTGAGTGTATGTCATGTGGTGTGTGCATGTATGCATG- TAAGTGTATG 3070 het 672 hom 48 5 45 57 N/A 0 0 327744 CASAVA_Build 21 40957054 2D GTATGTCAAA GT/-- GTGTGTGTGG 2698 het 193 hom 66 4 18 47 GT 5 4 327745 CASAVA_Build 21 40959770 8I ATCAGCTCAG --------/GCTTTTCC GCTTTTCCCC 3070 hom 116 het 41 0 36 5 GCTTTTCC 1 2 327746 CASAVA_Build 21 40961997 17I ACACTGCTGT -----------------/TTGCTGAATCCCAGTGC ACACTAGTCC 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 TTGCTGAATCCCAGTGC 0 1 327747 CASAVA_Build 21 40963744 1I TGGCTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 18 0 12 6 A 10 11 327748 CASAVA_Build 21 40964175 2D CTACTAAAAC AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 42 het 21 0 15 6 A 10 8 327749 CASAVA_Build 21 40967085 1D AAAAATGATG C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 99 het 37 0 31 6 C 8 7 327750 CASAVA_Build 21 40969178 6D4M1D ACACAGTGAA ATGTATACTTG/------ACTT- GGCCTATTTG 3070 het 3070 ref 38 19 19 4 N/A 0 0 327751 CASAVA_Build 21 40969986 2D AAAACTAAAA AC/-- ACTTAAATAT 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 AC 2 1 327752 CASAVA_Build 21 40971010 1I ATAGGAGGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 14 12 13 A 9 10 327753 CASAVA_Build 21 40971780 1I ATTTATATAT -/A AATACTTTTT 3070 het 2982 hom 22 7 9 6 A 2 3 327754 CASAVA_Build 21 40974357 1D TGTATTTTTG C/- TTATTTACTG 3070 het 3070 ref 55 26 21 8 C 1 0 327755 CASAVA_Build 21 40975993 1I AGAGGGATGC -/A GGGGGAGTGA 3070 het 3070 hom 44 15 28 1 A 0 1 327756 CASAVA_Build 21 40976757 1I TCATAAGGGT -/G GGCCCCTAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 2 3 327757 CASAVA_Build 21 40977859 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1780 hom 15 het 8 0 6 2 A 13 12 327758 CASAVA_Build 21 41033044 1I CAGCAATGCT -/A GGGGGGAGGT 3070 hom 126 het 45 0 39 6 A 0 1 327759 CASAVA_Build 21 41033578 1D AGAGAATTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1016 hom 37 5 22 10 T 15 14 327760 CASAVA_Build 21 41038253 17D AACAACTGAG TTTGGAAATTAAGTTCC/----------------- TTTGGAAATT 3070 hom 138 het 53 0 46 12 TTTGGAAATTAAGTTCC 2 1 327761 CASAVA_Build 21 41040172 2I AAATTGAAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 34 1 30 3 A 11 13 327762 CASAVA_Build 21 41040924 1I GATCTCAAAT -/A AAAAAATCCA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 6 7 327763 CASAVA_Build 21 41041086 1I TTGTTTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 10 11 327764 CASAVA_Build 21 41041561 1D AATACAACAA C/- AAAAAAGGAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 0 327765 CASAVA_Build 21 41049253 4I ACCTGCTAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AAAT 2 3 327766 CASAVA_Build 21 41058896 2D TGTATCACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 43 0 33 12 A 13 11 327767 CASAVA_Build 21 41062924 1D GCTCTCACTT C/- CCAAGGCTAT 3070 hom 94 het 34 0 32 2 C 3 2 327768 CASAVA_Build 21 41063014 3D TCTGTGATAC ACT/--- ACTTGTTCTC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 ACT 2 1 327769 CASAVA_Build 21 41068777 6D TTATATAACA TATAAT/------ TATAATTTTT 3070 hom 92 het 32 0 29 3 TATAAT 2 1 327770 CASAVA_Build 21 41074809 1D AATAGTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 11 10 327771 CASAVA_Build 21 41081617 1I ACAAAATACA -/G GGGAAAAAAT 3070 het 3070 ref 57 27 19 11 G 3 4 327772 CASAVA_Build 21 41088685 1I AGTCAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 15 27 6 A 11 12 327773 CASAVA_Build 21 41089151 1D CTACCCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 17 12 T 12 11 327774 CASAVA_Build 21 41091743 1D CATCTGGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 7 11 7 A 11 10 327775 CASAVA_Build 21 41097863 2D CAGCACCAAG TC/-- TGTAAACACT 3070 het 3070 hom 44 17 23 8 TC 1 0 327776 CASAVA_Build 21 41100156 1I CTGAAGATGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 A 8 9 327777 CASAVA_Build 21 41102271 1I ACAACCATCA -/T TTTTTTTTTT 2829 het 665 hom 39 4 10 25 T 17 18 327778 CASAVA_Build 21 41104730 1I ATAAAAATAA -/T TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 T 6 7 327779 CASAVA_Build 21 41110883 1I AATTAGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 T 12 13 327780 CASAVA_Build 21 41113231 2I GTTGAGTCTC --/AG AGGAAACAAC 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 AG 1 2 327781 CASAVA_Build 21 41121280 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAAAAGA 3070 hom 35 het 24 0 20 4 AG 0 1 327782 CASAVA_Build 21 41121381 1I GTGAAGAAGA -/C CCTGATCAGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 2 3 327783 CASAVA_Build 21 41124134 1D TATCATGAAG C/- ACAGCGCCAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 1 0 327784 CASAVA_Build 21 41125104 2D CACAGGTATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 CA 6 5 327785 CASAVA_Build 21 41126720 5D AAGTTAACGA ACCTC/----- ACCTCAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 ACCTC 2 1 327786 CASAVA_Build 21 41157399 1I CCAAGCCATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 8 9 327787 CASAVA_Build 21 41165485 1D AACAGCTGAC T/- TTTCATCAGA 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 4 3 327788 CASAVA_Build 21 41170511 4D CACAAGTGAT AAAA/---- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 A 13 9 327789 CASAVA_Build 21 41177879 1D AGAAAGACAG A/- AAAAAAAAAA 1396 het 1396 ref 16 8 5 4 A 12 11 327790 CASAVA_Build 21 41183793 2D CTGTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 T 13 11 327791 CASAVA_Build 21 41187550 1I GCCAAGTAAT -/A AAAATACTAC 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 A 4 5 327792 CASAVA_Build 21 41189029 1D GACATTCAGT G/- GGGTATCTGC 3070 het 3070 ref 56 24 21 13 G 4 3 327793 CASAVA_Build 21 41194918 1D CCCGCCCCCT C/- CCCCCCCCCC 1518 het 144 hom 8 1 4 4 C 11 10 327794 CASAVA_Build 21 41208958 2I CCAAAAATGT --/AG AGTCAGCTGC 3070 hom 172 het 68 0 57 11 AG 1 2 327795 CASAVA_Build 21 41211655 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 9 10 327796 CASAVA_Build 21 41217150 1D ATTCAAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 43 0 35 8 T 11 10 327797 CASAVA_Build 21 41220074 1I TGGGTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2177 hom 26 7 11 8 A 13 14 327798 CASAVA_Build 21 41221238 1I TTCCATAGGC -/T TCTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 11 19 2 T 1 2 327799 CASAVA_Build 21 41221527 2D CTTTCTACTG TT/-- TTTTTTTTTT 2956 het 1971 hom 27 8 10 9 T 12 10 327800 CASAVA_Build 21 41231880 1I TCTGTCACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 A 9 10 327801 CASAVA_Build 21 41234310 8I ATTCTAAATG --------/AGAAACTC TAAAATCATA 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 AGAAACTC 0 1 327802 CASAVA_Build 21 41234900 1I TAAAAAAACA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 T 7 8 327803 CASAVA_Build 21 41235172 11D ACTTTTGAAC TGATGAGATTT/----------- TGATGAAATT 3070 het 3070 ref 46 26 21 4 TGATGAGATTT 1 0 327804 CASAVA_Build 21 41239646 1I ACAGGCACAG -/A AAACCAAATA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 3 4 327805 CASAVA_Build 21 41255682 1I GTGAGGTCCA -/T TTTCATGCTC 3070 hom 102 het 39 0 33 6 T 3 4 327806 CASAVA_Build 21 41301452 1I TACCATTTAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 327807 CASAVA_Build 21 41306294 12D46M1I CACACATCTG CTCACACATTTACTCACACACATACACTCACACACATACTCTCACACACACTCTCAGA-/------------CTCACACACATACACTCACACACATACTCTCACACACACTCTCAGAC CCTATACACT 3070 het 3070 ref 61 53 15 38 N/A 0 0 327808 CASAVA_Build 21 41306437 6D TACACTCTCT CACACA/------ CACACACACA 3070 het 306 hom 75 8 26 42 CA 12 9 327809 CASAVA_Build 21 41306609 1I ACTCTCATAT -/A CATACCCACA 3070 het 3070 ref 71 31 28 12 A 0 1 327810 CASAVA_Build 21 41313412 1D CTCCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2178 het 573 hom 19 3 10 6 A 16 15 327811 CASAVA_Build 21 41318031 3I GGAGCTCAAC ---/TGG TATATGCTAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TGG 0 1 327812 CASAVA_Build 21 41322181 3D GTAAATTGTC GTG/--- GTGCTGATGG 3070 het 18 hom 30 1 23 6 GTG 2 1 327813 CASAVA_Build 21 41325691 2D CTTAATGTTC AT/-- ATGTTTACAG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 AT 2 1 327814 CASAVA_Build 21 41327840 1I TATTTTTCCT -/G GGGGGAGGGT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 G 5 6 327815 CASAVA_Build 21 41337646 1D ATGCATACCC T/- CCTTACCACC 3070 hom 115 het 46 0 36 10 T 1 0 327816 CASAVA_Build 21 41337988 2I AAGTTTCTGT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 135 het 52 0 45 7 TC 7 8 327817 CASAVA_Build 21 41342695 1D TTAGAAGGGG C/- CCATTTTTCC 3070 hom 126 het 50 0 43 7 C 3 2 327818 CASAVA_Build 21 41344019 1D ATCTATTGGG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 T 9 8 327819 CASAVA_Build 21 41345530 1I CTGTATTTCC -/T TTTTTTTTTT 1575 het 1575 ref 24 7 7 10 T 13 14 327820 CASAVA_Build 21 41348906 1D CTACATTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 648 hom 43 4 20 20 A 17 16 327821 CASAVA_Build 21 41356408 1D AAATGATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 18 6 A 13 12 327822 CASAVA_Build 21 41356702 3D ACTCCAGATC AAA/--- AAAAAAAAAA 1954 het 28 hom 11 1 7 3 A 19 16 327823 CASAVA_Build 21 41357173 2I AAAAAAAATA --/AT AAATAAAATA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 AT 0 1 327824 CASAVA_Build 21 41364113 2D13M1I CTGTCTCTAC AAAAAAATTAAAATT-/--AAAATTTAAAATTA AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 17 0 18 1 N/A 0 0 327825 CASAVA_Build 21 41364531 2D AAGACAAGCT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 99 het 37 0 33 5 TC 6 5 327826 CASAVA_Build 21 41365381 1D AGCACCCTAC A/- GAGACAGCAA 3070 het 3070 hom 41 12 19 11 A 1 0 327827 CASAVA_Build 21 41366837 4D TATTTATATC TCTA/---- TCTATCTAGC 3070 hom 78 het 30 0 27 6 TCTA 3 2 327828 CASAVA_Build 21 41381372 11D AAGAATGTGC GATCAAAGTGT/----------- GACGAGGGAG 3070 hom 93 het 35 0 32 6 GATCAAAGTGT 1 0 327829 CASAVA_Build 21 41383736 1I TCAGATGCTA -/G TTCAGTGCCC 3070 hom 78 het 33 0 25 8 G 0 1 327830 CASAVA_Build 21 41386072 1D GAGATTATAA C/- CAGGAGGCTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 1 327831 CASAVA_Build 21 41387665 8D TCTTTCTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 33 6 12 15 T 19 11 327832 CASAVA_Build 21 41389834 1D GATTTGAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 30 0 23 9 A 10 9 327833 CASAVA_Build 21 41399316 1I GAAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 106 het 38 0 36 2 A 9 10 327834 CASAVA_Build 21 41401003 1I TCGAAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 315 hom 31 3 13 15 G 0 1 327835 CASAVA_Build 21 41401531 1D CACTATCTTT C/- CCTGTTTTGA 3070 het 3070 hom 47 23 20 5 C 3 2 327836 CASAVA_Build 21 41402321 1I ACTCAATCTC -/A AAAAAAAAAA 2806 het 825 hom 25 4 10 11 A 15 16 327837 CASAVA_Build 21 41410133 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2515 het 126 hom 18 1 9 10 A 12 11 327838 CASAVA_Build 21 41415143 5D2M6D TGAGCTCAAG GAGCTTCAAAGGA/-----TC------ GCCTGCCCAC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 N/A 0 0 327839 CASAVA_Build 21 41419736 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 18 0 16 2 A 11 12 327840 CASAVA_Build 21 41422887 1I CAAAAAAAAA -/C ACACACACAC 2492 het 1213 hom 34 12 8 15 C 0 1 327841 CASAVA_Build 21 41428102 1I TTTCTCCATC -/T TTATGTCATC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 2 3 327842 CASAVA_Build 21 41439529 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 28 2 19 7 T 12 11 327843 CASAVA_Build 21 41443389 1I CCAAAGGCCC -/T TGTGCCACAA 3070 hom 144 het 56 0 48 8 T 1 2 327844 CASAVA_Build 21 41456502 1I TGCACGGCTT -/A TCTGTAAATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 0 1 327845 CASAVA_Build 21 41464013 1I TTTGGCAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 641 hom 35 2 27 6 A 11 12 327846 CASAVA_Build 21 41478489 3D GTGGAATCTC ATT/--- AGGGAATTGG 3070 het 3070 hom 49 18 24 8 ATT 1 0 327847 CASAVA_Build 21 41482992 2I CTGGATCTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2760 hom 29 8 11 10 A 14 16 327848 CASAVA_Build 21 41519939 1I GTCAGTATAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 T 9 10 327849 CASAVA_Build 21 41535796 1D GGATGGGCTG T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 T 7 6 327850 CASAVA_Build 21 41537713 1I GATCATCAGC -/T TTTTATCCTC 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 T 4 5 327851 CASAVA_Build 21 41553239 1D GCTGCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 12 11 327852 CASAVA_Build 21 41570882 1I CTTTGCATTT -/C TTTTGGGGTG 3070 het 3070 ref 55 26 23 6 C 0 1 327853 CASAVA_Build 21 41578146 1I GGAAACCCCC -/T GATCCAGAGC 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 T 0 1 327854 CASAVA_Build 21 41579220 1I TGGGTGGCTT -/A AAAAAAACAG 3070 hom 96 het 41 0 32 9 A 7 8 327855 CASAVA_Build 21 41582741 2D TGTTTTTATG CA/-- CACACACACT 3070 het 2602 hom 40 11 22 8 CA 5 4 327856 CASAVA_Build 21 41584159 1I CTTCTGGGAA -/C CCGGAGCATG 3070 hom 87 het 46 0 38 8 C 2 3 327857 CASAVA_Build 21 41608560 1D GGCTACTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 10 12 A 13 12 327858 CASAVA_Build 21 41639812 1I AGAAAAAGCC -/T TTTTTTTTAA 2658 het 2515 hom 28 10 11 7 T 8 9 327859 CASAVA_Build 21 41644823 1D TACTACCAAT G/- GTGCGGTTCT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 G 2 1 327860 CASAVA_Build 21 41648630 1I CGTGTACCCC -/T GAACTTAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 0 1 327861 CASAVA_Build 21 41670344 9D GACCCTGTCT CAACAACAA/--------- CAACAACAAC 3070 het 3070 ref 29 12 9 9 CAA 6 3 327862 CASAVA_Build 21 41678636 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1199 het 1199 ref 14 6 3 5 A 15 14 327863 CASAVA_Build 21 41689061 1D GAACAAGGCA T/- TTCTTGGAAA 3070 het 3070 ref 45 28 12 5 T 3 2 327864 CASAVA_Build 21 41690285 2I ATGGGAAAAC --/AG TGAATTTGGG 3070 het 3070 ref 59 30 24 5 AG 0 1 327865 CASAVA_Build 21 41694416 1D CAGAAAACTT A/- ACAATCATAG 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 A 2 1 327866 CASAVA_Build 21 41694501 4D TGCCAAACAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2236 hom 23 7 13 3 TTTA 4 3 327867 CASAVA_Build 21 41697050 1I CTCCTTTTTG -/T CTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 0 1 327868 CASAVA_Build 21 41720642 1I GCCCGCTGTT -/C CCCCCCCACC 2792 hom 30 het 14 0 9 5 C 7 8 327869 CASAVA_Build 21 41721322 1I AAAAGCTTAT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 A 7 8 327870 CASAVA_Build 21 41721511 1I AAGGAGAGAA -/C CCCCCTGACA 3070 hom 74 het 31 0 25 6 C 5 6 327871 CASAVA_Build 21 41722184 1I AAGGGAGTGA -/T TAGGGTAAGG 3070 hom 60 het 26 0 18 8 T 1 2 327872 CASAVA_Build 21 41736968 2I TATGAGTATA --/CT CTCACAAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 CT 1 2 327873 CASAVA_Build 21 41740418 1I GTGCTACTGG -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 52 21 25 6 A 7 8 327874 CASAVA_Build 21 41745477 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAGTAG 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 A 6 7 327875 CASAVA_Build 21 41747706 1I CCTGAGTTAA -/G GGCAGTGTTA 3070 hom 138 het 53 0 46 7 G 2 3 327876 CASAVA_Build 21 41747896 1D GGTGCAAATT C/- CCCCCCCACA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 C 8 7 327877 CASAVA_Build 21 41750549 1I AAGTTGTTGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1795 hom 23 5 13 5 T 8 9 327878 CASAVA_Build 21 41763107 2D CATCCACGCC CG/-- CACTCTGCTA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 CG 1 0 327879 CASAVA_Build 21 41764584 13I CGGGTATCAC -------------/CTAAGGCCTCGGG CTATGTCTCC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 CTAAGGCCTCGGG 0 1 327880 CASAVA_Build 21 41765312 1I CAGAGAACCA -/C CCCAGATGTC 3070 het 3070 hom 63 22 25 16 C 3 4 327881 CASAVA_Build 21 41770431 2D CAAAAAGAAC AG/-- GGGAAATTCT 3070 hom 113 het 43 0 38 7 AG 1 0 327882 CASAVA_Build 21 41773436 2D GGACTGTGAT GG/-- GGGGGCTTTG 3070 hom 105 het 38 0 35 5 G 7 5 327883 CASAVA_Build 21 41775065 6D GAATGAAATT CAGACA/------ CAGGCTGCAA 3070 het 3070 ref 53 27 19 9 CAGACA 1 0 327884 CASAVA_Build 21 41781150 2D TCACAGAAGC AG/-- AGAGTAGAAA 3070 hom 104 het 41 0 31 11 AG 3 2 327885 CASAVA_Build 21 41786016 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 8 9 327886 CASAVA_Build 21 41803810 5I GCCCTGCGCT -----/CCAGG CTGCCCCAGT 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 CCAGG 0 1 327887 CASAVA_Build 21 41809838 1I AGAGCTCTTT -/A ACGATGCTGA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 1 2 327888 CASAVA_Build 21 41811975 1D GCTCTGCCTT C/- CCCTGGATCT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 4 3 327889 CASAVA_Build 21 41816324 1I GCAGAGAATC -/T TTTTTTTTTT 2128 het 2128 ref 34 19 7 8 T 10 11 327890 CASAVA_Build 21 41824649 2I ATGCGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 55 28 14 13 GT 7 8 327891 CASAVA_Build 21 41830238 3I CCACTTGTTG ---/AAC AACGATTCAG 3070 het 1349 hom 39 8 18 13 AAC 1 2 327892 CASAVA_Build 21 41830250 1I CGATTCAGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 240 hom 35 1 17 17 T 10 11 327893 CASAVA_Build 21 41831039 3I CAAAAATAAT ---/ATA ATAATTTTAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 ATA 1 2 327894 CASAVA_Build 21 41834485 2D TGATGTTTCA AC/-- AGCTACAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 14 4 AC 1 0 327895 CASAVA_Build 21 41834979 1I GGTTCTCTTG -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 39 18 20 1 T 6 7 327896 CASAVA_Build 21 41837805 1I AAACGTATGT -/A AAAAACTTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 5 6 327897 CASAVA_Build 21 41839423 1I GGGAGGGAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 hom 27 het 11 0 9 2 G 0 1 327898 CASAVA_Build 21 41843242 12D TGTGTCTGTG TCTGTTCACGTC/------------ TGTGTCTGTG 3070 het 3070 ref 49 19 19 21 TCTGTTCACGTC 1 0 327899 CASAVA_Build 21 41844783 7I1M2D AGGTAGGCAC -------TCC/AAAGGGAT-- TCTCTTTTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 N/A 0 0 327900 CASAVA_Build 21 41847373 1I TGTCTTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 18 0 15 3 A 14 15 327901 CASAVA_Build 21 41851824 1I AAACAAAGAG -/T AGGAGCGGGA 3070 het 3070 ref 37 18 11 8 T 0 1 327902 CASAVA_Build 21 41856278 1I CTCACTGCGG -/C CCCTCCACCA 3070 hom 67 het 30 0 20 10 C 3 4 327903 CASAVA_Build 21 41858146 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAATAA 3066 het 3045 hom 19 7 8 4 A 7 8 327904 CASAVA_Build 21 41859650 1D AAAATACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 5 A 11 10 327905 CASAVA_Build 21 41866785 1D TCAGGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 26 1 20 5 T 13 12 327906 CASAVA_Build 21 41869912 1I AATTAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 42 1 34 7 A 10 11 327907 CASAVA_Build 21 41871006 1D GAGAACCATA G/- AATGGCATTA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 G 1 0 327908 CASAVA_Build 21 41878644 1D8M1D2M1D9M1D ACACCACATG TCACACATGTCTGCCCCACACAG/-CACACATG-CT-CCCCACACA- GACACACATA 3070 hom 56 het 17 0 16 16 N/A 0 0 327909 CASAVA_Build 21 41891748 1D GTGACATGGC A/- AAAAAAAAAA 1106 het 1106 ref 42 26 3 13 A 12 11 327910 CASAVA_Build 21 41921428 1I TGAGATCCAC -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 7 8 327911 CASAVA_Build 21 41931261 2D CATTCTCGAC AA/-- GGGGAGACAG 1894 het 1894 ref 18 12 4 3 A 2 0 327912 CASAVA_Build 21 41946182 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 20 0 11 9 T 14 13 327913 CASAVA_Build 21 41948523 3D ATAAATAAAT AAA/--- AAATAAAAAT 899 hom 15 het 8 0 6 2 A 6 3 327914 CASAVA_Build 21 41965969 2I2M1I27M5I17M12D ACAGCACACA --CA-CACACAAACCACACACACATCATACAC-----ACATATACTACACACACCATATGCAAACT/TGCACCACACATACCACATACACACCACACACAAAAAACACATACTCCACACAC------------ ACACACACAC 2639 het 2639 ref 82 78 9 8 N/A 0 0 327915 CASAVA_Build 21 41969604 2D TGCAACTCAC AT/-- GTGTTGACAC 3070 het 3070 hom 44 20 23 2 AT 1 0 327916 CASAVA_Build 21 41970620 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 25 7 15 3 A 6 7 327917 CASAVA_Build 21 41972542 14I CCATACACTC --------------/TTTCCACATACGAA CGTCTCCTGA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 TTTCCACATACGAA 0 1 327918 CASAVA_Build 21 41973659 1D TTAAATCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 10 11 A 11 10 327919 CASAVA_Build 21 41976569 1I ATTTCATCCA -/T TTTTCTTAAG 3070 het 3070 hom 63 22 32 9 T 4 5 327920 CASAVA_Build 21 41995486 1D CAGAAGGGGG A/- AAATTCCCTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 4 3 327921 CASAVA_Build 21 42001701 1I AATTTGTTTA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 89 het 31 0 29 2 T 7 8 327922 CASAVA_Build 21 42002441 4D ATCTACTGAC ACTT/---- ACAGCGACAT 3070 hom 114 het 42 0 39 5 ACTT 1 0 327923 CASAVA_Build 21 42002786 1I TAACTCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 10 11 327924 CASAVA_Build 21 42013314 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 6 7 327925 CASAVA_Build 21 42076334 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 24 0 13 11 T 14 13 327926 CASAVA_Build 21 42084295 1D GTTTGTTTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 92 het 33 0 31 2 T 9 8 327927 CASAVA_Build 21 42102150 3D GTATACACAC ATT/--- ATATATGTGC 3070 het 3070 hom 67 21 39 7 ATT 1 0 327928 CASAVA_Build 21 42117960 2I3M1I CAGGCACAGA --TTG-/GCTGGT TTTGCACAAA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 N/A 0 0 327929 CASAVA_Build 21 42118824 1I GCCAGGATGG -/C CCCCCTCACC 3070 hom 110 het 45 0 36 9 C 5 6 327930 CASAVA_Build 21 42122189 1D CAACTGACCA C/- CCGACCAATG 3070 hom 87 het 34 0 26 10 C 3 2 327931 CASAVA_Build 21 42127418 1D AGGAAGAACC A/- AACCCTGGTT 3070 hom 69 het 26 0 23 5 A 3 2 327932 CASAVA_Build 21 42130934 18D ACCATTAAAC TCCTGAGCTCCAGAACAT/------------------ TCCTGAGCTC 3070 hom 87 het 40 0 30 17 TCCTGAGCTCCAGAACAT 2 1 327933 CASAVA_Build 21 42132079 1D CCCAGACAGT A/- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 5 4 327934 CASAVA_Build 21 42144306 1I TACAACAATG -/C CACAAAAGGC 3070 hom 99 het 39 0 30 9 C 1 2 327935 CASAVA_Build 21 42157658 1D CCAACATGTC A/- AAAAGTAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 5 4 327936 CASAVA_Build 21 42161216 1D ACATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 486 hom 35 2 19 14 A 17 16 327937 CASAVA_Build 21 42178848 2D CCAATTTGTA CT/-- CTGAAGTTTC 3070 het 3070 hom 42 18 18 7 CT 2 1 327938 CASAVA_Build 21 42179838 1D AGTTAAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 94 hom 25 1 15 9 T 13 12 327939 CASAVA_Build 21 42182816 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1348 hom 26 9 10 7 T 12 11 327940 CASAVA_Build 21 42185846 1D GAGCATTTTT C/- AAAAGTTCCC 2413 het 2413 ref 21 13 7 2 C 1 0 327941 CASAVA_Build 21 42186764 1D TGCCCCAGGG A/- GCTCTGTGCC 3070 het 3070 ref 42 21 12 9 A 1 0 327942 CASAVA_Build 21 42197510 2I GCCGCCCCTC --/TG GTAGAAAACT 3070 het 3070 hom 45 19 17 9 TG 0 1 327943 CASAVA_Build 21 42198115 1I TCTTCAAAAA -/T GTCTATTACC 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 T 0 1 327944 CASAVA_Build 21 42198812 1D AACTTTTTCC A/- AATTCTGAAA 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 A 3 2 327945 CASAVA_Build 21 42203177 2D CAAAGGCATT AA/-- AAAAAAAAAA 1445 het 1145 hom 23 9 7 7 A 16 14 327946 CASAVA_Build 21 42204186 3I TCTAGAATAA ---/AAC AATAGGCATC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 AAC 0 1 327947 CASAVA_Build 21 42209607 5I AAGGAAACTC -----/CTCTT CTTCACTGCT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 CTCTT 0 1 327948 CASAVA_Build 21 42212213 4I TGCATGTGAC ----/TGTG TGTGTGAGCA 3070 het 3070 ref 73 38 28 7 TG 3 5 327949 CASAVA_Build 21 42214933 2I TATAAATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 TG 6 7 327950 CASAVA_Build 21 42216178 1D GTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1712 het 1712 ref 27 13 5 9 T 13 12 327951 CASAVA_Build 21 42222169 1D ATATCATACC T/- GTAATCTCAG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 1 0 327952 CASAVA_Build 21 42222281 1I TTTAAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 2872 het 2872 ref 28 12 11 5 A 14 15 327953 CASAVA_Build 21 42222683 1D GAAGGAAGTG C/- CCTAAACGAG 3070 het 3070 ref 51 29 14 8 C 3 2 327954 CASAVA_Build 21 42222735 1D GAGATGGGCC T/- TTCCCCAGAC 978 het 978 ref 32 17 5 10 T 3 2 327955 CASAVA_Build 21 42225929 1I CCTGTGGGAT -/C GACTCAAGCT 3070 hom 54 het 22 0 15 7 C 0 1 327956 CASAVA_Build 21 42226333 3D GAGGCAACCT GAC/--- ACCAAAGTGT 1835 hom 21 het 9 0 7 3 GAC 1 0 327957 CASAVA_Build 21 42228034 2I GCCTTGCCTC --/GT GTTTTTTTTT 3043 het 2010 hom 33 7 14 12 GT 1 2 327958 CASAVA_Build 21 42231921 1D TTGCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1565 het 967 hom 20 5 5 10 T 17 16 327959 CASAVA_Build 21 42243318 1D GTATCATAAT A/- AAAAAAAAAA 986 het 986 ref 21 17 4 0 A 11 10 327960 CASAVA_Build 21 42248112 4D TGTGTGTGTG GTGT/---- GTGTGTGTGA 3070 het 3070 ref 62 22 20 21 GT 6 4 327961 CASAVA_Build 21 42248163 2I TGCGTGTGTG --/GT GTGTCGGTGT 3070 hom 130 het 59 0 41 18 GT 2 3 327962 CASAVA_Build 21 42248303 2D AGTGTGGTGC GT/-- GTGTGTGTGG 3070 het 3070 ref 80 34 28 19 GT 5 4 327963 CASAVA_Build 21 42248585 1I TGCCCCTGTG -/C CCCTCCTCTT 3070 het 3070 hom 57 17 28 12 C 3 4 327964 CASAVA_Build 21 42262705 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1136 het 1136 ref 25 14 4 7 T 11 10 327965 CASAVA_Build 21 42281387 5I TCTCCCACAT -----/AAAGA AAACGATTCA 3070 hom 120 het 50 0 41 9 AAAGA 0 1 327966 CASAVA_Build 21 42288000 2I CAATTCCCAC --/AT GTCGTGGGAG 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 AT 0 1 327967 CASAVA_Build 21 42295499 4D GTTTTAATGA CAGT/---- CAGTATATTT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 CAGT 2 1 327968 CASAVA_Build 21 42301745 5D AAAAAAGAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 709 het 709 ref 16 8 5 6 AAAAG 3 2 327969 CASAVA_Build 21 42302337 1I CCGTGTGAAG -/T TCTAACTTTC 3070 het 3070 ref 33 11 12 10 T 1 2 327970 CASAVA_Build 21 42305673 1D TTGGCTGACT G/- CTCCTCCTGG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 G 1 0 327971 CASAVA_Build 21 42308988 2I GGGAGAGGAC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 46 hom 42 1 32 9 TG 8 9 327972 CASAVA_Build 21 42320723 2D GTGATGTGTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 61 het 35 0 20 15 GT 6 5 327973 CASAVA_Build 21 42354813 1D GCGAGGCATG T/- TTTTTTTCTG 1955 het 1955 ref 21 11 6 4 T 8 7 327974 CASAVA_Build 21 42360156 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1587 het 551 hom 23 4 8 11 T 15 14 327975 CASAVA_Build 21 42366186 2D CAGGAGATGA GT/-- GTGTGTGTGT 2438 het 974 hom 27 8 11 9 GT 7 6 327976 CASAVA_Build 21 42366998 5D CCCCAGAAAT CAATC/----- CAGCTACTCA 3070 het 3070 ref 43 22 15 8 CAATC 1 0 327977 CASAVA_Build 21 42368421 3I GCTGGAGATG ---/GTT GGGGGGGGGT 1090 het 1090 ref 14 7 5 2 GTT 0 1 327978 CASAVA_Build 21 42375467 1D GGGACCCGAG A/- AGGCCAGTCC 3070 hom 77 het 29 0 18 11 A 2 1 327979 CASAVA_Build 21 42376105 2D CTATAAGCCC CT/-- TTTTCTGGAA 3070 hom 52 het 23 0 16 7 CT 1 0 327980 CASAVA_Build 21 42378009 5I TATCAGATAT -----/TATTA TATGATAATA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TATTA 0 1 327981 CASAVA_Build 21 42386037 1I CTTAAGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 10 11 327982 CASAVA_Build 21 42388017 15I GAAATTTCGT ---------------/TAAAGAAGGGTTGGG AGATATGTAA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 TAAAGAAGGGTTGGG 0 1 327983 CASAVA_Build 21 42388670 1I TGTATAAATC -/T CCCCCGATTC 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 T 0 1 327984 CASAVA_Build 21 42423794 4I GTGTGGCCAT ----/GTGA GTAAGTTCTG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 GTGA 0 1 327985 CASAVA_Build 21 42427918 1I CTCAGCCTCC -/T TGAGTAGCTG 3070 hom 14 het 11 0 8 3 T 1 2 327986 CASAVA_Build 21 42433707 1I TACCAAGCTT -/A AGAGCCTTTC 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 1 2 327987 CASAVA_Build 21 42433862 17D CACCAGGTGT CCCAGTTGAGAGGCAGC/----------------- AACTGTTGTG 3070 het 3070 ref 32 18 10 8 CCCAGTTGAGAGGCAGC 1 0 327988 CASAVA_Build 21 42438387 4I AAATGGAGAC ----/AGTT AGCAACTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 AGTT 0 1 327989 CASAVA_Build 21 42439078 3D GTGAGGCTGG TCT/--- TCTTCAGAGA 3070 het 3070 hom 45 19 20 7 TCT 2 1 327990 CASAVA_Build 21 42440896 1I ACATGCTTCT -/G GCCTGGATGC 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 G 1 2 327991 CASAVA_Build 21 42443485 2D TCCACCTTCA CT/-- CTCAGTCTCT 2280 het 2280 ref 21 12 6 4 CT 2 1 327992 CASAVA_Build 21 42448398 1I GTGTTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 864 hom 28 2 23 3 T 10 11 327993 CASAVA_Build 21 42456054 1I GGGGTGAGTC -/G GGGGAGACTC 3070 hom 74 het 27 0 24 3 G 4 5 327994 CASAVA_Build 21 42465199 1D AATCCTTGAA T/- TGTTGGAATG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 2 1 327995 CASAVA_Build 21 42482598 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2461 hom 22 5 13 4 A 11 10 327996 CASAVA_Build 21 42485660 3D CCCTTCTCCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 13 10 327997 CASAVA_Build 21 42494460 6D CAGGCATTAG TTAGAT/------ TTAGATTCTC 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 TTAGAT 2 1 327998 CASAVA_Build 21 42503919 1I GCACCTCCCT -/C GCCTCCTTGA 2036 het 2036 ref 25 14 5 6 C 0 1 327999 CASAVA_Build 21 42509556 1I9M9D GCTCCCCTTG -CCTGGTTGATCCTCAGGG/CCCTGGTTGA--------- TTCTACTTAG 3070 het 3070 ref 31 20 13 3 N/A 0 0 328000 CASAVA_Build 21 42527203 1D GGGAGAAGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 18 17 7 T 9 8 328001 CASAVA_Build 21 42544230 1I CCTGACCATA -/G CCCTGTGAGG 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 G 0 1 328002 CASAVA_Build 21 42544723 3I AGGTTGGGAT ---/GAG GATAGGGTGG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 GAG 0 1 328003 CASAVA_Build 21 42581501 1I GGTAAGGCTG -/C CCCGCATCTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 C 3 4 328004 CASAVA_Build 21 42595230 1D CTTAGCCTAG T/- TTTTTTATGT 3070 hom 88 het 39 0 30 9 T 7 6 328005 CASAVA_Build 21 42613900 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 11 10 328006 CASAVA_Build 21 42620226 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2301 het 2301 ref 20 10 7 3 A 12 11 328007 CASAVA_Build 21 42620841 1D AAGATGTAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 9 8 328008 CASAVA_Build 21 42621440 1D ATAGAGGAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 10 9 328009 CASAVA_Build 21 42626751 1I CAGGGAAAAG -/A AACCCATCTT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 2 3 328010 CASAVA_Build 21 42665362 1D TTTTGCAAGA C/- CCCTGGAGAG 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 C 4 3 328011 CASAVA_Build 21 42668017 1D ATGAAACCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 10 9 328012 CASAVA_Build 21 42679486 6I GTAAATGCTA ------/TGGGGG TGGGGGTGTG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 TGGGGG 1 2 328013 CASAVA_Build 21 42680282 1I CCCACCATGA -/G GTGGCCTCTA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 G 1 2 328014 CASAVA_Build 21 42686432 1D CAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2551 het 2551 ref 27 14 8 5 A 11 10 328015 CASAVA_Build 21 42694446 1D CTAGCACTAA T/- TTTTTTTTTT 1311 het 857 hom 27 8 6 13 T 19 18 328016 CASAVA_Build 21 42694716 1I GATTATGGGC -/A TGAGCCTCTA 3070 het 3070 hom 38 18 15 5 A 0 1 328017 CASAVA_Build 21 42694977 1D CACAAGTTAG A/- AAAAACTAAT 3070 het 3070 ref 49 23 23 5 A 6 5 328018 CASAVA_Build 21 42695598 4D ACTCAAAGAC ACAT/---- ACAAGAACGT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 ACAT 1 0 328019 CASAVA_Build 21 42697563 1D TATTATGAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 10 9 328020 CASAVA_Build 21 42699937 1I AACATTTGGG -/T TTTATATTAG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 T 3 4 328021 CASAVA_Build 21 42713951 1D CTAAGTTTTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 A 9 8 328022 CASAVA_Build 21 42727247 1D AATCAGTCAT C/- CCTGACGTGG 3070 hom 94 het 53 0 39 15 C 3 2 328023 CASAVA_Build 21 42727529 5I CAGTGAGCCC -----/ACCTG ACTTCCAGCC 3070 hom 74 het 28 0 24 4 ACCTG 0 1 328024 CASAVA_Build 21 42728872 3D26M6D GAGTTATAGA GTTGTTATAGAGTTATAGAATTATAGAGTTAGTTA/---GTTATAGAGTCATAAAATTATAGAGT------ TAGAGTTATA 1832 het 1832 ref 40 44 4 1 N/A 0 0 328025 CASAVA_Build 21 42737063 1I AGCAGGGTCA -/G CACAATCCAC 2924 het 2924 ref 28 12 8 8 G 0 1 328026 CASAVA_Build 21 42743393 1D TGTGTGCTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 59 het 32 0 20 13 A 10 9 328027 CASAVA_Build 21 42760336 4D TCACATGCTG CAGT/---- CAGTCTCCAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 CAGT 2 1 328028 CASAVA_Build 21 42784040 1D ACCCACCAAC T/- TTTGGTAAAG 3070 hom 83 het 34 0 27 7 T 4 3 328029 CASAVA_Build 21 42801176 21D CAGACAGTGT TTGTTTAGAAGAAAAGTACCA/--------------------- TGTCCATAAA 3070 het 3070 ref 25 16 11 2 TTGTTTAGAAGAAAAGTACCA 1 0 328030 CASAVA_Build 21 42803704 4I AGTAAGTCCT ----/TATC TATCAATAAT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TATC 1 2 328031 CASAVA_Build 21 42805256 1D TCTCACCACC A/- AAAAAAAAAA 2204 het 2204 ref 25 15 5 5 A 13 12 328032 CASAVA_Build 21 42817077 1I AAATATGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 10 13 T 11 12 328033 CASAVA_Build 21 42832978 1D CAAAGTCCTT C/- CCTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 50 17 24 9 C 3 2 328034 CASAVA_Build 21 42833241 1D GTTCCCACCA G/- GGGAGCGCCC 3070 hom 71 het 30 0 23 7 G 4 3 328035 CASAVA_Build 21 42850964 1D TACCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1505 hom 19 6 12 1 T 12 11 328036 CASAVA_Build 21 42852514 3I TTAGAAATTC ---/AGA AGGTTCATAG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 AGA 0 1 328037 CASAVA_Build 21 42855856 1D TAGTAACATG C/- CCCCCCCATG 2156 het 2156 ref 23 13 6 4 C 8 7 328038 CASAVA_Build 21 42859187 1I CTAAAATTGT -/C CCGTGTCCTC 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 C 2 3 328039 CASAVA_Build 21 42864986 3I AGTAAACATC ---/TCA TCTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 TCA 0 1 328040 CASAVA_Build 21 42865421 2I TTTCTCTTAG --/AA ATCTCCAGGT 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 A 1 3 328041 CASAVA_Build 21 42867195 3I ATCATGCACC ---/CCT CGTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 CCT 0 1 328042 CASAVA_Build 21 42868248 2I TAAAGCTCCT --/TC TCTCTCTCTG 3070 het 3070 hom 41 15 15 11 TC 4 5 328043 CASAVA_Build 21 42869590 3I CCTTAGGCAG ---/TGA TAATACAGAA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 TGA 0 1 328044 CASAVA_Build 21 42870391 1D AAATGCAAGC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 9 8 328045 CASAVA_Build 21 42876910 1I CAGGGTGGGG -/A GGGGGGCTGA 2755 het 1866 hom 28 10 9 9 A 0 1 328046 CASAVA_Build 21 42880301 1I ATGAGTAGAA -/G GGGTTGGGTT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 G 3 4 328047 CASAVA_Build 21 42884753 2I27M2I CACATGTGCA --TGTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGTCC--/TGTGTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGTCCAT ATGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 58 27 24 25 N/A 0 0 328048 CASAVA_Build 21 42888285 5I AGACTGCCGA -----/GTGGG GGAAACGAGA 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 GTGGG 0 1 328049 CASAVA_Build 21 42898836 4D GCTTGAAGAA AGTC/---- AGTCTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 AGTC 2 1 328050 CASAVA_Build 21 42905432 1D TATTTCCGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 11 10 328051 CASAVA_Build 21 42905724 1D TATTCAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 14 8 T 12 11 328052 CASAVA_Build 21 42909238 1D ACATATCCAC A/- AGCATGCGGA 3070 hom 191 het 77 0 70 7 A 2 1 328053 CASAVA_Build 21 42911273 19I CCAGCAAAGC -------------------/ACCCAACACTGATGTTAAA ACCAGCACGA 3070 hom 62 het 31 0 21 10 ACCCAACACTGATGTTAAA 0 1 328054 CASAVA_Build 21 42911834 9D AGAAAATATT TCCCAGAAA/--------- TCCCAGAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 7 TCCCAGAAA 2 1 328055 CASAVA_Build 21 42940628 1D TAAGAAGAAG A/- TGTTAAAATG 3070 het 3070 hom 48 23 20 5 A 1 0 328056 CASAVA_Build 21 42949769 1I GCCACTTGGC -/A GCCAGGCCAA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 A 0 1 328057 CASAVA_Build 21 42955926 3D CATCACACAC AAG/--- AACGCACACC 3070 het 3070 hom 75 29 29 18 AAG 1 0 328058 CASAVA_Build 21 42961160 1D ACCAAGACAT C/- CAAGCTCTCT 3070 hom 75 het 29 0 25 6 C 2 1 328059 CASAVA_Build 21 42963704 2D CACAGGCAAT CA/-- CACATTCACA 3070 het 3070 ref 86 48 32 7 CA 3 2 328060 CASAVA_Build 21 42963785 2D CACATGCACT CA/-- CACACTATCA 3070 het 3070 hom 101 42 49 13 CA 3 2 328061 CASAVA_Build 21 42963879 4D CTCACACACT CACA/---- CATACACTTA 3070 het 3070 hom 82 21 44 20 CA 3 1 328062 CASAVA_Build 21 42963933 2D CACATACACT CA/-- CATTCACACG 3070 het 3070 hom 88 28 42 19 CA 2 1 328063 CASAVA_Build 21 42964076 4I48M2D TCCTGAGGTC ----TCTAGTTATACTTCCCATCCCTTTTCTTGCCATGTATTTCCTGAACACAT/TCTTTCTAGTTATACTTCCCATCCCTTTTCTTGCCATGTATTTCCTGAACAC-- GTTATCTTTG 3070 het 3070 hom 60 37 47 8 N/A 0 0 328064 CASAVA_Build 21 42970825 1D TCCAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 T 12 11 328065 CASAVA_Build 21 42983695 2D ATAGACTCTC CT/-- CTCTCATGAC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 CT 3 2 328066 CASAVA_Build 21 42987141 1D TTTTAAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 T 12 11 328067 CASAVA_Build 21 42992902 1D GCCTGGGTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 8 7 328068 CASAVA_Build 21 42995365 6I CTTTATTTTT ------/CTTAGA CTTAGACTTT 3070 het 3070 ref 45 25 12 8 CTTAGA 1 2 328069 CASAVA_Build 21 42999949 1D TGTGAGCAGT C/- CCCCCTCCAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 C 6 5 328070 CASAVA_Build 21 43003588 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1864 het 31 hom 19 0 7 13 A 16 15 328071 CASAVA_Build 21 43005274 1D TATGACTTTG A/- TTACTATTTT 3070 het 3070 hom 23 11 12 1 A 1 0 328072 CASAVA_Build 21 43007085 1I TTAATTCCAA -/T TTTTTTTTTT 2865 het 2825 hom 26 7 10 9 T 13 14 328073 CASAVA_Build 21 43008275 1D TAAATTTTTG T/- TTTCCATTTT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 T 4 3 328074 CASAVA_Build 21 43012717 1I CTACTCAGGA -/G GCTGAGGCAG 3070 hom 30 het 11 0 11 2 G 1 2 328075 CASAVA_Build 21 43012819 2D AGTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2539 hom 4 het 12 0 7 6 A 22 20 328076 CASAVA_Build 21 43015162 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 28 1 19 8 T 12 11 328077 CASAVA_Build 21 43020669 5D CGCCTGGCTA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 770 hom 18 4 10 6 T 24 19 328078 CASAVA_Build 21 43021547 3D TGAAGAAGTT CTC/--- CTCCATTCCT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 CTC 2 1 328079 CASAVA_Build 21 43026706 4D AGGTAAATAC AAAT/---- AAATGTCTTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 AAAT 2 1 328080 CASAVA_Build 21 43043708 21I4M2I TTTTGAAAAC ---------------------AGCT--/ATTAGAAAAAGGTTTTTTAGAAGCTTA TCTAAAAGAG 3070 hom 69 het 24 0 24 6 N/A 0 0 328081 CASAVA_Build 21 43046194 2I CTTTTTTTAT --/TA TATTATTTTT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TA 1 2 328082 CASAVA_Build 21 43047041 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 21 1 11 9 A 17 16 328083 CASAVA_Build 21 43047366 1I TTAAAGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 21 1 13 7 A 11 12 328084 CASAVA_Build 21 43053936 2D CCCAATTCCA CC/-- CCCCCTCACC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 7 5 328085 CASAVA_Build 21 43061319 1D CAGCAGCAGG C/- CCGTGTTCTA 3070 hom 97 het 37 0 32 5 C 3 2 328086 CASAVA_Build 21 43061545 1I TGCGTTAAAC -/A GAGCACGCCT 3070 het 3070 ref 51 26 16 9 A 0 1 328087 CASAVA_Build 21 43062347 3D GAGTAACTGT CAC/--- CACATGTCAC 3070 het 3070 hom 72 31 37 5 CAC 2 1 328088 CASAVA_Build 21 43062588 2D ACACACACGG CA/-- CACACAGGCA 3070 het 3070 ref 102 49 31 22 CA 4 3 328089 CASAVA_Build 21 43074928 1D ATTTGAGCCC A/- GATACCGCCA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 A 1 0 328090 CASAVA_Build 21 43090358 2D TGGCTAATTC TG/-- TATTTTTAAT 3070 hom 67 het 24 0 23 1 TG 1 0 328091 CASAVA_Build 21 43091192 1I ATTTAAAAAA -/T AGCATCCATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 0 1 328092 CASAVA_Build 21 43097178 2D CAGATAATTT AA/-- AGTGTCTCGG 3070 hom 42 het 19 0 15 5 A 3 1 328093 CASAVA_Build 21 43103011 22D CACAGGCACA CACTCGCACACGCACAGGCACG/---------------------- CACGCACACT 3070 het 3070 ref 69 42 31 11 CACTCGCACACGCACAGGCACG 1 0 328094 CASAVA_Build 21 43104221 1D TGACTCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 A 10 9 328095 CASAVA_Build 21 43104279 7D CATTAAAAGG GGTAAGA/------- GTCACATCAC 3070 het 3070 ref 32 15 11 8 GGTAAGA 1 0 328096 CASAVA_Build 21 43104453 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2018 het 1227 hom 32 9 10 13 T 17 16 328097 CASAVA_Build 21 43122078 1D GTCTTTTTTT A/- AAAAAAATTA 2765 het 1402 hom 15 4 7 4 A 8 7 328098 CASAVA_Build 21 43124944 8D3M3D ATTTGATTTT TGGACAAATCAAAT/--------TCA--- TGGACATTTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 N/A 0 0 328099 CASAVA_Build 21 43127484 13D CGGGAAGGAC TCCTGCCTGATTT/------------- TCCTGCCTTC 3070 het 3070 ref 40 21 12 10 TCCTGCCTGATTT 1 0 328100 CASAVA_Build 21 43128326 9D CTGGGAATGC AGCCATCGT/--------- AGCTGAGGAG 1782 het 1782 ref 25 16 5 5 AGCCATCGT 1 0 328101 CASAVA_Build 21 43130033 2I ACTGCTTCTC --/GG TCCCCATCTC 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 G 0 2 328102 CASAVA_Build 21 43133483 4I11M4D GTGGTGTGTG ----TGTATGGTGTCTATA/TGTCTGTATGGTGTC---- TAGTGTAGTG 3070 het 310 hom 49 3 24 31 N/A 0 0 328103 CASAVA_Build 21 43133536 2D19M2I GAGTGGTACA GTGTGTGCACAGCTGTATGTG--/--GTGTGCACAGCTGTATGTGGT GTGTCTGTGA 3070 het 445 hom 67 4 21 58 N/A 0 0 328104 CASAVA_Build 21 43135156 17D CGACCCCAGG GCCAGTCCCCGCCAGGT/----------------- GCCATCCTGA 1873 het 1873 ref 15 10 5 4 GCCAGTCCCCGCCAGGT 1 0 328105 CASAVA_Build 21 43140217 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 221 hom 17 1 11 5 A 11 10 328106 CASAVA_Build 21 43150976 1D AACAGGAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 9 8 328107 CASAVA_Build 21 43157110 1D ACGGTGAAAA C/- CCCGTCTCTA 627 het 627 ref 6 3 2 1 C 4 3 328108 CASAVA_Build 21 43165170 1D AGAATTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3029 hom 32 12 14 6 T 11 10 328109 CASAVA_Build 21 43170003 1D AAATAACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 T 12 11 328110 CASAVA_Build 21 43174770 2D ACCGTGACAT AG/-- AGTTGTTCAC 3070 het 3070 hom 59 23 29 8 AG 2 1 328111 CASAVA_Build 21 43176454 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2016 het 1702 hom 34 9 11 14 A 17 16 328112 CASAVA_Build 21 43178787 1I AAACTCCATC -/A AAAAAAAAAT 2586 het 2586 ref 14 7 6 1 A 9 10 328113 CASAVA_Build 21 43179572 1D TATTTTTAGC A/- AAAAAATAGG 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 7 6 328114 CASAVA_Build 21 43182811 1D TACTTCTCTG T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 8 7 328115 CASAVA_Build 21 43183993 4I ATAATGTATT ----/TGTC TGGCCTCTGC 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 TGTC 0 1 328116 CASAVA_Build 21 43185675 2I CGCTAGCTGT --/GA GTCAGGAATC 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 GA 0 1 328117 CASAVA_Build 21 43185744 3I AGCTGAAGGT ---/GTG GGCACGTCCA 3070 het 2639 hom 27 8 11 8 GTG 0 1 328118 CASAVA_Build 21 43197829 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 941 het 941 ref 14 4 3 7 T 8 7 328119 CASAVA_Build 21 43207094 2I TCAGAGACTC --/TG TCACCTCCTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TG 0 1 328120 CASAVA_Build 21 43226588 1I TCAAAGAGAG -/A AAGAAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 2 3 328121 CASAVA_Build 21 43227989 1I GGATGAAAAA -/G ATCCTGTTTA 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 G 0 1 328122 CASAVA_Build 21 43229896 2I CGCCCAAAGC --/CT CAAGACTATC 1474 het 1474 ref 13 8 4 1 CT 0 1 328123 CASAVA_Build 21 43248253 3D ATTGTCCCTA ACT/--- TCCAGAGGGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 ACT 1 0 328124 CASAVA_Build 21 43253199 2D GCCCAAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 828 het 475 hom 30 5 4 21 T 14 12 328125 CASAVA_Build 21 43257192 1D ACGAGATGGT A/- AACGTTCATT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 3 2 328126 CASAVA_Build 21 43260533 1I TGCCCAGCCC -/T TAGAATTGGC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 1 2 328127 CASAVA_Build 21 43263938 2D GGGTTTCACC CT/-- GTTAGCCAGG 2448 hom 15 het 6 0 6 0 CT 1 0 328128 CASAVA_Build 21 43264261 2I GGAGGAGGAG --/AC ACTACTGATA 3070 hom 74 het 30 0 24 6 AC 1 2 328129 CASAVA_Build 21 43264999 3D CTTCAGAAAT GAA/--- GAAAAAGAAG 3070 hom 92 het 35 0 29 6 GAA 2 1 328130 CASAVA_Build 21 43265592 1I TTTATGGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 27 0 19 8 T 10 11 328131 CASAVA_Build 21 43271643 8I AACTTGGCTA --------/ACTTGTTT ACTTGTTTTT 2747 hom 27 het 17 0 10 7 ACTTGTTT 1 2 328132 CASAVA_Build 21 43273562 1I GAAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 9 10 328133 CASAVA_Build 21 43276289 1D GTGGCTGGCC T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 8 7 328134 CASAVA_Build 21 43276489 1D CCCCTCCCTG A/- AGCCCCTGGC 3070 hom 129 het 45 0 43 3 A 2 1 328135 CASAVA_Build 21 43278089 2I GGCAGTGCCT --/GA GAGAGAGGCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 GA 3 4 328136 CASAVA_Build 21 43283276 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1943 hom 15 het 10 0 6 4 A 13 12 328137 CASAVA_Build 21 43284913 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 11 5 A 13 12 328138 CASAVA_Build 21 43289622 1I GGAGTCCCAA -/T TCTCTCCTGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 2 328139 CASAVA_Build 21 43290071 1I TTGTATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 16 2 8 6 T 13 14 328140 CASAVA_Build 21 43295589 1D CTGTGCCCCC T/- CCCTTGTATC 3070 hom 73 het 35 0 26 9 T 1 0 328141 CASAVA_Build 21 43297759 1I TCGTGTTCAG -/A AAAAAAAGCC 3070 hom 120 het 53 0 41 12 A 7 8 328142 CASAVA_Build 21 43298611 1I GGTGTTAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 621 hom 29 2 20 7 T 9 10 328143 CASAVA_Build 21 43300496 5D AAATTTTACC TTTAT/----- TTTAAAGCAC 3070 het 3070 ref 51 27 23 2 TTTAT 1 0 328144 CASAVA_Build 21 43302460 3I AACCCTGTCT ---/CTA CTAAAGATAC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 CTA 1 2 328145 CASAVA_Build 21 43307525 1I TTTAGTTGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 T 9 10 328146 CASAVA_Build 21 43310736 1I CCTCAGTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 176 hom 34 1 27 6 A 10 11 328147 CASAVA_Build 21 43320926 2I GTGTAACCCC --/CT GTTTACTAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 4 CT 0 1 328148 CASAVA_Build 21 43321629 1D GAGTTGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 484 hom 36 2 28 6 A 11 10 328149 CASAVA_Build 21 43323440 16D CTTCTTTCAA GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3 hom 27 1 22 6 GT 16 8 328150 CASAVA_Build 21 43325005 1I CAGGAGCTTT -/A ACTGAAAGAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 1 2 328151 CASAVA_Build 21 43331436 1I TTTTGTAGAA -/C TGTGGAGACC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 0 1 328152 CASAVA_Build 21 43333192 1D TTGCTCTGTC A/- CCCAGGCTGA 1930 het 131 hom 18 4 6 10 A 1 0 328153 CASAVA_Build 21 43336595 4I GCTGGCACGT ----/CTGA CTGTGTGCAG 3070 hom 89 het 35 0 25 10 CTGA 0 1 328154 CASAVA_Build 21 43336851 2I CCCCCATCTC --/TT GGTGCTGTGG 3070 hom 137 het 53 0 44 9 T 0 2 328155 CASAVA_Build 21 43338008 2D GCCTGCCGGG CT/-- CAGCAAACAG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 CT 1 0 328156 CASAVA_Build 21 43343224 2I CTCCTGTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 1493 hom 29 8 14 7 TC 0 1 328157 CASAVA_Build 21 43386549 3D AGGAAAAACA CTG/--- CTGAAGAGAC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 CTG 2 1 328158 CASAVA_Build 21 43388039 2I AATCCAAGTA --/TG TATCAGAGAG 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 TG 0 1 328159 CASAVA_Build 21 43391114 1I TTGAACTTCC -/A AGGAATCTGC 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 A 1 2 328160 CASAVA_Build 21 43412610 1I AATTCCCCCC -/T ATGAGTGAGA 2022 hom 12 het 6 0 5 1 T 0 1 328161 CASAVA_Build 21 43453571 9D CACACACCAC ACACACTAT/--------- ACACGGTACA 3070 het 3070 ref 70 30 25 20 ACACACTAT 1 0 328162 CASAVA_Build 21 43461832 1I TGTGTGCTCT -/A CCCTCCTCTG 3070 het 3070 hom 46 16 16 14 A 0 1 328163 CASAVA_Build 21 43472862 2I GGGGTGAGTG --/TA TGAGTGTGTG 3070 het 3070 hom 69 32 32 5 TA 0 1 328164 CASAVA_Build 21 43473003 4I44M4D TGTGAATGAA ----TGTGTGTGAGTCCCTGTGTGTAACAGCATGTGTGTGTGTGTCCCTGTG/TGTGTGTGTGTGAGTCCCTGTGTGTAACAGCATGTGTGTGTGTGTCCC---- TGTGAGTGAA 3070 het 3070 ref 75 62 47 19 N/A 0 0 328165 CASAVA_Build 21 43473331 2I GTGTGTGTGT --/GA GTGTGGGTGT 3070 het 3070 hom 42 11 16 15 GA 0 1 328166 CASAVA_Build 21 43473369 2D GTGTGTGTGT GG/-- GGGGGGTCTC 2359 het 2138 hom 37 12 12 14 G 8 6 328167 CASAVA_Build 21 43477626 1I AAACAACAAC -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 7 8 328168 CASAVA_Build 21 43477821 24I TGGAGTTCAT ------------------------/GTCCCACCAAGTTAGAGGAGGGAA GTGATAAGCA 3070 hom 87 het 32 0 29 5 GTCCCACCAAGTTAGAGGAGGGAA 0 1 328169 CASAVA_Build 21 43489510 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 501 hom 28 2 18 8 T 11 12 328170 CASAVA_Build 21 43493268 1D AATGTTAATA T/- TTTATGAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 T 4 3 328171 CASAVA_Build 21 43495453 2D TTTTTTTGAG AC/-- ACAGCCTCAC 3070 het 3070 hom 28 12 14 4 AC 2 1 328172 CASAVA_Build 21 43508172 1D TCTCGGAGAG T/- TGGAGACCTC 3070 het 3070 ref 51 20 17 14 T 2 1 328173 CASAVA_Build 21 43511074 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1163 hom 35 10 19 6 T 21 20 328174 CASAVA_Build 21 43515698 2D CCTCCAGATG AT/-- ATGAGAATGG 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 AT 2 1 328175 CASAVA_Build 21 43525638 3I CGATGATGAT ---/GCC GCAGTGGGTC 2963 het 2963 ref 29 14 8 7 GCC 0 1 328176 CASAVA_Build 21 43525766 1D CGTGCGCTGT G/- GGCGGCAGGG 1296 het 1296 ref 31 16 6 9 G 3 2 328177 CASAVA_Build 21 43534460 1I TGGGAGGGTC -/T CCCACAAGCT 3070 het 2343 hom 29 10 11 8 T 0 1 328178 CASAVA_Build 21 43541480 1I ATTTGGGGAT -/G TTCACTAAGG 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 G 0 1 328179 CASAVA_Build 21 43542920 2I GCACGCATGG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 55 22 17 16 AC 7 8 328180 CASAVA_Build 21 43576850 19I CCATATATGT -------------------/GGGAGGTCTCACCTCCCTG GGGAGGTCTG 3070 het 3070 ref 44 20 11 13 GGGAGGTCTCACCTCCCTG 0 1 328181 CASAVA_Build 21 43578706 1I GCCCCACCAA -/C CCCCCAGGAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 C 5 6 328182 CASAVA_Build 21 43587319 1D TGATGTGAGG C/- CCCCCCCCAG 2789 het 2305 hom 21 8 10 3 C 9 8 328183 CASAVA_Build 21 43651457 3I AACCCCGTCT ---/CTA CTAAGAATAC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 CTA 1 2 328184 CASAVA_Build 21 43654387 5I TCTTTCTTTC -----/TTTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 14 11 T 12 17 328185 CASAVA_Build 21 43659233 3D AAAAGGGGAA GGG/--- GTTTTGTGTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 4 G 4 1 328186 CASAVA_Build 21 43675471 1I GTAAACCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 12 13 328187 CASAVA_Build 21 43683178 4I CTCTTATAGC ----/CTCT CTTTCTATTT 3070 het 3070 hom 26 11 15 0 CT 1 3 328188 CASAVA_Build 21 43684085 5I GCCATTTGTG -----/TTTCT TTTGAGTGTC 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 TTTCT 0 1 328189 CASAVA_Build 21 43684778 1I TACCCAGACT -/G TGATATTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 G 0 1 328190 CASAVA_Build 21 43686253 2D TGGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 61 30 21 10 GT 6 5 328191 CASAVA_Build 21 43687279 4I GATGGGTGAT ----/TTAA TTAGTGAACA 3070 het 3070 hom 59 23 31 5 TTAA 0 1 328192 CASAVA_Build 21 43740433 2D AAGTAAAATC CT/-- CTGTTTGTAC 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 CT 2 1 328193 CASAVA_Build 21 43744228 2I CACACGTGAT --/CA CACACTTATA 3070 het 3070 hom 71 31 30 10 CA 2 3 328194 CASAVA_Build 21 43750188 1D GTTGTAGGTC T/- TTTTTCTTAC 1221 het 1221 ref 31 17 5 9 T 6 5 328195 CASAVA_Build 21 43756518 3D CCTGGAAGGG CCA/--- CCACCAGGAT 2420 het 2420 ref 24 10 9 6 CCA 3 2 328196 CASAVA_Build 21 43765395 3I CCTAGAGCAG ---/GGA GGAGAATTTG 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 GGA 1 2 328197 CASAVA_Build 21 43778052 1D ACTAAAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 10 9 328198 CASAVA_Build 21 43781926 1D ACAAGAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 A 16 15 328199 CASAVA_Build 21 43786313 1I AACCAATGAG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 68 het 27 0 23 4 A 7 8 328200 CASAVA_Build 21 43790178 1D GACCATGTTA G/- GGACACAAAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 G 3 2 328201 CASAVA_Build 21 43791355 5D CTTCCAAACT TATGC/----- TATAAGGCCA 3070 het 3070 ref 56 30 20 8 TATGC 1 0 328202 CASAVA_Build 21 43791524 1D TCAAAAAAGA T/- TTATGCCAGA 3070 het 3070 ref 48 22 17 9 T 3 2 328203 CASAVA_Build 21 43792434 1I ACAACAACAA -/C AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 49 30 15 4 C 0 1 328204 CASAVA_Build 21 43797897 11D TTAAATACTT AGGTGTGCATA/----------- AGTGAGAGAA 3070 het 3070 ref 29 19 9 5 AGGTGTGCATA 1 0 328205 CASAVA_Build 21 43802329 1I TAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 2004 hom 32 12 10 10 C 0 1 328206 CASAVA_Build 21 43805782 1I ATAAGTATAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 A 9 10 328207 CASAVA_Build 21 43842996 1I TTTCACTGAC -/A AATTTTTACA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 2 3 328208 CASAVA_Build 21 43848793 2D CGCACACCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 61 17 15 31 AC 6 5 328209 CASAVA_Build 21 43849241 2I CATCACATAC --/CA CACAGACATC 3070 het 3070 hom 80 27 31 22 CA 2 3 328210 CASAVA_Build 21 43850051 1D ACACCCACCT C/- CCCCCAACAT 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 C 6 5 328211 CASAVA_Build 21 43852438 1I TCTCCACAGC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 A 8 9 328212 CASAVA_Build 21 43853188 3D AGGCCGAGGC AGA/--- AGGATTGCTT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 AGA 1 0 328213 CASAVA_Build 21 43853793 1D AAATAACCCC T/- ATCTCTGGGT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 1 0 328214 CASAVA_Build 21 43876273 1D19M2I CACACACACT CCCCCCCCACACACGCTCCC--/-CCCCCCCACACACGCTCCCCA CACACACACA 1966 het 1966 ref 41 18 11 20 N/A 0 0 328215 CASAVA_Build 21 43876727 2D CACACATGCT CC/-- CACACACACA 188 het 188 ref 58 23 1 35 C 3 1 328216 CASAVA_Build 21 43877187 2I TCTATATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 44 18 15 11 TG 7 8 328217 CASAVA_Build 21 43906958 2I TTTAAGTAAC --/AG AGTGTTGCGC 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 AG 1 2 328218 CASAVA_Build 21 43909261 2I CTCCCACCAC --/AT GTGGGGATTA 3070 het 3070 ref 40 18 12 10 AT 0 1 328219 CASAVA_Build 21 43911210 1I TATTTGTTGG -/A GGACATAGGT 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 A 0 1 328220 CASAVA_Build 21 43911351 1D CAGTTGGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 11 10 328221 CASAVA_Build 21 43938537 4I AGCCGAGTCA ----/CTGC CTGCCTGACC 2320 het 1676 hom 23 7 10 6 CTGC 1 2 328222 CASAVA_Build 21 43939390 8I CTGTGGTGGC --------/TGCGTGGT TTAATGGCTG 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 TGCGTGGT 0 1 328223 CASAVA_Build 21 43939484 1D TTAACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 12 11 328224 CASAVA_Build 21 43942242 2D CCTCCCCCAA AC/-- ACAGCTGAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 6 AC 2 1 328225 CASAVA_Build 21 43942968 2I GAGTGAGACC --/CA CGCTCTTATC 2533 het 2533 ref 28 19 6 3 CA 0 1 328226 CASAVA_Build 21 43947251 1D TGATTAAGGC T/- TCAGTCCGTC 3070 het 2570 hom 26 7 16 3 T 2 1 328227 CASAVA_Build 21 43947848 13I CCAGCTCTGG -------------/CCCTGGAAGGGCC CCCAGACCTG 3070 het 2335 hom 36 10 18 8 CCCTGGAAGGGCC 0 1 328228 CASAVA_Build 21 43950569 1D ACCCTGTATC A/- AAAAAAAAAA 2272 het 1666 hom 14 6 7 1 A 14 13 328229 CASAVA_Build 21 43952164 1I GAGTGCGAGC -/T TCCCAAGGCC 3024 het 2959 hom 22 9 9 4 T 1 2 328230 CASAVA_Build 21 43954091 1D CCATGTCCCG C/- CAGCACCCAG 3070 het 3070 hom 38 18 16 4 C 2 1 328231 CASAVA_Build 21 43995093 2I TTGTGTGTGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 282 hom 53 1 29 24 GT 5 6 328232 CASAVA_Build 21 43999235 1I ATGGGACTAG -/C CCCTCTGCAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 C 3 4 328233 CASAVA_Build 21 44006000 1I GGCAGGAGGA -/G GGGTGGGTGC 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 G 3 4 328234 CASAVA_Build 21 44014439 3I CAAAAAAACA ---/AAC AAAAAAAACC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AAC 0 1 328235 CASAVA_Build 21 44022752 1D AAGGGATGTT C/- CCGCTGCTTG 3070 hom 66 het 26 0 21 5 C 3 2 328236 CASAVA_Build 21 44022872 1I TGCTGGAGCT -/G GGTCCCAGGT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 2 3 328237 CASAVA_Build 21 44028404 1D ATTTTTATGG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 T 9 8 328238 CASAVA_Build 21 44030449 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTGTGTT 3070 het 529 hom 16 2 12 2 T 6 5 328239 CASAVA_Build 21 44034272 1I GTGCGGTGAC -/T TCTGGTCCCT 874 het 472 hom 9 5 3 1 T 1 2 328240 CASAVA_Build 21 44045055 1I GACCCTGAGA -/C CCGTCCCCAG 1632 het 1632 ref 26 9 7 10 C 2 3 328241 CASAVA_Build 21 44048409 1D GCCCTTGCCA G/- GGGAAGTGTC 3070 hom 70 het 26 0 16 10 G 4 3 328242 CASAVA_Build 21 44050125 1D TTGAGTTGAG T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 T 8 7 328243 CASAVA_Build 21 44060054 1D GGCTTCTCAA T/- TATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 2 1 328244 CASAVA_Build 21 44060189 1D CAGCTGGGAT C/- CTGGGGGAGT 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 C 2 1 328245 CASAVA_Build 21 44060799 1D AGTCACCCCC A/- ACTGCCCCTC 1371 het 1371 ref 16 9 4 3 A 2 1 328246 CASAVA_Build 21 44062523 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 10 11 328247 CASAVA_Build 21 44065155 1D ACCATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1945 het 425 hom 20 5 9 7 T 15 14 328248 CASAVA_Build 21 44073263 2D ACAAACAACG CC/-- CCCCCCCACC 3070 het 1784 hom 29 6 16 7 C 9 7 328249 CASAVA_Build 21 44082787 5D TCTCAAAAAA AAACC/----- AAACCAAACC 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 AAACC 4 3 328250 CASAVA_Build 21 44086378 1D TCAATACTTA G/- GAAAGTATTG 3070 hom 66 het 25 0 23 3 G 2 1 328251 CASAVA_Build 21 44094120 1D GAAGATTATT G/- GGGCTATTAG 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 G 4 3 328252 CASAVA_Build 21 44102846 4I GTAGGTATGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 TTTG 3 4 328253 CASAVA_Build 21 44125273 1D AATGCCAGGG A/- GGGGGAAGAG 3070 het 3070 hom 40 11 21 10 A 1 0 328254 CASAVA_Build 21 44130136 8D GTGAAGGTGT GCAGGTGC/-------- GCAGGTGCGC 2722 het 2132 hom 24 9 11 5 GCAGGTGC 2 1 328255 CASAVA_Build 21 44132708 2D TTTGTGTAGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AT 7 6 328256 CASAVA_Build 21 44133298 1I AACTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 11 328257 CASAVA_Build 21 44143195 1I ATTATTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 11 12 328258 CASAVA_Build 21 44143480 2I AACCCGCCCC --/TT TTGTGTTTGT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 2 4 328259 CASAVA_Build 21 44145752 2I ACGTGTTCAA --/TG TCAGGGCAAA 2703 het 2703 ref 25 14 7 4 TG 0 1 328260 CASAVA_Build 21 44163583 1D CCCGAGCAGT G/- GTACACTGGA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 G 2 1 328261 CASAVA_Build 21 44203784 4D GTGTGTGGTT TGTA/---- TGTGTGTGGC 3070 het 3070 ref 59 25 19 17 TGTA 1 0 328262 CASAVA_Build 21 44207202 17I GACTGAAGAT -----------------/GACCCACTGTGCCCCGA GACCCACTGT 3070 het 3070 hom 34 13 18 5 GACCCACTGTGCCCCGA 1 2 328263 CASAVA_Build 21 44288596 1I TGAATGAGAC -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 6 7 328264 CASAVA_Build 21 44336901 1I TGTCTGAATC -/T TCAGCATTTT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 1 2 328265 CASAVA_Build 21 44337080 1I GATGTAAAGA -/T TTACTTTTTA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 2 3 328266 CASAVA_Build 21 44338570 1D TTGGGAGGGT G/- GGGGTGAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 5 4 328267 CASAVA_Build 21 44350335 1I GAAGGTCAGA -/T TCCTGTATTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 328268 CASAVA_Build 21 44360911 1D TCTGGGCTGT G/- GGGGGAGGCT 3070 hom 66 het 25 0 19 6 G 6 5 328269 CASAVA_Build 21 44361417 4I GTCAGTGCCC ----/GTGA GTGAGTCCGT 3070 hom 48 het 21 0 15 6 GTGA 1 2 328270 CASAVA_Build 21 44362941 1D GTGAATTGTT G/- GAGTCTGGTG 3070 hom 62 het 23 0 19 4 G 2 1 328271 CASAVA_Build 21 44367182 5D CCCGGGAGGT CAAGG/----- CTGTAGTGAG 3070 het 3070 hom 43 22 18 6 CAAGG 1 0 328272 CASAVA_Build 21 44367547 1I GAGCTCAGAA -/G CCTGTTCAGC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 0 1 328273 CASAVA_Build 21 44374889 1D CATTGACCAT C/- CCCTGTGTGA 3070 hom 123 het 44 0 38 6 C 4 3 328274 CASAVA_Build 21 44386287 1I ATGCAGTTTT -/G GGGGGCGGGT 3070 hom 68 het 25 0 21 4 G 5 6 328275 CASAVA_Build 21 44391368 1D GCCATGGAGT C/- CCCCCTGGCA 3070 hom 63 het 23 0 19 4 C 6 5 328276 CASAVA_Build 21 44396484 18I GAACTCTTGG ------------------/CTCAGTCGGTCCTCCCAC CTCAGCCTCC 3070 hom 80 het 29 0 25 4 CTCAGTCGGTCCTCCCAC 0 1 328277 CASAVA_Build 21 44397062 12I CATTGCACTC ------------/CAACCTGGGTGA CAGAACAAGA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 CAACCTGGGTGA 0 1 328278 CASAVA_Build 21 44398958 1I AGGCTTCCCA -/G GGTCACGGGT 3070 hom 85 het 34 0 24 10 G 2 3 328279 CASAVA_Build 21 44401859 1I GGGTGAGGCC -/A AATAGCAGAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 3 328280 CASAVA_Build 21 44402813 1D TGGAACCTCC G/- GCCTCCTGGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 2 1 328281 CASAVA_Build 21 44404310 2I TCGTTATCAC --/AT GAGTCACCAG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 AT 0 1 328282 CASAVA_Build 21 44415686 1D CTGAGGCTTC T/- TCACCCGCGC 2570 hom 27 het 14 0 8 6 T 2 1 328283 CASAVA_Build 21 44416347 1D CCCTCCCACT C/- CCCTGGAGAC 3070 hom 72 het 30 0 22 8 C 4 3 328284 CASAVA_Build 21 44443170 2I GGTGGTAGAC --/TA TGTGTGTGTT 3070 het 3070 hom 50 19 21 10 TA 0 1 328285 CASAVA_Build 21 44453193 32D CCTGCACCCA TGTCCACTGGCACAAATGCCCACCTGCACCCG/-------------------------------- TGTCCACTGG 2803 het 1487 hom 31 6 9 18 TGTCCACTGGCACAAATGCCCACCTGCACCCG 1 0 328286 CASAVA_Build 21 44456849 1I AGAGACCGTT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 48 het 23 0 16 7 A 6 7 328287 CASAVA_Build 21 44465808 2D GGCAGAAATG AA/-- AGATTATTTG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 3 1 328288 CASAVA_Build 21 44468859 3I TACTAAAAAT ---/ACA ACAATTACCT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 ACA 1 2 328289 CASAVA_Build 21 44474437 1I GCAGCAGCGA -/C TGGGGGGTGT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 C 0 1 328290 CASAVA_Build 21 44499139 3D CTGTATATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 2492 hom 20 7 8 7 TTG 4 3 328291 CASAVA_Build 21 44513164 1I GCCAAGCTGG -/T TTTTTTTTTT 1395 het 611 hom 14 4 5 5 T 10 11 328292 CASAVA_Build 21 44520192 1I ATTGTCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 A 10 11 328293 CASAVA_Build 21 44520551 1D CCCAGCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 20 3 13 4 T 15 14 328294 CASAVA_Build 21 44536786 1D GGCTGGGCCA C/- CCCCTCCTGT 1810 hom 26 het 12 0 7 6 C 5 4 328295 CASAVA_Build 21 44585059 2D ATAAATCGGT TC/-- TGTCTAGGCA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 TC 1 0 328296 CASAVA_Build 21 44594268 1D TCGCCGGTTT A/- AAAGGAGACA 2314 hom 24 het 9 0 8 2 A 4 3 328297 CASAVA_Build 21 44604880 1D GTTTTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 28 3 11 14 T 16 15 328298 CASAVA_Build 21 44613440 1I CTGGGTGTCA -/G GGTGCCCCTC 3070 hom 50 het 20 0 16 4 G 2 3 328299 CASAVA_Build 21 44648692 2I ACACATACAT --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 hom 83 33 38 12 AC 4 5 328300 CASAVA_Build 21 44659553 1D TGAATAACAG C/- CCCAGGGAGG 3070 hom 65 het 26 0 22 4 C 4 3 328301 CASAVA_Build 21 44668136 3D GGAGGGCTCT GAG/--- GAGTGATGGT 3070 hom 96 het 37 0 28 10 GAG 2 1 328302 CASAVA_Build 21 44675216 4I60M1I ATTTAAAAAA ----TAATATAAATATATAGTAATTTCTCTTTTGAGCATTGATATTTATTATGTATTTCTCTTC-/TATCTAATATAAATATATAGTAATTTCTCTTTTGAGCATTGATATTTATTATGTATTTCTCTTCT TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 20 2 15 18 N/A 0 0 328303 CASAVA_Build 21 44689751 1I GGAAAGTATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 28 0 20 8 A 14 15 328304 CASAVA_Build 21 44690315 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 10 9 328305 CASAVA_Build 21 44697606 1I AAAAAGCCAC -/A AATTGCCAGT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 2 3 328306 CASAVA_Build 21 44709181 23D AAGTGGGGGG CGGGAGCTGTGAGCACAGGGGGT/----------------------- CGGGGTGCTG 3070 hom 56 het 18 0 17 6 CGGGAGCTGTGAGCACAGGGGGT 1 0 328307 CASAVA_Build 21 44714946 1D CCAAAGTGCT G/- GGGATTACAG 3070 hom 35 het 13 0 12 1 G 4 3 328308 CASAVA_Build 21 44715106 1I GGCAGCGACG -/C TGAAGGGTAA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 C 0 1 328309 CASAVA_Build 21 44775889 2I CATGAATTCG --/GT GGGGGGGCAC 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 GT 0 1 328310 CASAVA_Build 21 44780208 1D TATGTTTATC A/- AAAAAAAAAA 2268 het 81 hom 23 2 14 7 A 13 12 328311 CASAVA_Build 21 44807900 1I CAGTGGTGAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 8 9 328312 CASAVA_Build 21 44808367 1D AGTAGATTAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 9 8 328313 CASAVA_Build 21 44812805 1I CCATGGAGCT -/G GCAGTGCCTG 3070 hom 63 het 23 0 17 6 G 1 2 328314 CASAVA_Build 21 44834647 1D AGGGCTATTT G/- GGAGAGACCT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 G 3 2 328315 CASAVA_Build 21 44838952 9D CTCCATAACC TATTGCACA/--------- TATTGCACAT 3070 hom 75 het 27 0 24 5 TATTGCACA 2 1 328316 CASAVA_Build 21 44841740 10D16M1I TCTTTTTCTT TTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTT-/----------TTTCTTTCTTTCTTTTC TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 20 1 17 2 N/A 0 0 328317 CASAVA_Build 21 44844902 4I ACTCACTCAC ----/TCAT TCACTCACTC 3070 hom 113 het 44 0 32 12 TCAT 0 1 328318 CASAVA_Build 21 44846383 2D ACGTACCAAC TG/-- TGGGTTTCTC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TG 2 1 328319 CASAVA_Build 21 44870157 9D CTACCAGCTG CTTCTGCCT/--------- CTTCAGTGAG 3070 hom 82 het 28 0 24 9 CTTCTGCCT 1 0 328320 CASAVA_Build 21 44875427 2I GTAAAGAAAG --/AA AAAAAAAAGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 10 328321 CASAVA_Build 21 44876702 1I GCTGAAAGAG -/A AAAAAAACTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 8 328322 CASAVA_Build 21 44882825 1D GTGGACCCCC G/- GGGGGGCACA 3070 hom 48 het 17 0 16 1 G 7 6 328323 CASAVA_Build 21 44889285 4I AGTTAAGGAA ----/AGAG AGAGAGAAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AG 3 5 328324 CASAVA_Build 21 44895429 3I AAGCTGTTGG ---/CAC CACCAGCTAG 3070 hom 64 het 28 0 19 9 CAC 1 2 328325 CASAVA_Build 21 44896325 11D TAAAACTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 16 0 11 7 T 22 11 328326 CASAVA_Build 21 44900808 1I GGTTGGCAAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 9 328327 CASAVA_Build 21 44902786 1D ACCCTGGGAA C/- CCCCTCAAGG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 5 4 328328 CASAVA_Build 21 44907456 1D TAAAAATCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 10 9 328329 CASAVA_Build 21 44910436 1D ACTGGGTGAA G/- GGATCACTGA 3070 hom 50 het 23 0 17 7 G 3 2 328330 CASAVA_Build 21 44916920 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 16 8 A 10 11 328331 CASAVA_Build 21 44918251 1I AAAATTTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 150 hom 25 1 21 3 A 9 10 328332 CASAVA_Build 21 44919873 1I CAAGGATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 278 hom 38 2 28 8 T 11 12 328333 CASAVA_Build 21 44925253 2I GTACAAACAT --/AC AGTTACACAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AC 0 1 328334 CASAVA_Build 21 44927846 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 7 8 328335 CASAVA_Build 21 44928034 1D ATCAGATATT A/- AAAGATATAG 3070 het 3070 ref 31 18 12 4 A 4 3 328336 CASAVA_Build 21 44932545 4I AAGTGGGGTG ----/CACT CAGAGAATTG 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 CACT 0 1 328337 CASAVA_Build 21 44937991 2D ATGGCTGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 8 T 12 10 328338 CASAVA_Build 21 44948583 1I CTGCTTCCCT -/G GGGTACCCCA 1704 hom 28 het 17 0 7 10 G 3 4 328339 CASAVA_Build 21 44960091 1D TTAAAGACAC A/- AAAATTCTTC 2709 het 2709 ref 24 15 8 1 A 5 4 328340 CASAVA_Build 21 44961955 19I41M2I ATTTGAGAAT -------------------GGTGGACATTTTTATGATATGAAGTCTTCCCGCTGAAGATA--/GATGGACATTTTTATCTCAGATGGACATTTTTATGATATGAAGTCTTCCCGCTGAAGATATC TGTTTATTCC 3070 het 3070 ref 28 19 12 7 N/A 0 0 328341 CASAVA_Build 21 44967439 2D GAAAGAACTA TT/-- TTTTCCTCCT 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 T 6 4 328342 CASAVA_Build 21 44976694 1I TGAGGGGAAA -/T GGAGCACTGG 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 T 0 1 328343 CASAVA_Build 21 44978069 2I CAGGAATCTG --/TA TTTCTGATTA 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 TA 0 1 328344 CASAVA_Build 21 44982626 1D TGTTTGGGAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 9 8 328345 CASAVA_Build 21 44984132 4D TAAAGCACAA ACTG/---- ACTGCCAGCC 3070 het 1415 hom 47 10 16 27 ACTG 2 1 328346 CASAVA_Build 21 44984147 2D CTGCCAGCCC TG/-- TGAGGAAGCT 3070 het 1903 hom 44 6 25 14 TG 2 1 328347 CASAVA_Build 21 44993423 1D GGTTGACGAG A/- AAGAGTGAAA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 A 3 2 328348 CASAVA_Build 21 44995298 1D AATACTGGTA T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 6 5 328349 CASAVA_Build 21 44997755 6I GCTGGGCTGT ------/GTCTTC GTAGTAGAAT 2381 het 2248 hom 22 10 10 2 GTCTTC 0 1 328350 CASAVA_Build 21 45010135 4D GGATGTAGGG GAGT/---- GAGTCACCTG 3070 het 2776 hom 29 12 13 5 GAGT 2 1 328351 CASAVA_Build 21 45022907 2I AGTGTCAGCC --/AT ACTATGCCTG 3070 het 3070 ref 55 22 23 10 AT 0 1 328352 CASAVA_Build 21 45024343 1I AAAAATGTCT -/G GGGTAGTGTT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 G 3 4 328353 CASAVA_Build 21 45030431 1D CCCCACAAAT A/- ACTGCAGACA 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 2 1 328354 CASAVA_Build 21 45038390 1I GGGCCTTTAA -/T GAGGTAATTA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 0 1 328355 CASAVA_Build 21 45039403 1I GTCAGGAGTT -/A AGAGACCAGC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 1 2 328356 CASAVA_Build 21 45040103 4I AGAGGAAAAC ----/TGTT TGGCCGTTTC 3070 het 3070 hom 29 8 17 4 TGTT 0 1 328357 CASAVA_Build 21 45044768 1I AAATACAAGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 A 8 9 328358 CASAVA_Build 21 45060143 12I GCTCCAAACA ------------/GATGGACACCAG GAATGACGAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 GATGGACACCAG 0 1 328359 CASAVA_Build 21 45104820 2I AAAAGAGGGC --/TG TGTCTACGCA 2855 het 2855 ref 30 19 8 3 TG 1 2 328360 CASAVA_Build 21 45105158 1I TACTATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2648 hom 22 7 9 6 T 10 11 328361 CASAVA_Build 21 45107689 1I CCAACACGCA -/G GGTCCTCTTG 3070 het 2625 hom 30 8 13 9 G 2 3 328362 CASAVA_Build 21 45126390 2D GACGTGGACT GG/-- GGGGGCTCAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 6 G 7 5 328363 CASAVA_Build 21 45127335 1I TTGATGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 11 11 T 11 12 328364 CASAVA_Build 21 45137363 1I CCAGGGATTT -/G GGGCTCCAGG 2363 het 2363 ref 26 17 7 2 G 3 4 328365 CASAVA_Build 21 45142400 1I GATGGGGGTG -/T TCATTGTTCC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 1 2 328366 CASAVA_Build 21 45174193 1D GGGAAGAGCT A/- GAGAACCTAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 8 A 1 0 328367 CASAVA_Build 21 45181643 3I TGCTTGAGCC ---/GAG GAGTTCAAGA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 GAG 1 2 328368 CASAVA_Build 21 45182446 1D AGAATATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 12 11 328369 CASAVA_Build 21 45185078 2I TGTAGGTATC --/TT TGCATTTATT 3070 het 3070 ref 45 13 13 19 T 1 3 328370 CASAVA_Build 21 45185352 9I CCCAGAGGTG ---------/CTTTTGAAC CTTTTGAACC 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 CTTTTGAAC 1 2 328371 CASAVA_Build 21 45194641 1D GGGTATGACA G/- GAAACCATGC 3070 hom 82 het 37 0 26 11 G 2 1 328372 CASAVA_Build 21 45214289 1D CTGTCAGCTG A/- AGATCTGTCT 3070 hom 111 het 42 0 36 7 A 2 1 328373 CASAVA_Build 21 45215734 1D CCCCACTGGG T/- AGGCTGTGCG 2360 hom 33 het 13 0 10 3 T 1 0 328374 CASAVA_Build 21 45215994 1I GGTCTCCTGA -/C CCCAGCACGT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 C 3 4 328375 CASAVA_Build 21 45218596 1I TTTGTGTCAG -/T TTCTACCGAG 3070 het 3070 hom 60 25 30 5 T 2 3 328376 CASAVA_Build 21 45227716 1D19M1D CAGGCCTCTT CCCTGGCTTGTTTCAGCCTTC/-CCTGGCTTGTTTCAGCCTT- CCTGAAGATG 3070 hom 78 het 27 0 25 13 N/A 0 0 328377 CASAVA_Build 21 45227881 1D TCCCTGCAAG T/- ACTGTGGAGC 3070 hom 51 het 20 0 15 6 T 1 0 328378 CASAVA_Build 21 45232812 2I ATGTGTGTGC --/GT GTGTGTGCGG 1581 het 1581 ref 35 21 5 10 GT 3 4 328379 CASAVA_Build 21 45232852 4D GTGCATGCGT GTGC/---- GTGCGTGTGT 25 het 25 ref 42 22 2 19 GTGC 2 1 328380 CASAVA_Build 21 45240594 1D CACTGCCTCC A/- CCTGGCCTGC 2896 het 2532 hom 28 9 9 10 A 1 0 328381 CASAVA_Build 21 45241020 1I CTGGAGGATG -/C CCTGGTCCCC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 C 2 3 328382 CASAVA_Build 21 45241324 1I CATGGAAGAT -/G GGGTATCCTG 3070 het 128 hom 23 1 18 4 G 3 4 328383 CASAVA_Build 21 45243224 1I ACCAGTGCCC -/G GGACCCCCGA 1426 hom 31 het 13 0 8 5 G 2 3 328384 CASAVA_Build 21 45243386 20D CTCGGGGGGC TGGCGCCCCTGGGCTGGGCA/-------------------- TGGCGCCCCT 2151 het 2130 hom 22 8 7 10 TGGCGCCCCTGGGCTGGGCA 2 1 328385 CASAVA_Build 21 45243789 1D TGGCCGTGGC T/- TGTGCGGTCT 3070 hom 52 het 23 0 15 8 T 2 1 328386 CASAVA_Build 21 45249932 1I ACACATATAT -/A ATTGTATTTA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 2 328387 CASAVA_Build 21 45265864 2D ACAGAACAGT AC/-- GACGCCGAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AC 1 0 328388 CASAVA_Build 21 45286575 14D CGTATGTGTG GGGTGTGTGGTTTA/-------------- TATGTGTGTG 340 het 340 ref 52 32 2 28 GGGTGTGTGGTTTA 1 0 328389 CASAVA_Build 21 45289234 1D29M1I GTGTGGTACT GGGGGGAAGAAGAGACAAACGGGTGAATGG-/-GGGGGAAGAAGAGACAAACGGGTGAATGGA ACAGAATAGA 3070 hom 138 het 33 0 47 3 N/A 0 0 328390 CASAVA_Build 21 45291267 1I GGGCTGAGGC -/G GGCAGGCTGC 3070 hom 68 het 24 0 22 2 G 2 3 328391 CASAVA_Build 21 45294430 1I CCTCCCATGT -/C CCCAAGCTCC 3070 hom 58 het 23 0 15 8 C 3 4 328392 CASAVA_Build 21 45301895 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2854 het 1515 hom 28 7 8 13 T 13 12 328393 CASAVA_Build 21 45337242 1D GTACCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2473 hom 33 7 21 6 T 11 10 328394 CASAVA_Build 21 45343854 1I CTAAAAGTAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 8 9 328395 CASAVA_Build 21 45350484 15D ATTCCTTTCT TTGCCTTTAATGCAA/--------------- TTGTATCTTG 3070 hom 54 het 23 0 19 7 TTGCCTTTAATGCAA 1 0 328396 CASAVA_Build 21 45357341 3D CAGAATGTTT AAG/--- AAGTATTTCA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AAG 2 1 328397 CASAVA_Build 21 45359447 1D CCAGGGAAGA T/- TTTAAGGCGA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 4 3 328398 CASAVA_Build 21 45397685 1I GCTGTTGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 10 11 328399 CASAVA_Build 21 45400122 4D ATCCATCCAT CCAC/---- CCACCCACCC 1365 hom 10 het 5 0 4 1 CCAC 4 3 328400 CASAVA_Build 21 45408166 2D TCTGGCCCTC TG/-- TGCTCTGCCA 3070 hom 97 het 39 0 27 14 TG 2 1 328401 CASAVA_Build 21 45409597 4D GCAAGGTGCC CTAA/---- CTGACACCTC 3070 hom 72 het 27 0 25 6 CTAA 1 0 328402 CASAVA_Build 21 45411223 1D CAAATAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 11 10 328403 CASAVA_Build 21 45421304 1D CGTTAGGCAA C/- CCCCCCCATG 3070 hom 126 het 51 0 39 13 C 8 7 328404 CASAVA_Build 21 45437839 1D AGATTGTCTG C/- TCTCCCCACT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 1 0 328405 CASAVA_Build 21 45456401 1D GGATCTTATA T/- TTTTTGTTAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 6 5 328406 CASAVA_Build 21 45463219 1D TCTGCCCATG T/- TCTAAGCATG 3070 hom 90 het 36 0 29 7 T 2 1 328407 CASAVA_Build 21 45469414 5D AGGGCTTCTG TTGTT/----- TTGTTTTGTT 3070 hom 88 het 36 0 30 10 TTGTT 5 4 328408 CASAVA_Build 21 45482178 4D GTAAAGAAAT TAGC/---- TAGCAAGTAA 3070 het 3070 ref 40 30 9 1 TAGC 2 1 328409 CASAVA_Build 21 45488905 1D GTATGTTTTA T/- AAGTTTCTTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 T 1 0 328410 CASAVA_Build 21 45490487 20I GAAAAGAATT --------------------/CTATGGCCAGATACACATGG CTGTCTGCAC 3070 het 3070 hom 61 27 31 6 CTATGGCCAGATACACATGG 0 1 328411 CASAVA_Build 21 45493998 5D CTCAAAACTT TAATC/----- TACTGTTTAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 4 TAATC 1 0 328412 CASAVA_Build 21 45494321 6D CCCATCTCTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 999 hom 19 6 10 7 A 16 10 328413 CASAVA_Build 21 45495589 1I TTGAGGATGG -/C CAGTGGTAGA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 C 1 2 328414 CASAVA_Build 21 45508558 4I TCTGTCCCTC ----/CTCA CTAACTGTCC 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 CTCA 0 1 328415 CASAVA_Build 21 45520589 1D TAAAAAGAAT A/- AAAAAAAAAC 1706 het 1706 ref 12 5 6 1 A 10 9 328416 CASAVA_Build 21 45534706 1I TAGAGTGGGA -/G GGGGGGGTAA 1998 het 1998 ref 28 12 7 9 G 7 8 328417 CASAVA_Build 21 45534908 2D CGCTTGGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 1177 het 1177 ref 35 18 5 13 A 14 12 328418 CASAVA_Build 21 45542673 1I TGTTACACTA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 6 7 328419 CASAVA_Build 21 45543272 5D AGAGATGGCT CTTAA/----- CTTGATTTCT 3070 het 3070 ref 43 21 21 2 CTTAA 1 0 328420 CASAVA_Build 21 45552036 4D ACACACGTGC ACAG/---- ACACACTCCA 957 het 957 ref 58 46 4 12 ACAG 1 0 328421 CASAVA_Build 21 45557774 1D AAGTCTATTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 A 9 8 328422 CASAVA_Build 21 45572222 6I TTCCCTTTGT ------/GTAGTC TGGGAACGTG 3070 het 1865 hom 22 6 12 4 GTAGTC 0 1 328423 CASAVA_Build 21 45576861 2D TGTCTGTCAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 64 23 24 18 TG 6 5 328424 CASAVA_Build 21 45577079 1I TCTGTGTGTT -/G GTGCATCTCT 3070 het 3070 ref 79 36 32 11 G 1 2 328425 CASAVA_Build 21 45583356 1D CTTTAACATA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 8 7 328426 CASAVA_Build 21 45592683 2I AAAAGGAGAG --/AT ATTTTATCTG 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 AT 1 2 328427 CASAVA_Build 21 45595089 2D59M4D ACATATACAC GTGTGTTGCATATGTGTGCACATGTACCACATATACCGCATACGTGTGCATGGGTGCATGCCACA/--GTGTTGCATATGTGTGCACATGTACCACATATACCGCATACGTGTGCATGGGTGCATGC---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 76 39 26 51 N/A 0 0 328428 CASAVA_Build 21 45597870 1I ATGTCTGTTG -/T TTTAAGCCCC 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 T 3 4 328429 CASAVA_Build 21 45599003 1D TTAAATACTT A/- AGATTAGAAA 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 A 2 1 328430 CASAVA_Build 21 45604095 1I CCCCAGAGAA -/C CCCCCCCGCA 2119 het 2119 ref 23 10 9 4 C 7 8 328431 CASAVA_Build 21 45604534 22D AGGGGGAACG CAGCCCCCACCAAAATCTTCCC/---------------------- CAGACACAAT 2168 het 2168 ref 12 7 6 1 CAGCCCCCACCAAAATCTTCCC 1 0 328432 CASAVA_Build 21 45610458 1D GGCGCCTTGG T/- TTTTCTTGGC 2497 het 2497 ref 18 8 7 4 T 5 4 328433 CASAVA_Build 21 45622773 1D TCTAAAGACT C/- GAAAGGAAGA 3070 hom 66 het 25 0 20 6 C 1 0 328434 CASAVA_Build 21 45648723 1I GGAGCAGGCT -/G GGGGGGTGTT 2389 het 2389 ref 29 12 8 9 G 6 7 328435 CASAVA_Build 21 45651404 1D GGCCCAGAGA G/- GGGTCTGCAT 2134 het 2134 ref 18 9 6 3 G 4 3 328436 CASAVA_Build 21 45654611 1I GATCCCCTGT -/G GGGCCCCTCG 3070 hom 62 het 23 0 15 8 G 3 4 328437 CASAVA_Build 21 45658118 6D CAGCACTTGT GCCTGG/------ GCCTTTGCAG 2172 het 2172 ref 28 15 7 9 GCCTGG 1 0 328438 CASAVA_Build 21 45667136 1D TCCAAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2349 hom 25 9 12 4 T 12 11 328439 CASAVA_Build 21 45673760 1I AGGGGCAGTG -/C CCACAGCAGG 3070 het 875 hom 33 5 19 9 C 2 3 328440 CASAVA_Build 21 45692609 4D GCACTCCCTT TCTC/---- TCCATCTGTG 3070 het 3070 hom 68 29 31 12 TC 3 1 328441 CASAVA_Build 21 45723421 4I ACACGCACGC ----/GTGT GTGTGAGTGT 3070 het 3070 hom 38 12 15 11 GT 2 4 328442 CASAVA_Build 21 45723527 1D CGCGTGTGTG T/- GGGGGGGTGA 3070 het 3070 ref 57 25 22 10 T 1 0 328443 CASAVA_Build 21 45728023 1I TCCTCACCTT -/G GGCTGGACGG 2858 het 2858 ref 31 14 9 8 G 2 3 328444 CASAVA_Build 21 45728962 4I TATGTGCAAC ----/ACAT ACATGTATCT 3070 het 3070 ref 84 40 37 7 ACAT 1 2 328445 CASAVA_Build 21 45729845 1D GTCCAAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 9 8 328446 CASAVA_Build 21 45737087 14I CTGCATGCTG --------------/CCCGCCACTGCCCT CCCGGCTGGG 2466 het 2466 ref 25 9 9 7 CCCGCCACTGCCCT 0 1 328447 CASAVA_Build 21 45739950 4I GTCCACACAC ----/ACAT GCACACGTGT 3070 het 3070 ref 60 32 24 4 ACAT 0 1 328448 CASAVA_Build 21 45740945 1D CCTACAGCCA C/- CCTTGGCTGT 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 C 3 2 328449 CASAVA_Build 21 45744545 2I GTGGAGTGTG --/TA TGTGGCTGGG 2034 het 2034 ref 31 15 7 10 TA 0 1 328450 CASAVA_Build 21 45757889 2I ACATCAACCC --/CA GAGTCATTCG 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 CA 0 1 328451 CASAVA_Build 21 45759506 1D TACGTCAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 11 8 A 13 12 328452 CASAVA_Build 21 45761991 5D TAAGAGCGTG CCTGT/----- CCTGTCCCCC 3070 het 2048 hom 22 8 11 3 CCTGT 2 1 328453 CASAVA_Build 21 45774692 2I TGCGCATGTG --/GT GTGTGTTCAT 3070 hom 167 het 60 0 54 6 GT 3 4 328454 CASAVA_Build 21 45776965 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGTTTCAC 3070 hom 60 het 21 0 20 1 G 5 4 328455 CASAVA_Build 21 45777624 6D CATGGGAACG TGGAGC/------ TGGGCACGGG 3070 hom 100 het 40 0 31 11 TGGAGC 1 0 328456 CASAVA_Build 21 45785367 6I CTAGTTTAAA ------/AAGAAG AAGAAGAAGA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 AAG 4 6 328457 CASAVA_Build 21 45807685 1I GTGGGCATGC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 6 7 328458 CASAVA_Build 21 45825309 1I CAGGCCGGTG -/C CCCCACGCCA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 C 4 5 328459 CASAVA_Build 21 45826929 1D AATTCACACA C/- ACCTTCTCCC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 1 0 328460 CASAVA_Build 21 45830327 4I CTCCGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 AAAC 2 3 328461 CASAVA_Build 21 45830940 1I TTTGAATTGT -/C CCCTTTATTC 3070 het 3070 ref 45 22 21 2 C 3 4 328462 CASAVA_Build 21 45846578 1I CATGACACTC -/A ACACTAGCAG 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 A 1 2 328463 CASAVA_Build 21 45846919 2D AAAAGGAAAG GA/-- GTGGAAAGGA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 GA 1 0 328464 CASAVA_Build 21 45852174 2D CACGGGCAGC TT/-- TAACTACATG 3070 het 3070 hom 23 8 12 4 T 3 1 328465 CASAVA_Build 21 45883561 1I AGGGGCCCAG -/A AGCAGAGGAG 2308 het 2308 ref 18 8 6 4 A 1 2 328466 CASAVA_Build 21 45888856 1I AGTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 8 9 328467 CASAVA_Build 21 45889581 1D TCGAGCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 12 11 328468 CASAVA_Build 21 45891405 1D GGTTAGCAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 21 24 5 A 10 9 328469 CASAVA_Build 21 45902658 1I TTGTTGAGGA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 6 7 328470 CASAVA_Build 21 45907505 2D AAGCTGTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 2691 het 2691 ref 32 12 8 15 CT 10 9 328471 CASAVA_Build 21 45910733 2I GGTTACAAAC --/AG AAGTTACATT 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 AG 0 1 328472 CASAVA_Build 21 45920710 1D CTTTACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 9 9 T 11 10 328473 CASAVA_Build 21 45935799 2D TATGTATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1687 het 1687 ref 15 7 6 2 TG 10 9 328474 CASAVA_Build 21 45967191 1I TGAAAATATT -/A AAAAAAAAAC 2989 het 2989 ref 21 11 9 1 A 9 10 328475 CASAVA_Build 21 45976212 1I ATGCATTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 T 10 11 328476 CASAVA_Build 21 45984964 2I GGTGTGTGTA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 52 16 17 19 GT 8 9 328477 CASAVA_Build 21 46016080 1D CTATTCAGTA T/- TTTACTGGAG 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 4 3 328478 CASAVA_Build 21 46019702 2D CAGTTTAATT TA/-- AATGCCTCCT 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 TA 1 0 328479 CASAVA_Build 21 46021658 1D TTATAGATGA C/- TAGATGCTTT 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 C 1 0 328480 CASAVA_Build 21 46026394 1D TCAAAGCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 10 9 328481 CASAVA_Build 21 46068075 1I TTTTTTTTTT -/A ATTTTTTAAT 3070 het 2892 hom 27 9 12 6 A 1 2 328482 CASAVA_Build 21 46085753 1I TTCATTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 10 11 328483 CASAVA_Build 21 46090772 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 T 12 11 328484 CASAVA_Build 21 46104520 1D CAGCCGACAT C/- CGGGCTGTGG 3070 hom 82 het 34 0 24 10 C 2 1 328485 CASAVA_Build 21 46106532 1D TTGGGGCGGG T/- GGGGGGACAC 3070 hom 55 het 21 0 16 5 T 1 0 328486 CASAVA_Build 21 46124052 2D ACACCTCTAA AT/-- AATGCCCTAG 3070 het 3070 hom 28 10 17 1 AT 1 0 328487 CASAVA_Build 21 46146105 4D AGACAGAGAC AGAG/---- AGAGAGCGAG 1519 het 1519 ref 41 14 7 22 AG 5 3 328488 CASAVA_Build 21 46161607 2D ATAATTAGTG GA/-- GACCTCTTAC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 GA 2 1 328489 CASAVA_Build 21 46163476 4D AGAGAACGAG AGAC/---- AGACGGCCCC 3070 hom 106 het 43 0 29 14 AGAC 2 1 328490 CASAVA_Build 21 46164391 1I AGGTTCCAAA -/G GGGGGGGTCA 3070 hom 81 het 34 0 23 11 G 7 8 328491 CASAVA_Build 21 46166152 1I CAGAACGAGA -/C CCCGTTTCAA 3070 hom 55 het 24 0 16 8 C 3 4 328492 CASAVA_Build 21 46167321 3D GAAATGTGTC GTT/--- GTAAGTGGGA 3070 hom 108 het 44 0 32 15 GTT 1 0 328493 CASAVA_Build 21 46185496 1I CCATCCCTGT -/G GCCACAGGCC 3070 hom 85 het 33 0 20 13 G 1 2 328494 CASAVA_Build 21 46188193 3D CACTCCAGGT GGG/--- GGAGCACTCC 1456 het 1456 ref 25 16 4 5 G 5 2 328495 CASAVA_Build 21 46191067 1D GTTTTTAACG T/- TTTTAACGCC 3070 hom 104 het 42 0 34 8 T 5 4 328496 CASAVA_Build 21 46193886 3D GATATACCTC TAT/--- TAAGTGCAGA 3070 hom 51 het 20 0 17 6 TAT 1 0 328497 CASAVA_Build 21 46197721 14D TGGTACTGAT AATGCCTGGTACTG/-------------- TGGCATGCCT 969 het 969 ref 36 19 4 20 AATGCCTGGTACTG 1 0 328498 CASAVA_Build 21 46198917 5D TAAGTTCTGG CTTGA/----- GCCAGTTTGT 3070 hom 67 het 27 0 20 8 CTTGA 1 0 328499 CASAVA_Build 21 46201248 4I CTCTCATGGG ----/AACT AACTGAGTGA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 AACT 1 2 328500 CASAVA_Build 21 46208187 4D TTTTCGTGAT AGTG/---- AGTGAGTTAT 3070 het 3070 ref 42 22 12 10 AGTG 2 1 328501 CASAVA_Build 21 46210841 2D ATAGATGGCA TC/-- TCAAATAATT 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 TC 2 1 328502 CASAVA_Build 21 46222955 1D ATGTTCTCCC T/- GAGACATAAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 1 0 328503 CASAVA_Build 21 46223882 8I ACCTGTCCCT --------/GTGTGTCA GGGCGTCCGC 3070 hom 92 het 39 0 28 11 GTGTGTCA 0 1 328504 CASAVA_Build 21 46226656 1I AGAAGTCGTG -/C CGCTGCTGGT 1302 hom 17 het 14 0 5 9 C 1 2 328505 CASAVA_Build 21 46240278 1D CCTTCCGGGC T/- TTCCCTGCTC 2487 het 2487 ref 29 13 9 8 T 3 2 328506 CASAVA_Build 21 46243157 1I CTCTCTTATC -/T TTTATTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 3 4 328507 CASAVA_Build 21 46256263 2I TAAGACACTG --/TT TTTCTATTTG 3070 het 3070 ref 59 34 20 5 T 3 5 328508 CASAVA_Build 21 46260847 1I TTTTTTTTTT -/A TATTCGAGAC 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 A 0 1 328509 CASAVA_Build 21 46263387 1D TCTTACCTAC T/- TTCTGATCTT 2322 het 2322 ref 30 11 7 12 T 3 2 328510 CASAVA_Build 21 46264947 3I TGAAATCAGG ---/AGA AGGAGAGTCT 3070 het 2664 hom 26 9 14 3 AGA 0 1 328511 CASAVA_Build 21 46273382 1I TGTTTGCAGT -/C CCACATCACC 3070 hom 95 het 40 0 32 8 C 2 3 328512 CASAVA_Build 21 46290743 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGGAGAA 3070 het 1897 hom 18 7 9 2 G 7 6 328513 CASAVA_Build 21 46293326 2I TGTATGTAAA --/GG CGGCACCTCC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 G 0 2 328514 CASAVA_Build 21 46299625 3D CGGCTGACAT CTC/--- CTCAGAGCCT 3070 het 2172 hom 23 6 12 7 CTC 2 1 328515 CASAVA_Build 21 46302576 4D CACCTTTCCT AGAG/---- AGAGACACGA 3070 het 3070 ref 35 16 13 10 AG 4 2 328516 CASAVA_Build 21 46306867 15D CTGCTGAAGG CAGCGGAGCACCATC/--------------- CCCTGTTGTC 3070 het 3070 ref 40 25 15 9 CAGCGGAGCACCATC 1 0 328517 CASAVA_Build 21 46310166 3I CTCCACCCGC ---/AGA AGAAGAGGTT 3070 hom 84 het 34 0 23 11 AGA 2 3 328518 CASAVA_Build 21 46311731 6D TGAGGCACTT AGACAG/------ AGACCTCCCT 3070 het 3070 ref 27 15 9 4 AGACAG 1 0 328519 CASAVA_Build 21 46312973 2D TGCACGTGCA TG/-- TGTGTGTGCA 1539 het 1539 ref 48 23 8 17 TG 5 4 328520 CASAVA_Build 21 46313787 22D CCTGTGTGCC TGTGTGTGTGTGCATGTGCGTG/---------------------- TGTGTGCATG 550 het 550 ref 48 48 6 13 TGTGTGTGTGTGCATGTGCGTG 1 0 328521 CASAVA_Build 21 46313921 1I TGTGCATTGT -/G GGGGGTGGGG 3070 het 3070 ref 54 26 16 12 G 5 6 328522 CASAVA_Build 21 46326935 1I GATCTCTCTT -/C CCCATCTGAC 3070 het 484 hom 19 3 11 5 C 3 4 328523 CASAVA_Build 21 46341346 2D46M2I AGACACACAC ATTCACACTCAACCTCAGACGCAGACACACACCACACACTCACAGATG--/--TCACACTCAACCTCAGACGCAGACACACACCACACACTCACAGATGCA CACACAGTCT 3070 hom 125 het 42 0 37 32 N/A 0 0 328524 CASAVA_Build 21 46345031 1I CACGTGGCTT -/A AATGTCCTCC 3070 het 3070 hom 55 21 25 9 A 2 3 328525 CASAVA_Build 21 46346276 1I ACTATTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 A 10 11 328526 CASAVA_Build 21 46348514 1D ATTTCAAAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 A 9 8 328527 CASAVA_Build 21 46352446 1D ATATATATAT A/- TATTTTTTTT 3070 het 901 hom 19 3 14 3 A 1 0 328528 CASAVA_Build 21 46358187 1D CCTCACAGCA C/- CCCATGTCTC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 C 4 3 328529 CASAVA_Build 21 46362095 1I CACTGAGCCT -/G GGGCCTCACA 3070 hom 48 het 21 0 14 7 G 3 4 328530 CASAVA_Build 21 46367083 1I TCAGGCTTTG -/C CAAAAAAACC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 1 2 328531 CASAVA_Build 21 46368043 8I GGGTAGGTGG --------/ATGGATGA GTAGATGGAT 3070 hom 82 het 39 0 26 13 ATGGATGA 0 1 328532 CASAVA_Build 21 46368227 1I2M5D ATGGATGGGT -GAGTCAG/AGA----- TGGATAGATG 2603 het 2603 ref 46 19 9 21 N/A 0 0 328533 CASAVA_Build 21 46368880 1D CACCTGTTAG C/- CCCCCCCCCC 3023 hom 4 het 28 1 16 11 C 11 10 328534 CASAVA_Build 21 46371355 2D CTGCGGCTCT CA/-- CATCTCTGGG 3070 hom 55 het 24 0 15 10 CA 2 1 328535 CASAVA_Build 21 46372069 1D GCTATCAGGT G/- GGGGGCCTTC 3060 het 3060 ref 32 12 9 12 G 6 5 328536 CASAVA_Build 21 46381962 2D TTCTAGAGAC AA/-- AGTCATCCCC 3070 het 2462 hom 24 7 10 8 A 3 1 328537 CASAVA_Build 21 46382192 2D GCTGTGGCCC CT/-- GTCAGTGTGA 3070 hom 73 het 31 0 22 9 CT 1 0 328538 CASAVA_Build 21 46391632 1I GTGAAGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 32 1 23 8 A 13 14 328539 CASAVA_Build 21 46395812 1I TGCCCCATCC -/A CCACCGACCT 1681 hom 29 het 16 0 8 8 A 0 1 328540 CASAVA_Build 21 46398881 1I AGTCACTCCA -/G GCCCAAGCAC 1496 het 1239 hom 19 8 6 5 G 1 2 328541 CASAVA_Build 21 46410951 1D CAAATGAGAA C/- CAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 C 2 1 328542 CASAVA_Build 21 46420387 1I AGGACTAAAG -/A CAAAAACCAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 0 1 328543 CASAVA_Build 21 46430940 1D ACTCCGTATC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 20 0 20 1 A 10 9 328544 CASAVA_Build 21 46431180 4D CACAGCCACT TTTG/---- TTTGTTTGAT 3048 hom 24 het 11 0 9 3 TTTG 3 2 328545 CASAVA_Build 21 46432142 2I TCAAGGTTCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 24 16 10 T 10 12 328546 CASAVA_Build 21 46436941 2I TACGTATGTC --/TG TGTGTGGCAC 3070 hom 171 het 65 0 55 10 TG 3 4 328547 CASAVA_Build 21 46437589 4I CCTGTGCATG ----/TGTA CGTATGTGTG 3070 hom 91 het 52 1 45 6 TGTA 0 1 328548 CASAVA_Build 21 46446144 1I GTTTAAAATC -/T TTTTTTTTTT 1575 het 143 hom 11 2 5 4 T 14 15 328549 CASAVA_Build 21 46462675 13I AAAATGTTAC -------------/AAGACACTGGTTA AAGACACCAC 3070 hom 42 het 18 0 14 4 AAGACACTGGTTA 0 1 328550 CASAVA_Build 21 46465705 3I TTTGCTTGGC ---/TTT TTTATTTTAT 3070 hom 65 het 24 0 22 3 T 3 6 328551 CASAVA_Build 21 46474173 1I CAACAGGGCA -/G GGGGGCGTCT 2893 het 2603 hom 23 8 8 7 G 5 6 328552 CASAVA_Build 21 46474643 1D AAATCACCCG T/- TAAGTCAGAC 3070 het 3070 hom 45 20 18 8 T 2 1 328553 CASAVA_Build 21 46480725 1I TGAAAAGCAA -/C CCTGACCACT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 C 2 3 328554 CASAVA_Build 21 46495704 3I GGCTTAAAAA ---/AAT AATTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 AAT 1 2 328555 CASAVA_Build 21 46497494 2I AAAAAAACAC --/AA AGAGACTGTA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 1 3 328556 CASAVA_Build 21 46509142 1I CAGCCACCCC -/A AGCCATGCCC 3070 hom 60 het 25 0 17 8 A 1 2 328557 CASAVA_Build 21 46522507 1D CCACCCCCCG A/- AAAAAAAAAA 1690 het 1690 ref 24 16 4 4 A 13 12 328558 CASAVA_Build 21 46523612 2I CCTGGGCAAC --/AA AGCCAGACTG 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 1 3 328559 CASAVA_Build 21 46535568 1D AGTGATTTGG C/- TCAGAGATAA 3070 hom 53 het 26 0 19 7 C 1 0 328560 CASAVA_Build 21 46542333 1D TATTTCCTGC T/- TTTACCTCCT 2064 het 2064 ref 25 11 6 8 T 4 3 328561 CASAVA_Build 21 46542596 1I CCTTCCCACT -/G GACTTGCGTC 3070 hom 72 het 29 0 22 7 G 1 2 328562 CASAVA_Build 21 46545497 1I TTTTATTTTA -/T TTTTTGAGAC 3070 hom 64 het 25 0 21 4 T 5 6 328563 CASAVA_Build 21 46545820 1I ACAGCTGTGG -/C ACACAGGTGT 3070 hom 74 het 27 0 19 8 C 0 1 328564 CASAVA_Build 21 46567323 1I CAGGCCCGGA -/G GGACTACAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 2 3 328565 CASAVA_Build 21 46585415 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCCCC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 G 3 4 328566 CASAVA_Build 21 46587803 1I GTTGAACCTT -/G CATCCCTGGT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 0 1 328567 CASAVA_Build 21 46598680 1D ACCCTGCAGT G/- GGGCTGCATT 3070 hom 59 het 22 0 16 6 G 4 3 328568 CASAVA_Build 21 46608782 2D GGTGGGTGTC AG/-- GGGCGGGGAT 3070 het 2494 hom 22 7 10 5 AG 1 0 328569 CASAVA_Build 21 46612178 1D GGTCCCCTCC T/- TTTATTGATG 3070 hom 91 het 35 0 31 6 T 4 3 328570 CASAVA_Build 21 46615561 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 980 het 980 ref 12 5 6 1 C 0 1 328571 CASAVA_Build 21 46616336 2I TGCAGCACAT --/GC GCACACACAC 3070 het 3070 hom 97 38 41 18 GC 1 2 328572 CASAVA_Build 21 46619951 1D TTTGAGCCGG C/- CCGGTCAGAT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 C 3 2 328573 CASAVA_Build 21 46621431 1D CTTATCACAC A/- AAAAAAGGTA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 6 328574 CASAVA_Build 21 46622226 21I AAAACAAGAA ---------------------/ACCCCCCACTCGTTAGCATTT ACTCCCCATT 3070 het 3070 ref 47 27 15 7 ACCCCCCACTCGTTAGCATTT 0 1 328575 CASAVA_Build 21 46640536 1I CGGGGCTTCG -/C CACCCCAGGT 3070 hom 59 het 27 0 18 9 C 1 2 328576 CASAVA_Build 21 46642098 11I TGGGGCCCGG -----------/GCTGGGCCTGT GCTGGGCCTG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 GCTGGGCCTGT 1 2 328577 CASAVA_Build 21 46643163 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1065 het 556 hom 23 5 7 11 T 17 16 328578 CASAVA_Build 21 46644922 25I GTGCAGTGGC -------------------------/GCAATCTTGGCTCGAGTGCAGTGGT GCAATCTCGG 2315 het 987 hom 10 2 6 3 GCAATCTTGGCTCGAGTGCAGTGGT 0 1 328579 CASAVA_Build 21 46646481 1I CAGGCGTGAG -/C CCCATGCCCA 3070 hom 33 het 29 0 12 17 C 3 4 328580 CASAVA_Build 21 46657703 1D GGTGTGGGGA G/- GGGGGAAGGC 3070 het 118 hom 31 2 23 7 G 6 5 328581 CASAVA_Build 21 46658337 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1385 het 94 hom 13 1 6 6 T 15 14 328582 CASAVA_Build 21 46667506 1I AAATTGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 10 11 328583 CASAVA_Build 21 46675080 1D TTCATCCTTC T/- TTTCCTGTTC 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 T 4 3 328584 CASAVA_Build 21 46676580 1I TGCCGGCGGA -/G CGTCCACACC 3070 hom 75 het 32 0 20 12 G 0 1 328585 CASAVA_Build 21 46684366 1I GCTGCGTCTC -/T TAAGATGCTC 3070 het 1555 hom 22 4 11 7 T 1 2 328586 CASAVA_Build 21 46685070 1I AGGCCGATGG -/C CTCTGTGATG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 1 2 328587 CASAVA_Build 21 46709756 1I TAAATATAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 10 11 328588 CASAVA_Build 21 46711141 1D GACTTCAACC A/- AAAAAACCAC 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 A 7 6 328589 CASAVA_Build 21 46711257 1I ACCTCTTCTT -/A ACTAAATGTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 A 1 2 328590 CASAVA_Build 21 46719427 1D TTCTCCACTT A/- ACACTCTTCC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 2 1 328591 CASAVA_Build 21 46722096 2I TTTGTTTTGT --/TG TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 TG 0 1 328592 CASAVA_Build 21 46730040 3I AAATTAAGAA ---/CTT CTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 CTT 1 2 328593 CASAVA_Build 21 46734166 1D TCAAATGATA C/- CAGGGATTTT 3070 het 3070 hom 38 17 20 1 C 2 1 328594 CASAVA_Build 21 46735617 1I GAGCACGTTA -/T TCTATTTAAT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 1 2 328595 CASAVA_Build 21 46737696 5I CAATAATGTT -----/TAAAG TAGGGGAATC 3070 het 3036 hom 27 7 15 5 TAAAG 0 1 328596 CASAVA_Build 21 46737903 1D GGTTTAACAC T/- TTTTGTCTTC 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 5 4 328597 CASAVA_Build 21 46740412 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 17 0 11 6 A 11 10 328598 CASAVA_Build 21 46741476 1D CAAGTGTGGC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 51 23 22 7 T 8 7 328599 CASAVA_Build 21 46753377 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 A 9 10 328600 CASAVA_Build 21 46756982 1I TTCTTTTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 8 9 328601 CASAVA_Build 21 46757172 1D CAAAAAAAAC T/- TTTTTTTTGT 2855 het 2812 hom 17 8 8 1 T 9 8 328602 CASAVA_Build 21 46757448 1I TTACATGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 10 328603 CASAVA_Build 21 46765841 1I TCTTTCATTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 24 11 7 6 T 7 8 328604 CASAVA_Build 21 46766300 1I ACATTTCACA -/C CTTGCAGGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 1 2 328605 CASAVA_Build 21 46769538 1I CGATTTTTGC -/T TTTTATGTTC 3070 hom 111 het 39 0 37 2 T 4 5 328606 CASAVA_Build 21 46769962 3D ATCTTACATG CTC/--- ACTTTGGCAG 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 CTC 1 0 328607 CASAVA_Build 21 46770735 1I AAAACGTTCA -/T TTCCTTTTTT 3070 het 1581 hom 32 13 18 1 T 2 3 328608 CASAVA_Build 21 46779661 4I ACACTGTGAC ----/AAAT AATTTTAAAA 3070 het 2468 hom 23 6 15 2 AAAT 0 1 328609 CASAVA_Build 21 46781245 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1781 het 1781 ref 20 9 5 6 A 15 14 328610 CASAVA_Build 21 46798270 1D TTTGAGAGGC T/- GAGGCGGGCA 3070 het 2257 hom 28 8 13 7 T 1 0 328611 CASAVA_Build 21 46802750 1I GTGCCTGGGG -/C CTGCGGTTCT 3070 hom 67 het 29 0 21 8 C 1 2 328612 CASAVA_Build 21 46813825 1D GAAGGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2836 hom 39 15 13 11 A 15 14 328613 CASAVA_Build 21 46831514 6D CAAAAACAAA AACAAT/------ AAGCCAAGGT 3070 hom 63 het 24 0 21 5 AACAAT 1 0 328614 CASAVA_Build 21 46834285 1D CACATGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 A 14 13 328615 CASAVA_Build 21 46834908 1I AATCAACAAG -/A AAAAAAAAAT 2023 het 2023 ref 20 11 5 4 A 9 10 328616 CASAVA_Build 21 46844122 1D AAAATACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 A 11 10 328617 CASAVA_Build 21 46848069 11I ATTTGGAATT -----------/AGATGTTAAAA ATTTTATTTA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 AGATGTTAAAA 0 1 328618 CASAVA_Build 21 46850163 1D GTGTGCCCCC T/- TGCTGAAGCC 3070 het 3070 hom 42 16 18 9 T 2 1 328619 CASAVA_Build 21 46853604 1I GCTTTACCAC -/T TTGCTCATAG 3070 hom 129 het 51 0 44 7 T 2 3 328620 CASAVA_Build 21 46860862 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 2388 het 2039 hom 24 10 11 3 TA 12 10 328621 CASAVA_Build 21 46870051 4D CCTGCCACTC AGAA/---- GGGGGAAACT 3070 het 3070 hom 32 11 17 6 AGAA 1 0 328622 CASAVA_Build 21 46873120 1I TCTGAAGCCC -/T TGCCGCCCTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 1 2 328623 CASAVA_Build 21 46873541 1I ACAAACCGTA -/G GTCTACTTTG 3070 hom 123 het 45 0 39 6 G 1 2 328624 CASAVA_Build 21 46878027 1D TCAAAATAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 12 8 11 T 10 9 328625 CASAVA_Build 21 46884010 1I TTTTTTTTTT -/A ATCATTAGTG 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 1 2 328626 CASAVA_Build 21 46887367 14D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAATG 2481 het 900 hom 22 5 11 10 A 22 8 328627 CASAVA_Build 21 46889444 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 9 8 328628 CASAVA_Build 21 46894631 1I CTGTCTGCCC -/G GCGCTGTCTT 3070 hom 110 het 42 0 34 8 G 1 2 328629 CASAVA_Build 21 46895561 1D GGGCAGGTGT G/- GGGGATGCAG 2221 het 2221 ref 28 14 7 7 G 5 4 328630 CASAVA_Build 21 46905908 1I AGATTCCGCA -/G GAATCTGGGG 3070 hom 48 het 18 0 16 2 G 1 2 328631 CASAVA_Build 21 46936628 2I TGGTCAAACA --/CG ATTTCAGCCA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 CG 0 1 328632 CASAVA_Build 21 46938613 2D TTTAGGCTTT TA/-- TACAAACTCC 2568 het 2568 ref 73 61 6 8 TA 2 1 328633 CASAVA_Build 21 46940622 1D TTTGTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 67 19 31 17 T 11 10 328634 CASAVA_Build M 303 1D TTCCACCAAA C/- CCCCCCCTCC 3070 hom 2127 het 1560 10 1096 464 C 8 7 328635 CASAVA_Build M 16184 1D CCACATCAAA C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 3070 het 3503 0 3166 357 C 12 11 328636 CASAVA_Build 20 15501 10I CTGATTTCCT ----------/TGGTATCTAG TGGTATTAAA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 TGGTATCTAG 0 1 328637 CASAVA_Build 20 54704 1I TACGATAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 99 hom 23 2 13 8 T 15 16 328638 CASAVA_Build 20 68123 2I TAAAGAAAAA --/AG AATTTTAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 AG 0 1 328639 CASAVA_Build 20 68751 4I TTTATAAAAC ----/AATT AATTGAGACT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AATT 1 2 328640 CASAVA_Build 20 71652 1I TTCACTTTTG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 T 8 9 328641 CASAVA_Build 20 79506 3D ACTTGTGATC TCT/--- TGTCTTTGTG 3070 het 3070 hom 45 18 25 2 TCT 1 0 328642 CASAVA_Build 20 80305 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 502 hom 19 2 13 5 A 11 10 328643 CASAVA_Build 20 81740 1I GTGAGGTAAG -/T TTTTTATACT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 5 6 328644 CASAVA_Build 20 83116 2I3M2I2M21I TCTAGAGAAG --TGC--TC---------------------/TTTGCATTCACAGGAAGACTATAAATAACT TCCAATAGAA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 N/A 0 0 328645 CASAVA_Build 20 84929 1I CAACTGGTAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 8 9 328646 CASAVA_Build 20 86179 1D TTCTGGAAAG C/- CTGGCCATGG 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 C 2 1 328647 CASAVA_Build 20 88137 13I GAGTGAACAG -------------/AATGGCATAAACT AATGGGAGGA 3070 het 3070 hom 46 22 21 4 AATGGCATAAACT 0 1 328648 CASAVA_Build 20 88397 3D GGTTTTTGCT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 93 het 39 0 31 9 TTG 7 6 328649 CASAVA_Build 20 88594 1D AACATGGAAA G/- TTTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 G 1 0 328650 CASAVA_Build 20 92833 1I CCTAAAACTC -/T TTGTAATATC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 T 2 3 328651 CASAVA_Build 20 92885 3D GTAATGACAC CTT/--- CTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 CTT 2 1 328652 CASAVA_Build 20 93258 1I TGGTGGCAGG -/C GCCTGTAATC 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 C 0 1 328653 CASAVA_Build 20 95602 1D TACTGACCAC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 36 20 13 5 A 9 8 328654 CASAVA_Build 20 97120 1D CTTGTAGAAC T/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 1 0 328655 CASAVA_Build 20 101299 2I AGGATTTCTT --/TC TGTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 62 32 22 8 TC 0 1 328656 CASAVA_Build 20 108112 1I AGCTCTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 T 10 11 328657 CASAVA_Build 20 111608 2I CATTAAATGA --/AT TTCAAATGAT 3070 het 3070 ref 43 31 11 1 AT 0 1 328658 CASAVA_Build 20 137434 1D ATATTTTAGC A/- AAAAATTAGA 3070 het 3070 hom 37 12 22 3 A 6 5 328659 CASAVA_Build 20 157907 3I GGCTTTCTCT ---/CTC TTTTTTATAC 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 CTC 0 1 328660 CASAVA_Build 20 161110 2I16M1D AGAATATAAC --TAAAAAATATTTTCCTG/TTTAAAAAATATTTTCCT- GAAGTTTTTG 3070 het 3070 ref 36 21 14 7 N/A 0 0 328661 CASAVA_Build 20 164915 4D CCTTCACCAC TAAG/---- TGAGCCAATG 3070 het 3070 hom 54 20 25 11 TAAG 1 0 328662 CASAVA_Build 20 166256 1I GCTCACTGCA -/G ATAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 G 0 1 328663 CASAVA_Build 20 167487 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2890 het 1479 hom 29 7 13 9 A 11 12 328664 CASAVA_Build 20 185817 1I ATTTTCATCA -/T TTTTAATAAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 4 5 328665 CASAVA_Build 20 186436 6D TTCCTGCTCC TGGTCT/------ TGGCAGCCCT 3070 hom 114 het 42 0 36 9 TGGTCT 1 0 328666 CASAVA_Build 20 187423 1D GAAGACCAGG C/- TCCCCACCCC 2703 het 2703 ref 27 11 12 4 C 1 0 328667 CASAVA_Build 20 194032 3D TTTCCCTGCA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 11 6 AAG 4 3 328668 CASAVA_Build 20 200758 1I AAAAAAAAAA -/C AATTTCTAAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 C 0 1 328669 CASAVA_Build 20 202649 5D GAAAGAAAGA AAAAG/----- AAAAGAGAGA 3070 het 3070 hom 24 8 15 2 AAAAG 2 1 328670 CASAVA_Build 20 219136 1I AGACCGAGGG -/C CGACCTCGAG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 C 1 2 328671 CASAVA_Build 20 219811 4D CCTCCTCTTT TCTC/---- TCTCCTTTGT 3070 hom 84 het 30 0 28 3 TC 4 2 328672 CASAVA_Build 20 225488 2D CTGGGAACTT AA/-- GCAGCACTCA 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 2 0 328673 CASAVA_Build 20 245369 2D AACAAAGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 15 13 328674 CASAVA_Build 20 246417 1D TAACACGGTG A/- AAACCCAGCT 1746 hom 12 het 5 0 5 0 A 4 3 328675 CASAVA_Build 20 247586 1D CAGGGAGAGA C/- CTTGTCGAAA 1226 het 272 hom 9 2 5 2 C 2 1 328676 CASAVA_Build 20 282318 1D CTGGATCCTT C/- CCCCCTTCTC 3070 hom 92 het 35 0 31 4 C 6 5 328677 CASAVA_Build 20 289069 4D TTTTTTTCTA AGAC/---- AGAGTTTCGC 3070 het 2779 hom 27 8 13 6 AGAC 1 0 328678 CASAVA_Build 20 290644 1D CCAACATGGT A/- AAACCTTGTC 3070 hom 63 het 24 0 22 10 A 4 3 328679 CASAVA_Build 20 291324 2I ATAAACAGGA --/TG TGTCCACCAG 3070 hom 113 het 47 0 34 13 TG 1 2 328680 CASAVA_Build 20 295809 4D GAGCCAAGAT CGCA/---- CCATTGCACT 1426 het 1426 ref 18 14 4 2 CGCA 1 0 328681 CASAVA_Build 20 296366 1I CGGCCCATGG -/T GATCGAATAG 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 T 0 1 328682 CASAVA_Build 20 297322 2D CAGGCCTCCA CT/-- CTCTGCTGGT 3070 het 3070 ref 47 31 15 1 CT 3 2 328683 CASAVA_Build 20 298748 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1269 het 1269 ref 35 25 3 7 T 11 10 328684 CASAVA_Build 20 305798 6D AATATTTTAA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 18 1 11 6 T 17 11 328685 CASAVA_Build 20 306148 1D GGGATTTGAC A/- AACCCAGCTG 3070 hom 76 het 30 0 24 6 A 3 2 328686 CASAVA_Build 20 321202 1I ATGCTAAGAA -/T TTTTTTTTTT 1822 het 1286 hom 21 6 9 6 T 13 14 328687 CASAVA_Build 20 328791 1I ACCACACCCC -/T GACCCTAATT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 0 1 328688 CASAVA_Build 20 333990 1I GATTTTTTTT -/A AAAAAACTCT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 6 7 328689 CASAVA_Build 20 335658 1I TGCTGAGAAG -/A AAAAAATGAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 6 7 328690 CASAVA_Build 20 342736 1I TGGTTCATAC -/A AAAAAAAAAA 3035 het 3035 ref 30 13 11 6 A 12 13 328691 CASAVA_Build 20 344024 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 120 het 50 0 41 9 AAAC 2 3 328692 CASAVA_Build 20 347020 1I ATGTGCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2592 het 1184 hom 22 6 8 8 T 11 12 328693 CASAVA_Build 20 349110 1I CTGACGTTGA -/G GTGGCTCCAC 1338 het 1197 hom 15 4 4 7 G 1 2 328694 CASAVA_Build 20 353058 1I AACACATACA -/C CAGACCTCCT 3070 het 3070 hom 31 8 15 8 C 1 2 328695 CASAVA_Build 20 378159 1D GAGTCGCTTG A/- AACCCAGGAG 2793 hom 21 het 8 0 7 1 A 3 2 328696 CASAVA_Build 20 389079 3D CCCATCTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 32 1 18 15 A 18 15 328697 CASAVA_Build 20 394674 4I AAAAAAAAAA ----/AAAT AAAAAAAAAA 1962 het 418 hom 20 5 10 5 AAAT 0 1 328698 CASAVA_Build 20 398756 1D TTAAAGTGTT G/- GGGTATGGGG 1131 het 1131 ref 55 45 5 6 G 4 3 328699 CASAVA_Build 20 398926 1D16M6I CCTTTTACTC AAAGGAATTCTTATGAC------/-AAGGAATTCTTATGACCTCAGG ATCATAACCT 1894 het 1894 ref 59 60 5 6 N/A 0 0 328700 CASAVA_Build 20 418607 1I TTTTAAAATT -/A AAAAAAAAAT 2627 het 2627 ref 24 10 7 7 A 9 10 328701 CASAVA_Build 20 451337 4D TCTTAATTAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 TTTA 4 3 328702 CASAVA_Build 20 456382 2D CGTGTTTCAC CA/-- CACTGCCCAG 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 CA 2 1 328703 CASAVA_Build 20 473047 1I AAATACAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 49 21 12 16 T 9 10 328704 CASAVA_Build 20 481365 1D AGGAGGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 13 12 328705 CASAVA_Build 20 486640 1I CCACCACAAC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 7 8 328706 CASAVA_Build 20 487224 4D ACGCACATAA TTTT/---- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 12 8 328707 CASAVA_Build 20 487757 1I ATGTGAGCAG -/T TCTAGGTAAA 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 T 1 2 328708 CASAVA_Build 20 488199 1I GAGTCGCTGT -/G TATTAAAACC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 G 0 1 328709 CASAVA_Build 20 493850 1I TCTGGACTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 T 9 10 328710 CASAVA_Build 20 514371 16I TATATGTACA ----------------/TATATGTATATGTACG TATATGTGTG 3070 het 3070 ref 52 22 15 20 TATATGTATATGTACG 0 1 328711 CASAVA_Build 20 548990 1D CTGGGGCAAA G/- TGGGGGCCAG 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 G 1 0 328712 CASAVA_Build 20 555466 1I ACTGTCCTCA -/C CTTCATTGCC 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 C 1 2 328713 CASAVA_Build 20 563588 1D CCTGTCCTCA G/- CCAGGGCCGG 3070 het 3070 hom 42 18 15 9 G 1 0 328714 CASAVA_Build 20 568929 1I TGTGCAGGCT -/C CCAGCTCAGG 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 C 2 3 328715 CASAVA_Build 20 571538 3D GGAGCTACAG TGA/--- TGATGATGAT 2710 het 2710 ref 29 13 10 6 TGA 5 4 328716 CASAVA_Build 20 572909 1D ATCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 7 A 11 10 328717 CASAVA_Build 20 574023 1I GGACACTGTA -/G GGTCATGGTA 2061 het 2061 ref 29 12 10 7 G 2 3 328718 CASAVA_Build 20 574778 3I CTGACGCAGT ---/CTA TATTAGCAGC 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 CTA 0 1 328719 CASAVA_Build 20 596810 3I GCTGTTATTA ---/TTG TTGTTACTGG 3070 hom 148 het 52 0 50 2 TTG 1 2 328720 CASAVA_Build 20 606537 1I CCCATGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 315 hom 25 2 15 8 T 14 15 328721 CASAVA_Build 20 609136 1I CCATCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 11 328722 CASAVA_Build 20 637067 7D GCCCAGCTAA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 32 1 19 13 T 21 14 328723 CASAVA_Build 20 641047 1D TATTTAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 T 11 10 328724 CASAVA_Build 20 645803 2D TGCCCAGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 13 11 328725 CASAVA_Build 20 652074 3D TTCATTCTTC TCT/--- TTTCTTTCGT 2249 het 2249 ref 27 15 8 4 TCT 1 0 328726 CASAVA_Build 20 659400 1I TTATTTCAAA -/G GAAAAAGTTC 3070 hom 65 het 31 0 23 8 G 1 2 328727 CASAVA_Build 20 662137 1D TGTGGTTGTT A/- ACTGTAGTCC 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 A 2 1 328728 CASAVA_Build 20 663848 1I GCTCCGTCTC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 7 8 328729 CASAVA_Build 20 670256 5I ACAAACAAAC -----/AAACA AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 AAACA 2 3 328730 CASAVA_Build 20 674276 3D CATATATAAC AGA/--- AGGAGAGCAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 3 AGA 1 0 328731 CASAVA_Build 20 675518 1D AAAATCTGCC A/- AAAAAAAAAA 2383 het 2383 ref 26 13 7 6 A 11 10 328732 CASAVA_Build 20 683914 1I ATGAGAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 98 het 39 0 31 8 T 11 12 328733 CASAVA_Build 20 686886 1I TCGAGAACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 13 14 328734 CASAVA_Build 20 692663 9I AAGGACAAGA ---------/CAGGTCAAT CAGATCCCTG 3070 hom 108 het 43 0 33 10 CAGGTCAAT 0 1 328735 CASAVA_Build 20 694424 9D GCCATGGCGG TATCTGCCC/--------- TGGGCCAGAG 2833 het 2833 ref 35 21 10 12 TATCTGCCC 1 0 328736 CASAVA_Build 20 694856 1I TGGGATTACA -/G GTGTGAGCCA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 G 1 2 328737 CASAVA_Build 20 698228 1I TCAGCAAACG -/T TATCAGTTGC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 T 1 2 328738 CASAVA_Build 20 700065 2D AGCAAGACTC TT/-- GTCTCAAAAA 2757 het 2757 ref 35 23 9 5 T 2 0 328739 CASAVA_Build 20 701232 4D GTATTTTCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 278 het 278 ref 35 18 2 15 T 14 10 328740 CASAVA_Build 20 703107 1I CTGAGAGGTC -/A AAACCACAAA 3070 hom 98 het 38 0 31 7 A 3 4 328741 CASAVA_Build 20 705565 1I GTGGAGCCAT -/G GGGTGTCAAA 2164 het 2164 ref 21 10 6 5 G 3 4 328742 CASAVA_Build 20 707373 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 763 het 325 hom 16 3 6 8 T 15 16 328743 CASAVA_Build 20 709301 5I AATAAAATAA -----/AATAC AATAAAGAAA 2849 het 2849 ref 22 10 8 4 AATAC 0 1 328744 CASAVA_Build 20 710894 1D CTTGGGGGGG A/- AAAAATGGGA 3070 het 8 hom 18 1 10 7 A 6 5 328745 CASAVA_Build 20 713975 1I GCCATCTGGC -/T TAGTGGGCCC 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 T 1 2 328746 CASAVA_Build 20 721384 4D GAAATTGAGC CTCA/---- CCCCAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 14 16 2 CTCA 1 0 328747 CASAVA_Build 20 722204 2D AGTTGGGGGC GG/-- GGGGGGGGGC 2904 hom 15 het 18 0 10 9 G 11 9 328748 CASAVA_Build 20 724510 1D TGCCCAGGAG A/- AGCCTAACCG 3070 hom 76 het 31 0 27 4 A 2 1 328749 CASAVA_Build 20 734253 2D TAATTAAAAA AG/-- ATATTGCAGG 3070 het 3070 hom 20 8 12 1 AG 1 0 328750 CASAVA_Build 20 734765 1I CTATATATAT -/A AATATATTTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 2 3 328751 CASAVA_Build 20 737768 1I AAAGCCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 10 11 328752 CASAVA_Build 20 749158 3I TTCTCTTTCT ---/TTC TTTTTTCTTT 3070 hom 27 het 17 0 10 9 TTC 0 1 328753 CASAVA_Build 20 773083 9D TGCTCAGGTT GCCCAGGTC/--------- GCCCAGGTCT 3070 hom 66 het 27 0 21 6 GCCCAGGTC 2 1 328754 CASAVA_Build 20 775969 3D ATTGGGTTCT AGA/--- AGAAGATGGT 3070 het 3070 hom 31 9 14 8 AGA 3 2 328755 CASAVA_Build 20 781240 2D GAGAAATAGA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 76 het 36 0 25 11 CT 9 8 328756 CASAVA_Build 20 792442 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 11 10 328757 CASAVA_Build 20 803679 1D CTTTTTCTTT C/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 C 1 0 328758 CASAVA_Build 20 848699 1I GGAAGGCAGT -/C CCCCTTTCCT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 C 4 5 328759 CASAVA_Build 20 856894 1I TTTGGACAAG -/A AAAAAAAAAA 1176 het 1176 ref 31 23 4 4 A 11 12 328760 CASAVA_Build 20 878021 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 A 10 9 328761 CASAVA_Build 20 882154 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTAATA 3070 het 2157 hom 17 7 9 1 T 6 7 328762 CASAVA_Build 20 937432 5D GACTCCTCTC AAAAA/----- AAAAAAATAA 288 het 288 ref 23 11 2 11 A 12 7 328763 CASAVA_Build 20 953660 4D ACAAACAAAC TCAG/---- TCTGTCTGGT 3070 het 3070 hom 41 14 22 6 TCAG 1 0 328764 CASAVA_Build 20 959824 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2286 hom 29 9 14 6 A 12 11 328765 CASAVA_Build 20 965289 1D CATGGGGACC A/- GGGGGGCATG 3070 hom 62 het 23 0 20 4 A 1 0 328766 CASAVA_Build 20 968992 4D ACTAAAACTG TAAA/---- TAAAGAGAAG 3070 het 3070 ref 54 29 24 1 TAAA 2 1 328767 CASAVA_Build 20 977574 1D CAGGCCCCCT G/- GAAAAGCCAG 3070 hom 113 het 41 0 34 8 G 2 1 328768 CASAVA_Build 20 978615 1D CTCACTGCAA C/- CTCTGCCTCC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 2 1 328769 CASAVA_Build 20 979338 1I CGGCACAAAA -/G GTCAGGGCAC 3070 hom 129 het 51 0 39 12 G 1 2 328770 CASAVA_Build 20 990262 4D CAAACCCAAC CCTG/---- CCTGGCCTTG 3070 hom 107 het 45 0 33 14 CCTG 2 1 328771 CASAVA_Build 20 994055 1D ATGTATCAAG A/- AGATACAGCA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 A 2 1 328772 CASAVA_Build 20 998586 1D TCTAATTCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 10 9 328773 CASAVA_Build 20 999557 2D CATATATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 28 0 21 7 TG 7 6 328774 CASAVA_Build 20 1003353 1D ATTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 12 11 328775 CASAVA_Build 20 1026997 1I TAAGATTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1869 hom 37 5 23 9 T 13 14 328776 CASAVA_Build 20 1032745 1D CCATAAATGT G/- GGGCTACTGG 3070 hom 126 het 47 0 42 6 G 4 3 328777 CASAVA_Build 20 1053207 2I ATTTATCCAC --/AT GTGTACCAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AT 0 1 328778 CASAVA_Build 20 1062639 4I GTGTCCTCTC ----/TCTT TTTGTATTTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TCTT 0 1 328779 CASAVA_Build 20 1062728 3D CTTGTTTTTC TTT/--- TTTATTGACT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 T 6 3 328780 CASAVA_Build 20 1066279 2D GAAAAGGGAG AA/-- AAGGAGGCTC 3070 hom 102 het 37 0 33 5 A 4 2 328781 CASAVA_Build 20 1066960 5D CCAGGAATGA TTGAT/----- TTAACATCTG 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 TTGAT 1 0 328782 CASAVA_Build 20 1081621 1D AAGGACCAAG C/- CCTGTTTATA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 C 3 2 328783 CASAVA_Build 20 1086861 1I AAACTAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 A 9 10 328784 CASAVA_Build 20 1121752 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2541 hom 29 7 21 2 A 10 9 328785 CASAVA_Build 20 1142679 1I ACAAGATTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 8 9 328786 CASAVA_Build 20 1143706 3D GAGATGGCCA AAG/--- AAGACATGAG 3070 het 3070 hom 54 19 29 8 AAG 2 1 328787 CASAVA_Build 20 1183306 1I TTCTGTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 18 9 T 9 10 328788 CASAVA_Build 20 1192958 2I AATGTTCTCC --/TA TTCTAAACAT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 TA 0 1 328789 CASAVA_Build 20 1206200 2I TGTGTGTATC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 137 hom 82 2 45 35 TG 5 6 328790 CASAVA_Build 20 1211361 4D TCTCTGGGCC TTGG/---- TTTATAACAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 TTGG 1 0 328791 CASAVA_Build 20 1218443 1D ACTGCACTCC A/- AGCCTAGGTG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 2 1 328792 CASAVA_Build 20 1220296 5D CAAGTTCTGC TCTGT/----- TGATTGCAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 7 TCTGT 1 0 328793 CASAVA_Build 20 1220816 4I AGTCTAAGGC ----/ATAG ATAGCATCCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ATAG 1 2 328794 CASAVA_Build 20 1240719 1D57M1I AATTTTTTAG TTTTTTTTGTGGAAAGAGGGTTTCACATTGCCCAGGCTGGTCTCGTGCTCCTGGACTT-/-TTTTTTTGTGGAAAGAGGGTTTCACATTGCCCAGGCTGGTCTCGTGCTCCTGGACTTA AGTGATCCTC 3070 hom 72 het 26 0 25 19 N/A 0 0 328795 CASAVA_Build 20 1251649 1I GCAACACTCA -/G CCCGGCTGAG 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 G 0 1 328796 CASAVA_Build 20 1258673 1I GAGGTGGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 T 11 12 328797 CASAVA_Build 20 1266555 15D CCTAAGCATT CCCACAGAGAAGTCC/--------------- CCCAGGTAGC 3070 het 3070 ref 42 20 12 12 CCCACAGAGAAGTCC 1 0 328798 CASAVA_Build 20 1268255 1I AATAACAGTG -/T TTGTTTTTTT 2043 het 2043 ref 34 21 7 6 T 2 3 328799 CASAVA_Build 20 1281431 1I TGAAGGTGAC -/T TTCTCAGGTG 3070 hom 66 het 23 0 22 1 T 2 3 328800 CASAVA_Build 20 1290650 1D GTGTATGAGA T/- TTTTTGTTAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 6 5 328801 CASAVA_Build 20 1297440 3I CCACATTCCC ---/CCT CCTCCTCTGA 3070 het 3070 ref 49 26 15 8 CCT 2 3 328802 CASAVA_Build 20 1298367 1D TTCTTGCAAA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 10 9 328803 CASAVA_Build 20 1306695 23I TATACGGGTC -----------------------/AGTTTGGGCACTAACACCTACTT AGTTTGGGCA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 AGTTTGGGCACTAACACCTACTT 0 1 328804 CASAVA_Build 20 1311993 1D TTTTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 11 12 A 13 12 328805 CASAVA_Build 20 1317392 3D AGCGTGGGTT GGG/--- GGGGCGGGGG 3070 het 905 hom 21 3 12 6 G 7 4 328806 CASAVA_Build 20 1317479 1D AAAAACCAAC G/- AGGCTCCACC 2335 het 2335 ref 33 23 5 8 G 1 0 328807 CASAVA_Build 20 1320405 1D AGGGAGTGGG A/- AAAAAAGAGG 3070 hom 65 het 25 0 20 5 A 7 6 328808 CASAVA_Build 20 1327454 2I GCCAGGACTC --/TG TCCTCGCTGT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 TG 0 1 328809 CASAVA_Build 20 1329136 1D TTGAGGACAA G/- GCATTATAGA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 G 2 1 328810 CASAVA_Build 20 1334383 3D CTAATTAAAA GAG/--- AACCCTGATT 3070 hom 99 het 38 0 34 8 GAG 1 0 328811 CASAVA_Build 20 1340634 1D AGCCAACACA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 129 het 46 0 43 3 T 9 8 328812 CASAVA_Build 20 1342814 1D TATACAAAAC A/- AAAAAATCCA 3070 hom 114 het 44 0 39 7 A 7 6 328813 CASAVA_Build 20 1349888 1I GACTTTTTTT -/C CTCCCTGAGA 3070 hom 132 het 47 0 44 3 C 1 2 328814 CASAVA_Build 20 1351889 1I AGAGAGGGCG -/T TAAGATTGGA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 T 1 2 328815 CASAVA_Build 20 1359175 1I TCCAACAGTG -/T ACAAGGGTTT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 0 1 328816 CASAVA_Build 20 1359545 1D TTTATAAAAT G/- TTTTTGTTGC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 G 1 0 328817 CASAVA_Build 20 1360113 1D TATTTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 T 17 16 328818 CASAVA_Build 20 1368201 1D AGATGGAACC T/- TAAGTTCAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 T 2 1 328819 CASAVA_Build 20 1369628 1D GAGCCCAACG C/- CCATTTAAAG 3070 het 3070 ref 37 14 16 7 C 3 2 328820 CASAVA_Build 20 1376455 1D TACACCGACT C/- TGTGCAGGTA 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 C 1 0 328821 CASAVA_Build 20 1396429 1D CGGTAAACAA C/- CTTCCCGCGG 3070 het 3070 ref 33 21 8 5 C 2 1 328822 CASAVA_Build 20 1402026 10D CGCACACATG CACACACGCA/---------- CACACACGCA 3070 het 3070 ref 52 28 14 17 CACACACGCA 2 1 328823 CASAVA_Build 20 1413338 1D AGGCAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 11 15 A 12 11 328824 CASAVA_Build 20 1417293 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1411 hom 28 7 12 9 A 12 11 328825 CASAVA_Build 20 1418728 1D AACAATCATT G/- GGGAATATTT 3070 hom 135 het 47 0 46 1 G 4 3 328826 CASAVA_Build 20 1421490 5D TACTTACAAA TAATT/----- TTATTTTAAT 3070 het 3070 hom 38 13 20 9 TAATT 1 0 328827 CASAVA_Build 20 1422204 2D ACTATGAACA CC/-- CTGGGAAGAC 3070 het 3070 hom 44 20 21 5 C 3 1 328828 CASAVA_Build 20 1426404 2I CCTTCCTGTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1874 hom 23 5 14 4 T 10 12 328829 CASAVA_Build 20 1445995 22D TTTGAATTTG AAAGATTCAAATATGAAATTCA/---------------------- AATATGAAAG 3070 hom 96 het 28 0 33 1 AAAGATTCAAATATGAAATTCA 1 0 328830 CASAVA_Build 20 1446427 1I ACAACGGAAG -/A AAAAGCCTAA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 A 4 5 328831 CASAVA_Build 20 1448651 1I AGGAGCAGCA -/G GTTCTGAGAG 3070 hom 113 het 44 0 35 9 G 1 2 328832 CASAVA_Build 20 1455508 4D TTTTCCTGAT TAAC/---- TGTGTGGATA 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 TAAC 1 0 328833 CASAVA_Build 20 1458247 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 9 328834 CASAVA_Build 20 1458967 2I TTTATCTCTC --/TA TGTGTCATTT 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 TA 0 1 328835 CASAVA_Build 20 1460539 1D CATTCTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 24 10 T 11 10 328836 CASAVA_Build 20 1461597 1I GGTCTCTACT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 8 9 328837 CASAVA_Build 20 1461761 1D GAGACCTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 28 7 A 12 11 328838 CASAVA_Build 20 1465049 1D CGGCCTGTCG T/- TTTTTTTTTT 1550 het 239 hom 19 4 5 10 T 17 16 328839 CASAVA_Build 20 1472118 3I GGGATCAGGG ---/TGA TATTCCCTTC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TGA 0 1 328840 CASAVA_Build 20 1476987 1D ACCAAATTCC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 9 8 328841 CASAVA_Build 20 1477403 1I CACATTTTTT -/C CATAGTATTC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 C 1 2 328842 CASAVA_Build 20 1490032 27D GATACATTAT GATTAATCAAAGTTCATAGTTTATTTA/--------------------------- GATCTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 30 9 4 GATTAATCAAAGTTCATAGTTTATTTA 1 0 328843 CASAVA_Build 20 1573252 1D GGAGCTCAGC A/- GCCTTAAGGA 3070 het 3070 hom 41 18 13 10 A 1 0 328844 CASAVA_Build 20 1575289 5D CTTTTTTTCA TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 hom 53 het 35 0 18 20 TTTGT 4 3 328845 CASAVA_Build 20 1575767 1D CCTGCTCACC A/- CTCAGATCTC 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 A 1 0 328846 CASAVA_Build 20 1593572 1I ACTCTACAGT -/G GGGATTCCTT 3070 het 2934 hom 26 9 12 5 G 3 4 328847 CASAVA_Build 20 1604520 1D AGCTGCACTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 8 7 328848 CASAVA_Build 20 1606891 2D ATGTGATACA CT/-- GTGGGCCCAC 3070 het 3070 hom 37 15 17 9 CT 1 0 328849 CASAVA_Build 20 1607127 1I AGCAGGTGGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 7 8 328850 CASAVA_Build 20 1608494 1D ATTTGGGAGA T/- GCTATTACCC 3070 het 3070 ref 65 30 23 12 T 1 0 328851 CASAVA_Build 20 1609356 1D AAAAACACAT G/- ATTATCCATT 3070 het 3070 hom 42 16 23 4 G 1 0 328852 CASAVA_Build 20 1609479 1I TACTTTCTTG -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 7 8 328853 CASAVA_Build 20 1609817 1I ATTTGCAATC -/A ATACAGAAAG 3070 het 3070 hom 30 7 19 4 A 1 2 328854 CASAVA_Build 20 1610593 9D ATGGATATGG ATATAACTA/--------- ATATAACTAT 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 ATATAACTA 2 1 328855 CASAVA_Build 20 1613051 2I TACACACATA --/TG TATATATGTA 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 TG 0 1 328856 CASAVA_Build 20 1613505 10D TGTGAGGATT AGTAGAGTTA/---------- AGTAGAGTTA 3070 het 3070 ref 53 33 20 5 AGTAGAGTTA 2 1 328857 CASAVA_Build 20 1615771 1D GGGTTATGAT G/- GGGGGAGAAT 3070 hom 123 het 50 0 40 10 G 6 5 328858 CASAVA_Build 20 1617371 3D ATAAAATATG AGA/--- AGGTGTTCAA 3065 het 2797 hom 18 7 7 5 AGA 1 0 328859 CASAVA_Build 20 1618967 2D TGGGGGATGT GC/-- AGGTACCACC 2795 het 2795 ref 36 24 8 4 GC 1 0 328860 CASAVA_Build 20 1621402 1D GTTGGGGGGT G/- GGGGGGCAAG 1302 het 262 hom 9 2 6 1 G 7 6 328861 CASAVA_Build 20 1622715 1I AGGAGAATCA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 6 7 328862 CASAVA_Build 20 1630622 1I ATATATCATA -/T TTACACAGTG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 2 3 328863 CASAVA_Build 20 1631113 1I AAACCCTCTT -/C CCTATACCAC 3070 hom 90 het 40 0 29 11 C 2 3 328864 CASAVA_Build 20 1631154 1D CAGCAGCTGC A/- AGAAGTCTCA 3070 het 3070 ref 39 11 8 22 A 2 1 328865 CASAVA_Build 20 1631814 1I AGAGAATGTC -/T TTTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 54 22 23 9 T 5 6 328866 CASAVA_Build 20 1631960 1I CAACAATGAC -/A AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 7 8 328867 CASAVA_Build 20 1632577 11I TACTGTTTAA -----------/ATGTATAATAC ATATTTCCTG 3070 het 3070 ref 30 19 7 4 ATGTATAATAC 0 1 328868 CASAVA_Build 20 1634448 1D ATTATAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 T 11 10 328869 CASAVA_Build 20 1647511 4I ATGTCTCATT ----/CCCA CCCACATCCT 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 CCCA 1 2 328870 CASAVA_Build 20 1655383 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 10 11 328871 CASAVA_Build 20 1664623 3D CCATCCGGCC GCA/--- GAGGCCCGTC 1218 het 1218 ref 17 11 4 3 GCA 1 0 328872 CASAVA_Build 20 1667871 1D TCAAACCTCT G/- TGGGAGAGAG 3070 het 3070 hom 37 18 17 2 G 1 0 328873 CASAVA_Build 20 1670317 4D TTCTCTCTTC CTTT/---- CTTTCTTTCC 3070 hom 48 het 21 0 18 3 CTTT 3 2 328874 CASAVA_Build 20 1675043 1I ATTAAATTAT -/A ATAGAGGAAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 1 2 328875 CASAVA_Build 20 1676299 1I AGAACAGAGG -/T TTTTAAGCAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 4 5 328876 CASAVA_Build 20 1679626 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 9 8 328877 CASAVA_Build 20 1685729 1I GTTTGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 12 13 328878 CASAVA_Build 20 1686325 1I CACTCCTTTT -/C CCTTCATGAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 2 3 328879 CASAVA_Build 20 1686520 1I TGTCAAACTA -/G GCCTCTGGCT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 G 1 2 328880 CASAVA_Build 20 1689052 2I AAATATATAT --/AA GACTATTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 2 328881 CASAVA_Build 20 1693353 19I AAGACCATTA -------------------/CAATAATCACATCAAAGAT CACTAATCAC 3070 hom 107 het 41 0 35 7 CAATAATCACATCAAAGAT 0 1 328882 CASAVA_Build 20 1693364 5D2M2I ACTAATCACA GATCCTC--/-----TCAA AGATCAGATA 2175 het 2175 ref 35 7 10 21 N/A 0 0 328883 CASAVA_Build 20 1716363 2I AGAGTGATGG --/AA AAGAGACTGG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 2 4 328884 CASAVA_Build 20 1739561 1D ATTAGAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 11 10 328885 CASAVA_Build 20 1781293 1D TATTATGTAT A/- ATCTCAATTA 3070 het 3070 hom 25 12 13 0 A 2 1 328886 CASAVA_Build 20 1800150 2D ACCCCCTCTC CA/-- CACACACACA 2111 het 1586 hom 23 6 8 9 CA 8 7 328887 CASAVA_Build 20 1803570 6D TCACTCTACA ACACAC/------ ACACACACAC 3070 het 3070 hom 56 21 22 21 AC 10 7 328888 CASAVA_Build 20 1805977 1I CTTTGTTTTG -/T TCAGTTGTTT 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 T 1 2 328889 CASAVA_Build 20 1846853 1D TTGTTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 9 8 328890 CASAVA_Build 20 1851656 13D CCCCTGCCTC ATCTCCCTGGCTG/------------- CCATTGGGAG 3011 het 3011 ref 32 14 16 6 ATCTCCCTGGCTG 1 0 328891 CASAVA_Build 20 1858209 1I GCATCAGGTG -/C CCCCGCTCCT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 C 4 5 328892 CASAVA_Build 20 1872741 1I TTTGGAGATA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 49 20 26 3 T 8 9 328893 CASAVA_Build 20 1876147 1D CTGCCTCAAG C/- CAAGCAACCA 3070 het 2492 hom 27 8 10 9 C 2 1 328894 CASAVA_Build 20 1878085 1D AGGGGTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 13 12 328895 CASAVA_Build 20 1887869 1I TGTGTCCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 11 12 328896 CASAVA_Build 20 1888981 1I ACTACTCAGG -/A GGCTGAGATG 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 0 1 328897 CASAVA_Build 20 1942353 1D ACTTATCAAT A/- ATTACAGTAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 2 1 328898 CASAVA_Build 20 1956443 1I TTGACTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 10 11 328899 CASAVA_Build 20 1972832 1D CTTGGGCATT G/- GTTTGGTCAT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 G 2 1 328900 CASAVA_Build 20 1982932 3I GATAGGTAAG ---/TTC TTCTTCCCCA 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 TTC 2 3 328901 CASAVA_Build 20 1986239 1D ACCAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2430 het 189 hom 18 2 8 8 A 17 16 328902 CASAVA_Build 20 1994619 1I ACTTCTTCTC -/A AAAAAAAAAA 2745 het 2745 ref 35 10 11 14 A 13 14 328903 CASAVA_Build 20 1997396 1I ACTGAAAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 33 3 17 13 A 11 12 328904 CASAVA_Build 20 2000247 1D GTCCCAGCTA C/- TCAGGAGGCT 3070 het 2973 hom 27 8 11 8 C 1 0 328905 CASAVA_Build 20 2001864 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 1325 hom 20 4 13 3 A 8 9 328906 CASAVA_Build 20 2002516 1I AAGATATATA -/T AAAAAAAAAA 3070 het 2945 hom 35 11 14 10 T 0 1 328907 CASAVA_Build 20 2006362 1I TGGACTGCAA -/T TGGCGCAATC 1733 het 877 hom 6 2 4 0 T 1 2 328908 CASAVA_Build 20 2007212 1I TCTCAACGAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 A 8 9 328909 CASAVA_Build 20 2017864 1D GAAACGCAAG C/- AAATACATCA 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 C 1 0 328910 CASAVA_Build 20 2018646 1I ACCCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 A 11 12 328911 CASAVA_Build 20 2023391 1D GAGCCCTCTG A/- AAATCCAGAG 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 4 3 328912 CASAVA_Build 20 2025128 2D CTCTACTAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 29 8 10 11 AC 8 7 328913 CASAVA_Build 20 2033803 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 817 hom 30 5 16 10 A 16 15 328914 CASAVA_Build 20 2034354 2I TTCACTGCCT --/TA TATATAAGTT 3070 het 3070 hom 53 22 27 4 TA 3 4 328915 CASAVA_Build 20 2047069 1D TACTAAAAAT A/- ACAAAAAAAT 3070 hom 69 het 24 0 22 2 A 2 1 328916 CASAVA_Build 20 2068510 5D TGAAATGAGA AAGGT/----- AAGGATTCAT 3070 het 3070 ref 48 25 21 4 AAGGT 1 0 328917 CASAVA_Build 20 2070414 1D TAACCTACCC T/- TTTCCACCTA 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 T 4 3 328918 CASAVA_Build 20 2070956 13I CAGACAGTAA -------------/ATCATCCAATATT ATTATCCAAT 3070 hom 121 het 43 0 34 9 ATCATCCAATATT 0 1 328919 CASAVA_Build 20 2074053 8I ATTTCCGTTT --------/CTATGTGA CTATGTGACC 3070 hom 68 het 31 0 23 8 CTATGTGA 1 2 328920 CASAVA_Build 20 2074114 1D GCCCTGAGAA T/- TTGGGAGAGA 3070 het 3070 hom 40 11 18 11 T 3 2 328921 CASAVA_Build 20 2076698 9D CGAGATGAGT CCACTGCCG/--------- TTGCCTGCCC 3070 het 3070 ref 33 14 15 6 CCACTGCCG 1 0 328922 CASAVA_Build 20 2078226 18D CGCGCAGCTT TGGTGAGGCTGCCCAGTC/------------------ TGGTGAGGGT 3070 het 3070 ref 32 18 14 4 TGGTGAGGCTGCCCAGTC 1 0 328923 CASAVA_Build 20 2078659 1D TCCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 705 hom 32 5 18 9 A 15 14 328924 CASAVA_Build 20 2079708 2I CCTGTTGCCT --/GG GACCTGAGCC 3070 hom 84 het 32 0 26 6 G 1 3 328925 CASAVA_Build 20 2086801 1D CTTCTAGGAG A/- AAACATACAA 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 A 4 3 328926 CASAVA_Build 20 2087214 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACCTAA 3070 het 786 hom 26 6 14 6 C 0 1 328927 CASAVA_Build 20 2091220 10I GTGTGTGTGT ----------/GTGTGTGCGC GTGTGTGCGC 3070 het 1619 hom 47 11 22 14 GTGTGTGCGC 1 2 328928 CASAVA_Build 20 2092352 1I TGGTCCCTGG -/C TTTTCCTCCA 3070 het 2382 hom 25 10 9 6 C 0 1 328929 CASAVA_Build 20 2098613 1D CCTCCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1635 hom 29 7 14 8 T 13 12 328930 CASAVA_Build 20 2098736 2D TTACATTAGG TA/-- TATATCTCCT 3070 hom 30 het 11 0 11 2 TA 3 2 328931 CASAVA_Build 20 2100654 4D AGAAGAGAAA GAAG/---- GAAGGAAGGA 1602 het 1602 ref 20 8 5 7 GAAG 4 3 328932 CASAVA_Build 20 2100668 2D GAAGGAAGGA AG/-- GAGAGAGAGA 206 het 206 ref 18 14 3 3 AG 1 0 328933 CASAVA_Build 20 2104182 1I TATTATTATT -/A ATTTTGAAAG 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 1 2 328934 CASAVA_Build 20 2105678 2D AAAGTTCTGG AC/-- AGAAAGCTCA 3070 het 3070 hom 32 14 16 4 AC 1 0 328935 CASAVA_Build 20 2109944 1D TTTTGTTTGC A/- AAAGCTAGCT 3070 het 3070 hom 51 25 22 5 A 4 3 328936 CASAVA_Build 20 2119347 1D55M1I ATTTTTTTTT AAAATCCTTATTGTACATTTCTGTTGCTCATGGCCAATAGCGTCCTGATTGATCCT-/-AAATCCTTATTGTACATTTCTGTTGCTCATGGCCAATAGCGTCCTGATTGATCCTA AACTTAATGA 3070 het 3070 ref 30 33 10 13 N/A 0 0 328937 CASAVA_Build 20 2124120 2I CGCCCCAGCC --/AA AAAATGCGGA 1943 het 1581 hom 22 10 8 4 A 4 6 328938 CASAVA_Build 20 2147056 15I GGGGGAAGTG ---------------/CCACACACTTCTAAA CCATCAGATG 3070 hom 93 het 32 0 31 1 CCACACACTTCTAAA 0 1 328939 CASAVA_Build 20 2157337 3I CTGGAGTGCA ---/GTG GTGGTACAAT 3070 hom 24 het 11 0 8 3 GTG 1 2 328940 CASAVA_Build 20 2163493 1I14M1I GGATGAACGT -ATTTATTTAACCAG-/AATTTATTTAACCAGT TTTCTCTTGA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 N/A 0 0 328941 CASAVA_Build 20 2164793 2D GCGTTCATGC AG/-- TTTATGGGCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 AG 1 0 328942 CASAVA_Build 20 2183603 1D GAGATGGTGC G/- GGGGGTCTCA 3070 hom 61 het 25 0 21 4 G 6 5 328943 CASAVA_Build 20 2211099 1D GACGGATGGT G/- GAGTGAGAAG 3070 hom 147 het 54 0 46 10 G 2 1 328944 CASAVA_Build 20 2226676 11I CTCTGAAAAA -----------/TGAATGGCACT TGGTCACAGA 3070 hom 129 het 44 0 44 1 TGAATGGCACT 0 1 328945 CASAVA_Build 20 2228082 1I AACTTCATGC -/T GGCTCCACCC 3070 hom 112 het 39 0 35 4 T 0 1 328946 CASAVA_Build 20 2228752 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 A 10 9 328947 CASAVA_Build 20 2233899 7D CAAGTCTCTA GTCACTG/------- GTTGGTTCCC 3070 hom 99 het 37 0 31 9 GTCACTG 1 0 328948 CASAVA_Build 20 2235003 3D AAAAATCTCT AAG/--- AAGGCTCAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AAG 2 1 328949 CASAVA_Build 20 2237526 1D CCTTCAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 26 1 13 12 T 15 14 328950 CASAVA_Build 20 2242658 1D CAACAACAAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 82 het 38 0 28 10 A 9 8 328951 CASAVA_Build 20 2245085 1D GTGGCACGCA T/- TAACACCAGT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 2 1 328952 CASAVA_Build 20 2277826 1I TATGGGTTGT -/C CTTTGAGACT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 C 1 2 328953 CASAVA_Build 20 2283015 1D GCATTGAAAA G/- CACAGTGACT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 G 1 0 328954 CASAVA_Build 20 2283945 2I CTGAGAAAAC --/TG TATATCCAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TG 0 1 328955 CASAVA_Build 20 2284434 1I TGGCTGCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 10 11 328956 CASAVA_Build 20 2289769 1D TAGTTGATAG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 7 6 328957 CASAVA_Build 20 2289882 1D TGAGAAGTTG C/- TTGGTTTTTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 C 1 0 328958 CASAVA_Build 20 2290118 1I GCTTATTTTT -/G TCCACTTAAT 3070 hom 69 het 35 0 23 12 G 0 1 328959 CASAVA_Build 20 2290174 1D TTCTTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 6 T 12 11 328960 CASAVA_Build 20 2291692 1D TGTCTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 24 0 19 5 A 12 11 328961 CASAVA_Build 20 2292452 4I CACCCAACAG ----/AGGA AGGAAGGTTA 3070 hom 107 het 40 0 35 6 AGGA 1 2 328962 CASAVA_Build 20 2292540 4D CTACCCCAGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 365 hom 40 4 18 22 TTTG 5 4 328963 CASAVA_Build 20 2293270 6D TCGAGACCAT CCTGGC/------ TAACACGGTG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 CCTGGC 1 0 328964 CASAVA_Build 20 2293465 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 499 hom 19 4 12 4 A 15 14 328965 CASAVA_Build 20 2300931 1D TTCAGGCCTA C/- CTCTCAAGCT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 C 2 1 328966 CASAVA_Build 20 2301520 2D CTTGTTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 14 12 328967 CASAVA_Build 20 2310644 2I AGAACTTGTC --/TG TTAGATGCTG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TG 0 1 328968 CASAVA_Build 20 2324827 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 13 2 10 1 A 15 14 328969 CASAVA_Build 20 2353999 1D TGTCTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 1122 het 1122 ref 52 39 3 10 A 13 12 328970 CASAVA_Build 20 2362787 1I AAGCTTTCAG -/A AAAAAAACCC 3070 hom 73 het 29 0 25 4 A 7 8 328971 CASAVA_Build 20 2381932 1D CCTGGAAGCT C/- CCCTTTGTGT 3070 hom 81 het 34 0 24 10 C 4 3 328972 CASAVA_Build 20 2384358 1I CAGAGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 33 0 21 12 T 11 12 328973 CASAVA_Build 20 2384836 1I CAATGATGTA -/C CATTTTTCAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 1 2 328974 CASAVA_Build 20 2393534 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAACC 3070 het 22 hom 31 2 20 9 C 0 1 328975 CASAVA_Build 20 2396574 2D CCATGCCACC CT/-- GTTTTAGCCC 3070 hom 87 het 38 0 29 11 CT 1 0 328976 CASAVA_Build 20 2398955 1D AAACTTCCGC A/- AGTCTGAGCC 3070 hom 49 het 21 0 12 9 A 2 1 328977 CASAVA_Build 20 2400701 9D TTCTTGGATT AAAAAAGAA/--------- AAAAAAGAAA 3070 hom 96 het 39 0 33 9 AAAAAAGAA 2 1 328978 CASAVA_Build 20 2402874 1D ATTTTTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 37 hom 20 2 11 8 T 15 14 328979 CASAVA_Build 20 2406351 1I AAGGTGGGAG -/A AATTGCTTGA 3070 hom 109 het 41 0 36 5 A 2 3 328980 CASAVA_Build 20 2443947 1I CCCATATTGG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 7 8 328981 CASAVA_Build 20 2468637 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1184 het 1050 hom 19 6 4 9 T 18 17 328982 CASAVA_Build 20 2471837 1D9M1D GAGCCAAGAT CTTACCACTGC/-GTGCCACTG- ACTCCAGCCT 2731 het 2365 hom 16 6 6 4 N/A 0 0 328983 CASAVA_Build 20 2488913 1D GAAGTATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 14 13 328984 CASAVA_Build 20 2516177 1I TTTGGGAATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 401 hom 35 1 30 4 T 9 10 328985 CASAVA_Build 20 2524398 1D GAGGGGTCAC A/- GCCTCCCAGA 867 het 867 ref 37 19 5 13 A 1 0 328986 CASAVA_Build 20 2542697 1I TTCTGTCACA -/T TTTTTTTTCG 3070 hom 69 het 27 0 21 6 T 8 9 328987 CASAVA_Build 20 2545211 4D AAAGGAAAAT AAAG/---- AAGGAGGGAG 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 AAAG 1 0 328988 CASAVA_Build 20 2559782 5I TTATAATTAA -----/TATCT TATAACAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TATCT 0 1 328989 CASAVA_Build 20 2561972 1D TTGGACACAT A/- AACAGCCCTG 3070 hom 138 het 47 0 47 0 A 3 2 328990 CASAVA_Build 20 2562406 7I CTACAGAACT -------/GGGTAGG GGGTAGGGGA 3070 hom 117 het 41 0 39 2 GGGTAGG 1 2 328991 CASAVA_Build 20 2564003 1I CCTCCACCTC -/T CCCCTCTCAG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 0 1 328992 CASAVA_Build 20 2565265 8D CTTCTGGTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 TTTG 5 3 328993 CASAVA_Build 20 2565416 4D ACTACAGGCG TGCA/---- TGCACCACCA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TGCA 2 1 328994 CASAVA_Build 20 2565862 2I TGGTGAACCC --/CT GTCTCTACTA 3070 hom 62 het 24 0 21 3 CT 0 1 328995 CASAVA_Build 20 2566966 2I3M3D TTGTGCCACT --GCACTC/GGGCA--- CAGCCTGGGC 592 hom 6 het 5 0 2 3 N/A 0 0 328996 CASAVA_Build 20 2570731 6D ACGCTGTCTT AACAAC/------ AACAAGTCTG 3070 hom 48 het 18 0 17 3 AAC 3 1 328997 CASAVA_Build 20 2578437 3I CATGCCAGGT ---/ACC ACACCATTGT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ACC 0 1 328998 CASAVA_Build 20 2580177 3I ACCAACCACA ---/TTT TTTAGGTTTG 3070 het 3070 ref 52 27 23 2 T 3 6 328999 CASAVA_Build 20 2582286 2D TTGTGGGCAC TG/-- TAGTGACAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 TG 1 0 329000 CASAVA_Build 20 2591834 9I GGTATTCCAG ---------/AAATGCAAT AAATGCAATG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 AAATGCAAT 1 2 329001 CASAVA_Build 20 2598236 1I TTATTGGGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 9 10 329002 CASAVA_Build 20 2599703 1D TACAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 27 0 22 5 A 12 11 329003 CASAVA_Build 20 2613957 1D CCAGGCTATA G/- TGCAGTGGCG 3070 het 3070 ref 27 12 12 4 G 1 0 329004 CASAVA_Build 20 2614973 1D CTTCTCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 13 12 329005 CASAVA_Build 20 2619351 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 129 hom 18 1 14 3 TA 11 10 329006 CASAVA_Build 20 2620638 1D AGGAACTAAT A/- AAAAAAAAGG 2935 het 2010 hom 25 7 9 9 A 9 8 329007 CASAVA_Build 20 2626199 4I TCAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 1549 het 444 hom 15 4 6 5 AAAG 3 4 329008 CASAVA_Build 20 2645176 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2902 het 484 hom 14 1 8 5 A 17 18 329009 CASAVA_Build 20 2655227 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 10 12 A 11 13 329010 CASAVA_Build 20 2661484 2I TTTTTGAGAC --/AG GGAATTATAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 AG 0 1 329011 CASAVA_Build 20 2672731 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 1438 het 1438 ref 15 6 5 4 T 13 14 329012 CASAVA_Build 20 2682608 20I CTGTGGGCAC --------------------/CCCCTTGGTTTTGAAACTTT CCCCTTGGGC 3070 hom 60 het 26 0 20 6 CCCCTTGGTTTTGAAACTTT 0 1 329013 CASAVA_Build 20 2690853 14I TCAATAGCAC --------------/CAGCAATCCTCAGT CTGAGGATGA 3070 hom 150 het 55 0 49 6 CAGCAATCCTCAGT 0 1 329014 CASAVA_Build 20 2699168 5D ACTCTGTCTC CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 1544 hom 21 6 10 5 CAAAA 5 4 329015 CASAVA_Build 20 2714950 1I CTTCATTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 10 11 329016 CASAVA_Build 20 2723426 1I CTTCTGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 56 21 15 20 A 12 13 329017 CASAVA_Build 20 2744486 5I ATCAGGCCCC -----/CTTTT CTTTTCTCCT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 CTTTT 1 2 329018 CASAVA_Build 20 2745765 1D TGCCTTGGCA G/- GGCCCAGACC 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 G 3 2 329019 CASAVA_Build 20 2759418 1D GAACCTAGGC A/- GGGAACTGGG 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 A 1 0 329020 CASAVA_Build 20 2782054 2D AAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2666 hom 29 9 14 7 A 12 10 329021 CASAVA_Build 20 2783935 1D AGGAATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 13 12 329022 CASAVA_Build 20 2784149 2D GGCCCCAACA AG/-- AGTGTCAGCC 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 AG 2 1 329023 CASAVA_Build 20 2785627 6D TTTCTTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 T 15 9 329024 CASAVA_Build 20 2802850 15D CCCCGGCCCG TCTCCCAGGCCCCTC/--------------- TCCTTGCCGC 2861 het 2476 hom 17 6 10 3 TCTCCCAGGCCCCTC 1 0 329025 CASAVA_Build 20 2806850 1D ACAGCTGTAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 2389 hom 16 5 10 1 T 8 7 329026 CASAVA_Build 20 2807567 1D GTTGAAGAAA G/- ATTTGGTTGA 3070 het 3070 ref 45 26 16 4 G 1 0 329027 CASAVA_Build 20 2815548 1D AATAAAAAAA T/- GTAGTATCTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 1 0 329028 CASAVA_Build 20 2828757 5D26M2I CTCCATCTCA AAAACAAAACAAAACAAAACGAAAAATCTGC--/-----AAAACAAAACAAAACGAAAAATCTGCCT CTCCTTTTTT 3070 het 2451 hom 26 7 16 8 N/A 0 0 329029 CASAVA_Build 20 2842313 5D TGCTGTGTTC TTATT/----- TTATCCATCC 3070 het 3070 hom 52 20 32 1 TTATT 1 0 329030 CASAVA_Build 20 2844143 4I AAGAGTTCTT ----/TATC TATTCTGATA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TATC 0 1 329031 CASAVA_Build 20 2898625 4I CTAAATAAAT ----/AATA AATAAATAAA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 AATA 4 5 329032 CASAVA_Build 20 2921325 7I CCATATCCAA -------/GGGTTTT ATATTACGAT 3070 het 3070 hom 36 16 19 2 GGGTTTT 0 1 329033 CASAVA_Build 20 2925782 4D GTGAGAAAAC ATAT/---- GTGGGATAAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 5 AT 2 0 329034 CASAVA_Build 20 2926824 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1957 het 1336 hom 33 8 9 17 A 19 18 329035 CASAVA_Build 20 2930246 1D TGTGGAAATC T/- TATGTGAAGG 3070 het 3070 hom 43 20 17 7 T 2 1 329036 CASAVA_Build 20 2936475 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 TG 5 4 329037 CASAVA_Build 20 2937927 1D AGTTGTGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 17 17 6 T 10 9 329038 CASAVA_Build 20 2942066 1D ATATATAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 773 hom 38 5 20 13 T 15 14 329039 CASAVA_Build 20 2953542 1D GCAGTTTTTT C/- TGTAAGAGCC 3070 het 3070 ref 37 22 15 1 C 1 0 329040 CASAVA_Build 20 2955695 3I CAGGGCCTGA ---/GGT GGTGGGAGCA 3070 het 3070 hom 51 20 22 9 GGT 1 2 329041 CASAVA_Build 20 2960420 4I CTCCTTACTC ----/TGTT TGTGTGTTTT 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 TGTT 0 1 329042 CASAVA_Build 20 2963199 1D TTAATGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2066 hom 38 10 14 15 T 15 14 329043 CASAVA_Build 20 2969042 1D TCCGTGCTGA T/- TTGGCCAGTG 3070 het 3070 ref 47 21 19 8 T 3 2 329044 CASAVA_Build 20 2980367 1D CACTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 8 10 T 12 11 329045 CASAVA_Build 20 2982758 1D TGAATTTGAC T/- TTTTTTTTTT 2755 het 2747 hom 30 13 9 8 T 15 14 329046 CASAVA_Build 20 2988519 1D TGCATCTCCC A/- GAGGCCCAGG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 1 0 329047 CASAVA_Build 20 2988629 1D CACCCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 24 1 19 4 A 12 11 329048 CASAVA_Build 20 2995854 10I CTCCCTCTCA ----------/TTCCCCCATT TTCCCCCATT 3070 het 3070 hom 53 17 22 14 TTCCCCCATT 1 2 329049 CASAVA_Build 20 3006939 2I CTGGATACTC --/TT TGAACTCCTA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 1 3 329050 CASAVA_Build 20 3020607 3I CAAGTAAAAA ---/AGG AGGGCGGGGG 3070 hom 63 het 28 0 19 9 AGG 1 2 329051 CASAVA_Build 20 3033488 1I TTTTAGTAGA -/G GACGGGGTTT 1099 het 981 hom 10 3 3 4 G 1 2 329052 CASAVA_Build 20 3037363 2D AGGATCGCTT GA/-- GCCCAGGAGT 3070 het 1856 hom 26 7 16 3 GA 1 0 329053 CASAVA_Build 20 3062403 1I TATTTTTTTT -/G GGGGGGGGGA 2620 het 2620 ref 29 16 7 6 G 9 10 329054 CASAVA_Build 20 3064433 1D GGTTGTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 A 12 11 329055 CASAVA_Build 20 3089735 1I AGACTCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 25 0 20 5 T 13 14 329056 CASAVA_Build 20 3107347 1I CTGGGACTAC -/A GGCATTTACT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 0 1 329057 CASAVA_Build 20 3117477 3I65M1I ATGTTTACTT ---TTAATAAACTATTCATTTAATAAATGTATTAACTGAGCACTAAATAATGCTCAAAGGATCATAGA-/TTGTTAATAAACTATTCATTTAATAAATGTATTAACTGAGCACTAAATAATGCTCAAAGGATCATAGAT TTTTTTTCCT 3070 hom 84 het 31 0 28 14 N/A 0 0 329058 CASAVA_Build 20 3120772 2I CGAGACACAC --/AT GAGTGGTAAT 3070 het 3070 hom 41 14 14 13 AT 0 1 329059 CASAVA_Build 20 3125518 2I AATAAATAAC --/AT GTTACTGGAT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AT 0 1 329060 CASAVA_Build 20 3150221 4D GTCCCGGGTG TGGC/---- TGGCGAGGGC 3070 het 3070 hom 38 19 14 5 TGGC 2 1 329061 CASAVA_Build 20 3202250 1D CTGTGAACTC A/- AGAGTAAGAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 2 1 329062 CASAVA_Build 20 3214626 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 925 het 925 ref 20 14 3 3 A 12 11 329063 CASAVA_Build 20 3224660 1D CATCGGGAAC T/- TTCGGTTTCA 3070 hom 115 het 44 0 38 7 T 3 2 329064 CASAVA_Build 20 3228937 4I TATTGTCTTA ----/CTAG ATAGTAAGTC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 CTAG 0 1 329065 CASAVA_Build 20 3239955 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 12 11 329066 CASAVA_Build 20 3246882 2D TTATTTTGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2184 hom 35 12 14 9 A 16 14 329067 CASAVA_Build 20 3254531 1D GTCTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 T 12 11 329068 CASAVA_Build 20 3262334 1I TTATTAAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 10 11 329069 CASAVA_Build 20 3265062 1I TTTTGTTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 10 11 329070 CASAVA_Build 20 3266625 3D TATAATATAT AAA/--- ATATATAATA 532 het 532 ref 10 7 2 1 A 4 1 329071 CASAVA_Build 20 3268967 3D CATACCTAGT TTG/--- TACTATAAAA 2907 het 2907 ref 24 14 8 2 TTG 1 0 329072 CASAVA_Build 20 3271679 1D30M1I CTGATGATTA TTTCTATTGCTGTGCAGAAGCATGTTCATTT-/-TAAAATTGCTGTGCAGAAGCATGTTCATTTA GTTAGGTCCC 3070 het 3070 ref 43 24 21 5 N/A 0 0 329073 CASAVA_Build 20 3273019 1I ATATTTACTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 T 8 9 329074 CASAVA_Build 20 3281167 2D GGCTGTCATT CA/-- CATTCCAGCA 3070 het 3070 ref 43 21 17 7 CA 2 1 329075 CASAVA_Build 20 3284193 1I TGCACTCCAG -/C CCTGGGTGAC 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 C 2 3 329076 CASAVA_Build 20 3286277 5I ACCCATCCAG -----/CTTAT CTTTATCTTT 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 CTTAT 0 1 329077 CASAVA_Build 20 3297163 1D TCCTGGAAGC T/- TTTTTTTTTT 1083 het 1015 hom 17 5 3 9 T 15 14 329078 CASAVA_Build 20 3297534 2I14M1I GTAATCCCAG --CTTTCAGAAGCCGA-/CACTTTCAGAAGCCGAG GAAGGCAGAT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 N/A 0 0 329079 CASAVA_Build 20 3297613 1I CCCCATTTCT -/A CTAAAAATAC 3070 hom 32 het 12 0 10 2 A 0 1 329080 CASAVA_Build 20 3326367 1D GATTTTTTTT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 3070 hom 34 11 13 11 G 10 9 329081 CASAVA_Build 20 3328410 1D ACCACCTGCT A/- AAAGACAGCA 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 A 4 3 329082 CASAVA_Build 20 3330250 1I ATTATTATCT -/A TTCATTCAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 0 1 329083 CASAVA_Build 20 3330516 1D GGGGAGGGCT C/- CCCCGCCCCC 3070 hom 76 het 31 0 24 8 C 5 4 329084 CASAVA_Build 20 3369235 20I TCCTAGGCAG --------------------/AGGACCCTGCGGCCTTCCGC AGTGTGTGTG 1838 het 1512 hom 6 3 4 1 AGGACCCTGCGGCCTTCCGC 0 1 329085 CASAVA_Build 20 3376934 1D AAATTAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2261 hom 17 6 9 2 T 11 10 329086 CASAVA_Build 20 3384812 1D GCTTATTTGA T/- TTGCGGAAGG 3070 het 3070 ref 40 22 12 7 T 3 2 329087 CASAVA_Build 20 3389675 1I TCTTATTAGG -/A AAAAAAACCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 8 329088 CASAVA_Build 20 3476537 1D GCTAATAGTT A/- TCTACAGAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 329089 CASAVA_Build 20 3481083 2I CAGATGTCCC --/TA CCCCAGTTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TA 0 1 329090 CASAVA_Build 20 3484204 1D GGTAGACCAC A/- AAACAAAATC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 4 3 329091 CASAVA_Build 20 3487188 1D TTTCTTTTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 8 329092 CASAVA_Build 20 3497167 1I CTCAAAAAAA -/T ATATATTTCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 329093 CASAVA_Build 20 3498791 1D ATTGTCTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 T 10 9 329094 CASAVA_Build 20 3500209 1D TTTTTTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 21 9 T 15 14 329095 CASAVA_Build 20 3516125 1D GTTGAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 38 1 31 6 T 15 14 329096 CASAVA_Build 20 3525360 5D TTCTCTTAAA ACTTT/----- ACTTTATTTG 3070 hom 129 het 53 0 44 10 ACTTT 2 1 329097 CASAVA_Build 20 3535085 2I TCTCTCTTCA --/CT CTGTTTCCTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 CT 1 2 329098 CASAVA_Build 20 3545599 1D AAGGATCGCA T/- TTTTATCCCT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 5 4 329099 CASAVA_Build 20 3546457 1D GGAGCTGAAG T/- TCTGTTCGCC 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 2 1 329100 CASAVA_Build 20 3549984 23D ACTTTTGGCT GAAGTGCAACATTAGTGATTGAG/----------------------- GAAGTGCAGG 3070 het 3070 ref 43 30 11 10 GAAGTGCAACATTAGTGATTGAG 1 0 329101 CASAVA_Build 20 3550511 1I TTCATAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 A 9 10 329102 CASAVA_Build 20 3556929 2I AAAACTAGAA --/AG AGAAACTTCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AG 1 2 329103 CASAVA_Build 20 3574322 1D CCCTTCTGTA C/- CCCCTGTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 C 5 4 329104 CASAVA_Build 20 3575926 5I GTCAGATGAA -----/TTAAC TTGTTTTCAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TTAAC 0 1 329105 CASAVA_Build 20 3577545 4D GAAGATCCTC TTTG/---- TTTGTTCAAA 3070 het 3070 hom 34 11 18 8 TTTG 2 1 329106 CASAVA_Build 20 3579416 4I TTCGTTGAAC ----/TAAT TAATTCTGGC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 TAAT 1 2 329107 CASAVA_Build 20 3583571 2D AAATTCCACC AA/-- CCCGTGTCCA 3070 hom 99 het 36 0 33 5 A 2 0 329108 CASAVA_Build 20 3590222 2D CGCCACCATT TC/-- TCCAGAACGG 3070 hom 82 het 33 0 24 9 TC 2 1 329109 CASAVA_Build 20 3591130 1D GGGGTGGTAT C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 98 het 38 0 30 8 C 9 8 329110 CASAVA_Build 20 3598541 7I CAGGCTCTGA -------/CACCACC CAGCAGCCTG 3070 hom 95 het 38 0 28 10 CACCACC 0 1 329111 CASAVA_Build 20 3612604 1D TCTGTAGACA G/- GGGGGTCTCA 3070 hom 48 het 18 0 16 2 G 6 5 329112 CASAVA_Build 20 3615749 1I AAGTTCACCC -/G GCCCCCAACT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 G 1 2 329113 CASAVA_Build 20 3624467 2D TTAGGGAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 13 11 329114 CASAVA_Build 20 3625096 4I GAGGCCTTCT ----/GCTG GCTGGCTGGA 3070 hom 108 het 45 0 36 9 GCTG 2 3 329115 CASAVA_Build 20 3628464 1I TCTCAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 31 1 20 10 T 12 13 329116 CASAVA_Build 20 3633445 1I TGTTTTTTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 7 8 329117 CASAVA_Build 20 3642626 1D CTCCTGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 27 0 22 5 T 11 10 329118 CASAVA_Build 20 3648310 1D CAGCTAATCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 15 7 A 11 10 329119 CASAVA_Build 20 3648569 1D TTCATAAAAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 9 8 329120 CASAVA_Build 20 3650677 1I TATGTTGAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 10 329121 CASAVA_Build 20 3652136 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 19 1 11 7 A 12 13 329122 CASAVA_Build 20 3653236 4I AGAAAGAAAG ----/GAAA GAAAGAAATA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 GAAA 2 3 329123 CASAVA_Build 20 3667489 2D CTGTGAGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 91 het 44 0 28 19 GT 8 7 329124 CASAVA_Build 20 3672000 1D TGGCTAATTT A/- AAAAAAAAAA 2026 het 1050 hom 16 6 7 3 A 15 14 329125 CASAVA_Build 20 3684408 14D GCTGATCGAC CCCCAGCCCAGTGG/-------------- CCCCAGCCCT 2551 het 2551 ref 30 14 9 9 CCCCAGCCCAGTGG 1 0 329126 CASAVA_Build 20 3685086 22D GGGCTGGTGG GGGTGCCACGCCAGCAGGCAAA/---------------------- GGGTGCCTGC 2519 het 2045 hom 16 9 7 3 GGGTGCCACGCCAGCAGGCAAA 1 0 329127 CASAVA_Build 20 3703005 3I ACAGAGTGAG ---/ACA ACATCTCATA 3070 het 2295 hom 19 7 9 3 ACA 1 2 329128 CASAVA_Build 20 3724022 3D AACAAAACAA AAC/--- AAAAAGAAAG 1143 het 1143 ref 30 18 8 4 AAC 1 0 329129 CASAVA_Build 20 3734893 1I TTGTCCCTTC -/T TTCTCCCAAT 3070 het 3070 ref 41 16 16 9 T 2 3 329130 CASAVA_Build 20 3772586 5D GATGATTTAT TTTAC/----- TTTATATTTT 3070 het 3070 ref 30 18 11 5 TTTAC 1 0 329131 CASAVA_Build 20 3788884 1I CCCCAATTCC -/T TTTTTTTTTG 2801 het 669 hom 18 3 8 7 T 9 10 329132 CASAVA_Build 20 3827145 1I CCTCGCCCTT -/A AGGCTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 A 1 2 329133 CASAVA_Build 20 3833811 8D ATCGCTTGTG ACTGCACC/-------- ACTGCACCAG 3070 het 3070 ref 36 17 17 3 ACTGCACC 2 1 329134 CASAVA_Build 20 3847010 1I AGTCATACTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 T 9 10 329135 CASAVA_Build 20 3847974 3I GAAAAACCCT ---/TGA TGAACATTCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TGA 1 2 329136 CASAVA_Build 20 3848865 1I AGTTAACCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 10 11 329137 CASAVA_Build 20 3864586 7I AGTGGTTGAA -------/CTCCTTC CTCCTTTCTC 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 CTCCTTC 0 1 329138 CASAVA_Build 20 3877293 1I ACATACCAGG -/A ATAACTGTTG 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 A 1 2 329139 CASAVA_Build 20 3878626 11I CTGTGAGGTA -----------/GGGGTCCAGAC GCTTTTTATC 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 GGGGTCCAGAC 0 1 329140 CASAVA_Build 20 3878807 6I CTTGTATAGT ------/GACTGG GATGAATGTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 GACTGG 0 1 329141 CASAVA_Build 20 3884911 1D TGTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 1856 het 1856 ref 36 21 5 10 T 13 12 329142 CASAVA_Build 20 3890045 1I CACTATCTTG -/A AAAAAAAAAA 2680 het 2680 ref 35 14 9 12 A 14 15 329143 CASAVA_Build 20 3893172 1I TTTCAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2500 hom 22 9 8 5 T 10 11 329144 CASAVA_Build 20 3902711 1I GCTTAATATT -/A AAAAAAAAAA 2562 het 2562 ref 35 13 8 14 A 14 15 329145 CASAVA_Build 20 3904228 1I TTGTGTTCTC -/A AAAAAGATAT 3070 het 3070 ref 33 22 11 0 A 5 6 329146 CASAVA_Build 20 3906720 1I AGAAAACTAA -/T TTTTTTTTTT 2825 het 2617 hom 32 12 10 10 T 15 16 329147 CASAVA_Build 20 3907037 5D CAAAATAGCT AGAAG/----- AGAAGAATTT 3070 het 2188 hom 13 6 7 1 AGAAG 2 1 329148 CASAVA_Build 20 3919558 14I TTTGGCACAG --------------/TTCCATGATAACAT TTCCATGATA 3070 het 3070 hom 31 10 18 4 TTCCATGATAACAT 1 2 329149 CASAVA_Build 20 3921172 1I GTATTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 T 12 13 329150 CASAVA_Build 20 3926244 1I CAGCTAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 10 11 329151 CASAVA_Build 20 3933808 12D AACCTGAACA GGTTACTTCTTT/------------ GACATTTAGT 3070 het 3070 hom 30 13 19 1 GGTTACTTCTTT 1 0 329152 CASAVA_Build 20 3948674 1D TTGCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 30 0 14 16 T 13 12 329153 CASAVA_Build 20 3960059 2D TAGGTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1161 het 1161 ref 29 17 3 9 T 13 11 329154 CASAVA_Build 20 3973710 2D AATACATAAT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 73 het 29 0 25 4 GA 7 6 329155 CASAVA_Build 20 3977483 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 287 hom 34 3 23 8 T 13 12 329156 CASAVA_Build 20 3987146 1I TTGTATAAAT -/G GATTCAAACA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 G 1 2 329157 CASAVA_Build 20 3990279 1I AACACATAAA -/T TCTCTCTCTC 3070 hom 9 het 24 0 17 7 T 1 2 329158 CASAVA_Build 20 3992154 1I CCCCAGGGAC -/A GGGGGGCTGG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 0 1 329159 CASAVA_Build 20 3993873 1I GCTTTTCCTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 43 12 24 7 T 8 9 329160 CASAVA_Build 20 3996871 17D ACGTGCCCCA GAGTTATCTTGCCTGAG/----------------- GAGTGAGGGA 3070 het 3070 ref 50 29 20 4 GAGTTATCTTGCCTGAG 1 0 329161 CASAVA_Build 20 3998929 1I TAACTGCATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 8 9 329162 CASAVA_Build 20 3999702 7D AAGCCAAGGG CTGGATC/------- CTGGAGGCTG 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 CTGGATC 1 0 329163 CASAVA_Build 20 4000528 1I TAAGCATGAA -/T GTGGTCTCAG 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 0 1 329164 CASAVA_Build 20 4005208 1I AGATTATTTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 913 hom 47 3 40 4 T 0 1 329165 CASAVA_Build 20 4006328 2D6M4I TCTCTCTTTA ATATGTTT----/--ATGTTTATTA ATTATACATA 3070 hom 84 het 29 0 29 3 N/A 0 0 329166 CASAVA_Build 20 4019896 1I GGGACCTTTG -/T TTTTTGCAAA 3070 het 2752 hom 23 7 9 7 T 5 6 329167 CASAVA_Build 20 4023258 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 10 19 9 A 10 9 329168 CASAVA_Build 20 4032045 1D GTTCAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 383 hom 27 1 26 0 A 10 9 329169 CASAVA_Build 20 4033618 1I TGGTCAGGGC -/G GCGCCTCCTC 3070 hom 65 het 23 0 20 3 G 1 2 329170 CASAVA_Build 20 4062179 1I3M6D AAGAACAACA -GCTCAGAAA/GGCT------ CCTTCTTGGA 3070 het 3070 ref 30 19 10 3 N/A 0 0 329171 CASAVA_Build 20 4065880 1I AACCTGAGGC -/A AAAAAAAAAA 3021 het 3021 ref 25 11 7 7 A 10 11 329172 CASAVA_Build 20 4072038 16D GTATGTGTAT ACACACACACACACAC/---------------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 34 14 11 13 AC 15 7 329173 CASAVA_Build 20 4087665 1D TTGGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 12 11 329174 CASAVA_Build 20 4091848 1D GTAGGTCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 27 1 20 6 A 15 14 329175 CASAVA_Build 20 4103522 3D TGGAGGTGGC TCT/--- TCTTGTCCAG 3070 hom 54 het 24 0 17 7 TCT 2 1 329176 CASAVA_Build 20 4113147 2I ACTGTACACT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 21 0 14 7 A 12 14 329177 CASAVA_Build 20 4113245 2I AAAACTCAAC --/AG AGTTATATTT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 AG 1 2 329178 CASAVA_Build 20 4137406 7I GATCACAGAA -------/GTGTTCT GTGTTGAATG 3070 hom 89 het 37 0 27 10 GTGTTCT 0 1 329179 CASAVA_Build 20 4152546 9D TTCAATTTAC AACAGGTTT/--------- AACAGGACAT 3070 het 3070 hom 44 19 19 10 AACAGGTTT 1 0 329180 CASAVA_Build 20 4153415 1D TCTTGCCTTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 10 9 329181 CASAVA_Build 20 4156580 2D AAGCGGCCTT CC/-- TGCTCCTGCC 1729 het 1729 ref 14 8 5 1 C 2 0 329182 CASAVA_Build 20 4158073 1I GAAGGAAGAT -/A GGGGGCGAGT 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 A 0 1 329183 CASAVA_Build 20 4170607 1D AGCACAGCCT G/- ATGGCTCTGC 3070 hom 154 het 58 0 52 6 G 1 0 329184 CASAVA_Build 20 4171994 1D TGGGCTCCTC G/- GGGCATCCGG 3070 hom 35 het 16 0 11 5 G 4 3 329185 CASAVA_Build 20 4180707 1I TTTTCTTACC -/T TTTTTTTTTT 1628 het 1628 ref 30 15 8 7 T 13 14 329186 CASAVA_Build 20 4183342 1I ATAATTAAAA -/T TTTTTTTTTT 1431 het 1423 hom 19 4 8 7 T 16 17 329187 CASAVA_Build 20 4203586 1D GGAAGATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 22 1 10 11 T 17 16 329188 CASAVA_Build 20 4219264 1I AATGGATTCC -/T TTTTTTTTTT 2902 het 212 hom 31 2 15 14 T 13 14 329189 CASAVA_Build 20 4240357 1I TGCCATTTTA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 7 8 329190 CASAVA_Build 20 4248672 1I ATTTTTTAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 9 10 329191 CASAVA_Build 20 4253011 4I GGTTTGGCTC ----/CTGT CTGTCTGACA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 CTGT 1 2 329192 CASAVA_Build 20 4254265 1D CAATATAAGG T/- TTACTTCAAC 3070 het 3070 hom 32 15 15 3 T 3 2 329193 CASAVA_Build 20 4258292 1I TCCTACGTGT -/C CATGCCAGCT 3070 hom 125 het 49 0 40 9 C 1 2 329194 CASAVA_Build 20 4258978 1D CTGAAACTGG C/- GTAATTTATA 3070 het 3070 ref 50 25 20 6 C 1 0 329195 CASAVA_Build 20 4269072 1I AGTCAAATCA -/G GGGGGAGGAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 G 5 6 329196 CASAVA_Build 20 4270092 1D CCGTGTGTCC A/- GCCAAAACTT 3070 het 3070 ref 55 31 18 6 A 1 0 329197 CASAVA_Build 20 4272654 1D TTTGGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 11 10 329198 CASAVA_Build 20 4274396 1D TTCATGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 13 12 329199 CASAVA_Build 20 4277303 2D TGCCTAGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 638 hom 26 9 12 5 T 24 22 329200 CASAVA_Build 20 4280974 1D AGTTGACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 334 hom 34 1 24 10 T 12 11 329201 CASAVA_Build 20 4291822 1D ATTTTTTTTT A/- AAATTTTTGA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 4 3 329202 CASAVA_Build 20 4297379 1I TTTGAAGGCA -/T TTTCCAGGGT 3070 het 3070 hom 52 12 34 6 T 3 4 329203 CASAVA_Build 20 4299115 1D TTTTTTTTTT G/- AAACAGACTC 2372 het 2372 ref 23 12 8 3 G 1 0 329204 CASAVA_Build 20 4307344 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1149 het 1149 ref 36 24 3 9 T 10 11 329205 CASAVA_Build 20 4314638 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3068 hom 21 10 11 2 AAAC 5 4 329206 CASAVA_Build 20 4320295 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 19 1 8 11 A 13 12 329207 CASAVA_Build 20 4322566 8I CCTGGCAGCT --------/GAGGCAGA GAGGGAGAGG 3070 hom 41 het 15 0 14 1 GAGGCAGA 0 1 329208 CASAVA_Build 20 4328980 4D ACACACACAC ACAT/---- ACAAGCACAC 3070 het 121 hom 32 1 20 16 ACAT 1 0 329209 CASAVA_Build 20 4329268 11I ACAGCCTCCT -----------/GTGTATTGTGG TCAACAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 GTGTATTGTGG 0 1 329210 CASAVA_Build 20 4340385 2I GGAATATAGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 35 0 19 16 TG 6 7 329211 CASAVA_Build 20 4366284 2D GAAAAATGCT CC/-- CCAGGTTTAA 3070 hom 105 het 41 0 36 7 C 4 2 329212 CASAVA_Build 20 4370116 27D AATGGTGATG GGAGCTCCCAGGCTACAGAAAGATGAT/--------------------------- GGAGGTACTA 3070 hom 96 het 32 0 31 8 GGAGCTCCCAGGCTACAGAAAGATGAT 1 0 329213 CASAVA_Build 20 4371449 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 8 9 329214 CASAVA_Build 20 4379652 1D CTAGACCCTT A/- AAAATAACAC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 A 5 4 329215 CASAVA_Build 20 4390339 15D AGTATCTAAC TTTATTTTATTTTAT/--------------- TTTATTTTAT 3028 hom 21 het 13 0 8 5 TTTAT 6 3 329216 CASAVA_Build 20 4390596 1I AAACTCCCGA -/C CTCAGATGAT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 C 1 2 329217 CASAVA_Build 20 4393548 2I GTTTCCAGTT --/AA GTTATACTTT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 0 2 329218 CASAVA_Build 20 4406220 2D CTCTCATGTC TT/-- TGAATCGCCA 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 T 3 1 329219 CASAVA_Build 20 4408650 1I TTCCTCGGAG -/A AAAAAAAACA 1403 het 893 hom 21 5 6 10 A 8 9 329220 CASAVA_Build 20 4410042 1D ACCACAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 13 12 329221 CASAVA_Build 20 4410153 20D TACTTCTTGG GTCAATGTTATAAACTTTGC/-------------------- GTCCCTGACT 3070 hom 57 het 20 0 19 4 GTCAATGTTATAAACTTTGC 1 0 329222 CASAVA_Build 20 4410517 2I GGTTTAAAGT --/TC TCTCTAATGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TC 2 3 329223 CASAVA_Build 20 4412783 1I TTATTATATG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 7 8 329224 CASAVA_Build 20 4413738 1D TCCTTGACAT G/- GACTGAGAAC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 G 2 1 329225 CASAVA_Build 20 4422630 2I ATTAAAAAAA --/AT AAATATACAC 3070 hom 91 het 35 0 30 5 AT 0 1 329226 CASAVA_Build 20 4429374 1I CTTTTTTCAA -/G GTTTTTAGCT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 G 1 2 329227 CASAVA_Build 20 4435528 1D ACTAGGGGCT G/- GGGGCAGGGG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 G 5 4 329228 CASAVA_Build 20 4440337 1I CATTCTTGCC -/A ACCTTTGGTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 2 329229 CASAVA_Build 20 4441593 1I CATTTTGGAC -/G ATCTCACCCT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 G 0 1 329230 CASAVA_Build 20 4448614 1I TGCCCAAGGG -/C TGTCCCAGAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 0 1 329231 CASAVA_Build 20 4449797 1D TCTACAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2682 hom 23 9 9 6 T 15 14 329232 CASAVA_Build 20 4450875 1D ACAGCCCTTC T/- TGGGAGCCCA 3070 hom 112 het 42 0 34 8 T 2 1 329233 CASAVA_Build 20 4469064 1I GTCAGTAGAG -/C CAGGAGTGTG 3070 het 3070 ref 50 31 15 4 C 1 2 329234 CASAVA_Build 20 4476587 1D CTGGTAAGAT A/- AATTGTACTA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 3 2 329235 CASAVA_Build 20 4486478 1D TACTTTGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1557 hom 27 9 10 8 A 17 16 329236 CASAVA_Build 20 4489936 3I TGGCAGATTA ---/GAG GAGGAGACAT 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 GAG 2 3 329237 CASAVA_Build 20 4501926 1I GGCCCCTCTT -/C CACTTTTAAG 3070 hom 30 het 14 0 11 3 C 1 2 329238 CASAVA_Build 20 4508579 4I TGTTATATAC ----/CTTA CTTTTAGAGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 CTTA 0 1 329239 CASAVA_Build 20 4512269 6I GGTGCTAGTG ------/GTGTTA AAGAATGTGG 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 GTGTTA 0 1 329240 CASAVA_Build 20 4514008 1I GCTGGGGCTG -/C ACTCATCTGA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 C 0 1 329241 CASAVA_Build 20 4516149 13D GAATTTGGGT AAACATGGATGGA/------------- AAAACTATAC 552 het 552 ref 43 27 4 17 AAACATGGATGGA 1 0 329242 CASAVA_Build 20 4518547 2D AAGAATTTGT AG/-- AATGTTATTT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 AG 1 0 329243 CASAVA_Build 20 4519911 1D GGGCCCCCCA T/- TTTTTATGAC 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 T 6 5 329244 CASAVA_Build 20 4531698 1I ATCCCTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 47 0 36 11 A 11 12 329245 CASAVA_Build 20 4543662 1I TGAGTGAATC -/T TTTTAACTGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 4 5 329246 CASAVA_Build 20 4548001 1D GAACTCATCC A/- TTTTCCATAG 3070 het 3070 hom 22 11 11 1 A 1 0 329247 CASAVA_Build 20 4565265 4I AAAGCAAGAG ----/AGAA AGAAAGAAGA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 AGAA 2 3 329248 CASAVA_Build 20 4569827 1I ACCCTCACTC -/T TTTTCCAAGA 3070 hom 140 het 51 0 45 6 T 4 5 329249 CASAVA_Build 20 4572423 1I AACTAAATAG -/A AAAATCTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 4 5 329250 CASAVA_Build 20 4575673 1I ATAGTTGAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 A 9 10 329251 CASAVA_Build 20 4575984 1I ATCCTTGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 451 hom 32 3 16 13 A 11 12 329252 CASAVA_Build 20 4583002 2D CTGATTCCAT GG/-- GGAAGGAACA 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 G 4 2 329253 CASAVA_Build 20 4616191 1D TGTCCTTTTT A/- AGGAATTTTT 3070 hom 105 het 38 0 33 6 A 2 1 329254 CASAVA_Build 20 4624210 1D TTTTGCAATG A/- ACATACACGT 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 A 2 1 329255 CASAVA_Build 20 4639384 1D GGGGTCATCC A/- AGCATGGCTG 3070 hom 117 het 46 0 40 7 A 2 1 329256 CASAVA_Build 20 4654655 8D TACAGGTGTG TGCCATCA/-------- TGCCTGACTA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TGCCATCA 1 0 329257 CASAVA_Build 20 4658960 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2855 het 1324 hom 33 8 10 15 T 15 14 329258 CASAVA_Build 20 4667579 1D ACATCTAATA T/- TAGCCCTAAA 3070 het 3070 hom 32 10 21 1 T 2 1 329259 CASAVA_Build 20 4668264 1I CGGAGTCTCG -/C TCTGTTGCCA 2089 het 2089 ref 32 12 7 13 C 0 1 329260 CASAVA_Build 20 4678597 1I GTAACTGACA -/G TAGTTTTCCA 3070 het 3070 ref 66 29 27 10 G 0 1 329261 CASAVA_Build 20 4685531 1I TAAATGTATT -/A GAGGCTCATT 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 A 0 1 329262 CASAVA_Build 20 4689156 2I ACACACCAGG --/GA TGTGTCAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 GA 0 1 329263 CASAVA_Build 20 4696740 4I CTTTCACCAA ----/CTAT CTATTTTCAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTAT 1 2 329264 CASAVA_Build 20 4697458 1D GTTCAGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 25 1 15 9 T 15 14 329265 CASAVA_Build 20 4705721 1D TTTATTTTTG C/- CCTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 C 3 2 329266 CASAVA_Build 20 4716847 1D AAGTACACTG T/- GGTCTTCAGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 T 1 0 329267 CASAVA_Build 20 4726212 15D GACGGGCCCA CTATCAGTGGGGACT/--------------- CTGCTAACAT 3070 het 3070 hom 35 17 19 4 CTATCAGTGGGGACT 1 0 329268 CASAVA_Build 20 4744035 3D ATCTGAGGCT ACC/--- ACCACCCATC 3070 hom 114 het 45 0 37 10 ACC 3 2 329269 CASAVA_Build 20 4750487 2I ACTGCCACAG --/CC CCTAGGCATC 3070 hom 94 het 37 0 29 8 C 2 4 329270 CASAVA_Build 20 4751073 1D TGCACGCAGC T/- GTTGAGAGGC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 1 0 329271 CASAVA_Build 20 4771349 1D ATATTTTCCA T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 56 het 35 1 33 1 T 8 7 329272 CASAVA_Build 20 4772453 1D TCTCTCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 26 1 19 6 T 12 11 329273 CASAVA_Build 20 4828133 16D AAACGGCGCA GCTCAATGCCTTCTGC/---------------- GCTCAATGCC 3070 het 3070 ref 49 24 17 13 GCTCAATGCCTTCTGC 1 0 329274 CASAVA_Build 20 4831736 2I GTGAAAAGAG --/GA TAATTCTAAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 GA 0 1 329275 CASAVA_Build 20 4833110 2I AAAAAAACAA --/CC ACAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 C 0 2 329276 CASAVA_Build 20 4834528 1D CTCTACTGAG A/- AGAACAGATA 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 2 1 329277 CASAVA_Build 20 4913193 1I AGCAAGACTC -/T TGTCTCAAAA 2423 het 69 hom 11 1 7 3 T 1 2 329278 CASAVA_Build 20 4917381 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2507 het 1365 hom 19 6 7 6 A 13 14 329279 CASAVA_Build 20 4918271 7I GCAGTGAGCC -------/TTAATAT ATGATCTTGC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TTAATAT 0 1 329280 CASAVA_Build 20 4921954 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1630 het 195 hom 16 2 10 4 A 15 16 329281 CASAVA_Build 20 4926185 1I TGAAGCCCTA -/C CCCCCACAAT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 C 5 6 329282 CASAVA_Build 20 4927253 5D AATGAATTAA TGAGG/----- TGAGGTTACT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 TGAGG 2 1 329283 CASAVA_Build 20 4951824 1I TCAGCCTCCC -/A AGTAGCTGGG 2806 hom 21 het 9 0 8 1 A 1 2 329284 CASAVA_Build 20 4957310 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 1878 het 858 hom 11 5 6 0 A 14 13 329285 CASAVA_Build 20 4965675 2I CAAAAACATT --/AA AAAAAAAAAA 2405 het 2405 ref 39 24 8 7 A 12 14 329286 CASAVA_Build 20 4969324 1I TTTTTTTTTT -/C TCAATGGCAA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 C 0 1 329287 CASAVA_Build 20 4969472 1I CATAATGCTG -/A GTTAAAGAGG 3070 het 3070 ref 50 22 23 5 A 0 1 329288 CASAVA_Build 20 4975859 1D TATATATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 28 1 20 7 T 12 11 329289 CASAVA_Build 20 4984244 1I AAATGAGCTG -/T TTTTTGGGAG 3070 hom 99 het 36 0 32 4 T 5 6 329290 CASAVA_Build 20 4988558 8I CCTGAGTAGC --------/TGTGATTA CAGGCAACCA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TGTGATTA 0 1 329291 CASAVA_Build 20 5163247 2D68M2I AATAATAGAC ATATTTTAATTCTATCTTAATGGTAACTATTCATTATAATGAACAGAACTATTAATAAATTTATAAAAAC--/--ATTTTAATTCTATCTTAATGGTAACTATTCATTATAATGAACAGAACTATTAATAAATTTATAAAAACAT ATTAAATATT 3070 het 3070 ref 26 13 12 16 N/A 0 0 329292 CASAVA_Build 20 5171123 1D AATAAGACCT A/- GTATTTGCTA 3063 het 3063 ref 25 16 7 2 A 1 0 329293 CASAVA_Build 20 5174412 2D22M1I GTGTGTGCAA GTGTCTTTTTTATATAATGACTTA-/--GTCTTTTTTATATAATGACTTAT TTTCCTTTGG 3070 hom 57 het 22 0 20 7 N/A 0 0 329294 CASAVA_Build 20 5179784 1I TTTCTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 C 0 1 329295 CASAVA_Build 20 5180880 1I CGTATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 21 1 17 3 T 10 11 329296 CASAVA_Build 20 5188264 1D TTAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1997 hom 31 6 15 10 A 15 14 329297 CASAVA_Build 20 5190947 1I GCTGGAACCA -/C CTGTTGTGGA 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 C 1 2 329298 CASAVA_Build 20 5191528 1D TTCATTGCTT A/- AAAAAAAAGA 2975 het 2975 ref 32 22 8 2 A 9 8 329299 CASAVA_Build 20 5194343 1D ACCGAGACAG C/- CCCCCCTTTC 3070 het 3070 hom 57 26 24 8 C 7 6 329300 CASAVA_Build 20 5208611 1I AGTTCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 1925 het 1127 hom 18 5 7 6 T 13 14 329301 CASAVA_Build 20 5226337 1D TGAACTCTTT A/- AAAGTTTGAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 4 3 329302 CASAVA_Build 20 5228466 2D ATGGGGTTTT TG/-- GCCATGTTGG 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 TG 1 0 329303 CASAVA_Build 20 5228840 3I CCACAAATGT ---/ATA ATAATACAAA 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 ATA 2 3 329304 CASAVA_Build 20 5248606 1D ACGCCCAGCA T/- TTTTTTTTTT 2770 het 2770 ref 28 14 9 5 T 11 10 329305 CASAVA_Build 20 5249226 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 9 7 A 11 10 329306 CASAVA_Build 20 5264590 1D AATATCTGGG T/- AAAATTTAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 4 T 1 0 329307 CASAVA_Build 20 5274512 1I TGATTCAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 T 9 10 329308 CASAVA_Build 20 5274661 1I TTTATCCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 8 9 329309 CASAVA_Build 20 5276800 1D ACCACCTTCC A/- AAATGTGGAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 4 3 329310 CASAVA_Build 20 5291873 1D TTTCCTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 11 10 329311 CASAVA_Build 20 5310195 1I ACAAGGGAGT -/G GGGGGGTCCC 1718 het 1718 ref 16 10 4 2 G 6 7 329312 CASAVA_Build 20 5312905 1D AGGTGTAGAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 41 20 15 7 A 9 8 329313 CASAVA_Build 20 5320470 3I AAAACAAACA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 AAC 5 6 329314 CASAVA_Build 20 5325370 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAACACTA 3070 het 555 hom 33 3 21 9 A 6 5 329315 CASAVA_Build 20 5330441 1D TCCATTCCCA C/- CCCCCCCCCA 1749 hom 34 het 17 0 7 10 C 10 9 329316 CASAVA_Build 20 5338448 1I ATTAGCATAC -/A AAAAACCATC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 5 6 329317 CASAVA_Build 20 5348677 1D CTGCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 27 1 16 11 T 13 12 329318 CASAVA_Build 20 5356476 4D TCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 68 het 24 0 23 2 AAAC 5 4 329319 CASAVA_Build 20 5357192 1D TCTCTGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 46 0 39 7 A 11 10 329320 CASAVA_Build 20 5358362 1I TGGGTTGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 12 hom 42 1 34 7 A 9 10 329321 CASAVA_Build 20 5380395 1I TCCTCAATTG -/T AAAAATCTTA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 0 1 329322 CASAVA_Build 20 5398975 3D ACGTGTTCTC AAT/--- GATCAACACA 3070 hom 132 het 46 0 43 4 AAT 1 0 329323 CASAVA_Build 20 5421578 2I ACTGAGCAGA --/GT GTTCCTTTTT 3070 hom 119 het 43 0 40 4 GT 1 2 329324 CASAVA_Build 20 5450351 4D TGGGTTTTTC CCTT/---- TTTAGGTCCA 3070 het 3070 hom 48 20 27 1 CCTT 1 0 329325 CASAVA_Build 20 5455412 2I CAAACTAGAA --/CT CAGCAACAGA 3070 het 3070 ref 41 17 11 13 CT 0 1 329326 CASAVA_Build 20 5457034 1I GAAAGAAAAA -/G AAAAAAAATA 3070 het 2693 hom 24 8 14 2 G 0 1 329327 CASAVA_Build 20 5457359 1I GTCTAGAGTT -/G GGTACATCTT 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 G 2 3 329328 CASAVA_Build 20 5458367 3D GGAAAGAAAG AAT/--- TAGACCTTCA 3070 het 3070 hom 42 14 24 8 AAT 1 0 329329 CASAVA_Build 20 5462265 1I TTTTTACTTA -/T TTTTAATAGG 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 T 4 5 329330 CASAVA_Build 20 5464450 1D GTCCCTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 11 10 329331 CASAVA_Build 20 5475425 4D TAAAACGCCT ACAA/---- ACAGCCTTTT 1251 het 1251 ref 46 41 3 6 ACAA 1 0 329332 CASAVA_Build 20 5480818 1D GAATAAAATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 A 9 8 329333 CASAVA_Build 20 5488232 1I TCAAAAACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 8 9 329334 CASAVA_Build 20 5494353 2I AGTAGTCACA --/AG AGCTGTGATT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 AG 1 2 329335 CASAVA_Build 20 5504753 1D GTATATATAT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3011 hom 19 8 10 1 A 1 0 329336 CASAVA_Build 20 5510461 22D GGACTTTAAC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/---------------------- TTTTTTTTTT 2898 het 2898 ref 26 15 9 4 T 33 11 329337 CASAVA_Build 20 5526837 4I AAACCCCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 AAAC 3 4 329338 CASAVA_Build 20 5537269 1D AACAAGGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 11 9 A 11 10 329339 CASAVA_Build 20 5541938 4D TTTATAGATC TTTA/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 13 2 TTTA 1 0 329340 CASAVA_Build 20 5578420 1I TCAGGAGTTC -/A AGACCAGCCT 1242 hom 15 het 7 0 4 3 A 1 2 329341 CASAVA_Build 20 5582771 1I TTCACATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 33 2 23 8 T 11 12 329342 CASAVA_Build 20 5583154 14D AAGCCTGTTT GGAATATGAAAGAG/-------------- GTCTGTGACT 2204 het 2204 ref 25 16 7 4 GGAATATGAAAGAG 1 0 329343 CASAVA_Build 20 5584742 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 A 13 12 329344 CASAVA_Build 20 5612287 1D CTCGTCTCTA C/- TAAAAATACA 3070 het 1403 hom 11 3 7 1 C 1 0 329345 CASAVA_Build 20 5620709 1D AGCACTTGGC A/- GTCTGATTGG 3070 het 3070 ref 47 22 17 8 A 1 0 329346 CASAVA_Build 20 5643251 3D ACAAACATAG CTA/--- CTACCATGCA 3070 het 3070 hom 48 17 26 6 CTA 2 1 329347 CASAVA_Build 20 5647461 1I GTCTCAAAAA -/C AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 329348 CASAVA_Build 20 5654640 1I TGTCTCAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 9 10 329349 CASAVA_Build 20 5655624 40D GCAACCATTT TATCATGACTATGTATCTTATGGGTCAGGTCAGGAATTCA/---------------------------------------- GAAAGAGCAA 3070 hom 66 het 20 0 22 3 TATCATGACTATGTATCTTATGGGTCAGGTCAGGAATTCA 1 0 329350 CASAVA_Build 20 5661232 1D CCTCTTAAAC A/- AAGGCCTGAG 3070 het 3070 hom 34 13 13 9 A 3 2 329351 CASAVA_Build 20 5670347 2D AAAAAATGAT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 11 9 329352 CASAVA_Build 20 5670507 1I CCGTATCCGG -/A AAAAAAAAAA 2146 hom 36 het 37 0 12 25 A 11 12 329353 CASAVA_Build 20 5690258 1I TCTTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 4 T 14 15 329354 CASAVA_Build 20 5702004 1I GAGAGTGGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 9 10 329355 CASAVA_Build 20 5710290 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 471 hom 16 1 11 4 T 7 8 329356 CASAVA_Build 20 5715541 8D TCTCAAGCCA GATCATTT/-------- GATCATTTGT 3070 hom 93 het 33 0 32 4 GATCATTT 2 1 329357 CASAVA_Build 20 5716942 3D ATATTCAGTA GTT/--- GTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 GTT 3 2 329358 CASAVA_Build 20 5717855 2D AAAGTTGTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 431 hom 21 1 12 9 T 16 14 329359 CASAVA_Build 20 5719897 9D AAATCTTAGC AAATAAATA/--------- AAAGTTATAA 3070 hom 57 het 21 0 20 2 AAATAAATA 1 0 329360 CASAVA_Build 20 5726213 3D CATCTCAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 149 het 55 0 48 9 AAG 4 3 329361 CASAVA_Build 20 5726956 1D CTCAGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2740 hom 27 het 14 0 9 5 T 13 12 329362 CASAVA_Build 20 5728664 5I GGTTCTCAAA -----/TGAAG GTGATTTTGT 3070 hom 105 het 38 0 32 6 TGAAG 0 1 329363 CASAVA_Build 20 5729332 3D AGACTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 4 A 17 14 329364 CASAVA_Build 20 5729504 4D TGTGTGTGTG CGTA/---- TGTCTATATC 3070 hom 96 het 33 0 33 1 CGTA 1 0 329365 CASAVA_Build 20 5736896 14I ACTGCACTCC --------------/AGCCTGGGTGACAG AGCAAGACTC 3070 hom 69 het 26 0 21 5 AGCCTGGGTGACAG 0 1 329366 CASAVA_Build 20 5740504 1D TGTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2373 hom 22 7 12 3 A 13 12 329367 CASAVA_Build 20 5755782 1I GAGTGGGCGT -/G GGCACCCACA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 2 3 329368 CASAVA_Build 20 5756543 1I TCATTCACTC -/T TTGTGGGTAG 3070 het 3070 hom 65 22 39 4 T 2 3 329369 CASAVA_Build 20 5756968 9I TTAGAACAGT ---------/GTGTAGTAG GTGATAGGTC 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 GTGTAGTAG 0 1 329370 CASAVA_Build 20 5757145 3D AGTCATTTCT TGA/--- TGACTCCATT 3070 het 3070 ref 39 18 15 8 TGA 2 1 329371 CASAVA_Build 20 5757748 9D GTCTCAACTC CTGGGCTCA/--------- ATCTATCTGC 3070 het 3070 ref 22 13 12 2 CTGGGCTCA 1 0 329372 CASAVA_Build 20 5758528 1I CTTCTTTAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 19 0 A 9 10 329373 CASAVA_Build 20 5759335 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 23 0 17 6 A 18 17 329374 CASAVA_Build 20 5761126 1I TTTAATTTTC -/T TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 T 6 7 329375 CASAVA_Build 20 5761693 5D TCCTCCTTCT CCTGA/----- CCTGGAGCTC 3070 het 3070 ref 32 16 10 8 CCTGA 1 0 329376 CASAVA_Build 20 5762454 1I AGAAAGAGAG -/A AGGGGGCAGG 3070 hom 98 het 42 0 34 8 A 1 2 329377 CASAVA_Build 20 5764742 1D CAACTGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 19 24 12 T 12 11 329378 CASAVA_Build 20 5765358 2D GGGAGGATCC CT/-- CTCTGGAAAA 3070 hom 116 het 45 0 38 8 CT 3 2 329379 CASAVA_Build 20 5766452 1D ATTTTTCTTA T/- TTTTTTGATA 3070 het 3070 ref 37 24 9 5 T 7 6 329380 CASAVA_Build 20 5769561 1I TTGCTATTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 47 het 38 1 29 8 T 8 9 329381 CASAVA_Build 20 5775737 1I CATATTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 26 16 11 T 10 11 329382 CASAVA_Build 20 5796220 5I TTAAACACTC -----/AAAAT AAAAAAATAA 3070 hom 79 het 33 0 27 6 AAAAT 0 1 329383 CASAVA_Build 20 5808648 3D GAAAGAAAAT GAG/--- GAGCGAAGTC 3070 het 3070 ref 39 25 13 2 GAG 2 1 329384 CASAVA_Build 20 5826612 1I TGTCTCTACA -/G AAAAAAAAAA 2744 het 2744 ref 26 14 9 3 G 0 1 329385 CASAVA_Build 20 5827793 2D CAATAACATC AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 39 0 35 5 A 10 8 329386 CASAVA_Build 20 5830945 3D CAATAAAAAC ACT/--- ACATTATTAT 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 ACT 1 0 329387 CASAVA_Build 20 5837338 1I ATAATATGCT -/A AAAAAATGTG 3070 het 3023 hom 24 8 11 5 A 6 7 329388 CASAVA_Build 20 5841133 1D TTGGAGTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 A 11 10 329389 CASAVA_Build 20 5848670 1I ATGACAGATG -/C CATTTCCCTG 3070 het 3070 ref 57 27 27 3 C 1 2 329390 CASAVA_Build 20 5858439 3D TCTGCCTGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 456 hom 28 5 10 14 T 13 10 329391 CASAVA_Build 20 5859278 24D AAATACTTGT CTCAGGGTTTGCTCCTGGGGGACC/------------------------ CTGACCTAAG 3070 het 3070 ref 37 27 14 3 CTCAGGGTTTGCTCCTGGGGGACC 1 0 329392 CASAVA_Build 20 5859589 2D TGGCAAATCT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 CA 9 8 329393 CASAVA_Build 20 5892766 1D TTTTAATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 618 hom 33 2 20 11 T 17 16 329394 CASAVA_Build 20 5894415 19D AAGTGCTGGT TTTACTTCTTAGAGTATGC/------------------- CTGTACCATT 3070 hom 90 het 29 0 31 3 TTTACTTCTTAGAGTATGC 1 0 329395 CASAVA_Build 20 5906972 1D TTTGTGATCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 7 329396 CASAVA_Build 20 5930834 2D CAATGCACTC TT/-- TTGCTTACAT 3070 hom 84 het 31 0 27 5 T 4 2 329397 CASAVA_Build 20 5934174 5I AAATTTAAAA -----/TAATT TAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 TAATT 0 1 329398 CASAVA_Build 20 5938727 1I TATGGGATTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1980 hom 35 9 19 7 G 0 1 329399 CASAVA_Build 20 5940677 1I GTCTGCTACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 T 11 12 329400 CASAVA_Build 20 5947930 3I TTTTGACCAG ---/TTA TTTTTAAGTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 TTA 0 1 329401 CASAVA_Build 20 5952285 1I AAAATCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 T 11 12 329402 CASAVA_Build 20 5957785 1I GAACCCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2675 hom 31 11 13 7 T 13 14 329403 CASAVA_Build 20 5961971 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 1721 het 874 hom 7 2 5 0 G 4 5 329404 CASAVA_Build 20 5968390 1D TTTTTTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2418 hom 32 9 12 11 A 15 14 329405 CASAVA_Build 20 6000253 1D TCCCCAGCCC T/- TCCTGGCTTC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 2 1 329406 CASAVA_Build 20 6002898 1I GGGCAAGGCT -/G GGGAAGGAAG 3070 hom 101 het 37 0 32 5 G 3 4 329407 CASAVA_Build 20 6004043 1I CATCAAGTAT -/A ATACGGTACA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 1 2 329408 CASAVA_Build 20 6006042 1D AGGAATGATG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 9 8 329409 CASAVA_Build 20 6006636 2D CTGCAGGCTC TT/-- TAATGAATAA 3070 het 3070 hom 27 8 12 9 T 3 1 329410 CASAVA_Build 20 6009914 2D GCCTCTAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 14 14 A 14 12 329411 CASAVA_Build 20 6040323 1I AGAAAGAAAG -/C CCTCAATCTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 C 2 3 329412 CASAVA_Build 20 6072085 1D ACAATCTTTT A/- AAAAAAACTT 2856 het 2856 ref 37 21 10 6 A 8 7 329413 CASAVA_Build 20 6078141 1I TTGTTTCTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 T 9 10 329414 CASAVA_Build 20 6088312 2I CTATATGTAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 54 26 13 15 GT 8 9 329415 CASAVA_Build 20 6111014 2D AACTGAAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 731 hom 37 4 13 21 T 14 12 329416 CASAVA_Build 20 6111150 4D ACCTCTGAGC ATTT/---- ATTTCATGGG 3070 hom 114 het 40 0 37 5 ATTT 2 1 329417 CASAVA_Build 20 6117159 1I ATTGCAAGAC -/T CTTAAGAACC 3070 hom 111 het 48 0 38 10 T 0 1 329418 CASAVA_Build 20 6134523 1I AAAAAATGTG -/C TTTTTAATCA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 0 1 329419 CASAVA_Build 20 6134629 1I TCATCACCTC -/A AAACATTTAT 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 A 3 4 329420 CASAVA_Build 20 6137873 3I TTCCTCCCTC ---/CTT CTTTCCCTCT 3070 het 3070 hom 56 23 23 10 CTT 1 2 329421 CASAVA_Build 20 6138125 2I CCTGCCTCTC --/TT TCTTTCCTCC 542 het 542 ref 27 18 3 6 T 1 3 329422 CASAVA_Build 20 6138212 8I CTTTCCTCTC --------/TCTTTCTT TCTTTCAACC 1742 het 1742 ref 22 10 5 7 TCTT 1 3 329423 CASAVA_Build 20 6138922 1I CATAAGTACA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 16 10 T 2 3 329424 CASAVA_Build 20 6145006 1D ATGTAGCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2690 hom 40 10 15 16 A 12 11 329425 CASAVA_Build 20 6150428 1I AAATCCTTTC -/T TTTCCCCCTA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 3 4 329426 CASAVA_Build 20 6159245 1D TGATTTCCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 19 10 6 T 10 9 329427 CASAVA_Build 20 6180720 1I GTACCTCAAT -/A AAGTACTGTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 2 3 329428 CASAVA_Build 20 6195484 1I ATTTACAGGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 A 9 10 329429 CASAVA_Build 20 6216375 1D GTTAGGCAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 9 8 329430 CASAVA_Build 20 6217266 1D AAACTCTTAG A/- AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 A 7 6 329431 CASAVA_Build 20 6231527 1D TTTCAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 16 13 T 11 10 329432 CASAVA_Build 20 6233366 8I AACTGAGCAT --------/TGCTACTA TAGACAGAAA 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 TGCTACTA 0 1 329433 CASAVA_Build 20 6236300 3I CAATGGGTGT ---/TGA TGATGCAAAG 3070 het 3070 ref 56 30 23 3 TGA 1 2 329434 CASAVA_Build 20 6236733 1D AATGGCTCAA T/- TTTATCAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 T 4 3 329435 CASAVA_Build 20 6241813 1I GAAAAGAAAG -/A AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 4 5 329436 CASAVA_Build 20 6280222 1D ATTATTTCTG T/- TTTTTTTTTT 1709 het 1276 hom 21 6 7 8 T 14 13 329437 CASAVA_Build 20 6282228 1D TATTGTAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 A 10 9 329438 CASAVA_Build 20 6293190 1I TTGTTTTCAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 8 9 329439 CASAVA_Build 20 6294427 24D CTATTCTCTA TCTTTAATTTAATAGATAGATATC/------------------------ TCTATCTATG 3070 het 3070 ref 29 21 11 3 TCTTTAATTTAATAGATAGATATC 1 0 329440 CASAVA_Build 20 6312215 5D CTTTACAAAA CTCTT/----- CTAGAGAATT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CTCTT 1 0 329441 CASAVA_Build 20 6338975 2D TGCCTACCTT AA/-- ACACATAATT 3070 hom 154 het 59 0 52 7 A 3 1 329442 CASAVA_Build 20 6345596 1I ACCATTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1574 hom 38 6 17 15 T 13 14 329443 CASAVA_Build 20 6349101 1I TCAAAAAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 9 10 329444 CASAVA_Build 20 6351093 1D TAACTCTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 35 1 32 2 T 11 10 329445 CASAVA_Build 20 6354759 1I CTCTCCCCTC -/T TTTTTTCTCC 3070 hom 88 het 37 0 30 7 T 6 7 329446 CASAVA_Build 20 6358889 18D TCTCCACTCC AGGGCTTGGCCCTGGAGT/------------------ ATTGTTACAG 3070 het 3070 ref 48 27 22 7 AGGGCTTGGCCCTGGAGT 1 0 329447 CASAVA_Build 20 6368614 1I TTGGAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 11 12 329448 CASAVA_Build 20 6376682 1D GTGGGCCACC A/- ACAGTGTCTA 3070 het 3070 ref 53 26 21 7 A 2 1 329449 CASAVA_Build 20 6378457 1I AATATTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 10 11 329450 CASAVA_Build 20 6386084 1D ACAGATATAT A/- AAAAATGCTC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 6 5 329451 CASAVA_Build 20 6388155 1D AATCAGCAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 A 10 9 329452 CASAVA_Build 20 6389904 1I AATTAAATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 9 10 329453 CASAVA_Build 20 6395486 1I TTTGAATTTC -/A AAATATTTTC 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 A 3 4 329454 CASAVA_Build 20 6396180 5D ATCTCGAAAT AATAA/----- AATAAAATAA 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 AATAA 4 3 329455 CASAVA_Build 20 6404953 2D AATGATGTCA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 5 hom 30 1 15 14 T 10 8 329456 CASAVA_Build 20 6406186 1D AATAAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 A 10 9 329457 CASAVA_Build 20 6407293 1I ATCCTATCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 A 9 10 329458 CASAVA_Build 20 6410210 1I AAGAACTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3037 hom 38 10 18 10 A 11 12 329459 CASAVA_Build 20 6421905 29D CCCTAATTCT AGGTGAAATTTTCTTTTCTGTTTTTTTAA/----------------------------- AGGTGTTATT 3070 het 3070 ref 40 21 20 9 AGGTGAAATTTTCTTTTCTGTTTTTTTAA 1 0 329460 CASAVA_Build 20 6427140 1D TGCCTGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 43 0 33 10 T 11 10 329461 CASAVA_Build 20 6429087 4I TGTTCCTCTT ----/TGTC TGTCAGAGCA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TGTC 1 2 329462 CASAVA_Build 20 6434158 1I GTGTAGTGGA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 8 9 329463 CASAVA_Build 20 6436179 3D AGCTACTTGC TTG/--- TTGTTGAAAG 3070 het 3070 ref 41 21 19 2 TTG 3 2 329464 CASAVA_Build 20 6468041 1D ATGTACTCCC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 T 8 7 329465 CASAVA_Build 20 6468176 2I TACTTAAGAC --/TT TTTCTATTGA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 3 5 329466 CASAVA_Build 20 6476567 1I CAGAAAAAAA -/C AATGGAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 C 0 1 329467 CASAVA_Build 20 6479644 1D AGATAAAGTG T/- TTAATTCATG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 3 2 329468 CASAVA_Build 20 6491214 1D AAAGACAGGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 38 9 22 7 T 7 6 329469 CASAVA_Build 20 6511758 5I CAGTTAAGTT -----/TACAA TACACATCAC 3070 het 3070 ref 55 26 22 7 TACAA 0 1 329470 CASAVA_Build 20 6533233 1I CAAACCCATC -/T TCCTAAAATC 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 T 1 2 329471 CASAVA_Build 20 6534715 4D TTCCTTCCTT CCTC/---- CCTCCCTCCC 625 het 208 hom 6 1 3 2 CCTC 5 4 329472 CASAVA_Build 20 6538624 6I GAGTTATCTC ------/CTGCTT CTGCTGTCAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 CTGCTT 0 1 329473 CASAVA_Build 20 6550226 1I CTTTTTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 11 12 329474 CASAVA_Build 20 6551636 1I TAGTCAAGCC -/A AAAATCACAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 4 5 329475 CASAVA_Build 20 6557610 7I TTTTGATGCT -------/GGAGGAG TTCTGGCTTG 3070 het 2709 hom 23 6 11 6 GGAGGAG 0 1 329476 CASAVA_Build 20 6567420 1D AAAAATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1875 hom 30 8 10 12 T 17 16 329477 CASAVA_Build 20 6571110 1I ACAATTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 698 hom 35 2 23 10 T 11 12 329478 CASAVA_Build 20 6573389 1I TGAGGGCACG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 6 7 329479 CASAVA_Build 20 6576333 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1622 hom 21 6 12 3 T 12 11 329480 CASAVA_Build 20 6585542 1D TACATACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 33 1 20 12 T 15 14 329481 CASAVA_Build 20 6587947 1D AAACAGCAAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 83 het 32 0 28 4 A 8 7 329482 CASAVA_Build 20 6592453 5I TAAAAGGCAC -----/TGTAG TGTAGCATAG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 TGTAG 1 2 329483 CASAVA_Build 20 6595281 1I GCACTTCCAC -/T TTTTTTTTTT 2429 het 2429 ref 30 15 9 6 T 15 16 329484 CASAVA_Build 20 6595435 2I GATACTGAGA --/TC TTCTAAGTAG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TC 0 1 329485 CASAVA_Build 20 6604931 3D CTGTTTAACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 13 10 329486 CASAVA_Build 20 6613283 2D CGGGGAGAAA CT/-- CTACAAAACA 3070 het 3070 hom 40 18 19 6 CT 2 1 329487 CASAVA_Build 20 6616239 1D CTGGAGAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 144 het 54 0 49 8 T 10 9 329488 CASAVA_Build 20 6616896 3D GATTAAGATC TCT/--- GGGGAATCTA 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 TCT 1 0 329489 CASAVA_Build 20 6620009 1D GGTACCATGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 A 10 9 329490 CASAVA_Build 20 6621044 1D GTTATTTAAA G/- GAAACGGTGA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 G 2 1 329491 CASAVA_Build 20 6638401 1I TAATACATTT -/G GTATGCCCTG 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 G 1 2 329492 CASAVA_Build 20 6645399 11I AAGTTTCTGT -----------/TCCCACGTCAC TCGTGATCTA 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 TCCCACGTCAC 0 1 329493 CASAVA_Build 20 6655812 1D AGCCTGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 14 10 T 13 12 329494 CASAVA_Build 20 6665402 1I TCTCTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 682 hom 36 3 28 5 A 10 11 329495 CASAVA_Build 20 6681750 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1805 hom 16 5 9 2 A 10 9 329496 CASAVA_Build 20 6686015 4D TCATTGAATG AATA/---- AATAAAGCAA 3070 het 3070 hom 36 18 14 7 AATA 2 1 329497 CASAVA_Build 20 6711475 1D TACTTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2184 het 2184 ref 32 21 7 5 A 15 14 329498 CASAVA_Build 20 6717103 1I TTTACCTCCT -/C TGGTCTTCGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 329499 CASAVA_Build 20 6720754 2I AAAAAAAACC --/AG AGTCTTTACC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AG 1 2 329500 CASAVA_Build 20 6723584 1D TCAGATGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 T 13 12 329501 CASAVA_Build 20 6724292 1I ATCTTTTTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 8 9 329502 CASAVA_Build 20 6731522 2D TTCTTCTTCT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 10 11 1 TC 1 0 329503 CASAVA_Build 20 6735895 1I CCCAGCAGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 31 het 14 0 9 5 T 9 10 329504 CASAVA_Build 20 6746438 1I TGAAAATAAT -/G AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 G 0 1 329505 CASAVA_Build 20 6748750 1I TATGGTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1596 hom 32 7 13 12 T 12 13 329506 CASAVA_Build 20 6753873 2D GTTTTTTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 39 3 16 20 A 14 12 329507 CASAVA_Build 20 6755140 1I TAGACTTGCT -/C ATTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 22 15 8 C 0 1 329508 CASAVA_Build 20 6788200 1D AATATCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 33 1 27 6 A 11 10 329509 CASAVA_Build 20 6791795 1I GACTTATTAA -/T TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 6 7 329510 CASAVA_Build 20 6794644 1D AGTGGAGATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 10 9 329511 CASAVA_Build 20 6795705 1D GTTCATGTCA T/- TTTTCCTAGT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 T 5 4 329512 CASAVA_Build 20 6801256 2D AAATCAGTAA GT/-- GTGCTGCATT 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 GT 2 1 329513 CASAVA_Build 20 6804348 3I TCCTTTTCTT ---/GCG GTAAGTCTGA 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 GCG 0 1 329514 CASAVA_Build 20 6804771 20I TGAGGGCTTT --------------------/CTTTTACTGTCAGTGCCCAC TCAGCTCACA 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 CTTTTACTGTCAGTGCCCAC 0 1 329515 CASAVA_Build 20 6822638 2D TCTTCTAACC TA/-- TATATATATA 3070 hom 61 het 31 0 20 11 TA 9 8 329516 CASAVA_Build 20 6830700 1D CCCAAATAAA C/- CACTTGAACT 3070 hom 163 het 60 0 55 5 C 2 1 329517 CASAVA_Build 20 6842903 1D29M1D ATTAGCGTTG AAAAAAAAAAACAACAAACAAATTCCATCCA/-AAAAAAAAAACAACAAACAAATTCCATCC- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 39 20 17 10 N/A 0 0 329518 CASAVA_Build 20 6851393 1D TATTTTCTTT C/- CAATTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 C 2 1 329519 CASAVA_Build 20 6856747 1D GTGGGAGGGT C/- TATGAAGTTT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 1 0 329520 CASAVA_Build 20 6862444 4I CCTTTATTTT ----/TCTA TCTATAATAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 TCTA 1 2 329521 CASAVA_Build 20 6863006 1I TGCTATACAG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 8 9 329522 CASAVA_Build 20 6867092 1I ATATATGTGG -/T TTTTTTTTTC 1491 het 1491 ref 26 19 4 3 T 9 10 329523 CASAVA_Build 20 6867147 4I GAGATGGAGT ----/CTGG CTCTGTCGCC 3070 het 3070 ref 29 17 7 7 CTGG 0 1 329524 CASAVA_Build 20 6872320 1D TGTCTTTAGC T/- GCAGGTGCAG 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 T 1 0 329525 CASAVA_Build 20 6873815 12D ATATATGTAT ATATATACACAC/------------ ATATGTATGT 3070 het 3070 hom 39 13 24 8 ATATATACACAC 1 0 329526 CASAVA_Build 20 6875291 1I TACATGAGGT -/A AAAAATTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 5 6 329527 CASAVA_Build 20 6877368 2I TATTGATGAC --/TT AGTATACACA 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 0 2 329528 CASAVA_Build 20 6880067 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 A 15 16 329529 CASAVA_Build 20 6885574 6D TGCTTTTCAA TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 3070 het 973 hom 36 7 15 17 TC 9 6 329530 CASAVA_Build 20 6889407 1I GACCTGAAAT -/G AGTCCCTGAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 0 1 329531 CASAVA_Build 20 6905574 1D TTCTTTGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 250 hom 26 3 18 5 A 13 12 329532 CASAVA_Build 20 6915836 8D GTCAAAAAGT AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 1201 hom 26 6 20 4 A 22 14 329533 CASAVA_Build 20 6916824 3D CATATTAAAA TGT/--- TGTCAAAATG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TGT 2 1 329534 CASAVA_Build 20 6917240 1I AAATTAAATT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 9 329535 CASAVA_Build 20 6920420 1D TTTGTCTCAC A/- AGGATGATGT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 2 1 329536 CASAVA_Build 20 6940879 1I TTGGTACGTA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 386 hom 45 1 38 6 T 7 8 329537 CASAVA_Build 20 6945933 1I TAGAAAGGTC -/A TTTTTTTTGT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 A 0 1 329538 CASAVA_Build 20 6948980 10D ACTGGATCAC TTAATAGGAG/---------- TTAGCAATCT 3070 het 3070 hom 47 24 23 4 TTAATAGGAG 1 0 329539 CASAVA_Build 20 6950980 2D CAAAAAAAAA AC/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AC 1 0 329540 CASAVA_Build 20 6953207 1D CTTTCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 265 hom 35 1 29 5 T 12 11 329541 CASAVA_Build 20 6954059 2D TATTTGGGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 36 1 27 8 T 12 10 329542 CASAVA_Build 20 6955385 1D AAAGTGGTAC A/- AAAAAATGGA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 A 7 6 329543 CASAVA_Build 20 6956659 2D CAATTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 27 0 19 8 T 14 12 329544 CASAVA_Build 20 6964769 7D CTCTCCTCTC TTTTTTG/------- TTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 38 19 16 9 TTTTTTG 2 1 329545 CASAVA_Build 20 6972558 2I GATATATATA --/TC TTGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 TC 0 1 329546 CASAVA_Build 20 6973235 6I TATTTCTTTC ------/TTTTTT TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 32 0 17 15 T 8 14 329547 CASAVA_Build 20 6982839 10D AATATACATT TTTTCTTATA/---------- TTTTCTTGTA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TTTTCTTATA 1 0 329548 CASAVA_Build 20 6982927 1D AGTTGTTTTT A/- AAATCATTCT 3070 hom 75 het 27 0 26 3 A 4 3 329549 CASAVA_Build 20 6983038 3D ATTACCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 6 T 13 10 329550 CASAVA_Build 20 6999659 1I ACATTTCCTA -/T TCAAAGTGTC 3070 hom 115 het 46 0 37 9 T 1 2 329551 CASAVA_Build 20 7026890 1I GCAGATTTAA -/C CCAAAGAAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 2 3 329552 CASAVA_Build 20 7044306 1I AGTTTATAAG -/T TTTTTTTTTT 2688 het 2688 ref 39 23 7 9 T 15 16 329553 CASAVA_Build 20 7095237 1D ATCTTTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 11 10 329554 CASAVA_Build 20 7101171 1I TTGTCTCATG -/T TTTTCAACAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 4 5 329555 CASAVA_Build 20 7115715 1D ACAATACGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 39 0 29 10 T 11 10 329556 CASAVA_Build 20 7123056 1I GCTGTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 484 hom 21 2 14 5 A 10 11 329557 CASAVA_Build 20 7124101 1D GTCTCAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 900 hom 47 2 33 13 A 13 12 329558 CASAVA_Build 20 7126301 1D TCTAGTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 11 10 329559 CASAVA_Build 20 7131707 1D GGGTGTGTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 9 8 329560 CASAVA_Build 20 7153634 1D TCATATGTGG C/- CTTTATTATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 2 1 329561 CASAVA_Build 20 7156238 4D CTGTAACTCC TTTT/---- TTTTTTATTA 1177 hom 15 het 16 0 6 11 T 10 6 329562 CASAVA_Build 20 7157025 1I TATTTTGGAG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 7 8 329563 CASAVA_Build 20 7157520 1D AGCCTGTGGC T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 8 7 329564 CASAVA_Build 20 7171168 1D AAATAAAAAT C/- TTTTGCCTAA 3070 het 3070 ref 32 17 15 0 C 1 0 329565 CASAVA_Build 20 7185879 2D TTGAAAGAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 34 0 28 6 A 13 11 329566 CASAVA_Build 20 7200861 1D GTGTTTCTAT A/- AATGAGACCC 3070 het 3070 hom 45 20 24 1 A 3 2 329567 CASAVA_Build 20 7201861 1D CAAAAAAGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 31 13 15 3 A 10 9 329568 CASAVA_Build 20 7204974 1I CATTTGTATT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 7 8 329569 CASAVA_Build 20 7208001 1I CCTCTCTAGG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 T 6 7 329570 CASAVA_Build 20 7217783 11I3M1D AGCACCTATG -----------GCAT/TTTAGGCAACAGCA- CCTAAACTTT 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 N/A 0 0 329571 CASAVA_Build 20 7218416 1I GTTGCTGTAG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 A 7 8 329572 CASAVA_Build 20 7218511 1I GTGAAAAAGG -/A AAAAGAAAAA 3070 het 743 hom 35 3 29 3 A 4 5 329573 CASAVA_Build 20 7221034 1I TCAAGAAATT -/A TAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 0 1 329574 CASAVA_Build 20 7225484 1D ACATTTTAAT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 9 6 G 2 1 329575 CASAVA_Build 20 7225638 2D CGCTTTCATT TA/-- GTTAGATCTC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 TA 1 0 329576 CASAVA_Build 20 7226234 2I GTACAATAGC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 47 18 19 10 T 9 11 329577 CASAVA_Build 20 7227503 1D TTCCCTCCTA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 42 het 26 0 15 11 T 9 8 329578 CASAVA_Build 20 7230703 1D ATTTATCAGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 T 9 8 329579 CASAVA_Build 20 7260496 2D GGTGGAGCAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 20 8 8 5 GA 6 5 329580 CASAVA_Build 20 7273695 1I TTTTTTGTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 9 10 329581 CASAVA_Build 20 7279190 1D ACAGATAAGC A/- AGACCATGTT 3070 het 3070 ref 51 32 13 7 A 2 1 329582 CASAVA_Build 20 7285383 1D AGCATTGTTA C/- CCTGACTATT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 C 3 2 329583 CASAVA_Build 20 7295564 1D TTTTAACTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 28 8 14 6 T 9 8 329584 CASAVA_Build 20 7302346 1D GTTTCATGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1703 hom 36 8 12 16 T 17 16 329585 CASAVA_Build 20 7304709 9D TATCGTTTTT TTAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 10 5 TTAAAAAAA 1 0 329586 CASAVA_Build 20 7317002 2D AGTACTCATA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 15 het 32 1 19 12 AC 15 14 329587 CASAVA_Build 20 7323376 1D TTCTCAATCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 135 het 50 0 46 5 T 9 8 329588 CASAVA_Build 20 7328800 1D TATGAATAAC T/- AAGTCTGAAT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 1 0 329589 CASAVA_Build 20 7340998 1D GCATTTGTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 61 het 24 0 21 4 T 10 9 329590 CASAVA_Build 20 7373244 1D GAAGTGACAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 9 8 329591 CASAVA_Build 20 7373946 1D AGTATTCTTT G/- GGTTGAGAAA 3070 hom 71 het 27 0 23 5 G 3 2 329592 CASAVA_Build 20 7377037 1D TCTGCATTCA G/- TGTAATGTTG 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 1 0 329593 CASAVA_Build 20 7381625 5I TATAAAATGT -----/TATAA TATATAAAAC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 TATAA 0 1 329594 CASAVA_Build 20 7382531 1I GCTAATATCC -/A AAAAAAAAAG 716 het 716 ref 40 29 2 9 A 9 10 329595 CASAVA_Build 20 7383956 1I AGAGAGTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 31 2 25 4 A 11 12 329596 CASAVA_Build 20 7389502 1D AGGGATTGCA T/- TTTGGATGCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 4 3 329597 CASAVA_Build 20 7390430 1I ATTTTTCCAC -/A AAAAAAGTGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 6 7 329598 CASAVA_Build 20 7392444 1I GCTGTACTTC -/A ATTTAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 1 2 329599 CASAVA_Build 20 7395292 5I GTGTTCCACA -----/ACTTT ACTGAATCTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ACTTT 0 1 329600 CASAVA_Build 20 7396359 1I43M3D TTTAACTTTT -AAAAAAAAAACAACTTTTTGTTTCACTCATGTTTTATATTGTTTTC/AAAAAAAAAAACAACTTTTTGTTTCACTCATGTTTTATATTGTT--- TTCATTTCAA 3070 hom 96 het 29 0 33 6 N/A 0 0 329601 CASAVA_Build 20 7396915 1D TATAGTGCAG A/- TTAAGTCTAA 3070 hom 117 het 49 0 40 10 A 1 0 329602 CASAVA_Build 20 7397414 5I TATTTTGCTA -----/TTTGT TTTCTTTTTT 3070 hom 113 het 43 0 38 5 TTTGT 0 1 329603 CASAVA_Build 20 7398897 9I CGCCTGGCTA ---------/ATTTTTTGT ATTTTTAGTA 3070 hom 38 het 18 0 11 7 ATTTTTTGT 0 1 329604 CASAVA_Build 20 7408283 2D GTCTCTCTTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 99 het 38 0 33 7 CT 6 5 329605 CASAVA_Build 20 7409796 4D TTTACAAATT TATG/---- TATGTATGTA 3070 hom 117 het 43 0 40 7 TATG 3 2 329606 CASAVA_Build 20 7413585 1I AGACAAGGCA -/C CTTAAGGATG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 1 2 329607 CASAVA_Build 20 7413906 2I GTCTAAGTTG --/AA AAGTTTTTAA 3070 hom 99 het 34 0 34 1 A 2 4 329608 CASAVA_Build 20 7416028 1D ACAAATCCCT C/- CCCCCTAGAC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 6 5 329609 CASAVA_Build 20 7416618 1I TACCCTCCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 10 329610 CASAVA_Build 20 7416725 1I CAAAAGCAAT -/A ACGTAACCTT 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 1 2 329611 CASAVA_Build 20 7451683 1D CATCACTGGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 9 8 329612 CASAVA_Build 20 7457403 1I AAAGAAATCC -/G CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 32 9 13 10 G 0 1 329613 CASAVA_Build 20 7471659 2D ACTTTAAAAA AT/-- ATAGACAGTA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 AT 2 1 329614 CASAVA_Build 20 7474924 1I TAAAACTACT -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 6 7 329615 CASAVA_Build 20 7476207 2D ACATAAATAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 AT 7 6 329616 CASAVA_Build 20 7479521 1I GTTCTCCGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 8 18 3 A 9 10 329617 CASAVA_Build 20 7485996 1I TTTTAATATA -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 6 7 329618 CASAVA_Build 20 7500888 1D ATCTTACATG A/- AAAAAGATAT 3070 het 3070 hom 43 19 23 1 A 6 5 329619 CASAVA_Build 20 7505982 1I TTCTTACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 454 hom 22 1 16 5 A 11 12 329620 CASAVA_Build 20 7511020 1I AATTATTGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 8 9 329621 CASAVA_Build 20 7515626 1D ACACACATAT G/- TATATATACA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 G 1 0 329622 CASAVA_Build 20 7521840 1D TGTTAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 A 10 9 329623 CASAVA_Build 20 7524883 1D AGTTTGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 12 11 329624 CASAVA_Build 20 7549181 3I AATACTGAAA ---/ATG ATATTATAAA 3070 hom 123 het 54 0 42 12 ATG 0 1 329625 CASAVA_Build 20 7558003 8D CCATCTAAAC TGGTATTG/-------- TGACTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 5 TGGTATTG 1 0 329626 CASAVA_Build 20 7560703 1D TAAATTGAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 9 8 329627 CASAVA_Build 20 7567211 4I TTAATTTTCT ----/CTAA CTGAGAATAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CTAA 0 1 329628 CASAVA_Build 20 7570569 1I GTGCTTGTGA -/T TTTTTTTCTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 7 8 329629 CASAVA_Build 20 7580173 10D AAAGAAAGAG AGAAAGAAAT/---------- AGAGAGAGAG 3070 het 1282 hom 36 6 10 22 AGAAAGAAAT 1 0 329630 CASAVA_Build 20 7584262 1I AGAAGCACTG -/T TAAGTGTTAA 3070 het 3070 hom 56 22 30 4 T 1 2 329631 CASAVA_Build 20 7584374 1D ATGTTTTAGT G/- GGTGAATGAA 3070 het 3070 hom 55 23 28 5 G 3 2 329632 CASAVA_Build 20 7592878 1D TTCTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 T 11 10 329633 CASAVA_Build 20 7593069 1D TTTTGTATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 10 9 329634 CASAVA_Build 20 7593781 1D GCATCTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 11 10 329635 CASAVA_Build 20 7594709 4D TCAGAGTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 64 het 38 0 22 17 TTTG 5 4 329636 CASAVA_Build 20 7594745 1I CATTTCAAGA -/T TTTTTTTTTC 2282 het 1001 hom 28 3 7 18 T 9 10 329637 CASAVA_Build 20 7602260 3D CACTAACAAC TAT/--- TATTATTTCT 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 TAT 3 2 329638 CASAVA_Build 20 7605740 1I AGTATTGAAA -/G AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 G 0 1 329639 CASAVA_Build 20 7619748 1D AAGATCTAAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 8 7 329640 CASAVA_Build 20 7620133 6D TATAATGAAC CAACTA/------ AAATCAGTTA 3070 hom 93 het 33 0 31 3 CAACTA 1 0 329641 CASAVA_Build 20 7625223 6D TTCACTGTAC CTTACT/------ CTTACTCTGG 3070 hom 155 het 58 0 52 7 CTTACT 2 1 329642 CASAVA_Build 20 7626055 1I GTAAGTGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 32 1 25 6 T 9 10 329643 CASAVA_Build 20 7628618 1D GTTATCAATG A/- GTTGATAATA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 1 0 329644 CASAVA_Build 20 7635128 3I TCCAAGAGCT ---/GAC GACTGAAAGA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 GAC 1 2 329645 CASAVA_Build 20 7636385 5I GCTCATGTCA -----/TCAGC TCAGCTGCAT 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 TCAGC 1 2 329646 CASAVA_Build 20 7645581 1I TTACCACAAT -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 A 6 7 329647 CASAVA_Build 20 7647052 1I TAATTATAAT -/A TAAAAAAAAG 2432 het 1096 hom 10 3 6 1 A 0 1 329648 CASAVA_Build 20 7647170 1I62M4D AACTAATGAC -AAAAAAGAAAGATTTAAGTTGAAAATAGAAAAAAGTAGGACGTGTCTAAATATCAGTACAAGAATT/AAAAAAAGAAAGATTTAAGTTGAAAATAGAAAAAAGTAGGACGTGCCTAAATATCAGTATAAG---- AATAAAAAGT 3070 het 3070 ref 24 23 8 10 N/A 0 0 329649 CASAVA_Build 20 7647910 5I ATGCTGAGAA -----/AAAGC AAGTTGAAGA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 AAAGC 0 1 329650 CASAVA_Build 20 7666711 1I TCTTAACCCC -/T AGGTTGTTTA 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 T 0 1 329651 CASAVA_Build 20 7688488 4I TAAGATTATC ----/ATCA ATCAGATTTT 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 ATCA 1 2 329652 CASAVA_Build 20 7704416 2I ATCAAATGAC --/AT GTTTTCTTAG 3070 het 3070 ref 39 26 12 1 AT 0 1 329653 CASAVA_Build 20 7745260 2I GGGTTTTTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 13 15 329654 CASAVA_Build 20 7759095 3I TTCAAGGTAG ---/TAT TATAATGTAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAT 1 2 329655 CASAVA_Build 20 7767673 1D CACCCTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 39 1 28 10 A 12 11 329656 CASAVA_Build 20 7769812 2I GGCAGTTGAC --/TA TGAGAGTTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TA 0 1 329657 CASAVA_Build 20 7773680 4D CTTGAAGAGA ACAG/---- ACAATCTCCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ACAG 1 0 329658 CASAVA_Build 20 7780787 1D CAGAAGCAGG A/- AAAAAACAAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 7 6 329659 CASAVA_Build 20 7782064 1I TGACTTTCAG -/A AAATTTGTAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 329660 CASAVA_Build 20 7782898 11I ACCTTCCAGG -----------/CAAGGGATAGC CATATAGCAT 3070 hom 144 het 49 0 47 3 CAAGGGATAGC 0 1 329661 CASAVA_Build 20 7867026 1D AGTTGATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 44 0 36 9 T 11 10 329662 CASAVA_Build 20 7867752 1D GAGCAGAAAC T/- TTTAAATGAG 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 4 3 329663 CASAVA_Build 20 7891462 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAGAAAGAA 279 het 279 ref 26 7 4 15 AG 1 0 329664 CASAVA_Build 20 7894409 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 20 1 14 9 A 12 11 329665 CASAVA_Build 20 7894798 1D AGAGAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 11 10 329666 CASAVA_Build 20 7934659 1D GGCAGGGGGG T/- GTCTAATTGA 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 T 1 0 329667 CASAVA_Build 20 7940123 1D AAGTATCATT A/- AAAAAAAAAA 807 het 807 ref 45 39 2 5 A 11 10 329668 CASAVA_Build 20 7945636 1D TTATATACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 11 10 329669 CASAVA_Build 20 7949432 1D GAAATTTAAG A/- AAATGTCTTT 3070 het 3070 hom 46 21 22 4 A 4 3 329670 CASAVA_Build 20 7954463 1I CTTCATTAAG -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 7 8 329671 CASAVA_Build 20 7954756 4D37M5I GTTCTACAAA TAATTAAGAAAAAGATATTCAAACCAGCTGAAAAATATGGA-----/----TAAGAAAAAGATATTCAAACCAGCTGGAAAATATGGAATATT ATATTACTTA 3070 het 3070 ref 30 26 18 6 N/A 0 0 329672 CASAVA_Build 20 7955327 1I TATTTAATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 9 10 329673 CASAVA_Build 20 7960074 1D AATTAACAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 27 10 13 5 A 9 8 329674 CASAVA_Build 20 7961035 1I CATGTCCCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2538 hom 35 9 13 13 A 13 14 329675 CASAVA_Build 20 7976979 1D AGCATTCAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 A 9 8 329676 CASAVA_Build 20 7978652 6D GCACTCACCA CCATAC/------ CCAGCTAATT 3070 het 2011 hom 19 6 12 3 CCATAC 1 0 329677 CASAVA_Build 20 7982067 1D GACATCCCCC T/- CCCCCATATA 3070 hom 92 het 37 0 26 11 T 1 0 329678 CASAVA_Build 20 8012926 6D CAACTCTAGA CATATG/------ TATATACACA 3070 hom 99 het 36 0 34 5 CATATG 1 0 329679 CASAVA_Build 20 8022375 1D TAGAGGGATC G/- GGGTGGTGTC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 4 3 329680 CASAVA_Build 20 8024111 1I ACACAGCCAT -/A AGTTATTTGA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 2 329681 CASAVA_Build 20 8024606 1I GTTTTGTGGG -/T TTTTTTAATG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 6 7 329682 CASAVA_Build 20 8024746 23D CAGGATAAAG AGGCTTGAAGACCACTGAGCTCA/----------------------- ATAGCAGAGA 3070 hom 117 het 40 0 40 2 AGGCTTGAAGACCACTGAGCTCA 1 0 329683 CASAVA_Build 20 8027628 1I TCTTATATTG -/T TTTTCCCTAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 4 5 329684 CASAVA_Build 20 8028273 4D TTGATACTCC TTTG/---- TTTGTTTGGG 3070 hom 130 het 49 0 44 5 TTTG 3 2 329685 CASAVA_Build 20 8029580 4D ACAGAGAGAT AGAG/---- AGAGAGAGAA 3070 hom 88 het 37 0 30 7 AG 6 4 329686 CASAVA_Build 20 8033331 1I GCCTTTAAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 7 8 329687 CASAVA_Build 20 8049801 2I AGTATATATA --/AT ATATATATAT 2558 hom 15 het 7 0 6 1 AT 5 6 329688 CASAVA_Build 20 8055315 1I TTTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 10 11 329689 CASAVA_Build 20 8057833 1I AAAGAATGGG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 7 8 329690 CASAVA_Build 20 8060588 1D GTTGGGATCC A/- AAGACGCTCC 1330 het 1330 ref 22 9 6 7 A 3 2 329691 CASAVA_Build 20 8070270 1D CGATACTCCG A/- AAAAAAAAAA 451 het 451 ref 28 7 4 18 A 19 18 329692 CASAVA_Build 20 8095046 15I TTCTTTTCTT ---------------/GACTTTCTTTTTCTC GACTTTCTTT 3070 het 3070 hom 36 11 14 11 GACTTTCTTTTTCTC 1 2 329693 CASAVA_Build 20 8095061 2I8M3I TCTTTTTCTC --CTACCTCT---/GACTTTCTTTTTC TCCTACCTCT 1584 het 1584 ref 42 24 6 15 N/A 0 0 329694 CASAVA_Build 20 8104120 1I ATAAAAAAAA -/T AAGTATAAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 0 1 329695 CASAVA_Build 20 8111637 1D AAAAGAACTG T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 93 het 42 0 32 10 T 8 7 329696 CASAVA_Build 20 8130787 1I GGCAGTGGTG -/C CATCTCTGCT 3070 hom 126 het 44 0 42 2 C 1 2 329697 CASAVA_Build 20 8130875 1I45M1I CAGGCATGCG -CACCATGCCCAGCTAATTTTTGTAATTTTAGTAGTGATGGGGTTT-/CCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTAATTTTAGTAGTGATGGGGTTTC CCCATGTTGG 3070 hom 119 het 36 0 40 8 N/A 0 0 329698 CASAVA_Build 20 8137259 1D TTAGTATCAT G/- GCATCTGTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 2 1 329699 CASAVA_Build 20 8144958 1D TTTTAGGATA G/- GGAAAACATA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 3 2 329700 CASAVA_Build 20 8153027 5D ACCTAAACAT TAAAG/----- TATTTTGCTT 3070 hom 114 het 41 0 39 8 TAAAG 1 0 329701 CASAVA_Build 20 8161888 1I TATTCATCAA -/G TTGCTGGTCA 3070 hom 148 het 53 0 50 3 G 0 1 329702 CASAVA_Build 20 8180322 1I CATGTGCCCC -/T TTTAGGAGGC 3070 hom 154 het 57 0 52 5 T 3 4 329703 CASAVA_Build 20 8181110 1D GGAATGGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 48 16 25 7 A 10 9 329704 CASAVA_Build 20 8182853 1I ACATTTTGAA -/T GTCATCTAGT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 0 1 329705 CASAVA_Build 20 8183214 1D CTTAATCAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 A 9 8 329706 CASAVA_Build 20 8185913 1D CCAAGTCTAG A/- AAAAATCAGG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 6 5 329707 CASAVA_Build 20 8190896 1D GCCAGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 724 hom 20 4 9 7 T 11 10 329708 CASAVA_Build 20 8195871 1I TGGCTTTGTG -/C CCAGATCCCC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 C 2 3 329709 CASAVA_Build 20 8197485 1I TCTCTATGTA -/T TTTTTTTTAA 1882 het 1882 ref 17 8 6 3 T 8 9 329710 CASAVA_Build 20 8197694 1I CCTGGCTCTG -/C CACTTATTGA 3070 hom 57 het 21 0 19 3 C 1 2 329711 CASAVA_Build 20 8198544 1D CTTTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 1508 het 1508 ref 37 27 4 6 A 11 10 329712 CASAVA_Build 20 8203732 2D TTTCACAGGC TT/-- TTTGGTTTGA 3070 hom 93 het 34 0 32 3 T 5 3 329713 CASAVA_Build 20 8207620 1D CTATACAGTG T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 T 6 5 329714 CASAVA_Build 20 8209990 1D TTTTAATACA T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 7 6 329715 CASAVA_Build 20 8211580 10I GAGTTTATTT ----------/CTATCCCACA CTACTCTGAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 CTATCCCACA 0 1 329716 CASAVA_Build 20 8216901 2I TGGAGGCTAC --/AA AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 A 7 9 329717 CASAVA_Build 20 8222261 1I ACATAAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 21 7 T 10 11 329718 CASAVA_Build 20 8226712 1I GGAGGCCTAG -/C CAGGAGGATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 1 2 329719 CASAVA_Build 20 8227659 4I GTAGGTAGAT ----/AGAC AGACAGACTA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 AGAC 2 3 329720 CASAVA_Build 20 8248382 1I ACCCCATGGA -/G GGTGCATTAC 3070 hom 108 het 38 0 36 2 G 2 3 329721 CASAVA_Build 20 8301158 1D GGTAAAATGT A/- AAAAACAAAG 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 A 6 5 329722 CASAVA_Build 20 8311097 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 2083 hom 12 het 6 0 5 1 T 7 8 329723 CASAVA_Build 20 8356872 1D AGGGTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 24 8 T 12 11 329724 CASAVA_Build 20 8362617 1D TATGTGTTTG T/- TTTTTGCCCT 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 T 6 5 329725 CASAVA_Build 20 8362962 4I AGATCCTAAG ----/GTAT GTTTCACATA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 GTAT 0 1 329726 CASAVA_Build 20 8370175 4D AATAAGAAAT AATA/---- AATAATCTTT 3070 het 3070 ref 43 20 21 6 AATA 2 1 329727 CASAVA_Build 20 8374749 1I GAGACACAGC -/A AAAAAAAAGA 1978 het 1488 hom 10 3 5 2 A 8 9 329728 CASAVA_Build 20 8393508 1I TCCACCCACT -/C CCCCTCAGCC 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 C 4 5 329729 CASAVA_Build 20 8408962 2I GAGAAAAACA --/AC ACAGATTTGG 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AC 1 2 329730 CASAVA_Build 20 8424212 1I GGCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1095 het 842 hom 7 3 4 0 T 6 7 329731 CASAVA_Build 20 8424318 1I TGCTGGGATT -/A ACAGGCGTGA 3070 het 1242 hom 21 6 12 3 A 1 2 329732 CASAVA_Build 20 8449973 1D TATAAAAGGG A/- AAAAAAAAAA 2892 het 2868 hom 22 10 8 4 A 12 11 329733 CASAVA_Build 20 8453806 1D GAGAAGGGGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 A 9 8 329734 CASAVA_Build 20 8453904 1D ATATATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 A 11 10 329735 CASAVA_Build 20 8455592 1I AGAGCAGAGC -/A AAAACAGGGC 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 A 4 5 329736 CASAVA_Build 20 8458275 1D10M2D TATTTATTTT CTCAGTAGTTAAT/-TCAGTAGTTA-- ATACAAGCAT 3070 het 3070 hom 35 15 19 5 N/A 0 0 329737 CASAVA_Build 20 8472328 2I GTCACCCAAA --/TC TCATCTTGAA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 TC 1 2 329738 CASAVA_Build 20 8473532 1D AAAGAGAGGG T/- ATCTGTAACA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 T 1 0 329739 CASAVA_Build 20 8474835 1I GGTGGCGTAT -/G CCTGTAGTCC 1663 het 1663 ref 10 6 4 0 G 0 1 329740 CASAVA_Build 20 8474961 13D ACTCTATCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2275 hom 18 9 10 2 A 25 12 329741 CASAVA_Build 20 8475826 3D TTTCTTCAGG CTA/--- CTAAGCATCA 3070 het 3070 hom 38 14 18 7 CTA 2 1 329742 CASAVA_Build 20 8476207 2D TAACCCGTTC TA/-- TGTTCTGAAA 3070 het 3070 ref 53 24 20 12 TA 1 0 329743 CASAVA_Build 20 8476953 4D TTTCTTTCGT CTTC/---- CTTCCTTCCA 3070 het 3070 hom 30 10 18 3 CTTC 3 2 329744 CASAVA_Build 20 8477412 7D ACTTAATTTT ATGTTCC/------- ATGTTCTCAA 3070 hom 99 het 33 0 34 4 ATGTTCC 1 0 329745 CASAVA_Build 20 8484629 1I TCAGAAATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 329746 CASAVA_Build 20 8497309 1D TTATTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 11 10 329747 CASAVA_Build 20 8505110 2D TTTAGCAAAA GG/-- TTTGGAGATA 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 G 2 0 329748 CASAVA_Build 20 8508520 1D GAGCAAGGGG A/- AAAATGTGAG 3070 hom 129 het 50 0 42 9 A 5 4 329749 CASAVA_Build 20 8513346 1D CAAGATTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2467 hom 25 7 15 3 T 10 9 329750 CASAVA_Build 20 8515004 1D TTTATTATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 27 2 16 11 T 11 10 329751 CASAVA_Build 20 8515828 1D AATTAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 1 0 329752 CASAVA_Build 20 8517859 4I AACTCACTCC ----/TTCA TTCATTCAAC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TTCA 2 3 329753 CASAVA_Build 20 8550728 2I CATGGTGAAA --/CC CCGTCTCTAC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 C 2 4 329754 CASAVA_Build 20 8551416 1I AGATCTTTGA -/C TTGGGTCAGC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 C 0 1 329755 CASAVA_Build 20 8554825 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1942 het 20 hom 14 1 7 6 A 18 16 329756 CASAVA_Build 20 8555781 1I TGAAATGGGG -/T TTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 4 5 329757 CASAVA_Build 20 8564925 1D TTATTATATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 126 het 50 0 43 7 A 9 8 329758 CASAVA_Build 20 8567528 8I TGATTCTGTC --------/ACTCAGGA TTTGCATTTG 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 ACTCAGGA 0 1 329759 CASAVA_Build 20 8573961 2I TAAAAAAAAA --/AT TAAAAAAAAT 3070 het 2476 hom 22 8 12 2 AT 0 1 329760 CASAVA_Build 20 8577589 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 2745 het 2608 hom 20 7 9 5 A 13 12 329761 CASAVA_Build 20 8577665 3D TTAAATTTAT TAA/--- TAATGCAATG 3070 het 3070 ref 26 15 9 4 TAA 2 1 329762 CASAVA_Build 20 8579498 1I TTTTACTGAG -/A GGGGTGCAGG 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 0 1 329763 CASAVA_Build 20 8580327 2D CAAGGACAAT AG/-- AGTCTTCTGG 3070 het 3070 hom 42 17 17 9 AG 2 1 329764 CASAVA_Build 20 8612044 1I TTTCAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 7 9 A 10 11 329765 CASAVA_Build 20 8613965 2D AAAATGCAAC CA/-- CGGCTGACAT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 CA 1 0 329766 CASAVA_Build 20 8618796 2D TTTTTGCTGT TG/-- TTTTTTTTTT 2560 het 2560 ref 25 14 8 3 TG 1 0 329767 CASAVA_Build 20 8638834 1D CTCAGAGAGC T/- TTTTACTCAC 3070 het 3070 hom 38 15 17 7 T 5 4 329768 CASAVA_Build 20 8646724 1D AAAATTATCT G/- GGCATAGTGG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 G 3 2 329769 CASAVA_Build 20 8649494 2D CCCTCTCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2820 hom 29 10 16 4 T 12 10 329770 CASAVA_Build 20 8650590 4D ATGAAGGAGG GATA/---- GATAGTATAT 3070 het 3070 hom 29 11 14 7 GATA 2 1 329771 CASAVA_Build 20 8650809 1I CCAGTTTAGG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 6 7 329772 CASAVA_Build 20 8678604 1I CATTCAATAT -/A TTTTTTTTTA 2881 het 2881 ref 35 21 9 5 A 0 1 329773 CASAVA_Build 20 8681619 17I CAAAGCTTCA -----------------/TCTGTATTTATAGCTGC TCCCCATCAC 3070 het 3070 ref 39 26 8 7 TCTGTATTTATAGCTGC 0 1 329774 CASAVA_Build 20 8697660 4D TGAAGTTCTC TAAT/---- CAACAGCATT 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 TAAT 1 0 329775 CASAVA_Build 20 8698675 1D TCTCGGCTCA C/- TGCAAGCTCC 2345 hom 3 het 7 0 5 2 C 1 0 329776 CASAVA_Build 20 8703721 7D AAATTTTCCC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2693 het 1545 hom 30 8 8 16 T 23 16 329777 CASAVA_Build 20 8711782 2D ACAAACCAGC AA/-- AAAGTAATTG 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 A 5 3 329778 CASAVA_Build 20 8726059 2I CTAAGATTCC --/AT ATATATATTT 3070 hom 65 het 30 0 21 9 AT 4 5 329779 CASAVA_Build 20 8729392 1D TAGGTTTTGC A/- AAATACACAG 3070 het 3070 hom 39 14 20 7 A 4 3 329780 CASAVA_Build 20 8733086 1I AGCTTTCCAC -/A TATAAAAGAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 0 1 329781 CASAVA_Build 20 8760730 2I TTTAATTTTC --/AA AGAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 1 3 329782 CASAVA_Build 20 8763814 4D GTGGGAAGAG TAAA/---- ATTTCTAGGA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 TAAA 1 0 329783 CASAVA_Build 20 8764683 15D TCTTACCTAC CTGGCTGGCAGCTGA/--------------- CTGGCTGGCA 3070 het 3070 hom 50 21 20 18 CTGGCTGGCAGCTGA 1 0 329784 CASAVA_Build 20 8765304 1I AGAGATATAT -/A AAATATTACC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 A 3 4 329785 CASAVA_Build 20 8767405 2I CTTACTTGAC --/AT GTGCAGAAAA 3070 hom 166 het 62 0 56 6 AT 0 1 329786 CASAVA_Build 20 8773773 5I AAAAATAAAT -----/AAATA AAATAAAATA 2261 het 1643 hom 14 7 6 1 AAATA 3 4 329787 CASAVA_Build 20 8775860 2I AAGCTCAGGA --/TC TCACCACTTC 3070 het 3070 hom 42 13 21 8 TC 1 2 329788 CASAVA_Build 20 8777154 1I TACACAAGGC -/A CTCCTTATCA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 0 1 329789 CASAVA_Build 20 8779280 2D ATGAATGGGG AT/-- AGTGCCCTTA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 AT 1 0 329790 CASAVA_Build 20 8780360 1D CTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 20 9 T 13 12 329791 CASAVA_Build 20 8781756 1D GAAAAATGGC T/- TATCACAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 2 1 329792 CASAVA_Build 20 8784794 1I TATTCCTGTT -/C TTTTATATTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 C 0 1 329793 CASAVA_Build 20 8792496 6D GAAAACCCTA TTATAC/------ TTATAATCAT 3070 het 3070 ref 34 15 16 9 TTATAC 1 0 329794 CASAVA_Build 20 8797028 2D CAGGTCAATA AG/-- ACCCTGGGCC 3070 het 3070 ref 48 24 22 3 AG 1 0 329795 CASAVA_Build 20 8797837 3I TATTATCTTG ---/ATT ATTATTTTTT 3070 het 3070 hom 46 20 17 9 ATT 2 3 329796 CASAVA_Build 20 8801809 17I ATAGCATGTG -----------------/GTCCCATTTTCCCACAT GTCACTTTCC 3070 het 3070 hom 42 17 23 3 GTCCCATTTTCCCACAT 0 1 329797 CASAVA_Build 20 8804556 1I CTTCACTTAT -/G TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 G 0 1 329798 CASAVA_Build 20 8805701 4I AGGGGTGAAG ----/AATT AATTACTGCC 3070 het 3070 ref 53 27 22 4 AATT 1 2 329799 CASAVA_Build 20 8807944 3D TTTTGATGTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 12 29 11 A 15 12 329800 CASAVA_Build 20 8812449 4D ACTTAATAAA ACTT/---- AACTTCCAAT 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 ACTT 1 0 329801 CASAVA_Build 20 8814294 3D TTAAATGCAC AAT/--- AAGTTAATTG 3070 het 3070 ref 48 24 19 6 AAT 1 0 329802 CASAVA_Build 20 8845625 1I TCTCAAATAA -/C ATTTTATACA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 C 0 1 329803 CASAVA_Build 20 8846046 4I AGTTGTTGTC ----/TGTT TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 TGTT 2 3 329804 CASAVA_Build 20 8849188 7D AGATTTTGTT TGTTTGC/------- TGGTTGCATT 3070 hom 97 het 39 0 32 8 TGTTTGC 1 0 329805 CASAVA_Build 20 8850210 3D TCTCAATAAT AAC/--- TACAGCCCAT 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 AAC 1 0 329806 CASAVA_Build 20 8853673 1I GTTCCATGAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 9 10 329807 CASAVA_Build 20 8868282 3I TGACCTGAGC ---/AGA AGGAGTTGGC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AGA 0 1 329808 CASAVA_Build 20 8882069 1I CAAATTCCAG -/A TACTTAATAG 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 A 0 1 329809 CASAVA_Build 20 8892891 1I GTAGCCAGAG -/T TTGCCATGAC 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 2 3 329810 CASAVA_Build 20 8893687 1D CTGGAGGGAT G/- GGGATTCTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 G 4 3 329811 CASAVA_Build 20 8894145 1I CTCGCTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 26 0 20 6 A 11 12 329812 CASAVA_Build 20 8894795 14I CTCTAATGCA --------------/GTTTGGGAAATGCT GTTTTGAAGA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 GTTTGGGAAATGCT 0 1 329813 CASAVA_Build 20 8912144 1I GCTATCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 A 10 11 329814 CASAVA_Build 20 8921262 1D CATTTTCAAC A/- AAGGTACCGA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 A 3 2 329815 CASAVA_Build 20 8938726 1I CAATGAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 13 14 329816 CASAVA_Build 20 8947545 1D TGGTTTCATA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 9 8 329817 CASAVA_Build 20 8951820 3I GCTCACACCT ---/ATA ATAATCACAG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 ATA 1 2 329818 CASAVA_Build 20 8954185 4I CAAGTAAATA ----/AAAC AAACAGACAA 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 AAAC 1 2 329819 CASAVA_Build 20 8954377 2D TAGACGCTGG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 A 11 9 329820 CASAVA_Build 20 8959510 2D AGATATAGTT TA/-- TATATATATA 3070 het 1470 hom 21 4 12 5 TA 7 6 329821 CASAVA_Build 20 8964966 1I CTCCCGAGTT -/C AAGCGATTCT 2326 het 2326 ref 13 5 6 2 C 0 1 329822 CASAVA_Build 20 8969159 1I GGTTATTGGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 6 7 329823 CASAVA_Build 20 8977525 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3051 het 2536 hom 24 10 12 2 A 12 11 329824 CASAVA_Build 20 8978266 1D AGATGTGCTG T/- TTGTCTAGGC 3070 het 3070 ref 34 21 10 4 T 3 2 329825 CASAVA_Build 20 8979720 1D TCAATTTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 56 25 21 11 A 10 9 329826 CASAVA_Build 20 8980554 1I TTCTCAGATG -/A AAAATATCAC 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 4 5 329827 CASAVA_Build 20 8986920 2I CACCACCCCC --/CT GTTTTCTTGA 3070 hom 74 het 28 0 24 5 CT 0 1 329828 CASAVA_Build 20 9002539 1D TATTAAAAAA T/- AATAATAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 5 T 1 0 329829 CASAVA_Build 20 9005478 1D TTTCTTTTAA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 105 het 40 0 36 5 T 8 7 329830 CASAVA_Build 20 9007004 5I TCTTTTCTTC -----/TCTTT TCTTTTCTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TCTTT 2 3 329831 CASAVA_Build 20 9008479 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 32 0 31 1 T 10 9 329832 CASAVA_Build 20 9010758 1D CTGGAATTAG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 A 8 7 329833 CASAVA_Build 20 9012026 2D ACACACTCAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 98 het 51 0 30 21 AC 9 8 329834 CASAVA_Build 20 9012140 1D GCAATATTTT A/- AAAATGTTGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 5 4 329835 CASAVA_Build 20 9013165 1I TTTTTTTTTT -/G TGTGTGGGGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 G 0 1 329836 CASAVA_Build 20 9016077 4I CTTTGAATGA ----/TATT TTTTTTTTGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TATT 0 1 329837 CASAVA_Build 20 9016821 9D TTTTCTTTTC TTTTCTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 34 3 28 7 TTTTCTTTT 1 0 329838 CASAVA_Build 20 9019867 1D TGGTAGCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 10 9 329839 CASAVA_Build 20 9041532 3I CCTCTTGCCC ---/TTT TTTTTAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 5 8 329840 CASAVA_Build 20 9046952 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 10 11 329841 CASAVA_Build 20 9049108 4D TCTCTTCTTC CTTT/---- CTCTCTCTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CTTT 1 0 329842 CASAVA_Build 20 9049395 9D TTCCACGGCC AGGTGAATA/--------- ATGTCAAAAT 3070 hom 101 het 36 0 32 9 AGGTGAATA 1 0 329843 CASAVA_Build 20 9052068 1I AAATCTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 36 0 24 12 T 13 14 329844 CASAVA_Build 20 9062102 1I TTTACTAGAG -/A TGGGGTTTCA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 0 1 329845 CASAVA_Build 20 9066393 1D TTTTCTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 958 hom 39 4 23 12 T 17 16 329846 CASAVA_Build 20 9120528 1D ATTCTGTATG T/- TTTTTTTTTT 1110 het 1110 ref 34 27 3 4 T 15 14 329847 CASAVA_Build 20 9145322 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 T 7 6 329848 CASAVA_Build 20 9184579 2D ATTGCATAAC AT/-- ATATATATAT 1359 het 1359 ref 43 35 3 6 AT 7 6 329849 CASAVA_Build 20 9232758 1I TGTTTTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2016 hom 41 5 26 10 T 13 14 329850 CASAVA_Build 20 9233420 1I TTGAAGTCTG -/T TTTGTCTCAT 3070 hom 110 het 46 0 36 10 T 3 4 329851 CASAVA_Build 20 9239202 1I CTAAAAATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1617 hom 17 5 11 1 A 9 10 329852 CASAVA_Build 20 9260098 2D AAGTGATGGC GA/-- GAGAGAGGGC 3070 het 3070 ref 49 27 18 5 GA 4 3 329853 CASAVA_Build 20 9318507 1I CTCATTAACG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 9 10 329854 CASAVA_Build 20 9350282 1I TTTGGCCCTG -/C CCTCCTTTTG 3070 hom 184 het 66 0 62 4 C 2 3 329855 CASAVA_Build 20 9358709 4D TGAGCTATAA AAAT/---- AAATAAATAA 1632 het 1632 ref 13 8 4 1 AAAT 5 4 329856 CASAVA_Build 20 9363364 1I AAAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 9 10 329857 CASAVA_Build 20 9371027 1D TAGAGTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 11 10 329858 CASAVA_Build 20 9371168 1I TGAACCAAGA -/C CAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 C 1 2 329859 CASAVA_Build 20 9402862 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1274 het 1274 ref 26 8 5 13 A 15 16 329860 CASAVA_Build 20 9409900 1I GTTTTGTTTT -/G TTTTTTTTAA 3070 het 1333 hom 23 8 13 2 G 0 1 329861 CASAVA_Build 20 9446086 1I TTATTAGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 T 10 11 329862 CASAVA_Build 20 9446658 17I AATGAGGGTT -----------------/CTGCCAGCAGGAGGGGC CTAACTATTG 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 CTGCCAGCAGGAGGGGC 0 1 329863 CASAVA_Build 20 9447555 2I AGGGAGGGAA --/GG GGGTACCTGA 3070 hom 144 het 55 0 46 9 G 3 5 329864 CASAVA_Build 20 9449607 1I ACGCAGAGTT -/G GGTTCACTTA 3070 het 3070 ref 58 26 21 11 G 2 3 329865 CASAVA_Build 20 9498729 2I CTGTGAGTCT --/TA GTTTCCTTAT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 TA 0 1 329866 CASAVA_Build 20 9513637 1D TCTTAAAGGG C/- CCTTCTGAAT 3070 het 3070 ref 52 26 22 5 C 3 2 329867 CASAVA_Build 20 9516792 2D TAGAAGCCTT AG/-- AGTTATTGAT 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 AG 2 1 329868 CASAVA_Build 20 9519469 1D CAACCCAAAT A/- AACAACCCAA 3070 het 3070 hom 55 18 29 9 A 3 2 329869 CASAVA_Build 20 9537789 1I ACATGATGCT -/G GGGTGGGAAG 3070 hom 135 het 53 0 44 9 G 3 4 329870 CASAVA_Build 20 9550862 1I TAACCATTTT -/A GAGGTAATGC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 0 1 329871 CASAVA_Build 20 9558181 2D GTTGTTCTTG AA/-- CTGGTCTTGA 3070 hom 102 het 35 0 33 2 A 2 0 329872 CASAVA_Build 20 9564667 1D AAATAACTCC T/- TTCTGGCTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 3 2 329873 CASAVA_Build 20 9604552 4I ATTCTGTAAC ----/ACTT ACTTACAACA 3070 het 3070 ref 49 26 14 9 ACTT 1 2 329874 CASAVA_Build 20 9605188 1D AACAGGAAAG A/- AAACAGGATA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 4 3 329875 CASAVA_Build 20 9606701 2D CAAGATCCTG TC/-- TCTAGCCTCA 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 TC 2 1 329876 CASAVA_Build 20 9620846 1D GATATCAGGA C/- CTGTTTCATC 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 C 2 1 329877 CASAVA_Build 20 9633888 1I GTGTCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 10 11 329878 CASAVA_Build 20 9635120 1D CTACAAACTC T/- TTTTTTTTTT 2171 het 1504 hom 32 8 8 17 T 17 16 329879 CASAVA_Build 20 9637587 1I CCTTCCTCTG -/C CTCACATCCA 3070 het 3070 hom 59 22 29 8 C 1 2 329880 CASAVA_Build 20 9642281 4D CACTGAAAGA ATAG/---- ATAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 42 24 13 10 ATAG 1 0 329881 CASAVA_Build 20 9644807 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 17 0 12 5 A 13 12 329882 CASAVA_Build 20 9657412 1D CCTAGATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 48 3 29 16 T 12 11 329883 CASAVA_Build 20 9661298 1I CCACACACTT -/C CCCTTTCCTA 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 C 3 4 329884 CASAVA_Build 20 9667870 7D GTTCTTTCTT TGCTTTC/------- TTTTTTTTTT 341 het 341 ref 36 22 2 15 TGCTTTC 1 0 329885 CASAVA_Build 20 9689226 1D GATGGTTGAG A/- AAAAAAAAAA 2947 het 2947 ref 32 11 9 12 A 15 14 329886 CASAVA_Build 20 9697111 1D TATCTATAAT A/- AAAGTTGAAA 3070 het 3070 hom 22 8 12 3 A 4 3 329887 CASAVA_Build 20 9701117 3I TGCCATTGGT ---/CTA CAGAGGTCAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 CTA 0 1 329888 CASAVA_Build 20 9703919 1D TTTTAAGGGG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 A 8 7 329889 CASAVA_Build 20 9707116 1I AGACTCCTGG -/C CATCAACCAA 3070 het 3070 ref 53 23 21 9 C 1 2 329890 CASAVA_Build 20 9708003 12I TTGTCTAATA ------------/TATATATATAAT TATATATATA 2177 het 2177 ref 13 7 5 1 TATATATATAAT 0 1 329891 CASAVA_Build 20 9708136 1I TTCTGAGGAG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 22 14 8 0 T 8 9 329892 CASAVA_Build 20 9710364 1D CTATCCTTGA C/- CCCTTTCCCC 3070 hom 97 het 40 0 32 9 C 4 3 329893 CASAVA_Build 20 9711573 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2391 het 1756 hom 29 11 9 9 T 12 13 329894 CASAVA_Build 20 9713318 1I AAGCCTCAAA -/C TTTTGCAGGA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 0 1 329895 CASAVA_Build 20 9716632 1I TGTGTGTGTT -/G GGGGGGGGTA 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 G 8 9 329896 CASAVA_Build 20 9717246 1I ATCACCTTGC -/A AAAAAACAGC 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 A 6 7 329897 CASAVA_Build 20 9726901 1D GTTATGGGGT A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 A 8 7 329898 CASAVA_Build 20 9742747 12I GTGCATTCTA ------------/GGCAAGTAGAAT GGCAAGTGCA 3070 hom 129 het 50 0 43 7 GGCAAGTAGAAT 0 1 329899 CASAVA_Build 20 9749509 1D AACTGTAACA C/- TCAGGTTCAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 C 1 0 329900 CASAVA_Build 20 9754874 4D AAATTTCACA CTGT/---- CTGTGTTAAA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 CTGT 2 1 329901 CASAVA_Build 20 9755694 1D AATATTGGAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 8 7 329902 CASAVA_Build 20 9799170 1I2M2I TAAAAGAAAA -AT--/CATTC ATTTCAAATA 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 N/A 0 0 329903 CASAVA_Build 20 9801658 1D AAACATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1897 hom 32 8 11 13 T 17 16 329904 CASAVA_Build 20 9803274 1D TGAAACTACT G/- GGGTCTCTTG 3070 het 3070 hom 63 29 28 7 G 4 3 329905 CASAVA_Build 20 9804101 1I AGTTTCCAAC -/A AGATATTACA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 1 2 329906 CASAVA_Build 20 9806129 1D GAAATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 11 10 329907 CASAVA_Build 20 9811737 1I GATTGTATGG -/T TTTTGTCCTT 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 T 4 5 329908 CASAVA_Build 20 9813041 2D GTAGCTATTA CT/-- TGGGAGCTGT 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 CT 1 0 329909 CASAVA_Build 20 9813310 3D CAAGGAAGAG GAA/--- GAAGAAGGAG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 GAA 3 2 329910 CASAVA_Build 20 9816071 2I GTAAACCATG --/CT GTAAACAGAT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 CT 0 1 329911 CASAVA_Build 20 9817473 1D AAAACATAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 A 10 9 329912 CASAVA_Build 20 9818681 1I AATTTTGTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 8 9 329913 CASAVA_Build 20 9834191 1D TACTAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 135 het 49 0 45 4 A 10 9 329914 CASAVA_Build 20 9834529 1D TTCTTATGGT G/- GGGGAGAAGA 3070 hom 140 het 51 0 47 6 G 5 4 329915 CASAVA_Build 20 9835189 1I TTCTGCCTGC -/T TTTACATTTG 3070 hom 71 het 29 0 20 9 T 3 4 329916 CASAVA_Build 20 9838443 8D GGTTATTATT CTCAATTC/-------- CTCAATTCCT 3070 hom 89 het 40 0 28 17 CTCAATTC 3 2 329917 CASAVA_Build 20 9846676 6D TCTGCTAATT ATTCTC/------ ATTCATTTTA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 ATTCTC 1 0 329918 CASAVA_Build 20 9852637 1D CAAAGTGAGT G/- GATCACGAGG 3070 hom 105 het 38 0 35 4 G 2 1 329919 CASAVA_Build 20 9862243 3I GTTTTAAAGC ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 9 12 329920 CASAVA_Build 20 9870175 18D CACTTGGCCA CCTGTGATTGGCCGAAAC/------------------ CCTGTGATTG 3070 hom 126 het 43 0 43 4 CCTGTGATTGGCCGAAAC 2 1 329921 CASAVA_Build 20 9875675 1D CTCTCCTCTA T/- TTTTTCTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 6 5 329922 CASAVA_Build 20 9878741 1I ATATAGTCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 9 329923 CASAVA_Build 20 9880512 5D CAGGAGTTCA AGACC/----- AGCCTGGCCA 1834 het 1834 ref 21 8 7 9 AGACC 1 0 329924 CASAVA_Build 20 9887907 1D TCCAAATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 11 10 329925 CASAVA_Build 20 9891055 15D GGCCTTATGA AGAGTACAAGAATTG/--------------- AGAATGGCCT 3070 het 3070 ref 42 23 19 7 AGAGTACAAGAATTG 1 0 329926 CASAVA_Build 20 9898574 16I AATGTGTGTC ----------------/ATTCCTATAATAAAAT AAAGTCAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 14 1 ATTCCTATAATAAAAT 0 1 329927 CASAVA_Build 20 9908143 1I TATGCTAAAC -/A AAAAAAGCAG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 6 7 329928 CASAVA_Build 20 9914909 1D AGGGAGATGG A/- AAAAAAACTT 3070 het 2842 hom 25 9 11 5 A 8 7 329929 CASAVA_Build 20 9916447 1I AGATTCCATT -/C CCCCCCTCCA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 C 6 7 329930 CASAVA_Build 20 9937871 16I ATTACACTTC ----------------/TAGGCTGCCTTGCATA TAGGCAGAGC 3070 hom 99 het 37 0 33 6 TAGGCTGCCTTGCATA 0 1 329931 CASAVA_Build 20 9938334 2D CTCACTGAAC TA/-- TGTTAAGTAA 3070 het 3070 ref 55 25 23 7 TA 1 0 329932 CASAVA_Build 20 9942099 2D TTTGTGTGTA TG/-- TGTGTATATA 3070 hom 63 het 27 0 21 6 TG 3 2 329933 CASAVA_Build 20 9947054 1I GTTGTTTCCC -/T TTTTTGACTA 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 T 5 6 329934 CASAVA_Build 20 9947997 2I CAGTACCACA --/CT GTTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 53 27 19 7 CT 0 1 329935 CASAVA_Build 20 9949437 5I TTGGCATGAA -----/AGGCT AGGCTACTAA 3070 het 3070 ref 60 29 22 9 AGGCT 1 2 329936 CASAVA_Build 20 9956030 1I TGATAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 A 9 10 329937 CASAVA_Build 20 9956147 1D TTCTCTCATT A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 19 10 7 3 A 7 6 329938 CASAVA_Build 20 9958537 1I ATTTTAGAAG -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 A 6 7 329939 CASAVA_Build 20 9960022 1D CCATTATGTC A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 52 18 24 10 A 8 7 329940 CASAVA_Build 20 9962991 2I ATTAAAAAGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AT 5 6 329941 CASAVA_Build 20 9975235 4I AATGAAAATA ----/TTAG TTAATTATAT 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 TTAG 0 1 329942 CASAVA_Build 20 9979012 5D TTATTAACAA TTAAC/----- TTATAGGCTT 3070 het 3070 ref 27 14 11 3 TTAAC 1 0 329943 CASAVA_Build 20 9980973 2I CAGATGACAC --/AT TGAGTTATTA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 AT 0 1 329944 CASAVA_Build 20 9988813 1D GAATTAACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 9 8 329945 CASAVA_Build 20 9994179 10D AAAAAAAGAA AGAAAGAAAG/---------- AGAAAGAAAG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AGAAAGAAAG 2 1 329946 CASAVA_Build 20 9995721 1I ATGGTTTCTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 8 9 329947 CASAVA_Build 20 10023509 1D GATTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 20 6 A 11 10 329948 CASAVA_Build 20 10023670 1D ATAGCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 26 18 9 A 11 10 329949 CASAVA_Build 20 10025821 1D TTTCTTTTTT C/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 C 1 0 329950 CASAVA_Build 20 10026898 1I GGCTAATTAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 8 9 329951 CASAVA_Build 20 10027762 2I TATAATTATT --/AA GTGTCAATTA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 0 2 329952 CASAVA_Build 20 10029402 2I CTCAAAAAAA --/AG GAAAAAAAAA 3070 het 1940 hom 27 6 19 2 AG 0 1 329953 CASAVA_Build 20 10044906 1D TTTGGAAGCT A/- ATTTAATAAA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 2 1 329954 CASAVA_Build 20 10048540 6D ATATGTATAC TTCTAG/------ TTCTCTTTCT 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 TTCTAG 1 0 329955 CASAVA_Build 20 10049269 2D AAGTGAAAAT AA/-- AAAAACCACA 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 A 7 5 329956 CASAVA_Build 20 10053067 1D CAGCATGGGG A/- CCCTGGGCCG 1433 het 1433 ref 26 14 5 7 A 1 0 329957 CASAVA_Build 20 10055332 2I AACATACTGG --/TT TTTTTTTTTT 2867 het 2867 ref 35 12 13 10 T 12 14 329958 CASAVA_Build 20 10058727 1D TGGGCTTCCG T/- TTTTATGAAA 3070 het 2410 hom 22 7 12 4 T 5 4 329959 CASAVA_Build 20 10062706 1D ATCAGTGGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 29 1 23 5 A 12 11 329960 CASAVA_Build 20 10088126 2D GCAGCTTGAT GG/-- GGGGAGTGGC 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 G 6 4 329961 CASAVA_Build 20 10103039 1I5M1I TCACCTCCCA -TTTAC-/TTTTACT TTTTTTCAGG 3070 hom 84 het 31 0 26 7 N/A 0 0 329962 CASAVA_Build 20 10105870 2D TTTCTTAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 47 0 37 11 A 12 10 329963 CASAVA_Build 20 10106590 2I GTTTGGAAAA --/AG AGAGAGAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AG 3 4 329964 CASAVA_Build 20 10108774 1I GATCACCTGA -/C AAAAGGATAC 3070 hom 151 het 56 0 51 5 C 0 1 329965 CASAVA_Build 20 10119445 1D CTATAGACCG A/- AAAAAAAAAT 1131 het 1131 ref 37 29 4 6 A 10 9 329966 CASAVA_Build 20 10132382 2D CCCTGTGTCT CA/-- GTTTACTCAT 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 CA 1 0 329967 CASAVA_Build 20 10134372 1D GTATTTCCAC T/- TTTTTTGGCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 7 6 329968 CASAVA_Build 20 10135644 1D CACCCTTGTC A/- AAAAATAAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 6 5 329969 CASAVA_Build 20 10139905 1I TATAATTAGC -/T TTTTAAACTA 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 T 4 5 329970 CASAVA_Build 20 10145378 1I CATACACACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 9 10 329971 CASAVA_Build 20 10162834 1D TATTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 11 10 329972 CASAVA_Build 20 10181567 1D TCTCCATCTG A/- AAAAAAAAAG 881 het 881 ref 31 24 3 4 A 10 9 329973 CASAVA_Build 20 10197653 1I ATAACCTTGC -/A AATCAATCAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 2 3 329974 CASAVA_Build 20 10201794 1D ATGTTCCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 14 9 7 T 10 9 329975 CASAVA_Build 20 10225220 2I TGTTTTTCTC --/TG TGTTTTATGT 3070 het 3070 ref 55 23 24 8 TG 1 2 329976 CASAVA_Build 20 10226871 1I TGATTCTGAT -/A ATGCACTCAG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 1 2 329977 CASAVA_Build 20 10227749 1I ATTTTAAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 8 9 329978 CASAVA_Build 20 10238402 2D GATCCCAGTA AC/-- AGAGTCCTTT 3070 het 3070 ref 39 21 12 8 AC 1 0 329979 CASAVA_Build 20 10240713 1D TTCCTACTTG T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 T 8 7 329980 CASAVA_Build 20 10244273 1D AAGAAGAGGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 54 hom 29 1 25 5 A 10 9 329981 CASAVA_Build 20 10246296 5D TTTCTGTATG TATGT/----- TATATCTCAA 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 TATGT 1 0 329982 CASAVA_Build 20 10254275 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2575 het 573 hom 34 5 15 14 A 17 18 329983 CASAVA_Build 20 10268107 4I TAAATCACAA ----/AGTT AGACGCAAAA 3070 het 3070 hom 44 21 23 0 AGTT 0 1 329984 CASAVA_Build 20 10274193 2I8M4I GGAAGTTCCT --GTATGTGT----/GGGTCTGTGTTTTG TTGTTGCTGT 3070 het 3070 ref 38 21 17 6 N/A 0 0 329985 CASAVA_Build 20 10285073 1D TTTACTTTTG T/- TTTTTAGAGA 3070 het 3070 hom 43 18 23 2 T 6 5 329986 CASAVA_Build 20 10295973 6D TTCTCCCTTA AACTTT/------ ATCTCCCAAT 3070 het 3070 ref 59 30 25 5 AACTTT 1 0 329987 CASAVA_Build 20 10296859 1D AGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 T 10 9 329988 CASAVA_Build 20 10298361 2D CTTTAAAAAC TG/-- TATTTTTATT 3070 het 3070 ref 37 20 16 1 TG 1 0 329989 CASAVA_Build 20 10307700 1D ATAATAAAAC T/- TTTTTTAAAA 2151 het 2151 ref 23 11 10 2 T 7 6 329990 CASAVA_Build 20 10309649 1I TTGTCTCATG -/A TTTTTTTGTT 2630 het 2630 ref 23 16 6 1 A 0 1 329991 CASAVA_Build 20 10311856 1I GTGTCTGCCC -/A GTGACCCCCA 3070 hom 114 het 45 0 37 8 A 0 1 329992 CASAVA_Build 20 10313883 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 10 9 329993 CASAVA_Build 20 10319646 1D TCAAATTGAG T/- TAAGGTTAAA 3070 hom 96 het 41 0 33 9 T 2 1 329994 CASAVA_Build 20 10329166 1I ATTAATAATT -/A AAAAAAAAAA 2789 het 2789 ref 21 10 8 3 A 11 12 329995 CASAVA_Build 20 10346320 1D CCTTCTCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 702 hom 40 2 29 10 A 12 11 329996 CASAVA_Build 20 10358687 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 7 8 329997 CASAVA_Build 20 10359072 4D CTTGGCACTT TGTC/---- TGGGCTCAGT 3070 het 3070 ref 52 30 20 2 TGTC 1 0 329998 CASAVA_Build 20 10360597 2I TCTCTAGCAC --/AT GTGATTCCTT 3070 het 3070 ref 50 23 17 10 AT 0 1 329999 CASAVA_Build 20 10364687 1I CCCTGAACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 13 10 T 9 10 330000 CASAVA_Build 20 10372856 28I TGTAGTTGTA ----------------------------/GGGGTGTCCTCAGGATAACCCTTTCTTT GGGGTCTGGA 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 GGGGTGTCCTCAGGATAACCCTTTCTTT 0 1 330001 CASAVA_Build 20 10375169 14I ATTTTTGGGT --------------/TGTAGGTAAGTGCA TGTTTAGATT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 TGTAGGTAAGTGCA 0 1 330002 CASAVA_Build 20 10375548 3D TCTCCCAGTT TTC/--- TTAGAAAAGT 3070 het 3070 ref 28 15 10 6 TTC 1 0 330003 CASAVA_Build 20 10375939 1I AGTACGTTAG -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 7 8 330004 CASAVA_Build 20 10376733 4D TTGATTCTGA TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 35 17 16 4 TGTT 3 2 330005 CASAVA_Build 20 10378840 1D GGATCACACA T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 26 12 12 3 T 8 7 330006 CASAVA_Build 20 10382385 1D CAACGCACTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 A 8 7 330007 CASAVA_Build 20 10383068 2D AAGGTCTCTG TA/-- TTTGTATTCC 3070 het 2677 hom 24 6 12 6 TA 1 0 330008 CASAVA_Build 20 10393422 1D ATATGAATAC T/- TTTTTTTTGT 2944 het 2944 ref 31 9 10 13 T 9 8 330009 CASAVA_Build 20 10395505 1I AGATTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2096 hom 24 8 12 4 A 10 11 330010 CASAVA_Build 20 10404791 2I CATCCCTCAC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 545 hom 53 2 44 7 TG 7 8 330011 CASAVA_Build 20 10405819 1D GGGAATTCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 9 330012 CASAVA_Build 20 10408005 3I TATTTCTTTT ---/TTC TTTTTTTTTT 506 hom 21 het 13 0 8 5 TTC 0 1 330013 CASAVA_Build 20 10408285 1I6M2I GCGTGAGCCA -CGTCCC--/CCATCCCCG GGCTCGAATT 2798 hom 15 het 12 0 6 7 N/A 0 0 330014 CASAVA_Build 20 10409054 1I CCCTGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 28 4 17 7 A 12 13 330015 CASAVA_Build 20 10409731 1D TTCTTACAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 48 1 40 7 T 13 12 330016 CASAVA_Build 20 10415574 1I ACTTGCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 590 hom 28 2 20 6 T 11 12 330017 CASAVA_Build 20 10416721 2D AGACCTGGGT TC/-- TCTCCCCAGG 3070 hom 108 het 40 0 34 8 TC 3 2 330018 CASAVA_Build 20 10418842 1I TGGAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 896 hom 31 3 20 8 T 10 11 330019 CASAVA_Build 20 10427333 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2180 hom 43 7 31 5 T 13 12 330020 CASAVA_Build 20 10441425 34D ACACACACAC TCTATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------- TATATATATA 2329 het 373 hom 7 1 5 2 TCTATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 330021 CASAVA_Build 20 10445033 10I TTCAACAGAT ----------/CAATGTTGAC TAATGTTGAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 CAATGTTGAC 0 1 330022 CASAVA_Build 20 10449184 1D ATTTATCTAG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 14 15 8 T 7 6 330023 CASAVA_Build 20 10456386 1I GTTAGAGGTT -/C CTAATCCATG 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 C 1 2 330024 CASAVA_Build 20 10461427 1D CCACAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 2576 het 2423 hom 21 8 6 7 T 15 14 330025 CASAVA_Build 20 10464649 4I TGAGGGAGAA ----/AAGT AAGCAGAAAT 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 AAGT 0 1 330026 CASAVA_Build 20 10466940 1I AGGTTTTAGA -/C CAAGGTTTCT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 C 1 2 330027 CASAVA_Build 20 10475938 6I CCTTTGTGTT ------/TTACTC TTTATCTTTG 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 TTACTC 0 1 330028 CASAVA_Build 20 10481968 1D ACCCAATGCC T/- TAATAAACAA 3070 het 3070 ref 57 34 18 6 T 2 1 330029 CASAVA_Build 20 10487040 3I TTCCTCTGGG ---/ATC ATCATTTGTG 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 ATC 1 2 330030 CASAVA_Build 20 10487776 1I ATTGTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 2273 het 2273 ref 43 28 6 9 A 13 14 330031 CASAVA_Build 20 10509674 1D CTAAGGAATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 T 9 8 330032 CASAVA_Build 20 10518469 1D TCAAAAGTCG A/- AAGTGACAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 3 2 330033 CASAVA_Build 20 10520995 1D CTTTCTCCAA C/- CCCCCCCCAT 3070 het 2456 hom 32 9 18 5 C 9 8 330034 CASAVA_Build 20 10538582 1I CCTTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 10 11 330035 CASAVA_Build 20 10539554 3I AGAGAGACTT ---/CTC CTTCATTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 CTC 0 1 330036 CASAVA_Build 20 10550353 1D ACAGATCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 18 9 A 11 10 330037 CASAVA_Build 20 10550969 1D CTACTCCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 10 9 330038 CASAVA_Build 20 10569924 1I CACACACGTG -/T TAAGATTGAG 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 T 1 2 330039 CASAVA_Build 20 10571036 1D GTGTGTTCCC T/- TCCCTGAGCA 3070 het 3070 ref 60 33 24 3 T 2 1 330040 CASAVA_Build 20 10582613 22D AAAATGGAAT GTCAACGTGACAAGTGACTAAA/---------------------- GGAGTAAGAT 3070 het 3070 ref 46 25 24 4 GTCAACGTGACAAGTGACTAAA 1 0 330041 CASAVA_Build 20 10583185 1D TGTGGGGGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 54 23 29 2 A 10 9 330042 CASAVA_Build 20 10588384 1D GGAGGGTTTC T/- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 6 5 330043 CASAVA_Build 20 10588966 4D TGAACCACTT GCAG/---- GCAGGTAACA 3070 hom 121 het 46 0 38 10 GCAG 2 1 330044 CASAVA_Build 20 10590356 11D CTGAAAAGAC CAGGATGGCAG/----------- AAGAATGGAG 3070 het 3070 ref 49 29 20 3 CAGGATGGCAG 1 0 330045 CASAVA_Build 20 10591682 1D TTCTGTCAGC A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 92 het 45 0 32 15 A 8 7 330046 CASAVA_Build 20 10591737 1I GAAAGCAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 13 15 11 A 9 10 330047 CASAVA_Build 20 10597686 3I AGAAAAAAAA ---/AAT ATTAGAAACC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 AAT 0 1 330048 CASAVA_Build 20 10598196 23D TGGATTTTCC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------------- AAAAAAAAAA 1454 het 474 hom 20 4 6 15 A 41 18 330049 CASAVA_Build 20 10622636 3D AAATTTTAAT GTA/--- GTTGAATTTT 3070 het 3070 ref 32 20 9 4 GTA 1 0 330050 CASAVA_Build 20 10624850 1D TGTGAGTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 126 het 58 0 43 15 T 10 9 330051 CASAVA_Build 20 10631902 33I ACTACTCTAG ---------------------------------/TGGATTTCTTCAACTACTATAGACCATATGATA TGGTTTGGAT 3070 hom 69 het 22 0 23 4 TGGATTTCTTCAACTACTATAGACCATATGATA 0 1 330052 CASAVA_Build 20 10639128 1D TATATTTGTA T/- GAAAAAAATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 1 0 330053 CASAVA_Build 20 10644923 1D AGAAAGAGAA G/- CAAATCTTTC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 G 1 0 330054 CASAVA_Build 20 10645474 1I GCGATGCAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 845 hom 46 3 34 9 T 9 10 330055 CASAVA_Build 20 10647026 2I ATGCCTGGAT --/AC ACACACACAC 2946 het 2946 ref 42 17 9 16 AC 8 9 330056 CASAVA_Build 20 10652887 1D AGTGGGAAAA T/- TTTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 6 5 330057 CASAVA_Build 20 10664779 1I CTTTACGGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 8 9 330058 CASAVA_Build 20 10674052 1I AAAAAAAAAA -/G GAAAGAAGAA 3070 het 2083 hom 31 9 14 8 G 1 2 330059 CASAVA_Build 20 10675113 1D TCTTGTCACC A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 A 7 6 330060 CASAVA_Build 20 10676871 1I CCATCGCCTC -/A AAACCTTGAT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 3 4 330061 CASAVA_Build 20 10679947 1I TAATAAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 17 13 2 T 9 10 330062 CASAVA_Build 20 10680056 13I AACCAGCTAC -------------/AGACAATTCCTCT AGTCCTTAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 AGACAATTCCTCT 0 1 330063 CASAVA_Build 20 10692523 1D TTCAGTAAAT C/- TAAATATGAT 3070 het 3070 ref 49 25 19 6 C 1 0 330064 CASAVA_Build 20 10695912 1D CATTTTCGCC T/- GGCTGTGTCT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 1 0 330065 CASAVA_Build 20 10697127 1D GCATATCAAA G/- CCAGAGTGGT 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 G 1 0 330066 CASAVA_Build 20 10699870 1D AAAGAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 T 13 12 330067 CASAVA_Build 20 10712377 1I AACACCTGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 A 9 10 330068 CASAVA_Build 20 10759429 4I GGCAGATCTT ----/TATG TATTGCTATA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TATG 0 1 330069 CASAVA_Build 20 10771680 1I GACAAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 15 18 5 A 9 10 330070 CASAVA_Build 20 10777665 2D CTAACTCCCC CA/-- CCCGCCTCCA 3070 het 3070 ref 41 19 13 10 CA 1 0 330071 CASAVA_Build 20 10787681 1D TCTTGTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2935 hom 22 8 8 6 T 13 12 330072 CASAVA_Build 20 10790963 1I GATTTGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 T 11 12 330073 CASAVA_Build 20 10818959 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAATTACT 337 het 337 ref 27 19 3 5 A 5 6 330074 CASAVA_Build 20 10823662 1I AAGGATGGGT -/A AAATAGGGGA 3070 het 3070 ref 58 28 25 5 A 3 4 330075 CASAVA_Build 20 10824080 1I CAATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 912 hom 33 2 27 4 A 12 13 330076 CASAVA_Build 20 10842409 5D GACATTAAAC CTCAT/----- CTCATGACAC 3070 het 3070 hom 38 14 23 3 CTCAT 2 1 330077 CASAVA_Build 20 10842775 1D TGACAGACAA C/- CCAATACAAA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 C 3 2 330078 CASAVA_Build 20 10933478 6I GAATCAAACA ------/GTATAT ACTTTTATGT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 GTATAT 0 1 330079 CASAVA_Build 20 10933559 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 10 9 330080 CASAVA_Build 20 10937563 1I GATGCTGACC -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 163 het 62 0 55 7 T 6 7 330081 CASAVA_Build 20 10970127 3D GAACCTCAGA GAG/--- GAGGAGAGAT 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 GAG 3 2 330082 CASAVA_Build 20 10993221 8I2M19I TGTGGAAGTG --------CA-------------------/AGCATTTTCAAGACTATTGTGACTATGAC ATCACTTGCA 3070 het 3070 ref 40 24 15 2 N/A 0 0 330083 CASAVA_Build 20 11000722 1D CTTGAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 1651 het 1651 ref 39 26 4 9 T 12 11 330084 CASAVA_Build 20 11006512 1D AAATGGGGCA T/- TTTTTTTTTG 2948 het 1435 hom 18 4 8 6 T 10 9 330085 CASAVA_Build 20 11018880 1D AAGTTACTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 10 9 330086 CASAVA_Build 20 11020616 1I AGTTTGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 12 13 330087 CASAVA_Build 20 11020725 1D TCTAATGGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 9 8 330088 CASAVA_Build 20 11040169 4I TGTTTCTTTA ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 45 13 23 9 TTTC 3 4 330089 CASAVA_Build 20 11041273 18D TCAGTAGCAA ACACTATGAATTAGTTGT/------------------ ACACTATGAA 3070 het 3070 ref 46 23 15 14 ACACTATGAATTAGTTGT 2 1 330090 CASAVA_Build 20 11109397 1D TCATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 T 11 10 330091 CASAVA_Build 20 11124734 1I AGTTTATTTC -/A AGAGACTAGC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 1 2 330092 CASAVA_Build 20 11128097 1D CATAAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 148 hom 46 2 32 12 A 12 11 330093 CASAVA_Build 20 11146557 1I CAGACTTATT -/G TTTTGCCTGC 3070 hom 147 het 56 0 49 7 G 0 1 330094 CASAVA_Build 20 11147954 1I TCACATTACC -/T TCAAGATTTT 3070 het 3070 hom 58 23 25 10 T 1 2 330095 CASAVA_Build 20 11160121 1I ATTTTCCACA -/T TTACTAAGAG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 2 3 330096 CASAVA_Build 20 11161809 5I TTCCAGCAAA -----/AGCAC AGCACGTTCC 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 AGCAC 1 2 330097 CASAVA_Build 20 11166165 1D CATTTCTTTA T/- AATTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 1 0 330098 CASAVA_Build 20 11171980 1I GCCATACCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1342 hom 24 5 11 8 T 9 10 330099 CASAVA_Build 20 11172147 1I GGCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2122 het 1743 hom 17 5 6 9 T 9 10 330100 CASAVA_Build 20 11179390 1D ACATAACTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 399 hom 41 1 35 7 A 10 9 330101 CASAVA_Build 20 11184836 2D CATTGAAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 13 11 330102 CASAVA_Build 20 11185953 1I AAAATAAAAT -/A AAAATACTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 4 5 330103 CASAVA_Build 20 11202391 2I AGAACATTGG --/CC AGATAGAAGG 3070 het 3070 hom 34 11 22 1 C 0 2 330104 CASAVA_Build 20 11205339 2D GAATTAAGGT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TG 1 0 330105 CASAVA_Build 20 11208780 1D TCACAACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 67 het 29 0 21 8 A 10 9 330106 CASAVA_Build 20 11211691 1D AGGGCTATGA T/- CAAAAAGACA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 1 0 330107 CASAVA_Build 20 11216678 2I TTAGGGTGAC --/TG AGAGAAGGCA 3070 hom 120 het 50 0 41 9 TG 0 1 330108 CASAVA_Build 20 11224676 2D AGACTCTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 30 0 14 18 A 13 11 330109 CASAVA_Build 20 11232027 13D TCTCATGATT TTATACTACGATA/------------- TATCAATTTA 3070 het 3070 hom 32 16 17 1 TTATACTACGATA 1 0 330110 CASAVA_Build 20 11243073 1D AAATAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 13 12 330111 CASAVA_Build 20 11246473 11D GGTTGTTTTC TTTTTTTTTCT/----------- TTTTTTTTTC 3070 hom 80 het 28 0 26 5 TTTTTTTTTCT 1 0 330112 CASAVA_Build 20 11256934 2D GAAAAGAAGG AA/-- AAGAGATAAG 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 A 4 2 330113 CASAVA_Build 20 11263790 1I CAATATATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 A 13 14 330114 CASAVA_Build 20 11272745 1I GTAAAACACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 10 11 330115 CASAVA_Build 20 11283864 1D ATGTTATAAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 A 9 8 330116 CASAVA_Build 20 11286001 1D GGCTGATACA C/- CAAATCTGTA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 C 2 1 330117 CASAVA_Build 20 11290132 3D TTGTTAATTT AAA/--- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 10 7 330118 CASAVA_Build 20 11291206 1D GGGGGATTTA C/- CCCCATTTAC 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 C 5 4 330119 CASAVA_Build 20 11294985 1I GGGGTTACAG -/C CCAGCTAATT 1344 het 1344 ref 10 5 4 1 C 2 3 330120 CASAVA_Build 20 11297680 2D CATACATTGT CA/-- CACACAAACA 3070 het 3070 ref 83 31 33 20 CA 4 3 330121 CASAVA_Build 20 11297902 12D TCACACACAC GCACTGTCACAT/------------ ACATACACAT 3070 het 3070 ref 75 45 15 30 GCACTGTCACAT 1 0 330122 CASAVA_Build 20 11298076 4D15M2D ACATATACAC ACATACAAACATGAACTGTCA/----ACAAACATGAACTGT-- CACACAATCA 3070 het 3070 ref 83 50 31 17 N/A 0 0 330123 CASAVA_Build 20 11302044 1D GGTCAGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1178 hom 46 6 20 21 A 12 11 330124 CASAVA_Build 20 11309091 1D ACTGACCACT G/- GGGGGAAAAA 3070 hom 32 het 45 0 17 28 G 6 5 330125 CASAVA_Build 20 11310042 1D TAACATTCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 10 9 330126 CASAVA_Build 20 11317265 1I TTAAAAATTT -/A AAAAAACATT 3070 het 2844 hom 23 7 12 4 A 6 7 330127 CASAVA_Build 20 11323941 1I TGAGCCCAGG -/A ATTCATGACC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 1 2 330128 CASAVA_Build 20 11333226 4D ATAAGCCACA ATTT/---- ATTTATTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 6 ATTT 3 2 330129 CASAVA_Build 20 11334666 5D ACCATGGATA TTTCT/----- TTTCATGTTA 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 TTTCT 1 0 330130 CASAVA_Build 20 11337066 1I TATTAATTTA -/T TTTTCAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 4 5 330131 CASAVA_Build 20 11338583 1D GCTCATTGTT A/- AAAAATATGT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 6 5 330132 CASAVA_Build 20 11338974 3D CTCCTATTAT TAA/--- TATTTTATGT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 TAA 1 0 330133 CASAVA_Build 20 11339565 4I AATTTCTTTT ----/TTTC TTTTTTCTTT 3070 het 2772 hom 23 8 11 4 TTTC 0 1 330134 CASAVA_Build 20 11346596 28D ATTTATTTTA AATTAATTAAATTTAAAATTTAATTAAT/---------------------------- TTTAATTCTT 3070 hom 54 het 20 0 19 5 AATTAATTAAATTTAAAATTTAATTAAT 1 0 330135 CASAVA_Build 20 11348757 3I TTTTGATATC ---/ATT ATAAATAGCA 3070 het 3070 hom 19 7 8 4 ATT 0 1 330136 CASAVA_Build 20 11357418 1D ATTTTTTTGG A/- AAAAAAAATT 2876 het 2876 ref 25 16 7 2 A 9 8 330137 CASAVA_Build 20 11360824 2D ATATATACAC AT/-- GTGTATATAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 0 330138 CASAVA_Build 20 11369508 17D TTAGCAGTGT TCATTATCAAAAGGAAG/----------------- TCATAGCATA 3070 hom 125 het 42 0 42 5 TCATTATCAAAAGGAAG 1 0 330139 CASAVA_Build 20 11378134 1D TTATATTCCT C/- CCTCAAATAC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 C 3 2 330140 CASAVA_Build 20 11382669 1D AAAAATTTTT A/- AATTTTAAGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 3 2 330141 CASAVA_Build 20 11394640 1D GAAATATTGG T/- CTGTAGCTTT 3070 hom 117 het 40 0 39 1 T 1 0 330142 CASAVA_Build 20 11395626 2D TCTCAAAGAA TG/-- TGTTATATGC 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 TG 2 1 330143 CASAVA_Build 20 11397127 1I CCAGAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 880 hom 36 3 30 3 T 14 15 330144 CASAVA_Build 20 11405947 1D ACAGATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 13 6 A 15 14 330145 CASAVA_Build 20 11408110 1I TCATGATTTT -/A AAAAAACTAA 3070 het 271 hom 41 1 34 6 A 6 7 330146 CASAVA_Build 20 11419767 1D CTCTTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 22 13 13 T 15 14 330147 CASAVA_Build 20 11428830 1I CTTTTTGCTA -/T TTTTTTAAGC 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 T 6 7 330148 CASAVA_Build 20 11443796 1I ATAACTTTGG -/T TTTTCTTAAT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 4 5 330149 CASAVA_Build 20 11456170 1I AAACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2338 hom 27 8 12 7 A 13 14 330150 CASAVA_Build 20 11481507 1I TGAGTAATAT -/A AAAAATACAT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 A 5 6 330151 CASAVA_Build 20 11489906 27D AATAGAGATA TATAAGAATATCTCTTATATATGTACT/--------------------------- TATAAGAATA 3070 hom 86 het 33 0 29 7 TATAAGAATATCTCTTATATATGTACT 1 0 330152 CASAVA_Build 20 11496895 1D TTATTGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 12 11 330153 CASAVA_Build 20 11499643 2D TGCCTCCCTC TT/-- AGAAGGACTC 3070 hom 99 het 36 0 32 5 T 2 0 330154 CASAVA_Build 20 11501345 1I GTATAATTTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 39 0 34 5 A 8 9 330155 CASAVA_Build 20 11506685 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 10 9 330156 CASAVA_Build 20 11514188 1I GAGTTTTCTG -/T TTCTCGTTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 3 330157 CASAVA_Build 20 11533609 1D AACAACCTTC T/- TTTTTTTTTT 1253 het 1253 ref 45 37 3 5 T 11 10 330158 CASAVA_Build 20 11536072 3D TTGGGAGAGT TCC/--- CAGGACCCTA 3070 hom 84 het 36 0 29 8 TCC 1 0 330159 CASAVA_Build 20 11541673 4I AACCCATATC ----/TATT CATTAAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TATT 0 1 330160 CASAVA_Build 20 11554869 2D TCTCCAGGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AT 7 6 330161 CASAVA_Build 20 11610504 1I CACAAAAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 10 11 330162 CASAVA_Build 20 11621258 1D GAAAAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 10 9 330163 CASAVA_Build 20 11625916 1D ACGGGGGAGT G/- GGGGGGGGAA 3070 het 2396 hom 30 9 15 7 G 9 8 330164 CASAVA_Build 20 11627426 1D GTTCATTTCC T/- TTTTTTCCGT 3070 het 3070 hom 56 20 31 6 T 7 6 330165 CASAVA_Build 20 11629889 1I GCTGTTAGCC -/T AAGCCCAGAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 0 1 330166 CASAVA_Build 20 11634600 48D TCAAAACAAA GAAACAACCTTGAAAGTGGCAGAAGAATGTTGACTGTCACATACAAGG/------------------------------------------------ GAACTCCCAC 3070 het 3070 ref 31 28 10 8 GAAACAACCTTGAAAGTGGCAGAAGAATGTTGACTGTCACATACAAGG 1 0 330167 CASAVA_Build 20 11641918 1D TTTTAGTTTT G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 95 het 37 0 29 9 G 9 8 330168 CASAVA_Build 20 11643626 2I GAAGAGCAGC --/CA TCTGAGCAGA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 CA 0 1 330169 CASAVA_Build 20 11649053 1D AAAACATTAA T/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 7 6 330170 CASAVA_Build 20 11652860 1D CAACAGCCAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 48 22 19 9 A 9 8 330171 CASAVA_Build 20 11657628 1I AATGACCCAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2848 hom 30 9 17 4 A 9 10 330172 CASAVA_Build 20 11665887 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1729 hom 19 4 10 5 A 10 9 330173 CASAVA_Build 20 11667766 11D TATTTACAAA GGTAAATTATG/----------- GCAGCAATAA 3070 het 3070 ref 41 22 16 8 GGTAAATTATG 1 0 330174 CASAVA_Build 20 11675757 1D TCCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1832 hom 18 5 12 1 A 12 11 330175 CASAVA_Build 20 11679273 1D GGTAAGAGTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 5 T 8 7 330176 CASAVA_Build 20 11689399 1D TAACTAATCC A/- ATTCACGAGG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 2 1 330177 CASAVA_Build 20 11695738 1D TTCAGTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 45 2 28 16 T 12 11 330178 CASAVA_Build 20 11699666 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3012 het 145 hom 31 2 9 20 T 13 12 330179 CASAVA_Build 20 11701354 12I GTTCACTGTC ------------/TCCTATACATTA TACCACAACA 3070 hom 115 het 45 0 39 6 TCCTATACATTA 0 1 330180 CASAVA_Build 20 11702947 1D TGGATTTAGA G/- GCAGGGTCTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 G 2 1 330181 CASAVA_Build 20 11704017 2D AGTGCACCCC CG/-- CCCCCCCGCC 3070 hom 29 het 14 0 10 4 CG 1 0 330182 CASAVA_Build 20 11708482 3D TGAAGGTACA TCT/--- TCTTATGTGT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 TCT 2 1 330183 CASAVA_Build 20 11708603 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 9 10 330184 CASAVA_Build 20 11709083 1I CATCTCTTTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 T 8 9 330185 CASAVA_Build 20 11709675 1D CAATCATTAA C/- CCTGTCTGGT 3070 het 3070 ref 46 22 14 11 C 3 2 330186 CASAVA_Build 20 11711446 1D AAAAGCAGAC A/- AAGACTCTGC 3070 het 3070 ref 45 23 16 8 A 3 2 330187 CASAVA_Build 20 11722115 3I GATTTTTTTT ---/TTC TTCTTCTTAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 TTC 2 3 330188 CASAVA_Build 20 11725598 1I ACATCACTGC -/T TTTGGTTTTT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 T 3 4 330189 CASAVA_Build 20 11727019 1D GGAAAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 T 11 10 330190 CASAVA_Build 20 11727624 1I AAATACAAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 A 9 10 330191 CASAVA_Build 20 11731471 1I GACAACCAAA -/G CTTTACATTT 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 G 0 1 330192 CASAVA_Build 20 11738886 2I TTCCTCATAC --/TT TTCACCTGCC 3070 het 3070 hom 49 17 23 9 T 2 4 330193 CASAVA_Build 20 11740518 1D ACCAAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 11 10 330194 CASAVA_Build 20 11750352 1I AAAAAAAAAA -/G TGTGAAAAAT 2621 het 2621 ref 26 9 10 7 G 0 1 330195 CASAVA_Build 20 11755904 1I TCCAAGCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 A 11 12 330196 CASAVA_Build 20 11764514 1I TTATTTCAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 A 9 10 330197 CASAVA_Build 20 11767898 15D AGACTCTGTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 2265 het 1058 hom 16 3 9 6 A 29 14 330198 CASAVA_Build 20 11770610 1I TGAATGCATC -/T TTTTTTATGG 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 T 6 7 330199 CASAVA_Build 20 11778181 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 330200 CASAVA_Build 20 11786156 2D ATCCTTTACT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 12 19 13 AC 9 8 330201 CASAVA_Build 20 11787961 1D TGCATAGTTG T/- TTTTTATTAT 3070 het 3070 ref 43 19 18 7 T 6 5 330202 CASAVA_Build 20 11789838 5D AAAATTAAAA TAAAT/----- TAATTAGGTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 5 TAAAT 1 0 330203 CASAVA_Build 20 11790096 1I CAGGAGAGTC -/T TTTTTTAGCT 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 T 6 7 330204 CASAVA_Build 20 11796757 2D CCCTTCATAA TT/-- TTTTTTTTTT 2213 het 58 hom 23 1 13 9 T 20 18 330205 CASAVA_Build 20 11805150 11I ATTGCATGAC -----------/TTTAAAGTGGG CTTTAGCGCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTAAAGTGGG 0 1 330206 CASAVA_Build 20 11807816 2D GATGCTATGC TG/-- TGTGTCTCTG 3070 het 3070 ref 65 32 29 4 TG 3 2 330207 CASAVA_Build 20 11809274 1I TTAGTTTGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 53 17 26 10 A 9 10 330208 CASAVA_Build 20 11811290 1I TGTGATACAG -/A ATATCAAAAA 1312 het 1312 ref 17 11 3 4 A 1 2 330209 CASAVA_Build 20 11813713 1D GCGGCTCACA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 16 24 2 T 9 8 330210 CASAVA_Build 20 11815897 1I TATTCACAAA -/T TCTCATAATA 3070 het 109 hom 53 1 48 4 T 1 2 330211 CASAVA_Build 20 11816379 4I GAAGCAAAAG ----/AGTC AGGGGAATGA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 AGTC 0 1 330212 CASAVA_Build 20 11820942 1D AGCCAAGGGC T/- TTCCCCTTCT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 3 2 330213 CASAVA_Build 20 11821710 1I AAAATGTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 11 12 330214 CASAVA_Build 20 11822463 4I CATTTTACTC ----/TTTT TGTTTGTCTG 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 T 1 5 330215 CASAVA_Build 20 11838874 1I CGAATATCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 9 10 330216 CASAVA_Build 20 11839169 2D GTAGAAAGTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 AT 6 5 330217 CASAVA_Build 20 11839794 1D CTAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 41 0 34 7 A 10 9 330218 CASAVA_Build 20 11840214 1I CCCATGAGCT -/A AAAAAAATTG 3070 het 1534 hom 25 4 17 4 A 7 8 330219 CASAVA_Build 20 11842061 1D CTGTAGTGTG C/- CCCTACAGGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 4 3 330220 CASAVA_Build 20 11846347 1I TCATATGTTA -/T TTATCTTGTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 3 330221 CASAVA_Build 20 11849599 1I TGACAAGACC -/T TTCACAGTAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 2 3 330222 CASAVA_Build 20 11868609 1I AACAAAAACC -/A AAGCAAATAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 2 3 330223 CASAVA_Build 20 11872390 12D ATGCACATAC TTTCTTTTTCTG/------------ TTTCTTTTTC 3070 hom 48 het 18 0 17 4 TTTCTTTTTCTG 1 0 330224 CASAVA_Build 20 11872588 1D GAGCATCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 248 hom 40 1 29 11 A 11 10 330225 CASAVA_Build 20 11872893 1I TGAAGCTGGC -/T TTTGGGTAGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 3 4 330226 CASAVA_Build 20 11873156 1D CCAGTGACTT A/- AAAATAATGC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 A 5 4 330227 CASAVA_Build 20 11904064 1I TCTGTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 10 11 330228 CASAVA_Build 20 11907177 1D CTCAGGTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 T 10 9 330229 CASAVA_Build 20 11909620 3D TTGTTTTGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 38 13 23 4 TTG 5 4 330230 CASAVA_Build 20 11913261 1D CTCCACTGTG T/- TTTTTGGTCT 3070 hom 78 het 31 0 26 6 T 6 5 330231 CASAVA_Build 20 11917917 1I AATTCTGCTG -/T TCCCCCGCCA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 1 2 330232 CASAVA_Build 20 11920187 6I AAATGAGTTG ------/GAGTTT GAGTATGAGG 3070 het 3070 ref 45 27 10 8 GAGTTT 0 1 330233 CASAVA_Build 20 11923284 6D TTGGAAAACT TGTAAA/------ TGTAAGTACA 3070 het 3070 hom 28 13 15 2 TGTAAA 1 0 330234 CASAVA_Build 20 11929102 1D TATTGCACTT A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 8 7 330235 CASAVA_Build 20 11930533 2D TAACTTCTAC AG/-- AGAGGACAGG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 AG 3 2 330236 CASAVA_Build 20 11930835 1D AATGGTGCTA C/- CCCCCAGCAG 3070 het 3070 hom 46 21 17 9 C 6 5 330237 CASAVA_Build 20 11931703 1D CCCCACCCCC T/- TTTCTTGGGT 3070 het 3070 hom 36 18 17 2 T 4 3 330238 CASAVA_Build 20 11933083 3I CATAAGTAAT ---/GAG GAGCTGAATG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GAG 1 2 330239 CASAVA_Build 20 11934935 2I CAGTAAGCCT --/AG AGAGGAAGCC 3070 hom 126 het 46 0 41 5 AG 2 3 330240 CASAVA_Build 20 11948716 2I CTCATGGTTA --/TC TGAGGGGAGT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 TC 0 1 330241 CASAVA_Build 20 11948934 3D AAAAAAAAAC AAA/--- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 10 7 330242 CASAVA_Build 20 11950525 4I TCTATTCCAA ----/CTAT CTATTTCAAA 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 CTAT 1 2 330243 CASAVA_Build 20 11952934 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTGGG 3070 het 2340 hom 28 9 14 5 T 8 7 330244 CASAVA_Build 20 11954587 1I TCTGCCTCCC -/T TGAGAATCTC 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 T 1 2 330245 CASAVA_Build 20 11973097 1I TTTCAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 2234 het 2234 ref 31 10 8 13 T 14 15 330246 CASAVA_Build 20 11973502 2D CCAGAGTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 38 0 24 14 T 16 14 330247 CASAVA_Build 20 12021245 2D AGTTTTTCCC CT/-- TTTTCAGCTT 2905 het 2905 ref 25 13 7 5 CT 1 0 330248 CASAVA_Build 20 12030330 1D TGAATCTTTG A/- AAAAAAAAAA 1269 het 1269 ref 28 14 4 10 A 15 14 330249 CASAVA_Build 20 12034337 2I AAATCCATAC --/AT ATATATATAT 2594 het 2594 ref 23 10 9 4 AT 6 7 330250 CASAVA_Build 20 12037840 1D AAATTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 540 hom 32 3 15 14 A 11 10 330251 CASAVA_Build 20 12042326 1I TAGCTGTTGG -/C CAACAAACGC 3070 hom 135 het 52 0 44 8 C 1 2 330252 CASAVA_Build 20 12046619 1D GTTTTTTTTT A/- AAAGATAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 4 3 330253 CASAVA_Build 20 12046984 5D CCCTTTCATG ATAAA/----- ATAAATTCTC 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 ATAAA 2 1 330254 CASAVA_Build 20 12047281 4I AGAGTTCACC ----/AAGT AAGAAAAAGT 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 AAGT 0 1 330255 CASAVA_Build 20 12058948 1I TTTTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 T 13 14 330256 CASAVA_Build 20 12068350 3I GTTTCTAAAA ---/TTC TTCTTGTTAT 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 TTC 1 2 330257 CASAVA_Build 20 12077318 5D ATTAAAAGAT AAGAG/----- AATACAACAC 3070 het 3070 ref 41 20 20 3 AAGAG 1 0 330258 CASAVA_Build 20 12082335 1I ATCTTCATAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 10 330259 CASAVA_Build 20 12084889 3D AAAGACATTA TTG/--- ATATTAATAT 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 TTG 1 0 330260 CASAVA_Build 20 12085876 1I AATCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 11 12 330261 CASAVA_Build 20 12092128 1I AGTGTAAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 61 22 27 12 T 9 10 330262 CASAVA_Build 20 12107190 1D TGCCAATGTC A/- GCAGATGCAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 1 0 330263 CASAVA_Build 20 12107590 1D GTTGTCTCTC T/- ACCCTTCCAG 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 T 1 0 330264 CASAVA_Build 20 12111161 1D GTTTTAGAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 10 9 330265 CASAVA_Build 20 12113156 1D TGGTTTATAG T/- TTATGTTTCA 3070 het 3070 hom 34 15 19 0 T 3 2 330266 CASAVA_Build 20 12113666 44D ACTATATATG TGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------------------- TATATATATA 3014 het 738 hom 11 3 8 6 TGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 330267 CASAVA_Build 20 12116837 3I GCCTGGATGA ---/TGT TGGTGCATAG 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 TGT 0 1 330268 CASAVA_Build 20 12118552 1I GCTTGAGCCA -/C GGTGCCTGGC 3070 het 1922 hom 22 5 9 8 C 0 1 330269 CASAVA_Build 20 12118981 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 6 7 330270 CASAVA_Build 20 12122760 1D TGAAGGCCTT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 A 8 7 330271 CASAVA_Build 20 12123298 1D TAAGTATACA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 9 8 330272 CASAVA_Build 20 12127790 1D GAACTTTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 A 10 9 330273 CASAVA_Build 20 12128977 1D TCTGCCTTTT C/- CTCTTCTGTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 C 2 1 330274 CASAVA_Build 20 12129550 3D CAGTATGTGT GGC/--- GCAAGCTGGA 3070 het 3070 ref 39 19 12 10 GGC 1 0 330275 CASAVA_Build 20 12135868 4D GCTTTTGAAA TTCT/---- TTCTTTGTTT 3070 het 2856 hom 27 8 15 4 TTCT 2 1 330276 CASAVA_Build 20 12138454 1D ATATCCACTT A/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 43 25 13 6 A 1 0 330277 CASAVA_Build 20 12138898 28D CTTTTAAGAT ATATATATATCTTTAAGATATCTTTAAG/---------------------------- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 23 10 10 7 ATATATATATCTTTAAGATATCTTTAAG 1 0 330278 CASAVA_Build 20 12140701 1D ATTGATACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 A 10 9 330279 CASAVA_Build 20 12144088 4I TGCACCTCTC ----/TCTT TTTACTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 TCTT 0 1 330280 CASAVA_Build 20 12147800 3I CTTAATAAAT ---/AGG AGCCCAGAGA 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 AGG 0 1 330281 CASAVA_Build 20 12150875 1I GGTATCCTAG -/A AAAAGACTTA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 5 330282 CASAVA_Build 20 12151000 1I TGACAAAGTT -/A AACAGTCAAG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 2 3 330283 CASAVA_Build 20 12154926 3D AAAAAAAAAA AAC/--- CCAAAAAAAC 2859 het 2495 hom 48 17 24 8 AAC 1 0 330284 CASAVA_Build 20 12156995 1I AATTCAGCCC -/T TTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 6 7 330285 CASAVA_Build 20 12158743 1D ACTCTCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 11 10 330286 CASAVA_Build 20 12160706 1I CATGCACCTT -/G GGACCCTGAG 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 G 2 3 330287 CASAVA_Build 20 12164817 4I TTATTTAAAC ----/TCTT TATGCATTTA 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 TCTT 0 1 330288 CASAVA_Build 20 12172462 1D AGAAACTGAG A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 7 6 330289 CASAVA_Build 20 12175263 1D GCCATTGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 9 8 330290 CASAVA_Build 20 12176555 1I GGGGAGGTGA -/G GGGGGAGAGA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 G 5 6 330291 CASAVA_Build 20 12182082 1D GGCTTCTATT A/- ATTATTCTTC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 2 1 330292 CASAVA_Build 20 12192011 1I TAGACCTTGA -/G GGGGGGGCTC 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 G 7 8 330293 CASAVA_Build 20 12210436 10D AGTAAAAAAC AAACAAAACA/---------- AAACAAAACA 2757 het 2757 ref 23 13 8 2 AAACA 5 3 330294 CASAVA_Build 20 12211467 3I CTGTCATTTG ---/CAA CAACATGGAC 2647 het 2647 ref 32 13 7 12 CAA 1 2 330295 CASAVA_Build 20 12211790 2I AAAGTTCGTA --/AC ACAGTGAGAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 AC 1 2 330296 CASAVA_Build 20 12212198 1I TAAAAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 A 10 11 330297 CASAVA_Build 20 12215628 1D CAACTTTTTC A/- AATATTGGGA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 3 2 330298 CASAVA_Build 20 12217674 3I CGTAAACTCC ---/CTT CTTCTGTGCC 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 CTT 1 2 330299 CASAVA_Build 20 12220151 1D AGCAATTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 61 21 30 10 T 11 10 330300 CASAVA_Build 20 12223009 1I AGCAGTTTCA -/T TATACAGAGC 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 T 1 2 330301 CASAVA_Build 20 12225264 1D AAAATAGGGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 10 9 330302 CASAVA_Build 20 12226679 2D TTTGTCTGAC TG/-- TGTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 TG 2 1 330303 CASAVA_Build 20 12232079 7I CCAGGTCATG -------/TATCCAC CTGATGCAAG 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 TATCCAC 0 1 330304 CASAVA_Build 20 12232895 5D CAAAATGCTG CCAGT/----- CCAGTCCCTT 2498 het 2498 ref 26 19 7 2 CCAGT 2 1 330305 CASAVA_Build 20 12234381 5D CACGCTGAAT AGAAA/----- AGAAGGGAAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AGAAA 1 0 330306 CASAVA_Build 20 12248272 1D ACACAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 12 11 330307 CASAVA_Build 20 12250288 1I TTCAGCCTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 888 hom 44 2 37 5 T 9 10 330308 CASAVA_Build 20 12251400 1D TAGCTCTTTT G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 38 1 30 7 G 1 0 330309 CASAVA_Build 20 12252090 1I TTGCTATTAC -/A AATAAGGCTG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 2 3 330310 CASAVA_Build 20 12261268 1D TTCAACTGAA C/- CTCCCCTACT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 2 1 330311 CASAVA_Build 20 12265148 3I TTAAAATAGC ---/ATG ATATTACTTG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ATG 0 1 330312 CASAVA_Build 20 12265783 4I TACAGCATGT ----/TCTC TCTATTTTAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TC 1 3 330313 CASAVA_Build 20 12266932 1D CAGTAATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 35 1 28 6 A 15 14 330314 CASAVA_Build 20 12294360 3I AAGTTTTTTA ---/AAT AATAGGCAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AAT 1 2 330315 CASAVA_Build 20 12295025 1I AATCAAACTG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 8 9 330316 CASAVA_Build 20 12296573 4D TACTGGAAGT AGAA/---- AGAAAGTAAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 AGAA 2 1 330317 CASAVA_Build 20 12302048 3D CACAGATGAC TAT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 29 4 12 14 TAT 1 0 330318 CASAVA_Build 20 12310594 2D TGGAACACTT GG/-- GAGTCAGGAG 3070 hom 78 het 30 0 24 7 G 3 1 330319 CASAVA_Build 20 12315885 1I GAAGATACTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 8 330320 CASAVA_Build 20 12330063 2I TAAACAAAGG --/TA TAAGAAGCAC 3070 hom 132 het 52 0 45 7 TA 1 2 330321 CASAVA_Build 20 12330224 1I2M1I TTGCTTCTAA -GC-/TGCA TTCTATATGT 3070 hom 131 het 48 0 44 5 N/A 0 0 330322 CASAVA_Build 20 12332269 1I CTGTAATCCC -/A AGCACTTTGG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 1 2 330323 CASAVA_Build 20 12332351 1I ACCCTGGCTC -/T ACTAAAAATA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 0 1 330324 CASAVA_Build 20 12335445 1I CATGTTGAGG -/A CTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 36 2 28 6 A 0 1 330325 CASAVA_Build 20 12377491 1I AGCCTGCTGG -/A AAAGCGCAGT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 3 4 330326 CASAVA_Build 20 12382122 1D ATGCCTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 425 hom 26 1 21 4 A 11 10 330327 CASAVA_Build 20 12385612 4D TATTAAAGCA ACAC/---- ACACAGTGGA 3070 hom 160 het 54 0 54 3 AC 4 2 330328 CASAVA_Build 20 12386497 4I ATTGATAATT ----/TCAC TCACATAGCT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TCAC 1 2 330329 CASAVA_Build 20 12388600 34D GTATATCTCA TTTGAACATGGACTCGAAACATACTGCCATCATT/---------------------------------- TTTGAACATG 3070 hom 71 het 28 0 21 14 TTTGAACATGGACTCGAAACATACTGCCATCATT 2 1 330330 CASAVA_Build 20 12389010 5I TTCAATCACT -----/TAAGA TAAGCACAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TAAGA 0 1 330331 CASAVA_Build 20 12389309 11I CATTCTTGAC -----------/CCTGACTTGAT ATTCACCCAT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 CCTGACTTGAT 0 1 330332 CASAVA_Build 20 12391916 15D GAGGTAGATG AGGAAAGGAGAAACC/--------------- AGGAAAGGAG 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 AGGAAAGGAGAAACC 1 0 330333 CASAVA_Build 20 12392004 1D AAAGCTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 543 hom 38 3 25 10 A 14 13 330334 CASAVA_Build 20 12395614 1D GTGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 11 10 330335 CASAVA_Build 20 12398853 1D ACTCCATCTG A/- AAAAAAAAAA 1557 het 1557 ref 17 9 4 4 A 13 12 330336 CASAVA_Build 20 12448559 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2100 het 575 hom 17 3 7 8 A 12 11 330337 CASAVA_Build 20 12449057 1I CTAAATACTG -/T TTTTCTGAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 4 5 330338 CASAVA_Build 20 12462568 1I CTGAAAAAAA -/T ATTGGACCTC 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 0 1 330339 CASAVA_Build 20 12470145 1D TTTTTATTTC T/- GTGATATTAG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 1 0 330340 CASAVA_Build 20 12470520 6D ATTTCAAGAT ATTTTA/------ ATTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 ATTTTA 1 0 330341 CASAVA_Build 20 12471381 1D TCTAAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 2439 het 2439 ref 22 11 6 5 T 11 10 330342 CASAVA_Build 20 12474852 1I GGTGAAGATC -/T TTTTTTTTTA 2866 het 739 hom 15 3 7 5 T 9 10 330343 CASAVA_Build 20 12475671 30D TATGTATAAA CATATATATAAATATATATATATGGATATC/------------------------------ CATATATATA 1671 het 1464 hom 12 5 5 5 CATATATATAAATATATATATATGGATATC 1 0 330344 CASAVA_Build 20 12478407 5I TTAACTTCTC -----/TTTGT TTTGTTTTCC 3070 het 3070 hom 51 17 27 7 TTTGT 1 2 330345 CASAVA_Build 20 12485956 1D AAGTAATTGA T/- TTTTTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 10 20 6 T 6 5 330346 CASAVA_Build 20 12486838 1D TAACTTGTCA C/- TTTTATCTAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 C 1 0 330347 CASAVA_Build 20 12493651 1I TTCCAAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 A 11 12 330348 CASAVA_Build 20 12495903 1D ACAACCTGTA T/- TTTCCATCAG 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 T 4 3 330349 CASAVA_Build 20 12499007 14D TTTATTTCCA CACCCCCACTCTGT/-------------- CACCACAATC 2962 het 2962 ref 32 15 10 11 CACCCCCACTCTGT 1 0 330350 CASAVA_Build 20 12499365 3D ATCATTGTTG TCA/--- TCATCATTTT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 TCA 3 2 330351 CASAVA_Build 20 12500041 2I GCTAGGTATC --/AT ATTAAATGCT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 AT 1 2 330352 CASAVA_Build 20 12506643 1I ATTCTCCACA -/C CCTGGGTCAG 3070 hom 119 het 45 0 39 6 C 2 3 330353 CASAVA_Build 20 12526637 9D TTTGGAATAC AAAATATAA/--------- ATTATTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 12 7 AAAATATAA 1 0 330354 CASAVA_Build 20 12526679 3D AAGTTGACAC ACA/--- ACATTACATT 2508 het 2508 ref 30 17 6 10 ACA 2 1 330355 CASAVA_Build 20 12545930 1I AATAGGCCTG -/C CTTGCTGACA 3070 hom 69 het 30 0 22 8 C 1 2 330356 CASAVA_Build 20 12553887 6I ATCTCCTTGC ------/TTAAGT TTATTTCCAG 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 TTAAGT 0 1 330357 CASAVA_Build 20 12555430 1I TTGATGTACT -/C CCTGACTTAT 3070 het 3070 ref 54 24 24 6 C 2 3 330358 CASAVA_Build 20 12581660 1I AATGCTAAGA -/T TTAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 2 3 330359 CASAVA_Build 20 12598106 5D TCCCTTTTTT ATAGC/----- ATAGCAGCCC 3070 het 3070 ref 36 18 9 10 ATAGC 2 1 330360 CASAVA_Build 20 12604723 1I TCACTACACC -/A ATTAGTAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 1 2 330361 CASAVA_Build 20 12606392 1I AATCACCCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 16 16 12 T 9 10 330362 CASAVA_Build 20 12619758 1D TAATAAAGAC A/- ATACCCGAGA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 2 1 330363 CASAVA_Build 20 12634105 4D TTTCTTCCTT TTTC/---- TTTATTATTT 1971 het 1971 ref 18 7 8 4 TTTC 1 0 330364 CASAVA_Build 20 12635374 2D ACATATATTT TA/-- TATATATATA 2640 hom 18 het 9 0 7 2 TA 7 6 330365 CASAVA_Build 20 12636578 4I CTTTTTAAAA ----/AATT AATTTCAACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AATT 1 2 330366 CASAVA_Build 20 12639438 1D ATGAAAGTTC A/- ACCGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 2 1 330367 CASAVA_Build 20 12642367 3I AGGATGATGC ---/ATT ATGTTTTTTC 3070 hom 138 het 53 0 47 6 ATT 0 1 330368 CASAVA_Build 20 12653572 1I AGTAAAAAAT -/A AAAAAATAGG 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 A 6 7 330369 CASAVA_Build 20 12655118 4I CTGGAAAATA ----/CGTT TGTTTGATTG 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 CGTT 0 1 330370 CASAVA_Build 20 12668527 1D AATAAAAATG A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 8 7 330371 CASAVA_Build 20 12669350 1D AGCTCCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 47 1 40 6 A 11 10 330372 CASAVA_Build 20 12675102 1D CTACTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 1944 het 1944 ref 49 31 7 12 A 12 11 330373 CASAVA_Build 20 12712278 1D CCCCTCTGAG T/- TTCCAGCAAC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 3 2 330374 CASAVA_Build 20 12715213 1D AATTTTCTGG A/- GCGTATGGTC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 330375 CASAVA_Build 20 12729670 5D TATTTATTTA TTTTT/----- TTATTATACT 3070 het 1628 hom 15 4 10 1 T 7 2 330376 CASAVA_Build 20 12739104 2D TGAAGAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 27 2 17 9 A 16 14 330377 CASAVA_Build 20 12740096 1D GACTGACCAC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 9 8 330378 CASAVA_Build 20 12741083 1D GAACTAGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 21 2 A 11 10 330379 CASAVA_Build 20 12741387 6D AAAAAAAAAA AGAAGG/------ CAATCCTAGT 2569 het 946 hom 17 5 7 8 AGAAGG 1 0 330380 CASAVA_Build 20 12749647 1I GTAATTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 10 11 330381 CASAVA_Build 20 12767048 4I TGAGTGCAGA ----/AATC AATCCAAACT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 AATC 1 2 330382 CASAVA_Build 20 12769191 1D ATACAAGCAG A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 A 7 6 330383 CASAVA_Build 20 12772589 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2705 het 1670 hom 25 7 10 8 A 13 14 330384 CASAVA_Build 20 12782706 2I CAATTCTTTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 A 10 12 330385 CASAVA_Build 20 12785723 2D AACCTGGCAC AT/-- GTTTCACACT 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 AT 1 0 330386 CASAVA_Build 20 12805575 1D TCTTTCCCCT C/- CCCAGTAATG 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 C 4 3 330387 CASAVA_Build 20 12826028 1D ATAATTTTTT C/- CTACACATAC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 2 1 330388 CASAVA_Build 20 12828498 1I TTCTTGGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 34 0 23 11 T 10 11 330389 CASAVA_Build 20 12832964 2I AGTCAATATC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 AT 8 9 330390 CASAVA_Build 20 12839798 1D AAATGGATTT A/- AAAATCGGCC 3070 hom 81 het 29 0 27 3 A 5 4 330391 CASAVA_Build 20 12870751 4D TCCCTTTGTG ATTT/---- ATTTATTCCA 3070 het 3070 ref 31 19 11 4 ATTT 2 1 330392 CASAVA_Build 20 12887370 1I AGTCATGGAA -/C TTTTCTGCAG 3070 hom 129 het 51 0 44 7 C 0 1 330393 CASAVA_Build 20 12889408 1I CGATGGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 403 hom 26 1 19 6 A 11 12 330394 CASAVA_Build 20 12893356 4D GGAGAGAAAA AAAC/---- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 AAAC 1 0 330395 CASAVA_Build 20 12895074 1D ATTTCTGTCA T/- CTGAAGTTGA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 1 0 330396 CASAVA_Build 20 12906493 3I AGCAATTTCA ---/CTC CTAAGTGTTT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 CTC 0 1 330397 CASAVA_Build 20 12909869 5D GTAAATACAT ATATC/----- AGATATGATT 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 ATATC 1 0 330398 CASAVA_Build 20 12931391 1D AAACAACAAT A/- AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 36 20 3 13 A 11 10 330399 CASAVA_Build 20 12935345 3D TGCTAATTTT ATC/--- ATCTTTGCCT 3070 hom 135 het 48 0 46 3 ATC 2 1 330400 CASAVA_Build 20 12948996 1I CCCATTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2379 hom 28 7 13 8 A 12 13 330401 CASAVA_Build 20 12956119 6D ATTATAATGC CAGACA/------ CAGACACGCC 3070 het 3070 ref 36 17 15 6 CAGACA 2 1 330402 CASAVA_Build 20 12958170 3I ATATGGCACT ---/TGA TGAAAACAAT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 TGA 1 2 330403 CASAVA_Build 20 12960407 1D AGTATTCACC T/- GAGATGGAAA 3070 het 3070 ref 54 28 22 6 T 1 0 330404 CASAVA_Build 20 12962845 1D AAGATAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 53 26 18 9 A 10 9 330405 CASAVA_Build 20 12963439 1I GTTATTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 A 10 11 330406 CASAVA_Build 20 12978263 1D TTTGAACCAA T/- TTTTTTGGGC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 7 6 330407 CASAVA_Build 20 12979870 6D AGGACTCACA TAAACT/------ TAAAGTAAAC 3070 hom 57 het 20 0 20 1 TAAACT 1 0 330408 CASAVA_Build 20 12985976 1I AAAATTATGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 6 7 330409 CASAVA_Build 20 12986793 3D AAAGTGGGTT CAG/--- CAAGCTGCAG 3070 hom 90 het 33 0 31 3 CAG 1 0 330410 CASAVA_Build 20 12992920 2D TTTCCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2508 hom 31 het 17 0 10 7 T 12 10 330411 CASAVA_Build 20 12998755 1D TTGTAGCCTC A/- AAAAATATGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 6 5 330412 CASAVA_Build 20 13005172 1I GTTCCAGGGG -/A AAAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 5 6 330413 CASAVA_Build 20 13005268 1I TTATTTTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 10 11 330414 CASAVA_Build 20 13006865 3I AAGTAATAAT ---/ATA ATAATATTAT 2248 hom 18 het 7 0 7 0 ATA 2 3 330415 CASAVA_Build 20 13018140 1I TAATCACTAT -/A AAAAAAATAT 2672 het 2672 ref 15 8 6 1 A 7 8 330416 CASAVA_Build 20 13019545 1D ATACCCCACA T/- TGTATTTTTC 3070 het 3070 hom 47 18 22 9 T 2 1 330417 CASAVA_Build 20 13020220 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 20 1 16 3 A 13 12 330418 CASAVA_Build 20 13021493 1I GCTTAAGAAG -/T TTTACAATTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 3 4 330419 CASAVA_Build 20 13030935 1D TTAATGATAA T/- TAAAAGGTAT 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 2 1 330420 CASAVA_Build 20 13051977 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 1959 het 1959 ref 34 12 8 14 A 13 14 330421 CASAVA_Build 20 13059780 1I GACTCCCCTG -/A AGAAAGCATT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 A 1 2 330422 CASAVA_Build 20 13073401 2D AGGTCTACTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 37 0 29 8 TG 7 6 330423 CASAVA_Build 20 13118190 2D GCCAACAAAC AT/-- ATGAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 7 AT 2 1 330424 CASAVA_Build 20 13130228 1D ATTAATGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 A 12 11 330425 CASAVA_Build 20 13154824 4D TCTCTGTTTC CTAA/---- CTATCATCTT 3070 het 3070 hom 43 21 19 4 CTAA 1 0 330426 CASAVA_Build 20 13161672 1I ATGCTGGACC -/A AAAAAAAAAA 1891 het 1891 ref 36 10 9 17 A 12 13 330427 CASAVA_Build 20 13166767 1I CTTAAAATTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 A 8 9 330428 CASAVA_Build 20 13171788 1D GTCTATTACC A/- AAAAAGAACT 3070 het 3070 hom 46 17 24 6 A 6 5 330429 CASAVA_Build 20 13172279 1I22M1I ATCCCCTCAC -TTTTCAAATATAAGCTATGAAT-/TTTTTCAAATATAAGCTATGATTA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 19 25 3 N/A 0 0 330430 CASAVA_Build 20 13174920 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1207 hom 26 7 11 10 A 15 14 330431 CASAVA_Build 20 13184573 1D GTTCCTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3039 het 2671 hom 26 10 9 7 T 11 10 330432 CASAVA_Build 20 13200498 4D CATAGCTTAC TGCA/---- TGCAGCCCCT 3065 het 2420 hom 19 7 9 5 TGCA 2 1 330433 CASAVA_Build 20 13205325 2D TTTGGAAATC TG/-- TGCTCACTCC 3070 het 3070 ref 46 26 20 0 TG 2 1 330434 CASAVA_Build 20 13209039 2D TTCAAAGTAA CC/-- CCCCCCCCCC 2660 het 161 hom 25 3 7 15 C 12 10 330435 CASAVA_Build 20 13218311 12D AAGAGAAGGA GGAGGAGGAGGG/------------ GGAGGAGGAG 3070 het 3070 ref 37 18 16 10 GGAGGAGGAGGG 1 0 330436 CASAVA_Build 20 13234727 1I CCTCAAAATG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 7 8 330437 CASAVA_Build 20 13238499 1D CAACAGCATC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 8 7 330438 CASAVA_Build 20 13240709 4D GTCAGTTAAG AATT/---- AATTAACTTT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 AATT 2 1 330439 CASAVA_Build 20 13245945 3D AGAGAAATCA AAG/--- AAGTAAATAA 2318 het 2318 ref 15 9 5 1 AAG 2 1 330440 CASAVA_Build 20 13246570 1D CACTATCCGT G/- GAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 G 2 1 330441 CASAVA_Build 20 13255180 1I TTGGTATGAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 T 8 9 330442 CASAVA_Build 20 13259103 2D CTATATTTAT GA/-- GAGATATTAG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 GA 3 2 330443 CASAVA_Build 20 13267360 7I TCTTGGACTT -------/TACAGTG GCTTGAATTT 3070 het 3070 ref 67 39 24 4 TACAGTG 0 1 330444 CASAVA_Build 20 13269137 1D GTGTGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1966 het 1966 ref 31 18 5 8 T 11 10 330445 CASAVA_Build 20 13300127 4I TCTTTCTGTT ----/ACTA ACTTTTAATT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ACTA 0 1 330446 CASAVA_Build 20 13302104 2D ATTCTTTCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 25 1 15 10 T 14 12 330447 CASAVA_Build 20 13325250 1I TTAATGAATC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 8 9 330448 CASAVA_Build 20 13369328 1D CTGATAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 24 0 14 10 A 13 12 330449 CASAVA_Build 20 13396611 11D TTCAGTGAGG CGAGGTTGCAC/----------- CATTGCATTC 3070 hom 27 het 12 0 10 3 CGAGGTTGCAC 1 0 330450 CASAVA_Build 20 13396858 4I TAAAACAAAC ----/AAAT AAAGATACTC 3070 hom 138 het 52 0 47 5 AAAT 0 1 330451 CASAVA_Build 20 13397018 1I CTGGATTTTA -/C CACATTCATA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 C 1 2 330452 CASAVA_Build 20 13409614 2D TCCAATTACA CT/-- CTTTTAGTTA 3070 hom 27 het 30 1 27 5 CT 2 1 330453 CASAVA_Build 20 13410497 1D AGTTTGCAAA T/- TATCTTCTCC 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 2 1 330454 CASAVA_Build 20 13425133 2D TTTCCTACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 23 2 15 7 A 13 11 330455 CASAVA_Build 20 13450433 5D TATAATAATA AAATT/----- AAATTAAATT 3070 hom 48 het 17 0 17 3 AAATT 4 3 330456 CASAVA_Build 20 13468616 2I GATCACACGA --/AC ATACTCATGG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AC 0 1 330457 CASAVA_Build 20 13474293 1I GTGTTACACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 210 hom 31 1 25 5 T 9 10 330458 CASAVA_Build 20 13474837 1I GCCAAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 37 0 30 7 A 10 11 330459 CASAVA_Build 20 13475238 3I ATAGGAATTC ---/TTG TTGTGATGAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTG 1 2 330460 CASAVA_Build 20 13483053 2D TAAAGAAAAC AA/-- GAGCGCTCTA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 0 330461 CASAVA_Build 20 13483166 1I ACTTTAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 8 9 330462 CASAVA_Build 20 13490526 1I TTGTAACCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 389 hom 47 1 38 8 A 9 10 330463 CASAVA_Build 20 13492962 1D AAAAGAAATT A/- AGAAAGCAAT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 A 2 1 330464 CASAVA_Build 20 13503281 1I ATGGAAGACA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 6 7 330465 CASAVA_Build 20 13521045 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2091 het 2091 ref 25 13 6 6 A 15 16 330466 CASAVA_Build 20 13542977 1D TACTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 1328 het 1328 ref 42 27 3 12 A 11 10 330467 CASAVA_Build 20 13641491 2D TTATGATTAA AC/-- AGTTTAAAGA 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 AC 1 0 330468 CASAVA_Build 20 13651485 2D CCTGAGTGAC AG/-- AGCAAAATGC 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 AG 2 1 330469 CASAVA_Build 20 13652954 11D AAAAATAAAT AAATAAAATAA/----------- AAATAAAATA 2346 het 395 hom 14 1 9 4 AAATAAAATAA 2 1 330470 CASAVA_Build 20 13663426 1I ATTAAAAAAA -/T GAGACATCAT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 0 1 330471 CASAVA_Build 20 13669639 1D ATCCTCAATA T/- TCACAGCCTC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 2 1 330472 CASAVA_Build 20 13670006 1D CTTCACAGAA C/- CCCCATACAA 3070 het 3070 hom 52 21 21 11 C 5 4 330473 CASAVA_Build 20 13672197 1D ATTCAGCCAC A/- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 6 5 330474 CASAVA_Build 20 13676362 1I6M1I GAGAAATGTG -TAGGCA-/TTAGGCAT TTTTATTGTT 3070 hom 87 het 30 0 30 2 N/A 0 0 330475 CASAVA_Build 20 13685389 4D GGAAGTCACG TAAC/---- TAACTAGTGA 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 TAAC 2 1 330476 CASAVA_Build 20 13685766 3D ATTACAGATG ATA/--- ATCTTTCATT 3070 het 3070 ref 22 12 9 4 ATA 1 0 330477 CASAVA_Build 20 13686718 2D TTACTGACAC AG/-- AGAGCTCAAC 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 AG 3 2 330478 CASAVA_Build 20 13692054 1D CCCTAATGCC A/- AAAAATGTCA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 6 5 330479 CASAVA_Build 20 13698449 1I AAATAATAAC -/A AAAAAATTAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 6 7 330480 CASAVA_Build 20 13702127 1I TGACTTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 T 9 10 330481 CASAVA_Build 20 13702924 10I AAATCCCAAA ----------/TCCAAAATGC TCCAAAATTC 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 TCCAAAATGC 0 1 330482 CASAVA_Build 20 13703729 1D AACTATGGCC A/- AAAAAAAAAA 2693 het 2693 ref 27 13 7 7 A 17 16 330483 CASAVA_Build 20 13706452 1I TGGAGCTTAT -/G TTTCTGCTTA 3070 hom 84 het 38 0 29 9 G 0 1 330484 CASAVA_Build 20 13707110 1I TTGAATATCA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 7 8 330485 CASAVA_Build 20 13711897 4I TTTAAAACAC ----/ATTA ATTCACAATA 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 ATTA 0 1 330486 CASAVA_Build 20 13715712 2D CATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 778 hom 26 6 9 13 TG 9 8 330487 CASAVA_Build 20 13718984 1D TTAGTAACTC A/- ACGCCAAAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 2 1 330488 CASAVA_Build 20 13735694 1D CACCCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 1644 het 846 hom 19 4 5 10 T 17 16 330489 CASAVA_Build 20 13744590 10I CTAATGTGGG ----------/ATTAGTAAAA ATTAGTAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATTAGTAAAA 1 2 330490 CASAVA_Build 20 13746449 22D CAGTCTCTGC ACAGTCATCAGTTTATTGTTAA/---------------------- GCTTTCCTTT 3070 het 3070 ref 47 27 26 6 ACAGTCATCAGTTTATTGTTAA 1 0 330491 CASAVA_Build 20 13747090 1D TTTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 14 12 T 14 13 330492 CASAVA_Build 20 13754214 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 31 1 27 5 A 13 12 330493 CASAVA_Build 20 13754610 1D ATTGAACATA T/- TTTCTTTTAG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 4 3 330494 CASAVA_Build 20 13774157 1I ACCTGACTTG -/A CCTTTGAAAA 3070 hom 65 het 28 0 22 6 A 0 1 330495 CASAVA_Build 20 13776851 1D AAAAAAAGAA G/- AAGAAAAGTA 2364 hom 27 het 10 0 8 2 G 1 0 330496 CASAVA_Build 20 13782029 2D GATTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 910 hom 26 4 17 5 T 12 10 330497 CASAVA_Build 20 13790929 1I GACTTCAGTC -/T TTTGAAGTCC 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 T 3 4 330498 CASAVA_Build 20 13792615 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1662 het 1662 ref 21 10 5 6 A 15 14 330499 CASAVA_Build 20 13800324 1I TGCCCAGCTG -/A TTTTTCGTAT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 0 1 330500 CASAVA_Build 20 13800421 1D GCTTCCCAAA G/- TGGTGGGATT 3070 het 3070 ref 25 13 8 6 G 1 0 330501 CASAVA_Build 20 13801429 1I TTGTCAGGCG -/A AAGAGTGGCC 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 A 2 3 330502 CASAVA_Build 20 13812957 1D AATCATCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 26 10 6 A 11 10 330503 CASAVA_Build 20 13820953 1D AAATCAGCCA C/- CATATGATGG 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 C 2 1 330504 CASAVA_Build 20 13821096 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 13 12 330505 CASAVA_Build 20 13827380 1D CTTCCCATTG T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 T 7 6 330506 CASAVA_Build 20 13831359 2D TTAGTAGAAG AA/-- AAAACGTCTG 3070 hom 71 het 28 0 21 8 A 6 4 330507 CASAVA_Build 20 13832464 1I CCATCTTAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2881 hom 22 8 8 6 A 9 10 330508 CASAVA_Build 20 13849233 2D ACTCTCACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 11 13 14 AC 9 8 330509 CASAVA_Build 20 13852935 3I TTTGTTTTTC ---/TTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 19 11 11 T 9 12 330510 CASAVA_Build 20 13854965 1I CGTTTCAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 9 10 330511 CASAVA_Build 20 13859516 1D GAAGAACACA T/- TTTGTGATTA 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 T 4 3 330512 CASAVA_Build 20 13860073 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAATAAA 3070 het 1150 hom 18 5 10 3 A 7 6 330513 CASAVA_Build 20 13868312 8D ACCCTTATTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 653 hom 18 4 8 8 T 18 10 330514 CASAVA_Build 20 13871285 1D AATACAAAAA T/- TTAACATCAG 3070 het 3070 ref 51 26 22 4 T 3 2 330515 CASAVA_Build 20 13871677 1I GTAATAACCA -/C CCCCTAAGTG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 C 4 5 330516 CASAVA_Build 20 13872127 1D GAGCTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1074 hom 37 6 22 9 T 15 14 330517 CASAVA_Build 20 13875446 4I GCACCTGGTA ----/CCTG CTGTGATTTT 3070 hom 81 het 32 0 25 7 CCTG 0 1 330518 CASAVA_Build 20 13875774 7I TGGGGGCCAG -------/GATCCAT GATCCATTCC 3070 het 3070 hom 29 11 15 4 GATCCAT 1 2 330519 CASAVA_Build 20 13880227 1I CCTGGGTCAC -/T AGAGCAAGAC 2379 het 12 hom 8 0 5 3 T 0 1 330520 CASAVA_Build 20 13881411 1D CGCGGTGCCT G/- GACGCCTGTA 3070 hom 39 het 26 0 17 9 G 2 1 330521 CASAVA_Build 20 13882753 1D AGTAGATGAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 T 10 9 330522 CASAVA_Build 20 13886999 1D AGTTTTTGCA T/- TGTTGGAATT 3070 het 3070 hom 39 18 16 6 T 2 1 330523 CASAVA_Build 20 13887579 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAGTT 3070 het 252 hom 25 4 11 10 G 0 1 330524 CASAVA_Build 20 13888823 1D CAAAGTACAC A/- GAATAAAATT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 A 1 0 330525 CASAVA_Build 20 13891712 2I37M1D ACTCCATCTC --AAAAAAAAAAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAAATATA/AAAAAAAAAAAAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAAATAT- AAAAAAAACT 3070 hom 38 het 19 0 12 17 N/A 0 0 330526 CASAVA_Build 20 13893781 5I TAGGAAGGGA -----/TACTG TACTGATTCC 3070 hom 84 het 33 0 27 6 TACTG 1 2 330527 CASAVA_Build 20 13916809 1D GGTATGAGGT G/- GGGGTACAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 5 4 330528 CASAVA_Build 20 13917805 1D TAACTTCTTT A/- AACAATTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 A 3 2 330529 CASAVA_Build 20 13966942 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 13 14 330530 CASAVA_Build 20 13976660 1D ATTTTTTTTT C/- TTTTAATGCT 3070 het 1906 hom 35 10 16 9 C 1 0 330531 CASAVA_Build 20 13977821 5D TATATTTAAT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 44 het 44 ref 30 4 1 26 A 15 10 330532 CASAVA_Build 20 13984390 1D ATCAGTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 37 0 26 11 T 14 13 330533 CASAVA_Build 20 13985476 1D TTCAGATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 11 10 330534 CASAVA_Build 20 13987088 1D AGAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2546 het 2546 ref 22 7 7 8 A 11 10 330535 CASAVA_Build 20 13998970 4D TAGAGGGGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 276 hom 42 4 21 17 TG 10 8 330536 CASAVA_Build 20 14005805 5D AACCTTAGAC TTACA/----- TTACATTACA 3070 hom 96 het 39 0 33 8 TTACA 3 2 330537 CASAVA_Build 20 14009332 1I AGTCCTGTTC -/G ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 G 0 1 330538 CASAVA_Build 20 14011355 4I TTCTGCATTC ----/ATTT GTGATAAGTC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 ATTT 0 1 330539 CASAVA_Build 20 14013197 1D CACAGCTTTT A/- CTAGATTTAT 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 A 1 0 330540 CASAVA_Build 20 14013437 14I TCACAAATTC --------------/AAATATTCTCCTTG AAATTTCCTA 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 AAATATTCTCCTTG 0 1 330541 CASAVA_Build 20 14017136 1D ATAAATACAC T/- TATCAGCCTT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 2 1 330542 CASAVA_Build 20 14022315 1D CTCATTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 741 hom 29 3 21 5 A 12 11 330543 CASAVA_Build 20 14029367 2I TATATACATT --/AA TATATATAAT 2049 hom 12 het 5 0 5 0 A 0 2 330544 CASAVA_Build 20 14036342 1D CACCTCTTTC A/- GTGGAAACCC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 1 0 330545 CASAVA_Build 20 14059952 1D ACAAATGAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2630 hom 25 6 17 3 T 9 8 330546 CASAVA_Build 20 14077839 1I GTACCCAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 33 2 18 13 T 13 14 330547 CASAVA_Build 20 14079910 1D CTAGTGTAGA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 123 het 46 0 42 5 T 8 7 330548 CASAVA_Build 20 14098139 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGTTTCTC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 4 5 330549 CASAVA_Build 20 14129595 1I GCTGGTAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 332 hom 31 1 22 8 T 13 14 330550 CASAVA_Build 20 14133129 2D TGTCTGGGTA TG/-- TGTGTGTGAC 3070 hom 165 het 61 0 54 7 TG 5 4 330551 CASAVA_Build 20 14150837 2D TTTTTATACT TA/-- TCACAGCACA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 TA 1 0 330552 CASAVA_Build 20 14151460 16D TGGATTTCTG AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1505 hom 20 9 11 4 A 29 13 330553 CASAVA_Build 20 14152774 1I AATCACATCT -/A AAAAAACACT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 6 7 330554 CASAVA_Build 20 14156985 7D AATATTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 841 hom 23 3 12 8 T 17 10 330555 CASAVA_Build 20 14157496 1D TACTAAAAAT A/- ACAAAAATTA 3070 hom 50 het 22 0 17 5 A 2 1 330556 CASAVA_Build 20 14157699 1D AGTATTGCTA G/- GATGTCTGTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 G 2 1 330557 CASAVA_Build 20 14160864 1I TCCTTGCCCA -/T GCCTATTCTT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 0 1 330558 CASAVA_Build 20 14164567 1D AAACATACTT A/- ATAGTATTAC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 2 1 330559 CASAVA_Build 20 14178811 1D CTTCATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 290 hom 47 1 40 6 A 11 10 330560 CASAVA_Build 20 14185930 1I TAATAATATT -/A AGATATCATC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 1 2 330561 CASAVA_Build 20 14186544 1D TCTTCACTTT C/- CCCAGCATCC 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 C 4 3 330562 CASAVA_Build 20 14187036 1D ACATCTATTA T/- TTTTTTATTA 3070 het 2080 hom 15 5 8 2 T 7 6 330563 CASAVA_Build 20 14189909 1I GTAAGTGAAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 7 8 330564 CASAVA_Build 20 14190379 4D TGTGTCAGAT ACTG/---- ACAGTACAAA 3070 het 3070 ref 43 26 16 2 ACTG 1 0 330565 CASAVA_Build 20 14190528 1D AGAAACGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 10 9 330566 CASAVA_Build 20 14192823 1I GAAGTTGCTA -/G TAGCACCAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 0 1 330567 CASAVA_Build 20 14196628 1D CACCACTACT C/- AAACACATTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 C 1 0 330568 CASAVA_Build 20 14198451 1I AACTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 18 7 T 10 11 330569 CASAVA_Build 20 14207514 4D TTTAAATGAG TTAC/---- TTAAGTAAGA 3070 het 3070 hom 33 15 17 4 TTAC 1 0 330570 CASAVA_Build 20 14218644 1D GTAGGAACTT A/- ACAGTTAAGT 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 A 2 1 330571 CASAVA_Build 20 14233419 1D CTTTTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 28 1 20 7 T 13 12 330572 CASAVA_Build 20 14234653 2I GTCTCTCTTG --/CT CTTTCTCTCT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 CT 1 2 330573 CASAVA_Build 20 14249310 11D ACCTTTGGAA TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2458 het 2458 ref 33 16 7 12 T 25 14 330574 CASAVA_Build 20 14250011 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 11 10 330575 CASAVA_Build 20 14252937 1D TTTTTTGTTG A/- AAAAAAAAAA 2653 het 2653 ref 37 20 9 8 A 12 11 330576 CASAVA_Build 20 14263442 1D TTTCTAATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 11 10 330577 CASAVA_Build 20 14269203 2I GAAGTGGAAA --/AG AGAGGAATAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AG 2 3 330578 CASAVA_Build 20 14292333 4I CGGGCGCGGT ----/GGCA GGCGCCTGTA 935 het 223 hom 4 1 3 0 GGCA 0 1 330579 CASAVA_Build 20 14297941 1I GCAAATGTAG -/T TTTTTTGCGA 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 T 6 7 330580 CASAVA_Build 20 14301028 1I AGACTGTTTC -/A AGACCAGTAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 330581 CASAVA_Build 20 14311954 2D CCGTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 217 hom 32 5 16 11 T 11 9 330582 CASAVA_Build 20 14314086 1I AAATTTAAAA -/T AAGTATCAAC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 0 1 330583 CASAVA_Build 20 14328710 3I AATTTTTCTC ---/CTT CTTGTAGGTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CTT 1 2 330584 CASAVA_Build 20 14330434 1D TATACTTTAG T/- TTCATCTTTG 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 T 3 2 330585 CASAVA_Build 20 14333248 1I CATCTCCAAA -/G AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 G 0 1 330586 CASAVA_Build 20 14333939 1D AGACTTAACC A/- AAAAGCCCCT 3070 hom 69 het 25 0 24 2 A 5 4 330587 CASAVA_Build 20 14335767 1I AGTGGCAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 40 2 29 9 A 10 11 330588 CASAVA_Build 20 14342552 4I AGTGTCTACC ----/TTTG TTTGTTCCTC 3070 hom 138 het 51 0 46 5 TTTG 1 2 330589 CASAVA_Build 20 14343576 1D CTGCTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 13 6 T 13 12 330590 CASAVA_Build 20 14359209 2D AAAACAGAAA AC/-- ACAGAGGACG 3070 het 3070 hom 53 24 23 8 AC 2 1 330591 CASAVA_Build 20 14361063 1I AGATAGGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 T 13 14 330592 CASAVA_Build 20 14364359 1I ATAGAAGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 12 13 330593 CASAVA_Build 20 14367575 1D CATTTATTTA T/- TTTTGATTTT 3070 het 3070 ref 36 16 17 5 T 5 4 330594 CASAVA_Build 20 14377428 1I ATGCAGTGCG -/T TTGATTGTGC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 2 3 330595 CASAVA_Build 20 14383065 1I TCCACATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 11 12 330596 CASAVA_Build 20 14397085 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 2114 het 1271 hom 13 5 5 3 T 13 12 330597 CASAVA_Build 20 14399895 2I TCCGTGGGCT --/GC GCACCTACTG 2946 het 2946 ref 32 14 9 9 GC 1 2 330598 CASAVA_Build 20 14402247 1D ATAATGCTTC T/- AACAAACTTG 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 T 1 0 330599 CASAVA_Build 20 14403976 4I CATAATTAAT ----/TAAG TAATATAATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TAAG 0 1 330600 CASAVA_Build 20 14413265 3D GGTAACCACC CTT/--- CTTTTCTCCA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 CTT 2 1 330601 CASAVA_Build 20 14413674 1D TCTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 9 8 330602 CASAVA_Build 20 14422364 3I TATACAGTAC ---/TCT TCTTGTCAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TCT 1 2 330603 CASAVA_Build 20 14423841 1D TCTGTCTCAT G/- TAAAGGTAGT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 G 1 0 330604 CASAVA_Build 20 14438992 2I AATATAAATA --/TT TTGTGATTAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 4 330605 CASAVA_Build 20 14440226 1D TTCCATAGTG A/- ATAAATTCTG 2504 het 2504 ref 20 11 6 3 A 2 1 330606 CASAVA_Build 20 14440330 2I TTTAGGAAAA --/AG GACAACCCTA 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 AG 0 1 330607 CASAVA_Build 20 14440407 1D TTGCTGACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 24 1 18 5 A 11 10 330608 CASAVA_Build 20 14440974 2I17M1D TTGAATTCGT --AGTATGGGAGTTTCCCCT/AAAGTATGGGAGTTTCCCC- GTGGAGGAAT 3070 het 3070 ref 38 21 20 6 N/A 0 0 330609 CASAVA_Build 20 14446774 3D AAAATAAAGA TAT/--- TATACCTCCA 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 TAT 2 1 330610 CASAVA_Build 20 14446899 1D TGCTGCTGAC T/- TTTTTATATG 3070 het 3070 hom 35 16 16 5 T 6 5 330611 CASAVA_Build 20 14449124 1I CTGTTTGAGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 8 9 330612 CASAVA_Build 20 14449618 4I CACACACACA ----/CACG CACGCACACA 3070 het 2174 hom 46 10 19 17 CACG 1 2 330613 CASAVA_Build 20 14450887 22D AACACAGATA GATAGGTCCTCAACATTAGCAG/---------------------- GTTGGGTAGT 3070 het 3070 ref 29 17 15 6 GATAGGTCCTCAACATTAGCAG 1 0 330614 CASAVA_Build 20 14456150 1D TTATATAGGC A/- AAAAAAACCA 3070 het 31 hom 38 1 12 25 A 8 7 330615 CASAVA_Build 20 14461776 1D CAGTCTACCT A/- AAGCCTGGAG 3070 het 3070 hom 39 16 23 0 A 3 2 330616 CASAVA_Build 20 14471593 3D GAAATGGTAA ATT/--- ATTATAATTT 3070 het 3070 ref 25 17 8 0 ATT 2 1 330617 CASAVA_Build 20 14479527 1D TCAGTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 922 het 444 hom 37 1 5 31 T 15 14 330618 CASAVA_Build 20 14479541 2D TTTTTTTTTT TG/-- AGGCCTAATG 3070 het 593 hom 40 7 26 10 TG 1 0 330619 CASAVA_Build 20 14490631 1D AATCTTTTTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 T 8 7 330620 CASAVA_Build 20 14491010 4D TAAACATGTA GCTT/---- GCTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 40 18 18 8 GCTT 2 1 330621 CASAVA_Build 20 14491170 1D GATGATTGCA C/- CCACAACACA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 C 3 2 330622 CASAVA_Build 20 14493995 1I ATAAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 A 11 12 330623 CASAVA_Build 20 14501703 1I TGAAATAGCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 8 9 330624 CASAVA_Build 20 14502225 1I AAAGATATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 10 11 330625 CASAVA_Build 20 14507241 2D AATTTCAACA AC/-- AGTGAACCTA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 AC 1 0 330626 CASAVA_Build 20 14509088 2D CCGTTGCCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 27 2 11 14 A 12 10 330627 CASAVA_Build 20 14510706 6D CCCTTCCTGT TTTACA/------ TTTACACTTC 3070 het 3070 ref 51 20 19 14 TTTACA 2 1 330628 CASAVA_Build 20 14516385 1D CCCTGCATTT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 8 7 330629 CASAVA_Build 20 14521807 2I ATGATAAAAC --/TG TTTTAAATTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TG 0 1 330630 CASAVA_Build 20 14534047 1I TGTCCAAATG -/T CCCCTTTTTA 3070 hom 106 het 39 0 35 4 T 0 1 330631 CASAVA_Build 20 14537861 24D GTTTGAGTTG TAACATTAGAAACAGAGAGCGTCA/------------------------ TAACATTAGA 3070 het 3070 ref 41 26 19 6 TAACATTAGAAACAGAGAGCGTCA 1 0 330632 CASAVA_Build 20 14546760 1I TCCCTATGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 52 het 30 0 27 3 T 9 10 330633 CASAVA_Build 20 14568042 1I TTTTGAAATG -/T TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 2 3 330634 CASAVA_Build 20 14574654 2D GTAAATATAT AA/-- GTTATAAGAA 3070 het 2315 hom 15 5 9 1 A 2 0 330635 CASAVA_Build 20 14590448 1D ATCTCAATTC T/- TTTCAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 4 3 330636 CASAVA_Build 20 14608387 1I TCCCACACGC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 7 8 330637 CASAVA_Build 20 14618654 2D TTTAAAAAAC AT/-- ATTTTAACAT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 AT 2 1 330638 CASAVA_Build 20 14618727 1I TCCTAAGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 9 10 330639 CASAVA_Build 20 14618905 3I TCTGTTTCTT ---/TTA TTATTTCTTC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 TTA 1 2 330640 CASAVA_Build 20 14648120 1D AGATAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 20 0 14 6 A 14 13 330641 CASAVA_Build 20 14659641 16D ACACACACAC ACACACACACACACAT/---------------- GCACACACAC 3070 het 3070 hom 36 22 19 3 ACACACACACACACAT 1 0 330642 CASAVA_Build 20 14663193 1I ACAAAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 25 0 18 7 A 11 12 330643 CASAVA_Build 20 14668186 4D AACTTATAAG ACAA/---- ACAAAGGTAT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 ACAA 2 1 330644 CASAVA_Build 20 14671098 2I AAATGCAAAC --/AG AGTCAAATTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AG 1 2 330645 CASAVA_Build 20 14672334 1I GAAAATTAAT -/A ACACGCGATA 3070 het 3070 hom 59 26 29 4 A 1 2 330646 CASAVA_Build 20 14673466 2I GGCCCCTAAC --/AT GTGAGAGTTT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 AT 0 1 330647 CASAVA_Build 20 14679369 1I GCCTCCCAAA -/G TGCTGGGATT 3070 het 2854 hom 23 11 12 0 G 0 1 330648 CASAVA_Build 20 14679962 1I AGTTCCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 21 9 T 10 11 330649 CASAVA_Build 20 14680491 1I CAGTAAAGAA -/T TGTGGATATA 3070 het 3070 hom 54 16 25 13 T 1 2 330650 CASAVA_Build 20 14691868 1D CACCTCACCA G/- GCCAATAAAG 3070 het 3070 ref 44 22 17 6 G 2 1 330651 CASAVA_Build 20 14694025 1D ATTCCTGCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2765 hom 27 10 14 3 T 10 9 330652 CASAVA_Build 20 14728735 1I ACTGGATGGT -/A CCCAGTCACA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 0 1 330653 CASAVA_Build 20 14738605 1I CCTACCAACC -/A AAAAAAAGGC 1508 het 1508 ref 19 11 4 4 A 7 8 330654 CASAVA_Build 20 14744139 2D TTATGTGTGG GT/-- GTGTGTGTGT 1276 het 1276 ref 53 39 3 11 GT 7 6 330655 CASAVA_Build 20 14765724 3I AGTGTTTTCT ---/CTC CTCTTCACTC 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 CTC 1 2 330656 CASAVA_Build 20 14770174 1I TGTTTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 13 11 A 10 11 330657 CASAVA_Build 20 14775738 1I TAGACAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 8 9 330658 CASAVA_Build 20 14782160 1I AAGTAGGGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 8 9 330659 CASAVA_Build 20 14783665 1I CCGTCTCAAA -/G AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 G 0 1 330660 CASAVA_Build 20 14784637 2I TTGTTATTTA --/AG AAAGATTTCA 3070 het 3070 ref 43 25 11 7 AG 0 1 330661 CASAVA_Build 20 14804907 1I TTGGCTGCTT -/G TATGTCTTCT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 G 0 1 330662 CASAVA_Build 20 14811432 1D ATTATCTCCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 119 het 44 0 40 4 T 8 7 330663 CASAVA_Build 20 14812244 1I TGACTCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 41 1 33 7 A 10 11 330664 CASAVA_Build 20 14812585 1I ATTTGGGATT -/G GGATTCCCTC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 G 2 3 330665 CASAVA_Build 20 14816510 1D GAAAAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2812 hom 36 12 12 12 A 15 14 330666 CASAVA_Build 20 14820654 3I TAAACATAAT ---/CAG TTCCAATGGA 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 CAG 0 1 330667 CASAVA_Build 20 14832234 1I TTATTTAGAT -/A ATATCAGGAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 2 330668 CASAVA_Build 20 14842557 1D CAACAACCAA G/- ATTTGAATAC 3070 het 3070 hom 36 14 18 5 G 1 0 330669 CASAVA_Build 20 14856891 3I GTGTAGAATT ---/ATC ATTCTATCCT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 ATC 0 1 330670 CASAVA_Build 20 14860392 1I GGCGTGTAAT -/C CCAGTGCTTT 3070 het 3070 hom 47 15 22 10 C 2 3 330671 CASAVA_Build 20 14860650 7D CCTGTTTCTT AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 2941 het 2219 hom 25 10 10 7 A 22 15 330672 CASAVA_Build 20 14862284 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 12 330673 CASAVA_Build 20 14884670 1I CTTTTAGCTG -/T TTTTTTTTTT 699 het 699 ref 31 15 3 13 T 12 13 330674 CASAVA_Build 20 14885784 1D GAGCACACAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 T 9 8 330675 CASAVA_Build 20 14896138 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 2701 het 2701 ref 33 21 7 5 T 8 9 330676 CASAVA_Build 20 14907022 1D CCGCGCCCCG C/- CCCCCCCACT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 8 7 330677 CASAVA_Build 20 14943141 15D CACTATACGT TGGAGATGCTTTTAA/--------------- TAACTTGGAG 3070 het 3070 ref 46 26 20 4 TGGAGATGCTTTTAA 1 0 330678 CASAVA_Build 20 14950024 2I ATGCATACGC --/AT AGTCTTCTGT 3070 het 3070 ref 23 13 7 3 AT 0 1 330679 CASAVA_Build 20 14964078 5I AAAATAAAAT -----/AATAA AATAAAATGT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 AATAA 1 2 330680 CASAVA_Build 20 14966597 1D TTCTCACTAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 A 9 8 330681 CASAVA_Build 20 14969205 1I AAGGTGAGGA -/G GTGTCTTCAG 3070 het 3070 ref 57 29 20 8 G 1 2 330682 CASAVA_Build 20 14979768 5D CTTTTCTGTC TGATT/----- TAACTAATGT 3070 het 3070 hom 37 15 20 5 TGATT 1 0 330683 CASAVA_Build 20 14988031 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 71 het 25 0 24 1 A 9 8 330684 CASAVA_Build 20 15007849 1D AGAGTTAACA T/- TTTTTCTCCT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 6 5 330685 CASAVA_Build 20 15012243 1D TCAACAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 12 11 330686 CASAVA_Build 20 15020649 2D AAAATAAGAT TG/-- TATTTCTGGT 3070 het 3070 hom 63 25 31 7 TG 1 0 330687 CASAVA_Build 20 15031382 2I AAACTCCCAC --/AT GTGTGAAAAT 3070 hom 141 het 53 0 48 5 AT 0 1 330688 CASAVA_Build 20 15036630 1I GAGCAAGCTC -/T TTTTTTTTTT 1176 het 1176 ref 32 12 8 12 T 15 16 330689 CASAVA_Build 20 15039802 4D CGTAGTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 953 het 953 ref 36 20 8 8 TTTG 3 2 330690 CASAVA_Build 20 15046578 4D TAGTAAAGAA TCAG/---- TCAATGTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 21 2 TCAG 1 0 330691 CASAVA_Build 20 15048908 2D TTAAGGGGGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 1165 hom 54 4 23 27 GT 9 8 330692 CASAVA_Build 20 15052254 5I TTCATTGCAC -----/TTATT TTATTTTTTA 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TTATT 1 2 330693 CASAVA_Build 20 15052880 4I AGTCAAAAGA ----/AGTG AGTAATTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 AGTG 0 1 330694 CASAVA_Build 20 15068986 4I AGAGAAAGGC ----/CTAT CTATCAGTAC 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 CTAT 1 2 330695 CASAVA_Build 20 15072724 1D CGGTGCCAAA G/- CATGAATGTT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 G 1 0 330696 CASAVA_Build 20 15084501 1D TGAGGAATAG A/- AAAAAAAAAA 2371 het 2371 ref 40 32 5 3 A 11 10 330697 CASAVA_Build 20 15088282 1I TGATTGGTTT -/C TTGGTTGATA 3070 hom 108 het 44 0 36 8 C 0 1 330698 CASAVA_Build 20 15088732 1I AAAGTCACTG -/A ATACCCTTGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 2 330699 CASAVA_Build 20 15091951 1I ACTATTCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 A 9 10 330700 CASAVA_Build 20 15106173 1D TCATTCATCG C/- CATTGAATCT 3070 het 3070 ref 40 20 15 6 C 2 1 330701 CASAVA_Build 20 15110634 2D AAAAAAAAAC TT/-- ATGACAAAAT 3070 het 3070 hom 40 14 24 3 T 2 0 330702 CASAVA_Build 20 15112161 1I AAAAAAAAAA -/G TAGATCTTAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 G 0 1 330703 CASAVA_Build 20 15128722 1I TTATCTTCTT -/A TCAAGAACCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 0 1 330704 CASAVA_Build 20 15132316 5D TAAACTAAGA TAATT/----- TAATCTTCTA 3070 het 3070 hom 49 21 26 4 TAATT 1 0 330705 CASAVA_Build 20 15136732 1I TGAAACTCTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 333 hom 31 1 25 5 T 8 9 330706 CASAVA_Build 20 15147518 1D GGTGAAACAC T/- TGTCTCTACT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 T 2 1 330707 CASAVA_Build 20 15150437 3D GAATAAAACA TAT/--- TATCAGCACA 3070 het 3070 ref 42 20 20 3 TAT 2 1 330708 CASAVA_Build 20 15166160 1I ACTCTATTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 49 16 23 10 T 8 9 330709 CASAVA_Build 20 15186749 1I AGAAAAAGTA -/T TTTTTTGTAC 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 T 6 7 330710 CASAVA_Build 20 15188990 1D CATGAGATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2414 hom 33 9 13 11 T 13 12 330711 CASAVA_Build 20 15265287 1I AAAGTCTTGC -/T TCTTCAGAAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 1 2 330712 CASAVA_Build 20 15290655 1I TATTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 1578 het 784 hom 16 3 9 5 T 14 15 330713 CASAVA_Build 20 15291084 1D TTTTTTTATA G/- GTATACTGTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 G 2 1 330714 CASAVA_Build 20 15292368 1I AGACTCATTT -/G GGAGCAACTA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 2 3 330715 CASAVA_Build 20 15309071 1D TTAGGGAAAG T/- TTTTTTTTTT 1792 het 1792 ref 34 25 4 5 T 12 11 330716 CASAVA_Build 20 15309590 8D TTTTTCACTC TTTCACTT/-------- TCATATTACT 3070 het 3070 hom 32 15 15 6 TTTCACTT 1 0 330717 CASAVA_Build 20 15316015 13D CTCTCCCTTT CTTCCCTCTCTTC/------------- CTACCTCTCT 3070 het 3070 ref 33 22 12 2 CTTCCCTCTCTTC 1 0 330718 CASAVA_Build 20 15316384 4D AACTCAGGGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1393 hom 27 7 16 4 T 19 15 330719 CASAVA_Build 20 15316569 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 8 9 330720 CASAVA_Build 20 15351736 1D TAACTTATAG T/- TTTAGCATAG 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 T 4 3 330721 CASAVA_Build 20 15355670 4D TGTCTGTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTG 3070 het 3070 hom 64 29 30 6 TC 6 4 330722 CASAVA_Build 20 15356176 1I GAGTGCCCTT -/A AATCAATACC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 2 3 330723 CASAVA_Build 20 15358931 1D TAATAATTTC T/- TTTCCTTTGA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 4 3 330724 CASAVA_Build 20 15362977 1I TATCAGCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 10 11 330725 CASAVA_Build 20 15365368 1D TTCTTTCATC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 25 9 10 7 T 8 7 330726 CASAVA_Build 20 15367274 1D CTTTCTGAAA T/- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 T 7 6 330727 CASAVA_Build 20 15377942 3I CTATTAAAAA ---/CAG CAGCAGCAAC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 CAG 2 3 330728 CASAVA_Build 20 15396374 1D TAGGCATGGT A/- AAAAAATGTG 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 7 6 330729 CASAVA_Build 20 15407199 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 87 het 44 0 28 17 TG 10 9 330730 CASAVA_Build 20 15413974 12D CACCTTCCCA AAGAGGTCCATC/------------ AAAGTAAATC 3070 het 3070 ref 36 18 17 5 AAGAGGTCCATC 1 0 330731 CASAVA_Build 20 15442703 4D ATAAGGAGAT AAAG/---- AAAGAAAATA 2836 het 2836 ref 28 19 7 3 AAAG 2 1 330732 CASAVA_Build 20 15495042 1I ACTCGGGAGG -/C CTGAGGCATG 3070 het 3070 ref 21 10 10 2 C 1 2 330733 CASAVA_Build 20 15500074 1I CTGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 10 330734 CASAVA_Build 20 15507549 4D CATAGAAGAT AGAC/---- AGATAAACAG 3070 het 3070 ref 45 23 19 5 AGAC 1 0 330735 CASAVA_Build 20 15514413 1D CACTGCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 45 1 32 13 T 12 11 330736 CASAVA_Build 20 15526682 1D CAAGATTGTG C/- CCACTGCACT 3070 hom 87 het 34 0 25 9 C 3 2 330737 CASAVA_Build 20 15530673 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2404 hom 29 9 10 10 A 11 10 330738 CASAVA_Build 20 15531587 1D CCATTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 A 11 10 330739 CASAVA_Build 20 15533699 3D CTTTAAGTGA TTT/--- TTTTTGTTCT 3070 het 3070 hom 37 16 17 6 T 8 5 330740 CASAVA_Build 20 15561865 1D AGAGGACTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2887 hom 21 10 8 3 T 10 9 330741 CASAVA_Build 20 15565866 5I TTACTTGCTG -----/TATTA TATTAATTCT 3070 hom 150 het 58 0 50 8 TATTA 1 2 330742 CASAVA_Build 20 15582671 1I TAAGCATCCC -/A ATTCCAGCCC 3070 het 3070 hom 51 21 28 2 A 1 2 330743 CASAVA_Build 20 15589493 6D TTGGATTTCA TTCTTT/------ TTCTTTTTAT 3070 het 3070 ref 47 24 18 8 TTCTTT 2 1 330744 CASAVA_Build 20 15591361 1D TCAGAGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 11 12 12 T 12 11 330745 CASAVA_Build 20 15591632 9I CAAAAATAAC ---------/TTACCTTTA TTATTTTTGC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 TTACCTTTA 0 1 330746 CASAVA_Build 20 15592268 1D CAACAGACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1896 hom 23 6 11 6 A 10 9 330747 CASAVA_Build 20 15594635 1I AGAAAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 A 11 12 330748 CASAVA_Build 20 15595532 4I TTTTCCCCAA ----/TTTG TTTATTATAA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 TTTG 0 1 330749 CASAVA_Build 20 15637284 1I CTTTGGGAGC -/T GAGGCAGTAG 1256 het 1256 ref 36 25 4 10 T 0 1 330750 CASAVA_Build 20 15649888 7D GGTCTACATA TCTGAAG/------- TCTTGTAACC 3070 hom 138 het 49 0 47 3 TCTGAAG 1 0 330751 CASAVA_Build 20 15653121 1I TCTAAATTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 34 0 20 14 T 8 9 330752 CASAVA_Build 20 15654172 1I CATCTGCAAA -/T AAAGATATTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 330753 CASAVA_Build 20 15656110 1I TTTTTTCTGA -/T TTCTGTGAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 3 330754 CASAVA_Build 20 15656879 1I ACCAACCTTG -/C CATCCTAAGG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 C 1 2 330755 CASAVA_Build 20 15664611 2I TAAACTCCTT --/AG AGGGATATAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AG 1 2 330756 CASAVA_Build 20 15665202 6I TAATTTGAGT ------/CTACTA AGAGGAGATA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 CTA 0 2 330757 CASAVA_Build 20 15669357 1D ACATGGAGCC T/- TTTTTTTTTT 1234 het 1234 ref 60 42 3 15 T 11 10 330758 CASAVA_Build 20 15672755 1I GTTGTATCTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 7 8 330759 CASAVA_Build 20 15673583 1D TGAAGTGTAC A/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 A 1 0 330760 CASAVA_Build 20 15679206 1D GAGGTTCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 15 8 A 11 10 330761 CASAVA_Build 20 15685057 1D TTGGTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 11 10 330762 CASAVA_Build 20 15686018 1I AGTAGGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 11 12 330763 CASAVA_Build 20 15692326 1D ATCTTGCCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 20 19 7 A 10 9 330764 CASAVA_Build 20 15694553 1D ATGCATATAC T/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 50 17 23 11 T 5 4 330765 CASAVA_Build 20 15696026 1I CATATTCCTA -/G AAATTTTGTA 3070 het 3070 hom 46 14 26 6 G 0 1 330766 CASAVA_Build 20 15700533 1D ATCAAGACCA T/- CCTTGGCTAA 3070 het 1900 hom 15 5 9 1 T 1 0 330767 CASAVA_Build 20 15702691 2D GAAAATATTT TC/-- TCTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TC 3 2 330768 CASAVA_Build 20 15706084 1D GAGAGACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 12 11 330769 CASAVA_Build 20 15710108 1I TTATAGTTCT -/A GAGGCTGGGA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 0 1 330770 CASAVA_Build 20 15714807 2I TAACAATATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 12 14 330771 CASAVA_Build 20 15720582 13D AAAGTTCATC ATGAAAAATAAAA/------------- GTGAAAAATG 3070 hom 96 het 33 0 33 5 ATGAAAAATAAAA 1 0 330772 CASAVA_Build 20 15726174 1D CGGATGGTCA T/- TTTTTATCAG 3070 hom 60 het 22 0 20 3 T 6 5 330773 CASAVA_Build 20 15744059 1I ACAATAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 29 1 23 5 T 11 12 330774 CASAVA_Build 20 15757757 1I TTATTATCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 10 11 330775 CASAVA_Build 20 15763904 1I AATAATTATT -/G AATTCAGTAA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 G 0 1 330776 CASAVA_Build 20 15764740 1I GGTGACTCTT -/A ATATTTCCTG 3070 het 3070 ref 67 32 29 6 A 1 2 330777 CASAVA_Build 20 15767534 3I CCAGAAGTCA ---/GTT GTTAGTATAA 2856 het 2856 ref 48 26 9 13 GTT 1 2 330778 CASAVA_Build 20 15771217 1I ATATCAGAAA -/C CCACAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 20 8 6 C 2 3 330779 CASAVA_Build 20 15775557 32D AAAAAAAAAT TATATATATATATATATATATATATATATATA/-------------------------------- TATATATATG 3070 het 462 hom 13 1 14 1 TA 20 4 330780 CASAVA_Build 20 15788457 3I TTGGACTTAA ---/ATC ATCATTTCCA 3023 het 3023 ref 34 12 7 15 ATC 1 2 330781 CASAVA_Build 20 15793989 3I ATTACAGTTC ---/AAT AATAATAATG 3070 hom 63 het 32 0 22 10 AAT 3 4 330782 CASAVA_Build 20 15794035 3D TTAATAACAT AAC/--- AATAATGGTT 736 het 736 ref 20 6 2 13 AAC 1 0 330783 CASAVA_Build 20 15812245 7D TCTAATCATC ATTAATA/------- ATTAATAATC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 ATTAATA 2 1 330784 CASAVA_Build 20 15825182 1I TGTCACAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2867 hom 34 9 15 10 T 14 15 330785 CASAVA_Build 20 15843586 3D4M4I AGTTAATTAC AAAGGAT----/---TGCTACCA GTTGGAAAGG 3070 hom 111 het 39 0 37 6 N/A 0 0 330786 CASAVA_Build 20 15846677 1I AAACTCTTGC -/A AAGAGTGGGG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 2 3 330787 CASAVA_Build 20 15851626 1I ATTTTTGTCT -/C ACAAATATTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 0 1 330788 CASAVA_Build 20 15857642 2D AAAAATAAAC AT/-- GTGTATTAAT 3070 het 3070 ref 41 18 17 8 AT 1 0 330789 CASAVA_Build 20 15863664 1I AAGATTGTTT -/C CCATCCCTGT 3070 hom 165 het 60 0 54 6 C 2 3 330790 CASAVA_Build 20 15865317 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 hom 23 het 26 1 18 7 TA 8 9 330791 CASAVA_Build 20 15866375 2D ATAGAAAATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 27 0 17 10 TA 9 8 330792 CASAVA_Build 20 15870140 1D CCTAGCTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 57 29 24 4 A 10 9 330793 CASAVA_Build 20 15873093 1D TGCATAAAAG T/- TTGAACCTGT 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 T 3 2 330794 CASAVA_Build 20 15876088 1D GCCTGTAAAC A/- TTATGTTAAC 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 1 0 330795 CASAVA_Build 20 15880783 3I ATGTCACTTG ---/CTC CTCCTCCTTG 2703 het 2703 ref 30 13 7 10 CTC 2 3 330796 CASAVA_Build 20 15891880 2D TACGCATTAC AG/-- AGAAAGACTA 3070 het 3070 ref 37 17 18 3 AG 2 1 330797 CASAVA_Build 20 15905392 1D GAAAAATGAG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 A 8 7 330798 CASAVA_Build 20 15912763 8D TTATAGACTT TTTTTAAC/-------- TTTTTATAAT 3070 hom 45 het 17 0 16 2 TTTTTAAC 1 0 330799 CASAVA_Build 20 15913277 1D AATTTTGCCT C/- CCCCCCCCGC 1459 het 1120 hom 16 5 5 6 C 9 8 330800 CASAVA_Build 20 15916953 1D GAATTGAAAC A/- ACCCTTACTC 3070 het 3070 ref 49 29 17 3 A 2 1 330801 CASAVA_Build 20 15918476 1D47M1D TGATTCCTTT AAAAAAAAAAAAATCCAGACCAGGAAAAATATATAACCTTTTTCTCTCT/-AAAAAAAAAAAATCCAGACCAGGAAAAATATATAACCTTTTTCTCTC- TTTTTGTAGC 3070 hom 114 het 26 0 39 6 N/A 0 0 330802 CASAVA_Build 20 15919702 1D TAGGCCAGGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 14 22 6 A 9 8 330803 CASAVA_Build 20 15921707 1D GTTCCTTATA T/- TTAACTTCCT 3070 het 3070 ref 37 23 11 4 T 3 2 330804 CASAVA_Build 20 15930687 2D ATAATGTGTC TT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 17 14 2 T 2 0 330805 CASAVA_Build 20 15940271 11D GCTCAAGCGC AAGCCCGAGTA/----------- AAGGAGACAG 3070 het 3070 ref 41 24 17 6 AAGCCCGAGTA 1 0 330806 CASAVA_Build 20 15941823 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 9 330807 CASAVA_Build 20 15951829 1D AAGATATAAG A/- GATGGTGCCA 2616 het 2510 hom 20 6 7 7 A 1 0 330808 CASAVA_Build 20 15955770 1D TCCTAGTAGG A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 hom 36 17 17 3 A 7 6 330809 CASAVA_Build 20 15955919 1D GTAAACCAGC A/- AGATTATTTC 3070 hom 126 het 46 0 43 4 A 2 1 330810 CASAVA_Build 20 15961405 4D GGAGGAGGGA AGAG/---- AGGAAGGAAG 3070 het 1516 hom 23 5 10 8 AG 3 1 330811 CASAVA_Build 20 15964430 2D TGTATCCATC CA/-- CATGAGCTGA 3070 hom 132 het 46 0 45 1 CA 2 1 330812 CASAVA_Build 20 15964926 2D6M3I TGGAGGACTC CTCCCCCG---/--CCCCCGCTC GCCAGCATCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 N/A 0 0 330813 CASAVA_Build 20 15966815 1D ACTAGATAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 9 8 330814 CASAVA_Build 20 15967178 1I TTTTGTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 798 hom 39 2 32 5 T 11 12 330815 CASAVA_Build 20 15974638 1D TTTAGTTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 A 10 9 330816 CASAVA_Build 20 15974980 1D ACATTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 11 10 330817 CASAVA_Build 20 15981819 4D ACAAATAAAA TTTG/---- TTTGAGAGGA 3070 het 3070 hom 39 14 22 5 TTTG 2 1 330818 CASAVA_Build 20 15985775 1I TATTACAGCA -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 6 7 330819 CASAVA_Build 20 15985839 1I TTTTCGAAAC -/A AAAAAAAATC 1557 het 1557 ref 16 6 4 6 A 8 9 330820 CASAVA_Build 20 15986511 1D GTTTCCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 12 11 330821 CASAVA_Build 20 15988302 94D TGAGCAAGGG ATTGGATTTTGTTTTGATGTTACCACGTTCCATCTTTTTATCTGAGAGTTGATGATGACAAGAACTGTTTAGCTAGGGTTGGCCAGGCTACCTT/---------------------------------------------------------------------------------------------- GGGAAGACAA 3070 het 3070 ref 41 45 18 3 ATTGGATTTTGTTTTGATGTTACCACGTTCCATCTTTTTATCTGAGAGTTGATGATGACAAGAACTGTTTAGCTAGGGTTGGCCAGGCTACCTT 1 0 330822 CASAVA_Build 20 15988685 2D AGGAAAACAC AT/-- ATGTTTGGTT 3070 het 3070 hom 58 25 28 7 AT 2 1 330823 CASAVA_Build 20 15993506 12D TGTAAGAAAA TGAGGCTTAATC/------------ TGTTTTGATT 3070 het 3070 ref 38 23 14 1 TGAGGCTTAATC 1 0 330824 CASAVA_Build 20 15994011 1D TGGGTCCAGG C/- ATCAGCGTGT 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 C 1 0 330825 CASAVA_Build 20 15996064 14I TCATCCGTGG --------------/AGAGACCCAAGTGA AGAGGCCATG 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 AGAGACCCAAGTGA 0 1 330826 CASAVA_Build 20 15997068 1I CATGAGTCCT -/C CCCATTTGAC 3070 hom 126 het 51 0 41 10 C 3 4 330827 CASAVA_Build 20 16001248 1I GAGAAGACAG -/T TGTATGTGAT 3070 hom 153 het 57 0 51 6 T 1 2 330828 CASAVA_Build 20 16007630 14D TTAATTTTTA TTTATTTATTTATT/-------------- TTTATTTATT 2403 het 550 hom 9 3 6 0 TTTATTTATTTATT 2 1 330829 CASAVA_Build 20 16013706 5I AGACTAAGAA -----/AAGAG AAGAGACCCA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 AAGAG 1 2 330830 CASAVA_Build 20 16017894 1D AAACTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 T 12 11 330831 CASAVA_Build 20 16025036 1D ATTAAGGTTA G/- GGGACAGATA 3070 hom 108 het 40 0 34 7 G 4 3 330832 CASAVA_Build 20 16031093 6D GCTTGGTTTT TTGTTG/------ TTGTTGTTTC 3070 hom 69 het 28 0 24 6 TTG 4 2 330833 CASAVA_Build 20 16061579 2D ATTCACATTC AT/-- AGACTTTGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 6 AT 1 0 330834 CASAVA_Build 20 16064060 1D AACTGTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 5 T 11 10 330835 CASAVA_Build 20 16068829 4D CAAAGCTGGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 26 0 18 10 T 15 11 330836 CASAVA_Build 20 16070569 1I TGGTACAATC -/A TTTTTTTGTC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 0 1 330837 CASAVA_Build 20 16071003 1D TTCTGGAGTG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 9 8 330838 CASAVA_Build 20 16078098 1D ATGAAATCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 248 hom 20 1 15 4 A 15 14 330839 CASAVA_Build 20 16078633 1D TTAAGGTATT A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 6 5 330840 CASAVA_Build 20 16081647 1I AAACAGAGAG -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 6 7 330841 CASAVA_Build 20 16123994 1D CTATCTCTTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 62 het 29 0 22 8 A 9 8 330842 CASAVA_Build 20 16126017 1D TTGCTTGAGA C/- CCAGTGTCAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 C 3 2 330843 CASAVA_Build 20 16144119 4D GAAGAAAAAG AAGA/---- AAGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 4 AAGA 2 1 330844 CASAVA_Build 20 16181792 1I TGTTAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 14 7 A 11 12 330845 CASAVA_Build 20 16187249 1I TCCCATCCCC -/A AAACACACAC 2826 hom 48 het 28 0 12 16 A 3 4 330846 CASAVA_Build 20 16198335 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 381 hom 52 1 39 13 A 10 9 330847 CASAVA_Build 20 16210678 1D TTTCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2591 het 40 hom 19 1 10 8 T 17 16 330848 CASAVA_Build 20 16254023 1I CTGTTCACGA -/T GATATAATTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 0 1 330849 CASAVA_Build 20 16254204 2D ACAATAGCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 471 hom 21 1 11 9 A 14 12 330850 CASAVA_Build 20 16294724 4D GACAGAGGGG GACA/---- GAGAGGAAAG 3070 hom 114 het 42 0 38 8 GACA 1 0 330851 CASAVA_Build 20 16298110 2D TTTTCCATAT TA/-- TATATATATT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 TA 5 4 330852 CASAVA_Build 20 16299752 1D TTAAAAGTTG T/- CATAATTACA 2900 het 2900 ref 21 14 6 1 T 1 0 330853 CASAVA_Build 20 16310053 4D TGAATACATT TTGG/---- TGTATTAAAT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 TTGG 1 0 330854 CASAVA_Build 20 16324307 4D CTCAGCACAG AACT/---- AATTAGGAGC 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 AACT 1 0 330855 CASAVA_Build 20 16325556 7I TTTTTGATAT -------/TTTTTAG TCTAACTGGG 3070 het 3070 hom 36 9 20 7 TTTTTAG 0 1 330856 CASAVA_Build 20 16329731 4I GGAACCAGAG ----/AGAA AGAAAGTATG 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 AGAA 1 2 330857 CASAVA_Build 20 16362226 2D CAGCATGTAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 102 het 40 0 33 7 AC 9 8 330858 CASAVA_Build 20 16363151 1I CAAAAATCTA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 117 het 46 0 39 7 T 6 7 330859 CASAVA_Build 20 16363377 1I TAAGTGGCAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 9 10 330860 CASAVA_Build 20 16375946 1D TTCTGATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 12 11 330861 CASAVA_Build 20 16385769 1I TTATTTTGAT -/A AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 51 18 28 5 A 3 4 330862 CASAVA_Build 20 16394413 1I CCTCTCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 13 14 330863 CASAVA_Build 20 16396365 1I AATAGGGGGG -/A AAAAAAAAAA 2594 het 2594 ref 30 18 8 4 A 10 11 330864 CASAVA_Build 20 16403991 4I GCAGGGAGGT ----/TAAG TAAGTCACCC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 TAAG 1 2 330865 CASAVA_Build 20 16408163 1I TCAGAACTTT -/A AAAAAAAAAT 2551 het 2551 ref 29 15 7 7 A 9 10 330866 CASAVA_Build 20 16412661 4I TCCATATGAC ----/CAGT CAATCTTTTC 3070 het 3070 hom 55 17 28 10 CAGT 0 1 330867 CASAVA_Build 20 16418405 1I GGGGATCTTA -/T TAAAATACGG 2717 het 2717 ref 33 15 8 10 T 1 2 330868 CASAVA_Build 20 16423713 1D AACAGGAAAC A/- AAAAGTGATA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 5 4 330869 CASAVA_Build 20 16426601 2D CCAAAATCAA AC/-- ACAGTCTAAA 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 AC 2 1 330870 CASAVA_Build 20 16433574 1I TACTGTCTGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 A 9 10 330871 CASAVA_Build 20 16435363 5D CACAAATACT TCTGA/----- TCTATGTGTT 3070 het 3070 hom 28 8 16 7 TCTGA 1 0 330872 CASAVA_Build 20 16455563 2D TGAAAACACT AA/-- AAGTCTAGGC 3070 het 3070 ref 51 30 17 4 A 4 2 330873 CASAVA_Build 20 16460831 1I ATTATGACTT -/A AAAAAACCTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 6 7 330874 CASAVA_Build 20 16465754 2D GTCTGCTGCC AG/-- AGAGAGCCTT 2832 het 2832 ref 35 16 9 12 AG 4 3 330875 CASAVA_Build 20 16476264 6I TGGTCTCACT ------/CCTTTC CTGAGCATGC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 CCTTTC 0 1 330876 CASAVA_Build 20 16477681 1D GTTTTTTTTT C/- GTTAGTTTTT 1332 het 372 hom 11 2 5 4 C 1 0 330877 CASAVA_Build 20 16488251 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 11 12 330878 CASAVA_Build 20 16488427 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 326 hom 35 1 30 4 A 10 9 330879 CASAVA_Build 20 16493309 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2089 hom 22 8 13 1 A 13 12 330880 CASAVA_Build 20 16501108 1D CTACCTCATT C/- TTTGAAGTCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 0 330881 CASAVA_Build 20 16501533 1D GTTCGTGGTG C/- CCCCCCTCAG 3070 hom 61 het 36 1 29 6 C 7 6 330882 CASAVA_Build 20 16504372 2D CTACGCAAAC TG/-- TGAGAGCTTA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 TG 2 1 330883 CASAVA_Build 20 16508624 1D ATTTTGTCCC T/- TTTTTTTTTT 1752 het 1752 ref 46 32 5 10 T 12 11 330884 CASAVA_Build 20 16509233 1D ACTGAATCTG A/- AAAAGCTTAG 3070 hom 102 het 38 0 34 5 A 5 4 330885 CASAVA_Build 20 16510206 3I AGAGGCACTG ---/CTC CTTGCGGAGC 3070 hom 92 het 34 0 28 6 CTC 0 1 330886 CASAVA_Build 20 16516627 1I AGCAGACTTT -/C CCCTAGAAGA 3070 hom 111 het 40 0 36 4 C 3 4 330887 CASAVA_Build 20 16525756 1D GCTTTCCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1976 hom 25 10 11 4 A 16 15 330888 CASAVA_Build 20 16531291 1D AAAAGAAAAA G/- TGATTGGCTA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 G 1 0 330889 CASAVA_Build 20 16532773 1D TTTTTTTTTT A/- AAGAAATTGG 1202 het 684 hom 14 5 4 5 A 3 2 330890 CASAVA_Build 20 16537317 1I TATTTATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1581 hom 32 6 15 11 A 11 12 330891 CASAVA_Build 20 16543175 1D GGGATACCCC T/- GGGGAACTCC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 1 0 330892 CASAVA_Build 20 16545523 1D AAAGAGAAGG A/- AAGAGGTTTG 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 A 3 2 330893 CASAVA_Build 20 16556319 1I CTTTGCTATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 8 9 330894 CASAVA_Build 20 16566493 1I TTAGCAGACT -/C CCGTGCAGCT 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 C 2 3 330895 CASAVA_Build 20 16568032 1I CAGTTTGACC -/G GAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 G 1 2 330896 CASAVA_Build 20 16573601 2D TTTTGCTAGA TT/-- TTTTTAATTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 T 7 5 330897 CASAVA_Build 20 16591848 2I ATAATAATAA --/TT TTTAAAAAAA 3070 het 2768 hom 18 8 9 1 T 3 5 330898 CASAVA_Build 20 16594393 1D AGGAAACGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 48 hom 26 1 16 9 T 19 18 330899 CASAVA_Build 20 16595258 1D CAGTTTTTTT G/- GGGGGTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 G 6 5 330900 CASAVA_Build 20 16595639 1D TAACTTTTTT A/- TTTTTGAGCG 2313 hom 20 het 9 0 7 2 A 1 0 330901 CASAVA_Build 20 16596171 1I CTAAAAACAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 6 7 330902 CASAVA_Build 20 16596313 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2742 hom 26 7 12 8 A 11 10 330903 CASAVA_Build 20 16596465 1I AATCTTCCTA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 7 8 330904 CASAVA_Build 20 16597182 1I TGAATGGATC -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 7 8 330905 CASAVA_Build 20 16601718 22D AATGTATGTG TATATATATATATATATATATA/---------------------- TATATATATA 2090 hom 15 het 7 0 6 2 TA 21 10 330906 CASAVA_Build 20 16602899 7I CAGCTGCCAT -------/GCTGGGA GGAAGCTCAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 GCTGGGA 0 1 330907 CASAVA_Build 20 16607168 1D ACACACACAC A/- AAAATAATTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 5 4 330908 CASAVA_Build 20 16608065 2D CAATAGGGAT AA/-- AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 7 5 330909 CASAVA_Build 20 16613346 1D GTCAGGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 A 12 11 330910 CASAVA_Build 20 16628490 1D GGGTTGTGGG A/- AGCAGAAGCC 3070 het 3070 hom 27 13 12 3 A 2 1 330911 CASAVA_Build 20 16650433 1I CATTACTATT -/C CCCCAGGTAT 3070 het 2962 hom 26 7 13 6 C 4 5 330912 CASAVA_Build 20 16656755 1D GCACTGGCTC T/- TTTTAGAAGA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 5 4 330913 CASAVA_Build 20 16659575 1D ATAGCTACTC T/- TAAGTGTTTA 3070 het 3070 hom 60 24 31 6 T 2 1 330914 CASAVA_Build 20 16668551 1D CTAGTTCCAA T/- TTTTTTTTTT 1835 het 1835 ref 30 14 6 10 T 17 16 330915 CASAVA_Build 20 16670715 1I TTTTAGACTT -/A ACGTAGACAG 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 A 1 2 330916 CASAVA_Build 20 16671734 1D TAACCACAAT A/- ATGACCATCA 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 A 2 1 330917 CASAVA_Build 20 16672699 1I CCCCCTCCCC -/T CCCCAGGGTG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 0 1 330918 CASAVA_Build 20 16677655 5I TGGCAGTGTA -----/AGATG AGATAATTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AGATG 0 1 330919 CASAVA_Build 20 16688877 1I TTGAACTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 10 11 330920 CASAVA_Build 20 16694189 4D TTTAAAATAG TTTT/---- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 13 9 330921 CASAVA_Build 20 16700919 1I AACTTTATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 9 10 330922 CASAVA_Build 20 16703171 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2403 hom 19 8 11 1 A 10 9 330923 CASAVA_Build 20 16713993 1D GGCTATTTTG C/- CCTTTCAGCT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 3 2 330924 CASAVA_Build 20 16715403 1I CTCATTTTTT -/A ATGTAAGTAG 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 A 1 2 330925 CASAVA_Build 20 16729454 1D TTGTAATCAC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 90 het 33 0 30 4 T 9 8 330926 CASAVA_Build 20 16733033 1I CTGTTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1527 hom 19 5 10 4 A 13 14 330927 CASAVA_Build 20 16737890 1D AGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 14 11 T 12 11 330928 CASAVA_Build 20 16751954 2D TATCCTAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 AC 6 5 330929 CASAVA_Build 20 16756537 1I GAGCAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 T 11 12 330930 CASAVA_Build 20 16758336 2D CCTCCCTGTG GT/-- AATTCACCAT 3070 het 3070 hom 42 14 23 6 GT 1 0 330931 CASAVA_Build 20 16778147 1D CCTAAGTAGC T/- GGGACTACAG 2441 het 2441 ref 28 16 7 5 T 1 0 330932 CASAVA_Build 20 16780064 1D TGACAACTCA C/- ATTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 C 1 0 330933 CASAVA_Build 20 16787137 1I TGTACAGGGG -/A TTCCTGAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 0 1 330934 CASAVA_Build 20 16791460 4D ACCAGGAGAT AGTC/---- AGAGTACCAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 6 AGTC 1 0 330935 CASAVA_Build 20 16796805 1I GAAAACTGAT -/A AAACAAATTG 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 A 3 4 330936 CASAVA_Build 20 16806851 1D GCAATTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 13 12 330937 CASAVA_Build 20 16808082 1D TAGTGTGTGG C/- ATGAAGAGTT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 C 1 0 330938 CASAVA_Build 20 16810768 1D TTTTTGAGGG T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 51 22 24 6 T 8 7 330939 CASAVA_Build 20 16811106 5D TTAGGGAAAA TTCTC/----- TTCTCCTTTA 2806 het 2806 ref 27 18 6 4 TTCTC 2 1 330940 CASAVA_Build 20 16813954 1D TAACAGTCAC T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 7 6 330941 CASAVA_Build 20 16826843 1D AATAACTGGG T/- TTTTTTGGCA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 7 6 330942 CASAVA_Build 20 16855228 4D AGTTAAGATG AAGT/---- AATTAGGGTG 3070 het 3070 ref 35 20 13 4 AAGT 1 0 330943 CASAVA_Build 20 16856066 3D CATGGCTGTT AGG/--- AGGAGTCCTT 3070 het 3070 hom 59 21 22 16 AGG 2 1 330944 CASAVA_Build 20 16857058 1D TCAAAGTTAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 A 9 8 330945 CASAVA_Build 20 16867149 1D ACATATTATC T/- GTGACCTTTT 3070 het 642 hom 24 4 12 8 T 1 0 330946 CASAVA_Build 20 16885427 1D AGCCTTGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 T 13 12 330947 CASAVA_Build 20 16903694 1D CTGGGTGGAA G/- GGGACGGGTC 947 het 904 hom 15 4 4 7 G 4 3 330948 CASAVA_Build 20 16912238 1D ATTGTAAACT A/- GTCAGATTTC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 1 0 330949 CASAVA_Build 20 16913286 3D TAGCTCAGTA AAG/--- AAGGCATGTT 3070 het 3070 ref 34 24 8 2 AAG 2 1 330950 CASAVA_Build 20 16916556 34D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATAC/---------------------------------- ACACATGTAG 2685 het 519 hom 10 2 8 3 ATATATATATATATATATATATATATATATATAC 1 0 330951 CASAVA_Build 20 16917808 1I TAAAAAAAAA -/T TATAAAGGAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 1 2 330952 CASAVA_Build 20 16937384 3D GTGCCATATG AAA/--- AAAAAAAATA 3070 hom 24 het 16 0 9 7 A 11 8 330953 CASAVA_Build 20 16947849 4D TATTTACTTT TTCA/---- TTCATTCATT 2856 het 2856 ref 29 15 8 9 TTCA 4 3 330954 CASAVA_Build 20 16954775 1I GTGCTTGAGC -/A AAAAAAAAAA 2321 het 595 hom 39 5 16 18 A 16 17 330955 CASAVA_Build 20 16979063 1D TGCCATGCAG T/- TATGAAAAAA 3070 het 3070 hom 56 22 30 4 T 2 1 330956 CASAVA_Build 20 16989704 1I TTTTGAATTT -/C CTCTTTTTAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 C 1 2 330957 CASAVA_Build 20 16997336 1D AGGGGTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 20 10 T 11 10 330958 CASAVA_Build 20 17001300 4D CACACACCAA CACT/---- CACTCATCTG 3070 het 3070 hom 66 29 31 9 CACT 2 1 330959 CASAVA_Build 20 17011631 1D GCCCAACTAA T/- TTTTTTTTTA 2044 hom 15 het 8 0 6 2 T 10 9 330960 CASAVA_Build 20 17013431 11D AAAAACAAAC AAACAAAAAAA/----------- AAACAAAAAA 2937 het 654 hom 24 7 10 11 AAACAAAAAAA 2 1 330961 CASAVA_Build 20 17014940 1D GCAAGAGGCT G/- ATCATGACCA 3070 het 3070 ref 60 30 22 9 G 1 0 330962 CASAVA_Build 20 17018389 2I CCTTATAATC --/TT TGTCTACCTT 3070 het 3070 hom 52 20 24 8 T 1 3 330963 CASAVA_Build 20 17026249 12D AGTTTCATTG CTTAAATAGTCA/------------ CTAGAAAGAG 3070 het 3070 hom 60 30 28 6 CTTAAATAGTCA 1 0 330964 CASAVA_Build 20 17026416 1D TGGAGCTTGT C/- CCAAAGTCCA 3070 het 3070 hom 47 22 25 0 C 3 2 330965 CASAVA_Build 20 17032702 1D TCTATTTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 20 13 11 T 10 9 330966 CASAVA_Build 20 17046807 1I AGTTTGTTAT -/A ATTTCTGATC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 1 2 330967 CASAVA_Build 20 17053518 1I ACACTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 11 12 330968 CASAVA_Build 20 17056457 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1570 hom 22 6 12 4 T 13 12 330969 CASAVA_Build 20 17058512 1D CACTCAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 T 11 10 330970 CASAVA_Build 20 17060112 1D GTCAGTGAAG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 T 8 7 330971 CASAVA_Build 20 17063893 1D2M8I AGGGCAAGTG TAC--------/-ACTCCTTGGA TACACTCCTT 3070 het 3070 ref 57 34 20 4 N/A 0 0 330972 CASAVA_Build 20 17070152 4I TCCATATACA ----/TCCT TCCAGGCACC 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 TCCT 0 1 330973 CASAVA_Build 20 17078664 3I GATCAGAGCT ---/AGC AGAACACTTT 3070 hom 184 het 67 0 62 5 AGC 0 1 330974 CASAVA_Build 20 17083195 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 4 A 10 9 330975 CASAVA_Build 20 17085924 1I CTTCACTGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 163 hom 25 1 20 4 T 9 10 330976 CASAVA_Build 20 17097872 1D CATAGCCTGC T/- TTTTTTATTC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 7 6 330977 CASAVA_Build 20 17101375 1I TCTACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 52 3 41 8 T 12 13 330978 CASAVA_Build 20 17107394 1I GTTTGGTGTC -/T TTTTTTTTTT 1200 het 1200 ref 50 36 4 10 T 11 12 330979 CASAVA_Build 20 17132282 1D TCCCAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 361 hom 37 1 33 3 A 10 9 330980 CASAVA_Build 20 17132580 10D TCTGTTCACT AAAATAAAAA/---------- TGGAGGTATA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AAAATAAAAA 1 0 330981 CASAVA_Build 20 17158926 1D TTATTTATTC A/- TCCATATGAA 3070 het 3070 ref 49 23 18 9 A 1 0 330982 CASAVA_Build 20 17163825 5D TGGAAATTGT TGTGA/----- TGTGCTGAGA 3070 het 3070 ref 35 17 14 6 TGTGA 1 0 330983 CASAVA_Build 20 17166940 1I GTCAGACCAC -/T TGGAGATTGC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 1 2 330984 CASAVA_Build 20 17168085 3I GAAGTTCAGT ---/AGC AGCAGCACTT 3070 het 3070 hom 47 16 27 4 AGC 2 3 330985 CASAVA_Build 20 17175447 1I ATTCTGCTTG -/A AAAAAAAAAA 972 het 972 ref 38 30 3 5 A 11 12 330986 CASAVA_Build 20 17193396 5D GGCCAAACTC TTCTT/----- TCCTTTCAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 TTCTT 1 0 330987 CASAVA_Build 20 17193514 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 10 9 330988 CASAVA_Build 20 17222917 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 1796 hom 12 het 5 0 4 1 T 8 9 330989 CASAVA_Build 20 17239647 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1946 het 184 hom 16 3 6 7 A 17 16 330990 CASAVA_Build 20 17260413 1D TCGTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 11 3 A 13 12 330991 CASAVA_Build 20 17263839 5I AGCGGAGATT -----/CGGGG GGGGGGGTTG 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 CGGGG 0 1 330992 CASAVA_Build 20 17265739 1D AAGCCAGGGG T/- TCCCTCAGGG 3070 het 3070 hom 47 21 23 5 T 2 1 330993 CASAVA_Build 20 17266574 1I AACCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3053 het 2730 hom 33 11 11 11 A 14 15 330994 CASAVA_Build 20 17267158 3D GTTTTTAAAA TTG/--- TTGTTGTTGG 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 TTG 4 3 330995 CASAVA_Build 20 17268947 2I CCAAACTAAC --/TA TAGCTTTATT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 TA 1 2 330996 CASAVA_Build 20 17270815 2D AATTACACAT AC/-- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 66 32 30 6 AC 5 4 330997 CASAVA_Build 20 17273286 4I AGCAGACAGC ----/TTGT TTGTTTGTTC 3070 hom 135 het 53 0 45 8 TTGT 2 3 330998 CASAVA_Build 20 17273602 1I CTTCCTCGAA -/C CAATCTCAAC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 1 2 330999 CASAVA_Build 20 17280301 1D TGCCTTCAAG A/- AAAAAACCCT 2775 het 2775 ref 32 20 9 3 A 7 6 331000 CASAVA_Build 20 17281941 1I CCCTGTCTCC -/A AAAAAAAATA 824 het 824 ref 11 7 3 1 A 8 9 331001 CASAVA_Build 20 17283546 1D CATTGTGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 A 10 9 331002 CASAVA_Build 20 17286783 1D9M1I AGACCCCCCC TAATCTCTAC-/-AATCTCTACA AAAAAAATAC 1375 het 674 hom 19 2 5 15 N/A 0 0 331003 CASAVA_Build 20 17306948 1D TCATCTAGAA G/- CTTCATCAAT 3070 het 3070 hom 31 8 15 8 G 1 0 331004 CASAVA_Build 20 17310730 1D GCTTGCTTGA T/- TATTAATAAC 3070 het 3070 hom 49 20 27 3 T 2 1 331005 CASAVA_Build 20 17322107 1D CCAGAAAGCT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 8 7 331006 CASAVA_Build 20 17326132 1I ATTCAATATA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 19 4 T 11 12 331007 CASAVA_Build 20 17352290 1D ACTTTTGTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 81 het 31 0 27 5 A 10 9 331008 CASAVA_Build 20 17362836 4D TCTATCTACG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 79 het 39 0 33 6 CT 9 7 331009 CASAVA_Build 20 17363021 3I TGTCTTGGCT ---/GCA TGGTGCAGTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GCA 0 1 331010 CASAVA_Build 20 17365783 1D GGAAGGGGCC G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 69 het 28 0 21 7 G 9 8 331011 CASAVA_Build 20 17371629 2I CCCAAGGTTT --/TA TGTTTCCCCA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 TA 0 1 331012 CASAVA_Build 20 17374005 3D TACATCCCAA CTT/--- CTTCTTAATC 3070 het 3070 hom 35 16 16 7 CTT 3 2 331013 CASAVA_Build 20 17376253 1D TCGTCATTCA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 8 7 331014 CASAVA_Build 20 17391782 2D CTCTCTCATG CT/-- CTCTCTCTTT 3070 hom 102 het 43 0 34 11 CT 5 4 331015 CASAVA_Build 20 17398193 1I CAGAAAGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 14 14 A 13 14 331016 CASAVA_Build 20 17398468 1I GTCACTTTGA -/C CCCCTCACGG 3070 hom 147 het 53 0 49 4 C 4 5 331017 CASAVA_Build 20 17411674 1I GACAGGAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 T 13 14 331018 CASAVA_Build 20 17413745 4D TGCTATAGTA ACAG/---- ACAATCTCAA 3070 het 3070 ref 37 20 17 0 ACAG 1 0 331019 CASAVA_Build 20 17415873 28D CCAACCTGCC CTCCCCATCCCAAGATGGGGTGTGCCAG/---------------------------- CTCCCCATCC 3070 het 3070 hom 48 19 18 26 CTCCCCATCCCAAGATGGGGTGTGCCAG 1 0 331020 CASAVA_Build 20 17416918 1D CGGCAGACTG T/- TGGTGCATCC 3070 het 3070 ref 39 23 11 6 T 2 1 331021 CASAVA_Build 20 17420241 18D CTACAGAAGA AAACAGAACTAGATTGGG/------------------ AAACAGAACT 2170 het 2170 ref 21 14 7 12 AAACAGAACTAGATTGGG 2 1 331022 CASAVA_Build 20 17422721 2D TGGGCATTTT AA/-- GAGCTCTTCT 3070 het 3070 hom 53 23 26 6 A 2 0 331023 CASAVA_Build 20 17430822 1I GCTCCTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2853 hom 29 10 11 8 A 13 14 331024 CASAVA_Build 20 17436897 1I AAGGAACAAA -/G GAAGATGAGC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 G 1 2 331025 CASAVA_Build 20 17438243 1I CTAGAAAAGG -/C ATTTGACTCT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 C 0 1 331026 CASAVA_Build 20 17439763 2D AGCACCAGTC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 TA 7 6 331027 CASAVA_Build 20 17441051 1D GCGGAGGCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 12 14 A 11 10 331028 CASAVA_Build 20 17449700 10D TGCTTACAGT TTCCTCAAGA/---------- TAAGCAAATC 3070 het 3070 ref 29 17 10 7 TTCCTCAAGA 1 0 331029 CASAVA_Build 20 17466659 1D CCAGCTACTT G/- GGAGGCTGAG 3004 het 2749 hom 18 7 7 5 G 3 2 331030 CASAVA_Build 20 17479108 5D ACTATAATCC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1609 het 688 hom 21 6 5 10 T 19 14 331031 CASAVA_Build 20 17485496 1D ATTTTCAACA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 22 12 10 0 T 7 6 331032 CASAVA_Build 20 17486805 1I TTTATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 32 2 26 4 T 11 12 331033 CASAVA_Build 20 17493009 1D GAACCTGGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 205 hom 44 2 23 20 A 17 16 331034 CASAVA_Build 20 17496599 1D ACGGGGCACG A/- AAAAAAAAAA 1550 het 1550 ref 29 16 4 9 A 13 12 331035 CASAVA_Build 20 17497105 1D GGAGGATACA G/- GGGGGTTCCT 3070 hom 104 het 51 1 44 6 G 6 5 331036 CASAVA_Build 20 17507612 1I ATCTCAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 325 hom 35 2 27 6 G 0 1 331037 CASAVA_Build 20 17511973 1I GACTCAGCAG -/T TTTACTCCTA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 3 4 331038 CASAVA_Build 20 17519987 1D TATAATTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 13 12 331039 CASAVA_Build 20 17526649 3I AGGTTCATCC ---/TTG TTGTAGCATG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TTG 1 2 331040 CASAVA_Build 20 17526886 2D GTGTTAACTT TA/-- TGTTTAACTT 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 TA 1 0 331041 CASAVA_Build 20 17538496 2D GAAAGCTGAC TT/-- AGTCTCATCT 3070 het 3070 hom 54 20 30 5 T 2 0 331042 CASAVA_Build 20 17539211 1I GTTCAGTGCT -/A GGGGTGAGAT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 0 1 331043 CASAVA_Build 20 17540062 2I CCCTTAGAAC --/TG GAGCTGCAGG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 TG 0 1 331044 CASAVA_Build 20 17542715 1D TCTCTCGGAG C/- TACCGGAAGT 3070 hom 57 het 23 0 18 5 C 1 0 331045 CASAVA_Build 20 17547732 1D TGTGCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 4 hom 31 1 17 13 T 16 15 331046 CASAVA_Build 20 17555409 2I CAGGTGTTGG --/CT CCGGCCTTAG 3070 hom 106 het 39 0 31 8 CT 0 1 331047 CASAVA_Build 20 17555833 2I GGCCTGTCCC --/CT GTCCTCTAAA 3070 hom 45 het 21 0 13 8 CT 0 1 331048 CASAVA_Build 20 17561314 3I CCCCTGGGGT ---/CTC CTCATTATCC 3070 hom 119 het 44 0 38 6 CTC 1 2 331049 CASAVA_Build 20 17564822 1I AGCTGTGTGA -/T TTTTCAGGCC 1922 het 1922 ref 21 13 5 3 T 4 5 331050 CASAVA_Build 20 17567365 1D TGATGGTGGT G/- GGGGGGTTCC 3070 hom 66 het 24 0 23 2 G 7 6 331051 CASAVA_Build 20 17589679 2D GGCCAGACAC TT/-- TTAAAAAATT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 4 2 331052 CASAVA_Build 20 17595516 12I TTACCAATTG ------------/CTTTGTCTTTAC CAGTTGACAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CTTTGTCTTTAC 0 1 331053 CASAVA_Build 20 17599087 1D AATTACCTTT A/- AAAAAAAAAA 1940 het 1940 ref 23 8 9 6 A 13 12 331054 CASAVA_Build 20 17608507 12D GCCTAGAGCT CTAAACCCTCTC/------------ CTAAACCCCA 3070 het 3070 ref 27 12 11 6 CTAAACCCTCTC 1 0 331055 CASAVA_Build 20 17626873 1D AAATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2527 hom 17 7 9 1 A 10 9 331056 CASAVA_Build 20 17650024 4D TTTTTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2872 hom 24 het 13 0 9 4 TTTC 5 4 331057 CASAVA_Build 20 17655754 1I GTTTTAGAAC -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 A 6 7 331058 CASAVA_Build 20 17660709 1D AGACGTCGTC A/- AAAAAAAAAA 1711 het 1711 ref 14 4 5 5 A 12 11 331059 CASAVA_Build 20 17672915 1D GGATCTCGAA G/- GGAGCACTGA 3070 het 3070 hom 56 24 26 6 G 3 2 331060 CASAVA_Build 20 17677492 4D AAAATAATTT AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AATA 3 2 331061 CASAVA_Build 20 17683160 1I GCACACACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 16 19 20 T 10 11 331062 CASAVA_Build 20 17687425 4D GATACTTGTT TGTC/---- TGCTTACTTG 3070 het 3070 ref 50 24 20 10 TGTC 1 0 331063 CASAVA_Build 20 17687743 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 19 5 T 11 10 331064 CASAVA_Build 20 17690923 1I TCATTATGGA -/T TTATTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 2 3 331065 CASAVA_Build 20 17699622 1D CAAAATAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 2083 hom 26 6 19 1 A 9 8 331066 CASAVA_Build 20 17751740 14D TTGCACTCAC GAAATAACTGGAGG/-------------- GAAATAACTG 3070 het 3070 ref 25 15 11 9 GAAATAACTGGAGG 2 1 331067 CASAVA_Build 20 17767609 1I CACCCTGCCA -/G GGGCTGGTAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 3 4 331068 CASAVA_Build 20 17792519 17D GAAGAAACCA GGCATGCTGCCAAGAAT/----------------- GACACAAAAT 3070 hom 63 het 20 0 18 5 GGCATGCTGCCAAGAAT 1 0 331069 CASAVA_Build 20 17792639 1I TGGAACAAAA -/G CCAGATGTCT 3070 hom 59 het 25 0 17 8 G 0 1 331070 CASAVA_Build 20 17802889 2I TGTGGCCGCT --/CA CAGAGCTTCA 1589 het 1589 ref 25 9 6 10 CA 1 2 331071 CASAVA_Build 20 17817021 11I GCTAATATTC -----------/TGGGTGATAAT GTCCAGAGAG 3070 hom 83 het 37 0 25 12 TGGGTGATAAT 0 1 331072 CASAVA_Build 20 17823688 5D GCTGTCTCTT AAAAC/----- AAACAAAAAG 2564 het 2564 ref 30 22 8 3 AAAAC 1 0 331073 CASAVA_Build 20 17835068 32D ATGCCGCTGG CTTGCCCCACCAAATCGGTCTCTCCTATCTGC/-------------------------------- CTGTATTGCT 3070 het 3070 ref 38 28 16 5 CTTGCCCCACCAAATCGGTCTCTCCTATCTGC 1 0 331074 CASAVA_Build 20 17836328 7I AAGTCCAAGA -------/TTGAGAC TCCATCATTG 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TTGAGAC 0 1 331075 CASAVA_Build 20 17837081 1I ATTTGTGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 9 10 331076 CASAVA_Build 20 17848293 6I GAAAGGCAAA ------/AGAACT AGAATAGCTA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AGAACT 0 1 331077 CASAVA_Build 20 17868276 3D AGCAGTCCTC CCA/--- CCACCTCAGC 3070 hom 85 het 33 0 28 5 CCA 2 1 331078 CASAVA_Build 20 17869874 1D TCACAATACT G/- GGTTTGCACT 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 G 3 2 331079 CASAVA_Build 20 17876536 1D AAGGACTTTT G/- TTTTCCAGTA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 G 1 0 331080 CASAVA_Build 20 17881369 1I AAAGAGATGT -/G GCACATGGCA 3070 het 3070 hom 51 17 24 10 G 1 2 331081 CASAVA_Build 20 17886581 4D CTGAATACTC AATT/---- AACTGATTTT 3070 het 3070 ref 39 26 11 4 AATT 1 0 331082 CASAVA_Build 20 17887491 1I CATTAACTGA -/G ATGTGATTGC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 0 1 331083 CASAVA_Build 20 17888122 1I CTAGCAGCCA -/T TTTTGCCCAG 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 4 5 331084 CASAVA_Build 20 17890242 3D TCCCACATAA ATT/--- ACTACAGATA 3070 het 3070 ref 47 27 17 5 ATT 1 0 331085 CASAVA_Build 20 17890842 2D TTAACTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 1664 het 373 hom 23 5 5 13 T 18 16 331086 CASAVA_Build 20 17891051 1D TTTCACCATG T/- TGGTCAGGCT 1762 hom 10 het 6 0 4 3 T 2 1 331087 CASAVA_Build 20 17892555 1D TCTTTCACTC T/- TGAGTTTGAG 3070 hom 95 het 37 0 31 8 T 2 1 331088 CASAVA_Build 20 17892974 2I GGCAGAAAAT --/TA TAGTTTTCTC 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 TA 1 2 331089 CASAVA_Build 20 17895028 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2830 hom 33 9 15 9 A 16 14 331090 CASAVA_Build 20 17895987 2I AAGAACTTTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 A 10 12 331091 CASAVA_Build 20 17901080 1D TAGGTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1782 het 886 hom 39 9 9 22 T 19 18 331092 CASAVA_Build 20 17909567 1D TGCTTAAAAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 T 9 8 331093 CASAVA_Build 20 17914676 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2606 hom 21 7 8 6 T 11 10 331094 CASAVA_Build 20 17917347 1D GAAAAATTGT A/- AAAAAAAAAA 2273 het 2273 ref 23 9 6 8 A 13 12 331095 CASAVA_Build 20 17921431 8D AAAAAAAAAA AAAAAAAG/-------- GAATTAACAC 2269 het 1951 hom 27 12 14 3 AAAAAAAG 1 0 331096 CASAVA_Build 20 17922212 3D TTAAAGAAAC AAT/--- AAGTTGTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 AAT 1 0 331097 CASAVA_Build 20 17924721 1D TACCACCAAA T/- TTCCTCTCCA 3070 hom 166 het 71 0 56 16 T 3 2 331098 CASAVA_Build 20 17927343 1I GTATATGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 11 331099 CASAVA_Build 20 17943569 1D CTACTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2365 hom 18 6 8 4 A 13 12 331100 CASAVA_Build 20 17950457 7I GGAGGGGAAA -------/GGGAAGG GAGGAAGCAG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 GGGAAGG 0 1 331101 CASAVA_Build 20 17952998 1D TCCTTGGGGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 A 9 8 331102 CASAVA_Build 20 17953679 2D TAAAAGTCAT GC/-- CATGACCAAG 3070 het 3070 hom 41 20 18 4 GC 1 0 331103 CASAVA_Build 20 17955756 1I CAAAGTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 905 hom 28 2 19 7 T 11 12 331104 CASAVA_Build 20 17956173 2D CTCCGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 2970 hom 18 het 7 0 7 0 A 14 12 331105 CASAVA_Build 20 17957686 5I TATTTTATTT -----/TATTG TTTGAGAAGG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TATTG 0 1 331106 CASAVA_Build 20 17966565 1I TCCTTGTGTC -/A GCGTCTGCTT 3070 het 3070 ref 45 30 10 5 A 0 1 331107 CASAVA_Build 20 17966871 2D AGGGCCTGTT AC/-- ACATCAGGTC 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 AC 2 1 331108 CASAVA_Build 20 17969954 1I ATTACAGGCG -/C CCACCACCAC 751 het 751 ref 7 4 3 3 C 2 3 331109 CASAVA_Build 20 17982346 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 845 het 694 hom 30 8 8 16 A 18 16 331110 CASAVA_Build 20 17987049 1D AGCTACAACA C/- CCCCCCCCCA 1475 het 368 hom 16 3 4 9 C 10 9 331111 CASAVA_Build 20 17990353 1I TCGAACTCCT -/G ACCTTATGAT 2507 het 2507 ref 22 9 6 7 G 0 1 331112 CASAVA_Build 20 18008547 1D CGTTTGGAAA G/- GAAGGTGTAG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 G 2 1 331113 CASAVA_Build 20 18013145 1I CTCTGCATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 A 9 10 331114 CASAVA_Build 20 18017427 1I GATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTA 1770 het 392 hom 11 1 4 6 T 7 8 331115 CASAVA_Build 20 18038101 1I TGGGTCTTTT -/A GCCTCTCCAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 0 1 331116 CASAVA_Build 20 18041979 10D CGTGCCCAGC CTCAGCTATA/---------- CTCAGCTATA 2410 hom 18 het 14 0 7 9 CTCAGCTATA 2 1 331117 CASAVA_Build 20 18042015 4D ATTGTTTATT TCTC/---- TCTGTTTACT 2466 het 1365 hom 21 4 6 14 TC 3 1 331118 CASAVA_Build 20 18047816 3I ACAAAAATTA ---/AAT GCTGAGCATG 2840 het 1432 hom 14 4 6 4 AAT 0 1 331119 CASAVA_Build 20 18048589 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1150 hom 38 4 28 7 A 13 12 331120 CASAVA_Build 20 18050808 1I TTTTGGCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 29 1 17 11 T 15 16 331121 CASAVA_Build 20 18056459 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 10 9 331122 CASAVA_Build 20 18060473 4D ACCTCCCCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 42 19 14 13 TC 8 6 331123 CASAVA_Build 20 18062638 3D GCATTCATGC CCA/--- CCATCAAGCC 3070 het 3070 ref 39 19 14 8 CCA 2 1 331124 CASAVA_Build 20 18064955 1D ATAAACATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 12 11 331125 CASAVA_Build 20 18065046 1D AGTAGAATAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 491 hom 27 3 13 11 T 10 9 331126 CASAVA_Build 20 18071085 1D TATCTTCATC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 144 het 56 0 46 10 T 9 8 331127 CASAVA_Build 20 18073771 3D GGCTGAAGAA AAG/--- AAGACAACAT 3070 het 3070 hom 41 18 19 6 AAG 2 1 331128 CASAVA_Build 20 18083275 3I CTTCCCAGAA ---/TCC TCCTCGTAAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 TCC 1 2 331129 CASAVA_Build 20 18096529 1I ATGTGGTTGT -/C CCCCCCAAAC 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 6 7 331130 CASAVA_Build 20 18103314 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 11 12 331131 CASAVA_Build 20 18106752 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2255 het 213 hom 14 1 6 7 A 10 11 331132 CASAVA_Build 20 18109442 3I TATTCACTAC ---/TAT GAGAACAGTA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 TAT 0 1 331133 CASAVA_Build 20 18118064 1D TCATTTATCC T/- TTTTTTTTTT 1996 het 1996 ref 36 23 5 8 T 12 11 331134 CASAVA_Build 20 18118891 4D GTGTGTTCGT GAGA/---- GAGTCTGGAT 3070 het 3070 hom 26 9 12 7 GA 3 1 331135 CASAVA_Build 20 18121484 4D TATGATTGAT TTAA/---- TTAATGTATA 3070 het 3070 ref 31 13 16 2 TTAA 2 1 331136 CASAVA_Build 20 18127722 1D ATGTAGGAGG A/- AAATCATCCA 3070 het 3070 ref 27 10 9 9 A 4 3 331137 CASAVA_Build 20 18132622 8D GGACAGATCA TACAGAAC/-------- AATGGAATAG 3070 het 3070 ref 19 9 8 3 TACAGAAC 1 0 331138 CASAVA_Build 20 18140646 1D CTTCTGTAGT G/- GGGGGCCACA 3070 hom 60 het 24 0 20 5 G 6 5 331139 CASAVA_Build 20 18143450 2D AGTGGGAAGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AT 8 7 331140 CASAVA_Build 20 18144342 5I CCATGTTGAG -----/TTTTC TTTTAAAGCT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 TTTTC 0 1 331141 CASAVA_Build 20 18145598 8D AGACTCCGTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 12 5 A 19 11 331142 CASAVA_Build 20 18157896 1D AAAAAACAAA C/- AAAAAAAGGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 C 1 0 331143 CASAVA_Build 20 18169594 1D AAAACACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 24 3 15 6 A 15 14 331144 CASAVA_Build 20 18183941 3I TTTGAAATTT ---/TTG TTGTTGACTG 3070 hom 45 het 20 0 15 5 TTG 2 3 331145 CASAVA_Build 20 18184980 1I AAAAAAGAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 9 331146 CASAVA_Build 20 18187744 9D AAGTGATAAA TGTGCTAAT/--------- TGTGCTAATT 3070 hom 78 het 27 0 27 2 TGTGCTAAT 2 1 331147 CASAVA_Build 20 18189411 1D AAATGCATGC T/- TTTTTTTTTT 2483 het 2483 ref 24 11 7 6 T 15 14 331148 CASAVA_Build 20 18193972 3D ACCCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2802 het 76 hom 21 1 9 13 A 17 14 331149 CASAVA_Build 20 18198033 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 45 het 16 0 15 2 A 9 8 331150 CASAVA_Build 20 18200350 1D CCTGTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 3 A 13 12 331151 CASAVA_Build 20 18207255 1I TTTTAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 11 12 331152 CASAVA_Build 20 18223255 1D CTAAAATTTG T/- TACAAAATAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 T 2 1 331153 CASAVA_Build 20 18226815 1I AATTCCTCTT -/A ACTTGCTCCC 3070 het 3070 ref 54 30 20 4 A 1 2 331154 CASAVA_Build 20 18235451 1D ATGGAATTCT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 A 8 7 331155 CASAVA_Build 20 18235703 1I AATCACCCCC -/T CCTCCCAACA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 0 1 331156 CASAVA_Build 20 18237340 2I CATTTGGGTG --/TT TTTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 4 6 331157 CASAVA_Build 20 18239724 4I TCAGGAGGCT ----/GAGG GAGACCAAGG 2802 het 2037 hom 24 8 8 8 GAGG 0 1 331158 CASAVA_Build 20 18241370 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 40 12 22 6 T 7 8 331159 CASAVA_Build 20 18241624 3I AAAGTGCTGG ---/GAT TACAGGCGTG 2283 hom 15 het 16 0 6 10 GAT 0 1 331160 CASAVA_Build 20 18246780 1D AGGTGTACCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 10 9 331161 CASAVA_Build 20 18249004 2D AAATGAAAGC CA/-- CACACAGAGA 3070 hom 108 het 43 0 36 9 CA 4 3 331162 CASAVA_Build 20 18249163 1I CTCAAAATTT -/A AAATTCATAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 3 4 331163 CASAVA_Build 20 18250871 1I TTTTTTTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 11 12 331164 CASAVA_Build 20 18252445 1D AAAAAAAAAA T/- AAAAAAGCCA 2572 het 2572 ref 40 18 14 8 T 1 0 331165 CASAVA_Build 20 18257651 1D AATAGGGAGG T/- TTGGTCCAAT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 3 2 331166 CASAVA_Build 20 18260854 3D GAAAGAGACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 228 hom 28 2 13 13 A 14 11 331167 CASAVA_Build 20 18268706 1I CAGATGCAAG -/A AAAAAAGCTT 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 A 6 7 331168 CASAVA_Build 20 18271368 10I TAGTCTCAAA ----------/CTCCTGACCT CAGGTGATCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CTCCTGACCT 0 1 331169 CASAVA_Build 20 18275650 1I CATGAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 A 10 11 331170 CASAVA_Build 20 18278220 2D CAAAATGTCA AT/-- AGAGCTGAGG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 AT 1 0 331171 CASAVA_Build 20 18281283 1I TCAGTGGCTT -/A AAAAAATCCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 6 7 331172 CASAVA_Build 20 18283426 1I AAAAACTATT -/A AATTGGAACC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 2 3 331173 CASAVA_Build 20 18285040 1I CTTTTCTATC -/A AAAGTCTTTG 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 A 3 4 331174 CASAVA_Build 20 18289300 7D GAGGAGGAAA AGGATCC/------- AGGATCCAGG 3070 het 3070 ref 34 16 13 7 AGGATCC 2 1 331175 CASAVA_Build 20 18298227 1I AATTAAAAAA -/C AAAAAACTCA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 C 0 1 331176 CASAVA_Build 20 18299270 2I TAAAGTACAC --/AT GTGTCAAATA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AT 0 1 331177 CASAVA_Build 20 18305610 4D AACAGGCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 35 17 10 10 AAAT 4 3 331178 CASAVA_Build 20 18332375 2D AGCCCATGGG TT/-- GGACATGTGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 0 331179 CASAVA_Build 20 18346188 1D AAGTCTAAAA C/- CACATTAATA 3070 hom 105 het 41 0 36 7 C 2 1 331180 CASAVA_Build 20 18362186 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1808 het 1808 ref 35 17 5 14 A 15 14 331181 CASAVA_Build 20 18376138 1I GCACAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 35 het 14 0 12 2 T 6 7 331182 CASAVA_Build 20 18380716 2D TTAGGGGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 604 hom 37 9 19 9 T 15 13 331183 CASAVA_Build 20 18385351 1D TATTTATTTG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 47 20 24 3 T 9 8 331184 CASAVA_Build 20 18392155 1D AAGAAAAAAC A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 8 7 331185 CASAVA_Build 20 18392517 1I ATAATTGGTT -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 7 8 331186 CASAVA_Build 20 18394051 14I TAAATTCCAA --------------/TGTGCACTTATAGC TGTACACAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TGTGCACTTATAGC 0 1 331187 CASAVA_Build 20 18401193 3D TTATTTCAAC TTT/--- TTATTTATAT 3070 het 2198 hom 15 6 9 0 T 5 2 331188 CASAVA_Build 20 18403162 1D GTTTTCATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2151 hom 29 12 12 5 T 10 9 331189 CASAVA_Build 20 18406562 4D TATACAGGCA TGAT/---- TGATTGAATC 3070 het 3070 hom 33 12 13 9 TGAT 2 1 331190 CASAVA_Build 20 18409238 1D ACCCACATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1226 hom 32 3 23 6 T 12 11 331191 CASAVA_Build 20 18410053 3I ACCCAGCTAA ---/TTC TTGTATTTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 TTC 0 1 331192 CASAVA_Build 20 18417210 1I ACACCCAGCC -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 7 8 331193 CASAVA_Build 20 18430070 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2183 het 1330 hom 9 3 6 0 T 11 10 331194 CASAVA_Build 20 18431143 4I AATTGAGAAA ----/TATT TAGAGTAACA 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 TATT 0 1 331195 CASAVA_Build 20 18432194 4I TAATAAAATA ----/AAAT AAATAAATAA 2437 het 2437 ref 16 10 5 1 AAAT 2 3 331196 CASAVA_Build 20 18438243 1I ACAGTCTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 T 10 11 331197 CASAVA_Build 20 18440150 2D TTAAGTGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 670 hom 37 5 14 18 T 14 12 331198 CASAVA_Build 20 18445155 1D23M1D ACATTGTTTC TTTTTTTTAAACATTTTTGGGCTCT/-TTTTTTTAAACATTTTTGGGCTC- TTTTTTTTTC 2116 het 2116 ref 25 13 5 8 N/A 0 0 331199 CASAVA_Build 20 18449054 2I ATCGGTTGCC --/AG AGAGAGAGTG 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 AG 4 5 331200 CASAVA_Build 20 18451343 1I TGAGCAACAA -/G GCTGTTATTT 3070 het 1974 hom 19 5 11 3 G 1 2 331201 CASAVA_Build 20 18451722 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3016 het 671 hom 13 2 7 4 A 9 10 331202 CASAVA_Build 20 18453564 1D TCTTTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 1555 het 1555 ref 43 35 4 5 T 12 11 331203 CASAVA_Build 20 18460540 1D CAAATGATTT A/- AAAAAAAAAA 2260 het 1850 hom 19 6 8 5 A 13 12 331204 CASAVA_Build 20 18468675 4I CCCTCAAAAT ----/TATC TATAAGAACT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TATC 0 1 331205 CASAVA_Build 20 18472942 1D TCATGGAACC A/- TTTTTCAGGA 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 1 0 331206 CASAVA_Build 20 18473665 10D GTAATAGTTT ATTTTTGATA/---------- ATTTTTGATA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 ATTTTTGATA 2 1 331207 CASAVA_Build 20 18476566 1I CCCTTTTCTT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 31 het 16 0 11 5 A 7 8 331208 CASAVA_Build 20 18476906 1D AAGGCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 2159 het 2159 ref 16 8 6 3 A 11 10 331209 CASAVA_Build 20 18479471 1D CCTGACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2077 hom 25 6 9 11 A 12 11 331210 CASAVA_Build 20 18480858 1I GTGAAAAGAT -/A ATAAATTGTG 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 1 2 331211 CASAVA_Build 20 18482574 1D GTGGAAGTGG A/- AAAGGAGGGA 3070 het 3070 ref 41 17 15 10 A 4 3 331212 CASAVA_Build 20 18483591 30D GCTAAAGAAA TAGATTACTGTGCAGTAAAACAATTCTAAT/------------------------------ TAGATTACTG 3070 het 3070 ref 28 17 8 11 TAGATTACTGTGCAGTAAAACAATTCTAAT 2 1 331213 CASAVA_Build 20 18488698 2D41M2I CATTATTTAA AGAGTTAACTATTTCCAGCTTTTTTCTACGTAAAGTGTATTAT--/--AGTTAACTATTTCCAGCTTTTTTCTACGTAAAGTGTATTATTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 24 12 12 10 N/A 0 0 331214 CASAVA_Build 20 18490474 3D GAAAGCTCCT AAG/--- AAGCATTTAC 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 AAG 2 1 331215 CASAVA_Build 20 18496294 1D GATGAGAGTT C/- CCCGGGGGTC 3070 het 3070 ref 30 14 7 9 C 4 3 331216 CASAVA_Build 20 18517902 1D GGCTGAGGTA G/- GAGAATCGCT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 2 1 331217 CASAVA_Build 20 18518028 5D CCCAAAACAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 36 het 17 0 13 4 AAAAC 3 2 331218 CASAVA_Build 20 18518566 1D GGGGAACTGT G/- GAATTCTGTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 2 1 331219 CASAVA_Build 20 18520171 3D ATATGCAATG TTA/--- TTATAGTAGT 3070 het 3070 hom 24 8 15 2 TTA 2 1 331220 CASAVA_Build 20 18526634 1D ACATTTTGTC T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 7 6 331221 CASAVA_Build 20 18537026 1D TTTTTTTTTT A/- AAAAGTTTAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 6 A 5 4 331222 CASAVA_Build 20 18537794 1I ATTAACTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 816 hom 23 6 11 6 T 11 12 331223 CASAVA_Build 20 18538161 1D CAAACCCAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 10 9 331224 CASAVA_Build 20 18555869 3D TTGCTGAGTC CTT/--- CTGAAGTTAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 CTT 1 0 331225 CASAVA_Build 20 18558768 1I TAATGACATT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 7 8 331226 CASAVA_Build 20 18568696 1D GCTCTGAGGA T/- TTTTTTTTTT 2718 het 2529 hom 24 10 7 7 T 15 14 331227 CASAVA_Build 20 18572883 2D ACATACTAGA TC/-- TGTACAGAGA 3070 het 3070 hom 41 14 24 5 TC 1 0 331228 CASAVA_Build 20 18583443 3D AAAGCTCATT AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 A 12 9 331229 CASAVA_Build 20 18585528 1I GGCAATATTC -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 6 7 331230 CASAVA_Build 20 18596307 2I CTTTCAGCAA --/CT CTATGACATG 3070 het 3070 hom 53 20 25 8 CT 1 2 331231 CASAVA_Build 20 18597803 1D CATGGGGACC A/- GGGGGTAGTG 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 A 1 0 331232 CASAVA_Build 20 18608315 1I GCTGGTTATT -/C CCCTCACTGC 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 C 3 4 331233 CASAVA_Build 20 18609076 2D TTTTTTTTTT TG/-- GTCTCACTAT 1290 het 1290 ref 27 8 6 13 TG 1 0 331234 CASAVA_Build 20 18622294 1D GAGCGAGACT C/- CCATCTAAAA 3070 hom 16 het 22 1 17 4 C 3 2 331235 CASAVA_Build 20 18632373 1I TAGTATTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 12 4 T 11 12 331236 CASAVA_Build 20 18639022 1I TATTCTGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 10 11 331237 CASAVA_Build 20 18651071 1D TAAAGGAGAC T/- TAAGATGGTT 3070 het 3070 ref 61 32 23 7 T 2 1 331238 CASAVA_Build 20 18655546 1I CCTTGGAGCT -/G GACTTTATCT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 G 1 2 331239 CASAVA_Build 20 18656105 1I GGGTGGACTT -/C CTGTAACACC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 C 1 2 331240 CASAVA_Build 20 18665919 3I GCCTGGGAGT ---/GAG GAGTAGACAC 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 GAG 1 2 331241 CASAVA_Build 20 18668587 1I AGAGTCAGCA -/T TTACATCACT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 2 3 331242 CASAVA_Build 20 18693686 1D5M3D GATCATGACA TTTGGATGG/-TTGGA--- TGGTAAAATG 3070 het 3070 ref 53 29 24 4 N/A 0 0 331243 CASAVA_Build 20 18696954 5D TGTTTAATCA TCTAT/----- TCTAGAATGA 3070 hom 132 het 48 0 45 5 TCTAT 1 0 331244 CASAVA_Build 20 18697461 2D AACCTGAGTT CA/-- TTCAGAGTCC 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 CA 1 0 331245 CASAVA_Build 20 18699351 1D CTATACCCAG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 13 hom 20 1 14 5 T 9 8 331246 CASAVA_Build 20 18699385 1I TATCAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2406 hom 25 6 10 9 T 11 12 331247 CASAVA_Build 20 18701658 1I TACCAGGGAG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 7 8 331248 CASAVA_Build 20 18706491 1D CAGATGTTAC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 138 het 51 0 47 5 T 8 7 331249 CASAVA_Build 20 18710362 1I TTTGCTGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 17 15 11 T 11 12 331250 CASAVA_Build 20 18712443 1I CTCTCTGTGG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 7 8 331251 CASAVA_Build 20 18716626 4D GCAATTTACA AAAG/---- AAAGAGATTT 2120 het 2120 ref 15 7 5 3 AAAG 2 1 331252 CASAVA_Build 20 18721307 1I GTATTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1496 hom 22 6 13 3 T 9 10 331253 CASAVA_Build 20 18724898 1D AGTTCGGTGA T/- TTTTTTTTTT 2073 het 2073 ref 33 11 7 15 T 17 16 331254 CASAVA_Build 20 18733675 4D ATCATCTATC TCTA/---- TCTAATCTCT 3070 het 3070 ref 35 17 18 2 TCTA 2 1 331255 CASAVA_Build 20 18748915 1I CTAAAAAATA -/T TTTTTGAGCA 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 T 5 6 331256 CASAVA_Build 20 18754926 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1336 het 1336 ref 28 15 5 8 A 11 12 331257 CASAVA_Build 20 18758420 1I8M1I GTTTCCCCAG -TTTTGCTG-/TTTTTGCTGT TCCCATAAAC 3070 hom 152 het 52 0 50 8 N/A 0 0 331258 CASAVA_Build 20 18759328 4D CAAGACTTCC TGAT/---- TGATAACTGA 3070 het 3070 hom 32 15 14 4 TGAT 2 1 331259 CASAVA_Build 20 18762410 2I CAATAGGATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 TG 7 8 331260 CASAVA_Build 20 18775055 1D TTTTTTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1914 hom 29 6 17 6 T 12 11 331261 CASAVA_Build 20 18829867 1I AAACATAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 9 10 331262 CASAVA_Build 20 18831340 2D TCATCTCAGC AG/-- AGTCATCTTT 3070 het 3070 ref 46 30 12 7 AG 2 1 331263 CASAVA_Build 20 18840594 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 10 11 331264 CASAVA_Build 20 18840752 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2200 het 2176 hom 19 9 7 3 T 15 14 331265 CASAVA_Build 20 18843467 1D TTGCATGTCT G/- TTGTGACCAA 3070 het 3070 ref 45 25 12 8 G 1 0 331266 CASAVA_Build 20 18844395 6D AAGTGTGATG GGACCA/------ AGGCCAAGGC 3070 het 3070 hom 41 17 18 9 GGACCA 1 0 331267 CASAVA_Build 20 18878220 2D CTTGCTTGGC AG/-- AGAGAGAGAG 1569 het 1569 ref 52 37 4 12 AG 8 7 331268 CASAVA_Build 20 18925771 1D GGATTATTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 T 9 8 331269 CASAVA_Build 20 18932029 2I TATATGTAAC --/AT ATATACATAC 1628 hom 10 het 4 0 4 0 AT 2 3 331270 CASAVA_Build 20 18941832 3I CCTGGCAGTT ---/GGA GAAGTTCTCT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 GGA 0 1 331271 CASAVA_Build 20 18967587 1I TGAGAACGCT -/G GGACACAGGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 2 3 331272 CASAVA_Build 20 18985808 3I CACACTAAAA ---/AAC ACAACCAAGG 3070 hom 105 het 40 0 34 6 AAC 0 1 331273 CASAVA_Build 20 18988253 2D AAATTGAAAC AA/-- AAAAAAAATA 3070 hom 51 het 22 0 18 5 A 10 8 331274 CASAVA_Build 20 19001168 1I GGCAGGGCCT -/G GGGGGGGCGC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 G 7 8 331275 CASAVA_Build 20 19007136 1D CCGCCATAAG A/- GCTTTGGGTT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 1 0 331276 CASAVA_Build 20 19015477 1D TATTAATCCC T/- TTTTTTATAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 6 331277 CASAVA_Build 20 19026102 3I CTGCAGGAGA ---/GAG GAGGAGAAGG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 GAG 2 3 331278 CASAVA_Build 20 19043841 1D AGGGGCGGTT C/- CCCCATACTG 3070 hom 101 het 39 0 32 8 C 5 4 331279 CASAVA_Build 20 19052292 1D GTATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 81 hom 17 1 12 4 T 15 14 331280 CASAVA_Build 20 19058017 1D GTTTTCAGGA G/- TGGAGTTGCA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 G 1 0 331281 CASAVA_Build 20 19060160 2I ATAATGAACA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 58 25 22 11 TG 6 7 331282 CASAVA_Build 20 19060630 11I ACGCTGCTGT -----------/CAGTACTTCAC CATGGCCCCT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 CAGTACTTCAC 0 1 331283 CASAVA_Build 20 19067606 6D ATTAACCTAA AAGTCC/------ AAGTCCAAGT 3070 het 3070 hom 49 21 21 11 AAGTCC 3 2 331284 CASAVA_Build 20 19071929 1D CACTCCCAAT G/- ACATGATTCC 3070 het 3070 ref 53 27 24 2 G 1 0 331285 CASAVA_Build 20 19079625 4I GGGCCATCAC ----/TACT GATCTCATGG 3070 het 3070 ref 44 27 14 3 TACT 0 1 331286 CASAVA_Build 20 19080514 2I AATAAAACTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 11 13 331287 CASAVA_Build 20 19083514 23D8M18D2M6D GAAAAAGAGG TTTACCATTAAACCTCTTTTTAATTTAATGGTAAACTGTGAGGTTTACCATTAAACC/-----------------------TTTAATGG------------------AT------ TCACAGTTCC 3070 hom 54 het 13 0 16 5 N/A 0 0 331288 CASAVA_Build 20 19089994 1I TGTTGGGAAG -/T TTTTTTTTTT 1302 het 1302 ref 36 25 4 7 T 13 14 331289 CASAVA_Build 20 19096582 2I GGGTTTAGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 522 hom 38 2 29 7 TG 7 8 331290 CASAVA_Build 20 19096778 1D TTTCTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 41 1 18 22 T 12 11 331291 CASAVA_Build 20 19109468 2D AATTATATCA CT/-- GTTACTATGT 3070 hom 84 het 33 0 29 7 CT 1 0 331292 CASAVA_Build 20 19112970 2D CCTAAAAATC CT/-- CTGTGTTCCA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 CT 2 1 331293 CASAVA_Build 20 19118770 1D TGATTTTAGT A/- AAAAAAAAAA 810 het 810 ref 38 30 3 5 A 11 10 331294 CASAVA_Build 20 19137767 1I AAAAGAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 27 3 16 8 T 13 14 331295 CASAVA_Build 20 19138035 1I CCCTTCAAGT -/C CCTAGGCAAG 3070 hom 123 het 50 0 39 11 C 2 3 331296 CASAVA_Build 20 19139790 1D GGAGGAGGTC G/- GGGGGGGTAG 3070 het 2699 hom 34 12 14 8 G 8 7 331297 CASAVA_Build 20 19144939 1D TACCCAGCCA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 35 13 21 2 T 8 7 331298 CASAVA_Build 20 19145327 1D ATATGTACAT A/- TACCTATGTG 3070 het 3070 ref 60 33 20 7 A 1 0 331299 CASAVA_Build 20 19147339 1I TGTGGGAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2743 hom 29 8 12 9 T 13 14 331300 CASAVA_Build 20 19151945 1I TCGGGGTGGT -/G GCGGTGGGGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 2 331301 CASAVA_Build 20 19152766 8D GAGTGTGTGA GTGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 3070 het 1039 hom 47 9 19 22 GT 13 9 331302 CASAVA_Build 20 19156039 1D TTGTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 T 12 11 331303 CASAVA_Build 20 19158262 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 TA 6 5 331304 CASAVA_Build 20 19160798 1I TTAAAATTAT -/G CTACCCTTGA 3070 het 3070 ref 32 14 8 10 G 0 1 331305 CASAVA_Build 20 19182876 5I ACTCCCGACC -----/GGACT CCAGAGTCTG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 GGACT 0 1 331306 CASAVA_Build 20 19221712 2I TGGGGGGAAC --/AT ATAAGCATGA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 AT 1 2 331307 CASAVA_Build 20 19231648 1I GTGGCCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 15 10 T 11 12 331308 CASAVA_Build 20 19244158 1D AAAGCTAAGT G/- GGTTATATGG 3070 het 3070 hom 55 26 26 3 G 3 2 331309 CASAVA_Build 20 19244436 4I GTACATAAAC ----/GTTT GTAGGTGCTC 3070 het 3070 ref 66 33 28 5 GTTT 0 1 331310 CASAVA_Build 20 19262685 2D AAAAGCTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 A 13 11 331311 CASAVA_Build 20 19267755 11I TTGGACACAT -----------/AGCTCCCAACA AGCCTGACTC 3070 hom 138 het 48 0 46 2 AGCTCCCAACA 0 1 331312 CASAVA_Build 20 19279557 1I TCTGTCCAGG -/C CCCCAGTGGC 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 C 4 5 331313 CASAVA_Build 20 19296135 1I AAGCCCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 11 12 331314 CASAVA_Build 20 19296830 1D GAGGGATGTT G/- GGCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 3 2 331315 CASAVA_Build 20 19300016 2I ATCACCGAGC --/AG AGTCTGCTCT 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 AG 1 2 331316 CASAVA_Build 20 19301706 1I AGTTTTGCGA -/T TTTTTTTTTT 3029 het 3029 ref 29 13 11 5 T 11 12 331317 CASAVA_Build 20 19304410 1I GAGGTGACCT -/C CCCAGGCATC 3070 het 2970 hom 32 9 17 6 C 3 4 331318 CASAVA_Build 20 19330187 1I TACTGAACAA -/T GGAAAGGTTA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 T 0 1 331319 CASAVA_Build 20 19338492 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 871 het 871 ref 30 16 5 9 TA 9 8 331320 CASAVA_Build 20 19344487 11D ACTTCTTAAT GTCTTAAATTA/----------- AATGTCTTAA 3070 het 3070 ref 43 23 17 5 GTCTTAAATTA 1 0 331321 CASAVA_Build 20 19354423 1D CTGGGATTCA T/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 T 7 6 331322 CASAVA_Build 20 19355562 1I GCAAGGGCAT -/A AAAAAGAACA 3070 het 3070 ref 58 23 23 12 A 5 6 331323 CASAVA_Build 20 19360366 1D GATTCACTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2689 hom 32 10 14 8 A 11 10 331324 CASAVA_Build 20 19373255 1I TCTGGGTATA -/G GGTTGTCATA 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 G 2 3 331325 CASAVA_Build 20 19389087 2D TGGGCAGGAT TC/-- TCTCACAGCT 3070 het 3070 ref 39 16 17 7 TC 3 2 331326 CASAVA_Build 20 19390058 20D CATACATGTA CGCACATATACATATATGTT/-------------------- CACACATATT 3070 het 3070 ref 40 24 17 2 CGCACATATACATATATGTT 1 0 331327 CASAVA_Build 20 19390919 2I GGTGGCTTTC --/TT TTTCTTTTTT 1204 het 1204 ref 17 10 7 0 T 3 5 331328 CASAVA_Build 20 19391086 1I ACAGGCTCCC -/A AGGGGCTGCT 1395 het 1395 ref 25 16 5 4 A 1 2 331329 CASAVA_Build 20 19392313 1D ACTGAAGAGC A/- CAGGATGTGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 0 331330 CASAVA_Build 20 19400307 1D GGTTCAGGAT G/- GCTTAGCCCA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 G 2 1 331331 CASAVA_Build 20 19409866 1D ACGTCCTGGC T/- TGTCAGTGTG 3070 het 3070 hom 54 18 32 5 T 2 1 331332 CASAVA_Build 20 19418422 3D AGAAAACAGT TCA/--- GAGCACTGAG 3070 het 2607 hom 34 7 25 2 TCA 1 0 331333 CASAVA_Build 20 19420628 1I AGGGCCCCCC -/T CTTCACCCCT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 0 1 331334 CASAVA_Build 20 19422779 1I GGCCACCAGG -/C CCCCATGTGC 3070 hom 72 het 31 0 22 9 C 4 5 331335 CASAVA_Build 20 19426214 6I GTTAGGGTTT ------/GCATAA GCACATTTTT 3070 hom 193 het 71 0 63 8 GCATAA 0 1 331336 CASAVA_Build 20 19449367 6I GGTGGTCTCC ------/CCTGTT CCTGTTCCCC 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 CCTGTT 1 2 331337 CASAVA_Build 20 19473258 1I CTCTGGGGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 20 0 T 9 10 331338 CASAVA_Build 20 19475430 1D ACTGCAGTCA C/- CCTGCCTCCA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 C 3 2 331339 CASAVA_Build 20 19494063 1D GTGGGGGGTC A/- AATAACCAAT 3070 het 3070 ref 44 20 16 9 A 3 2 331340 CASAVA_Build 20 19508556 1D ATGACAGAAG A/- CATTATCAAA 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 A 1 0 331341 CASAVA_Build 20 19520138 1D CTCATACTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 16 14 15 T 12 11 331342 CASAVA_Build 20 19533973 1D TCTCCTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 440 hom 38 2 27 9 T 10 9 331343 CASAVA_Build 20 19538606 2D ACCACAAATC CT/-- CTGTTTCTAC 3070 hom 169 het 60 0 57 3 CT 2 1 331344 CASAVA_Build 20 19543707 1I AGATCTGTAA -/G GGGTAAAGCA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 3 4 331345 CASAVA_Build 20 19557608 3D AGACATACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 AAC 4 3 331346 CASAVA_Build 20 19557775 2D GAGCTATAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 2524 hom 31 8 13 10 AC 8 7 331347 CASAVA_Build 20 19564788 4D CATCTCAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 78 het 27 0 27 2 AAAG 6 5 331348 CASAVA_Build 20 19568945 2I TAAGGGTTAG --/TT TTTACTGACA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 3 5 331349 CASAVA_Build 20 19573534 1I CATAAATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 9 10 331350 CASAVA_Build 20 19577138 1D GAGAATATTT G/- TGCCTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 G 1 0 331351 CASAVA_Build 20 19577231 4D ACGCAATCTA TCTT/---- CATATATACT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 TCTT 1 0 331352 CASAVA_Build 20 19580691 1I AAGGAGGCTT -/G GAGATTAAAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 G 1 2 331353 CASAVA_Build 20 19585030 8I GCAGAGAGGT --------/TCAGAATG TCATGCTGGA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TCAGAATG 0 1 331354 CASAVA_Build 20 19586929 2D GAAAGCGCCA AT/-- AGAGTCCTTA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 AT 1 0 331355 CASAVA_Build 20 19594014 1I TTAAGGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 A 9 10 331356 CASAVA_Build 20 19596730 1D GAATTGGCCT G/- GGGGGGCCTT 3070 hom 68 het 32 0 23 9 G 7 6 331357 CASAVA_Build 20 19598146 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1020 het 1020 ref 18 11 3 6 A 13 12 331358 CASAVA_Build 20 19608512 2D TGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 17 17 9 TG 6 5 331359 CASAVA_Build 20 19617537 1D TTAATATATT G/- TATGCATGTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 1 0 331360 CASAVA_Build 20 19621506 4I GAAGCCCACT ----/GGAG GGAGGTCTTC 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 GGAG 1 2 331361 CASAVA_Build 20 19621863 1I TTCTTTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 10 11 331362 CASAVA_Build 20 19625646 17D AAGGAAGGCA GGAGGGAGAAGAGAAAG/----------------- GGAGGGAGAA 1366 hom 9 het 5 0 3 2 GGAGGGAGAAGAGAAAG 1 0 331363 CASAVA_Build 20 19626395 4D TATTGTTCAG TTAT/---- TCCGAAGAAG 3070 het 3070 ref 54 27 21 8 TTAT 1 0 331364 CASAVA_Build 20 19632818 16D TGGAGAGATG GATGGATGGATGGAGA/---------------- GATGGATGGA 2868 het 1500 hom 54 15 15 27 GATGGATGGATGGAGA 1 0 331365 CASAVA_Build 20 19640291 1D TGCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 12 11 331366 CASAVA_Build 20 19640594 4D AGATGCTCAT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 7 TTTG 4 3 331367 CASAVA_Build 20 19645063 3D TTAAAACTGT TTC/--- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 TTC 1 0 331368 CASAVA_Build 20 19648704 5I ACACTAAGAT -----/AAGAC AAGACAGATG 3070 het 3070 hom 59 24 27 8 AAGAC 1 2 331369 CASAVA_Build 20 19649198 1I GGAGGAACTT -/C CTCACCTCCA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 C 1 2 331370 CASAVA_Build 20 19654448 1I CACAGTTAAT -/A ACTCATGTTG 3070 het 3070 ref 51 27 13 11 A 1 2 331371 CASAVA_Build 20 19657269 4D TTGTCTCAAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 83 het 33 0 28 6 AAAT 4 3 331372 CASAVA_Build 20 19666287 1I GGAAAGTATA -/G CAGGAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 G 0 1 331373 CASAVA_Build 20 19666446 1I TGTAAAATTG -/A AAAAAAAAAA 2053 het 2053 ref 22 14 6 2 A 11 12 331374 CASAVA_Build 20 19677037 5D CAAGATCGCA CCACT/----- CCACTCCACT 1773 het 1773 ref 22 10 6 6 CCACT 4 3 331375 CASAVA_Build 20 19680873 1I TTTTGTGGGC -/A GGGGTGGATC 3070 het 2572 hom 26 7 18 1 A 0 1 331376 CASAVA_Build 20 19692176 4D AATGAATGAG TGAA/---- TGAATGAATG 3070 hom 123 het 46 0 42 6 TGAA 4 3 331377 CASAVA_Build 20 19692989 12I AGGGCAGCTG ------------/TGCTAGTCAGAT TGCATGGAAA 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 TGCTAGTCAGAT 0 1 331378 CASAVA_Build 20 19699518 2D ACTGCCCCCA CC/-- CCCCCCCCCC 1532 het 127 hom 21 3 7 11 C 12 10 331379 CASAVA_Build 20 19700691 1I TAGAACAGAT -/G GCGCGCTCTC 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 G 1 2 331380 CASAVA_Build 20 19710427 1D GATTATACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 17 11 T 15 14 331381 CASAVA_Build 20 19712134 21I GGCTGTCTCT ---------------------/GACCTGGGTGATTCCAGGTCA GACCTGGGTG 2533 het 2533 ref 29 13 9 7 GACCTGGGTGATTCCAGGTCA 0 1 331382 CASAVA_Build 20 19719921 5I TTCTAAAGAT -----/AAGAA AAGTTTTCCA 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 AAGAA 0 1 331383 CASAVA_Build 20 19722764 4I CCAAGATCAC ----/AATT AAGGATCCAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AATT 0 1 331384 CASAVA_Build 20 19723329 5D AAGAAAAATT AAATC/----- TAGTTGTATT 3070 het 3070 hom 26 12 14 1 AAATC 1 0 331385 CASAVA_Build 20 19724743 2I AAAAAAGAAA --/AG AGAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 AG 1 2 331386 CASAVA_Build 20 19731116 1D AAGTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2150 het 713 hom 25 8 9 8 A 17 16 331387 CASAVA_Build 20 19732997 1I ATGGCTCTTA -/T TTATTTTGAA 3070 het 3070 ref 36 24 8 4 T 2 3 331388 CASAVA_Build 20 19739690 1D TGTTTAATAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 17 9 0 A 10 9 331389 CASAVA_Build 20 19740421 2D69M1I TAATATGAAA CTCTCTTTGAGTTATAGTTTTGAGTAGAAAAAAGCACAGTACAAACAATATTTAGAATATGCTCCCATTTT-/--CTCTTTGAGTTATAGTTTTGAGTAGAAAAAAGCACAGTACAAACAATATTTAGAATATGCTCCCATTTTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 29 22 9 N/A 0 0 331390 CASAVA_Build 20 19740706 5I TAGCTTGTTC -----/TTTTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 9 14 331391 CASAVA_Build 20 19742240 2D19M4I ATGAAGTAAA ACACAATAAAAAAGTAGAGAC----/--ACAATAAAAAAGTAGAGACAGAT AGGTGCATAA 3070 het 3070 ref 40 25 17 7 N/A 0 0 331392 CASAVA_Build 20 19745060 2I TTTTCCTGTT --/TA CAGAGTAAAG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 TA 0 1 331393 CASAVA_Build 20 19746649 8I TTGTGCAAAT --------/GTTGTAGA GTTGTAGAGT 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 GTTGTAGA 1 2 331394 CASAVA_Build 20 19746747 1I GTGCAGCATG -/T TACTGTACTG 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 1 2 331395 CASAVA_Build 20 19746842 1D GTATAAAAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 T 9 8 331396 CASAVA_Build 20 19754755 5I TTTTTAACAA -----/TAATT TAACTTGCAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 TAATT 0 1 331397 CASAVA_Build 20 19758907 1I TAGCTTCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 10 22 6 T 9 10 331398 CASAVA_Build 20 19763789 4I GAAGGGAGGG ----/AGGA AGGAAGGAAG 2189 het 2189 ref 39 14 9 16 AGGA 4 5 331399 CASAVA_Build 20 19765693 1I TTTATCTATA -/T TAATTTCCAT 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 T 1 2 331400 CASAVA_Build 20 19766380 4D TTCTCCTTGA TTCT/---- TTCTTTTTTC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 TTCT 2 1 331401 CASAVA_Build 20 19777308 1I AATGAAACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 20 hom 28 1 18 9 T 9 10 331402 CASAVA_Build 20 19786768 1I CTGTCTTTTT -/A TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 A 0 1 331403 CASAVA_Build 20 19789001 2D AGTCTCACTC TG/-- TTGCTCAGGC 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 TG 1 0 331404 CASAVA_Build 20 19795653 2D TTTATTTTTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 11 9 331405 CASAVA_Build 20 19799297 1I TCAAAAAAAA -/T GAAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 T 0 1 331406 CASAVA_Build 20 19805224 1D CGAAATGGGG A/- TATGTGAGTA 3070 hom 68 het 25 0 22 3 A 1 0 331407 CASAVA_Build 20 19812534 2D CCACCTTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 20 9 A 16 14 331408 CASAVA_Build 20 19814206 1I GGCTACTTGC -/A AGGCTGAGGC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 1 2 331409 CASAVA_Build 20 19820395 10D CCTGGGAGGT GGAGGTTGCA/---------- GGAGGTTGCA 3070 hom 51 het 20 0 17 5 GGAGGTTGCA 2 1 331410 CASAVA_Build 20 19821224 4D CTTTCTTTCC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 51 het 21 0 18 5 TCTT 4 3 331411 CASAVA_Build 20 19839045 2I TCGAACTCCT --/CA CACCTCAAGT 3070 het 3029 hom 17 7 10 0 CA 1 2 331412 CASAVA_Build 20 19839701 1D AATATGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 11 10 331413 CASAVA_Build 20 19840386 4I TCATTCCGTG ----/TTTA AATTTTTGCT 3070 hom 138 het 48 0 47 1 TTTA 0 1 331414 CASAVA_Build 20 19840614 2I AGGGGCTGTC --/TG TGTGGTTTTG 3070 het 3070 hom 52 20 25 7 TG 2 3 331415 CASAVA_Build 20 19846404 2D ATCTCAAGAA AT/-- ATGTTTTAAA 3070 het 3070 hom 55 22 29 5 AT 2 1 331416 CASAVA_Build 20 19846904 1D CAACCTCCCA C/- CCAAGGCCAA 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 C 3 2 331417 CASAVA_Build 20 19862928 1D AATTACTATG T/- TTTCAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 24 15 9 T 4 3 331418 CASAVA_Build 20 19865066 2I GGAATTTCTC --/TT TATCCTGTGC 3070 het 3070 hom 34 13 21 0 T 1 3 331419 CASAVA_Build 20 19873335 2I GAGAAGTGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 T 10 12 331420 CASAVA_Build 20 19880299 2I AGCATCCACT --/CA CAATTTTTGC 3070 het 3070 ref 65 32 27 6 CA 1 2 331421 CASAVA_Build 20 19898412 4D CACTGGAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 55 26 21 10 AAAC 5 4 331422 CASAVA_Build 20 19898558 1D CTTAGAGCAT G/- GTCCTAACCT 3070 het 3070 ref 68 35 29 4 G 2 1 331423 CASAVA_Build 20 19899830 1I GCGTGCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 17 12 T 12 13 331424 CASAVA_Build 20 19906059 1I AAAACATGCT -/G AAAATTATGT 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 G 0 1 331425 CASAVA_Build 20 19912186 1I ACTTCCCTAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 8 9 331426 CASAVA_Build 20 19912248 1I TTACCTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 9 10 331427 CASAVA_Build 20 19912533 1D TACATTTTTT G/- TTTATTATTA 2220 het 2220 ref 14 8 5 1 G 1 0 331428 CASAVA_Build 20 19917917 1D GAAAACATTC T/- TTTTTTTTTT 1010 het 194 hom 26 2 4 20 T 19 18 331429 CASAVA_Build 20 19921919 1I CACGGTTTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2954 hom 30 11 13 6 T 11 12 331430 CASAVA_Build 20 19931023 1D TTGTAAATGA T/- TTTTTAAATG 3070 het 3070 ref 50 27 21 2 T 6 5 331431 CASAVA_Build 20 19946852 1D CAGGTACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 12 11 331432 CASAVA_Build 20 19958261 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 32 4 15 13 A 17 16 331433 CASAVA_Build 20 19959369 4D AGGAAACAAA ACTT/---- ACTTATTTTG 3070 het 3070 hom 23 8 13 4 ACTT 2 1 331434 CASAVA_Build 20 19962401 1I AATCTATACT -/A AAAAAAAATA 2133 het 2133 ref 16 8 6 2 A 8 9 331435 CASAVA_Build 20 19966883 1D GGAAGTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3064 hom 34 13 14 7 A 16 15 331436 CASAVA_Build 20 19972459 1D TTGTTGAAGG T/- TATCTCTGTC 3070 het 3070 hom 50 24 24 3 T 2 1 331437 CASAVA_Build 20 19973431 1D GCCCACTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2840 hom 38 10 17 11 T 11 10 331438 CASAVA_Build 20 19977671 19D10M3I GCCATTGGTT TTATTTTTTTTGGCCATTGTTTAGCTGAA---/-------------------TTCAGCTAAACAC ATTTGTAAAA 3070 het 3070 ref 29 27 13 3 N/A 0 0 331439 CASAVA_Build 20 19981564 4I TGTGCCCAAA ----/TAAT TAATTCTAAG 3070 het 3070 ref 40 18 10 12 TAAT 1 2 331440 CASAVA_Build 20 19986878 1I TAAAATGCCT -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 A 6 7 331441 CASAVA_Build 20 19988722 1D ACAGAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 2173 het 2173 ref 23 11 8 4 A 12 11 331442 CASAVA_Build 20 20004039 1I TAGAACAATT -/A AAGCACAATT 3070 hom 144 het 53 0 49 4 A 2 3 331443 CASAVA_Build 20 20008078 1D GTCAGTGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 103 het 42 0 35 7 T 10 9 331444 CASAVA_Build 20 20014793 1D TGCCAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1509 het 1509 ref 17 5 4 9 T 12 11 331445 CASAVA_Build 20 20021330 1I AGACACTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 10 19 10 A 8 9 331446 CASAVA_Build 20 20025741 4D TTAATACCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 5 T 17 13 331447 CASAVA_Build 20 20028223 1D CCTCCCACAC G/- GGGGGGGGGT 1903 het 257 hom 32 6 6 20 G 10 9 331448 CASAVA_Build 20 20030231 3D CACAAGATAC ATG/--- ATGAGTTTTT 2708 het 2708 ref 24 13 7 4 ATG 2 1 331449 CASAVA_Build 20 20030297 1D GAGATGAAGG C/- CCCCCTCTGT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 C 6 5 331450 CASAVA_Build 20 20034310 1D GAGTCTCGCT C/- TGTCGCCCAG 1882 het 489 hom 8 1 5 2 C 1 0 331451 CASAVA_Build 20 20036271 1D CTTAAAAAAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 8 7 331452 CASAVA_Build 20 20037169 1D ATCTCAGGTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 11 24 7 A 9 8 331453 CASAVA_Build 20 20037416 3D CCAACATGAA GTT/--- GTTGGAGCAC 3070 hom 105 het 41 0 35 7 GTT 2 1 331454 CASAVA_Build 20 20055975 3D TTTCTGGTTC CTT/--- CTTATTTGGG 3070 het 3070 hom 22 8 12 3 CTT 2 1 331455 CASAVA_Build 20 20059987 4I GTTATATACC ----/TATT TATTTGTTAT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 TATT 1 2 331456 CASAVA_Build 20 20064635 1I TTGAAGGATA -/T TTTTTGCCAG 3070 het 3070 ref 33 16 17 0 T 5 6 331457 CASAVA_Build 20 20065171 2I TATTAAGAGA --/CT CTGATACATT 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 CT 1 2 331458 CASAVA_Build 20 20073065 1D TACAATCAAT C/- AAGATGAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 8 5 C 1 0 331459 CASAVA_Build 20 20073252 1D GCTAGGACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 10 9 331460 CASAVA_Build 20 20077038 1I GCATGGGATG -/T TATTTCCATT 2956 het 2956 ref 19 11 8 0 T 1 2 331461 CASAVA_Build 20 20079990 1I CCAATTAGAC -/A AAAAAAAAAA 2255 het 2255 ref 28 12 8 8 A 10 11 331462 CASAVA_Build 20 20087952 1D TGCTCCAGAG C/- TTGGACTCTA 3070 het 3070 hom 50 18 23 9 C 1 0 331463 CASAVA_Build 20 20090552 1D GCCTTGTATT A/- AGTTTCTATT 3070 het 3070 ref 44 18 18 9 A 2 1 331464 CASAVA_Build 20 20091496 3I CTTTGCTCAG ---/CAA CAACAACAGA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 CAA 2 3 331465 CASAVA_Build 20 20095386 5I TGAATGACAC -----/TGTTA TGTTATTTTA 3070 het 3070 hom 69 27 32 10 TGTTA 1 2 331466 CASAVA_Build 20 20098416 4I AGATTGTGCA ----/GATT GATCTTTGTA 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 GATT 0 1 331467 CASAVA_Build 20 20099052 1D ATGAATCAAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 8 7 331468 CASAVA_Build 20 20100967 1D ATTAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 12 11 331469 CASAVA_Build 20 20103408 2I TGTTTGTATT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 9 11 331470 CASAVA_Build 20 20104782 1D AATGCAAATC A/- AAAACCACAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 A 5 4 331471 CASAVA_Build 20 20105055 1I21M1D TGTTCATTGC -GCACCGTTCATACTTGCAAAGA/AGCACCGTTCATACTTGCAAAG- CATGGAATTA 3070 het 3070 ref 27 17 15 3 N/A 0 0 331472 CASAVA_Build 20 20105981 4I ACTCAGAATG ----/CATT GCTTCCACTG 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 CATT 0 1 331473 CASAVA_Build 20 20106176 1D GGCTGATGTC T/- TGTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 T 2 1 331474 CASAVA_Build 20 20106463 2D GGCTGCCATT TA/-- TTGCCTAGGG 3070 het 3070 hom 48 17 19 12 TA 1 0 331475 CASAVA_Build 20 20107321 2I TTAATCGATT --/CC CTCCCCCCCA 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 C 1 3 331476 CASAVA_Build 20 20109821 2I ATATATACAC --/AT ATATATATGC 2503 het 2166 hom 17 7 7 3 AT 4 5 331477 CASAVA_Build 20 20111360 10I AATTGCTATG ----------/TAGAAGCAAT TAGAAGCAAT 3070 het 3070 ref 44 19 19 6 TAGAAGCAAT 1 2 331478 CASAVA_Build 20 20112321 3D ATATCCAAAA TAT/--- TATTGTTTCA 3070 het 3070 hom 43 19 22 4 TAT 2 1 331479 CASAVA_Build 20 20167602 1D AACTTGAAAC T/- TTTTTTTTTT 1066 het 1066 ref 45 29 4 12 T 13 12 331480 CASAVA_Build 20 20186271 2D AAACAAAAAA AC/-- AAAAAAAAAA 1122 het 14 hom 10 1 7 3 AC 1 0 331481 CASAVA_Build 20 20188560 3D GAAAAGTTAT CTG/--- CTGCTCTCCA 3070 het 3070 hom 56 23 28 6 CTG 2 1 331482 CASAVA_Build 20 20192126 1D GTCTTCTTTT G/- TGAAACTGAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 G 1 0 331483 CASAVA_Build 20 20199325 3D TGCATTATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2226 het 725 hom 36 10 10 16 T 17 14 331484 CASAVA_Build 20 20201092 5I TTAATTAATT -----/AAAAA ATAAAATAAA 2212 het 2212 ref 18 8 7 3 A 1 6 331485 CASAVA_Build 20 20203676 8I GCTCATGGGC --------/CAAAGCAA ATGACCATGA 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 CAAAGCAA 0 1 331486 CASAVA_Build 20 20204992 4I CAGCAGTTTA ----/TTTC TTTGTGAAAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 TTTC 0 1 331487 CASAVA_Build 20 20216766 1D GCATCATATA G/- GGACAAGCTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 3 2 331488 CASAVA_Build 20 20223647 1I AGTCCATAAC -/A AAAAAAAATC 1668 het 1668 ref 10 6 4 0 A 8 9 331489 CASAVA_Build 20 20238480 1D TTTTATCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 10 9 331490 CASAVA_Build 20 20260073 1D AAAGCTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 21 2 16 3 A 13 12 331491 CASAVA_Build 20 20265270 1D ACCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 25 1 19 5 A 15 14 331492 CASAVA_Build 20 20280219 1I CTCTGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 3063 het 545 hom 14 2 9 3 A 13 14 331493 CASAVA_Build 20 20284070 2I GTGGTCACAC --/TG TGAGGGGAGG 1812 het 1608 hom 29 7 6 16 TG 1 2 331494 CASAVA_Build 20 20286155 2I GGTGGTCACA --/GT CTGAGGGGAG 1210 het 1210 ref 34 21 3 10 GT 0 1 331495 CASAVA_Build 20 20287989 1I TAATCACTCC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 T 8 9 331496 CASAVA_Build 20 20288338 6I AACAACAACA ------/ACAACC ACAAAACAAG 3070 hom 115 het 41 0 39 2 ACAACC 0 1 331497 CASAVA_Build 20 20300370 1D TTTTGCTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 337 hom 36 2 27 7 T 11 10 331498 CASAVA_Build 20 20304271 1I ATTTCCACAC -/A AAGCATCAGC 3070 hom 113 het 42 0 33 9 A 2 3 331499 CASAVA_Build 20 20315442 2I TTCTGGAGCC --/AT AGAGAGAGGT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 AT 0 1 331500 CASAVA_Build 20 20317564 1I CCATGTTTTG -/T TAAGTATTAG 3070 het 3070 ref 62 31 26 5 T 1 2 331501 CASAVA_Build 20 20323275 1D ACCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 33 hom 31 1 24 6 A 10 9 331502 CASAVA_Build 20 20325422 1I AAACACAACA -/C CCCCCACAGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 5 6 331503 CASAVA_Build 20 20326171 1D TTCTCCTGAA C/- TCTCAGCCCC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 C 1 0 331504 CASAVA_Build 20 20332749 5D GTGGCCACAA AATAG/----- AATAGGGTTT 3070 het 3070 hom 46 16 24 7 AATAG 2 1 331505 CASAVA_Build 20 20337423 1I ATGTATTTAT -/A ACATAAAACA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 1 2 331506 CASAVA_Build 20 20349784 4D AATGGGCAAG GGAT/---- GGATGTGCAT 3070 het 3070 ref 43 24 16 5 GGAT 2 1 331507 CASAVA_Build 20 20397083 1I CTCAGGAGTG -/T TTTCTTTGTG 3070 hom 135 het 47 0 43 4 T 3 4 331508 CASAVA_Build 20 20439172 1I AAAAGTGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1900 hom 26 8 11 7 T 12 13 331509 CASAVA_Build 20 20504050 1D GTTGAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 20 11 T 14 13 331510 CASAVA_Build 20 20544431 4I AACTATGTTT ----/GATG AACGTTTAAA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 GATG 0 1 331511 CASAVA_Build 20 20575546 1I GTACTTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 9 10 331512 CASAVA_Build 20 20590947 1D CACTCAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1123 het 1123 ref 32 27 3 2 A 11 10 331513 CASAVA_Build 20 20629199 1I TCATAAATTT -/A AAACTTTACA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 3 4 331514 CASAVA_Build 20 20688941 8D GATTGCACCA GTACACTC/-------- CAGCCTTGGC 3070 het 3070 ref 21 12 9 5 GTACACTC 1 0 331515 CASAVA_Build 20 20736374 3D AACTAGTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 40 18 16 8 TTG 5 4 331516 CASAVA_Build 20 20741524 8I AAGCAAGATA --------/TTGTTGAT TTGTTGATTA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 TTGTTGAT 1 2 331517 CASAVA_Build 20 20742005 1I49M1I GGCTCTGTCG -CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCT-/CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTC CCAGGTTCAT 3070 hom 39 het 8 0 12 5 N/A 0 0 331518 CASAVA_Build 20 20748170 1D AAATTTTGCC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 8 7 331519 CASAVA_Build 20 20767628 1D CTCCAGATTG A/- AAAAAAAAAA 1858 het 1858 ref 32 10 5 17 A 15 14 331520 CASAVA_Build 20 20775526 3D GTCTATATAT CAC/--- CTGGCCAGAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 6 CAC 1 0 331521 CASAVA_Build 20 20799501 1D TACCTCACAG A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 26 8 12 6 A 8 7 331522 CASAVA_Build 20 20801331 2D GAAAGGAGAT TG/-- TGTTATTGAA 3070 het 3070 hom 53 25 24 4 TG 2 1 331523 CASAVA_Build 20 20815382 4D ATCTACCATG ATAA/---- ATAAATTGTT 3070 het 3070 ref 38 21 17 2 ATAA 2 1 331524 CASAVA_Build 20 20825555 1I AAGTTATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 10 20 12 A 11 12 331525 CASAVA_Build 20 20844524 1I CAGGGAAGAC -/A GGAGAAAATG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 0 1 331526 CASAVA_Build 20 20857041 1D AAAGCTCTTG T/- TTACTACCTA 3070 het 3070 ref 33 22 8 3 T 3 2 331527 CASAVA_Build 20 20864743 1I TCTTCCGGGG -/A AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 7 8 331528 CASAVA_Build 20 20875256 1I TGAAAGCAGA -/C CTTTGGGAAC 3070 hom 147 het 56 0 49 7 C 1 2 331529 CASAVA_Build 20 20875604 1D TCACGCTTAT A/- AATCCCAGTA 3070 hom 87 het 37 0 28 9 A 3 2 331530 CASAVA_Build 20 20885126 1I TTCTGCCGGT -/C CTTGTTCCCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 2 331531 CASAVA_Build 20 20899056 1D TTTATGATTG A/- AAGAGATGGG 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 A 3 2 331532 CASAVA_Build 20 20905868 1I TTCGGTTTCA -/T TCTAGGAAAC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 1 2 331533 CASAVA_Build 20 20926415 2I TCCCTCAGGA --/TC TCTACCTTAA 3070 het 3070 hom 59 21 28 10 TC 1 2 331534 CASAVA_Build 20 20949589 1I CAAACAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1606 hom 27 6 15 6 T 10 11 331535 CASAVA_Build 20 20950712 1I CTCCTCCTGA -/G TGGGGAAAGC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 0 1 331536 CASAVA_Build 20 20988394 4D ATACGCTTGC CTAA/---- CTAACTACCA 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 CTAA 2 1 331537 CASAVA_Build 20 21045446 3I TGATTGCAGA ---/CTT CTTCTACCTT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 CTT 1 2 331538 CASAVA_Build 20 21050348 6D6M12I TGGCTAATGG CTACCAGATTGG------------/------GGTAGGAAGCAATGTCTT ATATGTCTGC 1404 het 1404 ref 29 26 4 3 N/A 0 0 331539 CASAVA_Build 20 21065241 1D TTGTTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2749 hom 30 8 11 11 T 13 12 331540 CASAVA_Build 20 21066717 3I CCAGACATAA ---/TAT TATTTAATTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TAT 1 2 331541 CASAVA_Build 20 21073275 6I GAGACAGCAT ------/ATATTA ATATTACCTT 3070 het 3070 hom 41 9 26 6 ATATTA 1 2 331542 CASAVA_Build 20 21073813 1D GATTTTTTTT G/- TTTGTTTGGG 3070 het 3070 ref 43 23 17 4 G 1 0 331543 CASAVA_Build 20 21074937 1I CACTTGTGAC -/T TATGTGTGAA 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 T 1 2 331544 CASAVA_Build 20 21084057 1I GAAACCAATC -/A AAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 55 22 25 8 A 6 7 331545 CASAVA_Build 20 21090125 13D GGCACCTGCC ACCGTGCCCGGCT/------------- AATTTTTGTA 2501 het 1710 hom 21 7 9 5 ACCGTGCCCGGCT 1 0 331546 CASAVA_Build 20 21092550 1I AAATGGCATT -/A ATAACATCAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 1 2 331547 CASAVA_Build 20 21093354 1D TTCGAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 12 11 331548 CASAVA_Build 20 21124015 1I CGAGACCACT -/A AAAGTCAGTC 3070 hom 151 het 56 0 51 5 A 3 4 331549 CASAVA_Build 20 21133293 3D ACTTTCTGGT ACA/--- ACAAGATGTT 3070 het 3070 hom 37 17 17 4 ACA 2 1 331550 CASAVA_Build 20 21134162 1I GACGTACCGA -/G GGCACAGGTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 2 3 331551 CASAVA_Build 20 21138217 1D CTTCTCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 12 15 8 A 10 9 331552 CASAVA_Build 20 21139401 1D TACTATCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 12 11 331553 CASAVA_Build 20 21147812 14D AGGAGCTGCC ATATACCAGGTAGA/-------------- ATATTTATCG 892 het 892 ref 31 22 6 12 ATATACCAGGTAGA 1 0 331554 CASAVA_Build 20 21150564 1I TCCTATCCCA -/G AAGCATTTTC 3070 hom 180 het 68 0 58 10 G 0 1 331555 CASAVA_Build 20 21169351 1D GTCCATACGG C/- CCGCAAGCTA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 C 3 2 331556 CASAVA_Build 20 21171947 1I TGTTTTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 19 8 A 10 11 331557 CASAVA_Build 20 21187703 1I TTTACATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 A 10 11 331558 CASAVA_Build 20 21194443 1I AGAATTCTCT -/G GAAGACTCCA 3070 hom 69 het 27 0 21 6 G 1 2 331559 CASAVA_Build 20 21208005 1I GGCCAGGTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 T 8 9 331560 CASAVA_Build 20 21218394 20I ATTCACTGGA --------------------/AGAAAAGCTTTTTGATCCTT ACCTTTGTTA 3070 het 3070 hom 43 17 16 10 AGAAAAGCTTTTTGATCCTT 0 1 331561 CASAVA_Build 20 21224300 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2874 het 1466 hom 32 7 10 15 T 13 14 331562 CASAVA_Build 20 21226076 1D AAAAACACCC A/- GTGCGGCCCT 3070 het 3070 ref 37 22 9 6 A 1 0 331563 CASAVA_Build 20 21226891 2D TAAATTGTCC AA/-- AATAAGTGGA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 4 2 331564 CASAVA_Build 20 21245940 1D TAGATGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 8 14 8 T 11 10 331565 CASAVA_Build 20 21253136 1I GTATATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 13 14 331566 CASAVA_Build 20 21261110 1I TTGCCTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 A 11 12 331567 CASAVA_Build 20 21269693 3I AGAAGAGCAC ---/GTA GTAGGATTGT 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 GTA 1 2 331568 CASAVA_Build 20 21274579 1D TTATAAACTA T/- TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 39 23 15 3 T 7 6 331569 CASAVA_Build 20 21276716 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 8 7 331570 CASAVA_Build 20 21285777 1I ACATGTAGGG -/T TATCTTTTAG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 1 2 331571 CASAVA_Build 20 21301651 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 T 9 8 331572 CASAVA_Build 20 21310704 1D AGGTAATATT A/- AAAGTAGACA 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 A 4 3 331573 CASAVA_Build 20 21316594 3I TTCTTCTGAG ---/AGT ATTTTGTTAC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 AGT 0 1 331574 CASAVA_Build 20 21318335 2I GTTTGAACTC --/TT GAGCTGGAAC 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 0 2 331575 CASAVA_Build 20 21330335 2D GCTGTAACAC TA/-- TAGTTTTTAC 3070 het 3070 hom 45 19 23 4 TA 2 1 331576 CASAVA_Build 20 21331297 1D69M3D TGCAAATTTT GGTAGATTTTAAGCAATTTATTGCTTAATAATTTGCATTAAAAAGCTTAATATGAAACAATTTCATTAATCTA/-GTAGATTTTAAGCAATTTATTGCTTAATAATTTGCATTAAAAAGCTTAATATGAAACAATTTCATTAAT--- CTTTCTTCAG 3070 het 3070 ref 42 31 26 7 N/A 0 0 331577 CASAVA_Build 20 21353384 5I CTCTTTCCTG -----/TCTCT TCTCTTTCTG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TCTCT 1 2 331578 CASAVA_Build 20 21422474 2D AAAACTCAAC TG/-- TGAACAATTG 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 TG 2 1 331579 CASAVA_Build 20 21422947 2D GTATTCTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 21 14 11 A 12 10 331580 CASAVA_Build 20 21471180 4D TTTCTCTACT GTGA/---- GTGTTATTCA 3070 het 3070 ref 37 19 15 6 GTGA 1 0 331581 CASAVA_Build 20 21474253 1D ATTAGAGCAG A/- ATAGATTTTA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 2 1 331582 CASAVA_Build 20 21506490 9D TGCTTGTTTG ACTGCAAAC/--------- AAGTATGAGA 3070 hom 144 het 53 0 49 8 ACTGCAAAC 1 0 331583 CASAVA_Build 20 21508732 1D TTATCTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 42 1 31 10 A 11 10 331584 CASAVA_Build 20 21515677 3I GCCTAGATAA ---/CTT CTCCTCAGCC 3070 hom 99 het 39 0 32 7 CTT 0 1 331585 CASAVA_Build 20 21516998 1D GACTTCTGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 42 0 33 10 T 10 9 331586 CASAVA_Build 20 21523867 1I TTTAGGGATT -/A GGAGACTGGG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 0 1 331587 CASAVA_Build 20 21533613 1I ATCTTGAGAT -/G TTTTTTCCCT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 G 0 1 331588 CASAVA_Build 20 21550706 2D CTAGAAAAAC AA/-- GAGTATCAGC 3070 hom 110 het 44 0 36 10 A 2 0 331589 CASAVA_Build 20 21614388 1D GGAAATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1738 hom 34 11 14 9 T 14 13 331590 CASAVA_Build 20 21673331 1I AAAGTTAGAT -/G GCCTAGCCTA 3070 hom 129 het 49 0 42 7 G 1 2 331591 CASAVA_Build 20 21699452 1I CCTGGGCCCT -/G GGGCCCTGAG 3070 hom 44 het 20 0 14 6 G 3 4 331592 CASAVA_Build 20 21716152 1I CAATATGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 17 0 13 4 T 10 11 331593 CASAVA_Build 20 21717110 11D TTTTCTTTTC TTTTCTTTTCT/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 4 TTTTCTTTTCT 1 0 331594 CASAVA_Build 20 21718044 1D CCACATGTCC T/- TATAACCTAT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 T 2 1 331595 CASAVA_Build 20 21736326 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 553 hom 41 2 29 10 C 0 1 331596 CASAVA_Build 20 21742178 1D TTGAGTAGCA T/- TATATTATGT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 2 1 331597 CASAVA_Build 20 21759175 1I TTGGCTGTTA -/T GTAGAAAACC 3070 hom 111 het 47 0 38 9 T 0 1 331598 CASAVA_Build 20 21777632 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 37 0 28 9 T 11 10 331599 CASAVA_Build 20 21783499 1I AAGTTTAGAG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 7 8 331600 CASAVA_Build 20 21791824 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 235 hom 55 1 35 19 TG 8 9 331601 CASAVA_Build 20 21803322 1I GGAAATATAC -/T TGGGTACAAG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 1 2 331602 CASAVA_Build 20 21805853 5I TCTCTTTCTC -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 TTTCT 2 3 331603 CASAVA_Build 20 21807667 1D TTCCTAAGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 9 8 331604 CASAVA_Build 20 21810828 1D GATTTTTAGC T/- TCGTTGGATT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 2 1 331605 CASAVA_Build 20 21811069 1I GGCCTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 33 2 25 6 T 11 12 331606 CASAVA_Build 20 21823439 1I TGATGAGCTG -/T TTGCTCTGGA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 T 2 3 331607 CASAVA_Build 20 21839492 1I TTTTTCTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 20 het 28 1 23 5 T 9 10 331608 CASAVA_Build 20 21846028 1D AAATTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 31 0 22 10 T 11 10 331609 CASAVA_Build 20 21866880 1I AGAAACACAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 254 hom 33 1 28 4 T 9 10 331610 CASAVA_Build 20 21944831 1D GTTTGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 389 hom 33 2 13 18 T 15 14 331611 CASAVA_Build 20 21945217 1I ATTCCCTAAG -/A ATTACTTCCA 3070 hom 151 het 61 0 51 10 A 1 2 331612 CASAVA_Build 20 21977186 4D AGTTCTGCTG ATTT/---- ACCTCTCATG 3070 het 3070 ref 54 25 24 7 ATTT 1 0 331613 CASAVA_Build 20 22029562 1D ACAGATCCCG A/- GGGAAGCCAA 3070 hom 92 het 38 0 30 11 A 1 0 331614 CASAVA_Build 20 22040788 4D TAGCTAGCAG TCTA/---- TCTATTTTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TCTA 2 1 331615 CASAVA_Build 20 22051507 1D AAGGCTATTT A/- ACCCATTTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 1 331616 CASAVA_Build 20 22052960 4D TATGAAAGAA AAAT/---- AAAAGAAATG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 AAAT 1 0 331617 CASAVA_Build 20 22056926 1D GTGCTAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 31 0 24 7 A 10 9 331618 CASAVA_Build 20 22059387 1I CTTTTATGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 138 het 52 0 47 5 A 9 10 331619 CASAVA_Build 20 22064072 2D ATATATATAT AC/-- ACATATATAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 AC 2 1 331620 CASAVA_Build 20 22064222 2I TGTGGAATCT --/AA AAAATAAAGA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 4 6 331621 CASAVA_Build 20 22068754 2D CTATTATCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 17 15 331622 CASAVA_Build 20 22093515 1D GTGAGACTCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 38 het 16 0 13 3 A 9 8 331623 CASAVA_Build 20 22094057 1I CACGGCTAGA -/T TATTAACCAG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 2 331624 CASAVA_Build 20 22102624 1I TGCACCCTCC -/T TTTTTTGGTT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 6 7 331625 CASAVA_Build 20 22105085 2I CCTGAATACC --/TT TTTTTTTTCA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 8 10 331626 CASAVA_Build 20 22120049 1D AATCAATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 37 0 32 5 A 12 11 331627 CASAVA_Build 20 22128900 1D TATAATAGTT A/- AAAAAAAAAA 2811 hom 21 het 8 0 8 0 A 12 11 331628 CASAVA_Build 20 22133096 2I TGTTGGCTAA --/TC TCTTTCTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TC 1 2 331629 CASAVA_Build 20 22139123 1D TAATAAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 10 9 331630 CASAVA_Build 20 22142391 6D GCCACTGCTT CTCAGC/------ ACAGCACCGG 3070 hom 72 het 28 0 23 8 CTCAGC 1 0 331631 CASAVA_Build 20 22160576 1D CCCAGAGGGG A/- ACACCTCTCA 3070 hom 60 het 23 0 19 4 A 2 1 331632 CASAVA_Build 20 22172717 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1352 het 1352 ref 37 29 3 6 T 11 10 331633 CASAVA_Build 20 22207099 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 11 10 331634 CASAVA_Build 20 22220920 3D AAAATATGCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 57 hom 39 2 23 14 A 19 16 331635 CASAVA_Build 20 22221316 14D TAAAGATTAA CTGAAGTATTGGAT/-------------- CTCAGAAGCC 3070 hom 90 het 31 0 31 5 CTGAAGTATTGGAT 1 0 331636 CASAVA_Build 20 22241627 1D AGAAAAAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 33 0 27 6 A 11 10 331637 CASAVA_Build 20 22251117 1D ATTGACCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 39 2 23 15 T 13 12 331638 CASAVA_Build 20 22267820 1I GTGTCATGTA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 160 het 57 0 54 3 T 8 9 331639 CASAVA_Build 20 22273536 1I TTGTCAATAA -/T TTTTAAAAGT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 4 5 331640 CASAVA_Build 20 22388325 1D TATCTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 1374 het 1374 ref 31 20 4 7 T 17 16 331641 CASAVA_Build 20 22403263 1D TATTGTCCCC A/- AAATCAACTG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 4 3 331642 CASAVA_Build 20 22455769 1D TTCTTTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 36 2 25 9 A 12 11 331643 CASAVA_Build 20 22461410 1I AAGCAGGCCT -/G GCTTAGCCAG 3070 hom 123 het 49 0 41 8 G 1 2 331644 CASAVA_Build 20 22471093 1D TGATAGGGAG T/- TTTTTTTTTT 1127 het 1127 ref 39 31 3 5 T 12 11 331645 CASAVA_Build 20 22474663 1D CATCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 23 0 15 9 A 12 11 331646 CASAVA_Build 20 22475912 1D GAGCCTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 449 hom 38 2 18 18 T 15 14 331647 CASAVA_Build 20 22481530 1D TGCTTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 2270 het 2270 ref 55 35 6 14 T 12 11 331648 CASAVA_Build 20 22534087 1I CCCAAAATCC -/T TGTTTCTTTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 1 2 331649 CASAVA_Build 20 22534630 2I GCATTGGCAC --/AA AGGGGTGTGG 3070 hom 164 het 63 0 53 10 A 1 3 331650 CASAVA_Build 20 22534841 1D TGAGATGGAG C/- CATCTATTCC 3070 hom 126 het 46 0 42 5 C 2 1 331651 CASAVA_Build 20 22539084 3D AACACACACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 23 0 13 11 T 15 12 331652 CASAVA_Build 20 22544008 1D GACAATTAAT G/- GAAACATCAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 G 2 1 331653 CASAVA_Build 20 22544367 1D TTCATAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 124 hom 39 2 29 8 T 13 12 331654 CASAVA_Build 20 22546445 1I AGCAAACAAG -/A AAATAGATTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 3 4 331655 CASAVA_Build 20 22550024 1D TAACAAGCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 73 het 29 0 24 5 A 10 9 331656 CASAVA_Build 20 22580578 5D GGAGAGCAGG CCAGC/----- TGGAAACATC 3070 hom 141 het 52 0 45 9 CCAGC 1 0 331657 CASAVA_Build 20 22582905 2I ATACAAACCT --/AC ACACACACGC 3070 hom 129 het 60 0 44 16 AC 4 5 331658 CASAVA_Build 20 22595438 1D GTTCCAGACT C/- CCCCCTACAG 3070 hom 87 het 32 0 28 4 C 6 5 331659 CASAVA_Build 20 22615616 1I CCAAAGTGCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 2 3 331660 CASAVA_Build 20 22634105 1D ATCTTTTGCA T/- TTTTTTTGTT 1569 het 1569 ref 20 7 8 6 T 8 7 331661 CASAVA_Build 20 22634845 2D GTATTCTAAC AT/-- GTGGTCAATC 3070 het 3070 hom 35 17 17 3 AT 1 0 331662 CASAVA_Build 20 22635716 2D TAAGACTCTC TT/-- GAGCATTTCT 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 T 2 0 331663 CASAVA_Build 20 22641437 1D GTCATTTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 34 14 9 11 A 8 7 331664 CASAVA_Build 20 22642263 2D TGATATTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2281 hom 20 6 11 3 T 13 11 331665 CASAVA_Build 20 22644102 8D AAGCATGTAC AACTTGAT/-------- AGGATGGAAT 3070 het 3070 ref 55 26 24 7 AACTTGAT 1 0 331666 CASAVA_Build 20 22644556 1I GGCTTCAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 9 10 331667 CASAVA_Build 20 22650343 4D TTGAACAAGC ACAA/---- ACAGTTTCTA 3070 het 3070 ref 41 22 16 6 ACAA 1 0 331668 CASAVA_Build 20 22650914 1D TTTATATAAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 9 8 331669 CASAVA_Build 20 22651261 4I AAAGTTTGGA ----/GAAG GAAGGTTATG 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 GAAG 1 2 331670 CASAVA_Build 20 22652926 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 21 8 13 2 A 10 9 331671 CASAVA_Build 20 22653326 1D TAAAATATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 11 10 331672 CASAVA_Build 20 22660797 1I ACTTTTTTGG -/T TTTTATTTGT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 4 5 331673 CASAVA_Build 20 22671080 2D CTTTGGGAGG CT/-- GAGGCAGTTG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 CT 1 0 331674 CASAVA_Build 20 22671591 2I TATCTGCAAA --/CT CTCTCTGAGT 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 CT 3 4 331675 CASAVA_Build 20 22687945 2I ATATATATAT --/AC ACACATATTT 2822 het 1770 hom 17 6 7 4 AC 2 3 331676 CASAVA_Build 20 22688665 1D CTGACGGCTA C/- CTTCAACCTT 3070 het 3070 hom 57 23 26 9 C 2 1 331677 CASAVA_Build 20 22699667 1D GAACACATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 41 0 31 11 A 14 13 331678 CASAVA_Build 20 22721924 4I TCCTTGTGGT ----/AGTG AGTGAGTGAG 3070 hom 126 het 51 0 43 8 AGTG 2 3 331679 CASAVA_Build 20 22723475 1D AAGAGGAGTC G/- GGGGGACACT 3070 hom 108 het 41 0 34 8 G 6 5 331680 CASAVA_Build 20 22727074 1D AGAAGTGATG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 A 8 7 331681 CASAVA_Build 20 22738010 2D AGCCATAACC TT/-- ATTTGCTGTA 3070 het 3070 hom 38 17 16 6 T 2 0 331682 CASAVA_Build 20 22739706 1I AAAAACAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 27 14 12 A 12 13 331683 CASAVA_Build 20 22745588 6D GTTTATTATA TTATTT/------ TTATTTTACT 1725 het 1725 ref 13 7 5 2 TTATTT 2 1 331684 CASAVA_Build 20 22747741 1I TTCTAATGAG -/A AAGAATCTTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 3 331685 CASAVA_Build 20 22750143 1D GAGCTGTGCA T/- GGGTGTGTGA 3070 het 3070 ref 52 26 18 9 T 1 0 331686 CASAVA_Build 20 22753562 4I TCCACCCCAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 36 het 17 0 13 4 TTTA 3 4 331687 CASAVA_Build 20 22754327 9D GCTGCTCCCA TTCCATCAC/--------- TTCCATCACT 3070 hom 71 het 30 0 22 10 TTCCATCAC 2 1 331688 CASAVA_Build 20 22806316 4I TCCCCAAGGG ----/TTAA TTAAGGAAAA 3070 hom 132 het 49 0 45 4 TTAA 1 2 331689 CASAVA_Build 20 22811268 5I AGCTTCACTT -----/ATAAG AGAACATGCA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 ATAAG 0 1 331690 CASAVA_Build 20 22812163 1D GATGTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 28 1 19 11 T 12 11 331691 CASAVA_Build 20 22813311 1D GACTAAGAAG C/- TTTTGGGCTG 3070 hom 39 het 18 0 14 5 C 1 0 331692 CASAVA_Build 20 22829943 1I TGAATCCAGC -/A ACACATCAAA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 1 2 331693 CASAVA_Build 20 22847035 1I4M1I TCCAGCAAGA -TAGA-/TTAGAT GACTTGCCTG 3070 hom 148 het 53 0 50 5 N/A 0 0 331694 CASAVA_Build 20 22848147 1I GTTAAAGACT -/G GGGATGCTAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 3 4 331695 CASAVA_Build 20 22861616 1D TATATCTTCC A/- ACTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 2 1 331696 CASAVA_Build 20 22875194 2I GATGCACTTA --/TT TTGAAAATTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 4 331697 CASAVA_Build 20 22875306 1I CCTGGTGACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 T 10 11 331698 CASAVA_Build 20 22882486 1D ACCCATTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 907 hom 34 4 20 10 A 15 14 331699 CASAVA_Build 20 22904725 1I TATAGAAGTT -/A ATCACACTTG 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 A 1 2 331700 CASAVA_Build 20 22907958 4D ACTTTTAGCA GGAT/---- GGATAGGGAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 4 GGAT 2 1 331701 CASAVA_Build 20 22909031 2D TGAACCAGAC AG/-- AGAGTCCTCA 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 AG 3 2 331702 CASAVA_Build 20 22915692 1I TAGTCTCTAC -/A AAAAAATAGG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 6 7 331703 CASAVA_Build 20 22916145 1I GTAAAAAAAA -/C AAATGACATG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 0 1 331704 CASAVA_Build 20 22924286 4I CAATAGAGGG ----/TTTA TTTAAAAGAT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 TTTA 1 2 331705 CASAVA_Build 20 22925803 20I ACCATTGTTG --------------------/CTCCCCTCACTCCATCTTTC CTTCCTTGTT 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 CTCCCCTCACTCCATCTTTC 0 1 331706 CASAVA_Build 20 22927130 1D TAGGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 13 12 331707 CASAVA_Build 20 22932189 1D GGGCTCCCAC A/- ACTTTTCATC 3070 het 3070 ref 49 22 19 10 A 2 1 331708 CASAVA_Build 20 22947897 12D CAGAGCTGAG CCAGGATGAGCC/------------ CCACTGCATG 3070 het 3070 ref 34 15 13 10 CCAGGATGAGCC 1 0 331709 CASAVA_Build 20 22965927 5D GGTTTGGAGA GACAT/----- GACATGGGGT 3070 het 3070 ref 38 19 18 4 GACAT 2 1 331710 CASAVA_Build 20 22968277 1D TAGTGAATTA C/- CCCCATCTCC 3070 het 3070 hom 64 19 29 16 C 5 4 331711 CASAVA_Build 20 23022150 1D GTTCTAATGA T/- TTATGGTTAT 3070 hom 107 het 38 0 36 2 T 3 2 331712 CASAVA_Build 20 23024254 1I TGGCTTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 27 2 20 5 A 15 16 331713 CASAVA_Build 20 23024594 1I TTTTTGGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 608 hom 35 2 28 5 T 9 10 331714 CASAVA_Build 20 23024696 4D ATATTGGACA TCTC/---- TCCTCTTTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TC 3 1 331715 CASAVA_Build 20 23034821 1D TTATTATTTT A/- AAAAAATATA 3070 hom 75 het 28 0 25 5 A 7 6 331716 CASAVA_Build 20 23040964 2I CTCCCTGCTC --/CG CGCACACAGT 3070 hom 87 het 33 0 27 6 CG 1 2 331717 CASAVA_Build 20 23042600 2I AGTTCAGTGT --/AG AGTCTCAGGC 3070 hom 79 het 31 0 22 9 AG 1 2 331718 CASAVA_Build 20 23053888 1I TTGTGCTTAC -/T TTGCACCAGG 3070 hom 107 het 40 0 34 6 T 2 3 331719 CASAVA_Build 20 23073055 2D TGAGGTGAGC TA/-- TGTCTTTTCC 3070 het 3070 hom 52 22 28 3 TA 1 0 331720 CASAVA_Build 20 23078670 2I TAGACCAGGT --/GC GCCATCCTGC 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 GC 1 2 331721 CASAVA_Build 20 23079359 1D TGCCCTGAGG C/- CCCACAGCAG 3070 hom 132 het 50 0 40 10 C 4 3 331722 CASAVA_Build 20 23192701 1I CCTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3008 het 3008 ref 23 12 7 6 T 11 12 331723 CASAVA_Build 20 23213950 1I GCTGTTTTGG -/T TACTGGTTAC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 1 2 331724 CASAVA_Build 20 23240579 1I AGAGTTTTCC -/T TTGTAATCCT 3070 het 3070 hom 63 25 32 6 T 2 3 331725 CASAVA_Build 20 23249871 1D AGTACAGGAT A/- GGGGGGCACA 3070 het 3070 hom 34 14 15 8 A 1 0 331726 CASAVA_Build 20 23249991 3I CCGCCCACTT ---/CTA CTCAGTATTT 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 CTA 0 1 331727 CASAVA_Build 20 23250900 1D ATAATCGGGA G/- TTCTGTTCCT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 G 1 0 331728 CASAVA_Build 20 23268161 1I ACAGTCTCTA -/T TCATTGATGG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 1 2 331729 CASAVA_Build 20 23275363 2I AGAATCCCCC --/CT GCTTCCTTTG 3070 het 3070 ref 50 25 16 9 CT 0 1 331730 CASAVA_Build 20 23285227 3D GGCAGATGAA GGT/--- GAAAAGTTTA 3070 het 3070 ref 24 8 8 8 GGT 1 0 331731 CASAVA_Build 20 23285323 2D GAGTATAATC AG/-- CACGCAGTGC 2689 het 2689 ref 20 8 7 6 AG 1 0 331732 CASAVA_Build 20 23288530 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 AG 2 1 331733 CASAVA_Build 20 23289051 2I ATGCAAATAT --/AA AGAGAGTCGG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 A 1 3 331734 CASAVA_Build 20 23296850 2D TTAAAGTCAC TA/-- TTTTTATTTT 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 TA 1 0 331735 CASAVA_Build 20 23297608 1D TAGTTTGGCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 A 10 9 331736 CASAVA_Build 20 23303455 3D TGTGCAAAAA TAC/--- TGCTTTCAAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TAC 1 0 331737 CASAVA_Build 20 23304142 3D TTGTAGGATA TAT/--- TATTAGGTGG 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 TAT 2 1 331738 CASAVA_Build 20 23304794 1I ATTTAACTAT -/A AAATATTCAG 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 A 3 4 331739 CASAVA_Build 20 23310971 1D AGGCCAACTG A/- AAAGAGAACG 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 A 4 3 331740 CASAVA_Build 20 23313764 1D TCAAAACAAA C/- AAACAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 C 1 0 331741 CASAVA_Build 20 23317470 3I GAAAAGCCTC ---/ATG ATATCAGATT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 ATG 0 1 331742 CASAVA_Build 20 23333924 3D TCAAGAAGAA AAG/--- AAAGAAAGAG 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 AAG 1 0 331743 CASAVA_Build 20 23340276 2I CAAACAGCTT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 9 11 331744 CASAVA_Build 20 23343389 1I CTGATTTTAT -/C AACCAATCAG 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 C 0 1 331745 CASAVA_Build 20 23343609 4D TTTGATTAGC TTAA/---- TTATTCAGCA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TTAA 1 0 331746 CASAVA_Build 20 23351410 3D GATTAAATCA GTT/--- GTTCCCTAAC 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 GTT 2 1 331747 CASAVA_Build 20 23353494 2I GGAAAGGAGC --/CT GTAGCCTGAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 CT 0 1 331748 CASAVA_Build 20 23404038 3I GGGCTGGGCT ---/GCA GCAGCTGGAG 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 GCA 1 2 331749 CASAVA_Build 20 23413062 1I CAAAACAAAA -/G CTACGTGAGA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 G 0 1 331750 CASAVA_Build 20 23425979 1I TGGCTTGGGT -/A AAAAATCCCT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 5 6 331751 CASAVA_Build 20 23434160 1D GTAGGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 9 A 11 10 331752 CASAVA_Build 20 23435520 1D AAGTTCTCCT C/- CCCCTGCCCC 3070 het 3070 ref 35 19 10 7 C 5 4 331753 CASAVA_Build 20 23445028 1I GCCTGATGAA -/C CACGGAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 C 1 2 331754 CASAVA_Build 20 23461140 35D TGTTTTGCTG TCTTATCATTTATGTGTTCAATAGATTAGCACCTT/----------------------------------- TAATTTTTTT 3070 hom 57 het 20 0 20 4 TCTTATCATTTATGTGTTCAATAGATTAGCACCTT 1 0 331755 CASAVA_Build 20 23462102 1D TAGAATTTCT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 8 7 331756 CASAVA_Build 20 23466671 4D AAAATTTATT TTTA/---- TTTATTTTTA 1914 het 1914 ref 15 6 6 3 TTTA 2 1 331757 CASAVA_Build 20 23470063 1D AATAATAACC T/- GTCCTTGGGC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 1 0 331758 CASAVA_Build 20 23470174 2D GGGCTGGATC CT/-- CTGTTTTCTG 3070 het 3070 ref 38 21 11 7 CT 2 1 331759 CASAVA_Build 20 23474045 1D CCTGACCCCC T/- GAGAAAAATG 3070 hom 123 het 43 0 39 5 T 1 0 331760 CASAVA_Build 20 23477062 1I TGATGTCGGA -/T TCCCCACCAG 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 1 2 331761 CASAVA_Build 20 23477855 2I CCCGGCTTCA --/CT CTCAGCAGGC 3070 hom 135 het 53 0 43 10 CT 1 2 331762 CASAVA_Build 20 23478677 1I TAATTATCTC -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 T 6 7 331763 CASAVA_Build 20 23479770 1D AGGAGTAAAA G/- TGCTGTGAGT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 G 1 0 331764 CASAVA_Build 20 23487073 1I CCCTTCTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 9 10 331765 CASAVA_Build 20 23504794 1D CCAACATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 28 11 3 T 10 9 331766 CASAVA_Build 20 23508033 5I GTTTGGTACA -----/AGAAT AGCTATTCCT 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 AGAAT 0 1 331767 CASAVA_Build 20 23508916 1I TGTTCTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 10 11 331768 CASAVA_Build 20 23512665 3I TTTCTATGAC ---/ATT ATTCAACTGA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 ATT 1 2 331769 CASAVA_Build 20 23516870 26I TGTCCTGGCT --------------------------/CCCTCCCTCATGAAGAGGGAGCAGAG CCCTCCTTCA 3070 hom 73 het 31 0 21 11 CCCTCCCTCATGAAGAGGGAGCAGAG 0 1 331770 CASAVA_Build 20 23523939 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 21 1 18 2 A 10 11 331771 CASAVA_Build 20 23526165 1I TTCTGGGGAG -/A AACCACACTG 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 2 3 331772 CASAVA_Build 20 23538426 1D CAGTTCAGCC A/- AAAATGGTAT 3070 het 3070 hom 46 19 23 5 A 5 4 331773 CASAVA_Build 20 23538779 1D TAAATTGGGG T/- TGCAACGGGC 3070 het 3070 ref 46 20 15 11 T 2 1 331774 CASAVA_Build 20 23541304 1D TGATTCAGCC A/- AATTTTCCAC 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 A 3 2 331775 CASAVA_Build 20 23541915 1I AATGTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 10 11 331776 CASAVA_Build 20 23542422 2I CACACACATG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 CA 8 9 331777 CASAVA_Build 20 23543206 1D TCTATTGCCT G/- GGGGGTAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 12 5 G 6 5 331778 CASAVA_Build 20 23552767 3D GTCCCTCCCT CAA/--- CACGGGGATT 3070 het 3070 ref 40 16 18 7 CAA 1 0 331779 CASAVA_Build 20 23554941 1I AAAATGCAGT -/G GACTGCGTAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 1 2 331780 CASAVA_Build 20 23558372 5D AGTGACTGGT GGGGG/----- GGGGAGGGGG 3070 het 3070 ref 40 20 13 10 G 9 4 331781 CASAVA_Build 20 23565204 1I TGACTTGGGG -/A AGGGAAGCAG 2563 het 2563 ref 33 15 9 9 A 1 2 331782 CASAVA_Build 20 23567715 3I TTCACAACTC ---/CTT ATTATTCAGT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 CTT 0 1 331783 CASAVA_Build 20 23568639 1D TATAGACAAC A/- AAATGTCTAA 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 A 4 3 331784 CASAVA_Build 20 23573199 1I GAAAAAAAAA -/T ATTTTGGTGC 3070 hom 35 het 18 0 13 5 T 0 1 331785 CASAVA_Build 20 23575633 1D TGATTCTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 310 hom 39 1 31 7 T 10 9 331786 CASAVA_Build 20 23578307 2D TTAGCTCCTA AC/-- AAGAGAGTCA 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 AC 1 0 331787 CASAVA_Build 20 23584909 1D CAGAAGGGGA G/- GGGAAATTAT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 G 4 3 331788 CASAVA_Build 20 23591458 3I GTTGGCTGAA ---/CTC CTACTACCTA 3070 hom 112 het 48 0 37 11 CTC 0 1 331789 CASAVA_Build 20 23595433 1D ATGTTTTGGG A/- ATAAGTGAAG 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 A 2 1 331790 CASAVA_Build 20 23606727 3I GAAGACTGTA ---/TAT TATTCTGAAG 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 TAT 1 2 331791 CASAVA_Build 20 23623077 2I AAGAGACATG --/GA GATAAAGTAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 GA 1 2 331792 CASAVA_Build 20 23640604 6D CATCATGACC ACCATT/------ ACCATTATCA 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 ACCATT 2 1 331793 CASAVA_Build 20 23647687 2I ATAAAATAAG --/AA AAACCGTGAG 3070 het 2544 hom 17 7 9 1 A 3 5 331794 CASAVA_Build 20 23660966 1D TGTTTTGTAG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 T 8 7 331795 CASAVA_Build 20 23662693 1I CAAGCATTTC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 33 15 8 10 A 7 8 331796 CASAVA_Build 20 23666490 2D CATTTCTGTA AG/-- AGAGAAGACA 3070 het 3070 ref 31 19 11 3 AG 3 2 331797 CASAVA_Build 20 23667709 1I GGGCCAGAAG -/C CCCCAACCAG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 C 4 5 331798 CASAVA_Build 20 23669075 2D AGATAAAAAG TT/-- AGAGAGAGAG 398 het 398 ref 18 12 4 2 T 2 0 331799 CASAVA_Build 20 23670233 1I GAGGCCTAGA -/C CTCCTCACTG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 C 1 2 331800 CASAVA_Build 20 23670928 1D AGCAGGTTGT G/- GGGGGGGCCA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 G 8 7 331801 CASAVA_Build 20 23671678 1D TAATGCCCTT C/- TTTGTCCTCT 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 C 1 0 331802 CASAVA_Build 20 23672313 1D TATTGTATTG T/- TGCTATATAC 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 T 2 1 331803 CASAVA_Build 20 23672672 1D AGTTTTTGTA T/- TTTTTATGGG 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 T 6 5 331804 CASAVA_Build 20 23677556 2I TACCCACCTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 CA 5 6 331805 CASAVA_Build 20 23682996 1D CTGCCCAGGA G/- GGGGCATGTT 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 G 5 4 331806 CASAVA_Build 20 23693415 1D GGACTCTGAG C/- CTAAGCTAAG 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 C 2 1 331807 CASAVA_Build 20 23694160 2D5M5I24M3I1M2D8M15D TACTACACAT GGAAACA-----AAAGATCCCTGCTACCATAAAAAC---AAACTTAAGTACATAGTCCACAGACC/--GCAACCAGTTAATAACTTCATGAGAGGATCAAAATTTC--ACTTATTT--------------- TTAAATGACC 1585 het 1585 ref 28 26 4 0 N/A 0 0 331808 CASAVA_Build 20 23702647 4D TATGAACGAG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 67 29 27 11 CA 7 5 331809 CASAVA_Build 20 23703580 1I TGTCAGAACT -/G GGGAGAAGCA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 G 3 4 331810 CASAVA_Build 20 23705630 2D AAAAAGAAAC AG/-- AGGGAGTGAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 AG 2 1 331811 CASAVA_Build 20 23707166 1D ATGTCTGTTG T/- TTTTTGACTT 3070 het 3070 ref 45 23 11 13 T 6 5 331812 CASAVA_Build 20 23710526 4I AGATAGAGGT ----/AGAG AGAGAGAGAG 2431 het 2431 ref 33 12 10 11 AG 5 7 331813 CASAVA_Build 20 23720766 1D TGTGCTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 10 9 331814 CASAVA_Build 20 23724796 1D CTAAAAAAAA C/- ACACAAAAAA 2726 het 2726 ref 29 14 7 10 C 1 0 331815 CASAVA_Build 20 23731688 1D AGGGTGGGTG A/- CTCGGATCTT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 1 0 331816 CASAVA_Build 20 23755932 1I ATTATTCAAT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 7 8 331817 CASAVA_Build 20 23761453 1I AGTCTTGACA -/C CTATTGCAAT 3070 het 3070 hom 57 24 30 3 C 1 2 331818 CASAVA_Build 20 23764650 1I GGCATAGCTG -/A AAAAATGTCA 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 A 5 6 331819 CASAVA_Build 20 23802417 18D CTTATGGGTT CTGAGGAGATAGGAGGAG/------------------ CTGAGGAGAT 3070 het 3070 hom 60 28 27 13 CTGAGGAGATAGGAGGAG 2 1 331820 CASAVA_Build 20 23817862 3D CAGGGGAGGG TCT/--- TCTTCCTTTT 3070 het 3070 hom 26 12 10 4 TCT 2 1 331821 CASAVA_Build 20 23819444 3I CCATGATCAC ---/CAT CATCATCATC 3070 het 3070 hom 66 29 27 10 CAT 3 4 331822 CASAVA_Build 20 23834912 1D GTTTTTGTTG T/- TGTTGTATCT 3070 het 3070 ref 42 22 15 7 T 2 1 331823 CASAVA_Build 20 23841407 4I ACACACACAC ----/ACAA ACACACACCA 3070 hom 118 het 44 0 40 4 ACAA 0 1 331824 CASAVA_Build 20 23842156 2D TCTGTCTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 TC 7 6 331825 CASAVA_Build 20 23844219 1D GATAATAATC A/- AAAAAATTGC 3070 hom 108 het 43 0 37 7 A 7 6 331826 CASAVA_Build 20 23869752 1D AGACCCTGTC T/- CAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 40 2 34 4 T 1 0 331827 CASAVA_Build 20 23871259 9D CCATTATCAA CACTGCCGC/--------- CATCAGCATC 2954 het 2954 ref 24 16 8 3 CACTGCCGC 1 0 331828 CASAVA_Build 20 23874821 17D TGGTAGCTGT TAGGTGGGCATTTGTGG/----------------- TAGGTGGGCA 3070 hom 102 het 42 0 34 14 TAGGTGGGCATTTGTGG 2 1 331829 CASAVA_Build 20 23877699 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTATAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 7 6 331830 CASAVA_Build 20 23879876 1I TGCATTGCTC -/A AGGTTTCCCC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 A 1 2 331831 CASAVA_Build 20 23887660 1I ATCTGACTCC -/T CCTTTCACAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 0 1 331832 CASAVA_Build 20 23889268 1I TCCCTTCAGG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 9 331833 CASAVA_Build 20 23892529 1D AAACAGCAAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 99 het 40 0 34 7 A 8 7 331834 CASAVA_Build 20 23893143 2I TATGTACAGA --/TC ATTATGTATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TC 0 1 331835 CASAVA_Build 20 23895708 1I CGTAGCTAGG -/T TCTGTGGCTG 3070 hom 89 het 34 0 28 6 T 1 2 331836 CASAVA_Build 20 23897845 4D AAGATATAAC TTTG/---- TTTGATTTGA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 TTTG 2 1 331837 CASAVA_Build 20 23902940 1I ACAAGTATCA -/C TTTTGCTAAA 3070 hom 114 het 47 0 38 9 C 0 1 331838 CASAVA_Build 20 23906031 2D CTATGAAATA TT/-- ACCTCCCAGC 1301 het 1301 ref 29 24 3 2 T 2 0 331839 CASAVA_Build 20 23908796 10D47M2D ACACTCACAC ACACCCACAAACACCCACACATACACTCACACACACATTTACACACACCCACACACTCA/----------ACACCCACACATACACTCACACACACATTTACACACACCCACACACT-- CACACACACT 3070 het 443 hom 44 6 49 31 N/A 0 0 331840 CASAVA_Build 20 23987413 2D CGAAGTTATG GA/-- GGTGATGGTG 3070 het 3070 hom 52 20 21 11 GA 1 0 331841 CASAVA_Build 20 24002769 1I CGTGGTCTAG -/T GGACTTCACT 3070 hom 167 het 61 0 54 7 T 0 1 331842 CASAVA_Build 20 24015123 1I CTTTAAAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 9 10 331843 CASAVA_Build 20 24024239 1I GGTTGGTGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 9 10 331844 CASAVA_Build 20 24030295 1I CCAGTCTCTC -/G GGGGTCATGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 4 5 331845 CASAVA_Build 20 24038679 1I GCAAAGACTT -/A AAATATGAAT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 3 4 331846 CASAVA_Build 20 24049508 7D ACAATAGGCT CTGCTTC/------- CTGCTTCCTT 3070 het 3070 hom 54 25 24 7 CTGCTTC 2 1 331847 CASAVA_Build 20 24066738 2D CTATAGAAGA GT/-- GGCCAATATT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 GT 1 0 331848 CASAVA_Build 20 24068076 14D CCCCTCACCA AAGCCATGAACTTG/-------------- AAGCCATGAA 2745 het 2745 ref 36 21 7 15 AAGCCATGAACTTG 2 1 331849 CASAVA_Build 20 24081081 1D TTCAAACCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 A 10 9 331850 CASAVA_Build 20 24110942 1I GGAGAGATCA -/T TTACTGCCCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 2 3 331851 CASAVA_Build 20 24136843 2I TGCAATCGCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 78 2 45 31 TG 5 6 331852 CASAVA_Build 20 24190674 3D TTACATGGAC TCT/--- TCTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 40 20 17 5 TCT 2 1 331853 CASAVA_Build 20 24200289 1I ATACTTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 10 11 331854 CASAVA_Build 20 24206397 1I AGCCAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 1151 het 1151 ref 33 25 4 4 A 9 10 331855 CASAVA_Build 20 24249897 2I AAGTACCAGA --/CT CTCTCCTTTC 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 CT 2 3 331856 CASAVA_Build 20 24293794 1D GTCCTTTTGT A/- CTTGCTAGTA 3070 het 3070 ref 46 26 17 4 A 1 0 331857 CASAVA_Build 20 24299488 19D CAGGGCAGTC CGGGATCATCTGTGCAGTT/------------------- CCAGGTCCCA 3070 hom 39 het 15 0 14 2 CGGGATCATCTGTGCAGTT 1 0 331858 CASAVA_Build 20 24314046 2D GTGTGTGTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 71 24 27 20 TG 8 7 331859 CASAVA_Build 20 24321028 5D TCTGAGCCTC ATATA/----- AGCTGGGGAC 2132 het 2132 ref 24 12 5 8 ATATA 1 0 331860 CASAVA_Build 20 24336238 3D AGCCATGAAA TCT/--- TCTAATTACA 3070 het 3070 ref 40 17 19 7 TCT 2 1 331861 CASAVA_Build 20 24346154 2D AAGCGTGAAA CT/-- CTGATACGTG 3070 het 2913 hom 33 7 23 4 CT 2 1 331862 CASAVA_Build 20 24351476 1D TGACATGTCC T/- TTCACTTAGG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 T 3 2 331863 CASAVA_Build 20 24352959 1D AAACGAAAAC A/- AAAAAACTCA 3070 het 33 hom 37 1 33 3 A 7 6 331864 CASAVA_Build 20 24354717 1I CTTCAGCAAA -/C TTTTACTGAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 0 1 331865 CASAVA_Build 20 24362672 1I GAACATATGT -/A AATGGACACA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 3 331866 CASAVA_Build 20 24365746 1D GGGAGGATTA T/- TTTTTCCCCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 6 5 331867 CASAVA_Build 20 24420813 2I GAGCCTTCTC --/CA TCCACACCCC 1964 het 1964 ref 22 12 10 0 CA 0 1 331868 CASAVA_Build 20 24437073 11I CCATGTTGGC -----------/CAGGCTGATCT CAAACTCCTG 3070 hom 30 het 11 0 9 2 CAGGCTGATCT 0 1 331869 CASAVA_Build 20 24449330 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 31 10 A 15 14 331870 CASAVA_Build 20 24450211 1I TGGTTATTCT -/G GCTAGTATAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 1 2 331871 CASAVA_Build 20 24453923 5D CTTCTTCTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2743 het 162 hom 27 2 11 14 T 23 18 331872 CASAVA_Build 20 24456161 5I TTTTTTTTCC -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 TTTCT 3 4 331873 CASAVA_Build 20 24460268 2I GACAATTTTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 31 0 27 4 A 10 12 331874 CASAVA_Build 20 24467094 4I2M7I AAGACTGAGC ----AA-------/TTAAAATGGAGCT TACTCCATTG 3070 hom 129 het 46 0 44 4 N/A 0 0 331875 CASAVA_Build 20 24467410 1I TTATTTTCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 11 12 331876 CASAVA_Build 20 24470821 1D CTTCAATAAG A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 8 7 331877 CASAVA_Build 20 24479149 2D CGTTAACTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 22 0 13 9 T 14 12 331878 CASAVA_Build 20 24489512 1I TCTAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 12 13 331879 CASAVA_Build 20 24491587 3I AATGTAGTTT ---/GAG GAGTAGTTAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 GAG 1 2 331880 CASAVA_Build 20 24493416 6D AATGATTCTT GCCTGG/------ GCTCATCTGT 3070 hom 93 het 37 0 30 8 GCCTGG 1 0 331881 CASAVA_Build 20 24505657 2D CTCTTTCTAC AA/-- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 10 8 331882 CASAVA_Build 20 24522105 6I GTTGGTTCCA ------/TGTCTT TGCTATTGGG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TGTCTT 0 1 331883 CASAVA_Build 20 24530624 1D TATAATATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 34 0 31 3 T 12 11 331884 CASAVA_Build 20 24532759 1D TTATTCTTTC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 104 het 41 0 34 7 T 9 8 331885 CASAVA_Build 20 24536223 1I GAGCGAGACA -/G TCTCCATGGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 0 1 331886 CASAVA_Build 20 24536830 2I TTATCTCCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 23 0 15 8 T 12 14 331887 CASAVA_Build 20 24551523 4D CAAAAAACAA AAAC/---- AAACCAACAA 3070 hom 120 het 41 0 41 0 AAAC 2 1 331888 CASAVA_Build 20 24551822 4D CAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAA 353 het 353 ref 32 13 4 15 AAAG 1 0 331889 CASAVA_Build 20 24558845 1D AGGGGAGTAC A/- AAACGAAAAC 3070 hom 129 het 45 0 44 2 A 4 3 331890 CASAVA_Build 20 24579482 1I TCTTTCTTTT -/C TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 43 1 38 4 C 0 1 331891 CASAVA_Build 20 24584412 1D TATACTCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 672 hom 29 4 19 6 A 16 15 331892 CASAVA_Build 20 24632372 1I AGCGCCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 147 hom 27 2 21 4 T 10 11 331893 CASAVA_Build 20 24648704 1I GTTTGCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 36 1 31 4 A 10 11 331894 CASAVA_Build 20 24663221 1D CACGCGGCAA G/- CAAAGGTAAC 3070 hom 60 het 23 0 20 5 G 1 0 331895 CASAVA_Build 20 24664610 4D29M2I CACCACACAT ACACACATGCACACACACATGCACACACACACG--/----ACATGCACACACACATGCACACACACACGCA CACACACACA 3070 hom 102 het 28 0 34 11 N/A 0 0 331896 CASAVA_Build 20 24673110 1D42M7I AAGAAAAAAA GAAATGCTCAGAACATGGTTCATGCTCAAACAAGTTATGGAAG-------/-AAATGCTCAGAACATGGTTCATGCTCAAACAAGTTATGGAAGGCATCCA GCATCCATTT 3070 hom 63 het 25 0 22 11 N/A 0 0 331897 CASAVA_Build 20 24674939 1D AAGCTGCCTT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 99 het 36 0 27 9 C 10 9 331898 CASAVA_Build 20 24675238 9I GAGGAAACTC ---------/GGGGTCTGA CGCCTTGCTC 3070 hom 51 het 20 0 15 5 GGGGTCTGA 0 1 331899 CASAVA_Build 20 24675988 1D GAATATGACC A/- ACCTGATCCC 3070 hom 132 het 46 0 44 2 A 2 1 331900 CASAVA_Build 20 24676786 1D TTTGCTACCA G/- GCCTGTGTCA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 2 1 331901 CASAVA_Build 20 24678626 4I AGAGAGATAC ----/AGAT AGATAGATAG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AGAT 3 4 331902 CASAVA_Build 20 24679182 1I CTAATAAGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 393 hom 40 1 32 7 A 9 10 331903 CASAVA_Build 20 24684759 8I GAAACTACAA --------/CATGCTGT AAAGGGGTAA 3070 hom 150 het 52 0 50 2 CATGCTGT 0 1 331904 CASAVA_Build 20 24686183 1I TTGAGAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 31 1 25 5 A 10 11 331905 CASAVA_Build 20 24690300 4I CTTGCCTAGA ----/CTGT CTGTCAGCTG 3070 hom 144 het 54 0 40 14 CTGT 1 2 331906 CASAVA_Build 20 24732152 1I38M3I CCTCTCAGGC -TACCTGGCACCAGGTCTGGAGGCATAGCTGCCTGGGCC---/TTACCTGGCACCAGGTCTGGAGGCATAGCTGCCTGGGCCCAG AGCCAACCCC 3070 hom 63 het 16 0 20 5 N/A 0 0 331907 CASAVA_Build 20 24750037 1I AACAATTTAA -/C AATTCATGTT 3070 hom 98 het 38 0 32 6 C 0 1 331908 CASAVA_Build 20 24782473 1D TTGCTCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 A 12 11 331909 CASAVA_Build 20 24792458 2I CAACCATGAC --/TA TAAGTTTTCT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 TA 1 2 331910 CASAVA_Build 20 24794583 22D TGGGGATAGA AGGGAGTGGAAAGTGTGGATGG/---------------------- AGGGAGCATG 3070 hom 153 het 50 0 49 10 AGGGAGTGGAAAGTGTGGATGG 1 0 331911 CASAVA_Build 20 24797981 1D CCTGCTTCGG C/- CCTCCAGTGT 3070 hom 133 het 54 0 40 14 C 3 2 331912 CASAVA_Build 20 24815185 3D ACCAAGAGCA ACT/--- ACACTCCAAC 3070 hom 117 het 43 0 40 4 ACT 1 0 331913 CASAVA_Build 20 24821190 2I CCAGGGCCCC --/CG CTGTCTCCGG 3070 hom 91 het 35 0 29 6 CG 0 1 331914 CASAVA_Build 20 24826207 1I GTGAGGCCAG -/T TGTGAGCCCC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 1 2 331915 CASAVA_Build 20 24835252 1I5M1I AAAAAAAAAA -TAATT-/CTAATTA AAAAAAAAGG 3070 hom 39 het 14 0 13 2 N/A 0 0 331916 CASAVA_Build 20 24835484 1I TAAAATGGGT -/A AAAAAAACAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 7 8 331917 CASAVA_Build 20 24840520 1D CTACAGAATG A/- AACCAGAAAT 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 A 3 2 331918 CASAVA_Build 20 24848365 2I TCCTGCTACA --/TT TTTCTTGGTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 3 5 331919 CASAVA_Build 20 24859331 1D TCTAGCTGTT C/- CCCCCCGGCA 3070 het 3070 ref 26 18 8 1 C 7 6 331920 CASAVA_Build 20 24865915 2D GGGCTGAGAA TG/-- TGCATTTCCA 3070 het 3070 hom 50 19 26 6 TG 2 1 331921 CASAVA_Build 20 24869285 1I CCCAGTGGGG -/C GAGTAGCCCT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 C 0 1 331922 CASAVA_Build 20 24869960 1I TAGGATCTCA -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 T 6 7 331923 CASAVA_Build 20 24872712 3D TTCATCTAAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 31 6 T 14 11 331924 CASAVA_Build 20 24873731 1D TTTACCAAGC A/- AATGGAAACC 2649 het 2649 ref 26 12 8 6 A 3 2 331925 CASAVA_Build 20 24874743 1D CAGTGATCCC A/- TAGAAATACA 2442 het 2442 ref 16 8 5 3 A 1 0 331926 CASAVA_Build 20 24879346 3I GCTTGGGAGC ---/CTT CTTCTTAGCT 3070 het 3070 ref 46 19 17 10 CTT 2 3 331927 CASAVA_Build 20 24881609 2I GTTTTCTCTC --/TT CTCAGGTTGG 3070 hom 110 het 43 0 31 12 T 0 2 331928 CASAVA_Build 20 24889687 1I CAGCAAAAGC -/A TATCACATAT 3070 het 3070 hom 50 23 26 1 A 0 1 331929 CASAVA_Build 20 24891082 1D GAGTCCAAGG C/- CAGCCAGTGC 3070 het 3070 ref 24 10 10 5 C 2 1 331930 CASAVA_Build 20 24893080 3D ATTTCAAATA GGC/--- AAGGTGCAAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 7 GGC 1 0 331931 CASAVA_Build 20 24897253 6I TCAAAACACC ------/CAGAAA CAGAAACAGG 3070 het 3070 ref 47 23 14 10 CAGAAA 1 2 331932 CASAVA_Build 20 24902163 1D CCATCTACTA G/- ATGGTCAGAG 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 G 1 0 331933 CASAVA_Build 20 24914469 1D GCATAGCAGG A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 43 16 19 9 A 8 7 331934 CASAVA_Build 20 24931724 1D AAGCAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 11 10 331935 CASAVA_Build 20 24961784 10I GCCGTGGTCC ----------/ATAGCAGGGA AGAGTCACTC 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 ATAGCAGGGA 0 1 331936 CASAVA_Build 20 24962688 1I GATTTGATCC -/A GGTAAATCTC 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 A 0 1 331937 CASAVA_Build 20 24965589 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 1352 het 1352 ref 14 9 4 1 A 13 14 331938 CASAVA_Build 20 24974562 1D ATTTATTTTT A/- TTTTTATTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 A 1 0 331939 CASAVA_Build 20 24997809 5I54M3D AAGACAAAAT -----GCAAGAAAGTTAAAAGGGGAAACTTTGTATGATAAATGTTCACCAGGAAGATCTAGA/GCACAGCAAGAAAGGTAAAAGGGGAAACTTTGTATGATAAATGTTCACCAGGAAGATCT--- AGTTCTTAAC 3070 hom 93 het 32 0 32 15 N/A 0 0 331940 CASAVA_Build 20 25000120 1I ACTCAGGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1284 hom 40 3 28 9 T 12 13 331941 CASAVA_Build 20 25001865 3D GTTAATATTT TAA/--- TAATATTAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TAA 2 1 331942 CASAVA_Build 20 25005192 1I CATCCCTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 19 1 15 3 A 11 12 331943 CASAVA_Build 20 25006780 1D GTCAGGAATG A/- AAAAAACTAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 7 6 331944 CASAVA_Build 20 25009866 3D GGACCCGTCA ATC/--- ATTCGATCAT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 ATC 1 0 331945 CASAVA_Build 20 25010984 10D TTCTGTCCAG CCCACCCCAC/---------- CCCACCCCAC 3070 hom 57 het 22 0 19 4 CCCAC 4 2 331946 CASAVA_Build 20 25031271 1I TTGTGGGGAA -/C CCCCCCCCTC 3070 het 85 hom 31 1 17 13 C 8 9 331947 CASAVA_Build 20 25042247 1D TTTGGAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 10 9 331948 CASAVA_Build 20 25044963 1I GACTTGCTGT -/G GGACAATTCA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 G 2 3 331949 CASAVA_Build 20 25051242 14I TATATATGTG --------------/TGTGTGTATATATA TGTGTGTATA 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 TGTGTGTATATATA 1 2 331950 CASAVA_Build 20 25054242 1I CTCCTGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 12 13 331951 CASAVA_Build 20 25078940 1I ATGGGTCCCT -/G GGGGGGGTCC 3070 het 294 hom 29 1 23 5 G 7 8 331952 CASAVA_Build 20 25082504 5D AAGGACATGA GACGT/----- GACGGCTGAT 3070 hom 111 het 40 0 37 7 GACGT 1 0 331953 CASAVA_Build 20 25082851 4D TTAGCCACTG TTCC/---- TTCCTTCCTT 3070 hom 80 het 34 0 23 12 TTCC 4 3 331954 CASAVA_Build 20 25083246 1D TATTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 28 1 22 8 T 13 12 331955 CASAVA_Build 20 25107151 2D AAGAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 12 10 331956 CASAVA_Build 20 25118293 1I TTAGTGGGCC -/G GGCGCGGTGG 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 2 3 331957 CASAVA_Build 20 25121256 1D AGCCCCCCCC T/- GAAACAAACC 3070 hom 54 het 21 0 18 4 T 1 0 331958 CASAVA_Build 20 25122222 1I CAAAAACAAA -/C CCCCCCCCAA 3070 hom 64 het 26 0 21 5 C 8 9 331959 CASAVA_Build 20 25172547 5D CACTCCCACA ATGGC/----- ATTAATCTAT 3070 het 3070 ref 44 24 15 6 ATGGC 1 0 331960 CASAVA_Build 20 25197026 1D AAAAATGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 11 8 4 T 11 10 331961 CASAVA_Build 20 25222071 1I GATCTGGACG -/T TCATGAGGAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 1 2 331962 CASAVA_Build 20 25223554 6D TGCCTTTGGG TTAGTT/------ TTAGTTTTGT 3070 het 3070 ref 47 26 21 1 TTAGTT 2 1 331963 CASAVA_Build 20 25227727 2I CTGCATCATC --/TG TCAGTTTTGT 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 TG 0 1 331964 CASAVA_Build 20 25229160 2D CGGACTCCCC CT/-- GTCCAGCTCA 1965 het 1965 ref 29 11 6 15 CT 1 0 331965 CASAVA_Build 20 25241105 1D ACGGAGTCTC G/- TTCACTCAGT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 G 1 0 331966 CASAVA_Build 20 25244797 1I TTCTCTTTTC -/T CTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 0 1 331967 CASAVA_Build 20 25246942 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 72 het 28 0 23 5 CT 2 1 331968 CASAVA_Build 20 25249472 4I AATGTCAAGT ----/ATGC ATGCACCACC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ATGC 1 2 331969 CASAVA_Build 20 25255383 3D TTCAAAAAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 96 het 37 0 33 6 AAC 5 4 331970 CASAVA_Build 20 25264944 1D TTCAGGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 T 11 10 331971 CASAVA_Build 20 25275394 1D CATTCTCCTG C/- CCTCAGCCTC 2330 hom 15 het 14 0 6 8 C 3 2 331972 CASAVA_Build 20 25276299 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 11 10 331973 CASAVA_Build 20 25281897 2D TTTGTTTGTT TC/-- TGTTTTTTTT 3070 hom 46 het 36 1 31 6 TC 1 0 331974 CASAVA_Build 20 25284120 1I TTTCTTTGGG -/C AAATTTAAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 0 1 331975 CASAVA_Build 20 25284504 1I ATAAAGGGTA -/T TTTTTAAGAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 5 6 331976 CASAVA_Build 20 25312951 1D ATTTAAAAAC A/- AAAAAAACTG 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 8 7 331977 CASAVA_Build 20 25316786 3D ATGGACACAT GAA/--- GAAGGCTCAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 GAA 2 1 331978 CASAVA_Build 20 25322874 2I GACAAGAGAC --/AA AAGAGTATGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 2 4 331979 CASAVA_Build 20 25341035 1D ACTAAAAATA C/- AAAAAATTAG 3070 hom 30 het 14 0 11 3 C 1 0 331980 CASAVA_Build 20 25349418 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 23 0 15 8 A 15 13 331981 CASAVA_Build 20 25357606 27D TTCCTCTCTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/--------------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 2 T 37 10 331982 CASAVA_Build 20 25358333 4D AATTCATTTA TTAG/---- TTCTAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 TTAG 1 0 331983 CASAVA_Build 20 25363080 5I CAGTAATTTT -----/TTTTC TTTTCTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTTC 1 2 331984 CASAVA_Build 20 25379421 4I AACAGTGAGA ----/CCCT CCCTGTCTCA 3070 het 3070 hom 29 9 19 1 CCCT 1 2 331985 CASAVA_Build 20 25390990 7I2M4I CAGCCTCCAG -------CT----/GGGAGCCCTGGTG CAGCTCCCTG 2403 het 1998 hom 27 8 11 8 N/A 0 0 331986 CASAVA_Build 20 25422980 2D ATGGCACCAC AT/-- GAGTCCCACA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 AT 1 0 331987 CASAVA_Build 20 25434517 1I ACAAATTTTC -/A AAAATAAATC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 4 5 331988 CASAVA_Build 20 25447733 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1362 het 1362 ref 23 9 8 6 A 19 18 331989 CASAVA_Build 20 25448693 4I ATGCAGAATT ----/TATA TAAAATTCAG 3070 hom 67 het 27 0 23 4 TA 1 3 331990 CASAVA_Build 20 25465399 2I CAACATCAGC --/CT CCATAAAGCC 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CT 0 1 331991 CASAVA_Build 20 25468828 2I ATAAAAAGCA --/AC ACAGTTTCTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AC 1 2 331992 CASAVA_Build 20 25474112 1I AAATTCTGAG -/C CCCCCCCCCA 3070 hom 46 het 32 0 18 14 C 9 10 331993 CASAVA_Build 20 25475489 1I CAGACAGCTG -/A AAAACAGAAT 3070 hom 100 het 40 0 33 7 A 4 5 331994 CASAVA_Build 20 25506472 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 28 1 18 9 T 14 13 331995 CASAVA_Build 20 25508674 3D ATAAGGTTAT AAG/--- AAGATGTGTG 3070 hom 78 het 31 0 27 6 AAG 2 1 331996 CASAVA_Build 20 25510512 1D CCCACCTTAG A/- GCAGTCCTAT 3070 hom 102 het 38 0 35 4 A 1 0 331997 CASAVA_Build 20 25554526 1I TTGGAGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 13 14 19 T 15 16 331998 CASAVA_Build 20 25562673 1D GGTTTTTTTT C/- TTTTCTTTTA 3070 het 3070 ref 31 19 12 2 C 1 0 331999 CASAVA_Build 20 25580264 4I GATGCCCTTC ----/ATTT CTTCTCTTGC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 ATTT 0 1 332000 CASAVA_Build 20 25594683 2I TCCTGGTGAC --/TT TGTTAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 1 3 332001 CASAVA_Build 20 25597846 1I CCCTCCCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 14 10 A 10 11 332002 CASAVA_Build 20 25599226 1I ATGATTTCAA -/T TTTTTTTTTT 2179 het 2179 ref 24 10 8 6 T 15 16 332003 CASAVA_Build 20 25612151 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2618 hom 33 9 16 8 A 11 10 332004 CASAVA_Build 20 25615424 3I TGCACTGGAC ---/AGG AGAATACACA 3070 hom 122 het 43 0 39 4 AGG 0 1 332005 CASAVA_Build 20 25618759 1D TCATCTCTAC A/- AAAAATATAA 3070 het 3070 ref 42 20 20 3 A 6 5 332006 CASAVA_Build 20 25667637 4I ATTCAATAAA ----/TAAT TAATACTAAC 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 TAAT 1 2 332007 CASAVA_Build 20 25668108 1D CAAACTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 11 10 332008 CASAVA_Build 20 25681508 1I114M1I TGACTTGCTG -TTTTTGCTACCATTGTGGTTTTCTTACATTCATTCATTTTCCTTGCTGCACTGTCCGATTATATGATTGTAGAGAGTGAAATTTGTTTGTCCATTCTATTTTTTATTTTTTTTT-/TTTTTTGCTACTATTGTGGTTTTCTTACATTCATTCATTTTCCTTGCTGCACTGTCTGATTATATGATTGCAGAGAGTGAAATTTGTTTTTCCATTCTATTTTTGATTTTTTTTTG ATAATCCATA 3070 het 3070 ref 30 46 11 34 N/A 0 0 332009 CASAVA_Build 20 25681833 1D CTTGATATCA T/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 7 6 332010 CASAVA_Build 20 25683140 1D TTTGATGTAC A/- AAAGTTTTGA 1898 het 1898 ref 25 18 4 3 A 4 3 332011 CASAVA_Build 20 25684420 7D TGAATATATT CATTATC/------- TCATAATATG 2621 het 2621 ref 21 16 6 4 CATTATC 1 0 332012 CASAVA_Build 20 25685328 3I38M1D CCCATCGACA ---CAAGTGAACATTCTCTTTTAGAGATACTCATTGTCCTGT/CTCCAAGTGAACATTCTCTTTTAGAGATACTCATTGTCCTG- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 76 48 41 25 N/A 0 0 332013 CASAVA_Build 20 25686664 3I TATGGGTCTT ---/CTC CTGGCTCTCA 3070 het 3070 hom 80 27 36 17 CTC 0 1 332014 CASAVA_Build 20 25688746 1D ATGTATGGGC A/- AGGTACCTGT 3070 het 3070 ref 49 29 13 8 A 2 1 332015 CASAVA_Build 20 25690188 1D GCTACCTCCT C/- TCCTTTTCCT 3070 het 3070 ref 84 57 11 17 C 1 0 332016 CASAVA_Build 20 25690239 3I TGATGATGAT ---/GAC GGTGATGGTG 3070 het 3070 ref 90 49 19 22 GAC 0 1 332017 CASAVA_Build 20 25692032 1D CTCCTTCATA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 T 7 6 332018 CASAVA_Build 20 25692560 24D GATTTCCAGG AAGCAGAGCGTTGCAATCTCTCCC/------------------------ ACCACAAACC 3070 het 3070 ref 84 70 20 9 AAGCAGAGCGTTGCAATCTCTCCC 1 0 332019 CASAVA_Build 20 25697598 1I TCCACAATGC -/A GGTCTCCCAC 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 0 1 332020 CASAVA_Build 20 25702588 1D27M4I26M4D ATATATATAT ATATATATATATATATGACCTATGTAAC----ATACATACATACAAGTACACACACACACAA/-TATATATATATTTATTACATATATAACATGTATACATACACACAAGTACACACACAC---- AAAGTATATA 3070 het 3070 ref 19 26 22 22 N/A 0 0 332021 CASAVA_Build 20 25702921 2I TGTCAAAAAA --/AG AAGATGCCAT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 AG 0 1 332022 CASAVA_Build 20 25703989 4D TCAGAAAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 57 15 19 29 AG 10 8 332023 CASAVA_Build 20 25704021 1D AGCCATGAGC A/- AAAAAAAAGA 3015 het 3015 ref 67 25 8 34 A 9 8 332024 CASAVA_Build 20 25704338 1I TGTGAATAAT -/C TTTTATAAAC 3070 het 3070 ref 102 81 14 7 C 0 1 332025 CASAVA_Build 20 25704463 1I AGCCTGGAAG -/C TTTTTGGGTG 3070 het 3070 hom 61 29 29 4 C 0 1 332026 CASAVA_Build 20 25704542 3D TTCAACCTAC AAG/--- AAGAGCCTTA 3070 het 3070 hom 52 15 30 9 AAG 2 1 332027 CASAVA_Build 20 25705020 1I GATTTCAAGG -/A TTTATACCGT 3070 het 3070 hom 81 24 47 10 A 0 1 332028 CASAVA_Build 20 25705043 2D97M4I TTGATGTAAC ATAGAATGTATAGTATGAAGTACAAACAGTCTGTTAGCTTCTTGGAGCTATACTCCATTACCGGAGCAGGGGACAACAATTTGAAGGACATTACTACTT----/--AGAATGTATACTATGAAGGACAAATAGTCTGTTAGCTTCTTGGAGCTATACTCCATTACTGGAGCAGGGGACAACAATTTGAAGGACATTACTACTTAGAC AGTTTAATCT 1576 het 1576 ref 78 71 5 61 N/A 0 0 332029 CASAVA_Build 20 25705236 2I AATTTCCAAA --/AC AAAAAGGATA 3070 het 3070 ref 57 37 11 9 AC 0 1 332030 CASAVA_Build 20 25705335 2I CTGAATACTC --/TT TGATGAGTCC 3070 het 3070 hom 88 40 39 9 T 1 3 332031 CASAVA_Build 20 25706057 1D GGAGTGGAGT G/- GTGAGGTCTA 2886 het 2886 ref 57 44 8 5 G 2 1 332032 CASAVA_Build 20 25706325 1I CGCGATAAAA -/G CAAGTATTGT 3070 het 3070 hom 55 19 23 13 G 0 1 332033 CASAVA_Build 20 25773893 4D ACCCTGTTTA TTAT/---- TTATCACCTA 3070 het 3070 ref 74 45 26 4 TTAT 2 1 332034 CASAVA_Build 20 25774676 4I AAAAATGTAC ----/AGTG ATTGAGGGAA 3070 het 3070 ref 92 49 19 24 AGTG 0 1 332035 CASAVA_Build 20 25775983 1D CTCTGCAAAG C/- CCCTCTGTAC 2715 het 2715 ref 50 35 7 8 C 4 3 332036 CASAVA_Build 20 25777595 1D33M2I CTAGAAGGAA GGAAGACAAGACCAAAGCTAACGCTGCAATTGAC--/-GAAGACAAGACCGAAGCTAATGCTGCAATTGACAA AGAGGTAGTG 2425 het 2425 ref 78 68 15 24 N/A 0 0 332037 CASAVA_Build 20 25778347 1D TGGGAAGGGG T/- GGGCATGGGA 2270 het 2270 ref 40 22 8 10 T 1 0 332038 CASAVA_Build 20 25779102 1I AGCAGGACTG -/C TTGTGCTTGC 3070 het 3070 hom 95 35 46 14 C 0 1 332039 CASAVA_Build 20 25779426 1I GGGTGAATAA -/T TTTGCTCATC 3070 het 3070 ref 55 26 20 9 T 3 4 332040 CASAVA_Build 20 25781893 2I ACAAACGCAC --/AA AGACATACAG 3070 het 3070 ref 64 38 18 8 A 1 3 332041 CASAVA_Build 20 25782649 1I ACCCATCCAC -/G GGCAACAGTG 3070 het 3070 ref 36 13 16 7 G 2 3 332042 CASAVA_Build 20 25782982 1I AATCCTCTTC -/A GACCTGACTA 1453 het 1453 ref 34 19 6 9 A 0 1 332043 CASAVA_Build 20 25783766 1D AAAGCCATCA C/- TTGGGACATG 3070 het 3070 hom 66 23 32 11 C 1 0 332044 CASAVA_Build 20 25784080 1D GGTGACTAGG C/- CAGGAAGGCC 3070 het 3070 ref 100 60 33 9 C 2 1 332045 CASAVA_Build 20 25784968 1I GGCTCCGGAA -/G GCCAACCGCA 1099 het 1099 ref 50 31 4 15 G 1 2 332046 CASAVA_Build 20 25810448 2D55M1D TGGCAAGCTG GATATGAAGTAGGAATCTTTCTTTGAGTCATACATTTTCATGATTATGATTGTTATTG/--TATGAAGTAGGAATCTTTCTTTGAGTCATACATTTTTGTGATTATGATTATTATT- AATAATAGCT 2726 het 2726 ref 63 79 6 8 N/A 0 0 332047 CASAVA_Build 20 25810740 1I CAAATCCAGG -/C AGAACCCCTC 2945 het 2945 ref 41 24 9 8 C 0 1 332048 CASAVA_Build 20 25812475 2D CTTAGCTGGG AT/-- ATATGTCTGC 3070 het 3070 ref 69 33 29 8 AT 3 2 332049 CASAVA_Build 20 25813582 3D TTTAAAGAGT TTC/--- TTAAGCAAAC 3070 het 3070 ref 25 13 7 7 TTC 1 0 332050 CASAVA_Build 20 25813688 5I TGAATGTAGA -----/AGTAG AGTAGAGAAA 3070 het 3070 hom 47 8 33 6 AGTAG 1 2 332051 CASAVA_Build 20 25814388 1D AAGAAAAAAA T/- AAGTAAATTG 3070 het 3070 ref 55 40 9 6 T 1 0 332052 CASAVA_Build 20 25815608 1D TTGATTTGCA T/- TTTTTAAATG 3070 het 3070 ref 66 52 10 4 T 6 5 332053 CASAVA_Build 20 25815693 1D CCATGTCTTA T/- TTACTGAGGA 3026 het 3026 ref 95 80 7 10 T 3 2 332054 CASAVA_Build 20 25816168 4D CACAAAAAAA AAAG/---- GAAACATAGA 3070 het 3070 hom 80 30 44 10 AAAG 1 0 332055 CASAVA_Build 20 25817022 4D ACAGAATTAG AAAA/---- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 19 7 6 A 13 9 332056 CASAVA_Build 20 25817469 2I TGAGCAGACT --/TC ATGACTAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 TC 0 1 332057 CASAVA_Build 20 25821095 1I TATTTTGATA -/T TTAATCATAA 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 T 2 3 332058 CASAVA_Build 20 25821571 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAATATG 2719 het 2719 ref 37 25 6 7 A 7 6 332059 CASAVA_Build 20 25821613 1D GTCCTGAAAG T/- GCTCTTAGTT 1773 het 1773 ref 47 33 5 9 T 1 0 332060 CASAVA_Build 20 25823129 1D TTTGGACAGT G/- GGATCTTAGT 3070 het 3070 ref 83 64 9 11 G 3 2 332061 CASAVA_Build 20 25824287 3I TACAAGTATA ---/AAG AACCTTAAAA 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 AAG 0 1 332062 CASAVA_Build 20 25825836 2D TTACATTAGT AG/-- AGGCAAATTC 2547 het 2547 ref 101 87 6 9 AG 2 1 332063 CASAVA_Build 20 25826205 1I ATACACTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 58 21 23 14 A 12 13 332064 CASAVA_Build 20 25826919 1D ACCTTCTCTA C/- CAAAAAATAA 1978 het 1978 ref 76 33 9 34 C 2 1 332065 CASAVA_Build 20 25828308 1I TAAAAAAAGA -/G AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 82 29 13 41 G 0 1 332066 CASAVA_Build 20 25829066 2I GGAGAGAAAA --/AT CTCTCTTGTA 3070 het 3070 ref 53 41 9 3 AT 0 1 332067 CASAVA_Build 20 25829368 7I3M2D GTCAGATTTA -------CTTGA/CTAACATCTT-- GGCTAAGTCT 1470 het 1470 ref 95 81 4 24 N/A 0 0 332068 CASAVA_Build 20 25829795 1I CTAAAAGCAT -/A TTTTATACCT 3070 het 3070 ref 79 34 26 19 A 0 1 332069 CASAVA_Build 20 25830030 2D GTTTTGATTG GT/-- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 100 25 65 12 GT 1 0 332070 CASAVA_Build 20 25830116 1I13M4D ATGGTAGATG -AAAAAAATCGGATTAAA/AAAAAAAATCTGAT---- TAACTCTATT 3070 het 3070 ref 59 63 13 6 N/A 0 0 332071 CASAVA_Build 20 25831368 1I AACACATAAC -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 77 25 47 5 A 6 7 332072 CASAVA_Build 20 25832663 1I TTGTGAACAG -/T TGTAAGATAA 1676 het 1676 ref 51 36 4 11 T 1 2 332073 CASAVA_Build 20 25833216 2D AGGCCTCTAA TT/-- TTGTTTTTCT 3070 het 3070 ref 48 36 9 5 T 4 2 332074 CASAVA_Build 20 25833684 4I AATTTTACTT ----/CTTC CTTTCCAATT 3070 het 3070 ref 57 25 8 24 CTTC 0 1 332075 CASAVA_Build 20 25833702 1D TTTGGATGCC T/- TTTATATCTT 1999 het 1999 ref 67 27 8 32 T 4 3 332076 CASAVA_Build 20 25834233 1D TCTTCTTTAA T/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 86 26 56 4 T 7 6 332077 CASAVA_Build 20 25834499 1D ATAATCTTTT C/- TTATTTCTGT 3070 het 3070 ref 84 46 32 7 C 1 0 332078 CASAVA_Build 20 25834608 1I30M3D AATACCACAG -TTTTTTTAAATCTATTCACTTGCATTGGTTCTA/TTTTTTTTTAATCTATTCACTTGCATTGGTT--- CTTTCTGGTT 3070 het 3070 ref 79 65 22 18 N/A 0 0 332079 CASAVA_Build 20 25834689 1D48M1D CTTTATTTGC ATTAATCTTTATTATTTCCTTCCTTTTGCTGGGTTTGGGCTTAGTTCTTC/-TTAATTTTTATTATTTCCTTCCTTTTGCTGGGTTTGGGCTTGGTTCTT- TTTTTTAGTT 3070 het 3070 ref 84 93 13 10 N/A 0 0 332080 CASAVA_Build 20 25834881 4I GTGTTTTTTA ----/TTTT TATTTTGTCA 2609 het 2609 ref 36 27 6 3 T 1 5 332081 CASAVA_Build 20 25836891 1I TTACACTCTC -/T TTTTTCACAT 3070 het 3070 hom 60 27 26 7 T 5 6 332082 CASAVA_Build 20 25839714 5I ATCAATGGCC -----/AAAAT AATATATATT 3070 het 3070 hom 87 37 34 16 AAAAT 0 1 332083 CASAVA_Build 20 25839743 4D TCATCTATTC CTGA/---- CTATGTCCTT 3070 het 3070 ref 83 38 10 36 CTGA 1 0 332084 CASAVA_Build 20 25839941 7I AACTTACCAT -------/GTCATGG GTATAGTTAC 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 GTCATGG 0 1 332085 CASAVA_Build 20 25840326 1D GGTAGTCCTC T/- TTTTAAAAAT 2190 het 2190 ref 85 64 6 15 T 5 4 332086 CASAVA_Build 20 25840517 3D ATCCACCGAC AAT/--- AATTTAATTA 3070 het 3070 ref 56 44 7 7 AAT 2 1 332087 CASAVA_Build 20 25841140 3I23M1I AATCTGTAAA ---ACAATATACTATTGTTTAAAGTT-/ATTATAATATACTATTATTTAAAGTTC TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 57 37 16 9 N/A 0 0 332088 CASAVA_Build 20 25843533 2D CCAACCAAAC TG/-- TAAATCAGAT 3070 het 3070 ref 37 24 10 5 TG 1 0 332089 CASAVA_Build 20 25843624 1D TCAGGAATTT A/- CTGGAGAAGA 3070 het 3070 ref 91 66 22 4 A 1 0 332090 CASAVA_Build 20 25843754 1D AGTTATCTAG A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 83 27 49 9 A 8 7 332091 CASAVA_Build 20 25844475 3D ATTAGAAATC TTA/--- TTGTTCTATT 2166 het 2166 ref 102 92 5 7 TTA 1 0 332092 CASAVA_Build 20 25844834 1D101M1I ATTGGAATGT AAAATGCTAATCTATATTTAAATACTAATACAATTATAAATAAATATCACATCTCTAAAGTATAAATATTATAGTTTTCATATACTTCATCATCTCTAAACT-/-AAATGCTAATCTATATTTAAATACTAATACAATTATAAATAAATACCACCTCTCTAAAGTATAAATATTATAGTTTTCATATACTTCATCATCTCTAAACTC TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 48 71 9 24 N/A 0 0 332093 CASAVA_Build 20 25845918 1D ATAGATGAAG A/- GACACTTAGA 3070 het 3070 ref 80 58 18 4 A 1 0 332094 CASAVA_Build 20 25846220 6I ATAACAAAAG ------/ACTGTA ACAAGTGCTA 3070 het 3070 ref 59 26 25 8 ACTGTA 0 1 332095 CASAVA_Build 20 25847808 4I TCTGAAAAAA ----/CGTC TGTTCTGGTT 3070 het 3070 hom 53 23 29 3 CGTC 0 1 332096 CASAVA_Build 20 25847953 1D ATGAGGAAAT A/- AAAAAACTAG 3070 het 3070 ref 73 38 25 10 A 7 6 332097 CASAVA_Build 20 25848191 4D TCTATCTTGA AATT/---- AATATCTTTC 3070 het 3070 ref 77 55 13 12 AATT 1 0 332098 CASAVA_Build 20 25848282 5D TATTGTTATT GTTTG/----- GTTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 89 57 21 17 GTTTG 1 0 332099 CASAVA_Build 20 25848383 9D AAAAAAAAAA CAAACAAAC/--------- AAACAGACAA 2061 het 2061 ref 69 28 19 33 CAAACAAAC 1 0 332100 CASAVA_Build 20 25849271 2I GATGCATGCA --/CG CACACGTGTG 3070 het 3070 ref 76 32 30 14 CG 0 1 332101 CASAVA_Build 20 25849504 1I GGCCTATTCC -/A CTAATAAATA 3070 het 3070 hom 101 20 68 13 A 0 1 332102 CASAVA_Build 20 25849586 4D CTTCATAATC AAGT/---- AGTGTTCATG 3070 het 3070 ref 76 61 11 4 AAGT 1 0 332103 CASAVA_Build 20 25851822 1I27M2I TAATATCTTA -TTTTTTCTGACATTGCAAGTATATAAC--/TTTTTTTCTGACATTGCAAGTATATAACAG ATCACAAAGA 293 het 293 ref 36 28 2 12 N/A 0 0 332104 CASAVA_Build 20 25852381 1I TACCATTTAC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 81 64 10 8 A 7 8 332105 CASAVA_Build 20 25852449 1D TATTTTAATT G/- GGGCACAGAT 3070 het 3070 ref 85 62 10 15 G 4 3 332106 CASAVA_Build 20 25854989 1D AGTGGCTCAT G/- TCTGTAATCC 2778 het 2778 ref 55 40 6 11 G 1 0 332107 CASAVA_Build 20 25856501 2D TGTGTATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 73 34 9 30 TG 8 7 332108 CASAVA_Build 20 25857148 2D CCACTTTTTT TG/-- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 68 23 26 19 TG 1 0 332109 CASAVA_Build 20 25858928 1D TTTTCAACAC A/- AAATAGAATA 3070 het 3070 hom 67 29 29 9 A 4 3 332110 CASAVA_Build 20 25858986 1I TTGGACATTT -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 78 43 20 16 A 6 7 332111 CASAVA_Build 20 25859387 1I CCAAGCCACA -/T TGGAAGCATG 1884 het 1884 ref 38 29 5 4 T 1 2 332112 CASAVA_Build 20 25859944 4D9M1I TCTTATATAT TAAGTGAGGATAA-/----TGAGTATAAT TTTTTAATTT 3070 het 3070 ref 42 32 9 6 N/A 0 0 332113 CASAVA_Build 20 25860106 1D23M1D AGCTAATCCA TTAGCTAGTATATAGTAGAAACTGA/-TAGCTAGTATATAGTAGAAACTG- AAAAAAATTG 2361 het 2361 ref 58 33 5 27 N/A 0 0 332114 CASAVA_Build 20 25860502 1D CCTTTAAATG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 42 29 9 5 A 8 7 332115 CASAVA_Build 20 25860775 1D TAATTATGGA T/- TTTAATGTGA 3070 het 3070 ref 94 70 13 11 T 4 3 332116 CASAVA_Build 20 25860892 1D GAGAGAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 21 11 20 T 11 10 332117 CASAVA_Build 20 25862475 25D CTCCGAACCT TCTCAGGAGGAATCTTTCTAATTTC/------------------------- TCCCTCTGCC 2786 het 2786 ref 44 37 12 12 TCTCAGGAGGAATCTTTCTAATTTC 1 0 332118 CASAVA_Build 20 25862747 1I TTATGGCCTA -/T TTTTTTGGCC 3070 het 3070 hom 62 28 30 4 T 6 7 332119 CASAVA_Build 20 25862999 1I CACAATTTTT -/A AATCATTATT 3070 het 3070 ref 39 29 7 3 A 2 3 332120 CASAVA_Build 20 25863491 8I TTTGTTACAT --------/ATGTATTC ATGTGCCATT 1275 het 1275 ref 31 25 3 4 ATGTATTC 0 1 332121 CASAVA_Build 20 25865946 2D AAGGACATTC AT/-- ATAGATACCT 3070 het 3070 ref 43 24 8 13 AT 2 1 332122 CASAVA_Build 20 25866006 6I CCACAGTTAA ------/TTTTTT TCTTCACTTT 3070 het 3070 ref 40 19 12 9 T 1 7 332123 CASAVA_Build 20 25866644 1D GTCAGAAGTA T/- TTTTTATCAT 3070 het 3070 ref 35 22 9 5 T 6 5 332124 CASAVA_Build 20 25866930 1I ATATTTGACA -/T TTTTCATACT 3070 het 3070 ref 45 32 7 6 T 4 5 332125 CASAVA_Build 20 25867683 1I AAGCAATCTG -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 55 37 15 3 T 5 6 332126 CASAVA_Build 20 25868257 4D TATGTTTAAT AAAC/---- AAATTGAGTC 3070 het 3070 ref 33 26 7 1 AAAC 1 0 332127 CASAVA_Build 20 25870202 2D TAAATTGGCA GT/-- GGTCACGTAT 3070 het 3070 ref 57 41 10 7 GT 1 0 332128 CASAVA_Build 20 25870996 1I AATATTCGGC -/T TCAGGTGAAT 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 T 1 2 332129 CASAVA_Build 20 25871093 1D ATTTTAAAAT A/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 46 29 9 8 A 1 0 332130 CASAVA_Build 20 25871315 2I12M1D AGCAAAAGAC --ATATTGGACAAGA/TTATATTGGACAAG- AAAAATGTGT 3070 het 3070 ref 54 42 11 7 N/A 0 0 332131 CASAVA_Build 20 25874945 1D AGTGAAAAAA C/- ATAAGTGAGA 3070 het 3070 ref 61 47 9 5 C 1 0 332132 CASAVA_Build 20 25875195 1I29M1I AAAATAATTA -TCTATTATTTTGTTCAGTAAACATCGTAC-/TTCTGTTATTTTGTTCAGTAAACATTGTACT TTTTTATAGT 3070 het 3070 ref 43 33 11 10 N/A 0 0 332133 CASAVA_Build 20 25875309 1I AAATATCAAA -/C TTAGAAGAAG 3070 het 3070 ref 41 25 13 5 C 0 1 332134 CASAVA_Build 20 25875861 2I AATTTTTTTT --/TA AATCTAGAAT 3070 het 3070 ref 66 26 24 16 TA 0 1 332135 CASAVA_Build 20 25877406 5D GATTCTATAC TGTTA/----- TATTGGTCTA 2484 het 2484 ref 45 35 6 6 TGTTA 1 0 332136 CASAVA_Build 20 25877493 3I GGACTGTAAG ---/TAC TTTGTTCTTT 3070 het 3070 ref 46 31 11 4 TAC 0 1 332137 CASAVA_Build 20 25877809 2I AAGGGGTATC --/TT TTTTTATATT 3032 het 3032 ref 57 48 9 0 T 5 7 332138 CASAVA_Build 20 25877909 4D TTAATTCTAA TAAT/---- TAAGTAGAAA 3070 het 3070 ref 38 21 8 14 TAAT 1 0 332139 CASAVA_Build 20 25877957 1I CAAATGTATA -/G TGTGAAAATG 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 G 0 1 332140 CASAVA_Build 20 25878141 8D TTGCTGCAGA TTTTTTTC/-------- TTTTTTTTGA 1808 het 1808 ref 46 28 7 14 TTTTTTTC 1 0 332141 CASAVA_Build 20 25879038 2D TGTTTAAAAA AT/-- ATTTGCATAA 3070 het 3070 ref 53 37 12 5 AT 2 1 332142 CASAVA_Build 20 25879799 1I CATGTCTTTT -/G CAAAATTATG 3070 het 3070 ref 55 35 18 2 G 0 1 332143 CASAVA_Build 20 25880285 4I TTTGCATATC ----/TTCT TTTGTGAAGT 2226 het 2226 ref 27 18 6 3 TTCT 0 1 332144 CASAVA_Build 20 25881062 2D GCTTTTTAAC TT/-- TTAATCCAAT 2248 het 2248 ref 53 44 5 5 T 4 2 332145 CASAVA_Build 20 25881182 2I TGTGATAAAC --/AT GTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 51 25 10 16 AT 0 1 332146 CASAVA_Build 20 25881980 1I TGCCGACCTA -/G TCAAGCAAAC 3070 het 3070 ref 58 39 12 7 G 0 1 332147 CASAVA_Build 20 25882467 2D CTTATCACAT TC/-- TGTTTTATTT 3070 het 3070 ref 34 15 15 5 TC 1 0 332148 CASAVA_Build 20 25882513 7I GAAGTTATCA -------/ACTCCCG CACCTTAGAA 3070 het 3070 ref 39 21 10 8 ACTCCCG 0 1 332149 CASAVA_Build 20 25884072 2I CACTCAGTGT --/AA AGTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 43 27 10 6 A 1 3 332150 CASAVA_Build 20 25888581 1I CCCACCAAAA -/G ACTCAAATTA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 G 0 1 332151 CASAVA_Build 20 25889893 1I GGATACAGAC -/T TTTACTCCAA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 T 3 4 332152 CASAVA_Build 20 25890650 1D GACTCTGCCT A/- AAAAAAAAAA 2907 het 1125 hom 24 9 9 6 A 19 18 332153 CASAVA_Build 20 25893132 1D ATGACAAGAC A/- TGGAGGAATC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 A 1 0 332154 CASAVA_Build 20 25904311 1D ATCTGTTGCT A/- GGGGGGACTG 3029 het 3029 ref 24 10 8 6 A 1 0 332155 CASAVA_Build 20 25908738 2D CGAAAATATC TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 T 10 8 332156 CASAVA_Build 20 25910467 1I TAGGTTCTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 A 8 9 332157 CASAVA_Build 20 25910595 1I CACAGATAGC -/T TTTTTCTAGT 2862 het 2862 ref 20 10 6 4 T 5 6 332158 CASAVA_Build 20 25911005 3I TTTGAAATAT ---/CTC CTCATCAATT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 CTC 1 2 332159 CASAVA_Build 20 25924821 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2080 het 1589 hom 24 9 8 7 A 16 15 332160 CASAVA_Build 20 25928016 3I TTATCTGGGC ---/GTG GTGGTGGACG 2911 het 2911 ref 33 20 7 6 GTG 2 3 332161 CASAVA_Build 20 25934055 8I ACCCTGTCTC --------/TACTAAAA TACAAAAAAT 2953 het 2953 ref 26 15 8 3 TACTAAAA 0 1 332162 CASAVA_Build 20 25934380 1I AAACCATTTA -/T TTAAAGATCC 3070 het 3070 hom 54 19 34 1 T 2 3 332163 CASAVA_Build 20 25944108 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 12 10 1 A 10 11 332164 CASAVA_Build 20 26005880 1D AGAAACTATT A/- AAATTTAATA 3070 het 3070 ref 42 18 14 11 A 4 3 332165 CASAVA_Build 20 26005936 1D AGAAGCAAAA T/- AAACGTGAAC 3070 het 3070 ref 44 32 8 4 T 1 0 332166 CASAVA_Build 20 26007336 1I TATTTACTTT -/G TATGTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 G 0 1 332167 CASAVA_Build 20 26007929 2I CTATCCTTTT --/TG TTTTGGAAAT 3070 het 3070 ref 86 41 10 35 TG 0 1 332168 CASAVA_Build 20 26008546 1D TTGGTAACTA T/- TTTTATTACA 3070 het 3070 ref 100 62 22 16 T 5 4 332169 CASAVA_Build 20 26008599 2I TCATTGTGAA --/TT TGCTAACCCT 2808 het 2808 ref 78 49 6 23 T 1 3 332170 CASAVA_Build 20 26008694 1I36M9I GCAAGAGTGA -TCACCCAAAAGCTTCCAGGCTGGACGAGTTGGGACT---------/TTCACCCAAGAGCTTCCAGGCTGGACAAGTTGAGACTCAGTTCTTG CAGTTGCCAA 3070 het 3070 ref 50 34 15 15 N/A 0 0 332171 CASAVA_Build 20 26009278 4I ATTCAATTTC ----/TATT TATTAATGGC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 TATT 1 2 332172 CASAVA_Build 20 26010336 1D GCATCTCCAG C/- CAGCATCGCG 3070 hom 51 het 20 0 15 5 C 2 1 332173 CASAVA_Build 20 26010851 3I TGGCATCTTC ---/TTT TTTTTGACAT 3070 het 3070 hom 70 15 24 31 T 5 8 332174 CASAVA_Build 20 26011122 4D CCTCATATAC TTTT/---- TTTGTGTGTG 1811 het 1811 ref 26 14 8 5 T 7 3 332175 CASAVA_Build 20 26016188 1I GGGTGGGAGA -/G CCGCATTGTG 3070 hom 99 het 34 0 34 0 G 0 1 332176 CASAVA_Build 20 26018140 4I CGGGCCTCTT ----/ACTC ACAGCAAGGA 3070 het 3070 hom 45 11 25 9 ACTC 0 1 332177 CASAVA_Build 20 26021747 1D TTTATAAAAT A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 50 29 14 7 A 7 6 332178 CASAVA_Build 20 26023127 1D TATCAGTATC T/- ATCACCACCT 3070 het 3070 ref 103 67 28 8 T 1 0 332179 CASAVA_Build 20 26023560 3I51M1D TCACCATCAC ---CATCATTATCATCATCACAACCACAATTATGAAAATCTTGGAGGAAAAGAAG/CGTCATCATCATCATCATCACAACCACAATTATGAAAATCTTGGAGGAAAAGGA- AGGAGGTAGC 3070 het 3070 ref 74 70 17 14 N/A 0 0 332180 CASAVA_Build 20 26025614 2I ACAAGGAAAC --/TG AGGCCTAGAG 3070 het 3070 hom 67 23 40 7 TG 0 1 332181 CASAVA_Build 20 26026836 3I ACTGAGAGCC ---/AGG AGAAGACCCA 3070 het 3070 hom 98 39 52 11 AGG 0 1 332182 CASAVA_Build 20 26028113 5I AATCAGATTC -----/CTTTA CAAGATTACA 3070 het 3070 hom 92 35 43 14 CTTTA 0 1 332183 CASAVA_Build 20 26029639 1D TTTAAAAGGG A/- AAAAAAAATC 1980 het 1980 ref 28 10 5 14 A 9 8 332184 CASAVA_Build 20 26030610 6D36M1D TGCAAGTGAA AACTACAACTAGATACAACTTCACATCTACAAGGATGGCTATA/------AACTAGATACCACTTCACATCTACAAGGATGGCTAT- TTTTTTTAAA 2777 het 2777 ref 48 62 6 20 N/A 0 0 332185 CASAVA_Build 20 26031208 5I39M1D AAATGATAAA -----CATGTTCTAGAGTTAGAGAGTGGTGATAGCTGTACAACTG/GATGTGATGTTCTAGAGTTAGAGAGTGGTGATAGCTGTACAACT- TATGAATACA 1844 het 1844 ref 36 26 5 14 N/A 0 0 332186 CASAVA_Build 20 26031662 1D TATTCAACTG A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 58 27 24 10 A 7 6 332187 CASAVA_Build 20 26032616 4D CAATCATGAC AAAG/---- GAAGATACCA 3070 het 3070 ref 82 48 30 4 AAAG 1 0 332188 CASAVA_Build 20 26032964 5D CCAAAATCCA CTACC/----- CTCCAACACA 3070 het 3070 ref 80 41 37 8 CTACC 1 0 332189 CASAVA_Build 20 26033040 2D ATTATGAAAC AG/-- ATAAATTTTA 2224 het 2224 ref 43 29 5 10 AG 1 0 332190 CASAVA_Build 20 26034306 5I4M7I6M1D9M8I ATTCTGATGC -----ATGC-------CCAAAGAATTAATATT--------/ATCTGATGCATCAGATGCAAAG-ATTAATATTCTGATGCA ACAAATGAAT 3070 het 3070 ref 55 46 11 18 N/A 0 0 332191 CASAVA_Build 20 26034502 1I AATCCTGAAG -/A AAAAAGAATT 3070 het 3070 ref 48 26 15 7 A 5 6 332192 CASAVA_Build 20 26036529 1D ACTGTATGAT A/- AAAGATATTT 3070 het 3070 ref 40 16 20 6 A 4 3 332193 CASAVA_Build 20 26036971 1D CAGTATGCTT A/- AAAAAAAAGA 1335 het 1335 ref 41 32 3 6 A 9 8 332194 CASAVA_Build 20 26037858 1I13M2D2M6D CCTGAATACA -AAAAAGAATGAAGGATGTCAGAA/CAAAAAGAATGAAG--TG------ ATGATATATA 2132 het 2132 ref 38 35 6 5 N/A 0 0 332195 CASAVA_Build 20 26037916 2D AAGGAAAAAA AC/-- AATAAAGAGT 1331 het 1331 ref 47 21 4 23 AC 1 0 332196 CASAVA_Build 20 26038034 3I AAAAAATAAT ---/AAA AATAAAAATT 2308 het 2308 ref 42 26 6 10 A 2 5 332197 CASAVA_Build 20 26038855 1D CCCATCTCTA C/- CAAAAAATAC 3070 hom 39 het 15 0 13 2 C 2 1 332198 CASAVA_Build 20 26040022 1D GAGGCAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 22 8 T 13 12 332199 CASAVA_Build 20 26041692 1D AAAATCAACA C/- CCAATCATGA 2593 het 2593 ref 38 18 9 12 C 3 2 332200 CASAVA_Build 20 26041825 2I CAGGAACAAC --/GT AAGAATGTCC 3070 het 3070 hom 79 22 52 5 GT 0 1 332201 CASAVA_Build 20 26042095 4I ATCTACCATC ----/CCTT CCTTCCTTCC 3070 het 3070 hom 51 11 29 11 CCTT 2 3 332202 CASAVA_Build 20 26042156 2I GACAGAGGTC --/TT TATCCTGGCC 3070 het 3070 hom 50 11 34 5 T 1 3 332203 CASAVA_Build 20 26042301 1D TTCATCAAAA G/- CAAAGACAAG 2916 het 2916 ref 16 10 6 0 G 1 0 332204 CASAVA_Build 20 26042407 1I GCTCTTGCCA -/C TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 36 11 4 C 0 1 332205 CASAVA_Build 20 26042476 1D7M2D AAGAAAAACA CAAAAAACAT/-AAAAAAC-- GTGCAATTTG 3070 het 3070 ref 55 29 27 7 N/A 0 0 332206 CASAVA_Build 20 26042649 2D CTCACCAGAC TG/-- TGAGATCAAT 2230 het 2230 ref 69 50 6 15 TG 2 1 332207 CASAVA_Build 20 26042862 3I AATGTGTCAT ---/TTC TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 TTC 0 1 332208 CASAVA_Build 20 26049643 3D GAAAATCTTG CAA/--- CAACAAAATT 3070 het 3070 ref 55 35 8 12 CAA 3 2 332209 CASAVA_Build 20 26050631 1D AAAATAAACT A/- AAGCATTCTT 3070 het 3070 hom 63 20 34 10 A 3 2 332210 CASAVA_Build 20 26052850 5D GCACTGCAAA TAAAG/----- TCTAAATTAC 3070 het 3070 ref 43 24 17 4 TAAAG 1 0 332211 CASAVA_Build 20 26053216 1D CTTCATTTTA T/- TTGAGTATAT 3070 het 3070 hom 77 30 36 11 T 3 2 332212 CASAVA_Build 20 26053327 4I ATGTTTTTTA ----/AAAT AAATAAACAA 3070 het 3070 hom 62 21 35 7 AAAT 1 2 332213 CASAVA_Build 20 26053923 1I AAAAGGAAAA -/T AAAGAAACCA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 0 1 332214 CASAVA_Build 20 26055562 6D ACAAAAGGCC ATCAGA/------ ATCACATTTT 2217 het 2217 ref 50 43 5 6 ATCAGA 1 0 332215 CASAVA_Build 20 26055790 1I GCTGTTTGTA -/T CAAGTACACA 3070 het 3070 ref 75 42 17 16 T 0 1 332216 CASAVA_Build 20 26056371 1I ACAAACACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 24 16 9 A 10 11 332217 CASAVA_Build 20 26056420 13D TACATCCAGG AAGTGGTTCTTTC/------------- AATTTCATTA 1546 het 1546 ref 40 25 5 15 AAGTGGTTCTTTC 1 0 332218 CASAVA_Build 20 26057335 1I TTGGTTTTGA -/T TATCAGTTTA 3070 het 3070 ref 37 25 9 3 T 1 2 332219 CASAVA_Build 20 26057491 2I TTAATTTTTT --/TA ATATAAAACT 3070 het 3070 ref 48 20 17 11 TA 0 1 332220 CASAVA_Build 20 26058071 1D TAAACAGAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 9 8 332221 CASAVA_Build 20 26058621 2I GGAAAAAAAA --/AT TTAAAAACTC 3070 het 3070 hom 63 23 34 6 AT 0 1 332222 CASAVA_Build 20 26058695 2I TTCCAGAAAA --/AG AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 43 13 28 2 AG 0 1 332223 CASAVA_Build 20 26058807 1D GTTTGGAAGA G/- TAAGGGAGGA 3070 het 3070 ref 70 37 24 22 G 1 0 332224 CASAVA_Build 20 26059343 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTATC 3070 het 3070 ref 40 15 13 13 A 6 5 332225 CASAVA_Build 20 26059956 1I CTAGCAGTTG -/T TAAGTTTTTC 3070 het 3070 ref 69 43 21 5 T 1 2 332226 CASAVA_Build 20 26060431 1D TAGGGAACAG C/- TGGCAACAAG 1355 het 1355 ref 52 38 3 12 C 1 0 332227 CASAVA_Build 20 26061543 1D TCTTTGCCTT A/- ACAACATTAT 2821 het 2821 ref 41 32 6 5 A 2 1 332228 CASAVA_Build 20 26061740 1D CCAGAAAAAA T/- ATGTGAGAGA 3070 het 3070 ref 38 25 12 3 T 1 0 332229 CASAVA_Build 20 26067878 22I TGAGAAAGGA ----------------------/TCTTTAGGGAGAAAGGCTCTGT TCCTGAAAGA 1770 het 1770 ref 35 30 4 1 TCTTTAGGGAGAAAGGCTCTGT 0 1 332230 CASAVA_Build 20 26068510 4I AATGCTACCT ----/CTAA CTCTCATTCC 692 het 692 ref 41 34 2 6 CTAA 0 1 332231 CASAVA_Build 20 26069883 2D TTTGTAAAAC AG/-- AAGCTATGAA 3070 het 3070 hom 75 30 41 4 AG 1 0 332232 CASAVA_Build 20 26070111 1I AAAAGTGTTC -/T TTCTAGACAG 3070 het 3070 ref 57 29 21 7 T 2 3 332233 CASAVA_Build 20 26070614 1D ATCAATAGGG A/- AAAATGAAAC 3070 het 3070 ref 50 28 19 4 A 5 4 332234 CASAVA_Build 20 26070909 1D TCTTTTTTTT C/- TTTTGCAAGA 2880 het 2880 ref 51 25 13 13 C 1 0 332235 CASAVA_Build 20 26071031 4D TTGATTACTA ACTT/---- AATCTCTTTA 3070 het 3070 ref 46 23 17 10 ACTT 1 0 332236 CASAVA_Build 20 26071468 3I ATTGCATCAC ---/ATA AGAGATACTA 3070 het 3070 ref 67 31 28 8 ATA 0 1 332237 CASAVA_Build 20 26071860 4D CACTTGTGAA AGTG/---- AGTATTAAAG 1096 het 1096 ref 92 83 3 11 AGTG 1 0 332238 CASAVA_Build 20 26072136 1D TTTTCCATCC T/- TTTTTTTCTA 2935 het 2935 ref 48 37 9 2 T 8 7 332239 CASAVA_Build 20 26072240 4D AGTCTGACAA TCTG/---- TCTTTTATTT 3070 het 3070 hom 47 20 21 8 TCTG 1 0 332240 CASAVA_Build 20 26072404 6D TTATAAAACA TTTAAT/------ TTAAATTTAA 3070 het 3070 hom 31 14 17 12 TTTAAT 1 0 332241 CASAVA_Build 20 26072966 3I ATAAATAAAT ---/TTC TTCTTTACAA 3070 het 3070 ref 48 20 16 12 TTC 1 2 332242 CASAVA_Build 20 26074825 5I7M2I CCACAGAGCC -----AACTTTT--/AATTTAACTTTTTA TTCCAGATTT 3070 het 3070 ref 47 34 8 8 N/A 0 0 332243 CASAVA_Build 20 26074859 1I AATTTTAAAC -/T TTTAATTCCT 1845 het 1845 ref 57 40 4 13 T 3 4 332244 CASAVA_Build 20 26075627 2D10M3D AGAAAGACTA AGAGGCTTTCAAACT/--AGGCTTTCAA--- ACAAGTGTTA 1681 het 1681 ref 74 62 4 11 N/A 0 0 332245 CASAVA_Build 20 26076031 1D AAGAATAATG C/- CCAAACCTTT 3070 het 3070 ref 61 41 10 14 C 3 2 332246 CASAVA_Build 20 26076192 2I CCTTTGAATA --/AT ATATACTATT 2936 het 2936 ref 85 71 8 6 AT 2 3 332247 CASAVA_Build 20 26076388 1D TCAAGGCATA C/- TTCTCTAATA 3070 het 3070 ref 96 58 23 15 C 1 0 332248 CASAVA_Build 20 26077135 1I TACAGAGATA -/T TATATGTTAC 3070 het 3070 ref 47 33 7 7 T 1 2 332249 CASAVA_Build 20 26077265 2D TTTTAATATT GA/-- GTTAGGTTTT 3070 het 3070 ref 52 30 14 8 GA 1 0 332250 CASAVA_Build 20 26077865 1D13M6D TTGTTTTGTT CTTTTGAGATGGAATCTTGC/-TTTTGAGACGGAA------ TCTGTCACCC 3070 het 3070 ref 59 52 9 7 N/A 0 0 332251 CASAVA_Build 20 26078271 1I CCAGCACTTT -/G GGAGGCCGAG 1950 hom 33 het 15 0 6 9 G 2 3 332252 CASAVA_Build 20 26078460 1I35M4D8M2D TGCAGTCCAG -CAGGGCGACAGAGCCAGACTCCATCTCAAAAAAATAAACAAAAACAAAC/CCTGGGCGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAAAAAAAT----AAAAACAA-- AAGCCATTTT 3070 het 3070 ref 34 41 8 7 N/A 0 0 332253 CASAVA_Build 20 26079256 2I TCTCAATGAC --/AT AGTTGATACT 1262 het 1262 ref 35 28 3 4 AT 0 1 332254 CASAVA_Build 20 26079576 2D18M1I18M2D AATTTAAAAA AGAATATTAAAGATGCGAAA-TTTTAAACCCTCAAAGACAT/--AATATTAAAGATGCGAAATTTTTAAAGCCTCAAAGAC-- GTGAATAAAA 3070 het 3070 ref 40 43 9 6 N/A 0 0 332255 CASAVA_Build 20 26079962 3D TTAGATTAAA CAT/--- GATATTAATG 3070 het 3070 ref 47 31 13 3 CAT 1 0 332256 CASAVA_Build 20 26080280 1I TACAGAGCAG -/T TATGTTTGTT 3070 het 3070 ref 76 45 24 7 T 1 2 332257 CASAVA_Build 20 26080443 5I AAGGAAATAA -----/TATTT TATTTAATTG 3070 het 3070 ref 50 33 15 2 TATTT 1 2 332258 CASAVA_Build 20 26080762 3D AAACACTTCT TCC/--- TAAGCATACT 3070 het 3070 ref 44 25 13 9 TCC 1 0 332259 CASAVA_Build 20 26081151 2D TTGCTGTATA GC/-- ATTTTGTATA 3070 het 3070 ref 53 37 11 7 GC 1 0 332260 CASAVA_Build 20 26081222 1I9M11I4M13I14M12D TCCTTGGCCA -GCGATGTTA-----------TGTC-------------CATCTAATACCTTATCTCTTTCCTCT/TGTTATTTTAATTTTGTCTACTGTCATTGGCAGAAATGTATCTAATACCTTA------------ TCTCTTTCCC 3070 het 3070 ref 49 50 12 10 N/A 0 0 332261 CASAVA_Build 20 26081345 2D CTTTTTCATT TA/-- TGTCTAGAGA 3070 het 3070 ref 60 35 21 4 TA 1 0 332262 CASAVA_Build 20 26081428 1I ATTTTTTCAA -/G TAAATTTATA 3070 het 3070 ref 45 29 12 4 G 0 1 332263 CASAVA_Build 20 26081855 5D CAGACCAAAT TAAAG/----- TAATATGAGC 3070 het 3070 ref 50 38 10 4 TAAAG 1 0 332264 CASAVA_Build 20 26083119 4D CCACATTTCT CCAC/---- ATGAATATTA 2463 het 2463 ref 41 34 6 1 CCAC 1 0 332265 CASAVA_Build 20 26084329 1I ACTGATGTGC -/T TATTGAATTT 3070 het 3070 ref 57 36 12 10 T 1 2 332266 CASAVA_Build 20 26084760 2I GTTTCTGAGG --/AT ATCTTGTATT 3070 het 3070 ref 47 27 13 7 AT 1 2 332267 CASAVA_Build 20 26085317 1I ATGATTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 10 11 332268 CASAVA_Build 20 26085457 1I AGGTCCAGCT -/G ACCAAATGTC 1342 het 1342 ref 34 28 3 3 G 0 1 332269 CASAVA_Build 20 26085718 1I TTTACTGTTA -/C TTGTTTGAAG 3070 hom 44 het 37 0 29 8 C 0 1 332270 CASAVA_Build 20 26085887 1I GTTTTTATTT -/G TTTTAATGTT 3070 het 3070 ref 65 37 20 8 G 0 1 332271 CASAVA_Build 20 26086719 1I60M4I12M3D ATTTAAAAAA -AATTTGCATTATTAACATACTTTTATTCATTCTTTATTTTTACTTTTATTAATTATTTTT----ATTCTACACAATTAA/TAATTTGCATTATTAGAATACTTTTATTCATTCTTCATTTTTACTTTTATTAATTACTTTTATTAATTCTACACAAT--- CAAAATACTA 3036 het 3036 ref 36 57 8 5 N/A 0 0 332272 CASAVA_Build 20 26087216 2D46M1I AGCTAGTTTT AGAGTCAGGAAATAAAATGAAGTGGTCAGAATTTTAATTCTCTCATCT-/--AGTCAGAAAATAAAATGATGTGGTCAGAATTTTAATTCTCTCATCTA AGGGAATAGC 3070 het 3070 ref 41 32 11 11 N/A 0 0 332273 CASAVA_Build 20 26087530 4D AAAATACTAA CTAG/---- TAATGAGAAT 3070 het 3070 ref 58 24 9 26 CTAG 1 0 332274 CASAVA_Build 20 26088067 4D ATCAATAAAT AGTA/---- AGTTGATTAG 3070 het 3070 ref 81 40 25 19 AGTA 1 0 332275 CASAVA_Build 20 26088089 2D28M3I AGACAAAAAC ATGTGATTGACTAAGTTTGAATAATGAAAA---/--GTGATTGACTAAGTTTGAATAATGAAAAAAG AAAGAGAAGA 3070 het 3070 ref 97 53 12 47 N/A 0 0 332276 CASAVA_Build 20 26088180 1D13M1D AAATTAGTAG AAAAAAACTTATCGA/-AAAAAACTTCCCG- AAGAAAAAGT 3070 het 3070 ref 53 39 11 17 N/A 0 0 332277 CASAVA_Build 20 26088542 1D CATTGCTGTT A/- AAACATTAGG 3070 het 3070 hom 70 26 42 2 A 4 3 332278 CASAVA_Build 20 26089149 3I17M2I ATAAAATGAT ---ATAGACTCAATACTTTA--/GTAGTAGACTCAATACTTTAAG AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 32 19 17 6 N/A 0 0 332279 CASAVA_Build 20 26089436 1I TGTAGGATGT -/A AAATACTTTT 3045 het 3045 ref 43 31 9 3 A 3 4 332280 CASAVA_Build 20 26089881 3D AAATAATCAG TCC/--- TCTTTCAAAT 1466 het 1466 ref 90 77 4 15 TCC 1 0 332281 CASAVA_Build 20 26090204 5D TTTTTTCACT TTACA/----- TTATAAAATA 3070 het 3070 hom 89 29 22 41 TTACA 1 0 332282 CASAVA_Build 20 26090219 2I26M6D TTATAAAATA --TGATTTTGCTTTTTCGTACTTTTTGCTTTTCT/TTTGATTTTGCTTTTTCATATTTTTTGC------ TTTTAGATTC 3070 het 3070 hom 75 30 42 28 N/A 0 0 332283 CASAVA_Build 20 26090536 1I AGTATGGCTG -/T GTATTCATAT 3070 het 3070 ref 54 25 20 10 T 0 1 332284 CASAVA_Build 20 26091076 3D CAACAGAACA ATT/--- ATTATATGTA 3070 het 3070 ref 67 38 15 17 ATT 2 1 332285 CASAVA_Build 20 26091234 6D TCTCCCCACA TCATCT/------ TTGTATGCCA 2253 het 2253 ref 50 43 6 6 TCATCT 1 0 332286 CASAVA_Build 20 26092363 1D AGAAGATATA C/- AAGATAATAA 3070 het 3070 ref 77 47 24 12 C 1 0 332287 CASAVA_Build 20 26093379 1D AAAGACAAAA T/- TATGCCACTA 3070 het 3070 ref 74 49 19 6 T 2 1 332288 CASAVA_Build 20 26094005 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAGAGACG 3070 hom 75 het 40 0 26 14 A 4 5 332289 CASAVA_Build 20 26094044 1I CACAAAGTTT -/A ACTCAAGTAA 1976 het 1976 ref 42 17 5 21 A 1 2 332290 CASAVA_Build 20 26094176 12D TTGGAGACAT AGTCATTACAGG/------------ AGTAATTACT 3070 het 3070 ref 45 34 8 15 AGTCATTACAGG 1 0 332291 CASAVA_Build 20 26094268 19D AATGTGCCAA TTTATTTAGCCTATAAGAG/------------------- TTTATTTTCT 1035 het 1035 ref 50 34 6 21 TTTATTTAGCCTATAAGAG 1 0 332292 CASAVA_Build 20 26094665 1D23M1I TTGTTATATG CATGAGTTAAAATGCTTAATTGTG-/-ATGAGTTAAAATGCTTAATTGTGT TTGGATCCTA 3070 het 3070 hom 93 42 54 22 N/A 0 0 332293 CASAVA_Build 20 26094855 3I TTGTGTAAGA ---/TTG TTATTAATTT 3070 het 3070 ref 71 38 22 11 TTG 0 1 332294 CASAVA_Build 20 26094969 1D AAGGAAATAA G/- AGCAGATGAA 3070 het 3070 ref 80 47 22 11 G 1 0 332295 CASAVA_Build 20 26095050 5D AAAAAATAAG ATAAA/----- ATGGTGACAT 3070 het 3070 ref 73 51 19 4 ATAAA 1 0 332296 CASAVA_Build 20 26095125 1D ACTTATTCCT A/- GAAAATGCTT 3070 het 3070 ref 73 54 8 17 A 1 0 332297 CASAVA_Build 20 26095303 1I TTTGGAGGAC -/T TTGCATACTT 3070 het 3070 ref 98 54 37 8 T 2 3 332298 CASAVA_Build 20 26095412 4I CTCCGATTTA ----/TTTC TATTTCCTTC 3070 het 3070 ref 58 35 17 7 TTTC 0 1 332299 CASAVA_Build 20 26095568 3D34M2D CCACATATAT ATACTTTTTTAATTCTGCAATTCCTCTGAAGTTTTTAAG/---TTTTTTTAATTCTGCAATTCCTCTGAAGTTTTTA-- AGATCTTTGC 3070 het 3070 ref 66 50 21 22 N/A 0 0 332300 CASAVA_Build 20 26095864 10I AAACAAGAAC ----------/TGGGCTTTCA TGGGCTTTCA 3070 het 3070 ref 57 30 20 8 TGGGCTTTCA 1 2 332301 CASAVA_Build 20 26095934 4D AAACAAGAGA AAAT/---- AAATTTAAAA 3070 het 3070 ref 45 17 14 15 AAAT 2 1 332302 CASAVA_Build 20 26095949 3D AATTTAAAAT AAG/--- GAGGACAAAT 2796 het 2796 ref 38 14 7 19 AAG 1 0 332303 CASAVA_Build 20 26096146 2I TATACAGATG --/AA AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 66 26 11 29 A 7 9 332304 CASAVA_Build 20 26096258 1D AAGAAGAAAG A/- AAAAAGAAGA 3070 het 3070 ref 49 21 17 11 A 6 5 332305 CASAVA_Build 20 26096301 1D TTTTTTTTTC T/- GCCTGGAGGT 2352 het 2352 ref 41 21 14 6 T 1 0 332306 CASAVA_Build 20 26096430 1D AAAGTAAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 109 het 68 1 56 12 A 10 9 332307 CASAVA_Build 20 26096868 1I32M3I ATTTTTTTAA -TTGTATATATCTACTACTAGATACAAACTTTG---/GTTGTATATATCTACTACTAGATATAAATTTTGGTT AGTGGTGGTG 3070 het 3070 ref 60 48 26 2 N/A 0 0 332308 CASAVA_Build 20 26097511 1I AACACTCTAG -/T TGTCTGCATA 3070 het 3070 ref 74 33 36 5 T 1 2 332309 CASAVA_Build 20 26120449 3D GTGGAAGTCA ATT/--- ATTATACATA 3070 het 3070 ref 26 14 9 6 ATT 2 1 332310 CASAVA_Build 20 26127624 1D AATTTAGCAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 9 8 332311 CASAVA_Build 20 26134095 2D TATTTATATA TC/-- TAATTCATAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 TC 1 0 332312 CASAVA_Build 20 26136707 1I CGGGGAGGAG -/A AGAGGATCGG 1555 het 1532 hom 45 5 11 29 A 1 2 332313 CASAVA_Build 20 26137488 1I GGATCCCGTA -/C CCCCAAGGCA 3070 het 3070 hom 95 15 72 8 C 4 5 332314 CASAVA_Build 20 26141419 5D TTCAAGCAAA TAAAT/----- TAAATAATGA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 TAAAT 2 1 332315 CASAVA_Build 20 26144782 1D TGTTTGATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 A 9 8 332316 CASAVA_Build 20 26147140 4D AAGTTCAGAT TACA/---- AAAGAATTAA 1854 het 1854 ref 32 26 4 4 TACA 1 0 332317 CASAVA_Build 20 26147249 1I TTATTTTTCT -/G GTAACTGGTC 2273 het 2273 ref 57 45 5 7 G 1 2 332318 CASAVA_Build 20 26151210 1I AACAAGTTAC -/T TTTCTAATTA 3070 het 3070 hom 98 27 46 25 T 3 4 332319 CASAVA_Build 20 26152955 1D TACAGATTAA T/- TTTTAAACAA 3070 het 3070 hom 82 33 38 12 T 5 4 332320 CASAVA_Build 20 26153327 5D AAACAAAAAA AGAAT/----- ATCTTAGCTT 3070 het 3070 hom 71 22 42 29 AGAAT 1 0 332321 CASAVA_Build 20 26153669 1I CTTCAGAGGA -/T GAGAAAACCT 3070 het 3070 hom 87 39 44 5 T 0 1 332322 CASAVA_Build 20 26155034 4D AGGCAAAGAC AGAG/---- AGAGAGAGGG 3070 het 3070 ref 93 46 34 20 AG 6 4 332323 CASAVA_Build 20 26157241 1I ATATTTAATA -/T TTAATGAGGC 3070 het 3070 hom 77 22 51 4 T 2 3 332324 CASAVA_Build 20 26157894 3D TTGGTGAAAA AAC/--- TCCTATGTGT 3070 het 3070 ref 67 33 28 14 AAC 1 0 332325 CASAVA_Build 20 26157980 4D ATATAAATTC TGAA/---- TGGCATGAAA 3070 het 3070 hom 98 34 62 3 TGAA 1 0 332326 CASAVA_Build 20 26160643 3I AAATGAGTTG ---/AGA AGGTTACAGT 3070 het 3070 hom 76 30 38 9 AGA 0 1 332327 CASAVA_Build 20 26161926 3D TCCTTAACTT CTC/--- CTTACCTACA 3070 het 3070 ref 65 52 7 7 CTC 1 0 332328 CASAVA_Build 20 26168468 5D CATGGACTTC TCTAA/----- TCTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 79 22 53 9 TCTAA 1 0 332329 CASAVA_Build 20 26174990 4I TATTAGAATC ----/CTAT CTGAGAGCGC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 CTAT 0 1 332330 CASAVA_Build 20 26180722 3I TACCTCCCAC ---/AAT AAGCAGATGT 2339 het 2339 ref 42 30 5 7 AAT 0 1 332331 CASAVA_Build 20 26181039 2I CAAGTAGAAG --/AC AGGTCTGCTG 2090 het 2090 ref 43 31 5 7 AC 0 1 332332 CASAVA_Build 20 26181512 2I ATGGATAAAT --/AC AGAGATAACT 3070 het 3070 hom 54 26 24 4 AC 0 1 332333 CASAVA_Build 20 26186838 2D TCCAGATGAC AG/-- AGAATAGAAA 3070 het 3070 ref 56 44 9 3 AG 2 1 332334 CASAVA_Build 20 26187480 1D TTTAAGAGAA T/- TTCTCCAGAA 1374 het 1374 ref 32 26 3 3 T 3 2 332335 CASAVA_Build 20 26187997 1I GACTAGATAG -/T TTTTTGGTCC 3070 het 3070 ref 49 29 16 4 T 5 6 332336 CASAVA_Build 20 26188179 1I AAATATTATG -/A GACAATTTTT 3070 het 3070 ref 81 38 38 5 A 0 1 332337 CASAVA_Build 20 26190164 2D ATTTAAAGTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 56 23 12 21 T 11 9 332338 CASAVA_Build 20 26191497 1D CCTCCTCAGT A/- AATAAGACAT 3070 het 3070 ref 67 55 8 4 A 3 2 332339 CASAVA_Build 20 26192582 1I GTTGAGCATC -/T TTTCATGTGC 3070 het 3070 ref 98 63 21 14 T 3 4 332340 CASAVA_Build 20 26192810 1D TCCAATTTAC T/- TATTTTTTTC 1667 het 1667 ref 63 51 4 9 T 2 1 332341 CASAVA_Build 20 26193237 12I CAGTTTCATT ------------/TTTGATGAAACA TTGCTGAGGG 3070 het 1653 hom 28 4 23 3 TTTGATGAAACA 0 1 332342 CASAVA_Build 20 26194642 1I CTCCAAATAC -/A AAAAACGAAG 1768 het 1768 ref 54 47 4 3 A 5 6 332343 CASAVA_Build 20 26195370 1I TTATAAGAGA -/C AAAATTGGAA 3070 het 3070 ref 55 22 20 13 C 0 1 332344 CASAVA_Build 20 26195941 5I GCTCAGTAAA -----/TACTT TAACTTAAAA 3070 het 3070 ref 56 38 12 6 TACTT 0 1 332345 CASAVA_Build 20 26196206 3D GCCCGACTAA TTT/--- TTTTTTTTTA 1965 het 1965 ref 35 16 9 10 T 12 9 332346 CASAVA_Build 20 26196600 2D AGTGGAGAAA AC/-- ATATATAAAG 3070 het 3070 ref 96 71 19 16 AC 1 0 332347 CASAVA_Build 20 26197145 1D TATTTGAGGT G/- ATGGATATGC 1761 het 1761 ref 78 68 4 9 G 1 0 332348 CASAVA_Build 20 26197252 1D CAATAAAAAC A/- AAAAGGGCTT 3070 het 3070 ref 86 61 14 15 A 5 4 332349 CASAVA_Build 20 26197712 1I AAATGAAGCT -/A AAAAATAGCT 3070 het 3070 ref 61 36 14 11 A 5 6 332350 CASAVA_Build 20 26199029 1I CCTGGGAAGC -/A AGAGTTTGCA 3070 het 3070 ref 57 44 9 4 A 1 2 332351 CASAVA_Build 20 26200113 1I CTTCCTCTGG -/T GAATCATGAA 3070 het 3070 ref 54 41 10 3 T 0 1 332352 CASAVA_Build 20 26200928 1I CTGGTTAGGG -/T TATGATTCAG 3070 het 3070 ref 69 29 27 13 T 1 2 332353 CASAVA_Build 20 26201257 2D ACAGATGAGA CT/-- CTGCCCTGGG 3070 het 3070 ref 52 31 16 5 CT 2 1 332354 CASAVA_Build 20 26202735 1I TGGCTTAACT -/A AAAAATCTTT 2226 het 2226 ref 86 71 5 10 A 5 6 332355 CASAVA_Build 20 26203301 1D CCTTCGTTAC A/- AAAAATAATA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 6 5 332356 CASAVA_Build 20 26204235 2D ACTCTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 2509 het 1036 hom 23 4 8 13 A 16 14 332357 CASAVA_Build 20 26218353 2D TGAAGCCTGT GG/-- TTTAAAAGGA 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 G 2 0 332358 CASAVA_Build 20 26223523 2I4M2D12M1I TTTGAGGCCT --TTGATGGAAACGGGATAT-/TCTTGA--GAATTGGGATATC TTCACAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 8 N/A 0 0 332359 CASAVA_Build 20 26224457 5I CAGAGTTGGA -----/CTTTT CTTTAGTTAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CTTTT 0 1 332360 CASAVA_Build 20 26229719 1D TTAGAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 68 hom 29 2 17 10 T 11 10 332361 CASAVA_Build 20 26252717 1D AACTTCTTTG T/- GATGTGTGTA 3070 het 3070 hom 37 21 14 2 T 1 0 332362 CASAVA_Build 20 26254898 3D AATACTAGAC AGA/--- AGGATTCTCA 3070 het 3070 ref 32 18 9 6 AGA 1 0 332363 CASAVA_Build 20 26262307 1D AGCTTCTTTG T/- GAAGTTTGCA 3070 het 3070 ref 56 27 15 15 T 1 0 332364 CASAVA_Build 20 26262953 1I CTATCATCAC -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 55 18 16 21 A 7 8 332365 CASAVA_Build 20 26265431 2D CAGTTCTGAA AC/-- ACAGTTTTTG 3070 het 3070 ref 64 26 10 28 AC 2 1 332366 CASAVA_Build 20 28033306 1D TAAGTCATTC T/- TCCTATAAAG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 2 1 332367 CASAVA_Build 20 28033379 2I GAACCAATCC --/AA AAATGCCCAT 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 A 3 5 332368 CASAVA_Build 20 28033450 1I ATGCAACCAT -/A AAAAAGAATG 2298 het 2298 ref 30 21 6 3 A 5 6 332369 CASAVA_Build 20 28033792 3D GAACTTAAAG AAA/--- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 29 10 11 A 12 9 332370 CASAVA_Build 20 28034151 3I TATCTTTTGG ---/ACC ATAAAACTAT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 ACC 0 1 332371 CASAVA_Build 20 28034491 1I TTCTGGAAAA -/G TAAAGTCCAG 3070 het 3070 ref 54 35 15 4 G 0 1 332372 CASAVA_Build 20 28034670 1D TATTCTGGAG A/- AATTCTCTTA 3070 het 3070 ref 71 46 20 5 A 3 2 332373 CASAVA_Build 20 28035202 2D CATTTTTTCA TT/-- TTCCTTGCTT 3070 het 3070 ref 84 36 41 7 T 4 2 332374 CASAVA_Build 20 28035315 2D ATATTTCTAT TC/-- TCTGTCATCT 2360 het 2360 ref 98 88 6 4 TC 2 1 332375 CASAVA_Build 20 28036505 1I CCACTGTACT -/C CCCCCAGGCT 3070 het 3070 ref 101 45 14 42 C 5 6 332376 CASAVA_Build 20 28036542 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 101 44 16 45 A 9 8 332377 CASAVA_Build 20 28036801 1D AGGTCTACTT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 63 45 11 7 A 8 7 332378 CASAVA_Build 20 28037353 2I TCAGATAAAC --/AT ATGGAAAATC 3070 het 3070 ref 48 33 13 2 AT 1 2 332379 CASAVA_Build 20 28037661 4D21M2D CAAGCAGAAA TAATTAATTTGAAAGAGGTGATAACAT/----TAATTCGAAAGAAGTGATAAC-- ATTATTTACA 3070 het 3070 ref 70 55 23 19 N/A 0 0 332380 CASAVA_Build 20 28039659 1I AATGCTAATT -/A AAAAAATGTT 1764 het 1764 ref 51 27 10 14 A 6 7 332381 CASAVA_Build 20 28044429 1D TTCATTACGG A/- AAAAATACAT 3070 het 3070 ref 65 48 7 12 A 6 5 332382 CASAVA_Build 20 28045085 2I TATGGTAGAT --/AA AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 60 30 21 10 A 6 8 332383 CASAVA_Build 20 28045748 1I CATAAGAATA -/T TACAGTACAC 3070 het 3070 ref 62 25 27 10 T 1 2 332384 CASAVA_Build 20 28046694 4D TGTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 2198 hom 18 het 23 0 6 17 TA 11 9 332385 CASAVA_Build 20 28047036 1D GGTAGGTCTA T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 57 28 23 6 T 7 6 332386 CASAVA_Build 20 28049425 1I TTCATATTTT -/G TATTTCTTCT 1944 het 1944 ref 65 48 7 11 G 0 1 332387 CASAVA_Build 20 28049474 1I AGTAATTTGA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 58 34 11 13 T 7 8 332388 CASAVA_Build 20 28049644 1I AATACCACAG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 51 33 10 8 T 6 7 332389 CASAVA_Build 20 28051544 1I CTAAAGTTTG -/T TTGAAGCACT 788 het 788 ref 61 48 3 11 T 2 3 332390 CASAVA_Build 20 28051615 1I ACTTATCTTG -/T TTTTCCTGTC 3070 het 3070 ref 89 48 34 8 T 4 5 332391 CASAVA_Build 20 28052330 1I TCGAGCTTTT -/C TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 95 56 25 14 C 0 1 332392 CASAVA_Build 20 28053999 2D21M1I GAGAGAAGTT TATAGTTTGTCTGACTTTTATTC-/--TAGTTTGTCTGACTTTTATTCT TTTTAATCCA 3070 het 3070 ref 101 41 13 56 N/A 0 0 332393 CASAVA_Build 20 28054266 4D CTTCTCTCCT CTTC/---- CTTTGTATTC 3070 het 3070 ref 87 70 8 10 CTTC 1 0 332394 CASAVA_Build 20 28054512 1I GGTGGGAGGA -/G AAGCAGACAT 3070 het 3070 hom 73 21 47 5 G 0 1 332395 CASAVA_Build 20 28054754 5I ATCAATGGCC -----/AAAAT AGTATATATT 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 AAAAT 0 1 332396 CASAVA_Build 20 28055596 1I20M1D ACTTTCACTC -AAAAAAGGCATATGTGTACTA/AAAAAAACGCATATGTGTACT- TTTAAAAAAT 2732 het 2732 ref 52 49 6 7 N/A 0 0 332397 CASAVA_Build 20 28055763 2I18M1I TTGAAAATTT --GTCATTACCATCTTTGCA-/AAGTCATTACCATCTTTGCAT TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 60 46 17 7 N/A 0 0 332398 CASAVA_Build 20 28056037 33I AAACAGTCCT ---------------------------------/ATATAAGGAAGAATTGCTTCTTATGAAGGCCCA GTAGTACCTC 1152 het 1152 ref 65 54 3 11 ATATAAGGAAGAATTGCTTCTTATGAAGGCCCA 0 1 332399 CASAVA_Build 20 28056993 1I AAACCAAAAG -/A AAAATCAACG 3070 het 3070 ref 86 26 28 32 A 4 5 332400 CASAVA_Build 20 28057990 3D AGAGAGGGAA GAT/--- GATAAGATGA 2015 het 2015 ref 38 31 6 2 GAT 2 1 332401 CASAVA_Build 20 28059938 1I TCTCTAAACT -/C TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 76 50 15 11 C 0 1 332402 CASAVA_Build 20 28060414 2I ATTTAATCTC --/AT GTGTATATCT 3070 hom 232 het 94 0 78 16 AT 0 1 332403 CASAVA_Build 20 28060920 1D ATAGATGAAG A/- GACATTTAGA 3070 het 3070 ref 92 75 8 11 A 1 0 332404 CASAVA_Build 20 28062033 1D CTTACTTTTT G/- TATCTTATTT 3070 het 3070 ref 97 72 13 12 G 1 0 332405 CASAVA_Build 20 28062147 1D GAAATGGTGA G/- GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 90 23 25 46 G 2 1 332406 CASAVA_Build 20 28062420 1D36M2I GATTATATGA TTTTTTCCATATGAAAATATAAGTGACCAAAATGACA--/-TATTTCCATATGAAAATATAAGTGACCAAAATGACAAG AGTTATAAAA 3070 het 3070 ref 93 79 19 13 N/A 0 0 332407 CASAVA_Build 20 28062936 1D AAAGCCACTG A/- AAATAATATG 1663 het 1663 ref 57 49 4 5 A 4 3 332408 CASAVA_Build 20 28065312 1D TAATTGTAAA T/- AATAACTACG 3070 het 3070 ref 95 37 27 32 T 1 0 332409 CASAVA_Build 20 28065351 4D AATCCATATA TGTT/---- TGTTAACATA 2086 het 2086 ref 75 33 5 38 TGTT 2 1 332410 CASAVA_Build 20 28067145 4I AGTTCTTACA ----/CTGT CTATCTAAAA 3070 het 3070 hom 87 38 45 4 CTGT 0 1 332411 CASAVA_Build 20 28069546 1D AATTGGAAGT A/- TTAAATTTAT 2275 het 2275 ref 89 63 5 22 A 1 0 332412 CASAVA_Build 20 28072519 2I TCACTATCAC --/AG GGATAGCATG 3070 het 3070 ref 92 27 9 56 AG 0 1 332413 CASAVA_Build 20 28073299 1D GTGAGGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 11 17 16 T 11 10 332414 CASAVA_Build 20 28073376 1D AATTTATGCC T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 95 65 16 16 T 7 6 332415 CASAVA_Build 20 28074116 1D ACAAAAAATA G/- GAGTACATGA 3070 het 3070 ref 53 33 9 12 G 2 1 332416 CASAVA_Build 20 28074435 1D GAAGCAAAAG A/- AAACCTCAGT 3070 het 3070 ref 61 35 14 14 A 4 3 332417 CASAVA_Build 20 28075132 1I AGCTAATCCA -/T TAGCTAGTAT 2051 het 2051 ref 64 46 5 13 T 1 2 332418 CASAVA_Build 20 28075154 1D AGTAGAAACT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 71 37 22 13 A 9 8 332419 CASAVA_Build 20 28075429 1D TTATATTTTT G/- CTTCTAAAAT 3070 het 3070 ref 53 36 14 5 G 1 0 332420 CASAVA_Build 20 28075527 1I CCTTTAAATG -/A AAAAAAATAA 1827 het 1827 ref 48 37 4 7 A 7 8 332421 CASAVA_Build 20 28076010 2I CTCAGGCAAG --/AA AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 65 41 18 6 A 7 9 332422 CASAVA_Build 20 28077855 1I TTTGATAGTA -/T TTTTTCCTTG 3006 het 3006 ref 75 62 8 5 T 5 6 332423 CASAVA_Build 20 28080830 1I TTTTCCAGGA -/T TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 51 29 16 6 T 6 7 332424 CASAVA_Build 20 28082738 3D TTATTTTATT TTA/--- TTTTTCAGAG 3070 het 3070 ref 60 36 18 7 TTA 1 0 332425 CASAVA_Build 20 28083186 4D TTAATAAATG AATT/---- GAGTCTCATA 1660 het 1660 ref 55 45 4 10 AATT 1 0 332426 CASAVA_Build 20 28083204 4I CTCATATAAG ----/TTAA TTATTTATTC 2202 het 2202 ref 56 45 5 6 TTAA 0 1 332427 CASAVA_Build 20 28083874 1D CTAATCTGTG A/- GGTTATTATA 3070 het 3070 ref 54 37 13 5 A 1 0 332428 CASAVA_Build 20 28083988 1I AGAGTTAGAT -/G AACTATGATT 1070 het 1070 ref 72 59 3 10 G 0 1 332429 CASAVA_Build 20 28085089 1D TTGGAACTGC T/- TTGCTATGAA 3070 het 3070 hom 71 33 26 14 T 3 2 332430 CASAVA_Build 20 28085121 2D TAAATTGGCA GT/-- GGTCACATAT 3070 het 3070 ref 71 30 14 28 GT 1 0 332431 CASAVA_Build 20 28088098 12D TTAGGGAATA ACAGGTAGCTAT/------------ ACCTTGTACT 3070 het 3070 ref 78 64 11 16 ACAGGTAGCTAT 1 0 332432 CASAVA_Build 20 28090572 1D TTCTCTCTTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 48 22 16 10 T 8 7 332433 CASAVA_Build 20 28090874 1D TTGTATCAAT A/- AAAAGGTCAC 2189 het 2189 ref 54 38 6 11 A 5 4 332434 CASAVA_Build 20 28091018 1D AGTGAAAAAA C/- ATAAGTGAGA 3070 het 3070 ref 29 16 7 8 C 1 0 332435 CASAVA_Build 20 28094220 6D TGCTGCAGAT TTTTTC/------ TTTTTTTGAA 1795 het 1795 ref 37 30 4 4 TTTTTC 1 0 332436 CASAVA_Build 20 28094508 1D TTATTTATGA T/- TTTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 63 41 19 4 T 5 4 332437 CASAVA_Build 20 28094714 1D AAGAAGTCTC A/- AAAGATCTGA 3070 het 3070 ref 60 40 10 11 A 4 3 332438 CASAVA_Build 20 28094953 1D TTGACTTTCT A/- AAAAAAGGAC 3070 het 3070 ref 66 37 11 20 A 7 6 332439 CASAVA_Build 20 28095230 1D AAAATGTGTT G/- GAAAGGGTTT 3070 het 3070 ref 62 36 23 3 G 2 1 332440 CASAVA_Build 20 28096601 1I CTTCTGAGCC -/T TTACGTAACT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 2 3 332441 CASAVA_Build 20 28097138 2D GTTTTTTAAC TT/-- TTAATCCCAT 3070 het 3070 ref 44 30 10 5 T 4 2 332442 CASAVA_Build 20 28097257 4D ATGTGATAAA CGTC/---- TCTCTCTCTT 2370 het 2370 ref 38 32 5 9 CGTC 1 0 332443 CASAVA_Build 20 28097803 3D TTCAGAAATG AAA/--- AAGCCGCAGC 3070 het 3070 ref 67 35 27 7 A 5 2 332444 CASAVA_Build 20 28098180 13D AGATCATGCC CTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTGC 3070 het 2707 hom 30 10 10 13 CTTTTTTTTTTTT 1 0 332445 CASAVA_Build 20 28099056 4D CTTTCATTTC TCTA/---- TCTATTTTGT 3070 het 3070 ref 47 36 8 4 TCTA 2 1 332446 CASAVA_Build 20 28099829 3I GGAGGCAAAC ---/CTT CTCTTTAGAG 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 CTT 0 1 332447 CASAVA_Build 20 28101667 4D TATTTTTTAT TTTA/---- TTTATTTATT 1881 het 1881 ref 14 6 5 3 TTTA 3 2 332448 CASAVA_Build 20 28103624 1I CTGGCTAATG -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 34 20 7 7 T 6 7 332449 CASAVA_Build 20 28103800 1D AACCTTCTTG T/- TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 7 T 4 3 332450 CASAVA_Build 20 28106750 2I ACTATAGTAA --/TG CCTTTTTACT 1155 het 1155 ref 31 27 4 0 TG 0 1 332451 CASAVA_Build 20 28107778 2D CATGATTTTG AA/-- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 62 43 16 3 A 10 8 332452 CASAVA_Build 20 28111383 1I GGTTATGAAA -/T CTCCCCTTGT 2470 het 2470 ref 33 26 6 1 T 0 1 332453 CASAVA_Build 20 28112609 2D TAAAAGTGTG TT/-- CCCAACTCCC 2980 het 2980 ref 48 32 10 8 T 2 0 332454 CASAVA_Build 20 28113626 1D TAAGATGAAT C/- CTGCACATTA 3070 het 3070 ref 64 33 26 5 C 2 1 332455 CASAVA_Build 20 28113875 2D TAGATTGTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 8 A 12 10 332456 CASAVA_Build 20 28114089 2I AAAACAAAAC --/TT TAACTCTTTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 3 332457 CASAVA_Build 20 28115417 2D TCTTCATAGA CC/-- CTACAAAGAG 2801 het 2801 ref 47 40 6 1 C 3 1 332458 CASAVA_Build 20 28116030 4I ATAGCTTGGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 238 hom 56 1 45 10 TTTG 3 4 332459 CASAVA_Build 20 28116309 1I GATTTTAAAG -/T CTGCCAAATT 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 0 1 332460 CASAVA_Build 20 28117224 1I CACACATTGG -/A AAGCATTTTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 2 3 332461 CASAVA_Build 20 28119314 4I TTTGTGTTTG ----/TTTA TTTGTTTGTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TTTA 0 1 332462 CASAVA_Build 20 28119490 2I CGCAGGATAT --/TC TGTTTTTCAC 3070 hom 172 het 64 0 58 6 TC 0 1 332463 CASAVA_Build 20 28124133 1D GTCTGTGTGT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 2239 hom 29 9 11 9 G 10 9 332464 CASAVA_Build 20 28132624 1I CCTCCCTGGC -/A GTGCTTGGGT 2483 het 2483 ref 60 19 23 18 A 0 1 332465 CASAVA_Build 20 28136111 1I TTTATTGCTG -/T TTTGTCCAAT 3070 hom 52 het 20 0 17 3 T 3 4 332466 CASAVA_Build 20 28139204 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 28 2 20 6 T 15 14 332467 CASAVA_Build 20 28150984 1I AGGCCTTGGC -/G GTAACTCTCT 3070 het 3070 ref 53 32 19 2 G 1 2 332468 CASAVA_Build 20 28152450 1D GCATACACAA T/- TTTCCTTCAG 3070 het 3070 ref 49 26 11 12 T 4 3 332469 CASAVA_Build 20 28157819 2I TGCCCCAGGC --/CA CACTGCAGTA 3070 het 3070 ref 67 29 23 15 CA 1 2 332470 CASAVA_Build 20 28158096 1D ACATGTCTTT A/- AAAAAAAAAG 788 het 788 ref 28 14 4 11 A 10 9 332471 CASAVA_Build 20 28158796 1I CTAAGTTTTA -/T TTTTTTTAAT 1775 het 1775 ref 26 19 4 3 T 7 8 332472 CASAVA_Build 20 28162394 1I ATTTGGCCAC -/A AGCTCCTAGT 1714 het 1714 ref 36 28 4 4 A 1 2 332473 CASAVA_Build 20 28170298 1D GGAATGAGCA C/- AATGGGTCTG 3070 het 3070 ref 41 25 10 7 C 1 0 332474 CASAVA_Build 20 28170473 1D ACCCAGAGTG C/- TGATGGGTGG 3070 het 3070 ref 61 36 22 3 C 1 0 332475 CASAVA_Build 20 28171600 3I31M3D TCTCACACGC ---TCATCATACAGATGAGGAAACTGAGATGCAGAGA/TCATCATCATACAGATGAGGAAACTGAGATGCAG--- AGTTCACCCA 3070 het 3070 ref 49 40 19 7 N/A 0 0 332476 CASAVA_Build 20 28176372 1I TACTTTAACC -/A TGAGTTTTGG 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 A 0 1 332477 CASAVA_Build 20 28180407 1D ATTACTCTGA C/- CCAGCCTTTG 3070 het 3070 ref 66 51 11 7 C 3 2 332478 CASAVA_Build 20 28182353 2I AGAGAAATGG --/AC AGTCACTGGA 1809 het 1809 ref 27 21 4 2 AC 0 1 332479 CASAVA_Build 20 28183272 1I ATACACAAAA -/C ATTTCAAGCA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 C 0 1 332480 CASAVA_Build 20 28183754 1I ATACAAAAAG -/A ATTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 A 1 2 332481 CASAVA_Build 20 28186328 1I GCTACTATAT -/A AGAAAATACA 3070 het 3070 ref 53 32 19 2 A 1 2 332482 CASAVA_Build 20 28187001 1D CTCTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 2850 het 3 hom 26 0 7 19 A 13 12 332483 CASAVA_Build 20 28190384 1I TTAAAGTTTT -/G TTTCTGACAT 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 G 0 1 332484 CASAVA_Build 20 28191007 3I TTTTTTAAAA ---/AAT ATTGTTTTTT 3070 het 512 hom 20 4 9 7 AAT 0 1 332485 CASAVA_Build 20 28191410 2I GGAGTGTCTT --/CA CAGAGTCTTA 3070 het 3070 ref 55 31 18 6 CA 1 2 332486 CASAVA_Build 20 28193096 8I CCAGCTCTCA --------/GATTAATG GTTTCCCATG 2590 het 2590 ref 30 14 8 8 GATTAATG 0 1 332487 CASAVA_Build 20 28193138 1I CCATCCTCGG -/T TTTTTTTAGT 2646 het 2646 ref 26 9 8 9 T 7 8 332488 CASAVA_Build 20 28193617 1I TGGTGTGCTT -/C CCTTTCTTCT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 2 3 332489 CASAVA_Build 20 28194237 1D TACAGCTCAG A/- AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 A 7 6 332490 CASAVA_Build 20 28197231 4D ATATAATTAT AATA/---- AATAAAATTA 1795 het 1795 ref 83 53 5 33 AATA 2 1 332491 CASAVA_Build 20 28197404 1I ACTACTGTGA -/T TTTATTTTAG 3070 het 3070 ref 102 60 20 22 T 3 4 332492 CASAVA_Build 20 28198713 3I GAGTTTCCCA ---/GAG GCTACCTGAC 3070 hom 161 het 72 0 59 13 GAG 0 1 332493 CASAVA_Build 20 28199436 1I TAGTTCCATG -/T TTGTGCATTA 1737 het 1737 ref 98 76 4 18 T 2 3 332494 CASAVA_Build 20 28199457 3D ATCTCCAGAA ATT/--- ATTATAACTT 3070 het 3070 ref 92 68 8 20 ATT 2 1 332495 CASAVA_Build 20 28199921 1I TTTTGAAATC -/G GTTCCCACTC 3070 het 3070 ref 58 32 9 17 G 1 2 332496 CASAVA_Build 20 28207698 1D AACACCTTGA C/- TTAAGCCCAG 3070 het 3070 ref 88 75 9 4 C 1 0 332497 CASAVA_Build 20 28207959 2D GTTCTAAAAT AG/-- GTACACACTA 3070 het 3070 hom 95 19 64 12 AG 1 0 332498 CASAVA_Build 20 28208060 1D ACATATATAT G/- AAAATATTAT 85 het 85 ref 61 19 2 40 G 1 0 332499 CASAVA_Build 20 28210316 2I GCTGGCTTTG --/GT GCACATGCGA 3070 hom 231 het 95 0 65 30 GT 0 1 332500 CASAVA_Build 20 28210510 1D CCAACGAGAT C/- GTGTCCTGCT 3070 het 3070 ref 92 45 33 15 C 1 0 332501 CASAVA_Build 20 28211531 1I TGACACCAAA -/G GTGGTGCAAT 3070 het 3070 hom 93 27 60 8 G 1 2 332502 CASAVA_Build 20 28212639 1D TTTTTGCATT G/- AAAAGGAGAA 836 het 836 ref 46 38 3 6 G 1 0 332503 CASAVA_Build 20 28215206 3I ATGCAAATGG ---/GAA AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 72 35 29 10 GAA 0 1 332504 CASAVA_Build 20 28216506 4D CAAGGATGTG AAGA/---- AAGGGCAATG 2476 het 2476 ref 82 60 6 22 AAGA 1 0 332505 CASAVA_Build 20 28216601 2D AAAAATAGAC TT/-- ATCACATAAT 1820 het 1820 ref 93 85 5 4 T 2 0 332506 CASAVA_Build 20 28216799 3D CTTGCATTGC AAG/--- AATAAAGAAA 3070 het 3070 ref 64 36 26 4 AAG 1 0 332507 CASAVA_Build 20 28219192 1I GCCAGGATGG -/T CTCGATCTCC 3070 het 3070 hom 46 17 28 1 T 0 1 332508 CASAVA_Build 20 28222055 1D TAATAATACT A/- ATGTGGATGT 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 A 2 1 332509 CASAVA_Build 20 28222324 9D GTGTAAATAT TCCCTTTTC/--------- TCCACAGCCT 3070 het 3070 ref 82 74 8 10 TCCCTTTTC 1 0 332510 CASAVA_Build 20 28222843 3I CAGTATATCA ---/AAG AAGGTTTCAG 3070 het 3070 ref 75 42 24 10 AAG 1 2 332511 CASAVA_Build 20 28224000 2I TTACTCTAAC --/TT TGTTTAATTC 3070 het 3070 ref 69 36 20 13 T 1 3 332512 CASAVA_Build 20 28231148 1I TATTTTCAGT -/G CTTTATTTTC 2736 het 2736 ref 100 58 10 41 G 0 1 332513 CASAVA_Build 20 28231355 1D AAGTGTATTG T/- TTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 91 29 49 13 T 6 5 332514 CASAVA_Build 20 28234184 2I ATTTTGAGGA --/GC TTGTCTGCCA 3070 het 3070 hom 73 18 51 5 GC 0 1 332515 CASAVA_Build 20 28236169 1I AGTCTTCCTG -/T AGAGACATTT 3070 het 3070 hom 67 22 36 9 T 0 1 332516 CASAVA_Build 20 28238480 1I GCAGAGGAAG -/A AAAAATTCAA 1240 het 1240 ref 95 61 4 30 A 5 6 332517 CASAVA_Build 20 28238526 1I AACAAAAAAA -/G GATTATACAG 3070 het 3070 ref 71 51 10 10 G 1 2 332518 CASAVA_Build 20 28238715 5I CTAAAAGCTA -----/AAAAG GAAAGGAAAA 3070 het 3070 hom 84 32 44 8 AAAAG 0 1 332519 CASAVA_Build 20 28239098 4I TCACATGTAG ----/ATTT CTTTTTTTTT 447 het 447 ref 75 20 6 49 ATTT 0 1 332520 CASAVA_Build 20 28246181 1D TTAATAAGTG A/- AAAAAGAAAT 2649 het 2649 ref 36 24 8 4 A 6 5 332521 CASAVA_Build 20 28255054 1D TTTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3014 hom 30 7 12 11 A 16 15 332522 CASAVA_Build 20 28259453 1D CATAAAAAGG A/- ATGAGATCAT 2755 het 2755 ref 57 35 9 16 A 2 1 332523 CASAVA_Build 20 29268935 1I TGGAAAAGAC -/A AAAATGTAAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 4 5 332524 CASAVA_Build 20 29269154 2I50M1D TGGACTCGAA --GGAAAGAATGTAAAGGACTCAAATGGAATAGATTAGACTAGAATTGAGTAG/AGGAAAAGAATGTAAAGGACTCAAATGGAATAGATTAGACTAGAATTGAGTA- GAATGGAATG 3070 hom 102 het 39 0 34 35 N/A 0 0 332525 CASAVA_Build 20 29280795 15D AATGCAATCA AATGGAATGGAATCG/--------------- AATGGAATGG 3070 het 3070 ref 67 33 15 26 AATGGAATGGAATCG 2 1 332526 CASAVA_Build 20 29289226 10I AATAGAATCA ----------/AATGGAATGG AATGGAATGG 3070 hom 86 het 48 0 30 18 AATGG 2 4 332527 CASAVA_Build 20 29291358 1I ATTGGACACG -/A ACGGAATAAA 3070 hom 128 het 50 0 43 7 A 1 2 332528 CASAVA_Build 20 29292433 15D AAGGAATCAT ATGGAATGGAATCGA/--------------- ATGGAATGGA 3070 het 208 hom 64 4 47 18 ATGGAATGGAATCGA 1 0 332529 CASAVA_Build 20 29299063 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AAAAAACAGA 3070 hom 50 het 34 1 30 3 AAC 0 1 332530 CASAVA_Build 20 29302356 1I TATATGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 439 hom 45 2 33 10 T 10 11 332531 CASAVA_Build 20 29305429 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 31 1 26 4 A 13 14 332532 CASAVA_Build 20 29317884 1D ATGATTTCTG T/- TTTTTTACAT 2967 hom 18 het 8 0 6 2 T 7 6 332533 CASAVA_Build 20 29327347 1I TAGTTTTTTT -/C CTGCAAAGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 332534 CASAVA_Build 20 29333643 8I AGACTTAAAT --------/GTAAAACC GTAAAACCCC 3070 hom 54 het 22 0 19 4 GTAAAACC 1 2 332535 CASAVA_Build 20 29342244 1I TGAGAGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 397 hom 41 1 32 8 A 9 10 332536 CASAVA_Build 20 29353627 3D AAGCCAAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 662 het 363 hom 26 7 6 13 A 21 18 332537 CASAVA_Build 20 29373932 1I GGATGGCAGC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 240 hom 28 1 21 6 A 7 8 332538 CASAVA_Build 20 29374729 1I GTTGGTGGGA -/T TATTTTTTAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 1 2 332539 CASAVA_Build 20 29377022 1I GAAGGGATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 28 2 13 13 A 10 11 332540 CASAVA_Build 20 29377569 1I ACCATCTCTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 36 het 16 0 10 6 A 8 9 332541 CASAVA_Build 20 29403605 6I CATAGGTGGG ------/AATTGA ACAATGAGAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AATTGA 0 1 332542 CASAVA_Build 20 29403820 1D AAAAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 1045 het 1045 ref 18 13 3 2 A 13 12 332543 CASAVA_Build 20 29417239 2I GAAACCAGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 10 12 332544 CASAVA_Build 20 29417519 1I TAAAGCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 11 12 332545 CASAVA_Build 20 29419052 8D CCTCTGTAAA AGCTTTAC/-------- AGAGACTTTT 3070 het 3070 ref 36 25 10 4 AGCTTTAC 1 0 332546 CASAVA_Build 20 29427917 1D TATTATGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2285 hom 32 12 15 5 A 13 12 332547 CASAVA_Build 20 29429115 2I TGTGTGTATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2351 hom 28 10 9 9 TG 8 9 332548 CASAVA_Build 20 29430966 1D CTGTTGAGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 10 9 332549 CASAVA_Build 20 29437589 1D ACGTGAGGGC T/- TTGAATGTCT 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 3 2 332550 CASAVA_Build 20 29445968 1I GTCTCAAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 9 332551 CASAVA_Build 20 29447830 4D TTTGTTTTTT CTTG/---- TTTTTTTTTT 57 het 57 ref 21 9 1 11 CTTG 1 0 332552 CASAVA_Build 20 29449912 5I GGTTTCACCA -----/TGTTG GTCAGGCTGG 2776 het 2776 ref 14 7 6 1 TGTTG 0 1 332553 CASAVA_Build 20 29453882 1D CTCAGGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 11 8 T 13 12 332554 CASAVA_Build 20 29465165 1D CCTCATAACT C/- CACTGGCTAC 3070 het 3070 hom 52 20 21 11 C 2 1 332555 CASAVA_Build 20 29475700 1I CCACAACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 10 11 332556 CASAVA_Build 20 29482567 30D ATAGTATGAT AGGTATAGAGTGATGGCTGCCTGCATGAAA/------------------------------ AGGAGAAGGA 3070 het 3070 ref 33 19 18 5 AGGTATAGAGTGATGGCTGCCTGCATGAAA 1 0 332557 CASAVA_Build 20 29483802 1D CATTCAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2079 hom 29 6 9 14 T 17 16 332558 CASAVA_Build 20 29484557 4D GAATTCAATT ATTG/---- ATTGATTGAA 3070 het 3070 hom 35 14 20 2 ATTG 3 2 332559 CASAVA_Build 20 29485338 1D AAAAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 477 hom 22 2 12 8 A 15 14 332560 CASAVA_Build 20 29487703 10D TCCAGGCATG CTTGTGACTA/---------- CTTTGACCAA 3070 het 3070 ref 32 20 10 7 CTTGTGACTA 1 0 332561 CASAVA_Build 20 29490007 5D ATATATATAT ATATA/----- TTTTTTTTTC 3070 hom 33 het 17 0 12 5 ATATA 1 0 332562 CASAVA_Build 20 29490288 2D GCTTCAAAAC AA/-- GAGCAAAATT 3070 het 3070 ref 48 24 22 3 A 2 0 332563 CASAVA_Build 20 29491110 6D TGGCTTTCAC TGTTGT/------ TGTTGTTGTT 3070 hom 15 het 32 2 29 4 TGT 7 5 332564 CASAVA_Build 20 29497004 1I GATCAAATAA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 95 het 34 0 32 2 T 7 8 332565 CASAVA_Build 20 29498954 2I TGAAAAAGTC --/TT TATTTCTCCA 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 T 1 3 332566 CASAVA_Build 20 29499999 1D CACTCTGCTC T/- TTTTTCCCCC 2826 het 2826 ref 26 14 9 3 T 6 5 332567 CASAVA_Build 20 29500673 1D ATTTTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 1427 het 1427 ref 40 28 4 8 T 11 10 332568 CASAVA_Build 20 29505561 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2969 hom 25 8 11 6 A 11 12 332569 CASAVA_Build 20 29510581 1I AGGCAAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 12 13 T 13 14 332570 CASAVA_Build 20 29575655 1D AGTGAGCTAT G/- ATCCTGCCAC 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 G 1 0 332571 CASAVA_Build 20 29623604 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1044 het 1044 ref 21 12 3 6 A 13 12 332572 CASAVA_Build 20 29660526 2D CGTCAGAACT TG/-- TTAACGAGGC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TG 1 0 332573 CASAVA_Build 20 29689945 2I CCCAGTCCCC --/CA ACCCCAACCA 2556 hom 34 het 16 0 9 7 CA 0 1 332574 CASAVA_Build 20 29696529 8D TAAAATTAGG CATTTTAA/-------- CAGGTGAGGG 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 CATTTTAA 1 0 332575 CASAVA_Build 20 29699091 4I CTAGTGTATT ----/AGTC AGGGTTCTCT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 AGTC 0 1 332576 CASAVA_Build 20 29700938 1I ATATGAATTT -/G GGGGAGACAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 4 5 332577 CASAVA_Build 20 29707582 1I GAGCCAGGAT -/G GCACCACTGC 3070 hom 27 het 10 0 9 1 G 1 2 332578 CASAVA_Build 20 29712394 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 26 1 17 8 A 11 12 332579 CASAVA_Build 20 29713642 1I CACTCTGCTT -/C CCCCTCCGGA 3070 hom 81 het 35 0 26 9 C 4 5 332580 CASAVA_Build 20 29742038 1I TCAGTATGTA -/T TTTTTTTTTT 2192 het 2192 ref 29 9 8 12 T 14 15 332581 CASAVA_Build 20 29767947 12I ACTCCCAGTA ------------/TCTAAGACTGCC TGGTACACAG 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 TCTAAGACTGCC 0 1 332582 CASAVA_Build 20 29768867 1D TGAAAAAATA C/- CCGGGTAATT 2129 het 2129 ref 18 10 6 2 C 3 2 332583 CASAVA_Build 20 29778479 8D AAAAAAAAGA AGAATCCC/-------- AGAAACAGAC 3070 het 2670 hom 20 9 10 2 AGAATCCC 1 0 332584 CASAVA_Build 20 29779080 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 38 12 16 10 TCTT 4 3 332585 CASAVA_Build 20 29784226 1D GCTAACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2866 hom 22 8 12 2 T 11 10 332586 CASAVA_Build 20 29789702 1I TTAGTAGAGA -/T TGGGGGGGGG 3070 het 1405 hom 17 3 10 4 T 1 2 332587 CASAVA_Build 20 29809584 4D CCTCAATTCA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1268 het 899 hom 24 8 4 14 T 20 16 332588 CASAVA_Build 20 29809743 4D ACCAGCATGC CTAA/---- CTAATTTTTG 3070 het 1244 hom 17 3 14 1 CTAA 2 1 332589 CASAVA_Build 20 29815581 2D TATACATGTA TG/-- TGTGTATATA 3070 het 3070 ref 30 19 9 4 TG 3 2 332590 CASAVA_Build 20 29818835 9D TTTAGCTCTC TTTTTCTTT/--------- TTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 27 16 12 5 TTTTTCTTT 2 1 332591 CASAVA_Build 20 29822363 1D GATTTTTAGC T/- TTTTTTTTTT 2460 het 1419 hom 30 8 7 15 T 17 16 332592 CASAVA_Build 20 29833391 1I GGCAACAGAG -/T TGAGACCCTG 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 T 1 2 332593 CASAVA_Build 20 29836713 2D TACAATAAAC TG/-- TTAAGAAATC 3070 het 3070 hom 39 16 19 6 TG 1 0 332594 CASAVA_Build 20 29837871 9I ACTGTTTTTT ---------/TTTGTTTTG TTTTTTTTTG 133 het 133 ref 33 21 2 10 TTTGTTTTG 0 1 332595 CASAVA_Build 20 29856309 7I CCTCTGCCTC -------/CCAGGTT CAAGCGATTC 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 CCAGGTT 0 1 332596 CASAVA_Build 20 29856598 3D CTGGGAAGCA TGC/--- TGCTTTGTTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 5 TGC 2 1 332597 CASAVA_Build 20 29857256 1D TTTGTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2781 hom 43 12 15 16 T 17 16 332598 CASAVA_Build 20 29872565 1I TGTAAGCCAC -/A AATAAGAACA 3070 het 3070 ref 59 29 21 9 A 2 3 332599 CASAVA_Build 20 29910764 1D GCATTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 2288 het 1169 hom 29 10 8 11 G 11 10 332600 CASAVA_Build 20 29914540 2D CAGTATGGCT GG/-- GGGGGGGGGA 1406 het 1406 ref 30 14 6 11 G 11 9 332601 CASAVA_Build 20 29926902 4D GAAACAAGAC CAAA/---- CAGGTTTGGA 3070 het 3070 ref 52 31 16 10 CAAA 1 0 332602 CASAVA_Build 20 29932873 1D ATGCTCAGCT A/- AAAAACTGGG 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 6 5 332603 CASAVA_Build 20 29941200 1D ATTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 26 2 17 7 T 15 14 332604 CASAVA_Build 20 29945957 4D ATTTCTTCTC TAAT/---- GATTCTGATA 3070 het 3070 hom 33 12 17 6 TAAT 1 0 332605 CASAVA_Build 20 29953574 2D TCATCACCAC TT/-- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 T 9 7 332606 CASAVA_Build 20 29964599 1I ACTCCAGCCT -/G GGTGACAGAG 3070 het 3070 hom 36 13 13 10 G 2 3 332607 CASAVA_Build 20 30040995 1I ATGCGGGCAG -/C CCACACAGAA 2990 het 2990 ref 31 17 10 4 C 2 3 332608 CASAVA_Build 20 30091411 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 11 10 332609 CASAVA_Build 20 30109695 1D TCCCAAATCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 25 hom 31 2 21 8 A 10 9 332610 CASAVA_Build 20 30112362 15D GAAAAGGAAG GAAGAAAGGAAGGAA/--------------- GAAGAAAGGA 3070 hom 54 het 19 0 18 4 GAAGAAAGGAAGGAA 1 0 332611 CASAVA_Build 20 30151367 1D TTTCTCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 39 1 18 20 T 15 14 332612 CASAVA_Build 20 30165065 4D TGGAGAATAA AACT/---- CTACTTCCCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AACT 1 0 332613 CASAVA_Build 20 30169971 1I TAGCTCACTC -/T TAACTGCAGC 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 1 2 332614 CASAVA_Build 20 30171003 7I CATTTTCTTA -------/TTAAGTT TTAAGTGTTC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTAAGTT 0 1 332615 CASAVA_Build 20 30172268 4I TTATCTGATT ----/GAGG AAGTTCCCTT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 GAGG 0 1 332616 CASAVA_Build 20 30172674 1I TTTATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2023 het 29 hom 15 1 8 6 T 12 13 332617 CASAVA_Build 20 30174946 1I CCATTTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 10 11 332618 CASAVA_Build 20 30177146 3D CTCTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 31 1 12 18 T 21 18 332619 CASAVA_Build 20 30191766 1I TCTGGCAGCA -/G GTTACTCTGA 3070 hom 135 het 53 0 45 8 G 1 2 332620 CASAVA_Build 20 30192318 1I AACTGGGCTT -/C CTGGGGAGGC 3070 hom 83 het 33 0 24 9 C 1 2 332621 CASAVA_Build 20 30199323 1D TCTCCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1827 het 1306 hom 23 6 9 8 A 17 16 332622 CASAVA_Build 20 30202909 3D TCCTAGAGCG AGT/--- GAGTCTCTTA 3070 hom 84 het 30 0 24 6 AGT 1 0 332623 CASAVA_Build 20 30210445 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 15 1 10 6 A 17 16 332624 CASAVA_Build 20 30211204 3D GATAAGAATC ATT/--- ATTTTCTACA 3070 hom 118 het 43 0 39 5 ATT 2 1 332625 CASAVA_Build 20 30220847 1D CTCTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 20 0 13 7 A 15 14 332626 CASAVA_Build 20 30225948 1I TTAATTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 25 1 23 1 G 0 1 332627 CASAVA_Build 20 30226326 5I TTCATGTCTC -----/TACTT TATTTTATTA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TACTT 0 1 332628 CASAVA_Build 20 30229060 2D CTTCTGCCTT GG/-- GGAAAAAAAA 167 hom 9 het 9 0 3 6 G 4 2 332629 CASAVA_Build 20 30233095 13D AATCTACAGT GGCTTCTGGGAAA/------------- GGCTTCCTCC 3070 hom 108 het 37 0 35 6 GGCTTCTGGGAAA 1 0 332630 CASAVA_Build 20 30234650 1D GAGTGTAGAG A/- AAAAAAACAG 3070 het 26 hom 21 1 13 7 A 8 7 332631 CASAVA_Build 20 30277591 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTAAACC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 5 6 332632 CASAVA_Build 20 30281294 4D GAGTGCAGTG GCAA/---- GCAAAATCAC 3070 hom 81 het 30 0 24 10 GCAA 2 1 332633 CASAVA_Build 20 30304617 1I TTGGAGTCAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 8 9 332634 CASAVA_Build 20 30307217 1I GACATAGACT -/C CCCCTCCAAT 3070 hom 80 het 34 0 24 10 C 4 5 332635 CASAVA_Build 20 30310635 1I ATAAAGGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 27 1 20 6 T 14 15 332636 CASAVA_Build 20 30315821 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 6 7 332637 CASAVA_Build 20 30325132 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 27 1 15 11 A 13 12 332638 CASAVA_Build 20 30327142 1D ACTCATGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 612 hom 31 3 19 10 T 15 14 332639 CASAVA_Build 20 30329628 1I GGTCCTAACA -/C TTGCTGCTCA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 C 0 1 332640 CASAVA_Build 20 30331842 1D TTATACAGTT G/- GCCCCAGGAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 G 2 1 332641 CASAVA_Build 20 30340630 3I TGACTGTGTC ---/AAG AAGAATACTG 3070 het 24 hom 24 1 15 8 AAG 1 2 332642 CASAVA_Build 20 30349593 1I AAAATTGTTG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 227 hom 20 1 14 5 T 7 8 332643 CASAVA_Build 20 30349981 2I TGAAACCTTC --/CT CTGTTTTTGT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 CT 1 2 332644 CASAVA_Build 20 30353984 4I GCTTTCTTTC ----/TTCT TTCTTTCATA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TTCT 1 2 332645 CASAVA_Build 20 30355322 2D TCAGTCTCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 32 0 18 15 A 17 15 332646 CASAVA_Build 20 30368586 1I CTGTAGTCCT -/A AGCTACTTGG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 1 2 332647 CASAVA_Build 20 30369767 1I TTCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 16 0 12 4 A 13 14 332648 CASAVA_Build 20 30375578 1I AACTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 25 4 A 12 13 332649 CASAVA_Build 20 30387211 2I CTCACAGGCT --/AA AGTGATCTTC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 1 3 332650 CASAVA_Build 20 30392108 2D GGAGACAAAC TG/-- TAGGTAGCAG 3070 hom 39 het 17 0 14 5 TG 1 0 332651 CASAVA_Build 20 30397859 2I CAGAGCAAGA --/CT CTGTCTCGGG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CT 1 2 332652 CASAVA_Build 20 30411531 1D GGTGTTGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1318 hom 37 5 20 13 A 14 13 332653 CASAVA_Build 20 30414727 1I CATGCTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 11 332654 CASAVA_Build 20 30431306 1D AGAAAAAAAT A/- AAAAAGATGT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 6 5 332655 CASAVA_Build 20 30433421 1I TTTTCTTGCC -/T TTTTTTTTTT 1730 het 6 hom 14 0 9 5 T 16 17 332656 CASAVA_Build 20 30443431 1I TGGACCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 422 hom 42 2 26 14 T 12 13 332657 CASAVA_Build 20 30444505 6D TCTATCAGTT ATAGAC/------ AGAGGGTGTT 3070 hom 96 het 36 0 33 9 ATAGAC 1 0 332658 CASAVA_Build 20 30448475 1I AAAACAAACA -/C AAAAAAACTC 3070 het 323 hom 21 1 18 2 C 0 1 332659 CASAVA_Build 20 30449857 3I GTGTTGGGTA ---/ACC ACCATCTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ACC 1 2 332660 CASAVA_Build 20 30451567 1I GATTTGGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 9 10 332661 CASAVA_Build 20 30457283 1D TTTATTTCAG T/- TTTTTCCTAT 3070 hom 135 het 50 0 45 6 T 6 5 332662 CASAVA_Build 20 30464993 4I TGTTCAACGT ----/ATTG ATTTCATTCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 ATTG 0 1 332663 CASAVA_Build 20 30474866 2I GCTAATTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 42 het 19 0 14 5 TG 6 7 332664 CASAVA_Build 20 30496422 3I ACAAAAGCAA ---/AAC AACAAGTTCC 3070 hom 132 het 52 0 42 10 AAC 1 2 332665 CASAVA_Build 20 30520826 1D TATTTTTCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 9 8 332666 CASAVA_Build 20 30539402 2I GGTTTTATTT --/TA TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 42 1 31 10 TA 0 1 332667 CASAVA_Build 20 30570938 10I ATCCTCGGGC ----------/AAAACACCCA CTGACTTCAG 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 AAAACACCCA 0 1 332668 CASAVA_Build 20 30582832 1D TTTCTATACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2687 hom 24 9 11 4 T 12 11 332669 CASAVA_Build 20 30586739 1D CTGGAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1145 hom 30 7 11 12 A 15 14 332670 CASAVA_Build 20 30591681 1I TGCCAAGTGT -/C CCTCTGGGCC 3070 hom 112 het 41 0 33 8 C 2 3 332671 CASAVA_Build 20 30617889 1D GGTTGGCATC A/- CTGACTCCCG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 1 0 332672 CASAVA_Build 20 30624503 2D CATCCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1322 het 535 hom 23 7 6 10 T 16 14 332673 CASAVA_Build 20 30649761 1I CAACTCATCC -/T TTAACAGCAC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 2 3 332674 CASAVA_Build 20 30673043 4I GCTCATTTGA ----/TCAT TCATTCATTC 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 TCAT 3 4 332675 CASAVA_Build 20 30690328 5I TCCTCCTGCG -----/CTCCC CTCCCGGCAA 3070 het 2961 hom 27 11 12 4 CTCCC 1 2 332676 CASAVA_Build 20 30702811 1I AACCCTATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 11 9 A 11 12 332677 CASAVA_Build 20 30712353 1D AGCCCCTTAT A/- AAAATCATCA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 5 4 332678 CASAVA_Build 20 30726172 1D TGCAATCACA G/- CTCACTGCAG 2410 het 2410 ref 30 11 7 12 G 1 0 332679 CASAVA_Build 20 30729847 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAAGTGG 3070 het 2028 hom 16 6 10 0 AG 3 2 332680 CASAVA_Build 20 30738396 6D TCAGTACTAT GGCTTA/------ GGCTTAGTAC 3070 het 3070 ref 46 20 19 7 GGCTTA 2 1 332681 CASAVA_Build 20 30752113 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 A 7 8 332682 CASAVA_Build 20 30752935 1D GGGGAAAAAT A/- AAAACCTGTG 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 5 4 332683 CASAVA_Build 20 30755846 3I CAATGTAGAT ---/ATG ATAATTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 ATG 0 1 332684 CASAVA_Build 20 30766950 4I AGTCTCAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 2300 hom 25 7 12 6 AAAC 2 3 332685 CASAVA_Build 20 30771113 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 10 9 332686 CASAVA_Build 20 30773361 1D ACGTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1576 het 231 hom 15 3 6 6 A 15 14 332687 CASAVA_Build 20 30778589 1I CCAGCTACTT -/G GGGGGTTGAG 3070 het 3070 ref 28 15 8 6 G 5 6 332688 CASAVA_Build 20 30779156 11D AACTTTCCAG CTGTGCTGCAC/----------- CACAGCACAC 3070 het 3070 ref 38 21 18 8 CTGTGCTGCAC 1 0 332689 CASAVA_Build 20 30779916 6D AGACAGACAT ACACAC/------ ACACACACAC 3048 het 3048 ref 42 14 13 16 AC 11 8 332690 CASAVA_Build 20 30780148 7D AATCCTCCCA CCTCAGC/------- CTCCAGAGTA 3070 het 2029 hom 21 6 12 6 CCTCAGC 1 0 332691 CASAVA_Build 20 30781323 2D AACAAAAAAC AA/-- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 9 7 332692 CASAVA_Build 20 30786700 1D CGCGAGACTC A/- AAAAAAAAAA 2230 het 2182 hom 16 7 6 3 A 13 12 332693 CASAVA_Build 20 30789081 1I AGGATCCCTT -/A AAGGCCAGGA 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 A 2 3 332694 CASAVA_Build 20 30791785 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2840 hom 24 9 9 6 A 10 11 332695 CASAVA_Build 20 30792010 1I GGTAAAAGAT -/C CCCTGTTACC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 C 3 4 332696 CASAVA_Build 20 30792626 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 2540 hom 26 7 11 8 A 8 9 332697 CASAVA_Build 20 30797907 1I CATCCTGGAG -/A AAAACCACTG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 4 5 332698 CASAVA_Build 20 30822078 1I TCCGCCTTAC -/A TTTTTTTTTT 1871 hom 19 het 11 0 6 5 A 0 1 332699 CASAVA_Build 20 30824585 1I TGTGCCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 316 hom 20 1 13 6 T 13 14 332700 CASAVA_Build 20 30827700 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 27 1 20 7 A 15 14 332701 CASAVA_Build 20 30832798 1D ACAAAACAGA C/- TCCTGGCTGT 3070 hom 116 het 46 0 34 13 C 1 0 332702 CASAVA_Build 20 30834206 2D AGACAAAAAC AG/-- AGCACATATA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 AG 2 1 332703 CASAVA_Build 20 30842005 1I GTTTCCCCCC -/T ACCAGAGCCA 3070 hom 105 het 40 0 34 6 T 0 1 332704 CASAVA_Build 20 30844593 1I CCTGCTAACA -/T TTTTGACCAG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 4 5 332705 CASAVA_Build 20 30851399 4D GGAGATAAAC TAGT/---- TAACAACTAC 3070 hom 147 het 57 0 48 11 TAGT 1 0 332706 CASAVA_Build 20 30858293 1D TGTTTGTTCA T/- TTTGCTTATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 4 3 332707 CASAVA_Build 20 30860681 1D TTCATTAAAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 65 het 31 0 21 10 T 8 7 332708 CASAVA_Build 20 30863800 48D GTGCCCCTCA CCACCCCCCACATCCTGTAGAGATCCCAATGCTCCTTGCGAGGGTTCC/------------------------------------------------ CATCCTGTCT 3070 hom 48 het 16 0 15 6 CCACCCCCCACATCCTGTAGAGATCCCAATGCTCCTTGCGAGGGTTCC 1 0 332709 CASAVA_Build 20 30867056 1I CAAAGCAGCT -/G TGATCTCCCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 0 1 332710 CASAVA_Build 20 30871720 3I GGCCGGAAGT ---/GGG GGGCTGCTGC 1015 hom 12 het 5 0 4 1 G 3 6 332711 CASAVA_Build 20 30883861 1D CACTTTTTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 424 hom 30 1 26 3 A 10 9 332712 CASAVA_Build 20 30972669 1I TTCTCTCTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 80 het 38 0 25 13 T 9 10 332713 CASAVA_Build 20 31006482 1D CATCTATCCT C/- CCCATGAGTA 3070 hom 99 het 41 0 31 10 C 4 3 332714 CASAVA_Build 20 31041244 2D GGGAGGTAAC AG/-- GGGGCTGCAG 3070 hom 119 het 45 0 37 8 AG 1 0 332715 CASAVA_Build 20 31044049 1D AGCACTGCAC A/- AAAAAACATA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 6 332716 CASAVA_Build 20 31044555 1I CAATGATATG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 7 8 332717 CASAVA_Build 20 31046053 2I TCCTAGAACT --/AA AAACAATGCA 3070 hom 76 het 32 0 30 2 A 3 5 332718 CASAVA_Build 20 31046259 9I CCAGCTACTC ---------/AGGAGGCCG AGGTGTAGGA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AGGAGGCCG 0 1 332719 CASAVA_Build 20 31046340 1D ATTAAAAAAA C/- AAAAAGAACT 3070 hom 69 het 24 0 23 1 C 1 0 332720 CASAVA_Build 20 31113531 9D CGTAGGCTCC TAAGAAGGG/--------- TAAGAACCCC 3070 hom 81 het 29 0 27 3 TAAGAAGGG 1 0 332721 CASAVA_Build 20 31130533 1I TTTTTCAGAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 8 9 332722 CASAVA_Build 20 31131658 1I GAAAGAATTT -/G GGGGGCGCTG 3070 hom 85 het 36 0 28 8 G 5 6 332723 CASAVA_Build 20 31141197 1I CTCCCAAACA -/C CCCCCCCCGA 2430 hom 35 het 17 0 11 6 C 8 9 332724 CASAVA_Build 20 31219150 6I GGGGCAGGAC ------/GCTGTG CCCTGGGAGG 3070 hom 106 het 40 0 33 7 GCTGTG 0 1 332725 CASAVA_Build 20 31247189 1I GGCAAAAGCT -/G GGGTGAATAT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 G 3 4 332726 CASAVA_Build 20 31279341 1D ATACCAGGAC A/- AAAAAAAAAA 674 het 674 ref 44 27 3 14 A 15 14 332727 CASAVA_Build 20 31305024 2D TATATATACT AC/-- ACACACACAC 3070 het 1614 hom 17 5 8 5 AC 9 8 332728 CASAVA_Build 20 31316308 1I ATGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 10 11 332729 CASAVA_Build 20 31317473 1D AGAATGCATT G/- GTCTAGAAAT 3070 het 3070 ref 62 32 24 6 G 2 1 332730 CASAVA_Build 20 31320369 1I CAGAGCAAGA -/C CCTGTCTCAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 C 2 3 332731 CASAVA_Build 20 31326864 10D GTATGTGTGC GTGTGTGTGT/---------- GTGTGTGTGT 3070 het 2895 hom 37 10 16 13 GT 14 9 332732 CASAVA_Build 20 31344175 1I GATTTTTTTT -/C CTGCGTCAGT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 C 1 2 332733 CASAVA_Build 20 31370896 1I ACACCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1270 het 1270 ref 22 9 5 8 A 15 16 332734 CASAVA_Build 20 31380982 1D AGCATTTTTC G/- GGGGGGAGCA 3070 het 3070 hom 34 16 14 5 G 7 6 332735 CASAVA_Build 20 31396705 1I GATTTTTTTT -/C CCCTCAGTTC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 C 3 4 332736 CASAVA_Build 20 31409416 1D TAAAGTCAGG A/- AACCTGCCAC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 3 2 332737 CASAVA_Build 20 31413165 1D CTCACGCCTG T/- TAATTCCAGC 3070 hom 93 het 33 0 30 3 T 2 1 332738 CASAVA_Build 20 31420956 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 A 11 10 332739 CASAVA_Build 20 31425937 1D TTAAAGCCAT G/- GGAGCTGAAT 3070 hom 99 het 34 0 33 1 G 3 2 332740 CASAVA_Build 20 31432686 1I TATGACTACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 8 9 332741 CASAVA_Build 20 31435286 8I GGATAAGGCA --------/GGAGAATC GGAGAATCGC 2335 hom 12 het 6 0 5 1 GGAGAATC 1 2 332742 CASAVA_Build 20 31438482 1D TATAATCCCA G/- GATTTTGGAA 3070 het 2784 hom 24 7 13 4 G 2 1 332743 CASAVA_Build 20 31441742 1I CCCTGTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 14 8 A 13 14 332744 CASAVA_Build 20 31466595 2D ATGCACACAC AT/-- ATGTGCATAC 3070 hom 123 het 47 0 42 7 AT 2 1 332745 CASAVA_Build 20 31502031 1D TTATACCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2096 hom 28 8 11 10 T 13 12 332746 CASAVA_Build 20 31517154 1D CTGCAAGCCT C/- CCCATCCCCA 3070 hom 74 het 28 0 24 5 C 4 3 332747 CASAVA_Build 20 31517862 1I TGCAAACCAA -/T TTTTTTTTTT 1224 het 1224 ref 40 16 4 20 T 17 18 332748 CASAVA_Build 20 31528316 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 16 1 13 2 A 13 12 332749 CASAVA_Build 20 31539195 1D TGTCTGCCTC A/- GTCTCCCAAA 3018 hom 27 het 12 0 9 4 A 1 0 332750 CASAVA_Build 20 31541158 1D ACTTTGAGCC A/- GGGGGCTCGC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 A 1 0 332751 CASAVA_Build 20 31545252 10I AGAGGCATGA ----------/GCCTCTACTG GCCACCATAC 3070 hom 75 het 30 0 23 7 GCCTCTACTG 0 1 332752 CASAVA_Build 20 31553418 1I AATTACAAAA -/T TTTACTTAAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 3 4 332753 CASAVA_Build 20 31578198 1D CCAAATTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 15 6 A 11 10 332754 CASAVA_Build 20 31580159 2D ATGTCCACTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 67 hom 42 4 33 7 GT 9 8 332755 CASAVA_Build 20 31597016 1I CCGGGTTCAA -/G GGATTCTCCT 3070 hom 75 het 29 0 24 5 G 2 3 332756 CASAVA_Build 20 31631285 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1732 hom 23 5 11 7 T 14 13 332757 CASAVA_Build 20 31645255 2I CACTCATGAA --/AG AGAGTAAAAA 3070 het 3070 ref 39 25 13 1 AG 2 3 332758 CASAVA_Build 20 31669641 1I TATATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1606 het 1209 hom 31 6 8 17 T 15 16 332759 CASAVA_Build 20 31698328 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1202 het 187 hom 22 2 8 12 A 17 18 332760 CASAVA_Build 20 31716941 4I CCATCTCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 AAAC 2 3 332761 CASAVA_Build 20 31796060 2D AACTGTGTGG TT/-- TTTTTTCTTT 3070 het 2098 hom 24 6 15 3 T 8 6 332762 CASAVA_Build 20 31802099 1D ACTTGGCTAA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 4 3 332763 CASAVA_Build 20 31803576 1D TGCAAGCAAG C/- CCCCCCCCCT 2455 het 2200 hom 31 9 7 15 C 10 9 332764 CASAVA_Build 20 31838257 1D CAACGTGATG A/- AACCCCGTCT 3070 het 3054 hom 17 7 9 1 A 3 2 332765 CASAVA_Build 20 31838699 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 10 9 332766 CASAVA_Build 20 31839566 1I ACCTTCTGGT -/G GCTTCTCTTC 3070 hom 90 het 37 0 29 8 G 1 2 332767 CASAVA_Build 20 31839890 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 8 9 332768 CASAVA_Build 20 31962821 7D TGGTCACTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 18 6 T 18 11 332769 CASAVA_Build 20 31964904 1D CTGTCAGTTT C/- CCCCCCCCCC 2661 het 5 hom 16 1 11 4 C 11 10 332770 CASAVA_Build 20 31967095 1D ATTAAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 679 hom 51 2 34 16 A 12 11 332771 CASAVA_Build 20 31967994 1I CCACCTCCCT -/A AAAAGTTTCC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 4 5 332772 CASAVA_Build 20 31980340 13D GCCCGGCTAG TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 806 het 148 hom 10 3 3 4 T 23 10 332773 CASAVA_Build 20 32000845 2I TCACTGCCCC --/CT GTCACTGCCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 CT 0 1 332774 CASAVA_Build 20 32001546 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 18 0 14 4 A 12 13 332775 CASAVA_Build 20 32010010 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 863 het 232 hom 17 3 5 9 A 14 13 332776 CASAVA_Build 20 32034449 1I GTCTGTCTCA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 375 hom 20 2 14 4 G 1 2 332777 CASAVA_Build 20 32035708 1I GTGGAGAGTC -/A GGGGGTGAAG 3070 hom 121 het 46 0 40 6 A 0 1 332778 CASAVA_Build 20 32070150 2D TTGGTGTTTG TT/-- TTGTTTTTTC 3070 hom 141 het 50 0 48 3 T 4 2 332779 CASAVA_Build 20 32076776 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 34 3 22 9 C 1 0 332780 CASAVA_Build 20 32078038 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 13 12 332781 CASAVA_Build 20 32082523 1D CCTCCCCCCC T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 50 het 19 0 17 2 T 7 6 332782 CASAVA_Build 20 32083976 1D TTTTTGTGTG T/- TGGGGGGGGT 3070 hom 129 het 45 0 43 2 T 2 1 332783 CASAVA_Build 20 32109969 4I CCTATCCCCA ----/TACT TACTTCTCAA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TACT 1 2 332784 CASAVA_Build 20 32118164 1I CCTGGGGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 26 1 20 5 T 11 12 332785 CASAVA_Build 20 32128526 3I GAGGTGGCGC ---/CAG CGGCGGCGGC 2068 hom 42 het 17 0 11 6 CAG 0 1 332786 CASAVA_Build 20 32140689 26D TCCTAAGTCT CAAGGTCCCACCACACTCGCGTGGGA/-------------------------- GGCCGTGTCT 3070 hom 63 het 21 0 21 6 CAAGGTCCCACCACACTCGCGTGGGA 1 0 332787 CASAVA_Build 20 32146175 1D CTCAATATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 4 A 13 12 332788 CASAVA_Build 20 32165201 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAAAAAAAA 2739 hom 5 het 19 0 11 8 AAAG 0 1 332789 CASAVA_Build 20 32173923 1D AGGCCCCCGC A/- AGCCCTGGGA 1068 hom 23 het 9 0 4 5 A 2 1 332790 CASAVA_Build 20 32177240 8D TCAAAAAAAT AATAAATA/-------- AATAAATAAA 1560 hom 10 het 4 0 4 0 AATA 7 5 332791 CASAVA_Build 20 32324690 1I GTGGTGACCC -/T TTTTTTTTTT 3036 het 1078 hom 37 4 23 10 T 15 16 332792 CASAVA_Build 20 32325450 1D ACCTTCTAAT G/- GTGAGAATGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 2 1 332793 CASAVA_Build 20 32335083 1D TCATTTCAAA G/- GCCTGACCAA 3070 hom 117 het 43 0 36 10 G 2 1 332794 CASAVA_Build 20 32339666 1D CCCAAGAGGA G/- CAGTGTAGGG 3070 hom 94 het 39 0 28 11 G 1 0 332795 CASAVA_Build 20 32357838 1D TTTCAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 35 1 26 8 T 15 14 332796 CASAVA_Build 20 32420801 4I TCCATCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 92 het 41 0 31 10 AAAC 3 4 332797 CASAVA_Build 20 32430992 1D TACTATTCTG T/- TTTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 4 3 332798 CASAVA_Build 20 32433332 1D CCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1933 het 1933 ref 35 14 7 15 A 17 16 332799 CASAVA_Build 20 32438770 1D TGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2259 het 2259 ref 35 18 7 10 A 17 16 332800 CASAVA_Build 20 32441587 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 304 hom 36 1 27 8 A 11 12 332801 CASAVA_Build 20 32478121 3D TTTTGCCATA TTG/--- GCCAGGCTGG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTG 1 0 332802 CASAVA_Build 20 32481280 4D AGATGTAAAT TAAA/---- TAGTGTGTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 TAAA 1 0 332803 CASAVA_Build 20 32487159 1I TTGGTCTGAG -/A GAATAGTAGT 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 0 1 332804 CASAVA_Build 20 32498640 1D GTCTTTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 34 2 19 13 T 17 16 332805 CASAVA_Build 20 32517647 1I GATCATGTGA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 6 7 332806 CASAVA_Build 20 32521636 1D GTTGTGTTGC T/- TTATATTACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 2 332807 CASAVA_Build 20 32534607 4D TAGCTCCTAG GCCT/---- GCCTACAGGC 3070 hom 65 het 25 0 19 9 GCCT 2 1 332808 CASAVA_Build 20 32537160 3D CTAGATTTCG TTC/--- TTCTTTGACG 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 TTC 2 1 332809 CASAVA_Build 20 32543046 4D TTAAAAAATT AAAA/---- AAATCTGGTA 3070 hom 126 het 45 0 43 4 A 7 3 332810 CASAVA_Build 20 32551093 1D ATCCTTTCAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 14 het 46 2 37 7 A 10 9 332811 CASAVA_Build 20 32556081 1D AATTTTTTTT C/- TAATGTGGGA 3070 hom 100 het 42 0 36 6 C 1 0 332812 CASAVA_Build 20 32561380 1I AGAAAATACA -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 8 332813 CASAVA_Build 20 32567109 2I CCGGAGACTC --/CA GAGGTACCTG 3070 hom 74 het 31 0 20 11 CA 0 1 332814 CASAVA_Build 20 32569974 1D TGTTAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 2121 het 2121 ref 32 23 5 5 T 13 12 332815 CASAVA_Build 20 32580830 1I CAGAGTTCTC -/A GCAATTCCTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 0 1 332816 CASAVA_Build 20 32615090 1I ATACATCAAT -/G GGGGGGGGGG 3070 het 447 hom 31 1 17 13 G 10 11 332817 CASAVA_Build 20 32616732 1I GCTCCTCTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 20 0 15 5 T 9 10 332818 CASAVA_Build 20 32619061 2I TCTTCCCAGC --/AG AGTGAGGTTT 3070 hom 144 het 53 0 41 12 AG 1 2 332819 CASAVA_Build 20 32642497 1I AAAAAAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 9 10 332820 CASAVA_Build 20 32644807 2D TGTCTTAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 22 2 13 7 A 14 12 332821 CASAVA_Build 20 32721658 1D TAATAACGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 23 1 14 8 T 15 14 332822 CASAVA_Build 20 32740956 3D TGCAGATTCA GTT/--- GTGCCTTTTA 3070 het 3070 hom 42 17 23 5 GTT 1 0 332823 CASAVA_Build 20 32745577 1D CGGCTTGCCC T/- TTTTTTTTTT 1244 het 648 hom 15 3 8 5 T 15 14 332824 CASAVA_Build 20 32748432 5I AGTCTAGGCA -----/CAGCT CATCTGGGTT 3070 hom 102 het 42 0 34 8 CAGCT 0 1 332825 CASAVA_Build 20 32760626 4D CCCTTGTCCG GTGT/---- GTGTGTGTGT 1387 hom 24 het 12 0 9 3 GT 12 10 332826 CASAVA_Build 20 32772915 2I ATCCTTTAAA --/AC AGTGGTCCCC 3070 hom 66 het 27 0 21 6 AC 0 1 332827 CASAVA_Build 20 32774289 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAATA 3070 het 372 hom 23 1 18 4 A 8 9 332828 CASAVA_Build 20 32781541 1D AAAATTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 50 het 21 0 17 4 T 10 9 332829 CASAVA_Build 20 32799323 1I GCAAGAATTC -/A GTGGTAACCT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 1 332830 CASAVA_Build 20 32810218 2D TTTATAATGA TC/-- TGTGCAGAAA 3070 hom 96 het 35 0 31 5 TC 1 0 332831 CASAVA_Build 20 32821310 3D CCAAAATTTT GAC/--- TATTGTTATT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 GAC 1 0 332832 CASAVA_Build 20 32825024 2I AATTTTGCTC --/TT GACACCCAGG 2228 hom 18 het 7 0 6 1 T 0 2 332833 CASAVA_Build 20 32827158 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 27 het 19 0 17 4 A 10 9 332834 CASAVA_Build 20 32838587 1D CAAATTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 21 4 A 12 11 332835 CASAVA_Build 20 32854073 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 A 10 9 332836 CASAVA_Build 20 32872583 1D AGACATTGGA T/- GGCAAATTAG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 1 0 332837 CASAVA_Build 20 32890643 1D TAAGAAACCA T/- TTGCCAAATC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 3 2 332838 CASAVA_Build 20 32904413 1I TATATGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 352 hom 32 1 25 7 T 10 11 332839 CASAVA_Build 20 32905026 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2559 hom 30 het 13 0 8 6 A 18 16 332840 CASAVA_Build 20 32918011 1D TCACTATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 22 1 15 6 T 13 12 332841 CASAVA_Build 20 32953568 1I GTCTACTTTT -/C CCCCATAATG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 4 5 332842 CASAVA_Build 20 32976147 3D22M1D AACCTTTTTT TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTGT/---TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTG- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 N/A 0 0 332843 CASAVA_Build 20 32981729 1I AATCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1116 hom 24 4 16 4 A 16 17 332844 CASAVA_Build 20 32996848 1I GAATCTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 16 1 10 5 A 13 14 332845 CASAVA_Build 20 32997143 1I TGTCAACAAT -/A AAAGGGATCT 3070 het 73 hom 51 1 43 7 A 3 4 332846 CASAVA_Build 20 33010946 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 74 hom 20 2 11 7 T 14 12 332847 CASAVA_Build 20 33025838 4D AAGTCAGTAT CTTA/---- CTTAAGTCCT 3070 hom 90 het 34 0 30 6 CTTA 2 1 332848 CASAVA_Build 20 33034087 1D TCTTCCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2797 het 521 hom 21 2 13 6 T 12 11 332849 CASAVA_Build 20 33037052 1I CCCAGTACCA -/C CCAGCTGCAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 2 3 332850 CASAVA_Build 20 33039009 2I TACCCCACTC --/AT GTGCCCTGCC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 AT 0 1 332851 CASAVA_Build 20 33046695 3D GAGCACAGCC AAA/--- CTTTGCTACA 1649 het 1649 ref 24 12 5 9 A 3 0 332852 CASAVA_Build 20 33048440 1I44M1I GCAGGTGCAT -GGGGTGAGGTCCCTCAGGGCCTGAAGGGGACTGGGGGGCGTTAT-/GGGGGTGAGGTCCCTCAGGGCCTGAAGGGGACTGGGGGGCGTTATG GGGGTCCCAG 3070 het 23 hom 11 1 9 4 N/A 0 0 332853 CASAVA_Build 20 33048526 1I CTGTGCTGGC -/T CACCCACTCT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 T 0 1 332854 CASAVA_Build 20 33052360 22D TCACTGATGT GAGGCTGGGCAAGGGCTGTGGG/---------------------- GAGCCTGGGA 3070 het 3070 ref 32 15 12 11 GAGGCTGGGCAAGGGCTGTGGG 1 0 332855 CASAVA_Build 20 33054859 1I ACCCCCTTGA -/G GGGTGGGGCA 2374 het 2374 ref 24 10 9 5 G 3 4 332856 CASAVA_Build 20 33066610 1D ATTACAGGTG C/- CCCACCAACA 3070 het 2331 hom 22 6 12 4 C 4 3 332857 CASAVA_Build 20 33076300 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1327 hom 23 9 13 1 C 0 1 332858 CASAVA_Build 20 33079676 2I AAATATTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2982 hom 30 11 12 7 T 12 14 332859 CASAVA_Build 20 33087290 6I TTTACTTGTT ------/AGAGAA AGAGAGTAAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 AGAGAA 0 1 332860 CASAVA_Build 20 33089743 1I TGAGACACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 11 12 332861 CASAVA_Build 20 33090061 4I CTGTACAAAC ----/AGAA AGGAGTCAAT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 AGAA 0 1 332862 CASAVA_Build 20 33094488 2D TATTCTCCCC CT/-- GACTTAATAC 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 CT 1 0 332863 CASAVA_Build 20 33100953 5I AGATAGCGGT -----/AGAGA AAAGTGGTAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 AGAGA 0 1 332864 CASAVA_Build 20 33101857 1D TGGAACTCCA T/- TTTTTTCATC 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 7 6 332865 CASAVA_Build 20 33103705 1I CTGGGACTAT -/A GGTATATAAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 0 1 332866 CASAVA_Build 20 33107973 3D TAAATCCTCT TAA/--- TAACCACTAC 3070 het 3070 hom 42 19 20 7 TAA 2 1 332867 CASAVA_Build 20 33111175 6D AAGAAGAAAT AAGAAG/------ AAGAAGAAGA 2674 het 2674 ref 30 16 9 8 AAG 5 3 332868 CASAVA_Build 20 33111376 3D AGACGAAGAC GAA/--- GAAGACAAAG 3070 het 3070 hom 39 14 17 9 GAA 2 1 332869 CASAVA_Build 20 33132268 5I GTACACTTCA -----/GTTTT GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 GTTTT 1 2 332870 CASAVA_Build 20 33141005 11D CTATATTATA TATTTGTTTAC/----------- TACAATGAAA 2069 het 2069 ref 18 13 5 1 TATTTGTTTAC 1 0 332871 CASAVA_Build 20 33142412 1D TTTTTCTAAA G/- GTTATGTGCT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 G 2 1 332872 CASAVA_Build 20 33152882 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 9 8 332873 CASAVA_Build 20 33157396 2D TAGCATTAAA AC/-- AGTCAACTTA 3070 het 3070 hom 33 14 18 2 AC 1 0 332874 CASAVA_Build 20 33173264 1D GTGCCTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 10 15 T 12 11 332875 CASAVA_Build 20 33199731 2D GCTGTCACTC TT/-- GAGGTTTCCT 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 T 2 0 332876 CASAVA_Build 20 33200965 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1758 het 968 hom 21 7 7 8 A 18 16 332877 CASAVA_Build 20 33203466 4D GGGAAATTTC CCAT/---- CCATCTGTTG 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 CCAT 2 1 332878 CASAVA_Build 20 33206566 7I GCTGGGCACA -------/GTGCCTC GTGCCTCAAG 2220 het 1263 hom 14 4 7 3 GTGCCTC 1 2 332879 CASAVA_Build 20 33210861 4D CAATTCTTCC CAGT/---- CATTTACATG 3070 het 3070 ref 40 24 16 2 CAGT 1 0 332880 CASAVA_Build 20 33211891 1D AAGGTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 1551 het 1551 ref 29 20 6 3 A 13 12 332881 CASAVA_Build 20 33218883 4D TTTTTGGTTG TTGT/---- TTGTTTTGTT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 TTGT 2 1 332882 CASAVA_Build 20 33222130 1I TAGTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 9 10 332883 CASAVA_Build 20 33231722 8I AAATAAATAA --------/ATAAATAT ATAAATACAT 3070 hom 37 het 15 0 13 2 ATAAATAT 0 1 332884 CASAVA_Build 20 33234438 11D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 27 1 16 12 A 26 15 332885 CASAVA_Build 20 33240730 1D AACGCATTCC G/- GGGGGGGGCC 1350 het 765 hom 15 3 4 9 G 9 8 332886 CASAVA_Build 20 33240760 1D GCCACTCTGG A/- GGGGTGTCTG 2504 het 1266 hom 17 5 8 5 A 1 0 332887 CASAVA_Build 20 33246248 3I TGACACTGCA ---/ACC ACCACCCACA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 ACC 2 3 332888 CASAVA_Build 20 33247285 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2678 het 1469 hom 23 7 9 7 A 17 16 332889 CASAVA_Build 20 33274470 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAATGAT 1343 hom 7 het 3 0 3 0 A 7 6 332890 CASAVA_Build 20 33275662 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTA 2653 het 2653 ref 34 18 8 8 T 9 10 332891 CASAVA_Build 20 33324437 1I TAGTGAGATT -/C CATCTCTACA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 C 1 2 332892 CASAVA_Build 20 33335018 1D ATCTGGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2944 het 1691 hom 31 10 10 11 A 16 15 332893 CASAVA_Build 20 33336799 2D CAGTGGTAAC TT/-- GGAGCCCCTG 3070 het 3070 ref 38 22 12 5 T 2 0 332894 CASAVA_Build 20 33337241 1D AGGGCATCTC T/- TTCACCTGAT 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 T 3 2 332895 CASAVA_Build 20 33339376 14I8M3D GCTTAGTGTG --------------TGACCTCATGG/CCTGGGCACACGGCTGCCCTCA--- AGGCCCCAAC 3070 het 3070 ref 31 16 12 9 N/A 0 0 332896 CASAVA_Build 20 33344196 4I TGCAAGGCCC ----/TAAG TGAGAGCTGA 3070 het 3070 ref 51 28 16 7 TAAG 0 1 332897 CASAVA_Build 20 33352156 1I ACTTTAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 13 14 332898 CASAVA_Build 20 33369142 5I CTTCCAGAAA -----/GGGCT GGGGTAAAGG 3070 het 3070 hom 57 25 28 4 GGGCT 0 1 332899 CASAVA_Build 20 33379229 1I CAAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 2276 het 1247 hom 34 6 11 17 A 16 17 332900 CASAVA_Build 20 33403910 2I TGGTTTTTGT --/TC TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 TC 0 1 332901 CASAVA_Build 20 33407666 1D AGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 10 9 332902 CASAVA_Build 20 33408736 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAATT 3070 het 195 hom 19 1 15 3 A 9 8 332903 CASAVA_Build 20 33409656 1I AAATAAACTT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 7 8 332904 CASAVA_Build 20 33421820 12D AAAAGGAAAT TCTCAAATTGAG/------------ TCTCAGAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 18 1 TCTCAAATTGAG 1 0 332905 CASAVA_Build 20 33442851 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 34 1 28 5 A 13 14 332906 CASAVA_Build 20 33449971 3D GGCCAAAGGT GGG/--- GGGGGGGGGG 1978 het 95 hom 11 2 6 3 G 16 13 332907 CASAVA_Build 20 33454285 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2464 het 1513 hom 20 6 8 6 A 17 16 332908 CASAVA_Build 20 33458669 1I GCAATAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 11 12 6 A 9 10 332909 CASAVA_Build 20 33461198 1D AATTTTTGTA T/- TTTTAGTAGA 1733 het 802 hom 7 3 4 0 T 5 4 332910 CASAVA_Build 20 33465687 2D TATATTCCAC AT/-- ATGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 AT 2 1 332911 CASAVA_Build 20 33469913 1I CTCTATGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2239 hom 25 6 12 7 A 10 11 332912 CASAVA_Build 20 33471882 13I GAATAGCACA -------------/TGAAAAGGCTTTG ATTCAAGAAT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 TGAAAAGGCTTTG 0 1 332913 CASAVA_Build 20 33609123 3I13M4I CCCAGGCCAC ---TAATTCAGGGCCC----/TAATAATTCAGGGCCCTGAG TGAGTGCATA 3070 het 3070 ref 25 14 10 6 N/A 0 0 332914 CASAVA_Build 20 33626820 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 31 1 21 9 T 12 11 332915 CASAVA_Build 20 33642077 1I AACACTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 11 12 332916 CASAVA_Build 20 33642824 1D ACCCACAATT A/- TTTTTTTGGA 3070 hom 76 het 27 0 24 3 A 1 0 332917 CASAVA_Build 20 33684895 1I GCATTAGCCT -/C CTTCAACTGG 3070 het 3070 ref 46 23 14 9 C 1 2 332918 CASAVA_Build 20 33781180 1D CTTGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 31 1 26 4 A 13 12 332919 CASAVA_Build 20 33781193 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 hom 25 het 34 1 30 3 C 1 0 332920 CASAVA_Build 20 33782832 2I CCACGGTGAC --/AA AGACTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 1 3 332921 CASAVA_Build 20 33783617 1D AATCATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 25 1 19 5 A 15 14 332922 CASAVA_Build 20 33787453 1D CCTGACACCT A/- AATTGGATAA 3070 hom 114 het 50 0 36 14 A 3 2 332923 CASAVA_Build 20 33830862 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 24 hom 31 1 18 12 T 13 12 332924 CASAVA_Build 20 33836845 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGTTTCAC 2573 het 1353 hom 10 3 6 1 G 4 5 332925 CASAVA_Build 20 33839219 1D GTTCAAGTGA T/- TCTCCTGCCT 3070 hom 28 het 11 0 8 4 T 2 1 332926 CASAVA_Build 20 33851756 3I AGCGAGACTC ---/CTT CTCAAAAAAC 3070 hom 42 het 15 0 14 1 CTT 0 1 332927 CASAVA_Build 20 33923229 1D TTTGTGAACT A/- AAAAAAAAAA 1697 het 1697 ref 32 24 4 4 A 13 12 332928 CASAVA_Build 20 33960620 1I AACAGCAATT -/A CTTTTGCACC 3070 hom 86 het 40 0 25 15 A 0 1 332929 CASAVA_Build 20 34018019 1I AACCAGACTT -/A ATGGGACAGT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 1 2 332930 CASAVA_Build 20 34044492 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2346 hom 23 7 10 6 A 10 9 332931 CASAVA_Build 20 34045739 3I TAATTTTGTG ---/TTT TTGCCATGTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 2 5 332932 CASAVA_Build 20 34088574 1I TGGGCGCAGT -/G GCTTATGCCT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 G 1 2 332933 CASAVA_Build 20 34107839 1I CTGGCTAATT -/A AAAAAAAAAA 1045 het 1045 ref 30 15 3 12 A 15 16 332934 CASAVA_Build 20 34127108 3I TTATAGAAAT ---/GAG GGGGGGGGGG 3070 het 56 hom 20 2 12 6 GAG 0 1 332935 CASAVA_Build 20 34155041 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1164 het 878 hom 22 6 3 13 T 17 16 332936 CASAVA_Build 20 34158984 1I TGGCCAGCAT -/G GTGAAACCCC 839 het 20 hom 5 0 3 2 G 1 2 332937 CASAVA_Build 20 34159032 1I CAGGCGTGGT -/G GCACGTGCCT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 G 1 2 332938 CASAVA_Build 20 34159836 1I CATGGGGAAA -/C CCTGTCTCTA 3070 hom 66 het 23 0 22 2 C 2 3 332939 CASAVA_Build 20 34172411 1I GTCTGACATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2486 hom 47 7 29 11 A 14 15 332940 CASAVA_Build 20 34180171 1I GAGGCAGCAG -/C CCAGACCTGG 3070 hom 66 het 30 0 20 10 C 2 3 332941 CASAVA_Build 20 34211926 1I ACTCCGTCAC -/A AAAAAAAAAA 1468 het 1468 ref 23 12 4 7 A 12 13 332942 CASAVA_Build 20 34315166 1I TTTCTTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 12 13 332943 CASAVA_Build 20 34328825 1I TCCCAGATTC -/T CCAAATGAGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 0 1 332944 CASAVA_Build 20 34414002 1D GAGGCCAGAG T/- TGGGGAAGGA 3070 het 3070 ref 31 12 11 9 T 2 1 332945 CASAVA_Build 20 34417116 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1303 het 1303 ref 28 15 3 10 T 15 14 332946 CASAVA_Build 20 34430479 2D GTCTGAGAGC TG/-- TGTCTGTGGG 3070 het 3070 ref 33 15 13 7 TG 2 1 332947 CASAVA_Build 20 34445889 1I AACTAGCTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 9 10 332948 CASAVA_Build 20 34458154 5D ACACACACAC GCACA/----- CACACACACA 1376 het 1376 ref 28 15 4 10 GCACA 1 0 332949 CASAVA_Build 20 34479589 1D GGGTTTTTTT G/- GTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 24 5 G 2 1 332950 CASAVA_Build 20 34480653 4I AAACAACTAG ----/TTGA TTGAATATCA 3070 hom 135 het 54 0 45 9 TTGA 1 2 332951 CASAVA_Build 20 34481834 1D GAGCTCACAT A/- ATGTGAAGCA 3070 hom 144 het 55 0 46 9 A 2 1 332952 CASAVA_Build 20 34492962 10D AGGGCCAGCA CAGGGTCCTC/---------- CCGTGGGAGG 3070 hom 57 het 18 0 16 6 CAGGGTCCTC 1 0 332953 CASAVA_Build 20 34509860 1D TAAGATGGTC A/- AAAAAAAAAA 1184 het 69 hom 9 1 6 2 A 15 14 332954 CASAVA_Build 20 34652357 20D TGGGGTCCTG AGACATAGTAAGTGCTTCAT/-------------------- AGCTGTTTGT 3070 hom 102 het 38 0 33 6 AGACATAGTAAGTGCTTCAT 1 0 332955 CASAVA_Build 20 34655098 4D CTTGGGTGGG TGGA/---- TCTAGCCAGG 3070 hom 111 het 41 0 36 7 TGGA 1 0 332956 CASAVA_Build 20 34681614 1D CACGTGGCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 T 9 8 332957 CASAVA_Build 20 34731197 1I CAGGCGCGTG -/C CACCACACGT 1406 hom 7 het 3 0 3 0 C 1 2 332958 CASAVA_Build 20 34749045 4D TGTTCCAGAC ACTT/---- ATGCCTTGAG 3070 het 3070 ref 59 31 24 8 ACTT 1 0 332959 CASAVA_Build 20 34829204 1D TCGGTTCAGG A/- AAAAAAAAAG 2811 het 2811 ref 28 17 7 4 A 10 9 332960 CASAVA_Build 20 34886478 1I TTTATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 10 11 332961 CASAVA_Build 20 34900792 1D GTCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 716 hom 30 2 19 9 A 12 11 332962 CASAVA_Build 20 34903281 2D CCATCTCTAC AA/-- AAGAGACATT 3070 hom 89 het 39 0 27 13 A 4 2 332963 CASAVA_Build 20 34944354 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 T 9 10 332964 CASAVA_Build 20 34956063 1I TGTGTTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 9 10 332965 CASAVA_Build 20 34958702 5I TTTCTACCCT -----/GGACA GACAGGTCTC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 GGACA 0 1 332966 CASAVA_Build 20 34965860 11I TGAGGGCACA -----------/GATGACTTCTT TCATCTTTCT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 GATGACTTCTT 0 1 332967 CASAVA_Build 20 34968614 1I ATCTGTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1103 hom 19 3 12 4 T 13 14 332968 CASAVA_Build 20 34970062 6D TTTCTCTATC ATTATT/------ ATTATTATTT 2242 het 2242 ref 24 14 7 4 ATT 5 3 332969 CASAVA_Build 20 34997389 1D TTATGTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 501 hom 29 5 11 13 T 17 16 332970 CASAVA_Build 20 34998788 2D TGAAATCCCG TC/-- TCTACTAAAA 3070 het 1328 hom 12 4 8 0 TC 2 1 332971 CASAVA_Build 20 35001416 4D CATCTCAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 28 12 13 7 AAAG 3 2 332972 CASAVA_Build 20 35004471 1D ATCTAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2508 hom 29 7 13 9 T 11 10 332973 CASAVA_Build 20 35036809 1I TATTACAATT -/A TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 42 24 12 6 A 0 1 332974 CASAVA_Build 20 35042762 1D TGGGACCACA G/- GCATGCACCG 1275 het 1275 ref 13 8 4 1 G 2 1 332975 CASAVA_Build 20 35049637 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 26 0 12 14 T 17 16 332976 CASAVA_Build 20 35063877 2I TTTTGAGACA --/GG GTCTCTCTCT 3070 hom 74 het 27 0 25 2 G 1 3 332977 CASAVA_Build 20 35071247 1I ATTAAAATTA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 7 8 332978 CASAVA_Build 20 35080674 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAACTGCTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AGG 0 1 332979 CASAVA_Build 20 35085762 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2562 het 1154 hom 15 5 7 3 T 13 12 332980 CASAVA_Build 20 35087344 1D CTCCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1274 het 1274 ref 32 26 3 3 A 11 10 332981 CASAVA_Build 20 35090490 2D AACATAACAC AA/-- AAGAGTTTCA 3070 het 3070 hom 27 12 12 6 A 4 2 332982 CASAVA_Build 20 35094836 1D GACTGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 23 1 9 13 T 17 16 332983 CASAVA_Build 20 35113026 1I TGAGATGGAG -/T TTCGCTCTTG 3070 hom 69 het 30 0 22 8 T 2 3 332984 CASAVA_Build 20 35150370 6I TTATCTATGT ------/TATATA TATAACTTAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 TA 2 5 332985 CASAVA_Build 20 35161787 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1176 het 1176 ref 31 14 4 13 A 17 16 332986 CASAVA_Build 20 35168181 4D TTCACAGAAC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 hom 46 het 31 1 26 4 ATTT 6 5 332987 CASAVA_Build 20 35169243 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 43 het 20 0 17 3 AC 8 7 332988 CASAVA_Build 20 35179855 1D TCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1636 het 1564 hom 16 5 7 4 A 17 16 332989 CASAVA_Build 20 35204671 1D GATAGGACTT A/- AAAAAAGGCC 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 A 7 6 332990 CASAVA_Build 20 35221028 2I GGTTAGAGGA --/AG AGTTTTCCCC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 AG 1 2 332991 CASAVA_Build 20 35225895 4D TTTCTCTCTC CTTT/---- CTTTTTCTTT 1286 het 650 hom 18 4 4 10 CTTT 2 1 332992 CASAVA_Build 20 35226726 3D AGAATCACGC ATG/--- ATATCCTCTT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 ATG 1 0 332993 CASAVA_Build 20 35227587 1I TGCCATAACA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 68 het 30 0 24 7 T 6 7 332994 CASAVA_Build 20 35234319 2D TTTACCATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1958 het 466 hom 26 7 8 11 T 16 14 332995 CASAVA_Build 20 35235348 4I ACTTCAGTGA ----/CTGT CTGTTTACTC 3070 hom 163 het 58 0 55 3 CTGT 1 2 332996 CASAVA_Build 20 35238874 1D TTTGCTATTG T/- TGGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 2 1 332997 CASAVA_Build 20 35243730 3I ATAAATAATG ---/TTC TTATTTCATG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 TTC 0 1 332998 CASAVA_Build 20 35246962 1D CGGGACAGTC T/- TTTTTTTTTT 2070 het 388 hom 36 4 9 23 T 17 16 332999 CASAVA_Build 20 35250599 1D ATGCCTAGCT A/- AATTTTTTTT 1632 het 1583 hom 28 9 10 9 A 3 2 333000 CASAVA_Build 20 35256073 6D TTGAGGGAAA TTGTTG/------ TTGTTGTTGT 3070 het 161 hom 39 3 13 24 TTG 8 6 333001 CASAVA_Build 20 35260443 2I ATTCCTGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 31 0 22 9 T 10 12 333002 CASAVA_Build 20 35271287 1I AGCTGAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 23 2 16 5 T 11 12 333003 CASAVA_Build 20 35274303 1D TTGTATAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2817 hom 27 11 9 7 T 15 14 333004 CASAVA_Build 20 35278757 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 9 10 333005 CASAVA_Build 20 35280155 1D CCTTGAGCCC A/- GGAGTTTGAG 3070 hom 51 het 23 0 17 6 A 1 0 333006 CASAVA_Build 20 35284215 1D ACCTTTACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 12 13 T 11 10 333007 CASAVA_Build 20 35285453 1I TTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2562 het 2562 ref 37 9 10 18 T 13 14 333008 CASAVA_Build 20 35290794 5I GAAGTATAAA -----/CTTAC CTTTGTGAGT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 CTTAC 0 1 333009 CASAVA_Build 20 35298776 1D GAAAATTATT A/- GCTTTATGAA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 A 1 0 333010 CASAVA_Build 20 35312490 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1501 hom 26 7 12 7 A 16 15 333011 CASAVA_Build 20 35328230 1D TGCTACGAAC T/- TTTTTTTTTT 2928 het 2133 hom 21 7 7 7 T 13 12 333012 CASAVA_Build 20 35331903 17D ACTGTGTGAT CCCCAAGCCCAGCCCTG/----------------- CCCCAAGCCC 3070 hom 82 het 39 0 22 22 CCCCAAGCCCAGCCCTG 2 1 333013 CASAVA_Build 20 35336712 1D ATCACACTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 10 9 333014 CASAVA_Build 20 35337899 1D ACTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 11 10 333015 CASAVA_Build 20 35337910 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATTG 3070 hom 25 het 28 1 22 5 T 1 0 333016 CASAVA_Build 20 35338701 1I GCCCAATGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2412 hom 23 6 12 5 T 9 10 333017 CASAVA_Build 20 35342714 1I TTTTGCTGCG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 8 9 333018 CASAVA_Build 20 35343261 1I ATATAAAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 33 hom 21 1 15 5 T 9 10 333019 CASAVA_Build 20 35366795 1I TAGGCCAGAG -/C CTGGAGGGGC 3070 hom 93 het 41 0 30 11 C 1 2 333020 CASAVA_Build 20 35367161 4I GGAGGCTGCT ----/CACC CACCTCCTGT 2713 het 2713 ref 30 17 9 4 CACC 1 2 333021 CASAVA_Build 20 35371671 1D ACCTCAGGAC A/- CAGACTCACA 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 1 0 333022 CASAVA_Build 20 35379827 10I CATAATGAAG ----------/GGCCAGTCTT GGCTAGATAC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 GGCCAGTCTT 0 1 333023 CASAVA_Build 20 35383945 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 2660 hom 17 6 9 2 T 9 8 333024 CASAVA_Build 20 35385781 1I AAAATAAAAG -/T TAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 T 1 2 333025 CASAVA_Build 20 35391493 2I ACCTGGACAC --/TT TATTGGCCCT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 1 3 333026 CASAVA_Build 20 35405826 1D GGGAAGCTGC A/- TCTGTGCTTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 1 0 333027 CASAVA_Build 20 35427309 1I ATATTAACAA -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 7 8 333028 CASAVA_Build 20 35427407 1D TTGCAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 1134 het 1134 ref 47 37 4 6 T 12 11 333029 CASAVA_Build 20 35434028 21I ATTTCACCAT ---------------------/GTCGCTTAGGCTAGTCTTGAA CTCCTGAGCT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 GTCGCTTAGGCTAGTCTTGAA 0 1 333030 CASAVA_Build 20 35435274 2I GCATATATGC --/GT ATATATACAC 1527 het 1527 ref 39 25 6 8 GT 0 1 333031 CASAVA_Build 20 35435849 1I AAAACTTGGG -/T TTTTTTTTTA 2345 het 2345 ref 32 20 7 5 T 9 10 333032 CASAVA_Build 20 35436389 5D AATAATACTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2907 het 1170 hom 30 9 10 11 T 21 16 333033 CASAVA_Build 20 35440805 1D TGTGCAGGGG T/- TGTCGCTGAG 1459 het 1220 hom 14 5 8 2 T 2 1 333034 CASAVA_Build 20 35444040 7I TAACGGCTGA -------/GGTGCAG GGTGACCTGT 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 GGTGCAG 0 1 333035 CASAVA_Build 20 35446987 17I GCGCATTCAG -----------------/AGACACACACAAGACAC AGACACACGC 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 AGACACACACAAGACAC 0 1 333036 CASAVA_Build 20 35467964 2D CAGGGGGCGG GT/-- GTGTGTGTGT 870 het 870 ref 39 18 3 18 GT 10 9 333037 CASAVA_Build 20 35480894 4I TGTATCTCTG ----/TGTC TGTCTGTGTG 3070 hom 159 het 64 0 53 11 TGTC 1 2 333038 CASAVA_Build 20 35482154 1I GGTGACCCGG -/C CCCTCTTTCC 3070 hom 53 het 21 0 16 5 C 3 4 333039 CASAVA_Build 20 35486389 7D ACAGAGGGAG CCAGGAA/------- GGAGAAGGAG 1105 het 235 hom 24 4 6 19 CCAGGAA 1 0 333040 CASAVA_Build 20 35488008 1D CTCTTCCAGT G/- GCCTGCCGCC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 2 1 333041 CASAVA_Build 20 35489887 1I TGCAGCTATG -/A TCACATCTTT 3070 hom 102 het 46 0 34 12 A 0 1 333042 CASAVA_Build 20 35499469 1D CCAAGGCTGA C/- CCCTGGCCAG 3070 hom 37 het 15 0 11 4 C 4 3 333043 CASAVA_Build 20 35505522 1I TCCTGCCCTG -/C CCCCCCACCA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 C 6 7 333044 CASAVA_Build 20 35518799 1I CTCTATGTTA -/T TTGCTCCCTT 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 T 2 3 333045 CASAVA_Build 20 35524813 2D GATGTGAGAT AA/-- GAGTTAAGCC 3070 het 3070 hom 45 21 22 3 A 2 0 333046 CASAVA_Build 20 35538104 1I GGTTTTACCC -/T TTTTATTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 4 5 333047 CASAVA_Build 20 35542644 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 63 hom 16 1 11 4 T 13 12 333048 CASAVA_Build 20 35570719 1I CAGGGAGGTG -/T TTTAAGGGAT 3070 hom 132 het 49 0 41 8 T 3 4 333049 CASAVA_Build 20 35592477 1D TGCAGTTCCC T/- TTGGGTTTCA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 3 2 333050 CASAVA_Build 20 35594249 1D TGATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1299 het 1299 ref 26 17 4 5 T 12 11 333051 CASAVA_Build 20 35595066 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 823 hom 28 2 15 11 A 14 15 333052 CASAVA_Build 20 35597741 2D GGGAAGAATC AG/-- GGGAGAAGTA 3070 het 3070 hom 49 20 20 12 AG 1 0 333053 CASAVA_Build 20 35600972 1D GTAACAGGAC A/- AACCACACTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 3 2 333054 CASAVA_Build 20 35615637 1I TCAATGAAAC -/A AAAAAGTTGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 5 6 333055 CASAVA_Build 20 35630985 4I AGGAGAGGAA ----/GAGG GAGAGCAGTT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 GAGG 0 1 333056 CASAVA_Build 20 35635781 7I CGTCCAGGCA -------/GGAGGAG GGTGGTGCGG 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 GGAGGAG 0 1 333057 CASAVA_Build 20 35636240 1I GGCAGGCTGG -/A GGAGTCAGGA 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 0 1 333058 CASAVA_Build 20 35683948 1D TTTCTTCCTT C/- TTCCCTCCCT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 C 1 0 333059 CASAVA_Build 20 35689561 1D CCATTCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 48 1 35 12 T 11 10 333060 CASAVA_Build 20 35694569 1I GTTGCAAGGA -/G GCAAGGAGAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 1 2 333061 CASAVA_Build 20 35699400 15D CAATCCTTAT TTTTATTTTATTTTA/--------------- TTTTATTTTA 1444 het 1444 ref 10 3 4 3 TTTTA 7 4 333062 CASAVA_Build 20 35705627 1D ACAGGAGTGA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 8 7 333063 CASAVA_Build 20 35715102 1I GTCTAGAGAT -/G GGGGTCTTGC 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 G 4 5 333064 CASAVA_Build 20 35716845 1D GACACGTCCT G/- GAGACATTTT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 G 2 1 333065 CASAVA_Build 20 35729747 1I CCCCCAACCC -/T TTTTTTTTTT 2329 het 2329 ref 27 10 11 6 T 11 12 333066 CASAVA_Build 20 35736645 3I TGCTCTTCTC ---/ATA ATAATGAGTG 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 ATA 1 2 333067 CASAVA_Build 20 35758427 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTGTATTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 5 4 333068 CASAVA_Build 20 35775888 1I GAAGTACTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 10 11 333069 CASAVA_Build 20 35787413 1I CTGCGCCCAG -/C CCGCCTCTTT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 C 2 3 333070 CASAVA_Build 20 35791294 1I ATAGCTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 11 12 333071 CASAVA_Build 20 35841884 1D CAAGGGACTT A/- AAAAAAAAAA 1236 het 1236 ref 34 26 3 5 A 11 10 333072 CASAVA_Build 20 35854487 1I GCAAAACTGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 8 9 333073 CASAVA_Build 20 35856952 1D TCAGTTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 17 16 333074 CASAVA_Build 20 35857721 3D AGATGTTGAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 37 4 17 16 T 17 14 333075 CASAVA_Build 20 35891945 1I CCAACTGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 10 11 333076 CASAVA_Build 20 35893184 8D TTTTCTTTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 26 0 20 7 T 16 8 333077 CASAVA_Build 20 35894607 2D TGGACCATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 52 0 33 19 T 15 13 333078 CASAVA_Build 20 35899486 1I AAGTGCAAAA -/G GTATTTGAAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 G 1 2 333079 CASAVA_Build 20 35899748 2I AATAAACAAA --/TG ATACAGTATT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TG 0 1 333080 CASAVA_Build 20 35912012 2I TGAGCAGTCT --/GG GTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 G 1 3 333081 CASAVA_Build 20 35912386 36I TGCCATCAGT ------------------------------------/TAGCAGTGCATTTTTGAAAGAATTTTCTTTTACTGA TTCTTCAGCC 3070 hom 102 het 33 0 34 6 TAGCAGTGCATTTTTGAAAGAATTTTCTTTTACTGA 0 1 333082 CASAVA_Build 20 35920418 1D GATTGGGGTT G/- GGGGATGGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 5 4 333083 CASAVA_Build 20 35921923 4D TAGGTGGACT CTCA/---- CTCAGGGAAA 3070 hom 96 het 38 0 30 10 CTCA 2 1 333084 CASAVA_Build 20 35923944 4I TGATGGACAC ----/ACTT AGCCCCACTC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 ACTT 0 1 333085 CASAVA_Build 20 35926648 4I TGTAGGCTTC ----/TTTG TTCTATTCCA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 TTTG 0 1 333086 CASAVA_Build 20 35930110 1D TTTAGGGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 31 1 21 9 T 12 11 333087 CASAVA_Build 20 35936268 8D GTTGTGTGGT TTAATGAA/-------- TTCACAAAAA 3070 het 3070 hom 48 19 16 14 TTAATGAA 1 0 333088 CASAVA_Build 20 35940420 1D44M1I CGGGGAATGA GGGGGCCTATGCAGAGGCACAAGTGCAAAGGTCCTGAGCTGAGGC-/-GGGGCCTATGCAGAGGCACAAGTGCAAAGGTCCTGAGCTGAGGCA AGAGCATCGT 3070 het 3070 ref 41 21 19 15 N/A 0 0 333089 CASAVA_Build 20 35948470 2D GGATGGGGCT CC/-- CCCCGGGTGG 1635 het 1635 ref 23 14 6 3 C 6 4 333090 CASAVA_Build 20 35954749 6D GCCCCAGAGG GTCCAC/------ GTCCACCAAG 3070 hom 57 het 21 0 16 7 GTCCAC 2 1 333091 CASAVA_Build 20 35962307 1I CATCAGAGGG -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 7 8 333092 CASAVA_Build 20 35986254 1D CTGTAATCCC A/- AGCTACTCGA 3070 het 2333 hom 15 6 9 0 A 2 1 333093 CASAVA_Build 20 36040423 1D CTCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2997 hom 32 het 12 0 9 4 A 11 10 333094 CASAVA_Build 20 36041240 1I TGCCAAGGTA -/T TTTTTTTTTT 2569 het 2569 ref 39 17 7 15 T 11 12 333095 CASAVA_Build 20 36042183 1D TCTAATGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1903 hom 41 9 22 10 T 14 13 333096 CASAVA_Build 20 36060067 4D TCTTTGGCAC ACAT/---- ACATACACAC 3070 het 2547 hom 26 10 15 3 ACAT 2 1 333097 CASAVA_Build 20 36071907 2D CATTACTTAG CA/-- CAGTGTCTGA 3070 het 3070 hom 56 22 26 9 CA 2 1 333098 CASAVA_Build 20 36072454 1D GTCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1271 het 960 hom 11 5 4 2 T 13 12 333099 CASAVA_Build 20 36102064 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 22 7 T 12 11 333100 CASAVA_Build 20 36102970 2D ACATTGGATT AA/-- AAGTTTTATA 3070 het 3070 hom 46 21 24 1 A 4 2 333101 CASAVA_Build 20 36103837 2I GCCCTGACAC --/AG AGTAGGCGTT 3070 het 3070 hom 46 14 27 5 AG 1 2 333102 CASAVA_Build 20 36104401 3I TCTGTTTGCA ---/TTC TTCTGGTTCT 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 TTC 1 2 333103 CASAVA_Build 20 36104694 1I AAAAAAACTC -/T TCAAGTCAGA 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 1 2 333104 CASAVA_Build 20 36109349 2D CTCACAAAAC AG/-- AAGATTTCAT 3070 het 3070 ref 70 36 29 6 AG 1 0 333105 CASAVA_Build 20 36131830 1I GAGAAAAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 T 9 10 333106 CASAVA_Build 20 36131881 3I ATTTAATGAT ---/TGG TGGTTGTAAA 3070 het 2916 hom 36 7 15 14 TGG 1 2 333107 CASAVA_Build 20 36153146 4I CATTGAAACA ----/TAGG TAACCTATGT 3070 het 3070 ref 45 26 18 1 TAGG 0 1 333108 CASAVA_Build 20 36183212 1I GTCTAGCATC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 17 0 12 5 T 9 10 333109 CASAVA_Build 20 36210492 2D CTCCCATCCC CT/-- TTTTGACCTC 3070 het 2779 hom 24 9 13 2 CT 1 0 333110 CASAVA_Build 20 36221339 4D AAGTTTTAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AAAG 5 4 333111 CASAVA_Build 20 36225071 2I GCAAGACAGA --/CT CTCTGAGTGT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 CT 2 3 333112 CASAVA_Build 20 36249246 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 11 10 333113 CASAVA_Build 20 36261288 6D TACTAAAAAT AAAAAG/------ ATTAGCCAGG 2150 het 1457 hom 9 4 5 1 AAAAAG 1 0 333114 CASAVA_Build 20 36268289 1I TTTGGCCTTC -/T TTTCCAAGAT 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 3 4 333115 CASAVA_Build 20 36272065 5D TCTGGGGGAG GCCAT/----- GCCATGCCAT 3070 het 3070 ref 29 11 11 9 GCCAT 3 2 333116 CASAVA_Build 20 36296931 1I ATTAAAAGCA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 6 7 333117 CASAVA_Build 20 36311545 8I ACACTGAGGT --------/GGAGGGAG GGAGGGAGGG 3070 hom 33 het 15 0 11 4 GGAG 2 4 333118 CASAVA_Build 20 36321412 1D AGATGCATTT G/- CTGTGAGTGA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 0 333119 CASAVA_Build 20 36351978 10I2M3I AAAAGAGGGA ----------CA---/TGATATATACCAAAC TGCAAGCAGT 3070 het 3070 hom 47 16 27 5 N/A 0 0 333120 CASAVA_Build 20 36359275 2D ATTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1417 het 504 hom 15 2 4 9 A 18 16 333121 CASAVA_Build 20 36361410 14D TCTGATTCTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTGA 3070 het 2633 hom 28 10 13 11 T 22 8 333122 CASAVA_Build 20 36374590 1I AAATACAGAT -/A GGGGGGCATC 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 0 1 333123 CASAVA_Build 20 36377652 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1557 hom 28 8 10 10 T 14 13 333124 CASAVA_Build 20 36381680 1I GACAAAAAGT -/G GCTCAGAGAA 3070 het 3070 ref 58 31 23 4 G 1 2 333125 CASAVA_Build 20 36387095 1I TGGTCAAGGA -/G CGCCTCTGTC 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 G 0 1 333126 CASAVA_Build 20 36437253 1I GTTTTAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2922 hom 24 8 13 3 T 10 11 333127 CASAVA_Build 20 36441853 1I CAAACACTGC -/G GAAGGCCGCA 1059 het 1059 ref 13 8 3 2 G 1 2 333128 CASAVA_Build 20 36442822 1I GAGGGAGACC -/T TTGAGTCTGC 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 T 2 3 333129 CASAVA_Build 20 36470399 1D AATAAATACT A/- AAAAAAAAAA 510 hom 7 het 3 0 3 0 A 15 14 333130 CASAVA_Build 20 36537598 1I ACAATAAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 T 9 10 333131 CASAVA_Build 20 36549497 3D CTGAACTTAA ATC/--- ATTATGGGTT 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 ATC 1 0 333132 CASAVA_Build 20 36553391 1D ACTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 T 11 10 333133 CASAVA_Build 20 36566834 2D ACATGAACAG AC/-- ACTTATCAAA 3070 het 3070 hom 45 19 20 8 AC 2 1 333134 CASAVA_Build 20 36644869 1D GATATCATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 10 9 333135 CASAVA_Build 20 36659076 1I GAGGAAATTG -/T TGGGTAGGTG 2717 het 2717 ref 25 16 6 3 T 1 2 333136 CASAVA_Build 20 36663324 1I CCTGGGTTTT -/C CCCCTTACCC 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 C 4 5 333137 CASAVA_Build 20 36664465 2I CTCTGGGTGT --/AG AGAGTCTTAG 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 AG 2 3 333138 CASAVA_Build 20 36686706 1D CAAGTCCTTT G/- GTTCTCTCTG 3070 het 3070 hom 49 20 23 7 G 2 1 333139 CASAVA_Build 20 36704772 16D TCTCCATTCA TCCATCCATCCATCCT/---------------- TCCATCCATC 3070 het 3070 ref 45 25 18 10 TCCATCCATCCATCCT 1 0 333140 CASAVA_Build 20 36705203 2D ACTCTGACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2373 hom 30 9 13 10 A 13 11 333141 CASAVA_Build 20 36707974 1I TCCCGTGTCC -/A AACAAATGCA 3070 het 3070 hom 35 9 16 10 A 2 3 333142 CASAVA_Build 20 36713900 6D GTGATGATGG TGATGA/------ TGATGATGGT 1214 het 1214 ref 93 69 11 20 TGA 4 2 333143 CASAVA_Build 20 36715131 3I GGTGATGGAA ---/ATG ATGATGATGT 3070 het 3070 ref 103 63 17 28 ATG 3 4 333144 CASAVA_Build 20 36736865 4I TGAATTGTGC ----/TCAG TCAGACTCCC 3070 hom 53 het 22 0 17 5 TCAG 1 2 333145 CASAVA_Build 20 36739660 10D CAAAGAAAAG TGGACTGATT/---------- TGAATGCCTC 3070 het 3070 ref 39 23 15 4 TGGACTGATT 1 0 333146 CASAVA_Build 20 36741727 4I34M1I AGTCTCTGTG ----TTTAATTATGGAATTCCCCACACCTCTTTCAACC-/TTTATTTAATTATGGAATTCCCCACACCTCTTTCAACCT TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 34 25 14 11 N/A 0 0 333147 CASAVA_Build 20 36743207 1I TGCAATTCGC -/A GGAGGTGTGT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 A 0 1 333148 CASAVA_Build 20 36744699 1D GGATCTGAAG T/- TCTTTTGGAT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 T 2 1 333149 CASAVA_Build 20 36746470 1D TCTAATAGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 10 9 333150 CASAVA_Build 20 36749243 1I TCTTTGTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 T 8 9 333151 CASAVA_Build 20 36751504 1I TCAGAACAAT -/G AGGTAAATAC 3070 het 3070 ref 57 26 25 6 G 0 1 333152 CASAVA_Build 20 36794412 1I GTCTACCTGT -/A AAAAAAAAAA 2429 het 2429 ref 25 13 7 5 A 10 11 333153 CASAVA_Build 20 36801742 1D TTCAAATTCC T/- TTTTTTTTTT 2016 het 176 hom 27 1 8 18 T 16 15 333154 CASAVA_Build 20 36813193 1D6M2D GTTTCTCACA TTGGCACAA/-TGGCAC-- AGAGACCCAC 3070 het 3070 ref 50 26 20 7 N/A 0 0 333155 CASAVA_Build 20 36814977 1I AAACTGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 13 7 T 10 11 333156 CASAVA_Build 20 36823670 2I TAAGCTGGTG --/TC TCTTTCTGTC 3070 het 3070 hom 46 15 21 10 TC 1 2 333157 CASAVA_Build 20 36828210 1D ACTATTGGGA T/- TAAGAAACGC 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 T 2 1 333158 CASAVA_Build 20 36832980 7I GGAGGTGAGA -------/GGGAGGT GGGAGGTAGG 3070 het 3070 hom 39 18 14 7 GGGAGGT 1 2 333159 CASAVA_Build 20 36834815 1D GAAGAAAGAT A/- AGACTGGAGG 3070 het 3070 ref 24 11 11 5 A 2 1 333160 CASAVA_Build 20 36835083 1I CTCATACAGT -/C CTACCAAGGG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 C 1 2 333161 CASAVA_Build 20 36841580 2D GTCTTGGGAG GC/-- GGGGGGGGGG 3070 het 220 hom 25 4 13 8 GC 1 0 333162 CASAVA_Build 20 36843513 2I TCTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3045 het 2137 hom 30 8 12 10 T 14 16 333163 CASAVA_Build 20 36845282 2I TTTATGGAGG --/GA GAGAGAGAGT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 GA 4 5 333164 CASAVA_Build 20 36845874 3D TGCGTAGTGA GCT/--- GCTGCTTAAA 2132 het 2132 ref 26 15 10 1 GCT 3 2 333165 CASAVA_Build 20 36846742 1D TTGAGATAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 10 9 333166 CASAVA_Build 20 36847081 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2982 het 2982 ref 29 18 8 3 A 12 11 333167 CASAVA_Build 20 36859070 3D ACTATAAAAA ATG/--- ATATTAACTT 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 ATG 1 0 333168 CASAVA_Build 20 36859279 1D TCGCGTTTAA G/- GCAGAGACCA 3070 het 3070 ref 48 26 15 8 G 2 1 333169 CASAVA_Build 20 36861834 4D CCAGCAAGAC TGTT/---- TGAGCTCAGG 3070 het 3070 ref 39 26 11 2 TGTT 1 0 333170 CASAVA_Build 20 36863140 1D ATAGTTTAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 10 9 333171 CASAVA_Build 20 36865001 6D TCAAAAAAAC AAAACA/------ AAACAAACCC 43 het 23 hom 30 1 1 31 AAAACA 1 0 333172 CASAVA_Build 20 36870677 1D AGCTCTGTGA C/- CCTGTATACA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 C 3 2 333173 CASAVA_Build 20 36871109 4I AAGAAAAAAA ----/AAAG AAAGTGCTCA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 AAAG 1 2 333174 CASAVA_Build 20 36873219 1D TTGATGTGGC A/- AGATGGTGGC 3070 hom 93 het 39 0 30 9 A 2 1 333175 CASAVA_Build 20 36889850 1D TTTATGCTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 10 9 333176 CASAVA_Build 20 36898417 1I CTTAGACTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 8 9 333177 CASAVA_Build 20 36901745 1D TGCAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 47 1 39 7 T 11 10 333178 CASAVA_Build 20 36904888 1D TCTAATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2642 hom 22 8 8 6 A 13 12 333179 CASAVA_Build 20 36931213 1I AGCCATTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 9 10 333180 CASAVA_Build 20 36938598 1I TTCAACCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 37 0 28 9 A 10 11 333181 CASAVA_Build 20 36954134 1D CTCTTTGTCC A/- AGGTCAAGCA 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 A 2 1 333182 CASAVA_Build 20 36966151 2D AGCTCTCACA TC/-- TGTTTTATGC 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 TC 1 0 333183 CASAVA_Build 20 36999409 1D CACATTATTG C/- CTCCAGGAGT 3070 het 3070 ref 57 31 24 4 C 2 1 333184 CASAVA_Build 20 37027158 8D AGGCATCAGT GTTTTTTA/-------- AAGTCTCTAA 3070 het 3070 ref 31 19 14 2 GTTTTTTA 1 0 333185 CASAVA_Build 20 37029195 1D GGTCTACGGA C/- CCCCCCGAAT 3070 hom 14 het 34 0 19 16 C 7 6 333186 CASAVA_Build 20 37034391 1I AAGTGAAAAT -/C GTAAAGGGCG 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 C 0 1 333187 CASAVA_Build 20 37038185 1D ACAAAGGTAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 T 9 8 333188 CASAVA_Build 20 37041885 1D ACCTAGATGA T/- TTTTTTTTTT 3051 het 2324 hom 36 6 9 22 T 14 13 333189 CASAVA_Build 20 37041912 1D AGAGTTCTGT A/- AAAAAAAAAA 1943 het 1943 ref 25 7 7 11 A 12 11 333190 CASAVA_Build 20 37044239 4D TGAGCCTTTC TTTA/---- TTTATAACTT 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 TTTA 2 1 333191 CASAVA_Build 20 37048246 1D TGCTCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1706 hom 29 7 16 6 T 16 15 333192 CASAVA_Build 20 37051159 1I TTTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 1715 het 538 hom 24 7 12 5 C 0 1 333193 CASAVA_Build 20 37055743 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1941 het 1847 hom 25 10 8 7 T 15 16 333194 CASAVA_Build 20 37065236 1D AGGTCCATGT C/- CTGCACACAT 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 C 2 1 333195 CASAVA_Build 20 37067112 2D TAATAATAAC TT/-- TCAGATAGGT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 3 1 333196 CASAVA_Build 20 37079423 1D TTCCACCCCC T/- TCTTCTCAAG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 2 1 333197 CASAVA_Build 20 37104690 1I GTTTAATCTG -/T TTTTTTTTTT 1356 het 1356 ref 34 24 3 7 T 11 12 333198 CASAVA_Build 20 37111313 1D GCTACCTGAT A/- ACCAGGATGC 2662 het 2662 ref 33 13 10 10 A 2 1 333199 CASAVA_Build 20 37112193 2D CCCTGCGCCC AA/-- AGCAAGGTCG 2666 het 2158 hom 26 10 10 6 A 3 1 333200 CASAVA_Build 20 37127640 1D ACTCCGTATC G/- GGGGGGGAAA 3070 het 2268 hom 22 6 9 8 G 8 7 333201 CASAVA_Build 20 37141451 1I ATTACAGGCG -/T TGAGTCACCA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 T 1 2 333202 CASAVA_Build 20 37144148 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 9 10 333203 CASAVA_Build 20 37165324 3D TATATTGTGG AGA/--- AGATGTTAGA 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 AGA 2 1 333204 CASAVA_Build 20 37173781 14D GGAGGGGAAA GGGAGGAGGAAAAG/-------------- GGGAGGAGGA 2589 het 842 hom 14 4 6 6 GGGAGGAGGAAAAG 1 0 333205 CASAVA_Build 20 37202748 6D TGTCTTTTCT CCTTTC/------ CCTTTCCCTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 CCTTTC 4 3 333206 CASAVA_Build 20 37212221 9D TCCCAAGTTG CTGGGGTTA/--------- CAGGTGCACA 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 CTGGGGTTA 1 0 333207 CASAVA_Build 20 37214142 1D TGGAGGGCCT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 104 hom 27 1 11 16 G 13 12 333208 CASAVA_Build 20 37214303 3D4M19D TCAGGGCCAA CAGAGCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/---ATCC------------------- TGACCAAGAG 3070 het 3070 ref 38 30 7 5 N/A 0 0 333209 CASAVA_Build 20 37233301 2D CTCTAATAAC AG/-- AGTGAGTAGA 3070 het 3070 hom 63 24 33 8 AG 2 1 333210 CASAVA_Build 20 37242151 3I TTGAACACAC ---/AAT GAGATATCAC 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 AAT 0 1 333211 CASAVA_Build 20 37258123 1I TGGAGATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 15 10 15 T 13 14 333212 CASAVA_Build 20 37258493 1I TGAGGATCCA -/C TTGCAAAGTG 3070 het 3070 hom 70 28 37 5 C 0 1 333213 CASAVA_Build 20 37260160 1I GTTGAAGACA -/T CATCTTTGTC 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 T 0 1 333214 CASAVA_Build 20 37261337 11I TCAAGGGAGG -----------/GGGCCACAGAC CCCCCTCTTG 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 GGGCCACAGAC 0 1 333215 CASAVA_Build 20 37264137 2D CTAGGGAAAC AT/-- AGTATAAAGA 3070 het 3070 ref 39 21 16 3 AT 1 0 333216 CASAVA_Build 20 37275285 1D TCATTTCCTG T/- TTTCATCTCA 3070 het 3070 hom 51 14 30 8 T 4 3 333217 CASAVA_Build 20 37279396 1I TATACATTTA -/T TTTTGTATCT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 4 5 333218 CASAVA_Build 20 37289283 1D TTTTACCAGG A/- AAACCCCCAT 3070 het 3070 ref 55 27 20 9 A 4 3 333219 CASAVA_Build 20 37298580 4I ATTCCTATGC ----/CTAT CTATCCTTCT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 CTAT 1 2 333220 CASAVA_Build 20 37307316 3I GGCACTTAGT ---/GAG GAGTCCATAA 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 GAG 1 2 333221 CASAVA_Build 20 37320113 1I CTCCCCTCTT -/C CCCCCTCCCC 1714 het 1714 ref 22 8 7 7 C 5 6 333222 CASAVA_Build 20 37322357 1I TCCCTTTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 A 10 11 333223 CASAVA_Build 20 37324828 1D ATTCAGCCAT A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 A 7 6 333224 CASAVA_Build 20 37415624 2D AAAAACAAAC AT/-- GTGGACCAAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 1 0 333225 CASAVA_Build 20 37447055 1I AAGAAGACTG -/T TTTTTTTTTT 1225 het 1225 ref 38 31 4 3 T 10 11 333226 CASAVA_Build 20 37556435 1D GTTCAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 40 1 29 11 A 11 10 333227 CASAVA_Build 20 37596573 1I ATGTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 G 0 1 333228 CASAVA_Build 20 37600782 4D AATTAGATAG TAGA/---- TAAAGTGTGC 3070 het 3070 ref 40 19 17 7 TAGA 1 0 333229 CASAVA_Build 20 37659411 1I CCTCAGAGGC -/A TGAGCCATGA 3070 hom 141 het 49 0 46 3 A 0 1 333230 CASAVA_Build 20 37667544 1D55M7D TTAGACTTTT ATTTATTGGATTAATCTCTGATTTATCATTCAGTGTACTTTTCTGTCTGCTATGGAAATGATG/-TTTATTGGATTAATCTCTGATTTATCATTCAGTGTACTTTTCTGTCTGCTATGGA------- AATGATGTCA 3070 het 3070 ref 32 23 20 2 N/A 0 0 333231 CASAVA_Build 20 37689049 1D CTGTTTCCTG T/- TTCTGTCAGA 3070 hom 99 het 39 0 30 11 T 3 2 333232 CASAVA_Build 20 37690357 2I ACGTGATCAC --/TA TATATATATA 3070 het 712 hom 37 2 22 13 TA 6 7 333233 CASAVA_Build 20 37716969 1D ACAACATGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 10 9 333234 CASAVA_Build 20 37721502 8D GTTGAACATT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 3070 hom 83 het 38 0 27 12 TC 12 8 333235 CASAVA_Build 20 37736499 1D GAGACTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 43 0 38 6 A 16 15 333236 CASAVA_Build 20 37761395 1D AAACTCTCAC A/- AGCTGGCATT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 2 1 333237 CASAVA_Build 20 37772062 1D TAGAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 33 1 29 5 A 12 11 333238 CASAVA_Build 20 37772564 13D CGGTTAAAAA TGATGTACACTTC/------------- TGAAGAATGG 3070 hom 144 het 50 0 49 4 TGATGTACACTTC 1 0 333239 CASAVA_Build 20 37774049 1I ATGTACCACC -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 7 8 333240 CASAVA_Build 20 37774122 1I ACAGTGCTGC -/A GCACACATAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 1 333241 CASAVA_Build 20 37797832 1I TCTGTCCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 10 11 333242 CASAVA_Build 20 37806227 5D GAGCTTTTTA AATTT/----- AAGTTTGTTG 3070 het 3070 hom 41 12 24 8 AATTT 1 0 333243 CASAVA_Build 20 37813349 1D ATTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 A 12 11 333244 CASAVA_Build 20 37818711 2D TCCACTTTTA CT/-- CTGTTCTGCG 3070 het 3070 hom 53 24 24 7 CT 2 1 333245 CASAVA_Build 20 37820663 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2889 hom 32 10 18 4 T 11 12 333246 CASAVA_Build 20 37823636 2D GTCACAATGT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 GA 7 6 333247 CASAVA_Build 20 37826448 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 8 7 4 A 13 14 333248 CASAVA_Build 20 37831004 1D TTTATTTTTA T/- TTTATTTTAT 3070 het 1302 hom 15 4 10 1 T 4 3 333249 CASAVA_Build 20 37849646 4D TGTTTCCAGC TGAT/---- TGATTGATAG 3070 het 3070 ref 54 24 23 9 TGAT 3 2 333250 CASAVA_Build 20 37853820 1I AATCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 10 11 333251 CASAVA_Build 20 37856689 4D GAGATGGAGG TGTT/---- TGTTAAATAC 3070 het 3070 hom 32 11 16 6 TGTT 2 1 333252 CASAVA_Build 20 37872945 10D AGAAAAAGAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 31 16 10 8 AAAAG 4 2 333253 CASAVA_Build 20 37879795 4I CTTATTGACT ----/ATCA ATCACAAGAA 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 ATCA 1 2 333254 CASAVA_Build 20 37883312 1I CTCAAAAATG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 A 8 9 333255 CASAVA_Build 20 37897163 2D TCAGAAAACA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2271 hom 20 5 10 6 AT 9 8 333256 CASAVA_Build 20 37913517 1D GATTTAGCTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 43 hom 34 2 17 15 A 10 9 333257 CASAVA_Build 20 37913744 1I AAGTCACCCC -/A TCTTGGCCTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 0 1 333258 CASAVA_Build 20 37924210 4D GGTGTTATCT AGAG/---- AAAGTGTCTA 3070 het 3070 hom 42 15 22 7 AG 2 0 333259 CASAVA_Build 20 37934128 5I GGCTCTGGGG -----/TTAGA TAGGCTGTGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTAGA 0 1 333260 CASAVA_Build 20 37936494 2D AATGGAAGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 35 0 25 12 T 14 12 333261 CASAVA_Build 20 37946592 1I CCATTTTCTA -/T TCCCTTTTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 333262 CASAVA_Build 20 37956167 1I ATCGAGATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 40 0 32 8 T 8 9 333263 CASAVA_Build 20 37958583 2D TTTTAATAAC AG/-- ATAATTAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 AG 1 0 333264 CASAVA_Build 20 37962348 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 T 12 13 333265 CASAVA_Build 20 37972422 1I GGGAGTAGAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 A 9 10 333266 CASAVA_Build 20 37974952 2I GTGAATATGT --/TG TGTGTTTCTG 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 TG 2 3 333267 CASAVA_Build 20 37977616 1D CCTTGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3060 het 3060 ref 36 22 9 5 A 11 10 333268 CASAVA_Build 20 37979559 1I TTTCAAAGTT -/C TTTTTCCTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 0 1 333269 CASAVA_Build 20 37986740 1I ACAGTTATTA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 T 7 8 333270 CASAVA_Build 20 37986908 1I CAGTACTTGA -/C TTTTGGTATC 3070 het 3070 hom 49 18 18 13 C 0 1 333271 CASAVA_Build 20 37988934 2I AAGAGGAAAC --/AT GTGTAGCAAG 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 AT 0 1 333272 CASAVA_Build 20 38008317 2D TGTGCGTGCA TG/-- TGTGTGTGGA 3070 hom 186 het 66 0 62 4 TG 5 4 333273 CASAVA_Build 20 38009152 2D TTCCTTTAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 26 3 11 13 A 12 10 333274 CASAVA_Build 20 38009641 1I AGAACTCAGA -/T TTCCTCGGGG 3070 hom 156 het 56 0 52 4 T 2 3 333275 CASAVA_Build 20 38012225 1D GGGAGACTGA G/- GGGGGGGGCA 2480 het 1976 hom 19 8 6 5 G 9 8 333276 CASAVA_Build 20 38012786 1D GAGAATTCAT A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 117 het 50 0 40 11 A 8 7 333277 CASAVA_Build 20 38015325 2D AAAACGGAGA CT/-- CTCTATATAA 3070 het 1951 hom 28 6 20 3 CT 3 2 333278 CASAVA_Build 20 38024040 3I AAAACAAAAC ---/ACA ACAACACAGA 3070 hom 77 het 32 0 24 8 ACA 2 3 333279 CASAVA_Build 20 38049392 2I ATGGACAGAC --/AT GTGATAAAAC 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 AT 0 1 333280 CASAVA_Build 20 38051974 2I GTTGTTTTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 12 14 333281 CASAVA_Build 20 38054857 1I AAGAAAAACC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 8 9 333282 CASAVA_Build 20 38054958 2I TCAAGATCAT --/CA TATATAAAGC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CA 0 1 333283 CASAVA_Build 20 38062887 1D GAGTTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 14 7 T 12 11 333284 CASAVA_Build 20 38074236 2D TCCCCCCCGC TT/-- TTTTTTTTTT 2850 het 1710 hom 30 11 10 9 T 12 10 333285 CASAVA_Build 20 38083285 2D TCCCATCTAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 AT 7 6 333286 CASAVA_Build 20 38097580 1I ATTTAATAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 A 11 12 333287 CASAVA_Build 20 38102878 4I TTACATGTAG ----/TCTC TCTGTCTCTC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 TC 1 3 333288 CASAVA_Build 20 38105647 1D TCCTTTCTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 T 10 9 333289 CASAVA_Build 20 38105852 2I GTTAAACTAC --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 A 8 10 333290 CASAVA_Build 20 38106870 3D AAAAATTTAA TTT/--- TTTAATTGTA 1400 het 868 hom 5 2 3 0 T 6 3 333291 CASAVA_Build 20 38117960 1I CTCAGCAGAA -/G GCCCAGCCAA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 G 1 2 333292 CASAVA_Build 20 38119862 1D ATAACCAGAA T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 7 6 333293 CASAVA_Build 20 38139667 1I CATTATAGAC -/A AACTCCTCCC 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 A 2 3 333294 CASAVA_Build 20 38140728 1I TTTTTGTTTG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 7 8 333295 CASAVA_Build 20 38142527 8I CAGCTATAGT --------/GAAGATGA GAAGATAGAT 3070 het 3070 hom 55 22 24 9 GAAGATGA 0 1 333296 CASAVA_Build 20 38146837 1D TGAGCTGAGA T/- TCGTGCCACT 3070 het 3070 ref 23 13 10 1 T 2 1 333297 CASAVA_Build 20 38148492 5D GATTCACCCT CTTTA/----- CTTTTCATTT 3070 het 3070 hom 37 10 24 5 CTTTA 1 0 333298 CASAVA_Build 20 38154022 1I CTTTGAGGCC -/T TTTGCCCATT 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 3 4 333299 CASAVA_Build 20 38154663 4I GAAAGAAAGG ----/AAGA AAGAAAGAAA 3070 het 2202 hom 38 14 14 10 AAGA 4 5 333300 CASAVA_Build 20 38159678 4I GTCTAAGTAG ----/TATT ACACTTTCAC 2844 hom 15 het 6 0 6 0 TATT 0 1 333301 CASAVA_Build 20 38161343 17I CATTTTACAG -----------------/ATCTTATTTAAAATTCA ATTATTTCAT 3070 hom 120 het 45 0 39 6 ATCTTATTTAAAATTCA 0 1 333302 CASAVA_Build 20 38167125 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 34 2 18 15 A 16 15 333303 CASAVA_Build 20 38170021 1I TTATGTGGCA -/C CTGAAGGTGA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 1 2 333304 CASAVA_Build 20 38173213 1I CTGACCTTAC -/T GCCTGTTGTG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 T 0 1 333305 CASAVA_Build 20 38189196 1D CATGGGTCCT C/- CCCCTGATCA 3070 het 3070 ref 44 24 16 5 C 5 4 333306 CASAVA_Build 20 38228632 1D CATTTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 1526 het 1526 ref 37 27 4 6 T 12 11 333307 CASAVA_Build 20 38248307 1I CAATTTAAAT -/A ACTTTACTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 1 2 333308 CASAVA_Build 20 38257709 1I AGCACATAGA -/C CCCCTCTCTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 4 5 333309 CASAVA_Build 20 38270720 1D CACATACCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 A 10 9 333310 CASAVA_Build 20 38277924 1I AAGCCAGCTG -/A TATCAACCAA 3070 het 2833 hom 20 7 10 3 A 0 1 333311 CASAVA_Build 20 38283586 1I GATGGCTACT -/G TGGAGCCCTG 3070 het 3070 hom 53 19 26 8 G 0 1 333312 CASAVA_Build 20 38305214 2I TTCTTTCTTT --/TA TATATAAATT 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 TA 3 4 333313 CASAVA_Build 20 38326829 1D CCACAGTGAG A/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 1 0 333314 CASAVA_Build 20 38331977 18D AGACCACGCA GGGATGCTTGCCTTGGTC/------------------ CTTCACCCTT 1405 het 1405 ref 7 4 3 1 GGGATGCTTGCCTTGGTC 1 0 333315 CASAVA_Build 20 38347125 1D ATTCTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 1125 het 1125 ref 35 28 3 5 A 11 10 333316 CASAVA_Build 20 38349994 1D TTAGTGCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 18 21 12 A 14 13 333317 CASAVA_Build 20 38406992 1I AAGGTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2523 hom 28 6 13 9 A 13 14 333318 CASAVA_Build 20 38444742 1D CTGAAGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 A 14 13 333319 CASAVA_Build 20 38561372 1D CCTTGAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 40 0 32 9 A 12 11 333320 CASAVA_Build 20 38585873 3I AAGTTTCAGG ---/ATC TAGCTTGAAG 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 ATC 0 1 333321 CASAVA_Build 20 38597449 2I TTAACTGTCA --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 T 8 10 333322 CASAVA_Build 20 38614468 2I TTTCTGATGT --/AG AGAGCAAAGA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 AG 2 3 333323 CASAVA_Build 20 38619441 5D CTGGAACTTA AAATT/----- AAATTAAATT 3070 het 3070 hom 15 7 7 1 AAATT 4 3 333324 CASAVA_Build 20 38626350 1I TTTTAAAAGT -/A AAAATAAATG 3070 het 3070 ref 25 17 8 0 A 4 5 333325 CASAVA_Build 20 38627164 2I TACACAGGGG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 61 21 24 16 CA 7 8 333326 CASAVA_Build 20 38631427 2I ATAAGTATTC --/AT AGAGCACCCA 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 AT 0 1 333327 CASAVA_Build 20 38636852 1D ACAACTCAAC A/- AAAAACAAAG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 6 5 333328 CASAVA_Build 20 38637145 1D GATGATTCCT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 15 19 10 A 9 8 333329 CASAVA_Build 20 38638826 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1575 het 75 hom 17 2 7 8 A 17 16 333330 CASAVA_Build 20 38650814 1I TCTAGGGGAG -/A ATCTCTTTTC 3070 het 1794 hom 25 9 11 5 A 1 2 333331 CASAVA_Build 20 38662075 1D AAAATAATTT A/- AAAAAAAACA 2994 het 2994 ref 22 13 8 1 A 9 8 333332 CASAVA_Build 20 38664173 4D CTATGGCTGA TATT/---- TATTATTTTA 3070 het 3070 ref 33 15 12 9 TATT 2 1 333333 CASAVA_Build 20 38674380 1I TCAGCGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2801 hom 34 13 13 8 T 13 14 333334 CASAVA_Build 20 38688858 1D AAATTATTTC A/- AAAAAAAAAA 2856 het 2856 ref 22 12 8 2 A 11 10 333335 CASAVA_Build 20 38689624 1D ATGAGAAAGC A/- AATAGTAATG 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 A 3 2 333336 CASAVA_Build 20 38713038 4I TTGCCTTTCA ----/CAAG CACATAGGAA 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 CAAG 0 1 333337 CASAVA_Build 20 38734694 1D AGAAGGTGGG T/- GGTGGCAATG 3070 het 3070 ref 41 22 13 7 T 1 0 333338 CASAVA_Build 20 38739012 1D GGGTTTTTTT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 1694 hom 26 9 12 5 G 10 9 333339 CASAVA_Build 20 38739473 1D TAGATAGATA T/- GATTGACAGA 1703 het 1703 ref 30 15 4 11 T 1 0 333340 CASAVA_Build 20 38745080 1D GAAATCAAAA C/- AGAAGGAGAA 1733 het 1733 ref 14 6 4 5 C 1 0 333341 CASAVA_Build 20 38748341 1D TGACCTGCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 10 9 333342 CASAVA_Build 20 38749004 1I GAACTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2805 het 2531 hom 21 8 9 4 T 11 12 333343 CASAVA_Build 20 38770773 8I AAGAACACCC --------/CTTTGCCT ACGCAGCAGC 3070 het 3070 ref 53 24 19 10 CTTTGCCT 0 1 333344 CASAVA_Build 20 38772148 2I CATGAACTTT --/AA AAAAAAAAAA 1998 het 572 hom 25 2 12 11 A 16 18 333345 CASAVA_Build 20 38778453 14D GGGCTGGACC TGAACCATAATGTG/-------------- TGGAAACCCC 3070 het 3070 ref 45 29 18 5 TGAACCATAATGTG 1 0 333346 CASAVA_Build 20 38791915 1D TGTAAATTGT A/- TTGTTTCTCA 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 A 1 0 333347 CASAVA_Build 20 38814681 1I AGAAAGCCAC -/A AAAGGCGTCT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 3 4 333348 CASAVA_Build 20 38820247 2I ATCATCAAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 265 hom 41 2 29 10 AC 8 9 333349 CASAVA_Build 20 38823459 1I TTATCTTATA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 7 8 333350 CASAVA_Build 20 38826416 1I GCTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2744 het 1984 hom 23 7 10 6 A 15 16 333351 CASAVA_Build 20 38827259 10D TTCTGTTTGT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 2717 het 659 hom 21 4 8 11 TTTTG 6 4 333352 CASAVA_Build 20 38831563 1I GAACTGTTGC -/A AAACACAACT 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 A 3 4 333353 CASAVA_Build 20 38836331 1D CACTGCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 12 11 333354 CASAVA_Build 20 38841822 2D TTCATTTAAG AA/-- GTTGTTCAAT 3070 het 3070 ref 44 24 17 4 A 2 0 333355 CASAVA_Build 20 38848472 14I TCGCTCTGGC --------------/GCCTGTGAAGAACA GCCCCGCATT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 GCCTGTGAAGAACA 0 1 333356 CASAVA_Build 20 38857820 2D GATCAAAAAG AA/-- AAAGAGATGT 3070 het 3070 hom 40 15 23 4 A 5 3 333357 CASAVA_Build 20 38861358 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 10 9 333358 CASAVA_Build 20 38868814 1I AATGATTGGC -/T TTTGGGGAGA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 3 4 333359 CASAVA_Build 20 38905432 2D CTGCACACAC AG/-- GGGCTGTGCC 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 AG 1 0 333360 CASAVA_Build 20 38913578 1D GTGAGTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 A 11 10 333361 CASAVA_Build 20 38914036 1I TTCCCTGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 T 12 13 333362 CASAVA_Build 20 38934958 3D TGTTTTATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 1922 hom 26 6 11 9 TTG 7 6 333363 CASAVA_Build 20 38943893 1I GCAGCAGTGC -/A AAATAATAGC 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 A 3 4 333364 CASAVA_Build 20 38945078 5D GCAGCACCAA TCTCT/----- TCTCCTTACA 3070 het 3070 ref 54 33 17 8 TCTCT 1 0 333365 CASAVA_Build 20 38948956 2D AGAGAGAGTA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 2284 hom 43 11 19 14 AG 10 9 333366 CASAVA_Build 20 38958015 2I GGCAACAGAG --/AA AAGACCCTGT 3070 het 3070 hom 35 16 13 6 A 2 4 333367 CASAVA_Build 20 38977108 5I CTTTTTTATC -----/TGAAA TGAAATTCAG 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 TGAAA 1 2 333368 CASAVA_Build 20 38978415 1D TAAAAATCTA T/- TTTTATCAAT 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 5 4 333369 CASAVA_Build 20 38998116 1I TTTCTTTGTA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 6 7 333370 CASAVA_Build 20 39011593 1D CATTCTGAGG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 8 7 333371 CASAVA_Build 20 39029161 1D AATTATAATT C/- CGTGATGCAT 3070 hom 130 het 47 0 42 5 C 2 1 333372 CASAVA_Build 20 39030753 1I AAAGAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 A 11 12 333373 CASAVA_Build 20 39032724 7D CCAGGCGTGG TGGCTCA/------- TGCCTGTAAT 3070 hom 54 het 20 0 19 3 TGGCTCA 1 0 333374 CASAVA_Build 20 39038476 1D TCAAAAAAAC T/- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 T 3 2 333375 CASAVA_Build 20 39043684 1I GACCATATTC -/A AAAAAAAAAA 1226 het 1226 ref 38 25 3 10 A 13 14 333376 CASAVA_Build 20 39044976 1D ATCTAATGAA G/- TTTCACTTCT 3070 het 3070 ref 43 28 11 4 G 1 0 333377 CASAVA_Build 20 39072451 1D CAAACAAGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 333378 CASAVA_Build 20 39079407 1D TCCACAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 11 10 333379 CASAVA_Build 20 39080931 1D TGCCTAGCTA G/- GGACTACATG 3070 hom 105 het 38 0 36 4 G 3 2 333380 CASAVA_Build 20 39098732 2D GAATTGTAAC AT/-- GTAACTAGTG 3070 het 3070 ref 47 21 17 9 AT 1 0 333381 CASAVA_Build 20 39112954 1I AGAATGTTGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 46 19 20 7 T 7 8 333382 CASAVA_Build 20 39144892 1I TCTCCAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 371 hom 35 1 28 6 T 10 11 333383 CASAVA_Build 20 39149966 1I TTTCGATGTC -/T TAAGTACATG 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 T 1 2 333384 CASAVA_Build 20 39179338 11D GTAATGAGCT ACGACCATACC/----------- ACCGCACTCC 2657 het 2657 ref 19 10 9 2 ACGACCATACC 1 0 333385 CASAVA_Build 20 39238318 4I TAGCCAGTAT ----/CAAA CAAACAGCGA 3070 hom 78 het 33 0 24 9 CAAA 1 2 333386 CASAVA_Build 20 39238864 4I GAAGGCAGAG ----/TGTT TGTTTGTTGG 3070 hom 90 het 42 0 30 12 TGTT 2 3 333387 CASAVA_Build 20 39252014 3I AGCTGTGGGT ---/TTA TTATTTATGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTA 1 2 333388 CASAVA_Build 20 39315300 2D GGACTACAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 32 1 25 7 A 16 14 333389 CASAVA_Build 20 39318425 1I AAATTGAGAA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 7 8 333390 CASAVA_Build 20 39322234 1I AGCCAAATGT -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 32 0 20 12 G 1 2 333391 CASAVA_Build 20 39325450 1D ATTAGAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 22 2 10 10 T 17 16 333392 CASAVA_Build 20 39336946 1D GCGGTGGCTT A/- ATGCCTGTAA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 2 1 333393 CASAVA_Build 20 39343299 4D CCTAAAACTG TTAC/---- TTAAGTATGA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTAC 1 0 333394 CASAVA_Build 20 39345824 1D AAAAAAAAAA T/- CACTTTTATC 3070 het 4 hom 24 0 16 8 T 1 0 333395 CASAVA_Build 20 39349004 1D GATAGTGCCT G/- GCTTCCCCTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 2 1 333396 CASAVA_Build 20 39353646 4I ATATATATAC ----/TATA TATATATTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TA 3 5 333397 CASAVA_Build 20 39360130 1D CATCCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 11 10 333398 CASAVA_Build 20 39365093 1I TATCCTCTTC -/A AAGTACTTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 3 333399 CASAVA_Build 20 39366624 2I ATGAAACAAC --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 TA 4 5 333400 CASAVA_Build 20 39372735 1D GGGGAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 13 12 333401 CASAVA_Build 20 39383366 4D AAAAAAAAAG TTGT/---- TTTTTTTTTG 3070 het 6 hom 28 2 23 3 TTGT 1 0 333402 CASAVA_Build 20 39384141 3I CAGGGCACTT ---/ATC ATGAATGGAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATC 0 1 333403 CASAVA_Build 20 39384889 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 22 1 16 5 A 13 12 333404 CASAVA_Build 20 39385029 1I AACACTTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 851 hom 28 2 18 8 T 11 12 333405 CASAVA_Build 20 39427520 1D CCCTGCCACA C/- CCCCCCATCC 3070 hom 41 het 19 0 14 5 C 7 6 333406 CASAVA_Build 20 39441700 1I TCTTCTGTTT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 7 8 333407 CASAVA_Build 20 39444003 1D GGGTGATTTC T/- TTTTTTTTTT 2985 het 322 hom 19 1 12 6 T 13 12 333408 CASAVA_Build 20 39445963 1I GGAGGAAAGT -/G GGGGGTCAGA 3070 het 3070 ref 53 24 20 9 G 5 6 333409 CASAVA_Build 20 39448036 6I TTTCTTTTTC ------/TTTTCT TTTTCTCTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TTTTCT 1 2 333410 CASAVA_Build 20 39454351 1D GGAGGGGTGC T/- CCCAAGATGG 3070 het 3070 ref 39 17 16 7 T 1 0 333411 CASAVA_Build 20 39456553 1I TTTGAGCACA -/G GGGTTGGTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 G 3 4 333412 CASAVA_Build 20 39458040 1I GGCTGCGGCT -/G GGGGCTTTCC 2778 hom 36 het 15 0 12 3 G 4 5 333413 CASAVA_Build 20 39473270 2I TCCAGGTGAC --/AA ACTCTTGAAC 3070 hom 117 het 45 0 38 7 A 1 3 333414 CASAVA_Build 20 39474186 3D CTCACGTGGC CTT/--- CTTCCTTACC 2162 het 2162 ref 35 24 7 4 CTT 2 1 333415 CASAVA_Build 20 39474385 1D AGGCTGATGC T/- TTTCAACTGG 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 4 3 333416 CASAVA_Build 20 39486130 1D TCTAGCCTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 T 9 8 333417 CASAVA_Build 20 39495130 1D CAATGTGAAT A/- ACAGAAAAAA 1631 het 1631 ref 32 17 7 8 A 2 1 333418 CASAVA_Build 20 39497485 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 7 6 333419 CASAVA_Build 20 39501401 2D CAAAGCAAGA CT/-- CTATCTCGGG 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 CT 2 1 333420 CASAVA_Build 20 39506922 1D ATGTCACACA T/- TTTAGTAAGT 3070 het 3070 hom 53 22 25 6 T 4 3 333421 CASAVA_Build 20 39508498 1D GAGTTTCTGT A/- ACGTGTTTGG 3070 hom 183 het 68 0 60 9 A 2 1 333422 CASAVA_Build 20 39517822 1D TTCTCTCCCA C/- CCCCAACAGC 3070 het 3070 ref 44 21 14 11 C 5 4 333423 CASAVA_Build 20 39535811 1I AAAACAAAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 A 9 10 333424 CASAVA_Build 20 39543176 1D GAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 1 0 333425 CASAVA_Build 20 39552995 1D CCCTAGAACT A/- AAAAATAAAC 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 6 5 333426 CASAVA_Build 20 39557098 1D TATCTGGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 10 12 A 12 11 333427 CASAVA_Build 20 39564050 5D TTGTTCTTTC TAATT/----- TATTTTCAAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 4 TAATT 1 0 333428 CASAVA_Build 20 39565441 1I AAAAGTTTTA -/C TACTCCCTTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 C 0 1 333429 CASAVA_Build 20 39574027 1D GACTTTTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 10 9 333430 CASAVA_Build 20 39574188 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2653 hom 22 6 15 1 T 11 12 333431 CASAVA_Build 20 39578222 2D CAGATGGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 13 13 T 14 12 333432 CASAVA_Build 20 39581338 4D CCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 31 13 11 8 AAAC 5 4 333433 CASAVA_Build 20 39584444 2D TTGTAACCAA CG/-- TAGAAAAGAT 3070 het 3070 hom 42 16 20 9 CG 1 0 333434 CASAVA_Build 20 39588669 1I GATGAAAGCG -/A AAAAAAGGTA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 6 7 333435 CASAVA_Build 20 39599928 2I CATCATAGAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 54 20 21 13 AC 7 8 333436 CASAVA_Build 20 39608212 3I AAACTCAACA ---/AAT AATTGTTCAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AAT 1 2 333437 CASAVA_Build 20 39622892 1D TAAAACAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 A 11 10 333438 CASAVA_Build 20 39624894 5D TATCAATAGT GGGTC/----- AAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 29 17 12 2 GGGTC 1 0 333439 CASAVA_Build 20 39627705 15I TGACTCCGAA ---------------/GTACAATAATTAGAT GTACAATAAT 3070 het 3070 ref 43 18 12 13 GTACAATAATTAGAT 1 2 333440 CASAVA_Build 20 39643631 1I AGGAGGCTGA -/G GGCAGGAGAA 3070 het 2099 hom 21 5 14 2 G 2 3 333441 CASAVA_Build 20 39643728 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 264 hom 25 3 15 7 A 15 14 333442 CASAVA_Build 20 39649884 1D AAAACAAACC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 7 333443 CASAVA_Build 20 39652059 1I GGTACGGGTA -/C CAAAACAGAG 1540 hom 10 het 4 0 4 0 C 1 2 333444 CASAVA_Build 20 39667821 4I TAAAATTGAC ----/AAAA AAAATTTCAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 4 8 333445 CASAVA_Build 20 39679474 4D TAATTGTATC AAAT/---- AAAACTGAAG 3070 het 3070 hom 45 20 23 4 AAAT 1 0 333446 CASAVA_Build 20 39708022 1I GCAAACAACT -/G GGAAATGAAT 3070 het 3070 ref 61 30 22 9 G 2 3 333447 CASAVA_Build 20 39728773 1I ATTCTAGTTC -/A AAATTTTTTT 3070 het 8 hom 22 1 18 3 A 3 4 333448 CASAVA_Build 20 39742138 1I ATGTTAAGTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 7 8 333449 CASAVA_Build 20 39757918 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 28 1 14 13 T 15 14 333450 CASAVA_Build 20 39777216 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 515 het 233 hom 6 1 4 1 T 14 13 333451 CASAVA_Build 20 39817029 1D TAGGCACACG C/- CGCCACACCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 2 1 333452 CASAVA_Build 20 39821969 1D GAAGGTTTAT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 18 3 13 2 G 1 0 333453 CASAVA_Build 20 39825973 7I TTCTGGGATT -------/TTTTTGG TTAGTAGACT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 TTTTTGG 0 1 333454 CASAVA_Build 20 39826432 2I GTTGAAGGCT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 9 11 333455 CASAVA_Build 20 39827147 1D TAATATTTTT G/- GGTTTCCTGT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 G 3 2 333456 CASAVA_Build 20 39828874 6I CTTAAAGTGA ------/AATAAT AATAATAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 AAT 2 4 333457 CASAVA_Build 20 39829321 1D GCCATGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 28 2 17 9 T 13 12 333458 CASAVA_Build 20 39833957 17I AGGGGATTAG -----------------/CAGAGGAGTCTTAAAGT CAGTGTTATC 3070 hom 84 het 30 0 28 5 CAGAGGAGTCTTAAAGT 0 1 333459 CASAVA_Build 20 39841317 4I CTCATCTGCC ----/AGAT AGATCTACCT 3070 hom 174 het 61 0 58 3 AGAT 1 2 333460 CASAVA_Build 20 39843595 1D TCAAGCCACA C/- CCGCCTGGGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 C 3 2 333461 CASAVA_Build 20 39847426 1I TGCTATCCCT -/C CCCCCTCCCC 2890 hom 18 het 8 0 7 1 C 5 6 333462 CASAVA_Build 20 39848133 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTTCTT 1473 hom 15 het 7 0 6 1 T 7 8 333463 CASAVA_Build 20 39861948 4I GCAAAAACAA ----/AAAC AAAAAAGCAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AAAC 0 1 333464 CASAVA_Build 20 39899675 1D TAAGACACCA T/- TTTTTTGGCC 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 7 6 333465 CASAVA_Build 20 39943209 17D GCATCTACAT AGACTGAAGCTTCATGA/----------------- AGACAATCTG 3070 het 3070 ref 35 26 11 4 AGACTGAAGCTTCATGA 1 0 333466 CASAVA_Build 20 39944415 5I TATTCCTGGA -----/ATTTT ATTTTATTTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 ATTTT 2 3 333467 CASAVA_Build 20 40001952 2D CATGTGTGTG CA/-- CACACACAGA 3070 het 3070 hom 50 17 21 12 CA 5 4 333468 CASAVA_Build 20 40005783 4I TATATAAAAT ----/ATAC ATAGATTATA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 ATAC 0 1 333469 CASAVA_Build 20 40007337 1D TCTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 12 15 T 13 12 333470 CASAVA_Build 20 40024011 1D TGGTAAATGG T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 8 7 333471 CASAVA_Build 20 40068718 8D ACGAAAGAGG GAAGGAGA/-------- GAAATAAATC 3070 het 3070 ref 45 26 15 6 GAAGGAGA 1 0 333472 CASAVA_Build 20 40068883 1I AAGACAAAAT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 A 8 9 333473 CASAVA_Build 20 40069361 2I GGTCCTCAAT --/GG GGGGACCAAG 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 G 4 6 333474 CASAVA_Build 20 40127988 1I AATGTTTTTT -/A AAGTATTAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 2 3 333475 CASAVA_Build 20 40128260 1I TGACGGCTGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1243 hom 21 3 14 4 T 8 9 333476 CASAVA_Build 20 40128505 1I GTTGTAGGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 7 8 333477 CASAVA_Build 20 40129532 1I TCCACATACT -/C CTCCACCCCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 C 1 2 333478 CASAVA_Build 20 40135679 5I TGGGTCTATG -----/GCAAA GCAAAGCAGC 3070 het 3070 hom 65 22 31 12 GCAAA 1 2 333479 CASAVA_Build 20 40137090 2I CCCTGCTGTT --/CA CAGTCTATGA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 CA 1 2 333480 CASAVA_Build 20 40139813 2I ATAAGGGGAT --/GA GAGCTGGGGG 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 GA 1 2 333481 CASAVA_Build 20 40152294 1I AAATAGATGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 7 8 333482 CASAVA_Build 20 40155519 1I ACCACTGCAG -/A GAATGAAAGA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 0 1 333483 CASAVA_Build 20 40156412 1D AATTCATTTA T/- TTTTTATAGT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 6 5 333484 CASAVA_Build 20 40160291 1I CTGGAGGTCT -/G GGGGGGTGAC 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 G 6 7 333485 CASAVA_Build 20 40161872 1I TGCATTGGCT -/G GGGGGGGCCC 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 G 7 8 333486 CASAVA_Build 20 40170306 5D AGCTGTGTTT ATTTC/----- ATTTCAGCAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 ATTTC 2 1 333487 CASAVA_Build 20 40170707 4D GGGAATATGA AAAC/---- AAACAAACAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AAAC 3 2 333488 CASAVA_Build 20 40172835 4I GAGACCTTCT ----/TTTG TTTGTTTGCC 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 TTTG 2 3 333489 CASAVA_Build 20 40211477 1D AAGTTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 749 hom 30 2 16 12 T 15 14 333490 CASAVA_Build 20 40221259 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1832 het 1832 ref 36 26 4 7 T 12 11 333491 CASAVA_Build 20 40246849 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2071 hom 20 het 11 0 7 4 T 13 14 333492 CASAVA_Build 20 40274373 1I AAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 1314 het 155 hom 17 1 10 6 A 13 14 333493 CASAVA_Build 20 40275320 57I TCTTCAGCAG ---------------------------------------------------------/TTTCACATCATTAAAAGTTGTAGAATCTTGGATTCTCTGGCTGGAAAGGCCCTCCCA GTCTGAATTA 3070 hom 48 het 15 0 16 3 TTTCACATCATTAAAAGTTGTAGAATCTTGGATTCTCTGGCTGGAAAGGCCCTCCCA 0 1 333494 CASAVA_Build 20 40282635 4I ACATTAATAA ----/AAAG AAAGAATGGG 3070 hom 51 het 21 0 17 4 AAAG 1 2 333495 CASAVA_Build 20 40322218 12D TGCTTAAACA AAACTAGACTAC/------------ AAACTTGATT 3070 het 3070 ref 61 38 23 8 AAACTAGACTAC 1 0 333496 CASAVA_Build 20 40342058 1D GAGAGACTGG T/- GACCCATCTC 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 T 1 0 333497 CASAVA_Build 20 40347855 1I AAACTTTACC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 7 8 333498 CASAVA_Build 20 40358500 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 22 1 15 6 A 15 16 333499 CASAVA_Build 20 40367339 2I CCTGGGAGGC --/AG AGGTTGTAGT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AG 1 2 333500 CASAVA_Build 20 40374857 4D AGTGAGATCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1668 het 345 hom 28 5 8 15 T 22 18 333501 CASAVA_Build 20 40375020 6D TACTGAGATG CATTCC/------ CAGATGGTTA 3070 het 3070 ref 32 24 8 0 CATTCC 1 0 333502 CASAVA_Build 20 40376985 7D TAAGCACTAA TGCCAGT/------- TAATTGGTGT 3070 het 3070 ref 42 28 13 5 TGCCAGT 1 0 333503 CASAVA_Build 20 40378760 1D GCTACTCCAG A/- CCCCATGCTA 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 A 1 0 333504 CASAVA_Build 20 40390793 3I TGAGGTTGGA ---/ATT ATTTAGACAA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 ATT 1 2 333505 CASAVA_Build 20 40393273 1I AGGAGCAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 A 8 9 333506 CASAVA_Build 20 40393474 1D CTCTGAACAG T/- TTTTTTTTTT 2456 het 2456 ref 24 11 7 6 T 13 12 333507 CASAVA_Build 20 40397492 1D GCAGTGAATT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 8 7 333508 CASAVA_Build 20 40405929 13D TCTTTGCCTC AACAGCTTGGCCA/------------- AACACAAGGA 3070 het 3070 ref 42 23 13 9 AACAGCTTGGCCA 1 0 333509 CASAVA_Build 20 40413168 1D CCCCTCTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 10 26 14 T 12 11 333510 CASAVA_Build 20 40416117 1I CTAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 9 9 5 A 10 11 333511 CASAVA_Build 20 40419289 1D AAATATGGAC T/- TATGGCTACT 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 2 1 333512 CASAVA_Build 20 40420141 1I AGAAATCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 21 20 10 A 12 13 333513 CASAVA_Build 20 40432113 1D TACCCATCCC A/- AATCCTGTAA 3070 het 3070 hom 49 13 26 10 A 3 2 333514 CASAVA_Build 20 40451921 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGAAAGAA 3070 het 19 hom 36 2 25 9 AAG 0 1 333515 CASAVA_Build 20 40462248 1D ACTGATCATT G/- ATTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 G 1 0 333516 CASAVA_Build 20 40470660 1I CTATCCTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1086 hom 37 3 28 6 T 11 12 333517 CASAVA_Build 20 40473902 1D AAATATCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 535 hom 46 2 39 5 A 11 10 333518 CASAVA_Build 20 40496373 1D ACTCAAGTTT G/- GAATGCATTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 G 2 1 333519 CASAVA_Build 20 40506356 8I AAGAATTAAA --------/CAGCAAAG CAACTCCAAA 3070 het 3070 hom 49 15 28 6 CAGCAAAG 0 1 333520 CASAVA_Build 20 40510913 1D TTCATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 12 11 333521 CASAVA_Build 20 40524058 1D ACATTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 1467 het 1467 ref 43 32 4 7 A 12 11 333522 CASAVA_Build 20 40527204 1I TAGAAAAAAA -/C AACACTCTTT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 C 0 1 333523 CASAVA_Build 20 40535434 1D AGATTTTTTT A/- ATATAAAACA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 2 1 333524 CASAVA_Build 20 40565297 1D TCTATTGTTC T/- TTTTTACCGT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 6 5 333525 CASAVA_Build 20 40601729 4D AAAAAAAACA AACT/---- ATTACTAACA 3070 het 3070 hom 25 11 12 4 AACT 1 0 333526 CASAVA_Build 20 40608534 1I ACAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 15 11 A 10 11 333527 CASAVA_Build 20 40618618 1D ATATATATAT C/- CCCTATCTAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 4 3 333528 CASAVA_Build 20 40624103 1I CACCTCACCT -/C TCTGGGTTTC 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 C 0 1 333529 CASAVA_Build 20 40628166 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 A 9 8 333530 CASAVA_Build 20 40628327 1I GTAGCTGGGA -/T TTACGTGTGT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 T 2 3 333531 CASAVA_Build 20 40643585 2D GTGGCTGCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 38 1 23 17 A 16 14 333532 CASAVA_Build 20 40654201 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 986 het 894 hom 10 4 4 2 T 15 14 333533 CASAVA_Build 20 40691244 1D GTGAGGATGC T/- TTTTTTTTTT 949 het 949 ref 51 30 3 19 T 13 12 333534 CASAVA_Build 20 40717789 2I GACTCTCAGG --/TT TTTCTGATCT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 3 5 333535 CASAVA_Build 20 40724888 2I ATTCACTAAC --/TG TAATAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TG 0 1 333536 CASAVA_Build 20 40725021 2D CCTGAATATA TG/-- TGTGTGTGTG 2043 het 2043 ref 20 7 7 6 TG 10 9 333537 CASAVA_Build 20 40741770 1D ATTGTAAGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 16 22 8 T 10 9 333538 CASAVA_Build 20 40756858 2I GTGTTTATCT --/GC CATCTGTACA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 GC 0 1 333539 CASAVA_Build 20 40763144 1I ACCTGACAAC -/T TCAGTTTAGT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 1 2 333540 CASAVA_Build 20 40766486 1D GTTGATATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 A 15 14 333541 CASAVA_Build 20 40773425 1D TTTGGGTCAT G/- GGGGGCAGAT 3070 het 1716 hom 25 6 16 3 G 6 5 333542 CASAVA_Build 20 40817627 1I TGTCAAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 13 14 333543 CASAVA_Build 20 40825502 1D TTTGAACTTC T/- TGGCATCAAA 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 T 2 1 333544 CASAVA_Build 20 40837680 1I AAAATAATTT -/C CTTTGAGTAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 1 2 333545 CASAVA_Build 20 40839257 1I AGAGCCTCCC -/T TGCCCTTAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 2 333546 CASAVA_Build 20 40841904 1D TGGTGGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 34 0 25 9 T 13 12 333547 CASAVA_Build 20 40845430 1D GAGAATCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 30 0 27 4 A 11 10 333548 CASAVA_Build 20 40846800 1D ACTACCAAAT A/- AAAGATAATT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 4 3 333549 CASAVA_Build 20 40850291 6I CCTGACCACC ------/CCAAGG CCAAGGCCAG 3070 het 3070 hom 46 17 19 10 CCAAGG 1 2 333550 CASAVA_Build 20 40857239 1D CTTCTCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 42 3 32 8 A 12 11 333551 CASAVA_Build 20 40874126 1I ACAACTTGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 418 hom 34 1 26 7 T 9 10 333552 CASAVA_Build 20 40895327 1I AAATTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 15 19 9 A 13 14 333553 CASAVA_Build 20 40896141 1D GCCATAGGCT G/- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 G 3 2 333554 CASAVA_Build 20 40902280 2I GCGTTGTCAC --/AT GTTTTTCTCC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 AT 0 1 333555 CASAVA_Build 20 40907352 3I GTCACTTCTC ---/CTT CTGGATCTCA 3070 hom 111 het 45 0 40 5 CTT 0 1 333556 CASAVA_Build 20 40933370 1D AGCCCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 595 hom 34 2 23 10 A 16 15 333557 CASAVA_Build 20 40935744 2D TTTTCATACT AA/-- GTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 8 A 2 0 333558 CASAVA_Build 20 40946017 2D ACACCCCCAT AC/-- ACACACACAC 1262 het 1262 ref 52 30 3 20 AC 7 6 333559 CASAVA_Build 20 41026588 1I AGAAATCAAC -/A AAAATACAGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 4 5 333560 CASAVA_Build 20 41041981 1D CATGCCTGGA G/- GGGGTCTTTT 2940 hom 24 het 9 0 9 1 G 5 4 333561 CASAVA_Build 20 41115111 1I CCTCAGACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 13 10 A 11 12 333562 CASAVA_Build 20 41138484 1I AAATGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 16 9 A 11 12 333563 CASAVA_Build 20 41141232 1D CTCTCTCCCT C/- CCCCCCCCCA 1965 het 429 hom 16 4 8 4 C 10 9 333564 CASAVA_Build 20 41144354 5I TACTATGCTT -----/TTTTC TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 TTTTC 0 1 333565 CASAVA_Build 20 41146459 1D AGGCAAAGGA G/- AAGCAAGAAC 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 G 1 0 333566 CASAVA_Build 20 41150119 1I AATGATCAAT -/G GTTGAGACGA 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 G 1 2 333567 CASAVA_Build 20 41161209 1I AATAATGTAT -/C TTTATATCAT 3070 het 3070 hom 47 17 20 10 C 0 1 333568 CASAVA_Build 20 41195104 2I TAGCATAAAT --/AC AGTTTAAATA 2847 het 2847 ref 17 9 7 1 AC 0 1 333569 CASAVA_Build 20 41195802 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1857 het 493 hom 24 3 7 14 A 18 17 333570 CASAVA_Build 20 41204670 2D GGTAAATAAC AA/-- GAGCTATAGC 3070 het 3070 ref 65 29 27 11 A 2 0 333571 CASAVA_Build 20 41220094 1I CTGTCAAGAC -/A AAGGCAGAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 3 333572 CASAVA_Build 20 41242525 1D TACACCCACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 T 10 9 333573 CASAVA_Build 20 41247985 1D GACTGATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 12 11 333574 CASAVA_Build 20 41261947 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 24 het 24 ref 10 3 1 6 A 14 11 333575 CASAVA_Build 20 41263920 1I GGGCCCAGTT -/G GGGGTCAACA 2488 het 2488 ref 20 11 6 3 G 4 5 333576 CASAVA_Build 20 41271960 2D ACTCCACCTC AA/-- AAAAAAAAAA 820 het 820 ref 23 17 2 4 A 13 11 333577 CASAVA_Build 20 41274527 1I GAAAAAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 2666 hom 26 10 12 4 C 0 1 333578 CASAVA_Build 20 41286321 1I AATGCACCTA -/C CCCGTAATGG 3070 hom 98 het 38 0 32 6 C 3 4 333579 CASAVA_Build 20 41350226 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 507 hom 25 2 13 10 T 16 15 333580 CASAVA_Build 20 41366874 1I ATAATGTTTG -/A ATTTTAAAAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 2 333581 CASAVA_Build 20 41368939 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2115 hom 33 het 14 0 8 6 A 12 13 333582 CASAVA_Build 20 41379791 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 68 het 26 0 23 3 T 10 9 333583 CASAVA_Build 20 41393429 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 9 8 333584 CASAVA_Build 20 41411789 23D CATCTGGGAT GAGCTCTATCTGCATCCCGTCAA/----------------------- GAGCTCTATC 3070 hom 111 het 49 0 37 19 GAGCTCTATCTGCATCCCGTCAA 2 1 333585 CASAVA_Build 20 41414905 1D GCCAAGCCTC T/- TGAGCTCATT 3070 hom 62 het 25 0 18 7 T 2 1 333586 CASAVA_Build 20 41416366 3D CTCACCAAAC AAA/--- AAAAATATTC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 8 5 333587 CASAVA_Build 20 41422879 1I CCACCTTAGC -/A AAAAAAATAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 7 8 333588 CASAVA_Build 20 41429699 1D TCTCATTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 32 2 20 11 A 15 14 333589 CASAVA_Build 20 41439829 2D TTCCATCATG TA/-- TATATAGAGA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 TA 4 3 333590 CASAVA_Build 20 41447964 1D AACTCCGTTT A/- AAAAAAAAAA 2984 hom 32 het 16 0 10 8 A 13 12 333591 CASAVA_Build 20 41448088 1I CACACTACTT -/C CCGGCATAGC 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 2 3 333592 CASAVA_Build 20 41449935 1D AGACACCTTC T/- TACATGTACA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 2 1 333593 CASAVA_Build 20 41452173 2I GGAGTCTGGG --/GT GTCGGGAGAT 1834 het 1834 ref 24 8 8 8 GT 1 2 333594 CASAVA_Build 20 41454202 5I ACAGAAAAAA -----/TAAAG AAAAAAAGAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TAAAG 0 1 333595 CASAVA_Build 20 41455452 2I AAGAATTGTC --/TG TCTCTCTCCT 3070 hom 120 het 48 0 40 8 TG 0 1 333596 CASAVA_Build 20 41457706 1D TCCCTCCCCC T/- GAGCCTCAGT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 1 0 333597 CASAVA_Build 20 41459542 1D GTTTTGTCTT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 10 9 333598 CASAVA_Build 20 41460949 1D TCAACAACTC T/- TGATTTTTCC 3070 hom 152 het 55 0 51 6 T 2 1 333599 CASAVA_Build 20 41462417 2D CTTATATCAC AT/-- GTTTCTAGGG 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 AT 1 0 333600 CASAVA_Build 20 41462576 1D TGCCTGCCTG C/- TTTCTAGCTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 C 1 0 333601 CASAVA_Build 20 41462855 5D CAATTAAACC CACAA/----- CACATGTGTT 1671 het 1671 ref 26 21 4 1 CACAA 1 0 333602 CASAVA_Build 20 41466855 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2772 het 957 hom 17 5 9 3 A 13 12 333603 CASAVA_Build 20 41468079 1D ATTACATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 11 8 A 13 12 333604 CASAVA_Build 20 41471707 1D TGCAGAGAAA T/- AGACATCCAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 1 0 333605 CASAVA_Build 20 41475200 1D AGCAATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 31 1 22 9 A 12 11 333606 CASAVA_Build 20 41484596 1I TGGAAGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1000 hom 30 4 19 7 A 14 15 333607 CASAVA_Build 20 41486066 1I TTTATTAAGG -/T TTTTTTTTAG 2197 hom 18 het 13 0 7 6 T 8 9 333608 CASAVA_Build 20 41492953 5D ATGTCTCTTG CTTCA/----- CTTCGGCAAC 3070 hom 75 het 28 0 25 4 CTTCA 1 0 333609 CASAVA_Build 20 41495332 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAGAAGAAGA 249 het 249 ref 17 5 2 11 AG 1 0 333610 CASAVA_Build 20 41495632 4I GGAGAAAGAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 24 het 22 0 14 8 AAAG 3 4 333611 CASAVA_Build 20 41497059 1D AAAAAAAAAA T/- GAAGACATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 1 0 333612 CASAVA_Build 20 41499768 2D AAATGAATGC AA/-- AAAAAAATCC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 9 7 333613 CASAVA_Build 20 41503559 1D TGTCATGATC T/- TCTGTTACTC 3070 het 3070 ref 48 24 14 10 T 2 1 333614 CASAVA_Build 20 41503678 4I AAACTTGGTC ----/TTTG TTTTTCTCTA 3070 hom 93 het 35 0 30 5 TTTG 0 1 333615 CASAVA_Build 20 41505821 1D GAGCTCTCCA T/- AAAAATGATC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 T 1 0 333616 CASAVA_Build 20 41508002 1D CAGGTGATGC A/- CCCACCTCGG 3070 het 1071 hom 15 3 9 3 A 1 0 333617 CASAVA_Build 20 41517048 20D GACAGAACTA CCCCCTGTTGAGAACCACTG/-------------------- CCCCCTGTTG 2247 het 2247 ref 33 19 6 12 CCCCCTGTTGAGAACCACTG 1 0 333618 CASAVA_Build 20 41544226 1I GCCTGTCAGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 8 9 333619 CASAVA_Build 20 41587169 1I CTGGGGAGTT -/A AAAAAAAAAA 670 het 670 ref 25 8 5 12 A 15 16 333620 CASAVA_Build 20 41587611 6I ATTATACAAC ------/CATACA CATACACAGG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 CATACA 1 2 333621 CASAVA_Build 20 41605161 1I CACCACTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 34 2 23 9 T 13 14 333622 CASAVA_Build 20 41651724 1I CTCCACTTTC -/T TTTTTGAGAC 2351 het 2351 ref 23 14 6 3 T 5 6 333623 CASAVA_Build 20 41654625 1D AGACTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1532 hom 29 6 18 5 A 15 14 333624 CASAVA_Build 20 41677993 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAT 2370 het 2370 ref 23 10 9 4 A 10 9 333625 CASAVA_Build 20 41680703 2I ACCTGGCTGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 1296 hom 23 3 9 11 T 9 11 333626 CASAVA_Build 20 41682894 1I AATTATATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 10 11 333627 CASAVA_Build 20 41688852 9D AAGTGTTAAA AGTGTTGAT/--------- AGAGAAGAAA 3070 het 3070 ref 27 16 10 4 AGTGTTGAT 1 0 333628 CASAVA_Build 20 41691403 1D5M4D CTCGACTCAC TGCAAGCTCC/-GTGAG---- GCCTCCCGGG 2286 het 978 hom 10 3 6 1 N/A 0 0 333629 CASAVA_Build 20 41696269 1D TGCATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 11 10 333630 CASAVA_Build 20 41697242 1D AGAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 1188 het 1188 ref 16 10 4 2 A 13 12 333631 CASAVA_Build 20 41711554 3D CCCAAGACAA TTC/--- TTCCAATGTT 3070 het 3070 hom 22 9 13 0 TTC 2 1 333632 CASAVA_Build 20 41715531 4I AAATACAAAA ----/AGTT AGCCAGGTGT 1819 het 1170 hom 11 4 5 2 AGTT 0 1 333633 CASAVA_Build 20 41720948 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2371 hom 24 7 11 6 A 12 13 333634 CASAVA_Build 20 41723962 1D AAACTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 15 14 333635 CASAVA_Build 20 41733015 15D CTATGATTTC TTTTTTTTCTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 18 0 15 3 TTTTTTTTCTTTTTT 1 0 333636 CASAVA_Build 20 41734482 1D CTGTCATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 21 4 11 6 A 14 13 333637 CASAVA_Build 20 41735301 2D GCCTGGCCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 4 T 16 14 333638 CASAVA_Build 20 41741906 2D TTGAGGATGC GG/-- GGTGGGCTGT 3070 hom 52 het 28 0 21 7 G 4 2 333639 CASAVA_Build 20 41741967 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 554 hom 31 2 15 14 A 13 12 333640 CASAVA_Build 20 41742079 4D TTTTGACTAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 38 het 16 0 13 3 TTTA 3 2 333641 CASAVA_Build 20 41756451 2I GACAAAAAAT --/TA AGATTTGATG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TA 0 1 333642 CASAVA_Build 20 41757092 1I AGGAGGTCAA -/T TTTTTTTTTT 2228 het 819 hom 24 3 7 14 T 15 16 333643 CASAVA_Build 20 41757741 1D CTGTCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 27 0 18 10 A 14 13 333644 CASAVA_Build 20 41758788 1I GTGTGGTTGA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 69 31 26 12 T 7 8 333645 CASAVA_Build 20 41763338 2D AGGATGTACT TC/-- TGGTCTACCA 3070 het 3070 hom 41 14 20 8 TC 1 0 333646 CASAVA_Build 20 41789667 1I TTTTGGTGTT -/C CAGCTTAACA 3070 hom 105 het 39 0 33 6 C 1 2 333647 CASAVA_Build 20 41794992 1D AGAGGGAAGA C/- TTTGAATAGA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 C 1 0 333648 CASAVA_Build 20 41864567 2I CTTTCTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TC 0 1 333649 CASAVA_Build 20 41866654 1I TGTAAAGAAA -/T TTTTTTTGGC 3070 hom 62 het 26 0 21 5 T 7 8 333650 CASAVA_Build 20 41867581 1D CTTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 401 hom 41 1 33 8 T 10 9 333651 CASAVA_Build 20 41883336 6D AAAAACTTAA AAGCTT/------ TTCTCATATG 3070 hom 60 het 22 0 21 2 AAGCTT 1 0 333652 CASAVA_Build 20 41892816 1I CCTTGATACA -/T CCCCATCAGG 3070 hom 147 het 64 0 48 16 T 0 1 333653 CASAVA_Build 20 41905563 1D GAGCATCTGT G/- ATGTGCCAGG 3070 het 3070 hom 50 20 24 7 G 1 0 333654 CASAVA_Build 20 41917047 1D TCTCAACATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 273 hom 40 1 33 6 T 11 10 333655 CASAVA_Build 20 41922426 1D AGATGAAATC T/- TTTTTTTTTT 1725 het 21 hom 21 1 7 13 T 18 17 333656 CASAVA_Build 20 41944119 1D AAAGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 11 10 333657 CASAVA_Build 20 41961057 1I CATTTAGATT -/A AAAAAAAAAA 1891 het 1891 ref 23 9 5 9 A 13 14 333658 CASAVA_Build 20 41974249 1D GAGATAGAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 9 8 333659 CASAVA_Build 20 41980107 1D AGGTTTGACT C/- CCAGCAGGAC 3070 het 3070 ref 50 24 22 5 C 3 2 333660 CASAVA_Build 20 42005357 1D ATAAACTCCC T/- CTCCTACAGA 3070 hom 122 het 46 0 40 6 T 1 0 333661 CASAVA_Build 20 42005917 4I GAGAGCCATG ----/ATTT ATTTATCCAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATTT 1 2 333662 CASAVA_Build 20 42012090 1D GCCTCTCTGC T/- TTGGAGGGTC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 3 2 333663 CASAVA_Build 20 42013942 4D AAAATAATTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TTTG 5 4 333664 CASAVA_Build 20 42015288 5I TGTAAGAGAA -----/TAATT TATGTTGTTT 3070 hom 90 het 33 0 30 4 TAATT 0 1 333665 CASAVA_Build 20 42029014 6D GACACGGACC CACCAA/------ CACCAACATG 3070 hom 171 het 64 0 54 11 CACCAA 2 1 333666 CASAVA_Build 20 42063732 17D TGGGCACCTT CTCTGTGCCAGCACCTG/----------------- CTCTGTGCCA 3070 het 3070 hom 33 15 17 3 CTCTGTGCCAGCACCTG 1 0 333667 CASAVA_Build 20 42070614 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 13 12 333668 CASAVA_Build 20 42086463 6I GTTTTCCCTC ------/TTTATG TTTATGAATC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTTATG 1 2 333669 CASAVA_Build 20 42087571 10D GGAAGGGGCC AAGAACTTCT/---------- GCATCAGCTG 1315 het 1315 ref 20 9 4 7 AAGAACTTCT 1 0 333670 CASAVA_Build 20 42090688 4D TTCCAGTGAT ACAG/---- ACAGACAAAG 3070 hom 114 het 42 0 38 6 ACAG 2 1 333671 CASAVA_Build 20 42106183 3I CCTTTGTAGG ---/GAT GACATGGATG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 GAT 0 1 333672 CASAVA_Build 20 42106477 1D CTTAAAGCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 34 2 26 6 A 14 13 333673 CASAVA_Build 20 42107406 4D CAAAGTTGTA AAAT/---- AAATAGCCTA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 AAAT 2 1 333674 CASAVA_Build 20 42112829 1D TGATCTTTAA G/- GAACCCTAGA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 G 2 1 333675 CASAVA_Build 20 42139900 1I GATTTATAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 T 8 9 333676 CASAVA_Build 20 42140439 1I CACTCATTTT -/C CCCCCAAAGC 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 C 5 6 333677 CASAVA_Build 20 42141265 2D TTTATTTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 2248 het 2248 ref 20 6 8 6 T 13 11 333678 CASAVA_Build 20 42146255 2D GGCATCAGGC TT/-- TTTTTTTTTT 1572 het 1514 hom 42 13 7 22 T 20 18 333679 CASAVA_Build 20 42147557 1I TCCCCAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2251 hom 29 7 12 10 T 12 13 333680 CASAVA_Build 20 42156847 3D AATCTGTTAC AAT/--- GTTTTTGTTA 3070 het 3070 hom 38 14 21 5 AAT 1 0 333681 CASAVA_Build 20 42164141 1D CTACACAGCC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 8 7 333682 CASAVA_Build 20 42165334 1I AAGTACAGCC -/A TTTTGGAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 0 1 333683 CASAVA_Build 20 42183123 1D GGAGGAGTAG A/- GAATACAATG 3070 het 3070 ref 46 24 14 9 A 1 0 333684 CASAVA_Build 20 42183665 4I AGAAATTAAC ----/TTAT TTAACCCCCC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 TTAT 0 1 333685 CASAVA_Build 20 42187024 16D TCAGCTGGGC ACGGTGGTGCGCACCT/---------------- GTAGTCCCAG 3070 het 3070 ref 22 12 10 4 ACGGTGGTGCGCACCT 1 0 333686 CASAVA_Build 20 42190762 2D TTTTAAAGAT AC/-- AGAGTCTCGC 2580 het 970 hom 16 4 7 6 AC 1 0 333687 CASAVA_Build 20 42192120 5D TTACTGCAGC AACAA/----- AACAAAACAA 3070 het 3070 hom 29 8 18 5 AACAA 5 4 333688 CASAVA_Build 20 42200394 1I TTACACGCTG -/T TTTTTTAACT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 6 7 333689 CASAVA_Build 20 42207035 3D ATGAAGAAAT GGA/--- GGTACAGGAA 3070 het 3070 hom 32 15 12 6 GGA 1 0 333690 CASAVA_Build 20 42230435 3D AATATTGTGG ATA/--- ATGAGTTAAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 ATA 1 0 333691 CASAVA_Build 20 42240647 4D CTGGTTTTCT TTTC/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 TTTC 1 0 333692 CASAVA_Build 20 42246090 3I GGTGGGTGCC ---/TGT TGTCCCAGCT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TGT 1 2 333693 CASAVA_Build 20 42247524 3I CAAAAAAAAA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 AAT 3 4 333694 CASAVA_Build 20 42274006 4I AGTTGTAGTC ----/AACT AACTAGATAG 3070 het 3070 hom 47 21 18 8 AACT 1 2 333695 CASAVA_Build 20 42282266 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1215 hom 24 3 16 5 T 13 12 333696 CASAVA_Build 20 42283249 1D CTTGTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3055 hom 32 9 13 11 T 11 10 333697 CASAVA_Build 20 42322340 1D AGTGAAGGGC A/- AAAAAAAAAA 2203 het 2203 ref 39 28 5 7 A 13 12 333698 CASAVA_Build 20 42334084 5D TGAGGGAAGT CAGTC/----- CAACATCACT 3070 het 3070 ref 37 16 15 9 CAGTC 1 0 333699 CASAVA_Build 20 42359058 21I GACTGCAGAG ---------------------/TCTCGGAGACTCCATTCCCAT GCTGGAGCAC 2991 het 1987 hom 17 6 7 4 TCTCGGAGACTCCATTCCCAT 0 1 333700 CASAVA_Build 20 42365685 1D TTGGAGAGCC T/- TTTTTTTTTT 948 het 948 ref 32 19 4 9 T 12 11 333701 CASAVA_Build 20 42386194 1I TGATGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 2868 het 2314 hom 16 5 8 3 A 10 11 333702 CASAVA_Build 20 42391258 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 27 2 14 11 A 11 10 333703 CASAVA_Build 20 42399801 10I AATTAATTTG ----------/CCCGAGGTCA CCCAGCCAGG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 CCCGAGGTCA 0 1 333704 CASAVA_Build 20 42411384 1D CAATCCTTTG T/- TTTTTTAAGC 1383 het 1383 ref 13 8 3 2 T 7 6 333705 CASAVA_Build 20 42411457 1D CCAGGTATCA C/- CACCACCCAC 3070 het 3070 hom 25 10 12 5 C 2 1 333706 CASAVA_Build 20 42419907 4D AAAAAAAAAC ACAA/---- ACAAACAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 13 5 ACAA 3 2 333707 CASAVA_Build 20 42420674 4D6M3D CAAAAAAAAC AAAACAAAACAAA/----CAAAAC--- AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 15 6 N/A 0 0 333708 CASAVA_Build 20 42423759 1D AAACAAAACC A/- AAAAAAAACA 160 het 160 ref 33 27 3 4 A 9 8 333709 CASAVA_Build 20 42424903 1I TTCTCTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1313 hom 30 9 18 4 C 0 1 333710 CASAVA_Build 20 42425075 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2308 hom 18 5 12 1 T 9 8 333711 CASAVA_Build 20 42426521 1D GGTCATGCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1613 hom 18 5 8 5 T 10 9 333712 CASAVA_Build 20 42427531 1I GCCTTTACAA -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 6 7 333713 CASAVA_Build 20 42431127 2D TGGTGAAACC CT/-- GTCTCTACTA 1842 het 1842 ref 12 5 5 3 CT 1 0 333714 CASAVA_Build 20 42450711 4D GTCCCTAAGG CTAT/---- CTAAGTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 CTAT 1 0 333715 CASAVA_Build 20 42462402 3D AGAGGGAGGA GGG/--- GGAAGAGGAT 3070 het 3070 hom 43 22 19 2 G 5 2 333716 CASAVA_Build 20 42466909 2I TGACTGTGTG --/GT GTGTGTGTGC 3070 hom 38 het 47 1 39 7 GT 4 5 333717 CASAVA_Build 20 42471894 2D TGGTCCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2714 het 165 hom 27 3 10 15 T 16 14 333718 CASAVA_Build 20 42473946 1I CCCGTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 1574 het 1574 ref 33 15 7 11 A 15 16 333719 CASAVA_Build 20 42479213 1I CAAACAAAGG -/C ATTTTAACCT 3070 het 3070 ref 55 24 24 7 C 0 1 333720 CASAVA_Build 20 42492652 19D AGCAAGAATT GAGGAAGAATGGTGTGGGA/------------------- GAGGGATGAT 3070 het 3070 ref 38 21 16 7 GAGGAAGAATGGTGTGGGA 1 0 333721 CASAVA_Build 20 42519855 9D AGATATTGGT GGTGGTGGA/--------- GGTGGAGCAA 2483 het 2483 ref 28 16 8 7 GGTGGTGGA 1 0 333722 CASAVA_Build 20 42521175 1D ATAGATGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 11 10 333723 CASAVA_Build 20 42524344 1I ACTCTAGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 9 10 333724 CASAVA_Build 20 42534458 1D CATGCCATTC T/- TTTTTTTTTT 825 het 825 ref 33 24 2 8 T 12 11 333725 CASAVA_Build 20 42548258 1D CCTCAGCCTC T/- CCAAGTAGCT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 T 1 0 333726 CASAVA_Build 20 42549332 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2167 het 1879 hom 22 8 6 8 A 15 14 333727 CASAVA_Build 20 42550950 1D ACGACTGTGA T/- TCTGAGTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 1 333728 CASAVA_Build 20 42554617 2D AGACACTGTA CT/-- CTCTCTTTTT 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 CT 4 3 333729 CASAVA_Build 20 42556162 3I TAGTAACAAA ---/CAT CATCACAGTC 3070 het 3070 ref 45 18 18 9 CAT 1 2 333730 CASAVA_Build 20 42556275 3D ATCTCACTGG GCA/--- GCAGGTTTAG 3070 het 3070 hom 55 23 23 9 GCA 2 1 333731 CASAVA_Build 20 42556602 3D TGAAAATATG TAA/--- TAATTTTAGT 3070 het 3070 hom 35 13 21 2 TAA 2 1 333732 CASAVA_Build 20 42567519 1I TGGGATTACA -/G GTGCCCGCCA 3070 hom 45 het 16 0 15 1 G 1 2 333733 CASAVA_Build 20 42570562 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 27 10 12 6 A 8 7 333734 CASAVA_Build 20 42577873 1I CCCCAGCTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1466 hom 26 5 12 9 T 9 10 333735 CASAVA_Build 20 42581027 1D TTCTCAAAAA C/- GAAAAAAAAA 3070 het 1186 hom 23 6 11 8 C 1 0 333736 CASAVA_Build 20 42586621 1I GTAGGATCCC -/A CCCATCTCTT 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 A 0 1 333737 CASAVA_Build 20 42590597 3D TTGCAACTCC CCT/--- GTCTTGATAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 7 CCT 1 0 333738 CASAVA_Build 20 42600977 1D TGTACCTAGC T/- TTTTTTTTTT 1839 het 1839 ref 40 30 4 6 T 11 10 333739 CASAVA_Build 20 42601808 1I CATTATGAGA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 T 6 7 333740 CASAVA_Build 20 42606981 11D TCCTTCTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1303 het 1303 ref 21 7 3 13 T 28 17 333741 CASAVA_Build 20 42608848 1D CCTCAGGTAA T/- TCCACCCGTC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 2 1 333742 CASAVA_Build 20 42620098 2I AATAAAACTT --/TC TGTCTTTAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TC 0 1 333743 CASAVA_Build 20 42640643 1I ATGCAACATT -/C CCGGCTCTCC 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 C 2 3 333744 CASAVA_Build 20 42645559 3D TCCCTGAACT GAG/--- GAGGATTCCT 3070 het 3070 hom 44 21 19 5 GAG 2 1 333745 CASAVA_Build 20 42655216 1D TCTATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2860 het 787 hom 15 4 7 6 A 12 11 333746 CASAVA_Build 20 42680209 6D ACCACCTCAG TCCAGC/------ TCCAGCTCGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 9 TCCAGC 2 1 333747 CASAVA_Build 20 42697958 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2478 het 2478 ref 21 9 9 3 A 11 12 333748 CASAVA_Build 20 42703520 2I TTGGAGGGGG --/CA CAGGACGTGC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 CA 1 2 333749 CASAVA_Build 20 42706234 1I GCCCTGCTCG -/C CCTCCGGCAG 3070 hom 70 het 25 0 22 3 C 2 3 333750 CASAVA_Build 20 42712493 1I TTTTCTTCTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 8 9 333751 CASAVA_Build 20 42720212 1I CTTGTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2113 hom 31 9 10 12 T 11 12 333752 CASAVA_Build 20 42725911 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 30 6 14 10 A 15 14 333753 CASAVA_Build 20 42730334 4D TCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 6 AAAC 3 2 333754 CASAVA_Build 20 42745922 5D TAATCTAATG TAACC/----- TAACCCCTTT 3070 hom 88 het 34 0 29 7 TAACC 2 1 333755 CASAVA_Build 20 42769950 1D GGCTGGTCTT A/- AACTCCTGGA 2783 het 2500 hom 21 6 8 8 A 3 2 333756 CASAVA_Build 20 42798103 3I TTTTAACACT ---/GGC AATGTTTAGA 3070 hom 117 het 42 0 39 3 GGC 0 1 333757 CASAVA_Build 20 42800748 1D CTCTTACATG T/- GTGTCATTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 1 0 333758 CASAVA_Build 20 42801574 1D AAACATCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 718 hom 39 3 30 7 A 11 10 333759 CASAVA_Build 20 42804074 8D5M2D CTCTGTGCTG AGCAGTTCTTCATAC/--------GTCAT-- ACTCCATTTA 3070 hom 114 het 37 0 39 5 N/A 0 0 333760 CASAVA_Build 20 42805014 19D GCTGGGAGGA CTTGGCAGGTTAAGTATCT/------------------- CTTGGCAGGT 3070 hom 76 het 27 0 23 11 CTTGGCAGGTTAAGTATCT 1 0 333761 CASAVA_Build 20 42807433 5I AAGAAGAGAT -----/GAAAG GAAGGGACGA 1578 hom 18 het 9 0 4 5 GAAAG 0 1 333762 CASAVA_Build 20 42808254 1D CATCGGTGAG C/- CGCCCGGAGC 1154 het 1154 ref 13 8 5 0 C 2 1 333763 CASAVA_Build 20 42835085 2I TGTCTCCCAC --/AT GTGTCTTTGT 3070 het 3070 ref 60 24 24 12 AT 0 1 333764 CASAVA_Build 20 42844487 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2391 hom 29 7 17 5 T 10 9 333765 CASAVA_Build 20 42869136 4D GGGCAACAAA ACAC/---- ACACACAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 7 AC 5 3 333766 CASAVA_Build 20 42910821 1I GCTAATAGTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 16 12 13 T 8 9 333767 CASAVA_Build 20 42929557 2I ACATGGTGAA --/AC CCCCCCCCCT 2590 het 740 hom 10 2 7 1 AC 0 1 333768 CASAVA_Build 20 42933224 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 A 9 8 333769 CASAVA_Build 20 42934659 1I AAGAAAAAAA -/C GGATGCATAG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 C 0 1 333770 CASAVA_Build 20 42935177 1D CTCCGTCACG A/- AAAAAAAAAA 2737 het 1921 hom 21 6 8 7 A 13 12 333771 CASAVA_Build 20 42935637 4D TTTAAGAAAT AAAC/---- AAAGAAACAG 3070 het 2439 hom 25 8 17 1 AAAC 1 0 333772 CASAVA_Build 20 42935931 1D GGATGTGGGT G/- GGAGGAGGGA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 G 3 2 333773 CASAVA_Build 20 42939155 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3049 het 2736 hom 17 8 7 3 A 12 11 333774 CASAVA_Build 20 42940480 5I TAAAATGTAT -----/ACAGA ACAGAAATGC 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 ACAGA 1 2 333775 CASAVA_Build 20 42962109 1D GTGTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1341 het 1341 ref 34 23 3 8 T 11 10 333776 CASAVA_Build 20 42990068 1I AATCATACTG -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 6 7 333777 CASAVA_Build 20 43029750 1I ACCAAGAGGT -/G GAAGAGAAGG 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 G 1 2 333778 CASAVA_Build 20 43031581 4I TGTGATTAAG ----/TGAA TGATGACAGA 3070 hom 150 het 58 0 49 9 TGAA 0 1 333779 CASAVA_Build 20 43032302 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 2851 hom 15 7 8 0 A 9 8 333780 CASAVA_Build 20 43040857 1D TCAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 848 het 848 ref 25 12 3 10 T 13 12 333781 CASAVA_Build 20 43044165 1D GTGTGACAGC T/- TTTTTTTTTT 2390 het 458 hom 44 7 8 30 T 19 18 333782 CASAVA_Build 20 43046154 1I GCACTTTTGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2974 hom 24 8 13 3 T 9 10 333783 CASAVA_Build 20 43046842 1I TAATTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 T 11 12 333784 CASAVA_Build 20 43051589 2D GCAAATATTT TC/-- TCTCATTCTG 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 TC 3 2 333785 CASAVA_Build 20 43055309 2I ATATATATGT --/AC ACACACACAC 3070 hom 117 het 48 0 40 8 AC 5 6 333786 CASAVA_Build 20 43058980 4D ATAAAAAAGC TTGA/---- TTGATGTTGT 3070 het 3070 ref 40 23 12 6 TTGA 2 1 333787 CASAVA_Build 20 43064958 1D TTGGGCAAGA T/- TTTTTTTTTT 1207 het 1207 ref 42 34 3 5 T 13 12 333788 CASAVA_Build 20 43072073 4D GTGCATTTTA TTTC/---- TTTCTTTTGC 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 TTTC 2 1 333789 CASAVA_Build 20 43082872 1D TATACAAGAC T/- TTTTTTTTTT 2710 het 2116 hom 25 8 8 9 T 13 12 333790 CASAVA_Build 20 43084113 1I TTACTTTCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 9 10 333791 CASAVA_Build 20 43088139 1I AACCCAGGCT -/C ATTTGTTTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 C 0 1 333792 CASAVA_Build 20 43094324 1I TATTTTATTC -/T TTTTTTTTAC 1809 het 1809 ref 28 16 7 6 T 8 9 333793 CASAVA_Build 20 43100376 6I ACCTTTTAAA ------/AATTAT AATTATAATA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AATTAT 1 2 333794 CASAVA_Build 20 43104271 3I TATTTTTCAC ---/TCT TCTTCTTTTG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 TCT 2 3 333795 CASAVA_Build 20 43104821 2D TGAGAAAAAA AC/-- ACAACTCAGG 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 AC 2 1 333796 CASAVA_Build 20 43107850 1D AGAAAGTGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 9 333797 CASAVA_Build 20 43114333 1D AACTCTTCCA C/- CCCCCCCAGC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 8 7 333798 CASAVA_Build 20 43117781 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 T 10 6 333799 CASAVA_Build 20 43127197 1I TTTGTTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 12 13 333800 CASAVA_Build 20 43127686 1I CTGGTTCTAC -/T ATTTTGTAGC 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 T 0 1 333801 CASAVA_Build 20 43139441 2I AATAGTTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 TC 6 7 333802 CASAVA_Build 20 43140228 2D TTCTGTCTTT AA/-- AAAAAAAAAT 2829 het 24 hom 10 1 7 2 A 11 9 333803 CASAVA_Build 20 43155460 1D ATCTTTTTTT C/- CCCCTCTGAG 3070 het 3070 ref 41 26 14 1 C 5 4 333804 CASAVA_Build 20 43188612 2I TTTTAAGTGC --/AT ATACTAACAG 3070 het 3070 ref 53 24 22 8 AT 1 2 333805 CASAVA_Build 20 43188720 1D TATTCCCCCC A/- CCCCCAGACC 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 1 0 333806 CASAVA_Build 20 43195489 4D GGATGTCTAT TTTG/---- TTTGTTCTAT 3070 het 3070 ref 33 21 11 2 TTTG 2 1 333807 CASAVA_Build 20 43326061 1I GGAGACAGGG -/C AAGGAGAAGC 3070 hom 74 het 29 0 23 6 C 0 1 333808 CASAVA_Build 20 43370732 5D GAGGAGAGAC TCTGG/----- TCCTGCCAAG 3070 het 3070 hom 26 10 9 10 TCTGG 1 0 333809 CASAVA_Build 20 43381420 1D GAACACGGGA T/- TAAAAAAAAA 3070 het 252 hom 33 1 26 6 T 2 1 333810 CASAVA_Build 20 43382843 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 11 10 333811 CASAVA_Build 20 43383944 4D AAAAAAAGAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 47 21 21 7 AAAC 3 2 333812 CASAVA_Build 20 43386734 2D TCGACTCTCC AG/-- ACACACTAGG 3070 het 3070 hom 58 24 28 6 AG 1 0 333813 CASAVA_Build 20 43387689 1I TTCCCCCCCC -/T CCTACCCAGG 3070 het 931 hom 25 4 11 10 T 0 1 333814 CASAVA_Build 20 43389747 1I TGCCCGAGCT -/G GAGTGCAGTG 3070 hom 90 het 32 0 29 3 G 1 2 333815 CASAVA_Build 20 43391827 2I ATTCCTCACC --/AT GCACATTCCA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 AT 0 1 333816 CASAVA_Build 20 43396008 3D TTAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAAT 3070 het 2504 hom 22 6 13 5 AAG 3 2 333817 CASAVA_Build 20 43398122 1I ACTCTACCTC -/T TAACTCACCG 3003 het 3003 ref 27 17 7 3 T 1 2 333818 CASAVA_Build 20 43406353 1I GTCCCCTCGA -/G GCCCCGGACA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 G 1 2 333819 CASAVA_Build 20 43410284 1I6M1D GCGTACCCCC -GATCTGC/TGATCTG- CCCCCCCCAT 982 hom 15 het 9 0 4 6 N/A 0 0 333820 CASAVA_Build 20 43422055 3D4M1D AGCAGAATGG GTAGGCAG/---GGCA- GGCCTTTCCT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 N/A 0 0 333821 CASAVA_Build 20 43437570 3D GGAACTCTTC ATT/--- ATTTTGTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 7 ATT 2 1 333822 CASAVA_Build 20 43438816 1I GAGGCATGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 228 hom 25 1 21 3 A 9 10 333823 CASAVA_Build 20 43441789 3D TCACCCTATG TTT/--- TTAATATCAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 5 2 333824 CASAVA_Build 20 43443896 1D AATATTTGTC T/- TTTTTTTGTG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 8 7 333825 CASAVA_Build 20 43444253 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 28 1 14 14 A 13 12 333826 CASAVA_Build 20 43452796 2D TGAGTGAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 959 het 959 ref 42 34 3 5 GT 7 6 333827 CASAVA_Build 20 43457652 2D TTCTTTTTCC TT/-- TTTTTTGTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 8 6 333828 CASAVA_Build 20 43460949 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 32 1 24 7 T 13 12 333829 CASAVA_Build 20 43463381 4I TAGGTGGAAG ----/GGAC GGACTTGCCT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 GGAC 1 2 333830 CASAVA_Build 20 43466019 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 27 1 22 4 A 11 12 333831 CASAVA_Build 20 43477221 1I TTCCCATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 33 1 28 4 A 10 11 333832 CASAVA_Build 20 43481480 1I AGCCGGGGGC -/G GGGGGGTGTA 3025 het 892 hom 27 8 13 6 G 6 7 333833 CASAVA_Build 20 43483331 1I CAGGGCTGTT -/C CCCCATCTAC 3070 hom 93 het 40 0 24 16 C 4 5 333834 CASAVA_Build 20 43489225 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 65 het 23 0 21 3 A 9 8 333835 CASAVA_Build 20 43489495 3I GACTTAACAC ---/GTG GTGTTCCTTA 3070 hom 92 het 34 0 30 4 GTG 1 2 333836 CASAVA_Build 20 43495956 1D17M1D CTGCTGCTGA TTTTTTTTTTTTTACCTGT/-TTTTTTTTTTTTACCTG- TTTTTTTTTT 3070 het 317 hom 29 2 22 9 N/A 0 0 333837 CASAVA_Build 20 43496736 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTG 1883 hom 10 het 9 0 4 5 T 9 10 333838 CASAVA_Build 20 43540686 1D AACCTAAATC T/- TTTTTTTTTT 895 het 895 ref 18 10 3 5 T 12 11 333839 CASAVA_Build 20 43548048 3D ATGGTTACAA GGT/--- CAAGCTTCCA 3070 hom 72 het 29 0 25 6 GGT 1 0 333840 CASAVA_Build 20 43548506 1D ACACAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 24 0 15 10 A 13 12 333841 CASAVA_Build 20 43550006 2D AGGTAAATAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 25 0 18 8 T 14 12 333842 CASAVA_Build 20 43574616 6D ACCTCTTGTT CACACA/------ CACACACACA 3070 hom 66 het 33 0 23 10 CA 11 8 333843 CASAVA_Build 20 43583561 2D ATTGCTGTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 40 1 33 6 T 12 10 333844 CASAVA_Build 20 43590978 1I TCAGCTTCCC -/A AAAATTGTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 4 5 333845 CASAVA_Build 20 43598305 2D GTATTCACAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 42 2 35 5 A 13 11 333846 CASAVA_Build 20 43613671 3D TCCGTCTCAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 20 1 17 3 A 15 12 333847 CASAVA_Build 20 43616209 1D ACCATGCCTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 110 het 42 0 33 18 T 8 7 333848 CASAVA_Build 20 43618485 2D GTAAAGCAGC AG/-- AGACAACTTG 3070 hom 75 het 32 0 26 8 AG 2 1 333849 CASAVA_Build 20 43621758 6D GCTTTCTACC TTTTAT/------ TTTTATTTTT 3070 het 140 hom 38 2 26 13 TTTTAT 3 2 333850 CASAVA_Build 20 43626933 3D GAGGAGAGGA GAG/--- GAGAAGAGAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 GAG 2 1 333851 CASAVA_Build 20 43627569 1D CCTCTTTAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 47 0 39 8 T 9 8 333852 CASAVA_Build 20 43628262 1D TCTACCAGCT A/- AAAAAACAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 6 333853 CASAVA_Build 20 43632492 6D AGTTTAAAAA ATTAAT/------ ATTTACATGT 3070 hom 72 het 27 0 25 4 ATTAAT 1 0 333854 CASAVA_Build 20 43661746 2I TATATGTGCA --/TC TCTTAGTGAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 TC 1 2 333855 CASAVA_Build 20 43701311 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 2126 het 24 hom 13 1 6 6 T 15 14 333856 CASAVA_Build 20 43761020 1D GAATCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 16 0 9 7 A 14 13 333857 CASAVA_Build 20 43792385 6I ATATTTGCCT ------/TATAAA TATGAGTGTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TATAAA 0 1 333858 CASAVA_Build 20 43794479 2I CTCTAAGGTT --/TC TGTTTGGCTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TC 0 1 333859 CASAVA_Build 20 43796192 2I CTTTCATGAT --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 9 11 333860 CASAVA_Build 20 43796706 2I GAACCCTATA --/AT AAACATTAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 0 1 333861 CASAVA_Build 20 43796929 2I ATCATGAGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 36 0 26 10 A 16 18 333862 CASAVA_Build 20 43796942 2I AAAAAAAAAA --/AC AAACGTAGAG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AC 0 1 333863 CASAVA_Build 20 43797316 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 28 1 20 9 A 13 12 333864 CASAVA_Build 20 43800479 1D TTCTCACCAC A/- AAAAAATAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 7 6 333865 CASAVA_Build 20 43803272 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1075 hom 33 4 24 5 A 10 11 333866 CASAVA_Build 20 43803692 8D AGACGCTGTC TAAATAAA/-------- TAAATAAATA 3070 hom 100 het 39 0 34 9 TAAA 4 2 333867 CASAVA_Build 20 43804342 4I CCCATGTCGG ----/CCTC CCTCCCAAAG 2256 het 135 hom 10 1 8 1 CCTC 1 2 333868 CASAVA_Build 20 43807046 4D7M2D ACATATATAC ACATATACATATG/----ATACATA-- TATATGTGTA 1049 hom 19 het 10 0 7 8 N/A 0 0 333869 CASAVA_Build 20 43807913 1D AAAGTTGCCT C/- CCTTCATGAT 3070 hom 84 het 32 0 28 5 C 3 2 333870 CASAVA_Build 20 43811778 4I CTTCTCTATT ----/TCTC TCTGTGTCAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TC 1 3 333871 CASAVA_Build 20 43827307 1I AGAATACTTT -/A AAAAAAAAAA 1546 het 1546 ref 21 10 6 5 A 16 17 333872 CASAVA_Build 20 43828726 2I ATATTTCTTG --/AT ATATATATAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AT 5 6 333873 CASAVA_Build 20 43845118 2D TCTGTCACAC TA/-- TATGAGCAAG 3070 hom 63 het 27 0 21 8 TA 2 1 333874 CASAVA_Build 20 43851252 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2751 het 12 hom 17 1 11 5 A 15 14 333875 CASAVA_Build 20 43858434 1D AAAGCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 224 hom 32 1 26 6 A 13 12 333876 CASAVA_Build 20 43876318 12D GTATGTGAGC ATATATATATAT/------------ ATATATATAT 3070 hom 38 het 16 0 14 4 AT 14 8 333877 CASAVA_Build 20 43877007 1I GCCTCAGCCT -/C CCGAGTAGCT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 2 3 333878 CASAVA_Build 20 43881033 3I CAGGGAAAAT ---/AAC ACAGCTCTGC 3070 hom 101 het 41 0 33 9 AAC 0 1 333879 CASAVA_Build 20 43881421 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 27 0 20 7 A 15 14 333880 CASAVA_Build 20 43902390 1I GAAGAACTAA -/C TGCTCTATGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 C 0 1 333881 CASAVA_Build 20 43914393 1D TTTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 1568 het 1568 ref 24 13 5 6 T 12 11 333882 CASAVA_Build 20 43916862 2D ACACCTCTAG CA/-- CAGAGGTCAC 3070 hom 72 het 30 0 23 7 CA 2 1 333883 CASAVA_Build 20 43918239 1D GGGCCCAGGA G/- GTCGAGGTTG 3070 het 3070 hom 37 14 12 11 G 2 1 333884 CASAVA_Build 20 43920825 1D CCTGCAGGGC T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 7 333885 CASAVA_Build 20 43921485 1I AAAAAAAAAA -/G AAGAAATGTA 3070 hom 99 het 40 0 33 7 G 0 1 333886 CASAVA_Build 20 43922474 4I GGCAGCAGAA ----/TTGC TTGCAGCCGG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 TTGC 1 2 333887 CASAVA_Build 20 43927541 5D TTCAAAAAAT AAAAA/----- GAAAAGAATA 3070 hom 42 het 15 0 15 4 A 5 0 333888 CASAVA_Build 20 43930467 2I TGTTTGGGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 23 0 15 8 T 12 14 333889 CASAVA_Build 20 43930836 3D TTTGCTAAAT ATA/--- ATAATAATAA 3070 hom 63 het 28 0 22 7 ATA 4 3 333890 CASAVA_Build 20 43932386 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 26 2 14 10 A 12 13 333891 CASAVA_Build 20 43933911 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 376 hom 26 1 22 3 A 13 14 333892 CASAVA_Build 20 43937529 1D CTTAATTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 11 10 333893 CASAVA_Build 20 43937789 9D CCTTGTGATC TGCCCTCCT/--------- TGGCCTCCCA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 TGCCCTCCT 1 0 333894 CASAVA_Build 20 43941927 7I CATAAGCACC -------/TTTTTGT TTTTTGTTTT 3070 hom 60 het 32 0 21 12 TTTTTGT 2 3 333895 CASAVA_Build 20 43951666 4I TCTCTCTCTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 hom 28 het 19 0 15 4 TCTT 2 3 333896 CASAVA_Build 20 43956850 1D CACACCCATT C/- CCCCACCTCA 3070 hom 74 het 29 0 21 9 C 5 4 333897 CASAVA_Build 20 43957507 2I ACTACAGACG --/CA CACCACCACC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 CA 1 2 333898 CASAVA_Build 20 43958654 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 11 10 333899 CASAVA_Build 20 43958872 1D AGAGAGGTGG C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 50 het 25 0 13 13 C 9 8 333900 CASAVA_Build 20 43974235 1I TTATAAAGCC -/G GGCCTCCCCG 1766 hom 12 het 5 0 5 0 G 2 3 333901 CASAVA_Build 20 43975498 3D ATTAATTAAT TAA/--- TTTTTTTGAG 772 het 367 hom 28 4 7 17 TAA 1 0 333902 CASAVA_Build 20 43986252 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 20 0 14 6 T 13 12 333903 CASAVA_Build 20 43989936 1D TTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 210 hom 35 3 22 11 A 14 13 333904 CASAVA_Build 20 43992487 1D GGCTGGTCTC T/- TAACTCCTGA 3070 hom 70 het 26 0 24 2 T 2 1 333905 CASAVA_Build 20 43999088 1I GCCAAAGCCA -/C CGTGCCCAGC 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 1 2 333906 CASAVA_Build 20 44008656 4D TGGGTTTCTC AGTG/---- AGTCAGTTCA 3070 hom 105 het 37 0 32 5 AGTG 1 0 333907 CASAVA_Build 20 44011623 1I ACCTGTTGGT -/G GGGGGGGGCG 3070 het 3070 ref 30 9 14 7 G 8 9 333908 CASAVA_Build 20 44017866 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 28 0 24 4 A 14 13 333909 CASAVA_Build 20 44066166 1I ACCCTGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 A 10 11 333910 CASAVA_Build 20 44072376 13I ACAAAAAAAA -------------/CAAACAAACAAAC AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 23 1 15 7 CAAACAAACAAAC 0 1 333911 CASAVA_Build 20 44077500 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 946 het 235 hom 17 3 5 9 T 15 14 333912 CASAVA_Build 20 44103210 1I GGAGCTTAAG -/A AAAAAAAAAA 2426 het 1224 hom 28 6 13 9 A 14 15 333913 CASAVA_Build 20 44110253 12D GAGTCGTGCC CTAAAAGCCCAG/------------ CCTTGTCTGA 3070 het 3070 hom 47 22 22 8 CTAAAAGCCCAG 1 0 333914 CASAVA_Build 20 44110925 1I AAAAAAAAAA -/G GGGGGAAATT 3070 het 193 hom 24 2 15 7 G 5 6 333915 CASAVA_Build 20 44112613 1I GGGGCACCCC -/T GATGGCTTGC 3070 hom 98 het 37 0 30 7 T 0 1 333916 CASAVA_Build 20 44138264 2D GATGCACCCC CT/-- GTGGCTGGGG 3070 het 3070 ref 44 24 14 9 CT 1 0 333917 CASAVA_Build 20 44163000 2D AAAAGAAACA CT/-- GTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 CT 1 0 333918 CASAVA_Build 20 44163316 1D CATAGATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 26 0 22 4 T 12 11 333919 CASAVA_Build 20 44166115 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 89 het 38 0 27 11 T 9 8 333920 CASAVA_Build 20 44168807 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 10 11 333921 CASAVA_Build 20 44169779 1D TTTTTTACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 362 hom 36 1 33 3 A 10 9 333922 CASAVA_Build 20 44173895 2D GGAGAGAGAG AA/-- GAGAAAAGAG 3024 het 3024 ref 27 14 9 4 A 2 0 333923 CASAVA_Build 20 44181059 1I GGAGACCCCT -/G GGGGAGATGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 4 5 333924 CASAVA_Build 20 44195542 1D GGAATCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 26 1 16 9 T 15 14 333925 CASAVA_Build 20 44204634 1D GCTATCTGCT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 63 het 33 0 24 9 G 10 9 333926 CASAVA_Build 20 44211274 3I CTGAGACTTG ---/TGT GAGTTCAGCA 3070 het 3070 ref 51 22 18 11 TGT 0 1 333927 CASAVA_Build 20 44224442 4D ATCAGCTCAT AAGA/---- AATCTGGACA 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 AAGA 1 0 333928 CASAVA_Build 20 44233786 4I GAAAGAAAAA ----/TAAG TAAAGAAAGA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 TAAG 0 1 333929 CASAVA_Build 20 44235436 1I ATGAGTGGGA -/T AGACTGATGG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 0 1 333930 CASAVA_Build 20 44245816 1I GCCACTAAGG -/C CTCCGCATTG 3070 hom 62 het 24 0 19 5 C 1 2 333931 CASAVA_Build 20 44251018 7D TCCAGGCTCC CCAAGAG/------- TTTCACGGGG 2532 het 2532 ref 22 9 9 4 CCAAGAG 1 0 333932 CASAVA_Build 20 44261994 7I CTTCCTTCTT -------/TCTTCTC TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 TCTTCTC 0 1 333933 CASAVA_Build 20 44271874 1D AACTGGTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2766 hom 31 10 11 10 T 10 9 333934 CASAVA_Build 20 44309094 1I TGACAACCTT -/C CCCCCCCACT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 C 7 8 333935 CASAVA_Build 20 44309401 1I AGGGTAAAAA -/C AGTTGGCCCT 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 C 0 1 333936 CASAVA_Build 20 44328958 1D TATAGGGTGC T/- TTTTTTTTTT 3052 het 2294 hom 32 10 9 13 T 14 13 333937 CASAVA_Build 20 44337839 1D ACCATAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 A 12 11 333938 CASAVA_Build 20 44338874 2I CCAGATCCAC --/AA AGAGTGTGAG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 1 3 333939 CASAVA_Build 20 44343508 2D AAAAAATCAC AT/-- ACGCCTACCC 3070 het 3070 ref 50 26 19 7 AT 1 0 333940 CASAVA_Build 20 44372383 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3024 hom 32 8 20 4 T 9 10 333941 CASAVA_Build 20 44374973 1I GCCGAGGCCG -/C TGCGCCCTTA 1944 hom 15 het 10 0 6 4 C 0 1 333942 CASAVA_Build 20 44382738 1D GATACATACG A/- AAAAATTGCA 3070 hom 114 het 41 0 39 4 A 6 5 333943 CASAVA_Build 20 44401472 1I GGGTCTGCAG -/C CATCCAGTGA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 C 1 2 333944 CASAVA_Build 20 44405808 2I CTGTCCCCGC --/GT GTCCCCCCTT 3070 hom 77 het 30 0 21 9 GT 1 2 333945 CASAVA_Build 20 44406346 1D CTGGAAAGCA G/- GGGCTGTTCA 3070 hom 135 het 51 0 45 7 G 4 3 333946 CASAVA_Build 20 44408264 1D GCCTGTTTCT G/- GGAAGTATGT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 G 3 2 333947 CASAVA_Build 20 44419010 14D TCAGGATGGA ACACAAACTCCTCC/-------------- ACGGGGAATC 3070 hom 69 het 22 0 22 3 ACACAAACTCCTCC 1 0 333948 CASAVA_Build 20 44422598 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 65 het 26 0 22 4 T 10 9 333949 CASAVA_Build 20 44422940 3D GTTTTTATTA ATC/--- ATATGTTTCA 2521 het 2521 ref 26 19 7 1 ATC 1 0 333950 CASAVA_Build 20 44430742 1D CATCTGGGTG C/- CCCCCCAACC 3070 hom 111 het 42 0 36 8 C 7 6 333951 CASAVA_Build 20 44439219 3I GCCCATGAAA ---/TGT TGTTAGGCCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TGT 1 2 333952 CASAVA_Build 20 44446598 1D ATTCAGAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 5 A 11 10 333953 CASAVA_Build 20 44499306 7I GTGGTTCCTT -------/GGGGATG GGGGATTGGG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 GGGGATG 0 1 333954 CASAVA_Build 20 44502787 2I GGTTAAACGA --/AC AGTGGTGCAC 3070 hom 138 het 50 0 45 5 AC 0 1 333955 CASAVA_Build 20 44518845 3I AGATTCCTTC ---/TTT AAGACTCTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 0 3 333956 CASAVA_Build 20 44519172 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 A 10 11 333957 CASAVA_Build 20 44525742 1I TTTTTGAAAC -/T TTTTTTCCAC 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 T 6 7 333958 CASAVA_Build 20 44526738 4I GCAAAGCAGC ----/TTCT TTGTTATCAC 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 TTCT 0 1 333959 CASAVA_Build 20 44531581 1D CACTGGGCTA T/- TTTTTTTTTG 2003 het 1529 hom 13 5 7 1 T 10 9 333960 CASAVA_Build 20 44555137 1D CTGTCTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 148 hom 30 1 21 8 A 15 14 333961 CASAVA_Build 20 44560011 2I AGATTTCCCC --/CT GTCTATGGAA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 CT 0 1 333962 CASAVA_Build 20 44614345 1D CAAAGTGTAG C/- CCCCCCCACT 3070 hom 101 het 39 0 32 8 C 8 7 333963 CASAVA_Build 20 44618086 1D ATCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 39 1 30 8 A 11 10 333964 CASAVA_Build 20 44620141 4I ATACAGTGTC ----/CTAA CTATTAAGGA 3070 hom 120 het 47 0 41 6 CTAA 0 1 333965 CASAVA_Build 20 44640886 2I AAGTGATGGA --/GT GTGAGTCACG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 GT 1 2 333966 CASAVA_Build 20 44659326 1I TAAAAGATCA -/T TAATGTTGGC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 2 333967 CASAVA_Build 20 44674109 4I TGACATTTTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TCTT 2 3 333968 CASAVA_Build 20 44674654 1D GTCTGTGTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 30 1 23 7 A 13 12 333969 CASAVA_Build 20 44695620 1D CCCAGCCTCT G/- GGGCAACTCT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 G 4 3 333970 CASAVA_Build 20 44698861 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 27 hom 16 1 10 5 T 10 9 333971 CASAVA_Build 20 44699342 1D TCCACTGCTC A/- CAGTCCCTCG 3070 hom 48 het 22 0 16 6 A 1 0 333972 CASAVA_Build 20 44784179 1D GTTTCTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 A 10 9 333973 CASAVA_Build 20 44790001 1D AGTGGAAGAA C/- CCCCCCTATC 3070 het 3070 hom 43 21 17 5 C 7 6 333974 CASAVA_Build 20 44796341 1D ACTCTTATCA T/- TTTTTTTTTT 2418 het 2418 ref 28 13 8 7 T 12 11 333975 CASAVA_Build 20 44799597 2D GAAATGACAC AT/-- GTCAGTCACT 3070 het 3070 ref 36 16 15 6 AT 1 0 333976 CASAVA_Build 20 44809412 3I TACTGCACAT ---/TTC TTCTTTCTTG 3070 het 3070 hom 58 24 24 10 TTC 1 2 333977 CASAVA_Build 20 44810565 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 964 hom 20 6 11 4 A 13 11 333978 CASAVA_Build 20 44824352 7D TCTTTCTCAA ATGGGTC/------- TAACCATTTA 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 ATGGGTC 1 0 333979 CASAVA_Build 20 44827407 1I GCAGCCAAGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 7 8 333980 CASAVA_Build 20 44881454 1I TTCAGATGGT -/C CCTAAATTTT 3070 het 3070 hom 35 9 21 5 C 2 3 333981 CASAVA_Build 20 44882925 1D ACAGGGGGAG C/- TGTCCCTAGG 3070 hom 132 het 49 0 44 6 C 1 0 333982 CASAVA_Build 20 44883671 2D TTTAGGCTTT TG/-- TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 TG 1 0 333983 CASAVA_Build 20 44886168 1I CCCTATAAAT -/G GCCCTAGTGG 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 G 1 2 333984 CASAVA_Build 20 44887918 1D GGATCTACTT G/- GGGGGGGAAG 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 G 8 7 333985 CASAVA_Build 20 44889885 2D TCCCCACCTC AG/-- GGTACATGGC 2843 het 2843 ref 29 17 8 5 AG 1 0 333986 CASAVA_Build 20 44891027 4I ATTATCTGCT ----/GAAA GATGCGATGC 3070 het 3070 hom 50 19 22 9 GAAA 0 1 333987 CASAVA_Build 20 44892543 1I CAATTGGGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 9 10 333988 CASAVA_Build 20 44892651 1D GGTGATTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 6 A 12 11 333989 CASAVA_Build 20 44895736 1I CCCTGAAGGG -/T CCCCACAGAT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 0 1 333990 CASAVA_Build 20 44897225 2I TTTATGTGTC --/TA TATATATATA 2430 hom 12 het 8 0 5 3 TA 5 6 333991 CASAVA_Build 20 44905121 1D CATCCTTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 A 10 9 333992 CASAVA_Build 20 44908720 2D TCACTGCAAG CT/-- CCACCTCCCG 1516 het 204 hom 7 1 4 3 CT 1 0 333993 CASAVA_Build 20 44942252 1D TTCATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1699 het 1699 ref 32 22 6 4 T 13 12 333994 CASAVA_Build 20 44975634 4D CTGTTCAGAC AGGG/---- AGGTGACGGT 3070 hom 108 het 40 0 34 12 AGGG 1 0 333995 CASAVA_Build 20 44978467 2D TGTCAGAGTC TG/-- TGTGAATATG 3070 hom 153 het 56 0 51 7 TG 3 2 333996 CASAVA_Build 20 44982281 1I TAATTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 900 hom 37 2 30 5 A 11 12 333997 CASAVA_Build 20 44986716 10D ACTCCATCTC AAAAAAAAAA/---------- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 14 0 9 7 A 24 14 333998 CASAVA_Build 20 44991466 2I GAGAAGGGGC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 9 11 333999 CASAVA_Build 20 45005487 2D AGAAAATGTA TC/-- TCTCTCCCAG 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 TC 4 3 334000 CASAVA_Build 20 45006618 3I TCTCCAAAAT ---/GAG GAGAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 GAG 1 2 334001 CASAVA_Build 20 45020497 1I TGTAATTATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 A 9 10 334002 CASAVA_Build 20 45031266 1I TTGTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 10 11 334003 CASAVA_Build 20 45032995 1I ATACTATGAC -/A GGGGGAAATA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 0 1 334004 CASAVA_Build 20 45036794 1I TTGGCTTTTC -/T TTTTTTTCTT 2358 het 2358 ref 27 14 8 5 T 7 8 334005 CASAVA_Build 20 45038438 16I GTTTTTGGGT ----------------/TTTGTTTGTGTGTTTA TTTGTTTTGT 321 het 321 ref 28 18 1 9 TTTGTTTGTGTGTTTA 0 1 334006 CASAVA_Build 20 45038847 1I GAGGAGCGAC -/A ATGCAAACGG 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 1 2 334007 CASAVA_Build 20 45038956 1I GCTCCAGTCA -/T TGTGGAATTC 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 1 2 334008 CASAVA_Build 20 45042494 1I TGTGCTGAAA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 8 9 334009 CASAVA_Build 20 45043958 5I29M3D GTAACTAATG -----TAATATAAACATACATGAAATGTTTACATTTA/TAATATAATATAAACATACATGAAATGTTTACAT--- TTATTATTCT 3070 het 3070 ref 42 28 21 4 N/A 0 0 334010 CASAVA_Build 20 45045009 1D TAGTAGAGGT G/- GGGTTTCACC 3070 het 2447 hom 15 6 9 0 G 4 3 334011 CASAVA_Build 20 45046428 2D AATCAGTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 14 8 A 12 10 334012 CASAVA_Build 20 45063834 1D CTCTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 35 1 24 10 T 14 13 334013 CASAVA_Build 20 45066538 4I TTTGTTTCTT ----/ACTC ACATAAAGTC 3070 hom 147 het 56 0 48 8 ACTC 0 1 334014 CASAVA_Build 20 45072411 1D CTAGATGGCA C/- CAGTGGGGCC 3070 hom 72 het 31 0 23 8 C 2 1 334015 CASAVA_Build 20 45072675 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2488 het 329 hom 9 1 7 1 A 10 11 334016 CASAVA_Build 20 45073677 18D ACAGGTATTC CTTCGGGTGTCCACAAGT/------------------ CTTGCTCCTT 3070 hom 135 het 45 0 45 5 CTTCGGGTGTCCACAAGT 1 0 334017 CASAVA_Build 20 45082206 1I ATATAATTTT -/A TAGAAGCAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 0 1 334018 CASAVA_Build 20 45089057 3I GCTCCATATT ---/TTC TTAACTGAAC 3070 hom 113 het 41 0 33 8 TTC 0 1 334019 CASAVA_Build 20 45092584 2I ATATCCCAGG --/GA GAGGATACAG 3070 hom 61 het 23 0 18 5 GA 1 2 334020 CASAVA_Build 20 45093059 1D ATACAGTCAC A/- ATTGGGGGTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 2 1 334021 CASAVA_Build 20 45101158 2D ATGTCGAAAT CA/-- CACACACACA 3070 hom 97 het 41 0 33 8 CA 10 9 334022 CASAVA_Build 20 45107928 3D GGGTGTTACA GAG/--- GAGGAGACCC 3070 hom 123 het 47 0 40 7 GAG 3 2 334023 CASAVA_Build 20 45111239 2I AAGATAGTAC --/AG AGAGTTCCCT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AG 2 3 334024 CASAVA_Build 20 45111630 27D GCTCTGTCTC GTCGTGTGACACCCCCTGCTCCATGTT/--------------------------- GTCATGTGAC 3070 hom 61 het 21 0 18 7 GTCGTGTGACACCCCCTGCTCCATGTT 1 0 334025 CASAVA_Build 20 45119861 1I AACTAAGGCA -/G GGCAGTGGCC 3070 het 3070 ref 46 17 16 13 G 2 3 334026 CASAVA_Build 20 45120172 1I AAAGGAGGAA -/G GGTTTGCATG 3070 hom 99 het 41 0 32 9 G 2 3 334027 CASAVA_Build 20 45122448 2I CACATGACTC --/AG GGGAGGAGGT 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 AG 0 1 334028 CASAVA_Build 20 45131705 1I TGGATACCCC -/T TTCTCCATGA 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 T 2 3 334029 CASAVA_Build 20 45131912 2D ATATATGCAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 15 18 8 AT 6 5 334030 CASAVA_Build 20 45144487 3D AAAATCAACA AAC/--- AACAGGAAAT 3070 het 3070 ref 42 26 15 2 AAC 2 1 334031 CASAVA_Build 20 45146881 1D TGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1422 het 477 hom 14 2 6 6 T 19 18 334032 CASAVA_Build 20 45148580 1D AGGAAAAGGA G/- GGGGTCAGGG 3070 het 3070 ref 29 13 10 7 G 5 4 334033 CASAVA_Build 20 45148978 2D GGGGGCAAAC AA/-- ATGTTTTCTA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 3 1 334034 CASAVA_Build 20 45157060 1I GCCCTGTCTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 8 9 334035 CASAVA_Build 20 45161868 6D CATAATTATG TTTATT/------ TTTATTTTAT 3070 hom 75 het 28 0 25 6 TTTATT 2 1 334036 CASAVA_Build 20 45173367 1I GCTACAAAAC -/A AATCACCCCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 2 3 334037 CASAVA_Build 20 45175903 1I CCTAGATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1013 hom 40 3 24 13 T 12 13 334038 CASAVA_Build 20 45180555 2I CATTGTTTGA --/GG GGTGTTGGAT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 G 2 4 334039 CASAVA_Build 20 45182860 1I AAGATGAATA -/T TTTTTTACTT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 6 7 334040 CASAVA_Build 20 45189155 1D AATCTCTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 11 10 334041 CASAVA_Build 20 45195233 1D CAGGAAGGCT C/- TGCCTGTAGG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 1 0 334042 CASAVA_Build 20 45211735 7D CTAAAAATAC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 1923 hom 14 het 16 0 9 7 A 23 16 334043 CASAVA_Build 20 45225084 1I TGTATCACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 739 hom 30 2 20 8 T 12 13 334044 CASAVA_Build 20 45238459 1I CAGTCATTTC -/A GAGGATGATC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 A 0 1 334045 CASAVA_Build 20 45238852 2D TCCTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 30 0 19 11 T 13 11 334046 CASAVA_Build 20 45240544 2I GGGAACAAAC --/AA GAGGCCTCCA 3070 hom 114 het 44 0 35 9 A 0 2 334047 CASAVA_Build 20 45242263 2I AATTTTTGTA --/TT TTTAGTAGAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 3 5 334048 CASAVA_Build 20 45243777 1D AGCAAAAAAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 A 8 7 334049 CASAVA_Build 20 45249114 1I CTCTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 341 hom 35 1 29 5 A 11 12 334050 CASAVA_Build 20 45249528 1I TTAGTGTCAT -/C CTGACCTGGC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 C 1 2 334051 CASAVA_Build 20 45257995 1I TGACAAGATA -/T TCAGAAGGTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 1 2 334052 CASAVA_Build 20 45262378 1D TTTAACTAGA C/- CCCCCCCCTT 3070 het 1256 hom 17 3 10 4 C 9 8 334053 CASAVA_Build 20 45263964 1D AATGAGACTC T/- TGTCTCAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 2 1 334054 CASAVA_Build 20 45271508 1D AGCTAGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 24 1 16 8 T 12 11 334055 CASAVA_Build 20 45276099 2D TAACTAAAAT TC/-- TCTCTCTTCC 3070 het 3070 hom 52 18 26 8 TC 4 3 334056 CASAVA_Build 20 45279673 5D CTGGAGAGAT CTGAA/----- CTGAAGTCTT 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 CTGAA 2 1 334057 CASAVA_Build 20 45284143 2D CTGCTGATTT AG/-- AGTTACTCTA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 AG 2 1 334058 CASAVA_Build 20 45288792 1D ATATGTCCAC G/- GCATGCGGAG 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 G 2 1 334059 CASAVA_Build 20 45289782 3D ACTCTTACAT AAC/--- AACATTTAGG 3070 het 3070 hom 43 16 19 12 AAC 2 1 334060 CASAVA_Build 20 45293168 1I TTATAGTCCA -/T TTTACAGATA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 T 3 4 334061 CASAVA_Build 20 45311127 3I ATGCGTACTG ---/AGA AGGAGAGCAG 3070 hom 129 het 48 0 42 6 AGA 0 1 334062 CASAVA_Build 20 45311807 1D TTTAAACAGT C/- CACTGAACAA 3070 het 3070 hom 53 21 30 2 C 2 1 334063 CASAVA_Build 20 45322620 21D CAACACACCC AGTTACTCCTATAGCACACCA/--------------------- ACTTAATCCT 3070 hom 81 het 27 0 28 7 AGTTACTCCTATAGCACACCA 1 0 334064 CASAVA_Build 20 45325440 3D CACTAACAAC AAT/--- GACAGCCAAC 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 AAT 1 0 334065 CASAVA_Build 20 45325591 2D GCACTTGCCT CA/-- GTTTCCTCAC 3070 het 3070 hom 43 20 19 8 CA 1 0 334066 CASAVA_Build 20 45326816 1D TTCCTTCACT G/- GGGGGGGCTG 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 G 8 7 334067 CASAVA_Build 20 45327205 2I ATATATATAC --/AT ATATATATAT 1651 hom 12 het 9 0 4 5 AT 7 8 334068 CASAVA_Build 20 45329647 1D AGGGCCGGGG C/- GGGGGGGGGG 3070 hom 35 het 20 0 13 8 C 1 0 334069 CASAVA_Build 20 45330131 1D GCCTACTGTC T/- TTCCTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 T 3 2 334070 CASAVA_Build 20 45330869 1D CGGAGGTGGC G/- AGTGAGCCGA 3070 hom 38 het 25 0 18 7 G 1 0 334071 CASAVA_Build 20 45336225 2D AAGAATGAGG TA/-- TATTTTTCCA 3070 hom 125 het 45 0 42 4 TA 2 1 334072 CASAVA_Build 20 45350000 10I CACACACACA ----------/CACGCACACT CACGCACACA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 CACGCACACT 0 1 334073 CASAVA_Build 20 45351764 1I TGATCGAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 645 hom 48 3 38 7 A 11 12 334074 CASAVA_Build 20 45356520 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAAAA 776 het 286 hom 18 1 5 12 AAC 1 0 334075 CASAVA_Build 20 45359573 1D CCAATGTACC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 51 1 43 8 T 10 9 334076 CASAVA_Build 20 45364155 3I GCAGCCATGT ---/GAA GAAGGACGTG 3070 hom 51 het 24 0 18 6 GAA 1 2 334077 CASAVA_Build 20 45364361 2I GGCGTGGTGG --/CT CACGCCTGTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 CT 0 1 334078 CASAVA_Build 20 45393802 3D TGGCCAGAGA GAG/--- GAGGAGAAGG 3070 het 3070 ref 38 22 11 7 GAG 3 2 334079 CASAVA_Build 20 45420777 1D GCTTTCCCTG C/- CCCCCCCCAA 3070 het 2559 hom 24 8 13 3 C 9 8 334080 CASAVA_Build 20 45426575 4D TACTAGTTTT TTTG/---- TTTGTTTTTG 1946 het 1946 ref 14 5 6 4 TTTG 2 1 334081 CASAVA_Build 20 45444128 1I GTTTTTTTTT -/G TTTGTTTCTT 3070 het 1674 hom 19 7 9 3 G 0 1 334082 CASAVA_Build 20 45475806 1I TCCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3019 het 1372 hom 26 8 12 6 A 13 14 334083 CASAVA_Build 20 45479596 4D CCAGGGCTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 45 23 18 6 TTTG 3 2 334084 CASAVA_Build 20 45480728 1D AATCATCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 22 10 T 12 11 334085 CASAVA_Build 20 45489072 4D CCCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 4 AAAC 5 4 334086 CASAVA_Build 20 45489977 2D GATTCTGCCC TT/-- TTTTTTTTTT 2828 het 1890 hom 24 6 9 9 T 13 11 334087 CASAVA_Build 20 45490242 1I TGAAATTGAG -/A AACCCTGATC 3070 het 3070 hom 19 7 11 1 A 2 3 334088 CASAVA_Build 20 45491407 1I TATCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2842 het 2842 ref 20 9 8 3 T 9 10 334089 CASAVA_Build 20 45495168 6D AAAAAAAAAA AAAAAG/------ AGGAAGAAGA 3070 het 666 hom 30 9 16 8 AAAAAG 1 0 334090 CASAVA_Build 20 45518768 1I CCCCACTATG -/T TGGTTAATGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 1 2 334091 CASAVA_Build 20 45522256 1I CTATCGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 25 2 17 6 T 11 12 334092 CASAVA_Build 20 45527526 3D GCCAGGCTAA TTT/--- TTTGTATTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 6 3 334093 CASAVA_Build 20 45533585 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 28 2 21 5 A 13 12 334094 CASAVA_Build 20 45539917 4D TGAACTTGTC TGAT/---- TGTATCCACA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TGAT 1 0 334095 CASAVA_Build 20 45543103 2D CTTCCTTCTT TC/-- TCTCTTTCCT 3070 hom 41 het 17 0 12 5 TC 3 2 334096 CASAVA_Build 20 45543365 9D GTGCAATCTC ACTGCAGGT/--------- TGCTCACTGC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 ACTGCAGGT 1 0 334097 CASAVA_Build 20 45552959 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1141 het 154 hom 13 2 5 7 A 20 18 334098 CASAVA_Build 20 45553745 1D TTTTTAACTT A/- AAAGTGTCTG 3070 hom 91 het 33 0 30 4 A 4 3 334099 CASAVA_Build 20 45557497 4I CTTCACCTGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AAAC 3 4 334100 CASAVA_Build 20 45558793 1I TATGATTTAG -/T TTTTTTTTCT 2582 het 267 hom 17 1 15 1 T 8 9 334101 CASAVA_Build 20 45560516 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 12 11 334102 CASAVA_Build 20 45568920 1D CATCTGTGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 8 334103 CASAVA_Build 20 45583792 28D CAGGGTGGAG CAGGTAATCAGAATAAGTCAGAGTGGAA/---------------------------- CAGGTAATCA 3070 hom 84 het 33 0 28 7 CAGGTAATCAGAATAAGTCAGAGTGGAA 1 0 334104 CASAVA_Build 20 45596418 1D GGGATTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 29 2 21 6 A 17 16 334105 CASAVA_Build 20 45599836 1D GTTCAAGTGA T/- TCTCCTGCCT 3070 hom 52 het 20 0 18 2 T 2 1 334106 CASAVA_Build 20 45610391 1D AGGTTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 12 11 334107 CASAVA_Build 20 45628523 11D ATGAAATCCA CCATTATATAG/----------- CGCTATCTGT 3070 hom 30 het 11 0 11 2 CCATTATATAG 1 0 334108 CASAVA_Build 20 45636154 1D TGAGATCTAA C/- ACCATTTGTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 1 0 334109 CASAVA_Build 20 45676220 1I7M3I CAGTTCCACG -TTATAAA---/TTTATGAACTT AGCTCTTCCC 3070 hom 90 het 32 0 31 4 N/A 0 0 334110 CASAVA_Build 20 45682246 2I CACCTGGCTC --/TT TTTAATTATT 3070 hom 38 het 17 0 12 5 T 3 5 334111 CASAVA_Build 20 45693444 1D GCAGTTTTGG T/- TCCTTGAGCC 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 T 2 1 334112 CASAVA_Build 20 45719039 12D GCCTAAAGAG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 42 0 33 9 T 24 12 334113 CASAVA_Build 20 45732853 6D GTGGGAGAAC GGGGTG/------ GGGGTGGGAG 574 het 34 hom 5 1 2 2 GGGGTG 2 1 334114 CASAVA_Build 20 45749835 2D TGTCTGTAAC TG/-- TGTATTTTTG 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 TG 2 1 334115 CASAVA_Build 20 45758554 1I CTCCTTACCA -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 C 7 8 334116 CASAVA_Build 20 45766429 1I TGCATGTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 T 10 11 334117 CASAVA_Build 20 45775913 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAAAA 3070 hom 27 het 23 1 22 0 T 0 1 334118 CASAVA_Build 20 45783298 1D TCTGCTTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 10 9 334119 CASAVA_Build 20 45785395 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2891 hom 26 10 9 7 A 8 9 334120 CASAVA_Build 20 45790796 4D GAGCTGGCAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2857 hom 24 7 12 6 TTTA 3 2 334121 CASAVA_Build 20 45794203 1I CATTGCTAAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 8 9 334122 CASAVA_Build 20 45805498 1I TCTCACTCTG -/C TACCCAGGCT 3070 hom 96 het 36 0 29 7 C 0 1 334123 CASAVA_Build 20 45817174 1D TTGTTAAGAC G/- GGGGGGGTCT 3070 het 2892 hom 28 12 13 3 G 8 7 334124 CASAVA_Build 20 45831199 1D GCCTGCCTCA T/- TTTTTTTTTG 3056 hom 30 het 15 0 10 5 T 10 9 334125 CASAVA_Build 20 45833439 1D GTCAGGTCCA G/- GGGGTTCTGA 3070 hom 86 het 33 0 27 7 G 5 4 334126 CASAVA_Build 20 45846549 3D CTTTCAAGGG GGA/--- GGAGGAGGAG 3070 hom 91 het 35 0 28 7 GGA 5 4 334127 CASAVA_Build 20 45863289 2D TATGTGTGTA TG/-- TGAGTGTATG 3070 hom 159 het 66 0 55 12 TG 2 1 334128 CASAVA_Build 20 45870314 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 10 hom 21 1 11 10 A 14 12 334129 CASAVA_Build 20 45871228 1I TTCTTTTTAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 10 334130 CASAVA_Build 20 45900607 1I CCTATGCCAA -/C CAGGACCACA 3070 hom 63 het 22 0 21 1 C 1 2 334131 CASAVA_Build 20 45902377 1D ACTTATCCTT A/- AAAAACATGC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 6 5 334132 CASAVA_Build 20 45906373 24D AAAAAGAAAG AAAGAAAGGAAGAAAGGAAGAAAC/------------------------ AAAGAAAGGA 3070 het 3070 ref 29 16 12 11 AAAGAAAGGAAGAAAGGAAGAAAC 1 0 334133 CASAVA_Build 20 45911255 2D TGCCACCCAG CA/-- CACACACAAG 3070 hom 98 het 38 0 32 6 CA 5 4 334134 CASAVA_Build 20 45913239 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 8 7 334135 CASAVA_Build 20 45916377 2D ATCTCCATTT AA/-- AAAAAAAAAA 1935 het 278 hom 14 1 6 7 A 18 16 334136 CASAVA_Build 20 45922389 1D TGGGTGACAG T/- TTTGAGTTCA 3070 het 3070 ref 64 31 27 7 T 4 3 334137 CASAVA_Build 20 45924351 1D GATTTAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2188 hom 27 8 10 9 T 13 12 334138 CASAVA_Build 20 45929259 1I GCTGTGAAGC -/A AATTCCTGGA 2950 het 2950 ref 24 14 8 2 A 2 3 334139 CASAVA_Build 20 45945288 1I6M1D ATTGCCACAG -CAAGGCT/CCAAGGC- TAAGCCCTGG 2899 hom 83 het 29 0 21 10 N/A 0 0 334140 CASAVA_Build 20 45960265 3D GAGCCGGTGC TAT/--- TATTGTTCAT 3070 het 3070 ref 43 27 13 6 TAT 2 1 334141 CASAVA_Build 20 45965083 3I ATTTAAAATC ---/TTG TTTTCTTCTA 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 TTG 0 1 334142 CASAVA_Build 20 45965666 4D CATTGGAAAC AATT/---- AATACTGCTC 1617 het 1617 ref 14 9 4 1 AATT 1 0 334143 CASAVA_Build 20 45972641 1I TTAGACACCC -/T GGTATACTCT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 0 1 334144 CASAVA_Build 20 45973303 1D GGTATGCATG T/- CAGCTGCTAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 1 0 334145 CASAVA_Build 20 45974193 1D CTTATAAGGA C/- CCCTGTGATT 2321 het 2321 ref 16 9 5 2 C 4 3 334146 CASAVA_Build 20 45974866 1I TCCCCCACAT -/C CCCTTTCAGG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 3 4 334147 CASAVA_Build 20 45985113 1I TCTCTGCCCT -/G GCTGTTCTGT 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 G 1 2 334148 CASAVA_Build 20 45993389 1I GGTGCTGCAA -/G CCAGAGAAAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 G 0 1 334149 CASAVA_Build 20 45999373 1D TTCTAAAGCA T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 7 6 334150 CASAVA_Build 20 46000244 5D AAAATGTATT AAATC/----- AAACAGTTGT 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 AAATC 1 0 334151 CASAVA_Build 20 46002447 1D CAAGAAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 10 9 334152 CASAVA_Build 20 46026737 1D AATAATCCTT A/- AAACTGAGTA 3070 hom 90 het 39 0 31 9 A 4 3 334153 CASAVA_Build 20 46049671 1D TCTCGGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 13 6 A 18 17 334154 CASAVA_Build 20 46073069 18D CACCATCAAT ATCACCATTACCTTCATC/------------------ ATCACCATCA 3070 het 2295 hom 60 25 18 30 ATCACCATTACCTTCATC 1 0 334155 CASAVA_Build 20 46089759 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 4 T 15 14 334156 CASAVA_Build 20 46095689 1I GCGTGAACCC -/G GGAGGCGGAG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 2 3 334157 CASAVA_Build 20 46097957 1I AGTTATGGAG -/T GGGGTCAGGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 0 1 334158 CASAVA_Build 20 46104624 1D ATGAAAAAAA G/- TCAACCAGGA 3070 hom 132 het 51 0 43 9 G 1 0 334159 CASAVA_Build 20 46108184 3D AGCTCCCTTC TTT/--- GTGTTTCTTA 3070 hom 120 het 47 0 40 8 T 3 0 334160 CASAVA_Build 20 46110699 1I AAGAATTACT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 8 9 334161 CASAVA_Build 20 46118625 5I TCAAGAGACA -----/TTCAT CTCATCAGGA 3070 hom 103 het 41 0 34 7 TTCAT 0 1 334162 CASAVA_Build 20 46120530 2I AGCCTGGGCT --/TA TCTCTCTCAT 3070 hom 123 het 47 0 39 8 TA 0 1 334163 CASAVA_Build 20 46127475 1I CTTTGATAAT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 7 8 334164 CASAVA_Build 20 46137726 1I GGAAGCAAAT -/G TCCTCCCTTG 3070 hom 68 het 27 0 21 6 G 0 1 334165 CASAVA_Build 20 46147259 1D TACAAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 516 hom 30 2 17 11 A 14 13 334166 CASAVA_Build 20 46177898 1D ATTGAAAATG A/- AAAAAAAAAA 2570 het 2432 hom 22 10 8 4 A 15 14 334167 CASAVA_Build 20 46191253 1D GGTAAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2163 hom 42 9 19 14 A 14 13 334168 CASAVA_Build 20 46201145 1D TGTGGGATCA G/- GGGCCCCCAA 2007 het 2007 ref 31 8 8 15 G 4 3 334169 CASAVA_Build 20 46204237 1D AAATAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 24 1 14 9 A 12 11 334170 CASAVA_Build 20 46209562 2D AGGCAGAAGC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 48 21 14 14 AG 8 7 334171 CASAVA_Build 20 46224374 8D TTTTTTGTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 TTTG 5 3 334172 CASAVA_Build 20 46235661 1D GGTATAGCAA T/- TGAGCTGCCC 3070 het 3070 ref 47 28 17 2 T 2 1 334173 CASAVA_Build 20 46236701 1D GCAACTTGGG T/- ATCACCGGGA 3070 het 3070 hom 50 24 25 3 T 1 0 334174 CASAVA_Build 20 46237410 3I CCTGAGAGAC ---/CTT CTGCTTAGTC 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 CTT 0 1 334175 CASAVA_Build 20 46254358 1D GAGTCAGGAG C/- CCCCCCCCCT 1776 het 794 hom 12 3 7 2 C 10 9 334176 CASAVA_Build 20 46260939 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAGAAGAAGA 3070 het 2128 hom 23 6 16 3 AAAAG 1 0 334177 CASAVA_Build 20 46261144 1I AGTTGACAAA -/C CCAGTCAACC 3070 hom 123 het 45 0 36 9 C 2 3 334178 CASAVA_Build 20 46267594 1D GGCAGGGACA C/- TGGGGACCTG 3070 het 2965 hom 39 13 17 9 C 1 0 334179 CASAVA_Build 20 46275261 1I GTAGTGGCAA -/G GGGGGTCCCC 1398 het 1398 ref 30 14 5 11 G 5 6 334180 CASAVA_Build 20 46276680 1I CTGGGTCCTC -/T CCCCAACCTC 2293 hom 27 het 11 0 7 4 T 0 1 334181 CASAVA_Build 20 46277426 5D GTGTTTGGCT AAATA/----- AAATAATCAG 3070 hom 177 het 62 0 58 7 AAATA 2 1 334182 CASAVA_Build 20 46278838 3D AAACAGCTAA CAT/--- CATAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 CAT 2 1 334183 CASAVA_Build 20 46279233 2D AATATAATAC AA/-- AGTTACATAG 3070 het 2284 hom 20 6 12 4 A 3 1 334184 CASAVA_Build 20 46280911 1I CATGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 3070 hom 47 het 17 0 11 6 C 4 5 334185 CASAVA_Build 20 46289671 5D TCCATCTCAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 2892 het 650 hom 19 6 9 5 AAAAG 5 4 334186 CASAVA_Build 20 46292347 2D GTGTCCCAGG CC/-- ACTGTGGGGT 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 C 2 0 334187 CASAVA_Build 20 46296325 1D GTCTGCACCT G/- TGCACCCTCT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 G 1 0 334188 CASAVA_Build 20 46297962 2I CCAGCCAGAC --/GG GGCAACAAGG 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 G 2 4 334189 CASAVA_Build 20 46298420 2D CCTGCAGAAC TG/-- TTTCTTATTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 10 TG 1 0 334190 CASAVA_Build 20 46302937 2I CAACAATATA --/AC ACAGTCTGCC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AC 1 2 334191 CASAVA_Build 20 46308954 1I CATGCTTTTA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 7 8 334192 CASAVA_Build 20 46309633 1D GTGTGTACCA C/- CCATGCCCGG 3070 het 2006 hom 22 5 14 3 C 3 2 334193 CASAVA_Build 20 46311422 1D CCTAGAGGTT G/- GGGGGGATGG 3070 het 3070 ref 28 13 9 7 G 7 6 334194 CASAVA_Build 20 46314466 3D TTGGATCCTC TTA/--- TTATTTCAAT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 TTA 2 1 334195 CASAVA_Build 20 46316021 15I GCAAGAAAAG ---------------/AGAAACAGAGGAATA AGAAACAGAG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AGAAACAGAGGAATA 0 1 334196 CASAVA_Build 20 46323968 1D CCAGTTAATA T/- CACGGTTCTG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 1 0 334197 CASAVA_Build 20 46329250 2D CCTGGGTGAT AG/-- AGAGAGAGAG 1883 het 1883 ref 48 34 5 9 AG 10 9 334198 CASAVA_Build 20 46335917 1D TATTTTTCGT A/- AGAGATGGGG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 1 334199 CASAVA_Build 20 46362959 1I GATGGTTACA -/C GGTTATATTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 C 0 1 334200 CASAVA_Build 20 46372532 2D CCCCGCCTGA CT/-- CTGCTATTTC 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 CT 2 1 334201 CASAVA_Build 20 46382529 1D CAGGGCCCAG T/- CCCTGTTTTT 3070 hom 62 het 26 0 20 6 T 1 0 334202 CASAVA_Build 20 46385071 1I TAATAGATTT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 7 8 334203 CASAVA_Build 20 46389460 1D AAAGACCTCA G/- GCCCCGAGGG 3070 het 3070 ref 28 10 11 8 G 2 1 334204 CASAVA_Build 20 46390968 11I AGGCCATGGG -----------/TACAAAGGAAT TACAAAGGAA 3070 het 3070 ref 36 14 14 9 TACAAAGGAAT 0 1 334205 CASAVA_Build 20 46397233 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2165 het 2165 ref 21 7 8 6 A 11 10 334206 CASAVA_Build 20 46402619 6D CATCCCCAGT CCTGCG/------ CCTGCGCCTC 3012 het 3012 ref 36 18 10 10 CCTGCG 2 1 334207 CASAVA_Build 20 46409715 1I GCTTTCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 T 10 11 334208 CASAVA_Build 20 46415311 11D CTCACCACTG ATGAGCTCTAA/----------- AGAATTACTT 3070 het 3070 hom 38 21 22 3 ATGAGCTCTAA 1 0 334209 CASAVA_Build 20 46430713 1I TCAGGTTCTT -/G GGGGTGGCTC 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 G 4 5 334210 CASAVA_Build 20 46432202 1I TTCTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 2342 het 2342 ref 26 11 6 9 A 10 11 334211 CASAVA_Build 20 46437727 1D CAGGAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 A 13 12 334212 CASAVA_Build 20 46438061 2I ACATAAAGAC --/AG AAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 AG 0 1 334213 CASAVA_Build 20 46469745 3I ATAATTCATA ---/GAT AATACAGCCT 3070 het 3070 ref 32 12 13 7 GAT 0 1 334214 CASAVA_Build 20 46477534 4D GCCCTTACAG CAGT/---- CAGAGGGGCT 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 CAGT 1 0 334215 CASAVA_Build 20 46478195 3I TTGATTCTGG ---/CTT CTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 CTT 1 2 334216 CASAVA_Build 20 46478465 8D TACAATATTC ATTTCTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 ATTTCTTT 1 0 334217 CASAVA_Build 20 46489176 4D TTATTATTAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 186 hom 11 1 8 2 TTTA 4 3 334218 CASAVA_Build 20 46489928 1D TTATTAATTA T/- TTTTTAAGTG 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 T 6 5 334219 CASAVA_Build 20 46490571 1I GTCCCCAACC -/T TTTTGGAACC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 4 5 334220 CASAVA_Build 20 46496366 1I TACTTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 13 14 334221 CASAVA_Build 20 46497204 2D TGATTGAGTC AA/-- GGGTGAACAG 3070 het 3070 hom 40 14 25 3 A 2 0 334222 CASAVA_Build 20 46497964 1D AAAGGCTTAA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 T 9 8 334223 CASAVA_Build 20 46498825 1I TTTATGTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 10 11 334224 CASAVA_Build 20 46516095 1I GGGTGCCGCC -/G GGTGACTCCT 3070 het 3070 hom 49 17 21 11 G 2 3 334225 CASAVA_Build 20 46519831 1D TCTGAGTCTA G/- GCAGCGCTGA 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 G 2 1 334226 CASAVA_Build 20 46519884 1D TCACAAATAA C/- CCCCCCACCC 3066 het 3066 ref 31 14 7 10 C 7 6 334227 CASAVA_Build 20 46521504 2I ACACAATGCG --/CT CTGATGTCTC 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 CT 1 2 334228 CASAVA_Build 20 46522447 2I GAGTGACAGA --/GT GAGGGAGGAG 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 GT 0 1 334229 CASAVA_Build 20 46527843 5I TTTTATCAAC -----/TTATT TTGACAATGA 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 TTATT 0 1 334230 CASAVA_Build 20 46539184 4D AGTCAGTGAC AAAT/---- AAACAATGCT 3070 het 3070 ref 38 20 18 0 AAAT 1 0 334231 CASAVA_Build 20 46541048 1D GGGGCCACCA G/- GGCCCAATGT 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 G 3 2 334232 CASAVA_Build 20 46543730 2I GCAAAAAAAC --/TG CGATTAACAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 TG 0 1 334233 CASAVA_Build 20 46554876 1D TGAGGAAACT G/- AGGCTCAGAG 3029 het 3029 ref 26 15 8 3 G 1 0 334234 CASAVA_Build 20 46557558 20D CATGCCTGTA ATCACAGCATTTTGGCAGCC/-------------------- AAGACAGGCG 2607 het 2607 ref 25 18 6 6 ATCACAGCATTTTGGCAGCC 1 0 334235 CASAVA_Build 20 46569303 1I GCCTGTCCCT -/A ACTTCTGAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 1 2 334236 CASAVA_Build 20 46592927 1I GTGCCCTTCG -/A AAGGTTCAAA 3070 hom 105 het 38 0 34 4 A 2 3 334237 CASAVA_Build 20 46601725 2I56M4I TCACACACTC --ATACTCACTCATTCAAATGTATACAGTTACACACCCTCACACATGAACATAGTCAA----/ATATACTCACTCATTCAAATGTATACAGTTACACACCCTCACACATGAACATAGTCAAAAAC AAACACACAC 3070 hom 66 het 19 0 22 38 N/A 0 0 334238 CASAVA_Build 20 46601978 2I AGAGCGTGGA --/CT CTGTCCCCTT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 CT 1 2 334239 CASAVA_Build 20 46607319 1I TAACTCCTAT -/A AGCCCAGCTT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 A 1 2 334240 CASAVA_Build 20 46610340 6I ACACACACAC ------/ACACAG ACACACTCTC 3070 hom 116 het 44 0 38 6 ACACAG 0 1 334241 CASAVA_Build 20 46618739 2I TTATTTTTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 10 12 334242 CASAVA_Build 20 46618913 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 27 0 24 3 T 11 10 334243 CASAVA_Build 20 46619463 9D TCTTAGGGTC CCTCATGTT/--------- CTGTGGAGTC 3070 hom 51 het 19 0 17 3 CCTCATGTT 1 0 334244 CASAVA_Build 20 46623404 39D GAGAAGACAA GTTCTCATCACCAACTGCCTCATCCTGGTTTGAAGACAG/--------------------------------------- GTTCTCATCA 3070 hom 82 het 36 0 27 21 GTTCTCATCACCAACTGCCTCATCCTGGTTTGAAGACAG 1 0 334245 CASAVA_Build 20 46625357 2D CCCTCTCTAC AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 10 8 334246 CASAVA_Build 20 46631922 2D GCCCATCCAT TC/-- TGTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 TC 1 0 334247 CASAVA_Build 20 46632600 1I AATTTCAACA -/T AGACTCCCCA 3070 hom 72 het 28 0 23 5 T 0 1 334248 CASAVA_Build 20 46634307 11D TTCAGACCTA GCAGAGGTTTT/----------- GGAGACAGAT 3070 het 3070 ref 45 27 12 9 GCAGAGGTTTT 1 0 334249 CASAVA_Build 20 46642182 1I CCATCAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 11 12 334250 CASAVA_Build 20 46644490 1I CAAAACAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 9 10 334251 CASAVA_Build 20 46652964 1D ACAGCGGTGC A/- AAAAAAGCCA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 7 6 334252 CASAVA_Build 20 46661002 1I CAGGGGTTGG -/T TTTTTTTTAA 3062 het 2828 hom 21 9 8 4 T 8 9 334253 CASAVA_Build 20 46663196 1I ATAAACAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 9 10 334254 CASAVA_Build 20 46664955 1I AGTCTCTTAT -/A AAAGAGGCAC 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 A 3 4 334255 CASAVA_Build 20 46673887 1D TCCAGGGGGG A/- AAAAAGCTGA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 A 6 5 334256 CASAVA_Build 20 46690707 1I ACAGGTAGAT -/G GATGAATGAA 3070 het 1220 hom 15 3 10 2 G 1 2 334257 CASAVA_Build 20 46698885 1I CAGCTGCCTC -/A CTTTCTATGA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 0 1 334258 CASAVA_Build 20 46699146 1D GGACAGCCCA C/- CCCCCACTAC 2544 het 2544 ref 30 11 9 10 C 6 5 334259 CASAVA_Build 20 46702213 1D CCTCATCTCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 A 10 9 334260 CASAVA_Build 20 46706371 1I GCCTCCAGGG -/C CTGGACCCCG 3070 hom 57 het 23 0 18 5 C 1 2 334261 CASAVA_Build 20 46710047 1I CAGATTCACA -/T GGGAAAGTTT 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 T 0 1 334262 CASAVA_Build 20 46710433 1D CCCAGGGGGG A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 57 28 25 5 A 7 6 334263 CASAVA_Build 20 46723644 2D ACCCCCCCAC CT/-- CTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 47 22 10 16 CT 2 1 334264 CASAVA_Build 20 46727328 1I TCAGGTCAGA -/G GGACAGAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 G 2 3 334265 CASAVA_Build 20 46730838 1D GGCACGTCCT C/- CTCCCGTTCA 3070 het 3070 ref 36 17 11 10 C 2 1 334266 CASAVA_Build 20 46747314 3D AGCCTCTGTG TTC/--- TTTTTTTCTT 1163 het 1163 ref 30 14 7 10 TTC 1 0 334267 CASAVA_Build 20 46763704 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAT 3029 het 3029 ref 28 14 10 8 AG 6 4 334268 CASAVA_Build 20 46767443 1D CCACCACTTT A/- AAAAAAAAAA 2075 het 2075 ref 32 15 9 8 A 15 14 334269 CASAVA_Build 20 46769249 1D GATGGCAGGA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 1543 hom 28 8 10 10 C 10 9 334270 CASAVA_Build 20 46773487 1I CCAAACAGCA -/C CCCCCACCCC 3070 hom 71 het 30 0 18 12 C 5 6 334271 CASAVA_Build 20 46774196 4D AGGCCACTTC CTTT/---- CTCTGTGCCT 3070 het 3070 ref 37 17 19 1 CTTT 1 0 334272 CASAVA_Build 20 46780183 1I CAGATACTAA -/C AGGGGGGCCT 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 C 0 1 334273 CASAVA_Build 20 46782335 1I TATTATTTTA -/T TAGTTTAGCA 3070 het 3070 hom 48 20 27 1 T 1 2 334274 CASAVA_Build 20 46796702 1D CTACCTCATT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 9 8 334275 CASAVA_Build 20 46800015 1I CCGAACTCTT -/C CCCCACTTAA 3070 hom 62 het 28 0 20 8 C 4 5 334276 CASAVA_Build 20 46822165 1D TAAAATAACT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 7 6 334277 CASAVA_Build 20 46825606 11D GGGCAGGTCT TTCCCGTGCTG/----------- TTCTCGTGAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTCCCGTGCTG 1 0 334278 CASAVA_Build 20 46841094 2D CAGATTCATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 86 het 47 0 32 17 CA 10 9 334279 CASAVA_Build 20 46846722 2D AGTTATATAT AC/-- AGTTATATAC 1832 het 1832 ref 17 10 6 1 AC 1 0 334280 CASAVA_Build 20 46857608 1I TGCCAATGTA -/T TTTTCCCCCA 3070 het 3070 hom 48 19 18 11 T 4 5 334281 CASAVA_Build 20 46860230 1D TTCTACAATT A/- AAAAAAAAAA 2181 het 2181 ref 37 24 6 8 A 12 11 334282 CASAVA_Build 20 46861123 2D TAAATAACAA TT/-- TTTTTTTTAT 126 het 126 ref 38 17 1 20 T 10 8 334283 CASAVA_Build 20 46861706 1I CACTGAAGTC -/A AAAGAATCTG 3070 het 3070 ref 70 33 23 14 A 3 4 334284 CASAVA_Build 20 46866766 1D ACACCCTGAT G/- GCAGCCTCAT 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 G 2 1 334285 CASAVA_Build 20 46882087 2I CAGGGGGAAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 13 8 8 A 9 11 334286 CASAVA_Build 20 46884511 1I TTCCTGAGCC -/T TTTTTTTTTT 2887 het 2887 ref 18 7 8 3 T 10 11 334287 CASAVA_Build 20 46890284 1D AACCTTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2259 hom 33 11 9 14 A 15 14 334288 CASAVA_Build 20 46890912 1D GTAGCTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 27 1 20 7 A 11 10 334289 CASAVA_Build 20 46894084 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 9 10 334290 CASAVA_Build 20 46899040 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2526 hom 26 9 10 7 A 13 14 334291 CASAVA_Build 20 46915895 1D AGTGTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2018 hom 35 11 14 10 T 17 16 334292 CASAVA_Build 20 46924822 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1041 het 1041 ref 29 19 5 5 A 13 14 334293 CASAVA_Build 20 46952946 1I TGGTGGGGGG -/C GGGGGCGGAG 2769 het 770 hom 20 7 9 4 C 0 1 334294 CASAVA_Build 20 46958603 1D CTCTATGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2860 hom 30 10 12 9 T 11 10 334295 CASAVA_Build 20 46960205 1D GGCAAGTGAG C/- TCCAAAACTG 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 C 1 0 334296 CASAVA_Build 20 46961477 1I AATTTTTTCA -/T TTTTTTATAG 2408 het 2408 ref 22 12 7 3 T 6 7 334297 CASAVA_Build 20 46964209 3D TAAAAAAAAT TGC/--- TGACCAGGTG 3070 hom 84 het 29 0 28 1 TGC 1 0 334298 CASAVA_Build 20 46964332 1I ATCTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 2 A 11 12 334299 CASAVA_Build 20 46970765 4I TGTCTTTCTC ----/CTCA CTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 CTCA 0 1 334300 CASAVA_Build 20 46979497 3D CCTCTAGGTC ATA/--- ATAACAACCC 3070 het 3070 hom 50 23 25 2 ATA 2 1 334301 CASAVA_Build 20 46983387 1D TAAAACAGTT A/- ATGGATGATT 3070 hom 84 het 36 0 27 9 A 2 1 334302 CASAVA_Build 20 46996422 2D ATATCAATTT TA/-- TATATATATA 1492 het 162 hom 12 2 4 8 TA 9 8 334303 CASAVA_Build 20 47008548 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1563 het 1043 hom 10 4 5 1 T 12 11 334304 CASAVA_Build 20 47010433 1D AATAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3001 het 1550 hom 17 5 8 4 T 12 11 334305 CASAVA_Build 20 47057894 3D CCTATTCCCA TTT/--- GAAAAGGGGC 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 T 3 0 334306 CASAVA_Build 20 47067414 1I ACATTGATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 T 8 9 334307 CASAVA_Build 20 47077700 3D AAGTTATCTT GTA/--- ATACAGAGGA 3070 het 3070 hom 41 21 20 0 GTA 1 0 334308 CASAVA_Build 20 47078410 1I AGATTTCTAG -/T TCATACACAG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 T 1 2 334309 CASAVA_Build 20 47085938 1I GTACGAAATG -/A AAAAAAAAAA 1938 het 1938 ref 25 9 8 8 A 12 13 334310 CASAVA_Build 20 47086772 4I ATCTATTAAC ----/TTTG TTTGTTGTTG 3070 hom 47 het 37 1 30 6 TTTG 1 2 334311 CASAVA_Build 20 47089252 1D AGTAGAGACT G/- GCTTTCACCA 3010 het 1386 hom 16 4 7 6 G 2 1 334312 CASAVA_Build 20 47095156 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAGAAAAG 1655 het 927 hom 27 10 12 5 G 0 1 334313 CASAVA_Build 20 47101330 2I CTTTACTGTA --/AG TATAAAACTC 3070 het 2394 hom 22 6 14 2 AG 0 1 334314 CASAVA_Build 20 47106638 3I TTTCTGTGTG ---/TTT TTTTTTCATT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 6 9 334315 CASAVA_Build 20 47110720 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1794 hom 18 5 8 5 A 14 15 334316 CASAVA_Build 20 47113063 3D CTTTTTTTGA TTT/--- TTTTTTATAT 1113 het 650 hom 9 2 4 3 T 9 6 334317 CASAVA_Build 20 47120646 1D CGGCCAAGGT G/- GGGAGGATCC 3070 hom 53 het 30 0 21 9 G 4 3 334318 CASAVA_Build 20 47129406 2I TCCTGACCTC --/CT AGGTGATCCA 3070 het 2342 hom 20 6 9 5 CT 0 1 334319 CASAVA_Build 20 47139171 2D CATAATTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 12 10 334320 CASAVA_Build 20 47154093 1I GACACCAGTC -/A AGAGGTTTGC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 1 2 334321 CASAVA_Build 20 47156255 1I TAGTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 14 12 T 10 11 334322 CASAVA_Build 20 47163376 1D CATTACAAAG T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 7 6 334323 CASAVA_Build 20 47171584 4D ACTACACATC CTTT/---- CTGTCAGTAA 3070 het 3070 ref 46 24 21 3 CTTT 1 0 334324 CASAVA_Build 20 47194233 1D TCACACGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 12 11 334325 CASAVA_Build 20 47205031 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 12 11 334326 CASAVA_Build 20 47238833 1I AAATAAAATT -/A GAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 0 1 334327 CASAVA_Build 20 47241453 1I GGACACAATA -/G GTACATGATA 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 G 1 2 334328 CASAVA_Build 20 47243629 2I TCAAAAAAAC --/AG GGGCCGGGCG 1728 het 1728 ref 15 7 5 3 AG 0 1 334329 CASAVA_Build 20 47243918 1D CAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 21 1 18 2 A 12 11 334330 CASAVA_Build 20 47247093 3D AGTGAGACTC TGT/--- CTCCAAAAAA 3070 het 1786 hom 17 5 12 0 TGT 1 0 334331 CASAVA_Build 20 47268657 1D TCTTCTGAGA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 T 8 7 334332 CASAVA_Build 20 47270734 4I GGGAATTGTT ----/TGTC TGTGTTTGTT 1379 het 1379 ref 27 13 3 11 TGTC 0 1 334333 CASAVA_Build 20 47274307 1I TATTTCTTTC -/T TTTCTTTTTT 2461 het 2250 hom 27 12 10 5 T 3 4 334334 CASAVA_Build 20 47287321 1D ATTAGTAAAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 9 8 334335 CASAVA_Build 20 47289651 1I TATGCAGCCT -/G GGGGTTGGGG 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 G 4 5 334336 CASAVA_Build 20 47292662 14D CTTGGTATTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTG 3070 het 1289 hom 20 5 10 5 T 23 9 334337 CASAVA_Build 20 47294985 1I GGCCCCACCT -/G GGAAAACTGT 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 G 2 3 334338 CASAVA_Build 20 47296817 2D AAAAGAATGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 T 13 11 334339 CASAVA_Build 20 47303974 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2885 hom 33 13 16 4 T 13 12 334340 CASAVA_Build 20 47304685 8D ATGAAGTGAA CCTTGGAC/-------- CCTTGGAGCA 3070 het 3070 ref 30 18 13 3 CCTTGGAC 1 0 334341 CASAVA_Build 20 47305443 4I TCTCTGTTCT ----/TTTC TTTCTGAGTT 3070 het 3070 ref 31 21 9 1 TTTC 1 2 334342 CASAVA_Build 20 47307686 1D CGCTCTTTTG C/- CCAGGGTGGA 3027 het 2590 hom 26 8 8 10 C 3 2 334343 CASAVA_Build 20 47310234 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1205 het 1086 hom 15 5 4 7 A 17 18 334344 CASAVA_Build 20 47312352 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2588 het 2227 hom 28 11 10 7 A 14 13 334345 CASAVA_Build 20 47316546 1I TACATCTTGA -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 7 8 334346 CASAVA_Build 20 47319718 1D TCTGCAACAT G/- GCAATTTACA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 2 1 334347 CASAVA_Build 20 47322953 1I ATGATTTGAT -/A AAAAAAGTTG 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 6 7 334348 CASAVA_Build 20 47334001 1D TGTCAGTAGT A/- AGAGTGTAAA 3070 hom 95 het 42 0 33 9 A 2 1 334349 CASAVA_Build 20 47340305 1D TGCCTGCGTC A/- AGCCTCCCAA 2857 het 2857 ref 20 12 7 1 A 2 1 334350 CASAVA_Build 20 47340488 37I TGTAGCGGAG -------------------------------------/GCTTGATGACTACCACCCCAGCAGACCTCTCGGAGAT GCTTGTGAGA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 GCTTGATGACTACCACCCCAGCAGACCTCTCGGAGAT 0 1 334351 CASAVA_Build 20 47341991 1I CATGACCCAC -/T GTGCCTGGCC 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 T 0 1 334352 CASAVA_Build 20 47346774 1D GAGTGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 15 14 T 11 10 334353 CASAVA_Build 20 47352733 1D ACTCCAGCCT G/- GGGCAACAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 4 3 334354 CASAVA_Build 20 47369931 1D CACTGGAGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 10 9 334355 CASAVA_Build 20 47388560 1D TTAATCAGTG T/- TTTTTTTTTT 1396 het 147 hom 24 3 7 14 T 17 16 334356 CASAVA_Build 20 47391315 5I ACTACAGGTG -----/CACAC CACACCACCA 3070 het 1031 hom 17 4 11 2 CACAC 1 2 334357 CASAVA_Build 20 47395266 1D TACAATTTTG A/- AAAAAAAAAT 2157 het 2157 ref 27 9 9 9 A 10 9 334358 CASAVA_Build 20 47400994 1I CATGGCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2605 hom 33 10 14 9 T 13 14 334359 CASAVA_Build 20 47412249 2D CTCTCTCTAA GT/-- GTGAACCAGA 3070 het 2922 hom 28 9 17 3 GT 2 1 334360 CASAVA_Build 20 47427922 18D CACAGGTGCG TGCGTGTGTGTGTGTGCA/------------------ TGCGTGTGTG 3070 hom 81 het 34 0 27 11 TGCGTGTGTGTGTGTGCA 2 1 334361 CASAVA_Build 20 47439671 4I TAGGCCCTGG ----/TAAT TAATACTGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TAAT 1 2 334362 CASAVA_Build 20 47446646 1D GCCAGATCAT G/- GGGGTGCTGT 3070 het 3070 ref 46 22 16 9 G 5 4 334363 CASAVA_Build 20 47453661 1I TGTAACATTT -/A AAAAAATCAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 6 7 334364 CASAVA_Build 20 47516882 1I AACCCAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2717 hom 36 10 13 13 T 12 13 334365 CASAVA_Build 20 47528705 6I TGGAGAAATT ------/ACCTAA AGCTAAAAGC 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 ACCTAA 0 1 334366 CASAVA_Build 20 47541729 2D GGTGGGCAGC CA/-- CAGTGTCCAC 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 CA 2 1 334367 CASAVA_Build 20 47547540 1D TGGAAAGAGA C/- CAGAGGCTCA 3070 hom 113 het 43 0 34 9 C 2 1 334368 CASAVA_Build 20 47551195 1D CCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 26 1 17 8 A 17 16 334369 CASAVA_Build 20 47595778 24D TCTGTCATGC CTGCTGTTTGGGAAGTAGGATGGA/------------------------ CTGCTGTTTG 3070 hom 82 het 45 0 24 25 CTGCTGTTTGGGAAGTAGGATGGA 2 1 334370 CASAVA_Build 20 47605216 1D GAGTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 11 10 334371 CASAVA_Build 20 47607508 1D GAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 22 4 A 11 10 334372 CASAVA_Build 20 47619773 5I CAGTACTTCA -----/CATGT CATGTCCTGC 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 CATGT 1 2 334373 CASAVA_Build 20 47628430 1D TCACTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 13 12 334374 CASAVA_Build 20 47642186 1I TCATCTGTCC -/A TCAATCCACT 3070 hom 125 het 48 0 38 10 A 0 1 334375 CASAVA_Build 20 47643293 1I CACGGCCGCT -/C TTTTTTTACC 3070 hom 77 het 36 0 24 12 C 0 1 334376 CASAVA_Build 20 47680543 2I ACATATTCAC --/AT GTTACTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 AT 0 1 334377 CASAVA_Build 20 47683382 5I ATTTGGTTCC -----/TGTTT TGTTTTTTTT 3070 hom 47 het 37 1 30 6 TGTTT 1 2 334378 CASAVA_Build 20 47688891 3I TAATGTTGAT ---/ATA ATAAAAACAG 2604 het 2604 ref 24 13 7 4 ATA 1 2 334379 CASAVA_Build 20 47691063 6D CATCTCCAAA AAAAAG/------ AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 5 AAAAAG 3 2 334380 CASAVA_Build 20 47701899 4I GGCACCCACC ----/TGGT TGGTGTCCCA 2292 het 362 hom 12 2 6 4 TGGT 1 2 334381 CASAVA_Build 20 47713388 1D ATATTTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 8 7 A 11 10 334382 CASAVA_Build 20 47717176 1D TTTTGAAGTG T/- TTTTTTTTTT 1304 het 462 hom 13 2 4 7 T 13 12 334383 CASAVA_Build 20 47717195 3D TTTTGGCTTG TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 het 230 hom 15 1 9 7 TGT 4 3 334384 CASAVA_Build 20 47719830 1D AGACTGGTAT A/- AACCCTTTGG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 3 2 334385 CASAVA_Build 20 47721795 1D TTTCTTTTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 39 0 31 8 T 9 8 334386 CASAVA_Build 20 47722497 4D CATCTATTAT GACA/---- GACAGACTCT 3070 het 3070 hom 59 23 25 13 GACA 2 1 334387 CASAVA_Build 20 47723324 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 A 10 11 334388 CASAVA_Build 20 47732707 2I AAATGTAGTT --/AA AAGAGTATTA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 2 4 334389 CASAVA_Build 20 47733048 1D TCTGGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 11 10 334390 CASAVA_Build 20 47740092 2D GGATTAGAAG CA/-- CACACCACTA 3070 het 3070 hom 20 8 9 5 CA 3 2 334391 CASAVA_Build 20 47753836 1I CCATCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2231 hom 23 7 11 5 A 13 14 334392 CASAVA_Build 20 47766722 1D GCTTGAACCT G/- GGAGGCAGAG 950 het 671 hom 7 2 3 3 G 3 2 334393 CASAVA_Build 20 47768967 1D ATATAGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 11 10 334394 CASAVA_Build 20 47775084 1D AGGGAGGGGT G/- GCTCCCCGAG 3070 hom 99 het 38 0 30 9 G 2 1 334395 CASAVA_Build 20 47785004 1D TGCATGAACC T/- TTTTTTTTTT 1171 het 1171 ref 44 28 3 13 T 13 12 334396 CASAVA_Build 20 47786363 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1389 het 678 hom 11 4 4 4 A 15 14 334397 CASAVA_Build 20 47804847 1D CTATCTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 589 hom 26 5 12 10 A 13 12 334398 CASAVA_Build 20 47805777 1I ACTTGGGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 36 1 32 3 T 10 11 334399 CASAVA_Build 20 47807124 1D GTCCCAAAAA C/- AAAAACAAAA 3070 het 327 hom 39 1 31 8 C 1 0 334400 CASAVA_Build 20 47810058 1D GACTGCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 11 10 334401 CASAVA_Build 20 47820362 1D CCCTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 33 0 16 17 A 15 14 334402 CASAVA_Build 20 47821994 2D CACAGTGAAA CC/-- CCGTCTCTAC 3070 het 105 hom 18 1 15 2 C 4 2 334403 CASAVA_Build 20 47823250 15D TTTCTTTTCC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTG 2757 hom 24 het 10 0 9 1 T 24 9 334404 CASAVA_Build 20 47830972 2D TTATTATTAT TA/-- TTTTTTTTTT 708 het 460 hom 17 5 2 10 TA 1 0 334405 CASAVA_Build 20 47836464 28I TGGCCGGGCA ----------------------------/CGGTGGCTCACGCCCGTAATACCAACAC TTTTGGAGGC 3070 hom 36 het 12 0 12 2 CGGTGGCTCACGCCCGTAATACCAACAC 0 1 334406 CASAVA_Build 20 47836721 27D AAAAAATAAA ATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAT/--------------------------- ATAAAATAAA 2230 hom 12 het 7 0 5 4 ATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAT 1 0 334407 CASAVA_Build 20 47838284 1D AAATATGTTC T/- TTTTTTTTTA 1820 het 728 hom 8 2 4 2 T 10 9 334408 CASAVA_Build 20 47838445 1I CTACAGAAAG -/T TTTAAAAAAA 3070 het 33 hom 24 1 19 4 T 3 4 334409 CASAVA_Build 20 47838982 1I CAGGAAGGCC -/A AATGCTCCAT 3070 hom 97 het 42 0 29 13 A 2 3 334410 CASAVA_Build 20 47848945 1D ATAAATTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 36 1 21 14 T 11 10 334411 CASAVA_Build 20 47852359 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2160 het 651 hom 10 4 6 0 T 13 14 334412 CASAVA_Build 20 47856865 1D TCATTTGCAG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 8 7 334413 CASAVA_Build 20 47867974 1I GCGGGCCTGG -/A AAAAAAAAAA 2781 het 2773 hom 19 8 9 2 A 10 11 334414 CASAVA_Build 20 47869692 1D GCTTTCTGTC T/- CTAGGAATTT 3070 het 3070 ref 43 23 16 5 T 1 0 334415 CASAVA_Build 20 47872990 1I CATTGTATTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 9 10 334416 CASAVA_Build 20 47878963 3I TTTTTTTTTT ---/TGA GAGAGAGAGA 3070 het 2101 hom 22 7 10 5 TGA 0 1 334417 CASAVA_Build 20 47879467 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2272 hom 21 6 13 2 A 12 13 334418 CASAVA_Build 20 47885135 2I ATAGTCTGGG --/TT TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 24 11 5 T 3 5 334419 CASAVA_Build 20 47888019 4D CACACACAAA CACT/---- CACACCCTGG 3070 het 3070 ref 36 23 10 4 CACT 1 0 334420 CASAVA_Build 20 47898398 1I GAGGACACTC -/T TTTCACAAGT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 3 4 334421 CASAVA_Build 20 47904506 2D CCTGGGTCAC AT/-- GTGGTATTGT 3070 het 3070 ref 42 19 15 9 AT 1 0 334422 CASAVA_Build 20 47907762 3D TTGTTGTTTT CAC/--- CACATTTGCC 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 CAC 2 1 334423 CASAVA_Build 20 47919776 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 A 11 10 334424 CASAVA_Build 20 47950575 1D TCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 24 8 7 10 T 9 8 334425 CASAVA_Build 20 47950946 1D CGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1666 het 1607 hom 12 4 4 4 A 11 10 334426 CASAVA_Build 20 47963975 3D AGTCTGGTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2477 hom 30 14 9 7 A 19 16 334427 CASAVA_Build 20 47976355 1I GTGATTCCAC -/T TAGATGAGAT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 1 2 334428 CASAVA_Build 20 47977143 80D ACCGGGAGGC AAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTACCACTGCACTCCAGCCTGGGAACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAATA/-------------------------------------------------------------------------------- AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 22 25 8 6 AAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTACCACTGCACTCCAGCCTGGGAACAAAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAATA 1 0 334429 CASAVA_Build 20 47979476 4I TTTTTGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 TTTG 3 4 334430 CASAVA_Build 20 47985813 2D GACCCGCCCG CT/-- CTCTGCACCA 1178 het 952 hom 9 3 4 2 CT 3 2 334431 CASAVA_Build 20 47989424 4D TACTGTCTTA ATCT/---- ATCAGGTTGG 3070 het 3070 ref 34 17 17 2 ATCT 1 0 334432 CASAVA_Build 20 47992955 1D TTTTTTCCAC T/- TTTCAGGTTT 3070 het 2809 hom 21 7 12 2 T 4 3 334433 CASAVA_Build 20 47995491 9I TACAAAGAGG ---------/TTGGACACC TTGCATGCCC 3070 het 3070 ref 53 27 20 6 TTGGACACC 0 1 334434 CASAVA_Build 20 47996556 6D GAAATTCATG TTTTAA/------ TTTTAACAAT 3070 het 3070 ref 43 16 22 9 TTTTAA 2 1 334435 CASAVA_Build 20 48002648 1D ATCTGATGCT G/- GAAGTTTTGA 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 G 2 1 334436 CASAVA_Build 20 48004505 2I CAGGTGTCAG --/CC TCCGAGCCTG 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 C 0 2 334437 CASAVA_Build 20 48006058 1D CTCCATCTCT A/- AATAAATAAA 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 A 3 2 334438 CASAVA_Build 20 48007388 2D CTGGGTTGAC TG/-- TGGAGGTAGA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 TG 2 1 334439 CASAVA_Build 20 48009410 1I CTCGTCTTTG -/A AAAAAAAAAT 1410 het 1410 ref 11 6 3 2 A 9 10 334440 CASAVA_Build 20 48011288 1I AACAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 10 11 334441 CASAVA_Build 20 48024526 1D AGCATCGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 880 hom 28 6 14 8 T 17 16 334442 CASAVA_Build 20 48043733 1D ATTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 410 het 405 hom 15 6 2 7 T 19 18 334443 CASAVA_Build 20 48047203 1D TTTGTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2112 het 2112 ref 34 19 6 10 T 13 12 334444 CASAVA_Build 20 48056044 1I ATTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2276 het 856 hom 28 5 11 12 T 13 14 334445 CASAVA_Build 20 48063912 1I AGAGACAGGG -/T TTCACCATGT 3070 het 3008 hom 24 7 14 3 T 2 3 334446 CASAVA_Build 20 48064860 4D AGTCTCTGGT GTTA/---- GTTGATGGGA 3070 het 3070 ref 45 19 18 8 GTTA 1 0 334447 CASAVA_Build 20 48156656 1I TGCCTGTAAT -/C CGAGCTACTC 3070 het 1730 hom 23 7 12 4 C 1 2 334448 CASAVA_Build 20 48170045 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 1480 het 670 hom 14 5 7 2 A 15 14 334449 CASAVA_Build 20 48190540 1D CTCTGCACGG C/- CCCTCCCTCA 2716 het 2716 ref 33 17 8 9 C 4 3 334450 CASAVA_Build 20 48197836 3I AACCCCGTCT ---/CTA CTAAGAATAC 3070 het 3067 hom 25 9 11 5 CTA 1 2 334451 CASAVA_Build 20 48206233 1D6M7D CGCTCTGTCG CCCAGGCCGGACTG/-CCAGGC------- CGGACTGCAG 179 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 334452 CASAVA_Build 20 48214409 1I AATAATTCAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 T 8 9 334453 CASAVA_Build 20 48235232 1I CCATGTTCCA -/T TTTTTTTTTT 2777 het 2533 hom 30 8 10 12 T 13 14 334454 CASAVA_Build 20 48236908 1I ACTAGAGACA -/C CCCCCCCATT 2423 het 2084 hom 20 6 8 6 C 7 8 334455 CASAVA_Build 20 48268746 4D GAACTTATCT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 AAAC 4 3 334456 CASAVA_Build 20 48275614 2D ATTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 25 5 A 13 11 334457 CASAVA_Build 20 48287289 1I GAGCCACTGT -/G GCCGGCTGCC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 G 1 2 334458 CASAVA_Build 20 48295211 1D CTGCTCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 27 1 17 9 T 15 14 334459 CASAVA_Build 20 48304927 1D TTGGAATTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 52 19 25 8 T 10 9 334460 CASAVA_Build 20 48324498 1I TCTAGAGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 9 10 334461 CASAVA_Build 20 48325552 1D TGTGAAACAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 14 24 9 T 10 9 334462 CASAVA_Build 20 48326363 1I AGAGGAAGAA -/C TGATCGCGAG 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 C 0 1 334463 CASAVA_Build 20 48328886 1D GGCGTCTTGG A/- AACTGCATCA 3070 hom 102 het 37 0 29 8 A 3 2 334464 CASAVA_Build 20 48338842 1I GAGGGAGATG -/T TTGGAGTGGA 3070 hom 110 het 42 0 35 7 T 2 3 334465 CASAVA_Build 20 48339479 1I CCCGTGGGAA -/G GCCGGGACTG 3070 hom 68 het 28 0 23 5 G 1 2 334466 CASAVA_Build 20 48340455 1I TTTCTTTTTT -/A TTGAGACAGG 3070 hom 45 het 19 0 16 5 A 0 1 334467 CASAVA_Build 20 48356857 1I CTGAGTCCCA -/C CAAGCTAGGA 3070 hom 82 het 32 0 25 7 C 1 2 334468 CASAVA_Build 20 48365252 1I TATGTCAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 15 9 12 A 9 10 334469 CASAVA_Build 20 48379053 1D AGAATCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 26 1 15 10 T 15 14 334470 CASAVA_Build 20 48394761 5D TGGAGTCCTC GTCAG/----- GTCAGGAACC 3070 het 3070 ref 39 18 14 9 GTCAG 2 1 334471 CASAVA_Build 20 48402093 14D ACTGAGTCTC AAAAAAATAAAAAT/-------------- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 23 14 8 6 AAAAAAATAAAAAT 1 0 334472 CASAVA_Build 20 48418270 5D CTCATTACAA ACCTC/----- ACATCCTGAC 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 ACCTC 1 0 334473 CASAVA_Build 20 48420965 1D TGAGTTAGGA G/- AATCACTTGA 3070 hom 78 het 37 0 33 4 G 1 0 334474 CASAVA_Build 20 48423860 1D AGAGTGGGGG T/- GTACTACCAC 3070 hom 88 het 35 0 26 10 T 1 0 334475 CASAVA_Build 20 48425120 1D ACCTGCCATG T/- CTTTGGGTCC 3070 hom 75 het 36 0 24 12 T 1 0 334476 CASAVA_Build 20 48431080 17D GAAGGAAGGA GGGAGGGAGGGAGGGAG/----------------- GGGAGGGAGG 1813 het 194 hom 27 2 5 23 GGGAGGGAGGGAGGGAG 1 0 334477 CASAVA_Build 20 48437706 1D CTATCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 16 0 10 6 A 13 12 334478 CASAVA_Build 20 48440234 1I GAGGAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 25 1 15 9 A 13 14 334479 CASAVA_Build 20 48451067 5I CCCCGGAACT -----/TAAAA TAAAATCTAA 3070 hom 32 het 14 0 11 3 TAAAA 1 2 334480 CASAVA_Build 20 48465037 1D AAATATGACA T/- TTTTTTAAAC 3070 het 3070 hom 34 12 21 1 T 7 6 334481 CASAVA_Build 20 48485224 2I AATACACATT --/AA AAAAAAAAAA 1007 het 517 hom 19 4 5 10 A 16 18 334482 CASAVA_Build 20 48492467 2D GGTTTTTTGC AA/-- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 38 15 22 2 A 10 8 334483 CASAVA_Build 20 48500855 1I TTTTTTTTGT -/A AAAAAAAAAC 2057 het 2057 ref 23 11 7 5 A 9 10 334484 CASAVA_Build 20 48507727 1I GTTTGATGTG -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 19 7 7 5 T 7 8 334485 CASAVA_Build 20 48527692 5D ATGTTTAAAG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 331 hom 19 2 12 5 A 16 11 334486 CASAVA_Build 20 48533431 3D GCCCTCAGGG GAT/--- GATGTGGAGT 3070 het 3070 hom 37 14 20 5 GAT 2 1 334487 CASAVA_Build 20 48536563 1D TGCATTTGTC A/- AAAAATACAG 3070 het 3070 hom 39 12 24 3 A 6 5 334488 CASAVA_Build 20 48538273 1D GCTCTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 1807 het 822 hom 15 5 6 4 A 16 15 334489 CASAVA_Build 20 48545207 13D AATGCTCCTG ATGTCTTCAAATA/------------- ATGTCTTCAA 3070 het 3070 ref 50 27 17 18 ATGTCTTCAAATA 2 1 334490 CASAVA_Build 20 48551529 1I GCAGAGCAAA -/G CAAGTGCAGG 3070 hom 76 het 32 0 25 7 G 0 1 334491 CASAVA_Build 20 48555608 1I AAATGGGGCA -/G GGCAGAACAG 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 G 2 3 334492 CASAVA_Build 20 48566170 1I AAGTCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 10 11 334493 CASAVA_Build 20 48589176 1D ACAAGGTTTC T/- TCCATGTTGG 2040 het 1759 hom 14 6 5 3 T 2 1 334494 CASAVA_Build 20 48609579 1D TAATTTTCTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 39 14 21 5 T 9 8 334495 CASAVA_Build 20 48628274 1I TAGAGGTAGA -/T GAGTGGAAGG 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 T 0 1 334496 CASAVA_Build 20 48636413 4D CGAAGCTGGG TTGA/---- TTGATTGCAT 3070 het 3070 ref 55 25 21 12 TTGA 2 1 334497 CASAVA_Build 20 48640760 1D ATGAAGGCCC T/- TTTTTTTTTT 2400 het 480 hom 34 8 8 18 T 17 16 334498 CASAVA_Build 20 48656672 1D CTTTCTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 39 1 28 10 T 12 11 334499 CASAVA_Build 20 48660952 16I CAGAGAATGG ----------------/GGCTTAGTGCCGGGCC GGCCCCTCAC 3070 hom 45 het 17 0 15 2 GGCTTAGTGCCGGGCC 0 1 334500 CASAVA_Build 20 48673643 3D GAACAGCTGA CAC/--- CACAAGCCCA 3070 het 3070 ref 28 15 9 6 CAC 2 1 334501 CASAVA_Build 20 48703539 1I ACTTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1327 hom 23 4 14 5 T 13 14 334502 CASAVA_Build 20 48707472 1I CTCTTCTCAG -/A AAAAAAAAAG 1226 het 1226 ref 31 24 3 4 A 9 10 334503 CASAVA_Build 20 48712672 2I ACTCTCTGGC --/CG TGGTGACACG 3070 hom 70 het 31 0 19 12 CG 0 1 334504 CASAVA_Build 20 48719971 1I CGTGGTGGCA -/G GGCGCCTGTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 G 2 3 334505 CASAVA_Build 20 48723089 1I AGAAGACAGC -/A AGGGCTGCTT 3070 hom 114 het 43 0 34 9 A 1 2 334506 CASAVA_Build 20 48744702 9D AGAAAGAAAG AGAAAAGAA/--------- AGAAAGAAAG 1162 het 559 hom 21 4 5 13 AGAAAAGAA 1 0 334507 CASAVA_Build 20 48753937 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1024 hom 39 3 24 12 T 12 13 334508 CASAVA_Build 20 48775203 1D AATCCTCACG C/- CCCATCCTGA 3070 hom 54 het 23 0 19 5 C 4 3 334509 CASAVA_Build 20 48782851 1I TATCAATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 35 0 25 10 A 11 12 334510 CASAVA_Build 20 48783535 2I TTGCTTGAGC --/TA TATAGCGTTA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TA 2 3 334511 CASAVA_Build 20 48803013 2I TACACACTAC --/CT CTCTCTCTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 CT 4 5 334512 CASAVA_Build 20 48812149 1D ACCCACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 490 hom 30 3 21 7 T 12 11 334513 CASAVA_Build 20 48816646 2I AGTTTCACTC --/TT GTCGCCCAGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 0 2 334514 CASAVA_Build 20 48818608 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 12 0 9 3 A 13 14 334515 CASAVA_Build 20 48820955 1I TGGGATTCCC -/A ATTCAGCCTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 1 2 334516 CASAVA_Build 20 48846782 1I ACGTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 899 het 899 ref 25 13 3 9 T 13 14 334517 CASAVA_Build 20 48892447 1D TGCAACCTTT G/- GCCTCCTGGG 3070 hom 51 het 19 0 17 2 G 2 1 334518 CASAVA_Build 20 48900730 1I GTTTGAGTCT -/C CCCCCCCGGT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 C 7 8 334519 CASAVA_Build 20 48901018 1D TGCAAGTGGT G/- GGGGGTGCTG 1311 hom 18 het 8 0 6 2 G 6 5 334520 CASAVA_Build 20 48901073 1D GACTCGGGGA G/- GGAGCCCGAC 1656 hom 12 het 8 0 4 4 G 3 2 334521 CASAVA_Build 20 48912508 4I CACAGCCAGA ----/CCTC CCTCCAAGGA 2730 het 2730 ref 20 11 7 2 CCTC 1 2 334522 CASAVA_Build 20 48928050 1I AAATAGTTTA -/G GACAATTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 2 334523 CASAVA_Build 20 48956921 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 451 hom 22 3 11 8 T 11 10 334524 CASAVA_Build 20 48976480 1I AATTCTGGTA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 44 14 24 6 T 7 8 334525 CASAVA_Build 20 49034643 1I TGTACATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 106 hom 25 1 23 1 A 9 10 334526 CASAVA_Build 20 49035107 1D GCTCAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 494 hom 18 2 15 1 T 11 10 334527 CASAVA_Build 20 49058446 1I GCTAATTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 21 3 T 10 11 334528 CASAVA_Build 20 49058588 2I GATCTTATGA --/TT TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 8 10 334529 CASAVA_Build 20 49093620 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 21 0 18 5 A 13 12 334530 CASAVA_Build 20 49095093 1D TCAACCCACT C/- CCCCCATCCA 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 C 6 5 334531 CASAVA_Build 20 49097626 1D TTATACAAGG A/- ACAATAAATC 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 A 2 1 334532 CASAVA_Build 20 49100123 1D CAGAGTAGTC A/- AAATTCATAG 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 4 3 334533 CASAVA_Build 20 49114359 2I GCAACTATAC --/GT GTGTGTATAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 GT 3 4 334534 CASAVA_Build 20 49143262 1D AGGCAAAAGG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 A 9 8 334535 CASAVA_Build 20 49148855 1I TAATAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 228 hom 23 1 17 5 A 10 11 334536 CASAVA_Build 20 49151131 2D TAAAAATACC AA/-- AAAAAAAAAA 668 het 432 hom 9 2 4 3 A 16 14 334537 CASAVA_Build 20 49153952 1D GAATAACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 11 10 334538 CASAVA_Build 20 49155888 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 25 4 A 13 12 334539 CASAVA_Build 20 49180585 2I ACCTCTCTAA --/AC ACACACACAC 2452 het 2452 ref 25 14 6 5 AC 8 9 334540 CASAVA_Build 20 49193685 1D CACATCTTTT G/- TTCTCATCAT 3070 het 3070 ref 48 24 21 5 G 1 0 334541 CASAVA_Build 20 49203546 2I GCTTACCCCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 15 26 4 TG 7 8 334542 CASAVA_Build 20 49208853 2D CCTTCCACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 682 hom 27 4 15 8 T 12 10 334543 CASAVA_Build 20 49224132 1D CAATTAACCC T/- TTTTTCCTGG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 6 5 334544 CASAVA_Build 20 49236803 1I GAAAATCTTG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 8 9 334545 CASAVA_Build 20 49271983 2D GAGAGGACGG GA/-- GAGAGAGAGA 875 het 875 ref 27 21 3 3 GA 8 7 334546 CASAVA_Build 20 49278900 2D TATATATAAC AT/-- ATATTAATTA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 AT 3 2 334547 CASAVA_Build 20 49282396 1I TTCCTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 23 1 16 6 T 14 15 334548 CASAVA_Build 20 49283012 1D TCTTTCCCCC A/- CCCCCCCCAA 289 het 70 hom 21 2 7 12 A 1 0 334549 CASAVA_Build 20 49296773 1D TCACACAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 34 1 24 9 T 12 11 334550 CASAVA_Build 20 49307749 3D TGGCAGGCAC CTA/--- CTGTAGTCCG 3070 hom 29 het 11 0 9 2 CTA 1 0 334551 CASAVA_Build 20 49309128 1D TTCCTATAGG C/- GAGATCCCGG 3070 hom 93 het 38 0 31 8 C 1 0 334552 CASAVA_Build 20 49310604 1I AGGAGACAGC -/T GCACTGAGAT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 0 1 334553 CASAVA_Build 20 49312147 2D ATCCAGAAAC AG/-- AACACAACCA 3070 hom 117 het 44 0 39 7 AG 1 0 334554 CASAVA_Build 20 49367579 5D TTGTATTTCC AGGAG/----- AGGAGAGGAG 3070 het 2800 hom 28 7 16 9 AGGAG 5 4 334555 CASAVA_Build 20 49368885 1D TCTGAACTGC T/- TTTTTTTTTT 1281 het 685 hom 18 6 5 7 T 17 16 334556 CASAVA_Build 20 49374125 10D TAGGGTTGAT TTGGCCCAGC/---------- TTGGCTTGGG 3070 hom 108 het 37 0 35 4 TTGGCCCAGC 1 0 334557 CASAVA_Build 20 49374300 4D GTGTGTGTGT GTGA/---- GTGTGCACAC 3070 hom 103 het 40 0 35 5 GTGA 1 0 334558 CASAVA_Build 20 49381133 1I GCCCCTCCCA -/G GCACTGCCAT 3070 hom 129 het 48 0 40 8 G 1 2 334559 CASAVA_Build 20 49406562 4I CCTTGGGCAC ----/ACAG ACAGCCTGCG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ACAG 1 2 334560 CASAVA_Build 20 49448515 1D TACTTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 13 12 334561 CASAVA_Build 20 49451794 14D TAAAAACACA AGGTGTCAACAAAT/-------------- AGCCATTACA 3070 hom 93 het 30 0 30 8 AGGTGTCAACAAAT 1 0 334562 CASAVA_Build 20 49452424 1I CTGCCTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 38 0 27 11 A 11 12 334563 CASAVA_Build 20 49455380 7I TCACACGTGT -------/CATCTCA CATCTCACCG 3070 hom 122 het 49 0 38 11 CATCTCA 1 2 334564 CASAVA_Build 20 49456322 10D AGAAAAATGG GGGTGACAGT/---------- GTTGGCATCG 3070 hom 93 het 34 0 31 4 GGGTGACAGT 1 0 334565 CASAVA_Build 20 49464136 6I CCAGCCCAGG ------/TGCAAA GGCAGTCAGC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TGCAAA 0 1 334566 CASAVA_Build 20 49467790 1I GCAAATGCTC -/A AGCAACACGC 3070 hom 99 het 38 0 31 7 A 1 2 334567 CASAVA_Build 20 49469958 1D TAATGGTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 30 0 22 8 A 13 12 334568 CASAVA_Build 20 49476062 1D GAGTAGCCCA T/- TTTTTCTCCT 3070 hom 106 het 41 0 32 9 T 6 5 334569 CASAVA_Build 20 49476443 4I AATCATAAAC ----/AAAT AAAACAGCAG 3070 hom 66 het 30 0 23 7 AAAT 0 1 334570 CASAVA_Build 20 49476816 3D TACAGAATGC ACT/--- ACTGATTTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 ACT 2 1 334571 CASAVA_Build 20 49486660 8D CTTTGTCTCA AAACAAAC/-------- AAACAAACAA 3070 hom 54 het 21 0 19 6 AAAC 6 4 334572 CASAVA_Build 20 49487057 3D AAGTTGGGCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 38 0 18 20 A 19 16 334573 CASAVA_Build 20 49487956 1D AGGCATGTCT G/- ATGCTCAAAA 3070 hom 165 het 61 0 53 9 G 1 0 334574 CASAVA_Build 20 49497031 1I CTTAATTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 31 1 28 2 A 11 12 334575 CASAVA_Build 20 49499840 7I ATTAATGAAC -------/TACTAAT TACTAATTAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TACTAAT 1 2 334576 CASAVA_Build 20 49507579 26I AAGAGAAAAC --------------------------/AGTGAGAGTCTAATCCAGCTGCCTGG ACGCCTTTAG 3070 hom 53 het 20 0 15 7 AGTGAGAGTCTAATCCAGCTGCCTGG 0 1 334577 CASAVA_Build 20 49510584 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 43 3 28 12 T 13 12 334578 CASAVA_Build 20 49516449 1I TGCTTTCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 A 9 10 334579 CASAVA_Build 20 49517502 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAATAA 2636 het 2636 ref 24 15 7 3 A 8 7 334580 CASAVA_Build 20 49518263 1I ATACCTCCAT -/A AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 A 5 6 334581 CASAVA_Build 20 49532312 1D TTGCTGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 11 10 334582 CASAVA_Build 20 49533299 1I TTAAGTAGCA -/T TTTTGTTGAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 4 5 334583 CASAVA_Build 20 49535477 1I TTCTTGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 34 2 24 8 T 12 13 334584 CASAVA_Build 20 49538728 1D CTTGTCCCTT G/- GTCCCTATCC 3070 hom 111 het 40 0 36 4 G 2 1 334585 CASAVA_Build 20 49548093 1D GAACCGGTCC T/- TTCTGAATGG 3070 hom 123 het 45 0 40 5 T 3 2 334586 CASAVA_Build 20 49555399 2D ATATGTGTAG GT/-- GTGTGTATAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 GT 4 3 334587 CASAVA_Build 20 49556695 1D GAGATGGCTC G/- GGGGCCTGCG 3070 hom 85 het 31 0 28 3 G 5 4 334588 CASAVA_Build 20 49559227 2D CATACTATTT AA/-- AATTTTCCTA 3070 hom 96 het 35 0 32 5 A 4 2 334589 CASAVA_Build 20 49577118 1D AAGTGTTGTG A/- TTACAGACGA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 A 1 0 334590 CASAVA_Build 20 49578363 4D CACAATGTAC ACAG/---- ACAGATGTAC 3070 het 3070 ref 56 27 28 1 ACAG 2 1 334591 CASAVA_Build 20 49601973 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1706 het 1290 hom 8 4 4 1 A 13 12 334592 CASAVA_Build 20 49606660 1D ACAGTGCCCG T/- TGAGGAGGAG 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 2 1 334593 CASAVA_Build 20 49610361 1I ATCATCTCAC -/T TCAGATAAAA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 2 334594 CASAVA_Build 20 49611078 1I TATCAGTAAA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 T 8 9 334595 CASAVA_Build 20 49615230 3D AACAAATCCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 14 11 334596 CASAVA_Build 20 49629519 1D TGCTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2181 hom 27 8 15 4 T 12 11 334597 CASAVA_Build 20 49630391 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 10 9 334598 CASAVA_Build 20 49631461 1I GCTCATGGCC -/A AGCCTGGTGA 3070 het 3070 ref 55 29 17 9 A 1 2 334599 CASAVA_Build 20 49636789 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 19 1 16 2 A 15 14 334600 CASAVA_Build 20 49638310 1I TGTATACAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 9 10 334601 CASAVA_Build 20 49638422 1I ACCTTCTTTT -/C CCCTCCTGCC 3070 hom 94 het 39 0 29 10 C 3 4 334602 CASAVA_Build 20 49639876 1I CATAGCAAGA -/C CCCCATCTCT 2477 hom 28 het 16 0 8 8 C 4 5 334603 CASAVA_Build 20 49640319 2D GCCTTGTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 3 T 13 11 334604 CASAVA_Build 20 49648161 1I GGTGGGGGGA -/G GGGGAAGAAA 3070 hom 56 het 25 0 14 11 G 4 5 334605 CASAVA_Build 20 49649341 1D ACTCACTCAA T/- GAATACGTCA 3070 het 3070 hom 44 20 24 0 T 1 0 334606 CASAVA_Build 20 49653020 1D GGGGTTGTCA T/- TAACTGAAAG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 2 1 334607 CASAVA_Build 20 49654133 1D ACACTCACTT A/- ATGTGTGTTT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 2 1 334608 CASAVA_Build 20 49668165 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2464 het 1059 hom 30 9 10 11 A 15 16 334609 CASAVA_Build 20 49677119 1D GATGAATGTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 A 9 8 334610 CASAVA_Build 20 49684974 1I GTGTCAGCCA -/C CCCCCCTGGA 3070 hom 38 het 19 0 11 8 C 6 7 334611 CASAVA_Build 20 49688998 1I TAAAAAAATA -/C CATGTTCAAT 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 C 1 2 334612 CASAVA_Build 20 49694697 1I55M1I GTAATAAAGT -AAAAAAAAAAATTATTCTTCAGGTACTTTCAAACACTTATGGAAATGATTTTTTT-/AAAAAAAAAAAATTATTCTTCAGGTACTTTCAAACACTTATGGAAATGATTTTTTTA ATTCCTATTC 3070 het 3070 ref 24 20 9 17 N/A 0 0 334613 CASAVA_Build 20 49697985 1I CCCCTTGGGT -/C CCAAGGTCAT 3070 het 3070 ref 58 26 25 7 C 2 3 334614 CASAVA_Build 20 49700919 4D AGTCATATGA CTTT/---- CTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 13 19 9 CTTT 2 1 334615 CASAVA_Build 20 49703129 1I AAAGTAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 11 12 334616 CASAVA_Build 20 49705438 3D CATTTTTCCA AAG/--- AAGATAAACA 3070 het 3070 ref 38 21 15 3 AAG 2 1 334617 CASAVA_Build 20 49706166 1D TGATGGTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 87 hom 30 3 17 10 A 15 14 334618 CASAVA_Build 20 49711749 2I CAGAGCTACT --/AC ACCTCCAAAT 3070 het 3070 ref 53 33 18 2 AC 1 2 334619 CASAVA_Build 20 49713350 1D41M1I TTTTTTCTGC AAAAAAAACTTTCATAAATACCAGAAAGTTTTTTCAATGAGT-/-AAAAAAACTTTCATAAATACCAGAAAGTTTTTTCAATGAGTA AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 27 24 11 6 N/A 0 0 334620 CASAVA_Build 20 49715051 1I TGCTACAACC -/A GGAAGAACCT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 0 1 334621 CASAVA_Build 20 49715714 1I AACCCAGGGG -/A AAAAACCATC 3018 het 3018 ref 24 12 7 6 A 5 6 334622 CASAVA_Build 20 49719892 1I TATAGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 21 19 10 A 11 12 334623 CASAVA_Build 20 49725834 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 A 14 15 334624 CASAVA_Build 20 49726171 1D TGGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 A 13 12 334625 CASAVA_Build 20 49736312 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 2958 het 2956 ref 18 9 7 2 A 11 12 334626 CASAVA_Build 20 49737148 8D GGCTGTGCCC AGGCGTGG/-------- CCCAGGCATG 2390 het 2390 ref 26 15 8 4 AGGCGTGG 1 0 334627 CASAVA_Build 20 49743891 2I CCCCCAGGTA --/TC TGAGTTTGAG 2117 het 2117 ref 25 10 6 9 TC 0 1 334628 CASAVA_Build 20 49745063 1D TCATGTATTC A/- AAAAACCTCC 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 6 5 334629 CASAVA_Build 20 49752939 3I CTTGGTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 TTG 3 4 334630 CASAVA_Build 20 49758294 6D TAAAATGTTG AAAACT/------ AAAACAAAGC 2004 het 2004 ref 25 18 6 2 AAAACT 1 0 334631 CASAVA_Build 20 49760249 1I AACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 200 hom 26 3 12 11 A 9 10 334632 CASAVA_Build 20 49760259 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAACTTC 3070 het 512 hom 27 6 16 5 A 7 6 334633 CASAVA_Build 20 49761733 2D ATATCTTGCA AG/-- TGGGGGGTCA 3070 het 3070 ref 32 15 9 9 AG 1 0 334634 CASAVA_Build 20 49767573 1D GGTGGGAGTA G/- GGGCAGAGAA 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 G 4 3 334635 CASAVA_Build 20 49768320 1I ATGTGTGTGT -/G GGGGGGGGGT 3070 het 2588 hom 35 12 13 10 G 9 10 334636 CASAVA_Build 20 49783619 1I GTACCTGGCC -/T TTTTTTTTTT 2547 het 24 hom 14 1 10 3 T 10 11 334637 CASAVA_Build 20 49786464 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 43 het 19 0 17 3 T 9 10 334638 CASAVA_Build 20 49796910 1I CGAGGTAGTG -/C CCATTGCACT 3070 hom 29 het 15 0 8 7 C 2 3 334639 CASAVA_Build 20 49802000 1D GAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 29 2 22 5 A 13 12 334640 CASAVA_Build 20 49804042 7D CTGGCCAGGC CCTGGAG/------- CCTGGAGCCC 3059 het 3059 ref 27 14 9 6 CCTGGAG 2 1 334641 CASAVA_Build 20 49805385 1D CATCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 1516 het 1516 ref 27 21 5 1 A 13 12 334642 CASAVA_Build 20 49810221 2D AAATATGCGG TT/-- TTTAAAAAAC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 5 3 334643 CASAVA_Build 20 49817020 1D AGCACCATTC T/- TTTTTTTTTT 949 het 779 hom 17 5 4 8 T 17 16 334644 CASAVA_Build 20 49832281 1I CCTGGGTGAG -/A AAAAAAAAAC 3022 het 3022 ref 29 19 9 1 A 9 10 334645 CASAVA_Build 20 49837603 1D TTTCAGCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 T 10 9 334646 CASAVA_Build 20 49851866 2D TAAGTTACAA GG/-- GGGGGGGGTA 1643 hom 12 het 6 0 4 2 G 10 8 334647 CASAVA_Build 20 49853185 1I CAAACCTTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 T 9 10 334648 CASAVA_Build 20 49860503 1D TAATACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 11 10 334649 CASAVA_Build 20 49861341 1D TAAAAGAAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 T 9 8 334650 CASAVA_Build 20 49866464 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 26 1 20 5 A 13 14 334651 CASAVA_Build 20 49881980 1D CATGTGGGTC A/- GGGGGATGAA 3070 het 3070 ref 49 26 19 5 A 1 0 334652 CASAVA_Build 20 49882855 1I AAAAAAAAAA -/C CAAAGAACCC 1961 het 1961 ref 22 8 6 8 C 1 2 334653 CASAVA_Build 20 49884454 1D CAAAAAAAAA G/- CCAGGCATGG 3070 het 3070 ref 36 17 10 10 G 1 0 334654 CASAVA_Build 20 49886140 2I TCTTTTCTTT --/TC TTTTTTTTTT 1101 het 973 hom 25 7 4 14 TC 0 1 334655 CASAVA_Build 20 49888346 4D TTTTTTGGGG GGGC/---- GGGGGGAGGG 1600 het 1600 ref 18 7 8 4 GGGC 1 0 334656 CASAVA_Build 20 49889541 2D TATCTTTTCC AA/-- AGTTTGAATT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 3 1 334657 CASAVA_Build 20 49889776 1I ATGAAAAGAA -/T TTTTTTTTTT 1169 het 1169 ref 13 8 3 2 T 11 12 334658 CASAVA_Build 20 49890968 12D GTGCTTACAT TCTCTCTCTCTC/------------ TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 48 18 22 10 TC 13 7 334659 CASAVA_Build 20 49894451 1I AAGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2412 het 341 hom 18 2 10 6 A 13 14 334660 CASAVA_Build 20 49899283 5D ACATATATTG TTATA/----- TTATATTACA 3070 hom 93 het 35 0 32 6 TTATA 2 1 334661 CASAVA_Build 20 49902617 3I ATAGGCTCAG ---/GCA GCAGCTTCTC 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 GCA 1 2 334662 CASAVA_Build 20 49903480 1D TACACGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 34 0 23 11 T 11 10 334663 CASAVA_Build 20 49906616 5D ACCCTCACTG TCCTC/----- TATAAGCTGC 3070 het 3070 hom 50 22 25 8 TCCTC 1 0 334664 CASAVA_Build 20 49909273 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACAC 3070 het 2429 hom 16 6 8 2 AG 2 1 334665 CASAVA_Build 20 49911419 4D CCATCCACCC ACCT/---- ATCCATCCAT 3070 het 3052 hom 35 15 16 5 ACCT 1 0 334666 CASAVA_Build 20 49913486 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2443 het 1049 hom 17 4 8 5 T 10 11 334667 CASAVA_Build 20 49917961 6D ACCAGGAATT TGAGAC/------ TGAGACTAGG 3069 hom 24 het 10 0 9 1 TGAGAC 2 1 334668 CASAVA_Build 20 49924465 1I CAGAGTTTGA -/G GGGGCTCACA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 G 4 5 334669 CASAVA_Build 20 49941852 13D CCTAAGTAAC ACACACCTAAGGT/------------- GGTGTGAGAC 3070 het 3070 ref 20 11 7 4 ACACACCTAAGGT 1 0 334670 CASAVA_Build 20 49942173 1D CTATATCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 T 13 12 334671 CASAVA_Build 20 49950814 1D TAAAAAAAAA C/- CCCCACAGCT 2561 het 2561 ref 18 9 7 2 C 5 4 334672 CASAVA_Build 20 49955291 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 474 hom 17 3 12 2 A 17 16 334673 CASAVA_Build 20 49956305 1I TATTTTTTTT -/G TTTTTGAGAT 3070 het 1609 hom 20 6 12 2 G 0 1 334674 CASAVA_Build 20 49981662 1D TAATTGAGTG T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 7 6 334675 CASAVA_Build 20 49999172 3D GTGGACACAA AAT/--- AATCTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 21 19 5 AAT 2 1 334676 CASAVA_Build 20 50006683 1D GTACCATAAA T/- TTTTTTTTTT 2351 het 1537 hom 23 6 6 11 T 17 16 334677 CASAVA_Build 20 50008420 3D AGTGAGATAA AAG/--- AAGTACATGA 3070 het 3070 hom 40 19 17 8 AAG 2 1 334678 CASAVA_Build 20 50016240 1I GCTCATTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 9 10 334679 CASAVA_Build 20 50026183 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 20 2 12 6 A 15 14 334680 CASAVA_Build 20 50034200 1D CCAAGAGGAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 111 het 43 0 38 6 A 9 8 334681 CASAVA_Build 20 50036096 1I AACTTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 A 10 11 334682 CASAVA_Build 20 50043642 3D TGGTTGACAG GGT/--- GGTGGAAACC 3070 hom 45 het 25 0 11 15 GGT 2 1 334683 CASAVA_Build 20 50047959 1I TAACTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 28 0 23 5 T 10 11 334684 CASAVA_Build 20 50049156 1I CACCGCACCT -/G GGCCATTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 G 2 3 334685 CASAVA_Build 20 50059390 3I TACAATTATT ---/ATC ATAATTGTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 ATC 0 1 334686 CASAVA_Build 20 50061108 1D CGGTTTCAAA T/- CCTTGTGGGA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 T 1 0 334687 CASAVA_Build 20 50069105 18D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 3070 het 1471 hom 15 6 9 2 A 30 12 334688 CASAVA_Build 20 50073121 1D TCGCCCAGGC T/- TGGAGTGCAA 1177 het 1177 ref 19 9 3 7 T 2 1 334689 CASAVA_Build 20 50095591 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 2861 het 1168 hom 15 4 7 4 T 6 7 334690 CASAVA_Build 20 50098956 2I ACACAAACCG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 26 1 20 5 T 14 16 334691 CASAVA_Build 20 50103345 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 A 8 9 334692 CASAVA_Build 20 50105159 3D AAAACATACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 28 0 16 12 A 17 14 334693 CASAVA_Build 20 50119725 7I CGTCTCTACC -------/AAAAACG AAAAACGAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AAAAACG 1 2 334694 CASAVA_Build 20 50125165 1I AGGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3032 hom 16 8 8 0 A 10 11 334695 CASAVA_Build 20 50127114 5D AATATCAGAC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 702 hom 14 3 9 3 T 16 11 334696 CASAVA_Build 20 50127859 2D AAAAACACAC TT/-- AACAATTTAA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 T 2 0 334697 CASAVA_Build 20 50128587 3D TATTCTTGCA AAG/--- AAGACTTTGT 3070 het 3070 hom 42 17 20 7 AAG 2 1 334698 CASAVA_Build 20 50129427 1D CAACCAAACA G/- GGGGCCTCCT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 G 5 4 334699 CASAVA_Build 20 50136425 1I TCACAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 1998 het 131 hom 13 3 5 5 T 17 18 334700 CASAVA_Build 20 50137917 3I TGGTCCTATC ---/ATT ATTTCAGTAG 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 ATT 1 2 334701 CASAVA_Build 20 50145387 1D GGAACATCAT G/- GTGCAGAAAT 3070 het 2739 hom 21 7 10 5 G 2 1 334702 CASAVA_Build 20 50147060 1D TGGCTGCCCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 10 9 334703 CASAVA_Build 20 50147854 1D CCCCCTATTT A/- AAAAAAAAAA 2048 hom 22 het 13 0 7 6 A 11 10 334704 CASAVA_Build 20 50149266 5D AATGTCAAAC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 20 10 T 16 11 334705 CASAVA_Build 20 50151327 1D GGACTTGCGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 36 18 15 3 T 9 8 334706 CASAVA_Build 20 50157070 2I ATACACACAC --/AT GTTTATCATA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 AT 0 1 334707 CASAVA_Build 20 50162572 5I TTTTTTTTTT -----/TTTTC CTTTGTTGGG 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 TTTTC 0 1 334708 CASAVA_Build 20 50171338 1I CATGAGTGAT -/A AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 6 7 334709 CASAVA_Build 20 50171592 4D GTGAAGCAGC AGGT/---- AGGTGCTGAT 3070 het 3070 ref 48 23 20 7 AGGT 2 1 334710 CASAVA_Build 20 50172942 1D GGATTGACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 10 9 334711 CASAVA_Build 20 50174723 2I TTGTATTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 9 9 10 T 10 12 334712 CASAVA_Build 20 50178867 1I TTAAATTTTC -/T TTTCTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 3 4 334713 CASAVA_Build 20 50182849 1I AAAACACATC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 8 9 334714 CASAVA_Build 20 50188600 2D AAAATATAAT AA/-- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 19 9 7 3 A 10 8 334715 CASAVA_Build 20 50193649 1D ACCCGGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 14 6 T 11 10 334716 CASAVA_Build 20 50194046 2I AATACTTGAC --/AT GTGTTAATCT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AT 0 1 334717 CASAVA_Build 20 50196346 1I TATGCAGCCA -/T TAAAAAATGA 972 hom 7 het 3 0 3 0 T 1 2 334718 CASAVA_Build 20 50199237 1I AAAAAAAAAA -/G AGCTGAATAT 3070 het 930 hom 33 9 15 9 G 0 1 334719 CASAVA_Build 20 50200502 1I TTACCAAAAA -/C CATAGTTAAT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 C 1 2 334720 CASAVA_Build 20 50202080 1D ACTCCTTTTG T/- TTTTTTAAGC 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 7 6 334721 CASAVA_Build 20 50212922 2I GTAGGCTAAC --/TG TGTAGAAGAT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 TG 1 2 334722 CASAVA_Build 20 50213733 1I CATATAACAC -/T TTGTTAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 2 3 334723 CASAVA_Build 20 50236461 1D AAACAACCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 10 9 334724 CASAVA_Build 20 50245903 1I2M2D ACTTGCCCTA -TACT/GTA-- TGTTTTTCTT 3070 hom 108 het 39 0 37 4 N/A 0 0 334725 CASAVA_Build 20 50247417 2I CCCTACCATT --/AG TTTTAATGGT 3070 hom 93 het 34 0 30 4 AG 0 1 334726 CASAVA_Build 20 50253916 1I GCCCCTGGCC -/G TTATCTGATA 3070 hom 72 het 25 0 24 4 G 0 1 334727 CASAVA_Build 20 50256845 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 26 0 19 7 T 12 11 334728 CASAVA_Build 20 50267552 1D CAGATCAATG C/- TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 36 1 28 7 C 1 0 334729 CASAVA_Build 20 50284674 1I GTAAACGTAG -/A AAAGCCTATC 3070 hom 199 het 74 0 67 7 A 3 4 334730 CASAVA_Build 20 50289796 2I CCAAGTTTTC --/AG AGTCAAAGAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AG 1 2 334731 CASAVA_Build 20 50330769 11I ATTTTCTATG -----------/GAATGTCAGCC CTTGCCATGT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 GAATGTCAGCC 0 1 334732 CASAVA_Build 20 50331689 1I TAGAGCCCTT -/A ATTCAATCTG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 1 2 334733 CASAVA_Build 20 50370133 1I AGACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 18 6 A 13 14 334734 CASAVA_Build 20 50380309 1D GGGCATAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 6 T 13 12 334735 CASAVA_Build 20 50385828 2D CTTTTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 40 0 31 10 TG 9 8 334736 CASAVA_Build 20 50401911 1D TTTCCAGCAG T/- TTTTTTTTTT 1259 het 1259 ref 21 8 3 10 T 17 16 334737 CASAVA_Build 20 50402218 1I TATGTACTGG -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 334738 CASAVA_Build 20 50435675 1I GACCCTTTCT -/C CAATAGTAGG 3070 hom 144 het 56 0 48 8 C 1 2 334739 CASAVA_Build 20 50440379 1D CAGGATTTCA T/- TTTTTTTTTT 1576 het 283 hom 15 1 5 9 T 17 16 334740 CASAVA_Build 20 50457037 1D TGCTTGTAAC T/- TTTTTTTTTT 903 het 903 ref 48 41 3 4 T 11 10 334741 CASAVA_Build 20 50475388 1I GAGGACGCCT -/C CCTGCAGGTT 3070 hom 117 het 45 0 37 8 C 2 3 334742 CASAVA_Build 20 50481123 30D TCATATGTTC ATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------ ATATATATAT 3070 hom 78 het 34 0 25 13 AT 22 7 334743 CASAVA_Build 20 50507606 4I CTTAATAGTT ----/GTCA GTCACTGTGT 3070 hom 163 het 57 0 55 2 GTCA 1 2 334744 CASAVA_Build 20 50510525 2I ACACTCCCCA --/CC TAAATTGAAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 0 2 334745 CASAVA_Build 20 50536594 1D CCTGGATAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1524 hom 25 7 15 3 T 10 9 334746 CASAVA_Build 20 50538511 1D CTGTAATCCC A/- AGCACTTTGG 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 2 1 334747 CASAVA_Build 20 50545851 1D CTGTCTCTAG A/- AAAAAAAAAT 2934 het 2380 hom 22 7 8 7 A 10 9 334748 CASAVA_Build 20 50545964 1D TGTCACTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 11 10 334749 CASAVA_Build 20 50555045 6I AAAAAAACTT ------/TTACTC TAGAATAGTA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 TTACTC 0 1 334750 CASAVA_Build 20 50557822 1I ATAAACAAAT -/C CAGTAAAGTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 C 1 2 334751 CASAVA_Build 20 50585649 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAATCTT 3070 het 148 hom 35 3 17 15 A 7 6 334752 CASAVA_Build 20 50586032 2I AAAAGAGTAA --/CT CTCAGTTTTG 3070 het 3070 ref 50 20 20 10 CT 1 2 334753 CASAVA_Build 20 50588242 2I AGTATCCAAG --/AT ATATATATAA 2587 het 2587 ref 29 14 7 8 AT 4 5 334754 CASAVA_Build 20 50591902 2I TTTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 190 hom 25 1 19 5 T 12 14 334755 CASAVA_Build 20 50600290 1I TGTTCCTCCC -/T GCATGCTTCT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 0 1 334756 CASAVA_Build 20 50602238 2I CCAGGAGCAC --/AG GGGAGAGCAC 3070 hom 123 het 48 0 40 8 AG 0 1 334757 CASAVA_Build 20 50603798 1I TTTTGATGCA -/T TTTTTTAGTC 2253 hom 30 het 18 0 11 7 T 6 7 334758 CASAVA_Build 20 50604526 2I CCTATTTGAG --/TA TATATATATG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TA 4 5 334759 CASAVA_Build 20 50605588 1D CTATCCTACC A/- GGGGTGAGAT 3070 hom 60 het 23 0 20 4 A 1 0 334760 CASAVA_Build 20 50608551 1I TTTTTGACAT -/G GAGTCTGTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 2 334761 CASAVA_Build 20 50611692 3D TCAATGCAAG TTA/--- TTATATATGT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 TTA 2 1 334762 CASAVA_Build 20 50611938 1D CCTTGGACAC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 9 8 334763 CASAVA_Build 20 50644966 1I TTTAAAAAAA -/G TTATTAGCCA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 G 0 1 334764 CASAVA_Build 20 50649881 1D GTGATGGTTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 9 8 334765 CASAVA_Build 20 50668698 2I AGACTACAAC --/TT TATCCCAGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 1 3 334766 CASAVA_Build 20 50669490 1D TAGTGAATTT A/- GAATGGGAGA 3070 het 3070 hom 45 17 22 7 A 1 0 334767 CASAVA_Build 20 50670587 1I AGACCTTATC -/A CCACTGGATA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 0 1 334768 CASAVA_Build 20 50671403 2I AGGGGTATCC --/TT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 41 18 13 10 T 8 10 334769 CASAVA_Build 20 50672737 1I TTAAAAAAAA -/T ATATATATAA 3070 het 2642 hom 20 8 9 3 T 0 1 334770 CASAVA_Build 20 50672966 1D ACACACATCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 131 het 47 0 45 2 T 9 8 334771 CASAVA_Build 20 50673145 1D TATCCCAGAA T/- TTTTTTGCAC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 7 6 334772 CASAVA_Build 20 50675958 1I AGGTTTATTG -/T TTTAATTATC 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 T 3 4 334773 CASAVA_Build 20 50679002 2D GAACTCAGTC TA/-- GGCTTATTTC 3070 het 3070 hom 51 22 23 8 TA 1 0 334774 CASAVA_Build 20 50688507 2I GCTAAAATGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 35 0 29 6 A 11 13 334775 CASAVA_Build 20 50690680 2I GTATTCCATC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 AT 6 7 334776 CASAVA_Build 20 50696897 1I TGAAAATGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 8 9 334777 CASAVA_Build 20 50707820 3I TGGCCAGATC ---/AGA AGGTCACTGT 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 AGA 0 1 334778 CASAVA_Build 20 50708448 1I GTATTTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 11 12 334779 CASAVA_Build 20 50721628 1D TCTGTCTTGC T/- TTTAGGTCCT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 4 3 334780 CASAVA_Build 20 50724549 1D AATCAAACTA T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 129 het 45 0 44 3 T 7 6 334781 CASAVA_Build 20 50728807 4D AACTCCACTA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 51 24 13 16 AAAC 5 4 334782 CASAVA_Build 20 50730587 8D ACATTGACTC ATGATTAA/-------- ATAACAGTGA 3070 het 3070 ref 39 25 13 5 ATGATTAA 1 0 334783 CASAVA_Build 20 50733152 1I AGCGTTTTGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 33 17 13 3 A 8 9 334784 CASAVA_Build 20 50733393 1I CAGTTGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 A 10 11 334785 CASAVA_Build 20 50742002 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1467 het 1467 ref 32 19 7 6 T 14 13 334786 CASAVA_Build 20 50742980 4D TAACACTTAC TGAG/---- TGTTTACTCT 3070 het 3070 hom 49 20 27 2 TGAG 1 0 334787 CASAVA_Build 20 50750031 6D AAAACAAAAA ACACAC/------ ACACACACAC 961 het 961 ref 10 4 5 2 AC 8 5 334788 CASAVA_Build 20 50751728 2D ACACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 95 het 45 0 32 15 AC 10 9 334789 CASAVA_Build 20 50770069 1I ATATATCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1279 hom 60 3 45 12 T 11 12 334790 CASAVA_Build 20 50801136 1I ATATTAAATA -/C CTACTTATGC 3070 het 3070 ref 41 27 12 2 C 1 2 334791 CASAVA_Build 20 50824437 1D TGAAAATGTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 12 26 5 A 9 8 334792 CASAVA_Build 20 50844035 1I ATATATTCTG -/T TTTTTCCTTA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 T 5 6 334793 CASAVA_Build 20 50859884 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 2619 hom 14 6 8 0 A 8 7 334794 CASAVA_Build 20 50868890 1I CGAAAATACA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 G 0 1 334795 CASAVA_Build 20 50914015 9D ATAATACTGT GAGGAACCA/--------- GTGAGCTGCA 3070 het 3070 ref 32 21 11 1 GAGGAACCA 1 0 334796 CASAVA_Build 20 50960317 1D TTATGGTCTG C/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 1 0 334797 CASAVA_Build 20 50960673 1I ATATTAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 737 hom 31 3 20 8 A 12 13 334798 CASAVA_Build 20 50961007 1D AAGTCCTTGC A/- GGAAGAAGAT 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 A 1 0 334799 CASAVA_Build 20 50961562 1I AAATATATAT -/A TTTTTAACAT 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 A 0 1 334800 CASAVA_Build 20 50971864 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1815 het 847 hom 9 2 5 2 A 11 12 334801 CASAVA_Build 20 51020001 1D AATCAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1444 hom 22 5 13 4 A 13 12 334802 CASAVA_Build 20 51020929 1I ATAATAAAGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 413 hom 36 1 30 5 A 9 10 334803 CASAVA_Build 20 51039111 1D TCTGTCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2531 hom 33 8 13 13 A 17 16 334804 CASAVA_Build 20 51067502 1D CTGAATTTTT A/- AGTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 2 1 334805 CASAVA_Build 20 51069195 1D GTTGCCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2793 hom 33 12 16 5 T 13 12 334806 CASAVA_Build 20 51073572 13D TTTGTTTTTT TTTTTGCTTTTTG/------------- TTTTTTATGA 3070 hom 83 het 37 0 31 16 TTTTTGCTTTTTG 1 0 334807 CASAVA_Build 20 51077030 1I TGTTTGCAAC -/T TTTTTTGCTA 3070 hom 21 het 28 0 8 20 T 6 7 334808 CASAVA_Build 20 51079802 1D AAATTTGGAG T/- TTTTTTGATA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 7 6 334809 CASAVA_Build 20 51085914 12D ATATACACAT ATTATTCACTTA/------------ AATATAAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 22 2 ATTATTCACTTA 1 0 334810 CASAVA_Build 20 51086625 6I AATCTGTACA ------/TAATAT TAATATGTGT 2530 het 2530 ref 14 8 6 0 TAATAT 1 2 334811 CASAVA_Build 20 51089260 1I AGAGAACTTT -/C CCACACTCTT 3070 het 3070 ref 54 33 15 6 C 2 3 334812 CASAVA_Build 20 51101942 1D ACACATAACA T/- TGCAATTTAT 3070 het 3070 ref 51 29 20 3 T 2 1 334813 CASAVA_Build 20 51103528 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 9 17 4 TA 9 8 334814 CASAVA_Build 20 51107364 3I TCCCAGACGC ---/CCT CCTACAACCT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 CCT 1 2 334815 CASAVA_Build 20 51109101 1I TTAAACTCCT -/A AAAATATTAG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 4 5 334816 CASAVA_Build 20 51116214 1D GACTCCACTC G/- AGGCCAAGGA 2872 het 2872 ref 32 15 11 9 G 1 0 334817 CASAVA_Build 20 51127204 1D ACTAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 10 9 334818 CASAVA_Build 20 51129770 1D TCTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 34 0 32 2 T 10 9 334819 CASAVA_Build 20 51134545 3I TCCTTTCCTC ---/TGT TGTTTTTCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TGT 1 2 334820 CASAVA_Build 20 51149414 3I TGCTACAACC ---/TAA TGTTTCTTCA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 TAA 0 1 334821 CASAVA_Build 20 51171376 12I AGAGGATTAT ------------/GAGTACAAATAA GTTTCAGTCC 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 GAGTACAAATAA 0 1 334822 CASAVA_Build 20 51180177 1D GCTAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 12 11 334823 CASAVA_Build 20 51220901 1D AAAAGTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 12 11 334824 CASAVA_Build 20 51221494 1I CTTCTAAATG -/T TTTTTTTTTT 975 het 975 ref 33 25 3 5 T 10 11 334825 CASAVA_Build 20 51229091 1D CAAATGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 8 T 13 12 334826 CASAVA_Build 20 51232174 3D CTTCCCTCTT GAC/--- TCCCTCCTTC 690 het 690 ref 39 24 6 10 GAC 1 0 334827 CASAVA_Build 20 51243114 1I AAATACTTTC -/A AAAAAAAAAA 2703 het 696 hom 22 6 11 5 A 13 14 334828 CASAVA_Build 20 51243135 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 1193 het 1193 ref 28 15 7 7 A 10 9 334829 CASAVA_Build 20 51245316 2D TTGTGCATAG CT/-- CTGTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 12 20 6 CT 2 1 334830 CASAVA_Build 20 51250963 1D TTTCCATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 18 9 T 11 10 334831 CASAVA_Build 20 51259840 10D AGACGACAGA TTCTTCCCTG/---------- TTCTTCCAGG 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 TTCTTCCCTG 1 0 334832 CASAVA_Build 20 51261456 2D TGCCTGAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 8 7 A 12 10 334833 CASAVA_Build 20 51263644 1I CTAATTGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 34 1 23 10 T 14 15 334834 CASAVA_Build 20 51271167 1D GATTGTGAGG C/- CCCCCCCGCC 3070 het 516 hom 23 3 14 6 C 8 7 334835 CASAVA_Build 20 51276066 26D ACTAAATTTA ACACACACACACACACACACACACAC/-------------------------- ACACACACAC 3070 het 1696 hom 31 9 17 8 AC 20 7 334836 CASAVA_Build 20 51292595 3I TGAGTTTAAA ---/CCC CCCATGTGCA 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 C 3 6 334837 CASAVA_Build 20 51298956 1I GCTGATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2955 hom 25 7 11 7 T 11 12 334838 CASAVA_Build 20 51320611 1D ATGAATGCCT C/- CCCCCCAAAA 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 C 7 6 334839 CASAVA_Build 20 51321961 1D GAGAAGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 17 12 T 11 10 334840 CASAVA_Build 20 51323250 5D ACTTTCTTTC TTTTT/----- TTGAGACAGA 3070 het 3070 hom 43 17 25 1 T 7 2 334841 CASAVA_Build 20 51327207 1D AGCAATGGTT A/- AAACTGTTCA 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 A 4 3 334842 CASAVA_Build 20 51380132 1D GTCTTTCAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 25 13 4 T 9 8 334843 CASAVA_Build 20 51394155 6D ACCCTCCTCC TCCTCA/------ TCATCATCAT 3070 het 3070 ref 59 26 23 10 TCCTCA 1 0 334844 CASAVA_Build 20 51405726 5D TGAAGCTGTT AACAA/----- AACAAAAAGA 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 AACAA 2 1 334845 CASAVA_Build 20 51411871 1I GTTTTGTGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 G 0 1 334846 CASAVA_Build 20 51412615 1I CTGTATTTGT -/G GCTGTCACAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 1 2 334847 CASAVA_Build 20 51436828 1I TCACCTAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 11 12 334848 CASAVA_Build 20 51442507 1I TTTGTAGCAA -/T TAAGTATAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 1 2 334849 CASAVA_Build 20 51455194 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 295 hom 25 2 17 6 A 11 12 334850 CASAVA_Build 20 51465271 1D AAATTAAATA T/- TGCAATGATA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 2 1 334851 CASAVA_Build 20 51465643 19D ATACATATTA TATGTGTGTATATACATAT/------------------- TATATATGTG 3070 het 2722 hom 17 7 13 4 TATGTGTGTATATACATAT 1 0 334852 CASAVA_Build 20 51474506 1I GACCAACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 22 8 T 10 11 334853 CASAVA_Build 20 51483390 3D AGGCTGAGGC TGG/--- TGGAGGATCG 3070 hom 109 het 40 0 35 6 TGG 2 1 334854 CASAVA_Build 20 51499671 4D CCTCCATCAG TTAA/---- TTAATTATTC 3070 het 3070 ref 44 25 14 9 TTAA 2 1 334855 CASAVA_Build 20 51502545 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2288 het 2072 hom 33 11 10 12 A 17 15 334856 CASAVA_Build 20 51513439 4D GAGGAAAGAA AGAG/---- AGAAGGAAGA 3070 het 3070 hom 30 12 16 4 AG 3 1 334857 CASAVA_Build 20 51530990 1D AATATATTAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 9 8 334858 CASAVA_Build 20 51538782 1I CATTGGGATT -/A AAAAAAAAAA 2784 het 2784 ref 28 10 9 9 A 15 16 334859 CASAVA_Build 20 51548263 1I CGATCACGAG -/C TTTGTTGTCA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 C 0 1 334860 CASAVA_Build 20 51550137 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 964 het 617 hom 11 3 5 3 TA 8 7 334861 CASAVA_Build 20 51552945 1D CCCACCATCT G/- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 G 1 0 334862 CASAVA_Build 20 51564537 1I AAGAAAGAAC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 8 9 334863 CASAVA_Build 20 51571916 2I AGACTCTGTC --/AA AAAAAAAAAA 2188 het 1429 hom 14 4 6 4 A 11 13 334864 CASAVA_Build 20 51584893 1I CCAAATCACA -/T TTTTTCTCTT 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 T 5 6 334865 CASAVA_Build 20 51587123 1I ACTTCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2997 hom 28 11 10 7 A 11 12 334866 CASAVA_Build 20 51598504 5D TAGAAAAGTT AAAAG/----- GAAAATACAG 3070 het 2406 hom 14 6 7 2 AAAAG 1 0 334867 CASAVA_Build 20 51608325 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1530 het 1260 hom 14 5 5 4 A 12 13 334868 CASAVA_Build 20 51620680 20D AGTTCCCCTC CTTGGCAGATAAGTACTTAT/-------------------- CTTGGCAGAT 3070 het 3070 ref 45 18 20 13 CTTGGCAGATAAGTACTTAT 1 0 334869 CASAVA_Build 20 51621807 1I TTCCTGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 11 9 A 10 11 334870 CASAVA_Build 20 51630787 3D GCTCTAGTTG ATC/--- ATCACTCCCA 3070 het 3070 ref 49 20 19 10 ATC 2 1 334871 CASAVA_Build 20 51636406 1D CAGCACAAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 9 18 10 A 10 9 334872 CASAVA_Build 20 51637500 2I3M4D ACCATAATAC --AGCTTTG/AAAGC---- AATAAGGTAT 3070 het 3070 ref 52 44 7 5 N/A 0 0 334873 CASAVA_Build 20 51640361 1I ACAATTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 36 9 10 T 10 11 334874 CASAVA_Build 20 51641023 1D TTGACCTGTT A/- ACCAAAATAG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 2 1 334875 CASAVA_Build 20 51647030 1I GTAACATAAC -/A AAAAAAAAAA 1917 het 752 hom 28 9 14 5 A 13 14 334876 CASAVA_Build 20 51650934 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 186 hom 22 2 11 9 A 13 12 334877 CASAVA_Build 20 51655328 2D ATAGTAACAC AG/-- GGTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 AG 1 0 334878 CASAVA_Build 20 51656655 1D GCAGTGACCA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 272 hom 30 1 14 16 C 9 8 334879 CASAVA_Build 20 51659312 4I TTCTTGACTC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 13 11 A 10 14 334880 CASAVA_Build 20 51675518 1D AATTAAAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 24 2 13 9 T 14 13 334881 CASAVA_Build 20 51676319 1D CATCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2185 hom 28 6 15 8 A 13 12 334882 CASAVA_Build 20 51696218 1I TCTCTACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2548 hom 20 8 11 1 A 11 12 334883 CASAVA_Build 20 51700954 3I GCATGCACTG ---/CTT GGGTGACGGG 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 CTT 0 1 334884 CASAVA_Build 20 51706745 1D GCTAATTAAT A/- AATCAATCAC 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 A 3 2 334885 CASAVA_Build 20 51710336 1I AAAATAGATT -/G GGGGGGCGGG 1533 het 1533 ref 18 11 5 2 G 6 7 334886 CASAVA_Build 20 51721114 1D GCATGGTGTC A/- CACGCCTGTA 1818 het 1818 ref 14 9 4 1 A 1 0 334887 CASAVA_Build 20 51744724 1D AGAAGTTAGC T/- TTTTTTTTTT 2332 het 2332 ref 30 16 5 10 T 13 12 334888 CASAVA_Build 20 51755014 1D CTGTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 2040 het 2040 ref 30 13 7 11 T 17 16 334889 CASAVA_Build 20 51768638 1D GCTCATGAGC T/- TTTTTTTTTT 1049 het 1049 ref 35 25 3 7 T 11 10 334890 CASAVA_Build 20 51790658 1I GCTGCTTAGG -/A AAAAAAGAGG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 A 6 7 334891 CASAVA_Build 20 51794351 3D AAGTGGGAGA CAT/--- CGTGGTATGT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 CAT 1 0 334892 CASAVA_Build 20 51795932 1D ACTCTGCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 13 12 334893 CASAVA_Build 20 51799595 1D CATTAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 20 9 A 11 10 334894 CASAVA_Build 20 51803843 19D ACGTTGTCTT AAATGTAGACTTTGATCTA/------------------- AATGTTGAGT 2176 het 2176 ref 14 9 6 2 AAATGTAGACTTTGATCTA 1 0 334895 CASAVA_Build 20 51807790 1I AAATACCATC -/T TTGAGGATTT 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 2 3 334896 CASAVA_Build 20 51809761 1I GTTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 2576 het 366 hom 22 7 10 5 G 0 1 334897 CASAVA_Build 20 51820388 2I TCTACTAAAA --/AT ATACAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 7 13 2 AT 1 2 334898 CASAVA_Build 20 51823376 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 704 het 704 ref 18 11 4 3 A 19 16 334899 CASAVA_Build 20 51835858 1D CAAATAGACA C/- CCCCCCCGAA 3070 hom 51 het 24 0 17 7 C 8 7 334900 CASAVA_Build 20 51849456 1I GCTGGGCGTG -/A GTAGTGCGTG 2732 het 1543 hom 13 4 7 2 A 0 1 334901 CASAVA_Build 20 51852217 1D AGCCTGTGCA T/- TTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 56 30 16 11 T 7 6 334902 CASAVA_Build 20 51852449 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1166 het 1166 ref 38 17 3 19 T 13 11 334903 CASAVA_Build 20 51865465 1D TTTTTGAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 11 20 13 T 12 11 334904 CASAVA_Build 20 51876320 1I GGCAAAATTG -/C CCCCCATTAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 C 5 6 334905 CASAVA_Build 20 51877144 1I GCAAGGCTGC -/A ACAGGGCATC 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 A 1 2 334906 CASAVA_Build 20 51880586 1D TTTACAAGAG A/- AAAATAATTA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 5 4 334907 CASAVA_Build 20 51909052 2I TGCTATAAAC --/AT GTGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 45 32 9 4 AT 0 1 334908 CASAVA_Build 20 51909458 1D51M1D TCTCTTGCTG TGTAACAAATTTTCCCTAAACGTACTCGCTTAAAATATGGACATTTAAAAACT/-GTAACAAATTTTCCCTAAACTTACTCGCTTAAAATATGAACATTTAAAAAC- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 52 35 25 4 N/A 0 0 334909 CASAVA_Build 20 51910239 1D TTTAAAGCTG A/- AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 53 36 13 4 A 7 6 334910 CASAVA_Build 20 51912843 2I AATAGAAACT --/AC ACATGTCTTA 3070 het 3070 ref 87 40 39 8 AC 1 2 334911 CASAVA_Build 20 51913394 1I TAATCCCCCC -/A TCCCCCCAAG 2950 het 2950 ref 56 34 11 11 A 0 1 334912 CASAVA_Build 20 51913913 1D22M1I AAAACTCAAC TAAAACTTAAAACTGTGTCTTCC-/-AAAGTGTAAAAGTATGTCTTCCA AAGGGACAAA 3070 het 3070 ref 65 47 23 8 N/A 0 0 334913 CASAVA_Build 20 51915074 1I GGCTGTCGCA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 63 34 21 8 T 6 7 334914 CASAVA_Build 20 51915603 2D ATTAGGTAAC TG/-- TGTAATGACA 3070 het 3070 ref 75 38 22 18 TG 2 1 334915 CASAVA_Build 20 51915654 1D AAAACAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 64 33 13 19 T 12 11 334916 CASAVA_Build 20 51915937 6D TCCTGAATGA GGAGAG/------ AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 76 36 31 19 GGAGAG 1 0 334917 CASAVA_Build 20 51916465 9D25M5D CTCTCTCTCT CTCTCTCTCAATTCTGGGCAGAATGCTTATTTTTGTTTC/---------AATTTTTGGCAGAATGCTTATTTTT----- GTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 39 26 14 17 N/A 0 0 334918 CASAVA_Build 20 51916660 3I17M2D CAGGCTTTTC ---TCTTCATGAAATCCCCCCT/TCTTCTTCATGAAATCCCCC-- GTGAGGTTTT 3070 het 3070 ref 55 33 26 9 N/A 0 0 334919 CASAVA_Build 20 51917574 1I AGTATGCTTT -/C TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 58 30 19 9 C 0 1 334920 CASAVA_Build 20 51917710 1D AGGGGGGAAA G/- AAAAGTTTAG 3070 het 3070 ref 64 46 16 2 G 1 0 334921 CASAVA_Build 20 51921643 4D AATTTATACT TAGA/---- TATTTATTTG 3070 hom 131 het 49 0 44 7 TAGA 1 0 334922 CASAVA_Build 20 51925181 1I AGGGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 29 2 19 8 A 11 12 334923 CASAVA_Build 20 51953412 1I TGCAAACAAC -/T TTTTTTTTTT 1276 het 1276 ref 47 27 6 14 T 15 16 334924 CASAVA_Build 20 51959887 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 15 1 10 4 T 14 13 334925 CASAVA_Build 20 51963197 2D23M2D CGTATACATG TATATATATACACATATACAGATACAT/--TATATATACACGTGTATATATAC-- GTATATATAC 2805 het 2805 ref 32 14 10 13 N/A 0 0 334926 CASAVA_Build 20 51966104 1I TTCACTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 33 0 25 8 T 11 12 334927 CASAVA_Build 20 51967317 1D ACTTAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2910 hom 29 8 10 13 T 11 10 334928 CASAVA_Build 20 51970360 1I CAATGGTCAC -/T TACCTGGCTC 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 1 2 334929 CASAVA_Build 20 51971960 1I TGGGTGCACA -/G GGGAGAAGTG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 3 4 334930 CASAVA_Build 20 51973526 2I GCTATGAAAC --/TT TTTATGCAGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 3 5 334931 CASAVA_Build 20 51991763 2D AACAACAATA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AC 9 8 334932 CASAVA_Build 20 51993911 1D TTTTTTATTT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3002 hom 25 10 13 2 A 1 0 334933 CASAVA_Build 20 51994262 2D TGCCACTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 35 1 15 19 T 13 11 334934 CASAVA_Build 20 51995351 1D TATTTTCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 5 het 27 1 17 9 T 10 9 334935 CASAVA_Build 20 51996797 4D CTAGTATATG TACA/---- TAGTGTCATA 3070 het 3070 ref 42 22 16 6 TACA 1 0 334936 CASAVA_Build 20 51999149 2D TGCATATATC CG/-- CACACACACA 3070 het 26 hom 47 3 36 8 CG 1 0 334937 CASAVA_Build 20 51999317 2D GGGTTGCTCT CA/-- GTTAGAACTC 3070 het 3070 hom 50 23 22 7 CA 1 0 334938 CASAVA_Build 20 52000094 9D TGCACAGCCC GTACAGCCT/--------- GCATGAGGAG 3070 het 3070 ref 38 22 11 10 GTACAGCCT 1 0 334939 CASAVA_Build 20 52000822 2I GAAAGCAGCT --/AC AGACAACATG 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 AC 0 1 334940 CASAVA_Build 20 52005734 13I CTCCTAGGTG -------------/GGTATAAATAGAA GGATGTTTCT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 GGTATAAATAGAA 0 1 334941 CASAVA_Build 20 52009203 1D TGTCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1223 het 1223 ref 28 14 3 12 T 15 14 334942 CASAVA_Build 20 52020867 1D CTCCCACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 T 11 10 334943 CASAVA_Build 20 52050685 1I AAATTCACAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 9 10 334944 CASAVA_Build 20 52052635 1I GTAGCAGATC -/T TTTTTATATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 5 6 334945 CASAVA_Build 20 52055125 14I AGTGAGGCTA --------------/CATTGTCTTTTTAT AGCACAGTGG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 CATTGTCTTTTTAT 0 1 334946 CASAVA_Build 20 52061113 1D ACCTATGGTT A/- AAAAAATCCA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 7 6 334947 CASAVA_Build 20 52061430 1I ATAAGCACAT -/G AAAGATGTTC 3070 hom 117 het 47 0 39 8 G 0 1 334948 CASAVA_Build 20 52067347 4I TTTCTTTTCT ----/TTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 TTTC 0 1 334949 CASAVA_Build 20 52072232 2D AATTGATTGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 113 het 55 0 36 20 TG 10 9 334950 CASAVA_Build 20 52074638 1I TGGAAGAGTA -/G CCAGGGAGGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 0 1 334951 CASAVA_Build 20 52076269 1D GTTCTACCCC T/- AAGAGTTCTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 1 0 334952 CASAVA_Build 20 52076984 1I AGATGCCTGG -/A TGCATTTGGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 0 1 334953 CASAVA_Build 20 52077750 1I CCCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 38 1 29 8 A 10 11 334954 CASAVA_Build 20 52083311 1D TCAGGAGCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 35 1 30 4 T 10 9 334955 CASAVA_Build 20 52086999 1I AAGAATTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 31 1 23 7 T 10 11 334956 CASAVA_Build 20 52107738 2D GGAGATGGCC AT/-- ATCTACAAGC 3070 hom 111 het 42 0 34 9 AT 2 1 334957 CASAVA_Build 20 52110516 8I GATCCACCCG --------/CCTTGGCC CCTTGGCCTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 CCTTGGCC 1 2 334958 CASAVA_Build 20 52113925 1I TTAAACATAC -/A GAAGCTATGG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 0 1 334959 CASAVA_Build 20 52115227 2D CATATTTTGG AT/-- ATCTTGTCCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AT 2 1 334960 CASAVA_Build 20 52117316 2I AATGAAACTC --/TG TCTCAATAAG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TG 0 1 334961 CASAVA_Build 20 52119118 14D GAGTATATAC ACCCAGGGCCTGAA/-------------- GCTGCTGTGA 3070 hom 44 het 20 0 14 10 ACCCAGGGCCTGAA 1 0 334962 CASAVA_Build 20 52120831 13I TTCTGTCTGC -------------/CTTTTACCTTCAT TGACTTCAGA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 CTTTTACCTTCAT 0 1 334963 CASAVA_Build 20 52122043 1D TTGTTCATTC T/- TTTTTTTTTT 1907 het 1399 hom 35 10 5 20 T 17 16 334964 CASAVA_Build 20 52124630 1D CAGCTGTGTT A/- AGATTTTCAA 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 A 2 1 334965 CASAVA_Build 20 52126563 1I GGCACCCCTC -/T TTTTTTTTTT 2057 het 2057 ref 27 10 9 8 T 11 12 334966 CASAVA_Build 20 52128681 11D AAAAAAAAAA AAAAAGAAAAG/----------- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 29 15 14 5 AAAAAGAAAAG 1 0 334967 CASAVA_Build 20 52130383 1D AAAGCCGGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 T 10 9 334968 CASAVA_Build 20 52133374 5I ACACTATCTG -----/ACTGT ACTGTTATTC 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 ACTGT 1 2 334969 CASAVA_Build 20 52141891 4I GTCTGTCTGA ----/CTGT CTGTCTATTT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 CTGT 1 2 334970 CASAVA_Build 20 52143127 1D ATCATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 16 15 334971 CASAVA_Build 20 52143683 1I TTTGCCTCTT -/C CCGCAGCTGG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 C 2 3 334972 CASAVA_Build 20 52157308 1D TGAACGTGTT G/- GGGCATGAAT 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 G 4 3 334973 CASAVA_Build 20 52168646 1I TAAAGAAAAG -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 T 6 7 334974 CASAVA_Build 20 52170635 1I AAAATAAGAA -/T TTTTTTAATC 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 T 6 7 334975 CASAVA_Build 20 52172086 16D GCTGCAGGGC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTG 3070 het 2465 hom 27 8 9 12 T 25 9 334976 CASAVA_Build 20 52178179 1D GTGTTTTTTG T/- TTCATAAAAC 3070 hom 104 het 40 0 35 5 T 3 2 334977 CASAVA_Build 20 52194960 2D CCTTACAGTT GA/-- GAATTGTTGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GA 2 1 334978 CASAVA_Build 20 52195232 2D GCTCTAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 19 0 13 7 A 14 12 334979 CASAVA_Build 20 52203462 2I CTGACAAGAC --/AT GTGAATTTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 0 1 334980 CASAVA_Build 20 52217726 3D CAAATAAGTA ATT/--- AAAAAAAGTT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 ATT 1 0 334981 CASAVA_Build 20 52219920 1I AAGGAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 20 18 12 T 10 11 334982 CASAVA_Build 20 52227387 1I CCACTTTCCG -/A TTGCGGAAAC 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 A 0 1 334983 CASAVA_Build 20 52246760 4D GTTTGAACAA AGTT/---- AGTTCTAAAG 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 AGTT 2 1 334984 CASAVA_Build 20 52248426 2D GATGAAGAAA AC/-- AGGCATGATC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 AC 1 0 334985 CASAVA_Build 20 52248978 2I CTGATGGTTT --/TA TGTGTTTGGT 3070 het 3070 hom 44 18 20 7 TA 0 1 334986 CASAVA_Build 20 52250051 1I TTCAAACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 21 19 6 T 10 11 334987 CASAVA_Build 20 52250695 1D CTCTGTGAGT G/- GGGGGGTCTG 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 G 7 6 334988 CASAVA_Build 20 52251586 1D CTGGAGCCCC T/- GTCTCCTGGT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 1 0 334989 CASAVA_Build 20 52252562 1I TCATTCTTTC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 48 26 17 5 T 8 9 334990 CASAVA_Build 20 52258609 1I GGCCCCAGAG -/C ACCCTGTGTC 1965 het 1965 ref 26 16 6 4 C 0 1 334991 CASAVA_Build 20 52281572 5D ACGGCAAGGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2258 het 2258 ref 34 10 7 18 T 21 16 334992 CASAVA_Build 20 52287609 1I TAAGGGAATC -/A AATTTCTTCC 3070 het 3070 ref 52 25 19 8 A 2 3 334993 CASAVA_Build 20 52295944 1I TTTTTTCTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 49 12 28 9 T 7 8 334994 CASAVA_Build 20 52310866 1D ATATTTATAG A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 A 7 6 334995 CASAVA_Build 20 52313907 1I AATTTAAAGG -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 T 5 6 334996 CASAVA_Build 20 52320506 1I TCACCATAAT -/A ATATAAAACT 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 A 1 2 334997 CASAVA_Build 20 52331030 1I AAACTGCAAA -/C CCCCTTCAAC 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 C 4 5 334998 CASAVA_Build 20 52333434 2I2M4D GGACAAATAC --AACAGT/TGAA---- TATGTGTTTA 3070 het 3070 hom 46 20 23 7 N/A 0 0 334999 CASAVA_Build 20 52355332 1D TAAGTACTGA G/- GTCATTACAG 3070 het 3070 hom 44 16 24 5 G 2 1 335000 CASAVA_Build 20 52359572 1D CATGGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 1787 het 13 hom 8 1 4 3 C 4 3 335001 CASAVA_Build 20 52383648 5I ATGGAAACAG -----/ATAGT ATAGTAAGGT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 ATAGT 1 2 335002 CASAVA_Build 20 52402363 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 289 het 289 ref 27 14 1 12 C 1 0 335003 CASAVA_Build 20 52410938 2I AGGAAAAAAC --/AT GTGCTGGAAT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 AT 0 1 335004 CASAVA_Build 20 52427537 1D CACCGTATAA T/- TTTTTTTTTT 1380 het 1380 ref 20 11 4 5 T 17 16 335005 CASAVA_Build 20 52430540 1D TCAGACATTC A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 8 7 335006 CASAVA_Build 20 52433910 1I ATCATCTCAA -/C CATCACTTCC 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 C 1 2 335007 CASAVA_Build 20 52435474 7D TTTTCCTTGA TTATCCT/------- TGATCCTTGA 3070 het 3070 ref 68 34 29 6 TTATCCT 1 0 335008 CASAVA_Build 20 52441365 1I AGTGTCTGTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 T 8 9 335009 CASAVA_Build 20 52449435 2D CAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1579 hom 19 6 10 3 A 14 12 335010 CASAVA_Build 20 52451855 1I AATATAGCAC -/T AATTCATGTA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 0 1 335011 CASAVA_Build 20 52453274 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2777 hom 25 7 15 3 A 10 11 335012 CASAVA_Build 20 52460534 1I AAATCTTAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 9 10 335013 CASAVA_Build 20 52464258 1I TAGGGATTGC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 51 19 24 8 T 7 8 335014 CASAVA_Build 20 52478480 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 504 hom 16 2 13 1 A 13 12 335015 CASAVA_Build 20 52482922 1D TTTTTCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1035 hom 49 7 20 22 T 16 15 335016 CASAVA_Build 20 52483249 1D TTCACTTAAC T/- TTAACATCCT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 3 2 335017 CASAVA_Build 20 52486058 12D GTTGAAGGCA GATGCCACACCC/------------ GATATCTGAA 3070 het 3070 ref 34 25 8 5 GATGCCACACCC 1 0 335018 CASAVA_Build 20 52491263 6D CAGTAGTTTG TTTCAA/------ TTTCAACAAT 3070 het 3070 ref 44 21 20 6 TTTCAA 2 1 335019 CASAVA_Build 20 52492224 1I TATTTAGGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 A 9 10 335020 CASAVA_Build 20 52494952 1I AAAAAAAAAA -/C AACCCCATCA 3070 het 1307 hom 19 6 12 1 C 0 1 335021 CASAVA_Build 20 52497136 2I ACAAGAGGGG --/AA AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 7 9 335022 CASAVA_Build 20 52498187 1I GTCAGCAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 9 13 11 T 8 9 335023 CASAVA_Build 20 52514698 1D AGAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 11 10 335024 CASAVA_Build 20 52523915 1D ATGGGCAGCA T/- TTTTTTTTTT 2161 het 2161 ref 39 27 6 7 T 11 10 335025 CASAVA_Build 20 52527606 1I AAAAAAAAAA -/C AACCCAGCAT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 C 0 1 335026 CASAVA_Build 20 52545072 1I TCATACACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 9 10 335027 CASAVA_Build 20 52573719 2I ATTTGTCTAA --/TT ATGTATTTTT 3070 het 1503 hom 15 4 9 2 T 0 2 335028 CASAVA_Build 20 52574008 1I GTTCACTCTG -/T TTCACCTCTC 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 2 3 335029 CASAVA_Build 20 52579489 1D GGGTGACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 8 A 11 10 335030 CASAVA_Build 20 52600127 1I ATTGGATGGC -/A AAAAAAAAAA 2255 het 840 hom 31 6 9 16 A 17 18 335031 CASAVA_Build 20 52600688 1I TTTTATTGCT -/A AGTAGTATTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 A 1 2 335032 CASAVA_Build 20 52612687 1I TATTTACATT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 7 8 335033 CASAVA_Build 20 52631338 1D CCTATTTCTG A/- AAAAAAAAAA 1575 het 1575 ref 42 31 4 7 A 12 11 335034 CASAVA_Build 20 52689570 1D TATCTATTGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 10 9 335035 CASAVA_Build 20 52697648 1D CTAAGAAAGG T/- TACTGTGGTC 3070 hom 117 het 45 0 39 7 T 2 1 335036 CASAVA_Build 20 52699513 4I AAGGCTTTGC ----/GGTG GGTGAGTCCT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 GGTG 1 2 335037 CASAVA_Build 20 52708625 1D TGCAAGGTGT C/- CCCCCTTTTA 3070 hom 157 het 59 0 52 7 C 6 5 335038 CASAVA_Build 20 52710561 1I CTGGGGTTCA -/C AAAGGGAAGT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 C 0 1 335039 CASAVA_Build 20 52712670 6D GAAAAATAAT TAAAAA/------ TAATTCAGTA 3070 hom 117 het 42 0 38 8 TAAAAA 1 0 335040 CASAVA_Build 20 52715721 2I TTTTTACTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 32 1 29 2 T 10 12 335041 CASAVA_Build 20 52715989 1D ACTGATGGAA T/- TATTGCTTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 2 1 335042 CASAVA_Build 20 52719930 1D CCAGTACAAC A/- GTCAATATTT 3070 hom 93 het 35 0 31 6 A 1 0 335043 CASAVA_Build 20 52720393 4D CAAAAAAGAA AAAG/---- AAAAGGAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AAAG 1 0 335044 CASAVA_Build 20 52724959 1I GTCATTTTGT -/A AAAATTAACA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 4 5 335045 CASAVA_Build 20 52726498 1I GTGAACCCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 123 het 49 0 40 9 T 9 10 335046 CASAVA_Build 20 52727195 4D TAAAAAAATT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 24 0 22 8 A 16 12 335047 CASAVA_Build 20 52727479 1I CTAGGGGAGA -/G GGGTGGCAGC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 3 4 335048 CASAVA_Build 20 52728597 2D GTGAAATAAT AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 A 10 8 335049 CASAVA_Build 20 52730997 1D TCTCATTTGG A/- AAAAAAAAAG 1325 het 1325 ref 30 21 3 6 A 10 9 335050 CASAVA_Build 20 52731752 2I CCTTCCTTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TC 0 1 335051 CASAVA_Build 20 52743972 1D TTGCTGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 55 2 29 24 A 17 16 335052 CASAVA_Build 20 52744746 1D TGGGGAGCCA T/- TTTTCAGTCT 3070 het 3070 hom 40 18 18 5 T 5 4 335053 CASAVA_Build 20 52745145 1D ATCTGGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 22 7 T 11 10 335054 CASAVA_Build 20 52747036 2D CACATAGAAC TG/-- TGAGTCCATT 3070 het 3070 hom 46 17 21 9 TG 2 1 335055 CASAVA_Build 20 52750026 1I TCTTTCCTTA -/C CCTGAGCTGC 3070 het 3070 hom 47 18 27 2 C 2 3 335056 CASAVA_Build 20 52750352 4D ATGGTAAATG TTAA/---- TTAAATTATT 3070 het 3070 ref 47 30 13 6 TTAA 2 1 335057 CASAVA_Build 20 52751107 2I TATTTCAATT --/CA GTTTTCTATA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 CA 0 1 335058 CASAVA_Build 20 52752769 2I TTCTTAAGTT --/TA TATGTTTTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TA 1 2 335059 CASAVA_Build 20 52753195 1I TTTCTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 11 12 335060 CASAVA_Build 20 52758325 4I TGAGTCTGTC ----/AAAT AAACCTTATC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 AAAT 0 1 335061 CASAVA_Build 20 52758510 1I ATAACCTATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 A 9 10 335062 CASAVA_Build 20 52760715 1I TTGTGCTGCA -/G GGCATGCCCA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 G 2 3 335063 CASAVA_Build 20 52761168 1I TTCATTGGAA -/G AAGTCTGGAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 0 1 335064 CASAVA_Build 20 52845194 1I CCGTGCCTCT -/C CCCCACGGGT 3070 hom 83 het 38 0 27 11 C 4 5 335065 CASAVA_Build 20 52845727 1I TTTCAACAGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 8 9 335066 CASAVA_Build 20 52847550 1D GTACTTTAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 T 10 9 335067 CASAVA_Build 20 52860782 1I TTCTTTTTTA -/T TTTTTTTTTA 1709 het 1708 ref 18 7 8 4 T 9 10 335068 CASAVA_Build 20 52866280 1D ATAAAAAAAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 A 7 6 335069 CASAVA_Build 20 52870775 10D TGTTTTCCTC TTCAATAATT/---------- TTCAATAATT 3070 het 3070 ref 31 17 12 3 TTCAATAATT 2 1 335070 CASAVA_Build 20 52871768 1I CACTATGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 82 het 32 0 26 6 T 9 10 335071 CASAVA_Build 20 52875030 1I TGATTTAATT -/A AAAAAATCTG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 6 7 335072 CASAVA_Build 20 52876594 16D TAACTATTGT GTAACAAATTACCCCA/---------------- GTAACAAATT 3070 hom 102 het 46 0 34 14 GTAACAAATTACCCCA 2 1 335073 CASAVA_Build 20 52880209 5I TGTCTCAAAA -----/AAAAG AAAAAAAAAT 3070 het 134 hom 21 2 7 12 AAAAG 0 1 335074 CASAVA_Build 20 52883399 4D CTCTCTGTCT CCCC/---- CCCCCTCTCT 174 het 174 ref 36 16 4 17 C 9 5 335075 CASAVA_Build 20 52888249 2I AAAATTTGGA --/CG CTCAAAAATT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 CG 0 1 335076 CASAVA_Build 20 52894202 1I CAGAGGGGGG -/A AAAAACCTGA 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 5 6 335077 CASAVA_Build 20 52899437 1I11M1I8M1I10M1I TTTGCCTCCT -CAAATCTCATG-TGAAATGT-ATCCCCAGTG-/CCAAATCTCATGTTGAAATGTAATCCCCAGTGT TGGAGGGGGC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 N/A 0 0 335078 CASAVA_Build 20 52899496 1I6M1I10M1I6M1I10M1I8M1I13M1I12M1I AATGGCTTGG -GCCCTT-CCATGGTAAT-AGTGAG-TCTTGCTCTG-TAGTTCAT-AGAGAGCTGATTG-TTAAAGGAGTCT-/TGCCCTTCCCATGGTAATGAGTGAGTTCTTGCTCTGTTAGTTCATGAGAGAGCTGATTGTTTAAAGGAGTCTG GCACCTCCTC 3070 hom 24 het 6 0 9 8 N/A 0 0 335079 CASAVA_Build 20 52899665 1I50M1I GAAGCCGAGC -GATGCTGTTGCCATGCTTGTAGTCTGCAGAACCATAACCCAAATAAACCC-/AGATGCTGTTGCCATGCTTGTAGTCTGCAGAACCATAACCCAAATAAACCCA AGTTTTTATA 3070 hom 83 het 27 0 30 19 N/A 0 0 335080 CASAVA_Build 20 52900526 1D TGTAACCCCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 50 13 28 9 T 9 8 335081 CASAVA_Build 20 52903429 13D GTCCTGGCCA GCCAGTGGAGAGT/------------- GCCAGTTCTA 3070 het 3070 ref 38 18 18 5 GCCAGTGGAGAGT 1 0 335082 CASAVA_Build 20 52905940 1I ATTTTCTGAT -/A AACCATGAAA 3070 hom 135 het 53 0 43 10 A 2 3 335083 CASAVA_Build 20 52912324 1D TATCTCCCCC A/- ACCCAATTTA 3070 hom 115 het 41 0 39 2 A 2 1 335084 CASAVA_Build 20 52922586 1I TATTGAAACA -/T TAGGCTGCAT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 1 2 335085 CASAVA_Build 20 52925584 1D TAGTCTCTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 10 9 335086 CASAVA_Build 20 52931293 3D AGCCATACCA TTT/--- TTTTTTTTTT 1294 het 75 hom 37 1 3 33 T 14 11 335087 CASAVA_Build 20 52957074 2D TAATAATAAT AA/-- AAAAAAACAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 9 7 335088 CASAVA_Build 20 52957387 1D ACATTAAAAA G/- GTCCTTCATC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 2 1 335089 CASAVA_Build 20 53022576 1I GGTGTTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1684 hom 30 5 13 12 T 14 15 335090 CASAVA_Build 20 53047252 3D CATATCTGAC ATG/--- ATTATATATT 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 ATG 1 0 335091 CASAVA_Build 20 53055748 1D GGGAGAAGGT C/- TTAACCCCAT 3070 hom 102 het 37 0 34 4 C 1 0 335092 CASAVA_Build 20 53061387 1I TATCTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 39 0 27 12 T 10 11 335093 CASAVA_Build 20 53063075 1I AAACTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 21 het 18 0 16 2 A 9 10 335094 CASAVA_Build 20 53063241 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 201 hom 21 2 16 3 A 12 13 335095 CASAVA_Build 20 53066753 1I AGAATATAGT -/C ATTATATCTC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 C 0 1 335096 CASAVA_Build 20 53071407 4I TAAACTGCAG ----/TTTA TTTGTCTTGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TTTA 0 1 335097 CASAVA_Build 20 53076325 1I ATTGAGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 42 0 30 12 T 10 11 335098 CASAVA_Build 20 53087410 1D ATTTCAAGAC A/- AGAGTCTTGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 1 335099 CASAVA_Build 20 53094207 2I CTTCAAAAAA --/CT CTAGTTCATT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 CT 1 2 335100 CASAVA_Build 20 53099668 1D GAAGTTGTAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 9 8 335101 CASAVA_Build 20 53099877 1I TTAGGTAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 9 10 335102 CASAVA_Build 20 53110065 1I AAATACATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 T 10 11 335103 CASAVA_Build 20 53125944 7I CCAATGCTAT -------/CCCTCCC CCCTCCCCCC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 CCCTCCC 1 2 335104 CASAVA_Build 20 53132735 2D ACATATATAG AT/-- ATATATATGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 5 4 335105 CASAVA_Build 20 53133288 12D TCAAAAAAAA AAAAAAAAAAAT/------------ AATAAAGCAA 3070 hom 29 het 16 0 17 3 AAAAAAAAAAAT 1 0 335106 CASAVA_Build 20 53146467 1D ACGTATCAAA G/- GCACGGACGC 3070 hom 99 het 42 0 34 8 G 2 1 335107 CASAVA_Build 20 53149655 1D CCAGAGTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 166 hom 25 2 14 9 A 16 15 335108 CASAVA_Build 20 53158865 1D GATAAGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 33 0 21 14 T 11 10 335109 CASAVA_Build 20 53164218 1I CCAACATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1377 hom 26 3 20 3 T 12 13 335110 CASAVA_Build 20 53173986 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 20 11 A 12 11 335111 CASAVA_Build 20 53181037 7D TTTTCTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2163 het 45 hom 17 1 7 11 T 19 12 335112 CASAVA_Build 20 53200823 2I TGATTAGGAT --/AG AGTTTGCTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AG 1 2 335113 CASAVA_Build 20 53204934 1I GACCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1350 hom 12 het 5 0 5 0 T 10 11 335114 CASAVA_Build 20 53212545 1I CAGATCAGGC -/A ACACAGAGCT 3070 hom 115 het 44 0 37 7 A 1 2 335115 CASAVA_Build 20 53217669 1I AAAGACAGAG -/A AAAAATGTAC 3070 hom 85 het 32 0 29 3 A 5 6 335116 CASAVA_Build 20 53222267 4D CCCTATTTCC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 15 11 335117 CASAVA_Build 20 53224024 15I CTGGTTGCCA ---------------/GAAAGACCAAACCAT GATTAAAGGG 3070 hom 89 het 34 0 27 8 GAAAGACCAAACCAT 0 1 335118 CASAVA_Build 20 53231930 6D AAATTCAAAG TTTGTA/------ TTTGTTTTTG 2825 het 2825 ref 30 18 7 6 TTTGTA 1 0 335119 CASAVA_Build 20 53236247 4D TCCTGAAGAT ATAG/---- ATAAAGTTCT 3070 hom 144 het 52 0 48 8 ATAG 1 0 335120 CASAVA_Build 20 53237951 3D GATGTGTACT TTA/--- ACAACAACCG 3070 hom 146 het 56 0 47 10 TTA 1 0 335121 CASAVA_Build 20 53240903 1I AATGAATGCA -/C TAGTATAATA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 C 0 1 335122 CASAVA_Build 20 53246344 1I TCTGTGCTCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 7 8 335123 CASAVA_Build 20 53246453 3I TAGAGTTGGA ---/ATC TGGAGGTGCT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 ATC 0 1 335124 CASAVA_Build 20 53247311 1I ACATTTTACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 T 9 10 335125 CASAVA_Build 20 53248352 1D AAAAGTAAGG A/- AAAAATTTAG 3070 het 3070 hom 44 21 18 5 A 6 5 335126 CASAVA_Build 20 53251789 1D CCCCTTGAAA T/- TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 T 7 6 335127 CASAVA_Build 20 53252446 1D TATTGGTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 11 10 335128 CASAVA_Build 20 53254871 1D TTTAAAAATA T/- TTTTTGTCAC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 6 5 335129 CASAVA_Build 20 53255611 1D TTTCTAATTC A/- GTGAAAAATG 3069 het 3069 ref 29 17 7 7 A 1 0 335130 CASAVA_Build 20 53266581 1D ATTTGTCTTT A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 9 8 335131 CASAVA_Build 20 53268144 1I CACAGAAAAC -/A AAAAAAACTA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 A 7 8 335132 CASAVA_Build 20 53270228 9D TAGAATAATA TTTTCTTTT/--------- TTTTTTCTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTTTCTTTT 1 0 335133 CASAVA_Build 20 53281337 1I TTTTTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 T 12 13 335134 CASAVA_Build 20 53287319 1I TATCTTAAGT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 7 8 335135 CASAVA_Build 20 53288984 2D ATGGATTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 T 11 9 335136 CASAVA_Build 20 53293107 1I CAATTATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 60 24 27 9 T 10 11 335137 CASAVA_Build 20 53294960 1D AAAATACACC A/- AAAAAAAAAA 2629 het 2629 ref 22 11 7 4 A 11 10 335138 CASAVA_Build 20 53297130 2I GATGACATGG --/TT CTCTATATTT 2739 het 2739 ref 23 12 8 3 T 0 2 335139 CASAVA_Build 20 53299174 1I GACGCACACT -/G GGGCCTGTTG 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 G 3 4 335140 CASAVA_Build 20 53300516 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 10 11 5 A 11 12 335141 CASAVA_Build 20 53301311 26D TGCACACACA TGCGCACACACCCACACACGCACATG/-------------------------- CACGCACATG 3070 het 3070 ref 38 20 13 14 TGCGCACACACCCACACACGCACATG 1 0 335142 CASAVA_Build 20 53303746 2D CATCATCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 T 14 12 335143 CASAVA_Build 20 53309391 1D CACATAAATG C/- CCCTATGCTC 3070 het 3070 hom 52 23 25 5 C 4 3 335144 CASAVA_Build 20 53395295 1I TATCATCTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 9 10 335145 CASAVA_Build 20 53403316 1I AGATTTCCAT -/G GGGGAAAAGC 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 G 4 5 335146 CASAVA_Build 20 53403570 40D GAAAGAAAGA AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG/---------------------------------------- AAAGAAAGAA 3070 hom 45 het 22 0 16 8 AAAG 15 5 335147 CASAVA_Build 20 53411072 2D AGACTCAGGT AA/-- AAAAAAAAAA 2833 het 517 hom 41 5 11 26 A 18 16 335148 CASAVA_Build 20 53412523 1I TAATGCATGT -/A AATTATTTTA 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 2 3 335149 CASAVA_Build 20 53419861 2I TGGGGGGGGG --/GT TGCGGTAAAG 3070 hom 75 het 31 0 24 7 GT 0 1 335150 CASAVA_Build 20 53426409 1I TTGCATGGGG -/C CAAATCCATA 3070 hom 78 het 30 0 23 7 C 1 2 335151 CASAVA_Build 20 53436972 4I GAGGATAGAC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 TTAT 2 3 335152 CASAVA_Build 20 53442616 8I AGCTTGACAG --------/ATTCCAGT ATTCCAGTAG 3070 het 3070 hom 50 16 27 7 ATTCCAGT 1 2 335153 CASAVA_Build 20 53444662 9D GTGCTGGATG CAGAGGATA/--------- CAGAAATGAG 3070 het 3070 ref 44 26 17 6 CAGAGGATA 1 0 335154 CASAVA_Build 20 53445997 1I GCATCTGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 41 1 27 13 A 12 13 335155 CASAVA_Build 20 53489031 1I AACTATCAGA -/T TATATCACTA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 1 2 335156 CASAVA_Build 20 53496217 1D TTTTTAAGTG A/- AAAAATTGGA 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 A 6 5 335157 CASAVA_Build 20 53508014 1D TCTGGAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 11 10 335158 CASAVA_Build 20 53513996 1I TTCATTTGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 T 9 10 335159 CASAVA_Build 20 53514359 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 24 0 16 8 T 15 14 335160 CASAVA_Build 20 53514689 1I ATCAAAGGTA -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 6 7 335161 CASAVA_Build 20 53516114 1D GGAAAGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 11 14 A 11 10 335162 CASAVA_Build 20 53516864 1D GCAGCCCTGG A/- AAAACAACAA 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 A 5 4 335163 CASAVA_Build 20 53518720 4D CTGAAGTAAA AGTT/---- AGTCTCAACA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 AGTT 1 0 335164 CASAVA_Build 20 53521679 1I AGCAGAGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 9 10 335165 CASAVA_Build 20 53521783 1D TTTTACCCAC G/- GTCTTTGCTG 3070 het 3070 hom 44 22 19 3 G 2 1 335166 CASAVA_Build 20 53523872 2I TCTTCTAAGC --/CT CTCTTTCCTC 3070 het 3070 hom 43 12 22 9 CT 2 3 335167 CASAVA_Build 20 53532301 2I CACAATACTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 11 13 335168 CASAVA_Build 20 53532848 2D CAAGTCTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 T 12 10 335169 CASAVA_Build 20 53533399 1D TTTTATGACA T/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 46 22 21 4 T 7 6 335170 CASAVA_Build 20 53534613 6D TGGTTGTTAC TTTAAG/------ TTTTTCTGGC 3070 het 3070 hom 32 15 17 1 TTTAAG 1 0 335171 CASAVA_Build 20 53534925 2D TATTAAATGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 39 0 19 20 A 11 9 335172 CASAVA_Build 20 53538211 1D AATGTGAAAT A/- AAAAGAGGAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 5 4 335173 CASAVA_Build 20 53540561 4D GATCTTTAGA ACTT/---- ACTTTGTATG 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 ACTT 2 1 335174 CASAVA_Build 20 53543647 1D CCAATTTCAA T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 51 het 19 0 17 4 T 9 8 335175 CASAVA_Build 20 53546249 1D CAACTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 12 11 335176 CASAVA_Build 20 53546724 2D TTGAAAATTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 11 9 335177 CASAVA_Build 20 53551954 1I TACACTATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 A 10 11 335178 CASAVA_Build 20 53554816 1I CAACATTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1151 hom 57 5 35 17 T 13 14 335179 CASAVA_Build 20 53556895 1D GTGGTTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 15 0 T 11 10 335180 CASAVA_Build 20 53557344 2I TCCATGAAAC --/TG TGGCAGGCTA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 TG 1 2 335181 CASAVA_Build 20 53557435 4D CCATTTTCTA AAAT/---- AAATACAACT 3070 het 3070 hom 49 19 25 7 AAAT 2 1 335182 CASAVA_Build 20 53558577 2I TGCGAGATTT --/AA AAAGTGATTG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 3 5 335183 CASAVA_Build 20 53561297 1I TTCCATACCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 51 23 19 9 T 8 9 335184 CASAVA_Build 20 53562059 6I GAGGCCTGTT ------/TTAGTC TGATCTGTTG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 TTAGTC 0 1 335185 CASAVA_Build 20 53562190 11I AGGATGGATT -----------/GAATGTGAAGG GAATGTGAGG 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 GAATGTGAAGG 0 1 335186 CASAVA_Build 20 53562280 1I AAGAAATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 10 11 335187 CASAVA_Build 20 53567011 3D ATTCATAATC TTA/--- TTATGATACT 3070 het 3070 ref 45 22 15 10 TTA 2 1 335188 CASAVA_Build 20 53568502 1I GATAAAAAAA -/G GCTTATTAAT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 G 1 2 335189 CASAVA_Build 20 53569162 4D TTTCATAATT TGTA/---- TGATGCAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 16 5 TGTA 1 0 335190 CASAVA_Build 20 53575328 1I AATTCCTTAT -/A AAAAAACATC 3070 hom 132 het 53 0 45 8 A 6 7 335191 CASAVA_Build 20 53582433 1D ATTTTAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1338 het 1338 ref 41 26 4 13 T 11 10 335192 CASAVA_Build 20 53597523 1I AATTACCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 11 12 335193 CASAVA_Build 20 53602213 4I TACACGAAAT ----/AATC AAAAAGGAAA 2808 het 2808 ref 20 11 6 3 AATC 0 1 335194 CASAVA_Build 20 53605468 1D ATTGTACCCA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 T 9 8 335195 CASAVA_Build 20 53609738 7I ACACCAAAGT -------/ATTGGTG GCTATCACAT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 ATTGGTG 0 1 335196 CASAVA_Build 20 53613285 1D TAATTTATTC T/- TTTTTTATGA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 7 6 335197 CASAVA_Build 20 53625433 2I TAAAAAAAAA --/AC AAACAAACTC 3070 het 2182 hom 38 10 20 8 AC 0 1 335198 CASAVA_Build 20 53628184 8D AGTAGTAGAT GTGTATGA/-------- GTGTATGAAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 6 GTGTATGA 2 1 335199 CASAVA_Build 20 53634944 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3063 het 3063 ref 25 12 11 2 T 10 11 335200 CASAVA_Build 20 53637405 1D AAGCATCTGA T/- TTTTTCATGA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 T 6 5 335201 CASAVA_Build 20 53637536 1D TTTCAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 2460 het 811 hom 24 5 8 11 T 17 16 335202 CASAVA_Build 20 53641593 3I AGCAAGACGT ---/GCA AAAGGAGTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 GCA 0 1 335203 CASAVA_Build 20 53649273 12I ACTCCTTTGA ------------/CTATTTTAGCCT CTATTTTAGC 3070 het 3070 hom 44 17 19 9 CTATTTTAGCCT 1 2 335204 CASAVA_Build 20 53651116 1I TTAAAGATTT -/A AAAAATGTGC 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 5 6 335205 CASAVA_Build 20 53651857 5D CAGATGAGAT AAGAC/----- AACCAGGTCC 3070 het 3070 ref 51 27 20 6 AAGAC 1 0 335206 CASAVA_Build 20 53651960 3I GAAGGTAGAG ---/AGA AGAAGAAAAC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 AGA 2 3 335207 CASAVA_Build 20 53652724 3I AAGAGGTAGA ---/GAT GATGTTTTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GAT 1 2 335208 CASAVA_Build 20 53654387 1D CTCCACTCCC T/- CCCATACCCA 3070 het 3070 hom 39 19 19 1 T 1 0 335209 CASAVA_Build 20 53660694 2I CATTTTAATA --/TC TCTTTGTTCT 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 TC 1 2 335210 CASAVA_Build 20 53662463 1D AGAAGTGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 A 12 11 335211 CASAVA_Build 20 53663354 3I CTGGCCAGGT ---/GTG GTGGCTCATG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 GTG 1 2 335212 CASAVA_Build 20 53663626 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2932 het 2932 ref 33 13 12 8 A 13 14 335213 CASAVA_Build 20 53668368 1D AACTGGCTTG A/- CTGACTTGAA 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 A 1 0 335214 CASAVA_Build 20 53668845 1D TTTAATGTAT G/- GAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 G 2 1 335215 CASAVA_Build 20 53693935 1I AACTTCTCAC -/T TTTTTTAAAC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 T 6 7 335216 CASAVA_Build 20 53695633 1I AAAAGTGTCA -/G GGGGGGTCAC 3070 hom 45 het 20 0 15 5 G 6 7 335217 CASAVA_Build 20 53695969 1I7M2I16M3I TGAGGCAGAA -AATCGTT--GACCCAGGAGGCAGAG---/GAATCGTTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTT GCAGTGAGCC 3070 hom 52 het 18 0 16 3 N/A 0 0 335218 CASAVA_Build 20 53696351 1I28M1I TGATTGGTTT -AAAAAAGTATATAAAAAACCCAATTGAT-/AAAAAAAGTATATAAAAAACCCAATTGATA ATGTTTGTTG 3070 hom 87 het 32 0 30 12 N/A 0 0 335219 CASAVA_Build 20 53696588 1I ACCACCATGC -/A CTACAAAAGG 3070 hom 97 het 40 0 33 7 A 0 1 335220 CASAVA_Build 20 53696725 3I CTTCTTTAAA ---/AAT TAATTTAGGG 1625 hom 12 het 11 0 5 6 AAT 0 1 335221 CASAVA_Build 20 53696854 1I9M1I TCTCCATTAA -AAGAAATTA-/CAAGAAATTAG CTGGGCGTTG 3070 hom 45 het 16 0 16 1 N/A 0 0 335222 CASAVA_Build 20 53697317 1I61M1I AGGAGCAACA -GCCATACCATATAGCCTAGGTGTGTAGTAGGCTGTACCATCTAGATTTGTGTTAAGTTCAC-/GGCCATACCATATAGCCTAGGTGTGTAGTAGGCTGTACCATCTAGATTTGTGTTAAGTTCACA CTATGATGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 18 N/A 0 0 335223 CASAVA_Build 20 53697660 1I25M1I TAAGAAATCA -AATCTCTATGGAAGTACCCCATTGT-/GAATCTCTATGGAAGTACCCCATTGTC ACCAGTATTC 3070 hom 117 het 34 0 40 3 N/A 0 0 335224 CASAVA_Build 20 53699081 1I TCTTACATTT -/A AAAAAATACT 3070 hom 126 het 50 0 42 8 A 6 7 335225 CASAVA_Build 20 53714116 2D ATTGTGTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 2895 het 2895 ref 31 15 8 8 T 12 10 335226 CASAVA_Build 20 53715530 2D GAATGAGGAA AG/-- AGAGTAGCCC 3070 het 3070 ref 36 17 17 3 AG 3 2 335227 CASAVA_Build 20 53717809 2D TGGTGGCAGA AG/-- AGAGAGAGCG 3070 het 3070 ref 44 24 18 4 AG 5 4 335228 CASAVA_Build 20 53721076 1D TTTTATGGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2881 hom 32 11 14 7 A 10 9 335229 CASAVA_Build 20 53722514 1D GTATGTTATA G/- GGACAGTAAG 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 G 3 2 335230 CASAVA_Build 20 53724426 6I TATTCACAAC ------/TATTAA TATTATTTCT 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 TATTAA 0 1 335231 CASAVA_Build 20 53726583 14D TACAAGTGTG TAGCACCTCCCCCT/-------------- TTGCTCTCTT 3070 het 3070 ref 37 23 16 1 TAGCACCTCCCCCT 1 0 335232 CASAVA_Build 20 53757947 1I TTGCTCTGAT -/A AAAAAAAAAA 3004 het 3004 ref 35 21 7 7 A 11 12 335233 CASAVA_Build 20 53766276 1D CACTGGGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2527 hom 25 9 13 3 T 10 9 335234 CASAVA_Build 20 53774184 1D GTAATTTATT A/- AAAAAAAAAA 2935 het 2935 ref 23 10 7 7 A 12 11 335235 CASAVA_Build 20 53779901 1I GAAGCAATAG -/A AAAAAAAAAG 3041 het 3041 ref 29 13 7 9 A 9 10 335236 CASAVA_Build 20 53788302 1D TTTATTTAAA G/- GGTTTTTATT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 G 3 2 335237 CASAVA_Build 20 53794681 1D AATCAGCATT A/- TTACTTCTCT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 1 0 335238 CASAVA_Build 20 53798454 1D TTTTGTCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 A 13 12 335239 CASAVA_Build 20 53805329 1D TACTTTGTTT A/- AAAATAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 A 5 4 335240 CASAVA_Build 20 53810497 1D TAGATCCTCA G/- TGGCTCAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 G 1 0 335241 CASAVA_Build 20 53814516 1I TCACACAACA -/G GAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 G 1 2 335242 CASAVA_Build 20 53815359 1I CAGAAATCAA -/T TTTTTTTTAT 1829 het 1829 ref 19 6 5 8 T 8 9 335243 CASAVA_Build 20 53815414 4I CAATGTGCAG ----/GTTA GTTACATATG 3070 hom 60 het 24 0 21 4 GTTA 1 2 335244 CASAVA_Build 20 53816203 1D TTTGATGGGG T/- TTTTTGTTTT 1446 het 495 hom 4 1 3 0 T 6 5 335245 CASAVA_Build 20 53817840 4I TAAAATTCTC ----/TTTT TTGTTTGTGT 2342 het 2342 ref 16 11 5 0 T 2 6 335246 CASAVA_Build 20 53820834 5D AGACTATATC AGATA/----- AGATGTTTTT 3070 het 3070 ref 43 26 15 3 AGATA 1 0 335247 CASAVA_Build 20 53826405 2I ACTGCAACTC --/TA TTTATTTGAA 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 TA 0 1 335248 CASAVA_Build 20 53831949 1D GCTTGAATGA T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 T 6 5 335249 CASAVA_Build 20 53838522 1D AATTTTCTAA T/- TTTTCCAGTT 3070 hom 96 het 37 0 33 5 T 5 4 335250 CASAVA_Build 20 53848886 2D TTCATATTCA AC/-- AGTGAAAAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 4 AC 1 0 335251 CASAVA_Build 20 53849667 2I AAATGCAGAC --/AT ATACAGAAAC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AT 1 2 335252 CASAVA_Build 20 53850108 2D TTCTATAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 22 7 A 12 10 335253 CASAVA_Build 20 53851935 1I ATATGTGTGT -/G GTGGGGGGTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 1 2 335254 CASAVA_Build 20 53854266 4D TTGAAAAGAA AGAC/---- AGAGTAAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 AGAC 1 0 335255 CASAVA_Build 20 53861322 1D GTATATGGAC T/- TTTTTTTTTT 3034 het 3034 ref 36 20 10 6 T 13 12 335256 CASAVA_Build 20 53880332 4I TATATATATA ----/TGTG TGTGTGTATA 2375 het 2375 ref 21 12 6 3 TG 3 5 335257 CASAVA_Build 20 53894170 2D ACACCACTCA TT/-- TTTTTTTTTT 2710 het 960 hom 28 6 10 12 T 18 16 335258 CASAVA_Build 20 53899010 4I CTCTCTTTTT ----/TTCA TTCATTATTT 3070 hom 67 het 27 0 22 5 TTCA 1 2 335259 CASAVA_Build 20 53899509 1I TATCTCATGG -/T TTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 6 7 335260 CASAVA_Build 20 53900119 2I GAAGAAACCC --/TG TCTTTTGTAG 3070 hom 83 het 30 0 26 4 TG 0 1 335261 CASAVA_Build 20 53900324 3D ATGAAAAATT TTA/--- TTGTTTCCGT 2365 het 2365 ref 24 17 6 3 TTA 1 0 335262 CASAVA_Build 20 53904542 1D TTTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 2846 het 295 hom 30 3 12 15 T 19 18 335263 CASAVA_Build 20 53929363 1D AGCCTACCCC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 77 het 35 0 24 11 T 6 5 335264 CASAVA_Build 20 53950486 1D TTCTAGGAGC T/- TTTTGGATTA 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 5 4 335265 CASAVA_Build 20 53959250 11I TGGATTGGTA -----------/TGAGGGTTAAG TGAGTGACTA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 TGAGGGTTAAG 0 1 335266 CASAVA_Build 20 53963445 1I AAACTGATTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 T 7 8 335267 CASAVA_Build 20 53971561 5D TCTACTTATC TTATT/----- AAGAAATAAT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 TTATT 1 0 335268 CASAVA_Build 20 54129116 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 789 hom 26 2 21 4 A 11 10 335269 CASAVA_Build 20 54131660 1I ACTCCATATC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 8 9 335270 CASAVA_Build 20 54131843 1D TGGGTGTTAC G/- GGTAATCACT 3070 hom 114 het 45 0 36 9 G 3 2 335271 CASAVA_Build 20 54134407 1I TTCTTGAAAG -/C CCCCCCCCCC 3047 het 435 hom 25 1 11 13 C 10 11 335272 CASAVA_Build 20 54139850 1I CATCCAAAGG -/A AAACAAATTG 3070 hom 135 het 49 0 45 4 A 3 4 335273 CASAVA_Build 20 54153851 1D ATGGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1581 het 436 hom 18 3 5 10 T 19 18 335274 CASAVA_Build 20 54164268 4D TTTCTGTCTC TCTG/---- TCTCTTTCTC 3070 hom 96 het 45 0 34 11 TCTG 1 0 335275 CASAVA_Build 20 54185129 3D CAGGAAGAAA TTT/--- TTTTTCTTGC 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 T 8 5 335276 CASAVA_Build 20 54189150 10I GCAAAGAGAT ----------/ATGAAAGGAG CTTTGGGTTG 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 ATGAAAGGAG 0 1 335277 CASAVA_Build 20 54192199 2I GTATGTTAAC --/AG AGATGATTAT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AG 1 2 335278 CASAVA_Build 20 54196167 1I ACTTTTTCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 39 hom 42 1 30 11 T 9 10 335279 CASAVA_Build 20 54196417 1D ATAACGAAAA G/- GCTGTCCTCT 3070 het 3070 ref 44 22 21 2 G 2 1 335280 CASAVA_Build 20 54204447 1D CTTTTTGCTT A/- TTTCAATTTA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 1 0 335281 CASAVA_Build 20 54206307 1D ATTTCCATCT G/- TTGCATTTAG 3070 het 3070 ref 48 26 20 3 G 1 0 335282 CASAVA_Build 20 54209562 8D CTAACCCCCA GAATCTGT/-------- GAATGTGACT 3070 het 3070 hom 41 16 17 10 GAATCTGT 1 0 335283 CASAVA_Build 20 54218262 2D TGAAGTCGGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 42 4 22 18 A 12 10 335284 CASAVA_Build 20 54220889 2I TCAGCCTCTC --/TG TCAATGGGGA 2863 het 2863 ref 23 11 8 4 TG 0 1 335285 CASAVA_Build 20 54232337 1I CCTTGACTTT -/A AAAAAAAAAA 2077 het 2077 ref 32 12 10 10 A 15 16 335286 CASAVA_Build 20 54238978 8I AGACAGGGAA --------/GAAAGAGG GAAAGAGGGA 2821 het 2821 ref 20 9 8 3 GAAAGAGG 1 2 335287 CASAVA_Build 20 54272712 2D GTTTAGGAAC AG/-- AGAGTGACAT 3070 hom 126 het 48 0 41 7 AG 3 2 335288 CASAVA_Build 20 54278603 2D ACTTCCAGGG TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 94 hom 30 2 11 18 T 10 8 335289 CASAVA_Build 20 54279940 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAATTAGC 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 5 7 335290 CASAVA_Build 20 54280093 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 12 8 A 10 11 335291 CASAVA_Build 20 54281600 2I CTTTCTGTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 26 0 17 9 T 14 16 335292 CASAVA_Build 20 54291448 1D GAAGAGAGAA C/- CCAGAAATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 3 2 335293 CASAVA_Build 20 54294910 7I ACTTTCAGAT -------/TTGGGTC TTGGGTCTTA 3070 hom 123 het 47 0 39 8 TTGGGTC 1 2 335294 CASAVA_Build 20 54307309 5I GAGGATAAAT -----/AAAAG AAAATATCCA 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AAAAG 0 1 335295 CASAVA_Build 20 54314965 1I GAACTGGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 928 hom 26 2 21 3 A 12 13 335296 CASAVA_Build 20 54317203 1D AAGGTCCTGA G/- GGCAGGATAC 3070 hom 105 het 40 0 35 6 G 3 2 335297 CASAVA_Build 20 54379856 1I ACCCGGGAGG -/T CGAGCTTGTA 916 het 916 ref 12 7 2 3 T 0 1 335298 CASAVA_Build 20 54399136 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 20 0 18 2 A 11 12 335299 CASAVA_Build 20 54403310 1D ATTATTACTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 195 hom 38 2 31 5 T 10 9 335300 CASAVA_Build 20 54459970 1D GAAAGGGTTG C/- CAAGGGCATT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 C 2 1 335301 CASAVA_Build 20 54464553 1I ACTTGGAAAG -/C CCCCCGCTTT 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 C 5 6 335302 CASAVA_Build 20 54464844 1I TAAACTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 T 11 12 335303 CASAVA_Build 20 54466235 1D CCAGCACTTT A/- AGGAGGCTGA 3070 het 2796 hom 29 9 15 6 A 2 1 335304 CASAVA_Build 20 54471943 1D ATTACCTCTG A/- AAAAAACTTT 2791 het 2791 ref 22 12 8 2 A 7 6 335305 CASAVA_Build 20 54472651 1D GATATTTGCG T/- GATAAATGCA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 1 0 335306 CASAVA_Build 20 54474183 1D TGAAATGTCG T/- TATGTGCTAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 2 1 335307 CASAVA_Build 20 54478247 3D TCTGACCTCA TCT/--- TCTGCCCCTC 3070 het 3070 hom 57 26 24 8 TCT 2 1 335308 CASAVA_Build 20 54481040 1I TCTGAACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 A 10 11 335309 CASAVA_Build 20 54481904 3I AAGTGATTTT ---/GAG GAGAATTTTG 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 GAG 1 2 335310 CASAVA_Build 20 54493357 1I ACTGTATTTT -/G CCTGTATCAA 3070 het 3070 hom 50 17 25 8 G 0 1 335311 CASAVA_Build 20 54506572 1I ATTGCCCTTA -/T TTAGGGAGAT 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 T 2 3 335312 CASAVA_Build 20 54509667 1D ATGGCCTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 11 10 335313 CASAVA_Build 20 54514897 1I TAATATTATT -/G GTAAGCACAA 3070 het 3070 ref 49 27 12 10 G 1 2 335314 CASAVA_Build 20 54518379 3D ATTTGGCAAT AAG/--- AAGAAATGTA 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 AAG 2 1 335315 CASAVA_Build 20 54520925 7I CCACCAGTGA -------/TCACATG CAGCATGGTC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 TCACATG 0 1 335316 CASAVA_Build 20 54550885 1I GTCTCAAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 8 335317 CASAVA_Build 20 54550956 18I CAGAAGTGTC ------------------/CTGTCACCACAGGGATTT CTGTGCACCG 3070 hom 72 het 30 0 24 7 CTGTCACCACAGGGATTT 0 1 335318 CASAVA_Build 20 54554791 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 11 5 A 12 11 335319 CASAVA_Build 20 54558075 1D GTTTCAAACC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 A 9 8 335320 CASAVA_Build 20 54558794 1D GCTCTTTTTC G/- CTTGGCAGTG 3070 het 3070 hom 31 8 18 5 G 1 0 335321 CASAVA_Build 20 54592010 1D TCTTACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 T 12 11 335322 CASAVA_Build 20 54597006 1D CATTTCCAGC T/- TTTTTTTTTG 2050 hom 10 het 9 0 5 4 T 10 9 335323 CASAVA_Build 20 54600519 1D AACAGGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 25 2 16 7 T 12 11 335324 CASAVA_Build 20 54615852 3D GGCCAGGTGC GGT/--- GGTGGCTCAT 2955 het 2955 ref 27 17 7 3 GGT 2 1 335325 CASAVA_Build 20 54621284 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1882 het 650 hom 17 4 7 6 A 17 15 335326 CASAVA_Build 20 54625507 1D TTCCTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1839 hom 32 7 14 11 T 12 11 335327 CASAVA_Build 20 54633014 4I ACCTTCCTTT ----/CTTC CTTCCTTCCT 3070 het 3070 hom 39 11 14 14 CTTC 4 5 335328 CASAVA_Build 20 54641193 2I GGTTGTTCTT --/GA GAGGGGAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 GA 1 2 335329 CASAVA_Build 20 54650506 5D GGAAGGTGCC CCGGG/----- CCCTGCAGAT 3070 het 3070 hom 35 12 16 11 CCGGG 1 0 335330 CASAVA_Build 20 54661376 1I GGATTACAGG -/T TCCTGCCACC 2725 hom 15 het 6 0 6 0 T 1 2 335331 CASAVA_Build 20 54678850 2D GTGAAAGAGT GA/-- GACTCCGTCT 3070 het 2698 hom 18 7 7 4 GA 2 1 335332 CASAVA_Build 20 54691106 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2818 hom 34 12 13 9 T 13 14 335333 CASAVA_Build 20 54696952 2D CTGGGCTGAA GT/-- GTGTTAGCTA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 GT 3 2 335334 CASAVA_Build 20 54697568 1I GGGCCCTGCC -/T TTATGGAGTT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 2 3 335335 CASAVA_Build 20 54709104 1I AGCTAGAACT -/A CAGGCACCCG 1738 hom 18 het 7 0 6 1 A 0 1 335336 CASAVA_Build 20 54709469 1D CTTCCTCTTC T/- TTTTTTTTTT 20 het 20 ref 18 8 1 9 T 11 10 335337 CASAVA_Build 20 54710894 4D CAAGTTTAGC CAGT/---- CAGAGTCCTT 3070 het 3070 ref 44 25 16 4 CAGT 1 0 335338 CASAVA_Build 20 54725765 2D AAGGGCTGCG TT/-- TCAGGCATGA 3070 het 3070 ref 49 27 19 4 T 3 1 335339 CASAVA_Build 20 54750149 1D TTGACTTTCC G/- GGGCTTAAGT 3070 het 3070 hom 32 12 15 6 G 4 3 335340 CASAVA_Build 20 54756171 1I ACAACAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 12 14 11 C 0 1 335341 CASAVA_Build 20 54757743 3D TGTTAAAGAG TTC/--- TTCTACAAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TTC 2 1 335342 CASAVA_Build 20 54758133 1D GTAACTGGCT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 10 9 335343 CASAVA_Build 20 54758342 2D TGCTCTGTGG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 102 het 45 0 34 11 CT 8 7 335344 CASAVA_Build 20 54764903 1I GAGTGGAGGG -/A GGGGATGCAG 3070 hom 144 het 55 0 46 9 A 0 1 335345 CASAVA_Build 20 54768111 4D CCTCCTTGAC GGTT/---- GGTTGCTGGC 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 GGTT 2 1 335346 CASAVA_Build 20 54769868 3D ATAAAGGTGA TGC/--- TGCTGCTGCT 3070 het 3070 ref 82 40 30 12 TGC 5 4 335347 CASAVA_Build 20 54779625 5I TTTTCGTTTT -----/GATTA AAGTCCAATT 3070 hom 89 het 34 0 27 7 GATTA 0 1 335348 CASAVA_Build 20 54784768 1I CTATAACAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 8 9 335349 CASAVA_Build 20 54798031 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1492 het 913 hom 21 3 4 14 T 14 13 335350 CASAVA_Build 20 54800285 6D CTTCCTTCCA CCTGTT/------ CCTGTTCCTT 3070 hom 98 het 40 0 31 10 CCTGTT 2 1 335351 CASAVA_Build 20 54801469 1I AAAAAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 247 hom 33 4 18 11 T 15 16 335352 CASAVA_Build 20 54804310 1D TTTTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 371 het 371 ref 21 14 3 4 T 15 14 335353 CASAVA_Build 20 54808161 7D TCCTGCTTCC TAGCCAA/------- TAGCCAGCAA 3070 het 3070 ref 41 20 13 10 TAGCCAA 1 0 335354 CASAVA_Build 20 54811847 1I TCAGGTGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 10 11 335355 CASAVA_Build 20 54813832 4D CAGGCACACA CTCC/---- CTCCCCCCAC 3015 het 3015 ref 51 25 14 13 CTCC 2 1 335356 CASAVA_Build 20 54813964 4D AACCCCGACA CACT/---- CACACACAGA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 CACT 1 0 335357 CASAVA_Build 20 54814765 1D ACCCGTTCCT C/- GGGAGAGTGA 2968 het 2968 ref 29 12 9 9 C 1 0 335358 CASAVA_Build 20 54820507 9I ATCCAGCTAT ---------/TTGGGAGGC TGAGGAAGGA 3070 hom 65 het 24 0 19 5 TTGGGAGGC 0 1 335359 CASAVA_Build 20 54823993 1D GAAACAAAAC A/- AAAAAAATTA 3008 het 3008 ref 29 17 8 5 A 8 7 335360 CASAVA_Build 20 54824147 1I AAAGAACTCC -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 68 het 29 0 22 7 A 8 9 335361 CASAVA_Build 20 54827965 2I TTAAGAAGCA --/CT CTGCTGTTAA 3070 het 3070 hom 40 19 17 4 CT 1 2 335362 CASAVA_Build 20 54831176 2D CTAATTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 12 10 335363 CASAVA_Build 20 54837608 1D TATGGGATGC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 125 het 47 0 40 8 A 9 8 335364 CASAVA_Build 20 54871388 1I ATGGTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 35 2 20 13 G 0 1 335365 CASAVA_Build 20 54873430 1D ACTTTCTGTA T/- ATTCTGAGCC 3070 hom 99 het 37 0 33 5 T 1 0 335366 CASAVA_Build 20 54881032 1I46M1D ATAAGAGGTA -GTAGTGTTGAACCAATGTTTCCACAGTTGGGAACCAAAGTGCAAAGA/GGTAGTGTTGAACCAATGTTTCCACAGTTGGGAACCAAAGTGCAAAG- AAAGCAGAGA 3070 hom 205 het 51 0 69 4 N/A 0 0 335367 CASAVA_Build 20 54881525 12D AGAGAAAGAA AAAGAAAGAAGG/------------ AAAGAAAGAA 3070 hom 46 het 24 0 16 8 AAAGAAAGAAGG 1 0 335368 CASAVA_Build 20 54882222 24D GTAAGCTCTA GCCCAGCGGTCCCCAACCTTTGTG/------------------------ GCCCAGCGGT 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 GCCCAGCGGTCCCCAACCTTTGTG 2 1 335369 CASAVA_Build 20 54883182 2I AAGAGAATGC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 103 het 43 0 33 10 AG 5 6 335370 CASAVA_Build 20 54885565 3I CATTTACCTA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 9 12 335371 CASAVA_Build 20 54891858 2D ATACTGTCCT TG/-- TGGTAGTGGA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TG 2 1 335372 CASAVA_Build 20 54906749 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1177 het 1177 ref 29 14 4 12 T 17 18 335373 CASAVA_Build 20 54908344 1D AAGAGCTTTA T/- GGGCTGGAGT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 1 0 335374 CASAVA_Build 20 54910901 1I ATAGTCTTGA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 88 het 39 0 30 9 T 6 7 335375 CASAVA_Build 20 54911849 1I CCACAATGTT -/A AACAGCTTCT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 3 335376 CASAVA_Build 20 54920814 13I CGTGCCGTCT -------------/GCCCCTGCTGCCC GCCCCTGCTG 3070 hom 35 het 17 0 12 5 GCCCCTGCTGCCC 1 2 335377 CASAVA_Build 20 54924323 2D GGTCAACCAC TG/-- GGACCACTCC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 TG 1 0 335378 CASAVA_Build 20 54927575 1D ACTCTGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 18 2 10 6 A 13 12 335379 CASAVA_Build 20 54928712 1I CCAGCCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 25 1 19 5 T 10 11 335380 CASAVA_Build 20 54929710 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2418 het 2226 hom 26 9 7 10 A 15 14 335381 CASAVA_Build 20 54934602 1I AGAACTCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 36 0 27 9 T 9 10 335382 CASAVA_Build 20 54943000 1D ATTCTTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 46 0 33 14 T 14 13 335383 CASAVA_Build 20 54945212 1D GCCTGCGATT C/- CCCCTGGTTA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 C 5 4 335384 CASAVA_Build 20 54951096 1D CTACAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 10 9 335385 CASAVA_Build 20 54951747 1D GGAGGCGGAA G/- GTACAGTGAG 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 G 2 1 335386 CASAVA_Build 20 54955704 1D TAAGTTCTGG A/- TAATGGGATG 3070 het 3070 hom 48 21 22 6 A 1 0 335387 CASAVA_Build 20 54956475 3D ACGCAGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1039 het 573 hom 16 6 5 5 A 19 16 335388 CASAVA_Build 20 54957475 1D CCACGCCCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 19 0 12 7 T 11 10 335389 CASAVA_Build 20 54960259 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2990 het 2990 ref 22 9 11 2 T 11 10 335390 CASAVA_Build 20 54964911 1I TGGCTCAGCA -/G TGTTACATAT 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 G 0 1 335391 CASAVA_Build 20 54978660 2D TGTGCTAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 31 17 3 11 T 18 16 335392 CASAVA_Build 20 54982698 15D AATTTCTCAG CCATCTCAACGCGCC/--------------- CCATCTCAAC 3070 hom 92 het 39 0 28 14 CCATCTCAACGCGCC 2 1 335393 CASAVA_Build 20 54985616 8D GTTGAAAGTT CTCCTGAA/-------- GGAGAATGAC 3070 het 3070 hom 38 18 17 7 CTCCTGAA 1 0 335394 CASAVA_Build 20 54991119 7D GCCTACTGCA GAGCTCT/------- GACCTGTGTG 3070 het 3070 ref 38 22 14 4 GAGCTCT 1 0 335395 CASAVA_Build 20 54997774 1D TCTCAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 A 11 10 335396 CASAVA_Build 20 55000838 2D CATTCTTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 2538 het 1629 hom 19 6 6 7 T 11 9 335397 CASAVA_Build 20 55005871 1D CGCTCTCCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2411 hom 24 9 13 2 A 10 9 335398 CASAVA_Build 20 55087602 1I ATGATTAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 55 27 18 10 T 9 10 335399 CASAVA_Build 20 55089223 1I TTTCTCAACT -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 6 7 335400 CASAVA_Build 20 55091567 2D TGTATGTGAC TG/-- TGTATGTGTG 3070 hom 225 het 85 0 72 15 TG 2 1 335401 CASAVA_Build 20 55091804 2I ATGTATGTAG --/GT GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 90 40 34 16 GT 4 5 335402 CASAVA_Build 20 55091881 2D22M4I CGTGTGTGCA TGTGTGTACGTGCGTGCGTGCATG----/--TGTGTACGTGCGTGCGTGCATGTGTA TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 58 17 23 24 N/A 0 0 335403 CASAVA_Build 20 55095742 7I AGCCGCGCCC -------/GCCCGTA GCCTCCCTGC 1553 het 1553 ref 18 10 4 4 GCCCGTA 0 1 335404 CASAVA_Build 20 55100068 12D CCATGCCTCC CATTCATTCATT/------------ CAGTCATTCA 3070 het 2685 hom 29 8 16 10 CATT 3 0 335405 CASAVA_Build 20 55105414 3D CCAAGTCTCT ACA/--- ACAAGACAGG 3070 het 3070 hom 34 15 15 6 ACA 2 1 335406 CASAVA_Build 20 55108340 1I ACACGTCACA -/G TACATTTCCG 3070 hom 129 het 51 0 43 8 G 0 1 335407 CASAVA_Build 20 55109805 1D CAGCACTTTG T/- GGGGGCAGAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 0 335408 CASAVA_Build 20 55113156 1I ATGACAACAC -/G GGGGTGCACC 3070 hom 27 het 21 0 12 9 G 4 5 335409 CASAVA_Build 20 55120690 1D ACGATTGGGA C/- CAGAACCAGG 3070 hom 69 het 25 0 21 4 C 2 1 335410 CASAVA_Build 20 55122604 33D TGTATTGCTA GGGGTGGCCCTGGCAGTATTGGTGGTGTTGATG/--------------------------------- GGGGTGGCCC 2724 het 2724 ref 44 15 9 28 GGGGTGGCCCTGGCAGTATTGGTGGTGTTGATG 2 1 335411 CASAVA_Build 20 55129715 1I GTTACACACG -/C AGCTCAGCTC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 C 0 1 335412 CASAVA_Build 20 55132515 1I AGGAAAGGCA -/G GGTGGCCTCT 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 G 2 3 335413 CASAVA_Build 20 55135069 3I GCAAAACGAC ---/CTT CTTTGCTTGG 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 CTT 1 2 335414 CASAVA_Build 20 55138337 1I GCGTCTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2297 hom 31 8 13 10 A 12 13 335415 CASAVA_Build 20 55142497 1D CTTTGGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 A 11 10 335416 CASAVA_Build 20 55144083 1I TCTGGATGAC -/T TTTTTGGCAC 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 5 6 335417 CASAVA_Build 20 55148797 1I TGACTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 11 12 335418 CASAVA_Build 20 55160585 1I CCTTTTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 471 hom 18 1 13 4 T 10 11 335419 CASAVA_Build 20 55165355 1D TTAAGGACAA T/- TTTTTTTTTT 2582 het 2582 ref 32 17 8 7 T 13 12 335420 CASAVA_Build 20 55181101 1I AGCTCTTATC -/A ACTATGGTTG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 1 2 335421 CASAVA_Build 20 55182110 5D CTAAAAAAAC ATAAA/----- ATAAAAATGA 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 ATAAA 2 1 335422 CASAVA_Build 20 55184304 1I GTGGCCCACA -/G GGCCCGGTGT 3070 hom 84 het 29 0 24 5 G 2 3 335423 CASAVA_Build 20 55185819 1I TCATCAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 924 hom 18 2 11 6 T 10 11 335424 CASAVA_Build 20 55191853 1D ATGGGGTAAG C/- CCCCCCAGGG 1033 hom 14 het 11 0 4 7 C 7 6 335425 CASAVA_Build 20 55191889 1D TTTCAGGGTC T/- TTCCTTCATC 2292 hom 18 het 14 0 5 10 T 3 2 335426 CASAVA_Build 20 55224361 1D TCCAACCTCA T/- TTTTTTTTTT 3017 het 1775 hom 26 5 13 8 T 15 14 335427 CASAVA_Build 20 55227858 4D GTACTTGACA TCCC/---- TCCCTCCCTC 3070 het 3070 hom 41 18 18 7 TCCC 3 2 335428 CASAVA_Build 20 55231697 3I CATCTCAAAA ---/AAG AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 23 3 16 4 AAG 0 1 335429 CASAVA_Build 20 55243118 1I AACACTCCCA -/G GTAGCTGTGT 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 G 1 2 335430 CASAVA_Build 20 55255452 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 2887 het 2887 ref 25 12 7 6 A 9 10 335431 CASAVA_Build 20 55263582 2D GGGCTCGGCT TC/-- TGTTTTAATG 3070 het 3070 hom 50 20 24 7 TC 1 0 335432 CASAVA_Build 20 55337371 1D AAAAGAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2414 hom 31 12 14 5 T 13 12 335433 CASAVA_Build 20 55360631 4I TTGAAGTATA ----/ACTT AAATAACATT 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 ACTT 0 1 335434 CASAVA_Build 20 55390310 4I TGGGGCTGTG ----/CTGT CTGTCGGTAT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 CTGT 1 2 335435 CASAVA_Build 20 55396907 5I TAATAATAAC -----/AAATA AAATAAAATG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 AAATA 1 2 335436 CASAVA_Build 20 55397569 4I GGTGAATGAC ----/TGAT TGATTGTCAG 1456 het 918 hom 16 4 4 8 TGAT 1 2 335437 CASAVA_Build 20 55400100 1I CGGCCCCTGG -/C CGCCCCCGGC 983 hom 15 het 7 0 5 2 C 1 2 335438 CASAVA_Build 20 55402775 31D ACCCGGCTGA GCCTGGCTCCCAGGTGAATGGGTCCCCTGGG/------------------------------- GCCTGGCTCC 3070 het 3070 ref 38 20 13 10 GCCTGGCTCCCAGGTGAATGGGTCCCCTGGG 1 0 335439 CASAVA_Build 20 55428823 1I AGAATATTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 159 hom 32 1 23 8 A 9 10 335440 CASAVA_Build 20 55433751 2D ACTGAGTTAC AG/-- AGTGTGAGGA 3070 hom 66 het 24 0 18 6 AG 2 1 335441 CASAVA_Build 20 55474873 1I TGGCTCCAGT -/A AAAAAAATAT 3070 het 135 hom 23 1 18 4 A 7 8 335442 CASAVA_Build 20 55476748 1D TTATAAACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 289 hom 16 2 10 6 T 10 9 335443 CASAVA_Build 20 55478409 1D GGGGTGGGGT G/- GGTGGGGGGG 1825 hom 21 het 17 0 8 9 G 3 2 335444 CASAVA_Build 20 55485928 2I TTCTTGAGTC --/AG AGTCTCGCTC 1703 het 1703 ref 20 6 5 9 AG 1 2 335445 CASAVA_Build 20 55514776 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 T 7 8 335446 CASAVA_Build 20 55539778 1D AATGTCATGA T/- TGCGTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 T 2 1 335447 CASAVA_Build 20 55560748 1D TAAAAAACGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 T 9 8 335448 CASAVA_Build 20 55564847 1D TGTGTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2652 hom 36 7 15 14 T 12 11 335449 CASAVA_Build 20 55585095 1D CCTTAGCTCT G/- GGGGAAGCTG 3070 hom 100 het 39 0 33 9 G 5 4 335450 CASAVA_Build 20 55600279 3I CCAGAAGCAG ---/AGA AGATCTGCCT 3070 hom 68 het 27 0 22 5 AGA 1 2 335451 CASAVA_Build 20 55604488 1D ACCTGAGCAC A/- TTGTCAGACT 3070 het 3070 hom 42 16 15 12 A 1 0 335452 CASAVA_Build 20 55607330 1D CACTTGTCAG C/- CATGTGGCTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 C 2 1 335453 CASAVA_Build 20 55608101 1I GAATAATGAC -/A AAAAAAGTCC 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 6 7 335454 CASAVA_Build 20 55608890 2D ACTTAATCAT TC/-- TCTGCTTTTA 2844 het 2844 ref 13 7 6 0 TC 2 1 335455 CASAVA_Build 20 55616590 2I AGTGTGACCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 842 hom 28 6 12 10 T 12 14 335456 CASAVA_Build 20 55621020 1D GTGTCCCGAC T/- TTGGGGCTGA 3070 het 3070 ref 46 21 21 5 T 3 2 335457 CASAVA_Build 20 55624579 2D ACCAAGGCAC AG/-- AGAGAGGAAA 3070 het 3070 ref 39 15 14 11 AG 4 3 335458 CASAVA_Build 20 55626157 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 7 8 335459 CASAVA_Build 20 55632549 1D TTATCTGTAA G/- GGGAGGCCTG 3070 het 3070 hom 47 15 28 4 G 4 3 335460 CASAVA_Build 20 55636734 4D TTGTTTCAAA TTGT/---- TTGATTGTGA 3070 het 3070 hom 23 10 8 9 TTGT 1 0 335461 CASAVA_Build 20 55637123 1I AGCCCTCGCT -/C GCTCTCTGCG 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 C 0 1 335462 CASAVA_Build 20 55641181 1D AGACCATATA T/- TGGCAATTAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 2 1 335463 CASAVA_Build 20 55643806 1D AATGGGAAAA G/- AAAAGTAGTT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 G 1 0 335464 CASAVA_Build 20 55646987 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1769 het 1769 ref 27 20 6 1 T 17 16 335465 CASAVA_Build 20 55691121 1I TTTTTGATTT -/A AAAAAAAATC 1622 het 1622 ref 28 16 4 8 A 8 9 335466 CASAVA_Build 20 55696811 10I ACACTTCTTT ----------/GTGGGGTGGA GTGGGGTGGG 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 GTGGGGTGGA 0 1 335467 CASAVA_Build 20 55700996 1I CTCCTTCCAA -/G GGGCCCAGGT 1891 het 1891 ref 23 9 8 6 G 3 4 335468 CASAVA_Build 20 55768773 2D TTTGAGGGGC AT/-- TATTCTGCCT 3070 het 3070 ref 45 26 14 6 AT 1 0 335469 CASAVA_Build 20 55813678 2D ACCCCACCCC CT/-- GTCATTGTAT 1554 het 1553 ref 18 7 4 7 CT 1 0 335470 CASAVA_Build 20 55845748 5D GATTATCTGG GATTA/----- GCAGATTGGC 3070 het 3070 hom 43 18 20 6 GATTA 1 0 335471 CASAVA_Build 20 55852332 1I GATGATTTAT -/G GGGGGGGGTG 2565 het 2565 ref 41 18 9 14 G 8 9 335472 CASAVA_Build 20 55874619 1D TGGTTCTGAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 9 8 335473 CASAVA_Build 20 55880826 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2396 het 1701 hom 22 10 8 5 A 14 12 335474 CASAVA_Build 20 55894033 1D TCTTGTTTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 T 8 7 335475 CASAVA_Build 20 55896574 1D AAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 10 9 335476 CASAVA_Build 20 55898249 1I TTTTGCTGAT -/G GTATTTTTGC 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 G 1 2 335477 CASAVA_Build 20 55903015 1D AAGGGAGGAA G/- GGAAGGAAGG 2794 hom 29 het 16 0 10 6 G 3 2 335478 CASAVA_Build 20 55919932 3D TTATTGATAC ATA/--- ATAATGATAC 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 ATA 2 1 335479 CASAVA_Build 20 55947185 2I TCGCAGAGCC --/CT CTCTGAGCAC 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 CT 2 3 335480 CASAVA_Build 20 55947330 15I TTCATTTTGG ---------------/GTCCCTGTGACTGGC GTCCCTTCAG 3070 het 3070 ref 52 22 21 10 GTCCCTGTGACTGGC 0 1 335481 CASAVA_Build 20 55950407 3D TGGTGGTTGC TGT/--- TGTTGTTTTT 2005 het 2005 ref 31 17 6 8 TGT 3 2 335482 CASAVA_Build 20 55953436 2D33M3I TATATGTGTG TATATATATATATATGGAGTACATGCTTAAATAAT---/--TATATATATATATGGAGTACATGCTTAAATAATGAC AAGAGGTATA 3070 het 3070 ref 31 18 19 7 N/A 0 0 335483 CASAVA_Build 20 55954424 2D GAGGCCAGGC CG/-- CGTGACAACC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 CG 2 1 335484 CASAVA_Build 20 55955017 4D TTCATCATCC CAAA/---- CAGATTTTAG 3070 het 3070 hom 42 18 22 4 CAAA 1 0 335485 CASAVA_Build 20 55960432 1D TACAACTCCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 10 9 335486 CASAVA_Build 20 55964542 2I GGAAAGAGGT --/GG GGTCGACAGG 3070 hom 97 het 38 0 29 9 G 2 4 335487 CASAVA_Build 20 55965032 1D CTGGTTTACC A/- AAGCATGGAT 3070 het 3070 ref 51 25 16 11 A 3 2 335488 CASAVA_Build 20 55969661 1I TACTCTTTAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 27 10 12 5 A 7 8 335489 CASAVA_Build 20 55983354 13D15M3D CAACTACCAG CCACCACAAATACCACCATCACTATCACCAT/-------------CATCATCACCATCAC--- CACTATCACT 2839 het 2839 ref 20 19 8 14 N/A 0 0 335490 CASAVA_Build 20 55996352 2D TGCACATGCT TG/-- TGTGTGTGTG 2959 het 2959 ref 68 40 8 20 TG 9 8 335491 CASAVA_Build 20 55998192 2D TCCTCAATAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 12 13 A 14 12 335492 CASAVA_Build 20 56014171 1I TATTCTATTG -/C CCAGGCTGGA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 C 2 3 335493 CASAVA_Build 20 56014239 1I AAGCAATTCT -/C CCATCTCGGC 3070 hom 65 het 29 0 25 4 C 2 3 335494 CASAVA_Build 20 56031043 3I AGACTGAGAA ---/AAG AAGATTTGCT 3070 het 3070 ref 55 21 18 16 AAG 1 2 335495 CASAVA_Build 20 56042668 1I TAAAGAAATG -/A AAACAACGTC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 3 4 335496 CASAVA_Build 20 56071357 1I AAGATCAATA -/T TTTTTTCATT 2593 het 2593 ref 29 20 6 3 T 6 7 335497 CASAVA_Build 20 56083508 1I GAAGTGTAAA -/T AACCGACTTT 3070 het 3070 hom 45 15 21 9 T 0 1 335498 CASAVA_Build 20 56087779 23I CCCAGACAGA -----------------------/GTTCCCCAACCATACCAGAGAGG GTCCCCCCAC 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 GTTCCCCAACCATACCAGAGAGG 0 1 335499 CASAVA_Build 20 56104999 1D AATAGTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1381 het 1381 ref 15 10 3 2 A 13 12 335500 CASAVA_Build 20 56124396 1I AAAATTTGTC -/T TTGTGGTCTG 3070 hom 107 het 40 0 35 5 T 2 3 335501 CASAVA_Build 20 56131690 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1318 het 1318 ref 14 8 3 3 A 15 16 335502 CASAVA_Build 20 56138001 5D ATCGCGCACA ATATC/----- ATATCGGGTC 3070 hom 109 het 40 0 33 11 ATATC 2 1 335503 CASAVA_Build 20 56138669 1I TGTCAGCTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 46 het 24 0 16 8 T 9 10 335504 CASAVA_Build 20 56145300 1D ACCATCTCCC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 45 0 39 7 A 10 9 335505 CASAVA_Build 20 56149558 2I TGTCACAAGA --/CT CTGAAACCTG 3070 hom 96 het 36 0 29 7 CT 1 2 335506 CASAVA_Build 20 56167985 1D TAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 48 1 37 11 A 13 12 335507 CASAVA_Build 20 56177021 1D CCCCATGTGA G/- GGGGAGAAAC 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 G 5 4 335508 CASAVA_Build 20 56178427 1I TTGTGTGATA -/T TTTTTACAAA 3070 het 3070 ref 43 23 19 1 T 5 6 335509 CASAVA_Build 20 56179283 1I TCATTTTTAT -/A AAATAATTAT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 A 3 4 335510 CASAVA_Build 20 56180591 2D CACCTCTGGT AG/-- AGACAGCCGT 3070 hom 168 het 60 0 53 8 AG 2 1 335511 CASAVA_Build 20 56182325 1I ATTTCACCTC -/A AAAAAACATG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 6 7 335512 CASAVA_Build 20 56189057 2D ACAGTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2392 hom 21 het 30 0 13 17 A 18 16 335513 CASAVA_Build 20 56199049 1I GTGTTAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 41 2 32 7 A 10 11 335514 CASAVA_Build 20 56250770 2I ACCATAAAAC --/AA AGGCTCCATT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 1 3 335515 CASAVA_Build 20 56260025 1D ATACAGACTC T/- TTATCTCCAG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 3 2 335516 CASAVA_Build 20 56261846 6I GGTGTAGGCA ------/AAGAAT AAGAATTTAT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 AAGAAT 1 2 335517 CASAVA_Build 20 56269107 1D CAACTAATTG T/- TAAGTTCTAA 3070 het 3070 ref 67 34 27 6 T 2 1 335518 CASAVA_Build 20 56282850 1I CCACTAAAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 8 9 335519 CASAVA_Build 20 56283509 1D ATATGGGGGG A/- AAAAAAATTG 3035 het 3035 ref 29 18 7 5 A 8 7 335520 CASAVA_Build 20 56284046 2D AGCTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 671 het 671 ref 27 8 6 14 A 20 18 335521 CASAVA_Build 20 56284574 7I ATTCTCAACA -------/TCACAAG TCTTCAGAAA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 TCACAAG 0 1 335522 CASAVA_Build 20 56292315 1D CCAAAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 12 11 335523 CASAVA_Build 20 56295654 3D CCTGAGCCTC CTT/--- GAGTAGCTGG 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 CTT 1 0 335524 CASAVA_Build 20 56301077 3D TACAGGCGCG CAC/--- CACCAGACCT 2427 het 2427 ref 18 9 6 3 CAC 2 1 335525 CASAVA_Build 20 56303602 3D TTATCCTGAT CTA/--- CTTTCCTGTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 CTA 1 0 335526 CASAVA_Build 20 56305578 3I ATAACAGGGT ---/TTA TTATCCCTTG 3070 hom 83 het 36 0 28 8 TTA 1 2 335527 CASAVA_Build 20 56322516 1I ATTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2250 hom 28 7 13 8 T 13 14 335528 CASAVA_Build 20 56324024 1I AGGTTGGGGC -/G GGGGGGTCAT 3070 hom 68 het 31 0 21 10 G 6 7 335529 CASAVA_Build 20 56330211 2I CATACATGTC --/AT ATGTATTATA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 AT 1 2 335530 CASAVA_Build 20 56331292 1I ACCATTAGTC -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 T 7 8 335531 CASAVA_Build 20 56332768 1D TACATTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 T 11 10 335532 CASAVA_Build 20 56339760 1I CCACACAGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 8 9 335533 CASAVA_Build 20 56357255 1D TGATGAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 10 19 11 A 12 11 335534 CASAVA_Build 20 56357603 1I CAGTAATAGC -/A GAGTGGCTTG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 0 1 335535 CASAVA_Build 20 56368984 1I ATGCTGTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 9 10 335536 CASAVA_Build 20 56374949 4D TTCCCAACAC AAAG/---- AAAAGATAAG 3070 het 3070 ref 28 17 10 4 AAAG 1 0 335537 CASAVA_Build 20 56378212 1I GATTACAGGT -/A ATGAGGCACC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 1 2 335538 CASAVA_Build 20 56379621 1I AACAGACCAA -/G GGGGGTCAGA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 G 5 6 335539 CASAVA_Build 20 56379922 2I AACAGTTAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 AC 6 7 335540 CASAVA_Build 20 56395139 1I AATTAAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 11 12 335541 CASAVA_Build 20 56399853 2D AACTCCTGAA AG/-- AGGTGTCATT 3070 het 3070 ref 62 35 22 5 AG 2 1 335542 CASAVA_Build 20 56417091 1I GGGCAACTTT -/A AAAAAAAAAC 2818 het 2818 ref 28 17 7 4 A 9 10 335543 CASAVA_Build 20 56417655 1I CAAGAGGGAC -/A AAAAAAGTCT 2863 het 2863 ref 23 15 7 1 A 6 7 335544 CASAVA_Build 20 56424437 1I GCCTGTTCTT -/A ACAAATATCT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 A 1 2 335545 CASAVA_Build 20 56437617 1I TTTTTTTTTT -/C CCAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 40 13 13 14 C 2 3 335546 CASAVA_Build 20 56440021 1D ATCTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 T 11 10 335547 CASAVA_Build 20 56443384 1D AAGGCTGTTC T/- TTTCTGACTT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 T 4 3 335548 CASAVA_Build 20 56444790 14D TTTTTCTTCC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 15 15 12 T 23 9 335549 CASAVA_Build 20 56460132 3D TTTCTGGAGA TCT/--- TCTATGCACA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 TCT 2 1 335550 CASAVA_Build 20 56462879 2D TACTGCACAG CT/-- CTCATTCCAG 3070 het 3070 ref 45 21 19 6 CT 2 1 335551 CASAVA_Build 20 56464221 3D TGTCTGTGGG TCT/--- TCTTTTTACT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 TCT 2 1 335552 CASAVA_Build 20 56473319 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1393 het 1393 ref 29 9 9 11 T 13 14 335553 CASAVA_Build 20 56482062 1D TTCTTTGCTT C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 C 8 7 335554 CASAVA_Build 20 56493415 2I GCTATTAAAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 T 13 15 335555 CASAVA_Build 20 56495873 1D CTTAAATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 33 1 26 6 A 13 12 335556 CASAVA_Build 20 56498405 1D CACATTTTAT A/- AAGCTGACAC 3070 het 3070 ref 25 12 10 5 A 3 2 335557 CASAVA_Build 20 56502972 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 33 0 25 8 T 10 11 335558 CASAVA_Build 20 56521353 1I GGGCAGGCTG -/C CCCCCCTCTC 2869 het 2762 hom 24 8 8 8 C 6 7 335559 CASAVA_Build 20 56523379 1D CACTCATAGG T/- CCAACTTGCC 1204 het 1094 hom 13 5 3 5 T 1 0 335560 CASAVA_Build 20 56526383 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2983 het 359 hom 20 1 7 12 A 11 10 335561 CASAVA_Build 20 56532634 1I CAGAGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 907 hom 33 3 19 11 T 11 12 335562 CASAVA_Build 20 56535181 1D TGTTGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 11 10 335563 CASAVA_Build 20 56540364 2I GACAGTGTGG --/TT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 T 8 10 335564 CASAVA_Build 20 56541937 2I GCTGGCATAA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 54 20 21 13 GT 8 9 335565 CASAVA_Build 20 56544994 7I CTCTACCCTG -------/TGCCCTA TCCTCATCCT 3070 hom 147 het 53 0 49 4 TGCCCTA 0 1 335566 CASAVA_Build 20 56559259 2D AGAGTTGGGC GA/-- GGGGGGGGGA 2144 hom 4 het 24 0 9 15 GA 1 0 335567 CASAVA_Build 20 56563138 2D CATGAGAGAA AG/-- AGGGAAGCAG 3070 hom 105 het 42 0 31 12 AG 2 1 335568 CASAVA_Build 20 56572108 1D AACTTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 41 0 31 10 A 13 12 335569 CASAVA_Build 20 56613083 1I CAGCCCCTAG -/C CCCCCCTGCT 1777 het 1777 ref 25 13 8 4 C 6 7 335570 CASAVA_Build 20 56632362 4I GTGTGCATTT ----/GAGG GGGGGGTGTG 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 GAGG 0 1 335571 CASAVA_Build 20 56634027 1I ACAGCGGAGA -/G GGGCCCCTAA 3070 hom 79 het 30 0 25 5 G 3 4 335572 CASAVA_Build 20 56635426 1I TGGGCTCATA -/G GGTTTCTCAC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 2 3 335573 CASAVA_Build 20 56693777 1D CTATGGGGGT A/- AAAAAAGGTT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 A 7 6 335574 CASAVA_Build 20 56694951 2D TCTTAGTCTC AA/-- AGTGTCACTC 3070 het 3070 hom 44 17 20 8 A 3 1 335575 CASAVA_Build 20 56697136 20D GTGCGTGTAT GTGTGTGTGGTGTGTGTGTG/-------------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 36 14 14 13 GTGTGTGTGGTGTGTGTGTG 1 0 335576 CASAVA_Build 20 56697516 16I CCAGCTGCTC ----------------/CAGGACCATGTGGTGG AGGGAGGTCC 3070 het 3070 ref 45 16 10 19 CAGGACCATGTGGTGG 0 1 335577 CASAVA_Build 20 56703479 17D8M1I ATGTGTGATG TGTGTGTGTGTGTGGTATGTGTTGC-/-----------------TGTGTTGCG TGTGTATGTT 3070 het 3070 ref 46 31 19 23 N/A 0 0 335578 CASAVA_Build 20 56712751 1D GTTTTGCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1740 hom 23 6 12 7 A 10 9 335579 CASAVA_Build 20 56712966 2D TAAAAATAAC AT/-- ATAAATCCAT 3070 het 3070 ref 19 9 10 1 AT 2 1 335580 CASAVA_Build 20 56720421 1D CTTCGGGGTC A/- GGGGGCACCC 3070 hom 58 het 24 0 14 10 A 1 0 335581 CASAVA_Build 20 56722719 1D CAGGAGTCAT C/- CCAGACAGCG 2983 het 2983 ref 34 15 10 9 C 3 2 335582 CASAVA_Build 20 56733925 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 9 10 335583 CASAVA_Build 20 56737625 1D CATTATGCTT A/- AAGTAAAACA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 A 3 2 335584 CASAVA_Build 20 56745112 1I GAAAACAGGC -/A ACCCACTTTA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 A 1 2 335585 CASAVA_Build 20 56750534 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 2461 het 1846 hom 15 5 8 2 TA 6 5 335586 CASAVA_Build 20 56780876 3I GGCCAAGATG ---/TCA GTGAAACCAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 TCA 0 1 335587 CASAVA_Build 20 56783066 2D CCTACAAAGA AG/-- AGTGACTGCT 3070 het 3070 hom 61 26 28 7 AG 2 1 335588 CASAVA_Build 20 56783431 1D AGTGGGCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 10 9 335589 CASAVA_Build 20 56793317 1D TTCCCCACAG C/- CGTTTGCCCA 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 C 2 1 335590 CASAVA_Build 20 56793529 3D CTGTGAATCC AGG/--- AGAACTTGGA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 AGG 1 0 335591 CASAVA_Build 20 56795606 1I TACAAGCCTA -/G GGTTTGGGAC 3070 hom 83 het 31 0 26 5 G 2 3 335592 CASAVA_Build 20 56800245 1D CAGGTGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 11 10 335593 CASAVA_Build 20 56807009 1I GTCATGAGAA -/G GGGGACACTT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 G 4 5 335594 CASAVA_Build 20 56807412 4I TGCACCCGGC ----/TTAT TTATTTATTT 2425 het 2425 ref 17 9 6 2 TTAT 2 3 335595 CASAVA_Build 20 56810470 1I CCAAAGGTCT -/G GGGGAGCAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 G 4 5 335596 CASAVA_Build 20 56810705 1D ATTTTCGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 7 T 11 10 335597 CASAVA_Build 20 56818494 2D CTGGAGGAAG AA/-- AAGAGTAAGG 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 A 4 2 335598 CASAVA_Build 20 56821915 4D TGCGCGCGCG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 115 het 49 0 37 12 CA 12 10 335599 CASAVA_Build 20 56822367 2D GTTTATATCT CA/-- CACACACACA 3070 hom 78 het 33 0 26 9 CA 9 8 335600 CASAVA_Build 20 56836446 2I ATGTTATCAG --/TT TCACAGTGTA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 1 3 335601 CASAVA_Build 20 56844394 3I GTGAGGAAAG ---/CTC CTCCACAGGC 3070 hom 72 het 25 0 22 3 CTC 1 2 335602 CASAVA_Build 20 56853136 1I ACACTAGTGA -/T TTTAACCCTA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 3 4 335603 CASAVA_Build 20 56855692 24D ACTTTTTCCA CTACCTCTAATATCAGCCTTGCAT/------------------------ CTGCCTCTAA 3070 het 3070 ref 30 16 15 5 CTACCTCTAATATCAGCCTTGCAT 1 0 335604 CASAVA_Build 20 56885599 1I AAGAACAAGA -/T TTTTTTTTTT 1969 het 1969 ref 28 14 7 7 T 10 11 335605 CASAVA_Build 20 56904679 1I CAGTTTCTCA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 8 9 335606 CASAVA_Build 20 56908116 2D CACACACACG CA/-- CACACATGCA 3070 het 2549 hom 34 7 21 6 CA 4 3 335607 CASAVA_Build 20 56910573 1D CTCGGTGACT C/- CCCCCCTCTT 3070 het 2948 hom 25 12 11 2 C 7 6 335608 CASAVA_Build 20 56921995 1D AAGCCATTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2985 hom 19 9 8 3 A 9 8 335609 CASAVA_Build 20 56925240 2D GTACATGTAT TA/-- TATATATATA 3070 het 2089 hom 24 7 13 4 TA 6 5 335610 CASAVA_Build 20 56929083 1D CCAAGACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 11 10 335611 CASAVA_Build 20 56947382 1D ACTTCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 1445 het 1445 ref 33 19 5 9 A 19 18 335612 CASAVA_Build 20 56961410 1D CAAGAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1756 hom 21 5 13 3 A 11 10 335613 CASAVA_Build 20 56964271 1D TTTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2817 het 2817 ref 35 13 10 12 A 17 16 335614 CASAVA_Build 20 56964730 7D TGAGAAACAT GTCATTA/------- CGCAATTTCA 3070 het 3070 hom 55 23 24 13 GTCATTA 1 0 335615 CASAVA_Build 20 56965196 2I TTTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTT 3070 het 2743 hom 25 7 10 8 AG 1 2 335616 CASAVA_Build 20 56970000 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 13 14 335617 CASAVA_Build 20 56976651 12D TCCAGAGACA CTGCCTTACTTT/------------ CTGCCTTACT 3069 het 3069 ref 36 15 12 12 CTGCCTTACTTT 2 1 335618 CASAVA_Build 20 56977111 2I GAAAATATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 AT 6 7 335619 CASAVA_Build 20 56977678 1I ACAATCTGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 8 9 335620 CASAVA_Build 20 56978500 4D GCAAAGGAAA CAAT/---- CAACAAAATG 3070 het 3070 ref 34 21 8 7 CAAT 1 0 335621 CASAVA_Build 20 56979138 2I TTCAGCCATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 10 13 5 A 10 12 335622 CASAVA_Build 20 56982500 6D AGAAGAAGAA GAAGAG/------ GAGGAGGAGG 3070 het 507 hom 34 8 16 11 GAAGAG 1 0 335623 CASAVA_Build 20 56988729 4D TTTCTTTTTC TTTT/---- TCTTTTTTTT 674 het 411 hom 19 4 10 5 T 5 1 335624 CASAVA_Build 20 56990478 1D GACAGTGTGT C/- CCCACCTTAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 C 4 3 335625 CASAVA_Build 20 57007963 1D TCTGCACCTT C/- CATCTGTCCC 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 C 2 1 335626 CASAVA_Build 20 57008010 3I TCCAGGAGAA ---/TTC TTTCTGGCTG 2715 het 2715 ref 30 13 8 9 TTC 0 1 335627 CASAVA_Build 20 57017027 12D CTCCCTGACT ATAGGAGCTGGG/------------ TCCTTGTGAG 3070 het 3070 ref 29 17 12 3 ATAGGAGCTGGG 1 0 335628 CASAVA_Build 20 57017982 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2429 het 2429 ref 37 13 9 15 T 13 14 335629 CASAVA_Build 20 57021736 1D TCGGCCTTCC T/- TTTGTAAGAG 3070 het 3070 ref 51 20 23 10 T 4 3 335630 CASAVA_Build 20 57031728 2I CAGAGCAGAC --/AA TGATGGAGAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 0 2 335631 CASAVA_Build 20 57041802 5D AGTTTTTAAA AAATC/----- AAAGGATAAG 3070 het 3070 ref 38 22 14 4 AAATC 1 0 335632 CASAVA_Build 20 57053814 1D TTGAACTCCT A/- ACCTCAAGTG 2994 het 18 hom 10 1 8 1 A 2 1 335633 CASAVA_Build 20 57057463 4D CTCATATAAA TATC/---- TATCATTATA 3070 het 1968 hom 14 6 7 1 TATC 2 1 335634 CASAVA_Build 20 57063503 7D TTTCTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2475 het 930 hom 17 4 11 2 T 17 10 335635 CASAVA_Build 20 57083930 1D TGCCCATTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 69 het 39 0 29 11 T 9 8 335636 CASAVA_Build 20 57087466 7D TGGTAAGCAG TGACACA/------- TGTCATCAAC 3070 hom 60 het 24 0 20 5 TGACACA 1 0 335637 CASAVA_Build 20 57088483 2I ACGTAAATTT --/AA AAAAGTGTCA 3070 hom 108 het 38 0 35 3 A 4 6 335638 CASAVA_Build 20 57088742 1I TCAATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 946 hom 25 2 19 4 T 11 12 335639 CASAVA_Build 20 57093405 1I AAAAAACAAC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 36 het 18 0 13 5 A 8 9 335640 CASAVA_Build 20 57098730 1I CTACCAATCT -/G GCATCCTGTC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 1 2 335641 CASAVA_Build 20 57099191 1I CTTGCAAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 386 hom 47 1 39 7 T 9 10 335642 CASAVA_Build 20 57102693 1D TAATACACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 39 0 32 8 A 10 9 335643 CASAVA_Build 20 57119664 1I AGGGAACTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 9 10 335644 CASAVA_Build 20 57121272 1D TCTCTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 126 het 46 0 42 5 A 12 11 335645 CASAVA_Build 20 57123342 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1100 het 1100 ref 18 9 3 6 A 16 15 335646 CASAVA_Build 20 57131516 1D ACTAGCTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 121 hom 17 1 10 6 T 13 12 335647 CASAVA_Build 20 57135583 7I ACTCTCGGAG -------/GATCCTT GATCCTTTCT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 GATCCTT 1 2 335648 CASAVA_Build 20 57140740 1D GGTTTAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 630 hom 44 5 25 14 T 17 16 335649 CASAVA_Build 20 57145730 2D CCAATACATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 37 0 29 8 T 14 12 335650 CASAVA_Build 20 57185466 2I CTGCCCTTGG --/CA CACACAACAG 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 CA 3 4 335651 CASAVA_Build 20 57242806 1I TGCTCCCCTG -/T TGTGGGCCTG 3070 het 3070 ref 45 20 21 4 T 1 2 335652 CASAVA_Build 20 57247302 2D ATTTCTTTCC CT/-- GAGATAAGTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 CT 1 0 335653 CASAVA_Build 20 57252631 1I GGTTTCTGGG -/A AAAAAAAACA 3070 het 422 hom 31 1 27 3 A 8 9 335654 CASAVA_Build 20 57263217 2I ACATGGTGTC --/TT TGGTCAAAAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 T 1 3 335655 CASAVA_Build 20 57266566 1D AAGCTAATAA T/- CCCCTTTGGT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 1 0 335656 CASAVA_Build 20 57275027 1I TTTTTTCTTA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 7 8 335657 CASAVA_Build 20 57296700 3D GGAAGACCTC CTT/--- CTTTGCAGAG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 CTT 2 1 335658 CASAVA_Build 20 57297357 5I GCCTCTACAG -----/AAACC AAACCAGAGA 3070 het 3070 hom 41 20 16 5 AAACC 1 2 335659 CASAVA_Build 20 57301407 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2224 het 1988 hom 29 10 10 9 T 15 14 335660 CASAVA_Build 20 57306807 3I GTGAAGACAA ---/GTG GTGGTGGTCG 3070 het 3070 hom 40 19 15 6 GTG 2 3 335661 CASAVA_Build 20 57319280 1I TGGGGAGCGC -/A AAATTGCTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 3 4 335662 CASAVA_Build 20 57362732 1D TTGCTGGGCA T/- TTTCTGCAGT 3070 hom 101 het 39 0 34 6 T 4 3 335663 CASAVA_Build 20 57366832 3I ATGCAATCCC ---/TTT TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 T 8 11 335664 CASAVA_Build 20 57369700 1I GGTGCTTATC -/A CGCAATCACA 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 A 0 1 335665 CASAVA_Build 20 57377912 1I CCCACTGGAA -/G TGGGCAGCCT 3070 hom 74 het 36 0 30 6 G 0 1 335666 CASAVA_Build 20 57378774 4I5M1D AAAATTTTGC ----ACAAAT/TTGTGCAAA- CTAATAGTCA 3070 het 3070 ref 44 22 22 3 N/A 0 0 335667 CASAVA_Build 20 57383870 1D TTAAAAAAAA T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3018 hom 28 8 15 5 T 8 7 335668 CASAVA_Build 20 57406239 4I CGCGCACGCG ----/CACA CGCGCACACA 3070 het 3 hom 32 1 19 12 CA 0 2 335669 CASAVA_Build 20 57406426 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 834 het 834 ref 48 30 3 15 CA 7 6 335670 CASAVA_Build 20 57407329 2I TCTCATCCTT --/AC ACACACACAC 3070 het 489 hom 43 2 33 8 AC 7 8 335671 CASAVA_Build 20 57409764 2D CACACATGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 CA 9 8 335672 CASAVA_Build 20 57419306 2I AGCTGGCCTC --/AG GGGCCCCATC 3070 het 1378 hom 28 6 16 6 AG 0 1 335673 CASAVA_Build 20 57426280 1I GAATCCTCCC -/A AAAATATGTT 3070 hom 108 het 45 0 35 10 A 4 5 335674 CASAVA_Build 20 57429379 2I ACAATATGCA --/AT ATGATGTCCA 3070 het 3070 hom 38 11 26 1 AT 1 2 335675 CASAVA_Build 20 57432734 1D GCTCACCCCA C/- CCCCCCAACT 2195 het 2195 ref 21 9 7 5 C 7 6 335676 CASAVA_Build 20 57435580 3I GGACAGACTA ---/CTT CTTTGTGATT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 CTT 1 2 335677 CASAVA_Build 20 57457514 1I ATTAGAATGA -/T TACCATCTAC 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 T 1 2 335678 CASAVA_Build 20 57458161 3I TCGGGAGGCT ---/GAG GAGGCAGGGG 3070 hom 56 het 22 0 20 2 GAG 1 2 335679 CASAVA_Build 20 57464586 9D CTGAACTGCT GACAGTGGG/--------- GACAGTGGGG 3070 het 3070 ref 36 15 12 11 GACAGTGGG 3 2 335680 CASAVA_Build 20 57476594 3I TGCAGCAGTT ---/ATC AGCCTGGGGA 3070 hom 66 het 28 0 21 7 ATC 0 1 335681 CASAVA_Build 20 57517942 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2163 hom 31 7 19 5 A 14 15 335682 CASAVA_Build 20 57527532 2I CACAGCTAGC --/TG TGTCATCACT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 TG 1 2 335683 CASAVA_Build 20 57532820 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAATCAC 2652 het 2652 ref 34 17 12 5 A 6 7 335684 CASAVA_Build 20 57537135 1D CAAAAACTGC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 A 9 8 335685 CASAVA_Build 20 57538951 1D AACAACCTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 T 8 7 335686 CASAVA_Build 20 57547476 2D GTGGAGTCTT TA/-- TGTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 24 13 5 TA 1 0 335687 CASAVA_Build 20 57552762 3D ATGTCTTTTA AAT/--- AATCTCAGAG 3070 het 3070 hom 32 9 20 4 AAT 2 1 335688 CASAVA_Build 20 57564512 1D AAGTCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 33 1 25 7 T 13 12 335689 CASAVA_Build 20 57569375 10I GTCTTTCTTC ----------/TCCCCTTCCT TCCCCTTCAG 3070 het 45 hom 36 1 19 16 TCCCCTTCCT 0 1 335690 CASAVA_Build 20 57569386 1D CCCCTTCAGC T/- ACTCTGAATT 3070 het 223 hom 34 1 17 16 T 1 0 335691 CASAVA_Build 20 57574800 6D TCGGTCACGC TGGCCA/------ TGGCCATGTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 7 TGGCCA 2 1 335692 CASAVA_Build 20 57576064 8I CCAGCCCTCA --------/TCACTGGC TCAGCTCTCC 1618 het 1618 ref 22 14 5 4 TCACTGGC 0 1 335693 CASAVA_Build 20 57581932 2D CCATGAACTC AA/-- GTCTCACTTG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 A 2 0 335694 CASAVA_Build 20 57602788 1D TTTGGTCGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 15 7 T 13 12 335695 CASAVA_Build 20 57614309 1D GGGGGGAGGT G/- GGGGGGGGGG 1094 hom 19 het 11 0 5 7 G 11 10 335696 CASAVA_Build 20 57614754 1D CTGGATCCCT C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 72 het 32 0 23 9 C 9 8 335697 CASAVA_Build 20 57633203 1D AAGAAGACTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 A 9 8 335698 CASAVA_Build 20 57638729 1D GCCTCCCAGG T/- TCAAGTGATT 2689 het 1841 hom 12 4 8 0 T 2 1 335699 CASAVA_Build 20 57654888 1D CATTGTTGCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 8 7 335700 CASAVA_Build 20 57685347 1D TTTTTTTTTT G/- TTCTTGAATC 3035 het 2946 hom 30 12 12 6 G 1 0 335701 CASAVA_Build 20 57689113 1I TGTTATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 10 10 T 11 12 335702 CASAVA_Build 20 57709419 1I TTTAAAAAAA -/T TTTTTTGGCG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 6 7 335703 CASAVA_Build 20 57719220 8I CCATGGCTTT --------/CCCTCACC CCCTCACCCA 3070 hom 69 het 31 0 24 7 CCCTCACC 1 2 335704 CASAVA_Build 20 57724987 6D ATCCACTGCA CCCGGC/------ CCTCTTCACT 3070 hom 69 het 24 0 24 1 CCCGGC 1 0 335705 CASAVA_Build 20 57727015 1I GATGCTATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 A 12 13 335706 CASAVA_Build 20 57745977 4D TGTGCGTGTA TGTG/---- TGTGCGTGCA 3070 het 3070 hom 58 25 24 11 TG 4 2 335707 CASAVA_Build 20 57794313 1D11M14D4M9D CATCCCCTGC TTCTGCATCCCCTACTTCATTTTGTTTTCCAACGGCCCT/-CCTGCATCCCC--------------TTCC--------- CTGCATCCCC 3070 hom 135 het 40 0 46 5 N/A 0 0 335708 CASAVA_Build 20 57795383 1I CTAATCACTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 459 hom 65 2 55 8 T 9 10 335709 CASAVA_Build 20 57797932 2I TGCAACAGAC --/TG TTGAAATCCC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TG 0 1 335710 CASAVA_Build 20 57800045 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 577 het 577 ref 34 18 4 12 T 13 12 335711 CASAVA_Build 20 57801510 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 435 hom 30 1 22 7 T 10 9 335712 CASAVA_Build 20 57803858 2D GCCTAATATA TT/-- ATCTAGGAGA 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 2 0 335713 CASAVA_Build 20 57807649 1I TTCTGGTCCA -/G AATATGTCCA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 G 0 1 335714 CASAVA_Build 20 57830327 1D GCAGCTGGCA G/- GAAGTTGAGG 3070 hom 39 het 15 0 14 2 G 2 1 335715 CASAVA_Build 20 57843729 1D GGAATTGTCA G/- GGGGGGAGGT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 7 6 335716 CASAVA_Build 20 57847774 1D TGACTCACTT A/- AAAAAAATTA 1863 het 1863 ref 43 34 4 6 A 8 7 335717 CASAVA_Build 20 57857183 2D AAAGGATTTG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 48 het 22 0 16 6 AT 9 8 335718 CASAVA_Build 20 57868220 1D CCATGACCAT G/- GGATTACCTT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 G 3 2 335719 CASAVA_Build 20 57870953 2D TAACATGGAC TA/-- TAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 46 24 19 6 TA 2 1 335720 CASAVA_Build 20 57939943 2D ATGTGAAAAC TT/-- GATTTAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 T 2 0 335721 CASAVA_Build 20 57986029 1I GGGACATCAT -/A TTTTTCAAAT 2959 het 1160 hom 12 3 6 3 A 0 1 335722 CASAVA_Build 20 57988751 1I TGTTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 8 9 T 11 12 335723 CASAVA_Build 20 57991949 1D ACAAAAATCA T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 24 10 10 5 T 7 6 335724 CASAVA_Build 20 58022464 1D GATAAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 11 10 335725 CASAVA_Build 20 58024065 1I TGTGCAGAAA -/C ATTTTTCGTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 335726 CASAVA_Build 20 58056391 1I ATGCAGTCTC -/T TCCCCCAGTG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 1 2 335727 CASAVA_Build 20 58057907 8I CAGGGTTTTC --------/TCTGGGTT TCTGGTCTGT 1998 het 1998 ref 42 17 7 18 TCTGGGTT 0 1 335728 CASAVA_Build 20 58057938 13I AATCCGAAGT -------------/TGCTGGAGGGAGA TGAGCGCAGG 1956 het 1956 ref 35 16 7 13 TGCTGGAGGGAGA 0 1 335729 CASAVA_Build 20 58071015 4I GAGCCACAGC ----/TGAT TGATTATTTT 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 TGAT 1 2 335730 CASAVA_Build 20 58083929 1D AGTGCGCTTC A/- AGGTGAACCC 3070 hom 84 het 34 0 28 7 A 2 1 335731 CASAVA_Build 20 58098449 1D AGTGCTCACT G/- GCCTGATAGA 3070 hom 158 het 62 0 56 6 G 2 1 335732 CASAVA_Build 20 58105190 1D CCTTCCACTG T/- TTTTTTTTTT 1457 het 1457 ref 43 30 5 8 T 12 11 335733 CASAVA_Build 20 58111780 5D CAAAATATTA TCATT/----- TCAACATATC 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 TCATT 1 0 335734 CASAVA_Build 20 58113586 1D CATGCCAGAC T/- TCCTCACCAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 2 1 335735 CASAVA_Build 20 58142835 7D CCTGAGTCAA TTTCTTT/------- TTTCTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 27 6 TTTCTTT 3 2 335736 CASAVA_Build 20 58143511 1I CTTGTGTGAA -/C CCTGAAAGAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 2 3 335737 CASAVA_Build 20 58145140 1I ACCTACTTCC -/T TAATGGACCT 3070 hom 132 het 51 0 43 8 T 1 2 335738 CASAVA_Build 20 58167140 1D TTTACCAACT G/- GCAACAACTA 3070 hom 129 het 48 0 44 5 G 2 1 335739 CASAVA_Build 20 58169399 1D TGGAAGTCAA T/- TTTCAGAACA 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 4 3 335740 CASAVA_Build 20 58193575 6D GCTGTGGCTG TGGCTC/------ TGGCTCCACA 3070 het 2450 hom 28 11 12 7 TGGCTC 2 1 335741 CASAVA_Build 20 58193751 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAACG 2442 het 2442 ref 16 8 5 4 A 9 8 335742 CASAVA_Build 20 58203875 1D GCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 11 10 335743 CASAVA_Build 20 58220850 1I CCGTTCTTCC -/T AGGCGTCCCT 3070 hom 96 het 39 0 30 9 T 0 1 335744 CASAVA_Build 20 58225220 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 22 0 16 6 T 12 11 335745 CASAVA_Build 20 58226168 1I CAATGACAAG -/A AAAAAAGTCT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 6 7 335746 CASAVA_Build 20 58228215 1I TTATGTAACC -/A GTGTCAGCCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 0 1 335747 CASAVA_Build 20 58229192 1D TCTTCTCCTC T/- TCCCCCTAGT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 T 2 1 335748 CASAVA_Build 20 58233967 1D TGCTGAAAGG A/- AGGAGGATCT 3070 het 3070 ref 45 23 15 8 A 2 1 335749 CASAVA_Build 20 58257770 12I GAAAGCAATC ------------/CAGGAAGCAAGG GAGGGGACAT 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 CAGGAAGCAAGG 0 1 335750 CASAVA_Build 20 58264766 3I GATGCCAGCT ---/ATG ATGATGAAGC 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 ATG 2 3 335751 CASAVA_Build 20 58279492 1D TATAAAAGAA C/- TAACATATTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 C 1 0 335752 CASAVA_Build 20 58295259 1D AATCAAAAGG A/- AAAACCCAAC 3070 het 3070 ref 39 20 19 1 A 5 4 335753 CASAVA_Build 20 58388094 1D AAAAAACATT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 2187 hom 31 10 12 9 G 10 9 335754 CASAVA_Build 20 58390280 1D AACCTAGCTT A/- AAAAACCTAG 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 6 5 335755 CASAVA_Build 20 58394048 4I TAATAATAAT ----/AAAC AACTTATCAC 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 AAAC 0 1 335756 CASAVA_Build 20 58397171 5D ATAAACAAGA GAAAT/----- GAAATGAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 19 8 GAAAT 2 1 335757 CASAVA_Build 20 58407950 7D AATGCCTGCA CGTATGT/------- AATGGAAAGC 3070 het 3070 ref 33 16 13 6 CGTATGT 1 0 335758 CASAVA_Build 20 58432523 1D TGGCCGAGGG T/- TTTTTTTTTT 1309 het 1072 hom 19 7 6 6 T 13 12 335759 CASAVA_Build 20 58439865 1D ACAAATGGAG T/- TTTAACCAGA 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 T 4 3 335760 CASAVA_Build 20 58475154 1D ATGAATTATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 15 16 13 T 10 9 335761 CASAVA_Build 20 58479969 4I ACTTTTTTAT ----/ATCA ATCAAATGGT 3070 het 3070 ref 57 24 27 6 ATCA 1 2 335762 CASAVA_Build 20 58481925 1D CACCACGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 15 9 A 13 12 335763 CASAVA_Build 20 58484724 1D ACCAACATTG T/- TTTTGCGGGA 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 T 5 4 335764 CASAVA_Build 20 58512266 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2087 het 307 hom 14 2 6 6 T 10 11 335765 CASAVA_Build 20 58520199 1D AACTGATGCC T/- TTTGTCCTTT 3070 hom 102 het 41 0 34 8 T 4 3 335766 CASAVA_Build 20 58524510 3D GTACTATAAT GTA/--- GTACATATTT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 GTA 2 1 335767 CASAVA_Build 20 58539433 6D TGAATAATGT CCCCAG/------ CCCCATACTG 3070 hom 102 het 37 0 35 4 CCCCAG 1 0 335768 CASAVA_Build 20 58544974 1I ACTTAAAAAA -/C CAAGTGCAGG 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 C 1 2 335769 CASAVA_Build 20 58546261 4D AATTCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1660 het 600 hom 25 8 6 13 A 16 12 335770 CASAVA_Build 20 58546686 1D CAAAACTAAT A/- TACCTCATTA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 1 0 335771 CASAVA_Build 20 58553962 1D GTGAATAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2308 hom 31 8 14 10 T 11 10 335772 CASAVA_Build 20 58554686 1D TTCTTCAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 T 10 9 335773 CASAVA_Build 20 58558440 1D AGCCAGGCTT G/- TGTCCTCCCC 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 G 1 0 335774 CASAVA_Build 20 58577815 2I GAGCGTCCTG --/GT GTGTGTGTGA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 GT 4 5 335775 CASAVA_Build 20 58592655 4D CTTATAAATA ATTG/---- ATTGTATTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ATTG 2 1 335776 CASAVA_Build 20 58593907 1D CATCTCTGTA C/- CCCCCAACCA 3070 hom 84 het 33 0 27 7 C 6 5 335777 CASAVA_Build 20 58596256 1I AGCAAGCACA -/T TTTTTTCCCC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 6 7 335778 CASAVA_Build 20 58633931 16D TACTTGCTTT GTTTGTTTGTTTTTTG/---------------- GTTTGTTTGT 2429 hom 18 het 13 0 7 6 GTTTGTTTGTTTTTTG 2 1 335779 CASAVA_Build 20 58694719 1I AACGACAAGC -/A AAAAAAAAAA 1262 het 1262 ref 43 32 4 7 A 13 14 335780 CASAVA_Build 20 58705578 1I TCAAATGGTT -/G GGGGCCTTAG 3070 hom 67 het 25 0 21 4 G 4 5 335781 CASAVA_Build 20 58709701 3I TGAAAAAATG ---/TGC TGCATTAGTA 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 TGC 1 2 335782 CASAVA_Build 20 58710050 1D TGGAATGCAG A/- GTAGTTAATG 3070 het 3070 hom 40 14 20 7 A 1 0 335783 CASAVA_Build 20 58723431 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 13 13 12 TG 6 7 335784 CASAVA_Build 20 58724166 2D AAACTGTAAC AA/-- GAGAACAGAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 2 0 335785 CASAVA_Build 20 58725151 8D ACGGGTATCT CTTACATC/-------- CTTACATCCT 3070 het 3070 hom 46 19 22 9 CTTACATC 3 2 335786 CASAVA_Build 20 58733758 1I TTCTCTACTC -/T TTTTTCTATC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 5 6 335787 CASAVA_Build 20 58734367 1I CCTCTCATTA -/C ATGCCCCAAT 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 C 0 1 335788 CASAVA_Build 20 58734560 1D TCACCCTCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 10 9 335789 CASAVA_Build 20 58734657 1I ATCACTCACC -/T GACACAGTGC 3070 het 3070 hom 44 15 27 2 T 0 1 335790 CASAVA_Build 20 58734822 4D AGAACAGAAG TAAA/---- TAAATAAAGT 3070 het 3070 ref 46 19 19 10 TAAA 3 2 335791 CASAVA_Build 20 58735859 1I TGTCATAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 T 9 10 335792 CASAVA_Build 20 58737705 1D CTACATGGAG T/- TGCCCAATTG 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 T 2 1 335793 CASAVA_Build 20 58738726 1D TCTGGCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 12 11 335794 CASAVA_Build 20 58743100 1I CTGGTACATT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 7 8 335795 CASAVA_Build 20 58743329 2I63M1D CTATGTGCAC --GTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCCTGTGTGTGTAAAACCTCCATCTCCATCCCAGGCCTTAACCA/GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCCTGTGTGTGTAAAACCTCCATCTCCATCCCAGGCCTTAACC- CCCCCCCCTC 3070 het 3070 ref 45 38 16 13 N/A 0 0 335796 CASAVA_Build 20 58743702 2D TGTCTTTAGA AC/-- TGCTGATTAT 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 AC 1 0 335797 CASAVA_Build 20 58745486 2I TTATTCATCC --/TA TGTGTTGATG 3070 het 3070 ref 43 25 17 1 TA 0 1 335798 CASAVA_Build 20 58746422 1I GTTCTTAATC -/T TAATGAAGTC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 335799 CASAVA_Build 20 58746740 2I ATAACCTAAC --/TG AGATATTTAG 3070 het 3070 ref 50 28 20 2 TG 0 1 335800 CASAVA_Build 20 58747482 1D TGTTTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 A 11 10 335801 CASAVA_Build 20 58748408 11D AGTCTCTGTC AACCTACTACT/----------- AACCTACTAC 3070 het 3070 hom 33 12 17 9 AACCTACTACT 2 1 335802 CASAVA_Build 20 58748893 1I TTATTATCTG -/T TTTTTTTTTT 2065 het 2065 ref 31 16 6 9 T 11 12 335803 CASAVA_Build 20 58753958 1I TATAGTTGGA -/C ATTCTCAGTC 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 C 0 1 335804 CASAVA_Build 20 58763249 2D ATTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 901 hom 15 2 12 2 A 14 12 335805 CASAVA_Build 20 58764442 1I ACACTGCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 774 hom 30 2 24 4 T 11 12 335806 CASAVA_Build 20 58766624 1I GGTTTTTTGG -/T ATTAAGTTGT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 0 1 335807 CASAVA_Build 20 58770042 6D CCAGTTAGCA GTATTG/------ GTTGGAAACA 3070 het 3070 hom 40 13 21 10 GTATTG 1 0 335808 CASAVA_Build 20 58772663 6I19M2I40M12D GGTATGCACA ------TACACACACGTACACACAT--TCACACACACCTATATATACATTCACACTTACATGCACACTCACACCTATAT/CTCTATCACACACACCTATACACATTCTCTCACACACCTGTACACACATTCACACTCGCATATACAC------------ ACATCCACAC 1091 het 1091 ref 93 123 3 5 N/A 0 0 335809 CASAVA_Build 20 58772793 6D19M12I TTCACACACT CATGCACACTCACACCTATACACAT------------/------CACACACACCTACACACATTTGCACTTAATG CCACACACAC 3070 het 3070 ref 46 36 15 12 N/A 0 0 335810 CASAVA_Build 20 58774784 1I ATTAAAACCG -/A AGAGAATCAG 3070 het 3070 hom 54 23 25 6 A 1 2 335811 CASAVA_Build 20 58778032 4I TGGGCATTGG ----/TGTC TGTCATTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 TGTC 1 2 335812 CASAVA_Build 20 58782239 1I GTTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 9 10 335813 CASAVA_Build 20 58845065 7D ATACCCATAA TCCATTT/------- TCCATTTTCC 3070 het 3070 ref 34 18 15 3 TCCATTT 2 1 335814 CASAVA_Build 20 58849101 6D TTTCCTGGAT CTCCAG/------ CTTGCAAAGG 3070 het 3070 ref 58 29 24 7 CTCCAG 1 0 335815 CASAVA_Build 20 58850769 1I GGGATCCTGA -/G GTTCCTAAGT 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 G 1 2 335816 CASAVA_Build 20 58852148 1D GGCAGGAGCA G/- GGGGCAGGCA 3070 het 3070 hom 38 13 16 10 G 5 4 335817 CASAVA_Build 20 58853524 1I ATTCTGGGTG -/T TATTAGTCTG 3070 het 3070 ref 52 29 16 7 T 1 2 335818 CASAVA_Build 20 58861827 5D TCCCCTTCCT GTGTC/----- GTGTCCGTGT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 GTGTC 2 1 335819 CASAVA_Build 20 58867856 10I TGAACACAAA ----------/GGAGTCTGTG GGTAACAGCA 3070 hom 109 het 40 0 35 5 GGAGTCTGTG 0 1 335820 CASAVA_Build 20 58889530 1I CACAGAGAGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 7 8 335821 CASAVA_Build 20 58890312 1I TTTGAGCGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 T 11 12 335822 CASAVA_Build 20 58921259 1D GATTCCATCT A/- AAAAAAAAAG 1792 het 1792 ref 38 31 4 4 A 10 9 335823 CASAVA_Build 20 58959443 2D CTGTGTCTTG CA/-- CACACACAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CA 5 4 335824 CASAVA_Build 20 58975629 1I GCAATTTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 746 hom 25 2 21 2 A 11 12 335825 CASAVA_Build 20 58987934 1D ATGATGCATT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 96 het 33 0 33 2 A 8 7 335826 CASAVA_Build 20 59027738 11D CCATGTGTGG TCAAAGGAACC/----------- TACACATATG 3070 hom 156 het 54 0 52 3 TCAAAGGAACC 1 0 335827 CASAVA_Build 20 59037663 1I GAGACTGGGT -/A ATTATAAAGA 3070 hom 19 het 9 0 7 2 A 1 2 335828 CASAVA_Build 20 59038977 1I TGTTGAAGAC -/A AAGTGACTGT 3070 hom 135 het 53 0 45 8 A 2 3 335829 CASAVA_Build 20 59039611 6D GGCTTCAGGA CCCTGG/------ CCCTGGCCCT 3070 hom 90 het 35 0 26 11 CCCTGG 4 3 335830 CASAVA_Build 20 59040015 1D CCCCACCCCG C/- CCCCCCAGCA 3070 hom 35 het 14 0 11 3 C 7 6 335831 CASAVA_Build 20 59042440 4I CAAAGGTAGT ----/TTTA TTTCTTTCTT 3070 hom 117 het 46 0 39 8 TTTA 0 1 335832 CASAVA_Build 20 59050388 2I GGAACCCCCT --/AC ACACACACAC 3070 het 91 hom 50 2 42 6 AC 6 7 335833 CASAVA_Build 20 59056892 1D TATGGAGAGC T/- TTCTCAACTT 3070 het 3070 hom 35 17 17 2 T 3 2 335834 CASAVA_Build 20 59066838 1D TTGAGAATGC A/- AAAAAATAAT 3070 hom 57 het 21 0 19 3 A 7 6 335835 CASAVA_Build 20 59067160 2I GGGTGTCATC --/TG TGTTTCCCCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TG 1 2 335836 CASAVA_Build 20 59072197 1I CAGGCATGAG -/C CACCGCACCC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 2 335837 CASAVA_Build 20 59075952 1D GCTCCCTGCA C/- CCACACCCCT 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 C 3 2 335838 CASAVA_Build 20 59097675 6D GTAGATAGAA ATAGAT/------ ATAGATATAG 3070 het 808 hom 41 7 15 21 ATAGAT 4 3 335839 CASAVA_Build 20 59105149 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1979 hom 16 het 38 0 10 28 T 17 16 335840 CASAVA_Build 20 59109797 7I AGACCCCAAG -------/AGAGGGC AGAGGGCAGA 3070 het 3070 hom 43 13 17 13 AGAGGGC 1 2 335841 CASAVA_Build 20 59116873 6D CCCAGTGCGG ATCAAT/------ ATCAATCCCA 3070 hom 89 het 32 0 24 8 ATCAAT 2 1 335842 CASAVA_Build 20 59129696 5D3M4I AGTGACAGCC CTGGGTGA----/-----TGACACT TTCCAAACAG 3070 hom 83 het 30 0 26 5 N/A 0 0 335843 CASAVA_Build 20 59130683 1I TGTGTTACAT -/C CGGAGGCTCT 3070 hom 117 het 42 0 37 5 C 1 2 335844 CASAVA_Build 20 59135747 1D TGAAATTAAG T/- TTTAAAATAG 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 T 4 3 335845 CASAVA_Build 20 59138948 4D ATGTCAATAC TTTG/---- TTTGTCCTGA 3070 hom 95 het 34 0 30 5 TTTG 2 1 335846 CASAVA_Build 20 59177962 4D CAAAAAATAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AAAT 5 4 335847 CASAVA_Build 20 59178714 4I AGTGCAAGGA ----/CTCT TCACTAAAGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CT 0 2 335848 CASAVA_Build 20 59179512 1D TGGTCTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2161 hom 32 10 12 11 A 12 11 335849 CASAVA_Build 20 59194658 1I CTGTTTCAGG -/T TTTTCTGGAA 3070 het 3070 ref 51 27 23 1 T 4 5 335850 CASAVA_Build 20 59197532 1I TTTTTTATAG -/T TTTTTTTAAC 2813 het 2813 ref 21 10 6 5 T 7 8 335851 CASAVA_Build 20 59198188 1D CTATGTTGCA T/- TTTTTTTTTT 2838 het 1886 hom 40 13 10 17 T 17 16 335852 CASAVA_Build 20 59199073 11D GGGGAGTCAC GGAAAGAAAAG/----------- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 20 6 GGAAAGAAAAG 1 0 335853 CASAVA_Build 20 59199278 1I GGCTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2156 hom 39 10 13 16 T 13 14 335854 CASAVA_Build 20 59224135 2D TCATTATGTT AA/-- GTTTGATCAT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 A 2 0 335855 CASAVA_Build 20 59290997 2D GGTGTGTGTG CA/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 39 0 36 4 CA 1 0 335856 CASAVA_Build 20 59296653 1I ATTTTCCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 391 hom 44 1 37 6 A 9 10 335857 CASAVA_Build 20 59297425 1I TTAGGGAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 9 335858 CASAVA_Build 20 59300143 7I GTTTCCAGTC -------/TGCTGTG TGACCCTATC 3070 hom 105 het 37 0 32 5 TGCTGTG 0 1 335859 CASAVA_Build 20 59306836 1I GGGCTGAGGA -/C CCCACCACTC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 C 3 4 335860 CASAVA_Build 20 59307265 1D GGTGAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 11 10 335861 CASAVA_Build 20 59311913 1D GCTCTTGCCA T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 79 het 39 0 21 19 T 7 6 335862 CASAVA_Build 20 59312715 2I GTGGACGGCA --/CC CCCCCCCAAC 3070 hom 38 het 18 0 11 7 C 7 9 335863 CASAVA_Build 20 59314798 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 10 9 335864 CASAVA_Build 20 59315573 3D CTGCTGCCTT AGG/--- AGGAATTCCT 3070 hom 131 het 48 0 40 10 AGG 2 1 335865 CASAVA_Build 20 59318245 1I GCCCTGTCTA -/T AGTGGTGAAC 3070 hom 154 het 57 0 52 5 T 0 1 335866 CASAVA_Build 20 59328237 2D CATCTCAATT AA/-- AAAAAAAAAA 1890 het 1710 hom 23 9 7 8 A 14 12 335867 CASAVA_Build 20 59329914 1I TGTTAAGTTT -/C TCCTTAAAAC 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 C 0 1 335868 CASAVA_Build 20 59333674 1I TGGTCACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1919 hom 26 7 13 6 A 14 15 335869 CASAVA_Build 20 59337893 1I TCCTCATGGT -/C CCCCCGTGGG 3070 hom 180 het 94 1 70 24 C 5 6 335870 CASAVA_Build 20 59338127 1I TTGTCACTTT -/A AAAAAAAAAA 2609 het 99 hom 19 1 7 11 A 10 11 335871 CASAVA_Build 20 59338347 9I CCTCCCTGTG ---------/TCCATCTGT AGTCATTATT 2302 hom 18 het 7 0 7 0 TCCATCTGT 0 1 335872 CASAVA_Build 20 59341716 4D ACACACATGT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 AC 11 9 335873 CASAVA_Build 20 59347826 1D TGTGACACTT C/- CTGGAGATCT 3070 het 3070 ref 66 33 30 3 C 2 1 335874 CASAVA_Build 20 59347910 2D ATGTGCGTGC AT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 67 32 30 5 AT 1 0 335875 CASAVA_Build 20 59354733 2I GACGGCCCCA --/GG GGGGCCATGA 2162 het 2162 ref 36 14 8 14 G 4 6 335876 CASAVA_Build 20 59356358 4D AAAGTCTGAT AGTC/---- AGAGGGAATA 3070 het 3070 ref 38 26 8 4 AGTC 1 0 335877 CASAVA_Build 20 59359165 2D CAGGCAGAGG CC/-- CCCCCCCAGT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 C 9 7 335878 CASAVA_Build 20 59359318 1I GCATGCTGCC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 41 0 30 11 T 8 9 335879 CASAVA_Build 20 59359693 1I CATGGACAGA -/C TTTTTTCTTG 3070 hom 138 het 48 0 45 3 C 0 1 335880 CASAVA_Build 20 59360176 1D TTTATTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 12 11 335881 CASAVA_Build 20 59361736 2D GGTGCCAGGG TC/-- TCTGGAACCA 3070 hom 74 het 28 0 21 7 TC 2 1 335882 CASAVA_Build 20 59368554 2D CCTGTGAGAC AG/-- AGTCTGCATG 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 AG 2 1 335883 CASAVA_Build 20 59375697 2D TAACACACCT GA/-- GAGTGTCTTC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 GA 2 1 335884 CASAVA_Build 20 59384022 18D GATGGTGGCG CTGGTGGTGGTCATAGCA/------------------ CTGGTGGTGG 3070 het 3070 ref 76 31 17 37 CTGGTGGTGGTCATAGCA 2 1 335885 CASAVA_Build 20 59388445 2I CAGACTTTTT --/TA TTACAAAGAC 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 TA 0 1 335886 CASAVA_Build 20 59390372 1I CTAAAAATAC -/A AAAAGATTAG 3070 het 470 hom 15 1 11 3 A 4 5 335887 CASAVA_Build 20 59390550 1I AAAAATAATT -/A AAAATAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 4 5 335888 CASAVA_Build 20 59391328 1D TCTGCAAAGA C/- CCATTTTTCC 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 C 3 2 335889 CASAVA_Build 20 59393231 1I TTCTTTTTTT -/A ATACTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 1 2 335890 CASAVA_Build 20 59393619 1I AGTACTCCTA -/C CCCTCTGCTC 3070 het 3070 hom 51 14 20 17 C 3 4 335891 CASAVA_Build 20 59393914 3D CCGCCCCCCG CCC/--- CCTTGGATTG 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 C 5 2 335892 CASAVA_Build 20 59394955 2D CTGTAAGCTC TT/-- TCCTTCTGGT 3070 het 3070 ref 38 19 12 8 T 3 1 335893 CASAVA_Build 20 59395629 10D TATGACACAC ACACACACAG/---------- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 33 14 14 7 ACACACACAG 1 0 335894 CASAVA_Build 20 59396893 2D CCAGAAGTGG TC/-- TCATGTCATA 3070 het 1346 hom 24 6 9 10 TC 2 1 335895 CASAVA_Build 20 59398179 1I GGGTGGGGGC -/T TGGGGGTGCT 2989 het 2989 ref 24 14 9 1 T 1 2 335896 CASAVA_Build 20 59399995 3D TGTCTAAACA GAG/--- GAGGCTCCTT 3070 het 3070 hom 63 23 28 15 GAG 2 1 335897 CASAVA_Build 20 59401360 1I CATAAAGTCT -/C CCCGATCAGG 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 C 3 4 335898 CASAVA_Build 20 59407110 1D TCATCCACCT C/- ACTCCATGTC 3070 het 3070 hom 51 20 27 6 C 1 0 335899 CASAVA_Build 20 59409844 1I TTTTTTGTCA -/T GACAAAAAGA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 T 0 1 335900 CASAVA_Build 20 59417188 1I AACACCATGG -/A AATCACATGA 3070 hom 84 het 36 0 25 11 A 2 3 335901 CASAVA_Build 20 59424460 1D CTCTCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1683 hom 26 het 21 0 7 14 T 17 16 335902 CASAVA_Build 20 59435950 1I ACTGAGAGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 18 22 5 T 9 10 335903 CASAVA_Build 20 59441959 1D CTTGTCATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 A 12 11 335904 CASAVA_Build 20 59444326 8D CATCCTGTTG GCCCATGT/-------- GCTGGGGAGG 3070 het 3070 ref 39 22 13 6 GCCCATGT 1 0 335905 CASAVA_Build 20 59452502 8D TGTGGATATC TCTGGTTG/-------- TCTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 61 37 23 8 TCTGGTTG 1 0 335906 CASAVA_Build 20 59452741 10D TATGTATGTG TGGGTTTCTT/---------- TGTGTATGTA 3070 het 3070 ref 38 27 9 4 TGGGTTTCTT 1 0 335907 CASAVA_Build 20 59467646 2D GTGTGGCCAT CC/-- CCTTCTCCAG 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 C 4 2 335908 CASAVA_Build 20 59471040 19I ATTGCTCCTG -------------------/AGCAGACCTGGGTGCCGAA AGCCTCCCTC 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 AGCAGACCTGGGTGCCGAA 0 1 335909 CASAVA_Build 20 59476816 2D GGTTAAATTC TT/-- TCTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 T 3 1 335910 CASAVA_Build 20 59478859 4D ACTTCACTGA ATTT/---- ATTTATCTGT 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 ATTT 2 1 335911 CASAVA_Build 20 59479950 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 8 9 335912 CASAVA_Build 20 59485794 1D GGGGTTAGGC G/- TGGAAACGAG 3070 het 3070 ref 54 27 19 8 G 1 0 335913 CASAVA_Build 20 59486866 1I GAGCGTGACG -/T TAAGTTTGGA 3070 het 3070 ref 51 29 17 5 T 1 2 335914 CASAVA_Build 20 59495177 1I CTCACCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2569 het 2569 ref 30 18 9 3 A 10 11 335915 CASAVA_Build 20 59515661 1D CTTCCCCAAA G/- GTAGTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 G 2 1 335916 CASAVA_Build 20 59538488 4D TTTGTTTGTG TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 TGTT 3 2 335917 CASAVA_Build 20 59554413 4D GTGTGTGTTC GTGT/---- GTGTGTGTGT 304 het 304 ref 53 37 2 16 GT 10 8 335918 CASAVA_Build 20 59577410 9I AGTAGGTCCT ---------/CGCTCAAGA CGCTCAAGAC 3070 het 3070 hom 48 14 21 13 CGCTCAAGA 1 2 335919 CASAVA_Build 20 59589091 1D TTGACGCTCT A/- GGGGGGGAAA 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 A 1 0 335920 CASAVA_Build 20 59593321 3D CTGCACACTT GTC/--- GTCTGCAGGT 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 GTC 2 1 335921 CASAVA_Build 20 59599328 2I CTAAATCTAT --/GC GGGGGGGGGG 126 het 126 ref 22 3 2 17 GC 0 1 335922 CASAVA_Build 20 59600356 2D GCCATGGCAG AC/-- ACAAACTTTC 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 AC 2 1 335923 CASAVA_Build 20 59600946 2I GACTTGGAAA --/GT GTACAATTTA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 GT 1 2 335924 CASAVA_Build 20 59613372 1D CTGGAAGGAC A/- GGTTCCTGCT 3070 het 3070 hom 57 21 27 10 A 1 0 335925 CASAVA_Build 20 59623582 1D GTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2461 hom 28 8 14 6 T 10 9 335926 CASAVA_Build 20 59637844 1D GAAATGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2762 hom 24 8 12 4 A 11 10 335927 CASAVA_Build 20 59642948 1I AAGCAACAAT -/G CCCAGAGGCT 3070 het 1593 hom 21 8 10 3 G 0 1 335928 CASAVA_Build 20 59660797 1D CCCTACATAC T/- AAATAGCACG 3070 het 3070 ref 49 23 19 9 T 1 0 335929 CASAVA_Build 20 59663348 36D GACCCAGCCC CGCTCTGGACAGGGACACGGGGGCCTGAGCCAGCCT/------------------------------------ CGCTCTGGAC 2412 het 2412 ref 27 11 8 14 CGCTCTGGACAGGGACACGGGGGCCTGAGCCAGCCT 1 0 335930 CASAVA_Build 20 59686325 7D GATAGATGAT GGATAGA/------- TGATGGATGA 1729 het 134 hom 33 2 7 26 GGATAGA 1 0 335931 CASAVA_Build 20 59707977 1D TTCTGGCTCT C/- CGAGTTGTTG 3070 hom 107 het 41 0 30 12 C 2 1 335932 CASAVA_Build 20 59708203 1I GCCTGCTGCT -/G GGGGGCTTTC 3070 hom 35 het 21 0 11 10 G 5 6 335933 CASAVA_Build 20 59722912 1I GATACAAGTG -/T TTTTTGGTGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 5 6 335934 CASAVA_Build 20 59725896 7D TCGTGGGGTT TTTTTGG/------- TTTTTGGTTT 3070 het 904 hom 25 5 11 15 TTTTTGG 3 2 335935 CASAVA_Build 20 59727642 1I TAATCAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 36 1 33 2 T 11 12 335936 CASAVA_Build 20 59729077 15I GGGGTGCAGA ---------------/GTGCATGGGTGCAGG GTGCCATTCC 3070 hom 99 het 38 0 31 7 GTGCATGGGTGCAGG 0 1 335937 CASAVA_Build 20 59730646 1I TGCTTTGGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 8 9 335938 CASAVA_Build 20 59736613 1D AGCCATAGAA C/- CTGGCCTCTC 3070 hom 135 het 51 0 45 7 C 2 1 335939 CASAVA_Build 20 59737567 4D GAGCGCTGAC TGCA/---- GCGTGTTTTG 3070 hom 105 het 39 0 34 5 TGCA 1 0 335940 CASAVA_Build 20 59737819 1D ACTTTTGTGT A/- AATACCTGCC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 3 2 335941 CASAVA_Build 20 59752961 1D AGGAAAGGGA G/- GGGAGAGGAA 3070 hom 52 het 24 0 17 10 G 4 3 335942 CASAVA_Build 20 59756394 1D AGAAATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 946 hom 23 2 18 3 A 11 10 335943 CASAVA_Build 20 59768109 1I TTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 T 10 11 335944 CASAVA_Build 20 59780073 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1324 het 177 hom 18 2 7 9 A 17 18 335945 CASAVA_Build 20 59783139 1D CCCCACCCCT C/- CCACAGGCCC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 3 2 335946 CASAVA_Build 20 59785599 3D CACCTACTTA CTT/--- CTTCTCTAAG 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 CTT 2 1 335947 CASAVA_Build 20 59789702 4I CATGTCAAAA ----/AGAG AGAGAGAAAA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 AG 3 5 335948 CASAVA_Build 20 59799528 1I TTCAAAACGC -/T TTAAGGCCTT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 2 3 335949 CASAVA_Build 20 59826469 1D CTGCACTTTC T/- TTTTTTTTTT 1197 het 1197 ref 20 9 5 6 T 12 11 335950 CASAVA_Build 20 59847311 1D AAGGAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 46 het 26 0 17 10 A 10 9 335951 CASAVA_Build 20 59856787 2D GCCAGTGCGC AG/-- ACACTTTTGC 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 AG 1 0 335952 CASAVA_Build 20 59872403 5D CTTGGGCGGG TGGAC/----- TGGAGCCCTG 3070 hom 87 het 32 0 28 5 TGGAC 1 0 335953 CASAVA_Build 20 59872947 1I ACACATTGCT -/G GGGAGAGGGC 3070 hom 146 het 57 0 44 13 G 3 4 335954 CASAVA_Build 20 59893132 5D AAGGGCTGAG CACCT/----- CACCTCGGGG 1447 het 1447 ref 16 9 5 3 CACCT 2 1 335955 CASAVA_Build 20 59898041 30D AATGAGTTAG TGGATGGATGGATGATGGGTGGATAGATGA/------------------------------ TGGATGGATG 3070 hom 108 het 38 0 26 23 TGGATGGATGGATGATGGGTGGATAGATGA 1 0 335956 CASAVA_Build 20 59898663 3D GATAGATGGA TGT/--- TGGATGGGTG 2415 het 2415 ref 59 16 14 31 TGT 1 0 335957 CASAVA_Build 20 59923055 2D ATCCCTCAGG CC/-- TGGGAGGCTT 3070 hom 77 het 31 0 23 9 C 2 0 335958 CASAVA_Build 20 59927311 2D TGCCCATCCA AT/-- ATACTATTAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 2 1 335959 CASAVA_Build 20 59929287 3D GCATGGAAAC GTG/--- GTGTGATTGC 3070 hom 130 het 50 0 41 9 GTG 2 1 335960 CASAVA_Build 20 59946094 1I CTGCTCCCCA -/C CCCCTCCCGG 2639 hom 48 het 20 0 11 9 C 4 5 335961 CASAVA_Build 20 59946272 1I CAGCCAGCAT -/C CTGGCTCCAG 3070 hom 105 het 37 0 32 5 C 1 2 335962 CASAVA_Build 20 59957283 2D CTGTCTGTAC TG/-- TGGCCTCCCT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 TG 2 1 335963 CASAVA_Build 20 59963703 1I GTAAAGCCTC -/A GGTCACAACA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 0 1 335964 CASAVA_Build 20 59966619 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 25 0 19 6 A 11 10 335965 CASAVA_Build 20 59969960 3D TTTTTTTTTT AAC/--- AACAGGGTCT 3070 hom 86 het 34 0 26 10 AAC 2 1 335966 CASAVA_Build 20 59981744 2I TCATGTTCAC --/AT GAGGCTGCTC 3070 hom 119 het 44 0 38 6 AT 0 1 335967 CASAVA_Build 20 59993568 2D TCTCCGGACC AT/-- GGCAACGCTC 3070 hom 33 het 13 0 11 2 AT 1 0 335968 CASAVA_Build 20 59996720 1D CCACCCGGCC A/- AGCGGGGGAG 3070 hom 103 het 38 0 33 5 A 2 1 335969 CASAVA_Build 20 59997758 7I GAGGAACCAG -------/AGCTCCA GGGAAGCTGC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AGCTCCA 0 1 335970 CASAVA_Build 20 60002558 1D GAAATCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 31 0 22 9 A 12 11 335971 CASAVA_Build 20 60010291 1I CCAGTCCCGC -/A AATCAGCCTT 3070 hom 117 het 42 0 37 5 A 2 3 335972 CASAVA_Build 20 60044030 6D TTACATACTT AAAAGC/------ AAAAGCAAAA 3070 hom 96 het 42 0 33 12 AAAAGC 3 2 335973 CASAVA_Build 20 60045632 1D GAGAAGACAG A/- CTGCCTCCCC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 1 0 335974 CASAVA_Build 20 60048296 2D AAAAGATTTG AA/-- AAGACACCTC 3070 hom 90 het 36 0 31 6 A 4 2 335975 CASAVA_Build 20 60051348 2I CCCCTGAAGA --/CT CTGCAGGGAG 3070 hom 105 het 37 0 34 3 CT 1 2 335976 CASAVA_Build 20 60061778 1D ATGAGGCCGC G/- GGAGCCGGAG 3070 hom 71 het 28 0 17 11 G 3 2 335977 CASAVA_Build 20 60066116 1D AATGGGGCTC G/- GGGGGCCAAC 1619 hom 31 het 13 0 10 3 G 6 5 335978 CASAVA_Build 20 60067439 1D AATGGGGCTC G/- GGGGGCCAAC 3070 hom 72 het 27 0 22 8 G 6 5 335979 CASAVA_Build 20 60092718 1D TTACCATAAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 9 8 335980 CASAVA_Build 20 60094861 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 78 het 34 0 26 8 A 8 7 335981 CASAVA_Build 20 60097771 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 44 het 19 0 14 5 T 10 9 335982 CASAVA_Build 20 60101659 12D ACTATTTTGG CTTGGAGTTTTC/------------ CTTGGAGTTT 3070 hom 69 het 32 0 22 10 CTTGGAGTTTTC 2 1 335983 CASAVA_Build 20 60108105 11D CCATAGAGTG CCCAGCCCCAC/----------- CCCAGCCCCG 3070 hom 69 het 30 0 22 9 CCCAGCCCCAC 1 0 335984 CASAVA_Build 20 60119130 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1845 hom 10 het 6 0 4 2 A 13 14 335985 CASAVA_Build 20 60121599 1I AGTGTGAGAG -/C CCAGCAAGCG 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 C 2 3 335986 CASAVA_Build 20 60133334 1I AGGAATAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 41 1 24 16 T 13 14 335987 CASAVA_Build 20 60144694 3I CCAAGGACCA ---/GAG GAGGACCCAA 3070 hom 111 het 38 0 35 3 GAG 1 2 335988 CASAVA_Build 20 60149073 2I TTTAGCCATT --/TC TGTTTCACCT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TC 0 1 335989 CASAVA_Build 20 60153770 1I CTGAGGCCTA -/G GGGGGGCTAA 3070 hom 123 het 44 0 39 5 G 6 7 335990 CASAVA_Build 20 60192821 1D AAACATACCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 12 11 335991 CASAVA_Build 20 60193894 1I AAAAAATAAA -/T ATATATACAC 190 het 190 ref 11 8 2 1 T 0 1 335992 CASAVA_Build 20 60197756 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2379 hom 29 9 12 10 A 12 11 335993 CASAVA_Build 20 60204811 1I CCCTATCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 803 hom 25 4 17 4 A 13 14 335994 CASAVA_Build 20 60210641 1D CCTGGTGTCT C/- CCTGACTGCA 3070 het 2048 hom 22 7 11 4 C 3 2 335995 CASAVA_Build 20 60233003 1D GAGGTGGATA T/- TGGAGGAAGC 3070 het 3070 hom 34 16 13 6 T 2 1 335996 CASAVA_Build 20 60237673 2I ACACACACTC --/CA CACACTTATC 3070 hom 167 het 64 0 49 15 CA 2 3 335997 CASAVA_Build 20 60237935 2I34M14D ATTCCACACT --CACACTCACACACACTTCTCCAATTCCACACACACACACAGTCACACT/CACACACTCACACACACTTCTCCAATTCCACACACA-------------- CAAACACATA 3070 het 3070 hom 46 15 29 33 N/A 0 0 335998 CASAVA_Build 20 60252315 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 40 het 17 0 13 4 T 8 9 335999 CASAVA_Build 20 60268203 19D AGGAGCCTGG GCACTGGAGCTCGCTGGGA/------------------- GCGCGTTCTT 3070 hom 65 het 21 0 22 3 GCACTGGAGCTCGCTGGGA 1 0 336000 CASAVA_Build 20 60276335 4I TGCATTATTT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 74 het 27 0 25 3 TTTA 3 4 336001 CASAVA_Build 20 60279713 6I CCATGCGCCC ------/TCTCTG TGCCGTCCAG 3070 hom 47 het 19 0 13 6 TCTCTG 0 1 336002 CASAVA_Build 20 60301334 1I CCTTTCCTCA -/T TTTTTTTTTT 2140 het 788 hom 19 2 10 7 T 15 16 336003 CASAVA_Build 20 60301638 1I TTAAAGTGTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 53 het 19 0 18 1 A 8 9 336004 CASAVA_Build 20 60307749 1D50M1I TTAAAATGTT AAAAAAAAAAAAAACCCACAAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGC-/-AAAAAAAAAAAAACCCACAAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCA CTTTGGGAGG 3070 hom 32 het 22 0 20 8 N/A 0 0 336005 CASAVA_Build 20 60317479 4D CTGTCTTGAG ACTC/---- ACTCTCTCCG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ACTC 2 1 336006 CASAVA_Build 20 60334684 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 702 het 121 hom 22 2 6 14 A 13 11 336007 CASAVA_Build 20 60348069 1I CACGCTTCAG -/T TTTTGTTACT 3070 hom 141 het 51 0 47 4 T 4 5 336008 CASAVA_Build 20 60348192 8I AGTAGCAAAA --------/ACAAACAG ACCAAAATCA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 ACAAACAG 0 1 336009 CASAVA_Build 20 60350278 11D CTGATCAACC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2862 het 72 hom 14 1 9 7 A 21 10 336010 CASAVA_Build 20 60381526 6D14M4D TGTCTCTATT TCTCTGTCTCTATCTCTTTGTCTA/------TCTCTATCTCTTTG---- TCTCTCTGTT 3070 het 323 hom 39 4 22 18 N/A 0 0 336011 CASAVA_Build 20 60387390 2I GCTAGGCCCC --/CT GAGAGCCAGT 2706 het 2706 ref 26 14 8 4 CT 0 1 336012 CASAVA_Build 20 60388149 4I AGAAACAGGC ----/CTGT CTGATTCCCA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 CTGT 0 1 336013 CASAVA_Build 20 60390422 3I GCATAATAAC ---/AAT GATGACAATG 3070 het 3070 ref 67 29 25 13 AAT 0 1 336014 CASAVA_Build 20 60390547 12I TGATGGTGAC ------------/GATGATGGTGAT GATGATGGTG 3070 het 3070 hom 84 30 27 27 GATGATGGTGAT 0 1 336015 CASAVA_Build 20 60403759 1I AAGGCTCCTT -/C CCTGACCCAG 3070 het 1972 hom 33 8 15 10 C 2 3 336016 CASAVA_Build 20 60412454 1D CAGCCTAGAC A/- ATATAGTGAG 3070 het 3070 hom 29 14 15 1 A 2 1 336017 CASAVA_Build 20 60460244 2I GGAGAGGAGG --/GA GAGAGAGAGG 1998 hom 15 het 8 0 6 2 GA 4 5 336018 CASAVA_Build 20 60460576 2I AGGGGGAGGA --/AG AGAGAGGGAG 3070 hom 51 het 18 0 15 3 AG 3 4 336019 CASAVA_Build 20 60469944 1I ACACATCCCT -/A AAAAATGGAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 5 6 336020 CASAVA_Build 20 60472068 1D AATGACCGGA C/- CCGCTCCTGA 3070 hom 74 het 33 0 24 9 C 3 2 336021 CASAVA_Build 20 60488765 1I TGCCCACATA -/C ACCCCCATCC 2198 hom 17 het 7 0 6 1 C 0 1 336022 CASAVA_Build 20 60505066 1I GCGATGCGCG -/C CCCCTGGTGG 1333 hom 21 het 9 0 7 2 C 4 5 336023 CASAVA_Build 20 60512695 1I TATAGCAGAT -/G GGGAAACAGG 3070 hom 83 het 34 0 27 7 G 3 4 336024 CASAVA_Build 20 60575260 1D TTTTTCCTCC T/- AGTCGTTAAA 2613 het 2613 ref 27 14 8 5 T 1 0 336025 CASAVA_Build 20 60575637 1D CATCCCCTGC T/- CCCCCCCGCA 1952 het 1952 ref 26 10 11 5 T 1 0 336026 CASAVA_Build 20 60576849 2I AAGTAACGTA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 39 11 16 12 GT 6 7 336027 CASAVA_Build 20 60578687 2D ACACGTGCAA AC/-- ACACACACAG 3070 het 3070 ref 71 33 27 12 AC 5 4 336028 CASAVA_Build 20 60579781 1I TTGCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2530 het 1532 hom 20 8 9 3 T 11 12 336029 CASAVA_Build 20 60591087 2I TCTCTTTCTT --/TC TCTTTCTTCT 3070 het 215 hom 19 1 17 1 TC 1 2 336030 CASAVA_Build 20 60591553 1I GTGCGGGGGT -/G GGGGGGGGAT 3070 het 520 hom 16 2 12 2 G 8 9 336031 CASAVA_Build 20 60592783 2D GTCCCTCATG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 66 26 13 27 AC 6 5 336032 CASAVA_Build 20 60615967 3I AGCCCACGGA ---/GAC GTGAGGAGCA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 GAC 0 1 336033 CASAVA_Build 20 60763632 3I GGGTGAACCC ---/TCT GGGGCCCTGA 1293 het 1293 ref 21 10 5 6 TCT 0 1 336034 CASAVA_Build 20 60773356 2D TCATTCCCTC TT/-- TAACAATATT 3070 het 3070 ref 43 19 17 9 T 3 1 336035 CASAVA_Build 20 60780534 1D AGCCGTGAGA G/- GGGGGCACTG 2135 het 2135 ref 28 18 7 3 G 6 5 336036 CASAVA_Build 20 60783687 1I CTTGGGTGAG -/T TTTGGTAGTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 3 4 336037 CASAVA_Build 20 60795745 12D TTCCTACCCT CACAGCACTGAA/------------ CACAGCACTC 3070 het 3070 ref 64 37 25 7 CACAGCACTGAA 1 0 336038 CASAVA_Build 20 60819602 1D ATAGCAGCCC A/- AAAAAACTGG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 7 6 336039 CASAVA_Build 20 60820904 1D TGCTTCCAGT C/- CCTTTTTTTT 1891 het 1891 ref 44 21 10 13 C 3 2 336040 CASAVA_Build 20 60826239 3D ACAAGGTGCA GGG/--- CACCCATCAA 1385 het 1385 ref 25 19 4 3 G 3 0 336041 CASAVA_Build 20 60829904 4I AGGACGAGCC ----/ACGT TTGTGGATGA 3070 het 2461 hom 26 10 11 5 ACGT 0 1 336042 CASAVA_Build 20 60833917 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 1222 het 945 hom 21 10 4 7 A 16 15 336043 CASAVA_Build 20 60864255 1D TGAAGTCGGC T/- TTTCCCGTTG 2644 het 2644 ref 29 12 10 8 T 4 3 336044 CASAVA_Build 20 60867858 2I GTGTAGACAC --/TG TGTCCAGGCT 2226 het 2226 ref 26 11 9 6 TG 1 2 336045 CASAVA_Build 20 60868435 2I AACCGAGAGA --/AC ACAGTCACTG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 AC 1 2 336046 CASAVA_Build 20 60881236 3D CTCGCCCCTG CAA/--- CAACAGCACT 3070 hom 34 het 15 0 11 4 CAA 2 1 336047 CASAVA_Build 20 60883164 2I GGTGAAACCC --/TG TCTCTACCAA 2015 het 1980 hom 15 8 5 2 TG 0 1 336048 CASAVA_Build 20 60890258 2D TTTGTTGCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2367 hom 41 10 16 17 A 12 10 336049 CASAVA_Build 20 60895138 2I TCATGACGAC --/CG CGCCCAGCAT 2562 het 2562 ref 19 10 6 3 CG 1 2 336050 CASAVA_Build 20 60899873 3D GCAAGCACTC TCT/--- TCTTCTTTGC 3070 het 3070 ref 38 13 12 15 TCT 3 2 336051 CASAVA_Build 20 60911891 2I CCCCGGAAAC --/AT AGCATGCCCT 3070 hom 74 het 28 0 19 9 AT 0 1 336052 CASAVA_Build 20 60911973 2D GTGACAACAC AA/-- GAGAGGGAAG 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 A 2 0 336053 CASAVA_Build 20 60924628 3D CCCTTCCCAC CCT/--- CCTCACCACC 2946 het 2822 hom 29 9 10 11 CCT 2 1 336054 CASAVA_Build 20 60934124 11D CGTGTCTGTC AGTCGCCCTTT/----------- CTGGCTCCTG 3070 hom 71 het 25 0 20 7 AGTCGCCCTTT 1 0 336055 CASAVA_Build 20 60935683 3I GGGGTTTTGT ---/TTG TTGTTTTTTT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 TTG 1 2 336056 CASAVA_Build 20 60936450 1I TCTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 9 10 336057 CASAVA_Build 20 60942992 5I TACAAACTCA -----/CATCT CATCTCCAAT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 CATCT 1 2 336058 CASAVA_Build 20 60944078 1D AGATTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 T 11 10 336059 CASAVA_Build 20 60950962 1I ACGCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3017 het 2280 hom 26 8 11 7 A 10 11 336060 CASAVA_Build 20 60953791 1D TAATAGAGAC G/- GGGGTCTCAT 3070 het 1799 hom 18 6 9 3 G 5 4 336061 CASAVA_Build 20 60960754 4D CTGGCAGCCC TAAT/---- AGGGTCCTCC 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 TAAT 1 0 336062 CASAVA_Build 20 60984564 4I TATTTTAAAT ----/TATC TATAATGCTA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 TATC 0 1 336063 CASAVA_Build 20 60986002 1D GTATTAGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 10 9 336064 CASAVA_Build 20 60991170 1I CCCTACAACC -/T GTGCTCACCT 2065 het 2065 ref 20 8 8 4 T 0 1 336065 CASAVA_Build 20 60993560 1D CTATGTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 13 12 336066 CASAVA_Build 20 60994830 1D GTAGAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3033 hom 33 11 15 7 T 12 11 336067 CASAVA_Build 20 60997257 1D TGGCTCTGCT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 A 10 9 336068 CASAVA_Build 20 61001909 1D ACACGCTGCT G/- GGCCCCCTGG 3070 het 2944 hom 34 13 14 8 G 3 2 336069 CASAVA_Build 20 61003342 1D GGGGCATGTT A/- AAATTAGTCC 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 A 4 3 336070 CASAVA_Build 20 61006014 2I TTAAAAATCC --/CT CTCTCTGCAT 3070 het 3070 ref 51 21 23 7 CT 3 4 336071 CASAVA_Build 20 61008508 10D ACATTCCAAA TAACACGGAG/---------- TTCTTTCCAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 TAACACGGAG 1 0 336072 CASAVA_Build 20 61008836 1D CACGTGTGCG C/- CCCCCTACAC 3070 het 3070 hom 64 22 25 19 C 6 5 336073 CASAVA_Build 20 61014227 1D GGTATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1961 hom 43 12 18 13 T 15 14 336074 CASAVA_Build 20 61026075 2I TGAGCCTGCC --/AG AGAGAGATGA 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 AG 3 4 336075 CASAVA_Build 20 61028859 1I GAAGACCCTA -/C CCTGCTGCCT 2598 het 2598 ref 24 9 9 6 C 2 3 336076 CASAVA_Build 20 61030766 1I AGCAATTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 A 9 10 336077 CASAVA_Build 20 61039169 1D CCTGCCGGGA G/- GGTCTCCAGT 3070 het 535 hom 20 4 12 6 G 3 2 336078 CASAVA_Build 20 61040915 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 10 9 336079 CASAVA_Build 20 61047154 1D GGTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1800 hom 31 7 14 11 T 13 12 336080 CASAVA_Build 20 61048185 1D GAGTGTTGAT C/- AGGAGGCGTC 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 C 1 0 336081 CASAVA_Build 20 61066914 1D CCCCTTCCTT G/- GCCTCCCCCT 3070 het 2396 hom 30 9 13 9 G 2 1 336082 CASAVA_Build 20 61068392 1D GGACCTTGCC T/- TACCCCAGCT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 T 2 1 336083 CASAVA_Build 20 61071169 1I AAGGCTAGCT -/C CCCCGTTGCT 2214 het 2214 ref 30 16 7 7 C 4 5 336084 CASAVA_Build 20 61072539 1I AACCCCCTGG -/C CCCCCCAGTC 3039 het 1898 hom 27 11 9 7 C 6 7 336085 CASAVA_Build 20 61077355 1I CCCCTGAGGC -/G GGCAGCTGGA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 G 2 3 336086 CASAVA_Build 20 61086079 2D GGCCGATCCC CT/-- GTTTTCAGCT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 CT 1 0 336087 CASAVA_Build 20 61125098 1I GTGCAGGTGG -/A ACCTCTGTCT 3070 hom 62 het 24 0 18 6 A 1 2 336088 CASAVA_Build 20 61131750 1I GACTCCGCCT -/C CCAGCCGGTG 2681 hom 28 het 13 0 10 3 C 2 3 336089 CASAVA_Build 20 61134822 1D AAGGACACAT C/- CCCCCCGTCT 3070 hom 67 het 30 0 21 9 C 7 6 336090 CASAVA_Build 20 61142183 1D GGTTTAACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1101 hom 46 4 19 23 T 14 13 336091 CASAVA_Build 20 61165300 1D ACACCTGGCT A/- ATTTTTGTAT 3070 het 120 hom 22 2 13 7 A 2 1 336092 CASAVA_Build 20 61178330 1D GCGAGAGCAT G/- GGGAGCAAGA 3070 hom 78 het 31 0 27 5 G 4 3 336093 CASAVA_Build 20 61179671 1D GATCATGTGG T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 108 het 40 0 36 5 T 7 6 336094 CASAVA_Build 20 61180178 1I ACTCTGTCAG -/T TTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 6 7 336095 CASAVA_Build 20 61182088 1D TCAGTGTCTC T/- CCCCCCATCT 3070 het 2059 hom 23 7 12 4 T 1 0 336096 CASAVA_Build 20 61183304 1I CGTGCGAAAC -/A CATGCATGGT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 0 1 336097 CASAVA_Build 20 61183796 1D AGGAATGTGG T/- GCCTGCAGGA 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 1 0 336098 CASAVA_Build 20 61185209 1D CCAGGGCTTC A/- GGGGGTTCCA 2598 het 2598 ref 33 17 9 7 A 1 0 336099 CASAVA_Build 20 61186413 1I GGACCACCAG -/C CCCCCCTTCA 2579 het 2579 ref 30 11 9 10 C 6 7 336100 CASAVA_Build 20 61187882 2I TGTCTGTGTG --/TT TGTGTGTGTG 3070 het 463 hom 46 5 25 16 T 1 3 336101 CASAVA_Build 20 61194098 2I GTGGGGGCAC --/CT CTCTGCAGCA 1571 het 1046 hom 12 4 5 3 CT 2 3 336102 CASAVA_Build 20 61217080 10D CACACACCAC ACACACAGAT/---------- ACACACAGAC 3070 hom 162 het 61 0 53 13 ACACACAGAT 1 0 336103 CASAVA_Build 20 61226081 1I CGAGTGGATG -/A AGACAGGACC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 1 2 336104 CASAVA_Build 20 61241858 1I GGCTATGGCC -/A GGGGCGGGGC 3070 hom 82 het 32 0 25 7 A 0 1 336105 CASAVA_Build 20 61249570 1D TTCTTTTCAG T/- TTGTGGCAGT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 T 3 2 336106 CASAVA_Build 20 61291391 4D CGGGCACACA CAGG/---- CAAACACAAT 3070 het 3070 ref 60 27 24 12 CAGG 1 0 336107 CASAVA_Build 20 61312912 9I TCACACAAAA ---------/CACAGGAAC CACGGTAGCC 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 CACAGGAAC 0 1 336108 CASAVA_Build 20 61341051 1I GGGACCCCCT -/G GGGTGAGGGC 1426 het 1426 ref 17 8 4 5 G 3 4 336109 CASAVA_Build 20 61370030 2I GAGTGTGGGG --/CT CTTTCTGGCT 3070 hom 102 het 37 0 33 4 CT 1 2 336110 CASAVA_Build 20 61370453 4D CCGGCACCTC CTCT/---- CTGTGTCCTC 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 CT 3 1 336111 CASAVA_Build 20 61392659 4I CCAGCCAACA ----/CAGT CAGGCGGGGG 2729 het 2729 ref 22 9 8 5 CAGT 0 1 336112 CASAVA_Build 20 61407177 2I CACACGTGTG --/CC CACCTTGGCC 2149 het 2149 ref 26 12 10 4 C 1 3 336113 CASAVA_Build 20 61418815 1I ATGGGCCAAA -/T CTGCCAGTAG 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 0 1 336114 CASAVA_Build 20 61418918 2D TTTACAGAGA AC/-- AGTTGTTCAT 3070 het 3070 ref 35 22 9 4 AC 1 0 336115 CASAVA_Build 20 61420189 2D CAATTCTATC AG/-- GGGCCCGAGA 3070 het 3015 hom 22 9 9 4 AG 1 0 336116 CASAVA_Build 20 61421772 1D TGGCCTGGCC T/- TGGGGGCTCA 1444 hom 30 het 15 0 6 10 T 2 1 336117 CASAVA_Build 20 61422484 3D TCCTCAGTGA CTC/--- CTCTGTATAC 3070 hom 58 het 22 0 17 7 CTC 2 1 336118 CASAVA_Build 20 61427932 1I CCTGCCTGGA -/C CCCCTGGCCC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 4 5 336119 CASAVA_Build 20 61431207 2D AGGAGGCGCC TG/-- TGTGGAGCAC 3070 het 1504 hom 27 4 12 11 TG 3 2 336120 CASAVA_Build 20 61435541 2D GTCCACCCAC AG/-- AGGATGGCTC 2385 het 2176 hom 28 12 11 6 AG 2 1 336121 CASAVA_Build 20 61442755 1D TGAGACAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 A 10 9 336122 CASAVA_Build 20 61445374 2I CCGGAGGCCA --/AT GCCATTGAGA 2528 het 1982 hom 18 6 6 6 AT 0 1 336123 CASAVA_Build 20 61446079 1D GTGCTTAAGT C/- AGAGCCACAG 3070 het 3070 hom 46 19 20 8 C 1 0 336124 CASAVA_Build 20 61459085 16D TATCTCCCCA CAGGACCTCATCCCCT/---------------- CAGGACCTCA 2798 het 2798 ref 41 21 10 14 CAGGACCTCATCCCCT 1 0 336125 CASAVA_Build 20 61459461 1D CTGGTGGGAC G/- GGCAGAGTGG 3070 hom 88 het 34 0 28 6 G 3 2 336126 CASAVA_Build 20 61460743 1I TGGTTCCTAT -/C CCTGCCTTGG 3070 hom 50 het 18 0 17 1 C 2 3 336127 CASAVA_Build 20 61460842 2I6M1D CACCAGAAAG --AACATAT/GAAACATA- CTTCAGACAA 1294 hom 15 het 7 0 5 2 N/A 0 0 336128 CASAVA_Build 20 61464117 1I CCTCCCATCG -/C CTCTCCCATC 2206 het 1314 hom 21 6 8 7 C 1 2 336129 CASAVA_Build 20 61469575 5D GCAGCGAGCT CTGGG/----- CAGGCATCGG 1584 het 1584 ref 19 6 6 8 CTGGG 1 0 336130 CASAVA_Build 20 61471297 2D ATGCACAAAC AG/-- GGTGTGTGCA 3070 het 3070 hom 78 35 33 10 AG 1 0 336131 CASAVA_Build 20 61474674 1D AGATGCTGAG C/- CCCCCCCCGC 2307 het 1486 hom 21 7 8 7 C 9 8 336132 CASAVA_Build 20 61491415 1D GTTAACATCA G/- GAATAAGTAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 2 1 336133 CASAVA_Build 20 61513440 2D TGTGGCTTTT TC/-- AGGAACAGAG 2675 hom 25 het 11 0 9 3 TC 1 0 336134 CASAVA_Build 20 61515558 2D TCTGCCCGGG AC/-- AGGTGGGGCT 3070 hom 68 het 27 0 20 8 AC 1 0 336135 CASAVA_Build 20 61522630 1D GACTTTGGGG T/- CCCCAGGCAC 3070 hom 36 het 17 0 12 5 T 1 0 336136 CASAVA_Build 20 61528298 1D CCTGAATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 67 hom 40 1 18 21 T 15 14 336137 CASAVA_Build 20 61531064 1I TCTGGGGCCT -/C CCCCCACCCG 3070 hom 48 het 17 0 15 2 C 5 6 336138 CASAVA_Build 20 61537692 3I CTCATCTCTC ---/GAT GAGAGTCCCC 3070 hom 75 het 33 0 22 11 GAT 0 1 336139 CASAVA_Build 20 61537783 2I GTGTGGTTTC --/TT TTTTTTTTTT 1397 het 1397 ref 46 18 9 19 T 15 17 336140 CASAVA_Build 20 61547301 10I CAAGCTGACC ----------/CCCCAAAGGG CCCCCACCCC 2538 hom 35 het 14 0 10 4 CCCCAAAGGG 0 1 336141 CASAVA_Build 20 61577490 3I CCGAACTGTC ---/CTT CTCCCTGGAG 3070 hom 60 het 24 0 18 6 CTT 0 1 336142 CASAVA_Build 20 61592702 1D CCAGGGACAA G/- GGCAGACACA 2536 het 2536 ref 21 10 8 4 G 3 2 336143 CASAVA_Build 20 61593002 5D CTCCCTGCAG GCCCT/----- GCTCCCTGCT 135 het 135 ref 24 9 1 19 GCCCT 1 0 336144 CASAVA_Build 20 61594613 4I ATAGAGAGAA ----/GGAT GGATGGATGG 3070 hom 130 het 58 0 38 20 GGAT 2 3 336145 CASAVA_Build 20 61612187 1D AAATTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 2715 hom 16 7 8 1 T 7 6 336146 CASAVA_Build 20 61612707 1D TTTTGTTGTT G/- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 29 15 9 6 G 1 0 336147 CASAVA_Build 20 61617354 1I CTGAGTAGCT -/G GGGACTACTG 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 G 3 4 336148 CASAVA_Build 20 61623962 1D GCAGCCAGTA G/- CCCCGATGGT 1065 het 1065 ref 10 5 3 2 G 1 0 336149 CASAVA_Build 20 61625186 1D CACATGGCCT G/- GGGGGGCTCC 3070 het 1032 hom 29 6 15 8 G 7 6 336150 CASAVA_Build 20 61626692 2I AAAAAAAAAA --/AG AAGAAAAAGC 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 AG 0 1 336151 CASAVA_Build 20 61678161 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2275 het 1651 hom 31 5 10 17 A 15 16 336152 CASAVA_Build 20 61687824 1D GGGTAGCAGG A/- GGGTAGGAAG 3070 het 3032 hom 35 10 17 8 A 1 0 336153 CASAVA_Build 20 61714560 2D CCTACCTGTG CC/-- TCAGACTGCC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 C 2 0 336154 CASAVA_Build 20 61746319 2D GTCCCCTGCC TT/-- CTGTCTCTCT 2911 het 2911 ref 30 12 11 7 T 2 0 336155 CASAVA_Build 20 61748605 1D ACCAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 11 10 336156 CASAVA_Build 20 61758133 1D TGGTGGCATG C/- ACCTGTAATC 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 1 0 336157 CASAVA_Build 20 61759172 2D TTGGGTGGAG AC/-- ACAGAGCCGA 3070 het 3070 hom 43 19 17 7 AC 2 1 336158 CASAVA_Build 20 61767447 3I GATAGGCTGA ---/GGG GGGGCTGTTC 3070 het 3070 ref 31 12 9 10 G 4 7 336159 CASAVA_Build 20 61777238 1D AGAGAGTGAG T/- TTGCAAAGTT 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 T 3 2 336160 CASAVA_Build 20 61778707 1I ACTCCAGCCT -/G GGCGACAGAG 3070 het 2044 hom 19 5 14 0 G 2 3 336161 CASAVA_Build 20 61778857 1D AGGTGTTTTC A/- TGTGGGCTCT 3070 hom 86 het 36 0 27 9 A 1 0 336162 CASAVA_Build 20 61785844 3I ACATGTTTCC ---/TTG TTGTCAGATT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 TTG 1 2 336163 CASAVA_Build 20 61803083 1I TGAAGATTCA -/C CCTGGCCCTC 3070 hom 56 het 24 0 17 7 C 2 3 336164 CASAVA_Build 20 61806010 1D AGGATACAGG A/- AACCAGGGTG 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 3 2 336165 CASAVA_Build 20 61834412 2D33M2I TCAGGGTCTC TGTGTATGTGTATGACGTGTGAGTACATGTGTTAA--/--TGTATGTGTATGACGTGTGAGTACATGTGTTAATG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 81 60 25 31 N/A 0 0 336166 CASAVA_Build 20 61838981 1D GAGTCTGTGG C/- CCTGTGGCGC 3070 hom 55 het 24 0 15 10 C 3 2 336167 CASAVA_Build 20 61860337 2I TTTCTGTGTC --/TG TGTGTCCTAC 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 TG 2 3 336168 CASAVA_Build 20 61861078 4I CAGTATATTT ----/GGTA AATTATCCTG 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 GGTA 0 1 336169 CASAVA_Build 20 61862963 1I ACCCGGCTAA -/T TTTTTGTATT 470 het 470 ref 8 3 2 3 T 5 6 336170 CASAVA_Build 20 61864186 2D CACAGTAGCT CA/-- CACCTGTAAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CA 2 1 336171 CASAVA_Build 20 61866842 4D27M8D GTGTGCGTGC GTGTGTGTGTATGTTTGTATGTGCATGTGTGCGTGTGCA/----GTGTGTATGTTTGTATGTGCATGTGTG-------- TGTGTGCATG 3070 het 102 hom 24 2 21 8 N/A 0 0 336172 CASAVA_Build 20 61867523 9I CATTGCACCC ---------/AGCCTGAAA ACTTCATATG 3070 hom 114 het 42 0 36 6 AGCCTGAAA 0 1 336173 CASAVA_Build 20 61873716 1D GGCAGGCGTC T/- GGGGCATCCA 2481 het 2085 hom 25 8 7 10 T 1 0 336174 CASAVA_Build 20 61915876 2I TTAAAAATAC --/AA AAAAATTAGC 2201 het 1296 hom 10 4 5 1 A 5 7 336175 CASAVA_Build 20 61917334 15D GGCACAGGTC CAGTGGGTGCAGGTG/--------------- CAGTGGGTGC 1570 het 1570 ref 48 17 9 28 CAGTGGGTGCAGGTG 1 0 336176 CASAVA_Build 20 61917641 31D AGCACAGGTG CAGTGAGTGCAGGTGCAGGTGGGCGCAGGTC/------------------------------- CAGTGGGTGC 3070 het 3070 ref 50 29 11 21 CAGTGAGTGCAGGTGCAGGTGGGCGCAGGTC 1 0 336177 CASAVA_Build 20 61918147 8I TCTCTCCTCA --------/CAGGCTAG CAGGCTCACA 2227 het 2227 ref 21 8 8 5 CAGGCTAG 0 1 336178 CASAVA_Build 20 61918910 5D CTCAAAAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 2060 het 2060 ref 22 11 5 8 AAAAG 4 3 336179 CASAVA_Build 20 61928435 1I GGCAGGAGAA -/T TGGGGTGAAC 2010 het 2010 ref 16 7 5 4 T 1 2 336180 CASAVA_Build 20 61936756 1D TGTGTCCCCA C/- CCCCCCCCAA 1227 het 763 hom 12 3 6 3 C 9 8 336181 CASAVA_Build 20 61941244 2I TTAAAAGGGG --/AA AAAATGCAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 4 6 336182 CASAVA_Build 20 61945862 1D CGGGCGCCGA G/- GGCCGCTCCC 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 G 3 2 336183 CASAVA_Build 20 61949003 2D ACACACAGAG AC/-- ACACACACAG 3070 hom 31 het 49 2 31 16 AC 5 4 336184 CASAVA_Build 20 61949057 10D22M4D ACACTGACAC ACACAAGCAGAGACACACACACAGACACACACACTG/----------AGAGACACACACAGACACTGAC---- ACACAGAGAC 1642 het 1642 ref 43 19 9 36 N/A 0 0 336185 CASAVA_Build 20 61994189 2I ACTGGAAAAC --/TT TAGTGGGAGC 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 1 3 336186 CASAVA_Build 20 62004824 4D CACCCAAGTT AGAG/---- AGGAGTGACA 3070 het 3070 ref 26 16 10 2 AG 3 1 336187 CASAVA_Build 20 62019109 1I CTGGAATACA -/G TGGTGTGATC 3070 hom 30 het 14 0 9 5 G 0 1 336188 CASAVA_Build 20 62022230 1D GGGATGCCCG C/- CATGCGGGGG 1755 het 1755 ref 30 15 9 7 C 2 1 336189 CASAVA_Build 20 62025996 2I AAAAAATCAG --/TT TATCAGTTTC 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 1 3 336190 CASAVA_Build 20 62041862 3D CCTGGAAAAA GGG/--- GGGGGGGGGT 1279 het 444 hom 18 2 7 10 G 12 9 336191 CASAVA_Build 20 62048522 1I CCACAGGGCA -/T CCCCCCCCAC 2883 hom 40 het 17 0 13 4 T 0 1 336192 CASAVA_Build 20 62076512 2I TCTTGAGGGC --/GA GAGGGGGGAA 1562 het 1562 ref 26 15 4 7 GA 1 2 336193 CASAVA_Build 20 62092447 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 603 het 603 ref 18 6 2 10 T 13 12 336194 CASAVA_Build 20 62095481 1I TACTGTAAAA -/G GGTAGGACAA 3070 het 3070 ref 42 27 11 4 G 2 3 336195 CASAVA_Build 20 62123087 2D AGCCCCGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 864 het 864 ref 75 53 5 17 GT 9 8 336196 CASAVA_Build 20 62128164 5I TTAGCCGGGC -----/GTGGT GTGGTGGTGC 1851 het 679 hom 9 2 4 3 GTGGT 1 2 336197 CASAVA_Build 20 62161370 16D CCTTATCCAT CCTGGCTGGCCTGTGG/---------------- CCTGTACTTC 3070 hom 54 het 20 0 17 5 CCTGGCTGGCCTGTGG 1 0 336198 CASAVA_Build 20 62167104 1D GTGAGCAGAC T/- ATGCCACCCG 3070 hom 53 het 22 0 17 5 T 1 0 336199 CASAVA_Build 20 62193613 4I TTTTCATCTC ----/TGTT TGTGTGTCCT 3070 hom 69 het 25 0 20 5 TGTT 0 1 336200 CASAVA_Build 20 62198619 21D TCACCACCAT CATCACCATCATCATCATGAC/--------------------- CATCACCACC 3070 hom 32 het 57 1 36 30 CATCACCATCATCATCATGAC 1 0 336201 CASAVA_Build 20 62237748 4D TTTGTGCATC ACAA/---- ACACACACAT 3070 het 3070 ref 61 41 13 10 ACAA 1 0 336202 CASAVA_Build 20 62238245 54D GGTGTGGCGT CCCCTGACCGATTTAGCCGTTATTGAGGGACATCGAGGTTGCTTGGTGTGGCGG/------------------------------------------------------ CCCCTGACCG 2810 hom 56 het 24 0 16 22 CCCCTGACCGATTTAGCCGTTATTGAGGGACATCGAGGTTGCTTGGTGTGGCGG 1 0 336203 CASAVA_Build 20 62243201 2I ATCAGCTATG --/CT CCCCCCCCGC 3070 hom 57 het 20 0 19 1 CT 0 1 336204 CASAVA_Build 20 62244457 10D ACCTGAAGCC CAGGTGAGGA/---------- CAGGTGCTTG 3070 het 3070 ref 37 21 12 5 CAGGTGAGGA 1 0 336205 CASAVA_Build 20 62254763 1D CCCTTGGGGT G/- GGGGGGGGAC 3070 hom 65 het 25 0 19 6 G 9 8 336206 CASAVA_Build 20 62272882 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 18 2 11 5 T 14 13 336207 CASAVA_Build 20 62281744 4I ACACACAGTT ----/ACAC ACACATTTGC 3070 hom 238 het 90 0 79 11 AC 2 4 336208 CASAVA_Build 20 62303266 5D CATTGCTAAC ATGCA/----- ATGTGATGCT 3070 hom 138 het 49 0 46 4 ATGCA 1 0 336209 CASAVA_Build 20 62310495 2I AGCGAGACAC --/AG AGCGGAGACG 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 AG 1 2 336210 CASAVA_Build 20 62336115 1D TGGGAGGTCA G/- GGCTGCAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 G 3 2 336211 CASAVA_Build 20 62354500 1I TTCCCTCCGT -/C CCGAGGCTCC 3070 het 3070 ref 54 23 18 13 C 2 3 336212 CASAVA_Build 20 62356731 3I AGGAAGTCCT ---/GAC GACATGTGCC 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 GAC 1 2 336213 CASAVA_Build 20 62363400 1D GATAATTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 10 9 336214 CASAVA_Build 20 62369941 2I7M15I3M16I TGTAAAATTC --TACAAGC---------------AAT----------------/TGTGCAGGCCTTTCTGACTTTGGTAATAAACGTTGTTTTATAA TTCAGGCATT 3070 het 3070 hom 30 15 15 5 N/A 0 0 336215 CASAVA_Build 20 62370523 1D ATAGTCTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1185 hom 29 6 17 6 A 14 13 336216 CASAVA_Build 20 62371650 7I GGGTGCTGGC -------/GTGTGCG GTGTGGGGGG 3070 het 2877 hom 40 12 15 13 GTGTGCG 0 1 336217 CASAVA_Build 20 62379568 1D TGCTTATGTC T/- TTTCCCTTCT 2522 het 2522 ref 31 23 6 2 T 4 3 336218 CASAVA_Build 20 62381684 3I AGGCAAAAGC ---/CTT CTGGCTCCGA 3070 hom 50 het 18 0 17 1 CTT 0 1 336219 CASAVA_Build 20 62386976 1I TCGGATTGAT -/C ACCACACATG 3070 het 3070 ref 59 38 14 7 C 0 1 336220 CASAVA_Build 20 62419554 1I GTTTTTGTAG -/C TGCTGTTTTT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 0 1 336221 CASAVA_Build 20 62431459 1I TTTCCTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 45 1 27 17 T 13 14 336222 CASAVA_Build 20 62433881 4I GTTCAAGTGA ----/TTCT TTCTCCTGCC 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 TTCT 1 2 336223 CASAVA_Build 20 62435811 1I TGTAGTTTCC -/T TTTTTTGTTA 3070 het 3070 ref 60 33 23 4 T 6 7 336224 CASAVA_Build 9 11138 1I GGCCTGAGCT -/G GGGTGGTGGG 2096 het 2096 ref 94 80 6 8 G 3 4 336225 CASAVA_Build 9 19681 10D TCAATAGAGA AGCCAGACGC/---------- AAAACTACAG 2582 het 2582 ref 51 44 7 7 AGCCAGACGC 1 0 336226 CASAVA_Build 9 20054 2D ATCATCAGTC CA/-- AAGTCCAGCA 3070 het 3070 ref 72 49 15 8 CA 1 0 336227 CASAVA_Build 9 21590 2I CTGTGAATAT --/AC ACACACACAC 1730 het 1730 ref 17 12 4 1 AC 5 6 336228 CASAVA_Build 9 23312 1D GTTTTTTTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 C 1 0 336229 CASAVA_Build 9 29270 1I ACTAAGGTGA -/C CCCCCACAAC 1103 het 1103 ref 19 8 4 7 C 5 6 336230 CASAVA_Build 9 31645 1I CTGTTTCCCC -/T CTCTCCCTCT 1329 het 1329 ref 30 20 3 7 T 0 1 336231 CASAVA_Build 9 38302 1D AAGTGCTGAA T/- GTCTAAGTGA 3070 het 3070 ref 64 27 23 16 T 1 0 336232 CASAVA_Build 9 40080 4I CATTTCTGAT ----/TTTA TTTATTTGAG 2547 het 2547 ref 17 10 6 1 TTTA 1 2 336233 CASAVA_Build 9 41811 1D AATTCTTCAG A/- AAAAAAAAGA 2342 het 2342 ref 23 12 6 5 A 9 8 336234 CASAVA_Build 9 50530 2I CCTTTGTGAT --/TC TCTTTTAGCT 1335 het 1335 ref 47 42 3 2 TC 1 2 336235 CASAVA_Build 9 60380 2I AAAGAGTAAC --/TG TAGTTTTTCC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TG 0 1 336236 CASAVA_Build 9 91368 2I TTGTGACAGC --/AG AGACCTAGAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AG 1 2 336237 CASAVA_Build 9 95328 3D AGTGATATTG TTA/--- TTATTAATAG 2334 het 2334 ref 23 14 6 4 TTA 3 2 336238 CASAVA_Build 9 98757 1D CAGGATCGCA G/- GGGGGGTGTT 3070 hom 47 het 23 0 15 8 G 7 6 336239 CASAVA_Build 9 99219 1I TGTCATGATT -/C CCCTCTCTTT 1120 het 1120 ref 56 46 3 7 C 3 4 336240 CASAVA_Build 9 99700 1D TGTGTAAGCA G/- GGGATAGCTT 1558 het 1558 ref 38 26 5 8 G 4 3 336241 CASAVA_Build 9 105485 2I CCTGTAAAAA --/TG TGTGTCTCCA 2131 het 2131 ref 30 18 5 7 TG 2 3 336242 CASAVA_Build 9 106154 4I TGAAAATAAA ----/TTGT TTGAGGGAAA 3070 het 3070 ref 48 36 7 5 TTGT 0 1 336243 CASAVA_Build 9 109986 1I ACAGAGGAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 A 8 9 336244 CASAVA_Build 9 113687 1D CTACTACCTT G/- TATTTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 25 9 3 G 1 0 336245 CASAVA_Build 9 128397 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2786 het 2786 ref 22 12 6 4 T 11 12 336246 CASAVA_Build 9 128542 1D CTGAAGGTGG A/- AAAAAAAAAA 2879 het 2879 ref 23 13 7 3 A 11 10 336247 CASAVA_Build 9 129533 1D TTACTACAAT A/- AAAAAAAGAA 1386 het 1386 ref 32 26 3 3 A 8 7 336248 CASAVA_Build 9 143248 1D ATTTATGAAG A/- GAAACAAGAT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 A 1 0 336249 CASAVA_Build 9 157100 1I ATTTTAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 A 11 12 336250 CASAVA_Build 9 161047 3I ACCAGATTCA ---/AAT AATATTTAAC 3070 het 3070 ref 39 26 8 5 AAT 1 2 336251 CASAVA_Build 9 161337 1D GACCCAGATC A/- AAAAAAAAAA 2733 het 2733 ref 39 25 6 8 A 11 10 336252 CASAVA_Build 9 173211 1I AATAGACGAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 7 17 8 T 8 9 336253 CASAVA_Build 9 177975 1I CAAAAATCTG -/C CTAGTGTGAT 1416 het 1416 ref 17 10 3 4 C 1 2 336254 CASAVA_Build 9 185915 1I CTTCCAGTCT -/C CCAAATTGCT 3070 het 3070 hom 44 9 35 0 C 2 3 336255 CASAVA_Build 9 187805 1D TAGTGCTACA G/- TAAACATGAG 1847 het 1847 ref 49 37 4 8 G 1 0 336256 CASAVA_Build 9 187887 2I ATTGTTGAAT --/TA TATGATGGTT 3070 het 3070 ref 40 25 9 6 TA 1 2 336257 CASAVA_Build 9 189898 1D ATCTATACTA T/- TTACCCTATG 1335 het 1335 ref 33 27 3 3 T 3 2 336258 CASAVA_Build 9 191388 2I CCATATCACA --/CT GTGTCTGAAT 3070 het 3070 hom 64 22 31 11 CT 0 1 336259 CASAVA_Build 9 193900 1I CCTCAGCCTC -/T CAAGTAGCTG 3070 het 3070 ref 25 16 9 2 T 0 1 336260 CASAVA_Build 9 215169 1D GAATCCAGCT G/- GGGTGAGTGG 3070 het 3070 ref 48 24 17 8 G 4 3 336261 CASAVA_Build 9 227908 1I TTTATTTGAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 A 7 8 336262 CASAVA_Build 9 228956 1I ACACACACTC -/T TCACTGGGAC 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 T 1 2 336263 CASAVA_Build 9 237983 1I TCTCTAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 972 hom 36 3 24 9 A 14 15 336264 CASAVA_Build 9 248103 4D AGTTCCATAG TTTA/---- TTTAACAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 7 TTTA 2 1 336265 CASAVA_Build 9 248350 3I CAGCATGTGG ---/CCT CCTCTAAATT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 CCT 1 2 336266 CASAVA_Build 9 253213 1I TCTCAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 14 12 16 A 12 13 336267 CASAVA_Build 9 255247 1D CTTGATTTTT A/- AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 30 13 13 5 A 7 6 336268 CASAVA_Build 9 263146 2D31M1I AAGGATAATT TGTGTGTTGCGTCATTAATGAAATAGTAGTACG-/--TGTGTTGCGTCACTAATGAAATAGTAGTACGA AAAAACCTAT 3070 hom 141 het 45 0 48 6 N/A 0 0 336269 CASAVA_Build 9 263780 20D CTCTGCCTCC TAGTTCAAGCAATTCTCCTG/-------------------- TAGTTCAAGC 3070 hom 30 het 15 0 10 9 TAGTTCAAGCAATTCTCCTG 2 1 336270 CASAVA_Build 9 282656 1I TAAGCACTTT -/A TTTGGTAAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 0 1 336271 CASAVA_Build 9 290020 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2772 het 25 hom 15 1 8 6 A 16 15 336272 CASAVA_Build 9 294943 1D AGCTCTAACT G/- GGGGACAGAG 3070 hom 90 het 33 0 31 4 G 5 4 336273 CASAVA_Build 9 307976 1D CTATGATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 27 0 20 7 A 12 11 336274 CASAVA_Build 9 308509 3D CCTCTGCCAA CTT/--- CTTCTGCCTC 3070 het 3070 hom 35 14 15 8 CTT 2 1 336275 CASAVA_Build 9 315137 4D TGCAAAAGAC ATTA/---- ATTATTTCCT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 ATTA 2 1 336276 CASAVA_Build 9 315812 1I GTTTTTAAAT -/C TTCTTTGCAG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 0 1 336277 CASAVA_Build 9 323601 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2245 het 691 hom 11 3 5 3 A 15 14 336278 CASAVA_Build 9 323712 1D TTTTTTTTTT A/- AAATCTGTCT 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 4 3 336279 CASAVA_Build 9 324048 7I ATCAGCTAGA -------/CTTCTGG CCCAAGTGCA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 CTTCTGG 0 1 336280 CASAVA_Build 9 325244 4D GTGATCTGAA TCAT/---- TCATTCCTAC 3070 het 3070 hom 34 10 22 3 TCAT 2 1 336281 CASAVA_Build 9 328161 1I CTCAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2796 hom 25 7 13 5 A 11 12 336282 CASAVA_Build 9 330621 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 A 10 11 336283 CASAVA_Build 9 333486 1D CCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1849 hom 25 8 13 4 A 13 12 336284 CASAVA_Build 9 336335 1I GCTTTCTGGT -/G GGGGGCAGAA 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 G 5 6 336285 CASAVA_Build 9 342771 3I TTATATATCT ---/AGC TCTGAAAGAA 3070 hom 46 het 24 0 17 7 AGC 0 1 336286 CASAVA_Build 9 343279 1D AGAGGCAGCT G/- GGGGCATCTG 3070 hom 103 het 41 0 31 10 G 5 4 336287 CASAVA_Build 9 346844 1I ATCTTACTTG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 A 7 8 336288 CASAVA_Build 9 348677 1D GGTGAAACCC T/- GTCTCTACTA 3070 het 880 hom 12 2 10 0 T 1 0 336289 CASAVA_Build 9 359173 1D AGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 17 12 A 11 10 336290 CASAVA_Build 9 364629 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 151 hom 28 2 15 11 T 16 15 336291 CASAVA_Build 9 367361 1D TCTTATGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 10 9 336292 CASAVA_Build 9 373080 1D TCATTAACAT C/- CACAGATTGA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 C 2 1 336293 CASAVA_Build 9 378799 1I AAGTAATCTG -/C CCTCCTCGGC 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 C 2 3 336294 CASAVA_Build 9 379853 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1973 hom 18 6 7 5 A 9 10 336295 CASAVA_Build 9 391082 1I ATCACCACCA -/C CCACCTCCAC 3070 het 10 hom 45 1 37 7 C 2 3 336296 CASAVA_Build 9 420670 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 13 14 336297 CASAVA_Build 9 421040 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 31 het 29 1 23 5 T 8 9 336298 CASAVA_Build 9 422141 2D TTACTTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 41 0 29 13 T 14 12 336299 CASAVA_Build 9 435744 4I TTCTAGTCTT ----/TGTC TGTTATGAAT 3070 hom 77 het 31 0 26 5 TGTC 0 1 336300 CASAVA_Build 9 438013 5I ATTTCAAAAC -----/CTTTT CTTTTCTTTT 3070 hom 108 het 50 0 37 13 CTTTT 2 3 336301 CASAVA_Build 9 439402 1D CAGTAATAGG A/- AAAGGCACCT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 4 3 336302 CASAVA_Build 9 441885 2I ATATATATAC --/AT ATATATATGC 1860 hom 27 het 13 0 9 4 AT 4 5 336303 CASAVA_Build 9 445341 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAATAC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 7 8 336304 CASAVA_Build 9 453277 1D AAAATAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 34 0 27 7 A 12 11 336305 CASAVA_Build 9 478288 3D TGTGTGGCTC AAA/--- GAGGAGAGGA 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 A 3 0 336306 CASAVA_Build 9 492245 1I GATGTCAATG -/T TCTGGAATTA 3070 hom 113 het 42 0 36 6 T 1 2 336307 CASAVA_Build 9 519517 1I ATTTTTAAAA -/G TGTGTGTATA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 0 1 336308 CASAVA_Build 9 546694 1D CCTTTGGTAC T/- TTTCTCTCTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 4 3 336309 CASAVA_Build 9 547996 2I CAGAGCAAGA --/CT CTCTCTCAAA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 CT 3 4 336310 CASAVA_Build 9 548692 1I CACAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 2032 het 2032 ref 41 20 11 10 A 10 11 336311 CASAVA_Build 9 550780 1D ATCAGGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 280 hom 38 1 32 5 A 11 10 336312 CASAVA_Build 9 559198 1I ACTTTGTCTC -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 A 6 7 336313 CASAVA_Build 9 571522 1I ATGAACCATT -/C CTTCATTAGT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 C 1 2 336314 CASAVA_Build 9 577290 1I TGTATGATTG -/C AGAAAAGACT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 0 1 336315 CASAVA_Build 9 578080 1D AAAAAAAAAA G/- AAAGAAAGAA 3070 het 201 hom 26 1 18 7 G 1 0 336316 CASAVA_Build 9 580325 3D TCTGTGAAAT GAG/--- GAGTTGGACT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 GAG 2 1 336317 CASAVA_Build 9 582483 2D AGCACCCCGA TC/-- CCCTAGTCCG 2801 het 2801 ref 27 14 7 7 TC 1 0 336318 CASAVA_Build 9 583452 1D TTTATACATT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 1755 hom 24 9 10 5 C 10 9 336319 CASAVA_Build 9 586950 2D TTTCAGTCTC TA/-- TGAATTTACA 3070 het 3070 hom 38 12 18 8 TA 1 0 336320 CASAVA_Build 9 596585 1D TGTGTTTTAT A/- AACCTATAAA 1073 het 953 hom 11 4 3 4 A 3 2 336321 CASAVA_Build 9 596982 2D CACATTTTTA TT/-- TTTTTAAGTA 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 7 5 336322 CASAVA_Build 9 603807 2D TAAAAAAGAC TG/-- TATTCACTAG 3070 het 3070 hom 42 20 21 3 TG 1 0 336323 CASAVA_Build 9 613613 5D TCAAAAAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 252 het 252 ref 32 15 5 15 AAAAG 1 0 336324 CASAVA_Build 9 617056 1I TCCAAGGGGG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 A 7 8 336325 CASAVA_Build 9 617951 1D AAATTACAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 10 9 336326 CASAVA_Build 9 618410 1I TCCCAGTAGG -/T GGGGGTTCCT 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 T 0 1 336327 CASAVA_Build 9 621546 1I TCTCCTTCTT -/A CCACATTCCT 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 A 0 1 336328 CASAVA_Build 9 637276 3I TAATTTTCTA ---/ATT ATTATGACTA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 ATT 1 2 336329 CASAVA_Build 9 644584 1I CACTCAATCG -/T TTTCTCATCC 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 T 3 4 336330 CASAVA_Build 9 651088 1I GGTTTGTTTG -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 7 8 336331 CASAVA_Build 9 658349 4I TGTATTATAA ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TC 6 8 336332 CASAVA_Build 9 661226 1D CCTGGTGGAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1537 hom 25 4 17 5 T 10 9 336333 CASAVA_Build 9 661510 28I TGGACGTGGT ----------------------------/GGTCTGTGCCTGTAGTCCCAGCTAATCG GGAGGCTGAG 2462 hom 21 het 9 0 7 2 GGTCTGTGCCTGTAGTCCCAGCTAATCG 0 1 336334 CASAVA_Build 9 665024 3D ATTTTTAATA ATG/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 20 10 10 2 ATG 1 0 336335 CASAVA_Build 9 666838 1I AAGATTTAGT -/G TTGTACATTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 G 0 1 336336 CASAVA_Build 9 674905 1I TTTCCTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 11 12 336337 CASAVA_Build 9 675397 2D CTATAAAAAT GA/-- GAGAAGGCCA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 GA 3 2 336338 CASAVA_Build 9 679581 1D TTTGCTGGAC T/- TTCCTTTTAA 3070 het 3070 hom 47 18 21 9 T 3 2 336339 CASAVA_Build 9 681302 1D ATGTAGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 11 10 336340 CASAVA_Build 9 681613 7I ATACCAGAAT -------/TTTTTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 11 2 TTTTTTC 0 1 336341 CASAVA_Build 9 682103 2I AATTCAAAAC --/AG GGGACAGCTG 3070 hom 96 het 41 0 31 10 AG 0 1 336342 CASAVA_Build 9 682339 7D GCACTTATTT GGGCTTG/------- GGGCTTGGTT 3070 hom 102 het 35 0 35 5 GGGCTTG 2 1 336343 CASAVA_Build 9 682715 1D TCTGCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 24 0 15 9 A 13 12 336344 CASAVA_Build 9 683012 1D AAAAAAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 T 13 12 336345 CASAVA_Build 9 685473 4I GTGTGCACAC ----/TTGA ACACATCCCC 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TTGA 0 1 336346 CASAVA_Build 9 687077 12D TTGTTCCATC TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 93 het 40 0 31 9 TG 14 8 336347 CASAVA_Build 9 692232 2D GAGTTGGCTC AG/-- AGATGATGCC 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 AG 2 1 336348 CASAVA_Build 9 696535 1I CTGAGTGCCC -/T TTTTTTTACG 3070 het 3070 ref 53 14 14 25 T 7 8 336349 CASAVA_Build 9 703813 1I AACTGCCTTT -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 6 7 336350 CASAVA_Build 9 705366 2I ATACCTCCAG --/AC ACAGATGGCA 3070 hom 97 het 36 0 32 4 AC 1 2 336351 CASAVA_Build 9 708486 3I CTAATTTTTG ---/TAT TATTTTTAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAT 1 2 336352 CASAVA_Build 9 713939 1I TAAAAATACG -/A AAAAAAAAAA 1656 het 784 hom 17 3 7 7 A 15 16 336353 CASAVA_Build 9 724666 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 10 11 336354 CASAVA_Build 9 726698 1D ACACCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 2866 het 2179 hom 26 7 9 12 A 14 13 336355 CASAVA_Build 9 730770 6D CCTAAGAGAC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2784 het 2394 hom 35 13 9 14 T 18 12 336356 CASAVA_Build 9 731248 1D ATGCTCAGTG A/- CTGTTGCTTC 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 A 1 0 336357 CASAVA_Build 9 734185 4I TGGTCATTCA ----/TAAT TAATTAATTA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 TAAT 2 3 336358 CASAVA_Build 9 736922 3D ATATCAGAGA CTT/--- CTTCTTTCCC 3070 hom 30 het 11 0 11 1 CTT 3 2 336359 CASAVA_Build 9 741108 4D AAGAGATAGT GAAA/---- GAAGGTAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 15 5 GAAA 1 0 336360 CASAVA_Build 9 742366 1D CAGCAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 90 hom 41 1 15 25 A 12 11 336361 CASAVA_Build 9 743373 1D CTGTAGAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 38 0 27 11 T 13 12 336362 CASAVA_Build 9 744171 2D AAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 7 CT 2 1 336363 CASAVA_Build 9 748239 8D TGTGTGTGTG TGTGTGTT/-------- TGTGTATCAT 3070 hom 72 het 26 0 25 7 TGTGTGTT 1 0 336364 CASAVA_Build 9 762986 1D AAGAGTCAAC T/- TGGTGCAAGT 3070 het 3070 ref 21 9 9 3 T 2 1 336365 CASAVA_Build 9 765730 1D AAAAAAAAAA C/- AAACTGTATT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 C 1 0 336366 CASAVA_Build 9 771989 2D TTAAAGAAGA CC/-- CCTCAAAAGC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 C 4 2 336367 CASAVA_Build 9 777360 1D TCCAAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 115 hom 31 3 12 16 T 13 12 336368 CASAVA_Build 9 782589 23D AGCAGAATTA CAAGGAGGTACAGCGTTGTTAGG/----------------------- TTGAAGCGGG 3070 het 3070 ref 33 20 13 6 CAAGGAGGTACAGCGTTGTTAGG 1 0 336369 CASAVA_Build 9 783333 1I CAAAATTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 11 12 336370 CASAVA_Build 9 783816 1D TCTCCAGCTA G/- GGGTGCACAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 G 4 3 336371 CASAVA_Build 9 798629 4D TCCGTCTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 32 12 11 9 AAAC 4 3 336372 CASAVA_Build 9 813802 3I AAACAAAACA ---/AAC AAACAAGTGA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 AAC 0 1 336373 CASAVA_Build 9 815483 1I3M2I TCTAGTACCA -GTA--/GGTACT CAGGAGGCTG 2693 het 2693 ref 24 12 8 4 N/A 0 0 336374 CASAVA_Build 9 821838 2I CAAAAAAAAA --/AG AAAAAAAAGG 3070 hom 39 het 17 0 13 4 AG 0 1 336375 CASAVA_Build 9 828732 1D GGAGTTTTGC T/- TTTTTTTTGC 735 hom 10 het 7 0 3 4 T 9 8 336376 CASAVA_Build 9 830865 1D ACAACCTCAG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 84 het 30 0 28 4 T 8 7 336377 CASAVA_Build 9 831118 1I TTGTGCCCCA -/C ACACTGAGGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 336378 CASAVA_Build 9 835772 4D CTAAGCAGAC CCTG/---- CCTGCCTTTC 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 CCTG 2 1 336379 CASAVA_Build 9 837667 4D CCTGAGACAT AGAC/---- AGTTATGGGA 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 AGAC 1 0 336380 CASAVA_Build 9 838855 42D ATGCCAGGCC AAAACTTTGCTTTTCATAGGAAGGAAGGAGTGTATCAGAAAT/------------------------------------------ ACGATCTTTA 1967 het 1967 ref 27 35 6 1 AAAACTTTGCTTTTCATAGGAAGGAAGGAGTGTATCAGAAAT 1 0 336381 CASAVA_Build 9 839791 1D GCTCCGGGAG C/- CTTTACCTTC 2755 het 2597 hom 41 12 15 15 C 2 1 336382 CASAVA_Build 9 839815 4D GGACGATGGG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 38 het 36 0 15 21 CT 8 6 336383 CASAVA_Build 9 839830 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 635 het 90 hom 32 1 4 27 T 11 10 336384 CASAVA_Build 9 840742 1I TATAGATGTG -/A AGGCCAGCCA 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 A 1 2 336385 CASAVA_Build 9 841427 2I TTAGTAGAGA --/GT CAGAGTTTCA 3070 het 1404 hom 17 4 12 1 GT 0 1 336386 CASAVA_Build 9 841948 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3066 het 3066 ref 32 14 12 6 T 12 11 336387 CASAVA_Build 9 844695 1D TTAAGAAAAA G/- CTTTTCAGAT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 G 1 0 336388 CASAVA_Build 9 845294 2I GCCAGGAAAC --/AT GTAAATACAG 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 AT 0 1 336389 CASAVA_Build 9 847317 1I AAAAAAAATA -/T TATATATGTG 2684 het 2318 hom 15 5 7 3 T 1 2 336390 CASAVA_Build 9 848854 5D AGTCTGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 669 hom 14 het 13 0 4 9 A 18 13 336391 CASAVA_Build 9 850407 5D AATTGAATTG AATTC/----- ATCTCTGCTG 3070 het 3070 hom 42 19 19 7 AATTC 1 0 336392 CASAVA_Build 9 853320 2D CACGTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2726 hom 42 het 26 0 13 13 A 18 16 336393 CASAVA_Build 9 854213 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2880 hom 7 het 24 0 11 13 T 13 12 336394 CASAVA_Build 9 854877 3I CAAAAGCTTC ---/AAT GACTAAACCA 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 AAT 0 1 336395 CASAVA_Build 9 856528 2D CTTGAAAACA CT/-- CTCAAAACTT 3070 het 3070 ref 51 24 22 8 CT 2 1 336396 CASAVA_Build 9 863311 1I TCTATAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 T 12 13 336397 CASAVA_Build 9 866529 1I GTCAATAGGC -/T TTTTTTTTTT 2540 het 2540 ref 30 12 10 8 T 12 13 336398 CASAVA_Build 9 873790 1D CCTGTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 1946 het 1946 ref 36 15 8 13 A 17 16 336399 CASAVA_Build 9 878303 1D AATGGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1401 hom 27 6 13 8 T 15 14 336400 CASAVA_Build 9 895474 2D TCCCTTGCCC CT/-- GTGTGTGTGT 1713 het 102 hom 32 4 19 9 CT 1 0 336401 CASAVA_Build 9 898464 1I TCTAAAAATG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 7 8 336402 CASAVA_Build 9 899723 1D TTTGTTTCTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 8 336403 CASAVA_Build 9 903426 4I GTGTGTTTGA ----/GTTT GTTTTTACTG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 GTTT 1 2 336404 CASAVA_Build 9 903893 1I ACTCGGTCTC -/A AAACAATTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 3 4 336405 CASAVA_Build 9 905498 6I TCACATGCAG ------/CTGCCA CTGCCACTGG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 CTGCCA 1 2 336406 CASAVA_Build 9 912048 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 26 5 T 11 10 336407 CASAVA_Build 9 913478 5I GGCCACACCA -----/GTGTT GTGAGGATGA 3070 hom 176 het 65 0 59 6 GTGTT 0 1 336408 CASAVA_Build 9 916175 1I AGGTGTGGTG -/T TTCTCTTTAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 2 3 336409 CASAVA_Build 9 949735 1I GCCATGTTGG -/C CCAGGCTCGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 2 3 336410 CASAVA_Build 9 953419 1D CGATCATTAC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 9 8 336411 CASAVA_Build 9 960631 1D CCTTGACAGG T/- TTTTGCAGAT 3070 hom 72 het 33 0 21 13 T 5 4 336412 CASAVA_Build 9 961692 1I CGCTGACTCT -/G GGAATTTTGT 2759 hom 36 het 15 0 10 5 G 2 3 336413 CASAVA_Build 9 967910 1I GGAGCCAAGG -/C CCAACACTCG 3070 hom 98 het 36 0 31 5 C 2 3 336414 CASAVA_Build 9 970091 1D TGAAGAGAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 9 8 336415 CASAVA_Build 9 982346 1D CTTGCTCAGA T/- TTTTTTTTTT 1389 het 1389 ref 33 25 3 5 T 11 10 336416 CASAVA_Build 9 988499 4D CCAGGAGCCT GAGA/---- GGACGTGGCG 3070 het 41 hom 17 1 15 2 GA 2 0 336417 CASAVA_Build 9 999022 2D CTTGATCATT AC/-- ACAGTCTATG 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 AC 2 1 336418 CASAVA_Build 9 1000628 1I AGTATTGTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 42 16 15 11 T 7 8 336419 CASAVA_Build 9 1008917 1D CTCAGGAGGC G/- GGGGTTGCAG 3070 het 3070 hom 24 9 15 1 G 5 4 336420 CASAVA_Build 9 1011256 1D CCTTTCTCGC T/- TTTTTCCCTC 3070 het 3070 ref 46 23 17 7 T 6 5 336421 CASAVA_Build 9 1012722 1I ATGAGTGGGA -/T TGCTAGGTTA 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 T 1 2 336422 CASAVA_Build 9 1013223 1I GATCCTTTAA -/G GAAACACCAT 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 G 1 2 336423 CASAVA_Build 9 1015185 2D GGAGAGGAGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 123 het 50 0 39 11 GT 8 7 336424 CASAVA_Build 9 1016095 1I24M1D GCTAATTCGA -TTTTTTTTCCATAGAGGTGGGGGGT/TTTTTTTTTCCATAGAGGTGGGGGG- TCTCACTATG 3070 hom 102 het 32 0 32 5 N/A 0 0 336425 CASAVA_Build 9 1044701 1D CTATTTTTAA C/- CGTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 C 2 1 336426 CASAVA_Build 9 1050728 1D AAAAACCAAA T/- TTTTTTTTTT 1690 het 1690 ref 27 17 5 5 T 17 16 336427 CASAVA_Build 9 1063487 2D TTTTTGCAAA AT/-- ATCCATTTTC 3070 het 3070 ref 39 17 16 7 AT 2 1 336428 CASAVA_Build 9 1067063 1D TCCTCTAGGA G/- GGAACAAGAT 3070 het 3070 ref 53 31 19 3 G 3 2 336429 CASAVA_Build 9 1071649 1I AGCTAAACTG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 A 7 8 336430 CASAVA_Build 9 1071976 1I GGTACAGCAT -/A AATGCCTATA 3070 het 3070 ref 32 22 8 2 A 2 3 336431 CASAVA_Build 9 1073565 1I AAGGAAACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 9 10 336432 CASAVA_Build 9 1078129 1I CTTTTGGATT -/A TTTGTAGAGA 3070 hom 78 het 28 0 25 3 A 0 1 336433 CASAVA_Build 9 1079386 1I GGGGCAAGGA -/G GGGGGATTAT 3070 hom 116 het 42 0 38 4 G 5 6 336434 CASAVA_Build 9 1094810 2D ATCTTGAGTT TC/-- GATTTTTGTT 3070 hom 69 het 24 0 23 1 TC 1 0 336435 CASAVA_Build 9 1121051 12D TCTTCTCTTC TCTTTTCTTTTT/------------ TCTTTTCTTT 3070 hom 54 het 18 0 19 0 TCTTTTCTTTTT 1 0 336436 CASAVA_Build 9 1125647 1D TCCTATTTTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 9 8 336437 CASAVA_Build 9 1143877 1I ATATGTCAGG -/T TTGTGTTGTG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 3 336438 CASAVA_Build 9 1159711 1D ACATCAGGCT A/- GGGGAAAAGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 0 336439 CASAVA_Build 9 1187846 1I ATATTTAGTC -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 8 9 336440 CASAVA_Build 9 1200807 21D GCACATGTAT ACATATGTAACAAACCTGCAC/--------------------- ACATATGTAA 3070 het 3070 ref 35 26 16 1 ACATATGTAACAAACCTGCAC 2 1 336441 CASAVA_Build 9 1209596 1I AGTTGTGGCC -/T TTCAGTAGAG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 2 3 336442 CASAVA_Build 9 1210837 7I AATCAAAAGA -------/CTTGGTC TAATTATCAC 3070 hom 60 het 26 0 21 5 CTTGGTC 0 1 336443 CASAVA_Build 9 1213540 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTGAG 1436 hom 24 het 14 0 9 8 T 8 7 336444 CASAVA_Build 9 1219744 2D GTGGTGGGGT GG/-- GGGGGATGGG 838 hom 5 het 3 0 2 1 G 7 5 336445 CASAVA_Build 9 1246747 4D ATAGAAATAG AAAA/---- AAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 30 10 17 5 A 10 6 336446 CASAVA_Build 9 1252053 1D AGTGGTAGCA G/- GCAGAGTTGG 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 G 2 1 336447 CASAVA_Build 9 1261365 1D CGAGTTCCTG A/- AAAAATGCTG 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 A 6 5 336448 CASAVA_Build 9 1268382 1I AGGGATATTC -/A ACCTGAATTT 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 A 1 2 336449 CASAVA_Build 9 1289570 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 49 het 21 0 16 5 T 8 7 336450 CASAVA_Build 9 1293430 9D ATATATTTTA TATAATATT/--------- TATGTGTGTG 3070 hom 39 het 13 0 14 0 TATAATATT 1 0 336451 CASAVA_Build 9 1300546 10D TTCTTCTTCT TTCTTTTTTC/---------- TTCTTCTTTC 3070 het 3070 ref 33 22 11 5 TTCTTTTTTC 1 0 336452 CASAVA_Build 9 1302146 1I TTATATCAGA -/T TTTTTTTTTT 2651 het 2651 ref 29 13 9 7 T 13 14 336453 CASAVA_Build 9 1303224 1I GGACTAGAAG -/A AAACTTCTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 3 4 336454 CASAVA_Build 9 1313144 1I GACTGAATGG -/C CATCAATAGA 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 C 1 2 336455 CASAVA_Build 9 1323968 1D AACTTGCCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 9 10 5 T 11 10 336456 CASAVA_Build 9 1329010 1I ACCTTGTTCC -/T TTAATGAGTA 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 2 3 336457 CASAVA_Build 9 1334767 8I9M4D GTTATCTTTC --------GAAAATAGGCTTT/ACATTTTTGAAAATAGG---- CTAACTGGGG 3070 het 3070 ref 46 26 20 5 N/A 0 0 336458 CASAVA_Build 9 1347466 5D TCTTTGTTTC CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 11 18 CAAAA 5 4 336459 CASAVA_Build 9 1395696 2I CTATTTGCCA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 T 9 11 336460 CASAVA_Build 9 1402448 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 2803 het 2803 ref 33 12 8 13 A 15 16 336461 CASAVA_Build 9 1410953 5D CATGCATATT GTTGC/----- AAATGTATTG 3070 het 3070 ref 35 18 15 7 GTTGC 1 0 336462 CASAVA_Build 9 1423018 1I TTCAGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2202 hom 19 8 8 3 A 13 14 336463 CASAVA_Build 9 1423091 1D TGGCAAATAC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 T 8 7 336464 CASAVA_Build 9 1436276 1D TGTTTGTAAG A/- AAAAAAAACA 1660 het 1660 ref 32 19 5 8 A 9 8 336465 CASAVA_Build 9 1437939 1D TCTAGGGGTA G/- GGGGCTCACT 3070 het 3070 ref 39 17 14 9 G 5 4 336466 CASAVA_Build 9 1438157 1I TCCAAGGTAG -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 7 8 336467 CASAVA_Build 9 1444144 1D GTGATTGTCC T/- TAATGTTGGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 2 1 336468 CASAVA_Build 9 1444996 1D TAAGAACTCA G/- AGCCATCTGT 3070 hom 123 het 45 0 41 6 G 1 0 336469 CASAVA_Build 9 1483492 2D CCAGGCTGTC AA/-- GTGTTCTTCT 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 A 2 0 336470 CASAVA_Build 9 1487496 2D TAATAGTAAC AT/-- ATGCAAAATA 1126 het 1126 ref 25 19 3 4 AT 2 1 336471 CASAVA_Build 9 1493107 4I CAAAATATAT ----/CTTA AAAGGAATCT 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 CTTA 0 1 336472 CASAVA_Build 9 1494707 1I TTGAAGTGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 T 7 8 336473 CASAVA_Build 9 1495361 2I TAAACAAGAC --/TT TTTATCTACA 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 T 3 5 336474 CASAVA_Build 9 1495558 4I CATTTGTTCC ----/ATTT ATTTTATGGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 ATTT 1 2 336475 CASAVA_Build 9 1504311 1I GTTTTAGAGC -/A AGGAGTGAGA 3070 hom 108 het 43 0 34 9 A 1 2 336476 CASAVA_Build 9 1519268 1I GTCCTTTTTT -/C CCCCCCCAAA 3070 hom 116 het 48 0 38 10 C 7 8 336477 CASAVA_Build 9 1520509 1D ATCTGTCAGG A/- ACTTGTGGAA 3070 hom 123 het 50 0 41 9 A 2 1 336478 CASAVA_Build 9 1522600 1D GTTAAGCTTC T/- TGAGGTTTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 2 1 336479 CASAVA_Build 9 1526498 11I TAATTAGGCT -----------/AAAGTTTTGGG GAAGTTTTTC 3070 hom 84 het 34 0 29 6 AAAGTTTTGGG 0 1 336480 CASAVA_Build 9 1527350 1I TTATTACTAA -/T TAGGAGCAAT 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 T 1 2 336481 CASAVA_Build 9 1555054 1I AATTGGGCAA -/T TAACCAAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 336482 CASAVA_Build 9 1565158 1D AAAGTTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 27 4 T 11 10 336483 CASAVA_Build 9 1568771 2I TAAGAAGTTG --/AC ATATTGGTAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AC 0 1 336484 CASAVA_Build 9 1569385 2I61M4D TATGTGTGTG --TATATATATATGTATGTATATATTTTGGCACAAAAGGAAGGACAATGGTGTGAATACTTTTAGAG/TATATATATATATGTATGTATATATTTTGGCACAAAAGGAAGGACAATGGTGTGAATACTTTT---- AGAGTGAAAG 3070 het 490 hom 36 3 53 11 N/A 0 0 336485 CASAVA_Build 9 1572537 1D ATGTTTTCTT C/- CCCCCCCTTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 8 7 336486 CASAVA_Build 9 1572728 1D GTGTTCCCCT C/- CCCTGTGCCC 3070 hom 81 het 32 0 29 4 C 4 3 336487 CASAVA_Build 9 1579825 1D GGGCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 984 hom 33 4 16 13 A 17 16 336488 CASAVA_Build 9 1582201 1I CCCATTTTAC -/A GATGTTAAAT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 0 1 336489 CASAVA_Build 9 1584818 6D AATAAGTGTT GATGAA/------ GATGTGGAAG 3070 hom 129 het 47 0 40 9 GATGAA 1 0 336490 CASAVA_Build 9 1587793 1I ATTATCTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 8 9 336491 CASAVA_Build 9 1596657 2D TTGGGCATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 52 2 28 22 T 16 14 336492 CASAVA_Build 9 1596672 2D TTTTTTTTTT TC/-- TCCTGGGAAC 3070 het 86 hom 43 1 24 21 TC 2 1 336493 CASAVA_Build 9 1601610 1D ACATAGGCAT A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 A 8 7 336494 CASAVA_Build 9 1605005 1I TCTTCTGTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 46 0 37 9 A 10 11 336495 CASAVA_Build 9 1610880 1I ATGGGGTTTT -/C TTTTTTTTGT 3070 hom 24 het 27 1 24 2 C 0 1 336496 CASAVA_Build 9 1615402 2D CCCCATCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 A 12 10 336497 CASAVA_Build 9 1616663 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 31 1 24 9 A 12 11 336498 CASAVA_Build 9 1624079 1D GACTGAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 14 hom 24 1 19 6 A 10 9 336499 CASAVA_Build 9 1632114 1I AGTTTTTTTT -/A ATTTATCCAG 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 1 2 336500 CASAVA_Build 9 1633928 1I CTTTTATTTC -/T TTTTTTTTGG 2559 het 2559 ref 23 14 6 3 T 8 9 336501 CASAVA_Build 9 1636080 2D TTTTTTTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 32 2 26 5 T 13 11 336502 CASAVA_Build 9 1640315 1D ATTGTTCTGC A/- AAAAAATGCC 3070 het 3070 ref 49 23 21 6 A 7 6 336503 CASAVA_Build 9 1653540 4I CTGATATGTC ----/ATAA ATAAATAAGA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 ATAA 2 3 336504 CASAVA_Build 9 1658381 1D TTCCGAGTCC A/- AAAAAAAAAA 2144 het 2144 ref 42 29 6 7 A 12 11 336505 CASAVA_Build 9 1660678 5I CTGAAAAAGA -----/TAAGT TCAAGCACAT 3070 het 3070 hom 55 21 27 7 TAAGT 0 1 336506 CASAVA_Build 9 1669256 1D TTCCATGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 39 0 28 11 T 12 11 336507 CASAVA_Build 9 1673656 2D GCTAACTACA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 GT 7 6 336508 CASAVA_Build 9 1677650 1I GGGCAGGCCA -/G GGGGGGCTTT 3070 hom 97 het 37 0 29 8 G 6 7 336509 CASAVA_Build 9 1699609 3I CTAAATTTTT ---/TTC TTAGACATCG 3070 hom 60 het 26 0 20 6 TTC 0 1 336510 CASAVA_Build 9 1707688 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 18 0 15 3 T 11 12 336511 CASAVA_Build 9 1708434 1I ATGACATCCA -/G CCACAGTAAG 3070 hom 151 het 60 0 51 9 G 0 1 336512 CASAVA_Build 9 1711962 1I ACTCAGGGGA -/G GGGACTGGCG 3070 hom 88 het 34 0 30 4 G 3 4 336513 CASAVA_Build 9 1720950 1D AAACTGTCTT A/- AGTCTTTTTG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 2 1 336514 CASAVA_Build 9 1730493 1I GTAGAGTTTA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 7 8 336515 CASAVA_Build 9 1738903 1D ATACCTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 27 0 19 8 T 14 13 336516 CASAVA_Build 9 1746943 1I TCACACTTCA -/C TTTTGTCCCA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 0 1 336517 CASAVA_Build 9 1753920 1D ACCCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1733 het 1733 ref 24 16 4 4 A 13 12 336518 CASAVA_Build 9 1766806 1D ACTAGAGGAG A/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 31 0 26 5 A 1 0 336519 CASAVA_Build 9 1776586 1D CTCGTTTGTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 24 14 7 3 T 9 8 336520 CASAVA_Build 9 1796824 1I TATTTTTCTA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 T 6 7 336521 CASAVA_Build 9 1798763 1I TGCTTAGCAG -/T AATTCATATA 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 T 0 1 336522 CASAVA_Build 9 1812480 2D GCAACTCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 1937 het 1937 ref 21 9 4 8 T 12 10 336523 CASAVA_Build 9 1815274 6I CTTTAAAAAC ------/ATTCTT ATATCTGGTC 3070 het 1433 hom 21 3 13 5 ATTCTT 0 1 336524 CASAVA_Build 9 1816060 1I ATTTTTGTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1302 hom 40 3 35 2 T 9 10 336525 CASAVA_Build 9 1819148 4I TTAAAATAAA ----/TAAG TAATTGAATG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 TAAG 0 1 336526 CASAVA_Build 9 1828176 2I GTCCTCACAC --/TG TTGCCTTCCC 3070 het 3070 ref 54 26 26 2 TG 0 1 336527 CASAVA_Build 9 1958615 5D TGAGTGTATT TTTTG/----- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 10 TTTTG 2 1 336528 CASAVA_Build 9 2020542 1D TTCCTCTAGC T/- TTTTTTTTTT 1899 het 1899 ref 32 13 7 13 T 19 18 336529 CASAVA_Build 9 2040323 1D CCTGTACTGC T/- TTTTTTTTTT 1172 het 1172 ref 41 30 3 8 T 11 10 336530 CASAVA_Build 9 2046862 1I AGACCCTGGG -/T CTTTGCTCAC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 0 1 336531 CASAVA_Build 9 2053741 1I TAGTGTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 32 2 22 8 T 12 13 336532 CASAVA_Build 9 2055701 1I ATTCTTCTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 8 9 336533 CASAVA_Build 9 2099633 1D GATTTCTTGT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 2027 hom 21 6 12 3 G 8 7 336534 CASAVA_Build 9 2104009 12D CCAGACAGCA TAGAACGTTTAC/------------ TATTGCGCCC 3070 het 3070 ref 29 20 10 5 TAGAACGTTTAC 1 0 336535 CASAVA_Build 9 2131193 1D TTCTCTCAGT A/- TATCTACTAT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 A 1 0 336536 CASAVA_Build 9 2135305 16D CTCTTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAG 3070 het 1228 hom 29 8 11 11 A 25 9 336537 CASAVA_Build 9 2146350 1I ATTTAGATAA -/T TTTGGTTTCT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 T 3 4 336538 CASAVA_Build 9 2154341 4D TACAGACTCT TGTC/---- TGTCTTGATT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 TGTC 2 1 336539 CASAVA_Build 9 2162239 1I CTGAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 A 10 11 336540 CASAVA_Build 9 2162821 1I AGGGAGCCGA -/G CATCAGCCCT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 G 0 1 336541 CASAVA_Build 9 2166728 1I AAGTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 T 11 12 336542 CASAVA_Build 9 2168094 1D CCATGCATAC A/- AGGAGTTCAA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 A 2 1 336543 CASAVA_Build 9 2171207 2I TATGTACGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 TA 5 6 336544 CASAVA_Build 9 2176865 1I ATATTAGCCT -/A ACTACACATT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 1 2 336545 CASAVA_Build 9 2177229 1D TTTTAAAATA T/- TTACCTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 3 2 336546 CASAVA_Build 9 2184613 4I18M8I CGTGATCTGC ----CTGTCTCGGCCTCCCAAA--------/CTGTCTGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG GTGCTGGGAT 1870 het 1870 ref 15 7 8 2 N/A 0 0 336547 CASAVA_Build 9 2186918 1D CAGCATCAGC A/- TGACTTGGAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 A 1 0 336548 CASAVA_Build 9 2187222 1D AAAGCTGAAT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 32 3 24 5 A 1 0 336549 CASAVA_Build 9 2192786 1D TACACTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 12 11 336550 CASAVA_Build 9 2193126 1I CAAAAAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 99 het 44 0 34 10 A 8 9 336551 CASAVA_Build 9 2195147 1I TGTTACGGTA -/T TTTTTGTACC 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 T 5 6 336552 CASAVA_Build 9 2196530 1D GGATTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2213 hom 26 7 12 7 A 12 11 336553 CASAVA_Build 9 2197473 5D CCTAGCAGAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 113 hom 23 3 11 9 T 21 16 336554 CASAVA_Build 9 2204269 1D TAGCGGGCCA G/- GGAGGTTACT 3070 het 2813 hom 26 7 14 5 G 3 2 336555 CASAVA_Build 9 2216116 5D CTGAAGTGAG TATAC/----- TATAATATAC 2094 het 1159 hom 10 3 6 3 TATAC 1 0 336556 CASAVA_Build 9 2218945 4I GATAGGGAGG ----/GTTT GTTTGTTTGT 3070 hom 105 het 44 0 36 9 GTTT 3 4 336557 CASAVA_Build 9 2235813 6I GTGGGGCTTG ------/TTCCCT TTCCCTCACT 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 TTCCCT 1 2 336558 CASAVA_Build 9 2239523 9D TTGGGTGATC CACCCGCTG/--------- TGGCCTCCCA 2178 het 1212 hom 12 3 6 5 CACCCGCTG 1 0 336559 CASAVA_Build 9 2241401 1D CAGAGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 2142 het 2142 ref 27 18 6 3 T 15 14 336560 CASAVA_Build 9 2244185 3D GACAGTTCCC TTT/--- TCTGGCTCCC 3070 het 3070 hom 32 13 13 8 T 4 1 336561 CASAVA_Build 9 2246074 1D AAGACAGTTA C/- TCGTATCTCC 3070 het 3070 hom 61 25 30 7 C 1 0 336562 CASAVA_Build 9 2262127 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1138 het 829 hom 7 3 4 0 T 11 10 336563 CASAVA_Build 9 2266713 2D CCCGACCCCT TC/-- TCTCTGTGTC 3070 het 3070 ref 33 15 14 5 TC 3 2 336564 CASAVA_Build 9 2277306 1I CCACAGCAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 9 10 336565 CASAVA_Build 9 2292603 2I CCCAGCAAAG --/GA CCCTCTTTGC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 GA 0 1 336566 CASAVA_Build 9 2292675 1I TGCTTGGAGC -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 7 8 336567 CASAVA_Build 9 2341650 1I CTTCGTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2632 hom 28 8 14 6 T 10 11 336568 CASAVA_Build 9 2349197 1D GAAGTGCTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 T 10 9 336569 CASAVA_Build 9 2351361 1D ACCTTGGCCA T/- TTGTATCCAA 3070 hom 90 het 38 0 29 9 T 3 2 336570 CASAVA_Build 9 2351751 2I TGTTATCATG --/TA GGAGCCAAGG 3070 het 3070 ref 45 26 16 3 TA 0 1 336571 CASAVA_Build 9 2354857 5D TATAAGCAAA TAACT/----- TTATATAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 TAACT 1 0 336572 CASAVA_Build 9 2361494 1I AGCAGAGTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 T 8 9 336573 CASAVA_Build 9 2364084 1I AGGGTATCAG -/A AAAAACTAAC 3006 het 3006 ref 23 14 7 2 A 5 6 336574 CASAVA_Build 9 2364976 1D GAAAATATTT G/- CAGACTATTC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 G 1 0 336575 CASAVA_Build 9 2373935 1D CAAAGGAAAC A/- GCTGAGACCA 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 A 1 0 336576 CASAVA_Build 9 2374060 1D TGTGTCAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 10 9 336577 CASAVA_Build 9 2375858 1D CTGTAGGCAC A/- GGGCTACAGC 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 A 1 0 336578 CASAVA_Build 9 2379756 1I CTCTATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 12 14 10 T 11 12 336579 CASAVA_Build 9 2387704 1I AGGTTTTCAA -/C CTTTTAGCTA 3070 hom 48 het 29 0 17 12 C 1 2 336580 CASAVA_Build 9 2394366 1D CAACTGAACT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 22 het 21 1 19 3 A 8 7 336581 CASAVA_Build 9 2394476 1I AGAAATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 A 10 11 336582 CASAVA_Build 9 2398050 4D GTTCTTAAGA TTGT/---- TTATCTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 TTGT 1 0 336583 CASAVA_Build 9 2406671 1D ACCTTTTGCC T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 67 het 29 0 24 7 T 8 7 336584 CASAVA_Build 9 2406829 1I TAGTTAGAAA -/C CCAATAATTT 3070 hom 80 het 41 1 38 2 C 2 3 336585 CASAVA_Build 9 2409796 1I ACGGTTTTAG -/T TGCCTGGGAA 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 T 1 2 336586 CASAVA_Build 9 2410025 1D TCAAGTCAAA G/- GACAGGGAAA 3070 het 3070 hom 51 23 22 7 G 2 1 336587 CASAVA_Build 9 2423665 4D TTTTAAAAAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 TTTA 3 2 336588 CASAVA_Build 9 2425599 1D GGGTTTTCTA G/- GTACACAATC 3070 hom 65 het 28 0 24 8 G 2 1 336589 CASAVA_Build 9 2428107 1D TTTTTTTTTT G/- ATTATTCCCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 0 336590 CASAVA_Build 9 2430516 1D CATAATCCCA T/- TTTTTTGGAG 3070 hom 82 het 30 0 28 3 T 7 6 336591 CASAVA_Build 9 2447122 1D TAAGAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 T 12 11 336592 CASAVA_Build 9 2449494 1D GAGGAGGGGG A/- ATATCCCCTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 A 2 1 336593 CASAVA_Build 9 2455842 1D CCAGATATCT A/- ATCAGTGAGA 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 A 2 1 336594 CASAVA_Build 9 2460282 1D TGCAAATGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 9 8 336595 CASAVA_Build 9 2460758 1D AGCTGAGATT A/- AAAATGAGGT 3070 het 3070 hom 43 15 23 6 A 5 4 336596 CASAVA_Build 9 2461570 1D AATACATTCC T/- TTTATTCATG 3070 het 3070 ref 46 22 21 4 T 4 3 336597 CASAVA_Build 9 2462122 1I ACTGCCTTTT -/G ACTTACAGGC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 G 0 1 336598 CASAVA_Build 9 2469236 1D AATGTGCCCC T/- AGGCAAATTG 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 T 1 0 336599 CASAVA_Build 9 2471701 1I5M25D2M16D CAGTTTCCCA -TGCTCTCATGCTATAATACATTCCCATGGGAATGCTCTCATTCCCATG/GTGGTC-------------------------AA---------------- CTGATCATGC 3070 het 3070 ref 40 35 19 1 N/A 0 0 336600 CASAVA_Build 9 2480543 1D TTTGGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 11 10 336601 CASAVA_Build 9 2485326 1I GTCATGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 821 hom 41 2 24 15 T 12 13 336602 CASAVA_Build 9 2495975 1D TCTAGCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2482 hom 29 7 14 8 T 11 10 336603 CASAVA_Build 9 2501783 4I CCATGTGTGC ----/AGGA AGGACCCCAC 3070 het 3070 ref 40 19 10 11 AGGA 1 2 336604 CASAVA_Build 9 2512875 1D GCAAGCAAAC A/- ACAATAAAAC 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 A 2 1 336605 CASAVA_Build 9 2523931 3I TAAGAAAGTA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 24 3 10 11 T 11 14 336606 CASAVA_Build 9 2524565 1D ACCAGTGGTT G/- TAAGATGCAC 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 G 1 0 336607 CASAVA_Build 9 2532712 1I AGTGAACATA -/C GTGTGCATGT 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 C 0 1 336608 CASAVA_Build 9 2534895 1D ACCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 10 9 336609 CASAVA_Build 9 2535648 2I CCAAACAATT --/TC TGTTTCTAAT 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 TC 0 1 336610 CASAVA_Build 9 2540842 1I AATTCTATGC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 A 8 9 336611 CASAVA_Build 9 2542347 1I CTCTAAATCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 A 8 9 336612 CASAVA_Build 9 2551380 1I AGAATGCATG -/A AGAGTCTCTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 2 336613 CASAVA_Build 9 2551962 1D TTTCCCAGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 55 het 36 0 28 9 A 10 9 336614 CASAVA_Build 9 2570335 1D AAGACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 2907 het 2907 ref 18 11 7 0 A 10 9 336615 CASAVA_Build 9 2571751 1I TTTGTGATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 9 10 336616 CASAVA_Build 9 2576373 4D AATGAAATTG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 42 het 20 0 15 6 AAAC 5 4 336617 CASAVA_Build 9 2576732 2D AATTACCAAC AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 36 1 32 3 A 11 9 336618 CASAVA_Build 9 2580399 1D ATAGTTGATC A/- AAAATTGATG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 5 4 336619 CASAVA_Build 9 2580821 10D AGCTTTAGGC TGAATCAAGG/---------- TGACTTACTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 8 TGAATCAAGG 1 0 336620 CASAVA_Build 9 2581518 1I AAAATCAGCC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 8 9 336621 CASAVA_Build 9 2589825 1I TTCTTGTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 17 0 A 9 10 336622 CASAVA_Build 9 2592540 2I CTAGGAGGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 14 7 A 11 13 336623 CASAVA_Build 9 2598957 3I GAGAAAAGGG ---/AAC AACATCATTT 3070 het 3070 ref 42 20 20 2 AAC 1 2 336624 CASAVA_Build 9 2600131 1I AGAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 A 9 10 336625 CASAVA_Build 9 2606124 1D GAATTTCCAC T/- GTTTTTACAT 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 T 1 0 336626 CASAVA_Build 9 2613474 1I CAGGGGCCCT -/A GCCGGCCTGC 3070 hom 47 het 23 0 12 11 A 0 1 336627 CASAVA_Build 9 2616813 4D TTACATCACA AGTT/---- TGTTAGAACT 3070 hom 147 het 53 0 49 7 AGTT 1 0 336628 CASAVA_Build 9 2617066 3I ACCATAGCAC ---/TGG TGGTTCCTTC 3070 hom 111 het 46 0 38 8 TGG 1 2 336629 CASAVA_Build 9 2621701 1D TGGGTTAAAG A/- ATACAAACCT 3070 het 3070 ref 45 20 20 6 A 2 1 336630 CASAVA_Build 9 2625952 1I TGGACATGAG -/A AAAATCCCAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 4 5 336631 CASAVA_Build 9 2627635 1I CCTCCTTACG -/T TTTTCTAAGA 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 4 5 336632 CASAVA_Build 9 2637142 4D AGAACTCAGT CAGC/---- CAGCCAACCC 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 CAGC 2 1 336633 CASAVA_Build 9 2644732 1I AGTGAGTTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 8 9 336634 CASAVA_Build 9 2644891 2I TCTTCTTATG --/AA AAAGTCTAGA 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 A 3 5 336635 CASAVA_Build 9 2646447 5D AAAATTTATA AAAAT/----- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 23 14 8 2 AAAAT 1 0 336636 CASAVA_Build 9 2650057 3I TTTGGGATAA ---/TTG TTGTGAGCCT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 TTG 1 2 336637 CASAVA_Build 9 2650164 1I CCTTTCTAGG -/A AACAAGTAGG 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 A 2 3 336638 CASAVA_Build 9 2672382 1D TGGATTTCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 73 het 33 0 25 8 A 10 9 336639 CASAVA_Build 9 2683340 2I CTGAAGAAAT --/AA AAGTCCATAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 4 336640 CASAVA_Build 9 2687694 1I AACCTTTCAG -/T TCCCTTCTGG 3070 hom 129 het 48 0 42 6 T 1 2 336641 CASAVA_Build 9 2691159 1I TATGAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1185 hom 32 3 25 4 A 11 12 336642 CASAVA_Build 9 2697851 4I GTATATGGAT ----/AGAG AGAGACAGCA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 AG 2 4 336643 CASAVA_Build 9 2699119 1D TACCTTTCTC A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 57 29 25 4 A 9 8 336644 CASAVA_Build 9 2703614 1I AGAATCACTG -/A AAAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 A 3 4 336645 CASAVA_Build 9 2721380 2D TATTGGATTA CT/-- TTTTAATTTA 3070 het 3070 ref 47 26 17 5 CT 1 0 336646 CASAVA_Build 9 2738799 1I ATGCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 19 2 10 7 T 15 16 336647 CASAVA_Build 9 2750916 1D GACAACATGG C/- GCTAGCCAGG 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 C 1 0 336648 CASAVA_Build 9 2751826 1I TTGTCCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 25 25 6 T 10 11 336649 CASAVA_Build 9 2765760 1D TTCCTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 10 9 336650 CASAVA_Build 9 2770497 1I AAAGTCCTGC -/T TTTTCTGTTA 3070 het 3070 hom 38 10 24 4 T 4 5 336651 CASAVA_Build 9 2782707 2D26M2D25M2D GGATGTATAC ATACACACACACATATATATGTGTATATACACACACATACACATATATGTATACATG/--ACACACACACATATATATGTGTATAT--ACACACATACACATATATGTATACA-- TGTGTGTACA 3070 het 3070 hom 59 35 27 23 N/A 0 0 336652 CASAVA_Build 9 2786136 2D TTGAATCCCC CA/-- CTTCTCTGCT 3070 het 3070 ref 60 30 24 8 CA 1 0 336653 CASAVA_Build 9 2806319 1D TTTTGTTCTG A/- AAACAGGGTG 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 4 3 336654 CASAVA_Build 9 2812729 2D TATTTATAAC AT/-- AATAATATAA 2315 het 1581 hom 11 4 5 3 AT 1 0 336655 CASAVA_Build 9 2823693 1D GTAAAAAAAA T/- AATAAAACAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 1 0 336656 CASAVA_Build 9 2824834 4I AAGTCGAATA ----/TCTT TCTATCACCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 TCTT 0 1 336657 CASAVA_Build 9 2825563 4D TTACTTATAT ATTC/---- ATTCCCTGTC 3070 het 3070 hom 35 11 21 4 ATTC 2 1 336658 CASAVA_Build 9 2864680 1D CCAGTAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 T 11 10 336659 CASAVA_Build 9 2867212 3I CTGCTTTTCT ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 45 0 38 7 A 9 12 336660 CASAVA_Build 9 2873562 1D TATGGCTATA T/- TAGTATTCCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 2 1 336661 CASAVA_Build 9 2880908 8D TGTGTGTGTG TATATATA/-------- TATATATATA 3070 hom 69 het 24 0 24 5 TA 18 14 336662 CASAVA_Build 9 2892739 1D TATGGAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 13 14 11 T 12 11 336663 CASAVA_Build 9 2918009 1I TTTAAATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 10 11 336664 CASAVA_Build 9 2933519 2I GTTTTAAAAA --/CT CTGGTTTACT 3070 het 3070 hom 35 10 23 2 CT 1 2 336665 CASAVA_Build 9 2957657 1I TTTAAAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 10 11 336666 CASAVA_Build 9 2984832 1D ATTCTGTGTG A/- AAAAAAAAAA 2174 het 2174 ref 59 39 6 14 A 12 11 336667 CASAVA_Build 9 3002540 1D TCACATGACC T/- TTTGTGACTG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 4 3 336668 CASAVA_Build 9 3009415 1I ATTAATAAAT -/A AAAAAAACCT 3070 het 157 hom 35 1 30 4 A 7 8 336669 CASAVA_Build 9 3010087 1I GCTCTCAGGC -/T TGTAAACCAT 3070 hom 129 het 52 0 44 8 T 1 2 336670 CASAVA_Build 9 3018474 5D TCATTTTGAT AAAGG/----- AAAATGGACA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AAAGG 1 0 336671 CASAVA_Build 9 3020370 2D TAACCATCAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 114 het 47 0 38 9 AT 7 6 336672 CASAVA_Build 9 3027763 1I TGGGACCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 352 hom 34 2 26 6 T 10 11 336673 CASAVA_Build 9 3067869 1I CCTCTTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 122 hom 32 1 25 6 A 8 9 336674 CASAVA_Build 9 3080766 2D TTTTTCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 991 het 519 hom 24 7 5 14 T 20 18 336675 CASAVA_Build 9 3085247 1D ACACACACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 12 11 336676 CASAVA_Build 9 3093094 1I ATAAAAAAAA -/T ATTTTACAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 0 1 336677 CASAVA_Build 9 3095403 1D GTCAACAGAC A/- AAAAAATGAC 3070 hom 135 het 49 0 46 3 A 7 6 336678 CASAVA_Build 9 3100934 2I TGGACAAGCG --/CC CCCCCCCGTG 3070 hom 47 het 20 0 15 5 C 7 9 336679 CASAVA_Build 9 3107836 1D TTATCTTGTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 379 hom 20 1 17 2 A 10 9 336680 CASAVA_Build 9 3109342 1I CTGACTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 29 0 23 6 T 10 11 336681 CASAVA_Build 9 3116224 1I ATAGGAAAAT -/G GGAAGTGAAT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 2 3 336682 CASAVA_Build 9 3123152 2D AAAACAGGGA AC/-- ATCACTTCAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AC 1 0 336683 CASAVA_Build 9 3125564 11D TGCCTCGGCC TCCCAAAGAGT/----------- TGGGATTACA 3070 hom 54 het 19 0 18 2 TCCCAAAGAGT 1 0 336684 CASAVA_Build 9 3128006 2I ACTAAAATAC --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 9 11 336685 CASAVA_Build 9 3131226 2I CAGGAGTTAG --/AC ACCAGCCTGG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 AC 1 2 336686 CASAVA_Build 9 3131588 4D ACATAGTATG AAAC/---- AAAGAAAAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 AAAC 1 0 336687 CASAVA_Build 9 3131757 1D TTTTTCAGAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 92 het 36 0 31 7 A 9 8 336688 CASAVA_Build 9 3134812 3I TCTTTTCTTC ---/TTT ATTAGTCTGG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 0 3 336689 CASAVA_Build 9 3139082 21I CTAGCTCAGT ---------------------/GTCTGCCCAAAGGGCAGCCCA GTTTTGTGCT 3070 hom 50 het 20 0 17 3 GTCTGCCCAAAGGGCAGCCCA 0 1 336690 CASAVA_Build 9 3142143 1D ATACACGGGG C/- CAGGGGGTGG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 2 1 336691 CASAVA_Build 9 3148269 1I AGATCACAGC -/A GTACTATGTA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 0 1 336692 CASAVA_Build 9 3163015 10D TATGTTATTA TTATTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 18 1 15 5 TTATTTTTTT 1 0 336693 CASAVA_Build 9 3167273 1D TTTTTTTGTT C/- CCCCCTTTTC 3070 hom 48 het 33 0 23 10 C 6 5 336694 CASAVA_Build 9 3173795 2D TGTCTTCTCT TC/-- TGTCTCTTAC 3070 hom 98 het 40 0 32 9 TC 1 0 336695 CASAVA_Build 9 3176997 1D ACTCTAACTT G/- GGAAAAGTGC 3070 hom 103 het 43 0 35 9 G 3 2 336696 CASAVA_Build 9 3184299 4D AGGGGGTCTC ACTT/---- ACCCTTTGGG 3070 hom 144 het 52 0 44 8 ACTT 1 0 336697 CASAVA_Build 9 3185861 3D AAAGAAAACA AAC/--- TTAGAATTAT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 AAC 1 0 336698 CASAVA_Build 9 3186306 1D GGATCAGGAG T/- TGGGGGTAGG 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 T 2 1 336699 CASAVA_Build 9 3189125 3D AGACAGGAGG ACT/--- ACTAGCTCTT 3070 het 3070 hom 47 19 25 5 ACT 2 1 336700 CASAVA_Build 9 3193771 1D TATTAAAACA T/- TAAGGCACAG 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 T 2 1 336701 CASAVA_Build 9 3197640 1D GGTTTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 17 8 T 12 11 336702 CASAVA_Build 9 3209571 1D AAATGAAAGG A/- AAAAAAAATC 1079 het 1079 ref 39 32 3 4 A 9 8 336703 CASAVA_Build 9 3210637 1I TCTCTTCCTA -/C CCCCCCCCTT 3070 het 3070 ref 29 10 12 7 C 8 9 336704 CASAVA_Build 9 3223836 1D CCTGGCACAT A/- AGGAAGCACT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 2 1 336705 CASAVA_Build 9 3237256 1I CCAGCCCTTG -/T TTATATTCAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 3 336706 CASAVA_Build 9 3243550 1D AAGGCAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 76 het 54 1 47 6 T 10 9 336707 CASAVA_Build 9 3249508 1I CTTAAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 10 11 336708 CASAVA_Build 9 3261528 14D CTCCCTTCTT TCTTTCTCTCTTTC/-------------- TCTTTCTCTC 3070 hom 26 het 24 0 14 10 TCTTTCTCTCTTTC 2 1 336709 CASAVA_Build 9 3294616 11D TGTTCTTGTG GTAGTGAGTAA/----------- GTCTCACGAG 3070 het 3070 ref 37 23 15 7 GTAGTGAGTAA 1 0 336710 CASAVA_Build 9 3346081 2D TATTAGGGGG AA/-- AAAAATCTAA 3070 hom 7 het 25 1 14 11 A 7 5 336711 CASAVA_Build 9 3358805 1D AACTGGATGA C/- AGAGTTAATT 3070 het 3070 ref 46 29 14 4 C 1 0 336712 CASAVA_Build 9 3364434 5D ATAATTCACA AGGGC/----- AGGGCCAAAA 3070 het 3070 ref 50 27 22 2 AGGGC 2 1 336713 CASAVA_Build 9 3374214 1I GAATACCTCA -/G TGTTTGCATT 3070 hom 113 het 47 0 35 12 G 0 1 336714 CASAVA_Build 9 3386620 1D CGCCACACTG A/- CTTCCACAAT 3070 het 931 hom 10 2 8 0 A 1 0 336715 CASAVA_Build 9 3388340 1D GACAGGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 13 12 15 A 12 11 336716 CASAVA_Build 9 3406498 1D ATTCTTATTA G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 G 5 4 336717 CASAVA_Build 9 3425383 4D TTTTGTATAT TTAG/---- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 TTAG 1 0 336718 CASAVA_Build 9 3426951 1I TTAATTTTTT -/A TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 A 0 1 336719 CASAVA_Build 9 3454210 2D ACTTTGGAAA AC/-- AGTTTGGCAG 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 AC 1 0 336720 CASAVA_Build 9 3564416 1I AGGCTAAATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 8 9 336721 CASAVA_Build 9 3574735 5D ACTGAAACTT AAAAC/----- AAACATGGTG 3070 het 3070 ref 38 23 10 6 AAAAC 1 0 336722 CASAVA_Build 9 3579000 4I AAACTGTCTT ----/TTTG TTTGGTTCCT 3070 hom 91 het 34 0 30 4 TTTG 1 2 336723 CASAVA_Build 9 3580989 1D AATAAAGAAG A/- AAACTCCAGA 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 A 4 3 336724 CASAVA_Build 9 3581153 1D GGATCAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 448 hom 26 1 16 10 A 12 11 336725 CASAVA_Build 9 3581612 1D GAAAAAAAAA T/- AAATTTAGAT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 1 0 336726 CASAVA_Build 9 3589559 3D GGTAGAAAAC ATT/--- ATTAAACTAT 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 ATT 2 1 336727 CASAVA_Build 9 3590043 6I ATATTTTGTC ------/ATAAGT ATAATAGAAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 ATAAGT 0 1 336728 CASAVA_Build 9 3600204 1I TCCTTTTTTT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 A 8 9 336729 CASAVA_Build 9 3608083 1D CTTCTTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2779 hom 32 10 13 9 T 15 14 336730 CASAVA_Build 9 3609184 1D TTTTGATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 T 11 10 336731 CASAVA_Build 9 3610741 1I TTTGCCAGTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 2550 hom 22 7 12 3 T 8 9 336732 CASAVA_Build 9 3613118 1I TCCACTTGAT -/C AATTCAGCTA 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 C 0 1 336733 CASAVA_Build 9 3657442 2I37M3I1M2D TAACAAAGTC --GGGATTCATTCTATATGATATCCAATGAGTATGGCAT---CCA/AGGGGATTCATTCTATATGATATCCAATGAGTATGGCATTGGC-- ATGAGTATAG 3070 het 3070 ref 39 29 11 8 N/A 0 0 336734 CASAVA_Build 9 3693308 1I AAAAGGAGTA -/T TAAGTTTGTT 3070 hom 114 het 47 0 38 9 T 1 2 336735 CASAVA_Build 9 3696414 2I TATTTTTGGC --/AA AAAAAAAAAA 2989 het 2842 hom 30 8 10 12 A 15 17 336736 CASAVA_Build 9 3699833 1D GCCCAGGCAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 25 8 11 6 T 8 7 336737 CASAVA_Build 9 3702426 1I AGGATTCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 8 9 336738 CASAVA_Build 9 3702582 1I AGATAAATCT -/A AAAAAATAAT 1865 het 1865 ref 29 17 5 7 A 6 7 336739 CASAVA_Build 9 3713357 1D AGGAAATGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 T 6 5 336740 CASAVA_Build 9 3723227 2I ACTTAGTAAC --/TG GGGTCACAGA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 TG 0 1 336741 CASAVA_Build 9 3725022 1I AAGTAGGCAG -/A AAAAACAGCC 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 A 5 6 336742 CASAVA_Build 9 3741562 15D TACCAGCTTC TTATGCTGGTAAATA/--------------- TAAATTAACC 3070 hom 75 het 27 0 26 4 TTATGCTGGTAAATA 1 0 336743 CASAVA_Build 9 3742289 2D GAGGAATCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 31 0 24 7 A 14 12 336744 CASAVA_Build 9 3746130 2I ATTAGCTTCC --/TA TATAGCCACT 3070 het 3070 hom 59 21 33 5 TA 2 3 336745 CASAVA_Build 9 3749737 1D TTTCCACCCC A/- AAAAATATCA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 6 5 336746 CASAVA_Build 9 3752638 2D TTTGTGTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 38 7 21 11 T 15 13 336747 CASAVA_Build 9 3757144 2D CTTCTCTAAG CA/-- CAGAGTAGGA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 CA 2 1 336748 CASAVA_Build 9 3759322 18D GCCTAGGTCA GCTGCTTCGGGAGATGAG/------------------ GCTGCTTCCA 3070 het 3070 ref 38 19 18 6 GCTGCTTCGGGAGATGAG 1 0 336749 CASAVA_Build 9 3765847 2I AGAATTTGCT --/AA AGAGAGTGGC 3070 hom 138 het 53 0 47 6 A 1 3 336750 CASAVA_Build 9 3776405 1I TTATATATTT -/C CCCTGGGAGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 3 4 336751 CASAVA_Build 9 3785994 1I CCCATTTTTG -/T TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 T 6 7 336752 CASAVA_Build 9 3795200 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGA 2642 het 2642 ref 20 10 8 2 T 9 8 336753 CASAVA_Build 9 3810138 1I TTCCCCACAG -/C CCCTGCTAAT 3070 het 3070 hom 51 23 25 3 C 3 4 336754 CASAVA_Build 9 3816472 1I GCAGGTTTTT -/G TAAAGTGGCT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 G 0 1 336755 CASAVA_Build 9 3817608 1I GACCTTTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 147 hom 25 1 17 7 T 9 10 336756 CASAVA_Build 9 3820209 1D TTCCTTTCAA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 33 18 12 5 T 8 7 336757 CASAVA_Build 9 3828745 5I GATGGGAAAG -----/GAAAA GAAAAGGGAC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 GAAAA 1 2 336758 CASAVA_Build 9 3837215 1D ATACATAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 9 8 336759 CASAVA_Build 9 3841696 1I TTCTTCATTT -/G GGAAGACCAA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 G 2 3 336760 CASAVA_Build 9 3844544 1I GTTGATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 16 5 T 11 12 336761 CASAVA_Build 9 3845964 1I GCAACAGCAC -/A AATGTCACTT 3070 het 3070 ref 39 23 15 1 A 2 3 336762 CASAVA_Build 9 3851550 1I TGCCCATCAA -/T GATAGACCGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 0 1 336763 CASAVA_Build 9 3852917 1I TGGGGAGGTA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 63 het 22 0 21 1 T 6 7 336764 CASAVA_Build 9 3856465 3D TCTCAGAAAC AAA/--- AAGTAAAGGG 3070 het 3070 hom 31 13 13 6 A 5 2 336765 CASAVA_Build 9 3858370 1D74M1D ATGGAAGTAA TTTTTTTTTTGACACTCAGCGACTCTTCAAAACCCTGGTAGTTCATGACTACATAAAATACAAGCTTCAAATTGCT/-TTTTTTTTTGACACTCAGTGACTCTTCAAAACCCTGGTAGTTCATGACTACATAAAATACAAGCTTCAAATTGC- TAGGGACAAA 3070 het 3070 hom 31 16 17 23 N/A 0 0 336766 CASAVA_Build 9 3858815 28D TTCTTAGCTT TTGTATACAACACTTGTTGTACATAGTG/---------------------------- TTGTATACAA 3070 hom 90 het 36 0 29 15 TTGTATACAACACTTGTTGTACATAGTG 1 0 336767 CASAVA_Build 9 3859242 2I ACTACATTAA --/AG AGAGAGTGAG 3070 het 2893 hom 39 12 12 18 AG 3 4 336768 CASAVA_Build 9 3863838 1D CATAGAGACT A/- AAAAAAACTG 3070 hom 129 het 47 0 44 4 A 8 7 336769 CASAVA_Build 9 3865434 1I ACTCAGCCCA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 T 8 9 336770 CASAVA_Build 9 3866320 4D GATGAAAAAG AAAT/---- AAAAATTAAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 AAAT 1 0 336771 CASAVA_Build 9 3867253 1I GCATTTTTTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 41 18 21 2 A 7 8 336772 CASAVA_Build 9 3872216 2I GATGAACAAG --/AT ATATAAATGC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AT 2 3 336773 CASAVA_Build 9 3872477 13D CTACGGCTGG TGCATTAGCTGGC/------------- TGCATTAGCA 3070 het 3070 ref 56 32 12 13 TGCATTAGCTGGC 1 0 336774 CASAVA_Build 9 3884720 3D AAAACATCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 7 T 13 10 336775 CASAVA_Build 9 3889427 1I AGTTACATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 10 11 336776 CASAVA_Build 9 3890485 1D AAGATTTGTA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 8 7 336777 CASAVA_Build 9 3904137 4D ACTTGGGTAG TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 TTTC 4 3 336778 CASAVA_Build 9 3904991 17D TGAGCACTGT ATGTCTTAGAGCAATGC/----------------- ATGTCTTAGA 3070 hom 141 het 61 0 48 20 ATGTCTTAGAGCAATGC 2 1 336779 CASAVA_Build 9 3913584 1I CAGAAAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 40 1 29 10 T 10 11 336780 CASAVA_Build 9 3942096 1D GCAGATCTGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 52 34 12 7 A 9 8 336781 CASAVA_Build 9 3943764 39D2M1D AGATTTGCTC TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATA/---------------------------------------AT- TATATATATA 3070 het 3070 hom 21 13 11 5 N/A 0 0 336782 CASAVA_Build 9 3957141 1D CTATCTGCCA T/- ACACCTGGCC 3070 het 3070 ref 46 22 22 2 T 1 0 336783 CASAVA_Build 9 3964958 1D AACGTGATAA G/- GCACATGGAG 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 G 2 1 336784 CASAVA_Build 9 3966492 1D CCATTGCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 T 10 9 336785 CASAVA_Build 9 3975097 1D CTCAATTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 22 0 15 7 A 13 12 336786 CASAVA_Build 9 4027956 1I CCAGGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 12 10 2 A 10 11 336787 CASAVA_Build 9 4028301 4I CCAACTTGTT ----/ACCA GGTTCCAAAA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 ACCA 0 1 336788 CASAVA_Build 9 4032951 1D GCTTGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 23 0 13 10 A 15 14 336789 CASAVA_Build 9 4047710 1D TGCAGCTAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 A 9 8 336790 CASAVA_Build 9 4051064 1D TACTGATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2502 hom 33 9 14 10 T 12 11 336791 CASAVA_Build 9 4057162 1D TCTTCTTTTA T/- TTTTTTTTAA 2617 het 2617 ref 20 8 6 6 T 9 8 336792 CASAVA_Build 9 4057804 1I ACATTAGAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 A 10 11 336793 CASAVA_Build 9 4058319 4D CTTATCTTAC AGAG/---- AATCAGTAGT 3070 het 3070 ref 37 19 17 2 AG 2 0 336794 CASAVA_Build 9 4080452 1I GGACTTAAAG -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 T 3 4 336795 CASAVA_Build 9 4081526 10D CGCACACGTG CACACAAACA/---------- CACACACACA 3070 het 3070 ref 28 12 12 9 CACACAAACA 1 0 336796 CASAVA_Build 9 4089463 2D CAATGCACAC AT/-- GTCTTTGTGT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 AT 1 0 336797 CASAVA_Build 9 4104032 1I ACGTTCCCCC -/T AATTCCCTTA 3070 het 3070 ref 47 18 18 11 T 0 1 336798 CASAVA_Build 9 4116482 1I ATCTACTCAA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 82 het 34 0 28 6 T 6 7 336799 CASAVA_Build 9 4117784 1D TTCTGTCAAA T/- TTAATGTCAT 3070 hom 126 het 45 0 43 3 T 3 2 336800 CASAVA_Build 9 4127592 3D AGTAAGATGA TAT/--- TATTAGGAAC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 TAT 2 1 336801 CASAVA_Build 9 4133565 2D AGACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 2133 hom 17 6 9 2 A 11 9 336802 CASAVA_Build 9 4135453 2D GCTGTGATAC AT/-- ATAGTACAAC 3070 het 3070 ref 56 29 22 7 AT 2 1 336803 CASAVA_Build 9 4137665 3I AACAATGACT ---/CCC CCCTTCAAGG 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 C 3 6 336804 CASAVA_Build 9 4138825 1D AGCCTGGAGT G/- GGGGTAACGT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 G 5 4 336805 CASAVA_Build 9 4140048 2I GCACACATAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 43 16 18 9 AC 6 7 336806 CASAVA_Build 9 4144610 6I GCGAATCAAT ------/GATAAA GATAAACATT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 GATAAA 1 2 336807 CASAVA_Build 9 4149724 1I ATTTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 17 0 A 10 11 336808 CASAVA_Build 9 4151850 3D CTAATTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 24 0 15 9 T 14 11 336809 CASAVA_Build 9 4152943 3D CAAGAAAATG TTC/--- TTTTTAACTG 2399 het 2399 ref 24 19 5 0 TTC 1 0 336810 CASAVA_Build 9 4153245 8D TGTGCACTGG CACACACA/-------- CACACACACA 3070 het 2074 hom 31 9 14 11 CA 12 8 336811 CASAVA_Build 9 4160423 2D AAAACCACAC AT/-- GAGTCAGCAA 3070 het 3070 ref 61 30 20 12 AT 1 0 336812 CASAVA_Build 9 4165485 6D TGAACACAAA TAACTT/------ TAACTTTTAT 3070 hom 103 het 39 0 34 7 TAACTT 2 1 336813 CASAVA_Build 9 4174892 1I TATTAAATAT -/A TGGGTTACAT 3070 het 3070 ref 51 22 16 13 A 0 1 336814 CASAVA_Build 9 4187949 2D AGGGAAAGAG AA/-- AGAGACAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 3 1 336815 CASAVA_Build 9 4188429 2D AATTTCATCA AT/-- AGACTGAACC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 AT 1 0 336816 CASAVA_Build 9 4194914 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 9 10 336817 CASAVA_Build 9 4203928 2D ACACAGAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1333 hom 40 8 13 19 A 15 13 336818 CASAVA_Build 9 4213578 2I ATGAAAGAAG --/TT TGTTTTAATC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 3 336819 CASAVA_Build 9 4221110 4I ATGTTCAGGA ----/TAAT TAATGAGATG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 TAAT 1 2 336820 CASAVA_Build 9 4230196 1D TGGGGGAGGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 68 het 32 0 17 16 G 11 10 336821 CASAVA_Build 9 4238240 1D CTTCCCCCAG C/- CCCCCATCCC 3070 hom 102 het 38 0 32 6 C 6 5 336822 CASAVA_Build 9 4241428 1D AGGATTGCAA T/- CTTTTTTTTT 2315 hom 33 het 19 0 14 5 T 1 0 336823 CASAVA_Build 9 4246807 2I CAAAAAAGTT --/AA AAGAGAACTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 2 4 336824 CASAVA_Build 9 4253514 1I CATTGAGGCC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 A 9 10 336825 CASAVA_Build 9 4263155 1D ATTTCAAAAG A/- CAAGTCTCAA 3070 het 3070 hom 51 25 24 3 A 1 0 336826 CASAVA_Build 9 4265604 1I TACAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1807 het 1807 ref 26 8 9 9 A 13 14 336827 CASAVA_Build 9 4269707 1D GTCGGTTTGC T/- TAGCTGTGTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 2 1 336828 CASAVA_Build 9 4273270 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 25 1 17 7 T 14 13 336829 CASAVA_Build 9 4274962 1D TTTAGTGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 T 10 9 336830 CASAVA_Build 9 4278495 1D AAAGGAGTCA T/- TTTTTTTGGC 3070 het 426 hom 31 1 26 4 T 8 7 336831 CASAVA_Build 9 4278752 1I AAAACAACAA -/C AAAGTATACT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 0 1 336832 CASAVA_Build 9 4284708 1I ATTAAGTTTT -/G GGGGTCATAG 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 G 4 5 336833 CASAVA_Build 9 4286293 1D CAGTCAGAGG A/- AAAAAAAAAA 2378 het 1630 hom 32 10 9 13 A 18 17 336834 CASAVA_Build 9 4290338 2I TTAAACTGAC --/TT TTATTTTAAC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 2 4 336835 CASAVA_Build 9 4293130 4I ACAGTAAACC ----/ACTT ACTTACAAAC 3070 hom 118 het 48 0 40 8 ACTT 1 2 336836 CASAVA_Build 9 4295749 2I TTTTCTCCTC --/TA TGTGTTGTGG 3070 hom 111 het 42 0 36 6 TA 0 1 336837 CASAVA_Build 9 4296262 1I TGTAGAGGCA -/G GGGGGGTCTC 2424 het 2212 hom 24 9 7 8 G 6 7 336838 CASAVA_Build 9 4296301 1D GGGTTTTTCA G/- GGTAAAGTTA 3070 het 3070 ref 37 9 9 20 G 3 2 336839 CASAVA_Build 9 4301953 3D GGACACAGAG AGA/--- AGAACTACAG 3070 het 3070 hom 43 20 18 7 AGA 2 1 336840 CASAVA_Build 9 4306873 3D ATCTTTATTT AGA/--- AGAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 AGA 2 1 336841 CASAVA_Build 9 4306962 3I TTTTTTAATA ---/TGT TGTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 TGT 1 2 336842 CASAVA_Build 9 4309535 1I ATACTAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 10 11 336843 CASAVA_Build 9 4317981 1I AAAGTAGGAA -/G GGCAAAAGCC 3070 het 3070 ref 47 25 21 1 G 2 3 336844 CASAVA_Build 9 4318757 3D AGGTATGGAC ATA/--- ATCTCTCTGC 3070 het 3070 ref 50 27 18 7 ATA 1 0 336845 CASAVA_Build 9 4321131 8D GTTCTAGAAG CTGTAAGT/-------- CTCAAGTTGT 3070 het 3070 ref 38 24 12 4 CTGTAAGT 1 0 336846 CASAVA_Build 9 4321394 1I CTAGACCCTA -/T TTCCAAATAA 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 T 2 3 336847 CASAVA_Build 9 4326513 1I GTTGATATCA -/G CCCTTTCTCT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 336848 CASAVA_Build 9 4333176 3D TCATCTCTTC AAA/--- AAAAAATTAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 9 6 336849 CASAVA_Build 9 4336399 1I GACTGCCCTG -/C CCCTGAAGCA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 C 3 4 336850 CASAVA_Build 9 4338337 15D CGGGAAACAG CTTTCTGAGGTTATC/--------------- TCACGATCCA 3070 hom 50 het 21 0 18 7 CTTTCTGAGGTTATC 1 0 336851 CASAVA_Build 9 4356954 1I TTTCTGCCAC -/T TTTCCAGCAG 3070 hom 144 het 53 0 46 7 T 3 4 336852 CASAVA_Build 9 4363292 1D CCCTTCACCT A/- AATCAGTAGT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 3 2 336853 CASAVA_Build 9 4369980 1D CCAGGAGGAC T/- TGGGTTCCAA 3070 hom 144 het 52 0 47 6 T 2 1 336854 CASAVA_Build 9 4372531 2D ATTCCTATGG TT/-- CTTTTGTTCT 3070 het 3070 ref 45 20 18 8 T 2 0 336855 CASAVA_Build 9 4373617 1D CTGGATGCAG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 129 het 45 0 44 3 A 7 6 336856 CASAVA_Build 9 4374343 1D CCTTCACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 11 10 336857 CASAVA_Build 9 4375666 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 779 het 482 hom 11 3 3 5 A 17 16 336858 CASAVA_Build 9 4376393 1D TTTTCTTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 8 7 336859 CASAVA_Build 9 4405798 4I AATTTTAACT ----/TTTC TTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 TTTC 1 2 336860 CASAVA_Build 9 4408269 1D TATGTATTGC A/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 A 7 6 336861 CASAVA_Build 9 4434529 3D TTTTGTATTC CAA/--- CAACTTCAAA 3070 het 3070 ref 64 31 28 5 CAA 2 1 336862 CASAVA_Build 9 4451372 3I TTAAAGAACC ---/AAT AATTCTTCTC 3070 hom 169 het 63 0 57 6 AAT 1 2 336863 CASAVA_Build 9 4464023 1D AGTTCCCCCC T/- AAAGCTATCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 1 0 336864 CASAVA_Build 9 4473220 1I AAATGCCGTA -/G AATTGGTTGC 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 G 0 1 336865 CASAVA_Build 9 4484295 7D AAATTGGAGA TATTACT/------- TATTACTTCG 3070 hom 75 het 26 0 25 4 TATTACT 2 1 336866 CASAVA_Build 9 4487124 1I GGGTGGTTTT -/A AAAAAACAGA 70 het 70 ref 22 17 1 4 A 6 7 336867 CASAVA_Build 9 4488542 1I TAGGGAAAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 8 9 336868 CASAVA_Build 9 4489588 1I TCAAAACTCC -/A AACAAAATGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 3 336869 CASAVA_Build 9 4505612 15I ATGAACATCA ---------------/ACATCAGTGTGAAGC ACAATGTCAA 3070 hom 150 het 51 0 49 4 ACATCAGTGTGAAGC 0 1 336870 CASAVA_Build 9 4527049 1D GTTGTGGAGT G/- GGGGGAGGAG 3070 het 1730 hom 14 5 7 2 G 6 5 336871 CASAVA_Build 9 4538793 1D TTTAAAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 101 het 41 0 35 6 A 10 9 336872 CASAVA_Build 9 4545991 1D ACTAGCCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 487 hom 22 2 12 8 T 15 14 336873 CASAVA_Build 9 4549469 1D TCATAATGGT G/- ATCACTTCCT 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 G 1 0 336874 CASAVA_Build 9 4549548 1D CCAGTCACTT A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 8 7 336875 CASAVA_Build 9 4558418 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1152 het 1152 ref 30 20 5 5 A 15 14 336876 CASAVA_Build 9 4591369 1I TTACGGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1385 hom 21 4 14 3 T 11 12 336877 CASAVA_Build 9 4656070 4I ATATGGAGAA ----/TCTT AAAGACAAAG 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 TCTT 0 1 336878 CASAVA_Build 9 4660188 1I AAAAAGGCAT -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 6 7 336879 CASAVA_Build 9 4660983 1D CTCAACAGAC T/- TCATTTGTCA 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 T 2 1 336880 CASAVA_Build 9 4662035 1I GTCTGATGAT -/A AAAAATATGG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 5 6 336881 CASAVA_Build 9 4668812 1D AAACACATGG A/- AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 A 7 6 336882 CASAVA_Build 9 4670614 3D TATCCAAATG TGA/--- TATACTATTA 3070 het 3070 ref 37 23 10 5 TGA 1 0 336883 CASAVA_Build 9 4686486 1D CTTTATGGAG A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 8 7 336884 CASAVA_Build 9 4688942 1I TTTGGAAAAC -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 A 0 1 336885 CASAVA_Build 9 4691842 1D ACAGTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 9 T 11 10 336886 CASAVA_Build 9 4696859 4D TCAAGCTCAC TCTT/---- TCTTAACATA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 TCTT 2 1 336887 CASAVA_Build 9 4697048 1D TTAAAAATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 10 9 336888 CASAVA_Build 9 4697352 1D GGTTATATTT G/- GGTGTAGTCT 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 G 3 2 336889 CASAVA_Build 9 4698415 2D GTCCATTTAT TC/-- TCTGTTAACT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 TC 2 1 336890 CASAVA_Build 9 4700754 3D TCTACAAAAA AAT/--- AAAATTAGCC 3070 het 3070 hom 33 17 15 2 AAT 1 0 336891 CASAVA_Build 9 4709040 4I AGGAGTTTTG ----/GTCA GTCAGAGGAT 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 GTCA 1 2 336892 CASAVA_Build 9 4714785 1D TTTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 26 1 22 3 A 13 12 336893 CASAVA_Build 9 4721575 1I AAGCTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 30 1 24 5 A 13 14 336894 CASAVA_Build 9 4722117 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTAC 2780 het 2780 ref 31 16 10 5 T 8 9 336895 CASAVA_Build 9 4723334 1I CAAGGGCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 16 19 0 A 9 10 336896 CASAVA_Build 9 4724319 14I7M1I TATAAGAAAA --------------TAAGCCC-/TAAATTATGTGGTTTAAGCCCT CCTAGTGTGT 3070 het 3070 ref 34 20 13 5 N/A 0 0 336897 CASAVA_Build 9 4737514 1I CCCTGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2720 hom 25 9 11 5 A 13 14 336898 CASAVA_Build 9 4739850 2I CAGAATGAGA --/CT CTGTCTCAAA 392 het 392 ref 16 3 3 10 CT 1 2 336899 CASAVA_Build 9 4745584 1I GTGTTAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 A 10 11 336900 CASAVA_Build 9 4747419 1D ATCTGCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 10 12 A 12 11 336901 CASAVA_Build 9 4748903 3D AATTGGCCAG AAA/--- AAAAAAAAAG 797 het 18 hom 23 0 5 18 A 12 9 336902 CASAVA_Build 9 4757256 2D CAATGTACTC TT/-- TTCTTGTCTT 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 4 2 336903 CASAVA_Build 9 4761562 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 2856 het 2856 ref 24 11 9 4 A 9 10 336904 CASAVA_Build 9 4766625 1I GATCTTTCAC -/T GCTTGAGCTA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 0 1 336905 CASAVA_Build 9 4778866 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 22 7 13 2 A 7 6 336906 CASAVA_Build 9 4780875 1I TAACTCATGG -/A AAATAGAGAG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 3 4 336907 CASAVA_Build 9 4788879 1D AGACTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2540 hom 25 het 21 0 9 12 T 19 18 336908 CASAVA_Build 9 4802345 1D TTTAAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 T 11 10 336909 CASAVA_Build 9 4805454 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 32 4 T 12 11 336910 CASAVA_Build 9 4807147 1D AATGTTGGGG A/- AAAAAAACTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 336911 CASAVA_Build 9 4821641 1D GCCCAGCTTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 33 13 13 8 T 9 8 336912 CASAVA_Build 9 4828588 2D ACTGTAACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 105 het 44 0 34 11 AC 6 5 336913 CASAVA_Build 9 4836569 1D CTTATTTGTA G/- GGGGGCGGGA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 6 5 336914 CASAVA_Build 9 4839094 1I CTGATTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1211 hom 35 4 23 8 T 13 14 336915 CASAVA_Build 9 4839169 1D GAAAGTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 308 hom 36 1 28 7 T 15 14 336916 CASAVA_Build 9 4845363 2I GAGCGGTGGG --/TC TCTCTTTGCC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TC 2 3 336917 CASAVA_Build 9 4847459 1D TTTATGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 132 het 49 0 44 6 A 11 10 336918 CASAVA_Build 9 4855147 1D CTCCCACATG C/- CCCCCTCTTG 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 C 6 5 336919 CASAVA_Build 9 4874308 1I CACCCCCCAG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 99 het 38 0 32 6 T 7 8 336920 CASAVA_Build 9 4895423 1D CCAAGGAAAA G/- TTGCCAAATT 3070 het 3070 ref 39 25 11 3 G 1 0 336921 CASAVA_Build 9 4899202 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTG 2036 hom 15 het 9 0 6 3 T 10 9 336922 CASAVA_Build 9 4901900 1I TCCTGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 11 12 336923 CASAVA_Build 9 4910544 1D GCTGCATGCT G/- GGAGAACCAC 1421 het 1421 ref 10 6 3 1 G 3 2 336924 CASAVA_Build 9 4914299 1I TTCCTCCTGC -/A GGCCCCTCAT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 A 0 1 336925 CASAVA_Build 9 4914998 1D GTCTCAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 34 2 20 12 A 13 12 336926 CASAVA_Build 9 4926284 7D GGAGGTAGGT AATGTAA/------- AATATATCAG 3070 het 3070 ref 50 24 23 6 AATGTAA 1 0 336927 CASAVA_Build 9 4952212 1D TCTGTTTACA T/- TGCCCACTTG 3070 het 3070 ref 34 21 10 3 T 2 1 336928 CASAVA_Build 9 4954250 1D ACAGTGTGTA T/- TTTTTTTTTT 1580 het 1580 ref 41 32 4 5 T 11 10 336929 CASAVA_Build 9 4970757 1D AATCAAGGGG T/- TGTGGGAAGC 3070 het 3070 hom 35 12 20 4 T 2 1 336930 CASAVA_Build 9 4971685 1D GATTTGTAGT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 8 7 336931 CASAVA_Build 9 4977693 7D CCGAGATCTC ACCACTG/------- CACTCCAGGC 332 het 332 ref 19 7 3 10 ACCACTG 1 0 336932 CASAVA_Build 9 4991626 1D TTGCCTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 13 10 T 15 14 336933 CASAVA_Build 9 5000382 1D GGAGTGCAGT A/- AACATGACCT 2288 het 2288 ref 19 7 5 8 A 3 2 336934 CASAVA_Build 9 5005539 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 10 10 T 14 13 336935 CASAVA_Build 9 5055131 1D GTATGTTTAG A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 A 7 6 336936 CASAVA_Build 9 5060228 5D GCAAAATTAA TTATC/----- TTAATTATCC 3070 het 3070 hom 26 12 11 6 TTATC 1 0 336937 CASAVA_Build 9 5064467 1D TTCAAACTTT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 7 6 336938 CASAVA_Build 9 5066946 1I ATATTTTTTT -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 6 7 336939 CASAVA_Build 9 5071260 1I AATTATAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 10 11 336940 CASAVA_Build 9 5073787 1I TTTCAAGTAA -/T TTTTTCTAGT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 5 6 336941 CASAVA_Build 9 5077475 17I AACCATATCA -----------------/CTGGTAGTTCTTTTACT CTCCCTTACT 3070 het 3070 ref 34 19 14 2 CTGGTAGTTCTTTTACT 0 1 336942 CASAVA_Build 9 5078543 1D AGACATCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 11 10 336943 CASAVA_Build 9 5080967 3D TCAAACTTTA TTG/--- TTGTTATTTA 3070 het 3070 ref 37 22 13 5 TTG 2 1 336944 CASAVA_Build 9 5088698 1I CTTCAATTCC -/T TTTTTTTTTT 2086 het 2086 ref 22 9 6 7 T 14 15 336945 CASAVA_Build 9 5101359 1D CCCGGTACTA C/- CCCTCCTACG 1928 het 1928 ref 29 13 8 8 C 4 3 336946 CASAVA_Build 9 5115682 20D17M5I ATGTACTTTT GCCAAGTTGATAGGGGAGAAGTTATATATATTTTAAT-----/--------------------CTTTTATTAATGTGATTGACTA TTCCATTTCT 2403 het 2403 ref 35 34 7 4 N/A 0 0 336947 CASAVA_Build 9 5117975 3I AATGAGCATA ---/CAT CATCTTAAAT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 CAT 1 2 336948 CASAVA_Build 9 5128731 1I AAACTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 189 hom 20 1 16 3 A 9 10 336949 CASAVA_Build 9 5128918 1D AAAATAAATA T/- AATAATCCTC 3070 het 1552 hom 23 5 14 5 T 1 0 336950 CASAVA_Build 9 5130716 1I TGGGGATTCA -/C TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 C 0 1 336951 CASAVA_Build 9 5137667 2I AGTTTCTTAT --/TC TCTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 TC 2 3 336952 CASAVA_Build 9 5139709 1D AGCAATGTCA T/- TTTTTCACAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 6 5 336953 CASAVA_Build 9 5140257 2D AAGACATAGT TA/-- TAAACTAGAA 3070 het 3070 ref 51 25 24 2 TA 2 1 336954 CASAVA_Build 9 5141223 1I TTATACCCCC -/T AAATCAATAT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 0 1 336955 CASAVA_Build 9 5146142 1I TCTTAAAAGG -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 A 7 8 336956 CASAVA_Build 9 5149360 1D TCAGAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 23 7 T 12 11 336957 CASAVA_Build 9 5153634 3I CAGCTTAAGA ---/CTT GAGTTTCAAC 3070 het 3070 hom 50 14 28 8 CTT 0 1 336958 CASAVA_Build 9 5153849 1D GCACAATTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 10 23 4 A 9 8 336959 CASAVA_Build 9 5158806 4I AAAATGAAGG ----/AAAA AATGTTAAGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 2 6 336960 CASAVA_Build 9 5160557 1I ATCCAGGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2679 hom 29 9 13 7 T 13 14 336961 CASAVA_Build 9 5163777 1D AAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 12 10 A 13 12 336962 CASAVA_Build 9 5166720 2D AAATCAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 14 12 336963 CASAVA_Build 9 5172302 1D GATATATCTT A/- AAACATATGA 3070 het 3070 ref 31 14 13 5 A 4 3 336964 CASAVA_Build 9 5175131 1D CCTCCAAGTT A/- AAAAAAAAAG 1356 het 1356 ref 42 35 3 5 A 10 9 336965 CASAVA_Build 9 5177240 1I CTGAATGGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 11 12 336966 CASAVA_Build 9 5191432 3D AATCTTTCTA TTG/--- TTGTTAAAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 4 TTG 2 1 336967 CASAVA_Build 9 5191516 2I ATATCAATAA --/AC ACAGTGTCAG 3070 het 3070 hom 51 20 27 4 AC 1 2 336968 CASAVA_Build 9 5192953 1D TGTTTGTCTG T/- TAACAGGTAT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 2 1 336969 CASAVA_Build 9 5193565 1I CTAGACAGGC -/A AAAAACCACC 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 A 5 6 336970 CASAVA_Build 9 5208714 1D AATTGAGCCT A/- AATTTTAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 28 4 A 3 2 336971 CASAVA_Build 9 5223558 1D TGGAGGCAAT G/- GGTACATTGT 3070 het 3070 hom 53 22 22 9 G 3 2 336972 CASAVA_Build 9 5229798 2D TTTTTTAATG TT/-- TTTTTTTTTT 149 het 147 ref 8 2 1 5 T 14 12 336973 CASAVA_Build 9 5235316 1D CACCATCAAA T/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 1 0 336974 CASAVA_Build 9 5236164 2I CCTCATGGTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 12 21 9 A 10 12 336975 CASAVA_Build 9 5236715 1I ATGTCCCTGC -/A AAGGACATGA 3070 hom 21 het 12 0 8 4 A 2 3 336976 CASAVA_Build 9 5240919 3D CCCAGAGGAA AAG/--- AAGTCATTAC 3070 het 3070 hom 30 13 16 3 AAG 2 1 336977 CASAVA_Build 9 5242804 2D GATTTCAATC TT/-- TTTATGGCTG 3070 het 3070 ref 37 22 12 4 T 5 3 336978 CASAVA_Build 9 5247272 1D TAGCTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 T 11 10 336979 CASAVA_Build 9 5259158 3D TAGAGAGATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 7 A 16 13 336980 CASAVA_Build 9 5262476 1D TTGGAAAACA C/- ACACCCCTAG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 C 1 0 336981 CASAVA_Build 9 5309988 2D AAGCTAACAC TT/-- TTTTTTTTTT 1612 hom 21 het 13 0 6 7 T 16 14 336982 CASAVA_Build 9 5318771 1I ATTCTTAAAG -/A AAAGAATTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 3 4 336983 CASAVA_Build 9 5319583 1I AAACGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 2855 hom 15 het 6 0 6 0 A 11 12 336984 CASAVA_Build 9 5339496 1I TGATTATAAT -/A TGTCTTGATG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 0 1 336985 CASAVA_Build 9 5341279 1D CTGTTGGGTA C/- CTTAGTATCA 3070 het 3070 hom 49 24 21 4 C 2 1 336986 CASAVA_Build 9 5345224 1I GTTATTTTTG -/T TTTAACTGGG 3070 hom 154 het 55 0 52 3 T 3 4 336987 CASAVA_Build 9 5345656 3I TGTGATGATT ---/ATA ATAAGCTAGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATA 1 2 336988 CASAVA_Build 9 5345769 3I ATTAATATAA ---/ATG ATGAAGAAAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 ATG 1 2 336989 CASAVA_Build 9 5355117 1D TCTACTCTCC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 109 het 39 0 35 5 A 9 8 336990 CASAVA_Build 9 5355512 1D GATCTTGGGC T/- TTGCTTAGTT 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 3 2 336991 CASAVA_Build 9 5367250 1D CAAGTAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 11 10 336992 CASAVA_Build 9 5371683 1I AACACGCTTT -/A AAAAGGGGTC 3070 het 3070 ref 53 23 22 8 A 4 5 336993 CASAVA_Build 9 5376375 1D TTTGCCTCCC A/- GGGGATATTT 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 A 1 0 336994 CASAVA_Build 9 5380236 2D TGTGTGTGTG TA/-- TGTGTATATA 3070 het 2603 hom 31 14 14 8 TA 1 0 336995 CASAVA_Build 9 5391296 1D GGACGGGCTA G/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 G 1 0 336996 CASAVA_Build 9 5397653 1D CAAATTTTTC A/- AAAAAAAAAA 1577 het 1577 ref 41 32 6 4 A 13 12 336997 CASAVA_Build 9 5407657 1I TAAAGTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 11 12 336998 CASAVA_Build 9 5428970 6D CTAAAACCAG GCGAGA/------ GCGAGAGCGG 3070 hom 108 het 43 0 36 8 GCGAGA 2 1 336999 CASAVA_Build 9 5430076 4D GGCAGGGGAA ACAT/---- ACATAAGTAA 3070 hom 102 het 39 0 35 6 ACAT 2 1 337000 CASAVA_Build 9 5431824 2I GTGTGTATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 AT 5 6 337001 CASAVA_Build 9 5435875 1D TTAGAATCAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 10 9 337002 CASAVA_Build 9 5444629 2D ATATACAGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 57 21 28 10 AT 7 6 337003 CASAVA_Build 9 5552643 1D CTATTGATAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 10 9 337004 CASAVA_Build 9 5563227 6D CAAAAAATGC ATATAT/------ ATATATATAT 1354 het 57 hom 11 1 4 6 AT 11 8 337005 CASAVA_Build 9 5577045 4I GCACCAAGAT ----/AGAG AGATAGTAAA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 AG 1 3 337006 CASAVA_Build 9 5581150 4I TGTAACTTTG ----/GGTA TGACATTTGA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 GGTA 0 1 337007 CASAVA_Build 9 5589426 1I TCTAAACCCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 10 11 337008 CASAVA_Build 9 5599891 2I GTGATTTAAA --/AT AGAGTAACAC 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 AT 0 1 337009 CASAVA_Build 9 5600459 2I AAGCCACTTC --/CA CACACAGTCA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 CA 3 4 337010 CASAVA_Build 9 5601731 2I TAAAAAACTT --/AA AGACTGAGTG 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 A 1 3 337011 CASAVA_Build 9 5609249 4I TTGTAATAAC ----/ACTT AGCTTAAAAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 ACTT 0 1 337012 CASAVA_Build 9 5616401 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 9 0 8 1 T 13 14 337013 CASAVA_Build 9 5634077 1D ATGGTTTAAA T/- TTTTAAGAGC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 5 4 337014 CASAVA_Build 9 5634854 2D CCAAAGTGAC TG/-- TAGCATTTTA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TG 1 0 337015 CASAVA_Build 9 5639740 1D TAATTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 165 hom 35 2 24 10 T 12 11 337016 CASAVA_Build 9 5642685 1D AATTTGGATA C/- TTTTTATTCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 0 337017 CASAVA_Build 9 5652468 1I CCTGGGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 651 hom 25 2 17 6 T 11 12 337018 CASAVA_Build 9 5656805 10D GATTTATATT GATTACCAAA/---------- ACTCAAGTCA 3070 hom 111 het 41 0 38 6 GATTACCAAA 1 0 337019 CASAVA_Build 9 5658242 1I CCATGACACA -/T GGGGATTATG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 0 1 337020 CASAVA_Build 9 5678185 4D ATGCATTGTT TTGA/---- TTGGTTGATT 3070 hom 104 het 41 0 35 9 TTGA 1 0 337021 CASAVA_Build 9 5683910 1I GAGTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 13 14 337022 CASAVA_Build 9 5684797 1I TTTTGGTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 776 hom 31 2 21 8 T 12 13 337023 CASAVA_Build 9 5689496 1D TTTCAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 39 2 32 6 T 13 12 337024 CASAVA_Build 9 5701570 2D ATCTTTATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TA 7 6 337025 CASAVA_Build 9 5719850 1D GAAAAAACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 10 9 337026 CASAVA_Build 9 5722533 1D AAAATACTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 35 1 30 4 T 11 10 337027 CASAVA_Build 9 5724605 1D ATATTCATAG T/- TTTAACGTTG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 4 3 337028 CASAVA_Build 9 5727603 10I CACACACATG ----------/TGTGTGTATA TTTTATATCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TGTGTGTATA 0 1 337029 CASAVA_Build 9 5729862 1I CAGGGTCCCA -/T TTTTTTTCCA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 T 7 8 337030 CASAVA_Build 9 5734047 1I TTGATCTGAT -/A AAAATCACAA 3070 hom 91 het 36 0 28 8 A 4 5 337031 CASAVA_Build 9 5737796 1I TTTCAGCCTC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 7 8 337032 CASAVA_Build 9 5740764 1I TCATGACCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 8 9 337033 CASAVA_Build 9 5746495 1I TGTTAGAGGT -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 7 8 337034 CASAVA_Build 9 5746640 1D AGATACTAAA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 8 7 337035 CASAVA_Build 9 5757480 1I TCATATTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 676 hom 45 4 28 13 T 13 14 337036 CASAVA_Build 9 5761594 2D TTTGAGGAAT CG/-- CCATGTTTCC 3070 hom 135 het 52 0 45 7 CG 1 0 337037 CASAVA_Build 9 5769604 1I CTAGCCGCAG -/T TTTTTTTTTT 2294 hom 32 het 17 0 10 7 T 11 12 337038 CASAVA_Build 9 5771835 3D ATAAAACAGA CTT/--- CTTTAAACCA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 CTT 2 1 337039 CASAVA_Build 9 5787065 1I TTTTGAGACA -/G GGGTCTTGCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 3 4 337040 CASAVA_Build 9 5796429 1D CCATATAAAC T/- TTTTTTTTTT 1079 het 1079 ref 26 18 3 5 T 17 16 337041 CASAVA_Build 9 5803078 1I ATTCCGGCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 8 9 337042 CASAVA_Build 9 5825351 6I AGACAATGAA ------/CGCGCG CGCGCGCGCG 3070 hom 76 het 31 0 22 9 CG 5 8 337043 CASAVA_Build 9 5838615 2I GGTTTTCTAC --/AA AAGGATTTAG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 4 337044 CASAVA_Build 9 5842253 1I CAGCAGAGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 359 hom 40 2 30 8 T 9 10 337045 CASAVA_Build 9 5855150 1I TTATATAAAA -/G TAAATGAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 0 1 337046 CASAVA_Build 9 5865135 2I ACACACACAC --/AT TCACAGTAAG 3070 hom 148 het 58 0 50 8 AT 0 1 337047 CASAVA_Build 9 5870482 1D CCACTGCACT C/- CAGCCTCGGC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 2 1 337048 CASAVA_Build 9 5873168 4D AAAAAAACAA AAAC/---- AAAGACAAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AAAC 1 0 337049 CASAVA_Build 9 5890926 2D GTCAGGGCAC TG/-- TGTTTTTCAA 3070 hom 111 het 45 0 37 8 TG 2 1 337050 CASAVA_Build 9 5892022 1I CTGGCCTCAT -/A AGCAATGAGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 2 337051 CASAVA_Build 9 5915359 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2145 het 37 hom 11 1 8 2 A 15 14 337052 CASAVA_Build 9 5918845 1I CATGAGAATG -/T TAAGTCACAG 3070 hom 129 het 50 0 43 7 T 1 2 337053 CASAVA_Build 9 5941329 1I ATTAGGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 30 0 23 7 A 12 13 337054 CASAVA_Build 9 5950563 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 15 1 10 5 A 15 14 337055 CASAVA_Build 9 5951958 1I TTTTGAAGGG -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 57 het 24 0 18 6 T 6 7 337056 CASAVA_Build 9 5955057 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 1628 het 15 hom 8 1 4 3 A 17 16 337057 CASAVA_Build 9 5967887 2I TAAGGCAGAC --/AA AAAGCCATCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 5 337058 CASAVA_Build 9 5970015 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 26 2 19 5 A 14 13 337059 CASAVA_Build 9 5981181 6D TGTGTGTGTG TATATA/------ TATATATATA 3070 hom 75 het 29 0 26 7 TA 10 7 337060 CASAVA_Build 9 5982717 2D TTTCTCCCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 31 7 T 13 11 337061 CASAVA_Build 9 5982928 1D CATTATGTGA T/- TTTTCTTTTG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 5 4 337062 CASAVA_Build 9 5986308 1D TGTAACTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 40 0 32 8 T 11 10 337063 CASAVA_Build 9 5987442 1I AAAAAATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 42 1 31 10 T 10 11 337064 CASAVA_Build 9 5988294 1I TACACATTTT -/A AATTAATAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 3 337065 CASAVA_Build 9 6006835 1D GGATGCGGTT A/- ACTAGAATCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 1 337066 CASAVA_Build 9 6070408 1I TGGCCGCCCC -/T GATCCCGCCC 3070 hom 44 het 16 0 12 4 T 0 1 337067 CASAVA_Build 9 6070475 1D CTTCTGGTTG C/- CCCCCAGTCC 3070 hom 27 het 17 0 9 8 C 6 5 337068 CASAVA_Build 9 6081303 1I AGATATAAGG -/A ATTCTTTTAA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 A 1 2 337069 CASAVA_Build 9 6082990 2D GCATTTTTTT TA/-- TATGTTTGTT 3070 hom 76 het 29 0 26 5 TA 2 1 337070 CASAVA_Build 9 6103626 2I GTGAGAATCT --/CA CCGTTTTTGT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 CA 0 1 337071 CASAVA_Build 9 6106544 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 57 het 20 0 19 1 T 6 7 337072 CASAVA_Build 9 6107590 1I CTCTTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 16 8 T 13 14 337073 CASAVA_Build 9 6112630 1D TTCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 31 0 30 1 T 12 11 337074 CASAVA_Build 9 6116040 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 11 12 337075 CASAVA_Build 9 6116858 1I AACAGAGGTT -/A TCAGGGGCTG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 A 0 1 337076 CASAVA_Build 9 6145341 1D GTATACAAAC T/- TTTCTCAAGT 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 T 4 3 337077 CASAVA_Build 9 6218907 1I AAGTAAAAAC -/A AAAAAACCAA 3070 hom 68 het 31 0 21 10 A 6 7 337078 CASAVA_Build 9 6224762 1I GCCTCCGTCT -/C CCTTCTTTCC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 2 3 337079 CASAVA_Build 9 6226713 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAAATTG 3070 hom 56 het 20 0 19 2 A 8 7 337080 CASAVA_Build 9 6242054 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAAAAC 543 het 237 hom 14 3 4 8 AAC 1 0 337081 CASAVA_Build 9 6242331 2D AGCAGGCTAT AA/-- AAATATTATC 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 A 5 3 337082 CASAVA_Build 9 6247937 3D TCAAATATAT CTA/--- CTACATTGTT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 CTA 2 1 337083 CASAVA_Build 9 6254781 2I TCCTTTTTTT --/TA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TA 0 1 337084 CASAVA_Build 9 6256170 4I2M6I TGGCCAGGTG ----GG------/AACTGGCCATAA TCTCGAACTC 3070 hom 60 het 21 0 18 3 N/A 0 0 337085 CASAVA_Build 9 6266612 1I CAAATTCACC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 10 337086 CASAVA_Build 9 6272861 6D AAAAAGAAAG AAAGAA/------ AAAGAAAAAG 3070 het 75 hom 22 2 16 5 AAAGAA 3 2 337087 CASAVA_Build 9 6273463 3I TTACCCAGGC ---/GTG GTGGTGGCGG 2648 hom 21 het 10 0 7 3 GTG 2 3 337088 CASAVA_Build 9 6286151 4D ACTTCCAGAG CAAC/---- CAACGATCAG 2965 hom 18 het 7 0 7 0 CAAC 2 1 337089 CASAVA_Build 9 6295452 4D GGAACATATG TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TGTT 3 2 337090 CASAVA_Build 9 6322526 1I TAAATTTCTG -/T TTAAGATACC 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 T 2 3 337091 CASAVA_Build 9 6334903 1D TTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 33 0 24 9 A 11 10 337092 CASAVA_Build 9 6340999 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2822 het 1612 hom 32 9 12 11 A 13 14 337093 CASAVA_Build 9 6343148 1D CTCGTGGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 11 10 337094 CASAVA_Build 9 6347642 1D AAAAAAAAAG A/- TTAAAAAAAA 403 het 80 hom 21 1 7 13 A 1 0 337095 CASAVA_Build 9 6372913 3D TTTTGCCAAA ATG/--- ATGACTCAGA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 ATG 2 1 337096 CASAVA_Build 9 6375733 1I AATGGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1720 hom 36 6 23 7 A 11 12 337097 CASAVA_Build 9 6384037 1D TCGACCTCCC A/- AAAATCAAGA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 5 4 337098 CASAVA_Build 9 6388115 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 29 0 24 5 A 10 11 337099 CASAVA_Build 9 6392802 1D GAGGTGATCC T/- GTGCCAATTC 3070 hom 100 het 36 0 32 4 T 1 0 337100 CASAVA_Build 9 6395726 1D AGATGTGGGG T/- CTCTATTTAC 3070 hom 94 het 37 0 30 9 T 1 0 337101 CASAVA_Build 9 6396389 2D GTCGGGGGGC GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 42 het 32 0 17 15 GA 9 8 337102 CASAVA_Build 9 6396894 1D CAGAGTGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 233 hom 24 1 14 9 T 13 12 337103 CASAVA_Build 9 6402272 1I GGGTGGGGGG -/A TGGGGGAAGC 2516 hom 26 het 17 0 9 8 A 0 1 337104 CASAVA_Build 9 6410436 1I CGGGTGCGGT -/G GCTCACGCTG 2469 hom 15 het 6 0 6 0 G 1 2 337105 CASAVA_Build 9 6414015 1I ATATTTTAAA -/C CACATTCTAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 1 2 337106 CASAVA_Build 9 6414125 5D TAGGCAGGAG AACAA/----- AATAAAGTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 5 AACAA 1 0 337107 CASAVA_Build 9 6414381 2D GTCACAATTA AG/-- AGAGAATTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 AG 3 2 337108 CASAVA_Build 9 6414777 1I TTTCTCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2389 hom 43 8 13 22 T 17 18 337109 CASAVA_Build 9 6415774 1D TAAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 13 12 337110 CASAVA_Build 9 6424450 1I TTAGGTGGGC -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 7 8 337111 CASAVA_Build 9 6425000 1D GTTTGGCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 25 1 17 7 T 14 13 337112 CASAVA_Build 9 6436160 1D ACCTGGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 23 0 19 4 T 13 12 337113 CASAVA_Build 9 6441467 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 12 11 337114 CASAVA_Build 9 6445791 1I CTGAGACCAG -/C CTGGGCAACA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 1 2 337115 CASAVA_Build 9 6453285 1D TCGTCTCAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 22 1 17 6 A 11 10 337116 CASAVA_Build 9 6484290 1I AGAGTAAACT -/C CAGTAATTTG 3070 het 3070 ref 34 15 17 2 C 1 2 337117 CASAVA_Build 9 6522511 1D AATGCAGATT A/- AAAAAAAAAA 1024 het 1024 ref 28 18 3 7 A 13 12 337118 CASAVA_Build 9 6538363 6D ACATTTCACA GAGCAG/------ GAGCTAAGCT 3070 het 3070 ref 48 25 19 8 GAGCAG 1 0 337119 CASAVA_Build 9 6543515 1I TCTTCCTGTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 8 9 337120 CASAVA_Build 9 6569534 1D AATTTTATTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 8 7 337121 CASAVA_Build 9 6583269 2D GTAGTATCAG AT/-- ATATATATAT 505 het 505 ref 14 5 2 7 AT 9 8 337122 CASAVA_Build 9 6605582 1D ACCTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1335 het 1335 ref 26 10 4 12 A 15 14 337123 CASAVA_Build 9 6614991 1D CTGTCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1884 hom 25 7 11 10 A 12 11 337124 CASAVA_Build 9 6616521 10I TTCAAGACTG ----------/ACCACTTACA TGGGTCTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 ACCACTTACA 0 1 337125 CASAVA_Build 9 6616661 1I CTCTCAAGTA -/G AAGAGAGATT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 G 0 1 337126 CASAVA_Build 9 6619611 2D CTACAACTAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 66 het 27 0 22 7 AC 8 7 337127 CASAVA_Build 9 6628645 4D AACTTTTTAA CTGT/---- CTGTCTGATC 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 CTGT 2 1 337128 CASAVA_Build 9 6629396 1I CCACTGAGTC -/T GCCATGAAGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 0 1 337129 CASAVA_Build 9 6632908 1I TTCCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 T 10 11 337130 CASAVA_Build 9 6636760 3D AAAGGATATT TTG/--- TTGTTGTTTT 1793 het 1793 ref 22 12 4 6 TTG 3 2 337131 CASAVA_Build 9 6637708 1D CAAAAAAAAA C/- ATGTATATAT 2862 het 2862 ref 24 15 8 1 C 1 0 337132 CASAVA_Build 9 6640105 1I TGCCTCCCCC -/T TTTTCTTTTT 2410 het 2410 ref 32 18 9 5 T 4 5 337133 CASAVA_Build 9 6642634 1D AAAAACAAAA C/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 C 1 0 337134 CASAVA_Build 9 6647611 1I ACTTGAACCT -/G GGAGGCGAAG 2672 hom 24 het 10 0 7 3 G 2 3 337135 CASAVA_Build 9 6648762 6D ATTTCCTTCC CTTCTT/------ CTTCTTATAC 3070 het 3070 ref 26 13 11 6 CTT 4 2 337136 CASAVA_Build 9 6652591 1D GAAATGAAAA T/- TTGTCTCTGT 3070 het 3070 ref 55 31 23 2 T 3 2 337137 CASAVA_Build 9 6665478 1I GCAAACCAAA -/C AAAACCAGAG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 C 0 1 337138 CASAVA_Build 9 6669767 1I AATAATCCAA -/C CATACCAATT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 C 1 2 337139 CASAVA_Build 9 6683156 1I GGGAGTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 8 9 337140 CASAVA_Build 9 6704374 1I CCGCCTATTT -/A AAAAAAAAAA 2610 het 1752 hom 23 9 12 2 A 15 16 337141 CASAVA_Build 9 6707683 1D GCATAGAAAT A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 A 8 7 337142 CASAVA_Build 9 6712516 1D TATGTCTATA T/- ATTTTTTTTT 2359 het 1336 hom 17 5 10 2 T 1 0 337143 CASAVA_Build 9 6715140 1I TTTTTGTTTT -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 A 6 7 337144 CASAVA_Build 9 6727499 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 8 9 337145 CASAVA_Build 9 6730832 3I AGTATAATTA ---/TTG TTTTCTTTTT 3070 het 2376 hom 17 8 7 2 TTG 0 1 337146 CASAVA_Build 9 6731892 2D AAATGTTGTT AC/-- ACACACACAC 2901 het 1212 hom 12 4 7 1 AC 9 8 337147 CASAVA_Build 9 6748556 1I CGCCAGTCGG -/T CTGTGGCGGA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 0 1 337148 CASAVA_Build 9 6753121 1I CCATACTAAC -/A AGTCAGAATA 3070 het 3070 ref 28 13 9 6 A 1 2 337149 CASAVA_Build 9 6753466 3D TTAAGCAATC ATG/--- CCATTACTTG 3070 het 3070 ref 52 26 22 6 ATG 1 0 337150 CASAVA_Build 9 6757138 1I TCTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTA 1827 het 1827 ref 18 12 5 1 T 9 10 337151 CASAVA_Build 9 6768093 1D TAATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1388 het 741 hom 16 6 4 6 T 15 14 337152 CASAVA_Build 9 6771385 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 T 10 9 337153 CASAVA_Build 9 6788257 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 20 9 T 14 13 337154 CASAVA_Build 9 6793757 1I AAAAGAAAAA -/G AAAAAAAAAA 2958 het 1559 hom 20 9 8 3 G 0 1 337155 CASAVA_Build 9 6806851 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 16 6 T 10 11 337156 CASAVA_Build 9 6818875 1D CCGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 76 het 37 0 31 6 A 10 9 337157 CASAVA_Build 9 6821370 4I CTTTTTTATT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 2437 hom 29 5 19 5 TTTA 2 3 337158 CASAVA_Build 9 6828717 1D AAATGCAAAA G/- GGAAAATAGT 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 G 3 2 337159 CASAVA_Build 9 6834281 2D TAATTTACAC TA/-- TTTTATTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 14 5 TA 1 0 337160 CASAVA_Build 9 6836542 3D ATTTTGAAAC AAT/--- AAGATTTATC 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 AAT 1 0 337161 CASAVA_Build 9 6846172 1D TTTGAAGATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 13 12 337162 CASAVA_Build 9 6848267 1D CATATTAATG A/- ATTACTGCTC 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 A 2 1 337163 CASAVA_Build 9 6854810 1I GTTGGCAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 T 9 10 337164 CASAVA_Build 9 6855756 3D ATTTTATTTA TTT/--- TTTTTTTTGT 861 het 861 ref 12 5 3 4 T 11 8 337165 CASAVA_Build 9 6875621 2D TAAAAAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 A 14 12 337166 CASAVA_Build 9 6876500 1I TCTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1910 het 1334 hom 18 5 6 7 T 13 14 337167 CASAVA_Build 9 6906240 1D AGAGTTATCC G/- GACCTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 G 2 1 337168 CASAVA_Build 9 6913230 1D ATCAGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 T 13 12 337169 CASAVA_Build 9 6920453 1I ATGTCTTTTG -/A AAAAAATCTG 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 6 7 337170 CASAVA_Build 9 6921505 1I TATATATATA -/T TATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 T 1 2 337171 CASAVA_Build 9 6923063 4I GGTGAAATAC ----/AATT CATCTCAAAG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 AATT 0 1 337172 CASAVA_Build 9 6924886 1I ATAATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 11 9 T 11 12 337173 CASAVA_Build 9 6925342 1I TTTTCAAATG -/T TTTGATTTTT 3070 het 2976 hom 23 8 13 2 T 3 4 337174 CASAVA_Build 9 6928849 3D TCAGATACAC TAA/--- TAATAAAATA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 TAA 3 2 337175 CASAVA_Build 9 6930631 1D TGAAAGTGGG A/- AAAAAAACGT 3070 het 3070 hom 37 15 21 1 A 8 7 337176 CASAVA_Build 9 6930900 1D AAGAAAAAAA C/- GTATCATTCT 3070 het 3070 ref 44 20 18 7 C 1 0 337177 CASAVA_Build 9 6931865 2D TCTCTCTCTC TT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 59 29 19 14 T 2 0 337178 CASAVA_Build 9 6932422 1D ATTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1771 hom 36 10 15 11 T 13 12 337179 CASAVA_Build 9 6933680 1I GTCTCAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 C 0 1 337180 CASAVA_Build 9 6937827 1D GTTCCTTGAT A/- TTTTTTTTTT 2540 het 2540 ref 29 21 7 1 A 1 0 337181 CASAVA_Build 9 6949925 15D AACAGCTGTG GTATAAAATACTGTA/--------------- GGGGCCTCTG 3070 hom 115 het 38 0 34 8 GTATAAAATACTGTA 1 0 337182 CASAVA_Build 9 6950871 1I AAAATCACCT -/G CAGTTGAGAA 3070 hom 122 het 48 0 41 7 G 0 1 337183 CASAVA_Build 9 6954041 3D AATATTTTAC TAT/--- TATTATTATT 2174 het 2174 ref 31 17 6 8 TAT 4 3 337184 CASAVA_Build 9 6962729 5I GTTCTGCGTG -----/TTGGA TTGGATACCT 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 TTGGA 1 2 337185 CASAVA_Build 9 6966074 1I GGATTATACC -/T TTTTTTGTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 6 7 337186 CASAVA_Build 9 6966819 2I TGTTGTTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 10 12 337187 CASAVA_Build 9 6968947 1I AGGTCAAAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 375 hom 58 1 43 14 T 9 10 337188 CASAVA_Build 9 6972217 1D ATTTTCTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 10 9 337189 CASAVA_Build 9 6973790 1I TCTGATTTTT -/C ATTTATTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 0 1 337190 CASAVA_Build 9 6974816 3I AGGTTTTAAG ---/AAC AACAACAATA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAC 2 3 337191 CASAVA_Build 9 6978512 4I TGGTGTTGGA ----/TAAC TAACTCCTAG 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 TAAC 1 2 337192 CASAVA_Build 9 6979941 1D TACCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2031 hom 20 5 10 5 T 13 12 337193 CASAVA_Build 9 6981841 1D TTTAAGACCA G/- CCTGGGCAAC 3070 het 3070 ref 55 26 21 8 G 1 0 337194 CASAVA_Build 9 6982020 2I GTTCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 T 10 12 337195 CASAVA_Build 9 6983975 1D TTCCCCTGCC T/- TTTTAGCACC 3070 het 3070 hom 39 20 19 1 T 5 4 337196 CASAVA_Build 9 6985016 1I AGCTTATTTA -/G GGCTATGGTG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 G 2 3 337197 CASAVA_Build 9 6988797 1D CTCTGGTTCC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 7 6 337198 CASAVA_Build 9 6989338 1D AAATTACAAA T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 2 T 7 6 337199 CASAVA_Build 9 6989764 1I ACTTGGCTTA -/G CGAATAGGTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 0 1 337200 CASAVA_Build 9 6993433 1D ATCATGGGTG T/- TTTTTTTTTT 943 het 943 ref 38 22 4 12 T 14 13 337201 CASAVA_Build 9 7008496 1I TTCCTAGTAT -/A ATGAGCCAAC 3070 het 3070 hom 50 20 26 4 A 1 2 337202 CASAVA_Build 9 7009449 1D TTCCCTGGAA T/- TTTTTTTTTA 2397 het 2397 ref 31 20 9 2 T 10 9 337203 CASAVA_Build 9 7023144 1I TTATGCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2620 hom 40 12 14 14 T 17 18 337204 CASAVA_Build 9 7031544 1I TCATAAATGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 T 9 10 337205 CASAVA_Build 9 7048275 1I CTGTTTCCAA -/G CCCTTTTCAG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 G 0 1 337206 CASAVA_Build 9 7048861 1D TCATGCAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 11 10 337207 CASAVA_Build 9 7050216 1D CATTGTCATG T/- TTTTTTTTTT 1960 het 1960 ref 33 19 5 9 T 13 12 337208 CASAVA_Build 9 7051551 2D TTTATTGGGA AG/-- AGATACTGGT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 AG 2 1 337209 CASAVA_Build 9 7077275 1I ATATGAAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 13 6 T 10 11 337210 CASAVA_Build 9 7079251 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 T 8 7 337211 CASAVA_Build 9 7081322 1D GCAATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 A 11 10 337212 CASAVA_Build 9 7091836 4D ATCTTAACTT ATTC/---- AAACACTGAC 3070 het 3070 hom 45 19 21 8 ATTC 1 0 337213 CASAVA_Build 9 7106340 1D ATTATACCTT A/- AAAATGTCAT 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 A 5 4 337214 CASAVA_Build 9 7106415 19I ACTTTAATTG -------------------/AGGTTATGTGGACCACCTA AGGTTATATG 3070 het 3070 ref 40 23 11 6 AGGTTATGTGGACCACCTA 0 1 337215 CASAVA_Build 9 7110160 1I GGAATGATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 21 10 T 11 12 337216 CASAVA_Build 9 7148320 2D GATTCATTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2475 het 2475 ref 23 13 7 3 T 13 11 337217 CASAVA_Build 9 7156443 8D ACATACATTG TGTGTGTA/-------- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 57 23 17 19 TGTGTGTA 2 1 337218 CASAVA_Build 9 7230134 4I CCCAGTGCTT ----/TGGA TGGAAGTCTG 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 TGGA 1 2 337219 CASAVA_Build 9 7232633 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1034 het 393 hom 26 2 3 21 T 19 18 337220 CASAVA_Build 9 7241852 7I GGGAGGAAGA -------/TACAGAT TACAGATTTC 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 TACAGAT 1 2 337221 CASAVA_Build 9 7252831 5D TGTTTTGCTC TTATA/----- TTAATTAGGA 3070 het 3070 hom 36 13 20 5 TTATA 1 0 337222 CASAVA_Build 9 7274628 1D GAAACAGTAA T/- TTGCGTAAGC 3070 het 3070 hom 58 24 29 5 T 3 2 337223 CASAVA_Build 9 7278998 4I TGCTAACCTT ----/ACAC AATGATAAAG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 AC 0 2 337224 CASAVA_Build 9 7284089 1I TTAATCAGAG -/T TTTTTTTTTT 2833 het 2833 ref 23 11 8 4 T 14 15 337225 CASAVA_Build 9 7302307 1D GGGTTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2774 hom 28 10 10 8 T 13 12 337226 CASAVA_Build 9 7326549 1D CCCTGGATAC A/- AAAACCTGCC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 5 4 337227 CASAVA_Build 9 7366040 1D GTGTCCACAG A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 8 7 337228 CASAVA_Build 9 7366487 1I TCAGAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 T 10 11 337229 CASAVA_Build 9 7376709 1I ATGAGATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 9 10 337230 CASAVA_Build 9 7380940 1D GAAAAAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 34 1 22 11 A 13 12 337231 CASAVA_Build 9 7396712 1D ACTCAGGCAT C/- CCTACAAATT 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 C 3 2 337232 CASAVA_Build 9 7411220 2I TGTGTGCTAC --/CA CACCTGGTTA 1780 het 1503 hom 11 4 4 3 CA 1 2 337233 CASAVA_Build 9 7414930 1D TTTTTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 12 11 337234 CASAVA_Build 9 7415620 1I GGATCTTCTC -/T TTTTTTTTTT 2779 het 2779 ref 36 16 7 13 T 13 14 337235 CASAVA_Build 9 7415875 1D ATAGAATCAT G/- TTGTCTGCAA 3070 het 3070 ref 43 23 18 3 G 1 0 337236 CASAVA_Build 9 7422806 1D GCTAGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 14 4 T 12 11 337237 CASAVA_Build 9 7422913 1D CTTGTAATTA T/- TTTTCATGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 5 4 337238 CASAVA_Build 9 7428456 1D AAGAGTTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 T 10 9 337239 CASAVA_Build 9 7434093 1D AAGGTGTCTC T/- TTGAAATGGT 3070 het 3070 hom 35 13 21 2 T 3 2 337240 CASAVA_Build 9 7437446 2D26M4D TATATATATG TATATATATATATATGTGTGTGTGTGTTTGTG/--TATATATATATATGTGTGTGTGTGTT---- TGTGTGTGTG 1663 het 1663 ref 15 9 9 2 N/A 0 0 337241 CASAVA_Build 9 7443594 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2930 het 881 hom 30 11 12 8 A 18 16 337242 CASAVA_Build 9 7444211 1D CCATCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 11 10 337243 CASAVA_Build 9 7446401 1I AAGACTCTCC -/T TCCCCACAGG 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 T 1 2 337244 CASAVA_Build 9 7449502 13I TAACAAAGCA -------------/GGTGTAAATATAG GCCCCACCTG 3070 het 3070 ref 51 25 21 6 GGTGTAAATATAG 0 1 337245 CASAVA_Build 9 7450116 1I TTACAGAAAT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 6 7 337246 CASAVA_Build 9 7463066 1D AATACTAAAT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 34 13 16 5 A 7 6 337247 CASAVA_Build 9 7475802 1D CCCTGCTGTG T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 40 17 17 7 T 9 8 337248 CASAVA_Build 9 7480688 1D CTCTAGAGTT A/- AAAATTTCCA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 A 5 4 337249 CASAVA_Build 9 7482454 1I TTTTTTGGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 531 hom 35 2 28 5 T 9 10 337250 CASAVA_Build 9 7493337 1D GTTACTTGGT G/- GGGTCCTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 G 4 3 337251 CASAVA_Build 9 7505411 1I ACCCTCTTTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 40 10 27 3 A 8 9 337252 CASAVA_Build 9 7514576 2D TTCCCAAGTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 11 9 337253 CASAVA_Build 9 7516508 1I ACTTTTTGCC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 6 7 337254 CASAVA_Build 9 7517106 2D TAAACCTTTT TA/-- AATCTGTTGA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TA 1 0 337255 CASAVA_Build 9 7517330 1I TATAATTGCC -/T TATTAAAGGG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 337256 CASAVA_Build 9 7520167 2I GTAATTTTTT --/CC TTCATTTTTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 0 2 337257 CASAVA_Build 9 7520391 25D TGCATTAGAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 23 0 23 5 T 35 10 337258 CASAVA_Build 9 7520644 1D TTTCTTCCCA T/- TTTTCTTATG 3070 hom 160 het 59 0 54 5 T 5 4 337259 CASAVA_Build 9 7522164 1D TATCAGCTTA T/- TTTCATGAGT 3070 hom 138 het 53 0 47 7 T 4 3 337260 CASAVA_Build 9 7522461 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 251 hom 41 2 32 7 T 9 8 337261 CASAVA_Build 9 7523212 4D GTTTTTTGAG GAAA/---- GAAATAAGAG 3070 hom 81 het 29 0 28 3 GAAA 2 1 337262 CASAVA_Build 9 7527201 2D AATGGGAAAC AT/-- GTGCAGAACA 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 AT 1 0 337263 CASAVA_Build 9 7530854 1I GCATTTTGCG -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 57 24 23 10 T 6 7 337264 CASAVA_Build 9 7575287 1I CTGAATTTGT -/C TTCATTAGTT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 C 0 1 337265 CASAVA_Build 9 7575635 1D79M4D CCTATGCCAT AAACACCATTTAAGATTATTTTTGCATGTGAATAACTCCAATAGGAAATAAATTTGAAATTTGAAGGTTTCCATGCATCTGTTG/-AACACCATTTAAGATTATTTTTGCATGTGAATAACTCCAATAGGAAATAAATTTGAAATTTGAAGGTTTCCATGCATCT---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 26 15 10 N/A 0 0 337266 CASAVA_Build 9 7588920 3I CTTTTATGAT ---/AAA AACAACAAAC 3070 hom 76 het 33 0 27 6 A 2 5 337267 CASAVA_Build 9 7595050 10I TTTCCCCTGC ----------/CCTTTGTGGT CCTGGCAGTG 3070 het 3070 hom 42 18 20 5 CCTTTGTGGT 0 1 337268 CASAVA_Build 9 7603450 14D TTGTAAGGTA AGCCCCTCTTTATG/-------------- TATACTGGGT 3070 het 3070 hom 32 12 18 5 AGCCCCTCTTTATG 1 0 337269 CASAVA_Build 9 7605717 4D GGACTATATT AGTC/---- AGGGTTCTCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 AGTC 1 0 337270 CASAVA_Build 9 7637269 2D TTCTTTGTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 33 3 18 12 T 14 12 337271 CASAVA_Build 9 7647320 1D TGAGTGTTCA T/- TTTTTTAACA 3070 hom 96 het 39 0 31 8 T 7 6 337272 CASAVA_Build 9 7654764 2D TTCAGGCAAA AG/-- AGGCAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 AG 2 1 337273 CASAVA_Build 9 7658522 1D TTGCAGACGA C/- ATGATTGTTT 3070 het 1896 hom 13 4 9 0 C 1 0 337274 CASAVA_Build 9 7662994 1I GATGGAAGTG -/C CCCCAGGGTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 C 4 5 337275 CASAVA_Build 9 7698347 1I CACAAATGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 10 11 337276 CASAVA_Build 9 7710409 1D ATAAACTACG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 9 8 337277 CASAVA_Build 9 7716339 1I TTTTTGCTCA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 T 6 7 337278 CASAVA_Build 9 7722281 1I TTTACAACTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 51 19 21 11 T 8 9 337279 CASAVA_Build 9 7724764 4D GTGGTTTTTG TCAA/---- TCAGATTATT 3070 het 3070 hom 46 16 28 3 TCAA 1 0 337280 CASAVA_Build 9 7731267 1I AAATATTCAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 A 8 9 337281 CASAVA_Build 9 7736173 1D TTGCCTCTTC T/- TTTCTGTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 18 7 T 4 3 337282 CASAVA_Build 9 7739085 4D ATATTGTCAC TATT/---- TACTTATTAG 3070 het 3070 hom 42 15 22 7 TATT 1 0 337283 CASAVA_Build 9 7739487 1I TTTTCAGAGC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 A 8 9 337284 CASAVA_Build 9 7780482 1I GCTGCAACTC -/A AGTGCAGGTA 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 1 2 337285 CASAVA_Build 9 7786783 1D CTTAATAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 43 0 34 24 T 10 9 337286 CASAVA_Build 9 7810306 1D TAATTAACAA T/- GTGAACCAAT 3070 het 3070 hom 42 9 22 12 T 1 0 337287 CASAVA_Build 9 7818754 1I TCTGCTCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 A 12 13 337288 CASAVA_Build 9 7825164 2D TGAGAAAGCA GT/-- GTGTCATTAT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 GT 3 2 337289 CASAVA_Build 9 7839925 1I ATTATTCGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 T 13 14 337290 CASAVA_Build 9 7841303 1D TATCTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 10 4 T 11 10 337291 CASAVA_Build 9 7845420 1I TTTTCTTAGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 T 8 9 337292 CASAVA_Build 9 7846516 1I TCTCGGAGGG -/A AAAAAAAAAA 1510 het 1510 ref 39 27 4 8 A 13 14 337293 CASAVA_Build 9 7849132 4D TCATTCATGT ATTC/---- ATTCATTCAT 3070 het 3070 hom 67 20 37 11 ATTC 5 4 337294 CASAVA_Build 9 7892578 2D AAAAGTAATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 13 11 337295 CASAVA_Build 9 7898168 8D CTCAGGCCCC AGCTCTAA/-------- AGCTCTAAAG 3070 het 3070 hom 48 17 22 12 AGCTCTAA 2 1 337296 CASAVA_Build 9 7899269 1D AAAAAAAAAA G/- GTCAGGTATG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 G 2 1 337297 CASAVA_Build 9 7902833 1D TTAAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 337298 CASAVA_Build 9 7910291 2D GAATCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 7 T 14 12 337299 CASAVA_Build 9 7913989 1I AGAAAAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1383 hom 42 5 27 10 T 13 14 337300 CASAVA_Build 9 7932744 1D TGAATTAGGA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 337301 CASAVA_Build 9 7940100 1I ATTAGTTAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 21 17 8 A 9 10 337302 CASAVA_Build 9 7950399 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1219 hom 36 6 20 10 T 15 14 337303 CASAVA_Build 9 7954226 9D GGGTAAAATA GGGAAAAAT/--------- GAGAAAAATG 3070 hom 111 het 38 0 37 3 GGGAAAAAT 1 0 337304 CASAVA_Build 9 7954749 2I TAAAGAAGAC --/AG AGGAGGTTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AG 1 2 337305 CASAVA_Build 9 7956777 4I TGTAAGAAAA ----/AGAG AGAGAGAGTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AG 4 6 337306 CASAVA_Build 9 7963089 1I AATAAAGAGG -/T TAATAGAGGA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 1 2 337307 CASAVA_Build 9 7976289 6I TTGGAAAAGA ------/TTAACT TTTAATAAGA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TTAACT 0 1 337308 CASAVA_Build 9 7998280 1I GGTGTGTCAC -/G GCTTCCCTTG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 G 1 2 337309 CASAVA_Build 9 8000852 1D CATTGCTTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 32 0 29 4 A 10 9 337310 CASAVA_Build 9 8001473 1I CATTAACCTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 8 9 337311 CASAVA_Build 9 8001670 2D AAGGAAAAAA AC/-- ATATTTTACA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 AC 1 0 337312 CASAVA_Build 9 8014808 1D TCAGACTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 38 6 15 19 T 15 14 337313 CASAVA_Build 9 8016558 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 9 8 337314 CASAVA_Build 9 8019963 1D CTCTGGGCAG A/- AAAATTCCCC 3070 hom 117 het 41 0 39 4 A 5 4 337315 CASAVA_Build 9 8021194 2I GTGAGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 GT 5 6 337316 CASAVA_Build 9 8038531 1D AATAACATAG A/- AAAAAATGCT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 7 6 337317 CASAVA_Build 9 8040370 1D TAATTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 11 14 A 11 10 337318 CASAVA_Build 9 8041200 1D CTTCTTTGTC T/- TTTTTTGATG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 6 337319 CASAVA_Build 9 8041335 1D CCTTGTAGAC T/- TTTTTTCATC 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 7 6 337320 CASAVA_Build 9 8050976 1I ATGATTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 43 3 30 10 T 11 12 337321 CASAVA_Build 9 8055390 1D AAAAGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 27 6 A 11 10 337322 CASAVA_Build 9 8056140 1D TTTTCTTTTT A/- AAAAAACTTA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 7 6 337323 CASAVA_Build 9 8056486 3D TATCAGAGTA TTC/--- TTCCCATGAT 3070 het 3070 ref 33 17 16 0 TTC 2 1 337324 CASAVA_Build 9 8059067 1I GGTTTTTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 7 8 337325 CASAVA_Build 9 8059520 34D TGGTGAGAGT GGATATCCTTGTCTTTTTACAGTTCTCAAGGGCA/---------------------------------- GGATATCCTT 3070 het 763 hom 30 9 22 1 GGATATCCTTGTCTTTTTACAGTTCTCAAGGGCA 2 1 337326 CASAVA_Build 9 8061520 1I GTGCACAAAA -/C CCCCCTGGTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 5 6 337327 CASAVA_Build 9 8077588 7D TTGTGGGGTT GGGGGAG/------- GGGGGAGGGG 3070 hom 54 het 20 0 17 3 GGGGGAG 3 2 337328 CASAVA_Build 9 8082969 1D GTTCTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1304 hom 39 6 17 16 A 12 11 337329 CASAVA_Build 9 8087168 4I GCAAATTTGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 AAAC 4 5 337330 CASAVA_Build 9 8092216 2D TTGTTTAATA TC/-- CACACAATTG 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 TC 1 0 337331 CASAVA_Build 9 8104363 8D TGATGAGGAG GTCAGAAT/-------- GAAGTAAGGT 3070 hom 108 het 36 0 36 5 GTCAGAAT 1 0 337332 CASAVA_Build 9 8107196 3D ACTTAACTTA TTG/--- TTCAAAATGG 3070 hom 96 het 43 0 33 15 TTG 1 0 337333 CASAVA_Build 9 8109117 1D ATGAACTAAG C/- AAAGTAGGAA 3070 hom 132 het 53 0 44 9 C 1 0 337334 CASAVA_Build 9 8125173 1I ATCAGTCTAC -/A AAAAAAATGC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 8 337335 CASAVA_Build 9 8135226 4D TTTGAAGATA CGGT/---- CTTTAAAACA 2720 het 2720 ref 16 9 7 0 CGGT 1 0 337336 CASAVA_Build 9 8140582 1I CACATGTTAT -/G GGGGGGGGAC 3070 hom 82 het 35 0 25 10 G 8 9 337337 CASAVA_Build 9 8164153 2I CAATCCACAG --/AC CGTTGGTCTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AC 0 1 337338 CASAVA_Build 9 8184008 8D TGACACAAAC TAGAAAAT/-------- CCAAAGGGAA 3070 het 3070 ref 40 22 18 5 TAGAAAAT 1 0 337339 CASAVA_Build 9 8185689 1I CCAAGTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 31 0 25 6 A 10 11 337340 CASAVA_Build 9 8196287 1D GAGAATTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 24 15 9 0 T 9 8 337341 CASAVA_Build 9 8205278 1I TGTGGTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 43 3 19 21 A 17 18 337342 CASAVA_Build 9 8215741 34D TTACTCATTT CATTGTAATTCATATAGTTGTAAAGTTGGTGATA/---------------------------------- CAAACCTTGC 3070 hom 78 het 24 0 27 5 CATTGTAATTCATATAGTTGTAAAGTTGGTGATA 1 0 337343 CASAVA_Build 9 8224077 12D GTTGTTGTGC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 42 0 33 12 T 21 9 337344 CASAVA_Build 9 8243982 1D GTCCTAAAAA C/- AAAAAAAGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 1 0 337345 CASAVA_Build 9 8246646 1D AAAAATCCTA T/- TTTGAAGGAA 3070 hom 89 het 38 0 30 8 T 4 3 337346 CASAVA_Build 9 8248041 1D CAAATGGGGG A/- GGAAATGGCA 3070 hom 105 het 37 0 35 3 A 1 0 337347 CASAVA_Build 9 8259269 4I TAATATACAC ----/AAAT GAATGAATTA 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 AAAT 0 1 337348 CASAVA_Build 9 8261403 6I CAGAGTAGAA ------/AATTTT AATTTTAATA 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 AATTTT 1 2 337349 CASAVA_Build 9 8270057 1I TATCATTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 14 12 T 11 12 337350 CASAVA_Build 9 8275047 2I GGATTAAAAC --/AT GTGCTGCGGC 3070 het 3070 hom 50 24 25 1 AT 0 1 337351 CASAVA_Build 9 8300018 1D TTAAACATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 12 11 337352 CASAVA_Build 9 8305940 2D GGTAAGATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 AT 6 5 337353 CASAVA_Build 9 8313616 1I AATAGCAAGA -/T TAACTAGAAC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 T 1 2 337354 CASAVA_Build 9 8314836 1D TTGATTTGCA T/- TTCTCTAATG 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 T 3 2 337355 CASAVA_Build 9 8315571 1D TTGTGGGCTC T/- TTTTTGGTTC 1455 het 1455 ref 15 10 4 1 T 6 5 337356 CASAVA_Build 9 8315806 1D ATTCCTTGTT A/- AGTTGGACTC 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 A 2 1 337357 CASAVA_Build 9 8317347 1D TTTTGAGTGG T/- TTTTTTTTTT 2832 het 2832 ref 28 10 8 10 T 11 10 337358 CASAVA_Build 9 8318600 8D CTTCTGGATA ATATCCTG/-------- ATATCCTGAA 3070 het 3070 ref 34 17 16 4 ATATCCTG 2 1 337359 CASAVA_Build 9 8320564 7D AATAACTCAA TAGAAAG/------- TAGAAAGCAA 3070 het 3070 ref 53 28 24 5 TAGAAAG 2 1 337360 CASAVA_Build 9 8321103 1I ATAGCAACAA -/T TTTTCAAGCA 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 T 4 5 337361 CASAVA_Build 9 8321407 10D TTTCCTCTGA TTATTTTCAC/---------- TTATTTTCAC 3070 het 3070 ref 37 21 12 8 TTATTTTCAC 2 1 337362 CASAVA_Build 9 8321575 21I CACAAATGGA ---------------------/AACTTACCATTCCTGAACTGT AACTTACCTG 3070 het 3070 ref 31 15 10 7 AACTTACCATTCCTGAACTGT 0 1 337363 CASAVA_Build 9 8321927 24D ACATACCTTT AAATCCTAAATTTATTTACTCTTG/------------------------ AAATCCTAAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 11 AAATCCTAAATTTATTTACTCTTG 2 1 337364 CASAVA_Build 9 8322544 1D CAAAAGGTAG A/- AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 A 8 7 337365 CASAVA_Build 9 8324352 4I GACCACAGTG ----/CAAT CAATCAAATT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 CAAT 1 2 337366 CASAVA_Build 9 8327872 3I GAAAGAGCAC ---/TAT TATTTTTTTT 3070 het 1546 hom 29 5 19 5 TAT 1 2 337367 CASAVA_Build 9 8328779 1I TATTAAACAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 A 9 10 337368 CASAVA_Build 9 8330750 4D GTCATACAAA TTAC/---- TTAAGAAACA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 TTAC 1 0 337369 CASAVA_Build 9 8331019 1D GATGAAATTT A/- TTCTGGTTAT 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 A 1 0 337370 CASAVA_Build 9 8333150 1D TAAGAGATCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 10 9 337371 CASAVA_Build 9 8334453 2I ATAATGGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 10 12 337372 CASAVA_Build 9 8336200 1D AAATTGTTAT G/- TATTCAAACT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 G 1 0 337373 CASAVA_Build 9 8339048 2D CAAAATTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 20 1 14 5 A 12 10 337374 CASAVA_Build 9 8342084 1I CCTAATCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 30 0 21 9 T 12 13 337375 CASAVA_Build 9 8343426 8D TTATGAATGT ATGAATGA/-------- ATGAATGAAT 1784 het 1784 ref 27 10 8 11 ATGA 6 4 337376 CASAVA_Build 9 8345434 1D ATGGTTGACC T/- TTTAGTTCGA 3070 het 3070 hom 47 18 20 10 T 4 3 337377 CASAVA_Build 9 8360226 14D ACACACACAC ACACACACACACAT/-------------- ATATATATAT 3070 het 1787 hom 28 12 14 7 ACACACACACACAT 1 0 337378 CASAVA_Build 9 8368433 1I AGAAAAAAAA -/C AATTAACAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 0 1 337379 CASAVA_Build 9 8373234 2I CAAAATGTGA --/AT ATGTCTCCAC 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 AT 1 2 337380 CASAVA_Build 9 8377209 11D GTTCATTTAG TAACTTCCAAA/----------- TAAGTTCCTC 3070 het 3070 hom 31 11 19 6 TAACTTCCAAA 1 0 337381 CASAVA_Build 9 8381068 1D ATGATATGGG A/- AGGTACACTA 3070 het 3070 ref 49 23 22 6 A 2 1 337382 CASAVA_Build 9 8381140 1I GGGGTAACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 13 11 T 10 11 337383 CASAVA_Build 9 8385633 1D ACACATAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 11 10 337384 CASAVA_Build 9 8386131 3D GATGCTCAGT CTC/--- CTCATCACTA 3070 het 3070 hom 47 21 22 6 CTC 2 1 337385 CASAVA_Build 9 8389097 2D CCCACTAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1076 hom 31 9 13 10 T 17 15 337386 CASAVA_Build 9 8392692 1I GACCCCCCAC -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 7 8 337387 CASAVA_Build 9 8394886 2D AAATGAAAAA AG/-- AAATCAATAC 3070 het 3070 hom 49 18 25 7 AG 1 0 337388 CASAVA_Build 9 8398893 3D TGATTTAAAG AAC/--- AACGGGAAAG 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 AAC 2 1 337389 CASAVA_Build 9 8400469 13D CTTATCTCTC TTTGTCCAATTAG/------------- TTATCAAATC 3070 het 3070 ref 39 23 16 4 TTTGTCCAATTAG 1 0 337390 CASAVA_Build 9 8405571 5I AACCATAGAC -----/TTATT CTATTGTTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTATT 0 1 337391 CASAVA_Build 9 8406075 1I CTTAAAAGTG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 8 9 337392 CASAVA_Build 9 8408569 1D GTAAAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 T 13 12 337393 CASAVA_Build 9 8414665 1I10M1I14M1I AAACTGGCAG -AAAATAAAGA-AGGGGACTGGGAAG-/AAAAATAAAGACGGGGGACTGGGAAGA AAAAGGGAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 8 N/A 0 0 337394 CASAVA_Build 9 8415452 1I ATGACCCTGA -/T GCTGCAATGA 3070 hom 111 het 41 0 36 5 T 0 1 337395 CASAVA_Build 9 8416798 2D ATGTCTGAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 18 5 T 16 14 337396 CASAVA_Build 9 8419256 3D AAGGTGCAGT GAA/--- GAAGAACAAA 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 GAA 3 2 337397 CASAVA_Build 9 8426213 3D AAAGGGGAGA TGT/--- TGATCAGTTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 TGT 1 0 337398 CASAVA_Build 9 8427289 4I CAAATTCTTC ----/AAAA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 A 9 13 337399 CASAVA_Build 9 8431947 1I ACATGTACAT -/A AAAGCTGGGT 3070 het 3070 hom 54 22 28 4 A 3 4 337400 CASAVA_Build 9 8454716 1I ATCTCTCCCC -/T TTTTTTTTTT 1998 het 1271 hom 26 5 8 13 T 11 12 337401 CASAVA_Build 9 8516187 1D CCACCTTGGC T/- TTGGTCCAGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 3 2 337402 CASAVA_Build 9 8554163 1I ATACACTATA -/G TGTACTGTGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 0 1 337403 CASAVA_Build 9 8586255 9D ATATGGATTT TATGGATTA/--------- TATGGATTAT 2791 het 2791 ref 33 19 7 9 TATGGATTA 2 1 337404 CASAVA_Build 9 8675259 1D TAGAAAGCAG A/- AAAAAAAAAA 1282 het 1282 ref 37 30 3 4 A 12 11 337405 CASAVA_Build 9 8678565 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 930 het 930 ref 12 4 2 6 A 15 14 337406 CASAVA_Build 9 8696720 4D AGCAAAGCAC AACA/---- AACAATGAAA 3070 het 3070 ref 53 29 20 4 AACA 2 1 337407 CASAVA_Build 9 8701156 1I ACTGTAAGAA -/C TCACTACCAA 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 C 0 1 337408 CASAVA_Build 9 8701264 2D TTATTCAAAC AT/-- ATAATTATAC 3070 het 3070 ref 24 16 7 1 AT 2 1 337409 CASAVA_Build 9 8712499 1D CAATAAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 11 10 337410 CASAVA_Build 9 8719449 1I AGGTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 11 12 337411 CASAVA_Build 9 8720942 1I CCATTCAAGA -/C CACCGGAATG 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 C 1 2 337412 CASAVA_Build 9 8741421 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 13 10 5 A 9 8 337413 CASAVA_Build 9 8744730 4D GATAAATTTC AATT/---- AATTAAAATT 2667 het 2667 ref 23 10 6 8 AATT 2 1 337414 CASAVA_Build 9 8749626 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTTTGTCC 3070 het 1566 hom 35 6 26 3 C 0 1 337415 CASAVA_Build 9 8761181 2I ATTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2174 hom 21 het 8 0 8 0 A 12 14 337416 CASAVA_Build 9 8762389 10I GGAGCACAGT ----------/ACATTTTTAA ACATAAAGAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 ACATTTTTAA 0 1 337417 CASAVA_Build 9 8764258 4D TCCGGATATC TTTT/---- TTAGGTAGCA 3070 het 3070 hom 31 11 19 2 T 6 2 337418 CASAVA_Build 9 8765578 1I TCAAATATTA -/T TTTTTATAAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 T 5 6 337419 CASAVA_Build 9 8766531 1D CTCCTGGGCT C/- AAGCGATCTG 3070 het 3070 hom 21 9 11 3 C 1 0 337420 CASAVA_Build 9 8768938 1I AGAAAATTAC -/T TTTTCAAGAG 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 T 4 5 337421 CASAVA_Build 9 8771664 5D GCAGTGCTTT AATGA/----- AATGAAATGA 3070 het 3070 hom 48 13 25 11 AATGA 3 2 337422 CASAVA_Build 9 8777906 4I ATTTTGCACC ----/CTAG CTATCACCTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 CTAG 0 1 337423 CASAVA_Build 9 8804162 1D TATGCAAGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 18 7 T 10 9 337424 CASAVA_Build 9 8813679 5D GGGAAAAGGA AAGGG/----- AAAGGAAAGG 3070 het 2709 hom 21 10 9 5 AAGGG 1 0 337425 CASAVA_Build 9 8814600 5I AAAGCAAAAT -----/AAGTA AAGTTATTTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 AAGTA 0 1 337426 CASAVA_Build 9 8815813 1I AGTAACTTCC -/T GACATTCCCA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 0 1 337427 CASAVA_Build 9 8817308 1I TTTGTTATTG -/A AAAAAATTTT 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 6 7 337428 CASAVA_Build 9 8821911 1I CCTTTAGTGC -/T TTTTTTTGAC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 T 7 8 337429 CASAVA_Build 9 8822777 2D AAATTGGAGT TC/-- TCTCTCTCTC 790 het 790 ref 43 32 3 8 TC 9 8 337430 CASAVA_Build 9 8823540 1I CTTTTTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 T 9 10 337431 CASAVA_Build 9 8823788 1I TTAATAACTG -/T TTAAAATTTA 3070 het 3070 hom 19 7 7 5 T 2 3 337432 CASAVA_Build 9 8824428 4I TCTTTTATAA ----/CCTG CCTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 CCTG 1 2 337433 CASAVA_Build 9 8829808 4D CCAACAAAAG ACAA/---- ACAGACACAT 3070 het 3070 ref 40 20 12 9 ACAA 1 0 337434 CASAVA_Build 9 8831713 1I GAAGTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1896 hom 24 7 11 6 A 10 11 337435 CASAVA_Build 9 8832338 1D CAGCAACATA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 T 8 7 337436 CASAVA_Build 9 8835178 2I AAAAAAAAAC --/AA AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 5 7 337437 CASAVA_Build 9 8846215 1I AGTTATTATC -/A TCTACAGATC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 0 1 337438 CASAVA_Build 9 8856783 1D ATCAAGTCAG T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 39 0 28 11 T 9 8 337439 CASAVA_Build 9 8861361 17D CACTAAGGAA ATGTGGGGCATACACAT/----------------- AGGCCCTAGA 3070 hom 99 het 33 0 34 4 ATGTGGGGCATACACAT 1 0 337440 CASAVA_Build 9 8861777 6D TTGGTACAGC AATAAT/------ AATAATAATA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 AAT 6 4 337441 CASAVA_Build 9 8865624 5D GTTGACAGTT ATAAG/----- ATAAGCAGAT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 ATAAG 2 1 337442 CASAVA_Build 9 8874935 1I AAAAGTTATC -/T TCCTGGATTC 3070 het 3070 ref 58 31 21 6 T 1 2 337443 CASAVA_Build 9 8883945 1I ATGTGGAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 9 10 337444 CASAVA_Build 9 8892346 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1953 hom 37 10 15 12 T 15 14 337445 CASAVA_Build 9 8912644 1I TCTAATTTTA -/T TTTTTTTTGA 2559 het 2559 ref 33 19 6 8 T 8 9 337446 CASAVA_Build 9 8914126 3D CCTAAGCTAC GAT/--- TAAATCCAGC 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 GAT 1 0 337447 CASAVA_Build 9 8914237 1I GTATCAACCC -/G AAAATTTTTA 3070 het 3070 ref 42 18 15 10 G 0 1 337448 CASAVA_Build 9 8918581 12I TTGGTACCAG ------------/TACCATGCTGTT TTGGTTACTC 2966 hom 15 het 6 0 6 0 TACCATGCTGTT 0 1 337449 CASAVA_Build 9 8925425 8I GATCTGTACA --------/TTGAAAAC TAGAAAACAC 3070 hom 135 het 54 0 45 9 TTGAAAAC 0 1 337450 CASAVA_Build 9 8926314 1I GGGGTTGGCA -/G GGGGGTGGTG 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 G 5 6 337451 CASAVA_Build 9 8927086 1I GAAATGGTAG -/T TTTTTTTACC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 7 8 337452 CASAVA_Build 9 8929577 2I TATATACATA --/AC ACACACACAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AC 7 8 337453 CASAVA_Build 9 8930067 1D ATAAGTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 28 1 23 4 A 12 11 337454 CASAVA_Build 9 8935202 2D TTTATCAAAC AG/-- AAAATCATTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AG 1 0 337455 CASAVA_Build 9 8937030 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 627 hom 24 2 13 9 T 13 12 337456 CASAVA_Build 9 8939516 1I AACGCCTTTG -/A AAAGGTCCCT 3070 hom 92 het 33 0 31 2 A 3 4 337457 CASAVA_Build 9 8942958 3I TATATGTTAG ---/GTT GTTATACCTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 GTT 1 2 337458 CASAVA_Build 9 8947974 2I AGAAGATCAC --/AA AAAGAAGTGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 3 5 337459 CASAVA_Build 9 8953789 2D TGGCTAATTA TT/-- TTTTGTAGAG 3070 hom 66 het 28 0 21 8 T 6 4 337460 CASAVA_Build 9 8960915 1D CAAAACAAAA C/- AAAACAACAA 3070 het 318 hom 22 3 10 9 C 1 0 337461 CASAVA_Build 9 8965098 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 25 3 14 9 A 17 16 337462 CASAVA_Build 9 8996216 1D TGTAATGTGA T/- TTTTCAACAT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 5 4 337463 CASAVA_Build 9 8997476 2I AAAATATATT --/TA TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 TA 0 1 337464 CASAVA_Build 9 8999149 1D TTATTTAGGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 17 12 10 T 9 8 337465 CASAVA_Build 9 8999409 5D CAGTTCTTTC TATTT/----- TATTTTATTT 3070 het 3070 hom 34 10 13 13 TATTT 5 4 337466 CASAVA_Build 9 9004033 1D TCTTCTGATG T/- TCATAATAAG 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 T 2 1 337467 CASAVA_Build 9 9004186 2D5M3D CGTTTTTTTT TGTTTGTTTG/--TTTGT--- TTTGTTTTTT 765 het 765 ref 36 17 6 17 N/A 0 0 337468 CASAVA_Build 9 9016135 2D AAGGCCTTAT AG/-- AGATGGCTGA 3070 hom 81 het 32 0 26 8 AG 2 1 337469 CASAVA_Build 9 9019498 1I TACTTGCACT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 8 9 337470 CASAVA_Build 9 9022019 1D TCCTGTAATC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3066 hom 22 8 9 5 T 8 7 337471 CASAVA_Build 9 9022619 1D TTGGTGCTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 10 9 337472 CASAVA_Build 9 9029982 1I TTCCTGTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 11 12 337473 CASAVA_Build 9 9030580 1D TCCCGAAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 10 9 337474 CASAVA_Build 9 9039579 1D CAAAAAGTCA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 T 9 8 337475 CASAVA_Build 9 9040701 4I CCTACCTCTT ----/AGTC AGTAGCTGTC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 AGTC 0 1 337476 CASAVA_Build 9 9063841 1D TCTCCAAAAT C/- CATTAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 C 2 1 337477 CASAVA_Build 9 9067379 16I AGGTGACTGA ----------------/AAATGTTTCATAGATC AAATGTTATT 3070 het 3070 hom 39 16 19 8 AAATGTTTCATAGATC 0 1 337478 CASAVA_Build 9 9091102 4D AATGTAAAAC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 43 12 25 7 AG 8 6 337479 CASAVA_Build 9 9130192 1I CCATGCATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 11 12 337480 CASAVA_Build 9 9137204 1I GCAGAGTCCT -/A AAAAACCTGA 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 5 6 337481 CASAVA_Build 9 9146377 1D TTATGGTACA T/- TATCCCCAAA 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 T 2 1 337482 CASAVA_Build 9 9146752 2D CAAAAATCTT AG/-- AGTCTTCTCC 3070 het 3070 hom 54 22 29 4 AG 2 1 337483 CASAVA_Build 9 9157016 4I TAAGTCTTAT ----/CTTA CTTAATCATT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 CTTA 1 2 337484 CASAVA_Build 9 9175874 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 11 12 337485 CASAVA_Build 9 9185717 1I TTTTAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1229 hom 32 6 14 12 A 14 15 337486 CASAVA_Build 9 9189810 2D TATAAACATC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2662 hom 23 6 11 6 AT 6 5 337487 CASAVA_Build 9 9201805 1I ACTGGTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 12 13 337488 CASAVA_Build 9 9237000 2I CATTTTCCCC --/CA GAGTGACTCA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 CA 0 1 337489 CASAVA_Build 9 9281796 1D ATTTTCTCTC T/- TTTTTTAGGT 3070 het 3070 ref 30 15 13 4 T 7 6 337490 CASAVA_Build 9 9282183 1D GAATGAACAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 10 9 337491 CASAVA_Build 9 9282448 1D CAAGAGAGTA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 T 8 7 337492 CASAVA_Build 9 9292492 1I ATAAGGCCCA -/C TGTAACTTGA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 C 0 1 337493 CASAVA_Build 9 9299343 1I AACCAACAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 A 8 9 337494 CASAVA_Build 9 9304344 1D CTGTTCTTAC A/- TCACTCATGT 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 A 1 0 337495 CASAVA_Build 9 9322577 1D TAGAAGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 538 hom 36 3 21 12 A 15 14 337496 CASAVA_Build 9 9331125 2D TATTTATGTG TA/-- TATATATATA 2349 het 2349 ref 25 11 8 6 TA 8 7 337497 CASAVA_Build 9 9332708 1D TATCTCTGAC T/- TTTTTTTTTT 2162 het 1475 hom 11 5 5 1 T 13 12 337498 CASAVA_Build 9 9333724 1D GAGGGAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 11 10 337499 CASAVA_Build 9 9339591 1D TTTCTCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 T 13 12 337500 CASAVA_Build 9 9345388 1I AGCGGAGGTG -/A AAAGAATGGG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 3 4 337501 CASAVA_Build 9 9358320 4D AGCTCACATG TGAA/---- TGAAATATAC 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 TGAA 2 1 337502 CASAVA_Build 9 9367878 1D AAAGCACCTC T/- TCTAGAAGAT 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 T 2 1 337503 CASAVA_Build 9 9368732 3I GTTGTATATC ---/ATT GTTGTTTGAA 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 ATT 0 1 337504 CASAVA_Build 9 9368995 1D AAATCAGAAG T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 7 6 337505 CASAVA_Build 9 9369197 2D66M1I CTATGTTGAG ATATATATATATATGATATATATTTGATATATTTTATATATATATATATATTTGCCTGTGAATGTTCA-/--ATATATATATATGATATATATTTGATATATTTTATATATATATATATATTTGCCTGTGAATGTTCAG ATGTCCCTCT 2160 het 2160 ref 17 15 5 10 N/A 0 0 337506 CASAVA_Build 9 9371677 1I AAAGTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 594 het 594 ref 23 13 4 6 T 9 10 337507 CASAVA_Build 9 9372153 1D GTAAATGGGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 8 7 337508 CASAVA_Build 9 9373044 1I TTAGGTAAAA -/T TTCCCTGCCA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 2 3 337509 CASAVA_Build 9 9385188 1I AACATGAAAC -/A AAAAAAAAAA 1942 het 1942 ref 33 11 10 12 A 14 15 337510 CASAVA_Build 9 9390448 4D AAATCCGTCC TTCT/---- AATACTACAA 3070 hom 105 het 38 0 36 4 TTCT 1 0 337511 CASAVA_Build 9 9392743 1I ATCAAAAAAA -/T AAGACAATTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 0 1 337512 CASAVA_Build 9 9396848 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 T 11 12 337513 CASAVA_Build 9 9401042 4D AAAACCTCTT TGTG/---- TGTGTGTATG 3070 het 3070 ref 40 22 17 2 TG 5 3 337514 CASAVA_Build 9 9402458 2D GGGCACAGAT AG/-- AGACTCTCAT 3070 het 3070 hom 52 16 29 8 AG 2 1 337515 CASAVA_Build 9 9406915 1I TTGTTTTTTT -/C CCCTCAATAC 3070 het 3070 hom 54 20 25 9 C 3 4 337516 CASAVA_Build 9 9409267 5D GTAAGAAAGA ATAAT/----- ATATTCAGAT 3070 het 3070 hom 26 7 16 5 ATAAT 1 0 337517 CASAVA_Build 9 9410114 4I ACACTATAAT ----/AAAG ATTTATAAAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AAAG 0 1 337518 CASAVA_Build 9 9411284 2D51M2I TGTCTTTGTG AAAAAAAAAAAATTATACCAGTGTTACATACAATATAAACAGGAAATATGCAC--/--AAAAAAAAAATTATACCAGTGTTACATACAATATAAACCGGAAATATGCACAT GTCAAAATAA 3070 het 3070 ref 39 26 22 12 N/A 0 0 337519 CASAVA_Build 9 9415370 3I TATAAAATAT ---/ATA ATATTATAAT 1807 het 332 hom 7 1 5 1 ATA 1 2 337520 CASAVA_Build 9 9415589 4I ACAGGCTGAC ----/ACTT ACAATGTGGA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 ACTT 0 1 337521 CASAVA_Build 9 9415875 1D TAATGTGAAG A/- AAAAATGAAT 3070 het 3070 hom 25 7 17 1 A 6 5 337522 CASAVA_Build 9 9423534 7D GAAACTAATT AAGTAAA/------- AAGTGGAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 24 4 AAGTAAA 1 0 337523 CASAVA_Build 9 9425418 1D CAGCTACTCA G/- GAGGATCCCT 3070 hom 54 het 21 0 19 4 G 2 1 337524 CASAVA_Build 9 9426890 1I TTACTAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 10 11 A 11 12 337525 CASAVA_Build 9 9427446 1D GTGTATCAGG T/- TTTTTTATGC 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 T 7 6 337526 CASAVA_Build 9 9429195 1D ATACATTAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 T 9 8 337527 CASAVA_Build 9 9439418 1D CTATATATAT A/- TTTTTAAGCT 3070 het 3070 hom 38 17 20 2 A 1 0 337528 CASAVA_Build 9 9442707 1I TTAGTAAAAG -/T TTAAAGTCAA 3070 het 3070 hom 29 8 19 2 T 2 3 337529 CASAVA_Build 9 9443021 2D GCCTATTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 8 T 12 10 337530 CASAVA_Build 9 9447775 1I CCCAAATACA -/G GGGGGAAGAT 3070 het 2350 hom 20 7 12 1 G 5 6 337531 CASAVA_Build 9 9447987 1I TTTCATAAAT -/A AATAAGTGGT 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 2 3 337532 CASAVA_Build 9 9461778 1I TAGGCATTCA -/C CCCCCATTAT 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 C 5 6 337533 CASAVA_Build 9 9477567 1I TTCTTAATTC -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 A 7 8 337534 CASAVA_Build 9 9480901 1D TAAATGAACG A/- ATTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 2 1 337535 CASAVA_Build 9 9480964 6I ATAATGAACT ------/AATATA AATATAAATA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 AATATA 2 3 337536 CASAVA_Build 9 9493284 1D CCAAAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 12 11 337537 CASAVA_Build 9 9499804 1I CTTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 38 2 29 7 A 10 11 337538 CASAVA_Build 9 9503613 2I AAAAAATCTC --/AT AGTCTCATTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AT 0 1 337539 CASAVA_Build 9 9509366 1D TAAATGAAAC A/- AAAAAAACCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 8 7 337540 CASAVA_Build 9 9562562 6D TATATATATG TATATA/------ TATATATATA 2042 het 781 hom 14 3 7 4 TA 9 6 337541 CASAVA_Build 9 9565064 1D GCTGATGGAT A/- ACATTTGCAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 A 2 1 337542 CASAVA_Build 9 9565781 5D AAAAGAAAGA AAAAG/----- AAAAAAAAAA 3070 het 507 hom 18 2 11 5 AAAAG 1 0 337543 CASAVA_Build 9 9566498 1D GACATTTGTG A/- AAGGAGAATC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 A 3 2 337544 CASAVA_Build 9 9572357 1D ATGCAGAATT A/- ATGCCTGGAG 3070 het 3070 ref 37 21 16 1 A 2 1 337545 CASAVA_Build 9 9572540 1D ATGGAAAAAG A/- AAGCAGATTA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 3 2 337546 CASAVA_Build 9 9577561 4I TTTGCTTCCT ----/TCTA TCTAAGTATG 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 TCTA 1 2 337547 CASAVA_Build 9 9581163 2I ACGAAGAGAA --/TT TTCTCTGGCT 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 T 2 4 337548 CASAVA_Build 9 9581226 1I GAGAGGGAGG -/C AACCTGCCAT 2575 het 2575 ref 30 16 7 9 C 0 1 337549 CASAVA_Build 9 9583197 1D ACCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 16 11 5 T 10 9 337550 CASAVA_Build 9 9590432 4I TCATTGTATT ----/AGTC AGCCCCCGTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AGTC 0 1 337551 CASAVA_Build 9 9593843 2D GTGAAATACA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 T 11 9 337552 CASAVA_Build 9 9597746 1D GACTGTTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2200 hom 43 13 13 18 A 17 16 337553 CASAVA_Build 9 9597873 1I AGTGACTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 A 10 11 337554 CASAVA_Build 9 9619880 1D AGCAGTGATC T/- TGGCTTGTTA 3070 het 3070 hom 48 17 26 5 T 2 1 337555 CASAVA_Build 9 9619981 1D GCAGCCTCCC T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 43 17 26 4 T 8 7 337556 CASAVA_Build 9 9622372 1I CAAATCTTTA -/C AAGTAGAAAG 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 C 0 1 337557 CASAVA_Build 9 9622615 1D AGAGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 17 2 A 11 10 337558 CASAVA_Build 9 9623527 1D AAGTGATTAT A/- AGCAGATATT 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 A 2 1 337559 CASAVA_Build 9 9634709 1I AAAATGTTGC -/T TTTTTCCAAA 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 T 5 6 337560 CASAVA_Build 9 9645005 2D ATATATATAT AG/-- ATATAGATAT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 AG 1 0 337561 CASAVA_Build 9 9669122 1I AAAAAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 2854 het 2854 ref 29 11 10 8 A 13 14 337562 CASAVA_Build 9 9675267 2D ATATGCTTAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 TA 6 5 337563 CASAVA_Build 9 9676289 4D AGATGTATGT ATGA/---- ATTATTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 ATGA 1 0 337564 CASAVA_Build 9 9677538 1D CAATTTCATA T/- TGTTAAATGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 1 337565 CASAVA_Build 9 9694090 1I CTGTAAGACC -/A CTGAAACCAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 0 1 337566 CASAVA_Build 9 9698239 1D TTAGGACATT C/- CATCAGTGAT 3070 hom 78 het 35 0 27 9 C 2 1 337567 CASAVA_Build 9 9704513 1D TTAAATCAGT A/- AGAATATTGA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 2 1 337568 CASAVA_Build 9 9707933 1D GACTTGAAAT A/- AAAAAATCCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 6 337569 CASAVA_Build 9 9711175 2D GATAAACATC TT/-- TTAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 T 4 2 337570 CASAVA_Build 9 9715315 1D CTGCACAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 14 14 T 13 12 337571 CASAVA_Build 9 9716468 1D CTGCCTAACA G/- CCCTACCACT 3070 het 3070 hom 64 26 32 7 G 1 0 337572 CASAVA_Build 9 9721463 1D AAATTTAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 16 14 1 T 9 8 337573 CASAVA_Build 9 9722913 1I CCTTGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 11 12 337574 CASAVA_Build 9 9724447 2D AGCCTGACAC AG/-- AAATAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 12 16 4 AG 1 0 337575 CASAVA_Build 9 9731360 1I AAAAATAGAA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 8 9 337576 CASAVA_Build 9 9731450 1D TTGAGTTGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 20 0 13 7 T 10 9 337577 CASAVA_Build 9 9736816 2D GCTTGAAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 2764 het 1984 hom 40 13 12 16 T 18 16 337578 CASAVA_Build 9 9737254 1D CAACAGCTTC T/- GTTCAGGCTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 0 337579 CASAVA_Build 9 9738870 3D TATCAGTGAC ATT/--- ATATTATTGT 3070 het 3070 hom 50 21 24 6 ATT 1 0 337580 CASAVA_Build 9 9739032 3D TATAATCTCC CTT/--- CTTCTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 23 13 9 CTT 4 3 337581 CASAVA_Build 9 9747589 1I TGATCAAAAT -/C AACTTATAAC 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 C 0 1 337582 CASAVA_Build 9 9748653 4D CTCCCTTGCC CCAA/---- CCAAGACAGA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 CCAA 2 1 337583 CASAVA_Build 9 9753459 2I GTTTTTAAGA --/AC ACAGTCTTCT 2258 het 2258 ref 30 21 5 4 AC 1 2 337584 CASAVA_Build 9 9753761 1I GTCCTTCTTC -/T TTTTTTGATA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 6 7 337585 CASAVA_Build 9 9757006 1D ATGTCTTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 10 9 337586 CASAVA_Build 9 9776253 1I TGAAAACTAG -/A AAAAATTTAC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 5 6 337587 CASAVA_Build 9 9777145 1I TCAATTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 22 0 16 6 A 10 11 337588 CASAVA_Build 9 9782124 1D GACACTTTTT A/- AAAAAATCAC 3070 het 19 hom 35 1 30 4 A 7 6 337589 CASAVA_Build 9 9784157 2D ATATATGTAC AT/-- GTATATATAT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 AT 1 0 337590 CASAVA_Build 9 9784513 1D ATGTAGATGA C/- AAAAATAGAG 3070 het 3070 ref 51 22 21 9 C 1 0 337591 CASAVA_Build 9 9784617 4D ATGACTAACA TTGT/---- TTGTCGACTA 3070 het 3070 ref 46 26 17 4 TTGT 2 1 337592 CASAVA_Build 9 9791338 1D AAAGAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 12 A 12 11 337593 CASAVA_Build 9 9802138 1D GGTATATGCA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 9 8 337594 CASAVA_Build 9 9802566 2D AATCTGTCAC AA/-- AAAAAGTCAC 3070 het 3070 hom 50 21 24 6 A 7 5 337595 CASAVA_Build 9 9803390 1I AAACCTTTAG -/C CAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 C 1 2 337596 CASAVA_Build 9 9806881 1D29M1D AGGTGAGAAC AAAAATCACAAGATACTAATAATAATAAAGA/-AAAATCACAAGATACTAATAATAATAAAG- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 33 21 14 5 N/A 0 0 337597 CASAVA_Build 9 9814184 1D GCAAGTTATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 A 10 9 337598 CASAVA_Build 9 9846616 2D21M1D ATGAATTGTT AAAAAAAAAGAAGAAAATTTACCA/--AAAAAAAGAAGAAAATTTACC- AAAAAAAAAA 3070 het 2487 hom 26 11 14 10 N/A 0 0 337599 CASAVA_Build 9 9847910 7D ATACTCTACT TTTTTCA/------- TAAAGTAAAT 3070 het 3070 ref 43 31 12 3 TTTTTCA 1 0 337600 CASAVA_Build 9 9852958 1D GTTTGTAAAC T/- TTTTCAACCA 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 T 5 4 337601 CASAVA_Build 9 9882745 1I ATAACGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 A 13 14 337602 CASAVA_Build 9 9891433 2D AAAGATAATC CT/-- CTTTCATTAT 3070 het 3070 hom 41 16 23 3 CT 2 1 337603 CASAVA_Build 9 9894404 1D TCTACAGTTG T/- TTTCAAATTG 3070 het 3070 ref 25 12 11 3 T 4 3 337604 CASAVA_Build 9 9897165 6I CAAACTCCAG ------/GTTTTT GTTTTTGTTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 GTTTTT 1 2 337605 CASAVA_Build 9 9898080 1D ACATTAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 11 10 337606 CASAVA_Build 9 9899463 1D ATGACAGTTG A/- AAAAAAGCAG 3070 het 3070 ref 23 11 10 4 A 7 6 337607 CASAVA_Build 9 9899779 2I GGATTGAATG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 15 18 7 T 9 11 337608 CASAVA_Build 9 9900983 2D GTTTGGTGTC TA/-- GTTTCCAATT 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 TA 1 0 337609 CASAVA_Build 9 9901470 17D TCCCTTACCA TTTGTTATGGTTTGGGG/----------------- TTTGTTACCC 3070 het 3070 hom 50 23 25 9 TTTGTTATGGTTTGGGG 1 0 337610 CASAVA_Build 9 9903140 1D AAATAATTCC A/- AATTACATTC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 3 2 337611 CASAVA_Build 9 9907101 1I TGTCTACATC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 A 8 9 337612 CASAVA_Build 9 9907916 2D TAAAAGGAAC AT/-- ATCTCAGCAT 3070 het 3070 hom 49 20 25 7 AT 2 1 337613 CASAVA_Build 9 9929014 1D TCTGAATTCC T/- TTTTTTTTTT 1282 het 1282 ref 30 20 5 5 T 13 12 337614 CASAVA_Build 9 9987286 1D AGATAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 1542 het 1542 ref 39 23 5 11 T 17 16 337615 CASAVA_Build 9 10020309 1I CTGGGTAGAT -/G ACCCTTTAAT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 G 0 1 337616 CASAVA_Build 9 10025915 1I TTCAGGAAGC -/A GGAAATCTAT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 0 1 337617 CASAVA_Build 9 10026569 1I CACAAATACA -/T TTTTTTTTTA 2628 het 2628 ref 20 9 7 4 T 9 10 337618 CASAVA_Build 9 10029723 1I ATTCTAAGAC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 T 8 9 337619 CASAVA_Build 9 10038279 1I ATTCTTACTT -/C CGATCTCTGT 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 C 1 2 337620 CASAVA_Build 9 10098868 1I CACGTAAAGA -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 G 3 4 337621 CASAVA_Build 9 10105644 1D ACTTTACAAG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 9 8 337622 CASAVA_Build 9 10107613 1D AATCTCCCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 28 2 14 12 T 13 12 337623 CASAVA_Build 9 10110670 1D ATAAATTTTG A/- AAAAAAATTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 8 7 337624 CASAVA_Build 9 10122960 5I CAAGATTGTT -----/ACAAA ATTTTGTAGC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 ACAAA 0 1 337625 CASAVA_Build 9 10127702 2D AGAGTATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 1694 hom 17 het 11 0 6 6 A 20 18 337626 CASAVA_Build 9 10133573 1I ATACATAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 8 9 337627 CASAVA_Build 9 10135697 2D GCATTGTACA AG/-- AGTCTCCAGC 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 AG 2 1 337628 CASAVA_Build 9 10137897 1I ATAAATACAT -/A AAAAACATAA 3070 het 2644 hom 22 6 14 2 A 5 6 337629 CASAVA_Build 9 10144770 1I CAGGGTGGCC -/T TATTTCTAGG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 1 2 337630 CASAVA_Build 9 10157122 1I AAAGTAGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2527 hom 29 7 15 7 T 12 13 337631 CASAVA_Build 9 10184680 4D CCCACACAAT TACA/---- TACATTGGTT 3070 hom 117 het 43 0 40 6 TACA 2 1 337632 CASAVA_Build 9 10218152 1I AGATACTTCA -/T TTTCCAATAA 3070 hom 117 het 48 0 40 8 T 3 4 337633 CASAVA_Build 9 10224630 1I TGGAAATGCA -/T TTGCTAAATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 3 337634 CASAVA_Build 9 10228034 2I CCATTTGCTT --/TC TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TC 0 1 337635 CASAVA_Build 9 10228146 27D11M1D GAAAGCTGAC CATACAAATTGGGGTCATTTTGTCATACCTGCTCTAAAG/---------------------------CCTGCCCTAAA- GACAGGAAGA 3070 hom 108 het 34 0 37 2 N/A 0 0 337636 CASAVA_Build 9 10229615 3D GTGATAGCAG AAT/--- AATAATAATG 3070 hom 141 het 51 0 47 5 AAT 4 3 337637 CASAVA_Build 9 10229705 1I CTGAATCCAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 26 hom 37 1 34 2 A 7 8 337638 CASAVA_Build 9 10231018 1I ACCAGAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 31 1 21 9 A 11 12 337639 CASAVA_Build 9 10232610 2I ATTGAATACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 13 15 337640 CASAVA_Build 9 10232692 1I TTACTTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 9 10 337641 CASAVA_Build 9 10233351 1I AATGTTAATG -/T TTTTATGTTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 T 4 5 337642 CASAVA_Build 9 10234037 3I AGGATTAAAT ---/GAG GTAATATACG 3070 hom 69 het 30 0 24 6 GAG 0 1 337643 CASAVA_Build 9 10234598 1D TGGATATGAG C/- CAGGGAATCA 3070 hom 117 het 47 0 40 8 C 2 1 337644 CASAVA_Build 9 10238879 2I ATATTTTATC --/TT TTTTTTTTAG 3070 hom 117 het 46 0 38 8 T 8 10 337645 CASAVA_Build 9 10240040 3I AAAATGAATA ---/TTG TTAAGATGGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTG 0 1 337646 CASAVA_Build 9 10241385 1I ATAAGAGACT -/A AAACTCTTTC 1157 hom 12 het 18 0 4 14 A 3 4 337647 CASAVA_Build 9 10242203 2D TGCATGAAAC TT/-- TGTGACAGCC 3070 hom 82 het 37 0 28 11 T 3 1 337648 CASAVA_Build 9 10247078 1I AAGTACAGAC -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 53 17 27 9 A 6 7 337649 CASAVA_Build 9 10258116 1D CATCTCCATC T/- TTTTTTTTTT 1666 het 199 hom 28 3 8 17 T 19 18 337650 CASAVA_Build 9 10260251 1I AATGTTTTTT -/A AAGAATGGTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 3 337651 CASAVA_Build 9 10261381 4I TTAAAGAGTA ----/ACTC ACTCAGAGTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 ACTC 1 2 337652 CASAVA_Build 9 10261475 2D TAATTATCTC AA/-- GTGTTTTCTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 2 0 337653 CASAVA_Build 9 10263982 2D CCTCATGCTT TG/-- TGTCACAAGA 3070 hom 98 het 37 0 33 6 TG 2 1 337654 CASAVA_Build 9 10267583 4I TAGAAAATTC ----/AATA AATAAATACT 3070 hom 141 het 50 0 48 2 AATA 2 3 337655 CASAVA_Build 9 10370785 1I ATATCACAAC -/A AATTTCCATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 3 337656 CASAVA_Build 9 10374771 1I AATTTGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 7 A 10 11 337657 CASAVA_Build 9 10374783 5D AAAAAAAACC TCCTT/----- CTCCATCTTA 3070 het 1029 hom 28 3 15 10 TCCTT 1 0 337658 CASAVA_Build 9 10376663 1I GACCAAAAAA -/T ACAAAACAAA 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 0 1 337659 CASAVA_Build 9 10378481 2D GATAATTAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 16 14 337660 CASAVA_Build 9 10384792 1I ATAGAATAAA -/C CGTCAATATA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 1 2 337661 CASAVA_Build 9 10395528 5D CTAAACAAGG AAATA/----- AAATAAAAGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAATA 2 1 337662 CASAVA_Build 9 10396815 5D TGAAAATTGT TAGAC/----- TAAAGATGTT 3070 hom 113 het 40 0 37 5 TAGAC 1 0 337663 CASAVA_Build 9 10440289 1D AATAAAAAAC A/- AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 7 6 337664 CASAVA_Build 9 10454487 6D AGAAAGACAG GAAGAT/------ GAAGATGAAG 3070 hom 98 het 41 0 30 13 GAAGAT 4 3 337665 CASAVA_Build 9 10461167 2D TAGGGGAAGG AC/-- ACAGCATTAG 3070 hom 45 het 19 0 16 6 AC 2 1 337666 CASAVA_Build 9 10463182 4I TCAAACAGCT ----/GTGA GTAATTTTGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GTGA 0 1 337667 CASAVA_Build 9 10465881 1D CAAAAAAAAA C/- ATATGATTAT 2592 het 2592 ref 28 19 6 3 C 1 0 337668 CASAVA_Build 9 10468148 1I AGTAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 10 11 337669 CASAVA_Build 9 10470122 4I AGAAAACAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 AAAC 2 3 337670 CASAVA_Build 9 10471037 1D CATTTGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 27 6 11 12 T 12 11 337671 CASAVA_Build 9 10475029 1D TTTTACTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 T 10 9 337672 CASAVA_Build 9 10476030 2D CTTTTTGATG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 T 11 9 337673 CASAVA_Build 9 10486429 1D AACTATTTAG C/- AGCTAATTTA 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 C 1 0 337674 CASAVA_Build 9 10486621 1D ACATCTGTTC T/- TTTTTGACTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 6 5 337675 CASAVA_Build 9 10489759 5I ATGTCCCACA -----/TTAAG TTAAGTTTCT 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 TTAAG 1 2 337676 CASAVA_Build 9 10495688 1D ACAAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 6 A 13 12 337677 CASAVA_Build 9 10495874 1D TTAAGCAATA T/- TTTAATTAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 4 3 337678 CASAVA_Build 9 10499558 6D TAATAAATAT TATATA/------ TATATATATA 2400 hom 12 het 8 0 5 3 TA 11 8 337679 CASAVA_Build 9 10502187 5I ACAAAAAAAG -----/AAGAT CTTATTTACC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AAGAT 0 1 337680 CASAVA_Build 9 10502898 1D GAAAGGAAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 16 15 9 A 9 8 337681 CASAVA_Build 9 10505579 1I ATTTTTATTT -/A AAAATTTGTA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 4 5 337682 CASAVA_Build 9 10508536 1D TCATTTACAA T/- TTTTTTTTTT 1480 het 1480 ref 23 10 4 9 T 15 14 337683 CASAVA_Build 9 10520273 4D ACTTAGTTCA TTAT/---- TTAAAGGTAT 3070 hom 93 het 32 0 30 3 TTAT 1 0 337684 CASAVA_Build 9 10532559 3D AATTAATTAA TTG/--- TTATTATTTC 3070 hom 54 het 21 0 19 4 TTG 1 0 337685 CASAVA_Build 9 10536494 1D AGTAGGGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 11 10 337686 CASAVA_Build 9 10538749 1I AGCAACATCT -/G TAGAATGCTG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 0 1 337687 CASAVA_Build 9 10542252 1I AAAACCAAGC -/T TTTTTTATCT 3070 hom 126 het 52 0 43 9 T 6 7 337688 CASAVA_Build 9 10553673 1I TCATCGTTAT -/A TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 0 1 337689 CASAVA_Build 9 10557384 1I GCTTTTCTGC -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 A 6 7 337690 CASAVA_Build 9 10564535 1I GAGAGAAAGG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 A 8 9 337691 CASAVA_Build 9 10566672 2I TTGAGAAAAC --/AT ATAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 AT 1 2 337692 CASAVA_Build 9 10566969 1D TTATTTCTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 9 337693 CASAVA_Build 9 10575455 1D TCCAATTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 10 9 337694 CASAVA_Build 9 10575698 17D CATTAGAGAA ATAGTATACATACACAC/----------------- ACACATACAC 3070 het 3070 ref 34 21 12 5 ATAGTATACATACACAC 1 0 337695 CASAVA_Build 9 10585022 3I AATTATTCAA ---/ATG ATAACTATTT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 ATG 0 1 337696 CASAVA_Build 9 10588157 1D AAGAGATGTG A/- ATTATAACTG 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 2 1 337697 CASAVA_Build 9 10591300 2D AATTTGATTT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 A 10 8 337698 CASAVA_Build 9 10594170 16D ACCATATATT CTGACCTATTCTGACC/---------------- ATATTCTGAC 3070 hom 129 het 43 0 44 2 CTGACCTATTCTGACC 1 0 337699 CASAVA_Build 9 10602376 3D AGAAAAGAAA GAC/--- AGAAGCACAG 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 GAC 1 0 337700 CASAVA_Build 9 10670589 1D GAAAGACCTA C/- CCCCATGTTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 C 5 4 337701 CASAVA_Build 9 10673035 1I GAAAGCTAAT -/C CCCACCCTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 3 4 337702 CASAVA_Build 9 10679231 1I CCTGGATATT -/A AAAAAAAAAA 2498 het 373 hom 16 2 8 6 A 13 14 337703 CASAVA_Build 9 10680503 16D TCTGTTGTAT GTGTGTGTGTGGGTGC/---------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 109 het 44 0 37 9 GTGTGTGTGTGGGTGC 2 1 337704 CASAVA_Build 9 10685242 4I TGTTTGTTTG ----/TTTT TTTTAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 32 4 T 4 8 337705 CASAVA_Build 9 10695219 1I GAGGATCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 184 hom 36 2 28 6 T 10 11 337706 CASAVA_Build 9 10701487 1D ACACTAAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 146 hom 25 1 23 1 A 10 9 337707 CASAVA_Build 9 10702535 4I TGAATATAAG ----/AGAT AAATAAAATT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AGAT 0 1 337708 CASAVA_Build 9 10702719 1D ATAAATATAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 8 7 337709 CASAVA_Build 9 10709349 1D AACCAATACT A/- AAACTTAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 4 3 337710 CASAVA_Build 9 10716095 4I CAATGTGCAG ----/ATTA GTTACATATG 3070 hom 33 het 12 0 12 1 ATTA 0 1 337711 CASAVA_Build 9 10716368 3D GGATATGAAC TCA/--- TCATTTTTTA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 TCA 2 1 337712 CASAVA_Build 9 10716756 1I CATGTAGAAG -/A AATATCTTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 2 3 337713 CASAVA_Build 9 10719764 2D64M1I CTTTCCTTAA ACAAAAAAGATTCATATATTCTCATTTCATATAATATATGGTGTATATTTAACATTCTAAAATATC-/--AAAAAAGATTCATATATTCTCATTTCATATAATATATGGTGTATATTTAACATTCTAAAATATCA CGAGAGCTTC 3070 hom 132 het 33 0 44 5 N/A 0 0 337714 CASAVA_Build 9 10725109 1D TTGCTTTTTT C/- CATAACAAAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 2 1 337715 CASAVA_Build 9 10731850 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAATC 3070 het 2670 hom 22 6 10 6 A 9 8 337716 CASAVA_Build 9 10732009 1I CTGATGATAG -/T TTTTTTTTTC 3034 het 40 hom 12 1 8 3 T 9 10 337717 CASAVA_Build 9 10734283 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 43 0 33 10 T 8 9 337718 CASAVA_Build 9 10745294 4I AGAAAAGAAA ----/TAAT TCATTCATTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TAAT 0 1 337719 CASAVA_Build 9 10746073 1I AATTAACAAT -/A AAAAAAACCC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 8 337720 CASAVA_Build 9 10750304 2I ATTCTAGAGG --/GT GTGTGTGGGG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 GT 3 4 337721 CASAVA_Build 9 10755057 2I ACTCACAAAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 AC 8 9 337722 CASAVA_Build 9 10757008 1D GTTTTCTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 11 10 337723 CASAVA_Build 9 10781276 1D GAGCCCAGAA G/- TAGGGGCTCC 2620 het 115 hom 25 1 9 15 G 1 0 337724 CASAVA_Build 9 10791295 4D GATTTTTTTC TCTT/---- TCTATTTTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TCTT 1 0 337725 CASAVA_Build 9 10796800 4D GAAACAAGAG GAAA/---- GAAAGAAAGA 3070 hom 3 het 17 1 12 4 GAAA 3 2 337726 CASAVA_Build 9 10817239 1I TATTGGCCTG -/A AAGTTTTCTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 2 3 337727 CASAVA_Build 9 10817746 1D TAATTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 170 hom 30 1 25 4 A 11 10 337728 CASAVA_Build 9 10818576 3I TGCAACAAAG ---/AGA AGAATGTATA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AGA 1 2 337729 CASAVA_Build 9 10821389 3D CTAAGCAAAC AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 120 het 44 0 41 6 AAT 5 4 337730 CASAVA_Build 9 10822561 4I AAAAATGTGG ----/GTGT GTATGTTTGC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 GT 1 3 337731 CASAVA_Build 9 10823400 1I AACTCTCAGA -/T TTCCACGTAA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 2 3 337732 CASAVA_Build 9 10824036 2I CCCTCAGCTC --/CA GAGTCTACCC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 CA 0 1 337733 CASAVA_Build 9 10825610 3I AGAGCTAAGC ---/TCT TCTTCAGAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TCT 1 2 337734 CASAVA_Build 9 10827104 1I TCTAAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 637 hom 21 3 16 2 T 11 12 337735 CASAVA_Build 9 10827788 2I GGGTTTGGAA --/AG AGAGTATATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AG 2 3 337736 CASAVA_Build 9 10829024 1I ATAAGGATAT -/A AAAAAAATTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 8 337737 CASAVA_Build 9 10862935 5D GCCTGTAATA GGAGG/----- GGCTATTGTG 3070 hom 84 het 32 0 29 8 GGAGG 1 0 337738 CASAVA_Build 9 10865823 1D TTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 6 A 10 9 337739 CASAVA_Build 9 10917518 1D TTCTTCAACG T/- TTTTTTTTTT 1315 het 1315 ref 33 27 3 3 T 11 10 337740 CASAVA_Build 9 10919029 1I AAGTTTTCCA -/G GGACATAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 G 2 3 337741 CASAVA_Build 9 10920652 1D CCCTCCAAAC T/- TTTAGAACTC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 4 3 337742 CASAVA_Build 9 10922467 2D CTATATATAT AG/-- ATGTATATAA 1605 het 1605 ref 18 10 7 1 AG 1 0 337743 CASAVA_Build 9 10928188 1I AATCTTTTAG -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 A 6 7 337744 CASAVA_Build 9 10936098 1D AAACATAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 11 10 337745 CASAVA_Build 9 10936235 1I TAAATTTCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 8 9 337746 CASAVA_Build 9 10937976 1I AGTATAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 10 11 337747 CASAVA_Build 9 10943344 2D AACAAACAAC AA/-- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 20 5 A 7 5 337748 CASAVA_Build 9 10949284 5D AAGTTATTAT GAGTG/----- GAAACACACA 3070 het 3070 ref 43 27 11 9 GAGTG 1 0 337749 CASAVA_Build 9 10955749 2I ATTATTTTAA --/AT ATATGATTAT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 AT 2 3 337750 CASAVA_Build 9 10958916 1D ATTCAAACTT A/- AAAAAAAAAC 1193 het 1193 ref 30 24 3 3 A 10 9 337751 CASAVA_Build 9 10960352 1I TTATAGTATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 8 9 337752 CASAVA_Build 9 10962391 1D GTTGTTGCCT G/- GCTCCATATG 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 G 2 1 337753 CASAVA_Build 9 10963979 1D CAATGGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 25 10 4 A 11 10 337754 CASAVA_Build 9 10977670 1I TTATCTTCTG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 7 8 337755 CASAVA_Build 9 10979615 1I CATCACACAC -/A CGGGGCCTGT 2382 het 486 hom 7 1 6 0 A 0 1 337756 CASAVA_Build 9 10983592 2D CCCAAAGACC GT/-- GGGGAAAATG 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 GT 1 0 337757 CASAVA_Build 9 10994761 1D GGAATAAAGG C/- CCTATGTATC 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 C 3 2 337758 CASAVA_Build 9 10999891 2D TGCCATCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 17 15 337759 CASAVA_Build 9 11000526 2D CTACTCCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 30 9 T 14 12 337760 CASAVA_Build 9 11006999 2D TTTAAGATTG TC/-- TCTTTTTTAG 3070 hom 112 het 43 0 38 9 TC 2 1 337761 CASAVA_Build 9 11008461 1D TTTCATCCTC A/- GCTATGCTTG 3070 hom 123 het 44 0 40 6 A 1 0 337762 CASAVA_Build 9 11010475 1I CAGCAGTAAA -/C TTAATTTGGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 C 0 1 337763 CASAVA_Build 9 11010630 1I TATGACCATG -/T TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 T 6 7 337764 CASAVA_Build 9 11017219 1I TGGGGGTTCC -/A ACCCCCCATG 3070 hom 51 het 23 0 16 7 A 1 2 337765 CASAVA_Build 9 11018132 1D ACTTTCCCTC A/- TCTTCCTATC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 1 0 337766 CASAVA_Build 9 11021187 2D TGTTTTTCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 63 het 27 0 22 5 TC 9 8 337767 CASAVA_Build 9 11022756 2I AGAAACGAAA --/TC TCTCTTTTTC 3070 hom 118 het 45 0 38 7 TC 2 3 337768 CASAVA_Build 9 11022969 1I AGACACAGAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 T 8 9 337769 CASAVA_Build 9 11023756 1D GCCAGAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 19 6 T 12 11 337770 CASAVA_Build 9 11025121 1I GAAAGACTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 T 9 10 337771 CASAVA_Build 9 11026751 3I TGCATGTATG ---/TCT TCTTTTGAGA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 TCT 1 2 337772 CASAVA_Build 9 11028383 1I CAAAACAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 995 hom 42 5 27 10 C 0 1 337773 CASAVA_Build 9 11043315 1I CTCCGAAATA -/T TACCTCTGTA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 T 1 2 337774 CASAVA_Build 9 11062543 3I GTTTCAATAT ---/TTC TTATTTCATT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 TTC 0 1 337775 CASAVA_Build 9 11064034 1D TGTTTAAAAG A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 8 7 337776 CASAVA_Build 9 11065331 1I CAGTAAACAA -/G GGGAGTGTGG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 G 3 4 337777 CASAVA_Build 9 11065869 2D TTTTTGTCCA TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 99 hom 57 5 32 20 T 10 8 337778 CASAVA_Build 9 11066344 1D AATGATATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 296 hom 30 2 24 4 T 9 8 337779 CASAVA_Build 9 11069237 12D CTCTTTTTTG CTCTTTTACCTT/------------ CTTTATTTTT 1508 het 1508 ref 38 15 6 21 CTCTTTTACCTT 1 0 337780 CASAVA_Build 9 11079853 1D ATTATAGGAC A/- AAAAACAATG 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 6 5 337781 CASAVA_Build 9 11088748 1D ATCCTCAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 37 0 33 5 A 11 10 337782 CASAVA_Build 9 11089784 1I CTGATCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 36 1 23 12 T 14 15 337783 CASAVA_Build 9 11095972 1D GATTTGACTG C/- CTCAGCCTGC 3070 het 2880 hom 23 9 12 2 C 2 1 337784 CASAVA_Build 9 11096812 1D TAAAGGAAAT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 A 8 7 337785 CASAVA_Build 9 11097559 1I GATGGTGGAC -/T GTGAGTGCCT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 T 0 1 337786 CASAVA_Build 9 11101792 4D TACAATTTAA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 266 hom 33 4 13 16 T 16 12 337787 CASAVA_Build 9 11103971 3I CTCGGCTCTT ---/CTC CACTTTTCTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 CTC 0 1 337788 CASAVA_Build 9 11104190 2D CATAAACATT TC/-- TCTATTTTAT 3070 het 3070 ref 37 20 17 1 TC 2 1 337789 CASAVA_Build 9 11105148 1I TATCTTTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 556 hom 30 2 23 5 A 9 10 337790 CASAVA_Build 9 11105322 1D AATGTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 2446 het 2446 ref 29 17 6 6 T 11 10 337791 CASAVA_Build 9 11106256 1I CTGGTAAGGG -/A AAAAACACCT 3070 het 3070 hom 44 12 25 7 A 5 6 337792 CASAVA_Build 9 11107967 4D TGCTATACAC TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 25 het 20 0 13 7 TTTA 4 3 337793 CASAVA_Build 9 11121473 1D CCTAATATTG T/- TTTTCATGCC 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 5 4 337794 CASAVA_Build 9 11123070 3D GGCTGGGTGC GGT/--- GGTGGCTCAC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 GGT 2 1 337795 CASAVA_Build 9 11123344 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 20 0 17 3 A 13 14 337796 CASAVA_Build 9 11123662 1I GAAAAATGTG -/T ACAATTAGTA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 0 1 337797 CASAVA_Build 9 11128318 1I AATTGGTACC -/A AAAAAATCAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 7 337798 CASAVA_Build 9 11128519 2I AGACACTGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 10 12 337799 CASAVA_Build 9 11136190 2I2M15I TCTACATTGC --AA---------------/TTAAGCCACCCAGTTGGTG AAATTTTGTT 3070 hom 75 het 27 0 25 4 N/A 0 0 337800 CASAVA_Build 9 11141645 1D AATTTATCTA T/- TTTTAAGTAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 5 4 337801 CASAVA_Build 9 11144567 1I CTTGGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 26 6 T 10 11 337802 CASAVA_Build 9 11157698 1D ATGAAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 27 0 20 7 T 12 11 337803 CASAVA_Build 9 11161836 6I TATCTAACAA ------/TGATTT TGAAAATCAT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 TGATTT 0 1 337804 CASAVA_Build 9 11168801 1I GCTTTTAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 12 17 0 T 9 10 337805 CASAVA_Build 9 11179663 1I GTCTTACCTC -/A AAAATGATAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 5 337806 CASAVA_Build 9 11198453 2I TGCATGGCAG --/GA GAGAGGGGGA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 GA 2 3 337807 CASAVA_Build 9 11201419 2D TGTTTGTGGG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 GT 1 0 337808 CASAVA_Build 9 11228218 1D AGTGCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 361 hom 36 1 30 5 T 13 12 337809 CASAVA_Build 9 11233105 1I ATTTTAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 429 hom 32 1 24 7 T 10 11 337810 CASAVA_Build 9 11236145 1I ATCTTAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 37 0 29 8 A 10 11 337811 CASAVA_Build 9 11279064 1I AAATATAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 888 hom 37 2 28 7 A 13 14 337812 CASAVA_Build 9 11290315 1I TGTGGCTGTG -/C CCCTTGGTGT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 C 3 4 337813 CASAVA_Build 9 11294417 1D TATAAAAAAA G/- GAGCTCTAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 G 2 1 337814 CASAVA_Build 9 11313132 1D TCCCAGGATC A/- AAAATGACAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 5 4 337815 CASAVA_Build 9 11315209 1D AATAAACACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 12 11 337816 CASAVA_Build 9 11316517 5D GGAACAAGAC ACATA/----- ACATAACCCC 3070 hom 129 het 49 0 43 11 ACATA 2 1 337817 CASAVA_Build 9 11319538 1D CTGTTACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 400 hom 41 1 29 12 A 13 12 337818 CASAVA_Build 9 11338275 3I ATTGAAATGC ---/AGA AGCAGTCCAC 3070 hom 129 het 50 0 43 7 AGA 0 1 337819 CASAVA_Build 9 11361925 2I AGTTGAAACA --/CT CATCCCTGAA 3070 hom 120 het 44 0 40 4 CT 0 1 337820 CASAVA_Build 9 11370924 1I ATAAGAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 A 10 11 337821 CASAVA_Build 9 11371792 5I TAACATTAAT -----/TAATC TAAGCATAGA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 TAATC 0 1 337822 CASAVA_Build 9 11374916 1D TCAGAGCCAC A/- AAAAAACCCA 3070 het 3070 hom 35 9 24 3 A 7 6 337823 CASAVA_Build 9 11378741 1I CAAGTATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 8 8 4 A 10 11 337824 CASAVA_Build 9 11380854 8D TCAAGTAAAA TGAAAGTG/-------- TGAATAAATG 3070 het 3070 ref 40 19 17 7 TGAAAGTG 1 0 337825 CASAVA_Build 9 11381042 2I TTGTCACTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 10 12 337826 CASAVA_Build 9 11390577 2I CTACATGCAC --/AA AGAGTTCAAT 3070 het 3070 ref 18 7 7 4 A 1 3 337827 CASAVA_Build 9 11396129 1I GATTATTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1140 hom 20 6 8 6 T 10 11 337828 CASAVA_Build 9 11401039 1I CATTAATTTA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 T 7 8 337829 CASAVA_Build 9 11439893 1D TCATATTTGC A/- AGCTAGAATT 3070 het 3070 ref 35 23 11 2 A 2 1 337830 CASAVA_Build 9 11439985 14D TATTTCAGCC AAAGTAATAATTTA/-------------- AAAGTAATAA 3070 hom 93 het 36 0 32 7 AAAGTAATAATTTA 2 1 337831 CASAVA_Build 9 11450720 4I TTACCTAAAT ----/AAAC AAATGGTAAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 AAAC 0 1 337832 CASAVA_Build 9 11477975 2D CATAAAAACT AA/-- AGTGTCCAAA 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 A 3 1 337833 CASAVA_Build 9 11483792 1I GTGCAAGTCT -/A ACACTAATTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 1 2 337834 CASAVA_Build 9 11495618 1D ATAAACTATT A/- AAAGGAATAA 3070 het 2702 hom 16 7 9 0 A 4 3 337835 CASAVA_Build 9 11501754 5I TCCACCTGTC -----/ATGGG AGTTACCAGG 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 ATGGG 0 1 337836 CASAVA_Build 9 11508345 1I GGCCATTAGT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 7 8 337837 CASAVA_Build 9 11516825 8I AAACAAACAA --------/ACAAACAG ACAAACAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 ACAAACAG 0 1 337838 CASAVA_Build 9 11519353 1I22M1D TAGACTTTCC -TTTTTTTTAGAATAAGTCTTTAT/TTTTTTTTTAGAATAAGTCTTTA- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 9 18 4 N/A 0 0 337839 CASAVA_Build 9 11521559 2I AAAAGCACTC --/TA TGACTTCTGA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 TA 0 1 337840 CASAVA_Build 9 11522605 1D CTATACAATA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 10 9 337841 CASAVA_Build 9 11537687 1D GAATATCATT A/- GGGGGCAATA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 1 0 337842 CASAVA_Build 9 11558230 4D GTTAACTGGA ATCC/---- ATCCACTAGA 3070 het 3070 ref 42 25 16 2 ATCC 2 1 337843 CASAVA_Build 9 11573248 1I CATAATGGCC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 8 9 337844 CASAVA_Build 9 11580196 1D CAAACATATG A/- AAAAAAGATC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 7 6 337845 CASAVA_Build 9 11581736 2D ATAAACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 AC 10 9 337846 CASAVA_Build 9 11597570 1I GCATCTCAAT -/A AAAAAAAAAA 2623 het 1313 hom 25 8 9 8 A 15 16 337847 CASAVA_Build 9 11610843 1I ATACTTATCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 9 10 337848 CASAVA_Build 9 11612709 4D GAGATGGAGT TTCA/---- TTCACTCTTG 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 TTCA 2 1 337849 CASAVA_Build 9 11613690 1I ATCAATAACT -/G GGCAAGGAAA 3070 het 3070 ref 45 26 17 2 G 2 3 337850 CASAVA_Build 9 11622928 1I CATCTGTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 T 10 11 337851 CASAVA_Build 9 11634809 1I CCCTCCCCCC -/T CTCCCCACCC 2148 het 672 hom 8 3 5 0 T 0 1 337852 CASAVA_Build 9 11635710 1I TTGTCAGCTC -/T GAAATAATCT 3070 het 3070 ref 53 29 20 4 T 0 1 337853 CASAVA_Build 9 11638191 1D AAAACTAGAT A/- AATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 3 2 337854 CASAVA_Build 9 11642052 1D ATATTATAAA C/- TAAAAGGCGG 3070 het 3070 ref 32 18 14 1 C 1 0 337855 CASAVA_Build 9 11644498 4I ATTTACAATC ----/AATT CATTTGCAAA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 AATT 0 1 337856 CASAVA_Build 9 11650914 10D TATACACACA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 36 0 37 1 TG 10 5 337857 CASAVA_Build 9 11657082 1I TGATGTGTAA -/G AATGCTTGTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 0 1 337858 CASAVA_Build 9 11663254 1D TGTACATTTC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 9 8 337859 CASAVA_Build 9 11667585 1I AGCTATTATG -/A AAAAAATATG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 6 7 337860 CASAVA_Build 9 11669640 1D ATAAGCCTTT A/- AAAAATTAAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 6 5 337861 CASAVA_Build 9 11670469 1D ACGGAATGGG A/- AAAAAATTCT 3070 hom 60 het 27 0 20 8 A 7 6 337862 CASAVA_Build 9 11671353 2D AATAATCTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 31 6 A 13 11 337863 CASAVA_Build 9 11683389 1I TTATGAGTGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 9 10 337864 CASAVA_Build 9 11683775 1D ATGTCATTCC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 9 8 337865 CASAVA_Build 9 11685116 4D CCAAATCAAT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 57 27 21 10 CAAA 4 3 337866 CASAVA_Build 9 11688013 5I AATGCATGTT -----/TTATC TTATAATTTC 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TTATC 0 1 337867 CASAVA_Build 9 11692446 3I TAGTGCAAAG ---/ATA ATAATATATT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 ATA 2 3 337868 CASAVA_Build 9 11708678 2D TGAGAGCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2166 hom 25 6 12 7 T 13 11 337869 CASAVA_Build 9 11721431 2I CTCTAAAGAC --/AT ATGATTTTGA 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 AT 1 2 337870 CASAVA_Build 9 11726327 5I TCAGACACAA -----/ATCTT ATCTATTAGT 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 ATCTT 0 1 337871 CASAVA_Build 9 11727230 8D TCAGCTCCAT GGGGTAAG/-------- GTGCTATTTC 3070 het 3070 ref 40 23 15 3 GGGGTAAG 1 0 337872 CASAVA_Build 9 11728062 9I GAAAGATGGT ---------/ATTAATGAA ATTAATGGCA 3070 hom 103 het 46 0 33 13 ATTAATGAA 0 1 337873 CASAVA_Build 9 11728892 3D TCTTGGGAAG CTC/--- CTGACACACT 3070 het 3070 hom 43 14 23 7 CTC 1 0 337874 CASAVA_Build 9 11731542 4D ATTCTGGAAT TAGG/---- TAAGATGATT 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 TAGG 1 0 337875 CASAVA_Build 9 11733162 10I AGCTTTTATC ----------/AAAAGAAAAG GAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 AAAAG 0 2 337876 CASAVA_Build 9 11736790 3I AATATAAGAA ---/AAG AAGTCTGTAC 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 AAG 1 2 337877 CASAVA_Build 9 11740628 1I AAATTATATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 9 10 337878 CASAVA_Build 9 11742474 1D CATATCTATC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 T 8 7 337879 CASAVA_Build 9 11743433 4I TGCCTCTTGC ----/TGAT TGATTGAAAG 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 TGAT 1 2 337880 CASAVA_Build 9 11743675 5D CACCACATTG ATCAT/----- ACACCAGAGC 3070 het 3070 ref 34 17 14 6 ATCAT 1 0 337881 CASAVA_Build 9 11748216 2D CTCTAAGAGT AG/-- AGAGTCTTCC 3070 het 3070 ref 30 17 9 5 AG 3 2 337882 CASAVA_Build 9 11750909 1D TTAAAATCTG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 8 7 337883 CASAVA_Build 9 11751899 1D ATACGGATAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 A 9 8 337884 CASAVA_Build 9 11755152 1I ATTTCATGTA -/C CCCATAAATA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 C 3 4 337885 CASAVA_Build 9 11767322 4I GGTTTTTACA ----/AAAT AAATATACCA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AAAT 1 2 337886 CASAVA_Build 9 11768661 1I TCCACATTTA -/T TTTTTTAACA 3070 hom 107 het 44 0 37 7 T 6 7 337887 CASAVA_Build 9 11772521 4D GGGGTTTGAA TTTT/---- TTTTGGTATG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 T 8 4 337888 CASAVA_Build 9 11776324 3D CCATTAAAAT TAA/--- TAATAAGTAA 3070 hom 39 het 15 0 14 4 TAA 3 2 337889 CASAVA_Build 9 11779125 1I AATTATCAAG -/A AAAAAATAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 6 7 337890 CASAVA_Build 9 11784111 1D TATTGTCATT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 8 7 337891 CASAVA_Build 9 11785274 1D AGTAGGCGCC T/- ACCTGTAGAA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 1 0 337892 CASAVA_Build 9 11786206 1I TAATAAATGG -/T TCTGTAACAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 1 2 337893 CASAVA_Build 9 11787464 1D ACATCTTATC A/- ACCCAGCAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 2 1 337894 CASAVA_Build 9 11796594 4D ATATAGAAAA AAAT/---- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 21 9 12 1 AAAT 1 0 337895 CASAVA_Build 9 11796835 1I CATTTTCATA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 7 8 337896 CASAVA_Build 9 11799586 1I GACCCAGGTG -/T TATTTGTTCC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 1 2 337897 CASAVA_Build 9 11799826 1I GGCACCCGCC -/A CCAAGCCCGG 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 0 1 337898 CASAVA_Build 9 11800347 1I CTTAAGTGTA -/T TTTTTCTGGT 3070 het 3070 hom 49 23 24 2 T 5 6 337899 CASAVA_Build 9 11804639 1D GTTTTAAGAG T/- TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 T 8 7 337900 CASAVA_Build 9 11804790 2D ATTTTAAGTA AG/-- AGTGTTGAGA 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 AG 2 1 337901 CASAVA_Build 9 11820119 4D AGACATACAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 109 hom 26 3 15 10 AT 9 7 337902 CASAVA_Build 9 11825046 12I ATGTGCTTTA ------------/GAACGTACTCTT TGAGCAAGAT 3070 hom 144 het 53 0 48 5 GAACGTACTCTT 0 1 337903 CASAVA_Build 9 11838835 1D GGAATAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 14 13 337904 CASAVA_Build 9 11840636 1I CCAACCTCAG -/C TGTGTCCTAG 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 C 0 1 337905 CASAVA_Build 9 11840802 3D ACCAATAATA ATG/--- ATAACGATGA 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 ATG 1 0 337906 CASAVA_Build 9 11841892 3I ATAATAAGAC ---/ATA ATAATAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATA 2 3 337907 CASAVA_Build 9 11848226 4D AATAAAAGAC AAAT/---- AAGAGAATTT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 AAAT 1 0 337908 CASAVA_Build 9 11849044 3D ATTTGGAGTC ATA/--- TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 ATA 1 0 337909 CASAVA_Build 9 11857300 1I CTGCTAAAGG -/A ATTCAAGTGT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 1 2 337910 CASAVA_Build 9 11863924 4I TGGACCATGG ----/TATA TATAACACTC 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 TA 2 4 337911 CASAVA_Build 9 11867992 1I AACTTTTTTC -/A AAATAAAATT 3070 hom 84 het 38 0 29 9 A 3 4 337912 CASAVA_Build 9 11869693 2D GGGTATAGGC TA/-- TATATAGGAA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 TA 4 3 337913 CASAVA_Build 9 11871162 1I TAAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 9 10 337914 CASAVA_Build 9 11881785 4D CTGGAAAAGG CTAT/---- CTTTTCTTCA 3070 het 3070 ref 45 22 19 7 CTAT 1 0 337915 CASAVA_Build 9 11885952 1I TAGTCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 710 hom 31 2 21 8 T 12 13 337916 CASAVA_Build 9 11893377 1I TTGTTTTCAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 53 27 16 10 T 9 10 337917 CASAVA_Build 9 11893772 1D TGAATGATAA T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 8 7 337918 CASAVA_Build 9 11894243 1I TTACCTTACG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 T 7 8 337919 CASAVA_Build 9 11898565 43D TTTGAGGTTT GGTCCATCAATACCTAGTTTATTGAATGTTTTTAACATTAAAG/------------------------------------------- GGTCCATCAA 2446 het 2446 ref 34 26 6 15 GGTCCATCAATACCTAGTTTATTGAATGTTTTTAACATTAAAG 1 0 337920 CASAVA_Build 9 11903516 1D TTAATTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 11 10 337921 CASAVA_Build 9 11919765 4D ACGTGTGCAG ACAC/---- ACACACATAC 2356 het 2356 ref 22 12 7 4 AC 5 3 337922 CASAVA_Build 9 11928825 1D ATAGGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 16 12 T 12 11 337923 CASAVA_Build 9 11936462 5D TTTTGGCACC AGTAA/----- AGTAATCTAT 3070 het 3070 hom 42 17 24 3 AGTAA 2 1 337924 CASAVA_Build 9 11939068 1I GAACTCACTC -/A ACTAGTACAA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 A 1 2 337925 CASAVA_Build 9 11951646 1D TGGAGAATCT A/- AAAACGTTAA 3070 het 3070 ref 51 23 22 6 A 5 4 337926 CASAVA_Build 9 11970320 1I CAACTCAATC -/T TTTTTTTTTT 1594 het 1594 ref 18 10 4 4 T 11 12 337927 CASAVA_Build 9 11976162 1D GCAAAATACC T/- TTTTATTAAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 5 4 337928 CASAVA_Build 9 11981214 1I TTTTCTATAT -/A AAAAATATTT 2427 het 2427 ref 18 10 6 2 A 5 6 337929 CASAVA_Build 9 11983448 1I CTGCTGGGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 T 9 10 337930 CASAVA_Build 9 11985518 1I AGTTGTGCCT -/A TTTTATTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 20 0 A 0 1 337931 CASAVA_Build 9 11988232 1I AAAGAAATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 9 10 337932 CASAVA_Build 9 11989920 1D AAGAAATAAT A/- AAAAACGTGG 3070 het 3070 ref 37 17 19 3 A 6 5 337933 CASAVA_Build 9 11991942 1D ATTCAACAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 39 0 31 8 A 10 9 337934 CASAVA_Build 9 11993529 1D GGGGAGTAAT A/- AAAAAAATGC 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 8 7 337935 CASAVA_Build 9 11995742 35D TTCTCTTGTT TTAAATGTTCCTAATAAAATCAATAAATCATTTTA/----------------------------------- TTAAATGTTC 3070 hom 39 het 15 0 14 6 TTAAATGTTCCTAATAAAATCAATAAATCATTTTA 2 1 337936 CASAVA_Build 9 12028244 1D CAAAAAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 12 11 337937 CASAVA_Build 9 12029103 4D CTAGACTAAT AAAG/---- AAGAAGAGAG 3070 het 3070 ref 34 19 14 4 AAAG 1 0 337938 CASAVA_Build 9 12030117 1D CTTGAACTGA T/- AAGCAACTTC 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 T 1 0 337939 CASAVA_Build 9 12035120 4I AACTAAGATA ----/TAAT AAGCATTCAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TAAT 0 1 337940 CASAVA_Build 9 12044067 1I TTCCATTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 36 1 29 6 A 10 11 337941 CASAVA_Build 9 12059990 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2520 het 233 hom 24 2 11 11 A 15 16 337942 CASAVA_Build 9 12065843 4D TCTGAAAAGT AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 39 17 13 11 AG 7 5 337943 CASAVA_Build 9 12078865 1D TCTCTTCTTC T/- TTCTTTGGTA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 3 2 337944 CASAVA_Build 9 12104971 1D ATGTTTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 A 15 14 337945 CASAVA_Build 9 12116772 5I TTTTTTTGCA -----/AAAAT AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 AAAAT 2 3 337946 CASAVA_Build 9 12116946 6D GAAATGAAAG AAAAAC/------ AAATTTCAAT 3070 het 3070 hom 35 13 21 6 AAAAAC 1 0 337947 CASAVA_Build 9 12117985 2I TATTCTTCTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1781 hom 28 9 10 9 TG 8 9 337948 CASAVA_Build 9 12121157 6D GACATTTATT TCTTTC/------ TCTTTCTCTT 3070 het 3070 hom 44 17 18 11 TCTTTC 3 2 337949 CASAVA_Build 9 12122456 2D TTCATGTATT TG/-- TGTATAATTT 3070 hom 83 het 31 0 28 5 TG 2 1 337950 CASAVA_Build 9 12129769 2I ATGAGGAGGT --/GG GGGGAGGCAA 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 G 4 6 337951 CASAVA_Build 9 12137364 2I AATTATCAAA --/AT ATATGTCATC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AT 2 3 337952 CASAVA_Build 9 12137901 1I CCAAAAAAAA -/T ATTTAAAAGA 3070 het 63 hom 47 1 41 5 T 0 1 337953 CASAVA_Build 9 12148746 1I AGTTTGTCTA -/T TTTTTTCCAA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 6 7 337954 CASAVA_Build 9 12159206 12D GGAGAGTTAA TTATCTCCCTTG/------------ TGGGAGGGGA 3070 het 3070 hom 35 14 20 4 TTATCTCCCTTG 1 0 337955 CASAVA_Build 9 12164929 1I TAAGACTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 373 hom 24 1 17 6 A 10 11 337956 CASAVA_Build 9 12164939 2I AAAAAAAAAA --/AT TTAAGGATTG 3070 het 528 hom 26 3 12 11 AT 0 1 337957 CASAVA_Build 9 12165950 6D TGTTAAAGCT CTGTGG/------ CTGCTCCTGT 3070 hom 120 het 42 0 40 4 CTGTGG 1 0 337958 CASAVA_Build 9 12168343 1I GAAAGATAGT -/A AAAAAAAGCA 3070 het 268 hom 33 1 25 7 A 7 8 337959 CASAVA_Build 9 12172351 2I TCATGTTATT --/AG AGAGCATGCA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AG 2 3 337960 CASAVA_Build 9 12177122 6I GCAAACTAAG ------/AGCAAC AGCAACACTT 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 AGCAAC 1 2 337961 CASAVA_Build 9 12178532 2D GCATATGTAT AC/-- ACAGTCATGT 3070 het 3070 hom 54 26 21 7 AC 2 1 337962 CASAVA_Build 9 12185200 1I TAATCACAGA -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 6 7 337963 CASAVA_Build 9 12186226 4D ACCTCTTACT AATA/---- AATAGACCTT 1437 het 1437 ref 12 9 3 0 AATA 2 1 337964 CASAVA_Build 9 12187460 2D TTTCTAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 25 1 12 12 A 12 10 337965 CASAVA_Build 9 12189322 3I AATGTTCATA ---/AAC AACAAAAGCA 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 AAC 1 2 337966 CASAVA_Build 9 12191124 5D CCAACCTAAT AAATC/----- AAACTGCATT 3070 het 3070 hom 41 19 21 5 AAATC 1 0 337967 CASAVA_Build 9 12192622 1I TGATCTTATT -/A TGTAACAGTG 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 A 0 1 337968 CASAVA_Build 9 12210234 2I AATAAGATTT --/AA AAAAAAAAGA 1660 het 1660 ref 27 14 5 8 A 8 10 337969 CASAVA_Build 9 12212004 1I TCTCAGTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 9 12 A 11 12 337970 CASAVA_Build 9 12215057 5I ATTTATGTAA -----/GACAT AACATAGATT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 GACAT 0 1 337971 CASAVA_Build 9 12216311 5I GTACCTCAAG -----/TTTAT TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 TTTAT 1 2 337972 CASAVA_Build 9 12227365 4I TTTCACTTAA ----/TTAC TTCTGTAAAA 3070 het 3070 ref 24 14 7 3 TTAC 0 1 337973 CASAVA_Build 9 12236057 3D TCACGAGGTC AGG/--- AGGAGTTCAA 3070 het 3070 hom 26 9 17 0 AGG 2 1 337974 CASAVA_Build 9 12245475 1I TTATTATCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 T 9 10 337975 CASAVA_Build 9 12246644 3D AGGGGTAGAT GGA/--- GGAGTTCTGC 3070 het 3070 ref 49 23 22 6 GGA 2 1 337976 CASAVA_Build 9 12247670 2D ACACAAATAA AC/-- ACAATTTGAA 3070 het 3070 ref 49 24 20 6 AC 2 1 337977 CASAVA_Build 9 12253618 1I TAGGAGAGTA -/T TTTTACAAAC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 4 5 337978 CASAVA_Build 9 12255269 1I TCAGAGTTCT -/A AAAAAGCATC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 5 6 337979 CASAVA_Build 9 12260436 1D AACAAAAAAT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 8 A 7 6 337980 CASAVA_Build 9 12261793 2I GCTTCCAAGG --/TT TTCTGTCCCT 3070 het 3070 hom 47 21 25 1 T 2 4 337981 CASAVA_Build 9 12263087 1D CTGGAGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 101 het 40 0 33 7 A 10 9 337982 CASAVA_Build 9 12269239 1D ACCTGTAATG A/- AAAAATCAAT 3070 het 102 hom 43 2 22 19 A 6 5 337983 CASAVA_Build 9 12296518 1I TTATTAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 9 10 337984 CASAVA_Build 9 12297024 1I CCTTCATAAT -/C CCATGACATT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 C 2 3 337985 CASAVA_Build 9 12297549 1D TTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2140 hom 18 5 12 1 A 10 9 337986 CASAVA_Build 9 12298236 1D TTATGTTCAT A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 30 12 14 5 A 7 6 337987 CASAVA_Build 9 12300641 1D GCCTAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 1544 het 1544 ref 17 8 4 5 T 13 12 337988 CASAVA_Build 9 12301423 1I CAGCTTAAGG -/A TTTTTTGGGC 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 0 1 337989 CASAVA_Build 9 12322998 1D AAATTAAAAA T/- ATCTGCTCTG 3070 het 3070 ref 31 14 14 5 T 1 0 337990 CASAVA_Build 9 12323132 4I ATAAGAAAAG ----/AAAC AACTCAATTT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AAAC 0 1 337991 CASAVA_Build 9 12323349 2I GAAAAACTGC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 A 9 11 337992 CASAVA_Build 9 12323516 1D GTGTTAACTT A/- AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 50 24 23 5 A 6 5 337993 CASAVA_Build 9 12330007 4D GTATCATAAA ACTT/---- AAAGTATAAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 ACTT 1 0 337994 CASAVA_Build 9 12330115 2D ATATAATCCC CT/-- CCCAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 CT 1 0 337995 CASAVA_Build 9 12330321 1I AATCCAATAT -/A AAAAATTGAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 5 6 337996 CASAVA_Build 9 12330932 5D AATAGAGAAA TTCTG/----- TTCTGTTCTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTCTG 3 2 337997 CASAVA_Build 9 12334263 1I ACTAAAAGGC -/T TCTGTACAGC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 1 2 337998 CASAVA_Build 9 12343755 4D ATTAGAACAC AGAA/---- AGCCATTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 12 8 AGAA 1 0 337999 CASAVA_Build 9 12344304 2D CAATAGGATG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 GA 7 6 338000 CASAVA_Build 9 12348395 3I AACAAAAAAC ---/AAT GAGATACCAC 3070 hom 48 het 23 0 17 6 AAT 0 1 338001 CASAVA_Build 9 12355041 1D TCTTTTTTTT G/- TTTGTTTTTT 405 het 405 ref 30 7 5 19 G 1 0 338002 CASAVA_Build 9 12359966 1I GCAACAACTA -/T TTTTAACATT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 4 5 338003 CASAVA_Build 9 12360742 2D ATTATTAAGA CT/-- CTTGAAATTA 3070 hom 87 het 34 0 30 6 CT 2 1 338004 CASAVA_Build 9 12361468 1I AAAAAAAATT -/C AAAAATTTTA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 C 0 1 338005 CASAVA_Build 9 12362642 4I TTCTGTAAAT ----/TATC TATCTGTAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TATC 1 2 338006 CASAVA_Build 9 12366367 4D ATAGTTAAAA TAAG/---- TAAGATAACA 3070 hom 114 het 39 0 39 0 TAAG 2 1 338007 CASAVA_Build 9 12370317 2D TTACTGCTAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 75 het 31 0 26 7 TA 7 6 338008 CASAVA_Build 9 12371051 1D GTCTCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 24 0 16 8 T 11 10 338009 CASAVA_Build 9 12372411 7I TCACATAGTG -------/TCCCCTC TGCTTCAGTC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TCCCCTC 0 1 338010 CASAVA_Build 9 12376099 15D TCACTTTCAG TTTTGCCTTAATAAA/--------------- TTTACCATTT 3070 hom 117 het 41 0 39 4 TTTTGCCTTAATAAA 1 0 338011 CASAVA_Build 9 12387357 1I AGAAGAAAGA -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 7 338012 CASAVA_Build 9 12388405 5D GTATTCAAGT GAAAA/----- GAAGAGTCAC 3070 hom 78 het 28 0 27 5 GAAAA 1 0 338013 CASAVA_Build 9 12396628 1D ACACAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 23 0 17 6 T 17 16 338014 CASAVA_Build 9 12418023 2I ACTGAATGAA --/AG AATTATTATT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AG 0 1 338015 CASAVA_Build 9 12419646 1I TTGGAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 931 hom 23 3 20 0 A 11 12 338016 CASAVA_Build 9 12422666 1D GAGGAAAGGA T/- TTTAACTTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 4 3 338017 CASAVA_Build 9 12436709 4D ACTCCACCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 77 hom 15 1 10 5 A 20 16 338018 CASAVA_Build 9 12442475 2D GAAGAAAGAC AT/-- GTGTAGAAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 AT 1 0 338019 CASAVA_Build 9 12457443 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 10 11 338020 CASAVA_Build 9 12463731 1D CAGAGCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2471 hom 25 6 15 4 A 12 11 338021 CASAVA_Build 9 12466303 4D TGCTCGCTCA CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 126 het 51 0 41 10 CT 11 9 338022 CASAVA_Build 9 12474045 1I AATAAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 13 11 A 15 16 338023 CASAVA_Build 9 12479075 1D AGTCTGGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 15 14 338024 CASAVA_Build 9 12484600 7I TGTCTTTACT -------/GCACTGG GCACTGGGCA 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 GCACTGG 1 2 338025 CASAVA_Build 9 12499893 1I ATATCAGCTA -/T TTTTATTATA 2898 het 2898 ref 30 21 6 3 T 4 5 338026 CASAVA_Build 9 12513039 1D CCAAGAGCGT A/- AAAAAACTAG 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 7 6 338027 CASAVA_Build 9 12518114 2I CCCAGCTAAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 TA 6 7 338028 CASAVA_Build 9 12518813 1D TTTGTTTTTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 27 11 13 4 A 8 7 338029 CASAVA_Build 9 12519170 1I CTTACATGGC -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 A 7 8 338030 CASAVA_Build 9 12519490 1D AACTGTATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 11 10 338031 CASAVA_Build 9 12522388 1D AATCCACTTC A/- AAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 7 6 338032 CASAVA_Build 9 12523606 1I AGATTCCATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 21 7 10 4 A 8 9 338033 CASAVA_Build 9 12559274 1D TGCAGATGGA T/- TTTTTTTTTT 3020 het 3020 ref 47 22 8 17 T 15 14 338034 CASAVA_Build 9 12561313 1I GATTTTAAGT -/G GGGACATAGC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 3 4 338035 CASAVA_Build 9 12573923 1I TTTAAAGTTT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 8 9 338036 CASAVA_Build 9 12587471 1D GAAAAGTGTT A/- ACTTACTAGA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 2 1 338037 CASAVA_Build 9 12604287 1I TCCATTTCAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 15 1 10 4 G 0 1 338038 CASAVA_Build 9 12606402 1I CCTCCCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1869 hom 30 6 12 12 T 13 14 338039 CASAVA_Build 9 12607879 1D ATTTAGATTG A/- AATGATTATA 3070 hom 105 het 39 0 36 5 A 3 2 338040 CASAVA_Build 9 12611701 1I TAACACATTT -/C CCCCCCAATG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 6 7 338041 CASAVA_Build 9 12617557 1I TATCCTTGTT -/A AAAAAAGATA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 6 7 338042 CASAVA_Build 9 12617713 2I AACATGCGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 49 het 32 1 29 2 TG 8 9 338043 CASAVA_Build 9 12621716 2I TAGAGAAAAC --/AT AAATTATAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 0 1 338044 CASAVA_Build 9 12633500 4I CATATGAAAG ----/ATTA ATTAGTTATA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 ATTA 1 2 338045 CASAVA_Build 9 12637951 2D ATTTATATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 13 0 9 4 TA 7 6 338046 CASAVA_Build 9 12638479 3D TTTTATTTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 14 11 338047 CASAVA_Build 9 12640939 1D ACTTACCCTC T/- TAGGGTTCAT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 T 2 1 338048 CASAVA_Build 9 12647895 1I TAGGGGCTCT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 8 9 338049 CASAVA_Build 9 12648339 1D GCTGTCCCGT C/- ATCTCCTCAG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 1 0 338050 CASAVA_Build 9 12653622 1I TCACAGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 9 10 338051 CASAVA_Build 9 12655668 6D TTATTATTAT TATTAC/------ TATTATTATT 2956 hom 18 het 7 0 7 0 TATTAC 1 0 338052 CASAVA_Build 9 12664678 1I TCTTGATGCC -/T TTTTTTTCAC 3070 hom 105 het 43 0 34 9 T 7 8 338053 CASAVA_Build 9 12683765 14D4M1I TAAAGGTAAA ATTTGTGTGAAATGTCAC-/--------------TTACT ACTTTTATTA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 N/A 0 0 338054 CASAVA_Build 9 12689535 5I TGCATCAAGT -----/ATTAA ATTATTTTAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 ATTAA 0 1 338055 CASAVA_Build 9 12691823 1I AATGTAAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 132 het 51 0 44 7 T 9 10 338056 CASAVA_Build 9 12698959 1I TTTTATTTTT -/A ATCTTCCTTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 1 2 338057 CASAVA_Build 9 12699475 4D TGTGAAGATA TAAG/---- TAAGTGAACT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 TAAG 2 1 338058 CASAVA_Build 9 12699649 4D AATTAAAGAA AATT/---- AATTATGTGT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AATT 2 1 338059 CASAVA_Build 9 12700257 3I GGTAAAAATA ---/AAT AATAATAACA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 AAT 2 3 338060 CASAVA_Build 9 12716280 1I GCTTAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 1337 het 1337 ref 25 12 3 10 A 15 16 338061 CASAVA_Build 9 12717188 1D ACCCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 44 0 32 12 A 11 10 338062 CASAVA_Build 9 12722172 1D43M1D CCCAACTCTG AAAAAAAAAATGGTGGAAATTTAAGTGCATATTACTAAGTGAAAG/-AAAAAAAAATGGTGGAAATTTAAGTGCATATTACTAAGTGAAA- AAGCCAATCT 3070 hom 126 het 35 0 43 6 N/A 0 0 338063 CASAVA_Build 9 12734506 4D TGCCCCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTT 3070 hom 60 het 24 0 19 6 TC 6 4 338064 CASAVA_Build 9 12737843 2I CTATAGAATC --/AT ATATATATAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AT 5 6 338065 CASAVA_Build 9 12746781 46D GTAAACTCCC ATATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 45 het 13 0 16 6 ATATATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 338066 CASAVA_Build 9 12748620 2I ACACACGCAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 96 het 41 0 33 8 AC 7 8 338067 CASAVA_Build 9 12751323 1D CTTTTTAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 367 hom 36 1 31 4 A 9 8 338068 CASAVA_Build 9 12752950 3I TGCTATTATT ---/ATC ATCACATTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATC 1 2 338069 CASAVA_Build 9 12757496 2I AAATTCTTAT --/CA CCTAGTAACA 3070 hom 54 het 22 0 19 7 CA 0 1 338070 CASAVA_Build 9 12759594 1D TGTAAAGTAG C/- CTGTCGTTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 C 2 1 338071 CASAVA_Build 9 12759686 3I TTTGTTGTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TTG 5 6 338072 CASAVA_Build 9 12770384 14I AAAACAAGGT --------------/TGTATTTTCAGGTG TATATTTCAA 3070 hom 76 het 28 0 26 2 TGTATTTTCAGGTG 0 1 338073 CASAVA_Build 9 12770747 1D TCTTTTTTTT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 8 7 338074 CASAVA_Build 9 12778365 1I GTATACATTC -/A AAAAACACCT 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 5 6 338075 CASAVA_Build 9 12779676 1I AGTTGACAAC -/T TACTTTAAGA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 T 1 2 338076 CASAVA_Build 9 12835918 2D GTGTATACAC AT/-- ATGTGTGTAT 959 het 959 ref 10 5 4 1 AT 2 1 338077 CASAVA_Build 9 12839233 3D8M1D AAAGAAAAAA AAGAATAAAATA/---AATAAAAT- AAAAAAATTG 3070 het 2840 hom 17 8 10 0 N/A 0 0 338078 CASAVA_Build 9 12839650 1I CAAAGCAATT -/A AAATAGCTTT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 A 3 4 338079 CASAVA_Build 9 12855661 1I AGGTGATTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 9 10 338080 CASAVA_Build 9 12858324 1D ATTAGGTCCA C/- TTGGTCCAGA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 C 1 0 338081 CASAVA_Build 9 12859144 1D CTGGCTTGTA G/- GGGTTCCTGC 1854 hom 12 het 5 0 5 0 G 4 3 338082 CASAVA_Build 9 12859720 1D CTTAGCTTCC T/- TGCATTGGGT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 2 1 338083 CASAVA_Build 9 12861330 5I AAAAAAAGAA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 AAAAG 2 3 338084 CASAVA_Build 9 12861482 2D GAAATTATAC AT/-- GAGAGCGCTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 AT 1 0 338085 CASAVA_Build 9 12861738 1D TATTCTATGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 10 9 338086 CASAVA_Build 9 12864430 1D TTTAAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 10 9 338087 CASAVA_Build 9 12868238 1D TACTTTTTTT A/- GCCCTTTGCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 1 0 338088 CASAVA_Build 9 12868889 1I ACTTAGTGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 37 1 32 4 A 10 11 338089 CASAVA_Build 9 12873274 1D TTTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 29 1 25 3 A 13 12 338090 CASAVA_Build 9 12874633 1I AAAAAAAAAC -/A AAACTTTCCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 3 4 338091 CASAVA_Build 9 12877923 1I AGAGACGGGG -/T TTCACCTTGT 2893 het 1339 hom 13 4 7 2 T 2 3 338092 CASAVA_Build 9 12879795 1I CACCATGTTA -/T TTGGGGGGGG 3070 het 3070 hom 58 26 26 6 T 2 3 338093 CASAVA_Build 9 12880192 1I ATAAGGCATC -/A AGAGGCTCTT 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 A 1 2 338094 CASAVA_Build 9 12882594 3D TGCCTACAAC AAA/--- AAAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 31 15 14 3 A 9 6 338095 CASAVA_Build 9 12885147 1I GAGTTTCCTC -/A AAAAACTAAA 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 5 6 338096 CASAVA_Build 9 12885594 1I AATGCATACC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 A 7 8 338097 CASAVA_Build 9 12889052 1D TATGTTGCTT G/- GTACTTAAGC 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 G 2 1 338098 CASAVA_Build 9 12894104 1D TTCCTACGAA T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 T 7 6 338099 CASAVA_Build 9 12918735 1I GGTTGAAAGA -/G GGGGGTTGCC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 5 6 338100 CASAVA_Build 9 12919225 1D AAAAATTAAA C/- ATCATCAGCC 3070 hom 82 het 31 0 26 5 C 1 0 338101 CASAVA_Build 9 12919781 1I TGCGAGTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 42 1 35 6 A 10 11 338102 CASAVA_Build 9 12933307 1D TCTATACAAA T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 7 338103 CASAVA_Build 9 12937599 2I ATCATGATGT --/AA AGAGTGAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 3 338104 CASAVA_Build 9 12948427 3I CTTTTCCCCT ---/GGA GTTCAATGAG 3070 het 3070 hom 43 19 18 6 GGA 0 1 338105 CASAVA_Build 9 12950497 1D AAGAGCATAC T/- TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 52 19 29 4 T 7 6 338106 CASAVA_Build 9 12951699 1I AAAGGCAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 A 11 12 338107 CASAVA_Build 9 12953242 4D TCTGAACTGT TTAA/---- TTAATTTTAT 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 TTAA 2 1 338108 CASAVA_Build 9 12965914 6I AAAGAGAAAT ------/AAAAAC AAACAGAATA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 AAAAAC 0 1 338109 CASAVA_Build 9 12967466 4D AGCAAGGAAA TAAT/---- TAATTGATAG 3070 hom 96 het 33 0 32 2 TAAT 2 1 338110 CASAVA_Build 9 12977677 1D CTTAAGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 711 hom 50 3 35 12 A 13 12 338111 CASAVA_Build 9 12984175 1I TGGGTACCAT -/C CTTTAAAGAC 3070 hom 131 het 49 0 42 7 C 1 2 338112 CASAVA_Build 9 12986409 1I GAGATGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1429 hom 34 4 19 11 A 13 14 338113 CASAVA_Build 9 12999233 1D ATATACTTGG T/- TTTTTTTTTT 1511 het 297 hom 21 2 13 6 T 11 10 338114 CASAVA_Build 9 12999546 1I AACCAGACCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 8 9 338115 CASAVA_Build 9 13009190 3I ATATACTATT ---/CTA CTCTCTCCTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CTA 0 1 338116 CASAVA_Build 9 13015964 1I GAGATTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 31 1 28 2 A 11 12 338117 CASAVA_Build 9 13027637 4D GGCTTTTTAA TAGT/---- TAATTTGTAA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 TAGT 1 0 338118 CASAVA_Build 9 13035721 12I AGTTATAAAT ------------/GTGTACTTCAAG GTGTACTTCA 3070 het 3070 hom 54 19 25 10 GTGTACTTCAAG 1 2 338119 CASAVA_Build 9 13057342 1I CATTTTATTT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 7 8 338120 CASAVA_Build 9 13062089 1I AGAAAAAAAA -/T ATACAGAGAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 0 1 338121 CASAVA_Build 9 13066680 4D TACCAAGATA GATT/---- GATTATACTC 3070 het 3070 hom 31 13 18 1 GATT 2 1 338122 CASAVA_Build 9 13069776 1I TCATCTCTGC -/A AAAAAAATAA 1871 het 1871 ref 22 11 6 5 A 7 8 338123 CASAVA_Build 9 13077822 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTCT 998 het 284 hom 21 4 6 12 TTC 1 0 338124 CASAVA_Build 9 13082635 2I CAACAACAAC --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 9 11 338125 CASAVA_Build 9 13094245 1D TGGCTAGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 64 het 26 0 21 6 T 9 8 338126 CASAVA_Build 9 13094478 2I TTTCTCACAG --/TA TATAGAGGGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TA 2 3 338127 CASAVA_Build 9 13120456 2I GCAGATACTT --/AC ACAGTCTGAA 3070 hom 78 het 27 0 26 1 AC 1 2 338128 CASAVA_Build 9 13165716 3D CAAGGGGGTT GAG/--- GAGTAGGTAT 3070 hom 90 het 31 0 31 1 GAG 2 1 338129 CASAVA_Build 9 13177762 21I TTTTCTTAAG ---------------------/AAAACGTGTATCTGCCTTTTC ACTTCAAACT 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AAAACGTGTATCTGCCTTTTC 0 1 338130 CASAVA_Build 9 13187159 2I AACAATAAAC --/TA TATATATATA 1454 het 629 hom 14 2 6 6 TA 8 9 338131 CASAVA_Build 9 13191353 1I GCTTTCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 13 23 9 T 11 12 338132 CASAVA_Build 9 13200422 1D TAAGAGGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 15 14 338133 CASAVA_Build 9 13221716 1I TTTTTGTGAC -/A AAAAAAAGGC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 7 8 338134 CASAVA_Build 9 13224027 1I GATTTGTCTT -/C CCCAAATATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 3 4 338135 CASAVA_Build 9 13224817 1D AAATGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 144 het 51 0 47 5 T 11 10 338136 CASAVA_Build 9 13236056 2I CTTCTTTACA --/CT CTCTGAAAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 CT 2 3 338137 CASAVA_Build 9 13264256 1D TTTTTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 1236 het 1236 ref 31 24 3 4 T 11 10 338138 CASAVA_Build 9 13290190 4D ACTGAATCTC AATT/---- AAGAGGCTGT 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 AATT 1 0 338139 CASAVA_Build 9 13312544 1I ACAGATTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 47 3 39 5 T 10 11 338140 CASAVA_Build 9 13321634 1D TTTCCGTATT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 135 het 51 0 46 6 A 9 8 338141 CASAVA_Build 9 13322376 3D GGCTCTGTCA AAG/--- AAGAAGAAAG 3070 hom 105 het 37 0 36 3 AAG 3 2 338142 CASAVA_Build 9 13330137 1D GTTTGTATCC T/- TTTTTTCCTT 3070 het 2100 hom 21 6 13 2 T 7 6 338143 CASAVA_Build 9 13340710 9D TCTCAGATTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2384 het 1021 hom 31 6 10 18 T 23 14 338144 CASAVA_Build 9 13347848 1D ATATTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 14 10 T 12 11 338145 CASAVA_Build 9 13351930 1I CAGAAAGCTG -/C CATGTACTCA 3070 het 3070 ref 62 27 26 9 C 1 2 338146 CASAVA_Build 9 13372408 1I TGAATGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 T 11 12 338147 CASAVA_Build 9 13383359 1D ATGTACCCCC A/- AAACCTAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 4 3 338148 CASAVA_Build 9 13385545 1D TTCCTAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 T 11 10 338149 CASAVA_Build 9 13387553 6I TCACTGATAG ------/TGTTAA TGTTAAAATG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TGTTAA 1 2 338150 CASAVA_Build 9 13388563 1D TAGCATATTA C/- AAATGCAAAT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 C 1 0 338151 CASAVA_Build 9 13417683 2D TTTCTGATTG AT/-- AGAGATCAAA 3070 het 3070 hom 45 14 21 11 AT 1 0 338152 CASAVA_Build 9 13433273 1I TATTATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 9 8 T 10 11 338153 CASAVA_Build 9 13445195 3D TTTTTTTTTT TTG/--- TTTGTTTGTT 3070 hom 45 het 26 0 22 4 TTG 1 0 338154 CASAVA_Build 9 13452630 1I ACAAATTCCA -/T TTTTTCACTC 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 T 5 6 338155 CASAVA_Build 9 13459014 1D CAACTGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 14 11 A 11 10 338156 CASAVA_Build 9 13460259 1D TTTCCCCTCA T/- TGGCTATGAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 2 1 338157 CASAVA_Build 9 13501243 1D ATGCATCATC T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 121 het 45 0 41 5 T 8 7 338158 CASAVA_Build 9 13506086 1I CTATTGTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 T 10 11 338159 CASAVA_Build 9 13508737 1D AAAAAAGTCA T/- TTTTTTTTTT 2640 het 4 hom 22 1 11 10 T 13 12 338160 CASAVA_Build 9 13525460 1I CATTGTTGGT -/G GGGGGTCCAG 3070 het 3070 ref 64 28 26 10 G 5 6 338161 CASAVA_Build 9 13534878 4D AAAAAGTTAT CAAA/---- CAAAGGAATA 3070 het 3070 hom 46 18 24 7 CAAA 2 1 338162 CASAVA_Build 9 13542385 2D AATAAAAGAT AG/-- AGACATAGAC 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 AG 2 1 338163 CASAVA_Build 9 13551657 2D TTATTATGAC AT/-- ATTTTATACA 3070 het 3070 hom 49 18 27 5 AT 2 1 338164 CASAVA_Build 9 13553803 19I AAATTCCAGA -------------------/TCATTTGCTCCCTGTCATG TCATATAGCA 3070 het 3070 ref 39 26 8 5 TCATTTGCTCCCTGTCATG 0 1 338165 CASAVA_Build 9 13555084 1D ACATAGGTAT A/- AATTTTTTTT 2852 het 1894 hom 15 6 7 2 A 3 2 338166 CASAVA_Build 9 13562497 1D CATATTTTAT C/- TATCTTAACT 3070 het 3070 ref 33 15 11 8 C 1 0 338167 CASAVA_Build 9 13569620 1D TGCAGATCTA T/- TTTTTAGAAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 6 5 338168 CASAVA_Build 9 13577438 1I CTCTCTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 13 12 T 13 14 338169 CASAVA_Build 9 13578169 1D GAGAATTTTT C/- CTTATCGAAG 3070 het 3070 ref 41 22 14 7 C 2 1 338170 CASAVA_Build 9 13579787 1D TCACTGTCTA C/- CCAAAGATGT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 C 3 2 338171 CASAVA_Build 9 13581573 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAGAACTAAA 3070 het 632 hom 32 8 14 10 AAAG 1 0 338172 CASAVA_Build 9 13582169 1I TGGGCCAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 9 10 338173 CASAVA_Build 9 13582354 1I GGAAAGCAGG -/C TGTTGGCCCT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 C 0 1 338174 CASAVA_Build 9 13582737 1D GACAGTCCCC A/- AACAAAGAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 A 3 2 338175 CASAVA_Build 9 13584325 1I CCATATCTAC -/A AAAAAATATA 3070 het 2937 hom 26 8 14 4 A 6 7 338176 CASAVA_Build 9 13584681 1I ACCTTAAATT -/C TATGCAATTT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 C 0 1 338177 CASAVA_Build 9 13587448 1I TTAAGGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 A 14 15 338178 CASAVA_Build 9 13588106 7I27M4D TTAAAATATT -------TAAATAAAAATATAGATTTAAAAAATCTATT/TAAAATCTAAATAAAAATATAGATTTAAAAAATC---- TAGTGTGTGA 3070 hom 45 het 16 0 16 5 N/A 0 0 338179 CASAVA_Build 9 13589254 3I TTCATGTTGA ---/AAT AATAATATTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAT 2 3 338180 CASAVA_Build 9 13591215 2D TCCTCTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 39 0 31 9 T 13 11 338181 CASAVA_Build 9 13608468 1I CCTAGTAGAT -/A ATAGTATGTC 3070 het 3070 hom 58 27 26 5 A 1 2 338182 CASAVA_Build 9 13609716 2D AGGCTTCTGC CT/-- TGTTAAGCAA 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 CT 1 0 338183 CASAVA_Build 9 13612196 1D CAAATAATTT A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 50 16 27 8 A 7 6 338184 CASAVA_Build 9 13615958 1I GTTTAATACA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 6 7 338185 CASAVA_Build 9 13623961 2D GGAGCTAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 20 10 A 14 12 338186 CASAVA_Build 9 13625767 2I ATATTGCTCT --/AG AGGTCCTAGT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 AG 1 2 338187 CASAVA_Build 9 13628993 9I TGTGAGTGAT ---------/TAGACTGAG TTTTAATGGT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 TAGACTGAG 0 1 338188 CASAVA_Build 9 13631494 1D GAAATTAGGC A/- AAAAAAAAAA 2281 het 2281 ref 38 20 6 12 A 16 15 338189 CASAVA_Build 9 13651553 1I CACAATACCT -/G GATTGCTGCC 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 G 1 2 338190 CASAVA_Build 9 13686479 2D TCCTCGTCTC TT/-- TTAGGGACAC 3070 het 3070 hom 36 16 15 6 T 4 2 338191 CASAVA_Build 9 13689420 2D TCTGATTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 21 1 11 9 T 12 10 338192 CASAVA_Build 9 13722040 1D CTATCTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 11 10 338193 CASAVA_Build 9 13725782 1D GTCACTTTCC T/- TTTTTTTTTT 875 het 875 ref 36 22 4 10 T 17 16 338194 CASAVA_Build 9 13725953 1I ATCTGGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 10 11 338195 CASAVA_Build 9 13732258 4D TAAAAAAAAT TAAA/---- TAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 TAAA 3 2 338196 CASAVA_Build 9 13735104 6I ATAAAAGCTC ------/TACAAG TAAATGCTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 2 TACAAG 0 1 338197 CASAVA_Build 9 13741985 1I TTTATAAATA -/T TGAAATATGA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 1 2 338198 CASAVA_Build 9 13744661 6I ATTAAACTTA ------/AAAAAG AAAGAGTCTA 3070 hom 89 het 37 0 30 7 AAAAAG 0 1 338199 CASAVA_Build 9 13748513 4I AGCAACTTGT ----/CTAA CTAACTTCAC 3070 hom 187 het 68 0 63 5 CTAA 1 2 338200 CASAVA_Build 9 13754565 1D ACATACACTA C/- CCACGCTGGC 3070 hom 144 het 51 0 47 5 C 3 2 338201 CASAVA_Build 9 13754756 1I GAGAGGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 36 1 19 16 T 10 11 338202 CASAVA_Build 9 13755100 5D GTATGGTCTA TTTTC/----- TTCATCAGGC 3070 het 3070 ref 48 30 17 3 TTTTC 1 0 338203 CASAVA_Build 9 13756285 12D AATACTTTTA GGAGCAACACCT/------------ GTAGGAAGGT 3070 het 3070 ref 50 24 23 8 GGAGCAACACCT 1 0 338204 CASAVA_Build 9 13756462 11D TTTAGATGGA GGCTGCATCCT/----------- GAGAAGAAGG 3070 het 3070 ref 47 28 16 6 GGCTGCATCCT 1 0 338205 CASAVA_Build 9 13762399 35D TTCTTTTATT ATTAAGGTTATAAGTAAAAGGCATTATGCTAATAA/----------------------------------- ATTAAGGAGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ATTAAGGTTATAAGTAAAAGGCATTATGCTAATAA 1 0 338206 CASAVA_Build 9 13763734 2D GGGATTATAG GT/-- GTGAGCCACC 3070 het 1176 hom 20 5 13 3 GT 2 1 338207 CASAVA_Build 9 13766406 14D GTGTATGGAT AACTCCAAGCCATA/-------------- CAAAGTATAA 3070 hom 114 het 37 0 39 3 AACTCCAAGCCATA 1 0 338208 CASAVA_Build 9 13772067 19I TTCTATTGGA -------------------/AGAAGATAGCATGCCATCT AAGACTTTCA 3070 het 3070 ref 35 18 13 6 AGAAGATAGCATGCCATCT 0 1 338209 CASAVA_Build 9 13772303 1D GCTGCTCAGA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 35 1 30 4 G 2 1 338210 CASAVA_Build 9 13775971 4I GTTCTGAGAG ----/TGAT TGATTACTGT 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 TGAT 1 2 338211 CASAVA_Build 9 13776774 1I CCCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2656 het 2656 ref 34 14 11 9 A 11 12 338212 CASAVA_Build 9 13779262 12D GGTTATTACT AAAATAGAGTGA/------------ AAAATAGAGG 3070 het 3070 ref 39 21 17 4 AAAATAGAGTGA 1 0 338213 CASAVA_Build 9 13781291 1I TACCACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 A 11 12 338214 CASAVA_Build 9 13788337 1I71M1D ATACAGCCAT -AAAAAGGATGAGTTAATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTAGAAACCATCATTCTCAGCAAAGTAACA/AAAAAAGGATGAGTTAATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTAGAAACCATCATTCTCAGCAAAGTAAC- ACAAGAAAAC 3070 hom 72 het 21 0 25 2 N/A 0 0 338215 CASAVA_Build 9 13789355 4D ACATAAGTTT ATTA/---- ATTACTGTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 5 ATTA 2 1 338216 CASAVA_Build 9 13792019 5I TGTAGACAAT -----/AAGAA AAGAAAACAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AAGAA 1 2 338217 CASAVA_Build 9 13815103 1I TTGTTGTGAC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 A 7 8 338218 CASAVA_Build 9 13854602 1D AGCAAGGACT A/- AAGAGCTTAA 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 A 3 2 338219 CASAVA_Build 9 13855507 1D GGCTAACACA G/- TGAAACCCCG 2742 hom 12 het 9 0 6 3 G 1 0 338220 CASAVA_Build 9 13856937 2D GGTGACACTG AA/-- AAGACCACAT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 A 4 2 338221 CASAVA_Build 9 13862144 1I AAATTTTTGA -/T TTTTCAATTG 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 T 4 5 338222 CASAVA_Build 9 13863569 10I TTTTTTTAAT ----------/GAAAAAATGC TAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 GAAAAAATGC 0 1 338223 CASAVA_Build 9 13864806 4D GCCCAGTGTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 17 20 4 TTTC 4 3 338224 CASAVA_Build 9 13866151 1D TGATCTCCAA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 8 7 338225 CASAVA_Build 9 13866861 2D TGGGACAGGA CT/-- CTCTTTTGGC 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 CT 3 2 338226 CASAVA_Build 9 13868613 1D AAACCGTGAT G/- GGGGGGGAAT 1918 het 1918 ref 22 10 5 7 G 8 7 338227 CASAVA_Build 9 13874716 1D AAATAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 272 hom 31 3 16 13 A 15 14 338228 CASAVA_Build 9 13879675 1D CTTATAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 20 7 13 0 A 11 10 338229 CASAVA_Build 9 13880064 5D TAAAAACCTA AATAT/----- AAGATATAAA 3070 het 3070 ref 25 16 9 0 AATAT 1 0 338230 CASAVA_Build 9 13899741 1I TCATTAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 10 11 338231 CASAVA_Build 9 13906359 2I CTTGCTTTGG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 9 11 338232 CASAVA_Build 9 13906766 1I GCTCAACAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 24 11 7 T 9 10 338233 CASAVA_Build 9 13908613 1D ATATGTAGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 9 8 338234 CASAVA_Build 9 13913734 1D CACACACATT A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 51 24 18 10 A 6 5 338235 CASAVA_Build 9 13914753 2D CCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 1076 hom 20 4 11 5 T 11 9 338236 CASAVA_Build 9 13925647 1D TTGAAAGGGT G/- GGGGGAAGAG 2166 het 655 hom 24 3 5 16 G 6 5 338237 CASAVA_Build 9 13927181 3I GTGTTAAATG ---/TCC CCCTTTTATT 3070 het 3070 hom 63 25 29 9 TCC 0 1 338238 CASAVA_Build 9 13928906 1I GTGAAGAGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 T 9 10 338239 CASAVA_Build 9 13947037 1I ACTTCTCTTG -/A AAAAAAAAAA 2221 het 2221 ref 30 11 8 11 A 13 14 338240 CASAVA_Build 9 13948439 1I ATATATAAGA -/G GAGGTCTGTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 2 338241 CASAVA_Build 9 13958548 1D AGTATCTCAC A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 1 0 338242 CASAVA_Build 9 13961144 1I TCCCCACCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 65 het 39 1 32 6 A 9 10 338243 CASAVA_Build 9 13963955 1D AAGTAATCCA C/- CCCACCTCAG 3070 het 3070 hom 24 12 10 3 C 4 3 338244 CASAVA_Build 9 13964291 1D TTTGTTTTTA T/- TCTATGCCTA 3070 het 3070 ref 32 17 11 6 T 2 1 338245 CASAVA_Build 9 13972327 1D TATGGAGCCA T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 7 6 338246 CASAVA_Build 9 13974649 2D CAGGTATTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 T 12 10 338247 CASAVA_Build 9 13999273 1D AAACTGTTGT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 8 7 338248 CASAVA_Build 9 14001479 1D ATTCAGTCTT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 8 7 338249 CASAVA_Build 9 14007397 1D GCAAGGTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 13 12 338250 CASAVA_Build 9 14008653 1D TCTCAAGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 44 1 29 14 T 11 10 338251 CASAVA_Build 9 14013330 1I ATCATGCCTG -/T TTTTTAAGAT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 5 6 338252 CASAVA_Build 9 14020153 5I TTTTAATTAC -----/CAGAA CAGAACAGAG 3070 hom 22 het 9 0 8 1 CAGAA 1 2 338253 CASAVA_Build 9 14022818 1I CCACTTAGGA -/G CACAGAAGAT 3070 het 3070 ref 49 28 15 6 G 0 1 338254 CASAVA_Build 9 14030147 2D TCACCATAAC AG/-- ATATAATAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 1 0 338255 CASAVA_Build 9 14043777 1I AAAGAGTAAG -/A AAAAAAGAGT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 A 6 7 338256 CASAVA_Build 9 14044836 1I AAACTGGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 10 11 338257 CASAVA_Build 9 14051917 1D CTTACAGAGG A/- AAAAAATCTC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 7 6 338258 CASAVA_Build 9 14062241 11I7M1D ATGTGTTAAC -----------CAGTGAGT/TCCCCTTCTGTCAGTGAG- GAGGAACCAG 3070 het 3070 ref 39 19 17 8 N/A 0 0 338259 CASAVA_Build 9 14071803 3D GTAGGCAGAA CAG/--- CAAGGAGACG 3070 het 3070 hom 32 12 17 6 CAG 1 0 338260 CASAVA_Build 9 14073096 1D TTTTATTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 493 hom 26 2 17 7 A 15 14 338261 CASAVA_Build 9 14076382 1I GCATACATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 10 11 338262 CASAVA_Build 9 14109523 1I TTTGCTAATT -/A TAAATTGATA 3070 het 3070 ref 49 28 15 6 A 0 1 338263 CASAVA_Build 9 14135129 1D TTCCGTCTGA G/- GGGGGGGTCT 3070 het 3070 hom 28 9 11 10 G 8 7 338264 CASAVA_Build 9 14157069 2D GGCATATTGT TG/-- TGTGTGTGTG 1734 hom 38 het 26 0 15 12 TG 6 5 338265 CASAVA_Build 9 14162774 1D AATTCAACAC T/- TTTTTTTTTT 1293 het 1293 ref 35 20 3 12 T 13 12 338266 CASAVA_Build 9 14174098 1I ATATCTAAGC -/T TTACCTAAGG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 2 3 338267 CASAVA_Build 9 14174504 10I TAAATCAAAT ----------/TTAGTTTGGA TTGTCTCCAT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTAGTTTGGA 0 1 338268 CASAVA_Build 9 14175092 4I TTAAAAAAAG ----/AATA TATACTCTAT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AATA 0 1 338269 CASAVA_Build 9 14186688 1D ATTCTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 806 hom 25 3 12 10 A 17 16 338270 CASAVA_Build 9 14187368 5D TCCCTAACAC ACTGT/----- ACTGTGATCT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ACTGT 2 1 338271 CASAVA_Build 9 14191499 1D CCTAATTCAT C/- TTTAAAAGCT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 C 1 0 338272 CASAVA_Build 9 14191896 3D ATCCATTCGT TTA/--- TTTTTTTGAA 3070 hom 93 het 37 0 32 6 TTA 1 0 338273 CASAVA_Build 9 14197409 2D GTGGAGGCCA CT/-- GACTGTGGGG 3070 het 3070 ref 45 18 15 13 CT 1 0 338274 CASAVA_Build 9 14200300 1D ATTTAAAACA T/- TTTTTGTGGT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 6 5 338275 CASAVA_Build 9 14202637 2D TTCCTCTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1580 hom 23 7 7 9 A 12 10 338276 CASAVA_Build 9 14216549 1D CCTATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2105 hom 29 9 11 9 A 15 14 338277 CASAVA_Build 9 14216983 1I TAATAAATAC -/A AAAAAAAATT 2144 het 2144 ref 17 8 6 3 A 8 9 338278 CASAVA_Build 9 14218197 1D TTTATGATTC T/- TTTTTTTTTT 2353 het 1269 hom 23 4 6 13 T 17 16 338279 CASAVA_Build 9 14224373 2D ATCATTACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 502 hom 32 4 10 18 T 13 11 338280 CASAVA_Build 9 14224666 1I TGGTCTACTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 T 8 9 338281 CASAVA_Build 9 14226850 1D GCTTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3050 hom 33 9 16 8 A 13 12 338282 CASAVA_Build 9 14227482 2I AAAGCTCTTC --/AA ATTATGTCTA 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 A 1 3 338283 CASAVA_Build 9 14233611 1I GGTATTTTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 22 9 8 5 A 9 10 338284 CASAVA_Build 9 14240267 1I ATATAATATC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 T 7 8 338285 CASAVA_Build 9 14250994 1D GAAAGGAGGA G/- GGAAAAAAGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 3 2 338286 CASAVA_Build 9 14253280 1D CATGAGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 12 11 338287 CASAVA_Build 9 14278356 4D AAAAGAGATT AATC/---- AATCAAAGCC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 AATC 2 1 338288 CASAVA_Build 9 14279229 2I CCAAATACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 272 hom 16 1 12 3 AT 5 6 338289 CASAVA_Build 9 14281802 1I ACTTTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 855 hom 27 2 19 6 A 13 14 338290 CASAVA_Build 9 14298672 4D ATGAATTATC AGTT/---- AGAACTGTGG 3070 hom 148 het 53 0 50 5 AGTT 1 0 338291 CASAVA_Build 9 14301549 3D TCACAAGTTA TTG/--- TTGTTAAGTG 3070 hom 130 het 49 0 44 5 TTG 2 1 338292 CASAVA_Build 9 14317103 1D TACTAAGGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 10 9 338293 CASAVA_Build 9 14331939 1D CCTCGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 696 hom 35 3 10 23 A 17 16 338294 CASAVA_Build 9 14334782 5D AAAAAAAATC CGTAA/----- CTACAAACAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 CGTAA 1 0 338295 CASAVA_Build 9 14338154 1D GCCGCGGCCC A/- TTCTACACAC 3070 het 2664 hom 24 10 8 6 A 1 0 338296 CASAVA_Build 9 14341399 1D GGGAGCTGGG C/- TAGGGCTGGC 3070 het 3070 hom 33 14 16 5 C 1 0 338297 CASAVA_Build 9 14342262 1D GATTTTTTCA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 9 8 338298 CASAVA_Build 9 14373083 1I GGAATATGAC -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 53 24 22 7 A 6 7 338299 CASAVA_Build 9 14376616 4D TAGGGGACAA AATC/---- AATCAGTGTT 3070 het 3070 hom 29 12 15 3 AATC 2 1 338300 CASAVA_Build 9 14379749 1D AGCATTTCCA C/- CCCCAAAGAC 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 C 5 4 338301 CASAVA_Build 9 14381336 13D AGATGCCCCC CCCCCACCCCCCG/------------- CCCGCTTCCA 3070 het 1905 hom 28 9 13 7 CCCCCACCCCCCG 1 0 338302 CASAVA_Build 9 14381466 4D CCCAATAGAT AGGA/---- AGGAAACACC 3070 het 3070 hom 40 14 24 4 AGGA 2 1 338303 CASAVA_Build 9 14387328 2D CAAAGATAAC TG/-- TGTATTTGTG 3070 het 3070 hom 54 24 26 6 TG 2 1 338304 CASAVA_Build 9 14388094 1I TGCTTATTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 53 17 28 8 T 8 9 338305 CASAVA_Build 9 14396582 1I GCAACCAGAA -/G GATAGGCTGG 3070 hom 148 het 53 0 50 3 G 1 2 338306 CASAVA_Build 9 14416186 1D TGGCTTAAAG A/- AAAAAAATCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 7 338307 CASAVA_Build 9 14420363 1D GGAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 6 A 11 10 338308 CASAVA_Build 9 14420573 4D CCTGAAATGC TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 38 12 16 11 TATT 6 5 338309 CASAVA_Build 9 14446208 1D CTACTTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 38 6 12 20 T 13 12 338310 CASAVA_Build 9 14450414 1I ATACCTAATG -/C TAAATGACGA 2430 het 2430 ref 16 7 6 3 C 0 1 338311 CASAVA_Build 9 14451017 1D TTCTTTTCCC T/- TCCTCCGTGC 3070 het 3070 ref 43 19 12 12 T 2 1 338312 CASAVA_Build 9 14453146 4D AATAATTATT TTGA/---- TTGTTTTATT 1460 hom 15 het 7 0 6 1 TTGA 1 0 338313 CASAVA_Build 9 14502403 1D ATTACTAAGT A/- ATGATTTTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 1 338314 CASAVA_Build 9 14502692 5I TTATTTATAA -----/AGTAG AGTAAATTTT 3070 hom 103 het 40 0 35 5 AGTAG 0 1 338315 CASAVA_Build 9 14507600 2D TGGATGTGTG GT/-- GTGTGGTAGC 3070 hom 159 het 55 0 52 3 GT 3 2 338316 CASAVA_Build 9 14511628 1I TGAAAAATGC -/A AAAAACAGCT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 5 6 338317 CASAVA_Build 9 14521686 1I ATTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1778 het 1778 ref 32 13 9 10 A 15 16 338318 CASAVA_Build 9 14522872 4D TGTGCCCAGA ATCT/---- ATCTGACTCT 3070 hom 117 het 41 0 40 2 ATCT 2 1 338319 CASAVA_Build 9 14523291 11D GTAGTCATTC TGCCTTCCGTA/----------- TGCCCTGCTA 3070 het 3070 ref 43 21 19 6 TGCCTTCCGTA 1 0 338320 CASAVA_Build 9 14524486 1D GATGAGTTGA T/- TACACAAGCA 3070 het 3070 ref 25 9 10 7 T 2 1 338321 CASAVA_Build 9 14527034 5I GGACCTGGCA -----/GAAAC GAAACAGAGC 3070 hom 131 het 49 0 42 7 GAAAC 1 2 338322 CASAVA_Build 9 14538664 1I ACAACATTTC -/T TTTTTTTTTT 2368 het 2368 ref 32 21 6 5 T 13 14 338323 CASAVA_Build 9 14555325 5I AACCACTGGT -----/GTCTG GTCTGGTAAG 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 GTCTG 1 2 338324 CASAVA_Build 9 14573943 5D GCTAATCCTC TTCCA/----- TTCATCTGAA 3070 het 3070 hom 57 26 28 4 TTCCA 1 0 338325 CASAVA_Build 9 14579033 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2375 het 2375 ref 27 14 8 6 A 11 10 338326 CASAVA_Build 9 14588924 1D CCTAGCTAAA T/- TTTTTTTTGT 2375 het 2375 ref 19 10 6 3 T 9 8 338327 CASAVA_Build 9 14591397 3D GAAAAAAAGG TCA/--- TCATCACTGG 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 TCA 3 2 338328 CASAVA_Build 9 14599175 1D ATGAAACAGC A/- AAAAACCATT 3070 het 3070 ref 42 20 20 4 A 6 5 338329 CASAVA_Build 9 14604307 1D ATGACTTTTT A/- AAATACCATT 3070 hom 138 het 49 0 47 3 A 4 3 338330 CASAVA_Build 9 14609882 1I TATACTATGC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 9 10 338331 CASAVA_Build 9 14610566 1D GGTGGACTTA T/- TTAAGCAGTA 3070 het 3070 ref 38 18 16 6 T 3 2 338332 CASAVA_Build 9 14613644 1D AACTCAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 15 10 A 15 14 338333 CASAVA_Build 9 14618582 1I TGCAAGAGTA -/G GGGAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 G 3 4 338334 CASAVA_Build 9 14634836 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 3061 het 893 hom 28 5 17 6 AT 7 8 338335 CASAVA_Build 9 14644396 1I ATATCCTATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 A 9 10 338336 CASAVA_Build 9 14645868 3I TAATTTTTTA ---/ATG ATGAAATATC 2996 het 2996 ref 34 24 8 2 ATG 1 2 338337 CASAVA_Build 9 14646002 1I CTAATAACAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 A 8 9 338338 CASAVA_Build 9 14647514 1D AAGTTACTGT A/- AAAGAGCCAG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 4 3 338339 CASAVA_Build 9 14650433 2I TTGAGGCAAC --/GT GTGAGAATTG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 GT 1 2 338340 CASAVA_Build 9 14651276 5D CTGTGCTATC AAAAT/----- AAGTTATCAA 3070 het 3070 hom 31 9 19 4 AAAAT 1 0 338341 CASAVA_Build 9 14652010 4D GCTCAAATCT CTCC/---- CTGTTAGAAA 3070 het 3070 hom 50 22 24 5 CTCC 1 0 338342 CASAVA_Build 9 14653492 1D AGATTACAGA T/- TTTTTTTTTT 2953 het 2424 hom 24 7 9 8 T 15 14 338343 CASAVA_Build 9 14685772 2D AGATCGTACC AT/-- ATTTTTTCCC 3070 het 2421 hom 30 7 21 4 AT 2 1 338344 CASAVA_Build 9 14698144 1I TTGAATTGGT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 8 9 338345 CASAVA_Build 9 14704284 1D AAAAAATAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 10 9 338346 CASAVA_Build 9 14726006 1I GAACTGAAAT -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 37 20 8 9 A 7 8 338347 CASAVA_Build 9 14728370 1I ATTTTACCTT -/C CCCCAACTGT 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 C 4 5 338348 CASAVA_Build 9 14736009 3I CTCAGAAAAT ---/CTC CTTCTGATTT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 CTC 0 1 338349 CASAVA_Build 9 14746319 1I ACATGCCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2550 hom 35 8 16 11 A 9 10 338350 CASAVA_Build 9 14750906 1I AGACACAAGC -/A AACCTTCACT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 A 2 3 338351 CASAVA_Build 9 14758273 1D TTAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 8 A 11 10 338352 CASAVA_Build 9 14767651 4D TTGGAAGTTC TTTT/---- TTAACTAGAG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 6 2 338353 CASAVA_Build 9 14768356 1I CACCTGTAAA -/C CCCAGTACCT 3070 hom 78 het 27 0 23 4 C 3 4 338354 CASAVA_Build 9 14775694 13I TGAAAAGATA -------------/TATACTATATGAT TCCACTTACA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TATACTATATGAT 0 1 338355 CASAVA_Build 9 14813625 1I AAGCTCATAG -/T TCCTTTATGT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 1 2 338356 CASAVA_Build 9 14817174 3D TGCTCTAGAC AGA/--- AGAACCTCAA 3070 het 3070 ref 41 24 14 5 AGA 2 1 338357 CASAVA_Build 9 14824903 1I TTTTTAACTG -/T TAACTATCCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 2 338358 CASAVA_Build 9 14895903 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2675 hom 29 8 17 4 A 11 10 338359 CASAVA_Build 9 14897213 1I TATGTTGTCA -/G AAAAGCACAT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 G 0 1 338360 CASAVA_Build 9 14899362 1D AAATCAGTCC A/- AAAACTTCAG 3070 het 3070 hom 48 19 26 4 A 5 4 338361 CASAVA_Build 9 14905551 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 31 0 27 4 A 13 12 338362 CASAVA_Build 9 14922567 1I AAGATAGTTA -/T TTTTTATGAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 5 6 338363 CASAVA_Build 9 14925024 1D30M1D CATACATACA TACACAAACAAACTTCCAACTTTTACATTTGA/-ACACAAACAAACTTCCAACTTTTACATTTG- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 12 N/A 0 0 338364 CASAVA_Build 9 14925805 1I TTTATTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 12 13 338365 CASAVA_Build 9 14932971 1D GTTTGCCATT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 9 8 338366 CASAVA_Build 9 14934236 1I AAAAAATAAG -/A AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 A 6 7 338367 CASAVA_Build 9 14941278 12I GACGGGGAGA ------------/AATGGAACCAAG CTGGAAAAGA 2524 hom 17 het 7 0 6 1 AATGGAACCAAG 0 1 338368 CASAVA_Build 9 14943132 1I GACACATACA -/C CCCCCCCAAG 3070 hom 25 het 13 0 9 4 C 7 8 338369 CASAVA_Build 9 14952272 1D CAAAGGTCCT G/- GGCCCCACGC 3070 hom 96 het 36 0 32 4 G 3 2 338370 CASAVA_Build 9 14952665 3D TGAATATCCA TAT/--- TAATAAGGAT 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 TAT 1 0 338371 CASAVA_Build 9 14957412 3D TTGCAGTGAT ATC/--- ATCATCCTCT 3070 hom 105 het 42 0 34 10 ATC 3 2 338372 CASAVA_Build 9 14963133 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 9 10 338373 CASAVA_Build 9 14976342 1I CCTGTGTTGT -/G GATTAGGATC 3070 hom 81 het 28 0 27 1 G 1 2 338374 CASAVA_Build 9 14984555 2D GTGCTAGGAC TG/-- TTCTGTGTAT 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 TG 1 0 338375 CASAVA_Build 9 14985297 1D GTTTTTGAGC T/- TATTTATGTT 3070 het 3070 hom 47 16 25 7 T 2 1 338376 CASAVA_Build 9 14988414 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 1221 het 988 hom 17 6 5 6 A 14 13 338377 CASAVA_Build 9 14990748 1I TCCTTATAAA -/C ATTTTTTTTC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 0 1 338378 CASAVA_Build 9 14995034 4I AAAGAAAACA ----/ACTG ACTATTTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 ACTG 0 1 338379 CASAVA_Build 9 14996724 2D TTTCAACATT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 36 het 22 0 13 9 A 11 9 338380 CASAVA_Build 9 14998468 1I CCTCTGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 53 het 24 0 16 8 A 9 10 338381 CASAVA_Build 9 15000371 1I TACTTTTGTT -/G GCCATGGTAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 1 2 338382 CASAVA_Build 9 15002679 2D GTAGAGAGAG AT/-- GTCTTAGATG 3070 het 3070 hom 34 13 18 5 AT 1 0 338383 CASAVA_Build 9 15004055 1D GCTGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2419 hom 25 8 14 3 T 11 10 338384 CASAVA_Build 9 15005485 1I AATTTCTCTA -/T TTTTTTCTAG 3070 het 2210 hom 33 6 19 8 T 6 7 338385 CASAVA_Build 9 15006414 1D TTATACTGTA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 7 6 338386 CASAVA_Build 9 15007532 1I ACATGTGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1491 hom 27 6 10 11 A 13 14 338387 CASAVA_Build 9 15007689 1I TTTGAAGTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 T 8 9 338388 CASAVA_Build 9 15010435 7D ATCACCTGAG GTTTGGA/------- GTTTGTGACC 2856 het 2856 ref 23 12 7 8 GTTTGGA 1 0 338389 CASAVA_Build 9 15011760 1I GTTTGTAGGA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 7 8 338390 CASAVA_Build 9 15012100 1D ACTACTGAAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 39 20 19 0 T 9 8 338391 CASAVA_Build 9 15030406 1I ATCACGCTCC -/G GGGACTGTTG 2031 hom 12 het 6 0 5 1 G 3 4 338392 CASAVA_Build 9 15034055 1D GACTCTGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 32 2 19 11 A 15 14 338393 CASAVA_Build 9 15051529 1D AGACAAAGGA G/- GTCTTTAGGA 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 G 2 1 338394 CASAVA_Build 9 15051930 1D AGACAAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 18 1 13 4 T 15 14 338395 CASAVA_Build 9 15054561 1D AGTTTAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 22 1 14 7 A 15 14 338396 CASAVA_Build 9 15062969 1D TAATGTGATG A/- AAAAAAATAC 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 8 7 338397 CASAVA_Build 9 15063854 2I TGGAGTGTTC --/TA TAAGTGACAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TA 1 2 338398 CASAVA_Build 9 15078536 1I TAAATAATAC -/T TGATGATAAT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 T 1 2 338399 CASAVA_Build 9 15079157 1D TTTAAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 11 10 338400 CASAVA_Build 9 15080623 1I CTTCTCAGAG -/A AAAAAAACTA 3070 hom 116 het 49 0 38 11 A 7 8 338401 CASAVA_Build 9 15085501 1D CAATTATGCC T/- TTTTCAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 T 5 4 338402 CASAVA_Build 9 15087588 1D AATGGCAAGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 138 het 48 0 46 2 A 9 8 338403 CASAVA_Build 9 15093110 1D ATATGAGAAT A/- AGGCTATTAA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 2 1 338404 CASAVA_Build 9 15096845 1I TCAAAAAAAA -/T AAATAGATAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 0 1 338405 CASAVA_Build 9 15097316 1I CAAAAAATAC -/A AACAGCATTT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 A 2 3 338406 CASAVA_Build 9 15099974 1D ATGTTATGTA T/- TTTTTTTACC 3070 hom 108 het 46 0 37 9 T 8 7 338407 CASAVA_Build 9 15106926 1I GTTAATTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 A 10 11 338408 CASAVA_Build 9 15115682 1I CCCCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 24 2 18 4 A 10 11 338409 CASAVA_Build 9 15138320 1D TTACCTATTA C/- TTTTATCCAT 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 C 1 0 338410 CASAVA_Build 9 15151322 1I CCAGAAGGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 T 8 9 338411 CASAVA_Build 9 15154741 1D TCAGCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 A 11 10 338412 CASAVA_Build 9 15158810 14D ACTCTGTCTC AATAAAATAATATT/-------------- AAATTAAAAT 2762 het 2378 hom 11 5 6 2 AATAAAATAATATT 1 0 338413 CASAVA_Build 9 15161260 1I ATAATCCATG -/C TATGTATTTT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 C 0 1 338414 CASAVA_Build 9 15195463 1I CTCATATTCC -/A AATGTTTAAT 3070 het 3070 ref 53 22 23 8 A 2 3 338415 CASAVA_Build 9 15213839 1D CATGACACTC A/- AAAAAAAAAA 1385 het 1385 ref 40 27 4 9 A 15 14 338416 CASAVA_Build 9 15220985 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1007 hom 20 3 14 3 A 13 12 338417 CASAVA_Build 9 15225926 3D ACAACTAGCT AAC/--- AACACTATGA 3070 het 3070 ref 52 24 22 7 AAC 2 1 338418 CASAVA_Build 9 15243729 1D TGTTCAAGTA T/- TTTCTCTTTG 3070 het 3070 hom 46 17 28 1 T 4 3 338419 CASAVA_Build 9 15250276 1D CCTCATTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 T 13 12 338420 CASAVA_Build 9 15250622 2D TAATGAGGGG AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 11 13 8 A 10 8 338421 CASAVA_Build 9 15250820 1I TTACCTGGCT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 A 7 8 338422 CASAVA_Build 9 15251471 1D AGATCCTATC A/- AAAAAAAACA 3070 het 365 hom 52 1 46 7 A 9 8 338423 CASAVA_Build 9 15255206 1D AATAGATGTT A/- AAAAAACTGC 3070 het 3070 ref 27 10 14 4 A 7 6 338424 CASAVA_Build 9 15260750 1D TTTTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 9 18 6 A 11 10 338425 CASAVA_Build 9 15263658 10D TGAAGACCAC AGGTGGGCAG/---------- GTGCCCACCC 3070 het 3070 ref 36 23 12 5 AGGTGGGCAG 1 0 338426 CASAVA_Build 9 15273554 3D AGAACTCAGT CAA/--- TAAGATTCGC 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 CAA 1 0 338427 CASAVA_Build 9 15284213 1D TAGCAGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 13 7 A 11 10 338428 CASAVA_Build 9 15301375 2D AAATATATAT TA/-- TATATATATA 1614 het 1614 ref 11 5 5 1 TA 7 6 338429 CASAVA_Build 9 15319235 1I CCCCTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 10 11 338430 CASAVA_Build 9 15321329 2D ATTGAGTTGT TG/-- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 TG 1 0 338431 CASAVA_Build 9 15326982 1I AAAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 2610 het 2591 hom 28 11 11 6 A 13 14 338432 CASAVA_Build 9 15346022 1D ATTCCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 636 hom 33 2 21 10 T 13 12 338433 CASAVA_Build 9 15346672 1I AATAAACGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 25 0 21 4 A 10 11 338434 CASAVA_Build 9 15347781 1I GTGATTAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 30 2 25 3 A 11 12 338435 CASAVA_Build 9 15359166 1I CCATAGATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 717 hom 34 4 23 7 A 13 14 338436 CASAVA_Build 9 15367342 1I TCTGGGCAGG -/A AGCACACACC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 1 2 338437 CASAVA_Build 9 15378942 2I CAGAGGACAG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 97 het 40 0 33 7 A 9 11 338438 CASAVA_Build 9 15381946 1I TCCTGCATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 861 hom 38 2 31 5 T 9 10 338439 CASAVA_Build 9 15382956 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 11 12 338440 CASAVA_Build 9 15388343 1I ACATCCGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 20 0 16 4 A 10 11 338441 CASAVA_Build 9 15390022 1I AGACAGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 880 hom 13 3 9 2 A 9 10 338442 CASAVA_Build 9 15391177 2I TCAGCCTCCC --/AA AAAGTGCTGG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 5 338443 CASAVA_Build 9 15391510 1I38M2D GGAACATACC -AAAAAAAACAGTCTCGTCGCACGCAGTAGGCAAAGGGCAA/AAAAAAAAACAGTCTCGTCGCACGCAGTAGGCAAAGGGC-- AAAAAAAAAA 3070 het 2861 hom 40 9 13 30 N/A 0 0 338444 CASAVA_Build 9 15399950 2D TGTATTCCAT TG/-- TGTGTGTGTG 2226 hom 15 het 12 0 5 7 TG 11 10 338445 CASAVA_Build 9 15408068 2I CCTCCCCCTG --/TC TCTCTACTGG 2546 het 2546 ref 25 9 7 9 TC 2 3 338446 CASAVA_Build 9 15417015 5D AATTTCACAT TATTA/----- TATTATAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 TATTA 2 1 338447 CASAVA_Build 9 15423270 1D TCTGGAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 13 12 338448 CASAVA_Build 9 15431186 1I CTGTAACGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 10 11 338449 CASAVA_Build 9 15431382 17D TTCCCTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTAGT 2024 het 888 hom 13 4 5 4 T 24 7 338450 CASAVA_Build 9 15435567 2D66M3I TGAAATATTA ATATATATATAAGTTGCACTTATGAATAAATAGGCTTTTACAAAGCATCTGGGATGTAGTTAATACTA---/--ATATATATAAGTTGCACTTATGAATAAATAGGCTTTTACAAAGCATCTGGGATGTAGTTAGTACTAATT ATCTTATTTG 3070 het 3070 ref 41 30 24 13 N/A 0 0 338451 CASAVA_Build 9 15437362 3I ATTCCATCAA ---/ACT ACTACACTAT 3070 hom 99 het 41 0 33 8 ACT 1 2 338452 CASAVA_Build 9 15437516 1I TTCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 9 10 338453 CASAVA_Build 9 15441208 1I AGCAGTTTTT -/G TAACACATAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 G 0 1 338454 CASAVA_Build 9 15441969 1D TGCCCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 35 1 31 5 A 12 11 338455 CASAVA_Build 9 15442321 1I GGTTTCAGCA -/T TTTTTTTTTT 928 het 156 hom 12 1 5 6 T 15 16 338456 CASAVA_Build 9 15456385 3D TCAAAGAAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 42 19 19 6 AAC 4 3 338457 CASAVA_Build 9 15457038 1D GGGTTTTGAT G/- GCTTTGTCAA 3070 hom 101 het 39 0 31 8 G 2 1 338458 CASAVA_Build 9 15458415 3D TGGTTTCTGC CTT/--- AGAAGTCGAA 3070 het 3070 ref 43 21 19 4 CTT 1 0 338459 CASAVA_Build 9 15461650 5I GATAAGTTAT -----/TTAAA TTAAATTACT 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 TTAAA 1 2 338460 CASAVA_Build 9 15466159 4D TTACAGCTCA CACT/---- CAGCCTACGC 3070 het 3070 hom 54 22 28 4 CACT 1 0 338461 CASAVA_Build 9 15471682 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 23 8 13 2 A 8 9 338462 CASAVA_Build 9 15474292 1D CATGTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 18 0 15 3 A 11 10 338463 CASAVA_Build 9 15487213 5D GACAATAAAA AGTAG/----- AGTAGTAATG 3070 het 3070 ref 31 18 10 4 AGTAG 2 1 338464 CASAVA_Build 9 15491395 1I AGAAAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2113 hom 31 7 19 5 A 11 12 338465 CASAVA_Build 9 15494353 1I ATATATTTAT -/A ATATGAAAAT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 1 2 338466 CASAVA_Build 9 15523668 1D TTGATTCCAA T/- TTTTTTTTTT 1386 het 1348 hom 18 7 3 8 T 16 15 338467 CASAVA_Build 9 15528876 1D CTCTTGGACT C/- AAGGTATCTG 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 C 1 0 338468 CASAVA_Build 9 15530494 1D AATTAAAAGG A/- CAATAGAATA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 1 0 338469 CASAVA_Build 9 15532855 1I CATTTTCAGT -/A AGAGACAGGG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 1 2 338470 CASAVA_Build 9 15550849 1I TCTGGTTTCT -/C CCCATCTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 C 3 4 338471 CASAVA_Build 9 15552903 2I AGAGCTTGAT --/AG AGACTCCTTG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AG 1 2 338472 CASAVA_Build 9 15563640 1I TTGTAATAAT -/C CATATAAAGT 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 C 1 2 338473 CASAVA_Build 9 15595683 2D AGACTCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 680 hom 22 4 14 5 A 13 11 338474 CASAVA_Build 9 15603489 1D TAATAAAAAC A/- AATGGTTTTG 2889 het 1164 hom 13 3 8 3 A 3 2 338475 CASAVA_Build 9 15610935 1D ATGGTTAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 T 11 10 338476 CASAVA_Build 9 15635344 1D CCTCTCCAAA G/- GAACTCAGCT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 G 2 1 338477 CASAVA_Build 9 15645178 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 2 A 12 11 338478 CASAVA_Build 9 15647002 1D TCTTGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 1570 het 1570 ref 43 23 4 16 A 11 10 338479 CASAVA_Build 9 15651288 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 180 hom 16 3 9 4 C 0 1 338480 CASAVA_Build 9 15661692 1D GAGCTCATCC T/- TTTTTATGGC 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 T 6 5 338481 CASAVA_Build 9 15677426 1D CCCGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 27 5 A 12 11 338482 CASAVA_Build 9 15678117 5D ACTCCATCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2437 hom 31 het 14 0 10 7 A 21 16 338483 CASAVA_Build 9 15682366 1D CTGTCTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 595 hom 26 3 16 7 A 12 11 338484 CASAVA_Build 9 15683212 2D AGGTACACAC AG/-- ACACACATGC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AG 1 0 338485 CASAVA_Build 9 15683472 2D TGGTGAGGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 52 21 21 11 A 12 10 338486 CASAVA_Build 9 15688063 3D3M2I TTAACTGTAG AGTTCA--/---TCACC ATACTGTGCT 3070 het 3070 ref 39 25 12 4 N/A 0 0 338487 CASAVA_Build 9 15689089 1D GGTGAGCGTT A/- ACAGTTCTTG 3070 het 2804 hom 23 9 10 4 A 2 1 338488 CASAVA_Build 9 15694194 4D TTTGTGTGTA TTTG/---- TTTGTAGCAC 3070 het 3070 hom 52 23 27 4 TTTG 2 1 338489 CASAVA_Build 9 15703314 2D ACCAAGCCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 109 hom 28 3 10 15 T 13 11 338490 CASAVA_Build 9 15704592 1I TTAATTCCTC -/T CCCCCGGTAC 3070 hom 144 het 52 0 46 6 T 0 1 338491 CASAVA_Build 9 15708001 13D AGCTTGGCCA CAGGGTGGTAGAG/------------- CACCAAGTGG 3070 het 3070 ref 33 17 12 9 CAGGGTGGTAGAG 1 0 338492 CASAVA_Build 9 15709986 3D AGAGTACTGT CTC/--- CTCTATTATC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 CTC 2 1 338493 CASAVA_Build 9 15710132 4I TTGGTGCTTA ----/AATT AATTATACCT 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 AATT 1 2 338494 CASAVA_Build 9 15723668 9I TATACTGATT ---------/TAATCACTC TAACCTTTTA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 TAATCACTC 0 1 338495 CASAVA_Build 9 15723744 1D GAACTCTTTG A/- AAATCTACCA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 4 3 338496 CASAVA_Build 9 15730382 1D TCCATTGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 9 T 12 11 338497 CASAVA_Build 9 15732076 1I TGTAATTTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 8 9 338498 CASAVA_Build 9 15751881 2D TAGAAAAGTC AA/-- AAGAGTTTTA 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 A 4 2 338499 CASAVA_Build 9 15752154 1D AGCCTGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 8 11 T 17 16 338500 CASAVA_Build 9 15756662 1I TTATTTTATA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 1099 hom 15 3 10 2 T 6 7 338501 CASAVA_Build 9 15761571 5D ATTAACACTT TATCA/----- TAGTGCAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 14 2 TATCA 1 0 338502 CASAVA_Build 9 15763702 1I CACTAGAGGA -/T TTTTTTTTTG 2127 het 2127 ref 22 11 5 6 T 9 10 338503 CASAVA_Build 9 15765104 1I CTATTGAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 8 9 338504 CASAVA_Build 9 15770860 1D AGATATGTGA T/- TTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 7 6 338505 CASAVA_Build 9 15778501 1D ATGGATACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 22 hom 33 2 25 6 A 10 9 338506 CASAVA_Build 9 15784032 2D GGAGGTGGAG GT/-- GTGGTAGGCA 3070 hom 103 het 40 0 31 9 GT 2 1 338507 CASAVA_Build 9 15793749 1I CTATTTGGGC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 8 9 338508 CASAVA_Build 9 15794461 1I ATCGAAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 10 11 338509 CASAVA_Build 9 15798860 2I AGCAGAAATT --/TA TTTCTCACAT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 TA 0 1 338510 CASAVA_Build 9 15804631 1D AGATATCTTA C/- ATTGTTATAA 2561 het 2561 ref 17 11 6 0 C 1 0 338511 CASAVA_Build 9 15816325 1I TTGTTGATCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 9 10 338512 CASAVA_Build 9 15829978 1D CTTCAAATTC T/- CTTAAATAAT 3070 het 3070 ref 31 19 9 4 T 1 0 338513 CASAVA_Build 9 15832072 1D AAATGTTATC T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 6 5 338514 CASAVA_Build 9 15841437 1I TTTGGGGGGG -/C AATTTCAAGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 338515 CASAVA_Build 9 15842780 1D CCCAACTTCA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 8 7 338516 CASAVA_Build 9 15848551 2D TCATGAACAC AG/-- AATGTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 AG 1 0 338517 CASAVA_Build 9 15850141 1D CCTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 10 9 338518 CASAVA_Build 9 15851053 6D TTTTTGGCTT CTAATC/------ CTAATCTATT 3070 hom 118 het 47 0 40 8 CTAATC 2 1 338519 CASAVA_Build 9 15851688 4D TATATGGTGT ATTC/---- ATTCATTCAT 3070 hom 96 het 38 0 33 8 ATTC 4 3 338520 CASAVA_Build 9 15853891 3D GCTTGCTCTA GTT/--- GTTGTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 GTT 3 2 338521 CASAVA_Build 9 15855383 6I TTGTCATATT ------/TGTGTG TGTGTGTGTG 3070 het 20 hom 29 1 22 6 TG 6 9 338522 CASAVA_Build 9 15857727 1D CAGTTTTTAG C/- TTAAACACAT 3070 hom 138 het 54 0 47 7 C 1 0 338523 CASAVA_Build 9 15860131 1D AATAGACAGT G/- GGCTGGATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 3 2 338524 CASAVA_Build 9 15860791 1I CAGAAATAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 29 1 24 4 T 10 11 338525 CASAVA_Build 9 15861477 1I TTCCTTTTAG -/C GAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 0 1 338526 CASAVA_Build 9 15874281 3I ATCCTATAAC ---/ATA ATGTATGAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 ATA 0 1 338527 CASAVA_Build 9 15887283 1I GTTGTTTTCC -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 T 6 7 338528 CASAVA_Build 9 15889358 1D TACTGAGGAA T/- GTGATTGCCT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 T 1 0 338529 CASAVA_Build 9 15890507 15D AGCCTGCTGA GACACCCGAGCAGAG/--------------- GACCCCACTA 3070 het 919 hom 40 4 16 26 GACACCCGAGCAGAG 1 0 338530 CASAVA_Build 9 15892590 1D CCAGTCTACA G/- CTCCCAGCAT 3070 het 1590 hom 15 4 10 1 G 1 0 338531 CASAVA_Build 9 15899400 4D ACATGTGCGT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 162 hom 37 3 28 8 AC 11 9 338532 CASAVA_Build 9 15904694 1D ATGGGGTATG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 63 het 23 0 21 4 A 9 8 338533 CASAVA_Build 9 15905099 1I AGACATCTTG -/C CCAGGAATCC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 C 2 3 338534 CASAVA_Build 9 15905363 1I ATTCCTAGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 308 hom 37 2 31 4 T 9 10 338535 CASAVA_Build 9 15906411 5I AATATATTTA -----/CTTTG CGTAAGATAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 CTTTG 0 1 338536 CASAVA_Build 9 15907467 5D AAAATTGGAT TATTA/----- TATTCTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 TATTA 1 0 338537 CASAVA_Build 9 15910961 1D ACTTAACACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 11 11 A 13 12 338538 CASAVA_Build 9 15944668 3I TGCTTGTTGA ---/TTT TTTTTTTTTT 3069 het 3069 ref 31 18 10 3 T 10 13 338539 CASAVA_Build 9 15955696 13I GAAGGGAAGA -------------/AGAGGAGCTACTC TATGCTACAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AGAGGAGCTACTC 0 1 338540 CASAVA_Build 9 15956894 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 TA 9 8 338541 CASAVA_Build 9 15963351 1I TGATTCAAAT -/A TACCCAACTG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 0 1 338542 CASAVA_Build 9 15969926 1D TTTGTGGGAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 8 7 338543 CASAVA_Build 9 15976945 1I CATTTGTCCA -/G GAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 20 7 12 1 G 1 2 338544 CASAVA_Build 9 15977076 1I TGGCATAGAG -/A AAGGCATTTC 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 2 3 338545 CASAVA_Build 9 15990727 1I AAGAAGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 16 12 T 11 12 338546 CASAVA_Build 9 16001411 2D TGTTTTTTAC TT/-- TTTTTTTGCA 3070 hom 67 het 48 0 24 26 T 9 7 338547 CASAVA_Build 9 16002607 1D TTGCTGGTTG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 193 hom 29 1 24 5 T 9 8 338548 CASAVA_Build 9 16007304 1I CAAACTGCAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 7 8 338549 CASAVA_Build 9 16009593 2D AGAGAGAAAC AG/-- AAAGACATGG 3070 het 3070 hom 40 16 17 11 AG 1 0 338550 CASAVA_Build 9 16026846 3D AGCCATAAAA AAG/--- AATGAAATCC 3070 hom 93 het 35 0 31 7 AAG 1 0 338551 CASAVA_Build 9 16034481 1I50M1D ACCACAGGAG -AAAAAAAAAGAATGAAAAATATAGATCAAATATAGCCAGCTATTTAATAAT/AAAAAAAAAAGAATGAAAAATATAGATCAAATATAGCCAGCTATTTAATAA- TTTTTTTTTT 3070 het 525 hom 19 3 15 15 N/A 0 0 338552 CASAVA_Build 9 16040454 3D TAAAAATGCA GAT/--- GAACAATACA 3070 hom 117 het 44 0 40 5 GAT 1 0 338553 CASAVA_Build 9 16056459 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1405 hom 24 4 13 7 T 13 14 338554 CASAVA_Build 9 16076027 12I GAATAGTTTC ------------/AGAAGGAATGGT ACCAGCTCCT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 AGAAGGAATGGT 0 1 338555 CASAVA_Build 9 16095451 1D AAGTCCAGCA C/- CCCCCCCTTC 3070 het 2276 hom 40 10 11 20 C 8 7 338556 CASAVA_Build 9 16106076 1D AGTATGGGGG A/- AAATGATACC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 4 3 338557 CASAVA_Build 9 16144515 1D CTTGCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1847 het 1847 ref 35 19 5 11 A 13 12 338558 CASAVA_Build 9 16245594 8I CAAGCCACCA --------/TCAACTCT TCTGGAGATG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TCAACTCT 0 1 338559 CASAVA_Build 9 16285208 2D ATCCATGACT GA/-- GAGACCCATA 3070 het 3070 ref 26 14 12 0 GA 3 2 338560 CASAVA_Build 9 16287969 1D TACCAACAAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 9 8 338561 CASAVA_Build 9 16294805 2D CTGGAAAGGT GG/-- GGGGGGGGGG 2387 het 955 hom 24 6 7 11 G 12 10 338562 CASAVA_Build 9 16296255 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1905 het 1656 hom 31 13 7 15 A 19 16 338563 CASAVA_Build 9 16297466 1I CCAGAAACTT -/A ACTACCTCCT 3070 het 3070 hom 49 21 25 3 A 1 2 338564 CASAVA_Build 9 16314432 1I CCCAGGGACC -/T GCAGGGCAGT 2222 het 1635 hom 24 8 8 8 T 0 1 338565 CASAVA_Build 9 16314781 2D CTGGTACATT AA/-- AAAAAAAAAA 3029 het 606 hom 25 4 9 12 A 18 16 338566 CASAVA_Build 9 16317711 1I CCTCCTGTCA -/C CTCCCCCTAA 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 C 1 2 338567 CASAVA_Build 9 16349465 2I CCAGTCTCGC --/AT ATGTCTTTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AT 1 2 338568 CASAVA_Build 9 16359054 2I GTGATTCTGA --/GT GTGTGTTTGC 3070 het 3070 hom 48 16 23 9 GT 3 4 338569 CASAVA_Build 9 16365175 1I ATCAATATCA -/T GGAAATGACC 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 T 0 1 338570 CASAVA_Build 9 16373356 5I19M1D AAAAAAGAAT -----AAAACAGTTGAGCAAACAGA/AAAAGAAAACAGTTGAGCAAACAG- AAAAAAAAAG 3070 hom 57 het 20 0 20 3 N/A 0 0 338571 CASAVA_Build 9 16387679 1I CACAACTATG -/T TATTTTCATT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 1 2 338572 CASAVA_Build 9 16388160 1D TAATTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 45 1 37 7 T 12 11 338573 CASAVA_Build 9 16403188 1D ATAAAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 T 11 10 338574 CASAVA_Build 9 16403355 1D AAATGCTTAG T/- TTTTTTTTTT 2498 het 2498 ref 27 14 9 4 T 16 15 338575 CASAVA_Build 9 16408441 10D TTACATCAAT GGCCCCTCAA/---------- GGCTAAATAT 3070 het 3070 ref 31 17 13 4 GGCCCCTCAA 1 0 338576 CASAVA_Build 9 16411863 2I AATCCTACCC --/CT GTTTATTATT 3070 het 3070 hom 47 17 29 1 CT 0 1 338577 CASAVA_Build 9 16436801 1I CACTCTGGGG -/T TACAACATAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 2 338578 CASAVA_Build 9 16441057 6D TTCTAAATCA TTAACT/------ TTATCTTTTA 3070 het 3070 ref 45 24 12 11 TTAACT 1 0 338579 CASAVA_Build 9 16444361 1I AGTGCAGTGG -/T TGTGATCATA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 1 2 338580 CASAVA_Build 9 16446064 1I GACTTTGTTC -/T TTACTCATCA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 2 3 338581 CASAVA_Build 9 16448210 1D TGGAAGCCAA G/- GGACCATGCT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 G 3 2 338582 CASAVA_Build 9 16459192 2D7M2D CTCAGAAAAA GTGAACATGCT/--GAGCATG-- CTCAAACAGT 3070 het 3070 ref 54 24 26 6 N/A 0 0 338583 CASAVA_Build 9 16472666 3D AAATCTGCTA CTT/--- CTTCTCTATC 3070 het 3070 ref 30 19 9 3 CTT 2 1 338584 CASAVA_Build 9 16482720 1D GGCCTGCCCA T/- TTTTTTTTTT 1033 het 1033 ref 37 22 3 12 T 15 14 338585 CASAVA_Build 9 16547843 1I TTCTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 1326 het 1326 ref 34 25 4 5 T 10 11 338586 CASAVA_Build 9 16550545 1D CCATGTCCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2773 hom 37 14 12 11 A 10 9 338587 CASAVA_Build 9 16576600 2D CTGCTCTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 106 het 50 0 36 14 CT 9 8 338588 CASAVA_Build 9 16591707 1D TGGATGCAGG A/- GAAAAGATAT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 1 0 338589 CASAVA_Build 9 16593894 1D TATAAAAAAA C/- ATTCTGTCAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 1 0 338590 CASAVA_Build 9 16594835 1D GGTTAAAAAT G/- ATTAATTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 0 338591 CASAVA_Build 9 16600142 1I AAGGGGTGGC -/A AAAAACTGGG 3070 hom 99 het 40 0 33 7 A 5 6 338592 CASAVA_Build 9 16601833 1D TTTAACAAAA T/- TTTTGAAAAT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 T 5 4 338593 CASAVA_Build 9 16602027 1D27M4D TTGTAAGAGG TAGAAGAGAGAACAGAGATCTAACACTAAAAT/-AGAAGAGAGAACAGAGATCTAACACTA---- AAATAACTAG 3070 het 1542 hom 22 4 14 8 N/A 0 0 338594 CASAVA_Build 9 16604305 1D TAGCAAGGAT G/- GGGGTCTTAC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 5 4 338595 CASAVA_Build 9 16604462 1I CCTTTTCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1290 hom 39 5 28 6 A 13 14 338596 CASAVA_Build 9 16604654 1I GCATGAAGTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 8 9 338597 CASAVA_Build 9 16622427 1D CTAAAACGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 12 11 338598 CASAVA_Build 9 16624884 1D AATAAAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 T 11 10 338599 CASAVA_Build 9 16633304 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1527 het 369 hom 12 5 4 3 A 17 16 338600 CASAVA_Build 9 16648279 4I AAACATGGAA ----/ACAG ACAGCTATAA 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 ACAG 1 2 338601 CASAVA_Build 9 16650852 1I CTATGTATTG -/T TAAGTAATAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 1 2 338602 CASAVA_Build 9 16654872 1I CCTATACCAT -/G AAGCATTGTG 3070 hom 96 het 38 0 30 8 G 0 1 338603 CASAVA_Build 9 16683017 1I AATCCCAGCT -/A ACTTGGGAGG 3070 hom 30 het 13 0 10 3 A 1 2 338604 CASAVA_Build 9 16685550 3D TTTTTTTTTT TTG/--- ATAAAAATGG 3070 het 118 hom 26 4 12 11 TTG 1 0 338605 CASAVA_Build 9 16685861 5I CGAGCTAAAC -----/AAGCA AAGCAAATAG 3070 hom 151 het 56 0 51 5 AAGCA 1 2 338606 CASAVA_Build 9 16687599 5I14M1I CATGCCTGTA -----ATCCCAGCTAGTTG-/ATCCCATCCCAGCTAGTTGA GGAGGCTAAG 3070 hom 37 het 11 0 13 4 N/A 0 0 338607 CASAVA_Build 9 16688321 1D ACTGTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 27 1 19 7 A 12 11 338608 CASAVA_Build 9 16691862 1D ATCACTTGAA C/- CCGGGAGGCG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 3 2 338609 CASAVA_Build 9 16692636 1D TATTCCCCTA C/- CATCCTACAC 3070 hom 123 het 43 0 42 1 C 2 1 338610 CASAVA_Build 9 16693503 1D AAGAAAAAAA T/- ATCTAATGAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 0 338611 CASAVA_Build 9 16695655 2I GTGGCTTGGG --/GT TTTTTTTTTC 1109 het 493 hom 26 3 7 16 GT 0 1 338612 CASAVA_Build 9 16700122 1D TTCAACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 821 hom 40 3 30 7 A 13 12 338613 CASAVA_Build 9 16713500 1D CAAAAAAATT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 50 hom 23 1 12 10 G 10 9 338614 CASAVA_Build 9 16724447 2I TCACTGGCCC --/CT CTCTCATTAT 3070 hom 120 het 45 0 39 6 CT 2 3 338615 CASAVA_Build 9 16726442 1D ACAGAGACTA T/- TTATTATTAT 1945 hom 21 het 14 0 8 6 T 3 2 338616 CASAVA_Build 9 16728339 1D TTAAAGGGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 30 het 49 1 46 2 A 10 9 338617 CASAVA_Build 9 16728557 4I ACATCAAAAC ----/TTTT TTTAAGAAAT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 3 7 338618 CASAVA_Build 9 16737350 1D AGATACAATT A/- ACAGTAAAAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 2 1 338619 CASAVA_Build 9 16738016 1D AGAAGAATGG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 A 9 8 338620 CASAVA_Build 9 16739068 1I TTCAGTATGT -/A AAGCTTGTAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 2 3 338621 CASAVA_Build 9 16741265 1I AAAATGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 72 hom 20 2 13 5 A 13 14 338622 CASAVA_Build 9 16741566 3I AAAAGTTATT ---/ACA ATTGTTCTAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 ACA 0 1 338623 CASAVA_Build 9 16742199 3D GTTTTGGCTC AAA/--- ATTTTGTTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 4 1 338624 CASAVA_Build 9 16742424 1I GAAGTCAATG -/T TGTTTGGGCG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 1 2 338625 CASAVA_Build 9 16742615 1D34M2I AATTGCTAGA TTTTTTTAATGACACACAAGTTACAAAATAATCTG--/-TTTTTTAATGACACACAAGTTACAAAATAATCTGTA TATAGTTTTC 3070 hom 151 het 41 0 51 6 N/A 0 0 338626 CASAVA_Build 9 16743147 1I TTTGAATAGT -/A AACAATGGCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 2 3 338627 CASAVA_Build 9 16743873 1I CAGTAATCCA -/T TACTTTAGAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 338628 CASAVA_Build 9 16747080 4I TTACTTAATT ----/TCTA TCTTTCTTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 8 TCTA 0 1 338629 CASAVA_Build 9 16747650 1D TAATTTTACT G/- TTTCCAACAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 0 338630 CASAVA_Build 9 16748357 1I CTTTTTTTTT -/G AGATGGAGTT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 0 1 338631 CASAVA_Build 9 16748913 1I TCAACCTTTT -/A AAAAATATTG 3070 het 326 hom 24 1 23 0 A 5 6 338632 CASAVA_Build 9 16751078 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 18 1 13 4 A 11 12 338633 CASAVA_Build 9 16754738 2I TATTTGTCTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 10 12 338634 CASAVA_Build 9 16757548 2I CAGCCTGTAT --/AC ACAGAGTTGA 3070 hom 138 het 52 0 45 7 AC 1 2 338635 CASAVA_Build 9 16760651 1D CATTCAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 29 0 18 12 T 14 13 338636 CASAVA_Build 9 16771245 23I AGGTCTGAAG -----------------------/ATCTGGATTCAAGACCTCATGTT ATCAGGGCTG 3070 hom 57 het 24 0 18 7 ATCTGGATTCAAGACCTCATGTT 0 1 338637 CASAVA_Build 9 16782103 1I TTGACCCTCC -/A AAAAAAAAAA 2665 het 454 hom 29 3 15 11 A 16 17 338638 CASAVA_Build 9 16782247 3I AACCCCCATT ---/TTG CAGAATACCA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 TTG 0 1 338639 CASAVA_Build 9 16785382 2D TAATTCTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 2423 het 1447 hom 43 11 11 21 T 16 14 338640 CASAVA_Build 9 16787149 1I TTAATATAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 10 338641 CASAVA_Build 9 16791742 1I AAAAAAAAAA -/C ACACACACAC 3070 het 1119 hom 44 3 32 9 C 0 1 338642 CASAVA_Build 9 16797008 1I CTTTCTTCTC -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 8 338643 CASAVA_Build 9 16808887 1D TAAGAAGTAC T/- TTAGCTAGAG 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 3 2 338644 CASAVA_Build 9 16809812 1I GAGATATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 730 hom 34 2 31 1 T 10 11 338645 CASAVA_Build 9 16811232 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 22 3 13 6 A 13 12 338646 CASAVA_Build 9 16815043 1I CTTACCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 709 hom 41 2 33 6 T 10 11 338647 CASAVA_Build 9 16824195 1I CTGGCCAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 10 11 338648 CASAVA_Build 9 16830157 1D TCTGGGTTAG A/- AAAAAATCCA 3070 hom 148 het 54 0 50 4 A 7 6 338649 CASAVA_Build 9 16831540 1I GCTAATCAAA -/C CCAGGGCATA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 2 3 338650 CASAVA_Build 9 16835314 1D CAACACCAGC T/- TTTTTACAGT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 6 5 338651 CASAVA_Build 9 16843297 4I AGGCCCAGTT ----/AGTC AGGAGGCTAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 AGTC 0 1 338652 CASAVA_Build 9 16843405 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 691 het 691 ref 28 18 3 7 A 17 16 338653 CASAVA_Build 9 16849181 1D GGTTACCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 356 hom 29 1 19 9 A 12 11 338654 CASAVA_Build 9 16851036 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 27 1 20 6 A 13 12 338655 CASAVA_Build 9 16851180 2D TCTCTACAAA AT/-- ATATATATAT 2635 hom 18 het 10 0 7 3 AT 10 9 338656 CASAVA_Build 9 16855034 1D CTTTGGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 32 0 16 17 A 17 16 338657 CASAVA_Build 9 16859222 5I AGTATATAAA -----/AAAAT AATAAAACAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 AAAAT 0 1 338658 CASAVA_Build 9 16865284 1D AAGAATATGC G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 88 het 40 0 32 8 G 9 8 338659 CASAVA_Build 9 16865760 3I CAGGTGCGTG ---/CCA CCACATCCGG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 CCA 1 2 338660 CASAVA_Build 9 16865987 4I GATTCTTACT ----/CTCA CTGACTTCAA 3070 hom 79 het 31 0 23 8 CTCA 0 1 338661 CASAVA_Build 9 16867724 1D TGTTTGTGAG C/- CTGTGTTTCT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 C 2 1 338662 CASAVA_Build 9 16868448 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 20 2 12 6 A 17 16 338663 CASAVA_Build 9 16874168 1D TGACGATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 11 10 338664 CASAVA_Build 9 16876715 1D TGTCTTATCA T/- TTTGTGTGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 4 3 338665 CASAVA_Build 9 16877787 4I AGATGGGCTT ----/AGAA AGAGGGCCTA 3070 hom 148 het 59 0 50 9 AGAA 0 1 338666 CASAVA_Build 9 16880388 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 7 8 338667 CASAVA_Build 9 16888794 1D CGTCTGCTTA T/- TTTACTATAA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 T 4 3 338668 CASAVA_Build 9 16890120 11D GACTTAGAGA GGTTGACTATT/----------- GGTTTGAGGG 1914 het 3 hom 26 1 8 19 GGTTGACTATT 1 0 338669 CASAVA_Build 9 16896415 1I AAACTATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 11 12 338670 CASAVA_Build 9 16898403 10D CCCAAAGTGC TGGGAGGAAG/---------- TGTGATTATA 3070 het 3070 ref 22 13 9 2 TGGGAGGAAG 1 0 338671 CASAVA_Build 9 16899474 6I GCTTGCTCAT ------/ACATGA GTAGGAACCC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 ACATGA 0 1 338672 CASAVA_Build 9 16901412 1I TATTATTATT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 12 13 5 A 8 9 338673 CASAVA_Build 9 16908150 1D ACATTACTTC T/- TGGTACCTAC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 2 1 338674 CASAVA_Build 9 16913823 1I CATAAAGGCA -/G CACAGACTGA 3070 het 3070 ref 40 22 12 6 G 0 1 338675 CASAVA_Build 9 16917042 3I AAGACAAGGT ---/AAG AAGTGCAATA 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 AAG 1 2 338676 CASAVA_Build 9 16918032 1I GTACCCCCCA -/G GAACAGGAAC 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 G 1 2 338677 CASAVA_Build 9 16921522 3I CTCTCTCTCT ---/CTC TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 26 0 21 5 CTC 0 1 338678 CASAVA_Build 9 16923452 2I GAAATGTTAC --/AG AGTTAAGGGC 3070 hom 138 het 58 0 47 11 AG 1 2 338679 CASAVA_Build 9 16924170 2I AAGGGGTCTC --/AT GTGAGATACT 3070 hom 117 het 49 0 40 9 AT 0 1 338680 CASAVA_Build 9 16927414 2D GATTAATAAC AA/-- TAATTATAAA 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 A 2 0 338681 CASAVA_Build 9 16928874 3D AAATGTGATA AAT/--- CCACATTAAA 3070 het 3070 ref 47 23 23 3 AAT 1 0 338682 CASAVA_Build 9 16929182 4D CACCCAAATT AGAA/---- AGAAGTTAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 8 AGAA 2 1 338683 CASAVA_Build 9 16934307 1D GCAAAAGAAT A/- AAAGTTGGAC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 4 3 338684 CASAVA_Build 9 16958054 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 20 1 15 4 T 20 19 338685 CASAVA_Build 9 16961305 1I TCCTGTCTTT -/G GAACTATTGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 338686 CASAVA_Build 9 16970466 17I TATCCTCACT -----------------/CCTGAACCTATGCATAG CCTGAGAGAG 3070 hom 102 het 36 0 35 3 CCTGAACCTATGCATAG 0 1 338687 CASAVA_Build 9 16977061 4D CTTTGTGAGT GTGA/---- GTGTGTGTGT 61 het 61 ref 52 12 2 39 GTGA 1 0 338688 CASAVA_Build 9 16985786 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 12 11 338689 CASAVA_Build 9 16986628 1D TGTTAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 255 hom 44 1 31 14 A 13 12 338690 CASAVA_Build 9 16994248 2D AATCAAGCAT AA/-- GTTATTTTTG 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 A 2 0 338691 CASAVA_Build 9 17007629 1D AGTCTGTAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2941 hom 31 10 18 3 A 10 9 338692 CASAVA_Build 9 17009421 1I AGTCTATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 10 11 T 13 14 338693 CASAVA_Build 9 17015696 1I GTATACTAAG -/T TTTTTACATC 3070 het 2270 hom 19 6 11 2 T 5 6 338694 CASAVA_Build 9 17033987 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1717 het 1012 hom 15 5 6 4 T 13 12 338695 CASAVA_Build 9 17038902 1D AATTTTGGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 9 8 338696 CASAVA_Build 9 17046847 4D GTTCACAAAT AATC/---- AGAGAAACTT 3070 het 3070 ref 23 14 8 2 AATC 1 0 338697 CASAVA_Build 9 17046932 1I GCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2094 het 2094 ref 25 12 8 5 T 11 12 338698 CASAVA_Build 9 17048197 3D GTAAAAGAAA AAG/--- AAGATCCTGG 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 AAG 2 1 338699 CASAVA_Build 9 17084242 4I AAAACTAAAC ----/TTAG TTAGGCTGCT 3070 het 3070 ref 38 20 18 0 TTAG 1 2 338700 CASAVA_Build 9 17169842 7D TATTTTGAGC TCTAAAG/------- TCTAAAGTTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 TCTAAAG 2 1 338701 CASAVA_Build 9 17178010 2D TATATACACC AT/-- ATATATATAT 2744 hom 27 het 24 0 9 17 AT 10 9 338702 CASAVA_Build 9 17225643 1D GTAATTTAAA T/- TTTTTTCCAC 3070 het 3070 ref 36 15 14 8 T 7 6 338703 CASAVA_Build 9 17274642 5D TTTGATTCTT TTCTC/----- TTTTCTTATT 3070 het 3070 hom 39 16 19 5 TTCTC 1 0 338704 CASAVA_Build 9 17298890 1I AAATTAGTTA -/T TTTTTTGTGT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 6 7 338705 CASAVA_Build 9 17298969 2D ACAGTTCATA TG/-- TATATATACA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TG 1 0 338706 CASAVA_Build 9 17299591 2I AGTATCTAAC --/AG TAAGTTTCAT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 AG 0 1 338707 CASAVA_Build 9 17299672 1D CTACCTTGAT A/- ACATGATTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 7 A 2 1 338708 CASAVA_Build 9 17302016 1D AAAGTCCAGA T/- TATATGCCTG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 2 1 338709 CASAVA_Build 9 17305961 9D TTCTGTTCTA TTCTGTTTT/--------- TTCAGGTCTG 3070 hom 135 het 46 0 46 2 TTCTGTTTT 1 0 338710 CASAVA_Build 9 17310393 1I TCCATCTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1131 hom 38 3 29 6 T 9 10 338711 CASAVA_Build 9 17310491 4D TCCAATGCCT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 79 het 33 0 27 6 TTTG 5 4 338712 CASAVA_Build 9 17315169 6D TAAATTGATA TTCTTT/------ TTCTTTTTCT 3070 hom 63 het 26 0 22 6 TTCTTT 3 2 338713 CASAVA_Build 9 17317311 1D CCAGGTTCAC G/- GCCATCCTCC 3070 hom 63 het 22 0 20 2 G 2 1 338714 CASAVA_Build 9 17321362 1I AATGTCTCAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 9 338715 CASAVA_Build 9 17322485 2D CCATGCAGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 7 T 14 12 338716 CASAVA_Build 9 17323748 2D CAAAAATAAC AT/-- GTCCAAATGA 3070 hom 126 het 52 0 43 10 AT 1 0 338717 CASAVA_Build 9 17334149 5D TGATTTGGAG TTTAT/----- TTTATTTGTT 3070 hom 81 het 28 0 28 2 TTTAT 2 1 338718 CASAVA_Build 9 17345891 2D TGAAAGCCCG TC/-- TCTACTAAAA 3070 hom 27 het 13 0 10 5 TC 2 1 338719 CASAVA_Build 9 17347266 1I GATGTTTGGG -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 6 7 338720 CASAVA_Build 9 17352509 1D GTAAACATTA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 8 7 338721 CASAVA_Build 9 17357400 4I ATATAAACTT ----/AAAA AAAAGACTGT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 4 8 338722 CASAVA_Build 9 17359985 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 1094 het 1094 ref 27 9 3 16 A 14 13 338723 CASAVA_Build 9 17378823 1D CATTAATAGT A/- AAATACTGTT 3070 hom 54 het 19 0 19 1 A 4 3 338724 CASAVA_Build 9 17379585 1D ACTATTTTTT A/- TATTTACCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 1 0 338725 CASAVA_Build 9 17379736 4D GAAATGAAAC ATAT/---- ATGCAGATTA 3070 hom 72 het 26 0 25 3 AT 3 1 338726 CASAVA_Build 9 17391813 3D GAAAAAGCGT TAA/--- TAGAACTTTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TAA 1 0 338727 CASAVA_Build 9 17391919 3I GGTAAAGGAC ---/TAA TAATATCCAG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TAA 1 2 338728 CASAVA_Build 9 17403138 3I TGAACAACTG ---/ATT ATTTTTGACC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ATT 1 2 338729 CASAVA_Build 9 17403211 1D ATTTCTACGC A/- AAAAATATAG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 6 5 338730 CASAVA_Build 9 17423615 1D TTTGTAGTGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 9 8 338731 CASAVA_Build 9 17424010 1D CCTTATGCTG A/- TCTATTCTTA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 1 0 338732 CASAVA_Build 9 17431062 3D AAGAAGTGTA CAC/--- CACCTTTAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 CAC 2 1 338733 CASAVA_Build 9 17447513 1D TTCTTTTTTT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 8 7 338734 CASAVA_Build 9 17463600 6D CAAAAAAAAA AAAAAC/------ AAAACAAAAA 53 het 53 ref 31 24 1 6 AAAAAC 1 0 338735 CASAVA_Build 9 17470357 2D AATTAATGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 39 0 31 10 A 13 11 338736 CASAVA_Build 9 17473332 1D AAACAGATAC T/- TTTTATACAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 5 4 338737 CASAVA_Build 9 17476283 22D TGATGCCTGC CATACAGTAAATTTCAACAAAT/---------------------- AATAGTTTCT 3070 hom 99 het 31 0 34 4 CATACAGTAAATTTCAACAAAT 1 0 338738 CASAVA_Build 9 17483129 1I TGGAAAGATG -/A AAAAATCCTA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 A 5 6 338739 CASAVA_Build 9 17490825 5D CCTGTAGTCT TGTCA/----- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 TGTCA 1 0 338740 CASAVA_Build 9 17494099 1D TACTGCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 49 0 40 10 A 10 9 338741 CASAVA_Build 9 17495141 1I CATTTATTTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 8 9 338742 CASAVA_Build 9 17495550 1D CCCGAAAAAG A/- GAAATACTTA 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 A 1 0 338743 CASAVA_Build 9 17496735 1I CTGTAAAAAC -/A AACAAAATGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 2 3 338744 CASAVA_Build 9 17509243 1D GATTTGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 476 hom 27 2 18 8 T 15 14 338745 CASAVA_Build 9 17512029 1D GCATTAGCAA C/- TACTGTTTAC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 1 0 338746 CASAVA_Build 9 17516742 4D CATGTAAAAA AATT/---- AATTAATTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 AATT 3 2 338747 CASAVA_Build 9 17525635 4I GGATGGCTTA ----/GTCG GTCGGGCCCT 3070 hom 107 het 41 0 34 7 GTCG 1 2 338748 CASAVA_Build 9 17535568 1I AAAGTATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 11 12 338749 CASAVA_Build 9 17536374 3D TAGAAAATCT AGA/--- AGAAGTGGAT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 AGA 2 1 338750 CASAVA_Build 9 17538959 1D AACAACACAC A/- AGTAGGGTCT 3070 hom 126 het 46 0 41 5 A 2 1 338751 CASAVA_Build 9 17540915 2I GTGTGTGTGT --/GA TTGTACGCGT 3070 het 160 hom 55 1 44 10 GA 0 1 338752 CASAVA_Build 9 17545581 1D GTAACTTGGC T/- TTTTCAGTTC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 5 4 338753 CASAVA_Build 9 17571243 2I TGTGTCGCCC --/TA TAAAGTGTAG 3070 hom 99 het 41 0 32 9 TA 1 2 338754 CASAVA_Build 9 17572278 4D GATACCAAAA ATTG/---- ATTGATCATC 3070 hom 69 het 31 0 24 8 ATTG 2 1 338755 CASAVA_Build 9 17592785 1D47M4D TAACAAGGAC TTCTATCACTGAAACATTCTCTTTTTAATGTTTAACTGCAGGATGCTTAAAG/-TCTATCACTGAAACATTCTCTTTTTAATGTTTAACTGCAGGATGCTT---- AAATCCTACA 3070 hom 157 het 43 0 53 6 N/A 0 0 338756 CASAVA_Build 9 17614524 1I CATATAATTT -/C TATTTATTTA 3070 hom 87 het 40 0 33 7 C 0 1 338757 CASAVA_Build 9 17647732 2I TATCTGTAAC --/AG GGGAACAATA 3070 hom 165 het 60 0 55 5 AG 0 1 338758 CASAVA_Build 9 17661301 1D CAATGAGGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 10 9 338759 CASAVA_Build 9 17676939 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 20 1 18 1 A 11 12 338760 CASAVA_Build 9 17677454 4I TTTTTGACTC ----/TGAT TGTAACAGGG 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TGAT 0 1 338761 CASAVA_Build 9 17682279 1D TCTTATTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 12 11 338762 CASAVA_Build 9 17687414 1I TAGAGACAGG -/C GTTTCACCAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 0 1 338763 CASAVA_Build 9 17707809 1D TTTGATATTA T/- TTAGTAGTAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 3 2 338764 CASAVA_Build 9 17723870 1D TCGCAAGAAC A/- AAAAAACCAA 3070 hom 81 het 28 0 28 1 A 7 6 338765 CASAVA_Build 9 17729623 1I ATGCCAGTTA -/T ATTTTATTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 0 1 338766 CASAVA_Build 9 17748777 3I TTGCTCTGTA ---/ATG ATGATGCCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ATG 2 3 338767 CASAVA_Build 9 17752397 1D GACAAGTGAT C/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 35 2 22 11 C 1 0 338768 CASAVA_Build 9 17756675 1I ATATTCTATG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 8 9 338769 CASAVA_Build 9 17778901 1I TGAGCAACTT -/A ACGTGATTCT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 1 2 338770 CASAVA_Build 9 17792302 2D CTGAGGAAAC AT/-- AGACTTACTG 3070 hom 120 het 45 0 40 5 AT 1 0 338771 CASAVA_Build 9 17798706 4I GAACACAAAA ----/CTTT CTTTGACCTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 CTTT 1 2 338772 CASAVA_Build 9 17802912 1D TTAGCTGAAG C/- AAACCACCTT 3070 hom 90 het 39 0 31 9 C 1 0 338773 CASAVA_Build 9 17807788 1I CTTGCCCCAG -/C CTCTGATCCC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 C 1 2 338774 CASAVA_Build 9 17808985 1D GCAGTGCTGC A/- AATATACATA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 A 3 2 338775 CASAVA_Build 9 17809459 1I ACATTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 19 2 12 5 T 11 12 338776 CASAVA_Build 9 17817797 1I CAAATGACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 41 1 28 12 T 10 11 338777 CASAVA_Build 9 17823401 29I TTACACTACT -----------------------------/GTAGACTTGATACACGTTGTGTCCTTAGG GTACATCAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 3 GTAGACTTGATACACGTTGTGTCCTTAGG 0 1 338778 CASAVA_Build 9 17831824 1I TCTATACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 11 12 338779 CASAVA_Build 9 17835674 1I ACTGGAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 42 1 29 12 T 12 13 338780 CASAVA_Build 9 17845016 1D CTATTGTGAA T/- AATGCTGCTA 3070 het 3070 ref 49 24 24 2 T 1 0 338781 CASAVA_Build 9 17872283 1D TCTCTCTTGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 59 23 18 18 T 10 9 338782 CASAVA_Build 9 17882413 1D AGAAAACATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2783 hom 37 11 13 13 T 15 14 338783 CASAVA_Build 9 17888076 9I GTAGCTGTAG ---------/ATTTTTATT ATTTTTATTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ATTTTTATT 1 2 338784 CASAVA_Build 9 17888166 1I TTCTCATCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 88 het 35 0 29 6 T 8 9 338785 CASAVA_Build 9 17890499 1I TTAAATGTAA -/T TTTTTGGTTC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 5 6 338786 CASAVA_Build 9 17890790 1D TGTGATGTCA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 148 het 55 0 50 7 T 7 6 338787 CASAVA_Build 9 17891200 1D ATTGGGGCAA G/- GAGTAAGTGA 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 G 2 1 338788 CASAVA_Build 9 17908337 1I TCTATATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 9 10 338789 CASAVA_Build 9 17912086 1I CAGTTCAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1003 hom 26 3 15 8 T 13 14 338790 CASAVA_Build 9 17912728 1D TGCTCAGTGA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 7 6 338791 CASAVA_Build 9 17921354 1D TGGGCTGCTG A/- ATTCTTTCTA 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 A 2 1 338792 CASAVA_Build 9 17924901 3D TATTTCCTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 1975 het 217 hom 25 4 8 14 A 19 16 338793 CASAVA_Build 9 17927620 4I3M2I12M1I5M3D TTTAAATTCC ----TAA--AATCTTGTTGAT-TTAAATTC/ATGTTAATCACTCAGGTACCTCTTAAA--- CTTAAATACT 3070 hom 96 het 31 0 33 3 N/A 0 0 338794 CASAVA_Build 9 17929295 1D CATTAGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 31 0 21 11 T 13 12 338795 CASAVA_Build 9 17930711 2D CATAACGTGC AA/-- AAAAAAAAAA 2266 het 404 hom 27 6 7 14 A 15 13 338796 CASAVA_Build 9 17931037 2D GTTTTTTAAT AA/-- GAGTCTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 A 2 0 338797 CASAVA_Build 9 17954563 4D AAACTGTGTT TAAC/---- TAAATATACA 3070 het 3070 hom 55 23 27 6 TAAC 1 0 338798 CASAVA_Build 9 17959207 1D ATTGCCAGTT A/- AAAATCTAAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 5 4 338799 CASAVA_Build 9 17966233 1D AAATTTAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 10 9 338800 CASAVA_Build 9 17968960 1I TGGTTGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 11 12 338801 CASAVA_Build 9 17969525 1D CAGCCATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 35 1 26 8 T 13 12 338802 CASAVA_Build 9 17983462 2I CGTAGTTTAC --/AG AGTTCTATTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 AG 1 2 338803 CASAVA_Build 9 18013139 2I AATTATTTAC --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 TA 4 5 338804 CASAVA_Build 9 18027950 5I TCTGGTCTGG -----/TCTGT TCTGGCATAT 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 TCTGT 0 1 338805 CASAVA_Build 9 18063977 1D GTAAAACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 26 24 7 T 11 10 338806 CASAVA_Build 9 18121926 1D TCCTTCATAG T/- TCAGGAAGTT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 T 2 1 338807 CASAVA_Build 9 18133502 1I TGCTTTTGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 71 het 33 0 23 10 T 8 9 338808 CASAVA_Build 9 18138338 1I AGTGACAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1733 hom 38 5 16 17 A 13 14 338809 CASAVA_Build 9 18143047 1D CATGAAGTAG A/- AAAAAAAGCC 3070 hom 101 het 42 0 34 8 A 8 7 338810 CASAVA_Build 9 18175858 1I TACAATTGGG -/A AAAAAAGTTT 3070 hom 123 het 50 0 42 8 A 6 7 338811 CASAVA_Build 9 18263339 12I TTGGCCTCTC ------------/CAGTTGGCCCAG AAAGTGCTGG 2871 het 2871 ref 29 17 10 2 CAGTTGGCCCAG 0 1 338812 CASAVA_Build 9 18280280 1D GGGGATTAGA T/- TTTTTTTTTT 1857 het 1857 ref 44 31 4 9 T 13 12 338813 CASAVA_Build 9 18316431 1D TTTTTTACCT A/- AAAAAAAAAA 1388 het 1388 ref 25 18 3 5 A 12 11 338814 CASAVA_Build 9 18326308 1D TGTAATTTCA T/- TTTTTTTTTT 1353 het 1353 ref 38 26 3 9 T 15 14 338815 CASAVA_Build 9 18335409 1I TCTATTTCAG -/A AAAAAATTGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 6 7 338816 CASAVA_Build 9 18356328 1D TATATACATA T/- GGCTGAAGTC 3070 hom 96 het 37 0 33 6 T 1 0 338817 CASAVA_Build 9 18357374 1D GAAGATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 24 10 T 13 12 338818 CASAVA_Build 9 18384489 2I CCATTCTGCA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 AG 5 6 338819 CASAVA_Build 9 18389515 1I GATTTTTATA -/T TTTTTTTGTA 1936 het 1936 ref 17 9 7 1 T 7 8 338820 CASAVA_Build 9 18403208 16D GTGCAGTGGC GCAATCTTGGCTTGCT/---------------- GCAATCTTGG 2372 het 1608 hom 19 6 6 13 GCAATCTTGGCTTGCT 2 1 338821 CASAVA_Build 9 18415401 1D GTTCTGTTAG A/- ATAGCAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 2 1 338822 CASAVA_Build 9 18439093 9D ACTTCCGCAT TTATTCATG/--------- TGAGTGAGAA 3070 het 3070 ref 20 11 8 2 TTATTCATG 1 0 338823 CASAVA_Build 9 18445521 1D ACTCCTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 19 10 T 11 10 338824 CASAVA_Build 9 18455919 1D GCTAATTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1160 hom 16 3 9 4 T 10 9 338825 CASAVA_Build 9 18460845 2D TCTCTCTCTC TT/-- GCTTCTGATT 3070 het 3070 hom 32 11 13 9 T 2 0 338826 CASAVA_Build 9 18466670 1I TCCTATAGTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 8 9 338827 CASAVA_Build 9 18496590 1I CCATGCGAAA -/T TTCAAAAATA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 2 3 338828 CASAVA_Build 9 18498193 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 12 9 6 A 11 10 338829 CASAVA_Build 9 18533345 1I GACCCACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 10 11 338830 CASAVA_Build 9 18541545 1D TACCGCTGAA T/- TTTTTTTTTT 2043 het 2043 ref 39 14 5 20 T 17 16 338831 CASAVA_Build 9 18544668 1D ATCTGAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 T 12 11 338832 CASAVA_Build 9 18544943 1D TTCACAAATA T/- GTAAGGAACA 3070 het 3070 ref 43 20 17 7 T 1 0 338833 CASAVA_Build 9 18555567 1D CCTAGTTATG A/- AAAAAAAAAA 2592 het 2592 ref 36 16 10 10 A 17 16 338834 CASAVA_Build 9 18562633 1D CTACCCCACA T/- TGCCTAGAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 2 1 338835 CASAVA_Build 9 18574366 1I GATTGTGAGG -/C CCCCCCCCAG 2442 het 2442 ref 26 14 7 5 C 8 9 338836 CASAVA_Build 9 18574610 1D CAGAGTTACC T/- TTAACATCTA 3070 het 3070 ref 33 23 8 3 T 3 2 338837 CASAVA_Build 9 18580471 1D CAACTTTTCG T/- TTTGTTGACC 3070 het 3070 ref 50 26 17 7 T 4 3 338838 CASAVA_Build 9 18583788 1D TTATTTCAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 9 8 338839 CASAVA_Build 9 18597571 6D ATAATTTCTT TTATTA/------ TTATTATTAT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 TTA 7 5 338840 CASAVA_Build 9 18599432 1I GAGGGAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 594 hom 50 2 35 13 A 12 13 338841 CASAVA_Build 9 18608527 2I GGTATACATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 34 0 20 14 A 10 12 338842 CASAVA_Build 9 18618197 1I GATTTTCTCC -/T GTGTTTTCTT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 0 1 338843 CASAVA_Build 9 18619980 1I TATGTGCTGT -/A TTTTTTTGTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 0 1 338844 CASAVA_Build 9 18623637 2D TAATCTTAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 30 1 13 16 T 18 16 338845 CASAVA_Build 9 18632295 4D TTTAATTTTT ATTA/---- ATTAATTTTT 3070 hom 93 het 34 0 32 4 ATTA 2 1 338846 CASAVA_Build 9 18637140 1I GAGGAATTTA -/T CCATTTCTTC 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 0 1 338847 CASAVA_Build 9 18649918 1D TGTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 4 A 11 10 338848 CASAVA_Build 9 18664069 1D TGGTTCACTC A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 7 6 338849 CASAVA_Build 9 18664997 6I AGTAGGTCAG ------/AGTAGT AGTAGTTTAT 3070 het 3070 hom 47 21 23 3 AGT 2 4 338850 CASAVA_Build 9 18669831 1I TTCTTCTATT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 51 17 26 8 A 8 9 338851 CASAVA_Build 9 18674837 2D TATTTGAAAC TG/-- TTTTGTTTAA 3070 het 3070 ref 45 24 19 3 TG 1 0 338852 CASAVA_Build 9 18712139 2I TGCTCTGGGG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 60 29 22 9 GT 5 6 338853 CASAVA_Build 9 18714908 1I GGATTGAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 10 11 338854 CASAVA_Build 9 18725896 1D CTCTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 29 2 19 8 A 15 14 338855 CASAVA_Build 9 18747037 3I TTGTTTTAGA ---/AAC AATTAAGCAG 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 AAC 0 1 338856 CASAVA_Build 9 18755420 3D GGTTTAGGAG ATA/--- ATAATTTTAT 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 ATA 2 1 338857 CASAVA_Build 9 18755504 1D TTATGAATCA T/- TATCAAAACA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 2 1 338858 CASAVA_Build 9 18758545 7D GCTTCAATGG GTAGGTA/------- GTTGATCCCA 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 GTAGGTA 1 0 338859 CASAVA_Build 9 18765049 1D ACTTGTTGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 8 het 38 1 25 12 T 10 9 338860 CASAVA_Build 9 18773840 4D AAAATATTTA CTAT/---- CTGTCCCTTT 3070 het 3070 ref 29 14 14 4 CTAT 1 0 338861 CASAVA_Build 9 18775161 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 24 0 14 10 A 13 14 338862 CASAVA_Build 9 18785187 3D CAATGGGAAA CCT/--- CCTTATTTGA 3070 het 3070 ref 53 23 17 15 CCT 2 1 338863 CASAVA_Build 9 18788982 6D ACGTGCTGAT TTTATC/------ TTTAAGTCTC 3070 het 3070 hom 65 24 34 8 TTTATC 1 0 338864 CASAVA_Build 9 18789744 1I TCCTAGCATG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 7 8 338865 CASAVA_Build 9 18790985 1D GGCAAAAAAA T/- ATCTGAATAT 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 T 1 0 338866 CASAVA_Build 9 18798987 2D ATATAAACAC AT/-- ATTTTCACTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AT 2 1 338867 CASAVA_Build 9 18808311 1D GGCAGTGGCA C/- CCCCATGCTT 3070 hom 123 het 46 0 38 9 C 5 4 338868 CASAVA_Build 9 18814179 1I ATGCCGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 T 11 12 338869 CASAVA_Build 9 18815554 1I CATACATATA -/T TTTTAACGTT 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 T 4 5 338870 CASAVA_Build 9 18816262 1D GGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 12 11 338871 CASAVA_Build 9 18829022 1I CACACTCTCC -/T TTTTTTTTTT 1887 het 262 hom 11 1 6 4 T 11 12 338872 CASAVA_Build 9 18837662 3D AGAGAGAAGA GAG/--- GAGAAGAGCA 3070 het 3070 ref 42 23 16 4 GAG 2 1 338873 CASAVA_Build 9 18848050 1D CCCAGAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 129 het 49 0 44 6 A 10 9 338874 CASAVA_Build 9 18848187 2I CAGGATTTAT --/TC TTTTTTCTTC 3070 hom 126 het 45 0 42 3 TC 0 1 338875 CASAVA_Build 9 18862159 1D AATAACCTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 18 13 13 T 10 9 338876 CASAVA_Build 9 18877012 1D ACTGAGGGGG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 7 6 338877 CASAVA_Build 9 18880939 3I CTGCAAATGA ---/AAT AATAATGGCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAT 2 3 338878 CASAVA_Build 9 18881381 1I AAGAGTGGGA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 T 7 8 338879 CASAVA_Build 9 18885438 1D CCCTCCCCCC A/- ATGTGGCATG 3070 hom 84 het 44 0 25 19 A 2 1 338880 CASAVA_Build 9 18885662 4D ACACCACATA AAAG/---- AAAGATCTGA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AAAG 2 1 338881 CASAVA_Build 9 18892502 27D CACAAACAGT AAATCAGTCAGAAAAGAAATAACAAGG/--------------------------- AAAATTAGAA 3070 het 3070 ref 31 20 20 1 AAATCAGTCAGAAAAGAAATAACAAGG 1 0 338882 CASAVA_Build 9 18893711 4D TATCCACAGG TGAT/---- TGATTGGTGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TGAT 2 1 338883 CASAVA_Build 9 18893963 1D TTTTAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 23 5 T 11 10 338884 CASAVA_Build 9 18897050 1I GAGTTGAGCA -/T TTTCAGTGGG 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 3 4 338885 CASAVA_Build 9 18900417 3I ACTTCCTGCA ---/GTT GTTGTGTTCC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 GTT 1 2 338886 CASAVA_Build 9 18902478 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1903 het 681 hom 22 5 10 7 A 14 15 338887 CASAVA_Build 9 18922919 1I GGTAATTTTT -/G TGGATTCCTT 3070 het 3070 hom 42 13 23 6 G 0 1 338888 CASAVA_Build 9 18931310 1D CTACTATGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 11 10 A 10 9 338889 CASAVA_Build 9 18932581 1D TAACTGGAAA C/- CCTGACTCCT 3070 het 3070 hom 42 13 19 10 C 3 2 338890 CASAVA_Build 9 18939382 1D TTGAGCCCAG A/- AATTCGAGGC 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 3 2 338891 CASAVA_Build 9 18939683 3I CTCACAGTCT ---/CAA CAGATGTTTC 3070 het 3070 hom 54 20 32 2 CAA 0 1 338892 CASAVA_Build 9 18940287 3D TCAAAATTTA CAG/--- CAGCATAATT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 CAG 2 1 338893 CASAVA_Build 9 18945283 3I ATATACCTAA ---/AAT ATTATCATTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 AAT 0 1 338894 CASAVA_Build 9 18945938 1I ACTTTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 15 7 T 10 11 338895 CASAVA_Build 9 18948860 5D GAAGTTGCTC GAAGA/----- GAAGAGGAAG 3070 het 3070 hom 43 18 19 7 GAAGA 2 1 338896 CASAVA_Build 9 18950798 4I AAAAATTGCT ----/GAAA GAATTAATCG 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 GAAA 0 1 338897 CASAVA_Build 9 18958597 1D CCCCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2434 hom 27 10 10 7 T 12 11 338898 CASAVA_Build 9 18961939 4I ATTCACTAAT ----/AATC AATAACAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AATC 0 1 338899 CASAVA_Build 9 18965202 24D GCAAGGAGGC TGCAGGCTGGGGAAGCAGGGAGAG/------------------------ TGCAGGCTGG 3070 hom 92 het 42 0 25 22 TGCAGGCTGGGGAAGCAGGGAGAG 2 1 338900 CASAVA_Build 9 18965891 1D CAGACAGACC A/- AGAGAGATGT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 A 2 1 338901 CASAVA_Build 9 18976609 1D TCCAAAGGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 6 het 26 1 16 10 A 10 9 338902 CASAVA_Build 9 18977954 5I ACATCTTCAT -----/AACTG AACTGATGAC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AACTG 1 2 338903 CASAVA_Build 9 18980167 1D AGTCATGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 36 0 31 5 T 15 14 338904 CASAVA_Build 9 18982773 1D TTAAGAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 36 0 27 9 T 12 11 338905 CASAVA_Build 9 18986078 1I ACTACATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 797 hom 37 3 25 9 A 13 14 338906 CASAVA_Build 9 18991662 1I AGACTCCGTC -/A AAAAAAAAAA 2751 hom 18 het 12 0 7 5 A 15 16 338907 CASAVA_Build 9 18999245 2D TGCCAAATTT AA/-- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 10 8 338908 CASAVA_Build 9 18999830 1I TGGGGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 34 1 23 10 T 13 14 338909 CASAVA_Build 9 19000148 9D TCTAAAAAAA AACAACAAC/--------- AACAACAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 5 AAC 5 2 338910 CASAVA_Build 9 19002711 2I TATATTTTGG --/CT CTTACTTTTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 CT 1 2 338911 CASAVA_Build 9 19010358 1D TTTTTTTTTT G/- TGAGACAGGG 2035 het 186 hom 19 1 11 7 G 1 0 338912 CASAVA_Build 9 19013788 4D GAAGGAAGGA AGGG/---- AGGGAGGAAA 3070 hom 54 het 36 0 17 19 AGGG 2 1 338913 CASAVA_Build 9 19032111 1I CTAATAATCT -/A AATTTTTTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 2 3 338914 CASAVA_Build 9 19062507 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1218 het 1218 ref 24 17 3 4 A 15 14 338915 CASAVA_Build 9 19073816 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 8 7 338916 CASAVA_Build 9 19081300 1D TTCGTCTGCG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 22 0 16 6 A 13 12 338917 CASAVA_Build 9 19088728 1I TTTAACATTT -/A AAAAAAAGTG 2292 hom 18 het 8 0 7 1 A 7 8 338918 CASAVA_Build 9 19110063 1D AGTAAACTGC T/- TTTTTTTTTT 1670 het 1670 ref 47 25 5 17 T 12 11 338919 CASAVA_Build 9 19122449 16D TATGCTTGCC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 2823 het 1018 hom 21 5 8 8 T 28 12 338920 CASAVA_Build 9 19124134 5I AAACAAAACA -----/AAACC AAAAACAGTT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 AAACC 0 1 338921 CASAVA_Build 9 19124686 1I AAAAAAAAAA -/T ATTTTTTGGG 3070 hom 36 het 14 0 12 2 T 0 1 338922 CASAVA_Build 9 19136104 1I CTTCTTCCTC -/T TTTTTTTTTT 1489 het 993 hom 25 5 5 15 T 14 15 338923 CASAVA_Build 9 19147520 2D TGGAGTTTTG CT/-- CTCTTGTTGC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CT 3 2 338924 CASAVA_Build 9 19148214 2I TAATTATTAC --/TT TTAAGATACA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 2 4 338925 CASAVA_Build 9 19153431 1D GGGAGGCCAA G/- GGGGGGCGGA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 G 7 6 338926 CASAVA_Build 9 19156351 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 83 hom 23 1 14 9 T 14 13 338927 CASAVA_Build 9 19158989 1D AAAAAGATAA T/- TTAAAAATGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 3 2 338928 CASAVA_Build 9 19170102 1D GCCACCATGA T/- TTTTTTTTTT 1408 het 1408 ref 44 21 5 18 T 17 16 338929 CASAVA_Build 9 19178146 1D ACTTTTTGTA T/- TTTTTTGCAG 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 7 6 338930 CASAVA_Build 9 19179378 1D ATTTTTAACC T/- TTTTTTTTTT 1022 het 1022 ref 29 19 3 7 T 12 11 338931 CASAVA_Build 9 19180686 3D CCCATCTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 17 0 9 10 T 17 14 338932 CASAVA_Build 9 19188073 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 1708 het 150 hom 18 2 4 13 A 19 18 338933 CASAVA_Build 9 19202610 4I TTTTTGTATT ----/ATTA TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 13 0 12 1 ATTA 0 1 338934 CASAVA_Build 9 19204072 1D CTCAAACAAC T/- TTCTTACATA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 3 2 338935 CASAVA_Build 9 19216046 1I TATTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 1742 het 551 hom 14 2 7 5 T 14 15 338936 CASAVA_Build 9 19222441 1D AGTACCTCGT G/- CAGTGTACAG 3070 het 3070 ref 59 27 23 9 G 1 0 338937 CASAVA_Build 9 19230671 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 2 A 12 11 338938 CASAVA_Build 9 19235957 1D TGGAATCCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 45 0 40 5 T 10 9 338939 CASAVA_Build 9 19245386 4I29M1D CTGGGCAACA ----GAGTGAGATCCTGCCTCCAAAAAAAAAAAT/GAGTGAGTGAGATCCTGCCTCCAAAAAAAAAAA- TTTTTTTTAA 3070 het 2622 hom 32 10 16 19 N/A 0 0 338940 CASAVA_Build 9 19248120 4D TGTCTCAAAA AATC/---- AATCAATCAA 3070 het 3070 ref 25 13 8 7 AATC 4 3 338941 CASAVA_Build 9 19251449 1I TAGTATGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 34 0 22 12 T 14 15 338942 CASAVA_Build 9 19251577 1I CACGGCTCAC -/T TGCAGTCTTG 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 T 1 2 338943 CASAVA_Build 9 19255439 4D CTTTTTTATT TTTA/---- TTTATTTATT 2372 hom 18 het 13 0 7 6 TTTA 5 4 338944 CASAVA_Build 9 19256386 1D ATTGTAAAAA T/- TTTCTCCTGT 1719 het 1719 ref 18 12 4 2 T 4 3 338945 CASAVA_Build 9 19258102 1D TTTTTGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 12 11 338946 CASAVA_Build 9 19268073 2D CTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1139 het 791 hom 24 9 3 12 T 16 14 338947 CASAVA_Build 9 19269909 1I GTGAAGATAT -/A ATGAATTCAA 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 A 1 2 338948 CASAVA_Build 9 19270017 2I TATAGGAAAA --/AG AGATATTTTA 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 AG 1 2 338949 CASAVA_Build 9 19271237 1D GTTCCTAAGG C/- TTCTAATTTT 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 C 1 0 338950 CASAVA_Build 9 19272157 4D AGTTTAAAAC ACTT/---- ACCATACAGC 3070 het 2483 hom 14 5 8 2 ACTT 1 0 338951 CASAVA_Build 9 19273162 1D TGTGCCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 11 10 338952 CASAVA_Build 9 19277738 1I TGCATACTTA -/C TTTTTTTTTT 2822 het 39 hom 18 1 13 4 C 0 1 338953 CASAVA_Build 9 19283458 1D GGTTAAAAAC T/- TTGAGATCAC 3070 het 3070 hom 33 11 19 4 T 3 2 338954 CASAVA_Build 9 19294126 1I TTGAGGAATG -/T TTTTTTTCTC 3070 het 2463 hom 21 9 11 1 T 7 8 338955 CASAVA_Build 9 19313429 1I CTCTGTCTGG -/A AAAAAAAAAA 933 het 933 ref 29 11 3 15 A 15 16 338956 CASAVA_Build 9 19317022 1I AGTAAGTACA -/T TCCCAAAATA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 1 2 338957 CASAVA_Build 9 19330194 1I GCTTCTAAAC -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 T 6 7 338958 CASAVA_Build 9 19347277 3I ACATCTTAAC ---/TTA TTATTACCAC 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 TTA 2 3 338959 CASAVA_Build 9 19352537 1D ATTTGCTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 13 12 7 A 10 9 338960 CASAVA_Build 9 19371070 4D ATCTGAGTAC TGTG/---- TGTCATTTTT 3070 het 3070 ref 46 25 16 6 TG 3 1 338961 CASAVA_Build 9 19383396 1I ACCCAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 T 12 13 338962 CASAVA_Build 9 19388684 1I TCTTTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 2309 het 2309 ref 28 17 8 3 A 13 14 338963 CASAVA_Build 9 19426560 1D TCTAGCTGTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 T 8 7 338964 CASAVA_Build 9 19432836 1D CAATAAATAC T/- TTTTTTTTTT 770 het 770 ref 20 11 3 6 T 13 12 338965 CASAVA_Build 9 19441950 1I CTCACCTTTC -/T TCAAGTGCTG 3070 het 3070 ref 33 25 8 0 T 1 2 338966 CASAVA_Build 9 19447612 1I GCCATCTTGT -/G GGGTTTTTGA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 G 3 4 338967 CASAVA_Build 9 19461863 1D TCCCTCCTGG A/- AAAATCTCAC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 5 4 338968 CASAVA_Build 9 19470756 1D TTTTATTATT A/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 A 1 0 338969 CASAVA_Build 9 19498794 1I CCTGTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 10 11 338970 CASAVA_Build 9 19524010 1D GTGCAGTAGC T/- TTTTTGATGG 3070 hom 135 het 47 0 46 3 T 6 5 338971 CASAVA_Build 9 19551792 1D GTATACTCCC T/- TTATAATACC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 3 2 338972 CASAVA_Build 9 19553182 1I TTGGCATCTC -/T TCCCCCAGCA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 1 2 338973 CASAVA_Build 9 19554552 4D CTATCTGTCT ATCA/---- ATCAATCACA 3070 hom 108 het 40 0 35 7 ATCA 3 2 338974 CASAVA_Build 9 19562089 1D TCAACTGAAA C/- CCCATCTCTA 3070 hom 46 het 17 0 16 1 C 4 3 338975 CASAVA_Build 9 19566817 2D TGCTGCAGCG GT/-- GTGTGTGTCT 3070 hom 135 het 55 0 44 13 GT 5 4 338976 CASAVA_Build 9 19567315 1D CAGGTCTAGA G/- AAACAGAGCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 G 1 0 338977 CASAVA_Build 9 19568357 4D GCAATAAGCC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 33 1 22 12 A 18 14 338978 CASAVA_Build 9 19568553 2D CCACGATGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 36 0 26 10 T 12 10 338979 CASAVA_Build 9 19578177 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 28 2 16 10 T 16 15 338980 CASAVA_Build 9 19580165 4D CTGTGGTAAC AACT/---- AACTTCTAAA 3070 hom 127 het 45 0 42 6 AACT 2 1 338981 CASAVA_Build 9 19591648 1D TGTTAGAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 11 10 338982 CASAVA_Build 9 19597047 5I TTCAACCTCA -----/TCCCG TGAAGTGAGG 3070 hom 144 het 51 0 48 3 TCCCG 0 1 338983 CASAVA_Build 9 19628771 15D TAATCATCAG ATTAAATAAGATGAC/--------------- ATTAAATAAG 3070 hom 93 het 32 0 32 8 ATTAAATAAGATGAC 2 1 338984 CASAVA_Build 9 19628962 1D TCTGAAGCTT A/- AGGCCAAGAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 2 1 338985 CASAVA_Build 9 19629107 1I14M4D TTGCAAGTGG -TTTTTTCCCCCAACAACA/TTTTTTTCCCCCAAC---- ACAAAAATTC 3070 hom 117 het 36 0 40 2 N/A 0 0 338986 CASAVA_Build 9 19631516 1I TACTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 29 2 18 9 T 15 16 338987 CASAVA_Build 9 19641567 4D CCATCATCAA TTTC/---- TTTCTCTCTT 3070 hom 109 het 42 0 36 8 TTTC 2 1 338988 CASAVA_Build 9 19642919 23D CGATGAGACA AACCTTCTCTTCCATCCTGTTTC/----------------------- AACCTTCTCT 3070 hom 93 het 32 0 32 11 AACCTTCTCTTCCATCCTGTTTC 2 1 338989 CASAVA_Build 9 19661286 3I12M2I6M2I TATTCCTCAG ---TATTTTATTATT--ATTATT--/GTTTGTTTGTTTATTTATTTATTTA TTTTGCAGCT 1329 het 1329 ref 46 45 3 2 N/A 0 0 338990 CASAVA_Build 9 19670141 1I GGGAAAGACA -/C ATACAGAACT 3070 hom 156 het 57 0 51 6 C 0 1 338991 CASAVA_Build 9 19670527 1D AACTTTCGCT C/- ATTAAAATGG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 C 1 0 338992 CASAVA_Build 9 19674711 3I AACGCAACCC ---/AGA AGATGACAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AGA 1 2 338993 CASAVA_Build 9 19703608 3D TTTGATAATG AGA/--- AGAAGTCCTG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AGA 2 1 338994 CASAVA_Build 9 19712656 1D ATAGGATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 35 0 26 9 A 12 11 338995 CASAVA_Build 9 19720878 1D AACTCTTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2916 hom 29 7 15 7 T 11 10 338996 CASAVA_Build 9 19722112 1D TTGTTTTGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 35 hom 41 2 34 5 A 10 9 338997 CASAVA_Build 9 19730159 1I CTTTGAAAAA -/G TTCTTAGGCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 0 1 338998 CASAVA_Build 9 19730870 1D AAAAAGGACC A/- AAAAAAAAAA 1729 het 1729 ref 29 19 4 7 A 13 12 338999 CASAVA_Build 9 19745921 2I CAATGGGCTG --/TA TAATTGGATT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 TA 1 2 339000 CASAVA_Build 9 19769894 1I CGTCTCTAGT -/A AAAAAAAGTA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 7 8 339001 CASAVA_Build 9 19771396 1D AGGGAGAGAT A/- ATGGTGACTC 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 2 1 339002 CASAVA_Build 9 19774793 12D TAGAAAATAT GTAGTACAAGTA/------------ GAAATATTGC 3070 hom 99 het 36 0 33 5 GTAGTACAAGTA 1 0 339003 CASAVA_Build 9 19777698 8D6M1D CCTTCCCTAA ACATCTAGACATTGT/--------ACATTG- TTTCAGCTAA 3070 hom 92 het 31 0 30 5 N/A 0 0 339004 CASAVA_Build 9 19782707 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 10 11 339005 CASAVA_Build 9 19784595 1I TTGGAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 30 2 14 14 A 13 14 339006 CASAVA_Build 9 19785940 1D ATACAGCCAT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 7 6 339007 CASAVA_Build 9 19786267 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 1368 het 1368 ref 11 7 3 2 A 12 11 339008 CASAVA_Build 9 19800993 4I TTTCACTCCG ----/CAAA CAGTGAACAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CAAA 0 1 339009 CASAVA_Build 9 19802782 1D GTATTCACCA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 9 8 339010 CASAVA_Build 9 19809035 6I ATCCAGAAAT ------/AAACCC AAACCCAGAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 AAACCC 1 2 339011 CASAVA_Build 9 19816172 2D GATGCATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 38 1 19 20 A 18 16 339012 CASAVA_Build 9 19834958 1I TGCCTCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 25 1 18 6 T 12 13 339013 CASAVA_Build 9 19835886 2D TCCATGTAAC TG/-- TGTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 TG 3 2 339014 CASAVA_Build 9 19835968 1I TATGACTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 38 0 30 8 T 9 10 339015 CASAVA_Build 9 19863180 8D AAGTAAGGTG TCCCTTCC/-------- TCCCTTCCTC 3070 hom 70 het 41 0 26 15 TCCCTTCC 3 2 339016 CASAVA_Build 9 19872663 1I TCTACAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1164 hom 36 4 20 12 A 16 17 339017 CASAVA_Build 9 19900895 1I TTTTTTTTTT -/C CTTTTCTTTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 1 2 339018 CASAVA_Build 9 19904369 1I AATAAAACCC -/G ATACACCTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 0 1 339019 CASAVA_Build 9 19908392 1I TGCCTTTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 588 hom 42 3 28 11 A 15 16 339020 CASAVA_Build 9 19925408 1I CAAACAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 8 9 339021 CASAVA_Build 9 19931240 1I AGAGACAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 339022 CASAVA_Build 9 19934766 1D ATTGGAACTT A/- AGAAGCCTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 2 1 339023 CASAVA_Build 9 19941560 1D TCAAGATTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 103 het 39 0 35 4 T 10 9 339024 CASAVA_Build 9 19947273 1D AACAATTTTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 9 8 339025 CASAVA_Build 9 19961049 4D AAATGTGGGG CAAA/---- CAGAGATCTG 3070 het 3070 ref 56 30 23 5 CAAA 1 0 339026 CASAVA_Build 9 19975017 1I CTGAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 348 hom 22 1 15 6 A 10 11 339027 CASAVA_Build 9 19980621 1I AAACAAAAAA -/C AAAAAAACAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 0 1 339028 CASAVA_Build 9 19985078 1I ATCTCAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 289 hom 42 3 25 14 T 12 13 339029 CASAVA_Build 9 19994810 1D AAGATGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 T 11 10 339030 CASAVA_Build 9 19999382 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 19 0 20 3 A 22 9 339031 CASAVA_Build 9 20003227 1I AACAGGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 10 11 339032 CASAVA_Build 9 20043921 12D CATTGTATCA ATGTTTAGGTCC/------------ ATCTGGCACT 3070 het 3070 ref 30 16 13 4 ATGTTTAGGTCC 1 0 339033 CASAVA_Build 9 20125726 1I GTTTTGCTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 9 10 339034 CASAVA_Build 9 20135628 2I TGCACGTGTG --/CA CAATTACACA 2190 het 494 hom 21 4 10 7 CA 1 2 339035 CASAVA_Build 9 20135947 1I ATCTTGTCAA -/G GTCAGTACAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 2 339036 CASAVA_Build 9 20139517 4D TATTTAACTC TGTA/---- TACAGACTAT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TGTA 1 0 339037 CASAVA_Build 9 20155773 1I TGTGACAATG -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 A 6 7 339038 CASAVA_Build 9 20161303 1I AAAATACAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 462 hom 16 1 14 1 A 9 10 339039 CASAVA_Build 9 20165016 2I CTGAATTTTT --/TA TATATATATA 3070 het 1258 hom 27 6 9 12 TA 8 9 339040 CASAVA_Build 9 20166908 12I TCTAAAGTGT ------------/GAGGTGGGTGGG GAGGATGGAG 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 GAGGTGGGTGGG 0 1 339041 CASAVA_Build 9 20171247 1D TTCTCATCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 15 7 A 11 10 339042 CASAVA_Build 9 20178096 17D TTTTCTATCC TGTCAGAAGAGGATTAG/----------------- AGTCAGAAGC 3070 het 3070 ref 40 30 15 7 TGTCAGAAGAGGATTAG 1 0 339043 CASAVA_Build 9 20179821 2D GGTTTCTCCT AA/-- GTTTCCAGCC 3070 het 3070 hom 41 16 23 3 A 2 0 339044 CASAVA_Build 9 20181160 1D TTTCCGGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 T 14 13 339045 CASAVA_Build 9 20185840 1D AGATTAAAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 A 9 8 339046 CASAVA_Build 9 20188650 2D TCCCCTCGCA TC/-- TCTCTCTCTC 845 het 845 ref 42 25 3 14 TC 9 8 339047 CASAVA_Build 9 20193121 1D GACTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 A 13 12 339048 CASAVA_Build 9 20196450 1D TAATTTTCCC A/- AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 A 7 6 339049 CASAVA_Build 9 20196880 1I AAACTAAGTT -/G GGGGGGGGCG 3070 het 1370 hom 18 5 10 3 G 8 9 339050 CASAVA_Build 9 20204628 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2558 hom 23 8 13 2 A 11 10 339051 CASAVA_Build 9 20206102 1D AATAAGAGGG T/- TTTTTTCTCC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 T 7 6 339052 CASAVA_Build 9 20229517 2I GTTCCCCAGA --/CT CTACCTCATG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 CT 1 2 339053 CASAVA_Build 9 20363941 1D TTCTTTCATT A/- AAAAAAAAAA 1364 het 1364 ref 39 33 3 3 A 11 10 339054 CASAVA_Build 9 20379622 1D AAATTAAAAC A/- AAAAAAAAAG 993 het 993 ref 34 26 3 5 A 10 9 339055 CASAVA_Build 9 20455500 1I ATCAATTGCA -/G TAGGGTGATA 3070 hom 108 het 43 0 35 8 G 0 1 339056 CASAVA_Build 9 20473873 1I GCAAGTCTAA -/T TTTTTTTTTT 1164 het 827 hom 11 4 3 4 T 10 11 339057 CASAVA_Build 9 20475744 2D ATATACACAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 GT 8 7 339058 CASAVA_Build 9 20484630 1I TTTCAGGCTG -/C CCACTTTAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 2 3 339059 CASAVA_Build 9 20496078 1I TTTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 27 1 19 7 T 11 12 339060 CASAVA_Build 9 20497741 1D CCCAAAATGG A/- AAAAAAAAAA 1748 het 1748 ref 36 18 7 11 A 17 16 339061 CASAVA_Build 9 20511076 1I TTGTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 10 11 339062 CASAVA_Build 9 20511637 4I TTAAACTGAC ----/AAAG AATGTTGGAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 AAAG 0 1 339063 CASAVA_Build 9 20512283 1D GAAAGTGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 31 1 18 12 A 15 14 339064 CASAVA_Build 9 20512677 1D AAAACAGTTG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 8 7 339065 CASAVA_Build 9 20527026 1D CCATGAAACC T/- TAGGTGCCCT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 T 2 1 339066 CASAVA_Build 9 20533954 2I ATAAAACAAG --/AT ATTCCCCTAC 3070 hom 120 het 47 0 40 7 AT 1 2 339067 CASAVA_Build 9 20537201 1D ACTCATATAC T/- TTTTTTTTTC 1399 het 1399 ref 19 12 4 4 T 10 9 339068 CASAVA_Build 9 20539473 1D CTCCGTGCCA G/- GAACTGTCCT 3070 hom 120 het 44 0 40 5 G 2 1 339069 CASAVA_Build 9 20553295 1I TCTAAAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 38 0 27 11 T 10 11 339070 CASAVA_Build 9 20560209 2I ATTATATTGT --/CC AAGGGACAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 0 2 339071 CASAVA_Build 9 20563123 1D ACAGGAGAAC T/- TTTTTTTTTT 2889 het 2889 ref 29 15 8 6 T 13 12 339072 CASAVA_Build 9 20576683 1D CATCAAGGAG T/- TTTTTTTTTT 2329 het 2329 ref 30 12 7 11 T 12 11 339073 CASAVA_Build 9 20590145 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3009 het 3009 ref 41 14 11 16 A 10 11 339074 CASAVA_Build 9 20591146 4I ATTCTGGAAA ----/CAGT CAAACTTCAC 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 CAGT 0 1 339075 CASAVA_Build 9 20594419 1D AAAGTCTAAC T/- TTAAACAGTC 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 T 3 2 339076 CASAVA_Build 9 20604641 1D TACAAATTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 10 9 339077 CASAVA_Build 9 20614048 1D CTTGAATTGA G/- AAGAGCAGAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 G 1 0 339078 CASAVA_Build 9 20616040 1D TTTTTTTTTT A/- AATTTCATAA 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 3 2 339079 CASAVA_Build 9 20629758 1D TGAATGCCTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 21 8 1 T 9 8 339080 CASAVA_Build 9 20638580 1I AATCAGTGGC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 A 7 8 339081 CASAVA_Build 9 20654958 1I AAACACTGCA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 7 8 339082 CASAVA_Build 9 20661618 2I GTAATAAAAG --/AT AGGAGAGATT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AT 0 1 339083 CASAVA_Build 9 20698762 2D GTGACAGAGT GA/-- GAGACCCTGT 3070 het 3070 ref 41 16 13 13 GA 3 2 339084 CASAVA_Build 9 20702519 3D TTAGCTGAGC CCA/--- GTGGTGGTGG 1893 het 1893 ref 13 6 4 4 CCA 1 0 339085 CASAVA_Build 9 20708445 2D GAAACTCTTC TT/-- TTAAGAGAGG 3070 het 3070 ref 46 23 18 6 T 4 2 339086 CASAVA_Build 9 20729602 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2896 het 727 hom 16 4 8 4 A 16 15 339087 CASAVA_Build 9 20730356 1D CTTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 T 10 9 339088 CASAVA_Build 9 20737822 1D ATTTTTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 T 13 12 339089 CASAVA_Build 9 20762985 2I AAATGCATAT --/AG ATAGATGTTT 3070 het 3070 hom 27 7 16 4 AG 0 1 339090 CASAVA_Build 9 20807659 1I CTTTTGTGGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 8 9 339091 CASAVA_Build 9 20817565 2D CCCTTAAAAA AG/-- GAGATCCTGC 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 AG 1 0 339092 CASAVA_Build 9 20825109 1I ATTTACATAC -/T TTGTCAGAAT 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 T 2 3 339093 CASAVA_Build 9 20830596 1I TTTTTTAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 T 11 12 339094 CASAVA_Build 9 20832127 1I CTTTACATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 23 13 11 T 10 11 339095 CASAVA_Build 9 20838176 4I AGAAACAGTC ----/TGTT TGTATGCTTA 3070 het 3070 hom 51 16 21 14 TGTT 0 1 339096 CASAVA_Build 9 20846994 1D CTATAGCTCT A/- GTAGTATAAC 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 A 1 0 339097 CASAVA_Build 9 20848051 1D TGTAGTTCTC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 41 18 18 7 T 8 7 339098 CASAVA_Build 9 20848839 4I ATTTCTTCAT ----/TGAC TGACTGGTCT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TGAC 1 2 339099 CASAVA_Build 9 20858707 1D GCTTTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 1951 het 1951 ref 44 27 5 12 T 11 10 339100 CASAVA_Build 9 20861922 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 8 9 339101 CASAVA_Build 9 20867130 19D TAACTTAAAC TATAGACCGATGTGAATTT/------------------- TATAGGGTTT 2111 het 2111 ref 20 17 5 2 TATAGACCGATGTGAATTT 1 0 339102 CASAVA_Build 9 20876216 1D TTTCAGAAGC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 37 8 23 6 T 9 8 339103 CASAVA_Build 9 20880861 1D CATGAGGCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 24 11 3 T 9 8 339104 CASAVA_Build 9 20883342 1I GATTATTAGC -/T TTTAATGCAT 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 T 3 4 339105 CASAVA_Build 9 20917021 2D ATGTATAGAC AT/-- ATATATATAT 2247 het 1889 hom 13 5 5 3 AT 8 7 339106 CASAVA_Build 9 20917948 1I TAGTTGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 14 15 339107 CASAVA_Build 9 20920190 4D GACTGCTAAC TTTA/---- TTTACCCTTG 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 TTTA 2 1 339108 CASAVA_Build 9 20928946 1I TATATGTATA -/T TTTTACCTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 4 5 339109 CASAVA_Build 9 20933453 1I GGCTAGGAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 8 9 339110 CASAVA_Build 9 20938126 2I AAAAAAACAC --/TT TTAAGTCTGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 2 4 339111 CASAVA_Build 9 20945522 1D TAACTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 33 1 18 14 T 15 14 339112 CASAVA_Build 9 20947255 4I TAGAGATGGA ----/GTCT AACAATGTTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GTCT 0 1 339113 CASAVA_Build 9 20959711 1I ATATAAAAAA -/T ATATATATAT 2409 hom 12 het 9 0 5 4 T 0 1 339114 CASAVA_Build 9 20959749 6I TATAATGGCT ------/TTTATA TTTATATTTA 2115 het 421 hom 7 1 5 1 TTTATA 1 2 339115 CASAVA_Build 9 20959991 1I TCGATGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 26 0 20 6 T 12 13 339116 CASAVA_Build 9 20970503 4I CTTGGTTAAT ----/TAAC AAATTAAGTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TAAC 0 1 339117 CASAVA_Build 9 20984979 2I CTAAAATAAG --/AT ATATAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AT 2 3 339118 CASAVA_Build 9 20985374 2I AAAAAAAAAA --/AC AAACAACTTT 3070 hom 100 het 44 0 33 11 AC 0 1 339119 CASAVA_Build 9 20987601 1D ACACAACTAG T/- TAAGTGGCAG 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 2 1 339120 CASAVA_Build 9 20989625 1I AAAACTTATG -/T TGTCTTCTAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 1 2 339121 CASAVA_Build 9 21007419 5D AGTCTTTCTT TATAA/----- TATAATACTC 3070 het 3070 ref 41 20 16 10 TATAA 2 1 339122 CASAVA_Build 9 21009869 4D GAAAGTCAGA TTAT/---- TTAGTCTAGC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 TTAT 1 0 339123 CASAVA_Build 9 21015409 4I TGTACATTTA ----/CATT CATTCTAAGC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CATT 1 2 339124 CASAVA_Build 9 21050759 1I AGCTATCTTA -/T GTATGTGTCT 3070 hom 149 het 58 0 47 11 T 0 1 339125 CASAVA_Build 9 21054671 4D AAATGGTTTT ATAA/---- ATAAATTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 ATAA 2 1 339126 CASAVA_Build 9 21057784 1D TCCACAGGGT C/- CAGTCTTCTC 3070 hom 138 het 51 0 47 5 C 2 1 339127 CASAVA_Build 9 21058119 1I GTTGCCTGTG -/T TTTTTCCATT 3070 hom 127 het 52 0 41 11 T 5 6 339128 CASAVA_Build 9 21066199 1D AAAAGCTTGA T/- TTTTTTCCCG 3070 hom 88 het 33 0 29 4 T 7 6 339129 CASAVA_Build 9 21066693 1D TTCGAGGAGC A/- AAGTATCCCC 3070 hom 96 het 36 0 33 5 A 3 2 339130 CASAVA_Build 9 21082098 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2071 het 2071 ref 34 20 8 6 T 17 16 339131 CASAVA_Build 9 21083846 2D TATATTTTGA AG/-- AGAAAGTTAT 3070 het 3070 ref 27 15 9 5 AG 2 1 339132 CASAVA_Build 9 21084195 1D GTGGAATTTT C/- CTGACCATGG 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 C 2 1 339133 CASAVA_Build 9 21095951 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 30 9 15 8 A 18 15 339134 CASAVA_Build 9 21108016 1I CTGATAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 13 12 T 10 11 339135 CASAVA_Build 9 21129650 4D TTTCCACTTG ACAA/---- ACAAACTTCC 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 ACAA 2 1 339136 CASAVA_Build 9 21145622 1I TTCTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 36 1 27 8 T 11 12 339137 CASAVA_Build 9 21145790 1I27M1D GCCCAGCTAA -TTTTTTTTTTTCTTTTGTAGAGATGGGT/TTTTTTTTTTTTCTTTTGTAGAGATGGG- TTTTTTCCAT 3070 hom 81 het 29 0 26 6 N/A 0 0 339138 CASAVA_Build 9 21152878 10D AGGTGTAGCT AAAAACATAA/---------- AAAAAAGACA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAAAACATAA 1 0 339139 CASAVA_Build 9 21153083 1I ATAAAAATAC -/A AAAATTGTCT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 4 5 339140 CASAVA_Build 9 21186334 1I GTCACCTAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 31 0 26 5 T 11 12 339141 CASAVA_Build 9 21202192 1D AAAGCCTGTC T/- TAACATTGCC 1598 het 1598 ref 38 27 5 6 T 2 1 339142 CASAVA_Build 9 21203853 8I TTGGTGCACT --------/TTGACCAG TTGGGGGCTC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TTGACCAG 0 1 339143 CASAVA_Build 9 21228985 2D AAATAACCAA AC/-- ACAAGAAATT 3070 het 3070 ref 17 10 7 0 AC 2 1 339144 CASAVA_Build 9 21240614 7D ACACTGACTG GAAAAAA/------- GAAAAAAGAA 2875 het 2875 ref 28 12 10 8 GAAAAAA 3 2 339145 CASAVA_Build 9 21267390 1D AAATTCATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 214 hom 35 1 25 9 T 10 9 339146 CASAVA_Build 9 21321494 2I TATAGGGGGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 73 het 31 0 20 11 TG 5 6 339147 CASAVA_Build 9 21332825 1D CGTTGCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 104 hom 40 3 26 11 T 15 14 339148 CASAVA_Build 9 21399037 1D ACAGAAGTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 107 het 45 0 39 6 A 10 9 339149 CASAVA_Build 9 21400118 4D TATAGAAAAA TTCT/---- TTATTTATTC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TTCT 1 0 339150 CASAVA_Build 9 21408691 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 925 hom 24 3 11 11 A 16 15 339151 CASAVA_Build 9 21408707 1D AAAAAAAAAA G/- AAGAAGAAGA 3070 het 1296 hom 36 11 13 13 G 1 0 339152 CASAVA_Build 9 21472126 1I AGTAAAACTT -/A ACCAAAGGCT 3070 het 379 hom 35 1 27 7 A 1 2 339153 CASAVA_Build 9 21496653 1I GCTTCCTTTG -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 8 9 339154 CASAVA_Build 9 21498066 1D ATCCAGCCAG T/- CTGCCCTACC 3070 hom 120 het 42 0 41 3 T 1 0 339155 CASAVA_Build 9 21498671 5D49M4D AATAAATTTA AATACAATTACTAAAAAAACCCAACTTTTTTTATAAATTGTCTTCCAATTTGCTTACA/-----AATTACTAAAAAAAAACAACTTTTTTTATAAATTGTCTTCCAATTTGCT---- TAGTTTTCAC 3070 het 3070 hom 34 12 14 17 N/A 0 0 339156 CASAVA_Build 9 21505439 4D AAATAAATAA ATAC/---- ATATATATAT 2579 het 2579 ref 13 7 6 1 ATAC 1 0 339157 CASAVA_Build 9 21507815 1I GCAGAGATGG -/A TGTAACCTTG 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 0 1 339158 CASAVA_Build 9 21510761 1D TTTTTCTCAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 69 hom 29 1 17 11 T 10 9 339159 CASAVA_Build 9 21511839 3I GCTCCCATTT ---/ATG ATAAGATCAT 3070 hom 90 het 40 0 29 11 ATG 0 1 339160 CASAVA_Build 9 21524535 3I TATAGAAATG ---/TCT TCATGTAATA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TCT 0 1 339161 CASAVA_Build 9 21546667 1D ACATCCTGAC A/- AAAAAATTCA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 7 6 339162 CASAVA_Build 9 21553821 1D CTAGCTGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 39 0 30 9 A 11 10 339163 CASAVA_Build 9 21574668 1I CCTTATTTAA -/T TTTTTTTTTT 903 het 903 ref 47 25 5 17 T 15 16 339164 CASAVA_Build 9 21576509 6D TACCATTCAC TAAACT/------ TAAAAAGCCC 3070 het 3070 hom 39 16 21 3 TAAACT 1 0 339165 CASAVA_Build 9 21577101 5I TCCAAAACTG -----/TTAAA TTAAAGTGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TTAAA 1 2 339166 CASAVA_Build 9 21582382 1I AGCCCCCCGC -/A AAATACTTCT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 3 4 339167 CASAVA_Build 9 21684612 1D TGGGTGTTCA G/- GTGCCCAGGA 3070 het 2242 hom 20 6 8 6 G 2 1 339168 CASAVA_Build 9 21692287 1I TCATCAGAAA -/T TTTTTTGTGA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 6 7 339169 CASAVA_Build 9 21699516 1D TACCAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 A 12 11 339170 CASAVA_Build 9 21700109 1I TCATAATTTT -/G GGGATTATAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 G 3 4 339171 CASAVA_Build 9 21710828 1I AATTAGAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 9 10 339172 CASAVA_Build 9 21712080 1D TAGCAAGGAC A/- AAAAAACCAA 3070 het 2382 hom 23 6 16 1 A 7 6 339173 CASAVA_Build 9 21713266 1I ATATGGATTT -/A AAAAATAAAC 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 5 6 339174 CASAVA_Build 9 21715311 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2905 het 2905 ref 30 19 8 4 A 13 12 339175 CASAVA_Build 9 21716629 4I GACCCTGTCT ----/CAAA CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 CAAA 3 4 339176 CASAVA_Build 9 21717057 1D AACAGGAGGT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 50 17 25 8 A 9 8 339177 CASAVA_Build 9 21721543 3D ATATATATAT ATA/--- TATTTTATTA 1302 het 495 hom 4 1 3 0 ATA 1 0 339178 CASAVA_Build 9 21731130 1I37M1I AACCTCTACA -AGATACCTAATCCTCTATTTTTCTTAAAATTGTTGGA-/CAGATACCTAATCCTCTATTTTTCTTAAAATTGTTGGAT TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 33 13 4 N/A 0 0 339179 CASAVA_Build 9 21733331 1I52M1D TTTTGCTCTC -AAATGTGGGCAAGGTAACAAAAATTTGGCTTAAAAATGTGGGCAAAAGTTAAC/AAAATGTGGGCAAGGTAACAAAAATTTGGCTTAAAAATGTGGGCAAAAGTTAA- AAAATATGTC 3070 het 3070 ref 31 27 15 4 N/A 0 0 339180 CASAVA_Build 9 21734303 1D GACAGACTCA C/- CTGCCTCACT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 C 2 1 339181 CASAVA_Build 9 21738070 1D ATGGCTTTCT G/- GGGCTTACCA 3070 het 3070 ref 41 20 19 3 G 4 3 339182 CASAVA_Build 9 21746888 1I TGTGACTGGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 9 10 339183 CASAVA_Build 9 21747875 2I TTAAGAGAGG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 GA 6 7 339184 CASAVA_Build 9 21750453 1I CACTTTATTT -/A AAAAGCTTAT 3070 het 3070 hom 36 16 16 6 A 4 5 339185 CASAVA_Build 9 21750592 1D AGTAGTGGGA G/- GGCTATGAAT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 G 3 2 339186 CASAVA_Build 9 21754135 1D TTTCTGCCCC T/- AAACTTGTTT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 1 0 339187 CASAVA_Build 9 21771299 1D CTATATTATG A/- TTGAAATATT 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 A 1 0 339188 CASAVA_Build 9 21793730 5I AGAATGCGTT -----/CTTAA CTTGTTTGAT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 CTTAA 0 1 339189 CASAVA_Build 9 21795209 2I AGATATTAAC --/AG GGGGTGGATC 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 AG 0 1 339190 CASAVA_Build 9 21816188 1D GAACATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2669 het 2669 ref 33 18 7 9 T 15 14 339191 CASAVA_Build 9 21819417 1D TCTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 2595 het 2595 ref 38 15 11 12 T 12 11 339192 CASAVA_Build 9 21821495 1D TGCTTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 13 10 T 12 11 339193 CASAVA_Build 9 21827145 1D TTCAAAACTG T/- TTTGTCAGAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 4 3 339194 CASAVA_Build 9 21872976 1I TTTCAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 2928 hom 21 9 9 3 A 8 9 339195 CASAVA_Build 9 21884211 5D CTTTCATGTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 2042 hom 30 11 12 8 A 19 14 339196 CASAVA_Build 9 21927337 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1198 het 1198 ref 21 13 4 4 A 11 10 339197 CASAVA_Build 9 21937235 1I CACAAGTAAA -/G AAGAAATAAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 0 1 339198 CASAVA_Build 9 21937402 1I GCACCCACAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 A 8 9 339199 CASAVA_Build 9 21938079 1I TCAGCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 22 21 11 A 10 11 339200 CASAVA_Build 9 21972479 1D TTTTTGTAAA T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 8 7 339201 CASAVA_Build 9 21972871 1I TAATGCAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 10 11 339202 CASAVA_Build 9 21986624 2D AACCAGATCC TT/-- TTATGGGTCT 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 T 4 2 339203 CASAVA_Build 9 21992478 1I CAGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 9 10 339204 CASAVA_Build 9 21993299 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 A 8 9 339205 CASAVA_Build 9 21997358 1D GCCTCATCTC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 8 7 339206 CASAVA_Build 9 22018213 2D CATATAAAAC AT/-- ATAAAAATAT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 AT 2 1 339207 CASAVA_Build 9 22019058 1I TACAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 A 11 12 339208 CASAVA_Build 9 22037962 2D AATTTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 8 T 13 11 339209 CASAVA_Build 9 22039483 2I TTTAGGACTC --/TT TCTGCACACT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 1 3 339210 CASAVA_Build 9 22039892 1D TTCCTTAAAT A/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 A 1 0 339211 CASAVA_Build 9 22043957 1D GCCTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 12 11 339212 CASAVA_Build 9 22056212 2D AAAAATTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3052 hom 20 9 9 3 T 13 11 339213 CASAVA_Build 9 22059355 1I TTTTCTCGAA -/T TAACCACTAT 3070 het 3070 ref 32 21 8 3 T 1 2 339214 CASAVA_Build 9 22089747 1I ATTATTAAGT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 8 9 339215 CASAVA_Build 9 22101585 5I ATCCATATAT -----/ATTTG ATGTGACATT 3070 het 3070 ref 53 26 20 7 ATTTG 0 1 339216 CASAVA_Build 9 22110483 1I CACTTCTACC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 8 9 339217 CASAVA_Build 9 22111370 1I TTTTAAAACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 18 21 2 A 9 10 339218 CASAVA_Build 9 22119718 1I ACAGTAAAAA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 6 7 339219 CASAVA_Build 9 22120561 1I TTTTGATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 694 hom 38 2 29 7 A 12 13 339220 CASAVA_Build 9 22143335 1D AAGCAATACA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 9 8 339221 CASAVA_Build 9 22144067 1I CAAAGCCTGT -/C CCCCCCCACT 2298 het 2298 ref 19 11 7 1 C 7 8 339222 CASAVA_Build 9 22148440 1D ACCTGAGGAC T/- TTTACAGGTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 5 T 4 3 339223 CASAVA_Build 9 22155672 1D ATAATACCCA T/- TTTTTTCTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 T 7 6 339224 CASAVA_Build 9 22156474 1D AAAATCCTAT A/- AGAACATAAA 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 A 2 1 339225 CASAVA_Build 9 22160024 1D ATTCTTATAG C/- CACAAATTTA 3070 het 3070 ref 43 23 11 10 C 2 1 339226 CASAVA_Build 9 22162286 21D TGTGGAGTCA TGGTGATAAATATACCATGGT/--------------------- TGGTGATAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 11 TGGTGATAAATATACCATGGT 2 1 339227 CASAVA_Build 9 22177334 1I AACAGAGTTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 A 8 9 339228 CASAVA_Build 9 22181880 2I AAATATTACA --/TC TGTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 TC 0 1 339229 CASAVA_Build 9 22182246 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2274 het 2274 ref 26 14 6 8 A 13 12 339230 CASAVA_Build 9 22182790 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 864 het 814 hom 13 7 2 5 A 15 14 339231 CASAVA_Build 9 22184773 1D TTTAAAATAG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 T 8 7 339232 CASAVA_Build 9 22191894 1I AAGAGATGTA -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 7 8 339233 CASAVA_Build 9 22195083 1I ACTTCTATGG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 8 9 339234 CASAVA_Build 9 22239350 2D TGATTTTTGT AC/-- ACACTGAGTT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 AC 3 2 339235 CASAVA_Build 9 22255766 1D TTGGCTGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 34 1 24 9 T 11 10 339236 CASAVA_Build 9 22260315 2D ATATAGTTAC AA/-- ATTTATTTGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 3 1 339237 CASAVA_Build 9 22274278 1D AAGCCTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 36 0 30 6 T 12 11 339238 CASAVA_Build 9 22274453 3I GTAGGCAAAC ---/AAA AAAATATTTG 3070 hom 69 het 34 0 24 10 A 4 7 339239 CASAVA_Build 9 22281432 3I TCCTCTCATC ---/CTT CTAGCCTCCT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 CTT 0 1 339240 CASAVA_Build 9 22284056 4D ACTTACTTAC TTAA/---- TTAATTAATT 3070 hom 51 het 23 0 18 6 TTAA 3 2 339241 CASAVA_Build 9 22288572 3D GGCCCGTGTC CTT/--- CTTTACAGGT 3070 hom 74 het 30 0 20 11 CTT 2 1 339242 CASAVA_Build 9 22291580 1D AGGGGATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 32 0 23 9 T 12 11 339243 CASAVA_Build 9 22300278 1D TCTCCCAAGG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 8 7 339244 CASAVA_Build 9 22308687 2D GAACATAATC AA/-- AAAAAAGGTT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 8 6 339245 CASAVA_Build 9 22329158 5D GCAAAATAGA TTGAT/----- TTGATTTATT 3070 het 3070 ref 32 18 12 5 TTGAT 2 1 339246 CASAVA_Build 9 22330927 1I TCCTAATGTG -/A ATTGGTTTGG 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 1 2 339247 CASAVA_Build 9 22336919 1D AAACACGCAC A/- AAATGAGGCA 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 A 4 3 339248 CASAVA_Build 9 22354232 1D ATACTTTTTC A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 43 23 16 5 A 8 7 339249 CASAVA_Build 9 22355969 1I CTTGTTACAC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 T 8 9 339250 CASAVA_Build 9 22356785 1D CTGAGTTGTC A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 hom 39 11 21 9 A 8 7 339251 CASAVA_Build 9 22360254 1I GGGAAATGAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 8 9 339252 CASAVA_Build 9 22361170 9I GCCCACTTTC ---------/ACCACTTCT ATTCAATATA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 ACCACTTCT 0 1 339253 CASAVA_Build 9 22363126 2I GAAAATGTGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 TA 6 7 339254 CASAVA_Build 9 22367741 1D TCTATAATTT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 8 7 339255 CASAVA_Build 9 22398577 4D ACAAAACAAA AAAC/---- AAACAAAGAA 3070 hom 36 het 16 0 13 6 AAAC 2 1 339256 CASAVA_Build 9 22399490 1D ATTGTCAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 9 25 5 A 10 9 339257 CASAVA_Build 9 22405214 1D GAGATCTCTT G/- GGTAATGTAT 3070 het 3070 ref 38 21 12 8 G 3 2 339258 CASAVA_Build 9 22420921 1I CCTATGAGTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 19 14 10 A 8 9 339259 CASAVA_Build 9 22421449 1I GCCTTGTTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 9 10 339260 CASAVA_Build 9 22422775 2D CCATGATAAT GC/-- TCAAATGCAT 3070 het 3070 ref 37 21 12 7 GC 1 0 339261 CASAVA_Build 9 22429464 1D AACCCTGCCA T/- TTTTCTCCCA 3070 het 3070 ref 52 29 18 6 T 5 4 339262 CASAVA_Build 9 22432698 1I TTCTAGCAGC -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 55 20 30 5 T 7 8 339263 CASAVA_Build 9 22442042 2D AAATGCTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 8 T 12 10 339264 CASAVA_Build 9 22448359 4D CTTATTTATG ACTT/---- ACTTCAACAT 3070 het 3070 ref 62 27 28 12 ACTT 2 1 339265 CASAVA_Build 9 22454060 1I23M10D TATATAAAAA -ATATATATAAATATATATAGAAAATATATAAAT/TATATATATAAATATATATAGAAA---------- ATATATAAAT 1947 het 940 hom 6 2 4 0 N/A 0 0 339266 CASAVA_Build 9 22456636 1D CCAACCAACC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 10 9 339267 CASAVA_Build 9 22457548 1I AGTGCTTATA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 61 28 27 6 T 7 8 339268 CASAVA_Build 9 22459599 1I CCATTTCTCT -/G GGGGTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 G 4 5 339269 CASAVA_Build 9 22463603 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2548 het 565 hom 18 4 7 7 A 15 16 339270 CASAVA_Build 9 22480070 1I AGCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 T 10 11 339271 CASAVA_Build 9 22485147 1I CATTTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3039 het 1192 hom 22 4 13 5 T 15 16 339272 CASAVA_Build 9 22491250 1I AGAACAATGT -/G GGGGAAACCT 3070 hom 48 het 18 0 16 2 G 4 5 339273 CASAVA_Build 9 22500190 1I ATTAATGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 A 10 11 339274 CASAVA_Build 9 22503556 1D CCATAAATAG A/- AATAGGAGGC 3070 het 3070 hom 28 9 17 3 A 3 2 339275 CASAVA_Build 9 22503911 1I AATGGTAAGC -/A ATTACCTGTA 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 A 1 2 339276 CASAVA_Build 9 22510807 1D ACTATCTTTT G/- GGGGGGCTGT 3070 het 3070 hom 40 17 21 3 G 7 6 339277 CASAVA_Build 9 22536356 1D GTGCTTTTAA C/- CCACTCTATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 C 3 2 339278 CASAVA_Build 9 22537229 1I AGTTCATTTG -/A AAAACTACAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 4 5 339279 CASAVA_Build 9 22539523 1D GAATAGATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 11 10 339280 CASAVA_Build 9 22548631 1D ATAATAATAA T/- AAAAGAGTTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 1 0 339281 CASAVA_Build 9 22548827 9I GTTTTGATAG ---------/TTATTACTT TTATTATCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTATTACTT 0 1 339282 CASAVA_Build 9 22567956 1D CTCTGATGGG T/- TTTTTTTTTA 1147 het 1147 ref 37 27 4 6 T 10 9 339283 CASAVA_Build 9 22569260 1I GTTTAAAGCG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 9 10 339284 CASAVA_Build 9 22581318 1I AAGTTTCTTA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 8 339285 CASAVA_Build 9 22588497 1D ATCTTTACGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 42 0 35 7 A 11 10 339286 CASAVA_Build 9 22598383 1D TTAGTTCATA T/- TAAAGCATCA 3070 het 3070 ref 52 27 19 6 T 2 1 339287 CASAVA_Build 9 22602275 1I CTGTTCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 312 hom 42 2 29 11 A 13 14 339288 CASAVA_Build 9 22603903 1I TGATTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 11 339289 CASAVA_Build 9 22610446 4I TTGGTCAGGC ----/TGGT TGGTCTCAAA 2895 het 1182 hom 16 5 8 3 TGGT 1 2 339290 CASAVA_Build 9 22625506 1I AAATTTGAAG -/A AAAAAACTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 6 7 339291 CASAVA_Build 9 22626841 2I AGAGTCAGAC --/AG AGAGAGAGAG 2058 het 1758 hom 28 7 10 11 AG 7 8 339292 CASAVA_Build 9 22628320 1D ATTGCATTGT C/- CCATGAATAA 3070 het 3070 ref 28 12 12 5 C 3 2 339293 CASAVA_Build 9 22635048 1I AAACGTCTCA -/G GGTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 19 17 0 G 2 3 339294 CASAVA_Build 9 22635134 1D GACTATTAGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 22 7 12 3 T 9 8 339295 CASAVA_Build 9 22653737 4D4M2I TGGGTGCAGG TGAAAAGG--/----CAGGCT GAGTCTGAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 N/A 0 0 339296 CASAVA_Build 9 22660352 1I GTATTAGGTC -/T TTTTTAATCT 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 T 5 6 339297 CASAVA_Build 9 22666154 2D6M8I GAATTATTAT TATTTTTT--------/--TTTTTTCCACTGGG TCCAGATTTT 3070 het 3070 hom 25 13 12 1 N/A 0 0 339298 CASAVA_Build 9 22673981 1I CAGCAGGCAC -/T TTTTTTTTTT 2603 het 2603 ref 48 21 13 14 T 13 14 339299 CASAVA_Build 9 22677010 1I ATCTCACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 13 14 339300 CASAVA_Build 9 22680078 1I AAATGGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 T 13 14 339301 CASAVA_Build 9 22688263 5D AGACTTGGAG TCTTT/----- TCTTAACATT 3070 het 3070 ref 31 18 10 6 TCTTT 1 0 339302 CASAVA_Build 9 22688429 3I GATTATTGTC ---/CTT CTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 CTT 1 2 339303 CASAVA_Build 9 22704623 1I ATGGAATATG -/T TTTTTCATAC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 5 6 339304 CASAVA_Build 9 22706084 1D CTTCTGCCGC T/- TTTTTTTTTT 2523 het 1376 hom 17 4 9 4 T 13 12 339305 CASAVA_Build 9 22713751 4D TACTGTTACT TAAA/---- TAAACACAAG 3070 het 3070 ref 31 14 14 7 TAAA 2 1 339306 CASAVA_Build 9 22719633 4I TAGGGATTAT ----/ATAA ATATTTAAAC 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 ATAA 0 1 339307 CASAVA_Build 9 22719849 1D ACTAAAAAAA C/- GTCTCTGAAA 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 C 1 0 339308 CASAVA_Build 9 22719937 4I AAACTATGTT ----/CTTC CTTCTACTTG 3070 het 3070 hom 45 20 23 2 CTTC 1 2 339309 CASAVA_Build 9 22721538 2I TATTAATTTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 T 9 11 339310 CASAVA_Build 9 22722476 5D TCTTTTAAAC TTTTA/----- TTTTAAGTTC 3070 het 3070 ref 46 22 19 8 TTTTA 2 1 339311 CASAVA_Build 9 22722588 1I CTAGTACCCA -/T TAGTTATTTT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 1 2 339312 CASAVA_Build 9 22748012 1D TACTTAGGTC T/- TTTTTTTTTT 2362 het 2362 ref 52 35 7 10 T 11 10 339313 CASAVA_Build 9 22753737 1I ACAGAAACAG -/A GAGTAAAATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 0 1 339314 CASAVA_Build 9 22754078 6I TTTGATAGGG ------/AAAAAT AAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 AAAAAT 1 2 339315 CASAVA_Build 9 22754784 1D GACAAAAAAA C/- CAAACACTGC 3070 het 2389 hom 35 5 29 1 C 2 1 339316 CASAVA_Build 9 22756172 1I ATATATTCTG -/T TTTTTTTTTT 913 het 913 ref 43 33 3 7 T 11 12 339317 CASAVA_Build 9 22764960 5I CTGTATTTAT -----/AAAGA AAAGAAATTC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 AAAGA 1 2 339318 CASAVA_Build 9 22773199 4I AAAATAAAGA ----/AGAC AGACATGTAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 AGAC 1 2 339319 CASAVA_Build 9 22775475 1I AAATGGTGCT -/A AGAAGAAATG 2963 het 2963 ref 23 11 8 4 A 1 2 339320 CASAVA_Build 9 22776371 20D CGTTCCTGCC TCAATTTCAGAACTTGTTAT/-------------------- TCAATTTCAG 3070 het 3070 ref 48 21 15 15 TCAATTTCAGAACTTGTTAT 2 1 339321 CASAVA_Build 9 22779994 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2304 het 2304 ref 22 7 7 8 A 11 12 339322 CASAVA_Build 9 22780038 2I GAACAGGAAA --/AC ACACACACAC 2120 het 2120 ref 29 19 5 5 AC 6 7 339323 CASAVA_Build 9 22785771 1I TCATGTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 T 10 11 339324 CASAVA_Build 9 22787069 2I CTTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 45 22 20 3 TA 5 6 339325 CASAVA_Build 9 22794675 14D ACGCACACGC ACACACACACATAG/-------------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 17 9 17 ACACACACACATAG 2 1 339326 CASAVA_Build 9 22798489 1D TGATTTAGAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 9 8 339327 CASAVA_Build 9 22813497 1I CTTGGGTTTT -/C CTGTTGAGAT 3070 hom 74 het 28 0 24 4 C 1 2 339328 CASAVA_Build 9 22813911 5I ATGATGTTTT -----/TTATG TTATGTTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 TTATG 1 2 339329 CASAVA_Build 9 22814132 4D TACTGGCATG ACTT/---- ACTTACTTAC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 ACTT 3 2 339330 CASAVA_Build 9 22818125 2I AACCTGTTTT --/AA GTCTGATGTA 3070 het 3070 ref 41 27 10 4 A 0 2 339331 CASAVA_Build 9 22840871 1I TTTTAAAGAT -/A TTTTTTTTCT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 0 1 339332 CASAVA_Build 9 22846832 1I ATAATGCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 38 1 26 11 T 10 11 339333 CASAVA_Build 9 22851997 1I CACCACCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 32 1 24 7 T 11 12 339334 CASAVA_Build 9 22858915 4D80M2D TATTAAATAA TAATTAATAATCACATAACACAATGATTTCATTATATAATTAATGATAATAATTAAAAGCTCTGATACAAGTGGTTATATAAAAAT/----TAATAATCACATAACACAATGATTTCATTATATAATTAATGATAATAATTAAAAGCTCTGATACAAGTGGTTATATAAAA-- ATTTAATTTA 3070 het 3070 hom 39 19 22 19 N/A 0 0 339335 CASAVA_Build 9 22865268 1D AAAAGTATTC T/- TTTTTTTTTC 1178 het 1178 ref 38 29 3 7 T 10 9 339336 CASAVA_Build 9 22866240 2D CATTTCTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 6 T 14 12 339337 CASAVA_Build 9 22871796 12D AAACTGGATC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTGA 3070 het 962 hom 18 5 11 2 T 20 8 339338 CASAVA_Build 9 22890420 3D CTCAAATACG ATA/--- ATCTTTTAAA 3070 het 3070 ref 53 28 24 1 ATA 1 0 339339 CASAVA_Build 9 22915229 4D TCTAAAGCCC TGGA/---- TGATGTCCAG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 TGGA 1 0 339340 CASAVA_Build 9 22945755 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 2291 hom 22 7 13 2 A 11 9 339341 CASAVA_Build 9 22985975 1I GGAGAATATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 21 7 11 3 A 9 10 339342 CASAVA_Build 9 23017797 1D CTTAGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 30 17 6 7 A 13 12 339343 CASAVA_Build 9 23026335 1D ATGTTTGAAA T/- TTTTAATAGT 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 T 5 4 339344 CASAVA_Build 9 23042672 13I ACAGTAGAAG -------------/AGATTAACGGATT AGAATTGAGA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AGATTAACGGATT 0 1 339345 CASAVA_Build 9 23059546 1I ATATGGTAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 8 9 339346 CASAVA_Build 9 23060284 2I AGGTGAACTC --/TT ATATCCTGTT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 0 2 339347 CASAVA_Build 9 23066420 1D AATTTCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 22 1 14 8 T 12 11 339348 CASAVA_Build 9 23074187 1D CTCTGACTTA T/- TTTTTTTATG 3070 hom 102 het 44 0 34 10 T 8 7 339349 CASAVA_Build 9 23089221 1D ATTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 914 hom 39 4 25 10 T 13 12 339350 CASAVA_Build 9 23102441 1I ATACCCATTT -/G TTTATATGAG 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 G 0 1 339351 CASAVA_Build 9 23112034 7I GATTCTTTAA -------/GTTTTAC GTATGTCAGT 3070 het 3070 hom 47 15 27 5 GTTTTAC 0 1 339352 CASAVA_Build 9 23123627 3D GAAGAAAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 1655 het 1655 ref 39 17 6 17 A 21 18 339353 CASAVA_Build 9 23126424 1D CTTTTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1430 het 1430 ref 35 15 4 16 T 16 15 339354 CASAVA_Build 9 23130437 1I TCTCTAGTAT -/A AAAAAAAAAA 1027 het 1027 ref 27 16 5 6 A 13 14 339355 CASAVA_Build 9 23132156 1D GTATTTAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2772 hom 25 8 15 2 A 10 9 339356 CASAVA_Build 9 23132614 1D CAATTCATAA T/- TTTTTTTTTT 391 het 391 ref 35 28 3 4 T 15 14 339357 CASAVA_Build 9 23142440 1D ATGAATTCTC T/- GTCTGAGAGG 3070 het 3070 ref 38 19 19 0 T 1 0 339358 CASAVA_Build 9 23150368 2D GTAAAGAAAA AG/-- AGCATAGAGG 3070 het 3070 ref 49 24 21 5 AG 2 1 339359 CASAVA_Build 9 23157541 1I CAAGACACAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 A 7 8 339360 CASAVA_Build 9 23160371 1D AAAGAGACAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 8 16 8 A 9 8 339361 CASAVA_Build 9 23165182 1D CCTCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 40 1 29 10 T 12 11 339362 CASAVA_Build 9 23170551 1I CTTGCAGATC -/A AAAAAAAATT 3070 het 432 hom 28 1 24 3 A 8 9 339363 CASAVA_Build 9 23172038 1I ATTAACAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1158 hom 36 3 27 6 A 12 13 339364 CASAVA_Build 9 23174595 5I CAGTTCTAAT -----/GAATA GAATAGAATA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 GAATA 2 3 339365 CASAVA_Build 9 23174804 1I AGTCAGCATG -/C CTACTAACAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 C 1 2 339366 CASAVA_Build 9 23221363 1I TTTCCTGCAA -/G GCCCATCTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 2 339367 CASAVA_Build 9 23223994 1D ATCACATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 13 12 339368 CASAVA_Build 9 23232213 1I TCAGAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 10 11 339369 CASAVA_Build 9 23251349 1D GATTGATGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 30 3 A 11 10 339370 CASAVA_Build 9 23261150 1I ACCTTGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 9 10 339371 CASAVA_Build 9 23263161 1D CCGAAATATG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 230 hom 36 1 32 3 T 9 8 339372 CASAVA_Build 9 23265042 1D TAAACAAAGC A/- AAAACCTTAC 3070 hom 111 het 41 0 38 5 A 5 4 339373 CASAVA_Build 9 23271137 6D CATTAAGATG TTACTT/------ TTAAACATAT 3070 hom 108 het 39 0 36 4 TTACTT 1 0 339374 CASAVA_Build 9 23271627 1I TTTTTTTAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 416 hom 27 1 18 8 A 11 12 339375 CASAVA_Build 9 23277482 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 hom 141 het 48 0 48 1 A 10 8 339376 CASAVA_Build 9 23280787 1D TGACACTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 863 hom 40 3 29 8 A 18 17 339377 CASAVA_Build 9 23292681 1D GAGTTATAAG A/- AAAAAAATTC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 8 7 339378 CASAVA_Build 9 23318987 31D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------------- AAAAAAAAAA 1598 het 40 hom 6 1 5 1 A 47 16 339379 CASAVA_Build 9 23322330 1D TGATTACCTA G/- GTAGATGTAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 2 1 339380 CASAVA_Build 9 23336708 21I GGTGCCCATC ---------------------/ACCAGTGGACTGGATAAAGAA ACCGTGGTAC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 ACCAGTGGACTGGATAAAGAA 0 1 339381 CASAVA_Build 9 23342174 1D TATTATGTCA T/- GATCCCCTCA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 1 0 339382 CASAVA_Build 9 23349269 1D CCACAGAGAG A/- AAAAAAGAGT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 7 6 339383 CASAVA_Build 9 23356386 3I ATGATCTGTA ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 AAT 3 4 339384 CASAVA_Build 9 23360978 1D CAAGTTGGAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 T 9 8 339385 CASAVA_Build 9 23363044 1I TATATATGTC -/T TAGATCCAAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 2 339386 CASAVA_Build 9 23370158 2D TAAAAAAAAA AG/-- AAAAGAAAAG 3070 hom 60 het 23 0 21 3 AG 1 0 339387 CASAVA_Build 9 23377544 1D AAAATGAGAG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 A 8 7 339388 CASAVA_Build 9 23380240 1D GAAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 30 0 19 11 A 15 14 339389 CASAVA_Build 9 23391169 1I CGCTATTATG -/A AAAAAGAAAT 3070 het 261 hom 43 1 39 3 A 5 6 339390 CASAVA_Build 9 23392223 1D TATATGTATA T/- TTTTTTTGTA 2347 het 2347 ref 26 20 5 1 T 8 7 339391 CASAVA_Build 9 23407879 1D TTCCCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 11 10 339392 CASAVA_Build 9 23413515 1D TGTTACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 19 1 15 3 A 13 12 339393 CASAVA_Build 9 23421274 4D AGAAGATGAT AAAG/---- AAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 AAAG 1 0 339394 CASAVA_Build 9 23422984 1I TGCCAAGATG -/C CCCCCCATAG 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 C 6 7 339395 CASAVA_Build 9 23423263 1D CTTTTCTTAT G/- GAGCCCAATA 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 G 2 1 339396 CASAVA_Build 9 23425516 1D GAAAGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 1736 het 1644 hom 37 13 6 18 T 19 18 339397 CASAVA_Build 9 23425683 1D TGCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2322 het 387 hom 17 2 9 6 T 17 16 339398 CASAVA_Build 9 23455702 1D14M1D16M1D5M1D AATTCCTTCA GGGCTGAAAACAAGTGGGCCCCAGACAGTAACTTTTAGT/-GGCTGAAAACAAGT-GGCCCCAGACAGTAAC-TTTAG- TTTACACACA 3070 hom 69 het 22 0 23 6 N/A 0 0 339399 CASAVA_Build 9 23504905 1I GAAGTTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 132 hom 46 1 35 10 A 10 11 339400 CASAVA_Build 9 23521557 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTGTGT 650 het 650 ref 8 4 2 2 T 6 7 339401 CASAVA_Build 9 23522733 1I TTTTCTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 11 12 339402 CASAVA_Build 9 23538199 2D AGAAATAGGA AC/-- AGTTTTACAC 3070 het 3070 ref 23 13 9 3 AC 1 0 339403 CASAVA_Build 9 23566144 4D CAGGTCAAAT CTAA/---- CTGACACTAC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 CTAA 1 0 339404 CASAVA_Build 9 23573611 5I CAGGGGTTTA -----/TATAT TGTAACTATA 3070 het 3070 hom 43 15 26 2 TATAT 0 1 339405 CASAVA_Build 9 23583457 1D TATTGTTGTA T/- GCTAGGCTCT 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 T 1 0 339406 CASAVA_Build 9 23584846 1I ATTTCCAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 10 11 339407 CASAVA_Build 9 23626987 1I CAGGAAAATT -/G GGGGCTAGGG 3070 het 3070 ref 52 30 18 4 G 4 5 339408 CASAVA_Build 9 23632382 1I CTTCCATCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 10 11 339409 CASAVA_Build 9 23638215 3I ATATTTTCTT ---/CTC AGGGGATATT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 CTC 0 1 339410 CASAVA_Build 9 23655717 1D AAGTATCCAT G/- GGGAAGATGA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 G 4 3 339411 CASAVA_Build 9 23657173 1D TATGATGAAG A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 39 19 18 3 A 7 6 339412 CASAVA_Build 9 23661049 1D TAATGAGCTT A/- AAAAAAAAAA 1486 het 1486 ref 25 11 10 4 A 12 11 339413 CASAVA_Build 9 23674946 4D AAACTTTATT AAAG/---- AAAAAAGCAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 AAAG 1 0 339414 CASAVA_Build 9 23675393 1D CTCTGGGTCT G/- GCTCATACAT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 G 2 1 339415 CASAVA_Build 9 23676181 2D AATTACTACT AC/-- ACCTAAGGCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 AC 2 1 339416 CASAVA_Build 9 23685426 1D CCAAGCATAC G/- GCCCAGAGAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 2 1 339417 CASAVA_Build 9 23716814 1D ACTATTTAGA T/- TTTTTTCAAT 3070 hom 132 het 48 0 45 5 T 7 6 339418 CASAVA_Build 9 23721339 1I GCTGTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 12 11 A 10 11 339419 CASAVA_Build 9 23729784 2I CCTGTGCCTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 36 18 10 8 CA 5 6 339420 CASAVA_Build 9 23730106 2I CCCAAAAGTT --/AA AAAGGTTCAC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 3 5 339421 CASAVA_Build 9 23731777 2D CCCATACCTT TC/-- TCCCTTTGAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 2 TC 2 1 339422 CASAVA_Build 9 23739536 1I AACAGGGCAC -/A AAAATCCAAG 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 4 5 339423 CASAVA_Build 9 23767980 1D CCAGGTGGCC T/- ACTCTGAACA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 0 339424 CASAVA_Build 9 23798219 2D CCTCCCACAC TG/-- TGTTATAAGC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TG 2 1 339425 CASAVA_Build 9 23803411 1D TCATATCGGC T/- TTTTTTTTTT 1173 het 1173 ref 27 12 6 9 T 17 16 339426 CASAVA_Build 9 23830422 1I CCACAGGTGA -/T TTCTGATGAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 2 3 339427 CASAVA_Build 9 23860449 1D TACCCAACAA C/- TGCAGAAAAT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 C 1 0 339428 CASAVA_Build 9 23863892 1I CTATGGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 968 hom 30 4 20 6 A 13 14 339429 CASAVA_Build 9 23864531 1D AAGAAATAAA C/- GAGCCCATTC 3070 hom 135 het 50 0 45 5 C 1 0 339430 CASAVA_Build 9 23891222 3I AGAAGCAATG ---/ACA ACAACAACAG 3070 hom 81 het 38 0 28 10 ACA 3 4 339431 CASAVA_Build 9 23900545 1D TAGTCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 5 A 11 10 339432 CASAVA_Build 9 23900812 1I CCCATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 467 hom 32 2 24 6 A 10 11 339433 CASAVA_Build 9 23901053 1D ACTAACCCTC A/- AAAAAACATT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 7 6 339434 CASAVA_Build 9 23917508 1I TTGCAATGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 773 hom 51 3 36 12 T 9 10 339435 CASAVA_Build 9 23928202 1D CCTAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 2295 het 38 hom 12 1 9 3 A 20 19 339436 CASAVA_Build 9 23929980 1I CAGCTATGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 G 0 1 339437 CASAVA_Build 9 23931429 2D AAGGATAAGG TT/-- ATAAGGGCAA 3070 hom 108 het 42 0 36 7 T 2 0 339438 CASAVA_Build 9 23945226 3D GATAGCTAGA GAG/--- GAGAAGTCAA 3070 hom 117 het 44 0 39 9 GAG 2 1 339439 CASAVA_Build 9 23978603 2D CAGAGGGATA AT/-- ATAGCAGAGA 3070 het 3070 ref 24 13 10 1 AT 2 1 339440 CASAVA_Build 9 23986487 2D ACCAAAACAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 14 0 14 1 AT 7 6 339441 CASAVA_Build 9 23999979 1I TTTTCTTTAT -/A AAAATTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 4 5 339442 CASAVA_Build 9 24062338 2I CTAGGACAAA --/AT ATTTTATTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AT 1 2 339443 CASAVA_Build 9 24118353 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 12 11 339444 CASAVA_Build 9 24132378 1D TTCTTACACA T/- TTTTTTTTTT 2540 het 2540 ref 37 19 7 12 T 15 14 339445 CASAVA_Build 9 24135435 1D TGTAAAACAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 33 0 31 4 A 9 8 339446 CASAVA_Build 9 24145071 1D TGAGAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 11 10 339447 CASAVA_Build 9 24152204 1D CTCTTGAGCT C/- AGGTGACTCA 2718 het 2718 ref 27 18 7 2 C 1 0 339448 CASAVA_Build 9 24153015 13I AAATATTTTT -------------/GTATGTTTAGTTA GTATCCATAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 GTATGTTTAGTTA 0 1 339449 CASAVA_Build 9 24156229 3D TGTATACCAT ATG/--- ATGTTTTGAA 2675 het 2675 ref 18 11 6 5 ATG 2 1 339450 CASAVA_Build 9 24164345 1D GTATATACCC A/- AAGGACTGTA 1883 het 1883 ref 16 12 4 0 A 3 2 339451 CASAVA_Build 9 24171585 1D TATTATCATG T/- TTTTTGTACA 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 6 5 339452 CASAVA_Build 9 24178354 3D CAGATTTTTT TGC/--- TATCCAAAAT 3070 het 3070 ref 57 30 21 7 TGC 1 0 339453 CASAVA_Build 9 24184670 2I CTGCAAGTGC --/AA AGTGTCTGAA 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 1 3 339454 CASAVA_Build 9 24187014 1D TAATGCTTTC A/- GTTATTTTTC 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 1 0 339455 CASAVA_Build 9 24190006 1I TTGTTGAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 T 9 10 339456 CASAVA_Build 9 24191384 1D TCCACTAGAG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 9 8 339457 CASAVA_Build 9 24205669 1I TGGAAAATGG -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 6 7 339458 CASAVA_Build 9 24257832 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 516 hom 13 2 8 3 T 7 8 339459 CASAVA_Build 9 24267444 1I ACAGTAGCCA -/G CTGAAATTGC 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 G 0 1 339460 CASAVA_Build 9 24269027 1I CTGAGAAAAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 T 8 9 339461 CASAVA_Build 9 24276645 2I GGCTGACTGC --/AA AACCTCTGCC 2027 het 997 hom 8 3 5 0 A 2 4 339462 CASAVA_Build 9 24277348 2D TTCTATACTC TT/-- TGTTTGATTT 3070 het 3070 ref 45 27 14 4 T 3 1 339463 CASAVA_Build 9 24287921 1I ATTATCTGCT -/A AAAAGAAAAT 3070 het 3070 ref 62 31 26 5 A 4 5 339464 CASAVA_Build 9 24305488 1I TGGAGGCCTA -/C TTTTCCAGGA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 C 0 1 339465 CASAVA_Build 9 24312150 1D AAAAAAAAAA T/- TAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 29 11 18 0 T 2 1 339466 CASAVA_Build 9 24315697 1I GTAGAAAGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 9 10 339467 CASAVA_Build 9 24323293 1D GTATTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 G 1 0 339468 CASAVA_Build 9 24327310 10I TATGTATATC ----------/TCTATATATA TCTCTATATA 2758 het 2758 ref 19 12 6 1 TCTATATATA 0 1 339469 CASAVA_Build 9 24343246 2D GGTTACAAAC AG/-- AGAGAGGGGG 3070 het 3070 ref 64 30 28 6 AG 4 3 339470 CASAVA_Build 9 24345653 4I GTTTCCTTAG ----/AAAT AAATACCTGA 3070 het 3070 ref 41 16 17 8 AAAT 1 2 339471 CASAVA_Build 9 24420578 2D CACAAGATCC TA/-- CATATAGTGA 3070 het 3070 ref 36 18 18 2 TA 1 0 339472 CASAVA_Build 9 24431050 1I GACAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 770 het 770 ref 55 37 3 15 T 10 11 339473 CASAVA_Build 9 24431550 1D CCTTTGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 29 2 13 14 T 19 18 339474 CASAVA_Build 9 24439329 1I TCCTACGGCC -/A AAAAAAAAAA 1500 het 1500 ref 35 19 4 12 A 15 16 339475 CASAVA_Build 9 24472752 1D ATGGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1373 het 1373 ref 43 29 5 9 T 13 12 339476 CASAVA_Build 9 24474968 1D TATTTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 1571 het 1571 ref 35 28 4 3 T 11 10 339477 CASAVA_Build 9 24484294 1I AAGATTAGCA -/T TTTTTTTTTC 2925 het 2925 ref 24 14 6 4 T 9 10 339478 CASAVA_Build 9 24491075 18D GTGTGCGCTC TCTCTGTCTCTCTGCCTG/------------------ TCTGTTTCTC 2656 het 2656 ref 27 17 8 4 TCTCTGTCTCTCTGCCTG 1 0 339479 CASAVA_Build 9 24491156 1I TTTTCGTTTG -/T TTTTTTTTCT 2423 het 2423 ref 15 8 6 1 T 8 9 339480 CASAVA_Build 9 24494157 2I CATTTATGGG --/TT TTTTTTTTTT 2454 het 2454 ref 25 13 6 6 T 10 12 339481 CASAVA_Build 9 24508148 1I CTTAATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 10 13 10 T 13 14 339482 CASAVA_Build 9 24578617 4I TCACTCACCT ----/CTCA CTCACTGACT 3070 hom 135 het 47 0 46 1 CTCA 1 2 339483 CASAVA_Build 9 24580161 1I AGAAAATTGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 9 10 339484 CASAVA_Build 9 24601241 1D GCAGATAGAA G/- GTTGCTAGGT 3070 het 3070 ref 33 14 16 5 G 2 1 339485 CASAVA_Build 9 24604001 1I GATTTACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1552 hom 36 4 25 7 T 14 15 339486 CASAVA_Build 9 24623671 1D GCCTTCCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2644 hom 28 10 13 6 A 14 13 339487 CASAVA_Build 9 24625372 1D CGATGTTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 13 12 339488 CASAVA_Build 9 24625671 1I AATGGCACTG -/C CTAGGTTTTC 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 C 1 2 339489 CASAVA_Build 9 24634992 1D TAGTGCTTCC T/- TCAGGAGCTC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 T 2 1 339490 CASAVA_Build 9 24637424 4I ATATATATAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 AC 5 7 339491 CASAVA_Build 9 24637896 2D CTGAAGGTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 46 21 20 6 TG 8 7 339492 CASAVA_Build 9 24642405 1D ACAAAGGCAC T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 T 7 6 339493 CASAVA_Build 9 24644320 4D AAGAAATCTT TGAC/---- TGACTCAAGA 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 TGAC 2 1 339494 CASAVA_Build 9 24659953 1I TTAAAAAGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 7 8 339495 CASAVA_Build 9 24704999 1D CTTTAGGAGA T/- TTTTTTTTTT 1716 het 1716 ref 30 23 4 3 T 12 11 339496 CASAVA_Build 9 24709704 1D AAGAGTCTGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 9 8 339497 CASAVA_Build 9 24710314 1I TTCCAACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1145 hom 43 5 30 8 A 12 13 339498 CASAVA_Build 9 24713074 1D GCCAAATGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 10 9 339499 CASAVA_Build 9 24739554 1D AAAATCAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 11 10 339500 CASAVA_Build 9 24752010 1D TAAAAAAAAA C/- CAGTTTCTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 2 1 339501 CASAVA_Build 9 24774228 1D TGTGTTTGGG A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 16 8 A 2 1 339502 CASAVA_Build 9 24823045 18I GCAAAACCTT ------------------/ACACACATAAACTTACAC ACACACATCT 3070 hom 105 het 45 0 36 10 ACACACATAAACTTACAC 0 1 339503 CASAVA_Build 9 24823056 2I17M2I3M1D CACACATCTA --TACCTACACACATCTAT--CTAT/CTTACACACACACATCTATACCTA- CAATCATCTA 3070 het 3070 ref 42 21 14 18 N/A 0 0 339504 CASAVA_Build 9 24898122 4I TTGTATAAAT ----/AAAA ATATATATAT 3070 het 1775 hom 15 5 9 1 A 1 5 339505 CASAVA_Build 9 24898946 4I GAGAAATGAG ----/GAAA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 GAAA 0 1 339506 CASAVA_Build 9 24899706 2I TTCATTACTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 10 12 339507 CASAVA_Build 9 24901396 1I GCAATAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 13 14 339508 CASAVA_Build 9 24920925 1D AATATATTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 9 8 339509 CASAVA_Build 9 24939086 1I AAAGTTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 977 hom 34 7 20 7 T 14 15 339510 CASAVA_Build 9 24951149 1D GGGATGAGTA T/- GGGGAAGAGA 3070 het 3070 ref 60 35 22 5 T 1 0 339511 CASAVA_Build 9 24951797 1D CACAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 16 10 A 15 14 339512 CASAVA_Build 9 24973748 2D TAATGACAGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 T 11 9 339513 CASAVA_Build 9 24978786 4I TATTACTGTG ----/TTGC TTGCTGTCTA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 TTGC 1 2 339514 CASAVA_Build 9 24979864 1D CTATGACAAA C/- CCATGGCCAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 C 3 2 339515 CASAVA_Build 9 24988689 1I AAACAGCCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 A 9 10 339516 CASAVA_Build 9 24995599 1D GGAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 10 9 339517 CASAVA_Build 9 25015032 1I AGAACCAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 456 hom 18 1 16 1 A 9 10 339518 CASAVA_Build 9 25016846 1D CTGTTATAAG T/- TTACAGATTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 3 2 339519 CASAVA_Build 9 25047946 6D GATCAGAGAC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2656 het 2656 ref 22 12 6 5 A 17 11 339520 CASAVA_Build 9 25053544 1D CTTGGCCCAC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 T 9 8 339521 CASAVA_Build 9 25055443 1D GTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 13 12 339522 CASAVA_Build 9 25069962 1D TTGCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 1532 het 1532 ref 38 26 7 5 T 15 14 339523 CASAVA_Build 9 25076105 3I TAACTTTTTA ---/TTC TTATGAGCAA 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 TTC 0 1 339524 CASAVA_Build 9 25077049 4D AAATTTATGC TTTG/---- TTGTATACAG 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 TTTG 1 0 339525 CASAVA_Build 9 25082272 3D ATTTTAAAAA CAT/--- CATAAGAAAA 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 CAT 2 1 339526 CASAVA_Build 9 25084391 1D TGTTTGTATA T/- TTCAAGGTGA 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 T 3 2 339527 CASAVA_Build 9 25086955 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2783 het 2753 hom 28 11 11 6 T 13 12 339528 CASAVA_Build 9 25089212 4D TTGTCCTTGA GTGC/---- GTATTTCCCT 2844 het 2844 ref 15 8 7 0 GTGC 1 0 339529 CASAVA_Build 9 25089294 6I TGTATAATAT ------/ATAAAG ATAAACTGAT 2843 het 2843 ref 20 12 6 2 ATAAAG 0 1 339530 CASAVA_Build 9 25089857 2D23M6D TATATATGTG TATATATGTGTGTGTATATATATACATACAT/--TATATGTGTGTGTATATATATAC------ ATACATATAC 3070 het 3070 ref 26 16 13 4 N/A 0 0 339531 CASAVA_Build 9 25114249 1I AAATATTTTT -/G ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 G 0 1 339532 CASAVA_Build 9 25114897 1I ATTTTCTGCA -/T TTTTTTTCTA 2717 het 2717 ref 17 8 8 1 T 7 8 339533 CASAVA_Build 9 25115621 1D CAAATTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 T 11 10 339534 CASAVA_Build 9 25178296 6D AAGGAGTGAC TATAAG/------ TATAAGGAAA 3070 hom 123 het 45 0 41 7 TATAAG 2 1 339535 CASAVA_Build 9 25179021 1I TTAAAAGTTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 8 9 339536 CASAVA_Build 9 25179272 1D CACAAGATAA C/- CATCCATACT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 2 1 339537 CASAVA_Build 9 25180220 4D TAAAATATCC ACTT/---- ACTCTTTTAA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 ACTT 1 0 339538 CASAVA_Build 9 25189164 5I CAGTAATCTT -----/TTAAC AAGAGTTTAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TTAAC 0 1 339539 CASAVA_Build 9 25191193 1I84M3D TTTATGGTAT -AACTAAATATAACTAAAATCATTGATGATAAAATAAGATCATGAATCACAGAATGGATAACTGGCACTAATGCATTCAAAATATAGG/AAACTAAATATAACTAAAATCATTGATGATAAAATAAGATCATGAATCACAGAATGGATAACTGGCACTAAGGCATTCAAAATAT--- AGAATAAAGC 3070 hom 172 het 37 0 58 16 N/A 0 0 339540 CASAVA_Build 9 25198388 11D AATTATTAAT GCCATACAAAG/----------- TCAATTGAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GCCATACAAAG 1 0 339541 CASAVA_Build 9 25201262 3I TTTTCATGTT ---/AAC AAACATTTAC 3070 hom 72 het 27 0 24 3 AAC 0 1 339542 CASAVA_Build 9 25208089 1D GATTTATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 109 het 46 0 38 9 A 11 10 339543 CASAVA_Build 9 25208529 1I TTAGGATGGG -/A AAAAAAGGTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 6 7 339544 CASAVA_Build 9 25214136 2I ATATCTTTAC --/TA TATATATATA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 6 7 339545 CASAVA_Build 9 25234162 1I7M2I AAGAATTCAA -GCACAAA--/TTCACAAATG TCACAAAATG 3070 het 3070 hom 36 17 18 2 N/A 0 0 339546 CASAVA_Build 9 25270290 1I ACTCCGACTC -/A AAAAAAAAAA 1997 het 1997 ref 20 8 9 3 A 16 17 339547 CASAVA_Build 9 25271619 1D TATTAAATTA T/- TTTTATCAGA 3070 hom 111 het 38 0 38 1 T 5 4 339548 CASAVA_Build 9 25273426 1I TTCTAACTAA -/T TTTTTTTTTT 1043 het 1043 ref 35 20 4 11 T 13 14 339549 CASAVA_Build 9 25277792 4D ATGAATGCAT ACTA/---- ACTCAGTTTA 3070 het 3070 ref 53 25 26 4 ACTA 1 0 339550 CASAVA_Build 9 25287444 16D GAAAAATGAT TAGATAGATAGATAGA/---------------- TAGATAGATA 3070 het 369 hom 31 2 19 12 TAGA 9 5 339551 CASAVA_Build 9 25295355 2I AATATCTAAC --/AA GAGCAATCTT 3070 hom 141 het 55 0 47 8 A 0 2 339552 CASAVA_Build 9 25302557 1D AGGTCAAACA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 T 8 7 339553 CASAVA_Build 9 25310840 1I GATTATTGAA -/G ACTTGCCATT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 0 1 339554 CASAVA_Build 9 25337539 1D AAGTAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 18 22 11 A 11 10 339555 CASAVA_Build 9 25340925 5I AATTGTCTAC -----/CAGAG CAGAAACAGA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 CAGAG 0 1 339556 CASAVA_Build 9 25371925 5D GATTATACTC AAATT/----- AATTATTTTA 3070 het 3070 ref 31 16 11 6 AAATT 1 0 339557 CASAVA_Build 9 25377634 5D AATTAAGTTT TACAA/----- TACAATTCTT 3070 het 3070 ref 53 25 22 6 TACAA 2 1 339558 CASAVA_Build 9 25380607 31I CTCTTACTTC -------------------------------/TTTGTAGAATTATTAAAATCAGGTTCTCTGG TTTTATGTCC 3070 het 3070 ref 17 9 8 1 TTTGTAGAATTATTAAAATCAGGTTCTCTGG 0 1 339559 CASAVA_Build 9 25380852 1D AGCCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1081 hom 21 6 10 6 A 15 14 339560 CASAVA_Build 9 25381172 4I TTATTGCTAC ----/TTCT TTAAGTGTCT 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 TTCT 0 1 339561 CASAVA_Build 9 25381563 1I CCTGTCTCCA -/T GATTCAATTA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 0 1 339562 CASAVA_Build 9 25382052 4I TATAAGGTAC ----/ATTA ATTAATATTT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 ATTA 1 2 339563 CASAVA_Build 9 25387846 4D CAGGTCCTCA TTTT/---- TTTTTTTTTT 1516 het 439 hom 29 4 6 19 T 22 18 339564 CASAVA_Build 9 25389157 1I TCCTGGATAA -/G ATGAAACAAC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 G 0 1 339565 CASAVA_Build 9 25390851 3D GACTATGATG GAA/--- GAAGGGCTTA 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 GAA 2 1 339566 CASAVA_Build 9 25391763 1D TACTAATCCC T/- TTTTTCAGGT 3070 het 3070 ref 47 24 14 9 T 6 5 339567 CASAVA_Build 9 25392562 1D ATCAGTGCAC A/- AGAGTTGTAA 3070 het 3070 hom 48 21 22 6 A 2 1 339568 CASAVA_Build 9 25393985 1D ACATAGTTTG T/- TAAGTATAAG 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 2 1 339569 CASAVA_Build 9 25394642 4D TTCTTATGAG TATT/---- TAAGGCTTTA 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 TATT 1 0 339570 CASAVA_Build 9 25395157 1I TTCCTCTACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 9 10 339571 CASAVA_Build 9 25402442 1D TTATATAGTA T/- TTATCATTTT 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 T 3 2 339572 CASAVA_Build 9 25405794 1I TTTAACTGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 8 9 339573 CASAVA_Build 9 25408959 31D CAAACATATT GTCATATGTTTGACATATGACAAAAAATATG/------------------------------- TTGTCATTCC 3070 het 3070 hom 27 17 24 2 GTCATATGTTTGACATATGACAAAAAATATG 1 0 339574 CASAVA_Build 9 25414070 1I CGTAAAAAAA -/T GTATCAGAAT 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 T 0 1 339575 CASAVA_Build 9 25422033 1D ACCAGGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 726 hom 32 2 19 12 A 13 12 339576 CASAVA_Build 9 25424649 1I GAAGACATCA -/T TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 44 32 3 9 T 10 11 339577 CASAVA_Build 9 25447041 1D AATGACTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 284 hom 43 1 21 21 A 19 18 339578 CASAVA_Build 9 25449825 1I GTTATTACTA -/T TTTTTTTTTT 800 het 800 ref 41 33 3 5 T 11 12 339579 CASAVA_Build 9 25455676 4I TTTCCTCATG ----/TTCT TTCTTTGACT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TTCT 1 2 339580 CASAVA_Build 9 25458964 1D GACTTACTGA T/- TTTTTTGGAG 3070 het 3070 ref 28 15 10 6 T 7 6 339581 CASAVA_Build 9 25459130 1I TGATTTGGAC -/A ATTTAGTGCT 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 A 1 2 339582 CASAVA_Build 9 25464705 8I ACATTAAAGG --------/TGGGATTT AACCTCTGAC 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 TGGGATTT 0 1 339583 CASAVA_Build 9 25465623 4D AATGGATGGG TGAA/---- TGAATGAATA 3070 het 3070 ref 47 27 16 5 TGAA 3 2 339584 CASAVA_Build 9 25470024 1D TTTCTGTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 10 9 339585 CASAVA_Build 9 25490567 1D CAAGCCTTTA T/- TTTTCTCTTT 3070 het 3070 hom 37 17 19 3 T 5 4 339586 CASAVA_Build 9 25491744 1D GCCTCGGAGG A/- AAAAAAAATG 1261 het 1261 ref 25 16 3 7 A 9 8 339587 CASAVA_Build 9 25494359 3I TATCATACTC ---/CTT CTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 CTT 1 2 339588 CASAVA_Build 9 25502050 1I CTATTTTTTT -/A AAAAATCAGT 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 5 6 339589 CASAVA_Build 9 25502910 1I ATCAGTGTGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 8 9 339590 CASAVA_Build 9 25508091 2D GTATATATAT AC/-- ACACACACAT 1961 het 1907 hom 22 10 9 3 AC 5 4 339591 CASAVA_Build 9 25510769 1I AATATAGACC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 A 8 9 339592 CASAVA_Build 9 25510854 2D TAGTTGTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 39 4 13 22 A 16 14 339593 CASAVA_Build 9 25514356 1D GGAGTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 T 11 10 339594 CASAVA_Build 9 25515566 1D TTTTGTTATG T/- TTTTTCAAAG 3070 het 3070 ref 27 17 7 4 T 6 5 339595 CASAVA_Build 9 25519914 2D AGACATTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 10 15 A 16 14 339596 CASAVA_Build 9 25528368 1D GTTCGGATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 10 9 339597 CASAVA_Build 9 25539389 1I AGGTTTCCTG -/C TGTTCCTCAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 C 0 1 339598 CASAVA_Build 9 25548200 2I GTATCAAGAT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 A 9 11 339599 CASAVA_Build 9 25549013 3D GAGTTCAATC CTT/--- CTTATTGCTG 3070 het 3070 hom 30 12 17 2 CTT 2 1 339600 CASAVA_Build 9 25549249 1D AAACTTCTAA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 38 24 10 4 T 7 6 339601 CASAVA_Build 9 25549554 1I ATTGAAAACT -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 G 1 2 339602 CASAVA_Build 9 25550846 1D TGCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 11 9 A 12 11 339603 CASAVA_Build 9 25551662 3D CACTCCCTCT CAA/--- CAACAACAAC 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 CAA 7 6 339604 CASAVA_Build 9 25556060 1D CCACCACCAC T/- GAACATATTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 1 0 339605 CASAVA_Build 9 25556763 4D GTAAGTGCTC AATA/---- AATATTTGCT 3070 het 3070 ref 42 23 18 2 AATA 2 1 339606 CASAVA_Build 9 25558818 1D TCAAATAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 37 0 26 11 T 13 12 339607 CASAVA_Build 9 25568562 1D AGAATTTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 24 het 39 1 35 3 T 10 9 339608 CASAVA_Build 9 25569039 2D AACTATTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 T 14 12 339609 CASAVA_Build 9 25570330 1I TATAGATCTC -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 8 9 339610 CASAVA_Build 9 25576917 1D TAAGTGGAAA C/- TAAACATTGA 3070 het 3070 ref 50 24 18 10 C 1 0 339611 CASAVA_Build 9 25577140 1I AATAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 A 10 11 339612 CASAVA_Build 9 25582118 2D ATTAGGTAAC AT/-- ATAGAATAAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 4 AT 2 1 339613 CASAVA_Build 9 25583856 5I TAATTTTGTT -----/AAATC AAGGAGGCCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 AAATC 0 1 339614 CASAVA_Build 9 25587837 4D TATAACAGAG AGAT/---- AGATAATAAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 AGAT 2 1 339615 CASAVA_Build 9 25590780 2D6M2D GTTATGAAAC TGTATGTGTA/--TATGTG-- TATATATATG 3070 het 3070 ref 37 18 17 5 N/A 0 0 339616 CASAVA_Build 9 25592707 1D AACAACAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 17 18 10 A 10 9 339617 CASAVA_Build 9 25596918 3I CAGTATTTAA ---/TTG TTATTTGAAT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 TTG 0 1 339618 CASAVA_Build 9 25602154 2I CCACCATAGA --/GT GTGTGGTATT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 GT 2 3 339619 CASAVA_Build 9 25603091 2D ATATATATCA TT/-- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 T 10 8 339620 CASAVA_Build 9 25604745 48D GTACATTATT AAAATAGGTAATTCCTATTTATGATAAATAGGTAATTCCTATTTATGA/------------------------------------------------ TAAATAGGTA 3070 het 3070 ref 25 22 13 2 AAAATAGGTAATTCCTATTTATGATAAATAGGTAATTCCTATTTATGA 1 0 339621 CASAVA_Build 9 25623740 1I TTTCCCAAAA -/T TATACCAGAA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 T 1 2 339622 CASAVA_Build 9 25624900 2D TTTTTTTTTT TC/-- TTGAGATAGA 3070 het 136 hom 25 4 14 8 TC 1 0 339623 CASAVA_Build 9 25628505 3I TACCAAAGTC ---/TAT TATTATTGTA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TAT 2 3 339624 CASAVA_Build 9 25632791 1D AATTTTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 8 T 14 13 339625 CASAVA_Build 9 25635891 4I TAATGTAAAA ----/TAAC TATTCAAGAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TAAC 0 1 339626 CASAVA_Build 9 25645792 5D AATATACTTT CTTAA/----- CTTAAGAAGT 3070 hom 93 het 32 0 32 4 CTTAA 2 1 339627 CASAVA_Build 9 25646493 6I GTTCATGGTT ------/TGACTC TGAAACAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TGACTC 0 1 339628 CASAVA_Build 9 25646799 1D AGAAGACATT A/- AAAAAAAAAA 1679 het 721 hom 16 2 5 9 A 15 14 339629 CASAVA_Build 9 25650515 5I TTTAAGACTT -----/TAATC TATAAGTTAA 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 TAATC 0 1 339630 CASAVA_Build 9 25650945 1D ACAATATATG T/- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 T 8 7 339631 CASAVA_Build 9 25651658 1D TTTAGTCAAC T/- TGAGCCAAGT 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 2 1 339632 CASAVA_Build 9 25651743 4I TCCCAAAATA ----/ATCT ATCTATCTAT 3070 het 3070 ref 37 22 15 1 ATCT 3 4 339633 CASAVA_Build 9 25653182 2I ATTTAAAGAG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 46 19 20 7 AT 5 6 339634 CASAVA_Build 9 25666181 1D CACCTCGTGA C/- CCCCCCACTC 3070 hom 40 het 15 0 14 1 C 7 6 339635 CASAVA_Build 9 25667300 1D AAAATACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 A 11 10 339636 CASAVA_Build 9 25670564 5I AATAATACTT -----/AAAAG AAAACATATA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AAAAG 0 1 339637 CASAVA_Build 9 25674760 1D TGTAGTACCT C/- CCCCCCACCT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 C 7 6 339638 CASAVA_Build 9 25687377 1I TTTAGTATAC -/A AAAAAAAAAA 1053 het 1053 ref 29 21 3 5 A 13 14 339639 CASAVA_Build 9 25706711 2D CCGCTGCCTG CT/-- CTCTCTCTCT 1015 het 1015 ref 55 34 3 19 CT 9 8 339640 CASAVA_Build 9 25731342 2D TTCCAATAAC AT/-- GTGCTCATTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 AT 1 0 339641 CASAVA_Build 9 25733474 1D GACTGGGGGC G/- GGGGGGGTCT 3070 het 3070 ref 26 13 10 4 G 8 7 339642 CASAVA_Build 9 25733575 1D CTGAAATTTG T/- TTTTTTTTTT 2470 het 2135 hom 12 5 6 1 T 11 10 339643 CASAVA_Build 9 25733660 1I ACGTATGTAT -/C ACATGTGCCA 2479 hom 12 het 5 0 5 0 C 0 1 339644 CASAVA_Build 9 25738437 2D ATAGGGCTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 20 22 8 A 14 12 339645 CASAVA_Build 9 25742979 1I GATATTTATT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 7 8 339646 CASAVA_Build 9 25759170 1D AGAAATGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 A 12 11 339647 CASAVA_Build 9 25760052 1I AACTTAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 42 0 33 9 A 10 11 339648 CASAVA_Build 9 25766932 2I TGGTTAGAAA --/AG ACTGATAATA 3070 hom 48 het 21 0 15 6 AG 0 1 339649 CASAVA_Build 9 25768822 1I GCTGAAAGTG -/A AAAAGCAGAA 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 A 4 5 339650 CASAVA_Build 9 25778982 1D CCAAAACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 12 11 339651 CASAVA_Build 9 25781964 3I ATTAATTGCA ---/TTG TTTATAGCCC 3070 het 3070 hom 43 17 25 1 TTG 0 1 339652 CASAVA_Build 9 25791193 11D TTTCTTCTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTGA 2673 het 1023 hom 15 4 7 4 T 19 8 339653 CASAVA_Build 9 25799446 1D AAGGCTATCC T/- TTTTTTTTTT 2634 het 535 hom 16 2 8 6 T 15 14 339654 CASAVA_Build 9 25800240 1D CATAAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2853 hom 28 11 12 5 T 13 12 339655 CASAVA_Build 9 25804378 8D TCCCCATGTC TGCAAATA/-------- TGCTATTAAA 3070 het 3070 ref 31 15 15 2 TGCAAATA 1 0 339656 CASAVA_Build 9 25815828 1D ACTATTCAAG T/- TTTTTTTTTT 1407 het 1407 ref 28 19 3 6 T 12 11 339657 CASAVA_Build 9 25826051 10D CCGTCTCTAC TAAAAATAAA/---------- CAAAAATTAG 1560 het 1560 ref 14 7 6 1 TAAAAATAAA 1 0 339658 CASAVA_Build 9 25856217 5I TTGTGACACT -----/GAGAA GAGACATCCA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 GAGAA 0 1 339659 CASAVA_Build 9 25875314 1I CCTGGCAGTT -/A ATCTCACCTC 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 A 1 2 339660 CASAVA_Build 9 25889646 1D TCTCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1277 het 1277 ref 21 13 3 6 A 12 11 339661 CASAVA_Build 9 25966906 5D TCAAAAGTTA GCTTT/----- ATCAAATCAG 3070 het 3070 ref 31 18 13 2 GCTTT 1 0 339662 CASAVA_Build 9 25967536 1I AAATATACAC -/A ATGCAGTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 1 2 339663 CASAVA_Build 9 25978275 2D AAGTGCACAC AT/-- ATGTTTTATT 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 AT 2 1 339664 CASAVA_Build 9 25991463 1I CAAATGCCCA -/T CAATCAATGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 0 1 339665 CASAVA_Build 9 25995610 1I CCTTCATGAC -/T TGAGACGGCA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 1 2 339666 CASAVA_Build 9 25997272 2I GTTTAAATGG --/CT CTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 CT 1 2 339667 CASAVA_Build 9 26023461 1I TTTTCTCCTC -/T TACTCTGTCC 3070 het 3070 hom 50 17 27 6 T 1 2 339668 CASAVA_Build 9 26023962 1D ATTCCAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 12 11 339669 CASAVA_Build 9 26026995 1I TGATCTCATG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 A 8 9 339670 CASAVA_Build 9 26028464 1D GAGAGTGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 812 hom 23 3 11 11 A 14 13 339671 CASAVA_Build 9 26073641 1I GAAGAAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 11 12 339672 CASAVA_Build 9 26076838 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 35 1 19 15 A 22 18 339673 CASAVA_Build 9 26077832 1D AGAAGAAAAG A/- GGGGGCAACA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 1 0 339674 CASAVA_Build 9 26080071 2D AATATATTTA AG/-- AGAAAATATT 3070 het 3070 ref 22 14 7 4 AG 2 1 339675 CASAVA_Build 9 26110106 1I ACAAACAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 12 12 12 A 11 12 339676 CASAVA_Build 9 26114727 1I CCCTCTCACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 11 16 0 A 9 10 339677 CASAVA_Build 9 26128714 11D GCTTGATTTT GAAATAATTTG/----------- GAAATAAATT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 GAAATAATTTG 1 0 339678 CASAVA_Build 9 26147808 1I TAAGTCAGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 9 10 339679 CASAVA_Build 9 26159564 1I AAAAGAGAAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 9 10 339680 CASAVA_Build 9 26172534 1D ACCTTATTTC A/- AAAAAAAAAA 1559 het 1529 hom 27 10 4 13 A 18 17 339681 CASAVA_Build 9 26175354 1D CAGGCTGGTC T/- TTTTTTTTTT 1473 het 608 hom 21 6 6 9 T 15 14 339682 CASAVA_Build 9 26180202 1D GCAGTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 10 13 9 A 12 11 339683 CASAVA_Build 9 26180309 1I AAAGTGCTGA -/G GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 G 4 5 339684 CASAVA_Build 9 26190903 1D TAAAGAGGTC A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 63 het 30 0 22 10 A 7 6 339685 CASAVA_Build 9 26192323 1D TAGATTCTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 120 het 42 0 41 1 T 9 8 339686 CASAVA_Build 9 26198936 2D TTGCTTAATT TA/-- TATATATATA 2113 hom 15 het 12 0 6 6 TA 7 6 339687 CASAVA_Build 9 26202150 1D TTGTAAATAC T/- TTTTTTTTTT 1483 het 1483 ref 29 14 5 11 T 19 18 339688 CASAVA_Build 9 26206932 1I ATCTTATCTC -/T TTTTCTACCT 3070 het 3070 ref 50 27 19 4 T 4 5 339689 CASAVA_Build 9 26208139 1D GGTCCTTGGC T/- TTTTTTTTTT 1099 het 1099 ref 40 31 3 6 T 12 11 339690 CASAVA_Build 9 26211442 1I AGAATACCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 A 9 10 339691 CASAVA_Build 9 26223975 1I TTTTAGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 13 14 339692 CASAVA_Build 9 26246013 1D TAACTCACCT C/- CCTAAGAGCT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 C 3 2 339693 CASAVA_Build 9 26248319 2D GTATTATGAC AT/-- AAATGTTAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 AT 1 0 339694 CASAVA_Build 9 26255241 1I ATGTCTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 T 11 12 339695 CASAVA_Build 9 26257020 1D TTCCTACCAC A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 42 13 25 4 A 7 6 339696 CASAVA_Build 9 26305999 1D CCTTTTACTT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 9 8 339697 CASAVA_Build 9 26342604 1D AAATCGGTAA G/- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 1 0 339698 CASAVA_Build 9 26353374 2D TGACAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 38 0 32 7 A 14 12 339699 CASAVA_Build 9 26355873 1D AAACATGCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 9 8 339700 CASAVA_Build 9 26366555 2D GATTTACAAC AA/-- AAGTCACTGA 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 4 2 339701 CASAVA_Build 9 26402846 1I GGTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 2733 het 2733 ref 33 16 10 7 T 10 11 339702 CASAVA_Build 9 26420392 2D ATGATATAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 13 11 339703 CASAVA_Build 9 26423206 1D GGATAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 654 hom 35 2 25 8 A 13 12 339704 CASAVA_Build 9 26423219 1D AAAAAAAAAA C/- AGCTCAAAGA 3070 het 882 hom 36 7 24 5 C 1 0 339705 CASAVA_Build 9 26461371 1D TCTTGGGTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 13 18 11 A 10 9 339706 CASAVA_Build 9 26469732 1I TTATCTGTGT -/C CCTGCAAAGC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 C 2 3 339707 CASAVA_Build 9 26472842 1I AAATAAGAAT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 8 9 339708 CASAVA_Build 9 26475490 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 2220 hom 19 het 10 0 7 3 T 10 9 339709 CASAVA_Build 9 26486321 1D ACATTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 21 1 9 11 T 11 10 339710 CASAVA_Build 9 26486332 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAGC 2838 hom 18 het 17 0 7 10 A 8 9 339711 CASAVA_Build 9 26488148 1I ATAGACAAAT -/G GGGTTATACC 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 G 3 4 339712 CASAVA_Build 9 26497967 1I TCTTGAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 T 11 12 339713 CASAVA_Build 9 26500459 1I AAGCTGTTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 8 9 339714 CASAVA_Build 9 26502185 1I ATAAAATGAC -/T CTCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 0 1 339715 CASAVA_Build 9 26503293 1D GTTGTGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 T 14 13 339716 CASAVA_Build 9 26508307 1D TTCACTTAAT A/- ACATATTGAA 3070 het 3070 ref 57 27 27 5 A 2 1 339717 CASAVA_Build 9 26510903 4D AGTAAGTAGG TATA/---- TATATATATA 2482 het 521 hom 10 2 6 2 TA 10 8 339718 CASAVA_Build 9 26525874 1D GAAGTATCAG A/- AAAGACCACT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 4 3 339719 CASAVA_Build 9 26527157 3D CCTACCCCAC CTT/--- CTCACTGGGG 3070 het 3070 ref 38 21 11 9 CTT 1 0 339720 CASAVA_Build 9 26533579 2D GCAGCATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2648 hom 25 11 12 3 A 14 12 339721 CASAVA_Build 9 26536027 1D ATGTCTATGG A/- AAAGGCCTTT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 4 3 339722 CASAVA_Build 9 26540811 1D CCTGTTGTTG A/- AAATTGGATT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 4 3 339723 CASAVA_Build 9 26556576 2I TCACCATAGT --/CA CACTAGAAAC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CA 1 2 339724 CASAVA_Build 9 26558239 1D CAAGGGTTTC A/- AAGTTCTCAA 3070 hom 123 het 50 0 42 9 A 3 2 339725 CASAVA_Build 9 26558676 1D ATTAAGTGAA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 9 8 339726 CASAVA_Build 9 26561027 1D TCAAATTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 39 1 34 4 A 11 10 339727 CASAVA_Build 9 26566477 1I TTTCCTCTTC -/T TTTCACTTAT 3070 hom 77 het 29 0 25 4 T 3 4 339728 CASAVA_Build 9 26566625 1I AAAGAGAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 8 9 339729 CASAVA_Build 9 26581581 1I ACCATCAGAT -/C ACATGAGATG 3070 hom 138 het 49 0 46 3 C 0 1 339730 CASAVA_Build 9 26584201 6D TTTTCTTTTC TTTTCT/------ TTTTTTTTTT 1914 hom 28 het 11 0 8 4 TTTTCT 1 0 339731 CASAVA_Build 9 26604729 1D GTTCATAATG T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 63 het 30 0 22 11 T 7 6 339732 CASAVA_Build 9 26628463 1I GAGGGTACTT -/G GGGGTAGGGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 4 5 339733 CASAVA_Build 9 26634897 1D CTTAGATTGC A/- AAAAAAAAAA 2294 het 2294 ref 19 8 7 4 A 17 16 339734 CASAVA_Build 9 26635588 1D TGTAATCAGG A/- AAAAAAAAAA 2076 het 2076 ref 22 10 8 4 A 11 10 339735 CASAVA_Build 9 26643647 3I GGGAATCAAA ---/GAT GATGAAGAAA 3070 het 3070 hom 65 27 32 6 GAT 1 2 339736 CASAVA_Build 9 26648367 1D GACAAAGGAG A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 7 6 339737 CASAVA_Build 9 26659146 1I ATATACGTTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 8 9 339738 CASAVA_Build 9 26660498 1I CTAAAGCAGT -/G GCTGTACCTT 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 G 1 2 339739 CASAVA_Build 9 26660844 1I TCTAAAACCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 8 9 339740 CASAVA_Build 9 26663997 1I TTCCTCCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 A 9 10 339741 CASAVA_Build 9 26667041 1I GAGGATGAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 9 10 339742 CASAVA_Build 9 26668932 2D ATTTTTAATC CT/-- CTCTCTCTCT 1753 het 1753 ref 41 27 4 10 CT 6 5 339743 CASAVA_Build 9 26683960 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2371 hom 34 14 13 7 A 13 12 339744 CASAVA_Build 9 26685569 1I TTCATGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 A 10 11 339745 CASAVA_Build 9 26693817 1I CTGGTGGGAG -/A AAAAAAAAAA 2315 het 2315 ref 29 12 10 7 A 13 14 339746 CASAVA_Build 9 26708154 1I CTAGAATGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 9 10 339747 CASAVA_Build 9 26713152 2D TCTGTTTCGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1864 hom 31 14 12 5 A 18 16 339748 CASAVA_Build 9 26730606 4D AGCAATACCA ATAC/---- ATACTGGGTA 3070 het 3070 ref 23 14 9 2 ATAC 2 1 339749 CASAVA_Build 9 26738772 1D ACATCAGACT C/- CCAGGTCCTT 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 C 3 2 339750 CASAVA_Build 9 26750158 1I TTTGCTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 532 hom 32 2 23 7 A 13 14 339751 CASAVA_Build 9 26789822 1D ACTCCAGTTG T/- TTAAGCTACC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 2 339752 CASAVA_Build 9 26812936 1I ACCCCCCAAA -/T TGCAGAATTT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 1 2 339753 CASAVA_Build 9 26814788 1D TTTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1700 het 1700 ref 24 18 4 2 A 11 10 339754 CASAVA_Build 9 26823055 1D AATTGAAAAC A/- GGGGGATTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 0 339755 CASAVA_Build 9 26836414 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2895 hom 27 het 11 0 10 2 A 24 13 339756 CASAVA_Build 9 26868812 1D GACAGTGTCT A/- AAAAAAAAAA 1115 het 1115 ref 46 34 4 8 A 13 12 339757 CASAVA_Build 9 26870093 2D AAAAAAATCC GG/-- GGGGGGGGGG 2256 het 25 hom 19 0 6 14 G 12 10 339758 CASAVA_Build 9 26897035 1D CATTTTATTG A/- AAAAAAAAAA 1718 het 1718 ref 33 20 5 9 A 16 15 339759 CASAVA_Build 9 26897460 11D CCGGGAGGCG GAGCTTGCAGT/----------- GAGCTTGCAG 2635 hom 21 het 8 0 7 1 GAGCTTGCAGT 2 1 339760 CASAVA_Build 9 26905212 1D CTCTGACTCG A/- AAAAAAAAAA 1498 het 1498 ref 27 16 4 7 A 13 12 339761 CASAVA_Build 9 26952925 1D ACTTTACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 13 12 339762 CASAVA_Build 9 26972271 1D GCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 9 339763 CASAVA_Build 9 26976151 4D GTGTTACAAG AAAT/---- AAACATTCTA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 AAAT 1 0 339764 CASAVA_Build 9 27016958 1D CAAAAGAAAA G/- GAAATTACAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 G 2 1 339765 CASAVA_Build 9 27031067 2D ACAGTAGCCC CA/-- GTCTTTTGTT 3070 het 3070 hom 46 21 23 5 CA 1 0 339766 CASAVA_Build 9 27058531 1I AACAATACTT -/C CATGACCTCA 3070 het 3070 hom 32 14 18 0 C 1 2 339767 CASAVA_Build 9 27091973 1D TGATGGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 469 hom 50 2 40 9 A 12 11 339768 CASAVA_Build 9 27093850 2D GACATTTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 37 0 25 12 T 14 12 339769 CASAVA_Build 9 27096708 2D GGGAGGCCAA GG/-- GGGGGGGGGG 3070 het 29 hom 13 1 10 2 G 13 11 339770 CASAVA_Build 9 27097943 1I ACTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 19 1 18 0 T 11 12 339771 CASAVA_Build 9 27099973 1D13M4D TTCTTATTGA TTTTTTTTTTAAAGAACA/-TTTTTTTTTAAAG---- AACCGGTTTT 3070 hom 99 het 33 0 34 3 N/A 0 0 339772 CASAVA_Build 9 27100171 2I AATTGTAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 37 0 25 12 T 12 14 339773 CASAVA_Build 9 27100916 1D CCATTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 10 T 11 10 339774 CASAVA_Build 9 27101242 1D AGGAAGTAGG T/- TCATGTTCTT 3070 hom 169 het 62 0 57 7 T 2 1 339775 CASAVA_Build 9 27101532 1D CCACAGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 28 1 21 6 A 13 12 339776 CASAVA_Build 9 27101737 4I TCCCTACTCT ----/TCTA TCCTCATAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TCTA 0 1 339777 CASAVA_Build 9 27109598 12D TGCTAAAAAT GTGGAGAGTCGG/------------ GTGGAGAGTC 3070 hom 79 het 32 0 27 8 GTGGAGAGTCGG 2 1 339778 CASAVA_Build 9 27109889 4I GTGCACATGC ----/GTGT GTGTGTGTGT 3070 het 372 hom 56 1 41 14 GT 6 8 339779 CASAVA_Build 9 27113815 1D CACTGTGTCA C/- CCAGGCAAAA 2646 het 2646 ref 30 18 7 5 C 3 2 339780 CASAVA_Build 9 27125108 1I CTGTAATCCC -/A GCTACTTGGG 3070 het 2600 hom 26 6 16 4 A 0 1 339781 CASAVA_Build 9 27125764 9D CTGGTCTATC TCAGAGCAG/--------- ACCTTAATCT 3070 het 3070 ref 49 36 13 3 TCAGAGCAG 1 0 339782 CASAVA_Build 9 27127222 2I GGCCTAAATC --/TT TATCTTTTGA 2340 het 2340 ref 17 8 6 3 T 1 3 339783 CASAVA_Build 9 27127454 1D ATTCTACTAG C/- TTAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 C 1 0 339784 CASAVA_Build 9 27127682 5I CTTAACAAGA -----/GCTGT TTTACTTCGT 3070 het 3070 ref 37 17 17 4 GCTGT 0 1 339785 CASAVA_Build 9 27142411 2D TGGAATGTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 A 14 12 339786 CASAVA_Build 9 27143291 1I CTAAAAATAG -/A AAAAAAAATT 984 het 984 ref 9 6 3 0 A 8 9 339787 CASAVA_Build 9 27157860 1I TTCATTCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 10 11 339788 CASAVA_Build 9 27205559 1D TGCATTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 543 hom 34 2 15 17 T 17 16 339789 CASAVA_Build 9 27205770 2D GCTCGTAGAC AT/-- ATGACTCAGG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AT 2 1 339790 CASAVA_Build 9 27207517 4D GGACTTATAC TGTT/---- TGTTTGCATG 3070 hom 120 het 43 0 41 3 TGTT 2 1 339791 CASAVA_Build 9 27207784 1I TGCCAAGGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 9 339792 CASAVA_Build 9 27208129 2I GCCAGACAGT --/TG GGCGGGGGTC 3070 hom 56 het 23 0 15 8 TG 0 1 339793 CASAVA_Build 9 27208259 3I AGGCCCCGAG ---/GGT GGTGGTGACT 3070 hom 56 het 24 0 19 5 GGT 2 3 339794 CASAVA_Build 9 27209730 24D AATCAGAAAA AAAGGTTAATCTTATTGGTATAAT/------------------------ AAAGGTTAAT 3070 hom 60 het 44 0 21 24 AAAGGTTAATCTTATTGGTATAAT 2 1 339795 CASAVA_Build 9 27210480 4D GTTCATTAAG ATTA/---- ATTAAGAAGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 ATTA 2 1 339796 CASAVA_Build 9 27213176 1I ATTATTGTGA -/G GGAGTCTTAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 2 3 339797 CASAVA_Build 9 27219746 2D ATCAGATTCT TC/-- TCTCTCAATT 3070 hom 96 het 33 0 30 3 TC 4 3 339798 CASAVA_Build 9 27224075 4I ATTTGAATTC ----/AAAT AAATATGTGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AAAT 1 2 339799 CASAVA_Build 9 27236151 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 2523 het 2523 ref 34 19 8 7 A 10 9 339800 CASAVA_Build 9 27237524 1D AAATAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 48 1 37 10 A 13 12 339801 CASAVA_Build 9 27244770 1I TGAAATAGAC -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 7 8 339802 CASAVA_Build 9 27253776 2I GTGGCCTAAA --/AG AATTCTAGGT 3070 hom 132 het 49 0 45 4 AG 0 1 339803 CASAVA_Build 9 27254616 1D ACCAAAAAAG A/- AAAATTAACA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 5 4 339804 CASAVA_Build 9 27258687 1D TTTTAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 12 11 339805 CASAVA_Build 9 27320789 1I TTCTGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 385 hom 35 2 27 6 T 10 11 339806 CASAVA_Build 9 27323354 1I ATGAGCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 35 0 28 7 A 11 12 339807 CASAVA_Build 9 27324822 6I AATATTCTTT ------/TTTTTC TTTTTCTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 TTTTTC 2 3 339808 CASAVA_Build 9 27341295 40D TCATATCAGT AGTAATCCCAGTAGGTCAGTAATCTTAGTAGTGACCCATC/---------------------------------------- AGTAATCTCT 3070 hom 88 het 27 0 25 9 AGTAATCCCAGTAGGTCAGTAATCTTAGTAGTGACCCATC 1 0 339809 CASAVA_Build 9 27345561 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2300 het 686 hom 17 7 6 4 T 15 14 339810 CASAVA_Build 9 27387304 1D TGGCAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 1898 het 1898 ref 50 37 5 8 A 13 12 339811 CASAVA_Build 9 27405417 1I AACTATGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 8 10 T 11 12 339812 CASAVA_Build 9 27406715 1I AGTTTTTTTT -/G GTAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 G 1 2 339813 CASAVA_Build 9 27408934 1D TAGAACTGAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 A 9 8 339814 CASAVA_Build 9 27409957 1D AATTAGTAAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 A 7 6 339815 CASAVA_Build 9 27435330 1D GAGAAGTTCA G/- GGTTTGCCAA 3070 het 3070 hom 51 19 29 4 G 3 2 339816 CASAVA_Build 9 27436235 1I GGAATACATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 9 10 339817 CASAVA_Build 9 27437005 1I TTAGCATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 T 10 11 339818 CASAVA_Build 9 27471506 2I TTTTTTTTTT --/TG TTTGTTTTTT 3070 hom 31 het 20 0 15 5 TG 0 1 339819 CASAVA_Build 9 27472306 9D TCATAATAAT GTCTGGATG/--------- GTCTGGATGT 3070 hom 97 het 39 0 31 9 GTCTGGATG 2 1 339820 CASAVA_Build 9 27479375 1I AGCAGCTGCT -/A AATCCTGAGC 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 A 2 3 339821 CASAVA_Build 9 27480978 2D TCATACAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 12 10 339822 CASAVA_Build 9 27501224 3D CAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 1010 het 1010 ref 41 12 7 23 AAG 1 0 339823 CASAVA_Build 9 27527964 1I GAAGGCAGCA -/C CAGCATGTTA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 C 1 2 339824 CASAVA_Build 9 27530049 2D TCTAGGCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 13 4 A 12 10 339825 CASAVA_Build 9 27530552 3D GAGAAATATC TGA/--- TGAAGCCTGT 3070 het 3070 ref 40 22 12 8 TGA 2 1 339826 CASAVA_Build 9 27533549 1I TCCATTTCTC -/T TTTTCCCCCC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 4 5 339827 CASAVA_Build 9 27536375 1I AAGCAGAAAG -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 7 8 339828 CASAVA_Build 9 27541087 1I ATCTCAAAAA -/C AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 C 0 1 339829 CASAVA_Build 9 27542358 1D GTGATTTTTC T/- TTTTTGAGAC 3070 hom 64 het 29 0 22 7 T 6 5 339830 CASAVA_Build 9 27545557 1D ATTGCAAGCA T/- TTTTTTTTTT 2353 het 341 hom 39 2 9 28 T 19 18 339831 CASAVA_Build 9 27549514 1I AGCTGATTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 9 10 339832 CASAVA_Build 9 27551466 3I AAATACGTAA ---/TGT TGTCCCTAGA 3070 hom 123 het 49 0 41 8 TGT 1 2 339833 CASAVA_Build 9 27552675 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2256 het 1630 hom 25 5 7 14 T 13 12 339834 CASAVA_Build 9 27553041 4I AAAAAATTTG ----/TTAA TTAAAGGTCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTAA 1 2 339835 CASAVA_Build 9 27564310 1D TGGATGAGTT G/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 G 1 0 339836 CASAVA_Build 9 27575110 1D TAAGGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 25 1 19 7 T 12 11 339837 CASAVA_Build 9 27575985 1D AAATAACAAT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 A 7 6 339838 CASAVA_Build 9 27579207 1I GAGAGAAAAC -/A AAGTGGCGAG 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 A 2 3 339839 CASAVA_Build 9 27596959 2D CCATCGTCTC TT/-- TTATAAATCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 4 2 339840 CASAVA_Build 9 27604991 1D AAAATAAAAA C/- TCCTGCAGCT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 C 1 0 339841 CASAVA_Build 9 27611064 1D CACGGTGAAA C/- CCTGTCTCTA 1848 het 1029 hom 8 3 4 1 C 3 2 339842 CASAVA_Build 9 27619627 9D21M1D TACCAAGGGC ACCAGAAAGACCAGAAAGACCAAAGTCCATC/---------ACCAGAAAGACCAAAGTCCAT- CTTTCTTAGT 3070 het 3070 ref 41 19 17 12 N/A 0 0 339843 CASAVA_Build 9 27644598 1D GAATTAGGTC T/- ATTTTAGCCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 1 0 339844 CASAVA_Build 9 27644892 6I ACGCCCCCAT ------/CCTGTG CCTATAAAAA 3070 hom 50 het 21 0 13 8 CCTGTG 0 1 339845 CASAVA_Build 9 27650466 1I ACATTGTGAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 46 hom 31 2 25 4 T 9 10 339846 CASAVA_Build 9 27671983 1D TTATTTCAAA G/- GCAAATAACT 3070 het 3070 ref 47 27 16 5 G 2 1 339847 CASAVA_Build 9 27679886 1D GAAAAACTTA C/- ACTGCTTATC 3070 het 3070 ref 27 18 7 3 C 1 0 339848 CASAVA_Build 9 27715003 1I ATAATCTTCT -/A AAAGAGATAA 3070 het 3070 ref 47 23 23 1 A 3 4 339849 CASAVA_Build 9 27715891 1D10M1D AACAAACAAA CAAAAAACTACA/-AAAAAACTAC- AAAAAAAACA 1521 het 242 hom 22 3 5 16 N/A 0 0 339850 CASAVA_Build 9 27719570 1D TGTGTCTTCT G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 82 het 36 0 26 11 G 9 8 339851 CASAVA_Build 9 27719766 1I TGAGGATACA -/C CAAATAGTGA 3070 hom 117 het 44 0 38 6 C 1 2 339852 CASAVA_Build 9 27724049 1I GTTTTCAGCT -/G TTATAAATAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 G 0 1 339853 CASAVA_Build 9 27752126 1D CATTAGATGC A/- AAAATCTTTC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 5 4 339854 CASAVA_Build 9 27756028 1I GAGGAGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 A 9 10 339855 CASAVA_Build 9 27756249 1D GCCTCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1605 het 1605 ref 34 22 4 8 T 13 12 339856 CASAVA_Build 9 27762663 9D TATAAGGCAA GATGTAAAT/--------- GATGTAAATT 3070 hom 153 het 58 0 51 8 GATGTAAAT 2 1 339857 CASAVA_Build 9 27767867 1I AGAGGAAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 370 hom 31 1 24 6 T 9 10 339858 CASAVA_Build 9 27768828 2I AAATAAACAC --/TT TTTTTTATCT 3013 het 3013 ref 25 12 10 3 T 6 8 339859 CASAVA_Build 9 27772181 1I GGATTCATTG -/T ATTTTTTTTG 3070 het 66 hom 22 2 10 10 T 0 1 339860 CASAVA_Build 9 27777559 5D GTTATAACTT AAAAC/----- AAAATGTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 5 AAAAC 1 0 339861 CASAVA_Build 9 27781662 1D AGCCTTTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 10 9 339862 CASAVA_Build 9 27790588 7I TTTGTGACTT -------/TATACTC TAGTCTATTC 3070 hom 138 het 50 0 47 3 TATACTC 0 1 339863 CASAVA_Build 9 27812217 34I TTTAGCTTCC ----------------------------------/CACCAGCCTCCACCCTCTCTCTACAGTATCTTCT CTTGTTAACT 3070 het 3070 ref 49 29 13 7 CACCAGCCTCCACCCTCTCTCTACAGTATCTTCT 0 1 339864 CASAVA_Build 9 27819651 2I ATTTATACAG --/TT TTTTTTTTTT 1961 het 1961 ref 44 22 9 13 T 11 13 339865 CASAVA_Build 9 27822679 1D TTATAGTTTT G/- GGTTTTACAT 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 G 3 2 339866 CASAVA_Build 9 27823806 1D ATGATGTGCT G/- GCTGGATTCA 2967 het 2967 ref 34 23 8 4 G 2 1 339867 CASAVA_Build 9 27824771 1D TTATTTGATT A/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 1 0 339868 CASAVA_Build 9 27837063 2I TTGAATTTAA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 TC 5 6 339869 CASAVA_Build 9 27843348 3I CATAAGTGTA ---/AAG AAGAAATTAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 AAG 1 2 339870 CASAVA_Build 9 27843930 1D TTTTTTTGTT G/- TTTTTTTTTT 2703 het 2703 ref 28 17 10 1 G 1 0 339871 CASAVA_Build 9 27848385 6D GCTTTCTTTC TTTCTT/------ TTTTTTTTTT 892 het 869 hom 19 5 4 10 TTTCTT 1 0 339872 CASAVA_Build 9 27848690 10D ACCGTGCCCG GCCGTATATT/---------- GCTTTCTTTA 3070 het 3070 ref 26 14 10 5 GCCGTATATT 1 0 339873 CASAVA_Build 9 27851795 2I GTTTCAGAGC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 10 26 4 A 9 11 339874 CASAVA_Build 9 27861306 1D TTCACTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 15 14 339875 CASAVA_Build 9 27863472 2D CCGATTTTTT CA/-- CAGATTCTGA 3070 het 3070 ref 38 20 16 4 CA 2 1 339876 CASAVA_Build 9 27870470 1I TCCGTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2319 het 2319 ref 35 15 10 10 T 13 14 339877 CASAVA_Build 9 27875460 1I AGATATGATA -/T TAACGAAAGA 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 1 2 339878 CASAVA_Build 9 27899284 1I ATAAAAAGTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 9 10 339879 CASAVA_Build 9 27903226 1D GGACATGATT A/- AAAAATAGAG 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 A 6 5 339880 CASAVA_Build 9 27905237 10D TCCCTAAGTA AAAGGCATAT/---------- AAAGGCATAT 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 AAAGGCATAT 3 2 339881 CASAVA_Build 9 27910092 4D AAAAAAATTC TCTA/---- TCTATCTATG 2962 het 2962 ref 30 19 10 2 TCTA 3 2 339882 CASAVA_Build 9 27910812 4D TCTGCACAGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 32 5 14 14 A 16 12 339883 CASAVA_Build 9 27911299 1D TACCCAAAGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 A 9 8 339884 CASAVA_Build 9 27913926 7I CTTATTTGAT -------/AGAGAAC AGAGAACAGA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 AGAGAAC 2 3 339885 CASAVA_Build 9 27928137 5D TTTGTTAAAA TTAAT/----- TTAATAATTT 3070 het 3070 ref 37 24 11 4 TTAAT 2 1 339886 CASAVA_Build 9 27931034 28I ACTAGCATAA ----------------------------/CCTTAATATCCATCAAAAGGGGATGGAT AATAAAAGCC 3070 het 3070 ref 31 15 12 6 CCTTAATATCCATCAAAAGGGGATGGAT 0 1 339887 CASAVA_Build 9 27932893 1I ACTGTCTTGT -/G TATGAAGCAA 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 G 0 1 339888 CASAVA_Build 9 27933097 3D CTGAATTAAT CTC/--- CTGTTTATTA 3070 het 3070 ref 28 14 11 5 CTC 1 0 339889 CASAVA_Build 9 27943814 1I TACAACTGTA -/T GCTTAACATG 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 0 1 339890 CASAVA_Build 9 27945680 5I ACAACTTGCT -----/TATCA ATTCAACTAT 3070 het 3070 ref 41 21 19 1 TATCA 0 1 339891 CASAVA_Build 9 27946079 1D CTGGGATCAC A/- AGGCGTGCGC 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 2 1 339892 CASAVA_Build 9 27967041 1D AGGTAAATGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 25 18 3 A 10 9 339893 CASAVA_Build 9 27975031 2I AATTAGACAC --/AT GTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 AT 0 1 339894 CASAVA_Build 9 27975811 1D AAGGTGAATG A/- AGATATCAAG 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 2 1 339895 CASAVA_Build 9 27977089 1I CATGTCAGTC -/A AACTACTCAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 2 3 339896 CASAVA_Build 9 27979444 12D GAATGCTCTC TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 3070 hom 160 het 55 0 53 7 TG 16 10 339897 CASAVA_Build 9 27980284 3I TAGCTTTGCC ---/ACT ACTAGTTTCT 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 ACT 1 2 339898 CASAVA_Build 9 27980469 1I TACCCCCCCC -/G CCTTTTATTT 3070 het 34 hom 24 2 13 9 G 0 1 339899 CASAVA_Build 9 27996928 1D ATTCATTTTA T/- CTATTCATGT 3070 het 3070 ref 52 29 19 4 T 1 0 339900 CASAVA_Build 9 27998483 1D AGTTATGGAA G/- GAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 2 1 339901 CASAVA_Build 9 27998584 1D AATAGATGAG T/- TTTAGCAAGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 4 3 339902 CASAVA_Build 9 27999140 2D AAGGGAAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 12 10 339903 CASAVA_Build 9 27999354 1I CACAAGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2604 hom 30 6 13 11 A 11 12 339904 CASAVA_Build 9 28004540 6D19M6I ACACTAGATA AATTTTACTTTTTTATCCAGGATAA------/------ATTGTCTTATCCTGGATAAAAAAGT GACAATTAAC 3070 het 3070 hom 41 20 22 3 N/A 0 0 339905 CASAVA_Build 9 28005487 5I CAACGTTTAA -----/ATAAC ATAAGAAAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 ATAAC 0 1 339906 CASAVA_Build 9 28006657 3I CAAACATATC ---/AAT AATGAGTTCC 3070 hom 63 het 34 0 21 13 AAT 1 2 339907 CASAVA_Build 9 28009318 2I GGAATATATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 42 0 30 12 T 11 13 339908 CASAVA_Build 9 28011864 1D CTTGATCTTT A/- AAGTGGGTTT 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 A 3 2 339909 CASAVA_Build 9 28015926 1I CAAGCTGCTC -/T TTCTCCTCAA 3070 het 3070 hom 44 14 24 6 T 2 3 339910 CASAVA_Build 9 28017459 1I ACATAATCAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 A 7 8 339911 CASAVA_Build 9 28017672 2D AAAATAAAAC AT/-- ATTTTACAAA 3070 het 3070 hom 38 19 18 2 AT 2 1 339912 CASAVA_Build 9 28028237 4I TTTAAGTATC ----/CATT CATTAAGTGG 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 CATT 1 2 339913 CASAVA_Build 9 28030526 4D TTCATGGCAG TTTC/---- TTTATCTGAA 3070 hom 90 het 35 0 30 7 TTTC 1 0 339914 CASAVA_Build 9 28030781 4I CAAAACAGAC ----/TAAT TAACAGAGCC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 TAAT 0 1 339915 CASAVA_Build 9 28034779 2D TGTCTTGGCT TC/-- TCTCTCAGGC 3070 hom 84 het 31 0 28 4 TC 4 3 339916 CASAVA_Build 9 28037800 1D AGAGCAAAGT A/- TTTTTTTTAC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 1 0 339917 CASAVA_Build 9 28045031 1I ACAAACTTGC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 8 9 339918 CASAVA_Build 9 28053434 1I ATTATCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 548 hom 34 2 26 6 T 11 12 339919 CASAVA_Build 9 28055437 2D CATATAAAAG AT/-- CACATATTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 AT 1 0 339920 CASAVA_Build 9 28065722 1D CAGTTTATTC T/- TTTGCCTGTT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 4 3 339921 CASAVA_Build 9 28066473 1I TACCTCAAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 9 10 339922 CASAVA_Build 9 28067788 7D AAAAAAAGAA AGAGAAG/------- AAAGAAGAAA 2988 het 2988 ref 34 24 8 4 AGAGAAG 1 0 339923 CASAVA_Build 9 28071289 1D TTCAATACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 40 1 17 23 A 17 16 339924 CASAVA_Build 9 28071828 1D TTAGCAATTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 120 het 41 0 41 1 T 9 8 339925 CASAVA_Build 9 28072463 1D CTTAATACAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 44 19 16 10 T 9 8 339926 CASAVA_Build 9 28087871 1I CACAACCTCT -/A TAAAAAAAAT 2960 hom 18 het 8 0 7 1 A 0 1 339927 CASAVA_Build 9 28092176 1D AAAGGCTGTA T/- TTTTTTTTTT 2162 het 2162 ref 33 15 8 11 T 12 11 339928 CASAVA_Build 9 28092600 1D AGGGGTTATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 27 15 5 A 10 9 339929 CASAVA_Build 9 28109054 1D GCAGTCAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 10 9 339930 CASAVA_Build 9 28136561 1D GGTAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 31 1 24 6 T 11 10 339931 CASAVA_Build 9 28144261 1I GCTTGTCATA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 7 8 339932 CASAVA_Build 9 28149636 1D AATAGTTATG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 9 8 339933 CASAVA_Build 9 28157310 3D TTCTACGTGA TCC/--- TCCTTGGGCT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TCC 2 1 339934 CASAVA_Build 9 28169538 1I CTATATATAG -/T TTTTTTACTA 1863 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 7 339935 CASAVA_Build 9 28178280 3D TCATAGTCCA CAT/--- AATAATTGCT 3070 hom 75 het 29 0 26 5 CAT 1 0 339936 CASAVA_Build 9 28179055 1D TATATCCCAG A/- AAAGTTCACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 4 3 339937 CASAVA_Build 9 28202317 1D AAAATGAGAC T/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 1 0 339938 CASAVA_Build 9 28208280 1I GAATTTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 21 1 18 2 T 10 11 339939 CASAVA_Build 9 28217631 1D CTCAGCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 14 5 A 11 10 339940 CASAVA_Build 9 28228823 5I ATGAAAATAA -----/ATAAT ATAACAGATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 ATAAT 0 1 339941 CASAVA_Build 9 28240973 1D ATAGGCTAAG T/- TGGGGAACCT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 2 1 339942 CASAVA_Build 9 28241056 1D TTTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 A 10 9 339943 CASAVA_Build 9 28248920 1I TTCATAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 839 hom 46 2 37 7 A 11 12 339944 CASAVA_Build 9 28252269 1D TGAATATTAC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 10 9 339945 CASAVA_Build 9 28254063 1D GCTGTGAAGT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 A 9 8 339946 CASAVA_Build 9 28268909 1D AAAAGATTCA C/- CATTCTAGAT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 C 2 1 339947 CASAVA_Build 9 28271479 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 63 het 27 0 22 8 AC 7 6 339948 CASAVA_Build 9 28311057 1I TTTTTGTTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 8 9 339949 CASAVA_Build 9 28318555 1I TCCATCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 11 12 339950 CASAVA_Build 9 28322195 1I AATTTTTTTT -/G TTCTAGTCCT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 G 0 1 339951 CASAVA_Build 9 28336794 1D ATATTGAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 92 het 36 0 31 5 T 10 9 339952 CASAVA_Build 9 28337432 2D AGAGAGTGAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 38 0 32 9 AC 8 7 339953 CASAVA_Build 9 28345820 1I GTGCATACAG -/A AAAAAACATC 3070 hom 129 het 53 0 44 9 A 6 7 339954 CASAVA_Build 9 28346945 1I TGAGAATTTT -/A AAAGGGCTAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 3 4 339955 CASAVA_Build 9 28353975 1D ATTAGGTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 33 9 12 12 A 15 14 339956 CASAVA_Build 9 28362606 10D GCATGGTAAA TCTAACTAAT/---------- TCTAACTAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 9 TCTAACTAAT 2 1 339957 CASAVA_Build 9 28363014 1I CTACAGAGAG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 8 9 339958 CASAVA_Build 9 28365088 28D ACACCCCTTA ACACACACACACACACACACACACACAC/---------------------------- ACACACACAC 3070 hom 63 het 29 0 22 9 AC 22 8 339959 CASAVA_Build 9 28374328 2D TGTTATGCAC TA/-- TATATATATA 1886 het 1886 ref 22 12 5 5 TA 10 9 339960 CASAVA_Build 9 28374835 3D AAAAAAAAAA AAT/--- GTCTTCACAT 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 AAT 1 0 339961 CASAVA_Build 9 28383997 1D TACTAACCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 10 18 12 T 10 9 339962 CASAVA_Build 9 28385532 1I AACAGAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 A 10 11 339963 CASAVA_Build 9 28386766 2I TGGGAGAACA --/AT ATATTTCAGG 3070 het 3043 hom 24 9 13 2 AT 2 3 339964 CASAVA_Build 9 28392218 5D GAAAAAACAA TAACT/----- TAGGATAGGC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TAACT 1 0 339965 CASAVA_Build 9 28393653 3D ACCCCTCTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 508 hom 29 8 10 11 T 15 12 339966 CASAVA_Build 9 28394344 1I AGGTTTAAAG -/A AAAAAAAATC 2461 het 2461 ref 26 15 7 4 A 8 9 339967 CASAVA_Build 9 28396340 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 78 het 28 0 24 4 AGG 0 1 339968 CASAVA_Build 9 28407093 1I GAGTTCAGAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 A 9 10 339969 CASAVA_Build 9 28407561 1D TACATAGTTT G/- TGGTTCCCTG 3070 het 3070 ref 45 24 17 6 G 1 0 339970 CASAVA_Build 9 28409604 1D GAGATAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 A 11 10 339971 CASAVA_Build 9 28409806 1I TTATGTATAA -/T TTTTATCGGT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 4 5 339972 CASAVA_Build 9 28411406 1D11M1D CCCAAAAGCA TTTTTTTTGCAGA/-TTTTTTTGCAG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 4 N/A 0 0 339973 CASAVA_Build 9 28411486 2I AAACGTCTTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 10 12 339974 CASAVA_Build 9 28421891 1D TAATAGGACA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 50 24 23 4 T 8 7 339975 CASAVA_Build 9 28423323 1D GCCACTGGGT G/- TACTCCAAAA 3070 het 3070 ref 42 25 14 5 G 1 0 339976 CASAVA_Build 9 28432972 1I CCCAACATTG -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 7 8 339977 CASAVA_Build 9 28448982 1I TGAATTATGA -/T TTTTGCATTA 3070 hom 120 het 50 0 41 9 T 4 5 339978 CASAVA_Build 9 28449269 1D GAGAAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 32 0 23 10 A 13 12 339979 CASAVA_Build 9 28449500 1I TATGTGCCAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 8 9 339980 CASAVA_Build 9 28453759 1D AAATAAAATG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 8 7 339981 CASAVA_Build 9 28459270 1I GAGTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 17 16 8 A 11 12 339982 CASAVA_Build 9 28462319 1D TGACTTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 13 12 339983 CASAVA_Build 9 28463204 1D TGATAACTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 643 hom 56 2 44 12 T 10 9 339984 CASAVA_Build 9 28464417 1I CATAAAAAAA -/T CTTGAGAAAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 0 1 339985 CASAVA_Build 9 28471084 5D4M2D TTGGAGAATG GGCATGGAGCC/-----GGAG-- CCATTTCTAA 3070 hom 117 het 40 0 39 5 N/A 0 0 339986 CASAVA_Build 9 28496624 2I GTCTCATAAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 AT 5 6 339987 CASAVA_Build 9 28500355 5D TTATATGTAT TATAA/----- TATATTCTTA 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 TATAA 1 0 339988 CASAVA_Build 9 28502056 2D TGGAGGCCAT GG/-- GCATTTGAGC 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 G 3 1 339989 CASAVA_Build 9 28504934 1I TGCTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 A 12 13 339990 CASAVA_Build 9 28522439 1D CTAAACCGAC T/- TTTTTTTTTC 1769 het 1769 ref 35 26 4 5 T 10 9 339991 CASAVA_Build 9 28525725 4D CGTGTGGACG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 68 23 24 23 CA 9 7 339992 CASAVA_Build 9 28558705 1I ATGCTGAAAG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 6 7 339993 CASAVA_Build 9 28559423 2I AGAAAAGGTG --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 AT 5 6 339994 CASAVA_Build 9 28559621 1D ACCAGGGGCT G/- GGGGGTAGAA 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 G 6 5 339995 CASAVA_Build 9 28569060 1I ATAAGAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 42 1 32 9 T 10 11 339996 CASAVA_Build 9 28574920 92D TATAGACTGT GACTGCAAGAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCAC/-------------------------------------------------------------------------------------------- GACTGCAAGA 3070 hom 51 het 23 0 16 13 GACTGCAAGAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCAC 1 0 339997 CASAVA_Build 9 28582792 1D TGTTTTTTTC A/- ATAGGGTACA 3070 het 3070 hom 50 22 25 3 A 2 1 339998 CASAVA_Build 9 28591547 15D ATCAGAGTGT GTGGCAATTGAGTGA/--------------- GTGGCACAAT 3070 hom 117 het 38 0 40 5 GTGGCAATTGAGTGA 1 0 339999 CASAVA_Build 9 28598150 1D GTAGAAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 33 0 29 5 A 13 12 340000 CASAVA_Build 9 28600336 1D TTGAAAACTG A/- AAAAGCAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 5 4 340001 CASAVA_Build 9 28608880 1I AACTTAAAGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 8 9 340002 CASAVA_Build 9 28612727 1D GGCAGCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2057 hom 29 14 11 4 T 15 14 340003 CASAVA_Build 9 28614630 1I TGTAGTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 9 10 340004 CASAVA_Build 9 28620210 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATAA 2831 het 2098 hom 15 6 8 1 A 7 8 340005 CASAVA_Build 9 28620890 1D GCACATAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 23 2 11 11 A 12 11 340006 CASAVA_Build 9 28639340 1I TTGCTCCCAC -/T TCAAACTATT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 1 2 340007 CASAVA_Build 9 28641673 1D CTTGTTATTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 A 9 8 340008 CASAVA_Build 9 28664263 1I TTATACAATA -/C ATGTAATAAT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 C 0 1 340009 CASAVA_Build 9 28727648 1I CTCTGGACTT -/A ATGTCAGCTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 1 2 340010 CASAVA_Build 9 28732280 2I TTTTTTTTTT --/TA AATTTCTGCA 3070 hom 96 het 42 0 31 11 TA 0 1 340011 CASAVA_Build 9 28732853 1D CTGTGCTATT A/- TTGTCAAATA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 1 0 340012 CASAVA_Build 9 28738395 4I ATAGAAATTT ----/CTAA CTAACAACTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 CTAA 1 2 340013 CASAVA_Build 9 28747560 2I ATATAAAGAA --/AT ATATATATAG 3070 het 3024 hom 32 9 16 7 AT 4 5 340014 CASAVA_Build 9 28751483 2I TATACATGCG --/CA CACACACACA 3070 hom 92 het 38 0 31 7 CA 7 8 340015 CASAVA_Build 9 28764591 1I CTCTGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 A 10 11 340016 CASAVA_Build 9 28764858 1I TGTTTCCCCT -/A ATTTTAACAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 1 2 340017 CASAVA_Build 9 28764990 1D AAAGCTTTGC T/- TTTTTAGTAT 3070 het 3070 hom 31 11 20 2 T 6 5 340018 CASAVA_Build 9 28770345 1D GTGAGTAAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 T 10 9 340019 CASAVA_Build 9 28788275 1I AGTAGGATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 A 9 10 340020 CASAVA_Build 9 28796090 1D CAATCTTCCA T/- TTGGTCCAGG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 3 2 340021 CASAVA_Build 9 28800140 1D GAAAATTAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 A 9 8 340022 CASAVA_Build 9 28807236 1D GACTTAAGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 56 21 26 9 A 10 9 340023 CASAVA_Build 9 28812575 1D GCCAGCATGG C/- TAGAATATAA 3070 het 2135 hom 21 5 12 4 C 1 0 340024 CASAVA_Build 9 28815563 3D TCATTTGTAT CTG/--- GTTTTTTTTT 751 het 751 ref 24 9 4 12 CTG 1 0 340025 CASAVA_Build 9 28818542 1I TAGTTCAAGG -/T AAGTGCTAAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 0 1 340026 CASAVA_Build 9 28820756 4D TTGCCCCTAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 54 27 19 10 AC 8 6 340027 CASAVA_Build 9 28822977 1D TTTTTGATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 40 1 22 17 A 11 10 340028 CASAVA_Build 9 28836004 2D GCTGTATCAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 108 het 47 0 37 12 AC 7 6 340029 CASAVA_Build 9 28839264 3I AAGCAGCTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 TTG 3 4 340030 CASAVA_Build 9 28842460 5D AAATTTTATG GTTCA/----- GTTAAGAGTG 3070 het 3070 hom 46 20 23 6 GTTCA 1 0 340031 CASAVA_Build 9 28848970 1D AGGCAGATCG T/- TATGTCATAA 3070 het 3070 ref 48 23 23 4 T 2 1 340032 CASAVA_Build 9 28852365 1D TAGCAAGATA T/- TTCTTAGGTA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 3 2 340033 CASAVA_Build 9 28854654 1D TCATGAACAT A/- AGAGTCCTAG 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 2 1 340034 CASAVA_Build 9 28861385 1D TACCAACTTC T/- TTAAAATGTT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 3 2 340035 CASAVA_Build 9 28871597 1D ACTGACAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 T 13 12 340036 CASAVA_Build 9 28874114 1I67M1I TCTAAACAAA -CTAATACTCAACGAAAATTAGTTGAACAAAGTATAAAAAGAAATCAGGGAATATTTTTTCACTGTTA-/GCTAATACTCAACGAAAATTAGTTGAACAAAGTATAAAAAGAAATCAGGGAATATTTTTTCACTGTTAT TTTTCCCTTA 3070 hom 141 het 29 0 48 7 N/A 0 0 340037 CASAVA_Build 9 28874666 2I TGTATTTTCC --/AT ATATATATAT 925 het 552 hom 9 2 4 3 AT 8 9 340038 CASAVA_Build 9 28874696 2I73M2D TATGTATGTG --TATATATATATATACAAATTTGTAATATATAAATTTGTAAAACTATACACATACACATTATATATAGTGTGTGTA/TATATATATATATATACAAATTTGTAATATATAAATTTGTAAAACTATACACATACACATTATATATAGTGTGTG-- TATATATATA 2237 het 437 hom 9 1 5 5 N/A 0 0 340039 CASAVA_Build 9 28875383 2D24M2D ATATATATAT ACACATACATACATACATATATACATAG/--ACATACATACATACATATATACAT-- ATATATATAC 1953 het 34 hom 13 1 6 9 N/A 0 0 340040 CASAVA_Build 9 28879436 1D TTTGCTTCAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 10 9 340041 CASAVA_Build 9 28881479 1D ATTTCTGGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 10 9 340042 CASAVA_Build 9 28883578 1D34M3I ATGGTTATCA TTTTTTTTTTTAATTTAAAAAATTTGATGGAAGAA---/-TTTTTTTATAAATTTAAAAAATTTGATGGAAGAAAAT AATATCTTAT 3070 hom 30 het 17 0 11 16 N/A 0 0 340043 CASAVA_Build 9 28883729 1D TTATTCACAC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 8 7 340044 CASAVA_Build 9 28886487 1I GCAAGAAATA -/T CATAATGAGA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 0 1 340045 CASAVA_Build 9 28889060 1D ATTGTTTCAC A/- AAAATACCTT 3070 hom 111 het 43 0 38 8 A 5 4 340046 CASAVA_Build 9 28893922 1D AAAAAAACTT A/- AGAGATTCCA 3070 hom 99 het 42 0 33 10 A 2 1 340047 CASAVA_Build 9 28906794 1I ATTGAGACTT -/G GTTTTATACT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 1 2 340048 CASAVA_Build 9 28907412 1D AACAAAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 12 11 340049 CASAVA_Build 9 28909750 2I ACTGGTATAA --/AC ACATTATAGA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 AC 1 2 340050 CASAVA_Build 9 28912375 1I AAGAGTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 11 12 340051 CASAVA_Build 9 28913637 2I TAGGCCACTC --/AG GGGATAATTG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AG 0 1 340052 CASAVA_Build 9 28923527 2I AATATATCAC --/AT GAGGCAGAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 0 1 340053 CASAVA_Build 9 28924709 4D AAAACAACGA AAGT/---- AAGACAATAG 3070 hom 102 het 35 0 35 1 AAGT 1 0 340054 CASAVA_Build 9 28925703 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 8 340055 CASAVA_Build 9 28940569 1I ATCAATGTGC -/A AAAAATCACA 2418 het 2418 ref 13 7 5 1 A 5 6 340056 CASAVA_Build 9 28946571 4D14M1D CCTTCCTTCC TCCATCCCTCCCTCCCCCT/----TCCCTCCCTCCCCC- TTCCTTCCTC 2071 het 2071 ref 19 13 7 3 N/A 0 0 340057 CASAVA_Build 9 28949208 1I ATGAGACTGA -/G GGGTAGAGAT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 G 3 4 340058 CASAVA_Build 9 28950830 1D GAAAATGTTG A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 7 6 340059 CASAVA_Build 9 28951950 1D AGCTGCTATG C/- CTGTATCATA 3070 het 3070 hom 43 13 19 11 C 2 1 340060 CASAVA_Build 9 28956325 3D AATCACACAG TAA/--- TAATTAGTAG 3070 het 3070 hom 46 17 25 5 TAA 2 1 340061 CASAVA_Build 9 28965202 3I ATTTACACAA ---/AAG AAGAGAAAGA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 AAG 1 2 340062 CASAVA_Build 9 28968840 5I TATTCTGAAG -----/AGAAA AGTGTTGAAT 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 AGAAA 0 1 340063 CASAVA_Build 9 28969504 2I ATTTTATTTT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 AC 6 7 340064 CASAVA_Build 9 28970816 1I TATTATTTTA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 7 8 340065 CASAVA_Build 9 28971370 4I TAAGATCCTT ----/AGAG AGATTATAAA 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 AG 1 3 340066 CASAVA_Build 9 28980761 1I GAGTGGACCT -/C TAGCAAACTC 2276 het 2276 ref 19 11 6 2 C 0 1 340067 CASAVA_Build 9 28986019 2I AAAGTATAAT --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 8 10 340068 CASAVA_Build 9 28987827 4D TCTCAAAAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 64 het 4 hom 18 0 1 19 AAAC 1 0 340069 CASAVA_Build 9 28988901 1I ATGAAGTTAA -/C AATTTTCTTC 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 C 0 1 340070 CASAVA_Build 9 28989899 2I TAAATAACTG --/TA TATCCATGTT 3070 het 3070 hom 43 14 25 4 TA 1 2 340071 CASAVA_Build 9 29000862 2D CCTGGGTGAC AG/-- AGCAAGACTC 3070 het 2130 hom 24 7 13 4 AG 2 1 340072 CASAVA_Build 9 29001402 8I ACATCCTTAC --------/TTTCTCCT TTTCTCCTTT 3070 hom 121 het 50 0 36 14 TTTCTCCT 1 2 340073 CASAVA_Build 9 29003389 1I TTATTATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 10 11 340074 CASAVA_Build 9 29007180 1I CTATGTAATT -/G AAGGAAGACT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 340075 CASAVA_Build 9 29010584 1I CCAAGTACCC -/A AAGCTCAATG 3070 het 3070 ref 51 21 18 12 A 2 3 340076 CASAVA_Build 9 29020287 1I GGCCCCAATT -/A ATGTAATTCA 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 A 1 2 340077 CASAVA_Build 9 29037940 3D TGTCTCCCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 AAC 5 4 340078 CASAVA_Build 9 29038319 1I AGAGGACACC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 A 8 9 340079 CASAVA_Build 9 29038460 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 51 18 28 5 A 9 8 340080 CASAVA_Build 9 29040032 1D GCTTATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 23 20 11 T 12 11 340081 CASAVA_Build 9 29053162 1I4M1I GACATTTAGT -CCTC-/GGATCA TGGGAATTAT 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 N/A 0 0 340082 CASAVA_Build 9 29057754 1D TATTTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2026 hom 31 7 16 8 A 15 14 340083 CASAVA_Build 9 29060741 1I ACTATTTTCC -/A AAAAAAAAAA 1351 het 1351 ref 15 7 4 4 A 11 12 340084 CASAVA_Build 9 29064037 1D CAAACTTTGA T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 7 6 340085 CASAVA_Build 9 29069144 1D TGTTGACATG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 9 8 340086 CASAVA_Build 9 29069786 1D AGTAAATAAG A/- AAAAAGTTCA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 6 5 340087 CASAVA_Build 9 29074190 1D ATTATTCTAC A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 hom 24 9 15 1 A 7 6 340088 CASAVA_Build 9 29074996 1D CTTGTTTTGG T/- TTTTATTGCT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 T 5 4 340089 CASAVA_Build 9 29081407 1I TCAAAAAAAA -/T TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 33 19 14 0 T 7 8 340090 CASAVA_Build 9 29089855 5D GGTTACCATA CAATC/----- CATCAACCCC 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 CAATC 1 0 340091 CASAVA_Build 9 29092083 2D CATCTGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3026 het 3026 ref 34 16 13 6 T 14 12 340092 CASAVA_Build 9 29099130 4D TATTTTGCTT GTGA/---- GTAATTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 13 1 GTGA 1 0 340093 CASAVA_Build 9 29099423 1I AAATCTTTTA -/T TTTTATAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 4 5 340094 CASAVA_Build 9 29100124 2I TATGCAAGAC --/AT GTGCATGTGA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 AT 0 1 340095 CASAVA_Build 9 29101008 1I TTTTAAAAAA -/G TAAGTTACTA 3070 het 1981 hom 20 6 11 3 G 0 1 340096 CASAVA_Build 9 29101817 4D TCAGATTTAA AGAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 AGAT 1 0 340097 CASAVA_Build 9 29102159 3D TTCTCCCAAA ATG/--- ATGTCTAATT 1599 het 1599 ref 24 15 4 8 ATG 2 1 340098 CASAVA_Build 9 29103961 2D AAGCTTTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 13 7 3 A 13 11 340099 CASAVA_Build 9 29104129 1I TCCTAACCTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 7 8 340100 CASAVA_Build 9 29104801 1D CAGTCTACCA T/- TGTTGGACAT 3070 het 3070 ref 22 14 7 1 T 2 1 340101 CASAVA_Build 9 29105586 2I ATTGAATGTG --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 T 9 11 340102 CASAVA_Build 9 29106131 1I53M1I TTAATCATTA -TGGAGGAGTGATTTAAATATATCTTTCCTGATAAGAGATTAATACAAAACATA-/TTGGAGGAGTGATTTAAATATATCTTTCCTGATAAGAGATTAATACAAAACATAT TTTAACAATT 3070 het 3070 ref 37 21 20 7 N/A 0 0 340103 CASAVA_Build 9 29109362 10I CACGTGTGCG ----------/CGCACACACA CGCACACACA 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 CGCACACACA 1 2 340104 CASAVA_Build 9 29115431 2I AAATTTAAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 AT 6 7 340105 CASAVA_Build 9 29122880 1I CATGTAATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 13 10 T 10 11 340106 CASAVA_Build 9 29128325 1I CCAGACCACC -/T GGCCAGAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 T 0 1 340107 CASAVA_Build 9 29128626 1I CCATCAGTCA -/T TTTGTATGAT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 3 4 340108 CASAVA_Build 9 29130616 1I TATAAATAAA -/T AATGGGCAAA 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 T 0 1 340109 CASAVA_Build 9 29133057 1D GAGAAAAAAA G/- TAAAATATTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 G 1 0 340110 CASAVA_Build 9 29134274 1I TTTAAAATAG -/T CTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 T 0 1 340111 CASAVA_Build 9 29134457 1D CTTATTTTGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 A 9 8 340112 CASAVA_Build 9 29135557 4D ATGATAGTTA TCTG/---- TCTCTGTACA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 TCTG 1 0 340113 CASAVA_Build 9 29136382 1D CAAAAAAAAA C/- CAGCTAAGAC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 C 2 1 340114 CASAVA_Build 9 29137319 1D AGGATTTATG A/- TTCTTGTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 12 0 A 1 0 340115 CASAVA_Build 9 29145555 1D AGGGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2366 het 1700 hom 23 8 8 7 T 14 13 340116 CASAVA_Build 9 29148520 24D AAAATAATAT GCTCTCAAGTCAATTTTCTCCAAA/------------------------ GCTCTCAAGT 3070 het 3070 ref 28 19 8 8 GCTCTCAAGTCAATTTTCTCCAAA 2 1 340117 CASAVA_Build 9 29148886 1D CTAAGAGCAT C/- CCATGTCCTC 3070 het 3070 ref 50 22 21 8 C 3 2 340118 CASAVA_Build 9 29150602 4D ATTATAAACC AGAG/---- AGAATGTTAC 3070 het 3070 ref 50 26 22 3 AG 3 1 340119 CASAVA_Build 9 29162340 1I TGAATTATCA -/G AGATGACTCT 3070 het 3070 hom 41 16 23 2 G 0 1 340120 CASAVA_Build 9 29172687 1D AATCTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 25 1 17 7 T 13 12 340121 CASAVA_Build 9 29173894 1I TACCTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 25 6 T 11 12 340122 CASAVA_Build 9 29174413 4I CAAGTAAATG ----/TATT TATTTTAAAG 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 TATT 1 2 340123 CASAVA_Build 9 29176316 1D TTATGTCACC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 38 22 12 4 A 7 6 340124 CASAVA_Build 9 29191614 4I AAAATCCAAT ----/AGAA AGAAAGAGAT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 AGAA 1 2 340125 CASAVA_Build 9 29222547 2I CTCTTTACAT --/AA AAAAAAAATG 3070 het 100 hom 42 1 37 4 A 8 10 340126 CASAVA_Build 9 29222872 1I TGGTGTTCAT -/G GTACAAATAC 3070 hom 135 het 51 0 46 5 G 1 2 340127 CASAVA_Build 9 29224277 1I TATTAAAAAA -/T GAAAGAGGTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 0 1 340128 CASAVA_Build 9 29224925 1I AATTTTCTTT -/C CCCCCCCGCC 3070 hom 74 het 26 0 24 2 C 7 8 340129 CASAVA_Build 9 29249916 3D ATGCCAAGGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 34 2 14 18 A 15 12 340130 CASAVA_Build 9 29256673 2I TAAGTGACAC --/AA ACTTCATTGT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 1 3 340131 CASAVA_Build 9 29270914 4D AAAATAAAAC TATT/---- TAAAGTGACA 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 TATT 1 0 340132 CASAVA_Build 9 29275554 1D TGACTATATA T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 105 het 41 0 36 6 T 8 7 340133 CASAVA_Build 9 29276738 2D GAGCAATTGC AT/-- ATATATATAT 2047 hom 14 het 10 0 5 5 AT 10 9 340134 CASAVA_Build 9 29284541 4I AGTAAAAAGC ----/ATAG ATAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 52 25 25 2 ATAG 0 1 340135 CASAVA_Build 9 29285325 4D GAAATCACAT TAAG/---- TATCTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 TAAG 1 0 340136 CASAVA_Build 9 29291567 1I ACTCAAGAAA -/C AACAGATGCT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 C 0 1 340137 CASAVA_Build 9 29305658 1I CTTTTTTCCC -/T TTCCTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 T 2 3 340138 CASAVA_Build 9 29326757 1I ATCTTTATTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 T 9 10 340139 CASAVA_Build 9 29335140 11I TTTAGACTAT -----------/TGCACAGTTTA TTTGCCTATT 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 TGCACAGTTTA 0 1 340140 CASAVA_Build 9 29340823 1I CCAGCAGATG -/A AAAAAAAAAA 1970 het 1970 ref 38 14 10 14 A 14 15 340141 CASAVA_Build 9 29351230 1I TATTAAAGTG -/T TTTAAAATGT 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 3 4 340142 CASAVA_Build 9 29365119 1D AATTTTAGCT A/- AGAGAGCATC 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 A 2 1 340143 CASAVA_Build 9 29367655 5I TGGCTTAGGT -----/CTGCC CTGCCCTGTG 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 CTGCC 1 2 340144 CASAVA_Build 9 29368534 4D AGTCAAGGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 39 18 14 8 AG 9 7 340145 CASAVA_Build 9 29369391 1D TAGAAAAAAA G/- GGGGGGGGTG 2326 het 703 hom 15 3 5 8 G 9 8 340146 CASAVA_Build 9 29380449 7I GTACCACCCT -------/CCGGAAG CCGGAAGTCT 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 CCGGAAG 1 2 340147 CASAVA_Build 9 29383461 1I ATTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 38 1 18 19 A 10 11 340148 CASAVA_Build 9 29383471 1D AAAAAAAAAA C/- AAAACTACAT 3070 het 209 hom 35 3 14 18 C 1 0 340149 CASAVA_Build 9 29383984 1I ACACATGTAC -/A AGATCTTTAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 1 2 340150 CASAVA_Build 9 29393897 1I CTTTTAGGGG -/A AAAAATGTTT 3070 hom 81 het 38 0 28 10 A 5 6 340151 CASAVA_Build 9 29406283 1D AATATGTACA C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 9 8 340152 CASAVA_Build 9 29412888 1I CCAGGATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 11 12 340153 CASAVA_Build 9 29416728 1I AGGAAATAAT -/A AAAAAAATTT 2072 het 2072 ref 24 14 6 4 A 7 8 340154 CASAVA_Build 9 29435919 22D AAAAAACACA AAGTTGGCTAGAACTCTGGAGG/---------------------- AATTTGCTGA 3070 het 3070 hom 47 21 29 2 AAGTTGGCTAGAACTCTGGAGG 1 0 340155 CASAVA_Build 9 29447032 1D AAAACCATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 10 9 340156 CASAVA_Build 9 29455704 1I AACAAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 26 12 9 A 9 10 340157 CASAVA_Build 9 29461936 1I TTTTGTGGGG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 26 10 5 T 7 8 340158 CASAVA_Build 9 29469134 1I TTGTAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 10 11 340159 CASAVA_Build 9 29470766 1I ATGGTAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 19 9 T 11 12 340160 CASAVA_Build 9 29479562 1D TGTGTCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1451 hom 33 6 12 15 T 15 14 340161 CASAVA_Build 9 29485198 1I AACTTTTTTT -/C CCCATCAAAA 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 C 3 4 340162 CASAVA_Build 9 29487465 1D TCTCTTTAAG A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 7 6 340163 CASAVA_Build 9 29488038 3I ATAATTTTTA ---/TTG TTGTTATCCT 3070 hom 57 het 28 0 20 8 TTG 1 2 340164 CASAVA_Build 9 29488179 4D GAGTTGCCAC TTAT/---- TTGTCACTTA 3070 het 3070 ref 41 18 22 2 TTAT 1 0 340165 CASAVA_Build 9 29489929 2D GTTCTTTATT TA/-- TTCAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 TA 1 0 340166 CASAVA_Build 9 29494810 1D ATTCTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 45 0 36 10 A 11 10 340167 CASAVA_Build 9 29503294 1I GTAGCATTGA -/T TTTTCCATCA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 4 5 340168 CASAVA_Build 9 29504162 1D AAGCCAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 68 het 29 0 23 6 A 10 9 340169 CASAVA_Build 9 29519959 6I AAAAATTGGT ------/TGTTAA TGTTAGTGAG 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 TGTTAA 0 1 340170 CASAVA_Build 9 29530618 2D CCTTTTTCCT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 11 9 340171 CASAVA_Build 9 29531059 1D CTCCCAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 11 10 340172 CASAVA_Build 9 29532661 4D CATATCTGTC ATCT/---- ATCTATCTAC 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 ATCT 3 2 340173 CASAVA_Build 9 29538285 1D TTCTCTGGCC T/- CTCTGATCAT 3070 het 43 hom 26 1 25 0 T 1 0 340174 CASAVA_Build 9 29540652 3D TCCCATGAGG GGT/--- GGTGGGCTGA 3070 hom 79 het 29 0 25 5 GGT 2 1 340175 CASAVA_Build 9 29540954 4I TGCTGAACCT ----/TCTG TCTGTCTATT 3070 hom 76 het 29 0 25 4 TCTG 1 2 340176 CASAVA_Build 9 29541871 1D GAAATGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 29 0 23 7 T 11 10 340177 CASAVA_Build 9 29545324 16D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 11 0 12 1 A 25 9 340178 CASAVA_Build 9 29545498 1I TCCAGCAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 29 0 20 9 T 10 11 340179 CASAVA_Build 9 29545961 4I ATTGACGAAG ----/CTAA CTATTTTAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CTAA 0 1 340180 CASAVA_Build 9 29546149 2I GCTTTTAAGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 10 12 340181 CASAVA_Build 9 29547394 1D TGAAATCTGG T/- TCAGATTTTC 3070 hom 84 het 39 0 29 12 T 2 1 340182 CASAVA_Build 9 29547795 1D CCTTCAAGTT G/- GAAGTGCTTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 8 G 2 1 340183 CASAVA_Build 9 29552438 2D GAAAGTGCTT AG/-- AGTTTTATGT 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 AG 2 1 340184 CASAVA_Build 9 29561918 1D CAGAATAAGA G/- GTGTACCTTC 3070 het 3070 hom 54 19 23 13 G 2 1 340185 CASAVA_Build 9 29566049 1I AACAAGCTAG -/A AAAATAATTT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 4 5 340186 CASAVA_Build 9 29566903 1D TATAATTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 20 1 17 2 A 11 10 340187 CASAVA_Build 9 29569175 1D TAATGAATAC A/- AACTAGAGGG 3070 hom 93 het 36 0 32 6 A 3 2 340188 CASAVA_Build 9 29571596 1I TTCTGTATAG -/A AAAAGTACTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 4 5 340189 CASAVA_Build 9 29572900 1D72M1I AATGAAAAAT AAAAAAAAAAACTCCCAGAGACTTAAATTTAAAAATCTTTAAGACAACATTAACAAATCAAATCTAACAATGT-/-AAAAAAAAAACTCCCAGAGACTTAAATTTAAAAATCTTTAAGACAACATTAACAAATCAAATCTAACAATGTA AAAAAAGAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 32 N/A 0 0 340190 CASAVA_Build 9 29575063 1D ACAAACATGT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 7 340191 CASAVA_Build 9 29579477 2I AAAAATAGAT --/AA AGTCAGTTTA 3070 hom 150 het 51 0 50 1 A 1 3 340192 CASAVA_Build 9 29582241 3D ACAATGCAAC TAA/--- TAATATTATA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 TAA 2 1 340193 CASAVA_Build 9 29582409 1D AAATGTTGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 10 9 340194 CASAVA_Build 9 29586161 2D ACACACAAAC AT/-- ATGATAGAGA 3070 het 3070 hom 49 20 25 5 AT 2 1 340195 CASAVA_Build 9 29611861 1D ACAAACAATT A/- AAAAAAAAAA 3040 hom 25 het 13 0 8 6 A 12 11 340196 CASAVA_Build 9 29634935 2D TCCAAATGAC AT/-- ATTTTCAATG 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 AT 2 1 340197 CASAVA_Build 9 29639965 34I TGAGCAAGAA ----------------------------------/GAACAAAACAAAGCATCACACTTTCCATTTTCAT AAACATCCTC 3070 het 3070 ref 36 20 12 7 GAACAAAACAAAGCATCACACTTTCCATTTTCAT 0 1 340198 CASAVA_Build 9 29645232 2D TCGTGGAGGC TG/-- TGAAATCCCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 TG 2 1 340199 CASAVA_Build 9 29647156 1D TCTGTATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 8 4 A 11 10 340200 CASAVA_Build 9 29647424 2I AGTCCTTCTA --/GC GCACACAAGT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 GC 1 2 340201 CASAVA_Build 9 29648479 1D ACCTTTGTAT G/- GTAATTAAGA 3070 het 3070 hom 38 17 16 6 G 2 1 340202 CASAVA_Build 9 29652816 2I CATTTTTATT --/TA TTTTTAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TA 0 1 340203 CASAVA_Build 9 29656932 1I TCTTTTTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 806 hom 39 2 29 8 T 10 11 340204 CASAVA_Build 9 29659776 6I GTGTGTGTGT ------/GTGTGA GTGTGTGTGT 3070 hom 89 het 36 0 30 6 GTGTGA 0 1 340205 CASAVA_Build 9 29667694 1D TGGCTACTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 155 hom 43 1 27 15 A 12 11 340206 CASAVA_Build 9 29677234 2D TCTGAAAAAC AG/-- AGAGAAAACG 3070 hom 93 het 34 0 32 3 AG 3 2 340207 CASAVA_Build 9 29689924 1I AAGGGACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 32 1 26 5 A 10 11 340208 CASAVA_Build 9 29696802 1D CAGACTTAAC A/- AAAAAATCCA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 7 6 340209 CASAVA_Build 9 29698355 20I AGTGACTCCC --------------------/TCCAATGACACGTGGGATTT TTACAATTAT 3070 het 3070 ref 40 27 11 4 TCCAATGACACGTGGGATTT 0 1 340210 CASAVA_Build 9 29703127 2D TTTATGAATA CT/-- CTCAGCCTTG 3070 het 3070 hom 39 10 23 6 CT 2 1 340211 CASAVA_Build 9 29707046 1I GTGCTGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 18 18 14 T 13 14 340212 CASAVA_Build 9 29707132 31D ATGGGTGTAT TTCCTAATGCTGAGATTTGGAATAGGAATGA/------------------------------- TTCCTAATGC 3070 het 3070 ref 42 21 14 17 TTCCTAATGCTGAGATTTGGAATAGGAATGA 2 1 340213 CASAVA_Build 9 29714212 1I TATAAAAAAA -/T GTCTTTAAAT 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 0 1 340214 CASAVA_Build 9 29719850 1D ATATATTTGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 T 8 7 340215 CASAVA_Build 9 29721305 18D CAAAAATTTT GGATATTCACATTGAGAC/------------------ TTATGGGGAG 3070 het 3070 ref 39 32 11 0 GGATATTCACATTGAGAC 1 0 340216 CASAVA_Build 9 29732276 1I AAGGAATTTA -/T TTTTTTTAAG 1867 het 1867 ref 25 18 5 2 T 7 8 340217 CASAVA_Build 9 29732743 1I TATTATTATT -/A AAAAAGCCTT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 A 5 6 340218 CASAVA_Build 9 29736702 1I TCAGTTACAT -/A AATCATTTAT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 A 2 3 340219 CASAVA_Build 9 29737245 1D CTGGGTAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 10 12 A 13 12 340220 CASAVA_Build 9 29738495 3I TAGCAGTATA ---/AAG AAGAGGAAAT 3070 het 3070 ref 47 20 17 10 AAG 1 2 340221 CASAVA_Build 9 29743521 2I AATTTCAGTT --/TC TTAATTTGTA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 TC 0 1 340222 CASAVA_Build 9 29743638 4I ATGATCTATC ----/TATT CATTTATGTT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 TATT 0 1 340223 CASAVA_Build 9 29744030 1D TTTCTTTTTT C/- CCTCCCAGGT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 C 3 2 340224 CASAVA_Build 9 29752479 1I AAACTTATAG -/A AATGCAAAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 2 3 340225 CASAVA_Build 9 29759187 1D AGCCCAGCTT A/- AAAAAAAAAA 2107 het 2107 ref 23 13 7 4 A 12 11 340226 CASAVA_Build 9 29762668 1D CCCTTAGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 A 10 9 340227 CASAVA_Build 9 29764068 1I TTCAGGAGGG -/T TTGCAGATTA 3070 het 3070 ref 54 33 15 6 T 2 3 340228 CASAVA_Build 9 29766512 1D AAACAGAAGC A/- AAAAAAACTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 8 7 340229 CASAVA_Build 9 29768248 1I ATACATCTTA -/G GGGGGGGTTT 2744 het 2744 ref 27 15 8 4 G 7 8 340230 CASAVA_Build 9 29768828 1I TGTATTTTTT -/C CCCCCTCAAT 3070 het 3070 hom 24 8 16 0 C 5 6 340231 CASAVA_Build 9 29770975 4D GAGCAGTAAC ACAG/---- ACAATCAGTT 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 ACAG 1 0 340232 CASAVA_Build 9 29771348 1I TTTCAGATAT -/A TTTTTCAGTC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 0 1 340233 CASAVA_Build 9 29777420 1I TACTCACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 19 8 T 12 13 340234 CASAVA_Build 9 29783373 2D GAAACTAGTA TT/-- TTTTTATGAA 3070 het 3070 hom 48 21 20 8 T 7 5 340235 CASAVA_Build 9 29804685 1D TTTCATTTAA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 9 8 340236 CASAVA_Build 9 29812893 1D CATTAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3057 hom 30 10 17 3 A 11 10 340237 CASAVA_Build 9 29838715 6D TCATTAGCAG GGGAAA/------ AGCAGGGAAA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 GGGAAA 1 0 340238 CASAVA_Build 9 29838961 1I ACACTTCTTT -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 47 20 18 9 A 7 8 340239 CASAVA_Build 9 29849686 1D AAAATGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2407 hom 24 7 10 7 A 11 10 340240 CASAVA_Build 9 29852494 4D AGAAATAGAA AGGG/---- AATGTAGAGA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 AGGG 1 0 340241 CASAVA_Build 9 29854292 1I TCTGGCAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2544 hom 28 9 13 6 A 12 13 340242 CASAVA_Build 9 29857656 1I CTGGGTCCTA -/G GTAATACTAA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 G 1 2 340243 CASAVA_Build 9 29865432 4D ATTGATAGAT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 het 3070 ref 34 15 11 9 ATAG 5 4 340244 CASAVA_Build 9 29882112 1D AGCCTACCAA C/- CAAAAAAAAA 1781 het 968 hom 18 6 7 5 C 2 1 340245 CASAVA_Build 9 29914337 3I ATGTGGGAAA ---/TAT TATTAAATAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TAT 1 2 340246 CASAVA_Build 9 29915019 5I GACTATAATC -----/AGATA AGATGTTGCC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 AGATA 0 1 340247 CASAVA_Build 9 29927451 2I CAAAAAAGAC --/TG TATCTTTCCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TG 0 1 340248 CASAVA_Build 9 29933098 1D TAGGGAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 40 1 31 10 A 11 10 340249 CASAVA_Build 9 29937443 1D TTTGGGGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 23 10 T 12 11 340250 CASAVA_Build 9 29940250 1I GGTTTTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 34 0 22 12 T 12 13 340251 CASAVA_Build 9 29941614 1I CGCCTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 487 hom 24 2 18 4 T 10 11 340252 CASAVA_Build 9 29943979 1D GCCTCATATA T/- TTTGATTATG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 4 3 340253 CASAVA_Build 9 29945736 5D TTATTTACAT TTAAG/----- TTTTTTTATT 3070 hom 57 het 20 0 20 3 TTAAG 1 0 340254 CASAVA_Build 9 29946021 3I TTCTTTCTTT ---/ATA TCAGAGTAGT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ATA 0 1 340255 CASAVA_Build 9 29949301 1D CCCTCTTTTT C/- CTCTCTCTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 2 1 340256 CASAVA_Build 9 29956056 4D TCTTGTGAGA ACTC/---- ACTCACTATC 3070 hom 129 het 50 0 44 7 ACTC 2 1 340257 CASAVA_Build 9 29958379 2I CTTTTCTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 12 14 340258 CASAVA_Build 9 29959783 1I GTCCACAGGT -/G GCCACTAGCA 3070 hom 132 het 52 0 43 9 G 1 2 340259 CASAVA_Build 9 29993967 2I AGTATTCCAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 45 0 29 16 TG 5 6 340260 CASAVA_Build 9 30005837 5I AAATATTTCA -----/TATAT TATATATATG 2185 hom 12 het 6 0 5 1 TATAT 1 2 340261 CASAVA_Build 9 30011036 2D TGCAATAAAC AT/-- ATGTGTGCAT 3070 hom 72 het 25 0 25 1 AT 2 1 340262 CASAVA_Build 9 30020366 1I ATAGAACCTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 9 340263 CASAVA_Build 9 30033355 1D TGCATCTTAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 41 het 17 0 14 3 T 10 9 340264 CASAVA_Build 9 30034319 4D TCTGCAATTT ATTA/---- ATTGAGTTGT 3070 hom 102 het 40 0 35 7 ATTA 1 0 340265 CASAVA_Build 9 30048026 1I GATATATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 34 0 30 4 A 11 12 340266 CASAVA_Build 9 30049724 1I AGATAGCAAC -/T TTTTTTTTTT 2513 het 2513 ref 28 13 7 8 T 11 12 340267 CASAVA_Build 9 30059327 1I TATATGCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 964 hom 28 3 18 7 T 13 14 340268 CASAVA_Build 9 30060319 1I GAAAAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 het 730 hom 18 4 11 3 T 0 1 340269 CASAVA_Build 9 30060883 1I TACACAATAG -/A AAAATGATAA 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 A 4 5 340270 CASAVA_Build 9 30070750 1I ACTCTCTTTC -/A AAAAAAAAAA 2268 het 2268 ref 30 11 8 11 A 13 14 340271 CASAVA_Build 9 30072183 1I TATTTGTAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 T 8 9 340272 CASAVA_Build 9 30092734 3I AATTTTATTC ---/TCA TTTTATTTTT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 TCA 0 1 340273 CASAVA_Build 9 30106307 1I TGAAAATAAC -/T TTTTTTACAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 6 7 340274 CASAVA_Build 9 30116116 1I ATTGTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 11 12 340275 CASAVA_Build 9 30119691 1D TTTTTTAAAT A/- AATGAATGAA 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 A 3 2 340276 CASAVA_Build 9 30124860 1D ATTTGATTAG A/- AAAAAAAAAA 1948 het 1872 hom 11 6 4 1 A 12 11 340277 CASAVA_Build 9 30127509 4I CATAGAATGC ----/ACAA ACAAATGGAA 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 ACAA 1 2 340278 CASAVA_Build 9 30129432 1I CTCTAATACG -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 6 7 340279 CASAVA_Build 9 30136774 1D AAAAGCAATC T/- ACTAAAAATT 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 T 1 0 340280 CASAVA_Build 9 30153585 1D CAGAAATACA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 8 7 340281 CASAVA_Build 9 30154487 1I TTTGTCTCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 341 hom 29 1 24 4 T 9 10 340282 CASAVA_Build 9 30160429 3I TTTGTTATTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 93 het 44 0 32 12 TTG 5 6 340283 CASAVA_Build 9 30165176 1D GAGGCACATC T/- TTTTTTTTTA 1798 het 1798 ref 39 28 5 7 T 10 9 340284 CASAVA_Build 9 30171562 13D TGTTTCTTTC TTTTTTCTTTTCT/------------- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 37 12 14 14 TTTTTTCTTTTCT 2 1 340285 CASAVA_Build 9 30173261 1I CCAGCATCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 9 10 340286 CASAVA_Build 9 30181073 3I AATAAGAGTG ---/TAA TAATGTACAT 3070 het 3070 ref 52 29 20 3 TAA 1 2 340287 CASAVA_Build 9 30201535 1D GGTTCCTCAC A/- ATGTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 2 1 340288 CASAVA_Build 9 30202540 1D ATATGTATAA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 8 7 340289 CASAVA_Build 9 30202980 1D AAATATGCTC A/- AAAATTTGTC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 5 4 340290 CASAVA_Build 9 30208608 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2639 het 1720 hom 17 6 7 4 T 13 12 340291 CASAVA_Build 9 30219074 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 24 11 11 3 A 9 7 340292 CASAVA_Build 9 30219243 1D TCAAAAAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1437 hom 23 5 14 6 A 14 13 340293 CASAVA_Build 9 30223265 1I GTATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1616 hom 28 5 11 12 T 15 16 340294 CASAVA_Build 9 30224106 2D TGTGTGTATT TA/-- TATAGTGTAC 3070 het 3070 ref 29 15 9 6 TA 3 2 340295 CASAVA_Build 9 30232115 6D AATGTGGCCC TATTTT/------ TATTTTTATT 3070 het 1778 hom 18 4 8 6 TATTTT 4 3 340296 CASAVA_Build 9 30238089 1I TTGAAACAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 T 9 10 340297 CASAVA_Build 9 30240841 1D GCTACAATTG T/- TAAGTTTCCC 3070 het 3070 ref 49 23 20 7 T 2 1 340298 CASAVA_Build 9 30267477 3D CTAATACAAT ATA/--- ATGATATATA 3070 het 1766 hom 17 5 10 2 ATA 1 0 340299 CASAVA_Build 9 30268089 5D AGTCAAAAAG TAAAA/----- TAAAATTTAA 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 TAAAA 2 1 340300 CASAVA_Build 9 30274862 1D AGTGGCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2291 het 2291 ref 28 12 8 8 T 11 10 340301 CASAVA_Build 9 30283922 3D CATTTTCCTG TCT/--- TCTTCTGAGC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 TCT 3 2 340302 CASAVA_Build 9 30285610 1D AAATATGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 774 hom 30 2 25 3 A 11 10 340303 CASAVA_Build 9 30287019 1I GAATAAATTT -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 6 7 340304 CASAVA_Build 9 30297942 1I TAGGTGGTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 41 17 16 8 T 8 9 340305 CASAVA_Build 9 30302214 1I GCTAATGCTT -/A ACCGTTTGCA 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 A 1 2 340306 CASAVA_Build 9 30305813 1D ATTCACTCAG T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 7 6 340307 CASAVA_Build 9 30306132 1I CTAGATTTAG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 7 8 340308 CASAVA_Build 9 30312006 1I ATGTATGGAA -/T TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 T 6 7 340309 CASAVA_Build 9 30317505 15D AGAAATCACT CCCCATCCCATCTCC/--------------- CCCCATCCCA 3070 hom 63 het 32 0 22 11 CCCCATCCCATCTCC 2 1 340310 CASAVA_Build 9 30318043 1D TCTTTTCATG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 29 14 15 1 T 9 8 340311 CASAVA_Build 9 30326202 1D CTCATCTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 12 12 T 11 10 340312 CASAVA_Build 9 30330474 2I GCCAACAAAC --/AT ATGAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AT 1 2 340313 CASAVA_Build 9 30334448 1D TTTTGGGGGG C/- CTGCTCCCAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 C 2 1 340314 CASAVA_Build 9 30339431 1I GGGGAGGGGA -/G GGAGGAGTGA 3070 het 3070 ref 42 21 12 9 G 2 3 340315 CASAVA_Build 9 30356942 1D GTGATTTTTG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 9 8 340316 CASAVA_Build 9 30359391 1D AGGGGAACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 A 10 9 340317 CASAVA_Build 9 30371732 10I AAAATAAGAC ----------/TCTAAATGCT TCTAAATGCT 3070 het 3070 ref 35 13 10 12 TCTAAATGCT 1 2 340318 CASAVA_Build 9 30397559 1D TTTTCTGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 11 17 7 T 10 9 340319 CASAVA_Build 9 30409282 21D CCATGGCACA TGTATACCTATGTAACAAACC/--------------------- TGCATGTTCT 3070 het 3070 hom 34 17 21 2 TGTATACCTATGTAACAAACC 1 0 340320 CASAVA_Build 9 30426312 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1386 het 1386 ref 16 9 3 6 A 11 10 340321 CASAVA_Build 9 30430312 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 14 1 9 4 A 0 1 340322 CASAVA_Build 9 30434633 1I ATAATGATCC -/A GAAGTGTCAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 0 1 340323 CASAVA_Build 9 30457386 4I AAACAAACAA ----/AAAC AAACAAAACA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AAAC 1 2 340324 CASAVA_Build 9 30461815 4D CTCTTGTCTT CAGA/---- CAATCATTCG 3070 hom 99 het 36 0 34 6 CAGA 1 0 340325 CASAVA_Build 9 30462781 2I TGTGTATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 541 hom 46 3 37 6 TG 7 8 340326 CASAVA_Build 9 30473538 1D AGCAAAAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 9 8 340327 CASAVA_Build 9 30474681 1I ACTTGTGTTA -/T TGGGAGTTTG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 1 2 340328 CASAVA_Build 9 30485788 1D ATCAATAAAC A/- TAGTACATCA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 1 0 340329 CASAVA_Build 9 30488833 3I AAACAAAAAT ---/AAA AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 11 340330 CASAVA_Build 9 30493547 1D AAACTCCATC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 235 hom 32 1 27 4 A 10 9 340331 CASAVA_Build 9 30498455 3D CAGACTAATA TTC/--- TTATTATCTT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 TTC 1 0 340332 CASAVA_Build 9 30513130 4I TGTATGTTTG ----/TATA TATATATGAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TA 3 5 340333 CASAVA_Build 9 30513796 4D AAATTAAATA TAAT/---- TTAATTTTGC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TAAT 1 0 340334 CASAVA_Build 9 30514229 4D ACTGGTAGCT AGCA/---- AGCAACTGCA 3070 hom 160 het 58 0 52 11 AGCA 2 1 340335 CASAVA_Build 9 30516203 1D GGGAGTTCAA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 7 6 340336 CASAVA_Build 9 30520062 1I ATAAACAAAT -/G GAAAAAAGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 G 1 2 340337 CASAVA_Build 9 30527780 2D AAGCTCTCTC TT/-- TGCCTGCTGC 3070 hom 84 het 33 0 29 6 T 3 1 340338 CASAVA_Build 9 30528979 1I AAACAACCAG -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 7 8 340339 CASAVA_Build 9 30529769 13I CGAATACTGC -------------/GCTTTTCCAACGG GCTTAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 GCTTTTCCAACGG 0 1 340340 CASAVA_Build 9 30535946 1I AATTTTATAA -/T TTTTTTCTGC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 6 7 340341 CASAVA_Build 9 30536110 1I TTTGCTTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 9 10 340342 CASAVA_Build 9 30537011 5I ATTTTTAGTT -----/TTATC TTATTATGGT 3070 hom 114 het 42 0 37 5 TTATC 0 1 340343 CASAVA_Build 9 30537540 1I TGGATTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 29 2 T 11 12 340344 CASAVA_Build 9 30539232 3D GTGTTTAGCT TTG/--- TTTTTAAATC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTG 1 0 340345 CASAVA_Build 9 30544168 1I GAAGTTCTGC -/T TACACATGTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 1 2 340346 CASAVA_Build 9 30547048 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 823 hom 32 2 18 12 A 16 15 340347 CASAVA_Build 9 30553590 2D GAAGCATCTC AA/-- GTCACTCTAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 2 0 340348 CASAVA_Build 9 30554737 1D TGATAGGTTG A/- AAACTACCAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 4 3 340349 CASAVA_Build 9 30558419 6I AGGTATTATT ------/ATTATA GTCTATAGAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 ATTATA 0 1 340350 CASAVA_Build 9 30560311 5D AATTTATAGC ACTAA/----- ACTAAATGCC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 ACTAA 2 1 340351 CASAVA_Build 9 30566544 1D ATTCTTACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 10 9 340352 CASAVA_Build 9 30571342 1I AGGATTTAGT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 83 het 33 0 28 5 A 9 10 340353 CASAVA_Build 9 30571816 1I CCATAGAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 10 340354 CASAVA_Build 9 30574087 1D ATCTGAATAT A/- AAAATCTTAA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 5 4 340355 CASAVA_Build 9 30576685 5I CCCAGAACTT -----/ATAAA ATAAAATAAA 2870 hom 15 het 7 0 6 1 ATAAA 2 3 340356 CASAVA_Build 9 30577145 1I TAGTTCTAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 927 hom 31 2 24 5 A 9 10 340357 CASAVA_Build 9 30577330 1D TTGTTGGGGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 29 0 24 5 A 9 8 340358 CASAVA_Build 9 30594158 1I CAGCAGGAAA -/T TTCCTGTCAT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 2 3 340359 CASAVA_Build 9 30595500 8D GGTGTGTATA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 hom 65 het 31 0 21 10 TG 13 9 340360 CASAVA_Build 9 30602104 3I ACATAATTGT ---/ATA ATGTCTTTGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ATA 0 1 340361 CASAVA_Build 9 30626762 1D CTTTTTTTTT A/- ATTATTATTC 3070 hom 21 het 12 0 8 4 A 2 1 340362 CASAVA_Build 9 30630137 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 190 hom 14 2 12 0 A 15 14 340363 CASAVA_Build 9 30640408 1D TGGCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 758 hom 32 2 26 4 A 12 11 340364 CASAVA_Build 9 30647322 3D CAGATTTTGT AAC/--- AAACCTGCAT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 AAC 1 0 340365 CASAVA_Build 9 30650822 1I TGTATGTTCA -/T TTTTTTGAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 6 7 340366 CASAVA_Build 9 30651131 4I TTTGAATGTT ----/TAAG TAGCCAAATA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TAAG 0 1 340367 CASAVA_Build 9 30659762 1D GTTTGTCAAA G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 39 het 36 0 26 10 G 5 4 340368 CASAVA_Build 9 30681472 1I TGGCAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 11 12 340369 CASAVA_Build 9 30725488 1I TACAAATATC -/T TGGGGGGGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 1 2 340370 CASAVA_Build 9 30727690 1D CATCTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 34 1 29 4 T 11 10 340371 CASAVA_Build 9 30728164 2I TTGATTTTTA --/AT ATATATATAT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 AT 7 8 340372 CASAVA_Build 9 30728444 1I TGCCTTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 10 11 340373 CASAVA_Build 9 30728713 3D ACTCCATGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 42 3 14 25 T 19 16 340374 CASAVA_Build 9 30728812 1D AACCCCAAAA T/- TGGGACCCGA 3070 hom 84 het 29 0 28 1 T 2 1 340375 CASAVA_Build 9 30728889 1D AAGAAAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 26 0 19 7 T 13 12 340376 CASAVA_Build 9 30730175 1D ACTTATATAT A/- AATATAAAAC 2108 hom 12 het 5 0 5 1 A 3 2 340377 CASAVA_Build 9 30739780 1D ACAGTACATT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 7 6 340378 CASAVA_Build 9 30743097 1D TAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1008 hom 7 het 4 0 3 1 T 1 0 340379 CASAVA_Build 9 30743340 1I CTTTATATAG -/T TTTTTTGTCA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 6 7 340380 CASAVA_Build 9 30757538 1I GAAAGTTACA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 T 8 9 340381 CASAVA_Build 9 30762541 1I GATTATTCCT -/G CAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 G 0 1 340382 CASAVA_Build 9 30765946 1I CCTTTTTCTA -/T TTGTCTTTTA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 T 2 3 340383 CASAVA_Build 9 30766848 1I ATGAAAAGAT -/A TTTTGCGTTC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 0 1 340384 CASAVA_Build 9 30770741 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1225 hom 22 4 15 5 T 10 11 340385 CASAVA_Build 9 30779759 1D CTTTTTATTC T/- TTTTTTGTCT 3070 hom 18 het 8 0 7 1 T 7 6 340386 CASAVA_Build 9 30789141 1D CTTACCTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 T 12 11 340387 CASAVA_Build 9 30793833 4D TGTATATGCT GGGG/---- GGGGGGGTAA 3070 het 77 hom 11 1 7 5 G 11 7 340388 CASAVA_Build 9 30796333 1I GGAGCAAAAT -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 7 8 340389 CASAVA_Build 9 30797111 1D ATCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 10 10 T 11 10 340390 CASAVA_Build 9 30799482 1D TAAAACCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 20 6 T 11 10 340391 CASAVA_Build 9 30807599 1I GTTAGGACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1620 hom 28 5 17 6 A 13 14 340392 CASAVA_Build 9 30810048 4D TCACTTCTCT TGAG/---- TAAGTACATA 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TGAG 1 0 340393 CASAVA_Build 9 30818520 1D GGTATATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 11 10 340394 CASAVA_Build 9 30819414 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 11 10 340395 CASAVA_Build 9 30821278 1I TAAATTATTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 T 8 9 340396 CASAVA_Build 9 30821391 21D GGCGAGGTGG CTCAAGCCTGTAATCCCAGCA/--------------------- CTTTGGGAGG 3070 het 3070 hom 23 9 16 0 CTCAAGCCTGTAATCCCAGCA 1 0 340397 CASAVA_Build 9 30822123 1D CTTAATGGCC T/- TGTCCTTGGG 2042 het 1689 hom 15 5 7 3 T 2 1 340398 CASAVA_Build 9 30824001 2D CTGTGTCTTT AC/-- ACACATATAT 3070 het 3070 hom 39 18 19 3 AC 3 2 340399 CASAVA_Build 9 30831718 1D CCATTACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 12 10 T 11 10 340400 CASAVA_Build 9 30843360 1D TCTGGTTCCT C/- TAGAATTTGG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 C 1 0 340401 CASAVA_Build 9 30861794 1I GGGAGGCTGA -/G GGGGGGGCGG 1872 het 1284 hom 12 4 4 4 G 7 8 340402 CASAVA_Build 9 30868524 6D TCCCATTGTT ATTTTG/------ ATTTGCATTT 3070 het 3070 ref 25 15 7 6 ATTTTG 1 0 340403 CASAVA_Build 9 30879161 3D CTCCTGCCCC CTT/--- CTTCTCTATT 2590 het 2590 ref 38 24 8 7 CTT 2 1 340404 CASAVA_Build 9 30883910 6D TAATGAAATG TTATAC/------ TTATATATAA 3070 het 3070 hom 38 13 23 3 TTATAC 1 0 340405 CASAVA_Build 9 30888730 1D TCAGGGTGAT C/- CGGATCTCTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 C 2 1 340406 CASAVA_Build 9 30898010 1D GGTAGGCTTA G/- AATTACCATT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 G 1 0 340407 CASAVA_Build 9 30901157 2D CTTCTCTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 2202 het 1266 hom 29 9 8 12 T 16 14 340408 CASAVA_Build 9 30903602 3D CTAGGATGTC GCG/--- GCGCTCACCA 3070 het 3070 hom 34 14 15 7 GCG 2 1 340409 CASAVA_Build 9 30912037 4I CAGCTTTCAA ----/TAAT GTAGTGGAGA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 TAAT 0 1 340410 CASAVA_Build 9 30916263 7I TCAGGACCTA -------/TACAATC TACTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 TACAATC 0 1 340411 CASAVA_Build 9 30937959 1I GTTCTTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 10 340412 CASAVA_Build 9 30943872 2I ATATATACAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 87 het 39 0 30 9 AT 6 7 340413 CASAVA_Build 9 30951494 1D AAGTTCTTTC T/- TCTGCTTATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 1 340414 CASAVA_Build 9 30951635 1I TTTTTGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 331 hom 29 2 17 10 T 13 14 340415 CASAVA_Build 9 30955385 3D TATTAATATG TAT/--- TATTATGAAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 TAT 3 2 340416 CASAVA_Build 9 30958988 1D TCAAATATGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 8 340417 CASAVA_Build 9 30959298 4I TTATCATAAC ----/AAAT AAAAACACTG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAAT 0 1 340418 CASAVA_Build 9 30960456 2D GATGACTGTC TT/-- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 T 7 5 340419 CASAVA_Build 9 30961696 1I AACAGTCTCC -/A ATCCACTTCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 340420 CASAVA_Build 9 30962428 1I ACTGAACCCC -/T GTCTCTACAA 3070 hom 61 het 25 0 20 5 T 0 1 340421 CASAVA_Build 9 30965347 1I CCTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 96 hom 37 1 30 6 T 9 10 340422 CASAVA_Build 9 30966095 1D GACTATTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 48 1 35 13 A 16 15 340423 CASAVA_Build 9 30966899 1I CTGTGATTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 8 9 340424 CASAVA_Build 9 30966957 5D CAATAAAAAT GAAAA/----- GAAGTTAATG 2475 het 2475 ref 21 7 6 9 GAAAA 1 0 340425 CASAVA_Build 9 30967329 3I TGAGAATGAT ---/CTC CTCCATACTG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 CTC 1 2 340426 CASAVA_Build 9 30978133 1D CCTTCTTGGT G/- GGCAAATGAT 3070 hom 129 het 47 0 44 4 G 3 2 340427 CASAVA_Build 9 30983164 1D CAGGCGGTTG T/- TTTTTTTTTT 2453 het 61 hom 11 1 7 3 T 11 10 340428 CASAVA_Build 9 30988182 2I ACAGGCAACA --/AC AAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 13 10 AC 0 1 340429 CASAVA_Build 9 30988569 1I AACAAATCAA -/T CAAAATAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 T 0 1 340430 CASAVA_Build 9 30988936 1D TGACATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 11 10 340431 CASAVA_Build 9 30994336 2D CCACTTAAAC AT/-- AGTCATTGTA 3070 het 3070 ref 35 22 10 4 AT 1 0 340432 CASAVA_Build 9 30998722 1D TGATAAAAAC T/- CTCGAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 T 1 0 340433 CASAVA_Build 9 31003222 4D ACAAAAAAAC AAAG/---- AAAGAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 AAAG 2 1 340434 CASAVA_Build 9 31003982 9D TACAAACGAC ACCACAGAA/--------- ATACAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 17 14 3 ACCACAGAA 1 0 340435 CASAVA_Build 9 31008488 2D ATATAGAAAC TT/-- ATATTAATTT 3070 het 3070 ref 38 25 9 4 T 2 0 340436 CASAVA_Build 9 31011147 1D GAGGTGGGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 11 10 340437 CASAVA_Build 9 31014338 2I ACCATGGAGT --/TG CTATATTCTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 TG 0 1 340438 CASAVA_Build 9 31019303 1D TCTTTGGGTA G/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 1 0 340439 CASAVA_Build 9 31020736 1D ATAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 A 10 9 340440 CASAVA_Build 9 31021271 2I ATTTTGTCTC --/TT TTTATGATAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 3 5 340441 CASAVA_Build 9 31022167 1I ATAGTTCAAA -/T TTAGGGATGG 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 2 3 340442 CASAVA_Build 9 31029305 1D ATCACTAAAT A/- AAAAAGACTT 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 6 5 340443 CASAVA_Build 9 31031792 1I TTTCTAGGTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 7 8 340444 CASAVA_Build 9 31038548 1D TTATTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 T 14 13 340445 CASAVA_Build 9 31041467 1I AATTTTATTG -/T TTTTTTTTTT 2665 het 1160 hom 14 3 6 5 T 11 12 340446 CASAVA_Build 9 31041584 1D CGTCTTTCAG C/- ATTAGGTATA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 C 1 0 340447 CASAVA_Build 9 31046093 5D TCAAATTCCC TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TTTTA 5 4 340448 CASAVA_Build 9 31056907 1I CCAATTACAG -/A AAAAAATGAG 3070 hom 169 het 62 0 57 5 A 6 7 340449 CASAVA_Build 9 31068604 2D CAGGTAAAAC AG/-- AAGAAAATTA 3070 het 3070 hom 37 17 19 2 AG 1 0 340450 CASAVA_Build 9 31070466 2I ATGAAATTCA --/TG TGGTGAAATT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 TG 1 2 340451 CASAVA_Build 9 31081441 1I GAGTTGTGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 9 10 340452 CASAVA_Build 9 31085564 4D ACAGAAAGAA AGAC/---- AGAAAGAAGG 2500 het 850 hom 27 4 9 16 AGAC 1 0 340453 CASAVA_Build 9 31085587 3D GAAAGAAAGA AAG/--- AAGAAGAAAT 3070 het 2914 hom 33 8 17 8 AAG 3 2 340454 CASAVA_Build 9 31087555 1D ATACACCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 12 11 340455 CASAVA_Build 9 31088417 5I CTAAAATGAA -----/TAAAC TAATGATACA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 TAAAC 0 1 340456 CASAVA_Build 9 31092457 3D GACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 3050 het 2897 hom 28 8 7 13 ATA 6 5 340457 CASAVA_Build 9 31094229 1I GTGAATCTGC -/A CACATGTTGA 3070 het 3070 ref 59 28 25 6 A 0 1 340458 CASAVA_Build 9 31094417 8D AAACTGCCCT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 50 29 15 10 AC 10 6 340459 CASAVA_Build 9 31096356 1D AAGGTTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 11 10 340460 CASAVA_Build 9 31096841 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 8 9 340461 CASAVA_Build 9 31097816 1I GATTGATTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 8 9 340462 CASAVA_Build 9 31110323 2I GGGCTGAGTC --/TG TGTAAATTTT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 TG 1 2 340463 CASAVA_Build 9 31116816 4D AAAAGAACAA AGTT/---- AGAGGTATCA 3070 het 3070 ref 33 20 10 5 AGTT 1 0 340464 CASAVA_Build 9 31123664 1D TAATATCCAT G/- GAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 23 12 5 G 2 1 340465 CASAVA_Build 9 31124699 1D AACAACAAAA C/- AAAAACAGTA 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 C 1 0 340466 CASAVA_Build 9 31124845 4I TAAAAATGCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 72 het 32 0 25 7 AAAC 3 4 340467 CASAVA_Build 9 31125050 4D AAAGAAAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 hom 84 het 33 0 29 6 AG 10 8 340468 CASAVA_Build 9 31125150 7I TAAATATATG -------/GCCATCT GCCATCTGAG 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 GCCATCT 1 2 340469 CASAVA_Build 9 31125355 1D TAGTTCTCTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 49 20 26 4 T 9 8 340470 CASAVA_Build 9 31126309 4I AAAGGAAGAA ----/AGAG AGAGAAAGGG 2284 het 1462 hom 22 10 8 4 AG 2 4 340471 CASAVA_Build 9 31127867 1I TCTTTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 23 17 11 T 10 11 340472 CASAVA_Build 9 31128858 1D TAAACGTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 A 9 8 340473 CASAVA_Build 9 31130312 1I65M1D ACTTTGAAGA -TTCAATCATTATATCTAGAGACTTACTTGTAATTATGATTTTAGAATGAGCCTATTGAAGTGTAGT/GTTCAATCATTATATCTAGAGACTTACTTGTAATTATGATTTTAGAATGAGCCTATTGAAGTGTAG- TTTCTGAGCT 3070 het 3070 ref 39 29 18 17 N/A 0 0 340474 CASAVA_Build 9 31131298 18I TCCTTCTTGA ------------------/GAACTAGTCTTTTTTTCG GAAATAGTCT 3070 het 3070 hom 32 16 15 2 GAACTAGTCTTTTTTTCG 0 1 340475 CASAVA_Build 9 31131715 3I ATATAAATAA ---/TAT TTTAAAACTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TAT 0 1 340476 CASAVA_Build 9 31134328 1I GTGTTTTATA -/C CCTTCTAGGA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 C 2 3 340477 CASAVA_Build 9 31135088 1I GCTAAGTACC -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 6 7 340478 CASAVA_Build 9 31135527 1D TCATTTGCAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 9 8 340479 CASAVA_Build 9 31138860 1I ATTATCTAAC -/T TTGTCAAAAT 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 T 2 3 340480 CASAVA_Build 9 31143836 1I CACACCTTTT -/A AAAAAATCAG 2970 het 2970 ref 24 12 7 5 A 6 7 340481 CASAVA_Build 9 31144625 1I TTGTATTAGG -/A GAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 A 0 1 340482 CASAVA_Build 9 31144728 4I CATTGTACAT ----/AAAC AAATCATAAA 3070 het 2454 hom 20 6 13 1 AAAC 0 1 340483 CASAVA_Build 9 31146917 5I TTTAACTTAC -----/TCTTT TCTTAATTGA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 TCTTT 0 1 340484 CASAVA_Build 9 31149247 1I TTGAAAATTC -/T TTTCTTTAAG 1969 hom 10 het 6 0 4 2 T 3 4 340485 CASAVA_Build 9 31152109 3I TGCTTTTCTG ---/TTC TTCTAAATAA 3070 het 3070 ref 33 20 12 1 TTC 1 2 340486 CASAVA_Build 9 31152696 1D GCTTTCATGG T/- TTTTTTTTTT 821 het 821 ref 32 25 4 3 T 12 11 340487 CASAVA_Build 9 31162589 4D TTGGTTTTGC TGTT/---- TGTTTGTCTT 3070 hom 110 het 40 0 37 4 TGTT 2 1 340488 CASAVA_Build 9 31165998 2D ACACATATGC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 7 hom 40 1 16 23 T 11 9 340489 CASAVA_Build 9 31166770 1D GGAAACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 30 2 12 16 A 13 12 340490 CASAVA_Build 9 31167571 2D CTGATTTCCA TT/-- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 10 8 340491 CASAVA_Build 9 31169615 5I AGACAGAAAA -----/TATAT TATATTACCA 3070 hom 68 het 29 0 23 6 TATAT 1 2 340492 CASAVA_Build 9 31172804 1I CTTAAAAACT -/A AGAGCATTGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 1 2 340493 CASAVA_Build 9 31173742 3D AACAATTTTG TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 27 10 12 7 TAA 4 3 340494 CASAVA_Build 9 31174026 21I TAGCAGGAGA ---------------------/TGGATATTGGCTGAATATGTT ATGGCGATTG 3070 hom 123 het 41 0 41 3 TGGATATTGGCTGAATATGTT 0 1 340495 CASAVA_Build 9 31180518 4D AGTTATAGTA AGTT/---- AAGTTTATCA 3070 hom 56 het 20 0 19 3 AGTT 1 0 340496 CASAVA_Build 9 31182585 2D TTGTATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 17 het 33 1 20 12 AC 6 5 340497 CASAVA_Build 9 31183382 1D GATTAGCACA G/- AAAGGAGAGG 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 G 1 0 340498 CASAVA_Build 9 31183653 2I AAAAGATAAC --/TG TGAATGCCTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 TG 1 2 340499 CASAVA_Build 9 31185277 9I AAAAGAGATA ---------/TTTTTGTAT TTTAAGCCAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTTTTGTAT 0 1 340500 CASAVA_Build 9 31185630 4I AGGGATTCCA ----/AAGT AAGTAAAATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AAGT 1 2 340501 CASAVA_Build 9 31185924 1I31M2D CATTCAATAA -TTTTTTTCATAAATATCTGAACATCATTGAGCA/TTTTTTTTCATAAATATCTGAACATCATTGAG-- CTTTTCTAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 7 N/A 0 0 340502 CASAVA_Build 9 31187422 5D GTTATTACTA CTCTC/----- CTCCTGGTGC 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 CTCTC 1 0 340503 CASAVA_Build 9 31188893 1I GGGCTATGGC -/A AATAAATTCT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 2 3 340504 CASAVA_Build 9 31191611 1D TGCAATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 12 11 340505 CASAVA_Build 9 31192688 4I CATAAAAAAT ----/AAAC AAACTATTAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 AAAC 1 2 340506 CASAVA_Build 9 31193195 4I ATACCGTTTG ----/TTCT TTCTATCTCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTCT 1 2 340507 CASAVA_Build 9 31194844 5D TTTTAAACAA CACAC/----- TATAAGAGGC 3070 het 3070 ref 36 18 17 3 CACAC 1 0 340508 CASAVA_Build 9 31198493 1D77M2I GAGGGCATTG AAATGCCTGCAGTTGGGAGAAAGAAGATTAGGAACTTAATAATTTGATCAACTTTGCCAGCTACAGAAAGATTAAGGC--/-AATGCCTGCAGTTGGGAGAAAGAAGATTAGGAACTTAATAATTTGATCAACTTTGCTAGCTACAGAAAGATTAAGGCGA GAGAGAGCTG 3070 hom 169 het 47 0 57 23 N/A 0 0 340509 CASAVA_Build 9 31199199 1I AATGCATGGA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 8 9 340510 CASAVA_Build 9 31203626 4D ATAAATGTAC TTTG/---- TTTGTCTAAG 3070 het 3070 hom 43 19 20 7 TTTG 2 1 340511 CASAVA_Build 9 31203956 6D GTCTTTCCTC AGTATA/------ AGTATATGAA 2680 het 2680 ref 38 21 9 8 AGTATA 2 1 340512 CASAVA_Build 9 31206789 1I AGTTCTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 32 1 26 5 T 10 11 340513 CASAVA_Build 9 31209090 4D CCATGTCTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 54 het 23 0 19 6 AAAT 4 3 340514 CASAVA_Build 9 31210535 1D ACAAATCAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 10 9 340515 CASAVA_Build 9 31211691 3D TTTCAATTAA AAT/--- AATATTAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAT 2 1 340516 CASAVA_Build 9 31212054 5I TTAATTTCTC -----/TCCTT TAAGTGCCTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TCCTT 0 1 340517 CASAVA_Build 9 31212433 4I AAATTTCCAC ----/CTAT CTATCTATTT 3070 hom 126 het 50 0 43 7 CTAT 2 3 340518 CASAVA_Build 9 31214748 1D TTCTACTGTG T/- TTTTTTTTTT 2867 het 2230 hom 25 9 8 8 T 12 11 340519 CASAVA_Build 9 31221893 1I AATTAAATAA -/G AACTAGTCCC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 G 0 1 340520 CASAVA_Build 9 31224523 1D TATCTTCCAA T/- TTTTTGAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 6 5 340521 CASAVA_Build 9 31225542 1D CACTTCTTAT G/- GGAAAGTGAA 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 G 3 2 340522 CASAVA_Build 9 31227580 1I ATTTGATCTC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 7 8 340523 CASAVA_Build 9 31228193 3D TTAAGATAAG AGA/--- AGTAGTTTGA 3070 het 3070 hom 42 14 27 3 AGA 1 0 340524 CASAVA_Build 9 31230661 1I TATGACTATA -/T TAATCAAATC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 1 2 340525 CASAVA_Build 9 31234214 4D ATATCAAGAC AATA/---- AAATTACTAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 5 AATA 1 0 340526 CASAVA_Build 9 31236799 1I ATTATTGTTG -/T TAAGTCTTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 1 2 340527 CASAVA_Build 9 31238548 6I GAAAAACAGA ------/TTTTCT TTTCCTGTTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTTTCT 0 1 340528 CASAVA_Build 9 31245106 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 15 4 A 11 10 340529 CASAVA_Build 9 31246399 1I33M2D AATAATGCTT -AAAATTGTTATGATAAAAATGTTTAAGACATTCAA/AAAAATTGTTATGATAAAAATGTTTAAGACATTC-- AAAAGATACA 3070 hom 99 het 32 0 34 4 N/A 0 0 340530 CASAVA_Build 9 31248062 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TA 6 5 340531 CASAVA_Build 9 31249970 1D AACCCTGATG A/- AAAACGACAG 3070 hom 126 het 50 0 41 10 A 5 4 340532 CASAVA_Build 9 31252139 1I CTAAAAATGC -/A AAAAAACATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 6 7 340533 CASAVA_Build 9 31253065 1D GTTTTGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 35 0 28 7 T 13 12 340534 CASAVA_Build 9 31253872 1I CAGTCCCAGC -/G CTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 0 1 340535 CASAVA_Build 9 31253959 1D TTCATCTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 99 het 35 0 34 3 A 10 9 340536 CASAVA_Build 9 31256816 1D ATTCTCAGAA T/- TTTTTTATAG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 7 6 340537 CASAVA_Build 9 31257703 8I CTCTTCTTTC --------/TCTTTCTT TCTTTCTTTC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TCTT 3 5 340538 CASAVA_Build 9 31260102 11I AGAGAGGCAC -----------/ACATAGAGAAT ATTTATATAG 3070 hom 114 het 44 0 37 7 ACATAGAGAAT 0 1 340539 CASAVA_Build 9 31266852 2I AAAGATATAG --/AT ATATATATAT 3070 het 879 hom 26 2 23 1 AT 7 8 340540 CASAVA_Build 9 31282237 1D CAATGCAAAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 72 het 32 0 24 9 A 8 7 340541 CASAVA_Build 9 31290435 1I TCTAATATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 11 340542 CASAVA_Build 9 31296576 1D AAGATTCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 329 hom 36 3 23 10 A 15 14 340543 CASAVA_Build 9 31303050 1D TGTGGATTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 63 het 26 0 21 6 T 8 7 340544 CASAVA_Build 9 31307132 4D AGGAAAAAAC GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 30 11 8 11 GAAG 4 3 340545 CASAVA_Build 9 31331856 4I TTTGAATATT ----/CAAA CAAAGGGATT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 CAAA 1 2 340546 CASAVA_Build 9 31336639 5D ACTGATACTC TGTTT/----- TAATTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 TGTTT 1 0 340547 CASAVA_Build 9 31352603 2I AAAAAATGAC --/AT GTTAGTGAAT 3070 het 3070 hom 47 19 26 2 AT 0 1 340548 CASAVA_Build 9 31356687 4I TTTTTATTAT ----/TTTA TTTGAGGGAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 TTTA 0 1 340549 CASAVA_Build 9 31365340 1D TTTAAAGTAG T/- TTTTTCCAAT 1458 het 239 hom 4 1 3 0 T 6 5 340550 CASAVA_Build 9 31373318 2I AAAGAATGTG --/AA AGTGCCCAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 1 3 340551 CASAVA_Build 9 31376236 1D TTTATCACAT A/- AAAAAATCCA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 7 6 340552 CASAVA_Build 9 31378380 4D TCCTAAAAAT TAAG/---- TAATAAAGGA 3070 het 3070 ref 47 29 15 4 TAAG 1 0 340553 CASAVA_Build 9 31382182 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTGTTTTT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 4 5 340554 CASAVA_Build 9 31386763 1D TTATTTGAAG A/- AAAAAATAAC 3070 hom 115 het 50 0 39 18 A 7 6 340555 CASAVA_Build 9 31394564 1I CAATTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 33 0 18 15 A 13 14 340556 CASAVA_Build 9 31397146 1D TAATTCCCCC T/- CATCCCCTTA 3070 het 3070 hom 16 7 9 0 T 1 0 340557 CASAVA_Build 9 31408369 4D ATGATTTTTA TTCT/---- TTCTGTTAAT 3070 het 3070 ref 39 23 10 11 TTCT 2 1 340558 CASAVA_Build 9 31412510 4I AACTAATAAT ----/AGAC AGACGCAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 AGAC 1 2 340559 CASAVA_Build 9 31416373 2I CTGTTCAAGT --/CA CAGTTTCATA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CA 1 2 340560 CASAVA_Build 9 31418710 1I TATTGTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 39 1 25 13 A 11 12 340561 CASAVA_Build 9 31436501 1D TTTAAGTCAT A/- AGGGAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 A 2 1 340562 CASAVA_Build 9 31437860 5I AGGGCCTCAA -----/TATAT GTTTATATCA 3070 het 2440 hom 26 5 18 3 TATAT 0 1 340563 CASAVA_Build 9 31439212 14D CTGAATATAG TTCTGAAAAACTAA/-------------- CTTCTGAAAA 3070 het 3070 hom 51 25 26 1 TTCTGAAAAACTAA 1 0 340564 CASAVA_Build 9 31442969 1I TTCATTAAAT -/A GGGGGAATCA 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 0 1 340565 CASAVA_Build 9 31444968 3I TTTATGAAAT ---/AAC AACAAGAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 AAC 1 2 340566 CASAVA_Build 9 31445691 2I ACATTATCAG --/AA AAAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 6 8 340567 CASAVA_Build 9 31446925 5D TAAGAATACT TAACA/----- TAAGATCTAC 3070 het 3070 ref 44 22 21 3 TAACA 1 0 340568 CASAVA_Build 9 31447549 1D CTGGCAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 11 10 340569 CASAVA_Build 9 31447810 1D TATTTTGAAA T/- ATTTTATTTT 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 T 1 0 340570 CASAVA_Build 9 31451998 1I TGATACAGGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 44 23 12 9 A 8 9 340571 CASAVA_Build 9 31453527 1I TAGAAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 A 10 11 340572 CASAVA_Build 9 31453817 1D CAAATACCCC A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 A 7 6 340573 CASAVA_Build 9 31455476 1D TATAAAGTGC A/- GCAAGAATAA 3070 het 3070 hom 23 9 14 1 A 1 0 340574 CASAVA_Build 9 31456549 1D CTAAACACCA T/- TTTGTATTTG 3070 het 3070 hom 36 17 19 0 T 4 3 340575 CASAVA_Build 9 31456973 3I ATTCCTGTGC ---/CTT CTTATAATAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 CTT 1 2 340576 CASAVA_Build 9 31459443 1D ACTTTACTGA G/- GGGGGCTCTA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 G 6 5 340577 CASAVA_Build 9 31459949 1I ACTCCATAGG -/C AATAGACAGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 C 0 1 340578 CASAVA_Build 9 31460513 1D25M1D AACATGAAAG AAAAAAAGTTCTAGAAATAAAAGTACT/-AAAAAAGTTCTAGAAATAAAAGTAC- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 25 18 10 4 N/A 0 0 340579 CASAVA_Build 9 31461963 2D AAAAAATGGC AG/-- AGTTTAACTG 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AG 2 1 340580 CASAVA_Build 9 31464049 1I GAAGAGTGAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 7 8 340581 CASAVA_Build 9 31469616 1D CAAACTATGG A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 A 7 6 340582 CASAVA_Build 9 31490029 3I GGAATCTGAG ---/TCC TCCTGATCTG 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 TCC 1 2 340583 CASAVA_Build 9 31491185 1D TCCGCCTCCC G/- GATTCAAGTG 2081 het 282 hom 9 1 6 3 G 2 1 340584 CASAVA_Build 9 31491516 4D TCAAAAAACC AACT/---- AACTTAGTTC 3070 het 3070 ref 37 19 17 3 AACT 2 1 340585 CASAVA_Build 9 31499772 2D TTTACTTTAC AT/-- ATATATATAT 2457 het 2404 hom 15 5 6 5 AT 7 6 340586 CASAVA_Build 9 31505579 1I AGTTTTCAGC -/A ATGAAGGGGT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 A 1 2 340587 CASAVA_Build 9 31509950 1I GCCAGTTTAA -/T AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 0 1 340588 CASAVA_Build 9 31511633 1D TCGGAGTCTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 22 10 10 T 9 8 340589 CASAVA_Build 9 31511968 1D ATTTTTTTTT A/- AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 8 7 340590 CASAVA_Build 9 31513639 1D AATAAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 10 9 340591 CASAVA_Build 9 31513748 1I GATTTTTGGC -/A AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 7 8 340592 CASAVA_Build 9 31514944 2D ATCCATTAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 A 13 11 340593 CASAVA_Build 9 31515481 1I ATCATTCCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 A 9 10 340594 CASAVA_Build 9 31524090 7D CCTCCTCCCG CCCTCCA/------- CCCTCCACCC 2742 het 2169 hom 23 7 12 5 CCCTCCA 2 1 340595 CASAVA_Build 9 31529821 1D TCCCGTTTTT A/- ATTTTCCTAT 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 A 2 1 340596 CASAVA_Build 9 31533358 1D CCTAGAAATG T/- TTTTTTATAT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 T 7 6 340597 CASAVA_Build 9 31533560 1I ATCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 679 hom 41 3 31 7 A 9 10 340598 CASAVA_Build 9 31534883 3D TTTTTGTAGA GAG/--- GAGATCTCCC 923 het 923 ref 23 6 6 13 GAG 2 1 340599 CASAVA_Build 9 31541247 1D TAAAACCATA C/- AAATATAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 C 1 0 340600 CASAVA_Build 9 31544026 1I TTATTATCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 T 9 10 340601 CASAVA_Build 9 31546281 2I TAGTAGAGAG --/AA AGAGAGAGAG 3070 hom 34 het 31 1 25 5 A 1 3 340602 CASAVA_Build 9 31556737 1D TCTTGATTCT G/- ATTGAGTATG 3070 het 3070 ref 53 30 17 8 G 1 0 340603 CASAVA_Build 9 31566898 29D TCAATATATG AATTTGGGGAATAAATTTTCAACACACAA/----------------------------- AATTTGGGGG 2398 het 2398 ref 24 17 9 3 AATTTGGGGAATAAATTTTCAACACACAA 1 0 340604 CASAVA_Build 9 31568918 4I ATAAATGATA ----/TTTT CTAAATTACT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 T 0 4 340605 CASAVA_Build 9 31569760 2D GTTGGACTAC AT/-- ATGTTTATAT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 AT 2 1 340606 CASAVA_Build 9 31570872 1D AAGACAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1333 hom 51 4 31 16 T 13 12 340607 CASAVA_Build 9 31578886 26I ATTCTTGATC --------------------------/ACACACAGCTTCATTTAGGCCAAACA ACACACAGCT 3070 het 3070 ref 49 23 20 9 ACACACAGCTTCATTTAGGCCAAACA 0 1 340608 CASAVA_Build 9 31589600 2D ATTTAGCTAT AA/-- AATTTTTATA 3070 hom 94 het 39 0 32 7 A 4 2 340609 CASAVA_Build 9 31593802 1D CAAAGTACTA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 63 het 22 0 21 1 T 8 7 340610 CASAVA_Build 9 31594946 7D GAAAATCAAC ATCTCCA/------- TCAGTCCCCT 3070 hom 117 het 43 0 39 5 ATCTCCA 1 0 340611 CASAVA_Build 9 31603830 2D22M1I AACACAAAGT GGGGGATGTGCTAGGTACAGAATG-/--GGGATGTGCTAGGTACAGAATGT TATGAAACAC 3070 hom 120 het 35 0 41 5 N/A 0 0 340612 CASAVA_Build 9 31608381 2D TCTTTATGAC AT/-- AGGAGGTAGG 3070 hom 54 het 21 0 18 4 AT 1 0 340613 CASAVA_Build 9 31609137 2D TTGTTTCTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 A 12 10 340614 CASAVA_Build 9 31610227 1I ATTGTATTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1158 hom 30 4 18 8 T 12 13 340615 CASAVA_Build 9 31612954 6D ATAAATGGTG CAATAA/------ CAATAACTAA 3070 het 3070 ref 49 22 22 6 CAATAA 2 1 340616 CASAVA_Build 9 31613449 5I AGTGCCTGAC -----/ACAGG ACAAGACAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 ACAGG 0 1 340617 CASAVA_Build 9 31614990 2D GTGGTTAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AC 7 6 340618 CASAVA_Build 9 31615154 6D TTATGGATAA TTTTCT/------ TTTTATCTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 3 TTTTCT 1 0 340619 CASAVA_Build 9 31617758 1D ACTTTTAACA C/- CCCCCCTCCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 7 6 340620 CASAVA_Build 9 31618438 1D AATACAGCTA T/- TCTATATATA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 2 1 340621 CASAVA_Build 9 31618811 3I TAGTCCTACC ---/ACT ACTAATTGAT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 ACT 1 2 340622 CASAVA_Build 9 31621133 2I GAAAATGAAC --/TT ATATTTATGG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 0 2 340623 CASAVA_Build 9 31621535 2D TTAACAAAAC AT/-- ATAATTTTCT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 AT 2 1 340624 CASAVA_Build 9 31624265 1D GAAATTATAA T/- TTTTTTGCAT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 7 6 340625 CASAVA_Build 9 31637990 2D CCAGTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2167 hom 24 8 9 10 T 18 16 340626 CASAVA_Build 9 31640707 3D AACAAAAAGT AAG/--- AAGGACAGAC 3070 het 3070 hom 36 13 21 5 AAG 2 1 340627 CASAVA_Build 9 31641133 3D TGATTTTCTA GAG/--- GAGCTTGAGG 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 GAG 2 1 340628 CASAVA_Build 9 31656184 8D TATACATACA TATATATG/-------- TATATATACA 3070 het 3070 ref 33 19 15 1 TATATATG 1 0 340629 CASAVA_Build 9 31659634 1D ATAGTCCAGG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 A 8 7 340630 CASAVA_Build 9 31659972 1D ATGTTCAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 10 9 7 A 10 9 340631 CASAVA_Build 9 31664770 1I GGAACAAAAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 8 9 340632 CASAVA_Build 9 31666350 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 44 12 26 6 A 7 8 340633 CASAVA_Build 9 31667081 5D AGTTGGTGCC TTTTT/----- TTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 T 11 6 340634 CASAVA_Build 9 31668156 2I CAAGAAGTAC --/AA AGAGTTCAGA 3070 het 3070 ref 40 23 16 1 A 1 3 340635 CASAVA_Build 9 31668592 1D CTATTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 7 A 13 12 340636 CASAVA_Build 9 31671974 1I25M1D GAAAATAAAT -GGTTCACCAAGTCTACAGTACAGTGA/GGGTTCACCAAGTCTACAGTACAGTG- AAGCATTTAG 3070 het 3070 hom 54 31 37 2 N/A 0 0 340637 CASAVA_Build 9 31673133 1I AAGTTGGCTG -/T AGAGCTGGAA 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 T 0 1 340638 CASAVA_Build 9 31673175 1D AATATGACAT A/- ATGCTTTTGC 3070 het 3070 hom 39 9 21 10 A 2 1 340639 CASAVA_Build 9 31677678 26D ACCTCTATTC TAAGTTTGTAATTCTTCTAGCTATTG/-------------------------- TAAGTTTGTA 3070 het 3070 ref 26 15 11 6 TAAGTTTGTAATTCTTCTAGCTATTG 1 0 340640 CASAVA_Build 9 31681616 1I ATTTATGCTA -/T TTTTTCTACA 3070 het 3070 ref 35 24 11 0 T 5 6 340641 CASAVA_Build 9 31682909 1I AGGATTATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 A 12 13 340642 CASAVA_Build 9 31683428 1D AAGTAGAATC A/- AAAGAGTTCA 3070 het 3070 ref 44 26 12 7 A 4 3 340643 CASAVA_Build 9 31692801 5D ATGTATCGGA TTTTC/----- TTTTATTTAT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 TTTTC 1 0 340644 CASAVA_Build 9 31695003 2D TACACCTCAT AA/-- AGAGGTGTCA 3070 het 3070 hom 30 14 13 5 A 3 1 340645 CASAVA_Build 9 31696100 2D CTCTCTCCCG AC/-- ACACACACAC 683 het 683 ref 38 20 5 13 AC 6 5 340646 CASAVA_Build 9 31696356 1D TCCCCCACCA C/- CCCCCCATTG 2874 het 2874 ref 26 13 7 6 C 7 6 340647 CASAVA_Build 9 31697960 1I CTTTGCTCAC -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 7 8 340648 CASAVA_Build 9 31701048 4I GAAAAGTCTA ----/TTTG TTGTTTTGTA 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 TTTG 0 1 340649 CASAVA_Build 9 31702145 4I ACTTGGTAAT ----/TGTG TGTGTATTTA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 TG 2 4 340650 CASAVA_Build 9 31702858 3I GTGTTCTCCA ---/AAC AACAGGCTGC 3070 het 3070 ref 55 25 23 7 AAC 1 2 340651 CASAVA_Build 9 31703063 2D GTTACGCTTT TC/-- TCTGTTTACT 3070 het 3070 ref 46 25 18 3 TC 2 1 340652 CASAVA_Build 9 31704509 2D AGCAATGCTT TA/-- GAGTCTGATA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 TA 1 0 340653 CASAVA_Build 9 31706111 1I GACTAACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 38 1 23 14 A 13 14 340654 CASAVA_Build 9 31708197 4I TTCTTAAATG ----/TTAA TTAATTAATG 3070 hom 132 het 54 0 45 9 TTAA 2 3 340655 CASAVA_Build 9 31712520 1I CCCATGATTA -/C CATCAATATC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 2 340656 CASAVA_Build 9 31716244 1I GGACTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 17 20 12 T 11 12 340657 CASAVA_Build 9 31724823 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 34 3 22 9 A 10 11 340658 CASAVA_Build 9 31725663 1D TATCTATATG A/- ATGGAATTTA 3070 het 3070 hom 32 10 21 1 A 2 1 340659 CASAVA_Build 9 31727860 1I ATGTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 2585 het 2585 ref 31 11 7 13 A 11 12 340660 CASAVA_Build 9 31728907 1I31M1I ACTTGTGAGG -TGAGGTGGGAGGATCCCTTGAACTGAGGTGG-/TTGAGGTGGGAGGATCCCTTGAACTGAGGTGGA AAAAAAAAAA 3070 het 1401 hom 30 3 35 5 N/A 0 0 340661 CASAVA_Build 9 31736201 2D CCTTTGGGGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 56 het 27 0 18 10 AG 6 5 340662 CASAVA_Build 9 31737154 2D ATGTAATAAG AT/-- AAAATAATTC 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 AT 1 0 340663 CASAVA_Build 9 31749918 1I TTTGGATGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 760 hom 44 2 30 12 T 9 10 340664 CASAVA_Build 9 31750174 3I TATAAAAATT ---/ATC ATATACTTTT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 ATC 0 1 340665 CASAVA_Build 9 31766488 1D CATGTCAATG C/- TGCTGGATTA 863 het 863 ref 45 37 3 6 C 1 0 340666 CASAVA_Build 9 31774611 1I GACTACTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 A 10 11 340667 CASAVA_Build 9 31776231 1D TTCTCTTTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 10 9 340668 CASAVA_Build 9 31782762 6D AATAGCTTTA AGTTAC/------ AAGAATAATA 3070 het 3070 ref 41 22 12 12 AGTTAC 1 0 340669 CASAVA_Build 9 31786037 44I AGTCGTTTCA --------------------------------------------/ACAAATGTTATTGGGGAAACTGGGTATCTACATGCAAAAATATT GTTGAACCCT 3070 hom 66 het 19 0 23 5 ACAAATGTTATTGGGGAAACTGGGTATCTACATGCAAAAATATT 0 1 340670 CASAVA_Build 9 31797409 4D TGATTAAATC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 1000 hom 32 6 14 15 A 15 11 340671 CASAVA_Build 9 31798189 4I TGCGTGCCTG ----/TGGC TGGCTGTCGA 1715 het 1715 ref 21 9 6 6 TGGC 1 2 340672 CASAVA_Build 9 31808453 1I CTGTCTGACC -/T TTTCAGCCTA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 3 4 340673 CASAVA_Build 9 31815538 1D CCTTTTATAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 63 20 34 10 T 10 9 340674 CASAVA_Build 9 31821799 1I GAAAATGCCC -/A AACAAATGGA 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 2 3 340675 CASAVA_Build 9 31824752 1I AAGTTCCCCA -/C CCTCCTATCC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 C 2 3 340676 CASAVA_Build 9 31826653 1I TGGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 9 10 340677 CASAVA_Build 9 31830157 1D AGACATACTC T/- TTTTTTCTAA 2603 het 2603 ref 24 15 6 3 T 7 6 340678 CASAVA_Build 9 31831277 5I CAAGGAAAAC -----/TAAAT TAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 TAAAT 0 1 340679 CASAVA_Build 9 31831861 1D AGAAATATAC A/- AAACAAGTAG 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 A 4 3 340680 CASAVA_Build 9 31837977 1D TACTTTTTGT G/- GTTTCAGTTA 3070 het 3070 ref 52 27 23 4 G 2 1 340681 CASAVA_Build 9 31850303 1D TAAAAGCCTT G/- TAGTTTGCCT 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 G 1 0 340682 CASAVA_Build 9 31851119 1I CATTAATATG -/T TTTAGCATTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 3 4 340683 CASAVA_Build 9 31852884 1D ATTTTTGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 T 10 9 340684 CASAVA_Build 9 31861165 2D GGTTCAAAAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 AT 6 5 340685 CASAVA_Build 9 31861368 3I GAGACCACCA ---/CAT CATGCTCTAT 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 CAT 1 2 340686 CASAVA_Build 9 31885758 2D GCCTACCTTC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 44 20 19 7 TA 6 5 340687 CASAVA_Build 9 31887428 1I AAAAGAGGTT -/G GGGGGCAGAA 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 G 5 6 340688 CASAVA_Build 9 31912794 2D CCTTTTGCAC AT/-- GTTTCATTGT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 AT 1 0 340689 CASAVA_Build 9 31920364 1D ATCTACATTA G/- GGTATTTCTC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 G 3 2 340690 CASAVA_Build 9 31944322 1I AAGAGGAACA -/T ACTAAGCCTA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 0 1 340691 CASAVA_Build 9 31960985 5D AGTTTTAAAT TTTAC/----- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 TTTAC 1 0 340692 CASAVA_Build 9 31963481 2D GTGGAATCAG TA/-- CCTTGTATTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 TA 1 0 340693 CASAVA_Build 9 31965942 1I GCACACACAC -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 A 6 7 340694 CASAVA_Build 9 31969675 1D AGACGGAAAA C/- TTTGCTGATA 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 C 1 0 340695 CASAVA_Build 9 31975797 2D TTATTAAGAC TT/-- TTTAGTTTAT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 5 3 340696 CASAVA_Build 9 31983860 1D CTGAATGGAC A/- AAAACTGTAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 5 4 340697 CASAVA_Build 9 31984195 4D TACACCAATA ACAT/---- ACAAACAGAG 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 ACAT 1 0 340698 CASAVA_Build 9 31987944 2I TCATGTGCAT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 1894 hom 26 5 18 3 TC 6 7 340699 CASAVA_Build 9 31988185 2D GAGACTGGAA AG/-- AGATGTACGC 3070 het 3070 hom 48 18 23 7 AG 2 1 340700 CASAVA_Build 9 31991369 7D TTTGGATAAT AGAGATG/------- AGGTCTTCTC 3070 het 3070 hom 41 14 22 6 AGAGATG 1 0 340701 CASAVA_Build 9 31997936 1I TTTGCCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 T 10 11 340702 CASAVA_Build 9 31998469 1I TGAGTTTTTC -/A AAAAAAAAAA 1331 het 1331 ref 14 6 5 3 A 13 14 340703 CASAVA_Build 9 32003367 1D3M4I ACTTTTTGAT ATAT----/-TATTTGA TTATTATCTA 3070 het 3070 ref 26 15 10 3 N/A 0 0 340704 CASAVA_Build 9 32004364 11D GTCTCATTTT TTTTTTTTTTC/----------- TTTGGGAGAC 1208 het 1208 ref 17 9 4 5 TTTTTTTTTTC 1 0 340705 CASAVA_Build 9 32006660 1I AAGTGTGCAG -/C CCCAGCATGG 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 3 4 340706 CASAVA_Build 9 32016330 4D TGTACACATT ATAA/---- ATAAATAGCA 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 ATAA 2 1 340707 CASAVA_Build 9 32017418 5D TTTCTGAGAA TTGAG/----- TTAAGTTGGC 3070 het 3070 ref 50 23 25 2 TTGAG 1 0 340708 CASAVA_Build 9 32023431 5D ATTTTTTCTT TTGAA/----- AAGTCTTTCC 3070 het 3070 hom 32 16 15 2 TTGAA 1 0 340709 CASAVA_Build 9 32033135 1D TCGTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1831 het 1831 ref 38 24 4 10 T 12 11 340710 CASAVA_Build 9 32036755 1D AAAGTAGCTG A/- AAAAAAAAAG 1839 het 1839 ref 43 32 5 6 A 10 9 340711 CASAVA_Build 9 32037933 1D TGTGGGTGGG T/- TGGAAGAGGG 3070 het 3070 ref 25 13 8 5 T 2 1 340712 CASAVA_Build 9 32039806 1D ATCTCTAGAA T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 48 24 18 7 T 7 6 340713 CASAVA_Build 9 32041798 1D CTGAGACAAT G/- GGGTTTTCTA 1843 het 1843 ref 10 6 4 1 G 4 3 340714 CASAVA_Build 9 32047928 3I AATTAGTAAC ---/AAA AAAGTGCCTA 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 3 6 340715 CASAVA_Build 9 32048949 1D TTAACTGCAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 A 9 8 340716 CASAVA_Build 9 32050261 1D TGAAAATCTC A/- AAAATTAGAA 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 A 5 4 340717 CASAVA_Build 9 32053386 1D ACATAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 15 8 A 12 11 340718 CASAVA_Build 9 32056651 1I TAACAGACCC -/T TACGAGAATT 3070 het 3070 hom 55 26 26 3 T 1 2 340719 CASAVA_Build 9 32060275 1D CACCCATGAA G/- GGGGTCAAGG 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 G 5 4 340720 CASAVA_Build 9 32063244 6I4M6D TGAGACTTCA ------TTTAAGAAAT/AACCTCTATA------ GAAAAAGGCA 3070 hom 102 het 36 0 35 4 N/A 0 0 340721 CASAVA_Build 9 32065975 1D AGTTTCCTGA G/- GGCTTGCCAA 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 G 3 2 340722 CASAVA_Build 9 32067453 4I CCTTGATATT ----/ATTA ATTGTCTACT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 ATTA 0 1 340723 CASAVA_Build 9 32067721 1D CAATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2588 het 2588 ref 22 8 8 6 A 11 10 340724 CASAVA_Build 9 32070049 1D GAATTTGCAC A/- AAATATTTTC 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 A 4 3 340725 CASAVA_Build 9 32071129 1I TCTGTCCTCA -/T TGAATCCAGT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 T 1 2 340726 CASAVA_Build 9 32073195 5D GTCCAAATTC CTGAT/----- CTGATTCACA 3070 hom 144 het 52 0 49 3 CTGAT 2 1 340727 CASAVA_Build 9 32075230 2D TATGAGCCAC CA/-- CACACCCAGC 3070 het 3070 hom 29 15 14 1 CA 3 2 340728 CASAVA_Build 9 32077834 1D TCCTGTCAGT G/- GGTGGGGTGG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 G 3 2 340729 CASAVA_Build 9 32079796 2D TCAGTGTCTC TT/-- TACTTTCCCC 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 3 1 340730 CASAVA_Build 9 32083592 1D GGTGGGCTGT C/- CCCCCCCACT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 C 8 7 340731 CASAVA_Build 9 32084513 1D TAACACAATC A/- AATTAATTAA 3070 het 3070 hom 36 17 16 5 A 3 2 340732 CASAVA_Build 9 32085982 3D GGTCTGTGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 20 0 11 12 A 14 11 340733 CASAVA_Build 9 32086473 5D CTGGCTTTTC TTTTT/----- AATTAGACTG 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 5 0 340734 CASAVA_Build 9 32097326 46D33M16D AGATATAGAT ATAGATATCTATATATGTAGATAGATATAGATATCTATATATGTAGATAGATATAGATATCTATATATGTAGATAGATATAGATATCTATATATG/----------------------------------------------ATAGATATAGATATCTATATATGTAGATAGATA---------------- TAGATAGAGA 3070 hom 42 het 14 0 15 5 N/A 0 0 340735 CASAVA_Build 9 32108759 2D GGCTCTAAAA CT/-- CTACAATAAA 3070 het 3070 hom 46 13 23 10 CT 2 1 340736 CASAVA_Build 9 32110053 3D GCTTACAGTG ACT/--- AGTCAGGAAG 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 ACT 1 0 340737 CASAVA_Build 9 32116736 1I TGGGTGAAAC -/T TGCCTCTATT 3070 het 3070 hom 46 19 19 8 T 1 2 340738 CASAVA_Build 9 32120673 1D TAGACTAAAG T/- CCCCAATTAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 T 1 0 340739 CASAVA_Build 9 32121018 1D ATAAAACAAG T/- TTTTAGAGAC 3070 het 3070 hom 17 8 9 0 T 5 4 340740 CASAVA_Build 9 32127951 12D GCCCAGCAAC CAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 30 0 21 11 CAAAAAAAAAAA 1 0 340741 CASAVA_Build 9 32133376 1I CTGAAATTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 8 9 340742 CASAVA_Build 9 32135071 1I ATGAACTCTT -/C CTTTTTTATG 1364 hom 7 het 4 0 3 1 C 1 2 340743 CASAVA_Build 9 32171520 5I GATATCTGTG -----/ATATA ATATAATGTG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 ATATA 1 2 340744 CASAVA_Build 9 32172186 1D TACCTGAAGT G/- AATACCACAA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 G 1 0 340745 CASAVA_Build 9 32175057 1D TTGTTAAGGG A/- AAAAAAAAAA 1327 het 1327 ref 38 31 3 7 A 11 10 340746 CASAVA_Build 9 32175205 5D AGATTTGATG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 32 1 25 7 T 17 12 340747 CASAVA_Build 9 32189145 1D TGTGCTGATG A/- AAAAAAAAAA 1010 het 1010 ref 44 30 4 11 A 13 12 340748 CASAVA_Build 9 32198614 1D TCTATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1048 het 1048 ref 32 20 3 10 T 13 12 340749 CASAVA_Build 9 32199160 3I ATGCCATGTT ---/ATC ATGTATAGAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 ATC 0 1 340750 CASAVA_Build 9 32226043 5D ACTCGGTCTC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 15 3 9 5 A 18 13 340751 CASAVA_Build 9 32226409 3I TGAACATGTG ---/AAC AACAAAATTA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AAC 1 2 340752 CASAVA_Build 9 32227776 1D CAACACGTGG C/- AAATTGTGGG 3070 hom 126 het 44 0 42 3 C 1 0 340753 CASAVA_Build 9 32234296 1I GCTCTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 471 hom 42 2 35 5 A 10 11 340754 CASAVA_Build 9 32236882 1D TTCATGGTCC T/- TATCAGCAGT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 2 1 340755 CASAVA_Build 9 32246591 1D GGAAGTAAAA G/- CATTTCACAA 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 G 1 0 340756 CASAVA_Build 9 32249867 2I GATGGAAAAG --/AA AAAGTTAACT 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 A 3 5 340757 CASAVA_Build 9 32255734 1I TAAGATTAAC -/A GCAAGAATGC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 0 1 340758 CASAVA_Build 9 32256412 1I CCTTTCTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 9 10 340759 CASAVA_Build 9 32269040 1I TTTAGGGATC -/A ATTTAATCTG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 1 2 340760 CASAVA_Build 9 32270676 1I CATGTGGCTG -/C AAAGGACATG 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 C 0 1 340761 CASAVA_Build 9 32296094 1I AAAGCCAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 9 10 340762 CASAVA_Build 9 32297079 1I AGAATGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 T 11 12 340763 CASAVA_Build 9 32299679 4I CTTTGGGGAC ----/TCAG TCAGGGAGGG 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 TCAG 1 2 340764 CASAVA_Build 9 32302931 1D AGACTTCGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2453 hom 20 6 7 7 A 11 10 340765 CASAVA_Build 9 32306318 12D TATAAGAAAA GATTAATTATAG/------------ GATTTGGGCA 3070 hom 87 het 33 0 30 5 GATTAATTATAG 1 0 340766 CASAVA_Build 9 32314285 1I TCTCACATAG -/A AAAAAATGAC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 6 7 340767 CASAVA_Build 9 32329306 1I TCTCTGGCTG -/T TTGGCCTCTG 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 2 3 340768 CASAVA_Build 9 32331739 2I TATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 1474 het 372 hom 10 2 5 3 TG 8 9 340769 CASAVA_Build 9 32334461 1I TTATTAAACA -/T TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 6 7 340770 CASAVA_Build 9 32336857 2D TCCCCAGGCA GC/-- GCTCAGGACC 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 GC 2 1 340771 CASAVA_Build 9 32342164 4I TTCACTGAAC ----/GGAA GGACCAGTAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 GGAA 0 1 340772 CASAVA_Build 9 32343665 1D CAGGTTGTGG T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 72 het 32 0 24 8 T 8 7 340773 CASAVA_Build 9 32361249 1I GACAAGCTGA -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 6 7 340774 CASAVA_Build 9 32384525 7D CTAATGCTGC TTTAGTA/------- TTTGTCACTC 3070 het 3070 ref 63 30 29 6 TTTAGTA 1 0 340775 CASAVA_Build 9 32384947 1I AAGATGGCCC -/T AGAAGACCTC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 0 1 340776 CASAVA_Build 9 32385474 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 340777 CASAVA_Build 9 32395110 12I CATGTGAGAC ------------/TAGGTGGGAGAA GTAGTTCCCA 3070 hom 93 het 47 0 36 11 TAGGTGGGAGAA 0 1 340778 CASAVA_Build 9 32396311 2I ACATGTATAA --/AT ATATGTTACT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 AT 2 3 340779 CASAVA_Build 9 32400748 1I AGATGGGTGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 A 8 9 340780 CASAVA_Build 9 32414915 5I CCACACTGTT -----/TACTC TACTCACCCG 3070 het 3070 hom 64 28 30 6 TACTC 1 2 340781 CASAVA_Build 9 32416978 1D TTTTCCCTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 A 10 9 340782 CASAVA_Build 9 32418111 1D CTGTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2695 het 1058 hom 19 5 9 6 A 12 11 340783 CASAVA_Build 9 32442063 1I GCTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1999 het 492 hom 18 2 6 10 A 15 16 340784 CASAVA_Build 9 32443134 2D GAAGATTCCC CT/-- GTTTGTTTGG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 CT 1 0 340785 CASAVA_Build 9 32443356 1I TAGCTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1556 hom 30 5 18 7 A 14 15 340786 CASAVA_Build 9 32444369 1D TAAGGACAGG A/- ATTGGTTTAC 3070 het 3070 hom 54 17 26 11 A 2 1 340787 CASAVA_Build 9 32444781 4D TAAGTTCTCC TTAT/---- TTATTTTCAC 3070 het 2549 hom 26 9 12 5 TTAT 2 1 340788 CASAVA_Build 9 32447492 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAG AAAAGAAAAC 3005 het 3005 ref 32 15 12 5 AAAAG 1 2 340789 CASAVA_Build 9 32449125 1I GACCTCGTGA -/T TCGCCCACCT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 1 2 340790 CASAVA_Build 9 32449990 1D ATTGTATCTT A/- ACAGAATTCC 3070 het 3070 ref 39 16 14 10 A 2 1 340791 CASAVA_Build 9 32450773 1I TACACTGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 9 10 340792 CASAVA_Build 9 32451043 3D AAGCAGCCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 24 2 9 16 A 15 12 340793 CASAVA_Build 9 32473698 2I CCTTTAGTGG --/GT TCCTGCAGCC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 GT 0 1 340794 CASAVA_Build 9 32475289 1I TAGAGACGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 10 11 340795 CASAVA_Build 9 32479660 1D GGCAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 542 hom 28 2 16 10 A 13 12 340796 CASAVA_Build 9 32483522 1I CTCGAGAGGC -/T GAGGCAGGAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 0 1 340797 CASAVA_Build 9 32510814 38D TGGCTGGGTG TGGTGGCTCAGGCTGGGCGTGGTGGCTCAGGCCGGGGC/-------------------------------------- TGGTGACTCA 3070 hom 54 het 20 0 18 4 TGGTGGCTCAGGCTGGGCGTGGTGGCTCAGGCCGGGGC 1 0 340798 CASAVA_Build 9 32514946 1I CAGCAAACTG -/T TTTATCATGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 3 4 340799 CASAVA_Build 9 32515795 2I TAAATGAAAC --/AG AAAATTTCTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 AG 0 1 340800 CASAVA_Build 9 32517298 1I GGACCTTTGT -/A AAAAAAACCA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 7 8 340801 CASAVA_Build 9 32519837 2I TTGTAGCTGC --/TT TTAATTTATG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 2 4 340802 CASAVA_Build 9 32522134 1D AATGGAATCA T/- TTGACAGATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 T 3 2 340803 CASAVA_Build 9 32525647 1I TCTCATATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 17 7 A 12 13 340804 CASAVA_Build 9 32525834 1D TTGTCAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2044 hom 30 10 13 8 T 13 12 340805 CASAVA_Build 9 32526555 1I TCCTACTGTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 20 12 T 6 7 340806 CASAVA_Build 9 32531023 1I AATAACTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 12 13 340807 CASAVA_Build 9 32537037 4D CCCTGTTTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 90 het 39 0 28 11 AAAC 6 5 340808 CASAVA_Build 9 32537245 3I ATGCATGTAG ---/ATC ATCAAATAAG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ATC 1 2 340809 CASAVA_Build 9 32545094 1I GTTCCTGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2504 hom 34 9 21 4 A 13 14 340810 CASAVA_Build 9 32546089 1D ATTTGGGGCC G/- GGGTGCAATG 3070 hom 112 het 42 0 37 6 G 4 3 340811 CASAVA_Build 9 32547337 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 11 0 9 2 T 10 9 340812 CASAVA_Build 9 32554511 1I TATTACACTT -/C TTTTAAAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 0 1 340813 CASAVA_Build 9 32556069 1D TGGAGTGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 29 4 12 14 A 13 12 340814 CASAVA_Build 9 32558644 2D TCTCATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2858 hom 24 7 13 4 AT 6 5 340815 CASAVA_Build 9 32559678 11D CATCCAGCTA TTTTTTTTTCT/----------- TTTTTTTTGG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TTTTTTTTTCT 1 0 340816 CASAVA_Build 9 32559861 4I GTTCTTTTAC ----/ACAT ACTGCTATTA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 ACAT 0 1 340817 CASAVA_Build 9 32561293 5D AAGACTATAA CAAGG/----- CATTTATAGA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 CAAGG 1 0 340818 CASAVA_Build 9 32561740 3D ACTTCGACAC ATT/--- ATTATTTATT 3070 het 3070 hom 32 15 15 4 ATT 3 2 340819 CASAVA_Build 9 32567194 1I TAATAAAAAA -/T AATAACTCAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 0 1 340820 CASAVA_Build 9 32604878 1I CATCAGGCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 8 9 340821 CASAVA_Build 9 32611864 3I TACCTCAAGG ---/TTA TTATTTCTCT 3070 het 3070 ref 41 24 16 1 TTA 1 2 340822 CASAVA_Build 9 32613933 5I GATTTTCTGC -----/TTTGT TTTATCTAGT 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 TTTGT 0 1 340823 CASAVA_Build 9 32627288 1D TCCTTTATGC T/- TTTTTTTTTT 1338 het 1065 hom 13 4 4 5 T 15 14 340824 CASAVA_Build 9 32654863 1D AGACCCTGTT A/- AAAAAAAAAA 1265 het 1265 ref 36 20 6 10 A 17 16 340825 CASAVA_Build 9 32658381 3D GGCTATACTG GAA/--- GAAGAAGAAT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 GAA 4 3 340826 CASAVA_Build 9 32687896 1D GACAGCCCAA G/- GAGTTAGAAG 3070 hom 108 het 38 0 32 7 G 2 1 340827 CASAVA_Build 9 32694347 1I AAAAGAGATT -/C AGATACACAT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 0 1 340828 CASAVA_Build 9 32696403 1I GCAGGTCCAG -/C CCCCCCTTAA 3070 hom 41 het 36 1 28 7 C 6 7 340829 CASAVA_Build 9 32699993 1D GAAGCAACAC A/- AGATGGATGC 3070 hom 99 het 39 0 32 8 A 2 1 340830 CASAVA_Build 9 32706374 2I AAAATATGAT --/AA AAAAAAATAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 7 9 340831 CASAVA_Build 9 32708414 1D AAAGCTCCCA C/- CCCCCCTTCT 3070 hom 85 het 36 0 26 10 C 7 6 340832 CASAVA_Build 9 32728056 6D TGCAAGGGGC TAATTT/------ AAGTATCAAT 3070 het 3070 hom 37 16 16 7 TAATTT 1 0 340833 CASAVA_Build 9 32729869 1I AGTCCCTTTG -/A AATCCTAGGC 3070 het 3070 hom 52 17 25 10 A 2 3 340834 CASAVA_Build 9 32731665 7D ACTCTTCTTT AAATGAG/------- GCATTAAATG 3070 hom 102 het 38 0 35 6 AAATGAG 1 0 340835 CASAVA_Build 9 32738028 2D TTCCATCGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 TA 7 6 340836 CASAVA_Build 9 32744904 4I CCCCATGAAC ----/AAGT AAGTGCAGCC 3070 het 3031 hom 39 13 20 6 AAGT 1 2 340837 CASAVA_Build 9 32753540 2I CTTCCCCCAC --/CT CTCTCTCTCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 CT 8 9 340838 CASAVA_Build 9 32760771 4D TAGATGAATG GATA/---- AAGAAAATGT 3070 het 3070 ref 56 27 25 5 GATA 1 0 340839 CASAVA_Build 9 32785708 1I TCTTAGGCAG -/C TCCACCCCTA 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 C 0 1 340840 CASAVA_Build 9 32792284 11D TTCTAAATGT TTCCCATAATA/----------- TTCCCATAAT 3070 het 3070 ref 34 18 14 6 TTCCCATAATA 2 1 340841 CASAVA_Build 9 32793855 1I ACAGTGTAAC -/A GAAATAAAGA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 0 1 340842 CASAVA_Build 9 32795909 13D CAGCCATTCA GCCAAGAAGAGAG/------------- GCCTTACTTG 3070 het 3070 ref 40 23 16 5 GCCAAGAAGAGAG 1 0 340843 CASAVA_Build 9 32797626 2D TTGTACTTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 14 12 340844 CASAVA_Build 9 32802003 2D ACTTCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2300 het 1225 hom 18 5 7 6 A 16 14 340845 CASAVA_Build 9 32808843 16I3M45I CAAAACAAAC ----------------CAG---------------------------------------------/ATGTGCAATTCTTTAGCAGATGTATATCCAAACCTTACCTAGGCTAATAGTTTTTCATGGGTCT CCCTATGTTG 2709 hom 21 het 7 0 8 1 N/A 0 0 340846 CASAVA_Build 9 32846075 1I GAATGGTAGG -/T TTTTTTTATT 3070 hom 121 het 47 0 41 6 T 7 8 340847 CASAVA_Build 9 32846337 2D TTCTTTCTTT TC/-- TTTCTTTCTT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TC 1 0 340848 CASAVA_Build 9 32850007 2I GGTCACACTC --/TT TTCCAATCAA 3070 hom 129 het 46 0 42 4 T 2 4 340849 CASAVA_Build 9 32861030 1D ATTTAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 27 0 24 5 T 9 8 340850 CASAVA_Build 9 32861468 5D TTTTTTATTT ATTTA/----- CTTTGTTTGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 ATTTA 1 0 340851 CASAVA_Build 9 32865045 1I40M1D AGTCCCTCTC -TAGCCAGTTGCAATGACTCTAAGTCCTAGATGATTCACAGA/ATAGCCAGTTGCAATGACTCTAAGTCCTAGATGATTCACAG- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 32 0 29 11 N/A 0 0 340852 CASAVA_Build 9 32867452 1D TAGGAGAATA G/- GGGGCTTTGT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 G 5 4 340853 CASAVA_Build 9 32869730 8I8M4I3M3I GGAAAGCTGG --------CAGGGTGC----TAA---/CCTGCCTTCAGGGGACACATTAAGCG CCTGGGTGCT 3070 hom 69 het 24 0 24 2 N/A 0 0 340854 CASAVA_Build 9 32871332 1I GAAATCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 40 1 30 9 T 14 15 340855 CASAVA_Build 9 32872497 1D GATGTATAGG A/- AAAAAAACAG 3070 hom 101 het 39 0 34 5 A 8 7 340856 CASAVA_Build 9 32874112 1I CACAGCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 28 9 T 11 12 340857 CASAVA_Build 9 32880469 3I CTTGACAGTC ---/TTT TTATACATTG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 2 5 340858 CASAVA_Build 9 32883006 4D TTTGTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTTTA 3070 hom 24 het 14 0 9 5 TTTG 2 1 340859 CASAVA_Build 9 32884010 1I GTCCCCACGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 11 12 340860 CASAVA_Build 9 32887260 3D7M2D35M1D GACCAGAAAA CTTCTTGTGATTTTGCGTAATCGACCCTCTTAGTTTTACAAAATATTG/---CTTGTGA--CTGCGTAATTGACCCTCTTATTTTTACAAAATATT- GGGGTGATTC 3070 hom 87 het 29 0 29 5 N/A 0 0 340861 CASAVA_Build 9 32887376 1D CTGTGTACTC T/- TTTGACTTCA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 4 3 340862 CASAVA_Build 9 32892785 1D TTATTGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 351 hom 28 3 20 5 T 13 12 340863 CASAVA_Build 9 32893748 1D CTACCCTAAG A/- ACCTCATTTT 3070 hom 151 het 56 0 51 6 A 2 1 340864 CASAVA_Build 9 32897245 2D GTGCATTTAC AA/-- AATCCTTTAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 4 2 340865 CASAVA_Build 9 32898237 1D GTTGGAGCCT G/- CCAAGACAGC 3070 hom 117 het 45 0 37 9 G 1 0 340866 CASAVA_Build 9 32898920 1I CGTGGCAAGA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 3 4 340867 CASAVA_Build 9 32900016 6D TAATAATAAT AAAATA/------ AAATAAAATA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 AAAATA 1 0 340868 CASAVA_Build 9 32901522 1I AGACTCTGCT -/A ATTGCTTCAA 3070 hom 138 het 49 0 47 2 A 1 2 340869 CASAVA_Build 9 32908101 1D GTGCAAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 514 hom 38 2 29 7 A 13 12 340870 CASAVA_Build 9 32917997 1D GTGGGATCTG T/- TTTTTTTTTA 2096 het 2096 ref 32 25 5 2 T 10 9 340871 CASAVA_Build 9 32922461 2D CAGAGTAAAA CT/-- CTGTCTTAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 6 CT 2 1 340872 CASAVA_Build 9 32930529 4I AACCATCACC ----/ACCA ACCAGTCCAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 ACCA 1 2 340873 CASAVA_Build 9 32944500 2D CAATTCAGAA AC/-- ACTTTTTATT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AC 2 1 340874 CASAVA_Build 9 32957102 2I TGATATTATA --/AC AGTCACTTCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AC 0 1 340875 CASAVA_Build 9 32958888 1D AAAAAAGGGA T/- TTAAAAAATA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 3 2 340876 CASAVA_Build 9 32964571 1I TAGTTGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 285 hom 44 1 36 7 A 9 10 340877 CASAVA_Build 9 32981778 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1779 hom 23 7 13 3 A 13 14 340878 CASAVA_Build 9 32987367 2I AGAAAAACAC --/AG AAACAATTAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 AG 0 1 340879 CASAVA_Build 9 32987622 3I AAGCAAAGAG ---/AAC AACAAGGGCA 3070 hom 83 het 31 0 27 4 AAC 1 2 340880 CASAVA_Build 9 33046972 1D CCTTTATTTG A/- AAAAAAAAAA 1476 het 1476 ref 43 33 4 6 A 12 11 340881 CASAVA_Build 9 33057296 13D GCTAATGACC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 5 A 27 14 340882 CASAVA_Build 9 33061662 1D ATAAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 993 het 993 ref 37 20 3 14 A 16 15 340883 CASAVA_Build 9 33069111 2D AAATCTTCTC TA/-- TGATTACTTA 3070 het 3070 hom 38 13 24 1 TA 1 0 340884 CASAVA_Build 9 33092031 1D AGAACTTACA G/- GGGGGTCTTG 3070 hom 132 het 53 0 45 8 G 6 5 340885 CASAVA_Build 9 33104546 2I CATGGGGAAG --/TC TCTCTGGAAA 3070 hom 90 het 37 0 29 8 TC 2 3 340886 CASAVA_Build 9 33106239 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 340887 CASAVA_Build 9 33127646 5D GGCCCTTCCC TTAGA/----- GAGTCTGTGG 3070 hom 87 het 32 0 29 4 TTAGA 1 0 340888 CASAVA_Build 9 33130477 1D GCTGGACTGA T/- TTTTAAAATT 3070 hom 90 het 35 0 31 7 T 5 4 340889 CASAVA_Build 9 33138803 1D GCCTAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 9 8 A 17 16 340890 CASAVA_Build 9 33147716 1D ATTTTCAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 48 2 40 6 A 12 11 340891 CASAVA_Build 9 33159517 3D ACTGCTTGAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2117 het 163 hom 25 3 7 15 T 19 16 340892 CASAVA_Build 9 33164121 22I CAGAATGTCA ----------------------/AGGTCATGATAGTCAAAGACTG AGAAAATGTT 3070 hom 141 het 46 0 48 2 AGGTCATGATAGTCAAAGACTG 0 1 340893 CASAVA_Build 9 33166839 1D AAATCTAACA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 8 340894 CASAVA_Build 9 33171961 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 36 4 23 9 T 15 14 340895 CASAVA_Build 9 33179985 1I AAAACTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 5 hom 37 1 23 13 T 13 14 340896 CASAVA_Build 9 33189123 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 2634 het 2218 hom 12 5 7 0 A 8 7 340897 CASAVA_Build 9 33195315 3I CAACAAGGAA ---/TAG AAGAGTCAGG 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 TAG 0 1 340898 CASAVA_Build 9 33204030 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 863 hom 17 5 10 3 A 15 14 340899 CASAVA_Build 9 33212129 1I CCAGGCTTAT -/A TTCTAGGCTC 3070 hom 129 het 46 0 42 4 A 0 1 340900 CASAVA_Build 9 33220130 1D ATGATGACAG C/- CCCCCCAAAG 3070 hom 96 het 34 0 31 3 C 7 6 340901 CASAVA_Build 9 33228639 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3016 het 2403 hom 18 8 9 1 A 10 11 340902 CASAVA_Build 9 33231121 3I GATATCTGGG ---/AGA AGAAGATTCC 3070 het 3070 ref 49 24 13 12 AGA 2 3 340903 CASAVA_Build 9 33232449 1D GGGGACATGG C/- ATGAGCCAAA 3070 het 3070 ref 46 20 20 7 C 1 0 340904 CASAVA_Build 9 33236240 3I TCAATGGGAC ---/CAG CAGCAGAAGT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 CAG 2 3 340905 CASAVA_Build 9 33247975 1I GTACAGTCAG -/C CATGTATTCT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 C 1 2 340906 CASAVA_Build 9 33248200 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATCACTT 2506 het 975 hom 12 3 8 1 AGG 1 0 340907 CASAVA_Build 9 33253590 1I GGATTCTTAG -/A AAGAAGCCGT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 A 2 3 340908 CASAVA_Build 9 33253782 1D CAGAGTACAA C/- GCTTGGACCC 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 C 1 0 340909 CASAVA_Build 9 33276930 6D ATTTCCATCT TTCACC/------ ACCTGCAGCT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 TTCACC 1 0 340910 CASAVA_Build 9 33291772 3D TTTTAATTTA TCT/--- TCTTCTCATT 3070 het 3070 ref 36 13 16 7 TCT 3 2 340911 CASAVA_Build 9 33315417 2D ATCCCAGCAC TT/-- TGAGAGGCCG 1566 het 1445 hom 8 3 5 0 T 3 1 340912 CASAVA_Build 9 33319643 1D TTTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2001 hom 19 5 11 4 T 13 12 340913 CASAVA_Build 9 33338504 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 8 16 8 A 12 11 340914 CASAVA_Build 9 33344071 5D TCCCTTTCTT TTTTA/----- TATTTCAGAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 5 TTTTA 1 0 340915 CASAVA_Build 9 33364737 1D GAGATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2013 hom 24 7 11 6 A 13 12 340916 CASAVA_Build 9 33372355 1D34M4D CTACAAGACT GGTGTCACACTGTATATAGTCTACTGTATTACTTTGTTG/-GTGTCACACTGTATATAGTCTACTGTATTACTTT---- TTGTTTTTTT 3044 het 3044 ref 38 37 7 4 N/A 0 0 340917 CASAVA_Build 9 33373627 13I GGTCATCACT -------------/TCCCAGCACTCTC TTCGCAGGCC 2256 het 2256 ref 39 23 6 10 TCCCAGCACTCTC 0 1 340918 CASAVA_Build 9 33381106 4I CTCGGTCTCA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 AAAT 3 4 340919 CASAVA_Build 9 33383518 1I CTTCCTCTAG -/C CATGCACCTG 3070 het 3070 ref 69 50 14 5 C 1 2 340920 CASAVA_Build 9 33385917 1D AGTAGATGTG C/- AATAAGTATT 3070 het 3070 ref 71 53 11 8 C 1 0 340921 CASAVA_Build 9 33389101 2D GCCTCCCAAG GT/-- GCAGGGATTT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 GT 1 0 340922 CASAVA_Build 9 33391803 4D ATCTTTATCT CTAA/---- CTGACAGCAT 3070 het 3070 ref 82 64 14 7 CTAA 1 0 340923 CASAVA_Build 9 33399528 1I ATTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 13 14 15 T 11 12 340924 CASAVA_Build 9 33402699 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2506 het 2506 ref 20 9 8 3 A 11 10 340925 CASAVA_Build 9 33412489 1I TTTGCCTCTC -/T TTTTTTTTAT 1388 het 1388 ref 17 10 3 4 T 8 9 340926 CASAVA_Build 9 33412539 1D ATAATGCCTA C/- CAAAGAAAAT 3070 het 3070 hom 28 15 13 0 C 2 1 340927 CASAVA_Build 9 33419812 1D CCCATATAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 9 8 340928 CASAVA_Build 9 33425715 2I CTGTGAACCC --/CT GTTTCATCGC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 CT 0 1 340929 CASAVA_Build 9 33429148 1D GTGCTTCTTT G/- CCCTGCATCC 3070 het 3070 ref 45 21 14 11 G 1 0 340930 CASAVA_Build 9 33448198 1D CGTCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 1585 hom 12 het 7 0 5 2 A 11 10 340931 CASAVA_Build 9 33453452 3D AAGGAAGGGG AGA/--- AGGAGGGGTC 2717 het 2717 ref 31 15 10 7 AGA 1 0 340932 CASAVA_Build 9 33473409 1I GCGGGAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 14 0 10 4 T 12 13 340933 CASAVA_Build 9 33481890 3D CCTTAAGGAG AGA/--- AGAATAGAAA 3070 hom 120 het 43 0 40 4 AGA 2 1 340934 CASAVA_Build 9 33484261 1D TAAACTATGA T/- TTTTTTTTTT 964 het 964 ref 26 17 3 6 T 12 11 340935 CASAVA_Build 9 33506966 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 2589 het 2589 ref 23 12 8 3 T 10 9 340936 CASAVA_Build 9 33512637 1D54M1D GGATTTAGTC TTTTTTTGTTTTCTTCCACTGCCTTTAGGTATAGAGTGCGGATATTGATTTGAGAT/-TTTTTTGTTTTCTTCCACTGCCTTTAGGTATAGAGTGAGGATACTGATTTGATA- TTTTTCTTAA 2940 het 2940 ref 49 51 8 10 N/A 0 0 340937 CASAVA_Build 9 33513026 1I32M1D AGTTCCACAT -AACTTGAAAAGAATGTATATTCTGCTGTTGTTG/GCACTTGAAAAGAATGTATATTCTGCTGTTGTT- GGATGGACTG 3070 het 3070 ref 56 43 19 11 N/A 0 0 340938 CASAVA_Build 9 33533547 5D ACATCAAAAA TTGAG/----- TTGTATTACT 3070 het 3070 ref 30 16 10 7 TTGAG 1 0 340939 CASAVA_Build 9 33545009 19D AAGTTTCAAT ATAACACTTATTGTGTTCA/------------------- ATAAAAACAC 3070 hom 18 het 7 0 7 2 ATAACACTTATTGTGTTCA 1 0 340940 CASAVA_Build 9 33545146 1D AAAAGTTATT A/- TTTGTGTATT 2328 het 2328 ref 25 16 5 4 A 1 0 340941 CASAVA_Build 9 33553349 10I TTCCCTAGGA ----------/ACAGCTGATC AGTTGGAGAA 2869 het 2869 ref 49 36 7 6 ACAGCTGATC 0 1 340942 CASAVA_Build 9 33561222 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 12 0 10 3 T 11 10 340943 CASAVA_Build 9 33562570 1I TTTTAAATGA -/C TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 C 0 1 340944 CASAVA_Build 9 33562711 9I GTAAAGGTCA ---------/TCGAAGCCG TCTTTGCATT 2548 het 2548 ref 27 12 9 6 TCGAAGCCG 0 1 340945 CASAVA_Build 9 33569655 3I TGATCAGAAG ---/GCT GACAGAAAGA 3070 het 3070 ref 52 31 15 6 GCT 0 1 340946 CASAVA_Build 9 33584777 9I TGGGAAGTGG ---------/ATGTATGAA ATGTCTTCAA 3070 het 3070 hom 32 15 12 5 ATGTATGAA 0 1 340947 CASAVA_Build 9 33587940 1D CTGGTCAGCT G/- GGGCTTAGTG 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 G 4 3 340948 CASAVA_Build 9 33596597 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 A 10 11 340949 CASAVA_Build 9 33607692 12D GCAGAGAGAT GGATGTAACACG/------------ GGTCATGAGC 2204 het 2204 ref 22 15 6 4 GGATGTAACACG 1 0 340950 CASAVA_Build 9 33613307 3I GGTCAGAGTA ---/CTC CTCTTATACC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 CTC 1 2 340951 CASAVA_Build 9 33615818 1D TGTCTCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 12 11 340952 CASAVA_Build 9 33621185 4D AATAGGACAC TATT/---- TAACACTGAC 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 TATT 1 0 340953 CASAVA_Build 9 33633971 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 A 9 8 340954 CASAVA_Build 9 33635519 6D74M4D GAAAAGGAAG AAGTAAAAGTACAATTATTTGCAGATTACATGATTGTTTACATAGAAAATCATAAGAAATCAAGGAACAACAACTAGAAATAAT/------AAGTACAATTATTTGTAGATTACATGATTGTTTACATAGAAAATCATAAGAAATCAAGGAACAACAACTAGAAA---- TAGTGAATTT 2718 het 2718 ref 40 54 6 12 N/A 0 0 340955 CASAVA_Build 9 33635651 1I TAAAAATCAA -/G ATTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 56 38 12 6 G 0 1 340956 CASAVA_Build 9 33642233 1I TTGTTTTTTT -/G TTTGTTTTTT 3070 het 2639 hom 37 11 20 6 G 0 1 340957 CASAVA_Build 9 33650797 1I GAGGTATAGA -/T TTTAAATCCA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 T 3 4 340958 CASAVA_Build 9 33652182 12D GAGACATCCT CTGTAGCCCCAA/------------ CTGTGCCATG 3070 het 3070 ref 31 17 10 6 CTGTAGCCCCAA 1 0 340959 CASAVA_Build 9 33656272 2I AGACTATACC --/TG GAAAATCAGG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TG 0 1 340960 CASAVA_Build 9 33668707 1I TTTGTGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 10 7 T 11 12 340961 CASAVA_Build 9 33692892 1D TCTGTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 659 hom 35 2 29 4 A 12 11 340962 CASAVA_Build 9 33694581 14I TGAGCTAAGA --------------/ACGGGCTTTGCACT ACGGTATGTT 3070 hom 75 het 32 0 24 8 ACGGGCTTTGCACT 0 1 340963 CASAVA_Build 9 33701037 4I GGACAAAATG ----/AATA AATATTGTCT 2903 het 2903 ref 22 13 7 2 AATA 1 2 340964 CASAVA_Build 9 33703110 1D ACTTGCTTGT A/- ACAAATACTT 3070 het 2712 hom 23 7 13 3 A 2 1 340965 CASAVA_Build 9 33718209 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 10 9 2 A 10 11 340966 CASAVA_Build 9 33718484 6I CAACTTTTTC ------/TTTTAT GGATCGTGCT 3070 het 3070 ref 38 22 8 8 TTTTAT 0 1 340967 CASAVA_Build 9 33719895 2D CTCTGCCTCG CT/-- CTTTTTAAAC 3070 het 3070 ref 32 15 13 6 CT 2 1 340968 CASAVA_Build 9 33720027 2D TTGATTTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 35 15 12 9 TG 6 5 340969 CASAVA_Build 9 33730061 1I CCAGTACCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 A 11 12 340970 CASAVA_Build 9 33731080 1I TGGATACAAT -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 6 7 340971 CASAVA_Build 9 33734370 1D ATAACTTATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 10 9 340972 CASAVA_Build 9 33747199 1D TCCTTGACTC T/- GCCTCCACTT 3070 het 3070 ref 37 21 11 6 T 1 0 340973 CASAVA_Build 9 33747473 1D CAGATTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 33 1 19 13 T 15 14 340974 CASAVA_Build 9 33750889 1D GAGAAAATAG A/- ATTTAGTCCA 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 A 2 1 340975 CASAVA_Build 9 33756961 1D ACATGGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 T 13 12 340976 CASAVA_Build 9 33757841 6I AAGGAACTTT ------/AGACAC AGACACAGAC 2906 het 406 hom 14 1 7 6 AGACAC 2 3 340977 CASAVA_Build 9 33760140 2I TGAAATGAAA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 CT 1 2 340978 CASAVA_Build 9 33768046 1D GTCTAACATT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 A 7 6 340979 CASAVA_Build 9 33786502 5I ATGCTCACCA -----/GGGGT GGGGTGGCAG 718 het 718 ref 39 29 3 7 GGGGT 1 2 340980 CASAVA_Build 9 33839689 1D ATCTCTACTT A/- AAAAAAAAAA 2654 het 167 hom 23 1 11 11 A 17 16 340981 CASAVA_Build 9 33850105 1D TTGCCTGCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 34 0 26 8 T 13 12 340982 CASAVA_Build 9 33942357 2D GCCTTCACTA AC/-- AGTTTCTGAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 AC 1 0 340983 CASAVA_Build 9 33945833 1I CTCAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 1914 het 1342 hom 24 8 6 10 A 17 18 340984 CASAVA_Build 9 33946316 1D GTGAATGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 30 3 9 18 T 19 18 340985 CASAVA_Build 9 33980055 2D CTAATCTACC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 30 0 25 6 AT 8 7 340986 CASAVA_Build 9 33981302 6D CTGTATCAAA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 hom 57 het 24 0 19 8 AAT 5 3 340987 CASAVA_Build 9 33982608 1I ACTGCCCCTC -/A AAGCAAAGTC 3070 hom 42 het 20 0 14 6 A 2 3 340988 CASAVA_Build 9 33993058 1I TCTTTCGTTG -/T TTTTTTTTTT 2581 het 440 hom 25 4 11 10 T 11 12 340989 CASAVA_Build 9 33993374 2D CAAAGATGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 38 1 22 15 T 16 14 340990 CASAVA_Build 9 33995646 10D TTTTCCTGTA AAAAGGAAAT/---------- AAAAGGAAAG 3070 hom 54 het 22 0 19 5 AAAAGGAAAT 1 0 340991 CASAVA_Build 9 33998637 4I AAGATATATA ----/CTAT CTAACACTTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CTAT 0 1 340992 CASAVA_Build 9 34001994 3I AAAGATAAAC ---/ATT ATTAACAGTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ATT 1 2 340993 CASAVA_Build 9 34002527 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 850 hom 26 2 23 1 A 13 14 340994 CASAVA_Build 9 34005493 1D AATTTTCGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 14 0 11 3 T 12 11 340995 CASAVA_Build 9 34008228 1D GCGATTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 21 0 10 11 T 17 16 340996 CASAVA_Build 9 34010663 1D CTCTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 31 1 16 14 T 13 12 340997 CASAVA_Build 9 34011631 3D ATCCATTTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2401 het 52 hom 26 1 13 12 T 19 16 340998 CASAVA_Build 9 34014341 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 907 hom 19 3 12 4 A 14 13 340999 CASAVA_Build 9 34014630 6D GGTCAGAAAA TAACTT/------ TAACAGGATG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TAACTT 1 0 341000 CASAVA_Build 9 34017171 4I CAGAAGACAA ----/AATT AGCTCAGATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AATT 0 1 341001 CASAVA_Build 9 34019273 1I GACCTGTAAT -/C CCAGCACTTT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 C 2 3 341002 CASAVA_Build 9 34024886 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 10 9 341003 CASAVA_Build 9 34025895 1D ACATTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 37 2 24 11 T 11 10 341004 CASAVA_Build 9 34033588 14I TCACTGTGGC --------------/CTCAACCTCCTGGA CTCAAGCAAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 CTCAACCTCCTGGA 0 1 341005 CASAVA_Build 9 34033836 1I TTTCAGGGGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 320 hom 26 1 18 7 A 8 9 341006 CASAVA_Build 9 34034992 2D TCAATTATGC TA/-- TGTCCAGCAT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 TA 1 0 341007 CASAVA_Build 9 34036642 15D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 16 0 14 2 A 29 14 341008 CASAVA_Build 9 34041985 1D CCTCAAAAAG A/- AAAAAAATGA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 A 8 7 341009 CASAVA_Build 9 34051867 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 506 hom 15 2 10 3 A 13 14 341010 CASAVA_Build 9 34053516 1D CCAATAGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 268 hom 34 1 27 6 T 12 11 341011 CASAVA_Build 9 34055261 1D TGTGAAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 29 2 17 10 A 15 14 341012 CASAVA_Build 9 34078023 5I TAAGGGTGAG -----/AAAGA CTATGTCATT 3070 hom 99 het 35 0 32 3 AAAGA 0 1 341013 CASAVA_Build 9 34090810 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 T 8 9 341014 CASAVA_Build 9 34093040 5D GTGAGCCATG ATCAC/----- ATCACGCCAC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 ATCAC 2 1 341015 CASAVA_Build 9 34099004 1D ATATATATGG T/- TTTTTTTTTT 832 hom 12 het 9 0 5 4 T 13 12 341016 CASAVA_Build 9 34119377 2I TACATAACAC --/TT TTCCTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 2 4 341017 CASAVA_Build 9 34123975 1D CAGCTGCTTG T/- TGGGAATCCT 3070 hom 63 het 28 0 15 13 T 2 1 341018 CASAVA_Build 9 34129711 1I CCCACTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2479 het 1482 hom 26 8 8 10 A 15 16 341019 CASAVA_Build 9 34133267 1D AAAGACCTGG A/- AATTTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 3 2 341020 CASAVA_Build 9 34135048 1D CACTGCAACC T/- CTACTTCCTG 1423 het 201 hom 5 1 3 1 T 1 0 341021 CASAVA_Build 9 34144091 1D GTGAAATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 668 hom 37 7 15 16 T 17 16 341022 CASAVA_Build 9 34148283 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 539 hom 27 3 17 7 T 13 14 341023 CASAVA_Build 9 34151956 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2419 het 1816 hom 24 8 8 8 T 15 16 341024 CASAVA_Build 9 34152597 1D GCATAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2015 het 1000 hom 10 4 5 1 T 11 10 341025 CASAVA_Build 9 34161045 1D ACAAGATAAC T/- TTTTGCTATG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 5 4 341026 CASAVA_Build 9 34162566 2I GATTATCTCT --/AC ACACATTTTT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 AC 2 3 341027 CASAVA_Build 9 34182903 1D TAATTACTTA T/- TTTTCTATAT 3070 het 3070 ref 25 11 9 7 T 5 4 341028 CASAVA_Build 9 34186315 1D TTAAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3 hom 26 1 13 12 T 15 14 341029 CASAVA_Build 9 34199701 2D TAGTTACCTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 10 16 9 T 11 9 341030 CASAVA_Build 9 34200579 3D TAGCTGGGCA TGG/--- TGGTGTGTGC 2542 het 2542 ref 14 7 6 1 TGG 2 1 341031 CASAVA_Build 9 34201135 4D TTTTTCCTTC ATTT/---- ATTCTCTCAT 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 ATTT 1 0 341032 CASAVA_Build 9 34202728 1I AATTACCAAC -/A AAAAAAGTCC 3070 hom 59 het 21 0 20 1 A 6 7 341033 CASAVA_Build 9 34206156 2D TCTGGAGCAC CT/-- CTCTGCTGCC 1460 het 1460 ref 24 15 5 4 CT 3 2 341034 CASAVA_Build 9 34208523 2I ATATTCACAA --/CT CTCATTGCTG 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 CT 1 2 341035 CASAVA_Build 9 34227231 1I TACTGGGCAC -/T TGCAGGTAGA 3070 het 3070 ref 51 31 16 4 T 1 2 341036 CASAVA_Build 9 34230745 1I TTTAGCTACC -/T AGCTTTATGC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 T 0 1 341037 CASAVA_Build 9 34242467 4D AAATAATTTG CTAA/---- CTAACTATTT 3070 het 3070 hom 49 17 26 8 CTAA 2 1 341038 CASAVA_Build 9 34251853 2D AACAGTGGTC TA/-- AGTCTTAGAG 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 TA 1 0 341039 CASAVA_Build 9 34256223 9D ACTATAAATC CCACATATA/--------- CCACATATAT 3070 hom 41 het 14 0 14 3 CCACATATA 2 1 341040 CASAVA_Build 9 34284547 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 16 3 A 10 9 341041 CASAVA_Build 9 34285114 12D ACAATTTTAA TAGATAGGTAGG/------------ TAGATAGGTA 3070 het 3070 ref 41 24 15 6 TAGATAGGTAGG 2 1 341042 CASAVA_Build 9 34286730 1D TTAATTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 9 15 5 T 10 9 341043 CASAVA_Build 9 34287759 1I GATTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 1816 het 635 hom 9 3 5 1 A 15 16 341044 CASAVA_Build 9 34290236 3I TTTGAAAAAT ---/GTG GTGGTAAGAT 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 GTG 1 2 341045 CASAVA_Build 9 34296800 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 878 het 878 ref 25 18 2 5 A 13 14 341046 CASAVA_Build 9 34297400 1D GAATTGGTTT A/- AAAAAAAAAA 1240 het 1240 ref 34 25 3 7 A 13 12 341047 CASAVA_Build 9 34299107 1D ACAAATAAAC A/- AAAGAGTCAA 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 A 4 3 341048 CASAVA_Build 9 34300392 4D GTAGAAGGGT TAAC/---- TATTTCACTT 3070 het 3070 hom 37 15 19 5 TAAC 1 0 341049 CASAVA_Build 9 34303921 1D AATTTTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1663 hom 23 6 15 2 T 13 12 341050 CASAVA_Build 9 34313164 1D AATAGAATTC T/- TAAGGCAAGA 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 T 2 1 341051 CASAVA_Build 9 34315343 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2809 het 1668 hom 21 6 8 7 A 15 16 341052 CASAVA_Build 9 34316946 1I CTGAACTGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 9 10 341053 CASAVA_Build 9 34329940 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 11 12 341054 CASAVA_Build 9 34330379 30D GGAGTGAGGA GATGGGCAGGGCCTTCTTAGACCAGGAGGG/------------------------------ GATGGGCAGG 3070 het 3070 ref 31 24 13 10 GATGGGCAGGGCCTTCTTAGACCAGGAGGG 1 0 341055 CASAVA_Build 9 34350018 1D TTTTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2985 hom 31 9 14 8 A 12 11 341056 CASAVA_Build 9 34351283 1D GAAAAAAATT A/- AAACACAAAA 3070 het 3070 ref 34 24 9 2 A 4 3 341057 CASAVA_Build 9 34360702 1D GTATAGAGGT G/- GGAGGTTCCT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 G 3 2 341058 CASAVA_Build 9 34377029 1D ATCCTTATGA T/- TTTTTTTTTT 1661 het 836 hom 44 7 6 31 T 19 18 341059 CASAVA_Build 9 34381946 2I AGTAATTGTA --/GT GTGTTACAAT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 GT 2 3 341060 CASAVA_Build 9 34391971 1D CCTTCTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 33 2 15 18 T 15 14 341061 CASAVA_Build 9 34396802 1D GTCCAGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 17 1 9 7 T 17 16 341062 CASAVA_Build 9 34405120 1D CCTGGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 30 0 20 10 T 15 14 341063 CASAVA_Build 9 34457659 2I TAAAATGCAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 TA 5 6 341064 CASAVA_Build 9 34486187 1D GCCAGAGGTT G/- CCACCGGGTT 3070 het 3070 hom 32 10 11 11 G 1 0 341065 CASAVA_Build 9 34512395 2D TCTGGGTCAG GT/-- GTGTGTGTGT 1281 het 1281 ref 48 31 4 13 GT 7 6 341066 CASAVA_Build 9 34530494 1I GCCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2530 het 2314 hom 24 9 9 6 A 13 14 341067 CASAVA_Build 9 34533941 5I ACTGTATTCT -----/TAAAA TAAAGCTAGA 3070 hom 42 het 17 0 15 3 TAAAA 0 1 341068 CASAVA_Build 9 34557181 1D AGGGGGAGGA T/- TGGGGTTCTT 3070 hom 76 het 32 0 26 7 T 2 1 341069 CASAVA_Build 9 34563145 1D GCAATGTTCC G/- GGTTGCCCTG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 G 3 2 341070 CASAVA_Build 9 34567585 2D GAAAAGAAAG AT/-- ATCAGGAGCT 3070 hom 60 het 21 0 20 3 AT 2 1 341071 CASAVA_Build 9 34572681 1I GTTAGAGACA -/G GGTGGTTGAT 3070 hom 114 het 47 0 38 9 G 2 3 341072 CASAVA_Build 9 34591397 1I GTACAGTGAT -/G GGGGCCAGAC 3070 hom 87 het 34 0 26 8 G 4 5 341073 CASAVA_Build 9 34596160 1D GGGTGCTGCT A/- AGAGCTCACA 3070 hom 117 het 45 0 38 7 A 2 1 341074 CASAVA_Build 9 34653288 1D TGGCTGAGGA G/- GGTTCTTGGC 3070 hom 73 het 30 0 25 5 G 3 2 341075 CASAVA_Build 9 34658890 3D TTCTGCCCTA TTG/--- TTTATGCAAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTG 1 0 341076 CASAVA_Build 9 34663351 2D ACTCTATTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 14 12 341077 CASAVA_Build 9 34671892 1D AAGGGACCTC T/- CTTTGTCTCT 3070 het 3070 ref 63 31 24 8 T 1 0 341078 CASAVA_Build 9 34673063 1D TCTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 31 1 22 8 T 13 12 341079 CASAVA_Build 9 34704334 1D AGTGACTAAG A/- AAGTAGTGAG 3070 het 3070 hom 31 12 11 9 A 3 2 341080 CASAVA_Build 9 34720409 1D TGGTAATGGT G/- GTCTCAGGCC 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 G 2 1 341081 CASAVA_Build 9 34722023 1D AATTTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2536 hom 31 10 11 10 T 17 16 341082 CASAVA_Build 9 34726298 1I GGGGTTTTTC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 88 het 41 0 38 3 A 7 8 341083 CASAVA_Build 9 34728028 2D AAGATTATGC AG/-- AGAGACTACA 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 AG 3 2 341084 CASAVA_Build 9 34732737 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 8 7 341085 CASAVA_Build 9 34732940 5D CATTTGTTGA TGTAT/----- TGTCTGTGGC 3070 hom 108 het 37 0 35 2 TGTAT 1 0 341086 CASAVA_Build 9 34739566 1I CCTGTCTCAA -/T TTTTTTTTTT 1712 het 1641 hom 15 7 4 4 T 10 11 341087 CASAVA_Build 9 34741208 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCC 1329 het 1329 ref 11 7 4 0 A 5 4 341088 CASAVA_Build 9 34747265 1D TTATTTCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 832 hom 26 3 19 4 T 13 12 341089 CASAVA_Build 9 34751312 1I ACATTGTCAG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 8 9 341090 CASAVA_Build 9 34764402 1D CAACAAAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 8 7 341091 CASAVA_Build 9 34781580 1D ATATAGATTT A/- AAAAAAAAAA 2869 het 894 hom 30 5 14 12 A 15 14 341092 CASAVA_Build 9 34782675 1D CCATCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 30 1 16 13 A 12 11 341093 CASAVA_Build 9 34783776 1D CCTCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 32 0 20 12 T 15 14 341094 CASAVA_Build 9 34786420 1I TAAAAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 9 10 341095 CASAVA_Build 9 34801009 1D CCTTTGAACG A/- AAGAATAAAG 3070 het 3070 hom 52 24 25 3 A 3 2 341096 CASAVA_Build 9 34803880 1I GTTAGAGACC -/G GTCCCCACCA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 G 1 2 341097 CASAVA_Build 9 34805317 4D GAATTCTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 4 TTTG 4 3 341098 CASAVA_Build 9 34816730 1D AAGGTTGGGG C/- CATTCACCAT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 C 2 1 341099 CASAVA_Build 9 34817549 3I AGTACTGCCA ---/CCT CCTCCTCCTC 3070 hom 120 het 47 0 40 7 CCT 3 4 341100 CASAVA_Build 9 34857444 9D TTCAGGGTCT ACAAACATG/--------- AAAACTAAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 5 ACAAACATG 1 0 341101 CASAVA_Build 9 34860578 4I CTTCCATGTC ----/TTTT TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 32 0 23 9 T 9 13 341102 CASAVA_Build 9 34875458 1D AACATGTCAT A/- AAGAAGTCAT 3070 hom 126 het 47 0 43 5 A 3 2 341103 CASAVA_Build 9 34883046 1D TTCTCACCTG C/- CAGCAATTGC 3070 het 3070 hom 39 17 17 6 C 2 1 341104 CASAVA_Build 9 34905912 1I GCGGTCCCCC -/T CCCACACCAC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 0 1 341105 CASAVA_Build 9 34913047 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 21 5 T 16 15 341106 CASAVA_Build 9 34914343 1D CTGTCTAGAT A/- AACCTGTCCA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 3 2 341107 CASAVA_Build 9 34920666 2D GGAATTGATG TT/-- TTTTAGAAGA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 T 6 4 341108 CASAVA_Build 9 34937690 1I GAGACAAGAT -/A ATGAAGGTGG 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 1 2 341109 CASAVA_Build 9 34938221 5D TGTTATTACA AGAGT/----- AAAGAAGTTT 3070 het 3070 hom 30 14 14 4 AGAGT 1 0 341110 CASAVA_Build 9 34945413 2I AAGTGGCTCA --/CG CCTGTAATCC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 CG 0 1 341111 CASAVA_Build 9 34969253 3D AAAGCCTTAC AGA/--- AGAAGTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 27 7 AGA 2 1 341112 CASAVA_Build 9 34977122 4I AAATAACTCC ----/CAAT CAGACTCACA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 CAAT 0 1 341113 CASAVA_Build 9 34978089 3I ATTCCTCATG ---/CTC CTCATTTCCC 1928 hom 20 het 9 0 6 3 CTC 1 2 341114 CASAVA_Build 9 35004434 1D AGAAAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 16 0 9 7 T 15 14 341115 CASAVA_Build 9 35014576 4D GACCCAGGGT CATA/---- CATAGGTGGA 3070 hom 54 het 21 0 17 5 CATA 2 1 341116 CASAVA_Build 9 35028607 1D GGCAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 615 hom 38 3 25 10 T 15 14 341117 CASAVA_Build 9 35028622 1D TTTTTTTTTT C/- TTTAAGAGAC 3070 het 603 hom 31 3 25 3 C 1 0 341118 CASAVA_Build 9 35028970 1D CTCATTAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 55 hom 22 1 18 3 T 9 8 341119 CASAVA_Build 9 35051800 4D TGCCAGCACT AAAA/---- AAGTCTCAAG 3070 het 3070 ref 42 24 10 10 A 6 2 341120 CASAVA_Build 9 35088060 3I TGTTTTCTTC ---/ATT ATGATATCCT 3070 hom 174 het 65 0 58 7 ATT 0 1 341121 CASAVA_Build 9 35091384 2D GGTACTGGAG CA/-- CCCTGAGGCC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 CA 1 0 341122 CASAVA_Build 9 35100491 1I CAAGACGCTC -/T TATATTCACT 3070 hom 83 het 31 0 25 6 T 1 2 341123 CASAVA_Build 9 35102304 14I TGAGATCAGC --------------/CTGTCCCATCCCTT CTGCCAGCAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 CTGTCCCATCCCTT 0 1 341124 CASAVA_Build 9 35111442 4D GTTCTTTCTC TCTT/---- TCTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 TCTT 2 1 341125 CASAVA_Build 9 35117824 1I19M1D GACCTTGTCA -TTTTTTTTTTGAGCAAAAGT/TTTTTTTTTTTGAGCAAAAG- TTTTTTTTCT 3070 hom 42 het 17 0 15 6 N/A 0 0 341126 CASAVA_Build 9 35120690 2D ATCTTAAACA CT/-- GACAGCAATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 1 0 341127 CASAVA_Build 9 35123387 1D TTTTTCCCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 28 0 21 7 T 10 9 341128 CASAVA_Build 9 35124528 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 32 1 28 3 A 11 10 341129 CASAVA_Build 9 35125192 1D GCACCCAGGC A/- AACACGTCAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 2 341130 CASAVA_Build 9 35127110 1I GGAAATTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 9 10 341131 CASAVA_Build 9 35140157 1D GTCAATTGTG T/- TTTTTGACTG 3070 het 3070 ref 54 27 25 2 T 6 5 341132 CASAVA_Build 9 35166185 4D ATCAGCTGAT AGTG/---- AGGTGGTGGG 3070 hom 99 het 37 0 32 5 AGTG 1 0 341133 CASAVA_Build 9 35170926 2I CCCTGTCTTT --/AA AAAAAAAAAA 1971 het 1262 hom 26 7 9 10 A 16 18 341134 CASAVA_Build 9 35174799 5D AGAAAGAAGC GGGGG/----- GGGGGGGGGA 988 het 80 hom 15 2 6 7 G 14 9 341135 CASAVA_Build 9 35174847 4D GAAAGAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAA 1733 het 1417 hom 17 7 7 5 AAAG 4 3 341136 CASAVA_Build 9 35185084 1D TAATCTTTTT A/- ATGCAAATGG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 2 1 341137 CASAVA_Build 9 35185490 1D CACAAGCCAT G/- GGTCCTTAAC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 G 3 2 341138 CASAVA_Build 9 35210281 1D CCTTTATTTG T/- TTAACAATCT 2635 het 2635 ref 25 14 6 6 T 3 2 341139 CASAVA_Build 9 35219686 3D GGCCTACTGC ACT/--- ACTACTACTA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 ACT 5 4 341140 CASAVA_Build 9 35228907 1D GGTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 2583 het 2583 ref 24 9 7 8 T 15 14 341141 CASAVA_Build 9 35242311 3I AGTCTGAAAA ---/ATG ATGATTTTCT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 ATG 1 2 341142 CASAVA_Build 9 35249203 4D TCTCTGATGG CTGT/---- CTATCTATTA 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 CTGT 1 0 341143 CASAVA_Build 9 35260337 4D TGTATATATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 45 16 16 14 TG 11 9 341144 CASAVA_Build 9 35271420 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGGA 3070 het 2353 hom 35 10 16 10 AG 6 4 341145 CASAVA_Build 9 35278921 1D TTCTATGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 10 9 341146 CASAVA_Build 9 35279002 1D TACAGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 17 0 12 5 T 12 11 341147 CASAVA_Build 9 35289264 1D TAATTTGTTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 T 7 6 341148 CASAVA_Build 9 35308063 2I ATAATAATTC --/AG AGTCTCTCAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 AG 1 2 341149 CASAVA_Build 9 35339345 1D GTTGGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 1894 het 1230 hom 33 8 8 17 A 19 18 341150 CASAVA_Build 9 35357641 1I TTAAGTTACT -/C CCTAGGCTTG 3070 het 3070 ref 46 22 14 10 C 2 3 341151 CASAVA_Build 9 35373707 1D AGTATACACT A/- TGGGAAATGT 3070 het 3070 ref 43 24 16 3 A 1 0 341152 CASAVA_Build 9 35467059 1D ACAGCTTCCC T/- TTGCTTCTCC 3070 het 3070 hom 45 21 20 5 T 3 2 341153 CASAVA_Build 9 35474261 5D TATGTGACTC TTCCT/----- TTCACTTGAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 6 TTCCT 1 0 341154 CASAVA_Build 9 35480114 9D GGGCGAGACA CGCCGCCGC/--------- CGCCGCCGCC 2016 het 584 hom 14 2 6 6 CGC 7 4 341155 CASAVA_Build 9 35482673 2D TATGGTGGTA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 14 12 8 AT 7 6 341156 CASAVA_Build 9 35488156 1D TTAGTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 182 hom 40 1 24 15 T 12 11 341157 CASAVA_Build 9 35493710 11I CAGTTTACAT -----------/TCCCAATAGCA TCCCAATAGC 3070 hom 85 het 32 0 29 4 TCCCAATAGCA 1 2 341158 CASAVA_Build 9 35502187 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1122 hom 17 3 12 2 A 10 9 341159 CASAVA_Build 9 35517136 1I CCTTTCGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 593 hom 49 2 38 9 T 10 11 341160 CASAVA_Build 9 35526184 5D GATGATCATC AAAGT/----- AAAGTTTTTT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 AAAGT 2 1 341161 CASAVA_Build 9 35539911 1I GGCCTTGTTT -/A AAAAAAAAAG 2817 het 2817 ref 23 11 8 4 A 9 10 341162 CASAVA_Build 9 35544746 1D GTCTGAACTC A/- AAACTTCTCA 3070 het 3070 ref 50 27 21 2 A 4 3 341163 CASAVA_Build 9 35547049 1D TGCTCTTGGA G/- GGGGCGGGTG 3070 het 3070 ref 31 13 15 4 G 5 4 341164 CASAVA_Build 9 35552329 4D CCATACCCAT ACAA/---- ACAAACATTC 2430 het 2430 ref 24 10 8 6 ACAA 2 1 341165 CASAVA_Build 9 35557860 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1527 het 1527 ref 18 12 4 2 T 13 12 341166 CASAVA_Build 9 35558983 1D TCAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 721 hom 5 het 3 0 2 1 A 20 19 341167 CASAVA_Build 9 35559874 2D GAGGAGGGCA TG/-- TGTGCAGACC 3070 het 3070 ref 51 22 22 9 TG 3 2 341168 CASAVA_Build 9 35592421 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGGATTGCTT 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 AGG 1 2 341169 CASAVA_Build 9 35593569 1D GCGTGTGCTG A/- AGACCAAACG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 2 1 341170 CASAVA_Build 9 35600316 4D GTAAAGTATC AGTG/---- AGCTCCATGG 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 AGTG 1 0 341171 CASAVA_Build 9 35602582 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 A 13 12 341172 CASAVA_Build 9 35617456 1I ATTGGGAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 10 11 341173 CASAVA_Build 9 35634934 8D CGCGGTGGCT CACGCCTG/-------- TAATCCCAGC 2794 hom 23 het 14 0 7 9 CACGCCTG 1 0 341174 CASAVA_Build 9 35636299 12D CCCTAGGAGC TCCCCCTGAGGG/------------ TCTGTCCCTG 3070 hom 44 het 15 0 14 3 TCCCCCTGAGGG 1 0 341175 CASAVA_Build 9 35641837 1D AGAAATTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 10 9 341176 CASAVA_Build 9 35645126 4I AGCCCACAAC ----/CTAT ATCACGTGCA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 CTAT 0 1 341177 CASAVA_Build 9 35660811 2I TTTTTGAAAC --/AG AGTCTCGCTT 2267 het 2267 ref 22 9 7 6 AG 1 2 341178 CASAVA_Build 9 35667479 1D CTAGTATCCT A/- AGTAAAGTGG 3070 het 3070 ref 57 26 21 10 A 2 1 341179 CASAVA_Build 9 35667712 1D TCTATGGGAA C/- CCCCCTTCAT 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 C 6 5 341180 CASAVA_Build 9 35669546 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 A 7 8 341181 CASAVA_Build 9 35677774 1I GTGGGGTGAC -/A AAAAGACTCT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 A 4 5 341182 CASAVA_Build 9 35694899 1D AAGGACATAG A/- AAAAAACATG 3070 het 3070 hom 43 15 20 9 A 7 6 341183 CASAVA_Build 9 35719070 2I CATTTATTGA --/CT CTATGTCACT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 CT 1 2 341184 CASAVA_Build 9 35721561 4D CTGATTCCTG TTGT/---- TTGTTGACCC 3070 het 3070 hom 54 22 30 3 TTGT 2 1 341185 CASAVA_Build 9 35726738 1I GAGGATATGT -/G GGGGGGTCTC 2130 het 1144 hom 15 4 5 6 G 6 7 341186 CASAVA_Build 9 35729116 1I GCTGGGGGAG -/C AGACACAGAA 2824 het 2824 ref 31 12 11 8 C 0 1 341187 CASAVA_Build 9 35742275 1D CCCGGAACAG T/- TTCTCAGACC 3070 het 3070 ref 55 24 25 7 T 3 2 341188 CASAVA_Build 9 35775558 1I CATAATTAGG -/T TTTTTGTTTC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 T 5 6 341189 CASAVA_Build 9 35780128 3D TGACTGTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 20 21 10 T 14 11 341190 CASAVA_Build 9 35780579 1D ATAGCTTGAA G/- GGGGGAGAGA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 G 6 5 341191 CASAVA_Build 9 35794231 2D TCATTAAGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 30 3 11 16 T 16 14 341192 CASAVA_Build 9 35820653 1I TACTAGTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 T 9 10 341193 CASAVA_Build 9 35844485 1I TGGGGAAAGA -/G GGGCCCCTCA 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 G 3 4 341194 CASAVA_Build 9 35850651 4D AATCATGGAC CATT/---- CATTATTTTG 3070 hom 158 het 58 0 52 8 CATT 2 1 341195 CASAVA_Build 9 35855763 1I CACGGTCCTC -/A ACCTCTCCCT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 1 2 341196 CASAVA_Build 9 35855905 1I ATATTGGGAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 15 14 8 T 9 10 341197 CASAVA_Build 9 35856557 1I ATAATAATTT -/A AAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 37 20 17 0 A 6 7 341198 CASAVA_Build 9 35858463 11I TTGCTCCTCA -----------/GCTTGCAGACG GCCTATTGTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 GCTTGCAGACG 0 1 341199 CASAVA_Build 9 35862781 2D TTTAAAATGT AC/-- AATTCAAATA 3070 het 3070 hom 27 11 14 4 AC 1 0 341200 CASAVA_Build 9 35866336 1D TTATTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2837 hom 38 11 14 13 T 11 10 341201 CASAVA_Build 9 35869856 23D GCAGTGACAC AACTAAACATAATTGGCACTATT/----------------------- AACTAAACAT 3070 hom 63 het 30 0 22 10 AACTAAACATAATTGGCACTATT 2 1 341202 CASAVA_Build 9 35870006 1D ATCCATTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 22 14 0 T 9 8 341203 CASAVA_Build 9 35870207 1I CACATATATA -/C ATATATGTAT 2632 het 2632 ref 25 15 6 4 C 0 1 341204 CASAVA_Build 9 35873673 3I ACAAGAAAGG ---/ATT ATTTTTCATC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 ATT 1 2 341205 CASAVA_Build 9 35875301 1I CCCAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2531 hom 24 6 12 6 A 10 11 341206 CASAVA_Build 9 35884424 1I CACCCAGCTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 2288 hom 29 7 20 3 T 7 8 341207 CASAVA_Build 9 35890003 1D ATGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1067 hom 31 5 23 6 A 12 11 341208 CASAVA_Build 9 35909604 1D AATCAGGCAG C/- CCCCCAGAAC 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 C 6 5 341209 CASAVA_Build 9 35911099 1D ATACATTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2892 hom 30 9 11 10 T 13 12 341210 CASAVA_Build 9 35912284 1D AAATTTGTTA T/- TTTTTTCCGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 7 6 341211 CASAVA_Build 9 35922948 1D CCCCTCCCCC T/- AGCCCCTGGT 2016 het 358 hom 11 2 6 3 T 1 0 341212 CASAVA_Build 9 35923507 1I TTTGATTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 10 11 341213 CASAVA_Build 9 35925973 1D GTCAGATAAC T/- TATATTGACT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 2 1 341214 CASAVA_Build 9 35926124 1I TCCTTTGCTT -/A AAAAAAAAAA 2903 het 1549 hom 24 5 11 8 A 13 14 341215 CASAVA_Build 9 35928293 1D TGTTAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 A 12 11 341216 CASAVA_Build 9 35929382 2D ATAGCAACAT TA/-- TGAGGAGGAC 2323 het 2323 ref 35 19 7 10 TA 1 0 341217 CASAVA_Build 9 35934942 9D TCAGAGAGAC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2301 het 2301 ref 26 10 9 7 T 23 14 341218 CASAVA_Build 9 35936637 2I ACCTTAGCCT --/CC CCCGAAGTGC 3070 het 3070 hom 22 10 10 3 C 3 5 341219 CASAVA_Build 9 35938252 1D CCTTCCATGA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 8 7 341220 CASAVA_Build 9 35953658 1I AGTTTTCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 10 11 341221 CASAVA_Build 9 35965366 1D TTGTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2041 het 2041 ref 29 18 5 6 T 13 12 341222 CASAVA_Build 9 35978104 1D TTTATATCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 17 19 11 T 10 9 341223 CASAVA_Build 9 35979775 1I TCCTAGCCTC -/T TTTTTATAGG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 5 6 341224 CASAVA_Build 9 35982182 9D CAGGTACATC AGCAGGATG/--------- AGCACGAAGA 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 AGCAGGATG 1 0 341225 CASAVA_Build 9 35983060 2I TCTTTACTAG --/CT CACTTCCAAG 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 CT 0 1 341226 CASAVA_Build 9 35986459 1I CTTTTTGATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 A 9 10 341227 CASAVA_Build 9 35989877 1D TCATCACCTC A/- ACTGTTATGG 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 A 2 1 341228 CASAVA_Build 9 35990592 1D TATTCCTTCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 15 7 A 10 9 341229 CASAVA_Build 9 35993429 2D GCCGGCAGCC TT/-- ATGGGCATGT 3070 het 3070 ref 47 25 14 8 T 2 0 341230 CASAVA_Build 9 35994548 2D TCTGGAACTC TA/-- TAGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TA 2 1 341231 CASAVA_Build 9 35994874 1I ATGTGATGGT -/G GTTTCACCTC 3070 hom 108 het 44 0 35 9 G 1 2 341232 CASAVA_Build 9 35998232 6D CCAACCCCTC CTCCTT/------ CTCCTTCTCC 3070 het 3070 hom 46 17 17 15 CTCCTT 2 1 341233 CASAVA_Build 9 36004489 8D TGTAATCCCC AGTGTTGG/-------- AGGAGGGGCC 3070 het 3070 ref 31 18 11 4 AGTGTTGG 1 0 341234 CASAVA_Build 9 36008120 1I CAGAGTGAGA -/C CCCCCCACTC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 6 7 341235 CASAVA_Build 9 36009002 2I TGACTGTTTC --/TA TGACTATTTT 3070 het 3070 ref 41 18 19 4 TA 0 1 341236 CASAVA_Build 9 36009155 1I ACCATGATTC -/A AATTTGTGGA 3070 het 3070 hom 26 9 17 0 A 2 3 341237 CASAVA_Build 9 36017348 1I CCCAAAGTGC -/T GGGATTACAG 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 0 1 341238 CASAVA_Build 9 36021072 1D AGAAAATGCG T/- TAAATAAATC 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 T 2 1 341239 CASAVA_Build 9 36021515 2I ATTTCATAAC --/AT GTGGGTGTTG 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 AT 0 1 341240 CASAVA_Build 9 36026412 1I TGAGGCTATA -/T GTGCCAAAGA 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 T 0 1 341241 CASAVA_Build 9 36029162 1D ATTGTTTGAT A/- AAAAAAAAAA 2525 het 2525 ref 30 17 7 6 A 12 11 341242 CASAVA_Build 9 36046240 1D TATGTCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 20 5 A 10 9 341243 CASAVA_Build 9 36068025 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTAATT 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 T 6 7 341244 CASAVA_Build 9 36085914 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1677 het 246 hom 5 1 4 0 A 10 11 341245 CASAVA_Build 9 36118813 4I TTATATTTAT ----/TGGA TGGATTTTCT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 TGGA 1 2 341246 CASAVA_Build 9 36123049 1D TCTCAATCTT A/- AAAAAAAAAA 2207 het 2207 ref 25 10 6 9 A 15 14 341247 CASAVA_Build 9 36131465 1I GGGGCAGGGG -/T GCCTGTTCAC 3070 hom 67 het 27 0 21 6 T 0 1 341248 CASAVA_Build 9 36151501 1D AGCTTAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 21 0 12 9 A 12 11 341249 CASAVA_Build 9 36171608 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1965 het 1965 ref 23 10 8 5 A 15 14 341250 CASAVA_Build 9 36175408 2D CATGCATGTG TA/-- TATATATGTG 3070 het 3070 hom 80 35 36 13 TA 4 3 341251 CASAVA_Build 9 36180460 3D AAGGATTCAA TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TCT 4 3 341252 CASAVA_Build 9 36223664 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 A 13 12 341253 CASAVA_Build 9 36227653 1I TTTTTTTTTT -/A AATTAAGTTT 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 2 3 341254 CASAVA_Build 9 36233956 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 1558 het 1558 ref 17 10 4 3 T 9 8 341255 CASAVA_Build 9 36242826 4I TCCCTGGAAG ----/CAAA CAGTTACTGG 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 CAAA 0 1 341256 CASAVA_Build 9 36249390 2D TATTAACATC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 T 11 9 341257 CASAVA_Build 9 36281497 2D TTTCTAACCA AT/-- ATTATTTGTG 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 AT 2 1 341258 CASAVA_Build 9 36282407 1I GCGCTCACAC -/T TTTTTTTTTT 2427 het 2427 ref 24 11 7 6 T 10 11 341259 CASAVA_Build 9 36288326 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1636 hom 15 het 9 0 6 3 A 10 11 341260 CASAVA_Build 9 36294537 2D ATTGTGAAGA CT/-- CTGTTTCTCT 3070 het 1202 hom 18 6 8 4 CT 2 1 341261 CASAVA_Build 9 36309779 1D TTTATTTTCC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 111 het 40 0 36 4 T 9 8 341262 CASAVA_Build 9 36319576 1I AGCAAAACTC -/A AAAAAAAAAA 2044 het 2044 ref 13 8 5 0 A 10 11 341263 CASAVA_Build 9 36326372 4I CATCCCTAAC ----/ACAG ACAGTGACAT 3070 het 2931 hom 22 6 11 5 ACAG 1 2 341264 CASAVA_Build 9 36327647 1I TTAAACATGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 2962 hom 31 9 20 2 T 8 9 341265 CASAVA_Build 9 36329984 1D AGCCCAGGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 86 het 34 0 28 6 T 10 9 341266 CASAVA_Build 9 36332182 3I CTGGCCTTTT ---/CTC CTCATTTGCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CTC 1 2 341267 CASAVA_Build 9 36336690 3I AACAGTTAAT ---/GTG GTAATAACTG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 GTG 0 1 341268 CASAVA_Build 9 36350151 1D GACAGGATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 10 9 341269 CASAVA_Build 9 36351440 1D GATTATAGAC G/- TGAGCCACCA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 1 0 341270 CASAVA_Build 9 36355229 1D TAAGAGCCTT A/- AAAAAAACGG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 8 7 341271 CASAVA_Build 9 36359647 1D ACAAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 12 11 341272 CASAVA_Build 9 36368902 1I TTCTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3003 hom 30 10 11 9 T 13 14 341273 CASAVA_Build 9 36389491 2I AATATATATA --/AT ATATATTATA 1268 het 919 hom 8 2 4 2 AT 3 4 341274 CASAVA_Build 9 36392492 1D ATCTAAGCTT A/- AAAAAAAAAA 2278 het 1315 hom 35 9 11 15 A 17 16 341275 CASAVA_Build 9 36394913 1I TGTAGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 9 10 341276 CASAVA_Build 9 36395266 1I TCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2336 het 2336 ref 28 18 5 5 A 11 12 341277 CASAVA_Build 9 36395748 1D ATATAAGAAA G/- ATCTCATTCT 3070 het 3070 hom 24 10 14 1 G 1 0 341278 CASAVA_Build 9 36402024 2D AGCCAAATTC AG/-- AGAGACAGAA 3070 het 3070 hom 52 23 29 3 AG 3 2 341279 CASAVA_Build 9 36410932 2D AACTATAAAC AG/-- ATACATATCA 3070 het 3070 hom 36 13 20 5 AG 1 0 341280 CASAVA_Build 9 36431724 3I CTCAATTAAA ---/AAC AACAACAACT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 AAC 3 4 341281 CASAVA_Build 9 36445908 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 1667 het 1667 ref 22 11 4 7 A 17 16 341282 CASAVA_Build 9 36459327 1I TTGTTCAATC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 T 8 9 341283 CASAVA_Build 9 36468038 6I TTTGAGATAC ------/CAATAA CAAGTAATAC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 CAATAA 0 1 341284 CASAVA_Build 9 36496987 11D GGAGCGCAGT GGCGCGATCTC/----------- GGCTCACTGC 1620 het 1463 hom 9 3 4 3 GGCGCGATCTC 1 0 341285 CASAVA_Build 9 36506285 1D CTGGCCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 12 11 341286 CASAVA_Build 9 36515521 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 293 hom 48 1 41 8 T 9 8 341287 CASAVA_Build 9 36518517 2D CAGCTATTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 31 0 24 7 TG 9 8 341288 CASAVA_Build 9 36526932 7D TGTGCCCAGC CCCAAAT/------- CCCAAATCAC 3064 het 1835 hom 13 5 8 2 CCCAAAT 2 1 341289 CASAVA_Build 9 36537310 4I TTGTTTTTTG ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 hom 84 het 37 0 29 8 TTGT 2 3 341290 CASAVA_Build 9 36550659 1D AAACTCCGTC T/- CAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 T 1 0 341291 CASAVA_Build 9 36561608 1I TCTCTTTCTC -/T TTTTTTTGAG 1877 het 1877 ref 14 5 4 5 T 7 8 341292 CASAVA_Build 9 36568241 1I ATCCAATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 821 hom 38 2 27 9 T 11 12 341293 CASAVA_Build 9 36570622 1I GCTTCGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1699 hom 20 6 10 4 T 10 11 341294 CASAVA_Build 9 36572512 2I GGGACATTTT --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 50 23 16 11 AC 4 5 341295 CASAVA_Build 9 36589298 8D ACTCCGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 2884 het 864 hom 14 4 9 4 A 24 16 341296 CASAVA_Build 9 36590097 1D TTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2855 hom 23 8 12 3 T 12 11 341297 CASAVA_Build 9 36610546 1D ATTCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1486 het 367 hom 25 5 4 16 T 19 18 341298 CASAVA_Build 9 36611416 5I CTTACCCACA -----/AAGAT AAGATAAGTA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 AAGAT 1 2 341299 CASAVA_Build 9 36625087 2I TATTAAAAAC --/AT GTACTCAGAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 AT 0 1 341300 CASAVA_Build 9 36640258 1I ATTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2209 het 629 hom 9 2 6 1 A 10 11 341301 CASAVA_Build 9 36644018 7I AAGGGAGATA -------/ATCTTAT TCCTGCATGG 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 ATCTTAT 0 1 341302 CASAVA_Build 9 36648728 1D GACAGAGGCT C/- CGCTGTATCG 3070 het 1806 hom 17 5 11 1 C 2 1 341303 CASAVA_Build 9 36658603 1D TCTGCCTACT G/- GGTTCAAGGG 2097 het 1416 hom 15 5 7 3 G 3 2 341304 CASAVA_Build 9 36659880 1I CAAGACAATT -/G GGAGAATTAG 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 G 2 3 341305 CASAVA_Build 9 36670329 1I GTTTTTGACC -/A CTAGCCACAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 0 1 341306 CASAVA_Build 9 36678504 1I AAGCTTCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 10 11 341307 CASAVA_Build 9 36706922 4D AAGGGGAAGA AGGC/---- ATATCTTACA 3070 het 3070 ref 40 21 16 5 AGGC 1 0 341308 CASAVA_Build 9 36709073 1I AGAGAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 14 11 T 10 11 341309 CASAVA_Build 9 36716872 1D AAACATAGAC A/- AAAATCCAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 5 4 341310 CASAVA_Build 9 36718940 1I ACCTAATGAG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 A 8 9 341311 CASAVA_Build 9 36721092 12D GGTGATATAT CCATGATGAAGC/------------ CCATGGCAGA 3070 het 3070 ref 36 21 17 2 CCATGATGAAGC 1 0 341312 CASAVA_Build 9 36722620 4D AGAGGAGGGG TTGA/---- TTGTAGTTCA 3070 het 3070 ref 43 22 15 7 TTGA 1 0 341313 CASAVA_Build 9 36723121 2I CATAAATAAC --/TT TTATTGCTTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 2 4 341314 CASAVA_Build 9 36723462 1I GTTTGTTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 T 9 10 341315 CASAVA_Build 9 36724269 1D CCCACATTCA C/- CAATGCTGGC 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 C 2 1 341316 CASAVA_Build 9 36725069 5I ATCCACCCGA -----/CTCTG CTCTGTTGGT 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 CTCTG 1 2 341317 CASAVA_Build 9 36729228 1D GGTGGGAGAT G/- GGGGGGGGCA 3029 hom 29 het 11 0 8 3 G 9 8 341318 CASAVA_Build 9 36737580 1D GTCTGTCCTT G/- GGATTTTATA 3070 hom 85 het 34 0 30 5 G 3 2 341319 CASAVA_Build 9 36754429 7D14M1I5M1I3M1I GTATGTGGTG TATGTGATGTGTGTGTGCTGT-GTGTG-GTG-/-------TGTGTGTGTGCTGTGGTGTGTGTGA TGTGAGTGGT 3070 het 3070 ref 31 27 12 17 N/A 0 0 341320 CASAVA_Build 9 36757799 1D GTGGTTTTCC T/- TTTTCTATCA 3070 het 3070 hom 31 11 13 8 T 5 4 341321 CASAVA_Build 9 36779197 3D ATTGTGTGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 34 1 17 16 T 13 10 341322 CASAVA_Build 9 36780499 4D AGTTTAAAAA AATT/---- AACCTGGCCG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 AATT 1 0 341323 CASAVA_Build 9 36786516 1I TGCCAAGCTG -/A AATCACAAAG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 A 2 3 341324 CASAVA_Build 9 36786590 8D AGCCATCCTC TGGAAAGG/-------- TGGAAAGGTC 3070 het 3070 hom 46 20 22 8 TGGAAAGG 2 1 341325 CASAVA_Build 9 36789458 1I CCCATATCAG -/A AAAAAGCCTG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 5 6 341326 CASAVA_Build 9 36795596 1D GATGCTATGT G/- GGTGTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 G 3 2 341327 CASAVA_Build 9 36796560 1D CCCTGTCCCC T/- GAATGCTCGA 3070 het 3070 ref 49 26 17 7 T 1 0 341328 CASAVA_Build 9 36802967 1D TAGATATTCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 A 10 9 341329 CASAVA_Build 9 36810926 3D CTCTCTCCAG TCT/--- TCTGCTGCCT 3070 het 3070 ref 34 13 14 8 TCT 2 1 341330 CASAVA_Build 9 36815026 2I ATTTTTTAAC --/TG TGGGTGTGTG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TG 1 2 341331 CASAVA_Build 9 36833078 2D TGTGTGTGCC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 55 24 18 13 TG 6 5 341332 CASAVA_Build 9 36843225 1I TGTTTACTAG -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 6 7 341333 CASAVA_Build 9 36857552 3D TCGTCTTCTT AGC/--- AGCATTGTGA 3070 het 3070 ref 39 20 17 4 AGC 2 1 341334 CASAVA_Build 9 36865543 1D AGAATTGTGG C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 8 C 8 7 341335 CASAVA_Build 9 36873992 1I AGAAAAAGTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 A 0 1 341336 CASAVA_Build 9 36877928 4I GCTCAATAAT ----/AAAA AGACAAATAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 1 5 341337 CASAVA_Build 9 36890935 1I ACCAGGGGAG -/C CATCGTTGAT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 C 1 2 341338 CASAVA_Build 9 36896899 2I ACACATACAT --/AC ACACACATGT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AC 3 4 341339 CASAVA_Build 9 36925392 1D GCAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2445 hom 35 9 20 6 A 11 10 341340 CASAVA_Build 9 36945032 1I TTAATTCTCA -/C CATCATAATT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 C 1 2 341341 CASAVA_Build 9 36945781 3D AAAAAAAAAA TAT/--- ATATATATAT 869 het 274 hom 12 1 5 6 TAT 1 0 341342 CASAVA_Build 9 36947016 1D GAAGCCTTGT C/- CCCCCCACTT 3070 hom 66 het 33 0 20 13 C 7 6 341343 CASAVA_Build 9 36948297 2I AAATGTCAGG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 76 het 33 0 26 7 A 9 11 341344 CASAVA_Build 9 36948736 1D GAGGCCTCTC T/- TTGCTCTCAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 T 3 2 341345 CASAVA_Build 9 36952224 1I AGAGTTCTGG -/A ATGACAGGCA 3070 hom 78 het 33 0 24 9 A 1 2 341346 CASAVA_Build 9 36958605 1I TGACCAGATA -/C CCCCCACATG 3070 het 3070 ref 45 12 15 18 C 5 6 341347 CASAVA_Build 9 36959170 3D ACTCAGTGAA ACC/--- TCCTTCCTGT 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 ACC 1 0 341348 CASAVA_Build 9 36971182 1I AAACAGCAAA -/G GCCCCCCCCC 1806 hom 41 het 24 0 10 14 G 1 2 341349 CASAVA_Build 9 36972898 1I ATTCCAGTGG -/T TTGTCGGTAA 3070 het 3070 ref 51 23 23 5 T 2 3 341350 CASAVA_Build 9 36979368 2I ACACTGCCAC --/TA TATTGAGCTG 3070 het 3070 ref 56 28 21 7 TA 1 2 341351 CASAVA_Build 9 36979491 2I ATTTAAAATC --/CA CAGAGTCAAT 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 CA 1 2 341352 CASAVA_Build 9 36981716 1D TTGTTCCTAA C/- CCTGGACAGC 3070 het 3070 ref 63 29 15 19 C 3 2 341353 CASAVA_Build 9 36981790 3D50M4D TCTGACTCCC TCATCACTTTCGTCCTCCACTGTTCAGTCCCTCAAGAGGCTATGCCTTTCTTTCTGC/---TCACTTTCGTCCTCCACTGTTCAGTCCCTCAAGAGGCTATGCCTTTCTTT---- CTATTTCCTC 3070 het 3070 ref 47 40 15 20 N/A 0 0 341354 CASAVA_Build 9 36983484 1D TTGGTGCCAG A/- AAAAAACCTC 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 A 7 6 341355 CASAVA_Build 9 36983753 8D CGCCTTGGCA GGGGACTG/-------- CCCACAGCAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 GGGGACTG 1 0 341356 CASAVA_Build 9 37003087 1I ATCTCTACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 10 11 341357 CASAVA_Build 9 37029670 1D CAAATCTACC A/- AAAAAAAAAA 1638 het 1638 ref 36 23 4 9 A 13 12 341358 CASAVA_Build 9 37041307 1I CGTGTACACC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 A 9 10 341359 CASAVA_Build 9 37064464 2I ATGCCACATA --/TG TGTGTATATA 962 het 586 hom 16 5 7 4 TG 2 3 341360 CASAVA_Build 9 37067016 1I TCTACATCTG -/T TTCCTTTTTT 1552 het 1490 hom 26 6 9 11 T 2 3 341361 CASAVA_Build 9 37072483 1D CTTGGGAGTC A/- ACGTACAGGG 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 A 2 1 341362 CASAVA_Build 9 37073296 4I TATTTCTGGA ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 AAAC 1 2 341363 CASAVA_Build 9 37074150 1I TTTATCAGGG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 7 8 341364 CASAVA_Build 9 37076286 2D TTGAAACGAG CT/-- CTCTGCTGAT 3070 het 3070 hom 44 18 23 7 CT 3 2 341365 CASAVA_Build 9 37077221 8I AGCAACCAAC --------/ACATGGTG ACATGGTGAT 3070 het 3070 hom 56 26 25 5 ACATGGTG 1 2 341366 CASAVA_Build 9 37079081 1I ATTGTTTTCC -/T TTTTTGATTC 3070 het 3070 ref 42 16 19 7 T 5 6 341367 CASAVA_Build 9 37081588 1I TAGTAGAGTC -/G GGTTTTCACC 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 G 2 3 341368 CASAVA_Build 9 37084378 4I AATGTTTTAA ----/TAAT TATTTTAATG 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 TAAT 0 1 341369 CASAVA_Build 9 37096338 6I CCAGCCTCTA ------/AGTAGG ACCTTCTATT 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 AGTAGG 0 1 341370 CASAVA_Build 9 37104068 1I GCAATGTACC -/T TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 6 7 341371 CASAVA_Build 9 37133103 1D TGTCAGACAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 T 10 9 341372 CASAVA_Build 9 37142239 1D CTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 28 0 23 5 T 11 10 341373 CASAVA_Build 9 37144671 1I TTTTTTTTTT -/A AAATAGGGAC 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 A 3 4 341374 CASAVA_Build 9 37147195 1D AACTTAGTTG A/- AAAAAAAAAA 2273 het 1832 hom 32 9 10 13 A 15 14 341375 CASAVA_Build 9 37175315 1D AGGCAGTCTT C/- CTGGGTGTTC 3070 het 3070 hom 33 9 20 4 C 2 1 341376 CASAVA_Build 9 37252214 2D AAAAAGGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2680 hom 30 8 12 12 T 13 11 341377 CASAVA_Build 9 37254457 1D TTAAATAGTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 9 8 341378 CASAVA_Build 9 37270607 1D AATCTATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2518 hom 21 6 10 6 A 13 12 341379 CASAVA_Build 9 37274596 1D TTAAATGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 A 10 9 341380 CASAVA_Build 9 37279148 1D CTTCTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1016 het 999 hom 18 5 3 10 T 15 14 341381 CASAVA_Build 9 37282874 3I GCACAGGGAA ---/AAC AACAGTCTTA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AAC 1 2 341382 CASAVA_Build 9 37294169 1I TAATTCTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 T 9 10 341383 CASAVA_Build 9 37295830 4D ACTCCGTGAG ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 2621 hom 27 6 16 7 AT 9 7 341384 CASAVA_Build 9 37305441 2I AAAAAATCAT --/AA AAGCAATACT 3070 het 3070 ref 27 16 11 0 A 2 4 341385 CASAVA_Build 9 37307841 1D CTCCCCCCGA C/- CCCCCCCAAA 3070 het 508 hom 21 5 12 5 C 8 7 341386 CASAVA_Build 9 37309172 3I TCATCCTTAT ---/TTC TTCTTTGGTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TTC 1 2 341387 CASAVA_Build 9 37312593 1D TGATCCAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 8 T 9 8 341388 CASAVA_Build 9 37330406 1D GTCTGCAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2375 hom 26 8 12 6 A 13 12 341389 CASAVA_Build 9 37346002 2I CAGTTATAAC --/TT TTATAATTAG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 2 4 341390 CASAVA_Build 9 37358499 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 413 het 413 ref 22 6 5 11 A 15 16 341391 CASAVA_Build 9 37362474 1I GTGAAGATTT -/G GGGGCTACGA 3070 het 3070 hom 53 18 24 11 G 4 5 341392 CASAVA_Build 9 37363241 4I ATCTATTAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 AAAC 2 3 341393 CASAVA_Build 9 37379481 30D AGGCTGAGAC TTAGCCTCACTTAAGCCCTCACTTAAGACT/------------------------------ TAGAGAATCA 3070 hom 27 het 9 0 10 1 TTAGCCTCACTTAAGCCCTCACTTAAGACT 1 0 341394 CASAVA_Build 9 37381823 3I TAGAAATGGT ---/GTC GTGCTAGGAG 3070 hom 93 het 35 0 26 9 GTC 0 1 341395 CASAVA_Build 9 37383126 19D TATTTATGAT AATATAAATTGAATATAAG/------------------- AATATAAATT 3070 het 3070 hom 31 14 18 7 AATATAAATTGAATATAAG 1 0 341396 CASAVA_Build 9 37383487 3D CTAAAAATAA AAT/--- AAAAATTAAA 14 het 14 ref 20 9 1 10 AAT 1 0 341397 CASAVA_Build 9 37383635 1D CTGGGCAACA G/- ACAGAGACCC 2696 het 1294 hom 16 5 6 5 G 1 0 341398 CASAVA_Build 9 37384810 1I GATAACAGGT -/G GTACATTTAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 G 1 2 341399 CASAVA_Build 9 37386466 1D AATTTTGCTC T/- TGTTGCCCAG 1899 het 1098 hom 20 4 5 11 T 2 1 341400 CASAVA_Build 9 37388302 2D CAGAGCAAGA CT/-- CTGTCTTAAA 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 CT 2 1 341401 CASAVA_Build 9 37393490 4D GAATTGCAAT AGAA/---- AGAGTTTAAT 2593 het 2593 ref 23 15 6 4 AGAA 1 0 341402 CASAVA_Build 9 37394421 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1242 hom 24 6 11 7 T 11 10 341403 CASAVA_Build 9 37397621 7D ACCAGGTCTG AAAAGAA/------- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 AAAAGAA 3 2 341404 CASAVA_Build 9 37398681 1I CGACAGAGCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 29 1 25 3 A 10 11 341405 CASAVA_Build 9 37401110 11I TGGGAGCAGG -----------/TCTGGGGCAGC TCCTTCTGGC 3070 hom 60 het 24 0 17 7 TCTGGGGCAGC 0 1 341406 CASAVA_Build 9 37410146 9D TTTCTTTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2447 het 80 hom 13 1 8 4 T 19 10 341407 CASAVA_Build 9 37413340 1D AATTTTCTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 10 9 341408 CASAVA_Build 9 37429786 4I GCACATAGGG ----/AAAC AAACAATACC 3070 hom 126 het 51 0 43 8 AAAC 1 2 341409 CASAVA_Build 9 37438528 4D ATAGTTTTAC TGAG/---- TAAGAGGTGA 3070 het 3070 ref 39 20 14 7 TGAG 1 0 341410 CASAVA_Build 9 37449710 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2247 hom 11 het 8 0 5 3 T 17 16 341411 CASAVA_Build 9 37450892 1D AAGTAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 11 10 341412 CASAVA_Build 9 37459731 1D CTGGAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 2258 het 2258 ref 33 17 6 10 T 17 16 341413 CASAVA_Build 9 37469145 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 315 hom 15 2 10 3 T 10 9 341414 CASAVA_Build 9 37478536 5D ATACTCCAAT AGAGG/----- AGAGGTCAGA 3070 het 3070 ref 37 19 15 6 AGAGG 2 1 341415 CASAVA_Build 9 37480019 2D AAAAGCAATC TG/-- AGCAATGATC 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 TG 1 0 341416 CASAVA_Build 9 37482086 1I ACTGTTGTTC -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 50 23 22 5 T 7 8 341417 CASAVA_Build 9 37486604 6D GTGCCTTGGA ATTATT/------ ATTATTATTT 762 het 762 ref 15 3 6 6 ATT 5 3 341418 CASAVA_Build 9 37489515 11D TTTTTTGTTG TTTTTTTGTTT/----------- TGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 41 19 13 12 TTTTTTTGTTT 1 0 341419 CASAVA_Build 9 37493417 2D CTACCGGAGG AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 1977 hom 29 7 19 3 A 10 8 341420 CASAVA_Build 9 37497310 2I CTTATAAGGC --/AG AGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 AG 1 2 341421 CASAVA_Build 9 37509469 2I CTCTGCCCAC --/CA CAACAGCAAC 3070 het 3070 ref 39 14 12 13 CA 1 2 341422 CASAVA_Build 9 37509906 1I CCTCGAACTC -/T TGAGTCCTGA 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 T 1 2 341423 CASAVA_Build 9 37513219 2D CACCTACTAT AC/-- ACCCAATGGC 3070 hom 102 het 35 0 35 1 AC 2 1 341424 CASAVA_Build 9 37513394 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 2612 hom 20 8 11 1 A 8 9 341425 CASAVA_Build 9 37523168 1D ACAGTTGTCT C/- CCCCATGTCT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 C 5 4 341426 CASAVA_Build 9 37525353 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 890 het 890 ref 13 5 3 5 T 10 11 341427 CASAVA_Build 9 37541777 1D ACATAACCAG A/- ACTGAGAGTT 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 A 2 1 341428 CASAVA_Build 9 37557146 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1100 het 1100 ref 32 18 3 11 T 12 11 341429 CASAVA_Build 9 37559491 1I AAAAAAAAAA -/C CACCCAGTAA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 C 1 2 341430 CASAVA_Build 9 37563882 4I CACTAAACTA ----/AAAG AAAGAGGGTA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 AAAG 1 2 341431 CASAVA_Build 9 37576897 2I ACCAAGTGCC --/CA CACCACAGTG 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 CA 1 2 341432 CASAVA_Build 9 37583732 2D GGCTGGTCTT GG/-- AAACTCCTGA 3070 het 3070 hom 32 10 17 6 G 2 0 341433 CASAVA_Build 9 37590051 1I CTATTTATTC -/T TTTTTTTTTT 2539 het 2539 ref 25 10 9 6 T 10 11 341434 CASAVA_Build 9 37596818 1I TGGGACACAC -/A AGCCAGAGAG 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 A 1 2 341435 CASAVA_Build 9 37598384 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 80 hom 37 1 13 23 T 11 10 341436 CASAVA_Build 9 37599738 4I25M2I AATCAAAGCC ----CTTACAATGGCTACAAAGGCTCCAC--/CTTACTTACAATGGCTGCAAAGGCTCCACAG GGGCCCGTGT 3070 het 3070 hom 42 22 23 3 N/A 0 0 341437 CASAVA_Build 9 37600474 3I CTGTCAAAAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 AAC 3 4 341438 CASAVA_Build 9 37617088 4D CCCAGAGCTG TTTC/---- TTTCAGCTCC 3070 het 3070 hom 47 20 24 4 TTTC 2 1 341439 CASAVA_Build 9 37638163 1I TTTGCAAAGG -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 A 7 8 341440 CASAVA_Build 9 37646692 1D AATCTGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 11 10 341441 CASAVA_Build 9 37646932 1D GGTGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 A 11 10 341442 CASAVA_Build 9 37662390 1D AGGCTTGAGA G/- GGGGAGTGGG 3070 het 3070 ref 50 28 14 9 G 5 4 341443 CASAVA_Build 9 37680394 1D TAGATTGAAA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3025 hom 25 8 15 2 T 8 7 341444 CASAVA_Build 9 37683091 4I ACTCTTTTGA ----/TCTC TCTCTCTCTG 3070 het 3070 ref 63 34 23 6 TC 4 6 341445 CASAVA_Build 9 37686986 1I TTATACACAC -/A AGAGTAATGT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 A 1 2 341446 CASAVA_Build 9 37699273 2I ACTTGAAGAG --/AT ATATATATAT 2191 het 2191 ref 19 7 5 7 AT 8 9 341447 CASAVA_Build 9 37699348 1I GTATTAATTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2148 hom 21 7 11 3 T 9 10 341448 CASAVA_Build 9 37739474 2I CGGTTCACTC --/AG GGCCTCCAAA 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 AG 0 1 341449 CASAVA_Build 9 37745890 2I TTTAGGTAAA --/TG TGTAGGTATA 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 TG 1 2 341450 CASAVA_Build 9 37746408 1D TCTTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1508 hom 24 8 10 6 A 13 12 341451 CASAVA_Build 9 37747706 3D GGGTTTTGAA TAG/--- TAGTTAACAG 3070 het 3070 hom 49 17 26 9 TAG 2 1 341452 CASAVA_Build 9 37761447 8I TATAGGTAGA --------/GGTAGATG GGTAGATGTG 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 GGTAGATG 1 2 341453 CASAVA_Build 9 37777732 1D CCGTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 2680 het 2680 ref 29 16 9 4 T 12 11 341454 CASAVA_Build 9 37782507 2D ACCCACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 21 8 9 5 AC 8 7 341455 CASAVA_Build 9 37802167 3D CACTCCAAAC CTT/--- CTGAAACAAA 3070 het 3070 hom 25 9 12 6 CTT 1 0 341456 CASAVA_Build 9 37822148 3D TCTAAAAAAA AAT/--- AATAATAATT 2948 het 1998 hom 14 5 6 3 AAT 4 3 341457 CASAVA_Build 9 37828866 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1479 het 1479 ref 20 8 7 5 A 13 14 341458 CASAVA_Build 9 37864252 1D ATAAACCCCC T/- AATGGTTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 1 0 341459 CASAVA_Build 9 37869638 1D TTAAAACAGG T/- TAAGTGCTGT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 2 1 341460 CASAVA_Build 9 37875340 2D AGGTAATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 1437 het 532 hom 16 7 5 5 A 26 24 341461 CASAVA_Build 9 37880693 1I ACCCTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 13 19 8 A 12 13 341462 CASAVA_Build 9 37925923 1D CTCATTAAAG A/- AAAAAAAAAT 2813 het 2813 ref 23 14 6 3 A 10 9 341463 CASAVA_Build 9 37943419 1I TGAGTCAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 T 12 13 341464 CASAVA_Build 9 37946127 1I GAAGGGTAAC -/G GTTCAGCTGG 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 G 1 2 341465 CASAVA_Build 9 37982878 4D ACACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 99 het 37 0 32 7 AC 9 7 341466 CASAVA_Build 9 37985459 12I TTTCCCAGCT ------------/CTGGCAGAGGGG CTGGCCACTG 3070 hom 68 het 29 0 18 11 CTGGCAGAGGGG 0 1 341467 CASAVA_Build 9 38008504 1I CCTTCCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 40 1 27 12 A 14 15 341468 CASAVA_Build 9 38009770 1I GGTCCATGGG -/C AAGGATGCTG 3070 hom 114 het 41 0 37 4 C 0 1 341469 CASAVA_Build 9 38043100 2I GAGCTGACCC --/CT GTCACTGTCC 3070 hom 119 het 45 0 35 10 CT 0 1 341470 CASAVA_Build 9 38059765 2I GCTGTCCCTC --/TT TTCCTTAAAG 3070 hom 45 het 18 0 14 4 T 2 4 341471 CASAVA_Build 9 38070790 1D CAAGACTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 7 hom 32 1 27 4 A 13 12 341472 CASAVA_Build 9 38080421 1I GGGTTGGCGG -/T GGGGGGGAAC 3070 hom 70 het 27 0 22 5 T 0 1 341473 CASAVA_Build 9 38090944 5I TAGGATACAA -----/GATCC GATCCATATA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 GATCC 1 2 341474 CASAVA_Build 9 38113561 1I TTCACTTTTT -/C CTGTGTCCTC 3070 hom 56 het 21 0 17 4 C 1 2 341475 CASAVA_Build 9 38113660 1D TTTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 24 1 16 8 T 18 17 341476 CASAVA_Build 9 38117394 1D AGGGGAGAAA G/- GAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 20 4 G 2 1 341477 CASAVA_Build 9 38126422 2D TCTAACAGAG GA/-- GTCCTCCTCC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 GA 1 0 341478 CASAVA_Build 9 38149350 1D TGACAGCACT G/- GGGGAGCCAG 3070 hom 107 het 42 0 32 10 G 5 4 341479 CASAVA_Build 9 38151678 1D CATGCCCAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 9 341480 CASAVA_Build 9 38154598 1I TCAGAGCGCT -/C CAGGCTGCCC 2859 het 2859 ref 30 17 9 4 C 1 2 341481 CASAVA_Build 9 38172238 1D TCTCTTTTTT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 103 het 41 0 34 7 A 9 8 341482 CASAVA_Build 9 38174883 1D CCCATTTAGT A/- AAAAAAAAAA 2531 het 469 hom 21 3 8 10 A 17 16 341483 CASAVA_Build 9 38177403 1I GAGCCACAGC -/T TGCTATACCA 3070 hom 87 het 31 0 28 3 T 1 2 341484 CASAVA_Build 9 38188229 1I TTGTCAGAGT -/G GGCCTATGCG 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 G 2 3 341485 CASAVA_Build 9 38194810 12I ACTGGCAATG ------------/TTGGCTGACTTC TTGGTGAATC 3070 hom 104 het 37 0 35 3 TTGGCTGACTTC 0 1 341486 CASAVA_Build 9 38198665 4D GTCATGTGAC TTTG/---- TTTGGTGGAC 3070 het 3070 ref 47 23 22 6 TTTG 2 1 341487 CASAVA_Build 9 38199200 1I TATGCCCTCT -/G GCCTGGAATG 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 G 1 2 341488 CASAVA_Build 9 38208746 1D TCTACTTTTG T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 33 14 13 7 T 8 7 341489 CASAVA_Build 9 38213363 1D ATTCACATGC A/- AAAAAACCCC 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 7 6 341490 CASAVA_Build 9 38218747 1I GATTAAAGAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 9 341491 CASAVA_Build 9 38230058 2D CATGATCCTC AA/-- AGAGTTTCCT 3070 het 3070 ref 53 22 23 8 A 3 1 341492 CASAVA_Build 9 38233598 1I AAATAAATTT -/A AAAAAAAAAA 2196 het 1211 hom 15 4 8 3 A 15 16 341493 CASAVA_Build 9 38235763 1I TATGCTGTTA -/T TTTTAATGAA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 4 5 341494 CASAVA_Build 9 38238468 1I ATGTTAATAA -/G AATCTCATTA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 0 1 341495 CASAVA_Build 9 38245715 5I ACAGACTGGG -----/TAAGT TATTATGAAC 3070 hom 101 het 47 0 42 5 TAAGT 0 1 341496 CASAVA_Build 9 38249825 4D CGAATCAGCC TAGA/---- TAGAGGCCAA 3070 hom 138 het 51 0 46 6 TAGA 2 1 341497 CASAVA_Build 9 38258926 1I AGGACCTTAG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 37 25 9 3 A 6 7 341498 CASAVA_Build 9 38259781 3D GTCTTTGCAA TTC/--- TTCTTCTAAT 3070 hom 60 het 23 0 21 4 TTC 3 2 341499 CASAVA_Build 9 38265938 1I ACCATAAAAC -/A AATGTGGGAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 2 3 341500 CASAVA_Build 9 38277003 11I ATGCATAGTG -----------/TGACACACCCA GGTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 50 26 19 6 TGACACACCCA 0 1 341501 CASAVA_Build 9 38283938 1I GTACAGCTTT -/C AAATCTATTA 3070 hom 123 het 47 0 41 6 C 0 1 341502 CASAVA_Build 9 38285536 4I13M4I ATCATATATT ----CATCCATCTATTA----/CATCCATCCATCTATTATCTG TCTGTCTATA 3070 hom 90 het 29 0 31 0 N/A 0 0 341503 CASAVA_Build 9 38290649 11I TTATCACAAT -----------/CATTAGTGTTA CATTAGTGGA 3070 hom 96 het 35 0 33 5 CATTAGTGTTA 0 1 341504 CASAVA_Build 9 38304769 1I TCCCTTTATT -/A AAAAAAAAAA 2748 het 1087 hom 19 4 10 5 A 13 14 341505 CASAVA_Build 9 38305025 1D TTTCTAAGGG T/- TTTCGTTATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 4 3 341506 CASAVA_Build 9 38324132 23D GGGAAAAACC TATATCTCAGAGAGATTGTGACA/----------------------- CTCAGGTGAG 3070 hom 99 het 34 0 33 5 TATATCTCAGAGAGATTGTGACA 1 0 341507 CASAVA_Build 9 38333132 2I TATGGGCTTT --/GA GAGGTTGGAC 3070 het 3070 hom 61 26 29 6 GA 1 2 341508 CASAVA_Build 9 38353247 4D TTCAAAAAAA AAAC/---- AAAGCCAAAA 3070 het 3070 hom 55 21 23 14 AAAC 1 0 341509 CASAVA_Build 9 38357921 1D AATAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1840 hom 29 6 16 7 A 12 11 341510 CASAVA_Build 9 38360949 10D CTGGTGTTTT TGTTTGTGTG/---------- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 17 12 TGTTTGTGTG 1 0 341511 CASAVA_Build 9 38363535 1I CACACTAAGG -/A ATTCTGTACA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 341512 CASAVA_Build 9 38418887 1D ATGCCTGGCT A/- AATTTTTGTA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 A 3 2 341513 CASAVA_Build 9 38449192 1I CCCCAGTGTT -/A ATAACCTTAG 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 1 2 341514 CASAVA_Build 9 38453683 1D CATTTGCCTG T/- TTTCAAAAAT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 T 4 3 341515 CASAVA_Build 9 38478211 1D GGAGCATTTC G/- GGCTCGCCCA 2035 hom 30 het 13 0 10 3 G 3 2 341516 CASAVA_Build 9 38479709 12D TGTGCTCTTA ACAGTATACAAC/------------ ACATTATACA 3070 hom 70 het 21 0 19 6 ACAGTATACAAC 1 0 341517 CASAVA_Build 9 38482287 1D GTTTTTTTTT A/- AATTAATAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 3 2 341518 CASAVA_Build 9 38502012 1D AAAAAGAAAA C/- TTCAAGACAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 C 1 0 341519 CASAVA_Build 9 38523047 1I TTTGAGCTAT -/A AAAATAATAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 4 5 341520 CASAVA_Build 9 38523410 1I CTGTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 29 0 20 9 A 10 11 341521 CASAVA_Build 9 38540323 1D AAATTTTCCA G/- AAGTCTTAAC 3070 het 3070 ref 35 24 10 1 G 1 0 341522 CASAVA_Build 9 38543168 1D CACCCTCTCA C/- CAGCTTACTG 1404 het 1404 ref 39 26 4 9 C 2 1 341523 CASAVA_Build 9 38550310 2I TCCAGGCATT --/AA GAGTTCCCAG 2869 hom 15 het 6 0 6 0 A 0 2 341524 CASAVA_Build 9 38561977 4I ATTTTATGGT ----/TAAA TAATCTCTTC 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TAAA 0 1 341525 CASAVA_Build 9 38608866 2I TATATAACTG --/AT ATATATATAT 2536 het 2022 hom 15 5 6 4 AT 6 7 341526 CASAVA_Build 9 38621160 1D TCTTGTTTTC T/- TTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 8 7 341527 CASAVA_Build 9 38643259 1D AAAAATATCA T/- TTACCATAAG 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 3 2 341528 CASAVA_Build 9 38644532 1D CATTCACACA G/- CAGTGAAGTT 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 G 1 0 341529 CASAVA_Build 9 38648995 1I TATAATCATA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 7 8 341530 CASAVA_Build 9 38661564 1I TGGGCCCTCA -/C CCTCCTCCAC 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 2 3 341531 CASAVA_Build 9 38664405 1I CACAATTTGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 58 23 25 10 T 8 9 341532 CASAVA_Build 9 38665699 1D CTGAAAATGT A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 A 6 5 341533 CASAVA_Build 9 38682946 4I TCCCCACCCC ----/CTGA CTATCTCCTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CTGA 0 1 341534 CASAVA_Build 9 38691905 2I AAATAGGAGA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 AC 8 9 341535 CASAVA_Build 9 38701657 2D TTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 91 hom 39 2 22 15 T 17 15 341536 CASAVA_Build 9 38706470 5I CTCCGCTCTT -----/AAATA AAATAAAATA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAATA 2 3 341537 CASAVA_Build 9 38708748 1D TGAGATAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 12 11 341538 CASAVA_Build 9 38708900 1I CATTTTGATG -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 6 7 341539 CASAVA_Build 9 38710039 5I AATTTGCAGG -----/TGGAC TGATACCCGG 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TGGAC 0 1 341540 CASAVA_Build 9 38719037 1D TGACATACTC T/- TAAGGGAAAA 3070 hom 120 het 50 0 40 10 T 2 1 341541 CASAVA_Build 9 38719786 1D GGCAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1007 het 318 hom 14 2 5 8 T 17 16 341542 CASAVA_Build 9 38733852 1D ACAAGAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 13 10 T 13 12 341543 CASAVA_Build 9 38737728 1I CCAAGGAGGC -/A AAATCACCCC 3070 het 3070 ref 42 29 9 4 A 3 4 341544 CASAVA_Build 9 38738507 2D TTATTGGAAT AC/-- ATTTTGGCTG 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 AC 1 0 341545 CASAVA_Build 9 38740447 6I TATACACACA ------/TATATG TATATACATA 3070 hom 51 het 24 0 18 6 TATATG 0 1 341546 CASAVA_Build 9 38744333 1I GATTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2279 hom 20 8 12 0 T 9 10 341547 CASAVA_Build 9 38752298 1D GAGAGGGGCT G/- GGTGGGGCTG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 G 3 2 341548 CASAVA_Build 9 38754820 67D ATGTGAATAA CCCGTCTTTCCACCTCGCTGCTCTTGCCCCTAGCTTCTGCAGCCTCGATTGTACATTGTGTGAATCT/------------------------------------------------------------------- CCCGTCTTTC 3070 hom 4 het 19 1 15 15 CCCGTCTTTCCACCTCGCTGCTCTTGCCCCTAGCTTCTGCAGCCTCGATTGTACATTGTGTGAATCT 1 0 341549 CASAVA_Build 9 38755521 3D GTGGGGTGAT GAC/--- AGTTATAGAA 3070 het 3070 hom 35 16 17 3 GAC 1 0 341550 CASAVA_Build 9 38755852 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 20 0 14 6 AG 1 0 341551 CASAVA_Build 9 38758829 20D GCCCCCCAAA AAAAAGAAAAATATAAATGC/-------------------- AAACATAATA 3070 het 3070 ref 23 11 12 3 AAAAAGAAAAATATAAATGC 1 0 341552 CASAVA_Build 9 38760239 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTGAGACA 3070 het 492 hom 27 4 19 4 C 0 1 341553 CASAVA_Build 9 38760392 1D GCCTGGTTAA T/- TTTTTGTATT 3070 hom 62 het 23 0 21 2 T 6 5 341554 CASAVA_Build 9 38761090 2I ATGCGCACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 13 14 12 AC 7 8 341555 CASAVA_Build 9 38804868 3D TTCACAATAA TTC/--- TTCTTCTTCC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TTC 4 3 341556 CASAVA_Build 9 38817096 7I TATTGCTTTT -------/CAATGGC CAACGTTCAC 3070 het 3070 ref 45 28 11 6 CAATGGC 0 1 341557 CASAVA_Build 9 38817722 1D TTTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 1914 het 1914 ref 16 7 4 5 T 13 12 341558 CASAVA_Build 9 38824584 1D TATTACACTA T/- TTGACCAATG 2983 hom 15 het 12 0 6 6 T 3 2 341559 CASAVA_Build 9 38828693 1I TTTGGATTTA -/T TTTTTTTTTT 2261 hom 18 het 9 0 7 2 T 10 11 341560 CASAVA_Build 9 38842299 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1285 het 322 hom 13 1 7 5 A 12 13 341561 CASAVA_Build 9 38896887 1D ATCAGTTTTT A/- AAAAAATCAA 1590 hom 12 het 5 0 5 0 A 7 6 341562 CASAVA_Build 9 38919021 1I AAAAAGGAAA -/G GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 9 14 G 4 5 341563 CASAVA_Build 9 38925131 1I TGACAGCCAT -/G GGCTGAATGG 1890 het 1890 ref 28 22 4 2 G 2 3 341564 CASAVA_Build 9 38940571 2D AAATTGTATT AA/-- AAAAAAAAAA 2415 het 2415 ref 20 10 5 5 A 12 10 341565 CASAVA_Build 9 38967437 1D GAGGTAATTG T/- TTTCTTCTAT 2160 het 2160 ref 27 15 5 7 T 4 3 341566 CASAVA_Build 9 38985808 1I AGTATCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 887 hom 26 9 15 2 T 13 14 341567 CASAVA_Build 9 38987893 1I CTTGCCACGT -/G GGTAAAAGCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 2 3 341568 CASAVA_Build 9 38990421 1D TATATGCAAA G/- TTCCTAATGA 1944 het 1944 ref 11 7 4 0 G 1 0 341569 CASAVA_Build 9 38996218 1D TAATGGCTAT A/- AAAAAATTAG 3070 hom 51 het 21 0 18 4 A 7 6 341570 CASAVA_Build 9 38996321 3I CATTTTTCAT ---/ATC ATATATTTGC 1440 het 1440 ref 21 8 3 10 ATC 0 1 341571 CASAVA_Build 9 38996357 3I CCAAAAATTG ---/TAA TAATGCTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TAA 1 2 341572 CASAVA_Build 9 38996407 1I ACTAAAAGGA -/T TTTTTTTTCT 1947 het 1947 ref 19 6 4 9 T 8 9 341573 CASAVA_Build 9 38996616 1I ATATAACCCT -/A AAAAAGCCCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 5 6 341574 CASAVA_Build 9 38998363 1D AAGATCTACA T/- TTTTTTTTAG 1443 het 1443 ref 15 7 3 5 T 9 8 341575 CASAVA_Build 9 38998428 1D TTTATATTTT A/- AAAATATGAG 2787 het 2787 ref 21 12 6 4 A 5 4 341576 CASAVA_Build 9 39003111 1I TCTAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 28 1 11 16 A 12 13 341577 CASAVA_Build 9 39003328 4D ATGTTCTCAC CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 31 14 11 7 CA 9 7 341578 CASAVA_Build 9 39006891 1I AGTTCCAGAA -/T TTTTTTTTCT 1990 het 1990 ref 48 41 6 1 T 8 9 341579 CASAVA_Build 9 39007754 3D GATGGTAAAT GTG/--- GGGGATTTTA 3070 het 366 hom 24 1 15 10 GTG 1 0 341580 CASAVA_Build 9 39009614 2D TAAAACACTC TT/-- ATTGCAAACA 3070 het 321 hom 23 1 21 2 T 2 0 341581 CASAVA_Build 9 39010903 1D ACGTGAGTCA C/- CGCGGTCGGC 3070 het 370 hom 11 1 8 2 C 2 1 341582 CASAVA_Build 9 39014281 6D CACTGGTTTG TTTGTT/------ TGTTTAGTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TTTGTT 1 0 341583 CASAVA_Build 9 39014800 1I CCTGGGTGAA -/T TTTTTTTTTT 1149 het 533 hom 14 3 4 7 T 15 16 341584 CASAVA_Build 9 39015205 4I GCAGAGTATA ----/TTCT TTCTTATTCT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 TTCT 1 2 341585 CASAVA_Build 9 39018167 4D TAAGATTAGT TATG/---- TATGTCCATT 3070 hom 57 het 22 0 20 3 TATG 2 1 341586 CASAVA_Build 9 39021890 1D TTGATCATAA T/- TTTTTGATAG 1737 het 1737 ref 19 14 4 1 T 6 5 341587 CASAVA_Build 9 39025219 1D ATTATAAGGT C/- TAAAATGCCT 3070 het 3070 ref 29 19 9 2 C 1 0 341588 CASAVA_Build 9 39026852 3I AGGTATTACA ---/CAT CATCATAATA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 CAT 2 3 341589 CASAVA_Build 9 39027975 2I TGAGGGTGTG --/TT TTTTTTTTAA 1323 het 1323 ref 34 26 3 5 T 8 10 341590 CASAVA_Build 9 39029687 2D TGCAGATGAG AC/-- ACAGTCACAT 1752 het 1752 ref 35 30 4 2 AC 2 1 341591 CASAVA_Build 9 39029862 3D GTAAGTTGTC CTT/--- CATTATATGC 3070 het 3070 ref 49 36 8 6 CTT 1 0 341592 CASAVA_Build 9 39030321 3I ATAGATTGTT ---/ATC ATCAGAGATA 3070 het 3070 ref 41 25 8 8 ATC 1 2 341593 CASAVA_Build 9 39035275 1D TTTTTTCACC T/- CTCAAGGTTG 2096 het 2096 ref 51 43 5 4 T 1 0 341594 CASAVA_Build 9 39042942 5I CTTTACTAAC -----/ATATT AAATAATGGG 3070 het 3070 ref 41 28 9 4 ATATT 0 1 341595 CASAVA_Build 9 39059019 2I ACACATACAC --/AT ATATATATAT 1664 het 1664 ref 18 9 4 5 AT 5 6 341596 CASAVA_Build 9 39065148 1D TATTTATTCA T/- TTTTTTTTTA 1754 het 1754 ref 16 7 5 4 T 10 9 341597 CASAVA_Build 9 39067833 1D ACTGTTCTTC A/- AAAAAAATTG 2452 het 2452 ref 37 23 9 5 A 8 7 341598 CASAVA_Build 9 39068478 4D GGGAGAATGA TGTT/---- TATTAGCTTG 844 het 844 ref 49 37 2 10 TGTT 1 0 341599 CASAVA_Build 9 39069422 3D AATATCCCTC TTT/--- ATCTCATTTA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 T 3 0 341600 CASAVA_Build 9 39071028 3I GATGAAACAG ---/AGT AGAACTTTCT 2499 het 623 hom 8 2 6 0 AGT 0 1 341601 CASAVA_Build 9 39072459 2I TCTTTCTTGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 9 11 341602 CASAVA_Build 9 39073058 1D GATGAATTTT A/- AAATGTTAAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 4 A 4 3 341603 CASAVA_Build 9 39073613 1D CCGAGATTGC G/- CCACTGCACT 1412 het 516 hom 5 2 3 0 G 1 0 341604 CASAVA_Build 9 39076450 2I TAAAACAAAT --/AA AGATATTTTG 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 1 3 341605 CASAVA_Build 9 39078264 1D AGCTTTTATA C/- ATAACCATTA 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 C 1 0 341606 CASAVA_Build 9 39078777 4I CCTTTCCTGT ----/TTTA TTTTTTATTT 1394 het 1394 ref 21 16 3 2 TTTA 0 1 341607 CASAVA_Build 9 39082783 5I TCTGAGTAAT -----/TATTC TATCCTTTAT 1416 het 1416 ref 19 16 3 0 TATTC 0 1 341608 CASAVA_Build 9 39084033 4D ATTTTCTGTT TTTA/---- TTTATTTATT 1184 het 1184 ref 23 15 3 6 TTTA 4 3 341609 CASAVA_Build 9 39084570 1D GAACATCCAC T/- TTTCCTACCT 3070 het 3070 hom 40 14 18 9 T 4 3 341610 CASAVA_Build 9 39085039 4D AATGTCTAAG TCTT/---- TCACTTTCTC 3070 het 3070 ref 26 17 8 2 TCTT 1 0 341611 CASAVA_Build 9 39090607 1I ATATATGGAT -/A AATTTCTTAC 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 A 2 3 341612 CASAVA_Build 9 39096022 3D TTCCTCAGTG AGA/--- AGGTCACTCC 1399 het 1399 ref 29 20 3 7 AGA 1 0 341613 CASAVA_Build 9 39129348 2D TGTTTGAGTC AG/-- GGGATTTTGG 3070 het 3070 ref 60 43 13 4 AG 1 0 341614 CASAVA_Build 9 39130251 1I TTTGTATTTT -/A TCATGATGCA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 0 1 341615 CASAVA_Build 9 39133087 1I AACAAATAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 A 8 9 341616 CASAVA_Build 9 39146631 1I CTCCCTGTCT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 41 26 11 4 A 8 9 341617 CASAVA_Build 9 39147504 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 995 het 644 hom 10 3 3 4 T 13 12 341618 CASAVA_Build 9 39207592 4I TTCATAAAAT ----/GTTA GTTAATCTCT 2982 hom 15 het 8 0 6 2 GTTA 1 2 341619 CASAVA_Build 9 39282250 1I CCAAATTTTT -/A AAAAAAAGTT 1446 hom 7 het 3 0 3 0 A 7 8 341620 CASAVA_Build 9 39569540 1D GAACACAGTT C/- CCCGTAGGAG 2889 hom 15 het 6 0 6 0 C 4 3 341621 CASAVA_Build 9 39644075 1D TTGTAGAGAT C/- TTTTTTTCTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 0 341622 CASAVA_Build 9 39806943 2I TATTAAGATG --/CT CTTTTCAGGT 3070 het 3070 ref 59 44 10 5 CT 1 2 341623 CASAVA_Build 9 39807095 1I AATTCCAAAT -/A TTTTTTTAAG 2922 het 2922 ref 27 19 7 1 A 0 1 341624 CASAVA_Build 9 39816510 1I CATGTACCCC -/T GAACCTAAAA 3070 het 3070 ref 58 39 14 5 T 0 1 341625 CASAVA_Build 9 39897239 4I GTCTTAAAAG ----/ATAT ATATATATAT 1409 het 1409 ref 22 14 3 6 AT 5 7 341626 CASAVA_Build 9 40016976 10I TGGGAAGAAA ----------/CTAGTGGAGT ACGTGTGTTT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 CTAGTGGAGT 0 1 341627 CASAVA_Build 9 40019844 1I TCAATTTATT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 7 8 341628 CASAVA_Build 9 40023593 2D ATATACATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 62 15 28 21 AT 7 6 341629 CASAVA_Build 9 40023631 1D ATACTTACAT A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 66 28 9 29 A 2 1 341630 CASAVA_Build 9 40061677 2I ATTTAGAAAG --/AA ATATATTATT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 A 1 3 341631 CASAVA_Build 9 40066646 5D GACTAATCAC AAGCA/----- AAGCAAAGAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AAGCA 2 1 341632 CASAVA_Build 9 40084501 3D AGGGTATTAC TTG/--- TTGTGGTAAA 1910 het 1910 ref 9 5 4 0 TTG 2 1 341633 CASAVA_Build 9 40096620 1I ACTCCGTCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 9 10 341634 CASAVA_Build 9 40147882 1D TGCCTGCAAC T/- TTTTACTTTA 3070 hom 120 het 41 0 41 0 T 5 4 341635 CASAVA_Build 9 40273641 2I TCTTTTTTTG --/TC TCTGTCAGTC 1400 het 1400 ref 26 21 3 2 TC 1 2 341636 CASAVA_Build 9 40277587 1D CTAGGTGTGG T/- TTTTTTTTGT 1852 het 1010 hom 8 4 4 0 T 9 8 341637 CASAVA_Build 9 40289515 2D CAATATTTTG CA/-- CAGTCAGTAT 1501 het 1501 ref 11 7 4 0 CA 2 1 341638 CASAVA_Build 9 40308418 1I ATATAGCCCC -/A AAATTGCATA 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 A 3 4 341639 CASAVA_Build 9 40320263 3I AAAGTATATA ---/TGG TGATCATTTT 1229 het 1229 ref 73 65 3 5 TGG 0 1 341640 CASAVA_Build 9 40329101 2D AATGAATACA CT/-- CTCTGTCTTA 3070 het 1736 hom 17 7 8 2 CT 3 2 341641 CASAVA_Build 9 40338182 1I AAAGGAACTC -/T TTATACACTG 3067 het 3067 ref 41 28 7 6 T 2 3 341642 CASAVA_Build 9 40341097 2I CTCTTTAAAA --/CT CTCTATCCTA 2393 het 2393 ref 35 22 6 7 CT 2 3 341643 CASAVA_Build 9 40341396 1D GACCCAGCAG C/- CAGGTCCAGC 3070 het 3070 ref 92 71 14 9 C 2 1 341644 CASAVA_Build 9 40353156 1D TGCGTTTATA T/- TTAGGATTGT 3070 het 3070 ref 57 46 8 3 T 3 2 341645 CASAVA_Build 9 40363458 1I TTTCAAAATT -/A AAAAAAAAAC 999 het 999 ref 20 12 3 5 A 9 10 341646 CASAVA_Build 9 40371172 1I AGGGAGTAAT -/A AAAAAAAATG 1487 hom 10 het 4 0 4 0 A 8 9 341647 CASAVA_Build 9 40384528 1I TCAACAATAG -/A AAAAAAAATT 1371 het 1371 ref 34 31 3 0 A 8 9 341648 CASAVA_Build 9 40392773 1I AATTCTAAAA -/G AAAATGTAGA 3070 het 3070 ref 44 33 7 4 G 0 1 341649 CASAVA_Build 9 40400180 1D ACTAAAATGT G/- GGATTCTAAT 1926 het 1926 ref 18 12 4 2 G 3 2 341650 CASAVA_Build 9 40402575 1I TGTAGGGGTA -/G AAAAGATGTG 2756 het 2756 ref 20 10 6 4 G 0 1 341651 CASAVA_Build 9 40403852 1I AAAAAAAAAA -/T AATACTGAGG 2363 het 2363 ref 38 26 5 7 T 0 1 341652 CASAVA_Build 9 40468217 5D AATAAACACA TTAAG/----- TTAAGAATTA 3070 het 3070 ref 28 19 8 1 TTAAG 2 1 341653 CASAVA_Build 9 40468694 1D ACTCTGTTAG A/- AAAAAAAAAA 2081 het 476 hom 8 1 6 1 A 11 10 341654 CASAVA_Build 9 40486120 1D CAGATTACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 24 1 17 6 T 12 11 341655 CASAVA_Build 9 40489347 4D GAATTGTCTT TTTG/---- TTTTTGTGTG 1389 het 1389 ref 30 25 3 3 TTTG 1 0 341656 CASAVA_Build 9 40493207 1D GCATTGCCTT A/- AAAGGAGAAG 3070 het 3070 ref 44 27 10 7 A 4 3 341657 CASAVA_Build 9 40495948 1I ATTTGAGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 21 hom 14 1 11 2 T 9 10 341658 CASAVA_Build 9 40513598 2D ATTAGCATAT TA/-- TCTTTATCAC 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 TA 1 0 341659 CASAVA_Build 9 40532659 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 A 10 11 341660 CASAVA_Build 9 40555385 3I TGGATTTTTT ---/TTC TTCTTTTTCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TTC 1 2 341661 CASAVA_Build 9 40557997 1I GCCAGGTAAG -/A ACTGACTACA 3070 het 3070 ref 39 23 7 9 A 1 2 341662 CASAVA_Build 9 40567727 2I ATATATACAT --/AC ACACACACAC 1905 hom 19 het 12 0 5 7 AC 6 7 341663 CASAVA_Build 9 40576081 1I AAGTTGGGAG -/T GGGGGGATTA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 T 0 1 341664 CASAVA_Build 9 40592193 1D AAGGTTTTCA G/- GAATTACTAG 1846 het 443 hom 8 1 6 1 G 2 1 341665 CASAVA_Build 9 40592319 1I GGCATGAAAC -/T TTTTTTTTTT 1652 het 1652 ref 26 8 9 9 T 13 14 341666 CASAVA_Build 9 40601164 1D GCATGTCATA T/- TATTTTCTCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 1 341667 CASAVA_Build 9 40601787 1I GAATTTGTGA -/T TTTTTTACAT 1350 het 1350 ref 50 38 3 9 T 6 7 341668 CASAVA_Build 9 40603385 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 12 11 341669 CASAVA_Build 9 40603499 4D TTCTGTAAAC ACTT/---- TCTTTCTAGA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 ACTT 1 0 341670 CASAVA_Build 9 40604847 1D AATAAGAATG A/- AAAAAAAAAA 1100 het 805 hom 9 2 3 4 A 12 11 341671 CASAVA_Build 9 40608278 3D GTTTACAGAG TTT/--- TTTTTTTTTT 2896 het 611 hom 25 6 10 9 T 19 16 341672 CASAVA_Build 9 40621525 4D GTAATGAATA AATT/---- AACCCACTGA 2266 hom 18 het 9 0 6 4 AATT 1 0 341673 CASAVA_Build 9 40635586 2I AACAGAAGAC --/TT TAGCAGGCAG 3070 hom 42 het 17 0 13 4 T 1 3 341674 CASAVA_Build 9 40660042 2I TCGTCTTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1894 hom 16 6 10 0 TG 5 6 341675 CASAVA_Build 9 40675072 1D AACCAGAAAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2781 hom 18 6 9 3 T 10 9 341676 CASAVA_Build 9 40703838 4D AAAAGAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 18 8 10 2 AAAG 5 4 341677 CASAVA_Build 9 40709043 1I CTGGAAACTT -/A AAAAAAAAAT 2439 hom 12 het 5 0 5 0 A 9 10 341678 CASAVA_Build 9 40731204 2D ATCCCTGAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 T 12 10 341679 CASAVA_Build 9 40744332 1D AATGTTGATG T/- TAGGTACATT 3070 het 3070 hom 36 17 15 5 T 2 1 341680 CASAVA_Build 9 40748245 4D AGAGGCCCAT AATC/---- ATACTTAGCA 3070 het 3070 ref 25 13 7 6 AATC 1 0 341681 CASAVA_Build 9 40765522 3D ATAAAACAGG TAT/--- TATTTCCGGG 1217 het 1217 ref 31 24 3 5 TAT 2 1 341682 CASAVA_Build 9 40768925 1D AAAAGGAATA T/- TAAACTACAA 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 T 2 1 341683 CASAVA_Build 9 40771216 5D TGATAGGGTT AGCTG/----- AAGTTTAATT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 AGCTG 1 0 341684 CASAVA_Build 9 40771731 1D AGCCTCTCTA G/- GCATATTTAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 G 2 1 341685 CASAVA_Build 9 40791614 1D TGATTTAAAG T/- TTTTGTCTAT 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 T 5 4 341686 CASAVA_Build 9 40792294 2D CCTTAAACAC AT/-- GTTTCAGTTG 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 AT 1 0 341687 CASAVA_Build 9 40817860 2D AGAACTTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 2726 het 625 hom 17 3 9 5 A 16 14 341688 CASAVA_Build 9 40817959 2I CTGAAAAACC --/TA TGTCTTTGAA 3070 het 3070 ref 25 16 7 2 TA 0 1 341689 CASAVA_Build 9 40889037 3I GACAGCTGTC ---/AGG AGGACTCGGA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 AGG 1 2 341690 CASAVA_Build 9 40889417 1D TTTTTTTTTT G/- AGTAATACAG 1686 het 1686 ref 25 12 6 8 G 1 0 341691 CASAVA_Build 9 40899253 2I12M5I TCTTTCACTC --AAAAAAAAGAGG-----/AAAAAAAAAAGAGGAAATC AAATCTTTAA 3070 het 3070 ref 24 15 9 2 N/A 0 0 341692 CASAVA_Build 9 40997291 2D CATGTGCACG CA/-- CACACACACA 1890 het 1890 ref 31 24 4 4 CA 7 6 341693 CASAVA_Build 9 40997842 1D TTTTGTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1217 het 991 hom 9 4 3 2 T 12 11 341694 CASAVA_Build 9 41007511 1I TGTGTGTGTG -/C GGTGGAGACA 675 het 675 ref 37 26 3 8 C 0 1 341695 CASAVA_Build 9 41036905 3D GGGCTCTGTT CTC/--- CTCCGTCAGT 1389 het 1389 ref 28 24 3 1 CTC 2 1 341696 CASAVA_Build 9 41081713 2D CCATGACTAG TT/-- TTTTTTTTTT 2461 het 436 hom 8 2 5 2 T 14 12 341697 CASAVA_Build 9 41213476 1I GCCTTTCATT -/C ATGACGTGTG 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 0 1 341698 CASAVA_Build 9 41217738 1D CAGATAGCAT G/- GGAAACACCT 3070 hom 18 het 7 0 7 1 G 3 2 341699 CASAVA_Build 9 41228944 1I ATAAAACAAC -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 49 33 11 5 A 7 8 341700 CASAVA_Build 9 41238116 1I TATTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1868 hom 25 7 13 5 T 10 11 341701 CASAVA_Build 9 41241496 1D AGGGTTATAG T/- TTTTTTTGGG 1338 het 1338 ref 32 25 3 4 T 8 7 341702 CASAVA_Build 9 41262614 1D CAACAATGCC T/- TTAGTCACAA 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 T 3 2 341703 CASAVA_Build 9 41264942 1D CAGCACCCTT G/- GAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 36 23 12 2 G 2 1 341704 CASAVA_Build 9 41269679 1D CCCTCCTCTA C/- CCAGCACTTC 2114 het 1290 hom 8 3 5 0 C 3 2 341705 CASAVA_Build 9 41270359 1D CCAGCATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 36 3 24 9 T 18 17 341706 CASAVA_Build 9 41441528 1D CAAGAAAAAG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 9 8 341707 CASAVA_Build 9 41682598 2D ACTTTAGCAC TA/-- TGTTTGGGGG 3070 het 3070 ref 37 18 15 6 TA 1 0 341708 CASAVA_Build 9 41890685 1I GCTTCTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 61 22 23 16 T 15 16 341709 CASAVA_Build 9 41892421 1I CTGGGTCCTT -/C CCACAACACA 3070 het 1780 hom 26 8 17 1 C 2 3 341710 CASAVA_Build 9 41908185 2I TAAAATCGAC --/TA TGTTTCCTTA 3070 het 3070 ref 36 25 8 3 TA 0 1 341711 CASAVA_Build 9 41912368 3D TGGGAATTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 87 23 23 43 T 15 12 341712 CASAVA_Build 9 41912635 1I CAAGTTGTTT -/C CATCTTAGAC 1500 het 1500 ref 71 54 4 13 C 1 2 341713 CASAVA_Build 9 41915915 1D GGGCCTGGAA T/- TTTTTTTGTG 1904 het 1904 ref 27 20 4 3 T 8 7 341714 CASAVA_Build 9 41918970 1I CATTAACCAA -/C CCCTTTTCGT 3070 het 3070 ref 35 22 9 4 C 3 4 341715 CASAVA_Build 9 41925248 15I GCTGCTATAT ---------------/ATTAGCTGCTATATA CAATTGAAAA 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 ATTAGCTGCTATATA 0 1 341716 CASAVA_Build 9 41947454 1D ATGTTGGGAG A/- ATATATATTT 3070 het 3070 ref 77 58 11 8 A 2 1 341717 CASAVA_Build 9 41961991 2D GCTCTATCCC CT/-- TTGTCTGAAA 1800 het 1800 ref 16 8 5 4 CT 1 0 341718 CASAVA_Build 9 41970881 2D TTACATAATG GT/-- GTAAAGAGTT 1706 het 1706 ref 39 30 5 4 GT 2 1 341719 CASAVA_Build 9 41996999 1I ATGTGAAACT -/C CTTTTTTTTT 2152 het 2152 ref 22 14 5 3 C 1 2 341720 CASAVA_Build 9 42000238 1I CCTGGGCAGC -/A AAGGGAAACC 1343 het 1343 ref 14 8 4 2 A 2 3 341721 CASAVA_Build 9 42004324 2D ACCATTTATT AA/-- AGAGACTAAA 2021 het 613 hom 10 2 6 2 A 3 1 341722 CASAVA_Build 9 42064226 3I AGAAATTGAT ---/AAG AATAGCTCAA 2965 hom 15 het 6 0 6 0 AAG 0 1 341723 CASAVA_Build 9 42076453 1I TTAGTCGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 288 hom 32 3 14 15 T 10 11 341724 CASAVA_Build 9 42135891 4D CACATAAAAT AAAC/---- ATTGGATAAA 2431 het 2431 ref 15 10 5 0 AAAC 1 0 341725 CASAVA_Build 9 42136419 1D CTTATAGCAG T/- TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 41 24 10 7 T 7 6 341726 CASAVA_Build 9 42136714 1D ATACCTATGT G/- GAATGTATTT 2368 het 2368 ref 45 33 5 7 G 2 1 341727 CASAVA_Build 9 42139751 1D GGTTTGAAAA T/- TTTTTTCATA 2367 het 2367 ref 51 33 5 13 T 7 6 341728 CASAVA_Build 9 42140115 6I GGATTTTCTT ------/TAATAA TGGTTTAAAA 2043 het 2043 ref 60 45 8 7 TAA 0 2 341729 CASAVA_Build 9 42144858 1I GGGTACTGTG -/T TTACTGCCTG 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 T 2 3 341730 CASAVA_Build 9 42146920 1D TATGTGCTCA T/- TTTTTTTTAA 1574 het 1574 ref 60 40 6 17 T 9 8 341731 CASAVA_Build 9 42149126 1I TGAATGAAAT -/A AAAAAAGTTG 3070 het 3070 ref 47 30 15 2 A 6 7 341732 CASAVA_Build 9 42151567 1I ATGTTATTTT -/A AATCTTACCC 3070 het 3070 ref 57 41 8 8 A 2 3 341733 CASAVA_Build 9 42160049 1I TATATATTAC -/T TTTTTTCTAT 2444 het 2444 ref 14 7 5 2 T 6 7 341734 CASAVA_Build 9 42161107 13D GTTACTTACC TACAGACCTTATT/------------- TACATATTTT 2491 het 2491 ref 23 26 6 2 TACAGACCTTATT 1 0 341735 CASAVA_Build 9 42161509 1I AAAAAAAAAA -/T GTTAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 0 1 341736 CASAVA_Build 9 42161631 1D ACATAATATA T/- TTTGGCAAGA 2404 het 2404 ref 11 6 5 0 T 4 3 341737 CASAVA_Build 9 42163286 1I TATTTTCCCC -/A AATCTGTAGT 2581 het 2581 ref 23 14 6 3 A 2 3 341738 CASAVA_Build 9 42163543 1I ATAACCACTC -/A AAAACTTCCT 3070 het 3070 ref 57 37 14 6 A 4 5 341739 CASAVA_Build 9 42163776 1D ATTTGTTCAA T/- TTTCACTCAC 1383 het 1383 ref 39 27 3 10 T 4 3 341740 CASAVA_Build 9 42166769 1D TTGAGAGATT A/- AAAACATCTA 3070 het 3070 ref 44 30 10 4 A 5 4 341741 CASAVA_Build 9 42173429 1I TCTAAAGAAG -/A AAAAAAAAGT 1395 het 1395 ref 54 21 3 30 A 8 9 341742 CASAVA_Build 9 42173458 2I TTTGTGAGAC --/AT GTAGACTGAG 3070 het 3070 ref 86 44 35 7 AT 0 1 341743 CASAVA_Build 9 42173538 5D TAGAGAAGAT AAATG/----- AAAGTTATGC 3070 het 3070 ref 63 45 13 5 AAATG 1 0 341744 CASAVA_Build 9 42176015 5D ACAGGAACAT ATAAC/----- ATAAACTACA 3070 het 3070 ref 90 78 12 6 ATAAC 1 0 341745 CASAVA_Build 9 42176254 4I TTTGCTAGGG ----/TTAA TTGTTTAGGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTAA 0 1 341746 CASAVA_Build 9 42178342 4I9M4I CATGTTGTTC ----GTCAACCGT----/AAGTGTCAACTGTACTA ACTTTTTTAT 2449 het 2449 ref 11 6 5 0 N/A 0 0 341747 CASAVA_Build 9 42180876 10I GCAATACTTC ----------/TGCATTCCAG ACAGTAAAAT 3070 het 3070 ref 79 58 16 5 TGCATTCCAG 0 1 341748 CASAVA_Build 9 42181849 2D TCTTAGAGCC AA/-- AAGGGCCCTT 3038 het 3038 ref 54 44 8 3 A 4 2 341749 CASAVA_Build 9 42189761 1D ACTAAAACAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 10 9 341750 CASAVA_Build 9 42189937 1I ACAGTGATTC -/T TTTTTTGAAA 3070 het 3070 ref 65 40 25 6 T 6 7 341751 CASAVA_Build 9 42190012 4D AAATGAATTA AATT/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 50 24 15 11 AATT 4 3 341752 CASAVA_Build 9 42193261 1D TCCATCACAC T/- TTTTCATTTA 3070 het 3070 ref 56 40 9 7 T 5 4 341753 CASAVA_Build 9 42196557 1D ATTTTCTAGG T/- TTAAGTATGC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 3 2 341754 CASAVA_Build 9 42197365 1D ATGTGGAACA T/- TTCAAACTAC 3070 het 3070 ref 38 24 8 9 T 3 2 341755 CASAVA_Build 9 42204994 4I TTTCCTTTCT ----/TTTG TTTTTTTTAA 3070 hom 42 het 25 0 15 10 TTTG 0 1 341756 CASAVA_Build 9 42207887 1I TGAAAATTTT -/A ACTGGGTAAC 1973 hom 10 het 4 0 4 0 A 1 2 341757 CASAVA_Build 9 42208457 4I AAAATAAAAA ----/AATT AGAGTTTTTT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AATT 0 1 341758 CASAVA_Build 9 42210309 1I GAGAAGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 9 10 341759 CASAVA_Build 9 42214295 1D ACACAAATGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 66 42 13 11 T 10 9 341760 CASAVA_Build 9 42215810 1D GTGTGAAAGT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 51 het 22 0 18 5 A 8 7 341761 CASAVA_Build 9 42216506 1D TTTAGAAGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 351 hom 15 1 14 0 T 10 9 341762 CASAVA_Build 9 42216673 2D ATATTATCTC TT/-- ATACATTTCA 2412 het 2412 ref 35 23 7 6 T 2 0 341763 CASAVA_Build 9 42216891 4I TGGGCAACAG ----/TATC TATCCTCTGA 3070 het 3070 ref 60 35 18 7 TATC 1 2 341764 CASAVA_Build 9 42218014 3D TTGTGTCAGC AAG/--- AAGATCTGTA 1954 hom 10 het 5 0 4 1 AAG 2 1 341765 CASAVA_Build 9 42222236 3D TTTTTTTGTA TTT/--- TTTTTTTTTA 2755 het 752 hom 14 3 7 5 T 12 9 341766 CASAVA_Build 9 42231075 4D ATCAAAAGAG AACA/---- AACAGTATGA 3070 het 3070 ref 95 54 33 8 AACA 2 1 341767 CASAVA_Build 9 42231165 2D CTTAGTATGA TG/-- TTTTGGCTCA 3070 het 3070 ref 94 59 24 13 TG 1 0 341768 CASAVA_Build 9 42231291 1I ATAAAATATA -/G TATTTTATAA 2873 het 2873 ref 19 10 6 3 G 0 1 341769 CASAVA_Build 9 42233034 2I GAGAGAGAGA --/GG GAGAGGATAA 1282 het 1282 ref 34 24 3 7 G 1 3 341770 CASAVA_Build 9 42242766 1I CCAGGGGCAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 64 38 17 9 A 8 9 341771 CASAVA_Build 9 42245311 1D GGGGCAAAGG A/- AAAAAAAAAC 1770 het 1770 ref 14 7 5 2 A 10 9 341772 CASAVA_Build 9 42247381 1D TGAGGCAGAG A/- AAAAAAAAAA 2683 het 263 hom 15 1 8 6 A 11 10 341773 CASAVA_Build 9 42250315 2I CATTTTCACA --/CT GTTATAAAAA 3070 het 3070 ref 48 32 13 3 CT 0 1 341774 CASAVA_Build 9 42254151 2D TTAGGCCACA GG/-- TTAACACGAA 1263 het 1263 ref 24 17 3 5 G 2 0 341775 CASAVA_Build 9 42254217 14D2M4D GAAGGGTCCT GTGGACATCAGGCCTGAGAA/--------------TG---- GGGTCCAGGT 2333 het 2333 ref 42 31 8 3 N/A 0 0 341776 CASAVA_Build 9 42254573 4D AGGCCCCAGC TAGA/---- TAGATACCTA 2643 hom 18 het 7 0 6 1 TAGA 2 1 341777 CASAVA_Build 9 42258619 1D CCATTTGGAG T/- TTTAGGACAA 1437 het 1437 ref 87 61 8 20 T 4 3 341778 CASAVA_Build 9 42259701 4D TTGAGTAAAC AAGT/---- AAGAGACTGG 3070 het 3070 ref 82 55 23 5 AAGT 1 0 341779 CASAVA_Build 9 42264856 2D ATGAAGGTAA AT/-- ATATTTAATT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AT 3 2 341780 CASAVA_Build 9 42269617 4I TATTTACTTT ----/GATA GATGTATGCA 2889 het 2889 ref 42 32 8 2 GATA 0 1 341781 CASAVA_Build 9 42272327 2I TTGGAAGGAG --/GT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 64 36 13 15 GT 0 1 341782 CASAVA_Build 9 42275062 1D ACACACTTTT A/- AACAGCCAGA 3070 het 3070 ref 54 25 16 15 A 3 2 341783 CASAVA_Build 9 42275786 1D TCCAACCCCA C/- ATTTCCACTT 3070 het 3070 ref 52 41 9 2 C 1 0 341784 CASAVA_Build 9 42278606 16D GCTATATATA TATATATATATATTTT/---------------- TTTTTTTGTG 3070 het 1304 hom 22 6 20 3 TATATATATATATTTT 1 0 341785 CASAVA_Build 9 42296645 2D41M1D AGACTGTAAC TGTAGCTTTGTCACTGAGAATTGGTCAACCATTTCAAAATAGGT/--TACCTTTGTCACTGAGAATTGGTCAACCATTTCAAAATAGG- TAAGTTTTCT 1819 hom 12 het 5 0 5 0 N/A 0 0 341786 CASAVA_Build 9 42296781 1I AGGGAGAGAT -/A ACCAAAGATT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 1 2 341787 CASAVA_Build 9 42298436 2I GCCAACAAAC --/AT ATGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 60 30 18 12 AT 1 2 341788 CASAVA_Build 9 42299202 1I TCATTCTACG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 57 39 7 11 T 8 9 341789 CASAVA_Build 9 42309504 2I TGCTTCAGAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 83 hom 12 1 7 4 A 9 11 341790 CASAVA_Build 9 42331294 1I CTGTGGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 75 31 24 20 T 12 13 341791 CASAVA_Build 9 42333874 2D TCATCTCTCT TG/-- TCTCTCCCCC 2117 het 2117 ref 15 8 5 4 TG 1 0 341792 CASAVA_Build 9 42334336 3D GTGCATGGGT GTA/--- GTATTCATTT 1401 het 1401 ref 26 21 3 2 GTA 2 1 341793 CASAVA_Build 9 42352776 2D AACAAAAGAT GG/-- GGTCCTATCA 2000 hom 13 het 11 0 5 6 G 4 2 341794 CASAVA_Build 9 42354300 2I GCTTTTATGC --/TG TGTCTGAGAT 3070 het 2344 hom 34 8 18 8 TG 1 2 341795 CASAVA_Build 9 42359643 6I CTGCTGCTTA ------/AAGTTT AAGTTGCTGA 1975 hom 10 het 6 0 4 2 AAGTTT 0 1 341796 CASAVA_Build 9 42361777 4I29M4I GAGCAATAAG ----AGTAAGTATTGTACTTTCTTCAAAAAATT----/AGCTAGTAAGTATTGTGCTTTCTTCAAAAAAATTAAG TATTTGTTTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 N/A 0 0 341797 CASAVA_Build 9 42376485 5D AAAACCAAAC CAAAA/----- CAAAACAAAA 1088 het 1088 ref 36 25 3 8 CAAAA 3 2 341798 CASAVA_Build 9 42428118 2D CCTACAGCAC TG/-- TGGGCTTCTT 1784 hom 12 het 5 0 5 0 TG 2 1 341799 CASAVA_Build 9 42433503 1I CATGGGATTT -/G GGGGGGGTCA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 G 7 8 341800 CASAVA_Build 9 42440196 1D GGTAAGGGTA G/- GGGGGCAGAT 2720 het 2720 ref 55 39 7 9 G 6 5 341801 CASAVA_Build 9 42451901 2D GGTTTCAAAA AG/-- GGTGATTTTG 1876 hom 4 het 6 0 4 2 AG 1 0 341802 CASAVA_Build 9 42467007 1I ACCATTTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1397 hom 27 3 12 12 A 11 12 341803 CASAVA_Build 9 42471301 1I TAAATAAAAA -/T TAAAAAAACC 3070 het 400 hom 21 4 11 6 T 1 2 341804 CASAVA_Build 9 42471357 5I ACAAACTCTC -----/TTTTG TTTTAACAAA 3070 het 1898 hom 22 5 13 4 TTTTG 0 1 341805 CASAVA_Build 9 42479949 1D TTTTCTTCTT A/- AAAAACAGAG 2561 het 491 hom 8 1 6 1 A 6 5 341806 CASAVA_Build 9 42482073 2I CGGCTGGAGG --/GC GCCACCGCGG 3070 het 795 hom 47 4 23 20 GC 1 2 341807 CASAVA_Build 9 42487383 1D TGATCTTTAC A/- GCAACTTTAT 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 A 1 0 341808 CASAVA_Build 9 42489130 2D GTCTGGCTGT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 390 hom 63 8 35 21 A 10 8 341809 CASAVA_Build 9 42513650 1I TTCGAGACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 90 64 13 13 A 12 13 341810 CASAVA_Build 9 42513986 1I ATAGCCTACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 66 32 24 10 A 9 10 341811 CASAVA_Build 9 42522262 1D TAGAGGTATC T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 8 7 341812 CASAVA_Build 9 42524781 1D CATTTTTACA T/- TTTTTTTTCA 2319 het 678 hom 13 4 6 3 T 9 8 341813 CASAVA_Build 9 42530164 1D AGGAAGGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 138 het 48 0 46 2 A 10 9 341814 CASAVA_Build 9 42537002 1D CTTCAGCTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 24 8 5 A 10 9 341815 CASAVA_Build 9 42545255 1D AATATTTGAG A/- AAAAAACAAT 69 het 69 ref 4 1 1 2 A 7 6 341816 CASAVA_Build 9 42556183 1I TTAGCCATTG -/T TTTTTTCCAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 6 7 341817 CASAVA_Build 9 42565750 2D CTGTATTCTC TT/-- TTCTAAACTG 1399 het 1399 ref 11 7 3 1 T 4 2 341818 CASAVA_Build 9 42595665 3D CAAACTCTAA CAT/--- CATTTTTTCT 1937 het 1937 ref 13 9 4 0 CAT 2 1 341819 CASAVA_Build 9 42672090 3D47M2D TGCTTTGAGC GTGATGGTGGCTCAAAATTACTATTCTTAGTATTTATAAGTTCTACTGACAT/---ATGATGGCTCAAAATTACTATTCTTAGTATTTATAAGTTCTACTGAC-- TAGATTTTGA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 N/A 0 0 341820 CASAVA_Build 9 42755563 1D24M1D ATGCACAAAA CTAAAAATATAAGGAGGGTCTTTTCT/-TTAAAATATAAGAAGGGTCTTTTC- GGATCTCTGT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 341821 CASAVA_Build 9 42782059 3D TCAATTCATC TCA/--- TCATTTTTCA 3070 het 1383 hom 11 3 8 0 TCA 2 1 341822 CASAVA_Build 9 42868247 4D TTTGTATGAG ATAT/---- ATATATATAT 187 het 187 ref 15 5 2 8 AT 10 8 341823 CASAVA_Build 9 42872296 1I ATGCAGTGGC -/T TAGATCTCAG 3070 het 1958 hom 22 6 11 5 T 1 2 341824 CASAVA_Build 9 42876915 1I CTATACATTT -/C CCTCAATGCT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 C 2 3 341825 CASAVA_Build 9 42877515 4D5M1D TGTAATTCCC TTCTTTGTCT/----TTGTC- TTTTTTATCT 2028 het 2028 ref 70 53 6 11 N/A 0 0 341826 CASAVA_Build 9 42877621 2D ATTTTCCTCC AT/-- CTCTTTATTT 2284 het 2284 ref 38 32 6 1 AT 1 0 341827 CASAVA_Build 9 42884659 1D ATTGTAAATC T/- TTTTAAACTA 2418 het 2418 ref 26 15 5 6 T 5 4 341828 CASAVA_Build 9 42911918 4D TTTTCTTCAG AGAC/---- AGTGTCTTTC 3070 het 3070 ref 25 16 8 2 AGAC 1 0 341829 CASAVA_Build 9 42916151 2D CTCAGTTTAG AA/-- AAGAGAATAC 1167 het 1167 ref 48 43 3 2 A 4 2 341830 CASAVA_Build 9 42939028 2I30M3I CCATTCTTCC --CTCTCCCCTCTCTCATCTCTCTTTTCTCCC---/CTCTCTCTCCTCTCTCATCTCTCTTTTCTCCCCTT CTTTTCCTCT 1933 het 1933 ref 39 33 5 1 N/A 0 0 341831 CASAVA_Build 9 42940118 1D ACATACCAAA T/- TTTTAAATCT 2527 het 2527 ref 33 23 6 5 T 5 4 341832 CASAVA_Build 9 42940835 1D TTGCATTACC T/- TTTTTTCCTA 1742 het 1742 ref 86 74 4 9 T 7 6 341833 CASAVA_Build 9 42944889 1I TATTCAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 62 32 9 21 T 10 11 341834 CASAVA_Build 9 42948555 1D TTATAATTTT A/- GAATTCCCAC 3070 het 3070 ref 75 41 29 5 A 1 0 341835 CASAVA_Build 9 42949387 1I28M1I GTAAACTTTT -AAAAACATTATGGGATTTTTTTTGGTGA-/AAAAAACATTATGGGATTTTTTTTGGTGAT TTTTTTTTTC 3070 het 2509 hom 52 9 13 48 N/A 0 0 341836 CASAVA_Build 9 42952302 1I ATCAGTTTTT -/C TTCTATTTAT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 C 0 1 341837 CASAVA_Build 9 42955345 4I ATTTGCATTC ----/TCTT TATTTTTTTC 2357 het 2357 ref 50 35 5 10 TCTT 0 1 341838 CASAVA_Build 9 42959624 1D TTGAAATTTG A/- AAAAAAAAGA 2714 het 2714 ref 44 33 6 5 A 9 8 341839 CASAVA_Build 9 42984447 1D ATAGAGACCA T/- TACACCATTT 1379 het 1379 ref 35 28 3 5 T 2 1 341840 CASAVA_Build 9 42998906 6D GTTGGCCAGG CTGGTC/------ TTGAACTGCC 1501 het 1501 ref 35 27 5 10 CTGGTC 1 0 341841 CASAVA_Build 9 43002231 5D ACAATAATTG TATAA/----- GATAATATTA 1885 het 1885 ref 33 20 5 8 TATAA 1 0 341842 CASAVA_Build 9 43015720 2I CCTCACTGAC --/TG TGACACTTGG 3070 hom 51 het 19 0 16 3 TG 1 2 341843 CASAVA_Build 9 43016287 4I TACTGCTGGC ----/CAAA CAAAGTGGCT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 CAAA 1 2 341844 CASAVA_Build 9 43028882 1D CCTCCTAGTA C/- CCACCACCCT 2829 het 2829 ref 24 14 7 3 C 3 2 341845 CASAVA_Build 9 43073949 1I AAAAAAAATC -/G TGTGATCAAA 1314 het 1314 ref 40 35 3 2 G 0 1 341846 CASAVA_Build 9 43074099 5I GTAAATTTCC -----/ATGAT ACGTTTTATA 4 het 4 ref 26 11 1 14 ATGAT 0 1 341847 CASAVA_Build 9 43118023 3D ATAATTGAAA AGG/--- AGAACTTTGA 3070 het 3070 ref 44 33 11 1 AGG 1 0 341848 CASAVA_Build 9 43118162 1I ACCTTGAAGG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 40 28 8 4 T 6 7 341849 CASAVA_Build 9 43121460 3D TATTTATATG TGT/--- TGTTTTATTT 2376 het 2376 ref 34 19 5 11 TGT 2 1 341850 CASAVA_Build 9 43121487 5D AGAACACAAT TAAAA/----- TGAAATGATT 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 TAAAA 1 0 341851 CASAVA_Build 9 43122047 4D GTTCTCTTTA AAGT/---- AAGTACTGTG 3070 het 3070 ref 31 20 8 4 AAGT 2 1 341852 CASAVA_Build 9 43127006 1D ACCCAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 22 22 10 T 12 11 341853 CASAVA_Build 9 43128375 1D ACTGCATCCC T/- TCTGGAGGTT 3070 het 3070 ref 63 40 21 2 T 2 1 341854 CASAVA_Build 9 43130879 1D GCTGTGAGAG C/- TTTTCCACCG 1858 het 1858 ref 48 40 5 4 C 1 0 341855 CASAVA_Build 9 43133182 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 A 6 7 341856 CASAVA_Build 9 43136864 1D TTATGGCTCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 708 hom 27 2 19 6 T 8 7 341857 CASAVA_Build 9 43141524 1D CAAAGGGCTT A/- GGGGGGCACA 3070 het 3070 ref 64 42 10 12 A 1 0 341858 CASAVA_Build 9 43144661 4D GTGTGTAAAG TCTA/---- TCTATTTTAC 3070 het 3070 ref 48 36 10 4 TCTA 2 1 341859 CASAVA_Build 9 43146533 2D44M3D GGGGTGTTTT TAAAAAAAAATCAAAATTGACGAGTTTTAACTAGATGAAGTTAGATAAG/--AAAAAAAATCAAAATTGACAAGTTTTAACTAGATGAACTTAGAT--- AAAAAGAAAA 1416 het 1416 ref 23 15 3 13 N/A 0 0 341860 CASAVA_Build 9 43149159 1I CCTCCCTCTT -/C CCCCCATCTA 1411 hom 8 het 6 0 3 3 C 5 6 341861 CASAVA_Build 9 43152710 1D TAAAAAACCA T/- TTTTTCCTTA 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 T 6 5 341862 CASAVA_Build 9 43153805 1D GGGAAAACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 23 17 16 T 15 14 341863 CASAVA_Build 9 43168570 2D GCCTGTGGTC TG/-- TGTCTTTCCG 1941 het 1941 ref 13 7 4 3 TG 2 1 341864 CASAVA_Build 9 43181239 1I GAGTAAATAA -/C CCCATGCAAA 1688 het 1688 ref 32 25 4 3 C 3 4 341865 CASAVA_Build 9 43185031 1I TGAATCTTTG -/C GTATCTCTCC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 0 1 341866 CASAVA_Build 9 43191581 2I AGTGTATGAC --/AT GTGGTTGGAG 2277 het 1949 hom 13 7 5 1 AT 0 1 341867 CASAVA_Build 9 43196978 1D CCTCTAATGG A/- ATGGGAAACA 2946 het 2946 ref 77 65 7 6 A 2 1 341868 CASAVA_Build 9 43203166 4D AAAAAAAAAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 1230 hom 32 6 12 14 AT 8 6 341869 CASAVA_Build 9 43302943 15I TGTATAGATA ---------------/ATGAAACTGCGGACC AGAGAGGCTG 3070 hom 21 het 10 0 8 2 ATGAAACTGCGGACC 0 1 341870 CASAVA_Build 9 43326498 2D3M2D TGCTTCACTA TTTGAAG/--TGA-- CATGGTAAGA 3070 het 3070 ref 24 15 10 3 N/A 0 0 341871 CASAVA_Build 9 43334630 1D TTTCTTTCAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 234 hom 22 4 11 7 T 10 9 341872 CASAVA_Build 9 43334865 1D TCCTCCTATT A/- TTTTTTTTAA 2947 het 2947 ref 22 13 9 1 A 1 0 341873 CASAVA_Build 9 43340882 4I CCACCCTGCC ----/ATTA ATGTCGGTCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 ATTA 0 1 341874 CASAVA_Build 9 43341522 1I ACAAATAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 A 9 10 341875 CASAVA_Build 9 43341735 1D CATCACACTA C/- CCAACTTCAA 3070 het 2443 hom 16 5 8 4 C 3 2 341876 CASAVA_Build 9 43345751 1I ATTTAAAAAG -/A AAAAAAATAA 3070 het 1273 hom 13 5 7 1 A 7 8 341877 CASAVA_Build 9 43362965 2I GAAGGGTAAC --/TG AGAAGTGACG 3070 het 3070 ref 56 32 21 3 TG 0 1 341878 CASAVA_Build 9 43369488 2I TTCCCTTCTG --/CA CAAATGGCTC 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 CA 1 2 341879 CASAVA_Build 9 43379252 1I AAAGGAGGAT -/G GGGGGATGAG 2651 hom 15 het 6 0 6 0 G 5 6 341880 CASAVA_Build 9 43384237 4D TTTAATGGGG TTAT/---- TTGTTTTTTT 1911 het 1911 ref 23 18 4 1 TTAT 1 0 341881 CASAVA_Build 9 43453781 1D GAGTCTCATA T/- TTTTAGGACT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 5 4 341882 CASAVA_Build 9 43459209 1I AGATACACTC -/T TTTTTTGCCA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 T 6 7 341883 CASAVA_Build 9 43461475 1I TGATATCCTT -/C CAGCTAGTTG 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 C 1 2 341884 CASAVA_Build 9 43466731 1D TGCTCTTGCA T/- TTTTTTTTTC 2361 het 2361 ref 18 9 5 5 T 10 9 341885 CASAVA_Build 9 43493798 8I GTGATGTCAT --------/CTAAGGAC CTAAGGACTG 1525 hom 15 het 12 0 4 8 CTAAGGAC 1 2 341886 CASAVA_Build 9 43494271 2D TTAATGAGTC TT/-- TTGCTTATCT 1682 het 1682 ref 74 59 4 11 T 4 2 341887 CASAVA_Build 9 43508748 1I GATTATTATT -/A AAAAAAAAAA 880 het 880 ref 15 7 5 3 A 13 14 341888 CASAVA_Build 9 43526211 1D GAAGTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 G 1 0 341889 CASAVA_Build 9 43526859 1D AGAAGGAGAG A/- GGGAGGGAGG 3070 het 68 hom 20 1 13 6 A 1 0 341890 CASAVA_Build 9 43552268 1D AAATTTCTCC A/- ACAAAAGAAG 1125 het 1125 ref 14 10 3 1 A 2 1 341891 CASAVA_Build 9 43571331 1I ACAATTAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 9 10 341892 CASAVA_Build 9 43592532 1D TTAAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 T 14 13 341893 CASAVA_Build 9 43596875 3D CATTCTTTTG GGA/--- GGAGTAGAGA 2308 het 2308 ref 28 21 5 5 GGA 2 1 341894 CASAVA_Build 9 43601012 3D ATTGTCTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2201 het 225 hom 12 1 6 5 A 20 17 341895 CASAVA_Build 9 43602393 1D10M1D GGAATAATAC AAAATGCACTCT/-AAATGTACTC- TTGGTTCTGG 3070 het 3070 ref 45 37 7 8 N/A 0 0 341896 CASAVA_Build 9 43611488 1D CCAAATGGTT C/- CTTTCCCCTT 2429 het 2429 ref 27 16 7 4 C 2 1 341897 CASAVA_Build 9 43613035 1I TATTCACTTC -/T TTTTTTTTTT 1097 het 1097 ref 27 8 4 15 T 13 14 341898 CASAVA_Build 9 43638211 1I CTTTTTACTC -/T TTTTTTCTCT 3001 het 3001 ref 16 9 7 0 T 6 7 341899 CASAVA_Build 9 43644228 2I TTCCATATAA --/AC AGTGTGTTCA 3070 het 3070 ref 36 21 9 6 AC 0 1 341900 CASAVA_Build 9 43644932 1I CCATGCATTC -/T TTTTTTTTTT 2434 het 2434 ref 52 29 8 15 T 11 12 341901 CASAVA_Build 9 43648003 1D CTTTGTATGT A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 A 7 6 341902 CASAVA_Build 9 43650079 1D TGCCATGTCC T/- TTTTTTTTTT 1380 het 1380 ref 11 6 3 2 T 11 10 341903 CASAVA_Build 9 43659336 2D TGAAATATAT GA/-- GAGAATTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 GA 3 2 341904 CASAVA_Build 9 43663702 2D GTATACTGAC TA/-- TATATAGTCA 1890 het 1890 ref 22 15 4 3 TA 4 3 341905 CASAVA_Build 9 43677195 1I AATTATTCTA -/T TTTTTTCTAT 2904 het 2904 ref 18 10 6 2 T 6 7 341906 CASAVA_Build 9 43718855 1D TGAGGCACTG A/- AGGATTTTTG 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 A 2 1 341907 CASAVA_Build 9 43725572 1I TTTAAATCAA -/T TTTTTTTTCT 1923 het 1923 ref 28 18 4 6 T 8 9 341908 CASAVA_Build 9 43756627 1I TTCCTTCTCC -/T TTTAAGGCAA 3070 het 3070 ref 37 22 8 7 T 3 4 341909 CASAVA_Build 9 43781269 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2130 hom 19 8 9 2 A 12 11 341910 CASAVA_Build 9 43784261 1D AGCAGGGGGC G/- CTGGGGAGTT 1410 het 1410 ref 10 5 4 3 G 1 0 341911 CASAVA_Build 9 43784590 1D AAAAATACAG A/- AAAAAAAAAA 2233 het 166 hom 11 3 6 2 A 11 10 341912 CASAVA_Build 9 43791401 1I ACACATTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 T 8 9 341913 CASAVA_Build 9 43800618 4D TTTATTCGAT AATG/---- AAAGAAATAG 2624 het 2624 ref 17 10 6 1 AATG 1 0 341914 CASAVA_Build 9 43801864 1I GAATCCCCAC -/A AGTCCCCTGC 2041 het 2041 ref 58 43 5 10 A 1 2 341915 CASAVA_Build 9 43804304 2I TGTCTGTGAA --/TG TGTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 TG 1 2 341916 CASAVA_Build 9 43813424 1I TCTCTTTTCA -/T TTTTTTTCCT 1443 het 1443 ref 15 7 3 5 T 7 8 341917 CASAVA_Build 9 43827961 1D AAATATTCTC T/- TCTGTAAAAC 2375 het 2173 hom 11 6 5 0 T 2 1 341918 CASAVA_Build 9 43832822 1I CACTTGTTCA -/T TTCTTAAGTG 1817 het 1817 ref 48 34 6 8 T 2 3 341919 CASAVA_Build 9 43938881 1D AGGGTTTTTT C/- CCCCACCTTC 1321 het 1321 ref 36 24 5 8 C 5 4 341920 CASAVA_Build 9 43940986 27D TACAAATTTT AAAAAATATTCATGTCTCATTCTATGA/--------------------------- ATCAATCTAA 1830 hom 12 het 5 0 5 1 AAAAAATATTCATGTCTCATTCTATGA 1 0 341921 CASAVA_Build 9 44001888 1D CAATTTGAAT A/- AAATGCTATC 1990 hom 12 het 5 0 5 0 A 4 3 341922 CASAVA_Build 9 44008419 1D TAACCAAGAT A/- AAAAAAGTAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 7 6 341923 CASAVA_Build 9 44008988 5I GTAAATTTCC -----/ATGAT ACATTTTATA 72 hom 5 het 25 0 2 24 ATGAT 0 1 341924 CASAVA_Build 9 44009009 3I CTAAAAGAAA ---/AAG AAGCAGAAAC 2479 hom 12 het 27 0 5 22 AAG 1 2 341925 CASAVA_Build 9 44009074 3I CACAAACAGG ---/TCT TCTTTAAACC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 TCT 1 2 341926 CASAVA_Build 9 44010079 3D78M4D AATTTTCATC ATTATCTTTTCCGAAATTTAAACTGCCAACAATGTTTGTTACAAATGAGGGTTTTTACACACAAAATACTAAGGGTTAGTTAAAA/---ATCTTTTCTGAAATTTAAACTGCCAAAAATGTTTGTTACAAATGAGGGTTTTTACACACAAAATACTAAGGGTTAGTT---- AAAAAAAAGA 2320 het 2320 ref 60 77 6 70 N/A 0 0 341927 CASAVA_Build 9 44013107 1I TTTAGAATAT -/A AACCTTACTA 2567 het 2567 ref 36 25 6 5 A 2 3 341928 CASAVA_Build 9 44014128 4D TTTAAATAAA AGAT/---- AGATAAAGAA 2826 het 2826 ref 22 13 7 2 AGAT 2 1 341929 CASAVA_Build 9 44014383 1I AAAAATACTG -/T TTTAACAGGA 2468 hom 12 het 5 0 5 0 T 3 4 341930 CASAVA_Build 9 44015728 4I TTGAAAATAC ----/TCAT TTCAGGTGTA 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 TCAT 0 1 341931 CASAVA_Build 9 44020717 1D TTTATCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1969 hom 25 9 10 6 T 12 11 341932 CASAVA_Build 9 44024396 5I ATAAAGACTA -----/TAATC TATATAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TAATC 0 1 341933 CASAVA_Build 9 44030319 1D TACATCCTTT C/- TTTGTACTGC 3070 het 3070 ref 75 44 31 0 C 1 0 341934 CASAVA_Build 9 44030627 3I TTCTTCTTGG ---/CTT CTTCTTTTCA 2053 het 2053 ref 52 40 5 7 CTT 2 3 341935 CASAVA_Build 9 44032970 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTCTGA 363 hom 4 het 9 0 3 6 T 7 6 341936 CASAVA_Build 9 44037078 1D TGATTTTCCT G/- TCACTACTAA 1616 het 1616 ref 50 29 5 16 G 1 0 341937 CASAVA_Build 9 44037103 2I CCAGTTCATT --/TA TTTTTCAGCT 3070 het 3070 ref 46 20 9 17 TA 0 1 341938 CASAVA_Build 9 44037475 1I TATCCAGCTT -/C CCCCTCAAAA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 4 5 341939 CASAVA_Build 9 44038751 1I TCCTTGATTT -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 8 9 341940 CASAVA_Build 9 44042182 6D GGAGAGATGA ACAGGC/------ ATAGCATAGA 3070 het 229 hom 20 1 16 3 ACAGGC 1 0 341941 CASAVA_Build 9 44044170 1D ACCACATGCA C/- CTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 49 35 10 5 C 2 1 341942 CASAVA_Build 9 44045931 1I TTTGTCAGGA -/T CTACTTATGC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 0 1 341943 CASAVA_Build 9 44048473 1D TGCCAGAGCA G/- GGTGCTGGGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 3 2 341944 CASAVA_Build 9 44049171 3D AAGGTAGACT AAC/--- TCTTCGCTAT 3070 het 3070 ref 55 27 16 13 AAC 1 0 341945 CASAVA_Build 9 44049224 2I TCACCTAATG --/TA TATAAGATGG 1673 het 1673 ref 64 49 4 11 TA 2 3 341946 CASAVA_Build 9 44049362 3I GAGCGAAGAT ---/ATC AATATTTTGC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATC 0 1 341947 CASAVA_Build 9 44053913 1I ACTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 9 10 341948 CASAVA_Build 9 44056514 4I TTAATCTATC ----/TTTG TTTGCATAAA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TTTG 1 2 341949 CASAVA_Build 9 44057853 1D TTTTCATCTG A/- AAAAAAAAAA 2979 hom 15 het 8 0 6 2 A 11 10 341950 CASAVA_Build 9 44059712 4I CGCGTGGCAG ----/GTGT GTGTGCAGGT 3070 het 3070 hom 53 17 27 9 GT 2 4 341951 CASAVA_Build 9 44059925 1I TTCTCTGTGG -/A AACTGGGATG 3070 het 3070 hom 46 14 22 10 A 2 3 341952 CASAVA_Build 9 44060223 1D GGGCAAGGTA C/- GGGGGGAGCT 3070 het 3070 hom 54 25 25 4 C 1 0 341953 CASAVA_Build 9 44060981 1D GTCTGCCTTC T/- CCCATAACAC 3070 het 3070 ref 60 22 23 17 T 1 0 341954 CASAVA_Build 9 44061751 5I TCTCCTGTCT -----/TGGCC TCCCGAGTAG 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 TGGCC 0 1 341955 CASAVA_Build 9 44063125 1D ATTTTTTTTT C/- CCACGTAGAC 2017 het 2017 ref 31 16 6 9 C 3 2 341956 CASAVA_Build 9 44063879 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAATAC 3070 het 2728 hom 32 12 12 8 A 8 7 341957 CASAVA_Build 9 44064547 8I GTTCTGTACC --------/CCTCCCGA CCTCCCGACA 3070 hom 48 het 19 0 13 6 CCTCCCGA 1 2 341958 CASAVA_Build 9 44065256 1I TGTATCTCAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 80 44 29 7 A 8 9 341959 CASAVA_Build 9 44066398 1I CAAAAAAAAA -/G GGGGGGGGGA 2337 het 6 hom 30 1 11 18 G 9 10 341960 CASAVA_Build 9 44066559 1D TCTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 191 hom 46 2 22 22 T 13 12 341961 CASAVA_Build 9 44067765 1D CCCTGTGCAA G/- AAAAGTAGTA 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 G 1 0 341962 CASAVA_Build 9 44067853 1I TGGCAAATTG -/T TTTTTTGCAT 3070 het 2181 hom 38 10 23 5 T 6 7 341963 CASAVA_Build 9 44069998 1I AAAGTCAATG -/A AAAAAAGAGA 3070 hom 40 het 24 0 14 10 A 6 7 341964 CASAVA_Build 9 44070452 1D ACATTGATCC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 64 het 25 0 22 5 A 9 8 341965 CASAVA_Build 9 44078513 6D CAGATCTCTT TTTTAA/------ AAGTTTAAGA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TTTTAA 1 0 341966 CASAVA_Build 9 44083720 1I CCTCCATCTA -/C CCCCAAACTT 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 C 4 5 341967 CASAVA_Build 9 44094069 1I TGCAGGCCTT -/A ACCTTCCAAT 1566 het 1566 ref 55 44 5 6 A 1 2 341968 CASAVA_Build 9 44094919 2D AGATCAAGTG GA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 GA 1 0 341969 CASAVA_Build 9 44111723 1I CACACTTTAT -/A AAAAAAACAC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 7 8 341970 CASAVA_Build 9 44113790 1I AAAGAAGATG -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 45 29 16 0 T 6 7 341971 CASAVA_Build 9 44117047 1I AGCTTCCCTT -/C CTCCCATCCT 3070 het 3070 ref 45 22 11 12 C 1 2 341972 CASAVA_Build 9 44117177 2I ATGGTACTGA --/GG GGGTCACGTT 1750 het 1750 ref 51 34 4 13 G 3 5 341973 CASAVA_Build 9 44133473 1D ATAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 19 1 12 6 A 13 12 341974 CASAVA_Build 9 44139531 1D ACTTAATAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 584 hom 39 2 31 7 A 10 9 341975 CASAVA_Build 9 44160515 5I TTGTTTTTTT -----/TTTTC TTTTTTGCTA 2596 hom 40 het 27 0 8 19 TTTTC 0 1 341976 CASAVA_Build 9 44161782 1D AGGGAAAGTG A/- ATATCTTTGT 3070 het 515 hom 38 3 29 7 A 2 1 341977 CASAVA_Build 9 44165686 1I TTGTTGTCCT -/G TTTTTTTCTT 2236 het 2236 ref 51 43 5 3 G 0 1 341978 CASAVA_Build 9 44166037 4D TTTGAACAAA TTAT/---- TTATTAGCTG 3016 het 3016 ref 35 27 7 2 TTAT 2 1 341979 CASAVA_Build 9 44180221 2I TTCATCTTGT --/AA AACTGAAATA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 A 2 4 341980 CASAVA_Build 9 44187026 20D AATAAGCACA TGCTACCAGAAAAGTGGCAC/-------------------- TGGTAGACTT 3070 hom 54 het 18 0 18 7 TGCTACCAGAAAAGTGGCAC 1 0 341981 CASAVA_Build 9 44189862 1D AATTAACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 629 hom 23 3 16 4 A 12 11 341982 CASAVA_Build 9 44197668 1D AGCATATAGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 806 hom 16 2 12 3 A 10 9 341983 CASAVA_Build 9 44198026 1D TTAAAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 11 10 341984 CASAVA_Build 9 44263602 1I CTCTTCCGCA -/G GGGAAACTAG 2258 het 2258 ref 32 18 8 6 G 3 4 341985 CASAVA_Build 9 44263825 1I AAAGATACAC -/A AATAGTAAGC 3070 het 3070 hom 86 35 37 17 A 2 3 341986 CASAVA_Build 9 44272785 1D TAAATTTGAA T/- TTTTTTAGCA 1437 het 1437 ref 13 9 3 1 T 7 6 341987 CASAVA_Build 9 44272871 2D CTGTTTTAAC AT/-- AAAATAAATG 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 AT 1 0 341988 CASAVA_Build 9 44365793 1I TATTCACTTT -/C CCCTAAGATC 1937 het 997 hom 8 2 4 2 C 3 4 341989 CASAVA_Build 9 44368188 1D TTTCACCTCC T/- TGGTTAAATT 2422 het 2422 ref 16 9 5 2 T 2 1 341990 CASAVA_Build 9 44375947 1D CCTTGACACC A/- AGTGGGTGGT 2454 het 2454 ref 31 18 9 5 A 2 1 341991 CASAVA_Build 9 44376856 2I TTTCATTCTC --/TT TTATTTTTCA 2883 het 2883 ref 23 13 7 3 T 2 4 341992 CASAVA_Build 9 44403179 1I AAATAATCAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 22 10 9 T 9 10 341993 CASAVA_Build 9 44426753 1D AAGATCTCAT G/- CACTGGGTTC 1932 het 1932 ref 10 5 4 1 G 1 0 341994 CASAVA_Build 9 44451250 1I TTCTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2389 hom 12 het 5 0 5 0 T 10 11 341995 CASAVA_Build 9 44463781 1D AGCACAGGGA T/- TTTGTTTAAT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 4 3 341996 CASAVA_Build 9 44482332 1I TCTGATTGGT -/A AAAAAGAGTC 2832 het 2832 ref 21 12 7 2 A 5 6 341997 CASAVA_Build 9 44530196 1I TGAAATTATA -/T TTTTTTGCAG 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 T 6 7 341998 CASAVA_Build 9 44676133 3D AGGGCTGTTC ACG/--- ACTTCTTCCT 1379 het 1379 ref 9 6 3 0 ACG 1 0 341999 CASAVA_Build 9 44679837 1D AGAAAATGGA T/- TTTTTTTGAA 2103 het 2103 ref 27 16 6 5 T 8 7 342000 CASAVA_Build 9 44681292 2D GTGGTTTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 65 42 19 4 TG 6 5 342001 CASAVA_Build 9 44684962 3I GACAGCTTAA ---/ATT AGGTTAGAAG 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 ATT 0 1 342002 CASAVA_Build 9 44686050 2I AAAGAATGCA --/AC AGTTTGTCTC 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 AC 0 1 342003 CASAVA_Build 9 44687245 1D ATGGAGAGAT G/- GGGGAATGGA 2170 het 2170 ref 19 13 5 2 G 5 4 342004 CASAVA_Build 9 44699163 2D GACTTAACAC AT/-- GTGCACACAG 2263 het 2263 ref 17 8 6 3 AT 1 0 342005 CASAVA_Build 9 44700337 1D AGGGGGACTT G/- GGGGTCTTTC 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 G 5 4 342006 CASAVA_Build 9 44700662 1D AGGGGACAAA G/- AATCCTATTA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 G 1 0 342007 CASAVA_Build 9 44708533 26D CTTCCTGCCT TTGCCTGGAGAGAATAACAATCTATA/-------------------------- GTCCAAACTC 1459 het 1459 ref 22 26 4 4 TTGCCTGGAGAGAATAACAATCTATA 1 0 342008 CASAVA_Build 9 44710240 4I AGAAAGAAAA ----/AAAG AAAGATGAAA 1419 het 1419 ref 20 11 7 2 AAAG 1 2 342009 CASAVA_Build 9 44713856 1I ACAAATACAG -/A CACATAGACC 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 A 0 1 342010 CASAVA_Build 9 44714122 2I AAACTAGGAA --/AC ACTCTTCTCA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 AC 1 2 342011 CASAVA_Build 9 44714879 2D CCAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 953 hom 20 4 13 4 A 13 11 342012 CASAVA_Build 9 44718113 1I ACTGGTTTTG -/T TTTTTTTGTT 2645 het 1082 hom 13 5 6 2 T 7 8 342013 CASAVA_Build 9 44722030 1I GGATGGTGTT -/A ATCTCAGTCC 3070 het 3070 hom 57 26 28 3 A 1 2 342014 CASAVA_Build 9 44724022 1D GGCAGGATCA G/- GGCATACTGC 1510 hom 15 het 6 0 5 1 G 3 2 342015 CASAVA_Build 9 44727366 1D CTGTCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 2910 het 389 hom 12 1 8 3 A 11 10 342016 CASAVA_Build 9 44733965 1I ATAAAACTTC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 8 9 342017 CASAVA_Build 9 44734442 1I GCTCACACCT -/G TAATCTCAAC 3070 het 3070 hom 33 10 21 2 G 0 1 342018 CASAVA_Build 9 44735907 2D GAGGTACCTC TG/-- GGCTGTGAGA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 TG 1 0 342019 CASAVA_Build 9 44738137 1I TGTAAGAAGG -/A GAAAGAAATT 3070 het 3070 ref 71 55 13 3 A 0 1 342020 CASAVA_Build 9 44739718 1I GTAAAATGCT -/C CAACACCAAG 3070 het 3070 ref 95 64 24 7 C 1 2 342021 CASAVA_Build 9 44742088 1I AACTTGTTGA -/C CTTATCTCTC 3070 het 3070 ref 58 44 10 4 C 1 2 342022 CASAVA_Build 9 44745419 1I CTAAAAACAG -/A AAAAATTAGC 2364 het 2364 ref 26 20 5 1 A 5 6 342023 CASAVA_Build 9 44745571 1D AGACTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 23 1 12 10 A 12 11 342024 CASAVA_Build 9 44749500 1I AACCTGCAAA -/G GTACCCTCCG 1870 het 1870 ref 39 27 4 8 G 1 2 342025 CASAVA_Build 9 44750204 2I ACTTGGGACT --/CA CACAGATTGG 1778 het 1778 ref 50 42 4 4 CA 2 3 342026 CASAVA_Build 9 44750409 1I CAAATGGAAG -/C CCCCTTCCCA 2032 het 2032 ref 48 34 7 7 C 4 5 342027 CASAVA_Build 9 44761189 3D TCCTTACACA AGG/--- ACTGGAGGGA 2586 het 2586 ref 41 33 7 1 AGG 1 0 342028 CASAVA_Build 9 44767409 2D CCCTATTTCC AA/-- AAGAGTTCAT 2793 het 2793 ref 68 56 7 8 A 4 2 342029 CASAVA_Build 9 44776031 3D26M3I CCTGGGTGAA CTTCTCTGCATCTCAGTTTCCTCATCTGT---/---CTCTGCATCTCAGTTTCCTCATCTGTATG ATGATGAGTG 1790 het 1790 ref 53 56 4 3 N/A 0 0 342030 CASAVA_Build 9 44786297 1D TTTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 8 7 T 13 12 342031 CASAVA_Build 9 44786430 1D TTGCTGTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 T 12 11 342032 CASAVA_Build 9 44787391 1D CTTAGGACAG A/- AAAAAAATCT 1280 het 1280 ref 27 20 3 4 A 8 7 342033 CASAVA_Build 9 44789566 1I TTATTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 255 het 255 ref 20 12 1 7 C 0 1 342034 CASAVA_Build 9 44792060 1D TCCTTTATTT G/- ATGGAGTCAT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 G 1 0 342035 CASAVA_Build 9 44794438 1D CTCCCTCTAC T/- TGGAATACTC 2049 het 2049 ref 30 22 5 3 T 2 1 342036 CASAVA_Build 9 44797163 1I ATGTAAGCTG -/A GCTGTGGAGG 3070 het 3070 ref 61 41 13 7 A 0 1 342037 CASAVA_Build 9 44801693 1D CACTACTGGA G/- GTATCTGCCT 1339 het 1339 ref 44 35 3 6 G 2 1 342038 CASAVA_Build 9 44828558 1I TAATAGTCTC -/A AAACATAGGG 3070 hom 48 het 18 0 15 3 A 3 4 342039 CASAVA_Build 9 44830101 1D CAAACCAAAA T/- CGAGGTAAAT 3070 het 3070 ref 50 23 19 10 T 1 0 342040 CASAVA_Build 9 44830491 2D AGCCACACAC AG/-- ATATCCACGA 1315 het 1315 ref 38 18 5 16 AG 1 0 342041 CASAVA_Build 9 44831680 1I GGCCTATAGT -/G GAAACACCAA 1359 het 1359 ref 39 35 3 1 G 1 2 342042 CASAVA_Build 9 44832717 4I GCCTATAGTA ----/AAAC AAACAAATAA 1902 het 1902 ref 29 21 4 4 AAAC 1 2 342043 CASAVA_Build 9 44835157 9I AAAGTAGAAA ---------/GAAGATATC TGTGAAAATG 3070 het 3070 ref 48 36 11 1 GAAGATATC 0 1 342044 CASAVA_Build 9 44836630 2D CTGTCTTTGT AG/-- AGTATATGAA 1841 het 1841 ref 34 30 4 1 AG 2 1 342045 CASAVA_Build 9 44837477 14I GCGGGATTGA --------------/AGCACTCTTTTTGT AGAATCTACA 2623 het 2623 ref 36 28 6 2 AGCACTCTTTTTGT 0 1 342046 CASAVA_Build 9 44838067 1D AAAAACTAGA G/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 G 1 0 342047 CASAVA_Build 9 44842783 1D TGCTTAAGCA C/- ATATATCCAC 2299 het 2299 ref 38 29 5 6 C 1 0 342048 CASAVA_Build 9 44912613 1D AAGAAATTTG C/- ATTAGAAATG 3070 het 2739 hom 21 9 11 2 C 1 0 342049 CASAVA_Build 9 44954966 2I CTTTCAGCTA --/TC CCCCCCCCCA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 TC 0 1 342050 CASAVA_Build 9 44976497 1I AGTCCCTGCT -/C TGATACCAAA 2811 hom 21 het 9 0 8 1 C 0 1 342051 CASAVA_Build 9 44992537 14D GGAGGTAGTT GAATCTTTAGAGCC/-------------- GGTCTTTCCC 3070 het 1026 hom 12 3 8 1 GAATCTTTAGAGCC 1 0 342052 CASAVA_Build 9 44993847 1I CCACTGCATG -/A AGACATTATG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 2 342053 CASAVA_Build 9 44998910 3D ATGGGCTTAG AGT/--- AGGGACTGCA 1920 het 1920 ref 20 15 4 3 AGT 1 0 342054 CASAVA_Build 9 45020178 1D29M1D CTCTCAAATT AAAAAAAAAATTTAAAAAAGAGTGTGTTTGT/-AAAAAAAATTTTAAAAAAGAATGTGTTTG- TGGGGGGGGG 1358 het 1358 ref 35 32 3 6 N/A 0 0 342055 CASAVA_Build 9 45045614 3D GGATGATGAA TGG/--- TGGATGGATG 613 het 613 ref 11 5 5 1 TGG 2 1 342056 CASAVA_Build 9 45057600 1D ACTGCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 20 0 14 6 T 13 12 342057 CASAVA_Build 9 45069260 4D ATGTAAACTG CACA/---- CACAAACTAT 3070 het 3070 ref 83 55 21 16 CA 4 2 342058 CASAVA_Build 9 45092442 5D ATGTTTATAA TTAAG/----- TTAAAAGGGT 1447 het 1447 ref 8 5 3 2 TTAAG 1 0 342059 CASAVA_Build 9 45105905 1D ACTTTCCTGA C/- TTTTTCATTG 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 C 1 0 342060 CASAVA_Build 9 45242943 2I ATAAACGCAT --/TA CACGTACAAT 3070 het 3070 ref 56 34 15 7 TA 0 1 342061 CASAVA_Build 9 45244631 1I CATTAGAAAT -/A AAAAAACAGA 2223 het 2223 ref 69 50 5 14 A 6 7 342062 CASAVA_Build 9 45246303 1I CCCAGGTGGT -/G GAGCATGGCC 2638 het 2638 ref 31 12 12 7 G 1 2 342063 CASAVA_Build 9 45249033 8I CTAAGTTTTG --------/TTTGTTTT TTTGTTTGTT 2273 het 2273 ref 35 12 7 16 TTTGTTTT 0 1 342064 CASAVA_Build 9 45252785 3D CTTCAGCCTG TTC/--- TTCTTCAGTC 3070 het 3070 ref 77 61 9 9 TTC 3 2 342065 CASAVA_Build 9 45254016 1I CTAAGGACCC -/T CCCTCCCCAC 1401 het 1401 ref 84 69 4 11 T 0 1 342066 CASAVA_Build 9 45255256 1D AGTGATATAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 44 29 9 6 T 8 7 342067 CASAVA_Build 9 45255422 5D ACTTATGTAA TTATC/----- TTATAGAATG 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 TTATC 1 0 342068 CASAVA_Build 9 45255721 1I GTGGCAAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1092 hom 34 3 28 3 T 10 11 342069 CASAVA_Build 9 45256010 2I CATTTTTTCA --/CT CTCATACACC 3070 het 3070 ref 61 29 24 9 CT 1 2 342070 CASAVA_Build 9 45256952 1D TTCACTGTAA C/- CTTACTCCTG 3070 het 3070 ref 51 37 11 3 C 2 1 342071 CASAVA_Build 9 45257736 4D TAGATTTCCT GAGA/---- GAGAGGATGA 3070 het 3070 ref 83 65 14 4 GA 4 2 342072 CASAVA_Build 9 45258111 2I CACAAATGAC --/TG TTTTATAGTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TG 0 1 342073 CASAVA_Build 9 45259286 1D AAGAACAGGC A/- AGCAGCATTA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 2 1 342074 CASAVA_Build 9 45259466 1I CATTCTGTGC -/A AAAATAGGCA 3070 het 3070 ref 76 36 36 4 A 4 5 342075 CASAVA_Build 9 45266751 1D TTAATGACCT A/- GCTCCTGCGG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 1 0 342076 CASAVA_Build 9 45267342 1I17M1I TACAGAATTA -ACACAACTATGGCGTTA-/GACACAACTATGGCATTAT TTTTTTGTAC 2711 het 2711 ref 64 57 6 13 N/A 0 0 342077 CASAVA_Build 9 45267993 2D AAACTCTCAC AA/-- AAAAATGTAT 3070 het 3070 hom 75 13 47 16 A 7 5 342078 CASAVA_Build 9 45268057 4D TAGATGTAAA AAAC/---- AAACAATGTG 3070 het 1729 hom 27 6 14 7 AAAC 2 1 342079 CASAVA_Build 9 45268615 7D CTAATGCTAT CCCTCCC/------- CCCTCCCCCC 3040 het 3040 ref 29 19 9 3 CCCTCCC 2 1 342080 CASAVA_Build 9 45268825 10I25M2D TATGGCTGCA ----------TGGTATTCCATATTCTTTCCACACATT/TAATAAAATTTTTTATTCCATATTCTTTCCACACA-- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 69 41 16 36 N/A 0 0 342081 CASAVA_Build 9 45281916 1D TGTGTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 2468 hom 20 het 10 0 5 6 A 12 11 342082 CASAVA_Build 9 45283389 2D7M3I TCAGACTCTC TGAGGAATG---/--AGGAATGTTT TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 74 45 26 7 N/A 0 0 342083 CASAVA_Build 9 45285123 1I ATTTTATAGA -/T TTTTGTCTTT 3070 het 3070 ref 77 55 15 8 T 4 5 342084 CASAVA_Build 9 45285257 1D43M1I TAACATGATT CCTGAGGAATTACTCAATTGTTAATTGTTTCTGCCTTCTCTACC-/-TTGAGGAATTACTCAATTGTTAATTGTTTCTGCCTTCTCTACCA AAATGACTAA 3070 het 3070 hom 79 26 38 44 N/A 0 0 342085 CASAVA_Build 9 45293294 1I CCACAAAAAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 72 het 45 0 24 21 A 7 8 342086 CASAVA_Build 9 45296428 1D CCAATTTCTC T/- CTTTTGTAAT 3070 het 3070 ref 82 55 24 3 T 1 0 342087 CASAVA_Build 9 45297342 2I AAATAAATAT --/AG AGACAAACAT 3070 het 3070 ref 38 27 9 2 AG 1 2 342088 CASAVA_Build 9 45298256 1I AAACTTTGTG -/A ACTTCAATTC 3070 het 3070 ref 49 24 19 7 A 1 2 342089 CASAVA_Build 9 45300096 5D CTTATTGGAA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 11 12 T 17 12 342090 CASAVA_Build 9 45302594 1D TCAACCTCCT G/- AACACTGAAT 2926 het 2926 ref 18 12 6 0 G 1 0 342091 CASAVA_Build 9 45302757 2D AGCAGTATAT TG/-- TGTGTTTTTT 3070 het 996 hom 69 13 16 42 TG 3 2 342092 CASAVA_Build 9 45304289 1I AGAACAGCAT -/G GGGGAAACTG 3070 het 3070 ref 54 34 16 5 G 4 5 342093 CASAVA_Build 9 45306605 1D TCATTTCATG A/- AAAAAAGCCT 3070 het 3070 ref 79 62 10 8 A 7 6 342094 CASAVA_Build 9 45307049 4I ATTTACCTTC ----/TGCT ATCAAGCATT 3070 het 3070 ref 31 21 9 1 TGCT 0 1 342095 CASAVA_Build 9 45307507 1D AGGAAATTAT A/- CTGCTAATGT 2605 het 2605 ref 78 62 6 11 A 1 0 342096 CASAVA_Build 9 45307960 2D23M1D TTTACTGATC ATTTTTACCTTACACCAAGTGATCTC/--GTTTACCTTACACCAAGTGATCT- CAGCTCGTGG 3070 het 3070 ref 77 96 17 21 N/A 0 0 342097 CASAVA_Build 9 45308789 9D GTAAGAAAGC AAAGATAAG/--------- AAAGATAAGA 3070 het 3070 ref 85 70 17 13 AAAGATAAG 2 1 342098 CASAVA_Build 9 45310924 2D38M1D AGTGATAACA TTTGTTATGTATAAAATGATTTCAATCTCAGTTAAAAATAT/--CGTTATGTATAAAATGATTTCAATCTCAGTTAAAAATA- TTTTTGCATA 3070 het 3070 hom 48 24 21 50 N/A 0 0 342099 CASAVA_Build 9 45315349 4I TTTGTTTGTT ----/TGTC TGTTTTGAGA 3070 het 2038 hom 20 7 9 4 TGTC 0 1 342100 CASAVA_Build 9 45315412 1D GTGATCTGGG C/- TCACTGCAAG 3070 het 1474 hom 16 4 7 5 C 1 0 342101 CASAVA_Build 9 45317349 9I ATATCCACCT ---------/GGAGCCCAA GGACCCTTCT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 GGAGCCCAA 0 1 342102 CASAVA_Build 9 45320037 1I GGATATGAGG -/C CCCCAAGTGG 2276 het 2276 ref 62 51 6 5 C 4 5 342103 CASAVA_Build 9 45324416 1I AGGCCCTGTG -/T TTGACTACCT 1675 het 1675 ref 36 26 5 5 T 2 3 342104 CASAVA_Build 9 45325312 1D TTTCGTCCGT G/- GGGGACCCAG 1886 het 1886 ref 67 40 8 20 G 5 4 342105 CASAVA_Build 9 45325345 1D GGCGGCGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 72 24 13 36 T 11 10 342106 CASAVA_Build 9 45325538 7I TCCGTGGCGC -------/GGTTGTT GTTTTTTTTT 923 het 923 ref 51 29 3 19 GGTTGTT 0 1 342107 CASAVA_Build 9 45330772 1I AGGTCTCCTG -/T TTTTTTTTCT 1630 het 1630 ref 35 26 4 5 T 8 9 342108 CASAVA_Build 9 45336076 1D TACACTTTAG A/- AAAAAAATAG 2989 het 2989 ref 30 19 9 2 A 8 7 342109 CASAVA_Build 9 45338921 1I AAATGAGAGG -/T GTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 T 0 1 342110 CASAVA_Build 9 45340299 3D ACCACCTTAA TCT/--- TTTTTTTTCT 2237 het 2237 ref 50 37 6 7 TCT 1 0 342111 CASAVA_Build 9 45340453 5I TGTCAGCATC -----/TCTTT TCTTTAGTTT 869 het 869 ref 38 31 2 5 TCTTT 1 2 342112 CASAVA_Build 9 45342353 2D ATGAGCCAAA AC/-- ATCATACTAA 1544 het 1544 ref 31 23 4 4 AC 1 0 342113 CASAVA_Build 9 45343820 2I TTGATGAAAC --/AT GGTGTTTGTG 3070 het 3070 ref 51 38 9 4 AT 0 1 342114 CASAVA_Build 9 45344486 2D TACCAGACTC TT/-- ACATCATTTG 3070 het 3070 hom 37 14 20 4 T 2 0 342115 CASAVA_Build 9 45344549 5D TTAATAGTAC TTTTA/----- TTTTAATTTT 2340 het 2340 ref 48 42 5 6 TTTTA 2 1 342116 CASAVA_Build 9 45346222 1I TTATTGTCAT -/G TAATTTATTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 G 0 1 342117 CASAVA_Build 9 45347342 1D AAGAAATAAA G/- GGTACCCAAA 3070 het 3070 ref 43 22 10 14 G 3 2 342118 CASAVA_Build 9 45349825 6I TTTAAAGGCA ------/TTCAGT TTCATTTTAT 3070 het 3070 ref 82 52 22 8 TTCAGT 0 1 342119 CASAVA_Build 9 45355205 2D TAAATGAAAG TC/-- TGTGTTTGTA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 TC 1 0 342120 CASAVA_Build 9 45357007 1D ATCATTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1681 het 1681 ref 11 5 4 2 A 11 10 342121 CASAVA_Build 9 45362751 2D ACAAAGAGAG AA/-- AATAAGCTAT 3070 het 3070 ref 64 48 8 10 A 4 2 342122 CASAVA_Build 9 45362937 1I GCTAGATCAG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 41 27 10 4 A 6 7 342123 CASAVA_Build 9 45365634 1I AGTTACCCAG -/T TAAAATTTTC 1346 het 1346 ref 41 31 3 7 T 1 2 342124 CASAVA_Build 9 45380793 1D TAACATAGAC T/- TTTTTTAACC 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 T 7 6 342125 CASAVA_Build 9 45387214 2D TGTATATGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CA 6 5 342126 CASAVA_Build 9 45394895 4I GAAATAAAAA ----/AGTT AGTACGGTTG 3070 het 446 hom 14 1 8 5 AGTT 0 1 342127 CASAVA_Build 9 45394939 1I25M1I CTGTGTGCAT -CCCTTATATAGAGATTATTTTAATT-/CCCCTTATATAGAGATTCTTTTAATTA AAAAAAATCA 3070 het 893 hom 27 2 17 8 N/A 0 0 342128 CASAVA_Build 9 45395972 3D CCTCTACAGA ATT/--- ATTATATGAA 2949 het 1118 hom 9 3 6 0 ATT 2 1 342129 CASAVA_Build 9 45399734 5D TCTGCATAAC TTTCA/----- TTTATCTTCT 1405 hom 10 het 4 0 4 4 TTTCA 1 0 342130 CASAVA_Build 9 45399845 1D ATAGAACTAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 252 hom 16 1 13 2 T 9 8 342131 CASAVA_Build 9 45400581 2I TAATAAGAGC --/AT ATATATATAT 1686 het 1686 ref 34 27 4 3 AT 5 6 342132 CASAVA_Build 9 45407026 8I ATAGATAGAT --------/AGGTGATA GATAGATAGA 1471 hom 7 het 4 0 3 1 AGGTGATA 0 1 342133 CASAVA_Build 9 45413546 4D TGTCTATTGT TTGA/---- TTGATTTCTT 1799 het 1799 ref 65 55 4 6 TTGA 2 1 342134 CASAVA_Build 9 45413683 1D GGAGAGCTAA G/- GGACAGAATT 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 G 3 2 342135 CASAVA_Build 9 45417613 5I TAAAGTTATC -----/ATATA ATATGAGCTA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 ATATA 0 1 342136 CASAVA_Build 9 45423509 1I AATTTTTTTT -/A AATTTGTTCA 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 A 2 3 342137 CASAVA_Build 9 45433612 5I ACATTATAAA -----/TTTTT TTTTTAGACT 3070 het 3070 ref 70 51 13 6 T 5 10 342138 CASAVA_Build 9 45442732 1D GGGCTTTTAC T/- TGGGCATCAG 1430 het 1430 ref 19 10 3 6 T 2 1 342139 CASAVA_Build 9 45456081 1I TCAGGTCTTT -/A AAAAATATAG 3070 het 2732 hom 14 6 7 1 A 5 6 342140 CASAVA_Build 9 45474543 6I GTATATCTGC ------/ATAAAT ATAAAGACTT 2916 het 2916 ref 18 11 6 1 ATAAAT 0 1 342141 CASAVA_Build 9 45492813 2I AGTGAACCTC --/CA CACACACACA 2416 het 2416 ref 58 39 8 11 CA 5 6 342142 CASAVA_Build 9 45495178 1I TATAAGTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 56 22 11 23 A 10 11 342143 CASAVA_Build 9 45496699 1I AAAATTCTAG -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 73 39 9 25 A 7 8 342144 CASAVA_Build 9 45511363 2D GAGCTATAAC TG/-- TGACCAGTGC 1873 het 1873 ref 30 25 4 3 TG 2 1 342145 CASAVA_Build 9 45519677 1D TTTCTGAAAA T/- GTGACTATTT 1808 het 1808 ref 45 37 4 4 T 1 0 342146 CASAVA_Build 9 45521409 4D ACCTTAGAGC ACCT/---- ACCTAACAGG 1438 het 1438 ref 39 34 4 2 ACCT 2 1 342147 CASAVA_Build 9 45522899 1D TTTCCTTCCT G/- CCACAATGTG 3070 het 3070 ref 25 17 8 1 G 1 0 342148 CASAVA_Build 9 45540632 3D AAACAACAAC AAA/--- AAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 77 29 41 8 A 9 6 342149 CASAVA_Build 9 45540725 3D32M4I ACACTTAAAC AGAAGAAGACAAAGATGATAAAAAAAAGAAAAGGA----/---AGAAGACAAAGATGATAAAAAAAAGAAAAGGAAAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 32 22 22 16 N/A 0 0 342150 CASAVA_Build 9 45557934 1I TTTTCATTGC -/A GTTAACATTT 403 het 403 ref 21 7 3 11 A 0 1 342151 CASAVA_Build 9 45566812 5I CATAAACTTG -----/AAATT AAATTAGATT 2443 het 1470 hom 9 3 5 1 AAATT 1 2 342152 CASAVA_Build 9 45586569 1I AAACATAACC -/A AAACATAAGT 3070 het 3070 ref 40 25 11 4 A 3 4 342153 CASAVA_Build 9 45587665 1I AACAAAACAG -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 ref 67 38 27 2 A 6 7 342154 CASAVA_Build 9 45591769 5D GTCTCATCTG AGACA/----- AGACAAGTCC 1723 het 1723 ref 49 39 5 8 AGACA 2 1 342155 CASAVA_Build 9 45592110 1I GCATCTGAGG -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 ref 86 49 20 17 T 7 8 342156 CASAVA_Build 9 45592272 1D CTCCATGATC A/- CCCCCCCTCC 1655 het 1655 ref 64 49 7 9 A 1 0 342157 CASAVA_Build 9 45593357 1I TTAACAAAAG -/A AAAAAAAAGC 2478 het 2478 ref 63 47 7 9 A 8 9 342158 CASAVA_Build 9 45593495 4I CAGTAGGCAG ----/ATAA ATAAATATAA 3070 het 3070 ref 82 68 8 6 ATAA 1 2 342159 CASAVA_Build 9 45594772 1D AAAACTATTT A/- TTCTGTAATA 3070 het 3070 ref 46 29 8 9 A 1 0 342160 CASAVA_Build 9 45598729 1D ATGCTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 89 63 15 12 A 11 10 342161 CASAVA_Build 9 45599383 1I ATCAAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 73 43 14 16 A 10 11 342162 CASAVA_Build 9 45599401 1D AAGAAATTTG C/- ATTAGAAATG 3070 het 3070 ref 79 48 11 21 C 1 0 342163 CASAVA_Build 9 45601350 1I AATAGACATA -/T TATTATTTAT 3070 het 3070 ref 37 24 8 5 T 1 2 342164 CASAVA_Build 9 45601902 1I TGTATCCTGA -/C AGTCCTGAAG 1672 het 1672 ref 77 67 4 6 C 0 1 342165 CASAVA_Build 9 45606774 1D GTAGCAGGGG A/- GTGATAACAG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 1 0 342166 CASAVA_Build 9 45609500 2D TAATTTTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 64 23 13 29 T 14 12 342167 CASAVA_Build 9 45610904 1D AAACAACAAC A/- AAAAAGAACC 3070 het 3070 ref 74 52 17 5 A 6 5 342168 CASAVA_Build 9 45611118 1D AGGCAACAAC A/- AAAGATCCAA 3070 het 3070 ref 76 43 24 9 A 4 3 342169 CASAVA_Build 9 45611198 1I ATAGTGCTTC -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 66 55 7 4 A 7 8 342170 CASAVA_Build 9 45611629 1D GATTAAATTG C/- CCCCCCCCCA 3070 het 464 hom 11 2 9 0 C 10 9 342171 CASAVA_Build 9 45615249 4I TATATATATA ----/TCTC TCTCTAAATA 2479 hom 12 het 5 0 5 0 TC 2 4 342172 CASAVA_Build 9 45616210 1I TCTTTCCACA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 8 9 342173 CASAVA_Build 9 45617505 32D TGTGTGTGTG TGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTT/-------------------------------- TCTGTGTGTG 1923 het 541 hom 16 8 13 12 TGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTT 1 0 342174 CASAVA_Build 9 45638499 1I GAAAGGAGAG -/A AATGAGCAGA 2311 hom 12 het 5 0 5 0 A 2 3 342175 CASAVA_Build 9 45638714 1I TATTTCTGCA -/C CCCCCTGACC 3070 het 1809 hom 13 4 8 1 C 5 6 342176 CASAVA_Build 9 45654658 1I TCAGCCCCCC -/T TAACCGCACA 2449 het 2449 ref 48 33 6 9 T 1 2 342177 CASAVA_Build 9 45655176 1I TTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 2040 het 2040 ref 27 11 9 7 A 13 14 342178 CASAVA_Build 9 45671548 1D GTACCACTCA C/- CCCCCCCAAT 2954 het 453 hom 15 2 6 7 C 8 7 342179 CASAVA_Build 9 45674418 3D CTCCCTCCAG TCC/--- TTGTGTAAGG 1636 het 1636 ref 24 19 4 3 TCC 1 0 342180 CASAVA_Build 9 45700977 1D AAATTCCAAT A/- ATTTTTTTTT 2123 het 75 hom 8 2 6 0 A 2 1 342181 CASAVA_Build 9 45756018 2D CATGCAGTGC TT/-- GTCTTTCTGT 1434 het 1434 ref 14 10 3 1 T 2 0 342182 CASAVA_Build 9 45770939 24D TGTATGTATG TATGTATGTATGTATGTATGTATT/------------------------ TATTTTGAGA 1867 het 1867 ref 32 21 4 8 TATGTATGTATGTATGTATGTATT 1 0 342183 CASAVA_Build 9 45776398 3I CTTTTGTAAG ---/TAA TAATATCATG 3070 het 3070 ref 55 30 18 7 TAA 1 2 342184 CASAVA_Build 9 45777525 4D AATTAGTGAC ATTA/---- ATTGTTTTAT 1458 het 997 hom 5 2 3 0 ATTA 1 0 342185 CASAVA_Build 9 45786086 1D ATAGAACTAC T/- TTTTTTTTCT 790 het 790 ref 29 23 2 4 T 9 8 342186 CASAVA_Build 9 45793271 4I ATAGATAGAT ----/GATA GATAGATAGA 3070 het 3070 ref 26 15 8 3 GATA 4 5 342187 CASAVA_Build 9 45796594 1I AGTTGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 10 11 342188 CASAVA_Build 9 45800457 1I AAGGTGATAG -/A TATGCTAATT 1655 het 1655 ref 10 6 4 0 A 0 1 342189 CASAVA_Build 9 45809754 1I AATTTTTTTT -/A AATTTGTTCA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 2 3 342190 CASAVA_Build 9 45839865 2D TAATTATTAG GT/-- TTTTTTTTAT 2217 het 2217 ref 43 36 5 2 GT 1 0 342191 CASAVA_Build 9 45842327 1I TCAGGTCTTT -/A AAAAATATAG 1884 het 1884 ref 15 11 4 0 A 5 6 342192 CASAVA_Build 9 45845324 1D ACTGAATGAG T/- TAGTGGTCAA 1839 het 1839 ref 28 22 4 2 T 2 1 342193 CASAVA_Build 9 45867967 1D GAAGGAGCAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 20 8 8 4 A 9 8 342194 CASAVA_Build 9 45871547 3D CTCAAGTAGC CTT/--- CTTCTATTTC 3070 het 3070 ref 29 20 9 0 CTT 2 1 342195 CASAVA_Build 9 45879065 2I AGTGAACCTC --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 51 26 15 10 CA 5 6 342196 CASAVA_Build 9 45879229 2D CCTCAAAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 18 9 29 A 12 10 342197 CASAVA_Build 9 45881087 4D TTGTTCTAAC AATT/---- AGTTAGAACA 3070 het 3070 ref 40 25 12 5 AATT 1 0 342198 CASAVA_Build 9 45886785 4D TTTTATTTTA TTTT/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 44 30 9 19 T 9 5 342199 CASAVA_Build 9 45888843 1I TTGGGGAAAA -/C AACACCCTCT 3070 het 3070 ref 71 48 20 3 C 0 1 342200 CASAVA_Build 9 45893430 1D TCTATTTCCA T/- TTTTTTTCAC 1586 het 623 hom 11 2 4 7 T 8 7 342201 CASAVA_Build 9 45909092 1D TTTCCTTCCT G/- CCACAATGTG 3070 het 3070 ref 74 56 14 6 G 1 0 342202 CASAVA_Build 9 45909317 7D TTATTTTTAC ATTGACT/------- ATTGTCTATC 2929 het 2929 ref 50 36 7 8 ATTGACT 1 0 342203 CASAVA_Build 9 45920797 1D AAAGAAAAAA C/- GTGGGTCATG 3070 het 2748 hom 38 7 24 7 C 1 0 342204 CASAVA_Build 9 45920842 4D ATCATGTCAC AAAT/---- AGATAAGCTA 3070 het 3070 ref 58 29 10 21 AAAT 1 0 342205 CASAVA_Build 9 45924100 1D TATCATAACC T/- GTACCTTCAA 3070 het 3070 hom 51 11 29 13 T 1 0 342206 CASAVA_Build 9 45926516 1D CAGGTTGAAT C/- CCCATCCCTT 3070 het 3070 ref 60 33 16 13 C 4 3 342207 CASAVA_Build 9 45931102 1I ACTGATGGTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 T 9 10 342208 CASAVA_Build 9 45931386 1I TACAATATAA -/T TTTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 25 7 17 1 T 6 7 342209 CASAVA_Build 9 45931770 3I TTTTGAAATC ---/ATT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 81 56 21 4 ATT 0 1 342210 CASAVA_Build 9 45937340 1I GTTTTTTTTT -/A TTTTAATTTT 3070 het 3070 hom 54 22 19 13 A 0 1 342211 CASAVA_Build 9 45937489 2I TGAGAAAGAC --/AT AAAATTTGGG 3070 het 3070 ref 32 13 7 12 AT 0 1 342212 CASAVA_Build 9 45939369 4I AAGGATTTGA ----/ATAG ATAGTGTTTT 3070 het 3070 hom 56 15 38 3 ATAG 1 2 342213 CASAVA_Build 9 45968624 1D TTTTTTTTTT C/- CCCCTATGGT 3070 het 3007 hom 30 15 13 2 C 5 4 342214 CASAVA_Build 9 45997985 1D TGTGAGGGGT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 2079 hom 30 11 9 10 G 10 9 342215 CASAVA_Build 9 46000192 1I CAGTAAGTCC -/A AAAAAAAAGG 2328 het 2328 ref 27 16 7 4 A 8 9 342216 CASAVA_Build 9 46000355 1D AAATGCAACC T/- TAACTATTGC 2150 het 2150 ref 59 49 5 5 T 2 1 342217 CASAVA_Build 9 46008101 3I GGGCCGACTC ---/GTT CTCCCCTCCT 3070 het 1958 hom 36 9 24 3 GTT 0 1 342218 CASAVA_Build 9 46009461 7D TAAAAAAAAA AAAAAAC/------- ACACACACAC 3023 het 3023 ref 47 22 17 11 AAAAAAC 1 0 342219 CASAVA_Build 9 46013893 2I GGGAGGAGGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 A 9 11 342220 CASAVA_Build 9 46015745 1I CTTTTCGAGG -/T TTTTTTTTTA 1343 hom 10 het 5 0 4 1 T 9 10 342221 CASAVA_Build 9 46025041 1I TATTTCTGCA -/C CCCCCTGACC 3070 het 3070 hom 20 9 11 0 C 5 6 342222 CASAVA_Build 9 46032131 1D CATCATTTTT A/- TATTAAGTTG 3070 het 3070 hom 28 9 16 4 A 1 0 342223 CASAVA_Build 9 46032302 5I TAAACATGTC -----/TTTTT TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 7 12 342224 CASAVA_Build 9 46094131 7D ACTGCGTCTC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 334 het 334 ref 53 28 3 26 A 18 11 342225 CASAVA_Build 9 46096570 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 48 31 11 6 A 10 9 342226 CASAVA_Build 9 46096750 3D GAATCCATCT AAA/--- AAAAAAAAAA 1868 het 1868 ref 25 16 5 5 A 14 11 342227 CASAVA_Build 9 46102123 2I ACGGGTGTCT --/GA GAGATAACCC 2554 het 2554 ref 58 47 7 4 GA 2 3 342228 CASAVA_Build 9 46105749 1I AACACTTTAT -/G GTGCCAGAAA 1456 hom 7 het 3 0 3 0 G 1 2 342229 CASAVA_Build 9 46169731 1I CTCCTGAACT -/C CCCCTTCATC 2122 het 2122 ref 48 30 7 11 C 4 5 342230 CASAVA_Build 9 46174158 1I GTGGAGACAG -/A GAAACTAAGG 3070 het 3070 ref 74 64 7 3 A 0 1 342231 CASAVA_Build 9 46174731 4I CTCCTTCTGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 TTTG 3 4 342232 CASAVA_Build 9 46191450 2D GAAACAAGAG AA/-- AAAAAAAACA 2577 het 651 hom 10 2 6 2 A 10 8 342233 CASAVA_Build 9 46194859 4I AATTCTGGAG ----/GACA GATCAGGGAG 1379 het 1379 ref 24 20 3 1 GACA 0 1 342234 CASAVA_Build 9 46232261 1D CTGTCTTTTT A/- AAAAACAACC 3070 het 3070 ref 58 34 20 5 A 6 5 342235 CASAVA_Build 9 46233031 4I CATGGAGTGG ----/ATGA ATGAATGTCT 3070 het 3070 ref 64 46 11 7 ATGA 1 2 342236 CASAVA_Build 9 46251188 1D CCTTTTTTCC T/- TTCTCCTTTT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 3 2 342237 CASAVA_Build 9 46251254 1D ATGTAATATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 2678 hom 20 6 11 3 A 9 8 342238 CASAVA_Build 9 46266762 1I GACAGGCACT -/G AGAGATCCAT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 G 0 1 342239 CASAVA_Build 9 46281894 4I GGTTAATCAG ----/CACA CACAAAAAAA 1438 hom 7 het 3 0 3 0 CA 2 4 342240 CASAVA_Build 9 46288005 2I CAAGCAAGAA --/AG AGGGGATAAT 3070 het 3070 hom 48 11 35 2 AG 1 2 342241 CASAVA_Build 9 46306464 3I ACTTGAGGAC ---/ACA ACATTTAGAG 3070 het 1366 hom 11 3 8 0 ACA 1 2 342242 CASAVA_Build 9 46329254 1D TGCTTAACAT G/- TTACTTATTT 2837 het 2837 ref 27 21 6 0 G 1 0 342243 CASAVA_Build 9 46418203 4D TAGGATTAAA AAAC/---- AAACAAACAA 2977 het 1397 hom 10 3 7 0 AAAC 4 3 342244 CASAVA_Build 9 46439624 2D AGTGATCTGG AC/-- ACACAGTTTG 2434 het 2434 ref 14 5 5 4 AC 3 2 342245 CASAVA_Build 9 46472810 3I AAACTTGAGC ---/CAT TATTATCAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 CAT 0 1 342246 CASAVA_Build 9 46487146 2D30M1D AAAAACAAAA ACACACACACACAAATAAAAACTAACTGCAGAC/--ACACATACACAAATAAAAACTAACTGCAGA- AAAATATAAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 342247 CASAVA_Build 9 46497239 4I ATGTCACAAA ----/TAGG TAAGCTAATT 1938 het 1938 ref 20 9 4 7 TAGG 0 1 342248 CASAVA_Build 9 46520872 5D AAATCTATTT TTTTC/----- TTTTAACAAA 2394 het 2394 ref 31 20 7 10 TTTTC 1 0 342249 CASAVA_Build 9 46602355 2I GCTCGCCACC --/CT CTCTTTCCCC 2092 het 2092 ref 32 12 8 12 CT 2 3 342250 CASAVA_Build 9 46604930 1D AGTTTGTGGT G/- GGGGGGGGCA 907 het 5 hom 9 0 3 7 G 9 8 342251 CASAVA_Build 9 46613726 1I ACATAGATCT -/G GGAAAAAAAA 3070 het 1472 hom 46 9 27 10 G 2 3 342252 CASAVA_Build 9 46681900 1I CAAAAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 9 10 342253 CASAVA_Build 9 46708983 1I TAGCAAAAAA -/G AAAAAAAACA 940 het 940 ref 32 26 3 3 G 0 1 342254 CASAVA_Build 9 46713700 1I CTGTTGAAAG -/A AAAAAGCCAG 2640 het 1735 hom 14 5 7 2 A 5 6 342255 CASAVA_Build 9 46714010 4D AAACAAAAAT TAAC/---- TACCGAACTA 3070 het 3070 ref 48 40 7 4 TAAC 1 0 342256 CASAVA_Build 9 46719763 1D TCCCTGGGGA T/- ACCAAAACCC 1865 het 1865 ref 47 35 5 7 T 1 0 342257 CASAVA_Build 9 46740843 4I AAAACACTGT ----/GAAG TTTGAGTAGA 3070 het 3070 ref 74 52 16 6 GAAG 0 1 342258 CASAVA_Build 9 46747440 4I GTAATCATTT ----/TAAG TAAGTAAGTG 3070 het 3070 ref 53 22 11 20 TAAG 2 3 342259 CASAVA_Build 9 46775145 2D ATGTGTAGAT GA/-- GAGTATATAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 GA 2 1 342260 CASAVA_Build 9 46954299 1D TCCTCAGCCT C/- CCTCAAGGAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 C 3 2 342261 CASAVA_Build 9 46956835 1I GAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 2633 het 2633 ref 40 34 6 0 A 9 10 342262 CASAVA_Build 9 46961182 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 1394 hom 7 het 3 0 3 0 A 12 11 342263 CASAVA_Build 9 46976785 2D ACACATAAAC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 96 73 8 18 CA 6 5 342264 CASAVA_Build 9 46976991 2D ACACACACAC AT/-- ATAAACCACA 3019 het 3019 ref 89 70 8 11 AT 2 1 342265 CASAVA_Build 9 46977483 4I TTCATAAACT ----/ACAC ACACAAACTA 3070 het 3070 ref 82 61 8 13 AC 2 4 342266 CASAVA_Build 9 46986504 2D TGCAAATCCC CA/-- GTTTCTTCTC 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 CA 1 0 342267 CASAVA_Build 9 46998257 1D CGCACTGCCT C/- CCCCCGTGAT 2575 het 2575 ref 74 59 6 9 C 6 5 342268 CASAVA_Build 9 46999604 1D TAGTATCTAT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 841 hom 32 8 8 17 G 2 1 342269 CASAVA_Build 9 47002314 1D ATCTTATTGT G/- GGGACTGGCG 3070 het 3070 ref 77 45 18 16 G 4 3 342270 CASAVA_Build 9 47004705 3D TGCTGAACTT ATC/--- AGCCCATCAT 2868 het 2868 ref 42 31 6 7 ATC 1 0 342271 CASAVA_Build 9 47007484 1D GTGTTGATTT A/- AAAAAAAAAT 2422 het 2422 ref 20 15 5 0 A 10 9 342272 CASAVA_Build 9 65314202 1D TTAAATAGAA G/- GTAAGAAGTT 2340 het 1080 hom 10 3 5 2 G 2 1 342273 CASAVA_Build 9 65341278 1D AATTTGCAGA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 56 het 34 1 30 3 T 8 7 342274 CASAVA_Build 9 65342352 4D TTCACATAAA AGAC/---- AGGTCTGCTT 3070 het 3070 ref 85 58 18 14 AGAC 1 0 342275 CASAVA_Build 9 65345155 1I GTAAATGAAA -/T TATATAGTAT 3070 het 3070 ref 63 48 9 6 T 1 2 342276 CASAVA_Build 9 65351970 1I TAGGTGTGGA -/T TTTTTTTGTA 2799 het 2799 ref 27 18 6 3 T 7 8 342277 CASAVA_Build 9 65356960 1D CAGAGAGTAC G/- TGTATCTTTC 2378 het 2378 ref 26 18 6 3 G 1 0 342278 CASAVA_Build 9 65358276 1D ATTGGTTTTC T/- TTTTTTTTAT 1440 het 1440 ref 12 8 3 2 T 9 8 342279 CASAVA_Build 9 65359984 1I TTTCATTTGG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 A 7 8 342280 CASAVA_Build 9 65365371 3I CATGTAGCTG ---/GGA CTACAGGTGT 1794 het 1794 ref 23 10 5 8 GGA 0 1 342281 CASAVA_Build 9 65367710 1D CAAAAACTTA T/- CCAGAATATG 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 1 0 342282 CASAVA_Build 9 65368064 1D GGGTCTTTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 986 hom 12 4 7 1 T 9 8 342283 CASAVA_Build 9 65374682 1I CCACCTTAGG -/C CCACCGAATT 3070 hom 60 het 26 0 20 6 C 2 3 342284 CASAVA_Build 9 65374722 1D AAAAACTGCA T/- TTTTCCAGAA 415 het 415 ref 34 12 3 19 T 5 4 342285 CASAVA_Build 9 65380062 1I ATTGTTGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2186 hom 20 7 8 5 A 10 11 342286 CASAVA_Build 9 65383096 2D AATTAATAAC AT/-- AAAGAAATTG 2758 het 2758 ref 19 11 6 2 AT 1 0 342287 CASAVA_Build 9 65383199 3I AAGCAAAAAT ---/ACA ACAACATTAC 1941 het 1941 ref 12 8 4 0 ACA 2 3 342288 CASAVA_Build 9 65428666 4I TTAGATTCCT ----/TTGA TTGTGTTTCA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTGA 0 1 342289 CASAVA_Build 9 65528203 1D CAAAATGTGC T/- TTTTTTTTTT 2639 het 2639 ref 35 18 8 9 T 11 10 342290 CASAVA_Build 9 65531626 4I ACTAAGAAGT ----/TAAC TAGTCAGTCA 3070 het 2956 hom 18 8 9 1 TAAC 0 1 342291 CASAVA_Build 9 65547268 15I ACAGTTGCAA ---------------/AGTAAAACTTTAGGG AGCATCTATT 1957 hom 10 het 4 0 4 0 AGTAAAACTTTAGGG 0 1 342292 CASAVA_Build 9 65582336 10D AAAACAAAAT CACACACACA/---------- CACACACACA 1464 hom 6 het 5 0 3 2 CA 14 9 342293 CASAVA_Build 9 65657174 1I TAGAAAGGTG -/A AAAAAAAAAA 1791 het 1791 ref 23 13 6 4 A 14 15 342294 CASAVA_Build 9 65712041 1D ATAGGATAAA C/- CCCTCCCTGA 1756 het 1756 ref 10 5 4 3 C 4 3 342295 CASAVA_Build 9 65745510 1D TCATCCCTTG C/- CCCCCTCCCA 3046 het 3046 ref 23 13 7 3 C 6 5 342296 CASAVA_Build 9 65753557 1I TTACGAAAGA -/T TTTTTTTTAT 1915 het 1484 hom 15 5 5 5 T 8 9 342297 CASAVA_Build 9 65827018 3D AAAGAATGAA ATT/--- ATACTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 19 10 0 ATT 1 0 342298 CASAVA_Build 9 65864225 1D GGGTTTTGTC A/- TGTTGGCCAG 1469 hom 7 het 3 0 3 0 A 1 0 342299 CASAVA_Build 9 65865178 2I AAAAAAAAGG --/TT TTTTTTTTTT 1791 hom 12 het 5 0 5 0 T 10 12 342300 CASAVA_Build 9 65982537 4I AATAATCTTA ----/TCTC TCTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 25 23 3 TC 2 4 342301 CASAVA_Build 9 65983921 1D ATGTATGTTC T/- CATACTGTAT 3070 het 3070 ref 56 44 9 3 T 1 0 342302 CASAVA_Build 9 65984884 1I ATTGCGAATA -/T TGCTGAAACA 3070 het 3070 ref 60 40 13 7 T 1 2 342303 CASAVA_Build 9 65985684 2I TAAGAGTAAC --/AG AAAGAGCAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 AG 0 1 342304 CASAVA_Build 9 65985918 2D GAATTTACAC AT/-- GTAATAAAAT 3070 het 3070 ref 39 25 9 5 AT 1 0 342305 CASAVA_Build 9 65985996 1I CTGTAGCTAC -/A AAAAAAAATG 2901 het 2901 ref 55 38 7 10 A 8 9 342306 CASAVA_Build 9 65986631 1D AACACAAGTT A/- AAAAAAAATG 2349 het 2349 ref 36 27 5 4 A 9 8 342307 CASAVA_Build 9 65988899 10D GTAATGACTG CACCATTTTT/---------- CACTTTTTCT 3070 hom 27 het 12 0 9 4 CACCATTTTT 1 0 342308 CASAVA_Build 9 65990473 1D AATAGAGCTT C/- CTATTATGTG 1376 het 1376 ref 28 23 3 2 C 2 1 342309 CASAVA_Build 9 65991657 1I TTTCTTTAGT -/A TGAAATTGCA 3070 het 3070 ref 62 29 20 13 A 0 1 342310 CASAVA_Build 9 65991698 1D GTGTTGGTTG T/- TTTTGCAAAG 3070 het 3070 hom 48 9 28 11 T 5 4 342311 CASAVA_Build 9 65994945 2D TGCCAACGAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 36 het 21 0 13 9 TA 9 8 342312 CASAVA_Build 9 65996815 2D TATAAACAAT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 26 11 3 TG 6 5 342313 CASAVA_Build 9 65996918 6I GTTTAAACTT ------/AAGTTG ATTTGCCATG 3070 het 3070 ref 51 31 18 2 AAGTTG 0 1 342314 CASAVA_Build 9 65997053 1D TTCTAAATTT A/- AAAAAAAATT 1833 het 1833 ref 39 33 4 4 A 9 8 342315 CASAVA_Build 9 65999706 2I CAAATGATTC --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 2112 hom 40 6 23 11 A 9 11 342316 CASAVA_Build 9 66001534 2D CTCAGTTTAG AA/-- AAGAGAATAC 1364 het 1364 ref 39 32 3 5 A 4 2 342317 CASAVA_Build 9 66002945 3D GTAATCAAGT TAA/--- AAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 4 TAA 1 0 342318 CASAVA_Build 9 66003193 1D GATGACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 150 hom 16 2 8 6 T 15 14 342319 CASAVA_Build 9 66004487 1D TACATAGTTT A/- AAAAATCAGC 1374 het 1374 ref 40 30 3 7 A 6 5 342320 CASAVA_Build 9 66007445 1I TCTGCTTATT -/C CCAGATAACA 3070 het 3070 ref 46 27 14 5 C 2 3 342321 CASAVA_Build 9 66010028 1I TTTTAGTAAT -/A AAAAAAGTAA 1893 het 1893 ref 28 24 4 0 A 6 7 342322 CASAVA_Build 9 66010873 1D TTGCAAATGG A/- AAAAAACAAT 3070 het 2801 hom 35 10 24 1 A 7 6 342323 CASAVA_Build 9 66012982 1D TTTAAGTCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 10 9 342324 CASAVA_Build 9 66015615 1I ATATGTTCTC -/T TTTTTTCTTT 1558 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 7 342325 CASAVA_Build 9 66016491 1D TTGTATTACA T/- TTAGTAGGTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 3 2 342326 CASAVA_Build 9 66021752 3I ATTATTTTTA ---/TTG TTGTATTGCA 1738 het 1738 ref 44 39 4 1 TTG 1 2 342327 CASAVA_Build 9 66022026 1D TACATTTAAA C/- CGAAGAATTT 3070 het 2859 hom 40 9 26 6 C 2 1 342328 CASAVA_Build 9 66023745 2I GATTGTGGAA --/AT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 AT 0 1 342329 CASAVA_Build 9 66025966 1I TTGCATTACC -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 T 6 7 342330 CASAVA_Build 9 66038722 1I CTTTAACTAC -/T ATAGAGTGGT 3070 het 3070 ref 37 23 9 5 T 0 1 342331 CASAVA_Build 9 66038833 1D CCATTTTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 10 9 342332 CASAVA_Build 9 66039433 1I AATAAATAAC -/A AGATTCTTAA 2370 het 2370 ref 43 32 5 6 A 1 2 342333 CASAVA_Build 9 66043397 1I AACCAAAAAC -/G CTTTAGCCCT 3070 hom 42 het 16 0 14 2 G 0 1 342334 CASAVA_Build 9 66044748 1D TTGAAATTTG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 9 8 342335 CASAVA_Build 9 66048031 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 70 hom 21 1 10 11 A 15 14 342336 CASAVA_Build 9 66048400 1D AAATTTGAAG C/- AGAACTGTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 1 0 342337 CASAVA_Build 9 66059322 1I TTACAGATAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 483 hom 8 1 7 0 T 8 9 342338 CASAVA_Build 9 66072358 1D CTGTCATCCC A/- ACACTTTGGG 1520 het 196 hom 9 1 5 3 A 2 1 342339 CASAVA_Build 9 66075188 1D TCTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 20 0 11 9 T 12 11 342340 CASAVA_Build 9 66077532 5D AGAAAAAAAA AAACC/----- AAGTAATATA 3070 het 3070 ref 48 37 8 9 AAACC 1 0 342341 CASAVA_Build 9 66080500 3D CTTCTTTAAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 29 1 14 14 T 17 14 342342 CASAVA_Build 9 66080600 2I AACAGGAGTC --/TT ATATAGTCAG 3070 hom 10 het 15 0 13 2 T 0 2 342343 CASAVA_Build 9 66083656 1D TGTCTAAAAG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 45 31 9 5 A 8 7 342344 CASAVA_Build 9 66198052 1D CAGAGGCGAG C/- CGGGCGCGTT 3070 het 1981 hom 85 7 57 21 C 2 1 342345 CASAVA_Build 9 66213465 1D CAAGAAATGC T/- TAAGGGATAT 1637 het 1637 ref 88 70 4 16 T 2 1 342346 CASAVA_Build 9 66215545 4I CATGATTTGG ----/CTCT CTGTGTGCCT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 CT 1 3 342347 CASAVA_Build 9 66218953 5D GTAAATTTGT TTAAG/----- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 89 76 9 10 TTAAG 1 0 342348 CASAVA_Build 9 66219956 1I TGCTAAAGTT -/G CTTATCAGCT 3070 het 3070 ref 90 43 32 15 G 0 1 342349 CASAVA_Build 9 66220423 1D TAAAATTCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 42 het 74 1 57 16 T 9 8 342350 CASAVA_Build 9 66221784 1I CAACCCCTGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 63 46 13 4 T 8 9 342351 CASAVA_Build 9 66226904 2D GATTGTTTCC TT/-- TTATTTATTT 3070 hom 217 het 95 0 68 27 T 4 2 342352 CASAVA_Build 9 66231269 1I CTCAACATAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 96 73 9 14 A 6 7 342353 CASAVA_Build 9 66236018 2D GTTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTGTT 2371 het 2228 hom 51 8 5 38 T 9 7 342354 CASAVA_Build 9 66237293 3I TTGTTGTTGT ---/TGC TGCTGTGTCA 2004 het 2004 ref 23 17 5 1 TGC 1 2 342355 CASAVA_Build 9 66238475 1D GGTTTCATGA T/- TTTAGAGCTC 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 T 4 3 342356 CASAVA_Build 9 66239644 2I CACCTTCTAT --/TC ACAGTTATGC 3070 het 3070 ref 60 32 15 13 TC 0 1 342357 CASAVA_Build 9 66239982 3I TAAAATACTT ---/TTG TTGTGTTTGA 3070 het 3070 ref 46 29 11 6 TTG 1 2 342358 CASAVA_Build 9 66241898 1I AAAAAGTGTA -/T TTTTTTTGTT 1848 het 1848 ref 56 39 4 13 T 7 8 342359 CASAVA_Build 9 66242366 4D AAATGGTTGT ACTC/---- ACTCAGATAT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 ACTC 2 1 342360 CASAVA_Build 9 66243281 1D TGAATACATT C/- CACAAATAAG 2118 het 2118 ref 79 57 5 18 C 2 1 342361 CASAVA_Build 9 66244024 1D TTGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 66 28 11 27 A 13 12 342362 CASAVA_Build 9 66244922 1D GTTCCCAAAA C/- CCTCTTTAGA 3070 het 3070 ref 89 74 7 8 C 3 2 342363 CASAVA_Build 9 66245141 5I ATCATATTGA -----/TATAT TATAGTATCA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TATAT 0 1 342364 CASAVA_Build 9 66246852 2D GAATTCTGAC AG/-- TATTTATCAA 1465 het 1465 ref 53 43 5 8 AG 1 0 342365 CASAVA_Build 9 66247383 1D TTCTTTTTTT G/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 92 67 10 15 G 1 0 342366 CASAVA_Build 9 66248655 1D AAAGTCTGTA G/- ACATCTCTAG 3070 het 3070 ref 92 70 11 12 G 1 0 342367 CASAVA_Build 9 66249085 1D AAATATTCCC T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 89 64 18 7 T 7 6 342368 CASAVA_Build 9 66254922 2I AAACTCTCAC --/AA AAAAATGTAT 3070 het 3070 ref 74 59 10 5 A 5 7 342369 CASAVA_Build 9 66254984 4I TAGATGTAAA ----/AACC AAACAATGTG 2819 het 2819 ref 67 41 8 18 AACC 0 1 342370 CASAVA_Build 9 66255162 1I AAGTCTGGGG -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 55 33 11 11 T 7 8 342371 CASAVA_Build 9 66255404 1I CTTTCCACAC -/T TTTTTTATTA 3070 het 686 hom 27 4 12 11 T 6 7 342372 CASAVA_Build 9 66261527 2I TTTTAATGAA --/AC ACTTATTTAC 3070 het 3070 ref 85 62 11 12 AC 1 2 342373 CASAVA_Build 9 66261637 1D TCTTGATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 66 13 33 20 T 12 11 342374 CASAVA_Build 9 66262852 2I CAATATTCAA --/CG CAGTCAGAAA 2354 het 2354 ref 84 72 6 6 CG 0 1 342375 CASAVA_Build 9 66263714 1D CAATTAAAGG C/- CCCAACAAAC 3070 het 3070 hom 50 19 21 10 C 4 3 342376 CASAVA_Build 9 66264555 4I AGTAGTCAAA ----/AAAG TGTACATTAT 3070 hom 187 het 70 0 62 8 AAAG 0 1 342377 CASAVA_Build 9 66265252 1I CTTACAGGAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 68 33 11 24 A 8 9 342378 CASAVA_Build 9 66266311 1I47M1I GAAGACCCAG -GCCTCAAAACTTAATGTCCATGACGCAATCCAAAATTACAAAAAAAA-/AGCCTCAAAACTTAATGTCCATGACACAATCCAAAATTACAAAAAAAAG CAGATAAACT 3070 het 3070 ref 92 122 15 15 N/A 0 0 342379 CASAVA_Build 9 66267200 1I AAGAAGAAAT -/A AACAAATGTA 3070 het 3070 ref 94 71 13 10 A 2 3 342380 CASAVA_Build 9 66267675 1D AACTCTCATC A/- AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 92 59 19 16 A 8 7 342381 CASAVA_Build 9 66269086 6D ATTGATTATA TAAGTT/------ TGTGTTATAC 3070 het 3070 ref 64 47 14 5 TAAGTT 1 0 342382 CASAVA_Build 9 66269341 1I TGATACTGCC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 76 49 17 10 A 8 9 342383 CASAVA_Build 9 66271944 3D ACATTGATAC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 ref 94 67 19 8 ATT 4 3 342384 CASAVA_Build 9 66272249 1I GCATTTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 96 27 29 40 T 11 12 342385 CASAVA_Build 9 66273390 2I TATTAATATA --/TT TTTATTAATC 2362 het 2362 ref 18 12 5 1 T 3 5 342386 CASAVA_Build 9 66274016 7I GTTAAGATGA -------/GATTTGG GTGGGGACAC 2359 het 2359 ref 60 42 6 12 GATTTGG 0 1 342387 CASAVA_Build 9 66276148 1D TTGTTACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1336 hom 63 6 36 21 A 11 10 342388 CASAVA_Build 9 66277574 2D CCTGGCCAAC GT/-- GGTGAAATCC 3070 het 3070 ref 27 18 8 1 GT 1 0 342389 CASAVA_Build 9 66278938 3D AGGTATCTCA TTG/--- TTGTTGTTTT 3070 het 3070 hom 70 26 39 5 TTG 3 2 342390 CASAVA_Build 9 66285515 1D CTGTAAGAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 112 hom 27 1 20 6 A 9 8 342391 CASAVA_Build 9 66290600 2I AAACTGTAAC --/AA GAGACAAAGT 3070 het 273 hom 25 2 23 0 A 0 2 342392 CASAVA_Build 9 66292554 1I GCCGCAGCCT -/C CCCAGGTAGC 1928 het 1928 ref 58 44 5 9 C 3 4 342393 CASAVA_Build 9 66295406 4D TCTTTGTAAT AATC/---- TTTAATACCT 3070 het 3070 ref 64 45 11 10 AATC 1 0 342394 CASAVA_Build 9 66301518 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTAGA 2846 het 2846 ref 47 35 7 7 T 8 7 342395 CASAVA_Build 9 66314300 1D ATTCCCTAAC T/- AGTCATGGAG 3070 het 3070 ref 34 21 9 4 T 1 0 342396 CASAVA_Build 9 66314585 1D TGGTTGGGGG T/- GGGGGACTGC 1708 het 1708 ref 36 15 8 13 T 1 0 342397 CASAVA_Build 9 66316991 1I CTTTGTGATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 93 71 9 13 A 9 10 342398 CASAVA_Build 9 66317860 1I CTGCAGTGAT -/A AAAAAATAAA 1917 het 1917 ref 25 16 4 5 A 6 7 342399 CASAVA_Build 9 66323592 1D TAGTTTAAAA G/- AAAAAGCTCT 2343 het 2343 ref 42 28 5 9 G 1 0 342400 CASAVA_Build 9 66409393 1I GGTTTATGAC -/A AAAAACACAG 2728 het 2728 ref 52 39 7 6 A 5 6 342401 CASAVA_Build 9 66413181 1D ACTGCCCAAA G/- CAATCGACAG 2378 het 2378 ref 31 22 5 4 G 1 0 342402 CASAVA_Build 9 66413243 1I AAAATTAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 9 10 342403 CASAVA_Build 9 66417532 1D GCCTTCAAGG A/- AAAAAAGTTA 3070 het 139 hom 11 1 10 0 A 7 6 342404 CASAVA_Build 9 66423030 1I CACAAAGCCA -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 78 48 19 11 T 6 7 342405 CASAVA_Build 9 66423174 1I CTGGCTTGAA -/C TTTTTCCCCA 2186 het 2186 ref 27 22 5 0 C 0 1 342406 CASAVA_Build 9 66434123 1I AGAACTTCTT -/A AAAACTTCCT 1923 het 1923 ref 22 14 4 4 A 4 5 342407 CASAVA_Build 9 66435373 1D GTTGAGCAAA C/- AGGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 36 19 8 9 C 1 0 342408 CASAVA_Build 9 66437198 3I CTCAAGCCGT ---/ATA ATAGGGAGGC 3070 het 3070 ref 43 27 7 9 ATA 1 2 342409 CASAVA_Build 9 66438263 1I GATTTGTTAC -/A AAAAAAAAAA 2361 het 2361 ref 23 13 6 4 A 10 11 342410 CASAVA_Build 9 66438895 1I CTTCCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 59 24 14 21 A 11 12 342411 CASAVA_Build 9 66441953 1D GGACCAACTA C/- GTCATAAAAG 1341 het 1341 ref 61 49 4 8 C 1 0 342412 CASAVA_Build 9 66448590 1D ATGAAATTCT C/- CTACCTCAGC 1752 het 1752 ref 48 38 5 5 C 2 1 342413 CASAVA_Build 9 66449716 6I GGTGCAAGAA ------/AAGTAT TTTTGAGTTC 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 AAGTAT 0 1 342414 CASAVA_Build 9 66450353 1I AAATAATTTA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 46 28 11 8 T 6 7 342415 CASAVA_Build 9 66451013 2D ATATATGTAA AC/-- ACATGCTACT 3070 het 3070 ref 72 43 20 9 AC 2 1 342416 CASAVA_Build 9 66451155 1I ATACCTTTTG -/T TTATATTCCA 3070 het 3070 ref 71 56 11 4 T 2 3 342417 CASAVA_Build 9 66451364 1I ATTAAAGAAG -/A AAGAAAGATA 3070 het 3070 ref 88 67 16 5 A 2 3 342418 CASAVA_Build 9 66453795 2I AGCATAACGT --/TC TGCAATCATT 1372 het 1372 ref 35 29 4 2 TC 0 1 342419 CASAVA_Build 9 66464437 2D TGTTTTTTGT TG/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 26 0 21 5 TG 1 0 342420 CASAVA_Build 9 66475085 2I AGAGAATGGC --/GA AGACTTTTAC 2480 het 2480 ref 57 45 7 5 GA 0 1 342421 CASAVA_Build 9 66475247 2D GAATCTCAGG AC/-- ACAAAGCAAT 3070 het 3070 ref 44 36 7 1 AC 2 1 342422 CASAVA_Build 9 66476419 2D TTTTTTGTGC AT/-- ATCTTTTTGC 2412 het 2412 ref 30 17 5 9 AT 2 1 342423 CASAVA_Build 9 66477196 2D7M1D TGTTTGTTTG TTTTTGTTTG/--TTTGTTT- TTTTGTTTTT 3011 het 3011 ref 23 12 8 3 N/A 0 0 342424 CASAVA_Build 9 66484066 1D ATATCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 53 20 10 24 T 12 11 342425 CASAVA_Build 9 66498916 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTA 2334 het 2334 ref 21 12 6 3 T 10 9 342426 CASAVA_Build 9 66504362 1D ATATTGGAGT A/- AAAAAAAATA 2397 het 2397 ref 34 23 5 6 A 9 8 342427 CASAVA_Build 9 66505239 3I ATAATAATAA ---/TAG TAATAATGCT 1845 het 1845 ref 21 16 4 1 TAG 0 1 342428 CASAVA_Build 9 66511824 1I AATATCTTCA -/C AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 C 0 1 342429 CASAVA_Build 9 66513859 1D TGGTGTAAAA G/- GAAACATCTT 1410 het 1410 ref 22 18 3 2 G 2 1 342430 CASAVA_Build 9 66518309 2I ATCTTCACAT --/AG AAAACCTAGA 3070 het 3070 ref 63 48 7 8 AG 0 1 342431 CASAVA_Build 9 66519680 1D ATATGTTCAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 90 hom 24 2 13 9 A 10 9 342432 CASAVA_Build 9 66536250 4D GTTTGCATTC AACT/---- AACAGGGTTG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AACT 1 0 342433 CASAVA_Build 9 66537420 2I CTCAGAAACT --/TC TTTGTGATGT 1077 het 1077 ref 49 36 6 7 TC 0 1 342434 CASAVA_Build 9 66537487 2D TGAAACACTC TT/-- TTTGTAGTAT 2162 het 2162 ref 60 46 5 9 T 5 3 342435 CASAVA_Build 9 66538156 1D TGATAGAGCA G/- CTTTGAAACA 3070 het 3070 ref 74 56 11 7 G 1 0 342436 CASAVA_Build 9 66538851 4I TTTGAAACAC ----/TCTT TTTGTGAATC 3070 het 3070 ref 63 21 26 16 TCTT 0 1 342437 CASAVA_Build 9 66546608 1D ATGTTCACAT A/- AAAACTAGAC 2324 hom 18 het 9 0 7 2 A 5 4 342438 CASAVA_Build 9 66551544 4D AACGGGAATA TCTT/---- CACATAAAAA 3070 het 3070 ref 52 33 16 5 TCTT 1 0 342439 CASAVA_Build 9 66556025 1I TCTCAGAAAC -/T TTTTTTTTGA 1852 het 1852 ref 52 33 4 15 T 8 9 342440 CASAVA_Build 9 66561387 4I TGAAACACTC ----/TGTT TGTAGAATGT 3070 het 3070 ref 86 54 22 10 TGTT 0 1 342441 CASAVA_Build 9 66564232 1D TGTACTCAAC T/- TTATAGGGTT 3070 het 3070 ref 81 27 46 8 T 3 2 342442 CASAVA_Build 9 66573962 1I CCCATAAAAA -/C TAAACAGAAG 1139 het 1139 ref 95 69 12 14 C 0 1 342443 CASAVA_Build 9 66576953 2D TTCGCAGAGA CT/-- CTCAGCACCT 3070 het 3070 ref 71 49 18 4 CT 2 1 342444 CASAVA_Build 9 66577070 1D CGCCCTAGCA G/- CTCTCTCGTG 2972 het 2972 ref 57 42 11 6 G 1 0 342445 CASAVA_Build 9 66578409 2I AGGGCTTTCT --/AA TAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 57 40 7 10 A 0 2 342446 CASAVA_Build 9 66584311 2D GGAAACACTC TT/-- TTTGTAGAAT 3070 het 3070 ref 90 65 18 8 T 5 3 342447 CASAVA_Build 9 66589700 6D TTTGTTGAAT CTACAA/------ ATGGACATCT 3070 het 3070 ref 66 51 11 8 CTACAA 1 0 342448 CASAVA_Build 9 66591387 1D AGTTTGGAAA C/- ACTCTTTTTG 1607 het 1607 ref 77 71 4 2 C 1 0 342449 CASAVA_Build 9 66593776 1D AGTTTGGAAA C/- ACTCTTTTTG 3070 het 3070 hom 60 25 30 5 C 1 0 342450 CASAVA_Build 9 66597278 46I AGAGAGAAGC ----------------------------------------------/AACCTGAGAAACTTCTTTGTGATGTGTGTATTCATCTCACGGTGTT AAAACTTTCT 3070 hom 51 het 21 0 18 5 AACCTGAGAAACTTCTTTGTGATGTGTGTATTCATCTCACGGTGTT 0 1 342451 CASAVA_Build 9 66654418 1I5M5I AGACAAATTA -TTAAC-----/TTTAACAAATT AAACCATCTA 2479 hom 12 het 5 0 5 0 N/A 0 0 342452 CASAVA_Build 9 66656197 1D3M6I ATAGTAATAA GATA------/-ATAAGGTAT CCAATTAGAA 2447 het 1722 hom 11 4 6 2 N/A 0 0 342453 CASAVA_Build 9 66682623 1I34M6D TCATATTTTT -ATATCATTTTTCGTATCATTTTTCATCACATTTCATCTCA/GATATCATTTTTCATACCATTTTTCATCTCAATTC------ ATTTCATCTC 3070 hom 27 het 8 0 10 7 N/A 0 0 342454 CASAVA_Build 9 66684426 5I TCCATTTCAT -----/TTTCA TTTCATTATT 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 TTTCA 1 2 342455 CASAVA_Build 9 66684607 2D ATCTCATCAA CT/-- CTTTTCATCT 936 het 936 ref 8 4 2 2 CT 2 1 342456 CASAVA_Build 9 66686855 8D TTATCTCATC TCATCATT/-------- TCATCATTTC 1371 hom 7 het 6 0 3 3 TCATCATT 2 1 342457 CASAVA_Build 9 66687009 3I ACATTTCATC ---/TCA TTTCATCTCA 3070 het 97 hom 22 1 20 2 TCA 0 1 342458 CASAVA_Build 9 66716904 1D CAGATTATAG A/- AAAAGAGAGA 3070 het 3070 ref 36 22 8 6 A 5 4 342459 CASAVA_Build 9 66718632 1I CAAAAGTGCT -/C AATTGAAAGA 1895 hom 12 het 7 0 5 2 C 0 1 342460 CASAVA_Build 9 66728712 1I AGTTTTCACT -/C TGTGAAATGA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 0 1 342461 CASAVA_Build 9 66748147 4D CTTTCATTTT TTTC/---- TTTTTTCTTT 3070 het 2181 hom 22 8 14 0 TTTC 1 0 342462 CASAVA_Build 9 66749822 1D TCAATATGTG A/- AAAAAAATCT 2676 het 2676 ref 38 26 6 8 A 8 7 342463 CASAVA_Build 9 66759821 4I TGAGGGTGGC ----/CTGG CTAATTTACA 3070 het 3070 hom 55 17 28 10 CTGG 0 1 342464 CASAVA_Build 9 66764018 3D GTACCCATTT TTG/--- TTAACTGAGG 3070 het 3070 ref 54 44 9 1 TTG 1 0 342465 CASAVA_Build 9 66774741 3I CTTGGGCCCC ---/TCT TCTTAGTCTG 3070 het 3070 ref 46 29 11 6 TCT 1 2 342466 CASAVA_Build 9 66806606 1I AATCAAGAAA -/T TTTACATAAC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 3 4 342467 CASAVA_Build 9 66812351 1D TTTAAAATAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 10 9 342468 CASAVA_Build 9 66818419 1D GAATGCAGCT A/- AAAGAGACAC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 4 3 342469 CASAVA_Build 9 66823069 3D ATAAATTCTC AGA/--- AGAAGAAAAA 1906 het 1418 hom 7 3 4 0 AGA 3 2 342470 CASAVA_Build 9 66823192 1I TAACAGAAAG -/A GCAAAAATAT 1470 hom 7 het 3 0 3 0 A 0 1 342471 CASAVA_Build 9 66824447 1I TTCATCTTCA -/T TTTAATAACA 1885 het 1885 ref 16 11 4 1 T 3 4 342472 CASAVA_Build 9 66902377 1D TTCACCATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 9 9 8 A 10 9 342473 CASAVA_Build 9 66905535 1D AAAAAATAAG T/- TTTTTTTTTT 2420 het 1260 hom 21 8 5 8 T 12 11 342474 CASAVA_Build 9 66906529 1D AATAAAACTA C/- AAATAAAACT 3070 het 3070 ref 51 31 13 8 C 1 0 342475 CASAVA_Build 9 66906632 2I TTCATGCATC --/CG CACGATTGGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CG 0 1 342476 CASAVA_Build 9 66907080 1D AAAAGGATAG A/- AATGTGGAAT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 3 2 342477 CASAVA_Build 9 66909633 3D TAAATTTCTC TTT/--- TTTTTACTTG 3070 het 3070 ref 64 47 9 9 T 8 5 342478 CASAVA_Build 9 66909763 4D TATTTTTTAT TTTA/---- TTTATTTATT 1833 het 1833 ref 37 19 4 15 TTTA 6 5 342479 CASAVA_Build 9 66911533 1I ATCAAAAAAT -/C GAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 65 52 9 4 C 0 1 342480 CASAVA_Build 9 66912387 4D CTAGGATAGG CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 72 46 8 20 CTTT 3 2 342481 CASAVA_Build 9 66913519 1D GTCCATAAAA T/- TTTTTTGCAG 3070 het 3070 hom 19 7 10 2 T 7 6 342482 CASAVA_Build 9 66915521 1I TAATAACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 11 12 342483 CASAVA_Build 9 66925997 3D ATGGCTGAGT TAA/--- TGTAGTTAAA 3070 het 1348 hom 17 3 13 2 TAA 1 0 342484 CASAVA_Build 9 66927781 1D CAAGATGAGA T/- TTTTTTTCTG 1961 het 492 hom 6 1 4 2 T 8 7 342485 CASAVA_Build 9 66937622 1I TGAGTCCTTT -/G AAAAATGTTT 2873 het 2873 ref 29 17 6 6 G 0 1 342486 CASAVA_Build 9 66941407 1D CGGCACACGC G/- GGGGCGGCCC 1448 het 806 hom 11 4 4 3 G 5 4 342487 CASAVA_Build 9 66942587 2D AAATAAAACA TT/-- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 90 48 21 21 T 9 7 342488 CASAVA_Build 9 66943004 1I TGGTGCTGTA -/T TTTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 T 5 6 342489 CASAVA_Build 9 66949599 2D AAATAAAGAG AT/-- GGAGGAAAAT 2430 het 2430 ref 11 6 5 0 AT 1 0 342490 CASAVA_Build 9 66954982 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAACA 2793 het 2793 ref 61 38 6 18 A 9 8 342491 CASAVA_Build 9 66957341 3D AAATATTTAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 2969 hom 23 7 13 3 AAT 5 4 342492 CASAVA_Build 9 66957987 1I GGGTTTTTTT -/G TGTGTGTGCT 3070 het 3070 ref 61 47 7 7 G 0 1 342493 CASAVA_Build 9 66960238 4D TTCCTCTCCA AACC/---- ATTTCCTCAC 2014 het 2014 ref 58 44 6 11 AACC 1 0 342494 CASAVA_Build 9 66963594 1I AGGAACACAG -/A AGGCGATGGC 1848 het 1848 ref 48 23 7 18 A 1 2 342495 CASAVA_Build 9 66971491 1I CCTGGCAGAG -/C CCCACCCACT 3070 het 3070 ref 69 35 19 15 C 3 4 342496 CASAVA_Build 9 66972284 2I ATGAATGACC --/AA GAGAGAGGGA 3070 het 3070 ref 95 63 21 11 A 0 2 342497 CASAVA_Build 9 66980830 1D GCTGAGGGGG T/- ACCCTGATAA 1253 het 1253 ref 67 60 3 5 T 1 0 342498 CASAVA_Build 9 66983821 3I GAATTCAGTC ---/TGT TATTTAAATG 3070 het 3070 ref 55 37 7 11 TGT 0 1 342499 CASAVA_Build 9 66988351 1D GTAGGCCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 394 hom 42 1 30 11 T 11 10 342500 CASAVA_Build 9 66989830 2I GCTCAATTTT --/TA TATTTTTCAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TA 1 2 342501 CASAVA_Build 9 66990053 1I CATTGACTTC -/A ACATTGAGGC 2450 het 2450 ref 64 52 6 6 A 1 2 342502 CASAVA_Build 9 66990691 3I CTTTTTTTTT ---/TTA TTTTTTGAGA 2368 het 2368 ref 28 18 6 4 TTA 0 1 342503 CASAVA_Build 9 66992808 8D ACAACTGCTA ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 50 33 13 9 AT 9 5 342504 CASAVA_Build 9 66994370 3I ACCAGATCTC ---/ATG AGAACTCACT 1626 het 1626 ref 62 44 4 14 ATG 0 1 342505 CASAVA_Build 9 66998982 4I TGAATATTTA ----/TATG TATATTTGCA 3070 het 3070 ref 68 54 10 4 TATG 0 1 342506 CASAVA_Build 9 66999728 2I AATAGAAGCA --/AT GAGACATAAG 2963 het 2963 ref 48 34 7 7 AT 0 1 342507 CASAVA_Build 9 67006114 1I ATAAAAATTA -/C ACAGAAGCAT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 C 0 1 342508 CASAVA_Build 9 67007343 1D GTGATTTGTG C/- ATTCAACTCA 1352 het 1352 ref 38 29 3 7 C 1 0 342509 CASAVA_Build 9 67007887 3I ATACCTTATC ---/ATA GAGCAGTTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 ATA 0 1 342510 CASAVA_Build 9 67011185 1D GATCATTGAA T/- TTTTTCAAGA 3070 het 3070 ref 68 50 11 7 T 6 5 342511 CASAVA_Build 9 67015590 1D ATCAGATGAG A/- AAAAAAAGGC 3070 het 3070 ref 55 43 8 4 A 8 7 342512 CASAVA_Build 9 67018629 1D CATGAAAACA G/- TAAGATAAAC 3070 het 3070 ref 53 40 8 8 G 1 0 342513 CASAVA_Build 9 67025082 3D TGGACACTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 2350 het 2350 ref 66 38 10 18 TTC 1 0 342514 CASAVA_Build 9 67026912 1D ATAAAAATGC T/- TCAACAAGCA 3070 het 3070 ref 89 50 23 18 T 2 1 342515 CASAVA_Build 9 67027472 18D TCAAGTGCTT AAAAAAAACCAACCAAAC/------------------ AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 61 32 16 27 AAAAAAAACCAACCAAAC 1 0 342516 CASAVA_Build 9 67027689 1D10M1D TTAAAACAAA CAAATCAAAATA/-AAATCAAAAT- AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 86 64 18 7 N/A 0 0 342517 CASAVA_Build 9 67030480 3I CTTCCTGTTT ---/GCA GCCATGTTTG 3070 het 459 hom 24 1 17 6 GCA 0 1 342518 CASAVA_Build 9 67030533 2I CAGAGTGTAG --/AA AAAGGCATTG 2275 het 2275 ref 35 16 6 13 A 3 5 342519 CASAVA_Build 9 67043157 3D ATGATATGAA ATG/--- ATGAGATGAA 1772 hom 10 het 4 0 4 0 ATG 2 1 342520 CASAVA_Build 9 67044828 2D GATAGATGAG AT/-- AAAATGATGA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 AT 1 0 342521 CASAVA_Build 9 67050107 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 58 28 16 14 A 19 17 342522 CASAVA_Build 9 67050549 3D AGAAAAAGAT CAA/--- CATGTTATTA 1904 het 1904 ref 10 6 4 0 CAA 1 0 342523 CASAVA_Build 9 67052935 1I TTTTCAAGAT -/A AAAACAACTT 2264 het 2264 ref 27 15 7 5 A 4 5 342524 CASAVA_Build 9 67053461 1I TGTGGAAAAA -/G TTATGCATTT 3070 het 3070 ref 77 59 13 5 G 0 1 342525 CASAVA_Build 9 67054384 3D TTTGGATTTA TTG/--- TTATTTAATT 1366 het 1366 ref 85 72 4 15 TTG 1 0 342526 CASAVA_Build 9 67251687 13D TATGTGTGTA TATTTTGTGTGTG/------------- TGGTTTATAT 2714 het 2714 ref 34 26 7 1 TATTTTGTGTGTG 1 0 342527 CASAVA_Build 9 67261540 1I AGTCAGCTTG -/T TTTTTAGCCA 3070 het 3070 ref 84 60 17 7 T 5 6 342528 CASAVA_Build 9 67263758 1I ACCCTCTCTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3030 hom 22 9 7 6 A 7 8 342529 CASAVA_Build 9 67281845 4I TTATACCTTT ----/ATTA ATTTTTACTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 ATTA 0 1 342530 CASAVA_Build 9 67286495 4D AACTCTCTCT AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 48 28 17 3 AACA 6 5 342531 CASAVA_Build 9 67290895 2D TCGAGGGTTA TC/-- TCTCAGACAC 3070 het 3070 ref 58 40 17 1 TC 3 2 342532 CASAVA_Build 9 67295056 3D GCCAGGCTAA TAT/--- TTGTAATTTT 2351 het 2351 ref 21 14 5 4 TAT 1 0 342533 CASAVA_Build 9 67295642 1I TATATTCTAG -/T TTTTTTGTTG 2973 hom 15 het 6 0 6 0 T 6 7 342534 CASAVA_Build 9 67304958 1I ACTTCAAAAA -/T AAAAGCGCCT 3070 het 1583 hom 14 6 8 0 T 0 1 342535 CASAVA_Build 9 67321694 1D TCCTCTTCTT C/- TCTGAGATTT 1955 het 826 hom 7 3 4 0 C 1 0 342536 CASAVA_Build 9 67380866 1I5M1I TGGGACCCGG -GGGTG-/AGGGTGT GGGGGCCGCC 3070 het 150 hom 39 2 29 26 N/A 0 0 342537 CASAVA_Build 9 67389410 1D TGGGGGGGGG C/- CAATTTAATC 3070 hom 46 het 20 0 18 2 C 2 1 342538 CASAVA_Build 9 67417997 1I GGAAAAATAA -/C TGAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 C 0 1 342539 CASAVA_Build 9 67434397 1D TTTAATTTTT A/- AAATATGATA 112 het 112 ref 9 6 1 2 A 4 3 342540 CASAVA_Build 9 67436989 3D AATTTCACTA TTG/--- TTGTGTCTCA 3070 het 3070 ref 26 15 10 3 TTG 2 1 342541 CASAVA_Build 9 67440380 1D CATGATAATA T/- TAATATGCTG 3070 het 3070 ref 43 29 11 3 T 2 1 342542 CASAVA_Build 9 67441298 1I49M1D GAATGCAGAT -CCGAGTGACTGTCTGCCTCTCAAAAGAATTCTGCTGAGATGTCTAGAAGT/ACAGAGTGACTGTCTGCCTCTCAAAAGAATTCTGCTGAGATGTTCAGAAG- AAGTAGAGTA 2889 het 2889 ref 25 26 6 2 N/A 0 0 342543 CASAVA_Build 9 67443522 1D TCAATGAGAG T/- TTCAAACTGA 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 3 2 342544 CASAVA_Build 9 67449723 2I TCCCAAATTT --/TA TGTCTTTCTC 2124 het 2124 ref 32 25 5 2 TA 0 1 342545 CASAVA_Build 9 67462726 4I GAGAGTTTTT ----/TAAA TAAATAATCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TAAA 1 2 342546 CASAVA_Build 9 67469159 3D ATATGTAGTT AGG/--- AGGATAGAAA 3070 het 3070 ref 59 41 10 10 AGG 2 1 342547 CASAVA_Build 9 67470173 1D TGAATACATG A/- GAGAAAATAA 2787 het 2787 ref 40 32 6 2 A 1 0 342548 CASAVA_Build 9 67476776 2D AGTTTTTATT TG/-- TGTGTGTGTG 1486 het 1486 ref 21 14 5 3 TG 6 5 342549 CASAVA_Build 9 67477823 1D TTCACATTGT A/- ATTTGATTGA 3070 het 3070 ref 34 21 11 2 A 2 1 342550 CASAVA_Build 9 67485922 1I GAACTGGAAC -/T TTTTTTACTG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 6 7 342551 CASAVA_Build 9 67487423 5I ACTTTCTCTC -----/TCTCT TTTTTTTCTC 1250 het 1250 ref 40 23 3 14 TCTCT 0 1 342552 CASAVA_Build 9 67490521 1D GGTGGATGAA G/- GGGGAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 G 5 4 342553 CASAVA_Build 9 67495463 4D TACACGTAAA ATAG/---- ATAGACTTTA 1802 het 1802 ref 31 23 4 5 ATAG 2 1 342554 CASAVA_Build 9 67497594 1D AATTTTGAGA G/- GGCACAAACA 1207 het 1207 ref 94 84 3 7 G 3 2 342555 CASAVA_Build 9 67503080 1I GAAATCACTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 A 9 10 342556 CASAVA_Build 9 67510844 3I GTTCTTCTGG ---/CAA CAACCAGCCC 3070 het 2411 hom 13 6 7 0 CAA 1 2 342557 CASAVA_Build 9 67517190 1D TATCAAAAAT A/- ACCGTGAGTT 3070 het 1731 hom 30 4 23 3 A 2 1 342558 CASAVA_Build 9 67517270 5D TATATATATA TATTT/----- TTTTTTCAGA 1931 het 1484 hom 17 4 4 10 TATTT 1 0 342559 CASAVA_Build 9 67524363 1D AGGAGGGTTG T/- TTGCAAGGCA 3070 het 3070 ref 33 22 11 0 T 3 2 342560 CASAVA_Build 9 67524697 6I TTCTAGAGTG ------/GTAACA GTCACTCAAG 3070 het 3070 ref 28 19 9 0 GTAACA 0 1 342561 CASAVA_Build 9 67524799 4D ATATTTGGAC TGAG/---- TAACATAAAG 2979 het 2979 ref 73 64 7 8 TGAG 1 0 342562 CASAVA_Build 9 67528745 1I CATTCATTTA -/T TTAATTATGA 3012 het 3012 ref 29 19 9 1 T 2 3 342563 CASAVA_Build 9 67532952 3I GTGCTATGCC ---/TGT TGTTCATCTT 3070 het 1359 hom 15 4 7 4 TGT 1 2 342564 CASAVA_Build 9 67542266 3I TAATAAGTAA ---/AGG AGAAGTGAAA 3070 hom 65 het 26 0 22 4 AGG 0 1 342565 CASAVA_Build 9 67554797 3D ATAAAATAAT AAC/--- AATTATTATT 1458 het 997 hom 8 2 3 3 AAC 1 0 342566 CASAVA_Build 9 67554813 4I TATTATTCAT ----/CTTA CTTTTATTAA 1455 het 1323 hom 9 3 3 3 CTTA 0 1 342567 CASAVA_Build 9 67555005 1D CTATAGCAGT G/- TTTTTTTTTT 2498 het 15 hom 8 1 7 0 G 1 0 342568 CASAVA_Build 9 67555817 3I TATATGTAAT ---/AAG AAGGTGAATT 3070 het 637 hom 16 3 9 4 AAG 1 2 342569 CASAVA_Build 9 67564493 1I TGATGAAAAA -/T AGATTTCTGA 1611 het 1611 ref 26 19 4 3 T 0 1 342570 CASAVA_Build 9 67565258 4I AGGCAACTGG ----/GCAT GTATGGTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 13 6 GCAT 0 1 342571 CASAVA_Build 9 67566135 2D CATATATATA AA/-- AATATATGTA 3070 het 3070 ref 35 9 7 22 A 5 3 342572 CASAVA_Build 9 67569473 1I TTCTTTCCAC -/T TTTTCACTCT 3070 het 2091 hom 20 5 15 0 T 4 5 342573 CASAVA_Build 9 67575066 1D AGAGTTCTAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 9 8 342574 CASAVA_Build 9 67631830 1D41M3I ATGGGAATAG AAAAAATTATGTACAAAAAGCATTTTATTTGGAGAGTAATTT---/-AAAAATTATGTACAAAAATCATTTTATTTGGAGAGTAATTTAGG AGATCTTTAG 2585 het 2585 ref 12 6 6 1 N/A 0 0 342575 CASAVA_Build 9 67636759 1D93M2D AATAGACTGG AAAAAGGGAACTTTTTAAATATAAAAAAAATTGCCTCTTTTCTGACAGTATTCTTTCTTCTTAAACTTCATGATTGTTCCTGGAAATTAAAGTGAA/-AAAAGGGAACTTTTTAAATATAAAAAAAATTGCCTCTTTTCTGATAGTATTCTTTCTTCTTAAACTTCATGATTATTCCTGGAAATTAAAGTG-- AAAAAAACTA 2346 het 2346 ref 20 39 5 5 N/A 0 0 342576 CASAVA_Build 9 67638532 1I CAAACTAATC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 30 8 7 T 9 10 342577 CASAVA_Build 9 67639289 7D GGCTGAAGCA GCAAAGG/------- GCAAAGGGCA 1684 het 1684 ref 40 26 5 15 GCAAAGG 3 2 342578 CASAVA_Build 9 67640775 2D CCAAAATTTA TT/-- TTTGTTTGTG 3070 het 3070 ref 57 29 24 6 T 5 3 342579 CASAVA_Build 9 67642873 1D AATTAGGAAA C/- TTTTTAGAGA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 C 1 0 342580 CASAVA_Build 9 67643949 1I CAATCTTTTT -/C TCTCTTCTGT 3070 het 3070 hom 76 35 36 5 C 0 1 342581 CASAVA_Build 9 67644058 4D AATAAGCAAC TAAT/---- TAAATTTGAC 3070 het 2039 hom 32 6 26 0 TAAT 1 0 342582 CASAVA_Build 9 67646091 4D GAATGACACA AACT/---- GTGTGTCCAG 3070 het 3070 ref 62 37 24 3 AACT 1 0 342583 CASAVA_Build 9 67649840 2I TCAAATATCT --/TC ATTTTTATGC 3070 het 3070 hom 85 37 45 3 TC 0 1 342584 CASAVA_Build 9 67654291 5D AAAAAAAAAA AAAAC/----- TCTTAGGAGG 3070 het 3070 hom 55 18 17 20 AAAAC 1 0 342585 CASAVA_Build 9 67655194 1D TTCTATATCA C/- TATCCTCATA 3070 het 3070 ref 48 24 19 5 C 1 0 342586 CASAVA_Build 9 67656606 1D TAAAATAATC A/- ATGTATGGGT 3070 het 3070 ref 59 35 24 2 A 2 1 342587 CASAVA_Build 9 67657380 5D CCTTTTTCTA TAAAT/----- TAACTTCTTC 3070 het 3070 ref 41 28 11 2 TAAAT 1 0 342588 CASAVA_Build 9 67658971 1D TCCCCCCACC A/- TCATCTTTCT 1657 het 1657 ref 83 76 4 5 A 1 0 342589 CASAVA_Build 9 67659566 13D TTATTTCTAC CATCAATTACCTG/------------- TATCAATTCC 3070 het 3070 ref 44 34 10 6 CATCAATTACCTG 1 0 342590 CASAVA_Build 9 67660955 1D AAACTCTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 22 10 1 T 10 9 342591 CASAVA_Build 9 67661211 5D TGGGTGCCAT GGGAA/----- GTTTCAAGAA 3070 het 3070 hom 58 24 32 6 GGGAA 1 0 342592 CASAVA_Build 9 67662276 1D TCTAGGCTAG T/- TTTTTTCCAC 1401 het 1401 ref 21 16 3 2 T 7 6 342593 CASAVA_Build 9 67662626 4D AAGAAAAATA AATT/---- AACTGTGCAA 3070 het 3070 ref 52 37 12 4 AATT 1 0 342594 CASAVA_Build 9 67666739 2D AGATAAAAAA AT/-- ACCTAATAAT 3070 het 3070 ref 41 30 11 1 AT 1 0 342595 CASAVA_Build 9 67667481 1I TATTTTTGTT -/G TAGGGTTGCT 3070 het 3070 ref 35 24 10 1 G 0 1 342596 CASAVA_Build 9 67668350 2D ACTAAAACTC TT/-- TGCTTCATGT 3070 het 3070 hom 60 16 40 9 T 3 1 342597 CASAVA_Build 9 67669597 1D ATCACACATA T/- TTTTTCATGT 3070 het 3070 ref 51 41 8 2 T 6 5 342598 CASAVA_Build 9 67669986 1I TTCTTGGGGG -/T GTTCTGTGGG 3070 het 3070 hom 66 28 29 9 T 0 1 342599 CASAVA_Build 9 67674874 1I AGTTAATATC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 39 0 30 9 T 7 8 342600 CASAVA_Build 9 67674982 1D TAAGCAATAG A/- AAAACAAATT 3070 het 3070 ref 43 26 15 2 A 5 4 342601 CASAVA_Build 9 67677241 1I ATTTAAAAAT -/A ATTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 A 1 2 342602 CASAVA_Build 9 67679409 1D TCACATTGAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 53 29 19 6 T 9 8 342603 CASAVA_Build 9 67681363 1D GCACAATGTG T/- TTTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 70 38 16 17 T 6 5 342604 CASAVA_Build 9 67682260 1D TTATTATCAT A/- AAAATATATT 2397 het 2397 ref 27 21 5 1 A 5 4 342605 CASAVA_Build 9 67682648 4I AAAAGTATTC ----/AAAG AGTCTAGTTA 3070 het 3070 ref 73 39 23 11 AAAG 0 1 342606 CASAVA_Build 9 67683581 5I30M3D CTAAACAATC -----TAAGTATAGTTCCTATTTAGACTTAACCATAAC/TAATTTAAGTATAGTTCCTATTTAGACTTAACCAT--- AACACTTTGA 3070 het 3070 ref 38 22 12 11 N/A 0 0 342607 CASAVA_Build 9 67683784 5D TAAGGACCTT TTTCA/----- TTTCTTTTTA 3070 het 3070 hom 50 24 25 3 TTTCA 1 0 342608 CASAVA_Build 9 67684359 1D ATACCTATGT G/- GAATGTATTT 3070 het 3070 ref 60 44 9 7 G 2 1 342609 CASAVA_Build 9 67684978 4D GAATTAATAG CTAT/---- CTTAGTAAGG 3070 het 3070 hom 51 23 25 5 CTAT 1 0 342610 CASAVA_Build 9 67690633 4I AAAAGAAATT ----/AAAC AATCTCTCTT 3070 het 3070 ref 39 30 7 2 AAAC 0 1 342611 CASAVA_Build 9 67690756 3I GTAGGAAAAT ---/AAG TAGCATTTTT 1909 het 1909 ref 45 36 5 4 AAG 0 1 342612 CASAVA_Build 9 67691114 1D AATAGCCAAA G/- CAATCCTAAG 3070 het 3070 hom 46 13 27 6 G 1 0 342613 CASAVA_Build 9 67691720 1I AATCTACAAG -/C AAAAAACCCA 3070 het 3070 ref 73 41 27 5 C 0 1 342614 CASAVA_Build 9 67694199 1D44M2D ATGATTATGG AAAAAAAACTAAGGAATACATTTCAAAAGCTACTAGAACTAAATAAT/-GAAAAAACTAAGGAATACATTTCAAAAGCTACTAGAAATAAATA-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 26 17 13 N/A 0 0 342615 CASAVA_Build 9 67694530 1D TATGTGCTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 T 9 8 342616 CASAVA_Build 9 67694681 4I15M7I GATTTTAATC ----AGTAATAATGATTGC-------/ATTTAATAATAATGATTGCAACATGG AACAGGGAAA 3070 het 3070 ref 48 42 11 2 N/A 0 0 342617 CASAVA_Build 9 67695204 1D TCTAGAAGCT G/- AAAAATATTA 2371 het 2371 ref 40 32 5 3 G 1 0 342618 CASAVA_Build 9 67703983 1D TTGAAAAAAA T/- ATATAACTTT 2828 het 2828 ref 37 26 6 5 T 1 0 342619 CASAVA_Build 9 67704047 4D CATCGATGAC CTTT/---- CTAAGCTAAT 2332 het 2332 ref 40 33 6 1 CTTT 1 0 342620 CASAVA_Build 9 67704159 1D TTACCTCCAA C/- CCAGGGGAGC 3070 het 3070 ref 43 27 13 4 C 3 2 342621 CASAVA_Build 9 67704326 1D TTCTTTTCTG A/- AAAAATAAAC 3070 het 3070 ref 46 20 13 13 A 6 5 342622 CASAVA_Build 9 67706076 1I CTATTTTTTC -/T TTTATTTTTA 2360 het 2360 ref 27 21 5 1 T 3 4 342623 CASAVA_Build 9 67706717 1D TAAATTCTGT C/- CCTTAGCTCT 3070 het 3070 ref 74 42 15 17 C 3 2 342624 CASAVA_Build 9 67706948 2D ACTTTTTCCC CT/-- GAGTGTTCTC 3070 het 3070 ref 36 22 11 8 CT 1 0 342625 CASAVA_Build 9 67707483 3D CATTTTTTTC TAT/--- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 TAT 1 0 342626 CASAVA_Build 9 67708694 1D TGAAGTTTGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 52 26 23 3 T 8 7 342627 CASAVA_Build 9 67710370 1I ACTTTTTTCT -/A AAAAGGCTCT 2835 het 2835 ref 42 32 6 4 A 4 5 342628 CASAVA_Build 9 67710902 1D ATTTGTTCAA T/- TTTCACTCAC 3070 het 3070 ref 49 30 17 2 T 4 3 342629 CASAVA_Build 9 67714529 1D AAGAGAGAAG A/- AAGGAAAGAG 3070 het 3070 ref 41 29 8 4 A 3 2 342630 CASAVA_Build 9 67718588 2I AAATGAGCTG --/AA AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 52 33 16 3 A 7 9 342631 CASAVA_Build 9 67719759 1I ATGCAGATAC -/G ATAAGATCTG 3070 het 3070 ref 34 23 10 1 G 0 1 342632 CASAVA_Build 9 67724331 1I CTTAACACAA -/T TTTTTTTATT 2261 het 2261 ref 71 41 6 24 T 7 8 342633 CASAVA_Build 9 67726611 4D TCTTGCAAAT AGAA/---- AGGCACTAGC 3070 het 3070 ref 86 67 16 5 AGAA 1 0 342634 CASAVA_Build 9 67727073 1D CAATAGTCCC T/- TAAAACTGTC 3070 het 3070 ref 60 45 11 5 T 2 1 342635 CASAVA_Build 9 67727608 1D AAATTTATAA T/- GTTGCAGTGA 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 T 1 0 342636 CASAVA_Build 9 67728516 10D AGGCCTACCG AAGATAAGTA/---------- AATCTTTAGT 2684 hom 18 het 10 0 7 6 AAGATAAGTA 1 0 342637 CASAVA_Build 9 67729434 1I ATAAATAATA -/T TTTAAATGCT 1431 het 1431 ref 16 11 3 2 T 3 4 342638 CASAVA_Build 9 67730823 1D TGGTAAGAAC T/- TTTGTTTATT 3070 het 3070 hom 45 12 29 4 T 4 3 342639 CASAVA_Build 9 67731475 2I AAAAGAAATA --/AT TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AT 0 1 342640 CASAVA_Build 9 67732963 1I CCCTGGCTAA -/T TTTTTTGCAT 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 T 6 7 342641 CASAVA_Build 9 67733142 2D GATGTGTATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 TG 6 5 342642 CASAVA_Build 9 67733760 1I TCGTCAATAA -/C TTTTGGATGT 3070 het 2629 hom 29 7 20 2 C 0 1 342643 CASAVA_Build 9 67734220 2I48M7D TAAATTACTT --GTCACAATTTTAGCCTAATTTTTTCATTTTCTAGATAGATTACTCTTCTTTTTTT/AAGTCACCATTTTAGCCTAATTTTTTCATTTTCTAGATAGATTACTCTTC------- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 30 18 5 N/A 0 0 342644 CASAVA_Build 9 67738781 1I CCAGTTGCTC -/T TGACCCCCTT 3070 het 3070 ref 61 35 23 4 T 1 2 342645 CASAVA_Build 9 67741513 2I TTTGTGTAAA --/AC ACATTATCTG 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 AC 1 2 342646 CASAVA_Build 9 67742218 1D TGTGCAGCTG T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 8 7 342647 CASAVA_Build 9 67743433 4I GTTGGTGCTT ----/ACTC AATATAGCCT 3070 het 3070 ref 52 25 23 4 ACTC 0 1 342648 CASAVA_Build 9 67745948 1D CAATTGGTAG A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 A 7 6 342649 CASAVA_Build 9 67746049 1I CCTTGAACCA -/T TGAACCATCA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 1 2 342650 CASAVA_Build 9 67747968 2D TAGCATACAT GA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 603 hom 63 6 39 20 GA 9 8 342651 CASAVA_Build 9 67753840 1I ATTTTTAACA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 70 27 36 7 T 7 8 342652 CASAVA_Build 9 67754389 5I26M1I TATATTTCTA -----TGTTTTGCAGAGATCATGAAAATTTT-/ATCTGTGTTTTGCAGAGATCATGAAAATTTTA ACTGGGTAAC 3070 het 3070 ref 36 29 9 5 N/A 0 0 342653 CASAVA_Build 9 67755874 3I TACTTCATGA ---/TAT TATTAAGTTC 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 TAT 1 2 342654 CASAVA_Build 9 67756427 4D TCCAATAGTC AGTA/---- CAAAACTACA 1164 het 1164 ref 16 9 3 6 AGTA 1 0 342655 CASAVA_Build 9 67757745 4D AACCACAAAA CTTG/---- CTTTTTACTC 1746 het 1746 ref 81 73 4 6 CTTG 1 0 342656 CASAVA_Build 9 67759649 1D ATATTTTTTT C/- AAAATGTGTG 3070 het 3070 hom 58 25 32 2 C 1 0 342657 CASAVA_Build 9 67759762 1D AGCAACTGGC A/- AACAGGAAGC 2811 het 2811 ref 20 13 6 1 A 3 2 342658 CASAVA_Build 9 67760754 5D58M4D CAAAAGCTTT TTAAATTTTCTTTCCACTCCTTTTTCTGAAAGCTTTGATACAAAAATCATTTGACACAAATGATTTT/-----TTTTCTTTCCACTCCTTTTTCTGAAAGCTTTGATACAAAAATCATTTGACACAAATGA---- TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 34 41 8 7 N/A 0 0 342659 CASAVA_Build 9 67763404 1D ATCTTGAAAA C/- TTTTATAACG 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 C 1 0 342660 CASAVA_Build 9 67763501 2D ATATTATCTC TT/-- ATACATTTCA 3070 het 3070 ref 44 25 14 6 T 2 0 342661 CASAVA_Build 9 67764479 6I TGTTTGTTTG ------/TTTTGT TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 50 21 11 18 TTTTGT 2 3 342662 CASAVA_Build 9 67765267 2D ACACACACAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 282 hom 46 7 25 15 AG 9 8 342663 CASAVA_Build 9 67765510 1I GAAAATTCAG -/A AAAAAGTACC 3070 het 3070 ref 34 18 8 8 A 5 6 342664 CASAVA_Build 9 67766159 1D AAACTTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 27 0 19 8 A 11 10 342665 CASAVA_Build 9 67767066 5I CTTATTCAAA -----/CTTCT CTTCTCTTCT 2754 het 2754 ref 41 27 6 8 CTTCT 2 3 342666 CASAVA_Build 9 67771033 3I TCCACCAGGC ---/GGT GGTGCCCCAG 2787 het 2787 ref 57 26 11 20 GGT 1 2 342667 CASAVA_Build 9 67772453 9D TTTGTTTTTG AGATAGAGA/--------- AGGAGATCTT 3070 het 3070 ref 49 38 10 2 AGATAGAGA 1 0 342668 CASAVA_Build 9 67774104 1D TATTTGGGTA C/- CCTTTATTTC 3070 het 3070 hom 46 9 29 8 C 3 2 342669 CASAVA_Build 9 67775277 1D AATGTTGTTA C/- TTCATGATAC 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 C 1 0 342670 CASAVA_Build 9 67775532 2D ATCTTCTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1521 hom 35 8 15 12 T 12 10 342671 CASAVA_Build 9 67780276 3I CTTATTCTGA ---/AAT AATATACTCA 3070 het 671 hom 25 2 15 8 AAT 1 2 342672 CASAVA_Build 9 67781048 3D CTGTCTTAGG GAA/--- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 68 36 30 4 GAA 2 1 342673 CASAVA_Build 9 67781977 1D ACTTCCCAGA T/- TGAATCAATA 3070 het 3070 ref 28 19 7 2 T 2 1 342674 CASAVA_Build 9 67782651 2I CATTTTATTC --/TA TGTTTCCATT 3070 het 3070 hom 60 26 33 1 TA 0 1 342675 CASAVA_Build 9 67782885 4D AGGATAAAAT GAAA/---- GAAAGATACA 2326 het 2326 ref 39 27 6 8 GAAA 2 1 342676 CASAVA_Build 9 67783837 5I TTCACCAAAT -----/ATAAA ATATAGTTAT 3070 het 3070 ref 58 36 19 3 ATAAA 0 1 342677 CASAVA_Build 9 67784794 4D AAGAAATGTG GAGA/---- GAGAAATATT 3070 het 373 hom 33 1 29 4 GA 4 2 342678 CASAVA_Build 9 67785664 2I TGGTGGACAC --/TT ATATTTTACA 3070 het 3070 hom 88 35 46 7 T 0 2 342679 CASAVA_Build 9 67785992 4I TTGCATTAAT ----/TAAG TCTTATAATA 3070 het 3070 ref 83 69 8 6 TAAG 0 1 342680 CASAVA_Build 9 67786504 1D ATAATTCTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 79 23 48 9 T 8 7 342681 CASAVA_Build 9 67786952 1I TTACTTTCCC -/T TTTACTATCC 3070 het 3070 ref 90 76 8 6 T 3 4 342682 CASAVA_Build 9 67787646 1I AACTAACAAA -/C TTTTGGCCAT 3070 het 3070 hom 58 22 26 10 C 0 1 342683 CASAVA_Build 9 67788038 2D ATATTGACGG AA/-- GAGTGCTAGA 3070 het 3070 hom 85 32 45 8 A 2 0 342684 CASAVA_Build 9 67788921 6I GGGCACACAG ------/ACACGC ACGCGCGTGC 568 het 568 ref 38 22 2 15 ACACGC 0 1 342685 CASAVA_Build 9 67792213 4D GGGTACCCCA AGGC/---- AGACAGAAGG 3070 het 3070 ref 52 27 15 11 AGGC 1 0 342686 CASAVA_Build 9 67793699 2D TGGGGCAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 1686 het 393 hom 34 6 8 20 A 16 14 342687 CASAVA_Build 9 67795780 1I GGGGCAGAGG -/A AAAAAAAAAC 1409 het 25 hom 11 1 7 3 A 9 10 342688 CASAVA_Build 9 67796909 1I CCAGGTAGTC -/A AACACAGGGC 2995 het 2995 ref 40 17 8 15 A 2 3 342689 CASAVA_Build 9 67798753 2I CATTTTCACA --/CT GTTATAAAAA 3070 het 3070 ref 63 35 25 3 CT 0 1 342690 CASAVA_Build 9 67801652 1D GTGGACACCA G/- CACTCAATTG 1302 het 1302 ref 20 13 3 4 G 1 0 342691 CASAVA_Build 9 67802451 1I GGACCCCGAT -/G GGCACCAGTT 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 G 2 3 342692 CASAVA_Build 9 67802535 1D ATACCTGGAT C/- CTGGTAGACA 3070 het 3070 ref 69 51 14 4 C 2 1 342693 CASAVA_Build 9 67805196 1D CCAGGCCTCA C/- CAGTGATCCC 3070 het 3070 ref 60 37 9 16 C 2 1 342694 CASAVA_Build 9 67807843 1D TGTGTAGAAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 45 24 13 8 T 8 7 342695 CASAVA_Build 9 67807999 1D ATATTTTTTT C/- CTAAGAAATC 3070 het 3070 ref 82 38 27 17 C 2 1 342696 CASAVA_Build 9 67809317 1I TAAAAAATAC -/A AAATAGGCCG 729 het 729 ref 37 24 3 10 A 3 4 342697 CASAVA_Build 9 67811324 1I CATTCCAACG -/A AGCTGCTCAT 3070 het 3070 ref 68 53 12 3 A 1 2 342698 CASAVA_Build 9 67811911 4I CCTCTCTCTC ----/CTCT CTCTCTTGCT 3070 het 3070 ref 74 51 21 2 CT 3 5 342699 CASAVA_Build 9 67813263 1I CAGAGCCTGT -/A TTTTTAGATT 3070 het 3070 ref 79 56 16 7 A 0 1 342700 CASAVA_Build 9 67815677 1D CAGTGTTCTG C/- CCCAGGGTAG 1774 het 1774 ref 63 36 12 15 C 4 3 342701 CASAVA_Build 9 67816121 4I TTCTCATGAT ----/AGTA AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 57 31 16 12 AGTA 0 1 342702 CASAVA_Build 9 67816522 1I TGGGGATTGG -/A AAGTGAGGGT 3070 het 3070 hom 88 29 43 16 A 2 3 342703 CASAVA_Build 9 67818102 4I TATTTACTTT ----/GATA GATGTATGCA 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 GATA 0 1 342704 CASAVA_Build 9 67820808 2D TTGGAAGGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 69 48 10 12 T 12 10 342705 CASAVA_Build 9 67826717 4D TGCATTGTTG GAAT/---- GGATTAGAAA 3070 het 3070 ref 85 52 30 11 GAAT 1 0 342706 CASAVA_Build 9 67827078 4D AAGCTCTTGC TATA/---- TATATATATA 3070 het 204 hom 40 2 12 27 TA 9 7 342707 CASAVA_Build 9 67827094 3D TATATATATA TAT/--- TTTTTTTTGT 2010 het 994 hom 38 5 7 28 TAT 1 0 342708 CASAVA_Build 9 67828952 6D AGAAATTCCA CTTTTC/------ CTTACCGAGG 3070 het 3070 ref 45 29 9 12 CTTTTC 1 0 342709 CASAVA_Build 9 67829050 1D AATTCCTCAA G/- AATCATGTTA 3070 het 3070 ref 92 56 31 6 G 1 0 342710 CASAVA_Build 9 67832817 4I GATTGTTTTC ----/TATT TGTTTGATTT 3070 het 3070 hom 59 27 27 5 TATT 0 1 342711 CASAVA_Build 9 67833580 1D TAAATTATAC A/- AGATGTAACT 2209 het 2209 ref 82 71 5 8 A 2 1 342712 CASAVA_Build 9 67834256 1I AGTCCTATTC -/A GGGTCAAGGG 3070 het 3070 hom 89 30 44 15 A 0 1 342713 CASAVA_Build 9 67835900 1D GCAAATCATG A/- GAACCATCTA 1961 het 1961 ref 48 40 5 4 A 1 0 342714 CASAVA_Build 9 67840057 3I TCTTAATCTC ---/CTT CTACTATTCT 3070 het 3070 ref 69 43 22 4 CTT 0 1 342715 CASAVA_Build 9 67841514 3I ATTATTCTAC ---/GTT TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 41 24 9 8 GTT 0 1 342716 CASAVA_Build 9 67842233 2I TCATGGTCTC --/TT TGAAGACTCC 2153 het 2153 ref 89 71 5 13 T 1 3 342717 CASAVA_Build 9 67842408 1D ACACTAGTCA T/- TTGATAAGGG 1196 het 1196 ref 52 39 3 11 T 3 2 342718 CASAVA_Build 9 67842513 1D34M2I TTTGAACATC TTTTTTGGGGAAGACACAATTCAACCCACAGTACT--/-TTTTTGGGGAAGACATAATTCAACCCACAGTACTCA CAACCCAAAG 3070 het 3070 ref 72 58 22 13 N/A 0 0 342719 CASAVA_Build 9 67842962 2D ATTATCACAC AT/-- ATATATATAA 3070 het 3070 ref 40 21 12 9 AT 5 4 342720 CASAVA_Build 9 67843368 7I GAATTAGGAA -------/TTTTTTT TTAAAAAAAA 1517 het 1517 ref 55 29 8 18 T 2 9 342721 CASAVA_Build 9 67843805 1I10M1I TGTTCCAAGC -TCCTAGATTT-/TTCCAAGTTTTG TTTTTGTTTT 2130 het 2130 ref 58 36 5 18 N/A 0 0 342722 CASAVA_Build 9 67843893 1D TCATGCTTCA G/- GGAAAGGGAA 2180 het 2180 ref 45 31 6 8 G 3 2 342723 CASAVA_Build 9 67844343 2D TGAATTGTTT AA/-- GAGTCATTAC 1338 het 1338 ref 48 42 3 5 A 2 0 342724 CASAVA_Build 9 67849843 10D ATATATATAT ATATACACAC/---------- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 52 25 13 20 ATATACACAC 1 0 342725 CASAVA_Build 9 67852539 2I AGCTATCCAC --/AG CGTCAGGGCA 2288 het 2288 ref 90 79 6 5 AG 0 1 342726 CASAVA_Build 9 67854392 2D TTGATAAATA CT/-- GTCAGAATTC 3070 het 3070 ref 66 43 19 5 CT 1 0 342727 CASAVA_Build 9 67856283 1I TACACCTGGG -/A AAAAGGGTCA 3070 het 3070 ref 74 45 18 11 A 4 5 342728 CASAVA_Build 9 67856526 4D TGCATTCATC TTCT/---- CTCTCAGGAA 3070 het 3070 ref 76 59 10 9 TTCT 1 0 342729 CASAVA_Build 9 67858844 5D TGAACATTCT ATAAG/----- ATAATTACAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 ATAAG 1 0 342730 CASAVA_Build 9 67859010 1I TTACCATTAT -/G AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 G 0 1 342731 CASAVA_Build 9 67859348 1D ATAAGTTAAC A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 75 48 15 13 A 8 7 342732 CASAVA_Build 9 67859458 4I TGTCTAACTC ----/GAAA TAATTTTTAT 3070 het 3070 ref 72 57 10 5 GAAA 0 1 342733 CASAVA_Build 9 67863518 1D GCACATGGAA T/- TTTTTCCAAG 1244 het 1244 ref 36 31 3 2 T 6 5 342734 CASAVA_Build 9 67868348 2I GGAAAAAGAC --/TT TTTATTTAAT 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 3 5 342735 CASAVA_Build 9 67869217 4D AGTGGTGGTC TGGA/---- TAAAGACTCA 3070 het 3070 hom 84 30 51 5 TGGA 1 0 342736 CASAVA_Build 9 67869608 1D GCTTGAACCC G/- GGGGGCGGAG 1988 het 1988 ref 78 64 6 9 G 6 5 342737 CASAVA_Build 9 67870054 1D AATCTTAACT C/- CATCGCCTAC 1279 het 1279 ref 68 52 5 11 C 2 1 342738 CASAVA_Build 9 67870225 1I TCCTTTGCCA -/G GGGGCTGGGC 3070 het 3070 ref 81 44 12 25 G 4 5 342739 CASAVA_Build 9 67871206 1I ATATACAAGG -/C TTTTGTGGAG 817 het 817 ref 81 63 3 15 C 0 1 342740 CASAVA_Build 9 67874642 1D AGAAGAGAGT G/- GGGGTCAATA 3070 het 3070 ref 34 26 8 0 G 5 4 342741 CASAVA_Build 9 67875775 1D GATAGAGACA C/- AAAAAAAACT 1517 het 1517 ref 51 39 6 6 C 1 0 342742 CASAVA_Build 9 67876558 1D GTCTTTCCTG C/- TAAAAACTCT 3070 het 3070 hom 91 35 41 17 C 1 0 342743 CASAVA_Build 9 67877869 8D CCAGAATCTA CAAAAAAC/-------- CAAAAAACTT 2098 het 2098 ref 39 25 10 6 CAAAAAAC 2 1 342744 CASAVA_Build 9 67877902 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAACAC 1636 het 1636 ref 33 18 5 15 A 7 8 342745 CASAVA_Build 9 67877991 1I CATGAGAAAA -/T GCTCATCATC 3070 het 3070 hom 75 24 47 4 T 0 1 342746 CASAVA_Build 9 67879137 1D CCTATTCAGA T/- TTTTTTATGG 2744 het 2744 ref 64 48 6 10 T 7 6 342747 CASAVA_Build 9 67879209 1I TTATCATATT -/G TTTGGCATAT 3070 het 3070 hom 74 14 54 6 G 0 1 342748 CASAVA_Build 9 67880581 4D29M1D TTGTAGTTCT TTTGTTTATATATTTTATTTCTTGCTGTCTTCCT/----TTTATTTATTTTATTTCTTGCTGTCTTCC- TTTTGTCTAA 3070 het 3070 ref 91 79 14 30 N/A 0 0 342749 CASAVA_Build 9 67883225 4I TATTGTTTAC ----/TCTT TCTATTTGAG 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 TCTT 0 1 342750 CASAVA_Build 9 67884655 1D19M2D CCCACTGCAA CCACTACTTGGCTACCATATAA/-CACTACTTGGCTACCATAT-- GTTTATTCAA 3070 het 3070 ref 81 103 9 12 N/A 0 0 342751 CASAVA_Build 9 67894467 2I AATAAAGAAG --/AA ATGAAAGAAG 3070 het 3070 ref 74 44 26 4 A 1 3 342752 CASAVA_Build 9 67898163 1D ACCTAAAGGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 85 39 19 27 A 9 8 342753 CASAVA_Build 9 67898848 1I CTGGTAATAG -/C CGGTACCGTA 2183 het 2183 ref 66 19 10 37 C 1 2 342754 CASAVA_Build 9 67899480 4I AGAAGCAAAC ----/AAAG GAAGGACCTT 3070 het 3070 ref 58 23 19 16 AAAG 0 1 342755 CASAVA_Build 9 67901287 1D GGGCCCACAG C/- ACCAAGAGGA 1425 het 1425 ref 76 59 5 13 C 1 0 342756 CASAVA_Build 9 67904788 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAGAAAAG 65 het 65 ref 62 29 1 32 A 5 4 342757 CASAVA_Build 9 67912354 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 1989 hom 20 7 7 6 A 6 7 342758 CASAVA_Build 9 67917413 2I GGTTTCTAGT --/AC ACTTCATGCT 3070 het 3070 hom 91 29 53 10 AC 1 2 342759 CASAVA_Build 9 67925035 4D TACTTCTCAC ACAA/---- ACAGAAAAAG 1755 het 1755 ref 76 61 6 14 ACAA 1 0 342760 CASAVA_Build 9 67925197 2I TTATGAACTG --/AA AGTCTTTTAG 3070 het 3070 hom 77 23 47 7 A 1 3 342761 CASAVA_Build 9 67925420 1I GATCCATATC -/T GGGCACTAAG 3070 het 3070 ref 53 36 14 3 T 0 1 342762 CASAVA_Build 9 67925697 1I CATCTGAACG -/C CCAACAACAA 2927 het 2927 ref 51 28 11 14 C 2 3 342763 CASAVA_Build 9 67927797 4D TTTTATACAC TGAG/---- TGAGACAGGG 3070 het 3070 ref 78 45 15 18 TGAG 2 1 342764 CASAVA_Build 9 67928977 1I GTCCTGTCTC -/A AAAAAAAGAC 1622 het 1622 ref 70 52 4 14 A 7 8 342765 CASAVA_Build 9 67929261 1D TTCTCTGCCT C/- AGCTTCCCGA 3070 het 3070 ref 53 33 11 9 C 1 0 342766 CASAVA_Build 9 67929312 1I GCCCAAATAA -/T TTTTTTTTGT 2638 het 2638 ref 70 51 10 9 T 8 9 342767 CASAVA_Build 9 67935342 1D ATTAATTTGG A/- TATTTCCATA 1246 het 1246 ref 38 31 4 3 A 1 0 342768 CASAVA_Build 9 67936030 1D CAGGATGTGG A/- GGAACTGAAA 2734 het 2734 ref 45 23 7 17 A 1 0 342769 CASAVA_Build 9 67936066 1D GTGGGAAGGT A/- AAATGGTGCA 1822 het 1822 ref 62 40 6 19 A 4 3 342770 CASAVA_Build 9 67938801 3D GTAAGGACAC AGA/--- AGATGTGCAT 3070 het 3070 ref 58 44 12 6 AGA 2 1 342771 CASAVA_Build 9 67939692 5D TTTTTTTTTC CTTTT/----- TTTTTTTTGG 3049 het 3049 ref 51 24 8 21 CTTTT 1 0 342772 CASAVA_Build 9 67940323 1I TCCAATATCT -/C CCATCAACAC 3070 het 3070 hom 67 16 25 26 C 2 3 342773 CASAVA_Build 9 67940875 1I TGAAACAGAC -/G TTATCAGACT 3070 het 3070 ref 93 74 10 9 G 0 1 342774 CASAVA_Build 9 67944281 3D ACCACTACAA CAT/--- CCTCCTCACA 2803 het 2803 ref 61 38 10 14 CAT 1 0 342775 CASAVA_Build 9 67945054 2I ACTTCTGTGC --/GG AGAGGCTGAA 3070 het 2523 hom 66 10 41 17 G 0 2 342776 CASAVA_Build 9 67947583 1D AGAGTCTTTG C/- TTTTTGAAAA 858 het 858 ref 41 35 2 5 C 1 0 342777 CASAVA_Build 9 67948797 1D ACGGCATCTG C/- CTGGCGCCTG 3070 het 3070 ref 89 59 21 10 C 2 1 342778 CASAVA_Build 9 67949315 4I AGGTTTGACA ----/AACT AACTATTAGG 3026 het 3026 ref 56 41 8 7 AACT 1 2 342779 CASAVA_Build 9 67949840 5D ATTTTCAAAA TAAAT/----- TAATTAATGA 2325 het 2325 ref 41 27 6 8 TAAAT 1 0 342780 CASAVA_Build 9 67952925 3I TAATCAAGAC ---/TGT TGAATTACTC 3070 het 3070 ref 53 32 15 6 TGT 0 1 342781 CASAVA_Build 9 67954681 1D TTCATAGTTT G/- GGGGCCTTAC 3070 het 3070 ref 85 38 27 20 G 5 4 342782 CASAVA_Build 9 67954780 1D GGATATGCAC T/- TTTCCCTGAA 3070 het 3070 ref 74 44 18 17 T 4 3 342783 CASAVA_Build 9 67955210 1D TATTTTAATT C/- TTTAAATTGT 3070 het 3070 ref 46 33 9 4 C 1 0 342784 CASAVA_Build 9 67955487 1I ACAATTTGAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 89 48 21 20 T 8 9 342785 CASAVA_Build 9 67956710 1D CTCATTTGTA T/- TTTTTTGTCT 2796 het 2796 ref 49 34 7 9 T 7 6 342786 CASAVA_Build 9 67957540 1D TTCTGCATTC T/- TTTGATTTCC 1885 het 1885 ref 37 23 5 10 T 4 3 342787 CASAVA_Build 9 67958391 5I ACAGATTTTT -----/TTTTC TTAAAAAAAA 1864 het 1864 ref 44 25 6 13 TTTTC 0 1 342788 CASAVA_Build 9 67959295 1D ATAGATGTGT C/- CATAGGGGTA 3070 het 3070 ref 74 52 17 7 C 2 1 342789 CASAVA_Build 9 67962876 2D TAAAAAATGA TT/-- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 80 38 21 22 T 9 7 342790 CASAVA_Build 9 67965985 1I AAAGCTGAAA -/G GGAGTGCATG 3070 het 3070 ref 74 40 30 4 G 2 3 342791 CASAVA_Build 9 67966791 4I TGAATGTCTC ----/CTTA CTTTTAATAT 3070 het 3070 hom 85 38 41 6 CTTA 0 1 342792 CASAVA_Build 9 67966914 2D CCCATATGGC CT/-- GCTCCCCTGT 2259 het 2259 ref 61 49 5 10 CT 1 0 342793 CASAVA_Build 9 67968325 2I CTTGAAAAAC --/AG AGTATTTGCA 3070 het 3070 hom 73 29 36 20 AG 1 2 342794 CASAVA_Build 9 67968526 2D GCAAGAGAGG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 94 41 27 27 A 11 9 342795 CASAVA_Build 9 67969164 1D GAGATAGATC A/- AATCTTAGGT 1675 het 1675 ref 72 55 4 16 A 3 2 342796 CASAVA_Build 9 67969506 1I CTTTACAAAT -/A AAACAATTAG 2400 het 2400 ref 29 22 5 2 A 3 4 342797 CASAVA_Build 9 67971358 1D CTGTAGAAAG A/- AAAAACACTA 3070 het 3070 ref 79 52 17 11 A 6 5 342798 CASAVA_Build 9 67972305 6D ATCTATGAAA AAAAAT/------ TAAAATTAAC 3070 het 3070 ref 69 47 15 18 AAAAAT 1 0 342799 CASAVA_Build 9 67972945 1I TATAATGTAC -/A AACATGGAAC 2463 het 2463 ref 84 67 6 11 A 2 3 342800 CASAVA_Build 9 67972969 3D CTGTATCATA TTC/--- TTGTGTTCTG 1545 het 1545 ref 91 78 4 11 TTC 1 0 342801 CASAVA_Build 9 67973372 2D TCAGGAACAC TT/-- TACATTTTTA 2894 het 2894 ref 90 63 7 20 T 3 1 342802 CASAVA_Build 9 67973486 2D AAATAAAATA AT/-- ATATGTTTAC 3070 het 3070 ref 63 39 15 14 AT 3 2 342803 CASAVA_Build 9 67975123 3I TTGTCAGAAT ---/GAA GATTTCCTTT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 GAA 0 1 342804 CASAVA_Build 9 67976068 1I TGAGCAAACA -/T TTCCTTGATT 1171 het 1171 ref 93 73 4 16 T 2 3 342805 CASAVA_Build 9 67978806 4I CTCTTTCATA ----/TTAG TTCAAATGTC 3070 het 3070 hom 47 22 24 1 TTAG 0 1 342806 CASAVA_Build 9 67978874 2D TAAAAAACAA AC/-- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 78 39 24 17 AC 1 0 342807 CASAVA_Build 9 67981979 21I CATGTGTGGC ---------------------/CCAGGACAGCTTTGAATGCAG CCAACACAAA 1293 het 1293 ref 45 22 4 20 CCAGGACAGCTTTGAATGCAG 0 1 342808 CASAVA_Build 9 67982312 2I TTCAAAACTC --/TT GAGTTCTGCC 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 T 0 2 342809 CASAVA_Build 9 67984725 4I TGTACCAAAA ----/AAAT AATAAAATAA 3070 het 3070 ref 53 19 19 16 AAAT 0 1 342810 CASAVA_Build 9 67984861 1I GTTGCAGTGA -/G CCGAGATCAC 3070 het 3070 ref 84 31 37 17 G 0 1 342811 CASAVA_Build 9 67984912 5D23M1D GACTCGGCCT CAAAACAAAACAAAACAAAAACACCCAGA/-----CAAAACAAAACAAAAACACCCAG- AAAATAACGA 3070 het 3070 hom 93 22 47 34 N/A 0 0 342812 CASAVA_Build 9 67985204 8D CACCCACCCC CCTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2305 het 2305 ref 56 27 8 26 CCTTTTTT 1 0 342813 CASAVA_Build 9 67985283 1I ATAGGCACGA -/T CCCCCTGCTG 1219 het 1219 ref 47 33 4 15 T 0 1 342814 CASAVA_Build 9 67988592 3I GGATTTGACT ---/CTC CTCATAAAAT 3070 het 3070 ref 72 34 32 6 CTC 1 2 342815 CASAVA_Build 9 67992193 16D AGCACCTCCT GCTGCCTTGTGAACAA/---------------- GGTGACTTGA 3070 het 3070 ref 73 43 26 12 GCTGCCTTGTGAACAA 1 0 342816 CASAVA_Build 9 67992375 2I TGTCTCTATT --/AC AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 78 39 26 14 AC 0 1 342817 CASAVA_Build 9 67992480 1I CTCACCTAGA -/C TTAACAGCCT 3070 het 3070 hom 88 31 54 3 C 0 1 342818 CASAVA_Build 9 67993454 2I TGTGAGACCT --/TA TCTATATAAG 3070 het 3070 ref 74 47 18 9 TA 0 1 342819 CASAVA_Build 9 67993518 2D AAGGGAACAC AA/-- ACTCTCTCTA 1230 het 1230 ref 58 47 3 9 A 3 1 342820 CASAVA_Build 9 67996747 4D TAGAACACAC AAAT/---- AAACATCAGT 3070 het 3070 ref 76 62 11 5 AAAT 1 0 342821 CASAVA_Build 9 67996819 5I CAAAATTAAT -----/ACATG ATAAGAAGCA 3070 het 3070 ref 53 34 12 7 ACATG 0 1 342822 CASAVA_Build 9 68003729 4D GAGGGAAAAA CAAT/---- CAAACAACAG 3070 het 3070 ref 52 34 14 5 CAAT 1 0 342823 CASAVA_Build 9 68058421 3I CTGGGCGACA ---/GAG GAGACTCTGT 2206 het 2206 ref 36 13 8 15 GAG 1 2 342824 CASAVA_Build 9 68059084 2I AGTTCAGAGT --/AA AACAAAATTC 3070 het 3070 hom 70 24 42 5 A 2 4 342825 CASAVA_Build 9 68062863 1D TTTTAAAACA T/- TTTGGAAGTT 3070 het 3070 ref 72 51 9 14 T 4 3 342826 CASAVA_Build 9 68063055 1D TTTATAGGCC A/- AATGCTCCAC 3070 het 3070 ref 91 67 14 10 A 3 2 342827 CASAVA_Build 9 68066218 1D TTAAGTAACT C/- CCATATAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 C 3 2 342828 CASAVA_Build 9 68066894 1I TGTCAGTGCA -/T TTTTTTCATG 3070 het 141 hom 79 3 46 30 T 6 7 342829 CASAVA_Build 9 68066994 13D AAAATAGAAA CAAACAAACAAAC/------------- AAAAAAAAAA 53 het 53 ref 51 38 3 25 CAAACAAACAAAC 1 0 342830 CASAVA_Build 9 68073420 1D AGTATCATTT C/- CAATACTGGA 3070 het 3070 ref 88 69 15 5 C 2 1 342831 CASAVA_Build 9 68073604 1I GAAGATATCC -/T TTTTGCACAT 3070 het 3070 hom 88 34 48 7 T 4 5 342832 CASAVA_Build 9 68078193 2I GAAAGCAAAC --/AT ATTGGTTAAA 3070 het 3070 ref 96 70 16 10 AT 1 2 342833 CASAVA_Build 9 68081015 1D TTCCTCCACT G/- GCCCCAGGAT 3070 het 3070 ref 75 33 29 15 G 2 1 342834 CASAVA_Build 9 68082725 4D70M4I TGGGGTTTTT TTTGTTTGTTTGTTTTTTACTTTTCATGGAGATTTTCCTTAATTTAACCCAAAAGATATACCCATATGACATTT----/----TTTGTTTGTTTTTTACTTTTCATGGAGATTTTCCTTAATTTAACCCAAAAGATATACCCATATGACATTTCAAC GAATATGAAA 3070 het 3070 ref 47 37 17 57 N/A 0 0 342835 CASAVA_Build 9 68086482 3I GAAAATGAAA ---/TCT TCATTCTGAC 3070 het 3070 hom 29 7 18 4 TCT 0 1 342836 CASAVA_Build 9 68088109 2D12M2D ATGTGATTTA TTTGTAAACATATATT/--TGTAAACATATA-- ATTTTATTTG 1630 het 1630 ref 34 18 6 20 N/A 0 0 342837 CASAVA_Build 9 68088451 2D CTTTCTTAAC AA/-- AGCTTTATGA 3070 het 2302 hom 41 5 31 6 A 3 1 342838 CASAVA_Build 9 68090665 1D AATGATTTTT G/- TATGTCGATT 60 het 60 ref 11 7 1 4 G 1 0 342839 CASAVA_Build 9 68091132 1I TCCAGATATT -/A AAGAAAAAGC 3070 het 3070 ref 65 29 33 3 A 2 3 342840 CASAVA_Build 9 68092438 1D TGACCTAAGA T/- TTGATCTATC 1259 het 1259 ref 72 57 3 16 T 3 2 342841 CASAVA_Build 9 68093068 1I TTTGCAGTTC -/T TTTTTTTTTT 1154 het 1154 ref 41 18 4 19 T 10 11 342842 CASAVA_Build 9 68093274 2I TTTGCAAATA --/CT CTGTTTTTCA 3070 het 3070 ref 81 42 26 14 CT 1 2 342843 CASAVA_Build 9 68094313 1I AAATTAATAT -/A TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 33 22 8 3 A 0 1 342844 CASAVA_Build 9 68095613 1I ATCATGCACT -/C CCTTTCAGCT 3070 het 3070 hom 60 8 33 19 C 2 3 342845 CASAVA_Build 9 68098660 2I CATCCCAGCA --/GT GTGTGGCCAG 1451 het 1451 ref 26 15 4 7 GT 2 3 342846 CASAVA_Build 9 68099808 1D ACAAAGCCGC G/- CCCCCCAGCG 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 G 1 0 342847 CASAVA_Build 9 68100508 1I TGTGTCCAGA -/T TATTACACAC 3070 het 3070 ref 47 26 12 9 T 1 2 342848 CASAVA_Build 9 68103076 1D TGTACATCTA C/- AAAAAATAAG 3070 het 3070 ref 78 55 18 5 C 1 0 342849 CASAVA_Build 9 68104054 1D ACAATGGAAA T/- CAAAAGAATG 3070 het 3070 hom 50 15 22 14 T 1 0 342850 CASAVA_Build 9 68107199 3D38M1I CAAAAATACA AATAATTGGATTAGAAAATAGTCAAGATAGCTGAATAGACA-/---AATTGGATTAGAAAATAGTCAAGACAGCTGAATAGACAT TTCTCCAAAT 3070 het 202 hom 28 1 18 30 N/A 0 0 342851 CASAVA_Build 9 68108366 4I GCAGTAAGGA ----/AGAG AGAGTCTGAA 3070 het 3070 ref 79 49 29 1 AG 2 4 342852 CASAVA_Build 9 68108663 3I GGGAGTAATT ---/CAA CAGTCTTGAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 CAA 0 1 342853 CASAVA_Build 9 68110919 1I AATATATAAC -/T TTTTTGAGAT 2597 het 2597 ref 80 64 6 10 T 5 6 342854 CASAVA_Build 9 68110997 1D TTCAAGAATT C/- CTTAGGATTC 3070 het 3070 ref 94 54 34 7 C 2 1 342855 CASAVA_Build 9 68111734 4D CATTTAATCA TATT/---- TATTTATTCA 3070 het 3070 ref 78 43 12 25 TATT 3 2 342856 CASAVA_Build 9 68111752 5D TATTCATTAA TTAAT/----- TTATTTTGAA 3070 het 3070 ref 85 45 8 32 TTAAT 1 0 342857 CASAVA_Build 9 68118593 3D TTTCAATCTT ATG/--- ATATTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 31 20 2 ATG 1 0 342858 CASAVA_Build 9 68120605 1I AGTCTGATAA -/C GTCTGTTTCA 1201 het 1201 ref 57 32 3 22 C 0 1 342859 CASAVA_Build 9 68121300 1D ATAGGTATGA T/- TTCTTCTTTA 2856 het 2856 ref 33 27 6 1 T 3 2 342860 CASAVA_Build 9 68121945 1I ATTTTCAGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 72 31 26 15 T 9 10 342861 CASAVA_Build 9 68124339 1I AATTTCTTAA -/T TTTTTTTGTA 1202 het 1202 ref 83 66 5 12 T 7 8 342862 CASAVA_Build 9 68125451 1D GTTTCAGTTT C/- TCCACATCCT 2725 het 2725 ref 51 38 6 7 C 1 0 342863 CASAVA_Build 9 68133757 1D AATAGCCACA T/- TTTTTAAAGC 3070 het 3070 ref 52 39 11 3 T 6 5 342864 CASAVA_Build 9 68134230 1D CAGGAAGACT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 72 29 23 23 A 8 7 342865 CASAVA_Build 9 68135053 2D TTGATGACAT AA/-- AGTTTTAGTA 1533 het 1533 ref 36 30 4 4 A 3 1 342866 CASAVA_Build 9 68136013 1I CCTTAGTGCC -/T CGATATGGAT 2201 het 2201 ref 16 6 5 5 T 0 1 342867 CASAVA_Build 9 68136514 5I AAGCAAATAG -----/AAGAT AAGCTCAGCC 3070 het 3070 hom 80 20 52 9 AAGAT 0 1 342868 CASAVA_Build 9 68136585 2I AGCAGTGTTT --/TC TAAGATGACA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 TC 0 1 342869 CASAVA_Build 9 68162858 2D ATTATATATG TA/-- TATATATATT 2910 het 2667 hom 15 8 6 2 TA 5 4 342870 CASAVA_Build 9 68173243 1D GGGGTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 1958 het 964 hom 29 7 10 12 T 17 16 342871 CASAVA_Build 9 68202836 4D AGTAAAGTGC CTGA/---- CTAATAGAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CTGA 1 0 342872 CASAVA_Build 9 68227858 2I TGCTCTTCAC --/TG AGCCTTCATA 2721 het 2721 ref 37 27 6 4 TG 0 1 342873 CASAVA_Build 9 68278958 4D GAAGTGCCAG CCCT/---- ACAGTGGGTG 3070 het 3070 ref 73 53 18 3 CCCT 1 0 342874 CASAVA_Build 9 68284982 5I AATTAAAAAA -----/AGGTC AGGAAACAAC 3070 het 3070 ref 62 49 11 2 AGGTC 0 1 342875 CASAVA_Build 9 68285634 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAGA 3020 het 1730 hom 38 11 11 16 A 9 8 342876 CASAVA_Build 9 68297452 3I19M2I CTGGGCGACA ---GAGACTCTGTCTCAAAAAA--/GAGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAT AATAAAATAA 3070 het 3070 hom 71 27 25 37 N/A 0 0 342877 CASAVA_Build 9 68302083 1I TTTATAGGCC -/A AATGCTCCAC 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 2 3 342878 CASAVA_Build 9 68305920 1I TGTCAGTGCA -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 65 24 33 8 T 6 7 342879 CASAVA_Build 9 68307253 2D TCTCTCCCCT AG/-- AGAGAGTGTG 1183 het 1183 ref 70 48 4 18 AG 4 3 342880 CASAVA_Build 9 68308662 1I GAGACCAGCA -/C TGGGGTAACC 3070 het 3070 ref 83 34 38 11 C 0 1 342881 CASAVA_Build 9 68309695 1I CCATGAAACC -/G ATTTTTTCCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 G 0 1 342882 CASAVA_Build 9 68311957 1I GTAGGATAAG -/A AGTCATTTAG 3070 het 3070 hom 74 9 63 3 A 1 2 342883 CASAVA_Build 9 68312502 7D GTTTTATGCA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTG 2330 het 2330 ref 94 25 12 58 T 16 9 342884 CASAVA_Build 9 68317214 2I GAAAGCAAAC --/AT ATTGGTTAAA 3070 het 3070 ref 68 34 24 10 AT 1 2 342885 CASAVA_Build 9 68317977 2D TTTGAAGAAC CT/-- CTCTGGGTGT 1755 het 1755 ref 66 54 5 8 CT 3 2 342886 CASAVA_Build 9 68318302 2I GGGCAGAACT --/AA CGAGTTTTGA 3070 het 3070 ref 50 18 28 4 A 0 2 342887 CASAVA_Build 9 68318578 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 74 56 15 3 A 8 7 342888 CASAVA_Build 9 68319142 8I GAAAGGAAAG --------/GGAGGGAA GGAAGGAAGG 1418 het 1418 ref 18 6 8 4 GGAGGGAA 0 1 342889 CASAVA_Build 9 68320031 1D TTCCTCCACT G/- GCCCCAGGAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 5 G 2 1 342890 CASAVA_Build 9 68323393 1D TTTCAAAGAA T/- TTTGTTGCCT 3070 het 3070 ref 60 42 10 8 T 4 3 342891 CASAVA_Build 9 68323413 8D TGAAATATGG TGCCATAA/-------- TCACATATTA 1936 het 1936 ref 53 33 5 17 TGCCATAA 1 0 342892 CASAVA_Build 9 68327603 2I ATTTACCATT --/GG GTGTGTGTTG 3070 het 3070 hom 55 20 29 6 G 1 3 342893 CASAVA_Build 9 68328315 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTCAG 1611 het 1611 ref 58 47 4 7 T 8 7 342894 CASAVA_Build 9 68328998 3D CAGGAGTTTT ATG/--- GTTTCAGTGA 3070 het 3070 ref 49 36 10 4 ATG 1 0 342895 CASAVA_Build 9 68329491 4I ATACAGTACT ----/AACC CTTTCAATCC 3070 het 1949 hom 14 4 9 1 AACC 0 1 342896 CASAVA_Build 9 68330149 1I TCCAGATATT -/A AAGAAAAAGC 3070 het 685 hom 27 2 23 2 A 2 3 342897 CASAVA_Build 9 68333225 1D AATGGGGAAG A/- AAAAAGCAAG 1747 het 1747 ref 25 17 4 4 A 6 5 342898 CASAVA_Build 9 68333339 1D TTTTTTTTTT G/- GCTTAGACCA 3070 het 2790 hom 46 18 18 10 G 2 1 342899 CASAVA_Build 9 68336166 1I GAGTATTAAC -/A AGACTAACAG 3070 het 3052 hom 25 7 18 0 A 1 2 342900 CASAVA_Build 9 68338732 1D CCAACCTGAT C/- GTGTCCTGCT 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 C 1 0 342901 CASAVA_Build 9 68338832 1D ACAAAGCCGC G/- CCCCCCAGCG 3070 het 3070 ref 92 69 16 9 G 1 0 342902 CASAVA_Build 9 68339913 1D GGATCCCTTC A/- TTTTGGCGAC 3070 het 3070 ref 70 54 10 6 A 1 0 342903 CASAVA_Build 9 68343538 2D CAAATCATAT CA/-- CTTGTTTTTT 2389 het 2389 ref 79 43 9 33 CA 1 0 342904 CASAVA_Build 9 68345842 1D TGGTGCTGGG A/- AAAGTGCATA 3070 het 3070 ref 68 45 19 6 A 4 3 342905 CASAVA_Build 9 68346387 1I CTTAGAATGC -/T TTGTTATGAA 1161 het 1161 ref 19 14 3 2 T 2 3 342906 CASAVA_Build 9 68346432 4D CAAGGATGTG AAGA/---- AAGGGGAATG 3070 het 3070 ref 43 29 10 5 AAGA 1 0 342907 CASAVA_Build 9 68348806 1I ACAGCAACTG -/T TTGAGTTTCT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 2 3 342908 CASAVA_Build 9 68356339 1I AATATTGAGC -/A TTTCCTCCTG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 A 0 1 342909 CASAVA_Build 9 68357968 2D AAGAATTACA AC/-- ACTCTGACTT 3070 het 3070 ref 65 45 16 5 AC 2 1 342910 CASAVA_Build 9 68358928 3D GCTTAGTTTA TTT/--- TTTTTTCTTT 1299 het 741 hom 21 6 3 13 T 9 6 342911 CASAVA_Build 9 68359511 4I23M2I ATTCTTAAGT ----ATTTTATAATTTTACATTACTGT--/ATGGATTTTATAATTTTACACTACTGTCA GTAGAACTTT 3070 het 3070 ref 86 25 17 63 N/A 0 0 342912 CASAVA_Build 9 68360138 1I ATTTCTAGGT -/G TTTTTTTTTT 153 het 153 ref 31 9 3 19 G 0 1 342913 CASAVA_Build 9 68360925 2I TTACTTATTT --/TG TCTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 96 16 56 24 TG 0 1 342914 CASAVA_Build 9 68365260 1D CCCCACACAC G/- TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 70 30 34 6 G 1 0 342915 CASAVA_Build 9 68371160 1D TCGGGAAGCT G/- AGGCAGAGAA 1495 het 1495 ref 29 23 5 1 G 1 0 342916 CASAVA_Build 9 68373569 2I TCTTTGAAAG --/TC TGATAAGTAG 880 het 880 ref 26 7 4 15 TC 0 1 342917 CASAVA_Build 9 68373912 1I CTGTTTTTTT -/C CATATCAGGT 3070 het 3070 hom 72 8 20 44 C 1 2 342918 CASAVA_Build 9 68375386 4D TTCCTTTTTC TGTT/---- TGTGTGAGAA 613 het 613 ref 31 22 3 7 TGTT 1 0 342919 CASAVA_Build 9 68375413 1I AAGATTGAAC -/A AAAAATATGT 3070 het 3070 ref 57 43 11 13 A 5 6 342920 CASAVA_Build 9 68375506 5I AAGCAAATAG -----/AAGAT AAGCTCAGCC 3070 het 3070 hom 69 23 36 10 AAGAT 0 1 342921 CASAVA_Build 9 68376360 1I AGTACAATGC -/A AAGAAATATT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 2 3 342922 CASAVA_Build 9 68408657 3I AATATGCCAT ---/ATA ATATTATCCC 2984 hom 15 het 6 0 6 0 ATA 1 2 342923 CASAVA_Build 9 68416960 1D TAAACCATCC A/- AAAAAAAAAA 2018 het 2018 ref 35 13 7 15 A 15 14 342924 CASAVA_Build 9 68422199 14D CCCAGTGAGA GGTGTTTGGATCAT/-------------- GGGGGCGAGT 3070 het 3070 ref 61 39 12 13 GGTGTTTGGATCAT 1 0 342925 CASAVA_Build 9 68423302 3D TTTTCACATC ACT/--- TTCTTCTCTG 2294 het 2294 ref 46 38 6 2 ACT 1 0 342926 CASAVA_Build 9 68427208 1I GATCCTGTCC -/A AAAAAAAGAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 8 342927 CASAVA_Build 9 68428497 1D AACATATAGA T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 41 29 11 1 T 7 6 342928 CASAVA_Build 9 68443154 4D GTTTAATAAG TGTT/---- TGATGTAATT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 TGTT 1 0 342929 CASAVA_Build 9 68443965 1D TTCTCTATAC T/- TTTTTTAATA 2161 het 2161 ref 22 14 5 3 T 7 6 342930 CASAVA_Build 9 68446000 1D TCTTCTCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 25 1 14 10 T 12 11 342931 CASAVA_Build 9 68455242 8I ACAAACAAAC --------/AAACAAAA AAAAAATGCT 3070 het 2179 hom 20 8 11 1 AAACAAAA 0 1 342932 CASAVA_Build 9 68463895 3I CCCGTCCTGG ---/AAA AAAAAAAAAG 1977 het 1977 ref 28 20 6 2 A 9 12 342933 CASAVA_Build 9 68468922 6D GTGCACGTCC AGTCAT/------ AGTACCTTCC 3070 het 3070 ref 42 33 8 5 AGTCAT 1 0 342934 CASAVA_Build 9 68475486 1D CACCCCCAAG C/- CCCCCCGGGG 3070 hom 107 het 39 0 36 3 C 7 6 342935 CASAVA_Build 9 68476935 3D GCGTGTACAC CTT/--- CTGTCATATT 3070 het 3070 ref 61 37 10 15 CTT 1 0 342936 CASAVA_Build 9 68476997 1D CAACATCCCT G/- GGGGGGGTGT 3070 het 3070 ref 44 27 13 5 G 8 7 342937 CASAVA_Build 9 68477280 1I CCTGCGATAC -/T TTAATTTTTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 2 3 342938 CASAVA_Build 9 68478785 3I AGGGGAGAGC ---/ATA ATATTACTCT 3070 hom 59 het 23 0 20 3 ATA 1 2 342939 CASAVA_Build 9 68479612 2D CAACCCCCCT CC/-- GTGATGTTGT 1846 het 725 hom 11 4 7 0 C 2 0 342940 CASAVA_Build 9 68493874 3I AAAGGGAGTA ---/TTG TTAGTTTTCC 2901 hom 21 het 8 0 6 2 TTG 0 1 342941 CASAVA_Build 9 68495616 1D TGTGTATTGA T/- TTTTTTTTTG 1229 het 1229 ref 17 13 3 1 T 10 9 342942 CASAVA_Build 9 68502838 1D ATGTATCCTT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 53 35 9 9 A 8 7 342943 CASAVA_Build 9 68503391 4I TAACACAATG ----/GTAA GTATTTGTGT 1471 hom 7 het 4 0 3 1 GTAA 0 1 342944 CASAVA_Build 9 68504040 1D GCCTGTCAAA G/- CGCTAGGATT 3070 het 3070 ref 43 33 10 0 G 1 0 342945 CASAVA_Build 9 68507437 2D AAGAACTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 16 0 13 3 T 13 11 342946 CASAVA_Build 9 68508583 1I TTAAAAAAAA -/C ACACACATTC 1249 het 1249 ref 17 14 3 0 C 0 1 342947 CASAVA_Build 9 68509395 1I ATATGCTTTT -/C CCTTATGTTC 3042 hom 21 het 10 0 7 3 C 2 3 342948 CASAVA_Build 9 68536375 4D AAGAATGAGT TTAA/---- TTATGCCTAA 3070 het 3070 ref 43 21 8 14 TTAA 1 0 342949 CASAVA_Build 9 68536775 1D CTACAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2929 hom 24 13 10 1 T 12 11 342950 CASAVA_Build 9 68544369 3I ATACAATATA ---/TTT TTCTTTCTTA 1440 het 1440 ref 12 8 3 1 T 2 5 342951 CASAVA_Build 9 68546268 1D TTGATAGTCA T/- TTTTTTTTTT 1380 het 1380 ref 35 28 3 5 T 11 10 342952 CASAVA_Build 9 68556550 1I AGACGAGTTT -/C TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 20 8 1 C 0 1 342953 CASAVA_Build 9 68559792 1D TATGTGTATA T/- ATATAGTATT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 T 1 0 342954 CASAVA_Build 9 68623334 6I GGAGTCCCAG ------/AAGAAC AAGAACACTG 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 AAGAAC 1 2 342955 CASAVA_Build 9 68629042 3I ATAACAAATA ---/TTT TTTTTTCAAA 3070 het 2448 hom 23 6 16 1 T 6 9 342956 CASAVA_Build 9 68629523 1D ATACTCATCA C/- CAGCAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 26 8 0 C 2 1 342957 CASAVA_Build 9 68632754 2D TAATCTGAGA TT/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 22 11 5 T 2 0 342958 CASAVA_Build 9 68636780 3D ATTGGCAGGG AGC/--- AGCAACCTAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AGC 2 1 342959 CASAVA_Build 9 68638752 1I TGAAACCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 11 12 342960 CASAVA_Build 9 68639718 1D AATTCAGAAC T/- TTAAAAATAA 3070 het 3070 ref 91 68 11 12 T 3 2 342961 CASAVA_Build 9 68640103 3D TTCTATTAGT TAA/--- TAATTCTACA 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 TAA 2 1 342962 CASAVA_Build 9 68640179 5D TTTTAGACTA TACTT/----- TATTAGTAAA 3070 het 3070 ref 38 30 7 3 TACTT 1 0 342963 CASAVA_Build 9 68642662 2I TTCAACTTTC --/TT TCTCTTTTTT 2922 het 2922 ref 39 18 12 9 T 1 3 342964 CASAVA_Build 9 68647083 1D TATTTAAATC T/- TTTATTTTGA 1468 hom 7 het 3 0 3 0 T 4 3 342965 CASAVA_Build 9 68666229 1D CAAAAGATGC T/- CCTATCACCT 1721 het 1721 ref 16 12 4 0 T 1 0 342966 CASAVA_Build 9 68666653 1I TTGAGGGGGG -/T GGGTCTCACT 3070 het 471 hom 17 1 11 5 T 0 1 342967 CASAVA_Build 9 68668324 1D CTCTTTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1291 hom 22 5 14 3 A 13 12 342968 CASAVA_Build 9 68669384 1D GTGTTATGGG A/- GAAGGCAGAC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 1 0 342969 CASAVA_Build 9 68677149 1D AATAATAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 647 hom 29 2 24 3 A 11 10 342970 CASAVA_Build 9 68677598 3I TCAATTAGAA ---/TAG TAGCAAATCC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 TAG 1 2 342971 CASAVA_Build 9 68681000 2D CGCTCAAGAC AT/-- GTGTGGACGA 3070 het 3070 ref 72 54 14 4 AT 1 0 342972 CASAVA_Build 9 68702671 1I ATGTACTTTG -/T GTTTACTCCC 1274 hom 7 het 3 0 3 0 T 0 1 342973 CASAVA_Build 9 68709567 1D CACAGGATTC A/- AAAAAAAAAA 787 het 787 ref 15 8 4 3 A 13 12 342974 CASAVA_Build 9 68710071 4I TATTATTCAT ----/CTTA CTTTTATTAA 1948 het 1948 ref 13 7 5 1 CTTA 0 1 342975 CASAVA_Build 9 68714503 3D ACTGCTGAAA TAG/--- TAATTTTAAT 3070 het 3070 ref 52 38 13 3 TAG 1 0 342976 CASAVA_Build 9 68715283 2I TGTTGTGTAA --/GC AAGAGAATAC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 GC 0 1 342977 CASAVA_Build 9 68715685 1I AGCTAGTTGA -/G ATTATATAAC 3070 het 3070 hom 54 19 29 6 G 0 1 342978 CASAVA_Build 9 68715786 4I AATGTACTTA ----/TTAT TTTTTTTATA 2103 het 2103 ref 65 51 6 8 TTAT 0 1 342979 CASAVA_Build 9 68716464 4I GGCAACCACC ----/ATCT ATCTACTTTT 3070 het 468 hom 48 2 43 3 ATCT 1 2 342980 CASAVA_Build 9 68719701 1I TGATGAAAAA -/T AGATTTCTGA 2964 het 2964 ref 43 32 7 4 T 0 1 342981 CASAVA_Build 9 68720069 1D TCTTTTTTTT A/- AACTAACCCT 3070 het 3070 ref 56 41 9 7 A 3 2 342982 CASAVA_Build 9 68720338 1I TTTTAAACAC -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 44 19 17 8 T 7 8 342983 CASAVA_Build 9 68723778 1I AATTTGGGGT -/A GGGGGTAACA 3070 het 2754 hom 32 8 21 3 A 0 1 342984 CASAVA_Build 9 68723998 1I CACCTTCTTT -/G TATAGATTTG 3070 hom 18 het 10 0 7 3 G 0 1 342985 CASAVA_Build 9 68728338 1D TCAATGATAG C/- AATTTATTCA 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 C 1 0 342986 CASAVA_Build 9 68733158 4I5M1D TTCTGTTGAC ----TTATGC/TGAATTCTG- ATGTTTAGTA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 N/A 0 0 342987 CASAVA_Build 9 68738266 1I CAGTTACTCC -/T CAGAACCCAC 1827 het 1827 ref 26 18 4 4 T 0 1 342988 CASAVA_Build 9 68741532 1I CGCTGCCTTT -/G GGGCTCCAAT 2401 hom 18 het 9 0 7 2 G 3 4 342989 CASAVA_Build 9 68742364 1I AGAGATACTA -/T TTTTTTCAAA 1759 het 1759 ref 15 6 4 5 T 6 7 342990 CASAVA_Build 9 68744147 1D TTAAATGGGG T/- TTTGTGTTAT 1910 het 1063 hom 9 4 4 1 T 4 3 342991 CASAVA_Build 9 68747474 1I GAGGTGTGTT -/G GGGGGGTGGA 3070 het 2305 hom 27 9 8 10 G 6 7 342992 CASAVA_Build 9 68750013 1I GCCTTCTGGG -/T TTTGGACTTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 3 4 342993 CASAVA_Build 9 68754406 2D TTGGTGGGTC TG/-- TGAATCTGGG 3070 het 3051 hom 32 12 14 7 TG 2 1 342994 CASAVA_Build 9 68758977 1I TTCATAGACC -/G CCCCCCCAAA 3070 het 8 hom 22 1 8 13 G 0 1 342995 CASAVA_Build 9 68768118 1I TGGATAAAGG -/A AGGGACAGTC 2506 het 2506 ref 40 28 6 6 A 1 2 342996 CASAVA_Build 9 68768334 3D GATGAAAATA AGG/--- AGGAGTTGTC 1873 het 1873 ref 20 13 4 3 AGG 2 1 342997 CASAVA_Build 9 68772241 1D ATGAAACTGC T/- GGGAATGAGG 3070 het 2480 hom 20 7 11 2 T 1 0 342998 CASAVA_Build 9 68775554 1D GAAGTTTCAT A/- ATGTCTCATA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 2 1 342999 CASAVA_Build 9 68778466 1I GAATGTCCAA -/C CTTTTGGCTT 3070 het 3070 hom 54 20 27 7 C 1 2 343000 CASAVA_Build 9 68779246 1I ATGCTCTGTG -/A AAAAAATTAG 3001 het 654 hom 12 2 7 3 A 6 7 343001 CASAVA_Build 9 68779812 1I TGGAGAGGGT -/G GGGGTCAAGG 3070 hom 102 het 36 0 32 4 G 4 5 343002 CASAVA_Build 9 68780797 4I AGCAATAGTT ----/ACTC AATGAAAGAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 ACTC 0 1 343003 CASAVA_Build 9 68782683 3D GGAGTAAAAT ATC/--- ATTCTTCCTC 3070 het 3070 ref 49 28 17 7 ATC 1 0 343004 CASAVA_Build 9 68783908 1I TATTTATCCT -/A GTACTAATGT 1879 het 1879 ref 29 22 4 3 A 0 1 343005 CASAVA_Build 9 68790425 4D CTCAAAAATA AAAT/---- AAAGTGTTGA 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 AAAT 1 0 343006 CASAVA_Build 9 68792141 1D ATCTACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 19 1 10 8 T 11 10 343007 CASAVA_Build 9 68794167 11I TGAGGAATGT -----------/GCTTGAAAGTA GCTGTACTGG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GCTTGAAAGTA 0 1 343008 CASAVA_Build 9 68796813 1D TGTATATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 37 1 27 9 T 11 10 343009 CASAVA_Build 9 68797143 1I AAGACCATCT -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 57 24 26 7 A 7 8 343010 CASAVA_Build 9 68797858 1I TGACTAGCCT -/G AGGTCACTCA 3070 hom 148 het 57 0 54 3 G 0 1 343011 CASAVA_Build 9 68799437 1I CAGTAATTAC -/T TTTAATAAAA 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 T 3 4 343012 CASAVA_Build 9 68804582 1D TTATGAGGAC A/- ACATCATACA 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 2 1 343013 CASAVA_Build 9 68808696 4I TACATTTCTT ----/TTCC TTTTTTTTTT 1420 het 51 hom 16 1 5 10 TTCC 0 1 343014 CASAVA_Build 9 68808910 4D CTCGTGATCT GCTC/---- GCCTCGGCCT 2369 het 2261 hom 13 6 5 2 GCTC 1 0 343015 CASAVA_Build 9 68839780 1D AAAAATCACC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 29 het 20 0 10 10 A 9 8 343016 CASAVA_Build 9 68840608 2D28M1D ATCTGTCAAT AAAAAGTAAAAGCTACCAAAGTGGGAATTCT/--AAAGTAAAAGCTACCAAAGTGGGAATTC- AAAATTATAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 N/A 0 0 343017 CASAVA_Build 9 68840751 4I CATGGAAGTA ----/TTAT TTATGTACAA 3070 hom 42 het 15 0 14 1 TTAT 1 2 343018 CASAVA_Build 9 68852585 1I AAAATAATAC -/A AAAAATACAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 5 6 343019 CASAVA_Build 9 68855483 2D AGGTGCCCCT AA/-- AAGGTTCAGG 2937 hom 18 het 8 0 6 2 A 4 2 343020 CASAVA_Build 9 68860067 1I TATGACTGAC -/A AAAATCAAAG 2361 hom 15 het 7 0 6 1 A 4 5 343021 CASAVA_Build 9 68861431 1I AAGTAAAGGA -/T AAAGGTAGAT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 0 1 343022 CASAVA_Build 9 68878577 1I15M1I TGGTAGGCTA -TAATTACTGCCTCAA-/TTAATTACTGCCTCAAT TTTCAGAACT 1471 hom 7 het 4 0 3 1 N/A 0 0 343023 CASAVA_Build 9 68893657 1D AAGGCTAATC T/- ATTGTCTGGT 1446 het 1446 ref 9 6 3 0 T 1 0 343024 CASAVA_Build 9 68894904 1D TGTTCTTGGT G/- GTAATATATC 1357 het 1357 ref 8 3 3 2 G 2 1 343025 CASAVA_Build 9 68900822 2I ACTGAGAATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 31 hom 12 1 10 1 TG 6 7 343026 CASAVA_Build 9 68930406 1D AGCTAAGGTA C/- AGAGCATAGA 1801 het 1801 ref 11 7 4 0 C 1 0 343027 CASAVA_Build 9 68931916 1I CTTCCTCTAG -/C CATGCACCTG 2867 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 343028 CASAVA_Build 9 68934324 1D AGTAGATGTG C/- AATAAGTATT 3058 het 838 hom 11 3 7 1 C 1 0 343029 CASAVA_Build 9 68942782 1D GCTGAGGGGG T/- ACCCTGATAA 3070 het 3070 hom 23 8 8 7 T 1 0 343030 CASAVA_Build 9 68953168 1I GAGCATGTTT -/G GGGCATCAAT 3070 het 808 hom 15 2 10 3 G 3 4 343031 CASAVA_Build 9 68960943 4I TATGAATATT ----/TATA TATATATTTG 2147 het 417 hom 9 1 6 2 TA 3 5 343032 CASAVA_Build 9 69027741 1D28M5D GATGAAAAAT GATACGAAAAATGATATAAAAAATATGACATGAA/-ATACGAAAAATGATATAAAAAATATGAC----- ATGAAATGAG 3070 het 3070 ref 30 36 11 13 N/A 0 0 343033 CASAVA_Build 9 69041842 3D GTAGTTTTTT TTG/--- TTTTTGTTTT 2304 het 639 hom 23 7 10 6 TTG 1 0 343034 CASAVA_Build 9 69054174 6I3M1D TTCTAATTGG ------TATC/ATACCTTAT- TTATTACTAT 2828 het 2828 ref 16 9 6 1 N/A 0 0 343035 CASAVA_Build 9 69065909 5D6M5D ATATATATAT ATATATATATATGGGT/-----TACATA----- TTATTACATA 1343 het 1143 hom 18 5 3 10 N/A 0 0 343036 CASAVA_Build 9 69067315 1D CACTCTGTTG A/- CAGTAATAAG 2224 het 2224 ref 93 82 6 6 A 1 0 343037 CASAVA_Build 9 69068399 1I AAGATGATAA -/C TGTGTCACGC 3070 het 3070 hom 88 36 43 9 C 0 1 343038 CASAVA_Build 9 69068589 2D TATTTCAAAA TC/-- TCTGTTTCAC 3070 het 3070 ref 71 40 23 8 TC 2 1 343039 CASAVA_Build 9 69077802 4D AGATAGAGGT AACA/---- AACTTAAATA 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 AACA 1 0 343040 CASAVA_Build 9 69078398 4D AAGAGGAAAA AATT/---- AATAACCATC 1842 het 1842 ref 16 12 4 4 AATT 1 0 343041 CASAVA_Build 9 69079318 3I ATTCCCCAGA ---/GTT GTTGTGTTTT 3070 het 2843 hom 23 12 10 1 GTT 1 2 343042 CASAVA_Build 9 69081151 4I AAGAAAAGTA ----/AAAG GGAGGAGGAG 521 het 6 hom 15 0 4 14 AAAG 0 1 343043 CASAVA_Build 9 69084495 2I TATTTTAGAG --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 47 21 15 11 T 8 10 343044 CASAVA_Build 9 69085118 2I TAAAATGGTT --/AA GTTATTAATT 3070 het 1804 hom 28 4 9 15 A 0 2 343045 CASAVA_Build 9 69085151 8I TTTTTACCTT --------/AAAAAAAG AGAAAATAGC 3070 hom 36 het 26 0 13 13 AAAAAAAG 0 1 343046 CASAVA_Build 9 69087654 4D CTTTCCTTCC CTCT/---- TTCTTTCTTG 3070 het 3070 hom 30 14 12 5 CT 2 0 343047 CASAVA_Build 9 69093826 3I ATCAGGCCTC ---/TCT TCTTCTAATG 3070 het 3070 ref 52 34 9 9 TCT 2 3 343048 CASAVA_Build 9 69094888 2D CTCTATGATT TC/-- TGTTCAGCTT 3070 het 3070 ref 52 34 17 3 TC 1 0 343049 CASAVA_Build 9 69095566 1D AACCTTGGTG C/- TACTTACCTT 2065 het 2065 ref 50 34 6 10 C 1 0 343050 CASAVA_Build 9 69097978 1D TAGTATTTTT C/- CAGCAGATGG 1404 het 1404 ref 40 27 4 9 C 2 1 343051 CASAVA_Build 9 69098254 3D24M1I CTTATCAAGG AGAAGAACTCAAGCTGATTATTCTTTT-/---AGAACTCAAGCTGATTATTCTTTTA TTTTCTCTTC 1782 het 1782 ref 51 61 4 7 N/A 0 0 343052 CASAVA_Build 9 69099969 3I GCCAGGGAAG ---/TAT TGTTCTTCCA 2264 het 2264 ref 62 51 5 6 TAT 0 1 343053 CASAVA_Build 9 69100757 3I TTATCTATTT ---/GGA GCAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 82 65 7 10 GGA 0 1 343054 CASAVA_Build 9 69101457 1I CTTTCTCTAC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 60 45 9 6 T 8 9 343055 CASAVA_Build 9 69108038 4D GGGTTCTGAG TGTT/---- TGTCCCTCAC 2323 het 2323 ref 69 58 8 7 TGTT 1 0 343056 CASAVA_Build 9 69113065 1I CAGATATAGT -/A TCTACTATGT 1994 het 1994 ref 81 70 5 6 A 0 1 343057 CASAVA_Build 9 69113288 1I TGTTTAGAGA -/G GAAACTGTCT 3070 het 3070 ref 72 55 7 10 G 1 2 343058 CASAVA_Build 9 69115457 1I TCAGAGTGTA -/T CCCTTTGAGC 3070 het 3070 ref 62 45 14 3 T 0 1 343059 CASAVA_Build 9 69117191 6D17M2D AACTCCGTCC CGAAAAAAAAAAAAAAAATCAATAA/------AGAAAAAAAAAATCAAT-- GAGATAAACA 1776 het 1776 ref 63 47 6 22 N/A 0 0 343060 CASAVA_Build 9 69119360 2D GAAAATTTGT TC/-- TGTTATAATT 3070 het 3070 ref 69 49 15 6 TC 1 0 343061 CASAVA_Build 9 69121107 1I CTTTTATTGC -/T TTTGGGGATA 3070 hom 136 het 60 0 49 11 T 3 4 343062 CASAVA_Build 9 69122394 1I ATGTACAGAA -/T TTTTTTTCTT 2716 het 2716 ref 81 70 6 5 T 7 8 343063 CASAVA_Build 9 69122580 1D ATCAGTTTAG T/- TTTTTGCCTA 3070 het 3070 ref 90 52 31 9 T 6 5 343064 CASAVA_Build 9 69122854 1I TTTCCATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 88 55 17 16 T 9 10 343065 CASAVA_Build 9 69123109 15D ATTTTGCATG TATCATCTTTTTTTT/--------------- TACTACAGTC 3070 het 3070 ref 56 47 12 3 TATCATCTTTTTTTT 1 0 343066 CASAVA_Build 9 69123409 2D TTCTTTCACA AT/-- ATATGTTTCA 3070 het 3070 ref 64 49 12 6 AT 3 2 343067 CASAVA_Build 9 69125511 5D TAAGTATTGG TATAC/----- TATATTTATA 1266 het 1266 ref 27 22 3 3 TATAC 1 0 343068 CASAVA_Build 9 69126526 1D ATTTTCCCTA T/- TTTTTTCTTT 1842 het 1842 ref 54 42 5 8 T 7 6 343069 CASAVA_Build 9 69128765 1I ATAAACTTGT -/A ATTATCTAGG 3070 het 3070 ref 70 53 9 8 A 1 2 343070 CASAVA_Build 9 69130579 1D GTCAATTTTG T/- TCCTTTTTTA 2714 het 2714 ref 54 43 6 5 T 2 1 343071 CASAVA_Build 9 69131633 1I GTCTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 14 7 A 12 13 343072 CASAVA_Build 9 69132293 2I TCTTTGTATA --/TT TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 90 56 15 19 T 6 8 343073 CASAVA_Build 9 69133143 1D TTTAATGACC T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 55 23 29 3 T 7 6 343074 CASAVA_Build 9 69134817 5D TTTTTTTTTT TTTAC/----- TTCTTAGGCC 3070 het 906 hom 33 6 11 16 TTTAC 1 0 343075 CASAVA_Build 9 69146595 2D AACAACAAAA AT/-- AAAAATTAAA 3070 het 3070 ref 32 22 7 4 AT 1 0 343076 CASAVA_Build 9 69148896 1I AACTTTAATA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 56 42 9 5 T 6 7 343077 CASAVA_Build 9 69156661 4I AGAAAGAACA ----/TGTG TGTGTGTGCA 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 TG 4 6 343078 CASAVA_Build 9 69162969 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AATGATAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 AAG 0 1 343079 CASAVA_Build 9 69166206 3I TCTTCTCTTC ---/TCT TCTTCTTGTT 2608 het 2608 ref 24 15 7 2 TCT 2 3 343080 CASAVA_Build 9 69167123 1I AGAACTTCTT -/A AAAACTTCCT 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 A 4 5 343081 CASAVA_Build 9 69168543 1I23M5D TTAGGCAAAG -AGATAATAATCCCTGAAAAAGAGAAAAA/AAGATAATAATCCCTGAAAAACAG----- AAAAAAAAAC 2154 het 2154 ref 29 28 5 4 N/A 0 0 343082 CASAVA_Build 9 69171123 1I AGTTAAAAAA -/G TTAATCAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 G 0 1 343083 CASAVA_Build 9 69171891 2D CTTCCTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 2617 het 2617 ref 15 9 6 2 A 12 10 343084 CASAVA_Build 9 69172042 4D GGGGGTGGGG GGCA/---- GAGTGAGATC 2623 het 2623 ref 35 28 6 1 GGCA 1 0 343085 CASAVA_Build 9 69172118 1I TTGTTAGTTA -/T GTTCATCTAA 810 het 810 ref 19 12 2 5 T 0 1 343086 CASAVA_Build 9 69174191 1I CTTACTGCAT -/C CTTTTAGGTT 3070 het 3070 ref 49 30 12 7 C 1 2 343087 CASAVA_Build 9 69174950 1D GGACCAACTA C/- GTCATAAAAG 914 het 914 ref 14 11 2 2 C 1 0 343088 CASAVA_Build 9 69179494 2I AAGAATTAGA --/GT TGTAAGGAGG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 GT 0 1 343089 CASAVA_Build 9 69181988 2D TACAAAAAAA AG/-- AAAAAACAAA 2920 het 2920 ref 18 11 6 2 AG 1 0 343090 CASAVA_Build 9 69195091 1I CAAAACAAAC -/A AAAAAACCAC 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 6 7 343091 CASAVA_Build 9 69202425 3D AGAATATTTT CTC/--- CTATGTTTTT 1733 het 1470 hom 11 4 4 4 CTC 1 0 343092 CASAVA_Build 9 69205348 5I TTGATTCCAT -----/ACAAC ACATGTTTTT 1343 het 1343 ref 46 37 3 6 ACAAC 0 1 343093 CASAVA_Build 9 69214781 1D ATGTAGAGAA C/- ATGGAACAAA 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 C 1 0 343094 CASAVA_Build 9 69214962 1D TGCTGTTTTA T/- TTTTTCTCCC 3070 het 3070 ref 26 15 11 2 T 6 5 343095 CASAVA_Build 9 69223562 8D AGAGATAATT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 1826 het 1826 ref 26 22 5 4 TC 11 7 343096 CASAVA_Build 9 69235446 3I ATAATAATAA ---/TAG TAATAATGCT 2482 het 2482 ref 28 20 6 2 TAG 0 1 343097 CASAVA_Build 9 69237954 1D GCATTCTGAG A/- AACTTCTTTG 2664 het 2664 ref 20 14 6 0 A 3 2 343098 CASAVA_Build 9 69241372 1D GGCGGAAAAC A/- AAATATTTTC 3070 het 3070 ref 52 33 14 5 A 4 3 343099 CASAVA_Build 9 69241801 1I TGAATCATTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 71 47 15 9 T 8 9 343100 CASAVA_Build 9 69247492 1I CTTCTTCGAG -/A ATGTGTGCGT 3070 het 3070 ref 65 52 7 6 A 1 2 343101 CASAVA_Build 9 69248100 1I TCTAGAGCAC -/T TTGAGGCCTA 3070 het 3070 ref 78 58 8 12 T 2 3 343102 CASAVA_Build 9 69249152 1D AGGAAATATC T/- TCACATAAAA 3070 het 3070 ref 48 37 9 2 T 2 1 343103 CASAVA_Build 9 69254460 1I AATATCTTCA -/C AAAAAATCTA 1558 het 1558 ref 9 5 4 0 C 0 1 343104 CASAVA_Build 9 69255587 1D TGAAACTCTC T/- TTTTGTTGAA 1895 het 1895 ref 22 18 4 0 T 5 4 343105 CASAVA_Build 9 69257875 1I AAATATCTTC -/A CATAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 A 0 1 343106 CASAVA_Build 9 69259764 3D AAAACTAGAC AGA/--- AGAATACTGT 2506 het 1102 hom 12 3 7 3 AGA 2 1 343107 CASAVA_Build 9 69266944 1D TAGACAGAAG C/- TTTCTCAGAA 3070 het 3070 ref 43 32 10 1 C 1 0 343108 CASAVA_Build 9 69268537 2I TGAAACTATC --/TT TATATAGAGC 1920 hom 12 het 11 0 5 6 T 1 3 343109 CASAVA_Build 9 69273707 1D ATTTGGACTG C/- TTTGAGGCCT 2606 het 2606 ref 34 16 6 16 C 1 0 343110 CASAVA_Build 9 69279712 1I GAGAAGCATT -/C CTCAGAAACT 2209 het 2209 ref 43 30 5 8 C 1 2 343111 CASAVA_Build 9 69280138 1D ACTCTTTTTG T/- AGAATTTGCA 3070 het 3070 ref 68 41 20 7 T 1 0 343112 CASAVA_Build 9 69286346 1D ATGTTCACAT A/- AAAACTAGAC 2858 het 2858 ref 35 22 6 7 A 5 4 343113 CASAVA_Build 9 69403297 2I TCCAAAAGAA --/AC ATGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 47 14 27 6 AC 0 1 343114 CASAVA_Build 9 69409945 1I AGCAAAAAAA -/G ATAAAGAATA 1490 het 831 hom 8 2 4 2 G 0 1 343115 CASAVA_Build 9 69412706 3D19M1I ACTATTTTTT TAAAAACTACGGGGCAAAAAAC-/---AAACTAAGGGGCAAAAAACA AAAAAACCAA 3070 het 2343 hom 13 5 7 3 N/A 0 0 343116 CASAVA_Build 9 69416374 1D GCCCCGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1138 hom 29 7 18 4 T 11 10 343117 CASAVA_Build 9 69425762 3D TCATTGGCAA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 1705 hom 24 7 13 4 T 12 9 343118 CASAVA_Build 9 69428843 2I24M2I19M4D TTATAAATAA --ATATATATATGTGTGTGTGTGTGC--ATATATATGTATGTGTGTGCGTA/ATATATATATATGTGTGTGTGTGTGCATATATATATGTATGTGTGTG---- TGTATATATA 1748 het 1268 hom 17 6 6 7 N/A 0 0 343119 CASAVA_Build 9 69442912 4I GAAAACTGAT ----/TGGC TGGGGGATGA 2075 het 2075 ref 24 14 5 5 TGGC 0 1 343120 CASAVA_Build 9 69444464 4I TCCTGTCTTC ----/GAAA AGAACTAGAT 1442 het 1442 ref 15 7 3 5 GAAA 0 1 343121 CASAVA_Build 9 69451960 1I AACATGAAAG -/A AATCAAAGGT 1973 hom 10 het 4 0 4 0 A 2 3 343122 CASAVA_Build 9 69452337 1D CTTTCTTTCC T/- CTTATTCTTC 2718 hom 18 het 15 0 6 9 T 1 0 343123 CASAVA_Build 9 69452771 4D CCTTCCTTCT TTCC/---- TTCCTTCTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 10 TTCC 2 1 343124 CASAVA_Build 9 69473395 1D TTTTAAGATG A/- AAAGGAACAT 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 A 4 3 343125 CASAVA_Build 9 69478454 1D TTCTTGTATC T/- TTTTTTTTTT 1986 het 1986 ref 64 43 6 15 T 11 10 343126 CASAVA_Build 9 69483957 3D AAGAACTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 14 11 343127 CASAVA_Build 9 69484960 3D AACTTTATAC GTT/--- ATTTAGTGAC 1857 het 1633 hom 10 5 4 2 GTT 1 0 343128 CASAVA_Build 9 69485096 2D AAAATTTCTT AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 330 hom 8 1 7 0 A 10 8 343129 CASAVA_Build 9 69496437 2D TTTTTGTATT TC/-- TTTTATACCC 2852 het 2396 hom 14 6 7 4 TC 1 0 343130 CASAVA_Build 9 69498527 4D ATTTTAAAAC TGAG/---- TAAGAGAATG 1790 het 1790 ref 16 9 4 3 TGAG 1 0 343131 CASAVA_Build 9 69506069 2D ATTATTATAC AT/-- ATATATATAT 1729 hom 10 het 4 0 4 0 AT 7 6 343132 CASAVA_Build 9 69717896 1D TAATTTGACC A/- AAAAAAAAGT 1893 het 1893 ref 15 10 4 1 A 9 8 343133 CASAVA_Build 9 69724581 1D AATGAAGGCA T/- TTTTTTCTTG 2383 het 2383 ref 30 16 5 9 T 7 6 343134 CASAVA_Build 9 69728831 1I TTTTAAAAAA -/C AAAAGCAGTT 2649 hom 20 het 9 0 6 3 C 0 1 343135 CASAVA_Build 9 69728900 1D GTCTCTAGCA C/- ACAACTAGGA 2267 het 2267 ref 19 12 5 2 C 1 0 343136 CASAVA_Build 9 69734125 1D AATAGACGAG T/- TTTTTTTTTT 2331 het 1499 hom 12 5 5 2 T 11 10 343137 CASAVA_Build 9 69736362 1I GGGCAAAATG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 26 10 8 8 A 8 9 343138 CASAVA_Build 9 69739034 1D TCTCCAAAGG A/- AAAAAAAAAG 2788 het 2788 ref 36 22 6 8 A 10 9 343139 CASAVA_Build 9 69742029 1I ATGTTACCTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 A 8 9 343140 CASAVA_Build 9 69745482 1I CCTCTGATTC -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 42 27 8 7 T 6 7 343141 CASAVA_Build 9 69745589 1I TACCATATAT -/A TTATCATTAA 3070 het 3070 ref 26 17 7 2 A 0 1 343142 CASAVA_Build 9 69796740 1I ATGTTATTTT -/A AATCTTACCC 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 2 3 343143 CASAVA_Build 9 69804950 1D TTTTTTTCTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 2540 hom 20 6 11 3 T 7 6 343144 CASAVA_Build 9 69810283 1I TGTTTTACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 63 34 27 2 T 9 10 343145 CASAVA_Build 9 69810450 1I ATTTTTGTGG -/T TTTTTTTTAG 1357 het 1357 ref 41 33 3 5 T 8 9 343146 CASAVA_Build 9 69810781 8I TGTATCTATC --------/TATCTATT TATCTATCTA 2774 het 186 hom 17 2 6 9 TATCTATT 0 1 343147 CASAVA_Build 9 69812560 5D TAAAGCAGAA ATAAC/----- AGAAGTTGAA 2230 het 2230 ref 11 6 5 2 ATAAC 1 0 343148 CASAVA_Build 9 69819331 1I AAAACTTAAC -/T ATTAAGATGG 3070 het 3070 hom 47 18 19 10 T 0 1 343149 CASAVA_Build 9 69822861 1I CAGATGCTGA -/T TTTTTTTAAT 1716 het 1716 ref 34 28 4 2 T 7 8 343150 CASAVA_Build 9 69825460 10I GCAATACTTC ----------/TGCATTCCAG ACAGTAAAAT 3070 het 3070 ref 36 24 8 4 TGCATTCCAG 0 1 343151 CASAVA_Build 9 69825808 2D AATAACAATC AT/-- ATGTATAACA 1889 het 1889 ref 31 25 4 2 AT 2 1 343152 CASAVA_Build 9 69831741 3D ATTACTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 865 hom 38 5 27 9 T 14 11 343153 CASAVA_Build 9 69834459 4D TGTTTCAGGG CTAA/---- CTAACTTACT 1866 het 1866 ref 37 32 4 1 CTAA 2 1 343154 CASAVA_Build 9 69837043 1I AAAATAGGTT -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 hom 45 24 18 3 A 6 7 343155 CASAVA_Build 9 69842012 1D ATGTGGAACA T/- TTCAAACTAC 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 T 3 2 343156 CASAVA_Build 9 69842803 1I GCCACTGGAC -/A TTTAAAAAAT 2878 het 2878 ref 29 21 6 2 A 0 1 343157 CASAVA_Build 9 69847160 1D CTTAGAATTG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 1662 hom 13 4 9 0 A 9 8 343158 CASAVA_Build 9 69850354 1I TAATATTACT -/C AGCAATCACA 3070 het 3070 hom 49 17 28 4 C 0 1 343159 CASAVA_Build 9 69857898 1D AGCAACTGGC A/- AACAGGAAGC 1334 het 1334 ref 20 16 3 2 A 3 2 343160 CASAVA_Build 9 69858044 1D GTTTATTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1402 hom 30 5 17 8 T 11 10 343161 CASAVA_Build 9 69860694 1D TATGTAAAAA G/- AAACAAAGTT 1619 het 1619 ref 73 64 5 6 G 1 0 343162 CASAVA_Build 9 69863101 4I ATATATACAC ----/ACAG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 36 17 13 6 ACAG 0 1 343163 CASAVA_Build 9 69864383 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 T 10 9 343164 CASAVA_Build 9 69867408 8I TACAATATAC --------/ATACATAA GTTCTGTGAA 3070 het 3070 hom 61 18 41 2 ATACATAA 0 1 343165 CASAVA_Build 9 69871989 1D AATGTTGTTA C/- TTCATGATAC 1410 het 1410 ref 25 18 3 4 C 1 0 343166 CASAVA_Build 9 69878887 3D AAGTATTTTT CTG/--- CTTTCAGTTT 1944 het 1944 ref 9 5 4 2 CTG 1 0 343167 CASAVA_Build 9 69880725 11I AAAACTCACA -----------/CATTCTGGTGG CAACTGCCAT 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 CATTCTGGTGG 0 1 343168 CASAVA_Build 9 69887638 1D GCGGAAGGTG A/- GGCACCTGAG 3070 het 3070 ref 48 22 22 4 A 1 0 343169 CASAVA_Build 9 69892875 1D TGGGGCAGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 72 29 21 22 A 10 9 343170 CASAVA_Build 9 69894788 1I CCACATAGGA -/C TTGGGTATCA 3070 het 3070 ref 94 57 30 7 C 0 1 343171 CASAVA_Build 9 69897165 1I AAGACCCGGT -/G TTTAACTGGG 3070 het 3070 ref 58 36 8 14 G 0 1 343172 CASAVA_Build 9 69904914 1D43M1D ATATTTTTTT CCTAAGAAATCCAATAATACAAGTATTCAGAGTGGAGTACCAACA/-CTAAGAAATCCAATAATACAAGTATTCAGAGTGGAGTACCAAC- CTGATTTACT 3070 het 3070 ref 49 55 18 25 N/A 0 0 343173 CASAVA_Build 9 69907763 1I ATACCTAGCT -/A AAAAAAAAAT 2825 het 2825 ref 29 15 6 8 A 9 10 343174 CASAVA_Build 9 69908864 1D GTCATTGCCC T/- TTTTTAAATC 1335 het 1335 ref 33 29 3 1 T 6 5 343175 CASAVA_Build 9 69914739 4I TATTTACTTT ----/GATA GATGTATGCA 3070 het 3070 ref 61 47 9 5 GATA 0 1 343176 CASAVA_Build 9 69919299 1D TCAACGAGCC A/- GGGGGAGGAG 1425 het 492 hom 4 1 3 0 A 1 0 343177 CASAVA_Build 9 69920547 2I44M1D TACTTCTAAG --AAAATTGGGGTACAGGCATTGGGTAAACATTCCCATTACAAAAGA/ATAAAATTGGGGTACAGGCATTGGGTAAACATTCCCATTACAAAAG- GAGAAATTGG 3070 het 3070 ref 88 51 42 11 N/A 0 0 343178 CASAVA_Build 9 69923735 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 1442 het 1442 ref 11 7 3 1 A 1 0 343179 CASAVA_Build 9 69924549 4I GAGTGCACTG ----/AACA GCTGTTAAAA 3070 het 3070 ref 69 42 17 10 AACA 0 1 343180 CASAVA_Build 9 69925269 1D TAGATCTCCT A/- TACGCTCAAT 3070 het 3070 ref 83 52 28 4 A 1 0 343181 CASAVA_Build 9 69931696 1I CGAGGTTCTC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 73 16 42 15 T 7 8 343182 CASAVA_Build 9 69933641 2D54M1D AAACATTCCT CAGAGAGTCTGATCTCAAGCTGATGTTTCTTTATTGAATTTGATTCTAAACCATCAT/--GAGAGTCTGATCTCAAGCTGATGTTTCTTTATTGAATTTGATTCTAAACCATCA- TTTTGTTGAA 3070 het 3070 hom 24 22 19 2 N/A 0 0 343183 CASAVA_Build 9 69936810 4D33M4I GAAGGCTGGA AGGGAGGGAGGGAGGGAGGAAACAGGGAAAGAAGGAG----/----AGGGAGGGAGGGAGGAAACAGGGAAAGAAGGAGGGAA GGAAGGAAGG 3070 het 1503 hom 13 4 10 9 N/A 0 0 343184 CASAVA_Build 9 69941004 2D CAGATATATT AA/-- GTTTTATATT 3070 het 3070 hom 55 16 35 5 A 2 0 343185 CASAVA_Build 9 69941737 1I ATTTCAAAAT -/A AGGTAAGTTT 2749 hom 15 het 6 0 6 0 A 1 2 343186 CASAVA_Build 9 70026133 4D GTTGTTGTTG TTGT/---- GAGACGGAGT 3070 het 3070 ref 45 26 12 7 TTGT 1 0 343187 CASAVA_Build 9 70031200 1I AGTAGGAATG -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 56 45 7 4 A 6 7 343188 CASAVA_Build 9 70031321 2I TAGAAATGGT --/AG AGTGTATTCG 2140 het 2140 ref 46 34 5 7 AG 1 2 343189 CASAVA_Build 9 70054687 3I GGTAAGAAAG ---/AAA AATATATTGT 1958 het 993 hom 8 2 4 2 A 2 5 343190 CASAVA_Build 9 70055725 4I CCAGCTACTT ----/GGGA GGATCACTTG 3070 het 3070 ref 30 17 7 6 GGGA 0 1 343191 CASAVA_Build 9 70055928 1D ATTTATTGCT A/- AAAAATGCTA 3070 het 3070 ref 52 39 11 3 A 6 5 343192 CASAVA_Build 9 70064572 1I TTAAGTTTGC -/T TTTTTTTTCC 1752 het 1752 ref 52 42 4 6 T 8 9 343193 CASAVA_Build 9 70071055 2D ACAAAATGAT AA/-- GTGTGTTAAG 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 A 2 0 343194 CASAVA_Build 9 70089941 1D CCTACTAGGA C/- CCCCCCAAAG 2219 het 894 hom 9 4 5 0 C 7 6 343195 CASAVA_Build 9 70090518 2I TATATATGAA --/TG TGTGTGTTTT 2390 het 2390 ref 16 9 5 2 TG 3 4 343196 CASAVA_Build 9 70092291 3D ATTTAAAAAA AAC/--- AAATGTATTT 3070 het 3070 ref 77 54 17 9 AAC 1 0 343197 CASAVA_Build 9 70095793 1D GCAACAGGCT A/- ATACAGCATA 2170 het 2170 ref 17 10 5 2 A 2 1 343198 CASAVA_Build 9 70104007 3D AGGACTTTTG TTC/--- TTCTTCAATT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 TTC 3 2 343199 CASAVA_Build 9 70109178 4I18M4D ACGAACTTCT ----GTTCGCTGCAAAATGGTTAGAA/GTTCGTTCGCTGCAAAATGGTT---- AGAAACAGCT 3070 het 2364 hom 26 9 11 12 N/A 0 0 343200 CASAVA_Build 9 70111422 1D GCTGGGTTTT A/- AAATCACGGC 1363 het 1363 ref 20 9 3 9 A 4 3 343201 CASAVA_Build 9 70114746 1D TTGTTTTGTG T/- TTTAAAACAT 2149 het 489 hom 8 1 5 2 T 4 3 343202 CASAVA_Build 9 70116568 1I GCCCATGGTA -/T TAGGAGAGCA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 1 2 343203 CASAVA_Build 9 70118574 1I ATATCAACTT -/C TTCATTGCTG 3070 het 1148 hom 12 3 8 1 C 0 1 343204 CASAVA_Build 9 70118911 1D TCACAGAGGA G/- GTGTACACCC 1838 het 1838 ref 85 70 5 10 G 2 1 343205 CASAVA_Build 9 70120193 2I TAATATCATC --/CT CTCTCCACCT 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 CT 2 3 343206 CASAVA_Build 9 70122122 1D AAAGTGTACA C/- CCCCCCCCAG 3070 het 65 hom 13 1 9 3 C 9 8 343207 CASAVA_Build 9 70130009 4D TATTTCTAGT TGGG/---- TGGGTGGGAG 2478 het 2478 ref 21 14 7 0 TGGG 3 2 343208 CASAVA_Build 9 70135302 1I AATGTAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 131 hom 19 1 12 6 T 11 12 343209 CASAVA_Build 9 70176401 2I GTCAGGGGAT --/AG AGTCAAGACT 3070 hom 69 het 26 0 23 3 AG 1 2 343210 CASAVA_Build 9 70177017 1I ATCTGCTCCC -/T GCCTCTTCCA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 0 1 343211 CASAVA_Build 9 70182913 1I ACTGGATTGA -/T TTTTTTTTTT 2690 het 2690 ref 21 13 8 0 T 11 12 343212 CASAVA_Build 9 70186059 1D AAAGTTCAGC A/- TTCTTTCTTA 3070 hom 39 het 21 0 14 8 A 1 0 343213 CASAVA_Build 9 70205844 1D TTTATGTATT A/- AACTGGCTAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 3 2 343214 CASAVA_Build 9 70210569 1D CCATGTTCCC T/- TTTCCTTTAG 3070 hom 59 het 26 0 18 8 T 4 3 343215 CASAVA_Build 9 70215005 1D ATAGCTCCAA G/- GGAAGTTGTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 3 2 343216 CASAVA_Build 9 70215539 1D TTGCAAGTAA C/- AAAAACTGAA 1836 het 1836 ref 48 39 4 5 C 1 0 343217 CASAVA_Build 9 70234347 1D TAAATGAAAT A/- AATATGTTTT 3070 hom 102 het 38 0 34 5 A 3 2 343218 CASAVA_Build 9 70301716 10D CACGCGCCCC ACGTGTAGTG/---------- ACAACGGGAA 3070 het 3070 ref 34 18 16 7 ACGTGTAGTG 1 0 343219 CASAVA_Build 9 70303135 1D AATTTTCCTC T/- GCCTCATTTG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 1 0 343220 CASAVA_Build 9 70304850 1I GATAAGATGA -/T TTTTTTCAGA 3070 hom 119 het 45 0 39 6 T 6 7 343221 CASAVA_Build 9 70314439 1D GTAAGGTAAA G/- CATGATGAGA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 1 0 343222 CASAVA_Build 9 70335756 1D TTGCTAGGAC A/- TTTAGTGGCC 3070 hom 99 het 42 0 34 9 A 1 0 343223 CASAVA_Build 9 70350440 1I TCAGGAGACC -/T TTTGGCCCTT 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 3 4 343224 CASAVA_Build 9 70357234 2D TTCAATCTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 38 0 22 16 T 16 14 343225 CASAVA_Build 9 70357981 1D TTTCTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 24 1 13 11 T 13 12 343226 CASAVA_Build 9 70367753 1D GCTTCAATAA T/- TCATTTACTA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 2 1 343227 CASAVA_Build 9 70369582 4D GTGGCCGTAT TCTC/---- TCTCTTCATG 3070 het 3070 ref 42 23 14 7 TC 4 2 343228 CASAVA_Build 9 70389019 3I AAAAAAAAGT ---/AGG AGAACTGTGA 3070 hom 62 het 26 0 21 5 AGG 0 1 343229 CASAVA_Build 9 70391425 5I48M1I TACTGTATAT -----TTACATATGTTTCTTAACCTTACTTTTACTAATAAAATTTCTTAAAGG-/ACATACTATATATATATTTTAAACATAATTTTACTAATAAAATTACTTAAAGGA GAAACCTTTG 1074 het 1074 ref 38 52 3 9 N/A 0 0 343230 CASAVA_Build 9 70391576 1I GATTCTGAAG -/C CCAATTTTAG 3070 het 3070 ref 74 42 23 10 C 2 3 343231 CASAVA_Build 9 70391822 1I ATATTCACTG -/A CTGCGTTAGT 3070 het 3070 ref 47 33 10 4 A 0 1 343232 CASAVA_Build 9 70414703 8I CACTTCATGT --------/TGGCCATC TGGCCATCCG 3070 hom 130 het 52 0 43 9 TGGCCATC 1 2 343233 CASAVA_Build 9 70417461 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 22 1 15 6 A 13 12 343234 CASAVA_Build 9 70420103 1D AGGCTCTGTC T/- TTGGAGTAGC 3070 hom 93 het 39 0 29 10 T 3 2 343235 CASAVA_Build 9 70423843 2D CAGTCCTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 30 0 23 7 A 13 11 343236 CASAVA_Build 9 70426714 1D TCATTGCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 A 10 9 343237 CASAVA_Build 9 70432680 4I AAATTTTATT ----/TTTA TTTTTTTCTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TTTA 0 1 343238 CASAVA_Build 9 70441072 1I AATGAATACC -/A AAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 7 8 343239 CASAVA_Build 9 70444384 3D CTAAGAGTTC AAA/--- AAATATAGCT 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 A 6 3 343240 CASAVA_Build 9 70476265 1D TTTGTGATTA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 7 6 343241 CASAVA_Build 9 70488205 29I GTAATAAATG -----------------------------/TTGTGATGGAAACAAATCTGTAATAAACA TTGTGATGGA 3070 het 3070 hom 51 16 25 10 TTGTGATGGAAACAAATCTGTAATAAACA 0 1 343242 CASAVA_Build 9 70500673 8D TTCTATAAAT GTAATTAA/-------- ACAACATGTA 3070 het 3070 ref 43 23 18 6 GTAATTAA 1 0 343243 CASAVA_Build 9 70504242 3I ATTTTTTGTC ---/CTT CTTTCTCTCC 3070 het 2615 hom 31 7 20 4 CTT 1 2 343244 CASAVA_Build 9 70506219 1D AGACATCACC A/- AAAAAAAAAA 1232 het 1232 ref 49 31 4 14 A 15 14 343245 CASAVA_Build 9 70513278 2I TTGTTTGCCG --/CC CCCCCCCGCC 2562 het 2562 ref 28 14 7 7 C 7 9 343246 CASAVA_Build 9 70528974 2D TTTTTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 17 19 13 T 13 11 343247 CASAVA_Build 9 70557918 1D AATTCTAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 12 19 11 T 12 11 343248 CASAVA_Build 9 70561353 2I TAATGTGTAC --/AT ATGTTATTCT 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 AT 1 2 343249 CASAVA_Build 9 70567032 1I CATTGTGCAA -/T TTTTTTCTCC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 6 7 343250 CASAVA_Build 9 70581241 2I TAAGATGAGG --/TC TCTCTCTCTT 2745 het 1862 hom 14 4 7 3 TC 4 5 343251 CASAVA_Build 9 70582843 2I CATGCGAAAT --/TC TCTCTCTTTA 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 TC 3 4 343252 CASAVA_Build 9 70588660 4D GCCAAAATGT ATTA/---- ATTCTGGGCT 3070 het 3070 ref 41 19 19 4 ATTA 1 0 343253 CASAVA_Build 9 70589049 4D CAATAGCAAC ATTT/---- ATTTAAAGTA 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 ATTT 2 1 343254 CASAVA_Build 9 70591219 1D TATTATAAAC T/- TTTTTTTATT 3070 het 925 hom 16 3 11 3 T 8 7 343255 CASAVA_Build 9 70601061 4I TTCCTCAATT ----/ACAA ACAATGTTCT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 ACAA 1 2 343256 CASAVA_Build 9 70614094 3D TAAGGGCTCT AGA/--- AGAAGAACTA 3070 het 3070 hom 33 12 18 4 AGA 3 2 343257 CASAVA_Build 9 70620004 1I TGGTACTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 535 hom 31 2 24 5 A 11 12 343258 CASAVA_Build 9 70631677 1I TAGTTGAGAT -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 G 4 5 343259 CASAVA_Build 9 70634867 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1350 het 1350 ref 29 19 3 7 A 11 10 343260 CASAVA_Build 9 70635179 1I AGCGAGCCAA -/C CCCTCTCATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 3 4 343261 CASAVA_Build 9 70641363 2I ACATACATCT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 32 10 19 3 AC 7 8 343262 CASAVA_Build 9 70642352 2I TGTTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 580 hom 37 5 24 8 TG 0 1 343263 CASAVA_Build 9 70666024 1I AGGAGAAAGA -/T TTTTTTCTTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 6 7 343264 CASAVA_Build 9 70669501 5D TTTCAAATGA TCCAG/----- AAAATAAAAA 939 het 939 ref 37 22 5 11 TCCAG 1 0 343265 CASAVA_Build 9 70670036 1D CTACCATTCC A/- AAAAAAAAAA 1186 het 1186 ref 45 33 3 11 A 13 12 343266 CASAVA_Build 9 70671884 1D TCTTCCCTTC A/- AAAAAAAATG 3070 het 2445 hom 33 7 13 14 A 9 8 343267 CASAVA_Build 9 70671922 1D ATTTGATGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 9 14 14 T 10 9 343268 CASAVA_Build 9 70676644 2D TTGTCGGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 2925 het 1685 hom 43 17 10 17 T 14 12 343269 CASAVA_Build 9 70678350 1I ATTTTTCTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 9 10 343270 CASAVA_Build 9 70700365 1D ACTGTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1514 hom 56 5 32 19 T 14 13 343271 CASAVA_Build 9 70704198 1I TGTCTAATGA -/T TTTAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 3 4 343272 CASAVA_Build 9 70709494 2I AGTAGTTTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 12 14 343273 CASAVA_Build 9 70716114 1D CATCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 2734 het 14 hom 17 1 9 8 A 17 16 343274 CASAVA_Build 9 70721614 1I TCTCAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 2977 het 2756 hom 23 10 9 4 A 12 13 343275 CASAVA_Build 9 70739350 4D CAAGTAAGAC TTTA/---- TTGCAAAATC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TTTA 1 0 343276 CASAVA_Build 9 70741111 2I TTGCTAAAAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 39 0 37 2 T 10 12 343277 CASAVA_Build 9 70753382 2I ACCTTGCCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 21 0 14 7 A 11 13 343278 CASAVA_Build 9 70753834 1I TTTAACTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 A 11 12 343279 CASAVA_Build 9 70768241 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1363 hom 27 4 17 6 A 13 12 343280 CASAVA_Build 9 70769957 4I ATATATATGA ----/CTAT CTAGTACAAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 CTAT 0 1 343281 CASAVA_Build 9 70772688 1I ATTGCTCCCC -/A AAAACCCAGT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 A 4 5 343282 CASAVA_Build 9 70773452 2I TATATATATA --/TT TTTTTTTTTT 2073 het 1331 hom 14 3 7 4 T 10 12 343283 CASAVA_Build 9 70784251 10D14M2I TTTAAAAAGG AGGAACCCTTTTTATATTTATATC--/----------TTTCTCCCTCCAGCCA CTATCACACA 3070 hom 129 het 40 0 41 7 N/A 0 0 343284 CASAVA_Build 9 70787496 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 24 1 16 7 A 13 12 343285 CASAVA_Build 9 70793181 12D TTTTTTGGGG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2443 het 568 hom 15 3 7 7 T 23 11 343286 CASAVA_Build 9 70796937 1I GACCTCAGGT -/G ATCTGCCCAC 3070 hom 30 het 13 0 10 3 G 0 1 343287 CASAVA_Build 9 70799716 1D TACAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1044 het 1044 ref 16 5 6 5 A 15 14 343288 CASAVA_Build 9 70799972 12I GGAGAAAGAA ------------/AGAGAGAAAGAG AGAGAGAAAG 3070 het 3070 hom 47 18 21 8 AGAGAGAAAGAG 0 1 343289 CASAVA_Build 9 70809851 1I ACATCCTTAG -/T TTTAAAAAAA 3070 het 801 hom 33 2 22 9 T 3 4 343290 CASAVA_Build 9 70811440 4I2M2D TCACTCAGGT ----TACT/GATGTA-- CACTGTCCCT 3070 hom 102 het 37 0 34 7 N/A 0 0 343291 CASAVA_Build 9 70815015 2I ATATGGGGTG --/TT TTTTTTTTTT 1386 het 60 hom 39 1 9 29 T 10 12 343292 CASAVA_Build 9 70816238 1D AAGTGATGAG A/- GGGGGAAATA 3070 hom 63 het 23 0 18 7 A 1 0 343293 CASAVA_Build 9 70817575 2I AAGGCATGGG --/GC GGGGGGTGAG 2536 het 1562 hom 17 4 7 6 GC 0 1 343294 CASAVA_Build 9 70826929 2D TAAAAAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 1314 hom 6 het 11 0 5 6 T 16 14 343295 CASAVA_Build 9 70831337 2D ACTCCAACTC AA/-- AAAAAAAAAA 1735 het 543 hom 25 8 5 13 A 16 14 343296 CASAVA_Build 9 70833877 1D CCTTAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 15 0 10 5 T 13 12 343297 CASAVA_Build 9 70836879 1D ACAAAAACCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 26 6 A 14 13 343298 CASAVA_Build 9 70844256 1D CCCAGCCTTA C/- CTACCTGGAG 3070 hom 27 het 33 1 20 13 C 2 1 343299 CASAVA_Build 9 70849986 1I ACAGGGAGAA -/C TCACTGTAAT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 C 0 1 343300 CASAVA_Build 9 70864303 1D GTCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 32 2 20 10 T 11 10 343301 CASAVA_Build 9 70871606 1I AAAAAAAAAA -/T ATATATATAT 802 hom 12 het 11 0 5 6 T 0 1 343302 CASAVA_Build 9 70872790 4D CTAGCAAGGG AGAC/---- AGACTCTTTG 3070 hom 105 het 39 0 33 6 AGAC 2 1 343303 CASAVA_Build 9 70896532 8I AAAATTAGCC --------/AGGTGTGG AGGTGTGGTG 1891 het 696 hom 13 3 5 5 AGGTGTGG 1 2 343304 CASAVA_Build 9 70898900 1D TATGAGCAGG A/- CTCTGCTCTT 3070 het 3070 hom 42 18 24 1 A 1 0 343305 CASAVA_Build 9 70899598 2D GTGGTGCAAT CA/-- CACAGCTCAC 3070 het 3070 ref 34 19 10 6 CA 3 2 343306 CASAVA_Build 9 70900362 5I AGAGTGTACA -----/CCCAC CCCACTGTGA 3070 het 2954 hom 26 10 10 6 CCCAC 1 2 343307 CASAVA_Build 9 70905718 1I GTATGTGTAT -/G GGGGGGATGT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 6 7 343308 CASAVA_Build 9 70909755 1I CTTTAAAAGA -/G GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 G 1 2 343309 CASAVA_Build 9 70913276 1I AAAAAAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 23 hom 38 1 30 7 A 11 12 343310 CASAVA_Build 9 70913766 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 2229 hom 28 9 11 10 AG 8 7 343311 CASAVA_Build 9 70921218 1D TCAAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 2361 het 2361 ref 23 9 8 6 A 13 12 343312 CASAVA_Build 9 70922861 1I TTATCCTTCC -/A AAAAAAAAAA 2461 het 2461 ref 35 20 9 6 A 10 11 343313 CASAVA_Build 9 70923075 6I ATGAAAATGA ------/GTTTTT GTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 GTTTTT 2 3 343314 CASAVA_Build 9 70937708 1D ATTTATTGCC T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 8 7 343315 CASAVA_Build 9 70938705 14I TTTCTCTTTT --------------/TCTCTTTCTCTTTC CTCTCTTTCT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TCTCTTTCTCTTTC 0 1 343316 CASAVA_Build 9 70947335 1I CCTATAAAAC -/A AGACTGTACA 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 A 1 2 343317 CASAVA_Build 9 70951463 1I GTCAATGTCT -/G GGGGCATTTT 3070 hom 33 het 26 1 21 4 G 4 5 343318 CASAVA_Build 9 70952662 2D CACTGATCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 37 0 21 16 T 16 14 343319 CASAVA_Build 9 70953272 1I ATGCCTAGCT -/A ATTTTTGTAT 3070 hom 55 het 22 0 19 3 A 1 2 343320 CASAVA_Build 9 70956198 2D CCTGGGCAAC AA/-- GAGCAAAACT 3070 het 1565 hom 26 4 13 9 A 2 0 343321 CASAVA_Build 9 70964142 6D TTGAAATATA ATATTG/------ ATATTGATAT 3070 hom 42 het 17 0 15 6 ATATTG 2 1 343322 CASAVA_Build 9 70964644 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 42 het 17 0 14 4 TG 7 6 343323 CASAVA_Build 9 70970858 1D TTCTTTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 9 8 343324 CASAVA_Build 9 70975709 1D CTCAAATACT C/- ATCAGTGCCT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 C 1 0 343325 CASAVA_Build 9 70979512 4D GTGTTTTCCT TCTC/---- TATTTCAAAC 3070 het 3070 ref 30 14 11 8 TC 2 0 343326 CASAVA_Build 9 70982379 1I TTTATTTTTG -/T TTTTTTTGGT 3070 het 2993 hom 22 9 12 1 T 7 8 343327 CASAVA_Build 9 70983713 1I TTTTTTCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 10 11 343328 CASAVA_Build 9 70984925 12D TGTGGGAGAG AGTTATTAGAAT/------------ AGTTATTCTT 3070 het 3070 ref 55 27 25 6 AGTTATTAGAAT 1 0 343329 CASAVA_Build 9 70989609 1I ACCTCAGCCT -/C CCGATTAGCT 2473 het 2473 ref 19 11 7 1 C 2 3 343330 CASAVA_Build 9 70995868 4D TCTGAGCACT GACA/---- GACAGGTTTG 3070 het 3070 hom 41 19 21 3 GACA 2 1 343331 CASAVA_Build 9 70995971 4I GGTGGTGACC ----/AATA AATAAAAGCA 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 AATA 1 2 343332 CASAVA_Build 9 70996666 1D AGAGACAGGG T/- TTTTGCCTTG 3070 hom 70 het 25 0 24 1 T 5 4 343333 CASAVA_Build 9 70998252 1I ATTCAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 11 12 343334 CASAVA_Build 9 70998947 1I TTTTAGAGAC -/T ACCAAAAGGA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 0 1 343335 CASAVA_Build 9 70999864 1D TCAACCTGCC T/- TTTTGACAAA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 5 4 343336 CASAVA_Build 9 71000154 1D TATCAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 14 17 T 13 12 343337 CASAVA_Build 9 71001345 1D TCTTTTTTTT A/- AAAACAGCTT 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 5 4 343338 CASAVA_Build 9 71004954 1D TCTGAACGGG C/- TGTTCCCTCT 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 C 1 0 343339 CASAVA_Build 9 71005121 1I TGTTTTGTGG -/T TTTTTTACAC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 T 6 7 343340 CASAVA_Build 9 71007931 10D GAGCCAGCCC ATGGGCTGAA/---------- CCTGGCTGGT 3070 het 3070 ref 24 12 9 6 ATGGGCTGAA 1 0 343341 CASAVA_Build 9 71008049 3I TTATATAATA ---/AAT AATAATTTAT 1860 het 1860 ref 18 9 5 4 AAT 2 3 343342 CASAVA_Build 9 71020050 6I TCCTGAATCT ------/AAAATA AAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 17 3 AAAATA 2 3 343343 CASAVA_Build 9 71021372 1I CATGTTTGAA -/T TAATGCCCAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 1 2 343344 CASAVA_Build 9 71023651 1D AAGTGTGCTT A/- GGGGCAATGC 3070 het 3070 hom 40 17 23 0 A 1 0 343345 CASAVA_Build 9 71023689 2D CATATATGGT TG/-- TGTGTGTGTG 528 het 476 hom 31 7 3 23 TG 8 7 343346 CASAVA_Build 9 71031864 1D CTTTTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 42 0 32 10 T 11 10 343347 CASAVA_Build 9 71036196 1I ATATATGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 10 11 343348 CASAVA_Build 9 71042333 18I TACTCAGGAG ------------------/GCTTGAGGTAGGAGGATC GCTTGAGCCT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 GCTTGAGGTAGGAGGATC 0 1 343349 CASAVA_Build 9 71044558 4D CCAAATAAGT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 86 het 32 0 29 5 AAAC 4 3 343350 CASAVA_Build 9 71048663 1D TCACGCCTGT A/- AATCCCAGCA 3070 hom 95 het 34 0 30 4 A 3 2 343351 CASAVA_Build 9 71060381 8D TTTTTTTTTT TTTTTTTA/-------- AACATGAAAT 3070 hom 23 het 36 1 26 12 TTTTTTTA 1 0 343352 CASAVA_Build 9 71061527 1D GAACATAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 24 6 A 12 11 343353 CASAVA_Build 9 71073102 1D TCATCAACCT G/- ACAAACCAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 1 0 343354 CASAVA_Build 9 71073339 3I ATTATTAATT ---/ATA GTAGTAGTAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 ATA 0 1 343355 CASAVA_Build 9 71075194 1I AACCCTAGAG -/T TTCATGTTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 2 3 343356 CASAVA_Build 9 71075321 1D ATAATAGATT A/- AATATAAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 3 2 343357 CASAVA_Build 9 71077301 1I AAAAATCACC -/A AAAAACAAAT 3070 hom 76 het 42 1 40 1 A 5 6 343358 CASAVA_Build 9 71077912 1D TCCCTAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 35 0 24 13 A 13 12 343359 CASAVA_Build 9 71081801 1D CTTGAGACTT G/- TATGTGCCTT 3070 hom 123 het 47 0 39 8 G 1 0 343360 CASAVA_Build 9 71086867 4D TGTTTGTTTG TTTT/---- GTTTTTTTGT 3070 hom 39 het 19 0 13 7 T 4 0 343361 CASAVA_Build 9 71087122 1D CGCCCGCCTT G/- GCCTCCCAAA 3070 hom 48 het 20 0 16 8 G 2 1 343362 CASAVA_Build 9 71091149 3D TTGTTTCTTC TTT/--- ACTAGTCTAG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 T 3 0 343363 CASAVA_Build 9 71097234 3I TTTGTGATGT ---/AGC AGCATTTCTC 3070 het 3070 ref 54 29 20 5 AGC 1 2 343364 CASAVA_Build 9 71098310 8I GAATAAAATG --------/TCATAATA TCATTTGAAT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 TCATAATA 0 1 343365 CASAVA_Build 9 71105865 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2568 het 466 hom 14 3 8 3 A 11 12 343366 CASAVA_Build 9 71126657 4I TCTTCCACAC ----/TTTA TTTATTTTTA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 TTTA 1 2 343367 CASAVA_Build 9 71130711 4I TAATAGAATT ----/AAAC AAAGACACCC 3070 hom 54 het 26 0 18 8 AAAC 0 1 343368 CASAVA_Build 9 71131563 2D GCCTCCCAAA GT/-- GTGGGGATTA 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 GT 2 1 343369 CASAVA_Build 9 71132666 4I ATAGAACAAT ----/TAAC TAAATACAAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TAAC 0 1 343370 CASAVA_Build 9 71133398 1I AGGTTTCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 10 11 343371 CASAVA_Build 9 71135781 1D TCTCAATTTG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 66 het 24 0 22 3 T 8 7 343372 CASAVA_Build 9 71146221 1D ATATGCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 12 11 343373 CASAVA_Build 9 71155072 1I AAAGACTCTT -/C TTTCCCCTTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 0 1 343374 CASAVA_Build 9 71161231 2I TTGGGGAGTC --/AT ATGATCTGAT 3070 het 3070 hom 56 22 22 12 AT 1 2 343375 CASAVA_Build 9 71165635 1D TGTAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 11 10 343376 CASAVA_Build 9 71169126 1I CCTGCAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2296 hom 28 11 12 5 T 13 14 343377 CASAVA_Build 9 71171122 1I CCAACTGGGG -/T TTTTTTTTTT 3069 het 1765 hom 30 9 9 12 T 15 16 343378 CASAVA_Build 9 71172795 2I ATCCTGAGAC --/TT TACTGAATTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 1 3 343379 CASAVA_Build 9 71177586 1D TATTTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 T 11 10 343380 CASAVA_Build 9 71182749 2I ATTCTCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 53 17 23 13 TC 6 7 343381 CASAVA_Build 9 71188939 1D CTACAAACGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 10 9 343382 CASAVA_Build 9 71189585 4D TCCTAAGTAG AATT/---- AATTATGAAG 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 AATT 2 1 343383 CASAVA_Build 9 71190249 1D GAAAAAAAAA C/- CCCTGCCATT 3070 het 3070 ref 47 25 10 12 C 4 3 343384 CASAVA_Build 9 71191189 2I TCTCTGTGTT --/GA GTTTGTGTAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 GA 0 1 343385 CASAVA_Build 9 71196624 1I GGTCCACCTC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 8 9 343386 CASAVA_Build 9 71200148 5D AATAGTCATA AAAGT/----- AAAGTACTCT 3070 het 3070 ref 50 29 16 9 AAAGT 2 1 343387 CASAVA_Build 9 71215274 1D TCCTCTCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2994 hom 17 7 7 3 A 10 9 343388 CASAVA_Build 9 71218463 1I TTTTAATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2346 hom 21 8 10 3 T 10 11 343389 CASAVA_Build 9 71227571 1D ACCATAACAT A/- AAAAGTACTA 3070 het 3070 ref 38 26 10 2 A 5 4 343390 CASAVA_Build 9 71229070 4D ATTAATGATT AATA/---- AATCTCTGAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 AATA 1 0 343391 CASAVA_Build 9 71231358 2D AAGCTTCTAC CT/-- CTTAGAGGTG 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 CT 2 1 343392 CASAVA_Build 9 71251041 1D CCCATTCAAC A/- AGCGGCGCAC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 2 1 343393 CASAVA_Build 9 71255560 1I CATGGGTATC -/A AAAAAAAAAA 2014 het 2014 ref 53 39 6 8 A 11 12 343394 CASAVA_Build 9 71267829 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 7 8 343395 CASAVA_Build 9 71268022 1I TATTGGTTAA -/T ATTTATTCCT 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 0 1 343396 CASAVA_Build 9 71273164 1D CTATTACTTG C/- CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 9 8 343397 CASAVA_Build 9 71287872 8I AAAATTAAGT --------/CAAAAAAA CAAAAAAACA 2725 hom 27 het 13 0 9 4 CAAAAAAA 2 3 343398 CASAVA_Build 9 71287885 5D AAAAACAAAA AAACG/----- AAACAAAAAA 91 het 91 ref 14 6 2 9 AAACG 1 0 343399 CASAVA_Build 9 71290313 1D AATTTTAAGC A/- AATGAGACAT 3070 hom 115 het 49 0 39 11 A 3 2 343400 CASAVA_Build 9 71291607 1I TCTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2830 het 2730 hom 25 10 9 6 T 10 11 343401 CASAVA_Build 9 71293674 1D GTGAAAGACC T/- CTTCAAGGAG 2910 het 936 hom 9 3 6 0 T 1 0 343402 CASAVA_Build 9 71296342 1I AGTATTATTT -/A AAAAAAAAAA 1368 het 1324 hom 15 5 5 5 A 13 14 343403 CASAVA_Build 9 71301700 1D TCAGTTATTA C/- TCAGAAATGA 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 C 1 0 343404 CASAVA_Build 9 71304403 2D GCAACGGTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 810 hom 39 6 13 20 A 14 12 343405 CASAVA_Build 9 71320427 5D ATCAGAAACT GGGGG/----- GGGGGGGGGC 2739 hom 5 het 20 0 9 13 G 14 9 343406 CASAVA_Build 9 71329319 1I TCAGTAATAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 9 10 343407 CASAVA_Build 9 71340783 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 37 1 25 11 T 13 12 343408 CASAVA_Build 9 71345996 2I GACCCCCCCC --/CA CCCATTCTGT 2133 het 483 hom 18 5 7 6 CA 0 1 343409 CASAVA_Build 9 71346056 1D TATACAGGGG T/- TTCCAATTTC 3070 hom 45 het 22 0 16 10 T 3 2 343410 CASAVA_Build 9 71346284 3D CTTTTTTGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 39 1 33 5 T 15 12 343411 CASAVA_Build 9 71348013 7D GCTGGGATTT CCCCCCC/------- CCCCCCCCGG 3070 hom 67 het 27 0 23 7 C 15 8 343412 CASAVA_Build 9 71359528 1D TTTTTAGGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 90 het 41 0 31 10 A 10 9 343413 CASAVA_Build 9 71368072 3I TACTAAATTT ---/CTC CTCTACTTTT 3070 hom 83 het 34 0 28 6 CTC 1 2 343414 CASAVA_Build 9 71386127 1D CTGAAGGTAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 A 9 8 343415 CASAVA_Build 9 71393280 1I TGAAGATGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 9 10 343416 CASAVA_Build 9 71426439 3I ACTTATTAAT ---/AGA AGAACAGTTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AGA 1 2 343417 CASAVA_Build 9 71427318 1I AAGTCATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 28 1 23 4 A 10 11 343418 CASAVA_Build 9 71434801 1D GTGCTATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 39 0 29 11 A 11 10 343419 CASAVA_Build 9 71439577 1D GTGCAGAAGG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 8 7 343420 CASAVA_Build 9 71466349 1I TTCATCCCCA -/C CAAAATTCAT 3070 hom 135 het 48 0 44 4 C 1 2 343421 CASAVA_Build 9 71477948 2I TCGGAACTTA --/AG AGTGTCTTTG 3070 hom 45 het 18 0 15 3 AG 1 2 343422 CASAVA_Build 9 71480803 1I AGGGTATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 11 12 343423 CASAVA_Build 9 71507571 1D ATTGGTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 10 9 343424 CASAVA_Build 9 71511786 2D CAGTTTAATC TT/-- TTGTCTTTAG 3070 hom 84 het 33 0 28 6 T 4 2 343425 CASAVA_Build 9 71519070 1I AGCTTTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 126 hom 44 2 38 4 A 10 11 343426 CASAVA_Build 9 71520076 4D CTTAACACTC ACAA/---- ACAATCTTTC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 ACAA 2 1 343427 CASAVA_Build 9 71532248 1D ATTTAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 28 0 20 9 A 12 11 343428 CASAVA_Build 9 71532555 4D TAAGCTTTAT TCTC/---- TCTAATGTAC 3070 hom 105 het 37 0 36 2 TC 3 1 343429 CASAVA_Build 9 71536510 1D AAAGACAGCC A/- GCTGACTTAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 0 343430 CASAVA_Build 9 71537309 1D GATAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 745 het 745 ref 35 24 3 8 A 12 11 343431 CASAVA_Build 9 71543546 1I AACACCTCAA -/T TTTTTTTTTT 1677 het 35 hom 19 1 9 9 T 17 18 343432 CASAVA_Build 9 71559459 3D TATATATATA TTT/--- TTTTTTTTTG 1440 het 186 hom 11 2 4 5 T 12 9 343433 CASAVA_Build 9 71562076 1D GTATTATCCA G/- GTTTATAAAG 3070 hom 154 het 54 0 52 2 G 2 1 343434 CASAVA_Build 9 71562492 1D ACAATGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 37 1 29 7 A 13 12 343435 CASAVA_Build 9 71563112 1D TTTGTCCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 27 1 22 4 T 13 12 343436 CASAVA_Build 9 71564037 1D TCTGTTCACC T/- TTCAAAACAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 3 2 343437 CASAVA_Build 9 71568951 1I AATTTAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1006 hom 21 3 11 7 T 13 14 343438 CASAVA_Build 9 71578604 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 9 8 343439 CASAVA_Build 9 71578938 1I TATAACAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 A 12 13 343440 CASAVA_Build 9 71593797 2D TTAAAATGAC TT/-- TGTGTTACTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 1 343441 CASAVA_Build 9 71626478 1D CTCTGTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 13 12 343442 CASAVA_Build 9 71629161 1I CTCAGAGCGG -/C AAAAAAGGCA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 C 0 1 343443 CASAVA_Build 9 71637010 1I TTGTTATGTC -/A ATTATTAGAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 2 343444 CASAVA_Build 9 71650453 2D GCAGGAACTA AC/-- ACAGCTCTAA 3070 het 3070 hom 61 27 30 6 AC 2 1 343445 CASAVA_Build 9 71665341 1D ATACCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 17 1 11 5 T 15 14 343446 CASAVA_Build 9 71666589 2D CAGAGTTATC AG/-- AGACTTGATG 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 AG 2 1 343447 CASAVA_Build 9 71673012 1I AATGAAATGA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 T 7 8 343448 CASAVA_Build 9 71673087 1I TACATCAAAC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 8 9 343449 CASAVA_Build 9 71673542 1D AACTTATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 13 12 343450 CASAVA_Build 9 71674479 1I TCAAAATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 319 hom 52 1 42 9 A 9 10 343451 CASAVA_Build 9 71678928 1I ATCTGACACA -/T TGGAGATCAA 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 T 1 2 343452 CASAVA_Build 9 71679949 1D GTTTTTTGGA T/- TTTTTTTTTA 1428 het 1428 ref 34 24 4 8 T 10 9 343453 CASAVA_Build 9 71684613 1D TAACTTTTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 28 6 T 10 9 343454 CASAVA_Build 9 71684788 2I AATACATGAG --/AT ATTTTGGTAC 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 AT 1 2 343455 CASAVA_Build 9 71688573 1D AAAAACAATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 9 8 343456 CASAVA_Build 9 71689592 1I TAGATTTGTC -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 3 4 343457 CASAVA_Build 9 71690026 12D CCAGTCCCAT AATATTGCCAGG/------------ AATGGAGGTG 3070 het 3070 ref 38 24 16 6 AATATTGCCAGG 1 0 343458 CASAVA_Build 9 71699727 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAGA 2270 hom 25 het 24 0 14 10 A 9 8 343459 CASAVA_Build 9 71719592 1D CAGCAGTTCT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 8 7 343460 CASAVA_Build 9 71723646 1I CACGAAATGC -/T TTTTTTTTTT 2500 het 2500 ref 35 16 9 10 T 12 13 343461 CASAVA_Build 9 71744104 2D GTACATAATG GT/-- GTGTGTGTTA 3070 hom 56 het 21 0 18 4 GT 5 4 343462 CASAVA_Build 9 71747286 1D GCCCTGTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 16 7 T 11 10 343463 CASAVA_Build 9 71750626 1D TTTCTTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1731 hom 36 9 13 14 T 16 15 343464 CASAVA_Build 9 71752361 1I AATGCACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2894 hom 28 10 14 4 T 13 14 343465 CASAVA_Build 9 71753411 2D AGATAGATCC TT/-- TTTACAGAGG 3070 hom 117 het 40 0 40 2 T 5 3 343466 CASAVA_Build 9 71757048 1D AGACCCAGGC A/- AAAAATGTCT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 6 5 343467 CASAVA_Build 9 71758268 1D TCCCCACCAC T/- CCAAAAAAAG 3070 hom 83 het 33 0 28 6 T 1 0 343468 CASAVA_Build 9 71761953 1I TTTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 15 14 T 13 14 343469 CASAVA_Build 9 71771192 4I TTACAAAACA ----/CAGT CAGTCACCTC 3070 het 3070 hom 54 23 28 3 CAGT 1 2 343470 CASAVA_Build 9 71777672 1D AAAAAATATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 94 het 42 0 32 10 A 10 9 343471 CASAVA_Build 9 71799587 1D GGGAATTATT G/- GATAATTTTG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 2 1 343472 CASAVA_Build 9 71799764 1I CTTTTAATGG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 8 9 343473 CASAVA_Build 9 71801042 1D CCTCCAAATC T/- CATGTTGAAA 3070 het 3070 ref 49 24 17 8 T 1 0 343474 CASAVA_Build 9 71802338 1D GTAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 333 hom 42 1 36 5 A 12 11 343475 CASAVA_Build 9 71804136 2I AAGCATCATC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 48 1 34 13 A 10 12 343476 CASAVA_Build 9 71805808 1I GCTTTCGTCA -/C CCCCCCAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 6 7 343477 CASAVA_Build 9 71808602 11I ATTAAGATGT -----------/GACTCTTCTGA CGTTCTACCA 3070 het 32 hom 12 1 9 2 GACTCTTCTGA 0 1 343478 CASAVA_Build 9 71809767 1I AATCCTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 25 1 18 7 T 13 14 343479 CASAVA_Build 9 71812023 1I ATCTCTACCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 A 10 11 343480 CASAVA_Build 9 71834375 5I TCCCATTTAC -----/CCATT TTTGCTTTGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CCATT 0 1 343481 CASAVA_Build 9 71834754 1I TTTTTATGTC -/A TTACCATACT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 0 1 343482 CASAVA_Build 9 71863398 1I GCTCCTGCCT -/G GCCTTCTGTG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 G 1 2 343483 CASAVA_Build 9 71921238 2I TTTCTTAGTG --/TC TCTCCATTGA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TC 2 3 343484 CASAVA_Build 9 71921434 1D TTGGCATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1011 hom 26 3 12 11 A 17 16 343485 CASAVA_Build 9 71932191 3D TTACCCCAAG TTA/--- TTAATATCCT 3070 hom 86 het 34 0 27 7 TTA 2 1 343486 CASAVA_Build 9 71969737 4I GGTACCCTCT ----/TAAA TAGATACTAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TAAA 0 1 343487 CASAVA_Build 9 71972244 3D CTTCTGTTAT ATC/--- ATCCTTTGTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 ATC 2 1 343488 CASAVA_Build 9 71976074 1I ATCTTGACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 24 1 20 3 T 10 11 343489 CASAVA_Build 9 71980256 3I TTATTATTCC ---/TTG TTGTTAATCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 TTG 1 2 343490 CASAVA_Build 9 71984522 1I34M2I TTTTTCTAGC -AAAAAAAAAATACACTAGAGATCACTGTGCACTC--/AAAAAAAAAAATACACTAGAGATCACTGTGCACTCTG GCTACAAAAC 3070 het 415 hom 37 1 29 15 N/A 0 0 343491 CASAVA_Build 9 71991087 1I CTGCTGCTGA -/T TTCTTTCAGT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 2 3 343492 CASAVA_Build 9 71995295 1D AGTTTCTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 30 1 13 16 T 15 14 343493 CASAVA_Build 9 71998357 2D ATAAGGCAAT AA/-- AAAGTAATAC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 5 3 343494 CASAVA_Build 9 72001807 2I ATGTTCAGGT --/TG TGTTATTGCC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 TG 1 2 343495 CASAVA_Build 9 72002918 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 34 het 15 0 12 3 AC 8 6 343496 CASAVA_Build 9 72003798 2I TTCGTTTGTT --/TG TTTTTTTTAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 TG 0 1 343497 CASAVA_Build 9 72010721 1D AGTCAAGAAG A/- AAAAAATACT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 7 6 343498 CASAVA_Build 9 72014279 4D GTCTGAGCGG TCTA/---- TCTATCTATC 1416 hom 9 het 8 0 3 5 TCTA 4 3 343499 CASAVA_Build 9 72014337 1I GATTCACTGA -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 21 het 10 0 8 2 T 7 8 343500 CASAVA_Build 9 72015025 1I TGTAGGTCTC -/T TAAGGACTTG 2478 hom 12 het 8 0 5 3 T 1 2 343501 CASAVA_Build 9 72018488 4D TAATGAACTC AAAG/---- AAAGAATTAT 3070 hom 122 het 46 0 40 8 AAAG 2 1 343502 CASAVA_Build 9 72020001 9I TGTCCAATGT ---------/TACTGATGG TACAAAAATG 3070 hom 156 het 59 0 52 7 TACTGATGG 0 1 343503 CASAVA_Build 9 72028955 1D CCGAACCAGT A/- AGAGGAGAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 A 2 1 343504 CASAVA_Build 9 72055555 1I TCTGATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 T 13 14 343505 CASAVA_Build 9 72075878 17D ACACAAGAAG TTTTGGATTTTGGAGCA/----------------- TTTTGGATTT 3070 hom 54 het 27 0 19 10 TTTTGGATTTTGGAGCA 1 0 343506 CASAVA_Build 9 72083119 1D ATCTCAAATG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 107 het 42 0 37 7 T 8 7 343507 CASAVA_Build 9 72085780 1I AATTCATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 12 13 343508 CASAVA_Build 9 72100038 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 713 hom 5 het 3 0 2 1 A 11 10 343509 CASAVA_Build 9 72116438 1D TTGACCAGCC A/- AAAAAAAAAA 1738 het 1738 ref 49 33 6 11 A 15 14 343510 CASAVA_Build 9 72120045 4I TTTAAAATAT ----/AAAA AAAAGAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 4 8 343511 CASAVA_Build 9 72138630 1I TTCCAAATCT -/G TAAATTCAAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 0 1 343512 CASAVA_Build 9 72142187 15D TTGGGATTTG TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 28 0 22 9 T 24 9 343513 CASAVA_Build 9 72142588 1I GAATTACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 475 hom 36 2 23 11 T 14 15 343514 CASAVA_Build 9 72149908 3D TAAGTACAAT CTA/--- CTAATTTTTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 CTA 2 1 343515 CASAVA_Build 9 72162485 3D CCTGTCTCTT AAA/--- AAAAAAAGAG 3070 het 520 hom 38 5 18 16 A 10 7 343516 CASAVA_Build 9 72181185 1I TGTGTACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 9 10 343517 CASAVA_Build 9 72183429 1I CCTTTTTTCT -/C CCCTTTTTTT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 3 4 343518 CASAVA_Build 9 72199405 1D TTTCTCTTTG A/- AAAAATTCAA 3070 hom 105 het 37 0 35 3 A 6 5 343519 CASAVA_Build 9 72200136 4I ATCCTGGAAT ----/AAAG AGAGACTTTC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AAAG 0 1 343520 CASAVA_Build 9 72220386 1I TAATAATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 249 hom 18 1 12 5 A 9 10 343521 CASAVA_Build 9 72222385 1I AAAACAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 8 9 343522 CASAVA_Build 9 72238916 1I TATCATGTGT -/G GTTTTTTTTG 3070 hom 68 het 25 0 23 2 G 1 2 343523 CASAVA_Build 9 72239960 1D CTAACATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 143 hom 22 2 11 10 T 14 13 343524 CASAVA_Build 9 72241429 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 28 2 13 13 A 17 16 343525 CASAVA_Build 9 72245368 1I TGTGTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 368 hom 38 1 27 10 A 10 11 343526 CASAVA_Build 9 72250107 1I GACCCTGTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 797 hom 24 3 12 9 A 15 16 343527 CASAVA_Build 9 72250215 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3067 het 17 hom 14 1 9 4 T 15 14 343528 CASAVA_Build 9 72255246 1D CAGCTTATGA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 77 het 31 0 25 6 T 9 8 343529 CASAVA_Build 9 72256337 1D CACCACAGCA T/- TCCAGGCTGG 2803 hom 18 het 8 0 7 4 T 2 1 343530 CASAVA_Build 9 72263205 2I GGAAATAAGT --/AC ACAGGGATAT 3070 hom 56 het 22 0 19 3 AC 1 2 343531 CASAVA_Build 9 72266146 4D ACCCGGCTGA TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 36 het 17 0 13 5 TATT 6 5 343532 CASAVA_Build 9 72274247 2D TTATTAATAA TT/-- TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 10 8 343533 CASAVA_Build 9 72287718 1I GGGAAGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 34 2 20 12 A 13 14 343534 CASAVA_Build 9 72300750 1I TAACATTAAA -/T TTGCCAATTT 3070 hom 99 het 36 0 32 4 T 2 3 343535 CASAVA_Build 9 72307205 1D TTAATTCTAA T/- TTTTTTTTTT 2737 het 308 hom 29 2 13 14 T 17 16 343536 CASAVA_Build 9 72308551 4D ATTGTTCTCA TTTG/---- TTCATTCCAG 3070 hom 117 het 44 0 37 11 TTTG 1 0 343537 CASAVA_Build 9 72311503 1D ACATTTTTGG T/- TTTTAGACCT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 5 4 343538 CASAVA_Build 9 72314541 12D CCATGCACTC TGGGGAACAGAG/------------ TGGAGCCAGC 3070 hom 93 het 34 0 31 10 TGGGGAACAGAG 1 0 343539 CASAVA_Build 9 72316709 18D TGAGATTTGC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTGA 3070 hom 76 het 30 0 25 10 T 26 8 343540 CASAVA_Build 9 72328772 1I ACACTTTTTG -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 60 het 29 0 20 9 T 7 8 343541 CASAVA_Build 9 72333601 1I GTTCCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 A 11 12 343542 CASAVA_Build 9 72346246 3D TCCTTTAATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 28 hom 33 1 15 17 T 19 16 343543 CASAVA_Build 9 72374968 1D TCAGATTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 26 1 15 10 T 11 10 343544 CASAVA_Build 9 72379846 1D TCCCGCATAA T/- TTTTTTTTTT 2471 het 192 hom 18 3 8 8 T 17 16 343545 CASAVA_Build 9 72386687 9D TTCCTTGTCT TCTCCTTCC/--------- TTTCTTCCTT 3070 hom 44 het 20 0 15 7 TCTCCTTCC 1 0 343546 CASAVA_Build 9 72413118 10I TCAAATTTTA ----------/TTTCAACCCT TTAAAAATGT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 TTTCAACCCT 0 1 343547 CASAVA_Build 9 72421248 1D TCCACTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 23 hom 43 2 26 16 T 14 13 343548 CASAVA_Build 9 72428603 1I TTATAGCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 T 10 11 343549 CASAVA_Build 9 72428714 3D AAAGTGAGGC TGT/--- TATTTCAAGG 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 TGT 1 0 343550 CASAVA_Build 9 72431839 1D AGCCACAATC T/- TGTTAGTCAT 3070 het 3070 hom 34 13 19 3 T 2 1 343551 CASAVA_Build 9 72437460 1D ACTTAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 15 het 33 1 25 8 A 10 9 343552 CASAVA_Build 9 72450479 1D TCTTCACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 809 hom 16 2 13 1 A 12 11 343553 CASAVA_Build 9 72462029 2I AAATTGTAAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 10 12 343554 CASAVA_Build 9 72467501 1I GGATGTGGTG -/A AAAGGAAACA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 3 4 343555 CASAVA_Build 9 72476275 4I TGATTATTAT ----/AATA AATAAACATT 3070 het 3070 ref 49 31 14 4 AATA 1 2 343556 CASAVA_Build 9 72478020 2I TGATGACCAA --/TT TTTGCTTCAT 3070 het 3070 ref 37 20 11 6 T 3 5 343557 CASAVA_Build 9 72485828 2I AATATACTAT --/TG TGTGTGTGTT 3070 het 3070 ref 53 27 17 9 TG 4 5 343558 CASAVA_Build 9 72490629 2I TTATATGCAC --/TT TGTCATTTTC 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 1 3 343559 CASAVA_Build 9 72493032 1I CCAAAACTTT -/A AAAAAAATTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 7 8 343560 CASAVA_Build 9 72494258 1I AAATTACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 10 11 343561 CASAVA_Build 9 72501711 1D GAGAAGCTGC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 T 8 7 343562 CASAVA_Build 9 72544335 1I TTATTATTTA -/T TTTTTTTTTT 2470 het 2470 ref 22 7 8 7 T 11 12 343563 CASAVA_Build 9 72545206 1D ACAGACCTAG A/- AAAAACAATC 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 A 6 5 343564 CASAVA_Build 9 72547206 1I TAGCTGTTTG -/A AACTATGTGT 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 A 2 3 343565 CASAVA_Build 9 72555717 1D TATTACCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 17 10 A 12 11 343566 CASAVA_Build 9 72561763 1D AAAACACTTC A/- AAAAAATCAA 3070 het 2285 hom 14 5 8 1 A 7 6 343567 CASAVA_Build 9 72573336 1D CTATCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 11 10 343568 CASAVA_Build 9 72574509 3D TACTCTAGTA GAT/--- GATGAACTTT 3070 het 3070 ref 41 25 12 5 GAT 2 1 343569 CASAVA_Build 9 72574846 2D AACTCAAAGG GT/-- GTTTAGAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 GT 2 1 343570 CASAVA_Build 9 72577059 1D ACAGAGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 513 hom 30 2 10 18 T 13 12 343571 CASAVA_Build 9 72579606 4D TTATTGAAAC TGAA/---- TGGAGACTTT 3070 het 3070 hom 51 20 26 6 TGAA 1 0 343572 CASAVA_Build 9 72580524 1D AATTGTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 11 10 T 11 10 343573 CASAVA_Build 9 72581230 1I TGAGCTAGTC -/A AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 6 7 343574 CASAVA_Build 9 72591992 2I CCAGAGCTGA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 AC 7 8 343575 CASAVA_Build 9 72592289 4D TCACACACAC ACTT/---- ACTTACACAC 3070 het 3070 ref 32 16 13 5 ACTT 2 1 343576 CASAVA_Build 9 72628136 1D TTTACCAAGC T/- TTCCCCCGCT 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 T 3 2 343577 CASAVA_Build 9 72628426 1I ACTATGGTTG -/C CCCCCCTTGA 3070 het 3070 hom 48 21 26 1 C 6 7 343578 CASAVA_Build 9 72633248 1I TCTCTTATTT -/A AAAATCAACA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 A 4 5 343579 CASAVA_Build 9 72640049 2D TTTGAGGTAC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 11 9 343580 CASAVA_Build 9 72646216 1I ATTTAAAGTG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 7 8 343581 CASAVA_Build 9 72647866 1I AATAACACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 10 11 343582 CASAVA_Build 9 72648149 1D ATAAATACAA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 T 8 7 343583 CASAVA_Build 9 72648529 1D TTACCTTTTT A/- AAAACCATTT 3070 het 3070 ref 30 14 15 2 A 5 4 343584 CASAVA_Build 9 72652266 1I AACCCTGGAA -/G GACCTAGAGC 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 G 1 2 343585 CASAVA_Build 9 72652418 3D CCTGATGCAC AGA/--- AGAAGATGGC 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 AGA 3 2 343586 CASAVA_Build 9 72654545 2I TTTGATTTAT --/AA ATAAGATTAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 1 3 343587 CASAVA_Build 9 72660610 1D TTTAATAGAT A/- AAAAAATATC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 A 7 6 343588 CASAVA_Build 9 72681051 4I ATATATAGAC ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 24 het 17 0 9 8 AT 6 8 343589 CASAVA_Build 9 72720681 4D GGCATTTAAT AATC/---- AAACTTCCAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AATC 1 0 343590 CASAVA_Build 9 72727707 1D CATCTGAAAC A/- GTGTAATTGA 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 A 1 0 343591 CASAVA_Build 9 72730734 1D TTGGGAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 715 hom 39 3 24 12 A 14 13 343592 CASAVA_Build 9 72753944 1D AACAGTAGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 10 9 343593 CASAVA_Build 9 72759554 1D CCCTACGCTT C/- CTGGGGTCCC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 C 2 1 343594 CASAVA_Build 9 72763074 1I ATGCTCACAG -/T TATTTTTAAA 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 T 1 2 343595 CASAVA_Build 9 72766037 1I TACAGCTCTG -/C CAACACCTTG 3070 het 3070 hom 65 25 32 8 C 1 2 343596 CASAVA_Build 9 72771769 10I AAAACACAAC ----------/AAAAACAAAT AAAAACAATA 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 AAAAACAAAT 0 1 343597 CASAVA_Build 9 72806741 2D CAACACAGAC AG/-- AGGAACTACA 3070 het 3070 ref 62 32 20 11 AG 2 1 343598 CASAVA_Build 9 72822962 2I TTAGAAAAGC --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 A 8 10 343599 CASAVA_Build 9 72856671 1I GTTATCTCTA -/G GGGGGGTTGT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 G 6 7 343600 CASAVA_Build 9 72871785 16D TAATACAGTT CTGTCAGCTCTTGAAA/---------------- CTCCCACATG 3070 het 3070 ref 39 20 18 6 CTGTCAGCTCTTGAAA 1 0 343601 CASAVA_Build 9 72871961 1D TTTCAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 T 11 10 343602 CASAVA_Build 9 72874652 1I CGAAAATTAA -/T TTTTTTTAAA 2791 het 2791 ref 27 16 6 5 T 7 8 343603 CASAVA_Build 9 72882023 1D TCACTGGTTT A/- AAACACCAGA 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 A 4 3 343604 CASAVA_Build 9 72883570 5D ATGCAGAAAG AAATC/----- AAATCAAAAC 3070 het 3070 ref 35 22 8 6 AAATC 2 1 343605 CASAVA_Build 9 72883756 1I ATGAGCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 10 9 T 10 11 343606 CASAVA_Build 9 72886860 5D TTAAGTGTGT GTTCA/----- GTTATCAGTC 3070 het 3070 hom 42 19 20 4 GTTCA 1 0 343607 CASAVA_Build 9 72893516 1I TAAACTTTCC -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 58 25 27 6 T 7 8 343608 CASAVA_Build 9 72900125 1I GACGGGAGAT -/G CCTCTATTTA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 0 1 343609 CASAVA_Build 9 72902354 1I ATATAGGACC -/A AAAAAAAAAA 1054 het 1054 ref 39 29 3 7 A 11 12 343610 CASAVA_Build 9 72931807 1D TAGGAAAAAA C/- AAAAACAAAA 3070 het 5 hom 33 1 24 8 C 1 0 343611 CASAVA_Build 9 72950653 1D AAGTTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 12 11 343612 CASAVA_Build 9 72952847 1D TTCTGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2741 hom 25 8 14 5 A 11 10 343613 CASAVA_Build 9 72968067 12D AAACAAGATA TAGGTAGGTAGG/------------ TAGGTAGGTA 3070 het 3070 hom 53 20 27 13 TAGG 6 3 343614 CASAVA_Build 9 72972160 3D AACTTACCAG AAT/--- AATGCCTGCC 3070 het 3070 hom 51 18 28 6 AAT 2 1 343615 CASAVA_Build 9 72973247 5D GACATTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 2218 het 340 hom 15 2 5 8 T 17 12 343616 CASAVA_Build 9 72976636 3I GTTAGGGTTT ---/TTG TTGTTGTTTT 3070 het 2018 hom 22 8 11 3 TTG 2 3 343617 CASAVA_Build 9 72982350 6I12M6D GAATCTTGAG ------TCATTCATGTATTAGGAA/TTTTCCTAATACATGAAT------ AACCTATCTT 3070 het 3070 ref 35 20 16 3 N/A 0 0 343618 CASAVA_Build 9 72990374 1D ATTTATTATG C/- ATCTATTATA 3070 het 3070 ref 50 24 24 2 C 1 0 343619 CASAVA_Build 9 73001028 8D TATTTCTGAT AGTATTGA/-------- AGTTATGGCC 3070 het 3070 ref 32 20 12 4 AGTATTGA 1 0 343620 CASAVA_Build 9 73001707 1I TGCACCCATT -/A ACTCGTCATT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 1 2 343621 CASAVA_Build 9 73007045 1I AGGCAGTGTG -/C CCCATTCTCA 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 C 3 4 343622 CASAVA_Build 9 73009985 1D ATCAAATAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 9 8 343623 CASAVA_Build 9 73016098 1I TATGATTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 T 13 14 343624 CASAVA_Build 9 73017190 1D GTATTATATG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 8 7 343625 CASAVA_Build 9 73019058 3D TCTTAGTAGA AGG/--- AGAACAGTTT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 AGG 1 0 343626 CASAVA_Build 9 73020988 3I ATACTAATTA ---/TTC TTCTTATTTG 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 TTC 1 2 343627 CASAVA_Build 9 73030871 3D GGTTATAAAA TAT/--- TATTTGCAAG 2923 het 2923 ref 22 15 6 1 TAT 2 1 343628 CASAVA_Build 9 73039294 2D CTTCTGAAGC CT/-- CTCTCCTTGA 3070 het 3070 ref 49 22 18 9 CT 3 2 343629 CASAVA_Build 9 73044661 4I TTTCAAAGAC ----/TGTT TGCCTATTTA 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 TGTT 0 1 343630 CASAVA_Build 9 73048657 6D TAAGATCATG TTTGAT/------ TTTAAGTTCT 3070 het 3070 hom 43 18 22 4 TTTGAT 1 0 343631 CASAVA_Build 9 73068482 1D TAATCACCCC T/- GGTCTCAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 T 1 0 343632 CASAVA_Build 9 73072315 1I TACTTATCTC -/T TGTCACTCCT 3070 het 3070 ref 48 28 14 6 T 1 2 343633 CASAVA_Build 9 73074098 15D TGAGGGACTC AGCAGGGGCATGGCA/--------------- AGCATGTCTG 3070 het 3070 ref 47 25 21 8 AGCAGGGGCATGGCA 1 0 343634 CASAVA_Build 9 73077550 3D TAAGGCAAAT AAG/--- AAGCCAGGAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 AAG 2 1 343635 CASAVA_Build 9 73079803 1D TAAGGCAAGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 41 14 19 8 A 9 8 343636 CASAVA_Build 9 73081042 1D TTTTTATGTT G/- GGGGTAAAAG 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 G 5 4 343637 CASAVA_Build 9 73081867 1I AAAAAGCTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 16 15 1 T 8 9 343638 CASAVA_Build 9 73082627 2D AGTCAGAGAG TA/-- GAACTGTAAA 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 TA 1 0 343639 CASAVA_Build 9 73088853 1I CTTCAATGGG -/T TTTTTTACCA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 T 6 7 343640 CASAVA_Build 9 73090770 1D TTCAGGGAAA G/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 ref 42 24 13 5 G 1 0 343641 CASAVA_Build 9 73092374 1I ATTTACTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 12 12 A 13 14 343642 CASAVA_Build 9 73094815 1I TAAAAAGTAC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 7 8 343643 CASAVA_Build 9 73098343 1D ACATTTGTGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 58 32 17 9 A 10 9 343644 CASAVA_Build 9 73100125 4D TACAAGTGAT TAAC/---- TATGATAAAA 3070 het 3070 ref 49 31 15 4 TAAC 1 0 343645 CASAVA_Build 9 73102831 1D CTGCCACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 11 11 8 A 12 11 343646 CASAVA_Build 9 73106917 1I TACACATTTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 A 8 9 343647 CASAVA_Build 9 73123760 28I TAGTATGTAC ----------------------------/TCTTTTTGCTTTGCTTCTTTCACTTATG AAAATTGTGA 3070 hom 51 het 16 0 18 2 TCTTTTTGCTTTGCTTCTTTCACTTATG 0 1 343648 CASAVA_Build 9 73123981 1D GAAAGAGGTT A/- ATGACCGCTC 3070 hom 96 het 39 0 33 8 A 2 1 343649 CASAVA_Build 9 73140535 2I AGAATCTAAC --/AG AAACAGTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AG 0 1 343650 CASAVA_Build 9 73144258 2I ACTCAATAAC --/AT ATAGAAATTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AT 1 2 343651 CASAVA_Build 9 73146406 3D22M2D AGAAACTAGT AAAAAAAAAAAAAGAAAAAACTGGTAA/---GAAAAAAAAAGAAAAAACTGGT-- AAAAAAAAAT 3070 het 2590 hom 42 13 17 15 N/A 0 0 343652 CASAVA_Build 9 73151630 3D TATTTTCTGG GCA/--- GCACGGATAG 3070 hom 144 het 54 0 48 7 GCA 2 1 343653 CASAVA_Build 9 73157016 3D CAGAAGAAAC ATT/--- AATAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 14 5 ATT 1 0 343654 CASAVA_Build 9 73160577 1D AAATATTCCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 29 0 23 7 T 9 8 343655 CASAVA_Build 9 73162469 2D TGCTTTCCAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 32 hom 31 1 9 22 A 16 14 343656 CASAVA_Build 9 73172860 1I AGGACCAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 23 25 8 T 10 11 343657 CASAVA_Build 9 73173312 1D AAGTGATCTG A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 A 8 7 343658 CASAVA_Build 9 73178048 1I AAAAACCCTT -/A AAAAAAAAAA 2103 het 2103 ref 26 10 8 8 A 12 13 343659 CASAVA_Build 9 73184443 1I CTTTTTTTTT -/A AATTCAAATA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 A 2 3 343660 CASAVA_Build 9 73185864 1D TGCAATGATA C/- CAAACAACCT 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 C 2 1 343661 CASAVA_Build 9 73191187 1D CTGTCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 1085 het 1085 ref 35 21 3 12 A 13 12 343662 CASAVA_Build 9 73196115 4D TGTCTACTTC TCTT/---- TCTTTCTATG 3070 het 3070 ref 55 31 19 6 TCTT 2 1 343663 CASAVA_Build 9 73202538 1I TACATTATAT -/A TTCCAGAATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 0 1 343664 CASAVA_Build 9 73203861 3I TCATAACAGC ---/ATT ATTTATATAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 ATT 1 2 343665 CASAVA_Build 9 73219052 3D AAGAATCAGT TCA/--- TCATAACAAT 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 TCA 2 1 343666 CASAVA_Build 9 73222782 1I TTGAAAATCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 29 9 15 5 T 7 8 343667 CASAVA_Build 9 73231024 1I CCAGCAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 32 0 27 5 T 11 12 343668 CASAVA_Build 9 73233137 1I AGTCAGCCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 8 9 343669 CASAVA_Build 9 73237254 1D TTGTAGCTGT A/- AACCAGATCA 3070 het 3070 hom 37 13 21 4 A 3 2 343670 CASAVA_Build 9 73241228 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGGTTTCA 3070 hom 8 het 18 1 13 4 G 6 5 343671 CASAVA_Build 9 73245964 1D GAAAATGGTC T/- TTTTTTTTTC 1187 het 1187 ref 41 33 4 4 T 10 9 343672 CASAVA_Build 9 73258483 1D TTGAACCAGT G/- AGAAGATTCA 3070 hom 90 het 36 0 31 6 G 1 0 343673 CASAVA_Build 9 73268535 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAGAAAGAA 1687 het 328 hom 26 2 6 19 AG 1 0 343674 CASAVA_Build 9 73275399 2D TCTCTAAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 17 0 8 9 T 15 13 343675 CASAVA_Build 9 73281620 1D TAGGAGGAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 57 25 23 9 A 9 8 343676 CASAVA_Build 9 73282020 6I GGAGTTTAAA ------/GGGGTT GTGTTACTTG 3070 hom 126 het 44 0 41 3 GGGGTT 0 1 343677 CASAVA_Build 9 73283008 15I TGAAAGATTC ---------------/ATGAATAAAGTGATT ATGAATGTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 ATGAATAAAGTGATT 0 1 343678 CASAVA_Build 9 73285474 3D CTTGAAACCC ATG/--- ATGATATCCC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 ATG 2 1 343679 CASAVA_Build 9 73298275 1D TTGAGAGGGG A/- AAAAAAAAAA 894 het 894 ref 25 14 6 5 A 16 15 343680 CASAVA_Build 9 73316897 3I AACCTGTTAC ---/CTA CATTAGGTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CTA 0 1 343681 CASAVA_Build 9 73326541 1I GAAAACTTCC -/A GGGGAGGACT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 0 1 343682 CASAVA_Build 9 73330390 1I CTTCTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 41 1 32 8 A 10 11 343683 CASAVA_Build 9 73334240 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1705 het 993 hom 15 5 7 3 A 13 14 343684 CASAVA_Build 9 73337974 1D TTGAGAGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 A 10 9 343685 CASAVA_Build 9 73341098 1D ATTATATATA T/- ATGTATATAC 3070 het 3070 hom 19 9 9 2 T 1 0 343686 CASAVA_Build 9 73353070 4D TTTTTCTTTT CTTA/---- CTTAAGGATA 3070 het 3070 hom 25 7 14 10 CTTA 2 1 343687 CASAVA_Build 9 73368346 1I TGGCAGTCTG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 7 8 343688 CASAVA_Build 9 73377087 1D ACATCTTCAC A/- GACTCTTCCT 3070 hom 108 het 41 0 35 6 A 1 0 343689 CASAVA_Build 9 73401185 1I GGTCCTGACT -/G TTAGAAGGAA 3070 hom 19 het 20 1 18 1 G 0 1 343690 CASAVA_Build 9 73413625 2I ACAATGCATC --/AT ATATATGTGG 3070 het 3070 hom 53 26 23 4 AT 3 4 343691 CASAVA_Build 9 73427131 1I TACTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 17 17 18 T 10 11 343692 CASAVA_Build 9 73436604 2D AAAAAATAAG AA/-- AAAAAAATCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 9 7 343693 CASAVA_Build 9 73463116 1D ATTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1333 het 1333 ref 18 13 3 2 T 12 11 343694 CASAVA_Build 9 73501191 2I AGACTAAGAC --/TG TGATAGTAGA 2034 het 2034 ref 32 14 9 9 TG 1 2 343695 CASAVA_Build 9 73501620 1I ATAAATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 10 11 343696 CASAVA_Build 9 73503341 1D TCATAAATCA T/- TTTGGTTAAG 3070 het 3070 hom 50 20 30 1 T 4 3 343697 CASAVA_Build 9 73504189 1I ACCGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 A 13 14 343698 CASAVA_Build 9 73505253 3D CCTCTAATAG AGA/--- AGATGTGCAG 3070 het 3070 ref 40 19 16 8 AGA 2 1 343699 CASAVA_Build 9 73509870 1D ACACACATAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 9 8 343700 CASAVA_Build 9 73521088 1D ATTAATCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 11 10 343701 CASAVA_Build 9 73528092 1D AAGAGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 32 0 26 6 A 13 12 343702 CASAVA_Build 9 73538585 1D TTGTGTAGTC T/- TTTTTTTTTT 1308 het 1308 ref 34 23 3 8 T 13 12 343703 CASAVA_Build 9 73539738 2D CGCCTAAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 28 0 19 11 A 14 12 343704 CASAVA_Build 9 73543251 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 365 hom 19 1 15 3 A 9 10 343705 CASAVA_Build 9 73557216 2D AAGGAAGGAA GG/-- GGGAGGGAAG 1415 hom 7 het 3 0 3 0 G 5 3 343706 CASAVA_Build 9 73557775 1I AAGCAGCAGA -/C CAAAAATAAT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 1 2 343707 CASAVA_Build 9 73559636 1I AAATGCTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 10 343708 CASAVA_Build 9 73560698 18D TCTGTCTCAC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 11 12 A 29 11 343709 CASAVA_Build 9 73566782 1D TATGGGAGGG A/- GGGGAGGGTG 2303 het 2303 ref 21 10 9 2 A 1 0 343710 CASAVA_Build 9 73569559 3D AATAGACTTT AAC/--- AATCTAGATG 3070 het 3070 hom 47 22 22 5 AAC 1 0 343711 CASAVA_Build 9 73569652 1I ATAGCTTTTC -/T TTCCTTTTTT 2771 het 2771 ref 37 17 13 7 T 2 3 343712 CASAVA_Build 9 73570809 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1057 het 1057 ref 32 24 3 5 T 13 12 343713 CASAVA_Build 9 73577680 1D ACATTTTGCA T/- TTTTTTCCTG 3070 hom 123 het 48 0 42 7 T 7 6 343714 CASAVA_Build 9 73580765 2D AAGAGTGAAA CT/-- CTGTCTCCAA 868 het 868 ref 13 6 5 2 CT 2 1 343715 CASAVA_Build 9 73621793 1D AGGGATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 150 hom 40 2 33 6 A 12 11 343716 CASAVA_Build 9 73636428 1D CAACAACAAC A/- AACAAATAAC 2378 het 33 hom 43 1 9 33 A 3 2 343717 CASAVA_Build 9 73640635 4D TCTTTCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TCTT 6 5 343718 CASAVA_Build 9 73646117 1I CCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 9 10 343719 CASAVA_Build 9 73650108 2I TTTTTTTTTT --/TA AATTTATTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 TA 0 1 343720 CASAVA_Build 9 73652245 1D CAGAGTTATA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 T 9 8 343721 CASAVA_Build 9 73660228 3D TTTCTTTTCT GAG/--- ATGGAGTCTG 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 GAG 1 0 343722 CASAVA_Build 9 73665830 2I ATCATTTATA --/CT CTCTTTTTCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CT 2 3 343723 CASAVA_Build 9 73667030 4I GGTTTCAACA ----/TAAC TAACTAACTG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 TAAC 2 3 343724 CASAVA_Build 9 73667438 4D AATCACTCTT AAGA/---- TTTTGTCATG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AAGA 1 0 343725 CASAVA_Build 9 73687773 1I CCAGCTACTC -/A AGAGGCTGAG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 1 2 343726 CASAVA_Build 9 73694056 1I CCGTCTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 13 14 343727 CASAVA_Build 9 73697522 1I TAATGTTGTG -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 6 7 343728 CASAVA_Build 9 73702057 2I ACTTGAGCCT --/AA GAGTTCAAGA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 0 2 343729 CASAVA_Build 9 73716799 2D TAACTAATTG CA/-- CAGAGTGAAC 3070 hom 114 het 44 0 39 6 CA 2 1 343730 CASAVA_Build 9 73718633 1D ATCTTTAATT C/- CTTTCCCTCT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 C 2 1 343731 CASAVA_Build 9 73719922 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 11 3 A 0 1 343732 CASAVA_Build 9 73726718 1I TGCTCTGTCG -/C CCAGGCTAGA 2560 hom 15 het 6 0 6 1 C 2 3 343733 CASAVA_Build 9 73729107 3I TCTAAAATGT ---/TAA TAACGCAAAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TAA 1 2 343734 CASAVA_Build 9 73738933 4D TACAAAAATT AGAC/---- AGGTGTTGTG 3070 hom 74 het 27 0 23 4 AGAC 1 0 343735 CASAVA_Build 9 73740646 2I GGGGAGAAAC --/AT AGAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 AT 0 1 343736 CASAVA_Build 9 73741195 1D GTAGAGAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 10 9 343737 CASAVA_Build 9 73741507 1D TTGTTCAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1129 hom 34 4 16 14 T 19 18 343738 CASAVA_Build 9 73743817 2D TTTTATAAAA TT/-- TCTATATTTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 3 1 343739 CASAVA_Build 9 73747992 4D TAATTCTGTT TTTG/---- TTTGTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTTG 2 1 343740 CASAVA_Build 9 73748982 1I AAAAAAAAAA -/G AAGTTGTAGG 3070 het 393 hom 27 1 23 3 G 0 1 343741 CASAVA_Build 9 73755113 1D TTTGTCTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 138 het 59 0 47 12 T 9 8 343742 CASAVA_Build 9 73758851 1I CCCAGCTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 29 1 14 14 A 16 17 343743 CASAVA_Build 9 73761251 1I TCCCAGAGTG -/C CTGGAATTAC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 C 1 2 343744 CASAVA_Build 9 73770159 4I TCAGCTAGTC ----/CTGT CTGTCAGTAT 3070 hom 86 het 34 0 29 5 CTGT 1 2 343745 CASAVA_Build 9 73774688 1I GGGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 25 1 17 7 T 10 11 343746 CASAVA_Build 9 73781465 1I TAGCCCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 469 hom 13 1 10 2 T 12 13 343747 CASAVA_Build 9 73781953 2D CTTTTGTTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 8 8 A 14 12 343748 CASAVA_Build 9 73793150 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1846 het 491 hom 25 2 8 15 T 17 16 343749 CASAVA_Build 9 73800414 1D CCCTGCCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 353 hom 26 1 14 11 A 17 16 343750 CASAVA_Build 9 73816898 1D GAACAAGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3051 hom 30 11 14 6 T 11 10 343751 CASAVA_Build 9 73817263 1D ATGGCAGAGG C/- CCCAACTGCC 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 C 4 3 343752 CASAVA_Build 9 73820039 1I ACCAAATCAG -/A ACCTCCAGAG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 1 2 343753 CASAVA_Build 9 73838515 1I GCTGATGCAC -/T TTTTTTTTTT 2739 het 2739 ref 28 11 13 4 T 14 15 343754 CASAVA_Build 9 73885371 3I GTACTCATTC ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 12 343755 CASAVA_Build 9 73891644 1D TTATTATTAT C/- TATCTATCTA 3070 hom 30 het 15 0 12 4 C 1 0 343756 CASAVA_Build 9 73900947 1D GGGCAGCCAG A/- GAGAAAGGTT 3070 hom 47 het 19 0 14 5 A 1 0 343757 CASAVA_Build 9 73905457 1D TAATAATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 713 hom 15 3 10 2 T 15 14 343758 CASAVA_Build 9 73907711 1I AAGAGGATGG -/A AAAGAGAGAA 3070 het 73 hom 37 1 32 4 A 3 4 343759 CASAVA_Build 9 73915646 1D CTTGCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 2501 het 62 hom 24 1 9 14 T 14 13 343760 CASAVA_Build 9 73920969 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 592 hom 22 3 15 4 A 12 13 343761 CASAVA_Build 9 73927239 2D AATATTGTAA CT/-- CTGCAACTTT 3070 hom 157 het 56 0 53 4 CT 2 1 343762 CASAVA_Build 9 73936205 1I CCATTTATGA -/G GCATCCACCC 3070 hom 144 het 51 0 47 4 G 1 2 343763 CASAVA_Build 9 73939140 1D CCCCGCCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 30 0 24 6 T 13 12 343764 CASAVA_Build 9 73952353 1D CTAGTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 37 1 29 7 T 12 11 343765 CASAVA_Build 9 73970536 1I TGGGAGGCTG -/A AGGGGGGAGA 3070 het 2136 hom 17 5 12 0 A 1 2 343766 CASAVA_Build 9 73975556 3D ATTACTATTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 44 15 18 11 TTG 5 4 343767 CASAVA_Build 9 73976964 2D ATACAATCTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AT 8 7 343768 CASAVA_Build 9 73986109 1D TTGCTTAGGC T/- GGAGTGCAGT 3070 het 3070 ref 28 13 14 2 T 1 0 343769 CASAVA_Build 9 73993680 1I GCTTAAAGTG -/T TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 6 7 343770 CASAVA_Build 9 73995555 1D TAAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 11 10 343771 CASAVA_Build 9 73997895 1I GGTTAGGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 10 11 343772 CASAVA_Build 9 74005166 3D TTTTCCTCTT CTC/--- CTCCTCTCCT 3070 het 3070 hom 27 11 10 7 CTC 3 2 343773 CASAVA_Build 9 74005332 1I ATAGTAGACA -/T TTGGGAAATA 3070 hom 61 het 33 0 19 14 T 2 3 343774 CASAVA_Build 9 74012852 3D AACCCAAAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 50 24 19 9 AAC 4 3 343775 CASAVA_Build 9 74020073 1D TAAAGAAGAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 47 20 25 3 T 9 8 343776 CASAVA_Build 9 74035239 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 865 het 865 ref 16 5 6 6 T 1 0 343777 CASAVA_Build 9 74041827 1D AAAACCCCTT C/- TTAATCAGAC 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 C 1 0 343778 CASAVA_Build 9 74045778 1I AGAGCTTTTT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 7 8 343779 CASAVA_Build 9 74049773 1D AAGATACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 17 11 T 11 10 343780 CASAVA_Build 9 74051468 1D TAAGGGGTAA G/- GGGAGGGTCA 3070 het 3070 ref 38 25 9 4 G 4 3 343781 CASAVA_Build 9 74059196 4D AAAAAAAAAC AAAA/---- AAACAAAACA 3070 het 2687 hom 29 10 16 4 A 7 3 343782 CASAVA_Build 9 74062086 1I GTTTCTGTCA -/C CTGCAAATCA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 C 1 2 343783 CASAVA_Build 9 74072765 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 432 het 432 ref 32 22 2 8 T 12 11 343784 CASAVA_Build 9 74073960 5I CATCTATGTG -----/CTCCT CTCAACATCC 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 CTCCT 0 1 343785 CASAVA_Build 9 74076156 11D GCGGAGGTTG CAGTGAGCCGA/----------- CATCGTGCCA 3070 het 1897 hom 22 6 15 2 CAGTGAGCCGA 1 0 343786 CASAVA_Build 9 74082428 3D GGAAAAACAG CAA/--- CAACAACAAA 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 CAA 4 3 343787 CASAVA_Build 9 74083284 1I TTCTTTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 het 2146 hom 49 11 25 14 C 0 1 343788 CASAVA_Build 9 74091560 4I TCTAACAGTT ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 104 het 42 0 35 7 TG 7 9 343789 CASAVA_Build 9 74091675 1I TCTGGATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 10 11 343790 CASAVA_Build 9 74093376 1I CCGTGCCCAG -/C CGGAATGAGA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 C 1 2 343791 CASAVA_Build 9 74093843 2I GATATTTTTC --/TA TGTTTCTGCT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 TA 0 1 343792 CASAVA_Build 9 74094833 1I GGCAGCTCTG -/C CCCTGTGGCT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 C 3 4 343793 CASAVA_Build 9 74096591 1I ACAGCACAGG -/A AAAGACCCGC 1394 het 1394 ref 15 6 5 4 A 3 4 343794 CASAVA_Build 9 74109453 2D CTCTCTCTCA CT/-- CTCTCTCTCT 1187 het 1187 ref 50 35 5 11 CT 8 7 343795 CASAVA_Build 9 74110121 7I TCAAACACGT -------/CACACTA GGAAAGGAGT 3070 het 3070 ref 50 22 21 7 CACACTA 0 1 343796 CASAVA_Build 9 74113116 7D CCAAAAAAAA AAAAAAC/------- AAAATCCAAA 2014 het 2014 ref 17 6 6 7 AAAAAAC 1 0 343797 CASAVA_Build 9 74113838 17D CAGTCTACCG AAGACAAACAATTGCCA/----------------- CCTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 46 27 22 4 AAGACAAACAATTGCCA 1 0 343798 CASAVA_Build 9 74122526 2D CTTTTTAATA GC/-- TGTTGAGACT 3070 het 3070 ref 18 10 8 2 GC 1 0 343799 CASAVA_Build 9 74124747 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 1937 hom 15 het 11 0 6 5 AT 8 7 343800 CASAVA_Build 9 74127148 1I AATTAGTTTA -/G GGGAGAGCAC 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 G 3 4 343801 CASAVA_Build 9 74129301 1I CCCCATGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 30 1 24 5 T 11 12 343802 CASAVA_Build 9 74136828 1D GCTAGAGGCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2808 hom 34 13 21 0 A 10 9 343803 CASAVA_Build 9 74154459 6I CCAGATCTTG ------/TTTAAT TTTATTAGGT 3070 hom 89 het 33 0 30 3 TTTAAT 0 1 343804 CASAVA_Build 9 74158397 4I CCAAACAAAA ----/AACT ATCTATCTCT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 AACT 0 1 343805 CASAVA_Build 9 74158478 1D ACTCTTACTT C/- CATTTTTAAC 3070 hom 102 het 38 0 34 5 C 2 1 343806 CASAVA_Build 9 74159535 3D CACAGAAGTG ATT/--- ATTACCAGAC 3070 het 3070 hom 38 18 17 5 ATT 2 1 343807 CASAVA_Build 9 74163721 2I CTCCCACAAA --/AT ATATGATAGG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 AT 2 3 343808 CASAVA_Build 9 74163998 3I ATACTCATAC ---/TCT TCAAGATACT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 TCT 0 1 343809 CASAVA_Build 9 74166091 1I GAACTGGTAG -/C CCCTTCCTGC 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 C 3 4 343810 CASAVA_Build 9 74171403 2D ATGAATTAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 18 2 11 5 A 16 14 343811 CASAVA_Build 9 74172138 1D GGAAAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 A 11 10 343812 CASAVA_Build 9 74173240 1D CAATCATAAC G/- GATCTTGAAA 3070 het 3070 hom 29 13 16 1 G 2 1 343813 CASAVA_Build 9 74182677 1D ACATGGTGAA C/- CCCCCCCGTC 1250 het 196 hom 9 1 3 5 C 8 7 343814 CASAVA_Build 9 74183248 1I CAAAAAAAAA -/C CATTGCCAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 C 1 2 343815 CASAVA_Build 9 74219128 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 1096 het 1096 ref 16 7 3 6 A 13 14 343816 CASAVA_Build 9 74231995 1I4M1D AGTGCCATTG -GTGAG/CATGA- CCTTGGCTCA 2745 het 2745 ref 31 14 11 8 N/A 0 0 343817 CASAVA_Build 9 74251930 1D TATGATATAA T/- TTGGATATTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 3 2 343818 CASAVA_Build 9 74254720 2D TATATATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 TA 6 5 343819 CASAVA_Build 9 74268172 1I TAATGAGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 26 13 6 T 10 11 343820 CASAVA_Build 9 74275629 1D ATGCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1623 hom 24 6 9 9 A 16 15 343821 CASAVA_Build 9 74283979 3D TTTTTTTTTT TTG/--- TTTTTCAGGT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 TTG 1 0 343822 CASAVA_Build 9 74296042 3I TTTAAGTTTA ---/ACT ATAAACTAAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 ACT 0 1 343823 CASAVA_Build 9 74298386 1I ACCCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 A 11 12 343824 CASAVA_Build 9 74312656 2I GTATGTATAT --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 AC 4 5 343825 CASAVA_Build 9 74318913 1D AAGAAGAGAG A/- AAAAAAAATG 2253 het 2253 ref 26 13 7 6 A 9 8 343826 CASAVA_Build 9 74320387 1I AATACAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 T 10 11 343827 CASAVA_Build 9 74321054 1D TTTTTATTCG C/- TAGATGAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 C 1 0 343828 CASAVA_Build 9 74325584 2I TTTTTAAGAC --/TG TTATGTTAGT 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 TG 0 1 343829 CASAVA_Build 9 74326479 1D ACTCCGTCAC A/- AAAAAAAAAA 1148 het 1148 ref 24 17 3 4 A 11 10 343830 CASAVA_Build 9 74339781 2D TGGATCTCTT AG/-- AGAGAGAGAA 3070 het 158 hom 43 4 24 15 AG 5 4 343831 CASAVA_Build 9 74343836 1I TTCTTCTGCT -/G GCTGGGCATG 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 G 1 2 343832 CASAVA_Build 9 74344247 1I CACAGCCAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 T 9 10 343833 CASAVA_Build 9 74345238 1D TCGTTCTGAC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 T 8 7 343834 CASAVA_Build 9 74349076 13I TCAAGGTATA -------------/ACCCCAGATACTC TCCACTTCAC 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 ACCCCAGATACTC 0 1 343835 CASAVA_Build 9 74365562 3I TTGCAAGTTT ---/CAC CACATTTCCT 2792 het 2792 ref 22 14 6 2 CAC 1 2 343836 CASAVA_Build 9 74366745 1D TCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2426 het 2401 hom 22 7 8 7 A 15 14 343837 CASAVA_Build 9 74367460 1I TCCAAGTAAG -/A AAAAATCATA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 5 6 343838 CASAVA_Build 9 74367815 2D ATTTACAAAC AT/-- AGAGTACAGC 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 AT 1 0 343839 CASAVA_Build 9 74374967 16D TCAAAGAGTA GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 32 13 13 10 GT 17 9 343840 CASAVA_Build 9 74376113 2I CTTCTCTCTT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 TC 7 8 343841 CASAVA_Build 9 74388595 1I ATTATTATGG -/A AAAAAGTAGT 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 A 5 6 343842 CASAVA_Build 9 74390054 1I GCCCTGCTAA -/T TTTTTTGTAC 2304 het 2088 hom 12 5 5 2 T 6 7 343843 CASAVA_Build 9 74393512 1I AAAAACAAGA -/T TTTTTTTTTT 2045 het 1057 hom 25 5 8 12 T 17 18 343844 CASAVA_Build 9 74396469 5I ACCATGGCTA -----/TTTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 TTTTG 0 1 343845 CASAVA_Build 9 74398296 1I ACCTGGCTAA -/T TTTCGTATTT 2384 het 1953 hom 16 7 5 4 T 3 4 343846 CASAVA_Build 9 74399593 3I CTCTCCTCTG ---/CTT CTTCTTCTTC 1599 het 1354 hom 27 9 7 11 CTT 5 6 343847 CASAVA_Build 9 74403100 1D TTCCCAGGAA C/- GTGAATGATA 3070 het 3070 hom 34 15 14 6 C 1 0 343848 CASAVA_Build 9 74414283 3D GTCTCAAAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 25 10 12 6 AAC 4 3 343849 CASAVA_Build 9 74424232 2D CCATAAAAAG AA/-- AACTGAATGA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 4 2 343850 CASAVA_Build 9 74432635 1D CTGTATTGGA T/- TTTTTTTTTT 2697 het 2697 ref 25 12 7 6 T 12 11 343851 CASAVA_Build 9 74446407 3D TGCATTCATC CCT/--- CCTTCTTGGA 3070 het 3070 hom 36 15 16 6 CCT 2 1 343852 CASAVA_Build 9 74452685 1I TTATCATTCC -/A AATCAAAGAT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 2 3 343853 CASAVA_Build 9 74460478 1D AATCCGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 21 0 17 4 A 12 11 343854 CASAVA_Build 9 74466923 5D TTCTTTTTCT TTTTC/----- TTTTTTTTTT 400 het 400 ref 25 12 5 11 TTTTC 1 0 343855 CASAVA_Build 9 74468532 2I CTTTTGACTC --/TT TTGTAATAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 2 4 343856 CASAVA_Build 9 74472805 1D GACATTTTGG A/- ATAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 36 14 12 10 A 2 1 343857 CASAVA_Build 9 74477030 4D TTTTAAAATT TGAG/---- TGATGTACAG 3070 het 3070 hom 26 11 15 0 TGAG 1 0 343858 CASAVA_Build 9 74478040 1I AGAAAAACAA -/G AACAAATAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 G 0 1 343859 CASAVA_Build 9 74484739 1I ATACAAAGAC -/A GGGGGCAGAA 3070 hom 100 het 39 0 34 5 A 0 1 343860 CASAVA_Build 9 74488032 1I TGGTTTTAAG -/A AAAGCAAAAT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 3 4 343861 CASAVA_Build 9 74494272 5I GGAATGTAAT -----/ATTAC GTAGGGTATT 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 ATTAC 0 1 343862 CASAVA_Build 9 74498497 12D AATTTTATCT TAATTATCTTAA/------------ TTTATCTTAA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 TAATTATCTTAA 1 0 343863 CASAVA_Build 9 74500274 1D ACAGGTAATA G/- GGCCATGCGA 3070 het 3070 ref 43 25 11 7 G 3 2 343864 CASAVA_Build 9 74505254 3D ACTTTTAAAG AGA/--- AGAAGAAGAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 AGA 4 3 343865 CASAVA_Build 9 74515446 1D TTTTCCACCC T/- TTTACCTCAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 T 4 3 343866 CASAVA_Build 9 74519330 1D GAACCTCTGC T/- TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 8 7 343867 CASAVA_Build 9 74520464 3D TCGGAGGAGT TTG/--- TTATTACCCA 3070 het 3070 ref 24 9 9 7 TTG 1 0 343868 CASAVA_Build 9 74522806 4D TATATTTATG CTAT/---- CTATTTCACT 3070 het 3070 ref 25 16 9 3 CTAT 2 1 343869 CASAVA_Build 9 74529294 1I TAAACAGGGA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 T 8 9 343870 CASAVA_Build 9 74537903 4I CACAGTTGGA ----/TATC TATCTACAGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 TATC 1 2 343871 CASAVA_Build 9 74540550 1D GATATGGGGG A/- ATGAAGAATC 3070 hom 93 het 37 0 32 6 A 2 1 343872 CASAVA_Build 9 74542855 3I ACTCCCTGTG ---/GTC GTCAATGCAA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 GTC 1 2 343873 CASAVA_Build 9 74545847 1D ATGAGTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 12 11 343874 CASAVA_Build 9 74548449 16D GAATATTCAT AGGAAGGAAGGAAGGA/---------------- AGGAAGGAAG 3070 het 3070 hom 24 11 12 4 AGGA 7 3 343875 CASAVA_Build 9 74551317 2I AAAATGTGGC --/TT TAAAGGAGTC 3070 hom 138 het 53 0 46 7 T 1 3 343876 CASAVA_Build 9 74555280 1D AAGAGGGTGC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 343877 CASAVA_Build 9 74563647 2D TATTATACTC AT/-- ATATTTATAG 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 AT 3 2 343878 CASAVA_Build 9 74574515 1D CTGAGTGTCA C/- ATCTGTGGCA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 C 1 0 343879 CASAVA_Build 9 74707703 1D TCCACACTGT A/- AAAAAAAAAA 1182 het 1182 ref 36 27 3 7 A 12 11 343880 CASAVA_Build 9 74719472 2I ATATGCAAAG --/TA TATATATATA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TA 6 7 343881 CASAVA_Build 9 74720194 1I TAATCACAAC -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 6 7 343882 CASAVA_Build 9 74730097 1D GCTAAATGTA T/- TCCCCCCACT 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 T 2 1 343883 CASAVA_Build 9 74733795 2I AAAATTCCAT --/AA AAGTTTTAGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 2 4 343884 CASAVA_Build 9 74739678 3D CAAATATATA CTG/--- CTATTTGTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 CTG 1 0 343885 CASAVA_Build 9 74744287 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 19 0 10 9 T 11 12 343886 CASAVA_Build 9 74754384 2D AATTATTTAT TG/-- TGTGTGTGTG 1189 het 1189 ref 25 11 7 9 TG 8 7 343887 CASAVA_Build 9 74755598 1D ATAACCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 32 0 24 9 T 11 10 343888 CASAVA_Build 9 74758204 17I TCAGTAGAAG -----------------/CTGGTGAGGAGAGAACC CTGGCCAGGT 3070 hom 102 het 38 0 34 5 CTGGTGAGGAGAGAACC 0 1 343889 CASAVA_Build 9 74775886 1D ATCTTCAAAG T/- TTGAATGTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 2 343890 CASAVA_Build 9 74776663 1I TCATTTAAAG -/A AAAAAACCCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 6 7 343891 CASAVA_Build 9 74782325 2D CTAGCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 185 hom 22 3 11 8 T 16 14 343892 CASAVA_Build 9 74835926 1D TTTCTTTGTT C/- CCTGTGCTGT 3070 hom 56 het 24 0 20 4 C 3 2 343893 CASAVA_Build 9 74851652 11I CTAAATCTAG -----------/CTAATTAAAAT ATGCATTACC 3070 hom 84 het 31 0 29 3 CTAATTAAAAT 0 1 343894 CASAVA_Build 9 74885889 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 190 het 190 ref 28 11 2 15 TTTC 1 0 343895 CASAVA_Build 9 74888871 2D CACCCACAAT TA/-- TATGACACTA 3070 hom 141 het 48 0 48 0 TA 2 1 343896 CASAVA_Build 9 74898707 1I CCAGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 892 hom 36 3 26 7 A 15 16 343897 CASAVA_Build 9 74905725 3D CGCACACACA CAC/--- AACACATATA 3070 het 3070 hom 30 15 15 1 CAC 1 0 343898 CASAVA_Build 9 74915273 1I AACTTAACAC -/T TTTCAGTCCA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 3 4 343899 CASAVA_Build 9 74929568 1I CCTTGCTCTT -/G GACTTTCCAG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 G 1 2 343900 CASAVA_Build 9 74952202 3D GAATTTTTGA ATT/--- ATTATATTAG 3070 het 3070 ref 35 16 14 6 ATT 2 1 343901 CASAVA_Build 9 74975796 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1346 het 803 hom 7 3 3 1 T 13 12 343902 CASAVA_Build 9 74985023 2I AAAGTATAAT --/AA AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 6 8 343903 CASAVA_Build 9 74985221 1D ATAATTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1494 het 1494 ref 30 19 4 8 T 11 10 343904 CASAVA_Build 9 74989105 2D TAGTATATAT AC/-- ACACACACAC 2853 hom 30 het 13 0 11 3 AC 6 5 343905 CASAVA_Build 9 74990104 1I GAAGTTCCCC -/T ACACATGCTC 3070 hom 93 het 34 0 31 6 T 0 1 343906 CASAVA_Build 9 74990499 3D CAAGAACCAG CCC/--- CCCCCCCCGC 3070 hom 69 het 27 0 21 6 C 11 8 343907 CASAVA_Build 9 74991994 1I AACCTTAAAT -/G CACATGTTTT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 G 0 1 343908 CASAVA_Build 9 74994035 4I CCCTCTCTGC ----/AGGA AGGATTATCT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AGGA 1 2 343909 CASAVA_Build 9 74998000 1D TGTTTGTAGG A/- TTTTCCCCCC 3070 het 187 hom 13 2 8 4 A 1 0 343910 CASAVA_Build 9 75001248 1D ACTGTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 52 1 44 8 T 11 10 343911 CASAVA_Build 9 75004310 1I AGAAAGAAGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 7 8 343912 CASAVA_Build 9 75004613 2I TCTTTGGGTA --/AC ACATTCCAAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AC 1 2 343913 CASAVA_Build 9 75018634 4I TGATTATATT ----/TTTA TTTATTACAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 TTTA 1 2 343914 CASAVA_Build 9 75019987 2D GCTTTTCAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 806 hom 48 6 18 25 T 14 12 343915 CASAVA_Build 9 75025258 2D TCCCTAGCAC TT/-- CTTAAAGAGA 3070 hom 111 het 42 0 37 6 T 2 0 343916 CASAVA_Build 9 75026385 1D AAGAAGTATT A/- TTTTTAGGAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 1 0 343917 CASAVA_Build 9 75026946 1I AATACTTGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 9 10 343918 CASAVA_Build 9 75037025 1I ATCCGGGGGG -/A AAACAACCTC 3070 hom 66 het 29 0 22 7 A 3 4 343919 CASAVA_Build 9 75037386 1D CAACAAAGTC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 2814 hom 31 9 17 7 T 8 7 343920 CASAVA_Build 9 75048404 1I GGGGGATGAT -/A AAAAAAGGGG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 6 7 343921 CASAVA_Build 9 75053876 1I TTAAAAATTC -/A ATTTCTTGAG 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 1 2 343922 CASAVA_Build 9 75055137 1D TGTTTTTTGT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 A 9 8 343923 CASAVA_Build 9 75055836 1I CCCAAATAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 10 343924 CASAVA_Build 9 75074697 1I GAAGCCCCCC -/T GAGGTAGTAC 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 0 1 343925 CASAVA_Build 9 75083978 2I AATATATGTG --/TA TATATATATA 1855 het 1855 ref 26 10 10 6 TA 6 7 343926 CASAVA_Build 9 75099150 2I TTGGTCTCTC --/TT TAGTTTTTGT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 1 3 343927 CASAVA_Build 9 75131342 3D AAAAAATCTG AAA/--- ATACAAATAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 4 1 343928 CASAVA_Build 9 75133599 4I AGAATTTCTC ----/TCTT TGTTTTCTTT 3070 hom 66 het 32 0 23 9 TCTT 0 1 343929 CASAVA_Build 9 75137619 1D TTTTTTAAAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 10 9 343930 CASAVA_Build 9 75156199 1D CTCACTGTGA T/- TTTGATTTGC 3070 het 3070 ref 40 19 16 7 T 4 3 343931 CASAVA_Build 9 75159869 1D GGAAAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 11 10 343932 CASAVA_Build 9 75217517 1D CATCAATTCC A/- AAAATTTTAA 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 A 5 4 343933 CASAVA_Build 9 75226511 5D CAGTTAATGC CAATT/----- CAATTCTACA 3070 het 3070 hom 40 15 24 2 CAATT 2 1 343934 CASAVA_Build 9 75237351 1D CCCTTCCCCC T/- ATCAGGGCCA 3070 het 3070 ref 52 27 18 8 T 1 0 343935 CASAVA_Build 9 75257673 1I AACCTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 24 0 22 2 A 11 12 343936 CASAVA_Build 9 75259395 2D CCATAGACTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 10 14 11 TG 9 8 343937 CASAVA_Build 9 75303972 1D GAAAAAAAAA C/- ACACACACTA 2586 het 2586 ref 28 18 7 4 C 1 0 343938 CASAVA_Build 9 75330022 1D GTGTGGGTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 7 6 343939 CASAVA_Build 9 75337167 1D TAGTTAGGTT A/- AAAAAAAAAA 1278 het 1278 ref 28 17 4 7 A 13 12 343940 CASAVA_Build 9 75338589 5D TGTGGCACCG CGCAT/----- CGCATCTCTA 3070 hom 82 het 35 0 27 11 CGCAT 2 1 343941 CASAVA_Build 9 75340478 1D AACTTAAGTG T/- TTTTTTTTTT 1153 het 1153 ref 52 39 4 9 T 11 10 343942 CASAVA_Build 9 75343284 7D TACTGTTTTT TCTACTC/------- TCTACTCTCA 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TCTACTC 2 1 343943 CASAVA_Build 9 75350172 5D ATAGAAAAAA GAAAT/----- GAAGAGATTA 3070 hom 84 het 30 0 29 5 GAAAT 1 0 343944 CASAVA_Build 9 75351852 1D ATTAGAACAT A/- AACCCATAGC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 3 2 343945 CASAVA_Build 9 75352404 2D CCTCTTAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 32 0 27 5 T 14 12 343946 CASAVA_Build 9 75354530 2D TTTTTCTGTC TT/-- TGCTAGCATT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 T 3 1 343947 CASAVA_Build 9 75355392 2D AAATTTTACC TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TA 7 6 343948 CASAVA_Build 9 75359353 1I CTATTTTCCT -/A AAAAATATTG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 5 6 343949 CASAVA_Build 9 75363593 1D AATATCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 46 hom 32 3 26 3 T 12 11 343950 CASAVA_Build 9 75372905 5I GAAAAATATA -----/TTTTG TTTGACAAAG 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 TTTTG 0 1 343951 CASAVA_Build 9 75374649 1D TAGAAGACCT A/- AAAATTTATT 3070 het 3070 ref 21 12 8 1 A 5 4 343952 CASAVA_Build 9 75379835 1I GATCATTTTT -/A AAAGGCTTAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 3 4 343953 CASAVA_Build 9 75380540 1D GAAAAAAAAG A/- AAAAAATTTG 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 7 6 343954 CASAVA_Build 9 75392954 1I AACTTAGAGG -/A TGGATCGATA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 0 1 343955 CASAVA_Build 9 75436523 12I TATTACCAGC ------------/ACAGTTTCCGCA ACTACAAAAG 3070 hom 129 het 47 0 44 3 ACAGTTTCCGCA 0 1 343956 CASAVA_Build 9 75458149 5I TATTTAAAAA -----/ACAAC ACAACACATG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 ACAAC 1 2 343957 CASAVA_Build 9 75463461 3D ATTTAAAAAT AAC/--- AATAGGATTA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 AAC 1 0 343958 CASAVA_Build 9 75481592 1D AAACCCCTCC A/- AAAATGAAGC 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 A 5 4 343959 CASAVA_Build 9 75487257 1I GGCAGTATGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 13 12 13 T 8 9 343960 CASAVA_Build 9 75489510 1D TTGAGGCATG A/- ACAGATCTCC 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 A 2 1 343961 CASAVA_Build 9 75496673 1I TCAAAGAAAA -/T TGTCATCTCA 3070 het 3070 hom 44 19 21 4 T 1 2 343962 CASAVA_Build 9 75499507 5I TAATTGTACT -----/TTAAA TTAAATACAC 3070 het 3070 ref 57 25 23 9 TTAAA 1 2 343963 CASAVA_Build 9 75504899 1D TAATAAGGTG T/- TTTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 7 6 343964 CASAVA_Build 9 75517761 1I GAATTGAAAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 A 8 9 343965 CASAVA_Build 9 75523062 2I TTTAAATAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 10 12 343966 CASAVA_Build 9 75524479 1I GCATAGACCT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 8 9 343967 CASAVA_Build 9 75525741 1D GACCACTAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 A 9 8 343968 CASAVA_Build 9 75528625 4I CAAAAGGCAT ----/TGTG TGTGTGTGCG 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 TG 4 6 343969 CASAVA_Build 9 75530403 2D AATTAGAAAT AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 6 het 27 1 16 12 A 10 8 343970 CASAVA_Build 9 75541388 3D AATTCTGTCC TCA/--- TCATTTCTCT 3070 het 3070 hom 45 19 24 4 TCA 2 1 343971 CASAVA_Build 9 75550340 3I ATAAATGGAG ---/TAT ATGTACAGGT 3070 hom 52 het 24 0 20 4 TAT 0 1 343972 CASAVA_Build 9 75557374 1D ACTTTATGTA G/- TAAAGGTTGG 3070 hom 102 het 36 0 35 2 G 1 0 343973 CASAVA_Build 9 75557479 4I GTCATAACAC ----/TTAG TTAGGAAGCC 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 TTAG 1 2 343974 CASAVA_Build 9 75563718 1I ATTATTTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 329 hom 30 1 27 2 A 10 11 343975 CASAVA_Build 9 75575252 1I GATAGGACTG -/C CAATGATCTC 3070 hom 96 het 43 0 33 12 C 1 2 343976 CASAVA_Build 9 75577375 1I CTACAAGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 197 hom 43 1 36 6 A 9 10 343977 CASAVA_Build 9 75581638 2I TTATGATGAG --/AA AATTATAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 4 343978 CASAVA_Build 9 75582985 2D TACTTTCCAT CA/-- CACACACACA 3070 hom 141 het 54 0 47 9 CA 6 5 343979 CASAVA_Build 9 75591976 2D AGTGAAATTG TC/-- TCTGTTTGCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TC 2 1 343980 CASAVA_Build 9 75599410 1D GTAAGAAGGA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 7 6 343981 CASAVA_Build 9 75601029 4I TTCATCCATG ----/TCCC TACAAAGGAC 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TCCC 0 1 343982 CASAVA_Build 9 75658388 1D CCAGACTGTG C/- CAGATAACAG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 C 2 1 343983 CASAVA_Build 9 75663472 1I TTCTTAAGCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 9 10 343984 CASAVA_Build 9 75664583 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 967 het 967 ref 40 23 3 14 TG 10 9 343985 CASAVA_Build 9 75679807 1I TCCTCTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 28 0 20 8 A 13 14 343986 CASAVA_Build 9 75682743 1I ATTTTGTGAT -/A TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 0 1 343987 CASAVA_Build 9 75700365 2D GAGAATTTTA GT/-- GTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 28 2 18 8 GT 2 1 343988 CASAVA_Build 9 75700546 1D AATTTGACTT A/- AAAATCTCAC 3070 hom 72 het 28 0 25 5 A 5 4 343989 CASAVA_Build 9 75717120 1D ATTTAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 838 hom 35 2 31 2 T 12 11 343990 CASAVA_Build 9 75719297 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 27 1 23 3 T 13 12 343991 CASAVA_Build 9 75733195 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAACAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 5 6 343992 CASAVA_Build 9 75739009 2D TTAATTATCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 109 hom 27 3 17 7 A 13 11 343993 CASAVA_Build 9 75739768 2I ATACAATTAT --/TA TGTTTCTATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TA 0 1 343994 CASAVA_Build 9 75745019 1I GTATATTTTA -/G GAGGAATCAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 1 2 343995 CASAVA_Build 9 75748568 1I AAAAATCTAT -/A AAAAAACCCA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 6 7 343996 CASAVA_Build 9 75748801 1D AAAAACTACT G/- GATCTAATTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 G 2 1 343997 CASAVA_Build 9 75750235 1I TGTAAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 10 11 343998 CASAVA_Build 9 75751524 1I GGAAATTCAG -/A AAAACACCAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 4 5 343999 CASAVA_Build 9 75752280 1D CGCTATCTTC A/- AAAAAATTGT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 7 6 344000 CASAVA_Build 9 75752604 2I64M3I ACTAAAAGAC --AGGCTATCAGCGTGGACTAAAAGAAAAAACATTACACATTGCCTACAAGAAAGCCACTTTAAAT---/AGAGGCTATCAGCGTGGACTAAAAGAAAAAACATTACACATTGCCTACAAGAAAGCCACTTTAAATAGA AGGACACAGA 3070 hom 188 het 45 0 63 16 N/A 0 0 344001 CASAVA_Build 9 75753020 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 10 4 T 13 12 344002 CASAVA_Build 9 75757787 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 12 1 9 2 A 15 14 344003 CASAVA_Build 9 75760544 1D AAGACACAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 84 het 31 0 27 4 A 8 7 344004 CASAVA_Build 9 75760773 1I TTAAAGATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1670 hom 39 5 28 6 A 12 13 344005 CASAVA_Build 9 75765540 2D AGTCAGACCA CT/-- CTCTGTACTT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 CT 3 2 344006 CASAVA_Build 9 75767287 2D ATATACATTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TG 7 6 344007 CASAVA_Build 9 75769002 2I ATATATTTAT --/AC ACACACACAC 3070 het 416 hom 38 1 29 8 AC 7 8 344008 CASAVA_Build 9 75770524 9I TTCCAGCCTT ---------/GAATACTAA ATGTCATAAT 3070 hom 123 het 44 0 41 5 GAATACTAA 0 1 344009 CASAVA_Build 9 75779453 4D GGCCGGGCGC GGTG/---- GGTGGCTCAC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 GGTG 2 1 344010 CASAVA_Build 9 75781645 1D TAGATAAGGC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 34 0 28 7 A 8 7 344011 CASAVA_Build 9 75782580 1I CCCGAAGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 361 hom 41 1 33 7 A 9 10 344012 CASAVA_Build 9 75786119 1I TTCATCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 39 0 33 6 T 11 12 344013 CASAVA_Build 9 75787961 1I TTGTGGAGGA -/C TTTTGTGTCT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 C 0 1 344014 CASAVA_Build 9 75788253 1D GGTGTCTTTC A/- AAAAACTTTA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 6 5 344015 CASAVA_Build 9 75791083 1I TATTTCTGGA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 7 8 344016 CASAVA_Build 9 75793383 5I AACCACACTA -----/TTATC TTAACAGGCA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TTATC 0 1 344017 CASAVA_Build 9 75794472 2D GCTTTTCCAG AC/-- ACAGAGTACA 3070 hom 87 het 34 0 27 7 AC 2 1 344018 CASAVA_Build 9 75798310 5I TAAGTTGTTT -----/TTTAA GTATTTTCTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TTTAA 0 1 344019 CASAVA_Build 9 75804447 5I14M1D TATAGATATA -----TTATATAATATATAT/TTATGTTATATAATATATA- TTTTTTATAT 3070 hom 30 het 10 0 11 1 N/A 0 0 344020 CASAVA_Build 9 75816920 1D AATTGTATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 9 344021 CASAVA_Build 9 75821733 1I GCAGCAAGAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 9 344022 CASAVA_Build 9 75826856 2D CAGGCACTAA TT/-- AGATTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 2 0 344023 CASAVA_Build 9 75828252 2I GGAACCTTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 AT 6 7 344024 CASAVA_Build 9 75831247 1D AGTAAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 11 10 344025 CASAVA_Build 9 75835303 1I AGCCCTCGTG -/A AATGGTTTGG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 2 3 344026 CASAVA_Build 9 75843283 1I GCAGAAAATG -/A AAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 6 7 344027 CASAVA_Build 9 75844408 1I CTCCATTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 45 0 33 12 T 10 11 344028 CASAVA_Build 9 75849591 1D CTTTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 36 0 26 11 A 12 11 344029 CASAVA_Build 9 75850437 3D GGTTAAAAAA AAT/--- ATATATACAC 3070 hom 58 het 25 0 20 6 AAT 1 0 344030 CASAVA_Build 9 75854745 3D GGTGATGGAT TTG/--- TTAACTAATT 3070 het 3070 hom 36 17 16 7 TTG 1 0 344031 CASAVA_Build 9 75856598 2I ATTCCAGGTT --/TC TCTAATGCCT 3070 het 3070 ref 50 32 14 4 TC 1 2 344032 CASAVA_Build 9 75856786 3D CATGTTTGTT TTC/--- TTCTTCTGGT 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 TTC 3 2 344033 CASAVA_Build 9 75857889 5D ATGCAAGGAC TTAAA/----- TTAAAGAAGA 3070 het 3070 hom 37 14 19 6 TTAAA 2 1 344034 CASAVA_Build 9 75858320 15I AAGTATTTTG ---------------/TTTTCAATGTTTTGT TTTTCAATGT 3070 hom 102 het 35 0 35 3 TTTTCAATGTTTTGT 0 1 344035 CASAVA_Build 9 75864612 1I AAAGATGGGG -/A AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 A 6 7 344036 CASAVA_Build 9 75867790 1I TGATGTATTC -/T TTAGAAGTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 3 344037 CASAVA_Build 9 75876017 4I CTAATAGTGG ----/TCTA TCTTATTTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 TCTA 0 1 344038 CASAVA_Build 9 75879488 2I GAAGCAAGGT --/GG GGAGTTGGGT 3070 het 3070 hom 35 14 17 6 G 2 4 344039 CASAVA_Build 9 75880848 1D GAGAACTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 26 9 T 10 9 344040 CASAVA_Build 9 75888957 1I TTAGAGGAAG -/C TTTTTTGACC 3070 hom 175 het 64 0 58 6 C 0 1 344041 CASAVA_Build 9 75890159 1D TATTATTTTA T/- TTTTAGCTTG 3070 het 3070 ref 33 21 10 4 T 5 4 344042 CASAVA_Build 9 75897233 1I GCCCTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 10 22 9 T 12 13 344043 CASAVA_Build 9 75898075 1I TAAATAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1592 hom 20 4 12 4 A 10 11 344044 CASAVA_Build 9 75898516 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAAAAAAA 2943 het 454 hom 26 7 13 6 AG 0 1 344045 CASAVA_Build 9 75905424 3D CTCTGCATGG ATT/--- ATTGTTACTT 3070 het 3070 ref 33 20 9 7 ATT 2 1 344046 CASAVA_Build 9 75905907 1I GTAGTCTTAA -/T TTTTAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 4 5 344047 CASAVA_Build 9 75920411 1D ACTGATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 45 1 39 6 T 11 10 344048 CASAVA_Build 9 75927272 1D GAGCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 31 1 25 5 A 14 13 344049 CASAVA_Build 9 75928641 1D GCCTCGCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 88 hom 31 1 13 17 A 15 14 344050 CASAVA_Build 9 75929914 1D TGTGTTTCTG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 8 7 344051 CASAVA_Build 9 75937140 1D CAGACACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 803 hom 39 2 32 5 T 12 11 344052 CASAVA_Build 9 75938143 1I AGCTCTGCTG -/T TCTGTGATGG 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 1 2 344053 CASAVA_Build 9 75940861 1D ACATAGGCAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 9 8 344054 CASAVA_Build 9 75947547 1I ATACCTAATG -/T TAAATGATGA 1448 het 1448 ref 8 5 3 0 T 1 2 344055 CASAVA_Build 9 75947660 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 10 9 344056 CASAVA_Build 9 75954806 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2992 het 820 hom 34 5 17 13 T 15 14 344057 CASAVA_Build 9 75959141 1I TTATTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 40 1 32 7 T 10 11 344058 CASAVA_Build 9 75964693 1D TCACACACAC A/- AAAAAAAAAA 1831 het 1356 hom 21 5 6 10 A 17 16 344059 CASAVA_Build 9 75967354 1D CAAACCTTGC T/- ACCAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 1 0 344060 CASAVA_Build 9 75986155 1I CTTAGTGCTT -/A AAAAAATGAC 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 6 7 344061 CASAVA_Build 9 76003805 1D GGTTTCTACA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 T 8 7 344062 CASAVA_Build 9 76005280 1I TACTGACCAA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 34 16 17 1 T 7 8 344063 CASAVA_Build 9 76007651 1I GATCCTGAAA -/G AAATCACTAG 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 G 0 1 344064 CASAVA_Build 9 76010140 3D CTCATCTTCT AAG/--- AAGAGTTTCT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AAG 2 1 344065 CASAVA_Build 9 76012677 5I GGAATCTTCC -----/TAGTT TATTAGCATG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 TAGTT 0 1 344066 CASAVA_Build 9 76014281 1D TGTAGAAATG T/- TAACAAGTAA 3070 het 3070 hom 50 17 26 8 T 2 1 344067 CASAVA_Build 9 76016528 1I CTCTGATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 T 10 11 344068 CASAVA_Build 9 76018939 3D TTTTCTGTCT AGA/--- AGATCTGTCC 2882 het 2882 ref 15 8 7 1 AGA 2 1 344069 CASAVA_Build 9 76019001 4D CTACTGGGGC CTAT/---- CTCTTTCTTT 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 CTAT 1 0 344070 CASAVA_Build 9 76019610 1D ACAAAAAAGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 22 9 5 A 9 8 344071 CASAVA_Build 9 76020720 4D TTTCTGAAAG GTCT/---- GTCTTTCTTC 3070 het 3070 ref 37 23 12 6 GTCT 2 1 344072 CASAVA_Build 9 76030083 1I ATACCTAATG -/T AAATGACGAA 1422 het 1422 ref 10 5 4 1 T 0 1 344073 CASAVA_Build 9 76044032 1I GATAACAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 11 12 344074 CASAVA_Build 9 76048536 1I CTAAACTGTT -/A AAGAGTTTTT 2772 het 2772 ref 36 23 7 6 A 2 3 344075 CASAVA_Build 9 76051718 1I ATTCAGCCTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 8 9 344076 CASAVA_Build 9 76052306 3D GAAAAACCCT CAA/--- CAAAATACTA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 CAA 2 1 344077 CASAVA_Build 9 76052574 3D CAGGAAAAAA AAC/--- AAACCCCATT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 AAC 1 0 344078 CASAVA_Build 9 76054715 5D CAATTGTTAA TTGAG/----- TTATTTGTCA 3070 het 3070 hom 36 16 19 4 TTGAG 1 0 344079 CASAVA_Build 9 76058232 1I CTGGCTCTGG -/A TTCAAATCTC 3070 het 3070 hom 38 10 22 6 A 0 1 344080 CASAVA_Build 9 76060020 1I GGTCATATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 8 9 344081 CASAVA_Build 9 76062025 1I GAAAAATCTG -/T TAAATGTTCA 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 T 1 2 344082 CASAVA_Build 9 76065650 4D GATGCTGGAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 36 16 12 10 AC 10 8 344083 CASAVA_Build 9 76068147 1D TATAGAAATA T/- ATTCAAATTT 3070 het 3070 hom 32 13 11 9 T 1 0 344084 CASAVA_Build 9 76068246 3D TATTGTTATT TTC/--- TTTTCTTTAC 3070 het 3070 ref 36 21 14 2 TTC 1 0 344085 CASAVA_Build 9 76075619 5D AGGAAGAGAA AGAAG/----- AGAAAAGGTC 3070 het 3070 hom 41 14 23 8 AGAAG 1 0 344086 CASAVA_Build 9 76078385 1I TCTTTTATGC -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 42 13 24 5 A 6 7 344087 CASAVA_Build 9 76094537 1I TAGATTTCTG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 7 8 344088 CASAVA_Build 9 76100954 13I TGTCCATATC -------------/CTTCCGTAACTTA CTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 CTTCCGTAACTTA 0 1 344089 CASAVA_Build 9 76133131 4I GAAAGTGATC ----/CAAA CAATCAATCG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CAAA 0 1 344090 CASAVA_Build 9 76140575 5I TGTATGCATG -----/TATTT TATTTTTTTC 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 TATTT 1 2 344091 CASAVA_Build 9 76146455 1D CTAGAGAAAG T/- TTTTTTCATA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 7 6 344092 CASAVA_Build 9 76147641 5D AGCCAATCTT AAAAC/----- AAAAAAACCT 2431 het 2431 ref 25 15 6 4 AAAAC 1 0 344093 CASAVA_Build 9 76149083 1I TGTTGTCGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 34 1 25 8 T 11 12 344094 CASAVA_Build 9 76150645 1I ATTTTTAAAG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 13 15 7 T 8 9 344095 CASAVA_Build 9 76158244 5I AAGCAATAGA -----/TTTAT TTTTTCTCAA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TTTAT 0 1 344096 CASAVA_Build 9 76189569 1D TTTCCCAAAT G/- GGTCAGGTGC 3070 het 3070 hom 55 21 29 5 G 3 2 344097 CASAVA_Build 9 76203613 1D TCAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1037 het 1037 ref 31 24 3 7 A 14 13 344098 CASAVA_Build 9 76204696 1D CTAAACTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 T 15 14 344099 CASAVA_Build 9 76222955 1I TTTTGTAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 811 hom 29 3 20 6 A 12 13 344100 CASAVA_Build 9 76280796 2D GGGTTGGAAT CC/-- CCCCCCCCAC 3070 hom 64 het 27 0 19 8 C 10 8 344101 CASAVA_Build 9 76287728 1I TTAATCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 603 hom 33 2 23 8 A 11 12 344102 CASAVA_Build 9 76288966 1D ATTTGGTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 30 0 22 8 A 12 11 344103 CASAVA_Build 9 76291517 1I CTCAGGAAAA -/C AATCAATTCG 3070 hom 132 het 52 0 44 8 C 0 1 344104 CASAVA_Build 9 76339885 2D CACCATAGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 47 18 18 11 GT 6 5 344105 CASAVA_Build 9 76348529 1D GATATTTTTC T/- TTGTAGTAAT 3070 het 3070 hom 52 18 26 10 T 3 2 344106 CASAVA_Build 9 76350544 1I TACCTGACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 10 11 344107 CASAVA_Build 9 76365276 3D ATATATTCTC AGA/--- AGTTTTTAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AGA 1 0 344108 CASAVA_Build 9 76375467 2I GTGCACACAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 90 het 41 0 31 10 GT 5 6 344109 CASAVA_Build 9 76381203 5I GGGAGAAAGA -----/GATTT GAAGGGAATT 3070 hom 99 het 44 0 34 10 GATTT 0 1 344110 CASAVA_Build 9 76383423 1D TAGAAGATCC T/- TTTTAAGGAT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 5 4 344111 CASAVA_Build 9 76393675 1D AGTGATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 236 hom 41 1 33 7 A 12 11 344112 CASAVA_Build 9 76402372 1D AATATAGTAT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 A 8 7 344113 CASAVA_Build 9 76408787 5I GCACTAAATA -----/TTATT TTATTTTTCT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTATT 1 2 344114 CASAVA_Build 9 76413428 1I CTGTGAATGG -/T TTTTTATAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 5 6 344115 CASAVA_Build 9 76421825 1D CACCACCCGC T/- CCCCCCGCAA 3070 hom 54 het 21 0 17 4 T 1 0 344116 CASAVA_Build 9 76423049 4I ATGAACCAGT ----/TAAA TAAAGTTACT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAAA 1 2 344117 CASAVA_Build 9 76423512 1D TGTATATTGT G/- GGGGGTGGAA 3070 het 3070 ref 32 13 12 8 G 6 5 344118 CASAVA_Build 9 76436198 1D TCATAGAGTC T/- TAAGATCTAA 3070 hom 96 het 38 0 32 8 T 2 1 344119 CASAVA_Build 9 76438878 1D TATGGTGGGG A/- AAAACACATC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 A 5 4 344120 CASAVA_Build 9 76440793 1I TATTAACTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 T 9 10 344121 CASAVA_Build 9 76442324 1I CATCATTTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 7 8 344122 CASAVA_Build 9 76451404 4I TAGGACAGAG ----/AGTT AGTTAAGTGA 3070 hom 151 het 59 0 51 8 AGTT 1 2 344123 CASAVA_Build 9 76456271 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 37 1 28 8 A 14 13 344124 CASAVA_Build 9 76458195 1I TTCCAACTTT -/A AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 32 23 4 5 A 13 14 344125 CASAVA_Build 9 76458541 4D TGCTGAAATG TCTA/---- TCTAGTGAGA 3070 hom 138 het 54 0 46 9 TCTA 2 1 344126 CASAVA_Build 9 76464731 1I ATCAACTCAT -/A AGCCAATATT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 1 2 344127 CASAVA_Build 9 76482639 4D ACTCAATAAA TACT/---- TACTACAGGT 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 TACT 2 1 344128 CASAVA_Build 9 76503325 1D TCACACATTG C/- CCCCCAACCC 3070 hom 75 het 27 0 25 3 C 6 5 344129 CASAVA_Build 9 76510854 2D AGCAAAACTC TT/-- GTCTCAAATA 3070 hom 54 het 22 0 19 4 T 2 0 344130 CASAVA_Build 9 76514663 1I TTATTTTAAG -/C CATGTGTTTA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 C 1 2 344131 CASAVA_Build 9 76515241 1I CTTATTTGGA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 90 het 34 0 31 4 T 8 9 344132 CASAVA_Build 9 76515666 1D GTTTACCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 40 1 33 7 A 12 11 344133 CASAVA_Build 9 76518461 1I TCCTCTTCCC -/A AAAAAACCTT 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 A 6 7 344134 CASAVA_Build 9 76546627 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 2341 het 1480 hom 9 4 5 0 A 10 9 344135 CASAVA_Build 9 76561051 1D GGCTGAGGTA T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 T 7 6 344136 CASAVA_Build 9 76564055 1D AAAAAGAAAG A/- AAAATTGACC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 5 4 344137 CASAVA_Build 9 76608793 1I TCTGTTTCTC -/A TCCATGATTA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 0 1 344138 CASAVA_Build 9 76622477 1D TTCAAAAAAA G/- GGGGGGGGAG 3070 het 41 hom 28 2 19 9 G 9 8 344139 CASAVA_Build 9 76627150 1I CACACCTAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 26 1 19 6 T 13 14 344140 CASAVA_Build 9 76640118 1D TATTATGAAT G/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 G 1 0 344141 CASAVA_Build 9 76646242 1D TTTGAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 11 10 344142 CASAVA_Build 9 76650133 1I AATGTCCATC -/A GTGGAGAAGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 0 1 344143 CASAVA_Build 9 76655841 1D CATTTTATTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 44 19 16 9 T 9 8 344144 CASAVA_Build 9 76663126 14I TTCGTCTCAA --------------/AAAAACAAAAAAAC AAAAACAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 AAAAACAAAAAAAC 0 1 344145 CASAVA_Build 9 76665764 4D GTCACAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 108 het 46 0 37 10 AAAG 5 4 344146 CASAVA_Build 9 76669810 1D ATTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 35 0 22 14 A 16 15 344147 CASAVA_Build 9 76672590 1D TCATTCATTT A/- AAAAAAAATA 2337 het 2337 ref 26 15 8 3 A 9 8 344148 CASAVA_Build 9 76674930 1I AAAATAGTTG -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 44 13 20 11 A 6 7 344149 CASAVA_Build 9 76675945 2D TTGCAAATGG TA/-- TAAAATCCGG 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 TA 2 1 344150 CASAVA_Build 9 76678982 1I AAAAACAAAA -/C AAAAAAAAAA 696 het 696 ref 25 8 6 11 C 0 1 344151 CASAVA_Build 9 76692214 2I GGAGCGGAAT --/CA CAGAGCTGCC 1851 het 156 hom 13 1 5 7 CA 1 2 344152 CASAVA_Build 9 76699632 2I CATATATATA --/TG TGTGTGTGTG 1616 het 1352 hom 29 8 6 15 TG 5 6 344153 CASAVA_Build 9 76713432 1I CATCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 A 11 12 344154 CASAVA_Build 9 76723245 3D GGAGTTTGAG ACC/--- AGCCTAGACA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 ACC 1 0 344155 CASAVA_Build 9 76725678 8D TGGAGCTGGC AGACAAAA/-------- CTTAAGCAGG 3070 het 3070 ref 38 23 12 7 AGACAAAA 1 0 344156 CASAVA_Build 9 76727099 1D TTCATTCTAG A/- AAAAAAAAAA 1141 het 1141 ref 29 21 4 5 A 15 14 344157 CASAVA_Build 9 76729044 1I ATCAAAGACT -/C CCAGTGCCTT 3070 hom 171 het 59 0 57 2 C 2 3 344158 CASAVA_Build 9 76734043 1I CTACAACAGT -/G GGGAAAAAAA 2947 het 2947 ref 33 20 7 6 G 3 4 344159 CASAVA_Build 9 76739351 1I TCGATTTAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 8 9 344160 CASAVA_Build 9 76740126 1D GAAATGAACC A/- AAAAAAAAAA 2686 het 2686 ref 36 14 9 14 A 17 16 344161 CASAVA_Build 9 76745111 3D TCTTTTCATT AAG/--- TTTATTTTCT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 AAG 1 0 344162 CASAVA_Build 9 76758529 1I TTGGGCTCTT -/A AATTAATGTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 A 2 3 344163 CASAVA_Build 9 76760726 4D AGAATATAAC TATT/---- TAAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 21 16 2 TATT 1 0 344164 CASAVA_Build 9 76763646 2D TAATAAGTGA TT/-- TTGTGTGGAT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 4 2 344165 CASAVA_Build 9 76797850 1I TTGTACCAGG -/T TGACTAGGAA 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 T 1 2 344166 CASAVA_Build 9 76799456 1D ATTCTGAGAC T/- TTTTTTTTTA 1314 het 1314 ref 60 50 3 7 T 10 9 344167 CASAVA_Build 9 76818309 1D TTCAGCTGGG A/- AAAAAAAAAA 1328 het 1328 ref 34 28 3 3 A 11 10 344168 CASAVA_Build 9 76850979 62D CCATCTCAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 24 het 8 0 9 1 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 344169 CASAVA_Build 9 76854975 1D TATTTATAAC T/- GTCTTGGTAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 T 1 0 344170 CASAVA_Build 9 76867069 2D ATATTTTATA TT/-- TAATGAGAAA 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 T 3 1 344171 CASAVA_Build 9 76868696 3D TCCCTCTTTT AAG/--- TTTTTTTTTT 1276 het 1276 ref 26 11 7 9 AAG 1 0 344172 CASAVA_Build 9 76871331 1D AGTCTCCAAA C/- CCCCCCCCAG 3070 hom 62 het 25 0 20 5 C 9 8 344173 CASAVA_Build 9 76880090 1D GGAAGAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 30 0 23 10 A 10 9 344174 CASAVA_Build 9 76882376 1D CATTAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 23 11 T 12 11 344175 CASAVA_Build 9 76895989 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 1378 het 1378 ref 17 12 3 2 T 10 9 344176 CASAVA_Build 9 76899401 1D AGACTACATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 10 9 344177 CASAVA_Build 9 76907867 2D TACAAAAAAT AG/-- AGAAAGAAAA 2826 het 2826 ref 26 15 8 3 AG 2 1 344178 CASAVA_Build 9 76910376 1I TCAGGGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 T 11 12 344179 CASAVA_Build 9 76911728 4I AAAAAGAAAA ----/AAAG AAAAAAAAAA 3070 het 1734 hom 28 9 15 4 AAAG 0 1 344180 CASAVA_Build 9 76911946 2D CGGACTCCCC CT/-- GTTTTGTTTT 1339 het 1339 ref 34 18 4 13 CT 1 0 344181 CASAVA_Build 9 76913071 9I TGTGTGCCTT ---------/TAGTATTGG TCTGATTTGC 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 TAGTATTGG 0 1 344182 CASAVA_Build 9 76913822 1I4M1I AATCTTGGCT -CACT-/GCAGTG GCAGCCTCCA 2446 het 2446 ref 30 13 7 12 N/A 0 0 344183 CASAVA_Build 9 76916858 1D AGCCTACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 664 hom 32 2 21 10 T 15 14 344184 CASAVA_Build 9 76924702 1D CCGTCTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 13 12 344185 CASAVA_Build 9 76929527 4I CATAAAGTGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 9 15 8 TTTG 2 3 344186 CASAVA_Build 9 76934750 1D CTAGAATTTA T/- TTTAAAATAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 4 3 344187 CASAVA_Build 9 76939602 1I TTATATAACC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 32 14 8 10 T 7 8 344188 CASAVA_Build 9 76940196 3I AATTATCTTG ---/TAT TATTTCTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TAT 1 2 344189 CASAVA_Build 9 76943966 10I GATGGAGTTT ----------/CGCCATGTTA CGCCATGTTA 3070 het 3070 ref 32 19 8 5 CGCCATGTTA 1 2 344190 CASAVA_Build 9 76949427 1D ACATGAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 T 10 9 344191 CASAVA_Build 9 76952172 1D TGTGAGACTT C/- CAGTTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 C 2 1 344192 CASAVA_Build 9 76956110 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1458 het 1458 ref 41 19 4 18 T 19 18 344193 CASAVA_Build 9 76958173 1I AAATCAACTA -/T TTTTTTTTTT 2439 het 2439 ref 25 11 9 5 T 13 14 344194 CASAVA_Build 9 77007002 1D CTCACATAGA C/- CCCTTCAACC 3070 het 3070 hom 28 9 14 5 C 4 3 344195 CASAVA_Build 9 77007199 1I TTCTAATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 22 1 12 9 A 11 12 344196 CASAVA_Build 9 77014395 1D TATGAATTGG A/- GCCTGAAATC 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 A 1 0 344197 CASAVA_Build 9 77014855 2I TTTGCGATGG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 TA 5 6 344198 CASAVA_Build 9 77016416 1I TTAATAGAAT -/A AAAAAAATTG 2358 het 2358 ref 37 27 6 4 A 7 8 344199 CASAVA_Build 9 77020098 1D CTTCCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 22 7 T 13 12 344200 CASAVA_Build 9 77030580 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTT 2643 het 2643 ref 12 6 6 1 T 10 11 344201 CASAVA_Build 9 77031445 1D GAAAATGGGC T/- TTTTTTTTTC 1118 het 1118 ref 24 21 3 0 T 10 9 344202 CASAVA_Build 9 77033646 1I CTGCATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 11 12 344203 CASAVA_Build 9 77036723 2I ACATGATTAT --/TG TGTCTATGTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 TG 1 2 344204 CASAVA_Build 9 77041900 1I CCATAGGTTT -/A TGCCACATGG 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 A 0 1 344205 CASAVA_Build 9 77045250 2I AGGATCTCAC --/CT CTCTGTGTCT 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 CT 2 3 344206 CASAVA_Build 9 77045921 1D TGAAAGAGTA C/- TATAAACTCT 3070 het 3070 hom 36 18 17 2 C 1 0 344207 CASAVA_Build 9 77046154 2I TGGAACCCTG --/AT ATATATATAT 2034 hom 12 het 9 0 5 4 AT 8 9 344208 CASAVA_Build 9 77047064 4D TCTTTCTCTT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3009 hom 19 7 8 5 TC 9 7 344209 CASAVA_Build 9 77047950 1D TATTCTCTGG T/- TGCTGACCCA 1740 het 1740 ref 29 9 5 15 T 2 1 344210 CASAVA_Build 9 77049299 2D ATTTCATTTA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 26 16 8 T 11 9 344211 CASAVA_Build 9 77049597 1D TATAGAAGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 8 344212 CASAVA_Build 9 77058359 11D ACCTCCACCT CCCCACCAGCC/----------- CCCCACTATC 3070 het 3070 ref 36 22 13 2 CCCCACCAGCC 1 0 344213 CASAVA_Build 9 77078700 1I ATGTTTATTG -/T TTTTTTGGCT 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 T 6 7 344214 CASAVA_Build 9 77081449 4D TGTACCACAG TTTA/---- TTTATCTATT 3070 het 3070 ref 41 19 18 5 TTTA 2 1 344215 CASAVA_Build 9 77084019 1D TCATATAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2920 hom 24 10 10 4 T 11 10 344216 CASAVA_Build 9 77084904 5I AAATAATTTC -----/TAAAA TACAATATTG 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 TAAAA 0 1 344217 CASAVA_Build 9 77086412 1D TTTTTGTGCC T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 7 6 344218 CASAVA_Build 9 77096863 4D GGCAGCAGGC AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AG 7 5 344219 CASAVA_Build 9 77102792 2D TGTGCTATTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 11 9 344220 CASAVA_Build 9 77104164 1I ATACTACCAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 T 7 8 344221 CASAVA_Build 9 77111081 1I TTTTTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2097 hom 50 5 37 8 T 12 13 344222 CASAVA_Build 9 77115298 2D AGTTCTGTCC AT/-- ATAAACCTGG 3070 het 3070 ref 44 21 19 6 AT 2 1 344223 CASAVA_Build 9 77117596 1I ACTCAGCCAC -/A ACTGCTCCTT 2813 het 2813 ref 23 13 8 2 A 1 2 344224 CASAVA_Build 9 77128919 5D ATTCTGGCCT CATAA/----- AATGAGTTAG 3070 hom 57 het 21 0 20 3 CATAA 1 0 344225 CASAVA_Build 9 77129111 3I AGGAATTCAA ---/CTT CTTCCTGGTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 CTT 1 2 344226 CASAVA_Build 9 77129175 3D ATTTTCTAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 19 0 13 7 T 17 14 344227 CASAVA_Build 9 77129381 1I GATCCACTGA -/T TTTTTTTTTT 3033 het 367 hom 11 1 8 2 T 10 11 344228 CASAVA_Build 9 77135075 1I CAGTAGATGC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 8 9 344229 CASAVA_Build 9 77139421 1I AAATGAAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 T 9 10 344230 CASAVA_Build 9 77139581 1I CATTTACAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 9 10 344231 CASAVA_Build 9 77143072 1D GATGTTGAGC A/- TTTTTTCATA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 1 0 344232 CASAVA_Build 9 77144679 9D TTATCTTTTG TTTTTTTTT/--------- TTTGTTTTTT 3070 het 425 hom 25 5 15 11 T 12 3 344233 CASAVA_Build 9 77144868 3D TTAAAAAAAA AAC/--- AATACTGAAC 3070 het 2440 hom 22 8 12 2 AAC 1 0 344234 CASAVA_Build 9 77154795 1I GCTGTGGGGG -/A ATGGGGATGA 1668 het 1668 ref 18 14 4 0 A 1 2 344235 CASAVA_Build 9 77174094 1I TGCTTTTCTG -/T TTAAAAACGT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 2 3 344236 CASAVA_Build 9 77178420 2D ACACACACAC AT/-- GCGTGCACAC 3070 het 3070 hom 47 22 17 12 AT 1 0 344237 CASAVA_Build 9 77182227 1I AAAAACCAGA -/C CTTTCAAAGA 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 C 1 2 344238 CASAVA_Build 9 77203527 1I CAAAGAAGAA -/G GAATCACAGA 3070 het 3070 hom 56 21 33 2 G 1 2 344239 CASAVA_Build 9 77270346 1D TATGTAGGAA T/- TTTGGGCATA 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 T 4 3 344240 CASAVA_Build 9 77279487 1I TTGAATGATT -/A AATGAGGTCT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 A 2 3 344241 CASAVA_Build 9 77284001 4I TCTACCTACC ----/TACT TGTCTATTTA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 TACT 0 1 344242 CASAVA_Build 9 77289706 1I TTCCTTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 11 12 344243 CASAVA_Build 9 77292701 5I TCCATATAAG -----/GAGAC GAGACACTGA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 GAGAC 1 2 344244 CASAVA_Build 9 77298318 13D GAATTGGATA AACAATGCTGCAG/------------- AACAATGCTG 3070 het 3070 ref 52 29 19 10 AACAATGCTGCAG 2 1 344245 CASAVA_Build 9 77304218 1I TTAATTAATT -/C CTTGGACTGA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 C 1 2 344246 CASAVA_Build 9 77308157 1D AGCTGCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 11 10 344247 CASAVA_Build 9 77314350 1D ATTTTGGCAG T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 T 8 7 344248 CASAVA_Build 9 77315596 1D CTGTGTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 204 hom 33 4 10 19 T 15 14 344249 CASAVA_Build 9 77318653 5I TGAATTTCTC -----/TATTA TGAGTGAAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 TATTA 0 1 344250 CASAVA_Build 9 77325709 1D AAGTGTTCAC A/- AGCATCTTCT 3070 het 3070 hom 29 9 14 6 A 2 1 344251 CASAVA_Build 9 77327273 2D TATCTTAGGT TA/-- TATATGGCAC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 TA 3 2 344252 CASAVA_Build 9 77342801 1I CTATTTGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 676 hom 35 4 16 15 T 13 14 344253 CASAVA_Build 9 77349495 1D GATACTGCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 T 10 9 344254 CASAVA_Build 9 77354585 1I CTGCCAAGGT -/A AAAATTCATT 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 A 4 5 344255 CASAVA_Build 9 77363042 1D TAAATTTAAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 A 9 8 344256 CASAVA_Build 9 77380831 1D CATATAAGAA T/- AAACACATTG 3070 het 3070 hom 22 8 10 4 T 1 0 344257 CASAVA_Build 9 77397599 1I AGCAAAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 393 hom 42 1 37 4 A 9 10 344258 CASAVA_Build 9 77416006 16D TTCAAGTCCT CAGTGTCTTTTTTTCC/---------------- CAGCTCCTCT 3070 het 3070 ref 40 22 19 6 CAGTGTCTTTTTTTCC 1 0 344259 CASAVA_Build 9 77418394 11D TCTTTTTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTG 3070 het 571 hom 27 5 14 10 T 20 9 344260 CASAVA_Build 9 77423270 1D ATCCTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 T 13 12 344261 CASAVA_Build 9 77425284 1I TTACTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 221 hom 27 2 14 11 T 11 12 344262 CASAVA_Build 9 77426744 2I ACTTGTTTTA --/TG TGAACCTGGG 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 TG 1 2 344263 CASAVA_Build 9 77432925 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3031 hom 29 11 12 6 A 13 14 344264 CASAVA_Build 9 77433773 1D ATTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 36 1 25 10 A 11 10 344265 CASAVA_Build 9 77442887 1D TCAAACAGTA G/- GGCCACCTGG 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 G 3 2 344266 CASAVA_Build 9 77455027 1I TGCTATTTTT -/C CATCTACAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 1 2 344267 CASAVA_Build 9 77462897 1I TACCATAGTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 T 7 8 344268 CASAVA_Build 9 77463398 1D GCTCTGGCTC T/- TTTTTTTTTT 1642 het 1642 ref 43 29 5 9 T 13 12 344269 CASAVA_Build 9 77465907 1I CCACTCTAGA -/C TTTTAAAGTT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 C 0 1 344270 CASAVA_Build 9 77468061 1D TTACTGAATA T/- TTTAAGCCCA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 T 4 3 344271 CASAVA_Build 9 77469709 1D ATAACCCCTT C/- GATGGCAAGA 3070 het 3070 hom 47 18 26 3 C 1 0 344272 CASAVA_Build 9 77473039 1D GCCTGACTTC A/- AAAACATTTA 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 A 5 4 344273 CASAVA_Build 9 77485521 3D TTAAAAAATG TTT/--- TTTTAATGAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 4 344274 CASAVA_Build 9 77494085 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 16 14 344275 CASAVA_Build 9 77498954 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 940 hom 34 4 23 7 T 13 14 344276 CASAVA_Build 9 77514782 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTCTCATTC 2333 het 2333 ref 34 19 11 6 TCTT 1 0 344277 CASAVA_Build 9 77514962 11I AACTCAAGGC -----------/TTTGCCTGGGT TTTCCGTTGC 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 TTTGCCTGGGT 0 1 344278 CASAVA_Build 9 77552163 1I TTAACAATGA -/T TTTTTCCATG 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 T 5 6 344279 CASAVA_Build 9 77563952 4D AGATTTATTT TATA/---- TATATATATA 2141 het 1248 hom 11 4 6 1 TA 9 7 344280 CASAVA_Build 9 77581343 2D GACTCAGCAC AG/-- AGAGAGAGAG 956 het 956 ref 40 28 3 11 AG 9 8 344281 CASAVA_Build 9 77582148 1D AGAGTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 16 11 T 15 14 344282 CASAVA_Build 9 77598257 1D ACTTTTCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 T 12 11 344283 CASAVA_Build 9 77599335 4D ACTTCTGAGA TAAC/---- TAACCCACTT 3070 het 3070 ref 42 19 21 3 TAAC 2 1 344284 CASAVA_Build 9 77651896 1I CCTGACTCTC -/A AAAAAAAAAA 1358 het 1358 ref 40 29 3 8 A 10 11 344285 CASAVA_Build 9 77678835 1I CAATGGGTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 9 10 344286 CASAVA_Build 9 77679459 1I GTCTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 T 13 14 344287 CASAVA_Build 9 77692967 1D ATTCTGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 15 8 A 13 12 344288 CASAVA_Build 9 77697812 25D TATGCCCTGG GAATGGAACTGGGGAGGCTAGCACT/------------------------- GAAAGTAGCT 3070 hom 75 het 28 0 24 6 GAATGGAACTGGGGAGGCTAGCACT 1 0 344289 CASAVA_Build 9 77703414 1I AAAAAAAAAA -/C CCCACTAGAG 3070 het 1826 hom 37 5 24 8 C 3 4 344290 CASAVA_Build 9 77705415 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1400 het 107 hom 19 2 11 6 A 16 15 344291 CASAVA_Build 9 77717884 15D CAATGACTGG GCACATTCTTCCTCA/--------------- GCACCTGGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 GCACATTCTTCCTCA 1 0 344292 CASAVA_Build 9 77750358 2I TTAATGACTT --/TC TATTGATCCT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 TC 0 1 344293 CASAVA_Build 9 77752234 1I AAGAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 11 12 344294 CASAVA_Build 9 77758383 2D TGTGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1080 het 1080 ref 43 24 3 17 TG 10 9 344295 CASAVA_Build 9 77758557 1D TTAGTAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 A 10 9 344296 CASAVA_Build 9 77765690 1I TCTTCTATAA -/G GGAAATTGAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 G 2 3 344297 CASAVA_Build 9 77766872 1I TGGGGGAGGG -/A GGCCACGTTG 3070 hom 111 het 47 0 37 10 A 0 1 344298 CASAVA_Build 9 77768630 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 10 8 A 10 11 344299 CASAVA_Build 9 77770921 1D TACTGAGGCA G/- GGCTAGAAAG 3070 het 3070 ref 46 23 17 7 G 3 2 344300 CASAVA_Build 9 77771809 1I TTTCCACCCC -/T TTTTTTAAGT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 T 6 7 344301 CASAVA_Build 9 77772503 1D GTGCCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 44 0 31 13 T 12 11 344302 CASAVA_Build 9 77777818 1I TCTCCCTGGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 8 9 344303 CASAVA_Build 9 77785497 1I TTTTTTTTTT -/C CTCACCAGTT 3070 hom 105 het 41 0 34 7 C 1 2 344304 CASAVA_Build 9 77785651 1I ATGTCCATTA -/T CCACCTAACT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 0 1 344305 CASAVA_Build 9 77790242 1D GAAAGCCATT A/- AAAAAAAAAA 1017 het 1017 ref 32 23 3 7 A 11 10 344306 CASAVA_Build 9 77794232 1D CCCCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 2015 het 1838 hom 21 6 8 8 A 13 12 344307 CASAVA_Build 9 77808555 1I CTTTTATTTA -/T TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 7 8 344308 CASAVA_Build 9 77817800 1D ATCCCCTTTA T/- TTTTAGATAT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 5 4 344309 CASAVA_Build 9 77823997 1I ATATCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 14 10 T 11 12 344310 CASAVA_Build 9 77826106 1I GGTGTGGGTT -/G GGGGGGTGTA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 G 6 7 344311 CASAVA_Build 9 77834889 1D TACTTTAAGC A/- AAAAAAAAAA 1344 het 1344 ref 35 29 3 3 A 13 12 344312 CASAVA_Build 9 77878457 2D ATGAATGCGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 AT 6 5 344313 CASAVA_Build 9 77893667 2D GGTTTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 29 2 18 10 T 18 16 344314 CASAVA_Build 9 77895709 1I GGTCATAAGA -/G GGTTCGAGCG 3070 hom 81 het 33 0 25 8 G 2 3 344315 CASAVA_Build 9 77909575 1I ATGTGACCAT -/G GGGTGAGATA 3070 hom 126 het 48 0 42 6 G 3 4 344316 CASAVA_Build 9 77914176 2I TTATTTTTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 A 10 12 344317 CASAVA_Build 9 77928687 1D TTTAGGATTT C/- TTTTTTCATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 C 1 0 344318 CASAVA_Build 9 77930918 10D TGTGTGTGTA TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 22 0 21 3 TG 10 5 344319 CASAVA_Build 9 77938783 2D TTGCTTGTGA CT/-- CTCTGCTTCC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 CT 3 2 344320 CASAVA_Build 9 77943707 1D AACTACTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 T 12 11 344321 CASAVA_Build 9 77945261 15D AGAATAAAGA TGCGGAACTGTGATG/--------------- TGAATTAGAA 3070 het 3070 ref 34 22 17 1 TGCGGAACTGTGATG 1 0 344322 CASAVA_Build 9 77948301 5I TGGTTGAAAT -----/GAAAG GAAATTGTCT 3070 het 3070 hom 59 29 28 2 GAAAG 0 1 344323 CASAVA_Build 9 77951063 1I TAGCTCTAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 9 10 344324 CASAVA_Build 9 77951265 2I TACATGTATG --/TA TATATATATA 3070 het 1265 hom 22 6 8 8 TA 6 7 344325 CASAVA_Build 9 77960966 1D AAAGATCTGC A/- CATGTATATA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 A 1 0 344326 CASAVA_Build 9 77971135 1I TTATATTTAA -/T TTTTTGTGCC 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 T 5 6 344327 CASAVA_Build 9 77977015 3D GATTTTTCTC CTT/--- CTGTATTTAC 3070 het 3070 ref 41 21 17 5 CTT 1 0 344328 CASAVA_Build 9 77980758 1D TTGTTTTGAC A/- AAAAAAAAAA 1999 het 1999 ref 37 28 6 3 A 11 10 344329 CASAVA_Build 9 77987265 1I TGGGGGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 11 344330 CASAVA_Build 9 77989124 1I GAAGAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 379 hom 36 2 29 5 A 10 11 344331 CASAVA_Build 9 77995828 1I GCTGAAGCGA -/C CCTAAAATTT 3070 hom 126 het 49 0 42 7 C 2 3 344332 CASAVA_Build 9 77997449 4I ATAAGCATGG ----/AAAC AAACAAAACA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AAAC 1 2 344333 CASAVA_Build 9 78020177 5D ACCTAAGCCA TGGGC/----- TGGGCTAGGC 3070 hom 86 het 30 0 23 8 TGGGC 2 1 344334 CASAVA_Build 9 78020695 1D AAATTAAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 49 het 31 0 22 9 A 9 8 344335 CASAVA_Build 9 78040046 3D AACAAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 hom 120 het 54 0 39 18 AAG 6 5 344336 CASAVA_Build 9 78071652 1I GAGCACAAAA -/G CTGTAAACCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 0 1 344337 CASAVA_Build 9 78103387 1I TCTTTTGCTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 8 9 344338 CASAVA_Build 9 78106715 1I TATACATAGA -/C TGTAATTATA 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 0 1 344339 CASAVA_Build 9 78106836 1I TTTTTGCATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 340 hom 32 1 22 9 A 9 10 344340 CASAVA_Build 9 78107797 1I CTTGTTGAGA -/T TTAAGTCCCC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 2 3 344341 CASAVA_Build 9 78125852 1D ACCCGGCCAG T/- TAGCTATCTT 2347 het 2347 ref 19 9 7 4 T 2 1 344342 CASAVA_Build 9 78126542 1D AGATACACCC T/- TTTCATTATG 3070 het 3070 ref 57 30 23 7 T 4 3 344343 CASAVA_Build 9 78127750 1D CTTTCTCCTA C/- CCCCCGGGGA 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 C 6 5 344344 CASAVA_Build 9 78141050 1D ATTAGTCTAC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 103 het 43 0 40 3 A 9 8 344345 CASAVA_Build 9 78142577 1I TCTCTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 490 hom 28 2 18 8 A 13 14 344346 CASAVA_Build 9 78147902 1D TAGGATAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 36 1 20 15 T 17 16 344347 CASAVA_Build 9 78148682 1D AGTCATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 11 10 344348 CASAVA_Build 9 78149077 4D GCTCCCCTCA CCAC/---- CCACCATTCC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 CCAC 2 1 344349 CASAVA_Build 9 78150893 1I ATTTTTCCCA -/T CGTTTATTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 0 1 344350 CASAVA_Build 9 78153852 1I CTAAAAACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 9 10 344351 CASAVA_Build 9 78154848 2D ACCCCATCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 754 hom 43 6 14 25 A 14 12 344352 CASAVA_Build 9 78155061 1I CAAAGAAATG -/T TATCACCATC 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 1 2 344353 CASAVA_Build 9 78157625 1D CAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 8 5 A 12 11 344354 CASAVA_Build 9 78157757 1I AGCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 A 11 12 344355 CASAVA_Build 9 78170781 2I CAGATAAGAC --/TG TTTCAAAAAA 2557 het 2557 ref 27 10 6 11 TG 0 1 344356 CASAVA_Build 9 78180128 3D TGAATGATTC AGG/--- AGGACACACA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 AGG 2 1 344357 CASAVA_Build 9 78195576 1D AAGATAACGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 11 10 T 13 12 344358 CASAVA_Build 9 78204390 1I TCAGTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 A 13 14 344359 CASAVA_Build 9 78244295 1I AGAAAAAATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 201 hom 35 1 31 3 A 9 10 344360 CASAVA_Build 9 78250595 3I GGTGTGTGCC ---/TGT TGTTCCAGCT 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TGT 1 2 344361 CASAVA_Build 9 78252639 2I TTCCTGAAAC --/TG TGAAAATGCC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TG 1 2 344362 CASAVA_Build 9 78253403 6D TGTCACTATA GATTAG/------ ATTTGCCTCT 3070 het 3070 hom 45 20 22 4 GATTAG 1 0 344363 CASAVA_Build 9 78254049 2D AAAAAACAAC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 96 hom 28 3 11 15 A 11 9 344364 CASAVA_Build 9 78266880 1D CTATACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 774 hom 39 2 26 11 T 14 13 344365 CASAVA_Build 9 78273850 4D TAGAGGAAAC TAAG/---- TGTCAAGATT 3070 het 3070 ref 36 18 18 1 TAAG 1 0 344366 CASAVA_Build 9 78280614 4D ATTTAGGAAG TAAC/---- TAACATAGGC 3070 het 3070 hom 63 29 27 10 TAAC 2 1 344367 CASAVA_Build 9 78281287 1D ATTGCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 8 A 11 10 344368 CASAVA_Build 9 78282256 1I AGTGAGACTC -/T TGTCTCCAAA 3070 het 485 hom 21 2 10 9 T 1 2 344369 CASAVA_Build 9 78286148 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 2499 het 2499 ref 21 8 7 6 T 13 12 344370 CASAVA_Build 9 78288140 1D TAAGGAGGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 438 hom 25 1 13 12 T 10 9 344371 CASAVA_Build 9 78295499 2I AGTTTCCTAA --/CT CTGCAAGAGT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 CT 1 2 344372 CASAVA_Build 9 78297511 1I GCCTGCTCCA -/T TTTTCTGTCC 3070 het 3070 hom 18 7 9 2 T 4 5 344373 CASAVA_Build 9 78303787 2I CTAGTGATAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 10 12 344374 CASAVA_Build 9 78306557 1D CGATTTCAAG A/- ACAAGGGGTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 2 1 344375 CASAVA_Build 9 78309650 1I TTGGGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 13 11 T 11 12 344376 CASAVA_Build 9 78310373 3I AAAGTAAAAC ---/AGT AGTAGAGTGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 AGT 1 2 344377 CASAVA_Build 9 78312774 1I ATTGATACAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 T 8 9 344378 CASAVA_Build 9 78325667 1I TCAGCCTCCC -/A AAGTGCTGAG 3070 het 3070 ref 29 14 8 7 A 2 3 344379 CASAVA_Build 9 78345689 2I AGCTTTTAAA --/TG TGCATACTTC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 TG 1 2 344380 CASAVA_Build 9 78371765 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2018 het 1773 hom 32 11 8 13 T 19 18 344381 CASAVA_Build 9 78387666 1D CAAGCTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 T 12 11 344382 CASAVA_Build 9 78392132 1D CCACACTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 47 hom 35 1 21 13 T 13 12 344383 CASAVA_Build 9 78393373 4D TAGCAAACTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 53 het 33 0 18 15 TTTC 5 4 344384 CASAVA_Build 9 78393389 5D TCTTTCTTTC TTTCT/----- TTTTTTTTTT 1495 het 622 hom 24 4 8 12 TTTCT 1 0 344385 CASAVA_Build 9 78398450 1I GGCTGAGGCA -/G GCGGATCACG 1927 hom 12 het 5 0 5 0 G 1 2 344386 CASAVA_Build 9 78404211 3I CAAGTTAAAC ---/TAT TATTATTATT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 TAT 5 6 344387 CASAVA_Build 9 78405288 1I AAATTGTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1011 hom 31 3 15 13 T 15 16 344388 CASAVA_Build 9 78406530 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 10 11 344389 CASAVA_Build 9 78407329 1I AGCTCTAGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 9 10 344390 CASAVA_Build 9 78412141 1D TTTCCTGCTT G/- ATCAATGCTC 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 G 1 0 344391 CASAVA_Build 9 78413164 1D CTTCTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 17 16 344392 CASAVA_Build 9 78420802 1D GCATGCCCGG C/- CCCTCAGTGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 4 3 344393 CASAVA_Build 9 78431840 3D TCTTTTTTTT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 TTC 3 2 344394 CASAVA_Build 9 78432033 1I GAGATGGGGT -/G GGCGGGGGGC 1007 het 1007 ref 28 15 4 9 G 2 3 344395 CASAVA_Build 9 78433289 1I TGTGCAGAGT -/G GGGGGACACA 3070 het 3070 ref 46 22 19 5 G 5 6 344396 CASAVA_Build 9 78438293 1D ACTCCAGCCT G/- GGGCAACAGA 3070 hom 47 het 21 0 17 4 G 4 3 344397 CASAVA_Build 9 78445303 1I TCTCTGGATA -/T TTTTTGCTTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 5 6 344398 CASAVA_Build 9 78446474 2D GCATGAGCAA CC/-- CCCCCCCAGG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 C 9 7 344399 CASAVA_Build 9 78449223 1I AATTTGCACA -/G AGATGATCGC 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 0 1 344400 CASAVA_Build 9 78454093 3D ATTTGTTCCT ATC/--- ATCTATTAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 ATC 2 1 344401 CASAVA_Build 9 78454675 1I TAACGCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 49 1 29 19 T 12 13 344402 CASAVA_Build 9 78455954 1I TAACTTATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 10 11 344403 CASAVA_Build 9 78472294 1I GCAATGCAAA -/G GCTGCACTCT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 G 1 2 344404 CASAVA_Build 9 78474063 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 53 hom 34 1 27 6 T 10 9 344405 CASAVA_Build 9 78480814 10I AAAAAAAACC ----------/CAAAAACAAA AAAAACAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 CAAAAACAAA 0 1 344406 CASAVA_Build 9 78480981 1I TGAAAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 29 1 19 9 A 13 14 344407 CASAVA_Build 9 78481104 1I ATTTCAATGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 9 10 344408 CASAVA_Build 9 78487580 2D TTCAAATTTT TC/-- TTTTAACTAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 TC 1 0 344409 CASAVA_Build 9 78489548 13D AGTGCAGTAG CACAATCTCAGCT/------------- CACTGAAACC 3070 hom 42 het 19 0 14 5 CACAATCTCAGCT 1 0 344410 CASAVA_Build 9 78497203 1D ACCTCTTTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 A 9 8 344411 CASAVA_Build 9 78499495 1D AAAGGCAGTT A/- AAAAAAATTT 2948 het 2948 ref 29 14 10 5 A 8 7 344412 CASAVA_Build 9 78500021 1D TGATCTGCCC G/- ACTCAGCCTT 3070 het 3070 hom 26 7 15 4 G 1 0 344413 CASAVA_Build 9 78502788 1D ATGTAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2720 hom 37 11 14 12 T 15 14 344414 CASAVA_Build 9 78507850 2I AGGTATAAGA --/CT CTGAATGAAA 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 CT 1 2 344415 CASAVA_Build 9 78508196 15D ATTGTCATGG GTGACAGCCTGCAAC/--------------- GTAACTGCAT 3070 het 3070 ref 35 20 14 6 GTGACAGCCTGCAAC 1 0 344416 CASAVA_Build 9 78508951 1D TTTTTATATA T/- TTTATTTATT 1252 het 1252 ref 18 5 5 8 T 4 3 344417 CASAVA_Build 9 78518225 1D AATCTGTTCT G/- TCTTGCACTG 3070 het 3070 hom 43 16 23 4 G 1 0 344418 CASAVA_Build 9 78519283 1D GGTGTGTATC A/- CCATGCCCAG 3070 het 3070 ref 34 22 10 2 A 1 0 344419 CASAVA_Build 9 78524879 4D TATCAAAGAA TACT/---- TAATGACACA 3070 het 3070 hom 43 18 22 5 TACT 1 0 344420 CASAVA_Build 9 78529134 4D TGGTTGAGCC TGGG/---- TGGGGGTGGA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 TGGG 2 1 344421 CASAVA_Build 9 78556773 1I AATATCAGGA -/T TTAGATGGGC 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 T 2 3 344422 CASAVA_Build 9 78556837 2I TTTTTGGTTT --/TG TTTTTTTTTT 494 het 494 ref 18 10 2 9 TG 0 1 344423 CASAVA_Build 9 78558072 1I19M1D CAAAAATATG -TTTTAAGCATATTTATTACT/CTTTTAAGCATATTTATTAC- AAAGGATGCA 3070 het 3070 ref 30 26 8 4 N/A 0 0 344424 CASAVA_Build 9 78558612 2D TGAGATTGAG CC/-- ACTGCACTCC 3070 het 1350 hom 18 3 9 6 C 2 0 344425 CASAVA_Build 9 78563430 1D GGCATTTTCT A/- CCCCACAGAA 3070 hom 99 het 39 0 32 7 A 1 0 344426 CASAVA_Build 9 78583969 1I AAACTTAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 17 16 12 T 14 15 344427 CASAVA_Build 9 78612909 2D GTAAGCGAAA CT/-- CTGTGTCAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CT 2 1 344428 CASAVA_Build 9 78627553 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2275 hom 30 7 21 3 A 10 9 344429 CASAVA_Build 9 78635667 1D GTGAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2107 hom 29 8 9 12 T 17 16 344430 CASAVA_Build 9 78642181 10D TGTCTCAAAT AATAATAATA/---------- ATAATAATAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 AATAATAATA 1 0 344431 CASAVA_Build 9 78642982 4I ACATAATAAA ----/ATAG ATAGATAGAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ATAG 2 3 344432 CASAVA_Build 9 78644893 1D TAAAGATAGC A/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 40 23 12 5 A 7 6 344433 CASAVA_Build 9 78690584 1D ATTTAGTGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 10 9 344434 CASAVA_Build 9 78694077 1D TGACTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 11 10 344435 CASAVA_Build 9 78695500 1I AGACTTCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1323 hom 39 3 35 1 A 10 11 344436 CASAVA_Build 9 78696800 2I GAGAAAGTAG --/CC CCCCCCCAGC 3070 hom 106 het 42 0 31 11 C 7 9 344437 CASAVA_Build 9 78712625 1D TATGGAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 18 24 11 T 14 13 344438 CASAVA_Build 9 78724176 1D ATCCCAGCTA C/- TTGGGAAGCT 3070 hom 98 het 34 0 33 2 C 1 0 344439 CASAVA_Build 9 78742162 1I ATGGCCTTTT -/G GTTTTGGAGG 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 G 1 2 344440 CASAVA_Build 9 78750975 1D ACCCAGAAGG T/- TGGAGGTTGC 3070 het 2753 hom 20 7 13 1 T 2 1 344441 CASAVA_Build 9 78756842 1D AAATGTTAGA C/- TTTCAGATAT 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 C 1 0 344442 CASAVA_Build 9 78765096 1D ATCTCCCTTT A/- TATTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 A 1 0 344443 CASAVA_Build 9 78766785 1D CGTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 20 17 2 T 10 9 344444 CASAVA_Build 9 78769470 1D AGGACCATCT G/- GGGAAATAGA 3070 het 3070 hom 42 14 20 9 G 4 3 344445 CASAVA_Build 9 78770712 1I TTAACTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 12 13 344446 CASAVA_Build 9 78772287 14D GACTAATCAC ATTGCTAAGAAGTG/-------------- ATAGTATTGT 3070 het 3070 ref 41 23 20 5 ATTGCTAAGAAGTG 1 0 344447 CASAVA_Build 9 78778076 1D ACTAAGAACA T/- TTTTTTTTTT 2829 het 2386 hom 23 8 8 7 T 13 12 344448 CASAVA_Build 9 78793939 3I TCTGAACAAG ---/GAA GAAGAACTTA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 GAA 2 3 344449 CASAVA_Build 9 78796090 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAG 1754 het 1665 hom 21 9 8 4 G 0 1 344450 CASAVA_Build 9 78798471 1I ACTTACTTTC -/T TTTTTTTTTT 2960 het 2960 ref 32 16 10 6 T 10 11 344451 CASAVA_Build 9 78832541 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 462 hom 19 1 14 4 T 11 10 344452 CASAVA_Build 9 78833806 5D GCCAAAATTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 4 T 15 10 344453 CASAVA_Build 9 78854337 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 11 12 344454 CASAVA_Build 9 78856329 4I TCTGACAATT ----/AAAC AAAAAGTTCA 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 AAAC 0 1 344455 CASAVA_Build 9 78871179 1D TTTATATATA T/- TTTTTTATTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 7 6 344456 CASAVA_Build 9 78871466 3I TTTTTTACTC ---/TTT GTTGAATTTG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 3 344457 CASAVA_Build 9 78873528 1I TCCAGCTATC -/T TTCTGTTATT 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 T 2 3 344458 CASAVA_Build 9 78874277 1I AATAGTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1470 hom 21 6 11 4 T 11 12 344459 CASAVA_Build 9 78894197 1I ATGTTGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 18 17 13 T 10 11 344460 CASAVA_Build 9 78901474 1I GCAAAATTGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 42 27 13 2 A 8 9 344461 CASAVA_Build 9 78909250 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 A 8 9 344462 CASAVA_Build 9 78919614 1I TTAGTGGCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 59 24 24 11 A 9 10 344463 CASAVA_Build 9 78940921 2D TTCTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1399 het 979 hom 33 7 6 20 T 20 18 344464 CASAVA_Build 9 78942964 2D CCAATTTTTG TA/-- TGTTTAGTAG 2856 het 2856 ref 29 13 8 8 TA 1 0 344465 CASAVA_Build 9 78953915 4I AAACAAACAA ----/ACAG CAAAAAACCC 3070 hom 95 het 35 0 32 3 ACAG 0 1 344466 CASAVA_Build 9 78955354 1D ATATTTGTAG T/- TTTTTTATTA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 7 6 344467 CASAVA_Build 9 78973491 2D TCTACAGCAC AT/-- GTCTGTGTGT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 AT 1 0 344468 CASAVA_Build 9 78979758 1D GTCTAAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 956 hom 34 4 12 18 T 15 14 344469 CASAVA_Build 9 78984512 5I TATAGTCACA -----/ACCAC AAATTGTACA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 ACCAC 0 1 344470 CASAVA_Build 9 78984926 1I CATGTACAAG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 7 8 344471 CASAVA_Build 9 78988356 1D GAACTCTGTT A/- ATATGTCTCC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 2 1 344472 CASAVA_Build 9 78994589 1I CATTTTATTC -/T TTTTTGTGGC 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 T 5 6 344473 CASAVA_Build 9 79004505 2D AAGCATACTC TG/-- TTAGACTATG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 TG 1 0 344474 CASAVA_Build 9 79009705 1D TAGGTTTAGA G/- TAAGAACTGG 3070 het 3070 ref 36 22 12 3 G 1 0 344475 CASAVA_Build 9 79009962 1I TTATCTCTTC -/T AATGCCTGAC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 0 1 344476 CASAVA_Build 9 79011619 4I AAGCTTCAAT ----/AATA AATGTTTTAC 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 AATA 0 1 344477 CASAVA_Build 9 79019595 1I AAACAGAAAG -/A AAAAAAATCA 2991 het 2991 ref 24 14 7 3 A 7 8 344478 CASAVA_Build 9 79028457 2I TCTCTATAAC --/AT AAAAGTATAA 3070 hom 144 het 50 0 49 1 AT 0 1 344479 CASAVA_Build 9 79033676 1I GGGGAAGCCA -/C CCCCCATGAT 1404 het 1404 ref 17 10 5 2 C 5 6 344480 CASAVA_Build 9 79035658 3D TTAAAATTTG AAC/--- AACGTTTTAC 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 AAC 2 1 344481 CASAVA_Build 9 79044744 1I TTTTTTACTT -/A AAAAATACTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 5 6 344482 CASAVA_Build 9 79048880 2D AGGCTGAGAC TG/-- GAGGATTGCT 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 TG 1 0 344483 CASAVA_Build 9 79049084 1D ACACTTTGTT G/- GGAGAAGGAA 3070 het 3070 hom 45 18 18 10 G 3 2 344484 CASAVA_Build 9 79049440 1D CAAAGGAAAA T/- CATTTAAGCA 3070 het 3070 hom 40 15 24 1 T 1 0 344485 CASAVA_Build 9 79075433 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 10 11 344486 CASAVA_Build 9 79076457 1D ATAGAACGCA G/- GATTACTTGG 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 G 2 1 344487 CASAVA_Build 9 79076786 1D TAATGTGCTT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 47 24 14 9 A 8 7 344488 CASAVA_Build 9 79086043 4D GTCTCACCAC AAAG/---- AAAGATAGGA 3070 het 3070 hom 43 18 19 11 AAAG 2 1 344489 CASAVA_Build 9 79087693 1I CTCTGTTTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 11 10 A 11 12 344490 CASAVA_Build 9 79097395 1I GCTCTTCAGC -/T TCCCTGTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 T 1 2 344491 CASAVA_Build 9 79106693 1I ACATAGAGAT -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 A 1 2 344492 CASAVA_Build 9 79110782 3D TATTTTCATC TTA/--- TTATATGAAC 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 TTA 2 1 344493 CASAVA_Build 9 79112666 1I AGAACAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 20 5 T 10 11 344494 CASAVA_Build 9 79115348 3I ACTGTAAATC ---/TCA TCATTGAAAA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 TCA 1 2 344495 CASAVA_Build 9 79120379 1I ATAGTTTGCA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 42 20 18 4 T 6 7 344496 CASAVA_Build 9 79128621 1D ACTTGTTGTT G/- CTCAGTAGTA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 G 1 0 344497 CASAVA_Build 9 79129516 1I GGGTTTAAGC -/A AATCCTCCTA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 2 3 344498 CASAVA_Build 9 79135870 1D TTCATTTTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 9 8 344499 CASAVA_Build 9 79145126 1I GAGCTGTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 15 2 T 9 10 344500 CASAVA_Build 9 79147137 1I TTAACTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 624 hom 46 3 30 13 T 13 14 344501 CASAVA_Build 9 79152042 1I ATTGAATCTA -/C CCATCCATGA 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 C 2 3 344502 CASAVA_Build 9 79152600 1I CAAAGTGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 11 12 344503 CASAVA_Build 9 79164552 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1779 het 493 hom 14 5 5 4 A 17 16 344504 CASAVA_Build 9 79173247 1I GCCAGATGTA -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 T 7 8 344505 CASAVA_Build 9 79175474 1I AGTAGCCTCT -/A AAAACATTCT 3070 hom 123 het 43 0 42 1 A 4 5 344506 CASAVA_Build 9 79191234 1I AATTTATCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 A 11 12 344507 CASAVA_Build 9 79191874 1I TAGTAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 36 0 27 9 A 10 11 344508 CASAVA_Build 9 79192619 2I GTGAAAAATA --/CT CTGTTGTTTC 3070 hom 114 het 45 0 38 7 CT 1 2 344509 CASAVA_Build 9 79193271 2D CAATTTTAAA AC/-- ACACGTTTAA 3070 het 3070 hom 45 19 22 6 AC 3 2 344510 CASAVA_Build 9 79195857 1I TTAATTAAGC -/T AAAGTTGCTA 3070 het 3070 hom 53 21 25 7 T 0 1 344511 CASAVA_Build 9 79204275 1I TTGGAAGGTT -/A ACGATCTATT 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 A 1 2 344512 CASAVA_Build 9 79207335 1D ATGGTAAATC T/- TATTTTGTTC 3070 het 3070 ref 39 18 19 2 T 2 1 344513 CASAVA_Build 9 79209727 1I GAGTCAGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 27 10 8 T 11 12 344514 CASAVA_Build 9 79211476 4D TTTTAATTAG AAGA/---- AAGAATGTAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 9 AAGA 2 1 344515 CASAVA_Build 9 79222992 2D GCTATGGAAT GA/-- GAGGTGTTGA 3070 het 3070 ref 50 31 17 5 GA 2 1 344516 CASAVA_Build 9 79232061 2D TCTTGCCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2354 het 2354 ref 28 12 8 9 A 16 14 344517 CASAVA_Build 9 79234305 2D CCAAAGCCTC TA/-- TATCTGTGTC 3070 hom 108 het 41 0 37 5 TA 2 1 344518 CASAVA_Build 9 79243007 1D CCTGTTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 T 13 12 344519 CASAVA_Build 9 79250158 1D TCTCAGAGAA G/- GGTTTTGGGG 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 G 3 2 344520 CASAVA_Build 9 79252373 2D GTGGGGAGGA CT/-- CTCCTCCACA 3070 het 3070 hom 41 18 17 7 CT 2 1 344521 CASAVA_Build 9 79256963 2D ACCCCTACTC AT/-- GTGACGTGTG 3070 het 3070 ref 63 29 22 12 AT 1 0 344522 CASAVA_Build 9 79257375 6D GTGCGGTGTG TGTGTT/------ TGTGTTTGTG 3070 hom 36 het 13 0 13 4 TGTGTT 2 1 344523 CASAVA_Build 9 79258353 1D ACTTAGAAAG A/- TAATCCACAT 3070 het 3070 ref 60 28 27 6 A 1 0 344524 CASAVA_Build 9 79260924 3D TAGAGAAGAT AAG/--- AAGTAGTACC 3070 hom 96 het 35 0 32 4 AAG 2 1 344525 CASAVA_Build 9 79263031 1D ACAGCTTTGA G/- GGGGGAAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 12 12 G 6 5 344526 CASAVA_Build 9 79263646 2I CTGGAGGGGG --/GC GGGGGTTGTC 3070 hom 36 het 24 0 15 9 GC 0 1 344527 CASAVA_Build 9 79263972 1D4M8D ACCCAGTCTC AGGGAAAAAAAAG/-GGGA-------- AAAAAAAAGA 3070 het 538 hom 21 3 12 10 N/A 0 0 344528 CASAVA_Build 9 79266493 4I GAATTTCTTG ----/AACA AATAATAGTA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AACA 0 1 344529 CASAVA_Build 9 79270306 2I ACTGACAAAC --/TG TATTCTAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 TG 0 1 344530 CASAVA_Build 9 79270408 1D TGATATAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 T 11 10 344531 CASAVA_Build 9 79274271 1I ACTGACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 13 14 344532 CASAVA_Build 9 79279134 1D CACTTGTTAT C/- CATGACAAGC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 C 2 1 344533 CASAVA_Build 9 79289685 8I ATACAGCAAG --------/TTATAATC TTATAATCTT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 TTATAATC 1 2 344534 CASAVA_Build 9 79292236 1D TGGTATTTTT G/- TAATTGCCAA 3070 het 3070 ref 52 25 18 11 G 1 0 344535 CASAVA_Build 9 79299192 1D ATTGTGATTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 26 17 6 A 10 9 344536 CASAVA_Build 9 79301868 1D CCTTTCCATA C/- CTTAGAAGAA 3070 het 3070 hom 42 18 23 1 C 2 1 344537 CASAVA_Build 9 79304126 1D AAATTGCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 15 5 A 14 13 344538 CASAVA_Build 9 79313694 1D AAAAATACCT A/- ACATAAAGTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 A 2 1 344539 CASAVA_Build 9 79319345 12D TAATATCAGA TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2043 het 1017 hom 16 4 6 6 T 23 11 344540 CASAVA_Build 9 79337851 2I ATTTAGTTTT --/TC TCTGTTTTCA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TC 1 2 344541 CASAVA_Build 9 79356250 1I CACTCACCCA -/C CCCCCCCTTC 3070 hom 61 het 22 0 13 9 C 7 8 344542 CASAVA_Build 9 79369045 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACTTA 3070 het 212 hom 32 3 19 10 C 0 1 344543 CASAVA_Build 9 79369571 1I TCTGTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 31 2 23 6 A 13 14 344544 CASAVA_Build 9 79373228 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2800 het 1155 hom 16 6 8 2 A 14 13 344545 CASAVA_Build 9 79377362 4D ATTAACTAGC AACA/---- AATACAACAA 3070 hom 108 het 42 0 37 7 AACA 1 0 344546 CASAVA_Build 9 79381525 1I TTAAAAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 11 12 344547 CASAVA_Build 9 79391856 1D AGCTATACTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 9 344548 CASAVA_Build 9 79395446 1D GTCACACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 12 11 344549 CASAVA_Build 9 79488601 6I AACATTCTAG ------/ATACTA ATACTTTGTG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 ATACTA 0 1 344550 CASAVA_Build 9 79489109 4D GGTAGACTGA TTCT/---- TTATTTTTAT 3070 hom 72 het 28 0 25 5 TTCT 1 0 344551 CASAVA_Build 9 79489509 1D GTTGACTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 9 8 344552 CASAVA_Build 9 79504227 1I AGAGGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 24 2 20 2 T 11 12 344553 CASAVA_Build 9 79516543 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 168 hom 28 2 14 12 T 13 14 344554 CASAVA_Build 9 79517921 1D AAAACAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 142 hom 42 2 31 9 A 13 12 344555 CASAVA_Build 9 79520833 1I TTTTTTGGTG -/T TTTTTTTTTT 1390 het 1390 ref 34 24 4 6 T 13 14 344556 CASAVA_Build 9 79533830 5D CCTCACAATT AACTC/----- TATTCTAAGC 3070 hom 94 het 37 0 30 7 AACTC 1 0 344557 CASAVA_Build 9 79539256 6D TGAGGGCCTG ACAGTC/------ ATCTATGCAT 3070 hom 108 het 43 0 37 8 ACAGTC 1 0 344558 CASAVA_Build 9 79548402 4D TTTTTTTTAA ACTG/---- ACTGATAGCT 3070 hom 111 het 41 0 36 5 ACTG 2 1 344559 CASAVA_Build 9 79550348 1D GCACACACAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 27 0 23 6 A 10 9 344560 CASAVA_Build 9 79555400 1D ATCAAGCTGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 9 8 344561 CASAVA_Build 9 79558581 1I TGAATTAATT -/A AAAAAGCTCA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 5 6 344562 CASAVA_Build 9 79564152 1D TCATAAGGCA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 138 het 53 0 47 8 T 8 7 344563 CASAVA_Build 9 79585689 1D ATTAATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 42 4 23 15 T 17 16 344564 CASAVA_Build 9 79586056 1D GATATCTAGC T/- TTTCACAACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 4 3 344565 CASAVA_Build 9 79596807 1D TTAAAAAATA T/- TTTTTTGACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 7 6 344566 CASAVA_Build 9 79608845 2D TTTATCAATA AC/-- AGTTTTGAGG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AC 1 0 344567 CASAVA_Build 9 79616069 5D TTTATAAAGA TATAT/----- TATATATAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TATAT 2 1 344568 CASAVA_Build 9 79629517 1I ATTAATGAAG -/A AAAAAACAAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 6 7 344569 CASAVA_Build 9 79630062 1I ACCTCCACAG -/T TAAGACTGCT 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 T 1 2 344570 CASAVA_Build 9 79632120 1D TTAAATAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 524 hom 31 2 22 8 A 18 17 344571 CASAVA_Build 9 79636824 2I ATTAGAGCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 37 0 22 15 T 13 15 344572 CASAVA_Build 9 79639243 1I CTATTCTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 89 het 39 0 30 9 T 9 10 344573 CASAVA_Build 9 79640975 1I AGCCCCCCCC -/T GGATCTGTCC 3070 hom 59 het 24 0 18 6 T 0 1 344574 CASAVA_Build 9 79642392 1I AAATTATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1341 hom 18 3 13 2 A 10 11 344575 CASAVA_Build 9 79645897 1I AAGAATTTTC -/A GTAATATTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 0 1 344576 CASAVA_Build 9 79649603 1D ACAGACAGGG T/- TTTCACCATG 3070 hom 27 het 15 0 10 5 T 4 3 344577 CASAVA_Build 9 79662410 18D GGAAGGAGGG AAGGAGGGGAAGGAGAGA/------------------ AAGGAAGACA 3070 hom 91 het 27 0 27 10 AAGGAGGGGAAGGAGAGA 1 0 344578 CASAVA_Build 9 79662609 1D GCAATAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 39 2 31 6 T 13 12 344579 CASAVA_Build 9 79668420 1D GGCCATTTAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 8 344580 CASAVA_Build 9 79690735 1D TTTTTGAGAC A/- AGAGTCTTGC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 1 344581 CASAVA_Build 9 79698980 1I ACTAAATTTT -/A AAATGTTTCA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 3 4 344582 CASAVA_Build 9 79701250 1I AAATAAAAAC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 T 7 8 344583 CASAVA_Build 9 79704289 1I TCACATTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 11 12 344584 CASAVA_Build 9 79708669 5D GGGAAACCCT AAAAC/----- AAAACACACA 3070 hom 146 het 53 0 49 6 AAAAC 2 1 344585 CASAVA_Build 9 79727751 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 15 14 344586 CASAVA_Build 9 79738377 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 327 hom 29 1 22 6 A 11 12 344587 CASAVA_Build 9 79757094 3D TGTTGAATCC ATA/--- ATATTAAAAC 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 ATA 2 1 344588 CASAVA_Build 9 79765519 1D CTAAAAAAAA T/- GATCTATTCA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 1 0 344589 CASAVA_Build 9 79768868 4D TCATATTAAT AACA/---- GACACAGATT 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 AACA 1 0 344590 CASAVA_Build 9 79769409 3I ATAAAACAAA ---/AAC AACAACAAGA 2773 het 2773 ref 27 16 8 3 AAC 2 3 344591 CASAVA_Build 9 79769836 3D TTTTATTTCC TCT/--- TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 TCT 1 0 344592 CASAVA_Build 9 79775565 1I AAAACCTTTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 28 10 7 11 A 8 9 344593 CASAVA_Build 9 79777148 1D TCTCATACTG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 T 9 8 344594 CASAVA_Build 9 79784104 4D AAAAAAAAAA AATT/---- AAATTAAATT 643 het 640 ref 13 5 4 7 AATT 1 0 344595 CASAVA_Build 9 79785401 1I TTACTAGTTT -/A AAAAAAAAAA 2035 het 2035 ref 29 21 5 3 A 10 11 344596 CASAVA_Build 9 79787604 2D ATGGGTGCGG CA/-- CACACCAACA 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 CA 3 2 344597 CASAVA_Build 9 79818049 1D CTTACAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 10 7 T 13 12 344598 CASAVA_Build 9 79821418 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1647 hom 23 5 13 5 A 13 14 344599 CASAVA_Build 9 79834107 1D TAAAACACTC T/- TATTTCTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 T 2 1 344600 CASAVA_Build 9 79834205 1D AATGAGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 13 12 344601 CASAVA_Build 9 79844218 1D TATTATGGTA C/- TTTTATAGTA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 C 1 0 344602 CASAVA_Build 9 79851077 1D TGACCAGAGT C/- AAGTATGTGG 3070 hom 96 het 34 0 33 2 C 1 0 344603 CASAVA_Build 9 79853924 10I GAGAAGAGAA ----------/AAGAAGAGAG GAGAAGAACC 3070 het 151 hom 22 3 10 9 AAGAAGAGAG 0 1 344604 CASAVA_Build 9 79868424 1D TGAAGTTAAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2000 hom 21 6 10 5 T 9 8 344605 CASAVA_Build 9 79868691 4I TCTTGTGTTA ----/GTTT GCTGAGAATG 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 GTTT 0 1 344606 CASAVA_Build 9 79891933 1I TTATATATTT -/A AGAGAACCCC 2923 het 2923 ref 18 10 6 2 A 1 2 344607 CASAVA_Build 9 79904477 1I AAGGACTGTC -/T TTTTTTTTTC 3056 het 3056 ref 31 15 11 5 T 9 10 344608 CASAVA_Build 9 79905054 6D TGCAAGTTAT GGTGCA/------ GGAGTTGGCG 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 GGTGCA 1 0 344609 CASAVA_Build 9 79906096 7D TTTTACAGAG GAGTGTT/------- GATTTAGGCT 3070 het 3070 ref 31 21 9 3 GAGTGTT 1 0 344610 CASAVA_Build 9 79906199 5I TAGAAGGTGA -----/GGTGC GGTGCATCAT 3070 het 3070 ref 46 23 21 2 GGTGC 1 2 344611 CASAVA_Build 9 79911819 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2343 het 2253 hom 17 7 7 4 A 15 14 344612 CASAVA_Build 9 79923436 1D AACAGAAAAG A/- AAAAAAAAAG 2496 het 2496 ref 24 16 6 2 A 10 9 344613 CASAVA_Build 9 79966610 1I AAATACGGAG -/T TTTTTTTTTT 815 het 815 ref 35 21 3 11 T 13 14 344614 CASAVA_Build 9 79969102 3I TTGTACAGTC ---/ATA ATAATATACT 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 ATA 2 3 344615 CASAVA_Build 9 79977769 2I CCTATTTTTC --/TG TGTGTGTGTC 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 TG 4 5 344616 CASAVA_Build 9 79981417 1I TCTAAGTTGC -/T TTTTTTTTTT 1216 het 1216 ref 34 12 6 16 T 15 16 344617 CASAVA_Build 9 79997251 1I CCTAAGATCC -/A AAAAAAAAAA 1655 het 1655 ref 43 25 6 12 A 13 14 344618 CASAVA_Build 9 80004994 2I GAAATGAGGG --/GT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 GT 0 1 344619 CASAVA_Build 9 80019300 1I GAAGTAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 17 17 2 T 10 11 344620 CASAVA_Build 9 80019724 7I TTTACGGATG -------/GAAAATA TAGTTTGGAG 3070 het 3070 ref 34 20 8 6 GAAAATA 0 1 344621 CASAVA_Build 9 80030326 1I CCTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTT 1869 het 1869 ref 38 21 5 12 T 13 14 344622 CASAVA_Build 9 80031494 2D AAAAAATCCG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 34 14 13 8 CA 8 7 344623 CASAVA_Build 9 80044360 2D TCCCTGCCTC TT/-- TGTAAATTTC 3070 het 3070 hom 54 21 21 12 T 3 1 344624 CASAVA_Build 9 80109776 1I CCCTTGACAG -/T TGTTAGTTCA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 1 2 344625 CASAVA_Build 9 80118220 2I ACAGACTCTT --/GG AACTGGGCAT 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 G 0 2 344626 CASAVA_Build 9 80119747 1D AACAGGCTGC A/- GGTGTGGGAG 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 A 1 0 344627 CASAVA_Build 9 80121986 4D TCTTGTGTAT TTTC/---- TTTCTTTATT 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 TTTC 2 1 344628 CASAVA_Build 9 80133344 1I2M17D GCAGCAGGGA -ATGTCCTCACATGAGAATA/GAT----------------- GCCCAGCCCC 3070 het 3070 hom 53 27 26 5 N/A 0 0 344629 CASAVA_Build 9 80146460 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 19 2 12 5 A 14 15 344630 CASAVA_Build 9 80146934 1D TCCTCCTCCC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 A 9 8 344631 CASAVA_Build 9 80152757 7D GAACTAAATT GACATAA/------- GACAGAAGAA 3070 het 3070 ref 31 16 15 4 GACATAA 1 0 344632 CASAVA_Build 9 80157267 1I TTTCTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 17 10 T 13 14 344633 CASAVA_Build 9 80164833 1I GATGAATTTT -/G GGGGGGGACA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 G 7 8 344634 CASAVA_Build 9 80166618 1I GAGACAGAGC -/A AAAAAAAAAA 1406 het 1406 ref 15 9 3 3 A 10 11 344635 CASAVA_Build 9 80182056 3D AAAAAAAAAC AAA/--- AAACAAAAAA 1100 het 1100 ref 25 11 5 11 A 6 3 344636 CASAVA_Build 9 80186224 7D AGCAGAAGAA AATGAAC/------- ATGAAGACAA 3070 het 3070 ref 46 23 20 5 AATGAAC 1 0 344637 CASAVA_Build 9 80229661 1D CTCACCAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1745 hom 42 12 16 15 T 17 16 344638 CASAVA_Build 9 80260272 1I TCATTAGGTG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 8 9 344639 CASAVA_Build 9 80266717 1I TTGTATACTT -/A AAAAAAAAAA 2859 het 2859 ref 34 16 10 8 A 12 13 344640 CASAVA_Build 9 80303125 1D TTTTTGGATA C/- TATACTAGAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 C 1 0 344641 CASAVA_Build 9 80303659 1D AGACACTGTC A/- AAAAAAAAAA 1481 het 1481 ref 27 9 5 13 A 19 18 344642 CASAVA_Build 9 80305629 1D ATCATTAACC T/- TTTTTTTTTT 2278 het 2278 ref 42 23 7 13 T 15 14 344643 CASAVA_Build 9 80305830 2D CAATTTCATC TT/-- TTTTTTTTTT 1748 het 1748 ref 32 16 7 10 T 18 16 344644 CASAVA_Build 9 80312705 1I AGTCCCATTC -/T TTTCCCTTGT 3070 het 3070 ref 59 27 26 6 T 3 4 344645 CASAVA_Build 9 80313294 20D TCTACCTTGC TGGCACCTTGACATTGGACT/-------------------- TACCAGCCTC 2379 het 2379 ref 30 24 7 3 TGGCACCTTGACATTGGACT 1 0 344646 CASAVA_Build 9 80317943 1I TGCTGGAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 11 12 344647 CASAVA_Build 9 80322728 1D TTTTTGTTAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 11 19 5 A 9 8 344648 CASAVA_Build 9 80323568 1D ACAGGTGTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 9 18 7 A 10 9 344649 CASAVA_Build 9 80332365 1I GTGTGTGTGT -/G TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 31 8 13 10 G 0 1 344650 CASAVA_Build 9 80334936 4D ACAATATAAG AAAC/---- AAATGAAAAG 3070 het 3070 hom 34 13 19 5 AAAC 1 0 344651 CASAVA_Build 9 80337173 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 24 0 22 2 A 11 10 344652 CASAVA_Build 9 80346441 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 12 11 344653 CASAVA_Build 9 80348366 2D TTTTAAAATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 11 8 T 12 10 344654 CASAVA_Build 9 80362159 1D TTTTGAGGGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 46 het 36 1 31 4 A 9 8 344655 CASAVA_Build 9 80377932 1D GTACAAGTCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 70 31 27 12 T 9 8 344656 CASAVA_Build 9 80378403 1D TGCTAAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 11 10 344657 CASAVA_Build 9 80385160 50I AAATGTGGGT --------------------------------------------------/ATGGAAGCTAAGAGGAAGAATAGAAACTGCCTCCATTTCATCAATCTGCA ATGAACTCTT 3070 hom 66 het 16 0 23 0 ATGGAAGCTAAGAGGAAGAATAGAAACTGCCTCCATTTCATCAATCTGCA 0 1 344658 CASAVA_Build 9 80399042 1D TATGCTAACA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 8 7 344659 CASAVA_Build 9 80400501 1D CACATGCTAA C/- AACTGGAGGA 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 C 1 0 344660 CASAVA_Build 9 80416564 1I ACTTTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 525 hom 39 2 29 8 A 13 14 344661 CASAVA_Build 9 80418434 5I CGGTGATGTT -----/AAGAG AATGAAAAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AAGAG 0 1 344662 CASAVA_Build 9 80422005 1I TGGCTGAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 94 het 37 0 32 5 A 9 10 344663 CASAVA_Build 9 80474684 2I AAAAGGAAAC --/TG TAGGCTAATG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TG 0 1 344664 CASAVA_Build 9 80492511 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1732 het 94 hom 14 2 6 6 T 17 16 344665 CASAVA_Build 9 80515481 1D TCATCATAGT A/- AGTCTCAAGA 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 A 2 1 344666 CASAVA_Build 9 80537998 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 3 T 8 7 344667 CASAVA_Build 9 80554519 1D GTCTTCTCTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 8 7 344668 CASAVA_Build 9 80554853 1I TTAATTTTCC -/T TTTTTATGTA 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 T 5 6 344669 CASAVA_Build 9 80563173 1D AGGCTGAAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 A 9 8 344670 CASAVA_Build 9 80567178 2I ATATATAACA --/AT ATATATTATA 1449 het 1449 ref 8 5 3 0 AT 3 4 344671 CASAVA_Build 9 80574136 1I27M1D TTCAAGACAT -GGGGGGACAACAAGGAAAGAAAAATGCT/GGGGGGGAAAACAAGGAAAGAAAAATGC- TTTTTTTCCT 3070 het 1947 hom 43 9 18 22 N/A 0 0 344672 CASAVA_Build 9 80576822 1D TAAACAACAC A/- AAGTATGAGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 3 2 344673 CASAVA_Build 9 80578529 1D ATCAAGGACC A/- GCATGAGAAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 4 A 1 0 344674 CASAVA_Build 9 80579078 1D CCAAAGTGAG A/- ACCCTGTCTA 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 A 2 1 344675 CASAVA_Build 9 80592842 1I TGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 35 2 30 4 T 11 12 344676 CASAVA_Build 9 80592906 1D ATTTTTTGAG T/- TGGCATTTCT 3070 hom 45 het 28 0 19 9 T 2 1 344677 CASAVA_Build 9 80594239 2D TATATTTAAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 24 het 14 0 9 6 AT 7 6 344678 CASAVA_Build 9 80597604 1I AATGTGCATC -/A ACCAGGAGAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 2 344679 CASAVA_Build 9 80600120 1D ACATATTTTC T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 T 8 7 344680 CASAVA_Build 9 80606695 7D CCATGAATAC TTTTTTA/------- TTTTTTATTT 3070 hom 36 het 22 0 13 9 TTTTTTA 2 1 344681 CASAVA_Build 9 80611033 12I ATTAATCTCC ------------/TCTATATCTCAA TCTATATCTC 3070 het 3070 ref 51 24 21 7 TCTATATCTCAA 1 2 344682 CASAVA_Build 9 80613894 1I GTAATTAAAA -/G CTCAATAATA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 G 0 1 344683 CASAVA_Build 9 80617637 1D GCCCCAGTGA T/- TTTTTTTCAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 7 344684 CASAVA_Build 9 80617991 1D CACAAAAAAA G/- TTCAAATAAT 3070 het 3070 hom 34 11 18 6 G 1 0 344685 CASAVA_Build 9 80618238 1D TCTTGTATTT C/- TATAATATAT 2356 het 2356 ref 24 14 5 6 C 1 0 344686 CASAVA_Build 9 80635933 1D TGCTTTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 59 20 22 17 T 12 11 344687 CASAVA_Build 9 80642888 11D TCTATGAGGT TGTTTCTATGG/----------- CCACATGCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 7 TGTTTCTATGG 1 0 344688 CASAVA_Build 9 80654209 1I ATAATTGTGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 57 25 21 11 T 9 10 344689 CASAVA_Build 9 80656809 1I ACTGTCCTAG -/T TAGGGGTGTT 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 T 1 2 344690 CASAVA_Build 9 80668674 1I TGGGGAATGC -/A AAAATCTCAG 3070 hom 85 het 35 0 29 6 A 4 5 344691 CASAVA_Build 9 80668977 1D AAGTGATAGC T/- GCTATCCGTT 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 1 0 344692 CASAVA_Build 9 80669595 2I TATAAAAAAA --/AT ATATATTAGC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 AT 3 4 344693 CASAVA_Build 9 80685247 1D AGCCTAACGA T/- TTGTGAAAAG 3070 het 3070 ref 63 36 20 7 T 3 2 344694 CASAVA_Build 9 80688657 1I GTATATCTTG -/C ACAAAGGATG 3070 hom 162 het 57 0 54 3 C 0 1 344695 CASAVA_Build 9 80695748 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 T 11 10 344696 CASAVA_Build 9 80697590 1I TGGAATAAAA -/G CTATTTAAAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 344697 CASAVA_Build 9 80712536 1D TGGAAAATCG T/- TAAGTGGTGC 3070 het 3070 ref 42 16 18 8 T 2 1 344698 CASAVA_Build 9 80725925 1D AAATTTAAAA T/- TTTTCCCTAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 5 4 344699 CASAVA_Build 9 80728145 9I TTGAACAACA ---------/CTACTTTTT CTACTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 17 19 7 CTACTTTTT 1 2 344700 CASAVA_Build 9 80729056 1D ATTTATGGTG T/- GACCTATTTA 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 T 1 0 344701 CASAVA_Build 9 80730524 3I AGATGGCTTT ---/CCC TTCCCTCCCC 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 C 0 3 344702 CASAVA_Build 9 80732365 3D GCTTTGTACT AGC/--- AGCAGTTCAT 3070 het 3070 hom 41 19 21 3 AGC 2 1 344703 CASAVA_Build 9 80739518 1I CAATAATTAC -/A ATGATGAGAG 3070 het 3070 ref 60 30 24 6 A 1 2 344704 CASAVA_Build 9 80778312 1D TGCCTGTAGT C/- CCAGCTACTC 3070 het 2293 hom 22 7 10 5 C 3 2 344705 CASAVA_Build 9 80779258 1I CTAAAGGGGG -/A AAAAAGGACA 3070 het 3070 ref 52 28 20 4 A 5 6 344706 CASAVA_Build 9 80784359 1D CAGGGTCTCC A/- GCTTGCAGAG 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 1 0 344707 CASAVA_Build 9 80818868 1I GATTCCACCT -/A AATAAATGTG 3070 hom 144 het 55 0 49 6 A 2 3 344708 CASAVA_Build 9 80823867 1D TGTCATTTTG T/- TTTTTTTTTC 1392 het 1392 ref 34 25 3 6 T 10 9 344709 CASAVA_Build 9 80827594 1D GACATTTTTT C/- CCCCAAAGAT 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 C 5 4 344710 CASAVA_Build 9 80829843 1D AGACTAAATG A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 A 8 7 344711 CASAVA_Build 9 80833813 1I CATATAATGG -/T TTTTTTGTGC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 6 7 344712 CASAVA_Build 9 80836238 1D CTCTTTAATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 10 9 344713 CASAVA_Build 9 80836780 5D TGCTGAAATC TTTAT/----- TTTATTTTCT 3070 het 3070 hom 46 21 22 5 TTTAT 2 1 344714 CASAVA_Build 9 80837790 1D CTTTTCTCTC T/- GCTCAGGATA 3070 het 3070 hom 52 24 24 5 T 1 0 344715 CASAVA_Build 9 80849301 3I ATCTCTCTCC ---/CTT CTTCTCTCCC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CTT 1 2 344716 CASAVA_Build 9 80851472 1D TCTTGGAGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 T 9 8 344717 CASAVA_Build 9 80857255 3I TATGTCACAA ---/AAT AATAATTCAG 3070 hom 78 het 33 0 26 7 AAT 2 3 344718 CASAVA_Build 9 80885670 2D GTCTGTCATG CT/-- AGGGTTCTAC 3070 het 3070 ref 52 24 22 6 CT 1 0 344719 CASAVA_Build 9 80891107 2D CTGTTTGTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 A 13 11 344720 CASAVA_Build 9 80892383 1D ATTTATATAT A/- ATATATATAT 651 hom 5 het 6 0 2 4 A 2 1 344721 CASAVA_Build 9 80901425 1D TCCGCGCCCA G/- GGCATATTTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 G 3 2 344722 CASAVA_Build 9 80927448 2D AGGGAGAGAA AG/-- AGAAAAACAA 3070 het 2007 hom 19 7 8 4 AG 2 1 344723 CASAVA_Build 9 80930422 1I GGTGAGATTT -/G AGCTGGCTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 0 1 344724 CASAVA_Build 9 80936413 1I AATCTAAATC -/A AATACTTTCC 3070 het 3070 hom 47 16 26 5 A 2 3 344725 CASAVA_Build 9 80955135 20D AGTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 34 14 344726 CASAVA_Build 9 80969095 1D AAAAATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 30 0 16 14 A 15 14 344727 CASAVA_Build 9 80975014 4I CCTATAACAC ----/AAAT AAAGAGATAT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 AAAT 0 1 344728 CASAVA_Build 9 80977271 5D39M5D ATCATAAAAT ATAAAATAAAAGTATAAACTAGCATGTTGATTGACAACATAAATATAAA/-----ATAAAAGTATAAACTAGCATGTTGATTGACAACATAAAT----- ATGTGTAACA 3070 hom 48 het 24 0 17 23 N/A 0 0 344729 CASAVA_Build 9 80977445 4I TTTAAGGTAC ----/AAAG AAAGATTCTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AAAG 1 2 344730 CASAVA_Build 9 80981120 1I TCATTTTATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 9 10 344731 CASAVA_Build 9 80992294 4I TTTCTGAGCC ----/GTGT GTGTGTTTGT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 GT 3 5 344732 CASAVA_Build 9 80992384 1I CCAGATCTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 9 10 344733 CASAVA_Build 9 80993124 3D CCTTCCTTCT TTC/--- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 TTC 1 0 344734 CASAVA_Build 9 81002778 1D CCCTCTCTTC T/- TTCTTTTAGC 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 3 2 344735 CASAVA_Build 9 81003467 1I AATGATTGAG -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 A 7 8 344736 CASAVA_Build 9 81010036 3D GATGAAAATA AAT/--- AATAAGATAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 AAT 2 1 344737 CASAVA_Build 9 81010699 4I ATACACAAAC ----/ACAT ACAAATGCAC 665 het 665 ref 48 26 4 20 ACAT 0 1 344738 CASAVA_Build 9 81031803 5I CATTTGAGTC -----/ATCAT ATCATATTTG 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 ATCAT 1 2 344739 CASAVA_Build 9 81036508 1D GAGAAGATAG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 40 14 24 3 A 8 7 344740 CASAVA_Build 9 81061155 1I TAAGCGCTGC -/T TTTTTTTTTT 2278 het 2278 ref 25 10 8 7 T 10 11 344741 CASAVA_Build 9 81063156 4D CTACATAGTT AGAC/---- AGAGAATTAG 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 AGAC 1 0 344742 CASAVA_Build 9 81067047 2D GGAGGCAGAA GG/-- TATTGACTGA 3070 hom 141 het 51 0 46 5 G 2 0 344743 CASAVA_Build 9 81078528 2I GAAGAAAGAA --/AG AAAGAGAGAA 2961 hom 25 het 11 0 8 3 AG 0 1 344744 CASAVA_Build 9 81091832 1D CTGATCACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 A 10 9 344745 CASAVA_Build 9 81096315 2D GGCCAGGTGG GC/-- CAGTCCCAGT 3070 hom 147 het 53 0 48 7 GC 1 0 344746 CASAVA_Build 9 81103001 4D TGACCCCAGA AGTG/---- AGTAACTAAG 3070 het 3070 ref 42 20 18 7 AGTG 1 0 344747 CASAVA_Build 9 81106751 1D ATTCAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 241 hom 41 1 33 7 T 12 11 344748 CASAVA_Build 9 81106932 3D AGGAGGGAGG CAT/--- CAAGGAATCA 3070 het 3070 hom 44 14 21 9 CAT 1 0 344749 CASAVA_Build 9 81120732 1I CTGGATGGAA -/G GTTTCCTTTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 G 1 2 344750 CASAVA_Build 9 81128060 2I TAATATTTTA --/TT TTGTCTGTTC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 2 4 344751 CASAVA_Build 9 81128141 3D TCTGATTGCT CTA/--- CTATTTGGGG 3070 het 3070 hom 31 12 17 4 CTA 2 1 344752 CASAVA_Build 9 81128903 4I AACATTTATG ----/TTTA GCAGTTTGAC 3070 het 3070 hom 41 20 20 1 TTTA 0 1 344753 CASAVA_Build 9 81129143 1D TCCAAAAAAA T/- GTTATATTTA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 T 1 0 344754 CASAVA_Build 9 81140208 1I CTCTGATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 T 11 12 344755 CASAVA_Build 9 81145177 4I CATTGGTGCG ----/CTTT CTATTTTATG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 CTTT 0 1 344756 CASAVA_Build 9 81149501 1D GGTATTTTTT A/- AATAAGTTAT 3070 het 3070 ref 20 10 7 4 A 3 2 344757 CASAVA_Build 9 81173167 1D AAGCACTTCA T/- TAAGTTTGAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 2 1 344758 CASAVA_Build 9 81176388 1I ATTTTATTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 14 13 T 11 12 344759 CASAVA_Build 9 81180005 1D TGTCTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2081 hom 45 12 16 17 A 17 16 344760 CASAVA_Build 9 81180509 1I TAAAAACAAT -/A AAAAATTACA 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 A 5 6 344761 CASAVA_Build 9 81182936 4I GGTCTCCTTT ----/CAAA CAACTTCCAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 CAAA 0 1 344762 CASAVA_Build 9 81188155 3I CAAAATAATA ---/ATT ATTATTATTT 2231 het 1977 hom 14 6 6 2 ATT 3 4 344763 CASAVA_Build 9 81191920 19I ACTGTATATT -------------------/CTGATGAGTAAGTTGACTC CTTTTATAAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 CTGATGAGTAAGTTGACTC 0 1 344764 CASAVA_Build 9 81196921 1D AGTAGTATCC A/- GAATAAATAT 3070 het 3070 ref 45 24 17 5 A 1 0 344765 CASAVA_Build 9 81197943 2D TCTCAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 A 12 10 344766 CASAVA_Build 9 81260826 1D TTGTTTTACA T/- TTTTTTTTTT 1863 het 1863 ref 41 30 4 7 T 12 11 344767 CASAVA_Build 9 81270300 1D AGAGATAATA T/- TTTTTTTTTT 790 het 790 ref 44 29 4 11 T 13 12 344768 CASAVA_Build 9 81271258 1I GGAGATTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 9 15 3 T 9 10 344769 CASAVA_Build 9 81308330 1D ACCAGAGACC A/- AAAAAAAAAA 3027 het 3027 ref 35 16 9 10 A 15 14 344770 CASAVA_Build 9 81334669 1I TGTATTTTTT -/G TAGAGATGAG 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 G 0 1 344771 CASAVA_Build 9 81338434 1D AAGTAAACAT A/- AAATGCTTTG 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 4 3 344772 CASAVA_Build 9 81345413 1D ACTTAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2406 hom 24 6 14 4 A 12 11 344773 CASAVA_Build 9 81347987 1I AGCCAGCCAT -/G TGGTTGGGCC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 G 0 1 344774 CASAVA_Build 9 81383678 1D CAGATGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 14 13 344775 CASAVA_Build 9 81390398 1I AGAAATTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 T 11 12 344776 CASAVA_Build 9 81401366 4D CTTAATTGAG AGAC/---- AGAAAGAGCC 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 AGAC 1 0 344777 CASAVA_Build 9 81420378 1D TTTTAAACTT A/- AAAAAACTAT 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 7 6 344778 CASAVA_Build 9 81456837 6I GGTAGCATTT ------/CTTATA ATTGACTACA 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 CTTATA 0 1 344779 CASAVA_Build 9 81470473 1I TATCATCTGA -/T TTTTTTGGCA 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 6 7 344780 CASAVA_Build 9 81473483 1I TATAGCTAGC -/A AAATGGAAGT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 3 4 344781 CASAVA_Build 9 81474480 5D TGTGACCAAA TCTAG/----- GAAAGAATAG 3070 het 3070 hom 48 21 22 7 TCTAG 1 0 344782 CASAVA_Build 9 81475795 1D AATTTTGCCT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 9 8 344783 CASAVA_Build 9 81479055 10D AGATGAGGAA AGTGAGACAC/---------- AGTGAGACTA 3070 het 3070 ref 47 25 20 10 AGTGAGACAC 1 0 344784 CASAVA_Build 9 81489188 27D GCATGCATAC TCTATTGTGAACTGTGCAATGCAGGGA/--------------------------- TCTATTGTGA 3070 het 3070 ref 33 23 11 5 TCTATTGTGAACTGTGCAATGCAGGGA 2 1 344785 CASAVA_Build 9 81516067 4I AAATAGTTGT ----/TGAC TGACTAACAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TGAC 1 2 344786 CASAVA_Build 9 81530406 1D TGTTATTAGG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 8 7 344787 CASAVA_Build 9 81531278 4D GTGGTAGCAG AAAA/---- AAAAAAATGG 3070 hom 92 het 36 0 30 7 A 11 7 344788 CASAVA_Build 9 81535256 5D CTTACGAAGT AGTTA/----- AGTTGTTGAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AGTTA 1 0 344789 CASAVA_Build 9 81537640 1D ATACTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 44 3 28 14 A 15 14 344790 CASAVA_Build 9 81539574 3D AAAAGAGGGA CTC/--- CTCCTCCCTA 3070 het 929 hom 27 6 14 7 CTC 3 2 344791 CASAVA_Build 9 81542617 1I AGAAAGGACC -/A GGGAAATTGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 0 1 344792 CASAVA_Build 9 81547093 1I AGAAACAGTA -/G GGGGGGAAAA 3070 hom 72 het 28 0 23 5 G 6 7 344793 CASAVA_Build 9 81555196 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTGAC 3070 hom 6 het 29 1 22 6 T 7 8 344794 CASAVA_Build 9 81564146 1I TGAAGTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 25 1 23 1 T 10 11 344795 CASAVA_Build 9 81568283 1I ATCATAGTTC -/T TGACACACCT 3070 het 64 hom 40 1 36 3 T 1 2 344796 CASAVA_Build 9 81568364 2I TAATGTCATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 10 12 344797 CASAVA_Build 9 81571091 6I CTGGACGGTC ------/GTGTTT ATAGAGTACA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 GTGTTT 0 1 344798 CASAVA_Build 9 81580036 1I AAGTGGATTC -/A AAAGATTTCC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 3 4 344799 CASAVA_Build 9 81597300 3D ATAAAAAGGA ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ATT 4 3 344800 CASAVA_Build 9 81616387 1D TTTATGTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 10 9 344801 CASAVA_Build 9 81618271 1D TTTCCTCTAT C/- CCCTACGTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 C 4 3 344802 CASAVA_Build 9 81643965 1D TTGTTGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 11 10 344803 CASAVA_Build 9 81644705 4I TCTTTCAATA ----/AACC AATTGTTGGT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AACC 0 1 344804 CASAVA_Build 9 81645556 1D TTAAAATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 22 7 18 T 15 14 344805 CASAVA_Build 9 81653971 3I GTTCAGAACT ---/TTA TTAGTTCAGA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TTA 1 2 344806 CASAVA_Build 9 81664099 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 21 0 19 5 A 23 10 344807 CASAVA_Build 9 81680004 2D AGAGGCCCTC TG/-- TGTTACTTAA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 TG 2 1 344808 CASAVA_Build 9 81684761 5D TTAATTTAGA TATAC/----- TAAACTAGCT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TATAC 1 0 344809 CASAVA_Build 9 81693423 4D TCTCACTCTT AGTC/---- AGTGTACCAA 3070 het 3070 ref 46 24 21 2 AGTC 1 0 344810 CASAVA_Build 9 81694937 1I GCAAACGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 A 9 10 344811 CASAVA_Build 9 81703726 1D TGGCAAACAT C/- CCTAACCTCC 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 C 3 2 344812 CASAVA_Build 9 81708285 5I GACAAATACT -----/ATCAC TGTTGCCTGA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 ATCAC 0 1 344813 CASAVA_Build 9 81712099 4I AGCCCTCTAT ----/CTAA CTGCCTTCCT 3070 het 3070 hom 57 27 26 4 CTAA 0 1 344814 CASAVA_Build 9 81713009 6D TGAAAAACCA AAAATG/------ TATAATCTTG 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 AAAATG 1 0 344815 CASAVA_Build 9 81723450 1D ATAAGTTATT A/- TTTTTTTAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 1 0 344816 CASAVA_Build 9 81726299 1I TATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2177 het 1079 hom 28 4 13 11 A 15 16 344817 CASAVA_Build 9 81737605 10D AGACAGGTTT TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 47 23 17 8 TTTTG 4 2 344818 CASAVA_Build 9 81750519 1I TGTGAACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 9 10 344819 CASAVA_Build 9 81761164 1D TCTACCTTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 9 8 344820 CASAVA_Build 9 81767594 1I TTTACAGATT -/G GGTGCTGACA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 G 2 3 344821 CASAVA_Build 9 81771905 2D GGAAATTAAA CT/-- CTAAGTAATA 3070 het 3070 ref 37 18 18 2 CT 2 1 344822 CASAVA_Build 9 81799794 1D GGGTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 T 14 13 344823 CASAVA_Build 9 81805890 1I CCAAACTGTT -/C CCCCCCCTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 7 8 344824 CASAVA_Build 9 81840892 2I CCTCTACCAT --/GC CCATTGCAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 GC 0 1 344825 CASAVA_Build 9 81843260 1I GCCAGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 14 0 12 2 T 10 11 344826 CASAVA_Build 9 81858166 1D ACATGTAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 378 hom 25 1 19 5 T 13 12 344827 CASAVA_Build 9 81861882 1D ATTCAGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 30 2 17 12 A 13 12 344828 CASAVA_Build 9 81862382 1D TGAGTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 35 0 28 7 A 12 11 344829 CASAVA_Build 9 81863176 1D CACACACAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 10 9 344830 CASAVA_Build 9 81870728 1I TCATTTTGCA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 7 8 344831 CASAVA_Build 9 81884348 1D GGAACCAGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 10 9 344832 CASAVA_Build 9 81884484 1D AAAGTTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2279 hom 29 8 13 8 A 13 12 344833 CASAVA_Build 9 81945021 1D CCTCTTGTAT C/- CCCCCCACCT 1742 hom 15 het 6 0 6 0 C 7 6 344834 CASAVA_Build 9 82015270 1I ATGAAAGTTA -/T TCCATAAAAT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 1 2 344835 CASAVA_Build 9 82034087 8D TGGATCTTGT TTTTTTTG/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 8 TTTTTTTG 1 0 344836 CASAVA_Build 9 82034538 4I GGGATCCCTT ----/TGTA TGTGATCTTA 3070 hom 64 het 27 0 21 6 TGTA 0 1 344837 CASAVA_Build 9 82035003 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1437 het 63 hom 12 1 8 3 T 21 20 344838 CASAVA_Build 9 82037650 1I GTATGGCTGA -/T TTTGTATGAA 3070 hom 129 het 51 0 42 9 T 3 4 344839 CASAVA_Build 9 82043505 1I CAGAGTAAGA -/C CCCCCCCTCC 3070 hom 59 het 23 0 19 4 C 7 8 344840 CASAVA_Build 9 82048185 1D GCAACTGTGA C/- TATTTTTAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 1 0 344841 CASAVA_Build 9 82064743 4D AAATGATGAC AGAA/---- AGAGAGAAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 7 AGAA 1 0 344842 CASAVA_Build 9 82066266 1I GCACTTCAAG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 8 9 344843 CASAVA_Build 9 82069116 6D CCAAATAATA CTAATT/------ CTAACAGAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 CTAATT 1 0 344844 CASAVA_Build 9 82092619 1D AACTCTTTAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 30 het 43 1 36 6 A 9 8 344845 CASAVA_Build 9 82113461 1D36M1I AAACAGCAGC AAAATTGAATTAGCTTGGCATAAAGTTTAATTGCCTG-/-AAATTGAATTAGCTTGGCATAAAGTTTAATTGCCTGA AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 27 8 8 N/A 0 0 344846 CASAVA_Build 9 82113635 3D TGTCTGGGAA TCT/--- TCTTTTTGAT 3070 het 3070 ref 46 24 9 15 TCT 2 1 344847 CASAVA_Build 9 82114020 1I TACACACTTA -/G GGGAAACAAC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 G 3 4 344848 CASAVA_Build 9 82116015 4D TATAAATGTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2647 hom 28 8 14 6 A 14 10 344849 CASAVA_Build 9 82117311 1D AGGTCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 A 12 11 344850 CASAVA_Build 9 82117661 15D TATCACTTCA TCTTTTTTTTTTTCT/--------------- TCTTTTTTTT 3070 het 129 hom 22 1 10 14 TCTTTTTTTTTTTCT 1 0 344851 CASAVA_Build 9 82123819 4I TCTAAGCAAG ----/GAGA GAGGCTTTTT 3070 hom 122 het 46 0 37 9 GA 1 3 344852 CASAVA_Build 9 82124781 1I TGCTGAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 10 11 344853 CASAVA_Build 9 82126226 3D TTCAGAATGA AGC/--- AGCAGGACTA 3070 hom 72 het 34 0 25 11 AGC 2 1 344854 CASAVA_Build 9 82130560 1D TGGGGATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 55 0 38 17 T 11 10 344855 CASAVA_Build 9 82132349 3D TTGCAAAAAA AAG/--- AAGAGTGAAC 3070 het 3070 ref 45 22 20 4 AAG 2 1 344856 CASAVA_Build 9 82138672 5D AAACAAAACG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 hom 99 het 41 0 34 9 AAACA 4 3 344857 CASAVA_Build 9 82139958 3I ATATTGCTAG ---/AAC AACTGAATAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAC 1 2 344858 CASAVA_Build 9 82140277 5D TGGCAAAAGA CCTAT/----- CTGATAAATG 3070 het 3070 hom 26 9 15 6 CCTAT 1 0 344859 CASAVA_Build 9 82146231 1I ATAAAGAGAG -/T TCTTCAATCT 3070 het 3070 ref 48 31 14 3 T 1 2 344860 CASAVA_Build 9 82147736 1D TTAGTAGGAG C/- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 C 1 0 344861 CASAVA_Build 9 82148938 5I GAAAAAGAAA -----/TAAAG TAAATAGTCC 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 TAAAG 0 1 344862 CASAVA_Build 9 82149204 1I ACATAAATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 9 10 344863 CASAVA_Build 9 82151007 2D GTATAATAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2301 hom 24 5 17 2 A 13 11 344864 CASAVA_Build 9 82151230 1D AAATACTTGC A/- AACTACGCAT 3070 het 3070 ref 20 11 8 2 A 3 2 344865 CASAVA_Build 9 82158092 4D TTATAGGTAT TTAC/---- TTCATAAAAG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 TTAC 1 0 344866 CASAVA_Build 9 82158583 5D TATTTATCTC TCTAA/----- TCTATCTATC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TCTAA 1 0 344867 CASAVA_Build 9 82171018 1I GGCTTTAGGG -/T GTTTAAGAGT 3070 hom 151 het 53 0 51 2 T 0 1 344868 CASAVA_Build 9 82177255 3D CCCTGTCATC CTT/--- CTCGGCTGAC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 CTT 1 0 344869 CASAVA_Build 9 82179602 1D TTTTTCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 29 1 24 4 T 11 10 344870 CASAVA_Build 9 82180645 1D CTCATTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 44 1 33 10 T 13 12 344871 CASAVA_Build 9 82185511 1D AAATGCAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 10 9 344872 CASAVA_Build 9 82188405 2I ACTGAGAAAA --/CT CTGATTATCC 3070 hom 120 het 46 0 40 6 CT 1 2 344873 CASAVA_Build 9 82188649 6D TGAGAAAGTA TAGAAG/------ TAGAAGAGAT 3070 hom 114 het 43 0 39 7 TAGAAG 2 1 344874 CASAVA_Build 9 82189269 1D AATATATAAC A/- AAAAAGAAAG 3070 het 234 hom 33 1 29 3 A 6 5 344875 CASAVA_Build 9 82207677 2D ATGTGTTCTC AT/-- GTGGGGAGGG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AT 1 0 344876 CASAVA_Build 9 82215585 4D AGAATGAAGT AAAG/---- AAAGATAGTG 3070 hom 123 het 47 0 42 9 AAAG 2 1 344877 CASAVA_Build 9 82217748 2I GTTTGCCAAC --/AG AGTTATTTGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AG 1 2 344878 CASAVA_Build 9 82240027 1I TGTAGCACAG -/T TTTTTTTAGG 3070 het 3070 hom 44 13 26 5 T 7 8 344879 CASAVA_Build 9 82246399 1D TCTTCATACC G/- AATTTTAATA 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 G 1 0 344880 CASAVA_Build 9 82247254 13D TAGCAGCATT GACTAGAGTGGCC/------------- GTTCAGTGCT 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 GACTAGAGTGGCC 1 0 344881 CASAVA_Build 9 82250599 1I ACTAGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 1772 het 1772 ref 41 25 4 12 T 13 14 344882 CASAVA_Build 9 82261051 1I TGGCTTCAGG -/A AAAAAATTAG 3070 hom 92 het 36 0 30 6 A 6 7 344883 CASAVA_Build 9 82262532 2D GACACAGGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 50 hom 27 2 15 10 T 16 14 344884 CASAVA_Build 9 82273497 1I TATTTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 T 10 11 344885 CASAVA_Build 9 82276181 1I AAAAATAAGC -/A AATAAAGGAA 3070 hom 157 het 58 0 53 5 A 2 3 344886 CASAVA_Build 9 82285230 2I TCAGAGTTAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 GT 6 7 344887 CASAVA_Build 9 82289331 1D AACTTTTGCC A/- GAATTAATAT 3070 het 3070 hom 46 9 25 13 A 1 0 344888 CASAVA_Build 9 82295339 2I GGAACCCCCA --/TG TGTACCCCTA 3070 het 3070 ref 55 27 23 5 TG 1 2 344889 CASAVA_Build 9 82295995 1D CATGATCTTA T/- TTTTTGACAA 3070 hom 138 het 51 0 45 6 T 6 5 344890 CASAVA_Build 9 82301519 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 29 2 16 11 T 15 13 344891 CASAVA_Build 9 82304897 1D TCATAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 11 10 344892 CASAVA_Build 9 82307076 1I ACACACAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 10 11 344893 CASAVA_Build 9 82309487 2D GGCGAGACAC AT/-- GTGTGGCCTC 3070 hom 120 het 46 0 41 7 AT 1 0 344894 CASAVA_Build 9 82322549 1I GCCGTTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 36 0 28 8 T 10 11 344895 CASAVA_Build 9 82326400 2D TTAGATTGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 29 1 17 13 T 18 16 344896 CASAVA_Build 9 82334538 1D ATACAAAATC A/- ATGTGCAAAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 2 1 344897 CASAVA_Build 9 82335772 1I CAAATGGGAG -/A AATTGGCCAA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 2 3 344898 CASAVA_Build 9 82337416 1D TCTGAAACTG T/- TCCAATCAAT 3070 hom 24 het 9 0 8 1 T 2 1 344899 CASAVA_Build 9 82341756 1I GTAGAGGGCC -/A GGGGGAGGGA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 0 1 344900 CASAVA_Build 9 82343056 4I AATATTATAT ----/TATA TATGATATGC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TA 1 3 344901 CASAVA_Build 9 82343401 1D ATTAGATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 11 10 344902 CASAVA_Build 9 82343772 1D AGATCCAAAC A/- GGGAACAATA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 1 0 344903 CASAVA_Build 9 82343908 1I TGTGCTTTAA -/G TTTTCCTGAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 0 1 344904 CASAVA_Build 9 82346134 3I ACTGTATCTC ---/CTT CACAGAAGGA 3070 hom 105 het 39 0 35 4 CTT 0 1 344905 CASAVA_Build 9 82351532 2I AATAAAATTT --/AA AAAAAAAGTC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 7 9 344906 CASAVA_Build 9 82351679 2D AATTATTTTG TT/-- TTTTTTTAAT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 9 7 344907 CASAVA_Build 9 82352690 2I AGTACAAAAC --/AT GTGCAAATCT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 AT 0 1 344908 CASAVA_Build 9 82353021 1I TATAGCAATG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 8 9 344909 CASAVA_Build 9 82375530 1D TTACATGGAA C/- TCCACATTTT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 C 1 0 344910 CASAVA_Build 9 82377306 1D ACCATGTGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 10 9 344911 CASAVA_Build 9 82380712 1D CATGGTGAAA C/- CCCATCTCTA 1903 het 1903 ref 17 9 6 2 C 4 3 344912 CASAVA_Build 9 82388729 1I CTGCATAAAA -/G TTTGTCCTAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 0 1 344913 CASAVA_Build 9 82391906 1D AGAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 12 11 344914 CASAVA_Build 9 82394637 4I ATTCAAAAGG ----/AACA AACAGCACAT 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 AACA 1 2 344915 CASAVA_Build 9 82400307 1D ACTATAAGAT A/- ATATGAAACA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 2 1 344916 CASAVA_Build 9 82405410 4D CCATCAATAG AAAT/---- AAATTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 AAAT 2 1 344917 CASAVA_Build 9 82405917 1D ATAGACATAA T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 51 19 22 11 T 7 6 344918 CASAVA_Build 9 82406290 4D TCATCCTGTT ACAC/---- ACAGATGCTT 3070 het 3070 hom 50 17 27 7 AC 3 1 344919 CASAVA_Build 9 82408295 3D ATTAATGTAG GTA/--- GTTCTTACAG 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 GTA 1 0 344920 CASAVA_Build 9 82408423 1I CTCTTTATAA -/G GCCTCTTCAC 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 G 1 2 344921 CASAVA_Build 9 82418707 1I CTATTATGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 A 9 10 344922 CASAVA_Build 9 82422408 4I CTAGTCATTT ----/TTTG TTCTCTTGTT 3070 het 3070 hom 38 12 24 2 TTTG 0 1 344923 CASAVA_Build 9 82433068 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2139 hom 24 8 9 7 A 15 16 344924 CASAVA_Build 9 82439104 1I AAAGTTACTG -/T TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 46 26 12 8 T 7 8 344925 CASAVA_Build 9 82439756 1D CCTACACCAA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 T 7 6 344926 CASAVA_Build 9 82441534 1D TTTCAGTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 11 10 344927 CASAVA_Build 9 82448041 4I TAATTTTAAC ----/TATA TATATATATA 3070 het 2845 hom 18 6 8 4 TA 7 9 344928 CASAVA_Build 9 82453514 1I AGAGAAAAGG -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 7 8 344929 CASAVA_Build 9 82465881 1I GATTTGTTGA -/T TTTTTTTGAA 2295 het 1926 hom 10 5 5 0 T 7 8 344930 CASAVA_Build 9 82470236 2I ATTTTTTTTT --/TA ATCTAACTGT 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 TA 0 1 344931 CASAVA_Build 9 82470300 1D14M1I GTGTCACTCA CCCCTAGCAGTCTCT-/-CCCTAGCAGTCTCTG GTTATCTTTC 3070 het 3070 ref 33 23 11 2 N/A 0 0 344932 CASAVA_Build 9 82470392 1D CAATATTTTT G/- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 G 1 0 344933 CASAVA_Build 9 82470800 2D ACATCTATCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 664 hom 44 7 20 17 T 12 10 344934 CASAVA_Build 9 82471331 2D GGCGAGAGAC AG/-- GGGTCCAGTT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 AG 1 0 344935 CASAVA_Build 9 82480888 5D TATTAATTAA AACTT/----- AACTTCCTTC 3070 het 3070 ref 43 26 15 4 AACTT 2 1 344936 CASAVA_Build 9 82481970 5D ACTCCATCTG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1087 hom 25 8 12 6 A 21 16 344937 CASAVA_Build 9 82488765 1D TACTCATGAA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 T 8 7 344938 CASAVA_Build 9 82489031 3D TATAATTTTA CTT/--- CTTTCTTTAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 4 CTT 2 1 344939 CASAVA_Build 9 82490199 1I AGCTATTATG -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 6 7 344940 CASAVA_Build 9 82491710 4I GACACAAATT ----/ACTA ACATCAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 ACTA 0 1 344941 CASAVA_Build 9 82492633 1D TGCTATATAT C/- ATTCAAAATT 3070 het 3070 ref 46 22 22 2 C 1 0 344942 CASAVA_Build 9 82494022 1D ATGCTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 11 10 344943 CASAVA_Build 9 82500503 4D GCTACTTGCA TTAT/---- TTATTAGAAA 3070 het 3070 ref 35 17 17 1 TTAT 2 1 344944 CASAVA_Build 9 82502134 5I ACCTTGCAAA -----/TGAAT TAGAATGACC 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 TGAAT 0 1 344945 CASAVA_Build 9 82505875 1D AGTTCCTACC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 T 9 8 344946 CASAVA_Build 9 82509020 1D AACATTTTAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 8 7 344947 CASAVA_Build 9 82510350 4I11M1D TTGGCATAAA ----ACCATTGTGATA/ATATAAGGTAGTGAT- ACACCCTCCC 3070 het 3070 hom 36 14 23 1 N/A 0 0 344948 CASAVA_Build 9 82512133 1D GTTCTTGTTC A/- AAAAATTTAT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 6 5 344949 CASAVA_Build 9 82517123 1I TCTCTTTTAT -/A AATTACCCAG 2817 het 2817 ref 24 13 7 4 A 2 3 344950 CASAVA_Build 9 82523079 2I GCACGCGCGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 40 17 11 12 GT 7 8 344951 CASAVA_Build 9 82533466 1D GAGAAGCCAT A/- AAAATGCAGT 3070 het 3070 hom 35 15 15 7 A 5 4 344952 CASAVA_Build 9 82537492 9I GACTTGGAGT ---------/TTCACTAAA TTCAGAGTCT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TTCACTAAA 0 1 344953 CASAVA_Build 9 82542925 1D CAAGTCATGC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 9 8 344954 CASAVA_Build 9 82581703 1I ACAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2270 hom 23 6 12 5 A 11 12 344955 CASAVA_Build 9 82603425 3I TGGAAAGGAG ---/AGA AGGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 AGA 0 1 344956 CASAVA_Build 9 82614459 4D TCTCAAAAAA TAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 TAAT 1 0 344957 CASAVA_Build 9 82617092 5I TTTTTTACTT -----/ATCTC ATCTTATAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 ATCTC 0 1 344958 CASAVA_Build 9 82618093 5I ATGCTAACAT -----/ATAAC AGAAGGAACT 3070 het 3070 ref 65 29 28 8 ATAAC 0 1 344959 CASAVA_Build 9 82628901 1D TGAAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 858 het 327 hom 16 5 3 8 T 17 16 344960 CASAVA_Build 9 82630800 1D GATTATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 A 11 10 344961 CASAVA_Build 9 82650448 1I GTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 3022 hom 28 11 12 5 G 0 1 344962 CASAVA_Build 9 82655473 4I AAGGACCAAG ----/CTTA CTTTTCTGAA 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 CTTA 0 1 344963 CASAVA_Build 9 82667761 1I CATTATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 T 11 12 344964 CASAVA_Build 9 82668713 4D GTATATCACA GTTT/---- GTTTATCTGT 3070 het 3070 hom 39 13 17 11 GTTT 2 1 344965 CASAVA_Build 9 82669605 3D TTCTTTTTCT TTC/--- TTCTTTCTTT 1809 het 1809 ref 34 18 7 10 TTC 2 1 344966 CASAVA_Build 9 82671652 2D GACAATCCAA TC/-- TCTCTACACA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TC 3 2 344967 CASAVA_Build 9 82671914 5I GTGATACTTA -----/TCTTT TCAAGTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 TCTTT 0 1 344968 CASAVA_Build 9 82672898 4D CTTTCAAGGC TTCT/---- TTTTGACCTT 3070 het 3070 ref 37 20 17 2 TTCT 1 0 344969 CASAVA_Build 9 82674084 4I CTGAAGGTAC ----/TATT TATTTGTTAT 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 TATT 1 2 344970 CASAVA_Build 9 82680967 3I CCAGGTGAGA ---/AAT AATAATGGCT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 AAT 2 3 344971 CASAVA_Build 9 82690428 1I AGCATTAACC -/A AGGCTGTACT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 1 2 344972 CASAVA_Build 9 82691116 1I ACTGTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 13 9 A 12 13 344973 CASAVA_Build 9 82693911 1I AAAATGTTTT -/A AAAAGCAACA 3070 het 3070 ref 39 17 14 8 A 4 5 344974 CASAVA_Build 9 82695748 1D GAAAACAAAA T/- CATACAGGAT 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 T 1 0 344975 CASAVA_Build 9 82699554 1I TGTACACTGG -/A AACTATACAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 3 344976 CASAVA_Build 9 82704592 1D CAGTTTTAAA C/- AAGGTCTATC 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 C 1 0 344977 CASAVA_Build 9 82708535 1I ATCAGAGATG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 21 11 7 A 8 9 344978 CASAVA_Build 9 82716911 2D TACACGTGTG TA/-- TATATATACG 3070 het 2287 hom 31 8 19 4 TA 5 4 344979 CASAVA_Build 9 82723816 1D CATAAGAAGC A/- AACTCCTCAT 3070 hom 36 het 17 0 11 6 A 3 2 344980 CASAVA_Build 9 82733388 1D AATAGCAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 10 9 344981 CASAVA_Build 9 82735610 1D ACACATATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 8 A 12 11 344982 CASAVA_Build 9 82736611 4D CAGAGCTTGT AGTG/---- AGTGAGCCGA 1983 het 1983 ref 13 8 5 0 AGTG 2 1 344983 CASAVA_Build 9 82742069 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 35 0 25 10 A 12 11 344984 CASAVA_Build 9 82745105 4D TTGAAATTAT CAGA/---- CAGAGAATTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CAGA 2 1 344985 CASAVA_Build 9 82745598 1D AATTAATAGG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 8 7 344986 CASAVA_Build 9 82748388 1D TTTCCATTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 9 8 344987 CASAVA_Build 9 82749259 1D ATGTAGAATG A/- AAAAAAAAAA 1950 het 1950 ref 43 29 5 9 A 12 11 344988 CASAVA_Build 9 82755431 7D ATCCTTCATC CAAAAAT/------- CAAAAATCAA 3070 het 2774 hom 27 7 11 10 CAAAAAT 3 2 344989 CASAVA_Build 9 82757188 4D GGAAAATAAC TGAT/---- TGAGTCAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 TGAT 1 0 344990 CASAVA_Build 9 82760821 1I AATATTTTTT -/A AGCAGCCTTG 3070 het 3070 ref 52 26 24 2 A 1 2 344991 CASAVA_Build 9 82773175 2D ATTTACATAT AC/-- ACACTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 13 2 AC 3 2 344992 CASAVA_Build 9 82775776 17D CAATGCCAGC CCATAAAAGCAGCCAGG/----------------- CCATAAAAGC 3070 hom 35 het 15 0 11 9 CCATAAAAGCAGCCAGG 2 1 344993 CASAVA_Build 9 82777838 4I AAAATTGATC ----/CTCT CTCTATCTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CT 2 4 344994 CASAVA_Build 9 82782577 1D CAAATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 24 5 11 8 T 13 12 344995 CASAVA_Build 9 82786546 2D ATTTCATCAC AT/-- GTTTATGTAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 AT 1 0 344996 CASAVA_Build 9 82793789 2D TGTCATTTAA AT/-- ATATTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 AT 3 2 344997 CASAVA_Build 9 82795373 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 566 hom 29 5 13 11 A 18 17 344998 CASAVA_Build 9 82801182 1D GTTGTTCTAC A/- AAATTTAGGA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 4 3 344999 CASAVA_Build 9 82801277 4D TTTATGTCTC TGTT/---- TGTTGCATTA 3070 het 3070 ref 38 20 15 5 TGTT 2 1 345000 CASAVA_Build 9 82804216 2D TCTGATGTTT AA/-- AAGTTAATAA 3070 het 3070 hom 39 17 20 4 A 4 2 345001 CASAVA_Build 9 82804349 4D ACAATGCAAT TGAG/---- TAAGAATTAT 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 TGAG 1 0 345002 CASAVA_Build 9 82804546 5D TAGTAGGATG TCTTT/----- TCTAACTCTT 3070 het 3070 hom 51 26 25 0 TCTTT 1 0 345003 CASAVA_Build 9 82808815 1I TGTTAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 11 12 345004 CASAVA_Build 9 82810725 4D TAGTGAAATT ATCC/---- ATCAAAAGTA 3070 het 3070 hom 40 18 18 8 ATCC 1 0 345005 CASAVA_Build 9 82811190 3I AATATGCCAT ---/GAA GAAGATATAA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 GAA 1 2 345006 CASAVA_Build 9 82813444 3I AACATAAAAC ---/AGA AGAAGAAGAG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 AGA 3 4 345007 CASAVA_Build 9 82816173 1I AAGGCTCTCT -/C GACTGACTCC 2283 het 1565 hom 11 5 5 1 C 0 1 345008 CASAVA_Build 9 82821830 8D CTGGCTTGGC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 het 2202 hom 45 13 22 12 A 19 11 345009 CASAVA_Build 9 82823790 1D TCTAATAAAA T/- TTTTTTTCTA 1900 het 1900 ref 22 14 5 4 T 8 7 345010 CASAVA_Build 9 82826296 13D3M19D TTAAGAAAAA ATATAAAAATTTGAGGCATCACTGAATATTTTATC/-------------AGG------------------- AGGGTTCATT 3070 het 3070 ref 41 32 15 5 N/A 0 0 345011 CASAVA_Build 9 82827017 1D CACCAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 61 23 22 16 T 11 10 345012 CASAVA_Build 9 82827677 1D AGGTCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 T 12 11 345013 CASAVA_Build 9 82835137 2D CATTTTACTC AG/-- ACTTAAAATG 3070 het 3070 ref 47 23 19 6 AG 1 0 345014 CASAVA_Build 9 82835643 1I AGACCTACCC -/G GGTGGATAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 2 3 345015 CASAVA_Build 9 82837005 1D TCTGAACTTT G/- AGTCTTTACT 3070 het 3070 ref 51 27 21 4 G 1 0 345016 CASAVA_Build 9 82840986 8D CACATATATA TGTATGTG/-------- TGTATGTGTG 3070 het 3070 hom 37 18 13 10 TGTATGTG 2 1 345017 CASAVA_Build 9 82843313 14D CATGAAGGCT AAGTGACTGTCCTA/-------------- AAGTCACAAA 3070 het 3070 ref 37 21 15 5 AAGTGACTGTCCTA 1 0 345018 CASAVA_Build 9 82854030 1D CACTACACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 A 14 13 345019 CASAVA_Build 9 82867180 4I CCAGCCATGC ----/TTAA TTAACTGTGA 3070 het 3070 ref 47 21 18 8 TTAA 1 2 345020 CASAVA_Build 9 82868049 7D TCAGAGGCTG CAAGCCC/------- CAAGCCTTGG 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 CAAGCCC 1 0 345021 CASAVA_Build 9 82870207 1D TTGAATTCAG T/- TTGATAGTAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 3 2 345022 CASAVA_Build 9 82887765 1I TCTAAGCCTC -/T TTTTACTATG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 4 5 345023 CASAVA_Build 9 82888746 1I TTTCCTAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 96 hom 40 1 32 7 T 10 11 345024 CASAVA_Build 9 82894793 1I AGAGAAGGAG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 8 9 345025 CASAVA_Build 9 82909054 1I TATAGTGTAG -/A AAAAAAAATA 2729 het 2729 ref 23 13 7 3 A 8 9 345026 CASAVA_Build 9 82916698 2D CTCTCGATGT TC/-- TCTAATACCA 3070 het 3070 ref 48 30 14 5 TC 2 1 345027 CASAVA_Build 9 82919811 1I CTTTTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 11 345028 CASAVA_Build 9 82921593 1D CTGTTGTCCA T/- TTTTTCTGCC 3070 hom 84 het 38 0 29 9 T 6 5 345029 CASAVA_Build 9 82923024 4I AGAGCATGAC ----/AAAT AAGTTGATTA 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 AAAT 0 1 345030 CASAVA_Build 9 82936095 1I TTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2802 hom 25 9 14 2 A 11 12 345031 CASAVA_Build 9 82942614 1D TTTAATTTTT A/- TATTTTCTAG 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 A 1 0 345032 CASAVA_Build 9 82956554 2D GCTATATTGC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 11 het 31 1 18 12 A 11 9 345033 CASAVA_Build 9 82960086 3D CTTGGGAGGC TAT/--- TATTCTGCCT 3070 het 3070 ref 43 22 17 6 TAT 2 1 345034 CASAVA_Build 9 82963426 1I ATGTTCTTCC -/T GGGTGCTGGG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 0 1 345035 CASAVA_Build 9 83035653 1D GCCAAAACGA T/- TCTGCTTAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 2 1 345036 CASAVA_Build 9 83040254 1I TAGGTCCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 A 12 13 345037 CASAVA_Build 9 83048183 1D AGGCAATTAT A/- AATGAAAAGC 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 A 3 2 345038 CASAVA_Build 9 83050970 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 2269 hom 17 6 9 2 CT 2 1 345039 CASAVA_Build 9 83073405 1D CCTTTTCACA T/- TTTTTTCTGC 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 T 7 6 345040 CASAVA_Build 9 83080193 1I TTTTAAAAAG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 T 8 9 345041 CASAVA_Build 9 83104937 1D ACCGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2720 het 190 hom 32 3 19 10 T 19 18 345042 CASAVA_Build 9 83106208 1I TACATTAAAT -/A ACTGATTTCA 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 A 1 2 345043 CASAVA_Build 9 83107520 58D TAGGTACCCA ATCCTATTCACACTATTGCAAAAGACAGAGAAAGAAGGAATCCTCCCTAAATTATTAT/---------------------------------------------------------- ATGAAGCCAG 2058 het 2058 ref 31 35 5 3 ATCCTATTCACACTATTGCAAAAGACAGAGAAAGAAGGAATCCTCCCTAAATTATTAT 1 0 345044 CASAVA_Build 9 83110509 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 A 11 10 345045 CASAVA_Build 9 83111160 1D TTGAGAGGCC G/- AGGAGAGCAG 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 G 1 0 345046 CASAVA_Build 9 83137014 1D ACTCGGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1764 het 1764 ref 32 20 6 6 A 17 16 345047 CASAVA_Build 9 83154297 1I TTTTTTTTTT -/G ATTCAATCTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 G 0 1 345048 CASAVA_Build 9 83178601 3I AGGTGAAGCA ---/TGC CCACGATCCT 3070 het 3070 hom 54 23 20 11 TGC 0 1 345049 CASAVA_Build 9 83189188 1I TAGTGCTTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 10 345050 CASAVA_Build 9 83201213 1D CTCTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 18 5 T 12 11 345051 CASAVA_Build 9 83205855 1D AATCATGCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2120 hom 21 7 10 4 T 10 9 345052 CASAVA_Build 9 83208964 4D TCAATGCTGA TTAT/---- TTATTTAAGG 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 TTAT 2 1 345053 CASAVA_Build 9 83211329 2D CCTTATAATT TA/-- TATATATATA 3070 het 2906 hom 23 8 10 7 TA 7 6 345054 CASAVA_Build 9 83212202 4I TGAGGAACAT ----/AATC AATAAACTAG 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 AATC 0 1 345055 CASAVA_Build 9 83222265 1D AGTTACAACC T/- TTTTTTTTTT 1414 het 1414 ref 42 31 4 7 T 12 11 345056 CASAVA_Build 9 83296461 1D ATATTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 9 T 11 10 345057 CASAVA_Build 9 83313705 2I TGAAAATGAA --/AG AGGGGGAGGA 3070 hom 66 het 26 0 17 9 AG 1 2 345058 CASAVA_Build 9 83316834 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 het 2724 hom 18 7 10 2 A 9 8 345059 CASAVA_Build 9 83323864 1I CAGGACAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2287 hom 19 7 8 4 T 11 12 345060 CASAVA_Build 9 83325471 1D AGCTAATTTG A/- AAAAAAAAAA 2187 het 2187 ref 34 19 6 9 A 14 13 345061 CASAVA_Build 9 83327909 4D ACCATGACAG TAGA/---- TAGAGATAGA 3070 het 3070 ref 54 27 23 5 TAGA 2 1 345062 CASAVA_Build 9 83333066 4D GGAAGATGAC AGAG/---- AGCAGGTTTC 3070 het 3070 ref 31 16 14 5 AG 3 1 345063 CASAVA_Build 9 83338643 1I ACAAAAAGGA -/T TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 T 6 7 345064 CASAVA_Build 9 83340226 1D TGTTTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 13 12 345065 CASAVA_Build 9 83340751 2D TTATTGTGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1789 hom 29 8 16 5 A 14 12 345066 CASAVA_Build 9 83344899 1D CCTCTCATGT G/- GGGGGTCTCT 2504 het 2504 ref 20 12 6 2 G 6 5 345067 CASAVA_Build 9 83347262 1D TAAAAAAAAA T/- TATACTGTCC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 T 2 1 345068 CASAVA_Build 9 83357967 1D TTTAAGTCAT G/- GGGTGGGAAT 3070 het 2869 hom 31 9 17 5 G 4 3 345069 CASAVA_Build 9 83362200 1D ACTCAACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3066 hom 38 13 17 8 A 11 10 345070 CASAVA_Build 9 83378385 14D GTCAGCTGCT GGCTGTCAGCGGCC/-------------- GGCTGTCAGC 3070 hom 98 het 38 0 33 10 GGCTGTCAGCGGCC 2 1 345071 CASAVA_Build 9 83394903 7D AGCTCTGGTG TGAGCAC/------- TGACTTCTGA 3070 het 3070 hom 36 16 19 5 TGAGCAC 1 0 345072 CASAVA_Build 9 83399087 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 1812 hom 20 5 13 2 A 8 7 345073 CASAVA_Build 9 83411796 1I CAGTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 1016 het 1016 ref 35 21 5 9 A 15 16 345074 CASAVA_Build 9 83420448 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1125 het 238 hom 9 3 4 2 A 17 16 345075 CASAVA_Build 9 83423723 1D CAGACAAACC T/- AGTACATGCA 3070 het 3070 hom 50 19 28 3 T 1 0 345076 CASAVA_Build 9 83430328 2D ATTATGAAAC CA/-- CATACCTTCA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 CA 2 1 345077 CASAVA_Build 9 83432054 1I GTTCTCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 12 7 T 12 13 345078 CASAVA_Build 9 83436870 2I TGGCAAAACA --/AT ATAAGGCTTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 AT 1 2 345079 CASAVA_Build 9 83445132 1D TTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 A 15 14 345080 CASAVA_Build 9 83446832 1I GACAAAGATA -/T GTGTTAGTGA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 T 0 1 345081 CASAVA_Build 9 83465077 1I GGCTGTTCAC -/A AAAAAAAAAA 2615 het 2427 hom 23 9 7 7 A 13 14 345082 CASAVA_Build 9 83468085 5I TCATAGAGCA -----/AGATT AGAAGCCACA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AGATT 0 1 345083 CASAVA_Build 9 83469445 1I TTTAATTAAG -/A AAAAAAAAAA 2937 het 2937 ref 38 18 9 11 A 11 12 345084 CASAVA_Build 9 83470598 1I GCTGCCCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 928 hom 23 3 12 8 T 13 14 345085 CASAVA_Build 9 83480066 4D AAAGACTAAG TAAA/---- TAATCAGTGG 3070 hom 114 het 41 0 39 3 TAAA 1 0 345086 CASAVA_Build 9 83483116 1I GCCCAATTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 345087 CASAVA_Build 9 83484040 1D TTTTCTTCAC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 87 het 30 0 30 1 T 8 7 345088 CASAVA_Build 9 83486287 5D TCCGTCGCGC AAAAA/----- AAAAAAAGAA 3070 hom 81 het 29 0 26 6 A 12 7 345089 CASAVA_Build 9 83499696 1I TGTTTACATC -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 7 8 345090 CASAVA_Build 9 83509557 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1378 het 1378 ref 26 21 4 2 A 13 12 345091 CASAVA_Build 9 83519774 1D GAGAAACCAT A/- AAATAACAGA 3070 hom 51 het 20 0 17 4 A 4 3 345092 CASAVA_Build 9 83530286 1D AAACCATAGA T/- TTTTTTTTTC 2614 het 2200 hom 22 7 10 5 T 10 9 345093 CASAVA_Build 9 83539604 1D AAGGAAAAAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 28 0 26 9 A 9 8 345094 CASAVA_Build 9 83553328 8D TTAATTTGAC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 29 1 18 11 T 20 12 345095 CASAVA_Build 9 83553934 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 17 1 11 5 T 13 14 345096 CASAVA_Build 9 83554398 4D TTCTTTTCTT TCTC/---- TCTCTCTTTC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TC 5 3 345097 CASAVA_Build 9 83563158 1D GAAATGCACC A/- AATGTCCATT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 A 3 2 345098 CASAVA_Build 9 83565061 1I TCTTTTTTTT -/C TTTTTTTTTG 2478 het 378 hom 20 5 8 7 C 0 1 345099 CASAVA_Build 9 83570400 1I ACCAGAGGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 9 10 345100 CASAVA_Build 9 83580588 4I CTCCTCCTTC ----/TCCT CCTACTTCTT 3070 hom 79 het 31 0 25 6 TCCT 0 1 345101 CASAVA_Build 9 83583628 1D CTAAAAAGCA T/- TTTTTTTTTT 2659 het 2659 ref 25 12 7 6 T 12 11 345102 CASAVA_Build 9 83586660 8D AGAAAGAAAG AAGAAAGA/-------- AAGAAAGAAA 3070 het 3070 ref 33 20 14 6 AAGA 6 4 345103 CASAVA_Build 9 83593996 2I GTGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 58 29 20 9 GT 6 7 345104 CASAVA_Build 9 83598597 5I AACTCTCTTG -----/TTCTC TTGTTTTGTC 3070 het 3070 hom 61 24 31 6 TTCTC 0 1 345105 CASAVA_Build 9 83599655 1D AAGTCTCATG A/- AAATCCTAAT 3070 het 3070 ref 47 24 20 4 A 4 3 345106 CASAVA_Build 9 83603838 4I AAAATTTATC ----/TAAT TAAAATTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TAAT 0 1 345107 CASAVA_Build 9 83604016 1D ATGTTAGCTG A/- AAAAAATCTC 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 A 7 6 345108 CASAVA_Build 9 83612491 1I GAGGGAAAAC -/T TTTTTTTTTT 2286 het 2286 ref 22 13 5 4 T 10 11 345109 CASAVA_Build 9 83636335 6D CTCCTGCAAC CACACA/------ CACACACACG 3070 het 2702 hom 41 10 15 24 CA 7 4 345110 CASAVA_Build 9 83644193 4D TCTTTTTTTT GGGG/---- GGGGGGGGGG 2562 het 254 hom 24 4 9 11 G 14 10 345111 CASAVA_Build 9 83662807 1I CTTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 22 0 16 6 T 15 16 345112 CASAVA_Build 9 83668199 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1105 het 1105 ref 45 37 3 6 A 11 10 345113 CASAVA_Build 9 83714158 1D GACTGAAAAC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 8 7 345114 CASAVA_Build 9 83718388 1D43M3D AATGATATCC AAAAGGTAAGGAACTGTGGATGAACACCCAAGAGAGATTCCCTCTTG/-AAAGGTAAGGAACTGTGGATGAACACCCAAGAGAGATTCCCTC--- TTGTTTCCCA 3070 het 3070 hom 47 26 29 9 N/A 0 0 345115 CASAVA_Build 9 83758699 71D CATTTTTGGA AGGTGGAAATCTGGTAGAGGACAGGTAATTGACTTAGTGCCTGCAAACCAATTCACACCATGTATTAGTCC/----------------------------------------------------------------------- ATTTTCATGC 1806 het 1806 ref 36 45 5 7 AGGTGGAAATCTGGTAGAGGACAGGTAATTGACTTAGTGCCTGCAAACCAATTCACACCATGTATTAGTCC 1 0 345116 CASAVA_Build 9 83763999 1I TGTACAGGTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 9 10 345117 CASAVA_Build 9 83813640 1D ACTGTTAACA T/- TTTTTTTTTT 1236 het 1236 ref 35 17 3 15 T 17 16 345118 CASAVA_Build 9 83817950 1D AAACAGTGTA T/- TTTTTTAGGC 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 7 6 345119 CASAVA_Build 9 83845438 1D ATTCAGTGGG T/- TTTTTTTAGC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 8 7 345120 CASAVA_Build 9 83857537 1I ATTTAATATA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 7 8 345121 CASAVA_Build 9 83921752 1I GAAAAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 T 11 12 345122 CASAVA_Build 9 83934374 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1454 het 1454 ref 15 7 4 4 A 15 14 345123 CASAVA_Build 9 83949777 1D CTGTTAGTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 T 9 8 345124 CASAVA_Build 9 84044711 2D ATTTTTTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 12 10 345125 CASAVA_Build 9 84054016 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3011 het 3011 ref 22 12 9 2 A 10 11 345126 CASAVA_Build 9 84061533 1D AATAACTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2693 hom 22 7 10 5 T 15 14 345127 CASAVA_Build 9 84064054 1I TAGATGCCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 A 11 12 345128 CASAVA_Build 9 84067559 1I GATATTGAAA -/T ACCAAAATGA 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 T 0 1 345129 CASAVA_Build 9 84072100 1D GTTTGTGTCA T/- TTCCCCATAA 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 3 2 345130 CASAVA_Build 9 84083757 3I AAAAATTGAA ---/AAG AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 AAG 1 2 345131 CASAVA_Build 9 84088637 1I TCCGTAGAGA -/G GGATCCAGCT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 G 2 3 345132 CASAVA_Build 9 84113618 1I AACAAACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 10 11 345133 CASAVA_Build 9 84119997 1I AGTTTTGAGA -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 7 8 345134 CASAVA_Build 9 84136251 14I CACAGGTATG --------------/AAAATATGATGCCA TGTCAGAAGA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 AAAATATGATGCCA 0 1 345135 CASAVA_Build 9 84137881 2I GCCACCAGTT --/TC TCTCTTTACT 3070 hom 172 het 62 0 58 4 TC 2 3 345136 CASAVA_Build 9 84138953 1I GGGCTAGCCT -/G CAGGAAGATC 3070 het 3070 ref 51 20 18 13 G 0 1 345137 CASAVA_Build 9 84154397 1I CTGGCTCTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 9 10 345138 CASAVA_Build 9 84154721 1I ACTATGCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 11 23 11 A 10 11 345139 CASAVA_Build 9 84161585 1I TATTTAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 9 10 345140 CASAVA_Build 9 84164212 1I ATTTTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 1525 het 1525 ref 41 26 4 11 T 13 14 345141 CASAVA_Build 9 84168408 2D TCATTTAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 20 18 10 A 12 10 345142 CASAVA_Build 9 84175332 1I CTGATGGACA -/C ATAATGCATG 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 C 0 1 345143 CASAVA_Build 9 84187884 2D GTTTGGAGAC AG/-- GGGAAGAAAC 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 AG 1 0 345144 CASAVA_Build 9 84223506 1D GCAATGTAAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 T 10 9 345145 CASAVA_Build 9 84231476 8D ATACCTACAG TTTTTTGT/-------- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 16 18 1 TTTTTTGT 4 3 345146 CASAVA_Build 9 84233615 6D TATCAGATAC AGATAT/------ AGATATAGAT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 AGATAT 3 2 345147 CASAVA_Build 9 84247235 38I TGATTACCTG --------------------------------------/GGTAAAATACACGACTTCCTTGGATGACAGTTTCCCTA GGTATATAAA 3070 hom 88 het 30 0 30 4 GGTAAAATACACGACTTCCTTGGATGACAGTTTCCCTA 0 1 345148 CASAVA_Build 9 84253161 8I GTTTGTCTTT --------/GATTTAAA GATATCACTA 3070 het 3070 hom 33 16 17 1 GATTTAAA 0 1 345149 CASAVA_Build 9 84264070 1D TTGGGCATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 50 21 22 8 A 10 9 345150 CASAVA_Build 9 84266841 1I TTTGTAACAA -/T TTTTGACATA 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 T 4 5 345151 CASAVA_Build 9 84279702 4I AAAAGAAAAA ----/AAAT AAATAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 AAAT 1 2 345152 CASAVA_Build 9 84280539 4D TGAAAAACGT CTGC/---- CTGCCTGTAA 3070 het 3070 hom 55 27 25 3 CTGC 2 1 345153 CASAVA_Build 9 84283246 7D TATTGTTTCA TATATTT/------- TATATTTTAT 1512 het 1369 hom 9 5 4 2 TATATTT 2 1 345154 CASAVA_Build 9 84290748 3D AAACATGTAT GAC/--- AAGTTTCTTC 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 GAC 1 0 345155 CASAVA_Build 9 84311437 7D ACCTTAACAC AAAGAAA/------- AAAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 23 14 7 AAAGAAA 2 1 345156 CASAVA_Build 9 84313985 1I ATAGAACTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 880 hom 46 2 37 7 A 9 10 345157 CASAVA_Build 9 84351289 1D ACATAATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 T 13 12 345158 CASAVA_Build 9 84357297 2D AACAAGGTTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 47 16 18 14 TG 9 8 345159 CASAVA_Build 9 84377527 1D CTCATTTGAG A/- AAAGTTGAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 4 3 345160 CASAVA_Build 9 84384335 1D TTATAAATTA C/- CCCAATGTCA 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 C 4 3 345161 CASAVA_Build 9 84395935 1D TTTCCTTACA G/- GGAAGACCCT 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 G 3 2 345162 CASAVA_Build 9 84405125 3D TTGTTTAGTG TTA/--- TTATTTCACT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 TTA 2 1 345163 CASAVA_Build 9 84412620 1I AGTAACCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 12 13 345164 CASAVA_Build 9 84415648 1I ATTCCCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 12 13 345165 CASAVA_Build 9 84433170 15I TTCCATGGCT ---------------/GCTCTCTAGATCCTC GCTCTTAGAA 3070 het 3070 ref 42 23 17 3 GCTCTCTAGATCCTC 0 1 345166 CASAVA_Build 9 84449476 1D TAAGTTTCTC T/- TTTTTTGCCA 3070 het 3070 ref 49 22 22 6 T 7 6 345167 CASAVA_Build 9 84472748 5D TACTATGTAT TATAC/----- TATAGGCTGC 3070 het 976 hom 12 2 10 1 TATAC 1 0 345168 CASAVA_Build 9 84478331 1D ATCTAGGAGC A/- ACCTAGTTAG 3070 het 3070 ref 50 25 19 7 A 2 1 345169 CASAVA_Build 9 84493922 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 811 het 342 hom 14 1 6 7 A 13 14 345170 CASAVA_Build 9 84502515 4I TCGCACTGCT ----/GTAC GTACTCCAGC 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 GTAC 1 2 345171 CASAVA_Build 9 84502677 12I AGGATTCATG ------------/ATCCCATCAGGT AAATTCTCCC 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 ATCCCATCAGGT 0 1 345172 CASAVA_Build 9 84504627 4I GAAGGGGACC ----/CAGA CAATTAGAAC 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 CAGA 0 1 345173 CASAVA_Build 9 84523933 1D CCCATGCTGA C/- AAAATCTAGT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 C 1 0 345174 CASAVA_Build 9 84529150 2D GCTTACTCAG CT/-- CTCTCCCAGT 3070 het 3070 ref 52 23 17 13 CT 3 2 345175 CASAVA_Build 9 84530377 1D AGCTTTGTCA T/- TATCTATATA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 2 1 345176 CASAVA_Build 9 84531498 1D GATGGGAGTG T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 46 18 18 11 T 8 7 345177 CASAVA_Build 9 84534455 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2202 hom 27 8 15 4 A 14 16 345178 CASAVA_Build 9 84539742 1D ATCAGGAAAA T/- TCCAAGGGTA 3070 het 3070 hom 24 10 10 5 T 2 1 345179 CASAVA_Build 9 84540474 2I TGTACATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 TG 5 6 345180 CASAVA_Build 9 84551645 1D GACTATTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2597 hom 38 11 14 13 T 15 14 345181 CASAVA_Build 9 84585041 2I ATGACACAGC --/CA CAGAGTTCTG 3070 het 3070 ref 55 29 25 1 CA 1 2 345182 CASAVA_Build 9 84585293 5I TTTCCAAAAC -----/TTATT TTAAATTATT 3070 het 3070 ref 37 17 17 3 TTATT 0 1 345183 CASAVA_Build 9 84596516 6D ACTAAACATA AACATT/------ ATGTCAATAT 3070 het 3070 hom 54 20 33 4 AACATT 1 0 345184 CASAVA_Build 9 84613665 2D CATCCCATTC CA/-- CAGTTTTTAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 CA 2 1 345185 CASAVA_Build 9 84636864 1D AATAAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 15 9 T 11 10 345186 CASAVA_Build 9 84643881 1D TCCTTATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 A 11 10 345187 CASAVA_Build 9 84644034 2I CTGAAGTACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 22 4 A 10 12 345188 CASAVA_Build 9 84656944 17D CTCCCAATTC TCCGCCCGAGAACAATT/----------------- TCCTAACCAT 3070 het 3070 ref 43 27 16 4 TCCGCCCGAGAACAATT 1 0 345189 CASAVA_Build 9 84669474 1D AGAGAAGAAT C/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 23 14 7 2 C 1 0 345190 CASAVA_Build 9 84677186 1D GCTTCACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 A 12 11 345191 CASAVA_Build 9 84679735 1D AGGTATTAGA T/- TTTAAAATAT 3070 het 3070 ref 42 27 9 6 T 4 3 345192 CASAVA_Build 9 84683178 1D AGAGACAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 10 9 345193 CASAVA_Build 9 84689132 1D TTTCTCCTTT C/- AATCTTGGTG 2865 het 2081 hom 18 5 8 5 C 1 0 345194 CASAVA_Build 9 84697754 1I GTTATTTCCT -/G GGAACACAAA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 G 2 3 345195 CASAVA_Build 9 84699696 1D TACACTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 40 1 27 13 T 12 11 345196 CASAVA_Build 9 84708983 1D AAAAAGAAAC A/- CATACATACA 2860 het 1056 hom 33 9 14 10 A 1 0 345197 CASAVA_Build 9 84746864 1D GATGAAGAAT A/- AAAAAAAAAG 2836 het 1504 hom 10 4 6 0 A 10 9 345198 CASAVA_Build 9 84750252 1D CAGTCTGAAG A/- AAAACAGGAA 3070 het 3070 ref 47 21 20 7 A 5 4 345199 CASAVA_Build 9 84784957 5I CAAATGTATC -----/AAGTT AAGTCTAAGA 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 AAGTT 0 1 345200 CASAVA_Build 9 84785179 11D CTTAAAGATG ATTGGTTGACC/----------- ATCAAAGGCA 3070 het 3070 ref 41 23 15 9 ATTGGTTGACC 1 0 345201 CASAVA_Build 9 84787121 10D GAGCATGTGA TTTCTTTTCT/---------- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 20 4 TTTCT 3 1 345202 CASAVA_Build 9 84791988 5D TCTTCATATG TTTGC/----- TTTATTTATA 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TTTGC 1 0 345203 CASAVA_Build 9 84798894 1I CCTTGGACTG -/A AAGGCTCCAG 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 A 2 3 345204 CASAVA_Build 9 84803832 1I AAGACACTCA -/C TGTGAAGAGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 C 0 1 345205 CASAVA_Build 9 84803941 4I CTCCTTTTAC ----/TGAT TATTATGCAA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 TGAT 0 1 345206 CASAVA_Build 9 84809151 12I21M5D ATTCTATTAT ------------TTTAATCCACCTCCAAGGAAATTTAC/TTTATTCTATTATTTAATCCACCTCCAAGGAAA----- TTTCCTTTTA 3070 het 3070 ref 39 28 14 6 N/A 0 0 345207 CASAVA_Build 9 84816448 1D AGAAGAAACC A/- AAAAAATCAA 3070 het 3070 ref 38 27 9 2 A 7 6 345208 CASAVA_Build 9 84821207 1D AGCTCCCACT G/- GCTGAAACAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 G 2 1 345209 CASAVA_Build 9 84822235 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2020 het 2020 ref 18 6 8 4 A 11 12 345210 CASAVA_Build 9 84822960 2I TCCTAGAAAA --/TC TGACAAAATC 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 TC 0 1 345211 CASAVA_Build 9 84823422 3D ATTTCAAGAC TTA/--- TTATAAACCA 3070 het 3070 ref 38 16 18 6 TTA 2 1 345212 CASAVA_Build 9 84848135 1I CAGTGATTGG -/T GGGGGGGGAC 3070 het 2986 hom 39 11 20 8 T 0 1 345213 CASAVA_Build 9 84851703 2D ATAATTGATC AA/-- AGATACTATT 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 3 1 345214 CASAVA_Build 9 84881165 2D GGTCTAGTTA AG/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AG 1 0 345215 CASAVA_Build 9 84881306 4I TTCAGCTCTC ----/AGTT AATGTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 AGTT 0 1 345216 CASAVA_Build 9 84906789 1I ACAAAATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 22 11 3 A 10 11 345217 CASAVA_Build 9 84909362 1D CCTTTTTCTT C/- CCATAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 C 3 2 345218 CASAVA_Build 9 84911512 3I GACCATCCTT ---/CTC CTTTTCAGGG 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 CTC 0 1 345219 CASAVA_Build 9 84913852 2D AAGTAAAAAC AT/-- GTGTACCAAA 3070 het 3070 hom 42 20 19 4 AT 1 0 345220 CASAVA_Build 9 84920620 1D CTAAATTGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 21 11 9 3 A 10 9 345221 CASAVA_Build 9 84923925 2D TTTTTTTTTT TG/-- TATTTTTGGT 1812 het 1253 hom 13 4 5 4 TG 1 0 345222 CASAVA_Build 9 84926570 2I AGAGAGCAAT --/AA GACTCTGAAA 3070 het 3070 hom 62 23 29 10 A 0 2 345223 CASAVA_Build 9 84927761 1I AATCACCTGA -/G GTCAGGAGTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 G 1 2 345224 CASAVA_Build 9 84935253 1I TCAGCAGAAT -/A AAACCACATT 3070 het 3070 hom 72 31 35 6 A 3 4 345225 CASAVA_Build 9 84942531 1I GAAGTGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 11 12 345226 CASAVA_Build 9 84963766 1I CTAAAAACAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 331 hom 11 2 8 1 A 6 7 345227 CASAVA_Build 9 84984776 4I TTAGAGAGTG ----/CATT CATTCATTCT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 CATT 2 3 345228 CASAVA_Build 9 84987947 1I AAGAAAAAAA -/T CATAAAAGGA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 T 0 1 345229 CASAVA_Build 9 84990706 1D AATGGGTGGC G/- GGGGGGGCAA 3070 het 2406 hom 22 9 9 4 G 8 7 345230 CASAVA_Build 9 84999390 1D TAAAATATTT G/- GGATTCTTCT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 G 3 2 345231 CASAVA_Build 9 85003566 1D TTATAAATAG A/- ATGGGGGGGA 3070 hom 58 het 30 0 27 4 A 2 1 345232 CASAVA_Build 9 85017829 1D CACACGTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 A 14 13 345233 CASAVA_Build 9 85025451 4I CAGAATGAAC ----/ATGT ATGTATGTAA 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 ATGT 2 3 345234 CASAVA_Build 9 85027583 1D TCGCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 13 0 10 3 T 12 11 345235 CASAVA_Build 9 85036074 1D CAAGCTAGAA T/- TAGCATGTCT 3070 hom 114 het 43 0 39 6 T 2 1 345236 CASAVA_Build 9 85042211 1I AAATTACCCA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 7 8 345237 CASAVA_Build 9 85048858 3D19M3I AGCAAAACTC CATCATCATCTCAAAAAAAAAA---/---CATCATCTCAAAAAAAAAAAAG AAGTGGAATC 3070 hom 62 het 19 0 19 10 N/A 0 0 345238 CASAVA_Build 9 85049072 3D ACCCCTCTTC TAT/--- TATTTTTTCT 3070 hom 84 het 34 0 28 7 TAT 2 1 345239 CASAVA_Build 9 85049257 3I CACCATTATA ---/TGT TGTTGACCTC 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 TGT 1 2 345240 CASAVA_Build 9 85052120 2I AGGAGGCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 12 14 345241 CASAVA_Build 9 85052613 1D AAGAAATCAC T/- AGCATTGAAT 3070 het 3070 hom 47 20 24 4 T 1 0 345242 CASAVA_Build 9 85053923 2D TAAGGAGAAA AT/-- GCTATGAGAC 3070 het 3070 ref 30 15 12 5 AT 1 0 345243 CASAVA_Build 9 85060237 1I ACCACTCCCA -/T TTTGACAGAG 2339 het 2339 ref 22 9 6 7 T 3 4 345244 CASAVA_Build 9 85061018 1D GGACTCCCTA T/- TTGATAAATG 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 T 3 2 345245 CASAVA_Build 9 85068176 3D AGGGACTTGA AAT/--- ATCTACTAGA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 AAT 1 0 345246 CASAVA_Build 9 85081746 1I TTATCAAATA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 T 6 7 345247 CASAVA_Build 9 85087275 3D CAGTCTTGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 31 0 21 10 T 17 14 345248 CASAVA_Build 9 85091070 2D TAGAGAACAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 17 0 11 6 T 14 12 345249 CASAVA_Build 9 85094045 1I TTAAGATAGA -/T TAACAAAAGC 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 1 2 345250 CASAVA_Build 9 85106262 1I GGTTGGCTTA -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 21 0 17 4 C 0 1 345251 CASAVA_Build 9 85123217 2I ATATATAATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2799 hom 36 13 17 6 TG 8 9 345252 CASAVA_Build 9 85131339 1I TAATGATCCA -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 T 6 7 345253 CASAVA_Build 9 85132917 1I CCTTATCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 8 13 A 15 16 345254 CASAVA_Build 9 85139360 1D ACCAAAATGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 48 22 17 10 T 9 8 345255 CASAVA_Build 9 85149098 2D GTGAGGTTAA TT/-- TTTTATGTGT 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 T 6 4 345256 CASAVA_Build 9 85176057 1D GTCTTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1401 hom 26 6 18 2 T 14 13 345257 CASAVA_Build 9 85177700 1D GCTAGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 12 11 345258 CASAVA_Build 9 85178378 11I CAGCACATAC -----------/CTTTGTGCTGT AAAGATCACT 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 CTTTGTGCTGT 0 1 345259 CASAVA_Build 9 85179143 1I TATTTACCCC -/T GACCAGGTTG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 0 1 345260 CASAVA_Build 9 85181694 4D GAAATTGTGG TTGT/---- TTAAGAATGA 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 TTGT 1 0 345261 CASAVA_Build 9 85186280 1I GGCAGAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 12 9 0 A 10 11 345262 CASAVA_Build 9 85189922 1D ATACTGGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 13 12 345263 CASAVA_Build 9 85196814 1I CACCACAAAG -/A AAAAAAAAAA 2049 het 2049 ref 34 19 6 9 A 12 13 345264 CASAVA_Build 9 85198666 1I TTTGATTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 308 hom 35 3 27 5 T 9 10 345265 CASAVA_Build 9 85204230 3I CTCCATCTTT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 TTC 3 4 345266 CASAVA_Build 9 85226951 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 2845 hom 25 8 11 6 CT 1 2 345267 CASAVA_Build 9 85232465 1I ATGAATCTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 9 10 345268 CASAVA_Build 9 85246608 1I TGAAACTGCC -/A AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 7 8 345269 CASAVA_Build 9 85250933 1D AACAGCCGGG C/- CAGCCCCCGG 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 C 2 1 345270 CASAVA_Build 9 85254834 1I CCAAGCCTGC -/T GCCACCCAAC 3070 het 3070 ref 30 15 8 7 T 0 1 345271 CASAVA_Build 9 85259696 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 9 10 345272 CASAVA_Build 9 85261715 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 9 10 345273 CASAVA_Build 9 85276843 1I AAAAACTCCA -/T TTCCCAGCCC 3070 het 3070 ref 64 30 25 9 T 2 3 345274 CASAVA_Build 9 85299789 3D CTTAACCATT CTC/--- CTACTGTTTC 3070 hom 111 het 41 0 37 6 CTC 1 0 345275 CASAVA_Build 9 85301382 1D AAAGCAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 10 9 345276 CASAVA_Build 9 85302906 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 116 hom 31 2 25 4 A 13 12 345277 CASAVA_Build 9 85303478 5D CCCTTTAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAC 3070 hom 122 het 46 0 41 6 AAAAG 2 1 345278 CASAVA_Build 9 85309333 1D CATTTGACTT C/- CCCCCCCACC 3070 hom 108 het 40 0 34 6 C 8 7 345279 CASAVA_Build 9 85313819 1I ATTTTACTTA -/T TTTTTGCCTC 3070 hom 99 het 41 0 35 6 T 5 6 345280 CASAVA_Build 9 85337518 1D GGAATCTGAT G/- GGAAAACTGA 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 3 2 345281 CASAVA_Build 9 85340354 1D CTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 110 hom 36 1 30 5 T 13 12 345282 CASAVA_Build 9 85348936 14I CAGCTACATT --------------/GTGGCCTAAAGATA GAAGTGTCTG 3070 hom 132 het 51 0 41 10 GTGGCCTAAAGATA 0 1 345283 CASAVA_Build 9 85385841 4D GATGAAATGT TAAA/---- TAAATAAAAT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 TAAA 3 2 345284 CASAVA_Build 9 85397747 1D ATTAACTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 19 1 12 6 T 15 14 345285 CASAVA_Build 9 85398280 4I GTTTTTCTTC ----/CATA CATTTTCTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 CATA 0 1 345286 CASAVA_Build 9 85398424 1D GGTTTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 21 8 T 13 12 345287 CASAVA_Build 9 85413670 1I TCCCATAAGA -/G GCCCAAAGGC 3070 hom 39 het 18 0 13 5 G 1 2 345288 CASAVA_Build 9 85416588 1D GAAGATCCCA G/- TTAAGTGTGT 3070 het 3070 hom 44 20 18 6 G 1 0 345289 CASAVA_Build 9 85422569 4D TATACCTGAT CTGA/---- CTACCACATA 3070 het 3070 ref 36 16 18 8 CTGA 1 0 345290 CASAVA_Build 9 85427716 2D GAAGGGGCAG GA/-- GAGAGAGGCC 2208 het 651 hom 13 4 6 3 GA 4 3 345291 CASAVA_Build 9 85429442 2I GCTTCTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2727 hom 29 8 12 9 T 10 12 345292 CASAVA_Build 9 85431866 4D GTGAAGCAAT TAAA/---- TAAAAACATC 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 TAAA 2 1 345293 CASAVA_Build 9 85446202 5D ATTTGTGAAC ATGAT/----- ATAACTGTTT 3070 het 3070 ref 32 22 9 1 ATGAT 1 0 345294 CASAVA_Build 9 85446892 1D CGAACAGGGT C/- CCCCCCCAAC 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 C 8 7 345295 CASAVA_Build 9 85452826 1I GGTGTACAAA -/T TTTTTATCTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 5 6 345296 CASAVA_Build 9 85458913 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 7 6 345297 CASAVA_Build 9 85460284 1D CAGTTAAAAA T/- TTAAAAAAAA 2385 het 1463 hom 37 9 15 13 T 3 2 345298 CASAVA_Build 9 85462105 3D TCCACTCCTT CTC/--- CTGTCTTTCT 3070 het 3070 hom 66 31 32 6 CTC 1 0 345299 CASAVA_Build 9 85466353 1D AAAAGAAAAA T/- ACAGAAAAAC 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 T 1 0 345300 CASAVA_Build 9 85478921 1I CTGCAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 13 14 345301 CASAVA_Build 9 85480666 1I ATATTACCAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 7 8 345302 CASAVA_Build 9 85480745 1I TTTGCCTCTT -/G GGCCAGTAAT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 G 2 3 345303 CASAVA_Build 9 85487025 2I GTCTCAAAAA --/AT ATATATATAT 1926 het 255 hom 10 3 6 1 AT 8 9 345304 CASAVA_Build 9 85487222 4D TCTCTTAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 AAAC 5 4 345305 CASAVA_Build 9 85487560 1I GGAATGTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 12 13 345306 CASAVA_Build 9 85489891 1I AAATAGAAGG -/A AATATGTTGA 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 A 2 3 345307 CASAVA_Build 9 85493597 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 13 14 345308 CASAVA_Build 9 85495481 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 25 1 20 4 A 11 12 345309 CASAVA_Build 9 85498202 1D CTTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 24 10 8 T 10 9 345310 CASAVA_Build 9 85499122 1I TTTGAAAAAA -/T GTCCATAAAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 0 1 345311 CASAVA_Build 9 85500356 1D TTAAAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 15 7 A 11 10 345312 CASAVA_Build 9 85501381 1D CTAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 187 hom 26 1 20 6 A 13 12 345313 CASAVA_Build 9 85509253 1I AAGACTTTAA -/T TTTTATCTAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 4 5 345314 CASAVA_Build 9 85510603 3I ATACACACAG ---/TAC TACTATAGGC 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 TAC 1 2 345315 CASAVA_Build 9 85510862 1D AAATTACGTC A/- AAAAAACGTA 3070 hom 156 het 57 0 52 5 A 7 6 345316 CASAVA_Build 9 85522184 2D CCATGCCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 2704 het 9 hom 18 1 9 8 T 18 16 345317 CASAVA_Build 9 85535538 5I CAGGAGGCCA -----/AGGCG GTACTCCTTG 1922 het 1922 ref 35 22 5 9 AGGCG 0 1 345318 CASAVA_Build 9 85535757 6I ACCACTTCAT ------/ACTTCA ACACTGCCTC 3070 het 3070 hom 49 20 26 3 ACTTCA 0 1 345319 CASAVA_Build 9 85538808 2I GTGTATGTTG --/TT TTTTTTTTGT 3070 het 2796 hom 25 9 14 2 T 8 10 345320 CASAVA_Build 9 85539918 1I AGATGAGACC -/A AAAAAAAAAA 2775 het 2775 ref 32 12 10 10 A 15 16 345321 CASAVA_Build 9 85541232 2I CAATGAACAC --/AT GTGTGCATGT 3070 het 3070 ref 47 29 14 4 AT 0 1 345322 CASAVA_Build 9 85541604 2I CTCTTTAATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 T 10 12 345323 CASAVA_Build 9 85547002 1D AGATACAGGG T/- TAAGTTCTAT 3070 het 3070 hom 45 11 24 10 T 2 1 345324 CASAVA_Build 9 85551460 1I ATAACAATTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 7 8 345325 CASAVA_Build 9 85554505 3D ATTAAATTGT TGA/--- TGATAAGTAA 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 TGA 2 1 345326 CASAVA_Build 9 85554894 1D CAAAAATTGC A/- AATGAGCATG 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 A 3 2 345327 CASAVA_Build 9 85560475 1D TATGACCAAC A/- AACATTAAAA 2498 het 2498 ref 25 17 7 1 A 3 2 345328 CASAVA_Build 9 85571139 1D ACAGGAAAAC A/- ATTAAATTTA 3070 het 3070 hom 33 10 20 4 A 2 1 345329 CASAVA_Build 9 85571606 2D CTGGAGAATT AA/-- AACAGGCAAG 3070 het 3070 ref 40 21 17 5 A 4 2 345330 CASAVA_Build 9 85576718 1D TTGAGTGAGG C/- CACAAAGTTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 C 2 1 345331 CASAVA_Build 9 85581662 1D ATGTGGAGCA T/- TAGTGCTAAA 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 T 2 1 345332 CASAVA_Build 9 85583620 3I CAGCTCTAAA ---/ATT ATAAGGAAAG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 ATT 0 1 345333 CASAVA_Build 9 85588838 1D TGTCTCTACT A/- AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 28 11 17 0 A 6 5 345334 CASAVA_Build 9 85591277 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2424 hom 23 6 16 1 A 12 11 345335 CASAVA_Build 9 85592141 1I CCAGCTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 9 10 345336 CASAVA_Build 9 85594510 1I AAAAGCAGGT -/G GGGTTTAATT 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 G 3 4 345337 CASAVA_Build 9 85606131 1I CCAAGTTTGT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 2262 hom 36 11 19 6 G 1 2 345338 CASAVA_Build 9 85607120 3D AGGCTGAGGC AGA/--- AGAACTGCTT 3070 het 2839 hom 23 8 9 7 AGA 2 1 345339 CASAVA_Build 9 85627034 1D TCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2774 hom 31 10 11 10 T 13 12 345340 CASAVA_Build 9 85652806 2I CATATATATG --/AT ATATATGATA 2464 het 195 hom 6 1 5 0 AT 3 4 345341 CASAVA_Build 9 85664557 1D CGTGAGACAC T/- GCACCCGACC 1700 het 1700 ref 15 8 5 3 T 1 0 345342 CASAVA_Build 9 85727976 1D ATAGTTTTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 27 11 11 7 T 9 8 345343 CASAVA_Build 9 85741219 1D CCACCCATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 52 18 24 10 T 11 10 345344 CASAVA_Build 9 85743485 1D ATGTCAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 T 12 11 345345 CASAVA_Build 9 85753773 1I CCACTATTGT -/C CGATGACCCT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 C 1 2 345346 CASAVA_Build 9 85755332 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2998 het 1019 hom 32 8 9 15 T 17 16 345347 CASAVA_Build 9 85771456 1I AGATTTAGTA -/T TTTTACATTA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 T 4 5 345348 CASAVA_Build 9 85772746 4I TTACCACGTT ----/AATA AATTATGAGC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 AATA 0 1 345349 CASAVA_Build 9 85779036 1D TGACCACAGG T/- TAAGTTCACA 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 T 2 1 345350 CASAVA_Build 9 85789008 2I TGAACATACC --/TT TTTTTTTTTT 2948 het 2948 ref 35 13 9 13 T 14 16 345351 CASAVA_Build 9 85800029 1I CCACTGCCCC -/T GGCCTCAACC 3070 het 3043 hom 27 9 14 4 T 0 1 345352 CASAVA_Build 9 85807782 1D TAAGTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 425 hom 34 1 20 13 T 17 16 345353 CASAVA_Build 9 85816121 1I TGGGTTAAGG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 7 8 345354 CASAVA_Build 9 85826129 1I TTTCCACTTA -/T ACACACTCAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 T 0 1 345355 CASAVA_Build 9 85840307 1D CACTTGGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 10 9 345356 CASAVA_Build 9 85840791 3D GAGAACTTCT TCC/--- TCTTAAACTC 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 TCC 1 0 345357 CASAVA_Build 9 85849838 1D AAAAATGGCA G/- TAGTGGGTCA 3070 het 3070 hom 47 17 22 9 G 1 0 345358 CASAVA_Build 9 85851407 4I AGTGACATAA ----/TATG TGTGTGTGTG 3070 hom 28 het 24 0 14 10 TATG 0 1 345359 CASAVA_Build 9 85861616 1I TGTTCCCAAC -/T TCCTTATTTT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 T 1 2 345360 CASAVA_Build 9 85870065 2I TTGTTGAATC --/AT ATATGTATGT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 AT 2 3 345361 CASAVA_Build 9 85883687 1D GCAGAATTTT G/- TTTTACTTTT 2669 het 2669 ref 24 17 7 0 G 1 0 345362 CASAVA_Build 9 85888992 1D AAGCTGCTCC T/- GGCTGCTGCT 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 T 1 0 345363 CASAVA_Build 9 85893651 1D GAAAATAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 215 hom 29 2 17 10 T 15 14 345364 CASAVA_Build 9 85894406 1I CACCTTGCAC -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 T 6 7 345365 CASAVA_Build 9 85903979 2I AATTGAACTC --/TT ATTAGCAAAA 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 0 2 345366 CASAVA_Build 9 85916672 12I AATTAGCCAG ------------/GCTAAGGCAGAA GCAGTTTTCT 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 GCTAAGGCAGAA 0 1 345367 CASAVA_Build 9 85917733 3I CTGATGATCA ---/ATG ATGTTGAGCA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 ATG 1 2 345368 CASAVA_Build 9 85917830 3D GGTTATTAGA TTT/--- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 T 12 9 345369 CASAVA_Build 9 85919921 4I GTTTGTTGGT ----/TTTG TTTATCTTTT 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 TTTG 0 1 345370 CASAVA_Build 9 85920091 1I TTATTTTCAG -/T TTTTTTTACT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 7 8 345371 CASAVA_Build 9 85920356 2D ATGATTTCAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 20 16 8 T 11 9 345372 CASAVA_Build 9 85931034 1I AGTGGGAAGC -/A ACGGTGCTCA 3070 het 3070 hom 57 21 27 9 A 1 2 345373 CASAVA_Build 9 85935847 1D AACATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2608 hom 17 8 8 1 T 12 11 345374 CASAVA_Build 9 85937463 1I GATCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 A 15 16 345375 CASAVA_Build 9 85940098 32D TGCAACCTCT GCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA/-------------------------------- GCCTCCCGAG 2259 het 2259 ref 13 10 6 4 GCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCA 1 0 345376 CASAVA_Build 9 85946222 1D CTCATCCTCC T/- TTTTTTTTTT 2817 het 2817 ref 32 15 7 10 T 12 11 345377 CASAVA_Build 9 85947927 1I TAGAAGTATA -/G GGCAATGTGA 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 G 2 3 345378 CASAVA_Build 9 85949212 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 A 13 14 345379 CASAVA_Build 9 85952745 1D TGTTAAATAT C/- CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 39 13 17 10 C 9 8 345380 CASAVA_Build 9 85975088 1I ATTTGTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 37 1 26 10 T 13 14 345381 CASAVA_Build 9 86005824 1D TATTTTGTAC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 6 5 345382 CASAVA_Build 9 86008432 2D GTCCATTAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 28 0 21 7 A 14 12 345383 CASAVA_Build 9 86008989 1I ATCCTACCTA -/C CTCACTAGCT 3070 hom 128 het 47 0 40 7 C 1 2 345384 CASAVA_Build 9 86047303 1D CTAGGTAACA G/- GAGTTCCAGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 2 1 345385 CASAVA_Build 9 86075741 2D CATACATACG CA/-- CACACACACA 1155 het 1155 ref 56 41 3 12 CA 7 6 345386 CASAVA_Build 9 86087020 1D GAGGAAAACC T/- TTTTTTTTTT 908 het 908 ref 33 26 3 4 T 12 11 345387 CASAVA_Build 9 86118604 1D ACTCTACCTG A/- AAAAAAAAAA 1242 het 1242 ref 16 10 5 2 A 14 13 345388 CASAVA_Build 9 86153646 1D TAAACTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1576 het 1576 ref 26 13 4 9 T 15 14 345389 CASAVA_Build 9 86182580 1I AGTTCTAGGA -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 105 het 44 0 35 9 T 8 9 345390 CASAVA_Build 9 86184368 1D TTTTTGTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 14 het 32 1 22 9 T 10 9 345391 CASAVA_Build 9 86184434 1D CTTTCCTGTA T/- TTTTTGACAT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 6 5 345392 CASAVA_Build 9 86192420 1D AATAGAGACA G/- GGTTTTGCAT 3070 hom 42 het 15 0 13 2 G 3 2 345393 CASAVA_Build 9 86195603 1D CCTGGAAATC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 9 8 345394 CASAVA_Build 9 86206374 3I GAAGAAAGGA ---/GAT GATATGCATT 3070 hom 99 het 39 0 32 7 GAT 1 2 345395 CASAVA_Build 9 86209343 5D CCTCAATATC TTTAT/----- TTTATTTTAT 3070 hom 108 het 42 0 37 7 TTTAT 4 3 345396 CASAVA_Build 9 86210799 4D AGCTCTTTCT TTTC/---- TTTCTTTGTT 640 hom 42 het 31 0 10 21 TTTC 2 1 345397 CASAVA_Build 9 86212387 2D AGAAAAAAAT CA/-- CAGTTTTTAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 CA 2 1 345398 CASAVA_Build 9 86214851 1D GGTGGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 27 0 16 11 T 12 11 345399 CASAVA_Build 9 86216092 1D CAGAAAACAT C/- TTGAATCATG 3070 hom 93 het 33 0 31 3 C 1 0 345400 CASAVA_Build 9 86216709 1I AAATAGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 938 hom 26 2 20 4 T 13 14 345401 CASAVA_Build 9 86217903 3D ACTGCAGGAA CTG/--- CTGAAATTCA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 CTG 2 1 345402 CASAVA_Build 9 86218658 1D GCAGCGTCAG C/- CCCCCCGGGC 3070 hom 56 het 24 0 19 5 C 7 6 345403 CASAVA_Build 9 86220213 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 18 het 17 0 11 6 T 10 9 345404 CASAVA_Build 9 86221259 8D TTTTTCTTTA ATAGTTTT/-------- ATATTGCATA 3070 hom 36 het 21 0 13 11 ATAGTTTT 1 0 345405 CASAVA_Build 9 86228279 1I GTTTTCTATT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 7 8 345406 CASAVA_Build 9 86230373 1D TTATTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 43 0 26 17 T 13 12 345407 CASAVA_Build 9 86234387 1D ATAATCACTC T/- TTTTTTTTTT 813 het 813 ref 33 24 2 7 T 15 14 345408 CASAVA_Build 9 86252856 4D AGAGATTTGT GATA/---- GATAGAATAC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 GATA 2 1 345409 CASAVA_Build 9 86277896 1D TCTTTCCCCC T/- GGACAAAACT 3070 hom 117 het 43 0 38 5 T 1 0 345410 CASAVA_Build 9 86280336 1D GGTAGCCTTT A/- AAGTTGTCCA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 2 345411 CASAVA_Build 9 86281758 4I CAGAGGAAAT ----/AAGA GAGAGGGGGA 3070 hom 89 het 33 0 28 5 AAGA 0 1 345412 CASAVA_Build 9 86283331 1D CTACATTTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 9 8 345413 CASAVA_Build 9 86284388 1D CTTTCTAGCA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 120 het 45 0 41 6 T 9 8 345414 CASAVA_Build 9 86289321 1D CTGGCAAACA C/- CATAGTTTAC 3070 hom 156 het 53 0 50 4 C 2 1 345415 CASAVA_Build 9 86290021 2D TTCCTTCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 75 het 33 0 24 10 TC 9 8 345416 CASAVA_Build 9 86294389 3I GGTGTCAAAA ---/AAG AAGAAACACA 3070 hom 90 het 38 0 29 9 AAG 1 2 345417 CASAVA_Build 9 86296038 1I GGCGTCTGAC -/A AAAGAAAATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 3 4 345418 CASAVA_Build 9 86300649 1I TGCGTCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 12 13 345419 CASAVA_Build 9 86307442 2D ACTCAAACCA CC/-- CCTTGACTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 4 2 345420 CASAVA_Build 9 86311771 1I AGATATTGCC -/T TTTTTTTATT 3070 het 1717 hom 38 5 26 7 T 7 8 345421 CASAVA_Build 9 86313251 1D AAGAAATACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 44 het 21 0 16 5 T 10 9 345422 CASAVA_Build 9 86314697 4I TGAAGAGGTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TTTG 3 4 345423 CASAVA_Build 9 86315353 1I GGGTAATTTT -/A TTTTTTTTTC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 0 1 345424 CASAVA_Build 9 86316105 2D CACTTAGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 39 0 30 9 A 13 11 345425 CASAVA_Build 9 86317096 4D TTATTTTTTA TTTG/---- TTTGTCAGGC 3070 hom 109 het 41 0 36 10 TTTG 2 1 345426 CASAVA_Build 9 86317285 4I GGAGTCTGTC ----/AGTT AGTTATGCCC 3070 hom 148 het 57 0 50 7 AGTT 1 2 345427 CASAVA_Build 9 86319227 1D TGTAGATGGC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 T 9 8 345428 CASAVA_Build 9 86322689 1I TCCACTGTAC -/A ATAACAACAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 1 2 345429 CASAVA_Build 9 86325069 2D AATAGTTCTC AT/-- GAGTCTTTTA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 AT 1 0 345430 CASAVA_Build 9 86327751 8D CACGCGCGCG CACACACA/-------- CACACACACA 3070 hom 79 het 28 0 25 4 CA 12 8 345431 CASAVA_Build 9 86328854 1I CTTTTGTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 529 hom 16 3 12 1 T 10 11 345432 CASAVA_Build 9 86333467 1D AGGTTTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 16 0 11 5 T 14 13 345433 CASAVA_Build 9 86333525 3I GATTTATCTA ---/CTT CTTCTAGCTT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 CTT 1 2 345434 CASAVA_Build 9 86335045 1D GTGTGATGTT C/- CCCTTCCTGT 3070 hom 42 het 16 0 15 2 C 4 3 345435 CASAVA_Build 9 86343241 4I CTAGTGTCTT ----/TCTC TTCAGGGTGG 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TC 0 2 345436 CASAVA_Build 9 86345294 2I ATTTTTTTTT --/TA ATTAATTCAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TA 0 1 345437 CASAVA_Build 9 86345621 1I ATGTTGCTGT -/A AAAAAACATG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 6 7 345438 CASAVA_Build 9 86348830 3D TAGCATAGCC TAA/--- TGTGTGCGCA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 TAA 1 0 345439 CASAVA_Build 9 86354816 1I GAACTGTACT -/C CACAACATAA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 C 1 2 345440 CASAVA_Build 9 86355947 1I CTAAGATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 22 1 17 4 T 12 13 345441 CASAVA_Build 9 86357502 1I TCTGAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 667 hom 36 2 26 9 T 11 12 345442 CASAVA_Build 9 86358305 4D AATTAATTAG TTAC/---- TTAAACTGCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTAC 1 0 345443 CASAVA_Build 9 86359523 1D AGATGTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 342 hom 39 1 30 8 T 11 10 345444 CASAVA_Build 9 86361574 1D GTGAGGTATG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 8 345445 CASAVA_Build 9 86362486 1I CCTGTGTAGA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 8 345446 CASAVA_Build 9 86363920 13D TTTCTTTGGC AAGAATCATTGGT/------------- ATACTATGAA 3070 hom 123 het 41 0 40 6 AAGAATCATTGGT 1 0 345447 CASAVA_Build 9 86366261 2D GAGCTTTTTT TG/-- TTTTTTCTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TG 1 0 345448 CASAVA_Build 9 86368828 10D GTGTCTGCAG TGGGTAAATT/---------- TGGGATAATA 3070 hom 120 het 42 0 41 2 TGGGTAAATT 1 0 345449 CASAVA_Build 9 86370729 1I23M1I TTTTGTTTTG -TTTTGTTTTTGGTTTTGGTTTTT-/TTTTTGGTTTTGGTTTTAGTTTTTG TTTTTTTTTT 2151 het 2151 ref 48 16 9 30 N/A 0 0 345450 CASAVA_Build 9 86371171 4I ATGAATAAAT ----/TGAG AGCATAAAAC 3070 hom 74 het 30 0 24 6 TGAG 0 1 345451 CASAVA_Build 9 86381313 1I TTTATCCTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 263 hom 31 1 25 5 T 9 10 345452 CASAVA_Build 9 86381542 8D GACATGTATG TTTATTAA/-------- TTTATAAGTA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TTTATTAA 1 0 345453 CASAVA_Build 9 86382815 1I CAATTAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 364 hom 36 1 30 5 A 9 10 345454 CASAVA_Build 9 86384166 2D TGAAAAAGAC AT/-- GTACTAGGCA 3070 hom 87 het 30 0 30 2 AT 1 0 345455 CASAVA_Build 9 86385475 1I TGTATTTAAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 8 9 345456 CASAVA_Build 9 86386119 5D ATTAAGAAGA TATAT/----- TAGTAAGGTT 3070 hom 108 het 40 0 37 6 TATAT 1 0 345457 CASAVA_Build 9 86387694 2D AGGGTATGAC AG/-- GGGATGGGGC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AG 1 0 345458 CASAVA_Build 9 86389166 1I AAATGAAAGT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 9 345459 CASAVA_Build 9 86408530 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 34 0 17 18 T 17 15 345460 CASAVA_Build 9 86420044 2D ATTTTGTGTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 99 het 47 0 32 16 CA 8 7 345461 CASAVA_Build 9 86439054 4D ACATTGAAAA AAAG/---- AAGAGTAGAA 3070 hom 81 het 32 0 28 6 AAAG 1 0 345462 CASAVA_Build 9 86441529 3I29M2D CCTTCTTCTT ---CTCCTCCTCTTTTCCTCTTTCTTTCTCTTTC/CTCCTCCTCCTCTTTTCCTCTTTCTTTCTCTT-- TCTCTTTCTT 3070 het 122 hom 17 2 9 12 N/A 0 0 345463 CASAVA_Build 9 86448684 2D GTGTAGGCCC CA/-- GTCTGAGTCT 3070 het 3070 ref 47 23 18 7 CA 1 0 345464 CASAVA_Build 9 86454888 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2056 het 1220 hom 30 9 6 15 T 18 17 345465 CASAVA_Build 9 86459766 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 486 hom 23 2 17 4 T 11 12 345466 CASAVA_Build 9 86459936 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 9 10 345467 CASAVA_Build 9 86462011 3D AGAAAAAAAG GAC/--- GATTTGAACC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GAC 1 0 345468 CASAVA_Build 9 86466257 1I CTGGGATTAC -/A AGGTGCCTGC 3070 hom 77 het 29 0 26 3 A 1 2 345469 CASAVA_Build 9 86469391 1I TAAAATGTTG -/T TTTATTATTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 3 4 345470 CASAVA_Build 9 86470601 1I GGACTAGCTG -/T TTTTTATTGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 5 6 345471 CASAVA_Build 9 86476162 1I CCTTAACATC -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 7 345472 CASAVA_Build 9 86490101 1I CAGCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 30 1 19 10 T 13 14 345473 CASAVA_Build 9 86495284 1I AATTTATTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 35 het 19 0 14 6 A 9 10 345474 CASAVA_Build 9 86495454 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 11 10 345475 CASAVA_Build 9 86496122 2I AATTATAACA --/CT GATACAACTC 3070 hom 138 het 51 0 45 6 CT 0 1 345476 CASAVA_Build 9 86510972 1I GACGGTACCC -/T TGTGTAGGTA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 T 1 2 345477 CASAVA_Build 9 86520895 1D GTTACTATAT A/- AACCATCCTT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 3 2 345478 CASAVA_Build 9 86531232 3I AAAAAACAAA ---/AAC AAACAAACTA 3070 hom 87 het 30 0 30 0 AAC 0 1 345479 CASAVA_Build 9 86545882 1I ATGCTGAGTT -/A AAAAAAATGT 3070 hom 97 het 40 0 33 7 A 7 8 345480 CASAVA_Build 9 86549927 5D AGGGTGTTAA CACCT/----- AGGTTGGAAG 3070 hom 108 het 38 0 35 5 CACCT 1 0 345481 CASAVA_Build 9 86551261 1I GATCAGATCA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 123 het 48 0 42 6 T 8 9 345482 CASAVA_Build 9 86559038 1D TCTCAGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 12 11 345483 CASAVA_Build 9 86574328 2D GTTGGTTAAA TG/-- AATATGCACA 3070 hom 126 het 45 0 43 3 TG 1 0 345484 CASAVA_Build 9 86584780 1I GACTCTGCGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 11 345485 CASAVA_Build 9 86586147 5I CTTTTCAGAT -----/CATAA CATAAGTATA 3070 hom 80 het 32 0 27 5 CATAA 1 2 345486 CASAVA_Build 9 86589581 4D AAAACCATCC ATCT/---- GAGTTATTAA 3070 hom 117 het 49 0 40 10 ATCT 1 0 345487 CASAVA_Build 9 86597858 1D GGTTGCTGAG A/- GGTCTTTTCT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 0 345488 CASAVA_Build 9 86602279 1I GTATATATAA -/T TATATATATT 1471 hom 7 het 3 0 3 0 T 1 2 345489 CASAVA_Build 9 86604945 1I AGTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 144 hom 37 1 28 8 T 11 12 345490 CASAVA_Build 9 86616103 1D CTGTTTTGTT G/- GGGCTATAGA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 4 3 345491 CASAVA_Build 9 86624905 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2469 het 303 hom 16 2 8 7 T 17 16 345492 CASAVA_Build 9 86631821 1D AATCCTTAAA G/- AATATCATTA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 G 1 0 345493 CASAVA_Build 9 86632484 9D GCTTACTGCT TGTTGTCTA/--------- TGTCCTCCTG 3070 hom 108 het 38 0 37 3 TGTTGTCTA 1 0 345494 CASAVA_Build 9 86643202 1D TGTATATTGT A/- TATGCATTAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 1 0 345495 CASAVA_Build 9 86698904 17D TATTTGGGAG AATATATTTTTATAACA/----------------- CATTGAATAG 3070 hom 36 het 12 0 12 5 AATATATTTTTATAACA 1 0 345496 CASAVA_Build 9 86755327 1D GTCTAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 14 13 345497 CASAVA_Build 9 86761586 1D TTTTGTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 51 1 38 13 T 12 11 345498 CASAVA_Build 9 86766354 1D CATTCATTCA T/- TTTATCAGTA 3070 het 3070 hom 50 17 25 9 T 4 3 345499 CASAVA_Build 9 86767224 1D TTGTGTCCCC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 60 30 21 9 T 9 8 345500 CASAVA_Build 9 86778730 1I65M1D CCATGAATCA -TCAGAAGATGCATTTTATCTGCTGGCCTTACAGGTAAGAGGATTAGATGATACTATCTTTTTCTGT/TTCAGAAGATGCATTTTATCTGCTGGCCTTACAGGTAAGAGGATTAGATGATACTATCTTTTTCTG- TCTTTTCTCT 3070 hom 154 het 35 0 52 8 N/A 0 0 345501 CASAVA_Build 9 86781995 1D TGAATAAAGT G/- TATCTAATAC 3070 het 3070 ref 44 24 13 8 G 1 0 345502 CASAVA_Build 9 86791358 1I CAACTGAAAC -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 53 31 18 4 T 7 8 345503 CASAVA_Build 9 86791432 1D ACTTGTTTCC T/- TTAGATATAG 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 T 3 2 345504 CASAVA_Build 9 86794899 3I TAGTCTCTCA ---/AAG AAGGCCAGGC 3070 hom 96 het 40 0 32 8 AAG 1 2 345505 CASAVA_Build 9 86803937 1D ACGTACTTTT G/- GTGGCCCCAA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 G 2 1 345506 CASAVA_Build 9 86805919 11D AGTTCTTCCT GTTTGGTTAGG/----------- GCCTGGAGGA 3070 hom 120 het 38 0 41 0 GTTTGGTTAGG 1 0 345507 CASAVA_Build 9 86830865 1D AAAGCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 753 het 252 hom 9 2 2 5 A 11 10 345508 CASAVA_Build 9 86831988 40D AGACTCAAAC CCCTGGGCTCAAGCCATCCTCCTGCCTTAGCCTTCTGACT/---------------------------------------- CCCTGGGCTC 3070 hom 42 het 26 0 15 15 CCCTGGGCTCAAGCCATCCTCCTGCCTTAGCCTTCTGACT 2 1 345509 CASAVA_Build 9 86852555 1I CAATATGTAA -/T TTTTTTATCA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 6 7 345510 CASAVA_Build 9 86863399 1I TTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 26 0 19 7 A 13 14 345511 CASAVA_Build 9 86867243 4D AAAAGATGGG TTCT/---- TTCTTTGTTT 3070 hom 122 het 45 0 41 4 TTCT 2 1 345512 CASAVA_Build 9 86873372 1D GACGCTACTG A/- AAAAGATACA 3070 hom 96 het 33 0 32 1 A 5 4 345513 CASAVA_Build 9 86883388 3D TACTTATGAA AAG/--- AAGAAGAAGG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 AAG 4 3 345514 CASAVA_Build 9 86885350 1D GTTTTTTTGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 87 het 39 0 29 10 T 9 8 345515 CASAVA_Build 9 86892760 1D GCAGAGGGTT G/- GGGGGGCACA 3070 het 3070 hom 29 9 13 7 G 7 6 345516 CASAVA_Build 9 86896622 1I TGCAAGAGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 51 22 22 7 T 9 10 345517 CASAVA_Build 9 86903586 1D TGAAACAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 14 het 25 1 20 6 A 10 9 345518 CASAVA_Build 9 86905299 10D CACATGTTGC ATTTTATTTT/---------- ATTTTATTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 ATTTT 5 3 345519 CASAVA_Build 9 86906031 2D AAAAAAATAC AG/-- AGAGATTCCC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 3 2 345520 CASAVA_Build 9 86907965 1I AAGTATTTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 9 10 345521 CASAVA_Build 9 86909308 1D TCTTTTTCTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 7 345522 CASAVA_Build 9 86913650 1I TTCTAGGGGG -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 345523 CASAVA_Build 9 86914106 1D ACCAACTAGC G/- TAGTGTGTAG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 1 0 345524 CASAVA_Build 9 86916785 1I TCAAATAAGT -/C CTCCAAATGG 3070 hom 132 het 47 0 45 2 C 1 2 345525 CASAVA_Build 9 86926719 1I CTTTAATTCA -/C CTTTCCCAGT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 1 2 345526 CASAVA_Build 9 86937518 1D TTAAAGCATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 9 9 A 10 9 345527 CASAVA_Build 9 86941860 1D GCATAGTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 32 1 27 4 A 12 11 345528 CASAVA_Build 9 86942890 4I TACTTAATTC ----/CTAA CTAAGTCTTC 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 CTAA 1 2 345529 CASAVA_Build 9 86944618 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 1346 het 1346 ref 28 16 8 5 A 10 9 345530 CASAVA_Build 9 86962696 1I AATAACAAAT -/G GGGGTCGCAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 G 4 5 345531 CASAVA_Build 9 86974386 1I TTCCAGGCTG -/C TTTTTGATCA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 C 0 1 345532 CASAVA_Build 9 86995755 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1517 het 1517 ref 15 6 4 7 A 13 12 345533 CASAVA_Build 9 86997474 1I TCTTTGTCAC -/A TGACTTGCTT 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 A 0 1 345534 CASAVA_Build 9 87042762 1D TATTTTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 24 4 A 11 10 345535 CASAVA_Build 9 87077796 1I TTTCAATTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 144 het 51 0 46 5 A 9 10 345536 CASAVA_Build 9 87079520 4I TATCTATCTA ----/AATC TATCTATTGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AATC 0 1 345537 CASAVA_Build 9 87087171 11I TTCTACTTGA -----------/AATCTCCCAGC AATTACCAGA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 AATCTCCCAGC 0 1 345538 CASAVA_Build 9 87087821 1D CCTTTCAACG C/- CCCCCCCCAA 3070 het 2843 hom 26 8 14 4 C 9 8 345539 CASAVA_Build 9 87094115 1I ACAAGCACCA -/C CCCCTGCTCC 3070 hom 50 het 18 0 15 3 C 4 5 345540 CASAVA_Build 9 87108010 1I GGGGAGTGTC -/T AAACGCTGAA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 0 1 345541 CASAVA_Build 9 87113513 2I GTGAAATCAC --/GT GTGTTTGTAT 3070 hom 114 het 43 0 37 6 GT 2 3 345542 CASAVA_Build 9 87117897 4I CAGCCTCAAA ----/CTCT CTCCCAGGCA 3070 hom 70 het 29 0 22 7 CT 1 3 345543 CASAVA_Build 9 87122956 23D GACAAAATAC ATAAAAGACCTGTATACAGACCT/----------------------- ATAAAACATT 3070 hom 96 het 29 0 33 4 ATAAAAGACCTGTATACAGACCT 1 0 345544 CASAVA_Build 9 87123351 10D ACTTATTATA AAGCTACAGC/---------- AATTGGGATA 3070 hom 154 het 54 0 52 6 AAGCTACAGC 1 0 345545 CASAVA_Build 9 87127494 1D ATTGAACACA G/- GGCGCCAGGG 3070 hom 75 het 28 0 25 4 G 3 2 345546 CASAVA_Build 9 87130839 1D ACAGTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 11 10 345547 CASAVA_Build 9 87130974 1I AGAATGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 920 hom 27 2 20 5 A 11 12 345548 CASAVA_Build 9 87153738 3I TGCATTACTA ---/GGT GGTGCTCCTC 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 GGT 1 2 345549 CASAVA_Build 9 87197385 8D TGCTTCCTTC CTTCTTTT/-------- CTTTTTTTTT 3070 het 2759 hom 39 12 19 10 CTTCTTTT 1 0 345550 CASAVA_Build 9 87253209 1I TCCAGTTCTC -/G GGGGGGAATG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 G 6 7 345551 CASAVA_Build 9 87258184 1I9M13I TATCAAAAGG -TACATTTCC-------------/ATACATTTCCCTAGGTAGCTTGA CTAACTATTT 3070 hom 84 het 28 0 29 2 N/A 0 0 345552 CASAVA_Build 9 87259539 4D AGATATATAT AGAG/---- AGAGATTTAC 1471 hom 7 het 3 0 3 0 AG 4 2 345553 CASAVA_Build 9 87262436 1I TGAGGTGCAC -/G GGTACTCATT 3070 hom 135 het 50 0 43 7 G 2 3 345554 CASAVA_Build 9 87293808 1I GTAAGACCCT -/A AAAGAAAGCC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 3 4 345555 CASAVA_Build 9 87311263 1I CATCTACCCA -/T TTCCACAGAG 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 2 3 345556 CASAVA_Build 9 87315001 4D GAACCCTGTC TGTT/---- CTTGCACAGC 3070 het 3070 ref 48 27 21 3 TGTT 1 0 345557 CASAVA_Build 9 87331778 1I AAAGGAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 10 11 345558 CASAVA_Build 9 87364379 2I AAACCAGGTT --/GG GACCAACTGG 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 G 1 3 345559 CASAVA_Build 9 87399324 1D GACTGTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 A 11 10 345560 CASAVA_Build 9 87414026 1D TGTACAGATC T/- TTTTTTTTTT 1445 het 942 hom 17 6 4 7 T 17 16 345561 CASAVA_Build 9 87431421 3D CAGCAAACTT CTC/--- CTACAAAGAG 3070 het 3070 hom 38 18 17 4 CTC 1 0 345562 CASAVA_Build 9 87441776 1D CCCCAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 1176 het 39 hom 12 1 6 5 T 19 18 345563 CASAVA_Build 9 87445466 1I AGAATGCAAG -/A ACAACTCATC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 1 2 345564 CASAVA_Build 9 87460430 1D ATTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 11 10 345565 CASAVA_Build 9 87474532 1D AGTTATATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2928 hom 32 12 12 8 A 15 14 345566 CASAVA_Build 9 87489714 1D ACTTGAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 11 10 345567 CASAVA_Build 9 87543061 1I TACTGGAGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 814 hom 43 2 34 7 A 9 10 345568 CASAVA_Build 9 87714019 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 2784 het 2623 hom 28 9 12 7 A 13 15 345569 CASAVA_Build 9 87809174 1D TGATCCCACC A/- ACTGCATTCC 3070 hom 65 het 25 0 22 3 A 2 1 345570 CASAVA_Build 9 87820755 2D TATATATTTT TA/-- TATATATATA 1488 het 1488 ref 29 16 4 9 TA 7 6 345571 CASAVA_Build 9 87834369 1D TTAAAGGCTC T/- TAATAAAGTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 2 1 345572 CASAVA_Build 9 87844703 1D ATGCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1807 het 1807 ref 18 8 5 5 A 17 16 345573 CASAVA_Build 9 87858447 3D ACATACCCCA CCG/--- CATCACAGAC 3070 hom 28 het 24 0 9 16 CCG 1 0 345574 CASAVA_Build 9 87860718 4I AAAAAAACAA ----/AAAC AAACAAACCA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AAAC 2 3 345575 CASAVA_Build 9 87860874 1D TAGCTCCCCT C/- CCGACCCAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 3 2 345576 CASAVA_Build 9 87884682 1D AATGTGAACT C/- CCCCCCATGT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 7 6 345577 CASAVA_Build 9 87889786 4D TGTCCCAGAG AAAC/---- AAACAAAAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AAAC 2 1 345578 CASAVA_Build 9 87893308 4D CCTGGTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 18 1 13 4 T 16 12 345579 CASAVA_Build 9 87898900 1D CCGGGCCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 34 0 23 11 T 13 12 345580 CASAVA_Build 9 87899810 1I AACCCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 2513 het 531 hom 19 2 12 5 A 14 15 345581 CASAVA_Build 9 87903017 2D ATCTTTTATA AC/-- ACAACTGGAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AC 2 1 345582 CASAVA_Build 9 87914407 5I TTCCTAGCAC -----/AAAGA AAAGACAAAT 3070 het 3070 hom 23 10 13 0 AAAGA 1 2 345583 CASAVA_Build 9 87922088 1D19M1D TATGATAATT AAAAAAAAAATTAAAGACCCT/-AAAAAAAAATTAAAGACCC- TTTTTTCCTC 3070 het 2080 hom 19 8 10 5 N/A 0 0 345584 CASAVA_Build 9 87927657 1I ATTTTTGTAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 1614 hom 19 4 13 2 T 8 9 345585 CASAVA_Build 9 87928553 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2539 hom 24 7 13 4 A 9 10 345586 CASAVA_Build 9 87929543 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 12 13 345587 CASAVA_Build 9 87940062 1I ACTTACATAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 8 9 345588 CASAVA_Build 9 87941320 1D CCTCTCTGAA T/- TTTTTTTTTT 2129 het 1819 hom 24 10 7 7 T 17 16 345589 CASAVA_Build 9 87948217 2I19M1I CTAAAATTTT --TCTGTACATTGTGAACTAT-/TCTCTGTACATTGTGAACTATA ACAAGTGGAG 3070 het 3070 hom 48 25 25 5 N/A 0 0 345590 CASAVA_Build 9 87949182 1D TTCTTGGGTT G/- GGGGGGGGCC 1700 het 1700 ref 21 10 5 6 G 9 8 345591 CASAVA_Build 9 87959307 1D GTTGGGTGAC A/- GGGGAGTATA 3070 het 3070 hom 22 8 11 4 A 1 0 345592 CASAVA_Build 9 87960568 1D ACACATTCTC A/- AAAACCTGCA 3070 het 3070 hom 28 9 11 9 A 5 4 345593 CASAVA_Build 9 87977106 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 2756 hom 25 6 14 5 T 8 9 345594 CASAVA_Build 9 87999351 1D TAGAAATAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 17 19 4 T 9 8 345595 CASAVA_Build 9 88004900 1I TGGAGAGTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 9 10 345596 CASAVA_Build 9 88022705 2D AGACCACCTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 53 22 23 9 GT 7 6 345597 CASAVA_Build 9 88042185 2D AAGACACACA CT/-- GTTATTTACT 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 CT 1 0 345598 CASAVA_Build 9 88046097 3D TAGATACTCA TCT/--- TCTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 TCT 2 1 345599 CASAVA_Build 9 88047881 1D TTTGGAGGAG A/- AATTAGTCTC 3070 het 3070 hom 44 16 20 9 A 3 2 345600 CASAVA_Build 9 88054293 1I CTTTTTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 het 740 hom 46 6 31 9 C 0 1 345601 CASAVA_Build 9 88055455 1I TTCTTTGTTG -/T TTTTTTTACG 3070 het 3070 ref 51 25 18 8 T 7 8 345602 CASAVA_Build 9 88057730 1I TTAAGAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 24 11 4 T 11 12 345603 CASAVA_Build 9 88059921 3D ATCTCTATCT AAC/--- AACTTCTAAC 3070 het 3070 ref 31 17 13 3 AAC 2 1 345604 CASAVA_Build 9 88063767 1I CAGAGCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 T 12 13 345605 CASAVA_Build 9 88068193 2I CTTAGCTTCA --/CT CTGTGTTTTT 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 CT 1 2 345606 CASAVA_Build 9 88088349 5D TGCAGTTTCT GAAAG/----- GATAGTTCAA 3070 het 3070 ref 35 13 14 10 GAAAG 1 0 345607 CASAVA_Build 9 88088809 1I AGATAGAAAG -/A AAGAAAGAAA 2367 het 2367 ref 15 8 5 2 A 2 3 345608 CASAVA_Build 9 88089917 4I TATTTAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 39 9 21 9 AAAC 2 3 345609 CASAVA_Build 9 88099322 1I TATCAACTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2689 hom 22 6 12 4 A 9 10 345610 CASAVA_Build 9 88100559 4D ATTAAAATGG AATA/---- AATAAATAGA 3070 het 3070 ref 29 12 15 5 AATA 3 2 345611 CASAVA_Build 9 88107067 4D TAAGTGGAAT ACAA/---- ACAAAGAGTG 3070 het 3070 hom 40 18 21 4 ACAA 2 1 345612 CASAVA_Build 9 88115355 2D ATGAAATGAA TG/-- TGACTTCTTT 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 TG 2 1 345613 CASAVA_Build 9 88119126 1I CTTTCAATGC -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 A 7 8 345614 CASAVA_Build 9 88127672 3D CACAGGTGAA TTT/--- TTTTCTTCAC 3070 het 3070 hom 47 16 29 2 T 7 4 345615 CASAVA_Build 9 88129353 1D ATAAAGCTTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 15 11 5 A 9 8 345616 CASAVA_Build 9 88134259 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1554 hom 21 7 10 4 A 13 12 345617 CASAVA_Build 9 88138569 2D GGTGAGGTTT TA/-- TGTTTATCTG 3070 het 3070 ref 62 29 28 5 TA 1 0 345618 CASAVA_Build 9 88172089 1D TGCTGGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 11 10 345619 CASAVA_Build 9 88172574 1D GAATGAGTCA G/- GGTGGAGTAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 G 3 2 345620 CASAVA_Build 9 88172717 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAATT 2636 het 2636 ref 22 12 7 3 A 9 8 345621 CASAVA_Build 9 88178188 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 10 11 345622 CASAVA_Build 9 88178810 1I TCCCATAAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 9 10 345623 CASAVA_Build 9 88180674 1D CCTGATATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1143 hom 30 5 12 13 T 15 14 345624 CASAVA_Build 9 88189125 1D TTTAAAATTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 T 9 8 345625 CASAVA_Build 9 88205446 4D TGTTTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2854 het 2854 ref 22 9 9 4 TTTC 3 2 345626 CASAVA_Build 9 88218791 1D AGCAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2905 het 2905 ref 25 12 8 5 A 12 11 345627 CASAVA_Build 9 88219395 2D TGGGGCAGAA CT/-- CTCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 39 16 18 6 CT 5 4 345628 CASAVA_Build 9 88220008 3I TCAAGAGTAA ---/TGT TGTCAAGATG 3070 het 3070 hom 33 15 17 1 TGT 1 2 345629 CASAVA_Build 9 88226060 1D GCCTGGATAA T/- TTTTTTTTTT 2236 het 1375 hom 13 5 6 2 T 13 12 345630 CASAVA_Build 9 88226656 6D AGAAAATTTA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 103 het 103 ref 42 18 2 22 TG 11 8 345631 CASAVA_Build 9 88233081 1I CATCGATCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 9 10 345632 CASAVA_Build 9 88238678 2I GTTTTAAGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1468 hom 28 6 13 9 T 12 14 345633 CASAVA_Build 9 88243547 1D CTTCCATCAC T/- TTTCTACCTA 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 4 3 345634 CASAVA_Build 9 88249660 1I CCTGAAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 9 8 6 T 10 11 345635 CASAVA_Build 9 88253512 1I TCTTTCCCTT -/C CCCCCCCCAT 1933 het 1933 ref 26 11 8 7 C 8 9 345636 CASAVA_Build 9 88263759 1D ACTTTTTTTT C/- CCCTCAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 C 4 3 345637 CASAVA_Build 9 88270150 1I TTGGAGCCAC -/A ATCTGTGCAG 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 A 1 2 345638 CASAVA_Build 9 88270615 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2905 het 78 hom 16 2 8 6 T 11 10 345639 CASAVA_Build 9 88271909 3D TGTTTTAAAA AAT/--- AATAATAATG 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 AAT 4 3 345640 CASAVA_Build 9 88275028 1D GATGGAGACA T/- TTTCTGGAGG 3070 het 3070 hom 48 18 24 7 T 4 3 345641 CASAVA_Build 9 88282880 1I GATTCACTGA -/T TTTTTTGAAG 1439 het 1439 ref 13 7 3 4 T 6 7 345642 CASAVA_Build 9 88290921 1D TCTTTTGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 7 A 11 10 345643 CASAVA_Build 9 88317254 1D GAGAAACTCA T/- TAATAAATAT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 2 1 345644 CASAVA_Build 9 88318740 1I ATTACATTCC -/T TTTTTTTTTT 1536 het 1536 ref 30 12 4 14 T 15 16 345645 CASAVA_Build 9 88332342 1I TGAACTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 A 10 11 345646 CASAVA_Build 9 88336298 1D TTCTATTATG A/- AACCATGAGG 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 3 2 345647 CASAVA_Build 9 88361485 1I TTTACCTCAA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 2 3 345648 CASAVA_Build 9 88367843 1D TTAAAGTGTT A/- AAAAAAATGG 2839 het 2839 ref 22 13 7 3 A 8 7 345649 CASAVA_Build 9 88389503 1D GTAAACATAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 62 het 27 0 20 8 T 10 9 345650 CASAVA_Build 9 88392655 2I GCACAGAGAT --/AA GAGGTTGGGG 1947 hom 10 het 6 0 4 2 A 0 2 345651 CASAVA_Build 9 88450535 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 638 hom 30 2 22 6 T 12 13 345652 CASAVA_Build 9 88458675 1I GAGAGAGCTC -/A GGGGAAACTG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 0 1 345653 CASAVA_Build 9 88461528 1I ACCTGCTTCA -/G AAATCCCCGG 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 G 0 1 345654 CASAVA_Build 9 88464274 3I TGGTACCCAA ---/TTC TTCTTTCCTT 3070 het 3070 ref 49 27 19 3 TTC 1 2 345655 CASAVA_Build 9 88464652 2D GTCCATTTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 37 2 26 9 A 14 12 345656 CASAVA_Build 9 88469851 1D AAGGGTGGGA T/- TTTTTATATC 3070 het 3070 hom 40 15 16 11 T 6 5 345657 CASAVA_Build 9 88475319 4D AATAAAGTCA AAAC/---- ACCTTTTGGA 3070 het 3070 ref 44 25 17 4 AAAC 1 0 345658 CASAVA_Build 9 88480354 1I CAGGCCAGGG -/T CTCCTGCAGG 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 0 1 345659 CASAVA_Build 9 88480431 1D GGATTGAGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 10 9 345660 CASAVA_Build 9 88480628 1D TCTTCGTGCC T/- TTTTTTTTTT 1034 het 1034 ref 54 43 3 9 T 11 10 345661 CASAVA_Build 9 88498609 1D GGGAAAAGTT A/- AAAAGTTAAA 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 A 5 4 345662 CASAVA_Build 9 88501739 3I TATACAAGAC ---/ATT ATAGATAATA 3070 het 3070 ref 53 23 23 7 ATT 0 1 345663 CASAVA_Build 9 88501874 1D TAATATTGTA T/- TTTTTTAGCA 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 T 7 6 345664 CASAVA_Build 9 88502368 10I GTCTGCAGAC ----------/AACATGTGAA AATAATTTAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AACATGTGAA 0 1 345665 CASAVA_Build 9 88504221 1I GAGCCAGATT -/A AAAAAAAAAA 3054 het 3054 ref 31 14 9 8 A 12 13 345666 CASAVA_Build 9 88508476 2I TTCTACTTAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 20 20 10 AC 7 8 345667 CASAVA_Build 9 88547929 1I ACCGTCAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 24 14 12 T 9 10 345668 CASAVA_Build 9 88551307 1D AAAAAATGCA T/- TTTTTTTTTT 730 het 730 ref 28 16 3 9 T 13 12 345669 CASAVA_Build 9 88564326 3I ATTAATGATG ---/ATA ATAATAATAA 3070 hom 80 het 38 0 26 12 ATA 5 6 345670 CASAVA_Build 9 88566377 1I ATGGTGGGAG -/A CAAAAGGAAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 0 1 345671 CASAVA_Build 9 88574485 2D ATAAGATTGT GG/-- GGGGGGGGGG 2740 hom 18 het 18 0 7 11 G 12 10 345672 CASAVA_Build 9 88579085 1I GGTTCCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 A 10 11 345673 CASAVA_Build 9 88584237 1I AAATACCATG -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 49 17 32 0 A 6 7 345674 CASAVA_Build 9 88592574 2D TAAGTCAGTC TG/-- TGATCTGTGC 3070 het 3070 ref 32 19 9 5 TG 2 1 345675 CASAVA_Build 9 88600906 1I GCACAACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 16 12 A 11 12 345676 CASAVA_Build 9 88607722 32D TGGGTATGTA TGTGTGGGTGTATGTGAACACATGCATGAGTG/-------------------------------- TGTGTGGGTG 3070 het 3070 ref 47 41 17 14 TGTGTGGGTGTATGTGAACACATGCATGAGTG 1 0 345677 CASAVA_Build 9 88612159 1D ATCTAAATGT G/- AATCTAAAAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 1 0 345678 CASAVA_Build 9 88615992 1D GGTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 34 1 22 11 T 11 10 345679 CASAVA_Build 9 88617393 1D TATTGGCCAC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 8 7 345680 CASAVA_Build 9 88627172 1I ACGGAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 10 11 345681 CASAVA_Build 9 88634276 1D TGTTTTCATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2861 hom 27 9 13 6 A 10 9 345682 CASAVA_Build 9 88637265 1D TATATGTTTA T/- TGACCATTTG 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 T 2 1 345683 CASAVA_Build 9 88644236 2D GCATAAAATA AG/-- AGAGGGCAAA 3070 het 3070 ref 47 24 17 8 AG 3 2 345684 CASAVA_Build 9 88657597 19D CAACTTTTAT TTTAGCTTCAAGGGGCACA/------------------- TTTGCAGGAT 3070 het 3070 hom 35 15 18 9 TTTAGCTTCAAGGGGCACA 1 0 345685 CASAVA_Build 9 88661380 1I AGAGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 2600 het 2600 ref 36 13 12 11 A 13 14 345686 CASAVA_Build 9 88678533 1D ATAAAAAGTA G/- GGGGGGGGTC 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 G 9 8 345687 CASAVA_Build 9 88695068 2I GTTTTGAGAC --/AG AGTCTCGCTC 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 AG 1 2 345688 CASAVA_Build 9 88705002 1D TTAAGAGTCA C/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 C 1 0 345689 CASAVA_Build 9 88709758 6I AGGCATCCTC ------/GGGGTG GGGGTGGCAG 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 GGGGTG 1 2 345690 CASAVA_Build 9 88771766 4D GAGAAGGACA TATT/---- TATTAAACAC 3070 het 3070 ref 43 26 16 2 TATT 2 1 345691 CASAVA_Build 9 88797522 1I GATTTTTTGG -/C CCCTTTTTTT 3070 het 433 hom 26 4 17 5 C 3 4 345692 CASAVA_Build 9 88800136 1I TGCACAGGTA -/T TTCTTCTTTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 3 345693 CASAVA_Build 9 88800835 4D ATCTGTACTT TATC/---- TGTGCAATCT 3070 het 3070 ref 58 31 25 4 TATC 1 0 345694 CASAVA_Build 9 88802515 1I AGCTTTTGGT -/G GTTCTCAAGC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 G 1 2 345695 CASAVA_Build 9 88803520 2I GAGGTGAAGC --/AA AGAGTGTGGA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 A 1 3 345696 CASAVA_Build 9 88807149 1D GCTTTTTATC T/- ACTTGAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 1 0 345697 CASAVA_Build 9 88809603 1D GCATTTATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 T 10 9 345698 CASAVA_Build 9 88813217 1I TTAAATAAGC -/A AAAAAAAAAC 2160 het 2160 ref 24 14 6 4 A 9 10 345699 CASAVA_Build 9 88817375 3D AGTGGTGGCA ATG/--- ATAACTTGGT 3070 het 3070 ref 54 26 18 11 ATG 1 0 345700 CASAVA_Build 9 88834537 3I ATAATAATAA ---/TAC TAATAATAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAC 0 1 345701 CASAVA_Build 9 88834635 4I TATTTTTCTG ----/ATCA AATCTCATTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 ATCA 0 1 345702 CASAVA_Build 9 88836903 1I CTGGTAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1020 hom 49 3 35 11 T 12 13 345703 CASAVA_Build 9 88841396 4I TTCATAAAAA ----/AGAC AGATCGCAAA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AGAC 0 1 345704 CASAVA_Build 9 88855783 10D TCCATCCTCA AGTAGACCCC/---------- AGTGTCTGTT 3070 het 3070 ref 42 21 18 7 AGTAGACCCC 1 0 345705 CASAVA_Build 9 88857092 2I ATCTGTTGAT --/AA GAGATAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 A 0 2 345706 CASAVA_Build 9 88857899 1I AACACACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 T 11 12 345707 CASAVA_Build 9 88859634 1D AGAGGGGACT G/- GCCCTGGGCC 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 G 2 1 345708 CASAVA_Build 9 88905271 1D TGAAATTGGC A/- AAAAAAGATA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 7 6 345709 CASAVA_Build 9 88943073 2D CCAGTGAGGT AG/-- AGATGTTTAT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 AG 2 1 345710 CASAVA_Build 9 88947419 1I GGATTAAAAG -/A AATTACTTAT 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 2 3 345711 CASAVA_Build 9 88947870 3I TACAAGATAA ---/TTT TTTACTTCCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 3 6 345712 CASAVA_Build 9 88948713 1I AATGAAGAAC -/A AGACTTAGAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 1 2 345713 CASAVA_Build 9 88949673 3D GAAAGAAAGA AAG/--- AAAGAAAGAA 6 hom 3 het 5 0 1 4 AAG 1 0 345714 CASAVA_Build 9 88949802 1I AACAGAAGCT -/C CTTTGCAAAC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 1 2 345715 CASAVA_Build 9 88951599 1D TACCTGACCA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 66 het 28 0 20 8 C 9 8 345716 CASAVA_Build 9 88951984 1D TCAGCAAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 79 het 43 0 35 8 A 9 8 345717 CASAVA_Build 9 88952108 1D TTGTAATGAA T/- TTTTAATTAC 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 T 5 4 345718 CASAVA_Build 9 88952420 1I AAATTGCTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 43 1 38 4 T 10 11 345719 CASAVA_Build 9 88954480 3D AATGTGATGG TAT/--- TATTAGGAGG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 TAT 2 1 345720 CASAVA_Build 9 88955480 1I ATCACACGAA -/T AAAAGTGAGC 3070 hom 135 het 48 0 46 2 T 0 1 345721 CASAVA_Build 9 88958131 1D TTCTGGGTTT A/- ATGCCATCAA 3070 hom 96 het 33 0 32 1 A 2 1 345722 CASAVA_Build 9 88964315 2D ATCACAAAGA AC/-- ACTAGAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 AC 2 1 345723 CASAVA_Build 9 88980885 4I CCCTGCCCCC ----/CTCT CCCCCCCTCT 3070 hom 84 het 30 0 27 3 CT 0 2 345724 CASAVA_Build 9 88986432 1I ATATTTTATA -/T TATATATATA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 1 2 345725 CASAVA_Build 9 88993753 3D GTGAACAGTT AGG/--- GTGCCCCGAG 3070 hom 120 het 46 0 39 9 AGG 1 0 345726 CASAVA_Build 9 89001682 4I TTTAAAAAAA ----/AGAT AGTTGTTTTC 3070 hom 120 het 42 0 40 2 AGAT 0 1 345727 CASAVA_Build 9 89023787 1I ATATTTTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 12 13 345728 CASAVA_Build 9 89037285 5I AGCACCCCAC -----/AGGGA AGGGAAGGAG 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 AGGGA 1 2 345729 CASAVA_Build 9 89061106 1I ATACAATGAC -/A AAAAAAGATG 3070 het 3070 hom 60 20 35 5 A 6 7 345730 CASAVA_Build 9 89062546 1I TTTTTACTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 10 11 A 9 10 345731 CASAVA_Build 9 89087465 1I GCCAGGTTGG -/A AAAAAAAGTG 3070 het 157 hom 37 1 33 3 A 7 8 345732 CASAVA_Build 9 89108109 1D TCCCAACTGC T/- TTTTTTTTTT 1972 het 1972 ref 38 27 5 6 T 13 12 345733 CASAVA_Build 9 89109814 1I TAGGTAGGAG -/A AAAAAATGAG 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 A 6 7 345734 CASAVA_Build 9 89113073 1D TCTGATTGAA G/- GGGGAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 5 4 345735 CASAVA_Build 9 89130878 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 261 hom 24 1 22 1 A 12 11 345736 CASAVA_Build 9 89137041 2D ACTGGGAAAG AT/-- AATAAAATGG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AT 1 0 345737 CASAVA_Build 9 89151117 1D TTCCAAAGTC A/- AAAAAAAAAA 2013 het 2013 ref 41 21 5 16 A 15 14 345738 CASAVA_Build 9 89158479 1I CAGAATAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 10 11 345739 CASAVA_Build 9 89160144 7I ACAAATTATC -------/TAGCAGA TGGCAACATT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 TAGCAGA 0 1 345740 CASAVA_Build 9 89160411 1I TGGCAAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 51 27 15 9 A 9 10 345741 CASAVA_Build 9 89162569 1I CATTCTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 T 9 10 345742 CASAVA_Build 9 89166841 1I GAATGGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2438 hom 30 9 15 6 A 13 14 345743 CASAVA_Build 9 89166914 1I ACATAGACTG -/A AAAGAAAGGG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 A 3 4 345744 CASAVA_Build 9 89192661 1I ATTCAAAGAA -/C AATTGCTCAT 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 C 0 1 345745 CASAVA_Build 9 89193428 1D GAGTGAGACA C/- CCCCCCCCCC 2080 het 1252 hom 20 5 7 8 C 11 10 345746 CASAVA_Build 9 89203892 1I TCATGCTTGT -/A ATCCCAACAC 3070 het 3070 ref 31 20 9 2 A 1 2 345747 CASAVA_Build 9 89210390 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAGCAA 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 A 7 6 345748 CASAVA_Build 9 89225505 11I ATAGTAAATA -----------/TATTTTCTTAT TATTTTCTTA 3070 het 2418 hom 22 8 12 2 TATTTTCTTAT 1 2 345749 CASAVA_Build 9 89227169 1D TTGAAAAGTG A/- AAAAAAAGCC 3070 het 2516 hom 21 6 12 3 A 8 7 345750 CASAVA_Build 9 89229127 1I CTGAAACTTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 8 9 345751 CASAVA_Build 9 89245019 5D TTGCTTGAAC CCCAA/----- CCGGGAGGCA 2046 het 2046 ref 14 9 5 1 CCCAA 1 0 345752 CASAVA_Build 9 89246724 1I TGTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 0 1 345753 CASAVA_Build 9 89256255 1I GATGCACGCT -/G CAAACAAGAT 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 G 0 1 345754 CASAVA_Build 9 89257599 2I TCCCTGGAAT --/TC TCTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 41 21 19 1 TC 3 4 345755 CASAVA_Build 9 89261783 1D TATTTTGTTA T/- TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 8 7 345756 CASAVA_Build 9 89261997 11I AGTTTGGAGG -----------/AAGAAATGTAT AAGCAGATAT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 AAGAAATGTAT 0 1 345757 CASAVA_Build 9 89262669 10I CATGGCAAGG ----------/AGGATGAGAC AGTATGATAT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 AGGATGAGAC 0 1 345758 CASAVA_Build 9 89267525 1I CAGGCATGAG -/C CACCAAGCCT 1265 hom 10 het 5 0 3 2 C 1 2 345759 CASAVA_Build 9 89328561 14D CACTGTTGGT AGCTGTAGGGAATC/-------------- AGCAAAGCTG 3070 het 3070 ref 32 19 14 4 AGCTGTAGGGAATC 1 0 345760 CASAVA_Build 9 89331951 1I TGAAGACACT -/C TGCTTTTGCC 3070 het 3070 ref 66 35 25 6 C 0 1 345761 CASAVA_Build 9 89332955 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2625 het 194 hom 32 3 10 19 T 15 14 345762 CASAVA_Build 9 89333500 1D CCAGCTACTC G/- GGAGGCTGAG 3070 het 1041 hom 15 3 9 3 G 3 2 345763 CASAVA_Build 9 89335652 3I TCTTCTTCAA ---/AGG AGATTTTAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AGG 0 1 345764 CASAVA_Build 9 89338842 1D TTTCTTGCGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 9 T 13 12 345765 CASAVA_Build 9 89338994 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 131 hom 26 1 18 7 T 11 12 345766 CASAVA_Build 9 89342350 2I TACATGGTAA --/GT GTAGATATAT 3070 hom 192 het 71 0 64 7 GT 1 2 345767 CASAVA_Build 9 89344282 12I CTCCTGCCTC ------------/AGCCTCCCAAGT AGCTGGGATT 2141 het 839 hom 8 2 5 1 AGCCTCCCAAGT 0 1 345768 CASAVA_Build 9 89352312 10D GAGAGAGAGA GAGTGTGTGT/---------- GTGTGTGTGT 2150 het 423 hom 14 3 8 4 GAGTGTGTGT 1 0 345769 CASAVA_Build 9 89358227 1D TTTTCTTTTC T/- TTTCTTTTTT 2064 het 1827 hom 27 11 13 3 T 4 3 345770 CASAVA_Build 9 89359182 1D ATGTAATACT A/- AAAAAAAAAA 2975 het 2975 ref 29 13 8 9 A 13 12 345771 CASAVA_Build 9 89363257 2I ACACACACAC --/AT AGCCGTGTGA 3070 het 308 hom 60 1 50 9 AT 0 1 345772 CASAVA_Build 9 89370331 1D AGGCTGAATG T/- TGTGATGTTC 3070 het 3070 hom 46 22 20 5 T 2 1 345773 CASAVA_Build 9 89373784 1I GTCACGTGTG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 345774 CASAVA_Build 9 89375521 1D TTTCAGGAAC A/- GCAGAGAGGG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 1 0 345775 CASAVA_Build 9 89387293 1I ATTTTCCTGC -/T TTTTTTTTTT 1841 het 1841 ref 32 13 12 7 T 15 16 345776 CASAVA_Build 9 89389414 2I TGTGTGTGTG --/TA TGTGTGTGTG 3070 het 126 hom 24 4 11 9 TA 0 1 345777 CASAVA_Build 9 89394291 1I CATCAAGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 690 hom 43 3 36 4 T 10 11 345778 CASAVA_Build 9 89431177 3D ACAAACAAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 AAC 6 5 345779 CASAVA_Build 9 89443104 16I GGGGCTGCTC ----------------/TTGGCTACTGGGACAT TAGCCAGCAG 3070 hom 99 het 36 0 33 4 TTGGCTACTGGGACAT 0 1 345780 CASAVA_Build 9 89474500 1I GCCAGGGGCA -/G GGGGGGGGCC 3070 hom 77 het 30 0 24 6 G 8 9 345781 CASAVA_Build 9 89476245 1I TTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 24 0 22 2 T 9 10 345782 CASAVA_Build 9 89487824 5I TTATTTATTT -----/ATTTA TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 ATTTA 0 1 345783 CASAVA_Build 9 89492543 1D GCTTCTGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 90 het 41 0 31 10 T 10 9 345784 CASAVA_Build 9 89495239 1D ATGCTTTTTA T/- TTCTTTCCCT 3070 het 3070 hom 38 17 19 3 T 3 2 345785 CASAVA_Build 9 89496977 2D AATGACCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 28 0 21 8 T 13 11 345786 CASAVA_Build 9 89500904 2I ATGTATACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 133 hom 33 1 26 6 AC 7 8 345787 CASAVA_Build 9 89516126 3I CTGGAGGGCA ---/TGG TGGTGATGAT 3070 hom 127 het 46 0 43 3 TGG 1 2 345788 CASAVA_Build 9 89516242 1I CTTTAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 32 0 28 4 G 0 1 345789 CASAVA_Build 9 89517783 2D GTGTGTGCTT TG/-- TGTGTGTGGT 3070 hom 149 het 58 0 47 13 TG 5 4 345790 CASAVA_Build 9 89542308 1I ATTCAATCTC -/A AAAAAAAAAT 2155 hom 12 het 7 0 5 2 A 9 10 345791 CASAVA_Build 9 89542936 4I GCAATCCCAT ----/TACC TACCGGGTAT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TACC 1 2 345792 CASAVA_Build 9 89545869 1I CTAAATAGCT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 9 345793 CASAVA_Build 9 89558534 2D ATCACACATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 111 het 49 0 38 11 TG 7 6 345794 CASAVA_Build 9 89571249 2I GGCACGTGTC --/TG TAGTCCCAGC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TG 0 1 345795 CASAVA_Build 9 89582242 3D TTTCTCTAGC AGA/--- AGATTTCCCC 3070 hom 63 het 25 0 22 5 AGA 2 1 345796 CASAVA_Build 9 89592516 1I TGGAATGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 855 hom 41 2 30 9 T 11 12 345797 CASAVA_Build 9 89597464 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 2755 hom 39 het 14 0 12 5 AAAAG 4 3 345798 CASAVA_Build 9 89598041 1D AACCCACTGG C/- CAGCCAGAAT 3070 hom 86 het 36 0 29 9 C 2 1 345799 CASAVA_Build 9 89607557 1I AATGACAGTC -/A AATGTCCCCC 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 2 3 345800 CASAVA_Build 9 89609752 1I CCAGTGGTGG -/T TTTTTTTCTT 2958 hom 57 het 22 0 19 3 T 7 8 345801 CASAVA_Build 9 89614258 1I AACCAATAGG -/A AACCTCTATA 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 A 2 3 345802 CASAVA_Build 9 89616447 1D AGAGAACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2959 hom 33 10 14 9 T 13 12 345803 CASAVA_Build 9 89620297 2D AATGATGTAT GA/-- GAGTTTACTT 3070 het 3070 ref 33 18 14 2 GA 2 1 345804 CASAVA_Build 9 89625471 1D CTCCAGCTGG T/- TCAGGAACAT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 2 1 345805 CASAVA_Build 9 89645991 4D TGTTTATTTA TTTG/---- TTTGTTTGTT 2775 het 2775 ref 23 10 8 5 TTTG 4 3 345806 CASAVA_Build 9 89646171 1D ATTTTTGTAA T/- TTTTTTTTTT 2020 het 2020 ref 23 10 6 7 T 12 11 345807 CASAVA_Build 9 89663926 12D CAGCCAGCTG GGAAGGCCTCAC/------------ GGACAAGACG 2707 het 2707 ref 32 16 11 9 GGAAGGCCTCAC 1 0 345808 CASAVA_Build 9 89666044 1D AAAATTTGCA C/- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 C 1 0 345809 CASAVA_Build 9 89667318 1D TTCTCTTGCC A/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 1 0 345810 CASAVA_Build 9 89667646 1D GTCCACAGTT A/- AGAGTGTTGC 3070 het 3070 hom 48 19 25 5 A 2 1 345811 CASAVA_Build 9 89668062 1I ACTGTGTGGC -/A AGAAGCAGGC 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 A 1 2 345812 CASAVA_Build 9 89681295 1I CTACTCCATC -/G CCCCCACCCT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 G 0 1 345813 CASAVA_Build 9 89699368 1D ATAACTGCTA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 7 6 345814 CASAVA_Build 9 89706298 1D CCAGCAGCAG A/- AAAAAAAAAA 2605 het 2030 hom 21 7 8 6 A 12 11 345815 CASAVA_Build 9 89706653 3D CTCTGAACAG AAC/--- AATAACAGAG 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 AAC 1 0 345816 CASAVA_Build 9 89714144 24D CCTCCTAAGT CCCCACAGTCATCCTCCCCCACAA/------------------------ CCCCACAGTC 3070 het 3070 ref 27 15 12 3 CCCCACAGTCATCCTCCCCCACAA 1 0 345817 CASAVA_Build 9 89740591 5I CCAAAAAAAG -----/AAGAA AAGAAAAGTT 1747 het 1747 ref 12 6 4 2 AAGAA 1 2 345818 CASAVA_Build 9 89759772 2D ATAAAATAAC AT/-- AATCAAGACT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 AT 1 0 345819 CASAVA_Build 9 89762628 4D ACACACACAC ACAT/---- ACACACCATG 3070 het 3070 ref 30 15 13 4 ACAT 1 0 345820 CASAVA_Build 9 89778163 4I AAGGGAAGAA ----/TGTC TGGACTCTCA 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 TGTC 0 1 345821 CASAVA_Build 9 89779908 1D TTGAAAATAC A/- AAAAAAATTA 2742 het 1211 hom 16 4 8 4 A 8 7 345822 CASAVA_Build 9 89781290 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 11 10 345823 CASAVA_Build 9 89782536 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1497 het 1497 ref 34 9 12 13 T 17 16 345824 CASAVA_Build 9 89783774 1I GCAGAATTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 9 10 345825 CASAVA_Build 9 89788827 2I AATGTTTTAT --/AC ACACACACAC 3005 het 3005 ref 35 13 11 11 AC 7 8 345826 CASAVA_Build 9 89813036 2I TTTGAGAGAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 AG 5 6 345827 CASAVA_Build 9 89824985 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2815 het 2815 ref 28 11 9 8 T 12 13 345828 CASAVA_Build 9 89868161 2D AGGATCTGTG TA/-- TATATATATA 2168 het 1690 hom 15 7 5 3 TA 7 6 345829 CASAVA_Build 9 89874936 1I TATAGGACAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 14 14 12 T 8 9 345830 CASAVA_Build 9 89877610 1D GGAGCAGAAA G/- AAGAGAGAGT 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 G 1 0 345831 CASAVA_Build 9 89877689 8I CATGAGAACA --------/GCACCATC GCACCAAGAG 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 GCACCATC 0 1 345832 CASAVA_Build 9 89883859 1D TATCCGGGTC A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 42 19 15 9 A 8 7 345833 CASAVA_Build 9 89886263 1D TATGAGTCCT A/- AACCAATATA 3070 het 3070 hom 26 10 13 4 A 3 2 345834 CASAVA_Build 9 89890741 4I ATCTAATTTA ----/CTGT CTGTCATTCC 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 CTGT 1 2 345835 CASAVA_Build 9 89895486 4I TCGATTCCTC ----/TGTT TGTTTAAATT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 TGTT 1 2 345836 CASAVA_Build 9 89901244 3D GGATAATTTT TTG/--- TTTTTAGTTG 3070 het 2921 hom 21 8 12 4 TTG 1 0 345837 CASAVA_Build 9 89901824 2I TCTCCTACAC --/AT GATTTACACC 3070 het 3070 hom 54 17 34 3 AT 0 1 345838 CASAVA_Build 9 89902857 3I TACATGCTCG ---/CAC CACCACACCC 3070 het 3070 hom 24 13 11 0 CAC 2 3 345839 CASAVA_Build 9 89903061 1I AGTACTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 10 11 345840 CASAVA_Build 9 89904057 5I CATTGAGCAA -----/AATAT AATATGCTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 AATAT 1 2 345841 CASAVA_Build 9 89904874 5I GAGAAAAGAA -----/AAGGC AAGGCAAGAC 3070 het 3070 hom 35 17 14 4 AAGGC 1 2 345842 CASAVA_Build 9 89907538 2D AAACTCAGTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 22 11 8 3 T 11 9 345843 CASAVA_Build 9 89907639 4I AGTGCATGAC ----/AAAG AAAACTAAAT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 AAAG 0 1 345844 CASAVA_Build 9 89909929 3D TGATGCAAAA ATC/--- ATCAACAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 ATC 2 1 345845 CASAVA_Build 9 89911194 1D TGTAGTGTCT G/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 G 1 0 345846 CASAVA_Build 9 89915400 2I TAACTTTATT --/CA GTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 CA 0 1 345847 CASAVA_Build 9 89921510 9I AGAACGGGGA ---------/GGGACAGAG TGGGCCAGGG 3070 hom 30 het 12 0 9 3 GGGACAGAG 0 1 345848 CASAVA_Build 9 89921718 1I TCTTTTTAAG -/A AAAAAATTAC 1933 het 1933 ref 17 11 4 2 A 6 7 345849 CASAVA_Build 9 89923581 2D ATTTTAAACT CA/-- CACTTAGTTA 1748 het 1748 ref 14 9 4 1 CA 2 1 345850 CASAVA_Build 9 89925977 1D TCCTGGTCCT G/- GGGCCCTGGT 3070 hom 65 het 26 0 21 6 G 4 3 345851 CASAVA_Build 9 89927519 2D GAAGATACTG TA/-- TAGCCTTGTC 3070 het 3070 ref 36 25 7 4 TA 2 1 345852 CASAVA_Build 9 89947670 5D GGAAATTCCC ATGTA/----- ATGTAATATG 3070 hom 57 het 22 0 20 4 ATGTA 2 1 345853 CASAVA_Build 9 89950517 1I TCTACAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 11 345854 CASAVA_Build 9 89951719 2I ATTCTCAGAC --/AG GGGGGATTTT 3070 hom 118 het 45 0 38 7 AG 0 1 345855 CASAVA_Build 9 89953495 2D TAAAAAAAAA AC/-- AGCCCAATTA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 AC 1 0 345856 CASAVA_Build 9 89957809 1I GCATTGTTTC -/T TTTTTTATGC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 6 7 345857 CASAVA_Build 9 89958569 1D TAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 10 9 345858 CASAVA_Build 9 89960636 4D TTCAGCTATA AATT/---- AAATTACTTT 3070 hom 102 het 36 0 35 2 AATT 1 0 345859 CASAVA_Build 9 89963834 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 9 10 345860 CASAVA_Build 9 89964609 1D ATCAATTTTA T/- ATTTTAGCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 1 0 345861 CASAVA_Build 9 89974754 3I GAGTAACTTA ---/TTG TTGATCCACC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TTG 1 2 345862 CASAVA_Build 9 89975040 1I TTTTTCTTTG -/C TGCCCTGAAC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 C 0 1 345863 CASAVA_Build 9 89987662 1D CAGAAGATTC A/- ACCCAGGAAG 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 2 1 345864 CASAVA_Build 9 89998430 1D TTTGGTTCTT A/- ACCATTGCAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 1 345865 CASAVA_Build 9 90003787 1D TTGCTGGGAA G/- TTAGCATGTC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 G 1 0 345866 CASAVA_Build 9 90004358 4I TGCATACAGA ----/TTGT CCGTACAATT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 TTGT 0 1 345867 CASAVA_Build 9 90007848 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1692 hom 12 het 5 0 5 0 A 10 11 345868 CASAVA_Build 9 90017705 5I ATGGGTGAAT -----/AGACA AGACACAGGG 3070 het 3070 ref 53 25 20 8 AGACA 1 2 345869 CASAVA_Build 9 90019201 10D TTTAGTAGAG ACAGGGTTTC/---------- ACTGTGTTAG 2887 het 4 hom 11 0 8 3 ACAGGGTTTC 1 0 345870 CASAVA_Build 9 90019601 1D CAACCTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 14 2 A 11 10 345871 CASAVA_Build 9 90019664 4D TGAAATCAGG AGCA/---- AACACAGCAA 3070 het 3070 ref 35 21 9 9 AGCA 1 0 345872 CASAVA_Build 9 90022946 1D CCCCACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 263 hom 23 1 16 6 T 13 12 345873 CASAVA_Build 9 90024032 2I ATGACCATTC --/AT ATATCTTTTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AT 2 3 345874 CASAVA_Build 9 90027502 5D AACAAAAAAT AATAA/----- AATAAGTCGT 3070 het 3070 ref 26 16 10 1 AATAA 2 1 345875 CASAVA_Build 9 90034059 1I GCACAAAAAA -/C CCCTGTGCGG 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 C 3 4 345876 CASAVA_Build 9 90043049 1D TTGGATGGGG A/- AAAAAATTGC 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 A 7 6 345877 CASAVA_Build 9 90048086 1I ACACTAAACT -/G GGGGGATGTG 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 G 5 6 345878 CASAVA_Build 9 90050986 15D GATATCTGAA GTGGGGGCTATATTT/--------------- GTGTGGCTGA 3070 het 3070 ref 34 21 12 7 GTGGGGGCTATATTT 1 0 345879 CASAVA_Build 9 90057279 1I AACTAGCTTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 8 9 345880 CASAVA_Build 9 90060713 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 9 10 345881 CASAVA_Build 9 90068924 30D GGAGGGGAGC GGAGGGGAGGGGAAGGGAGTGGAGGGGAGG/------------------------------ GGAGGGGAGG 1556 het 234 hom 5 3 4 2 GGAGGGGAGGGGAAGGGAGTGGAGGGGAGG 1 0 345882 CASAVA_Build 9 90072441 3D ATAAGTAAAT AAA/--- AATTTTTAAA 2327 het 2327 ref 17 9 5 3 A 5 2 345883 CASAVA_Build 9 90072956 3D AAGAGAGACA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TTG 4 3 345884 CASAVA_Build 9 90073427 4D TATGTATGAC TGAT/---- TGAACTCTCA 3070 hom 72 het 27 0 25 4 TGAT 1 0 345885 CASAVA_Build 9 90097719 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 15 0 14 1 A 13 12 345886 CASAVA_Build 9 90121423 1D GATATACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 18 6 T 12 11 345887 CASAVA_Build 9 90126790 1I CAGATTCAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2036 hom 40 8 17 15 T 17 18 345888 CASAVA_Build 9 90133215 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 11 10 345889 CASAVA_Build 9 90134020 1D TTTGAAGATA G/- TTACTCTGAG 3070 hom 75 het 32 0 26 7 G 1 0 345890 CASAVA_Build 9 90146006 1D CAAGACTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 13 12 345891 CASAVA_Build 9 90149987 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2638 het 143 hom 16 2 9 5 A 17 16 345892 CASAVA_Build 9 90153927 14D CCTCCCATTA AGTGCTGGGATGAC/-------------- AGGCATGAGC 2663 hom 25 het 8 0 6 5 AGTGCTGGGATGAC 1 0 345893 CASAVA_Build 9 90157081 1D AGCAGAGTGA G/- GGGGGTCAGA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 6 5 345894 CASAVA_Build 9 90170798 1I CAAGGTAATT -/A AAAAAAAAAA 2493 het 2493 ref 27 15 7 5 A 11 12 345895 CASAVA_Build 9 90171827 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 59 hom 18 1 14 3 A 10 11 345896 CASAVA_Build 9 90189527 1I TGAATCAATG -/T GTCTTAGTAT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 0 1 345897 CASAVA_Build 9 90194697 2D AAACACCAAA AT/-- ATTGTAGTAC 3070 hom 120 het 44 0 38 8 AT 2 1 345898 CASAVA_Build 9 90200067 22D CAATAGGCAG CGTTCTATGCACACTGCTCTGC/---------------------- CGTTCTATGC 3070 hom 72 het 29 0 23 11 CGTTCTATGCACACTGCTCTGC 1 0 345899 CASAVA_Build 9 90209651 12D ATTTCGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AACAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 10 6 A 14 2 345900 CASAVA_Build 9 90212383 1D TCATCTCTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 23 0 22 3 T 9 8 345901 CASAVA_Build 9 90213094 3I TGTTTTGGTT ---/TGG TTTCTTTTCC 2657 het 56 hom 11 2 8 1 TGG 0 1 345902 CASAVA_Build 9 90225865 1I AAGTTAACTT -/A ACAGAAATTG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 1 2 345903 CASAVA_Build 9 90227450 1D CTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 822 hom 41 2 31 9 T 12 11 345904 CASAVA_Build 9 90228462 1I ACATCATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1022 hom 25 5 13 7 T 16 17 345905 CASAVA_Build 9 90242259 5I AAGGAAAGAA -----/ACAAC ACAACAAAAT 3070 hom 95 het 41 0 32 9 ACAAC 1 2 345906 CASAVA_Build 9 90246204 1I TTAAGAAAAA -/T AGGCCAGGCC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 0 1 345907 CASAVA_Build 9 90248676 4I CCCATGCTGA ----/TCCT CTAGCAATGT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TCCT 0 1 345908 CASAVA_Build 9 90255848 1I AACCAAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 24 1 19 4 A 10 11 345909 CASAVA_Build 9 90261919 3D GGTTGACCAG CTT/--- CTTATGAGGG 3070 hom 84 het 32 0 29 4 CTT 2 1 345910 CASAVA_Build 9 90263826 2D ATGGAATGTC TG/-- TGTAAATTAC 3070 hom 154 het 56 0 52 4 TG 2 1 345911 CASAVA_Build 9 90273451 3I TGGATATATG ---/ATT ATTCTTTTAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATT 1 2 345912 CASAVA_Build 9 90274340 1D ACCTCCGCCT C/- CCACGCTCAA 3070 hom 89 het 38 0 31 7 C 3 2 345913 CASAVA_Build 9 90275337 1D GCCCCCCCCC T/- TTTTTTTTTT 2581 het 196 hom 23 3 7 13 T 11 10 345914 CASAVA_Build 9 90278135 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 22 2 17 3 A 10 11 345915 CASAVA_Build 9 90280819 1D ATTTTTTTTT G/- GGGGGGGGTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 G 9 8 345916 CASAVA_Build 9 90283776 4I CTTTTACTCA ----/TAGT TAAATAATAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TAGT 0 1 345917 CASAVA_Build 9 90288510 1I ACTATCAAGA -/T TTGCGGGAGT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 T 2 3 345918 CASAVA_Build 9 90289860 1I CAACAGCATG -/C TGGGTAACAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 0 1 345919 CASAVA_Build 9 90292848 2D CCCAGGACCC CT/-- CTCCATCGTG 3070 hom 96 het 35 0 30 6 CT 2 1 345920 CASAVA_Build 9 90293656 3I GTTCAAGCAA ---/TTC TTCTGCCTCA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TTC 1 2 345921 CASAVA_Build 9 90340567 1I CTTTATGACG -/C CCCCCCCCCA 1559 het 342 hom 12 1 7 4 C 9 10 345922 CASAVA_Build 9 90376902 1D ATAGCACTAG A/- ACCTTTAACA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 2 1 345923 CASAVA_Build 9 90381704 1D GTGGTAGGTA G/- GGGGGGTCCC 3070 hom 69 het 27 0 22 5 G 7 6 345924 CASAVA_Build 9 90386175 1D CCACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 12 11 345925 CASAVA_Build 9 90399734 2I AATATTATAA --/AT ATAAACTTTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 1 2 345926 CASAVA_Build 9 90410688 3I CTCATGATTA ---/TCC TGATGACAGG 3070 hom 93 het 36 0 30 6 TCC 0 1 345927 CASAVA_Build 9 90417709 1D AATACAGAGA T/- TTTTCTATTT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 T 5 4 345928 CASAVA_Build 9 90419228 4D TCAGTTTTTA TTTG/---- TTTGGGAAAT 3070 hom 78 het 30 0 27 6 TTTG 2 1 345929 CASAVA_Build 9 90420403 5I TCTTAAACAG -----/TTTAC TTTAATTTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTTAC 0 1 345930 CASAVA_Build 9 90424736 1D ACTCTACCCT A/- ACAAGAAATG 3070 hom 102 het 42 0 33 9 A 2 1 345931 CASAVA_Build 9 90446001 2D TCTGCAGAAC GT/-- GTGTGTGTGT 1047 het 1047 ref 45 29 5 14 GT 9 8 345932 CASAVA_Build 9 90466508 4I AGTAGGAAAA ----/AGAT AGGCAATGAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 AGAT 0 1 345933 CASAVA_Build 9 90466613 1I TTTGTTAGCC -/A GGGGAAACTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 0 1 345934 CASAVA_Build 9 90471420 2I CAACTCATTT --/AA AAAAAAATAC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 7 9 345935 CASAVA_Build 9 90476471 2I GGGTGTGTGT --/TG TGTGGATTGT 3070 hom 207 het 77 0 66 11 TG 2 3 345936 CASAVA_Build 9 90477675 1I TGTGGTGTAT -/G GGGTGTGTGT 3070 hom 160 het 57 0 53 4 G 3 4 345937 CASAVA_Build 9 90477769 1D ATGGTGTGTA G/- TGTGTGGTGC 1723 hom 46 het 42 0 11 39 G 1 0 345938 CASAVA_Build 9 90479175 1I ATCTTTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 13 14 345939 CASAVA_Build 9 90481262 1I CATAGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 1718 hom 30 het 36 0 9 27 T 11 12 345940 CASAVA_Build 9 90482611 1D GAGTGTCTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 57 19 28 11 T 10 9 345941 CASAVA_Build 9 90486871 2D GCATGGTATC TT/-- TTTTTTTTTT 1658 hom 34 het 19 0 8 11 T 18 16 345942 CASAVA_Build 9 90504865 2D CTCCACAATC AT/-- GCGAGCCATT 3070 hom 85 het 30 0 29 2 AT 1 0 345943 CASAVA_Build 9 90514566 9I GAGATTACAC ---------/CACTGCACT CACTGCACTC 3070 het 984 hom 16 3 8 5 CACTGCACT 1 2 345944 CASAVA_Build 9 90514629 2I AAAAAAAAAA --/AG GGAAAAAAAG 2737 het 117 hom 30 1 13 16 AG 0 1 345945 CASAVA_Build 9 90516555 15I GATGATAGTG ---------------/ATGGTGATGGTGATA ATGGTGATGG 3070 hom 116 het 46 0 35 11 ATGGTGATGGTGATA 0 1 345946 CASAVA_Build 9 90527463 1D AGGTGGTTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 339 hom 41 3 18 20 T 9 8 345947 CASAVA_Build 9 90560615 16D GTCATTTTGA GAATGTCTTACAGATG/---------------- GAATGTTTTG 3070 het 3070 ref 21 15 7 5 GAATGTCTTACAGATG 1 0 345948 CASAVA_Build 9 90573803 1I TTAGTTTAAT -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 7 8 345949 CASAVA_Build 9 90585080 3D CATCAGTGGC TAT/--- TATTATTATT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 TAT 6 5 345950 CASAVA_Build 9 90590525 1D TACCTGGGAG A/- AATAAAAATC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 2 345951 CASAVA_Build 9 90591155 2I ATCTCAGTAA --/CT CAGCACGTCC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 CT 0 1 345952 CASAVA_Build 9 90593856 1I CTCTGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 A 10 11 345953 CASAVA_Build 9 90613173 18D AGCCAAAATT GCAAGACATGTATCCTGG/------------------ GCAAGACATG 3070 het 3070 ref 33 26 10 10 GCAAGACATGTATCCTGG 1 0 345954 CASAVA_Build 9 90617708 1D TACTATTTTT A/- AAAAAAACTC 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 A 8 7 345955 CASAVA_Build 9 90647597 2I GTCATACTTC --/TT TTCTTTCTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 2 4 345956 CASAVA_Build 9 90652750 1D AGAAGTTTGT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 8 7 345957 CASAVA_Build 9 90664293 1I GGACATAACC -/A AAAAAGAAAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 5 6 345958 CASAVA_Build 9 90675220 1I TGTTTTTTAG -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 108 het 41 0 36 5 T 7 8 345959 CASAVA_Build 9 90698015 5I TGTGTGATGC -----/TGGTT TGGAGTACAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TGGTT 0 1 345960 CASAVA_Build 9 90700126 1I TAATATTTGA -/G GGGGGTGCTA 3070 hom 61 het 24 0 21 3 G 5 6 345961 CASAVA_Build 9 90704303 1I TAGTCCTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 375 hom 42 1 32 9 T 9 10 345962 CASAVA_Build 9 90704850 2D CCAAATATCC TT/-- TTTTTTTGTC 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 9 7 345963 CASAVA_Build 9 90717369 1I AAGACAATAG -/A AAAAAATCAA 3070 hom 60 het 27 0 21 6 A 6 7 345964 CASAVA_Build 9 90725167 1D GTGTGTTTTG A/- AAAGTCCAGA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 4 3 345965 CASAVA_Build 9 90727404 2I ACATGCTTAA --/AT ATGGCTCATT 3070 hom 144 het 56 0 49 7 AT 1 2 345966 CASAVA_Build 9 90727645 1I GATTTTCAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 39 0 37 6 T 9 10 345967 CASAVA_Build 9 90731103 1D GCTCATTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 11 10 345968 CASAVA_Build 9 90732949 4D TGATAAAGTC TTAT/---- TTATCTGTTT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 TTAT 2 1 345969 CASAVA_Build 9 90758956 4D AGTAGTGCCT CAAG/---- CCAACTCTAA 3070 hom 57 het 20 0 18 4 CAAG 1 0 345970 CASAVA_Build 9 90762372 1D CCTGGGAGGG C/- TTATTGTGAG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 C 1 0 345971 CASAVA_Build 9 90763452 1D GCCTGAAAAA T/- TTTTTTTTTT 899 het 48 hom 18 1 5 12 T 14 13 345972 CASAVA_Build 9 90768997 1D TATGTTAAGT A/- AAATAAGTCA 3070 hom 154 het 56 0 52 4 A 4 3 345973 CASAVA_Build 9 90779131 4D21M1I ACACCACACA AACTGCACAATGCACACCACACACA-/----CCACACTATATCCCACACGCAT AACACACACA 3070 het 3070 ref 29 17 11 11 N/A 0 0 345974 CASAVA_Build 9 90787108 4D ATTCATGTGC TTGT/---- TTGTTTTGCC 3070 hom 111 het 43 0 38 7 TTGT 2 1 345975 CASAVA_Build 9 90795130 5I TTTGCACAAA -----/GAATC CTCAACTCTC 3070 hom 90 het 36 0 26 10 GAATC 0 1 345976 CASAVA_Build 9 90797870 1I TACCATATAC -/A AAAGGGTAGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 3 4 345977 CASAVA_Build 9 90829930 2D TGGAACAGGT CA/-- CACACACACA 3070 hom 135 het 55 0 44 11 CA 9 8 345978 CASAVA_Build 9 90830324 1D GTCAGGCCAT G/- ATGGGAAGTG 3070 het 3070 ref 40 21 15 5 G 1 0 345979 CASAVA_Build 9 90832330 7D GGATTACAGG CATAAGC/------- CATAAGCCAC 3070 het 3070 ref 29 16 14 3 CATAAGC 2 1 345980 CASAVA_Build 9 90837743 1I AATTAGATCC -/A AACAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 2 3 345981 CASAVA_Build 9 90949529 1D GTCATGAGCC T/- TTTTTTTTTG 1455 het 1455 ref 34 26 4 4 T 10 9 345982 CASAVA_Build 9 90951900 1D CTGGCAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 10 9 345983 CASAVA_Build 9 90955752 2D TCTGCATGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1650 het 1650 ref 42 11 4 27 T 13 11 345984 CASAVA_Build 9 90975970 1D CATATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 953 hom 33 4 24 5 T 12 11 345985 CASAVA_Build 9 90992534 2I ATGGTGTTTC --/AT ATTGAGTAGT 3070 hom 172 het 63 0 58 5 AT 1 2 345986 CASAVA_Build 9 91033750 1I AGAAGTGGGC -/T GGGCCCTTAG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 0 1 345987 CASAVA_Build 9 91036140 1I ATGGAAAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 8 9 345988 CASAVA_Build 9 91064451 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1530 het 1530 ref 25 17 4 4 A 13 12 345989 CASAVA_Build 9 91212050 2D CCTCAGTCCT TC/-- TCTTCCTGCT 3070 het 3070 hom 36 11 21 5 TC 2 1 345990 CASAVA_Build 9 91221181 2D CACCGAAGAC AT/-- GTGTAGAGCA 3070 het 3070 ref 62 28 21 15 AT 1 0 345991 CASAVA_Build 9 91245236 7I CCTGAGCCCT -------/ACCCTCC ACCCTCCGCT 2934 het 2619 hom 30 11 11 8 ACCCTCC 1 2 345992 CASAVA_Build 9 91263410 2D ACACAAACCT AC/-- AGAGACACAC 3070 het 3070 ref 67 34 23 11 AC 1 0 345993 CASAVA_Build 9 91263664 3D CTGCACACAC CCA/--- CATGTACTCA 3070 hom 169 het 61 0 57 6 CCA 1 0 345994 CASAVA_Build 9 91268673 1I CGTCTCAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1601 hom 14 5 8 1 A 13 14 345995 CASAVA_Build 9 91272743 2D TGCAGCAGAA AG/-- AGAGTCAGCC 3070 het 3070 ref 45 20 20 6 AG 3 2 345996 CASAVA_Build 9 91273906 3D CACAAAGAGT CAA/--- CAACTTAGAG 3070 het 3070 hom 42 20 21 1 CAA 2 1 345997 CASAVA_Build 9 91274067 3D4M5D15M5I3M3I AGAGATAGGT TCCTTACATGTTTGGTAGAATTTTCCA-----GTA---/---TTAC-----TGGAAAATTCTACCAAACATGTAAGG AAACTAACAA 3070 het 3070 ref 43 31 20 7 N/A 0 0 345998 CASAVA_Build 9 91277206 1I CTGAGAAGCA -/C CCCCCCTTTT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 C 6 7 345999 CASAVA_Build 9 91278531 1I CAGAGGTTGC -/A AGTGAGCTGA 2829 het 2829 ref 15 9 6 0 A 1 2 346000 CASAVA_Build 9 91279107 1I AGAACATCAC -/A AAAGATTACA 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 A 3 4 346001 CASAVA_Build 9 91288406 64D AATATCAGGG GGTGTCACAGATAGTTAAGGGCGGCTGTTATGAGCAAAACTTACTGGCATGTGTGCATCTGTGT/---------------------------------------------------------------- GCTGTGTGTG 2866 het 2866 ref 32 33 7 5 GGTGTCACAGATAGTTAAGGGCGGCTGTTATGAGCAAAACTTACTGGCATGTGTGCATCTGTGT 1 0 346002 CASAVA_Build 9 91294766 1D TCCACCCTCC T/- TTTTTTTTTT 706 het 706 ref 37 24 3 10 T 13 12 346003 CASAVA_Build 9 91295795 2I CTCAGTTAGC --/TG TGTGTTTGAA 3070 het 3070 ref 50 32 13 5 TG 2 3 346004 CASAVA_Build 9 91303740 1D AGGAACACAG T/- CCTGAGAAGG 3070 het 3070 ref 37 13 13 11 T 1 0 346005 CASAVA_Build 9 91312201 1D GACAACAGGT G/- GTTAAGCTAC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 G 2 1 346006 CASAVA_Build 9 91321563 4D TTAATTTAAC TTAT/---- TTCTTTCCGA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 TTAT 1 0 346007 CASAVA_Build 9 91333788 3I GAGGCTGCTC ---/CTT CTTTAGACTG 3070 het 3070 hom 53 21 22 10 CTT 1 2 346008 CASAVA_Build 9 91404112 1I TTGAATTGTA -/G AATGTTTAAT 3070 het 3070 ref 36 16 17 3 G 0 1 346009 CASAVA_Build 9 91412857 1D AAACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1712 het 1712 ref 33 19 5 9 T 15 14 346010 CASAVA_Build 9 91424357 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 801 het 801 ref 23 9 7 7 A 17 18 346011 CASAVA_Build 9 91505532 7I GGCACCTCTT -------/CATTGAC AGTGAGACTG 3070 hom 33 het 17 0 12 5 CATTGAC 0 1 346012 CASAVA_Build 9 91505814 4D GCCTTAGGGA CTCT/---- CTCCAATGTT 3070 hom 135 het 49 0 46 6 CT 3 1 346013 CASAVA_Build 9 91507668 1I ATACAAACAG -/C TTTTAAGCAC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 0 1 346014 CASAVA_Build 9 91509198 2I AGGACAAGAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 10 12 346015 CASAVA_Build 9 91510013 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2287 het 10 hom 27 0 9 18 T 12 11 346016 CASAVA_Build 9 91516915 4D ATACACACAC ACAT/---- ATATGCACAC 3070 hom 229 het 81 0 77 10 ACAT 1 0 346017 CASAVA_Build 9 91519718 1D AACTCAAGAC A/- AAAGTTATCT 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 A 4 3 346018 CASAVA_Build 9 91528706 2D AGCTAAAAAC CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 39 15 15 10 CA 13 12 346019 CASAVA_Build 9 91590795 2I ACACACATAA --/AC ACACAGACAC 3070 het 3070 ref 56 28 21 7 AC 2 3 346020 CASAVA_Build 9 91592852 1I CCGCATAACA -/T TTTTGAGACA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 T 4 5 346021 CASAVA_Build 9 91594587 2D TAGTGATGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 14 12 T 12 10 346022 CASAVA_Build 9 91596011 4D AACAGGCAGG CAAC/---- CAGTTCTCCC 2336 het 2336 ref 34 21 6 7 CAAC 1 0 346023 CASAVA_Build 9 91601550 1D GCTCTGAGGC T/- GCTGGGTCAT 3070 het 3070 hom 48 15 29 6 T 1 0 346024 CASAVA_Build 9 91607687 1I TTAACTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 11 346025 CASAVA_Build 9 91608099 2D TCTCTATGGA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 2328 hom 24 9 12 4 T 11 9 346026 CASAVA_Build 9 91612408 1I CCCCTCTCCT -/G GGGTGGCTGT 3070 het 3070 hom 34 15 12 7 G 3 4 346027 CASAVA_Build 9 91612729 4D GTGTATGTCT GTGA/---- GTGAGTATCT 3070 het 3070 ref 56 30 15 14 GTGA 2 1 346028 CASAVA_Build 9 91614876 3D TTACTGCTAT CCC/--- CAGTTTACAG 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 C 4 1 346029 CASAVA_Build 9 91625952 4D AATTTTTTAT TTTA/---- CTTGCAGAAT 3070 het 3070 hom 34 12 19 6 TTTA 1 0 346030 CASAVA_Build 9 91630928 1I GGGTCAGGAG -/A AGCATCCAAG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 1 2 346031 CASAVA_Build 9 91631347 4I TCAAGCCAGG ----/CTGC CTGCCTGCCT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 CTGC 2 3 346032 CASAVA_Build 9 91634469 1I CTGCCGCCTT -/C CACCAGAACC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 C 1 2 346033 CASAVA_Build 9 91648186 3D TGTCTCACAT TGC/--- TTGCATGGTC 3070 het 3070 ref 41 20 18 5 TGC 1 0 346034 CASAVA_Build 9 91719183 1D TAAGATTTTT A/- AAATTAAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 A 4 3 346035 CASAVA_Build 9 91728507 2D AAAAACAAAC AT/-- AGAGTGGTGT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 AT 1 0 346036 CASAVA_Build 9 91739074 1D TCAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2962 het 2962 ref 38 14 11 15 A 15 14 346037 CASAVA_Build 9 91812972 1I CCAGGTGTGA -/G CAAGCACAAG 3070 hom 54 het 22 0 19 4 G 0 1 346038 CASAVA_Build 9 91817378 2I AGGCCACTGC --/AG AGACTGTCTC 3070 hom 69 het 31 0 23 8 AG 1 2 346039 CASAVA_Build 9 91846656 1D TTGGGATGAT A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 108 het 42 0 37 7 A 8 7 346040 CASAVA_Build 9 91853709 1D AAACTGTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 55 het 42 1 30 11 T 10 9 346041 CASAVA_Build 9 91866529 1I CCCACTGGCT -/C CACTGGTGGA 3070 hom 132 het 49 0 41 8 C 1 2 346042 CASAVA_Build 9 91875295 3I ACTCCACCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 27 1 21 5 A 12 15 346043 CASAVA_Build 9 91890889 3I AAGTCTGGCC ---/TCA TCATGCAGGC 3070 hom 24 het 33 2 28 3 TCA 1 2 346044 CASAVA_Build 9 91896925 12D AGAACGGCCT GCAGCCTCTGCA/------------ GCAGCCTCTG 3070 hom 54 het 28 0 16 15 GCAGCCTCTGCA 3 2 346045 CASAVA_Build 9 91900092 1D TAACCCCTCC A/- GGCCACAAAG 3070 het 3070 hom 56 25 25 6 A 1 0 346046 CASAVA_Build 9 91901070 5D ACACATCACA CATAT/----- CATATCACAC 1292 het 1292 ref 60 32 11 20 CATAT 2 1 346047 CASAVA_Build 9 91901573 5I GCATACACAC -----/ACACA ACAACACAGC 3070 het 3070 ref 53 24 19 10 ACACA 0 1 346048 CASAVA_Build 9 91909896 1D CAAAACTTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 111 het 40 0 38 5 T 10 9 346049 CASAVA_Build 9 91912497 1I GAGCCTGGCA -/C CATGGTAAGT 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 C 1 2 346050 CASAVA_Build 9 91916693 12I CCCTGATTGA ------------/TTGATTGATTGT TTGATTGATT 3070 hom 62 het 41 1 34 6 TTGATTGATTGT 0 1 346051 CASAVA_Build 9 91917307 5I CCAGCAAGTG -----/TCCCT TGGCTTGGCT 3070 hom 137 het 50 0 45 5 TCCCT 0 1 346052 CASAVA_Build 9 91922185 1D TTGCAAACCT G/- GCTCCTTCCT 3070 hom 204 het 78 0 68 10 G 2 1 346053 CASAVA_Build 9 91928019 14I CCACTAAATC --------------/TTCTGTTCTCATCT TTCTTATTAC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTCTGTTCTCATCT 0 1 346054 CASAVA_Build 9 91933025 1D TACAGCAGTG C/- TATCCAGTGT 3070 het 3070 ref 53 31 18 4 C 1 0 346055 CASAVA_Build 9 91938179 5I TATAAGTAAA -----/TTAAG TTTACATATG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 TTAAG 0 1 346056 CASAVA_Build 9 91942230 1D GAGGTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2378 hom 30 6 19 5 T 12 11 346057 CASAVA_Build 9 91942809 1I AGGACTCTCG -/A GCTCCTGGTT 3070 hom 73 het 28 0 25 3 A 0 1 346058 CASAVA_Build 9 91945259 1D ACCCAAGGGC T/- TTACACATAT 3070 hom 69 het 30 0 24 7 T 3 2 346059 CASAVA_Build 9 91946228 1D TACAAACCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1237 hom 29 8 12 9 T 13 12 346060 CASAVA_Build 9 91951583 1D TTTCATTATT A/- GGGGTGCAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 1 0 346061 CASAVA_Build 9 91962369 4D ATCATCTCAT AGAG/---- AGAGAGAATT 3070 het 3070 hom 43 19 19 6 AG 5 3 346062 CASAVA_Build 9 91964613 3I TACTACACAC ---/AAT ACACCACATA 3070 hom 187 het 80 0 70 10 AAT 0 1 346063 CASAVA_Build 9 91976289 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1083 het 1023 hom 17 9 3 5 T 15 14 346064 CASAVA_Build 9 91980846 1D CTATGTTTTT G/- TTTATTTTCT 3070 het 3070 ref 50 26 21 4 G 1 0 346065 CASAVA_Build 9 91988260 1I TTTTCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3013 hom 23 10 10 3 T 13 14 346066 CASAVA_Build 9 91990285 13D AGTAACTTAA CATATGATATTTC/------------- CATTGCTCAA 3070 het 3070 ref 35 21 13 7 CATATGATATTTC 1 0 346067 CASAVA_Build 9 91990484 1I GCACTGAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 8 9 346068 CASAVA_Build 9 92016617 2D GCCCGGGACT TA/-- TAGAGTCTGG 1232 het 1232 ref 28 25 3 0 TA 2 1 346069 CASAVA_Build 9 92022925 1I CAATATCACA -/G GTAGGTGTAC 3070 hom 105 het 37 0 35 2 G 1 2 346070 CASAVA_Build 9 92025498 4D TAATATTAAT ATTA/---- ATTATTAGGA 3070 het 3070 ref 25 14 7 5 ATTA 2 1 346071 CASAVA_Build 9 92036732 1D CAGGTCTGTA T/- TATTAAGTGA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 2 1 346072 CASAVA_Build 9 92056710 2D GGCATTTTTT TA/-- TATGTTTCTT 3070 het 3070 ref 39 23 14 3 TA 2 1 346073 CASAVA_Build 9 92060816 1D TTTCCCACAC T/- TTTTCCAGAA 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 T 5 4 346074 CASAVA_Build 9 92069351 1I ATTGCCCCCC -/A ACTCTCTTCT 3070 het 2155 hom 15 5 10 0 A 1 2 346075 CASAVA_Build 9 92069708 2I ACACACATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 17 het 43 1 31 11 AC 7 8 346076 CASAVA_Build 9 92078096 1I TTTTTGACTC -/T TGTAATAACA 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 T 1 2 346077 CASAVA_Build 9 92083433 1D AAAGAAAATT A/- AGAAAATGAT 3070 het 3070 hom 53 24 27 2 A 2 1 346078 CASAVA_Build 9 92117093 4D TATGAAATAC TGAG/---- TGTTTAGTTG 3070 het 3070 ref 32 18 13 2 TGAG 1 0 346079 CASAVA_Build 9 92132069 1D TGAACTGGGC A/- AAAGTTCCTG 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 A 4 3 346080 CASAVA_Build 9 92132853 1I GAGTAGTTGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 9 10 346081 CASAVA_Build 9 92136004 1D AAAAAATGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 13 7 A 12 11 346082 CASAVA_Build 9 92139416 1D CATATTTCTT A/- ATCTGAAGCT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 A 2 1 346083 CASAVA_Build 9 92156110 2D AATAGAAATT AA/-- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 28 13 15 1 A 10 8 346084 CASAVA_Build 9 92161441 1D GAAAGAAGTT A/- ACGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 2 1 346085 CASAVA_Build 9 92168909 2D TGTTTTAAAT AA/-- AAGTGTGTAC 3070 het 3070 hom 32 11 18 4 A 4 2 346086 CASAVA_Build 9 92171929 1I GGGAATTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 A 11 12 346087 CASAVA_Build 9 92172287 1D15M3I AATATGAAAT ATTTTTTCTCATACAG---/-TTTTTACTCATACAGGAA GAAGAAGCAG 3070 het 1563 hom 31 4 13 17 N/A 0 0 346088 CASAVA_Build 9 92172869 1I ACACTCAAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 8 9 346089 CASAVA_Build 9 92176154 2D CACTTTATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 15 6 A 12 10 346090 CASAVA_Build 9 92192686 1I TTGCAAACAA -/G GAAATATCTG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 G 1 2 346091 CASAVA_Build 9 92194400 1I TAAAAAAGTA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 8 9 346092 CASAVA_Build 9 92202114 3I TTTGTATTGT ---/TAG TAGAGACAGG 3070 het 1859 hom 14 5 8 1 TAG 1 2 346093 CASAVA_Build 9 92207589 10D CAGATTATAT ATATTATATC/---------- TGTATAGACA 3070 hom 159 het 55 0 53 7 ATATTATATC 1 0 346094 CASAVA_Build 9 92210537 1D TAAGCAGCCA G/- GGGGTAGTGT 3070 het 3070 hom 40 12 15 14 G 5 4 346095 CASAVA_Build 9 92213149 1I TTAAAAAAAT -/A AAAAAAAAGT 2910 het 2910 ref 27 17 8 2 A 8 9 346096 CASAVA_Build 9 92213433 1I ACAACAAAAG -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 A 6 7 346097 CASAVA_Build 9 92220556 1I TTCAACTGAG -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 49 21 17 11 T 7 8 346098 CASAVA_Build 9 92221411 1D TTAAGAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 22 3 A 11 10 346099 CASAVA_Build 9 92221537 3D AGATTCATAC AGG/--- AGAAGTGTAA 3070 het 3070 ref 40 21 19 1 AGG 1 0 346100 CASAVA_Build 9 92221637 5I TTAATGAAGT -----/AGTTA AGTTAACAGG 3070 het 3070 hom 25 10 11 5 AGTTA 1 2 346101 CASAVA_Build 9 92224272 2I TCTAGTACTC --/AG AGGAAAAATT 3070 het 3070 hom 58 23 27 8 AG 1 2 346102 CASAVA_Build 9 92224899 4I TTTCTCTGAT ----/AAAG AAAGATGCAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 AAAG 1 2 346103 CASAVA_Build 9 92226002 2I CATAGGAAAC --/AG GGCAAGATGT 3070 het 3070 hom 50 18 28 4 AG 0 1 346104 CASAVA_Build 9 92227405 1I TTTCTCACAC -/A AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 6 7 346105 CASAVA_Build 9 92227879 10I GCATGTATAT ----------/GAGTGTGAGC ATGTGTGAGT 3070 hom 125 het 46 0 42 4 GAGTGTGAGC 0 1 346106 CASAVA_Build 9 92228041 5I ACAAATAGAT -----/ATATC ATATCAAACT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 ATATC 1 2 346107 CASAVA_Build 9 92228749 11D TCTTAAAAAA AAAAAGAAAAG/----------- AAAAGAAAAG 2449 het 912 hom 15 7 6 6 AAAAAGAAAAG 1 0 346108 CASAVA_Build 9 92234088 1I GTCAAGTGCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 456 hom 27 1 15 11 A 9 10 346109 CASAVA_Build 9 92234790 2D CAAACAACAC TA/-- TGTATTGTGA 3070 het 3070 ref 43 25 13 6 TA 1 0 346110 CASAVA_Build 9 92237737 2I CCAGAAAAAC --/AA AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 7 9 346111 CASAVA_Build 9 92254264 2I ATACATACAC --/AT GTGTATATAT 3070 het 3070 hom 30 9 19 2 AT 0 1 346112 CASAVA_Build 9 92269526 60D CTAGAAGCAA GAGGCTACATCATGTAGCCTACTTGTGTAGGAGGCTACATCATGTAGCCTACTTGTGTAG/------------------------------------------------------------ GAGGCTACAT 3036 het 3036 ref 41 20 8 21 GAGGCTACATCATGTAGCCTACTTGTGTAG 3 1 346113 CASAVA_Build 9 92271549 1I AACAGTACTC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 46 21 24 1 A 7 8 346114 CASAVA_Build 9 92274365 8D ACACCGTGTC AAAAAAAA/-------- AAAAAGAAAA 3070 het 2326 hom 36 12 13 13 A 13 5 346115 CASAVA_Build 9 92275229 1I TGCCTTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 11 12 346116 CASAVA_Build 9 92289688 12I GCATTCATTT ------------/AGCAGATATTTA AGTGTCTATT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 AGCAGATATTTA 0 1 346117 CASAVA_Build 9 92302518 1D GCCATTTTGT A/- GTCTCAGAGA 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 A 1 0 346118 CASAVA_Build 9 92310261 4D TCAACTTGAT AGAC/---- AGACTGGGCA 3070 het 3070 ref 46 25 18 6 AGAC 2 1 346119 CASAVA_Build 9 92326758 2I TTAGAAACCC --/CT GTTTTGGTTA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 CT 0 1 346120 CASAVA_Build 9 92343107 1D AGACAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1851 hom 27 7 11 10 A 13 12 346121 CASAVA_Build 9 92356677 1D TTTCTAGTAA C/- CCACTTCCTC 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 C 3 2 346122 CASAVA_Build 9 92360168 1D AATAATTGCT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 7 346123 CASAVA_Build 9 92371027 1D GTTAGTTTGG A/- AAAAAAAAAA 1186 het 1186 ref 38 26 3 10 A 13 12 346124 CASAVA_Build 9 92372174 1I TCACTTTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 377 hom 25 1 22 2 A 9 10 346125 CASAVA_Build 9 92372762 2D TAATGAATTG TA/-- TCTGTTTTGT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 TA 1 0 346126 CASAVA_Build 9 92376600 1I ATCAAAATAC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 8 9 346127 CASAVA_Build 9 92379461 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 21 0 13 8 A 13 12 346128 CASAVA_Build 9 92382296 2D GACAAGAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 26 1 21 5 A 14 12 346129 CASAVA_Build 9 92383477 1D TACGTCATCT C/- ATGGCTAAGG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 1 0 346130 CASAVA_Build 9 92384282 3I GTACTAAAGA ---/TGT TGTGTTAAAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TGT 1 2 346131 CASAVA_Build 9 92398704 2I GTTCACAATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 11 13 346132 CASAVA_Build 9 92410958 2D TCCCAGACTT AA/-- AACACCATCA 3070 hom 72 het 30 0 24 7 A 4 2 346133 CASAVA_Build 9 92412920 1I AATATGAAGG -/A AAAAAATGTG 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 6 7 346134 CASAVA_Build 9 92424564 1D TTTTCCGGAG T/- TTTTTTTTTT 1391 het 1391 ref 47 30 4 13 T 13 12 346135 CASAVA_Build 9 92435189 1I TTGCCAGGGG -/A AAGCCATGTG 3070 hom 101 het 36 0 30 6 A 2 3 346136 CASAVA_Build 9 92459362 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 13 12 346137 CASAVA_Build 9 92460127 10D TCTCCTATGA GTTTTGTTTT/---------- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 6 GTTTT 4 2 346138 CASAVA_Build 9 92460835 2I AGATGCTTTG --/AA TATATTTACA 3070 het 3070 ref 28 17 9 3 A 0 2 346139 CASAVA_Build 9 92478842 1D TAGATACCAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 19 8 7 T 9 8 346140 CASAVA_Build 9 92481295 4I3M1I GAGCCTTGTC ----CTG-/AATGTTGA TTATTATCAG 3070 het 3070 hom 59 27 30 3 N/A 0 0 346141 CASAVA_Build 9 92495467 1I TGTGGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 11 12 346142 CASAVA_Build 9 92497681 2D AGGCTGCTGC AA/-- AGTCTCTGTG 3070 hom 135 het 50 0 36 16 A 3 1 346143 CASAVA_Build 9 92533783 1D TTTTTTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1332 hom 34 8 18 8 T 14 13 346144 CASAVA_Build 9 92552624 1D CTGGTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 1338 het 1338 ref 28 18 5 5 A 15 14 346145 CASAVA_Build 9 92553588 1D GGCTTTATAC T/- TCCCATCTGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 2 1 346146 CASAVA_Build 9 92553799 2I GTGAATTGTA --/AT ACAATCTAAC 3070 het 3070 ref 44 34 7 3 AT 0 1 346147 CASAVA_Build 9 92556582 5I GGTCTGTACA -----/TCCCT TCCTGATATG 3070 hom 38 het 15 0 13 2 TCCCT 0 1 346148 CASAVA_Build 9 92561626 3I ATATTAATAT ---/TAA TAATCTGAAA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TAA 1 2 346149 CASAVA_Build 9 92563874 1I AGTATGGATT -/A AAAATATTAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 4 5 346150 CASAVA_Build 9 92563970 3I TCATAAGTGA ---/TGT TGGTAATAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TGT 0 1 346151 CASAVA_Build 9 92569976 5I CCTTCCTTGC -----/AAAAA AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 30 0 19 11 A 9 14 346152 CASAVA_Build 9 92579991 1D TTCAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 12 11 346153 CASAVA_Build 9 92581411 1D CAGAAATCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 30 3 18 9 T 15 14 346154 CASAVA_Build 9 92581582 1D AGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 255 hom 21 2 15 4 T 13 12 346155 CASAVA_Build 9 92582770 2I TAAACGTTAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 48 het 28 0 17 11 AT 6 7 346156 CASAVA_Build 9 92584980 8D ACCATGTTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 TTTG 5 3 346157 CASAVA_Build 9 92607059 2I CAATTTGAGG --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 378 hom 36 1 28 7 T 9 11 346158 CASAVA_Build 9 92609001 7I GAGAATGTTT -------/ATTTTTG ATTTTTGTGG 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 ATTTTTG 1 2 346159 CASAVA_Build 9 92609086 1I CTGAAGTGGA -/C ACTGCAGTGC 3070 het 3070 ref 40 20 19 2 C 0 1 346160 CASAVA_Build 9 92609635 1D GTGCTCGGTA C/- CTGGTATGTG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 C 2 1 346161 CASAVA_Build 9 92612600 1D ATTTGAACTT G/- GGGGGACACA 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 G 6 5 346162 CASAVA_Build 9 92613172 1D AAGAAAACTT A/- GGTGAGTTTT 2998 het 2998 ref 23 14 7 2 A 1 0 346163 CASAVA_Build 9 92614032 3D8M1D CTGTCTCAAA AATAATAAGTGA/---AATAAGTG- AAAAAAAAAA 1306 het 864 hom 14 7 6 5 N/A 0 0 346164 CASAVA_Build 9 92614223 1I AGAACAGCAG -/T CTTTGGGGGG 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 T 0 1 346165 CASAVA_Build 9 92630084 1I ATGCTAGCGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 8 9 346166 CASAVA_Build 9 92643641 1I19M3D CATGTAGTAT -GGGGGTGTATGTGTGTGGTGTA/GGGGGGTGTATGTGTGTGGT--- GTGTGTGTGA 3070 het 3070 ref 95 56 43 13 N/A 0 0 346167 CASAVA_Build 9 92643954 9D TGTGTGTGCA GTGTGTTAT/--------- GTGTGTTGTG 1138 het 1138 ref 61 40 8 19 GTGTGTTAT 1 0 346168 CASAVA_Build 9 92644066 11D TGTAGTGTGT TGTATGTGGAG/----------- TGTATGTAGT 3070 het 834 hom 53 8 26 23 TGTATGTGGAG 1 0 346169 CASAVA_Build 9 92647050 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTGAGA 3070 het 2417 hom 25 6 15 5 T 7 6 346170 CASAVA_Build 9 92660046 1I TCTGCCATGG -/A AAAAAAAATG 2679 het 2679 ref 38 13 10 15 A 8 9 346171 CASAVA_Build 9 92662542 5D TGTGGTTTTT TGTTG/----- TGTTGTGTTG 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 TGTTG 4 3 346172 CASAVA_Build 9 92691753 2D GCAGGCAAAC TG/-- TGGGTATATG 2808 het 2808 ref 31 16 9 10 TG 2 1 346173 CASAVA_Build 9 92714389 1I CAGAGCCTGA -/G GGGGGGGTCT 3070 hom 66 het 29 0 19 10 G 7 8 346174 CASAVA_Build 9 92714764 7I TCACCCATTT -------/TGTGTTG TGTGCTGTGT 3070 hom 93 het 36 0 29 7 TGTGTTG 0 1 346175 CASAVA_Build 9 92726017 1D GTAGATGCTA T/- AAACTAGTAA 3070 hom 148 het 55 0 50 5 T 1 0 346176 CASAVA_Build 9 92726350 1D CTAGGGATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 9 8 346177 CASAVA_Build 9 92727439 1D AGACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 269 hom 31 1 26 4 A 13 12 346178 CASAVA_Build 9 92769658 1D TCTTCACGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 65 het 41 0 30 11 T 10 9 346179 CASAVA_Build 9 92775188 1I ATTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1888 het 1888 ref 30 10 12 8 T 14 15 346180 CASAVA_Build 9 92779956 5D CAGCCTGCGG GCTGA/----- GTGATAGGTG 3070 hom 123 het 43 0 41 5 GCTGA 1 0 346181 CASAVA_Build 9 92780591 1I CGTGAGTTTA -/T TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 6 7 346182 CASAVA_Build 9 92804510 1D ACTCCATCCC A/- AAAAAAAAAA 2262 het 2146 hom 29 13 10 6 A 17 16 346183 CASAVA_Build 9 92810591 5D CAAAATGGCT AGAAG/----- AGAAGAATTG 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 AGAAG 2 1 346184 CASAVA_Build 9 92821510 1D CAACACAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 13 13 A 13 12 346185 CASAVA_Build 9 92835302 3D GGAAAATGAC CTT/--- CTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 CTT 2 1 346186 CASAVA_Build 9 92893640 10I AAAAAAAAGA ----------/GAGAAGAAAG GAGAAACAGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 GAGAAGAAAG 0 1 346187 CASAVA_Build 9 92909210 1I ATTATGTCTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 7 8 346188 CASAVA_Build 9 92927233 2D TTCTACATCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 35 1 20 14 T 16 14 346189 CASAVA_Build 9 92938174 3I ATGTTTTACC ---/ACA ACAAGAAAAA 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ACA 1 2 346190 CASAVA_Build 9 92940847 1D AGAGGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 354 hom 33 1 24 9 T 13 12 346191 CASAVA_Build 9 92947602 1I GGTTGGGGTT -/G GACAAGAGAG 3070 hom 125 het 45 0 37 8 G 1 2 346192 CASAVA_Build 9 92955703 1D TCACTGTCAT A/- AATTTTGCAA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 3 2 346193 CASAVA_Build 9 92961470 5I AGGAAGGAAA -----/GAGAG GAAAGAGAGG 2418 het 180 hom 18 1 8 9 GAGAG 0 1 346194 CASAVA_Build 9 92969345 4I GCAAAATAAC ----/AACA AACAAACAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AACA 3 4 346195 CASAVA_Build 9 92982305 3I CTGTTCTAAG ---/CCA CCACCGAGTC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CCA 1 2 346196 CASAVA_Build 9 92984200 2D TGTCTATGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 85 29 33 25 TG 6 5 346197 CASAVA_Build 9 92989523 1D ACAGCCTCTC G/- GGGGGGCTGG 3070 hom 87 het 33 0 28 8 G 7 6 346198 CASAVA_Build 9 92995824 1D ACTAGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2526 het 1575 hom 15 6 7 2 A 13 12 346199 CASAVA_Build 9 93001591 5I AGTCTCACAC -----/TTACT TTACGGCAGC 2678 het 2678 ref 29 14 8 7 TTACT 0 1 346200 CASAVA_Build 9 93003157 1I GAAAAAGGCT -/G TCAATCAAGA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 G 0 1 346201 CASAVA_Build 9 93006492 4I TTAAAAAAAA ----/AAAC AAACAAACAC 3070 hom 117 het 44 0 37 7 AAAC 2 3 346202 CASAVA_Build 9 93008977 1D ATGCTAAATG A/- AAAAAAAACA 1157 het 1157 ref 35 18 3 14 A 9 8 346203 CASAVA_Build 9 93051582 2I GTGGCTATTC --/TT TTTGAGCTAA 3070 het 3070 ref 42 23 11 8 T 3 5 346204 CASAVA_Build 9 93053916 7D ATTATAATGT GGTAAGG/------- GGTTGATAAA 1943 het 1943 ref 22 13 5 5 GGTAAGG 1 0 346205 CASAVA_Build 9 93067431 4D TTACTTCAAC TTCA/---- TTTTCTCACA 3070 het 3070 ref 36 16 12 9 TTCA 1 0 346206 CASAVA_Build 9 93071091 1D TAACACTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 11 10 346207 CASAVA_Build 9 93100348 1I ATTATTCTTC -/A AAAACATTAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 4 5 346208 CASAVA_Build 9 93102214 1D ATCCTGGACA C/- TCCCTCCTTG 3070 het 3070 ref 63 32 24 7 C 1 0 346209 CASAVA_Build 9 93104298 2D GCCGGGTGCA GT/-- GTGGCTCATG 3070 het 2920 hom 24 10 13 1 GT 2 1 346210 CASAVA_Build 9 93114114 1D GTCACATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1427 hom 24 7 13 4 T 14 13 346211 CASAVA_Build 9 93115173 1D CAGGCTTTGC G/- GGGGGGGTTG 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 G 8 7 346212 CASAVA_Build 9 93137452 1I TGACTTTATT -/G GCACATTCTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 1 2 346213 CASAVA_Build 9 93141177 2D TCTTCACACA AT/-- ATGTTTAGTA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 AT 2 1 346214 CASAVA_Build 9 93147113 1D CATGTTCATG A/- AAAAAAAAAA 1992 het 1992 ref 29 13 5 11 A 12 11 346215 CASAVA_Build 9 93152862 1D ATTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2881 het 2881 ref 25 16 8 1 A 12 11 346216 CASAVA_Build 9 93156991 1D ACATAAGAAT C/- CTAATTCTCT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 C 2 1 346217 CASAVA_Build 9 93161684 10D AAAAGAAAAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGGAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 7 AAAAG 3 1 346218 CASAVA_Build 9 93174558 1D TAGTTTTCCA T/- TTGTATCACA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 3 2 346219 CASAVA_Build 9 93176487 4I CCCTATAACT ----/TTTA TTTGTGTGTG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TTTA 0 1 346220 CASAVA_Build 9 93188978 1D TTTGGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 50 1 26 23 T 16 15 346221 CASAVA_Build 9 93195118 15D ACCAGCCTAG CCAACATGGTGAAAC/--------------- CCGTCTCTGC 1814 het 1814 ref 18 11 7 4 CCAACATGGTGAAAC 1 0 346222 CASAVA_Build 9 93208486 1D CATTTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 2031 het 128 hom 25 2 8 15 G 12 11 346223 CASAVA_Build 9 93209627 1D GGATAGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 19 5 T 15 14 346224 CASAVA_Build 9 93210925 5D ATATATAATA TAAAG/----- TAATTTAGTG 3070 het 2608 hom 24 7 15 2 TAAAG 1 0 346225 CASAVA_Build 9 93216012 1D GTTCCTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 A 11 10 346226 CASAVA_Build 9 93219340 2D TTTCCCTCTA CT/-- CTCTGAATGT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 CT 3 2 346227 CASAVA_Build 9 93220959 2D GTTTTGGGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 26 6 T 14 12 346228 CASAVA_Build 9 93224571 1D ATCCTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 53 hom 39 1 26 12 A 12 11 346229 CASAVA_Build 9 93227140 1D TGCTGGCCTT G/- GCGAAGGGAG 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 G 2 1 346230 CASAVA_Build 9 93229306 8I GTAAAATATC --------/CTGATTTT CTGATTTTCA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 CTGATTTT 1 2 346231 CASAVA_Build 9 93232754 1D CTTTTTTATT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 A 8 7 346232 CASAVA_Build 9 93238541 1D5M4D ATTAGCCGGG CGTGGTGGCG/-GTGGT---- GGCACCTTTA 3070 hom 78 het 28 0 23 7 N/A 0 0 346233 CASAVA_Build 9 93241588 5I CTTTCCTTTC -----/TGATT TAATTGCCTT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 TGATT 0 1 346234 CASAVA_Build 9 93241811 1D CTGTTGAGAG T/- TTTTTATCAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 T 6 5 346235 CASAVA_Build 9 93242872 8D CTCATTGATT GCTTAGGA/-------- GCATGTTGTT 3070 het 3070 ref 40 23 13 6 GCTTAGGA 1 0 346236 CASAVA_Build 9 93243781 1D AGGTTTTGGC T/- TTGTGGTTAC 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 T 3 2 346237 CASAVA_Build 9 93246133 1I CTGTCCCTGT -/C TTTGTCTCTT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 C 0 1 346238 CASAVA_Build 9 93250871 1D TCCCTTTCTA G/- AAAAAAAGGT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 1 0 346239 CASAVA_Build 9 93254555 1D ACAGGTATTG A/- ATGATGTATT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 2 1 346240 CASAVA_Build 9 93259353 1I AGTTTTTGTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 9 10 346241 CASAVA_Build 9 93262185 1D TCTCCCCAGC A/- ACCTCTCTCC 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 2 1 346242 CASAVA_Build 9 93267589 1D ATTATCCATG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 T 9 8 346243 CASAVA_Build 9 93283743 1I TTGCTTTTGA -/T TTTTGCGGTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 4 5 346244 CASAVA_Build 9 93288476 1I ATGCTTCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 10 11 346245 CASAVA_Build 9 93301311 5I ACAGTAAATT -----/AAATA AAATAAAAGT 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 AAATA 1 2 346246 CASAVA_Build 9 93307833 22D GAAGAGGGAA TACTTCAGGAGCAAGAGGGAAT/---------------------- TACTTCATTT 3070 het 3070 hom 24 11 13 7 TACTTCAGGAGCAAGAGGGAAT 1 0 346247 CASAVA_Build 9 93310735 7D GCTGGAGACA TGCTTCC/------- CACAGGCTAA 3070 het 3070 ref 52 25 19 12 TGCTTCC 1 0 346248 CASAVA_Build 9 93311785 1D CTCTGGAAGC A/- AAAAAAAAAA 1524 het 1524 ref 28 18 5 5 A 12 11 346249 CASAVA_Build 9 93321110 1I GAAGTATTTC -/T ATCAGGGAAT 3070 hom 99 het 40 0 33 7 T 0 1 346250 CASAVA_Build 9 93339685 1D ATACTAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 15 11 A 12 11 346251 CASAVA_Build 9 93349350 1I AAGCATTTCT -/C CCCTCTGGAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 C 3 4 346252 CASAVA_Build 9 93357219 1D GATCCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1987 hom 39 10 12 17 A 17 16 346253 CASAVA_Build 9 93363081 1I CTACATGAGT -/G TGCTTATTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 0 1 346254 CASAVA_Build 9 93369074 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2245 het 366 hom 26 4 16 6 T 24 22 346255 CASAVA_Build 9 93370392 3I GGGAAGGTAA ---/TCT TCTCCTGATG 3070 hom 93 het 38 0 31 7 TCT 1 2 346256 CASAVA_Build 9 93377511 1D AGGATGAGTC T/- TTTTTTTTTT 1408 het 1408 ref 37 19 4 14 T 13 12 346257 CASAVA_Build 9 93378238 1D CCCCACGGAA G/- GTGGAATTCT 3070 het 3070 ref 36 19 9 10 G 2 1 346258 CASAVA_Build 9 93395768 1I CACCTAATGA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 51 23 16 12 T 7 8 346259 CASAVA_Build 9 93403717 4D CTTCCTTCCT TCCC/---- TCCCTCCCTC 3070 het 978 hom 14 3 9 2 TCCC 4 3 346260 CASAVA_Build 9 93407697 1I ATTTTTGAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 8 9 346261 CASAVA_Build 9 93412000 2D ATATACACAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2404 hom 35 14 14 7 GT 6 5 346262 CASAVA_Build 9 93412941 4D CTAATTTGAA TTTG/---- TTTATGTATT 3070 het 3070 ref 39 16 15 10 TTTG 1 0 346263 CASAVA_Build 9 93422509 1I ACAATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 10 11 346264 CASAVA_Build 9 93425773 2I CAGTACCACA --/CT GTCTTGATTA 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 CT 0 1 346265 CASAVA_Build 9 93428828 1I GATATAACTA -/T TAAGATTCTC 3070 het 3070 ref 31 20 11 0 T 1 2 346266 CASAVA_Build 9 93430765 1I ATCTATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 15 4 T 11 12 346267 CASAVA_Build 9 93441561 1I AAGGCCTCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 14 hom 46 1 39 6 A 9 10 346268 CASAVA_Build 9 93447987 2D TCCCTTTCCC CA/-- CACAGTTTCA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 CA 3 2 346269 CASAVA_Build 9 93450015 2D TTTTTTTTTG TT/-- TTTTTGTTTT 2458 het 2458 ref 21 11 9 1 T 7 5 346270 CASAVA_Build 9 93453732 5D TACATTAATT TAAGA/----- TATTAGTAAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 7 TAAGA 1 0 346271 CASAVA_Build 9 93453911 1I TCCTAATAGA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 7 8 346272 CASAVA_Build 9 93454443 1D ATTTTGTTTT A/- AAAAAATAGA 2225 het 2225 ref 15 6 7 2 A 7 6 346273 CASAVA_Build 9 93456397 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 72 hom 26 2 14 10 A 9 8 346274 CASAVA_Build 9 93473545 4D CTCTCTTTTC TTCT/---- TTATTAGTCT 3070 het 3070 hom 17 9 8 2 TTCT 1 0 346275 CASAVA_Build 9 93475611 1D ATTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 23 5 T 11 10 346276 CASAVA_Build 9 93476994 4D TATTGGTCTA TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 37 9 15 14 TGTT 5 4 346277 CASAVA_Build 9 93477658 1D TACTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1743 het 469 hom 19 2 8 9 T 17 16 346278 CASAVA_Build 9 93478916 1I ATATTAGCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 T 8 9 346279 CASAVA_Build 9 93489896 1I ATAGTTAACA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 7 8 346280 CASAVA_Build 9 93494343 1D TCCTCACAGG C/- CCCCCCAGAG 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 C 7 6 346281 CASAVA_Build 9 93500129 4D GCAAACAGAA TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 45 16 15 16 TC 9 7 346282 CASAVA_Build 9 93505154 1D ATCACTCCAA C/- CCCATGAACA 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 C 4 3 346283 CASAVA_Build 9 93505551 1I GAACTGTGTT -/A AAATAGTAAT 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 A 3 4 346284 CASAVA_Build 9 93509427 1I CAGTTATCAC -/T TTTTTTTTTT 2468 het 1406 hom 22 7 8 7 T 14 15 346285 CASAVA_Build 9 93513151 2D TTTGTGTGTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 67 32 24 12 GT 6 5 346286 CASAVA_Build 9 93513465 4I ATGTGTGGTG ----/TGTA TGTGTGTGTA 3070 hom 232 het 85 0 72 13 TGTA 0 1 346287 CASAVA_Build 9 93513610 2I GGTATATGAG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 936 hom 86 3 64 19 GT 6 7 346288 CASAVA_Build 9 93515801 6I ATATGTGTAG ------/TGTGTA TGTGTATGGA 3070 hom 108 het 41 0 36 6 TGTGTA 1 2 346289 CASAVA_Build 9 93518553 1D ACTATGCAGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 A 9 8 346290 CASAVA_Build 9 93524048 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 2499 het 1687 hom 21 6 9 6 A 17 16 346291 CASAVA_Build 9 93529505 2I CTTCCCTGCA --/TT TTTTTTTTTT 2822 het 2712 hom 23 11 10 2 T 14 16 346292 CASAVA_Build 9 93549808 4I CTCTCCTATC ----/TTTG TTTGGTTAAG 3070 hom 112 het 45 0 37 8 TTTG 1 2 346293 CASAVA_Build 9 93550410 1I GAGAATAGAC -/T TTTAAGTGTT 3070 het 3070 hom 27 9 16 2 T 3 4 346294 CASAVA_Build 9 93557267 1D TTGGGGGGGG A/- AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 7 6 346295 CASAVA_Build 9 93578940 2I GAAAAGAGAC --/AT AAAAATTATT 3070 het 3070 hom 63 27 32 4 AT 0 1 346296 CASAVA_Build 9 93584731 6I TTTTAAGAAA ------/GTGTAC GAAGTTGTGT 3065 het 2919 hom 33 10 8 15 GTGTAC 0 1 346297 CASAVA_Build 9 93594495 1D ACTGCAAGCT C/- CCGCCTCCCG 1504 het 1504 ref 11 6 4 1 C 3 2 346298 CASAVA_Build 9 93624097 1D AAATATATAT A/- TACAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 1 0 346299 CASAVA_Build 9 93632797 1I ATTAAAAAGA -/G TAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 G 0 1 346300 CASAVA_Build 9 93640816 1D CTGCAGTCGG A/- AAATAGGATC 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 4 3 346301 CASAVA_Build 9 93652355 5D AAATCATAAC TTATG/----- TTATTTTATG 3070 het 3070 ref 37 16 15 8 TTATG 1 0 346302 CASAVA_Build 9 93652516 1D GAAGAGACGA C/- CCTGGACAAT 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 C 3 2 346303 CASAVA_Build 9 93656112 1I AGGGGGCCCT -/G GAAGTGGAGT 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 G 1 2 346304 CASAVA_Build 9 93675308 6D ATCGACTCAT CTACCA/------ CTACCACTGC 2639 het 2639 ref 25 15 6 4 CTACCA 2 1 346305 CASAVA_Build 9 93675512 1D CCAACAGGGT A/- AAAACCCCAT 1708 het 1708 ref 25 16 5 4 A 5 4 346306 CASAVA_Build 9 93678473 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2912 hom 30 13 13 4 A 11 12 346307 CASAVA_Build 9 93681613 1D TCTTCTACTC T/- TTTTCCCCAG 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 5 4 346308 CASAVA_Build 9 93703896 12I TCCAGCCTGG ------------/GCGACAGGGCAA GACTCCATCT 2707 het 2199 hom 18 11 7 0 GCGACAGGGCAA 0 1 346309 CASAVA_Build 9 93705258 1I AAAAGCAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 A 8 9 346310 CASAVA_Build 9 93707269 2I CAAGACACAC --/CA CACACAACAC 3070 het 3070 hom 83 31 38 14 CA 3 4 346311 CASAVA_Build 9 93711022 2I ACCATGAGGG --/AA AGTTTCCCTT 3070 het 3070 hom 50 19 27 4 A 1 3 346312 CASAVA_Build 9 93717071 2D TCCATCACCC CT/-- GTCAGAATAT 3070 het 3070 ref 48 27 16 6 CT 1 0 346313 CASAVA_Build 9 93718449 1I CTCCCCTGAC -/T TTTATATTGG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 3 4 346314 CASAVA_Build 9 93724057 2D ACATTTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 A 12 10 346315 CASAVA_Build 9 93729165 3D CGTTTTTTAT AAG/--- AAGTGTTATA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 AAG 2 1 346316 CASAVA_Build 9 93742808 6D AGTGATCCTC CTGTCT/------ CTGTCTCGGC 3070 het 3070 hom 23 11 11 2 CTGTCT 2 1 346317 CASAVA_Build 9 93744036 1I TGGAATTACA -/G GGCACATGTC 3070 het 2647 hom 18 6 9 3 G 2 3 346318 CASAVA_Build 9 93748866 3I CATTTCACTA ---/ATG ATAACTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 ATG 0 1 346319 CASAVA_Build 9 93752988 4I GAATGTGCAG ----/AAGT AATTTGCTTC 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 AAGT 0 1 346320 CASAVA_Build 9 93916854 4D AAAAAAACAA AAAT/---- AAATAAATAA 2754 het 2754 ref 28 14 10 5 AAAT 3 2 346321 CASAVA_Build 9 93920280 2D AAATTCTTTT AC/-- ACACTCATCA 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 AC 3 2 346322 CASAVA_Build 9 93927369 1D AAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3027 het 59 hom 23 1 15 7 A 11 10 346323 CASAVA_Build 9 93932275 4D AGAGAAAACT CAAA/---- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 CAAA 1 0 346324 CASAVA_Build 9 93932676 2D GTTGTCATTA TT/-- ATTATCATTT 2719 het 2051 hom 17 5 7 5 T 2 0 346325 CASAVA_Build 9 93936042 4I GCTACACCCG ----/CCCA CCCACAGGAG 3070 hom 67 het 26 0 21 5 CCCA 1 2 346326 CASAVA_Build 9 93941720 1D ACTAAAGCAC T/- GGTGCCCTCC 3057 het 3057 ref 22 11 7 4 T 1 0 346327 CASAVA_Build 9 93951120 2I ATAGTTAGAG --/CT AAGTTTTATG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 CT 0 1 346328 CASAVA_Build 9 93954826 1I TTCCCACTTT -/G TCTTATTGTT 3070 het 3070 ref 32 13 9 10 G 0 1 346329 CASAVA_Build 9 93955176 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2754 hom 13 6 7 0 T 8 9 346330 CASAVA_Build 9 93972013 3D AAAAAAAGAA AAC/--- AAAAAAACTA 1236 het 1236 ref 25 9 11 9 AAC 1 0 346331 CASAVA_Build 9 93973404 2I GAGTGGAGAC --/AG AGGCCAAAGT 3070 het 3070 ref 46 28 16 2 AG 1 2 346332 CASAVA_Build 9 94000949 1I TACGGTGAAA -/C ACCATATCTA 1386 hom 7 het 3 0 3 0 C 0 1 346333 CASAVA_Build 9 94009984 1D TGAAGATATC T/- TTTTTTTTTT 2945 het 2368 hom 21 8 7 6 T 12 11 346334 CASAVA_Build 9 94011059 1I GTCTTATGGT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 G 8 9 346335 CASAVA_Build 9 94013015 1D GAAAAAGTTG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 8 7 346336 CASAVA_Build 9 94023402 1I GAATAAGAGG -/T TAAGTTGGAC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 1 2 346337 CASAVA_Build 9 94024259 1I CGTCTCTACT -/A AAAATCCAAA 786 het 786 ref 12 6 3 3 A 4 5 346338 CASAVA_Build 9 94030685 1D GCATGGTGGT G/- GCATGCCTGT 3070 hom 95 het 42 0 38 4 G 2 1 346339 CASAVA_Build 9 94030934 10D ACATGACACA ATGAGGAGGC/---------- ATGAATAGAC 3070 het 3070 ref 47 26 20 6 ATGAGGAGGC 1 0 346340 CASAVA_Build 9 94031462 18D TATATACACT ACACACACACACACACAC/------------------ ACACACACAC 3070 het 1783 hom 28 8 14 12 AC 15 6 346341 CASAVA_Build 9 94032107 4D TAATCCCTGG CAAA/---- CAGTCTCCAT 3070 het 3070 hom 43 17 23 4 CAAA 1 0 346342 CASAVA_Build 9 94038480 9I TCTATTTTCT ---------/GGAAGAGTC GGAAGAGTCT 3070 het 3070 ref 32 20 8 4 GGAAGAGTC 1 2 346343 CASAVA_Build 9 94039632 1D TCTAACTGGT C/- TATTGATTAC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 C 1 0 346344 CASAVA_Build 9 94043859 1I GTAATCTTTC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 8 346345 CASAVA_Build 9 94046238 3I GAAGCATCAC ---/ATG ATGACACTTT 3070 het 3070 ref 61 28 25 8 ATG 1 2 346346 CASAVA_Build 9 94046650 1D ATATTCTCTT G/- AAAAGAGTGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 0 346347 CASAVA_Build 9 94057916 1I GGCATCTGAT -/G GGCACAATGG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 G 2 3 346348 CASAVA_Build 9 94079778 1D CCCTGTTTTT A/- AAAAAAAAAA 2637 het 2637 ref 25 9 7 9 A 17 16 346349 CASAVA_Build 9 94083833 1I CTAAGGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 10 11 346350 CASAVA_Build 9 94123656 1I CTCTACTTAT -/A ATGTTTGAAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 1 2 346351 CASAVA_Build 9 94159957 1D GGTTGACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1870 hom 21 5 13 4 T 11 10 346352 CASAVA_Build 9 94165338 2D ATACATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 45 18 14 13 AC 10 9 346353 CASAVA_Build 9 94173896 2I ATATTGGGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 TA 5 6 346354 CASAVA_Build 9 94177955 5D TTTCTGTTAA TTTCT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 3048 hom 34 12 20 3 TTTCT 1 0 346355 CASAVA_Build 9 94182581 1I TTAAATAATA -/T TTTCAGGGTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 3 4 346356 CASAVA_Build 9 94197078 5D ATAATCTGTG TTTAT/----- TTTAATAGTC 3070 het 3070 hom 35 15 20 3 TTTAT 1 0 346357 CASAVA_Build 9 94198672 1D CATACCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2926 hom 27 8 9 10 T 13 12 346358 CASAVA_Build 9 94401219 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 11 12 346359 CASAVA_Build 9 94493059 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1903 het 1903 ref 35 14 10 11 T 13 12 346360 CASAVA_Build 9 94580916 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 618 het 618 ref 11 7 3 1 A 13 12 346361 CASAVA_Build 9 94619886 2D GCCATGTAAT AC/-- AGTTTTGTAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AC 1 0 346362 CASAVA_Build 9 94620567 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 12 11 346363 CASAVA_Build 9 94629242 1I TTTGTTTTGC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 T 8 9 346364 CASAVA_Build 9 94682973 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2383 het 1825 hom 16 6 6 4 A 9 10 346365 CASAVA_Build 9 94710383 1D TTTTAGGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 34 1 21 12 A 12 11 346366 CASAVA_Build 9 94758942 1D GCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1454 het 1454 ref 45 24 5 17 T 17 16 346367 CASAVA_Build 9 94816627 1I CTTTGAAAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 T 9 10 346368 CASAVA_Build 9 94830604 1D GGTTTCGGCA C/- CCATAACAAA 3070 het 3070 ref 33 18 12 4 C 3 2 346369 CASAVA_Build 9 94832822 1D GGGGGGCAGC A/- GGGGGGGGGG 613 het 610 ref 17 8 5 4 A 1 0 346370 CASAVA_Build 9 94856397 1D GTCAGGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 T 11 10 346371 CASAVA_Build 9 94888192 2D CACAGTCACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1477 hom 36 12 16 8 T 14 12 346372 CASAVA_Build 9 94888425 3D CACCTGAGGT AAG/--- GAGTGTGAAA 3070 het 3070 hom 37 17 15 6 AAG 1 0 346373 CASAVA_Build 9 94894809 1I CTGTGAGCCC -/G GGGTGAGGGA 3070 hom 106 het 42 0 31 11 G 3 4 346374 CASAVA_Build 9 94903969 1D CTCACCAACA T/- TTGTTATATT 3070 hom 60 het 24 0 20 5 T 3 2 346375 CASAVA_Build 9 94904756 1D CCTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 2249 het 2249 ref 27 12 9 6 T 15 14 346376 CASAVA_Build 9 94907301 6D GTGTGTGTGC GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 11 hom 37 1 26 11 GT 12 9 346377 CASAVA_Build 9 94911416 2D GGTTTAACTC CA/-- GTTCCCTGTG 3070 het 3070 ref 37 19 13 8 CA 1 0 346378 CASAVA_Build 9 94914179 1D TGGTGACAGA C/- CCCCCCCCTA 3070 hom 25 het 13 0 8 5 C 9 8 346379 CASAVA_Build 9 94916259 2D TGAGCCTGCG CT/-- CTGTCACAGC 3070 hom 50 het 26 0 20 7 CT 2 1 346380 CASAVA_Build 9 94920345 1I TCTGCACATG -/T GGAATGAATG 3070 hom 81 het 34 0 24 10 T 0 1 346381 CASAVA_Build 9 94922567 1I CCCAGTTAGA -/C CCCCCTCACT 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 C 5 6 346382 CASAVA_Build 9 94927998 5D CCCGGTTTCA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 26 11 10 6 AAAAC 5 4 346383 CASAVA_Build 9 94931283 1D CAGCAAAGGC G/- GTTCCTTACC 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 G 2 1 346384 CASAVA_Build 9 94938506 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 8 9 346385 CASAVA_Build 9 94945256 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 699 hom 22 4 8 10 A 13 12 346386 CASAVA_Build 9 94947243 1I ACCCCCGTAA -/T TTTTTTTTTT 1947 het 1434 hom 20 5 6 9 T 13 14 346387 CASAVA_Build 9 94966537 1D GAGCAGGCTC G/- TGTTGCGGCT 2254 het 2254 ref 32 17 7 8 G 1 0 346388 CASAVA_Build 9 94971660 4I TCATGGGTAC ----/CCCT CTAGGGGGAG 3070 het 3070 ref 35 23 11 1 CCCT 0 1 346389 CASAVA_Build 9 94974420 1D ACTTTCTGGG T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 T 9 8 346390 CASAVA_Build 9 95010803 2I17M2D4M11D17M5D2M12D8M8D15M6I22M5D TTCTGTGTGT --CTGCGTGTTCTGTGTATGCTCTTCGTGCGTGTTCTGTGTGTGTTCATGTGTGTGCGCATGTCCTCCGTGTGTGTGTTCTGCGGCTGTGTGTGCTCTGCATG------TGTGTTCTGTGTATGTGCATGTTCTTC/TCATGTGTGTTCTGTGTAT--TCTT-----------TGTGTGTGTTCGTGTGT-----CA------------GTGTGTTC--------TGTGTGTTATTCATGTGTCCATGTGTTCTGTGTATGTTCATGT----- GTGTGTGTTC 2094 het 2094 ref 72 109 5 15 N/A 0 0 346391 CASAVA_Build 9 95015165 1I CCTACTTCCA -/G GGGAGGGGGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 G 3 4 346392 CASAVA_Build 9 95018930 1D CAACAACAAC A/- AACAAACAAA 3070 het 439 hom 17 1 16 0 A 3 2 346393 CASAVA_Build 9 95024217 2D AGGGTCCCAG GT/-- GGCCTTTAAG 3070 hom 63 het 25 0 19 6 GT 1 0 346394 CASAVA_Build 9 95053099 1D CTGCTGGCCA G/- GGTTGGCCTT 3070 hom 30 het 12 0 10 2 G 3 2 346395 CASAVA_Build 9 95065539 2I CGCACAGGAC --/AG GGGCTGCCTC 3070 hom 89 het 33 0 28 5 AG 0 1 346396 CASAVA_Build 9 95077164 3D6M4I GCACTATATT AAAAGGACA----/---ATGGCACTAT GTGTGCCATG 3070 hom 99 het 38 0 34 7 N/A 0 0 346397 CASAVA_Build 9 95077499 1I CAGGTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 23 22 9 A 11 12 346398 CASAVA_Build 9 95083477 1D AAACTATGCC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 105 het 40 0 36 5 A 9 8 346399 CASAVA_Build 9 95084397 3I CTCCACACTT ---/GTG GTGGAGGGGG 3070 hom 92 het 38 0 27 11 GTG 1 2 346400 CASAVA_Build 9 95086758 4D GGAGAAAGAA AAAG/---- AAGGGAAAGC 3070 het 3070 hom 43 15 22 10 AAAG 1 0 346401 CASAVA_Build 9 95105029 1I GCAGTCTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 660 hom 34 4 22 8 T 11 12 346402 CASAVA_Build 9 95113998 8D GCTGGGATTA CAGGCGTG/-------- AGCCACCGTG 3070 hom 33 het 12 0 11 1 CAGGCGTG 1 0 346403 CASAVA_Build 9 95124076 4D TTTTAATCAT TTTC/---- TTTAAGTGAA 3070 hom 87 het 33 0 28 7 TTTC 1 0 346404 CASAVA_Build 9 95125210 1I AGGGTGATAT -/C TGCGCCTCAT 3070 hom 126 het 48 0 40 8 C 0 1 346405 CASAVA_Build 9 95125426 4I CCTGTCTCTA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 AAAC 2 3 346406 CASAVA_Build 9 95135543 4I ACTGTATTGT ----/ACAG ACAGACACTT 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 ACAG 1 2 346407 CASAVA_Build 9 95144318 1I GTAAGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 31 6 18 7 A 10 11 346408 CASAVA_Build 9 95146735 1I ACAACCACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 16 8 A 11 12 346409 CASAVA_Build 9 95147446 2I TTCAGTAGAC --/AG GGGGTTTTGC 3070 hom 101 het 40 0 31 9 AG 0 1 346410 CASAVA_Build 9 95149021 1D TAACGGCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 10 9 346411 CASAVA_Build 9 95155446 1I GGACACCCAT -/G GAAAAAAAGG 3070 het 2871 hom 28 11 11 6 G 1 2 346412 CASAVA_Build 9 95157494 4I TTCTGGATTT ----/TCAG TCATTCACAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TCAG 0 1 346413 CASAVA_Build 9 95157966 3I TTCTGCAAGT ---/AAG ACATTTCTAG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AAG 0 1 346414 CASAVA_Build 9 95160664 1I CTAAGATAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 A 8 9 346415 CASAVA_Build 9 95161417 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 20 1 14 5 A 13 14 346416 CASAVA_Build 9 95166910 1D AATATGTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 124 het 50 0 40 10 A 11 10 346417 CASAVA_Build 9 95170166 3I TTTCTCTCTG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 46 0 32 14 T 12 15 346418 CASAVA_Build 9 95170544 5I TGCACATGTT -----/TTTTC TTTTCTTCTT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 TTTTC 1 2 346419 CASAVA_Build 9 95176986 3D TCTAAATAAT TTG/--- TTATCTTGCT 3070 het 3070 ref 44 23 16 7 TTG 1 0 346420 CASAVA_Build 9 95180327 1I TGCTTTGTGA -/T TTTTTATTGA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 5 6 346421 CASAVA_Build 9 95180779 1I CATCTCTACT -/A AAAATACAAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 4 5 346422 CASAVA_Build 9 95184517 2I ACTCTATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 10 12 346423 CASAVA_Build 9 95186367 1I GGTTAAAAGT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 8 9 346424 CASAVA_Build 9 95188449 3D GTAATCCCAG CTA/--- CTACTCGGGA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CTA 2 1 346425 CASAVA_Build 9 95189210 1D GATACTTAAC T/- AAAAAACCAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 1 0 346426 CASAVA_Build 9 95197302 2I AGTCTCTAGG --/TA AAGTTCCAAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 TA 0 1 346427 CASAVA_Build 9 95198403 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 8 9 346428 CASAVA_Build 9 95205821 1I AGCAATAAAG -/T GTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 T 0 1 346429 CASAVA_Build 9 95207986 1D TATAACTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 8 9 T 13 12 346430 CASAVA_Build 9 95223457 4I CAACCGCTGC ----/TCTT TCTATTGTCT 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 TCTT 0 1 346431 CASAVA_Build 9 95228164 1D TTTCACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2682 hom 20 7 9 4 T 13 12 346432 CASAVA_Build 9 95230204 1I CTGGCCCCAC -/A ACTGGGCCAC 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 A 1 2 346433 CASAVA_Build 9 95232754 5I AATCAGGCAA -----/CAGCC CAGCCCAGCC 3070 het 3070 hom 55 21 24 10 CAGCC 3 4 346434 CASAVA_Build 9 95244985 4D GAAAACTGAC AAAT/---- AAAGATAGAA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 AAAT 1 0 346435 CASAVA_Build 9 95258869 2D TACCTACAAT TC/-- TCACCCCCAG 3070 het 3070 ref 41 21 19 2 TC 2 1 346436 CASAVA_Build 9 95264491 3I GCAAGCAGTT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 het 3070 hom 22 11 11 0 CTC 0 1 346437 CASAVA_Build 9 95269350 2D TCTGCTGTCA CC/-- CCCCCCCCCC 2941 het 37 hom 26 0 9 17 C 12 10 346438 CASAVA_Build 9 95276190 4I AATAAATGAA ----/AAAC AAAATCAATT 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 AAAC 0 1 346439 CASAVA_Build 9 95280383 1I CATTTATAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 942 hom 20 3 11 6 T 13 14 346440 CASAVA_Build 9 95293914 1D TTTATTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 7 T 11 10 346441 CASAVA_Build 9 95308000 2D TTGTTTATGG TT/-- TTTGAGTGAG 3070 het 3070 hom 55 22 24 11 T 5 3 346442 CASAVA_Build 9 95312814 1I TGCCTCAGCC -/T CCCAGTGTCG 3056 het 3056 ref 38 23 10 5 T 0 1 346443 CASAVA_Build 9 95314640 1I AGTCTGCATA -/T TTTTTTTTTT 2774 het 2774 ref 29 12 8 9 T 11 12 346444 CASAVA_Build 9 95316050 1D GGCAGTGTGA G/- AGGTGGTGGT 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 G 1 0 346445 CASAVA_Build 9 95327840 1D ACTACACTCT G/- GGGATGCCTG 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 G 4 3 346446 CASAVA_Build 9 95338152 2I CTTCTTGACA --/CT CTAAATAGGA 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 CT 1 2 346447 CASAVA_Build 9 95340143 1D CCTTGTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2658 hom 28 10 12 7 T 12 11 346448 CASAVA_Build 9 95340317 1I TGTGGACTGT -/G GGGCTGCTCC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 G 3 4 346449 CASAVA_Build 9 95340981 1D AAACATTGAG T/- TTTTTTACTG 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 7 6 346450 CASAVA_Build 9 95343181 1I TGTGTGTGGT -/G GGGGGGTGTG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 G 6 7 346451 CASAVA_Build 9 95360527 1D CTGGTCCCCA G/- GGACCATGGG 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 G 3 2 346452 CASAVA_Build 9 95385679 1I GTTTTCCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 11 7 T 11 12 346453 CASAVA_Build 9 95396290 2D TCTCATGTGA CC/-- CCCCCCCCCT 3070 hom 43 het 27 0 11 16 C 11 9 346454 CASAVA_Build 9 95398851 1D GTTTCTGCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 21 0 15 6 T 12 11 346455 CASAVA_Build 9 95402319 3D GGTATGTGGT GTG/--- GTGGTGCATG 3070 het 3070 hom 59 25 20 14 GTG 3 2 346456 CASAVA_Build 9 95403563 1D GGGCCTAGTC T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 21 9 10 2 T 7 6 346457 CASAVA_Build 9 95406942 1D ATTCTGAGCC T/- TTTTTTTAGC 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 8 7 346458 CASAVA_Build 9 95410438 3I AATAATAATA ---/ATT ATTATTATTT 3070 het 433 hom 27 2 24 1 ATT 3 4 346459 CASAVA_Build 9 95412175 1D TAGGTGTAGA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 396 hom 21 2 18 1 T 9 8 346460 CASAVA_Build 9 95413519 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1964 het 22 hom 11 1 4 7 A 13 12 346461 CASAVA_Build 9 95414117 1I38M1I29M1I TGATTACAGA -GGGGCATATTTATGGATTTCCTTCAATCTTCCACACAC-AAAAAAGGTGTGTCTCTATACTCTTCTGC-/CAGGGCATATTTATGGATTTCCTTCAATCTTCCACACACAAAAAAAGATGTATCTCTATACTCTTCTACA AACTTGTGCT 3070 het 3070 ref 62 67 9 21 N/A 0 0 346462 CASAVA_Build 9 95414433 1D TAATGTGTGT G/- TTTTGCCAAG 3070 hom 99 het 44 0 34 10 G 1 0 346463 CASAVA_Build 9 95416865 1I TTAGCCCAGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 A 8 9 346464 CASAVA_Build 9 95416937 24D17M6D ATGACGATGG TGGTGATGGTGATAGTAATGATGATGGTGATGATGGTGACAGTGATG/------------------------TGGTGATGATGGTGACA------ GTGATGGTGA 3070 het 3070 hom 58 21 26 41 N/A 0 0 346465 CASAVA_Build 9 95418713 2D TCTGGGAGTG AA/-- AGAGGCCACT 2987 het 2987 ref 31 16 9 6 A 3 1 346466 CASAVA_Build 9 95420882 2D TGCATGTGTT TG/-- TGTTTGTATC 3070 het 3070 hom 55 26 25 5 TG 2 1 346467 CASAVA_Build 9 95424948 4D TGAGCCCCGA GTCT/---- GTCTGTCTGT 3070 het 3070 ref 60 34 20 10 GTCT 3 2 346468 CASAVA_Build 9 95426057 2I TAACAGCTCA --/CG CTGTCTAACG 448 het 448 ref 53 39 3 11 CG 0 1 346469 CASAVA_Build 9 95433907 3I TACCTGAGTT ---/GGG GGGCTTGGGA 3070 hom 41 het 17 0 13 4 G 3 6 346470 CASAVA_Build 9 95435043 4I TGCCCAGAGG ----/CTGT CTATGATGCC 3070 hom 132 het 52 0 43 9 CTGT 0 1 346471 CASAVA_Build 9 95442229 1I TGGTCTTTGG -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 8 9 346472 CASAVA_Build 9 95450221 3I ACATTGCATT ---/TGG TTTTTATATC 3070 hom 66 het 26 0 22 4 TGG 0 1 346473 CASAVA_Build 9 95451790 2D GGACACACTC AT/-- GACACTCACA 3070 het 3070 hom 81 30 43 8 AT 1 0 346474 CASAVA_Build 9 95452245 2I TCACCAACAC --/AG GGTACACTCA 3070 het 3070 ref 93 43 39 11 AG 0 1 346475 CASAVA_Build 9 95463129 2I ATTGAGGTTG --/AA AAACCTGAAG 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 A 3 5 346476 CASAVA_Build 9 95465871 4I CTCTGCATCT ----/CACA CACACACACC 3070 hom 165 het 71 0 55 16 CA 4 6 346477 CASAVA_Build 9 95485022 16I TCTCTCTTTA ----------------/CGAGCTGCAAAGTGGC CCACCCCTTT 3070 hom 68 het 33 0 24 9 CGAGCTGCAAAGTGGC 0 1 346478 CASAVA_Build 9 95485069 5D TGCCTGCCCC AGCCT/----- AGCCTAGCCT 3070 hom 55 het 28 0 16 15 AGCCT 3 2 346479 CASAVA_Build 9 95486025 1D TCTGGGCCTC T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 43 het 19 0 13 7 T 8 7 346480 CASAVA_Build 9 95486294 4D ACTGATGCTT AAAC/---- ACTTACTGAT 3070 het 3070 ref 33 18 9 8 AAAC 1 0 346481 CASAVA_Build 9 95487267 6I ATGTGTTGTC ------/TAGAAT CAGGAGTACC 3070 hom 129 het 53 0 44 9 TAGAAT 0 1 346482 CASAVA_Build 9 95490626 1I CCATATGACT -/A AAAAATCACT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 5 6 346483 CASAVA_Build 9 95500705 1D AAGCCCGGAA G/- CCTCTGTTCT 1617 het 1617 ref 22 11 5 6 G 1 0 346484 CASAVA_Build 9 95513678 1I AAACAGGTGG -/C CCTCCCCAGT 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 C 2 3 346485 CASAVA_Build 9 95517047 1I TTATGAGTCA -/T TTTTTTGGTG 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 6 7 346486 CASAVA_Build 9 95546222 1I TTGTGTTTTT -/A GTAGAGACGG 1660 het 381 hom 7 2 5 0 A 0 1 346487 CASAVA_Build 9 95556109 2D8M6D CCTGTTCATT TGTACTTCCAATCCTC/--TAATTTCA------ CTTTTTCCCA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 N/A 0 0 346488 CASAVA_Build 9 95567892 1D AACTGAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 10 9 346489 CASAVA_Build 9 95577161 1I GAAGCCCTAA -/C CCCCCAGTGT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 C 5 6 346490 CASAVA_Build 9 95600957 2D CGCACACGCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 18 het 33 0 19 14 CT 9 8 346491 CASAVA_Build 9 95608673 12D ACTCCGCCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 2891 het 1804 hom 14 7 10 1 A 23 11 346492 CASAVA_Build 9 95635305 1I TTCGTAGTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 T 8 9 346493 CASAVA_Build 9 95639062 1D ATGACTGAAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 T 8 7 346494 CASAVA_Build 9 95678502 5I GAATATAGAC -----/AAAAT AAAGTAAGAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 AAAAT 0 1 346495 CASAVA_Build 9 95681427 4I TAAAAATAAG ----/TTAA TTAATGAAAT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 TTAA 1 2 346496 CASAVA_Build 9 95683167 1I ATTCTCACTG -/T TTTAGTGGAG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 3 4 346497 CASAVA_Build 9 95684281 4D AGACCTGTAA CACT/---- CACCGCGAGG 3070 het 3070 ref 32 15 11 7 CACT 1 0 346498 CASAVA_Build 9 95684526 1D GAGCAGTTAG T/- TTGAGGACAG 3070 het 3070 ref 35 18 10 8 T 3 2 346499 CASAVA_Build 9 95685229 4D ATCATACATA TAAT/---- TACATATAAA 2068 het 2068 ref 11 5 5 1 TAAT 1 0 346500 CASAVA_Build 9 95685286 11D ATATATAGAT AAAGTTAGTCG/----------- AAAGTTAGTT 2596 het 2527 hom 13 6 6 3 AAAGTTAGTCG 1 0 346501 CASAVA_Build 9 95685534 5D ATTCAAAAAG TAAAT/----- TAAAGGATAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 7 TAAAT 1 0 346502 CASAVA_Build 9 95686418 1D CAAGCAAAAA C/- AAATAAAATT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 C 1 0 346503 CASAVA_Build 9 95687628 8D TTATATATAT ATGTATAC/-------- ATGTATACAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 7 ATGTATAC 2 1 346504 CASAVA_Build 9 95692467 3I CAAAATGCAG ---/CAT CATCTCCTTA 3070 het 3070 ref 41 27 10 4 CAT 1 2 346505 CASAVA_Build 9 95702669 1D TCTGTATTCA T/- TTTCCATTGC 3070 het 3070 hom 35 13 20 3 T 4 3 346506 CASAVA_Build 9 95708947 1I AATAAAGGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 T 9 10 346507 CASAVA_Build 9 95720278 1I ACCAGGCATG -/A AAAATCAAGA 3070 het 3070 hom 40 12 15 13 A 4 5 346508 CASAVA_Build 9 95731812 1I ATGCTTCTAA -/T CCCAGCACTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 0 1 346509 CASAVA_Build 9 95808668 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 117 hom 28 2 21 5 A 14 15 346510 CASAVA_Build 9 95933490 5I TGAGAATGCC -----/ACTTT ACTTCTGCAG 3070 hom 117 het 41 0 40 1 ACTTT 0 1 346511 CASAVA_Build 9 95946959 1D AGGCAGCAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 55 21 22 12 A 10 9 346512 CASAVA_Build 9 95958313 1I GCTCCAGCCC -/T TTTTCTCTCA 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 4 5 346513 CASAVA_Build 9 95959572 1D TCATCCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 14 13 346514 CASAVA_Build 9 95975081 4D TGAGAGGCGA AGGC/---- AGGCAGGCAG 3070 het 357 hom 23 2 15 9 AGGC 4 3 346515 CASAVA_Build 9 95982266 2I GGAATGAGAC --/TG GAATTTGTGC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 TG 0 1 346516 CASAVA_Build 9 95982357 2I CAAAATCTCA --/CT CTGTTTCCCA 3070 hom 45 het 23 0 15 8 CT 1 2 346517 CASAVA_Build 9 95982721 4I TTCTCATACT ----/CATA TGGGGCTTTA 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 CATA 0 1 346518 CASAVA_Build 9 95983045 1I47M1D CCATCTTACT -AAAAAAAAGTAGCTGGCATGGTGGTGGGCTACTTGTGAGGCTGATGTA/AAAAAAAAAGTAGCTGGCATGGTGGTGGGCTACTTGTGAGGCTGATGT- AGGAGAACCG 3070 het 2574 hom 33 6 12 28 N/A 0 0 346519 CASAVA_Build 9 95983190 3I GTCTTAAAAA ---/AAG TGTTTCTAGT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 AAG 0 1 346520 CASAVA_Build 9 95992668 3I TGAAAGTGTT ---/CCC TTTTCACCAC 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 C 0 3 346521 CASAVA_Build 9 95994517 4I TTTTTGTTTA ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 17 12 10 TTTG 2 3 346522 CASAVA_Build 9 96001884 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 375 hom 14 2 11 1 A 11 10 346523 CASAVA_Build 9 96002729 2I TGCCAGGCTC --/TT TTGAACAACC 3070 hom 84 het 31 0 25 6 T 2 4 346524 CASAVA_Build 9 96008400 1D TATTTTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2408 hom 26 9 9 8 T 12 11 346525 CASAVA_Build 9 96009828 6D TTTAGAAAGA CTTTAT/------ CTGGTGTTTT 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 CTTTAT 1 0 346526 CASAVA_Build 9 96016503 15D GGGAGGACTG GGTGGGGCCTCGGGA/--------------- AGTTAACACC 3070 het 3070 ref 30 13 13 10 GGTGGGGCCTCGGGA 1 0 346527 CASAVA_Build 9 96017010 2I GTGCAAGTAT --/CC ATCCATAGAC 3070 het 3070 hom 39 18 18 4 C 0 2 346528 CASAVA_Build 9 96048497 1D TACATGGAGA C/- CTGAGGAAGA 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 C 2 1 346529 CASAVA_Build 9 96052821 2D TGTGGGCAAA CT/-- CACACTGCCC 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 CT 1 0 346530 CASAVA_Build 9 96058580 1D CTTATCTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 T 12 11 346531 CASAVA_Build 9 96058957 1D GTAAGAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2918 hom 40 11 16 14 A 15 14 346532 CASAVA_Build 9 96062587 1D TCTTGATAGT G/- GGGGGGGGGA 1558 het 1074 hom 25 7 5 13 G 10 9 346533 CASAVA_Build 9 96065936 1D GCCAATTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 605 hom 34 3 23 8 T 15 14 346534 CASAVA_Build 9 96066241 5D ATAAACAGTC TTTTA/----- TTTTATCTTT 3070 hom 108 het 44 0 37 10 TTTTA 2 1 346535 CASAVA_Build 9 96067683 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1420 hom 18 6 10 2 A 15 14 346536 CASAVA_Build 9 96070145 1I ATTTTTTTTG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 8 9 346537 CASAVA_Build 9 96091939 9D CACTGTAGGC AAATCAAGA/--------- CAGAATTATA 3070 het 3070 ref 24 13 10 5 AAATCAAGA 1 0 346538 CASAVA_Build 9 96108289 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 6 A 12 11 346539 CASAVA_Build 9 96111347 2D GTTTTTAATA TT/-- TTTTTTAATA 3038 hom 18 het 7 0 7 0 T 8 6 346540 CASAVA_Build 9 96115866 2I CTATATAGAA --/AG TCAGTTCGTG 3070 hom 74 het 29 0 24 5 AG 0 1 346541 CASAVA_Build 9 96119424 1D CAGGGCACTT C/- CCAGACAGCC 2571 hom 24 het 13 0 8 5 C 3 2 346542 CASAVA_Build 9 96120766 3D TGCTGGCAGG AGA/--- AGGTGATGGG 3070 hom 33 het 14 0 11 4 AGA 1 0 346543 CASAVA_Build 9 96147469 1D AGCCTCCCAG A/- AAAAAAAAAG 1264 het 641 hom 5 2 3 0 A 10 9 346544 CASAVA_Build 9 96152214 4I AATATGGCCA ----/ATTG ATTGTTTTAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATTG 1 2 346545 CASAVA_Build 9 96163586 2I GATTCAGTAC --/CT ACCACACAGG 3070 hom 69 het 31 0 24 7 CT 0 1 346546 CASAVA_Build 9 96181526 2D GGCCTCACTC TG/-- TCATCCAGGC 1562 het 187 hom 6 1 4 1 TG 1 0 346547 CASAVA_Build 9 96182959 2I AAATAAACTG --/TA TGTGTTTGGA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 TA 0 1 346548 CASAVA_Build 9 96188371 2I AGAACATATC --/AT GTGTTTGTAT 3070 hom 60 het 22 0 19 3 AT 0 1 346549 CASAVA_Build 9 96190245 1I GTTCCCTGAA -/G AAAAATAGTG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 0 1 346550 CASAVA_Build 9 96196015 9I AAGGACTGTA ---------/TCCTGTTTC TCACCATTGT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TCCTGTTTC 0 1 346551 CASAVA_Build 9 96202613 1I GTCTTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 12 13 346552 CASAVA_Build 9 96205607 1I GTCAGTTTCC -/T TTTTTTTTTT 2243 het 2243 ref 26 13 7 6 T 13 14 346553 CASAVA_Build 9 96242264 1I TTTTCTCTTA -/T TTTTTTTTTT 1953 het 1953 ref 18 6 6 6 T 11 12 346554 CASAVA_Build 9 96288522 12I CATTCCAAAA ------------/AGCAATGCATAC AGCCTCCAAT 2188 het 2188 ref 37 30 5 2 AGCAATGCATAC 0 1 346555 CASAVA_Build 9 96293228 1D11M1D ATTATATGAA GTATGGGATGCTA/-TATGGGATGCT- GATTAAAGAA 3070 het 3070 ref 46 34 7 7 N/A 0 0 346556 CASAVA_Build 9 96324228 1D TTCATTTTGA T/- TTTGATTTAG 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 4 3 346557 CASAVA_Build 9 96324321 3D CTCTTGAGAT TTC/--- TTCGACTACT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTC 2 1 346558 CASAVA_Build 9 96324621 4I CAACTATATT ----/GTTA CTGATTTTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 GTTA 0 1 346559 CASAVA_Build 9 96325410 2D GCATCTTCTC TT/-- TGTCTTTTTC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 T 3 1 346560 CASAVA_Build 9 96325859 11I10M1I GTTTTTGGTT -----------TAATAATAAT-/TATTTATTTAATAATAATAATG TTTTTTTTGA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 N/A 0 0 346561 CASAVA_Build 9 96326830 3I TTTCTTTTTT ---/TTC TTCTTCTTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TTC 3 4 346562 CASAVA_Build 9 96332391 6D ATTCTAGAGC TCTTTT/------ TATTTTTTAA 3070 hom 54 het 21 0 19 4 TCTTTT 1 0 346563 CASAVA_Build 9 96334180 4D CAAGGAACTT AAAC/---- AAATTTACAA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AAAC 1 0 346564 CASAVA_Build 9 96338683 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 80 het 29 0 27 2 T 11 10 346565 CASAVA_Build 9 96340619 4I CACTAACATA ----/CAAT ATGTTAACTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 CAAT 0 1 346566 CASAVA_Build 9 96341023 6D TCTCTCTCAA AATAAT/------ AATAATAATT 3070 hom 90 het 35 0 30 7 AAT 5 3 346567 CASAVA_Build 9 96353908 1I AAAATAACTG -/A AAAGTGTCAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 3 4 346568 CASAVA_Build 9 96367874 8D ATACATAGAT GATAGATA/-------- GATAGATAGA 3070 hom 93 het 36 0 31 7 GATA 4 2 346569 CASAVA_Build 9 96369062 5I AGGTTGGAGC -----/TTAGA TTAAACAAAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TTAGA 0 1 346570 CASAVA_Build 9 96369238 1I AAGGCAGAGT -/C CCATCATCTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 2 3 346571 CASAVA_Build 9 96369559 2I GCCAGGAAAC --/AG AAGCCAACCG 3070 hom 74 het 27 0 24 3 AG 0 1 346572 CASAVA_Build 9 96375056 1I ACTAGTTCTA -/G GAAGTGTTTT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 G 1 2 346573 CASAVA_Build 9 96375623 1D CAGCAAGTTT C/- TTTTTTAAAT 3070 hom 87 het 35 0 28 7 C 1 0 346574 CASAVA_Build 9 96392560 3I CCCCTGCCTG ---/GGT GGTGGTGGTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 GGT 3 4 346575 CASAVA_Build 9 96402500 1D CCCAGAGGAA G/- GGGGGGGCAG 3070 hom 78 het 29 0 23 7 G 8 7 346576 CASAVA_Build 9 96403843 2I CTGCACCCTG --/AT ATATATATAT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AT 5 6 346577 CASAVA_Build 9 96406343 1D TTGAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 23 1 14 9 A 11 10 346578 CASAVA_Build 9 96421978 14D ACACTGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 22 2 16 6 A 28 14 346579 CASAVA_Build 9 96451701 12D GTCAGCTACC CTCCTGTGGGCT/------------ CTCACTGCCC 3070 hom 81 het 30 0 26 6 CTCCTGTGGGCT 1 0 346580 CASAVA_Build 9 96460020 1I ATTTGTCATC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 8 17 9 T 8 9 346581 CASAVA_Build 9 96466152 1I TTCCTGGAAT -/A AAAAAAAAAA 2547 het 2547 ref 26 11 8 7 A 13 14 346582 CASAVA_Build 9 96469987 1D CCTTCCCCCC G/- TCCCGGTTTC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 G 1 0 346583 CASAVA_Build 9 96470497 1D AATGTCCCCC T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 7 6 346584 CASAVA_Build 9 96484575 1D CCTAGGTGAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 1644 hom 20 5 12 4 T 9 8 346585 CASAVA_Build 9 96487928 1I ATAAAAGTAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 A 8 9 346586 CASAVA_Build 9 96490348 4I TTCCTGTAAT ----/CTCA CTCAGTACTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 CTCA 1 2 346587 CASAVA_Build 9 96490442 1D CTACAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 34 11 12 11 A 10 9 346588 CASAVA_Build 9 96505680 1D AGCAGGGCAA G/- GGGACAAAAC 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 G 4 3 346589 CASAVA_Build 9 96515661 1I AACACATAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 9 10 346590 CASAVA_Build 9 96515940 1D AATCAAGGAT G/- TTTTTCCCTC 3070 het 3070 ref 41 21 14 7 G 1 0 346591 CASAVA_Build 9 96516656 2I TTGCCCAATG --/CA CATGGCTATA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 CA 1 2 346592 CASAVA_Build 9 96517814 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 14 7 T 12 11 346593 CASAVA_Build 9 96522299 2D TGCAGCAAAT AA/-- AGAGTTACAG 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 3 1 346594 CASAVA_Build 9 96524284 1I TCAGAAATTC -/T TTTGAACTTT 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 T 3 4 346595 CASAVA_Build 9 96524704 2D TTTAATATTT TA/-- TGTTTTAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 TA 1 0 346596 CASAVA_Build 9 96531157 1D AAGTTGGTGT C/- CCACCAAAGT 3070 het 3070 ref 50 27 20 3 C 3 2 346597 CASAVA_Build 9 96532477 1D AGAGATCATT A/- ATGCATTTCC 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 2 1 346598 CASAVA_Build 9 96534351 1I TTCAGTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1542 hom 38 4 27 7 T 13 14 346599 CASAVA_Build 9 96538883 4I AATTAAGGTC ----/CTTT CTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 CTTT 1 2 346600 CASAVA_Build 9 96546249 1I TGTAATCCAG -/C ACTTTGGGAG 3070 het 3070 hom 19 9 8 2 C 0 1 346601 CASAVA_Build 9 96552022 3I ATGTCTAGTA ---/GTT TTATGTTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 GTT 0 1 346602 CASAVA_Build 9 96561026 1D TTTGCCTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 T 10 9 346603 CASAVA_Build 9 96568930 4D TTGTGATTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 11 18 7 TTTG 3 2 346604 CASAVA_Build 9 96591996 1I TTTTTTTTTT -/G AGACGGAGTC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 G 0 1 346605 CASAVA_Build 9 96594763 1I GTTGGCTCTT -/A ACCAGCTTAT 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 A 1 2 346606 CASAVA_Build 9 96595799 4D AAAAAGGAAA AAAG/---- AAAGGAAAGC 2875 het 2875 ref 34 21 8 5 AAAG 2 1 346607 CASAVA_Build 9 96596893 6D5M7D TCCTGCAGTA CAAAACAGAGCCTACAAA/------GGATC------- ACAGAGGAGG 3070 het 3070 ref 46 31 16 9 N/A 0 0 346608 CASAVA_Build 9 96601965 2D ATTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1609 hom 20 6 13 2 A 14 12 346609 CASAVA_Build 9 96607272 1D AGAGATCAAA T/- TTTTTTTTTT 2059 het 2059 ref 46 26 6 14 T 15 14 346610 CASAVA_Build 9 96610528 1I AATGGATTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 17 20 0 T 8 9 346611 CASAVA_Build 9 96612742 1D TTATTTCAAC A/- AGGCATGGGG 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 2 1 346612 CASAVA_Build 9 96618508 1I AAATTCGTCC -/A TGAATTTAGT 3070 hom 148 het 55 0 50 5 A 0 1 346613 CASAVA_Build 9 96623269 1I TTATTTATGC -/T TTTTTTGGGC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 6 7 346614 CASAVA_Build 9 96630437 9D GCTAAGAGTG ATTTATTTA/--------- TTATGATTTT 3070 het 3070 hom 50 22 26 4 ATTTATTTA 1 0 346615 CASAVA_Build 9 96652138 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1331 het 708 hom 15 7 5 3 A 17 16 346616 CASAVA_Build 9 96652363 5I GACATAGATT -----/TTAAA TTAAATTATT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 TTAAA 1 2 346617 CASAVA_Build 9 96660484 1I ACTTGGTGAC -/T TTAAAACAAT 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 T 2 3 346618 CASAVA_Build 9 96664482 1D CTCTCAGATG T/- GGGGTGAATG 3070 het 3070 hom 45 14 25 8 T 1 0 346619 CASAVA_Build 9 96692129 1D TATTACTTGA T/- TTTTTTTTTT 2820 het 2820 ref 43 19 9 15 T 17 16 346620 CASAVA_Build 9 96703195 3D TAATATGAAA CAT/--- CATTTCAGTA 3070 het 3070 ref 38 22 10 7 CAT 2 1 346621 CASAVA_Build 9 96772807 1D TGCTGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 1395 het 1395 ref 29 22 3 4 A 12 11 346622 CASAVA_Build 9 96809492 1D GGGAGAAAGT G/- GGGGGGGGAC 3070 het 1749 hom 19 5 10 4 G 9 8 346623 CASAVA_Build 9 96811399 5I ATATATACAT -----/ATAAA ATAATATAAA 2204 het 2204 ref 27 15 6 6 ATAAA 0 1 346624 CASAVA_Build 9 96843024 4I AAACAGTCTC ----/ACTT CCTTCCTCAA 3070 het 3070 ref 41 22 18 1 ACTT 0 1 346625 CASAVA_Build 9 96859945 2D GAATGGGACT CA/-- CAGAAACCTG 3070 het 3070 ref 31 16 12 5 CA 2 1 346626 CASAVA_Build 9 96864364 1D CAGATCTCTA G/- TACAGCGCAG 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 G 1 0 346627 CASAVA_Build 9 96866896 1D ATGAATTTCA T/- TTGGGCCAAA 3070 het 3070 hom 53 23 26 4 T 3 2 346628 CASAVA_Build 9 96870430 3I CCACCAGCAC ---/TTG TTGTTGTCCG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 TTG 2 3 346629 CASAVA_Build 9 96889652 1D TTCTGGTGTT C/- CCCCCCCACC 2574 het 1792 hom 15 5 7 3 C 8 7 346630 CASAVA_Build 9 96911013 1D CTTCAAGACC T/- TTTTTTTTTT 1764 het 1675 hom 23 7 6 10 T 13 12 346631 CASAVA_Build 9 96914568 11D CTCCTGCCCC AGTCCTCCCTG/----------- AGAACAAGTG 3070 het 3070 hom 55 27 27 6 AGTCCTCCCTG 1 0 346632 CASAVA_Build 9 96919709 7I TGGGACTTAA -------/AAATAAT AAATTTATGC 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 AAATAAT 0 1 346633 CASAVA_Build 9 96921469 1D CTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1912 het 1662 hom 25 8 6 11 T 15 14 346634 CASAVA_Build 9 96922097 6I ATTACAGGAG ------/TGAGTT TGAGCTATGC 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 TGAGTT 0 1 346635 CASAVA_Build 9 96963946 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3038 het 1300 hom 19 7 8 4 T 17 16 346636 CASAVA_Build 9 96991632 1I CATTAGTTCC -/A GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 43 21 10 12 A 0 1 346637 CASAVA_Build 9 97001415 13D AGGATTGACT CTGCAGCCCCACC/------------- CTGCAGCCCC 3070 het 771 hom 21 3 13 9 CTGCAGCCCCACC 2 1 346638 CASAVA_Build 9 97007666 1D GTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2320 hom 31 8 18 5 A 12 11 346639 CASAVA_Build 9 97019768 4D TGGTGTAAAT AAAG/---- AAAGGTCTCT 3070 het 3070 ref 21 12 8 4 AAAG 2 1 346640 CASAVA_Build 9 97032198 1I TTATTTCAGT -/A AAAAAAAAAA 2825 het 2825 ref 28 17 8 3 A 10 11 346641 CASAVA_Build 9 97073823 1D TACATCTTGC T/- TTTTTTTTTG 1814 het 1814 ref 43 29 4 10 T 10 9 346642 CASAVA_Build 9 97080898 23I ATCACGGTAA -----------------------/TTAAGCGAGCATAAGTCTGAAAC TTATTCTACG 3070 het 2646 hom 31 8 11 12 TTAAGCGAGCATAAGTCTGAAAC 0 1 346643 CASAVA_Build 9 97110554 1I ACCCGGCTAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 8 9 346644 CASAVA_Build 9 97133750 1I TAAAACTCTT -/A AAAAAAAAAA 1954 het 871 hom 23 5 6 12 A 15 16 346645 CASAVA_Build 9 97146615 1D ACAACCAGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 10 9 346646 CASAVA_Build 9 97158912 4D AGGAGCATTG AGAT/---- TTGACTCTCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AGAT 1 0 346647 CASAVA_Build 9 97178649 1D ATCATACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 28 0 21 7 T 18 17 346648 CASAVA_Build 9 97183841 4I TCTTTTTTCT ----/CTAA CTACCTCTCT 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 CTAA 0 1 346649 CASAVA_Build 9 97189178 1D GAGGTGTATT G/- TAGGATGCTC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 G 1 0 346650 CASAVA_Build 9 97207796 9D4M7D GCTCTAAGCC TCCAAGGTATTAGTGACTCT/---------TTAG------- AGTCACTAAT 3070 hom 168 het 55 0 53 7 N/A 0 0 346651 CASAVA_Build 9 97209832 4D TTCTTCCTTC CTTT/---- CTTTCTTTCC 3070 het 2816 hom 31 10 13 9 CTTT 3 2 346652 CASAVA_Build 9 97212704 1D GGAGGGGGAC A/- GGGGGTGATC 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 A 1 0 346653 CASAVA_Build 9 97222043 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 1963 hom 33 10 18 5 C 1 0 346654 CASAVA_Build 9 97253108 1I GTTCTGGGAA -/G GGGGGGGGCA 3070 hom 91 het 34 0 30 4 G 8 9 346655 CASAVA_Build 9 97255243 1I AATAACAATA -/T TTTTTTTTTT 2955 het 2064 hom 21 7 10 4 T 11 12 346656 CASAVA_Build 9 97258296 1I AGGGAGAATG -/C CAAGGTTCCC 3070 hom 101 het 36 0 32 4 C 1 2 346657 CASAVA_Build 9 97265274 1D CAAAGGCTTC A/- AAAAAAATCT 3070 hom 39 het 14 0 12 2 A 8 7 346658 CASAVA_Build 9 97270746 1D TTAAACGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 32 0 24 8 T 13 12 346659 CASAVA_Build 9 97274472 1D GAACCGGGAG T/- TTTGTGAGAT 3070 hom 102 het 37 0 30 8 T 4 3 346660 CASAVA_Build 9 97283011 1I CAAAATTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 13 14 346661 CASAVA_Build 9 97294925 1I AGGAGATGCA -/G TTTTTTTCAG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 0 1 346662 CASAVA_Build 9 97299593 1D ACCCATCAGC T/- TTTCCAGGCT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 4 3 346663 CASAVA_Build 9 97309240 1D TGGTGAGCGC G/- GCCGCCGGAG 3070 hom 51 het 18 0 15 3 G 2 1 346664 CASAVA_Build 9 97317189 8D TTTATCCGGA GTACCACC/-------- CAGAAATTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 GTACCACC 1 0 346665 CASAVA_Build 9 97320145 1D CATCCTAGGA G/- TTTTGGGATC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 1 0 346666 CASAVA_Build 9 97328573 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2490 het 518 hom 13 2 7 4 A 17 18 346667 CASAVA_Build 9 97338730 4D AACAAAACAG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 54 het 24 0 19 6 AAAC 5 4 346668 CASAVA_Build 9 97340252 1D TATGTTCACA T/- TTTTTTTTTT 1235 het 1235 ref 39 14 4 21 T 15 14 346669 CASAVA_Build 9 97348242 1D GTGAGGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 33 0 25 8 T 12 11 346670 CASAVA_Build 9 97357474 1I CAAAGCCTAC -/A ATATCTCCCC 3070 hom 132 het 48 0 43 5 A 1 2 346671 CASAVA_Build 9 97389334 7I GGCCTGACTG -------/GGAGACA GCCACATCTG 3070 hom 135 het 49 0 42 7 GGAGACA 0 1 346672 CASAVA_Build 9 97402041 3D AGTGTGTGTC GGG/--- GGGGGGGCAG 3070 hom 81 het 33 0 25 10 G 10 7 346673 CASAVA_Build 9 97408812 1D AGCAAATGCC T/- TTTTTTTTTT 1574 het 1574 ref 43 24 4 16 T 13 12 346674 CASAVA_Build 9 97428658 1I GCCCTAGGCC -/G GGGACGCCAT 3070 hom 66 het 27 0 19 8 G 3 4 346675 CASAVA_Build 9 97435990 8D ACTCCATCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 33 0 29 6 A 25 17 346676 CASAVA_Build 9 97444693 2D ACTGGGCTAA AT/-- AATCAAGCAG 3070 hom 129 het 48 0 42 9 AT 1 0 346677 CASAVA_Build 9 97454002 1D AAAATTCTTG A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 ref 50 26 23 2 A 7 6 346678 CASAVA_Build 9 97455326 1I ATTGAAAAAT -/A AAAAAGAATA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 5 6 346679 CASAVA_Build 9 97456892 1D TTGAGGTGAC T/- TGAAGGTATC 3070 het 3070 ref 20 9 9 2 T 2 1 346680 CASAVA_Build 9 97459386 1D TTCACAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 7 T 11 10 346681 CASAVA_Build 9 97460561 1I TTTTTGTAGA -/T ATTCTTTATC 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 0 1 346682 CASAVA_Build 9 97460810 1D GAAATACCGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 49 21 17 11 T 10 9 346683 CASAVA_Build 9 97473865 1D ACAAGAAGAT G/- GAAGGCAAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 G 2 1 346684 CASAVA_Build 9 97479437 4D AAAAAAACAC ACAA/---- ACAAACAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 14 8 ACAA 3 2 346685 CASAVA_Build 9 97505710 1I AAAATAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 1217 hom 13 3 8 2 A 8 9 346686 CASAVA_Build 9 97519306 4I AGAAATAATG ----/TACT ATATCCTGTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TACT 0 1 346687 CASAVA_Build 9 97522281 1D GTGAACCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 28 2 14 12 A 12 11 346688 CASAVA_Build 9 97524858 1D TCCACCTCAA G/- GGACCTCCGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 5 G 3 2 346689 CASAVA_Build 9 97529410 3D CCTGGTCTCA TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 hom 74 het 40 0 25 17 TCC 6 5 346690 CASAVA_Build 9 97533197 1D AATCTTTGCC A/- AAAGATTTCT 1924 het 1924 ref 17 8 5 6 A 4 3 346691 CASAVA_Build 9 97535828 1D TCTTGAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 9 8 346692 CASAVA_Build 9 97536840 1D CTTTCCTTTT G/- GACTTTATTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 2 1 346693 CASAVA_Build 9 97536976 3I GCTGCCCTTG ---/CTT CTTCTGAATG 3070 hom 94 het 45 0 38 7 CTT 1 2 346694 CASAVA_Build 9 97540665 5D CAGGAGATGA TCCCC/----- TCGCCCCTGC 3070 het 3070 hom 34 12 14 14 TCCCC 1 0 346695 CASAVA_Build 9 97542232 1D CACAACTACC G/- TGCAACTTCA 3070 het 3070 ref 28 14 9 6 G 1 0 346696 CASAVA_Build 9 97546166 1D ACAATTTGGG A/- AAAAAAATAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 8 7 346697 CASAVA_Build 9 97547129 2I GTGATTTAAC --/AG AGAATACCTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AG 1 2 346698 CASAVA_Build 9 97553027 2D CGGAGGAAAC TG/-- TGGTTTCCTG 3070 hom 87 het 33 0 28 5 TG 2 1 346699 CASAVA_Build 9 97555712 2I GATGGAGAAA --/CT CTGCCCTGAC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 CT 1 2 346700 CASAVA_Build 9 97561632 1I TTCTTTCTAT -/A AAAAAAAAAA 2323 het 2323 ref 31 10 11 10 A 15 16 346701 CASAVA_Build 9 97591863 1D GCCCAGCAAA T/- TTTTTTTTTT 2173 hom 15 het 7 0 6 1 T 13 12 346702 CASAVA_Build 9 97592510 1I AATTAAAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 32 het 29 0 23 6 A 9 10 346703 CASAVA_Build 9 97613272 1I CCTGCCACTT -/C CCCTGCTGGG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 3 4 346704 CASAVA_Build 9 97613930 5D GCACCAAGCA GGTGT/----- GGACTCTCTG 3070 hom 124 het 45 0 36 9 GGTGT 1 0 346705 CASAVA_Build 9 97616323 1I CACTGCCAAC -/A TAGCCAGAGC 3070 hom 93 het 37 0 30 7 A 0 1 346706 CASAVA_Build 9 97619395 4I TTTTATTTTA ----/CTTT CTTTCTTTCC 3070 hom 117 het 44 0 39 5 CTTT 2 3 346707 CASAVA_Build 9 97663304 5D TTTATCAGGA TTTAT/----- TTTTTCATTT 3070 het 3070 ref 37 17 18 4 TTTAT 1 0 346708 CASAVA_Build 9 97703179 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2075 het 2075 ref 29 14 7 8 A 15 14 346709 CASAVA_Build 9 97853329 1D GGTGTTTGGA G/- GGGGACCCTT 3070 het 3070 ref 30 13 8 9 G 5 4 346710 CASAVA_Build 9 97869704 1I CTGGAGGACA -/C CCCCCAGCAC 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 C 5 6 346711 CASAVA_Build 9 97870482 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 het 1638 hom 24 4 20 0 A 6 7 346712 CASAVA_Build 9 97877569 4D CTGTTGTTTG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 40 12 12 16 TGTT 6 5 346713 CASAVA_Build 9 97886214 4D TTTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 TCTT 2 1 346714 CASAVA_Build 9 97886982 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2388 het 553 hom 11 3 6 2 A 11 10 346715 CASAVA_Build 9 97887291 1D CTTCACTGGC T/- TGCCCTCTCC 3070 het 3070 ref 47 28 14 5 T 2 1 346716 CASAVA_Build 9 97896848 1D CCTCTCATGT A/- CCCCCTGCAG 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 A 1 0 346717 CASAVA_Build 9 97907542 11D TGGTTTATAG TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 681 hom 24 5 11 9 T 25 14 346718 CASAVA_Build 9 97912735 2I7M8D AGAGCATGCA --AGGTGCTCACACACC/TGAGTTGGT-------- GTGCAAGGTG 3070 het 3070 hom 69 37 35 3 N/A 0 0 346719 CASAVA_Build 9 97940800 4I GTTAAAGGCC ----/TAGA TTCTCTAACT 3070 hom 144 het 52 0 48 4 TAGA 0 1 346720 CASAVA_Build 9 97943165 1I TAGAACTGGA -/C CCCCCTTCAT 3070 hom 74 het 31 0 22 9 C 5 6 346721 CASAVA_Build 9 97950067 1D CCATCTCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 19 11 A 12 11 346722 CASAVA_Build 9 97953802 4D CTGAGAAGAA TATT/---- TATTCCCAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 4 TATT 2 1 346723 CASAVA_Build 9 97955466 1D AACTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 2315 het 1724 hom 20 7 5 8 T 13 12 346724 CASAVA_Build 9 97967345 2D TGAGATGCTT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 AC 10 9 346725 CASAVA_Build 9 97978503 1D ATATTTTAAG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 A 8 7 346726 CASAVA_Build 9 97982338 5D AGGTGACCTG CATCT/----- CATCTCTGTC 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 CATCT 2 1 346727 CASAVA_Build 9 98004396 1I TGCTGCCAAA -/G AGAAGAGTGT 3070 het 3070 ref 46 25 13 8 G 0 1 346728 CASAVA_Build 9 98033999 1D TGTTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 G 1 0 346729 CASAVA_Build 9 98036939 1D GACAAAACTC A/- AAGTCATCTC 3070 het 3070 ref 40 20 17 5 A 3 2 346730 CASAVA_Build 9 98037732 9D CCTCAGTTCA TCTTTGTGG/--------- TCTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 25 15 13 1 TCTTTGTGG 1 0 346731 CASAVA_Build 9 98041948 1D TTTGTGTTTG T/- TTTTAAAAGC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 5 4 346732 CASAVA_Build 9 98054215 4I GTCAATTCTC ----/AACT AACTATACTA 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AACT 1 2 346733 CASAVA_Build 9 98061829 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1916 het 1916 ref 19 6 7 6 A 11 12 346734 CASAVA_Build 9 98062977 1D TGACTCCCAT C/- CCCCTCAGGT 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 C 5 4 346735 CASAVA_Build 9 98063313 19I ATGGAGCCTT -------------------/CTGCTGCCAAGGGCTAGGA CTGCTGCCAA 3070 hom 116 het 43 0 36 8 CTGCTGCCAAGGGCTAGGA 0 1 346736 CASAVA_Build 9 98079304 1I ACTCCAGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 5 A 10 11 346737 CASAVA_Build 9 98098359 3D CAAAAAGTAA AAG/--- AAGAAGAAAC 3070 hom 117 het 43 0 39 5 AAG 3 2 346738 CASAVA_Build 9 98109271 1D TGTGCTGTAC T/- TTTTTTTTTT 1766 het 1766 ref 24 14 6 4 T 15 14 346739 CASAVA_Build 9 98109888 1D TTTAAGTGAT A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 8 7 346740 CASAVA_Build 9 98114414 5D TCATACCTTC CTTCA/----- CTTATTTAAT 3070 het 3070 hom 32 15 16 3 CTTCA 1 0 346741 CASAVA_Build 9 98118595 2I CTCAAAAAAA --/AC CAAAAAAAAA 865 het 858 hom 18 4 5 9 AC 0 1 346742 CASAVA_Build 9 98118884 4D CTAGGTCCTA TTAT/---- TTAATCAACC 3070 het 3070 ref 30 18 10 3 TTAT 1 0 346743 CASAVA_Build 9 98118935 6D AGATATACTT TATATA/------ TATATAAAGT 1300 het 1300 ref 22 14 4 4 TA 6 3 346744 CASAVA_Build 9 98120226 1I GTAGACACAG -/A ATCTTGCCAT 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 A 1 2 346745 CASAVA_Build 9 98121609 1I ACCACAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2792 hom 32 7 18 7 A 9 10 346746 CASAVA_Build 9 98125126 1D CTGGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 25 10 4 11 T 17 16 346747 CASAVA_Build 9 98130353 1I CCATTCTATA -/T TTTTTTAGAT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 T 6 7 346748 CASAVA_Build 9 98139634 4D AAGTTTATTC TTAA/---- TTAATAATGT 2592 het 2592 ref 19 11 6 2 TTAA 2 1 346749 CASAVA_Build 9 98161371 4D TGTGCCACTG CACT/---- CACTCTAGCC 1580 het 505 hom 11 2 5 4 CACT 2 1 346750 CASAVA_Build 9 98180196 1D ACCTTTTATT A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 A 8 7 346751 CASAVA_Build 9 98181240 1D CTCTCTACAG A/- AAAAAAAAAA 1906 het 1906 ref 19 11 5 3 A 13 12 346752 CASAVA_Build 9 98197963 1I AAAATTTGTT -/C AATGATAATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 346753 CASAVA_Build 9 98206119 7D CAACCTGGTG AAATCTC/------- ATTTCTACCA 2102 het 2102 ref 17 10 5 4 AAATCTC 1 0 346754 CASAVA_Build 9 98213270 4I CTGGGCGACA ----/GAGT GAGACCTTGT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 GAGT 0 1 346755 CASAVA_Build 9 98222817 3D CAGAAGGTGA TTC/--- CAGGAGCAAA 3070 het 3070 ref 43 25 12 8 TTC 1 0 346756 CASAVA_Build 9 98226659 10D TATATATATG TACATATATA/---------- TATGTGTGTG 3070 het 1695 hom 24 8 15 3 TACATATATA 1 0 346757 CASAVA_Build 9 98236198 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTA 1845 het 1845 ref 20 8 8 4 T 9 10 346758 CASAVA_Build 9 98238151 5D TCTGTATGAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 AAAAT 3 2 346759 CASAVA_Build 9 98243188 1D GCCCTGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 816 hom 21 6 9 6 T 15 14 346760 CASAVA_Build 9 98264417 1D AGCCGGATGT G/- GTGGCACACG 2540 het 2261 hom 21 5 10 7 G 2 1 346761 CASAVA_Build 9 98273253 1D TAATGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1719 hom 24 5 10 9 T 12 11 346762 CASAVA_Build 9 98281462 1I TTTGAAATAG -/T TTCTCTTGAT 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 T 2 3 346763 CASAVA_Build 9 98285312 4D GTGCAGCTCT GTGG/---- TTTTGACTTG 3070 het 3070 ref 30 18 12 4 GTGG 1 0 346764 CASAVA_Build 9 98289799 1I AAATGAAAAC -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 6 7 346765 CASAVA_Build 9 98296650 1D CCTGGAAAGC T/- CTCTGCCTGG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 1 0 346766 CASAVA_Build 9 98296801 4D TGAGCACTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2011 het 2011 ref 17 7 6 4 TTTC 4 3 346767 CASAVA_Build 9 98299646 1D GTGAGCGTGA C/- CCCCTACCCA 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 C 5 4 346768 CASAVA_Build 9 98302610 1I TGACAATTCT -/A ACCAGGTAAT 3070 het 3070 hom 22 9 8 5 A 1 2 346769 CASAVA_Build 9 98303494 1I GGTCTTCTAT -/A AACAACGACT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 2 3 346770 CASAVA_Build 9 98304959 1D AAGTGGTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2430 hom 39 10 17 12 T 11 10 346771 CASAVA_Build 9 98307738 5D ATTAATTCTT AAAAG/----- AGAAAGGTTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 6 AAAAG 1 0 346772 CASAVA_Build 9 98310475 4D TGTACTAAAC TAAA/---- TGTATGACTC 3070 het 3070 hom 33 14 17 6 TAAA 1 0 346773 CASAVA_Build 9 98393856 1I CTTTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 1242 het 1242 ref 22 14 4 4 T 11 12 346774 CASAVA_Build 9 98505673 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 20 1 16 3 A 13 12 346775 CASAVA_Build 9 98507535 1D TTTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 946 het 946 ref 25 20 3 2 A 13 12 346776 CASAVA_Build 9 98537014 3I GACCTCCCAA ---/AGT AGTGGGATTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AGT 1 2 346777 CASAVA_Build 9 98541857 2D ACACAATGTG AT/-- ATATATATAT 926 het 926 ref 37 27 3 7 AT 7 6 346778 CASAVA_Build 9 98573536 1I ATGCATGATT -/A AAAAAAAAAA 791 het 791 ref 34 20 3 11 A 13 14 346779 CASAVA_Build 9 98617822 4I TCAGAGAAAT ----/AGAG AGCAGGCAAG 3070 hom 92 het 35 0 31 4 AG 1 3 346780 CASAVA_Build 9 98619191 1I TCTCTGACCC -/G GGGTTCCTAC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 3 4 346781 CASAVA_Build 9 98688312 1D TTAAGTACAG A/- AAAAAAAAAA 2589 het 2589 ref 36 18 6 12 A 16 15 346782 CASAVA_Build 9 98750725 4D GAGTGAAGTT GAAC/---- GAACATCTTT 3070 het 3070 ref 50 40 9 2 GAAC 2 1 346783 CASAVA_Build 9 98764909 1I CACTCTGTCA -/C CCAGGCTCAG 2736 het 2736 ref 28 19 6 3 C 2 3 346784 CASAVA_Build 9 98791979 1D TAAGTGTTTT A/- AAAAAAAAAC 2509 het 2509 ref 45 33 6 6 A 10 9 346785 CASAVA_Build 9 98796164 1I TCTACCAAGA -/T TTTTTTTTTA 1602 het 1602 ref 14 9 4 1 T 9 10 346786 CASAVA_Build 9 98801248 2I AGGCAATGAG --/GC GAAGGACGGA 1748 het 1748 ref 36 30 4 2 GC 0 1 346787 CASAVA_Build 9 98892835 4D TTTTATAGTT TGTG/---- TATTTTTGTT 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 TG 2 0 346788 CASAVA_Build 9 98925856 3D GCATAAATTA GAT/--- GATAAGAAAA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 GAT 2 1 346789 CASAVA_Build 9 98938314 1D CATGGGCTGC T/- GCAGAGGTCT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 1 0 346790 CASAVA_Build 9 98959534 1I GATGCCTTTG -/T TTTTTGGAGA 2436 het 2436 ref 28 17 7 4 T 5 6 346791 CASAVA_Build 9 98960517 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 17 het 22 1 18 3 A 10 9 346792 CASAVA_Build 9 98966601 1D CAACCCCACT A/- ACTGGGTATT 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 A 2 1 346793 CASAVA_Build 9 98973560 1D26M1I AGTCTATAAG AAGAAAAAAAAGTACACACAAAAAGCA-/-AGAAAAAAAAGTACACACAAAAAGCAT CAAGGACATT 2823 het 2823 ref 40 36 6 5 N/A 0 0 346794 CASAVA_Build 9 98975821 1I CAGAGATCTA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 T 6 7 346795 CASAVA_Build 9 98988901 1I GCCAGAAAAA -/G GGGGCAGACA 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 G 4 5 346796 CASAVA_Build 9 98990955 1I TCTGGTTCTT -/A ATGGTTTTGG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 1 2 346797 CASAVA_Build 9 98995871 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 999 het 551 hom 6 2 3 2 A 9 8 346798 CASAVA_Build 9 99013402 3I TAATAATAAT ---/AAA AAAATAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 12 1 A 4 7 346799 CASAVA_Build 9 99020449 3D TCTTCTACAA AAC/--- AACAACTCCT 1956 hom 21 het 8 0 8 0 AAC 3 2 346800 CASAVA_Build 9 99022652 1I AAACCTTGAT -/A TTTTCATTCG 3070 het 3070 ref 23 10 8 5 A 0 1 346801 CASAVA_Build 9 99026797 1D10M1I GGCAGGATGC AAAACAAACAT-/-AAACAAACATA ATGCAAATGA 798 het 798 ref 49 45 3 5 N/A 0 0 346802 CASAVA_Build 9 99027733 10I CTCAACAACA ----------/TCTAACATCC GAATTTCTAA 1819 het 1819 ref 22 18 4 0 TCTAACATCC 0 1 346803 CASAVA_Build 9 99031119 4D TCTTTCATTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 9 11 T 16 12 346804 CASAVA_Build 9 99036318 5D TTAAATCAGC AAAGA/----- AAAGTAACTG 2398 het 2398 ref 28 21 5 5 AAAGA 1 0 346805 CASAVA_Build 9 99036580 1I CAGTCCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 10 11 346806 CASAVA_Build 9 99041053 1I GCTGAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 18 13 T 12 13 346807 CASAVA_Build 9 99041183 1D TCAGTCTACT G/- GAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 G 2 1 346808 CASAVA_Build 9 99044000 1D AAGGGGGGGG C/- CTTAGGACAC 3070 het 1538 hom 20 5 12 3 C 2 1 346809 CASAVA_Build 9 99047363 9D GTTTAATTGC ATTTTATTA/--------- ATTTTATTAG 3070 hom 81 het 28 0 26 4 ATTTTATTA 2 1 346810 CASAVA_Build 9 99048616 5D TATAAAAAAG AGTGT/----- AGTGTGGCAT 3070 hom 36 het 13 0 12 2 AGTGT 2 1 346811 CASAVA_Build 9 99048817 1I AAAACTGAAT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 372 hom 17 1 14 2 A 0 1 346812 CASAVA_Build 9 99051010 1D AATTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 11 10 346813 CASAVA_Build 9 99052647 4D CTATGAAATT AGTG/---- AGGTTTACTG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AGTG 1 0 346814 CASAVA_Build 9 99054441 2D CCTGACCAAC AT/-- AGTGAAACCC 1292 het 1292 ref 9 4 3 2 AT 1 0 346815 CASAVA_Build 9 99055902 1I AGTGAAGTAG -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 7 8 346816 CASAVA_Build 9 99058777 1D GCATTTTGCT G/- GGGAGAATCT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 G 4 3 346817 CASAVA_Build 9 99066696 1I ATTCAGCCTT -/A AAAAAAAGTG 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 7 8 346818 CASAVA_Build 9 99071255 2I GTGTGTATAC --/AT ATATATATAT 3034 het 3034 ref 30 18 8 4 AT 6 7 346819 CASAVA_Build 9 99073148 15D AGCTGTGATA GTATGATGTTAACTG/--------------- TGGGTTTGTC 3070 het 3070 ref 31 19 13 5 GTATGATGTTAACTG 1 0 346820 CASAVA_Build 9 99075075 1I TCCCAAGTAG -/C TGGGATTACA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 C 0 1 346821 CASAVA_Build 9 99107971 1D TAAATATTTG C/- CTCTTGTGGT 3070 het 3070 ref 40 22 12 7 C 2 1 346822 CASAVA_Build 9 99112520 1D GAGAGCAGGC G/- GGGGTCAGGC 3070 het 3070 hom 29 14 13 3 G 5 4 346823 CASAVA_Build 9 99115035 15I CCTACTATGC ---------------/AGGAAGTGCTATGGA AGGAAGTGTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 AGGAAGTGCTATGGA 0 1 346824 CASAVA_Build 9 99147667 1D ATTTTCTGTC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 26 7 12 7 T 8 7 346825 CASAVA_Build 9 99153781 2I ATACATGAGC --/AA AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 A 6 8 346826 CASAVA_Build 9 99155064 4D ATATATATAT ACAC/---- ACACACATAT 1090 het 1090 ref 26 12 7 7 AC 5 3 346827 CASAVA_Build 9 99156099 2D TCTGGAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1015 het 558 hom 24 5 3 16 T 20 18 346828 CASAVA_Build 9 99173034 3I GGCCATTATT ---/GGC GGCTGTTTTA 1497 het 742 hom 11 2 5 4 GGC 1 2 346829 CASAVA_Build 9 99174845 6I CACGTGTAGT ------/TCCAGC TCCAGCTCCT 2859 het 2859 ref 30 16 9 5 TCCAGC 1 2 346830 CASAVA_Build 9 99179491 1I AATATTTTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 A 11 12 346831 CASAVA_Build 9 99180656 1I CCAGTCCACT -/A AACTCAGTTC 3070 het 3070 hom 35 18 15 2 A 2 3 346832 CASAVA_Build 9 99180939 7D CATTAAGCAG TGCCCAT/------- TGCCCATTGC 3070 het 2939 hom 31 9 10 12 TGCCCAT 4 3 346833 CASAVA_Build 9 99194946 1D CTGCAGGCAG A/- AAAGTACCTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 5 A 4 3 346834 CASAVA_Build 9 99205262 2D TTTAATTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2174 hom 26 11 9 6 T 16 14 346835 CASAVA_Build 9 99224829 1I ATTCTGAGAG -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 6 7 346836 CASAVA_Build 9 99237339 1D CTATGCAAGA T/- TTTACTATTA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 T 4 3 346837 CASAVA_Build 9 99237732 4I GGGTAAGACC ----/CTGT CTCTTAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 CTGT 0 1 346838 CASAVA_Build 9 99247389 5D ACTGTTGTAT TTGAC/----- TTGACTGGTA 3070 hom 108 het 39 0 34 5 TTGAC 2 1 346839 CASAVA_Build 9 99263583 24D ACCTTGGACC CAAAGGTGCTCTATTTATTTGAGT/------------------------ CTTTCAGTAT 3070 hom 96 het 31 0 32 3 CAAAGGTGCTCTATTTATTTGAGT 1 0 346840 CASAVA_Build 9 99268555 1D ACGAACACTT A/- ACCATATGAC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 2 1 346841 CASAVA_Build 9 99279099 1I GACCAAGGGG -/T TATGTGCCTA 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 T 1 2 346842 CASAVA_Build 9 99290664 1D GATTTAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 123 het 50 0 41 13 T 19 18 346843 CASAVA_Build 9 99292653 1D ATATTTTGGT G/- GGGGGGGGGG 1338 het 1338 ref 30 16 3 12 G 11 10 346844 CASAVA_Build 9 99301469 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1766 het 1622 hom 13 6 5 2 A 12 13 346845 CASAVA_Build 9 99308192 1D GCTGTGCCTT C/- ATGCCTCCCT 3070 hom 111 het 42 0 38 6 C 1 0 346846 CASAVA_Build 9 99313956 1I CCAAAGTGCT -/G GGGATTACCG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 G 3 4 346847 CASAVA_Build 9 99326976 1D CCGCCATATC A/- GGGGGAATAA 2803 het 2803 ref 30 14 10 9 A 1 0 346848 CASAVA_Build 9 99331638 1D TGTGCACGTT A/- AAAAAAAAAA 1632 het 1632 ref 32 15 5 12 A 15 14 346849 CASAVA_Build 9 99354435 5D CGTCCTCTGA CTAGC/----- CTTCCCAAAA 2870 het 2870 ref 31 21 8 2 CTAGC 1 0 346850 CASAVA_Build 9 99362246 1D GATATTTTTT A/- AAAAATCACC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 6 5 346851 CASAVA_Build 9 99372627 1D GCATCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1024 het 1024 ref 30 21 3 6 T 11 10 346852 CASAVA_Build 9 99607630 17D GTAACCAATT TAGGCATCCCTCTCTTG/----------------- TAGGCATCCC 3070 het 3070 hom 29 10 11 15 TAGGCATCCCTCTCTTG 2 1 346853 CASAVA_Build 9 99622212 4I TTATTCCCTT ----/AGAC AGCAGTTCTG 3070 het 3070 ref 50 30 16 4 AGAC 0 1 346854 CASAVA_Build 9 99636511 1D TTCATCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 A 11 10 346855 CASAVA_Build 9 99638664 1D TTCTCCCCAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 T 9 8 346856 CASAVA_Build 9 99653625 1I TAATCCAGTT -/A AAAAATTTTA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 A 5 6 346857 CASAVA_Build 9 99684667 1D TTCACTTTTT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3055 hom 16 8 8 0 A 9 8 346858 CASAVA_Build 9 99731722 1I TTACAGCTTT -/G TATCTCCCTC 3070 het 3070 hom 42 14 26 2 G 0 1 346859 CASAVA_Build 9 99732059 1I AACAGGGAAT -/A ACCCAGGATT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 1 2 346860 CASAVA_Build 9 99757626 1D GTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 14 15 6 T 10 9 346861 CASAVA_Build 9 99761930 1I AGTTTTACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 T 9 10 346862 CASAVA_Build 9 99775767 16D GGTGTATGTA TGTGTGTGTGTGTGTG/---------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 30 10 16 9 TG 16 8 346863 CASAVA_Build 9 99808568 2I CACAAGCTAA --/CT CTATCCAACA 3070 het 3070 hom 36 13 21 2 CT 1 2 346864 CASAVA_Build 9 99816511 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 21 14 3 4 A 11 10 346865 CASAVA_Build 9 99888920 1I GGCGCTTGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 13 18 9 T 9 10 346866 CASAVA_Build 9 99908922 1I TTTTCTTTTC -/T TTTCTTCTTT 2850 het 795 hom 20 6 12 2 T 3 4 346867 CASAVA_Build 9 99909941 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2117 hom 24 7 14 3 T 10 9 346868 CASAVA_Build 9 99920362 1D CAGAGCCCCT G/- GGGCACTGTT 3070 het 3070 ref 43 24 11 8 G 4 3 346869 CASAVA_Build 9 99923525 1D AAAAATGTAA T/- TTAAAAAACA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 3 2 346870 CASAVA_Build 9 99933434 1I AACAAATCAC -/T TTTTTTTTTT 2073 het 2073 ref 29 14 6 9 T 15 16 346871 CASAVA_Build 9 99950913 1D CACAAAACAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 A 9 8 346872 CASAVA_Build 9 99958153 1D TTTGTTTGAA T/- TTTTTTTTTT 2228 het 111 hom 21 3 8 10 T 19 18 346873 CASAVA_Build 9 99969048 1I TGCTAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2869 hom 28 10 14 4 A 10 11 346874 CASAVA_Build 9 99975651 1I TTCTTAAGTC -/T TCTTCTCAAC 2557 het 2557 ref 20 9 8 3 T 1 2 346875 CASAVA_Build 9 99976243 2D AACAAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2007 hom 26 9 11 6 A 12 10 346876 CASAVA_Build 9 99985277 1D AAAGCGGCCC A/- AACTTCAGCA 3070 het 3070 ref 40 18 18 5 A 3 2 346877 CASAVA_Build 9 99991809 1I TTCAATCTGG -/A AATCTATGTC 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 2 3 346878 CASAVA_Build 9 99991993 2I CTCCTTTATT --/TA TTTTTTTTTT 3070 het 1368 hom 24 9 14 1 TA 0 1 346879 CASAVA_Build 9 99993352 10D3M1D CCGGACCTCT CAGACGGTCCCCAG/----------CCA- GAGGGGCAGG 3070 het 1809 hom 23 9 10 10 N/A 0 0 346880 CASAVA_Build 9 100010672 1I GTGCGGCCCC -/G TTAACAGGCC 3070 hom 62 het 22 0 21 1 G 0 1 346881 CASAVA_Build 9 100014610 1D CAAGTGCATC T/- TTTTTTTTTT 2498 hom 15 het 13 0 8 5 T 13 12 346882 CASAVA_Build 9 100020514 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 7 8 346883 CASAVA_Build 9 100032351 1D TTCTTATAAG A/- AAATATGTTT 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 A 4 3 346884 CASAVA_Build 9 100032844 1I GAGACCACCC -/T GGCCAACATG 3070 het 2815 hom 22 8 12 2 T 0 1 346885 CASAVA_Build 9 100049466 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 1311 het 1311 ref 26 13 4 9 A 11 12 346886 CASAVA_Build 9 100052123 3D GACGGGGGTA ATT/--- ATTAATAGAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 ATT 2 1 346887 CASAVA_Build 9 100052430 1D ATGGCAGTGA C/- CGGGTTCAGG 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 C 2 1 346888 CASAVA_Build 9 100054137 1I CTTTCCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 28 13 6 A 10 11 346889 CASAVA_Build 9 100062699 6D GAGCCAAGTA CAAAGT/------ TCTGAAAAAC 3070 het 3070 ref 48 28 15 8 CAAAGT 1 0 346890 CASAVA_Build 9 100073202 4I CCGAAAAGAG ----/AGTC AGCCAGCGAA 2631 het 1888 hom 19 6 10 4 AGTC 0 1 346891 CASAVA_Build 9 100074010 1D AGTGTAAGGG A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 A 8 7 346892 CASAVA_Build 9 100097639 1I ATGAGATGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 9 10 346893 CASAVA_Build 9 100151224 1D ATTTGTTGAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 83 het 31 0 29 2 T 9 8 346894 CASAVA_Build 9 100152281 1D TTATCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 37 1 31 6 A 11 10 346895 CASAVA_Build 9 100152725 1D ATTTCGATGT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 8 7 346896 CASAVA_Build 9 100153277 1I TTGGCTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 381 hom 40 2 32 6 A 8 9 346897 CASAVA_Build 9 100153522 2I TACCAGTGAG --/TT TTATACTTTT 3070 hom 135 het 54 0 46 8 T 2 4 346898 CASAVA_Build 9 100155910 2D GGATCATGGT GG/-- GGGGGGGTGG 3070 hom 63 het 26 0 21 5 G 9 7 346899 CASAVA_Build 9 100159785 2D AAACAACAAC AA/-- AAAAAAAAAC 772 het 246 hom 30 2 4 26 A 11 9 346900 CASAVA_Build 9 100205493 2D ACACAAATGC AG/-- AGAGGGTGAG 3070 het 3070 hom 34 14 17 4 AG 3 2 346901 CASAVA_Build 9 100213663 1I TAAAATCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 10 11 346902 CASAVA_Build 9 100222587 1D GAATTTACAC T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 6 346903 CASAVA_Build 9 100239741 4I TGCCATCTTC ----/CCAT CTGTTAATCC 3070 het 3070 hom 64 32 26 6 CCAT 0 1 346904 CASAVA_Build 9 100240189 4D CCACACATCT ATCC/---- ATCCATCCAT 3070 hom 155 het 68 0 43 25 ATCC 6 5 346905 CASAVA_Build 9 100242016 1D GGTAGGCCCC G/- TTGTTATCTA 3070 het 3070 ref 47 28 12 8 G 1 0 346906 CASAVA_Build 9 100242316 4I TTCTTGCTCT ----/GCCC TGTTCTGTCC 3070 hom 105 het 41 0 35 6 GCCC 0 1 346907 CASAVA_Build 9 100243398 5D AATAATAGCT AAATA/----- AAATAAGCTC 3070 het 2055 hom 20 5 12 3 AAATA 2 1 346908 CASAVA_Build 9 100253637 1I CTCCCCACTG -/C CCCCCCAGCA 3070 het 2720 hom 29 9 15 5 C 6 7 346909 CASAVA_Build 9 100262915 17D TATGAACTCC AGGCAAGATGAACACAA/----------------- AGGAAAGTTC 3070 het 3070 ref 49 32 18 2 AGGCAAGATGAACACAA 1 0 346910 CASAVA_Build 9 100287610 2D CACACGCAGG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 CA 7 6 346911 CASAVA_Build 9 100289717 2I GTCTCTACAA --/AT ATATATATAT 3070 het 2771 hom 37 11 14 12 AT 8 9 346912 CASAVA_Build 9 100290737 1I TCCCTAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 14 13 T 10 11 346913 CASAVA_Build 9 100290878 14I TGAGAGGCTA --------------/TGCAGGAATCTTTC TGCTGACTGA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 TGCAGGAATCTTTC 0 1 346914 CASAVA_Build 9 100299531 1I ATTTTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 10 11 346915 CASAVA_Build 9 100320459 1D CAAAGTATAA T/- TTTTTATATC 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 T 6 5 346916 CASAVA_Build 9 100324256 1D TAAAAAAAAA C/- TGATGAATAT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 C 1 0 346917 CASAVA_Build 9 100326107 1I GGCCTATAAC -/A AAAAAAACAG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 7 8 346918 CASAVA_Build 9 100329844 1I AGACATGGTA -/T TATAAAGATG 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 1 2 346919 CASAVA_Build 9 100336406 1D AGATCACTGA G/- GACCAGTGAC 3070 het 3070 hom 36 10 13 13 G 2 1 346920 CASAVA_Build 9 100336429 7D GGTGGGGAGT CTTGGAG/------- CTTGGAGCTT 3070 het 720 hom 32 2 18 12 CTTGGAG 3 2 346921 CASAVA_Build 9 100343463 1I ATATTTTGGC -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 346922 CASAVA_Build 9 100353052 1I ACACTCACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 10 11 346923 CASAVA_Build 9 100363398 1D CATTCCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 11 10 346924 CASAVA_Build 9 100367365 1I CAAGGCTGCT -/C CCTCTACTCT 3070 hom 138 het 49 0 45 4 C 2 3 346925 CASAVA_Build 9 100377191 1D AACACCACCA C/- CCCCCCCCAA 3070 het 2507 hom 32 12 14 6 C 9 8 346926 CASAVA_Build 9 100393952 1D CACTCTGTGA C/- CCCCACCTCA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 C 5 4 346927 CASAVA_Build 9 100400687 1I AAAGAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 1132 het 1132 ref 16 9 3 4 A 10 11 346928 CASAVA_Build 9 100401012 4D TGGTTTTCAC TCTG/---- TCTTTTATTA 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 TCTG 1 0 346929 CASAVA_Build 9 100405154 1D GACTTGGCCA C/- CCCCAAGGGA 3070 het 3070 hom 46 13 26 7 C 5 4 346930 CASAVA_Build 9 100413440 1I TCTCCTTCAG -/C CATGGAGCCA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 C 1 2 346931 CASAVA_Build 9 100415551 1I TCAGGGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 556 hom 28 2 16 10 A 13 14 346932 CASAVA_Build 9 100418855 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 33 0 28 5 A 13 14 346933 CASAVA_Build 9 100420902 13D ACAGAAAGAC TCCAGAAGAGACA/------------- GGCCCAGAGG 3070 hom 98 het 36 0 30 9 TCCAGAAGAGACA 1 0 346934 CASAVA_Build 9 100424627 1D TAGCTATGTA C/- TGCAGTCTAG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 1 0 346935 CASAVA_Build 9 100435730 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1590 het 180 hom 26 3 6 17 A 19 18 346936 CASAVA_Build 9 100458541 1D TATAAAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 45 0 36 9 A 10 9 346937 CASAVA_Build 9 100461589 1D21M4D ATTTCTTCTT CTTTTTTTTTTAAACAACCTTTTTTC/-TTTTTTTTTAAAACAACCTTT---- TTTTCTTTTC 3070 het 91 hom 24 1 16 7 N/A 0 0 346938 CASAVA_Build 9 100470697 3D TTGTTGTACA ACC/--- ACCACCACCA 3070 hom 117 het 46 0 38 9 ACC 5 4 346939 CASAVA_Build 9 100475700 1D AAAAAAAAAA C/- AGGGAATAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 C 1 0 346940 CASAVA_Build 9 100476561 1I CTGGGTGCCT -/G GGTGGGCAGT 3070 hom 75 het 31 0 24 7 G 2 3 346941 CASAVA_Build 9 100483868 1I AGAAAACAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 9 346942 CASAVA_Build 9 100484991 4D TTGATTTTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 37 0 30 9 TTTG 4 3 346943 CASAVA_Build 9 100488494 1D ATAAAATCTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 T 8 7 346944 CASAVA_Build 9 100490498 2I ATGTGGTTTC --/AT ATATATATAT 3070 het 21 hom 23 1 17 5 AT 8 9 346945 CASAVA_Build 9 100500609 1I CACAATTCTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 C 0 1 346946 CASAVA_Build 9 100505912 5I TTTTATTTTT -----/AAATA AAATAAAAAT 2127 hom 12 het 5 0 5 0 AAATA 1 2 346947 CASAVA_Build 9 100506863 1I AATCAAATTG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 A 8 9 346948 CASAVA_Build 9 100508213 5D CAAAAAAAAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 131 hom 19 3 12 4 A 17 12 346949 CASAVA_Build 9 100516682 4I TCTCCCTTAT ----/TAAG TAAGATAATG 3070 het 3070 ref 61 40 12 9 TAAG 1 2 346950 CASAVA_Build 9 100521552 1I TTGCAATGTG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 7 8 346951 CASAVA_Build 9 100521895 1D TTTACTATTG T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 7 6 346952 CASAVA_Build 9 100532002 1I ATCAACTTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 31 0 20 11 T 13 14 346953 CASAVA_Build 9 100552380 1D AAGCACACCC T/- ACGTGCCTTT 3070 hom 122 het 46 0 41 5 T 1 0 346954 CASAVA_Build 9 100555724 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 35 1 28 6 A 13 14 346955 CASAVA_Build 9 100562503 13D TCTAATCCTA CCCTCTAATCCTG/------------- CCCTCTAATC 3070 hom 95 het 42 0 29 17 CCCTCTAATCCTG 2 1 346956 CASAVA_Build 9 100562903 1D CTATTCACCT G/- TTGAAGAACA 3070 hom 87 het 37 0 29 9 G 1 0 346957 CASAVA_Build 9 100565331 2D GAAATTCACC AA/-- AAGAGATCAC 3070 hom 102 het 39 0 34 5 A 4 2 346958 CASAVA_Build 9 100571165 1D AGAAGGGGGA G/- GCTGCAGTGA 3070 hom 33 het 13 0 11 4 G 2 1 346959 CASAVA_Build 9 100577739 3D ATTATTATAT ACA/--- ACATCATATC 3070 hom 138 het 51 0 47 5 ACA 2 1 346960 CASAVA_Build 9 100578504 1D CCAAAAACCC T/- TTTTTTTTTT 2668 het 537 hom 30 2 13 15 T 17 16 346961 CASAVA_Build 9 100585907 1D CCTGTGCCGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 33 1 17 15 T 15 14 346962 CASAVA_Build 9 100586542 3D AGAAGAAGAC AGA/--- AGGAGAGTTC 3070 hom 81 het 33 0 26 9 AGA 1 0 346963 CASAVA_Build 9 100590532 3I TGTGCTGGGC ---/ACG ACGGCAGGGC 2521 het 2521 ref 41 14 12 15 ACG 1 2 346964 CASAVA_Build 9 100600823 22I CAGGCAAAAG ----------------------/CTGGAACCATTCCCCTTGAGAA CTGGAAGAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 CTGGAACCATTCCCCTTGAGAA 0 1 346965 CASAVA_Build 9 100606551 2I GTGGATGAGA --/GT GTGTTTTTTC 3070 hom 102 het 41 0 35 6 GT 2 3 346966 CASAVA_Build 9 100615912 1D CAAGAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 12 11 346967 CASAVA_Build 9 100639033 1D CCGCAGCTCA T/- CCCCTGCTCA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 T 1 0 346968 CASAVA_Build 9 100648802 1I ATCTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 2731 het 68 hom 17 1 11 5 A 11 12 346969 CASAVA_Build 9 100658368 1I CCACATGACA -/G TTTGCTCATT 3070 het 3070 ref 63 27 26 10 G 0 1 346970 CASAVA_Build 9 100658536 1I CTGGAGTACT -/A ATACCATCAT 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 A 1 2 346971 CASAVA_Build 9 100666094 1D GAGAGGTGGG A/- ATGGGAGACT 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 2 1 346972 CASAVA_Build 9 100668620 1I CAAAGCAAAC -/T TTTTACATTT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 T 4 5 346973 CASAVA_Build 9 100678968 3I AATTTTTGTA ---/TTT TTTTTTTTTT 1846 het 1846 ref 15 7 7 1 T 11 14 346974 CASAVA_Build 9 100682184 1D TCATTCCCAT G/- GGCTCCTGCC 2250 het 2250 ref 33 15 9 11 G 3 2 346975 CASAVA_Build 9 100685012 1D ATGGGTAATG T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 8 7 346976 CASAVA_Build 9 100688567 1D TTGTAGTCAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 A 10 9 346977 CASAVA_Build 9 100692594 3D ATCACCATCA AGC/--- CAGACAGTGT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 AGC 1 0 346978 CASAVA_Build 9 100698473 1D GTAGAGCTGC T/- TTTTTCAACA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 6 5 346979 CASAVA_Build 9 100702211 1I AATTTTCTTA -/T TTTTTTTTTT 2725 het 2725 ref 32 16 8 8 T 10 11 346980 CASAVA_Build 9 100710680 1I CGCCAGGGAG -/A AAAAAAATGA 1613 het 1613 ref 21 15 5 1 A 7 8 346981 CASAVA_Build 9 100711528 2D CCTGAATGGA TT/-- CCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 33 17 12 7 T 2 0 346982 CASAVA_Build 9 100712481 1D ACAGGCCAAA G/- GAAGGGACAT 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 G 2 1 346983 CASAVA_Build 9 100727372 1D AGAGTGCTGA G/- AACAGAGGCT 3070 het 3070 hom 39 14 19 6 G 1 0 346984 CASAVA_Build 9 100734240 1D TCTCAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 A 12 11 346985 CASAVA_Build 9 100737870 3I GTTGATCTCT ---/GCA GCAGCAATGG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 GCA 2 3 346986 CASAVA_Build 9 100738668 1I CAACTTCAAG -/T TTAGTGGCCT 3070 het 3070 ref 60 33 20 7 T 2 3 346987 CASAVA_Build 9 100747632 7D CTAGTCGGCC CAAAGGA/------- AACGGGATTG 3070 het 3070 hom 38 18 20 5 CAAAGGA 1 0 346988 CASAVA_Build 9 100756317 1D AAGAGATTCA T/- TTTTTTCAAT 3070 het 3070 hom 41 15 23 4 T 7 6 346989 CASAVA_Build 9 100762288 1I AGGTAGGGTG -/A ATTGCTTGAG 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 A 1 2 346990 CASAVA_Build 9 100765382 1I GCCTGCAAGT -/C CCCCCCAAAC 3070 het 3070 ref 52 20 21 11 C 6 7 346991 CASAVA_Build 9 100782264 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2334 hom 34 10 14 10 A 13 12 346992 CASAVA_Build 9 100790079 1D AAACTCAACG T/- TGTCAGGTGG 3070 hom 146 het 56 0 45 11 T 2 1 346993 CASAVA_Build 9 100808727 3D TCTCCTTCTC CTT/--- CTTCTTCCTC 3070 het 3070 hom 51 21 27 4 CTT 3 2 346994 CASAVA_Build 9 100817134 1I AGTATGTAGC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 51 23 21 7 T 8 9 346995 CASAVA_Build 9 100822414 1D ACCAGGACCA G/- GGAATGTCAT 3070 het 3070 hom 48 20 23 6 G 3 2 346996 CASAVA_Build 9 100823459 1I ACTTCAGATG -/C GAGCAGGGCT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 C 0 1 346997 CASAVA_Build 9 100897924 1I TCTAAATACC -/A AAATACGCTC 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 3 4 346998 CASAVA_Build 9 100899535 1D TCCCAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 A 12 11 346999 CASAVA_Build 9 100910381 1I TGCAGAAAAT -/A GGGGCAATAC 3070 het 3070 ref 49 22 19 8 A 0 1 347000 CASAVA_Build 9 100915027 2D CACCTCATAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 46 17 19 12 TC 8 7 347001 CASAVA_Build 9 100918279 1D CTTTATTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 10 A 15 14 347002 CASAVA_Build 9 100921124 1D CAGGAATCTC A/- ATCCTAATTA 3070 het 3070 ref 45 20 16 9 A 2 1 347003 CASAVA_Build 9 100941302 1D TTTCCTATTT A/- AAAAAAAAAA 1572 het 1572 ref 28 16 5 7 A 15 14 347004 CASAVA_Build 9 100949973 5D TTAAGGAAAA CTTTT/----- CTTTAAGAAT 3070 het 3070 hom 24 8 15 2 CTTTT 1 0 347005 CASAVA_Build 9 100950557 3I CAATATTGGT ---/GAA GAAGCAGAGC 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 GAA 1 2 347006 CASAVA_Build 9 100953512 1I TTTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 698 hom 29 8 14 7 G 0 1 347007 CASAVA_Build 9 100956627 1I CTGGAGGCTC -/G GGATGAATAG 3070 het 3070 hom 49 20 20 9 G 2 3 347008 CASAVA_Build 9 100961523 2I TAAACAGGGA --/CT CTCTCTGTCA 2337 het 2337 ref 29 14 7 8 CT 3 4 347009 CASAVA_Build 9 100972673 4I TCTTACTGTG ----/TAGA TAGATGGGGA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 TAGA 1 2 347010 CASAVA_Build 9 100972934 1I GAGGAGGGGG -/A CTCCCTCTCA 2750 het 1602 hom 22 7 11 4 A 0 1 347011 CASAVA_Build 9 101036315 4D TGCAGATCTT TGAC/---- TGACCTACTA 3070 het 3070 hom 41 19 20 4 TGAC 2 1 347012 CASAVA_Build 9 101049768 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAGTT 2241 het 1396 hom 9 3 5 1 A 8 7 347013 CASAVA_Build 9 101072744 2I ACTGACAGAC --/AT GTGCACAAAT 3070 hom 156 het 57 0 52 5 AT 0 1 347014 CASAVA_Build 9 101081251 1I AATAAAAAAA -/C ATGAAATAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 0 1 347015 CASAVA_Build 9 101085344 1I85M1D GCTATACCAT -TGGTTCTGATGCCTTTTAAAAATAGAAATTTTAATAAGCGTTCTAATGTTATCTAAAGTCTTGGTCCTTAAAAGTTGGGCTTTTTA/CTGGTTCTGATGCCTTTTAAAAATAGAAATTTTAATAACCGTTCTAATGTTATCTAAAGTCTTGGTCCTTACAAGTTGGGCTTTTT- AAAAAAAACT 3070 het 216 hom 13 2 12 19 N/A 0 0 347016 CASAVA_Build 9 101099254 1I TTTGTAGATG -/A AAAAACCAAG 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 5 6 347017 CASAVA_Build 9 101110364 2D CCAACTTCTA AT/-- ACCTGACTCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AT 1 0 347018 CASAVA_Build 9 101116221 8I CTCTCTCTTT --------/CTTCCTCC CTTCCTCCCT 2050 het 2050 ref 16 7 5 4 CTTCCTCC 1 2 347019 CASAVA_Build 9 101122158 1I TATTTTTCCT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 7 8 347020 CASAVA_Build 9 101131871 1I ATATTATTTT -/G TTTGTATTAT 3070 het 3070 ref 29 18 7 4 G 0 1 347021 CASAVA_Build 9 101132831 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTA 2917 het 2509 hom 15 6 8 1 T 10 9 347022 CASAVA_Build 9 101141549 1D CTGGAGCCGT G/- GTGATGCCTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 G 2 1 347023 CASAVA_Build 9 101142096 4D TTTGTTGTTG TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 37 9 17 12 TTGT 6 5 347024 CASAVA_Build 9 101143358 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2761 het 2502 hom 15 6 9 0 A 10 11 347025 CASAVA_Build 9 101150927 17I TCCCATCCAT -----------------/GCTGTCCCATAGCAATG GCATGATGAA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 GCTGTCCCATAGCAATG 0 1 347026 CASAVA_Build 9 101156407 1I55M1D TTCCAGGGAA -TTCTGGGCACTGAGCAAGCACTTCTGTCAAGAGACCTACTGTGTCTCTTTGGCAAT/TTTCTGGGCGCTGAGCAAGCACTTCTGTCAAGAGACCTACTGTGTCTCTTTGGCAA- TTTTTTTGTG 3070 hom 157 het 34 0 53 3 N/A 0 0 347027 CASAVA_Build 9 101157336 2I TGGAAAACAG --/TT TGGTAGTTTC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 1 3 347028 CASAVA_Build 9 101172863 1I ACTTCCCAGC -/T TCCAGAACCA 3070 hom 120 het 43 0 39 4 T 1 2 347029 CASAVA_Build 9 101187719 5D GTCAATTCAG TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 hom 114 het 49 0 39 13 TTTCT 4 3 347030 CASAVA_Build 9 101193006 4D AAACAAAAAT AAAC/---- AAACAAAAAC 3070 het 3070 ref 45 26 14 7 AAAC 2 1 347031 CASAVA_Build 9 101200402 5D CCATTGGTTT CCTTG/----- CCTTGCCTTG 2065 hom 35 het 41 0 11 32 CCTTG 3 2 347032 CASAVA_Build 9 101201349 2I CATCGGACTC --/AG GGGGATGTTG 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 AG 0 1 347033 CASAVA_Build 9 101241337 1I TTGTTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 30 1 23 6 A 10 11 347034 CASAVA_Build 9 101250646 1I AGTTCCTGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 9 10 347035 CASAVA_Build 9 101251522 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 5 6 347036 CASAVA_Build 9 101254780 1I TCTCTACAGA -/T TTTTTTTTTT 2245 het 2245 ref 24 11 6 7 T 11 12 347037 CASAVA_Build 9 101257673 1I GTCTTTGTTC -/T TTGTGATTCC 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 2 3 347038 CASAVA_Build 9 101268403 1D ATTTACAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 11 10 347039 CASAVA_Build 9 101279178 1I GGCATTTCTC -/A AAAAAAAAAA 836 het 836 ref 28 20 3 5 A 13 14 347040 CASAVA_Build 9 101300738 1D GAAAAAAAAA G/- TAGACTAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 G 1 0 347041 CASAVA_Build 9 101313418 1D AACCATTGAT A/- AAAAAAAAAG 1064 het 1064 ref 48 36 3 9 A 10 9 347042 CASAVA_Build 9 101349691 1D CTTTAGGATT G/- TTTTTTTTCC 2904 het 2904 ref 31 16 7 8 G 1 0 347043 CASAVA_Build 9 101387268 1I CAATTATGTT -/A AAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 A 5 6 347044 CASAVA_Build 9 101395373 1D GATCAATGGT A/- AAAAAAAAAA 1815 het 1815 ref 41 25 5 11 A 15 14 347045 CASAVA_Build 9 101401800 1I ATAATATACC -/A AGGCATTGTG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 1 2 347046 CASAVA_Build 9 101443489 1D AATAGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 87 hom 25 2 14 9 T 15 14 347047 CASAVA_Build 9 101453704 1D AGGCAAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 A 12 11 347048 CASAVA_Build 9 101592621 1D ACTTATAAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 10 9 347049 CASAVA_Build 9 101599846 3D CTTATAGATT TGA/--- TGGAGTGAAA 3070 het 3070 hom 53 20 28 5 TGA 1 0 347050 CASAVA_Build 9 101600267 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2335 het 2335 ref 18 7 7 4 A 10 11 347051 CASAVA_Build 9 101603429 1D10M5I AGGACACAGT AAAAGCCTGAC-----/-AATGGGTTACACCCA TCTCTCATCC 3070 het 3070 ref 35 17 15 4 N/A 0 0 347052 CASAVA_Build 9 101620377 2D GTTAATAAAA TT/-- TTTTAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 14 16 2 T 6 4 347053 CASAVA_Build 9 101629041 1I AAAACCGCCG -/T TTTTTTACCA 3070 het 3070 hom 32 16 13 3 T 6 7 347054 CASAVA_Build 9 101645785 1D ACAAAAAAAA T/- TTTTTTTTGA 2628 het 2628 ref 20 10 8 3 T 9 8 347055 CASAVA_Build 9 101662318 1I GTTGTAAACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 T 11 12 347056 CASAVA_Build 9 101667078 3I AGCAAGCAAA ---/TCT TCTTTTTAAA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TCT 1 2 347057 CASAVA_Build 9 101682537 1D CACTTTTGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1261 hom 29 6 16 7 T 10 9 347058 CASAVA_Build 9 101685488 1I GCTATTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 27 1 19 7 T 10 11 347059 CASAVA_Build 9 101686526 1D CCTGGATAGA G/- ATGCATATTT 3070 het 3070 hom 41 18 21 2 G 1 0 347060 CASAVA_Build 9 101689443 2D TGACTTTAAC AG/-- AATTTTAAGT 3070 het 3070 hom 26 8 14 6 AG 1 0 347061 CASAVA_Build 9 101689686 1D GATTAAAAAT A/- AAGTGAATGT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 3 2 347062 CASAVA_Build 9 101690976 2D CATGCACACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 32 12 12 9 CA 9 8 347063 CASAVA_Build 9 101691534 1D GTCACAGGGG A/- CATCCATGTC 3070 het 3070 hom 50 21 22 8 A 1 0 347064 CASAVA_Build 9 101730490 1I AACACTATCA -/T TGACAAACGT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 1 2 347065 CASAVA_Build 9 101733597 1D CATTTTGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2563 hom 25 8 9 8 T 13 12 347066 CASAVA_Build 9 101734500 1D ATCTCTCTAT A/- GCTGTATTTA 3070 het 3070 hom 57 24 30 4 A 1 0 347067 CASAVA_Build 9 101740970 1D CTATCGGCCT G/- AGATTTTTCT 2892 het 2892 ref 25 14 7 4 G 1 0 347068 CASAVA_Build 9 101746162 3D TATAGTCTTC TAA/--- TAATTTATTT 3070 het 3070 hom 25 9 16 2 TAA 2 1 347069 CASAVA_Build 9 101766175 3D CTTAAACTTT ACA/--- ACTACTATCA 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 ACA 1 0 347070 CASAVA_Build 9 101769568 1I ATAATTAAGA -/C CCCCCCCCTT 2465 het 2465 ref 30 12 10 8 C 8 9 347071 CASAVA_Build 9 101773952 1D AGTGAGACTC T/- TGTCTGTATG 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 T 2 1 347072 CASAVA_Build 9 101783191 3I ATAACTCTAA ---/CTT CTTCATTTAA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 CTT 1 2 347073 CASAVA_Build 9 101796529 4D ACTGCATGTT CTCA/---- CTCACAGGTG 3070 hom 72 het 27 0 25 3 CTCA 2 1 347074 CASAVA_Build 9 101798637 1I ACCATTATTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 459 hom 20 1 15 4 T 8 9 347075 CASAVA_Build 9 101798993 48D TATTCCATCG TGTATGTGTATATATATACATATATATATATATGTATATATATACACA/------------------------------------------------ TACATATACA 2097 hom 12 het 4 0 5 3 TGTATGTGTATATATATACATATATATATATATGTATATATATACACA 1 0 347076 CASAVA_Build 9 101799097 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 1512 hom 18 5 12 1 TA 8 9 347077 CASAVA_Build 9 101799512 4I TTAGCATTTT ----/TTTC TTTAACAAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TTTC 0 1 347078 CASAVA_Build 9 101802539 1D ATCCTGTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 37 4 13 21 A 19 18 347079 CASAVA_Build 9 101804236 1I TTATTCACAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 405 hom 37 1 32 4 A 11 12 347080 CASAVA_Build 9 101833294 1D CAAGTACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 11 10 347081 CASAVA_Build 9 101843407 1D TTTTTGCCAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 219 hom 27 1 21 6 A 10 9 347082 CASAVA_Build 9 101850127 3I TGCAAACCAA ---/CAC CACAATGAGA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CAC 1 2 347083 CASAVA_Build 9 101852142 1D CTAAGTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1166 hom 37 4 23 11 A 13 12 347084 CASAVA_Build 9 101852417 2D TTTGTGTAAC AT/-- ATGTCAATTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AT 2 1 347085 CASAVA_Build 9 101871440 3D GAAAAAAGAA AAG/--- AAGCATTTAT 3070 hom 45 het 16 0 16 1 AAG 2 1 347086 CASAVA_Build 9 101890149 4I CTCCTGTAAC ----/AGAG AGAGAATCAA 3070 hom 81 het 29 0 28 2 AG 2 4 347087 CASAVA_Build 9 101896910 1I TACAAAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 A 8 9 347088 CASAVA_Build 9 101904235 1I TCTCCCTCTG -/T TGCCCAGGCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 1 2 347089 CASAVA_Build 9 101915365 3D AGGGCTTCTG TTA/--- TTATATGTGT 3070 hom 123 het 50 0 42 11 TTA 2 1 347090 CASAVA_Build 9 101934881 1D ATGCCTGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 28 0 22 6 T 12 11 347091 CASAVA_Build 9 101948190 1I CAAGGGAGGT -/C CCCCCCGATC 2733 het 782 hom 13 4 6 3 C 6 7 347092 CASAVA_Build 9 101949060 1D CTTCATCAAC T/- TATGGTACTG 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 T 2 1 347093 CASAVA_Build 9 101955367 1D AAGCAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 438 hom 36 1 24 12 A 13 12 347094 CASAVA_Build 9 101959047 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AC 6 7 347095 CASAVA_Build 9 102024923 1D CTGGGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1977 het 1977 ref 30 12 8 10 T 17 16 347096 CASAVA_Build 9 102105033 1I TTTTAACCGC -/T CCCCCCCCCA 3070 het 2044 hom 31 10 17 4 T 0 1 347097 CASAVA_Build 9 102110329 5D TAGCAATGTT AATAA/----- AAGAAACCTC 3070 het 3070 hom 33 13 15 8 AATAA 1 0 347098 CASAVA_Build 9 102113335 1D CCTCATCTAG A/- AAAAAAAAAA 1431 het 1431 ref 35 22 4 10 A 13 12 347099 CASAVA_Build 9 102139995 2D TAAGCAGTTA TC/-- TGTCTCTTCC 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 TC 1 0 347100 CASAVA_Build 9 102140955 1I AGATTACGCC -/A TTGCACTCCA 1172 het 1172 ref 13 7 4 2 A 0 1 347101 CASAVA_Build 9 102143077 1I CTCAATTTGG -/T TTTTTTTTTT 937 het 937 ref 43 27 4 12 T 11 12 347102 CASAVA_Build 9 102143616 1I2M1I TAACACTGGC -AT-/GATG CATCCTTGAC 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 N/A 0 0 347103 CASAVA_Build 9 102146617 3D ATCAAACACC GAA/--- GAAGCTTGGA 3070 het 3070 hom 39 14 23 3 GAA 2 1 347104 CASAVA_Build 9 102151763 1D CTGAAATGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 17 14 10 T 10 9 347105 CASAVA_Build 9 102154126 3I TAGGTCTTTT ---/CTG CTAATTCCAA 3070 het 3070 hom 50 18 22 10 CTG 0 1 347106 CASAVA_Build 9 102159390 5D TAAACTGGCT CTTAC/----- CTTACATTTT 3070 het 3070 ref 44 24 17 5 CTTAC 2 1 347107 CASAVA_Build 9 102159882 1D TTGTATATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 11 10 347108 CASAVA_Build 9 102162190 2D ACTTTGTCTC AA/-- AAAAAATAAT 751 het 751 ref 30 12 6 13 A 8 6 347109 CASAVA_Build 9 102162787 1D AAACTCAGTA C/- CCTCTCAAAG 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 C 3 2 347110 CASAVA_Build 9 102173317 1D CCACTGTTCT A/- CTGTCTCTCA 3070 het 3070 ref 46 27 18 2 A 1 0 347111 CASAVA_Build 9 102174013 1I CATACCCGTA -/G TGAAGCTGTG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 G 0 1 347112 CASAVA_Build 9 102175178 5D TATCAAAACA TATTT/----- TAAAATCAGT 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 TATTT 1 0 347113 CASAVA_Build 9 102176351 3D AGCAAAAGAT ATC/--- ATAAACATAG 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 ATC 1 0 347114 CASAVA_Build 9 102187106 1D AGTACTAGAG C/- AAAGGCTACC 3070 hom 99 het 35 0 34 2 C 1 0 347115 CASAVA_Build 9 102217893 1D TTTTTCCCCC T/- TTTCTATACT 3070 het 3070 hom 45 19 17 9 T 4 3 347116 CASAVA_Build 9 102233650 1I AAGCAGTACT -/C CCCCCACTGC 3070 het 3070 hom 22 10 10 2 C 5 6 347117 CASAVA_Build 9 102249472 1D GAGGCCTGGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 9 8 347118 CASAVA_Build 9 102253409 1D GTGTGGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2714 hom 36 7 16 13 T 13 12 347119 CASAVA_Build 9 102271588 1D ACCTCTGGCA T/- TTTTTTTTTT 1555 het 1555 ref 39 26 5 9 T 13 12 347120 CASAVA_Build 9 102272555 1I GGCCCCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 11 12 347121 CASAVA_Build 9 102285892 1I TGTCTGTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 10 11 347122 CASAVA_Build 9 102289873 2D ATTATACTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 T 13 11 347123 CASAVA_Build 9 102292804 1D CACATTGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 T 13 12 347124 CASAVA_Build 9 102311885 1I TCAGAAAAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 471 hom 19 3 12 4 G 0 1 347125 CASAVA_Build 9 102317903 4I TCCGTCTGAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 44 16 15 13 AAAC 3 4 347126 CASAVA_Build 9 102328426 1D TTACTGACTT C/- CATTTTGAAA 3070 het 3070 ref 46 24 15 8 C 2 1 347127 CASAVA_Build 9 102339829 2D GTTTGTGCAC AT/-- GTTTTCACCC 3070 het 3070 ref 38 20 17 2 AT 1 0 347128 CASAVA_Build 9 102359934 1D CCATGCATGC T/- TTTTTTTTTT 2794 het 2794 ref 39 14 8 17 T 15 14 347129 CASAVA_Build 9 102362054 1D ATCATTAAGG T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 7 6 347130 CASAVA_Build 9 102373473 1D GGGAATAGAT A/- ATGCTAGCTA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 2 1 347131 CASAVA_Build 9 102376123 1D CTGTGGTCAT C/- CGACTAGTAA 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 C 2 1 347132 CASAVA_Build 9 102392515 1I GTCCCTTCAT -/C CCCTAGGAAG 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 C 3 4 347133 CASAVA_Build 9 102396079 1D GAGTTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2980 hom 32 10 12 10 A 15 14 347134 CASAVA_Build 9 102397945 4I AGTTTGGAAC ----/CTAT CTATCCACTG 3070 het 3070 hom 26 8 11 7 CTAT 1 2 347135 CASAVA_Build 9 102399896 6D CAGCACATGA TGTTAT/------ CCAGTGAGAA 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 TGTTAT 1 0 347136 CASAVA_Build 9 102401640 1D GCTCCACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 10 17 8 A 10 9 347137 CASAVA_Build 9 102412268 1D AAAAGAATGT C/- CCGGAGAAAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 C 3 2 347138 CASAVA_Build 9 102415793 1I TTTTAAATAA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 7 8 347139 CASAVA_Build 9 102417557 2I ACTCATAATG --/TT TTTTTTTTTT 2545 het 2545 ref 32 15 9 8 T 10 12 347140 CASAVA_Build 9 102423331 1D TGTGGCATCT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 72 het 28 0 25 5 A 9 8 347141 CASAVA_Build 9 102427370 3D TTATCTTTAA TAT/--- TTCCATGCTT 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 TAT 1 0 347142 CASAVA_Build 9 102434403 1D ATATCCTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3038 hom 40 9 20 11 T 15 14 347143 CASAVA_Build 9 102441413 1D AGAGAGTGGT G/- GGCAGCAGCC 3070 het 3070 ref 31 14 12 6 G 3 2 347144 CASAVA_Build 9 102466325 1I AGCATAAAAT -/A TATTATTAAC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 0 1 347145 CASAVA_Build 9 102467861 1I GCAATAAACA -/T GAGAGTGCAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 1 347146 CASAVA_Build 9 102526113 3D TTCTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 35 0 28 9 T 12 9 347147 CASAVA_Build 9 102530606 1I TCCCCTGACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 T 9 10 347148 CASAVA_Build 9 102531896 1I GAAGAAGCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 10 347149 CASAVA_Build 9 102541735 1D CTAGAACTCC A/- AAGATTAAAT 3070 het 3070 ref 49 26 16 8 A 3 2 347150 CASAVA_Build 9 102552031 1I GTGCAGGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 14 15 347151 CASAVA_Build 9 102560346 1I AATTAAATCT -/G GGTAATTGGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 3 347152 CASAVA_Build 9 102560713 1I CATTTCATTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 8 9 347153 CASAVA_Build 9 102561270 1I TTGCCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 10 11 347154 CASAVA_Build 9 102563257 1D CAGAAGCCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 10 9 347155 CASAVA_Build 9 102570069 1I CTCTTTTCTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 7 8 347156 CASAVA_Build 9 102588967 1D GTATAATGGA T/- CTTTATGTAA 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 T 1 0 347157 CASAVA_Build 9 102593360 4D ATCCAAAGAG AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 8 AAAC 2 1 347158 CASAVA_Build 9 102595379 1D TTGATGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 T 15 14 347159 CASAVA_Build 9 102603784 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 9 10 347160 CASAVA_Build 9 102666084 12D AAGGTATATT AATACAGTAATA/------------ GGTCCTGCTG 3070 het 3070 ref 53 31 24 2 AATACAGTAATA 1 0 347161 CASAVA_Build 9 102677742 1I GGCTAATATA -/T TTTTTTTTTT 1812 het 341 hom 7 1 4 2 T 10 11 347162 CASAVA_Build 9 102687347 4D CCAGTGGTGT TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 het 2297 hom 27 8 12 9 TC 10 8 347163 CASAVA_Build 9 102693941 1D AATAGCTTTT C/- CCCCCCAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 7 6 347164 CASAVA_Build 9 102695054 1I TAAATATGAC -/A TAATCAAACT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 A 0 1 347165 CASAVA_Build 9 102698875 1I TGTTTTCTTT -/A AAAAATAGCG 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 A 5 6 347166 CASAVA_Build 9 102699430 1I GAGGCGGGGT -/C TTACACCTTT 3070 het 3070 hom 50 19 24 7 C 0 1 347167 CASAVA_Build 9 102704521 14I CAGTCCTCAC --------------/CATGGTGTAGTGAA CATGAGTGCT 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 CATGGTGTAGTGAA 0 1 347168 CASAVA_Build 9 102707213 1I GAAGGAAGAA -/C CTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 C 1 2 347169 CASAVA_Build 9 102716388 5D ATGTGAAAGT GCCTA/----- GACTGTGGCA 3070 het 3070 hom 44 19 22 6 GCCTA 1 0 347170 CASAVA_Build 9 102729570 1D CTTAGTTATT A/- ATTAGTTTCT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 2 1 347171 CASAVA_Build 9 102730434 3D CAAAAAATTA GCT/--- GCTGGACGTG 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 GCT 2 1 347172 CASAVA_Build 9 102731252 1D TAAAAAAAGT A/- AAACTTTAAC 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 A 4 3 347173 CASAVA_Build 9 102733023 2D TATCTTTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 T 13 11 347174 CASAVA_Build 9 102733816 5D AAGGAAGGGG AAGAA/----- AAGAAAAGAA 3070 het 2877 hom 23 9 10 5 AAGAA 3 2 347175 CASAVA_Build 9 102735763 1I TTGGCGGGGT -/G GGGGGGGGGT 1047 het 1047 ref 32 13 8 11 G 9 10 347176 CASAVA_Build 9 102736384 1I GGTGAAAGGT -/G GGGGGTGGGG 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 G 5 6 347177 CASAVA_Build 9 102738790 1I TCATTTTCAA -/C CTTGTCTTGT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 C 1 2 347178 CASAVA_Build 9 102750938 2I TTATAAAAAC --/AG ATATTTTTAT 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 AG 0 1 347179 CASAVA_Build 9 102754135 1I AGTATTTTTA -/T TAGTGTTAGG 3070 het 3070 hom 39 19 20 0 T 1 2 347180 CASAVA_Build 9 102754801 1D TTGAACTTTA T/- TGATTATATA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 T 2 1 347181 CASAVA_Build 9 102758003 2I GTCTTGACAC --/TA TTGATATTTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TA 0 1 347182 CASAVA_Build 9 102763149 1I TAATATGCAT -/A AAAATTACTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 4 5 347183 CASAVA_Build 9 102778998 1D ATTGGTTTTG A/- TTTGCATTTC 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 A 1 0 347184 CASAVA_Build 9 102803273 1I TAGCTAGGGA -/T GGTGGCATAT 3070 hom 81 het 28 0 28 1 T 0 1 347185 CASAVA_Build 9 102808880 1D AATGTATAGT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 9 8 347186 CASAVA_Build 9 102815883 1I TATTTTATTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 7 8 347187 CASAVA_Build 9 102836153 1D GAATGGGAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 143 het 58 0 47 11 A 10 9 347188 CASAVA_Build 9 102869337 2I ACAAGTCACC --/AA AAAAAAAAAA 1491 hom 17 het 32 0 7 25 A 10 12 347189 CASAVA_Build 9 102871243 1I TTTGTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 427 hom 31 1 24 6 A 10 11 347190 CASAVA_Build 9 102875587 1I ATTTTATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 180 hom 40 2 29 9 A 10 11 347191 CASAVA_Build 9 102889267 4D GGTGACAGAC TGAG/---- TGAGACTCTG 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 TGAG 2 1 347192 CASAVA_Build 9 102897373 1I TCTATTCATT -/C CCCCACTGCT 3070 hom 126 het 48 0 42 6 C 4 5 347193 CASAVA_Build 9 102898769 3D GTGCTGTCTA ATG/--- AGGATTTGCA 3070 hom 169 het 62 0 57 6 ATG 1 0 347194 CASAVA_Build 9 102900140 1D TGCTTTTTTT C/- CCCCTCCCAG 3070 hom 132 het 46 0 45 1 C 5 4 347195 CASAVA_Build 9 102901187 4I AATAAGTCTA ----/ATAG ATGGATGTGG 3070 hom 72 het 27 0 23 4 ATAG 0 1 347196 CASAVA_Build 9 102920992 3I TGATGCCATG ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 11 14 8 T 9 12 347197 CASAVA_Build 9 102922850 1D CACACATCCC A/- AATGGCTTAA 3070 het 3070 ref 42 21 15 8 A 3 2 347198 CASAVA_Build 9 102925339 25D TTAGTCCCGA ACTAACTTATAGAACTATAAGTTAG/------------------------- TGTCTTGAAG 3070 het 3070 hom 31 13 19 4 ACTAACTTATAGAACTATAAGTTAG 1 0 347199 CASAVA_Build 9 102929152 1D GAAATTCTAA G/- TACTAACTTT 3070 het 3070 hom 53 20 24 10 G 1 0 347200 CASAVA_Build 9 102931415 1D TTGAGAAACT A/- AAAAAAAAAA 1209 het 1209 ref 30 24 3 3 A 11 10 347201 CASAVA_Build 9 102942330 1I ATAGATTCTG -/T TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 T 6 7 347202 CASAVA_Build 9 102942519 1D AATAGCCTTG A/- AATCGTTAGG 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 A 3 2 347203 CASAVA_Build 9 102947820 6I TTAAAAAATA ------/AGAATC AGAATAAGAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 AGAATC 0 1 347204 CASAVA_Build 9 102957214 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2323 hom 19 6 10 3 A 10 11 347205 CASAVA_Build 9 102958789 4I TGAGACATAA ----/TAAT TAATTCTGTC 3070 het 3070 hom 36 11 21 4 TAAT 1 2 347206 CASAVA_Build 9 102959012 9D TAAAGGTCCC TATATGACA/--------- TATAAAGAAG 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 TATATGACA 1 0 347207 CASAVA_Build 9 102971455 2D TTTGTGGCCA TT/-- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 41 21 15 7 T 9 7 347208 CASAVA_Build 9 102974082 4I TCACGTCTCA ----/TTCT TTCTTATCTT 3070 het 3070 ref 45 18 18 9 TTCT 1 2 347209 CASAVA_Build 9 102974457 1I ACTAAAGGGG -/A AAAAAAAAAA 2756 het 2756 ref 40 19 11 10 A 11 12 347210 CASAVA_Build 9 103010415 1I CACAGTGATT -/A AAAGTCCTCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 3 4 347211 CASAVA_Build 9 103031045 1D CTCCCACCCA C/- CCTCAAGTCA 3070 het 222 hom 15 1 12 2 C 3 2 347212 CASAVA_Build 9 103033383 1D TGCCCCAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 A 10 9 347213 CASAVA_Build 9 103033466 1D AGATCGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 17 11 T 14 13 347214 CASAVA_Build 9 103040453 2I TATATAGAGG --/TA TGTATATATA 2381 het 1697 hom 17 9 7 1 TA 0 1 347215 CASAVA_Build 9 103046681 1D TCTATGATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 9 8 347216 CASAVA_Build 9 103053731 1I TTTTGAGTTT -/C CACCTGTTAC 3070 het 3070 hom 43 20 19 4 C 1 2 347217 CASAVA_Build 9 103059930 2I TAAAATCCTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 9 11 347218 CASAVA_Build 9 103101715 2I TCATATGAGA --/CT CTAGTGATTC 3070 het 3070 ref 50 22 22 6 CT 1 2 347219 CASAVA_Build 9 103107308 2D TGAGGTAAAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 48 13 19 17 GT 7 6 347220 CASAVA_Build 9 103111926 2D AACAGTACTC TT/-- TGTCAAGGTT 3070 het 3070 hom 40 18 20 5 T 3 1 347221 CASAVA_Build 9 103113264 2D TAAAAATTAT TC/-- TGTTACTTAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 4 TC 1 0 347222 CASAVA_Build 9 103130707 5I ACAAAGCTTA -----/GAGTC GAGTGGGATA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 GAGTC 0 1 347223 CASAVA_Build 9 103149107 1I TGCATAAAAG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 7 8 347224 CASAVA_Build 9 103149761 1D CAATCTCTAT A/- AAATTCTTAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 4 3 347225 CASAVA_Build 9 103152853 1D AGGGCAGGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 9 15 9 T 10 9 347226 CASAVA_Build 9 103153558 1D GTATAGTGAA G/- GAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 G 2 1 347227 CASAVA_Build 9 103154733 1I AATTAATTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 30 2 16 12 A 15 16 347228 CASAVA_Build 9 103156552 1I AACATATAAA -/T TTGGGGGAAA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 2 3 347229 CASAVA_Build 9 103158391 1D TTTTATTTAC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 30 15 14 1 T 9 8 347230 CASAVA_Build 9 103165555 1I ATTTGCTTTG -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 T 6 7 347231 CASAVA_Build 9 103165748 1D ACACAGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 11 10 347232 CASAVA_Build 9 103168869 5D GTAATTGTTG CTTAT/----- CTTATTTCTG 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 CTTAT 2 1 347233 CASAVA_Build 9 103176496 6I GCCACATTTC ------/TTATTA TAAGTTCAGC 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 TTA 0 2 347234 CASAVA_Build 9 103178229 1I GGCTGGAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 388 hom 40 1 28 11 T 10 11 347235 CASAVA_Build 9 103182266 1I TAATCTGCCA -/T GTTGACATCT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 0 1 347236 CASAVA_Build 9 103190725 1D TATTCTGATA T/- AGTCACTGTA 3070 het 3070 ref 54 25 22 9 T 1 0 347237 CASAVA_Build 9 103197938 6I3M7D AATACAGTTA ------GAGAAGAGGA/CTCCTTTAG------- CTACAGCTAA 3070 het 3070 ref 38 22 17 0 N/A 0 0 347238 CASAVA_Build 9 103226523 4D CTCCATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AAAC 5 4 347239 CASAVA_Build 9 103236038 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 32 0 21 11 T 11 12 347240 CASAVA_Build 9 103243443 2D CATACACATG CA/-- CACACACACA 895 het 895 ref 44 28 3 13 CA 10 9 347241 CASAVA_Build 9 103244902 1D TACCCTACAA C/- ATTGTTGGAG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 C 1 0 347242 CASAVA_Build 9 103247326 1D AAATTGAGCA T/- TAGTCATCCT 3070 hom 84 het 35 0 29 7 T 2 1 347243 CASAVA_Build 9 103251816 2I CATAAAAACC --/AT ATGTCTCCAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 AT 1 2 347244 CASAVA_Build 9 103266865 1D TTATTCAGGC T/- GGTAGAACTG 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 T 1 0 347245 CASAVA_Build 9 103279471 1I AACAACCTCT -/G GGATGTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 34 6 G 2 3 347246 CASAVA_Build 9 103346148 2D TTCCTGATAA CT/-- CTCTTTGATG 3070 het 3070 ref 37 24 11 3 CT 3 2 347247 CASAVA_Build 9 103394858 1D ATTTGTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 934 hom 28 4 13 11 T 15 14 347248 CASAVA_Build 9 103404959 1D ATACGGAGGG A/- GGGGAAAACA 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 A 1 0 347249 CASAVA_Build 9 103409261 1D GGAATTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 455 hom 27 1 17 9 A 12 11 347250 CASAVA_Build 9 103416858 1D AAGTAGCTGG A/- ACCACAGGCA 3070 het 3070 ref 22 9 7 6 A 2 1 347251 CASAVA_Build 9 103434598 3D TAAATGAATT GTC/--- ATCATTATTA 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 GTC 1 0 347252 CASAVA_Build 9 103440082 1D ATAAAAATAA T/- TGCTCCTTGT 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 T 2 1 347253 CASAVA_Build 9 103443896 1D CAATAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 657 hom 13 2 11 0 A 11 10 347254 CASAVA_Build 9 103448714 1I CTTTGGGTAG -/T TGGGAACATT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 1 2 347255 CASAVA_Build 9 103449027 1I TTCTAAATAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 A 9 10 347256 CASAVA_Build 9 103455035 1D ATCCTTGTGA T/- TTTTTTTAGG 3070 het 38 hom 32 1 23 8 T 8 7 347257 CASAVA_Build 9 103455435 4I TTTTCAGAGA ----/AAAT AAATAGATTA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AAAT 1 2 347258 CASAVA_Build 9 103456388 2D ACACATGCAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 87 het 34 0 30 11 AT 5 4 347259 CASAVA_Build 9 103456476 2D ATTATACATA AT/-- ATATACATGT 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 AT 3 2 347260 CASAVA_Build 9 103458568 2D CCTAGAATGT CA/-- CAGATTCAAG 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 CA 2 1 347261 CASAVA_Build 9 103459880 1D CTTCTTTTTA G/- TTTATTAAGT 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 G 1 0 347262 CASAVA_Build 9 103460697 1I AAATTTTCTG -/T TTTTTTGGCA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 T 6 7 347263 CASAVA_Build 9 103464144 2I TAAGGTTACT --/TA TATATATACC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TA 4 5 347264 CASAVA_Build 9 103465792 1D GCCAATGTCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 8 7 347265 CASAVA_Build 9 103465969 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 13 12 347266 CASAVA_Build 9 103467155 1D GACTAATACC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 9 8 347267 CASAVA_Build 9 103468396 1I CCATGTTTCC -/A AATATCTGTT 3070 het 3070 hom 49 23 20 6 A 2 3 347268 CASAVA_Build 9 103469757 1D GGAGAGAAAA G/- CACTCATGTG 3070 het 3070 ref 48 23 19 7 G 1 0 347269 CASAVA_Build 9 103470338 1I ACTCTTACAG -/C ATTTTCATGC 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 C 0 1 347270 CASAVA_Build 9 103471866 4D GATAGGTGTG CTAT/---- CTATCAGATG 3070 het 3070 ref 46 22 20 6 CTAT 2 1 347271 CASAVA_Build 9 103474269 13D TAACATGGCC CTTGAACAATTTA/------------- CTTGAACAAT 3070 het 3070 ref 33 24 8 5 CTTGAACAATTTA 2 1 347272 CASAVA_Build 9 103476601 1D GTGATTTAAG A/- GGGCCAAATG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 1 0 347273 CASAVA_Build 9 103477771 1I ATAGGAGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 T 10 11 347274 CASAVA_Build 9 103478242 1I TCTACATATT -/A ATCACTTTTG 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 1 2 347275 CASAVA_Build 9 103478967 1I CCCCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1998 hom 29 7 11 11 T 11 12 347276 CASAVA_Build 9 103498636 1D ACCACCTTGG T/- TTTGGTCAAA 3070 het 3070 hom 44 18 26 0 T 4 3 347277 CASAVA_Build 9 103504067 1D TCCATACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 423 hom 30 1 27 2 T 11 10 347278 CASAVA_Build 9 103518234 3D GAGCAGAATT AAG/--- AGAGGAAAGG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AAG 1 0 347279 CASAVA_Build 9 103519827 1D GTTTGGCTAC A/- AAAATATAGA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 5 4 347280 CASAVA_Build 9 103533410 1D CTTCTCACTT C/- CTACAATGCA 3070 het 3070 hom 51 24 22 7 C 2 1 347281 CASAVA_Build 9 103537263 4D GAGATACCAA AAGT/---- AAGACAAATT 3070 het 3070 ref 46 26 17 4 AAGT 1 0 347282 CASAVA_Build 9 103537502 1I ACTTTATCCA -/C CCCCCCACCC 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 C 6 7 347283 CASAVA_Build 9 103545504 1D TAGTGTTTAT C/- CAAATGATCT 3070 het 3070 ref 40 20 18 3 C 2 1 347284 CASAVA_Build 9 103554806 1D TAGCATTAAG A/- AGTGTGCAAA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 2 1 347285 CASAVA_Build 9 103556411 1I AGAATGATGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 8 9 347286 CASAVA_Build 9 103558429 3D TGGGGTTATG TCC/--- TCCTCATAAA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 TCC 2 1 347287 CASAVA_Build 9 103562929 1I CTTTATTAAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 T 8 9 347288 CASAVA_Build 9 103572969 3D ATGGAATTCT AGA/--- AGAAGAAGTG 3070 het 3070 ref 45 21 17 8 AGA 3 2 347289 CASAVA_Build 9 103602505 10I CTACATTTAG ----------/TAAAATATTA GAAACATGTT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TAAAATATTA 0 1 347290 CASAVA_Build 9 103611290 1D TTAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 55 het 28 0 21 7 A 10 9 347291 CASAVA_Build 9 103612359 1D ATAGTGAGTA G/- GTGAGTTATC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 1 347292 CASAVA_Build 9 103614346 1I CACTTAATTG -/T TTTTTTAATA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 6 7 347293 CASAVA_Build 9 103616587 3D AATTTTCATT AGC/--- AGGCAGTCAA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 AGC 1 0 347294 CASAVA_Build 9 103617826 1D GTCTTTCTCA G/- GGGATCCCAC 3070 het 3070 ref 39 24 11 5 G 4 3 347295 CASAVA_Build 9 103621944 3D TCAAAATAAT AAG/--- AGCTATTTAT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 AAG 1 0 347296 CASAVA_Build 9 103624886 1D GTTAAGTGAG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 57 32 23 3 A 8 7 347297 CASAVA_Build 9 103635953 1D AATTGAGAGT A/- AAAAAACATC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 7 6 347298 CASAVA_Build 9 103637396 1I TTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTTT 2792 het 2171 hom 22 8 11 3 T 13 14 347299 CASAVA_Build 9 103643392 2D AAGTACAGTG GC/-- CATTCAGTGC 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 GC 1 0 347300 CASAVA_Build 9 103645044 1I CCTGACCTCC -/A AGTGATCCGC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 A 1 2 347301 CASAVA_Build 9 103649951 1I GCTGGAATCA -/C CCCAAAAGCA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 C 3 4 347302 CASAVA_Build 9 103658367 1D ATTTTTGTGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 9 8 347303 CASAVA_Build 9 103670005 8I GTGTTGCTAA --------/ATCCTGTT ATCCTGTTGT 3070 het 3070 ref 45 20 18 8 ATCCTGTT 1 2 347304 CASAVA_Build 9 103677673 3I TAAGGGTTCT ---/GAA ACCCCACCCT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 GAA 0 1 347305 CASAVA_Build 9 103678320 24D AGGACTCTAC CTGAAGTTTTTTTTTTTTTGGTCA/------------------------ TTTCCCTTTT 3070 het 3070 ref 19 15 9 3 CTGAAGTTTTTTTTTTTTTGGTCA 1 0 347306 CASAVA_Build 9 103679622 1D ACTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2674 het 1678 hom 11 5 6 0 A 12 11 347307 CASAVA_Build 9 103687410 1D ATGCAAATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 T 12 11 347308 CASAVA_Build 9 103688750 1I TTTCAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 27 1 18 8 T 11 12 347309 CASAVA_Build 9 103696198 2I TTATGATCAT --/AA AACATCGTGT 3070 het 3070 ref 45 27 16 2 A 2 4 347310 CASAVA_Build 9 103699058 6D TAAAAAACAA ATCAAC/------ TGATTCTGGC 3070 het 3070 hom 34 15 17 6 ATCAAC 1 0 347311 CASAVA_Build 9 103706139 1D TATCTCTATC A/- ATGGGTAGAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 2 1 347312 CASAVA_Build 9 103707289 10I TCAGAACCCA ----------/ACTACTTCCT ACTACTTCCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 ACTACTTCCT 1 2 347313 CASAVA_Build 9 103708812 1I TATGAGACAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 8 9 347314 CASAVA_Build 9 103710168 2I GGGAAAATAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 10 12 347315 CASAVA_Build 9 103715529 1I AATAAAAAAA -/T ATTGTATTTA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 T 0 1 347316 CASAVA_Build 9 103726051 1I AACAACAAAC -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 A 6 7 347317 CASAVA_Build 9 103736145 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 12 11 347318 CASAVA_Build 9 103736655 1I TTTTTCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 T 11 12 347319 CASAVA_Build 9 103737596 3D ACATGTGCCA TGT/--- TGTTGTGCTG 3070 het 2384 hom 17 5 11 1 TGT 3 2 347320 CASAVA_Build 9 103752202 6D TTAGCATGAC ATTAAA/------ ATTAAAAGTG 3070 het 3070 ref 52 21 22 11 ATTAAA 2 1 347321 CASAVA_Build 9 103773698 1I GTACCCACAG -/A AAAAATATTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 5 6 347322 CASAVA_Build 9 103787265 1I GTCACTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 951 hom 28 2 17 9 T 10 11 347323 CASAVA_Build 9 103800229 1I CAAGTTTATA -/G AATTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 0 1 347324 CASAVA_Build 9 103801272 1D CCCAGGTGGT G/- AGAGGCCTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 1 0 347325 CASAVA_Build 9 103806730 1D CTTGCATTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 9 8 347326 CASAVA_Build 9 103809504 1D ATAGAATGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 135 het 47 0 46 1 T 9 8 347327 CASAVA_Build 9 103809734 3D CATCAATATT AAG/--- AACTTATCTA 3070 hom 99 het 35 0 34 2 AAG 1 0 347328 CASAVA_Build 9 103811392 1I AACACACATT -/A AAAAAAATCC 3070 hom 88 het 36 0 30 6 A 7 8 347329 CASAVA_Build 9 103812791 3D TGAAACCAAC AAT/--- GATTGCAAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 4 AAT 1 0 347330 CASAVA_Build 9 103815788 4D AAACTATCTC TGTT/---- TGCAGGTGAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TGTT 1 0 347331 CASAVA_Build 9 103818750 4D AAAAATAAAA AGAT/---- AGGCTACAGA 3070 hom 60 het 23 0 21 4 AGAT 1 0 347332 CASAVA_Build 9 103821143 14I ATGGTCCTCT --------------/ACATATGTAGAATA CCTATTGGGT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 ACATATGTAGAATA 0 1 347333 CASAVA_Build 9 103825857 1I TTTAAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 10 11 347334 CASAVA_Build 9 103837950 1D CCACTAAGAT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 279 hom 40 3 20 17 G 11 10 347335 CASAVA_Build 9 103841940 1I TATTAAGCGG -/T TAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 1 2 347336 CASAVA_Build 9 103848258 1D GGTTTGGATG T/- TTTTTTTTTT 1776 het 1776 ref 37 28 4 5 T 13 12 347337 CASAVA_Build 9 103851972 1I AGAGAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 19 27 4 A 10 11 347338 CASAVA_Build 9 103854533 1D CCAGCGGCCC T/- TTTTCCCTAG 3070 het 3070 ref 52 23 20 9 T 5 4 347339 CASAVA_Build 9 103855080 1I TAGTACTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1918 hom 41 8 17 16 T 15 16 347340 CASAVA_Build 9 103874916 11I CTGAACCTTT -----------/CCTGTCTACAG CCAATTACAC 3070 het 3070 ref 42 23 18 2 CCTGTCTACAG 0 1 347341 CASAVA_Build 9 103878740 4D AAAAAAAATT ATTA/---- AAGAAAGCAG 3070 het 3070 hom 28 11 14 5 ATTA 1 0 347342 CASAVA_Build 9 103879046 2D TCCAAAACTT AA/-- AGAGTACAGC 3070 het 3070 ref 49 31 14 4 A 3 1 347343 CASAVA_Build 9 103880418 1I ATGATGTAAT -/A TAATGAAATA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 A 0 1 347344 CASAVA_Build 9 103880906 1D ATTTAAAAAG A/- AGAAATATAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 2 1 347345 CASAVA_Build 9 103882579 1I7M6I TAAATACATA -ATATACA------/TATATACATATATC TATATATATA 1162 het 1162 ref 15 9 4 2 N/A 0 0 347346 CASAVA_Build 9 103892625 4I TAAAATAATA ----/TCTT TCTTTATTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 TCTT 1 2 347347 CASAVA_Build 9 103894463 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 7 8 347348 CASAVA_Build 9 103898295 1D TTGAGTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 10 9 347349 CASAVA_Build 9 103899775 2I AATATGTGTC --/TT TTAGTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 T 2 4 347350 CASAVA_Build 9 103904606 5D CACAGTTACC TTCTT/----- TTGTCTGTGT 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 TTCTT 1 0 347351 CASAVA_Build 9 103909430 1I ATATGAGGGA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 T 6 7 347352 CASAVA_Build 9 103910416 1D TATAAGCCAA T/- TTGCTTTCCT 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 T 3 2 347353 CASAVA_Build 9 103910555 1D TGTAAAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2515 hom 25 6 15 5 A 10 9 347354 CASAVA_Build 9 103911858 4I TCTGCTGATA ----/CTTT CTTTTGCCGG 3070 het 3070 ref 34 18 16 1 CTTT 1 2 347355 CASAVA_Build 9 103912903 1I TGTTGAACGG -/T GAGGGAAGAG 3070 het 3070 ref 43 22 15 7 T 0 1 347356 CASAVA_Build 9 103914563 4I TTTAGTATAG ----/TTAA TTAAGTCTTT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 TTAA 1 2 347357 CASAVA_Build 9 103915554 1D TTTAAAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 10 9 347358 CASAVA_Build 9 103915999 4D ATATATATTC ATAT/---- ATATATATAT 2957 het 1620 hom 15 4 7 4 AT 7 5 347359 CASAVA_Build 9 103917780 8I GAACATACTT --------/TAGAAATA TAGTAATATT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 TAGAAATA 0 1 347360 CASAVA_Build 9 103920243 2D TGCATGCGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 CA 7 6 347361 CASAVA_Build 9 103921784 1D TTTTTGATGG T/- TTTTTTTTTT 2402 het 967 hom 14 5 5 4 T 11 10 347362 CASAVA_Build 9 103925609 1D AAACCACCAA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 hom 35 15 17 4 T 7 6 347363 CASAVA_Build 9 103928645 1D CCTCCCCCTT C/- CCCCCCCCTT 2118 het 1209 hom 17 4 6 7 C 9 8 347364 CASAVA_Build 9 103933983 1D CTGAAAATTC T/- AAAAATCAGA 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 T 1 0 347365 CASAVA_Build 9 103943924 1I GTTTCAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 T 13 14 347366 CASAVA_Build 9 103944888 1I TCCATAAAAT -/A AACTGTAAAA 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 A 2 3 347367 CASAVA_Build 9 103949848 1I GATCAAAATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 377 hom 21 1 17 3 T 9 10 347368 CASAVA_Build 9 103956367 1I TCTTTTGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 15 16 347369 CASAVA_Build 9 103971856 2D TAGTATTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 657 hom 22 4 9 9 T 19 17 347370 CASAVA_Build 9 103981829 4D ATCAGCAGTC TCTT/---- TCTTCTAGCA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 TCTT 2 1 347371 CASAVA_Build 9 103988127 1D AAATAACCTG C/- CATCCATGTG 3070 hom 114 het 42 0 39 5 C 2 1 347372 CASAVA_Build 9 103988396 4D GTTAGGAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 43 24 14 6 AAAC 3 2 347373 CASAVA_Build 9 103994701 1D TCAATTTATA T/- TTTTATCCTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 5 4 347374 CASAVA_Build 9 103996050 1I AAATTGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 360 hom 27 1 22 4 T 10 11 347375 CASAVA_Build 9 104006815 5I TAGTGCACTT -----/AAAAG AAGAGATAAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAAAG 0 1 347376 CASAVA_Build 9 104027470 1I TTTAAGACAT -/C CTACTTTATT 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 C 1 2 347377 CASAVA_Build 9 104030022 2I TTATAATTTC --/TA TGTTATAAAA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 TA 0 1 347378 CASAVA_Build 9 104036925 17I TCTAATGTCT -----------------/TCTCAGCATCATTTTTC TCTATTACAC 3070 het 3070 hom 24 10 12 4 TCTCAGCATCATTTTTC 0 1 347379 CASAVA_Build 9 104037148 4D TGACCATTTG TCTA/---- TCCTTTACTT 3070 het 3070 ref 34 22 12 2 TCTA 1 0 347380 CASAVA_Build 9 104038784 1D CAGGTGTGAG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 22 10 9 3 T 9 8 347381 CASAVA_Build 9 104040311 4D GGACCCAATA TCTT/---- TCTTTTGTTC 3070 hom 123 het 48 0 38 14 TCTT 2 1 347382 CASAVA_Build 9 104044225 5D TGCCAACCAA TACTT/----- TACTTTAAAC 3070 het 3070 ref 39 21 13 6 TACTT 2 1 347383 CASAVA_Build 9 104044423 4I CCTTTCTTCA ----/AGTT AGTTATATTC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 AGTT 1 2 347384 CASAVA_Build 9 104046901 4D AGCAAGTCTC ATGT/---- ATGTCTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 22 4 ATGT 2 1 347385 CASAVA_Build 9 104047452 6D AATCAATTCC TTAAGA/------ TGTTACCTCT 3070 het 3070 ref 44 22 16 10 TTAAGA 1 0 347386 CASAVA_Build 9 104059067 1D CATACTGGTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 T 8 7 347387 CASAVA_Build 9 104059685 1I CAGCTATAAA -/C ATACATGTGC 2909 het 2909 ref 28 17 7 4 C 0 1 347388 CASAVA_Build 9 104063727 1I63M4I TTCATTTAAA -AATGCATTACCTATTCTGGTTTATTCACGTTTAGGAAATTCTATTTTAAATGGAACACTGGCC----/TAATGCATTACCTATTCTGGTTTATTCACGTTTAGGAAATTCTATTTTAAATGGAACACTGGCCATCA AATCATCTGA 3070 het 3070 hom 35 17 30 5 N/A 0 0 347389 CASAVA_Build 9 104064864 1I AAAAACAACC -/A AAAAAAGTTT 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 A 6 7 347390 CASAVA_Build 9 104065290 1D TTTTCTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 T 11 10 347391 CASAVA_Build 9 104066104 2I ATAAAATAAA --/AT AAATTTAAGA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 AT 0 1 347392 CASAVA_Build 9 104073107 1D TGATTTTTTT C/- CCTCTGCCGG 3070 het 3070 ref 38 18 18 2 C 3 2 347393 CASAVA_Build 9 104087266 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 8 7 347394 CASAVA_Build 9 104088677 1I ACACGTAAAT -/A ATGCAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 A 1 2 347395 CASAVA_Build 9 104089852 1I TTGCTTAATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 A 8 9 347396 CASAVA_Build 9 104090880 1I TCTTGCTCTG -/T TCCCCCAGGC 1797 het 1797 ref 23 13 5 5 T 1 2 347397 CASAVA_Build 9 104093368 4D AATTAAAAAC AAAT/---- AAAGAAAATA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 AAAT 1 0 347398 CASAVA_Build 9 104104921 1I GAAACTAGGT -/A AAAGGGTATA 3070 het 3070 hom 27 9 18 0 A 3 4 347399 CASAVA_Build 9 104116682 2D GGACTTGCCT TG/-- TGTTTCAGAT 3070 het 3070 ref 32 17 8 7 TG 2 1 347400 CASAVA_Build 9 104122700 5D13M4D GTATAATAAT AATAAAATAAAAATAAAAAAAC/-----AATAAAAATAAAA---- AAACAAACAT 3070 het 3070 hom 15 8 11 1 N/A 0 0 347401 CASAVA_Build 9 104123052 3I TAGTAGAAAT ---/AAA AACACTCTAA 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 2 5 347402 CASAVA_Build 9 104123479 1D ATCTTTACTT A/- AAAAAAAAAA 2552 het 1292 hom 20 6 12 2 A 17 16 347403 CASAVA_Build 9 104145560 3D AGATCATTCC ATA/--- ATATGTTTAA 3070 het 3070 ref 45 19 21 7 ATA 2 1 347404 CASAVA_Build 9 104146979 2I TCAAATTATT --/AC CGTAATTATA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 AC 0 1 347405 CASAVA_Build 9 104194287 1D CTGTAGTTTT C/- TTTTTTGGTT 3070 het 3070 hom 35 12 20 4 C 1 0 347406 CASAVA_Build 9 104226986 1I GCCAATCACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 A 13 14 347407 CASAVA_Build 9 104227696 2D GAATAAGATG TA/-- TATATATATA 2713 het 2713 ref 23 8 7 8 TA 6 5 347408 CASAVA_Build 9 104228042 1I AAACAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 19 26 8 T 10 11 347409 CASAVA_Build 9 104250894 1D GAAAAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 A 11 10 347410 CASAVA_Build 9 104254247 1D CCATCATATA C/- AAAAATCAAA 3070 het 3070 ref 35 20 15 2 C 1 0 347411 CASAVA_Build 9 104260793 2D TAACATAAAT AA/-- AAATGAATTT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 5 3 347412 CASAVA_Build 9 104281232 2I AAATTAAAAC --/TT GATAAAAATT 3070 het 3070 ref 22 9 10 3 T 0 2 347413 CASAVA_Build 9 104296589 1D TTTCTGTAGT A/- GGGGGTAAGA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 1 0 347414 CASAVA_Build 9 104346135 2I GACTCTCCAT --/CC CATTCCTCCT 3070 hom 144 het 52 0 47 5 C 1 3 347415 CASAVA_Build 9 104352171 1I ATGATACTGC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 8 9 347416 CASAVA_Build 9 104353906 1D TTAATCTTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 10 9 347417 CASAVA_Build 9 104364244 2I ATATCTATAT --/AC ACACACACAC 2851 het 2851 ref 24 10 7 7 AC 7 8 347418 CASAVA_Build 9 104366754 2I21M8D6M27D TTTTAAATCT --GTGAACAAGCTCTGCAGGTATATAGAATAATGAGAAAAAAATGAACATAATAATAAAAGAAG/TGGTAGGAAGGCTTTCTAGATAT--------TTGAGA--------------------------- GAACTTAAGT 3070 het 3070 ref 38 57 10 13 N/A 0 0 347419 CASAVA_Build 9 104366973 4D ATCTAATAGC TTTG/---- TTTAACTACA 3070 het 3070 ref 92 66 21 5 TTTG 1 0 347420 CASAVA_Build 9 104368922 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 AT 7 6 347421 CASAVA_Build 9 104371033 1D GACACCACAG A/- TGCTGCAGGG 3070 hom 135 het 48 0 46 3 A 1 0 347422 CASAVA_Build 9 104375918 5I GTATAATTTC -----/TTTAG TTGATTTCTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TTTAG 0 1 347423 CASAVA_Build 9 104381761 1D GAAGTAATGT C/- CTATGTATGG 3070 hom 163 het 62 0 54 8 C 2 1 347424 CASAVA_Build 9 104392167 4D AACAAATTAG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 GTTT 4 3 347425 CASAVA_Build 9 104396086 1D GAAAAAGGAT A/- AAAAATATCA 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 A 6 5 347426 CASAVA_Build 9 104396518 1D ACTTGGAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 T 12 11 347427 CASAVA_Build 9 104406489 3D TGGTCCTGTT GTC/--- ATTACGGTAG 3070 het 3070 ref 48 29 14 8 GTC 1 0 347428 CASAVA_Build 9 104410300 1I GAACATAATG -/A AAAATCATTA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 4 5 347429 CASAVA_Build 9 104410626 3I CCTATTTAAT ---/TTC TTCTCATTTT 3070 het 2986 hom 22 7 14 1 TTC 1 2 347430 CASAVA_Build 9 104413990 3I TGCCTCGGTT ---/TTC TTCTTGGAGT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 TTC 1 2 347431 CASAVA_Build 9 104421538 1D TAATTAATTG T/- TTTACAAAAT 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 T 4 3 347432 CASAVA_Build 9 104423942 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 7 6 347433 CASAVA_Build 9 104424543 2D CACAGTTTGT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 11 9 347434 CASAVA_Build 9 104426201 1D AAAGCTATAT G/- TATTTACAGT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 G 1 0 347435 CASAVA_Build 9 104434053 1I TGCACCTGTA -/T TTTTTTTTTT 2121 het 1964 hom 26 7 6 13 T 11 12 347436 CASAVA_Build 9 104442326 1D AGCCACAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 13 12 347437 CASAVA_Build 9 104448045 2D TTTTTGTCTC TA/-- TGAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 52 27 20 6 TA 1 0 347438 CASAVA_Build 9 104451434 3D TCTTTACCTT TTG/--- TTTTCTGTTT 3070 het 3070 ref 42 23 18 2 TTG 1 0 347439 CASAVA_Build 9 104452283 1D ACCTTTTTTT G/- TTTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 G 1 0 347440 CASAVA_Build 9 104455558 1I AGTGTAGGCT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 A 7 8 347441 CASAVA_Build 9 104458024 1D GAACAACGAC A/- AAAAACGTAA 3070 het 2894 hom 17 7 9 1 A 6 5 347442 CASAVA_Build 9 104465087 1I AAGTAAATGC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 8 9 347443 CASAVA_Build 9 104490323 2D CACACACACA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 74 het 40 0 25 17 CT 10 9 347444 CASAVA_Build 9 104501451 1I GGGGAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 834 hom 47 3 38 6 A 10 11 347445 CASAVA_Build 9 104502626 2I TCAGGAAGAT --/AA AGTCAAAGTA 3070 hom 66 het 31 0 23 8 A 1 3 347446 CASAVA_Build 9 104506716 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 TA 9 8 347447 CASAVA_Build 9 104511897 1I TTCCTTAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 11 347448 CASAVA_Build 9 104512648 1I TGAGGGTCTT -/G TGGAAGAACT 3070 hom 154 het 56 0 52 4 G 0 1 347449 CASAVA_Build 9 104522011 1I AACCCCCCCC -/T CAACCCGTGA 3070 hom 87 het 33 0 27 6 T 0 1 347450 CASAVA_Build 9 104523801 3D TACGCATGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 13 10 347451 CASAVA_Build 9 104524965 5D GACCCTTATT TCTCA/----- TTATATATAA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TCTCA 1 0 347452 CASAVA_Build 9 104526105 2D24M2D ACTTCATTTT TCTCTTTCTCTTCCCTTTTCCCTTTCTT/--TCTTTCTCTTCCCTTTTCCCTTTC-- TTTCTTTCCC 3070 hom 69 het 22 0 23 3 N/A 0 0 347453 CASAVA_Build 9 104529740 1D CCCCAAAAAA G/- AAAATACCAA 3070 het 320 hom 35 1 33 1 G 1 0 347454 CASAVA_Build 9 104535134 1D GTGTCCAAAG T/- TTTTTATAGT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 6 5 347455 CASAVA_Build 9 104549796 1I TTGTAAAATG -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 9 347456 CASAVA_Build 9 104550786 1D TCAATTCTCC T/- TCTGCTTCTC 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 2 1 347457 CASAVA_Build 9 104551798 1D65M6D AAAACAAAAC AAAACAAGGCAAAACAAACAAAAAGACTCTAATTTGATTGGAACAAACCTATTAAACTCTTTGTGCCTTATT/-AAACAAGGCAAAACAAACAAAAAGACTCTAATTTGATTGGAACAAACCTATTAAACTCTTTGTGC------ CTTATTTAAT 3070 hom 84 het 24 0 28 13 N/A 0 0 347458 CASAVA_Build 9 104553184 1D20M4I AAGGGAAAGA TTTTTTTTTCTCCTCTAAAAT----/-TTTTTTTTCTCCTCTAAAATAATC CATCTAGGAT 3070 hom 102 het 35 0 35 5 N/A 0 0 347459 CASAVA_Build 9 104553529 1I ATCCTTAAAA -/T AACCTTTTCT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 0 1 347460 CASAVA_Build 9 104554433 1I TGTCTCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1807 hom 24 6 11 7 T 13 14 347461 CASAVA_Build 9 104555938 2D TCTTTCTATT CG/-- GTTTTCAGTG 3070 hom 99 het 34 0 34 3 CG 1 0 347462 CASAVA_Build 9 104566744 1D GAAGGGAAAA C/- ATTTTATAGT 3070 het 3070 ref 43 21 20 3 C 1 0 347463 CASAVA_Build 9 104568134 1I GTTGGAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1753 hom 49 7 34 8 A 10 11 347464 CASAVA_Build 9 104575886 1D11M1D TTACTTTCTG TTTTTTTTAACCT/-TTTTTTTAACC- TTTTTTTTAA 3070 het 624 hom 27 5 15 9 N/A 0 0 347465 CASAVA_Build 9 104576782 2D TTTCCTTCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 T 13 11 347466 CASAVA_Build 9 104577201 1D CTGTTGTGTA T/- ATACCCAGCA 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 T 1 0 347467 CASAVA_Build 9 104579222 1I20M1D TCTATACCTG -TTTTTTTTTTGGGAGTTTTTA/TTTTTTTTTTTGGGTGTTTTT- ATCATGAAGG 2048 het 2048 ref 28 13 13 6 N/A 0 0 347468 CASAVA_Build 9 104580149 1I GACCTGACAC -/T TTTCGGGAGA 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 3 4 347469 CASAVA_Build 9 104580536 43I AAAATCTTGC -------------------------------------------/TCCAGTGTTTGCAAGTTACATTCTCTTAGAAGTCTATTAACTT TGCTGTCTGT 3070 het 3070 hom 36 18 21 4 TCCAGTGTTTGCAAGTTACATTCTCTTAGAAGTCTATTAACTT 0 1 347470 CASAVA_Build 9 104584139 1I TAGCCATGAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 48 21 23 4 A 8 9 347471 CASAVA_Build 9 104584835 1I ACTGAAAATC -/A ATAGCTCTTT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 2 347472 CASAVA_Build 9 104585081 13I TTTAATCTTA -------------/GAGGGGTGCAGAC TTTTATGAGT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 GAGGGGTGCAGAC 0 1 347473 CASAVA_Build 9 104588061 2I ATTAATAGAC --/TT AACGTACCTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 0 2 347474 CASAVA_Build 9 104588487 4I GCATCTGTAT ----/CAGA CAGTCTTTGG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 CAGA 0 1 347475 CASAVA_Build 9 104591465 1I ATTGTAAGCT -/A GAGCAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 0 1 347476 CASAVA_Build 9 104597097 1D GTTTTCTGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 36 hom 26 1 16 10 A 10 9 347477 CASAVA_Build 9 104598222 5D TTCTTTCCTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 33 3 16 15 T 15 10 347478 CASAVA_Build 9 104599942 1I AGAAATACCA -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 T 6 7 347479 CASAVA_Build 9 104603912 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 15 0 9 6 A 14 12 347480 CASAVA_Build 9 104606544 1D AAGAAGGGTG A/- AAAAAGGGAG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 6 5 347481 CASAVA_Build 9 104606692 1D TTTTAATTGT A/- AACTACTGCC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 3 2 347482 CASAVA_Build 9 104608965 2D TTACTGTAAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 1449 hom 20 6 12 2 AT 9 8 347483 CASAVA_Build 9 104622784 1D TATTATAATG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 T 10 9 347484 CASAVA_Build 9 104624659 1I AGAAAAGAGA -/T TAAAAAAAAC 3070 hom 56 het 38 1 33 4 T 1 2 347485 CASAVA_Build 9 104625134 1I AATGTTGTGT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 245 hom 34 4 7 23 G 0 1 347486 CASAVA_Build 9 104626015 4I ATAACTATTC ----/AATT AATTAAGCAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AATT 1 2 347487 CASAVA_Build 9 104628477 2D ACATTTTGGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3012 hom 38 12 14 12 A 16 14 347488 CASAVA_Build 9 104631498 1D TGAAAAAAAA T/- ACCATATATA 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 T 1 0 347489 CASAVA_Build 9 104632049 4I AAGCTACAAA ----/TAAT TAAGTTCAGC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 TAAT 0 1 347490 CASAVA_Build 9 104632344 1D GGGAAGCTGC A/- GAAGAAAAGT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 1 0 347491 CASAVA_Build 9 104632407 5D TTAAGAGGTT AAAGA/----- AAAGAAGTCA 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 AAAGA 2 1 347492 CASAVA_Build 9 104634016 4D TGTGTATGTA GTGT/---- GTGTGTGTGT 2466 hom 24 het 22 0 9 14 GT 8 6 347493 CASAVA_Build 9 104634112 3D ATATATGTAT ATC/--- ATATATATGT 978 hom 7 het 3 0 3 0 ATC 1 0 347494 CASAVA_Build 9 104636546 1I CATGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 11 12 347495 CASAVA_Build 9 104638989 1D TGTTTTTTCT C/- ACATTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 C 1 0 347496 CASAVA_Build 9 104639074 5D GAAATGTTGA TCTTT/----- TCTTTTATCA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TCTTT 2 1 347497 CASAVA_Build 9 104641236 1I ATTATGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 923 hom 34 2 26 6 T 10 11 347498 CASAVA_Build 9 104644520 1D TACCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 13 23 11 T 11 10 347499 CASAVA_Build 9 104644858 1D GGTGCTGTAT A/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 1 0 347500 CASAVA_Build 9 104655514 2I TTTGTTGCCA --/TT TTTTTTTTTG 3017 hom 21 het 15 0 8 7 T 9 11 347501 CASAVA_Build 9 104662051 3D ATTAATAGTT ATC/--- ATTGCTCAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 ATC 1 0 347502 CASAVA_Build 9 104667676 1D CACCACAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 26 1 22 3 T 15 14 347503 CASAVA_Build 9 104692328 1D CCTATAAATG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 36 het 19 0 12 7 C 15 14 347504 CASAVA_Build 9 104694908 1I CTAGGAAATG -/A AGGCATTTAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 2 347505 CASAVA_Build 9 104712032 1I ACCAATGTAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 T 8 9 347506 CASAVA_Build 9 104712937 5D TGTGACACTT TTCTC/----- ATATCATTTT 3070 hom 105 het 36 0 36 2 TTCTC 1 0 347507 CASAVA_Build 9 104714116 1D TTAATACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 13 12 347508 CASAVA_Build 9 104715970 1I TTCTTCACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 689 hom 35 2 27 6 A 11 12 347509 CASAVA_Build 9 104733889 9D TAATCCCTAC TTCACTCCT/--------- TTGGGTCTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 5 TTCACTCCT 1 0 347510 CASAVA_Build 9 104734866 1I AACAGGCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1625 hom 33 4 26 3 A 11 12 347511 CASAVA_Build 9 104741235 1I TTTCCTTTTT -/C TTTATGTAAT 3070 hom 64 het 26 0 22 4 C 0 1 347512 CASAVA_Build 9 104743233 1I TTCAGAAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 10 347513 CASAVA_Build 9 104747396 2D TAAGCCTAAC TT/-- AGCCTATGAA 3070 hom 102 het 39 0 34 6 T 2 0 347514 CASAVA_Build 9 104753022 2I GGTTTATAAA --/AG AGAGGTATAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AG 2 3 347515 CASAVA_Build 9 104754867 1D TATGTATACC A/- AAAAAAAAAA 1206 het 1206 ref 50 35 5 10 A 13 12 347516 CASAVA_Build 9 104756487 1D GCCTGCGCTA G/- GGTCAGTGAT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 3 2 347517 CASAVA_Build 9 104773542 1D GTGCTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 42 2 31 10 A 15 14 347518 CASAVA_Build 9 104783528 5D ACCCCAATGT GTCCA/----- GAAGGTGGGA 3070 hom 144 het 51 0 47 5 GTCCA 1 0 347519 CASAVA_Build 9 104785965 1D TATATGTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 42 1 31 12 T 12 11 347520 CASAVA_Build 9 104786795 10I CAGGTGCGGT ----------/CATTAATTAC GGCTCACGCC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 CATTAATTAC 0 1 347521 CASAVA_Build 9 104787062 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2101 het 515 hom 32 4 16 12 A 17 18 347522 CASAVA_Build 9 104788837 1D GTCTGATCTG T/- AATAGCCAGA 3070 hom 150 het 53 0 50 4 T 1 0 347523 CASAVA_Build 9 104791502 2I AAATAGAGAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 26 0 19 7 A 9 11 347524 CASAVA_Build 9 104797015 2D GTACTAACTC AT/-- ATATTTATAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AT 3 2 347525 CASAVA_Build 9 104803393 1D ATACACACAC A/- ATACATATAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 2 1 347526 CASAVA_Build 9 104812093 2D ATTTTACATG TA/-- TGTGTATATA 3070 het 202 hom 25 1 21 4 TA 1 0 347527 CASAVA_Build 9 104817497 3I TAAATATATA ---/TAT TATATGCTTA 2413 hom 12 het 5 0 5 0 TAT 1 2 347528 CASAVA_Build 9 104821428 1D TCCTTTTTTA T/- TTTTTTGTAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 7 6 347529 CASAVA_Build 9 104825716 1D TCTAAGCAGC A/- AAAGTGTTCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 4 3 347530 CASAVA_Build 9 104841027 1I CCCGTGGGGC -/A AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 51 29 19 3 A 6 7 347531 CASAVA_Build 9 104842848 1D TGTATCCAGC A/- AAACTAAGTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 4 3 347532 CASAVA_Build 9 104844171 1D AGTATGTCCT A/- AAAAAAAAAA 2168 het 1912 hom 26 8 7 11 A 15 14 347533 CASAVA_Build 9 104844625 4I AAATGAAATT ----/CAAA CAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 18 5 CAAA 2 3 347534 CASAVA_Build 9 104846005 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 17 25 7 A 10 9 347535 CASAVA_Build 9 104853563 3D CTGTTTTCTC AGA/--- AGTTGTCATT 3070 het 3070 ref 35 18 15 3 AGA 1 0 347536 CASAVA_Build 9 104855953 3D TTTCATGTAA TAT/--- TATTCTATGT 3070 het 3070 ref 45 22 21 3 TAT 2 1 347537 CASAVA_Build 9 104861000 3I CTGTATTTTA ---/AAT ATTATCATTG 3070 het 3070 ref 46 23 19 4 AAT 0 1 347538 CASAVA_Build 9 104867837 4I GTATTTGATG ----/GTGA GTGTTTGTGT 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 GTGA 0 1 347539 CASAVA_Build 9 104884563 1I GCAATAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2517 hom 24 8 7 9 T 10 11 347540 CASAVA_Build 9 104889019 1D AACCAACATG A/- AAAAAACTTA 3070 hom 129 het 48 0 44 5 A 7 6 347541 CASAVA_Build 9 104908504 4I AGTGAGGGCT ----/ATAG ATAGATAGAT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 ATAG 4 5 347542 CASAVA_Build 9 104919666 1D TCTACTTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 35 8 A 13 12 347543 CASAVA_Build 9 104922469 2I AGGACTAATG --/TC TCTACCATTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TC 1 2 347544 CASAVA_Build 9 104933374 1I TAGAGGTCTG -/T CCCCTCTCAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 0 1 347545 CASAVA_Build 9 104948147 1I TTTGGAGGAA -/C TAGCAAAGAA 3070 hom 95 het 38 0 31 7 C 0 1 347546 CASAVA_Build 9 104950053 1I16M5D GTTTCATTGA -TTTTTTTTTAGTTTCTATTTG/TTTTTTTTTTAGTTTCT----- ATTTATTTCT 3070 hom 111 het 40 0 38 5 N/A 0 0 347547 CASAVA_Build 9 105006436 1I TGGGTGGCAA -/C CCATTAGCAG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 C 2 3 347548 CASAVA_Build 9 105016535 1D ATTTTTGTAC T/- TTTAGTAGAG 3070 het 1098 hom 15 3 12 0 T 4 3 347549 CASAVA_Build 9 105032316 1D TTTCTTTCTC T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 T 9 8 347550 CASAVA_Build 9 105037168 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1446 hom 21 7 11 3 A 13 12 347551 CASAVA_Build 9 105037601 1D CCATGGAAAT G/- GAAGAGTAAA 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 G 2 1 347552 CASAVA_Build 9 105038488 2I GCGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 12 14 12 GT 6 7 347553 CASAVA_Build 9 105043730 1D AAAAAAAAAA C/- AAACCTGCAC 1197 het 548 hom 6 3 3 0 C 1 0 347554 CASAVA_Build 9 105044047 1D GAATGTATAT C/- TTCCAATTCA 3070 het 3070 hom 46 12 29 5 C 1 0 347555 CASAVA_Build 9 105048659 1I CCTGAATAAA -/G GTTATGTGTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 1 2 347556 CASAVA_Build 9 105062071 1I TCACTGTCTG -/T TTTTTTGCAC 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 T 6 7 347557 CASAVA_Build 9 105067029 3D GAATACACCA AAC/--- AACATGTTCA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 AAC 2 1 347558 CASAVA_Build 9 105067425 4I GTAAATAAAT ----/AAAC AAATGTAAGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAC 0 1 347559 CASAVA_Build 9 105070620 1I CATTAAAATG -/T TTTTGGAGTA 3070 het 3070 hom 31 12 17 2 T 4 5 347560 CASAVA_Build 9 105071656 1I TAGCAAAAGC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 25 10 11 4 A 7 8 347561 CASAVA_Build 9 105072668 1D46M7D GCTTATCTAT GCATATAGGAATAAAACATACATAGTAATATCTGTGTATGTAGGCAGTCCTGTA/-CATATAGGAATAAAACATACATAGTAATATCTGTGTATGTAGGCAG------- TATTACTATA 3070 het 3070 hom 36 23 21 2 N/A 0 0 347562 CASAVA_Build 9 105081226 1D TGGTGCTCCC T/- TTCTCTGTTT 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 T 3 2 347563 CASAVA_Build 9 105103622 1D CGTAACGTTC T/- TTTTTTTTTT 1537 het 1537 ref 46 34 4 9 T 12 11 347564 CASAVA_Build 9 105108215 1D CTATGTCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 31 0 26 5 A 11 10 347565 CASAVA_Build 9 105116283 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 2331 hom 15 het 6 0 6 0 A 5 6 347566 CASAVA_Build 9 105120648 2I ACAAAAAAAC --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 52 23 17 12 CA 6 7 347567 CASAVA_Build 9 105131665 1I GTATTTACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 A 10 11 347568 CASAVA_Build 9 105134218 1I AAATTTAACC -/A AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 6 7 347569 CASAVA_Build 9 105136953 1D TAGTTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 1433 het 1433 ref 27 13 4 10 T 16 15 347570 CASAVA_Build 9 105173649 1I CTTGGGAATG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 415 hom 37 1 29 7 A 9 10 347571 CASAVA_Build 9 105204580 1I ACAAAAATTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 8 9 347572 CASAVA_Build 9 105222255 1D TTCTTAAGAA T/- TTATTTTACT 3070 het 3070 ref 22 12 9 2 T 3 2 347573 CASAVA_Build 9 105249391 1D ACATTGCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 13 12 347574 CASAVA_Build 9 105258427 1I GTGGCTCAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 A 8 9 347575 CASAVA_Build 9 105277294 1I ATTCAGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 11 12 347576 CASAVA_Build 9 105281887 1D TTTCATAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 13 12 347577 CASAVA_Build 9 105294506 1D AGCAAGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 15 14 347578 CASAVA_Build 9 105296689 1D CTTCTGTTTC A/- AAAAAACTAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 7 6 347579 CASAVA_Build 9 105300902 3I AGAAAAGAGA ---/GTT GTTGTGAGCT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 GTT 1 2 347580 CASAVA_Build 9 105330933 1D GGCCCAGAAA T/- TAAACCTACA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 2 1 347581 CASAVA_Build 9 105333567 2D AGGTTAAGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2237 hom 34 11 8 15 A 16 14 347582 CASAVA_Build 9 105343952 1D TTCCTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 2587 het 2587 ref 17 7 7 3 T 11 10 347583 CASAVA_Build 9 105355256 2D ATCATAAAAC TT/-- ATTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 T 2 0 347584 CASAVA_Build 9 105360652 3I TCATGGATAT ---/GAA GAATTAATAT 3070 het 3070 ref 41 24 15 2 GAA 1 2 347585 CASAVA_Build 9 105369314 1I TGCAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 A 10 11 347586 CASAVA_Build 9 105371358 1I CCCATATACA -/C CCACTTCTGA 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 C 2 3 347587 CASAVA_Build 9 105374877 4I AAAAAAAAGT ----/TTAA TTATTCTGTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 TTAA 0 1 347588 CASAVA_Build 9 105376334 1D AATAGCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 13 4 A 11 10 347589 CASAVA_Build 9 105380145 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAATC 2611 het 2611 ref 27 14 7 6 A 9 8 347590 CASAVA_Build 9 105385930 1D AAGAAACAGT G/- GACAACAATA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 G 2 1 347591 CASAVA_Build 9 105389645 1I TTGTCAGGGA -/C CCCCCCAGCA 3070 hom 117 het 42 0 37 5 C 6 7 347592 CASAVA_Build 9 105400912 1I TGTTGATTAA -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 6 7 347593 CASAVA_Build 9 105408386 1I TGTTGTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 10 11 347594 CASAVA_Build 9 105419469 11I GCCTTAGTTA -----------/AAAATAACTAT AAAATAACTA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 AAAATAACTAT 0 1 347595 CASAVA_Build 9 105424023 5D AAAAATATAT AAATA/----- AAATAAAAAT 2019 het 1532 hom 12 4 5 3 AAATA 2 1 347596 CASAVA_Build 9 105426909 4I TGTGAAATAG ----/TAGA TAGCCTGTAC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TAGA 0 1 347597 CASAVA_Build 9 105428809 1I AAAAAAATTA -/T TTTTTTTTTT 3001 het 3001 ref 32 10 12 10 T 12 13 347598 CASAVA_Build 9 105436950 1I CCTTTTTTTT -/A ATCTTTTAGG 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 A 1 2 347599 CASAVA_Build 9 105438780 1I TTTCGTCCCC -/A CTCCTGCACC 3070 hom 110 het 41 0 36 5 A 0 1 347600 CASAVA_Build 9 105442994 1I GGTAATTTAT -/A AAGAAAAGAG 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 2 3 347601 CASAVA_Build 9 105454173 1I ATTTGAAAAG -/A AGCATATGAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 1 2 347602 CASAVA_Build 9 105459076 17D CCTCCTCAGC CATGTGAAACTGTGAGT/----------------- CATTTAAACC 3070 het 3070 ref 29 18 15 4 CATGTGAAACTGTGAGT 1 0 347603 CASAVA_Build 9 105460436 3I GCCTAGGAGG ---/AAA AAAAAATGGT 2735 het 2735 ref 23 12 7 4 A 6 9 347604 CASAVA_Build 9 105471004 12D TACATATATA TGTGTGTGTGTG/------------ TGTGTGTGTG 442 het 442 ref 19 5 3 12 TG 11 5 347605 CASAVA_Build 9 105474174 2D ACATGCTCTG CC/-- CCCCCCCCAA 3070 het 2384 hom 25 8 15 3 C 10 8 347606 CASAVA_Build 9 105477650 1D GTTGTCACCT C/- CCCCCATAGC 3070 hom 125 het 45 0 40 5 C 6 5 347607 CASAVA_Build 9 105478541 3D GTTTTCAGTA ATT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 25 15 4 ATT 1 0 347608 CASAVA_Build 9 105481095 1D AAGAAAGCAG A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 A 8 7 347609 CASAVA_Build 9 105486097 4D ACAAATAAAT CTAA/---- CTATCACAGA 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 CTAA 1 0 347610 CASAVA_Build 9 105486830 1I AGAGACTGTG -/C TTTTTTATGT 3070 het 3070 hom 48 15 27 6 C 0 1 347611 CASAVA_Build 9 105492569 3D GGGAGGTGAA GGT/--- GGTGGTAGTG 3070 het 2345 hom 20 7 9 7 GGT 3 2 347612 CASAVA_Build 9 105492638 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1803 het 1803 ref 24 12 6 6 A 13 12 347613 CASAVA_Build 9 105495464 1I TCTAAAAGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 9 10 11 T 8 9 347614 CASAVA_Build 9 105497631 4I TGATTTTTCT ----/TTAA TTATTTTAAT 3070 het 3070 ref 46 22 22 2 TTAA 0 1 347615 CASAVA_Build 9 105498784 1I CCCAGCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 T 10 11 347616 CASAVA_Build 9 105499646 2D TTTATGGCTT TA/-- TCTCTTTGAT 3070 het 3070 ref 57 27 22 10 TA 1 0 347617 CASAVA_Build 9 105500873 3D CCAAAGTAAC AGG/--- AGATGATATT 3070 het 3070 ref 45 22 19 6 AGG 1 0 347618 CASAVA_Build 9 105501523 1I ATCAATAATG -/A AAAAAACAGG 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 6 7 347619 CASAVA_Build 9 105514284 2D GTGATTTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 11 9 T 13 11 347620 CASAVA_Build 9 105514967 2D32M1D TATACATATA TGTGTGTGTGTGTGTATATATATTATATATATATA/--TGTGTGTGTGTGTATATATATTATATATATAT- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 20 15 10 2 N/A 0 0 347621 CASAVA_Build 9 105522522 2D AGATACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 2588 hom 39 13 14 13 AC 6 5 347622 CASAVA_Build 9 105523440 1D ATGAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 A 12 11 347623 CASAVA_Build 9 105525556 3I TTCCTGCAAA ---/GTT GTTTATTTTC 2654 het 2251 hom 16 5 7 4 GTT 1 2 347624 CASAVA_Build 9 105543963 1I AAACAACCCT -/C CATTTCCCAT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 C 1 2 347625 CASAVA_Build 9 105552435 1D CAATTTTTTT A/- TTATTATTAT 2937 het 1614 hom 12 5 6 1 A 1 0 347626 CASAVA_Build 9 105556322 1D TAAGCAGCAG A/- AAAAATGTGA 2676 het 2222 hom 21 9 8 5 A 6 5 347627 CASAVA_Build 9 105561247 3D ATGTGAGATA TTG/--- TTATCTATGC 3070 het 3070 ref 54 29 23 3 TTG 1 0 347628 CASAVA_Build 9 105563311 2I CAAAGATTAT --/AA GTCTCAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 A 0 2 347629 CASAVA_Build 9 105567743 1D CTGTCAAAAG A/- GTTGGCGTTT 3070 het 3070 ref 38 21 9 8 A 1 0 347630 CASAVA_Build 9 105568149 1D TTCCTCAAAA G/- GTCTTGCTGC 3070 het 3070 ref 34 19 11 5 G 2 1 347631 CASAVA_Build 9 105568344 1I CCGGATACAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 9 10 347632 CASAVA_Build 9 105570870 1D AGAGGTAAAG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 8 7 347633 CASAVA_Build 9 105572673 2I TGAAACTGGG --/AA AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 8 10 347634 CASAVA_Build 9 105574512 2I GCCTTTTTTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 40 24 9 7 TA 5 6 347635 CASAVA_Build 9 105577738 1I CTTCTTTACA -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 41 19 17 5 T 6 7 347636 CASAVA_Build 9 105596392 1D CCCCTTTATG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 T 9 8 347637 CASAVA_Build 9 105601569 1I AGAAACAAAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 A 8 9 347638 CASAVA_Build 9 105609981 2I TCTATTACAC --/AT GTTTCCTTAG 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 AT 0 1 347639 CASAVA_Build 9 105629489 6D TATTAATTTG TTTTTC/------ TTTTTATTTT 3070 het 3070 ref 23 14 9 3 TTTTTC 1 0 347640 CASAVA_Build 9 105635772 1I ACATTACTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2385 hom 35 7 20 8 A 11 12 347641 CASAVA_Build 9 105638279 1I ACCTACTTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 9 10 347642 CASAVA_Build 9 105646563 1I GAACCAGACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 10 11 347643 CASAVA_Build 9 105657464 2I GATGTAGGAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 57 21 26 10 AT 6 7 347644 CASAVA_Build 9 105659466 1I ACTATATCCT -/C CCCCCGCCCA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 C 5 6 347645 CASAVA_Build 9 105660374 1I TCCATTATCA -/T TTTTTTAACA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 6 7 347646 CASAVA_Build 9 105669534 1I CTAAGTTCAC -/T TTTGTTTAAC 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 3 4 347647 CASAVA_Build 9 105678052 1I GCATATAGAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 A 6 7 347648 CASAVA_Build 9 105680413 1I ACTTTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 10 11 347649 CASAVA_Build 9 105691168 1I CTTCATGACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 17 10 A 10 11 347650 CASAVA_Build 9 105697536 4D AGTGACTCTC TCTT/---- TCAAGTAATA 3070 het 3070 hom 33 9 21 4 TCTT 1 0 347651 CASAVA_Build 9 105725994 6D CATGTACCAA AAAAAT/------ AAAAATAAAA 3070 hom 63 het 30 0 22 8 AAAAAT 3 2 347652 CASAVA_Build 9 105727391 45D TTTATATTTA TGCAATTATATATGCATAAATATATATGCATATATATATGCATAT/--------------------------------------------- ATAGTATGAT 3070 hom 78 het 31 0 27 7 TGCAATTATATATGCATAAATATATATGCATATATATATGCATAT 1 0 347653 CASAVA_Build 9 105732061 1I ACAATTATAG -/A TTTTTTTGAA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 A 0 1 347654 CASAVA_Build 9 105737910 18D TCAAAATATA TATATATATATATATATG/------------------ TATATATATA 3070 hom 32 het 16 0 12 6 TATATATATATATATATG 1 0 347655 CASAVA_Build 9 105755882 1D CAACTCAGTA C/- TAAGCAGCAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 1 0 347656 CASAVA_Build 9 105756824 1D TTGTTATATC A/- AAGCCTTCAT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 3 2 347657 CASAVA_Build 9 105759148 4D ATCCAAAGAT TGGG/---- TGAGCCTAAG 3070 hom 144 het 54 0 49 5 TGGG 1 0 347658 CASAVA_Build 9 105762549 1D TCTTTGATCA T/- TTTTTATGGG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 6 5 347659 CASAVA_Build 9 105764600 1I AAATTTAATT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 40 2 32 6 A 0 1 347660 CASAVA_Build 9 105766006 20I ATTGTTTCAT --------------------/AGACTTATAAAGATAAAAGA AGATAGCACA 3070 hom 111 het 37 0 38 2 AGACTTATAAAGATAAAAGA 0 1 347661 CASAVA_Build 9 105780319 4D AAAAAAAAAA AAAT/---- GTTTAAAATC 1642 het 412 hom 32 8 15 9 AAAT 1 0 347662 CASAVA_Build 9 105787683 1D CAATAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 386 hom 28 1 22 6 A 12 11 347663 CASAVA_Build 9 105791965 1D AATTTGAAAT G/- GGGAGAAAAG 3070 hom 123 het 50 0 41 9 G 4 3 347664 CASAVA_Build 9 105792363 1D AAGAGGAATT A/- AAAAAAGCCA 3070 hom 114 het 41 0 37 5 A 7 6 347665 CASAVA_Build 9 105796268 2D TTATAAACAG TA/-- TATATATATA 3070 hom 63 het 26 0 22 8 TA 6 5 347666 CASAVA_Build 9 105811834 1D GAGCTACTGG T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 96 het 40 0 33 8 T 9 8 347667 CASAVA_Build 9 105819400 1D CTACAACTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 31 0 24 7 A 11 10 347668 CASAVA_Build 9 105825341 1D AAAAATACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 10 9 347669 CASAVA_Build 9 105826395 1D ACTGCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 11 10 347670 CASAVA_Build 9 105850727 1I CTTCTCCCCT -/C CTAATCAGAG 3070 hom 117 het 41 0 39 2 C 1 2 347671 CASAVA_Build 9 105859650 1D ATCAGGACAG T/- TTGTTGTGAT 3070 hom 81 het 30 0 27 4 T 3 2 347672 CASAVA_Build 9 105866026 1I ACTCCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 12 13 347673 CASAVA_Build 9 105870782 2I AACTGCTAGA --/CT CTCTCCTCAT 3070 hom 119 het 46 0 40 6 CT 2 3 347674 CASAVA_Build 9 105872538 1I TACAAATTAG -/A AAAAAATGAC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 6 7 347675 CASAVA_Build 9 105878852 1I CCAACCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 697 hom 31 2 22 7 T 12 13 347676 CASAVA_Build 9 105882253 1D CCTAATTCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 12 het 23 1 18 5 A 10 9 347677 CASAVA_Build 9 105884151 2D AGCATTCTTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 32 0 25 7 TA 1 0 347678 CASAVA_Build 9 105891083 1D CACAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 237 hom 32 2 16 15 A 14 13 347679 CASAVA_Build 9 105892940 4D AAAATAACAG AACT/---- AACAGAAAAG 3070 hom 96 het 35 0 33 5 AACT 1 0 347680 CASAVA_Build 9 105893506 6I AACAGGAATT ------/TTTCAG ATCCATTATA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 TTTCAG 0 1 347681 CASAVA_Build 9 105893967 3D TTGCTGGTAC TGA/--- TGATGCCTTC 3070 hom 93 het 34 0 30 7 TGA 2 1 347682 CASAVA_Build 9 105895926 1I CTGGCCCCAA -/C GAAGTACAGC 3070 hom 62 het 24 0 19 5 C 0 1 347683 CASAVA_Build 9 105897002 10D GAGTGAAGGA TTGTGGAGAG/---------- GTGACATAGG 3070 hom 120 het 43 0 40 7 TTGTGGAGAG 1 0 347684 CASAVA_Build 9 105899523 1D TTTTGTTTTT A/- AAAATGTTGT 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 5 4 347685 CASAVA_Build 9 105900033 1D GTGTGATAGT A/- GAGTATGGTG 3070 hom 144 het 50 0 48 2 A 1 0 347686 CASAVA_Build 9 105910872 12D AGACAGTAAA ATCCTAGGTTTC/------------ ATGGTGGGCC 3070 hom 132 het 46 0 44 6 ATCCTAGGTTTC 1 0 347687 CASAVA_Build 9 105912686 3I35M4D CCAACTCCCA ---TGTTTAAGGATCAACTAAATAATTGAATCTAAGTCTTTA/TGTTGTTTAAGGATCAACTAAATAATTGAATCTAAGTC---- TTTACCATGG 3070 hom 174 het 48 0 58 9 N/A 0 0 347688 CASAVA_Build 9 105917687 1I ACTGTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1490 het 1490 ref 41 30 5 6 A 11 12 347689 CASAVA_Build 9 105918140 3D ATGGCAGCAT CTC/--- CTTTTTCAAG 3070 hom 128 het 46 0 43 8 CTC 1 0 347690 CASAVA_Build 9 105918661 4D TCACATGACT ATCA/---- ATCAGGTGAT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 ATCA 2 1 347691 CASAVA_Build 9 105926382 1D AGAGATGAGG T/- TTTATCATGT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 4 3 347692 CASAVA_Build 9 105928660 4D CATGAGATTA TTAT/---- TTATTTAATT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 TTAT 2 1 347693 CASAVA_Build 9 105936696 9I TCACTTTGCT ---------/ATATTATAA ATATTATAAT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 ATATTATAA 1 2 347694 CASAVA_Build 9 105939773 1D CATAGCTCTT A/- ACCTGCTACC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 2 1 347695 CASAVA_Build 9 105950310 3D AAATTGACAC AAG/--- AACAGACAAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 6 AAG 1 0 347696 CASAVA_Build 9 105951045 15I2M2I GGAAACTGAG ---------------AA--/TGGTCGGCTGAGTTAAACT GCTGACACCT 3070 hom 72 het 28 0 25 6 N/A 0 0 347697 CASAVA_Build 9 105957096 1D AATTCTAACG A/- GAGCAAAAAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 0 347698 CASAVA_Build 9 105959548 1I CTACTGCTTA -/T TTGCATCCTC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 2 3 347699 CASAVA_Build 9 105960464 2I AAAATACTAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AT 5 6 347700 CASAVA_Build 9 105961698 1D TAGTAGACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 30 4 9 17 T 17 16 347701 CASAVA_Build 9 105966939 1D AAATTGTTTA T/- TTTTTTTGGG 3070 hom 88 het 33 0 31 3 T 8 7 347702 CASAVA_Build 9 105967355 3D TTAGGGTGGC AAG/--- AAGGACATAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 AAG 2 1 347703 CASAVA_Build 9 105969281 1I ACTTATTCTT -/A ATATTTTTCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 1 2 347704 CASAVA_Build 9 105969625 1I AATGACAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 10 11 347705 CASAVA_Build 9 105971768 4D TGAAAAAAAA ATAT/---- ATATATATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 9 AT 8 6 347706 CASAVA_Build 9 105972025 1D ACATCAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 137 het 54 0 46 8 A 10 9 347707 CASAVA_Build 9 105972426 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 444 hom 26 1 20 5 A 10 9 347708 CASAVA_Build 9 105972567 3D GGAAAATGGG ATT/--- ATATTATGTC 3070 hom 108 het 37 0 36 2 ATT 1 0 347709 CASAVA_Build 9 105973564 1D GTGGGTCCAG C/- AACTATCCAT 3070 het 3070 hom 35 8 18 9 C 1 0 347710 CASAVA_Build 9 105974913 1D CACAATTCAA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 76 het 30 0 26 6 T 8 7 347711 CASAVA_Build 9 105976628 2D CATTTATTAA AC/-- ACACATTATA 3070 hom 141 het 54 0 48 7 AC 3 2 347712 CASAVA_Build 9 105980755 1D AACAAAAAAA T/- CCTAAAATTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 1 0 347713 CASAVA_Build 9 105982282 1I GGTAGTAAAA -/G GGTAATAAAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 2 3 347714 CASAVA_Build 9 105984796 1I GAAATGGAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 7 8 347715 CASAVA_Build 9 105988389 1D ATGTGGGGGC T/- TTTTATTAAT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 5 4 347716 CASAVA_Build 9 105989080 2I TCCAACGCTG --/TA TGTTTTGATT 3070 hom 117 het 48 0 40 8 TA 0 1 347717 CASAVA_Build 9 105995840 4D ACTTTGAAAT TAAG/---- TAAGGGTAGA 3070 hom 154 het 57 0 52 7 TAAG 2 1 347718 CASAVA_Build 9 106006936 1I TTTCCCCCCC -/G CCCATTGCCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 0 1 347719 CASAVA_Build 9 106009639 2I GAATATCTAA --/TC TCTCTCTCTA 3070 het 2902 hom 31 8 15 8 TC 4 5 347720 CASAVA_Build 9 106010236 2I AACAAAGAAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 12 14 347721 CASAVA_Build 9 106011554 1I AAGCTGAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 41 2 25 14 T 11 12 347722 CASAVA_Build 9 106013612 1D AACAGTTATA T/- CTTGTATGCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 0 347723 CASAVA_Build 9 106039095 1D CTGGCTTTTG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 9 8 347724 CASAVA_Build 9 106044476 8D CCACCATGCC TGGCTAAT/-------- TTTTTGTATT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TGGCTAAT 1 0 347725 CASAVA_Build 9 106044608 1I AGCCACCGCG -/C CCCGGCCGAT 3070 hom 54 het 20 0 16 4 C 3 4 347726 CASAVA_Build 9 106047527 1D TTCGTTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 433 hom 26 1 17 8 A 16 15 347727 CASAVA_Build 9 106051142 1D GTAAAAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1220 hom 33 3 25 5 A 14 13 347728 CASAVA_Build 9 106053424 2I AGCAAATCTC --/TT TAAAAGTCAG 3070 hom 172 het 63 0 58 5 T 1 3 347729 CASAVA_Build 9 106053610 2I AAAATACCTC --/TT TTATTTTGCA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 2 4 347730 CASAVA_Build 9 106055449 2D ATTCAGGCCC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 34 0 23 11 T 11 9 347731 CASAVA_Build 9 106055634 3D CTATCAGTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 31 0 20 11 T 15 12 347732 CASAVA_Build 9 106055882 1I ATAATGTCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 10 347733 CASAVA_Build 9 106056222 1D AAAATCACAT A/- AAAAAAATGA 3070 hom 105 het 40 0 36 7 A 8 7 347734 CASAVA_Build 9 106057903 1D CCTGGGGTTG T/- TTGTGAATTT 3070 hom 64 het 25 0 22 3 T 3 2 347735 CASAVA_Build 9 106063181 3D GAATGCTATA TAT/--- TATATTTTAT 3070 hom 123 het 43 0 42 3 TAT 2 1 347736 CASAVA_Build 9 106064282 1D CTTAATTCAC T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 8 7 347737 CASAVA_Build 9 106067529 16I AAAGAATGTA ----------------/TGCTCTCAGACCACAG TGCAATTGAA 3070 hom 148 het 47 0 50 2 TGCTCTCAGACCACAG 0 1 347738 CASAVA_Build 9 106074123 2D TTCGTCAAAC AT/-- GTCAGCCCAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AT 1 0 347739 CASAVA_Build 9 106074608 26D CTTCATTTCA GGGTTTGTCAATTCCATTGCTTTCTT/-------------------------- TACAAATAGT 3070 hom 57 het 20 0 20 3 GGGTTTGTCAATTCCATTGCTTTCTT 1 0 347740 CASAVA_Build 9 106078522 2I ACTGAATTGC --/AA AAAAAAAAGT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 A 8 10 347741 CASAVA_Build 9 106091770 2D ACTGGAGATC AA/-- AGTTTCCTGA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 3 1 347742 CASAVA_Build 9 106098102 6I TTTTAATTTG ------/TTTAAA TTTAAGTAGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTTAAA 0 1 347743 CASAVA_Build 9 106155759 5I GCTGTTATTG -----/TTTAT TTTAATTTCA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTTAT 0 1 347744 CASAVA_Build 9 106161003 1D TTCAGGAGTT G/- GGGGGCTGAA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 G 6 5 347745 CASAVA_Build 9 106197876 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2768 het 260 hom 21 3 8 10 T 15 14 347746 CASAVA_Build 9 106205653 1D TGCCTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 434 hom 25 1 22 4 T 14 13 347747 CASAVA_Build 9 106208129 3I AATTAATAAA ---/TTG TTGTCATAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TTG 1 2 347748 CASAVA_Build 9 106209075 2I TCTTGTTGCT --/AC AGTCTTTTTT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AC 0 1 347749 CASAVA_Build 9 106217919 7I TGAACCAATG -------/TACATCT TACACATATT 3070 hom 107 het 43 0 33 10 TACATCT 0 1 347750 CASAVA_Build 9 106230446 2D ATCCCCCCCC CA/-- ACACTCTGTA 3070 hom 54 het 22 0 19 5 CA 1 0 347751 CASAVA_Build 9 106234458 1D AAATAGGCAA C/- CCTGCAGCAA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 C 3 2 347752 CASAVA_Build 9 106251999 1D CTCAAAAAAC T/- TTTTATACAT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 5 4 347753 CASAVA_Build 9 106260880 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 11 12 11 T 12 11 347754 CASAVA_Build 9 106278768 1D CTCCACACAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 92 het 37 0 29 8 A 10 9 347755 CASAVA_Build 9 106304169 1I ACAATCAAGT -/C AACCTAAATG 3070 hom 114 het 41 0 38 4 C 0 1 347756 CASAVA_Build 9 106307617 3D TGACATAAGC ATA/--- ATAACAATAA 3070 hom 69 het 30 0 24 7 ATA 2 1 347757 CASAVA_Build 9 106307767 2D TACACACATG CA/-- CACACACACA 3070 hom 70 het 36 0 24 14 CA 10 9 347758 CASAVA_Build 9 106318441 1D ATAAACTAAG A/- ACACAGACTA 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 A 2 1 347759 CASAVA_Build 9 106331162 1I GGTTAGGAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 A 8 9 347760 CASAVA_Build 9 106340277 1I TTCAAGCCAG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 8 9 347761 CASAVA_Build 9 106362641 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2156 het 584 hom 19 4 8 9 A 15 14 347762 CASAVA_Build 9 106367227 1I AGTTCTCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 10 11 347763 CASAVA_Build 9 106382996 2D ATGCAACTAC CT/-- GGAAAATACA 3070 het 3070 hom 66 28 34 5 CT 1 0 347764 CASAVA_Build 9 106384621 3I AGACCAGACC ---/AGA AGGACAGGAA 3070 hom 19 het 25 0 19 6 AGA 0 1 347765 CASAVA_Build 9 106384796 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 1370 hom 17 4 13 0 A 9 8 347766 CASAVA_Build 9 106384954 1D46M3I ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAGAAAAAATAGCTGTCATGAGAAAAGTCTGTATTTTT---/-AAAAAAAAAAGAAAAAATAGCTGTCATGAGAAAAGTCTGTATTTTTTTG TTGTTGTTGT 3070 het 842 hom 17 2 9 16 N/A 0 0 347767 CASAVA_Build 9 106389170 5D TTAGTCTTCC TAACA/----- TAAGTATAGA 3070 het 3070 hom 29 10 15 7 TAACA 1 0 347768 CASAVA_Build 9 106397092 1I TTTTTTTAAA -/T TTTTGTATAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 4 5 347769 CASAVA_Build 9 106397934 1D ATTCTCTTTT C/- AGCAAATTGC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 C 1 0 347770 CASAVA_Build 9 106398469 4D ATGAAAAGGT TATC/---- TATACTAATT 3070 het 3070 ref 47 25 19 8 TATC 1 0 347771 CASAVA_Build 9 106400590 1D TCTCAGTAGG T/- GTTTTACTGC 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 1 0 347772 CASAVA_Build 9 106402648 1I AATATCAGAT -/A AAAAATGTGA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 5 6 347773 CASAVA_Build 9 106402735 5D AGAAAAGTAC TCATT/----- TCTATAACAA 1762 het 1762 ref 19 10 4 6 TCATT 1 0 347774 CASAVA_Build 9 106402895 2D CCAGGTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 16 1 9 6 A 12 10 347775 CASAVA_Build 9 106403823 1D TAGGAGCCCC T/- GTTTTTGTAA 1334 het 1334 ref 18 8 5 5 T 1 0 347776 CASAVA_Build 9 106403853 1I TATCTTTACT -/A AAAAAAAAAA 2409 hom 24 het 15 0 8 7 A 13 14 347777 CASAVA_Build 9 106407214 4D GATTGATGAT GTTA/---- TTCCTGCAGA 3070 het 3070 ref 44 30 9 5 GTTA 1 0 347778 CASAVA_Build 9 106407486 2D AAGCTCACTA GC/-- GTGGAGGGAA 3070 het 3070 ref 37 21 9 8 GC 1 0 347779 CASAVA_Build 9 106409068 1I ACAGGTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1232 hom 31 3 16 12 A 15 16 347780 CASAVA_Build 9 106410945 1I AATTTTCCTC -/A GATGAGAATG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 347781 CASAVA_Build 9 106413165 1D TAGGATTTTA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 T 8 7 347782 CASAVA_Build 9 106413238 1D AAACCTTATC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 29 8 18 3 T 8 7 347783 CASAVA_Build 9 106413996 1D TGTTCAATTG C/- CTTTGCATGC 3070 het 3070 hom 46 18 23 7 C 2 1 347784 CASAVA_Build 9 106414111 1D CTCAAATCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 126 hom 40 1 35 5 A 10 9 347785 CASAVA_Build 9 106416091 4D TGAAATGTAT TATA/---- TATATATACT 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 TA 6 4 347786 CASAVA_Build 9 106416488 10D ACACACACAC ACTACACACA/---------- CACACACACA 3070 het 1302 hom 19 7 9 5 ACTACACACA 1 0 347787 CASAVA_Build 9 106421797 1I GGTCTCGCTA -/T TTTTCCCAGG 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 4 5 347788 CASAVA_Build 9 106428754 1I ATAGGTCATA -/T TTGTATAAAA 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 2 3 347789 CASAVA_Build 9 106429760 1I CACGTTAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 9 10 347790 CASAVA_Build 9 106435856 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTAGTA 3070 het 3070 ref 18 7 9 2 T 6 7 347791 CASAVA_Build 9 106447434 1D GAAACCCCTC T/- TTTTTTTTTT 2859 hom 21 het 15 0 8 7 T 13 12 347792 CASAVA_Build 9 106447909 1D CCATTTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 277 hom 17 2 12 3 A 15 14 347793 CASAVA_Build 9 106454942 2D ACACAGAGAA AG/-- AGAGAGGTAC 3070 hom 79 het 31 0 27 4 AG 4 3 347794 CASAVA_Build 9 106508626 1D GGAAGGATCC A/- AAAATCAACA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 5 4 347795 CASAVA_Build 9 106535529 6I AAAGGACTAC ------/TGAGAA TAAGTTTTAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TGAGAA 0 1 347796 CASAVA_Build 9 106542225 3I AAGTTTTTGT ---/TTG TTTGTTTGTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TTG 0 1 347797 CASAVA_Build 9 106552005 3I GAAACTAATA ---/ATC AGAAAATTTT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 ATC 0 1 347798 CASAVA_Build 9 106554579 1D TAAATGCCTC A/- ATCAAGTAAG 3070 het 3070 hom 62 25 35 2 A 2 1 347799 CASAVA_Build 9 106558024 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 11 12 347800 CASAVA_Build 9 106558755 3D AAATAAAAGC CTT/--- ATTTTTATTG 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 CTT 1 0 347801 CASAVA_Build 9 106561437 2D CACCACTGAA AT/-- AGTTTTCTAC 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 AT 1 0 347802 CASAVA_Build 9 106562894 1D CCTGACCTTT A/- AAAAAAAAAA 1231 het 1231 ref 38 20 5 13 A 15 14 347803 CASAVA_Build 9 106569168 1I GATAAGATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 10 11 347804 CASAVA_Build 9 106574410 9D GTCATTCAAA ATTAATATC/--------- ATTGACATAG 3070 het 3070 hom 32 15 17 2 ATTAATATC 1 0 347805 CASAVA_Build 9 106578499 1I ATGTTTTTGT -/C CCCCCCAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 6 7 347806 CASAVA_Build 9 106599677 1I TTTTGAAAAC -/G GGACATTCAC 3070 hom 138 het 52 0 45 7 G 2 3 347807 CASAVA_Build 9 106604392 2D ATTTTGCCTC AG/-- AGAAGTTACA 3070 hom 165 het 60 0 55 6 AG 2 1 347808 CASAVA_Build 9 106708852 1D AAACCAAAAT C/- AAAAAAAAAA 2587 het 507 hom 24 6 10 8 C 1 0 347809 CASAVA_Build 9 106716059 5D CTGCCAACAC GCCCG/----- GCTAATTTTT 666 hom 7 het 3 0 2 1 GCCCG 1 0 347810 CASAVA_Build 9 106719679 1I CAACATGACG -/A AACCCCATCT 3070 het 2041 hom 17 6 9 2 A 2 3 347811 CASAVA_Build 9 106723199 1I TACTTATTTA -/G GAAGAACTAA 3070 hom 120 het 46 0 40 6 G 1 2 347812 CASAVA_Build 9 106728119 1I TACGGCCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 A 10 11 347813 CASAVA_Build 9 106737610 1D TTCTCCCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 25 0 22 3 A 11 10 347814 CASAVA_Build 9 106740540 1D AGAGTTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 A 11 10 347815 CASAVA_Build 9 106744157 1I GTTGTTGCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 T 9 10 347816 CASAVA_Build 9 106747877 1I ACACCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1760 hom 23 6 12 5 A 11 12 347817 CASAVA_Build 9 106753695 2D CTCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2609 het 2609 ref 27 14 8 5 A 14 12 347818 CASAVA_Build 9 106758004 1D AAACCCCGTC T/- CTACTAAAAA 3070 het 1893 hom 14 5 8 1 T 1 0 347819 CASAVA_Build 9 106761180 3I GAAGTATTAC ---/GAA GATGTGAGGT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 GAA 0 1 347820 CASAVA_Build 9 106763173 14D AAATGGAAAC AAGAAAAAAAGAAA/-------------- AAGAAAAAAA 2105 het 2105 ref 17 12 5 4 AAGAAAAAAAGAAA 1 0 347821 CASAVA_Build 9 106769723 3I GATAGTAAAC ---/GTA ATCAACCACA 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 GTA 0 1 347822 CASAVA_Build 9 106772528 1I TTATACAAAG -/T TTTGGAACAG 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 T 3 4 347823 CASAVA_Build 9 106776204 1D ATATAATTTT C/- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 C 1 0 347824 CASAVA_Build 9 106777638 1D ATTCTCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 11 10 347825 CASAVA_Build 9 106779573 1D TTTATAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 22 0 T 11 10 347826 CASAVA_Build 9 106783538 1D AGCCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3056 hom 20 9 8 4 A 11 10 347827 CASAVA_Build 9 106785963 5I AAAGTGGCTG -----/TTATT TTAATTTTGC 3070 hom 85 het 35 0 28 7 TTATT 0 1 347828 CASAVA_Build 9 106799726 4I TAGCAAAAAA ----/AAAC AAAAAAAAAA 3070 het 1415 hom 33 11 17 5 AAAC 0 1 347829 CASAVA_Build 9 106803548 1I AATTTGAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 168 hom 24 1 17 6 T 9 10 347830 CASAVA_Build 9 106804329 1I CTGATAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3059 het 2584 hom 25 7 10 8 A 11 12 347831 CASAVA_Build 9 106808590 1D TGCCAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 A 10 9 347832 CASAVA_Build 9 106811659 2I CTCACCCTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 TG 8 9 347833 CASAVA_Build 9 106814765 1D GTCTTTGCCA G/- GTTTTGGTAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 3 G 2 1 347834 CASAVA_Build 9 106817396 1I GTTACTACTT -/A AGTTATTTCT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 1 2 347835 CASAVA_Build 9 106821666 1D CTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2604 het 2201 hom 25 9 10 6 T 15 14 347836 CASAVA_Build 9 106822652 1I TTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2939 het 2939 ref 20 11 7 2 A 11 12 347837 CASAVA_Build 9 106826402 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAT 1202 het 1202 ref 8 5 3 1 A 11 9 347838 CASAVA_Build 9 106827508 6D AGCTACTTGG GAGGCT/------ GAGGCAGGAG 2968 het 2131 hom 12 5 7 1 GAGGCT 1 0 347839 CASAVA_Build 9 106828159 2I CTTGTGTAAC --/AT AGAAAAATTA 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 AT 0 1 347840 CASAVA_Build 9 106830423 7I GGGCATGGTA -------/GCACATG GCACATGCCT 3070 hom 30 het 15 0 11 4 GCACATG 1 2 347841 CASAVA_Build 9 106832746 1I ACATGTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 15 6 T 11 12 347842 CASAVA_Build 9 106833464 1I CTGTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 37 0 26 11 T 11 12 347843 CASAVA_Build 9 106836163 1D GATCCAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 12 11 347844 CASAVA_Build 9 106838132 1I AAATCATTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3061 hom 23 9 9 5 T 9 10 347845 CASAVA_Build 9 106839342 1I GAAAGAAAAC -/A AGTGAATTAA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 1 2 347846 CASAVA_Build 9 106843503 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 2969 het 2969 ref 21 11 8 2 A 10 11 347847 CASAVA_Build 9 106847690 1D CTGTTGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 29 3 14 12 T 15 14 347848 CASAVA_Build 9 106849730 3D ACAGAGAAGA AAC/--- AACAACATTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 6 AAC 3 2 347849 CASAVA_Build 9 106849898 1D ACCATTCCCC A/- ACATCCAAAG 3070 het 3070 hom 47 20 22 6 A 2 1 347850 CASAVA_Build 9 106851410 1D CCATATCCAC A/- AGGTCTTTGA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 2 1 347851 CASAVA_Build 9 106853829 1D TCGACAATAA T/- TTTTTTTTTT 2299 het 176 hom 21 4 8 9 T 17 16 347852 CASAVA_Build 9 106855805 2D AGCTTCGGTT AC/-- AGAGTGAGAC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 AC 1 0 347853 CASAVA_Build 9 106856473 1I GTTATGTATG -/T TTATGTTTAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 2 3 347854 CASAVA_Build 9 106857021 2D CATTAAATAT AG/-- AGTCTTTTAA 3070 het 3070 hom 42 19 20 5 AG 2 1 347855 CASAVA_Build 9 106857836 44D ATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATATAGATAGATAG/-------------------------------------------- ATAGTTTGAT 2928 hom 18 het 7 0 7 3 ATATATATATATATATATATATATATATATATATAGATAGATAG 1 0 347856 CASAVA_Build 9 106869835 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 1593 het 127 hom 7 1 5 1 A 9 10 347857 CASAVA_Build 9 106870696 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1609 het 1550 hom 24 6 8 10 T 11 10 347858 CASAVA_Build 9 106878354 1D TTGTAATATC T/- TTTTTTTTTT 2920 het 2242 hom 31 12 10 9 T 15 14 347859 CASAVA_Build 9 106883808 1I AAAGATGTTC -/A GTGCAACTGA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 A 0 1 347860 CASAVA_Build 9 106892853 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1535 het 554 hom 17 4 5 8 A 19 18 347861 CASAVA_Build 9 106954389 1I TTTTCAGGTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 T 8 9 347862 CASAVA_Build 9 106965271 4I TCCCCAGTTG ----/CACA CACTGGGGAA 3070 het 3070 hom 38 10 22 6 CA 1 3 347863 CASAVA_Build 9 106967508 1D AAAACAAAAC A/- AAACAAACAG 503 het 503 ref 27 13 4 10 A 4 3 347864 CASAVA_Build 9 106967662 1I CATATAGTAC -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 6 7 347865 CASAVA_Build 9 106972487 1D CTAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1036 hom 20 4 14 2 A 11 10 347866 CASAVA_Build 9 106973471 1D ATTTAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1368 hom 38 3 28 8 A 11 10 347867 CASAVA_Build 9 106975721 2I GGGAGCAGAT --/TC TGTGTCCGAG 3070 hom 101 het 36 0 32 4 TC 0 1 347868 CASAVA_Build 9 106976227 1I GAAGCAATAC -/T CATACAGCCT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 1 347869 CASAVA_Build 9 106976312 3I CGAAGGTTAG ---/TTC TTCTTATTAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTC 1 2 347870 CASAVA_Build 9 106977289 1I AATACAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 464 hom 36 1 13 22 T 14 15 347871 CASAVA_Build 9 106978528 2D GTAAGGAAAC TG/-- AAACACATTT 3070 het 3070 ref 37 22 12 8 TG 1 0 347872 CASAVA_Build 9 106984318 1D TATTAAAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 A 9 8 347873 CASAVA_Build 9 106988926 5D TTGGTCTGTG TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 hom 81 het 44 0 26 18 TGTTT 4 3 347874 CASAVA_Build 9 106990797 19I ATGTGACACC -------------------/CTGGCCATTCGAGTTACTA GAGTACTTGC 3070 hom 90 het 33 0 29 6 CTGGCCATTCGAGTTACTA 0 1 347875 CASAVA_Build 9 107001843 1D CAATGTTATA G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 G 5 4 347876 CASAVA_Build 9 107002728 1I27M5I GCTGAAAATA -TGTCTTCATTACAGTAAATGTAAAAAA-----/TTGTCTTCATTACAGTAAATGTAAAAAATACTT TATAAGGATA 3070 het 3070 hom 33 16 22 2 N/A 0 0 347877 CASAVA_Build 9 107003615 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 2816 het 2278 hom 30 8 13 9 A 15 16 347878 CASAVA_Build 9 107009774 1I CTGAATCTTT -/A AAAAAAAAAA 2917 het 2917 ref 41 18 11 12 A 12 13 347879 CASAVA_Build 9 107013280 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 27 8 16 3 A 7 6 347880 CASAVA_Build 9 107013453 1I CAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2873 hom 23 9 12 2 A 9 10 347881 CASAVA_Build 9 107013602 2D TTGATTACTA TC/-- TCTGATTTAC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TC 2 1 347882 CASAVA_Build 9 107014633 4D GAGTGAAAAG AAAC/---- AAACATTTAT 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 AAAC 2 1 347883 CASAVA_Build 9 107016162 1D CTTTAGGGGG C/- CAAGATGGGC 3070 het 1426 hom 26 6 13 7 C 2 1 347884 CASAVA_Build 9 107032694 1I TCCTATATAA -/T GATGCGGAAA 3070 het 3070 hom 56 22 29 5 T 0 1 347885 CASAVA_Build 9 107037728 1I TCAAGACTAT -/C TTTTATATCT 3070 het 3070 ref 39 25 10 4 C 0 1 347886 CASAVA_Build 9 107042693 1D TTTTTTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 13 12 347887 CASAVA_Build 9 107045877 1I CTTGAGTCTT -/A ACTGATTTAG 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 1 2 347888 CASAVA_Build 9 107046277 1D TCCTCTGGAG A/- AAAAAAACAG 2379 het 2379 ref 30 13 6 11 A 8 7 347889 CASAVA_Build 9 107058668 1I CTGGAAACTC -/T TTTTTTTTTT 2774 het 433 hom 23 2 11 10 T 15 16 347890 CASAVA_Build 9 107070858 1I GCCTTGGCCT -/C CCAAAGTGCT 2919 het 1362 hom 15 4 9 2 C 2 3 347891 CASAVA_Build 9 107084343 2D TCTTGGTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 13 11 347892 CASAVA_Build 9 107089798 1I AGCTGATCAT -/A CTACTGTTTA 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 A 0 1 347893 CASAVA_Build 9 107090391 1D TAATTTGTAA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 24 12 9 3 T 8 7 347894 CASAVA_Build 9 107099420 1D TAAAGTTGTG T/- TTTTTCATCT 3070 het 3070 hom 40 12 28 0 T 6 5 347895 CASAVA_Build 9 107111289 3D CACGTTCCTA TTG/--- TTCTTTGAAT 3070 het 3070 ref 51 28 21 2 TTG 1 0 347896 CASAVA_Build 9 107123917 1I TATTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 A 12 13 347897 CASAVA_Build 9 107169041 1D ATGCTGATAC T/- TTTTTTTTTT 1714 het 1714 ref 40 25 5 10 T 13 12 347898 CASAVA_Build 9 107201845 6I ATGTTTATAA ------/TATAGT TAGTGAAGAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 TATAGT 0 1 347899 CASAVA_Build 9 107202590 5I ACGCCATCTC -----/AAAAA AAAAAAAGAA 3070 hom 42 het 15 0 14 1 A 7 12 347900 CASAVA_Build 9 107204791 3I GTAGACAAAC ---/CTT CTCTCAATGA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTT 0 1 347901 CASAVA_Build 9 107205969 1D GCGGTCAGTA G/- GGATCAGATC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 3 2 347902 CASAVA_Build 9 107208316 2D CTTCAGTGGC CA/-- CACACACACA 934 het 934 ref 44 32 3 9 CA 7 6 347903 CASAVA_Build 9 107251881 16I TTACTTTAAT ----------------/GAGGAATCAGGACATG GAGTTGTGAC 3070 hom 126 het 43 0 43 1 GAGGAATCAGGACATG 0 1 347904 CASAVA_Build 9 107265257 1I AAAAAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 23 1 22 0 A 10 11 347905 CASAVA_Build 9 107271481 1I CTATTTTACA -/T TCCTACCAGC 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 1 2 347906 CASAVA_Build 9 107271805 1D GATTCACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1222 hom 46 7 31 8 T 15 14 347907 CASAVA_Build 9 107299370 1I TTGATTTGCT -/A ATATTTTGTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 1 2 347908 CASAVA_Build 9 107313295 2I GTACTATCTA --/TT TTTTTTTTTT 2213 het 105 hom 39 1 14 24 T 12 14 347909 CASAVA_Build 9 107314331 1I TTTATGTGGT -/C TCTTTTCCCT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 0 1 347910 CASAVA_Build 9 107317891 1I CTGCAGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 27 1 15 11 T 15 16 347911 CASAVA_Build 9 107333839 2I CATTTTTTCT --/AG GGGAGAATGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AG 0 1 347912 CASAVA_Build 9 107335821 1D CCGCGTGCAG C/- CCCCCCGTCC 2663 hom 7 het 13 0 8 5 C 7 6 347913 CASAVA_Build 9 107349242 1I TTCTTTACCT -/A ACTGCACTAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 1 2 347914 CASAVA_Build 9 107354307 2I CCTTTAATGA --/AC TACTTATGAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AC 0 1 347915 CASAVA_Build 9 107365485 2D GCAAGGGGTC AG/-- GGAATTCCCT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AG 1 0 347916 CASAVA_Build 9 107374333 2D CTTGAGACTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 30 het 21 0 10 11 TA 10 9 347917 CASAVA_Build 9 107375341 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 20 1 14 5 A 11 12 347918 CASAVA_Build 9 107384382 1I TAACCTTGAA -/C TCTGGGGCTC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 C 0 1 347919 CASAVA_Build 9 107401035 2D ACCCTAAAAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 70 het 47 0 24 24 AC 10 9 347920 CASAVA_Build 9 107408812 4I ATATATGTTT ----/TCTC TCTCTCTATC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 TC 3 5 347921 CASAVA_Build 9 107414606 1I TCTTCCAGGG -/T TTTTATAGTT 3070 hom 77 het 30 0 26 4 T 4 5 347922 CASAVA_Build 9 107417128 1D TGGAACTATA G/- GCGCGGGCCA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 G 2 1 347923 CASAVA_Build 9 107458827 1I TGGTTTGCAA -/G GGGGGAGCAA 3070 hom 63 het 24 0 19 5 G 5 6 347924 CASAVA_Build 9 107459219 1I ATGCTTGATA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 52 het 44 1 39 4 T 8 9 347925 CASAVA_Build 9 107460483 53I ACTAAATGCA -----------------------------------------------------/ATTTTCCTTTGATTTAATAAGTACTTCAGTCATTTTCCAGTGACCTCTACTTT GTGCTTTTCC 3070 hom 87 het 23 0 29 5 ATTTTCCTTTGATTTAATAAGTACTTCAGTCATTTTCCAGTGACCTCTACTTT 0 1 347926 CASAVA_Build 9 107461338 2D AAACTCCGTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2663 hom 30 12 12 7 A 14 12 347927 CASAVA_Build 9 107465205 1D AATTCTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2595 hom 30 9 16 6 A 13 12 347928 CASAVA_Build 9 107467077 1D TGAATGTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 121 het 51 0 39 12 T 11 10 347929 CASAVA_Build 9 107479574 1I TTGTTTTTTT -/C TTTGAGACAA 3070 het 2214 hom 21 7 8 6 C 0 1 347930 CASAVA_Build 9 107496194 1I TCTTCGTTTC -/G GAACTGCTCT 3070 het 3070 ref 52 24 24 4 G 1 2 347931 CASAVA_Build 9 107500219 1I TAGCGTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 T 12 13 347932 CASAVA_Build 9 107501831 1I GTGGGATTAA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 T 6 7 347933 CASAVA_Build 9 107508792 3D GTCTTTCTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 497 het 497 ref 34 20 6 9 CTC 1 0 347934 CASAVA_Build 9 107510133 1D TACTTCTGTT C/- CTATAATACT 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 C 2 1 347935 CASAVA_Build 9 107510957 1I TATCTGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 11 12 347936 CASAVA_Build 9 107513543 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 A 9 8 347937 CASAVA_Build 9 107518724 3I14M6D4M4I6M5I5M6I5M3I AACAACATGA ---ATTTGAACTGTGTGAATCCACTTA----TGTGCA-----GATTT------TCTTC---/CAGAGCTACCCTGTCTG------CTGAGAGCTGAGCACGGAGGAGTTACCCTCTCTGCAGG TGCCTCTGCC 3070 het 3070 ref 51 35 25 7 N/A 0 0 347938 CASAVA_Build 9 107519525 1I AATGTTTTTA -/G AAACACTATT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 G 0 1 347939 CASAVA_Build 9 107519763 1I TAAAACTACA -/T TAAAAAAGCT 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 T 1 2 347940 CASAVA_Build 9 107522441 5D CATTATAGCC TTTAT/----- TTTATATTAT 3070 het 3070 ref 29 16 11 5 TTTAT 2 1 347941 CASAVA_Build 9 107525511 2D TGTAATTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 17 6 T 16 14 347942 CASAVA_Build 9 107534763 1D CTGTTCCATT G/- GTCTGTATCT 1452 het 1452 ref 8 4 3 1 G 2 1 347943 CASAVA_Build 9 107536968 1D TAGTTGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1724 hom 33 6 10 17 T 15 14 347944 CASAVA_Build 9 107539448 2D GCAGGGAGTA AG/-- AGTCCCAGAG 3070 het 3070 ref 47 26 18 4 AG 2 1 347945 CASAVA_Build 9 107543077 2I CCGATATGGG --/TA AACATGTTCT 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 TA 0 1 347946 CASAVA_Build 9 107544222 7D ACAGGATTAA ATGAAAG/------- AAGGCTGTCA 3070 het 3070 ref 37 21 14 3 ATGAAAG 1 0 347947 CASAVA_Build 9 107550588 1I CGAAGATGAT -/A ACTGTCTCAT 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 1 2 347948 CASAVA_Build 9 107551728 1I TTTTAGTATA -/T TTCATGGATT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 2 3 347949 CASAVA_Build 9 107557585 3D AATAGATAAT AAA/--- AAAGAAGTGT 3070 het 3070 ref 45 21 22 2 A 6 3 347950 CASAVA_Build 9 107571319 2D TTCCTCAAAC AT/-- ATTAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AT 2 1 347951 CASAVA_Build 9 107571827 3I GAACTTTAAT ---/AGC AGTTTGTCTA 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 AGC 0 1 347952 CASAVA_Build 9 107576248 1D ATTGTGCTAA T/- TTTTCTATGT 3070 het 3070 ref 39 22 14 5 T 5 4 347953 CASAVA_Build 9 107579150 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTGT 2187 het 91 hom 11 1 7 3 T 9 8 347954 CASAVA_Build 9 107586624 1I CCTTTGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 T 13 14 347955 CASAVA_Build 9 107586923 22I CATCACCCAG ----------------------/GTACTGAGCACGGTATCCAATA GGTAGTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 GTACTGAGCACGGTATCCAATA 0 1 347956 CASAVA_Build 9 107595799 1D GTACACCCCC T/- GCTATGTTGG 3070 het 3070 hom 42 19 17 7 T 1 0 347957 CASAVA_Build 9 107598907 1D CAGGAAGGAG T/- TACACCCTGT 3070 het 3070 hom 47 23 19 6 T 2 1 347958 CASAVA_Build 9 107600336 2D GAGGTGTAGA CT/-- CTCTGCGATA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 CT 3 2 347959 CASAVA_Build 9 107602320 3D ATATTGGAAG TAA/--- TGTCAACCTC 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 TAA 1 0 347960 CASAVA_Build 9 107604254 1D GGGTAATATC T/- TTTTTTTTTT 2184 het 1000 hom 32 8 9 16 T 17 16 347961 CASAVA_Build 9 107604747 1D ACAATATCTC G/- GGGGGGGTGT 3070 het 2479 hom 28 7 10 11 G 8 7 347962 CASAVA_Build 9 107609221 1D ATCATTGTCT C/- CCCCCCCATG 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 C 8 7 347963 CASAVA_Build 9 107620810 4I TATTCAGGGG ----/GTGA GTGAGTGGAT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 GTGA 1 2 347964 CASAVA_Build 9 107624133 1I TCAATATTAA -/T TTTTACTATC 2237 hom 12 het 6 0 5 1 T 4 5 347965 CASAVA_Build 9 107628713 1D41M2D TCATTGGGTC TTTTTTTTTAAATCTATTTCAGCCACTCTATGTCTTTTGATCAG/-TTTTTTTTAAATCTATTTCAGCCACTCTATGTCTTTTGATC-- AGAGTTTAGT 3070 het 3070 hom 36 17 18 12 N/A 0 0 347966 CASAVA_Build 9 107636508 1D GTAAAAGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 11 10 347967 CASAVA_Build 9 107646293 7D ATGCATCCTA CGGGCTG/------- CGGGCTGCGG 3070 hom 64 het 23 0 22 5 CGGGCTG 3 2 347968 CASAVA_Build 9 107659881 1I32M1D CCCTTTTCTA -TTACTAGAAAGCATTTCAAAAAAAGATAGAAGA/TTTACTAGAAAGCATTTCAAAAAAAGATAGAAG- TTTTTTTTGT 3070 hom 59 het 36 1 44 6 N/A 0 0 347969 CASAVA_Build 9 107661793 1I AAAGAGAAAG -/A AAAAAAGGGG 3070 hom 68 het 29 0 21 8 A 6 7 347970 CASAVA_Build 9 107663815 2D AACAACAACA AC/-- AACAACAACA 2374 hom 20 het 32 0 6 26 AC 1 0 347971 CASAVA_Build 9 107665248 2I CTAAGAACTC --/AA AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 8 10 347972 CASAVA_Build 9 107666897 1I GTTAAAAATG -/A TGTATAATTT 3070 hom 148 het 57 0 50 7 A 0 1 347973 CASAVA_Build 9 107679157 2D TGAGAAAAAC AT/-- GAGATCAATT 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 AT 1 0 347974 CASAVA_Build 9 107679498 1D AATGTCTATT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 9 8 347975 CASAVA_Build 9 107685300 1D CAGACAGATT A/- AAGTAAAAAC 3070 hom 95 het 37 0 31 8 A 3 2 347976 CASAVA_Build 9 107696195 1I TATATCTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 10 11 347977 CASAVA_Build 9 107696839 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 A 12 11 347978 CASAVA_Build 9 107710758 1I GAAATCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 29 1 20 8 T 12 13 347979 CASAVA_Build 9 107730942 1I CTGCCATGAC -/T TTTTTGGCTG 2956 het 2956 ref 26 14 7 5 T 5 6 347980 CASAVA_Build 9 107739393 1D ACAAAAAAAA T/- TAGTCAGGCA 3070 het 1769 hom 16 4 12 1 T 2 1 347981 CASAVA_Build 9 107741053 1D ATTTTCAGTC T/- TTTCTTGATA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 4 3 347982 CASAVA_Build 9 107745535 1D CTCAGGATAC A/- AAAATCAATG 3070 het 3070 hom 53 19 30 4 A 5 4 347983 CASAVA_Build 9 107756073 1I GTTCTGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 30 1 21 8 T 10 11 347984 CASAVA_Build 9 107760395 1I TAAGATTTTG -/T TTTTTTTTTT 2541 het 402 hom 19 1 10 8 T 10 11 347985 CASAVA_Build 9 107766614 1D CTTTTAAGAC A/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 34 16 17 2 A 1 0 347986 CASAVA_Build 9 107768748 1D TTTGATTCTT C/- CCCCCAAACA 3070 het 3070 hom 47 16 28 4 C 6 5 347987 CASAVA_Build 9 107775033 1I AAATAAAATG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 220 hom 47 1 37 9 T 9 10 347988 CASAVA_Build 9 107796041 8I CATTTTGTCT --------/GTGAAGAG GTGAAGAGTA 3070 het 3070 hom 53 18 28 7 GTGAAGAG 1 2 347989 CASAVA_Build 9 107802227 2D AAGTTTAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 14 6 T 13 11 347990 CASAVA_Build 9 107812746 1I GTTTTAGATG -/T GAGCATTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 0 1 347991 CASAVA_Build 9 107816664 1D CTATCCTACC T/- TTTTCCACTT 3070 het 3070 hom 52 26 23 3 T 5 4 347992 CASAVA_Build 9 107826677 1I TAAAAAACTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 9 10 347993 CASAVA_Build 9 107849743 1D TTAAAAGTAA T/- TTTTTTTTTT 1408 het 1408 ref 32 26 3 3 T 12 11 347994 CASAVA_Build 9 107859665 2I TCATATAAAC --/TA AGTGAGCAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TA 0 1 347995 CASAVA_Build 9 107864683 1D ATAATGATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 17 12 T 11 10 347996 CASAVA_Build 9 107903209 1I CTTTGAAGCC -/T TTAAGTTAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 2 3 347997 CASAVA_Build 9 107905979 4D GTGTTAGTGG CTAA/---- CTAAGAGTTA 3070 hom 95 het 35 0 30 10 CTAA 2 1 347998 CASAVA_Build 9 107909305 3D TTTTTTTTTT GTA/--- TTTTTGTATT 388 hom 3 het 16 0 6 10 GTA 1 0 347999 CASAVA_Build 9 107917104 2D ATCAGCAAAC TG/-- TTTCAGAGAA 3070 hom 108 het 40 0 37 7 TG 1 0 348000 CASAVA_Build 9 107936580 1I GGATATAAAA -/T TTTTGCTGAG 3070 hom 74 het 30 0 24 6 T 4 5 348001 CASAVA_Build 9 107958418 1I ATTTTAAATG -/A AAAAACTGAG 3070 het 3070 ref 60 30 25 5 A 5 6 348002 CASAVA_Build 9 107959973 2D TTAATCTCTT TC/-- TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 36 11 22 5 TC 2 1 348003 CASAVA_Build 9 107961177 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 9 8 348004 CASAVA_Build 9 107975316 3D22M1I TTTCTCTCTT CTCCTTTTTATTTTCTCTCTTCTCC-/---CTTTTTATTTTCTCTCTTCTCCT TCTTATTTTT 3070 het 3070 hom 25 15 15 5 N/A 0 0 348005 CASAVA_Build 9 107976667 4D CAAGAAGGCA TTGT/---- TTGTGCCTTA 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 TTGT 2 1 348006 CASAVA_Build 9 107976841 1I CCAATTAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 T 11 12 348007 CASAVA_Build 9 107989948 1I GGCTTTTTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 16 17 9 A 8 9 348008 CASAVA_Build 9 108000969 1D TACACCCAGC A/- ATGGGATTGC 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 2 1 348009 CASAVA_Build 9 108018323 2I GATGCTGTGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 14 17 20 TG 8 9 348010 CASAVA_Build 9 108022256 2I CTTTAGAGAG --/TT TTTTTTTTTT 1770 het 1770 ref 27 11 9 7 T 14 16 348011 CASAVA_Build 9 108058798 1D CATTCCTGGG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 A 8 7 348012 CASAVA_Build 9 108059252 1I TCTTCTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 T 9 10 348013 CASAVA_Build 9 108071134 2I TTATGTGTGT --/AA CTAAATTGAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 2 348014 CASAVA_Build 9 108096977 5D AGGGATAAAT AACTA/----- AAGAAAAAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AACTA 1 0 348015 CASAVA_Build 9 108106234 1D CGGGGACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 T 11 10 348016 CASAVA_Build 9 108123848 1I TGGAAGCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 T 9 10 348017 CASAVA_Build 9 108124951 1I TATTCTGTCT -/C CAGCAGGGTA 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 C 1 2 348018 CASAVA_Build 9 108132946 1I AATTCAACTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 8 9 348019 CASAVA_Build 9 108134104 7I TAAGGCAACC -------/TACCTTA GTAACAAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 TACCTTA 0 1 348020 CASAVA_Build 9 108140601 1I ACTTTTTATC -/T TTGTCAAACT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 2 3 348021 CASAVA_Build 9 108141575 1I AATTCCTTTC -/T TGTTTTAAAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 348022 CASAVA_Build 9 108149837 1I AAAAGACATT -/A AAAGACATTT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 A 3 4 348023 CASAVA_Build 9 108151186 1D AATTTGCTGC A/- AAAGTCATTA 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 A 4 3 348024 CASAVA_Build 9 108163412 4D TCTCTTTGAC CTAA/---- CTGATTTTAT 3070 het 3070 ref 46 23 19 5 CTAA 1 0 348025 CASAVA_Build 9 108165395 1I CTCTCCAATT -/A AAAAAAAAAA 2509 het 2509 ref 29 15 6 8 A 10 11 348026 CASAVA_Build 9 108170922 1I TAATTTGATG -/T TTTTTTTTTT 2065 het 2065 ref 29 9 8 12 T 13 14 348027 CASAVA_Build 9 108173606 1D TCCAATATTG A/- AAAAACCAGT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 6 5 348028 CASAVA_Build 9 108174511 1I TTTACTGTGA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 7 8 348029 CASAVA_Build 9 108174700 1D TGTTCAATTA T/- TTTTTTTTTA 1821 het 770 hom 16 4 7 5 T 10 9 348030 CASAVA_Build 9 108180721 1I GATCTGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 11 12 348031 CASAVA_Build 9 108199457 1D AGGAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 31 7 A 13 12 348032 CASAVA_Build 9 108206989 2I ACAATGAGAT --/TG ACCACTCCAT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 TG 0 1 348033 CASAVA_Build 9 108210194 1I ATTAAGAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 8 9 348034 CASAVA_Build 9 108211250 1I AGATTAAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 37 1 31 5 A 10 11 348035 CASAVA_Build 9 108212398 1D TCCTAAGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 19 1 14 5 A 13 12 348036 CASAVA_Build 9 108220798 4D TACATATATT ACAC/---- ACACACACAC 1892 het 1892 ref 26 16 7 3 AC 10 8 348037 CASAVA_Build 9 108282479 6I CCATGACCCA ------/GAGGAT GAGGATTAAG 3070 het 3070 ref 55 30 18 7 GAGGAT 1 2 348038 CASAVA_Build 9 108287286 5I GGCTCCCAGT -----/TACTC TACTCTGTAT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 TACTC 1 2 348039 CASAVA_Build 9 108299819 1I TATTTATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 10 11 348040 CASAVA_Build 9 108306141 1I TTTGTGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 10 10 T 13 14 348041 CASAVA_Build 9 108314664 4I GTGACAGAGT ----/AAGA AAGACTCTCT 1924 het 1924 ref 24 5 7 13 AAGA 1 2 348042 CASAVA_Build 9 108327885 4I AAAAATAAAC ----/ATAA ATAAAATGAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ATAA 1 2 348043 CASAVA_Build 9 108332362 1I CCTCAGGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1183 hom 47 4 31 12 T 13 14 348044 CASAVA_Build 9 108332726 2D ACCCTGTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 34 1 22 11 T 16 14 348045 CASAVA_Build 9 108336318 1D GGTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1319 het 1319 ref 42 29 4 9 T 11 10 348046 CASAVA_Build 9 108345863 1I AAAATACAGG -/T TAAAAAAAAT 3070 het 148 hom 23 4 15 4 T 1 2 348047 CASAVA_Build 9 108354421 3I19M1I GATAAAACCC ---TGATAAGATTAATGAAGTT-/TGATGATAAGATTAATGAAGTTA AAAAAAAAGG 3070 het 1291 hom 24 5 11 14 N/A 0 0 348048 CASAVA_Build 9 108354767 1D ATCTTAACGC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 8 348049 CASAVA_Build 9 108356420 1D TAATTATCTC T/- TTGCAAATGA 3070 het 3070 ref 43 23 18 5 T 3 2 348050 CASAVA_Build 9 108359514 3I GCCATTGTCA ---/GAT GATTAGCCCA 3070 het 2947 hom 18 7 9 2 GAT 1 2 348051 CASAVA_Build 9 108359988 1D TTCCTCACTG T/- TGTCCTGGCT 3070 hom 114 het 40 0 37 3 T 2 1 348052 CASAVA_Build 9 108360101 24I AGGTGAGCTC ------------------------/CTGGGAGAAGCTGCATCCCCAGCG GTGGCACCGA 3070 hom 66 het 31 0 18 13 CTGGGAGAAGCTGCATCCCCAGCG 0 1 348053 CASAVA_Build 9 108364626 1D29M5I AGAAAAGCAA TTAGGAATTGGGAAATCTTCGTGGGGAAAA-----/-TAGGAATTGGGAAATCTTCGTGGGGAAAAGAAAG GAAATAGTCC 3070 het 2601 hom 27 8 13 15 N/A 0 0 348054 CASAVA_Build 9 108365454 3D ATAAATAGTT ATA/--- AGAAGAATAT 3070 het 3070 hom 21 8 12 2 ATA 1 0 348055 CASAVA_Build 9 108370791 1D TGTTTTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 22 0 17 6 A 11 10 348056 CASAVA_Build 9 108372226 1D ACAGAATTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 13 9 3 A 10 9 348057 CASAVA_Build 9 108384060 1I GGAGCAAAGG -/C ACATCTTATG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 0 1 348058 CASAVA_Build 9 108406998 1I GAATTCAAAT -/G TAAGCCTATG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 G 0 1 348059 CASAVA_Build 9 108413218 1D CTTAAAGTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 267 hom 11 1 9 1 A 12 11 348060 CASAVA_Build 9 108416959 4I TCTAGGTTTC ----/TCTA TCTGTCAGCT 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TCTA 0 1 348061 CASAVA_Build 9 108417052 4D TGTGAGAGTT GGGG/---- GGTGTGTGTG 1448 hom 19 het 26 0 12 15 G 6 2 348062 CASAVA_Build 9 108419817 4D GCAGACACTA TTTC/---- TTATCTTTGC 3070 het 3070 ref 34 15 16 4 TTTC 1 0 348063 CASAVA_Build 9 108422626 1D GACATGGCCT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 9 8 348064 CASAVA_Build 9 108426254 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 26 0 20 6 T 10 11 348065 CASAVA_Build 9 108430440 1D GAACAGTTTT A/- TGAAATTCAA 3070 het 3070 ref 38 21 10 9 A 1 0 348066 CASAVA_Build 9 108436957 1D TGTGGTGAGG A/- AAAAAGTGTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 A 6 5 348067 CASAVA_Build 9 108439206 1D CATTTGATGC T/- TTTCTTTAAT 3070 het 3070 ref 41 19 20 2 T 4 3 348068 CASAVA_Build 9 108444040 1D GTGAAATGAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 31 8 21 3 A 8 7 348069 CASAVA_Build 9 108447086 1D GCTCACCGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 9 18 9 A 11 10 348070 CASAVA_Build 9 108465980 2I ACATACATAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 39 15 17 7 AT 4 5 348071 CASAVA_Build 9 108468644 1D AATCAATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 T 11 10 348072 CASAVA_Build 9 108479437 12D TGTTTAAAGT AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 het 1887 hom 21 6 14 6 A 24 12 348073 CASAVA_Build 9 108522571 7D AACCATCACA GTGTGCT/------- GTGTGCTGTG 3070 hom 69 het 25 0 24 5 GTGTGCT 3 2 348074 CASAVA_Build 9 108536804 1D ATATCTTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 11 10 348075 CASAVA_Build 9 108537331 1D TTGAGGATTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 10 9 348076 CASAVA_Build 9 108548651 1D AGTCCCTTCT C/- CCCATTAATC 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 C 4 3 348077 CASAVA_Build 9 108554388 1D TTCTGTCTGC A/- GGGTTGAAAA 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 A 1 0 348078 CASAVA_Build 9 108556654 1I CTTGTTGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 A 11 12 348079 CASAVA_Build 9 108562306 1D TATAATTGGT G/- GGGGTGGTGA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 G 5 4 348080 CASAVA_Build 9 108586730 1D ACAGCTTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 T 11 10 348081 CASAVA_Build 9 108599240 1I AGGTTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 585 hom 30 2 27 1 A 10 11 348082 CASAVA_Build 9 108603272 1I AATAATACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 24 0 19 5 A 13 14 348083 CASAVA_Build 9 108607577 1I CACAAAAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 A 7 8 348084 CASAVA_Build 9 108631448 1D AGAATAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 25 0 21 5 A 11 10 348085 CASAVA_Build 9 108655991 1I TTGATTTTAG -/C TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 C 0 1 348086 CASAVA_Build 9 108658687 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTCATT 3070 hom 51 het 22 0 18 6 T 8 6 348087 CASAVA_Build 9 108660843 1D ATCAACTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 29 4 19 6 T 15 14 348088 CASAVA_Build 9 108669677 1D ACTTTTAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1220 hom 26 3 16 7 A 13 12 348089 CASAVA_Build 9 108670177 1I CAGTGAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 824 hom 42 3 25 14 A 14 15 348090 CASAVA_Build 9 108690687 1D AAACATAACT G/- GGGCTCTTTT 3070 hom 108 het 46 0 36 12 G 4 3 348091 CASAVA_Build 9 108709548 1D TTCTTGGATT A/- ATTTTGGTAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 1 348092 CASAVA_Build 9 108838973 1D CCAGTCACAG A/- AAAAAACAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 7 6 348093 CASAVA_Build 9 108843068 1I CTTTCTTTTT -/A AAAAAATAAT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 A 6 7 348094 CASAVA_Build 9 108920787 1D CTCATCTGGC A/- AAAAAAAAAA 967 het 967 ref 50 32 3 16 A 13 12 348095 CASAVA_Build 9 108932111 1D TGTTCAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 11 10 348096 CASAVA_Build 9 108960527 3D GGCTGCAGCC AAT/--- AATGCTTTGA 3070 hom 87 het 33 0 28 5 AAT 2 1 348097 CASAVA_Build 9 108992168 1D ATTGTTTCTC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 8 7 348098 CASAVA_Build 9 109006345 1D CCATTGGAAT A/- AAGTTAGCCC 3070 hom 147 het 51 0 49 3 A 3 2 348099 CASAVA_Build 9 109007507 1D TTTAAATATA G/- GAAAGAAAGA 3070 hom 99 het 36 0 33 4 G 2 1 348100 CASAVA_Build 9 109008763 11D AGCTTGCAGC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2307 hom 29 het 25 0 11 18 A 27 16 348101 CASAVA_Build 9 109021990 3I TCCCTCCCAC ---/ATA ATGTGAACTT 3070 hom 138 het 49 0 45 4 ATA 0 1 348102 CASAVA_Build 9 109027490 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 9 10 348103 CASAVA_Build 9 109042919 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1503 hom 29 6 14 9 A 15 14 348104 CASAVA_Build 9 109043712 4D ACTGCCCCCT GAAG/---- GAAGGAAGTA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 GAAG 3 2 348105 CASAVA_Build 9 109044520 4I GGAGGGAGGG ----/AGGA AGGAAGGAAG 1341 het 1341 ref 18 7 6 5 AGGA 3 4 348106 CASAVA_Build 9 109049670 1I GACTTAAAAT -/A AAGGGTATTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 3 348107 CASAVA_Build 9 109052122 5D TAAAAAGTGG GGCAT/----- GGCATGAATG 3070 het 3070 ref 25 15 9 2 GGCAT 2 1 348108 CASAVA_Build 9 109053182 1D AGGTTCAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 3 A 10 9 348109 CASAVA_Build 9 109089338 1I CTTTTGAGAT -/A AAAAAAAATA 3070 het 332 hom 36 1 30 5 A 8 9 348110 CASAVA_Build 9 109091127 44D TTTCTCTTTT TCCCTCCCTTCCTCTCTCCCTTCCTCCCTCCCTTCTTCCCTTCC/-------------------------------------------- TCCCTCCCTT 1761 hom 32 het 14 0 9 9 TCCCTCCCTTCCTCTCTCCCTTCCTCCCTCCCTTCTTCCCTTCC 1 0 348111 CASAVA_Build 9 109104743 1I TATGAGGAAG -/T TTTTTTTTGT 2156 hom 39 het 19 0 13 6 T 8 9 348112 CASAVA_Build 9 109106557 3I TTTAGAACAG ---/TAA TAATAATCTG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TAA 2 3 348113 CASAVA_Build 9 109109025 3D TTTTTTTTTT TTG/--- AGTAGAAACG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TTG 1 0 348114 CASAVA_Build 9 109110321 3D ATTAACTCCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 25 hom 28 1 17 10 T 17 14 348115 CASAVA_Build 9 109118924 1I ATGAAACATT -/A AAAAAAAAAA 930 het 930 ref 41 27 3 11 A 13 14 348116 CASAVA_Build 9 109133177 1I TTTTGTTTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 T 8 9 348117 CASAVA_Build 9 109133792 1D AACTGGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1036 hom 44 3 26 15 A 12 11 348118 CASAVA_Build 9 109134544 3I TTGTTCCATA ---/CTT CTTGTCTGAA 3070 hom 116 het 42 0 39 3 CTT 1 2 348119 CASAVA_Build 9 109134690 1D ATTTTCCCCA T/- TTTTTCCCCC 3070 hom 112 het 40 0 35 6 T 6 5 348120 CASAVA_Build 9 109135062 1D GATGCTTTTT A/- ATTCCTCTCC 3070 hom 164 het 61 0 54 8 A 2 1 348121 CASAVA_Build 9 109138810 2I CCTGGGTGAC --/AG GGGGAGACCC 3070 hom 56 het 23 0 19 4 AG 0 1 348122 CASAVA_Build 9 109144149 1D TTTAGACCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 26 0 21 5 T 13 12 348123 CASAVA_Build 9 109145468 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 19 0 11 8 T 15 13 348124 CASAVA_Build 9 109159831 1I AATTACATTT -/A AAAAAGGACC 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 5 6 348125 CASAVA_Build 9 109163332 1D TGTTTTCTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 197 hom 45 1 41 4 T 8 7 348126 CASAVA_Build 9 109185655 7I CAGCTCCCTG -------/CAGCCTC AAACTCCTGG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CAGCCTC 0 1 348127 CASAVA_Build 9 109199419 1D TTGAGAGCAG T/- TTTTTAGAGC 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 T 6 5 348128 CASAVA_Build 9 109221641 3D AACAAAACAA AAC/--- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 AAC 1 0 348129 CASAVA_Build 9 109226352 1I CATGTCTCAC -/A AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 6 7 348130 CASAVA_Build 9 109233140 17I ATCCCACTAG -----------------/CCTTGATCTTATGCTAC CCAGAGTCCC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 CCTTGATCTTATGCTAC 0 1 348131 CASAVA_Build 9 109236827 1I CTGACTCCAG -/C CACTCCCAGG 1981 het 1981 ref 24 13 5 6 C 1 2 348132 CASAVA_Build 9 109238163 4D CTGTCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 38 15 12 14 AAAC 5 4 348133 CASAVA_Build 9 109242867 1I AATAATGGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 A 12 13 348134 CASAVA_Build 9 109243207 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2771 het 2769 ref 33 11 9 13 A 16 17 348135 CASAVA_Build 9 109247437 1I ACTCCATCTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 9 10 348136 CASAVA_Build 9 109257423 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 338 hom 21 1 17 3 A 14 15 348137 CASAVA_Build 9 109260046 2D CATCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 99 hom 27 2 9 17 A 16 14 348138 CASAVA_Build 9 109262996 1D TTCAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2450 hom 23 6 8 9 T 13 12 348139 CASAVA_Build 9 109268808 2I CTAAGGCGAC --/AA GAGAAAGAAT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 A 0 2 348140 CASAVA_Build 9 109270351 1D GTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 831 het 831 ref 19 11 3 5 T 11 10 348141 CASAVA_Build 9 109308671 3I CCTAAAGTGC ---/TGA TATTACAGGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TGA 0 1 348142 CASAVA_Build 9 109320610 1I GTCTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 2374 het 2374 ref 37 12 13 12 T 15 16 348143 CASAVA_Build 9 109323837 3D TCGTCTCAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 42 20 18 7 AAC 7 6 348144 CASAVA_Build 9 109337538 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1420 hom 13 4 8 1 A 10 11 348145 CASAVA_Build 9 109343359 2D TGTGTAAACA GT/-- GGCACTTCTA 3070 het 3070 ref 49 25 18 6 GT 1 0 348146 CASAVA_Build 9 109354235 1D ACTCTGTTTC T/- TTAAAAAAAA 2625 het 2625 ref 26 10 7 9 T 3 2 348147 CASAVA_Build 9 109361777 1D GACAACCAGT G/- GGCTAAGTTC 3070 hom 116 het 44 0 38 6 G 3 2 348148 CASAVA_Build 9 109367841 3I GAGTGTGTTG ---/GGA GGAGGAGACC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 GGA 2 3 348149 CASAVA_Build 9 109384651 4D TCTAAGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 2349 het 2349 ref 29 9 9 14 TTTG 5 4 348150 CASAVA_Build 9 109405741 4D ATGTGTAGGG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 2734 hom 44 12 15 17 GT 11 9 348151 CASAVA_Build 9 109417316 11I CATGGAAGTG -----------/GACTGACTCCC GAGGTCATGC 3070 het 3070 ref 40 15 11 14 GACTGACTCCC 0 1 348152 CASAVA_Build 9 109423431 1D TATTACAACT A/- AAAAAAAAAA 702 het 702 ref 29 19 3 7 A 12 11 348153 CASAVA_Build 9 109441541 1D ATGAAGGCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 T 13 12 348154 CASAVA_Build 9 109445538 1D CAATTATAGA T/- TTTTTTTTTT 2304 het 594 hom 12 2 6 4 T 15 14 348155 CASAVA_Build 9 109451966 1I TCCCTCCCCC -/T GGCCTGCCCT 3070 het 2787 hom 28 7 15 6 T 0 1 348156 CASAVA_Build 9 109454542 1D ACGCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1467 hom 18 4 10 4 A 10 9 348157 CASAVA_Build 9 109476022 4D5M5D TTTTACAAAT AATGTTTACAAACT/----GTCAC----- AATCTGTGCT 3070 hom 105 het 34 0 36 2 N/A 0 0 348158 CASAVA_Build 9 109479118 1D ATCAGGTGGG T/- TTTTTTTCTT 1040 het 805 hom 22 5 6 11 T 8 7 348159 CASAVA_Build 9 109488530 1I ATAGAGTCAT -/G TTCCCAAAGA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 G 0 1 348160 CASAVA_Build 9 109489448 2D TTAGCATAAA AC/-- ACAAACATAC 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 AC 2 1 348161 CASAVA_Build 9 109490879 1D AATTTTTTCT A/- AAAAGCAGTA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 A 5 4 348162 CASAVA_Build 9 109505823 1D GAAGTAGAGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 10 9 348163 CASAVA_Build 9 109510600 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 10 9 348164 CASAVA_Build 9 109510777 3I CTCCGTCTCA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 AAC 5 6 348165 CASAVA_Build 9 109514093 1D ATAATGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 46 2 21 23 T 14 13 348166 CASAVA_Build 9 109516545 1I CTGGCCAACA -/T GGTGAAACTC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 0 1 348167 CASAVA_Build 9 109516933 1D AAACAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 11 10 348168 CASAVA_Build 9 109521520 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 11 12 348169 CASAVA_Build 9 109560297 4D AGTTTTTTTG TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 TGTT 6 5 348170 CASAVA_Build 9 109568585 1I TCTCAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 A 10 11 348171 CASAVA_Build 9 109574384 2D ATGGTGGCAG GA/-- GAGAGAGAGA 672 het 672 ref 31 23 3 5 GA 7 6 348172 CASAVA_Build 9 109581585 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2618 het 1546 hom 33 10 15 8 A 14 13 348173 CASAVA_Build 9 109582916 1I TTGTCACTGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 A 8 9 348174 CASAVA_Build 9 109599159 1D CGTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2265 hom 30 12 9 9 T 13 12 348175 CASAVA_Build 9 109621172 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2119 hom 29 7 17 5 A 11 10 348176 CASAVA_Build 9 109623251 1D AAATGCTTGC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 T 9 8 348177 CASAVA_Build 9 109631014 1D TAAATGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 255 hom 38 1 27 12 T 16 15 348178 CASAVA_Build 9 109672924 1D TAATTTGAAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 9 8 348179 CASAVA_Build 9 109673087 1I ATAATTACAC -/T TTTTTTTTTT 1378 het 1378 ref 16 5 4 7 T 12 13 348180 CASAVA_Build 9 109673710 1I TTTATTGCCT -/A ATAGTCCTCA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 1 2 348181 CASAVA_Build 9 109684969 1I ACGTGTCTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 8 9 348182 CASAVA_Build 9 109687495 1D TTTATCCATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 A 9 8 348183 CASAVA_Build 9 109691162 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 9 10 348184 CASAVA_Build 9 109693788 2I GCCCAGCTAA --/TT TTTTTTTTTT 1050 het 1050 ref 13 7 4 2 T 10 12 348185 CASAVA_Build 9 109699700 1D GACTCTGCCT A/- AAAAAAAAAA 2920 het 944 hom 11 2 8 2 A 12 11 348186 CASAVA_Build 9 109745724 2I AACATTTAAC --/TA TATATACAAA 3070 het 2811 hom 20 6 12 2 TA 3 4 348187 CASAVA_Build 9 109746287 1D TGGAAGTTGA G/- GGCATTTTGA 3070 het 3070 hom 30 7 20 3 G 3 2 348188 CASAVA_Build 9 109746627 1D CTGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAC 2859 hom 29 het 16 0 10 6 A 10 9 348189 CASAVA_Build 9 109748344 6I CTTCAGACTG ------/GATGGA GATGGATTCT 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 GATGGA 1 2 348190 CASAVA_Build 9 109749827 1I TGCAGATTAC -/T TTACTGTTCA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 2 3 348191 CASAVA_Build 9 109751166 1D ATATATATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 11 10 348192 CASAVA_Build 9 109754924 1D AAGTTGAATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 42 22 15 6 A 9 8 348193 CASAVA_Build 9 109759221 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1815 het 1396 hom 13 5 6 2 T 12 11 348194 CASAVA_Build 9 109766965 1I GTATCATTAA -/C CCCCTTTCCC 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 C 4 5 348195 CASAVA_Build 9 109777716 4I TTTTAAAGAC ----/ACTT AGCCCTGGCA 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 ACTT 0 1 348196 CASAVA_Build 9 109780411 1D AATGATTCTC T/- TAAGGTTTGA 2377 het 2377 ref 37 16 8 13 T 2 1 348197 CASAVA_Build 9 109780424 1D AGGTTTGACT A/- AAAAAAAAAA 947 het 947 ref 32 10 2 21 A 13 12 348198 CASAVA_Build 9 109781120 1D TTAATTTCTC A/- AAACACCCAA 3070 hom 117 het 44 0 38 7 A 4 3 348199 CASAVA_Build 9 109783809 2D TCTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2686 het 24 hom 20 1 8 11 T 16 14 348200 CASAVA_Build 9 109786212 1I GCAACCTTTA -/T TGCAGCTCAT 2960 het 2960 ref 19 11 7 1 T 1 2 348201 CASAVA_Build 9 109787216 3D ACACCCACAT CTC/--- CTCTGCTTGT 3070 het 3070 ref 49 27 16 7 CTC 2 1 348202 CASAVA_Build 9 109789327 1I AGCTTCCATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 A 9 10 348203 CASAVA_Build 9 109865857 2D ATGACAGCAG GA/-- GAGAGAGAGA 1280 het 1280 ref 41 34 3 6 GA 7 6 348204 CASAVA_Build 9 109899057 1I CTAGTAGATA -/G GGCCCCAGCC 3070 hom 93 het 40 0 31 9 G 2 3 348205 CASAVA_Build 9 109908642 3D TAAATACAAG TAT/--- TATATTTACA 1817 het 1414 hom 12 3 5 4 TAT 2 1 348206 CASAVA_Build 9 109910117 1D ATTTACCATT G/- TTTTTCTCAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 G 1 0 348207 CASAVA_Build 9 109912826 1I TCCACATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 10 11 348208 CASAVA_Build 9 109913217 1D ATAAAATAAA T/- GGATATTTTC 3070 het 3070 hom 47 14 31 3 T 1 0 348209 CASAVA_Build 9 109913330 1I CAGCATATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 14 11 T 13 14 348210 CASAVA_Build 9 109917151 1I CTTTCTTCAA -/T TTTTCAACTG 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 4 5 348211 CASAVA_Build 9 109922731 2I CAGCAGCGTG --/CA CACCCAAAAG 3070 het 3070 hom 43 18 16 9 CA 1 2 348212 CASAVA_Build 9 109923180 1D CCCTGTCTGG A/- AAAAAAAAAA 2268 het 2090 hom 33 12 9 12 A 17 16 348213 CASAVA_Build 9 109926787 1I ACCATGCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 20 19 10 A 12 13 348214 CASAVA_Build 9 109930509 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 12 13 348215 CASAVA_Build 9 109933373 1I ACGTACTTAC -/T TGGCAACTTA 3070 het 3070 ref 47 26 13 8 T 1 2 348216 CASAVA_Build 9 109933542 4D CCTTATCAGG TATT/---- TATTTATTAA 3070 het 3070 hom 49 21 27 3 TATT 3 2 348217 CASAVA_Build 9 109933962 1D GAGTGGTGTG A/- AAAAATGCCT 3070 het 3070 ref 58 31 21 7 A 6 5 348218 CASAVA_Build 9 109934366 2I GAGCAGTAAA --/AG AGAGAATGAG 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 AG 2 3 348219 CASAVA_Build 9 109953200 1D AGTAGTTTTT C/- CCCCCCCTTA 3070 het 3070 hom 49 23 20 6 C 8 7 348220 CASAVA_Build 9 109961066 1I GGGGTGGGGG -/T GGGGGTGTAT 3070 het 769 hom 29 5 12 12 T 0 1 348221 CASAVA_Build 9 109971798 1I TTTCATAATC -/A ATCAAATAAC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 1 2 348222 CASAVA_Build 9 109975893 2I TAAGCTAGTG --/TC TCTCGCACTT 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 TC 2 3 348223 CASAVA_Build 9 109980751 1D GAAAAAGTGA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 9 8 348224 CASAVA_Build 9 109981997 1D TCCAATATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 9 8 348225 CASAVA_Build 9 109982091 4D TCTTAATTTC CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 32 11 17 9 CT 8 6 348226 CASAVA_Build 9 109984753 1D CTGGGGGTTT G/- GCTTGACTTC 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 G 2 1 348227 CASAVA_Build 9 109999030 1I TGTATCTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 T 9 10 348228 CASAVA_Build 9 110001266 1D GCATCTTATG T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 37 16 18 5 T 7 6 348229 CASAVA_Build 9 110003974 1D TAAAACATTC A/- AAAAATTGAA 3070 het 3070 ref 46 27 17 3 A 6 5 348230 CASAVA_Build 9 110006456 1I ATAACCTGAT -/A AAAAAAAAAT 1430 het 1430 ref 29 21 4 4 A 9 10 348231 CASAVA_Build 9 110015804 2I53M1I AGAAATAAAA --GGGGAAGTGAGAGAAGAATGACGAAAGAAAAAATGGTACATCTATAGGACAAA-/AGGGGGAAGTGAGAGAAGAATGACGAAAGAAAAAATGGTACATCTATAGGACAAAG AACAGTGACA 3070 het 3070 ref 35 12 11 28 N/A 0 0 348232 CASAVA_Build 9 110016262 5D CTCTCTCAGC TTTTA/----- TTTTATTTTA 2528 het 1649 hom 17 6 6 5 TTTTA 4 3 348233 CASAVA_Build 9 110016546 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAACATA 2963 hom 23 het 11 0 8 4 A 6 7 348234 CASAVA_Build 9 110020124 1D GTCTTATAAG A/- TGAGCTAAAC 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 1 0 348235 CASAVA_Build 9 110020193 2I TTGTTAAAGC --/AA AAAAAAAATC 3070 hom 45 het 30 0 14 16 A 8 10 348236 CASAVA_Build 9 110029862 1I TCAAAGTTGC -/T GCCATGTAGT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 T 0 1 348237 CASAVA_Build 9 110039785 3I GAAGGGAAAC ---/TAA TAGCATTTGT 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 TAA 0 1 348238 CASAVA_Build 9 110043735 1D TCATGAGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 75 hom 35 1 18 16 A 15 14 348239 CASAVA_Build 9 110048218 4D ATGCCAAACC ACAA/---- ACAGTTTACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ACAA 1 0 348240 CASAVA_Build 9 110081028 1D TTCCATTACA T/- TTTTTTTTTT 1983 het 1983 ref 31 20 5 6 T 12 11 348241 CASAVA_Build 9 110093712 2I CATAATATAA --/AC ACACACACAC 3070 het 2897 hom 24 9 11 4 AC 8 9 348242 CASAVA_Build 9 110110679 1I GGGGAATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 10 11 348243 CASAVA_Build 9 110146450 2I TGACTAGCTC --/AT ATGCTAGGTT 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 AT 1 2 348244 CASAVA_Build 9 110162521 1I AATCCCTTCC -/T TTTACAAATG 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 T 3 4 348245 CASAVA_Build 9 110165450 2D CATCAGGCCA CT/-- CTGAGAGACC 3070 het 3070 hom 47 19 25 6 CT 2 1 348246 CASAVA_Build 9 110177922 24I TAATCCCAAC ------------------------/ACGACATCAAAACAATTTATTTTT ACTATATCCC 3070 het 3070 hom 35 15 15 6 ACGACATCAAAACAATTTATTTTT 0 1 348247 CASAVA_Build 9 110188259 4D GAGGAGAGGC CAGA/---- CAAAGGGAAT 3070 hom 105 het 36 0 34 2 CAGA 1 0 348248 CASAVA_Build 9 110189266 1I GCCAAAACTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 50 23 18 9 T 9 10 348249 CASAVA_Build 9 110202364 2D CGTTCTTATG AA/-- AATTTTCTTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 4 2 348250 CASAVA_Build 9 110203943 1I CAATTTTTTG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 T 6 7 348251 CASAVA_Build 9 110209826 4I18M1D GCTTTTCCTT ----AAACAAAACAACAGCACCA/AAACAAACAAAACAACAGCACC- AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 35 17 22 7 N/A 0 0 348252 CASAVA_Build 9 110216491 4I AAGAGAATTC ----/TAAA TGTAGCAAGG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TAAA 0 1 348253 CASAVA_Build 9 110216848 6D TCCCTTTGTT TATATA/------ TATATATATA 3070 hom 87 het 37 0 30 8 TA 9 6 348254 CASAVA_Build 9 110217852 1D TCAATTTAAA C/- CCCATTTTCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 4 3 348255 CASAVA_Build 9 110221544 1D ATAAATACTG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 90 het 35 0 30 7 A 9 8 348256 CASAVA_Build 9 110224948 3D GTAAGAGATT AAC/--- AACAACAATA 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 AAC 3 2 348257 CASAVA_Build 9 110226399 4I ATTTCTCCCC ----/CTTT CTTTACTACC 3070 hom 77 het 35 0 32 3 CTTT 1 2 348258 CASAVA_Build 9 110228025 3D ATCCTACAGT TCC/--- TCCTATTATT 3070 het 3070 hom 40 17 18 6 TCC 2 1 348259 CASAVA_Build 9 110229537 3I AAAAATAAGT ---/AAG AATAATAAAT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 AAG 0 1 348260 CASAVA_Build 9 110232907 1D TGTTAAAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 42 16 21 6 A 8 7 348261 CASAVA_Build 9 110233185 1D TATATGACAC T/- TTTTTTGCCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 7 6 348262 CASAVA_Build 9 110233400 1D AATAACCACT A/- AAAAAAAACT 2962 het 2962 ref 20 11 7 2 A 9 8 348263 CASAVA_Build 9 110235648 3I AACAATGAAA ---/ATG ATGACTATTT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 ATG 1 2 348264 CASAVA_Build 9 110242724 2I CTATCAATCC --/CT GTTAGTTCAC 3070 het 3070 hom 56 24 29 3 CT 0 1 348265 CASAVA_Build 9 110246668 1D ACCACTCACC G/- GGGCTGTCAA 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 G 4 3 348266 CASAVA_Build 9 110250490 1I CATACACACA -/C CTTTTTGATT 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 C 1 2 348267 CASAVA_Build 9 110266835 1D TAAAAAAAAA T/- TTTATCTGGA 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 T 4 3 348268 CASAVA_Build 9 110276680 3D CTCAGATTGA GAG/--- GAGAACAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 7 GAG 2 1 348269 CASAVA_Build 9 110282922 1D AGCTTTCAAG T/- TTTTTTTTTT 1321 het 1321 ref 47 35 3 9 T 13 12 348270 CASAVA_Build 9 110288182 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2423 hom 34 10 15 9 A 12 13 348271 CASAVA_Build 9 110298608 1D TGAACAGTCA T/- TTTTTTTTTT 1252 het 1252 ref 30 15 3 12 T 15 14 348272 CASAVA_Build 9 110316710 1D TTAGTCTACT G/- GGGGGAGTCA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 G 6 5 348273 CASAVA_Build 9 110319734 1D GAAAACATTA T/- TTTTTTTTCC 1336 het 1336 ref 45 33 3 9 T 9 8 348274 CASAVA_Build 9 110322949 1D CAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 10 9 348275 CASAVA_Build 9 110335549 1I ATGTAATGAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 52 22 20 10 A 7 8 348276 CASAVA_Build 9 110335873 2D AATTCGTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3067 hom 49 13 18 18 A 16 14 348277 CASAVA_Build 9 110350927 1D GTAGGCACAA G/- GGAGGCATCT 3070 het 3070 hom 39 15 18 7 G 3 2 348278 CASAVA_Build 9 110359576 1I ATCTTAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 T 13 14 348279 CASAVA_Build 9 110440867 5I ATAAACATAC -----/ATATT ATATTATATT 3070 het 3070 hom 35 12 18 5 ATATT 2 3 348280 CASAVA_Build 9 110456584 4I GGAAGTGTCC ----/TACA ATACTCATAC 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 TACA 0 1 348281 CASAVA_Build 9 110457940 1I ATTTCAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 20 4 A 12 13 348282 CASAVA_Build 9 110462211 1I AGAGCAGCTA -/C AGGGGCTGAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 C 0 1 348283 CASAVA_Build 9 110502385 1D CCTTTTTTTT C/- ATTTGAAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 C 1 0 348284 CASAVA_Build 9 110504131 1D GGTGGGGGAA G/- AGCCATGTTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 G 1 0 348285 CASAVA_Build 9 110507497 3D13M1I AAACACTTAC TGTTGTTACTACTTGA-/---TGTTACTACTTGAG TGGAACAAAG 3070 het 3070 ref 36 21 16 1 N/A 0 0 348286 CASAVA_Build 9 110522828 1D TGGGGGGGAT G/- GGGAAAAGAA 3070 het 3070 ref 36 15 18 4 G 4 3 348287 CASAVA_Build 9 110523493 13D CAGACACACA CAAGTATAAATTC/------------- CATTAATAAT 3070 het 3070 hom 37 18 20 5 CAAGTATAAATTC 1 0 348288 CASAVA_Build 9 110524511 2I AAGAAAGTGG --/GA GAGAGAGAGG 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 GA 4 5 348289 CASAVA_Build 9 110530194 1I CTTGAGGGGA -/G GAGAGGGAAG 3070 het 3070 ref 46 25 19 2 G 1 2 348290 CASAVA_Build 9 110532886 4I GCTAAAGGCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 AAAC 2 3 348291 CASAVA_Build 9 110538639 1I ACAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 10 11 348292 CASAVA_Build 9 110540359 1I ACGCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 9 10 348293 CASAVA_Build 9 110543587 5I TGTAATTATG -----/AATAT AATTATTCAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 AATAT 0 1 348294 CASAVA_Build 9 110548605 1I TTTCAGAGAG -/A AAAAATCAAT 2347 het 2347 ref 27 13 6 8 A 5 6 348295 CASAVA_Build 9 110550831 1I ACTTGGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 A 10 11 348296 CASAVA_Build 9 110555151 1I GAGCCAATCA -/C CCCCCCCTCT 3070 het 3070 ref 40 14 14 12 C 7 8 348297 CASAVA_Build 9 110557635 1I AAATCCTCAT -/C CAGAAGCCCC 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 C 1 2 348298 CASAVA_Build 9 110558748 1D TAAGTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 11 10 348299 CASAVA_Build 9 110674906 19D ACTCTGTCTG AAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAA 1255 het 131 hom 6 3 4 3 A 35 16 348300 CASAVA_Build 9 110687617 1D AACTAATAGT G/- GAAAAGCTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 G 2 1 348301 CASAVA_Build 9 110713821 8D CATTAAGGTG ACTACTTC/-------- ACTCTTCAGT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 ACTACTTC 1 0 348302 CASAVA_Build 9 110717401 1I GCTATCTGCT -/G AAACTCCAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 0 1 348303 CASAVA_Build 9 110752960 1D AATTCTAGGG A/- TCATTTTTCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 0 348304 CASAVA_Build 9 110763173 4D GGTTGAATGA TACT/---- TACAAGTATG 3070 hom 129 het 48 0 43 5 TACT 1 0 348305 CASAVA_Build 9 110768839 1I ATTAATGAAT -/C AACTAACATT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 0 1 348306 CASAVA_Build 9 110799033 1I GTTTCCCACA -/T TTTTGTCTTG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 T 4 5 348307 CASAVA_Build 9 110811408 1D TACTGCCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 11 10 348308 CASAVA_Build 9 110818648 1D ACCTAATTTT A/- GAAGTCCCAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 0 348309 CASAVA_Build 9 110838245 1D ATCCTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 484 hom 36 2 21 14 A 13 12 348310 CASAVA_Build 9 110845713 8I TGAGAATCAA --------/ATTCACAG ACTCTGGAGG 3070 hom 96 het 35 0 32 3 ATTCACAG 0 1 348311 CASAVA_Build 9 110867499 1D TGATACTGAT G/- GCATGCTACA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 2 1 348312 CASAVA_Build 9 110878357 3I AGCTGGAAAC ---/CAT CATTCTCAGC 3070 het 692 hom 29 4 24 1 CAT 1 2 348313 CASAVA_Build 9 110878487 1D ACTGTGGGGT G/- GGGGGGAGGG 2375 hom 17 het 8 0 6 2 G 7 6 348314 CASAVA_Build 9 110886186 1I TCTCAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 28 3 16 9 A 13 14 348315 CASAVA_Build 9 110890999 1I GGAAGCATGG -/C CATGGTATCT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 1 2 348316 CASAVA_Build 9 110894428 1D TAATTTCCTT A/- AGTGTTTTTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 2 1 348317 CASAVA_Build 9 110907630 4D ACGTGTATTC AAAT/---- AAATACTTGC 3070 het 3070 ref 54 36 13 7 AAAT 2 1 348318 CASAVA_Build 9 110908301 1I ACTCCAGCCT -/G GGAAACAGAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 2 3 348319 CASAVA_Build 9 110916178 5D AATCCATCCC CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 4 CAAAA 4 3 348320 CASAVA_Build 9 110923238 4D GTTTGCAGAT AAAG/---- AAACTATTGC 3070 hom 84 het 30 0 28 5 AAAG 1 0 348321 CASAVA_Build 9 111021709 6I GATCCACCCG ------/CCTCAC CCTCCCAAAG 2745 het 1165 hom 18 7 8 3 CCTCAC 0 1 348322 CASAVA_Build 9 111034413 1D TTCTTACAGA T/- TTTTTTTTTT 909 het 909 ref 35 25 2 9 T 11 10 348323 CASAVA_Build 9 111051160 3D ACTCCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 999 hom 7 het 4 0 3 1 A 15 12 348324 CASAVA_Build 9 111081300 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 40 1 19 20 T 15 14 348325 CASAVA_Build 9 111095481 3D ATATGCATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 38 1 25 12 T 16 13 348326 CASAVA_Build 9 111115973 1I TCATCATTTT -/A AAAAACATGT 3070 het 3070 hom 38 10 24 4 A 5 6 348327 CASAVA_Build 9 111116743 2I TCACCCCCCC --/CA CCACCTCAGC 2622 het 2622 ref 27 12 10 5 CA 0 1 348328 CASAVA_Build 9 111127639 6I TATAAATGTA ------/TTCTTT TTCTTTTAAT 3070 het 3070 hom 38 7 25 6 TTCTTT 1 2 348329 CASAVA_Build 9 111136245 1I CCTTATTGCC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 414 hom 35 1 28 6 T 7 8 348330 CASAVA_Build 9 111146016 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGTTTTGC 3070 het 2151 hom 17 5 9 3 G 4 5 348331 CASAVA_Build 9 111146995 1D CCCCAAGTAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 41 20 13 8 T 9 8 348332 CASAVA_Build 9 111147285 1I TGGGCCAGGA -/G GGGGCCAATG 3070 het 3070 ref 38 23 10 5 G 4 5 348333 CASAVA_Build 9 111150104 1I TCTCCTTCAA -/G GCTAAGTGTT 3070 het 3070 hom 45 21 20 4 G 1 2 348334 CASAVA_Build 9 111154049 1D AGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 11 10 348335 CASAVA_Build 9 111173947 1D CATCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 35 2 25 8 T 13 12 348336 CASAVA_Build 9 111193851 1D TCTTTAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 4 T 11 10 348337 CASAVA_Build 9 111201732 1D CAGGAGGGAC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 8 7 348338 CASAVA_Build 9 111204836 1I ATTTGCATAA -/G GTACATAATT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 G 1 2 348339 CASAVA_Build 9 111214479 1D CTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1711 het 1711 ref 25 15 5 5 T 15 14 348340 CASAVA_Build 9 111232645 1D CATTTATAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 A 10 9 348341 CASAVA_Build 9 111239267 1D ACTCCCTCTA G/- ACCCTCTTGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 1 0 348342 CASAVA_Build 9 111239857 1D GACCTGAAGG A/- ACAGCTTGTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 A 2 1 348343 CASAVA_Build 9 111241477 1D CTTCATCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 17 17 2 A 10 9 348344 CASAVA_Build 9 111244157 1D CAATAATTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2734 hom 24 8 13 3 T 10 9 348345 CASAVA_Build 9 111253139 7D ATTTTTCATT TTTTTAA/------- TTTTTAATTT 3070 het 3070 hom 32 12 16 7 TTTTTAA 2 1 348346 CASAVA_Build 9 111254671 1D CAACAGAGCC T/- TTTTTTTTTT 1293 het 1293 ref 26 18 3 5 T 12 11 348347 CASAVA_Build 9 111256253 1D CTACATCCTG C/- CTACATTGGT 3070 het 3070 ref 56 25 20 11 C 2 1 348348 CASAVA_Build 9 111258936 2D GTCTATCTCC CT/-- GTCTCTCTTG 3070 het 3070 hom 54 24 24 9 CT 1 0 348349 CASAVA_Build 9 111263861 1D TTGTTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1095 hom 28 3 18 7 A 15 14 348350 CASAVA_Build 9 111269369 1D GTGGGTTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 T 11 10 348351 CASAVA_Build 9 111272796 1I GACCTCATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 333 hom 16 1 9 6 A 15 16 348352 CASAVA_Build 9 111273773 1I TGGAAGGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 492 hom 35 4 22 9 T 13 14 348353 CASAVA_Build 9 111276013 1D TTAGAAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 26 5 T 14 13 348354 CASAVA_Build 9 111295509 2D CTAAAATGCA CT/-- GTTTGTTCCC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CT 1 0 348355 CASAVA_Build 9 111301669 2I CCCCCCTGCA --/AC ACACTGTCTG 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 AC 2 3 348356 CASAVA_Build 9 111302725 1I ATGTTAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 14 11 14 A 13 14 348357 CASAVA_Build 9 111308686 4D CCTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTTCTTT 363 het 363 ref 19 8 5 8 TCTT 2 1 348358 CASAVA_Build 9 111308709 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1902 het 1902 ref 17 7 5 5 T 13 12 348359 CASAVA_Build 9 111310819 4I AATCAATCAG ----/TAGA TAGATAGAAA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 TAGA 2 3 348360 CASAVA_Build 9 111310955 1D GTCAGGATGT C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 75 het 32 0 24 8 C 9 8 348361 CASAVA_Build 9 111328440 2D TTTCAGCAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 801 hom 27 5 13 10 T 14 12 348362 CASAVA_Build 9 111330814 2D TATATATATG TA/-- TATATATATG 3070 het 3070 hom 32 15 13 5 TA 5 4 348363 CASAVA_Build 9 111331532 1I CCGAGAGAGT -/C GCCCCAGTTA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 C 0 1 348364 CASAVA_Build 9 111333959 1D CTTGGAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 39 1 30 8 A 11 10 348365 CASAVA_Build 9 111337609 1I ACACATCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 17 13 T 10 11 348366 CASAVA_Build 9 111339630 4I GTCTGCCTGA ----/CTCT CTCTCTCCTG 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 CT 3 5 348367 CASAVA_Build 9 111343057 3D GCTCTTCTTT TTC/--- TTCTTCTTCT 2917 het 2917 ref 18 9 8 1 TTC 4 3 348368 CASAVA_Build 9 111343127 6D CCCTTCTCCT TCCTCC/------ TCCTCCTCCT 518 het 518 ref 18 9 3 6 TCC 5 3 348369 CASAVA_Build 9 111344127 1I ACCCAGCTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 T 8 9 348370 CASAVA_Build 9 111346309 1D ATATTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 536 hom 33 2 26 5 T 12 11 348371 CASAVA_Build 9 111346734 1I CTATGTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 28 0 20 8 T 11 12 348372 CASAVA_Build 9 111348074 2I ACACAAAAGT --/AA AAAAAAAATT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 A 8 10 348373 CASAVA_Build 9 111349576 1D TTTTTGTTTG T/- TTGTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 6 T 3 2 348374 CASAVA_Build 9 111352836 1D GCTTTATTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 9 8 348375 CASAVA_Build 9 111353041 2I AACACATTAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 37 0 26 11 T 13 15 348376 CASAVA_Build 9 111353628 1D GTCTCCACAG T/- CATAGCAATT 3070 hom 117 het 46 0 37 10 T 1 0 348377 CASAVA_Build 9 111354506 1D TTGTCACCTC A/- AAAAAAAACC 3070 het 237 hom 40 1 34 6 A 9 8 348378 CASAVA_Build 9 111362890 1I TACTTTCTCC -/T TCCAGGCATG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 1 2 348379 CASAVA_Build 9 111369576 1I AAGTGTACAC -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 6 7 348380 CASAVA_Build 9 111373481 2I ACTAGAAAAC --/AT AGAAGAAATG 3070 het 3070 ref 44 24 14 6 AT 0 1 348381 CASAVA_Build 9 111376795 1I AGAAAAGAAA -/C ATTTGATACC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 C 0 1 348382 CASAVA_Build 9 111385129 1D GAATTATATT C/- CCCCCCAGTT 3070 het 3070 hom 35 14 14 8 C 7 6 348383 CASAVA_Build 9 111386190 1I GGAGATATAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 A 0 1 348384 CASAVA_Build 9 111388502 6I TATTACATGC ------/TTAGCA TTACCTCTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TTAGCA 0 1 348385 CASAVA_Build 9 111389075 3D CAGAGAGGAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 10 10 A 14 11 348386 CASAVA_Build 9 111397838 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2735 hom 32 18 9 5 A 16 14 348387 CASAVA_Build 9 111406747 1I TCCTGGAGGG -/C CAGTATGATG 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 C 1 2 348388 CASAVA_Build 9 111409294 1I AAACAAAAAA -/C AAAAAAACAA 3070 het 2952 hom 26 11 11 4 C 0 1 348389 CASAVA_Build 9 111418466 1I CGATGGGGGT -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 A 7 8 348390 CASAVA_Build 9 111439529 2I CAAGGAGGCC --/AA GAGAGAGGCT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 0 2 348391 CASAVA_Build 9 111446102 1I AAGGGGTGGC -/G GGGGGTGTCA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 G 5 6 348392 CASAVA_Build 9 111461244 1I TGTAATGGGA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 7 8 348393 CASAVA_Build 9 111471369 1D TTGTTTTTCC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 9 8 348394 CASAVA_Build 9 111523418 2D GCTGAGTGAC AG/-- GGAGCAGCAA 3070 het 3070 hom 43 15 22 7 AG 1 0 348395 CASAVA_Build 9 111526625 1I AGTAAGGTAC -/T TAGAGCAGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 2 348396 CASAVA_Build 9 111529582 5I CATTAAAAAA -----/TTATC TTATTTTATA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTATC 0 1 348397 CASAVA_Build 9 111538389 1D ACTATAAAAG T/- TTTCTGTAGC 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 T 4 3 348398 CASAVA_Build 9 111551654 1I CATAGGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 23 1 17 5 A 13 14 348399 CASAVA_Build 9 111560632 6D GAGTGCAGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 29 0 24 8 TG 11 8 348400 CASAVA_Build 9 111566922 1D AATATTTTTT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 94 het 49 1 42 7 A 8 7 348401 CASAVA_Build 9 111570141 22D AAAGAAAAAG AGGGAAGGAAGGAAAGAAAAAC/---------------------- AGTGAAGGAA 2856 het 2856 ref 36 23 12 9 AGGGAAGGAAGGAAAGAAAAAC 1 0 348402 CASAVA_Build 9 111592440 1D GTGGGTGGGA T/- TTTTCCCCCC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 5 4 348403 CASAVA_Build 9 111598773 7I AGCAGGCACA -------/TCTTACG TCTTACGTGG 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 TCTTACG 1 2 348404 CASAVA_Build 9 111603499 1D TGTTGCTTAG A/- AAGGTGGATT 3070 het 3070 hom 46 15 27 4 A 3 2 348405 CASAVA_Build 9 111609242 1D AAGTGGAATG T/- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 56 21 26 10 T 1 0 348406 CASAVA_Build 9 111633552 1D TAGGCTACCA C/- CTGTCCTGTT 3070 het 3070 hom 55 26 25 4 C 2 1 348407 CASAVA_Build 9 111644772 1D GTAAGATGTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 13 7 A 10 9 348408 CASAVA_Build 9 111655389 1I GATGATGCTG -/T TTAGCAGCAA 3070 hom 148 het 56 0 50 6 T 2 3 348409 CASAVA_Build 9 111678979 26D AGATGGAAGT AGAGGGACATGCACCTCTGGGTGACC/-------------------------- AGAGTCACCA 3070 het 3070 ref 36 26 13 6 AGAGGGACATGCACCTCTGGGTGACC 1 0 348410 CASAVA_Build 9 111689787 1D TAACTTGCTG C/- CCCCCCCTAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 8 7 348411 CASAVA_Build 9 111708128 4D TACGTTGCAT TTCC/---- TTCTTTTCCT 3070 het 3070 ref 32 19 11 5 TTCC 1 0 348412 CASAVA_Build 9 111721454 3D AAAAGGGAAT TTG/--- TTGTTTTCAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 TTG 2 1 348413 CASAVA_Build 9 111792169 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2924 het 173 hom 25 4 12 9 T 17 16 348414 CASAVA_Build 9 111793339 3I TCACATTTTT ---/TTC TTTTTTCTTT 3070 hom 89 het 37 0 30 7 TTC 0 1 348415 CASAVA_Build 9 111843399 1D TTGAATAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 7 T 12 11 348416 CASAVA_Build 9 111844502 1I ACTCCAGCCT -/G GGCAGTAAGT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 G 2 3 348417 CASAVA_Build 9 111847175 12I GGGTCCCCTG ------------/GGGGCCACTCTT GCTCAGGGGT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 GGGGCCACTCTT 0 1 348418 CASAVA_Build 9 111859491 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 23 1 12 10 T 11 10 348419 CASAVA_Build 9 111863994 1D GGGTTTAGGG C/- AAGGGTACAC 3070 hom 60 het 21 0 21 2 C 1 0 348420 CASAVA_Build 9 111865708 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 9 10 348421 CASAVA_Build 9 111896765 8D ATAGCACCAC GGGGCGGG/-------- GGGGCGGGTA 1895 het 1217 hom 14 5 6 5 GGGGCGGG 2 1 348422 CASAVA_Build 9 111917855 1D CCACGATCGT G/- GGGGTGGTTC 3070 hom 129 het 53 0 44 11 G 5 4 348423 CASAVA_Build 9 111919974 2D ATATATATAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 AG 9 8 348424 CASAVA_Build 9 111920310 2I ACAGAAATAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 36 het 13 0 13 1 AC 7 8 348425 CASAVA_Build 9 111933313 1I AACTATTCTA -/G GAATTTAGTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 1 2 348426 CASAVA_Build 9 111940163 6I GACTGTAGAG ------/GAAGCT GAAGCTGAAG 2418 het 2418 ref 33 12 11 10 GAAGCT 2 3 348427 CASAVA_Build 9 111942733 1I CCTTCTTGAC -/A AAAAGATACT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 A 4 5 348428 CASAVA_Build 9 111945188 4D CAATAGTGTG TGCA/---- TGTGTGCCCT 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 TGCA 1 0 348429 CASAVA_Build 9 111953875 3D CAGTCTAACA TTG/--- TTGTAGTGGT 3070 het 3070 ref 50 26 21 5 TTG 2 1 348430 CASAVA_Build 9 111969580 7I GGAATCTCTT -------/TGATGCC CTTGATCAAA 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 TGATGCC 0 1 348431 CASAVA_Build 9 111978201 1D TCAGATCTAC T/- GATTCTGGGT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 T 1 0 348432 CASAVA_Build 9 111979883 2D GGAATATAAC AT/-- GTGGTGAAAT 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 AT 1 0 348433 CASAVA_Build 9 111980568 1D CAAGATTGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 18 16 10 T 10 9 348434 CASAVA_Build 9 111981429 1I AAAATTAGCC -/G GGGCATGGTG 3070 het 3070 ref 33 14 15 4 G 3 4 348435 CASAVA_Build 9 111986240 1I TGTAATCCTA -/G TACTTTGGGA 3070 hom 78 het 28 0 24 8 G 0 1 348436 CASAVA_Build 9 111987513 1I ACAGAAATAC -/A TGTAAAAATA 3070 hom 156 het 58 0 52 6 A 0 1 348437 CASAVA_Build 9 111988377 1D CTGGAAAGGT A/- CAGGCTCATT 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 A 1 0 348438 CASAVA_Build 9 111991488 2D CCCCATCAGC AG/-- AGATTAACAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 9 AG 2 1 348439 CASAVA_Build 9 111993150 1D TCTCGGTTCA C/- TGCAACCTCC 3070 het 1095 hom 23 4 15 4 C 1 0 348440 CASAVA_Build 9 111996100 4D AAGTTATTTG TTGT/---- TTGTTTGCTT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 TTGT 2 1 348441 CASAVA_Build 9 112008160 1I AATCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 25 1 19 5 A 13 14 348442 CASAVA_Build 9 112015472 1D ACCCGGCTAA T/- TTTTGTATTT 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 T 5 4 348443 CASAVA_Build 9 112028574 1I GTTTTTAACA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 55 het 23 0 19 4 T 9 10 348444 CASAVA_Build 9 112031523 1I TTAGATGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2430 hom 21 6 12 3 T 10 11 348445 CASAVA_Build 9 112041673 2I ATAGAATTTA --/TG TGACATTGAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 TG 1 2 348446 CASAVA_Build 9 112051409 1D CACTCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 392 hom 27 1 23 3 A 13 12 348447 CASAVA_Build 9 112054822 2I CTCGGCTCAC --/GT AGTAACCTTT 3070 het 3070 ref 30 12 12 6 GT 0 1 348448 CASAVA_Build 9 112055256 1I CCAAATAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 9 10 348449 CASAVA_Build 9 112056238 3D CCTAAAGCAC CAA/--- CAGAGTACCT 3070 het 3070 hom 47 18 25 5 CAA 1 0 348450 CASAVA_Build 9 112060355 2D GGAGGATGGT AC/-- AGTTATAAGG 3070 het 3070 hom 43 19 17 11 AC 1 0 348451 CASAVA_Build 9 112063014 3I CAGGAGAGGG ---/CTC CTCTCTACCC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 CTC 1 2 348452 CASAVA_Build 9 112067255 1D GTAGAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 2243 hom 15 het 8 0 6 2 A 11 10 348453 CASAVA_Build 9 112071424 2I TAGTTTTGTA --/TG TGGAGTAGTT 3070 het 3070 ref 21 8 9 4 TG 1 2 348454 CASAVA_Build 9 112080160 1I CACCTGCTAC -/T TTTTTTTTGT 2217 het 2217 ref 12 7 5 0 T 8 9 348455 CASAVA_Build 9 112081267 4I TCATAAATTT ----/ACTG ACTATTTTCA 3070 het 3070 hom 40 19 20 1 ACTG 0 1 348456 CASAVA_Build 9 112087385 1I AGTAAACTGT -/A AAAAAAAAAA 1734 het 1523 hom 12 4 6 2 A 13 14 348457 CASAVA_Build 9 112091677 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2206 het 6 hom 31 0 8 23 T 19 18 348458 CASAVA_Build 9 112092357 1I ACAGCTGCTC -/T TTTCCAGAGG 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 T 3 4 348459 CASAVA_Build 9 112123826 2D CAGTTCTATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2981 hom 42 11 23 8 A 15 13 348460 CASAVA_Build 9 112124286 2D TGGTCTCAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 15 13 4 T 13 11 348461 CASAVA_Build 9 112128750 19D TAACTCTACT TGAGACGTGGAACGCATCC/------------------- TGATCTAGCA 3070 het 3070 ref 41 23 21 1 TGAGACGTGGAACGCATCC 1 0 348462 CASAVA_Build 9 112133734 1I ATGGAAGACA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 T 7 8 348463 CASAVA_Build 9 112134675 5I TTTAGCTGTA -----/TAGAG TAGTCTTTAC 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 TAGAG 0 1 348464 CASAVA_Build 9 112137009 2D AAGTGATCAT TA/-- TTACAGCTAC 3070 het 3070 ref 45 22 19 5 TA 1 0 348465 CASAVA_Build 9 112144812 1D GGAATAGGGT G/- GGGGGGGCAG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 8 7 348466 CASAVA_Build 9 112144995 1I GAAAAAAAAA -/T GTTTATTTGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 0 1 348467 CASAVA_Build 9 112146304 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2507 hom 27 6 14 7 A 9 10 348468 CASAVA_Build 9 112147381 1I CTGGGAATAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 A 8 9 348469 CASAVA_Build 9 112152607 4D AGACAACTGA TTCT/---- TTCTTAATCT 3070 het 3070 hom 51 17 26 11 TTCT 2 1 348470 CASAVA_Build 9 112153666 1I CTGGAAAATA -/C CTCTATTTCT 3070 hom 84 het 33 0 28 5 C 1 2 348471 CASAVA_Build 9 112157003 13I GTGGAAGGGC -------------/AATGGAACCCTGG ACCTATTGGT 3070 het 3070 ref 40 23 10 7 AATGGAACCCTGG 0 1 348472 CASAVA_Build 9 112160951 1D TTTTAGGGTA C/- ATGTGCACAA 2390 hom 18 het 10 0 7 3 C 1 0 348473 CASAVA_Build 9 112163548 1I57M2I ACATTAATGT -GGGACTTTTACTTCAATTAATTTTTATGAAGATTATTACTTTTATGAATATGAAAAC--/GGGGACTTTTACTTCAATTAATTTTTATGAAGATTATTACTTTTATGAATATGAAAACAT ATTTACAAAT 2824 het 2824 ref 24 13 7 19 N/A 0 0 348474 CASAVA_Build 9 112164604 6D CACTGTGATT TTACTG/------ TAACTTCTAG 3070 het 3070 ref 35 20 13 6 TTACTG 1 0 348475 CASAVA_Build 9 112165467 1D CTTTATTTGG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 8 7 348476 CASAVA_Build 9 112166615 1D GTATGAAAGA T/- TTTAAAATTT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 4 3 348477 CASAVA_Build 9 112169511 3D GTGATCCGCT TGC/--- TGCCTTGGCT 3070 het 3070 hom 34 13 16 7 TGC 2 1 348478 CASAVA_Build 9 112169769 8I CAACCTAGGA --------/CTACAGTT CATTGATTCA 3070 het 3070 ref 32 12 14 6 CTACAGTT 0 1 348479 CASAVA_Build 9 112170250 2I GTAGCTAGAC --/AG AGGATGGAGG 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 AG 1 2 348480 CASAVA_Build 9 112171074 4D AGGAAATGAA AAAT/---- AAAAGTTTTC 3070 het 3070 hom 34 12 19 7 AAAT 1 0 348481 CASAVA_Build 9 112177061 1I GGATAAAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 327 hom 40 2 28 10 T 10 11 348482 CASAVA_Build 9 112180022 1D CTGCTTCTAT G/- AGTTTGACTG 3070 het 3070 ref 47 25 13 9 G 1 0 348483 CASAVA_Build 9 112180226 6D TATCTTCTTA ATCATC/------ ATCATCATCA 3070 het 3070 ref 49 28 15 6 ATC 6 4 348484 CASAVA_Build 9 112181149 4D AATGAAATAA TTAT/---- TATGATGTAT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 TTAT 1 0 348485 CASAVA_Build 9 112183529 1I TGCTTTCTGA -/T TTTCTTCCTT 3070 het 3070 ref 42 28 11 3 T 3 4 348486 CASAVA_Build 9 112183970 1D ATTTGGGTGC T/- CCTGTACTGG 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 1 0 348487 CASAVA_Build 9 112185354 1D TTGTGAGGGC T/- TTTTTGTTGA 3070 het 2060 hom 35 8 14 13 T 6 5 348488 CASAVA_Build 9 112185616 29D AAGGTGTCTG GTGACCCCTGTTGTGGGGGGGTCTCATCC/----------------------------- GTGACCCCTG 3070 het 379 hom 32 3 13 27 GTGACCCCTGTTGTGGGGGGGTCTCATCC 2 1 348489 CASAVA_Build 9 112186065 1I ACCAGCAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 334 hom 38 1 28 9 A 9 10 348490 CASAVA_Build 9 112187149 11D TGGTGCGATC TTGGCTCATTG/----------- CAACCTCCAC 2874 het 2874 ref 19 11 7 4 TTGGCTCATTG 1 0 348491 CASAVA_Build 9 112225908 4D AACAAAATGG GAAA/---- GAGACACAAA 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 GAAA 1 0 348492 CASAVA_Build 9 112226459 1I TGTAAAAAAA -/G ATAAGGTTAA 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 0 1 348493 CASAVA_Build 9 112231574 5D AATAATGCTT TTAAA/----- TTAATTTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 10 6 TTAAA 1 0 348494 CASAVA_Build 9 112232225 2I TTTTTTTTTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 31 hom 28 1 14 13 GT 6 7 348495 CASAVA_Build 9 112244563 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 27 2 16 9 T 17 16 348496 CASAVA_Build 9 112250060 1I CATGCTGAGT -/G GGAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 2 3 348497 CASAVA_Build 9 112252746 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 349 het 349 ref 14 8 2 4 T 10 9 348498 CASAVA_Build 9 112254964 1I GGATTTTCAA -/G GGCAACTTTG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 2 3 348499 CASAVA_Build 9 112257920 5I GGGTAGTGGT -----/AAAGA AAAGGGTAAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 AAAGA 0 1 348500 CASAVA_Build 9 112260099 1I TAAAGCATTT -/G GGTTTAGCTA 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 G 2 3 348501 CASAVA_Build 9 112262431 3I TAAAGATAAA ---/AAT AATAAATACT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AAT 1 2 348502 CASAVA_Build 9 112270122 4I TGATTGGAAG ----/CTTC CTAAGGCCAC 3070 hom 60 het 21 0 19 2 CTTC 0 1 348503 CASAVA_Build 9 112281020 3D TTTCTTTTCT TTC/--- TTCTTCTTTT 3070 het 2177 hom 33 8 19 6 TTC 3 2 348504 CASAVA_Build 9 112283632 7D AGGACTCCTC CTGTCTA/------- TCGCTATTTC 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 CTGTCTA 1 0 348505 CASAVA_Build 9 112296894 1D CTTCTCTGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 10 9 348506 CASAVA_Build 9 112300076 1I CTGAAAAAAT -/G TTTTAAAAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 0 1 348507 CASAVA_Build 9 112303609 1I ATTTTGTTGT -/G GGGGGGGGCA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 G 8 9 348508 CASAVA_Build 9 112318622 4D AACTACTGAA TTAT/---- TTATATTACT 3070 het 3070 ref 34 15 15 5 TTAT 2 1 348509 CASAVA_Build 9 112330176 2I ATGGTGTATG --/TA TATATATATA 2637 het 448 hom 17 1 10 6 TA 7 8 348510 CASAVA_Build 9 112331383 1D ATAGCTTTGT A/- GTATAATTTG 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 1 0 348511 CASAVA_Build 9 112331710 1D AGGAAGTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 10 9 348512 CASAVA_Build 9 112332121 1D ATATTTTGTG T/- TATGTTCCTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 2 1 348513 CASAVA_Build 9 112341717 2I ATTTTTAAAG --/TA TATATATATA 3070 het 385 hom 27 1 25 1 TA 5 6 348514 CASAVA_Build 9 112343376 1D TATTATTATT G/- TTTTTAAACT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 G 1 0 348515 CASAVA_Build 9 112346727 3D AATCCCATTC ATT/--- ATTATTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 36 7 ATT 3 2 348516 CASAVA_Build 9 112360114 5D TTAATTTTAA TTAAC/----- TTAAATTTAA 3070 het 3070 ref 36 21 14 2 TTAAC 1 0 348517 CASAVA_Build 9 112374223 1I TAGGAAAAGA -/G GGGGCACAAA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 G 4 5 348518 CASAVA_Build 9 112375283 1I CCCTTCCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2566 hom 33 8 19 6 A 11 12 348519 CASAVA_Build 9 112380469 1I AATTTTAGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 9 10 348520 CASAVA_Build 9 112381900 2D TCTCCTCCTC CT/-- CTCTCTCCCT 2503 het 2503 ref 24 13 8 5 CT 4 3 348521 CASAVA_Build 9 112402718 1I ACTGCAGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 11 20 17 T 13 14 348522 CASAVA_Build 9 112428059 1I AGCTGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3055 hom 23 8 10 5 A 13 14 348523 CASAVA_Build 9 112443753 1D TGCAGTCACC A/- GGGGTGACCA 3070 het 3070 ref 40 22 14 5 A 1 0 348524 CASAVA_Build 9 112445131 3I AAATAATAAC ---/AAT AATAATAATA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AAT 5 6 348525 CASAVA_Build 9 112445198 1D TTATTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 2282 het 2282 ref 23 7 7 9 T 12 11 348526 CASAVA_Build 9 112449977 2I CAGCTGTGAG --/AT ATAGCACAGG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 AT 1 2 348527 CASAVA_Build 9 112450339 1D ACTTTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1177 hom 24 6 15 3 A 11 10 348528 CASAVA_Build 9 112470413 1D TTTAAATATA T/- TTTTATGTGA 3070 het 3070 ref 30 17 10 5 T 5 4 348529 CASAVA_Build 9 112472182 4D GGGTTTCTTC ACAA/---- ACAATCTGAT 3070 het 3070 hom 37 17 19 3 ACAA 2 1 348530 CASAVA_Build 9 112480613 1I ATCTGAAAAA -/C CTTTGGGGCA 3070 hom 77 het 28 0 26 2 C 1 2 348531 CASAVA_Build 9 112480997 3I TTGGGATTTT ---/TTG TTGTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTG 1 2 348532 CASAVA_Build 9 112481881 4D33M3I CCATAGATGC TTCTTTCTGTTTGAAGTTATTCAATATTTCTGTCCTC---/----TTCTGTTTGAAGTTATTCAATATTTCTGTCCTCTTG TTGTTTATGG 3070 het 3070 hom 34 11 12 19 N/A 0 0 348533 CASAVA_Build 9 112483035 5D TTATGTTCTG TATAT/----- TATAATGATC 1342 het 1342 ref 7 4 3 0 TATAT 1 0 348534 CASAVA_Build 9 112484492 4I TTAAAAAGTA ----/CACT CAAATTGCAC 3070 hom 90 het 32 0 30 2 CACT 0 1 348535 CASAVA_Build 9 112494955 1D TTTCCTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 38 hom 30 1 22 7 A 11 10 348536 CASAVA_Build 9 112515364 1D CCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1337 het 1337 ref 36 20 3 13 T 15 14 348537 CASAVA_Build 9 112532312 1I TATTACCTTG -/T GTCTATTTTC 3070 hom 108 het 40 0 34 6 T 0 1 348538 CASAVA_Build 9 112534049 15I AAATAAAACC ---------------/TTTCCGATTACTATA TTTCCAAGAA 3070 hom 60 het 25 0 21 5 TTTCCGATTACTATA 0 1 348539 CASAVA_Build 9 112540387 1D TCAGGTCCAT A/- AACAAGGGTT 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 3 2 348540 CASAVA_Build 9 112559751 1I CCAATTTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 148 hom 27 1 20 6 A 11 12 348541 CASAVA_Build 9 112564333 1D ATTGTAACAA T/- TGTTTCCAAT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 2 1 348542 CASAVA_Build 9 112572851 1I TCTTTCTTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 92 het 36 0 32 4 T 8 9 348543 CASAVA_Build 9 112583092 13D CCTATAAGAC CCTCCATTTGCTG/------------- CAGGGCATAG 3070 hom 90 het 31 0 31 2 CCTCCATTTGCTG 1 0 348544 CASAVA_Build 9 112590805 1I GACAGATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 11 348545 CASAVA_Build 9 112599394 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 98 het 40 0 33 7 A 9 8 348546 CASAVA_Build 9 112607941 3I GCATCAATAT ---/TAA TAAGTTCATA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TAA 1 2 348547 CASAVA_Build 9 112611151 5D GGATGAAACA TAATT/----- TAAAGTCACC 3070 hom 69 het 26 0 24 6 TAATT 1 0 348548 CASAVA_Build 9 112614082 1D GGCATATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 29 1 21 7 A 13 12 348549 CASAVA_Build 9 112618408 2I GTATACACAA --/AT ATATATATAT 1501 het 205 hom 9 1 5 3 AT 7 8 348550 CASAVA_Build 9 112618681 2D TTTGCTTTGC AA/-- AAAAAAAAAA 2008 het 54 hom 26 2 11 14 A 19 17 348551 CASAVA_Build 9 112625773 1D AGGTTCAAAC A/- AGCCCAAACT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 2 1 348552 CASAVA_Build 9 112628696 1D CAAGGTTTCT C/- CCCATGTGAT 2639 het 2639 ref 22 9 8 5 C 4 3 348553 CASAVA_Build 9 112632062 1I ACTCAATAAA -/G CTTTGCACTC 3070 hom 61 het 23 0 19 4 G 0 1 348554 CASAVA_Build 9 112638247 1I ATTTTTTTTT -/A ATATAAACCA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 1 2 348555 CASAVA_Build 9 112640307 4D TGAGTTTTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 27 0 26 3 TTTG 5 4 348556 CASAVA_Build 9 112641072 3D CAAAAAAAAA AAC/--- AAAACAAAAC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 AAC 1 0 348557 CASAVA_Build 9 112641248 1D ACTAAAAATA C/- AAAAAAAAAT 1985 hom 18 het 8 0 7 2 C 1 0 348558 CASAVA_Build 9 112641668 1D TCCTATAGGG A/- TATTCTACCA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 1 0 348559 CASAVA_Build 9 112642219 1I GCTTTACCCC -/T GATGTTTTGT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 T 0 1 348560 CASAVA_Build 9 112654949 1I AAGCAAGAAA -/G GTTCATTTAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 1 2 348561 CASAVA_Build 9 112665663 1I ATATATTATC -/A GAATCATTGT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 0 1 348562 CASAVA_Build 9 112675190 1I ACTCAGATTG -/A AAAAAAAGCA 3070 hom 98 het 37 0 32 5 A 7 8 348563 CASAVA_Build 9 112685796 2I TTCTTTTTAT --/TC TCTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 TC 3 4 348564 CASAVA_Build 9 112717495 1D AAACTTAGCC A/- GGGGTGGTGG 3070 het 3070 hom 28 10 13 6 A 1 0 348565 CASAVA_Build 9 112718113 1D AACCTTATGG T/- TAAAATGTTA 3070 het 3070 hom 64 26 30 8 T 2 1 348566 CASAVA_Build 9 112718703 3I TAGGAAGACC ---/ATT ATTATTATTA 3070 hom 78 het 35 0 27 8 ATT 3 4 348567 CASAVA_Build 9 112726601 1I AATGATTTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 8 9 348568 CASAVA_Build 9 112728798 1I TGGTTTTGTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 T 8 9 348569 CASAVA_Build 9 112737516 1D CTCCAGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 A 13 12 348570 CASAVA_Build 9 112740810 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3033 het 3033 ref 28 14 8 6 A 11 10 348571 CASAVA_Build 9 112745118 4I TTATTTACAA ----/TAAT TATTTATAAT 3070 het 3070 ref 15 8 7 0 TAAT 0 1 348572 CASAVA_Build 9 112750023 5D AATAAGATAT AAATC/----- AAATCAAACC 3070 hom 90 het 33 0 29 8 AAATC 2 1 348573 CASAVA_Build 9 112756612 2I GTCTTCTCCA --/TG GCACATAATA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 TG 0 1 348574 CASAVA_Build 9 112758484 3D AACTTAAAGT ATA/--- ATAATAATAA 1857 het 336 hom 6 1 4 1 ATA 5 4 348575 CASAVA_Build 9 112758611 3I GGATCAACCA ---/AAG AAGAAGTTAG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 AAG 2 3 348576 CASAVA_Build 9 112759306 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1691 het 1691 ref 28 15 4 9 A 10 11 348577 CASAVA_Build 9 112759453 2D AAAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 174 het 174 ref 17 9 2 8 AT 1 0 348578 CASAVA_Build 9 112763171 2I ATTATTGTCC --/TT TTTTTTTATT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 7 9 348579 CASAVA_Build 9 112763318 1D TTTTAAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 30 0 18 12 A 13 12 348580 CASAVA_Build 9 112766397 1D TTTTAAAAAA T/- AAAAATAAAT 2400 het 2400 ref 23 13 6 4 T 1 0 348581 CASAVA_Build 9 112766781 1I TCAAAAAAAA -/C AACCCATTTA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 0 1 348582 CASAVA_Build 9 112779831 1I ATGTAAGAAA -/C CTGCATGTTC 3070 het 1140 hom 12 3 9 0 C 1 2 348583 CASAVA_Build 9 112783697 1I TTAAGGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 A 9 10 348584 CASAVA_Build 9 112787533 1D ATCATTTTTT C/- TACAGGGCAC 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 C 1 0 348585 CASAVA_Build 9 112790199 1I AATGGGAAGT -/G GGGGGAACTA 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 G 5 6 348586 CASAVA_Build 9 112790751 1D CAAGTGTTGG T/- TAAGAATGTG 3070 het 3070 ref 46 25 15 6 T 2 1 348587 CASAVA_Build 9 112792068 8D AATCTAACAG AGTAGATT/-------- AGTAGATTTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 AGTAGATT 2 1 348588 CASAVA_Build 9 112812100 36D AATTAGGAAA ATATATATATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------ ATATATATAT 1992 het 777 hom 11 4 5 5 AT 24 6 348589 CASAVA_Build 9 112829657 1D AAAAATACAA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 8 7 348590 CASAVA_Build 9 112837331 1D TTCCCTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 37 1 29 7 T 11 10 348591 CASAVA_Build 9 112849301 15I GTGGAGGAAA ---------------/AAAAAAAACAAAAAC AAAAAAAACA 3070 hom 51 het 27 0 17 10 AAAAAAAACAAAAAC 0 1 348592 CASAVA_Build 9 112863905 7I TTGTATCTAA -------/CTCCTGT TCCACCTGAC 3070 hom 132 het 49 0 43 6 CTCCTGT 0 1 348593 CASAVA_Build 9 112864640 3I GTAAAATGAT ---/ATG ATGTCTGAGA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 ATG 1 2 348594 CASAVA_Build 9 112872529 4I AAAAAAAGAA ----/AAAG AAGAAGAAGA 3070 hom 44 het 21 0 15 7 AAAG 0 1 348595 CASAVA_Build 9 112873785 4I TATATATAAA ----/ATAT ATATATATAT 2693 hom 15 het 9 0 6 3 AT 5 7 348596 CASAVA_Build 9 112874508 1I CCCCACATGC -/A ATTAGCTATT 3070 hom 72 het 29 0 23 6 A 1 2 348597 CASAVA_Build 9 112875147 1D GATGTTGAAC T/- TTTTTTCATA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 7 6 348598 CASAVA_Build 9 112876387 2D GTTTGATGGC AG/-- AGAGTCTCTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 AG 3 2 348599 CASAVA_Build 9 112876775 1I TCCCACCCAG -/C CCCCTATCTC 3070 hom 105 het 43 0 35 8 C 4 5 348600 CASAVA_Build 9 112878709 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 16 0 11 6 A 13 12 348601 CASAVA_Build 9 112899395 1D GGCTCCTGAA G/- TTTTTTTTTT 2635 het 2635 ref 29 17 8 4 G 1 0 348602 CASAVA_Build 9 112906471 2D CAGGCTTTTT TC/-- CGCCCCCCAG 2019 het 105 hom 15 2 5 11 TC 1 0 348603 CASAVA_Build 9 112923164 1D AAGAGAGACC T/- TTATTCCAGT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 3 2 348604 CASAVA_Build 9 112926256 4D AAAAAATAAA AAAT/---- AAATAAATTT 3070 het 2070 hom 24 9 13 4 AAAT 3 2 348605 CASAVA_Build 9 112929090 1I GAGAAGAGCC -/A AAAAAAAAAA 1950 het 1950 ref 30 11 10 9 A 13 14 348606 CASAVA_Build 9 112930103 4D TCATCTGTGT TTTG/---- TTTATGTTGC 3070 het 3070 ref 47 22 22 5 TTTG 1 0 348607 CASAVA_Build 9 112932277 1I TGATCCTCTC -/A CCTAAACCTC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 0 1 348608 CASAVA_Build 9 112941562 1D GCTAAAGCCC A/- AACTTTCTCT 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 A 3 2 348609 CASAVA_Build 9 112943018 2D TAGCAACAAA AC/-- ACACAAAAAG 3070 het 3070 ref 53 28 21 5 AC 3 2 348610 CASAVA_Build 9 112962674 1D CTGTACTTCC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 A 9 8 348611 CASAVA_Build 9 112971183 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2378 hom 25 8 9 9 A 13 12 348612 CASAVA_Build 9 112976228 1I GAAAGAGTAT -/A TATTATAGGC 2936 het 2936 ref 34 18 7 9 A 0 1 348613 CASAVA_Build 9 112977971 6D TTTCTGTTTC TATCTT/------ TAATTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 TATCTT 1 0 348614 CASAVA_Build 9 112980716 1D CTCCACTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 23 15 10 T 12 11 348615 CASAVA_Build 9 112982224 2D AGAGAAAGAG AA/-- AAAAAAAAAA 2053 het 269 hom 31 2 5 25 A 14 12 348616 CASAVA_Build 9 112985440 1D ATCTACTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 16 0 13 4 T 10 9 348617 CASAVA_Build 9 112987385 1D TGGTCCTGGA G/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 G 1 0 348618 CASAVA_Build 9 112989983 4I ATGTGTGTAT ----/ACAC ACACACACAC 2006 het 2006 ref 26 11 8 8 AC 5 7 348619 CASAVA_Build 9 112992784 3I ATTTTTGTAA ---/AAG AAGAAGAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AAG 2 3 348620 CASAVA_Build 9 112993265 1I AACTTGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 13 3 A 10 11 348621 CASAVA_Build 9 112993566 1I TAGCTGTAAA -/G GACACAGACT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 G 1 2 348622 CASAVA_Build 9 112994604 5D TTTTTTATCT TAGAG/----- TAATTTTTTC 3070 het 1157 hom 27 4 16 9 TAGAG 1 0 348623 CASAVA_Build 9 112994620 1I AATTTTTTCC -/T TTTTTAATTA 3070 het 401 hom 24 3 13 8 T 5 6 348624 CASAVA_Build 9 112996094 1D ACTCACTCAG A/- AAAAAGGTCT 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 A 6 5 348625 CASAVA_Build 9 113009012 1D AAATATTGTT C/- TTTTTGGCAT 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 C 1 0 348626 CASAVA_Build 9 113014715 1D AGTTGTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 13 12 348627 CASAVA_Build 9 113018239 2D TAGGTTGTCA AT/-- TTGTGCTCTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 AT 1 0 348628 CASAVA_Build 9 113018786 2D CAACCAAAAC AT/-- ATGTCTGTGA 3070 het 3070 ref 57 29 23 6 AT 2 1 348629 CASAVA_Build 9 113020360 24D GAGGCCATTG CAGAAGTGAAATTTCCATACTATA/------------------------ CAGTTGTGAG 3070 het 3070 ref 42 36 11 6 CAGAAGTGAAATTTCCATACTATA 1 0 348630 CASAVA_Build 9 113022725 3I AAACATCAGG ---/AAA AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 7 10 348631 CASAVA_Build 9 113023309 1D CAAGTGGTTC A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 A 8 7 348632 CASAVA_Build 9 113026359 1I TCGCAAGGAC -/A AAAAAACCAA 967 hom 5 het 4 0 2 2 A 6 7 348633 CASAVA_Build 9 113030627 1D CCCTTATGCC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 26 0 23 5 T 9 8 348634 CASAVA_Build 9 113031584 1D CATAATAGAT A/- ACTTAAATGA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 A 2 1 348635 CASAVA_Build 9 113031841 1I ACCCTCAAGG -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 5 6 348636 CASAVA_Build 9 113032887 1I AATTTTTACC -/T GTCAATTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 1 348637 CASAVA_Build 9 113044167 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 2768 hom 21 het 8 0 8 0 A 7 8 348638 CASAVA_Build 9 113049618 3D GCAAAAGGTT AAC/--- AATGATTGAA 3070 het 3070 ref 43 25 13 6 AAC 1 0 348639 CASAVA_Build 9 113050162 1D GTAAGGAAAT A/- AAAAACATTG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 A 6 5 348640 CASAVA_Build 9 113053612 2I TTTCTACATT --/AA GTTAGAATTG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 0 2 348641 CASAVA_Build 9 113064538 3D AAAAAAAAAA AAG/--- ATTTGTCTTC 3070 het 2924 hom 27 10 13 5 AAG 1 0 348642 CASAVA_Build 9 113066113 4D ATAACAAGAT CTAA/---- CTAACTGTTT 3070 het 3070 ref 47 26 11 13 CTAA 2 1 348643 CASAVA_Build 9 113073593 1I CGTTTCAAGT -/G TTCCCTTTTC 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 0 1 348644 CASAVA_Build 9 113081560 2D CTTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 23 2 12 9 TA 1 0 348645 CASAVA_Build 9 113103819 2I AACAAACTGG --/AA AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 8 10 348646 CASAVA_Build 9 113114079 1I ACTATCCTTT -/C CCCATTGGAT 3070 het 3070 ref 48 24 23 1 C 3 4 348647 CASAVA_Build 9 113124508 27I TTCTATTGTG ---------------------------/AGCACTCTTCCTGTGTTCATCAGGTCC AGCACTCTTC 3070 het 3070 hom 35 17 17 3 AGCACTCTTCCTGTGTTCATCAGGTCC 0 1 348648 CASAVA_Build 9 113128012 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2928 hom 21 11 8 2 A 13 12 348649 CASAVA_Build 9 113128130 1I TAGATGTATG -/T TTTTTTAATT 3070 het 2904 hom 29 9 15 5 T 6 7 348650 CASAVA_Build 9 113164278 1D ATTCTGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1883 hom 28 8 14 7 A 12 11 348651 CASAVA_Build 9 113219848 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1787 het 1174 hom 13 4 5 4 A 12 13 348652 CASAVA_Build 9 113223196 1I CCTTTGTCCA -/T TAACATATGA 3070 het 3070 ref 58 32 16 10 T 1 2 348653 CASAVA_Build 9 113226678 3I AGCAGGGAAA ---/AAT GGGATTCAAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AAT 0 1 348654 CASAVA_Build 9 113228796 1D GTCTCACTTC A/- AAAAAAAAAA 2191 het 347 hom 17 4 7 8 A 18 17 348655 CASAVA_Build 9 113266372 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1442 het 913 hom 19 4 5 11 A 17 16 348656 CASAVA_Build 9 113284961 1D GGTGACCACC G/- CTCTCCCCAG 1416 het 686 hom 11 3 5 4 G 1 0 348657 CASAVA_Build 9 113307407 10D GCTTCAGGCC TGCAATCAGG/---------- AAGCGTGGTG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 TGCAATCAGG 1 0 348658 CASAVA_Build 9 113310464 2D GGATGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1380 het 1380 ref 41 24 3 15 GT 10 9 348659 CASAVA_Build 9 113311687 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAATAC 1542 het 1542 ref 11 5 5 1 A 7 8 348660 CASAVA_Build 9 113325521 1D4M3D AAAGCTTGAG TAAGCTTT/-AACC--- ACTAAGTAAA 3070 het 3070 ref 35 21 14 2 N/A 0 0 348661 CASAVA_Build 9 113327603 2I TTGTTTTGTT --/TG TGTGGTGTGG 2104 het 2104 ref 33 15 9 9 TG 2 3 348662 CASAVA_Build 9 113331250 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG GATTGATTTC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 AAAG 0 1 348663 CASAVA_Build 9 113335773 1D AGCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1519 het 1519 ref 49 38 4 7 A 11 10 348664 CASAVA_Build 9 113343190 1D AGTTTGAACC T/- TTTTTTTTTT 731 het 310 hom 29 6 5 18 T 19 18 348665 CASAVA_Build 9 113350919 1D CAGTTGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 12 10 T 13 12 348666 CASAVA_Build 9 113354076 1I TTGAAAAATG -/T TGAGTTATTC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 1 2 348667 CASAVA_Build 9 113354897 6D TTTATTATTA AAATAT/------ AAATATTCTA 3070 het 3070 hom 36 11 23 2 AAATAT 2 1 348668 CASAVA_Build 9 113359545 1D ACTCATTATC T/- TTTTTTTGCT 1851 het 1851 ref 28 16 6 6 T 8 7 348669 CASAVA_Build 9 113379192 1I AAACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1997 hom 21 6 12 3 A 13 14 348670 CASAVA_Build 9 113384626 3I TTCCAAAGGT ---/ATA AGCCCATAAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 ATA 0 1 348671 CASAVA_Build 9 113393065 4I AATAATTGAT ----/AGAA AGCAGTTTTC 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 AGAA 0 1 348672 CASAVA_Build 9 113396020 1D TTTCTTTTAA G/- GTTTTTTTTT 2118 het 1247 hom 25 6 13 6 G 2 1 348673 CASAVA_Build 9 113400938 1I GTTTACTCTG -/T TTATTTCGAA 3070 het 3070 hom 42 21 17 4 T 2 3 348674 CASAVA_Build 9 113423020 1D AATTTCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1395 hom 17 5 11 1 T 12 11 348675 CASAVA_Build 9 113423159 6I AGTAGCTGGG ------/ACTACA ACTACAGGCG 3070 het 744 hom 13 3 9 1 ACTACA 1 2 348676 CASAVA_Build 9 113431970 2I TCTTTCTCAT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 TA 7 8 348677 CASAVA_Build 9 113434791 1D TTTTCTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 25 0 13 12 T 13 12 348678 CASAVA_Build 9 113440732 4D GTAGTAACTC TAAT/---- TAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 42 20 19 7 TAAT 1 0 348679 CASAVA_Build 9 113455486 2D CCCTTAAAAC TT/-- TATACATAAG 3070 het 3070 hom 33 13 19 2 T 3 1 348680 CASAVA_Build 9 113461332 4I CGTGGCTGAT ----/ACAC ACAGTATGAC 3070 het 3070 hom 64 22 33 9 AC 1 3 348681 CASAVA_Build 9 113461446 1I GGAGACATCT -/C TCACATTAAC 3070 het 3070 hom 54 22 26 6 C 0 1 348682 CASAVA_Build 9 113465923 7D AAAGATATTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTG 3070 het 1768 hom 21 7 10 4 T 16 9 348683 CASAVA_Build 9 113469340 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTGA 696 het 696 ref 32 14 4 14 TTC 1 0 348684 CASAVA_Build 9 113478695 1D ATTTTTTTTT A/- ACCTTCTCAT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 2 1 348685 CASAVA_Build 9 113479300 1D ACTGTATGCA G/- TATTTTATAC 3070 het 3070 hom 47 21 22 6 G 1 0 348686 CASAVA_Build 9 113485331 2D TAAATGCAAT TC/-- TCTGTCTTTG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TC 2 1 348687 CASAVA_Build 9 113489857 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 T 11 10 348688 CASAVA_Build 9 113490930 1I TTTCCCTCAT -/G AGCTTGATCC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 G 0 1 348689 CASAVA_Build 9 113491702 12D CTATGGAAAA ATAAATTTTTTT/------------ TAATTTAAAT 3070 het 3070 ref 24 15 8 2 ATAAATTTTTTT 1 0 348690 CASAVA_Build 9 113492196 4I CATGAAAATC ----/ATAA ATAAATATTA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 ATAA 1 2 348691 CASAVA_Build 9 113496144 4I GAAAAGAGTT ----/TAAG TAATAGTCAG 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 TAAG 0 1 348692 CASAVA_Build 9 113497188 1D CTCTCTTCTG A/- AATGTCAACC 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 A 3 2 348693 CASAVA_Build 9 113498762 1D ATTTGGATCA T/- GCCCTCCATG 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 1 0 348694 CASAVA_Build 9 113502444 1I CTTTATGACC -/A AAATCCTAGC 3070 het 3070 hom 49 17 24 8 A 3 4 348695 CASAVA_Build 9 113506848 1D ACATCTAATG T/- TGGTATGACC 3070 het 3070 ref 48 26 21 1 T 2 1 348696 CASAVA_Build 9 113507525 1I GCTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 12 11 T 11 12 348697 CASAVA_Build 9 113509496 1D CCAATATTTG A/- AAAAAAATAA 1044 het 1044 ref 21 14 3 4 A 8 7 348698 CASAVA_Build 9 113524831 5D GTATAAAAAC TTATT/----- TTAAGATATT 3070 het 3070 hom 21 9 12 1 TTATT 1 0 348699 CASAVA_Build 9 113535141 1D TAAGCATCTC T/- TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 T 8 7 348700 CASAVA_Build 9 113536337 3D CGGAATTATC ATA/--- ATAATTTATT 3070 het 3070 ref 31 17 13 3 ATA 2 1 348701 CASAVA_Build 9 113536916 1I TTTTGTGATT -/A AAAATATAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 4 5 348702 CASAVA_Build 9 113539762 4D24M3D CTATGTCTCA AAACAAACAAACAAACAATAAAAACAAACCC/----AAACAAACAAACAATAAAAACAAA--- CCCCCCCCAC 3070 het 2095 hom 20 11 9 6 N/A 0 0 348703 CASAVA_Build 9 113539907 3D ACATTTTTGC CTT/--- CTTAAGTTGT 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 CTT 2 1 348704 CASAVA_Build 9 113542001 4D TACATTCTTC CAGA/---- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 35 13 19 8 CAGA 1 0 348705 CASAVA_Build 9 113557302 1I TTTACATTTG -/C ATTTACGGAG 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 C 0 1 348706 CASAVA_Build 9 113569140 1D TTTAATTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 17 8 T 11 10 348707 CASAVA_Build 9 113569352 1I GATCCTATAC -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 A 6 7 348708 CASAVA_Build 9 113570983 1I ATTCAGTATG -/A AAGTTAACTA 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 2 3 348709 CASAVA_Build 9 113587516 1I TCTTTTAAGT -/A ACTGTGTCCT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 A 1 2 348710 CASAVA_Build 9 113591251 2I TTCTCAAGAC --/TT TTTAATGTTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 3 5 348711 CASAVA_Build 9 113592742 1D ACTTCCCAGA T/- TTCAAGTGAT 2657 het 1144 hom 15 4 8 3 T 3 2 348712 CASAVA_Build 9 113598591 1D AAATTATTAC T/- TTTAAAAATA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 T 4 3 348713 CASAVA_Build 9 113598821 1D ATATTGCCAA T/- TTTTCCTTCC 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 T 5 4 348714 CASAVA_Build 9 113600884 4D AAAAAAAAAG AAAA/---- AAAAGAAAAG 3070 het 1942 hom 20 8 11 3 A 8 4 348715 CASAVA_Build 9 113618412 2D AGTCATATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1741 het 1741 ref 22 9 6 8 T 18 16 348716 CASAVA_Build 9 113625672 2I AGAAAGAAAG --/AA AAAGAAAGAA 1361 hom 10 het 5 0 4 1 A 3 5 348717 CASAVA_Build 9 113625910 4I AGAAAGAGAA ----/AGAG AGAGAGAAAG 3070 het 2951 hom 27 13 12 2 AG 3 5 348718 CASAVA_Build 9 113632110 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 13 8 A 11 10 348719 CASAVA_Build 9 113640868 2D TCTTTGCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2857 hom 38 12 13 13 T 14 12 348720 CASAVA_Build 9 113651737 1D CAGCTATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 A 11 10 348721 CASAVA_Build 9 113668899 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1381 het 1381 ref 33 27 3 4 A 13 12 348722 CASAVA_Build 9 113672130 1I CTTATTTAAC -/A AAAATGGGAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 4 5 348723 CASAVA_Build 9 113673169 2D CACAGAAGTC TG/-- TGTTGATTGT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 TG 2 1 348724 CASAVA_Build 9 113679997 1D TCTATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1955 hom 29 8 12 9 T 15 14 348725 CASAVA_Build 9 113686378 1I GCCTCGGCTT -/C CCCAAAGTGC 3070 het 3070 ref 23 13 9 1 C 3 4 348726 CASAVA_Build 9 113693074 1D AAAAAAAAAA C/- CAAAAAACAT 2768 het 1923 hom 31 9 15 7 C 2 1 348727 CASAVA_Build 9 113694309 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTAATTA 2943 het 2943 ref 27 17 8 2 T 6 5 348728 CASAVA_Build 9 113696285 1I CATACTGTAT -/A AAAATCCTTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 A 4 5 348729 CASAVA_Build 9 113706181 1I AGAATGATTG -/C CCCCAGGCTG 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 C 4 5 348730 CASAVA_Build 9 113716868 5D TGTTACGGTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 ref 42 20 13 11 TTTTG 5 4 348731 CASAVA_Build 9 113725465 1D GCCATTAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1111 hom 24 4 14 6 T 13 12 348732 CASAVA_Build 9 113726751 4D TAGAGAATGT TAAA/---- TAATATGAAA 3070 het 3070 hom 38 14 22 5 TAAA 1 0 348733 CASAVA_Build 9 113743037 5D ACTAACAGTG GTCAT/----- TACTAACAGG 1144 het 1144 ref 41 26 3 12 GTCAT 1 0 348734 CASAVA_Build 9 113748969 1I AAAATAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 11 12 348735 CASAVA_Build 9 113749271 1D TAAAACAATC G/- TTTTTTAAAA 3070 het 2161 hom 23 5 14 5 G 1 0 348736 CASAVA_Build 9 113750514 3I ACTCCATCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 2713 het 1909 hom 26 6 12 8 A 11 14 348737 CASAVA_Build 9 113751471 1I AGTGAGCCTC -/A TCTTACCAGC 3070 het 3070 hom 46 22 22 2 A 0 1 348738 CASAVA_Build 9 113751766 1D AATTTTTTTT G/- TTTTGAGAGG 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 G 1 0 348739 CASAVA_Build 9 113753132 1I GCATATCCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 9 10 348740 CASAVA_Build 9 113756438 2D AGACTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 39 1 28 10 A 15 13 348741 CASAVA_Build 9 113756748 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 34 1 24 9 T 11 10 348742 CASAVA_Build 9 113760783 1D GGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1256 hom 27 3 20 4 T 12 11 348743 CASAVA_Build 9 113762270 1I CAAGGCTAGA -/G GGGGGAGGTC 3070 het 3070 hom 50 15 21 14 G 5 6 348744 CASAVA_Build 9 113768483 4I GTCTCAAAAC ----/AACA AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 AACA 2 3 348745 CASAVA_Build 9 113770242 1I GGTGGGTATC -/T TTTTTTTTTT 2967 het 1148 hom 24 6 9 10 T 15 16 348746 CASAVA_Build 9 113773210 2I TATTTGTGAA --/TT TTTCCTCTAC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 3 5 348747 CASAVA_Build 9 113779747 1D TGATTTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 593 hom 26 2 17 8 A 15 14 348748 CASAVA_Build 9 113780921 1I CACAGTTTTA -/C AAGTGAGTAA 3070 hom 144 het 55 0 49 6 C 0 1 348749 CASAVA_Build 9 113791321 1D GCTCTTCTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 15 0 13 3 A 10 9 348750 CASAVA_Build 9 113794265 1D ATACTATCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 T 10 9 348751 CASAVA_Build 9 113802847 3I TCACTTGGCC ---/TGA TATTATTCTG 3070 hom 83 het 33 0 28 5 TGA 0 1 348752 CASAVA_Build 9 113815464 1I CGGCCTTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 10 11 348753 CASAVA_Build 9 113830452 2I2M4D CTTACCAGGA --GTAAGG/TCCT---- GCCAGTGCCC 3070 hom 141 het 50 0 45 10 N/A 0 0 348754 CASAVA_Build 9 113833499 2I ACTCAACAGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 10 12 348755 CASAVA_Build 9 113841614 3D TATTGCACAT AAA/--- AATTAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 7 11 7 A 5 2 348756 CASAVA_Build 9 113860296 1I GAGTAAAAAC -/A AAAACCAGGT 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 4 5 348757 CASAVA_Build 9 113866979 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1243 het 834 hom 23 9 7 7 A 17 16 348758 CASAVA_Build 9 113892258 1I GGCAGAAAAT -/A AAAGATAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 3 4 348759 CASAVA_Build 9 113899121 1I TCAATCTGAT -/A AAAAAAAATA 2683 het 2683 ref 25 12 8 5 A 8 9 348760 CASAVA_Build 9 113924640 1I AAGTGATCCA -/C CTGCCTCAGC 3070 het 3070 ref 16 8 8 0 C 1 2 348761 CASAVA_Build 9 113944029 2D ACTTCTGGGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1443 hom 12 3 9 0 AT 8 7 348762 CASAVA_Build 9 113946915 1D CTTTTGCAGA T/- TTTTTTGCAC 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 7 6 348763 CASAVA_Build 9 113948282 1D ATTCTGAAAG A/- AACAGTATTA 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 A 3 2 348764 CASAVA_Build 9 113949953 4I TGCTTTTTTT ----/TTAG TTAGTGTCTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 TTAG 1 2 348765 CASAVA_Build 9 113955035 1I TTTTAATTGG -/A AAAAAAAATG 2943 het 2734 hom 18 7 7 5 A 8 9 348766 CASAVA_Build 9 113957981 3D AGGAAGAAGG AGA/--- AGGAGAGAGG 3070 het 2731 hom 19 8 9 2 AGA 1 0 348767 CASAVA_Build 9 113959926 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2960 het 2134 hom 36 12 11 13 T 16 15 348768 CASAVA_Build 9 113960332 1D CTAACTACTC T/- TTCCCTAACA 3070 het 3070 ref 50 27 18 6 T 3 2 348769 CASAVA_Build 9 113961100 1I ACCCTACTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 T 11 12 348770 CASAVA_Build 9 113962892 4D AAATTTCAGA AGAC/---- AGACATAAGG 3070 het 3070 hom 51 19 26 7 AGAC 2 1 348771 CASAVA_Build 9 113963922 1D GACTCCATCC A/- AAAAAAAAAA 3013 het 270 hom 23 4 11 8 A 19 18 348772 CASAVA_Build 9 113969215 2I AGTTCTCCAA --/TT TTTTTTTTTG 3020 het 3020 ref 45 24 13 9 T 9 11 348773 CASAVA_Build 9 113975513 1I GACCCTCTTT -/C CCCCCGCCTC 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 C 5 6 348774 CASAVA_Build 9 113976147 10D TCCCTGAGAC GGCTTCCAGT/---------- GGCTTCCAGG 3070 het 3070 hom 28 11 12 7 GGCTTCCAGT 1 0 348775 CASAVA_Build 9 113984852 1D ATAGAATGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 T 10 9 348776 CASAVA_Build 9 113986645 1D GGCCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 A 11 10 348777 CASAVA_Build 9 113998139 1I AAAAAATGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 9 10 348778 CASAVA_Build 9 113999059 1I TAAAAAAAAA -/C AAAAACCTAG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 0 1 348779 CASAVA_Build 9 113999853 1I ATCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1848 hom 17 4 10 3 A 10 11 348780 CASAVA_Build 9 114001008 2D GGCTCCACCC CT/-- GTTTTGGGCT 3070 het 3070 ref 50 31 12 7 CT 1 0 348781 CASAVA_Build 9 114005800 3I TTTGACTTTT ---/TAA TAATAGCCAT 3070 het 3070 hom 46 19 17 10 TAA 1 2 348782 CASAVA_Build 9 114006072 2I CTGTTCACTC --/TT TTGATAGTTT 3070 het 3070 ref 34 20 13 1 T 2 4 348783 CASAVA_Build 9 114006686 2I ATCCATGCAC --/AT AGAGTGTTTT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 AT 0 1 348784 CASAVA_Build 9 114008797 3I TCACTTAATC ---/CTT CTTATCAGCA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 CTT 1 2 348785 CASAVA_Build 9 114015960 1D AATAAATTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 15 14 7 A 10 9 348786 CASAVA_Build 9 114025843 4I TATCAAACTC ----/AGAA AGAGTTATTT 3070 het 2508 hom 29 6 17 6 AGAA 0 1 348787 CASAVA_Build 9 114027433 4I CAATGAAAAT ----/ACTG ACCTTACTTC 3070 het 3070 hom 56 28 26 2 ACTG 0 1 348788 CASAVA_Build 9 114030663 9I AGGCATTTCT ---------/TATACTATA TACTCTCCCT 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 TATACTATA 0 1 348789 CASAVA_Build 9 114032485 1D AAAATCTTAC A/- AATGAAGCAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 3 2 348790 CASAVA_Build 9 114036044 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAGA 790 het 790 ref 25 11 3 11 A 8 9 348791 CASAVA_Build 9 114036194 2D TAGGCTTACC AA/-- ACTCTGTCAT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 A 3 1 348792 CASAVA_Build 9 114040813 4D TGACAACTGA CTTT/---- CTAAGAGCAA 3070 het 3070 ref 42 25 12 5 CTTT 1 0 348793 CASAVA_Build 9 114042750 1I CTCCTACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 15 6 T 11 12 348794 CASAVA_Build 9 114044510 3I GAGCACTAAA ---/ATT ATAATTTACA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 ATT 0 1 348795 CASAVA_Build 9 114049654 1D AAAAAATGAC A/- AAAAAAAAAA 2580 het 2580 ref 27 14 9 5 A 13 12 348796 CASAVA_Build 9 114058959 5I TTTTTAAAGC -----/TTTTT TTTCATTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 3 8 348797 CASAVA_Build 9 114072050 1I CCAAATCTTC -/T TTTTTTTTTT 1760 het 988 hom 20 7 4 9 T 14 15 348798 CASAVA_Build 9 114077241 1I ATACTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2778 hom 31 9 18 4 T 11 12 348799 CASAVA_Build 9 114082015 1D TCAGTAACAC T/- TTTAAATTTT 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 4 3 348800 CASAVA_Build 9 114082888 2D GTGTGTGTGC AT/-- ATATATATAT 367 het 367 ref 23 9 4 11 AT 7 6 348801 CASAVA_Build 9 114082955 4I GAGATACAAC ----/AATT ATTTACATAA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 AATT 0 1 348802 CASAVA_Build 9 114084099 2I GCTGACTTTT --/CA CAGTGTCCTC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 CA 1 2 348803 CASAVA_Build 9 114086225 2I GAGCCCGTAC --/AT ATATAGTCCC 3070 het 3070 ref 38 22 9 7 AT 2 3 348804 CASAVA_Build 9 114087062 1I CTTTTGGGTT -/A ATGTTGGAAT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 1 2 348805 CASAVA_Build 9 114087150 1I GGGAGGGGCC -/A GGGGCAGAAT 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 0 1 348806 CASAVA_Build 9 114089294 1I CCACATATAT -/G GAAGATTTAG 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 G 1 2 348807 CASAVA_Build 9 114093331 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 10 11 348808 CASAVA_Build 9 114094071 1I CATACGTGAT -/A GGGGGTTAAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 0 1 348809 CASAVA_Build 9 114099922 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAACTCA 3070 het 2592 hom 30 10 17 3 C 0 1 348810 CASAVA_Build 9 114103558 1D TGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 11 10 348811 CASAVA_Build 9 114104499 14D AAGTTACCTG CTGTGAGGAACCAA/-------------- CTCTTTTCAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 4 CTGTGAGGAACCAA 1 0 348812 CASAVA_Build 9 114107362 1D CTGAAAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1856 hom 41 9 15 17 T 17 16 348813 CASAVA_Build 9 114114694 4I GGGAAATGAT ----/AAAC AAATGAAAAA 3070 het 1596 hom 16 4 12 0 AAAC 0 1 348814 CASAVA_Build 9 114115311 1I TTAATAAGAC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 6 7 348815 CASAVA_Build 9 114121817 2D TGAAAAGACA TC/-- TGCATTCCCA 3070 het 3070 hom 39 19 19 2 TC 1 0 348816 CASAVA_Build 9 114122454 2I AATGATAAGT --/GA GACAATGCAT 1456 het 798 hom 7 2 3 2 GA 1 2 348817 CASAVA_Build 9 114128118 4I GACCCTGTCT ----/CAAA CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 45 14 18 13 CAAA 3 4 348818 CASAVA_Build 9 114131515 1D GCTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2062 hom 21 6 11 6 A 12 11 348819 CASAVA_Build 9 114134163 5D TGCAACTGAA TAAGG/----- TAATGTGAAA 3070 het 3070 ref 32 17 15 4 TAAGG 1 0 348820 CASAVA_Build 9 114134485 3I GAAGATTTCA ---/TCT TCTTCAAATA 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 TCT 1 2 348821 CASAVA_Build 9 114138626 1D TCACACCTGT A/- AATCACAGCA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 3 2 348822 CASAVA_Build 9 114140463 4D GATTGCACTG TGTC/---- TGTGTGCTGC 3070 het 3070 hom 54 24 27 4 TGTC 1 0 348823 CASAVA_Build 9 114141668 1D CTTTTCACTC T/- TTTTTTTTTT 1109 het 1109 ref 31 23 3 5 T 12 11 348824 CASAVA_Build 9 114145314 1I CTCTGAACAA -/T TTTTTTTTTT 1818 het 1818 ref 26 10 5 11 T 13 14 348825 CASAVA_Build 9 114145892 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 14 11 6 A 15 14 348826 CASAVA_Build 9 114161942 1I ACAAAACACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 10 11 348827 CASAVA_Build 9 114163658 5I AAATTTCTAC -----/CTTCT CTTATTTTCC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CTTCT 0 1 348828 CASAVA_Build 9 114167270 4D TCTATCTATC TATG/---- TATCTATATA 3070 hom 99 het 38 0 32 8 TATG 1 0 348829 CASAVA_Build 9 114168383 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 458 hom 20 1 16 3 A 12 13 348830 CASAVA_Build 9 114170629 1D AAATCTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 29 1 26 3 T 11 10 348831 CASAVA_Build 9 114175138 1I TGGGACTACA -/G GTGCCCGCCA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 G 1 2 348832 CASAVA_Build 9 114180212 3I AAGTCCTCTC ---/CTT CTTCACCCAT 3070 het 3070 hom 41 13 22 6 CTT 1 2 348833 CASAVA_Build 9 114181600 2D TTGCAGAGAG CT/-- CTGTTCCAAG 3070 het 3070 hom 30 10 18 2 CT 2 1 348834 CASAVA_Build 9 114185043 1D AACCAAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 T 15 14 348835 CASAVA_Build 9 114185572 2I TATAGTCAGA --/TT TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 T 7 9 348836 CASAVA_Build 9 114188730 1D CAAAAAAAAA T/- AAAAATTAAC 2177 het 1330 hom 28 7 8 14 T 1 0 348837 CASAVA_Build 9 114201170 4I CACTTAGGAA ----/AAAG AAAGCCACTT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 AAAG 1 2 348838 CASAVA_Build 9 114205301 1I TTTTAAAACC -/T TTTAATCATC 3070 het 3070 ref 31 12 14 5 T 3 4 348839 CASAVA_Build 9 114212761 15D GGCATGGCGG CTCATGCTTGTAATC/--------------- CCAGCACTTT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 CTCATGCTTGTAATC 1 0 348840 CASAVA_Build 9 114214391 1D AAAAGGTTTT A/- GACTGGGTTT 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 A 1 0 348841 CASAVA_Build 9 114215601 5D AAAAAGAAAA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 hom 15 het 15 0 8 8 AAAAG 3 2 348842 CASAVA_Build 9 114216698 1I ATAGATCAAA -/G GGAAAGCCCA 3070 het 3070 hom 56 22 27 7 G 2 3 348843 CASAVA_Build 9 114217059 1I CAGGGTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 10 11 348844 CASAVA_Build 9 114218732 3D GGCATGGTGG TGC/--- TGCACACCTG 3070 het 1874 hom 24 6 10 8 TGC 2 1 348845 CASAVA_Build 9 114219138 1I AATCTGCACA -/T TAACATTCAT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 T 1 2 348846 CASAVA_Build 9 114220271 3D ATTTTAATCA AAT/--- ATTAGGAGGG 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 AAT 1 0 348847 CASAVA_Build 9 114220664 1I AGCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2502 het 2241 hom 25 12 8 5 A 15 16 348848 CASAVA_Build 9 114221277 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 5 6 348849 CASAVA_Build 9 114222616 2I TTAAAAAAAA --/AC AAACACACAC 3070 het 2772 hom 45 10 27 8 AC 0 1 348850 CASAVA_Build 9 114227706 17D CTGTGAGAGC CTTTGAGCTTTCATATT/----------------- CTTGGTGTCA 3070 het 3070 ref 41 30 14 3 CTTTGAGCTTTCATATT 1 0 348851 CASAVA_Build 9 114239668 2D CCCACAAGAA TG/-- TGTGCATGTG 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 TG 3 2 348852 CASAVA_Build 9 114240937 4D TTTTGAAGTG ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 9 12 9 AT 10 8 348853 CASAVA_Build 9 114246524 1D AATTGATGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 10 9 348854 CASAVA_Build 9 114247934 1I CAAAGCTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 T 9 10 348855 CASAVA_Build 9 114248213 1I CATCAGGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 180 hom 37 2 28 7 T 10 11 348856 CASAVA_Build 9 114249919 4D TGTTTTTATT AAAC/---- AAATTGAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AAAC 1 0 348857 CASAVA_Build 9 114250407 5D TCATTAAAAC TATTT/----- TATTTTAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 TATTT 2 1 348858 CASAVA_Build 9 114250609 16D25M3D TCTTTCACCT CTTTCTTTCTTTCCTCCTTTCTTTCTTTCCTTCTTTCTCTCTCT/----------------CTTTCTTTCTTTCCTTCTTTCTCTC--- TTTTATTTTT 3070 hom 45 het 20 0 15 10 N/A 0 0 348859 CASAVA_Build 9 114250813 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2284 hom 18 het 9 0 6 3 T 11 10 348860 CASAVA_Build 9 114251182 3D CTTTCCTCTG TTT/--- TTTTTTTTTT 1647 het 354 hom 21 5 6 10 T 19 16 348861 CASAVA_Build 9 114256044 4D TGTCCTGCTG ATTA/---- ATTAATTCTG 3070 hom 108 het 39 0 37 3 ATTA 2 1 348862 CASAVA_Build 9 114257420 1D TATACACAAA C/- CTTTTTTATT 3070 hom 87 het 36 0 28 9 C 2 1 348863 CASAVA_Build 9 114260205 2D AGTGCCACTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 128 het 52 0 42 11 T 11 9 348864 CASAVA_Build 9 114262840 2I GAATGAAACC --/CT GTCTCAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 28 4 CT 0 1 348865 CASAVA_Build 9 114265799 4I ACAGTCTTGC ----/TCTG TCTCCTAGGC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 TCTG 0 1 348866 CASAVA_Build 9 114268664 2D AAAAAAAAAA AT/-- CTTCATATAT 3070 hom 81 het 32 0 26 6 AT 1 0 348867 CASAVA_Build 9 114269308 1I CAAAGTGTGG -/T TATATACATA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 1 2 348868 CASAVA_Build 9 114270149 4D ACTCTCTTGA TTGT/---- TTGTCTGGGT 3070 hom 102 het 39 0 35 5 TTGT 2 1 348869 CASAVA_Build 9 114283458 2I ATTTTTCATT --/CG CTTCGAGAGA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 CG 0 1 348870 CASAVA_Build 9 114284551 1D TCCTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 33 2 19 13 T 11 10 348871 CASAVA_Build 9 114287668 2I GCTACCTAAA --/AG AGAGAACATG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AG 2 3 348872 CASAVA_Build 9 114289959 2I CCTTCAAGTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 9 11 348873 CASAVA_Build 9 114291576 1I TGTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1936 hom 30 7 12 11 T 13 14 348874 CASAVA_Build 9 114293669 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3062 het 3062 ref 28 11 12 5 T 10 11 348875 CASAVA_Build 9 114295267 1D CTTTTAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 50 0 38 12 T 11 10 348876 CASAVA_Build 9 114304466 80D7M4D CTGAGTCATG GCTCATGCCATGCTTTAATGCTGAGCTTTAATGTTTTTAAACATTAAATGTGTTTAAAACTCATAAATGCTGAGTTTAATGTGTTTAAAGT/--------------------------------------------------------------------------------GGGTATA---- CATGCTGAGC 3070 hom 33 het 9 0 11 4 N/A 0 0 348877 CASAVA_Build 9 114306027 2D GGTTATAAAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TA 10 9 348878 CASAVA_Build 9 114309246 1I ATAAAGCATG -/A AAATTGTGAC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 3 4 348879 CASAVA_Build 9 114311187 1D TACATTTAAT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 G 1 0 348880 CASAVA_Build 9 114319231 35D8M1D GGAGGCAGCT TCCATATTTAATATATTAATTCCATATATTAATTATTATTCCAT/-----------------------------------TTAGGCTA- ATATTAATTT 3070 hom 72 het 23 0 24 11 N/A 0 0 348881 CASAVA_Build 9 114327149 2I TGTCTTTATG --/AT ATAAGATTTT 3070 hom 105 het 36 0 36 0 AT 1 2 348882 CASAVA_Build 9 114328359 1D AACTGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 28 1 23 4 T 11 10 348883 CASAVA_Build 9 114330854 1I GTCCTGACTT -/C AGGTGATCCG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 C 0 1 348884 CASAVA_Build 9 114331944 1D CTCCTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 294 hom 29 1 25 3 T 11 10 348885 CASAVA_Build 9 114335525 1I AAATACAAAG -/A AAAAAAAAAA 1858 het 397 hom 9 1 5 3 A 10 11 348886 CASAVA_Build 9 114341959 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTCTATT 3070 hom 99 het 38 0 31 7 T 6 5 348887 CASAVA_Build 9 114343453 3D AAATTAAATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 5 A 14 11 348888 CASAVA_Build 9 114346664 1I CAAAGTCATG -/T TGACTATTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 1 2 348889 CASAVA_Build 9 114349134 3D CCTGGGTTCA AGC/--- GATTCTCCTG 3070 hom 45 het 19 0 15 4 AGC 1 0 348890 CASAVA_Build 9 114349343 1D AGCTGGGAGT G/- GGGTGCGTGC 3070 hom 32 het 13 0 10 3 G 4 3 348891 CASAVA_Build 9 114349699 2D CTGACAAAAC AG/-- ACTCTTTGTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AG 1 0 348892 CASAVA_Build 9 114359267 1D CACTCTATTA C/- CTAGGCTGGC 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 C 2 1 348893 CASAVA_Build 9 114360463 3I ATAAGTAGAT ---/TAA TGAGTCAGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TAA 0 1 348894 CASAVA_Build 9 114362309 1D CTTTTTTTTT C/- TTTTTTTGAA 1734 het 672 hom 15 2 9 4 C 1 0 348895 CASAVA_Build 9 114379878 1D AGCCTATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2744 hom 32 9 20 3 A 12 11 348896 CASAVA_Build 9 114382888 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 27 1 17 9 A 12 11 348897 CASAVA_Build 9 114399123 1D TTCATCTCTT A/- AAATTCATCA 3070 hom 117 het 42 0 39 4 A 4 3 348898 CASAVA_Build 9 114401484 1D GATTTAAGGG T/- TTTGTAAACT 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 4 3 348899 CASAVA_Build 9 114414683 4D AAATCTTCTA AAAG/---- AAATGCAAAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 AAAG 1 0 348900 CASAVA_Build 9 114415730 2D TTCTACAAAC AG/-- AAAAAAGCAG 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 AG 1 0 348901 CASAVA_Build 9 114419223 6D ATAAAGTAAT AAAAAG/------ AAACAGTGGA 3070 het 3070 ref 47 28 17 6 AAAAAG 1 0 348902 CASAVA_Build 9 114423161 3D CATTCCAGAG TTT/--- TTTTCTATTT 3070 het 3070 hom 29 14 12 4 T 7 4 348903 CASAVA_Build 9 114427138 3I CCCTCCCCTC ---/CTT CTTTGAGACT 3070 hom 76 het 32 0 23 9 CTT 1 2 348904 CASAVA_Build 9 114435010 1D GGAAACAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1777 hom 30 8 12 10 T 15 14 348905 CASAVA_Build 9 114446684 14I AAGAAAAGCC --------------/AGCTAAGGGTTGTG AGCTAGTTAT 3070 het 3070 hom 50 19 25 6 AGCTAAGGGTTGTG 0 1 348906 CASAVA_Build 9 114447123 2D ATAATCCCAG CT/-- ACTTGGGAGG 3070 het 2355 hom 22 6 11 5 CT 1 0 348907 CASAVA_Build 9 114453499 1D TATATACATA T/- TTTTTTTTTT 1771 het 1071 hom 12 3 5 4 T 13 12 348908 CASAVA_Build 9 114467136 1I ATTAAAGTGC -/T TTATTATTTA 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 T 2 3 348909 CASAVA_Build 9 114494836 1D TACAAAACTC A/- AAAAAAAAAA 1222 het 1222 ref 30 22 4 5 A 13 12 348910 CASAVA_Build 9 114564008 1D AAGATGGAGA G/- GTTTGAGGTC 3070 hom 111 het 43 0 34 9 G 2 1 348911 CASAVA_Build 9 114573216 9D CCACCAGACA TACTTGGTT/--------- TACTTTCTCC 3070 hom 74 het 29 0 24 6 TACTTGGTT 1 0 348912 CASAVA_Build 9 114580993 1D GAGAGAACTT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 41 het 27 0 16 11 G 11 10 348913 CASAVA_Build 9 114584781 1I TAGTTATCAT -/G TATTAAAACT 3070 hom 141 het 55 0 48 7 G 0 1 348914 CASAVA_Build 9 114587485 1D CCTGGCTAAG T/- TTTTTTTTTT 2184 het 531 hom 20 2 8 10 T 17 16 348915 CASAVA_Build 9 114596205 1I GTTTTACAAC -/A AAAATCAACA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 4 5 348916 CASAVA_Build 9 114606837 2I CTCTCCAGTA --/TG TGTTTTCATT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TG 1 2 348917 CASAVA_Build 9 114607324 2D CTTGCGCTTA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 T 11 9 348918 CASAVA_Build 9 114610816 2D CTTCATCCAG TT/-- TTACAAAAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 5 T 4 2 348919 CASAVA_Build 9 114622374 4I ATCTGGAGTG ----/GAGA GAGATTTAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 GA 2 4 348920 CASAVA_Build 9 114625102 5D ATAATTGTTC TGTTT/----- TATTATTGTG 3070 hom 93 het 34 0 31 5 TGTTT 1 0 348921 CASAVA_Build 9 114626436 1D GCAAATAGGA T/- TTTTTTGCAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 348922 CASAVA_Build 9 114654355 1I ACCCTATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 110 hom 25 2 18 5 A 10 11 348923 CASAVA_Build 9 114664039 1I GACAACACTT -/A ACGATATCTT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 A 1 2 348924 CASAVA_Build 9 114675739 2D CCACAAAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 40 0 30 10 T 14 12 348925 CASAVA_Build 9 114676872 1I AAAAGAATCG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 7 8 348926 CASAVA_Build 9 114679247 1D GGCCCAAGAA C/- CCCTGGGTTA 3070 hom 56 het 23 0 19 4 C 4 3 348927 CASAVA_Build 9 114685802 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2728 het 51 hom 30 1 14 15 T 15 14 348928 CASAVA_Build 9 114695695 2D AAGGAGGGAG AA/-- GAGAGGGGAA 3070 hom 59 het 28 0 20 8 A 2 0 348929 CASAVA_Build 9 114695925 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 32 0 24 8 T 12 13 348930 CASAVA_Build 9 114698400 1I CCTTCCCTAC -/A AAGGAAATAA 3070 hom 134 het 50 0 44 6 A 2 3 348931 CASAVA_Build 9 114701967 4I TCTGTCTTTA ----/TATT TATTTATTTA 3070 hom 75 het 28 0 25 4 TATT 3 4 348932 CASAVA_Build 9 114704572 1I CTTGTTTGTC -/A CATCCCTAAG 3070 hom 128 het 51 0 42 9 A 0 1 348933 CASAVA_Build 9 114705103 1D CGTCTTTTCC T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 147 het 57 0 49 9 T 7 6 348934 CASAVA_Build 9 114736991 1D GTCCCAGGAA G/- GAAGTAACAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 4 G 2 1 348935 CASAVA_Build 9 114737078 4I GTAGTAATGC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 39 12 22 5 TCTT 3 4 348936 CASAVA_Build 9 114740610 2I TATCAGCTCT --/GA GACCCCCTTC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 GA 1 2 348937 CASAVA_Build 9 114741986 1D ATGCTCATGG A/- AAAAAATCTG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 7 6 348938 CASAVA_Build 9 114745228 2D CAGGACAGGC TG/-- TGTTATATTG 3070 hom 90 het 34 0 29 5 TG 2 1 348939 CASAVA_Build 9 114746623 3I GGCTAAAAAT ---/AAA AATACCAAAT 3070 hom 67 het 25 0 21 4 A 2 5 348940 CASAVA_Build 9 114751135 2D ACTGAATGAC AA/-- AAAGTCCTCT 3070 hom 99 het 38 0 34 7 A 5 3 348941 CASAVA_Build 9 114754332 1I CATGTACCCC -/T GAACTTAAAA 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 0 1 348942 CASAVA_Build 9 114757247 4D TTTAGCAGGT TAGA/---- TAAACTAATG 3070 het 3070 ref 47 26 17 5 TAGA 1 0 348943 CASAVA_Build 9 114761660 1I CCATTGGATG -/C CCAGGCAGAA 3070 hom 128 het 47 0 39 8 C 2 3 348944 CASAVA_Build 9 114767206 3D GATGACAAAA AAG/--- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 AAG 1 0 348945 CASAVA_Build 9 114771050 2D ACTCTATATC AA/-- AAAAAAAAAA 3047 het 238 hom 25 2 7 17 A 14 12 348946 CASAVA_Build 9 114790955 3I ATGGCATCTC ---/ATG GTGGTTTTGA 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 ATG 0 1 348947 CASAVA_Build 9 114797310 4D AATAAAAGGC TGAG/---- TAAGAGACTT 3070 het 3070 ref 41 19 17 6 TGAG 1 0 348948 CASAVA_Build 9 114797812 1D TATTAAGATA G/- GTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 24 15 8 2 G 2 1 348949 CASAVA_Build 9 114803291 1I GGATATTAGC -/T TACAAGTCTG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 1 2 348950 CASAVA_Build 9 114806054 3I GTAATCCTAA ---/CCT CAGTACCTCA 3070 het 3070 hom 49 16 26 7 CCT 0 1 348951 CASAVA_Build 9 114808199 2D ATGAAAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 21 19 9 A 12 10 348952 CASAVA_Build 9 114811616 1I CTCATATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 601 hom 20 2 16 2 T 13 14 348953 CASAVA_Build 9 114814664 1I GTGATTAATA -/T TTTTTTAGCA 3070 het 2134 hom 14 5 9 0 T 6 7 348954 CASAVA_Build 9 114822853 1D GCATCCCAAT A/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 32 21 10 1 A 1 0 348955 CASAVA_Build 9 114827174 12I GAAGGGAAAC ------------/GGTCTCAGCCAG GTTCTACAGA 3070 het 3070 hom 33 15 18 0 GGTCTCAGCCAG 0 1 348956 CASAVA_Build 9 114892799 1I ATTCTCCTGA -/C GCGGGGACAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 C 0 1 348957 CASAVA_Build 9 114915001 18D CATCCCCAGC CAGGAGCAGAGAGCAAGG/------------------ GACGGAGAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 1 CAGGAGCAGAGAGCAAGG 1 0 348958 CASAVA_Build 9 114954058 1D CAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2771 hom 36 10 17 10 A 11 10 348959 CASAVA_Build 9 114956318 2I AGGTTTCAGG --/AA AAGAGTAGAT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 2 4 348960 CASAVA_Build 9 114957881 1D CATGTATGGG A/- AAAAAAGGCA 3070 hom 90 het 32 0 30 2 A 7 6 348961 CASAVA_Build 9 114962460 1D CTGTCCTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 A 8 7 348962 CASAVA_Build 9 114966019 1D ATTAAGCCAT G/- GGCAGGTACT 3070 hom 135 het 46 0 46 0 G 3 2 348963 CASAVA_Build 9 114966198 4D TGGGAATTAA AAAC/---- AAACAAATAC 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 AAAC 2 1 348964 CASAVA_Build 9 114966376 1D TCCATCTGCT A/- CAAAGACAAC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 1 0 348965 CASAVA_Build 9 114967569 2I ATTCCCAAAA --/AG GAGCACAGAC 3070 het 3070 ref 53 29 21 3 AG 0 1 348966 CASAVA_Build 9 114967836 3D GATTCAGGTA GAG/--- GAGGGCTCCC 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 GAG 2 1 348967 CASAVA_Build 9 114969987 1D GCTATTAATA C/- TGAACCCATT 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 C 1 0 348968 CASAVA_Build 9 114973844 9I GGCCTCAGGA ---------/ACCTGGATT ACCAGGTGAA 3070 hom 48 het 19 0 14 5 ACCTGGATT 0 1 348969 CASAVA_Build 9 114973948 1D TTTCAAATTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 12 het 15 0 11 4 T 9 8 348970 CASAVA_Build 9 114982502 14D CAGAAAAAAA TGTGTGTGTGTGTG/-------------- TGTGTGTGTG 3070 hom 63 het 26 0 22 8 TG 16 9 348971 CASAVA_Build 9 114982609 17I AAAATCTACA -----------------/CAGTGGATGGGATGGCT CCCTGGTTCC 3070 hom 60 het 24 0 21 4 CAGTGGATGGGATGGCT 0 1 348972 CASAVA_Build 9 114987460 11D GAAAGAGGGA CAGAGAATAGT/----------- CAGGGAAGGC 3070 het 3070 hom 44 19 25 3 CAGAGAATAGT 1 0 348973 CASAVA_Build 9 114994137 1I AAATTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 11 12 348974 CASAVA_Build 9 114998134 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 47 19 17 12 CA 6 5 348975 CASAVA_Build 9 115003144 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1165 het 658 hom 16 3 6 7 A 17 16 348976 CASAVA_Build 9 115004346 1I GTTTTATTTA -/T TTCCTTAAGA 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 T 2 3 348977 CASAVA_Build 9 115007043 4D AATATCTAGG TTAT/---- TTGTGAGTCT 3070 het 3070 ref 37 15 18 4 TTAT 1 0 348978 CASAVA_Build 9 115009255 3I GAGAAAAAGT ---/AGA AGCTTAACTG 3070 het 3070 ref 47 23 17 7 AGA 0 1 348979 CASAVA_Build 9 115012871 1I GCGTGGCTAG -/T TATAAGGCAG 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 T 1 2 348980 CASAVA_Build 9 115025429 1D GGGTGCACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 A 15 14 348981 CASAVA_Build 9 115051213 3D ATCAGATCAC CTT/--- CTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 35 11 16 9 CTT 2 1 348982 CASAVA_Build 9 115053627 4I GAAGCTGAGC ----/TTAA TTAAGTCAGA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 TTAA 1 2 348983 CASAVA_Build 9 115055056 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1497 het 122 hom 28 3 5 21 T 17 16 348984 CASAVA_Build 9 115074793 1D TTCTAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1965 het 1965 ref 32 11 6 15 T 17 16 348985 CASAVA_Build 9 115076638 1I TAAAAGGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 50 21 19 10 A 9 10 348986 CASAVA_Build 9 115080995 2D AGAAATTATT TC/-- TCTCTATTTG 3070 het 3070 hom 40 16 20 5 TC 3 2 348987 CASAVA_Build 9 115084579 1I TCTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1336 hom 36 3 32 1 A 10 11 348988 CASAVA_Build 9 115085133 1D TTACCGAATG A/- ATTCACCTTC 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 A 2 1 348989 CASAVA_Build 9 115097504 5D27M5D ATCGCATTTA TATTGTATTAGGTATTGTAAGTAATCAACAGATGAAT/-----TATTAGGTATTGTAAGTAATCAACAGA----- TAAAGTATAG 3070 het 3070 ref 44 30 17 13 N/A 0 0 348990 CASAVA_Build 9 115104232 4D CTAACTTTAC TCCA/---- TCCAGTAAGC 3070 het 2526 hom 27 7 14 8 TCCA 2 1 348991 CASAVA_Build 9 115114281 3D CATCTTGTCC TCA/--- TCGAGAGTTG 3070 het 3070 ref 63 30 23 11 TCA 1 0 348992 CASAVA_Build 9 115114529 1I GTCTACTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 363 hom 36 1 24 11 T 10 11 348993 CASAVA_Build 9 115140220 16I AATTATGGTT ----------------/TATTGTTAACATGCAA ACTAGCATGA 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 TATTGTTAACATGCAA 0 1 348994 CASAVA_Build 9 115146732 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 T 8 7 348995 CASAVA_Build 9 115158605 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 21 0 18 3 A 10 11 348996 CASAVA_Build 9 115167852 2D GAGAGAGAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2896 hom 25 8 9 9 GT 9 8 348997 CASAVA_Build 9 115177004 4D TGAGACAGGG TCTC/---- TCTCTGTCTC 3070 hom 60 het 25 0 21 5 TC 4 2 348998 CASAVA_Build 9 115196699 1I TGGAAATAGA -/C AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 C 0 1 348999 CASAVA_Build 9 115204540 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 65 het 29 0 23 6 T 9 8 349000 CASAVA_Build 9 115205881 4D AAAAAGGAAC AAGA/---- AAGAAAGCAG 3070 het 3070 ref 34 18 13 7 AAGA 2 1 349001 CASAVA_Build 9 115214098 1I TTAATGCTGC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 T 8 9 349002 CASAVA_Build 9 115216869 1I GGACTTTAAC -/A GATGAATTTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 0 1 349003 CASAVA_Build 9 115234120 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3031 het 3030 ref 24 11 10 3 T 13 12 349004 CASAVA_Build 9 115254836 3D TTTATTTTGG TCT/--- TCTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 4 TCT 2 1 349005 CASAVA_Build 9 115272274 2I GGCCTCCCAA --/AG AGAGTCAATT 3070 het 3070 hom 44 21 22 1 AG 2 3 349006 CASAVA_Build 9 115276183 1I TATCAAGAGA -/C CTGAATGCTA 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 C 1 2 349007 CASAVA_Build 9 115287196 1I AAAAATGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 9 12 6 T 11 12 349008 CASAVA_Build 9 115344242 1I AGGACATAAC -/T TTTTAAACCG 3070 het 3070 ref 57 25 20 12 T 4 5 349009 CASAVA_Build 9 115372655 1I ACAAAGCGTA -/G CCCCCATCCA 3070 het 3070 ref 37 21 11 5 G 0 1 349010 CASAVA_Build 9 115373666 1I TCCTATTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 10 349011 CASAVA_Build 9 115409232 1D GTTGAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 792 het 792 ref 30 11 4 15 T 17 16 349012 CASAVA_Build 9 115417913 8D CTGTGGAAGG TTCTTGAA/-------- CAAAGGAGTG 3070 het 3070 ref 34 20 13 3 TTCTTGAA 1 0 349013 CASAVA_Build 9 115422408 1I GTGGCATCAG -/C AGCCTCTGTG 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 C 0 1 349014 CASAVA_Build 9 115432090 1I CACTTAAAAT -/A AAAAAACGTC 3070 het 3067 hom 31 11 16 4 A 6 7 349015 CASAVA_Build 9 115435115 1D CCCTCATGAC A/- AAAATCTCGG 3070 het 3070 hom 28 10 16 2 A 5 4 349016 CASAVA_Build 9 115436219 1I CATTGCTAAG -/A AACCTGGCAG 3070 het 3070 hom 51 22 25 4 A 2 3 349017 CASAVA_Build 9 115438751 1D TCTCTGCCCC A/- GTTGCACTCC 3070 het 3070 hom 53 23 26 5 A 1 0 349018 CASAVA_Build 9 115439365 4I TTCTCGTGAT ----/AGTG AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 AGTG 1 2 349019 CASAVA_Build 9 115444705 1I AATTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 2433 het 396 hom 24 1 12 11 A 17 18 349020 CASAVA_Build 9 115445488 1D TATTCTATCC A/- ATATTGTGAT 3070 hom 90 het 35 0 30 7 A 2 1 349021 CASAVA_Build 9 115446087 2D GTCTTTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 2881 het 203 hom 30 3 8 19 T 13 11 349022 CASAVA_Build 9 115454480 1I CCCCATCTCT -/A AAGAAAAAAA 3070 het 13 hom 29 1 25 3 A 2 3 349023 CASAVA_Build 9 115455582 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 1604 hom 11 het 13 0 6 10 A 17 14 349024 CASAVA_Build 9 115470243 1D TGGGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 19 14 9 T 13 12 349025 CASAVA_Build 9 115520277 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 27 0 20 7 A 12 11 349026 CASAVA_Build 9 115524317 1D ACAAGGATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 A 10 9 349027 CASAVA_Build 9 115524415 2I AGAAGAAAAC --/AG GGGTAAATCT 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 AG 0 1 349028 CASAVA_Build 9 115551186 2I CGAAGTTAAC --/TG TCTATTCAGT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 TG 0 1 349029 CASAVA_Build 9 115565273 2I GTTAGGAAAC --/AT ATAAGAATTA 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 AT 1 2 349030 CASAVA_Build 9 115569230 2I GGCTGGAAAC --/TG TGGAGGAGAG 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 TG 1 2 349031 CASAVA_Build 9 115572452 1D AGAATCCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2131 hom 26 7 17 3 T 11 10 349032 CASAVA_Build 9 115585821 4I TGATGGATGA ----/TTGG TTGAGTGAGT 3070 hom 159 het 61 0 50 11 TTGG 0 1 349033 CASAVA_Build 9 115588507 4I TGTCGGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 TTTG 3 4 349034 CASAVA_Build 9 115593660 1D TCTGTGACTC A/- GCAGACAGCT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 1 0 349035 CASAVA_Build 9 115602036 1I TGTCTCAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1231 hom 47 5 30 12 A 10 11 349036 CASAVA_Build 9 115625823 1I CCTTCAAAAA -/G GAAGAAGGAC 3070 het 3070 hom 55 18 36 1 G 1 2 349037 CASAVA_Build 9 115637578 5D ATGAACTAGA TTATT/----- TTATAAGAAT 3070 het 3070 ref 35 19 15 2 TTATT 1 0 349038 CASAVA_Build 9 115638250 1D TTCTTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1087 het 1087 ref 35 27 3 5 T 11 10 349039 CASAVA_Build 9 115639660 1D TCATCTCTCA G/- GCTTCTGCTG 3070 het 3070 ref 36 18 14 7 G 2 1 349040 CASAVA_Build 9 115697201 4I TTTTTATCAC ----/TAAG TAAGCATCCT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 TAAG 1 2 349041 CASAVA_Build 9 115698160 1D AGTTGTATTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 T 8 7 349042 CASAVA_Build 9 115705577 1I TCTGCCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 16 13 T 12 13 349043 CASAVA_Build 9 115739978 1D ATTATGTGCC T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 8 7 349044 CASAVA_Build 9 115741104 1I TTCTCTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 T 10 11 349045 CASAVA_Build 9 115742224 1D TTAATTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 4 A 11 10 349046 CASAVA_Build 9 115743878 1D AGATGTCTTG T/- TTTATTCTTC 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 T 4 3 349047 CASAVA_Build 9 115755949 1I AAAGATGGAT -/G GTCCAGCTGT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 G 1 2 349048 CASAVA_Build 9 115769888 2I GGGACCAGAC --/AG GGGCTGGGTG 3070 hom 99 het 38 0 31 7 AG 0 1 349049 CASAVA_Build 9 115784103 2I GGTGAGACCC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 42 14 12 16 AG 8 9 349050 CASAVA_Build 9 115790014 1I AAGATCCCCC -/G CCAGCTGATC 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 G 0 1 349051 CASAVA_Build 9 115795990 1D AGTCTCCAGG A/- GGGGATTTCA 3070 het 3070 ref 47 26 14 9 A 1 0 349052 CASAVA_Build 9 115797394 1D TTCTCCAACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 10 9 349053 CASAVA_Build 9 115799156 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 TCTT 2 1 349054 CASAVA_Build 9 115802589 1D24M6I CTTTTTGTGA TTTTTTTTTTAGCTCATTAGCCATC------/-TTTTTTTTTAGCTCATTAGCCATCGTTAGT GTTAGTGTAT 3070 het 3070 ref 34 24 8 8 N/A 0 0 349055 CASAVA_Build 9 115802685 1I AAAGGTTGGA -/C CCCCCCTGAG 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 C 6 7 349056 CASAVA_Build 9 115803438 1D ACAAGACAAC T/- CCTCAGCAGG 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 1 0 349057 CASAVA_Build 9 115814204 2I AAGAGAACAC --/CT CTGAAAATGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 CT 1 2 349058 CASAVA_Build 9 115814459 2D TGATGGTGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 33 15 13 7 AG 6 5 349059 CASAVA_Build 9 115815093 1D AAACTATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 13 26 10 A 12 11 349060 CASAVA_Build 9 115816870 1I ACACCTAGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 T 9 10 349061 CASAVA_Build 9 115821281 3D ATATGTATCA GTT/--- GTTCATTCTT 3070 het 3070 ref 54 27 23 5 GTT 2 1 349062 CASAVA_Build 9 115822447 1I AATTTCTACC -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 A 7 8 349063 CASAVA_Build 9 115822721 1I TATTGCCTAT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 7 8 349064 CASAVA_Build 9 115837698 21D CTTTCTTTTT CCTCTTCCTTCTGTCCTTCTC/--------------------- CCTCTTCCTT 2734 het 1918 hom 22 9 9 10 CCTCTTCCTTCTGTCCTTCTC 1 0 349065 CASAVA_Build 9 115852659 2D CGATTGGGAA AG/-- AGGGAGATGT 3070 het 3070 ref 41 19 12 11 AG 2 1 349066 CASAVA_Build 9 115860729 1I AATAAAATTT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 71 het 28 0 23 5 A 7 8 349067 CASAVA_Build 9 115865150 3I GTAATGAAAA ---/AAG GGTACCTCCC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 AAG 0 1 349068 CASAVA_Build 9 115882088 1I TTTTTTAAAA -/C CCCAGGTCCG 3070 hom 68 het 31 0 23 8 C 3 4 349069 CASAVA_Build 9 115899249 6D CCCTTGGGCC ATGCCT/------ TTGAATTGTG 3070 hom 93 het 33 0 28 7 ATGCCT 1 0 349070 CASAVA_Build 9 115910609 2I CTGTGGTCTC --/CA CACCACCCTG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 CA 1 2 349071 CASAVA_Build 9 115913693 8I TCTCTTTCTC --------/TCTCCCTT TCTCCCTTTC 2704 hom 18 het 7 0 7 0 TCTCCCTT 1 2 349072 CASAVA_Build 9 115924995 2I ATATCAAGTG --/TC TCTGAGGCAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TC 1 2 349073 CASAVA_Build 9 115962786 1D AAAAAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 154 hom 23 1 15 8 A 13 12 349074 CASAVA_Build 9 115965334 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 18 5 A 11 10 349075 CASAVA_Build 9 115973571 1D AATCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 32 8 T 11 10 349076 CASAVA_Build 9 115986223 2D GAGCTGTGGA GG/-- GGGCAGATGG 3070 hom 91 het 35 0 26 10 G 5 3 349077 CASAVA_Build 9 115997477 1I CCCCCATCAT -/A ACCCCATGAG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 1 2 349078 CASAVA_Build 9 116026196 6I CCCTGATGTC ------/CATTCA CATTCAGTAG 3070 het 3070 hom 50 20 24 6 CATTCA 1 2 349079 CASAVA_Build 9 116062097 1D TCCTCTGGGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 39 het 19 0 11 9 G 10 9 349080 CASAVA_Build 9 116063402 7I ACATCTTCCT -------/CGAGGAG CGAGGAGCGG 3070 hom 59 het 24 0 18 6 CGAGGAG 1 2 349081 CASAVA_Build 9 116063862 1I GGTAGTGGTG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 7 8 349082 CASAVA_Build 9 116092560 1I CATCCAGAAG -/T TTCTCTGGGG 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 2 3 349083 CASAVA_Build 9 116113446 1I TTTTTTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3054 het 2049 hom 24 6 8 10 A 11 12 349084 CASAVA_Build 9 116120639 1I GCTGTCCCCA -/C ACAATGCTCA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 C 0 1 349085 CASAVA_Build 9 116124810 1D CCTCAAAGGT G/- GCTTCATCAT 3070 het 3070 ref 48 31 11 6 G 2 1 349086 CASAVA_Build 9 116198779 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2338 het 2338 ref 25 10 9 6 A 11 12 349087 CASAVA_Build 9 116201170 3D AGGCTCCATC AAA/--- AAAAAAAAAA 1921 het 20 hom 18 1 9 10 A 13 10 349088 CASAVA_Build 9 116209795 6I AAGAAACTTG ------/GTCAAA GTCATACTGT 3070 het 3070 ref 49 20 17 12 GTCAAA 0 1 349089 CASAVA_Build 9 116211343 3I TGGGGACACA ---/GAG GAGGTGGGAC 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 GAG 1 2 349090 CASAVA_Build 9 116217375 2D CCTATCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 2596 het 2404 hom 33 11 11 12 A 14 12 349091 CASAVA_Build 9 116224864 1I TGAACTGGGG -/A AGGTGGAGGT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 1 2 349092 CASAVA_Build 9 116229881 2I ACCGGCTTTG --/AC ACACTCAGGG 3070 het 3070 hom 59 19 29 11 AC 2 3 349093 CASAVA_Build 9 116231033 1D GATTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 25 3 12 10 T 13 12 349094 CASAVA_Build 9 116236243 1I CAATTACCAA -/C CCCCAAGTGC 3070 hom 135 het 50 0 45 5 C 4 5 349095 CASAVA_Build 9 116236625 11I AACCCCTGAC -----------/CTTCTCCGATT CTTTCCTCCA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CTTCTCCGATT 0 1 349096 CASAVA_Build 9 116237988 10D TTCACACACT TCTAAAACAC/---------- TCTAAAACAC 3070 het 3070 ref 35 23 10 4 TCTAAAACAC 2 1 349097 CASAVA_Build 9 116241198 2I AAAAAGAAAC --/AA AGAGGAATAA 3070 hom 135 het 55 0 46 9 A 1 3 349098 CASAVA_Build 9 116241737 2I ACACACACAT --/AC AGATATATGT 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 AC 0 1 349099 CASAVA_Build 9 116249862 4D TCACACACTT TCTC/---- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 7 TC 6 4 349100 CASAVA_Build 9 116252925 1I TTATTATTAG -/A TTTCCCCCCC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 0 1 349101 CASAVA_Build 9 116256447 2I AGAAAATTTC --/AA AGACTCTGCA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 A 1 3 349102 CASAVA_Build 9 116257108 1D GGCTGTCTAT A/- ATGCAAACAA 3070 het 3070 ref 36 15 17 4 A 2 1 349103 CASAVA_Build 9 116258253 3I AAAAAAAAAA ---/AAC CATCTCCAAA 1292 het 1292 ref 35 18 8 9 AAC 0 1 349104 CASAVA_Build 9 116261405 2I CTAAAAATAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 659 hom 14 3 10 1 A 11 13 349105 CASAVA_Build 9 116261563 1I GAGTTCATCT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 8 9 349106 CASAVA_Build 9 116282583 4I CTTTGTAGGA ----/AGAG AGAGAGAGTT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 AG 4 6 349107 CASAVA_Build 9 116287872 18D TTGGGGGACA GAGGCAGGAGGATTACTT/------------------ GAGGCCAGGA 3070 het 2484 hom 19 9 10 4 GAGGCAGGAGGATTACTT 1 0 349108 CASAVA_Build 9 116289154 2D AAGAGATACC AA/-- AAAAAAAAAA 2949 hom 18 het 10 0 7 3 A 12 10 349109 CASAVA_Build 9 116289798 4D GTCTTTATTC ACAG/---- ACAATCACAT 3070 het 3070 ref 36 17 16 5 ACAG 1 0 349110 CASAVA_Build 9 116292672 4I TCCACCCTCT ----/TTTC TTTAAGAGTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTTC 0 1 349111 CASAVA_Build 9 116293560 4D AAATACATGA ACAC/---- ACACACAAAC 3070 het 3070 hom 49 18 25 7 AC 5 3 349112 CASAVA_Build 9 116297029 1D CCATGACACT G/- GGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 44 21 13 11 G 9 8 349113 CASAVA_Build 9 116299618 1I TTTTGTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 11 12 349114 CASAVA_Build 9 116302079 1I AAAATACCGA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 89 het 37 0 30 7 T 7 8 349115 CASAVA_Build 9 116306159 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 142 hom 36 2 22 12 A 15 14 349116 CASAVA_Build 9 116309374 1I ATGTTTAAGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 A 8 9 349117 CASAVA_Build 9 116314007 1I GACAGGAGGT -/G GGGGGGTATG 3070 hom 80 het 30 0 26 4 G 6 7 349118 CASAVA_Build 9 116315364 1I CTCACTGGGC -/G GGGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 G 8 9 349119 CASAVA_Build 9 116322278 1D CCCTGGGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 11 10 349120 CASAVA_Build 9 116379062 1I CTCTGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 939 het 939 ref 39 29 3 7 A 11 12 349121 CASAVA_Build 9 116381229 1D TCTTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1360 het 1360 ref 22 9 4 9 T 13 12 349122 CASAVA_Build 9 116406467 14D TCATTTGAGG CCAGGAGTTCGAGA/-------------- CGAGCCTGGC 3070 het 3070 ref 30 12 14 6 CCAGGAGTTCGAGA 1 0 349123 CASAVA_Build 9 116416994 11D TGTCACTGCC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 1309 het 1309 ref 28 12 4 12 T 22 11 349124 CASAVA_Build 9 116433035 2I GCATCCTCTC --/TG TGTTGTTACT 3070 het 3070 ref 51 24 19 8 TG 1 2 349125 CASAVA_Build 9 116434279 1D TCTAAGTAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 T 9 8 349126 CASAVA_Build 9 116444463 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 9 8 349127 CASAVA_Build 9 116446696 1I CCTGCTAAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 9 10 349128 CASAVA_Build 9 116449087 1D TTGCCTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 14 14 12 T 17 16 349129 CASAVA_Build 9 116449667 1I CATTGCTAGT -/A TATGGGAAAG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 0 1 349130 CASAVA_Build 9 116450800 1I ATGCCATTTA -/T TTTTTTTTTT 2987 het 2987 ref 25 11 8 6 T 11 12 349131 CASAVA_Build 9 116453648 2I TAGCTGAAAA --/TG CGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 TG 0 1 349132 CASAVA_Build 9 116461371 1I CTCTGCCCAG -/A ACCTCCCAGT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 A 1 2 349133 CASAVA_Build 9 116479394 1D TGTCATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 T 12 11 349134 CASAVA_Build 9 116502876 6I TTTAGCTGTC ------/TAATAA TAATAAGGTC 3070 het 3070 hom 55 22 28 5 TAA 2 4 349135 CASAVA_Build 9 116516954 16D AGTAGCTGGG ACCACAGGTGCCTGCC/---------------- ACCACAGGTG 1031 het 1031 ref 11 9 3 3 ACCACAGGTGCCTGCC 2 1 349136 CASAVA_Build 9 116519116 1D AGACATGTGC T/- CATCACACCT 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 T 1 0 349137 CASAVA_Build 9 116534471 3I GTGCTGTCAT ---/CAC CACAATCAAG 3070 hom 156 het 58 0 52 6 CAC 1 2 349138 CASAVA_Build 9 116540310 7D TAGTGTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 443 hom 17 3 10 4 T 18 11 349139 CASAVA_Build 9 116542019 1D GTATGGTTAT C/- CCTAATTTAT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 3 2 349140 CASAVA_Build 9 116545862 3I TTTGTCTCTT ---/CTC CTCCTTTTGT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CTC 1 2 349141 CASAVA_Build 9 116550506 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 11 10 349142 CASAVA_Build 9 116551519 1D TTGTTTTCTT A/- ATCTATTGCT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 2 1 349143 CASAVA_Build 9 116554237 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1351 hom 12 het 5 0 5 0 A 10 11 349144 CASAVA_Build 9 116560681 1I CACTGGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 925 hom 24 3 17 4 T 12 13 349145 CASAVA_Build 9 116564746 1D CCCTTGTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 10 9 349146 CASAVA_Build 9 116587020 1D CCCCTGAAAC A/- AAAAAAGGGG 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 7 6 349147 CASAVA_Build 9 116611115 3I AAAAAGAGAT ---/AGA AAATGATCTT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 AGA 0 1 349148 CASAVA_Build 9 116651565 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 A 10 11 349149 CASAVA_Build 9 116656484 1D ATGATAATAC T/- AATACTGGGG 3070 het 3070 hom 46 18 20 9 T 1 0 349150 CASAVA_Build 9 116673834 3I AAAACATACG ---/AAA TTGTAAAGAC 2576 het 2576 ref 21 15 6 0 A 0 3 349151 CASAVA_Build 9 116768525 4I AGAAAACAAG ----/CAAA CAGACAAAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 CAAA 0 1 349152 CASAVA_Build 9 116789350 1I CATCATGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 13 12 A 11 12 349153 CASAVA_Build 9 116793379 2I GTGCGTGTGT --/GA GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 50 20 20 10 GA 0 1 349154 CASAVA_Build 9 116794449 1I ATTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1660 het 1514 hom 18 6 5 7 T 13 14 349155 CASAVA_Build 9 116798131 1D TTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 12 11 349156 CASAVA_Build 9 116802406 1D GGACAGCCCC G/- GTTGTTCTTC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 2 1 349157 CASAVA_Build 9 116810722 1I CTTTCAGTGG -/C CCCTGGGATT 3070 hom 95 het 36 0 28 8 C 3 4 349158 CASAVA_Build 9 116818345 1D AGAGAGCCTT C/- CCCCTCAGAT 3070 het 3070 ref 44 23 16 6 C 5 4 349159 CASAVA_Build 9 116822658 1I GCTTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 10 11 349160 CASAVA_Build 9 116827488 1I TCAGCCTGGC -/T TTTGGCAACC 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 T 3 4 349161 CASAVA_Build 9 116829220 2I GAAAGCAAAA --/AG AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 29 1 23 5 AG 0 1 349162 CASAVA_Build 9 116837181 1I TCTCTACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 91 het 38 0 30 8 T 10 11 349163 CASAVA_Build 9 116848171 1I CTTTGGAACG -/T TAAAAAAAAA 3070 het 31 hom 46 1 18 27 T 1 2 349164 CASAVA_Build 9 116851034 1D CCTTCAGCTC T/- TTTTTTTTTT 1283 het 1283 ref 32 21 4 7 T 13 12 349165 CASAVA_Build 9 116851173 1I AGGAGGTAAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 349166 CASAVA_Build 9 116851778 1D GGTAAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 11 10 349167 CASAVA_Build 9 116853638 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 484 hom 22 2 10 10 T 14 13 349168 CASAVA_Build 9 116854124 4I AATGTGGTGT ----/ATAG ATAGATAGAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 ATAG 2 3 349169 CASAVA_Build 9 116857623 1I CCCGCCAATC -/A AGCCCATGAA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 A 1 2 349170 CASAVA_Build 9 116864709 1D ACCCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 22 2 12 8 A 16 15 349171 CASAVA_Build 9 116869447 4D CTTTCCTGTT TTTG/---- TTTCTCTGCT 3070 het 3070 hom 34 16 14 5 TTTG 1 0 349172 CASAVA_Build 9 116882421 1I GTGATCTAAT -/G GATTTTTTTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 2 349173 CASAVA_Build 9 116885284 1D ACTTCTTGGG A/- ATGCATTGAG 3070 het 3070 hom 42 20 17 5 A 2 1 349174 CASAVA_Build 9 116909178 1D TACTAGATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 10 9 349175 CASAVA_Build 9 116915267 1D AAAAGACAAG C/- TTTTGTGTCT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 C 1 0 349176 CASAVA_Build 9 116917024 11I ACATATGTGA -----------/CACATAGCCCT CACTATTAAC 3070 hom 148 het 58 0 50 8 CACATAGCCCT 0 1 349177 CASAVA_Build 9 116919949 1I TACACACTCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 2721 hom 32 9 16 7 T 8 9 349178 CASAVA_Build 9 116928127 1D AGATGTAGTA T/- TTTGATAGCA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 4 3 349179 CASAVA_Build 9 116928480 1I TTTCAAGTAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 41 25 15 1 T 8 9 349180 CASAVA_Build 9 116931221 15D CCTTGTTGAA GGAAAGAAAAAGAAG/--------------- GGAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 46 25 19 5 GGAAAGAAAAAGAAG 2 1 349181 CASAVA_Build 9 116938083 4D TCATCGTGAT AGAA/---- AGAACGCCAG 3070 het 3070 ref 23 12 9 7 AGAA 2 1 349182 CASAVA_Build 9 116940115 1I TGTTTAAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 10 11 349183 CASAVA_Build 9 116941054 2I TCATTCTATC --/CT CTCTGATCCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 CT 2 3 349184 CASAVA_Build 9 116941509 1I ATTAAAGAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 T 9 10 349185 CASAVA_Build 9 116946131 2D TCCTTCCCTT CC/-- CCCTTCCCTT 473 het 473 ref 26 15 3 8 C 5 3 349186 CASAVA_Build 9 116959146 1D ATGATATTCC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 T 8 7 349187 CASAVA_Build 9 116967300 1D CAGAAGTACC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 55 25 19 11 T 10 9 349188 CASAVA_Build 9 116972207 8D GTTTTTTTGC TTGTTTGT/-------- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 ref 47 24 14 11 TTGT 5 3 349189 CASAVA_Build 9 116983030 1D ATTGTATCTC T/- TTTTATCTAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 5 4 349190 CASAVA_Build 9 116983935 5I TATGAAAACT -----/GCTTA GCTTATCAAT 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 GCTTA 1 2 349191 CASAVA_Build 9 116984206 1D TTGTGATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 19 22 8 T 11 10 349192 CASAVA_Build 9 116988271 1D TCAAGATCTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 8 7 349193 CASAVA_Build 9 116992272 1I GTGCAGAAGC -/T TTTCACTTGC 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 3 4 349194 CASAVA_Build 9 117025262 5I AAGCTGTCGG -----/GTTTT GTTTTGTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 GTTTT 2 3 349195 CASAVA_Build 9 117033325 4D CAAAAGTAGA TTAT/---- TTGTGGTGGG 3070 het 3070 hom 55 28 24 6 TTAT 1 0 349196 CASAVA_Build 9 117041064 2I TTTGACATTT --/TA TATATAATAG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 TA 3 4 349197 CASAVA_Build 9 117043559 4I ACAAGAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 AAAC 3 4 349198 CASAVA_Build 9 117045623 1I TACTCTAGCA -/T TTTATGATAC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 3 4 349199 CASAVA_Build 9 117046690 4D TTGCCTTATA TAAT/---- TAATTCAATA 3070 hom 101 het 37 0 33 5 TAAT 2 1 349200 CASAVA_Build 9 117053045 1D AAATGATAAA G/- AAGGAGTCAT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 G 1 0 349201 CASAVA_Build 9 117057473 2D CTTCATTCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 T 13 11 349202 CASAVA_Build 9 117064401 2D TGCCAGTGAA AC/-- ACAGAGTGTT 3070 het 3070 ref 49 23 21 7 AC 2 1 349203 CASAVA_Build 9 117078518 1D GAAATACGCT G/- GGTCACACCT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 G 3 2 349204 CASAVA_Build 9 117079832 12D TCTTTCTTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTGA 3070 het 2022 hom 25 9 13 4 T 20 8 349205 CASAVA_Build 9 117082138 1D CAGTCACACC T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 T 7 6 349206 CASAVA_Build 9 117090928 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1619 het 320 hom 7 1 4 2 A 10 11 349207 CASAVA_Build 9 117091676 1D TAGCAGAACT A/- GGTAAAAATT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 A 1 0 349208 CASAVA_Build 9 117100771 1D TGTTTTCTGA T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 T 7 6 349209 CASAVA_Build 9 117103604 2D TTTGGGGAAT GA/-- GAGAGAGAGA 1100 het 1100 ref 45 34 3 8 GA 8 7 349210 CASAVA_Build 9 117110935 4D CATCGTGCAG GTTA/---- GTTACATATG 2104 het 866 hom 12 4 6 3 GTTA 2 1 349211 CASAVA_Build 9 117112680 4I CATGATTTGG ----/CTCT CTGTTTGTCT 2817 hom 18 het 7 0 7 0 CT 1 3 349212 CASAVA_Build 9 117113058 1I ACTTGTGATA -/T TTGGTGATGA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 T 2 3 349213 CASAVA_Build 9 117121995 1I TCTCTGACTG -/A AAAAAAAAAA 1986 het 1986 ref 43 29 5 9 A 11 12 349214 CASAVA_Build 9 117122253 1D AGAAATGTAA T/- GTTTATCTAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 T 1 0 349215 CASAVA_Build 9 117125274 1I ATGGCTTTTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 55 20 26 9 T 7 8 349216 CASAVA_Build 9 117125480 1I TTGAGAGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 20 8 T 10 11 349217 CASAVA_Build 9 117125979 1I ATCAAGTGCT -/A AGGAGTACCC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 1 2 349218 CASAVA_Build 9 117127696 1D AATCTTCCTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3047 hom 31 7 19 6 T 8 7 349219 CASAVA_Build 9 117129109 2I CTGTCTTTTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 43 0 32 11 A 10 12 349220 CASAVA_Build 9 117135104 4I AAGGCTGTGG ----/AAAC AAACAAGGGG 3070 hom 140 het 54 0 47 7 AAAC 1 2 349221 CASAVA_Build 9 117139472 5D TCTACCTCAA AATTT/----- AATTTTCTAT 1930 het 1803 hom 8 4 4 2 AATTT 2 1 349222 CASAVA_Build 9 117144573 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 8 9 349223 CASAVA_Build 9 117146129 1D AACTTGACAA T/- AAAAATAATA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 1 0 349224 CASAVA_Build 9 117147632 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 7 6 349225 CASAVA_Build 9 117148274 3D ACCAATACTA GAT/--- GATTATATTA 3070 het 3070 hom 42 15 20 11 GAT 2 1 349226 CASAVA_Build 9 117153933 3I AGTAACTTGA ---/TCT TCTTCATTGC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 TCT 1 2 349227 CASAVA_Build 9 117156852 1I ATTCGAGCAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 65 hom 39 1 33 5 T 7 8 349228 CASAVA_Build 9 117157488 1D AAAAAAAAAA C/- AAAAATTGCT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 1 0 349229 CASAVA_Build 9 117158933 1D AAGGAAGGTG A/- AATCTGCCAC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 A 3 2 349230 CASAVA_Build 9 117160979 3I CACTGAAGCC ---/GGA AGAAGACAGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GGA 0 1 349231 CASAVA_Build 9 117162974 2D TATATTGCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 27 4 A 12 10 349232 CASAVA_Build 9 117163365 24D TGCTGAAATG TTTGTAATCAGTCCATGAAACTGA/------------------------ TTTCCTAACA 3070 het 3070 ref 39 23 21 8 TTTGTAATCAGTCCATGAAACTGA 1 0 349233 CASAVA_Build 9 117212298 1D TTTGGTACTT A/- AAAAAAAAAA 1153 het 1153 ref 29 22 3 4 A 12 11 349234 CASAVA_Build 9 117215241 1I GGTTTGTTAG -/T TTTTTTTTTA 1465 het 354 hom 35 6 4 25 T 9 10 349235 CASAVA_Build 9 117219998 1I CTACTACAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 856 hom 36 2 25 9 A 9 10 349236 CASAVA_Build 9 117221652 1I ATTTTTGTAC -/A TTGATTTTGT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 0 1 349237 CASAVA_Build 9 117226221 1I GTAATTTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 927 hom 30 6 19 5 A 13 14 349238 CASAVA_Build 9 117227752 1D TATAATACTT A/- AAAAATTTCT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 6 5 349239 CASAVA_Build 9 117235875 1D TCTAGTGGCT A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 119 het 46 0 40 6 A 9 8 349240 CASAVA_Build 9 117239129 5D CAAATTTCAC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 37 0 30 9 T 18 13 349241 CASAVA_Build 9 117244742 1I CTTTGCATAA -/T TTTTTTTTTG 1272 het 1272 ref 37 27 3 7 T 9 10 349242 CASAVA_Build 9 117245157 1D TTTAAACAAA G/- ATCAGGTTAT 3070 hom 99 het 35 0 31 4 G 1 0 349243 CASAVA_Build 9 117247296 1D AGAAAACAAC T/- TTTTTTTTTT 1756 het 1756 ref 43 28 4 11 T 13 12 349244 CASAVA_Build 9 117253013 1I GATGGTAAAA -/G TCCAGGTTCT 3070 hom 156 het 56 0 52 4 G 0 1 349245 CASAVA_Build 9 117256698 1D CACAATAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 37 2 19 18 T 15 14 349246 CASAVA_Build 9 117267043 1I GACACTTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 A 8 9 349247 CASAVA_Build 9 117267311 5D CACCATAAAA TACTT/----- TACAACCATT 3070 hom 148 het 60 0 50 10 TACTT 1 0 349248 CASAVA_Build 9 117267937 1I AAAGTGGATA -/G ATTAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 349249 CASAVA_Build 9 117292425 4I AAAGAAACCT ----/CTTA CTTTATAGGG 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 CTTA 0 1 349250 CASAVA_Build 9 117298791 1D GGAGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 24 0 18 6 A 11 10 349251 CASAVA_Build 9 117302100 1D GAAGGAGTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 349252 CASAVA_Build 9 117306537 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAGAA 3070 het 472 hom 23 2 21 0 G 0 1 349253 CASAVA_Build 9 117306675 5I CTATAGGCCA -----/GGTGT GGTGGTTCAT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 GGTGT 0 1 349254 CASAVA_Build 9 117307101 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 14 1 10 3 T 12 13 349255 CASAVA_Build 9 117310784 4D GAAAAGAAAA AAAT/---- AAAGCGTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 6 AAAT 1 0 349256 CASAVA_Build 9 117324215 1D ACCTCTTTCC T/- TTATAAATTA 3070 hom 90 het 35 0 31 9 T 3 2 349257 CASAVA_Build 9 117325005 1I CTCTCAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 942 hom 37 3 26 8 A 10 11 349258 CASAVA_Build 9 117325946 2I TCTATCCATG --/CA CACAGTTTCT 3070 hom 160 het 59 0 53 6 CA 2 3 349259 CASAVA_Build 9 117326399 1D ACACTGTGTA C/- AGGTTCTGGC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 C 1 0 349260 CASAVA_Build 9 117330784 2I AGCAATGGCA --/AC AAAAGACAAA 2510 hom 15 het 6 0 6 0 AC 0 1 349261 CASAVA_Build 9 117339680 1D ATGGATGGAA C/- TGTAGGCCAT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 C 1 0 349262 CASAVA_Build 9 117341043 2D CCAGGAATGT GG/-- CACACTGATA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 2 0 349263 CASAVA_Build 9 117345584 2D ATGCCTACTC TG/-- TGCTGGATTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 TG 2 1 349264 CASAVA_Build 9 117347001 1I TAAAAACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 32 2 23 7 A 11 12 349265 CASAVA_Build 9 117349689 2D TCAAACACAC AT/-- GTTTTACAAT 3070 hom 99 het 34 0 33 1 AT 1 0 349266 CASAVA_Build 9 117355908 2D TAAAACTTTA TT/-- TTTTTTTTGA 2440 hom 27 het 23 0 10 13 T 10 8 349267 CASAVA_Build 9 117356267 2I GAATTTATAT --/TG TCTTTTATAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TG 0 1 349268 CASAVA_Build 9 117358254 1D GTACACCCCC T/- GTGGATGCTT 3070 hom 44 het 27 0 19 8 T 1 0 349269 CASAVA_Build 9 117359609 2I ATGGCAACAG --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 14 het 36 1 33 2 GA 5 6 349270 CASAVA_Build 9 117359897 4D ATTTGTTTAT TTTA/---- TTTAAGTTGT 3070 hom 117 het 45 0 40 7 TTTA 2 1 349271 CASAVA_Build 9 117360968 4I AAGTGAATTG ----/ATAA ATAAACTGTA 3070 hom 111 het 44 0 38 6 ATAA 1 2 349272 CASAVA_Build 9 117362693 5I AATGAAAGAT -----/AAGTC AAGTTCAATA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AAGTC 0 1 349273 CASAVA_Build 9 117363132 11D TAACACTCTT ATAAATAACAA/----------- ATAGGTTTGA 3070 hom 39 het 16 0 14 4 ATAAATAACAA 1 0 349274 CASAVA_Build 9 117366887 1D TTATTAAGTC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 120 het 44 0 40 6 A 8 7 349275 CASAVA_Build 9 117368844 6D TCTCTCTCTC TTTCTT/------ TCTTTCTTTC 2401 hom 27 het 11 0 10 2 TTTCTT 1 0 349276 CASAVA_Build 9 117371984 2I ACTTTATTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 30 3 T 10 12 349277 CASAVA_Build 9 117373825 1I TCACACAAAA -/C AAATCATTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 0 1 349278 CASAVA_Build 9 117374575 1D79M2I TAATAGCAAC ATACTGGAAACAATCTATAAGTTCATGAGTAGAGGAATGAATGAATCCATATGCATATAATGAGTATATACAGTAATGAC--/-TACTGGAAACAATCTATAAGTTCATGAGTAGAGGAATGAATGAATCCATATGCATATAATGAGTATATACAGTAATGACAT ATACACAGAT 3070 het 361 hom 38 3 38 36 N/A 0 0 349279 CASAVA_Build 9 117375025 1D TTAAGCAGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 80 het 38 0 27 12 T 10 9 349280 CASAVA_Build 9 117385406 9I TACTATTGAT ---------/AAAGTTAAA AGAATAATTT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AAAGTTAAA 0 1 349281 CASAVA_Build 9 117386381 2D CACCACCACA AT/-- ATAAAGAGCA 3070 hom 97 het 37 0 33 4 AT 2 1 349282 CASAVA_Build 9 117395962 1D CTTGTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 22 1 19 2 T 11 10 349283 CASAVA_Build 9 117397870 16D ATAGAGGAGT CCCTCCAACAAAAAGA/---------------- GGGTTGCAAG 3070 hom 117 het 39 0 39 5 CCCTCCAACAAAAAGA 1 0 349284 CASAVA_Build 9 117403129 1D CCTGGTCTAT A/- AAAAAATACT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 7 6 349285 CASAVA_Build 9 117406132 4D34M4D TGAGGGAAGA AAGGAAGGAAGGAAGAGGGAAAGAAGGAAGGAAAGAAAGAAG/----AAGGAAGGAAGAGGGAAAGAAGGAAGGAAAGAAA---- GAAGGAAGAA 3070 het 2444 hom 41 12 33 13 N/A 0 0 349286 CASAVA_Build 9 117419197 1D CTGTAAAATT G/- TAAACAGGAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 0 349287 CASAVA_Build 9 117420046 1I CCCATCTGTA -/T TTTTTTTTTT 2422 hom 27 het 15 0 9 6 T 13 14 349288 CASAVA_Build 9 117422151 1D AATTTCTCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 5 A 11 10 349289 CASAVA_Build 9 117424133 1I AAAAGTTGTC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 87 het 40 0 30 10 A 7 8 349290 CASAVA_Build 9 117429439 1D AGAATTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 35 0 28 7 T 12 11 349291 CASAVA_Build 9 117547377 3D CTGACAAGTC ATA/--- ATAAGTAACA 3070 het 3070 ref 40 18 17 6 ATA 2 1 349292 CASAVA_Build 9 117556889 1D25M1I TGTAGACTTG TTTTTTTAAGGACTTCATTTTAAACA-/-TTTTTTAAGGACTTCATTTTAAACAC CCCCCCCTCC 3070 hom 78 het 25 0 31 4 N/A 0 0 349293 CASAVA_Build 9 117558331 1D AAGAAAAAAA C/- ACACCAAATT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 C 1 0 349294 CASAVA_Build 9 117561906 1I TTCCTGTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 23 17 10 A 11 12 349295 CASAVA_Build 9 117578913 1D AGAGAATAAA T/- TTTTTCCCTT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 6 5 349296 CASAVA_Build 9 117579004 3D CCATTGAAAT AAG/--- AAGAGTTGCA 3070 het 3070 ref 30 16 14 0 AAG 2 1 349297 CASAVA_Build 9 117581395 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 8 9 349298 CASAVA_Build 9 117589680 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 51 21 24 6 A 10 9 349299 CASAVA_Build 9 117593018 1D AAGTCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 11 10 349300 CASAVA_Build 9 117594675 1D TAGTAATGCT G/- GGAAAATATA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 G 3 2 349301 CASAVA_Build 9 117595109 4I TTTTGACCAA ----/AAAT AAATAGAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 AAAT 1 2 349302 CASAVA_Build 9 117607209 2D ATACACATAT AC/-- ACACACACAC 1928 het 1928 ref 28 13 7 9 AC 6 5 349303 CASAVA_Build 9 117608012 16D AACACAAAGA TGTGATCAACAGTCAC/---------------- TGGGGATTCC 3070 het 3070 ref 40 24 15 13 TGTGATCAACAGTCAC 1 0 349304 CASAVA_Build 9 117656025 2D TCAGAATGAC TA/-- TTATTAAAAT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 TA 1 0 349305 CASAVA_Build 9 117657235 4D38M4D TTTACTGTTA TAAGTAAGTACAGAAGCTCTTCTACTTAAAAAATTTCAAATTGTAA/----TAAGTACAGAAGCTCTTCTACTTAAAAAATTTCAAATT---- GTGTTTATAG 3070 het 3070 ref 29 18 18 6 N/A 0 0 349306 CASAVA_Build 9 117661356 1D TATCTGTTTT G/- GTACCAGTAC 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 G 2 1 349307 CASAVA_Build 9 117664022 1I TAAGGGGAAA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 47 22 24 1 T 7 8 349308 CASAVA_Build 9 117664830 1I GCAAGTAGTA -/G GTACTCAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 23 1 G 1 2 349309 CASAVA_Build 9 117674670 1I GGGCTAACAT -/G GGACACATTG 3070 het 3070 ref 51 29 16 6 G 2 3 349310 CASAVA_Build 9 117676656 1D AAACAGTGAC T/- TTTTTTACTT 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 7 6 349311 CASAVA_Build 9 117694346 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 54 18 22 14 A 10 11 349312 CASAVA_Build 9 117698483 4D TAAAAGTTGA TAAG/---- TAAGACATGG 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 TAAG 2 1 349313 CASAVA_Build 9 117698998 2D AGAAGTAAAC AA/-- AAAAAGACTG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 A 7 5 349314 CASAVA_Build 9 117709831 1D GGTAAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 29 1 23 5 T 11 10 349315 CASAVA_Build 9 117733637 1D AATAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 10 9 349316 CASAVA_Build 9 117736086 5D AATAAATATT AATTG/----- AATTGAATGT 3070 het 3070 ref 42 21 15 8 AATTG 2 1 349317 CASAVA_Build 9 117741499 1I CCTGGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 21 21 13 T 10 11 349318 CASAVA_Build 9 117765848 1D AGTGCTGAGA T/- TACAGGCATG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 2 1 349319 CASAVA_Build 9 117791817 1D TTTATTTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 18 26 7 A 11 10 349320 CASAVA_Build 9 117816404 1I TAAGCAGTAT -/A AAAATTCCTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 4 5 349321 CASAVA_Build 9 117842383 1I ACTGTGGGAT -/A AATGCTACAA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 A 2 3 349322 CASAVA_Build 9 117881454 1D CTGTCTCAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 75 het 30 0 26 6 A 8 7 349323 CASAVA_Build 9 117882837 1D GAGGCTGTCC T/- TGTGGTCATG 3070 hom 84 het 33 0 24 9 T 2 1 349324 CASAVA_Build 9 117888976 1I TACATAAATG -/T TTTTTTTGGG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 7 8 349325 CASAVA_Build 9 117917956 1D AATCCAGAGA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 49 het 42 1 37 4 T 8 7 349326 CASAVA_Build 9 117925835 1D GTGTCAGGTA T/- TTTTACATAT 3070 hom 160 het 59 0 54 5 T 5 4 349327 CASAVA_Build 9 117927492 6I AACCATCCTT ------/CTACTC CTACTATCTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CTACTC 0 1 349328 CASAVA_Build 9 117930451 1I TTTACCTAAA -/G AAAAAACCCA 3070 hom 115 het 45 0 39 6 G 0 1 349329 CASAVA_Build 9 117949520 2D TCTTTCAGAA GC/-- TTGAAGTGTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 GC 1 0 349330 CASAVA_Build 9 117955259 1I AGAGAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 11 12 349331 CASAVA_Build 9 117956829 1D GCAGAGACAT C/- CGGGCGAGCT 2874 het 1951 hom 22 8 10 4 C 2 1 349332 CASAVA_Build 9 117972981 1D GTGAGTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 A 13 12 349333 CASAVA_Build 9 117979066 1D AGAGGAAAGA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1468 hom 39 7 16 16 C 11 10 349334 CASAVA_Build 9 117997451 3D ACTGAATTAA AAG/--- AAGAACTGTT 3070 het 3070 hom 39 15 21 4 AAG 2 1 349335 CASAVA_Build 9 118009508 11I GAGGGCCTGT -----------/TATTTAAATAG TATCTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 TATTTAAATAG 0 1 349336 CASAVA_Build 9 118010473 1D TGCTATCTAC T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 8 7 349337 CASAVA_Build 9 118018052 2D ATACAAACAC AT/-- ATATATATAC 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 AT 5 4 349338 CASAVA_Build 9 118019753 2D ACGCAAGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 53 24 24 7 AC 6 5 349339 CASAVA_Build 9 118022663 2I TGTGTGTCAC --/AT GTGTGTATAT 2028 het 1534 hom 15 7 5 3 AT 0 1 349340 CASAVA_Build 9 118028110 1D CCTGCATGTC A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 7 6 349341 CASAVA_Build 9 118038842 1D TAAGGTCTTT G/- CATCTTTTAC 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 G 1 0 349342 CASAVA_Build 9 118070796 5I AATAGTATAC -----/TTAAT TTAATACAGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTAAT 1 2 349343 CASAVA_Build 9 118072947 1D TGCATGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 A 11 10 349344 CASAVA_Build 9 118076233 1D AGGGTGAATG A/- AAAAAAAACA 2205 het 2205 ref 27 17 6 4 A 9 8 349345 CASAVA_Build 9 118078627 1I ACTGGACTGA -/G GACTCTAAAG 3070 hom 117 het 43 0 38 5 G 1 2 349346 CASAVA_Build 9 118085983 1I GGGACAGGGA -/G GGGAGGAAAA 3070 het 3070 ref 42 26 10 6 G 3 4 349347 CASAVA_Build 9 118088936 1I CAGCTTCTCA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 31 11 17 3 T 7 8 349348 CASAVA_Build 9 118092466 1D TTTCTCCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 13 13 T 13 12 349349 CASAVA_Build 9 118100960 1D ATTTGACCTT G/- GTATTGACTT 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 G 2 1 349350 CASAVA_Build 9 118102953 1D AAGAAGAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 10 9 349351 CASAVA_Build 9 118129689 1D TTGGAAGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 53 1 44 8 A 11 10 349352 CASAVA_Build 9 118157304 1D CCCTGTGCCT C/- TCAGCACTTA 3070 hom 90 het 47 1 38 8 C 1 0 349353 CASAVA_Build 9 118162373 7I AGAAGGAGAG -------/TCTGGGC TCTGGGCTCT 3070 het 3070 ref 20 9 7 4 TCTGGGC 1 2 349354 CASAVA_Build 9 118164194 1I TGTCTTGGAA -/G AAAAAGCTTC 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 G 0 1 349355 CASAVA_Build 9 118172629 4I ACAAACATTA ----/GACT GACTCTGCTT 3070 het 3070 hom 48 24 23 1 GACT 1 2 349356 CASAVA_Build 9 118176252 3D GATGATGGTG GTA/--- GTGTTGGTGG 2811 het 2811 ref 57 33 13 12 GTA 1 0 349357 CASAVA_Build 9 118176274 15D27M3D GTGGTGTTGA TGATGATGATGGTGGTGATGATGATGGTGGTGCCAATGGTGCTGA/---------------TGATGATGATGGTGGTGCCAATGGTGC--- TGATGATGAC 3070 het 3070 ref 53 18 11 45 N/A 0 0 349358 CASAVA_Build 9 118178129 1I GGATTTTTTT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 175 hom 13 1 10 2 A 0 1 349359 CASAVA_Build 9 118190177 4D TCTCCCTCCC TTAT/---- TTGTCTGTAC 3070 het 3070 ref 32 17 11 6 TTAT 1 0 349360 CASAVA_Build 9 118192798 1D TGCCTCCCCC T/- GCCCCCCGCT 3070 het 1987 hom 33 10 15 11 T 1 0 349361 CASAVA_Build 9 118200580 1I CATAGCACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1091 hom 39 6 25 8 A 17 18 349362 CASAVA_Build 9 118205662 1D ACTAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 A 9 8 349363 CASAVA_Build 9 118208357 2I CTCTAATCAA --/AG AGGGGATGGG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AG 1 2 349364 CASAVA_Build 9 118211971 2I CACACGCACG --/CA CACACACACA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 CA 6 7 349365 CASAVA_Build 9 118218980 1I TGGTGATTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2868 hom 38 9 10 19 T 14 15 349366 CASAVA_Build 9 118233819 1I ACTGTACCTA -/T TGCAACATTA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 349367 CASAVA_Build 9 118234106 1I TAAATCAAGT -/A ATGTTTTAGA 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 A 1 2 349368 CASAVA_Build 9 118243540 1D CTGGAAACTT A/- AGAGTAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 A 2 1 349369 CASAVA_Build 9 118246201 2D GGCACTATTA CT/-- CTCTTTATTT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 CT 3 2 349370 CASAVA_Build 9 118252423 10D CAGAGGAAAG CCTACTGACT/---------- CCAATGTAGA 3070 het 3070 hom 37 18 22 4 CCTACTGACT 1 0 349371 CASAVA_Build 9 118253933 4I ATGCAAATGA ----/TCTG TCTGAGTGTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TCTG 1 2 349372 CASAVA_Build 9 118266525 4I CATCAATGGT ----/AATG AATGCATAGA 3070 het 3070 ref 53 24 24 5 AATG 1 2 349373 CASAVA_Build 9 118268070 1D TCCATACTTT A/- TTTTATTTCA 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 A 1 0 349374 CASAVA_Build 9 118281574 2D AGGCTCTCAG CC/-- CCCTGGGCTT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 C 5 3 349375 CASAVA_Build 9 118287456 2D GCCTTCAGTC TA/-- TAACCCTAAG 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 TA 2 1 349376 CASAVA_Build 9 118304639 3D AGAAGTGGAT AGA/--- AGGTCAGAGA 3070 het 3070 hom 27 11 13 5 AGA 1 0 349377 CASAVA_Build 9 118320970 1I TACATCAGAC -/A AAACAAACTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 3 4 349378 CASAVA_Build 9 118323235 5I ACCATTCTTC -----/ACAGA ACAGAACTAG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 ACAGA 1 2 349379 CASAVA_Build 9 118340950 2I CATTTCAGGC --/CA CAAACTCCTT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 CA 1 2 349380 CASAVA_Build 9 118341483 1D CTATGAGGGA G/- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 22 4 G 3 2 349381 CASAVA_Build 9 118345094 1D CATCCAGCTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 9 8 349382 CASAVA_Build 9 118347765 6I TGTTTTCATG ------/ACCAAT ACCAATTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 21 1 ACCAAT 1 2 349383 CASAVA_Build 9 118350207 4I CAAAGCACTC ----/TGTT TGTTTTCTAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TGTT 1 2 349384 CASAVA_Build 9 118351366 1I ATGAAAAAAA -/G AAAAACAGAA 3070 het 3070 hom 34 16 13 5 G 0 1 349385 CASAVA_Build 9 118361597 1D CTTTACTCTC A/- ACTTAGTGTG 3070 het 3070 ref 47 26 14 9 A 2 1 349386 CASAVA_Build 9 118363121 1D GAACTCTGGG T/- TAGTTTGTAA 3070 het 3070 ref 47 28 15 5 T 2 1 349387 CASAVA_Build 9 118364481 5I GGACTAATGT -----/TCTCG TCTCCTGTGT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 TCTCG 0 1 349388 CASAVA_Build 9 118366898 4D TCATTTATTC ATTA/---- ATTAATTTAC 3070 het 3070 ref 34 18 15 3 ATTA 2 1 349389 CASAVA_Build 9 118372496 1D TTTTAGTCTC T/- TTTTTTTTTT 2671 het 2671 ref 28 16 7 5 T 11 10 349390 CASAVA_Build 9 118379539 3I16M2D GGGCTGAGGC ---AGGATCACTTGAGCCCGG/AGGAGGATCACTTGAGCCC-- GGGAGGTCAA 2652 het 2652 ref 30 14 11 5 N/A 0 0 349391 CASAVA_Build 9 118379638 5D TCTCAAAAAA AAAAG/----- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 16 6 AAAAG 1 0 349392 CASAVA_Build 9 118380642 1I CCAGAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 A 10 11 349393 CASAVA_Build 9 118380871 2I TTTCAAATGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2854 hom 32 7 17 8 A 10 12 349394 CASAVA_Build 9 118383992 6D TGAATCTTAT CTTTAA/------ CTTTAACTAA 3070 het 3070 ref 31 17 12 7 CTTTAA 2 1 349395 CASAVA_Build 9 118386440 1I GGTACTATCT -/A GGGGCATTCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 349396 CASAVA_Build 9 118389956 1D AGATGCTCAT A/- TTCTATGCCC 3070 hom 129 het 46 0 43 4 A 1 0 349397 CASAVA_Build 9 118390755 3I AGCTTTAGAA ---/TAT TATTATGCTG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TAT 2 3 349398 CASAVA_Build 9 118399194 1I TTATATTTTT -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 42 26 13 3 A 6 7 349399 CASAVA_Build 9 118412990 6D AAATATTGAT ACAAGA/------ AGACAGAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 ACAAGA 1 0 349400 CASAVA_Build 9 118427681 16I TTCTAAAACA ----------------/CCACAACTTATTCTAT CCTCTTGCTT 2928 het 2928 ref 31 16 7 8 CCACAACTTATTCTAT 0 1 349401 CASAVA_Build 9 118429938 2D TGTTCTAGGT TC/-- TTTTTATGTA 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 TC 1 0 349402 CASAVA_Build 9 118433670 2D AGGAAGGGTA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 47 15 19 13 AG 6 5 349403 CASAVA_Build 9 118434435 1I CAATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 11 349404 CASAVA_Build 9 118440896 4D TGATTTGAAA AAAC/---- AAACAAGTAC 3070 het 3070 ref 39 21 16 4 AAAC 2 1 349405 CASAVA_Build 9 118453188 2D GGCGAATCTT TG/-- TGTTTTTAGT 3070 het 2309 hom 21 6 9 6 TG 2 1 349406 CASAVA_Build 9 118473795 1D TGCTGGCTTT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 50 23 18 10 A 8 7 349407 CASAVA_Build 9 118485934 1D TAAGAATCTG T/- TTTTGTCTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 5 4 349408 CASAVA_Build 9 118506433 3D AGAATAGTAG AAC/--- AACAACATCA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 AAC 3 2 349409 CASAVA_Build 9 118506912 5D ATCATTTGAT TAAAG/----- TAATTAAGAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 TAAAG 1 0 349410 CASAVA_Build 9 118507814 3I TGGCTGCAGA ---/GAT GATAAGGTAT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 GAT 1 2 349411 CASAVA_Build 9 118512608 1D AGGAGGGGGG A/- ATCACCTGAG 2226 het 2226 ref 20 9 7 4 A 2 1 349412 CASAVA_Build 9 118514400 4D AACTGTTTTG AGCC/---- AGGTGTTCAT 3070 het 3070 hom 50 15 28 8 AGCC 1 0 349413 CASAVA_Build 9 118519400 1D GAACAAATGC T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 8 7 349414 CASAVA_Build 9 118524358 1D40M4D ACGCACACAC AAAAAAAAATACAGAGAAAAAGCAGTTGGGAAATGTTCAGACAAT/-AAAAAAAATACAGAGAAAAAGCAGTTGGGAAATGTTCAGA---- CAATGAATAA 3070 hom 96 het 30 0 32 13 N/A 0 0 349415 CASAVA_Build 9 118526065 1I ACTCTTTCTT -/C CCCCTCTCCC 3070 hom 100 het 37 0 30 7 C 4 5 349416 CASAVA_Build 9 118529643 2D AACAAAAATA GG/-- GGGCTCAAAG 3070 het 3070 hom 49 16 31 2 G 5 3 349417 CASAVA_Build 9 118544879 1I TATGTCAATT -/A AAAATATAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 4 5 349418 CASAVA_Build 9 118570347 1I CTTTTTGCCA -/T TATTTATTCC 3070 hom 160 het 54 0 53 1 T 1 2 349419 CASAVA_Build 9 118572014 1D GCATGGTGGT G/- GGGTGCCTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 G 4 3 349420 CASAVA_Build 9 118573422 1I CATGTTCCCA -/T TTTTTCAGCT 3070 hom 153 het 57 0 47 10 T 5 6 349421 CASAVA_Build 9 118575796 1D AGTAAGAGCC A/- TTATCCTCAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 1 0 349422 CASAVA_Build 9 118579977 6I TGACATGGAG ------/TCTTAC TCTGTTGTCA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TCTTAC 0 1 349423 CASAVA_Build 9 118580309 1I GCAAACACTT -/A ATGCCATGAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 1 2 349424 CASAVA_Build 9 118580499 5I GGGATTTTTA -----/TTTAT TTTATTTTAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TTTAT 2 3 349425 CASAVA_Build 9 118581218 1I CTCTCCCCAT -/A ATCTCTGTGT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 1 2 349426 CASAVA_Build 9 118581602 1D GTCTCAGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 30 1 22 7 T 12 11 349427 CASAVA_Build 9 118592778 1I TCTCCAGAGA -/T TTTTTTTTTT 2573 het 233 hom 24 2 12 10 T 16 17 349428 CASAVA_Build 9 118605104 1I CAACAGGCTT -/C CCATGGGAAC 3070 hom 108 het 38 0 35 3 C 2 3 349429 CASAVA_Build 9 118610048 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 1942 het 42 hom 21 1 7 13 A 17 18 349430 CASAVA_Build 9 118611462 1D TGAAATGTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 10 9 349431 CASAVA_Build 9 118619429 1D AATGGGTATT A/- ATTATCTTGT 3070 hom 56 het 24 0 17 7 A 2 1 349432 CASAVA_Build 9 118620155 2D TGCTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 33 0 25 8 A 12 10 349433 CASAVA_Build 9 118624295 2I CACAATAACA --/AC AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 26 1 23 2 AC 0 1 349434 CASAVA_Build 9 118626498 2I TCTCTCTCTC --/TT ATCACTTGCT 3070 hom 103 het 40 0 34 6 T 0 2 349435 CASAVA_Build 9 118629414 2D CATCCCCCCC AA/-- AAAAAAAAAA 1797 het 313 hom 19 5 6 8 A 20 18 349436 CASAVA_Build 9 118630031 3D ACAAGGAAAT AAC/--- AACAACGAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AAC 3 2 349437 CASAVA_Build 9 118632515 1D AGTATGAAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 34 0 27 9 T 9 8 349438 CASAVA_Build 9 118636077 1I GAATTTCACC -/A AAAAAACGAA 3070 hom 151 het 56 0 51 5 A 6 7 349439 CASAVA_Build 9 118638473 1D GCCAGGGGAT G/- GGGGTGCTCA 3070 hom 97 het 36 0 33 5 G 5 4 349440 CASAVA_Build 9 118639794 3I TGTTCTGAGC ---/AGG AGAAGGAAAA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 AGG 0 1 349441 CASAVA_Build 9 118672043 1D ATTTCTATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 25 1 12 12 T 17 16 349442 CASAVA_Build 9 118673860 10D CTATGACTAA TGCTGCTATG/---------- AACATTCATA 3070 het 3070 ref 40 24 17 4 TGCTGCTATG 1 0 349443 CASAVA_Build 9 118675640 1D CATGGGCTAA T/- TATCTACTGA 3070 hom 126 het 50 0 41 9 T 2 1 349444 CASAVA_Build 9 118676381 2D ATTTAGGTTG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 AT 7 6 349445 CASAVA_Build 9 118679415 1D TAAGTGTGGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 129 het 51 0 45 6 T 9 8 349446 CASAVA_Build 9 118684929 2I CTTGACTCTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 33 0 21 12 A 14 16 349447 CASAVA_Build 9 118688836 1D ATAAAAGAAT A/- TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 33 0 33 1 A 1 0 349448 CASAVA_Build 9 118708552 1D GAGATTCCAG C/- CCCCCCAGAC 3070 hom 111 het 43 0 36 7 C 7 6 349449 CASAVA_Build 9 118730487 1I CAGATATTCT -/A AAAAAAATTC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 7 8 349450 CASAVA_Build 9 118736667 1D TAAATGATGA G/- AACACATGGA 3070 het 3070 hom 36 10 23 3 G 1 0 349451 CASAVA_Build 9 118738918 1I TGCCCAAGGC -/T TTGGCACACC 3070 het 3070 ref 59 28 18 13 T 2 3 349452 CASAVA_Build 9 118740358 1D TGTTTGCAAT G/- GTAGAGAAGG 3070 hom 144 het 55 0 47 8 G 2 1 349453 CASAVA_Build 9 118743268 9I GCAGAAGACA ---------/ACTGAGGAT ACTGAGGATA 3070 het 3070 hom 57 25 27 5 ACTGAGGAT 1 2 349454 CASAVA_Build 9 118750031 13D GGTAATGTCT TTTAGTCTTTAAA/------------- TTCAGAATGT 3070 het 3070 ref 45 26 18 5 TTTAGTCTTTAAA 1 0 349455 CASAVA_Build 9 118762574 1D CTAGGCCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 161 hom 37 1 27 9 T 13 12 349456 CASAVA_Build 9 118763131 3I GGAGGAGAGA ---/GGG AGAGGTGTAT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 G 0 3 349457 CASAVA_Build 9 118764685 1D GATTTATGAC A/- TTTGTTCACA 3070 het 3070 hom 47 18 20 10 A 1 0 349458 CASAVA_Build 9 118774310 1I ATGAAACTAG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 399 hom 39 1 35 3 T 8 9 349459 CASAVA_Build 9 118784651 1I TAATTTGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 35 0 33 2 T 10 11 349460 CASAVA_Build 9 118792453 32D TGCAACCTCT GCCTCTTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCC/-------------------------------- GCCTCCCGAG 3070 hom 103 het 36 0 34 11 GCCTCTTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCC 1 0 349461 CASAVA_Build 9 118793258 2D AAAGGTGGGG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 158 het 61 0 51 11 AC 7 6 349462 CASAVA_Build 9 118797174 4D TTTGAATCTT CATC/---- CATTTGAATC 3070 hom 123 het 44 0 42 3 CATC 1 0 349463 CASAVA_Build 9 118806136 1D TATCTTGATT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 56 het 22 0 17 7 A 8 7 349464 CASAVA_Build 9 118807972 18D CTTGTTTCCC ATTGTGGTGTTTAATTGA/------------------ ATCTGTGCCT 3070 het 3070 ref 38 21 18 5 ATTGTGGTGTTTAATTGA 1 0 349465 CASAVA_Build 9 118819331 5D TGAAAGCAAC TCTTT/----- TCTTTTAATT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TCTTT 2 1 349466 CASAVA_Build 9 118820544 1I AATCTCTTTC -/A ATTACTACAC 3070 hom 120 het 47 0 39 8 A 1 2 349467 CASAVA_Build 9 118830709 1D TCATCCAGGC A/- GCCTTGGGAG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 1 0 349468 CASAVA_Build 9 118847421 1D TGCCTGAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 T 11 10 349469 CASAVA_Build 9 118853327 1D CTTATTAACT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 91 het 41 0 31 11 A 10 9 349470 CASAVA_Build 9 118855555 1D CTGTCTCTTG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 A 9 8 349471 CASAVA_Build 9 118863478 32I TGCACAGTGC --------------------------------/CTGGCATTTAGTAAGCACTCAGTAAATGATAG CTATTATTAA 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 CTGGCATTTAGTAAGCACTCAGTAAATGATAG 0 1 349472 CASAVA_Build 9 118868117 3D CCATTTTATC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 21 1 14 6 T 14 11 349473 CASAVA_Build 9 118875283 1I ATCTAATGCA -/C CCCCCCTTGC 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 C 6 7 349474 CASAVA_Build 9 118876194 1D TCTATTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 101 het 39 0 32 8 A 11 10 349475 CASAVA_Build 9 118886137 2D GATCTTTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2845 het 2843 ref 28 14 9 5 A 16 14 349476 CASAVA_Build 9 118891614 1I ATTTTTTGTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 7 8 349477 CASAVA_Build 9 118893673 1I CTCACGTGAT -/G GGGGGGGCAG 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 G 7 8 349478 CASAVA_Build 9 118906084 12I CCTGCTATAG ------------/GCCAGGCACAGT GCCAGGCACT 3070 hom 100 het 39 0 30 9 GCCAGGCACAGT 0 1 349479 CASAVA_Build 9 118913537 1I TGTATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 11 12 349480 CASAVA_Build 9 118916686 5D GGCTTTTTTG TTGTT/----- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 ref 39 15 16 11 TTGTT 3 2 349481 CASAVA_Build 9 118918125 1D ACTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 10 9 349482 CASAVA_Build 9 118930573 4I TATAAGGGCA ----/ATTG ATTGGGGAGG 3070 hom 69 het 27 0 22 5 ATTG 1 2 349483 CASAVA_Build 9 118934528 1D CTACTGAAAG A/- AATATGGTAG 3070 het 3070 hom 43 13 23 8 A 3 2 349484 CASAVA_Build 9 118945917 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 10 11 349485 CASAVA_Build 9 118947762 1I CTTCCTGACA -/T TTCTTGTCCT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 T 2 3 349486 CASAVA_Build 9 118963965 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 9 10 349487 CASAVA_Build 9 118966184 4D CAATTGGTTT CATG/---- CATAAAGATC 3070 het 3070 ref 46 27 16 5 CATG 1 0 349488 CASAVA_Build 9 118967278 6I GCCTATTCCA ------/TCCCTC TCCCTCTCCC 3070 het 3070 hom 59 17 24 18 TCCCTC 1 2 349489 CASAVA_Build 9 118969372 1I CACCAAAACC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 T 8 9 349490 CASAVA_Build 9 118971309 1D GAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2416 hom 26 7 15 5 A 12 11 349491 CASAVA_Build 9 118986472 1D AGCGCCAATC A/- GGCAGCACTT 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 A 1 0 349492 CASAVA_Build 9 118988483 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAATACA 1729 hom 15 het 7 0 6 1 A 6 7 349493 CASAVA_Build 9 118994211 2D ATTTTAGAGA GT/-- GTGTAGAGAC 3070 hom 141 het 54 0 48 7 GT 3 2 349494 CASAVA_Build 9 119000093 1I GTTTTTAAGA -/T TTTTTTTTCT 2852 het 2852 ref 27 12 9 6 T 8 9 349495 CASAVA_Build 9 119007016 8D CATGATGTTT TGGCCTGC/-------- TGGTATTACT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TGGCCTGC 1 0 349496 CASAVA_Build 9 119013082 1I ATCTCAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 661 hom 34 3 19 12 A 13 14 349497 CASAVA_Build 9 119014039 12I TCCCATGCTC ------------/CCATACAGATAG ATGCAATCTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 CCATACAGATAG 0 1 349498 CASAVA_Build 9 119017573 11I CAACTGATAT -----------/ATATATATATA ATATATATAT 3070 hom 21 het 9 0 8 2 ATATATATATA 1 2 349499 CASAVA_Build 9 119023948 1I GTGTTAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2903 hom 36 8 17 11 A 12 13 349500 CASAVA_Build 9 119032217 2D ACTCTATCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 26 0 13 13 A 14 12 349501 CASAVA_Build 9 119034989 2D TAGGTACAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 9 het 28 1 15 14 T 13 11 349502 CASAVA_Build 9 119048246 1D TGAAAACAAA C/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 44 21 15 8 C 1 0 349503 CASAVA_Build 9 119053388 1D ACAAATGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 12 11 349504 CASAVA_Build 9 119055039 3I CTATGTTATA ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 TGT 3 4 349505 CASAVA_Build 9 119067911 1D GCAAAATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 26 2 19 5 A 15 14 349506 CASAVA_Build 9 119076450 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2469 hom 22 7 11 4 A 9 10 349507 CASAVA_Build 9 119104099 1I AGCCTATGGA -/T ACTCCCTGTC 3070 hom 78 het 27 0 26 1 T 0 1 349508 CASAVA_Build 9 119136585 1D ATATCAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1095 het 1095 ref 33 20 3 10 T 15 14 349509 CASAVA_Build 9 119160513 1D TGAATGAGTG T/- AACATTACAA 3070 het 3070 ref 56 25 26 6 T 1 0 349510 CASAVA_Build 9 119162880 1D TCTACCCCCA G/- TCTCTCCATC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 G 1 0 349511 CASAVA_Build 9 119179818 14I AAATGTCCAT --------------/CAATAGGAATATAG CAATAGGAAA 2591 het 2591 ref 15 7 6 2 CAATAGGAATATAG 0 1 349512 CASAVA_Build 9 119188865 1I TCACCCTTCC -/T GGACTATGAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 0 1 349513 CASAVA_Build 9 119257765 3D AGAATAAATA GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 hom 87 het 37 0 30 7 GTT 7 6 349514 CASAVA_Build 9 119271590 2I TGAAAAATCT --/CA CAGTCTGTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 CA 1 2 349515 CASAVA_Build 9 119286647 1D CCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 38 1 25 12 A 13 12 349516 CASAVA_Build 9 119299581 1D ATTTTGTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 9 8 349517 CASAVA_Build 9 119299745 1D ACTGTTGTAT G/- GCGTGTTAAG 3070 hom 49 het 20 0 16 4 G 2 1 349518 CASAVA_Build 9 119302034 1D TGAGTTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 37 hom 30 1 20 10 A 15 14 349519 CASAVA_Build 9 119310720 5I CCTGTTGCCA -----/GAGCT GAGCTGCAGC 3070 het 3070 ref 39 17 13 9 GAGCT 1 2 349520 CASAVA_Build 9 119312746 1D CTCCACAGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 T 9 8 349521 CASAVA_Build 9 119315883 4D GGTGTGGACT TCTA/---- TCTATCAATG 3070 het 3070 hom 54 24 25 5 TCTA 2 1 349522 CASAVA_Build 9 119320591 1I ACAAGCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 29 0 20 9 T 10 11 349523 CASAVA_Build 9 119322942 1D AACCAGTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 22 19 3 A 12 11 349524 CASAVA_Build 9 119329394 9I TACTCTCTCT ---------/TGTAGAAAA TGTAGAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 TGTAGAAAA 1 2 349525 CASAVA_Build 9 119329452 4I AAAAAAACTG ----/TAAT TAAGTCAAAA 3070 hom 73 het 35 0 24 11 TAAT 0 1 349526 CASAVA_Build 9 119335195 1I TTGACTGTGA -/C CCAATAGTAT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 C 2 3 349527 CASAVA_Build 9 119338482 1D CTAATATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 T 10 9 349528 CASAVA_Build 9 119339137 3I TTTAAACAAT ---/AAC AACAACAACT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 AAC 3 4 349529 CASAVA_Build 9 119342266 2D AGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 81 het 40 0 28 13 TA 8 7 349530 CASAVA_Build 9 119343686 4D GTAATATAAC ACTT/---- ACGAAGGGAT 3070 het 3070 hom 25 9 13 6 ACTT 1 0 349531 CASAVA_Build 9 119354458 10D AATTGTAAAT TTTAAAATGG/---------- TTAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 TTTAAAATGG 1 0 349532 CASAVA_Build 9 119358811 1D CCTACTCAGC T/- TTTTTTTTTT 1708 het 1708 ref 30 12 5 15 T 17 16 349533 CASAVA_Build 9 119366767 1I TCTCAAACAT -/A AAAAAAAAAA 2799 het 2799 ref 30 13 11 6 A 12 13 349534 CASAVA_Build 9 119367246 1D TTTCTTTCCT G/- GACATTTAAA 3070 het 3070 hom 38 19 18 2 G 2 1 349535 CASAVA_Build 9 119370530 1D AGAAGACAGC T/- TCTCTGGAAG 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 T 2 1 349536 CASAVA_Build 9 119391022 1I AAACAGCAAC -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 7 8 349537 CASAVA_Build 9 119395366 1I TAATTTTAGC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 7 8 349538 CASAVA_Build 9 119395926 2I GAAAAAATAA --/CT CTGCCATCTA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 CT 1 2 349539 CASAVA_Build 9 119425525 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1871 hom 25 6 15 4 A 13 14 349540 CASAVA_Build 9 119426018 1D ATCTCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 11 10 349541 CASAVA_Build 9 119434187 1I ACTGGTGATG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 23 8 10 5 A 8 9 349542 CASAVA_Build 9 119436203 1D TATCATAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 36 1 30 5 T 12 11 349543 CASAVA_Build 9 119440960 1I AACATTTAAC -/A GATAAATAAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 0 1 349544 CASAVA_Build 9 119449526 8D AGACCTCTTA TTTTATTT/-------- TTTTATTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 TTTTATTT 3 2 349545 CASAVA_Build 9 119451591 2D GGTTCCTATC AT/-- GTGTTCTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 AT 1 0 349546 CASAVA_Build 9 119452116 5I GCATAGAAGT -----/TTAGG TTAGGGCATG 3070 het 3070 ref 44 25 11 8 TTAGG 1 2 349547 CASAVA_Build 9 119459084 1I TATATCTAAG -/A ATAAGATTTA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 1 2 349548 CASAVA_Build 9 119459667 1I TGCAGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 512 hom 24 3 19 2 G 0 1 349549 CASAVA_Build 9 119459804 1I ATGCTATCCC -/T GCCCCCTCCC 2158 hom 15 het 6 0 6 0 T 0 1 349550 CASAVA_Build 9 119462419 4D TGTTCCTAAG TTAT/---- TTATTTGATT 3070 het 3070 hom 42 19 19 5 TTAT 2 1 349551 CASAVA_Build 9 119468519 1D CATGATGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 43 6 16 21 T 11 10 349552 CASAVA_Build 9 119472113 3I GTGTTAGTTA ---/CAT CATCATAATT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CAT 2 3 349553 CASAVA_Build 9 119474143 1I ATTTTGTAGG -/T TTTTTTTTTT 2752 het 2302 hom 25 8 10 7 T 13 14 349554 CASAVA_Build 9 119475697 1D TTCTTTTTAC T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 37 14 22 1 T 7 6 349555 CASAVA_Build 9 119481657 4D GAAATTTCTC AGAG/---- AGCTGAGCTT 3070 het 3070 ref 48 24 15 11 AG 3 1 349556 CASAVA_Build 9 119490520 5D GAGAGAAAAA GAATT/----- GAAGAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 19 13 2 GAATT 1 0 349557 CASAVA_Build 9 119493231 3I TCACATGCAA ---/AAG AATGATTTCT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AAG 0 1 349558 CASAVA_Build 9 119502817 2I ATTATAGGCC --/CA TAATGGTAAC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 CA 0 1 349559 CASAVA_Build 9 119506751 1D TTATTTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 29 11 A 12 11 349560 CASAVA_Build 9 119512434 4I TTTCTGTTCC ----/TTTG TTTGTTAATT 3070 het 3070 ref 50 32 13 5 TTTG 1 2 349561 CASAVA_Build 9 119512551 1D CACCTCTCCC T/- TTTTTTTTTT 1053 het 1053 ref 42 28 3 11 T 13 12 349562 CASAVA_Build 9 119529148 1D GAACCAAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 17 hom 47 1 39 9 T 10 9 349563 CASAVA_Build 9 119533656 1D CACATACACT G/- TAGCAATTTC 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 G 1 0 349564 CASAVA_Build 9 119540576 1D ATTCCTGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 10 9 349565 CASAVA_Build 9 119559196 19D TTGTCACTTA TTACACTCCAGACACTGAC/------------------- TATAGAGCAT 2368 het 2368 ref 19 13 5 7 TTACACTCCAGACACTGAC 1 0 349566 CASAVA_Build 9 119564035 1I TGTGCTTTTG -/T TCATGATGAT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 1 2 349567 CASAVA_Build 9 119569654 3D CTTCATTTAC TTA/--- TTATAGAATC 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 TTA 2 1 349568 CASAVA_Build 9 119576342 1I TTCTTCTTCC -/T TTTTTAGAGA 3070 het 3070 hom 36 18 18 0 T 5 6 349569 CASAVA_Build 9 119582445 1I AAGCAAAGCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 37 11 21 5 T 7 8 349570 CASAVA_Build 9 119583898 3I CTGCATTGAA ---/AAC AACAAGGTGT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 AAC 1 2 349571 CASAVA_Build 9 119583990 14D TTATGGACAC AATTTATGAGAACA/-------------- ATATATGTTC 3070 het 3070 ref 43 28 16 3 AATTTATGAGAACA 1 0 349572 CASAVA_Build 9 119584344 6I GCAGGATGCT ------/TGTGAG TGTGACAGTG 3070 het 3070 hom 50 18 31 1 TGTGAG 0 1 349573 CASAVA_Build 9 119593309 1D TTATTTTTGC T/- TTTTTTTTTG 1311 het 1311 ref 50 37 3 10 T 10 9 349574 CASAVA_Build 9 119596658 1I TAAGTAATAG -/A AAAAAACTCA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 A 6 7 349575 CASAVA_Build 9 119597662 1D TTTGTCAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 15 22 7 A 10 9 349576 CASAVA_Build 9 119605925 1I ATTTTTCTTT -/G CTATTAGACT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 G 0 1 349577 CASAVA_Build 9 119612026 2D CAGAACTCTC TT/-- GTTTGGTTTC 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 T 2 0 349578 CASAVA_Build 9 119613144 1I AAATAACAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 8 9 349579 CASAVA_Build 9 119613949 1D ATAATAAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 T 3 2 349580 CASAVA_Build 9 119618922 4D CCTACCTATT TATC/---- AGTTAGAGAT 3070 het 3070 ref 42 22 19 2 TATC 1 0 349581 CASAVA_Build 9 119627655 1I GCAGCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 802 hom 48 2 41 5 T 13 14 349582 CASAVA_Build 9 119628356 4D AGGGGAAGTA GTGG/---- GGTGGGGTAA 236 het 236 ref 29 2 3 25 GTGG 1 0 349583 CASAVA_Build 9 119641936 1I TCTTTTTCAC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 T 8 9 349584 CASAVA_Build 9 119649930 1D CTGGACCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 23 20 6 A 11 10 349585 CASAVA_Build 9 119651025 1D TTGCATGTAT C/- TTATATAAAC 3070 het 3070 hom 61 24 35 3 C 1 0 349586 CASAVA_Build 9 119656140 2D GTTAATGTTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 2605 hom 25 8 12 7 T 11 9 349587 CASAVA_Build 9 119656436 4I GAAATGGGGT ----/ATTA ATTGTAGAGC 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 ATTA 0 1 349588 CASAVA_Build 9 119657728 12I CAAGACCAGG ------------/GAGACCTACTGT GAGGCAATAG 3070 hom 90 het 31 0 31 2 GAGACCTACTGT 0 1 349589 CASAVA_Build 9 119661774 2D AGGCAAAGAA AC/-- ACAGACTAAA 3070 het 3070 hom 45 18 26 4 AC 2 1 349590 CASAVA_Build 9 119662951 1D26M2D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAG/-AAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAA-- AGAGACAGGT 1747 het 938 hom 9 5 5 4 N/A 0 0 349591 CASAVA_Build 9 119664016 1D CTTTTACTCA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 8 7 349592 CASAVA_Build 9 119664711 2I AGAGGTTTAA --/TT AATTCACAGG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 T 0 2 349593 CASAVA_Build 9 119680649 1D TTGGAAGGTC A/- AAAAAAAAAA 2129 het 2129 ref 39 18 7 14 A 15 14 349594 CASAVA_Build 9 119702221 1D CTTCCCTCTC T/- CTCTCTCTTT 3070 het 3070 hom 29 13 16 0 T 1 0 349595 CASAVA_Build 9 119711099 1D TTGGTTGCTG T/- TTGGTGTATA 3070 het 2962 hom 24 7 10 10 T 3 2 349596 CASAVA_Build 9 119716511 2D ACTATCCCGG AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 11 9 349597 CASAVA_Build 9 119734721 5I AATTGATTCT -----/TTAAA TTAATCCTTA 3070 het 3070 hom 36 15 13 8 TTAAA 0 1 349598 CASAVA_Build 9 119744005 4I GAAAGAAAAG ----/TATT TACCAAATAA 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 TATT 0 1 349599 CASAVA_Build 9 119759944 1I CTCTATTGCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 46 27 17 2 T 8 9 349600 CASAVA_Build 9 119762790 1I TGTGGTGATG -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 41 12 26 3 T 7 8 349601 CASAVA_Build 9 119764266 2I CACACACACA --/CG CACACACGTC 3070 het 462 hom 28 4 13 11 CG 0 1 349602 CASAVA_Build 9 119773353 1I TGGGATTATG -/T TCTATATCCC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 T 1 2 349603 CASAVA_Build 9 119775365 2I CAGAGAGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 CT 1 2 349604 CASAVA_Build 9 119791739 1D CAGCTTCTGC T/- TTTTTTTTTT 1904 het 1021 hom 37 7 8 22 T 19 18 349605 CASAVA_Build 9 119792214 3I TTCTTCTTCT ---/TTA TTATTATTAT 3070 hom 85 het 36 0 28 8 TTA 3 4 349606 CASAVA_Build 9 119795481 5D ATTCTTGTTT TTTTG/----- TTTTTGTTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 5 TTTTG 1 0 349607 CASAVA_Build 9 119799225 3D CCTTCCTCCT TCC/--- TCTTTTCCTC 3070 het 52 hom 42 2 23 19 TCC 1 0 349608 CASAVA_Build 9 119802207 1D CAACTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 11 10 349609 CASAVA_Build 9 119806989 8D TAGAAAATAA AGTTTTAG/-------- AGGTTGATCT 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 AGTTTTAG 1 0 349610 CASAVA_Build 9 119810688 1I CACTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 13 13 10 A 11 12 349611 CASAVA_Build 9 119814172 2D AAATGTTTTT TA/-- GTTTCTTCTC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TA 1 0 349612 CASAVA_Build 9 119814759 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 29 hom 33 2 21 10 T 14 13 349613 CASAVA_Build 9 119816402 1I CATTTTTATT -/G TTTTTTTCTA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 0 1 349614 CASAVA_Build 9 119817346 1D ATACTTGGTT C/- TTTTTATTAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 0 349615 CASAVA_Build 9 119818662 1D TGGCCATGTG T/- TGGTTTCTGT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 T 2 1 349616 CASAVA_Build 9 119824540 2I TAGATAAGAC --/TT AGGAGACTAC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 T 0 2 349617 CASAVA_Build 9 119825405 2D AGTCAGACAA AG/-- AGAGTGTGGA 3070 hom 160 het 59 0 54 7 AG 3 2 349618 CASAVA_Build 9 119826371 1I CAACTGCGCC -/G GAAGGACAGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 1 2 349619 CASAVA_Build 9 119826584 1I CCCAGCTACT -/C CGAAGGCTGA 1531 hom 18 het 7 0 4 3 C 1 2 349620 CASAVA_Build 9 119826691 1D ACACCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 22 1 12 9 A 14 13 349621 CASAVA_Build 9 119830812 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 33 2 14 17 T 15 14 349622 CASAVA_Build 9 119842311 1D TTATTAGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 26 3 18 6 A 15 14 349623 CASAVA_Build 9 119846994 1D TTGTGCTTCT G/- TGCTTAAGGA 3070 hom 108 het 45 0 37 9 G 1 0 349624 CASAVA_Build 9 119860060 1I ACCAGAAAAG -/A AAAACAATAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 4 5 349625 CASAVA_Build 9 119865041 1I CCAATCTGGC -/T GGCTGGGAGC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 0 1 349626 CASAVA_Build 9 119865360 1D GAAATTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 47 3 29 15 T 17 16 349627 CASAVA_Build 9 119870487 1D TATTGAGGGG A/- AAAAAAGAAC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 A 7 6 349628 CASAVA_Build 9 119884511 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 32 0 23 9 T 9 10 349629 CASAVA_Build 9 119896697 9D TCTGCAGGTG ATAATTTGC/--------- ATAATTTGCA 3070 hom 123 het 53 0 42 16 ATAATTTGC 2 1 349630 CASAVA_Build 9 119899901 1D AACAAAGGGT A/- AAAAAACATT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 7 6 349631 CASAVA_Build 9 119905708 38D AGGCTTAATA CCTGGGTAATAAGATAATCAGTACAGCAAACCCAAATG/-------------------------------------- CCTGGGTAAT 3070 hom 59 het 31 0 20 13 CCTGGGTAATAAGATAATCAGTACAGCAAACCCAAATG 1 0 349632 CASAVA_Build 9 119914491 3D GTTCAAAACA AGG/--- AGTTCATTTA 3070 het 3070 hom 29 9 14 7 AGG 1 0 349633 CASAVA_Build 9 119923503 3I ACATGTTTAG ---/CTA CTAACTTTTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 CTA 1 2 349634 CASAVA_Build 9 119935884 4I GGAATGTATC ----/TGTT TGTCCACTGT 3070 hom 117 het 42 0 38 4 TGTT 0 1 349635 CASAVA_Build 9 119970961 1I AAAGGAGAAG -/A AAAAAAGATG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 6 7 349636 CASAVA_Build 9 119987312 3D TGCTTAATAT AAA/--- AAAAAAAACC 3070 hom 66 het 31 0 23 9 A 11 8 349637 CASAVA_Build 9 119987498 1I AGAAAAAAAA -/T ATGCTCCTGT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 0 1 349638 CASAVA_Build 9 119996816 1D GAAAAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 30 1 20 9 A 12 11 349639 CASAVA_Build 9 119998246 14I CCGGTAAAGA --------------/AAAGCCCTGGAACC AAAGCCTTCA 3070 hom 84 het 33 0 29 6 AAAGCCCTGGAACC 0 1 349640 CASAVA_Build 9 120001322 5D ACATTAATAA ATATT/----- ATATTATATT 3070 hom 27 het 12 0 10 3 ATATT 3 2 349641 CASAVA_Build 9 120006939 2D AGAAGTTAGT AC/-- AGTCATTTGA 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 AC 1 0 349642 CASAVA_Build 9 120007676 1D CTCTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 1172 het 1172 ref 25 12 5 8 C 1 0 349643 CASAVA_Build 9 120011954 1D TTTAAGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 409 hom 21 1 16 5 T 13 12 349644 CASAVA_Build 9 120017622 1D TGATTCTCAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 5 T 9 8 349645 CASAVA_Build 9 120018744 6I CAAATAGTGA ------/CTGGCC CTAATATTGT 3070 hom 123 het 47 0 39 8 CTGGCC 0 1 349646 CASAVA_Build 9 120028905 4D TCATGGCTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 138 het 55 0 47 8 TTTG 5 4 349647 CASAVA_Build 9 120041446 1D TATATTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 478 hom 48 2 31 15 T 14 13 349648 CASAVA_Build 9 120042403 1I GAGAGAATGA -/C TAAAGAGTCC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 0 1 349649 CASAVA_Build 9 120046255 33D TGAGATTTGG GTGGGAACACAGCAAAACCAAGTAGAGATTTGT/--------------------------------- GTGGGAACAC 3070 hom 102 het 31 0 35 7 GTGGGAACACAGCAAAACCAAGTAGAGATTTGT 1 0 349650 CASAVA_Build 9 120052186 2D ATATCAATAA AG/-- AGAGTTATTT 3070 hom 57 het 20 0 20 0 AG 3 2 349651 CASAVA_Build 9 120074302 5D AAGAGAAAAT TACTC/----- TAAACAAATA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 TACTC 1 0 349652 CASAVA_Build 9 120089519 4I GTCCTTAGGT ----/TATA TATAGGTCAA 3070 het 3070 hom 50 22 20 8 TA 2 4 349653 CASAVA_Build 9 120090292 1I CATTTTCTAC -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 A 6 7 349654 CASAVA_Build 9 120091689 1I TCCATCTGCA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 106 het 45 0 35 10 T 6 7 349655 CASAVA_Build 9 120096945 1I CACTTACCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 241 hom 34 1 20 13 A 13 14 349656 CASAVA_Build 9 120099686 2D AGAATGGTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 AT 7 6 349657 CASAVA_Build 9 120102909 3D GATTTATTAG ATT/--- ATTATTTAGT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 ATT 3 2 349658 CASAVA_Build 9 120103659 1D TTGTCTATAA C/- CCCCCACTGT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 6 5 349659 CASAVA_Build 9 120108413 1D TGAAGAACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 10 9 349660 CASAVA_Build 9 120110960 4D ACAACATGAA GTCT/---- GTCTGAGACA 3070 het 3070 ref 47 25 16 8 GTCT 2 1 349661 CASAVA_Build 9 120117566 1I TCTCCTGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 A 9 10 349662 CASAVA_Build 9 120123222 2I CAGGAGCTTG --/TC TCTCTCCCTG 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 TC 3 4 349663 CASAVA_Build 9 120128681 2D CTTGACTAAC TT/-- TGTCTATTCA 3070 het 3070 ref 37 18 16 5 T 3 1 349664 CASAVA_Build 9 120131948 1D ATCAAATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 12 9 T 12 11 349665 CASAVA_Build 9 120137072 6D TTATTCCTGA CACATT/------ GCCTAAGGAT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 CACATT 1 0 349666 CASAVA_Build 9 120139259 1I GTCCCTGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 9 18 11 A 11 12 349667 CASAVA_Build 9 120140132 1D TCAAGATTTT C/- CAATTAATTT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 C 2 1 349668 CASAVA_Build 9 120141805 1I AACACCTTCA -/T TTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 6 7 349669 CASAVA_Build 9 120145529 4D TTCAAGTCTT AGAC/---- TGAGAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 AGAC 1 0 349670 CASAVA_Build 9 120146854 2D TGATGAGGTA TC/-- TCACAAAAGA 3070 het 3070 hom 59 24 32 5 TC 2 1 349671 CASAVA_Build 9 120146960 1I ATTATTTTAG -/T AATTAGAAAT 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 T 0 1 349672 CASAVA_Build 9 120150391 1D AGAAAGGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 11 10 349673 CASAVA_Build 9 120162790 1D AGAAAAAGCC T/- TTTACATTGG 3070 het 3070 ref 36 19 17 1 T 4 3 349674 CASAVA_Build 9 120166987 1D AATGCTTATT A/- AAAAATGCAA 3070 het 3070 hom 41 15 23 5 A 6 5 349675 CASAVA_Build 9 120170616 1D GAGTTTGAGA C/- CAGCCTGGTC 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 C 2 1 349676 CASAVA_Build 9 120185584 6D AAGAATACTA TCAATT/------ TCAAGTCCTA 3070 hom 84 het 30 0 29 2 TCAATT 1 0 349677 CASAVA_Build 9 120186072 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1898 hom 23 het 13 0 6 7 A 11 10 349678 CASAVA_Build 9 120186273 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 10 9 349679 CASAVA_Build 9 120188935 1I AGCTGTTGAA -/T TCACTTAGAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 T 1 2 349680 CASAVA_Build 9 120206112 1I GAGCATGTTC -/A AGGGCACGTT 3070 het 3070 hom 48 24 21 3 A 1 2 349681 CASAVA_Build 9 120213560 1D CAGAGTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 297 hom 33 1 25 8 T 10 9 349682 CASAVA_Build 9 120216957 1D AATAGCTCTT G/- CCAAATGCCA 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 G 1 0 349683 CASAVA_Build 9 120219940 1D ACACCCCCCC A/- CACACACATA 3070 hom 102 het 38 0 33 5 A 1 0 349684 CASAVA_Build 9 120242088 1D TGGGTAATAT A/- TAAGCTAACA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 1 0 349685 CASAVA_Build 9 120249706 1I TTTTGAGCCC -/T TTTTTCCCCC 3070 hom 118 het 42 0 40 2 T 5 6 349686 CASAVA_Build 9 120287434 2I CAGGCTTTGA --/CC GTGGATTTCA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 C 0 2 349687 CASAVA_Build 9 120307576 1D TAACAAACAG A/- AAGGACATCC 2215 hom 18 het 9 0 6 3 A 3 2 349688 CASAVA_Build 9 120312783 4D AAAATAAGAA AAAG/---- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 25 11 14 1 AAAG 1 0 349689 CASAVA_Build 9 120326676 2I AAGAAATAGT --/AA AATCGAGATG 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 A 2 4 349690 CASAVA_Build 9 120328003 1I ATGAACAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 A 9 10 349691 CASAVA_Build 9 120330504 1D TGAATTCTCA T/- TTTTTTTTTT 2600 het 638 hom 28 5 11 12 T 15 14 349692 CASAVA_Build 9 120333151 1D ATGTGATTCT A/- ATATGTGCTC 3070 het 3070 hom 53 24 24 6 A 2 1 349693 CASAVA_Build 9 120337152 1I ATTTTGCATG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 A 7 8 349694 CASAVA_Build 9 120342108 2D TATTTAAAAA TT/-- TTTTAAAAGC 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 6 4 349695 CASAVA_Build 9 120350706 1D CCTACATCAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 38 15 14 10 A 9 8 349696 CASAVA_Build 9 120356374 5D CACTCCATCC CCAGA/----- CCAGTTATTT 3070 het 3070 hom 38 15 18 6 CCAGA 1 0 349697 CASAVA_Build 9 120368909 4D TTGAAAACAT ACAG/---- ACAAACACTC 3070 hom 117 het 42 0 40 3 ACAG 1 0 349698 CASAVA_Build 9 120370946 1D TACTCCCTCC T/- CCCACTCAGT 3070 hom 96 het 34 0 32 4 T 1 0 349699 CASAVA_Build 9 120379640 1I AACATTTTTT -/A TGACTTTATT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 0 1 349700 CASAVA_Build 9 120397537 1I CATGAAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 45 1 37 7 T 10 11 349701 CASAVA_Build 9 120411336 55D AAATAGATGT TTATGTTTCACTTCCAAAAGATAGATTAACTGGACTGGAAATTCTGAGTTGAATA/------------------------------------------------------- TTATGTTTCA 3070 hom 87 het 35 0 32 10 TTATGTTTCACTTCCAAAAGATAGATTAACTGGACTGGAAATTCTGAGTTGAATA 2 1 349702 CASAVA_Build 9 120416468 1I CCAAAAAAAA -/T GTTTTCTTCA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 T 0 1 349703 CASAVA_Build 9 120419146 1I ATTTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2821 het 1228 hom 22 3 11 8 A 11 12 349704 CASAVA_Build 9 120454414 1D ATTGGTAGGA T/- TGGCAGAATG 3070 het 3070 hom 52 24 26 2 T 2 1 349705 CASAVA_Build 9 120465482 1I TGTTAATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 593 hom 29 2 22 5 A 15 16 349706 CASAVA_Build 9 120467550 1D GCCTGCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 7 T 11 10 349707 CASAVA_Build 9 120478721 1I TTTGAAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 A 10 11 349708 CASAVA_Build 9 120489076 2I CAAACAAAAA --/AG AGTGTTGAAG 3070 hom 87 het 37 0 29 8 AG 1 2 349709 CASAVA_Build 9 120506068 1D CTCTGACTTC A/- TTTGATGTCA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 A 1 0 349710 CASAVA_Build 9 120539289 3D ACATTAAGTC AAA/--- AGAGATTATT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 4 1 349711 CASAVA_Build 9 120550472 1D TATATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 34 5 11 18 A 11 10 349712 CASAVA_Build 9 120556326 15I CTCACTACTG ---------------/TGTTCATTGCAGCCT TGTTTACAAT 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 TGTTCATTGCAGCCT 0 1 349713 CASAVA_Build 9 120556601 1D TATGGAGATA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 9 8 349714 CASAVA_Build 9 120559125 1D GCTTGATTAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 A 9 8 349715 CASAVA_Build 9 120565702 3I CTCTTTATTA ---/ATG AGAAATCTGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 ATG 0 1 349716 CASAVA_Build 9 120568068 4D TGGGATTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 21 11 3 TTTG 4 3 349717 CASAVA_Build 9 120603969 2D GGAACAAAAT TA/-- TACTCTGTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TA 2 1 349718 CASAVA_Build 9 120604715 1I CTGCAATTGG -/A AAAAAAAAAA 1303 het 1303 ref 31 17 4 10 A 15 16 349719 CASAVA_Build 9 120609361 4I TGAATGGTAC ----/TATT TATTTCTTTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 TATT 1 2 349720 CASAVA_Build 9 120609539 1I ATGATATGCC -/T TGCCCATTAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 2 349721 CASAVA_Build 9 120612499 1I TCTTGCCTTA -/C TTTTTTAAGT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 0 1 349722 CASAVA_Build 9 120623902 1I TAAAATGCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 9 349723 CASAVA_Build 9 120642855 1D ATCACCACAC T/- TTTTTTTTTC 1185 het 1185 ref 46 38 3 5 T 10 9 349724 CASAVA_Build 9 120646680 1I CAGCTCTAAC -/T TTTTTTTTTT 2939 het 2939 ref 20 9 8 3 T 11 12 349725 CASAVA_Build 9 120691661 2I TGCTGAGACA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 16 16 8 AC 7 8 349726 CASAVA_Build 9 120737990 2D AGAGAGACAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 81 hom 19 1 13 5 AG 10 9 349727 CASAVA_Build 9 120769779 1D ACATTGAGCC A/- AAAAAAAAAA 1049 het 271 hom 27 2 9 17 A 13 12 349728 CASAVA_Build 9 120769802 1D GGAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 27 0 17 10 A 12 11 349729 CASAVA_Build 9 120774042 1I ATAAAAATCT -/A AAAAAAAAAA 649 het 649 ref 14 9 3 2 A 11 12 349730 CASAVA_Build 9 120777844 1I AAATGCAACG -/T TTTTTGACCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 5 6 349731 CASAVA_Build 9 120780927 1D CTGAGTAGAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 A 9 8 349732 CASAVA_Build 9 120791182 2D TATTTGATAT AC/-- ACCCTTTGAA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AC 2 1 349733 CASAVA_Build 9 120793325 4D GCCTTTCCTG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 34 3 20 11 A 26 22 349734 CASAVA_Build 9 120818651 1D TATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAC 1107 het 1107 ref 27 21 3 3 A 10 9 349735 CASAVA_Build 9 120827403 1I GAGACTCTTG -/T TTTGGACCCA 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 3 4 349736 CASAVA_Build 9 120830085 1I CTCTGCCAGG -/A AAAGTCTCAA 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 A 3 4 349737 CASAVA_Build 9 120834569 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 2713 het 2620 hom 23 9 9 5 T 11 10 349738 CASAVA_Build 9 120835830 1D TTCCCTCCTT A/- ATACTAAAAC 3070 hom 123 het 45 0 41 5 A 2 1 349739 CASAVA_Build 9 120836659 1I GGTAAGACAC -/A AAACATTCAG 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 A 3 4 349740 CASAVA_Build 9 120855177 4D GCTACTGTTT AAGA/---- AAGAAAAATC 3070 het 3070 ref 52 26 19 10 AAGA 2 1 349741 CASAVA_Build 9 120860446 1D GGTTGGCTTG A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 A 7 6 349742 CASAVA_Build 9 120874706 4D TGCACGTGTG CACA/---- CACACACACA 2146 het 2146 ref 29 18 6 6 CA 8 6 349743 CASAVA_Build 9 120878848 2I TGCATGTTTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 51 12 27 12 TG 8 9 349744 CASAVA_Build 9 120907754 1I CCGTCTCTAT -/A AAAAAAAAAA 3066 het 435 hom 22 2 15 5 A 14 15 349745 CASAVA_Build 9 120907928 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2670 het 2670 ref 22 8 6 8 A 13 12 349746 CASAVA_Build 9 120914627 1D TATATGACAA T/- AAACATAGAC 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 T 1 0 349747 CASAVA_Build 9 120917613 2D TAACAATCAC AT/-- GTCTTTTACA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 AT 1 0 349748 CASAVA_Build 9 120920969 2D GGGACTTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 1621 het 1621 ref 44 30 4 11 CT 7 6 349749 CASAVA_Build 9 120924545 1D CTCCTTGTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 10 9 349750 CASAVA_Build 9 120929496 1I TGTTCCTTCT -/G GCACAGAGCT 3070 het 3070 ref 51 23 23 5 G 1 2 349751 CASAVA_Build 9 120934636 2D ATGAGCACTT AA/-- AAAAGGTGAC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 6 4 349752 CASAVA_Build 9 120938479 2D TATAAAAAAT GG/-- GGGGGGGGGC 3070 het 136 hom 32 4 21 8 G 11 9 349753 CASAVA_Build 9 120938567 3D GGAAAGAAAG AAA/--- AAAAAAGATG 3070 hom 117 het 41 0 39 5 A 9 6 349754 CASAVA_Build 9 120999810 2I ACATTTCCAC --/AT GTTTCTATTT 3070 hom 148 het 53 0 50 3 AT 0 1 349755 CASAVA_Build 9 121000772 3D AAAATATTAA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 38 hom 27 1 19 8 T 17 14 349756 CASAVA_Build 9 121001900 1I CTTGTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 336 hom 43 2 27 14 T 13 14 349757 CASAVA_Build 9 121008519 12D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 20 0 20 5 A 22 10 349758 CASAVA_Build 9 121011675 1I CAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1984 hom 27 6 12 9 A 10 11 349759 CASAVA_Build 9 121019430 2D AGACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 70 het 36 0 20 16 AC 9 8 349760 CASAVA_Build 9 121028768 1D TATTCTAGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 9 8 349761 CASAVA_Build 9 121030583 1D TGAGTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 860 hom 39 2 34 4 A 11 10 349762 CASAVA_Build 9 121047294 2D AAGCTCACAT AC/-- ACACACACAC 1435 het 1435 ref 61 45 4 14 AC 9 8 349763 CASAVA_Build 9 121049587 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 12 0 9 3 A 9 10 349764 CASAVA_Build 9 121053772 2I21M1D CAGAAAACAT --TGAGAAGGGCAGAATAAAATAG/TATGAGAAGGGCAGAATAAAAGA- GGGGGAGCAT 3070 hom 61 het 21 0 18 11 N/A 0 0 349765 CASAVA_Build 9 121069736 24D ACTCCATCTC AATAAATAAATAAATAAATAAATA/------------------------ AATAAATAAA 3070 hom 45 het 15 0 16 3 AATA 10 4 349766 CASAVA_Build 9 121071968 1I ATAAAAAAAA -/C ATTCACAGGT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 0 1 349767 CASAVA_Build 9 121082504 2I CACCCAGCTA --/TT TTTTTTTTTT 2030 het 43 hom 13 1 7 5 T 13 15 349768 CASAVA_Build 9 121083777 6D ACTTATGCTT ATATAA/------ ATATAAATCT 3070 hom 105 het 39 0 36 4 ATATAA 2 1 349769 CASAVA_Build 9 121085337 9I TGGAACTGCA ---------/GCCTCAGCT GCTTCAGCTG 3070 hom 118 het 48 0 34 14 GCCTCAGCT 0 1 349770 CASAVA_Build 9 121087301 7D TGCAGGCATC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 43 1 31 12 A 20 13 349771 CASAVA_Build 9 121090450 1I TCTTTTTAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 8 9 349772 CASAVA_Build 9 121097074 1I AATCTCTATC -/A AAATTTTGCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 4 349773 CASAVA_Build 9 121097764 4I ATTCAAAACA ----/GTAT GTATGGTACT 3070 hom 126 het 50 0 42 8 GTAT 1 2 349774 CASAVA_Build 9 121098992 4D GTCAAAGGGT ACGA/---- ACGAAGTTTC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 ACGA 2 1 349775 CASAVA_Build 9 121111073 1D CACAGTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 847 hom 40 3 28 9 A 11 10 349776 CASAVA_Build 9 121111084 1D AAAAAAAAAA C/- AGAAAATAAA 3070 het 1245 hom 43 12 24 7 C 1 0 349777 CASAVA_Build 9 121126048 1D TAGAGGTGAA C/- CCCCCAAATT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 6 5 349778 CASAVA_Build 9 121141000 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 2720 het 2675 hom 20 8 8 4 A 9 10 349779 CASAVA_Build 9 121141468 1I TACAGAACTT -/A ACAACTACTT 3070 het 253 hom 39 1 33 5 A 1 2 349780 CASAVA_Build 9 121153918 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 349781 CASAVA_Build 9 121158210 28D TATTCCACTT CAGTCACACTGGTTTCTGTATACACTGA/---------------------------- CAGTCCCATC 3070 het 3070 ref 37 25 18 10 CAGTCACACTGGTTTCTGTATACACTGA 1 0 349782 CASAVA_Build 9 121182666 1I GCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 215 hom 50 1 39 10 A 9 10 349783 CASAVA_Build 9 121209197 1I TGAAGTTCAG -/T TTTGTCGTCT 3070 het 38 hom 37 1 29 7 T 3 4 349784 CASAVA_Build 9 121228286 1D GTTCTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 38 1 30 8 T 11 10 349785 CASAVA_Build 9 121229557 1I ACAGAATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 20 0 15 5 A 10 11 349786 CASAVA_Build 9 121244470 1I TCAAATCTCA -/G CAGGCTGACT 3070 hom 148 het 62 0 50 12 G 0 1 349787 CASAVA_Build 9 121257317 1D GCATTTTGAA G/- GGTTTCTCTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 3 2 349788 CASAVA_Build 9 121257466 12D GACATTCTTA TTTCTTACTTAC/------------ TTTCTTATTT 3070 hom 87 het 30 0 29 5 TTTCTTACTTAC 1 0 349789 CASAVA_Build 9 121257850 2I GAGTGATAAG --/CA CAGTTTTATG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 CA 1 2 349790 CASAVA_Build 9 121270502 4D GTGTGTGCAA CTCT/---- CTCTCTCTCA 1824 het 184 hom 42 2 17 25 CT 6 4 349791 CASAVA_Build 9 121282063 1I TGTTCATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 26 0 14 12 A 10 11 349792 CASAVA_Build 9 121282868 2D CCACAATAAG AT/-- ATATAACTGC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AT 3 2 349793 CASAVA_Build 9 121287250 1I TGACATTAGT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 8 9 349794 CASAVA_Build 9 121303321 1I TGTTCGCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 5 A 9 10 349795 CASAVA_Build 9 121303459 1D TCACCCCTCT G/- GGGGAAGAGT 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 G 5 4 349796 CASAVA_Build 9 121309607 1I TGTTTATTGC -/A GCACTAATCA 3070 hom 35 het 18 0 16 2 A 0 1 349797 CASAVA_Build 9 121310886 5I TTTTATTTTA -----/TTTAG TTTATTTTTT 3070 het 2952 hom 26 11 12 3 TTTAG 0 1 349798 CASAVA_Build 9 121315482 1D CGTTGGATTA G/- GTGCTCTCCA 3070 het 3070 ref 53 25 21 7 G 2 1 349799 CASAVA_Build 9 121330663 1I TTCTAGCTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 1267 hom 42 3 35 4 T 9 10 349800 CASAVA_Build 9 121343955 1I72M1D AAACAAAAAC -AAAAAAAAAACAGTTACTCTGGAACTAGGGTAAAAACGGAAACTAGAATTAAGCCAAAGTAATAGAAAGTCAC/AAAAAAAAAAACAGTTACTCTGGAACTAGGGTAAAAACGGAAACTAGAATTAAGCCAAAGTAATAGAAAGTCA- CTTATTGGCT 3070 het 340 hom 36 1 41 15 N/A 0 0 349801 CASAVA_Build 9 121350763 1D CACAGCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 150 het 56 0 50 6 A 12 11 349802 CASAVA_Build 9 121357303 5D AATGTGTTTC TCTTT/----- TCTTTTCTTT 3070 hom 94 het 47 0 32 15 TCTTT 4 3 349803 CASAVA_Build 9 121368574 1D ATCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 13 12 349804 CASAVA_Build 9 121405412 1D CAGTTCAGCA T/- TTTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 7 6 349805 CASAVA_Build 9 121407886 3D AATTGGGGTT CTC/--- CTGGCTCCAC 3070 het 2628 hom 23 6 8 9 CTC 1 0 349806 CASAVA_Build 9 121441734 4D TTGTTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 32 16 8 10 TTTC 3 2 349807 CASAVA_Build 9 121442408 1I GAAGCCAGAC -/T TTAAACAATG 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 T 2 3 349808 CASAVA_Build 9 121445739 4D GGTGTGATTA TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 3070 ref 47 25 16 7 TGTT 5 4 349809 CASAVA_Build 9 121448896 1I AATAAACTAG -/A AAACTGGGAT 3070 het 3070 ref 52 28 19 5 A 3 4 349810 CASAVA_Build 9 121449985 3I AAGTCCTAGA ---/AAG AAGAAGTGAC 3070 het 3070 hom 53 22 26 5 AAG 2 3 349811 CASAVA_Build 9 121451470 1I AACACATGTC -/A AATATTTTAT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 2 3 349812 CASAVA_Build 9 121457129 2I GTATAAAAAA --/AG ATGTAAATAT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 AG 0 1 349813 CASAVA_Build 9 121457642 1D TGCTTATAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 T 9 8 349814 CASAVA_Build 9 121457778 1D TGTAAAATAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 9 8 349815 CASAVA_Build 9 121459235 3I GAATGTGTCA ---/CCT CCTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 CCT 1 2 349816 CASAVA_Build 9 121462261 1I GACACATTTC -/A AAGTAAGGCA 3070 het 3070 ref 57 25 26 6 A 2 3 349817 CASAVA_Build 9 121472101 1D GCTATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 2963 het 2885 hom 33 12 9 12 A 15 14 349818 CASAVA_Build 9 121482726 2D TGTGCGGCCC CA/-- GTGTTCCCCT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 CA 1 0 349819 CASAVA_Build 9 121498430 2I AAAAAAAAAA --/AT TTAGCCAAGC 3070 hom 31 het 14 0 11 3 AT 0 1 349820 CASAVA_Build 9 121499621 2I TTAATTGACT --/CA CAGTTCTGCA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 CA 1 2 349821 CASAVA_Build 9 121505722 1I AGAAAATAAC -/A AAAAATATAC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 5 6 349822 CASAVA_Build 9 121509625 2I GGCTGGGGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 179 hom 36 1 25 10 T 12 14 349823 CASAVA_Build 9 121522477 1I CATAAAAATT -/A AAAAAATCAC 3070 hom 135 het 47 0 46 1 A 6 7 349824 CASAVA_Build 9 121526498 1I TCAATCTCCC -/T TTTGAAACTC 3070 hom 155 het 56 0 52 4 T 3 4 349825 CASAVA_Build 9 121528813 4D AGACTGAATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 30 0 16 16 T 20 16 349826 CASAVA_Build 9 121538689 4D AAATAAGAAT TCTG/---- TCTGTGTACT 3070 het 3070 ref 36 18 12 10 TCTG 2 1 349827 CASAVA_Build 9 121543832 1I AGATGCATAG -/T TTGCAAATAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 2 3 349828 CASAVA_Build 9 121544725 10I TGGCAGCACT ----------/CGGAAGTTAC TGTCCCTTTC 3070 hom 114 het 43 0 36 9 CGGAAGTTAC 0 1 349829 CASAVA_Build 9 121546663 1D TACTGGGGAC A/- AATGGCATGA 3070 hom 132 het 51 0 43 9 A 3 2 349830 CASAVA_Build 9 121553321 1I TTAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 10 12 A 11 12 349831 CASAVA_Build 9 121564799 1D AAGACTAGTT G/- TGTTTATTAC 3070 hom 137 het 54 0 45 10 G 1 0 349832 CASAVA_Build 9 121568744 1I GATCCCACAA -/G GGTGGAGATT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 2 3 349833 CASAVA_Build 9 121569376 5I TCCCAGCATG -----/TCTTC TCTTATTTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TCTTC 0 1 349834 CASAVA_Build 9 121570835 1I TCTAAAATTA -/T TTCATCAGAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 2 3 349835 CASAVA_Build 9 121574808 4D AGAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAATCA 3070 hom 75 het 28 0 24 5 AAAG 2 1 349836 CASAVA_Build 9 121585548 1D CCTTGTTCTG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 A 9 8 349837 CASAVA_Build 9 121597930 1D AAGGTTTTTT A/- AAAAAAATAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 8 7 349838 CASAVA_Build 9 121599873 1I CCTTCGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 A 13 14 349839 CASAVA_Build 9 121604589 1D TTAAATTGGA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 3 2 349840 CASAVA_Build 9 121607240 2D CTTATTTAAC AG/-- AGTATTGTTT 3070 het 3070 ref 51 27 20 5 AG 2 1 349841 CASAVA_Build 9 121610473 3I AATCACAGAT ---/ACA ACAACAACAG 3070 hom 123 het 53 0 40 13 ACA 3 4 349842 CASAVA_Build 9 121611034 2I CTTCTTTATT --/TC TCTCTTTCCT 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 TC 2 3 349843 CASAVA_Build 9 121616055 1D AGGAGGACTT A/- CAACAGGTGT 3070 hom 128 het 51 0 34 17 A 1 0 349844 CASAVA_Build 9 121616922 1I CCATGTATGT -/A AAAAAAATCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 7 8 349845 CASAVA_Build 9 121617414 1I ACCTCCATCA -/G AATGAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 0 1 349846 CASAVA_Build 9 121618760 3D AGAATGACTT AGG/--- AGGAGTAACA 3070 het 3070 ref 41 18 16 8 AGG 2 1 349847 CASAVA_Build 9 121620962 7D TTTTGGCCAC AGACTGA/------- AGGCTGCACT 3070 het 3070 ref 34 18 12 8 AGACTGA 1 0 349848 CASAVA_Build 9 121631014 1D TATTTTTCAT G/- GGGGGGGGTT 3070 het 2699 hom 26 9 11 7 G 9 8 349849 CASAVA_Build 9 121631511 1I TAAATGAGGG -/T TGGGAGAAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 1 2 349850 CASAVA_Build 9 121633417 1D CCCCTGGGAA C/- CCCCATTTTG 3070 hom 137 het 48 0 44 4 C 5 4 349851 CASAVA_Build 9 121645241 2D CTCTGGGTCT CA/-- GTTTCCTTGT 3070 het 3070 ref 45 21 21 4 CA 1 0 349852 CASAVA_Build 9 121649799 4I CGTCACCTCA ----/CTGT CTATTTCAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 CTGT 0 1 349853 CASAVA_Build 9 121651161 3D TTAATATTCT TAA/--- TATTCAAAGT 3070 het 3070 ref 30 19 9 3 TAA 1 0 349854 CASAVA_Build 9 121651519 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 60 hom 26 1 23 3 AC 10 9 349855 CASAVA_Build 9 121659368 1I TTGACCAAAC -/A AAAAATCTTT 3070 het 3070 ref 34 14 15 5 A 5 6 349856 CASAVA_Build 9 121661137 2D AAGGACTGAC CA/-- CAGACCCCTA 3070 het 3070 ref 49 24 19 7 CA 2 1 349857 CASAVA_Build 9 121706912 1D TTACAACCCC T/- AGATATGGAA 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 T 1 0 349858 CASAVA_Build 9 121708715 3I AATGAACAAA ---/TCT TCTGCTGAGC 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 TCT 1 2 349859 CASAVA_Build 9 121709755 4D AAAGCAACAA TTAT/---- TTATTTATCA 3070 het 3070 ref 42 19 16 8 TTAT 3 2 349860 CASAVA_Build 9 121710513 1I TGTGGTCTGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 8 9 349861 CASAVA_Build 9 121808273 1I TATACAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 11 20 12 T 13 14 349862 CASAVA_Build 9 121816809 1D CACTTGAGGG A/- ATAGAGATGA 3070 het 3070 ref 52 24 15 13 A 2 1 349863 CASAVA_Build 9 121821192 3D GGCAGTGAAT AAC/--- AGTGCATATG 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 AAC 1 0 349864 CASAVA_Build 9 121824636 1D TACTAACCAC G/- TAAGATTTCA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 1 0 349865 CASAVA_Build 9 121834044 1D TTCCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 28 1 16 11 T 15 14 349866 CASAVA_Build 9 121863354 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 10 9 349867 CASAVA_Build 9 121898932 1D CAGCAACTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 25 0 23 3 T 10 9 349868 CASAVA_Build 9 121900242 1I CAGGGAGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 93 hom 41 1 34 6 A 9 10 349869 CASAVA_Build 9 121903019 1D CCTTGGGAAA G/- GTACTTTACT 3070 hom 106 het 44 0 36 8 G 2 1 349870 CASAVA_Build 9 121927043 1D TAATAACATT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 8 7 349871 CASAVA_Build 9 121933376 1D AGATAAATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 10 9 349872 CASAVA_Build 9 121941466 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 651 hom 31 3 19 9 T 13 12 349873 CASAVA_Build 9 121945424 1D ACGATGCTCA T/- TTTATTCTCC 3070 hom 141 het 53 0 48 5 T 4 3 349874 CASAVA_Build 9 121945861 1D ATAGTGTAAC T/- TGTTCCTTCT 3070 hom 78 het 32 0 26 7 T 2 1 349875 CASAVA_Build 9 121960308 1D ACATCCATAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 990 hom 34 5 20 9 A 17 16 349876 CASAVA_Build 9 121973346 1D TCGAAGGCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 10 9 349877 CASAVA_Build 9 121975822 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAATACA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 7 6 349878 CASAVA_Build 9 121976604 3I TTAGAATAAG ---/GAC GACTCAGTAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GAC 1 2 349879 CASAVA_Build 9 121992440 7D GGTTTCAGGC ATTTGTG/------- GCAGAGGGGA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 ATTTGTG 1 0 349880 CASAVA_Build 9 121998491 1I TTCTCACCAC -/A AAAAAATAAG 3070 hom 120 het 49 0 40 9 A 6 7 349881 CASAVA_Build 9 122003195 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 14 0 12 2 A 10 9 349882 CASAVA_Build 9 122014535 1I AACAGAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 48 3 34 11 T 12 13 349883 CASAVA_Build 9 122020840 1I CCCTACCTAT -/C CAGTGCAACA 3070 hom 120 het 48 0 40 8 C 1 2 349884 CASAVA_Build 9 122030482 1I TTTCAACTTC -/G GGGGGGATCT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 G 6 7 349885 CASAVA_Build 9 122043422 1D TCTATTTCAA C/- CCCCCATTAT 3070 hom 129 het 53 0 44 9 C 6 5 349886 CASAVA_Build 9 122046826 1D TATAAACAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 27 0 25 2 T 10 9 349887 CASAVA_Build 9 122047942 2I TAACGTGTAC --/AG AGTTTCAGTT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AG 1 2 349888 CASAVA_Build 9 122049090 1D TGTAAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 38 hom 28 1 23 5 A 10 9 349889 CASAVA_Build 9 122056789 1I TCTAAAAAAA -/T TGCTGGTGGT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 1 2 349890 CASAVA_Build 9 122062127 1D GCCCCAGAAT A/- AAAAGACAAG 3070 hom 69 het 33 0 23 11 A 5 4 349891 CASAVA_Build 9 122066438 1I CCCACGTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1084 hom 44 3 32 9 T 10 11 349892 CASAVA_Build 9 122068892 2I TCTAAACCCG --/TC TCTGTTTAGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TC 1 2 349893 CASAVA_Build 9 122069812 1D TCTGGTGGGG T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 54 het 23 0 19 5 T 9 8 349894 CASAVA_Build 9 122071697 2D ACGTATTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 27 het 17 0 10 7 TG 6 5 349895 CASAVA_Build 9 122090027 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 16 1 12 3 A 16 15 349896 CASAVA_Build 9 122091762 1D GTCAATAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1047 hom 34 4 24 6 T 12 11 349897 CASAVA_Build 9 122095761 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 376 hom 40 2 32 6 A 10 11 349898 CASAVA_Build 9 122113701 3I GCGAGTTTAA ---/AAG AAGAAGTCTT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 AAG 2 3 349899 CASAVA_Build 9 122114159 1D TCCAACACCC T/- TTCTCCAGAT 3070 hom 86 het 31 0 27 4 T 3 2 349900 CASAVA_Build 9 122119515 4I AAAAAATGGT ----/TCTC TCTGTCAGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TC 1 3 349901 CASAVA_Build 9 122137822 1D TTTGCTAGGG C/- TGCCATAACA 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 C 1 0 349902 CASAVA_Build 9 122179770 2I TCTTCTCCCC --/TG TCTCTCCCGT 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 TG 0 1 349903 CASAVA_Build 9 122195259 1D AGTCATTCTT C/- AAGACCCAGT 3070 het 3070 hom 48 18 21 9 C 1 0 349904 CASAVA_Build 9 122280880 4D ACCCTGAAAT AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 42 17 13 14 AACA 4 3 349905 CASAVA_Build 9 122322019 1D TCATTTGGAG A/- AAAAAAAAAA 1049 het 1049 ref 50 42 3 5 A 12 11 349906 CASAVA_Build 9 122322819 2I CATATATCAT --/GA GATATATCAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 GA 1 2 349907 CASAVA_Build 9 122329619 2I TTGGGGGGGG --/AT ATATATATAT 3070 het 442 hom 26 1 20 5 AT 5 6 349908 CASAVA_Build 9 122330417 1I TCTGAGTTCA -/T TTCTAAAGAT 3070 hom 135 het 54 0 45 9 T 2 3 349909 CASAVA_Build 9 122333004 1I ATACCTAATG -/T TAAATGACAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 1 2 349910 CASAVA_Build 9 122333935 1D CAAGGTGCCA G/- GCAGCACCAG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 G 2 1 349911 CASAVA_Build 9 122349087 1I TGTTTTTTCG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 8 9 349912 CASAVA_Build 9 122363761 1D CCTTATGAAA T/- CAACTATTTT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 T 1 0 349913 CASAVA_Build 9 122371599 1D AGACTTGAAG A/- GAAAGGACCA 3070 het 3070 ref 52 22 20 10 A 1 0 349914 CASAVA_Build 9 122402793 1D TATGTTAATA T/- ATTTTCTTCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 0 349915 CASAVA_Build 9 122411405 4D CTCTTGTCTC TCTT/---- TCTAGTTCAG 3070 hom 120 het 46 0 41 7 TCTT 1 0 349916 CASAVA_Build 9 122422954 1I CGCATAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 432 hom 31 1 24 6 A 10 11 349917 CASAVA_Build 9 122433587 1I TTTGATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 857 hom 19 2 11 6 T 13 14 349918 CASAVA_Build 9 122434436 1D TTCCTAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 570 hom 21 3 10 8 T 15 14 349919 CASAVA_Build 9 122441895 5I CCCAATATCA -----/TTAAG TTTTACATTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TTAAG 0 1 349920 CASAVA_Build 9 122475684 1D GAAAGGATGC T/- TTTTTTTTTT 1255 het 1255 ref 27 19 3 5 T 12 11 349921 CASAVA_Build 9 122476980 1I GCAGTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 1561 het 493 hom 17 2 6 9 T 15 16 349922 CASAVA_Build 9 122477755 1I TGGGAGGCCG -/A AGGGGGGTGG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 1 2 349923 CASAVA_Build 9 122497037 4I ACTCCCAGAG ----/ATAA ATAATTTACT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 ATAA 1 2 349924 CASAVA_Build 9 122521384 1I ATGATACATA -/G GGGCTCAGCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 3 4 349925 CASAVA_Build 9 122522304 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 16 0 13 4 A 16 15 349926 CASAVA_Build 9 122523044 2D AGTGGCTGTC TT/-- TGCCGAGGCT 3070 hom 81 het 31 0 25 6 T 3 1 349927 CASAVA_Build 9 122532397 1I GTTCACCAGT -/A TAATCCTAGA 3070 hom 105 het 36 0 34 2 A 0 1 349928 CASAVA_Build 9 122536666 13D GGGATCTAGA ACAGCATATGTTT/------------- ACACCCAAAG 3070 hom 111 het 38 0 37 3 ACAGCATATGTTT 1 0 349929 CASAVA_Build 9 122540715 1I ACGGGGTTTC -/A ACATGTTGGC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 1 2 349930 CASAVA_Build 9 122559269 2I CCCCATAAAA --/AT ATGTTGTCAT 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 AT 1 2 349931 CASAVA_Build 9 122574600 3I AAAAAAAAAC ---/CAA CAACAACAAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CAA 3 4 349932 CASAVA_Build 9 122634493 10D TCCCCCAACC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1694 het 1694 ref 21 7 6 8 T 21 11 349933 CASAVA_Build 9 122666540 1I CTTTACATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 10 13 9 A 9 10 349934 CASAVA_Build 9 122693036 3D GTAGCCTCTT CTC/--- CTACTCTCCA 3070 het 3070 hom 42 18 19 8 CTC 1 0 349935 CASAVA_Build 9 122774109 4D GATAATAGAG AAAC/---- AAACCATGCT 3070 het 3070 ref 39 19 17 7 AAAC 2 1 349936 CASAVA_Build 9 122786306 1D ATTTTAAAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 10 9 349937 CASAVA_Build 9 122788466 1I AATGTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3009 hom 32 8 15 9 A 13 14 349938 CASAVA_Build 9 122807083 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 195 hom 35 1 29 5 A 10 11 349939 CASAVA_Build 9 122813645 2I AATTACTATA --/AC CACTATGGAG 3070 het 3070 hom 37 19 16 2 AC 0 1 349940 CASAVA_Build 9 122824398 2D TCTCACTGCC AT/-- ATATATATAT 3070 het 2229 hom 21 5 11 5 AT 8 7 349941 CASAVA_Build 9 122850863 6I AGAGGAGCAG ------/GTTACT GAGCTTGCAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 GTTACT 0 1 349942 CASAVA_Build 9 122852058 1D ATAATCACTT A/- ACGTAAATTT 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 2 1 349943 CASAVA_Build 9 122864162 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTCTTTTT 1450 het 1450 ref 28 16 6 6 T 5 4 349944 CASAVA_Build 9 122864485 3D TAAATGCAGG ACA/--- ACAACAGAGC 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 ACA 3 2 349945 CASAVA_Build 9 122873969 3I TTGGAAAAAA ---/AAG GACTGAGTAA 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 AAG 0 1 349946 CASAVA_Build 9 123009862 1D AACTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 16 10 T 12 11 349947 CASAVA_Build 9 123024994 1I CCTTGGACTT -/G GGGGGGGGGT 1386 het 1386 ref 34 17 6 11 G 9 10 349948 CASAVA_Build 9 123025405 2D CATTCCGAGT GA/-- GAGGGGTCCC 3070 het 3070 ref 39 18 17 6 GA 2 1 349949 CASAVA_Build 9 123050295 1D TTTTTTAGCA G/- GGGGGTCAGA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 G 6 5 349950 CASAVA_Build 9 123080018 4D AAACAACAAT AACA/---- AACAAACAAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 AACA 3 2 349951 CASAVA_Build 9 123086652 1D GTGCTTTTCC T/- TACTTGAGAG 3070 hom 79 het 32 0 26 6 T 2 1 349952 CASAVA_Build 9 123089782 1I GCGTGTGGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 13 11 9 T 9 10 349953 CASAVA_Build 9 123095509 1D TGTCTTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 T 13 12 349954 CASAVA_Build 9 123112145 2D AGAGAGGGAA AG/-- AGAATGAAAG 3070 het 3070 ref 34 18 15 3 AG 2 1 349955 CASAVA_Build 9 123114678 1I GAATTTGAGG -/A AAAAAAAAAA 2740 het 2046 hom 20 7 8 5 A 11 12 349956 CASAVA_Build 9 123125662 1D AGAGACGGAG T/- TTCACCATGT 3070 het 3070 hom 18 7 11 0 T 3 2 349957 CASAVA_Build 9 123140924 3D TTAAAGCTTT GTG/--- GTGGTGGTGG 3070 het 3070 hom 40 15 22 4 GTG 4 3 349958 CASAVA_Build 9 123181511 2I AGAAGATAAC --/AT AGAAGAAAAT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 0 1 349959 CASAVA_Build 9 123190826 1I AAGAGAAGCC -/A AAAAAAAAAA 2353 het 176 hom 22 1 11 10 A 15 16 349960 CASAVA_Build 9 123191054 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1806 het 32 hom 24 1 8 15 T 17 16 349961 CASAVA_Build 9 123192924 1D AGTTTGTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 11 10 349962 CASAVA_Build 9 123195393 2D CCAAAAAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 1692 het 652 hom 38 8 11 19 A 20 18 349963 CASAVA_Build 9 123203019 1D AAATTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 13 12 349964 CASAVA_Build 9 123208196 1D TGAAACGATA T/- TTTTTTCACT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 T 7 6 349965 CASAVA_Build 9 123210918 1D GACAGAACTC A/- AAAGTGATCC 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 A 4 3 349966 CASAVA_Build 9 123225528 2D AAAAAGTTTG AC/-- AGTCTCTTAA 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 AC 1 0 349967 CASAVA_Build 9 123242981 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 1638 het 1576 hom 12 5 7 0 T 6 5 349968 CASAVA_Build 9 123245106 5D TAACAAACAG TACAT/----- TACATTAAAT 3070 hom 139 het 55 0 46 11 TACAT 2 1 349969 CASAVA_Build 9 123255558 1I CATGAGGGTG -/A AAGCTCCAGG 3070 het 3070 ref 55 30 18 7 A 2 3 349970 CASAVA_Build 9 123264432 1I TCAGAAAATT -/A AAAAAAAAAT 2432 het 1343 hom 18 5 8 5 A 9 10 349971 CASAVA_Build 9 123276933 17I AGCCTTCTCC -----------------/GCAGGCTCCACCTCTCT GCAGGCTAAA 3070 hom 62 het 29 0 21 8 GCAGGCTCCACCTCTCT 0 1 349972 CASAVA_Build 9 123281036 1I CATAACTTCA -/C CCCTGAGCCC 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 C 3 4 349973 CASAVA_Build 9 123281770 7D TGCTCCTAGG ACCAGCC/------- ACCAGCCAAT 3070 het 3070 hom 38 13 23 6 ACCAGCC 2 1 349974 CASAVA_Build 9 123298723 14D CCCAGCTACT CAGGAGGCTGAGGC/-------------- AGGAGAATCG 3070 het 1821 hom 13 6 8 3 CAGGAGGCTGAGGC 1 0 349975 CASAVA_Build 9 123299479 1D CTCCATGACA T/- TTTGTCCATT 3070 hom 39 het 18 0 13 6 T 4 3 349976 CASAVA_Build 9 123303286 4I AAATGAATAG ----/ACAA ACAAACAAAC 2890 het 2890 ref 28 13 7 8 ACAA 4 5 349977 CASAVA_Build 9 123303782 1D GTTTGCGTGC T/- TTTTTTTTTT 2845 het 664 hom 25 5 11 9 T 15 14 349978 CASAVA_Build 9 123304688 2D CTTCTGGCCC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 56 het 23 0 19 4 CT 7 6 349979 CASAVA_Build 9 123306672 1D CTTCAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1657 hom 29 5 10 15 T 15 14 349980 CASAVA_Build 9 123320763 3D ATGCTCATGA CAT/--- TATTCACTGG 3070 het 3070 ref 62 30 20 15 CAT 1 0 349981 CASAVA_Build 9 123325455 16I CAGCCTCCTG ----------------/AGTGGCTGAGACTACA GGCGTGCACC 3070 hom 24 het 9 0 9 1 AGTGGCTGAGACTACA 0 1 349982 CASAVA_Build 9 123327790 6I TTGGGTTAGT ------/TATAGC TATTGCTTCT 3070 het 3070 ref 33 15 9 9 TATAGC 0 1 349983 CASAVA_Build 9 123341916 1I ATAATTCAGA -/T TATGCATCTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 1 2 349984 CASAVA_Build 9 123350689 1D AAAAAGAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 1836 hom 22 8 10 5 T 9 8 349985 CASAVA_Build 9 123352395 1I ACCCTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 30 2 22 6 A 10 11 349986 CASAVA_Build 9 123367109 1D AGAAGGCTGC G/- GGGAGCCGCT 3070 het 2980 hom 36 9 13 15 G 4 3 349987 CASAVA_Build 9 123368172 8I CTCCCTCTCC --------/CCTGGTGG CCTGGTGGCT 2178 het 2178 ref 41 17 8 16 CCTGGTGG 1 2 349988 CASAVA_Build 9 123368386 1D GAACTTATTC G/- GGGGGGCACT 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 G 7 6 349989 CASAVA_Build 9 123374084 7I TTGGGGTGAC -------/GGGTGAT GGCCAGACAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 GGGTGAT 0 1 349990 CASAVA_Build 9 123387945 1I GGGTTAGGGA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 433 hom 29 1 17 11 T 3 4 349991 CASAVA_Build 9 123417732 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 19 0 13 6 T 15 14 349992 CASAVA_Build 9 123422036 12I CCTATTTGGG ------------/TGGAAGTGGAAA TGGAGTTAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TGGAAGTGGAAA 0 1 349993 CASAVA_Build 9 123428525 1D ACGAGAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 32 1 19 12 T 17 16 349994 CASAVA_Build 9 123438007 1D TGTCTTTTTT G/- GGGGGGGGTC 1792 het 811 hom 20 5 6 9 G 9 8 349995 CASAVA_Build 9 123443184 1I CCTTGGCTAT -/G GGGGGATGCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 G 5 6 349996 CASAVA_Build 9 123457487 1D CTCTAGCCCT G/- GATAAAGTTC 3070 het 3070 hom 39 17 21 1 G 2 1 349997 CASAVA_Build 9 123469767 1I ATTTTTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 20 9 9 2 T 11 12 349998 CASAVA_Build 9 123470297 1D CTGTTGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 462 hom 31 2 17 12 T 15 14 349999 CASAVA_Build 9 123482844 11D TTTTTTTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTGAGA 3070 het 2618 hom 25 9 12 5 T 17 6 350000 CASAVA_Build 9 123580977 1I TATAAGATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 106 het 43 0 35 8 T 9 10 350001 CASAVA_Build 9 123591390 4D16M2D78M2D CACACAAAAC ACATACACATACACACGAATACACACAAATACACACACAAATACACATACACGCACACACATGCACACACGCATACACACATACACACACATACACGTGTGC/----ACACATACACACGAAT--ACACAAATACACACACAAATACACATACACGCACACACATACACACACGCATACACACATACACACACATACACGTGT-- GCGCGCACAC 3070 het 3070 ref 37 48 17 18 N/A 0 0 350002 CASAVA_Build 9 123603099 1I CAATAGTTGC -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 T 7 8 350003 CASAVA_Build 9 123608837 1I GCGCATGTGC -/T TGTATGTGTG 2472 het 2472 ref 62 35 8 19 T 1 2 350004 CASAVA_Build 9 123609013 4I TGTGGGTGTT ----/TGTG TAGGTGTGTG 1188 het 1188 ref 41 31 5 6 TG 0 2 350005 CASAVA_Build 9 123617369 1I CCTCTGGCTT -/C CCCCCGTGAG 3070 het 1944 hom 23 8 11 4 C 5 6 350006 CASAVA_Build 9 123623052 1D GAAGGGGTGC T/- GCGCGGCAGC 2694 het 1352 hom 25 7 8 10 T 1 0 350007 CASAVA_Build 9 123635128 1I ATTTAGAACA -/G AAACAATACC 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 G 0 1 350008 CASAVA_Build 9 123639310 1I TGTTTTCTTC -/T TTTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 T 7 8 350009 CASAVA_Build 9 123639413 7I TATGGGTCAA -------/GTAGTAT GTATTATTTT 3070 het 3070 hom 42 20 16 6 GTAGTAT 0 1 350010 CASAVA_Build 9 123642209 1D CCAAAACATT A/- ACATGCAAAT 3070 het 3070 hom 49 20 29 0 A 2 1 350011 CASAVA_Build 9 123644358 1D CCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 15 21 6 A 10 9 350012 CASAVA_Build 9 123648172 1I AAGATAGATA -/G AAAAAGCAAA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 G 0 1 350013 CASAVA_Build 9 123652167 4D TATATTATTT TTTA/---- TTTTTCTTAA 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 TTTA 1 0 350014 CASAVA_Build 9 123653938 1D GAGGAGTGGT G/- GGGGGGAAGC 3070 het 3070 hom 41 18 14 10 G 7 6 350015 CASAVA_Build 9 123656908 1D TCTTTATTTG A/- ATTCTGGGCA 3070 het 3070 hom 56 24 28 4 A 2 1 350016 CASAVA_Build 9 123658678 7D AGGATCTGTA CCTAATT/------- TATCTTTATA 3070 het 3070 hom 39 16 22 2 CCTAATT 1 0 350017 CASAVA_Build 9 123661228 1I GAAATATGCA -/T TGAAAGGACC 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 1 2 350018 CASAVA_Build 9 123661430 1D GTCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 726 hom 19 5 11 3 A 15 14 350019 CASAVA_Build 9 123708445 1D AATAATTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 32 0 29 4 A 13 12 350020 CASAVA_Build 9 123718623 1I AGCAATAAAG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 A 8 9 350021 CASAVA_Build 9 123725757 1D GTAAGAGTAA G/- TGGCTTGCTC 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 G 1 0 350022 CASAVA_Build 9 123729729 3D GAAGGTGGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 51 hom 38 2 18 19 T 19 16 350023 CASAVA_Build 9 123746607 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 9 10 350024 CASAVA_Build 9 123758099 1I TTCAATAATT -/A AAGTGGTTAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 2 3 350025 CASAVA_Build 9 123761081 1D CACTTTACAA G/- GGGGGGGGTC 3070 hom 88 het 40 0 26 15 G 9 8 350026 CASAVA_Build 9 123765247 3I TAGCCCCTAC ---/TAG TGCAGATCCT 3070 het 3070 ref 52 23 21 8 TAG 0 1 350027 CASAVA_Build 9 123779772 6D TTTAATTTAA TTTAAT/------ TTTTTTTTTT 68 het 68 ref 10 3 1 6 TTTAAT 1 0 350028 CASAVA_Build 9 123781120 4D TGTTTCTAAC AGAT/---- AGAATAGGGC 3070 het 3070 ref 33 14 13 8 AGAT 1 0 350029 CASAVA_Build 9 123799345 2I AGGAAGGGCC --/CA GTCGTACCGT 3070 hom 116 het 43 0 36 7 CA 0 1 350030 CASAVA_Build 9 123827008 1I ATGATCTATT -/A AAAAAATTGA 3070 hom 41 het 36 1 28 7 A 6 7 350031 CASAVA_Build 9 123834898 1D TCATTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 874 het 874 ref 21 13 3 6 T 15 14 350032 CASAVA_Build 9 123907138 1I AACACTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 11 12 350033 CASAVA_Build 9 123919674 1I GATGAGATTT -/G GGTGGGGACA 3070 hom 114 het 49 0 37 12 G 2 3 350034 CASAVA_Build 9 123938546 1I ATGGCATCTT -/A TTATGGTTTT 3070 hom 135 het 53 0 46 7 A 0 1 350035 CASAVA_Build 9 123941452 1D CGTTCCCTCA C/- CCCCTAGCTA 3070 hom 144 het 49 0 48 2 C 5 4 350036 CASAVA_Build 9 123949376 1D CTAATCTAAA G/- GAAGTGATGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 G 2 1 350037 CASAVA_Build 9 123966318 2D AGGAAGGGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 67 het 28 0 18 10 AG 7 6 350038 CASAVA_Build 9 124003137 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 22 3 A 12 11 350039 CASAVA_Build 9 124012333 7I TGATGCTCTT -------/TATAGTC TATAAAGAGC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TATAGTC 0 1 350040 CASAVA_Build 9 124026668 1D TGGGTGGAGG C/- CCTTAAGCAG 3070 het 3070 ref 50 22 19 9 C 3 2 350041 CASAVA_Build 9 124041325 2I TTTGTTTTTG --/TT TTTTTTTTGA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 T 8 10 350042 CASAVA_Build 9 124046243 1D AGCACGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 38 0 31 7 A 12 11 350043 CASAVA_Build 9 124051218 1D TTTTTAAATG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 T 8 7 350044 CASAVA_Build 9 124054508 4I TCTCAAAAAT ----/AAAC AAAGTAACAA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 AAAC 0 1 350045 CASAVA_Build 9 124057020 2D TGTGAAAGGA GT/-- GATATCTGAC 3070 hom 150 het 57 0 49 10 GT 1 0 350046 CASAVA_Build 9 124069481 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1579 het 75 hom 18 1 5 12 A 19 18 350047 CASAVA_Build 9 124090354 4D AAATAAAAAT AAAA/---- AACCACGCAC 3070 het 3070 hom 41 14 27 2 A 6 2 350048 CASAVA_Build 9 124105387 2I ATAAATATAT --/TA TATATATATA 1831 het 1626 hom 12 5 5 2 TA 8 9 350049 CASAVA_Build 9 124117186 1D ACAGTCACCT G/- GGGGGGGGAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 G 9 8 350050 CASAVA_Build 9 124124463 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2062 het 2062 ref 19 12 5 3 A 13 12 350051 CASAVA_Build 9 124134854 1D TCCATGGAAA C/- CCCACCCTTC 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 C 4 3 350052 CASAVA_Build 9 124198432 2D TCAAGACTGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 AT 10 9 350053 CASAVA_Build 9 124210723 1I AACTGACATC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 8 9 350054 CASAVA_Build 9 124217949 1D AAGCTGAGCG A/- AAAAAAAAAG 1200 het 1200 ref 34 28 4 3 A 10 9 350055 CASAVA_Build 9 124236052 12D ATGCTATTCT CGTGATAGTGAA/------------ CGTGATAGTG 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 CGTGATAGTGAA 2 1 350056 CASAVA_Build 9 124240591 1D GCTAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2044 het 2044 ref 23 10 6 7 T 15 14 350057 CASAVA_Build 9 124241978 1I GGCTAAAATT -/A GGCTGCCTCA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 0 1 350058 CASAVA_Build 9 124257824 1I GTTCACTTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 7 8 350059 CASAVA_Build 9 124260937 1I CCTAAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 24 10 8 T 10 11 350060 CASAVA_Build 9 124262293 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 55 het 25 0 22 7 AC 7 6 350061 CASAVA_Build 9 124263495 1I ATCTTTTGTA -/T TTTTTTTTTG 2881 het 2881 ref 28 14 8 6 T 9 10 350062 CASAVA_Build 9 124264411 1I GTGAGTCCTT -/A ATGTGACGGA 3070 het 3070 hom 47 16 23 8 A 1 2 350063 CASAVA_Build 9 124265180 3I TTTGGCTATT ---/TAA TAACATAACC 3070 het 3070 hom 27 14 12 1 TAA 1 2 350064 CASAVA_Build 9 124275794 1I TCACGGGACT -/A GTCATTGGAC 3070 het 3070 ref 52 25 14 13 A 0 1 350065 CASAVA_Build 9 124280028 2I AGGGCTCATG --/TT TTTATATCAG 3070 het 2373 hom 29 7 16 6 T 3 5 350066 CASAVA_Build 9 124284159 4D AGAAACAACC AACT/---- GAGTGAAAAG 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 AACT 1 0 350067 CASAVA_Build 9 124286155 1D GTAATCAATA T/- TAGGAGCCCA 3070 het 3070 ref 30 13 15 2 T 2 1 350068 CASAVA_Build 9 124290966 3I TTTTTAAAAT ---/TTA TTATTATACT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 TTA 2 3 350069 CASAVA_Build 9 124331371 4D ATTCAGCTGA TTGT/---- TTGTCTCATC 3070 het 3070 hom 50 22 24 5 TTGT 2 1 350070 CASAVA_Build 9 124331872 1D ACTTACCTCC A/- ACTGCCTCTT 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 A 2 1 350071 CASAVA_Build 9 124340563 1I ATGCAACTGA -/T TTTTTTGTGC 3070 het 3070 hom 50 23 23 4 T 6 7 350072 CASAVA_Build 9 124349220 1I TGAGCCACAT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 7 8 350073 CASAVA_Build 9 124358383 1D GTCTAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 19 16 9 T 12 11 350074 CASAVA_Build 9 124359031 2I TTCTCCTATC --/AG AGTTCTGCAG 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 AG 1 2 350075 CASAVA_Build 9 124360289 8D TCTTTAATAA TGTCCTAT/-------- TGTCCTATTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 TGTCCTAT 2 1 350076 CASAVA_Build 9 124361789 4D TCTGAGAGAC TGTT/---- TGTTATTTTT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 TGTT 2 1 350077 CASAVA_Build 9 124365285 1I GCATTTGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 11 12 350078 CASAVA_Build 9 124370821 1D TTTCCTTTAG A/- AACTTTCAGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 3 2 350079 CASAVA_Build 9 124374680 1I TTGGGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 727 hom 44 3 34 7 T 11 12 350080 CASAVA_Build 9 124378281 8I42M1I AGTATATACA --------TATATATGTATGTATGTCTACATGTAACATTTTCTTTTTTAC-/TATATATGTATATATGTATGTATGTCTACATGTAACATTTTCTTTTTTACT ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 23 3 N/A 0 0 350081 CASAVA_Build 9 124379982 4D CCAAATATAG TGTT/---- TGTTTGGCAT 3070 het 3070 hom 34 15 18 6 TGTT 2 1 350082 CASAVA_Build 9 124380784 5D CAATTTTCCT AAGTA/----- AAGTAAAGTA 3070 het 3070 ref 35 17 13 7 AAGTA 3 2 350083 CASAVA_Build 9 124381087 3I ATTACCACTA ---/AAG AACTTATTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAG 0 1 350084 CASAVA_Build 9 124382425 1I AAATGTATTC -/T TTTTTATTTC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 T 5 6 350085 CASAVA_Build 9 124382879 1D77M2D GTTGTATTTG TTTTTTGTTTTGGGGTTGTTAAAAAATATACTTTTGTTCTAGGCTGAAGCTACTACACTGTGGATCAATAAAACTACTAA/-TTTTTGTTTTGGGGTTGTTAAAAAATATACTTTTGTTCTAGGCTGAAGCTACTACACTGTGGATCAATAAAACTACT-- AAAGTGTCCC 3070 het 3070 hom 37 23 29 4 N/A 0 0 350086 CASAVA_Build 9 124383311 1D ACTAAAAATA C/- AAAAATTAGC 3070 het 968 hom 14 3 10 1 C 1 0 350087 CASAVA_Build 9 124388019 2I AATTTATTTT --/TA AAATTCATAA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 TA 0 1 350088 CASAVA_Build 9 124421528 1I AACTATCTGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 A 8 9 350089 CASAVA_Build 9 124428473 1D TTTTGAAGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 10 9 350090 CASAVA_Build 9 124431592 1I CCCAAGGAGC -/A AAAAAAACCG 3070 hom 135 het 55 0 46 9 A 7 8 350091 CASAVA_Build 9 124432797 6D ATCCAGGGTT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 13 14 TTTTTG 4 3 350092 CASAVA_Build 9 124496438 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 546 het 546 ref 23 10 3 10 A 15 14 350093 CASAVA_Build 9 124503412 4I CTTTCTCAAC ----/ATCT ATCTTCCTTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 ATCT 1 2 350094 CASAVA_Build 9 124505519 1D AGAATCCATC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 30 0 25 5 A 10 9 350095 CASAVA_Build 9 124518396 4I CACACACATG ----/TACA TAGAGTATAC 3070 hom 184 het 72 0 62 10 TACA 0 1 350096 CASAVA_Build 9 124527192 2D TCAGTTTCTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 TA 10 9 350097 CASAVA_Build 9 124532943 1D GTCAGTATAG A/- AAAGAATATA 3070 hom 66 het 25 0 23 4 A 4 3 350098 CASAVA_Build 9 124557430 1D AATTTTTTGA T/- TGTTAGACTT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 T 2 1 350099 CASAVA_Build 9 124569868 1D GCTGAAGCCA G/- GGAGCCAAGT 3070 het 3070 ref 49 27 11 12 G 3 2 350100 CASAVA_Build 9 124574500 2D TCACAATCAC CA/-- CACACACACA 3070 hom 78 het 36 0 26 10 CA 10 9 350101 CASAVA_Build 9 124592364 1I CACAGGGAGA -/C CCCCCCCACC 3070 het 111 hom 16 1 13 2 C 7 8 350102 CASAVA_Build 9 124614127 1D TGGATAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 26 1 21 5 A 13 12 350103 CASAVA_Build 9 124649754 2I AATGTCAGAA --/AT AAGTTAATGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 0 1 350104 CASAVA_Build 9 124659927 1I AAACCACTGC -/A AAATATCCAA 3070 hom 119 het 49 0 40 9 A 3 4 350105 CASAVA_Build 9 124666726 1D AGTCCCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1021 hom 24 4 11 9 T 13 12 350106 CASAVA_Build 9 124668002 1D TTTATATGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 8 350107 CASAVA_Build 9 124698221 2D CTGATGAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 29 1 14 14 A 18 16 350108 CASAVA_Build 9 124705210 7D CTAGAATATT TAAATTA/------- TAAAGTAATA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TAAATTA 1 0 350109 CASAVA_Build 9 124707981 1D AGTCCAAAGT G/- GGGGGGGGAG 1944 het 48 hom 13 1 7 5 G 9 8 350110 CASAVA_Build 9 124725284 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 894 hom 3 het 9 0 6 3 A 12 13 350111 CASAVA_Build 9 124725468 7I TGCATTGAGA -------/GATGTAG GAGGAGCGAT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 GATGTAG 0 1 350112 CASAVA_Build 9 124726715 4D CAAATTTCAA CTTT/---- CTTTTTTTTT 2541 het 50 hom 50 2 20 28 CTTT 2 1 350113 CASAVA_Build 9 124764348 1D AAAAAAAAAA T/- GGGTAATCCC 1670 het 1670 ref 34 20 6 8 T 1 0 350114 CASAVA_Build 9 124764504 1I CTGTAGTCAG -/A AAGGTGACTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 2 3 350115 CASAVA_Build 9 124765860 3I AGGAAAATAA ---/AAG AAGAACAGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AAG 1 2 350116 CASAVA_Build 9 124769829 1I CTCATATGTC -/T TTTTTTTCCT 3070 het 166 hom 29 1 25 3 T 7 8 350117 CASAVA_Build 9 124771312 1D AGTAACATGC T/- ATACAGGTTT 3070 hom 166 het 60 0 56 5 T 1 0 350118 CASAVA_Build 9 124771837 5I AATTTAAAAC -----/ATTTT ATTTTATTTT 3070 hom 93 het 42 0 32 10 ATTTT 2 3 350119 CASAVA_Build 9 124787098 1D TTTCCCCCCA G/- GAATGCTTAA 3070 het 330 hom 26 1 22 4 G 2 1 350120 CASAVA_Build 9 124799172 1D GCATATACAT A/- TAACTTCAGG 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 1 0 350121 CASAVA_Build 9 124799683 4D CCCTCTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTA 3070 hom 41 het 26 0 22 5 TTTC 3 2 350122 CASAVA_Build 9 124801424 1I GCTGGGACTA -/C AAGTGTATGC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 C 0 1 350123 CASAVA_Build 9 124804805 5D AACTTTTAAA ATATT/----- ATCATACAGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 ATATT 1 0 350124 CASAVA_Build 9 124809190 1I TGTGGGTTTA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 6 7 350125 CASAVA_Build 9 124818663 3I CTTTAGGTAT ---/TTA TTAACATGAC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TTA 1 2 350126 CASAVA_Build 9 124829209 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2854 het 15 hom 23 1 10 12 T 19 18 350127 CASAVA_Build 9 124840618 1I GCATGTTGAC -/T TTGGTATAGG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 2 3 350128 CASAVA_Build 9 124860646 1D AAAAGTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 12 11 350129 CASAVA_Build 9 124870796 2I TCAGATAAAC --/TG TGAAGAAATG 3070 hom 102 het 42 0 35 7 TG 1 2 350130 CASAVA_Build 9 124879127 1I25M1I CCAAACTATA -GAAGAGTATTAATATCCCTGTTTTG-/GGAAGAGTATTAATATCCCTGTTTTGA AGACAAATCA 3070 hom 48 het 19 0 16 7 N/A 0 0 350131 CASAVA_Build 9 124879265 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 26 2 13 11 T 13 12 350132 CASAVA_Build 9 124884828 1I ACACAACGTG -/A ATGTGCCAGA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 1 2 350133 CASAVA_Build 9 124891182 2D CTTGAGAGAA AG/-- AGAACAATAA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 AG 2 1 350134 CASAVA_Build 9 124894744 2I ATCAAAAACA --/TG TGAGGACCAG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 TG 1 2 350135 CASAVA_Build 9 124897809 1I GTCTTTGAAG -/A AAAAAAAAAA 2041 het 2041 ref 35 17 6 12 A 14 15 350136 CASAVA_Build 9 124906518 1I TAGCACCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 245 hom 30 1 24 5 A 14 15 350137 CASAVA_Build 9 124907617 3I AGCTTCCCTA ---/ATC ATCTTACGGT 3070 hom 113 het 42 0 36 6 ATC 1 2 350138 CASAVA_Build 9 124908793 4I GAGGAGAAGA ----/AATT AATTAAGGGT 3070 het 3070 ref 43 20 21 2 AATT 1 2 350139 CASAVA_Build 9 124914960 6I TTCTGAAGCA ------/AGGGGC AGGGGCAGTC 3070 hom 75 het 28 0 24 4 AGGGGC 1 2 350140 CASAVA_Build 9 124924541 1D ACCCAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 39 3 18 19 A 17 16 350141 CASAVA_Build 9 124960629 1D AGAGAAAATG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 34 0 28 7 A 10 9 350142 CASAVA_Build 9 124962676 1I TCAGGCAAAC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 7 8 350143 CASAVA_Build 9 124964331 1D GGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 22 0 17 5 T 12 11 350144 CASAVA_Build 9 124989369 1D TCAGCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1215 hom 37 5 23 9 A 17 16 350145 CASAVA_Build 9 124992568 1I TTTTTCATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 369 hom 29 1 18 10 A 10 11 350146 CASAVA_Build 9 124999005 1D AAAAGAAAAG A/- AATCAGTACA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 3 2 350147 CASAVA_Build 9 125037609 1D CAACTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 2065 het 2065 ref 35 12 8 15 A 18 17 350148 CASAVA_Build 9 125096178 1D AATAAGGTAG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 T 7 6 350149 CASAVA_Build 9 125112928 9D CCATGTACAA GTTTTTGCT/--------- GTATGTACAC 715 het 32 hom 18 1 4 13 GTTTTTGCT 1 0 350150 CASAVA_Build 9 125113226 2D TGCTTTGTCC AG/-- AGTGCAAAAG 3070 hom 78 het 27 0 27 1 AG 2 1 350151 CASAVA_Build 9 125125780 1D ACCTAGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 19 19 7 A 11 10 350152 CASAVA_Build 9 125135463 5I AAACAAAACA -----/CAACC AAACAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 CAACC 0 1 350153 CASAVA_Build 9 125139529 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTTA 3070 het 3047 hom 20 9 9 2 A 0 1 350154 CASAVA_Build 9 125140895 1D AGAGATCTGG C/- CAGGAGGGGG 3070 hom 67 het 27 0 19 8 C 2 1 350155 CASAVA_Build 9 125148684 2I AGGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 52 21 17 14 GT 7 8 350156 CASAVA_Build 9 125148883 4D GAGGGTGTGT GCGC/---- GCGCGTGTGT 387 het 387 ref 43 23 7 14 GC 4 2 350157 CASAVA_Build 9 125149760 2D12M3D4M7I TGTGTTGTGA TGTATGTGGATGTGAAATGTG-------/--TATGTGCAGGTG---TGTGTTATACA TGTGTGTTTG 3070 het 3070 ref 49 32 15 13 N/A 0 0 350158 CASAVA_Build 9 125149903 6D4M1D TGTTGTGTGT GTGGCGTGTGA/------TGTG- TGTGTGGGGT 562 het 562 ref 62 39 5 24 N/A 0 0 350159 CASAVA_Build 9 125151905 1D TGTACTTGTC T/- GCAGTTCCTA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 1 0 350160 CASAVA_Build 9 125154550 1I TTGCTGTCTC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 T 8 9 350161 CASAVA_Build 9 125156053 1I GTGGGGGGGG -/C GGTAAACTGA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 C 0 1 350162 CASAVA_Build 9 125158763 2I GTTTTGGGAG --/GT GTGCTGTGTT 3070 het 1863 hom 20 5 11 4 GT 1 2 350163 CASAVA_Build 9 125163240 1I GGCGGGGAGG -/C GGGGGGGGTT 1330 hom 15 het 7 0 5 2 C 0 1 350164 CASAVA_Build 9 125176510 1I AAAGCGAGTG -/A CAACCCTGTG 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 0 1 350165 CASAVA_Build 9 125181228 4D TTTTCAGCCT GTCA/---- GTCAGTCAGT 3070 hom 54 het 20 0 14 9 GTCA 3 2 350166 CASAVA_Build 9 125204343 2D CGCACACGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 1764 hom 47 7 24 17 CA 10 9 350167 CASAVA_Build 9 125214063 1D TCCTGCCTCG C/- CCCCACTGTC 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 C 5 4 350168 CASAVA_Build 9 125219986 1D GCCATAGATT G/- GGGGGGGGGC 3070 het 837 hom 30 8 11 11 G 10 9 350169 CASAVA_Build 9 125227731 1I AAACTCTCAT -/G GGGCAGCTCG 3070 hom 105 het 38 0 32 6 G 3 4 350170 CASAVA_Build 9 125248659 1D TTTAAAGATC A/- AAGATTTGTA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 3 2 350171 CASAVA_Build 9 125319882 2D AGGAAAATCC AT/-- ATAATTGCAT 3070 hom 96 het 35 0 33 5 AT 2 1 350172 CASAVA_Build 9 125321541 1I ATATCTTTTT -/A AAATTTTTTT 3070 het 498 hom 25 3 15 7 A 3 4 350173 CASAVA_Build 9 125332718 1D ATTTTGTTAG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 7 6 350174 CASAVA_Build 9 125339772 1D GCATGTAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 A 12 11 350175 CASAVA_Build 9 125346006 2D TTATTTGTCA GT/-- GTGTGTGCAA 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 GT 4 3 350176 CASAVA_Build 9 125362110 1D TGTTGTAGCA T/- TGTGTCAAGA 3070 het 3070 ref 53 27 22 4 T 2 1 350177 CASAVA_Build 9 125376274 2D TGTAGTTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 2194 het 521 hom 26 5 8 13 T 18 16 350178 CASAVA_Build 9 125387181 1D CACAAGCCTC A/- CTAGGATTGA 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 A 1 0 350179 CASAVA_Build 9 125420039 1D AAAAAAGGAT A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 47 23 20 5 A 7 6 350180 CASAVA_Build 9 125437188 1D CAAGGACACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 23 20 13 T 10 9 350181 CASAVA_Build 9 125441878 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 22 7 12 3 A 20 16 350182 CASAVA_Build 9 125453958 1D TTGGCACTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 43 2 32 10 A 13 12 350183 CASAVA_Build 9 125485146 1D CCACCCTTTC A/- AGTTTCACCT 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 A 2 1 350184 CASAVA_Build 9 125501200 5I GGAGCCAACT -----/AACTG AAAGAGCTGT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 AACTG 0 1 350185 CASAVA_Build 9 125506253 1D AAATAAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 A 11 10 350186 CASAVA_Build 9 125507169 2D AGATGAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 A 12 10 350187 CASAVA_Build 9 125509706 4D CAAACAGATC AAGA/---- AAGAGGAGAA 3070 het 3070 hom 39 18 17 7 AAGA 2 1 350188 CASAVA_Build 9 125515796 1I AGACAATTAG -/A AAAAAAAAAA 2272 het 2272 ref 21 9 6 6 A 10 11 350189 CASAVA_Build 9 125518706 1I CTAATAAAAT -/C AAAACTAAAT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 C 0 1 350190 CASAVA_Build 9 125535771 1I TTGTTGGTTA -/T TTTTTTTTTT 1404 het 1404 ref 29 4 6 19 T 13 14 350191 CASAVA_Build 9 125541458 8I CAGAGTCCTG --------/ATTTTCTT ATTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 ATTTTCTT 1 2 350192 CASAVA_Build 9 125542023 1D TACATAGGAG A/- AAAAAAAAAA 1355 het 1355 ref 27 21 3 3 A 15 14 350193 CASAVA_Build 9 125555804 4D ACTGCTGGAG ATGC/---- ATGCATAGTT 3070 het 3070 ref 44 23 17 6 ATGC 2 1 350194 CASAVA_Build 9 125557222 1D TATACACAGA T/- TTTTTTTTTT 1737 het 748 hom 23 4 4 15 T 19 18 350195 CASAVA_Build 9 125582100 1D ATTACAGGCG C/- CCCCCCACCA 3070 het 3070 hom 26 13 10 3 C 7 6 350196 CASAVA_Build 9 125582666 1D TGAATTGATC A/- GAGAATCAAA 3070 het 3070 hom 46 22 21 4 A 1 0 350197 CASAVA_Build 9 125589270 1I ATAATGATGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 A 8 9 350198 CASAVA_Build 9 125594359 1I TGAAATAGCA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3034 hom 32 9 16 7 T 7 8 350199 CASAVA_Build 9 125656801 5D TCTCAAAAAA AAAAT/----- AAAAATAAAA 1728 het 343 hom 26 2 12 13 AAAAT 1 0 350200 CASAVA_Build 9 125685969 1D TGACAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2913 het 2790 hom 45 17 11 17 A 18 17 350201 CASAVA_Build 9 125697722 1D ACTCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 1649 het 1649 ref 31 25 4 2 A 13 12 350202 CASAVA_Build 9 125720590 1D TCCGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1762 hom 24 het 11 0 7 4 A 15 14 350203 CASAVA_Build 9 125724013 1D AAAGCCATCC T/- TTTTTTTTTT 2274 het 1605 hom 20 8 6 6 T 14 13 350204 CASAVA_Build 9 125742188 12D TTATCTTCAA TCTTGACAATGC/------------ TCTTGGAAGA 3070 het 3070 ref 62 32 29 8 TCTTGACAATGC 1 0 350205 CASAVA_Build 9 125750306 1I ACTCTGCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 10 11 350206 CASAVA_Build 9 125774548 2D33M2D TGAGTATTGT GAGTGAATGTGTGTGAGTGCATGTGAGTGAGAGAATG/--GTGAATGTGTGTGAGTGCATGTGAGTGAGAGAA-- TGTGTGTGAG 3070 hom 139 het 59 1 56 26 N/A 0 0 350207 CASAVA_Build 9 125775347 2I GTGAGAATGA --/GT GTGTGTGTGA 3070 hom 132 het 70 0 44 26 GT 4 5 350208 CASAVA_Build 9 125775812 4D10M6D TTGAGAGAAT GTGAGTGTGTGAGAGAATGT/----GTGTGTGAGA------ GAGTGTGAGT 3070 hom 194 het 60 0 64 17 N/A 0 0 350209 CASAVA_Build 9 125776196 2I24M9D TGCCAGTGCA --TGTGTGTGTGAGTGTGTGAATGCATGAGTGCGT/TGTGTGTGTGTGAGTGTGTGAATGCA--------- TGAGTGTGTG 3070 hom 203 het 65 0 64 15 N/A 0 0 350210 CASAVA_Build 9 125777741 1D CCTGTCTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 33 2 20 11 A 15 14 350211 CASAVA_Build 9 125786042 1D AACATAAAGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 9 8 350212 CASAVA_Build 9 125827541 12D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 21 7 A 23 11 350213 CASAVA_Build 9 125830003 1I GAAGGCATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 97 hom 36 1 27 8 T 9 10 350214 CASAVA_Build 9 125834464 1I TGAAGCAGTC -/G GGGGGGATGC 2841 het 2599 hom 24 9 9 6 G 6 7 350215 CASAVA_Build 9 125835217 1I TGTAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 8 9 350216 CASAVA_Build 9 125837819 2D ATACAGAGGC AG/-- AGAGAGAGAG 2171 het 2171 ref 40 25 5 12 AG 10 9 350217 CASAVA_Build 9 125843825 4D CGTGTGTGTT TTTG/---- TTTATTTTTA 3070 het 3070 ref 48 23 20 5 TTTG 1 0 350218 CASAVA_Build 9 125845314 2D CTCATCAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1051 het 640 hom 35 9 5 21 T 20 18 350219 CASAVA_Build 9 125860949 1I TTATTTTTAC -/T TTTTTTTTTG 1385 het 1385 ref 17 10 4 3 T 9 10 350220 CASAVA_Build 9 125868735 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 8 350221 CASAVA_Build 9 125872526 1I ACTGTATTTG -/T TTTTTTTGCG 3070 hom 65 het 31 0 21 10 T 7 8 350222 CASAVA_Build 9 125882370 1D GGTAGAGACA G/- GGGTCTCACT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 4 3 350223 CASAVA_Build 9 125883493 1D TACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 1355 het 1355 ref 27 12 5 10 A 13 12 350224 CASAVA_Build 9 125899971 2D ACTAGGATAC CA/-- CACACACACA 1207 het 1207 ref 75 58 3 14 CA 7 6 350225 CASAVA_Build 9 125914052 14I GGTCTGTATA --------------/ATCCCTGATCCTGC ATCCCTGATC 3070 hom 69 het 27 0 22 5 ATCCCTGATCCTGC 1 2 350226 CASAVA_Build 9 125916579 1D TTATTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1487 hom 29 5 10 14 T 13 12 350227 CASAVA_Build 9 125932707 3I CTGTAAAAAT ---/AAC AAGGTTCCTG 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 AAC 0 1 350228 CASAVA_Build 9 125943991 1D TGTCCGGCCC T/- TTTTTTTTTT 1308 het 1308 ref 25 15 3 7 T 12 11 350229 CASAVA_Build 9 126008085 1I GTTACCATTG -/C CCCCCTATCT 3070 hom 163 het 62 0 55 7 C 5 6 350230 CASAVA_Build 9 126012316 3I AGCCCTGCTC ---/TCT ATGGTTTTAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TCT 0 1 350231 CASAVA_Build 9 126034864 1D CATCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 11 10 350232 CASAVA_Build 9 126036711 1I CATGGAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 645 hom 36 2 25 9 A 9 10 350233 CASAVA_Build 9 126038551 4D CCTGGCAGGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 31 0 16 16 T 20 16 350234 CASAVA_Build 9 126052550 1D TCGTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1779 het 303 hom 24 2 9 13 T 16 15 350235 CASAVA_Build 9 126064056 1D CATTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 1614 het 1614 ref 41 29 4 8 T 13 12 350236 CASAVA_Build 9 126098644 3I2M2D CCTGTGCACG ---TGCA/ATCTG-- CACACAGGAG 3070 het 3070 hom 56 24 26 9 N/A 0 0 350237 CASAVA_Build 9 126105459 3D TCAGATTGGC TGA/--- TGTTTGACCT 3070 hom 177 het 66 0 56 11 TGA 1 0 350238 CASAVA_Build 9 126109231 1I GCTCCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 656 hom 32 2 22 8 A 11 12 350239 CASAVA_Build 9 126142013 2D AAGGGAAGAC AG/-- AGGGAGCACA 3070 hom 48 het 22 0 16 6 AG 2 1 350240 CASAVA_Build 9 126164808 4I22M1I AAAAACAGCT ----AAGATTTAAGTGTTCTCACCAC-/AAGAAAGATTTAAGTGTTCTCACCACA AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 35 1 36 8 N/A 0 0 350241 CASAVA_Build 9 126168206 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTAATA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 6 350242 CASAVA_Build 9 126170297 6D CCACACATTT ACCCAA/------ ACAACGCTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 ACCCAA 1 0 350243 CASAVA_Build 9 126172324 2D AAAGAGCACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 40 0 27 14 T 16 14 350244 CASAVA_Build 9 126172612 1I ATTTGCTGAC -/T TTTCCCCCCT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 3 4 350245 CASAVA_Build 9 126178252 1I GTCTTGCTTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 83 het 36 0 30 6 T 8 9 350246 CASAVA_Build 9 126181291 1I AGTAATACAA -/T TTTTTATACC 3070 hom 120 het 52 0 41 11 T 5 6 350247 CASAVA_Build 9 126184444 1D AGTAGCTGGG A/- TTACAGGCGC 2734 hom 18 het 9 0 7 2 A 1 0 350248 CASAVA_Build 9 126188937 1D GCACAGTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 32 1 28 3 T 13 12 350249 CASAVA_Build 9 126193950 1I TTTCTATGTC -/A AGAGTTCACT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 2 350250 CASAVA_Build 9 126201152 4D CACATTTACA ACAC/---- TTTACAGCTA 3070 hom 83 het 38 0 24 15 AC 2 0 350251 CASAVA_Build 9 126202864 2I TGGCCGAAAC --/AT GTGTACACCT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AT 0 1 350252 CASAVA_Build 9 126204682 2D GGAATAACAA TG/-- TGTGTGTGAG 3070 hom 132 het 54 0 45 9 TG 5 4 350253 CASAVA_Build 9 126220664 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 2958 het 2099 hom 30 7 12 11 A 17 18 350254 CASAVA_Build 9 126225255 1I CTCATCACCC -/A GGGACAAGGT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 0 1 350255 CASAVA_Build 9 126230444 1D AACCTACCTC A/- AAAAAAAAAA 2342 het 1015 hom 24 8 6 10 A 19 18 350256 CASAVA_Build 9 126236216 1D GGGCGCCTGT A/- ATCCCAGCTA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 2 1 350257 CASAVA_Build 9 126358968 1D CTAATATACC T/- TTTTTTTTTT 2418 het 2418 ref 62 41 7 14 T 13 12 350258 CASAVA_Build 9 126508620 1D CATTTAACAA T/- TTTTTTTTTT 1380 het 1380 ref 34 23 4 7 T 13 12 350259 CASAVA_Build 9 126512047 1D TTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAA 1335 het 1335 ref 25 10 4 12 A 15 14 350260 CASAVA_Build 9 126553168 1D TTAAGTTGTT C/- CTCCCATCTG 3070 hom 93 het 38 0 31 9 C 2 1 350261 CASAVA_Build 9 126557275 10I CACATTACCG ----------/TAAGACTAAA TGGAAATATT 3070 hom 99 het 36 0 34 4 TAAGACTAAA 0 1 350262 CASAVA_Build 9 126608499 1I ATTATGTATC -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 7 8 350263 CASAVA_Build 9 126608623 1I ATCTCCTCAA -/T TCCCCCCATC 3070 het 12 hom 22 1 15 6 T 1 2 350264 CASAVA_Build 9 126609268 1D AAGTGATCCT C/- CCACCTCAGC 2832 het 2832 ref 20 13 6 1 C 3 2 350265 CASAVA_Build 9 126612930 1I CCATCTCCCC -/T GGTCTCCCTT 3070 hom 59 het 25 0 17 8 T 0 1 350266 CASAVA_Build 9 126631032 2I TCTTTCTTTC --/TT TCTCTTTCCT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 1 3 350267 CASAVA_Build 9 126631933 1I TCGAATGAAG -/A AAAAAACATC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 6 7 350268 CASAVA_Build 9 126639158 1D TTTTCACTTT G/- GGAAAAAAAG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 G 3 2 350269 CASAVA_Build 9 126639592 4I TCATTCAATT ----/AAGG GAGACACATT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAGG 0 1 350270 CASAVA_Build 9 126641615 3D TGTTTATCTT TTA/--- TTTTTTGTGG 3070 hom 78 het 28 0 26 2 TTA 1 0 350271 CASAVA_Build 9 126646434 1I TCAAAAAAAA -/T AAACAACAAC 3070 hom 28 het 28 1 23 6 T 0 1 350272 CASAVA_Build 9 126656614 2D TTCTTTAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 76 het 31 0 25 6 AC 9 8 350273 CASAVA_Build 9 126659447 1I TCCTGACATG -/C CCCCCCTCCT 3070 hom 77 het 33 0 23 10 C 6 7 350274 CASAVA_Build 9 126660302 2D CAGGCCACAC AT/-- GTCACTAACT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 AT 1 0 350275 CASAVA_Build 9 126685205 1D TGGAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 13 12 350276 CASAVA_Build 9 126687585 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2666 het 62 hom 21 1 14 6 A 17 16 350277 CASAVA_Build 9 126694079 2I TTCCTGAGAC --/AG AGTTTCATTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AG 1 2 350278 CASAVA_Build 9 126703668 1D CTGAGTAGCT A/- GGGACTACAG 3070 hom 35 het 14 0 11 3 A 1 0 350279 CASAVA_Build 9 126738710 1I CAGGCAAATT -/A AAAAAAAAAA 1546 het 1546 ref 34 15 6 13 A 17 18 350280 CASAVA_Build 9 126740197 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAAAA 61 het 61 ref 33 15 2 17 AAG 1 0 350281 CASAVA_Build 9 126763229 1D GTCTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 1424 het 1315 hom 35 12 7 17 A 19 18 350282 CASAVA_Build 9 126771045 1D TATTTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 2691 het 374 hom 19 1 9 9 A 15 14 350283 CASAVA_Build 9 126805678 1D AACCTGCAAG A/- AAAAAAAAAA 1122 het 1122 ref 51 40 4 7 A 11 10 350284 CASAVA_Build 9 126854973 2D CAAAACCACC AA/-- GAGACACCAT 3070 hom 87 het 31 0 30 4 A 2 0 350285 CASAVA_Build 9 126881863 1I TTGGTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 36 1 26 9 A 11 12 350286 CASAVA_Build 9 126929191 1D CAGAATCCAC A/- AAAAGGGAAC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 5 4 350287 CASAVA_Build 9 126932619 1D TGAAAACCTC T/- TTTTTTTTTC 1299 het 1299 ref 26 17 3 6 T 10 9 350288 CASAVA_Build 9 126946837 4I CTGAGATGGT ----/CCTA CCTACCTACA 3070 hom 138 het 52 0 45 7 CCTA 2 3 350289 CASAVA_Build 9 126947970 1D CTCTACCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 39 1 31 8 A 12 11 350290 CASAVA_Build 9 126948600 2D AAGAGTTGGA AC/-- ACTTAGCTCA 3070 hom 111 het 42 0 36 6 AC 2 1 350291 CASAVA_Build 9 126949908 1D TGGTAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 175 het 71 0 59 12 A 11 10 350292 CASAVA_Build 9 126950599 3D CTTTGCAAAA AAG/--- AAGAACTTGT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 AAG 2 1 350293 CASAVA_Build 9 126953792 2D5M1D GCTTGCTCCA GTGTAGCT/--CAAGC- TTCTATATCC 3070 hom 55 het 23 0 18 6 N/A 0 0 350294 CASAVA_Build 9 126967649 17D TCTGGCTAAA TAGAACATGGCTAGTCT/----------------- TAGAACTTGC 3070 hom 87 het 29 0 30 2 TAGAACATGGCTAGTCT 1 0 350295 CASAVA_Build 9 126979474 4D CTCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 30 het 15 0 11 5 AAAC 3 2 350296 CASAVA_Build 9 126992252 4I CTTTTAAGCA ----/CTCT CTCTCCAGAA 3070 hom 106 het 40 0 36 4 CT 2 4 350297 CASAVA_Build 9 126995327 1D CATCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 38 1 28 9 A 15 14 350298 CASAVA_Build 9 126998801 8D AATAAGAGAT CTGGGTTC/-------- CTGGGTTCCT 3070 hom 60 het 27 0 21 9 CTGGGTTC 2 1 350299 CASAVA_Build 9 127008047 2I GAAAAGAGAA --/TC TTGAGAATGA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 TC 0 1 350300 CASAVA_Build 9 127008598 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 24 0 21 3 A 12 13 350301 CASAVA_Build 9 127032639 1D ATGGAAACTA T/- TTTTTTTTTT 2263 het 1100 hom 16 5 6 5 T 15 14 350302 CASAVA_Build 9 127054061 1D ATTTTATTTT A/- TTTTTTTTTT 2349 hom 29 het 12 0 8 5 A 1 0 350303 CASAVA_Build 9 127058973 2D AAAACTATTT TA/-- GAGTTTTTTA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TA 1 0 350304 CASAVA_Build 9 127060124 1I GTGGCCCGAA -/C CTGTAATCCC 1719 het 337 hom 11 1 6 4 C 1 2 350305 CASAVA_Build 9 127060883 1D AAAGAACATT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 93 het 38 0 31 7 A 8 7 350306 CASAVA_Build 9 127110427 2D GCCTGGGTGA CC/-- CTGAGTGAGA 3070 hom 39 het 16 0 12 4 C 3 1 350307 CASAVA_Build 9 127124791 1I AACCTCACAT -/G GGCATATCAT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 G 2 3 350308 CASAVA_Build 9 127131735 2D AATTTGGTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 27 0 20 8 T 16 14 350309 CASAVA_Build 9 127133087 1I ATCCTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 981 hom 45 4 31 10 T 10 11 350310 CASAVA_Build 9 127136898 1I TCCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 372 hom 26 1 18 7 A 13 14 350311 CASAVA_Build 9 127149821 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 33 0 27 8 A 13 12 350312 CASAVA_Build 9 127157314 3I2M8I TCTCCCTGGT ---AG--------/TCAAGGGATTCTC CTGCCTCAGC 3070 hom 36 het 14 0 13 2 N/A 0 0 350313 CASAVA_Build 9 127170073 1I CTGTTCAGTA -/T TTTTTTTTTT 2015 het 1790 hom 38 8 10 20 T 17 18 350314 CASAVA_Build 9 127172719 1D CCCTTGACCT C/- TGACTTCACT 3070 hom 92 het 33 0 29 4 C 1 0 350315 CASAVA_Build 9 127177257 1I CCCTGCGTTG -/T TGGCAAATAA 3070 hom 48 het 25 0 16 9 T 1 2 350316 CASAVA_Build 9 127178950 2D GCTGGAAAAC AT/-- GTGGGTAATC 3070 hom 60 het 23 0 20 3 AT 1 0 350317 CASAVA_Build 9 127182191 1D CCTGGCTAAG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 70 het 32 0 22 10 T 7 6 350318 CASAVA_Build 9 127197943 1D CCATGCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 T 13 12 350319 CASAVA_Build 9 127203130 2D TCTGAGCCCC CT/-- CTCTCTCCTC 3070 hom 66 het 28 0 17 11 CT 4 3 350320 CASAVA_Build 9 127213337 3D CCACCTGCAG CCT/--- CCTCCTGCCT 3070 hom 84 het 35 0 24 11 CCT 3 2 350321 CASAVA_Build 9 127222800 4I ACAAAATGTC ----/AGTT AGGAGGAATA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 AGTT 0 1 350322 CASAVA_Build 9 127236296 1I ACGGCTGGGT -/G GGGGTGGGAG 3070 hom 51 het 20 0 16 4 G 4 5 350323 CASAVA_Build 9 127240831 1D TCCTAGGGGG C/- CCCCGACACC 3070 hom 67 het 26 0 19 7 C 5 4 350324 CASAVA_Build 9 127257398 1D GTGTAGACAC A/- ACCTCACAGA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 1 350325 CASAVA_Build 9 127262136 1D AACAGATTAT C/- CCCCATCATT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 5 4 350326 CASAVA_Build 9 127289439 3I CTTTTTCCAG ---/TCT TCATTTTTAC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TCT 0 1 350327 CASAVA_Build 9 127303764 7D AGGAAGGTTC CTAATTA/------- CTAATTAGCT 3070 hom 57 het 24 0 20 6 CTAATTA 2 1 350328 CASAVA_Build 9 127305050 1I TATATTTTGA -/G GCATATAGGT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 G 1 2 350329 CASAVA_Build 9 127311388 1I AAATCTAAGC -/A AAAAAATATG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 6 7 350330 CASAVA_Build 9 127315446 2I GAAAAATGAC --/AG AGTCAAAAGC 3070 hom 129 het 46 0 44 2 AG 1 2 350331 CASAVA_Build 9 127323404 1I ATTTTTTTTT -/C CTCCTTGAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 1 2 350332 CASAVA_Build 9 127327807 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 21 1 14 6 A 13 14 350333 CASAVA_Build 9 127328982 2I TTCAAGTGAT --/TC TTCTGCCTTA 3070 hom 39 het 15 0 13 2 TC 0 1 350334 CASAVA_Build 9 127331604 1D GTAGTGTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 55 hom 54 2 36 16 A 12 11 350335 CASAVA_Build 9 127366757 1D AGTAACCATA T/- CTACTGCATA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 T 1 0 350336 CASAVA_Build 9 127373023 1D GCTCTTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 171 hom 19 1 12 6 A 12 11 350337 CASAVA_Build 9 127373797 1D CATCTTTACT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 9 8 350338 CASAVA_Build 9 127387357 1D ATTGGTGCTC A/- ACAAACATCA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 2 1 350339 CASAVA_Build 9 127388611 1D TTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 1267 het 1267 ref 42 32 4 6 T 12 11 350340 CASAVA_Build 9 127401705 1D TGTAAGTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 30 1 19 10 T 17 16 350341 CASAVA_Build 9 127405512 1D ATGGGCGAGC A/- AGCACATGAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 2 1 350342 CASAVA_Build 9 127414506 1I ATTCTTTTAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 362 hom 33 1 26 6 T 9 10 350343 CASAVA_Build 9 127448050 1D CTAAATAAAA T/- TTTTAAAAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 5 4 350344 CASAVA_Build 9 127460215 17D CTTTGCTACT AACGGCAAGCTATGTGA/----------------- CAGTAGACAC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 AACGGCAAGCTATGTGA 1 0 350345 CASAVA_Build 9 127469588 2I CCCAGCTAAT --/TC TTATATTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TC 0 1 350346 CASAVA_Build 9 127470108 3I AGAGAAATTC ---/AAG AAGAACTACT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 AAG 1 2 350347 CASAVA_Build 9 127473111 4I ATCTAACCAA ----/ATTC CACTGAAGAA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 ATTC 0 1 350348 CASAVA_Build 9 127476060 1D AAAACAAAAC A/- AAACATACAA 1612 het 101 hom 28 1 8 19 A 4 3 350349 CASAVA_Build 9 127478650 2I TGATTCCATT --/TA TATGAGGTAC 3070 hom 148 het 57 0 50 7 TA 1 2 350350 CASAVA_Build 9 127481105 1D ATAAACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 29 2 20 8 T 15 14 350351 CASAVA_Build 9 127492050 3D TAGTTGGGCA TTG/--- TTGTAGGCGC 3070 hom 90 het 34 0 29 5 TTG 2 1 350352 CASAVA_Build 9 127495515 1D ATTCCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2956 hom 18 het 10 0 7 4 A 13 12 350353 CASAVA_Build 9 127497835 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 27 1 19 8 T 11 10 350354 CASAVA_Build 9 127499010 1D ATCACTTCCC A/- AATACGTAAG 3070 hom 115 het 45 0 37 9 A 3 2 350355 CASAVA_Build 9 127512629 1I GAATGGGGGG -/A AAAATCACTG 3070 hom 147 het 54 0 47 7 A 4 5 350356 CASAVA_Build 9 127516184 11I TGTTTCCTCT -----------/CATAGGGAAAA CATAGGGAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 7 CATAGGGAAAA 1 2 350357 CASAVA_Build 9 127519730 1I CAGGCATGAG -/C CACCGTACCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 1 2 350358 CASAVA_Build 9 127527992 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AATACTCAGA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 AAG 1 0 350359 CASAVA_Build 9 127537491 1D CAACGGAAAA T/- TTTTTTTTTT 1138 het 1138 ref 43 32 4 7 T 13 12 350360 CASAVA_Build 9 127540390 1D GTGTTAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 11 10 350361 CASAVA_Build 9 127576762 1D GGCAGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 T 11 10 350362 CASAVA_Build 9 127600615 1I AAGAAAATAA -/T TTTTTAGAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 5 6 350363 CASAVA_Build 9 127604775 1D GGCCAATACA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 10 9 350364 CASAVA_Build 9 127611529 1D TCAATGCTGA T/- TTTTTTTTTT 1947 het 1947 ref 38 22 7 9 T 15 14 350365 CASAVA_Build 9 127616101 1D8M1I15M3I CCTGTATCTA TTAAAAATA-AAAAATTAGTTGGGC---/-CAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTG ATGGTGCGCC 1777 het 1777 ref 12 7 4 2 N/A 0 0 350366 CASAVA_Build 9 127620291 1D AGAGCAAGCC T/- TTCGTCTCAA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 3 2 350367 CASAVA_Build 9 127624102 1I AGAATTAATT -/A AAAAATGATG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 5 6 350368 CASAVA_Build 9 127653410 3I TCTGTTGATT ---/ATA ATGTTTAAAA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 ATA 0 1 350369 CASAVA_Build 9 127669926 2D ATACACATAC AT/-- ATATATATAC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 AT 5 4 350370 CASAVA_Build 9 127670280 1I CAGACTGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 40 0 27 13 T 12 13 350371 CASAVA_Build 9 127690659 1D TTGATATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1332 hom 44 3 30 11 T 13 12 350372 CASAVA_Build 9 127696209 4I GTAAATAGTA ----/TATT TATTTTTTAC 3070 hom 108 het 42 0 37 5 TATT 1 2 350373 CASAVA_Build 9 127700550 1I CCATCTTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 A 11 12 350374 CASAVA_Build 9 127702025 16I CCCAAAAGTA ----------------/TTTTCTTGATATTAGC TTTCATTTAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 TTTTCTTGATATTAGC 0 1 350375 CASAVA_Build 9 127710674 3I ATTTTCTGGT ---/GAG GAGATCCCAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 GAG 1 2 350376 CASAVA_Build 9 127710854 1I AATAGTGCTG -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 9 350377 CASAVA_Build 9 127747330 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 316 hom 38 1 24 13 A 13 12 350378 CASAVA_Build 9 127750361 1I ACATACATAG -/A AACACTACAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 2 3 350379 CASAVA_Build 9 127750806 2I AGGTATATAC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 1060 hom 33 3 23 7 GT 8 9 350380 CASAVA_Build 9 127755577 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 510 hom 22 2 18 2 A 13 14 350381 CASAVA_Build 9 127755884 1I CTTTACGCAT -/A ACCCAGTATG 3070 hom 114 het 48 0 39 9 A 1 2 350382 CASAVA_Build 9 127755979 1D CTGCAAACTT G/- GGGGGACGCA 3070 hom 100 het 40 0 33 8 G 6 5 350383 CASAVA_Build 9 127760317 1I TCCACTGACC -/T CCAGAGCTAG 3070 hom 90 het 37 0 27 10 T 0 1 350384 CASAVA_Build 9 127763050 1D AGGACAGAGT G/- GACTTAAAAA 3070 hom 143 het 50 0 47 3 G 2 1 350385 CASAVA_Build 9 127766026 1D TACTCAAATC T/- TTTACATTTG 3070 hom 141 het 54 0 48 7 T 4 3 350386 CASAVA_Build 9 127766613 2I CCACCATAGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 39 0 28 11 T 14 16 350387 CASAVA_Build 9 127768217 1I ACACAATGTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 8 9 350388 CASAVA_Build 9 127769881 2D GTTAGATGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 47 3 20 27 T 18 16 350389 CASAVA_Build 9 127782999 1D TAAGAAGAAA G/- AAAAAAAAAG 3070 hom 25 het 28 1 24 3 G 1 0 350390 CASAVA_Build 9 127783591 1I TCAACCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 15 1 12 2 T 10 11 350391 CASAVA_Build 9 127787480 3D TATCATCTTA ATC/--- ATCATCACCA 3070 hom 134 het 50 0 43 10 ATC 3 2 350392 CASAVA_Build 9 127805853 1D CCCAGGAGGG C/- CCCCCGGCCA 3070 hom 77 het 30 0 26 4 C 6 5 350393 CASAVA_Build 9 127811478 1D TGGGGGATGA G/- GGGTGAGGAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 4 3 350394 CASAVA_Build 9 127822652 1I CATTTCTTTC -/T TTTTTTTTAT 2641 het 637 hom 22 4 13 7 T 8 9 350395 CASAVA_Build 9 127823560 2I AATTTTTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 20 0 15 5 T 10 12 350396 CASAVA_Build 9 127824636 1I GGGATGCTAA -/T TTACGGCCAT 2206 het 2206 ref 24 11 8 5 T 2 3 350397 CASAVA_Build 9 127826465 8I TGTGTGTGAG --------/TGTGTGCA TGTGTGCATA 3070 hom 126 het 50 0 40 10 TGTGTGCA 1 2 350398 CASAVA_Build 9 127827480 2I CAGAAACCCT --/AA AATAGGCCCT 3070 hom 120 het 44 0 37 7 A 2 4 350399 CASAVA_Build 9 127828602 3I CTTATCAAAA ---/CGC GCTTCCATAT 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CGC 0 1 350400 CASAVA_Build 9 127840437 1I TATGAAACAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 64 het 26 0 21 5 A 8 9 350401 CASAVA_Build 9 127840745 3D GTCTCTACCA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 42 het 21 0 15 8 AAT 7 6 350402 CASAVA_Build 9 127853306 1D CGTAGTGAGA C/- CCCCCCCATC 3070 het 2566 hom 22 9 10 3 C 8 7 350403 CASAVA_Build 9 127860997 1I TCCCTCCGCA -/G GGCTCTCCGG 3070 hom 73 het 28 0 23 5 G 2 3 350404 CASAVA_Build 9 127873495 1I GGATCCTGGG -/T TTTTTGGGGC 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 5 6 350405 CASAVA_Build 9 127888356 1D TGCACTCACC T/- TGCAGACCCC 3070 het 3070 hom 53 21 25 7 T 2 1 350406 CASAVA_Build 9 127893607 6D TGTTTGTGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGCG 3070 het 3070 hom 38 13 12 14 TG 7 4 350407 CASAVA_Build 9 127899019 1D AGGTGGGGCA C/- AGCCTTCTAG 2498 het 2498 ref 26 14 7 5 C 1 0 350408 CASAVA_Build 9 127916405 1I GAAGGTCATG -/C CCCCTCTGCC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 4 5 350409 CASAVA_Build 9 127922229 1I GATATGATGT -/A AAAGGCTTGG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 3 4 350410 CASAVA_Build 9 127923483 1I CTCAATGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 10 11 350411 CASAVA_Build 9 127934414 10D TGGAAGCAGG AAATAACAGA/---------- TTGAAGACGC 3070 het 3070 hom 46 22 23 8 AAATAACAGA 1 0 350412 CASAVA_Build 9 127937782 1D GCAAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 A 11 10 350413 CASAVA_Build 9 127941084 3I CTTTGAGATA ---/ATT ATTTAAGACT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 ATT 1 2 350414 CASAVA_Build 9 127953054 1I CTCTGTCTTG -/T TTGCCACCCT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 T 2 3 350415 CASAVA_Build 9 127974316 2I CATGTCTTCT --/TA TACGTTCCTT 3070 het 3070 ref 41 23 11 7 TA 1 2 350416 CASAVA_Build 9 127977631 2D AAGTACACAC AT/-- ATGTCTATAT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 AT 2 1 350417 CASAVA_Build 9 127978766 3D TGAGCATGTG CCC/--- TATACAAGCT 3070 hom 108 het 40 0 37 6 C 3 0 350418 CASAVA_Build 9 127979935 1I TGCATTGAAA -/T TTGTAGATCA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 2 3 350419 CASAVA_Build 9 127982055 1D AAGCAGATAC T/- GATTTGCTTT 3070 het 3070 ref 58 28 25 6 T 1 0 350420 CASAVA_Build 9 127986909 3I GAGGTAGCAG ---/AAC CAAGTGGAGA 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 AAC 0 1 350421 CASAVA_Build 9 128004371 5D AGCTAAGCCA AGCTG/----- CTTCTTGAAT 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 AGCTG 1 0 350422 CASAVA_Build 9 128022987 1I TTGATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 498 hom 38 4 28 6 T 10 11 350423 CASAVA_Build 9 128046008 1D TATTTTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 898 hom 34 2 28 4 A 12 11 350424 CASAVA_Build 9 128046766 1D ACTTTTTTCA T/- TTAAAAACAG 3070 hom 114 het 39 0 39 0 T 3 2 350425 CASAVA_Build 9 128071142 1D CATACTTTGC T/- CCAGACACCC 3070 hom 162 het 60 0 53 8 T 1 0 350426 CASAVA_Build 9 128100996 1I ATAGCCCCCC -/T GGACTTCTTC 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 T 0 1 350427 CASAVA_Build 9 128108073 1I CCCCAAGGCA -/T TTTTTTTTTT 1519 het 1519 ref 17 8 5 4 T 10 11 350428 CASAVA_Build 9 128108311 1I TGATAAGCCC -/G CCTCAGCCTC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 G 0 1 350429 CASAVA_Build 9 128119457 1D GTGGGTGGGT G/- GGGGGGAACA 3070 het 741 hom 19 2 13 6 G 7 6 350430 CASAVA_Build 9 128119945 1D AGTTAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 12 11 350431 CASAVA_Build 9 128147755 1I TTGATTTGGC -/T TTCATGATTT 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 2 3 350432 CASAVA_Build 9 128159706 1D GATTTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 1340 het 1340 ref 38 28 3 8 T 12 11 350433 CASAVA_Build 9 128203949 4I GAGCCTTAGG ----/TCAC TCACTGGCTG 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 TCAC 1 2 350434 CASAVA_Build 9 128210516 13I CTCCCCCCAC -------------/GAATGAGCCAGGA GCAGGCCTGA 3070 het 2204 hom 25 7 14 4 GAATGAGCCAGGA 0 1 350435 CASAVA_Build 9 128211580 1D GAGAATTAAA T/- TGGGGGGGGA 3070 het 91 hom 32 1 15 16 T 2 1 350436 CASAVA_Build 9 128213842 4I ATGAAAAGAA ----/AAAT AACCACAACT 3070 het 3070 ref 36 23 8 5 AAAT 0 1 350437 CASAVA_Build 9 128230057 1D GCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 46 2 29 15 T 13 12 350438 CASAVA_Build 9 128236346 1D ATTTATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 18 10 A 11 10 350439 CASAVA_Build 9 128240504 1I TAAAGTATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 19 21 6 A 11 12 350440 CASAVA_Build 9 128249018 3D TTATCTGTAT TAG/--- TTCTTTTTTT 3070 hom 36 het 18 0 12 6 TAG 1 0 350441 CASAVA_Build 9 128256889 1D CATAATTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 13 12 350442 CASAVA_Build 9 128258966 5I TTCAGTTTAT -----/AAAAG AAAAGAAAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 AAAAG 1 2 350443 CASAVA_Build 9 128263956 1D CCCGTGGGGG T/- TGAGAGCATG 3070 hom 55 het 21 0 15 6 T 2 1 350444 CASAVA_Build 9 128270262 2I TCAGCTCTGT --/CC CCCAGGTCTG 3070 het 3070 hom 60 23 30 7 C 3 5 350445 CASAVA_Build 9 128274073 1I AATAGAGTCT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 297 hom 34 1 29 4 G 1 2 350446 CASAVA_Build 9 128284281 6D AGCCCCCAAG GTGGCA/------ GTGGCCCCCT 3070 hom 66 het 23 0 21 4 GTGGCA 1 0 350447 CASAVA_Build 9 128287865 4I TCCTAATAAA ----/AAAG AAAGAAACCC 3070 hom 98 het 36 0 31 5 AAAG 1 2 350448 CASAVA_Build 9 128290398 1I CTCTGCTCAG -/A AATTTGCTTT 3070 hom 46 het 22 0 15 7 A 2 3 350449 CASAVA_Build 9 128293521 3D GCTTATTAGA TGT/--- TGAAGAATTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 6 TGT 1 0 350450 CASAVA_Build 9 128301866 1I CTAAAAAGGG -/A AAAAAATCCC 1286 het 1248 hom 16 6 5 5 A 6 7 350451 CASAVA_Build 9 128308456 2I TGAAGAGGCT --/GA GACTTGGCCC 3070 het 3070 hom 42 11 17 14 GA 1 2 350452 CASAVA_Build 9 128321559 6D TTTGACCAGC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 1994 hom 38 9 15 15 A 18 12 350453 CASAVA_Build 9 128331622 7D GAAGATGTTT AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 11 11 A 20 13 350454 CASAVA_Build 9 128335130 2I CGCGAGCGGG --/GT GTGTGTGTGC 3070 het 2824 hom 38 12 16 10 GT 4 5 350455 CASAVA_Build 9 128347101 8I ACTGGTTAAC --------/AGGCTGTG AGGTTGAGGG 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 AGGCTGTG 0 1 350456 CASAVA_Build 9 128348729 1D GGCAATTTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2929 hom 25 10 7 8 A 10 9 350457 CASAVA_Build 9 128361526 1I CAAAATACAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 8 9 350458 CASAVA_Build 9 128431094 1D CAATTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 30 0 26 4 A 13 12 350459 CASAVA_Build 9 128436703 1I GTTCTGCACA -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 85 het 32 0 23 9 C 8 9 350460 CASAVA_Build 9 128448997 1I CAAGGGGGTA -/G GGGGGTGGAA 3070 hom 94 het 49 1 45 3 G 5 6 350461 CASAVA_Build 9 128501140 2D GACACCCCTC TT/-- TCTCCTTTTG 3070 hom 115 het 45 0 34 12 T 3 1 350462 CASAVA_Build 9 128516256 1D AACAAAAGCG A/- AACTCAGTCT 2280 het 2280 ref 22 16 5 1 A 3 2 350463 CASAVA_Build 9 128529466 1I AATGCTTTGA -/T TTTTTTTTTT 2838 het 1205 hom 20 3 11 6 T 15 16 350464 CASAVA_Build 9 128550903 1D TAAAAAAAAA T/- GTCAACAATT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 1 0 350465 CASAVA_Build 9 128552222 9I14M1D TCTCTTTTTT ---------GTTTTTGAGTACACT/GTTTTTGAGGTTTTTGAGTACAC- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 31 17 16 3 N/A 0 0 350466 CASAVA_Build 9 128552968 1I TTAAAAAAAA -/C ACACACACAC 3070 hom 81 het 28 0 27 1 C 0 1 350467 CASAVA_Build 9 128554087 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 19 0 15 4 T 10 11 350468 CASAVA_Build 9 128555182 1I CACCTTGATC -/A CCAGGAGCTT 3070 hom 114 het 45 0 33 12 A 0 1 350469 CASAVA_Build 9 128598071 1D TCTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 16 8 T 12 11 350470 CASAVA_Build 9 128617759 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 35 0 12 23 T 13 12 350471 CASAVA_Build 9 128620220 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1596 het 1596 ref 32 15 4 13 T 15 14 350472 CASAVA_Build 9 128625028 1I AGGTGAGTAC -/A TTTTTTTTTT 3070 het 854 hom 40 3 32 5 A 0 1 350473 CASAVA_Build 9 128631794 1D ATGGGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 32 1 28 3 T 12 11 350474 CASAVA_Build 9 128643148 1I ATCACTGGAC -/T TTGTATTCCT 3070 het 236 hom 31 1 27 3 T 2 3 350475 CASAVA_Build 9 128665016 1D GTAATTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 16 9 T 13 12 350476 CASAVA_Build 9 128691438 1I AGTCCAGGCT -/G TGGGGACAGA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 0 1 350477 CASAVA_Build 9 128693710 1I CACATTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 10 11 350478 CASAVA_Build 9 128701599 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 2869 hom 17 8 8 1 A 9 10 350479 CASAVA_Build 9 128711883 4D ACACCTTAGA GTCT/---- GTCTGTCACA 3070 het 3070 hom 47 18 20 11 GTCT 2 1 350480 CASAVA_Build 9 128717954 1D TATGAGGCTT G/- GGAGGGGTCC 2984 het 2984 ref 31 17 12 2 G 3 2 350481 CASAVA_Build 9 128727658 2D CAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 A 12 10 350482 CASAVA_Build 9 128734082 1I CACAGACATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 20 24 9 T 12 13 350483 CASAVA_Build 9 128736303 9D GATTGAAGTC AGACCTTGT/--------- AGCACTGTAA 3070 het 3070 ref 55 27 27 3 AGACCTTGT 1 0 350484 CASAVA_Build 9 128737737 1D AACTCATATA G/- TACTTAGAAG 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 G 1 0 350485 CASAVA_Build 9 128767544 1D TGGGCTGTAA T/- TTTTTTACCC 3070 het 3070 hom 44 16 24 6 T 7 6 350486 CASAVA_Build 9 128772717 6D TGATCTAAGA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 51 27 18 8 GT 8 5 350487 CASAVA_Build 9 128778498 2I23M4D CACTCACATT --CACAGTCACACACACCATATACTCACA/CACACAGTCACACACACCATATACT---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 64 46 25 7 N/A 0 0 350488 CASAVA_Build 9 128780408 1I AGTGAGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 A 13 14 350489 CASAVA_Build 9 128801124 1I GTTGTTGGGT -/G GGGGGAGGGG 1631 hom 15 het 7 0 6 1 G 5 6 350490 CASAVA_Build 9 128809014 1D CGGTATTAAC T/- TTTGTGCATG 2037 het 2037 ref 27 17 5 5 T 4 3 350491 CASAVA_Build 9 128810591 1D GGAAACAAAA C/- CGTCAGTAGA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 C 2 1 350492 CASAVA_Build 9 128828552 3D CAGTATTAAC CAT/--- CATCACAATT 3070 het 3070 hom 50 19 27 6 CAT 2 1 350493 CASAVA_Build 9 128828950 1I TGCAGTTCTC -/T TAACTGTCAG 3070 het 2738 hom 31 6 19 6 T 1 2 350494 CASAVA_Build 9 128867002 1I TTTTGGTTTT -/G GTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 G 1 2 350495 CASAVA_Build 9 128871277 1D CAGTTATCCA C/- TCTTTAGCTT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 C 1 0 350496 CASAVA_Build 9 128873214 4D TAAAGCAAAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 2705 hom 25 7 12 6 AT 9 7 350497 CASAVA_Build 9 128883330 1I CAAAATGGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 26 12 8 T 9 10 350498 CASAVA_Build 9 128906116 4D CAAGGTACAA GTCC/---- CAGGGTCGAT 3070 het 3070 ref 45 22 18 7 GTCC 1 0 350499 CASAVA_Build 9 128908359 1D GCCCAAGGGC A/- CGTTTTACCC 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 A 1 0 350500 CASAVA_Build 9 128929957 1I GATTGTCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 12 13 350501 CASAVA_Build 9 128953283 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2348 hom 21 7 9 5 A 10 11 350502 CASAVA_Build 9 128956342 3D AAGAGGCAGG GCT/--- GCTGCTGGGC 3070 het 3070 hom 31 10 11 11 GCT 3 2 350503 CASAVA_Build 9 128957999 1D AATATCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 9 T 13 12 350504 CASAVA_Build 9 128973485 1D CTTTCATGTG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 28 0 24 6 A 9 8 350505 CASAVA_Build 9 128985272 1D CACCCCACCA G/- GCCTCGCCTC 2459 het 2459 ref 45 23 10 13 G 2 1 350506 CASAVA_Build 9 129042901 3D CCAGCTACTC AGG/--- AGGTTGAGGC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 AGG 2 1 350507 CASAVA_Build 9 129051217 1I AAAGTGCTTA -/C CTATTTGTTG 3037 het 3037 ref 19 9 7 3 C 1 2 350508 CASAVA_Build 9 129088118 1D CTTTATCCAC T/- TTCTCATTTT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 T 3 2 350509 CASAVA_Build 9 129093045 1D GATGCTCTTG T/- TTTTCCACTC 3070 hom 129 het 50 0 44 6 T 5 4 350510 CASAVA_Build 9 129097827 1D ATGAAAGCAC T/- TTTTTTTTTT 941 het 941 ref 31 22 3 6 T 12 11 350511 CASAVA_Build 9 129107323 1D GTATAAATGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 52 16 30 6 A 9 8 350512 CASAVA_Build 9 129108297 1I AATTAAATAC -/A TAGGATTACG 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 0 1 350513 CASAVA_Build 9 129119834 3D AACAAAACAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 37 13 18 7 AAC 7 6 350514 CASAVA_Build 9 129125852 1D TTAAACTGCA C/- CCCCCCATAA 3070 het 2403 hom 23 5 14 4 C 7 6 350515 CASAVA_Build 9 129132831 3D GCCACTCTGG AAA/--- TTGACACTTG 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 A 3 0 350516 CASAVA_Build 9 129147231 1I AGAATCTGCA -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 T 6 7 350517 CASAVA_Build 9 129159883 1D ATTTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 384 hom 22 2 18 3 A 13 12 350518 CASAVA_Build 9 129161067 1I ATCAGAATCT -/G GGGGGGGTGT 3070 hom 27 het 12 0 8 4 G 7 8 350519 CASAVA_Build 9 129161590 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 16 8 A 13 12 350520 CASAVA_Build 9 129162109 1I TTCCTAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 412 hom 30 1 26 3 A 9 10 350521 CASAVA_Build 9 129169961 1D CCTGCTTCTT A/- ACAACTGTTG 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 2 1 350522 CASAVA_Build 9 129179431 1D GTTAGGACAA T/- TGGACAAACT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 2 1 350523 CASAVA_Build 9 129183237 1D TCGGCTTCCC A/- AAAGTGCTGG 2486 hom 21 het 11 0 7 5 A 4 3 350524 CASAVA_Build 9 129208653 4I TTCGAGGAGG ----/GAGA GAGAGATCGC 3070 hom 92 het 39 0 29 12 GA 3 5 350525 CASAVA_Build 9 129209976 4D CAGCAAAAAA AAAC/---- AAAACAAAAC 3070 hom 35 het 24 0 21 3 AAAC 1 0 350526 CASAVA_Build 9 129212227 1D CCTTTGTAAT A/- ATGCTAGCTG 3070 hom 90 het 34 0 30 6 A 2 1 350527 CASAVA_Build 9 129215287 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAGAAACA 3070 hom 41 het 15 0 14 1 A 4 5 350528 CASAVA_Build 9 129216220 1D GTCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 616 hom 5 het 4 0 2 2 T 11 10 350529 CASAVA_Build 9 129220130 1I GATAGAACAG -/C CCCCAGGGGA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 4 5 350530 CASAVA_Build 9 129222256 2D TTTGGGAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 22 8 T 13 11 350531 CASAVA_Build 9 129239439 1I TCTCTCAAGG -/C CCCCCCCCCG 3070 hom 58 het 25 0 18 7 C 9 10 350532 CASAVA_Build 9 129241212 11I ACTCTGTCAC -----------/AAAAAAAAAGA AAAAAAAAAG 3070 hom 73 het 29 0 25 4 AAAAAAAAAGA 1 2 350533 CASAVA_Build 9 129246117 1D CAGCTTTTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 59 het 26 0 20 7 T 9 8 350534 CASAVA_Build 9 129255533 1I GAATAATAAC -/T GAGGGTGGTA 3070 hom 76 het 28 0 26 2 T 0 1 350535 CASAVA_Build 9 129258513 3I TTTGTATTTT ---/TAG TAGAGATGAG 3070 hom 36 het 13 0 12 1 TAG 1 2 350536 CASAVA_Build 9 129268097 1I ATTGTAAAAC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 8 9 350537 CASAVA_Build 9 129269553 1I AGGGAGGGAG -/A GGAAGGGGGC 3070 het 3070 ref 63 32 25 7 A 0 1 350538 CASAVA_Build 9 129281196 2I CTCTTACACG --/CA CAGTCTGCTG 3070 hom 119 het 47 0 38 9 CA 1 2 350539 CASAVA_Build 9 129289284 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2013 het 403 hom 22 5 9 9 A 17 16 350540 CASAVA_Build 9 129292192 4I GACCTTCAAG ----/CTAT CCTTGGGCAA 3070 hom 45 het 19 0 14 5 CTAT 0 1 350541 CASAVA_Build 9 129293108 1I CACGTCCATG -/A CCCCAGGAAC 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 0 1 350542 CASAVA_Build 9 129301156 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 16 6 A 12 14 350543 CASAVA_Build 9 129301639 1D TAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 1394 het 397 hom 8 1 5 2 T 1 0 350544 CASAVA_Build 9 129302251 1D ACCTGAAGTC A/- AAAGCTTGAG 3070 hom 36 het 14 0 10 4 A 4 3 350545 CASAVA_Build 9 129308237 4I ACTCAGCCAT ----/CTCA CTCACTCACT 3070 hom 51 het 22 0 16 6 CTCA 3 4 350546 CASAVA_Build 9 129327383 3I AAAGGAAGAA ---/GAG GAGGCAAGAG 3070 hom 101 het 43 0 30 13 GAG 1 2 350547 CASAVA_Build 9 129329053 1D TGACAGTTGG T/- TTATGAGGGA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 3 2 350548 CASAVA_Build 9 129333591 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 A 7 6 350549 CASAVA_Build 9 129341045 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 375 hom 22 4 11 7 A 17 16 350550 CASAVA_Build 9 129354510 1I CCATCTCTAC -/A GAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 0 1 350551 CASAVA_Build 9 129360149 1I GGGCTGCCCC -/T TTCCCCCTCC 2340 het 2340 ref 23 8 9 6 T 2 3 350552 CASAVA_Build 9 129373813 1D CAAAACCAAA G/- AAAAAAACAG 3070 het 258 hom 21 1 18 3 G 1 0 350553 CASAVA_Build 9 129407392 1D CAAATAATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1970 hom 15 4 8 3 T 10 9 350554 CASAVA_Build 9 129415727 1I TCTTTATAAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 8 9 350555 CASAVA_Build 9 129417339 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 9 9 9 A 10 11 350556 CASAVA_Build 9 129473565 1D TTTTTTTTTT C/- TTTTGTCCTT 2708 het 2708 ref 25 12 7 6 C 1 0 350557 CASAVA_Build 9 129528888 23D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------------- AAAAAAAAAA 2455 het 1655 hom 10 5 6 3 A 34 11 350558 CASAVA_Build 9 129529898 1D TTGCTCTGTC A/- ACCTAGGCTG 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 A 2 1 350559 CASAVA_Build 9 129541259 1I TTTTTGGTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 26 14 11 1 T 8 9 350560 CASAVA_Build 9 129543342 1D CTTCTTATTC T/- TTTTTTTTTT 1947 het 287 hom 26 4 6 16 T 17 16 350561 CASAVA_Build 9 129555455 1D AGAAGGATGA T/- TGGGACATGC 2596 het 2596 ref 23 11 7 5 T 2 1 350562 CASAVA_Build 9 129559373 1D CCTCATTTGA T/- TTTTTTTTTT 1328 het 324 hom 27 6 6 15 T 15 14 350563 CASAVA_Build 9 129559537 1D TGCTCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1075 hom 18 4 9 5 T 11 10 350564 CASAVA_Build 9 129584183 2D GATTGGAGAC AG/-- AGTTTCGCTC 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 AG 2 1 350565 CASAVA_Build 9 129595561 24D TGCGGCTTTT CTCAGCACCTAGATAGTGCCTGGC/------------------------ ACCATGTTCT 3070 het 3070 ref 29 20 15 2 CTCAGCACCTAGATAGTGCCTGGC 1 0 350566 CASAVA_Build 9 129595749 2D GTGTCCTGGC TT/-- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 5 3 350567 CASAVA_Build 9 129598167 2D TGCCAAACAC AG/-- GGATAAGTGC 3070 het 3070 ref 52 26 24 2 AG 1 0 350568 CASAVA_Build 9 129602022 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1635 hom 9 het 12 0 5 7 A 17 16 350569 CASAVA_Build 9 129603557 4D GAGGAGGAAC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 18 9 10 TG 9 7 350570 CASAVA_Build 9 129616703 2I GCTGAGATAG --/AT AGATAGTGCC 2997 het 1630 hom 17 4 7 6 AT 0 1 350571 CASAVA_Build 9 129634619 1D TTCTTTTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1533 hom 32 5 13 14 T 13 12 350572 CASAVA_Build 9 129659463 1I CACCGCGGGT -/G GGGGGGTGAA 2466 het 2466 ref 28 10 9 9 G 6 7 350573 CASAVA_Build 9 129682296 2I AACATGCAAA --/TG TGTGTGTGTG 2005 het 64 hom 16 1 9 6 TG 7 8 350574 CASAVA_Build 9 129683541 1D AGGAGCTGGG A/- GAGAATGAGG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 1 0 350575 CASAVA_Build 9 129684289 1I GTTTTATGAT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 24 het 11 0 8 3 A 8 9 350576 CASAVA_Build 9 129689183 1D GTTTGGAGGA C/- CTTTGGCTAC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 C 2 1 350577 CASAVA_Build 9 129689339 1I GTATAGCTGT -/C CCCCTAGTGG 3070 het 3070 hom 23 9 8 6 C 4 5 350578 CASAVA_Build 9 129691545 2D CTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2649 het 71 hom 19 1 9 9 T 14 12 350579 CASAVA_Build 9 129696842 1D AGGCTCAGCG C/- CCCCACCTCC 3070 hom 91 het 39 0 29 10 C 5 4 350580 CASAVA_Build 9 129705934 1I GGCTGCACCA -/G GGAGGGAAAC 3070 hom 68 het 28 0 22 6 G 2 3 350581 CASAVA_Build 9 129709892 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 13 14 350582 CASAVA_Build 9 129724433 1I CTGAGCCTTG -/A AATGTGGCTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 2 3 350583 CASAVA_Build 9 129726756 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2008 het 2008 ref 32 17 5 10 A 17 16 350584 CASAVA_Build 9 129733865 1I ATGGGACCAA -/G GCGAGTAGGA 3070 hom 78 het 28 0 26 2 G 1 2 350585 CASAVA_Build 9 129742963 1D GGTAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 30 1 23 6 A 12 11 350586 CASAVA_Build 9 129743674 3I AGGTGAGTAA ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 AAC 3 4 350587 CASAVA_Build 9 129763089 2D TAAAAAAAAA AC/-- CACAGCAGCA 3070 hom 74 het 30 0 23 7 AC 1 0 350588 CASAVA_Build 9 129763392 9D GTGGCATGCA TGGGGCATG/--------- ATCCCATGCA 3070 hom 54 het 23 0 15 8 TGGGGCATG 1 0 350589 CASAVA_Build 9 129784307 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 38 het 17 0 13 4 T 9 10 350590 CASAVA_Build 9 129798115 1D TAAAAATATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 10 0 10 1 A 10 9 350591 CASAVA_Build 9 129798270 5I CAAAACTGTC -----/AAAAA AAAAAAGAAA 3070 hom 49 het 20 0 17 3 A 6 11 350592 CASAVA_Build 9 129798968 5D GGCAAAATAT ACATA/----- ACATAAAATT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 ACATA 2 1 350593 CASAVA_Build 9 129845239 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 13 12 350594 CASAVA_Build 9 129848629 1I AGGAGCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 33 1 24 8 T 11 12 350595 CASAVA_Build 9 129851868 4D TCAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 66 het 26 0 22 5 AAAG 4 3 350596 CASAVA_Build 9 129859150 1I TCCCTCTTGT -/C CCCCTCCGAC 3070 hom 45 het 21 0 13 8 C 4 5 350597 CASAVA_Build 9 129876449 1I GCTGAGAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 T 9 10 350598 CASAVA_Build 9 129880500 3D TGGCACCCAG GGA/--- GACATAGCCC 3070 hom 75 het 27 0 23 4 GGA 1 0 350599 CASAVA_Build 9 129882351 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 37 het 16 0 12 4 A 10 9 350600 CASAVA_Build 9 129884023 5I TGTCTCAAAA -----/AAAAT AAAATAAAGT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 AAAAT 1 2 350601 CASAVA_Build 9 129886701 2D GCTGAACCAA TG/-- TGTACACCTT 3070 hom 60 het 25 0 21 5 TG 2 1 350602 CASAVA_Build 9 129887432 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 A 13 11 350603 CASAVA_Build 9 129888273 2I TTTGTTGTTG --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 11 350604 CASAVA_Build 9 129895331 1I AGTGGGTCTC -/T TCAGAGACTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 1 2 350605 CASAVA_Build 9 129921996 3I GTGTGCACCT ---/GTA GTTCCAGCTA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 GTA 0 1 350606 CASAVA_Build 9 129922122 1I CTCAAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 44 het 17 0 15 2 A 9 10 350607 CASAVA_Build 9 129932979 9I AGGTGAGGTC ---------/ACTGCTCCA ACTGCTCCAA 3070 het 3070 ref 77 33 30 14 ACTGCTCCA 1 2 350608 CASAVA_Build 9 129933245 20D GTCTTTTGAA AGCCAGTGGTTGCAGTAGGC/-------------------- ACATCCTCTC 3070 het 3070 ref 75 48 32 10 AGCCAGTGGTTGCAGTAGGC 1 0 350609 CASAVA_Build 9 129933732 1D AGACGTGTCC A/- TCAGGGCGAG 3070 het 3070 ref 73 40 22 12 A 1 0 350610 CASAVA_Build 9 129935819 1D TAACTACCTT C/- CATCTCCAGA 3070 het 3070 ref 66 44 21 5 C 2 1 350611 CASAVA_Build 9 129935930 1I CTATTTATTG -/T TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 61 30 23 8 T 1 2 350612 CASAVA_Build 9 129936663 4I CATTTCTGAT ----/TTTA TTTATTTGAG 3070 het 3070 ref 55 33 12 10 TTTA 1 2 350613 CASAVA_Build 9 129936764 1I TTTTGTATTA -/T TTTTCTAGTC 3070 het 3070 ref 56 26 19 11 T 4 5 350614 CASAVA_Build 9 129938303 1D AGCAAGTGCC G/- CTGGTGATTC 3070 het 3070 hom 71 27 38 11 G 1 0 350615 CASAVA_Build 9 129957594 1D GCCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 40 het 18 0 13 5 T 10 9 350616 CASAVA_Build 9 129961855 9D CGAAACCCCT CCCCCCCCC/--------- CCCCCCCCGT 2767 hom 27 het 22 0 12 11 C 17 8 350617 CASAVA_Build 9 129963382 4I ACTTACCCAT ----/TTAA ACTGTACAGT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 TTAA 0 1 350618 CASAVA_Build 9 130019775 1I GCCTCAGCCT -/C CCAAAGTGCT 2268 het 641 hom 9 2 5 2 C 2 3 350619 CASAVA_Build 9 130104801 1D AAGTGCTGGG T/- ATAACAGGCA 3070 hom 51 het 18 0 17 1 T 1 0 350620 CASAVA_Build 9 130106821 1D CATTTTAGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 15 8 T 10 9 350621 CASAVA_Build 9 130251089 1D ATACATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 312 hom 39 2 20 17 T 15 14 350622 CASAVA_Build 9 130260043 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTTT 261 het 261 ref 13 5 1 7 A 1 0 350623 CASAVA_Build 9 130266931 1D26M3D AGCTGGGACT ACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATT/-CAGGCATGCACCACCACACCCAGCTA--- TTTTTTGTAT 273 hom 7 het 3 0 3 0 N/A 0 0 350624 CASAVA_Build 9 130272728 1I GTTTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1165 het 1165 ref 21 11 4 6 A 13 14 350625 CASAVA_Build 9 130273016 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 24 1 17 6 T 13 12 350626 CASAVA_Build 9 130277209 2I ACCTATAGAC --/TG TTTTTCTTGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TG 0 1 350627 CASAVA_Build 9 130278189 1I TTCCATTGTG -/T TATCTCTACT 3070 hom 90 het 34 0 28 6 T 1 2 350628 CASAVA_Build 9 130282925 10D CTCTAAAAAA TAAAAAAAAT/---------- TAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 17 0 19 4 TAAAAAAAAT 2 1 350629 CASAVA_Build 9 130296163 1I CCAGAGTGCT -/A AGATTACAGG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 350630 CASAVA_Build 9 130302733 1I CTCTCTCAGG -/T TTTTTTCTGA 3070 hom 81 het 34 0 26 8 T 6 7 350631 CASAVA_Build 9 130305381 13I TGCTGGGATT -------------/ACAGGCGTGAGCC ACGGCACCCA 3070 hom 69 het 24 0 17 7 ACAGGCGTGAGCC 0 1 350632 CASAVA_Build 9 130312059 1D TCCCTATCTC A/- AAAAAAAGTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 8 7 350633 CASAVA_Build 9 130322858 1D TTCTCCACTA T/- TTTTTTTTTT 1367 het 1367 ref 38 26 3 10 T 13 12 350634 CASAVA_Build 9 130336512 1D TTTATGTAAA C/- TGGAGAGCCT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 C 1 0 350635 CASAVA_Build 9 130338066 2I ACAGAGACTC --/TT TGTTTCCCAA 3070 hom 65 het 23 0 22 1 T 1 3 350636 CASAVA_Build 9 130345474 3D ATTTCCTCTC CTT/--- ACCTTTGCCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 CTT 1 0 350637 CASAVA_Build 9 130346497 5D TTTAAATAAA TAAAT/----- TAAAAAGAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 TAAAT 1 0 350638 CASAVA_Build 9 130352978 3D TTCTCTACAT AGA/--- AGATTGCAGG 3070 hom 117 het 42 0 38 4 AGA 2 1 350639 CASAVA_Build 9 130355502 5D TCAAATCAAA TAACT/----- TAATAGCTTA 3070 hom 126 het 49 0 42 8 TAACT 1 0 350640 CASAVA_Build 9 130362733 1I TGCCCGCCTC -/G GCCTCCCAAA 3070 hom 28 het 12 0 9 3 G 1 2 350641 CASAVA_Build 9 130364809 3I TATCATTAAA ---/TAT TATTACAAAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 TAT 1 2 350642 CASAVA_Build 9 130373392 1I TGGGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2897 het 441 hom 13 1 8 4 A 11 12 350643 CASAVA_Build 9 130374578 1I GCCCTAGTTC -/T TTTCTTGAGG 3070 hom 111 het 39 0 37 2 T 3 4 350644 CASAVA_Build 9 130379987 1I GGACAGGATT -/G GGGGCATTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 4 5 350645 CASAVA_Build 9 130384429 1D AAGTTATGAG A/- AAAAATGTCA 3070 hom 120 het 43 0 41 2 A 6 5 350646 CASAVA_Build 9 130388923 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 41 0 31 10 T 11 12 350647 CASAVA_Build 9 130393168 1D ATTTTGGACC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 64 het 30 0 22 8 T 10 9 350648 CASAVA_Build 9 130408093 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 342 hom 15 2 8 5 A 15 14 350649 CASAVA_Build 9 130428882 2I ACGACAAGAC --/AA GAGCAGGATG 3070 hom 87 het 33 0 28 5 A 0 2 350650 CASAVA_Build 9 130432726 1I ACCTCCCAGG -/T TCAAGCAATT 3070 hom 51 het 24 0 17 7 T 1 2 350651 CASAVA_Build 9 130446376 2I CCAGGCGGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 30 0 26 4 T 13 15 350652 CASAVA_Build 9 130447289 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 2500 hom 24 het 9 0 9 0 A 15 14 350653 CASAVA_Build 9 130465565 1D GACACAGGCT G/- GGCTGGGGAC 3070 hom 69 het 28 0 22 8 G 3 2 350654 CASAVA_Build 9 130475535 1D TCTGCCTCCA G/- GGCTCAAGGG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 G 3 2 350655 CASAVA_Build 9 130485380 2I TTCTTTCTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 31 0 20 11 T 14 16 350656 CASAVA_Build 9 130504450 2D CGTGCGAGAC AA/-- AGAGAGACTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 3 1 350657 CASAVA_Build 9 130506162 1D GGTCTGGGGT G/- GGGGGGTCCC 3070 hom 55 het 23 0 16 9 G 7 6 350658 CASAVA_Build 9 130510944 2D CTCTTTCAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 24 0 24 1 A 13 11 350659 CASAVA_Build 9 130536947 1D ATGGTATGTG T/- TTTTTTTTTT 1659 het 1659 ref 27 14 5 8 T 14 13 350660 CASAVA_Build 9 130537169 1D TTGGACTGTT C/- CTGCACATGG 3070 hom 99 het 37 0 32 6 C 2 1 350661 CASAVA_Build 9 130547300 1D TTTGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 921 het 921 ref 26 11 6 9 T 19 18 350662 CASAVA_Build 9 130560604 1I CTGCACCCTC -/T TATTTCCCAG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 1 2 350663 CASAVA_Build 9 130561100 1D TTCAAGTGAA T/- TTTTTTTTTT 1786 het 1601 hom 25 9 6 10 T 17 16 350664 CASAVA_Build 9 130563639 1I CACCCGCCTC -/G GCCTCCCAAA 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 1 2 350665 CASAVA_Build 9 130564061 1I GTGTAAACTA -/G GACTGGAACC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 1 2 350666 CASAVA_Build 9 130587845 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1526 hom 28 6 17 5 T 13 12 350667 CASAVA_Build 9 130590824 3I AATGAGAGTT ---/GGG GGGACCTTTT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 G 3 6 350668 CASAVA_Build 9 130604838 1D ACATTGTCCA T/- TTTTTTTTTT 1527 het 1527 ref 58 27 5 26 T 17 16 350669 CASAVA_Build 9 130613436 1I CTGAATTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 30 0 22 8 A 9 10 350670 CASAVA_Build 9 130614259 1D15M1D GTTTTTTTTG TTTTTTTTTGTTTTTGT/-TTTTTTTTGTTTTTG- TTTTGTTTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 8 N/A 0 0 350671 CASAVA_Build 9 130616543 1I TTTTGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 2897 hom 24 het 14 0 9 5 T 11 12 350672 CASAVA_Build 9 130627426 1I GCTCTGCAAC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 350673 CASAVA_Build 9 130638403 1D TCTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 155 hom 21 1 11 9 T 14 13 350674 CASAVA_Build 9 130651724 2D TGAAACCAAG AT/-- GGTGTACTAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AT 1 0 350675 CASAVA_Build 9 130656085 3D6M2I CCTGCCAGAC AGGAGAAAA--/---AGAAAATG TACTTCCCAT 3070 het 3070 ref 49 33 17 2 N/A 0 0 350676 CASAVA_Build 9 130656927 3D TGCCCAACCT GAA/--- GAAGAAGGAA 1289 het 1289 ref 46 37 4 6 GAA 3 2 350677 CASAVA_Build 9 130657898 1D AAAAGATTCA T/- TTTTTACTTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 6 5 350678 CASAVA_Build 9 130678998 3D AGCTAATTTA TTT/--- TTATTTTTAT 1829 het 1829 ref 10 5 4 1 T 5 2 350679 CASAVA_Build 9 130696893 1D ACTCTACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 29 1 17 12 A 17 16 350680 CASAVA_Build 9 130706492 12D GGTAGCGTGT GCCTGTAATCCA/------------ GCTGCTTGGG 3070 het 3070 ref 24 15 10 0 GCCTGTAATCCA 1 0 350681 CASAVA_Build 9 130716498 5I CCAAGCTCAG -----/AGGCA TTTCTAGTCC 3070 hom 93 het 35 0 28 7 AGGCA 0 1 350682 CASAVA_Build 9 130744486 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1722 het 1116 hom 28 5 9 14 A 17 18 350683 CASAVA_Build 9 130758088 4I GTTATTTACC ----/CTTT CTAAGTGCTG 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 CTTT 0 1 350684 CASAVA_Build 9 130765610 1I AGCCGTAAAT -/G GAAATTTTTA 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 G 1 2 350685 CASAVA_Build 9 130781717 1D GCCCACCAGG T/- TTTTTTTTTT 2257 het 1057 hom 17 4 7 6 T 11 10 350686 CASAVA_Build 9 130798250 1D TCCAGATTAA T/- TTTTTTTTTT 1229 het 1229 ref 29 15 5 9 T 15 14 350687 CASAVA_Build 9 130822989 2I CAAAAACAAA --/AC ACACACACAC 2525 het 2514 hom 17 8 7 2 AC 8 9 350688 CASAVA_Build 9 130881512 1I ACTCCATGAA -/G TCTGAGAGCC 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 G 0 1 350689 CASAVA_Build 9 130894911 2D AAATTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 24 1 8 15 A 14 12 350690 CASAVA_Build 9 130895041 2D TCACTGGCGC CA/-- GAGTTTGGTC 3070 het 3049 hom 21 9 8 5 CA 1 0 350691 CASAVA_Build 9 130900917 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1607 hom 29 het 15 0 9 6 T 16 14 350692 CASAVA_Build 9 130902527 2D TGGGGACGCA GG/-- GCCGGGGACG 3070 hom 56 het 31 0 18 14 G 3 1 350693 CASAVA_Build 9 130904910 1I GTTTGTCACA -/G GGGGAGATGA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 G 4 5 350694 CASAVA_Build 9 130915047 2I GTCACCCCCC --/CA AAAAAAAAAA 3009 hom 30 het 18 0 11 7 CA 0 1 350695 CASAVA_Build 9 130915171 1I AAAAAGTCGC -/A AAAAAAAAAA 1351 het 1351 ref 14 6 6 2 A 11 12 350696 CASAVA_Build 9 130918452 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 1285 hom 12 het 8 0 5 3 T 8 9 350697 CASAVA_Build 9 130921429 2D TTATCCAGAA AG/-- AGAAATCACA 3070 het 3070 ref 29 17 11 3 AG 2 1 350698 CASAVA_Build 9 130926100 2I TTTATATAAC --/TT TTGAAATTAA 3070 het 2931 hom 18 8 8 2 T 2 4 350699 CASAVA_Build 9 130926465 3I TAAACAGCCC ---/CCT ATCTTCAGAC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CCT 0 1 350700 CASAVA_Build 9 130933201 2D TACTCTAAAC AG/-- TGCTGTTGTG 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 AG 1 0 350701 CASAVA_Build 9 130934750 1D ACCTGGCTAA T/- TTTAGTGTTT 3070 het 3070 ref 19 8 7 4 T 4 3 350702 CASAVA_Build 9 130944262 2D TGTGGGAGAA AG/-- AGGGGTGACT 3070 het 2196 hom 39 9 11 20 AG 2 1 350703 CASAVA_Build 9 130947851 11D TGTCTTTCCT CTGGGCCATGG/----------- CTGTGTGGGT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 CTGGGCCATGG 1 0 350704 CASAVA_Build 9 130949278 2I GGCTGCCTTT --/TC TCTCTTTCTC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TC 2 3 350705 CASAVA_Build 9 130963556 1I CGATGTCACA -/T TGGTAGCTAG 3070 hom 144 het 59 0 47 12 T 1 2 350706 CASAVA_Build 9 130966131 16D GAGGCCAGGC AGAGCCAGGGCACCAG/---------------- AGTGCCAGGG 3070 het 3070 ref 40 13 13 17 AGAGCCAGGGCACCAG 1 0 350707 CASAVA_Build 9 130977874 4D CTTTTAAATT AAAC/---- AAATCTATCG 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 AAAC 1 0 350708 CASAVA_Build 9 130978179 4I ACCCCTTACC ----/CAAA CAGTGTCCGA 2883 hom 38 het 17 0 10 7 CAAA 0 1 350709 CASAVA_Build 9 130989852 1I CATGAAGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 9 12 T 10 11 350710 CASAVA_Build 9 130997525 1D GGCCCAGAGA G/- GGGGGGGCAC 3070 hom 75 het 27 0 25 2 G 8 7 350711 CASAVA_Build 9 131001817 2I GACTGCACTC --/CA GTCTGGGTGA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 CA 0 1 350712 CASAVA_Build 9 131012726 1I ATTTGAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 T 13 14 350713 CASAVA_Build 9 131027054 1I GAGAGAGGCC -/G GGGGCTGCCT 3070 hom 72 het 27 0 21 6 G 4 5 350714 CASAVA_Build 9 131028572 3I ATCCCACAGA ---/TCT TCTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 14 8 TCT 2 3 350715 CASAVA_Build 9 131030309 1I TAGAGATGGC -/T TTTTTTTTTA 1964 hom 21 het 19 0 6 13 T 9 10 350716 CASAVA_Build 9 131030476 1I TTTTTTTTTT -/C CCCGAAATGG 1546 het 1546 ref 16 6 4 6 C 3 4 350717 CASAVA_Build 9 131030775 11D TGGTTTTCAT GCAGCAAAGTG/----------- TCACTTGTCC 3037 het 3037 ref 20 12 7 3 GCAGCAAAGTG 1 0 350718 CASAVA_Build 9 131046485 1I TTTTTGAGAT -/G GGAGTCTCGC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 2 3 350719 CASAVA_Build 9 131049157 1D23M1D GATCCTTTTC AAAAAAAAATTTAAAATTTTAATTA/-AAAAAAAATTTAAAATTTTAATT- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 18 11 9 5 N/A 0 0 350720 CASAVA_Build 9 131051630 1I TCTACAAAAT -/A AAAAAAAATT 2916 het 2916 ref 23 11 8 4 A 8 9 350721 CASAVA_Build 9 131054370 1D GCAGTTATTC A/- AAAAAGAGAG 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 A 6 5 350722 CASAVA_Build 9 131063661 1D TTACCACAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 A 10 9 350723 CASAVA_Build 9 131074307 1I TTTTTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 T 10 11 350724 CASAVA_Build 9 131074649 1D CTTATTTCCT C/- CCCCAGCCCA 3070 het 3070 ref 55 24 16 15 C 5 4 350725 CASAVA_Build 9 131080509 3I CTGACTGACC ---/TGT TACGTGGCTG 2808 het 2511 hom 28 11 10 7 TGT 0 1 350726 CASAVA_Build 9 131098025 1D GTTCCATGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 12 11 350727 CASAVA_Build 9 131101551 1D ATTTTTCACC T/- TTTTTTTTTA 1003 het 1003 ref 34 23 4 7 T 10 9 350728 CASAVA_Build 9 131102851 19D CCTTGGCCTC CCAAAGTGCTGGGATTACA/------------------- GGCATGAGCC 2469 het 2469 ref 16 11 6 2 CCAAAGTGCTGGGATTACA 1 0 350729 CASAVA_Build 9 131103608 1D TCTTGAGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2905 hom 35 11 14 10 T 11 10 350730 CASAVA_Build 9 131111650 1D ATGCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1436 hom 7 het 6 0 3 3 T 11 10 350731 CASAVA_Build 9 131115310 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 11 12 350732 CASAVA_Build 9 131125129 1I AGATTTAAAC -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 34 18 9 7 T 7 8 350733 CASAVA_Build 9 131125751 1I CTGCTGTCTG -/C CCCCCCCAAC 3070 hom 74 het 33 0 23 10 C 7 8 350734 CASAVA_Build 9 131131478 2D CATGGTGAAA CC/-- CCGTCTCTAC 3046 het 1171 hom 12 4 8 0 C 4 2 350735 CASAVA_Build 9 131131500 1I TAAAAATACC -/A AAAAAAAAAA 835 het 109 hom 14 1 3 10 A 10 11 350736 CASAVA_Build 9 131134972 1D AGCCTGCAGA T/- TTCTATGTGG 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 T 3 2 350737 CASAVA_Build 9 131141646 4D GAGCCAGAGA GAGT/---- GTCTGTGAGC 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 GAGT 1 0 350738 CASAVA_Build 9 131141716 2I GTGAGTTGTG --/TA TGTGTGAGGT 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 TA 0 1 350739 CASAVA_Build 9 131152260 3D GGGGAGGGGG GGC/--- GGTAAGGGGA 2311 het 18 hom 16 1 8 8 GGC 1 0 350740 CASAVA_Build 9 131163516 2I TGTGTGTGCC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 68 35 20 13 TG 6 7 350741 CASAVA_Build 9 131190634 1D TAATTAGTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 T 9 8 350742 CASAVA_Build 9 131191818 1I CCCAGCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 720 hom 23 4 11 8 T 14 15 350743 CASAVA_Build 9 131195087 2I GGGCCCACAC --/AT GTCAGGGGTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 AT 0 1 350744 CASAVA_Build 9 131195174 5D AGTGAAACCC ACTCA/----- CTTGGGGCCT 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 ACTCA 1 0 350745 CASAVA_Build 9 131197390 4D ACAAATGGAA AGAT/---- AGAATGGATG 3070 het 3070 ref 49 24 19 8 AGAT 1 0 350746 CASAVA_Build 9 131214436 6D TCCTTGGAAG AGAAAA/------ AGAAAAAGAA 2294 het 2294 ref 17 10 6 2 AGAAAA 3 2 350747 CASAVA_Build 9 131220471 1D TATGAATTTT G/- GGGGTGGGGG 3070 het 3070 ref 35 17 11 9 G 5 4 350748 CASAVA_Build 9 131223403 1I ACCCACAAGG -/A GTGACTCAGT 3070 het 3070 hom 40 11 16 13 A 0 1 350749 CASAVA_Build 9 131226743 1D CGCCACCCCC A/- ACCTTGGAGT 3070 het 3070 ref 38 14 12 12 A 2 1 350750 CASAVA_Build 9 131227918 1D18M2D CCCTATCTCT AAAAAAAATAAAATAAAATAG/-AAAAAAATAAAATAAAAT-- ATTTTCTGCT 1796 het 1796 ref 32 27 4 7 N/A 0 0 350751 CASAVA_Build 9 131228926 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 33 het 17 0 12 5 T 7 6 350752 CASAVA_Build 9 131229435 8D GTGAGACTGG CGGGCGGC/-------- GGGGGGGTTA 2836 het 728 hom 18 4 8 12 CGGGCGGC 1 0 350753 CASAVA_Build 9 131232079 1D3M1I ACACGGAACA CACT-/-ACTC GAGTCCCTAA 3070 het 3070 ref 62 43 16 6 N/A 0 0 350754 CASAVA_Build 9 131234265 17D AGCTGTATGA TCTTGATATCTGTATGT/----------------- TCTTGATATC 3070 het 3070 ref 59 37 20 12 TCTTGATATCTGTATGT 1 0 350755 CASAVA_Build 9 131236669 4I GAGAGACTGC ----/GCAG ACAGTTTACT 3070 het 3070 ref 67 29 29 9 GCAG 0 1 350756 CASAVA_Build 9 131237821 6D CCAGTCACTT TCCCTC/------ TCTGAGCCTC 1517 het 1517 ref 51 42 5 7 TCCCTC 1 0 350757 CASAVA_Build 9 131240166 1I ATCAGGCCGA -/C CAGGGTTTGA 3070 het 3070 ref 51 31 15 5 C 1 2 350758 CASAVA_Build 9 131241462 4I AAAGTGCTGG ----/AATT GATTACAGGT 776 het 776 ref 33 27 2 5 AATT 0 1 350759 CASAVA_Build 9 131244130 1I GCCCCACACA -/T CGTAAGCCTT 3070 het 3070 ref 79 51 20 8 T 0 1 350760 CASAVA_Build 9 131245481 3D GCTCTTTTGC ATA/--- ATAAGTGGGC 3070 het 3070 ref 60 33 21 7 ATA 2 1 350761 CASAVA_Build 9 131245710 23D TCTTCTTCTT CTTCTTCCTTTTCTTTTCTTTTC/----------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 23 8 13 CTTCTTCCTTTTCTTTTCTTTTC 1 0 350762 CASAVA_Build 9 131245791 2I ATGCAGTGAC --/GT GATCCCAGCT 576 het 576 ref 21 13 2 6 GT 0 1 350763 CASAVA_Build 9 131251865 1D ATTTTATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 11 10 350764 CASAVA_Build 9 131257000 1I CACTGGGCAC -/T TGCAGCCGGA 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 T 1 2 350765 CASAVA_Build 9 131263002 1D CCCTTCCCCA C/- CCCCACAAGC 3070 het 1706 hom 21 6 10 5 C 5 4 350766 CASAVA_Build 9 131265873 5I AGACTGGCCC -----/TGCCG TGCAGCTTCT 3051 het 986 hom 34 7 12 15 TGCCG 0 1 350767 CASAVA_Build 9 131269023 2I AAAAAAAAAA --/AT AAATAAAAAT 2597 het 1855 hom 25 9 9 7 AT 0 1 350768 CASAVA_Build 9 131273700 6I AGACCCCAGA ------/AAGGGC AAGTCTGCTA 3070 het 3070 ref 29 13 11 5 AAGGGC 0 1 350769 CASAVA_Build 9 131273825 1D CTGTGGCATC T/- TGCAAGCTGT 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 2 1 350770 CASAVA_Build 9 131278082 1I AGACCCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2468 hom 28 7 12 9 T 10 11 350771 CASAVA_Build 9 131279163 1D AACAATTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 A 9 8 350772 CASAVA_Build 9 131298295 1D ATGTACACCC T/- CCCCTCCCCC 2168 het 2168 ref 19 9 7 4 T 1 0 350773 CASAVA_Build 9 131304690 1D TCGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 22 1 15 6 T 12 11 350774 CASAVA_Build 9 131307330 1D ACACTGCCCA C/- CCCCCCGGGG 3070 hom 50 het 18 0 16 2 C 7 6 350775 CASAVA_Build 9 131312556 1I AGAACTCTCA -/G GACATTGCTG 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 G 1 2 350776 CASAVA_Build 9 131315980 1I GGTGCAGCCA -/G GGCTGCACAT 1934 hom 7 het 17 1 9 7 G 2 3 350777 CASAVA_Build 9 131318346 1I CTGGTGTCAA -/T TTTTTTTTTT 1247 het 1247 ref 25 6 8 11 T 15 16 350778 CASAVA_Build 9 131330826 2D TTTTATTTTA TG/-- TGTATTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TG 2 1 350779 CASAVA_Build 9 131332526 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 11 350780 CASAVA_Build 9 131333110 1I GCCTGGCACA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 30 het 16 0 10 6 T 8 9 350781 CASAVA_Build 9 131333549 5D CGGCCCCCAC GGGCT/----- GTTCCATGCT 3070 hom 105 het 39 0 35 5 GGGCT 1 0 350782 CASAVA_Build 9 131341072 1I GTGGACAAAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 7 8 350783 CASAVA_Build 9 131342974 2I TTTGTATTTT --/TA TAGTAGGAAC 3070 het 2695 hom 18 9 8 1 TA 1 2 350784 CASAVA_Build 9 131343481 8I CCCATCAACA --------/GAAACAGG GAAAGGGCAG 3070 hom 91 het 34 0 30 5 GAAACAGG 0 1 350785 CASAVA_Build 9 131354168 1D TGTTTTATCG T/- TAAGAACAAC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 T 2 1 350786 CASAVA_Build 9 131358540 18D CTTGGGGTCT GGATCGGGATCCATGGTG/------------------ GGATCGGGAT 3070 hom 54 het 22 0 17 6 GGATCGGGATCCATGGTG 1 0 350787 CASAVA_Build 9 131361677 4D ATTCAATTCA ATTC/---- ATTCATTCAT 3070 hom 66 het 27 0 19 9 ATTC 5 4 350788 CASAVA_Build 9 131365336 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1375 het 147 hom 23 2 5 16 T 17 16 350789 CASAVA_Build 9 131384464 1D TTGGATGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 10 9 350790 CASAVA_Build 9 131388509 1D CAGAAGCCTT C/- CCCTGATGTC 3070 het 3070 hom 49 22 18 9 C 4 3 350791 CASAVA_Build 9 131390206 1D AAACTCTCTC T/- CAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 25 4 17 4 T 1 0 350792 CASAVA_Build 9 131405845 1D TTAAAGAGAT G/- GGGGGGGGTC 2516 het 2516 ref 23 11 7 6 G 9 8 350793 CASAVA_Build 9 131406178 1D CAAAGGCGAG C/- TTTGGATAAA 3070 het 3070 ref 38 18 11 10 C 1 0 350794 CASAVA_Build 9 131419780 4D TTTCACTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2754 hom 36 9 15 12 TTTG 4 3 350795 CASAVA_Build 9 131423141 1I GAATGGGGAT -/A AATAGCAGCA 3070 het 3070 hom 38 11 14 13 A 2 3 350796 CASAVA_Build 9 131425869 1I GGTATGTGTC -/T TTTTTTAATG 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 6 7 350797 CASAVA_Build 9 131445602 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2078 hom 21 5 13 3 A 11 12 350798 CASAVA_Build 9 131447097 6I AAGGGTCCCC ------/CACCCT CTCAATGGAT 3070 hom 72 het 30 0 23 7 CACCCT 0 1 350799 CASAVA_Build 9 131450405 2I TCACACACAC --/AT GTGCCAGGCT 3070 het 2412 hom 37 7 19 11 AT 0 1 350800 CASAVA_Build 9 131458564 1D AATTCTTCAA G/- GAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 G 2 1 350801 CASAVA_Build 9 131462380 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 18 1 13 4 A 12 11 350802 CASAVA_Build 9 131465274 1I GAGGTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 24 0 13 11 T 10 11 350803 CASAVA_Build 9 131469261 17I GGGGCACCTT -----------------/CTGAGTGCACCCAGCTG CTGCCAGCCT 3070 hom 53 het 24 0 14 10 CTGAGTGCACCCAGCTG 0 1 350804 CASAVA_Build 9 131471259 5I AGGCTCAAAC -----/TTTTT TTTTTTTAAT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 7 12 350805 CASAVA_Build 9 131484431 2D CTGTGCGCAC TA/-- TGTTACTATT 3070 het 3070 ref 39 18 14 8 TA 1 0 350806 CASAVA_Build 9 131494221 1D AGTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 1684 het 1684 ref 18 11 6 2 T 9 8 350807 CASAVA_Build 9 131498183 1I AAAGAAAACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 A 10 11 350808 CASAVA_Build 9 131506384 2I TTAAGCATGT --/CC CCTTGGGAGA 3070 het 3070 hom 44 13 22 9 C 2 4 350809 CASAVA_Build 9 131507307 3I CTCAGGAATA ---/GGG GAGAGACTGA 2684 het 2173 hom 17 7 8 2 G 1 4 350810 CASAVA_Build 9 131508399 13I2M2I AATTTTTTTT -------------TC--/AAAAATTAACTGATCAG CCAGGCGCGG 3070 het 3070 ref 18 8 7 3 N/A 0 0 350811 CASAVA_Build 9 131525329 18I AGGCTCCCAG ------------------/GACAGTGGTGTGCTCCGT GACAGCTGAG 3070 het 3070 ref 38 13 13 12 GACAGTGGTGTGCTCCGT 0 1 350812 CASAVA_Build 9 131527546 1I AGATTCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 11 12 350813 CASAVA_Build 9 131528408 2I TCTGCTTTTA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 T 9 11 350814 CASAVA_Build 9 131536577 1I AGGCTCTGGG -/C CCCCCCAGGC 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 C 6 7 350815 CASAVA_Build 9 131564471 1I GTTTTTTTTT -/G TTTTGTTTTT 234 het 234 ref 27 18 3 6 G 0 1 350816 CASAVA_Build 9 131576263 1I ACAAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 1622 het 1622 ref 21 9 5 7 A 14 15 350817 CASAVA_Build 9 131595775 1I CTTCTTGTGA -/C TGGCTGATTC 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 C 0 1 350818 CASAVA_Build 9 131599712 1I TTTCTTCCCC -/T TTTTTTTTTT 2158 het 1053 hom 23 6 10 7 T 14 15 350819 CASAVA_Build 9 131627763 1I ACAGTACTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 T 9 10 350820 CASAVA_Build 9 131630512 1I CGTATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 562 hom 33 3 26 4 T 11 12 350821 CASAVA_Build 9 131656747 1I ACTGAAATGG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 8 9 350822 CASAVA_Build 9 131657535 1D CATCTCAAAA C/- AAAAAAAAAA 2191 hom 14 het 16 0 9 7 C 1 0 350823 CASAVA_Build 9 131660401 6D TGATAAGCAG CAGCCC/------ TCAGGGTCCT 3070 hom 81 het 32 0 27 8 CAGCCC 1 0 350824 CASAVA_Build 9 131662436 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1602 hom 12 het 6 0 5 1 A 11 12 350825 CASAVA_Build 9 131664235 1D AGATGCAGTA T/- ATGTATGCGG 3070 hom 117 het 41 0 38 4 T 1 0 350826 CASAVA_Build 9 131668329 3I TTCCGCCCTC ---/CTT TACCCCCTGC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 CTT 0 1 350827 CASAVA_Build 9 131670486 3D GGCTGCCCTT GAC/--- GACCAGCCCG 3070 hom 67 het 26 0 16 10 GAC 2 1 350828 CASAVA_Build 9 131671984 1I ATGGGCTGGG -/C CCTGTCCTGG 3070 hom 80 het 29 0 24 5 C 2 3 350829 CASAVA_Build 9 131673353 1D CCTCATAGAA G/- TGGAATTATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 G 1 0 350830 CASAVA_Build 9 131703147 7D AAACTTGTAC TTAAAAA/------- TTAAAGTAGA 3070 het 3070 hom 32 13 15 6 TTAAAAA 1 0 350831 CASAVA_Build 9 131714031 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1871 het 1360 hom 17 5 6 6 A 17 16 350832 CASAVA_Build 9 131719122 1I GACTGCTCTT -/G TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 G 0 1 350833 CASAVA_Build 9 131730114 1D AAGCACAGTA T/- TTAATTAACT 3070 het 3070 ref 29 14 14 2 T 3 2 350834 CASAVA_Build 9 131734327 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 23 10 12 2 A 9 8 350835 CASAVA_Build 9 131738062 2D AATGATAAAC TA/-- TATAGGTTGG 2795 het 2795 ref 27 17 8 3 TA 3 2 350836 CASAVA_Build 9 131739279 1I CAAGGGGGGG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 7 8 350837 CASAVA_Build 9 131741606 4I TAGTTTTGTC ----/TTCT TTCTTTTAGA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 TTCT 1 2 350838 CASAVA_Build 9 131742712 2D GAGAGTTTTC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AT 7 6 350839 CASAVA_Build 9 131745485 1D CATTAATTGC T/- TTTTTTTTTT 1425 het 571 hom 20 7 5 8 T 19 18 350840 CASAVA_Build 9 131748269 1I ACTCTGTTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 9 10 350841 CASAVA_Build 9 131760542 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 9 10 350842 CASAVA_Build 9 131760733 4D TCATCCACTT AAAC/---- AACATCTAAA 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 AAAC 1 0 350843 CASAVA_Build 9 131766962 1I CAGCCCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 358 hom 43 1 33 9 A 12 13 350844 CASAVA_Build 9 131767790 4I19M2I TAAAACACAC ----ACACACACGCGCGCGCGCG--/ACAGACACACACGCGCGCGCGCGCA CACACACACA 3070 hom 36 het 14 0 12 3 N/A 0 0 350845 CASAVA_Build 9 131805227 1I TCATTAAGTT -/A CAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 37 2 31 4 A 0 1 350846 CASAVA_Build 9 131836413 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1947 het 60 hom 12 1 7 4 A 17 16 350847 CASAVA_Build 9 131849752 1D TAAGTTTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 14 hom 35 1 31 3 T 11 10 350848 CASAVA_Build 9 131850266 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 1969 hom 21 5 15 1 A 7 8 350849 CASAVA_Build 9 131852926 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 7 8 350850 CASAVA_Build 9 131853005 1D TGCTCGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 26 2 22 2 T 14 13 350851 CASAVA_Build 9 131858445 2I CCAGCTACTC --/AG GGGGCTGAGG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AG 0 1 350852 CASAVA_Build 9 131861834 11D TTAATACGTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 29 2 14 13 T 23 12 350853 CASAVA_Build 9 131868508 3D TGGTGATGAT GAC/--- GACGATGATG 3070 hom 84 het 33 0 27 6 GAC 2 1 350854 CASAVA_Build 9 131870542 5D AAACAAAAGT AAAAC/----- AAAACACTGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AAAAC 2 1 350855 CASAVA_Build 9 131873435 1I CCCCTCACCC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 67 het 29 0 21 8 T 9 10 350856 CASAVA_Build 9 131875271 3I GTGATTCATA ---/TAC TACGTTGTTT 3070 het 3070 hom 54 17 27 10 TAC 1 2 350857 CASAVA_Build 9 131887659 1D CTGCCTTTTT G/- TAAGCCCCCT 3070 hom 87 het 35 0 30 6 G 1 0 350858 CASAVA_Build 9 131888475 1I ATTAGCATGC -/T TTCTATGCCG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 2 3 350859 CASAVA_Build 9 131889828 1I ACTTGAGCCT -/G GGGGGGTCAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 G 6 7 350860 CASAVA_Build 9 131892594 1I TTCCACAAAG -/A CCATCACAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 1 350861 CASAVA_Build 9 131897800 2D GACCGTGATA AC/-- ACAGTTTTCA 3070 hom 96 het 38 0 32 7 AC 2 1 350862 CASAVA_Build 9 131900982 1D TTGGCGCACG C/- CTGTAATCCC 3070 hom 30 het 15 0 8 7 C 2 1 350863 CASAVA_Build 9 131901902 4D TTCTTTGTTT TTGG/---- TTTGTTTTGT 318 het 64 hom 27 1 6 20 TTGG 1 0 350864 CASAVA_Build 9 131905058 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 12 11 350865 CASAVA_Build 9 131905642 3I GCTAAGAGCC ---/TAA TAATAACGGG 3070 hom 141 het 52 0 46 6 TAA 2 3 350866 CASAVA_Build 9 131910913 24D CTCTTGTGAT AGGTTCTTTTCAGTGGCTTTAAGC/------------------------ AGGTTCTTTT 3070 hom 30 het 21 0 10 14 AGGTTCTTTTCAGTGGCTTTAAGC 2 1 350867 CASAVA_Build 9 131916343 1D GTAGCGCACA C/- CTGTAATCCC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 2 1 350868 CASAVA_Build 9 131917570 1D GTTTTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 23 0 20 3 A 11 10 350869 CASAVA_Build 9 131917797 2I ACCGGGAGAC --/AG AGCTTGCAGT 3047 hom 30 het 11 0 9 2 AG 1 2 350870 CASAVA_Build 9 131919867 1I AAGAGTAGGT -/G GGGGGTGTTT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 5 6 350871 CASAVA_Build 9 131922983 3I TGCTCTTTCC ---/CTT CTTCTCACTG 3070 hom 86 het 33 0 27 6 CTT 1 2 350872 CASAVA_Build 9 131927501 1I GCTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 2361 het 277 hom 18 3 12 3 T 15 16 350873 CASAVA_Build 9 131986895 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 13 1 11 1 T 12 13 350874 CASAVA_Build 9 132001199 2D TCTCTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 2426 het 72 hom 25 3 6 16 T 13 11 350875 CASAVA_Build 9 132012501 1I TCAGTCTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2265 hom 32 8 10 14 A 15 16 350876 CASAVA_Build 9 132032904 1I GCCCTCCCCC -/T CCCACCCCCA 3070 hom 64 het 25 0 21 4 T 0 1 350877 CASAVA_Build 9 132042725 11D ACAGTGGGCA TGGAAAGGGGC/----------- TGGGAAGGCC 3070 het 3070 ref 45 25 15 7 TGGAAAGGGGC 1 0 350878 CASAVA_Build 9 132051254 4D TAATATAATA CAAT/---- TAACAATTGT 1446 het 1446 ref 9 6 3 0 CAAT 1 0 350879 CASAVA_Build 9 132055798 26D GAATTCGAGA CCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCC/-------------------------- CCCCCCGCCC 2776 het 56 hom 8 1 7 7 CCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCC 1 0 350880 CASAVA_Build 9 132056778 6I TGAGACGTTT ------/TTTTTC TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 43 11 19 13 TTTTTC 2 3 350881 CASAVA_Build 9 132072329 1I AAATCTATTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 8 9 350882 CASAVA_Build 9 132075247 1D GGTTCCACCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 34 17 16 2 T 10 9 350883 CASAVA_Build 9 132076154 1I GATACATTAA -/T TTTTTTTTTT 2656 het 1204 hom 21 4 11 6 T 15 16 350884 CASAVA_Build 9 132077241 1I TTTTTCCTTG -/T TTTTTTTGCT 3070 het 2600 hom 25 9 12 4 T 7 8 350885 CASAVA_Build 9 132083203 1I ACTCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 2938 het 2938 ref 27 13 8 6 A 13 14 350886 CASAVA_Build 9 132083698 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 16 0 11 5 A 11 10 350887 CASAVA_Build 9 132086007 5D GAACATATGT TTTCA/----- TTTCTCTTGG 3070 het 3070 hom 50 22 24 5 TTTCA 1 0 350888 CASAVA_Build 9 132215939 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATATAT 910 hom 5 het 6 0 2 4 A 5 6 350889 CASAVA_Build 9 132230573 4I CAGTCACATG ----/CCTC CCTCCCCCTT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 CCTC 1 2 350890 CASAVA_Build 9 132232142 1I GCTAGGAAGC -/G GGGAAAGATG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 G 3 4 350891 CASAVA_Build 9 132246157 2I GTAGGCTCTG --/TC ACCTGCTGAT 3070 hom 117 het 42 0 36 6 TC 0 1 350892 CASAVA_Build 9 132248476 1I CCACAGGGGT -/G GGGGGAGGCT 2857 hom 39 het 14 0 13 1 G 5 6 350893 CASAVA_Build 9 132253881 1D TGCCGTGTTG C/- CCCCCCCCCC 3047 het 4 hom 21 1 13 7 C 11 10 350894 CASAVA_Build 9 132277090 3I TGGAGATTGT ---/ACA ACAATGTCAA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 ACA 1 2 350895 CASAVA_Build 9 132277161 1D TATGTAATGT A/- TTTTTTTTAC 3070 hom 48 het 20 0 17 9 A 1 0 350896 CASAVA_Build 9 132279200 5D CCAAAAATAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 22 1 18 3 A 19 14 350897 CASAVA_Build 9 132302094 1I GTACACAGAG -/A AAAAAATCGC 3070 hom 147 het 58 0 49 9 A 6 7 350898 CASAVA_Build 9 132303160 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2367 het 461 hom 17 3 10 4 T 17 16 350899 CASAVA_Build 9 132306871 1D AAGTGAATTT A/- AAAAAAGTTG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 A 7 6 350900 CASAVA_Build 9 132307400 4I ACTATCTCTT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 81 het 36 0 27 9 AAAC 4 5 350901 CASAVA_Build 9 132326230 1I TGTCCCAAAC -/A AAAAAAAAAA 1551 het 1551 ref 23 7 7 9 A 10 11 350902 CASAVA_Build 9 132326593 1D CTTGGGGGCC G/- ACAAAGGCGG 1514 het 902 hom 17 4 6 7 G 1 0 350903 CASAVA_Build 9 132326677 1I GAGGAGAACG -/C CCCCCCAAGC 3070 het 2150 hom 29 9 12 8 C 6 7 350904 CASAVA_Build 9 132333620 1D ACCATAATTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 2081 hom 32 9 16 7 A 9 8 350905 CASAVA_Build 9 132374543 1D GAGTTCAAGA C/- AATCCTGGGC 3070 het 569 hom 14 2 10 3 C 1 0 350906 CASAVA_Build 9 132375379 2I TAGCAGAAAG --/TT TTTTTTTATA 3070 hom 45 het 23 0 16 7 T 7 9 350907 CASAVA_Build 9 132379966 4D ATCTCAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 66 het 66 ref 24 13 2 10 AAAG 1 0 350908 CASAVA_Build 9 132390075 1D AAGAAAACTT A/- AAAATTAGGC 2781 het 2781 ref 28 17 8 5 A 5 4 350909 CASAVA_Build 9 132390385 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 1131 het 1131 ref 20 8 6 6 A 15 16 350910 CASAVA_Build 9 132391076 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2209 het 2209 ref 22 9 6 7 A 13 12 350911 CASAVA_Build 9 132394275 1D CACGTATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 76 hom 28 2 13 13 T 10 9 350912 CASAVA_Build 9 132399373 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 921 het 921 ref 18 7 5 6 A 17 16 350913 CASAVA_Build 9 132415640 3D CAATGATCAT GGC/--- GGCTCACTGC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 GGC 2 1 350914 CASAVA_Build 9 132416337 1D TAGTAGAGAT G/- GGGGTCTCAT 3070 hom 51 het 18 0 18 4 G 5 4 350915 CASAVA_Build 9 132431091 1D AAAAAAAAAG A/- AAAGAAAAGA 3070 het 1022 hom 25 6 13 7 A 4 3 350916 CASAVA_Build 9 132432219 1I ACTCTAACTC -/A AAAAAAAACA 1829 het 1829 ref 20 12 4 4 A 8 9 350917 CASAVA_Build 9 132433732 4D CGTGTGTGTG TGTT/---- TGTTTATTTG 3070 het 2095 hom 30 13 15 4 TGTT 2 1 350918 CASAVA_Build 9 132436406 8I ATGAGTTTGA --------/GACCAGCC TGGGCAATAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 GACCAGCC 0 1 350919 CASAVA_Build 9 132441529 33D TTGTCACTCG CTTCTTCCTCTGCCCTGATAAAGTTTAATGTTC/--------------------------------- CAGACAGAGG 3070 het 3070 ref 52 39 23 10 CTTCTTCCTCTGCCCTGATAAAGTTTAATGTTC 1 0 350920 CASAVA_Build 9 132441977 1I ATTACAGGCA -/C CCCGCTACCA 3070 het 2400 hom 19 6 11 2 C 3 4 350921 CASAVA_Build 9 132442260 1I GTGCCCTCCA -/C CACGCCTTGC 1642 het 1642 ref 11 7 4 0 C 1 2 350922 CASAVA_Build 9 132456684 6D CATTACAGTT TAATTC/------ TATTAGGCAT 3070 het 3070 ref 51 32 15 4 TAATTC 1 0 350923 CASAVA_Build 9 132462469 2D AGTTGAAGTG TT/-- TTTAAATAGA 3070 het 3070 hom 27 11 15 3 T 5 3 350924 CASAVA_Build 9 132470185 2D TAGTACAGAC AT/-- ATTAAAACAC 3021 het 3021 ref 27 15 7 6 AT 2 1 350925 CASAVA_Build 9 132472104 1D TTTGGAGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 A 10 9 350926 CASAVA_Build 9 132563007 1D CTGGTTCATG T/- TTTTTTTTTT 1077 het 1077 ref 20 10 3 7 T 13 12 350927 CASAVA_Build 9 132570616 1I GCACCTGTAG -/T CTCTACTACT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 0 1 350928 CASAVA_Build 9 132611431 1D ATTTAATGCG T/- TTTTTTTTTT 2541 het 2541 ref 27 10 7 10 T 13 12 350929 CASAVA_Build 9 132616839 2I AGCTGTAGAA --/TC TCTGCCACAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TC 1 2 350930 CASAVA_Build 9 132635366 12D TTCTACCAGT TGTCTCTCTCTC/------------ TGTCTCTCTC 3070 het 2791 hom 24 9 10 7 TGTCTCTCTCTC 2 1 350931 CASAVA_Build 9 132647272 5D TTCTTTTTCT TTTTC/----- TTTTTTTTTT 341 het 341 ref 35 18 4 13 TTTTC 1 0 350932 CASAVA_Build 9 132666137 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 23 1 18 4 T 13 12 350933 CASAVA_Build 9 132667304 1D TCCTTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1932 het 1932 ref 32 14 8 10 T 15 14 350934 CASAVA_Build 9 132693530 3D GCCTCAGCCT CCC/--- CCCAAAGGGC 3070 hom 29 het 16 0 13 3 C 6 3 350935 CASAVA_Build 9 132697336 1I CTTCTAAATA -/T TTTTTTTTTT 3034 het 2016 hom 21 8 8 5 T 14 15 350936 CASAVA_Build 9 132700867 5D TCTTTCTTCC CTCTT/----- CTCTTCTCTT 2829 hom 28 het 14 0 8 6 CTCTT 4 3 350937 CASAVA_Build 9 132765206 3D GCTTGAGCCC AGG/--- AGTTCGCCAC 3070 het 3070 ref 28 14 12 4 AGG 1 0 350938 CASAVA_Build 9 132776533 4D TCTTGAAATC AGTG/---- AGACCAAGAA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 AGTG 1 0 350939 CASAVA_Build 9 132778026 6D GGGGGCAGAG TCTTAA/------ TCTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 TCTTAA 1 0 350940 CASAVA_Build 9 132778672 12D CGTTTGCCAA TGCTCTGAGCCC/------------ TGCTCTGAGC 3070 het 1680 hom 28 8 11 10 TGCTCTGAGCCC 2 1 350941 CASAVA_Build 9 132782014 1D TAGGCAAAAA G/- GGGTGGGGAG 3022 het 2044 hom 25 10 9 7 G 4 3 350942 CASAVA_Build 9 132800300 4D AGGGCCTCCC TAAA/---- TAGTCACTGA 3070 hom 93 het 32 0 32 1 TAAA 1 0 350943 CASAVA_Build 9 132807807 1D GGTGGTGCAC T/- CCTGTAATCC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 1 0 350944 CASAVA_Build 9 132809462 1D GAAAACTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 19 10 T 13 12 350945 CASAVA_Build 9 132811668 8I TACTTCTACT --------/AAAAATAC AAAAATTAGC 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AAAAATAC 0 1 350946 CASAVA_Build 9 132812846 1D ATGCCCTTAT A/- AAAAAAATGG 3070 hom 151 het 59 0 47 13 A 8 7 350947 CASAVA_Build 9 132820514 3D TCATCATCAT CAG/--- CACCATCACC 1356 het 1356 ref 49 14 11 26 CAG 1 0 350948 CASAVA_Build 9 132854047 1I ATTACACACA -/C CCCCCCCTCC 3070 hom 83 het 31 0 26 5 C 7 8 350949 CASAVA_Build 9 132864744 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1022 het 34 hom 8 1 3 5 T 20 18 350950 CASAVA_Build 9 132867951 18I CCCCATATAT ------------------/ACATATATATATATATAC ACATATATAT 3070 hom 48 het 18 0 17 2 ACATATATATATATATAC 0 1 350951 CASAVA_Build 9 132872165 1I TTACATTAAA -/T TGATATTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 2 350952 CASAVA_Build 9 132905224 1I ATTTAGAAGC -/T TTTTTTTTTT 2646 het 698 hom 23 3 8 12 T 17 18 350953 CASAVA_Build 9 132915986 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 22 0 20 2 A 13 12 350954 CASAVA_Build 9 132917007 23D GGGAAAGACC ACTGGGAAAGGAGGAGGGAGGGT/----------------------- ACTGGGAAAG 3070 het 3070 ref 42 23 13 15 ACTGGGAAAGGAGGAGGGAGGGT 2 1 350955 CASAVA_Build 9 132919023 1I ACTGGGCGAC -/A AGAGCCAGAC 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 A 1 2 350956 CASAVA_Build 9 132921249 1D CAAAAAATTT A/- AAAAATTAGC 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 6 5 350957 CASAVA_Build 9 132923320 7D TTATTTTATG TTTTATT/------- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 9 TTTTATT 2 1 350958 CASAVA_Build 9 132924764 7D GCAAGCACAA CCACACG/------- CCACACGCCA 1363 het 1363 ref 26 17 6 3 CCACACG 2 1 350959 CASAVA_Build 9 132927094 1D TCCCATCTCT A/- AAAAAAACAC 3070 het 1545 hom 18 4 11 3 A 8 7 350960 CASAVA_Build 9 132932994 1I GGCTGTGCCT -/G GTGACCCTCG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 G 1 2 350961 CASAVA_Build 9 132951604 1D TTTGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1807 het 1807 ref 26 17 5 4 T 12 11 350962 CASAVA_Build 9 132955141 1D37M1D AGGAAACTGA GGTGAGGAGAGTTTATTTTTATTTTTTATTTATTTTTGT/-GTGAGGAGAGTTTATTTTTATTTTTTATTTATTTTTG- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 30 24 13 9 N/A 0 0 350963 CASAVA_Build 9 132956081 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 2857 het 1312 hom 13 4 8 1 A 7 6 350964 CASAVA_Build 9 132957132 2I TGTGGATAGT --/CA CACTCCCTGC 3070 hom 96 het 40 0 25 15 CA 1 2 350965 CASAVA_Build 9 132960581 1I ACAGCCACAG -/A AAAAATGATG 3070 hom 48 het 18 0 15 3 A 5 6 350966 CASAVA_Build 9 132974361 4D ATGCTAGCAC AGTG/---- AGTGCTGTGT 3070 het 3070 ref 36 14 12 12 AGTG 2 1 350967 CASAVA_Build 9 132975714 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 397 hom 26 2 13 11 T 16 15 350968 CASAVA_Build 9 132984380 1D TACAGCATTG C/- CCCAGGGCAG 3070 hom 123 het 44 0 41 3 C 4 3 350969 CASAVA_Build 9 132986282 1I CTGGGGTTTT -/G GGGGGAAAGG 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 G 5 6 350970 CASAVA_Build 9 132987683 1I CTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2830 het 2830 ref 46 19 12 15 T 10 11 350971 CASAVA_Build 9 132990589 1D GAAGAGAGAC T/- TAACACTAGG 3070 het 2819 hom 29 9 13 7 T 2 1 350972 CASAVA_Build 9 132991759 1D AGAATAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2435 hom 29 8 13 8 T 15 14 350973 CASAVA_Build 9 132998513 2D TGTGTTTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 1301 het 1301 ref 32 18 6 8 T 18 16 350974 CASAVA_Build 9 133022357 4D TGTTTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 515 het 515 ref 32 9 4 20 TTTG 1 0 350975 CASAVA_Build 9 133043912 1I TGCAGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1033 hom 44 7 22 15 T 16 17 350976 CASAVA_Build 9 133080792 1D ATCAGAGCTG C/- AGGGAGAGGA 3070 hom 96 het 36 0 33 7 C 1 0 350977 CASAVA_Build 9 133091833 1I TTTTTAGCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 829 hom 38 2 26 10 T 10 11 350978 CASAVA_Build 9 133112429 1I GTAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2308 het 2308 ref 35 23 5 7 A 14 15 350979 CASAVA_Build 9 133120035 5I ACTCCGTCTC -----/AAAAA AAAAAAAAAA 1767 hom 24 het 19 0 8 11 A 11 16 350980 CASAVA_Build 9 133123341 1I TGTTTTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 25 3 19 3 A 11 12 350981 CASAVA_Build 9 133139815 1D GGGTTACTGT G/- ATCCTCATGT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 G 1 0 350982 CASAVA_Build 9 133158455 1D GCAGGTCGGG C/- ATATCACCCG 3070 het 3070 hom 29 11 11 7 C 1 0 350983 CASAVA_Build 9 133164419 10D GATCCTAGTG AGTGGAGGCC/---------- AGTGGAGGCT 3070 hom 72 het 23 0 23 3 AGTGGAGGCC 1 0 350984 CASAVA_Build 9 133170594 1D GCCCATCTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 9 350985 CASAVA_Build 9 133171684 5I CGGGAGGTGG -----/AAGTT GCAGTGAGCC 3070 hom 48 het 18 0 14 4 AAGTT 0 1 350986 CASAVA_Build 9 133178942 1D GGGTCTGTCA G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 45 het 20 0 15 6 G 8 7 350987 CASAVA_Build 9 133188405 4I TTATTAACTT ----/TTTC TTTTTCTTTT 2856 het 182 hom 18 2 6 10 TTTC 0 1 350988 CASAVA_Build 9 133188837 1D GCACAAGCAC A/- GGGGAAATGG 3070 het 3070 ref 44 23 13 8 A 1 0 350989 CASAVA_Build 9 133198190 4D CAGTAAATGT TTTG/---- TTTTTGTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TTTG 1 0 350990 CASAVA_Build 9 133210806 5I ATGGCAGGAT -----/CTTGG CTCACTGCAA 2481 hom 15 het 11 0 6 5 CTTGG 0 1 350991 CASAVA_Build 9 133211252 2I CTGGGCTCAG --/GT GTGATCCTCC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 GT 1 2 350992 CASAVA_Build 9 133245502 6D TTCTTAAGCT GGGCAC/------ GGGCACGGTG 1510 hom 15 het 6 0 6 0 GGGCAC 2 1 350993 CASAVA_Build 9 133252617 1D CCACTGACTC A/- AATGTTAATC 3070 hom 69 het 24 0 19 5 A 3 2 350994 CASAVA_Build 9 133262772 5D CTTTTGAGGG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 35 1 23 11 T 21 16 350995 CASAVA_Build 9 133269801 1I ACTCTCTCTG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 317 hom 35 1 25 9 A 9 10 350996 CASAVA_Build 9 133277179 1D AGCTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 532 hom 35 4 20 11 T 15 14 350997 CASAVA_Build 9 133281830 1I ACCCAGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1472 hom 61 5 48 8 T 10 11 350998 CASAVA_Build 9 133300822 15D GACTCCATCT AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 21 11 A 25 10 350999 CASAVA_Build 9 133306044 12I TGAGGGCTGG ------------/ACATGGTGACTC ACACCTGTAA 3070 hom 108 het 36 0 37 1 ACATGGTGACTC 0 1 351000 CASAVA_Build 9 133307189 1D TGGTGTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 11 10 351001 CASAVA_Build 9 133309656 1D GGAAACGTGG C/- TCTTTGACTC 3070 hom 126 het 43 0 38 6 C 1 0 351002 CASAVA_Build 9 133317288 28D TTCCTAAAGA ATAAGATTGGTATTTTTGTAAGATCAGT/---------------------------- ATAAGATTGG 3070 hom 62 het 27 0 21 13 ATAAGATTGGTATTTTTGTAAGATCAGT 2 1 351003 CASAVA_Build 9 133317832 4I GAATTGAATT ----/GTTA GTTTTATTAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GTTA 0 1 351004 CASAVA_Build 9 133331833 1I CTATCAGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 25 3 T 10 11 351005 CASAVA_Build 9 133332309 1I GCGCCTGTCA -/T TTTTTTGTAC 841 het 841 ref 10 4 3 3 T 6 7 351006 CASAVA_Build 9 133334544 5D TCCATCTCAA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 1483 hom 18 5 12 2 AAAAT 4 3 351007 CASAVA_Build 9 133338640 1D TAACTTCTTT G/- GGCCTTTGGT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 G 3 2 351008 CASAVA_Build 9 133343439 2D TGTCCGAGGT CA/-- CACACAGCTG 3070 hom 89 het 34 0 29 6 CA 4 3 351009 CASAVA_Build 9 133344820 1I TTGCCTAAAA -/T TTGGTAGAAG 3070 hom 125 het 50 0 41 9 T 2 3 351010 CASAVA_Build 9 133351800 2I ACTGGCATAC --/TT TTTCTGTGCT 3070 hom 105 het 37 0 35 2 T 3 5 351011 CASAVA_Build 9 133358361 8D CCCTCCCTCT GCCCCACC/-------- GCCCTTTGCC 3070 hom 96 het 35 0 32 5 GCCCCACC 1 0 351012 CASAVA_Build 9 133359078 1D GACCGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 1039 het 1039 ref 36 23 6 8 T 11 10 351013 CASAVA_Build 9 133370295 4D CATGTTCTTT TTTG/---- TTTAACTTTT 3070 hom 62 het 25 0 21 4 TTTG 1 0 351014 CASAVA_Build 9 133378162 1I CAGAAGGATT -/C CCTTGGCAGT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 C 2 3 351015 CASAVA_Build 9 133382444 1I GCTGATGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 33 1 19 13 T 13 14 351016 CASAVA_Build 9 133389822 4D AGTTATGTGT GTGA/---- GTGTGTAAGA 3070 het 3070 ref 56 28 26 5 GTGA 1 0 351017 CASAVA_Build 9 133393382 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1652 hom 40 5 26 9 A 13 14 351018 CASAVA_Build 9 133409585 1D CCCAGGAAGA T/- TTTTATTTCC 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 5 4 351019 CASAVA_Build 9 133424438 1I GATCACCTGA -/G GTCAGGAGTT 3070 hom 89 het 35 0 28 7 G 1 2 351020 CASAVA_Build 9 133424992 1D CAAAACTACT A/- AAAGGCATTA 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 A 4 3 351021 CASAVA_Build 9 133429961 1I ATCACTTGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2631 hom 19 9 8 2 T 9 10 351022 CASAVA_Build 9 133430859 1D CTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1595 het 399 hom 20 3 5 12 T 19 18 351023 CASAVA_Build 9 133430967 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGCCTCAGT 3070 het 2046 hom 17 5 11 1 CTC 1 0 351024 CASAVA_Build 9 133435722 1I ATATGAGGTA -/T TTTTTTGGTT 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 T 6 7 351025 CASAVA_Build 9 133439667 1I CATACCCGGG -/T TTTTTTTTTT 1332 het 502 hom 16 4 7 5 T 15 16 351026 CASAVA_Build 9 133457400 1D ATCTAGAGGG A/- AAAAACAATG 3070 hom 96 het 39 0 32 7 A 6 5 351027 CASAVA_Build 9 133467209 1D TGCTCAGGCA G/- GCCTCATGAG 1987 het 1987 ref 38 17 7 14 G 2 1 351028 CASAVA_Build 9 133470972 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 24 1 14 9 T 15 14 351029 CASAVA_Build 9 133477640 2D CAGCTGCATC AG/-- AGTGGTTGCT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 AG 2 1 351030 CASAVA_Build 9 133478462 1D AAAACACGGT G/- GGGGAGAAGA 3070 het 3070 hom 39 19 17 4 G 5 4 351031 CASAVA_Build 9 133487993 9D TTTTTTTTTT GAGACAGAG/--------- TTTCGCTCTT 1378 het 1378 ref 26 8 9 13 GAGACAGAG 1 0 351032 CASAVA_Build 9 133492211 7I CAGATCACCT -------/GAGGTCA AGAGTTCAAG 3070 hom 31 het 12 0 10 2 GAGGTCA 0 1 351033 CASAVA_Build 9 133496378 3D TTGTGTCAAC CTT/--- CTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 5 CTT 2 1 351034 CASAVA_Build 9 133497127 2I CCACTTCAGA --/CT CAGCCTCTCC 3070 het 3070 ref 48 27 14 7 CT 0 1 351035 CASAVA_Build 9 133505810 2D ACGAGTGTGA CT/-- CTCGCTCTCA 3070 het 3070 ref 29 11 9 10 CT 2 1 351036 CASAVA_Build 9 133517446 1I CTTTTAATTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 A 8 9 351037 CASAVA_Build 9 133524717 1I GTGAGCCATC -/A ACGCCAGGCC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 1 2 351038 CASAVA_Build 9 133528662 1I TCTCTATAGC -/T TTTTTTTTTT 1267 het 1267 ref 36 11 5 20 T 17 18 351039 CASAVA_Build 9 133529763 1D GCTCCCTTCC A/- CAACAGTGAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 1 0 351040 CASAVA_Build 9 133559023 1I CACTGCCACC -/A ACCCTTATCT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 A 1 2 351041 CASAVA_Build 9 133562405 4I TCCCTTCTCG ----/CTCC CTCCCTCCCT 3070 hom 85 het 34 0 26 8 CTCC 2 3 351042 CASAVA_Build 9 133568793 1D GAAATTAAGT A/- ACTTGCTGAA 3070 het 3070 ref 41 21 15 7 A 2 1 351043 CASAVA_Build 9 133573938 4I GATATTTCTT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 TTTC 3 4 351044 CASAVA_Build 9 133591804 43D GCTGCACTCC AGCCTGGGGGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAGAAAAAAAAAA/------------------------------------------- AGAAAGGAAG 3070 hom 33 het 11 0 12 3 AGCCTGGGGGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAGAAAAAAAAAA 1 0 351045 CASAVA_Build 9 133593021 1D TCATGAACAG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 8 7 351046 CASAVA_Build 9 133597450 1D AGGCCAACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 32 0 24 8 A 13 12 351047 CASAVA_Build 9 133597899 5I CATCCTAATT -----/GGCAA GGCAATTTGA 3070 hom 112 het 40 0 37 3 GGCAA 1 2 351048 CASAVA_Build 9 133603098 3D GCGTGAACCC AGG/--- AGGAGGCGGA 3070 hom 23 het 11 0 9 2 AGG 3 2 351049 CASAVA_Build 9 133603176 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 11 3 A 17 16 351050 CASAVA_Build 9 133603449 5D ATATAAAAAG ATATA/----- ATATAATCTT 3070 hom 24 het 10 0 9 1 ATATA 2 1 351051 CASAVA_Build 9 133609848 1D ATCTATTGGT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 9 8 351052 CASAVA_Build 9 133621165 4I CGCCCCCCCC ----/CCCA CCCAACCACC 1408 hom 14 het 7 0 5 2 CCCA 1 2 351053 CASAVA_Build 9 133632878 1D TTTTTTTTTT C/- GTATTTTTAG 2297 hom 18 het 7 0 7 0 C 1 0 351054 CASAVA_Build 9 133633034 1I AAATTCTAGT -/A AATGCAAACT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 2 3 351055 CASAVA_Build 9 133645867 1D GCCCCCGCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 22 2 14 6 A 12 11 351056 CASAVA_Build 9 133663100 1D TCAAAATCCC T/- GAGTTTGATT 3070 het 3070 ref 52 24 23 6 T 1 0 351057 CASAVA_Build 9 133664949 1I ACTCATTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 13 17 15 T 13 14 351058 CASAVA_Build 9 133666027 1D GATAGGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 14 9 T 11 10 351059 CASAVA_Build 9 133678499 3D AGCTTCTCCA CTG/--- CCTAGCGGTG 3070 het 3070 ref 40 21 16 4 CTG 1 0 351060 CASAVA_Build 9 133687563 1D TATTTTCCAT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 2395 hom 19 7 10 2 A 1 0 351061 CASAVA_Build 9 133688614 1I TGTGCTTTTG -/C AGGGAGAGAG 3070 het 3070 hom 52 22 17 13 C 0 1 351062 CASAVA_Build 9 133691993 2D GCGGGGTGCT AA/-- GAGAGGGCAC 3070 het 3070 ref 37 22 9 6 A 2 0 351063 CASAVA_Build 9 133693934 2D TTGGTAGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 31 3 16 12 T 13 11 351064 CASAVA_Build 9 133716233 1D TCTAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 1507 het 165 hom 16 2 6 8 T 15 14 351065 CASAVA_Build 9 133719145 2D AAAAAAAAAG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AT 7 6 351066 CASAVA_Build 9 133719382 1I ATAAAAAGTG -/A AAAAAATCCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 6 7 351067 CASAVA_Build 9 133721318 1I TTTAGTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 16 12 3 A 10 11 351068 CASAVA_Build 9 133726976 12D TAAATGGTTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 21 9 351069 CASAVA_Build 9 133763310 1D GCAGGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1626 het 1580 hom 34 11 7 17 T 17 16 351070 CASAVA_Build 9 133771659 7I GGAACAGAAA -------/GGGGGTC GGAGGTCGGA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 GGGGGTC 0 1 351071 CASAVA_Build 9 133784669 1I CTTCAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 10 11 351072 CASAVA_Build 9 133797517 1D AAGGAAACTG A/- AAAAATTTCT 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 6 5 351073 CASAVA_Build 9 133797591 1I CTAATTAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 923 hom 39 3 30 6 A 11 12 351074 CASAVA_Build 9 133803038 1D TGAGGCAGAC T/- TTTTTTTTTT 1701 het 1701 ref 19 5 5 9 T 14 13 351075 CASAVA_Build 9 133809739 1D GTTTTTAGTC T/- TTTTTTTTTT 2681 het 913 hom 22 7 8 8 T 15 14 351076 CASAVA_Build 9 133811187 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAG 3070 het 1440 hom 36 11 18 7 C 0 1 351077 CASAVA_Build 9 133813711 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1320 hom 32 8 18 7 A 12 11 351078 CASAVA_Build 9 133824509 1I CACATTTCCT -/A GTACAACACA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 0 1 351079 CASAVA_Build 9 133844692 3D AAGCTGTTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 15 hom 31 1 16 16 A 21 18 351080 CASAVA_Build 9 133850906 1D ATTTTAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 12 11 351081 CASAVA_Build 9 133854095 1D TTTGGCTGCG C/- CGAGGGTGAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 2 1 351082 CASAVA_Build 9 133858439 1D GTTATTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 37 0 31 6 T 13 12 351083 CASAVA_Build 9 133884120 1D ATTCACTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 T 10 9 351084 CASAVA_Build 9 133886628 3D CATCATAGGG ATT/--- ATTATTTGTA 3070 hom 144 het 52 0 48 5 ATT 3 2 351085 CASAVA_Build 9 133890391 1D TTAGAGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 737 hom 26 2 13 12 T 15 14 351086 CASAVA_Build 9 133917787 1D TCTCTCTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 10 9 351087 CASAVA_Build 9 133935895 15D GTGTGCACAA ATATCTGCCTGGGGC/--------------- AGAATATGCC 3070 hom 60 het 19 0 21 1 ATATCTGCCTGGGGC 1 0 351088 CASAVA_Build 9 133938977 1I ATCAAACGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 12 12 16 A 12 13 351089 CASAVA_Build 9 133946994 1D ACTAAAAAGA C/- AAAAAATTAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 1 0 351090 CASAVA_Build 9 133953841 4D GGTGACAGAA AGAG/---- ACTTTGTCTC 3070 het 3070 hom 30 12 14 7 AG 2 0 351091 CASAVA_Build 9 133959951 3D GAGTTTATTA AGG/--- AGAATTGACT 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 AGG 1 0 351092 CASAVA_Build 9 133964715 3D CTCTGAGTCA TGT/--- TGTATTACAT 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 TGT 2 1 351093 CASAVA_Build 9 133967251 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 9 6 A 12 11 351094 CASAVA_Build 9 133970489 3D ACTCCGTTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2332 het 1973 hom 27 13 9 7 A 19 16 351095 CASAVA_Build 9 133971413 1I TCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1104 het 638 hom 19 3 6 10 T 15 16 351096 CASAVA_Build 9 134005043 1D TTTTTTTTTT C/- CTTTAAGGTG 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 C 2 1 351097 CASAVA_Build 9 134019130 1I CTCCACCAGT -/A AAAAAAAAAA 1960 het 1954 hom 24 9 9 6 A 13 14 351098 CASAVA_Build 9 134039535 4I CGGACGGACG ----/GACA GACAGACAGA 3070 het 2487 hom 65 16 18 31 GACA 3 4 351099 CASAVA_Build 9 134040113 12D CTGGGCGACA GAGCAAGACTCT/------------ GTCTCAAAAA 1768 het 1768 ref 14 6 6 4 GAGCAAGACTCT 1 0 351100 CASAVA_Build 9 134041393 1I CCCATCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2593 hom 19 7 9 3 A 11 12 351101 CASAVA_Build 9 134043995 6D CTAAAAATAC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1323 het 305 hom 9 2 5 3 A 20 14 351102 CASAVA_Build 9 134056767 1I TATGTTAACT -/G CATCTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 G 0 1 351103 CASAVA_Build 9 134078903 1D ATGAAAAATG T/- TTTTTCCCAA 3070 het 3070 hom 43 12 25 6 T 6 5 351104 CASAVA_Build 9 134080083 1D TCAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 872 hom 18 4 13 1 T 14 13 351105 CASAVA_Build 9 134080286 2D TGTAGAGATT GG/-- GGGGGGGGGT 2421 het 1291 hom 19 5 8 6 G 11 9 351106 CASAVA_Build 9 134080695 1D GGCTGAGGCA G/- GATAATTGCT 2473 het 1527 hom 13 4 6 3 G 2 1 351107 CASAVA_Build 9 134165532 1D AATTGGCCAC A/- AAACCAAGGA 3070 het 3070 hom 45 15 24 7 A 4 3 351108 CASAVA_Build 9 134166908 1D ACTCTTACTT C/- TCATGATGTT 3070 het 3070 ref 50 28 16 6 C 1 0 351109 CASAVA_Build 9 134179139 1D AGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 14 10 T 11 10 351110 CASAVA_Build 9 134188053 4I TAAAATTATC ----/ATTA ATAAACTTTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATTA 0 1 351111 CASAVA_Build 9 134198106 2I GGTGGGTGAT --/AG AGTGAGATCC 3070 het 23 hom 21 1 15 5 AG 1 2 351112 CASAVA_Build 9 134200689 1D GAAAATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 25 1 19 5 T 13 12 351113 CASAVA_Build 9 134201431 2D AGCCTGGGCA AC/-- AGAGTGAGAC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 AC 1 0 351114 CASAVA_Build 9 134205756 4D AGAAAAACGT ACTC/---- ACTCACTGCC 3070 hom 106 het 39 0 33 10 ACTC 2 1 351115 CASAVA_Build 9 134213947 1I CAGCCTGGGC -/A AAAATAATAA 3070 hom 57 het 22 0 20 3 A 4 5 351116 CASAVA_Build 9 134218839 1I AACTCCTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1004 hom 36 3 26 7 A 11 12 351117 CASAVA_Build 9 134219704 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1122 het 281 hom 15 3 6 7 A 16 15 351118 CASAVA_Build 9 134222155 1D TAAAATATAA T/- TTTTTTTTTT 2858 het 192 hom 25 4 11 10 T 15 14 351119 CASAVA_Build 9 134231788 2D TTCCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 31 1 27 3 T 15 13 351120 CASAVA_Build 9 134235473 5D GTGGAGGTGG CTAGA/----- CTAGAGTCCA 3070 hom 100 het 36 0 30 9 CTAGA 2 1 351121 CASAVA_Build 9 134238046 2I GTTCAGGAAG --/CA GTGATTGTGG 3070 hom 108 het 40 0 36 4 CA 0 1 351122 CASAVA_Build 9 134248274 2D AATCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 18 0 13 5 A 13 11 351123 CASAVA_Build 9 134250988 13I GTTCCTACTC -------------/AGGCACTACGTTT TGTGCCTGGT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 AGGCACTACGTTT 0 1 351124 CASAVA_Build 9 134252711 13D AAGAGGATCA GGAAACCCACAGT/------------- GAGCCTTAGG 3070 het 3070 ref 35 18 16 6 GGAAACCCACAGT 1 0 351125 CASAVA_Build 9 134256617 1I TTTGGTCTGG -/C CCACAGAATG 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 2 3 351126 CASAVA_Build 9 134261883 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 26 3 19 4 T 13 12 351127 CASAVA_Build 9 134263581 1I GTTAATAATG -/A ACAAAAGCAA 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 1 2 351128 CASAVA_Build 9 134272432 1D TCACTGAGGA G/- GTGACATTTG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 2 1 351129 CASAVA_Build 9 134272808 2D CTGAAGAGAC TT/-- AGCCAAAAGG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 2 0 351130 CASAVA_Build 9 134283100 2I ATTTTCCCCC --/CT TTCTGCTCTC 3070 hom 172 het 62 0 58 4 CT 0 1 351131 CASAVA_Build 9 134286819 76D CATTAGACTT GAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG/---------------------------------------------------------------------------- GAGAATCCTG 3070 hom 87 het 31 0 30 5 GAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG 1 0 351132 CASAVA_Build 9 134298759 1D TATTCATTCA T/- TTTTTTTTTT 2288 het 1297 hom 27 6 8 13 T 15 14 351133 CASAVA_Build 9 134320219 1D AACATCCTAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 53 22 24 7 A 9 8 351134 CASAVA_Build 9 134323886 24I TGGCTAGTGA ------------------------/GACTGAAGAATAAATATCTAACTT GACTTAATTA 3070 het 3070 hom 32 14 12 7 GACTGAAGAATAAATATCTAACTT 0 1 351135 CASAVA_Build 9 134348480 5D ACTCTGTCTT AAAAC/----- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 30 15 15 4 AAAAC 1 0 351136 CASAVA_Build 9 134370002 4D TGGAAAGCCT CCAC/---- CCACCTTGCA 3070 het 3070 ref 44 21 20 6 CCAC 2 1 351137 CASAVA_Build 9 134379244 4D CACGGGTGAC AGTG/---- AGGAGATCCC 3070 het 3070 ref 49 22 22 7 AGTG 1 0 351138 CASAVA_Build 9 134434629 1D GAGGGTGGTA G/- GGGGGAAAAG 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 G 6 5 351139 CASAVA_Build 9 134437092 2D CTCCCTTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 1513 het 1513 ref 22 10 5 7 T 16 14 351140 CASAVA_Build 9 134442855 5I CAAAAAAAAA -----/AAAAC ACACATAAGA 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 AAAAC 0 1 351141 CASAVA_Build 9 134458971 1I CCAAGGATCT -/G GGGGGGATCT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 G 6 7 351142 CASAVA_Build 9 134462199 2I AATGGCACTC --/AT AGGTGTGAGG 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 AT 0 1 351143 CASAVA_Build 9 134490710 1D AAAGACGAGG A/- AAAAAAAAAA 1192 het 1192 ref 38 25 3 10 A 12 11 351144 CASAVA_Build 9 134526396 3D AAGAAATCAA GAG/--- GAGCCTGAAG 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 GAG 2 1 351145 CASAVA_Build 9 134537712 4D GTCATGAACA TAAT/---- TAATTATTGT 3070 hom 192 het 69 0 64 7 TAAT 2 1 351146 CASAVA_Build 9 134572625 1I ATTGGGTATG -/A AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 36 16 18 2 A 6 7 351147 CASAVA_Build 9 134592930 2D GAGCCTGTGT CC/-- CCCCAACCGC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 6 4 351148 CASAVA_Build 9 134594113 1D ATATGAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1283 hom 30 4 13 13 T 12 11 351149 CASAVA_Build 9 134597362 1D TTAATATCTC A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 39 17 17 5 A 8 7 351150 CASAVA_Build 9 134600410 1D TGGGATCCCC T/- GACCCACCCT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 T 1 0 351151 CASAVA_Build 9 134611395 2I CTTCCAAGCC --/AA AGTCTGGCAT 3070 het 3070 hom 52 18 22 12 A 1 3 351152 CASAVA_Build 9 134625180 1I AACAATTTGG -/A AATTTTAATT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 A 2 3 351153 CASAVA_Build 9 134662809 1D GATGCAACAA G/- GGTGGCCACA 3070 het 3070 hom 43 15 23 6 G 3 2 351154 CASAVA_Build 9 134670837 1D AGTCTAGTGT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 8 7 351155 CASAVA_Build 9 134677362 10D AATGGGAATT TGGAGAGAAA/---------- TGGAGAGAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 TGGAGAGAAA 2 1 351156 CASAVA_Build 9 134685421 1I TGCTCACTGT -/A AAAAAAAAAA 2080 het 1700 hom 23 8 7 8 A 15 16 351157 CASAVA_Build 9 134711113 1I GAAATTTTTT -/A AAAAATCACG 3070 het 3070 hom 35 14 21 0 A 5 6 351158 CASAVA_Build 9 134725489 2I CTCTGGCTGG --/GC CCTGGTGGAA 3070 het 3070 ref 32 20 11 1 GC 0 1 351159 CASAVA_Build 9 134735069 1D ACGAGGCAGA G/- GGCTCGTGTG 1445 het 1445 ref 33 16 4 13 G 3 2 351160 CASAVA_Build 9 134736099 2D GCCTCCCGCA CT/-- CTTCTAGGAC 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 CT 2 1 351161 CASAVA_Build 9 134737567 1D GGGAGAAAAT A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 8 7 351162 CASAVA_Build 9 134738932 1D ACCCACTCGG C/- CTCAGGGTGG 1645 het 1645 ref 27 12 5 11 C 2 1 351163 CASAVA_Build 9 134758550 1D TTTGGGTTTG T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 8 7 351164 CASAVA_Build 9 134765540 1I CATTAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 20 5 A 11 12 351165 CASAVA_Build 9 134769828 7D GGAGAAGCCT ACACTGG/------- ACACAATGGG 2988 het 2988 ref 25 12 9 5 ACACTGG 1 0 351166 CASAVA_Build 9 134770392 3I CAAAATAGAA ---/AAT AATAATAATA 3070 het 3070 ref 48 24 15 9 AAT 5 6 351167 CASAVA_Build 9 134772769 1I ACAATCTCGG -/C CTCACTGCAA 3070 het 561 hom 18 3 10 6 C 1 2 351168 CASAVA_Build 9 134773346 4I CCCAAGAGCT ----/TTTG TTTACGAGGC 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 TTTG 0 1 351169 CASAVA_Build 9 134781645 1D ACTTACTATT A/- ATGGGAAGTG 3070 het 3070 hom 33 15 15 5 A 2 1 351170 CASAVA_Build 9 134798653 1D AAAGCTGGGG T/- TTTTTTTGTT 3070 het 2270 hom 20 7 10 3 T 8 7 351171 CASAVA_Build 9 134808440 1I CTTTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 14 15 351172 CASAVA_Build 9 134813124 2I GTATTTGAAC --/AT AGTTTGAACA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 AT 0 1 351173 CASAVA_Build 9 134827774 1D AAACAAAAGC A/- AAAATCATCC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 5 4 351174 CASAVA_Build 9 134839340 4I GGAGAGAGAG ----/TCAT TCATTCATTC 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 TCAT 4 5 351175 CASAVA_Build 9 134878008 4D GAGAAGACAG AGAA/---- AGAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 AGAA 1 0 351176 CASAVA_Build 9 134880737 1D GATGGCAGTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 54 24 20 10 T 8 7 351177 CASAVA_Build 9 134881432 3I AAAGAAAGAT ---/AAC AAGTCATGTA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 AAC 0 1 351178 CASAVA_Build 9 134881659 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 7 T 11 10 351179 CASAVA_Build 9 134889841 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 266 hom 20 1 17 2 A 10 11 351180 CASAVA_Build 9 134890495 6I AGATCATAGA ------/TATGAT TATATGTAAG 3070 het 3070 ref 18 11 7 0 TATGAT 0 1 351181 CASAVA_Build 9 134925640 4D TGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 28 10 15 5 AAAC 3 2 351182 CASAVA_Build 9 134952573 4D CTGTCTGGCG TCTT/---- TCTTTGCTCT 3070 het 3070 ref 35 16 12 8 TCTT 2 1 351183 CASAVA_Build 9 134955835 1D CAGTCACCTC A/- GGGGGCTGCG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 1 0 351184 CASAVA_Build 9 134956803 1D ACAGATACTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 128 het 51 0 43 8 T 10 9 351185 CASAVA_Build 9 134958333 2I CCTCAAACCC --/TG TTACGTCGGC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TG 0 1 351186 CASAVA_Build 9 134959834 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 24 0 18 7 A 12 11 351187 CASAVA_Build 9 134962225 1I GATAGTTTTC -/T TTTCTTCCAG 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 T 3 4 351188 CASAVA_Build 9 134964693 1I TAATGGTGGG -/A AGGTGGTGTT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 1 2 351189 CASAVA_Build 9 134983785 1D GGACCTCCCC A/- AAACCTGCTG 3070 het 3070 ref 55 27 20 9 A 4 3 351190 CASAVA_Build 9 134986800 3D GTACGTGCTG ATC/--- ATGTGTGGGG 3070 het 3070 ref 36 16 14 7 ATC 1 0 351191 CASAVA_Build 9 134987145 1I GGGCCCTACC -/A TTTTTGGGGC 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 0 1 351192 CASAVA_Build 9 135006666 1I TGGGAGCCCA -/G AGGGCAGGGC 3070 hom 62 het 25 0 19 6 G 0 1 351193 CASAVA_Build 9 135006767 2I CCCAGCAATA --/AG AGCGCTGAGC 3070 het 1565 hom 30 7 15 8 AG 1 2 351194 CASAVA_Build 9 135030946 1I TTTTACTTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 329 hom 30 1 26 3 T 9 10 351195 CASAVA_Build 9 135031687 1I CGGTGTGGAG -/C CCCCCCCCAC 2474 hom 24 het 9 0 9 0 C 8 9 351196 CASAVA_Build 9 135049012 3D TCTCTGTTTT TTG/--- TTTTGTTTTG 695 hom 15 het 14 0 6 8 TTG 1 0 351197 CASAVA_Build 9 135051670 1I GCACTTTGGG -/A GGCCGAGGCG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 0 1 351198 CASAVA_Build 9 135062811 1D GACTCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1656 het 1656 ref 25 14 4 7 A 13 12 351199 CASAVA_Build 9 135067471 1I GCTGTCATAG -/C CCCTTGGTTC 3070 hom 65 het 26 0 20 6 C 3 4 351200 CASAVA_Build 9 135072156 8D TTAGGACGCT TAAGGTGA/-------- CCCTCCCCCT 548 het 548 ref 23 17 3 5 TAAGGTGA 1 0 351201 CASAVA_Build 9 135092484 1D GCTTTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 16 3 A 11 10 351202 CASAVA_Build 9 135106124 1D CCATGCCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 24 0 13 11 T 13 12 351203 CASAVA_Build 9 135120624 2I GTATGTAATG --/GT GTGTCTCTGT 1331 het 1331 ref 42 20 6 16 GT 2 3 351204 CASAVA_Build 9 135122730 1I GCCAAGGGGT -/C ACCACGAGGA 3070 het 3070 ref 46 24 14 8 C 0 1 351205 CASAVA_Build 9 135123202 3D AGGAGAGAAC GGG/--- GAAGCAGCCC 3070 hom 57 het 22 0 20 3 G 4 1 351206 CASAVA_Build 9 135123404 1D CAGGTAAGCA G/- GGGGTGTGCA 3070 hom 109 het 42 0 32 11 G 5 4 351207 CASAVA_Build 9 135124959 13D CTCCCACATG CTTCTGTCCACAC/------------- GCACACATGT 3070 hom 72 het 27 0 21 8 CTTCTGTCCACAC 1 0 351208 CASAVA_Build 9 135125507 1I AGCCAGGCCC -/A AAAAGGTGAT 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 4 5 351209 CASAVA_Build 9 135128172 1I GAAAAAAAAA -/C AAAAAAACAA 3070 het 2298 hom 34 9 18 7 C 0 1 351210 CASAVA_Build 9 135128429 17D AGTATATTGT TTTTGTTGTTGTTGTTG/----------------- TTTTGTTGTT 1836 het 1836 ref 22 12 6 6 TTTTGTTGTTGTTGTTG 1 0 351211 CASAVA_Build 9 135128587 12D GGTTTACAGG CGCCCACCACTA/------------ CGCCTGGCTA 3070 het 271 hom 15 1 12 2 CGCCCACCACTA 1 0 351212 CASAVA_Build 9 135129729 8D ACTTTGTAAG AAACTGCC/-------- AAACTGTGTT 3070 het 3070 hom 49 22 21 11 AAACTGCC 1 0 351213 CASAVA_Build 9 135131808 1I GGTTTGGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2985 hom 26 10 9 7 T 12 13 351214 CASAVA_Build 9 135132798 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2280 het 20 hom 21 1 8 12 T 17 16 351215 CASAVA_Build 9 135135729 1I TCTACATTAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 8 9 351216 CASAVA_Build 9 135135815 22D53M1I CAAAGTGAGA AGAAGGGAAATTAATAAATATTAGAGTGGAAACCAATGAACTAGAGAACAGAGAGAAAAAGATAAAGTAAAAAAA-/----------------------AGAGTGGAAACCAATGAACTAGAGAACAGAAAGAAAAAGATAAAGTAAAAAAAT ATCAAATGTC 3070 het 3070 ref 36 46 8 9 N/A 0 0 351217 CASAVA_Build 9 135138917 1D CCAACTGCCC A/- GTCCCTGGTC 3070 het 3070 ref 46 22 17 7 A 1 0 351218 CASAVA_Build 9 135139531 1D CAAAGTAAAA C/- ATCTCTCCCC 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 C 1 0 351219 CASAVA_Build 9 135141747 6D CTCCTTCTCA AAAAAT/------ AAAAATAAAA 1940 het 1637 hom 11 4 5 6 AAAAAT 4 3 351220 CASAVA_Build 9 135145870 2D ACTAAAGGAA TT/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 16 2 T 2 0 351221 CASAVA_Build 9 135149717 16I TGTGTCTTAT ----------------/AATAATAAAAGAAATA TTCTTTTCTC 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 AATAATAAAAGAAATA 0 1 351222 CASAVA_Build 9 135150681 1I AATCCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 1852 het 1852 ref 18 8 7 3 A 9 10 351223 CASAVA_Build 9 135165284 1I AAGAAAAAAA -/C AAATACTGAA 3070 hom 97 het 36 0 32 4 C 0 1 351224 CASAVA_Build 9 135168976 1I ACTCAGAGAA -/C GAAACAGCTG 3070 hom 108 het 42 0 33 9 C 0 1 351225 CASAVA_Build 9 135176491 1D GAAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 A 10 9 351226 CASAVA_Build 9 135181333 2D CCGCTGTACT AG/-- AGAGTGAATT 3070 hom 110 het 41 0 37 5 AG 3 2 351227 CASAVA_Build 9 135191978 1D CGTTTTAATG A/- AAAAAAAAAA 2618 het 515 hom 28 5 10 13 A 15 14 351228 CASAVA_Build 9 135197111 13D GCTCCCCCAC AGTGCTCCCCCAT/------------- ACTTCCTGTG 3070 het 3070 hom 34 15 18 3 AGTGCTCCCCCAT 1 0 351229 CASAVA_Build 9 135199222 5D TCATGCGGAA CAGGG/----- CAGGGCAGGG 2641 hom 33 het 19 0 10 9 CAGGG 5 4 351230 CASAVA_Build 9 135239371 13D GATAGTAATG GGTAATGGTCGTT/------------- GTGGTGGTGG 3070 het 3070 hom 32 14 15 17 GGTAATGGTCGTT 1 0 351231 CASAVA_Build 9 135248602 4D GGTGGGTGGG TGGA/---- TGGATGGATG 2062 het 919 hom 37 5 9 24 TGGA 5 4 351232 CASAVA_Build 9 135258290 5I GAGGGCAGCG -----/GTGGT GTGGTGCTGG 3070 hom 73 het 27 0 22 5 GTGGT 1 2 351233 CASAVA_Build 9 135282749 1D AGTCCTAGTT A/- ATACCCACTT 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 A 2 1 351234 CASAVA_Build 9 135287924 1I GGGGTGTCTC -/G GGGGGGATCC 3070 hom 73 het 27 0 25 2 G 6 7 351235 CASAVA_Build 9 135290638 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 988 het 865 hom 8 4 4 0 T 9 10 351236 CASAVA_Build 9 135291305 9D TTCGTGGAGG CAGTGTGGT/--------- CAGTGTGGCT 3070 het 3070 ref 39 19 12 12 CAGTGTGGT 1 0 351237 CASAVA_Build 9 135321522 2D TGTGATAAAC AT/-- GTGTCTGCTA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 AT 1 0 351238 CASAVA_Build 9 135334232 1I GAAGGTCACG -/C CCCCAAGACA 1679 hom 21 het 8 0 6 2 C 4 5 351239 CASAVA_Build 9 135341353 1D GCTCACAATA C/- CCCACTTCTG 3070 hom 78 het 30 0 25 5 C 4 3 351240 CASAVA_Build 9 135343677 13D TTGTCTCAAA AAAAAAAAAAAAG/------------- AAGAAGAAGT 3070 hom 70 het 23 0 22 6 AAAAAAAAAAAAG 1 0 351241 CASAVA_Build 9 135344834 1D GTGTCTGCAA G/- GCCAGGTTAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 2 1 351242 CASAVA_Build 9 135345731 1D AGAGGGAGGA G/- GGGGGGAAGG 2719 het 1976 hom 22 8 10 4 G 7 6 351243 CASAVA_Build 9 135350527 2I TGCGTGAGCT --/TG TGTGTGTGAG 3070 hom 27 het 63 0 14 49 TG 4 5 351244 CASAVA_Build 9 135350650 19D CTTATGTGTC ATGTGTGTGCTTATGTGTT/------------------- GTGTGTTGTG 3070 het 3070 ref 76 44 25 29 ATGTGTGTGCTTATGTGTT 1 0 351245 CASAVA_Build 9 135350731 2D TGTGTGTGCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 88 34 42 15 TG 6 5 351246 CASAVA_Build 9 135350810 4D CACATGAGTT TGTG/---- TGTGTGTGCT 3070 het 3070 ref 92 43 30 24 TG 6 4 351247 CASAVA_Build 9 135352946 1I CTTGTGGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 A 10 11 351248 CASAVA_Build 9 135357953 2D ATTACCCACC TA/-- TACAATTCAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 TA 2 1 351249 CASAVA_Build 9 135366625 4D GTGCACGTGC GTGT/---- GTGTATGTGT 1364 het 1364 ref 44 26 13 9 GT 4 2 351250 CASAVA_Build 9 135398071 1D TTTTTTTGCA T/- TTTTAGTAGA 3070 het 1998 hom 16 7 8 1 T 5 4 351251 CASAVA_Build 9 135404600 1I AGTGCTTGGA -/T TTATAGGCGT 3070 hom 96 het 36 0 33 5 T 2 3 351252 CASAVA_Build 9 135405636 4I GAGACTGGAC ----/TCCA GTTCAGGAGC 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 TCCA 0 1 351253 CASAVA_Build 9 135406756 13D AAGCAGCAGC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 2233 het 1820 hom 26 9 7 10 T 26 13 351254 CASAVA_Build 9 135414295 3D CCCACCCCCA TTT/--- TTTTTTTTTT 927 het 466 hom 14 3 3 8 T 16 13 351255 CASAVA_Build 9 135416457 1D ATGGTCAGGT C/- CAGGCCCCTG 2332 het 2332 ref 21 9 7 6 C 2 1 351256 CASAVA_Build 9 135431088 1I CGCCCGGAGA -/G GGCCCCAGGA 3070 hom 79 het 28 0 25 3 G 2 3 351257 CASAVA_Build 9 135431515 3I CCAACCCACA ---/TCT TCTTCCTGTC 3070 hom 90 het 35 0 27 8 TCT 1 2 351258 CASAVA_Build 9 135431733 4I CCCAGCCTGT ----/TTTC CCCCCCCACA 3070 hom 40 het 24 0 13 11 TTTC 0 1 351259 CASAVA_Build 9 135444567 2D GGGCGACACA GC/-- GCGCACACAC 3070 hom 116 het 42 0 36 7 GC 3 2 351260 CASAVA_Build 9 135454665 2D AGCATGTGCA TG/-- TGTGTCTGTG 3070 het 3070 ref 90 42 40 9 TG 3 2 351261 CASAVA_Build 9 135455669 1I TAGAGTCTTA -/G AAAATCAGAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 G 0 1 351262 CASAVA_Build 9 135457364 1I CTGTGGACGT -/G CCCTCCCTGC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 G 0 1 351263 CASAVA_Build 9 135479035 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTGGAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 5 4 351264 CASAVA_Build 9 135498131 10I GTCCCTGCCT ----------/TGGCAGGAAA TGGCCTGTAC 2967 het 2440 hom 25 7 11 7 TGGCAGGAAA 0 1 351265 CASAVA_Build 9 135499911 2D CACACACACA TG/-- CACACATGTA 3070 het 3070 ref 62 34 25 5 TG 1 0 351266 CASAVA_Build 9 135504896 2D GGCAGATAAA AG/-- AGGGGCACAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 AG 2 1 351267 CASAVA_Build 9 135551021 1D GGGGCCGGAC G/- GGGGGGAGCT 3070 hom 36 het 18 0 14 4 G 7 6 351268 CASAVA_Build 9 135560502 1I ACCCTGAGAA -/C CCCCATCTGT 3070 hom 56 het 23 0 18 5 C 4 5 351269 CASAVA_Build 9 135571709 1I CAAGAACCTT -/C CCCCCGCTGA 2150 het 405 hom 14 2 8 4 C 5 6 351270 CASAVA_Build 9 135577259 1I TTTTTTTTTT -/A AAAGCCTCAA 3070 hom 56 het 34 1 28 5 A 3 4 351271 CASAVA_Build 9 135580634 4I AAACAAAACA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 AAAC 3 4 351272 CASAVA_Build 9 135582663 1I TTTTCCTGTG -/C CTCCGGTACC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 C 1 2 351273 CASAVA_Build 9 135585472 3I ACTGCTTGGT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 24 0 14 10 A 13 16 351274 CASAVA_Build 9 135585578 1D GTCAATACTA G/- TTACTGCTGG 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 G 1 0 351275 CASAVA_Build 9 135590831 3I TACTAAAAAT ---/ACA ACATTAGCCG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 ACA 1 2 351276 CASAVA_Build 9 135601622 1D CTTTATGAGA T/- TTTTTTTTTT 1610 het 1610 ref 22 12 5 5 T 13 12 351277 CASAVA_Build 9 135621879 1I GGGAAATAGT -/A AAAAAAGTAC 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 6 7 351278 CASAVA_Build 9 135627578 6D ACCCCCTTGC CAGACA/------ CAGACATCAC 2140 het 2140 ref 26 14 6 8 CAGACA 2 1 351279 CASAVA_Build 9 135628255 3D TAGAAAAGAT AAA/--- AAACAGGACA 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 A 6 3 351280 CASAVA_Build 9 135628554 1I42M3D AGATATTTTA -TTCTTTGTATCCTTATTCTATAAGCTTTCCTGTTTTTTTTCTTTG/TTTCTTTGTATCCTTATTCTATAAGCTTTCCTGTTTTTTTTCT--- TTGTTGTTGT 3070 het 2454 hom 43 9 17 33 N/A 0 0 351281 CASAVA_Build 9 135631335 1I TGGATGTGAG -/C ACACCCACAG 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 0 1 351282 CASAVA_Build 9 135633112 25D GCTGAAGGTG GGGATGAACGCCCACAAAGGTCCCC/------------------------- GGGATGAACG 3070 hom 53 het 23 0 15 15 GGGATGAACGCCCACAAAGGTCCCC 2 1 351283 CASAVA_Build 9 135637041 10D TTAATAATCC GGCGGGGGCG/---------- GGGCGGGGGA 3070 hom 46 het 18 0 13 7 GGCGGGGGCG 1 0 351284 CASAVA_Build 9 135638433 1I GGGGGGGTGA -/G GGGGGGTACT 3070 hom 77 het 32 0 24 8 G 6 7 351285 CASAVA_Build 9 135641479 1I CCACCCAGGG -/C CCCCTCCACG 3070 hom 57 het 25 0 19 6 C 4 5 351286 CASAVA_Build 9 135658376 1I AAGGAAGCCA -/C CCAGGAGCTG 3070 hom 57 het 22 0 18 4 C 2 3 351287 CASAVA_Build 9 135662984 13D AGCAAACACG CCCGGGTGGCGGC/------------- CCCAGGCTGG 3070 hom 80 het 30 0 26 8 CCCGGGTGGCGGC 1 0 351288 CASAVA_Build 9 135665686 2I GGTCTGAGAC --/CT CTTCAGAACC 3070 hom 96 het 37 0 27 10 CT 1 2 351289 CASAVA_Build 9 135672200 2D TTCCTCTTCT GA/-- GAGACTGCAA 3070 hom 74 het 30 0 25 6 GA 3 2 351290 CASAVA_Build 9 135677110 1D ACAGAAAATC A/- AAAGAAAACC 1861 het 1861 ref 18 7 5 6 A 4 3 351291 CASAVA_Build 9 135677762 1I AACAGCCCCT -/G GGGCCAGGTC 1327 het 1062 hom 16 4 7 5 G 3 4 351292 CASAVA_Build 9 135701544 2I GGCCGCCAAG --/CA CAGTTCCCCA 3070 hom 42 het 19 0 9 10 CA 1 2 351293 CASAVA_Build 9 135743329 5D CACAGTCAAT AAAAC/----- AAAACAAAGC 3070 hom 89 het 33 0 26 12 AAAAC 2 1 351294 CASAVA_Build 9 135744693 2I CATTTCATTT --/AC ACACACACAC 3070 het 126 hom 23 1 21 1 AC 6 7 351295 CASAVA_Build 9 135753043 7D GCTCTTCCAA CATACTG/------- CATCCGGGTA 3070 hom 77 het 27 0 22 6 CATACTG 1 0 351296 CASAVA_Build 9 135756055 1I TCCTGTCTGA -/T TTTTCCAGTG 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 T 4 5 351297 CASAVA_Build 9 135760817 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 9 16 4 A 9 8 351298 CASAVA_Build 9 135764603 1D ACTAGATGGT C/- CGACTGGGCA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 C 2 1 351299 CASAVA_Build 9 135765590 2D CGACTCTACT AA/-- AAAAAAAAAA 1733 hom 26 het 11 0 9 2 A 18 16 351300 CASAVA_Build 9 135770528 2I AAAGACAAGG --/CA CGCACACACA 3070 het 348 hom 46 1 38 7 CA 0 1 351301 CASAVA_Build 9 135770769 3I ACTCACACAC ---/GAT GCACACGTGC 3070 hom 198 het 73 0 63 10 GAT 0 1 351302 CASAVA_Build 9 135770914 4D ACGTACACAT ACAC/---- ACTCACACGA 3070 het 3070 hom 83 37 36 12 AC 3 1 351303 CASAVA_Build 9 135771754 1D GGACTGTTTA G/- GTCAAGGGGT 3070 hom 116 het 44 0 37 7 G 2 1 351304 CASAVA_Build 9 135782054 1D CCTTACCAGT G/- GTGGCAAGAA 3070 hom 69 het 26 0 22 4 G 2 1 351305 CASAVA_Build 9 135786348 1I GCCCAGGGGG -/C CCCCCCTCCT 3070 hom 85 het 31 0 23 8 C 6 7 351306 CASAVA_Build 9 135787668 1D TTTGCTCTCA C/- CCGCCTGCCT 3070 hom 54 het 23 0 17 6 C 3 2 351307 CASAVA_Build 9 135787965 5D TGGGCGGAGA CCGCC/----- CTTAAGCAGC 3070 hom 87 het 32 0 28 8 CCGCC 1 0 351308 CASAVA_Build 9 135793453 4D GCCCGGCTCC TGCA/---- TGCAGGACTG 3070 hom 81 het 29 0 23 6 TGCA 2 1 351309 CASAVA_Build 9 135795963 1I TGGTACAGTC -/T CTCCAACAGA 3070 hom 96 het 35 0 31 4 T 0 1 351310 CASAVA_Build 9 135796360 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 10 11 351311 CASAVA_Build 9 135796552 5D ACTTTTTTTT GGGGG/----- GGGGGGGGGA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 G 14 9 351312 CASAVA_Build 9 135808967 3D ATGTGTGACA TTC/--- TTAAGATCCC 3070 het 3070 ref 60 28 21 12 TTC 1 0 351313 CASAVA_Build 9 135809721 4I GTGTGCACAT ----/GTGA GTATGTGTGC 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 GTGA 0 1 351314 CASAVA_Build 9 135819253 2D GTGAGCCCTG AT/-- ATATATATAT 2500 het 2500 ref 27 11 6 11 AT 7 6 351315 CASAVA_Build 9 135822708 1D AACCCCATCT C/- CTACTAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 2 1 351316 CASAVA_Build 9 135827440 2I AGGCAAACAC --/TG TCTTTGCCGC 3070 hom 73 het 26 0 25 1 TG 0 1 351317 CASAVA_Build 9 135839613 2D TTTTTGCCCC CT/-- CAAGAGCAGT 3070 het 3070 ref 28 15 11 3 CT 1 0 351318 CASAVA_Build 9 135839851 1I GCCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 A 14 15 351319 CASAVA_Build 9 135855990 1D ATCTCTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2328 hom 18 8 8 2 T 11 10 351320 CASAVA_Build 9 135863393 1I GAAGCCTTGA -/C CCCCCCAGGC 2338 het 2338 ref 36 23 9 4 C 6 7 351321 CASAVA_Build 9 135864711 1D AACTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 886 hom 34 3 26 5 A 12 11 351322 CASAVA_Build 9 135871252 1D AAATGGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 T 12 11 351323 CASAVA_Build 9 135886440 1I AATACCTTTG -/A AAAACGAGGG 3070 het 2068 hom 21 5 11 5 A 4 5 351324 CASAVA_Build 9 135892651 1D AAAGTAAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 T 8 7 351325 CASAVA_Build 9 135914473 1D CCCTCCTTCA C/- CCCTCGCAGC 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 C 4 3 351326 CASAVA_Build 9 135919327 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAATA 1631 het 629 hom 12 5 7 0 A 8 9 351327 CASAVA_Build 9 135928585 9I CCTGACACTG ---------/CAGATTCAA CAGTGAACAA 3070 het 3070 ref 54 31 20 3 CAGATTCAA 0 1 351328 CASAVA_Build 9 135932950 1D47M2I CAAATGATTT AAAAAAATAACTACATAATTGTAAATATATGTCAATGCACACACAATG--/-AAAAAATAACTACATAATTGTAAATATATGTCAATGCACACACAATGTA TATATATATA 3070 het 3070 ref 24 23 7 10 N/A 0 0 351329 CASAVA_Build 9 135933147 1D TTAAAAAAAC A/- AAATATATAT 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 4 3 351330 CASAVA_Build 9 135934691 1I TTTGAGTGTT -/A AAAAAAAGGG 2829 het 2829 ref 24 11 8 5 A 7 8 351331 CASAVA_Build 9 135934815 1D ACAGAATGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 9 11 7 T 10 9 351332 CASAVA_Build 9 135934992 1I GACTTTAAGA -/C AAAAATGTTT 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 C 0 1 351333 CASAVA_Build 9 135942310 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 30 1 13 16 A 13 12 351334 CASAVA_Build 9 135942351 2D GCACAGGCTC TG/-- TGCAAAGAGT 2350 het 2350 ref 34 17 8 9 TG 2 1 351335 CASAVA_Build 9 135949178 1I CACAATGGGG -/C AAGTATAGTC 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 C 0 1 351336 CASAVA_Build 9 135955017 4I CCAGGAACAT ----/AGTC AGTGTGCATA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AGTC 0 1 351337 CASAVA_Build 9 135957783 1D TGAAGACATC T/- TTTTTTTTTT 2622 het 404 hom 29 5 8 16 T 17 16 351338 CASAVA_Build 9 135965041 1D ACTCCCTTTC A/- AAAAAAAAAA 2520 hom 21 het 9 0 8 2 A 15 14 351339 CASAVA_Build 9 135969514 2D CAACATGCAG AA/-- AAGTCTTCAC 2473 hom 12 het 6 0 5 1 A 4 2 351340 CASAVA_Build 9 135985769 1I GCTGTGGTGG -/T TTTTTAATAG 3070 het 3070 ref 20 12 8 0 T 5 6 351341 CASAVA_Build 9 136002004 1D GACCTGGCAC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 7 6 351342 CASAVA_Build 9 136016063 4D GTGCACACAT ACAC/---- ACACATACAC 3070 het 3070 ref 50 25 23 4 AC 4 2 351343 CASAVA_Build 9 136016176 6D AAACCACAGC ATGTGT/------ ATGTGTATGT 3070 hom 129 het 60 0 42 22 ATGTGT 3 2 351344 CASAVA_Build 9 136016333 1D TTACTAGCTG T/- TTTTTTTTTT 2380 het 1761 hom 39 8 8 23 T 17 16 351345 CASAVA_Build 9 136024144 1I TACAGTACTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 52 22 17 13 T 9 10 351346 CASAVA_Build 9 136027303 18D TTCCCTGCTT CTGCAGAGAGGGTGATGA/------------------ CTGTCTAGGG 3070 het 3070 ref 29 15 11 6 CTGCAGAGAGGGTGATGA 1 0 351347 CASAVA_Build 9 136231510 5D CTCGGGAGGC TGAGG/----- TGAGAGGATC 3070 het 2092 hom 20 6 9 5 TGAGG 1 0 351348 CASAVA_Build 9 136231894 2I24M1D ACTGGGTGAC --AGAGAGAGAGAGAGACCCTGTCTCA/AGAGAGAGAGAGAGAGACCCTGTCTC- AAAAAAAAAA 2968 het 2353 hom 21 7 10 9 N/A 0 0 351349 CASAVA_Build 9 136243235 3D GCTCACCCTT CTC/--- CTCAGGAGGA 3070 het 3070 ref 24 10 12 4 CTC 2 1 351350 CASAVA_Build 9 136260730 14D GGGGGTTTAG CTGAGTCTTTGTCC/-------------- CTGAGATTTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 7 CTGAGTCTTTGTCC 1 0 351351 CASAVA_Build 9 136277409 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2574 het 2574 ref 26 12 11 3 A 15 14 351352 CASAVA_Build 9 136277499 33D GATTAACATT TGATTGGTGGGCAGTCTGGATGAGATTAACATC/--------------------------------- TGATTGGTGG 3070 het 3070 ref 34 23 13 9 TGATTGGTGGGCAGTCTGGATGAGATTAACATC 1 0 351353 CASAVA_Build 9 136279333 1D CAAGCAGACC A/- AAAAATCACC 3070 het 3070 hom 49 16 23 10 A 6 5 351354 CASAVA_Build 9 136280448 2D AACTCCGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 2490 hom 33 het 24 0 8 16 A 14 12 351355 CASAVA_Build 9 136283015 1I AAGATTCCAT -/G GGGGGGTGGG 3070 hom 35 het 26 0 16 10 G 6 7 351356 CASAVA_Build 9 136285283 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 A 11 10 351357 CASAVA_Build 9 136286839 1D TATTGAAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 46 het 23 0 16 8 T 8 7 351358 CASAVA_Build 9 136289063 2D GCGTTTATGG GT/-- CAGAGCAGGA 3070 het 1833 hom 24 7 13 4 GT 1 0 351359 CASAVA_Build 9 136299237 7D GGAATCCCCG GCCCGGC/------- CCAGGGGGGT 3070 hom 50 het 19 0 14 8 GCCCGGC 1 0 351360 CASAVA_Build 9 136305287 1I GCAGGCTGTA -/G GGGGCTGCGT 3070 hom 39 het 25 0 14 11 G 4 5 351361 CASAVA_Build 9 136306395 1I TGTGTGACTC -/A AGGGCAGGTG 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 1 2 351362 CASAVA_Build 9 136317257 1D TGTGTGTGTG T/- GTGTGTGTGT 186 het 186 ref 25 12 1 13 T 1 0 351363 CASAVA_Build 9 136317633 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 15 14 351364 CASAVA_Build 9 136412162 1D AGGTGGGCGG C/- CCCCCCTGGG 2199 het 1612 hom 20 8 8 4 C 7 6 351365 CASAVA_Build 9 136413793 1I GCCAGGATGT -/G GGGGGGGCGC 3070 hom 49 het 19 0 15 4 G 7 8 351366 CASAVA_Build 9 136463883 1I GCACAGGGGG -/A ACCCAGCAAG 2582 het 1774 hom 23 9 8 6 A 1 2 351367 CASAVA_Build 9 136486790 1D GAATTGAGCA T/- CGTCTGCCCG 3070 het 3070 hom 29 14 12 4 T 1 0 351368 CASAVA_Build 9 136506682 1I CTGCCTCTGG -/C CTGGAGCCTT 2452 het 2350 hom 26 8 11 7 C 1 2 351369 CASAVA_Build 9 136516224 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 31 0 23 9 A 11 10 351370 CASAVA_Build 9 136536794 1I CTGTGTGGAT -/A GGGTGGGTGC 3070 het 1393 hom 28 7 15 6 A 0 1 351371 CASAVA_Build 9 136549678 4I GTTAAGGCTC ----/GGTT GGGTGGGACT 1280 het 1280 ref 18 7 4 7 GGTT 0 1 351372 CASAVA_Build 9 136569493 8D ACGGTCAGTT GGGGTCTG/-------- GGGGTCTGGC 3070 hom 96 het 33 0 32 4 GGGGTCTG 2 1 351373 CASAVA_Build 9 136569885 1I TGAAGAAAAT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 A 8 9 351374 CASAVA_Build 9 136571175 3D CCCTGGGCTT ATC/--- ATGATCCAGA 3070 hom 96 het 36 0 30 6 ATC 1 0 351375 CASAVA_Build 9 136574337 2D GTGTGTGTGT GC/-- GCTATACAGA 3070 hom 154 het 61 0 52 9 GC 2 1 351376 CASAVA_Build 9 136614692 1I GGATTAGCCG -/T GGCGTGGTGG 3070 hom 47 het 18 0 12 6 T 0 1 351377 CASAVA_Build 9 136633865 1D CTCTGTTTAT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 A 9 8 351378 CASAVA_Build 9 136635750 1D AAGGAAGGAA G/- GAAGGAAAGA 2037 het 2037 ref 17 7 6 4 G 2 1 351379 CASAVA_Build 9 136690841 1I CGGGTGGATC -/A ACAAGGTCAG 2490 het 2490 ref 23 10 8 5 A 1 2 351380 CASAVA_Build 9 136700140 4I AGGGTAGCAG ----/GAGA GAGAGAACAG 3070 hom 178 het 63 0 60 6 GA 3 5 351381 CASAVA_Build 9 136702768 1D TGCAGATGGA T/- TTTTTCAGTG 3070 het 2982 hom 31 9 12 10 T 6 5 351382 CASAVA_Build 9 136706548 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 A 8 9 351383 CASAVA_Build 9 136717608 4D CATCCATCCA CCAT/---- CCATCCATCC 3070 het 63 hom 48 3 30 15 CCAT 4 3 351384 CASAVA_Build 9 136720653 1D TGGCGGGGGT G/- GGGGTGGCAC 2874 het 2173 hom 25 10 9 6 G 5 4 351385 CASAVA_Build 9 136721980 1D GGATAATGAC G/- GGGGGATAAA 3070 hom 105 het 39 0 31 8 G 6 5 351386 CASAVA_Build 9 136736472 2D TTTTTTTTTT TC/-- CCTTAACAGT 3070 het 1248 hom 30 5 14 12 TC 1 0 351387 CASAVA_Build 9 136736951 1D AAGGCCAGGG C/- TAACGGCTGG 3070 het 2734 hom 40 11 23 7 C 1 0 351388 CASAVA_Build 9 136740982 1I GAGGAGGGGT -/G GGGGGGGCTA 3070 hom 37 het 15 0 12 3 G 7 8 351389 CASAVA_Build 9 136746082 3D49M3D TGGTGGTGGT GAAGGTGATGGTGATGTTTATGGTGGTGGATATGCTGATGATGGTGATGGTGGTT/---GGTGATGATAATGGTAGTGGTGATGGGTATACTGCTGATGGTGATGCTG--- GTGATGGTGT 1711 het 1711 ref 55 58 5 17 N/A 0 0 351390 CASAVA_Build 9 136767871 4I CAGAAGTGAG ----/CTGT CTTAGTTCAT 3070 het 3070 ref 46 20 12 14 CTGT 0 1 351391 CASAVA_Build 9 136791066 10D ACATACGCAT ACACACCCAC/---------- ACACACCCAC 3070 het 3070 hom 71 29 24 25 ACACACCCAC 2 1 351392 CASAVA_Build 9 136792666 2I ACACATACAC --/AT GTGCACACCA 3070 het 3070 ref 63 25 18 20 AT 0 1 351393 CASAVA_Build 9 136792776 1I CATGCACACA -/C ACCCACACAT 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 C 0 1 351394 CASAVA_Build 9 136796083 1D GGGGCATTGT G/- GGGGGGGTCA 1984 het 1984 ref 20 5 8 7 G 8 7 351395 CASAVA_Build 9 136797025 1D TCTCTGGGGG A/- GCGTCTGCTC 2233 het 2233 ref 19 7 9 4 A 1 0 351396 CASAVA_Build 9 136823416 7I TTGCCTTGGG -------/ATTTGGA CTTTGGACTT 3070 hom 86 het 35 0 25 10 ATTTGGA 0 1 351397 CASAVA_Build 9 136823786 1D GGGCCGGCAC A/- GGGCCGAGCC 1377 het 1377 ref 20 6 7 8 A 1 0 351398 CASAVA_Build 9 136824508 70D GCATGTGTAT GTGTGTGTGCGCACACGTGTGTGTGCGCGCGTTTGTGCACACGTGTGTGTGCGCGCGTGTGTGCACGCGC/---------------------------------------------------------------------- GTGTGTGTGC 3070 hom 27 het 9 0 9 6 GTGTGTGTGCGCACACGTGTGTGTGCGCGCGTTTGTGCACACGTGTGTGTGCGCGCGTGTGTGCACGCGC 1 0 351399 CASAVA_Build 9 136828855 2I GAAGTGATTT --/TC TCTCTGAGTT 2049 het 2049 ref 17 9 6 2 TC 2 3 351400 CASAVA_Build 9 136829154 1I AATCTCTTTC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 1383 hom 22 5 16 1 T 7 8 351401 CASAVA_Build 9 136835519 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAC 1704 het 1260 hom 14 5 7 2 A 9 10 351402 CASAVA_Build 9 136836038 1D AAGGGGTGAC T/- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 46 22 20 6 T 7 6 351403 CASAVA_Build 9 136836137 4D TGGATTTCTT TGTC/---- TGAGCACGGT 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 TGTC 1 0 351404 CASAVA_Build 9 136852900 2D GAAAGCACCC CT/-- GTGTCCACCC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 CT 1 0 351405 CASAVA_Build 9 136855528 2D TGTATGTGCA TG/-- TGTGTGTGCA 3070 het 3070 ref 76 36 28 15 TG 5 4 351406 CASAVA_Build 9 136855683 2D TATATGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 65 22 23 21 TG 7 6 351407 CASAVA_Build 9 136858248 4I AGATGCTGTG ----/TGGA TGGTTTTGTA 3070 hom 84 het 30 0 25 5 TGGA 0 1 351408 CASAVA_Build 9 136858387 4I GGTGTGTGGG ----/TGTA TGGTGTGTGG 3070 hom 98 het 46 0 27 19 TGTA 0 1 351409 CASAVA_Build 9 136860104 2D AAGGTTCTAC CA/-- CACACACACA 3070 hom 79 het 52 0 21 31 CA 9 8 351410 CASAVA_Build 9 136860130 7D CACGCAGATG CACACTA/------- CACACCACAC 1910 het 1910 ref 48 8 8 36 CACACTA 1 0 351411 CASAVA_Build 9 136874839 4I TTTTTTTAAT ----/AGGG AGGGAAAAAA 3070 hom 38 het 17 0 13 4 AGGG 1 2 351412 CASAVA_Build 9 136875054 4D TCTTGTGGTG CTAT/---- CTATCTGTTT 3070 hom 79 het 32 0 27 5 CTAT 2 1 351413 CASAVA_Build 9 136878104 1D CTTTGACCAT C/- CCAGGCAGCA 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 C 3 2 351414 CASAVA_Build 9 136878443 16D TTCATCATTT ATCCATCCATTCATCC/---------------- ATCCATCCAT 3070 het 1043 hom 62 13 27 29 ATCCATCCATTCATCC 1 0 351415 CASAVA_Build 9 136879252 7D CTGGCGTGTG TATGGTA/------- TATGTGTGCG 3062 het 3062 ref 52 26 12 16 TATGGTA 1 0 351416 CASAVA_Build 9 136884475 4D GTGCCCATGT AACA/---- AACAGTGGGT 3070 hom 150 het 61 0 48 15 AACA 2 1 351417 CASAVA_Build 9 136889637 1I AAGTATAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2971 hom 22 8 11 3 A 12 13 351418 CASAVA_Build 9 136904799 1D GGAGGGTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 11 10 351419 CASAVA_Build 9 136905553 2D TTTGTTTGTT TG/-- TTTTGTTTTT 2616 het 85 hom 13 1 10 2 TG 1 0 351420 CASAVA_Build 9 136932501 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 21 0 15 6 A 13 12 351421 CASAVA_Build 9 136934071 1D TATCACACTA T/- TTTTTTGCCT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 7 6 351422 CASAVA_Build 9 136939653 3D GGACTGTGTG TCT/--- TCTTCTCCAA 3070 hom 114 het 45 0 34 13 TCT 3 2 351423 CASAVA_Build 9 136943704 1D GTGAAACTCA T/- CCCCTGCCCC 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 T 1 0 351424 CASAVA_Build 9 136946151 1I AAAGGCTGGT -/C CCAGAGTGGG 3070 hom 78 het 29 0 25 4 C 2 3 351425 CASAVA_Build 9 136949810 1D GCTGGAAAGC A/- TCGGCTTTGC 3070 hom 78 het 29 0 25 5 A 1 0 351426 CASAVA_Build 9 136963662 6I CTTTCTGATT ------/TTCTTC TTCTACTTTT 3070 hom 91 het 37 0 31 6 TTC 1 3 351427 CASAVA_Build 9 136966280 1D AAAAATAAAT A/- AAATAAAATA 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 4 3 351428 CASAVA_Build 9 136966750 4D AATTCATGCT TGGG/---- ACTATTTGGA 3070 hom 90 het 33 0 30 4 TGGG 1 0 351429 CASAVA_Build 9 136978126 2I ACATTCACAC --/CA CACACACACA 3070 het 276 hom 80 1 61 18 CA 7 8 351430 CASAVA_Build 9 136988602 2I TCTGCGTGTC --/TA TGTGTGTATC 3070 hom 166 het 70 0 55 15 TA 0 1 351431 CASAVA_Build 9 137015732 2D GCCTCTTGAC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 2123 hom 31 7 17 7 T 11 9 351432 CASAVA_Build 9 137017178 1D TGTGGACAGA C/- CCTAACGTTA 3070 het 3070 hom 50 19 26 6 C 3 2 351433 CASAVA_Build 9 137044418 1D TTATTTATTT A/- TTTTTTTTTT 3070 het 2486 hom 19 7 8 4 A 1 0 351434 CASAVA_Build 9 137060713 2I ACACTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2110 hom 27 9 10 8 A 12 14 351435 CASAVA_Build 9 137067082 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1004 hom 19 3 11 5 A 14 13 351436 CASAVA_Build 9 137071545 1I GGACGGTCCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 T 8 9 351437 CASAVA_Build 9 137072842 1I ACGTACGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2867 hom 34 8 19 7 T 11 12 351438 CASAVA_Build 9 137073263 1I ACACACTATG -/A GAAAGTACAC 3070 het 3070 hom 70 26 36 8 A 0 1 351439 CASAVA_Build 9 137086025 1I AAAGCAGAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 A 8 9 351440 CASAVA_Build 9 137088971 1I AGAACAAAAA -/T TGTCAATATC 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 T 1 2 351441 CASAVA_Build 9 137089433 2D CAAGAAAAAA AG/-- AAAAAAGCTA 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 AG 1 0 351442 CASAVA_Build 9 137089830 5I TAAGATTGGT -----/AACAA AACAAGAGTT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 AACAA 1 2 351443 CASAVA_Build 9 137090738 1D TAAATACAGA T/- TCCCAGGCCC 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 2 1 351444 CASAVA_Build 9 137092248 1I GAGAGGAAAA -/G GAACTTGCAG 3070 het 3070 hom 36 10 21 5 G 1 2 351445 CASAVA_Build 9 137103484 1I TATTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 2110 het 1261 hom 9 3 6 0 A 0 1 351446 CASAVA_Build 9 137108741 2I TCTAGGAGAG --/AA GTTTTCTTGG 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 0 2 351447 CASAVA_Build 9 137114075 1D TCCTGAGTGG T/- GCTGAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 T 1 0 351448 CASAVA_Build 9 137116166 4D TCTCCTCTCT TCTC/---- TCTCCTCTCT 3070 het 2383 hom 34 7 13 14 TC 4 2 351449 CASAVA_Build 9 137122056 2I TGTGTGTTTG --/TT TGTGTGTGTG 3070 het 400 hom 43 4 27 12 T 1 3 351450 CASAVA_Build 9 137156914 1I GTTGTTGGTC -/T TTACTTTCTC 3070 het 3070 hom 47 20 22 5 T 2 3 351451 CASAVA_Build 9 137158003 1I ACAGTTCTTG -/A TTGTTCTAAA 3070 het 3070 ref 44 28 11 5 A 0 1 351452 CASAVA_Build 9 137159738 1D CTGGCTAGTG C/- CCTCCAGCAC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 C 3 2 351453 CASAVA_Build 9 137171730 1I GCCACGCCCC -/G CCCACCCGCT 3070 het 3070 ref 28 9 9 10 G 0 1 351454 CASAVA_Build 9 137193672 1I TCTTTAGGCA -/G GAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 G 1 2 351455 CASAVA_Build 9 137206108 10D3M2D GCTGAGGAGA GAACACAGGGCCTCC/----------CCT-- CTGCCCACCT 2749 het 2749 ref 44 22 13 11 N/A 0 0 351456 CASAVA_Build 9 137210086 3I ATAAGTCCCA ---/CAG CCACTGGCTA 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 CAG 0 1 351457 CASAVA_Build 9 137220314 4D TGCCATGTCA CACT/---- CACCCCACAC 3070 hom 102 het 38 0 29 11 CACT 1 0 351458 CASAVA_Build 9 137227419 4D ACTGCAGACA GTGG/---- GTGGGTGGGT 3070 hom 64 het 32 0 19 13 GTGG 4 3 351459 CASAVA_Build 9 137231765 1I TGTGCTCACC -/T TCTGGCCAGG 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 1 2 351460 CASAVA_Build 9 137257486 48D CTCACCCACA CACACGCTCACACATCTACATGCGCTCACACACATGCACACACTCATG/------------------------------------------------ CACACTCACA 3070 het 3070 ref 58 56 14 13 CACACGCTCACACATCTACATGCGCTCACACACATGCACACACTCATG 1 0 351461 CASAVA_Build 9 137257714 2I CAAACACATG --/CA CACACACACA 3070 hom 254 het 95 0 81 15 CA 5 6 351462 CASAVA_Build 9 137280776 4D GCACCGCAGG CCTT/---- CCTTCCTCCT 3070 het 3070 ref 45 20 14 13 CCTT 2 1 351463 CASAVA_Build 9 137308346 2D TCACGTGACA CG/-- CCCCCCCTCC 2359 hom 30 het 17 0 8 9 CG 1 0 351464 CASAVA_Build 9 137310899 16D TTCCATCTCC AGAAAAAAAAAAGAAA/---------------- AGAAAAAAAA 1888 het 1888 ref 12 7 4 2 AGAAAAAAAAAAGAAA 2 1 351465 CASAVA_Build 9 137320083 15D GGAATGCCCG TCGCAGGTGTATTCA/--------------- TTACAGCCAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 3 TCGCAGGTGTATTCA 1 0 351466 CASAVA_Build 9 137325795 1I ACTAAGACCT -/C CGCCCGCCCC 3070 hom 69 het 28 0 23 5 C 1 2 351467 CASAVA_Build 9 137328193 1D CATCTTCTAG C/- GGGTGATACA 3070 het 3070 ref 35 16 13 7 C 1 0 351468 CASAVA_Build 9 137330123 3D TGGTCTCGAA CTC/--- CTGACCTCAG 3070 hom 54 het 19 0 17 3 CTC 1 0 351469 CASAVA_Build 9 137335286 1I ATATATTTTA -/G AAATCCCCAG 3070 hom 72 het 29 0 25 4 G 0 1 351470 CASAVA_Build 9 137335470 2D GGCATGCACG CA/-- CACACACACA 2237 het 2237 ref 42 28 7 8 CA 10 9 351471 CASAVA_Build 9 137346467 1I AAAAGAAATG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 8 9 351472 CASAVA_Build 9 137360061 10I TTCCTAGTTT ----------/ATTTCTTTAA ATGTAATTAG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 ATTTCTTTAA 0 1 351473 CASAVA_Build 9 137364423 1D TGCCCTGTTT C/- CCATGGCTGC 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 C 3 2 351474 CASAVA_Build 9 137368652 10I TGTGAGAGGA ----------/TGCACGTGTG TGCACGTGTG 3070 hom 158 het 70 0 45 25 TGCACGTGTG 1 2 351475 CASAVA_Build 9 137385597 1D CAACTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 13 12 351476 CASAVA_Build 9 137394793 2D AGTTCCCCTG CA/-- CACGCTCTCT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 CA 2 1 351477 CASAVA_Build 9 137405354 2D CTGGGGTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 2838 het 2834 hom 30 14 9 7 CT 6 5 351478 CASAVA_Build 9 137415257 1I ACAGGGTTTC -/A CCATGTTGGC 3070 het 2793 hom 18 7 8 3 A 0 1 351479 CASAVA_Build 9 137420148 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2292 het 6 hom 20 1 13 6 A 17 18 351480 CASAVA_Build 9 137437276 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 304 hom 16 2 14 0 A 14 13 351481 CASAVA_Build 9 137439558 1I GAAACATCTC -/T CCTTTTATAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 0 1 351482 CASAVA_Build 9 137458863 3I GAAAAATGGC ---/AAG AAGGGAGAAA 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 AAG 1 2 351483 CASAVA_Build 9 137463209 1D TGTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 13 12 351484 CASAVA_Build 9 137463854 1D GACTGGGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 95 hom 38 4 23 11 T 13 12 351485 CASAVA_Build 9 137466775 1I CATTTTTGTG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 65 het 25 0 22 3 A 7 8 351486 CASAVA_Build 9 137466997 1I AGGCTAGAAG -/A AAGAAATAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 A 2 3 351487 CASAVA_Build 9 137469358 2I CCTTTTAAAC --/AA AAAGACTGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 3 5 351488 CASAVA_Build 9 137476007 1D TGGTTAGAGT G/- GGGGGGGCGG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 8 7 351489 CASAVA_Build 9 137477449 5D ATGGTAAATT TTATG/----- TTATGTCTGT 3070 het 3070 ref 33 19 12 4 TTATG 2 1 351490 CASAVA_Build 9 137481513 1D GGGAGGCCAA G/- GGGGGGTGGA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 G 7 6 351491 CASAVA_Build 9 137495276 1D TTAAAGAAAA T/- CCAAATTATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 1 0 351492 CASAVA_Build 9 137502034 1I CACCCTCCCG -/T TTTTTTTCTT 3040 het 3040 ref 32 14 9 9 T 7 8 351493 CASAVA_Build 9 137526173 1I TCATAGAGGG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 32 9 21 2 A 8 9 351494 CASAVA_Build 9 137529068 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2695 hom 27 9 15 3 T 10 11 351495 CASAVA_Build 9 137567075 1D TAATAGAGAT G/- GGGGGGGGGG 1161 het 317 hom 13 2 3 8 G 11 10 351496 CASAVA_Build 9 137570645 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 11 11 A 15 14 351497 CASAVA_Build 9 137572889 2D TGGCTCTAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 T 14 12 351498 CASAVA_Build 9 137575638 1I TAGCCATAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 187 hom 27 1 22 4 T 9 10 351499 CASAVA_Build 9 137579011 1I TTCTGCCAGG -/C GTCCCAGCCC 3070 hom 48 het 17 0 13 4 C 0 1 351500 CASAVA_Build 9 137581507 1I AGCACAGCAG -/C CCCCCGGGTC 3070 het 772 hom 27 3 15 9 C 5 6 351501 CASAVA_Build 9 137588987 1I CCCATTTCTC -/T GGGATAAATG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 0 1 351502 CASAVA_Build 9 137591005 1D TCTTTCTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 38 0 29 10 T 11 10 351503 CASAVA_Build 9 137592213 13I GTGTGTGTGT -------------/GTATACACACACA CACACACATG 1519 hom 15 het 12 0 5 7 GTATACACACACA 0 1 351504 CASAVA_Build 9 137634448 2D TCAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 31 1 27 3 A 12 10 351505 CASAVA_Build 9 137653826 1I CTTTCATAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 8 9 351506 CASAVA_Build 9 137656168 1D CCATCGAGCC A/- CCACCTCTCG 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 A 1 0 351507 CASAVA_Build 9 137658904 1D CTAAGGAATC T/- TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 20 16 11 T 2 1 351508 CASAVA_Build 9 137672834 3I ATCTTCTAAG ---/CAT CATATCTTTT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 CAT 1 2 351509 CASAVA_Build 9 137682422 2D TGTGTGTGCA TG/-- TGTGTGAGTG 3070 het 3070 ref 59 30 20 10 TG 4 3 351510 CASAVA_Build 9 137682692 3I ATTGGTCTAA ---/TAT TGTTAATTTA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TAT 0 1 351511 CASAVA_Build 9 137701179 1D TTAAGCCCCC T/- CTCCAAGTCA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 T 1 0 351512 CASAVA_Build 9 137718799 1I ACTGTGGGCA -/G GGGGGGGTCC 2412 het 2196 hom 19 9 8 2 G 7 8 351513 CASAVA_Build 9 137721909 1D TTTCCTTTAT A/- AAATTACCCA 3070 hom 68 het 24 0 21 3 A 4 3 351514 CASAVA_Build 9 137723413 4I TATGGATGCG ----/CAAA CACTCGAGTA 3070 hom 214 het 81 0 72 9 CAAA 0 1 351515 CASAVA_Build 9 137727922 1D TCCCAGCAGA C/- CCAGGGACCC 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 C 3 2 351516 CASAVA_Build 9 137728181 1I AAACTTCGAA -/C CCCCGTTTGC 3070 hom 51 het 23 0 18 5 C 4 5 351517 CASAVA_Build 9 137738681 2I GCCAGGCACG --/GT GTGGGTCATG 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 GT 1 2 351518 CASAVA_Build 9 137774276 6D GGTCCGGGCC CCCCAG/------ AGCCTCCCTG 2330 het 2330 ref 23 12 9 3 CCCCAG 1 0 351519 CASAVA_Build 9 137789725 1I GTGCAGGCTG -/C CCCGTGGGCC 1947 het 1947 ref 28 11 7 10 C 3 4 351520 CASAVA_Build 9 137791064 1D CCGGCAGGCA G/- GGAGGCTCCG 547 het 547 ref 12 4 5 3 G 3 2 351521 CASAVA_Build 9 137799086 4D ACAGTTTCTT AGAC/---- AGCGTCTCAG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 AGAC 1 0 351522 CASAVA_Build 9 137805771 2D GTGTGTCAAC GT/-- GTGTTTGTCA 3070 het 3070 ref 77 31 28 19 GT 3 2 351523 CASAVA_Build 9 137815069 4D CCCAGGCCTC CAGA/---- GGGAGCGGGG 1196 het 1196 ref 29 15 7 7 CAGA 1 0 351524 CASAVA_Build 9 137831170 1D GGGTGCTTCC G/- GGTACACACT 3070 het 3070 hom 31 7 12 13 G 3 2 351525 CASAVA_Build 9 137852214 1D GAAAACCAGC A/- AAAAAAAAAA 2274 het 2274 ref 33 13 7 13 A 13 12 351526 CASAVA_Build 9 137857436 1D CTGGGGAGAT C/- ACAGGGGACA 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 C 1 0 351527 CASAVA_Build 9 137863148 1D TTTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 1274 het 1274 ref 23 14 3 6 A 13 12 351528 CASAVA_Build 9 137864697 1D GAAAAACAAA C/- CTAAAATCTG 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 C 2 1 351529 CASAVA_Build 9 137900118 1I GTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 9 10 351530 CASAVA_Build 9 137901177 1I CTCAAACAAA -/C AAAAAAAAAA 2883 het 2883 ref 27 13 9 5 C 0 1 351531 CASAVA_Build 9 137910061 1I CAAGGAGGGA -/G TTACCCAGGT 3070 het 3070 ref 46 27 13 6 G 0 1 351532 CASAVA_Build 9 137919490 1D GACTGGAGAC A/- AGAGTCGGCA 2853 het 2683 hom 28 13 8 8 A 2 1 351533 CASAVA_Build 9 137934440 3I AGAGAAAAAA ---/AGG AGGAGGGGAT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 AGG 2 3 351534 CASAVA_Build 9 137946114 1D ACTTGGGCTC A/- AAAAAAAAAA 2310 het 493 hom 14 3 6 5 A 18 17 351535 CASAVA_Build 9 137948324 1I CAATACTCCA -/T TCTGAAAAAA 3070 het 2904 hom 21 7 14 0 T 1 2 351536 CASAVA_Build 9 137950247 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1780 hom 19 5 12 2 A 10 11 351537 CASAVA_Build 9 137954135 4D CGTGCCCAGC CTTT/---- CTATTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 CTTT 1 0 351538 CASAVA_Build 9 137992258 1D GATGCTGCTG A/- AAAAAAACCT 3070 hom 70 het 27 0 24 4 A 8 7 351539 CASAVA_Build 9 137996561 1D CCTCCTCCAG C/- TCCTGGGGAC 3070 hom 83 het 35 0 22 14 C 1 0 351540 CASAVA_Build 9 138026836 1I GGAGTTGGGT -/A ACACGCGCCT 3070 hom 45 het 16 0 13 3 A 1 2 351541 CASAVA_Build 9 138032400 1D TGCCCGGGGC G/- GGGGGGGGGG 1003 hom 12 het 13 0 4 9 G 11 10 351542 CASAVA_Build 9 138035453 2I ACCTTCCCAC --/CT CCAGGACTGC 3070 hom 63 het 25 0 19 6 CT 0 1 351543 CASAVA_Build 9 138039098 4D GTGCACACAT ACAC/---- ACAGACGCGC 979 het 979 ref 22 12 4 7 AC 3 1 351544 CASAVA_Build 9 138039182 8D13M2I ACAGACGCGC ACACACAGACGCACAGACGTG--/--------ACGCACAGACGTGCA CACACACAGA 3070 het 1045 hom 33 6 15 15 N/A 0 0 351545 CASAVA_Build 9 138046662 1I TGAAGGACAC -/T GATGTCCAGG 3070 hom 102 het 35 0 31 4 T 0 1 351546 CASAVA_Build 9 138049476 4D TTCACTAGGG AATC/---- AATCCCACTG 3070 het 3070 hom 38 13 19 7 AATC 2 1 351547 CASAVA_Build 9 138050914 1I TGTTCATGGC -/A AGAGACAGGA 2033 het 2033 ref 23 14 7 2 A 1 2 351548 CASAVA_Build 9 138054591 1D ACCGTGCCTG T/- TAAGACACAG 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 T 2 1 351549 CASAVA_Build 9 138061379 11D GAGGTATGCC TGGTACAGCTG/----------- CAGCCCTGCA 1559 het 1559 ref 19 13 5 3 TGGTACAGCTG 1 0 351550 CASAVA_Build 9 138064050 1D ACTTACGAGG A/- AAAAAAAAAC 1007 het 1007 ref 43 36 4 3 A 10 9 351551 CASAVA_Build 9 138099285 1D CGGGCAGATC A/- CGAGGTCAAG 3070 het 753 hom 16 3 11 2 A 1 0 351552 CASAVA_Build 9 138102336 1D AAGGAATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 7 A 12 11 351553 CASAVA_Build 9 138105322 1I ATGTTTGCAG -/A AAAGTCGACT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 4 351554 CASAVA_Build 9 138106120 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 12 0 10 2 A 11 12 351555 CASAVA_Build 9 138122537 1D GCAGCATGGC T/- TTGCCGTTCA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 3 2 351556 CASAVA_Build 9 138133108 1D GCAGTACACT G/- GGGCTCTCTC 2721 het 2387 hom 22 8 10 4 G 4 3 351557 CASAVA_Build 9 138137407 2D TTTGGGTCTC TT/-- TTGCAGAAGA 1826 het 1826 ref 23 15 7 2 T 4 2 351558 CASAVA_Build 9 138144800 2I ACCAAGGGTG --/GA GAGCAGTGAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 GA 1 2 351559 CASAVA_Build 9 138149899 1D AGGGTCTCGC G/- GCCCGCGGCT 1528 hom 24 het 10 0 7 3 G 2 1 351560 CASAVA_Build 9 138185475 1D CCCAGCACAC A/- AGGAAGGGCC 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 2 1 351561 CASAVA_Build 9 138189587 2I CAGAGCTATG --/AT AGCTCCGAGG 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 AT 0 1 351562 CASAVA_Build 9 138198978 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 A 10 9 351563 CASAVA_Build 9 138212187 3I TGAGCTTGAA ---/CTT CTATCAGCCC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 CTT 0 1 351564 CASAVA_Build 9 138244911 12D TTTTGTTGTG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 2210 hom 33 12 10 14 T 22 10 351565 CASAVA_Build 9 138245635 2I TGATAAGCAA --/AC ACAGTGGTGG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 AC 1 2 351566 CASAVA_Build 9 138277804 4D TGAATTTCAG ACAA/---- ACAGTGAGTC 3070 hom 44 het 16 0 11 7 ACAA 1 0 351567 CASAVA_Build 9 138288176 1I GCCACCATGG -/A AAAAAAAGTC 2455 het 2455 ref 27 17 7 3 A 7 8 351568 CASAVA_Build 9 138296426 1D ACCCCAGCTC A/- CCTTTTTTTT 667 het 667 ref 28 10 7 11 A 1 0 351569 CASAVA_Build 9 138300342 1D GCAACAACTG A/- AAAAATCACG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 6 5 351570 CASAVA_Build 9 138358988 1D TGGGCAGAGA T/- TAACAGCCTG 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 T 2 1 351571 CASAVA_Build 9 138362005 1I TTCCATCCCA -/T TTTTTCCGTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 5 6 351572 CASAVA_Build 9 138379232 3I TGCCCAAGAA ---/AGG AGGGGGATCC 2066 het 2066 ref 22 10 7 5 AGG 1 2 351573 CASAVA_Build 9 138399839 2D CCCCCCCTTT TG/-- TTTTTTTTGA 2334 het 1804 hom 25 12 7 6 TG 1 0 351574 CASAVA_Build 9 138405829 8D AAAGAACTGA GTCCTTAC/-------- TCAGGAAACC 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 GTCCTTAC 1 0 351575 CASAVA_Build 9 138420983 2D CTGCTGACCT CA/-- GGTGATCCAC 2773 het 347 hom 9 1 7 2 CA 1 0 351576 CASAVA_Build 9 138422599 1I ACGCCTGTAC -/T CCCAGCACTG 1966 het 1966 ref 25 8 8 18 T 0 1 351577 CASAVA_Build 9 138432045 1D TATACATATG T/- TTTTTTTTTT 2089 het 2089 ref 17 7 7 3 T 13 12 351578 CASAVA_Build 9 138437180 1D CTGAGAACTC A/- ACGTCTGTCA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 2 1 351579 CASAVA_Build 9 138440145 2D GCTCCATCTC CG/-- GGGTTCACAC 2421 het 2421 ref 16 9 6 1 CG 1 0 351580 CASAVA_Build 9 138442070 2D TAGTAGAGAT GG/-- GGGGGGGGGG 1934 het 87 hom 10 1 6 3 G 13 11 351581 CASAVA_Build 9 138444335 3D CCACACCCAG CCC/--- CCCAGCTGGG 1381 het 1381 ref 20 9 8 4 C 6 3 351582 CASAVA_Build 9 138450416 1I ACTGGACACG -/A TTAAATCATG 3070 het 3070 hom 34 8 17 9 A 0 1 351583 CASAVA_Build 9 138452871 4D ACCCGCCAGG CCCT/---- CCCTACCTGC 1321 hom 29 het 13 0 6 7 CCCT 2 1 351584 CASAVA_Build 9 138457503 2I CCTCGTGTCG --/AC ACAGAGCTCC 2989 het 2989 ref 35 18 10 7 AC 1 2 351585 CASAVA_Build 9 138461351 1D CAGGCAAATC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 A 10 9 351586 CASAVA_Build 9 138485578 1D TCGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2950 hom 24 11 9 4 A 11 10 351587 CASAVA_Build 9 138494273 1D AAACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 8 5 A 11 10 351588 CASAVA_Build 9 138503401 1D CCTGCCTCAG C/- CCCCCCAAGT 3070 het 3019 hom 38 10 15 13 C 7 6 351589 CASAVA_Build 9 138515713 1D TCTCAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 5 het 5 ref 13 6 1 6 A 10 9 351590 CASAVA_Build 9 138544861 1D CACCAAAGTG C/- CCCCGCAGGC 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 C 5 4 351591 CASAVA_Build 9 138579881 2I AAACCATCCC --/CT GTCTGTCTAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 CT 0 1 351592 CASAVA_Build 9 138583702 2D TTGTGTGTAC GT/-- GTGTGTGTGC 3070 het 3070 hom 71 28 32 11 GT 5 4 351593 CASAVA_Build 9 138587156 1I GCATGCTGAG -/C TTTCCACCTG 3070 hom 57 het 42 0 27 15 C 0 1 351594 CASAVA_Build 9 138588070 3D TTATAACCTC ATT/--- ATTGATTTGT 3070 het 3070 hom 26 11 13 4 ATT 2 1 351595 CASAVA_Build 9 138588140 1D GTTCACAAGG A/- ATTTCCCCGC 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 A 2 1 351596 CASAVA_Build 9 138592617 8D CCCACACCGG GGCTAGCT/-------- GGCTAGCTAT 2998 het 1897 hom 18 6 10 5 GGCTAGCT 2 1 351597 CASAVA_Build 9 138593021 1D GGAAGCCCAG C/- CGGGAAGCTC 2973 het 2858 hom 25 11 8 7 C 2 1 351598 CASAVA_Build 9 138593478 3D TGGCCTCCGA AGG/--- AGATGTGGGG 1572 het 1572 ref 29 11 8 11 AGG 1 0 351599 CASAVA_Build 9 138598363 9D GAGCTGGGAG GGGCGGGAA/--------- GGGCGGGAAG 2897 hom 69 het 30 0 18 14 GGGCGGGAA 2 1 351600 CASAVA_Build 9 138610355 1D ATACTTGCTT G/- GGGGGGCTGA 3070 hom 48 het 21 0 16 5 G 7 6 351601 CASAVA_Build 9 138622727 1D6M3D AAGGAGGGAA GGAGGGAAGG/-GAGGGA--- AGGAGGGAGG 563 het 563 ref 17 8 3 9 N/A 0 0 351602 CASAVA_Build 9 138644327 6I TGCCCAAGAC ------/TGGGCA CCATCCTGGA 3070 het 2495 hom 29 8 14 7 TGGGCA 0 1 351603 CASAVA_Build 9 138645442 2D ACACATGCTT AC/-- ACACACACGC 3070 het 3070 ref 91 43 34 17 AC 5 4 351604 CASAVA_Build 9 138654407 4D GAGACAGGGT CTTA/---- CTATGTTGCC 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 CTTA 1 0 351605 CASAVA_Build 9 138666112 1I GCCTCATTCC -/T TTTTTTTTTT 1404 het 155 hom 12 1 6 5 T 15 16 351606 CASAVA_Build 9 138669500 1I CATGGGGGTG -/A TCCTGCCTGA 3070 het 1995 hom 29 5 17 7 A 0 1 351607 CASAVA_Build 9 138671919 1D CAGGGAGGGA C/- CCCCCACACC 3070 hom 57 het 25 0 13 13 C 6 5 351608 CASAVA_Build 9 138711789 8I GTGTGAGAGC --------/GTGTGCGT GTGTGCGTGC 3070 hom 75 het 38 0 23 15 GTGTGCGT 1 2 351609 CASAVA_Build 9 138716580 1D TGTCTCGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1729 hom 30 7 13 10 A 14 13 351610 CASAVA_Build 9 138719326 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 17 2 12 3 T 18 16 351611 CASAVA_Build 9 138721731 6D GGGATGAGGT AGGTGG/------ AGGTGGGTCC 3070 het 3070 ref 43 15 10 18 AGGTGG 2 1 351612 CASAVA_Build 9 138721959 1I GGGAGGCCGA -/G GGGGGGTGGA 955 het 955 ref 14 8 4 2 G 6 7 351613 CASAVA_Build 9 138723290 2D CGGAGCGAGA CT/-- CTATCTCAAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 CT 2 1 351614 CASAVA_Build 9 138737061 2D GAGTGAGCTG AC/-- ACATTGCTGG 3070 het 2345 hom 26 10 11 5 AC 2 1 351615 CASAVA_Build 9 138740809 5D TGATCCAGCG CGTAC/----- CTCACCTGAC 3070 hom 105 het 38 0 35 6 CGTAC 1 0 351616 CASAVA_Build 9 138740929 1D GGCCAGCCTA G/- CCCAGCGCGA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 G 1 0 351617 CASAVA_Build 9 138764618 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAACAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 6 7 351618 CASAVA_Build 9 138765536 1I ATTATTCAAA -/G CCTGTGTACA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 G 0 1 351619 CASAVA_Build 9 138765990 1I TCTGCGTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 9 10 351620 CASAVA_Build 9 138770985 1I GAGTATCCCA -/G GGCCTGGAGC 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 2 3 351621 CASAVA_Build 9 138773466 1I CCAGCTCCCC -/G CCCCGGCACC 2103 hom 47 het 20 0 11 9 G 0 1 351622 CASAVA_Build 9 138782815 1D7M7D CGCTCTGTCG CCCCAGGCGGGACTG/-CCCAGGC------- CGGACTGCAG 3070 hom 30 het 13 0 11 5 N/A 0 0 351623 CASAVA_Build 9 138786139 1I AAGAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2544 het 2544 ref 30 16 9 5 A 12 13 351624 CASAVA_Build 9 138787654 1I GTGCCAGTTC -/G GGGAGTGGCC 3070 het 3070 hom 47 18 22 7 G 3 4 351625 CASAVA_Build 9 138789019 1D CTCCTACCCT C/- AGGGCTGCGG 3070 het 3070 hom 42 13 18 11 C 1 0 351626 CASAVA_Build 9 138799231 5I TGCAGCCATC -----/TTTTG TTTTGGCCAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 TTTTG 1 2 351627 CASAVA_Build 9 138800351 1D TAACTTTCTC T/- TTTCCTAACT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 4 3 351628 CASAVA_Build 9 138804580 1D GATCTAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 A 11 10 351629 CASAVA_Build 9 138811236 3I GGTCTGTGCT ---/GAG GAGGAGTAGT 2895 het 2895 ref 19 11 7 1 GAG 2 3 351630 CASAVA_Build 9 138813274 7D CCCCCTGGAC CCTGGGG/------- CCTGGGGCCT 1810 het 1704 hom 22 8 6 9 CCTGGGG 2 1 351631 CASAVA_Build 9 138816509 2I ATGGGGACAC --/TG AGAGAGATTA 3070 hom 144 het 52 0 47 5 TG 0 1 351632 CASAVA_Build 9 138823113 1D CATTCTCGCC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2810 hom 30 10 16 5 T 9 8 351633 CASAVA_Build 9 138911446 4D CCGGGACGCT GAGG/---- GAGGAAGAGC 3070 het 2292 hom 23 8 9 7 GAGG 2 1 351634 CASAVA_Build 9 138911578 4I CTTGGTGCTT ----/AGAG AGGCAGAAGG 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 AG 1 3 351635 CASAVA_Build 9 138965299 9I GGACCTGGGG ---------/GGAGGAGGT GGCCTGGACA 2554 hom 18 het 8 0 7 1 GGAGGAGGT 0 1 351636 CASAVA_Build 9 138975690 23D CCTGCAGGGA CAGGGCTGCGAGGGGACTGCCTG/----------------------- CAGGGCTGCT 2081 hom 23 het 11 0 9 3 CAGGGCTGCGAGGGGACTGCCTG 1 0 351637 CASAVA_Build 9 138992113 21D GCGCGCAGGA AGGAGGCTGGGTAGCCGCCCG/--------------------- AGGAGGCTGC 2585 hom 41 het 13 0 10 8 AGGAGGCTGGGTAGCCGCCCG 1 0 351638 CASAVA_Build 9 139051504 6I GTGAAGGATG ------/GTGGGC GTGGGCGTGG 3070 hom 45 het 22 0 13 9 GTGGGC 2 3 351639 CASAVA_Build 9 139069064 2I GCCGAGAAAC --/AG AGGAGAAGCA 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AG 1 2 351640 CASAVA_Build 9 139087724 13D CTGTCCTGAG CTCTGACCACTTC/------------- CTCCTTCACT 3029 het 3029 ref 26 20 8 2 CTCTGACCACTTC 1 0 351641 CASAVA_Build 9 139115183 1I ATGAGCCACC -/A ACGCCCAGCC 3070 het 2479 hom 22 9 11 2 A 1 2 351642 CASAVA_Build 9 139116325 4I CTGTTACACA ----/CATT CATGCTGTTG 3070 het 3070 ref 90 56 16 18 CATT 0 1 351643 CASAVA_Build 9 139121163 3I TGTCAAAAAG ---/AAC AACGAAATCC 2258 het 26 hom 13 1 7 5 AAC 1 2 351644 CASAVA_Build 9 139124680 16D GACCTGAGCG TTGTGGAGCCTCTACC/---------------- TTGTGGAGCA 2552 het 2552 ref 30 13 12 10 TTGTGGAGCCTCTACC 1 0 351645 CASAVA_Build 9 139130473 1I TTGATGCCCC -/T TCTGGGCAGC 3070 hom 60 het 25 0 18 7 T 1 2 351646 CASAVA_Build 9 139132267 1D CATTTTGTCC T/- TTTTTTTTTT 2034 het 2034 ref 41 27 7 7 T 11 10 351647 CASAVA_Build 9 139138086 1D CGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 13 10 11 T 17 16 351648 CASAVA_Build 9 139148112 2D TTATCATCTC AA/-- GAGATACAGA 3070 het 3070 ref 34 22 11 1 A 2 0 351649 CASAVA_Build 9 139200732 2D GTGCATGCAG CA/-- CACACACACA 1012 het 1012 ref 27 18 3 6 CA 9 8 351650 CASAVA_Build 9 139228737 2D GCCGTGGGTC TG/-- GGGTTCGGAG 3070 hom 57 het 21 0 16 5 TG 1 0 351651 CASAVA_Build 9 139268675 1D TGTGGGAACA G/- GAGCTCTGCT 3070 hom 60 het 25 0 17 9 G 2 1 351652 CASAVA_Build 9 139275931 9D ACTCCGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 159 hom 17 3 13 5 A 20 11 351653 CASAVA_Build 9 139288729 1D AGGGCTTTGG T/- TGGGAGCTGG 3070 hom 54 het 22 0 14 8 T 2 1 351654 CASAVA_Build 9 139357717 1D TATCCATTAG T/- TTGACTGCAG 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 3 2 351655 CASAVA_Build 9 139383894 1D CTCCCTCCGA G/- GGACAGACTT 1700 hom 26 het 12 0 8 4 G 3 2 351656 CASAVA_Build 9 139387951 3D CGCAGAGAGG TTT/--- TTTAAAATTT 3070 het 3070 hom 25 8 13 4 T 6 3 351657 CASAVA_Build 9 139403610 1D TGGCACGGAG C/- CCCTTGCTCT 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 C 4 3 351658 CASAVA_Build 9 139412209 2D36M1I GAGCGAGACC CTGTCTCAAGAAAACCCCAAAAAACCATGAATAAAGTT-/--GTCTCAAGAAAACCCCAAAAAACCATGAATAAAGTTA AAAAAATATG 3070 het 3070 ref 32 25 20 7 N/A 0 0 351659 CASAVA_Build 9 139420651 2I TGGCAGCAAG --/TT TTATCTGGAG 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 T 2 4 351660 CASAVA_Build 9 139444590 3D AACATGGCGG AGA/--- AGAAGAACTC 1911 het 1868 hom 17 8 5 6 AGA 3 2 351661 CASAVA_Build 9 139552110 1D CAGAAAGAAC A/- AAGAAATAAT 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 A 3 2 351662 CASAVA_Build 9 139564061 1I CCGTCTTGGG -/A AAAAAAAAAA 880 het 880 ref 31 15 3 13 A 11 12 351663 CASAVA_Build 9 139597908 26I AAAGGCATGT --------------------------/GCTGTACAGAACAGGCCCTGGAGCGA GCACTGGCTG 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 GCTGTACAGAACAGGCCCTGGAGCGA 0 1 351664 CASAVA_Build 9 139602719 10D GCCAGGCCAT GTGGGCCACA/---------- GTGGGCTCCA 3070 het 3070 ref 46 20 16 14 GTGGGCCACA 1 0 351665 CASAVA_Build 9 139624844 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1468 hom 14 het 7 0 4 3 T 10 11 351666 CASAVA_Build 9 139625856 4D ACAACAACAA CAAC/---- AAAAAAACAA 1938 het 1938 ref 21 14 5 2 CAAC 1 0 351667 CASAVA_Build 9 139641057 1D TCTTGCAGAA T/- TTTTTTTTTT 2065 het 1245 hom 22 8 5 11 T 19 18 351668 CASAVA_Build 9 139653016 1I GTGTCCTCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 13 12 A 10 11 351669 CASAVA_Build 9 139653503 1D TTGTTAGATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 10 9 351670 CASAVA_Build 9 139672125 1I ATCCTTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 11 12 351671 CASAVA_Build 9 139680818 1D AGGCTGTGCA G/- GGCAAGGGCT 3070 het 3070 ref 41 17 17 8 G 3 2 351672 CASAVA_Build 9 139686791 2I CTGGCAACTC --/AT GTGGACAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 AT 0 1 351673 CASAVA_Build 9 139689678 3D GGTGACCAAT AGG/--- GGGGTTGGTG 3070 het 3048 hom 25 9 12 4 AGG 1 0 351674 CASAVA_Build 9 139691162 1D TTGCTGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 11 10 351675 CASAVA_Build 9 139700222 4I TCATTTATTT ----/AGTC AGTCAGTCAG 3070 het 3070 hom 50 14 18 18 AGTC 4 5 351676 CASAVA_Build 9 139700503 1I AATTTATCTG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 T 6 7 351677 CASAVA_Build 9 139710365 1D ATATTAATTG T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 7 6 351678 CASAVA_Build 9 139715548 1D TTCACATTTC T/- TTTTTTTTTT 1309 het 1309 ref 26 12 3 11 T 12 11 351679 CASAVA_Build 9 139723941 6I TTTGCAGCCT ------/CTTATA CTTCTTACCT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 CTTATA 0 1 351680 CASAVA_Build 9 139724844 4D TTTCTTGATT TATC/---- TATTTCTATA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 TATC 1 0 351681 CASAVA_Build 9 139733014 4D TAGTTCTCTC TCTT/---- TTTCTTTTTC 1362 het 1362 ref 20 13 5 3 TCTT 1 0 351682 CASAVA_Build 9 139764537 2I AGATTTTCTC --/TG TAGAAAATTT 3070 het 3070 hom 49 17 26 6 TG 0 1 351683 CASAVA_Build 9 139777458 9I GCCCAGAACT ---------/GCCCAGAAC GTGGTTTCCT 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 GCCCAGAAC 0 1 351684 CASAVA_Build 9 139783538 1D GCTTTAAGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 9 8 351685 CASAVA_Build 9 139786636 4I TTAATAAAAC ----/AGTG AGACACTAAA 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 AGTG 0 1 351686 CASAVA_Build 9 139814810 2D TTCAGCTCCC GT/-- GTGTGTGCCA 3070 het 3070 ref 43 20 14 10 GT 4 3 351687 CASAVA_Build 9 139857487 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCGAA 1786 het 947 hom 17 3 8 8 CT 2 1 351688 CASAVA_Build 9 139858972 1D TTACCACCCT A/- GACCCAGAGG 3070 hom 33 het 15 0 11 4 A 1 0 351689 CASAVA_Build 9 139859126 4D GTACAATAAT AGAG/---- AGGAGGCAGC 3070 hom 33 het 12 0 11 2 AG 3 1 351690 CASAVA_Build 9 139861379 1I CAACGCCAGT -/A TCCCATCCCA 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 0 1 351691 CASAVA_Build 9 139864769 12D TGAAGTCTCC TGGGATAATAGT/------------ TGGTGTGTCT 3070 hom 114 het 37 0 38 10 TGGGATAATAGT 1 0 351692 CASAVA_Build 9 139864884 1I GTCTTCTTTG -/A AGAATTTACC 3070 hom 141 het 54 0 47 7 A 1 2 351693 CASAVA_Build 9 139868105 1D GGCTGGCAGG T/- TTTTTTTTTT 1726 het 1726 ref 29 15 6 8 T 12 11 351694 CASAVA_Build 9 139873567 1I AGCTGGGACT -/A ACAGGCGCCC 2109 het 474 hom 10 1 6 3 A 1 2 351695 CASAVA_Build 9 139877955 1I TTGCTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 24 17 9 T 10 11 351696 CASAVA_Build 9 139885939 1D AGCCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 906 hom 17 4 10 3 A 15 14 351697 CASAVA_Build 9 139897373 4I TCTCGCTGAC ----/GGAA GGATCACAGT 3070 het 3070 hom 74 31 31 12 GGAA 0 1 351698 CASAVA_Build 9 139935323 3I ACAGCAGGCT ---/GAG GATGAGCATT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 GAG 0 1 351699 CASAVA_Build 9 139941519 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1730 het 620 hom 24 3 6 15 T 15 14 351700 CASAVA_Build 9 140014375 1D TGAAACATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 22 0 13 9 T 15 14 351701 CASAVA_Build 9 140043883 1D TTTCTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1818 het 1272 hom 25 7 9 9 T 18 17 351702 CASAVA_Build 9 140070299 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3032 het 3032 ref 21 9 9 3 A 10 11 351703 CASAVA_Build 9 140125252 1D TCCAGAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 13 12 351704 CASAVA_Build 9 140125811 1I TGGGAGTGAT -/G CAGCTGTTGC 3070 het 3070 ref 39 20 13 7 G 0 1 351705 CASAVA_Build 9 140126398 16I CAGTGCACAT ----------------/GCATGCACACACATGC GCATGCACAC 3070 het 3070 ref 41 19 10 12 GCATGCACACACATGC 0 1 351706 CASAVA_Build 9 140131562 1I TGGCTTGGGG -/T GGGGGGTCAG 3070 hom 42 het 19 0 13 6 T 0 1 351707 CASAVA_Build 9 140143578 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2386 hom 21 9 8 4 A 13 12 351708 CASAVA_Build 9 140157862 1D CGGTGTGCTG C/- TGAGCCAGGA 2940 het 2758 hom 24 9 10 5 C 1 0 351709 CASAVA_Build 9 140167656 5D TAAATTTTCC TTATT/----- TTAGAGTCCA 3070 het 3070 ref 22 13 7 5 TTATT 1 0 351710 CASAVA_Build 9 140168329 1I ATAATAATAA -/T AAAAAAAAAC 2446 het 2446 ref 12 7 5 0 T 0 1 351711 CASAVA_Build 9 140179766 4I31M7I ATCTCATATT ----TAAATGTAATTCTCCATGTTGGAGGTGGGCC-------/TAAATAAATATAATTCTCAATGTTGGAGATGGGCCTGGTGAG AGGTGATTTA 3070 het 3070 ref 87 44 11 46 N/A 0 0 351712 CASAVA_Build 9 140186287 7I12M4I AATCAATCAG -------CTGGCAAGTGGG----/CCAACACCTGGCAAGTGGGCTCT CTGTTAGAGT 3070 het 3070 ref 66 46 18 9 N/A 0 0 351713 CASAVA_Build 9 140186349 23D31M26D TACCCACTAT TACTTAAGTGAGAGGCCCTAGGGTATAATATTAGGGTGAGAGACTCAGCCCAAAGTTAGAGACCTGGGGGTGTCATACTC/-----------------------TATCATACTCAGATTAGAGGCCAAGCCCACA-------------------------- AGATTAGAGG 3070 het 3070 ref 40 58 23 18 N/A 0 0 351714 CASAVA_Build 9 140187001 1I AATTTATAAA -/G AAAAGAGGTT 3070 het 3070 ref 45 24 20 3 G 0 1 351715 CASAVA_Build 9 140187410 4D TCTGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 78 17 25 46 AAAT 4 3 351716 CASAVA_Build 9 140187980 1D CTTTGCTGCC A/- AAAAGTGACT 1566 het 1566 ref 74 55 5 14 A 5 4 351717 CASAVA_Build 9 140200989 1I TGATTAAGGT -/G ATCACGAGGT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 0 1 351718 CASAVA_Build 9 140202060 2D TTGATTTGTT AC/-- AGTTTTATTT 3070 het 3070 hom 86 33 45 11 AC 1 0 351719 CASAVA_Build 9 140204031 19I GCTATTGTGA -------------------/ACAGTGGTGAAATAAACAT ACAGTGCTGA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 ACAGTGGTGAAATAAACAT 0 1 351720 CASAVA_Build 9 140206233 1I TCTTTTATGA -/T TTTTAGCTTC 3070 hom 78 het 34 0 26 8 T 4 5 351721 CASAVA_Build 9 140207380 8D GGATGCAAAA CTCCTGGG/-------- CTTTCACGCA 2604 het 2604 ref 58 35 9 14 CTCCTGGG 1 0 351722 CASAVA_Build 9 140207465 3I CCCAAGGCCA ---/TGG TGGCTGAGCT 1324 het 1324 ref 42 26 9 7 TGG 1 2 351723 CASAVA_Build 9 140207834 6I15M1D ATATGTAACA ------ATATTTATCACAAATA/ATAATGATATTTATCACAAAT- ATATTTTGTC 3070 het 3070 hom 85 29 43 38 N/A 0 0 351724 CASAVA_Build 8 35999 2I GTGTGACGGG --/GC GTGTGCTGTG 2004 het 2004 ref 14 6 6 2 GC 0 1 351725 CASAVA_Build 8 91221 1I ACACAAATTT -/A AAAAAAAAGA 2437 hom 12 het 5 0 5 0 A 8 9 351726 CASAVA_Build 8 103442 1I AAAAATCGAT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 C 8 9 351727 CASAVA_Build 8 115529 1I CTGAAGAGCT -/C TGAGCTAGTC 3070 het 377 hom 18 1 14 3 C 0 1 351728 CASAVA_Build 8 117347 2D AAAATATCAC AT/-- AGAGAGAAAT 3070 het 340 hom 9 1 8 0 AT 1 0 351729 CASAVA_Build 8 144189 3D GCTCCTCCTC CTT/--- ATTTTCCTTC 2370 het 2370 ref 19 12 6 1 CTT 1 0 351730 CASAVA_Build 8 144906 4I AGTGAATAAT ----/AACA AACAAAAGGC 3070 hom 18 het 10 0 7 3 AACA 1 2 351731 CASAVA_Build 8 148828 1I AATTATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 12 9 23 A 11 12 351732 CASAVA_Build 8 151282 4I CAAACCTCTG ----/CTGA CTATGTGTTC 3070 het 3070 ref 46 27 12 7 CTGA 0 1 351733 CASAVA_Build 8 151824 4I AGGATATATG ----/TAGA TAGATAGATG 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 TAGA 2 3 351734 CASAVA_Build 8 153303 2D CCAGTCGAAC AT/-- ATATGCCTTG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 AT 3 2 351735 CASAVA_Build 8 171625 2I TTATATGTAC --/AG GAGATAAAAT 2666 het 2666 ref 19 12 6 1 AG 0 1 351736 CASAVA_Build 8 177097 2I GTTTTTACTC --/TA TTTTTGTGGA 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 TA 0 1 351737 CASAVA_Build 8 178906 1I AACACTGATA -/G ACAAGTAAAA 3070 het 3070 ref 42 28 8 6 G 0 1 351738 CASAVA_Build 8 184597 1I ATATAGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 26 17 9 T 10 11 351739 CASAVA_Build 8 188582 2I GCATCATAAC --/AT AGAGATTTTT 3070 het 2931 hom 30 8 18 4 AT 0 1 351740 CASAVA_Build 8 193523 1I TGCTCACATG -/T TTTTTTGCTG 3070 het 1131 hom 16 3 13 0 T 6 7 351741 CASAVA_Build 8 205070 4I CCTTAAGGTG ----/TTTT TTAAGAGCTG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 2 6 351742 CASAVA_Build 8 235515 4D ATCTACCATC TCTA/---- TCTACCATCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TCTA 2 1 351743 CASAVA_Build 8 235833 4I ATATGCACAT ----/ACAC ACATACATGT 2939 hom 18 het 7 0 7 0 AC 1 3 351744 CASAVA_Build 8 239525 3I ACCCCTTAAG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 11 14 351745 CASAVA_Build 8 274212 25D23M3I3M2D CAGCCTGAGG CTGTAAAGCCGTGGCCACTGTGCGTCTGTGTTGAAAGGATTCTGGCTG---GAAGG/-------------------------CTGTGTTGAAAGGATTCATGCTGTCACAA-- GCTTGCCAGG 3070 het 3070 ref 36 33 13 3 N/A 0 0 351746 CASAVA_Build 8 286514 1D GACAGAAAGT G/- GTAGCGGCAA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 G 2 1 351747 CASAVA_Build 8 286794 7D CACTCTCTCC CGGAAGA/------- CGGAAGACGT 3070 hom 96 het 35 0 29 7 CGGAAGA 2 1 351748 CASAVA_Build 8 311974 1I TGTGTCAGTC -/T TACCCCTACT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 T 1 2 351749 CASAVA_Build 8 314261 1I TTCTGAATTA -/C CAGCATCACC 3070 hom 117 het 44 0 38 6 C 1 2 351750 CASAVA_Build 8 321885 1D TCACCCAGGC T/- CCCACTTCCC 2697 het 2697 ref 32 15 10 7 T 1 0 351751 CASAVA_Build 8 329102 1I TTTTAAAGAC -/A AAAAAAAATG 1649 het 1649 ref 15 8 4 3 A 8 9 351752 CASAVA_Build 8 329747 1I TTTTTTTTCC -/A AAAAAAATGT 2030 het 2030 ref 19 9 6 4 A 7 8 351753 CASAVA_Build 8 338416 1I AGAAGTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 T 10 11 351754 CASAVA_Build 8 353000 4I CTTTAAAATT ----/AATG AATAAATGTT 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 AATG 0 1 351755 CASAVA_Build 8 369045 19D CAGTTCTTTT GAATATATACCCAGAAGTG/------------------- GAATTGTTGG 3070 het 3070 ref 37 27 13 5 GAATATATACCCAGAAGTG 1 0 351756 CASAVA_Build 8 369212 1I TGTTAGTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 9 10 351757 CASAVA_Build 8 382288 1D ACTCCAATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 T 13 12 351758 CASAVA_Build 8 386929 1D GGAAGGGATG A/- AAAAACTCCA 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 A 6 5 351759 CASAVA_Build 8 390200 3D CAATTGTGTA AAT/--- AATGTGATAA 3070 het 3070 ref 39 20 19 1 AAT 2 1 351760 CASAVA_Build 8 410085 1D CGACCCTGCC T/- TTTTTTAGAA 3070 het 3070 ref 33 12 12 9 T 7 6 351761 CASAVA_Build 8 413744 4I TTGTTCTTCC ----/TGTT TAAGTAAGGG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 TGTT 0 1 351762 CASAVA_Build 8 416344 2D TTATAGTGTC TT/-- TGTCTGGTTT 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 T 3 1 351763 CASAVA_Build 8 416825 3D TATTATTATA ATC/--- ATCTCCATTC 3070 het 3070 hom 26 9 15 4 ATC 2 1 351764 CASAVA_Build 8 416992 5I TGTATATTAC -----/GTTTA ATTTTTCATT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 GTTTA 0 1 351765 CASAVA_Build 8 426928 3I AACACCCACA ---/TGG TGGTGAGTCC 3070 hom 145 het 55 0 48 7 TGG 1 2 351766 CASAVA_Build 8 433761 1I TTTAACAGTG -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 8 9 351767 CASAVA_Build 8 452972 3D ATTTCACCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 27 1 20 7 A 14 11 351768 CASAVA_Build 8 458632 1I TAACTTCGAC -/A CAGTTAAAGA 3070 hom 117 het 47 0 40 7 A 0 1 351769 CASAVA_Build 8 458761 1I GATTCCACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 T 10 11 351770 CASAVA_Build 8 459075 3D CTCCAAAGAG AGA/--- AGGAGGGCTA 3070 het 3070 hom 58 21 26 11 AGA 1 0 351771 CASAVA_Build 8 461772 1I CTACTTCAGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 20 12 7 1 A 8 9 351772 CASAVA_Build 8 468838 10D TATATATGTG TGTGTATATA/---------- TGTGTGTGTG 1179 het 1179 ref 33 21 5 12 TGTGTATATA 1 0 351773 CASAVA_Build 8 469576 1I CTTCTTTGGC -/T TTTGGTTATC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 3 4 351774 CASAVA_Build 8 470213 3D TAGTTCTGTC TTG/--- TTGTTGATAT 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 TTG 3 2 351775 CASAVA_Build 8 472842 18D CCCAGCCACG ATCGTTCATTTACAAGTT/------------------ GCCTACGGCT 3070 het 3070 hom 31 14 17 6 ATCGTTCATTTACAAGTT 1 0 351776 CASAVA_Build 8 486090 4I ATCGCTTCTT ----/TCTC ACACCAAATA 3070 hom 70 het 27 0 23 4 TC 0 2 351777 CASAVA_Build 8 499041 1D TAGATACAAT A/- AAAAAATGAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 7 6 351778 CASAVA_Build 8 519966 1D CTGCGGGGGA C/- CCGCTTGCCA 3070 hom 77 het 35 0 27 9 C 3 2 351779 CASAVA_Build 8 520356 20D CCAGCTCCCA GAGGCCCCACATTCCTGGGT/-------------------- GAGGCCCCAC 2738 het 2738 ref 29 17 10 9 GAGGCCCCACATTCCTGGGT 1 0 351780 CASAVA_Build 8 520783 1D AAATTCTATC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 T 9 8 351781 CASAVA_Build 8 522490 4I GAGATAAATA ----/TTTG TTTACTATTA 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 TTTG 0 1 351782 CASAVA_Build 8 530604 2D ACTTGAAAAC AT/-- ACTAAGTGAG 3070 het 3070 hom 45 15 23 8 AT 1 0 351783 CASAVA_Build 8 530860 3I AAAATAAAAT ---/AAC AATAACAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 AAC 0 1 351784 CASAVA_Build 8 532283 1D AAAAAAGGGT C/- AAATAAGGAA 3070 het 3070 hom 51 18 29 4 C 1 0 351785 CASAVA_Build 8 532409 2D TGTCTCTCTG TC/-- TCTCTCACAC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 TC 4 3 351786 CASAVA_Build 8 534639 1D GGATAAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1499 het 1499 ref 42 27 4 11 T 13 12 351787 CASAVA_Build 8 549769 1D CGTGGCTTCA G/- GCCCTCTCTT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 G 2 1 351788 CASAVA_Build 8 561191 1D AGAAGAAATT A/- CAAGGGAAAT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 1 0 351789 CASAVA_Build 8 585518 4D CCAAACCTCA TCTT/---- TCTTCTGAAG 3070 het 3070 ref 36 17 11 8 TCTT 2 1 351790 CASAVA_Build 8 602470 1I CCAACATGGA -/G GAAACCCTTT 3070 het 1126 hom 15 5 10 0 G 1 2 351791 CASAVA_Build 8 605195 1D CAATCGCCCC T/- GATGTCACCA 3070 het 3070 ref 27 15 8 6 T 1 0 351792 CASAVA_Build 8 622078 1I TTCCATGATG -/T AGTAGGTCTT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 T 0 1 351793 CASAVA_Build 8 624462 5D AACTGTGAAG TGTTT/----- TGTAAATATT 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 TGTTT 1 0 351794 CASAVA_Build 8 626946 1I AATGCGGAGC -/G GGGGGGCAGC 2320 het 1532 hom 23 6 9 8 G 6 7 351795 CASAVA_Build 8 629123 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 7 8 351796 CASAVA_Build 8 633990 1D GTTTAGTCTT C/- CTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 52 24 22 6 C 2 1 351797 CASAVA_Build 8 635109 1I GGTGTCATTG -/A ACCTGGCTCC 3070 het 3070 ref 36 12 13 11 A 1 2 351798 CASAVA_Build 8 638222 2D ATATTCCTTT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1890 hom 31 10 14 7 TC 1 0 351799 CASAVA_Build 8 641104 1I11M5I ACCTGATTTT -AAACACACATG-----/AAAACACACATGGAAAA GCCAAGGGCC 3070 het 3070 ref 26 16 9 5 N/A 0 0 351800 CASAVA_Build 8 643344 1D AGGACAGATG A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 7 6 351801 CASAVA_Build 8 648119 1I GCTATTATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 20 18 10 A 11 12 351802 CASAVA_Build 8 666897 4I ACACACATCC ----/CAAG CAGACATGCA 3070 het 3070 ref 99 51 36 12 CAAG 0 1 351803 CASAVA_Build 8 710874 1D ATTATGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 12 11 351804 CASAVA_Build 8 718059 4I CTTTTTATTC ----/TTTT TTCTCTGAAC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 2 6 351805 CASAVA_Build 8 722238 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 36 0 30 7 A 10 9 351806 CASAVA_Build 8 741081 2I TGGTCTTCTC --/TT ACCACGCTGC 3070 hom 75 het 28 0 24 4 T 0 2 351807 CASAVA_Build 8 771367 1D CCTACCCCAG C/- CCCCCATCCC 3070 hom 33 het 15 0 12 3 C 6 5 351808 CASAVA_Build 8 782631 1D GCTTCTAACA T/- TTTGTTCTCT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 4 3 351809 CASAVA_Build 8 797873 1D TTGCACATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1007 hom 31 3 19 9 T 15 14 351810 CASAVA_Build 8 838044 2D CCTGCAGTAA GT/-- GGGTTGGAAA 3070 hom 126 het 45 0 42 3 GT 1 0 351811 CASAVA_Build 8 855548 1D CTCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2257 hom 10 het 13 0 7 6 A 12 11 351812 CASAVA_Build 8 870689 1D GCAGGTGTGC G/- GGGATTGGGA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 G 4 3 351813 CASAVA_Build 8 881820 1D ACAAAATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 11 10 351814 CASAVA_Build 8 883302 1I CATCAGTGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 9 10 351815 CASAVA_Build 8 903688 5D CTCGGTGAAT TTTAA/----- TTAATTTAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TTTAA 1 0 351816 CASAVA_Build 8 906647 5I CTCTAACAAA -----/ATGTG ATGTGATGGG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 ATGTG 1 2 351817 CASAVA_Build 8 909543 1I TGCCAGTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 21 1 14 6 A 12 13 351818 CASAVA_Build 8 917725 1I AATGTGGGGA -/G GGGCGTCGGG 3070 het 348 hom 24 2 20 2 G 3 4 351819 CASAVA_Build 8 935271 4D ACACATACAC ACAA/---- ACACACATAC 3070 het 3070 ref 64 32 29 5 ACAA 1 0 351820 CASAVA_Build 8 984370 1I AAATAATAGG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 8 9 351821 CASAVA_Build 8 987280 2D CATTTACAGT CA/-- CACACAAGTA 3070 het 3070 hom 93 37 48 9 CA 4 3 351822 CASAVA_Build 8 996747 3D TTCTCCGTGG AGA/--- AGGCATGAGG 3070 het 8 hom 19 1 15 3 AGA 1 0 351823 CASAVA_Build 8 999453 1I CATTTATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 17 11 A 11 12 351824 CASAVA_Build 8 1000929 1D GTATACTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 51 1 29 22 T 17 16 351825 CASAVA_Build 8 1024961 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 11 19 17 T 13 12 351826 CASAVA_Build 8 1025787 1I AAGCAAGGTG -/A AAAAGCTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 A 4 5 351827 CASAVA_Build 8 1040007 1D GTCCATGCAA T/- TCTGATAATA 3070 het 3070 ref 36 17 10 10 T 2 1 351828 CASAVA_Build 8 1054534 33D AGAAGAGGTT TTGGAAAACCCAACACCGTCTCTTTGACCTGTC/--------------------------------- TTGGAAAACC 2505 het 2505 ref 31 26 9 14 TTGGAAAACCCAACACCGTCTCTTTGACCTGTC 1 0 351829 CASAVA_Build 8 1061426 1I TGGTATTCTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 52 18 24 10 A 8 9 351830 CASAVA_Build 8 1071915 1I24M5I ATTTTTTGAG -TTTTAGTAATAGCCAGGAATTTGC-----/TTTTTAGTAATAGCCAGGAATTTGCATTAA ATTAATTAAT 3070 hom 90 het 29 0 30 2 N/A 0 0 351831 CASAVA_Build 8 1073708 2I CAAACCTCGT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 2630 hom 25 8 15 2 A 9 11 351832 CASAVA_Build 8 1079482 1I CGTATATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 212 hom 32 1 24 7 T 11 12 351833 CASAVA_Build 8 1085976 1I AATACTTCAA -/T TTTTTTATGT 3070 hom 116 het 41 0 39 2 T 6 7 351834 CASAVA_Build 8 1086556 1D AATTACCCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 67 het 28 0 23 5 T 10 9 351835 CASAVA_Build 8 1091834 1D ACTGATCAAA G/- TAGTAGGTGT 3070 het 3070 ref 51 23 18 10 G 1 0 351836 CASAVA_Build 8 1092035 1D TAACCATCCA T/- TAAAAACCCC 3070 hom 68 het 34 0 20 14 T 2 1 351837 CASAVA_Build 8 1096992 5I TCTTCTGTGT -----/ATTTA ATTTTTCTAT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 ATTTA 0 1 351838 CASAVA_Build 8 1112380 1I CCCTTTCTAG -/T TTCCCCCAAG 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 T 2 3 351839 CASAVA_Build 8 1114006 5D TCCAGTGCAC GACAG/----- GGGTCGTGTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 9 GACAG 1 0 351840 CASAVA_Build 8 1118029 4I AGGGCAGCAC ----/ACTT ACCATCAAGC 3070 het 3070 ref 46 23 13 10 ACTT 0 1 351841 CASAVA_Build 8 1128657 1I CGGCTCACTG -/C CAGCTCCACC 2153 het 166 hom 10 1 6 3 C 1 2 351842 CASAVA_Build 8 1139365 3D22M2I GTGTACACAT GTGGTGTGTACAGTATCTGTGTATC--/---GTGTGTACAGTATCTGTGTATCTG TGTGTATATG 3070 het 3070 ref 77 51 32 10 N/A 0 0 351843 CASAVA_Build 8 1141337 1D AGCCTGCCCC T/- GGGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 1 0 351844 CASAVA_Build 8 1158266 1I ATGTAATGCC -/T TTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 T 6 7 351845 CASAVA_Build 8 1165587 4D ATACATATGT AACA/---- AACCTGCACG 3070 het 474 hom 11 1 10 1 AACA 1 0 351846 CASAVA_Build 8 1166951 1I GGATCTTTTG -/T TTTTTCTGTG 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 T 5 6 351847 CASAVA_Build 8 1172396 27D ACGCATAGCA TCGTGTCTAGTTCTCTCACACATAGCG/--------------------------- TTGTGTCTAA 3070 hom 115 het 26 0 34 14 TCGTGTCTAGTTCTCTCACACATAGCG 1 0 351848 CASAVA_Build 8 1179153 1I GTAAGTGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 10 11 351849 CASAVA_Build 8 1180345 4D TGGATGGATT GATA/---- GATGGATGGA 3070 hom 196 het 71 0 62 9 GATA 1 0 351850 CASAVA_Build 8 1182022 9I AAATCCAGCC ---------/CCACCTGCT CCATACACCA 3070 hom 99 het 38 0 30 8 CCACCTGCT 0 1 351851 CASAVA_Build 8 1185216 1D3M2D GATCAGTGTG TGAGTC/-GAG-- TGATGGTCCA 1955 het 626 hom 35 7 9 19 N/A 0 0 351852 CASAVA_Build 8 1186108 1D GGGAAGAGGA C/- TGGGCATAGG 3070 hom 61 het 22 0 18 4 C 1 0 351853 CASAVA_Build 8 1187625 1I ATAAATCTGC -/T CCCCAGAAAC 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 0 1 351854 CASAVA_Build 8 1194933 1I TGTGCTCGCT -/C CCCCAGATTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 4 5 351855 CASAVA_Build 8 1201575 5D GGATGAAAAC AAAAG/----- AAAGGGGATC 3070 hom 64 het 26 0 21 6 AAAAG 1 0 351856 CASAVA_Build 8 1229502 4I AGTATTTCTT ----/TCTA TCTGTTATTC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TCTA 0 1 351857 CASAVA_Build 8 1230555 1D AAAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 38 0 33 5 T 11 10 351858 CASAVA_Build 8 1233111 2I CACGCGAGAC --/AG GGAGGAGAAA 3070 hom 156 het 56 0 49 7 AG 0 1 351859 CASAVA_Build 8 1235935 2D ATATATATAT AC/-- ACACACATAC 3070 hom 78 het 37 0 27 10 AC 4 3 351860 CASAVA_Build 8 1237122 2I TTTTTTTTTT --/TC TTAATGAAGT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 TC 0 1 351861 CASAVA_Build 8 1242248 1D AATAGTGTGG T/- TAAGTGCTGG 3070 hom 114 het 40 0 38 3 T 2 1 351862 CASAVA_Build 8 1242757 5I TAAATAACTA -----/CAACT CAACAGCAAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 CAACT 0 1 351863 CASAVA_Build 8 1243514 3I TTGGAGACAA ---/TGG TGGCACAATG 3070 het 3070 hom 51 23 21 7 TGG 1 2 351864 CASAVA_Build 8 1278103 1I GGCCGTGCGG -/C CTCAGTCGCA 3070 hom 129 het 48 0 43 5 C 1 2 351865 CASAVA_Build 8 1297686 1I AGTTAGCGTA -/G CTTCAAACCC 3070 hom 80 het 33 0 24 9 G 0 1 351866 CASAVA_Build 8 1313344 3D TCCAGCACAG CTT/--- CTTCATGTTT 3070 het 3070 ref 34 14 10 10 CTT 2 1 351867 CASAVA_Build 8 1324890 1I GGAAGGCGAC -/G GTGGCTTCCT 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 G 1 2 351868 CASAVA_Build 8 1325915 11D GTATGACCTT TTAAAACTCCG/----------- TTTATTAAAA 3070 het 3070 ref 51 28 27 4 TTAAAACTCCG 1 0 351869 CASAVA_Build 8 1344010 3D CTTGCGTAAT CTC/--- CACGAGCATC 3070 het 3070 ref 36 25 11 1 CTC 1 0 351870 CASAVA_Build 8 1348445 1D GATTACAGTG C/- CTCTCGCATG 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 C 2 1 351871 CASAVA_Build 8 1350260 1D GTGTCTTGCC T/- TTACAAGCAT 3070 het 3070 ref 34 17 9 8 T 3 2 351872 CASAVA_Build 8 1351034 1I CCCCAGCCCC -/T TTTTTCCCTC 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 T 5 6 351873 CASAVA_Build 8 1362471 1D ATGAAAGGGG A/- AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 38 20 15 4 A 7 6 351874 CASAVA_Build 8 1363729 4D TCAAAATAGA AAAC/---- AAAATGCTAG 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 AAAC 1 0 351875 CASAVA_Build 8 1367230 1I ACCGGGGCTT -/G GTCCTTCCAG 3070 het 3070 hom 43 15 18 10 G 1 2 351876 CASAVA_Build 8 1367325 1D TCAGCCTTCC T/- TTTCTTTAGT 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 T 4 3 351877 CASAVA_Build 8 1369195 4I GCAGCTGACC ----/GACT GACTTGGAAT 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 GACT 1 2 351878 CASAVA_Build 8 1380652 1D CAGATCATTC T/- TTTTTTTTTT 2151 het 207 hom 11 2 6 3 T 15 14 351879 CASAVA_Build 8 1387086 1D GCACCACCCC T/- GGTCCCATAA 2379 het 2379 ref 28 15 10 5 T 1 0 351880 CASAVA_Build 8 1392425 10I TCAGCAGGCT ----------/GTGCCAGGCC GTGCACTGGT 2152 het 2152 ref 56 33 9 14 GTGCCAGGCC 0 1 351881 CASAVA_Build 8 1399958 16D AGGATGGCAC CCTTCCGGAATGGCAT/---------------- CCTTCCAGGA 3070 het 3070 hom 48 17 16 21 CCTTCCGGAATGGCAT 1 0 351882 CASAVA_Build 8 1402097 2D CATCTCAATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 63 hom 37 2 16 20 TG 10 9 351883 CASAVA_Build 8 1406308 12D CACGGCCTCC CCTTCCCCGACT/------------ CCTTCCCCGA 1951 hom 18 het 8 0 7 2 CCTTCCCCGACT 2 1 351884 CASAVA_Build 8 1407262 3I GGGAAATGCC ---/TCT TCTTCAAGAC 3070 het 2986 hom 33 8 20 5 TCT 1 2 351885 CASAVA_Build 8 1422205 2I GCCACAACAC --/TT TAACAGAACT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 1 3 351886 CASAVA_Build 8 1423602 2D CATCATCGCT GA/-- GAGTCTTCGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 GA 2 1 351887 CASAVA_Build 8 1426965 1D CTGCTCCCCC T/- GACCTCGGAG 1124 het 1124 ref 14 7 4 3 T 1 0 351888 CASAVA_Build 8 1429617 1I TTCTGCATCG -/C GGGGGGGCAG 2391 het 2391 ref 32 11 7 14 C 0 1 351889 CASAVA_Build 8 1433953 1D CAAAATAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 13 12 351890 CASAVA_Build 8 1447406 4D TAGTGTAAGA CAAT/---- CAGTAGGTCA 3070 het 3070 ref 59 27 24 11 CAAT 1 0 351891 CASAVA_Build 8 1469696 1D AATATAATCA C/- CCAAAACCGT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 C 3 2 351892 CASAVA_Build 8 1470361 4D GTGTACGTGT GTGA/---- GTGTAAGTGT 3070 het 3070 hom 33 14 15 6 GTGA 1 0 351893 CASAVA_Build 8 1487207 2D AGAATGAACC CA/-- CACACCGTCA 3070 het 3070 hom 61 24 25 13 CA 3 2 351894 CASAVA_Build 8 1494434 8D GCACACACAC ATACACAT/-------- ATACGTACTT 3070 hom 161 het 60 0 50 16 ATACACAT 1 0 351895 CASAVA_Build 8 1500878 1D CCTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 33 1 23 9 T 12 11 351896 CASAVA_Build 8 1509192 2I TATGCAGGAA --/AC ACATCACGTG 3070 hom 90 het 34 0 29 5 AC 1 2 351897 CASAVA_Build 8 1512798 2D TAAAATCACA AC/-- ACACTTTTTA 3070 hom 108 het 39 0 35 4 AC 3 2 351898 CASAVA_Build 8 1520611 5D GCTTTACTTA TTCTT/----- TTCTGTTATT 3070 hom 111 het 42 0 38 5 TTCTT 1 0 351899 CASAVA_Build 8 1520941 3D GGTGGCCGAG CCA/--- GGAGAATTGC 2667 hom 21 het 9 0 8 5 CCA 1 0 351900 CASAVA_Build 8 1524379 13D CCTGTAATCC CAGCTACTCAGAA/------------- GGCTGGAGCA 3070 het 3070 ref 23 12 8 7 CAGCTACTCAGAA 1 0 351901 CASAVA_Build 8 1527115 6I CCTCCTCCCA ------/CTCCAC CTCCACCTCC 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 CTCCAC 2 3 351902 CASAVA_Build 8 1552379 1D CACGTCATGT G/- GGGTTTGGTG 3070 hom 98 het 40 0 33 8 G 4 3 351903 CASAVA_Build 8 1591177 2D ATAATTAAAC AT/-- GTGTTTAAAG 3070 het 3070 ref 48 28 18 3 AT 1 0 351904 CASAVA_Build 8 1612541 4D GTAAAACGAT AGAA/---- AGACAGCAAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 6 AGAA 1 0 351905 CASAVA_Build 8 1637944 1I TTAAAAAAAA -/C ACACACACGA 3070 het 3070 ref 36 24 9 3 C 0 1 351906 CASAVA_Build 8 1638873 1I TGAAAAATGC -/A AAAAAAAAAA 1549 het 1549 ref 31 19 4 8 A 13 14 351907 CASAVA_Build 8 1644751 1D GGACAACCCT C/- CCCCCAGCAC 3070 hom 63 het 27 0 22 6 C 6 5 351908 CASAVA_Build 8 1661539 3D GCCATCTCAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 26 11 12 3 AAT 4 3 351909 CASAVA_Build 8 1661629 1I TAAGGCATAT -/G AAAAGGACAT 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 G 0 1 351910 CASAVA_Build 8 1666581 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 25 0 24 5 A 11 9 351911 CASAVA_Build 8 1671999 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 9 10 351912 CASAVA_Build 8 1683192 1D GAGCCACTGC A/- ACCTGGCTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 2 1 351913 CASAVA_Build 8 1684378 7I TTCCAGGTCA -------/GGCTTTT GGCTTTTGTG 3070 hom 53 het 19 0 16 3 GGCTTTT 1 2 351914 CASAVA_Build 8 1688891 1D TGCCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 3 2 351915 CASAVA_Build 8 1689210 1I CTGTAATCCC -/A ACACTTTTGG 2233 hom 12 het 5 0 5 0 A 1 2 351916 CASAVA_Build 8 1692197 1I AATAGTAACA -/G GGATGAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 2 3 351917 CASAVA_Build 8 1693902 3D TGTCAACACA AAG/--- AGTCAAATTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AAG 1 0 351918 CASAVA_Build 8 1701964 1D CAGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1192 het 231 hom 29 2 6 22 T 17 16 351919 CASAVA_Build 8 1737854 2D TACGCCTCAT TG/-- TATCCTCTCC 3070 hom 87 het 32 0 24 8 TG 1 0 351920 CASAVA_Build 8 1742865 1D AATGAAAGTT C/- CAGGTGCTTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 2 1 351921 CASAVA_Build 8 1743371 2D CTGGGGAAAC TG/-- AAGATGTGGA 3070 hom 123 het 45 0 42 5 TG 1 0 351922 CASAVA_Build 8 1752351 1D CCGGGAGAGC G/- GGGGGGTGCT 2299 het 730 hom 10 3 6 1 G 7 6 351923 CASAVA_Build 8 1761974 15D TGCGTGTGTT TGTGTGTGTGCTGTG/--------------- TGTGTGTGCG 3070 het 3070 ref 54 32 18 12 TGTGTGTGTGCTGTG 1 0 351924 CASAVA_Build 8 1767812 1D GAGTTGCGGT G/- GGCGGGGGGC 3016 hom 38 het 18 0 11 7 G 3 2 351925 CASAVA_Build 8 1771756 1D TCTGCCATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 606 hom 18 2 15 1 A 12 11 351926 CASAVA_Build 8 1776841 1D TAGGGTAAAA G/- TAATCTATGT 3070 het 3070 ref 38 21 11 7 G 1 0 351927 CASAVA_Build 8 1790135 1I TCTGCCAGTC -/T TTTCAATGAC 3070 het 3070 hom 45 19 19 7 T 3 4 351928 CASAVA_Build 8 1793296 1I CAGCCTCTTG -/T TTTCTTCTCT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 3 4 351929 CASAVA_Build 8 1813768 1D GTTTTTCGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 4 hom 36 1 31 4 T 10 9 351930 CASAVA_Build 8 1823195 30D AGGTGAGGGT TGTGAGGAGACTGTGAGTGAGCTGAGAGTC/------------------------------ TGTGAGGAGA 3070 het 3070 ref 33 21 11 10 TGTGAGGAGACTGTGAGTGAGCTGAGAGTC 1 0 351931 CASAVA_Build 8 1825704 30D TGAGAAAACG GAGTGGGGTGAGGGTTTGTGAGGAGACACT/------------------------------ GAGTGGGGTG 2831 het 1698 hom 33 13 9 23 GAGTGGGGTGAGGGTTTGTGAGGAGACACT 2 1 351932 CASAVA_Build 8 1828274 1D TATATGGGGT G/- GGTGTGTACA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 G 3 2 351933 CASAVA_Build 8 1831834 3D GAGTTTCAAA TCT/--- TCTGTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 TCT 2 1 351934 CASAVA_Build 8 1837561 1I CAGAACCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 9 10 351935 CASAVA_Build 8 1840403 1I CTGAGTTGTT -/A ATAAGTATTG 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 1 2 351936 CASAVA_Build 8 1844366 1D AGTCATAGGG T/- TTTTTTTCGG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 7 351937 CASAVA_Build 8 1856079 1I TTTTAAACTC -/T TATGTTTTTG 3070 hom 83 het 32 0 28 4 T 1 2 351938 CASAVA_Build 8 1857309 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 2330 het 2330 ref 31 18 9 4 A 9 10 351939 CASAVA_Build 8 1866414 1I GTAGGTGGAG -/T TAAGCACAGG 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 1 2 351940 CASAVA_Build 8 1867379 1I GCGATTTGGG -/C ATCCTGCTGA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 C 0 1 351941 CASAVA_Build 8 1890046 1I TTCCAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 A 11 12 351942 CASAVA_Build 8 1901861 1I CTGTGGTCAG -/C CCCCCACTCT 3070 hom 36 het 18 0 11 7 C 5 6 351943 CASAVA_Build 8 1913272 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTGT 2931 het 2931 ref 24 14 8 2 T 9 8 351944 CASAVA_Build 8 1914420 1D TTGTGGCATC A/- AGACTTGGGC 3070 het 3070 hom 37 16 16 5 A 2 1 351945 CASAVA_Build 8 1915335 2D TGTGGCAGAC AG/-- GGGTGTGTGG 2663 het 2663 ref 37 19 12 6 AG 1 0 351946 CASAVA_Build 8 1918081 1D TGCTGCCTAC A/- AGAGACCCAC 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 2 1 351947 CASAVA_Build 8 1928009 1D GGAGCGAGCT C/- GGTGGAGGCT 2768 het 2768 ref 26 11 8 7 C 1 0 351948 CASAVA_Build 8 1932976 2D GTCATTCTGG AA/-- AAAAAAAAAA 1785 het 1785 ref 29 12 5 12 A 14 12 351949 CASAVA_Build 8 1934370 3I TTTGCATGAC ---/CAT TCAGCTGGCT 3070 het 3070 hom 38 14 15 9 CAT 0 1 351950 CASAVA_Build 8 1941050 2D CCCATGAAAC AG/-- AGAAAAGCCA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 AG 2 1 351951 CASAVA_Build 8 1947399 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 19 6 A 14 16 351952 CASAVA_Build 8 1948828 23I ATTGTGTTCC -----------------------/TAACTGTGTGTCTGTCGTCTATG GCTTTTATTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TAACTGTGTGTCTGTCGTCTATG 0 1 351953 CASAVA_Build 8 1951221 1D TATATGTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 10 9 351954 CASAVA_Build 8 1962115 4I AGACACAGGG ----/CAGA GACGGAGCAG 3070 het 3070 ref 26 9 8 9 CAGA 0 1 351955 CASAVA_Build 8 1967085 1I TAAATACAAG -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 T 5 6 351956 CASAVA_Build 8 1973422 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 493 hom 37 6 22 9 T 15 14 351957 CASAVA_Build 8 1973865 5D TTTCTCTTAC TATTT/----- TATTTTTTAT 3070 het 3070 ref 27 15 11 1 TATTT 2 1 351958 CASAVA_Build 8 1975510 4D GTGTATCCTG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 ref 45 20 19 7 TCTA 4 3 351959 CASAVA_Build 8 1975725 1I CATCATCATC -/T ATCTGTCTAT 3070 het 3070 ref 58 26 23 9 T 0 1 351960 CASAVA_Build 8 1977065 1D TAAAAATACC A/- AAAATATATA 403 het 403 ref 14 6 3 5 A 5 4 351961 CASAVA_Build 8 1979051 1I GTTTGCAACC -/T CCCCCAAAAT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 0 1 351962 CASAVA_Build 8 1982953 2D TGGGCATGTG AT/-- TGATAAAAGT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AT 1 0 351963 CASAVA_Build 8 1986698 4D TAGGATCTAA AAAT/---- AAAGCCACCC 3070 het 3070 hom 43 19 21 4 AAAT 1 0 351964 CASAVA_Build 8 1996047 1D GTATAAATAA G/- GTAAAAAATA 3070 hom 108 het 41 0 37 5 G 2 1 351965 CASAVA_Build 8 1996276 4D TGCTCTGTTC GTTT/---- GTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 47 13 29 5 GTTT 3 2 351966 CASAVA_Build 8 2006150 4D GGGGTTTCTC CTAT/---- CTATTAACAT 3070 het 3070 ref 42 20 16 7 CTAT 2 1 351967 CASAVA_Build 8 2007538 1D CTGGAATTCT G/- GGGGGGACAC 3070 hom 111 het 42 0 32 10 G 7 6 351968 CASAVA_Build 8 2012797 1D CTCCACCATC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 31 0 25 6 A 9 8 351969 CASAVA_Build 8 2017936 1I CTTCAGCTGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 8 9 351970 CASAVA_Build 8 2022122 1I AATAGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 19 9 T 11 12 351971 CASAVA_Build 8 2029566 13D AAAACATTGT TAGAGGTTACATG/------------- TGTTGCCAAA 3070 hom 99 het 33 0 33 1 TAGAGGTTACATG 1 0 351972 CASAVA_Build 8 2035900 1I ATGCTGAGCA -/C CCCTCCTTAC 2799 het 2799 ref 33 20 9 4 C 3 4 351973 CASAVA_Build 8 2038451 4D ATAAATGAGT GAGA/---- GAGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 57 31 20 9 GA 3 1 351974 CASAVA_Build 8 2039346 1D AGAAAATTTT A/- AAAAGCTGTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 5 4 351975 CASAVA_Build 8 2041884 1D ACTTGCTTAG A/- AAAAAAGACG 3070 het 3070 ref 33 14 16 4 A 7 6 351976 CASAVA_Build 8 2046047 1I AAGTCTTGCA -/T GGTAAGGATC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 0 1 351977 CASAVA_Build 8 2049683 1D TCTTTCCCCC T/- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 7 6 351978 CASAVA_Build 8 2050248 2D CATTAGAATT AG/-- AGTTATTTAA 1894 het 1894 ref 13 9 4 0 AG 2 1 351979 CASAVA_Build 8 2050363 2D GGCAACCAGC AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 A 11 9 351980 CASAVA_Build 8 2052463 1I GAAAGAAGTG -/A ACACATACTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 351981 CASAVA_Build 8 2057006 2D AAAGTTTCAG AC/-- ACAGAGAAAC 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 AC 2 1 351982 CASAVA_Build 8 2058262 2D TCTTTATGCC TA/-- GTCTAATTTC 3070 hom 93 het 35 0 31 5 TA 1 0 351983 CASAVA_Build 8 2058669 3I AGTAACACAA ---/GAC GAAAGCAAAA 3070 hom 135 het 46 0 46 0 GAC 0 1 351984 CASAVA_Build 8 2061652 2D CCCACACACT CA/-- CATCCCCACA 3070 het 3070 hom 84 23 38 24 CA 2 1 351985 CASAVA_Build 8 2061713 4D CATACACACA CACT/---- GACACACACC 3070 het 3070 ref 75 29 27 21 CACT 1 0 351986 CASAVA_Build 8 2062068 11D CTGATGGAGG CTGGGGGAGCA/----------- CTGGGGGAGG 2508 het 2059 hom 19 8 8 5 CTGGGGGAGCA 1 0 351987 CASAVA_Build 8 2074151 1I TTCTTGGATT -/C CTAAAACAAC 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 C 1 2 351988 CASAVA_Build 8 2077409 1D TGAATTTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1406 hom 39 10 17 12 A 15 14 351989 CASAVA_Build 8 2082247 2I TTTAAAAGAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 9 11 351990 CASAVA_Build 8 2085892 1D AATATAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2522 hom 32 14 12 7 T 17 16 351991 CASAVA_Build 8 2086202 1I GTCTACATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 9 10 351992 CASAVA_Build 8 2110220 1I TTCTTAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 11 12 351993 CASAVA_Build 8 2110877 1I GTCCGGCTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 569 hom 14 3 10 1 T 8 9 351994 CASAVA_Build 8 2113659 1D TTATACCTGA G/- GGCTGAAAGA 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 G 3 2 351995 CASAVA_Build 8 2121724 1I ATTGTTGAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 45 0 40 10 T 9 10 351996 CASAVA_Build 8 2125414 6D GTTCATTCAG CCCCGC/------ CCCCACGGCC 3070 het 1391 hom 31 6 21 8 CCCCGC 1 0 351997 CASAVA_Build 8 2127211 1I GCTAATTAAA -/T TCCTCATCTG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 1 2 351998 CASAVA_Build 8 2129360 1I GCCGGGCTTT -/A CTCAGCTTTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 0 1 351999 CASAVA_Build 8 2129621 1I AAAGGATCTG -/A AAAAGTTACC 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 A 4 5 352000 CASAVA_Build 8 2135776 2I TATAGTTGTG --/TC TGTGTGCATG 3070 het 3070 ref 41 27 9 5 TC 0 1 352001 CASAVA_Build 8 2135995 18D GCAGGTGTGT ATGTGTGTACATATGTAC/------------------ ATGTGTGTAC 3070 het 3070 ref 72 48 27 7 ATGTGTGTACATATGTAC 1 0 352002 CASAVA_Build 8 2141198 1I TCAATAAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 17 6 T 11 12 352003 CASAVA_Build 8 2147079 4I ATAAAATATA ----/AAAT ACCACTTGGT 3070 hom 120 het 41 0 40 1 AAAT 0 1 352004 CASAVA_Build 8 2148087 3I CCATGATGAT ---/GAG GAGTTTTACG 3070 het 3070 ref 34 13 15 6 GAG 1 2 352005 CASAVA_Build 8 2149571 1D TAAATGAATG C/- CATCCTCTTT 3070 het 3070 ref 38 16 17 6 C 2 1 352006 CASAVA_Build 8 2149809 1I TCTATAAATA -/T CACCTTAGAG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 0 1 352007 CASAVA_Build 8 2150934 2D ATCTAGAAAC AG/-- AGTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 AG 2 1 352008 CASAVA_Build 8 2152832 1I CCTACCCCCA -/C CCCCACAACA 2825 hom 15 het 6 0 6 0 C 4 5 352009 CASAVA_Build 8 2158841 27D GGACCCTGGG ATAGCAACACACCATTTAACTCACCCA/--------------------------- ATAGCAACAC 3070 het 3070 ref 36 25 12 9 ATAGCAACACACCATTTAACTCACCCA 1 0 352010 CASAVA_Build 8 2171560 2D TAACAGTAAC AT/-- ATAAGCATGC 3070 het 3070 hom 49 23 22 6 AT 2 1 352011 CASAVA_Build 8 2175251 1I GGCGACACTC -/A AGAGTTGTTT 2788 hom 15 het 7 0 6 1 A 1 2 352012 CASAVA_Build 8 2183869 1I GCCTCTCGCA -/C CCCCCAGACC 3070 hom 123 het 48 0 32 16 C 5 6 352013 CASAVA_Build 8 2192639 2I TATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 82 49 17 16 TA 6 7 352014 CASAVA_Build 8 2193099 1I ATGAAAAGTG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 81 14 57 10 A 7 8 352015 CASAVA_Build 8 2194294 1I AGCCCTTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 66 19 34 13 T 12 13 352016 CASAVA_Build 8 2202333 1I TTTAAGTGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 23 hom 56 2 34 20 T 9 10 352017 CASAVA_Build 8 2203538 3I GCAGAGGGCT ---/TGC TGCTGTAGGT 3070 het 3070 ref 91 63 20 8 TGC 1 2 352018 CASAVA_Build 8 2203920 1D CACAACCGAA C/- CAGACGGGTT 3070 het 3070 ref 82 44 16 22 C 2 1 352019 CASAVA_Build 8 2205918 1I CAGATTTGCC -/G GAAAAAGTCA 3070 het 3070 hom 71 25 36 10 G 1 2 352020 CASAVA_Build 8 2207472 16I ACATATATAT ----------------/ATATATGTATATATAC ATATATGTAT 3070 het 3070 ref 59 36 9 14 ATATATGTATATATAC 1 2 352021 CASAVA_Build 8 2210128 1D ATAGTGCACC A/- AATGTTTTGG 3070 het 3070 ref 71 47 16 8 A 3 2 352022 CASAVA_Build 8 2211212 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 9 10 352023 CASAVA_Build 8 2211980 8I CAGAGGGCTG --------/CTGTGATA CTGTGATACA 3070 hom 141 het 64 0 43 21 CTGTGATA 1 2 352024 CASAVA_Build 8 2213283 4D CCCAGGAAAG TGTT/---- TGACACAACG 3070 het 3070 ref 79 46 27 11 TGTT 1 0 352025 CASAVA_Build 8 2214781 2I GGGAAGGAAC --/TG GGGAAATTTC 3070 het 3070 ref 77 42 23 12 TG 0 1 352026 CASAVA_Build 8 2215444 2D AGCATCATTG TA/-- TATGGTATTT 3070 het 3070 ref 73 39 28 17 TA 2 1 352027 CASAVA_Build 8 2215786 4I CACACTCACC ----/AGCA AGCCGACCTT 3070 het 3070 ref 81 41 31 9 AGCA 0 1 352028 CASAVA_Build 8 2220592 1I GGTAGTTCCT -/A AAAATCTTCT 2802 het 2802 ref 41 26 8 7 A 4 5 352029 CASAVA_Build 8 2221291 1D ACCTCTCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 66 13 39 15 A 13 12 352030 CASAVA_Build 8 2224199 1D TCAGCTTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1268 hom 87 4 64 21 A 12 11 352031 CASAVA_Build 8 2226447 1I CTATATTAAT -/A AAAAAACATC 3070 het 3070 hom 61 28 28 5 A 6 7 352032 CASAVA_Build 8 2226789 1I GGAAGTTCTT -/A AACCTCAAAG 3070 het 3070 ref 99 66 20 13 A 2 3 352033 CASAVA_Build 8 2229001 3D TCATATAAGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 57 10 37 10 T 15 12 352034 CASAVA_Build 8 2230512 14D GTGAGTGAGC ATGGGGAACCCCCG/-------------- ATGTCTCTGG 3070 het 3070 ref 30 23 7 10 ATGGGGAACCCCCG 1 0 352035 CASAVA_Build 8 2249025 1D CCTGGGCTAC A/- GAGTGAGACT 3070 het 3070 ref 45 30 12 4 A 1 0 352036 CASAVA_Build 8 2250002 3I TTTTCGTAAT ---/TTC TTCAATGCAA 3070 hom 141 het 55 0 48 7 TTC 1 2 352037 CASAVA_Build 8 2257419 12D AACTCTCTAT CCCAGAACTTCC/------------ CCCAAATTTT 3070 het 3070 hom 58 26 27 12 CCCAGAACTTCC 1 0 352038 CASAVA_Build 8 2258752 1I AGACCTCATT -/G GGCTTAGGGA 3070 het 3070 ref 87 56 19 12 G 2 3 352039 CASAVA_Build 8 2259622 1D GTGGGCTAGG T/- TGGGACAGTT 3070 het 3070 ref 94 64 17 14 T 2 1 352040 CASAVA_Build 8 2261048 5I CTACTTTCTC -----/TAAGA TAAGATTTTA 3070 het 3070 ref 81 61 9 11 TAAGA 1 2 352041 CASAVA_Build 8 2263918 1D TAAAGAGAAG A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 73 50 13 11 A 7 6 352042 CASAVA_Build 8 2264482 1D TTTTCTTATA T/- TTTTACTAGT 3070 het 3070 ref 47 38 9 0 T 5 4 352043 CASAVA_Build 8 2266568 1D CAAACAAAAA C/- CCCTAATTAT 3070 hom 144 het 56 0 49 12 C 4 3 352044 CASAVA_Build 8 2266768 1D TAGCTGGGAC T/- TACAGGCACC 3070 het 2009 hom 20 6 9 5 T 2 1 352045 CASAVA_Build 8 2268791 4I AATAAAAAAG ----/AAAT GAATAGAAAA 3070 het 3070 ref 67 43 17 7 AAAT 0 1 352046 CASAVA_Build 8 2269615 4I TATTTGTATG ----/TTCA TTAAAGTAAT 3070 het 3070 hom 68 28 33 7 TTCA 0 1 352047 CASAVA_Build 8 2269702 4D AATCCCTCAC AGTG/---- AGTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 61 31 28 4 AGTG 1 0 352048 CASAVA_Build 8 2276486 6I AAACAAAAAC ------/AAACAA AAAAAAGAAT 1832 het 1832 ref 15 10 4 1 AAACAA 0 1 352049 CASAVA_Build 8 2277046 4D AAGCTGTGAA GAGT/---- GAGATAATAT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 GAGT 1 0 352050 CASAVA_Build 8 2277909 1D TCAATAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 T 11 10 352051 CASAVA_Build 8 2282385 1D TAAGGCAAAT A/- ACAAGAAGAA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 A 2 1 352052 CASAVA_Build 8 2283894 2D GTGACTGTGT GA/-- GAGCATGTGA 3070 het 3070 ref 81 42 28 17 GA 2 1 352053 CASAVA_Build 8 2284006 2D GAGTGTGTGA GT/-- GAGAGAGCAT 3070 het 3070 ref 67 34 28 6 GT 1 0 352054 CASAVA_Build 8 2293910 1I CTAATTTTTT -/G TATTTTTAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 0 1 352055 CASAVA_Build 8 2296992 1D AATCCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 982 hom 29 4 18 7 T 11 10 352056 CASAVA_Build 8 2306722 1D TACAGACGGG C/- TGGGGGTGGT 3070 het 3070 hom 48 21 21 7 C 1 0 352057 CASAVA_Build 8 2306918 1D GACCCCCCAT C/- CCCCCAGTGG 3070 hom 79 het 32 0 24 8 C 6 5 352058 CASAVA_Build 8 2308406 1I CTGTCAAGAG -/C AATTTGTCTC 3070 het 3070 hom 32 13 18 1 C 0 1 352059 CASAVA_Build 8 2309469 2D GAGACCCTAC CT/-- ATACACACAC 3070 het 3070 ref 63 37 18 8 CT 1 0 352060 CASAVA_Build 8 2309574 1D CCTCTCACAG C/- AGACCCTACA 3070 hom 75 het 30 0 25 5 C 1 0 352061 CASAVA_Build 8 2309728 11D CCCACACCTA CACACACACAC/----------- CACACACACA 3070 het 3070 ref 31 16 13 6 CACACACACAC 1 0 352062 CASAVA_Build 8 2310027 2D TGACTGCACT TC/-- TTTTTCATAT 3070 het 3070 ref 42 23 10 10 TC 1 0 352063 CASAVA_Build 8 2310334 1D TAAACTGTCC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 8 7 352064 CASAVA_Build 8 2314030 4D TTCGGATCTC TGTT/---- TGACTATTAT 2337 het 2337 ref 38 32 5 2 TGTT 1 0 352065 CASAVA_Build 8 2326615 3D AAAGTCAAGG AGA/--- AGAATTGCAA 1803 het 1803 ref 33 28 4 4 AGA 2 1 352066 CASAVA_Build 8 2327110 2D GTGCGTGTGT GA/-- GAGTGTGCAA 3070 het 3070 ref 61 32 22 8 GA 2 1 352067 CASAVA_Build 8 2327429 4I TGTGTGTGTA ----/TGTG TGTATGTGAG 3070 het 3070 hom 86 35 35 16 TG 1 3 352068 CASAVA_Build 8 2333378 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 788 het 492 hom 15 4 3 8 T 16 14 352069 CASAVA_Build 8 2340324 2I ATGAAATCAT --/AG AGAGTTGAAG 3070 het 3070 ref 32 17 14 1 AG 2 3 352070 CASAVA_Build 8 2344159 1I TGGGTGCATA -/T TTTGGGGGTA 3070 het 3070 hom 58 23 24 11 T 3 4 352071 CASAVA_Build 8 2347819 1D CAAACCCCCC A/- ACAAGGCAGT 3070 het 2767 hom 25 6 15 4 A 2 1 352072 CASAVA_Build 8 2350672 1D CCGAGTGGTG C/- CCGGCTTCCA 3070 het 3070 ref 50 25 16 10 C 3 2 352073 CASAVA_Build 8 2362147 1I4M14D TGAAAAGTTG -ACATGATAATGACAGATA/TATAT-------------- TCTCATTATC 3070 het 3070 ref 40 24 16 6 N/A 0 0 352074 CASAVA_Build 8 2376978 1D AAACTTATAA T/- TTTTTTTTTT 2256 het 968 hom 18 3 7 8 T 15 14 352075 CASAVA_Build 8 2380505 4I TAGATAGATA ----/ATAG ATAGATGACA 3070 hom 105 het 44 0 35 9 ATAG 1 2 352076 CASAVA_Build 8 2381799 1I TTGTAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 21 1 15 5 A 11 12 352077 CASAVA_Build 8 2394249 5I TTGAAAATAG -----/ACATC ACATCGCAGG 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 ACATC 1 2 352078 CASAVA_Build 8 2412064 1D TTTCTTTTTT G/- AGACAAGTTC 3070 het 3070 hom 54 18 31 6 G 1 0 352079 CASAVA_Build 8 2429377 1D CAGAGAGAAG A/- AAAAAAAAAG 1241 het 1241 ref 29 24 3 2 A 10 9 352080 CASAVA_Build 8 2459275 1I TTAGTTATAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 9 10 352081 CASAVA_Build 8 2461814 4I CTCTCAAGAT ----/CTCA CTGTCTCCCA 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 CTCA 0 1 352082 CASAVA_Build 8 2470147 4D CCTCAAATTA TATT/---- TACAAAGGAA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 TATT 1 0 352083 CASAVA_Build 8 2471369 1D TTCAAAGACA T/- TAAATATATT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 2 1 352084 CASAVA_Build 8 2472413 10D AATAATTTGG AGAAAAATGA/---------- AGTTAGTAAA 1630 het 1630 ref 11 7 4 2 AGAAAAATGA 1 0 352085 CASAVA_Build 8 2474265 1D TTTTCTGTTG C/- CCCCCTCTGC 3070 het 3070 ref 42 21 13 9 C 6 5 352086 CASAVA_Build 8 2479432 1I GCCCACCCCT -/C TCTGCCTGTC 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 C 0 1 352087 CASAVA_Build 8 2479900 1D GCCACATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 11 10 352088 CASAVA_Build 8 2481248 2D CTACTTAGAC AA/-- AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 41 17 17 9 A 8 6 352089 CASAVA_Build 8 2500950 1I ACAAGTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 12 16 11 T 10 11 352090 CASAVA_Build 8 2509979 1D GAGTTAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1600 het 1600 ref 24 14 6 4 A 11 10 352091 CASAVA_Build 8 2513495 1I CTTTGCTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 T 8 9 352092 CASAVA_Build 8 2514748 2D GTCCTGCTGC CG/-- CTCAAGGCGT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 CG 1 0 352093 CASAVA_Build 8 2515860 4I AGTAAAAATT ----/AGTG AGAATATAGA 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AGTG 0 1 352094 CASAVA_Build 8 2529949 1D TTTACTAGAG T/- TTTTGAATAG 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 5 4 352095 CASAVA_Build 8 2531019 1D GCCATTTGAT G/- GGTCTGGACA 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 G 3 2 352096 CASAVA_Build 8 2535689 1D ATAACTTTAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 8 7 352097 CASAVA_Build 8 2539184 1I GAGGCTTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 10 11 352098 CASAVA_Build 8 2546244 1I CATAAATGTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 T 7 8 352099 CASAVA_Build 8 2548549 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1504 het 1478 hom 23 7 5 11 T 18 16 352100 CASAVA_Build 8 2569315 1I CTTCAGTATT -/A AAATATGCCC 3070 hom 56 het 27 0 19 8 A 3 4 352101 CASAVA_Build 8 2578854 3I TCCTAGGAAG ---/TTC TTCTTTGCCG 3070 hom 103 het 39 0 33 6 TTC 1 2 352102 CASAVA_Build 8 2583639 1I76M1D AAAATTACTC -AAAAAAAAAATAGGAAAAACAAAGATAACAAGTTAGTACACTATTAAACATTCACTTAACACACAAGAAGGCTGTGA/AAAAAAAAAAATAGGAAAAACAAAGATAACAAATTAGTACACTATTAAACATTCACTTAACACACAAGAAGGCTGTG- GGGGGGGACG 3070 het 3070 ref 33 37 13 13 N/A 0 0 352103 CASAVA_Build 8 2585795 1D CCTGTTTTTA T/- CCTCCTAGAA 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 T 1 0 352104 CASAVA_Build 8 2601516 1D GTTACTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 11 10 352105 CASAVA_Build 8 2605862 1I AATGAATTTC -/A AAAAATTGCA 3070 het 3070 hom 24 8 15 1 A 5 6 352106 CASAVA_Build 8 2606937 1D GGCCTTTCAC A/- AAGGATTAGC 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 A 3 2 352107 CASAVA_Build 8 2695861 1I ATAGAAGCCA -/C TTAGCCATGA 2725 het 2725 ref 30 20 6 4 C 0 1 352108 CASAVA_Build 8 2701688 2D ATTCTCATGG CT/-- CTCAGCCTCC 3070 het 3070 hom 20 10 10 0 CT 2 1 352109 CASAVA_Build 8 2723533 1D GATAAGGATG A/- TTTTTTTTTT 3070 het 699 hom 48 4 37 7 A 1 0 352110 CASAVA_Build 8 2726097 1D GTAAAACACA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 35 0 28 9 T 9 8 352111 CASAVA_Build 8 2726958 4I AAAGAAAGAA ----/AGAG AGAGAGAAAG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AG 3 5 352112 CASAVA_Build 8 2727056 4D AGAAAGAAAC AGGG/---- AGGGAGGGAG 3070 hom 46 het 48 1 25 24 AGGG 6 5 352113 CASAVA_Build 8 2746100 2D GTTTCCACTT TA/-- TGTTAATGCA 3070 hom 187 het 70 0 61 11 TA 1 0 352114 CASAVA_Build 8 2746361 3I TACCATTCTA ---/TCT TCTTGTTAAC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 TCT 1 2 352115 CASAVA_Build 8 2746901 2I ATTCTACACA --/AT CTATTTCATT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 AT 0 1 352116 CASAVA_Build 8 2752279 1D AGTCCCAACA C/- ATTTCAAATA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 C 1 0 352117 CASAVA_Build 8 2752410 1D CAATGAATTT A/- AAATAAACAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 4 3 352118 CASAVA_Build 8 2764853 1D GACATCCTTG C/- CCTGTGCCCA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 C 3 2 352119 CASAVA_Build 8 2770247 1D ACTTTCACTC T/- TTTCTGACAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 T 4 3 352120 CASAVA_Build 8 2782380 3D AAAAAAAAAA AAC/--- AAAAAAAAAA 3070 het 9 hom 35 1 17 18 AAC 1 0 352121 CASAVA_Build 8 2782820 1D AAATAATTTA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 8 7 352122 CASAVA_Build 8 2789777 1I CCACAGTTAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 7 8 352123 CASAVA_Build 8 2792858 1I TTAATTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 14 13 T 13 14 352124 CASAVA_Build 8 2794078 1D TTCAAAATAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 T 8 7 352125 CASAVA_Build 8 2794474 4D GACACATTTA TAGT/---- TAAAGATCAG 3070 het 3070 ref 33 18 15 1 TAGT 1 0 352126 CASAVA_Build 8 2794606 5I TTTCTAAGGG -----/AAGAC AACACAAACG 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 AAGAC 0 1 352127 CASAVA_Build 8 2841113 2D ATGGGAAAAA AG/-- AGAGAGAATT 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 AG 4 3 352128 CASAVA_Build 8 2844708 1I GAAGGAGATC -/A AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 49 28 20 1 A 6 7 352129 CASAVA_Build 8 2859134 3I TTGATTCAGA ---/AAC AACATTTCTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AAC 1 2 352130 CASAVA_Build 8 2860029 1I CTTCTTAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 A 11 12 352131 CASAVA_Build 8 2869062 4D TCATGGTGTG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 GT 8 6 352132 CASAVA_Build 8 2884214 1D TCCTTCCTTC T/- TTTCCTTACT 3070 het 3070 ref 37 16 11 11 T 4 3 352133 CASAVA_Build 8 2886733 1I GCTTCTTTCT -/G GGCAGCCATC 3070 het 3070 hom 47 22 20 5 G 2 3 352134 CASAVA_Build 8 2889293 1D ATACGTTGTT C/- TTTACTTTGT 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 C 1 0 352135 CASAVA_Build 8 2893805 1D AAGAACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 13 12 352136 CASAVA_Build 8 2899549 4D CCTGTCTCAA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 28 16 11 AAAC 2 1 352137 CASAVA_Build 8 2901430 5D CCCAGTAGCT GGGGA/----- CTACAGGCCC 3070 het 3070 hom 36 18 17 2 GGGGA 1 0 352138 CASAVA_Build 8 2901690 4D TATATAACTT TAAA/---- TATGTATACA 3070 het 3070 ref 22 13 8 1 TAAA 1 0 352139 CASAVA_Build 8 2902493 1I GATTTTATAG -/T TTATAGTGTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 2 3 352140 CASAVA_Build 8 2904289 10D CTGCACAACT TTTTCTCTGC/---------- TTTTCTCTGC 3070 het 3070 ref 46 22 22 4 TTTTCTCTGC 2 1 352141 CASAVA_Build 8 2909819 1D ACCAAAAATC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 9 8 352142 CASAVA_Build 8 2920989 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1805 hom 18 het 13 0 7 7 A 13 14 352143 CASAVA_Build 8 2921959 1I GTCCTAAGTG -/C CACTTCTTTC 3070 hom 104 het 41 0 32 9 C 1 2 352144 CASAVA_Build 8 2923898 1I CCTTCAAAAC -/G GGGGGGGAGC 3070 het 3070 ref 48 18 15 15 G 7 8 352145 CASAVA_Build 8 2929852 2D CATTATAATC TA/-- TATATATAAT 3070 het 148 hom 12 1 8 4 TA 5 4 352146 CASAVA_Build 8 2931123 1I TCTTGTAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 A 9 10 352147 CASAVA_Build 8 2939018 4D TAGGGTTTTT TTTA/---- TTTTATTTTA 56 het 56 ref 13 7 1 5 TTTA 1 0 352148 CASAVA_Build 8 2942390 2I TACAGTAGGC --/CT CCCCTTACCC 2594 het 2594 ref 29 18 7 4 CT 0 1 352149 CASAVA_Build 8 2952530 6I TCTTTGTTTC ------/TGTTTT TGTTTTTGTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TGTTTT 1 2 352150 CASAVA_Build 8 2956297 1I AAGGGACTGT -/A ATGTAGAGAC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 1 2 352151 CASAVA_Build 8 2989212 1D TTGGTATGCC A/- ATAGACTAGA 3070 het 3070 ref 49 21 20 8 A 2 1 352152 CASAVA_Build 8 3000039 5D TTTGCAAATA TAAGT/----- TAATTCTTTG 3070 het 3070 hom 29 13 13 8 TAAGT 1 0 352153 CASAVA_Build 8 3003207 1I AAAATATGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 24 11 6 T 10 11 352154 CASAVA_Build 8 3033616 12D ATATAGAAAA ATGGTTAGAAAT/------------ ATTTTGTTGA 754 het 754 ref 26 17 3 6 ATGGTTAGAAAT 1 0 352155 CASAVA_Build 8 3033686 8D TTAAAATAAC CAGTATAA/-------- AAGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 18 8 5 CAGTATAA 1 0 352156 CASAVA_Build 8 3034043 4D AGAGAAAATG TACA/---- TGAACAATGA 3070 het 3070 hom 44 18 23 7 TACA 1 0 352157 CASAVA_Build 8 3037867 1D TGGCATGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 A 11 10 352158 CASAVA_Build 8 3043849 1D TAGAAAAACT A/- AAATATTGCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 4 3 352159 CASAVA_Build 8 3046773 1D AGAATTTGGT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 7 6 352160 CASAVA_Build 8 3052111 1D TGTCTTGCCC T/- GTCACCCAGG 2882 het 1409 hom 17 4 7 6 T 1 0 352161 CASAVA_Build 8 3065194 2D AATATCCCAG TT/-- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 45 20 14 12 T 8 6 352162 CASAVA_Build 8 3067251 1I TTCAATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 11 12 352163 CASAVA_Build 8 3072259 3I GAACACGGAA ---/GGT GGAGGTTGCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 GGT 0 1 352164 CASAVA_Build 8 3073712 1D AAATGGAAGG A/- AAAAAAAAAA 1258 het 1258 ref 27 17 3 7 A 11 10 352165 CASAVA_Build 8 3075412 1I ATATCAAGGG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 7 8 352166 CASAVA_Build 8 3077870 1D TCAGTTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 10 9 352167 CASAVA_Build 8 3078021 1D TTTCTTTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 T 10 9 352168 CASAVA_Build 8 3085358 3D AAGGAAAGGA GTT/--- GTTGTTTTAT 1802 het 1802 ref 24 19 4 3 GTT 3 2 352169 CASAVA_Build 8 3093248 1I GTTGTCTCAG -/C ATAGTGATGA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 0 1 352170 CASAVA_Build 8 3094685 1D TTTATTTCCG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 7 352171 CASAVA_Build 8 3104795 1I ATATCAAAAT -/A AAAATATTAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 4 5 352172 CASAVA_Build 8 3105334 3D TGGAAAACAC ATA/--- GAAGGAGTAT 3070 het 3070 ref 37 15 13 10 ATA 1 0 352173 CASAVA_Build 8 3109793 2I CTGTGTGTGG --/GT GTGTGTGTGG 3070 hom 100 het 45 0 32 13 GT 4 5 352174 CASAVA_Build 8 3112030 2I GGGTGAAAAT --/CC CAGGAGAGAA 3070 het 3070 ref 35 17 9 9 C 1 3 352175 CASAVA_Build 8 3114976 7D TAACCTCTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 2561 het 650 hom 22 6 9 7 T 21 14 352176 CASAVA_Build 8 3115055 1D CTTGGCCCAC T/- GCAACCTCTG 2111 het 2111 ref 13 8 5 0 T 1 0 352177 CASAVA_Build 8 3115841 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 792 hom 10 het 8 0 4 4 T 11 10 352178 CASAVA_Build 8 3118720 1I CCCTTTATCA -/T TTTTTATTGT 2850 het 2850 ref 22 16 6 0 T 5 6 352179 CASAVA_Build 8 3119955 1D CCTAGCCTTG A/- TGGTCTTTAC 3070 het 3070 hom 25 12 12 4 A 1 0 352180 CASAVA_Build 8 3123583 1D AAAGTTCCTC G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 G 1 0 352181 CASAVA_Build 8 3125656 3D TAAAAAATAG TAA/--- TTGTCATTTC 3070 het 2197 hom 22 6 10 6 TAA 1 0 352182 CASAVA_Build 8 3125718 5I TAAACACTAA -----/TATAT TAATTAATTA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TATAT 0 1 352183 CASAVA_Build 8 3127478 1I ATATCACAAC -/A AAAAAACAAG 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 A 6 7 352184 CASAVA_Build 8 3128462 2I TGATACTGAC --/AG AGTGTTCAGA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 AG 1 2 352185 CASAVA_Build 8 3133949 1D TGTTCCCCTT C/- CTGTGTCCGT 2904 het 676 hom 8 2 6 0 C 2 1 352186 CASAVA_Build 8 3136292 1D GAGGATTCCC A/- TCTTTTTCTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 1 0 352187 CASAVA_Build 8 3142774 3D AACCGTAAAG AAA/--- AAAAATGAGT 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 A 8 5 352188 CASAVA_Build 8 3143384 2I AACTGTACAA --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 TC 6 7 352189 CASAVA_Build 8 3144497 5I TCTGGCAGAT -----/AAAAG AAAAGCACGC 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 AAAAG 1 2 352190 CASAVA_Build 8 3145155 4D GCGTAAAAAA TAAT/---- TAAATAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 TAAT 1 0 352191 CASAVA_Build 8 3145291 1I CATTTAGGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 T 9 10 352192 CASAVA_Build 8 3149660 2I TATTTTTCTC --/TT TTTTTAATTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 5 7 352193 CASAVA_Build 8 3151589 4I AACAACAATG ----/AAAC AAACAGAAAG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 AAAC 1 2 352194 CASAVA_Build 8 3151751 23D TAGATCACCA AGAGCTTACTTTAAAAATATTAC/----------------------- AGAGCTTACT 3070 het 3070 hom 29 15 15 2 AGAGCTTACTTTAAAAATATTAC 2 1 352195 CASAVA_Build 8 3152346 1D AGTCATGATG T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 59 het 54 2 45 8 T 8 7 352196 CASAVA_Build 8 3152981 19D TAAGACACTC ATGTGATAATTCTAATAAT/------------------- ATGTGATAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 8 ATGTGATAATTCTAATAAT 2 1 352197 CASAVA_Build 8 3153120 4I AATACATAAA ----/ACTC ACTCACACTG 3070 het 3070 ref 65 38 23 4 ACTC 1 2 352198 CASAVA_Build 8 3154254 1I ATGGGAAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1029 hom 30 4 15 11 A 9 10 352199 CASAVA_Build 8 3154275 4I GGCGCTCCTG ----/AATT AATTACTGCC 3070 het 1580 hom 31 6 13 12 AATT 1 2 352200 CASAVA_Build 8 3156023 4I TGTAATATAC ----/CTAA CTAACTAACT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 CTAA 2 3 352201 CASAVA_Build 8 3157735 4I TCTCAAAGGC ----/AGTT AGTTAGACTT 3070 het 3070 hom 55 21 26 8 AGTT 1 2 352202 CASAVA_Build 8 3161465 2I AGCCTTGCGG --/GA GAGAGGGTTT 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 GA 2 3 352203 CASAVA_Build 8 3178302 10D CTATTATTTG AAAACACTTT/---------- AAAACACTTT 3070 het 3070 ref 40 21 18 4 AAAACACTTT 2 1 352204 CASAVA_Build 8 3181091 1D AAGGCAGTAG A/- AAAATAGTAA 3070 het 3070 hom 44 21 21 3 A 5 4 352205 CASAVA_Build 8 3187786 2D41M2D GTGTGTGTGT GCTTATACATATATATGATTAAATGTATAAATATATGTGTGTATG/--TTATACATATATATGATTAAATGTATAAATATATGTGTGTA-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 31 14 15 14 N/A 0 0 352206 CASAVA_Build 8 3193235 1I AGATCAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 T 9 10 352207 CASAVA_Build 8 3196695 3I TATTAAATGT ---/ATA ATAATATATA 2978 hom 18 het 7 0 7 0 ATA 2 3 352208 CASAVA_Build 8 3198697 2I AATGAACACA --/AT GTTTCTTAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 0 1 352209 CASAVA_Build 8 3199381 6D AGCTCAACTA AGAAAC/------ AGAAACAGAA 3070 hom 93 het 36 0 32 6 AGAAAC 2 1 352210 CASAVA_Build 8 3199707 3I TACAGTTTAG ---/TGA TGATATATAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 TGA 1 2 352211 CASAVA_Build 8 3201631 1D AACAAAAAAA C/- GTAATGGCAA 1421 het 1421 ref 20 11 5 4 C 1 0 352212 CASAVA_Build 8 3203779 4I CTCCAGATTT ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 99 het 38 0 31 7 TC 5 7 352213 CASAVA_Build 8 3209088 1I TTGTATACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 A 10 11 352214 CASAVA_Build 8 3210060 2I GGGAGAATGC --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 AG 5 6 352215 CASAVA_Build 8 3211315 1D CTTATCTGTA G/- AAAAAATTAG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 1 0 352216 CASAVA_Build 8 3215905 1I AAACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 A 11 12 352217 CASAVA_Build 8 3218882 2D CATCCAACTA TT/-- TTTTTTTTTT 2304 het 905 hom 33 9 7 17 T 18 16 352218 CASAVA_Build 8 3228028 8D TCGTTCCTTA CCACAAAT/-------- CCACAAATTT 3070 het 3070 ref 40 17 15 10 CCACAAAT 2 1 352219 CASAVA_Build 8 3230277 2D TTTGTGTTTT TG/-- TGTTTTACCC 2646 het 2646 ref 23 15 7 2 TG 2 1 352220 CASAVA_Build 8 3239567 1D GTTGGGGGGA G/- GGGTGTGGGA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 G 4 3 352221 CASAVA_Build 8 3245888 1D TAAAACAACC A/- AAATTATACT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 4 3 352222 CASAVA_Build 8 3250549 1D AAGAAGGGGA C/- CCCCAATCCA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 C 5 4 352223 CASAVA_Build 8 3251289 4D TGTATCATTC ATAG/---- ATAGATAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 6 ATAG 2 1 352224 CASAVA_Build 8 3252106 1I AAGGATGGAT -/A AATGGAAGGA 3070 hom 144 het 53 0 49 4 A 2 3 352225 CASAVA_Build 8 3254412 1D ATAACTCTCT C/- CCCCCACCAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 6 5 352226 CASAVA_Build 8 3262760 1D TACAGACCCT G/- TTTTTTGGAG 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 G 1 0 352227 CASAVA_Build 8 3282685 1I ATATCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 38 2 26 10 T 11 12 352228 CASAVA_Build 8 3285137 25D CTGAGATTCT TATAACAGGTGCATTAAACTGTATA/------------------------- TCAATTTGGG 3070 het 3070 ref 42 27 19 5 TATAACAGGTGCATTAAACTGTATA 1 0 352229 CASAVA_Build 8 3286777 1D TACTTACATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 110 het 45 0 36 9 A 9 8 352230 CASAVA_Build 8 3287138 1D AATGAAAAGG T/- TTATAAAGTA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 T 3 2 352231 CASAVA_Build 8 3292271 1I GATCAGTAAC -/T TGAGTCTCAG 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 1 2 352232 CASAVA_Build 8 3302109 1D TTCCTGGACT C/- CTCATCGTGG 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 C 2 1 352233 CASAVA_Build 8 3307053 1D AGAATCCAGG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 12 het 27 1 18 8 C 11 10 352234 CASAVA_Build 8 3316412 16D TCTGGCTTAG TTCCTTCCTTCTTTCC/---------------- TTCCTTCCTT 3070 het 3070 ref 32 19 11 9 TTCCTTCCTTCTTTCC 1 0 352235 CASAVA_Build 8 3331204 1I TTTAAAACTA -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 6 7 352236 CASAVA_Build 8 3332130 6I TCAGCATACT ------/TTTTTA TTTTTATTTA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TTTTTA 1 2 352237 CASAVA_Build 8 3339628 4D ATATATAAAT GAGA/---- GAGAGAGAGA 3070 hom 117 het 45 0 38 8 GA 7 5 352238 CASAVA_Build 8 3349189 1D TAAAAAAACA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 T 8 7 352239 CASAVA_Build 8 3349946 2D AGAAACAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 50 hom 39 2 15 22 A 13 11 352240 CASAVA_Build 8 3355609 11I AGAGGCAGGA -----------/TAAAAAATTCC TTACTTTTTA 3070 hom 66 het 24 0 23 2 TAAAAAATTCC 0 1 352241 CASAVA_Build 8 3356838 1D AAGTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1253 hom 19 5 10 4 A 13 12 352242 CASAVA_Build 8 3358051 1D TTGAATTATT A/- TTATTATTTT 495 het 495 ref 33 25 5 3 A 1 0 352243 CASAVA_Build 8 3363078 1D AGAAAAAAAA G/- AATGGAAATA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 G 1 0 352244 CASAVA_Build 8 3366080 4D ACACACTGAA AATG/---- AATGTATTTA 3070 het 3070 hom 46 17 22 10 AATG 2 1 352245 CASAVA_Build 8 3368605 2I GCACACACAC --/AT GTACACCCAG 3070 het 3070 ref 95 52 34 9 AT 0 1 352246 CASAVA_Build 8 3368961 4D34M4D ACACACACAC ACATGCACACCCAGAGACACGTGCACACACATGCACACACTT/----GCACACCCAGAGACACGTGCACACACATGCACAC---- ACACATGCAC 3070 het 3070 ref 78 53 48 13 N/A 0 0 352247 CASAVA_Build 8 3369828 1I TGGTGGAGTT -/A AAAAATAGTA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 A 5 6 352248 CASAVA_Build 8 3371248 1D TTAAAATATA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 13 12 7 T 10 9 352249 CASAVA_Build 8 3375950 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1982 het 1982 ref 15 9 5 1 T 13 12 352250 CASAVA_Build 8 3407387 1I CATACTCACA -/G GCATATATAT 3070 hom 135 het 49 0 45 4 G 1 2 352251 CASAVA_Build 8 3416686 11I CTAAGTCTCC -----------/ATCTGAGACAA GTCTGGGGCA 3070 het 3070 hom 55 19 27 9 ATCTGAGACAA 0 1 352252 CASAVA_Build 8 3418780 1I TACATAATTT -/A AGTGAAATCC 2851 het 2851 ref 17 9 7 1 A 1 2 352253 CASAVA_Build 8 3420654 1I CTTTAAAAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 47 20 20 8 A 8 9 352254 CASAVA_Build 8 3420775 2D ATGAAAGGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 21 21 5 T 13 11 352255 CASAVA_Build 8 3420937 2D TTTTCCTAAG AC/-- ATCCTATGAC 3070 het 3070 ref 52 27 21 5 AC 1 0 352256 CASAVA_Build 8 3421298 4I TCATCTGAGA ----/TCTC TCTCTCCTAA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 TC 3 5 352257 CASAVA_Build 8 3423242 1I CAATGAGTGA -/G GTGTCCTTGC 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 G 1 2 352258 CASAVA_Build 8 3424272 1I TTACTTAATA -/T AAAGTAATAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 0 1 352259 CASAVA_Build 8 3429467 2D AAGCACCTCT GA/-- GTGTGTGATA 3070 het 3070 ref 39 17 12 11 GA 1 0 352260 CASAVA_Build 8 3431208 1D GTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 11 10 352261 CASAVA_Build 8 3432446 1D AAACATAAAT A/- GATGCTTTCC 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 A 1 0 352262 CASAVA_Build 8 3433262 3I AAAACAAAAA ---/AGT GTCATAAAGC 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 AGT 0 1 352263 CASAVA_Build 8 3433684 1I TAAAACCCTT -/A ACGCACAGTA 3070 het 3070 ref 55 27 24 4 A 1 2 352264 CASAVA_Build 8 3451443 1I GGGTACTCCC -/T TATGAATGGA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 T 1 2 352265 CASAVA_Build 8 3454669 2D ATAAGAATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 23 0 19 4 A 13 11 352266 CASAVA_Build 8 3455407 21I CGAGATTACA ---------------------/GTGAGCTATGATCGTACTACT GTACTCCAGG 3070 hom 102 het 44 0 35 13 GTGAGCTATGATCGTACTACT 0 1 352267 CASAVA_Build 8 3456181 1D AAGTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 11 10 352268 CASAVA_Build 8 3461912 2D AAAATCAAAC AT/-- GTGTTTTCCA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AT 1 0 352269 CASAVA_Build 8 3464311 1I CAAATGCTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 9 10 352270 CASAVA_Build 8 3467724 9D ACTATGTATT CCATCCACA/--------- CCATGAGTCA 3070 hom 102 het 37 0 35 5 CCATCCACA 1 0 352271 CASAVA_Build 8 3473799 2I ATAATCTAAG --/TT TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 T 7 9 352272 CASAVA_Build 8 3474240 5I TTACTTAATA -----/TTATT TTATTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 TTATT 1 2 352273 CASAVA_Build 8 3474666 1I TAAAACACTA -/T TATGCCAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 T 1 2 352274 CASAVA_Build 8 3474992 2I TACATTAGAG --/TA ATCAAAATCC 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 TA 0 1 352275 CASAVA_Build 8 3475659 2D ATGGAGTTGC CT/-- CTCTGAAGCC 3070 het 3070 hom 57 21 26 11 CT 3 2 352276 CASAVA_Build 8 3477661 1D AAGATGACCA C/- ACCAATGTCC 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 C 1 0 352277 CASAVA_Build 8 3492324 29D AGAAATATAA AGAGAAATAGAACACAAAGAGAAAAACAG/----------------------------- CATAAAGAGA 3070 het 3070 hom 35 14 20 8 AGAGAAATAGAACACAAAGAGAAAAACAG 1 0 352278 CASAVA_Build 8 3494880 1I TCTTATTTTT -/A AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 6 7 352279 CASAVA_Build 8 3500590 4D GGAGGTTGCG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2207 hom 33 14 13 7 T 22 18 352280 CASAVA_Build 8 3501990 1D TTGGGATAAA C/- TTTTCTTCTG 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 C 1 0 352281 CASAVA_Build 8 3505660 1D CATGTTGGTC A/- GGGTGATGTC 3070 het 3070 ref 28 13 15 0 A 1 0 352282 CASAVA_Build 8 3510682 2I ATATAGGAAG --/GT GTGTTTATCC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 GT 2 3 352283 CASAVA_Build 8 3511195 5D TCCTCACAGG TCTTA/----- TCTTTTCTTT 2400 het 2400 ref 26 19 6 1 TCTTA 1 0 352284 CASAVA_Build 8 3517283 2D TTCAGTTGTA GT/-- GTGTGTCGGC 3070 het 3070 ref 46 21 19 10 GT 4 3 352285 CASAVA_Build 8 3519518 5D TACTGCAAAA TATAT/----- TATAACTCCA 3070 het 3070 hom 33 13 19 2 TATAT 1 0 352286 CASAVA_Build 8 3529039 16D26M4I ATATTATATA TTATATAATATATAATTTATATAATATATAATGCCTATATGT----/----------------TTATATAATATATAATGCCTATATGTTATA TATAATTTAT 2428 het 1406 hom 9 3 5 1 N/A 0 0 352287 CASAVA_Build 8 3529134 3I ATAACATGTA ---/AAT ATTATATATA 2436 hom 12 het 6 0 5 1 AAT 0 1 352288 CASAVA_Build 8 3530662 1D AATTTCTTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 9 8 352289 CASAVA_Build 8 3531031 1D GAAGGGTCAG T/- TTTCTATGTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 4 3 352290 CASAVA_Build 8 3534649 1D TATAATCAAT C/- CCTTTTTAGT 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 C 3 2 352291 CASAVA_Build 8 3536704 4D TTTTTTACAC ATTT/---- ATTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 ATTT 2 1 352292 CASAVA_Build 8 3542974 1D TAATAGATCC T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 T 7 6 352293 CASAVA_Build 8 3546441 1I ATTAAACCTT -/A ATTTTTTTTT 546 hom 17 het 31 0 6 25 A 1 2 352294 CASAVA_Build 8 3554864 1D AAGCATACAA G/- GGGTTGGGGC 3070 hom 10 het 32 1 26 5 G 4 3 352295 CASAVA_Build 8 3557097 1I GTTACTACGT -/G TCTCTTATTG 3070 hom 87 het 32 0 28 6 G 0 1 352296 CASAVA_Build 8 3563227 1I CATTCCTGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 37 0 27 10 T 8 9 352297 CASAVA_Build 8 3567844 2I AGCAAACTAT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 111 het 44 0 37 7 TG 5 6 352298 CASAVA_Build 8 3568596 2D CCCAAAACTT AA/-- AGACTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 3 1 352299 CASAVA_Build 8 3569126 2D CTTTTACTAC TT/-- TTTTTTTTTT 2562 hom 15 het 8 0 6 2 T 12 10 352300 CASAVA_Build 8 3576974 1I TTTTTTAGAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 8 9 352301 CASAVA_Build 8 3578987 1I CAAGCTGTTT -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 5 6 352302 CASAVA_Build 8 3582160 1D GATTTTTTGC T/- TTCTAGAGAT 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 T 3 2 352303 CASAVA_Build 8 3584723 1D GGAAAAAGGT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 9 8 352304 CASAVA_Build 8 3589425 4D TTGGAGGCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 72 het 36 0 25 13 AAAT 5 4 352305 CASAVA_Build 8 3592315 1I TTGAAAACAC -/T TTTTTTCACA 3070 hom 126 het 46 0 43 7 T 6 7 352306 CASAVA_Build 8 3592426 2D ATCATACGTT TG/-- TTTTTTTTCC 3070 hom 120 het 48 0 41 8 TG 1 0 352307 CASAVA_Build 8 3599903 2I AGTGCATTCA --/TC TTTTAAAAAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TC 0 1 352308 CASAVA_Build 8 3610715 2D AGCATAGCTC CA/-- GAGTCCTACG 3070 het 3070 ref 48 22 19 7 CA 1 0 352309 CASAVA_Build 8 3624639 5D ATCTAGCGCA TATTT/----- TATATCTGCA 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 TATTT 1 0 352310 CASAVA_Build 8 3626960 4D TTTAAGAGTA TCTC/---- TCTATTATTA 3070 het 3070 ref 47 23 21 5 TC 3 1 352311 CASAVA_Build 8 3628849 2I AGCTGGGCTG --/CA CAGTTTGAAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 CA 1 2 352312 CASAVA_Build 8 3636941 1I TTTTGTTTAC -/T TTCTAATGTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 T 2 3 352313 CASAVA_Build 8 3639549 1I TTAATAATTA -/T TTTTTTAATT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 6 7 352314 CASAVA_Build 8 3646563 7D TTCTACCCAA GAAAACT/------- GAAAACATAT 3070 het 3070 ref 44 24 14 9 GAAAACT 1 0 352315 CASAVA_Build 8 3650026 2D ACGGGAACCC CA/-- CTGTTATGAA 3070 het 3070 hom 51 23 23 6 CA 1 0 352316 CASAVA_Build 8 3652357 1I TTTTCTCTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 8 9 352317 CASAVA_Build 8 3656964 1I GCTTAGTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 10 11 352318 CASAVA_Build 8 3660557 2D CTAGACTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 11 hom 34 2 18 14 T 15 13 352319 CASAVA_Build 8 3670516 1I CCTAGAAGAG -/T TGGGGGAAGG 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 T 1 2 352320 CASAVA_Build 8 3682082 1D TCACTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 11 14 8 A 11 10 352321 CASAVA_Build 8 3691020 1D AGCAGTAGAC T/- TCTATAATAA 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 T 2 1 352322 CASAVA_Build 8 3693426 1I GGATTTATAC -/A TTTCCGATTT 3070 het 3070 ref 37 18 10 9 A 0 1 352323 CASAVA_Build 8 3694937 9I GTTTCACGAT ---------/GTTGGCCAG GTTGGTCTCA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 GTTGGCCAG 0 1 352324 CASAVA_Build 8 3726195 1I TGTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 771 hom 37 3 29 5 T 10 11 352325 CASAVA_Build 8 3734488 2D TATATGTGTG TC/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 TC 1 0 352326 CASAVA_Build 8 3736619 1I TCTCAAAACG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 9 10 352327 CASAVA_Build 8 3736961 1I CAAACAAAAA -/T AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 T 0 1 352328 CASAVA_Build 8 3737069 1D TAATATCAGT A/- AAGTGAAAGG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 3 2 352329 CASAVA_Build 8 3737899 1I CCACAGTGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 683 hom 36 2 27 7 A 10 11 352330 CASAVA_Build 8 3743293 1D TCTGTTATAT G/- GCATGATCTG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 G 2 1 352331 CASAVA_Build 8 3748260 1D CTGTCCAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 41 0 31 11 A 12 11 352332 CASAVA_Build 8 3751224 1D TGTCATAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 129 het 49 0 44 6 A 10 9 352333 CASAVA_Build 8 3751470 1I GAGTGAAGAC -/A AAGGTTTTAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 2 3 352334 CASAVA_Build 8 3751557 1D AAACCTAAGC T/- TTTTTTTTTT 2298 het 2298 ref 46 27 7 12 T 13 12 352335 CASAVA_Build 8 3753194 2I AAGCTGAGTC --/TT AGGTTCATCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 0 2 352336 CASAVA_Build 8 3761839 1D GAGACATATT A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 A 8 7 352337 CASAVA_Build 8 3762543 5I TTCATATTTA -----/TCATT TATTTTACCT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 TCATT 0 1 352338 CASAVA_Build 8 3763869 1D TGGGCTGCTC G/- GGTGATGGGT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 G 3 2 352339 CASAVA_Build 8 3765678 5I ATAAATATCA -----/TATTT TATTTTGTTA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 TATTT 1 2 352340 CASAVA_Build 8 3767061 4D TATTATGACA TTCT/---- TTCTTTCATG 3070 het 3070 ref 34 18 10 7 TTCT 2 1 352341 CASAVA_Build 8 3769703 1D TTTTTCTGGT A/- CTCTTCAACT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 A 1 0 352342 CASAVA_Build 8 3773305 1D TAAAGTGCAT A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 A 7 6 352343 CASAVA_Build 8 3777962 1D35M1D AATGTATGAT AAAAAAAAAAAACTGCTTGTGGCAAATTATCTCATTA/-AAAAAAAAAAACTGCTTGTGGCAAATTATCTCATT- AAAAAAAACA 3070 hom 39 het 21 0 14 19 N/A 0 0 352344 CASAVA_Build 8 3785820 1I TCTCCCTTCT -/C CCCCCCGAGA 3070 hom 74 het 41 0 32 9 C 6 7 352345 CASAVA_Build 8 3800662 4D GAACTGCCTC AAGT/---- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 AAGT 1 0 352346 CASAVA_Build 8 3802073 6D CCTCTTTCTC CCCCTA/------ CTTCACACCC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 CCCCTA 1 0 352347 CASAVA_Build 8 3802650 1I AAGAGAAAAG -/A AAAAAGGAAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 5 6 352348 CASAVA_Build 8 3803248 3D TTTAAACTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 1123 hom 42 het 34 0 14 20 CTC 1 0 352349 CASAVA_Build 8 3807256 1D CAGTGACAGA T/- TATGCAGGAT 3070 hom 141 het 51 0 48 4 T 2 1 352350 CASAVA_Build 8 3812204 1D TTCTCTCTCT A/- TACTGTTCTT 3070 het 3070 hom 43 17 18 9 A 1 0 352351 CASAVA_Build 8 3812388 3D TGCTAAAAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 123 het 48 0 40 9 A 13 10 352352 CASAVA_Build 8 3813118 3D CTCCGTCTCA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AAT 7 6 352353 CASAVA_Build 8 3815125 1D AACAAGGGAC T/- TTCTTTTACA 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 T 3 2 352354 CASAVA_Build 8 3819605 1D CGTGCAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 18 1 T 11 10 352355 CASAVA_Build 8 3825060 1D TTTTATCATT G/- TATAGTGCTG 3070 het 3070 ref 47 27 17 3 G 1 0 352356 CASAVA_Build 8 3825308 1D GTATTTTAAG T/- GTTGACCTAT 3070 het 3070 ref 46 22 21 4 T 1 0 352357 CASAVA_Build 8 3825468 2I TAGATTTGTC --/GT GTCTCTCTTT 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 GT 1 2 352358 CASAVA_Build 8 3827548 1D GCTGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 16 12 3 A 11 10 352359 CASAVA_Build 8 3830864 1I CATAACTCAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 11 15 8 T 9 10 352360 CASAVA_Build 8 3831690 4I GTTTAAGTGA ----/TTTC TTTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 TTTC 0 1 352361 CASAVA_Build 8 3837029 5D GCAGAGTATC AAGAA/----- AAGGAGAAAT 3070 het 3018 hom 23 10 10 5 AAGAA 1 0 352362 CASAVA_Build 8 3837055 2I TGTATATATA --/TG TGTGTGTGTG 2774 het 325 hom 18 2 11 5 TG 7 8 352363 CASAVA_Build 8 3839177 2D AGCCTGTTTC TT/-- TTGTTATATA 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 T 4 2 352364 CASAVA_Build 8 3840317 2D ACACAAAACA CT/-- CTGTTGACCC 3070 het 3070 hom 59 20 31 9 CT 2 1 352365 CASAVA_Build 8 3841117 1D TCACTTGCTT C/- TACCTCTCTC 3070 het 3070 ref 49 28 18 3 C 1 0 352366 CASAVA_Build 8 3841375 1I ATTTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 390 hom 34 1 23 10 T 10 11 352367 CASAVA_Build 8 3842778 1D TCGTTGGGGG A/- AAAAACGGGG 3070 het 3070 hom 44 14 28 4 A 6 5 352368 CASAVA_Build 8 3843169 1D CACTCAATCT G/- AAAAAGAATC 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 G 1 0 352369 CASAVA_Build 8 3846827 1I AGCACAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 A 10 11 352370 CASAVA_Build 8 3847145 4D GTGTGTGTGT GTGA/---- GTGTGTGTGC 3070 het 3070 ref 48 25 20 4 GTGA 1 0 352371 CASAVA_Build 8 3847932 15D TAATTTTTTC AAAATAAATGTATAA/--------------- AAATAAAAAC 2392 het 2392 ref 24 19 7 2 AAAATAAATGTATAA 1 0 352372 CASAVA_Build 8 3848342 4I ACAAACAAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 45 hom 20 2 13 5 AAAC 2 3 352373 CASAVA_Build 8 3848778 5I ATGTGAACTA -----/TTTAG TTTAATCACA 3070 hom 120 het 45 0 41 5 TTTAG 0 1 352374 CASAVA_Build 8 3848873 5D TAGAAAACAG AACAA/----- AACAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 5 AACAA 2 1 352375 CASAVA_Build 8 3856955 1D ATAATGACAA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 23 12 1 G 2 1 352376 CASAVA_Build 8 3858255 1I ACTCACCGTA -/C CGCTGTTGTC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 C 1 2 352377 CASAVA_Build 8 3864375 14D AGGAAGGGAA CATTCCCTTATTAG/-------------- GGCCCTTATT 3070 hom 72 het 29 0 23 8 CATTCCCTTATTAG 1 0 352378 CASAVA_Build 8 3864845 3D GTAATTCATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 19 10 A 17 14 352379 CASAVA_Build 8 3867111 2D TGTATATTTA TG/-- TGTATATATA 2195 hom 18 het 11 0 7 4 TG 2 1 352380 CASAVA_Build 8 3875134 1D AGCTCAACTA G/- GGCGGTGCCC 3070 hom 66 het 24 0 21 5 G 3 2 352381 CASAVA_Build 8 3880104 3D GGCGTACTGA TGT/--- TGTAGCCGTC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 TGT 2 1 352382 CASAVA_Build 8 3882546 5I GGACTTTAGG -----/TCTCT TCTCTTATAT 3070 hom 99 het 37 0 32 5 TCTCT 1 2 352383 CASAVA_Build 8 3883987 5I ATGATACTAC -----/AATAA AATACAATAT 3070 het 3070 ref 56 28 22 6 AATAA 0 1 352384 CASAVA_Build 8 3889640 2I3M2D ACAACCCTGG --ATGCA/TCATG-- TAGCACCCTG 2560 het 2560 ref 54 25 12 20 N/A 0 0 352385 CASAVA_Build 8 3894851 1I GAATCCATTC -/G GGATACCACA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 G 2 3 352386 CASAVA_Build 8 3896239 1I TTGAAGACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 228 hom 28 1 19 8 A 14 15 352387 CASAVA_Build 8 3899222 1D GATGTGGCTT C/- CACTTCACAT 3070 hom 108 het 45 0 35 10 C 2 1 352388 CASAVA_Build 8 3905174 1D AATTCAACAA C/- CCTTCATGCT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 C 3 2 352389 CASAVA_Build 8 3908207 1D TACATAGAAC A/- AAAAAACCAA 2738 het 2738 ref 25 14 9 3 A 7 6 352390 CASAVA_Build 8 3909860 1D ACCTAGGCTT A/- AAAAAAAAAA 2944 het 2944 ref 27 13 8 6 A 11 10 352391 CASAVA_Build 8 3910490 1I GTAGCTAATC -/T TTTTTTCACT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 6 7 352392 CASAVA_Build 8 3912413 2D AAATAAATTA CT/-- TTTTTTTTTA 2892 het 2892 ref 25 14 9 2 CT 1 0 352393 CASAVA_Build 8 3922228 6D TATATATGTG TATATA/------ TATATATATA 1895 hom 9 het 11 0 4 7 TA 12 9 352394 CASAVA_Build 8 3924885 2D TGTAAAAATA AT/-- ATAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 6 AT 2 1 352395 CASAVA_Build 8 3929264 1D GTTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 44 1 34 9 A 11 10 352396 CASAVA_Build 8 3929944 1D TTAGATTTTT C/- CTTATGCAAA 3070 het 3070 ref 44 21 20 4 C 2 1 352397 CASAVA_Build 8 3935842 1D AGGGGCAGTC T/- TTTTTTTTTT 2850 het 1131 hom 18 5 7 8 T 13 12 352398 CASAVA_Build 8 3938187 1D TAATTAAGCT A/- AAAAATCACA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 6 5 352399 CASAVA_Build 8 3946765 1I TCCGCACATC -/T TCTGAATTGA 3070 hom 135 het 54 0 45 9 T 1 2 352400 CASAVA_Build 8 3948196 6I ATACATACAT ------/TATATA TATATATATC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 TA 4 7 352401 CASAVA_Build 8 3949923 1I GTTTCACATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 A 9 10 352402 CASAVA_Build 8 3950268 2I CACTTCTGAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 20 10 10 T 10 12 352403 CASAVA_Build 8 3952974 12D AGAGAGAAAG AGAGACAGAGAC/------------ AGAGACAGAG 3070 hom 75 het 28 0 23 8 AGAGAC 5 3 352404 CASAVA_Build 8 3955567 4I GATATATACA ----/TGTG GGTGTGTGTG 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TG 0 2 352405 CASAVA_Build 8 3959496 5I TTAATAAATG -----/CATGT CATAAGTCTA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 CATGT 0 1 352406 CASAVA_Build 8 3961759 1D AGGGTCTATT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 A 9 8 352407 CASAVA_Build 8 3962175 3I CTGTCTGCTT ---/TCC TCCTCTCATC 2890 het 2890 ref 41 17 13 11 TCC 1 2 352408 CASAVA_Build 8 3963333 2D AGAAATTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 A 12 10 352409 CASAVA_Build 8 3963417 1I AAACATATAG -/A AAAAAAGCTC 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 6 7 352410 CASAVA_Build 8 3964527 1I CTTCTATCTA -/G GGGAGGAGAC 3070 hom 126 het 51 0 43 8 G 3 4 352411 CASAVA_Build 8 3964882 1I AATAGGTATC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 7 8 352412 CASAVA_Build 8 3969340 1D TTGTATTTAA T/- TTTTTTCCCT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 7 6 352413 CASAVA_Build 8 3970054 1D TTCCATCGAG A/- AAAAAACCTT 3070 hom 40 het 20 0 16 4 A 7 6 352414 CASAVA_Build 8 3972384 14D AGCATTAATG AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 het 1745 hom 33 13 12 8 A 26 12 352415 CASAVA_Build 8 3975658 1D AAGTATTTTG T/- CTATCAACTC 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 T 1 0 352416 CASAVA_Build 8 3978644 1I AAAGTGTAAT -/A CTCAAGACTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 0 1 352417 CASAVA_Build 8 3980269 10D18M9D7M1D AAGGGGAAAG AAGGAAGGAAGGGAAAGGAGGGAAGGAAGGGGAAAGTGGGAAAGA/----------GGGGAAGGAGGGAAGGAA---------GGGAAAG- GGGGGAAGGA 2838 het 2838 ref 22 16 10 9 N/A 0 0 352418 CASAVA_Build 8 3982796 1D GCCTTACATT A/- TTTTTTTTAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 1 0 352419 CASAVA_Build 8 3983555 1I ATTAAACAAA -/C GGAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 18 19 7 C 0 1 352420 CASAVA_Build 8 3984899 4D TGAAACTATG TTTA/---- TGTGGGCAGG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 TTTA 1 0 352421 CASAVA_Build 8 3985127 8I48M1I TAAAACCACA --------AAACAAATAAACAAAAATTCATCTGGATATGAAGGCTCAGCCTGTCAT-/AAACAAATAAACAAATAAACAAAAATTCGTCTGGATATGAAGGCTCAGCCTGTCATC CTAGCACTTT 3070 het 3070 ref 31 20 17 5 N/A 0 0 352422 CASAVA_Build 8 3985436 4I ACAAACAAAC ----/AAAG AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 3 AAAG 0 1 352423 CASAVA_Build 8 3986587 1D TTAAATCTCC A/- GATCTCTAAA 3070 het 3070 ref 45 23 18 10 A 1 0 352424 CASAVA_Build 8 3986987 5I TTGAATATAT -----/TTAAA AAGTTGAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TTAAA 0 1 352425 CASAVA_Build 8 3988062 8I ATTGGAATTA --------/GAGGATTG GCATTTCTAG 3070 het 3070 hom 53 22 27 4 GAGGATTG 0 1 352426 CASAVA_Build 8 3988302 1D GTCTTATCCC T/- TTTTTTTTTT 3041 het 117 hom 42 3 12 27 T 16 15 352427 CASAVA_Build 8 3995821 9I AGAAACGCCT ---------/AATAAATTA GAGAAAGAGC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 AATAAATTA 0 1 352428 CASAVA_Build 8 4005043 1I GCACTGAGGA -/C CATTAAAAAA 3070 het 51 hom 32 1 27 4 C 1 2 352429 CASAVA_Build 8 4009045 1D GAATACTTTT A/- AATTTTATTA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 A 3 2 352430 CASAVA_Build 8 4009137 1I GAAGAAAAAA -/G AAATGACAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 352431 CASAVA_Build 8 4021553 2D TCCATAAAAG AC/-- ACAGACTGGC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 AC 2 1 352432 CASAVA_Build 8 4026971 4D TGTGTGTGTG TGTC/---- GGTGTGTGTG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 TGTC 1 0 352433 CASAVA_Build 8 4029713 1I TCTGTACCAC -/A AACCTGTGAC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 3 352434 CASAVA_Build 8 4032083 1I TGATTTACTG -/A CTTGTAGTAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 0 1 352435 CASAVA_Build 8 4033737 1D TGAATATTAT G/- GGGGAGGATG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 5 4 352436 CASAVA_Build 8 4034854 1I CTTTTGCATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 T 10 11 352437 CASAVA_Build 8 4043888 1D ATCTTTTTTT A/- AGACAGTACT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 A 2 1 352438 CASAVA_Build 8 4044151 2D AAATATCCTC TT/-- GAGGTTAGAC 3070 het 3070 ref 58 31 18 9 T 2 0 352439 CASAVA_Build 8 4046818 1D TGGAAATTTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 115 hom 18 2 11 6 G 12 11 352440 CASAVA_Build 8 4047026 1I GTAAATTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 7 8 352441 CASAVA_Build 8 4049763 1D TTTTATTTAA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 26 17 9 0 T 9 8 352442 CASAVA_Build 8 4060438 2D ACATAGAGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 30 0 26 4 T 12 10 352443 CASAVA_Build 8 4062589 1I ACCTCATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 9 12 9 A 13 14 352444 CASAVA_Build 8 4064486 1D TGCTTATGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 444 hom 23 1 19 3 A 10 9 352445 CASAVA_Build 8 4066982 1D GAGAAGACAT C/- AAAGGCCATC 3070 hom 124 het 52 0 43 11 C 1 0 352446 CASAVA_Build 8 4067036 1D TCAAACCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 13 14 21 A 12 11 352447 CASAVA_Build 8 4069165 1D CCTTTTTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 10 9 352448 CASAVA_Build 8 4069838 1D TCAGGAGTCC A/- AAGGCCAGCC 3070 hom 71 het 27 0 22 5 A 3 2 352449 CASAVA_Build 8 4076455 1D AGGTCTGTAA T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 T 9 8 352450 CASAVA_Build 8 4076866 1I TGTGTTTTCC -/T TTCTTCCTTT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 T 2 3 352451 CASAVA_Build 8 4080291 1I ACGTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 12 15 3 T 10 11 352452 CASAVA_Build 8 4080957 24D ATGGATATTG TTTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTT/------------------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3014 hom 29 13 13 13 TTTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTT 1 0 352453 CASAVA_Build 8 4086639 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2021 hom 25 8 10 7 T 13 12 352454 CASAVA_Build 8 4087651 1I CACTCTGCCC -/A AGTTGAGTGG 3070 het 3070 hom 37 12 18 7 A 1 2 352455 CASAVA_Build 8 4102137 1I TAAGCATGAG -/A AGTTTTATTG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 1 2 352456 CASAVA_Build 8 4104470 1D AAAAAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 34 1 29 4 T 11 10 352457 CASAVA_Build 8 4104956 1D TTGTGCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 48 0 36 14 T 12 11 352458 CASAVA_Build 8 4122129 2D TACAGATAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 525 hom 25 2 18 5 AT 9 8 352459 CASAVA_Build 8 4128717 1D AAAGGAGAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 11 10 352460 CASAVA_Build 8 4134341 10I GGGAGCCAGG ----------/GCTCGAAAAT GCCTGTGTTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 GCTCGAAAAT 0 1 352461 CASAVA_Build 8 4141550 1I TAATAGTTTG -/T TTATTTAGTT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 T 2 3 352462 CASAVA_Build 8 4141805 1I AGACTCCCAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 T 7 8 352463 CASAVA_Build 8 4142026 2I GGGGAGACTC --/TT TAGAGCATCG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 T 1 3 352464 CASAVA_Build 8 4155460 4I ATAAAATATC ----/TTTG TTTGGACACA 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 TTTG 1 2 352465 CASAVA_Build 8 4158284 2I GGTAGCAGAC --/CT CATCATTGTC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 CT 0 1 352466 CASAVA_Build 8 4160734 3D TAATTCAAAC TTT/--- TTTTCTTTAT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 7 4 352467 CASAVA_Build 8 4163589 2I CGTCACTGAT --/TC TGTTTTTGAT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 TC 0 1 352468 CASAVA_Build 8 4168421 1I GGGCTTTCTC -/T TGAAACCTGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 1 2 352469 CASAVA_Build 8 4168684 1D ACTCAAATAT C/- CCCCCCTTCC 3070 hom 108 het 41 0 35 6 C 7 6 352470 CASAVA_Build 8 4187130 28D GCAGCAGTGC TGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/---------------------------- TGTGTCTGTG 3070 hom 88 het 51 0 29 31 TGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 1 0 352471 CASAVA_Build 8 4196880 1I CTTTATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 804 hom 34 2 19 13 T 15 16 352472 CASAVA_Build 8 4200850 1I GAATCAGCTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 T 7 8 352473 CASAVA_Build 8 4211185 1I GACGTGATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 T 10 11 352474 CASAVA_Build 8 4224607 28D GTTCTTACAG GGGAAGAGGGCAATGAAGCAACAATGGC/---------------------------- GGGAAGAGGG 3070 het 3070 ref 41 23 10 15 GGGAAGAGGGCAATGAAGCAACAATGGC 1 0 352475 CASAVA_Build 8 4228987 1D TTCAGTGTTG T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 T 8 7 352476 CASAVA_Build 8 4239593 1D TTTCTCCTTT C/- TTTCCCTATT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 C 1 0 352477 CASAVA_Build 8 4245892 2D ATATTATGTC TT/-- ATATTCCCTA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 T 2 0 352478 CASAVA_Build 8 4263719 1I GATTAACTTA -/T TTCCTTGATA 3070 hom 129 het 46 0 42 4 T 2 3 352479 CASAVA_Build 8 4271019 1I AATTATTTTG -/A AAAAAAAAAA 1457 het 1457 ref 49 36 5 8 A 13 14 352480 CASAVA_Build 8 4271554 5I ATTGTTTACT -----/ATATA ATATAATATA 1660 het 1660 ref 10 5 4 1 ATATA 2 3 352481 CASAVA_Build 8 4285927 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2397 het 2397 ref 11 5 5 1 A 12 11 352482 CASAVA_Build 8 4295952 1D CAACGTGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 19 18 1 A 10 9 352483 CASAVA_Build 8 4306093 6I ATTGTCTTAC ------/CAGATA CAGATAAAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CAGATA 1 2 352484 CASAVA_Build 8 4311375 16D AAATGAGTAT ATATATACTCAATATA/---------------- TAGGCAAGGA 3070 het 3070 ref 53 26 25 4 ATATATACTCAATATA 1 0 352485 CASAVA_Build 8 4313258 1I GGGCGATAGG -/C CCTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 C 2 3 352486 CASAVA_Build 8 4320628 3I CTCACTGCAG ---/CCC CTGCCTCTGG 3070 hom 56 het 20 0 16 4 C 1 4 352487 CASAVA_Build 8 4333615 1I TCATGGCGGT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 37 13 13 11 G 8 9 352488 CASAVA_Build 8 4336962 1I ATTATTCAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 16 20 9 A 10 11 352489 CASAVA_Build 8 4340515 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 8 9 352490 CASAVA_Build 8 4353090 1I AAGAGGTAAT -/A ATTTTTTTTT 3070 hom 61 het 24 0 20 4 A 1 2 352491 CASAVA_Build 8 4357726 4D CTAAACAAAG AGAT/---- AGCCCATGTT 3070 het 2381 hom 29 7 11 12 AGAT 1 0 352492 CASAVA_Build 8 4357749 1D TCATGGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2250 hom 27 8 10 9 A 13 12 352493 CASAVA_Build 8 4369183 1D GACAACACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 6 A 12 11 352494 CASAVA_Build 8 4383122 2I GGTGGCTACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 332 hom 34 1 10 23 T 14 16 352495 CASAVA_Build 8 4387287 1D ACTTACTAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 A 9 8 352496 CASAVA_Build 8 4403862 1I ACTGATCATG -/A TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 0 1 352497 CASAVA_Build 8 4411826 22I GTTTTCCAGC ----------------------/AATGAGAAAAACTCAATTTAGG AATGAGAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 4 AATGAGAAAAACTCAATTTAGG 0 1 352498 CASAVA_Build 8 4419101 1I GCTGGGGTCC -/A AAAAAAAACC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 8 9 352499 CASAVA_Build 8 4424250 4I TGAAGTTTAA ----/ACAT ACATACATAC 3070 het 3070 ref 19 9 9 1 ACAT 4 5 352500 CASAVA_Build 8 4426270 4D ATATACTACT TTAA/---- TTAAATCTTA 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 TTAA 2 1 352501 CASAVA_Build 8 4433301 27D TGCTATCTAG AGACAGAGATAAAGAACTATCTCATAA/--------------------------- AGACAGAGAT 1981 het 1981 ref 29 18 5 10 AGACAGAGATAAAGAACTATCTCATAA 1 0 352502 CASAVA_Build 8 4444293 1D ACCCTGGAAG A/- ATTTTTTTTT 1556 het 1556 ref 53 34 5 16 A 2 1 352503 CASAVA_Build 8 4445161 3I CCTCACGTGA ---/TAC TACTCTACTC 3070 hom 147 het 56 0 47 9 TAC 1 2 352504 CASAVA_Build 8 4457113 1D GCTGAGTGCT A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 A 8 7 352505 CASAVA_Build 8 4457282 1I TTCAGAATTG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 8 9 352506 CASAVA_Build 8 4461902 1I GATTTCTTTT -/G TTTTACCTAA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 0 1 352507 CASAVA_Build 8 4463229 8I CTCAGCCATG --------/TCTTATTC TCCCTCATAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 TCTTATTC 0 1 352508 CASAVA_Build 8 4472926 1I TGTGACAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 A 9 10 352509 CASAVA_Build 8 4473054 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 TA 8 9 352510 CASAVA_Build 8 4473543 1I AGAAAATGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 8 9 352511 CASAVA_Build 8 4478131 1D TATTAGGATC A/- AAAACAGGCT 3070 het 3070 hom 36 12 21 4 A 5 4 352512 CASAVA_Build 8 4489347 1D CTTTGCCCTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 9 8 352513 CASAVA_Build 8 4495587 3I GCCTTGAGTT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 A 12 15 352514 CASAVA_Build 8 4497314 1I TTCCATTCTG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 7 8 352515 CASAVA_Build 8 4499966 1I ATGTACCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 A 13 14 352516 CASAVA_Build 8 4502918 4D AAGCAGGTAG AAGA/---- AAGAATCAAC 3070 het 3070 hom 25 11 12 4 AAGA 2 1 352517 CASAVA_Build 8 4504205 1I AGAAAAGATC -/A AATTAACACC 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 A 2 3 352518 CASAVA_Build 8 4505630 1I GCTACAGACC -/A GCAGAAAGTA 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 0 1 352519 CASAVA_Build 8 4543688 1D TCTGCCCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2827 hom 31 8 18 5 A 11 10 352520 CASAVA_Build 8 4546248 1I CCTTTGATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 9 13 T 13 14 352521 CASAVA_Build 8 4546715 1D AACCTTGGGT G/- GAAGATTTAA 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 G 2 1 352522 CASAVA_Build 8 4550976 1D AAATATGTAA T/- TTTTTATATA 3070 het 1723 hom 15 4 10 1 T 6 5 352523 CASAVA_Build 8 4553059 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 7 8 352524 CASAVA_Build 8 4556602 1D AGGTAAATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 21 0 17 5 A 10 9 352525 CASAVA_Build 8 4559573 1D CAGGCCCTTT C/- CCCAGAAAGA 3070 hom 84 het 32 0 27 5 C 4 3 352526 CASAVA_Build 8 4575841 1D CCGTGCTTTG T/- TTCCAGTCAT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 3 2 352527 CASAVA_Build 8 4577955 1D GTTTCTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 11 10 352528 CASAVA_Build 8 4597014 2D TATTCATGTC TG/-- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 TG 5 4 352529 CASAVA_Build 8 4606302 2D GTGTTACTTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 64 het 30 0 21 9 GT 7 6 352530 CASAVA_Build 8 4620365 2D GAATCTAAAT AA/-- AGTCTGTGCT 3070 het 3070 hom 42 19 20 5 A 3 1 352531 CASAVA_Build 8 4624207 1I CCCTTCCATG -/T TATAGGGGTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 1 2 352532 CASAVA_Build 8 4624403 1D CATTAATTTA T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 7 6 352533 CASAVA_Build 8 4625506 1D23M1D TTTATATTTA TTTTTTTCCATAAGTTATTGGGGTA/-TTTTTTCCATAAGTTATTGGGGT- CAGGTGGTAT 3070 het 1681 hom 18 5 11 6 N/A 0 0 352534 CASAVA_Build 8 4631034 1I GTGTAAGACC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 352535 CASAVA_Build 8 4636170 1D GAACGTGCCT G/- GGGTTGCAGG 3070 het 3070 hom 49 21 21 7 G 4 3 352536 CASAVA_Build 8 4636876 1I TTAGTTTTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 9 10 352537 CASAVA_Build 8 4638766 1D CCAGAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 23 1 14 9 A 18 17 352538 CASAVA_Build 8 4649389 1D TCGGTGTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 T 13 12 352539 CASAVA_Build 8 4670518 10D AAGTGGGATC AAAAAGCACA/---------- GAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 29 16 13 2 AAAAAGCACA 1 0 352540 CASAVA_Build 8 4670864 7I AAAAAACAGG -------/CAGCTAT CAGCTATCAC 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 CAGCTAT 1 2 352541 CASAVA_Build 8 4712898 2I CTTAGATATT --/TA TACACGTTTG 3070 hom 123 het 48 0 42 6 TA 1 2 352542 CASAVA_Build 8 4713716 1I TAAAAATTGT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 353 hom 38 1 31 6 A 9 10 352543 CASAVA_Build 8 4726464 2D TCGAAGTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 479 hom 27 3 13 12 T 18 16 352544 CASAVA_Build 8 4739497 3I AAGAAAAAAA ---/AAG AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAG 0 1 352545 CASAVA_Build 8 4743305 1I ACACCTGCCA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 T 7 8 352546 CASAVA_Build 8 4744276 1I CACTAACAAA -/G AAGTGAGCCA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 0 1 352547 CASAVA_Build 8 4747365 1I TAAAGAGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 A 12 13 352548 CASAVA_Build 8 4751436 1I ACACACTTTG -/C TTTTTCAGTT 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 C 0 1 352549 CASAVA_Build 8 4751515 3I GCTTTTTTTT ---/TTC CCCCCACTTT 3070 het 3070 ref 31 16 13 4 TTC 0 1 352550 CASAVA_Build 8 4752478 3D TGGTTTGTGT TTC/--- TTTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 23 12 11 0 TTC 1 0 352551 CASAVA_Build 8 4753661 9I ACCATGTTAT ---------/TTATTTTCA TTTCTAGTAA 3070 hom 117 het 40 0 40 0 TTATTTTCA 0 1 352552 CASAVA_Build 8 4762582 5I TAAATAAATG -----/AAATA AAATAAAATA 3070 hom 26 het 12 0 9 3 AAATA 2 3 352553 CASAVA_Build 8 4763021 1I GCAATACTTT -/A TAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 0 1 352554 CASAVA_Build 8 4770468 1I TGGCATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 56 hom 28 2 23 3 T 10 11 352555 CASAVA_Build 8 4776502 2I GCTGATTTCA --/CG AGAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 CG 0 1 352556 CASAVA_Build 8 4777185 1D ACTTCTCTGG T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 21 3 T 4 3 352557 CASAVA_Build 8 4777270 1D ATATTTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 A 11 10 352558 CASAVA_Build 8 4778021 4D CGGCTTGAAG TAAT/---- TAATCACCTT 3070 het 3070 ref 44 23 18 5 TAAT 2 1 352559 CASAVA_Build 8 4779579 4I TCATGTATTT ----/ATTG ATTGATCAAT 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 ATTG 1 2 352560 CASAVA_Build 8 4783884 1I TGGAGAAATG -/T TTATTCTAGT 3070 het 3070 ref 24 13 7 5 T 2 3 352561 CASAVA_Build 8 4786203 4I GTAACATTCT ----/TTGA TTGATTCAAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 TTGA 1 2 352562 CASAVA_Build 8 4790455 1D GAAGGACATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 A 12 11 352563 CASAVA_Build 8 4792348 1I GAATTACCAG -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 7 8 352564 CASAVA_Build 8 4794237 1D CTGTTTTGTT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 A 8 7 352565 CASAVA_Build 8 4795043 3I GAAATGTTTC ---/ATA ATATGATAAG 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 ATA 1 2 352566 CASAVA_Build 8 4796513 1D GAAAAGAAGC A/- AAAAAAAAAG 2088 het 2088 ref 26 13 8 5 A 10 9 352567 CASAVA_Build 8 4796789 3D ACACTGAAGG ACC/--- ACCCTGCATA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 ACC 2 1 352568 CASAVA_Build 8 4801178 1D TTACTCGCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 2865 hom 27 8 14 5 T 9 8 352569 CASAVA_Build 8 4806829 1I AAATTCCTTC -/A CTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 0 1 352570 CASAVA_Build 8 4807045 1D TTTTTTGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 10 9 352571 CASAVA_Build 8 4807119 1D AAATTTCTGC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 343 hom 34 1 26 7 T 9 8 352572 CASAVA_Build 8 4813194 1I GAGAGCTAAC -/A TACAAAGTCT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 0 1 352573 CASAVA_Build 8 4816619 2D CTATTCTGAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 61 het 24 0 21 4 AT 9 8 352574 CASAVA_Build 8 4819451 3D TATTTTTAAC ATA/--- ATAACGTGAG 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 ATA 2 1 352575 CASAVA_Build 8 4820740 1D AGTGTATGCA T/- TTTTTTTGCA 2301 het 2301 ref 34 24 7 3 T 8 7 352576 CASAVA_Build 8 4823806 4I AGGCGGAGGT ----/GCAC TGCAGTGAGC 3070 het 902 hom 23 3 18 2 GCAC 0 1 352577 CASAVA_Build 8 4824486 1D TAGTTTTCAC T/- TTTTTGAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 6 5 352578 CASAVA_Build 8 4826105 2D CGTTCAACTG AA/-- AACGCTTTAC 3070 hom 141 het 52 0 47 5 A 4 2 352579 CASAVA_Build 8 4828774 4I AACATATGAT ----/AGAG AGAACTAGAA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AG 1 3 352580 CASAVA_Build 8 4830297 5I CCCTGGAACT -----/TAAAA TAAAAGTTTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 TAAAA 1 2 352581 CASAVA_Build 8 4840230 2D TTTATACATT TA/-- TATATATATA 3070 het 1866 hom 18 4 9 5 TA 8 7 352582 CASAVA_Build 8 4842403 1D GAGTGAGTGT G/- GGGGCCCAGG 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 G 5 4 352583 CASAVA_Build 8 4856052 1D AATGACATGG C/- TTCCGGGTAT 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 C 1 0 352584 CASAVA_Build 8 4868667 1D GCAATAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 A 11 10 352585 CASAVA_Build 8 4876876 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAACAC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 7 8 352586 CASAVA_Build 8 4888869 1D AATGCAAAAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 414 hom 39 1 30 8 A 9 8 352587 CASAVA_Build 8 4891430 6D GGTTCTGCAG GCTTCC/------ GCTTCCACGC 3070 hom 84 het 33 0 28 8 GCTTCC 2 1 352588 CASAVA_Build 8 4896810 4I TGCACACACA ----/CACT CACACACACA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 CACT 0 1 352589 CASAVA_Build 8 4896947 3I GTAAATATAT ---/ATA ATGTTAGATA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 ATA 0 1 352590 CASAVA_Build 8 4897034 2D TTACAAATTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 23 12 9 3 TA 9 8 352591 CASAVA_Build 8 4897251 2I ATATATATAT --/AC ACACACACAC 2858 het 611 hom 14 4 8 2 AC 6 7 352592 CASAVA_Build 8 4901213 1I TATTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 31 1 26 4 A 10 11 352593 CASAVA_Build 8 4904516 1I AAATTCATGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 8 9 352594 CASAVA_Build 8 4904721 2I1M3D TTTTATGTAA --TAAA/GTT--- ATAAATACAG 3070 hom 84 het 29 0 28 3 N/A 0 0 352595 CASAVA_Build 8 4904995 1D GTAAATCTAA C/- AGAGACCTCT 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 C 1 0 352596 CASAVA_Build 8 4905152 1D9M1D CAACCAAACT CCCCCCCTACA/-CCCCCCTAC- AAAAAAATAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 N/A 0 0 352597 CASAVA_Build 8 4906300 1D CTGACTCAAA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 7 352598 CASAVA_Build 8 4909756 2D ACTGATCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 592 hom 40 10 10 20 A 18 16 352599 CASAVA_Build 8 4915745 4I TTTTTCTTAC ----/AATA AAGATTTCCT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 AATA 0 1 352600 CASAVA_Build 8 4917029 5I TTTTTTAACT -----/TTAGA TTAGAAGATA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 TTAGA 1 2 352601 CASAVA_Build 8 4919125 49D ATTTAGTCTC CTCTGGAATAAGTATTAGTCTAAAAAACTCTAAATAAAGTCTTTGTCTT/------------------------------------------------- CTCTGGAATA 3070 het 3070 ref 35 28 13 4 CTCTGGAATAAGTATTAGTCTAAAAAACTCTAAATAAAGTCTTTGTCTT 1 0 352602 CASAVA_Build 8 4935494 1I TCCAACATAA -/T TTTCTGATTA 3070 het 3070 hom 57 25 29 3 T 3 4 352603 CASAVA_Build 8 4953837 1D60M1D TTTTGCCAAT CCCGACCCACCTACCTATCAATGTATGACCCTAAAATGGTAGATTTATAGTCGTAAGAGGCT/-CCGACCCACCTACCTATCAATGTATGACCCTAAAATGGTAGATTTATAGTCGTAAGAGGC- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 22 19 14 N/A 0 0 352604 CASAVA_Build 8 4960031 1D CTCTTGTAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 22 9 11 2 A 9 8 352605 CASAVA_Build 8 4975731 4D CACAATAAAG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3062 hom 29 8 16 7 TTTA 3 2 352606 CASAVA_Build 8 4980547 1I CTCACTCTGT -/C GCCCAGGCTG 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 C 0 1 352607 CASAVA_Build 8 4987863 1I AGTAACAATA -/T TTAAAAACTG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 2 3 352608 CASAVA_Build 8 4999539 4D CCATCTCAGC AGAG/---- AGAGAGTTGT 3070 hom 93 het 32 0 32 1 AG 5 3 352609 CASAVA_Build 8 5001901 1D ATTTGCCTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 36 0 31 6 T 10 9 352610 CASAVA_Build 8 5002206 1D CTTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 5 T 18 17 352611 CASAVA_Build 8 5006417 1D ATTTCTACGG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 47 17 22 8 A 9 8 352612 CASAVA_Build 8 5008967 1I CGGTGTGCAG -/T TTTTTGTGTG 3070 hom 135 het 54 0 46 8 T 5 6 352613 CASAVA_Build 8 5013246 1I AATCCACTTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 45 21 13 11 A 8 9 352614 CASAVA_Build 8 5027596 1I CATGTCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 10 11 352615 CASAVA_Build 8 5046169 3D ATCTGTAAAT ATC/--- ATATCTTCCT 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 ATC 1 0 352616 CASAVA_Build 8 5051395 1D GTTCTAACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 T 10 9 352617 CASAVA_Build 8 5053120 4D AGAGAGAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 47 18 22 9 AG 8 6 352618 CASAVA_Build 8 5060264 1D AAAATGAGAT A/- AATAATACTA 3070 het 3070 hom 42 21 19 3 A 3 2 352619 CASAVA_Build 8 5061833 15D TTTTTCTTTC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTGA 3070 het 1265 hom 16 6 9 2 T 23 8 352620 CASAVA_Build 8 5062547 1I TTCTTGAGTA -/G GGTGGGACTA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 G 2 3 352621 CASAVA_Build 8 5075547 1I AATAGCACCT -/C CCCCCCAGAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 C 6 7 352622 CASAVA_Build 8 5076086 1I CTTTGTCAAC -/A AATGTTCTAA 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 A 2 3 352623 CASAVA_Build 8 5077648 1I ATAGAAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 30 0 20 10 T 10 11 352624 CASAVA_Build 8 5077658 2I TTTTTTTTTT --/TA AAAAAAGGCA 3070 hom 51 het 33 0 17 16 TA 0 1 352625 CASAVA_Build 8 5077751 1D ATAAAAAAAA G/- AAATATGTCT 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 G 1 0 352626 CASAVA_Build 8 5078657 2D TCCGCCTTTG CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 CT 7 6 352627 CASAVA_Build 8 5080630 4I AAAAAAATTC ----/AGAT AGATAGATTA 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 AGAT 2 3 352628 CASAVA_Build 8 5083360 4D TAGTACCTGC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2680 het 398 hom 26 5 9 13 A 20 16 352629 CASAVA_Build 8 5085362 1D GGTCAATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 18 22 9 A 12 11 352630 CASAVA_Build 8 5093620 3D ATGGTAAAAC ATA/--- ATAATTGAGT 3070 het 3070 hom 49 20 27 4 ATA 2 1 352631 CASAVA_Build 8 5115893 14D GTTGGACCCC TACAAGCTACTTGT/-------------- TGGACTCCTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TACAAGCTACTTGT 1 0 352632 CASAVA_Build 8 5116046 3D CAAACAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 AAC 7 6 352633 CASAVA_Build 8 5117737 1D TTTCTAAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 26 0 22 5 A 10 9 352634 CASAVA_Build 8 5120750 1I GTTTTATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 T 9 10 352635 CASAVA_Build 8 5122470 1I CCTTGCCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 380 hom 28 1 25 2 T 11 12 352636 CASAVA_Build 8 5129066 1D AGGTAGATTA T/- TTTAAAAACT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 4 3 352637 CASAVA_Build 8 5139826 1D TCTATAAAAA G/- AGGAAGTCTG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 G 1 0 352638 CASAVA_Build 8 5142195 1I GTAAAAAAGG -/A AAAAAAATAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 7 8 352639 CASAVA_Build 8 5142522 2I AATATTATCA --/CC CCCCCCCTTT 3070 hom 49 het 30 0 16 14 C 7 9 352640 CASAVA_Build 8 5142708 1D TCCTTTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 14 13 352641 CASAVA_Build 8 5144006 1I AAGTTCTACC -/A AAAAAAATGT 3070 het 124 hom 24 1 19 4 A 7 8 352642 CASAVA_Build 8 5144554 4I CTCTTCCAGA ----/AAAT AAATAATTTA 3070 hom 94 het 37 0 32 5 AAAT 1 2 352643 CASAVA_Build 8 5145540 4D TTATTAGCTT AATC/---- AAGCCATTCC 1887 hom 15 het 8 0 6 2 AATC 1 0 352644 CASAVA_Build 8 5148778 1D TATTTTTTAC A/- AAGTGAACAT 3070 hom 150 het 52 0 50 2 A 3 2 352645 CASAVA_Build 8 5152635 17D CACACACACA CACACACACACACACAT/----------------- ATATATATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CACACACACACACACAT 1 0 352646 CASAVA_Build 8 5155097 1D GCGTGGAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 10 9 352647 CASAVA_Build 8 5166948 3I GAGTTTTAGC ---/CAA CAACTCCTGA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 CAA 1 2 352648 CASAVA_Build 8 5167540 1I AAAGGAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 12 13 352649 CASAVA_Build 8 5167685 3D AATAATTTTT ATA/--- ATATTTTCTC 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 ATA 2 1 352650 CASAVA_Build 8 5171607 1D ATGGAGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 23 0 20 3 A 11 10 352651 CASAVA_Build 8 5171956 1I AAAATAAAGT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 A 6 7 352652 CASAVA_Build 8 5173935 4I ATTTCTTTTC ----/TTTT TTATTTTCTT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 2 6 352653 CASAVA_Build 8 5174660 10D CATTGTCATA TATATGTAAT/---------- TATATTAATT 3070 het 3070 hom 20 9 9 5 TATATGTAAT 1 0 352654 CASAVA_Build 8 5175565 1I TTTTTCTGTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 T 8 9 352655 CASAVA_Build 8 5177487 4D CATATGCACA CAAT/---- CAATCACATT 3070 het 3070 hom 47 14 21 12 CAAT 2 1 352656 CASAVA_Build 8 5177510 2I TATATATATA --/TG TATGTGTGTG 3070 het 397 hom 35 3 19 13 TG 0 1 352657 CASAVA_Build 8 5180595 1I GAAACACCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 20 11 8 A 9 10 352658 CASAVA_Build 8 5185918 4I TTGAGGCTAA ----/TTTC TTTCTATTTG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 TTTC 1 2 352659 CASAVA_Build 8 5194370 2I GTTAACTCTG --/TA TATATATATG 3070 hom 129 het 52 0 44 8 TA 4 5 352660 CASAVA_Build 8 5197092 1I ACATCACACA -/C CAGGGGCCCG 1762 het 1762 ref 15 7 4 4 C 1 2 352661 CASAVA_Build 8 5197855 1D AGAAAAATAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 A 9 8 352662 CASAVA_Build 8 5200036 1D TAAAGCATAT G/- GTTATGGGGC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 G 2 1 352663 CASAVA_Build 8 5203721 2D GGAAAACTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2136 hom 33 10 16 7 T 14 12 352664 CASAVA_Build 8 5209199 4I TCTACCACAA ----/AGAT AAATAATGTA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 AGAT 0 1 352665 CASAVA_Build 8 5210306 1I AATGTGGGGG -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 33 0 24 9 A 8 9 352666 CASAVA_Build 8 5215009 4I CTTCCCCCTG ----/CTCT CTGTCTTTCT 3070 hom 67 het 48 2 43 3 CT 1 3 352667 CASAVA_Build 8 5215434 2I CTTCATGAGA --/TT TTTTCCTTCA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 4 6 352668 CASAVA_Build 8 5226805 3D GTAAAGCATA CTT/--- CTTGTCATAC 3070 het 3070 hom 46 24 18 4 CTT 2 1 352669 CASAVA_Build 8 5230192 1I TATCACTGAT -/A ACATTTCTTG 3070 hom 154 het 57 0 52 5 A 1 2 352670 CASAVA_Build 8 5230848 1I ATCACCCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 43 1 30 12 T 11 12 352671 CASAVA_Build 8 5231446 2D CTGTAAATGG TA/-- TATATATATA 3070 het 167 hom 29 3 17 9 TA 8 7 352672 CASAVA_Build 8 5231512 2I CACACACATC --/AT ATATATATAT 3070 het 1417 hom 28 6 12 10 AT 7 8 352673 CASAVA_Build 8 5236082 1D GAAAACGATG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 8 7 352674 CASAVA_Build 8 5237071 2D ATAAGACCAT AA/-- AAAGTTTCCC 3070 het 3070 ref 40 21 17 5 A 5 3 352675 CASAVA_Build 8 5239390 2D ATTCAAAAAC AT/-- GTTTCTAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 AT 1 0 352676 CASAVA_Build 8 5239755 1D GTAACCAACA G/- AAAGAAAAGC 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 G 1 0 352677 CASAVA_Build 8 5240882 1I TAACGTTTTC -/A AAAAAAATAG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 7 8 352678 CASAVA_Build 8 5248590 1I TTTTTAAACC -/T TTTTATAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 5 352679 CASAVA_Build 8 5252952 1D GGCCTATCCA T/- TTAGTGAAGG 3070 hom 102 het 40 0 34 6 T 3 2 352680 CASAVA_Build 8 5253114 1I AGATGTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 T 10 11 352681 CASAVA_Build 8 5263360 1D CTAGTTTCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 12 9 5 A 10 9 352682 CASAVA_Build 8 5264660 1D GGAGGAAAAA T/- GGGCAGCTGA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 1 0 352683 CASAVA_Build 8 5265369 1D CTCTGTGTAC A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 29 11 12 8 A 8 7 352684 CASAVA_Build 8 5267498 4D4M5D TTCTATGGTA TAATAAGCTTTCT/----AAGC----- ATGATATAAT 3070 hom 72 het 26 0 25 2 N/A 0 0 352685 CASAVA_Build 8 5273235 2D AATTCTCCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 214 hom 32 3 13 16 T 12 10 352686 CASAVA_Build 8 5273543 1D AATGAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 32 0 23 9 T 13 12 352687 CASAVA_Build 8 5275984 4I CAGCAAACTC ----/AAAG AGAGCTGAAT 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 AAAG 0 1 352688 CASAVA_Build 8 5277198 1D GACAGGAGAC A/- AAGAGGGATG 3070 het 3070 hom 48 25 23 1 A 3 2 352689 CASAVA_Build 8 5277931 1D TTTAGAGTAG A/- AATAAATGAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 3 2 352690 CASAVA_Build 8 5279847 6I GGAAAACATT ------/TTAAAC TCCCAGGAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TTAAAC 0 1 352691 CASAVA_Build 8 5287829 1I TTTAAAAATG -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 T 7 8 352692 CASAVA_Build 8 5288463 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 537 hom 25 6 10 9 A 13 11 352693 CASAVA_Build 8 5311084 1D CAGAAAAAAA T/- ATTTTTATTC 3070 het 3070 hom 38 16 20 3 T 1 0 352694 CASAVA_Build 8 5311179 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 17 24 6 A 10 9 352695 CASAVA_Build 8 5315496 1D AGGTCCTGTG A/- GAAATTGTAA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 1 0 352696 CASAVA_Build 8 5316874 2I CTAAGGAAGT --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 8 10 352697 CASAVA_Build 8 5319540 1D GCTCTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 11 10 352698 CASAVA_Build 8 5323748 1D TCAGATGACA G/- GTAAGTTATA 3070 het 3070 ref 38 24 9 5 G 2 1 352699 CASAVA_Build 8 5323985 1I CCTACTTTCT -/G AATTCTTGTT 2566 het 2566 ref 43 24 6 13 G 0 1 352700 CASAVA_Build 8 5350987 3I TATTAATAAT ---/AAA ATATGTATAC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 1 4 352701 CASAVA_Build 8 5351543 1D TTCTTTTCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2222 hom 20 7 10 3 T 10 9 352702 CASAVA_Build 8 5362212 6D TACGCTGTGC CTCAAA/------ CTCAAACTCT 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 CTCAAA 2 1 352703 CASAVA_Build 8 5380687 2I TTTTTTTAAA --/AG ATAGGCATAT 3070 het 3070 ref 25 11 12 2 AG 0 1 352704 CASAVA_Build 8 5404943 1I AGCTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 10 11 352705 CASAVA_Build 8 5450297 15D TAAACACAAG CACCCAATACACCTA/--------------- CACCAAATAG 3070 het 3070 hom 50 24 21 9 CACCCAATACACCTA 1 0 352706 CASAVA_Build 8 5459223 7I TCAAAGTCAT -------/AACCCAG AACATATACT 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 AACCCAG 0 1 352707 CASAVA_Build 8 5473076 1D ACTTGGAGGG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 9 8 352708 CASAVA_Build 8 5479090 2D TAACACTGTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 16 hom 45 1 30 16 CT 10 9 352709 CASAVA_Build 8 5482493 1I GGGAAATTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 660 hom 39 3 26 10 A 12 13 352710 CASAVA_Build 8 5483667 1D24M3I GAAATATAAG AAAAAGGAAAATGTTTTAAAATTTA---/-AAAAGGAAAATGTTTTAAAATTTAGAG GAGAGAAGGT 3070 hom 132 het 37 0 44 4 N/A 0 0 352711 CASAVA_Build 8 5485013 4D CCAAAAAGAG AACC/---- AACCCATCAC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 AACC 2 1 352712 CASAVA_Build 8 5485557 1D ACTAACTCAC T/- GGGATACAGA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 1 0 352713 CASAVA_Build 8 5493947 1I CTTGTAAGGA -/G ATTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 0 1 352714 CASAVA_Build 8 5494757 6D GTTCAGGTGA AAAAAT/------ AAAAATAATG 3070 het 3070 hom 29 14 17 0 AAAAAT 2 1 352715 CASAVA_Build 8 5497561 23I TATTTGGAGC -----------------------/ATGGTGGTTACATGTGTTTAAAA ACATAAGTGG 3070 hom 111 het 39 0 36 5 ATGGTGGTTACATGTGTTTAAAA 0 1 352716 CASAVA_Build 8 5498923 4D AGCTAACACC ACAA/---- ACAGTTTCCC 3070 het 3070 ref 49 28 19 3 ACAA 1 0 352717 CASAVA_Build 8 5499405 1D CCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2314 hom 28 9 13 7 T 11 10 352718 CASAVA_Build 8 5507843 2I TATATGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 47 18 13 16 TA 5 6 352719 CASAVA_Build 8 5509134 1I CGTACATTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 9 10 352720 CASAVA_Build 8 5543985 1I GTTGTCAATA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 7 8 352721 CASAVA_Build 8 5545037 3D TTTATTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2855 hom 28 9 15 5 T 14 11 352722 CASAVA_Build 8 5557488 1D AGTAAGTGGG A/- AGTTGCTGTT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 2 1 352723 CASAVA_Build 8 5560071 1I TTCAACAACC -/T TGTTTTTACG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 1 2 352724 CASAVA_Build 8 5564977 4D CATTAGATAA CTCT/---- CTCTTTCTTC 3070 het 3070 ref 27 17 7 4 CT 4 2 352725 CASAVA_Build 8 5574882 1D ACGTTAAAGC T/- TTTAAAGACA 3070 het 3070 hom 35 16 17 2 T 4 3 352726 CASAVA_Build 8 5583548 1D CATTATACTC T/- TAAGTTCTGG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 2 1 352727 CASAVA_Build 8 5594395 5I AGTACAAAAG -----/GCACA GGCAGGCGTG 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 GCACA 0 1 352728 CASAVA_Build 8 5599941 1I AATGGCTATT -/C CCCAAGGGAG 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 C 3 4 352729 CASAVA_Build 8 5606202 1D AGTATTTATA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 9 8 352730 CASAVA_Build 8 5628446 1I CTTGAATTGT -/A ATAATCCCCA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 1 2 352731 CASAVA_Build 8 5630692 1D GTATCACATT C/- CCCCCAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 C 6 5 352732 CASAVA_Build 8 5633855 10D TATGTGTGGA TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 1398 hom 33 11 15 9 T 22 12 352733 CASAVA_Build 8 5640967 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 A 7 8 352734 CASAVA_Build 8 5654893 1D CCTAGCATAA C/- TTTTGCTATA 3070 het 3070 hom 38 17 16 7 C 1 0 352735 CASAVA_Build 8 5658232 1D GGAAGCATTT C/- CCCTTGGAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 C 4 3 352736 CASAVA_Build 8 5663278 1I TTTTATATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 126 hom 29 1 26 2 T 9 10 352737 CASAVA_Build 8 5665428 1I ATTCCTGACA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 T 8 9 352738 CASAVA_Build 8 5669346 2I TGAGGTCTTT --/GC TGGCCAAGTT 3070 hom 111 het 38 0 33 5 GC 0 1 352739 CASAVA_Build 8 5678605 1I GTGTGGCAAG -/T TGTGGGAAGG 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 1 2 352740 CASAVA_Build 8 5683870 12I ACAATACTGA ------------/AATGATTTCTGG AATACATTTA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AATGATTTCTGG 0 1 352741 CASAVA_Build 8 5689640 1D TATCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2417 het 51 hom 16 1 9 6 T 15 14 352742 CASAVA_Build 8 5690906 4I4M2I CACTAGTGGG ----CAGT--/TCCACAGTTC CCCCAGTGGG 3049 het 3049 ref 30 11 11 9 N/A 0 0 352743 CASAVA_Build 8 5732658 1D TTTAAAAAAA T/- GTTCTCACAG 3070 het 3070 hom 21 9 11 2 T 1 0 352744 CASAVA_Build 8 5739629 4D GACCTAGCAG TCAA/---- TCAAAATTTA 3070 het 3070 ref 33 16 15 4 TCAA 2 1 352745 CASAVA_Build 8 5768899 2D GGGGATGGTC GG/-- GGGGGGGTTT 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 G 9 7 352746 CASAVA_Build 8 5777946 1D ATACATTTTG T/- TATTAGATTT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 T 2 1 352747 CASAVA_Build 8 5778200 1D AAAAAGTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 8 7 352748 CASAVA_Build 8 5780571 1I CTATAAAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 8 9 352749 CASAVA_Build 8 5782521 1D TCAAACTGGG C/- CCCATTCTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 4 3 352750 CASAVA_Build 8 5786238 1I TTGCCTTGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 352751 CASAVA_Build 8 5789071 1D GGCAGCACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 25 1 18 6 A 12 11 352752 CASAVA_Build 8 5793450 1D TGTACATGAC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 366 hom 52 2 43 7 T 9 8 352753 CASAVA_Build 8 5798706 4I CATGCATCTT ----/ATAC ATACATACGT 3070 hom 172 het 65 0 58 7 ATAC 2 3 352754 CASAVA_Build 8 5800242 1D TCCACAACAT A/- AAAAGTGCAA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 5 4 352755 CASAVA_Build 8 5808653 1D AGGGAACGTC A/- GAGAAACTTG 3070 het 3070 hom 30 8 14 8 A 1 0 352756 CASAVA_Build 8 5809378 1D ACACACCGGC T/- TTTCAACTTG 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 4 3 352757 CASAVA_Build 8 5813156 4D AATAACTTAT TTAA/---- TTGTCACAAC 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 TTAA 1 0 352758 CASAVA_Build 8 5813348 2D CTCTGTTCAG TT/-- TAGTAGTTGA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 3 1 352759 CASAVA_Build 8 5813739 1D AAGCCCTAGA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 8 7 352760 CASAVA_Build 8 5815801 1D AAAAGGCGTA T/- TTCCTTTGAG 3070 het 3070 hom 37 18 15 5 T 3 2 352761 CASAVA_Build 8 5815967 2D ACCGCAGAGG GA/-- GAGAGGGGAG 3070 het 3070 hom 38 14 20 7 GA 3 2 352762 CASAVA_Build 8 5818357 4D TTCCCTTCCA CATT/---- CATTCATTTT 3070 hom 138 het 48 0 46 5 CATT 3 2 352763 CASAVA_Build 8 5819346 1D GAAAAAGGAG A/- AAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 8 7 352764 CASAVA_Build 8 5822440 1I CTAAGATTTG -/C TAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 C 0 1 352765 CASAVA_Build 8 5823099 1I AACAGCAAAA -/G ATTGGTGTCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 G 0 1 352766 CASAVA_Build 8 5823191 1D AAATTTGTTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 51 21 29 1 A 8 7 352767 CASAVA_Build 8 5828479 3D AAATGTTTGT TTC/--- TTCATCAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 TTC 2 1 352768 CASAVA_Build 8 5832381 3I TGATAAATGT ---/CCA CCATGAAATG 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 CCA 1 2 352769 CASAVA_Build 8 5836117 3D AAAAACAAAT AAC/--- AAAGCGGTAG 3070 het 3070 ref 32 19 12 1 AAC 1 0 352770 CASAVA_Build 8 5841593 1I GTTTGACTGA -/G GGGGGGAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 G 6 7 352771 CASAVA_Build 8 5844186 2I ACTCTATCTC --/AA AAAAAAAAAA 1951 hom 18 het 12 0 6 6 A 12 14 352772 CASAVA_Build 8 5848324 1I TCTAACATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 21 4 A 10 11 352773 CASAVA_Build 8 5849941 1I TTTTTATTTA -/C TTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 C 0 1 352774 CASAVA_Build 8 5850001 1I TTACTATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 28 1 23 4 A 10 11 352775 CASAVA_Build 8 5851799 2I TAAAAAAAAG --/AA AAAGGAAAAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 3 5 352776 CASAVA_Build 8 5852938 1D TGTAAATATA T/- TTTTTAGCTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 6 5 352777 CASAVA_Build 8 5853091 1I ATGACACAGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 8 9 352778 CASAVA_Build 8 5853195 1D TGTAAATAAT A/- AAAAATGTGT 3070 hom 96 het 36 0 32 5 A 6 5 352779 CASAVA_Build 8 5853742 1D TGTTTCTAAG T/- TTTTTTAAGT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 7 6 352780 CASAVA_Build 8 5854097 2I TTTACCTCCC --/TT TTCTCGTGGG 3070 hom 117 het 45 0 38 7 T 2 4 352781 CASAVA_Build 8 5854510 3D60M1I TTAATTTTAT TTGTTATCAGGAAAATGAAAATTAAAACCACGATGTGATATCACTACATACTTACCTAACTGA-/---TTATCAGGAAAATGAAAATTAAAACCACAATGTGATATCACTACATACTTACCTAACTGAC TAAAAAGATG 3070 het 3070 hom 33 13 15 26 N/A 0 0 352782 CASAVA_Build 8 5855420 1I TCTTATAACT -/A ATGAGAATAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 1 2 352783 CASAVA_Build 8 5855701 1I CCTTCGTGTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 270 hom 34 1 30 3 T 8 9 352784 CASAVA_Build 8 5859118 1I ATAATATCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 8 9 352785 CASAVA_Build 8 5861142 2D TCATCCCCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 34 1 25 8 A 13 11 352786 CASAVA_Build 8 5863102 1I TTTTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 A 10 11 352787 CASAVA_Build 8 5863335 1D AAAGGAGTGA T/- TTCTTGTGTT 3070 het 3070 ref 30 13 12 6 T 3 2 352788 CASAVA_Build 8 5863493 1D CTCCACCTCA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 19 13 4 T 9 8 352789 CASAVA_Build 8 5863700 3D TTGATCTGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3043 hom 40 15 19 7 A 15 12 352790 CASAVA_Build 8 5864216 2D5M3I CATACCTTTA TGAAGAA---/--CAGTACTG ATGTCTTCTC 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 N/A 0 0 352791 CASAVA_Build 8 5865214 5I CAAATAAACC -----/TCTTT CCTTTATAAA 3070 het 3070 hom 38 18 20 0 TCTTT 0 1 352792 CASAVA_Build 8 5865668 4D CTCTCCTCTC TCTT/---- TCTCTCCCTC 3070 het 3070 ref 38 20 9 11 TCTT 1 0 352793 CASAVA_Build 8 5871509 4I AATGAGTTAA ----/TAAT TAATTAAGCA 3070 het 2790 hom 37 8 20 9 TAAT 1 2 352794 CASAVA_Build 8 5871900 5I ATTGTGTTGG -----/TTTGT TTTGTATTGC 3070 hom 117 het 41 0 40 1 TTTGT 1 2 352795 CASAVA_Build 8 5883163 1D TATAAAAAAA T/- ATCTGAGACC 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 1 0 352796 CASAVA_Build 8 5886633 1D TACAGGATTT A/- AAAGGTACTG 3070 het 3070 hom 42 17 24 3 A 4 3 352797 CASAVA_Build 8 5895993 2D CAATCATGGT TA/-- TATACCTCTT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TA 3 2 352798 CASAVA_Build 8 5903552 6D GCACACACTG CCAGCA/------ CCAGCAAAAT 3070 hom 129 het 46 0 44 5 CCAGCA 2 1 352799 CASAVA_Build 8 5905073 1I CAAATACAAA -/T TTAAAAAAAA 3070 het 20 hom 38 2 19 17 T 2 3 352800 CASAVA_Build 8 5908575 2D GTGTGTACAC AT/-- GTGTCTGTGT 3070 het 3070 ref 70 32 30 12 AT 1 0 352801 CASAVA_Build 8 5912413 2D CACACACATG CA/-- CACACACACA 649 het 649 ref 50 31 5 14 CA 6 5 352802 CASAVA_Build 8 5922318 2D TCTGTATGAC TG/-- TGTATCTGTC 3070 het 3070 ref 87 47 30 12 TG 2 1 352803 CASAVA_Build 8 5960318 2D GATTATATAT TA/-- TATATATATA 1297 het 1297 ref 7 3 3 1 TA 7 6 352804 CASAVA_Build 8 5961007 1D TCTATCCAGG C/- CCCTACAATA 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 C 4 3 352805 CASAVA_Build 8 5961879 1D CCCGCTCCGA G/- GGGAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 23 14 6 G 4 3 352806 CASAVA_Build 8 5972874 14D ATAGATCAAT AATACAGTGATGAA/-------------- AATACAATAT 3070 het 3070 hom 51 26 25 6 AATACAGTGATGAA 1 0 352807 CASAVA_Build 8 5976725 1I CATTTCATAT -/C CCCCCCATCA 3070 het 3070 hom 46 16 20 10 C 6 7 352808 CASAVA_Build 8 5998410 1I GGAACAATCA -/G CCAGCTCTCT 2664 het 2664 ref 17 9 6 2 G 0 1 352809 CASAVA_Build 8 6005834 1I CAGCCTTTGA -/C TTCTCCATCT 3070 hom 110 het 45 0 40 5 C 0 1 352810 CASAVA_Build 8 6006590 1D GTATTTTGGC A/- AAAAAAAAAA 1582 het 883 hom 32 9 6 17 A 17 16 352811 CASAVA_Build 8 6024305 1D CACCCGGCCA T/- TTTTTTTTTT 2096 hom 31 het 16 0 8 8 T 11 10 352812 CASAVA_Build 8 6026687 2I TTGTTTTGTT --/TG TTTGTTTTTT 927 het 333 hom 24 2 6 19 TG 0 1 352813 CASAVA_Build 8 6027489 31D47M3D ACACATGTAC CAAGTGTTGGAAACACCTGAGCTAGATGTTGCACACACGTGGCTTTTGGGTGAGATGGGTCATAGGCACACCCATCACATT/-------------------------------CACACATGTGGCTTTCGGGTGAGATGGGTCATAGGCACACCCATCAC--- GTTGGAGGAA 3070 hom 116 het 28 1 49 24 N/A 0 0 352814 CASAVA_Build 8 6034763 1I CTGTGACAGG -/A AAAAAATGTA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 6 7 352815 CASAVA_Build 8 6043709 1I ACTTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 41 0 25 16 T 13 14 352816 CASAVA_Build 8 6058148 4D GCTTGCTTGC TTAG/---- TTAGTTGTTC 3070 hom 162 het 58 0 53 6 TTAG 2 1 352817 CASAVA_Build 8 6058319 6D TCAAGACAGA GGTGGT/------ GGTGGTGGTG 3070 het 3070 ref 39 18 17 6 GGT 7 5 352818 CASAVA_Build 8 6059467 1D TCCCCAATAG A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 114 het 40 0 39 1 A 8 7 352819 CASAVA_Build 8 6061875 2D GGACCGTGGG GC/-- AGACCCCTCA 3070 het 3070 ref 48 23 20 6 GC 1 0 352820 CASAVA_Build 8 6065167 4I TGAGATGGAG ----/TCTC TCTCTGTCAC 2831 het 2432 hom 23 7 8 8 TC 2 4 352821 CASAVA_Build 8 6066928 1I AGATTTTTGA -/G GGGGGGGACA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 G 7 8 352822 CASAVA_Build 8 6068575 1D GCAGAAAGCT G/- GGCTGGGCGC 3070 hom 114 het 41 0 37 4 G 3 2 352823 CASAVA_Build 8 6080751 2D ATAATATAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 20 10 T 13 11 352824 CASAVA_Build 8 6087446 9I AAAACCACCT ---------/GGTATCCAG GGAGAAATAA 2389 het 2389 ref 18 12 5 1 GGTATCCAG 0 1 352825 CASAVA_Build 8 6090138 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 2678 hom 21 8 9 4 A 8 9 352826 CASAVA_Build 8 6091723 6I4M2D TACACTGTTA ------CACCAA/GGGATGAACC-- ATTCTGGAAA 3070 het 3070 ref 38 20 18 3 N/A 0 0 352827 CASAVA_Build 8 6092454 1I CTCTATCCTT -/C ACCCACTTTG 3070 het 3070 hom 45 23 21 1 C 0 1 352828 CASAVA_Build 8 6093081 2I AAGGAAGGGA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 62 26 18 18 TG 7 8 352829 CASAVA_Build 8 6102625 1D AGATTTCGGT G/- GGGACACAAG 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 G 4 3 352830 CASAVA_Build 8 6110063 1D ATGGTTGAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 T 12 11 352831 CASAVA_Build 8 6116473 1D ACAGCATGCT G/- AAAAAGAGGC 3070 het 3070 hom 48 26 19 3 G 1 0 352832 CASAVA_Build 8 6121184 1D AATGTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2153 hom 36 9 16 11 T 13 12 352833 CASAVA_Build 8 6124005 1I ACATGGCAGG -/C CTTCAACTTC 3070 hom 141 het 54 0 48 6 C 1 2 352834 CASAVA_Build 8 6149490 1I TGGGACAGGT -/C CCTACTAGAC 3070 hom 92 het 46 0 39 8 C 2 3 352835 CASAVA_Build 8 6151482 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 43 het 31 0 19 12 T 10 9 352836 CASAVA_Build 8 6153319 3D CGGACCGGAG AGC/--- AGCAGCAGTC 3070 hom 84 het 33 0 26 7 AGC 3 2 352837 CASAVA_Build 8 6160453 1I CTCAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 17 1 13 3 A 12 13 352838 CASAVA_Build 8 6161357 5I CCATCTTTCC -----/TTTCT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TTTCT 0 1 352839 CASAVA_Build 8 6162042 1D ACCCCCATAA C/- TGTGTGAACC 3070 hom 75 het 33 0 26 13 C 1 0 352840 CASAVA_Build 8 6162112 1I ATAATAGATG -/A GAGATAGATA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 0 1 352841 CASAVA_Build 8 6163360 6D AAGACTGTCT CAGTAA/------ CAATAATAAT 3070 het 9 hom 15 1 12 4 CAGTAA 1 0 352842 CASAVA_Build 8 6172167 4I TACTTGTGTT ----/AGTC AGGATTCTCC 3070 hom 86 het 32 0 29 3 AGTC 0 1 352843 CASAVA_Build 8 6173041 1D GAATCTCCTG A/- AAGTTGTCAT 3070 het 2508 hom 31 11 9 11 A 3 2 352844 CASAVA_Build 8 6179475 12I GTTACCACTT ------------/AAGAGCTTCTAA AATGTCATTG 3070 hom 135 het 48 0 46 5 AAGAGCTTCTAA 0 1 352845 CASAVA_Build 8 6198535 1I TAATTGATCA -/T ATGTAGTCAC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 0 1 352846 CASAVA_Build 8 6203566 10D ACCTCCTCCT TTGAGTTTGA/---------- GTGTGTCTCG 3070 hom 141 het 50 0 45 7 TTGAGTTTGA 1 0 352847 CASAVA_Build 8 6210654 1I ATCGCCTAAT -/A ATATGTGTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 2 352848 CASAVA_Build 8 6211239 1D AAAAGGGAGC A/- AGAGTTCTTT 3070 hom 107 het 42 0 35 7 A 2 1 352849 CASAVA_Build 8 6211569 4D CCACCTCCTT TTTC/---- ACTTTTCATC 3070 hom 105 het 37 0 36 3 TTTC 1 0 352850 CASAVA_Build 8 6211782 1D ACACAAAAAA C/- ATCCATTTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 C 1 0 352851 CASAVA_Build 8 6212061 2D GTAGCTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 29 0 21 9 T 16 14 352852 CASAVA_Build 8 6227327 1I GGCAGGAGAA -/T CACTTGAACC 3070 hom 33 het 18 0 12 6 T 0 1 352853 CASAVA_Build 8 6233371 1I TGCGGGGCGG -/T GGGGGACGGA 3070 hom 75 het 29 0 25 4 T 0 1 352854 CASAVA_Build 8 6241659 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2102 het 243 hom 8 2 6 0 T 14 12 352855 CASAVA_Build 8 6249137 1I AAAACAAAAT -/A AAAAAAACAA 1317 het 1317 ref 11 5 3 3 A 7 8 352856 CASAVA_Build 8 6249437 8I TCCCAAAGTG --------/TTGGGATT GCAGGCGTGA 3070 het 2210 hom 18 8 10 0 TTGGGATT 0 1 352857 CASAVA_Build 8 6249711 1D CTTATTTATA T/- AGCTACAATA 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 T 1 0 352858 CASAVA_Build 8 6253829 1I TCTTTTTTTT -/A TTTTTGAAAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 0 1 352859 CASAVA_Build 8 6254632 1D GGGCATACTG A/- AAAATATCTG 3070 hom 174 het 62 0 58 4 A 5 4 352860 CASAVA_Build 8 6258200 3I GTTGTCACTT ---/ATC ATTGTTTGCA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATC 0 1 352861 CASAVA_Build 8 6259949 1D CTAGTAATTT G/- AAATCCTCCA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 G 1 0 352862 CASAVA_Build 8 6261753 2D TAAAACCCTA TC/-- TCTATTAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 TC 2 1 352863 CASAVA_Build 8 6262331 5D GTGGCAGCAA ACTTT/----- ACTTATAAGT 3070 hom 87 het 33 0 30 8 ACTTT 1 0 352864 CASAVA_Build 8 6267270 1D AAATGATTTG A/- AAAAAAACTA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 7 352865 CASAVA_Build 8 6272725 3D TATTATACTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 22 1 17 4 T 15 12 352866 CASAVA_Build 8 6273192 4D TTTTAAACTT AAAA/---- AAAACTAGGA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 A 8 4 352867 CASAVA_Build 8 6273845 1D CTCCATATTT C/- TAAATACTGT 3070 hom 122 het 45 0 39 8 C 1 0 352868 CASAVA_Build 8 6284302 1I CTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 9 10 352869 CASAVA_Build 8 6286328 1I GTTTATTCTC -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 7 8 352870 CASAVA_Build 8 6287281 1I TTCCTATAGG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 9 352871 CASAVA_Build 8 6291930 14D TGCAGGCCAT CAGGCAGGGGTGTC/-------------- CAGGCAGGGC 3070 hom 75 het 27 0 22 7 CAGGCAGGGGTGTC 1 0 352872 CASAVA_Build 8 6294934 4D AAAGTCCTTC CTAT/---- CTATACCCCA 3070 hom 168 het 62 0 56 7 CTAT 2 1 352873 CASAVA_Build 8 6296490 3D TATTGAAGAG TGT/--- TGTTTTTGTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TGT 2 1 352874 CASAVA_Build 8 6298254 3I GTTTTAAATA ---/AAC AAATCATTTA 3070 hom 111 het 39 0 37 2 AAC 0 1 352875 CASAVA_Build 8 6298326 1I AATATCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 284 hom 31 2 20 9 T 12 13 352876 CASAVA_Build 8 6321994 1I TTTATTTAAA -/T TTTTTTTCAA 3070 hom 73 het 36 0 34 2 T 7 8 352877 CASAVA_Build 8 6335988 1D AAAATTTATC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 18 het 11 0 7 4 A 8 7 352878 CASAVA_Build 8 6337665 3D ATCAAATAAA TAT/--- TAATAATAAT 2170 hom 15 het 7 0 6 1 TAT 1 0 352879 CASAVA_Build 8 6346859 1D TTTGAAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2642 hom 29 9 13 7 T 12 11 352880 CASAVA_Build 8 6352769 1D TCCTTGGCCT C/- CCAAAGTGCT 3070 het 2447 hom 20 6 12 2 C 3 2 352881 CASAVA_Build 8 6356219 1D TATGGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 22 28 6 T 11 10 352882 CASAVA_Build 8 6360148 1I AGCCCCTGCC -/A CCTCCACAGA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 0 1 352883 CASAVA_Build 8 6372992 1I ACCCAGCTAA -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 16 8 7 7 T 6 7 352884 CASAVA_Build 8 6374812 2I ACAATAGGCG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1850 hom 18 7 8 3 T 10 12 352885 CASAVA_Build 8 6375497 3I TGGTCCAACC ---/TAA TAATAATTCG 3070 het 1860 hom 25 6 16 3 TAA 2 3 352886 CASAVA_Build 8 6376731 1D GCTCGGGCGT A/- GCACCATCTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 A 1 0 352887 CASAVA_Build 8 6381341 1I TTTAAGAGCC -/A AAAGTGATAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 3 4 352888 CASAVA_Build 8 6383959 2D GAGTTGGGCT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 97 het 48 0 31 17 TG 10 9 352889 CASAVA_Build 8 6385960 8D TTGCGAGAGT GCCGAGGA/-------- GGCTCTCATG 3070 hom 78 het 27 0 27 1 GCCGAGGA 1 0 352890 CASAVA_Build 8 6391469 1I ATAAAGGATC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 7 8 352891 CASAVA_Build 8 6401449 1D CATTCATTTA C/- CCCTTCTGTG 3070 hom 126 het 44 0 43 2 C 4 3 352892 CASAVA_Build 8 6409513 4I CTTTGCTGCG ----/GTTT GTTTATCTCT 3070 hom 94 het 35 0 32 3 GTTT 1 2 352893 CASAVA_Build 8 6417116 1D TTCCCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 620 hom 34 3 24 7 A 12 11 352894 CASAVA_Build 8 6434238 1D TGTTTCCAGT A/- AAAATTGGGA 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 5 4 352895 CASAVA_Build 8 6435359 9D AAAAAGCAAA GCAGGCCCT/--------- GCAGGCCCTG 3070 hom 63 het 28 0 20 12 GCAGGCCCT 2 1 352896 CASAVA_Build 8 6437750 2D CACCTGGCAA TT/-- TTTTTTTTTT 1377 het 402 hom 20 3 6 12 T 18 16 352897 CASAVA_Build 8 6448932 1I TCACTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 36 hom 23 1 16 6 T 13 14 352898 CASAVA_Build 8 6449115 21D AAGTGGCCTT CCAGGTTTGCACTGGAAGGAG/--------------------- CCACAGCCCC 3070 hom 48 het 15 0 15 5 CCAGGTTTGCACTGGAAGGAG 1 0 352899 CASAVA_Build 8 6450634 1I TTTTGTAATC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 9 10 352900 CASAVA_Build 8 6456556 1I TTTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 53 het 24 0 17 7 T 9 10 352901 CASAVA_Build 8 6462186 1D GTTTTTTGGT G/- GGGGGGGGGT 1705 het 1705 ref 23 12 6 5 G 10 9 352902 CASAVA_Build 8 6483508 1D GCTTACATTT A/- AAAAAAAAAA 1641 het 1641 ref 20 11 5 4 A 17 16 352903 CASAVA_Build 8 6495718 5D CTGCGTTTCT CTCCC/----- CTCCCCTCCC 3070 hom 39 het 39 0 20 19 CTCCC 4 3 352904 CASAVA_Build 8 6505379 4I CCAGGTGGAC ----/TTCT TTGTTTTAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTCT 0 1 352905 CASAVA_Build 8 6512274 2D TACAAATATC AT/-- ATGTTATTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AT 2 1 352906 CASAVA_Build 8 6520507 1I GTTAATATTG -/T TAACCAGAAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 1 2 352907 CASAVA_Build 8 6522395 2D TTGCTGGCTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 A 11 9 352908 CASAVA_Build 8 6525059 4I GTCTGATTTT ----/TCTG TCTAACCTGA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 TCTG 0 1 352909 CASAVA_Build 8 6526243 1I TAAAAAGCCT -/C CCAGACATAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 2 3 352910 CASAVA_Build 8 6540126 1D CCTGGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 2442 het 2257 hom 45 15 11 19 A 17 16 352911 CASAVA_Build 8 6541526 18D TGTGTTCCAT CTCCACATGTTATCCCAC/------------------ CTCCACATGT 3070 het 3070 ref 41 20 14 8 CTCCACATGTTATCCCAC 2 1 352912 CASAVA_Build 8 6541717 1D TGGTTTGTTT C/- TTTTTTACAT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 C 1 0 352913 CASAVA_Build 8 6554492 2D GAAGTGTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 33 8 A 14 12 352914 CASAVA_Build 8 6554649 1D TCTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 35 26 3 7 T 11 10 352915 CASAVA_Build 8 6557302 2D ATCTTGTGAT TA/-- TATATATATA 879 het 879 ref 30 21 3 7 TA 8 7 352916 CASAVA_Build 8 6558650 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 36 0 27 9 T 10 11 352917 CASAVA_Build 8 6563441 2D TGGAAAACAC TG/-- TGTAAGCTTT 3070 hom 152 het 54 0 50 8 TG 2 1 352918 CASAVA_Build 8 6565187 1D TCAACTTATC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 134 het 52 0 46 6 A 10 9 352919 CASAVA_Build 8 6569597 7D TTAATTTATT ACCGTTA/------- ACCTGTACTA 3070 hom 84 het 31 0 28 4 ACCGTTA 1 0 352920 CASAVA_Build 8 6574439 1I AGTCTCCCTT -/A ACATTTCATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 2 352921 CASAVA_Build 8 6577107 5I AAGATCGTGA -----/GTATT GACATGTTAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 GTATT 0 1 352922 CASAVA_Build 8 6580614 3D AGCTTGTCAG TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 hom 90 het 39 0 30 11 TGT 5 4 352923 CASAVA_Build 8 6588702 1D CCTATGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 39 1 32 6 T 12 11 352924 CASAVA_Build 8 6591005 11I TTCTTTCTGC -----------/TTTCTTTCTGT ATTCTTCTCC 3070 hom 78 het 31 0 26 5 TTTCTTTCTGT 0 1 352925 CASAVA_Build 8 6618867 1I GAGGCAGCAT -/G GGGGTCCTCT 3070 hom 44 het 21 0 13 8 G 4 5 352926 CASAVA_Build 8 6618940 1I TGATGAGGAA -/C CCAACTTCAG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 C 2 3 352927 CASAVA_Build 8 6624570 1D TATTTGGCCC T/- TTTTTCCTAG 3070 het 3070 ref 34 13 13 9 T 6 5 352928 CASAVA_Build 8 6633751 11I TGTTCAAATT -----------/GTGTTCAAATA AGGCATACGC 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 GTGTTCAAATA 0 1 352929 CASAVA_Build 8 6633817 1D GTACATCATT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1756 hom 38 8 12 18 C 11 10 352930 CASAVA_Build 8 6636225 3D TGGAATTGGT GAA/--- GATGCAGGAA 2009 het 2009 ref 22 7 5 10 GAA 1 0 352931 CASAVA_Build 8 6644568 1D GTCTTTTGTG T/- TTTGTTGTTT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 T 4 3 352932 CASAVA_Build 8 6652914 4D CTCTACCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 481 het 481 ref 23 13 3 8 AAAC 4 3 352933 CASAVA_Build 8 6654231 1I ATTAACAAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 9 10 352934 CASAVA_Build 8 6660788 1D GCTGGTCCAC A/- GATGCCCCCT 3070 hom 50 het 21 0 17 4 A 1 0 352935 CASAVA_Build 8 6661622 1I TAATTTAATT -/A AAAAATAATT 2663 hom 15 het 6 0 6 0 A 5 6 352936 CASAVA_Build 8 6665521 3D CAATATTCCA CTT/--- CTTTGTTCAC 3070 hom 111 het 44 0 35 11 CTT 2 1 352937 CASAVA_Build 8 6667431 1I TTCAAGCTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 T 8 9 352938 CASAVA_Build 8 6688945 3D GTGGACAGGA CTC/--- CTCGGGGGAC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 CTC 2 1 352939 CASAVA_Build 8 6689617 2D AGTTAAAAAA AT/-- ATATATAAGC 3070 hom 63 het 22 0 21 1 AT 4 3 352940 CASAVA_Build 8 6697498 1D GTTTGTTCTT C/- CCCACTATTC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 C 4 3 352941 CASAVA_Build 8 6713105 1D TTGTGATTTT A/- AAAAACTATT 3070 hom 90 het 32 0 31 3 A 6 5 352942 CASAVA_Build 8 6713375 2D AGACAAGGAT TC/-- TTTCACTCTG 3070 hom 111 het 42 0 37 6 TC 1 0 352943 CASAVA_Build 8 6719292 1D TTACTTTTTT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 132 het 53 0 45 8 A 8 7 352944 CASAVA_Build 8 6720802 3D CAAAAGTGTA AAG/--- AATATGAAAA 3070 hom 120 het 45 0 41 7 AAG 1 0 352945 CASAVA_Build 8 6725535 4D ATTTTTATTT TTTA/---- TTTATTTTAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TTTA 2 1 352946 CASAVA_Build 8 6735728 1D TTCTTCACCC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 10 9 352947 CASAVA_Build 8 6743434 2D TACATATATA TG/-- TATGTATATG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TG 1 0 352948 CASAVA_Build 8 6743517 8D ATGTACACAT ACACATAC/-------- ACACACACAT 2697 hom 15 het 6 0 6 0 ACACATAC 1 0 352949 CASAVA_Build 8 6747842 8D CCATAAACTC TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 3070 hom 131 het 51 0 42 11 TG 11 7 352950 CASAVA_Build 8 6772321 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 12 5 T 11 10 352951 CASAVA_Build 8 6772488 1D TCTTTCACTA T/- TTTTTTTTTT 2736 het 2736 ref 31 14 8 9 T 13 12 352952 CASAVA_Build 8 6777265 1D GTCTTTTATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 8 352953 CASAVA_Build 8 6783356 1D AGTTGAGAAA T/- TTGGCAGAAA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 3 2 352954 CASAVA_Build 8 6793122 5I GAACATGCTG -----/CTCTA CTCTACTCCT 3070 het 3070 ref 60 34 21 5 CTCTA 1 2 352955 CASAVA_Build 8 6795327 13D AAATGAGGCC GAGTGAAAAGCCA/------------- GAACAGTGAA 3070 het 3070 ref 39 26 13 5 GAGTGAAAAGCCA 1 0 352956 CASAVA_Build 8 6806482 1D GCTCACTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 10 9 352957 CASAVA_Build 8 6812808 2D CTTTTCAATT AG/-- AGTCTGAAGC 3070 het 3070 ref 27 14 10 4 AG 2 1 352958 CASAVA_Build 8 6817580 1D GATACTTCTC A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 89 31 33 28 A 8 7 352959 CASAVA_Build 8 6818614 1D AGATGAACAG A/- GGGCAATTTT 3070 het 3070 ref 76 57 8 13 A 1 0 352960 CASAVA_Build 8 6827711 5D CAGCTCTGCC ACAGA/----- CATATGTCCT 1450 het 305 hom 10 3 4 3 ACAGA 1 0 352961 CASAVA_Build 8 6828077 1I CTCAAACTCC -/A AAACTCAAAT 3070 het 3070 ref 43 29 9 5 A 3 4 352962 CASAVA_Build 8 6847631 2D GCCCCAGCAG AC/-- ACAGTGTGTG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 AC 2 1 352963 CASAVA_Build 8 6861309 4I AGCTCTTCTG ----/TAGA TAGAGTAAAA 3070 hom 217 het 79 0 73 6 TAGA 1 2 352964 CASAVA_Build 8 6862941 7I TGTCAACCAG -------/GACATGT GACATGTGTG 3070 het 3070 ref 79 47 23 9 GACATGT 1 2 352965 CASAVA_Build 8 6875405 1I CAAGAGAGAG -/A AAATATTTGT 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 A 3 4 352966 CASAVA_Build 8 6882206 1D AAAAAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 24 0 23 1 T 13 12 352967 CASAVA_Build 8 6886902 3D CACTCTCCAC CCT/--- CCTCCTCCTC 3070 het 3070 ref 48 20 13 19 CCT 6 5 352968 CASAVA_Build 8 6890778 2D TTTCCCTTAG TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 T 10 8 352969 CASAVA_Build 8 6898965 4I GTAATAAAAA ----/TGTT TGTTTGGTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 TGTT 1 2 352970 CASAVA_Build 8 6908431 1D ACGTAGTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 223 hom 39 2 23 15 T 13 12 352971 CASAVA_Build 8 6911562 18D GATTATTAAT TATTAATTGCGATAATGA/------------------ TATTAATTGC 3070 het 3070 ref 25 10 9 8 TATTAATTGCGATAATGA 2 1 352972 CASAVA_Build 8 6919830 1I GGGGTGTACA -/C CCGTGCTATA 3070 hom 99 het 35 0 32 3 C 2 3 352973 CASAVA_Build 8 6920948 1D CCTGGCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 495 hom 22 2 12 8 T 12 11 352974 CASAVA_Build 8 6923717 1I AAAACAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3008 het 3008 ref 23 11 7 5 A 9 10 352975 CASAVA_Build 8 6924554 3D TTCACTTTTC TCT/--- TCTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 19 10 9 1 TCT 4 3 352976 CASAVA_Build 8 6940696 1I GTGGTGGTGG -/T GGGGGGGCTG 3070 het 1840 hom 23 5 12 6 T 0 1 352977 CASAVA_Build 8 6942903 1D CCAAAGTGCT G/- GGACTACAGA 2867 het 2867 ref 16 9 6 1 G 3 2 352978 CASAVA_Build 8 6949831 1I TGTGTCATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 19 0 11 8 T 11 12 352979 CASAVA_Build 8 6950002 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 1802 het 1802 ref 12 6 4 2 T 7 8 352980 CASAVA_Build 8 6950320 1D TCATCCTGTG C/- TTTTAGGAGA 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 C 1 0 352981 CASAVA_Build 8 6953873 1D ATTGCTTTGT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 33 14 11 10 A 8 7 352982 CASAVA_Build 8 6954771 1D GATTTGTCTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 1606 hom 21 5 9 7 T 7 6 352983 CASAVA_Build 8 6959609 2D TTTTATACTC TT/-- TTGATAATTT 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 T 4 2 352984 CASAVA_Build 8 6962214 1D TGTATTTGCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 2867 hom 22 9 11 2 T 8 7 352985 CASAVA_Build 8 6966558 3I TTTTCTGTAT ---/TTC TTTTTTTTTG 2343 het 2343 ref 22 14 5 3 TTC 0 1 352986 CASAVA_Build 8 6967632 1I TACAAAAAAG -/A AAAAAATAAA 2870 het 2870 ref 23 14 7 2 A 6 7 352987 CASAVA_Build 8 6968389 2D TTGGAAAAGA TG/-- TAGAAAAGGC 3070 het 3070 ref 30 15 12 4 TG 1 0 352988 CASAVA_Build 8 6971644 1D GTGCTGGAGC A/- AAATGTATTC 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 A 4 3 352989 CASAVA_Build 8 6972759 1D AACACATGTA T/- TTTGAGCTCC 3070 het 2200 hom 20 6 11 4 T 4 3 352990 CASAVA_Build 8 6974220 2I CATGTTTCTT --/AA AAAAAAATAT 1310 het 1310 ref 51 38 3 10 A 7 9 352991 CASAVA_Build 8 6978136 2D GCAGTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 TA 8 7 352992 CASAVA_Build 8 6978537 1D AATTTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 2429 het 2335 hom 24 9 6 9 T 13 12 352993 CASAVA_Build 8 6987300 15D AATGCAATTA AATAAGTATTTGTTG/--------------- AATGCACTTG 2341 het 2341 ref 29 18 6 5 AATAAGTATTTGTTG 1 0 352994 CASAVA_Build 8 6993654 4D TCCTTGCAAT AGTG/---- AGTGAGTTCT 3070 het 3070 ref 32 18 8 7 AGTG 2 1 352995 CASAVA_Build 8 7001411 1D CACCGAACCT G/- TCCAATTAAT 3070 het 3070 ref 22 9 7 6 G 1 0 352996 CASAVA_Build 8 7002172 1D AAGCGATATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2990 hom 30 10 13 7 A 10 9 352997 CASAVA_Build 8 7017910 1D AGTAGGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 470 hom 13 1 7 5 T 13 12 352998 CASAVA_Build 8 7023687 1D GGACATCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 17 8 5 T 12 11 352999 CASAVA_Build 8 7030834 1I TGAACAAAAT -/G GTGATATCAG 3070 het 3070 ref 48 37 9 2 G 1 2 353000 CASAVA_Build 8 7049129 1D AAAAAAATGA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 30 het 12 0 11 2 T 8 7 353001 CASAVA_Build 8 7077241 2D GCAAAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 1322 hom 7 het 3 0 3 1 AG 7 6 353002 CASAVA_Build 8 7090459 3D TACTAACAAT ACA/--- ACAACAACAA 1270 het 1270 ref 15 9 3 3 ACA 6 5 353003 CASAVA_Build 8 7145828 1D AGAGCCTCAC A/- GGCGTCCGGG 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 1 0 353004 CASAVA_Build 8 7194692 1I ACTTGGAAAA -/C ATTTTGTTGG 3070 het 3070 ref 63 50 7 6 C 0 1 353005 CASAVA_Build 8 7206736 1D CTTATTCATT A/- AAAAGTTAGA 3070 het 3070 ref 46 28 14 4 A 5 4 353006 CASAVA_Build 8 7207562 1D CTCTCATATC T/- TTTTTTGTAA 1341 het 1341 ref 47 40 3 5 T 7 6 353007 CASAVA_Build 8 7210004 1D GTGCCAGGGA C/- AAAGAAAGGA 2894 het 2894 ref 52 42 7 4 C 1 0 353008 CASAVA_Build 8 7214977 1I AAAAGTTGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 11 17 11 T 9 10 353009 CASAVA_Build 8 7215203 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 18 9 A 13 12 353010 CASAVA_Build 8 7216413 1I ATTTCTTACC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 7 8 353011 CASAVA_Build 8 7219242 1I ATGGGTTTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 7 8 353012 CASAVA_Build 8 7228063 1I TTTGATTTTT -/A TTTTTTTTTT 2044 het 1358 hom 34 11 9 14 A 0 1 353013 CASAVA_Build 8 7229047 1D ATAGAGACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 T 10 9 353014 CASAVA_Build 8 7231399 1D GTGCCCTGTC T/- TTTTTTTTTT 1658 het 1658 ref 24 8 7 9 T 14 13 353015 CASAVA_Build 8 7236249 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2073 het 9 hom 8 0 6 2 A 15 14 353016 CASAVA_Build 8 7239486 4I TTCCTCTGTG ----/CTGA CTGAGCAGGC 3070 het 3070 ref 38 20 8 10 CTGA 1 2 353017 CASAVA_Build 8 7242748 1D CTGATAACCT C/- CCCCTCTTCA 3070 hom 27 het 10 0 9 1 C 5 4 353018 CASAVA_Build 8 7261521 1D AGAAAGACAG A/- AAAAAAGAGA 1569 het 1569 ref 13 5 4 4 A 7 6 353019 CASAVA_Build 8 7299015 1D GAAATCTCTC A/- AAAAAAAAAA 1493 het 1493 ref 17 9 4 4 A 17 16 353020 CASAVA_Build 8 7314520 1D CGCTGTTGAC A/- TTCCTTGGCT 3070 het 3070 ref 57 40 13 5 A 1 0 353021 CASAVA_Build 8 7320883 1D TTATTTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 17 0 13 4 A 11 10 353022 CASAVA_Build 8 7327940 4D TTGGGAAACG TCCC/---- TAAGCTATGG 3070 het 1950 hom 13 4 9 3 TCCC 1 0 353023 CASAVA_Build 8 7337709 4D ATGGGATAAT AGAA/---- AGAAATTTGG 3070 het 1973 hom 21 5 14 2 AGAA 2 1 353024 CASAVA_Build 8 7354842 1D GTTCCCCAAA G/- GTCATCGAAT 3070 het 3070 ref 27 18 7 2 G 2 1 353025 CASAVA_Build 8 7363934 5I AGTACTTAGT -----/AAAGG ATTTTACACT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAAGG 0 1 353026 CASAVA_Build 8 7383271 1I TAATTAGATT -/C CAATTTTTTT 1922 hom 10 het 4 0 4 0 C 1 2 353027 CASAVA_Build 8 7442073 1I ACAAAAAAAA -/T AAACACGGTA 1668 hom 10 het 5 0 4 1 T 0 1 353028 CASAVA_Build 8 7460160 2I TATAACCAGA --/GG GGATGGATTT 1574 het 435 hom 7 2 4 1 G 2 4 353029 CASAVA_Build 8 7578438 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 16 7 8 1 A 9 8 353030 CASAVA_Build 8 7669936 1I CTGCCTTTAT -/A AAAAAAAATG 2748 het 2748 ref 22 11 6 5 A 8 9 353031 CASAVA_Build 8 7701529 1I GATGAAGGAG -/A AGGTGGATCC 1895 het 1895 ref 17 11 4 2 A 1 2 353032 CASAVA_Build 8 7708597 1D AAACTCATAT A/- AGTTTGGCCT 3070 het 3070 hom 47 14 26 9 A 2 1 353033 CASAVA_Build 8 7709170 2I TGTCTCATTG --/AT ATACTTACTT 1471 hom 7 het 3 0 3 0 AT 1 2 353034 CASAVA_Build 8 7713705 4D CTTTCCCAAA TTTC/---- TTTCTATTAT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 TTTC 2 1 353035 CASAVA_Build 8 7723477 4D ACCATAGCTT AGGG/---- ACGTTTCCCA 1273 het 495 hom 5 1 3 1 AGGG 1 0 353036 CASAVA_Build 8 7724316 1I AATTTTATTC -/T TTTTTTTCTT 1461 het 16 hom 4 0 3 1 T 7 8 353037 CASAVA_Build 8 7729343 1D TATGAATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 15 14 353038 CASAVA_Build 8 7730525 1D AAATGAAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 63 hom 24 2 21 1 T 10 9 353039 CASAVA_Build 8 7752853 1I ATGGTTGTTG -/T AGGCTGGTTA 3070 het 3070 ref 33 22 7 4 T 0 1 353040 CASAVA_Build 8 7756109 1I TTCTTTCTTA -/C CACACCCAGC 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 1 2 353041 CASAVA_Build 8 7757588 1D AAGGCATGGT A/- AAAAAACTAG 2018 hom 12 het 6 0 5 1 A 7 6 353042 CASAVA_Build 8 7773772 1I CTAATCAAAA -/T TGTCAAAATG 3070 hom 27 het 16 0 10 6 T 1 2 353043 CASAVA_Build 8 7787730 1D GCAAGTATAC A/- AAAAAAAAAT 3001 hom 18 het 8 0 7 1 A 10 9 353044 CASAVA_Build 8 7789877 1D CCTCTCTCTC T/- TTTTTTCTGT 2401 het 2401 ref 23 15 5 3 T 7 6 353045 CASAVA_Build 8 7794572 2D TTCAGTTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 2234 het 22 hom 14 1 8 5 T 20 18 353046 CASAVA_Build 8 7800626 1D CATGATCAGC A/- AGGGAAAGCA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 2 1 353047 CASAVA_Build 8 7830442 2I AAACCAGCAC --/CT TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 12 1 11 0 CT 0 1 353048 CASAVA_Build 8 7868458 2I GACTTCTAGA --/AC ACCTGAATCA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AC 1 2 353049 CASAVA_Build 8 7888970 3I ATTCACATTA ---/AAT GTTAAATTAT 53 het 3 hom 6 0 1 5 AAT 0 1 353050 CASAVA_Build 8 7944656 5D AATGTGGATT ATTTG/----- TTTTTTTTAG 1929 het 1929 ref 23 12 4 8 ATTTG 1 0 353051 CASAVA_Build 8 7947077 1I ATCCTTTACC -/T TTTTTTTCAT 1692 het 1692 ref 10 5 4 1 T 7 8 353052 CASAVA_Build 8 7949334 1D TTTGCTTTTT A/- TTTCTCTCAT 2813 het 662 hom 19 5 8 6 A 1 0 353053 CASAVA_Build 8 7958161 2I TATAACCAGA --/GG GGATGGATTT 2295 het 41 hom 10 1 6 3 G 2 4 353054 CASAVA_Build 8 7962421 1I GTGTGTTTTT -/G CAGTGATGTT 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 0 1 353055 CASAVA_Build 8 7971399 1D TTAAAAAAGT A/- AAAATGCAAT 2452 het 1571 hom 11 5 5 1 A 5 4 353056 CASAVA_Build 8 7995953 1I ACATCTCAGC -/A AAGCAATTGT 2172 hom 15 het 6 0 5 1 A 2 3 353057 CASAVA_Build 8 8003334 1I GTCTCCTTTC -/T TTTTTTTTTG 1955 hom 10 het 4 0 4 0 T 9 10 353058 CASAVA_Build 8 8022468 2I ACTAAGAAAA --/AC ACAAAGTATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AC 1 2 353059 CASAVA_Build 8 8031082 1D TTGGCTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2445 hom 48 15 18 16 T 14 13 353060 CASAVA_Build 8 8033634 5I CTTTTTTGCC -----/TACTT TACTTCTGTA 1392 het 1392 ref 19 15 3 1 TACTT 1 2 353061 CASAVA_Build 8 8034327 1I TCCAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 1660 het 971 hom 11 3 4 4 A 11 12 353062 CASAVA_Build 8 8036717 1D CGGATTTACA C/- CCCTTTTGAC 1473 het 1473 ref 26 20 4 2 C 4 3 353063 CASAVA_Build 8 8036814 2I TCCAAAAACT --/AA AAAGATTTTC 3070 hom 41 het 16 0 15 2 A 3 5 353064 CASAVA_Build 8 8039346 1D AAGACTCAGA C/- ACTCCAAGAG 3070 het 3070 ref 86 75 11 2 C 1 0 353065 CASAVA_Build 8 8039908 1D GTATCAAAGC A/- TGTTCAACTA 3070 het 3070 ref 55 45 8 2 A 1 0 353066 CASAVA_Build 8 8045126 5D CTTAACAAAG TTTAA/----- TGGTATTCTT 3070 het 3070 ref 39 23 7 14 TTTAA 1 0 353067 CASAVA_Build 8 8055808 1I GCTGTTGACT -/C CCAATATCCT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 2 3 353068 CASAVA_Build 8 8059121 1D ATTTCTAAAG A/- AAAAAATAAT 3070 het 2380 hom 26 7 14 6 A 7 6 353069 CASAVA_Build 8 8059450 1D AATTTGAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 12 16 4 A 10 9 353070 CASAVA_Build 8 8059534 1D ATCAGAATGA C/- CCCCTCACCC 3070 het 3070 hom 43 13 22 8 C 5 4 353071 CASAVA_Build 8 8061307 1D AACGCTGCTG A/- AAAAAGGCCT 3070 het 3070 ref 47 28 15 6 A 6 5 353072 CASAVA_Build 8 8067230 1I TAATTGACGG -/A CAGTTGAGGC 1548 het 1208 hom 10 3 6 1 A 0 1 353073 CASAVA_Build 8 8080768 1I GTACAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2374 het 253 hom 15 1 12 2 A 13 14 353074 CASAVA_Build 8 8080931 1D CTGTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 57 24 13 21 A 11 10 353075 CASAVA_Build 8 8081310 5I CCTGGCTCTC -----/ATCTT AGTTCACAAT 3070 het 3070 ref 39 28 10 1 ATCTT 0 1 353076 CASAVA_Build 8 8085560 1D TGTTGATCCA G/- GCTGGTCTCA 1427 het 495 hom 4 1 3 0 G 2 1 353077 CASAVA_Build 8 8086432 1I TCACCTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 10 11 353078 CASAVA_Build 8 8087353 2I CTCAGGAAGC --/CT CTCTCTCTCT 2992 het 2992 ref 38 19 11 8 CT 5 6 353079 CASAVA_Build 8 8087875 1I AATAATGGCA -/T TCCTCATGGG 3070 het 1040 hom 16 3 12 1 T 1 2 353080 CASAVA_Build 8 8090353 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 19 2 10 7 A 12 11 353081 CASAVA_Build 8 8094026 3I GGCACTATAT ---/CAA CAACCCACGG 3070 hom 144 het 58 0 48 10 CAA 1 2 353082 CASAVA_Build 8 8094840 1D AGGACAAGTT A/- AAACATTTGG 1726 het 1726 ref 27 20 4 3 A 4 3 353083 CASAVA_Build 8 8096218 1I TGTAATTCAG -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 71 54 14 3 A 6 7 353084 CASAVA_Build 8 8099220 1D TAGGCCTAAA G/- GGAAACCATG 3070 het 3070 ref 39 26 12 1 G 3 2 353085 CASAVA_Build 8 8101813 3D AAGACGACTC AGA/--- AGAAGACCCA 3070 het 3070 ref 69 53 10 6 AGA 3 2 353086 CASAVA_Build 8 8102349 1I GCTCATTCAT -/C ACCACTGTGA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 0 1 353087 CASAVA_Build 8 8103341 2D ACCGCCTGAG CT/-- CTGTCTCCTG 1746 het 1746 ref 16 9 5 2 CT 2 1 353088 CASAVA_Build 8 8103644 1D CCTGAAACTT C/- CCCCCAACAA 3070 hom 59 het 28 0 21 7 C 6 5 353089 CASAVA_Build 8 8106814 2D TAAGAAAAAT CA/-- CAGTCTTCTA 3070 het 3070 hom 17 9 7 3 CA 2 1 353090 CASAVA_Build 8 8118665 1I TCCCATCCTA -/C CCCCACCCTT 1384 het 1384 ref 22 12 4 6 C 4 5 353091 CASAVA_Build 8 8118700 1I GTATATGTTT -/G TATACCATAA 1941 het 1941 ref 18 8 4 6 G 0 1 353092 CASAVA_Build 8 8119443 1I CCTGACTCAA -/T TTTTTTTTTG 2762 hom 21 het 8 0 8 0 T 9 10 353093 CASAVA_Build 8 8120246 1D GCACACTCTT G/- CAACTGAAAC 3070 hom 24 het 9 0 8 1 G 1 0 353094 CASAVA_Build 8 8133245 5I TTCACAGAGA -----/AGAGC AGAGCAGACA 3070 het 149 hom 21 1 14 6 AGAGC 1 2 353095 CASAVA_Build 8 8137112 1I GAAGAGTGTA -/T TTGCTGGAAT 3070 het 3070 ref 57 44 10 3 T 2 3 353096 CASAVA_Build 8 8153440 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 878 hom 29 3 16 10 T 13 12 353097 CASAVA_Build 8 8158307 1I TTTTGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 709 hom 35 2 25 8 T 10 11 353098 CASAVA_Build 8 8166602 6I AAACAAAAAA ------/TAAAAT TAAATTAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TAAAAT 0 1 353099 CASAVA_Build 8 8173678 1D ACCTTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 29 0 16 13 T 13 12 353100 CASAVA_Build 8 8179973 1I TCCAGGTCCG -/T TTGGCTCGGG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 2 3 353101 CASAVA_Build 8 8208667 6I ATTCTTGCTT ------/TTATTA TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 31 0 25 6 TTA 0 2 353102 CASAVA_Build 8 8208716 4D TTTGATTTCT AATA/---- AATAAATTCC 2122 het 2122 ref 27 6 7 16 AATA 2 1 353103 CASAVA_Build 8 8226660 1D GTCCCAGCAC A/- AAAAACCCTT 3070 het 3070 ref 46 21 19 7 A 6 5 353104 CASAVA_Build 8 8242744 1I AATTCACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 160 hom 32 2 25 5 T 10 11 353105 CASAVA_Build 8 8261614 1I TATTTTTATC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 9 10 353106 CASAVA_Build 8 8270135 8I TCTTTGTTTT --------/TTTTTTTG TTTTTTTGTT 3070 hom 57 het 26 0 20 7 TTTTTTTG 2 3 353107 CASAVA_Build 8 8282478 76D CCCACCCACT GAGAGGAGGAAGATGGGCCCCCACCCCCACCCCCAGATCCCTGGCTCTCCTCTTTGCTGCTGTGGGTGTGGACAGA/---------------------------------------------------------------------------- GAGGGAAGAT 3070 hom 50 het 16 0 17 4 GAGAGGAGGAAGATGGGCCCCCACCCCCACCCCCAGATCCCTGGCTCTCCTCTTTGCTGCTGTGGGTGTGGACAGA 1 0 353108 CASAVA_Build 8 8294747 4D CTTTCTTTCC TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 hom 105 het 44 0 34 10 TTCT 4 3 353109 CASAVA_Build 8 8298978 2D ATCTCAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AT 7 6 353110 CASAVA_Build 8 8309976 1D AGAATGCAAA T/- TGTTCTGGTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 8 T 2 1 353111 CASAVA_Build 8 8318474 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 5 6 353112 CASAVA_Build 8 8329116 1D TATACAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 36 0 22 15 T 11 10 353113 CASAVA_Build 8 8349594 1D TTAAAAACCT G/- GTGCCTGGTC 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 G 2 1 353114 CASAVA_Build 8 8352422 10D GCAAATGACC CAGAGAGGCT/---------- CAGAGAGGCT 3070 het 3070 ref 45 26 17 8 CAGAGAGGCT 2 1 353115 CASAVA_Build 8 8358623 1D ACATTGGTTT C/- CCCCCCCCCG 3070 het 2479 hom 25 7 14 4 C 10 9 353116 CASAVA_Build 8 8371810 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 1503 het 268 hom 12 3 6 3 A 17 16 353117 CASAVA_Build 8 8382277 5D GTTTGAGCTG TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 11 TGTTT 4 3 353118 CASAVA_Build 8 8392617 1I27M1D AATTTTCTTT -TTTTTTTTCTTTTTTTCTTTCTTTTTCT/CTTTTTTTTCTTTTTTTCTTTCTTTTTC- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 14 3 N/A 0 0 353119 CASAVA_Build 8 8395884 1I TCAATATGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 12 13 353120 CASAVA_Build 8 8407687 1I GCATGGGGTT -/C CTTTATGCAT 3070 hom 103 het 43 0 34 9 C 1 2 353121 CASAVA_Build 8 8415649 1D CTGATAAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 836 hom 44 2 36 6 A 12 11 353122 CASAVA_Build 8 8415874 1D TACTCAAGTG C/- AGTAATACTG 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 C 1 0 353123 CASAVA_Build 8 8417096 1I16M2I TAGGAAAAAA -AATAATAATAAAAGAC--/TAATAATAATAAAAGACAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 24 10 4 N/A 0 0 353124 CASAVA_Build 8 8420358 1I CTCCTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 2377 het 2377 ref 31 9 9 13 T 11 12 353125 CASAVA_Build 8 8421057 1I GAGGAAATTG -/C CCTAATTAAC 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 C 2 3 353126 CASAVA_Build 8 8424758 2I AGTTGAAGGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 65 27 30 8 GT 6 7 353127 CASAVA_Build 8 8441064 2D TTTAGCCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1305 hom 19 5 9 6 T 14 12 353128 CASAVA_Build 8 8459183 1I TGATAAAAAA -/G GAAATGATCA 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 G 1 2 353129 CASAVA_Build 8 8476361 1I GACTCGATCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 9 10 353130 CASAVA_Build 8 8478084 1D TTCTCATTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 T 9 8 353131 CASAVA_Build 8 8479184 1I CATGTACTGT -/A TTCTTAGAAT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 0 1 353132 CASAVA_Build 8 8480600 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 51 het 19 0 16 4 A 10 9 353133 CASAVA_Build 8 8489397 4D TGTTTGTTTG TTTT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 32 11 16 7 T 6 2 353134 CASAVA_Build 8 8507240 1I AAATCCTTTT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 7 8 353135 CASAVA_Build 8 8529162 1D AAATATGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 T 11 10 353136 CASAVA_Build 8 8542150 2D GACACACCAA AT/-- ACACACACCA 3070 het 3070 hom 74 32 36 9 AT 1 0 353137 CASAVA_Build 8 8557468 3I TTGTATTAAA ---/CTT CTTCTTCTTC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 CTT 5 6 353138 CASAVA_Build 8 8583694 4I ATCATATGAA ----/AATT AATTTCTTTT 3070 het 3070 hom 26 13 10 3 AATT 1 2 353139 CASAVA_Build 8 8587887 3I TTTTAATTAT ---/TTA TTGTCATTAT 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 TTA 0 1 353140 CASAVA_Build 8 8595564 1I TTACCACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 10 11 353141 CASAVA_Build 8 8619199 10D AATTAAGGAG ACAGAGATAC/---------- ACAGAGATCA 3070 het 3070 ref 31 17 13 7 ACAGAGATAC 1 0 353142 CASAVA_Build 8 8619566 10D CGTCTCAAAA AAAAGAAAAG/---------- AAAAGAAAAG 2201 het 2201 ref 19 14 7 1 AAAAG 4 2 353143 CASAVA_Build 8 8633162 1D TTCAGGGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 19 17 9 T 13 12 353144 CASAVA_Build 8 8635375 1I CTAAGCAAAA -/G AAAATTGGAG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 G 0 1 353145 CASAVA_Build 8 8639481 1D GGGAGGTGGA G/- GTTGCAGTGA 3070 het 3070 ref 21 10 10 1 G 2 1 353146 CASAVA_Build 8 8640166 1I AAGTAATTGC -/G GGCCGGGCGT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 G 2 3 353147 CASAVA_Build 8 8641764 1I GAAAACACGT -/G GGTAATTGGT 3070 het 3070 ref 25 14 11 0 G 2 3 353148 CASAVA_Build 8 8651916 1I ACCCTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 2947 het 2947 ref 29 13 10 6 A 10 11 353149 CASAVA_Build 8 8661017 1D CAGGCCAGCA G/- ATGCCCATGC 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 G 1 0 353150 CASAVA_Build 8 8662822 1I TCCCAAAGTG -/C TGGGATTACA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 C 0 1 353151 CASAVA_Build 8 8672120 2I ACTCCAGCCC --/TG TAAGACGTGC 2337 het 2337 ref 15 7 6 2 TG 0 1 353152 CASAVA_Build 8 8673019 4D CCCTTTTCTC TTGA/---- TTTTTTTTTT 2206 het 2206 ref 28 14 9 5 TTGA 1 0 353153 CASAVA_Build 8 8678013 1I TGGATCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 11 11 A 13 14 353154 CASAVA_Build 8 8679185 4D TAAATGTGAC CATT/---- CAGTTTTACA 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 CATT 1 0 353155 CASAVA_Build 8 8680308 2I AACAGAGAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 20 9 T 10 12 353156 CASAVA_Build 8 8713116 4D2M2D TAAAGTCAGT AGACTCAG/----TC-- AAGAGTTTCT 1490 het 1490 ref 41 29 6 7 N/A 0 0 353157 CASAVA_Build 8 8726537 1D AAATGGTCAA T/- TTTTTTTTTT 2272 het 2272 ref 31 14 9 8 T 17 16 353158 CASAVA_Build 8 8730106 4D GGGGTAATGG GAGT/---- GAATGCTCTC 3070 hom 165 het 58 0 55 4 GAGT 1 0 353159 CASAVA_Build 8 8773009 1D TTCTCTGAGA C/- CCCTGATGGC 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 C 4 3 353160 CASAVA_Build 8 8804308 2I CCAAGAGAGA --/CT CTGACCCACA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 CT 1 2 353161 CASAVA_Build 8 8808684 2I AACTTCACTC --/AT ATCTTTAGCA 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 AT 1 2 353162 CASAVA_Build 8 8839661 1I AACATATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 35 0 29 6 A 11 12 353163 CASAVA_Build 8 8841070 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 24 1 15 8 A 16 15 353164 CASAVA_Build 8 8841751 2I GGGAGGCTGA --/CC GGTAGAGAAT 3070 hom 53 het 21 0 17 4 C 0 2 353165 CASAVA_Build 8 8842763 1I AATTTTAGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 93 hom 22 1 17 4 T 9 10 353166 CASAVA_Build 8 8848258 1I TCTTTTCCCT -/G GGGAAGGAAG 3070 hom 117 het 45 0 39 6 G 3 4 353167 CASAVA_Build 8 8877224 2D ATACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 21 0 12 9 A 18 16 353168 CASAVA_Build 8 8879826 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 20 4 A 14 13 353169 CASAVA_Build 8 8889888 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 10 9 353170 CASAVA_Build 8 8892287 3I TATTATTATA ---/TAT TGAGGAGTAT 3070 hom 4 het 33 0 10 23 TAT 0 1 353171 CASAVA_Build 8 8892815 4I CGCCTGGCTC ----/TTTG TTTGTTTCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTTG 1 2 353172 CASAVA_Build 8 8899691 1D ACTGCAACCT C/- CCGCCTCCCG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 3 2 353173 CASAVA_Build 8 8907844 2D TTCAATAAAG TT/-- TAAGCTGTGT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 T 3 1 353174 CASAVA_Build 8 8907942 1I CCATTCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 430 hom 26 1 18 7 T 10 11 353175 CASAVA_Build 8 8921779 1D GTACCACGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 13 12 353176 CASAVA_Build 8 8928128 1I CCAAATCTGG -/C CTGCTGCCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 1 2 353177 CASAVA_Build 8 8928359 1D CAGCAAGGCC A/- AAAAATACTA 3070 hom 132 het 49 0 44 7 A 6 5 353178 CASAVA_Build 8 8928495 3I GTTAAGGTAC ---/AAT AATGATACTT 3070 hom 166 het 66 0 56 10 AAT 1 2 353179 CASAVA_Build 8 8928784 1I CATCTTCCTG -/C TATGGTTTAA 3070 hom 108 het 47 0 36 11 C 0 1 353180 CASAVA_Build 8 8935650 1D GTGTGTGTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 hom 78 het 32 0 26 7 G 10 9 353181 CASAVA_Build 8 8942664 2D TCTCCCTCCC CT/-- CTCCCCTTCC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 CT 2 1 353182 CASAVA_Build 8 8945091 4D CTAAGTGGTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 44 1 30 13 A 15 11 353183 CASAVA_Build 8 8959155 2D TGAAGGAGAA GG/-- GGGGTTGGGG 435 hom 4 het 10 0 3 8 G 6 4 353184 CASAVA_Build 8 8962765 1I CCCCAGCAGG -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 41 21 12 8 T 7 8 353185 CASAVA_Build 8 8972429 1D TACCCCACAG A/- AAAAAAATAG 3070 hom 74 het 28 0 22 6 A 8 7 353186 CASAVA_Build 8 8974912 2D TTTTAAAGAC AA/-- AAAAAAAAAA 2493 het 372 hom 22 3 8 12 A 18 16 353187 CASAVA_Build 8 8986816 8D AGTAACAAAA TTGTTAAT/-------- TTGTGGATGT 3070 het 3070 ref 31 19 10 5 TTGTTAAT 1 0 353188 CASAVA_Build 8 9010038 5I AAAGTAAAGA -----/TAAAG TAAAAGAATA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 TAAAG 0 1 353189 CASAVA_Build 8 9010579 1I GAGCTCTGCA -/G GCTGTGGTTG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 1 2 353190 CASAVA_Build 8 9010713 5I ACATTTTCTT -----/TTCTC TAGCTTACTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTCTC 0 1 353191 CASAVA_Build 8 9012487 2I AGGCGTGAGC --/CA CACTGCACCC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 CA 1 2 353192 CASAVA_Build 8 9014413 5D GGGTTCAAGG GCTTC/----- GCTTCTCCTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 GCTTC 2 1 353193 CASAVA_Build 8 9026248 2D AGGGAGGGGG GA/-- AATGGGTGCG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 GA 1 0 353194 CASAVA_Build 8 9026338 2D TCTGTGGCCC CA/-- AGGCTGGAGT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 CA 1 0 353195 CASAVA_Build 8 9066703 1D AAGCTTGAGC A/- AAAAAAAAAA 1967 het 1967 ref 24 14 6 5 A 17 16 353196 CASAVA_Build 8 9079594 4D CTCTGTCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 AAAC 3 2 353197 CASAVA_Build 8 9087944 1I AAGTTCTTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 7 8 353198 CASAVA_Build 8 9099573 4D ATGTATTGAA TATG/---- TAAGTATATA 3070 het 3070 ref 22 10 10 3 TATG 1 0 353199 CASAVA_Build 8 9114835 1D TCTACACACC T/- TTTTTTTTTC 1362 het 1362 ref 41 28 4 10 T 10 9 353200 CASAVA_Build 8 9115427 1D GTCTTGAACT C/- CTGGGCTCAA 3070 het 2744 hom 16 7 7 2 C 2 1 353201 CASAVA_Build 8 9122330 2I4M6I CAGCTGGGTT --CATG------/CACATGAACCAA TCCCCTCTTC 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 N/A 0 0 353202 CASAVA_Build 8 9122692 1D AGAGGAATGG C/- ACAGCGATTG 3070 het 3070 ref 57 34 20 4 C 1 0 353203 CASAVA_Build 8 9123074 2D47M2D ACATGCACAC ATGTGCACATATATACACACATACACACGTGTATACACAGATACATGCTCA/--GTGCACATATATACACACATACACACGTGTATACACAGATACATGCT-- CACATGCACA 3070 het 3070 ref 75 50 34 24 N/A 0 0 353204 CASAVA_Build 8 9124659 2D TGGGACACAG AC/-- ACACACAGAA 3070 het 3070 hom 56 23 27 7 AC 4 3 353205 CASAVA_Build 8 9125870 1D AATGTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 A 11 10 353206 CASAVA_Build 8 9125935 1D GAAGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2250 het 1348 hom 13 3 5 5 A 11 10 353207 CASAVA_Build 8 9126201 1D CATTCAGGCT C/- CATTTTAATC 3070 het 3070 hom 38 17 14 7 C 2 1 353208 CASAVA_Build 8 9131155 1I ACTGTGTTAT -/C AATACAGATG 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 C 0 1 353209 CASAVA_Build 8 9134446 22D GAATATTAAT GGGTTAATTGAACAATTAACAA/---------------------- GGGTTAATTG 3070 hom 99 het 37 0 34 7 GGGTTAATTGAACAATTAACAA 1 0 353210 CASAVA_Build 8 9137930 6D ATCTGTCTTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 18 12 353211 CASAVA_Build 8 9153314 2I GGGTAAAGAC --/AG AAGATTGACT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AG 0 1 353212 CASAVA_Build 8 9156993 3D3M1D AGAACACAGC AGAGTCA/---GTC- AACATCCATA 3070 het 3070 hom 38 16 21 5 N/A 0 0 353213 CASAVA_Build 8 9177476 2D TCCTGCATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 33 3 18 12 A 12 10 353214 CASAVA_Build 8 9179195 4I TGCACATGCA ----/GACT GACTGGGAAG 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 GACT 1 2 353215 CASAVA_Build 8 9181763 1I CTCAGAATTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 45 19 21 5 T 8 9 353216 CASAVA_Build 8 9183521 1D TGCTAGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 13 12 353217 CASAVA_Build 8 9191613 1I CTCACGTTGA -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 57 20 26 11 T 7 8 353218 CASAVA_Build 8 9196681 1I GGATGCTCGA -/G GTTTTAATTT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 1 2 353219 CASAVA_Build 8 9197032 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTA 3070 het 397 hom 35 1 28 6 C 0 1 353220 CASAVA_Build 8 9198842 1I TTGTAGCCAT -/G GGGGGGGGTC 3013 het 2428 hom 24 8 8 8 G 8 9 353221 CASAVA_Build 8 9202163 1D TTAAGAGGAG C/- CTTTAGAGCT 3070 het 3070 ref 50 25 23 2 C 2 1 353222 CASAVA_Build 8 9204112 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 1999 hom 21 het 10 0 7 3 T 9 8 353223 CASAVA_Build 8 9210512 10D TGGAAAGATA TTTTGTTTTG/---------- TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 TTTTG 4 2 353224 CASAVA_Build 8 9220513 11I GGAAAGAGGA -----------/AGAAGAAAGGG AAGGGAACAG 3070 hom 63 het 27 0 20 7 AGAAGAAAGGG 0 1 353225 CASAVA_Build 8 9221319 1I ATTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 185 hom 19 1 11 7 T 10 11 353226 CASAVA_Build 8 9223880 1D GGCCTGTCCC A/- ACCACCCCCA 3070 het 3070 hom 34 14 12 9 A 2 1 353227 CASAVA_Build 8 9224859 1I ATGCATATTG -/C CGCAGATACC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 C 1 2 353228 CASAVA_Build 8 9226436 10D TGCTCCCTAG GGTATAATCT/---------- GGTTTTCAAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 6 GGTATAATCT 1 0 353229 CASAVA_Build 8 9232651 2D CCTTCTCCCT TC/-- TCTCTGGTGA 3070 het 3070 hom 49 18 23 9 TC 3 2 353230 CASAVA_Build 8 9245580 1D TTTCAGAGAC A/- TACCACTGTT 3070 het 3070 ref 43 23 19 2 A 1 0 353231 CASAVA_Build 8 9247777 1I CATAGGGTTT -/A AAAAAATAGT 3070 het 3070 ref 35 13 13 9 A 6 7 353232 CASAVA_Build 8 9255239 1D TGCAGGTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 27 0 22 5 A 11 10 353233 CASAVA_Build 8 9264870 2D TATGCATTTC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 65 het 32 0 24 9 GT 9 8 353234 CASAVA_Build 8 9269673 1D ATGGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2654 hom 28 9 16 4 A 12 11 353235 CASAVA_Build 8 9274019 1I CAAATTCCCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 10 9 6 T 8 9 353236 CASAVA_Build 8 9279300 1D AATTCCTAGG C/- TTTCTCCCAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 3 C 1 0 353237 CASAVA_Build 8 9279685 1I GAAGTCTGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 9 10 353238 CASAVA_Build 8 9284928 1D GCAAAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 1537 het 1537 ref 49 40 4 5 T 12 11 353239 CASAVA_Build 8 9289133 1D AATTTGCCTC A/- AAGTAATTTA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 A 3 2 353240 CASAVA_Build 8 9290189 1I TAGAGCCCCC -/A CCTCCTACAC 3070 hom 57 het 21 0 19 2 A 0 1 353241 CASAVA_Build 8 9294454 2D GACTCCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 31 1 17 13 A 17 15 353242 CASAVA_Build 8 9294565 1D CAAACAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 9 8 353243 CASAVA_Build 8 9301626 1D TCTCCTCCGG C/- CTGTAATTTT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 C 2 1 353244 CASAVA_Build 8 9303888 1D GCATTTTAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 10 9 353245 CASAVA_Build 8 9305422 2D TCTGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 2447 het 2447 ref 41 21 8 13 TG 7 6 353246 CASAVA_Build 8 9305952 1D CAGGAGTTGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 16 11 9 T 10 9 353247 CASAVA_Build 8 9310534 4D CGTCTCAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 hom 19 7 12 1 AAAG 6 5 353248 CASAVA_Build 8 9314994 13I CTCACTGCAA -------------/GCTCTGCCTCCAG GGTTCATGCC 2820 het 2096 hom 11 5 6 0 GCTCTGCCTCCAG 0 1 353249 CASAVA_Build 8 9315067 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1397 het 333 hom 6 1 5 0 T 13 12 353250 CASAVA_Build 8 9329931 2D11M8I TGAGCCACCG GCCGCCTGGCCTG--------/--CGCCTGGCCTGTTCATTCT TTCATTCTTT 3070 het 562 hom 18 3 12 6 N/A 0 0 353251 CASAVA_Build 8 9333820 1D AAAATGATGT G/- GGGGGCTGCT 1798 hom 20 het 13 0 6 7 G 6 5 353252 CASAVA_Build 8 9335732 1I AATAAAAAAA -/G AAATAAATAA 2181 het 1821 hom 9 4 5 0 G 0 1 353253 CASAVA_Build 8 9346852 27D CCTCTGGTCT CTTTTTAATTTTTTTAAAAATGTTTGA/--------------------------- CTTTTTAAGT 3070 het 3070 ref 25 16 11 2 CTTTTTAATTTTTTTAAAAATGTTTGA 1 0 353254 CASAVA_Build 8 9347836 1D GTCACAGGGT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 46 19 21 7 A 8 7 353255 CASAVA_Build 8 9350225 1I TGTCTCAAAC -/A AAAAAAAAAA 2538 het 2538 ref 22 10 6 6 A 11 12 353256 CASAVA_Build 8 9364370 3D TCTCTCCTCT CTC/--- CTCCTTCTTC 3070 het 3070 ref 43 28 12 4 CTC 2 1 353257 CASAVA_Build 8 9379216 1D ACTGCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 A 13 12 353258 CASAVA_Build 8 9384118 1D GTTGTAACTC T/- TTTTTTTTTT 2407 het 2336 hom 43 20 7 16 T 17 16 353259 CASAVA_Build 8 9394258 3I AAATACAAAC ---/ATT AGCCGGGCGT 3070 het 2175 hom 21 7 11 4 ATT 0 1 353260 CASAVA_Build 8 9394789 1I GTGATATTTC -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 3 4 353261 CASAVA_Build 8 9396755 1D ATTTGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 22 9 2 T 11 10 353262 CASAVA_Build 8 9398673 1I CCTCTCAAAA -/G AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 G 0 1 353263 CASAVA_Build 8 9428788 1D TTTTTTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 46 4 22 20 A 16 15 353264 CASAVA_Build 8 9437348 1I TTAGTAGAGA -/C GGGGTTTTAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 0 1 353265 CASAVA_Build 8 9442346 4I TGGCTTGGCG ----/GGTC GGTCAGACAA 3070 hom 106 het 42 0 30 12 GGTC 1 2 353266 CASAVA_Build 8 9446997 1D GTTTTACCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 347 hom 41 1 30 10 T 10 9 353267 CASAVA_Build 8 9450070 1D GCAGAATAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 9 8 353268 CASAVA_Build 8 9490047 1D TGAATTGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2895 hom 25 10 10 5 T 13 12 353269 CASAVA_Build 8 9490484 1D CATATATATA T/- GTTATGTACT 3070 het 3070 hom 40 13 21 6 T 1 0 353270 CASAVA_Build 8 9498260 3D CAGGCATGAG CCA/--- CCACGCCTGA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 CCA 2 1 353271 CASAVA_Build 8 9498875 1D TGAAACTCTT C/- TGTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 1 0 353272 CASAVA_Build 8 9512904 10D CTCTTTTTTG GTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 3070 het 1067 hom 30 7 18 5 GTTTTTTTTT 1 0 353273 CASAVA_Build 8 9516228 1I TTATTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 1976 het 1686 hom 28 7 8 14 T 14 15 353274 CASAVA_Build 8 9516500 2D TGCTGGAATT AC/-- AGGCTTATTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 4 AC 1 0 353275 CASAVA_Build 8 9523088 1D ACAATAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 9 A 11 10 353276 CASAVA_Build 8 9526683 1I GGTTGGTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 14 15 353277 CASAVA_Build 8 9528013 1I ATGGTACATT -/A ACTGCTTACA 3070 het 3070 ref 22 11 8 3 A 1 2 353278 CASAVA_Build 8 9531309 4D TTCTGACCTT AGAC/---- AGCCTCTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 AGAC 1 0 353279 CASAVA_Build 8 9545971 1D CAATTATACC A/- ACACCATTTG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 2 1 353280 CASAVA_Build 8 9549295 1D TTCTTGTGTT A/- AAAAAAACAT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 8 7 353281 CASAVA_Build 8 9562760 1D CCCTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1066 hom 33 6 15 12 T 17 16 353282 CASAVA_Build 8 9573183 1D GCATGGGTTA T/- GCCATTTTCC 3070 het 3070 hom 44 15 25 4 T 1 0 353283 CASAVA_Build 8 9577741 4D ATATTATTAT ATTA/---- ATTTATTTTG 3070 het 3070 hom 21 7 13 1 ATTA 1 0 353284 CASAVA_Build 8 9581789 1D TTTTTAGCCT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 A 8 7 353285 CASAVA_Build 8 9586189 1D ATTGTTATTC T/- TTTTTTGTCC 3070 het 3070 ref 34 19 12 5 T 7 6 353286 CASAVA_Build 8 9588275 4D AAAAGAACTC AGAG/---- AGAAAACAAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 AG 3 1 353287 CASAVA_Build 8 9595532 1D CACTCCCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 11 10 353288 CASAVA_Build 8 9601208 1D CATCATTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 22 10 T 13 12 353289 CASAVA_Build 8 9603910 1D AACTATCCAC G/- TTTTTTTCTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 1 0 353290 CASAVA_Build 8 9609251 1D CCCTACAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 16 6 T 13 12 353291 CASAVA_Build 8 9610288 1D GCAGGGGGGG C/- GGGTATGATC 3070 hom 156 het 56 0 50 6 C 1 0 353292 CASAVA_Build 8 9612944 3I GTCAGAAGTT ---/ATG ATTAGTTAGT 3070 hom 120 het 46 0 40 6 ATG 0 1 353293 CASAVA_Build 8 9615205 1I TGAAAGTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 10 353294 CASAVA_Build 8 9616484 22D AGTAAAATGT AGAAGGCTATAGACTAGGAGTC/---------------------- AGAAGTCCTG 3070 hom 54 het 19 0 17 5 AGAAGGCTATAGACTAGGAGTC 1 0 353295 CASAVA_Build 8 9617475 11D GCTTGAACTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 37 0 32 7 A 20 9 353296 CASAVA_Build 8 9617874 4D AAGATAAAAC TAAA/---- TACTGAATAC 3070 hom 66 het 25 0 23 5 TAAA 1 0 353297 CASAVA_Build 8 9618194 1D146M1I TTAGCTGAAC TTTTTAGTTATTTATTAACCCAATATCAGGTTATATCTATAATGACTTTTGAAAGAATATATTAATATCAGTCAAATAAGATGTATAGTAATTTGTTTTGTTCTGGATAACATTTTATAAGATTCATTTAAATACACTTGTTAATAC-/-TTTTAGTTATTTATTAACCCAATATCAGGTTATATCTATAATGACTTTTGAAAGAATATATTAATATCACTCAAATAAGATGTATAGTAATTTGTTTTGTTCTGGATAACATTTTATAAGATTCATTTAAATACACTTGTTAATACT GGGTTTGAGA 3070 het 528 hom 25 2 30 39 N/A 0 0 353298 CASAVA_Build 8 9619880 2D23M2D TCAGTTATAA CTCTATATACATAAACAATTGTCTCTT/--CTATATACATAAACAATTGTCTC-- TATTTTGTTG 3070 hom 135 het 41 0 46 5 N/A 0 0 353299 CASAVA_Build 8 9629388 5D CAGTGTGTCT TACTC/----- TACTCTCTTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TACTC 2 1 353300 CASAVA_Build 8 9631003 3D ATATTGTAAT ATA/--- ATATATATAA 2956 hom 15 het 6 0 6 0 ATA 2 1 353301 CASAVA_Build 8 9656570 1I AGCTATTCAG -/A AAAAAAAAAA 2941 het 2941 ref 44 28 7 9 A 13 14 353302 CASAVA_Build 8 9673065 1D TGACATTTAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 9 8 353303 CASAVA_Build 8 9700623 1D CTTGTTAGGC A/- TGAAACATAT 3070 hom 62 het 27 0 21 8 A 1 0 353304 CASAVA_Build 8 9702729 1I CCCTTCCCTT -/C CCTACACATC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 C 2 3 353305 CASAVA_Build 8 9711334 2I AGATTTCTCT --/TC TCTCTGGTCA 3070 hom 75 het 29 0 23 6 TC 2 3 353306 CASAVA_Build 8 9715567 1I CAAATGAATC -/A AAAAACATTC 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 5 6 353307 CASAVA_Build 8 9726342 1I GTTTGGTCAT -/G GGGGCAGATA 3070 hom 100 het 37 0 30 7 G 4 5 353308 CASAVA_Build 8 9729517 1I CTATAAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 28 1 22 5 T 11 12 353309 CASAVA_Build 8 9730672 13D CCCTAGCTAC TTGGGAGGCTGAG/------------- GTGGGAGGAT 3070 hom 82 het 32 0 22 13 TTGGGAGGCTGAG 1 0 353310 CASAVA_Build 8 9733901 1D GGAGCTTGGT G/- GGGGGGGAGG 1761 hom 20 het 15 0 8 7 G 8 7 353311 CASAVA_Build 8 9734775 2D CCTCCAAGCT AA/-- GAGAGCATGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 2 0 353312 CASAVA_Build 8 9738948 1D CAACAAACAT A/- AAAAAAAGCT 3070 het 187 hom 12 1 9 2 A 8 7 353313 CASAVA_Build 8 9740387 2D AAATGAAATT AA/-- GAGAGTAGTT 3070 hom 81 het 32 0 28 6 A 2 0 353314 CASAVA_Build 8 9743526 1I CCAAAAAAAA -/C CAAAAACAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 1 2 353315 CASAVA_Build 8 9758226 1I AAATAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 243 hom 34 1 26 7 A 10 11 353316 CASAVA_Build 8 9761189 1I AATTTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 1653 het 379 hom 25 3 10 12 T 17 18 353317 CASAVA_Build 8 9761550 1D TCTGTCACCC A/- GGCTGGAGTG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 1 0 353318 CASAVA_Build 8 9770306 1I AGCAGGGGTT -/G GGGAGGGGAA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 G 3 4 353319 CASAVA_Build 8 9770863 10I CCAAAGTAAA ----------/AAAAAAAAAC AAAAAAAAAC 3070 hom 94 het 37 0 29 8 AAAAAAAAAC 1 2 353320 CASAVA_Build 8 9772995 1I AAGCTTCCAA -/G AAATATGGGA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 0 1 353321 CASAVA_Build 8 9779176 1D TGTGGGGCAA G/- GGGGTGGGCG 3070 hom 82 het 36 0 26 10 G 5 4 353322 CASAVA_Build 8 9779528 1D TCCCTTCCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 10 9 353323 CASAVA_Build 8 9780701 1D CATGAATTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 10 9 353324 CASAVA_Build 8 9791549 1I TAATTGTAGC -/T TTTCAACAGG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 3 4 353325 CASAVA_Build 8 9809721 8D AAAAAAAAAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 3070 hom 59 het 28 0 20 9 AAAG 6 4 353326 CASAVA_Build 8 9810051 1D TATAAATGTG A/- AATTCTTTGG 3070 hom 78 het 30 0 27 5 A 3 2 353327 CASAVA_Build 8 9821784 1D TGATGAAGGG T/- CTGGATGAGA 3070 hom 79 het 30 0 25 5 T 1 0 353328 CASAVA_Build 8 9823504 8I TAAGTAAATA --------/AATAAATG AATAAATAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 AATAAATG 0 1 353329 CASAVA_Build 8 9832027 1D ATTGGATCAT G/- GGGGGCAGTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 G 6 5 353330 CASAVA_Build 8 9832639 4D GGGAAGTTCC TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 24 6 T 13 9 353331 CASAVA_Build 8 9832968 2D AGAGGTTCCT GG/-- GACCTCAATA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 G 3 1 353332 CASAVA_Build 8 9846226 2I GGGATCAAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 12 14 353333 CASAVA_Build 8 9852503 1D ACCCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 44 hom 36 1 18 18 A 17 16 353334 CASAVA_Build 8 9853169 6I CACGCACACC ------/TCCTGT TCCTGTTACG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TCCTGT 1 2 353335 CASAVA_Build 8 9854755 1I TTATAAGTTG -/A AACTACATGA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 2 3 353336 CASAVA_Build 8 9857093 1I CTCTCTGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1096 hom 30 4 20 6 A 13 14 353337 CASAVA_Build 8 9864040 8D ACTCCTGAGC TCAAGCAA/-------- TCCACTTGCC 3070 hom 84 het 30 0 27 8 TCAAGCAA 1 0 353338 CASAVA_Build 8 9883880 4D AGTGTGAGCT ATAC/---- ATACAATGAA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 ATAC 2 1 353339 CASAVA_Build 8 9891683 6D CTTCTCTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 622 hom 28 6 14 9 T 19 13 353340 CASAVA_Build 8 9900452 1I GCTGCTAACA -/T TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 24 11 11 2 T 6 7 353341 CASAVA_Build 8 9900855 6I ATCTTTCTGT ------/TATAGA TATATAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TATAGA 0 1 353342 CASAVA_Build 8 9902811 1D TTATTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 11 10 353343 CASAVA_Build 8 9909108 1I CATATTCTCG -/T TTTTTTTTTT 2097 het 2097 ref 29 8 8 13 T 13 14 353344 CASAVA_Build 8 9918444 5D TGCTTGGTTT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 het 758 hom 53 9 22 24 TTTTG 5 4 353345 CASAVA_Build 8 9929414 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 9 8 353346 CASAVA_Build 8 9930662 2D TGAGACCTTG AT/-- ATGGTTTGGC 3070 het 3070 hom 53 22 27 4 AT 2 1 353347 CASAVA_Build 8 9931105 1D ACATTTCTAC T/- CAACATTCTG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 1 0 353348 CASAVA_Build 8 9939498 2I ATCAATCTGA --/AT ATGATATTTA 3070 hom 129 het 46 0 44 2 AT 1 2 353349 CASAVA_Build 8 9942222 4D AGATCGATTT CAAA/---- CAATCACACA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 CAAA 1 0 353350 CASAVA_Build 8 9944069 1I TGTAGATTTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 9 10 353351 CASAVA_Build 8 9950091 4I TGTTCTGGCT ----/GAAA GAGTCACCCC 3070 hom 61 het 24 0 20 4 GAAA 0 1 353352 CASAVA_Build 8 9953496 1D AGATTATCTA C/- CAAATATTTA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 2 1 353353 CASAVA_Build 8 9966997 8D TAGAGCAATG AGGTTGGC/-------- AGGTTGGCCA 3070 hom 87 het 31 0 29 3 AGGTTGGC 2 1 353354 CASAVA_Build 8 9967226 1D TTTCGCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 43 2 23 18 T 15 14 353355 CASAVA_Build 8 9968483 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 T 7 8 353356 CASAVA_Build 8 9971010 1I TCATGTGCTT -/A ACTGGCTGTG 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 A 1 2 353357 CASAVA_Build 8 9975613 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1392 hom 14 het 28 0 7 21 T 19 18 353358 CASAVA_Build 8 9979818 4I CTTTGCGAAT ----/TGAG TAACATTCTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TGAG 0 1 353359 CASAVA_Build 8 9987003 3I TAAAGGGTCT ---/GTA GTAGTACTCT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 GTA 2 3 353360 CASAVA_Build 8 10002187 1D TTCATGAGTG T/- TTTTTTTTTT 1146 het 1146 ref 45 35 3 7 T 11 10 353361 CASAVA_Build 8 10003727 1D TGTTGGGAAA T/- TTTTTTTTTT 1085 het 1085 ref 26 19 3 4 T 12 11 353362 CASAVA_Build 8 10009419 6D CCAACACTTG TTATTA/------ TTATTATTAT 3070 het 3070 ref 34 15 18 5 TTA 5 3 353363 CASAVA_Build 8 10016765 2D TAATTTTTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1552 hom 29 7 14 8 T 16 14 353364 CASAVA_Build 8 10024773 3I ATTCAGCAAA ---/TAG TAGTTCCATT 3070 het 3070 hom 51 17 24 10 TAG 1 2 353365 CASAVA_Build 8 10048439 1D TCTACCTTCC T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 9 8 353366 CASAVA_Build 8 10053597 3D ATTGTGAATA ATG/--- ATGCTGTGAA 3070 het 3070 ref 46 25 18 5 ATG 2 1 353367 CASAVA_Build 8 10061318 2D GTGTGTGCTC AT/-- ATGTGTGTAT 3070 het 3070 hom 65 24 31 11 AT 2 1 353368 CASAVA_Build 8 10078918 1D2M1D GTTTTCTTGG CTAC/-TA- TAGGTGGTGG 3070 hom 88 het 37 0 28 11 N/A 0 0 353369 CASAVA_Build 8 10080427 4I AATCAGCTCT ----/GTGC GGGCACAGCT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 GTGC 0 1 353370 CASAVA_Build 8 10087789 1I GCATGTTCAT -/G GGAAAATGGT 3070 het 3070 ref 55 26 23 6 G 2 3 353371 CASAVA_Build 8 10092109 3D CTTGTGTTAA TAG/--- TGGTGGTGAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 6 TAG 1 0 353372 CASAVA_Build 8 10093235 1D TACTTTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 10 13 T 11 10 353373 CASAVA_Build 8 10119416 1I TTACCAGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 88 het 36 0 29 7 A 9 10 353374 CASAVA_Build 8 10124159 1I TGATACTGAG -/C CAGGAGATGG 3070 hom 129 het 45 0 41 4 C 1 2 353375 CASAVA_Build 8 10134827 2I CCACCTGCAC --/AG AGTTTGTTCA 3070 hom 132 het 53 0 44 9 AG 1 2 353376 CASAVA_Build 8 10137191 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 21 0 18 4 A 13 12 353377 CASAVA_Build 8 10146129 1D CTCAGTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 T 12 11 353378 CASAVA_Build 8 10148667 1I ATAACCTTAT -/G GGGGGTCAGG 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 G 5 6 353379 CASAVA_Build 8 10150718 1I AGGCTGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 T 10 11 353380 CASAVA_Build 8 10163303 2D GGAGACTACA CT/-- CTTTTATTCC 3070 het 3070 ref 50 30 16 4 CT 2 1 353381 CASAVA_Build 8 10165328 2D AAGCATACTG AA/-- AAAAAAAAAA 2669 het 2451 hom 32 12 9 11 A 16 14 353382 CASAVA_Build 8 10172767 1I TACATATTTG -/A AAAGTTCATG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 A 3 4 353383 CASAVA_Build 8 10175288 5I TCTAATAATT -----/AATTC AATTCAAGTT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 AATTC 1 2 353384 CASAVA_Build 8 10179947 1I TTTTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 2864 het 2864 ref 29 11 10 8 A 13 14 353385 CASAVA_Build 8 10183901 1D GTGCCATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 28 0 24 4 T 12 11 353386 CASAVA_Build 8 10186339 1D GAGACAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 A 10 9 353387 CASAVA_Build 8 10193555 1I GGAAAAAAAT -/C CATGAGCATT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 C 1 2 353388 CASAVA_Build 8 10202090 1D AGGATGCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 44 2 20 23 T 17 16 353389 CASAVA_Build 8 10211448 36D TTGATGATCC CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT/------------------------------------ CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 38 17 14 16 CT 23 5 353390 CASAVA_Build 8 10228009 1D CAAGGAGACA T/- TTTTGATTTT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 5 4 353391 CASAVA_Build 8 10229930 1D TCTCGTGTCC T/- TAGGTCTAGT 2946 het 1966 hom 19 6 9 4 T 2 1 353392 CASAVA_Build 8 10231359 1D ATTTTAATCC T/- TTTTTTTTTT 1078 het 1078 ref 40 29 4 7 T 12 11 353393 CASAVA_Build 8 10232326 1D ATCTGGATCT C/- CTGACCTCGT 2716 het 2716 ref 17 9 7 2 C 2 1 353394 CASAVA_Build 8 10240966 1D TTGTATTGTG T/- TTATGTGTAC 3070 het 3070 ref 61 27 26 8 T 3 2 353395 CASAVA_Build 8 10244332 2D CTAGAATATC TT/-- TTCCTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 T 4 2 353396 CASAVA_Build 8 10248401 8D GTATTTGGTA CCGGAGGC/-------- CCGGAGGCCC 3070 hom 99 het 37 0 30 8 CCGGAGGC 2 1 353397 CASAVA_Build 8 10264279 1D GGCACTACTG C/- CCCCCTAATG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 6 5 353398 CASAVA_Build 8 10278491 12D TGGTTTCAGG TTGACGGTGAGT/------------ TTGACATTTG 3070 het 3070 hom 26 8 16 4 TTGACGGTGAGT 1 0 353399 CASAVA_Build 8 10296025 1I TCAAGAATAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 9 10 353400 CASAVA_Build 8 10296603 1D ATGAATGGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 42 0 31 11 A 10 9 353401 CASAVA_Build 8 10315139 1I ATGAGGGAGC -/T TAGAGGAGTC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 1 2 353402 CASAVA_Build 8 10315813 1I ACCACAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 42 0 35 7 A 11 12 353403 CASAVA_Build 8 10321896 19I GGACCTGCTG -------------------/GGCCTCAAGATCCTCGATC GGCCTTCTGC 3070 hom 74 het 33 0 20 13 GGCCTCAAGATCCTCGATC 0 1 353404 CASAVA_Build 8 10327104 1D CTCCTGTACT C/- CCCCCTCTCC 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 C 6 5 353405 CASAVA_Build 8 10331000 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2213 hom 30 8 18 4 A 13 12 353406 CASAVA_Build 8 10333450 4D TTAATTAAAT TTAA/---- TTAATTTATT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TTAA 2 1 353407 CASAVA_Build 8 10334847 1I TAGATTTTGG -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 45 16 23 6 T 7 8 353408 CASAVA_Build 8 10352345 8D ATGAAATGAC ATTGGAAG/-------- ATTGGAAGCT 3070 hom 93 het 35 0 32 4 ATTGGAAG 2 1 353409 CASAVA_Build 8 10354295 1I TCTTTTACTT -/A ATGCATTATT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 1 2 353410 CASAVA_Build 8 10359894 1D TTTATTCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 4 hom 30 1 14 15 T 10 9 353411 CASAVA_Build 8 10372028 1I GTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 25 12 1 T 9 10 353412 CASAVA_Build 8 10377910 1D TTAATGACTT C/- CTTGGTGGCC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 C 2 1 353413 CASAVA_Build 8 10385666 5D CATTGTATAA TACTT/----- TACTTTATGC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TACTT 2 1 353414 CASAVA_Build 8 10389497 20D ATACAGACGC ATATACATACATAAGTATAT/-------------------- GTATACATGT 3070 het 3070 ref 32 16 19 3 ATATACATACATAAGTATAT 1 0 353415 CASAVA_Build 8 10390023 8D ACAAAGTATC TGAATGAA/-------- TGAATGAATG 3070 het 3070 hom 43 18 23 4 TGAA 5 3 353416 CASAVA_Build 8 10394277 3D GTTGCCCGGG GCC/--- AGAGCTGATC 3070 het 3070 hom 41 17 22 3 GCC 1 0 353417 CASAVA_Build 8 10394700 1I GACTCTGACA -/G GGGGTTACTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 G 4 5 353418 CASAVA_Build 8 10413384 1I GATCTCTACT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 8 9 353419 CASAVA_Build 8 10413548 1I AAATCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 8 9 A 11 12 353420 CASAVA_Build 8 10414237 2D TCCCCATCTC TT/-- CTCATTTACA 3070 het 3070 hom 24 8 10 7 T 2 0 353421 CASAVA_Build 8 10420245 18I TTTATCAGCA ------------------/ACATGAAAATGGACTAAT ACACTCAGGA 3070 het 3070 ref 34 17 13 5 ACATGAAAATGGACTAAT 0 1 353422 CASAVA_Build 8 10428227 1D AAAGGACGCC A/- AGGCTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 13 16 7 A 2 1 353423 CASAVA_Build 8 10431605 1I TACGAAGCCA -/C TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 C 0 1 353424 CASAVA_Build 8 10432500 1D TATTTCAAAA T/- TAACTGGAAG 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 T 2 1 353425 CASAVA_Build 8 10438648 2D TTTTGTGTGT TA/-- TGTTTTCACT 3070 het 3070 ref 40 20 17 4 TA 1 0 353426 CASAVA_Build 8 10440122 1I GCCCACACTA -/T TTTTTTTTTT 2402 het 858 hom 28 4 13 11 T 14 15 353427 CASAVA_Build 8 10443692 1D GGCTCCCGTG C/- CCCCCTCCAG 1897 het 1634 hom 19 6 7 6 C 6 5 353428 CASAVA_Build 8 10446235 4D TTAAAATGCC CTCA/---- CTCACTCATT 3070 het 3070 ref 38 17 17 6 CTCA 3 2 353429 CASAVA_Build 8 10457444 1D AAACGCAAAT C/- CCTGAATGCT 3070 het 3070 ref 34 18 11 6 C 3 2 353430 CASAVA_Build 8 10459269 1I AACAGGCTGG -/C CCCCCACCCC 3070 hom 44 het 17 0 13 4 C 5 6 353431 CASAVA_Build 8 10476352 1D CGAGGTCTTT C/- CCGGGGGGGA 1981 het 1981 ref 27 10 7 10 C 3 2 353432 CASAVA_Build 8 10478248 1I CTCCCCTCTG -/T CCCCTGAATA 3070 het 3070 hom 38 16 16 6 T 0 1 353433 CASAVA_Build 8 10478420 1D CTTACGTCCA C/- CCCCAACAGG 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 C 5 4 353434 CASAVA_Build 8 10494368 1D GGCATCCACC T/- GCCGAATGTC 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 T 1 0 353435 CASAVA_Build 8 10518417 17D CCTTCAGAGT CACCATGTCCCCAGAAC/----------------- CACCATGAAA 3070 het 3070 ref 58 29 29 8 CACCATGTCCCCAGAAC 1 0 353436 CASAVA_Build 8 10522569 1D TACGAGATAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 55 het 24 0 21 3 A 10 9 353437 CASAVA_Build 8 10524217 1D GGCCCTGCCT G/- GGGGCTACCC 3070 hom 63 het 29 0 16 14 G 5 4 353438 CASAVA_Build 8 10526123 2D ACCTGCAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 16 13 18 AC 10 9 353439 CASAVA_Build 8 10526297 2D ACATGCACAC AA/-- ACACACATGC 2544 het 2544 ref 43 26 9 8 A 3 1 353440 CASAVA_Build 8 10530221 2D ACCTTCTCTA AG/-- AGGGGACCCT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 AG 2 1 353441 CASAVA_Build 8 10540794 1D ACAAGCATGG C/- CCTGGCGGCT 3070 het 3070 ref 43 17 17 10 C 3 2 353442 CASAVA_Build 8 10548577 2D ACACACGCAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 62 26 20 18 AC 8 7 353443 CASAVA_Build 8 10551055 6D ACACAGTAGT GATCAG/------ CCAAAGTCCA 3070 het 3070 ref 59 28 27 9 GATCAG 1 0 353444 CASAVA_Build 8 10570008 5D TTGCACAACA GCCAG/----- GGTGTTTGCT 3070 hom 105 het 40 0 36 8 GCCAG 1 0 353445 CASAVA_Build 8 10602152 1I TTGATTTTCC -/T CTATATGTGC 2911 het 2911 ref 34 19 7 8 T 0 1 353446 CASAVA_Build 8 10602679 3D GGAGAAACCT AGG/--- CTAAGACACG 3070 het 3070 ref 37 22 11 6 AGG 1 0 353447 CASAVA_Build 8 10608106 7I TATGTGCCTG -------/GCATGAA GCAGGCCCCA 3070 het 3070 ref 41 22 13 6 GCATGAA 0 1 353448 CASAVA_Build 8 10614882 1I TTTCTTTCCG -/C CCCCCCCCCC 1612 het 1612 ref 29 7 6 16 C 10 11 353449 CASAVA_Build 8 10615177 1D TATATGTCCC T/- TTTAAGAATT 3070 het 3070 hom 34 15 16 5 T 4 3 353450 CASAVA_Build 8 10615390 1D6M2D TAGAGAAGAA GAGAAAGAA/-AGAAAG-- AGAAAAAGAA 1475 het 1475 ref 21 11 8 5 N/A 0 0 353451 CASAVA_Build 8 10615506 3D AAAAGAAAAA AGG/--- AAAAGAAAGA 1331 het 1331 ref 39 11 6 23 AGG 1 0 353452 CASAVA_Build 8 10615568 3I AGGAAGAAAT ---/AAA GAAATAAAGA 2006 het 2006 ref 29 11 6 12 A 0 3 353453 CASAVA_Build 8 10633596 1I TAAAAGATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 35 2 29 4 A 10 11 353454 CASAVA_Build 8 10634941 1I AAGGATGAGA -/T TTTTTTATAC 3070 het 3070 ref 44 19 22 3 T 6 7 353455 CASAVA_Build 8 10639220 1D CTTCCAACTT G/- TTTTTTAGAT 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 G 1 0 353456 CASAVA_Build 8 10643630 5I AGCTAGGGAC -----/TACAG TACAGACATG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TACAG 1 2 353457 CASAVA_Build 8 10667848 1D TTTTTAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1835 hom 36 9 20 7 T 15 14 353458 CASAVA_Build 8 10674379 3D GACTGAAAAC ATA/--- ATAATTTAAC 3070 het 3070 hom 34 13 20 2 ATA 2 1 353459 CASAVA_Build 8 10676684 1D ACCCTCAAAG A/- AAAACAGTGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 5 4 353460 CASAVA_Build 8 10677341 1I TATACTCGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 30 1 23 6 A 11 12 353461 CASAVA_Build 8 10677706 1D AAATGGAAAA T/- TTGATCACCA 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 T 3 2 353462 CASAVA_Build 8 10690795 1D TCCCATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 9 21 6 T 11 10 353463 CASAVA_Build 8 10694034 1D AAACACAGTA T/- TTAAAAAAAG 3070 het 1071 hom 27 4 16 7 T 3 2 353464 CASAVA_Build 8 10694062 1I AGTTTGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2029 hom 32 5 15 12 T 10 11 353465 CASAVA_Build 8 10701336 4D TTGTGTTTTC TGTT/---- TGTGTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 TGTT 1 0 353466 CASAVA_Build 8 10711761 1D ACACAGATTT A/- AAAGCCCACG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 A 4 3 353467 CASAVA_Build 8 10712851 1D GGGAGGAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 9 8 353468 CASAVA_Build 8 10717183 1D CTTATAAACA C/- CAGGAAATTA 3070 het 3070 ref 49 26 17 7 C 2 1 353469 CASAVA_Build 8 10718216 1D CCAAACTCTC A/- AAAGGATTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 4 3 353470 CASAVA_Build 8 10724611 1I TCTTACATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 T 11 12 353471 CASAVA_Build 8 10727954 3D ACTGATACTC AGA/--- AGCAGAGCAC 3070 het 3070 ref 49 26 18 6 AGA 1 0 353472 CASAVA_Build 8 10729773 2D CATGCACAAC TT/-- TGTGTATTTT 3070 het 3070 ref 52 26 21 7 T 3 1 353473 CASAVA_Build 8 10731867 8D GAGCTGTTCC AATTGGAT/-------- CACCTTTTAC 3070 het 3070 ref 57 35 17 7 AATTGGAT 1 0 353474 CASAVA_Build 8 10737832 13I GGACACCAAG -------------/TGGTACCAATGGT TTGATCATTC 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 TGGTACCAATGGT 0 1 353475 CASAVA_Build 8 10737972 2D TTCCTAATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 50 0 31 19 T 17 15 353476 CASAVA_Build 8 10739114 3D CAAGGATGAT AAC/--- AGCCCCTCCC 3070 het 3070 hom 28 13 13 4 AAC 1 0 353477 CASAVA_Build 8 10739709 1I ACTGCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 10 11 353478 CASAVA_Build 8 10761284 1I TTTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 2551 het 1933 hom 19 7 9 3 T 13 14 353479 CASAVA_Build 8 10764835 1I AAGGATCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 A 10 11 353480 CASAVA_Build 8 10777695 1D ATGCATTACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 14 13 353481 CASAVA_Build 8 10784374 1D ATGTGCCTCT C/- CTTTCTTTAG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 2 1 353482 CASAVA_Build 8 10791686 1D CTTTGTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 11 10 353483 CASAVA_Build 8 10804120 2I CTGAGCTCTG --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 TC 7 8 353484 CASAVA_Build 8 10805221 1I AAATAGACAG -/T GAACTTGGCT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 0 1 353485 CASAVA_Build 8 10806260 2D TATATATATA TG/-- TGTGTGTGTG 2463 hom 34 het 15 0 12 3 TG 8 7 353486 CASAVA_Build 8 10809100 1D CCCCACCCAG C/- CCACTGCCGT 3070 hom 24 het 19 0 12 7 C 3 2 353487 CASAVA_Build 8 10809666 8I GGGAAATCTC --------/ACAGAAGA ACAGCTCCCT 3070 hom 63 het 25 0 20 5 ACAGAAGA 0 1 353488 CASAVA_Build 8 10810267 3I CGTTGTCAGA ---/GCC GCCCCCATGA 3070 hom 80 het 35 0 23 12 GCC 1 2 353489 CASAVA_Build 8 10810428 1D CTCCTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 35 3 24 8 T 11 10 353490 CASAVA_Build 8 10819846 1I GACTCAGCAT -/C CCCCCCAACT 2760 het 1287 hom 22 7 10 5 C 6 7 353491 CASAVA_Build 8 10826755 1D ATAAAAAAAA C/- AAAAAAGATA 3070 het 643 hom 29 3 22 4 C 1 0 353492 CASAVA_Build 8 10838645 14D CAAGAGGTTG TGGATGCCAGGGGT/-------------- TCATACCCAG 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 TGGATGCCAGGGGT 1 0 353493 CASAVA_Build 8 10849744 1D TTTTGACTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 9 8 353494 CASAVA_Build 8 10851253 2I CCCCGGGATG --/GA TGGTGGGGGT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 GA 0 1 353495 CASAVA_Build 8 10858467 1D AGACCCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2449 hom 35 11 15 9 T 13 12 353496 CASAVA_Build 8 10898079 6D TGAGCCTTGA AATAAT/------ AGAGTACGTA 3070 het 3070 ref 61 31 24 9 AAT 2 0 353497 CASAVA_Build 8 10910116 1I TGAGCTGCAC -/T TTTTTTTTTT 597 het 597 ref 36 22 3 11 T 15 16 353498 CASAVA_Build 8 10945297 2I CTCATCAGTG --/TA TAAAATAAGG 3070 het 3070 hom 46 20 19 7 TA 1 2 353499 CASAVA_Build 8 10959372 1I GGGAAGAAAG -/C CCCCAACATC 3070 het 3070 hom 58 20 26 12 C 4 5 353500 CASAVA_Build 8 10964645 4D TTCAGGGGTC AGTA/---- AAGATTTCTT 3070 het 3070 hom 45 21 22 4 AGTA 1 0 353501 CASAVA_Build 8 10966789 1I TCACAGGGAA -/T TCACTCTTCC 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 T 1 2 353502 CASAVA_Build 8 10975514 1I TCTGGGCAGG -/C CCCCCAGGTG 3070 hom 110 het 45 0 26 19 C 5 6 353503 CASAVA_Build 8 10980389 2D TGTATGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 1193 het 1193 ref 56 48 3 7 TG 7 6 353504 CASAVA_Build 8 10983178 1I AGCCCTTCCC -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 7 8 353505 CASAVA_Build 8 10985326 1D TTTTTAATGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 21 10 T 12 11 353506 CASAVA_Build 8 10985692 1D TTATAAATTC T/- GAACACCAAT 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 1 0 353507 CASAVA_Build 8 10985833 1I ACTTGCAATC -/A ACCCCATTTG 3070 het 3070 ref 32 24 8 0 A 1 2 353508 CASAVA_Build 8 10988586 1I AAAACTAGTG -/T AATAACTACT 3070 het 3070 hom 21 8 10 3 T 0 1 353509 CASAVA_Build 8 10992393 2D CAATATTTTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 2656 hom 28 12 13 3 T 11 9 353510 CASAVA_Build 8 10992794 1D AATTCTACAG T/- TTTTTTTTTT 2432 het 2432 ref 19 10 6 3 T 11 10 353511 CASAVA_Build 8 11001232 1D ACTGGCATCT G/- GGGGTCATAC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 G 5 4 353512 CASAVA_Build 8 11010560 1I ATACGTTACC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 7 8 353513 CASAVA_Build 8 11013169 1D AAGCTGGTTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 8 7 353514 CASAVA_Build 8 11037257 1I AGAAAGCTAT -/A AAGGGCTTGT 3070 het 3070 ref 63 33 24 6 A 2 3 353515 CASAVA_Build 8 11040195 1D TGCAAAATCC A/- AAAACACTTC 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 A 5 4 353516 CASAVA_Build 8 11061210 1I CATTTCAGGA -/T TGCGTGTTCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 1 2 353517 CASAVA_Build 8 11064902 2I AGACATACAT --/AA AACAAAATTT 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 2 4 353518 CASAVA_Build 8 11072482 15D ACTTAAGGTG AGGTCATAATGGAAT/--------------- AGGCAAGGCC 3070 het 3070 ref 44 28 13 6 AGGTCATAATGGAAT 1 0 353519 CASAVA_Build 8 11091898 2D CAGATTTTGT AG/-- AGAGCTGCAT 3070 het 3070 ref 43 21 19 4 AG 3 2 353520 CASAVA_Build 8 11093317 5D TGTCTTTTAA TAAGT/----- TAACTTTAGG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TAAGT 1 0 353521 CASAVA_Build 8 11093436 1D TTAAGATCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 20 7 4 A 12 11 353522 CASAVA_Build 8 11097628 1D TTTTACAGTT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 A 8 7 353523 CASAVA_Build 8 11109681 1D CCTGAAAACC T/- TTAAGCGCCC 3070 het 3070 ref 46 24 22 0 T 3 2 353524 CASAVA_Build 8 11111776 2I ATTTACTGAC --/TA TTTACATAAA 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 TA 0 1 353525 CASAVA_Build 8 11128618 4D AAGTTTTAAT AGTC/---- AGAGGCAGCA 3070 het 3070 hom 41 13 19 12 AGTC 1 0 353526 CASAVA_Build 8 11129943 1I CATATGAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 46 0 37 9 A 10 11 353527 CASAVA_Build 8 11150441 1D CAAAAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 70 het 36 0 32 5 A 9 8 353528 CASAVA_Build 8 11153148 3D TCAATTGATA AAT/--- AATAATTACA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 AAT 3 2 353529 CASAVA_Build 8 11158329 2D CGTTTTTTGG AA/-- AAGTTTGTGA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 4 2 353530 CASAVA_Build 8 11161928 1D AAAGGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1257 hom 36 3 19 15 T 15 14 353531 CASAVA_Build 8 11163321 1I ATAGCTAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 T 10 11 353532 CASAVA_Build 8 11172661 1D31M1I GTGTTAGTTT GCCAGGGCTGCCATAATAAAGTATCAAAGCCT-/-CCAGGGCTGCCATAATAAAGTATCAAAGCCTG GGTGGTTTAA 3070 hom 69 het 28 0 23 6 N/A 0 0 353533 CASAVA_Build 8 11172772 1I CGGTTGAGTT -/C TCCTGAACCC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 C 0 1 353534 CASAVA_Build 8 11173639 2D GAGAGAGAGA AG/-- GAAAGAAAGA 3070 het 1430 hom 41 13 18 10 AG 1 0 353535 CASAVA_Build 8 11184406 1D TTATACCTGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 10 9 353536 CASAVA_Build 8 11268273 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 122 hom 28 1 21 7 A 14 13 353537 CASAVA_Build 8 11276708 2I CCAGATCAAG --/AT ATATAGAGTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 2 3 353538 CASAVA_Build 8 11277353 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 33 0 26 7 T 11 12 353539 CASAVA_Build 8 11279346 1D AAGTATTCAG T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 8 7 353540 CASAVA_Build 8 11281604 1D ATAATCACTG T/- ATAGTTAGAT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 T 1 0 353541 CASAVA_Build 8 11293504 1D AATGCAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 35 1 31 3 T 12 11 353542 CASAVA_Build 8 11305920 1I TGGGCACAGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 51 het 19 0 17 3 G 1 2 353543 CASAVA_Build 8 11306034 1D CTGAAAATTC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 9 8 353544 CASAVA_Build 8 11311175 4D TGTCTCAAAA AAAC/---- AAACAAAAAG 1290 het 1290 ref 12 8 3 3 AAAC 2 1 353545 CASAVA_Build 8 11311336 14D ATTTTTAAAA AATTGATGTATAAT/-------------- AATTGTACAT 3070 het 3070 hom 20 12 10 3 AATTGATGTATAAT 1 0 353546 CASAVA_Build 8 11311424 2I AGGGTAATTA --/GC ATATCCATCA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 GC 0 1 353547 CASAVA_Build 8 11313264 1D CCAGAGCTGC A/- AGTGCTGTGG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 A 2 1 353548 CASAVA_Build 8 11316796 1I TGACTCATAG -/A ACCCACAGAG 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 1 2 353549 CASAVA_Build 8 11320588 1I CTTTGTTATA -/C CCCCCCCTTG 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 C 7 8 353550 CASAVA_Build 8 11323040 1D CCTATGGTTT A/- AGATTTGAGC 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 A 2 1 353551 CASAVA_Build 8 11334592 1I AAACTAGAAG -/A AAAAATATCA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 A 5 6 353552 CASAVA_Build 8 11340741 1I GGTGTGTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 A 11 12 353553 CASAVA_Build 8 11346316 1D CTACTTGGAG A/- TGGGGTTTCT 2457 het 2457 ref 35 17 9 10 A 1 0 353554 CASAVA_Build 8 11350059 2I GTGTGTGTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 48 15 15 18 GT 7 8 353555 CASAVA_Build 8 11353003 3I TCTCCCCAGC ---/AGA AGACCTCCCA 3070 hom 156 het 58 0 50 8 AGA 1 2 353556 CASAVA_Build 8 11361697 1I CGGAAAGGAC -/T TTTTTTTTTC 1849 hom 27 het 10 0 7 3 T 9 10 353557 CASAVA_Build 8 11363514 8D GCTGGCTGTT TCTGACCA/-------- CAGCCCCGGT 3070 het 3070 ref 42 21 18 5 TCTGACCA 1 0 353558 CASAVA_Build 8 11364408 1D GATTCCTTAC A/- GAGAAGTTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 0 353559 CASAVA_Build 8 11373412 1D GGTATTTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 13 12 2 T 10 9 353560 CASAVA_Build 8 11374083 1I GAGCATGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 42 1 28 13 T 13 14 353561 CASAVA_Build 8 11380054 1I CTGAGTCCCT -/C TGAGTCCCTC 3070 hom 115 het 42 0 37 5 C 0 1 353562 CASAVA_Build 8 11385463 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 6 7 353563 CASAVA_Build 8 11386040 1I ACCCATAAAA -/C TGCAGATTCT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 C 0 1 353564 CASAVA_Build 8 11390237 2I TTGCAGTAAC --/AG AGAAGAAATT 3070 hom 107 het 45 0 36 9 AG 1 2 353565 CASAVA_Build 8 11396274 1D ACTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 28 2 15 11 T 14 13 353566 CASAVA_Build 8 11406360 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 24 1 22 1 A 10 11 353567 CASAVA_Build 8 11417974 2I CATTATTTTC --/TG TGTTTTTTTA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 TG 1 2 353568 CASAVA_Build 8 11418758 1D GACAGAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 14 13 353569 CASAVA_Build 8 11420410 1D CAATTTACTC T/- TTTCATGTAA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 4 3 353570 CASAVA_Build 8 11425592 3D AAAAGTTGTA AAT/--- AGCTCAGTAG 2436 het 2436 ref 23 10 5 11 AAT 1 0 353571 CASAVA_Build 8 11425649 1D AATCAGCAAC A/- ATTTTAAGTG 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 2 1 353572 CASAVA_Build 8 11428021 1I AGTATTCATG -/T TTTTATGTGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 4 5 353573 CASAVA_Build 8 11436109 1D CACCTTAGCC T/- TGGGAGGCAG 3070 hom 87 het 33 0 28 5 T 2 1 353574 CASAVA_Build 8 11450881 1D CTGCCCCCTT C/- CCCCCCCCGC 2542 het 218 hom 17 2 8 7 C 9 8 353575 CASAVA_Build 8 11454246 2D77M2D AACACAGACT CACACACACACGGACAAACACAAACACATACACAGACTCACACAGACACGCAAACTCACACACAGACAGACACACACACAG/--CACACACACGGACAAACACAAACACATACACAGACTCACACAGACATGCAAACTCACACACAGACAGACACACACAC-- ACACACAGAC 3070 het 2056 hom 53 22 45 33 N/A 0 0 353576 CASAVA_Build 8 11460683 1D AAGGAGGTCT G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 49 het 24 0 13 13 G 9 8 353577 CASAVA_Build 8 11468520 2D CCTTAGAAAC AG/-- AGGATAGCAT 3070 hom 123 het 44 0 40 5 AG 2 1 353578 CASAVA_Build 8 11468968 2D GTTGACGCAT AC/-- ACACACTGAT 3070 hom 117 het 47 0 40 8 AC 4 3 353579 CASAVA_Build 8 11471825 7I AGAAGTCTCC -------/TCGGTTT TCAGAGACTG 3070 hom 111 het 41 0 37 4 TCGGTTT 0 1 353580 CASAVA_Build 8 11472701 4I GGGGTAGGGG ----/TGGC TGGCTGATCC 3070 hom 86 het 34 0 27 7 TGGC 1 2 353581 CASAVA_Build 8 11476275 1I TCATTTATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 8 9 353582 CASAVA_Build 8 11484061 3D TCCATAATGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 16 13 353583 CASAVA_Build 8 11495311 1D GGGAGCCCCC A/- ATGGCCAGCC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 A 2 1 353584 CASAVA_Build 8 11496511 1D TATTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1973 hom 37 8 16 13 T 13 12 353585 CASAVA_Build 8 11504163 6D CATCAGTAGC AATATT/------ AAAGTGCAGC 3070 het 3070 ref 43 24 17 6 AATATT 1 0 353586 CASAVA_Build 8 11506486 2I TTTGGGTATG --/TA TATATATATA 3070 hom 7 het 38 1 31 6 TA 6 7 353587 CASAVA_Build 8 11517455 9I ATCACACCAA ---------/GTTCTCCCT GTTCTCCCCA 3070 het 3070 hom 50 17 23 10 GTTCTCCCT 0 1 353588 CASAVA_Build 8 11537266 1I TTTCCGAGCA -/T GAACCCAGGC 3070 het 3070 hom 40 12 21 7 T 0 1 353589 CASAVA_Build 8 11551127 1D TAGAGCCTTG T/- TCATTGGTGA 3070 hom 63 het 25 0 21 5 T 2 1 353590 CASAVA_Build 8 11555124 1D CATTTCATTG C/- GGGGCTTGGG 3070 het 3070 hom 55 25 22 9 C 1 0 353591 CASAVA_Build 8 11557220 1D ATAGCAGAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 A 10 9 353592 CASAVA_Build 8 11577523 1D TTTAACTCTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 8 353593 CASAVA_Build 8 11591349 1D TAGTGTTGCT G/- GGGTGTTTGT 3070 hom 138 het 49 0 46 3 G 4 3 353594 CASAVA_Build 8 11624865 3I TGTTTTTGAG ---/AGA AGAAGGTCTT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 AGA 1 2 353595 CASAVA_Build 8 11635658 1I TCCTTTTCCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 10 9 T 11 12 353596 CASAVA_Build 8 11645866 1D CCCTGTCTCC A/- AAAAAATAAA 3070 hom 50 het 21 0 17 4 A 7 6 353597 CASAVA_Build 8 11648415 1I ACTGCAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 11 12 353598 CASAVA_Build 8 11651673 1D GAGATGAGAT A/- GGGGGAAGAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 A 1 0 353599 CASAVA_Build 8 11661874 1D CGAGACTGTC A/- AAAAAAAAGA 2417 hom 18 het 7 0 6 2 A 9 8 353600 CASAVA_Build 8 11662491 2D GGGAGGATCA CC/-- TAGGTTAGGA 3070 het 3070 hom 28 9 14 6 C 2 0 353601 CASAVA_Build 8 11667121 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2506 hom 24 7 12 5 A 8 9 353602 CASAVA_Build 8 11670237 3D TACCCTCTGA AGC/--- AGCAGCCTGG 3070 het 3070 ref 22 12 9 3 AGC 3 2 353603 CASAVA_Build 8 11683864 2D CAAAAAAAAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 40 14 16 11 GT 8 7 353604 CASAVA_Build 8 11686818 3D AAAATAAATC TCT/--- TCTTGTCATT 3070 hom 45 het 17 0 16 2 TCT 2 1 353605 CASAVA_Build 8 11690488 2I GGGCTGCCTT --/TA AAAAAAAACG 3070 hom 34 het 21 0 12 9 TA 0 1 353606 CASAVA_Build 8 11693376 3I GGCTTAAACC ---/TTT AAGATGGAGC 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 0 3 353607 CASAVA_Build 8 11700009 1I AATTTTTAAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 T 7 8 353608 CASAVA_Build 8 11714379 4D TTGGTTCCAT TCTG/---- TCTATCACTT 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 TCTG 1 0 353609 CASAVA_Build 8 11715400 8D CAGTAGGCCT TGCTGAGC/-------- TGCGGTGGGC 3070 het 3070 hom 36 14 15 8 TGCTGAGC 1 0 353610 CASAVA_Build 8 11719146 1I TAAGTTAACT -/A AATAGACAAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 A 2 3 353611 CASAVA_Build 8 11719525 1I TTTTTTTTTT -/C CTCACATGGG 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 C 1 2 353612 CASAVA_Build 8 11724065 3D TCACCAGCAC TTG/--- TTGTTATCTC 3070 het 3070 hom 40 14 17 10 TTG 2 1 353613 CASAVA_Build 8 11731071 1I ACACCATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 833 hom 28 3 16 9 A 15 16 353614 CASAVA_Build 8 11746094 1D CACCTTTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2622 hom 37 11 14 12 T 10 9 353615 CASAVA_Build 8 11748523 1D CGGAGAACTC T/- TAAGGAGCTG 2691 het 2691 ref 27 12 9 8 T 2 1 353616 CASAVA_Build 8 11749512 16I CCTCCCAGGT ----------------/TCAAACAATTCTTGTG TCTTAGCCTC 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 TCAAACAATTCTTGTG 0 1 353617 CASAVA_Build 8 11750944 2I ACTCTGCCTC --/AA AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 5 7 353618 CASAVA_Build 8 11754907 1D GGAAAATTGC T/- TGAACCCAGG 1686 het 1686 ref 13 6 5 2 T 2 1 353619 CASAVA_Build 8 11759822 2I CAGAGTGAAA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 2610 hom 35 8 19 8 CT 1 2 353620 CASAVA_Build 8 11761939 1I CAGTGGGTTT -/G GGGGGGTCTC 3070 het 3070 hom 33 16 12 5 G 6 7 353621 CASAVA_Build 8 11773193 1D TGCTTGATCC G/- GCTATAAAAT 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 G 2 1 353622 CASAVA_Build 8 11779621 2D ACTGGAAGAC AG/-- GGGGATTTCT 3070 het 3070 ref 49 23 16 12 AG 1 0 353623 CASAVA_Build 8 11785381 1D GGAGTTTCCC T/- GCACAAATTC 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 T 1 0 353624 CASAVA_Build 8 11787761 1I AGCTGGGATT -/A AAGGTGTGTG 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 A 2 3 353625 CASAVA_Build 8 11793649 1I ATTTTCTTTT -/C TTTTTTTTTT 2773 het 1022 hom 33 9 16 8 C 0 1 353626 CASAVA_Build 8 11794080 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1586 hom 21 8 8 6 T 10 9 353627 CASAVA_Build 8 11804575 1D TTTCTTTCCC G/- GGGCCCCCCT 3070 het 2088 hom 25 9 14 2 G 4 3 353628 CASAVA_Build 8 11811920 9I GAGAGGGTGG ---------/TGATATTAC TGATATTACT 978 het 306 hom 11 3 4 4 TGATATTAC 1 2 353629 CASAVA_Build 8 11815217 1D AAAGACCGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2018 hom 26 7 11 8 A 12 11 353630 CASAVA_Build 8 11815705 1D CTAGAAAAGA G/- GGTTGAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 G 3 2 353631 CASAVA_Build 8 11816110 3I TACAAATTCC ---/CTT GATTTAGAAC 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 CTT 0 1 353632 CASAVA_Build 8 11827704 1D CCAGGGAGGC G/- CAGGATGACA 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 G 1 0 353633 CASAVA_Build 8 11840385 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 33 het 14 0 12 3 A 9 8 353634 CASAVA_Build 8 11843773 4D CTCCTTCCTG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 CT 8 6 353635 CASAVA_Build 8 11846036 9D CTAGAAGGAA GAGAGGGAG/--------- GAGAGGGAGG 3070 het 3070 hom 36 11 13 17 GAGAGGGAG 3 2 353636 CASAVA_Build 8 11846533 4D ACCAAGCCAC CACG/---- CACGCCCGGC 3070 hom 40 het 16 0 11 5 CACG 2 1 353637 CASAVA_Build 8 11854693 1D CAAAAAATAA T/- TTTAAAAGGC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 T 4 3 353638 CASAVA_Build 8 11855042 4D TTATAGCAGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2787 het 717 hom 28 5 9 16 T 18 14 353639 CASAVA_Build 8 11867373 1D TCCTTCCCTG T/- TTTTTTTTTT 2063 het 1697 hom 37 12 9 17 T 17 16 353640 CASAVA_Build 8 11894536 1I CAATTCGTGA -/T TTTTACTTAA 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 T 4 5 353641 CASAVA_Build 8 11899128 1D GTGAAATGAG A/- AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 7 6 353642 CASAVA_Build 8 11901188 1I TATTCTGTTC -/T TTTTACTTCT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 T 4 5 353643 CASAVA_Build 8 11902762 1D TACGATGAAA T/- TTTTTTTTAC 2580 het 2580 ref 39 28 6 5 T 9 8 353644 CASAVA_Build 8 11906359 1I TACACAGGAT -/G GCCCCCCCCC 1348 het 1348 ref 31 17 5 9 G 1 2 353645 CASAVA_Build 8 11916267 1D GTTTCCTCAG T/- GTGAGTTATT 2866 het 486 hom 7 1 6 0 T 1 0 353646 CASAVA_Build 8 11920051 1D TATATATATG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 676 hom 12 2 7 3 T 10 9 353647 CASAVA_Build 8 11921461 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTC 1621 hom 12 het 8 0 5 3 T 9 10 353648 CASAVA_Build 8 11923131 1D GAGCTGGGGG A/- TGGTCAGTTC 2938 het 2938 ref 24 12 8 4 A 1 0 353649 CASAVA_Build 8 11923612 1D GGAGAACAGG T/- TCAACTGTCC 3070 hom 42 het 16 0 12 4 T 2 1 353650 CASAVA_Build 8 11926042 4D GGCTCCAAAG CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 CAAA 3 2 353651 CASAVA_Build 8 11935033 1D TAGTGACACC T/- GACTCCGGAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 T 1 0 353652 CASAVA_Build 8 11942169 1D ATACTAGGAA G/- AACTTTGGAA 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 G 1 0 353653 CASAVA_Build 8 11955534 1I CCTACTCCCA -/G GGACATGGGC 2831 hom 23 het 10 0 8 2 G 2 3 353654 CASAVA_Build 8 11970867 1I TAGAAAACTA -/C AATTTTTGGA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 C 0 1 353655 CASAVA_Build 8 11975464 3D GCTAGAGGAG CAA/--- CAACAAACAA 3070 het 483 hom 9 1 7 1 CAA 3 2 353656 CASAVA_Build 8 12037578 1D TGTTTTTTTT G/- TTGTTGTTGT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 1 0 353657 CASAVA_Build 8 12041857 1I ATAATAATAC -/T AACCCTGTGG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 0 1 353658 CASAVA_Build 8 12051165 1I ATAATTTATT -/A TAAGCCTGGA 1452 hom 7 het 3 0 3 0 A 0 1 353659 CASAVA_Build 8 12051285 1D AGCTCTGCAG C/- TCTCCTATAG 2721 hom 15 het 7 0 6 1 C 1 0 353660 CASAVA_Build 8 12092594 5D AAAATTTCCA CTTTC/----- CTTAGGCTGT 3070 het 3070 ref 32 22 8 2 CTTTC 1 0 353661 CASAVA_Build 8 12228229 1I GGACTTAATA -/G ACATCTACAG 3070 het 3070 ref 31 20 11 0 G 0 1 353662 CASAVA_Build 8 12260698 2I CAAAGGAGAA --/CT CTCTCATTCT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 CT 2 3 353663 CASAVA_Build 8 12264649 1I TCACTATGCA -/T TTTTTTTTTT 2710 hom 24 het 15 0 9 6 T 10 11 353664 CASAVA_Build 8 12285495 7I TGACATAAGA -------/TCATTCT TTCAGCGACT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TCATTCT 0 1 353665 CASAVA_Build 8 12292741 1I TAAAATTAAA -/G AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 40 26 10 4 G 0 1 353666 CASAVA_Build 8 12295891 1I TATCTATATA -/T TTTTTTTCTT 1337 het 1337 ref 10 6 3 1 T 7 8 353667 CASAVA_Build 8 12300580 1D AGCTCTGCAG C/- TCTCCTATAG 1839 het 1839 ref 13 8 4 1 C 1 0 353668 CASAVA_Build 8 12303705 1I AAATTAAAAC -/A AAAAAACCAT 1458 het 982 hom 8 2 3 3 A 6 7 353669 CASAVA_Build 8 12332049 3D CGAGACATGC TGT/--- TGTTGTTGAA 2048 het 840 hom 7 2 5 0 TGT 3 2 353670 CASAVA_Build 8 12336046 1I CAGGAACATT -/A AAACACGCAA 3043 het 3043 ref 26 18 7 1 A 3 4 353671 CASAVA_Build 8 12350888 1I TGCATGTGTG -/T TTTTTATATA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 T 5 6 353672 CASAVA_Build 8 12354401 1D ACTTAGCTCC T/- TTCCTGCCAT 3070 het 3070 ref 98 69 13 16 T 3 2 353673 CASAVA_Build 8 12354905 1I TCTTTCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2195 hom 52 7 16 29 T 14 15 353674 CASAVA_Build 8 12358300 3D47M2I CCTATCCACT TACTGTTTAGATTTTGTGATTTAGAAATGAATTAAGGGCAGGCATGGTGG--/---TGTTTAGATTTCGTGATTTAGAAATGAATTAAGGGCATGCATGGTGGCT CACACCTGTA 3070 het 3070 ref 104 112 11 10 N/A 0 0 353675 CASAVA_Build 8 12360435 4D GATGCATCTC TCAT/---- TTAATCCTTC 2823 het 2823 ref 97 77 7 16 TCAT 1 0 353676 CASAVA_Build 8 12360483 1I TCACCATCAT -/C CCTATTTCAC 1421 het 1421 ref 86 63 4 19 C 2 3 353677 CASAVA_Build 8 12362835 1I GGTTAATAGT -/A TAATATGGCT 2765 het 2765 ref 92 83 7 2 A 0 1 353678 CASAVA_Build 8 12365511 5D TGGGGCTAAG TGATC/----- TATTCTATTT 2418 het 2418 ref 22 16 5 1 TGATC 1 0 353679 CASAVA_Build 8 12367121 1I GAGTCAATTA -/C CCCAGTATGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 3 4 353680 CASAVA_Build 8 12367219 2D CCTGTAGGAA TC/-- TTTTGCAGGG 2006 het 2006 ref 27 18 5 4 TC 1 0 353681 CASAVA_Build 8 12370519 1I TCTTGCCTAC -/A AAGTCAGTCC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 A 2 3 353682 CASAVA_Build 8 12375119 6I CAACCCCTCT ------/GAGAGA GAGAGAGGCT 3070 hom 4 het 25 1 14 10 GA 3 6 353683 CASAVA_Build 8 12381693 1I GCCTGGCTCA -/T TTTTTTTTTT 1581 het 553 hom 14 2 6 6 T 13 14 353684 CASAVA_Build 8 12383282 5D GCAGATGTAA TTAAG/----- TTAAGGATCT 3070 het 3070 ref 48 35 7 9 TTAAG 2 1 353685 CASAVA_Build 8 12397723 2D CCTAGAGAAA AG/-- AGAGAGTAGA 1938 het 1938 ref 45 31 5 9 AG 4 3 353686 CASAVA_Build 8 12398587 1D GAAGGGAGAT A/- GGGGTGGGGC 1744 het 1744 ref 12 8 4 0 A 1 0 353687 CASAVA_Build 8 12402940 1I GGGAGGGTGA -/G GGGGTCATTC 2484 het 2484 ref 25 13 6 6 G 4 5 353688 CASAVA_Build 8 12403018 1D ATAGTACTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 25 11 9 5 T 10 9 353689 CASAVA_Build 8 12434220 1I CAAAAATTTG -/T TTTTTTTTTT 1631 het 1631 ref 31 25 4 2 T 11 12 353690 CASAVA_Build 8 12440025 2I TTAAATACTT --/TG TGTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 TG 1 2 353691 CASAVA_Build 8 12441613 1D AATAAAATGG A/- AAAACTAATC 3070 het 3070 ref 91 76 11 4 A 5 4 353692 CASAVA_Build 8 12450745 1D GCTTCTCTTT C/- AGAGCAATTC 3070 het 3070 ref 95 71 13 12 C 1 0 353693 CASAVA_Build 8 12453023 1I TTTTAACCAA -/T TTTTAATAGC 1074 het 1074 ref 89 75 3 11 T 4 5 353694 CASAVA_Build 8 12454500 1D CATGGTGAAA C/- CCCGTCTCTA 3070 het 2444 hom 23 6 15 4 C 4 3 353695 CASAVA_Build 8 12454957 1I CATAACATCT -/C CAAAGAAGCA 2001 het 2001 ref 95 81 5 9 C 1 2 353696 CASAVA_Build 8 12455691 1I AAAAAAAAAA -/T AATAATAAAA 3070 het 3070 hom 58 24 27 7 T 0 1 353697 CASAVA_Build 8 12455900 1I CTCCATTGCT -/A AAAAAAAAAA 1392 het 1392 ref 46 26 4 16 A 11 12 353698 CASAVA_Build 8 12463653 2D CAAAAAACTA AG/-- AACAAATCTA 3070 het 3070 ref 87 60 16 13 AG 1 0 353699 CASAVA_Build 8 12463862 1I ATTTAGCCAT -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 80 19 53 8 A 6 7 353700 CASAVA_Build 8 12464457 6D TTAGCTCCCA TGTTCT/------ CCCACGAGTG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TGTTCT 1 0 353701 CASAVA_Build 8 12466043 1D AATGAATTTT G/- GCATTTTTTT 1209 het 1209 ref 56 26 5 25 G 2 1 353702 CASAVA_Build 8 12467503 28D TGAGACTGGG GAGAGAGACAGTGTAAAAGAGAGAGAGA/---------------------------- GAGAGAGACC 3070 het 3070 ref 54 41 13 23 GAGAGAGACAGTGTAAAAGAGAGAGAGA 1 0 353703 CASAVA_Build 8 12471067 1I GATATAGACC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 77 53 9 15 A 9 10 353704 CASAVA_Build 8 12471754 4I ACTGAGTCAG ----/AATC AATCACCAGA 2123 het 2123 ref 69 43 7 19 AATC 1 2 353705 CASAVA_Build 8 12476649 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAACT 1069 het 200 hom 36 3 3 31 AC 1 0 353706 CASAVA_Build 8 12477231 1I TTTCAAGTGA -/T TTTTTTCTTC 2181 het 2181 ref 42 31 6 5 T 6 7 353707 CASAVA_Build 8 12477688 4D AAATTATGTT CTTG/---- CTGACAGTTT 3070 het 3070 ref 65 54 7 6 CTTG 1 0 353708 CASAVA_Build 8 12478107 1I AGTAAAAATA -/T TTTTTTTAAT 3063 het 3063 ref 51 38 8 5 T 7 8 353709 CASAVA_Build 8 12481855 2I TGAGCTCTTT --/AA AAAAAAAAGT 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 8 10 353710 CASAVA_Build 8 12483208 1D TCACATACAC T/- TTTTTTTTTT 1938 het 1234 hom 36 7 7 22 T 11 10 353711 CASAVA_Build 8 12486478 1I TTAACTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 11 12 T 10 11 353712 CASAVA_Build 8 12492432 1D CATTATTGCA T/- TTTTACTTTT 3070 het 3070 ref 82 50 20 14 T 5 4 353713 CASAVA_Build 8 12493397 1D GCCCGACTAA C/- TTTTGTATTT 3070 het 3070 ref 67 51 8 8 C 1 0 353714 CASAVA_Build 8 12493867 3I GAAGCCAAGG ---/AAA CCAGGGCACC 3070 hom 114 het 43 0 36 7 A 0 3 353715 CASAVA_Build 8 12496067 1D TTTGAGACAA C/- ATGGATGAGC 2889 het 2889 ref 68 57 7 4 C 1 0 353716 CASAVA_Build 8 12496458 4I TCTCAAAAAA ----/AAAG AAGAAAAAAA 2058 het 520 hom 49 6 8 35 AAAG 0 1 353717 CASAVA_Build 8 12503689 3D ATGATTTGGA GGT/--- GGTGGGAAAC 728 het 728 ref 55 36 3 16 GGT 2 1 353718 CASAVA_Build 8 12511899 1I AAGATAAGAG -/A CACCAACAGT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 A 0 1 353719 CASAVA_Build 8 12514035 1D CATAACATCT C/- CAAAGAAGCA 3070 het 3070 ref 51 42 8 1 C 2 1 353720 CASAVA_Build 8 12514369 1I AAGACTAGTC -/T TTTAAAATAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 3 4 353721 CASAVA_Build 8 12515175 5D ACACACAAAG AAGAA/----- AAGATTCAAA 3070 het 3070 ref 35 22 9 9 AAGAA 1 0 353722 CASAVA_Build 8 12521727 3D TGTATATTGT TGG/--- TGGGAATGTA 3070 het 2645 hom 20 7 11 3 TGG 2 1 353723 CASAVA_Build 8 12525791 1D CGTCCTCTTG C/- CCCCGTCACT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 C 5 4 353724 CASAVA_Build 8 12533996 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 11 12 353725 CASAVA_Build 8 12536817 1D CCTCCAAAAA G/- GGACAGCTGG 3070 hom 63 het 24 0 22 3 G 3 2 353726 CASAVA_Build 8 12543597 1D AGGCTGAGGA G/- GGAGGATCAC 3070 het 3070 ref 34 20 8 6 G 3 2 353727 CASAVA_Build 8 12544418 1D TTGTTTCTTG T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 T 9 8 353728 CASAVA_Build 8 12544949 1D CACTTTGCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 24 13 10 2 T 10 9 353729 CASAVA_Build 8 12551066 1I TTCTATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1247 hom 20 4 8 8 T 15 16 353730 CASAVA_Build 8 12551947 5I AGGTGCGTGA -----/ATTTT CTTCATGTCC 1285 het 1285 ref 34 28 3 3 ATTTT 0 1 353731 CASAVA_Build 8 12552441 1D TCTCAAACCA C/- CCCCCAATGC 3070 hom 24 het 9 0 9 1 C 6 5 353732 CASAVA_Build 8 12565978 4D TGTGGGTCTG TGTC/---- TCTCTCTCTC 2294 het 2294 ref 20 12 5 5 TGTC 1 0 353733 CASAVA_Build 8 12566678 3D GTCCACGTAA AAG/--- AAGGAGGTGG 3070 het 26 hom 24 1 19 4 AAG 2 1 353734 CASAVA_Build 8 12601604 1I CGAGAGAGAC -/A CCCCCCACCA 3070 hom 63 het 27 0 23 4 A 0 1 353735 CASAVA_Build 8 12604045 1I AAAGAAAAAG -/A AAACAAAATA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 3 4 353736 CASAVA_Build 8 12606282 1I AGAAATTAAG -/A AGCAGGGAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 1 2 353737 CASAVA_Build 8 12614739 5I TTAGAGTGGG -----/GGGGC GGTGGTTAAT 3070 hom 39 het 15 0 13 2 GGGGC 0 1 353738 CASAVA_Build 8 12629359 3I AGATGAAGAC ---/ATT ATGATGAGAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ATT 0 1 353739 CASAVA_Build 8 12635209 2D TCTCAATAAA TG/-- TAACATTTCT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 TG 1 0 353740 CASAVA_Build 8 12636143 1I TTGTTTTACA -/T TATCAGCTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 1 2 353741 CASAVA_Build 8 12643792 1D AAAATTCAGT C/- CTGTGGGTTG 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 2 1 353742 CASAVA_Build 8 12644627 1I TGAACCTAGA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 8 9 353743 CASAVA_Build 8 12645738 1D AAAAACAGTA T/- TGGCCCAATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 1 353744 CASAVA_Build 8 12646757 1I TGGATTTTTA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 8 9 353745 CASAVA_Build 8 12647286 4I GGACCATCAC ----/ACTT ACTGATCTCA 3070 hom 110 het 43 0 38 5 ACTT 0 1 353746 CASAVA_Build 8 12649633 5D CTGAAATCTC TCTCT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 4 TCTCT 1 0 353747 CASAVA_Build 8 12650279 1D GTACCACTAT G/- TTGCCCAGGC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 0 353748 CASAVA_Build 8 12664396 1D CACTGCACTT C/- CAGCCTGGAC 3070 hom 51 het 30 0 16 15 C 2 1 353749 CASAVA_Build 8 12666122 1I CTCAACCCCC -/T AATATTCTTC 3070 het 3070 ref 59 34 18 7 T 0 1 353750 CASAVA_Build 8 12667659 1I GAGAGTGTTG -/T TAATAGACCG 3070 het 3070 ref 48 27 17 4 T 1 2 353751 CASAVA_Build 8 12674393 1D TTGACAGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 15 7 A 10 9 353752 CASAVA_Build 8 12676391 6I ATTATATATA ------/TATGTT TATATAATCA 3070 het 1665 hom 12 4 7 1 TATGTT 0 1 353753 CASAVA_Build 8 12679404 1D GAGTCGCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1735 hom 26 8 16 2 A 15 14 353754 CASAVA_Build 8 12682525 2I CATATATATG --/TA TATATATATA 916 het 916 ref 11 8 3 0 TA 7 8 353755 CASAVA_Build 8 12688887 1D TGCCAATATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 A 10 9 353756 CASAVA_Build 8 12689677 1D CATTAGTTTT C/- CCCATTTTAC 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 C 4 3 353757 CASAVA_Build 8 12693630 3I TACATGGAAA ---/AAG AATGCATTTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 AAG 0 1 353758 CASAVA_Build 8 12699655 1I CCATATAGTT -/A AATATGTTTT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 A 2 3 353759 CASAVA_Build 8 12704479 1D AACCATTCAC T/- ACTAGTATAT 3070 het 3070 ref 34 19 9 7 T 1 0 353760 CASAVA_Build 8 12715644 1I AAATAAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 70 het 28 0 24 4 A 8 9 353761 CASAVA_Build 8 12716184 1I CAGTTGGCGG -/C CACCCACTCC 3070 hom 76 het 30 0 23 7 C 1 2 353762 CASAVA_Build 8 12717237 1I ACTCTGCCTT -/A AAAAAAAAAC 2365 het 2365 ref 28 18 7 3 A 9 10 353763 CASAVA_Build 8 12721117 1D AATTAAGTTA T/- GTAAACTTAC 2731 het 2731 ref 24 16 7 1 T 1 0 353764 CASAVA_Build 8 12733445 1I CTATAAAAAA -/T TTTTTTTTAA 3038 het 3038 ref 23 10 9 4 T 8 9 353765 CASAVA_Build 8 12735233 1D AGGGGTTTAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 35 11 21 4 T 8 7 353766 CASAVA_Build 8 12737513 1D ACTTGGAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2711 hom 24 8 9 8 T 13 12 353767 CASAVA_Build 8 12748428 1D TTGTTGTAGG T/- TTTTTTTTTT 1367 het 1367 ref 27 18 3 6 T 13 12 353768 CASAVA_Build 8 12749163 2D17M2D TTTCTGTGTC TTTTTTTTTTTCTTTTTTTTG/--TTTTTTTTTCTTTTTTT-- TGTGTGTGTG 3070 hom 108 het 36 0 37 5 N/A 0 0 353769 CASAVA_Build 8 12750708 1I TGTTTTTTTT -/G TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 G 0 1 353770 CASAVA_Build 8 12752926 15D GCCTGAGCGT CCCGTTTCTAGGCCA/--------------- CTCTTCCTAG 3070 het 3070 ref 36 20 15 3 CCCGTTTCTAGGCCA 1 0 353771 CASAVA_Build 8 12755070 1D GAAATGTGCC T/- TAACATGTTG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 T 2 1 353772 CASAVA_Build 8 12758095 1D ATATGTGAGA T/- TCCCTGAAGC 3070 hom 129 het 52 0 44 8 T 2 1 353773 CASAVA_Build 8 12758639 1D CCAACACTCT C/- TTGGATATCT 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 C 1 0 353774 CASAVA_Build 8 12760839 1I AAACCTTGTT -/A AAAAAAAAAA 1154 het 1154 ref 24 13 6 5 A 13 14 353775 CASAVA_Build 8 12775845 3D GAAGGGCTGG ATT/--- ATTATAGTGG 3070 het 3070 hom 38 17 18 5 ATT 2 1 353776 CASAVA_Build 8 12796431 1I TATGGGGGAG -/C ATTTTCCTTC 1519 het 1519 ref 27 21 4 2 C 0 1 353777 CASAVA_Build 8 12797312 1D AAGCAGGGTG C/- CGGTGACTCA 3070 hom 87 het 31 0 27 4 C 2 1 353778 CASAVA_Build 8 12803114 3D GTAATATAGG GAT/--- GATATAGAGA 3070 het 3070 ref 40 21 16 6 GAT 2 1 353779 CASAVA_Build 8 12803238 1I TCCTGGAACT -/A AATCCCCTCA 3070 het 2028 hom 30 6 17 8 A 2 3 353780 CASAVA_Build 8 12807772 1I TACTTTTAAT -/G GCAAAAGCCA 3070 hom 43 het 26 0 11 15 G 1 2 353781 CASAVA_Build 8 12811236 1D TCTCTACTAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 A 9 8 353782 CASAVA_Build 8 12812084 1I GAAGACACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 10 11 353783 CASAVA_Build 8 12821402 1I AAAGAAAAAA -/G AAAAACCTTG 3070 het 3070 hom 26 13 11 2 G 0 1 353784 CASAVA_Build 8 12825682 2I CAGCAGGCAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 AG 5 6 353785 CASAVA_Build 8 12834102 2I CTATCAACTT --/AA AAAGTTTAAA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 3 5 353786 CASAVA_Build 8 12834222 1D CATTTTCTTT A/- AAAAAAAGGG 3070 hom 58 het 23 0 20 3 A 8 7 353787 CASAVA_Build 8 12842897 3D ATTACTGGGT ATA/--- TACCAAAAGG 3070 het 1381 hom 12 3 9 0 ATA 1 0 353788 CASAVA_Build 8 12845181 1D TTACCATTAC G/- AATAGGTAGA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 G 1 0 353789 CASAVA_Build 8 12855122 3I TTATTGGTAA ---/TAT TACAGCTAAC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAT 0 1 353790 CASAVA_Build 8 12859351 1I TAGAGTAATT -/A AAAAAAATAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 7 8 353791 CASAVA_Build 8 12876808 3D ACAAATAGAG GCA/--- GCAGCATTAT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 GCA 3 2 353792 CASAVA_Build 8 12878249 1I TATGCTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 559 hom 31 3 14 14 T 12 13 353793 CASAVA_Build 8 12879732 1I CTATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 23 0 18 5 A 10 11 353794 CASAVA_Build 8 12882283 1I CTATAAACCC -/T TTTTTTCCAA 3070 het 3070 ref 49 26 14 9 T 6 7 353795 CASAVA_Build 8 12885204 1I GTTCCAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 10 11 353796 CASAVA_Build 8 12889573 2D ACCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 32 0 19 14 A 11 9 353797 CASAVA_Build 8 12899176 2I CATGAGAGCT --/GG GGTTGTTTAA 3070 het 3070 hom 50 20 20 10 G 2 4 353798 CASAVA_Build 8 12903619 2D TTCAAAACTC AT/-- AGTGTGCTGG 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 AT 1 0 353799 CASAVA_Build 8 12912827 1D GAAATAATAT G/- GTCACATTTA 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 G 2 1 353800 CASAVA_Build 8 12917447 7D TTGTCCAGGC TGGTCCT/------- GAAGTCCAGG 3070 het 3070 hom 42 18 22 7 TGGTCCT 1 0 353801 CASAVA_Build 8 12918957 6I7M2I TGAACCAGGT ------CACACCA--/TCACTGCACTCCAGG CTGCACTCCA 2850 het 2850 ref 20 10 6 4 N/A 0 0 353802 CASAVA_Build 8 12924066 1I TATTTGGTTG -/T TTTTGTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 4 5 353803 CASAVA_Build 8 12929689 1I GAGGGAATCA -/G AGAAGCATTA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 G 0 1 353804 CASAVA_Build 8 12938239 1D GACCATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 43 1 34 8 A 12 11 353805 CASAVA_Build 8 12948940 1I ACATAGCAAG -/A CCCTGTCTCT 3070 hom 75 het 33 0 25 9 A 0 1 353806 CASAVA_Build 8 12963059 5I GGCTCCAAAG -----/TGAGC CAGTGAGATT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 TGAGC 0 1 353807 CASAVA_Build 8 12964728 2I AGGAGATCTG --/AT ATGGTTTATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 1 2 353808 CASAVA_Build 8 12982048 3D AAAAAAAAAA AAC/--- GAGAGAGAAA 3070 het 162 hom 26 2 18 6 AAC 1 0 353809 CASAVA_Build 8 12982120 1D CCTCCCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 29 0 27 2 A 11 10 353810 CASAVA_Build 8 12984160 2I TTGAAGAGTC --/AA AAAAAAAAAA 1193 hom 27 het 17 0 9 8 A 16 18 353811 CASAVA_Build 8 12984565 1D AAGGTTAGGG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 36 het 20 0 12 8 C 10 9 353812 CASAVA_Build 8 12991169 1D ATGACATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 11 10 353813 CASAVA_Build 8 12992690 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 611 hom 40 2 29 9 T 14 15 353814 CASAVA_Build 8 12995029 1D CCTAAGCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 11 10 353815 CASAVA_Build 8 12996546 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 A 11 10 353816 CASAVA_Build 8 13017344 1I GCTTACAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 73 het 29 0 25 4 T 8 9 353817 CASAVA_Build 8 13019885 7D GTTCTCTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 22 2 13 8 T 23 16 353818 CASAVA_Build 8 13021873 4D GAAGGAACAA TTAC/---- TTACAAAAAT 3070 hom 31 het 12 0 10 2 TTAC 2 1 353819 CASAVA_Build 8 13023607 1D TTTTTATACT A/- TTTTTTATAG 3070 het 2849 hom 30 7 17 7 A 1 0 353820 CASAVA_Build 8 13025388 1D AATGAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1615 het 617 hom 11 5 6 0 T 19 18 353821 CASAVA_Build 8 13037453 3I AAACTTAAAA ---/AAT AATAAGAGTG 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 AAT 1 2 353822 CASAVA_Build 8 13039353 1D TTTGTTATAT G/- GGGGTGTTGT 3070 hom 102 het 40 0 34 6 G 5 4 353823 CASAVA_Build 8 13045502 1D CCCTGGTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 37 4 25 9 T 15 14 353824 CASAVA_Build 8 13048155 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2182 hom 24 9 11 6 A 14 12 353825 CASAVA_Build 8 13050000 1I AGATGTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 T 11 12 353826 CASAVA_Build 8 13057245 1I AAAGCAAATG -/A AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 A 5 6 353827 CASAVA_Build 8 13068629 1I ACACCTCTGA -/T TCATGTATCT 3070 het 3070 ref 34 23 8 3 T 1 2 353828 CASAVA_Build 8 13070763 2D ATTAGAATTC TG/-- TGTTTCCTGA 3070 het 3070 ref 49 29 16 5 TG 2 1 353829 CASAVA_Build 8 13076909 1D ATCCATCTTC A/- GTTAATTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 A 1 0 353830 CASAVA_Build 8 13077184 1D TGCCTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 1378 het 1378 ref 32 15 5 13 T 15 14 353831 CASAVA_Build 8 13080532 1I TGGAAGAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 T 11 12 353832 CASAVA_Build 8 13089033 1I CCTGCTTTAC -/T TTTTTTTTCC 2715 het 2715 ref 31 17 7 7 T 8 9 353833 CASAVA_Build 8 13097161 3D TGAACTTGAC AAA/--- TGTATTTTGT 3070 het 3070 ref 52 25 22 7 A 3 0 353834 CASAVA_Build 8 13137866 1D AGTGAAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 10 9 353835 CASAVA_Build 8 13140466 1D CTTAGGGAAG T/- TATCAGTACC 3070 het 3070 ref 47 27 16 4 T 2 1 353836 CASAVA_Build 8 13148539 1D CGACAAATGC T/- TTTTTTTTTT 2698 het 2698 ref 67 47 7 13 T 12 11 353837 CASAVA_Build 8 13156175 1D AAGAGATGTA G/- GGACACAGGC 3070 het 3070 hom 25 9 13 4 G 3 2 353838 CASAVA_Build 8 13156864 1I TTCTTTTTTC -/T TTATTTTTTT 2936 het 1346 hom 19 4 10 5 T 2 3 353839 CASAVA_Build 8 13159097 2I TGCTTATCAT --/AA AAAAAAAAAA 2215 het 2215 ref 42 19 9 14 A 10 12 353840 CASAVA_Build 8 13159602 1D GGAAAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 26 15 11 A 13 12 353841 CASAVA_Build 8 13161008 6D CGCAGTGAAA CTCCGT/------ CTCAAGAAAA 877 het 779 hom 11 3 4 4 CTCCGT 1 0 353842 CASAVA_Build 8 13161677 3D AACAGATGGG TTT/--- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 10 16 8 T 11 8 353843 CASAVA_Build 8 13163235 11I TGTATAGAAT -----------/GGAGTGAACAC GGGAAAGGAT 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 GGAGTGAACAC 0 1 353844 CASAVA_Build 8 13191928 2D AGGTAGTGTC TT/-- CAATAGTTTT 3070 het 3070 ref 49 25 19 7 T 2 0 353845 CASAVA_Build 8 13193316 4D5M7D GATATTAACT TCTATTATTTGAGATG/----TTATT------- AACAAAATAA 3070 het 3070 ref 40 24 16 5 N/A 0 0 353846 CASAVA_Build 8 13195726 1I AGAGGAAAAG -/A AACTATGTTC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 2 3 353847 CASAVA_Build 8 13199747 4D TCCATTTTAG TTTT/---- TTTTTGTTGT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 9 5 353848 CASAVA_Build 8 13204262 12D TGAATCCATA AAAGGCTGTTTC/------------ AAAGGCTGTT 3070 het 3070 ref 52 30 19 11 AAAGGCTGTTTC 2 1 353849 CASAVA_Build 8 13212227 1D AAAAATCAGT G/- ACAGAGTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 G 1 0 353850 CASAVA_Build 8 13218077 4D CAGCCACTTG ATCT/---- ACTAGCTAGT 3070 het 3070 ref 66 34 15 20 ATCT 1 0 353851 CASAVA_Build 8 13221387 3D CCTTGCTGTT CTC/--- CTGATAGTGA 1999 hom 26 het 10 0 8 3 CTC 1 0 353852 CASAVA_Build 8 13224376 2I ACATTATAAC --/AT ATAATTCAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 1 2 353853 CASAVA_Build 8 13224739 2I TTTAATAGAC --/TA TGGCAGAAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TA 0 1 353854 CASAVA_Build 8 13226272 1D TACGGTGAAA C/- CCTGTCTCTA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 C 3 2 353855 CASAVA_Build 8 13227328 14D ATAGTTCTGT ATACACACACACAC/-------------- ACACACACAC 3070 hom 140 het 45 0 48 4 ATACACACACACAC 1 0 353856 CASAVA_Build 8 13227917 1D TTTTTCTTAT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 7 353857 CASAVA_Build 8 13230231 2D ATTCATGCCT CA/-- GTTATATTTT 3070 het 3070 ref 54 23 24 7 CA 1 0 353858 CASAVA_Build 8 13231235 1D ATGCATAGAA G/- GGGGGTCAAG 3070 het 3070 ref 45 26 14 5 G 6 5 353859 CASAVA_Build 8 13234504 3I AGAGATTGGG ---/TTT TTCCATGTTG 3070 hom 53 het 20 0 16 4 T 2 5 353860 CASAVA_Build 8 13235298 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTGTT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 8 7 353861 CASAVA_Build 8 13237786 1I CAAAATATGA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 7 8 353862 CASAVA_Build 8 13238778 1D AAATTTGTCA T/- TTTTTTCCTA 3070 hom 123 het 46 0 42 6 T 7 6 353863 CASAVA_Build 8 13255923 1I CATACTGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 350 hom 33 1 18 14 T 11 12 353864 CASAVA_Build 8 13256406 1I TTTAGAAGTT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 7 8 353865 CASAVA_Build 8 13256999 4D TACCATAAAG AATT/---- AATTATTCAA 3070 hom 57 het 23 0 21 3 AATT 2 1 353866 CASAVA_Build 8 13257069 1I5M1I AACTAAAACT -TATTA-/GTATTAG TCTGTATTAG 3070 hom 48 het 19 0 16 4 N/A 0 0 353867 CASAVA_Build 8 13257801 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2733 hom 24 8 14 3 A 10 9 353868 CASAVA_Build 8 13260572 1I GGAAGGAGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 9 10 353869 CASAVA_Build 8 13262551 1D CATAGTGTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 9 8 353870 CASAVA_Build 8 13263302 1D GCTCTGCTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 10 9 353871 CASAVA_Build 8 13297006 1D TTTATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 919 hom 34 2 23 9 T 13 12 353872 CASAVA_Build 8 13297943 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 18 0 10 8 T 15 14 353873 CASAVA_Build 8 13299917 1D AGGCTGAGGC A/- GGAGAATTGC 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 A 1 0 353874 CASAVA_Build 8 13300010 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 A 8 9 353875 CASAVA_Build 8 13300177 1I TCTTCCCCAT -/C CACATCTCTT 3070 het 3070 hom 30 13 16 1 C 1 2 353876 CASAVA_Build 8 13306927 1D TTCTGGAGGA T/- TTTTTTTTTT 1324 het 1324 ref 29 17 3 9 T 12 11 353877 CASAVA_Build 8 13312533 1I AGACCATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 A 10 11 353878 CASAVA_Build 8 13315380 2D GTGTGCACAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 AT 7 6 353879 CASAVA_Build 8 13324283 1D CAGAGATTGC T/- TTTTTTTTTT 1302 het 1302 ref 32 21 3 8 T 11 10 353880 CASAVA_Build 8 13327549 1D GTGTCATAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 10 9 353881 CASAVA_Build 8 13328092 4I TCTTAAATGA ----/CAGT CAGTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 15 18 1 CAGT 1 2 353882 CASAVA_Build 8 13328668 1D TATATATATA T/- TTTTCCTTCT 1408 het 1408 ref 47 21 4 23 T 5 4 353883 CASAVA_Build 8 13345991 1I TCCTGGTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 10 17 6 T 8 9 353884 CASAVA_Build 8 13360711 1D CTTCATTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 11 10 353885 CASAVA_Build 8 13366627 26D AATTTTAAAT TATATATATATATATATATTTATATA/-------------------------- TATATATATA 1099 hom 10 het 5 0 4 2 TATATATATATATATATATTTATATA 1 0 353886 CASAVA_Build 8 13368839 1D AAAAAAAAAA C/- CCCTCCACGT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 C 4 3 353887 CASAVA_Build 8 13377001 1D CAAAATGACA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 8 353888 CASAVA_Build 8 13379091 1D AAACAAGATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 38 het 49 2 43 4 A 10 9 353889 CASAVA_Build 8 13384303 4I AAGATAAAAA ----/TAGG TAGTTGATGA 3070 hom 114 het 46 0 39 13 TAGG 0 1 353890 CASAVA_Build 8 13388615 5I ACCTAGCATG -----/GTCTA GTCCACTGAG 3070 hom 114 het 47 0 38 9 GTCTA 0 1 353891 CASAVA_Build 8 13391464 1D TATACAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 25 0 20 6 A 11 10 353892 CASAVA_Build 8 13391929 1I AAGGTTAAAT -/A ACACCCCCCA 3070 het 2414 hom 29 8 17 4 A 1 2 353893 CASAVA_Build 8 13392859 2I ATTTATATAA --/AT ATATATATAT 1590 hom 21 het 12 0 8 4 AT 5 6 353894 CASAVA_Build 8 13394354 1D16M4D TAGCCTGTCC TTTTTTTTCTATCACTTACTC/-TTTTTTTCTATCACTT---- TCTCTGTCTC 3070 hom 93 het 34 0 31 8 N/A 0 0 353895 CASAVA_Build 8 13399892 1I AGTAGATTTT -/G TTTTTCTCTC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 G 0 1 353896 CASAVA_Build 8 13402709 4I CCATTTACAA ----/TGCC TTAGGACAGA 3070 hom 148 het 56 0 50 6 TGCC 0 1 353897 CASAVA_Build 8 13408045 2D ATGTGTGTAT AC/-- ACACACATAT 3070 het 3070 hom 53 20 27 6 AC 4 3 353898 CASAVA_Build 8 13413204 1I ATCTTTCACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 411 hom 43 1 31 11 T 9 10 353899 CASAVA_Build 8 13435126 1D ATAATCGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 169 hom 21 1 16 5 T 9 8 353900 CASAVA_Build 8 13449781 1I ATCTCTCTTT -/C TTTCTTGTCT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 0 1 353901 CASAVA_Build 8 13450256 1D GTACTACACA C/- CCCAGTATTA 3070 hom 93 het 36 0 32 6 C 4 3 353902 CASAVA_Build 8 13462337 1D AATAAAGATA C/- TTCTTAATGA 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 C 1 0 353903 CASAVA_Build 8 13463003 1I GTGTTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 10 13 T 13 14 353904 CASAVA_Build 8 13470468 5I TTTTGGAAAT -----/GACTA GAATAAGAAG 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 GACTA 0 1 353905 CASAVA_Build 8 13471243 1D AAAGATACTA T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 6 353906 CASAVA_Build 8 13491570 1D GAATGCTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 16 0 15 1 T 12 11 353907 CASAVA_Build 8 13503526 1D GATAATAGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2003 hom 36 7 17 12 A 10 9 353908 CASAVA_Build 8 13520068 1D AATTATGTGT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 ref 43 23 14 6 A 8 7 353909 CASAVA_Build 8 13523058 1D AGTACATAGT G/- GGAGATTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 4 G 3 2 353910 CASAVA_Build 8 13524148 1D TAGGAAAAAA T/- AAGTGTGAAA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 T 1 0 353911 CASAVA_Build 8 13525145 1I ATCTGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 9 8 2 A 11 12 353912 CASAVA_Build 8 13528033 4D TAATAAACAC ACCT/---- GTTTAGGTGT 3070 het 3070 ref 30 17 11 3 ACCT 1 0 353913 CASAVA_Build 8 13529930 2D AATTTTTCTC AT/-- ATTCTGGTGA 3070 het 3070 ref 41 24 12 5 AT 2 1 353914 CASAVA_Build 8 13537590 1D ATAAAGTTCA T/- TGGGGATACT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 1 353915 CASAVA_Build 8 13541414 5I TCTATAAATG -----/TCTGC TGTCTCTGTC 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TCTGC 0 1 353916 CASAVA_Build 8 13549303 2D TCTAGAATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 22 hom 37 2 20 16 T 17 15 353917 CASAVA_Build 8 13553349 1D CTTTTTCATT A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 7 353918 CASAVA_Build 8 13554003 2D AGAAGGAAAG AA/-- GAGAGAAGGA 3070 hom 160 het 59 0 54 8 A 2 0 353919 CASAVA_Build 8 13555782 5D GAAATGAAGG AGAGA/----- AGAGAAGAGT 3070 het 3070 ref 35 20 12 8 AGAGA 2 1 353920 CASAVA_Build 8 13556778 2I AATGGAAAAA --/AG AAAAAATAAC 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 AG 0 1 353921 CASAVA_Build 8 13557876 1I AGGTGACTTG -/A AAATCTTACT 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 A 3 4 353922 CASAVA_Build 8 13558722 8D GTCTCTCGGC CCCACCAT/-------- CCTCTGCAAG 3070 het 3070 ref 51 29 23 1 CCCACCAT 1 0 353923 CASAVA_Build 8 13574626 1I ACGTTGAACA -/G GCAACATGGT 3070 het 3070 ref 47 19 16 12 G 1 2 353924 CASAVA_Build 8 13579345 1D GGCACAGTCA T/- TTTTAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 5 4 353925 CASAVA_Build 8 13586289 2I AATCAAGTGA --/TC TCTCTCTGCA 3070 hom 138 het 57 0 46 11 TC 3 4 353926 CASAVA_Build 8 13587212 1I ATGAGAAGAA -/G AAAAACAATG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 G 0 1 353927 CASAVA_Build 8 13589536 1I TGAGACTTCA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 7 8 353928 CASAVA_Build 8 13594538 1I ACAATATGAT -/G TTAGTTGTGG 3070 het 3070 hom 52 19 28 5 G 0 1 353929 CASAVA_Build 8 13596683 1D CTTTAGGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1070 hom 32 7 15 10 T 17 16 353930 CASAVA_Build 8 13597541 1I TTCACACACA -/C AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 C 0 1 353931 CASAVA_Build 8 13602249 1I AAAAGCTTTG -/T TTTTTCCCAC 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 T 5 6 353932 CASAVA_Build 8 13602570 1I AGTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 A 0 1 353933 CASAVA_Build 8 13602934 37D6M17D4M8D CAAAGTGGGG AGAAAAATTTGTAAATCATGTATTTGATAAATGATTTTTATCTAGAATACATGAGTAATGTTTGCAGCTCAA/-------------------------------------CTCTCT-----------------TTTG-------- CAATAGACAA 3070 het 3070 ref 35 41 9 4 N/A 0 0 353934 CASAVA_Build 8 13603895 3D CATTACCAAA AAT/--- AATAAGCATA 3070 het 3070 hom 29 14 14 4 AAT 2 1 353935 CASAVA_Build 8 13606043 4I GGGATTACAG ----/GCGT GAGCCACAGC 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 GCGT 0 1 353936 CASAVA_Build 8 13614093 1D CCTCAAGCTA T/- TCTCATCAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 5 T 2 1 353937 CASAVA_Build 8 13614311 3I TTGAAACACA ---/TCT TCTTGATAAT 3070 het 3070 ref 56 29 23 4 TCT 1 2 353938 CASAVA_Build 8 13616319 1I TTGTGGAGAC -/G GGGGTTTCAC 3070 het 1170 hom 17 4 10 3 G 4 5 353939 CASAVA_Build 8 13621254 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 11 8 A 13 12 353940 CASAVA_Build 8 13639580 1I AAAATCTGGC -/A AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 A 5 6 353941 CASAVA_Build 8 13639633 1D AATCATCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 16 13 T 13 12 353942 CASAVA_Build 8 13642228 19D ACCAATGTCA AAAAATGATACTTTTTCAT/------------------- ATGAGTGATC 3070 het 3070 hom 34 14 20 5 AAAAATGATACTTTTTCAT 1 0 353943 CASAVA_Build 8 13646476 1D GTCTGTTTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 A 10 9 353944 CASAVA_Build 8 13667943 1D TGAGATGATG A/- ATGTGTTAAT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 2 1 353945 CASAVA_Build 8 13668803 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 39 het 21 0 13 8 T 9 8 353946 CASAVA_Build 8 13677041 1D TATTTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 9 T 14 13 353947 CASAVA_Build 8 13693154 1D TCAATAGATA T/- TTTTTGGAAG 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 6 5 353948 CASAVA_Build 8 13703955 3D TATAAATAAT AAG/--- AAAAACTGAA 2752 het 2752 ref 15 7 7 1 AAG 1 0 353949 CASAVA_Build 8 13704234 2I21M2I ATGTGTACAC --GTGTGTACATACAGTATACAC--/ATGTGTGTACATACAGTATACACAT ATACACATAT 2445 het 2445 ref 10 7 5 1 N/A 0 0 353950 CASAVA_Build 8 13705270 1D AAGGTATTCT C/- CTTGAGCCTT 3070 hom 163 het 60 0 54 6 C 2 1 353951 CASAVA_Build 8 13707160 1D TTCCAAACAG T/- TTTTTTAGAG 3070 het 3070 ref 46 19 22 5 T 7 6 353952 CASAVA_Build 8 13708182 1D GCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 6 A 11 10 353953 CASAVA_Build 8 13724370 1D GGGAGATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 T 10 9 353954 CASAVA_Build 8 13729196 2D CACTTTGGTA TC/-- TCTGTTAAAA 3070 hom 81 het 30 0 26 4 TC 2 1 353955 CASAVA_Build 8 13730001 3D TAAGAATTGC GAT/--- GATATAAACA 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 GAT 2 1 353956 CASAVA_Build 8 13733222 1I TAATAGCAGA -/T TTTTTGGCAT 3070 hom 87 het 31 0 30 7 T 5 6 353957 CASAVA_Build 8 13738732 34D CTATGGAGAT TAATCAGTAACAGTCCTCATCATTCTTTGGTTTC/---------------------------------- TAATCAGTAA 3070 hom 54 het 20 0 18 3 TAATCAGTAACAGTCCTCATCATTCTTTGGTTTC 1 0 353958 CASAVA_Build 8 13740538 1I CACATTCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2957 hom 43 11 14 18 T 12 13 353959 CASAVA_Build 8 13746107 5D TTTGAAAAAA TAAAT/----- TAATCCTGAA 3070 het 3070 ref 46 24 16 9 TAAAT 1 0 353960 CASAVA_Build 8 13752607 1D TTGACTTGAA G/- GGGCCATCAA 3070 het 3070 ref 42 19 21 3 G 4 3 353961 CASAVA_Build 8 13757310 1I CCTTCCCATG -/C CCTGCCTTTC 3070 het 3070 hom 21 7 11 3 C 2 3 353962 CASAVA_Build 8 13761557 4D TTCCTTAAAA AAAT/---- AGCTACTAAG 3070 hom 60 het 21 0 21 4 AAAT 1 0 353963 CASAVA_Build 8 13766273 2D TTTATGAATT TA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TA 1 0 353964 CASAVA_Build 8 13771359 1D ATGATTTTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 8 7 353965 CASAVA_Build 8 13772346 1I GGAGTAAAAC -/T TTTATTTTTT 3070 het 788 hom 46 2 40 4 T 3 4 353966 CASAVA_Build 8 13775057 30D CACATATTGT TATATATATATATATATATATATATATATA/------------------------------ TATATATATA 2896 hom 24 het 11 0 9 2 TA 23 8 353967 CASAVA_Build 8 13775274 2D TTGCTGACTC AG/-- GGGTGGCAGA 3070 hom 63 het 23 0 21 3 AG 1 0 353968 CASAVA_Build 8 13776407 1D CCTTTGTGAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 T 9 8 353969 CASAVA_Build 8 13776666 1I AATGACTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 8 9 353970 CASAVA_Build 8 13777612 1I TTTTTTTGTT -/C GTTGTTCTTT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 C 0 1 353971 CASAVA_Build 8 13778052 4I TAAAATAAAC ----/AATT AACATAAACA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AATT 0 1 353972 CASAVA_Build 8 13786875 2I AATTTTTTTA --/CT GATATTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 CT 0 1 353973 CASAVA_Build 8 13788488 1I GATTTCCAAG -/A AAAGAGGGAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 A 3 4 353974 CASAVA_Build 8 13791962 1I TTTTAATGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 414 hom 34 1 30 3 T 8 9 353975 CASAVA_Build 8 13793173 1D TTTTTCTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 16 10 T 12 11 353976 CASAVA_Build 8 13793411 2D CTCTCTAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 2950 het 11 hom 26 1 10 15 T 16 14 353977 CASAVA_Build 8 13793590 4D TCTTTATATC TTTT/---- ATTTATGTAC 3070 het 3070 hom 29 14 14 3 T 4 0 353978 CASAVA_Build 8 13798552 1I TGTATGTTGC -/T TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 T 6 7 353979 CASAVA_Build 8 13799092 1I ATTCATATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 11 12 353980 CASAVA_Build 8 13802397 2I AGGTCTAGTG --/AA AAATGAAGTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 5 353981 CASAVA_Build 8 13809701 1I CTTCCATTAA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 7 8 353982 CASAVA_Build 8 13812578 1I AGGATTGAAG -/A AAAAATAATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 5 6 353983 CASAVA_Build 8 13814115 4D CATGAAAACG TTAT/---- TTGACTACAA 3070 het 3070 ref 38 18 18 3 TTAT 1 0 353984 CASAVA_Build 8 13817974 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2291 het 301 hom 18 5 8 5 A 12 11 353985 CASAVA_Build 8 13819252 1D GGTTTTCACT C/- CCTGGTGCTG 3070 het 3070 hom 44 16 23 6 C 3 2 353986 CASAVA_Build 8 13824157 2D ATTCATTTTT TC/-- TCTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 TC 3 2 353987 CASAVA_Build 8 13824208 1I TTTTTTTCTC -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 39 19 8 12 T 7 8 353988 CASAVA_Build 8 13827789 1D CTCCCCTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 174 hom 36 1 22 13 T 12 11 353989 CASAVA_Build 8 13827801 1D TTTTTTTTTT A/- GGTCTCAGAC 3070 het 220 hom 34 4 22 8 A 1 0 353990 CASAVA_Build 8 13828773 1D AATTTTCCTT A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 8 7 353991 CASAVA_Build 8 13829958 1I7M25I AGTATCTTTT -TTTTTGT-------------------------/GTTTTTGTCTTTAATCCATCACAAAGTTCATGG CTGAGACCAC 3070 het 3070 ref 34 17 16 6 N/A 0 0 353992 CASAVA_Build 8 13834344 1I AATAATTGGG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 8 9 353993 CASAVA_Build 8 13834597 2D GCTTACCAAA GT/-- CTCTGTGTGT 3070 hom 79 het 35 0 27 8 GT 1 0 353994 CASAVA_Build 8 13836816 1I ATTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 11 12 353995 CASAVA_Build 8 13837531 1D TAGTTTGTTA T/- TTTGCCCCAT 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 T 4 3 353996 CASAVA_Build 8 13838374 44D GCTATTCCTT GAACAGATAAAAGCTTAGAGTAGAACTGACCTTTTAGCAGATCC/-------------------------------------------- TTCATTTTTA 2119 hom 12 het 6 0 5 3 GAACAGATAAAAGCTTAGAGTAGAACTGACCTTTTAGCAGATCC 1 0 353997 CASAVA_Build 8 13838936 1D AGGCAGATCA C/- TTGAGGTCAG 2247 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 0 353998 CASAVA_Build 8 13840821 5D GTATAATAAT AATAA/----- AATAAAAAAA 956 het 702 hom 5 2 2 5 AATAA 2 1 353999 CASAVA_Build 8 13843149 4D CAATTAATTC AAAT/---- ACTTTATTTC 3070 hom 60 het 30 0 21 10 AAAT 1 0 354000 CASAVA_Build 8 13843433 2D TCAGTTTTTC TA/-- TTTTCCATTT 3070 het 3070 ref 25 15 10 0 TA 1 0 354001 CASAVA_Build 8 13844519 1I TAATAGGCAG -/A ATTTGAATAG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 2 354002 CASAVA_Build 8 13845732 3D CAATTAAAAA AAG/--- GTAAATGTCT 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 AAG 1 0 354003 CASAVA_Build 8 13846962 1I45M1D AAGCAATAGT -AAAATAGACTAATAGTTTTGGAAAAGTATATTGAATTTAACAAAGA/AAAAATAGACTAATAGTTTTGGAAAAGTGTATTGAATTTAACAAAG- AAATATATTT 3070 hom 129 het 37 0 44 8 N/A 0 0 354004 CASAVA_Build 8 13851567 1I TATGTTAACA -/T TTTTTAATAG 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 5 6 354005 CASAVA_Build 8 13860250 1D GATAGGATGA C/- CCCCATCCTG 3070 het 3070 hom 48 20 18 10 C 5 4 354006 CASAVA_Build 8 13869630 4I ATTTGAAGAA ----/TTAC TTAATGTCAG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TTAC 0 1 354007 CASAVA_Build 8 13871184 1I GATCACTCCA -/T TTTTACTCGA 3070 hom 75 het 26 0 25 1 T 4 5 354008 CASAVA_Build 8 13871600 2D TATGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 TG 6 5 354009 CASAVA_Build 8 13872138 1D AGTCTGAGAC A/- AAAGTGGGTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 4 3 354010 CASAVA_Build 8 13875357 1D ATACTTGCCA T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 T 7 6 354011 CASAVA_Build 8 13875692 4D CTCTGCAGAA AGAC/---- AGCAATTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AGAC 1 0 354012 CASAVA_Build 8 13885131 1D AAGATTGTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 T 9 8 354013 CASAVA_Build 8 13889460 1I CACCTGGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2729 hom 20 9 8 3 T 9 10 354014 CASAVA_Build 8 13893975 1D ACTAAATTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 90 het 37 0 30 7 T 9 8 354015 CASAVA_Build 8 13896554 1I CAGTGAAGAC -/T TTTTTTCATA 3070 het 2889 hom 18 6 10 2 T 6 7 354016 CASAVA_Build 8 13901578 1D CCATTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 2916 het 1604 hom 33 13 7 13 T 13 12 354017 CASAVA_Build 8 13908338 1I AAAATGCACA -/T TTTTTACTTC 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 5 6 354018 CASAVA_Build 8 13908521 1I GAAACCAGTG -/T GTGTAGGTGC 3070 hom 147 het 57 0 49 8 T 0 1 354019 CASAVA_Build 8 13922615 1D TTTTTTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 653 hom 32 3 14 16 T 14 13 354020 CASAVA_Build 8 13927616 1I AAGATGGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1793 hom 18 4 12 2 T 10 11 354021 CASAVA_Build 8 13930048 2I AGAAGCTGGT --/GG AGCAGAGTGT 2696 het 2696 ref 30 15 7 8 G 0 2 354022 CASAVA_Build 8 13932328 4I AATATATAGT ----/TATA TATAGTTACA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 TA 2 4 354023 CASAVA_Build 8 13936275 1D CAATTTTAAA T/- TTTTTTTGGT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 T 8 7 354024 CASAVA_Build 8 13940523 1I GCTGAAACTA -/G GGTATTAATA 3070 hom 123 het 48 0 42 6 G 2 3 354025 CASAVA_Build 8 13943755 1D AAAATAAATA T/- TTTTTCTGTA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 6 5 354026 CASAVA_Build 8 13944735 1I ACAATGATTA -/C CAGAAACCAT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 C 1 2 354027 CASAVA_Build 8 13946022 2D CAGCTAAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 46 het 25 0 17 8 T 14 12 354028 CASAVA_Build 8 13946703 1I AATTTACAAG -/A AAAAAATCAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 6 7 354029 CASAVA_Build 8 13947749 1I TTCTAGGACT -/A AAAAATATTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 5 6 354030 CASAVA_Build 8 13950657 1D TTTTCTTTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 9 8 354031 CASAVA_Build 8 13951044 2D TGATGCTAAC TT/-- TTTGTAAGAC 3070 hom 129 het 47 0 44 4 T 5 3 354032 CASAVA_Build 8 13970023 1D TGGACTCATG A/- AAAAAAAAAA 1253 het 1253 ref 37 25 4 8 A 15 14 354033 CASAVA_Build 8 13988942 1I TTTTCCGAGA -/T TTTGAAGTAC 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 3 4 354034 CASAVA_Build 8 13989186 1D GTTCTTGCTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 111 het 43 0 38 6 T 9 8 354035 CASAVA_Build 8 13996859 1D TTTTTGATGG T/- TTTTTTTTCT 1938 het 1938 ref 22 12 6 4 T 9 8 354036 CASAVA_Build 8 14001820 12D CATTCTTCTA CATTTCATCCAT/------------ CATTTCATCC 3070 het 3070 ref 30 18 11 3 CATTTCATCCAT 2 1 354037 CASAVA_Build 8 14005166 2D AGCAAAAATG AC/-- ACACAACACA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 AC 3 2 354038 CASAVA_Build 8 14006310 1D CTATCAAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 10 9 354039 CASAVA_Build 8 14009953 1D GGGAGAAACA T/- TTGTCTAGTT 3070 hom 69 het 25 0 22 3 T 3 2 354040 CASAVA_Build 8 14012935 3D28M1D CTATATTAAA AATAATAACAACAACAACAACAACAAACTTTA/---AATAACAACAACAACAACAACAAACTTT- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 39 23 20 6 N/A 0 0 354041 CASAVA_Build 8 14014805 1I ACAATACTGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 7 8 354042 CASAVA_Build 8 14019237 2D ATAGGTAGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 27 0 19 9 T 15 13 354043 CASAVA_Build 8 14024710 3I GGGAAACATT ---/ATC ATCACATCTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 ATC 1 2 354044 CASAVA_Build 8 14031639 4D AATATAATAA TAGT/---- TAGGAATAAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 TAGT 1 0 354045 CASAVA_Build 8 14032368 1I CCCACACACA -/C AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 28 8 16 4 C 0 1 354046 CASAVA_Build 8 14036738 4I TGGTTTTTAC ----/TGTT TGTTTGATAT 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 TGTT 1 2 354047 CASAVA_Build 8 14048836 1D GAATAAACAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2698 hom 16 7 9 0 A 10 9 354048 CASAVA_Build 8 14051537 1I TCTTCATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 499 hom 35 2 26 7 A 14 15 354049 CASAVA_Build 8 14053825 1I ACCAAAAATA -/T TATCATAGAC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 1 2 354050 CASAVA_Build 8 14056272 1D CAGCAACAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 54 het 20 0 19 3 A 9 8 354051 CASAVA_Build 8 14071938 2D TTTCACTTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 21 4 T 14 12 354052 CASAVA_Build 8 14073653 3D TAAGCTATGC TTA/--- TTGACATTTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTA 1 0 354053 CASAVA_Build 8 14075050 1D GCTTTGAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 10 9 354054 CASAVA_Build 8 14075641 2D TACAGGAAAC AG/-- AGCGAGATGA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 AG 2 1 354055 CASAVA_Build 8 14079379 8D TGTTTCCTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 hom 36 het 22 0 13 10 TTTG 6 4 354056 CASAVA_Build 8 14090311 1I ATGTTTGGTG -/A AAAAAACCCA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 6 7 354057 CASAVA_Build 8 14095217 1I CAGCATGCTA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 144 het 55 0 49 6 T 8 9 354058 CASAVA_Build 8 14098145 1I ATTAGAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 15 16 354059 CASAVA_Build 8 14103740 3D ATCTTTAAAA AAC/--- AACAACAATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 AAC 3 2 354060 CASAVA_Build 8 14107052 1D CTAGACTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 40 1 31 8 T 12 11 354061 CASAVA_Build 8 14115090 2I TTTAAGAAGC --/TG TGAAAGAGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TG 1 2 354062 CASAVA_Build 8 14116578 1I CTAACAGTAA -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 7 8 354063 CASAVA_Build 8 14117380 1I AGGCAGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 9 10 354064 CASAVA_Build 8 14118615 2I AAGAAATCTT --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 89 het 36 0 29 7 A 8 10 354065 CASAVA_Build 8 14119452 3D AAAAAAGCAC ATG/--- ATGATTTTGA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 ATG 2 1 354066 CASAVA_Build 8 14122667 4D ACTCTGCCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 81 het 32 0 27 6 AAAC 5 4 354067 CASAVA_Build 8 14129919 3D AAGTGAATGA TCT/--- TCTGTGTACA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TCT 2 1 354068 CASAVA_Build 8 14131531 2D TCTCTAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 18 9 A 13 11 354069 CASAVA_Build 8 14134017 2I TTCTTTCATC --/AT ATATATATAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AT 5 6 354070 CASAVA_Build 8 14139622 1I TACAAAAAAA -/T TATACTGCAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 1 2 354071 CASAVA_Build 8 14150635 1I AAAAAAAATC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 9 10 354072 CASAVA_Build 8 14156629 3D TCGTGTCGTC TTT/--- TTTTTTCTGG 3070 hom 100 het 42 0 32 12 T 9 6 354073 CASAVA_Build 8 14159241 1I AAAAAAAAAG -/A AAGAAAGAAA 3070 hom 35 het 24 0 17 7 A 2 3 354074 CASAVA_Build 8 14159369 2D CGTATGACAA TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 28 het 13 0 10 3 T 10 8 354075 CASAVA_Build 8 14160116 10I TGAAGATTAT ----------/AATGAAAACA AATGAAAACT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AATGAAAACA 0 1 354076 CASAVA_Build 8 14162983 1I ATAATAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 111 hom 24 1 22 1 A 9 10 354077 CASAVA_Build 8 14169978 2I CAAATTTGCT --/AA GTTTCAGTGA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 0 2 354078 CASAVA_Build 8 14172044 1D AAACCCTGTG T/- TCTATGAATA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 2 1 354079 CASAVA_Build 8 14182682 3D AACTATAGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 T 14 11 354080 CASAVA_Build 8 14182826 1I AATAAAAGTG -/T TTTTTTCTAA 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 6 7 354081 CASAVA_Build 8 14183347 2D TTTTTATATC AT/-- AGAACTTTGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 1 0 354082 CASAVA_Build 8 14183749 1D CATACTGTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 354083 CASAVA_Build 8 14184012 1I TCTACTATGT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 9 10 354084 CASAVA_Build 8 14184237 1D CCTTTCTTTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 10 9 354085 CASAVA_Build 8 14187471 1I TGTTAAAAAT -/A AAAACAAATG 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 4 5 354086 CASAVA_Build 8 14188343 1D TCTCACAAAA C/- TCCAGCTGTT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 1 0 354087 CASAVA_Build 8 14189019 1I ACATACAGTA -/T TTTTTTAAAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 6 7 354088 CASAVA_Build 8 14191099 2I CATAGTAGGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 12 354089 CASAVA_Build 8 14192209 1D AAAGAAAATA T/- AGACACATGA 3070 hom 66 het 26 0 23 6 T 1 0 354090 CASAVA_Build 8 14192617 6D TGCTGGTGGG AATGTA/------ AATGTAAATT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 AATGTA 2 1 354091 CASAVA_Build 8 14193561 2D ATTCGGAAAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AT 6 5 354092 CASAVA_Build 8 14203253 1I TTCAAATCAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 9 10 354093 CASAVA_Build 8 14213677 1I GAAATGTGTA -/T TTTTTTTCTG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 7 8 354094 CASAVA_Build 8 14216167 1I CATAGTATTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 100 het 39 0 34 5 T 8 9 354095 CASAVA_Build 8 14223419 1D CTGTACAACC A/- CAAAGTAATT 3070 het 3070 ref 30 15 14 1 A 1 0 354096 CASAVA_Build 8 14228872 1D TTAAAGTGGC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 55 20 26 9 A 9 8 354097 CASAVA_Build 8 14230943 1I ATTTTCTGCG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 9 10 354098 CASAVA_Build 8 14231740 1I TTGTATTTGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 T 8 9 354099 CASAVA_Build 8 14235626 1D AAATACACCA G/- GGAAATACTT 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 G 3 2 354100 CASAVA_Build 8 14240978 1D ACATATTATG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 49 22 17 10 T 9 8 354101 CASAVA_Build 8 14251367 4D GCCATGGAAT TTTC/---- GTAAGCAATA 3070 het 3070 ref 40 22 13 7 TTTC 1 0 354102 CASAVA_Build 8 14254954 26D TTGCACGTTG CATGAGTTTGAAATCTTGTTCTTACA/-------------------------- CATACGATTT 3070 het 3070 ref 43 28 16 4 CATGAGTTTGAAATCTTGTTCTTACA 1 0 354103 CASAVA_Build 8 14266097 1D AACTTAGAGC T/- TTTAATGTTA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 T 4 3 354104 CASAVA_Build 8 14273401 1I ATGTAAATAT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 8 9 354105 CASAVA_Build 8 14276461 6I GTTGAGAAGA ------/ACACAG ATGTATTACA 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 ACACAG 0 1 354106 CASAVA_Build 8 14284034 1I GTGGAACAAA -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 T 6 7 354107 CASAVA_Build 8 14290720 1D AATAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 14 9 2 A 11 10 354108 CASAVA_Build 8 14294710 2I AAATTCTAAG --/TT TGAGATTTGC 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 T 1 3 354109 CASAVA_Build 8 14295536 3D GTTTCTCTTT CTC/--- CTCTCTTCTG 3070 het 3070 ref 35 17 13 6 CTC 2 1 354110 CASAVA_Build 8 14296024 14D GCCCCCCACC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 2388 het 629 hom 21 4 9 8 T 25 11 354111 CASAVA_Build 8 14302641 1I ATCAATAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 9 19 6 T 9 10 354112 CASAVA_Build 8 14303163 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 T 9 8 354113 CASAVA_Build 8 14308601 1I CCTTTCTACG -/C CAACAACATG 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 C 1 2 354114 CASAVA_Build 8 14311356 1D TCAGAATTTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 45 27 17 2 A 9 8 354115 CASAVA_Build 8 14312421 2D AAGTTAATAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 13 11 354116 CASAVA_Build 8 14315239 1I CTTTTTAAGC -/T TATTTATATG 3070 het 3070 hom 52 16 32 4 T 1 2 354117 CASAVA_Build 8 14319680 4D CATTTCACAA TGTG/---- TATGTATATT 3070 het 3070 ref 27 14 12 4 TG 2 0 354118 CASAVA_Build 8 14325207 1D ATAAAAAAAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 1359 hom 13 4 9 0 A 8 7 354119 CASAVA_Build 8 14326513 2I TCATTTTTAC --/AT GTCAGTGCAT 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 AT 0 1 354120 CASAVA_Build 8 14327519 5D AAAGAAAAAG AAAAA/----- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 44 18 21 6 A 11 6 354121 CASAVA_Build 8 14332032 1D TGACACTATT C/- CCACAAGATA 2582 het 2582 ref 31 22 7 2 C 3 2 354122 CASAVA_Build 8 14333351 1D TAGTGCTGGG A/- AAATTGGCCA 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 A 4 3 354123 CASAVA_Build 8 14333893 1D GCTATAATCC A/- AAAATTAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 A 5 4 354124 CASAVA_Build 8 14350581 2I TTTCTTAGTA --/TC TGTTAGGTGC 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 TC 0 1 354125 CASAVA_Build 8 14352203 1D CAAGTATTGC G/- GTATGCATAT 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 G 2 1 354126 CASAVA_Build 8 14364752 3I CTTTTAAGAA ---/TTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 T 9 12 354127 CASAVA_Build 8 14365286 2D CAAGTGGTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 A 16 14 354128 CASAVA_Build 8 14381169 3I GCAGTCTAAC ---/TTA GTTCAACGGC 3070 hom 105 het 41 0 33 8 TTA 0 1 354129 CASAVA_Build 8 14381621 22D CTTTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA/---------------------- TTTGAGATGG 3070 het 1324 hom 25 9 13 3 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA 1 0 354130 CASAVA_Build 8 14381805 1I TTGTATTTTT -/A AGTAAAGATA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 1 2 354131 CASAVA_Build 8 14390914 1D46M1D AAAACACTGC AACCAGTGGAACTGAACATAAAGTAATTCAAATTCACAGAACGCATCT/-ACCAGTGGAACTGAACATAAAGTAATTCAAATTCACAGAACGCATC- TTTTTTTCAG 2651 het 2651 ref 11 10 6 5 N/A 0 0 354132 CASAVA_Build 8 14392702 2D TGATCATTTC AA/-- AAAAAAAATC 3070 hom 12 het 38 1 16 24 A 10 8 354133 CASAVA_Build 8 14393015 1D GTTTAGTTAC T/- TTTGACTATG 3070 het 3070 ref 37 25 9 4 T 4 3 354134 CASAVA_Build 8 14393736 1I TTTGACCCAT -/A TAGAAATGAG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 0 1 354135 CASAVA_Build 8 14393842 2D ATTGTTCAAT AA/-- ATCTAAGACG 3070 het 3070 ref 29 14 14 1 A 3 1 354136 CASAVA_Build 8 14397660 1I TAGATAAACG -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 T 7 8 354137 CASAVA_Build 8 14398121 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 T 9 8 354138 CASAVA_Build 8 14399441 2D TGTGTGCGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2337 hom 42 11 22 10 TG 8 7 354139 CASAVA_Build 8 14401669 1I CAACTGCCTT -/C CCTTTGGCAT 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 C 2 3 354140 CASAVA_Build 8 14402322 1D TTCCAGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 20 19 8 T 12 11 354141 CASAVA_Build 8 14402837 1I53M1D TTGCTGGTGT -AAAAAAAAAATTACAACAAACTTAATAGCTTAAAACCACAAATTTATTATCTTA/AAAAAAAAAAATTACAACAAACTTAATAGCTTAAAACCACAAATTTATTATCTT- ACAGATCTTG 3070 het 3070 ref 29 23 12 8 N/A 0 0 354142 CASAVA_Build 8 14404491 1D AATTTACAAG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 8 7 354143 CASAVA_Build 8 14408383 1I TTATTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 A 11 12 354144 CASAVA_Build 8 14413111 1I GTCCCTGTAG -/T GGAAAGCCTG 3070 hom 81 het 35 0 28 7 T 0 1 354145 CASAVA_Build 8 14414506 1D CACCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 7 T 11 10 354146 CASAVA_Build 8 14417992 1I GAAACTTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 9 10 354147 CASAVA_Build 8 14432576 1I TCAAGAATGA -/T TTATATGCCT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 2 3 354148 CASAVA_Build 8 14433153 2D ACTGGCAATC CA/-- CTTTCGGGTC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 CA 1 0 354149 CASAVA_Build 8 14434126 1D CCAGAATCTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 A 9 8 354150 CASAVA_Build 8 14436225 2D TCTGTCTAAA CT/-- CTCTGAAACT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 CT 3 2 354151 CASAVA_Build 8 14436569 1I AAGGGTACAA -/G GGTAACAATA 3070 het 3070 hom 49 18 20 11 G 2 3 354152 CASAVA_Build 8 14439441 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 T 9 10 354153 CASAVA_Build 8 14445308 1D AATCATTATT A/- CATGATTGGG 3070 het 3070 ref 41 19 15 8 A 1 0 354154 CASAVA_Build 8 14462216 2D TATATACAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 29 13 12 5 AT 6 5 354155 CASAVA_Build 8 14466202 1D GTTGATCATA T/- TTAGATTTAA 3070 hom 151 het 56 0 51 5 T 3 2 354156 CASAVA_Build 8 14468297 1D CCTGCTGGGT C/- GATTCCCTAC 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 C 1 0 354157 CASAVA_Build 8 14474385 4I CCAGAGAGGG ----/AAGT AAGTTTATTA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 AAGT 1 2 354158 CASAVA_Build 8 14475246 1I CCCGGCTAAA -/T TTTTTTTTGT 1004 het 1004 ref 11 5 4 2 T 8 9 354159 CASAVA_Build 8 14477786 1I ACCCTGTCTC -/A AAAATAACAA 787 het 145 hom 19 1 5 13 A 4 5 354160 CASAVA_Build 8 14488908 1I TTCTTACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 10 11 354161 CASAVA_Build 8 14490081 1D TACCCAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 224 hom 24 3 16 5 A 13 12 354162 CASAVA_Build 8 14494475 1D TTCCTTATTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 18 15 5 A 10 9 354163 CASAVA_Build 8 14500146 4D TTTGAGTATC TCAA/---- TCAATCTAAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TCAA 2 1 354164 CASAVA_Build 8 14500360 2D GGTTTTATCA TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 33 9 19 6 TC 6 5 354165 CASAVA_Build 8 14501136 1D TCAAATCCCT C/- CTTACCTATT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 C 2 1 354166 CASAVA_Build 8 14507140 1D CTTTTTAAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 11 17 6 T 9 8 354167 CASAVA_Build 8 14507865 1I TAATATGCCA -/G AAAACTGATA 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 G 0 1 354168 CASAVA_Build 8 14508210 1I ATTTGGTTCC -/T TAAACCTCCT 3070 het 3070 ref 57 31 22 4 T 1 2 354169 CASAVA_Build 8 14510141 2I TATTTGAGGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 10 13 14 T 10 12 354170 CASAVA_Build 8 14510537 2I ATTTGGTGGG --/GC CTGGTGGAAG 3070 hom 33 het 13 0 11 2 GC 0 1 354171 CASAVA_Build 8 14513213 2D TGTGGGTCTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 11 het 24 1 18 6 TG 7 6 354172 CASAVA_Build 8 14516879 2D TGTGTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 42 het 33 1 28 5 TG 7 6 354173 CASAVA_Build 8 14516893 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 110 het 42 0 39 3 TA 6 5 354174 CASAVA_Build 8 14519972 2I TATCCAACAG --/AT ATATTTATGG 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 AT 2 3 354175 CASAVA_Build 8 14521099 1D ATGCAGAAAA G/- GCCTTTGACA 2449 het 1994 hom 9 4 5 0 G 2 1 354176 CASAVA_Build 8 14529632 1I AATTACTTCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 9 10 354177 CASAVA_Build 8 14530231 1D CTGATAACCT C/- CCTCTAATCG 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 C 3 2 354178 CASAVA_Build 8 14531228 23D TAGGTAAGAT TAATGTAAAATACATTATCTAAA/----------------------- TAATGTAAAA 3070 het 3070 ref 29 19 16 4 TAATGTAAAATACATTATCTAAA 1 0 354179 CASAVA_Build 8 14531602 1D TATTTAGGAC T/- TTTTTAGGGT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 6 5 354180 CASAVA_Build 8 14532117 1D TGTGTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 16 7 T 12 11 354181 CASAVA_Build 8 14532574 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAAGATG 3070 het 3070 hom 18 7 10 1 A 6 7 354182 CASAVA_Build 8 14533172 2D ATTCTTTTTT TA/-- TTATTATTAT 3070 hom 52 het 42 0 18 25 TA 1 0 354183 CASAVA_Build 8 14533938 1I TGTTCTGTTG -/C CAGGTTGAAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 C 1 2 354184 CASAVA_Build 8 14536955 2D ATTTAAAAAC AT/-- ATAGAAATTT 3070 het 3070 ref 24 13 10 2 AT 2 1 354185 CASAVA_Build 8 14539191 1D TCTATTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 T 11 10 354186 CASAVA_Build 8 14539456 1I GCAGTATTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 55 24 28 3 T 8 9 354187 CASAVA_Build 8 14545896 1I CCTGGTAGTA -/T TTTTACATGT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 T 4 5 354188 CASAVA_Build 8 14547894 5D TTGAACAAAT TAAAG/----- TAGCTTGTAG 3070 het 3070 hom 28 13 14 4 TAAAG 1 0 354189 CASAVA_Build 8 14548325 1D CATTATCCAA C/- CCACTGTTGA 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 C 3 2 354190 CASAVA_Build 8 14552358 1D CCAACGGTTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 48 17 21 11 T 9 8 354191 CASAVA_Build 8 14556115 1D CAGAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 10 8 A 12 11 354192 CASAVA_Build 8 14556619 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1684 het 1684 ref 23 13 5 5 T 14 12 354193 CASAVA_Build 8 14558078 21D ACCAGCAAAG CAGAGATAAAGTGTCTTTATC/--------------------- CAGAGATAAA 3070 het 3070 ref 35 19 16 6 CAGAGATAAAGTGTCTTTATC 1 0 354194 CASAVA_Build 8 14558295 4D TCCTCTCCTC TCCT/---- TCCTTCCTTC 1813 het 1813 ref 38 12 7 21 TCCT 4 3 354195 CASAVA_Build 8 14558412 20D TTTTCTTTCT TTTTTCTTTCTTTCCCTTTC/-------------------- TTTTTCTTTC 2884 het 2884 ref 28 15 10 7 TTTTTCTTTCTTTCCCTTTC 1 0 354196 CASAVA_Build 8 14558492 2D TCTCCCTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 36 13 10 13 CT 8 7 354197 CASAVA_Build 8 14586983 1I ATTATTTAAA -/C CACATTAATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 1 2 354198 CASAVA_Build 8 14602774 4D ATTCCAAAAA TAGT/---- TAGCAAGAAG 3070 hom 72 het 26 0 23 7 TAGT 1 0 354199 CASAVA_Build 8 14620540 1D ATGCTATAAT A/- AAAAAACTGT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 7 6 354200 CASAVA_Build 8 14622793 2D ATGGAAACTG TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 14 13 7 T 10 8 354201 CASAVA_Build 8 14634814 1D TATTACCTAC A/- AAATAAGATT 3070 het 3070 ref 39 21 17 2 A 4 3 354202 CASAVA_Build 8 14636730 1D ACCTTAATTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 A 8 7 354203 CASAVA_Build 8 14650634 5D TGAACACTAG AAATA/----- AAATAAATTA 3070 het 3070 ref 26 12 11 5 AAATA 2 1 354204 CASAVA_Build 8 14653707 1D GGATTACAGG T/- TGTGAGCCAC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 T 2 1 354205 CASAVA_Build 8 14717124 1D CTCAATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 7 10 6 T 12 11 354206 CASAVA_Build 8 14749389 1I ATTAACAAGT -/A AAAAAAAAAG 2300 het 2300 ref 20 13 5 2 A 9 10 354207 CASAVA_Build 8 14796644 1I TATAAACTAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 8 9 354208 CASAVA_Build 8 14819196 1D AAGCAAGAGA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 37 12 18 8 T 8 7 354209 CASAVA_Build 8 14826418 1D GAATAAGTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 10 9 354210 CASAVA_Build 8 14827745 1D GGGAATTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 A 10 9 354211 CASAVA_Build 8 14829432 1D AAGAAAGAAG A/- GGGAGAGAGA 3070 het 2579 hom 23 6 16 2 A 1 0 354212 CASAVA_Build 8 14842579 1D AAGGTAAAGG A/- AAAAACAACA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 6 5 354213 CASAVA_Build 8 14882636 1D CTGGGTCCCT C/- CCCACAACAT 3070 hom 126 het 43 0 43 0 C 4 3 354214 CASAVA_Build 8 14885073 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 31 0 21 10 T 11 10 354215 CASAVA_Build 8 14886826 1D TTTTTCTGGG C/- CACAGTATCT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 2 1 354216 CASAVA_Build 8 14892270 1D AGTGGCAAGC A/- AGCCAGCCAA 3070 het 3070 ref 39 19 12 9 A 2 1 354217 CASAVA_Build 8 14904083 1I AGTCAGCTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 37 0 28 9 A 11 12 354218 CASAVA_Build 8 14906754 11I ACTGACGGGT -----------/TCTTTAATCTA TCTTTGTGTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCTTTAATCTA 0 1 354219 CASAVA_Build 8 14907199 4D6M2D CCCCCGTTTT TTTCTTTTTCTT/----TTGTTC-- TTTTTTTTTT 1710 het 22 hom 6 1 4 2 N/A 0 0 354220 CASAVA_Build 8 14907448 1D TGACCTCAGG T/- TGTTCCGCCC 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 2 1 354221 CASAVA_Build 8 14929281 1D TGGCTCAAAT A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 7 6 354222 CASAVA_Build 8 14936668 2D CTTTACAGAC AA/-- GAGAGAGTGG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 2 0 354223 CASAVA_Build 8 14939977 1D ACAGAAATAT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 92 het 37 0 31 6 A 9 8 354224 CASAVA_Build 8 14956842 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 232 hom 25 1 17 7 A 16 15 354225 CASAVA_Build 8 14966415 18D CAGGCCTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 37 11 19 8 A 26 8 354226 CASAVA_Build 8 14977106 1D GTAGTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 12 11 354227 CASAVA_Build 8 14979892 1I GGACTGGAGG -/C CCCCATGCAC 3070 hom 105 het 40 0 34 6 C 4 5 354228 CASAVA_Build 8 14988545 1I TCTGTAATTG -/A AAAAAATAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 7 354229 CASAVA_Build 8 14990485 11D GAGACTTAAA GCTAGGAACTC/----------- CTAAGTTCCT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 GCTAGGAACTC 1 0 354230 CASAVA_Build 8 14992506 1I AGAGCCAGAG -/A AAACTGATTA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 3 4 354231 CASAVA_Build 8 15001838 2D CTTCCCTGAC AA/-- AAAAAAAAGT 3070 hom 105 het 39 0 36 6 A 10 8 354232 CASAVA_Build 8 15006579 2D CAGCATCTTC CT/-- ATTTGAGCAC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 CT 1 0 354233 CASAVA_Build 8 15015088 1D GACCTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 388 hom 32 4 20 10 A 15 14 354234 CASAVA_Build 8 15033652 1D TTATCCCATG A/- AAACTAGCCA 3070 hom 93 het 37 0 31 7 A 4 3 354235 CASAVA_Build 8 15043776 3D TGAGACTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 20 6 A 14 11 354236 CASAVA_Build 8 15048023 1D GAAAACTAAG A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 24 14 8 4 A 7 6 354237 CASAVA_Build 8 15051057 1I ATTATTCTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 37 10 16 11 T 9 10 354238 CASAVA_Build 8 15051970 1D AAGGCTCTAC A/- ATCAAAATGT 2569 het 2569 ref 28 19 8 1 A 2 1 354239 CASAVA_Build 8 15052124 1D TATGTTTGAT A/- AAAATGAATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 5 4 354240 CASAVA_Build 8 15055132 3D CATGAAAATA AAC/--- AACATAAAAC 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 AAC 2 1 354241 CASAVA_Build 8 15069561 1I TGGGATGTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 329 hom 24 1 21 2 A 9 10 354242 CASAVA_Build 8 15070523 5I GGACACCTGT -----/TCCCC TCCCCTCTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 TCCCC 1 2 354243 CASAVA_Build 8 15071486 1D TAGACTAGGC G/- GCTAATAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 G 2 1 354244 CASAVA_Build 8 15076939 2D CCACATGTAT AC/-- CAATGTAACA 3070 het 3070 ref 45 26 17 3 AC 1 0 354245 CASAVA_Build 8 15080683 1D GCAGGGAAGG A/- AAAAAACTAG 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 A 7 6 354246 CASAVA_Build 8 15082658 1D CCCCAGCTAC T/- CAGGAGGCTG 3070 het 1448 hom 15 4 11 0 T 1 0 354247 CASAVA_Build 8 15085054 4D TTTTATAAGT AGAA/---- AGATTACACT 3070 het 3070 ref 29 15 12 3 AGAA 1 0 354248 CASAVA_Build 8 15086419 1D ACACCAGGCC T/- CGGGAGACTG 2948 het 2948 ref 36 16 10 10 T 1 0 354249 CASAVA_Build 8 15087982 2D ATAAAAAAAT AA/-- AAAAAAAACT 2265 hom 15 het 6 0 6 0 A 10 8 354250 CASAVA_Build 8 15091448 1I CCTTGAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 11 12 354251 CASAVA_Build 8 15098446 6I AAAGTTTTCA ------/TTTAAC TTTGACTACA 2043 het 2043 ref 23 16 5 2 TTTAAC 0 1 354252 CASAVA_Build 8 15110987 1I CACAAATATC -/T TTAGTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 2 3 354253 CASAVA_Build 8 15111356 19D44M8I GCATAATAGT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGGCTTTCAGCTTGTGTTAAATACCTAAGTATAA--------/-------------------AAAAAAAAAGTGACTTTCAGCTTGTGTTAAATACCTAAGTATAAAAAGAATG AAAGAATGAA 3070 het 3070 hom 25 17 18 8 N/A 0 0 354254 CASAVA_Build 8 15111652 2D6M1I CTTAAAAAAA TTAATTAA-/--AATTAAT TTAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 26 14 11 2 N/A 0 0 354255 CASAVA_Build 8 15112374 1D TTGCTCTGAC T/- TTACCCTTTG 3070 het 3070 ref 40 22 16 4 T 3 2 354256 CASAVA_Build 8 15113163 1I CTGGTTGCCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 16 11 14 A 11 12 354257 CASAVA_Build 8 15127189 1D ATAGGAACAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 45 24 18 6 A 9 8 354258 CASAVA_Build 8 15128711 1D TAACAGAAGG A/- AAAAAGCAGA 3070 het 3070 hom 47 18 28 2 A 6 5 354259 CASAVA_Build 8 15138558 1D TAAATATATA T/- ATTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 1 0 354260 CASAVA_Build 8 15143687 3I ATATAATTCT ---/TAA TAATAATCTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TAA 2 3 354261 CASAVA_Build 8 15145231 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 9 10 354262 CASAVA_Build 8 15158607 1D AGTAGTAGAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1876 hom 43 7 27 9 A 10 9 354263 CASAVA_Build 8 15167313 1D CTGGACAGAC T/- TGAAAAATCA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 2 1 354264 CASAVA_Build 8 15177212 3D ACGTCTACCA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 52 25 21 7 AAC 4 3 354265 CASAVA_Build 8 15178737 1D ATACTCTTGT C/- ATATAATCAA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 C 1 0 354266 CASAVA_Build 8 15180756 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTCTTCAC 3070 het 3070 hom 51 22 28 1 T 5 4 354267 CASAVA_Build 8 15180841 1I TTCTCATTAC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 A 7 8 354268 CASAVA_Build 8 15188312 1D TGGCCTTTGT A/- AGCAATGGTA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 2 1 354269 CASAVA_Build 8 15189908 11D TGTTTCTTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 131 hom 26 2 15 10 T 23 12 354270 CASAVA_Build 8 15198096 1D GAATATTTAT A/- TTTTTTTACA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 1 0 354271 CASAVA_Build 8 15201063 1I GTGCAGTGAT -/G GCGATCCTGG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 1 2 354272 CASAVA_Build 8 15211626 1D35M2I AACTGTCTGA GAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAACAAACAA--/-AAAAAAAAAACTAAAAACAAAAAACAAACAAACAAAC AAAAAACTCG 3070 hom 51 het 15 0 17 5 N/A 0 0 354273 CASAVA_Build 8 15212822 1I AGCCAAGAAG -/C CAGGATCAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 C 1 2 354274 CASAVA_Build 8 15213141 1D TCCCTTTCTA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 354275 CASAVA_Build 8 15222058 7D TTACTAACTG TAACTAA/------- GACATACATT 3070 hom 160 het 56 0 53 4 TAACTAA 1 0 354276 CASAVA_Build 8 15224984 1I TTAATGATGA -/T TTTTTTGCAT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 6 7 354277 CASAVA_Build 8 15235536 5D AAGGAGCAGA GAAAT/----- GGTGGTCACT 3070 hom 96 het 33 0 33 2 GAAAT 1 0 354278 CASAVA_Build 8 15237697 1D AAAGGCAACC T/- TTGTCCATAA 3070 hom 107 het 44 0 35 10 T 3 2 354279 CASAVA_Build 8 15238155 1D ATGTGTACAC A/- AAAGTAATTT 3070 het 2458 hom 23 6 14 3 A 4 3 354280 CASAVA_Build 8 15240605 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 60 het 30 0 21 9 T 8 9 354281 CASAVA_Build 8 15240752 1D TGTTTGACTC T/- TTTGGCCACA 3070 hom 129 het 45 0 44 2 T 4 3 354282 CASAVA_Build 8 15242208 1I TGTGGTTCAG -/A ACAAATGTGA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 1 2 354283 CASAVA_Build 8 15245633 5D TTGATAATTG AAGTT/----- AAGTGAATAT 3070 hom 81 het 30 0 28 3 AAGTT 1 0 354284 CASAVA_Build 8 15251612 1D TAATGCAAAA G/- AAAAAGAATT 3070 hom 75 het 34 0 26 9 G 1 0 354285 CASAVA_Build 8 15253265 1D CTACAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 393 hom 43 1 37 5 A 12 11 354286 CASAVA_Build 8 15258885 2I ATGTGTGTGC --/AT ATATGTGTGT 3070 het 30 hom 50 2 37 11 AT 2 3 354287 CASAVA_Build 8 15259311 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2017 het 2017 ref 15 9 6 0 TA 6 7 354288 CASAVA_Build 8 15260099 1D ATTACACATG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 A 9 8 354289 CASAVA_Build 8 15262129 9D TTATCTCACA AAGTTTCTG/--------- AAGGTCATGA 3070 het 3070 ref 37 21 12 7 AAGTTTCTG 1 0 354290 CASAVA_Build 8 15263264 3D ACATAAACCA GAG/--- TAGTGCAGGG 3070 hom 120 het 45 0 40 7 GAG 1 0 354291 CASAVA_Build 8 15268008 1I AAATAGAAAA -/T TCAAACAAGA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 2 354292 CASAVA_Build 8 15269628 1D ATCCAAGGGC A/- AAGGTCTAGT 3070 het 3070 hom 57 24 25 9 A 3 2 354293 CASAVA_Build 8 15275177 1D CTGCACCTGG C/- CGGGATGGTT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 C 2 1 354294 CASAVA_Build 8 15276885 1I CTGGCATTGG -/C CCCCCCTGGC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 C 6 7 354295 CASAVA_Build 8 15277321 1D TAAATATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 12 11 354296 CASAVA_Build 8 15278045 1I ATTTATTTTA -/T ATTCTATGTT 3070 het 3070 hom 37 18 19 0 T 0 1 354297 CASAVA_Build 8 15283401 1I CTAAACTCAA -/G TCACCTTCTC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 G 0 1 354298 CASAVA_Build 8 15291885 1I AAATAGTAAT -/A GGCCGGGCAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 0 1 354299 CASAVA_Build 8 15292168 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 13 0 11 2 A 10 11 354300 CASAVA_Build 8 15294455 1I AGATATTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 10 11 354301 CASAVA_Build 8 15296228 2D GCCTAAGTCC AA/-- AAAAAAAAAA 1614 het 599 hom 32 2 5 25 A 16 14 354302 CASAVA_Build 8 15296640 1I AGGTCCAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 248 hom 38 1 34 3 A 8 9 354303 CASAVA_Build 8 15300160 1I CATTATTTCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 9 10 354304 CASAVA_Build 8 15303370 1D28M6I GGTATTAAAG CCATTTGATGACCCAACCAGCCCATGATT------/-CATTTGATGACCCAACCAGCCCATGATTTTATCA TTATCATTTT 3070 hom 111 het 31 0 38 4 N/A 0 0 354305 CASAVA_Build 8 15306361 1I AATTGATATG -/C CCCCCCTCCC 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 C 6 7 354306 CASAVA_Build 8 15312866 1I AAACTCCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 A 11 12 354307 CASAVA_Build 8 15318439 1I TTATTGTTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 8 9 354308 CASAVA_Build 8 15322482 1D CAGTTTCTGC A/- AAAATTCCTC 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 A 5 4 354309 CASAVA_Build 8 15323266 1D TTACGGTAGT A/- ACTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 54 24 21 11 A 2 1 354310 CASAVA_Build 8 15326759 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2283 het 2283 ref 23 10 8 5 A 13 12 354311 CASAVA_Build 8 15346647 1D ATATGTATAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 9 8 354312 CASAVA_Build 8 15348791 3I AAAAAAAAAC ---/AAA AAAGGAGGTA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 3 6 354313 CASAVA_Build 8 15352100 5D TGTTTATCAT TTTTC/----- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 TTTTC 2 1 354314 CASAVA_Build 8 15355137 1D GCCATAATTA T/- TTTCAAATTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 4 3 354315 CASAVA_Build 8 15358989 1D TAGGTGGGAA T/- TGAACAATGA 3070 het 1465 hom 27 4 20 3 T 2 1 354316 CASAVA_Build 8 15359756 3I AATTAATTAG ---/ATA ATAATTACTA 1808 hom 12 het 8 0 5 3 ATA 1 2 354317 CASAVA_Build 8 15370870 4I CCCTGAAGAG ----/AATT AATTAATGAA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 AATT 1 2 354318 CASAVA_Build 8 15371986 1I AAAAATTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2058 hom 28 7 12 9 A 11 12 354319 CASAVA_Build 8 15373007 3I GTGCAAACAT ---/TTC TTCTTTGATT 3070 hom 129 het 46 0 42 4 TTC 1 2 354320 CASAVA_Build 8 15373393 5D ATGAGATTTC TTAAA/----- TTAACTTAAA 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 TTAAA 1 0 354321 CASAVA_Build 8 15384886 3I CAAAAGAATG ---/ATA ATAATTTAAC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 ATA 1 2 354322 CASAVA_Build 8 15385195 1I AAAAGCACTG -/T TTTTTGTTGT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 T 5 6 354323 CASAVA_Build 8 15393081 2D AAGGGATGAC TT/-- TGAGTTCTGT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 T 3 1 354324 CASAVA_Build 8 15394662 1D CATAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2968 het 2673 hom 24 9 7 8 A 13 12 354325 CASAVA_Build 8 15401764 2D ACATACATAC GT/-- ACACACACAC 1053 het 1053 ref 51 29 4 20 GT 1 0 354326 CASAVA_Build 8 15412654 1I GATACTATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 A 9 10 354327 CASAVA_Build 8 15419403 18D AGCGTGAGGC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 26 0 18 13 A 34 16 354328 CASAVA_Build 8 15426707 1I TAGAAAGAGA -/T TCCCAGAATA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 1 2 354329 CASAVA_Build 8 15439037 3I TCTCTGAAGT ---/CTG CTGTCTGAGA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 CTG 1 2 354330 CASAVA_Build 8 15445124 3D ATATAATAAA TAT/--- TATTGACATA 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 TAT 2 1 354331 CASAVA_Build 8 15449569 1I10M1D TGGGAAGTGA -TAGGTCCTCAG/TTAGGTCCGCA- GGGTGCCGCC 3070 hom 72 het 26 0 24 4 N/A 0 0 354332 CASAVA_Build 8 15456044 1I TCTCTTCAAA -/G CCCCACCTTC 3070 hom 154 het 57 0 52 5 G 0 1 354333 CASAVA_Build 8 15471788 2I TCTCTAATTT --/AA TTAAATTCAG 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 A 0 2 354334 CASAVA_Build 8 15477042 1I GATAGATGTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 8 9 354335 CASAVA_Build 8 15477852 3D GTGAATTGAT ATA/--- ATAACTGAGT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 ATA 2 1 354336 CASAVA_Build 8 15493224 4I ATCCTCACTT ----/AGAA AGGCTTTCTC 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 AGAA 0 1 354337 CASAVA_Build 8 15500468 16I CTAAAACTCG ----------------/TCTGTGTCTCACCTAT TCATACTTCC 3070 hom 157 het 57 0 53 5 TCTGTGTCTCACCTAT 0 1 354338 CASAVA_Build 8 15503798 1I TATTTATGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 T 9 10 354339 CASAVA_Build 8 15505668 2D GCTAATTCTA TT/-- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 44 18 16 10 T 10 8 354340 CASAVA_Build 8 15506680 1D TAGCCCTACA T/- TTTTTCTATA 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 T 6 5 354341 CASAVA_Build 8 15511633 2I AACAAACATT --/AA TAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 23 15 11 A 0 2 354342 CASAVA_Build 8 15514945 2I TATATATATG --/AT ATATATATAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AT 8 9 354343 CASAVA_Build 8 15515114 1I CTTACAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 18 10 7 1 T 11 12 354344 CASAVA_Build 8 15515896 2D TGTTTTGTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 29 1 15 15 T 15 13 354345 CASAVA_Build 8 15522877 4D GTGTCTGTGT GTGA/---- GTGTGTGTTG 2223 het 2223 ref 20 10 5 7 GTGA 1 0 354346 CASAVA_Build 8 15523385 2D TAAAATACAC AT/-- AAATATATGT 3070 het 431 hom 13 2 10 1 AT 1 0 354347 CASAVA_Build 8 15523661 1I TGGGTCTTTT -/A AAAAAAAAAA 2790 het 2790 ref 28 11 9 8 A 10 11 354348 CASAVA_Build 8 15524691 1I TTGAGCCTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 9 10 354349 CASAVA_Build 8 15528861 1D CCTGAAGCCT G/- GGGGGCTGGG 2813 hom 38 het 19 0 9 10 G 6 5 354350 CASAVA_Build 8 15531617 1D TCTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 2272 het 2272 ref 30 16 8 6 A 13 12 354351 CASAVA_Build 8 15531895 1D AGCTCCAAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 T 9 8 354352 CASAVA_Build 8 15532344 5D TATATATATT ATGTC/----- ATGTGATTCT 3070 het 3070 hom 37 17 19 6 ATGTC 1 0 354353 CASAVA_Build 8 15541663 1I ATAAGAGTCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 703 hom 37 2 20 15 T 14 15 354354 CASAVA_Build 8 15544712 1I TTGAAGTATC -/T TTGAGGCAGT 3070 het 3070 hom 44 20 22 2 T 2 3 354355 CASAVA_Build 8 15564375 4I TTTTCACTGC ----/TAAA ATGTACTGTC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TAAA 0 1 354356 CASAVA_Build 8 15571876 1D AATGCATCAT A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 7 6 354357 CASAVA_Build 8 15575878 4D ACATGTGCAT ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 30 17 9 5 AC 7 5 354358 CASAVA_Build 8 15577293 1D TATTGTATTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 9 8 354359 CASAVA_Build 8 15581980 1D TTAGAATAGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 T 10 9 354360 CASAVA_Build 8 15583099 1I TCCGTCCTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 941 hom 26 2 17 7 T 9 10 354361 CASAVA_Build 8 15583440 1I ATCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 35 0 23 12 T 11 12 354362 CASAVA_Build 8 15587739 2D50M10I AGTTCTTAGG TTTTTTTTTTTTTGAAAAATTAGTGGTATTTGTAAGGCTAGTGACTCTGCTC----------/--TTTTTTTTTTTGAAAAATTAGTGGTATTTGTAAGGCTAGTGACTCTGCTCACATTTTCAT ATATTAATTG 3070 het 2231 hom 28 6 11 24 N/A 0 0 354363 CASAVA_Build 8 15591339 1D GTGCCAAGAA G/- GCCGCAGCTG 3000 het 3000 ref 27 14 9 4 G 2 1 354364 CASAVA_Build 8 15593684 2I GTTTTGAGAC --/AG AGTCTCGCTC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 1 2 354365 CASAVA_Build 8 15594542 1D TTCTGAGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 20 16 9 T 12 11 354366 CASAVA_Build 8 15601142 4D TTATTACTGG TAAT/---- TAATTAATTC 3070 hom 114 het 45 0 39 7 TAAT 3 2 354367 CASAVA_Build 8 15606516 2I TAAAGGAAAC --/TT TCTTTTTTTT 3070 hom 107 het 42 0 36 6 T 1 3 354368 CASAVA_Build 8 15606827 3D TGTATTCTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 13 10 354369 CASAVA_Build 8 15624712 1I CTGTTTAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 9 10 354370 CASAVA_Build 8 15634446 1D GATGACCAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 10 9 354371 CASAVA_Build 8 15637147 3D GAGTGACTCA GCT/--- GCTGTTTTAG 3070 het 3070 ref 47 21 19 11 GCT 2 1 354372 CASAVA_Build 8 15641798 4I TTCAGTTTCC ----/TTGT TTGTTTGTAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 TTGT 2 3 354373 CASAVA_Build 8 15643029 2I AACCGATAAC --/AT ATGTTTGTGT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 AT 1 2 354374 CASAVA_Build 8 15644113 25I GTATGGTGGG -------------------------/AGGGTTGATGTTGTGCAGGGGTGGC AGGGGCTTTT 3070 hom 87 het 28 0 29 5 AGGGTTGATGTTGTGCAGGGGTGGC 0 1 354375 CASAVA_Build 8 15646588 3I AAAAGAAAGG ---/AGC AGATTACTTT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 AGC 0 1 354376 CASAVA_Build 8 15647758 1I GAGACAGGCA -/T TTTCCTAGGT 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 T 3 4 354377 CASAVA_Build 8 15649342 2D TTTAAATATC TT/-- TGTCTTTTAT 2280 het 2280 ref 16 9 6 1 T 3 1 354378 CASAVA_Build 8 15651008 1D3M1D TAAATAACTT AACAT/-ACA- TTTTTTCTTT 2550 het 299 hom 19 2 7 14 N/A 0 0 354379 CASAVA_Build 8 15653562 6I AAATACAATG ------/ACAAGT ACAAGTACCT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 ACAAGT 1 2 354380 CASAVA_Build 8 15656211 4D TCCAAGACAG AAAT/---- AAATACATTG 3070 hom 146 het 54 0 49 7 AAAT 2 1 354381 CASAVA_Build 8 15656666 5D TAATTGTCTT TAAAC/----- TAATTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 11 4 TAAAC 1 0 354382 CASAVA_Build 8 15659551 2D CGTCTATCCC CT/-- GTCTTATCTA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 CT 1 0 354383 CASAVA_Build 8 15664785 3I CTGCTGACAT ---/TCG TCTTCATGGA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TCG 0 1 354384 CASAVA_Build 8 15667980 2I GGTTTTCTAG --/TT CTCTTATTTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 0 2 354385 CASAVA_Build 8 15668400 1I CAGTGGAGAG -/A AAAAATCCCA 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 5 6 354386 CASAVA_Build 8 15670038 1D TCTTTTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 10 9 354387 CASAVA_Build 8 15674862 31I AACACAAACA -------------------------------/CTCAACAAAATAGGAATAAAAAGAGGATTTT CTCAACATTA 3070 hom 132 het 47 0 45 7 CTCAACAAAATAGGAATAAAAAGAGGATTTT 0 1 354388 CASAVA_Build 8 15676127 5D CTCCTCAAAA AAGAT/----- AAGTTGAAGT 3070 het 3070 hom 41 18 19 6 AAGAT 1 0 354389 CASAVA_Build 8 15677516 6I ACAGACACAT ------/ATATAC ATATATATAT 2296 hom 15 het 7 0 6 1 ATATAC 0 1 354390 CASAVA_Build 8 15677532 4I ATATATATAC ----/ATAT ACACACATAT 1955 hom 21 het 9 0 7 2 AT 0 2 354391 CASAVA_Build 8 15678814 1D GTGTTCATTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 21 21 2 A 10 9 354392 CASAVA_Build 8 15679980 1I ACTTTAAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 17 5 A 12 13 354393 CASAVA_Build 8 15686887 2I ATTGTACCTA --/AT ATATATATAT 2674 het 2674 ref 28 14 8 6 AT 8 9 354394 CASAVA_Build 8 15687699 2D CCAGGAAATG AA/-- AAGAGCCAAA 3070 het 3070 hom 55 27 27 1 A 4 2 354395 CASAVA_Build 8 15693171 2I CCACGCACAA --/AC ACACACACAC 3070 hom 47 het 47 1 33 13 AC 7 8 354396 CASAVA_Build 8 15696597 4D GGAAGCCTAA TAAT/---- GCTTTGGGAA 3070 hom 66 het 26 0 22 6 TAAT 1 0 354397 CASAVA_Build 8 15700524 2I ACTCTCCTGG --/GT GTGTGTGGGG 3070 hom 69 het 32 0 23 9 GT 3 4 354398 CASAVA_Build 8 15705095 1D AATAGAATTT A/- TCTTTCCGGC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 1 0 354399 CASAVA_Build 8 15708312 1D GAAACCAGAG A/- AAAAAATCAC 3070 hom 98 het 36 0 32 4 A 7 6 354400 CASAVA_Build 8 15709113 1D AATTACCCCA C/- CCCCAGGCAT 3070 het 3070 hom 56 21 28 7 C 5 4 354401 CASAVA_Build 8 15709880 2D GTATATGTAC CT/-- CTATTGAATC 3070 hom 63 het 25 0 22 5 CT 2 1 354402 CASAVA_Build 8 15711378 1D AGACCCCCCC T/- GTAGATGCCT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 1 0 354403 CASAVA_Build 8 15714320 1D CTATTTTCCT G/- TGAAGGAAAT 3070 het 3070 hom 48 20 21 7 G 1 0 354404 CASAVA_Build 8 15719229 1I TTAAGACTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 10 11 354405 CASAVA_Build 8 15720945 1D TCTCTACAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 11 15 10 A 10 9 354406 CASAVA_Build 8 15721278 1I AATTTTCTAT -/A ACTACTTTCT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 2 354407 CASAVA_Build 8 15723679 1D GTGTTTTGTT C/- ACAAATTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 16 7 C 1 0 354408 CASAVA_Build 8 15725689 1I GAGTTAACGA -/T TAACACCTGT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 1 2 354409 CASAVA_Build 8 15726354 1I TGAACTCATC -/T ATTTTTTATG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 0 1 354410 CASAVA_Build 8 15727641 1D CTCCTATGCA T/- TTTTTTGCCC 3070 het 3070 ref 47 24 14 10 T 7 6 354411 CASAVA_Build 8 15728641 1D ATGGTGAGGG A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 ref 38 13 13 12 A 8 7 354412 CASAVA_Build 8 15732027 1D GGTTGTTAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 18 14 9 T 10 9 354413 CASAVA_Build 8 15733417 12I ACTCAATCTA ------------/GAAAGCAAGATT GAAAGCAAAG 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 GAAAGCAAGATT 0 1 354414 CASAVA_Build 8 15735569 6D ACCTAACAAA AGGTAG/------ AGGGTGGGAG 3070 hom 102 het 38 0 33 8 AGGTAG 1 0 354415 CASAVA_Build 8 15736120 3I AATAAAATTA ---/CTG CTTTCTTCAT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 CTG 0 1 354416 CASAVA_Build 8 15737738 5I GGACTGAAAG -----/AAGTA AATTATAATT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AAGTA 0 1 354417 CASAVA_Build 8 15738025 1D TATAAAATTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 T 9 8 354418 CASAVA_Build 8 15739099 1D GGATTATGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 9 8 354419 CASAVA_Build 8 15750476 6D GGTGAAACTC AAACTT/------ AAACATTCTT 3070 het 3070 ref 48 25 18 13 AAACTT 1 0 354420 CASAVA_Build 8 15751992 1I TTGTTTATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 16 13 T 13 14 354421 CASAVA_Build 8 15754928 6I GTCTGCTTTG ------/CCTCTT CCTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 CCTCTT 1 2 354422 CASAVA_Build 8 15758311 1D ATTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 20 17 4 T 10 9 354423 CASAVA_Build 8 15759656 7D TTCTCAGGAC AACAAAG/------- TTTTCTCTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 6 AACAAAG 1 0 354424 CASAVA_Build 8 15761727 1I AAAACAGTTT -/G GGGTGGTGGC 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 G 3 4 354425 CASAVA_Build 8 15768681 2I AAAAAGCTCC --/TG TGTACACCAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 TG 1 2 354426 CASAVA_Build 8 15773175 1I AATTTTATTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 8 9 354427 CASAVA_Build 8 15773961 1D AGAAAGAAGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 22 0 21 2 A 9 8 354428 CASAVA_Build 8 15774719 1D CTCAATAGAC A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 39 14 22 4 A 9 8 354429 CASAVA_Build 8 15775639 1D AAGCTACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 12 11 354430 CASAVA_Build 8 15779749 2D CCAAATTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 39 0 29 10 A 14 12 354431 CASAVA_Build 8 15782722 2D TTAATTAAAC AT/-- TGGTTTATAA 3070 hom 81 het 33 0 28 6 AT 1 0 354432 CASAVA_Build 8 15797854 1I GCCTTTAAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 53 het 37 1 27 9 T 8 9 354433 CASAVA_Build 8 15801005 3D CGCCCACGTG CCT/--- CCTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 CCT 2 1 354434 CASAVA_Build 8 15806473 2I GTGAGACCTC --/CT CTCTCTATAT 3070 het 2982 hom 26 8 16 2 CT 3 4 354435 CASAVA_Build 8 15809130 1I TGGGCAAATG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 46 14 19 13 T 8 9 354436 CASAVA_Build 8 15815752 2D GACAATGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 103 het 48 0 35 13 GT 10 9 354437 CASAVA_Build 8 15817672 1D CAGGTTAGAG C/- CTTGTAGAGT 3070 het 3070 ref 30 19 10 1 C 2 1 354438 CASAVA_Build 8 15818584 1I TACGCACTTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 8 9 354439 CASAVA_Build 8 15823789 1I TTTATTATTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 2248 hom 19 7 10 2 T 8 9 354440 CASAVA_Build 8 15833888 1I GCTTTGTGAA -/G GCTATAGGGG 3070 hom 135 het 52 0 46 6 G 1 2 354441 CASAVA_Build 8 15839044 1I GCCTCTCATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 9 10 354442 CASAVA_Build 8 15840443 2D TATTTATGTG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 A 11 9 354443 CASAVA_Build 8 15843393 1D AAGAAGTCCA G/- CTAGGTTTCA 3070 het 3070 ref 42 24 13 6 G 1 0 354444 CASAVA_Build 8 15849269 1D TCATTCTTTC T/- ATAGATTTTA 3070 het 3070 ref 41 24 14 4 T 1 0 354445 CASAVA_Build 8 15855503 1D TTGCTCAGGC T/- GTTTTCAAAT 3070 het 3070 hom 48 18 19 12 T 1 0 354446 CASAVA_Build 8 15865877 2D GACTCCTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 14 12 354447 CASAVA_Build 8 15873648 1I TTTTTAGTAG -/A GACGCGGTTT 3070 het 2977 hom 23 8 14 1 A 0 1 354448 CASAVA_Build 8 15892356 5I TTCTAACATT -----/TAGTC TATTCTGCAG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 TAGTC 0 1 354449 CASAVA_Build 8 15906638 1D ATTTTGAACA C/- CCACCCCTGA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 3 2 354450 CASAVA_Build 8 15909135 1D AAAGTAAAAA G/- AAAAAAAAAA 3070 het 2353 hom 32 12 16 4 G 1 0 354451 CASAVA_Build 8 15910078 1D TATGAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 1301 het 1301 ref 38 24 4 10 T 13 12 354452 CASAVA_Build 8 15915200 1D TAAAAAAAAA T/- ATATATGTAA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 T 1 0 354453 CASAVA_Build 8 15922483 5I TGTGATTCTT -----/TACAC TAAACAGGCA 3070 het 3070 ref 47 26 12 9 TACAC 0 1 354454 CASAVA_Build 8 15924010 1D ATTCCATATC A/- CTTGCTATTT 3070 hom 130 het 46 0 43 4 A 1 0 354455 CASAVA_Build 8 15946629 1I AAAATAGGTC -/A CATTTATTAT 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 0 1 354456 CASAVA_Build 8 15948737 3D TAATAATTAA TTT/--- TTAATTCATG 2786 het 2786 ref 19 12 7 0 T 5 2 354457 CASAVA_Build 8 15958809 1I TGCCCCCGCC -/T TTTTTTTGAG 1161 het 1161 ref 22 6 5 11 T 7 8 354458 CASAVA_Build 8 15971537 1I GAAAAAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2348 hom 20 7 12 1 A 10 11 354459 CASAVA_Build 8 15971902 1D GACTTCGTCT A/- AAAAAAAAAA 1404 het 1404 ref 30 15 7 8 A 11 10 354460 CASAVA_Build 8 15978110 4I TCTATATACT ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TA 5 7 354461 CASAVA_Build 8 15981121 1D CATCTCTACT A/- AAAATATAAA 1620 het 1389 hom 10 3 5 2 A 5 4 354462 CASAVA_Build 8 15988035 1D CACCCAATTT C/- CCCCCCCCTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 C 9 8 354463 CASAVA_Build 8 15993208 1I AGCAGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 31 1 22 8 T 10 11 354464 CASAVA_Build 8 15994893 1I TTTCAACTCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 T 8 9 354465 CASAVA_Build 8 16004011 5I AATTTCTTGC -----/TTTAT TATACTGTAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTTAT 0 1 354466 CASAVA_Build 8 16009550 1D GGAAAGTTTT G/- ATTTGAAACT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 1 0 354467 CASAVA_Build 8 16011055 2D GCACCCCCCA CC/-- CCCCCCCCCG 1356 het 162 hom 15 2 4 9 C 11 9 354468 CASAVA_Build 8 16016112 1I TACCCTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2445 hom 30 5 21 4 T 10 11 354469 CASAVA_Build 8 16025465 2D GACATGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 33 0 25 9 TG 10 9 354470 CASAVA_Build 8 16031659 1I TACATCTTAA -/G GGGCAGGACA 3070 het 3070 hom 45 17 25 3 G 3 4 354471 CASAVA_Build 8 16038923 1I TTATGGAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 A 9 10 354472 CASAVA_Build 8 16039313 4D TTTCTGCCTT TCTC/---- TCTCTCTATC 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 TC 5 3 354473 CASAVA_Build 8 16050371 2I CAGGGTCTCA --/CT CTGTTACCCA 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 CT 1 2 354474 CASAVA_Build 8 16068205 1I ACCTGACTAA -/T TTTTTTTTTT 2053 het 1703 hom 16 4 7 5 T 13 14 354475 CASAVA_Build 8 16072228 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 557 hom 20 3 15 2 A 13 12 354476 CASAVA_Build 8 16087037 1D TATTTTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 928 hom 29 2 24 3 A 12 11 354477 CASAVA_Build 8 16103426 1I AACTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 773 hom 25 3 21 1 T 10 11 354478 CASAVA_Build 8 16117967 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 2370 het 6 hom 11 0 8 3 A 13 12 354479 CASAVA_Build 8 16125178 3D TTGGACAGCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 42 0 36 6 T 13 10 354480 CASAVA_Build 8 16126482 1D AAGTAATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 28 2 15 11 T 11 10 354481 CASAVA_Build 8 16137844 1I AGGCCATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 36 1 24 11 A 10 11 354482 CASAVA_Build 8 16143204 1I ATCCTGTTGG -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 7 8 354483 CASAVA_Build 8 16155499 1D TGTGAAGTGT A/- ATTTCATACT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 2 1 354484 CASAVA_Build 8 16158864 1D TTCCTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 323 hom 19 1 13 5 T 12 11 354485 CASAVA_Build 8 16164171 1D TGACACAGAA G/- GGTCCCTGTT 3070 hom 123 het 43 0 41 4 G 3 2 354486 CASAVA_Build 8 16169723 7D CTTAACAGCA TATAGTT/------- TATAGTTTCA 3070 hom 93 het 35 0 31 6 TATAGTT 2 1 354487 CASAVA_Build 8 16187267 1I AATTCAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 35 hom 35 2 26 7 T 9 10 354488 CASAVA_Build 8 16189196 1I TACATAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 900 hom 45 2 35 8 T 11 12 354489 CASAVA_Build 8 16197440 1I CTTTTTCCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 9 10 354490 CASAVA_Build 8 16216956 4I CTGAAAATGT ----/CTGA CTATTTAGTC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 CTGA 0 1 354491 CASAVA_Build 8 16218518 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 2504 het 2504 ref 49 30 8 11 A 15 14 354492 CASAVA_Build 8 16228940 1I AGACATGGAG -/T TGGCAATTCT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 1 2 354493 CASAVA_Build 8 16253006 4I TGCTGTTTTA ----/TACT TAAAGTACAG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 TACT 0 1 354494 CASAVA_Build 8 16263850 2D CTCTCTCTCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 75 het 38 0 25 14 CT 10 9 354495 CASAVA_Build 8 16271925 1I TCTTCCCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 9 10 354496 CASAVA_Build 8 16280862 2I TGGCGGATAT --/AA AGTTATACTT 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 1 3 354497 CASAVA_Build 8 16283550 4D ATTTCATAAC TAAT/---- TAATATTTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 6 TAAT 2 1 354498 CASAVA_Build 8 16294557 1I ATTGGTTCTA -/T TTTTTCTGGA 3070 hom 82 het 31 0 28 3 T 5 6 354499 CASAVA_Build 8 16297373 1D GGGCTCATGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 9 8 354500 CASAVA_Build 8 16298483 1I ACAACCACCG -/C CCCCCCGCCC 3070 hom 32 het 12 0 11 1 C 6 7 354501 CASAVA_Build 8 16300222 1I AAAAAAAAAA -/T AAGAAAAACT 3070 het 739 hom 35 2 28 5 T 0 1 354502 CASAVA_Build 8 16306538 1D TATTTTCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 13 12 354503 CASAVA_Build 8 16308713 2D GAAATTACTA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AT 8 7 354504 CASAVA_Build 8 16360202 3I AAGAAGATAA ---/TCT TCTTGCAGGA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 TCT 1 2 354505 CASAVA_Build 8 16368454 1I CTACTCCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 10 11 354506 CASAVA_Build 8 16371449 5D GTGTGCATAT ATATG/----- ATATATGTGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATATG 1 0 354507 CASAVA_Build 8 16374248 2D TGTTATTAAC AT/-- ATATATATAT 1895 het 1821 hom 13 5 4 4 AT 10 9 354508 CASAVA_Build 8 16378162 2I GTTTCCTCCT --/AA GAGTTTTATG 3070 hom 69 het 29 0 24 5 A 0 2 354509 CASAVA_Build 8 16380189 4I AGTCAGTCAT ----/AAAC AAGCACCTCC 3070 hom 99 het 41 0 33 8 AAAC 0 1 354510 CASAVA_Build 8 16390810 2D GAGCTGGTGT TG/-- TGTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 41 16 21 8 TG 2 1 354511 CASAVA_Build 8 16393064 1D AACCAACTTC T/- TCAACATTCC 3070 hom 108 het 42 0 37 6 T 2 1 354512 CASAVA_Build 8 16402523 2D TTGTTAACAC AT/-- GTTACCATTA 3070 hom 93 het 35 0 31 5 AT 1 0 354513 CASAVA_Build 8 16402969 2D GATCCCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 2473 het 31 hom 17 1 8 8 A 17 15 354514 CASAVA_Build 8 16465085 1D AGTGCAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 108 het 47 0 36 11 A 11 10 354515 CASAVA_Build 8 16466743 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 213 hom 18 1 12 7 A 11 10 354516 CASAVA_Build 8 16466779 1D CGACATGTCA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 T 2 1 354517 CASAVA_Build 8 16484983 1I CCCTGATACC -/A AAAAAAAAAA 1392 het 1392 ref 34 23 3 8 A 11 12 354518 CASAVA_Build 8 16491133 13D GATGTTGAAA GAGTTTTTATCAT/------------- GAAGGGATGT 3070 hom 84 het 31 0 28 6 GAGTTTTTATCAT 1 0 354519 CASAVA_Build 8 16493593 1I56M1D TTACATTGCT -AAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAGGAAGCTTTTGAAGGCAGCTAGGA/AAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAGGAAGCTTTTGAAGGCAGCTAGG- AAAAAAAAAG 3070 het 778 hom 27 3 19 17 N/A 0 0 354520 CASAVA_Build 8 16507346 2D AATAGGGAAA AG/-- AGAGAGTCTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AG 4 3 354521 CASAVA_Build 8 16564816 1I AGTATGTTGT -/G GGGGGGAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 G 6 7 354522 CASAVA_Build 8 16571876 1I GAATAGTTAA -/T AAAACATTCG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 1 354523 CASAVA_Build 8 16577156 1I CTTAAAGTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 9 10 354524 CASAVA_Build 8 16591120 100D ATGTCAGTTT AAAATGGGGCTTACATATGTATACATGTGCCATGACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGA/---------------------------------------------------------------------------------------------------- AAAATGGGGC 3070 hom 42 het 16 0 14 5 AAAATGGGGCTTACATATGTATACATGTGCCATGACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGA 1 0 354525 CASAVA_Build 8 16627156 3I TACACAGAGC ---/TAT AGGTTTAACT 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TAT 0 1 354526 CASAVA_Build 8 16632448 1I TGGACGAAAT -/A AAATCCCATT 3070 het 3070 ref 40 15 18 7 A 3 4 354527 CASAVA_Build 8 16633176 1D CTCTAAAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 33 0 21 12 A 13 12 354528 CASAVA_Build 8 16633756 1I ACAACCCTAG -/A AAAAAAAAAA 1541 het 1541 ref 41 26 7 8 A 13 14 354529 CASAVA_Build 8 16640414 1I CCTTTAATGC -/T TTCTGGAAAC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 2 3 354530 CASAVA_Build 8 16640734 2D CTTTCCTCTC TT/-- TGCTATACCA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 3 1 354531 CASAVA_Build 8 16640878 3D TGCTGCAAAG CTC/--- CTCAAGAGAC 3070 het 3070 hom 27 11 12 5 CTC 2 1 354532 CASAVA_Build 8 16642245 1D TGCCTTGCTT A/- CCTTCACTTT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 1 0 354533 CASAVA_Build 8 16643397 1I AATAAAAAAA -/T AAATAAATAA 2602 het 300 hom 12 1 8 3 T 0 1 354534 CASAVA_Build 8 16645391 1D AGTTTTGAGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 9 8 354535 CASAVA_Build 8 16646683 1I GTTTTGAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 10 11 354536 CASAVA_Build 8 16648156 23D CATATTCCCA ACATGGCCAATTTCAAGCTCCCG/----------------------- ACATGGTATC 3070 het 3070 hom 43 22 28 9 ACATGGCCAATTTCAAGCTCCCG 1 0 354537 CASAVA_Build 8 16650505 1I CCTCTACCTC -/A ACTGCAACCT 3070 het 2882 hom 29 8 16 5 A 1 2 354538 CASAVA_Build 8 16652440 1D GCCTTTTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 A 12 11 354539 CASAVA_Build 8 16656862 1I TTTTAAGAAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 30 13 11 6 A 8 9 354540 CASAVA_Build 8 16669985 4I TTTTGATGTG ----/TTTA TTTATCATCT 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 TTTA 1 2 354541 CASAVA_Build 8 16670931 1D TAATTGCCTG A/- AAAAAAAGGC 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 8 7 354542 CASAVA_Build 8 16678576 49D AGATCACGCC ACTACAATCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAA/------------------------------------------------- AAAAAAGTGT 2383 het 2383 ref 17 12 7 2 ACTACAATCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAA 1 0 354543 CASAVA_Build 8 16687533 4D GATCATTTCA TCTT/---- TCTTTTTTTT 3070 hom 74 het 32 0 26 6 TCTT 2 1 354544 CASAVA_Build 8 16690091 1D GATCAGGATT G/- TTTTTCAATT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 G 1 0 354545 CASAVA_Build 8 16695139 1D ATAAAATTTT A/- AAAAAAGAAA 2355 hom 18 het 10 0 7 3 A 7 6 354546 CASAVA_Build 8 16696322 2D ACAAGAAACA AC/-- ACTGTGAACC 3070 het 3070 hom 32 13 15 5 AC 2 1 354547 CASAVA_Build 8 16704155 1I TAGAGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 A 9 10 354548 CASAVA_Build 8 16714401 1D CTTCATCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 217 hom 33 1 24 8 A 11 10 354549 CASAVA_Build 8 16714412 1D AAAAAAAAAA T/- GCACTACATT 3070 het 353 hom 34 4 23 9 T 1 0 354550 CASAVA_Build 8 16717392 6I CATGTATATG ------/TAAATT TAAATTTAAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TAAATT 1 2 354551 CASAVA_Build 8 16721271 9I GGGAGAGATG ---------/CCAGCCAAC CCAGCCAACC 3070 het 1570 hom 36 8 12 16 CCAGCCAAC 1 2 354552 CASAVA_Build 8 16724920 1D CCATGTGGCT G/- GGGAGGCCTC 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 G 4 3 354553 CASAVA_Build 8 16726399 1D TGAAATATAA T/- TTTTAAATGT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 5 4 354554 CASAVA_Build 8 16729458 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 2655 het 71 hom 13 2 9 3 AT 8 7 354555 CASAVA_Build 8 16729525 4I10M2I ATGTATATAT ----ATGTATATAT--/ATACATGTATATATAC ATACATGTAT 3070 het 2963 hom 17 8 9 1 N/A 0 0 354556 CASAVA_Build 8 16729771 1I CGTTTTTCTG -/C CTGCTTTATA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 C 1 2 354557 CASAVA_Build 8 16730503 1D ATTACATGTA T/- AATCTGGTAG 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 T 1 0 354558 CASAVA_Build 8 16735173 1D TGTTTAGTCT A/- AAATGTCACA 3070 het 3070 hom 44 11 26 7 A 4 3 354559 CASAVA_Build 8 16740495 1D GGGGTGAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 77 het 36 0 29 8 T 10 9 354560 CASAVA_Build 8 16749858 3D TGGTGACAGG AGA/--- AGATGAAGAG 3070 hom 90 het 36 0 29 8 AGA 2 1 354561 CASAVA_Build 8 16752142 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 20 1 14 5 A 15 14 354562 CASAVA_Build 8 16752897 1D GACAAAAAAA T/- GAATAAATGC 3070 hom 96 het 39 0 32 8 T 1 0 354563 CASAVA_Build 8 16759562 1I AAGCATTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 41 3 31 7 A 11 12 354564 CASAVA_Build 8 16759829 3D CAGGGTGCTG ACT/--- ACTGTAGCAG 3070 hom 88 het 32 0 24 9 ACT 2 1 354565 CASAVA_Build 8 16763050 5I TTTAAATGTG -----/TACGC TACTTTTTAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 TACGC 0 1 354566 CASAVA_Build 8 16773169 1I TTTTAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 901 hom 27 3 18 6 T 10 11 354567 CASAVA_Build 8 16775718 1I CTTGTTTTCA -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 T 7 8 354568 CASAVA_Build 8 16776108 1I TAATTTTTTC -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 7 8 354569 CASAVA_Build 8 16776971 1D CTGTTTTGTC A/- GAAACTAGGA 2442 het 2442 ref 14 8 5 2 A 1 0 354570 CASAVA_Build 8 16780067 2I AGCAAAAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 10 4 A 13 15 354571 CASAVA_Build 8 16782801 2D ATTCTGACAC AT/-- GTTACAATAT 3070 het 3070 hom 54 23 25 7 AT 1 0 354572 CASAVA_Build 8 16790166 4I TAGATATTAC ----/CAAA CAGTTTTCCA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 CAAA 0 1 354573 CASAVA_Build 8 16791966 4D CTTCATATGC AGCA/---- AGCATTTTTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGCA 2 1 354574 CASAVA_Build 8 16796154 2I ATATTCCATG --/GT GTGTGTGTGT 3070 hom 24 het 12 0 9 3 GT 6 7 354575 CASAVA_Build 8 16796820 2I TCTGATTAGT --/AA ATAGCCACTG 3070 hom 101 het 39 0 33 6 A 1 3 354576 CASAVA_Build 8 16801490 1D AATACTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 18 8 5 T 10 9 354577 CASAVA_Build 8 16810032 1D AACGAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 12 12 A 11 10 354578 CASAVA_Build 8 16814519 1I CCACCTCTTC -/A AAAAAAAAAA 1906 het 1906 ref 24 13 5 6 A 15 16 354579 CASAVA_Build 8 16822258 1I ATTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2807 hom 33 10 13 10 T 10 11 354580 CASAVA_Build 8 16827352 4D TTTTTCCCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2571 het 1692 hom 39 9 7 23 T 20 16 354581 CASAVA_Build 8 16841550 1D ACAAAATAAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 32 9 22 1 A 9 8 354582 CASAVA_Build 8 16841924 1D CAATCTCAAT A/- AAAAATACCC 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 6 5 354583 CASAVA_Build 8 16844353 2I AAGAGGAACA --/CT CTGTTCATTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 CT 1 2 354584 CASAVA_Build 8 16859523 1I TATCACTTGA -/C CTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 38 15 21 2 C 1 2 354585 CASAVA_Build 8 16864497 1D TTAAAAAAAA T/- ATATATGTTT 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 T 1 0 354586 CASAVA_Build 8 16866758 1D AAAATGTTGA G/- GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 G 5 4 354587 CASAVA_Build 8 16867085 1D ATTAAAAGTT A/- ACACCAATCC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 A 2 1 354588 CASAVA_Build 8 16870592 1I TCATTGTGGA -/G GTGGTTACAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 1 2 354589 CASAVA_Build 8 16872308 1D TTTTCTTTGA T/- TTTTTTCCTG 3070 hom 123 het 46 0 41 6 T 7 6 354590 CASAVA_Build 8 16872463 1I AACCTTATGA -/C CTGCTTTGAA 3070 hom 120 het 49 0 41 8 C 1 2 354591 CASAVA_Build 8 16881747 1D CTGGGGTACG A/- AAAAAAAACT 3070 hom 6 het 26 1 18 7 A 9 8 354592 CASAVA_Build 8 16881873 7I AAGACCATGG -------/GAAAAGC GAAAAGCATA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 GAAAAGC 1 2 354593 CASAVA_Build 8 16885970 1I GCCAGATGAG -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 6 7 354594 CASAVA_Build 8 16889103 1D CCCTCTCTTT A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 7 6 354595 CASAVA_Build 8 16894128 1I GCATTTTTCT -/A AGGCCAAAAG 3070 het 3070 ref 20 8 8 4 A 1 2 354596 CASAVA_Build 8 16895448 1D TGGAAGACAA T/- TTTTCCACGG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 5 4 354597 CASAVA_Build 8 16896356 1I TGTGTGCATG -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 6 7 354598 CASAVA_Build 8 16902357 1D CGATAAGAGA G/- GGCCATTCAG 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 G 3 2 354599 CASAVA_Build 8 16911682 5D AAGAAAAGAA AAGAG/----- AAGAGAAGAG 3070 hom 81 het 35 0 28 8 AAGAG 5 4 354600 CASAVA_Build 8 16913263 2D CATGAGAGGA GT/-- GTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 4 GT 2 1 354601 CASAVA_Build 8 16972519 1D TATAGATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 12 11 354602 CASAVA_Build 8 17022099 4I ATAAGAATAT ----/TTGA TTAACACTAT 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 TTGA 0 1 354603 CASAVA_Build 8 17029356 61D TTCAGCCTAT TAAAGCACAGCCAAATGTCAGCCTTCATTTGTCAACTTAAATATGTTTTTTCTAAAATTTA/------------------------------------------------------------- TAAAGATTCA 3070 het 3070 ref 34 31 9 7 TAAAGCACAGCCAAATGTCAGCCTTCATTTGTCAACTTAAATATGTTTTTTCTAAAATTTA 1 0 354604 CASAVA_Build 8 17033293 1D CCATCCACAG A/- AAAGTGGAGT 3070 hom 74 het 27 0 25 4 A 4 3 354605 CASAVA_Build 8 17036998 9D AATGGACATT TGGCCAGGC/--------- GCAGTGGCTC 3070 het 3070 hom 33 12 19 3 TGGCCAGGC 1 0 354606 CASAVA_Build 8 17039402 1D GCTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 2801 hom 38 het 24 0 16 8 A 17 16 354607 CASAVA_Build 8 17043961 1I ATACATAAGA -/C TGGATAATTT 3070 hom 102 het 35 0 34 1 C 0 1 354608 CASAVA_Build 8 17052044 4I ATGTATACTG ----/TTTT TTCTATGATC 3070 hom 108 het 44 0 36 8 T 2 6 354609 CASAVA_Build 8 17069762 1I AGGAAACACT -/C CCAACAGCAT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 C 2 3 354610 CASAVA_Build 8 17075571 3D TAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 432 het 432 ref 30 18 3 9 AAG 1 0 354611 CASAVA_Build 8 17086068 2D CTTGTGGCCC CT/-- GTCCTCATCT 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 CT 1 0 354612 CASAVA_Build 8 17086501 2I TTCCTGCACC --/CT CTCTCCACAC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 CT 2 3 354613 CASAVA_Build 8 17089293 1I AGCCAAGTTT -/A AAAAAAAAAA 835 het 835 ref 48 38 4 6 A 11 12 354614 CASAVA_Build 8 17090252 3I TCTGCCTAGC ---/AAT AATAGCAGCT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 AAT 1 2 354615 CASAVA_Build 8 17098462 1D AAAAATGTTT A/- AAAAAAAAAA 2177 het 590 hom 13 3 7 3 A 13 12 354616 CASAVA_Build 8 17104190 4I AACCTCCACC ----/TCCT TCCTGGGTAT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 TCCT 1 2 354617 CASAVA_Build 8 17105690 3D CTTTTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 26 0 14 12 T 17 14 354618 CASAVA_Build 8 17121914 1D GAGTCTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 47 0 38 9 T 11 10 354619 CASAVA_Build 8 17124611 25D TAAAGTGGTT GATCACCTACATTATCTGTCTATAA/------------------------- GAAACTGCCT 3070 hom 60 het 21 0 21 3 GATCACCTACATTATCTGTCTATAA 1 0 354620 CASAVA_Build 8 17128894 1I TGTTTCTCAC -/A AAAAAAAAAA 2504 het 2504 ref 40 24 9 7 A 13 14 354621 CASAVA_Build 8 17131509 2I TTTTATCAGC --/TA TATATATATA 1830 het 1830 ref 21 10 5 6 TA 7 8 354622 CASAVA_Build 8 17140390 1D AAGTAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2794 hom 37 8 16 13 T 17 16 354623 CASAVA_Build 8 17165996 1I GGTGGGTAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 8 9 354624 CASAVA_Build 8 17174739 2I CCGTGTCACT --/TC TTTTTCCCTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 TC 0 1 354625 CASAVA_Build 8 17175056 1D CTTTAGCAAG C/- CTGACAGATA 3070 het 3070 ref 37 23 13 1 C 2 1 354626 CASAVA_Build 8 17199233 4I GAGACTAGGA ----/AATT AATTTATATC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 AATT 1 2 354627 CASAVA_Build 8 17199437 3I AATTCTTACC ---/TAT TATTTATTTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TAT 1 2 354628 CASAVA_Build 8 17208271 1D AGACAACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 10 12 A 11 10 354629 CASAVA_Build 8 17208808 1D CTAAAACTAT A/- AAAAACCCTA 2325 het 2064 hom 13 7 6 0 A 6 5 354630 CASAVA_Build 8 17213899 1I AGGAAAAGGC -/A AAAAAAGTTA 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 A 6 7 354631 CASAVA_Build 8 17217295 2I TTTATTAAAC --/AT GTGTCAAAAC 3070 het 3070 hom 49 18 26 5 AT 0 1 354632 CASAVA_Build 8 17229615 5D TTTTACCACA TTCTT/----- TTGAGTATTG 3070 het 3070 hom 41 22 19 3 TTCTT 1 0 354633 CASAVA_Build 8 17258609 3I AATAAAATAA ---/AAT AATAACCTTG 3070 het 3070 ref 36 17 17 2 AAT 1 2 354634 CASAVA_Build 8 17261465 1I CTGTTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1517 hom 32 5 22 5 A 15 16 354635 CASAVA_Build 8 17282453 1D TGATGAGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 44 0 33 11 A 13 12 354636 CASAVA_Build 8 17285675 1D CCCGGTGGTC G/- AGGGATTCTC 3070 het 2925 hom 31 11 15 5 G 1 0 354637 CASAVA_Build 8 17289663 4D AAAAGGAGAA AAAT/---- AAATCACCCA 3070 het 3070 hom 36 12 21 5 AAAT 2 1 354638 CASAVA_Build 8 17291965 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAGAAATC 3070 het 581 hom 33 4 17 12 G 0 1 354639 CASAVA_Build 8 17298007 1D TACGGTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 A 13 12 354640 CASAVA_Build 8 17307843 20D CACAGCATTT TTTCTGGATTTATGCAAATA/-------------------- TTTCTGGATT 3070 het 3070 hom 25 10 12 5 TTTCTGGATTTATGCAAATA 2 1 354641 CASAVA_Build 8 17309479 1D CCATAGGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 A 10 9 354642 CASAVA_Build 8 17312022 1I AGAAAAGAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 A 9 10 354643 CASAVA_Build 8 17326324 1I TAAAGGAATG -/T TTTTATGGTG 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 T 4 5 354644 CASAVA_Build 8 17340119 1I AACATAGGAG -/A AAAATCTATG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 4 5 354645 CASAVA_Build 8 17340368 1I GAAAACAAAC -/A CCCAGTTTTA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 0 1 354646 CASAVA_Build 8 17340552 2D ACTAAAAATG AA/-- AAAAAAAAAA 2657 het 37 hom 30 1 12 17 A 16 14 354647 CASAVA_Build 8 17351787 1D GCTGTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 24 1 15 8 T 17 16 354648 CASAVA_Build 8 17355327 1I TTCCTTTTTC -/T TTTTTTCTTT 3070 het 531 hom 43 2 33 8 T 6 7 354649 CASAVA_Build 8 17376015 2D TCAGAGGCTC TT/-- TTTGAATTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 4 T 5 3 354650 CASAVA_Build 8 17376555 1I33M1D GTGTAATGTT -AGTTCCAGTTTTTTCATATATGGCCTTTATTATG/AAGTTCCAGTTTTTTCATATATGGCCTTTATTAT- TTTAGGTAAA 3070 hom 126 het 38 0 43 4 N/A 0 0 354651 CASAVA_Build 8 17385845 1I TCATGTGGTC -/A ACACTGGCTC 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 A 1 2 354652 CASAVA_Build 8 17389819 2I AAACATTTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 453 hom 28 1 16 11 AT 7 8 354653 CASAVA_Build 8 17389833 4I ATATATATAT ----/ATAC ACACACACAC 3070 het 803 hom 32 5 18 9 ATAC 0 1 354654 CASAVA_Build 8 17390854 1I GTCTGCCTGG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 T 7 8 354655 CASAVA_Build 8 17392322 1D GTAGGATTAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 T 8 7 354656 CASAVA_Build 8 17408647 1I TTCTGTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 10 11 354657 CASAVA_Build 8 17409235 4I AGCTGGACAC ----/TATT TAAATGTGTG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TATT 0 1 354658 CASAVA_Build 8 17410962 1D TAGACATCAG C/- CTGTAGTTGT 3070 hom 94 het 38 0 31 7 C 2 1 354659 CASAVA_Build 8 17414208 1D AGGCCAAGGA G/- GGGTGGATCA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 G 4 3 354660 CASAVA_Build 8 17416228 1D TTATAGAGAA C/- CCTGCAGAGT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 C 3 2 354661 CASAVA_Build 8 17417215 1D AAGATGGAGT C/- CTTGCCCTGT 2411 hom 29 het 13 0 9 5 C 2 1 354662 CASAVA_Build 8 17420109 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 T 11 12 354663 CASAVA_Build 8 17420526 4D CATTAGCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 4 AAAC 3 2 354664 CASAVA_Build 8 17421735 3D CTTTATGATG TCT/--- CCTCCATAAA 3070 het 3070 ref 30 15 11 5 TCT 1 0 354665 CASAVA_Build 8 17424624 1I AGGAAGTATA -/T TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 T 5 6 354666 CASAVA_Build 8 17436848 1I TACCCCACCG -/C CCTTCCCCTA 3070 hom 110 het 42 0 35 7 C 2 3 354667 CASAVA_Build 8 17443888 3D AAAAGAACAT AGA/--- ATAATATTTG 3070 het 3070 ref 36 21 12 4 AGA 1 0 354668 CASAVA_Build 8 17445744 3I AAAATGTCTC ---/CTT CTAATTACAA 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 CTT 0 1 354669 CASAVA_Build 8 17449124 1D CCGAGTAGGG A/- AAGAACGTCT 3070 het 3070 hom 23 9 11 4 A 3 2 354670 CASAVA_Build 8 17450899 1D GGGAAGCCTC A/- CAATCGTGGC 2816 het 2816 ref 21 10 8 4 A 1 0 354671 CASAVA_Build 8 17459655 5I TTGAGTTGTC -----/TATGA TATAACTCAG 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 TATGA 0 1 354672 CASAVA_Build 8 17469348 4D TGTATGAGTG TATA/---- TATATATCTG 3070 het 3070 ref 34 14 14 8 TA 5 3 354673 CASAVA_Build 8 17477313 2I CCAGAACCTG --/AC ACACCACATT 3070 het 3070 ref 41 15 18 8 AC 2 3 354674 CASAVA_Build 8 17479770 1D ACCGCTGTGC G/- GTTTTTGAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 1 354675 CASAVA_Build 8 17479829 22I TGACCACAGG ----------------------/GTCTGGTGTTATTTTTCTGTGT GTCTGGGTGT 3070 het 1569 hom 26 6 12 11 GTCTGGTGTTATTTTTCTGTGT 0 1 354676 CASAVA_Build 8 17482285 2D GTTTGAGGGC AA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 52 24 25 4 A 2 0 354677 CASAVA_Build 8 17486493 1I CAGAAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 14 15 354678 CASAVA_Build 8 17487729 1I TTTTTGTCTG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 2603 hom 37 8 20 9 T 6 7 354679 CASAVA_Build 8 17488439 3I ATAGCACTTA ---/GCT GCTAGCAATC 3070 het 3070 hom 49 18 24 7 GCT 1 2 354680 CASAVA_Build 8 17496018 1D AATATTATAT C/- TAAATGTATA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 C 1 0 354681 CASAVA_Build 8 17517101 2I TGATTTGGGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 50 19 23 8 GT 6 7 354682 CASAVA_Build 8 17519782 6D TTCCCTTTTC TTTTCT/------ TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 20 16 6 TTTTCT 1 0 354683 CASAVA_Build 8 17520699 4I TTCCTGAGAG ----/TCGA TTGATCCTAA 3070 het 3070 ref 55 24 24 7 TCGA 0 1 354684 CASAVA_Build 8 17522652 3D GTTTTTATCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 13 10 354685 CASAVA_Build 8 17524194 18D CTTTCAGACG TAGACCTAGACATAGGCC/------------------ TAGACCTAGA 3070 het 3070 hom 48 26 25 13 TAGACCTAGACATAGGCC 2 1 354686 CASAVA_Build 8 17526784 6D TTATTTTTAT TTATTA/------ TTATTATACT 494 het 246 hom 5 1 2 2 TTA 4 2 354687 CASAVA_Build 8 17527242 1I CCTGGTCGAG -/T TTTTTTTTTT 2193 het 1361 hom 16 5 6 5 T 11 12 354688 CASAVA_Build 8 17531170 3I TGTGTTGGAT ---/CAG CAGGTCTTCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 CAG 1 2 354689 CASAVA_Build 8 17538109 3D TCAGTCTTAT TCA/--- TCATCTACAT 3070 hom 45 het 17 0 16 2 TCA 2 1 354690 CASAVA_Build 8 17538350 1D TCTAGATTTG T/- TTTTTTTTTT 2002 het 357 hom 13 1 5 7 T 12 11 354691 CASAVA_Build 8 17539724 1D TTTCTAACTG A/- AGCTTATTTG 3070 hom 72 het 27 0 24 4 A 2 1 354692 CASAVA_Build 8 17546846 4D TTCTTTACAC AGTT/---- AGTTAGTTAG 3070 hom 114 het 41 0 39 5 AGTT 4 3 354693 CASAVA_Build 8 17550886 1I TATAGCACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 30 8 T 10 11 354694 CASAVA_Build 8 17553318 1D GTACGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 1611 het 1611 ref 38 17 6 15 T 17 16 354695 CASAVA_Build 8 17560758 1I ATTTAACATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 9 10 354696 CASAVA_Build 8 17564850 1I TCTCAGCAAG -/A AAAAAAAAAT 975 het 975 ref 34 18 3 13 A 9 10 354697 CASAVA_Build 8 17567311 3I TCCAGCCTCT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 TTG 4 5 354698 CASAVA_Build 8 17571642 1I TCTAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 2757 hom 30 10 14 6 A 8 9 354699 CASAVA_Build 8 17580162 1D60M1I GAAAAAAGAG AAAGGTGGAAATCTGGATATAAAGATGCCTTTATGCTCAGGCATTAAATATATGAAATGCT-/-AAGGTGGAAATCTGGATATAAAGATGCCTTTATGCTCATGCATTAAATATATGAAATGCTC CAAGAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 25 30 11 N/A 0 0 354700 CASAVA_Build 8 17580929 1I ACCATTTTCA -/C CCCATAATCG 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 C 3 4 354701 CASAVA_Build 8 17581001 3D ACACACACAC ACA/--- AATACCTATA 3070 het 90 hom 30 1 12 18 ACA 1 0 354702 CASAVA_Build 8 17581114 2D TATCTGTATC TA/-- TTTTATATAC 3070 het 2929 hom 34 9 16 9 TA 1 0 354703 CASAVA_Build 8 17587486 1D AAAAACAGGG A/- AAAAAAGGCT 3070 het 3070 ref 40 19 19 3 A 7 6 354704 CASAVA_Build 8 17600174 1I ACATGATAGC -/A AAAACCAAAA 3070 hom 88 het 33 0 29 4 A 4 5 354705 CASAVA_Build 8 17602699 2D TCAAACAAAC AG/-- AAATTCCACT 3070 hom 72 het 32 0 25 9 AG 1 0 354706 CASAVA_Build 8 17611796 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 310 hom 11 1 9 1 A 12 11 354707 CASAVA_Build 8 17614590 1D CTTGGGAATG T/- TAAGTCCAGT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 2 1 354708 CASAVA_Build 8 17632784 3I TTTGCCACAA ---/TTT TTTAAGTTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 6 354709 CASAVA_Build 8 17641243 4I GATTGCGTCA ----/ATTG ATTGCACTCC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 ATTG 1 2 354710 CASAVA_Build 8 17641998 12D CTCCGTCTCA AAAAAAAAAAAG/------------ GAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 12 6 AAAAAAAAAAAG 1 0 354711 CASAVA_Build 8 17649022 3I CCCACCACAC ---/CTA CTACCTAGAG 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 CTA 1 2 354712 CASAVA_Build 8 17650526 4I TGGCGGGCTG ----/AATA AATGGGGCAC 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 AATA 0 1 354713 CASAVA_Build 8 17651737 2I AGTTTGACCC --/TT TTTTTTTGAC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 7 9 354714 CASAVA_Build 8 17653356 1I CATGATCGTG -/A AAAAAAGAGT 3070 het 3070 ref 21 11 10 0 A 6 7 354715 CASAVA_Build 8 17654008 1D TGTCATTAAA G/- AAAAAGAAAC 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 G 1 0 354716 CASAVA_Build 8 17666192 1I AGAAAACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 31 0 26 5 A 14 15 354717 CASAVA_Build 8 17669323 1I CCATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 763 hom 25 5 12 8 A 15 16 354718 CASAVA_Build 8 17670322 1D ATGCCATGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 12 11 354719 CASAVA_Build 8 17684869 4I TTCTGTCTCA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 44 27 12 5 AAAC 4 5 354720 CASAVA_Build 8 17685892 4I CTTCATAAAG ----/TATT TAATCATAAG 3070 het 3070 ref 45 28 13 4 TATT 0 1 354721 CASAVA_Build 8 17686579 1I CAAGAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2472 hom 25 8 8 10 T 13 14 354722 CASAVA_Build 8 17686928 1I55M11D CTATCACATG -CAGCTTCTTTGCTAGGTGATGGGGACACAATGCTGAACAAGATGGTCCCAGCCTTCAAAGAGCCTC/CCAGCTTCTTTGCTAGGTGATGGGGACACAATGCTGAACAAGATGGTCCCAGCCTT----------- CAAAGAGCCT 3070 het 3070 ref 40 32 18 4 N/A 0 0 354723 CASAVA_Build 8 17688358 4D AACACTGAGT TATC/---- TTGAGGTTGC 3070 het 3070 hom 39 15 22 3 TATC 1 0 354724 CASAVA_Build 8 17701729 1D ATTGCCTATG A/- AAAAAAAAAA 1258 het 1258 ref 42 31 3 8 A 12 11 354725 CASAVA_Build 8 17718449 4I GCACGTGTAA ----/AAAT AAATAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 AAAT 1 2 354726 CASAVA_Build 8 17718994 4D CATACCTAAA TAAC/---- TATGCTACAT 3070 het 3070 hom 33 13 19 2 TAAC 1 0 354727 CASAVA_Build 8 17724210 3I ATAAAACCTT ---/TTG TTATTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 TTG 0 1 354728 CASAVA_Build 8 17725949 1I ATATCAGTGG -/A AAAAATAGAA 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 5 6 354729 CASAVA_Build 8 17728544 3D TCTGAAAAAC ATT/--- ATCAAACAGC 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 ATT 1 0 354730 CASAVA_Build 8 17733997 1D CATTTCAACA C/- GAGCGTCGGA 3070 het 3070 ref 44 27 11 6 C 1 0 354731 CASAVA_Build 8 17735195 1D CCAAAGTGCT G/- GGATTACAGG 2805 het 1361 hom 9 3 6 0 G 3 2 354732 CASAVA_Build 8 17752352 1D TTAAGCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 T 11 10 354733 CASAVA_Build 8 17755094 1D TATCATTCTT A/- ACGCCTTTGC 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 A 2 1 354734 CASAVA_Build 8 17756723 1I ATATGAAATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 A 8 9 354735 CASAVA_Build 8 17757619 1I TACAAATGAT -/A AAAAAATTAA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 6 7 354736 CASAVA_Build 8 17762909 1D TTGCTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 5 A 13 12 354737 CASAVA_Build 8 17763137 2I CAATCTCTAT --/TC TCTCTCTCTT 3070 het 2214 hom 28 8 12 8 TC 4 5 354738 CASAVA_Build 8 17768145 1I TGTGGAAAAA -/G AACATTTTAT 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 G 0 1 354739 CASAVA_Build 8 17772749 15I CACACACCAG ---------------/CAGCAGAAGAGGACA GACGAGAACA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 CAGCAGAAGAGGACA 0 1 354740 CASAVA_Build 8 17775492 2D ATATAGCGAC TT/-- ATATTCTATA 2221 het 2221 ref 17 8 6 3 T 2 0 354741 CASAVA_Build 8 17776713 13I ACAGGTGTGA -------------/GCTACCACGCCTG GCTTAGTTTC 3070 het 3070 ref 24 12 11 2 GCTACCACGCCTG 0 1 354742 CASAVA_Build 8 17779403 1D CAACATAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 12 11 354743 CASAVA_Build 8 17780747 4D TTTTATTTAT TGAG/---- TATCTGTTCT 2037 het 2037 ref 15 7 5 3 TGAG 1 0 354744 CASAVA_Build 8 17788571 10D GAGAGGAGAA GAGAGGAGAG/---------- GAGAGGAGAG 3070 het 1976 hom 29 7 17 9 GAGAG 6 4 354745 CASAVA_Build 8 17801108 1I GGAAGAGTAC -/A AAAGATGTTT 3070 het 3070 ref 28 11 11 6 A 3 4 354746 CASAVA_Build 8 17817120 3D TCCTCTCCTC CTT/--- CAACTTCCTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 CTT 1 0 354747 CASAVA_Build 8 17817897 5I AGAGGGGCTT -----/AACAG AACAGAACAG 3070 het 3070 ref 55 27 18 10 AACAG 2 3 354748 CASAVA_Build 8 17818778 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 1310 hom 24 4 16 4 A 6 7 354749 CASAVA_Build 8 17841165 13I AATTAATTTA -------------/TAACAATATTATG TAAACATTAG 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 TAACAATATTATG 0 1 354750 CASAVA_Build 8 17843318 2I GATTTTTGTT --/TG TTTTTTTTTT 169 het 169 ref 29 18 5 6 TG 0 1 354751 CASAVA_Build 8 17844786 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2948 het 1166 hom 20 6 9 8 A 16 14 354752 CASAVA_Build 8 17851344 1D GGAATACAGT G/- GGCGTGATCT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 G 3 2 354753 CASAVA_Build 8 17856229 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAA 30 het 30 ref 30 24 2 6 AAAG 1 0 354754 CASAVA_Build 8 17861135 2I CACAGTACAT --/AC AGTTATTTGT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AC 0 1 354755 CASAVA_Build 8 17861365 17I TTAATTGGTC -----------------/TCTAGAACAATTAGTTT TCTAGAGAGC 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 TCTAGAACAATTAGTTT 0 1 354756 CASAVA_Build 8 17871541 1I AACCAAGGTA -/C CTGATTGTAA 3070 het 3070 hom 48 22 22 4 C 1 2 354757 CASAVA_Build 8 17874037 2I AAATCTACTC --/AA GAGTAGACTA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 0 2 354758 CASAVA_Build 8 17883695 2D ACAAAAGGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 19 16 7 A 12 10 354759 CASAVA_Build 8 17889999 1I AACAGTAAAA -/T AAAATGGTTT 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 T 0 1 354760 CASAVA_Build 8 17918076 4I AGGTTTAGAA ----/AGAT AGATAGGGTA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 AGAT 1 2 354761 CASAVA_Build 8 17918219 5D ACACTTTACC AGAGA/----- AGAGAAGAGT 3070 het 3070 ref 32 16 11 7 AGAGA 2 1 354762 CASAVA_Build 8 17918958 1D TAGAAGCTAT C/- CCCATGGTCT 3070 het 3070 ref 46 26 16 5 C 4 3 354763 CASAVA_Build 8 17920751 2D TTCAAGACTT AA/-- ACATACAATA 3070 het 1557 hom 14 4 10 0 A 3 1 354764 CASAVA_Build 8 17929063 4I TTCCTCCACT ----/GTCA GTCATTGGGT 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 GTCA 1 2 354765 CASAVA_Build 8 17929688 1I TGGGTCTTCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 2749 hom 27 12 8 7 T 7 8 354766 CASAVA_Build 8 17930106 3D TTACATCATT ATC/--- ATCTGTTTGT 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 ATC 2 1 354767 CASAVA_Build 8 17930448 4D TTTTGAAAAG TGAT/---- TGATTTGCTT 3070 het 3070 ref 41 24 16 2 TGAT 2 1 354768 CASAVA_Build 8 17931370 4D TCAAAATTGC TTAT/---- TTGACTGGTG 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 TTAT 1 0 354769 CASAVA_Build 8 17933373 1I CAACTTTCTT -/A TAATCAGCTC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 0 1 354770 CASAVA_Build 8 17934872 1I GCCTATATAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 8 9 354771 CASAVA_Build 8 17936113 6I TCTCCAACCT ------/TAAAAG TAAACAACTA 3070 het 3070 ref 41 19 21 1 TAAAAG 0 1 354772 CASAVA_Build 8 17940397 5D TGGAGAGACG TACAA/----- TACATTTTGA 3070 het 3070 ref 33 20 9 6 TACAA 1 0 354773 CASAVA_Build 8 17941747 1I ATATGCACTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 T 9 10 354774 CASAVA_Build 8 17960879 1D CTCCTTCCCC T/- TTTTTAAATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 6 5 354775 CASAVA_Build 8 17968212 1D AAAGAAAACC A/- AAAAAAAAAA 2883 het 1194 hom 41 9 13 19 A 17 16 354776 CASAVA_Build 8 17968336 1D TGACACTAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 A 9 8 354777 CASAVA_Build 8 17968893 30D GACCTGTGCA CCTGTGCTGTATATCTAAGACATACAGCAC/------------------------------ CTGTGCTGTA 3070 hom 105 het 33 0 35 6 CCTGTGCTGTATATCTAAGACATACAGCAC 1 0 354778 CASAVA_Build 8 17971945 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 16 1 13 2 T 11 12 354779 CASAVA_Build 8 17973494 1I ATACCTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 T 10 11 354780 CASAVA_Build 8 17974295 5I TGATTTAGAC -----/AGAAA AGAAAAGTAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AGAAA 1 2 354781 CASAVA_Build 8 18001972 1D CTGGCTTTTG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 8 7 354782 CASAVA_Build 8 18004732 1D TACCATACCT G/- AAATTCTGGA 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 G 1 0 354783 CASAVA_Build 8 18021816 1D AGTGTAAGAA T/- GGACTAATAC 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 T 1 0 354784 CASAVA_Build 8 18024729 1D CCCTCATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 31 3 17 12 T 13 12 354785 CASAVA_Build 8 18033402 1I AATTATCAGG -/A AAATGCAAAT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 A 3 4 354786 CASAVA_Build 8 18047319 6D TCCTTCTTTC TCTCTT/------ TCTCTTTCTC 3070 hom 72 het 37 0 23 14 TCTCTT 3 2 354787 CASAVA_Build 8 18054204 1I TAAGAGGGGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 344 hom 37 1 27 9 A 8 9 354788 CASAVA_Build 8 18063292 1D TCAAGAGAAC A/- AAAAGACAAG 3070 het 3070 ref 25 14 9 3 A 5 4 354789 CASAVA_Build 8 18072684 1D CTCTCTCTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 95 het 36 0 32 5 T 10 9 354790 CASAVA_Build 8 18073173 1D CCAAATTGCC T/- CCTTAAAAGA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 1 0 354791 CASAVA_Build 8 18097256 2I AACACCTGTA --/AT ATAGCTGGAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AT 1 2 354792 CASAVA_Build 8 18099955 1D CAATCTAGGC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 9 8 354793 CASAVA_Build 8 18102108 1D AGACTGGATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 A 9 8 354794 CASAVA_Build 8 18106355 2I TATGATACAG --/AA AACAAAATAT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 2 4 354795 CASAVA_Build 8 18112962 1D GACAAAAAAA T/- TTAACTCCTT 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 T 3 2 354796 CASAVA_Build 8 18117851 1D GTGAATGTGC T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 87 het 39 0 30 10 T 8 7 354797 CASAVA_Build 8 18119093 5I ATTATCAGGG -----/TTAAT TTAATACTCA 3070 het 3070 hom 40 14 25 1 TTAAT 1 2 354798 CASAVA_Build 8 18125477 2D CTTGCCCCCC CA/-- CCCCTGTCAT 3053 het 3053 ref 28 12 9 9 CA 1 0 354799 CASAVA_Build 8 18126895 4D GGAGGGTTAC TGTT/---- TGTCTACCCC 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 TGTT 1 0 354800 CASAVA_Build 8 18174996 3I ATTAATGTTT ---/TTA AGCCAGCTCT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 TTA 0 1 354801 CASAVA_Build 8 18175126 3D AATACACTGG ACC/--- ACATTTTTTC 3070 hom 126 het 52 0 43 12 ACC 1 0 354802 CASAVA_Build 8 18178197 10D GTTTCTCTTG AAAACATGTA/---------- ATAGGTTGCA 3070 hom 148 het 49 0 50 3 AAAACATGTA 1 0 354803 CASAVA_Build 8 18183648 1D CACCTATTTA T/- TTGTGGCATC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 3 2 354804 CASAVA_Build 8 18183908 1D AAATTACAAT A/- AAATATTTTC 3070 het 3070 hom 24 9 12 4 A 4 3 354805 CASAVA_Build 8 18184731 4D GCAACGTACT AGAG/---- AGATCTGCAA 3070 het 3070 ref 42 26 15 3 AG 3 1 354806 CASAVA_Build 8 18185523 26I TAGCATTGAA --------------------------/AGGGTAGAAGGAACGGTCTCACTTCG ACCACCTAAC 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 AGGGTAGAAGGAACGGTCTCACTTCG 0 1 354807 CASAVA_Build 8 18188894 3D CAGTTTAGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 28 3 13 13 T 13 10 354808 CASAVA_Build 8 18193194 1D TTTAGCAGTC G/- GGGGAACTCA 3070 het 3070 ref 44 25 11 8 G 5 4 354809 CASAVA_Build 8 18195445 7I CTGGTGAAAC -------/TTATTCA TTATCACAAG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TTATTCA 0 1 354810 CASAVA_Build 8 18198128 1D TGTGTGTGTG T/- GGGGGGGTGT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 1 0 354811 CASAVA_Build 8 18200593 1I TCACACAGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 A 9 10 354812 CASAVA_Build 8 18200853 1D TCTAATACCC T/- TTATACAGTA 3070 het 3070 ref 34 18 9 8 T 3 2 354813 CASAVA_Build 8 18201942 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2165 het 2165 ref 26 10 7 9 T 11 12 354814 CASAVA_Build 8 18203244 1D CTTTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 62 24 30 8 T 11 10 354815 CASAVA_Build 8 18203670 1D GTAAATATTA T/- TTTTTGCTAT 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 T 6 5 354816 CASAVA_Build 8 18204308 1D AAAAGTAAAA T/- TTTAGTAATG 3070 het 3070 ref 50 28 18 5 T 4 3 354817 CASAVA_Build 8 18218605 2I ATATACACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 AC 7 8 354818 CASAVA_Build 8 18230720 3D GGTTTTTTTT TTG/--- TTTTGTTTTG 139 het 139 ref 31 3 3 26 TTG 1 0 354819 CASAVA_Build 8 18237648 1I ATATTTCATT -/A AAAGATGTTT 3070 hom 102 het 39 0 33 6 A 3 4 354820 CASAVA_Build 8 18237720 1D TATTCTCTTG A/- TTAGAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 1 0 354821 CASAVA_Build 8 18239077 1D CCAAATTGTT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 66 het 28 0 22 7 A 9 8 354822 CASAVA_Build 8 18244052 2I GTAATCCCAG --/CA CCTTGGGAGG 3070 hom 48 het 17 0 17 2 CA 0 1 354823 CASAVA_Build 8 18246624 1D TACATAAGGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 9 8 354824 CASAVA_Build 8 18247636 11D GGAAATGGTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2499 het 1541 hom 28 10 8 12 A 25 14 354825 CASAVA_Build 8 18251778 1D CATGCTGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 40 1 32 8 A 11 10 354826 CASAVA_Build 8 18251920 1D ATACAAATGG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 8 7 354827 CASAVA_Build 8 18256336 1I TAGGAAGGAT -/G GGGGGGATGA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 G 6 7 354828 CASAVA_Build 8 18257803 4D ATCTAAAGCA TTCT/---- TTCTTTCTGC 3070 het 3070 ref 45 22 20 7 TTCT 3 2 354829 CASAVA_Build 8 18261030 2I AAATTCACTC --/AT ATGTGGAATC 3070 hom 141 het 54 0 48 6 AT 1 2 354830 CASAVA_Build 8 18263671 2I GTTCAGTTAA --/AC AGTCATGTCA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 AC 0 1 354831 CASAVA_Build 8 18272442 1D AAGAACTCTA G/- GAACAAATTA 3070 hom 123 het 44 0 42 3 G 2 1 354832 CASAVA_Build 8 18275462 2D GCTGAGTGTG TA/-- TGTGTTAATC 3070 hom 168 het 60 0 54 6 TA 1 0 354833 CASAVA_Build 8 18280603 1I TATTAGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 30 2 25 3 T 10 11 354834 CASAVA_Build 8 18280693 1D CCACTGATTT G/- GGGGGAGTTG 3070 hom 78 het 31 0 27 6 G 6 5 354835 CASAVA_Build 8 18284041 1I TGTTAAGACC -/A TTTAAGCTAA 1770 het 1770 ref 30 22 5 3 A 0 1 354836 CASAVA_Build 8 18303996 1D ATGTGGTGGC A/- AAAAAACAAA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 7 6 354837 CASAVA_Build 8 18305908 1I TATTCCAATT -/A AAAAACAAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 5 6 354838 CASAVA_Build 8 18309868 1I AATGAAAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 9 10 354839 CASAVA_Build 8 18314237 1D AGAAGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 994 hom 22 3 14 5 A 13 12 354840 CASAVA_Build 8 18316359 1I CCTTCCATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 T 11 12 354841 CASAVA_Build 8 18316784 13I GTCATCAGGC -------------/CATGAGCTGCCTG CTGCTAAAAC 3070 het 3070 ref 49 24 19 7 CATGAGCTGCCTG 0 1 354842 CASAVA_Build 8 18326764 1D GCTTATATCA T/- TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 T 7 6 354843 CASAVA_Build 8 18327229 1I GGATTAACTC -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 54 21 25 8 T 6 7 354844 CASAVA_Build 8 18342606 2D AGAATTAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 46 0 27 21 AC 9 8 354845 CASAVA_Build 8 18342975 1D AAATCATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 17 2 A 11 10 354846 CASAVA_Build 8 18353400 1D AATAGTTTTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 9 8 354847 CASAVA_Build 8 18357190 1D AAATTTCACC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 9 8 354848 CASAVA_Build 8 18358640 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 1099 hom 34 5 19 10 C 0 1 354849 CASAVA_Build 8 18362172 4D CTCAAAGAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 73 het 27 0 24 5 AAAC 3 2 354850 CASAVA_Build 8 18377880 1D TCTGAAACAT A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 7 354851 CASAVA_Build 8 18392651 1D ACCACCACCC T/- TCCTCTCGAA 3070 hom 54 het 23 0 19 5 T 2 1 354852 CASAVA_Build 8 18395485 12D GGACACAGCC ATGAGAATGGAG/------------ AGCTGGACCT 2086 het 254 hom 35 4 9 28 ATGAGAATGGAG 1 0 354853 CASAVA_Build 8 18397600 1I TCTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 34 1 27 6 A 11 12 354854 CASAVA_Build 8 18410860 7D AATTGCTTGA ACCCGGG/------- AGGCGGAGGT 3070 hom 60 het 21 0 21 2 ACCCGGG 1 0 354855 CASAVA_Build 8 18411869 8I CACAAAAATG --------/AAAAAGAA AAAAAGAAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAAAAGAA 1 2 354856 CASAVA_Build 8 18412600 1I TGATAAAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 463 hom 41 2 32 7 A 9 10 354857 CASAVA_Build 8 18439473 1D CCTCTCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 114 hom 33 1 21 12 T 12 11 354858 CASAVA_Build 8 18442948 4D ATTTTACTTG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 37 1 28 9 A 15 11 354859 CASAVA_Build 8 18455163 7D TCACCTGGGT GAGAACA/------- GTCACCAGGT 3070 hom 75 het 29 0 25 5 GAGAACA 1 0 354860 CASAVA_Build 8 18461424 1D CAAACTTCTA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 8 354861 CASAVA_Build 8 18465902 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 T 12 11 354862 CASAVA_Build 8 18467375 1D ACAATCTTTT A/- ATTGAACGTC 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 A 2 1 354863 CASAVA_Build 8 18469059 2D TTTTGGAAGG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 76 hom 30 2 13 17 T 11 9 354864 CASAVA_Build 8 18470104 2D AACATTCTCC CT/-- GTTTGTATTA 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 CT 1 0 354865 CASAVA_Build 8 18470289 2D GGTCAGACAC CA/-- CAGTCCCCAG 3070 het 3070 ref 48 25 13 10 CA 2 1 354866 CASAVA_Build 8 18470497 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 26 0 13 13 T 12 11 354867 CASAVA_Build 8 18473154 9D GCCTTCGTTC CTCTGATGG/--------- CTCTTTTTCC 3070 het 3070 ref 46 25 22 3 CTCTGATGG 1 0 354868 CASAVA_Build 8 18473687 4I AAACCTAGCT ----/GGTA GGTAGGTAGT 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 GGTA 2 3 354869 CASAVA_Build 8 18478680 1D TTGTGTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1064 hom 28 3 20 5 T 13 12 354870 CASAVA_Build 8 18479410 1I TTCTTTATCC -/T GTTTAATGCT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 354871 CASAVA_Build 8 18480525 1I TTAAAAATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 32 1 28 3 A 13 14 354872 CASAVA_Build 8 18484607 13D CACACTGATC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 2102 hom 35 het 19 0 10 9 T 27 14 354873 CASAVA_Build 8 18489213 1D TGAAACATAA T/- TTTTTTCATC 3070 hom 105 het 39 0 35 6 T 7 6 354874 CASAVA_Build 8 18490686 4I GTGAGAATAG ----/TGTT TGTTCTCTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TGTT 1 2 354875 CASAVA_Build 8 18497293 1I AGAGAGAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 318 hom 31 1 24 6 A 9 10 354876 CASAVA_Build 8 18497953 1I TCAATGGGTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 A 9 10 354877 CASAVA_Build 8 18498537 1D AAATTACTAG A/- AACCTACAAT 3070 het 3070 ref 45 22 21 3 A 3 2 354878 CASAVA_Build 8 18503150 1D GAAATAGACA G/- GGAGAGCCAT 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 G 3 2 354879 CASAVA_Build 8 18507167 1I CTGTAGCCCC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 80 het 34 0 26 8 T 8 9 354880 CASAVA_Build 8 18510954 1I GTAAAATGAC -/A AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 7 8 354881 CASAVA_Build 8 18512623 1D GAAATGCCAG A/- AAGTATCATA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 3 2 354882 CASAVA_Build 8 18513042 3D AGGATTTTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 A 17 14 354883 CASAVA_Build 8 18513556 4D TTAAGGGACC TGGA/---- TGGATCACAT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TGGA 2 1 354884 CASAVA_Build 8 18515332 1I AAGAACCCCG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 8 9 354885 CASAVA_Build 8 18517813 3I CAAGGAATAT ---/GAC AACAGCCTCA 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 GAC 0 1 354886 CASAVA_Build 8 18518419 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2713 het 56 hom 20 2 9 10 T 13 12 354887 CASAVA_Build 8 18525025 1I CTAATTGTAA -/T TTTTCCTGTG 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 4 5 354888 CASAVA_Build 8 18526475 1I TTAAAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 143 hom 15 2 10 3 A 10 11 354889 CASAVA_Build 8 18528063 4I CACCAAATCT ----/TGAG TGAGTGAAAT 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 TGAG 1 2 354890 CASAVA_Build 8 18528810 4I GCCCAAGAAA ----/CAGT CAGTAACTGC 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 CAGT 1 2 354891 CASAVA_Build 8 18530181 1I GATAGGAGAC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 7 8 354892 CASAVA_Build 8 18532452 1I GAAATTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 14 16 10 T 10 11 354893 CASAVA_Build 8 18536314 1I TAGTTTACCA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 T 7 8 354894 CASAVA_Build 8 18538051 12D TGTGTTCTAA TTTTTAACAATT/------------ TTTTTAACAA 3070 hom 90 het 29 0 31 2 TTTTTAACAATT 1 0 354895 CASAVA_Build 8 18540340 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 9 8 354896 CASAVA_Build 8 18543671 1D GGATGAGTCT A/- AAATGGATCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 4 3 354897 CASAVA_Build 8 18549921 1D GAATTGCTAT A/- AAAAATACCT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 6 5 354898 CASAVA_Build 8 18558259 1D27M1D CTTAGGATAG TTTTAGAGTTTCGATACCACTGACTTAAT/-TTTAGAGTTTCGATACCACTGACTTAA- CCAGTTTTTA 3070 hom 81 het 28 0 28 8 N/A 0 0 354899 CASAVA_Build 8 18559443 4D TATGGAAGTG CAGA/---- GAGAGTTGAA 3070 het 3070 hom 41 18 17 7 CAGA 1 0 354900 CASAVA_Build 8 18560398 1D CTGCAGCCTC A/- AAATCCTGGG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 A 4 3 354901 CASAVA_Build 8 18560601 1I GTCAGATCAT -/A AAAAAGTATG 3070 het 3070 ref 52 26 22 4 A 5 6 354902 CASAVA_Build 8 18576854 1I CTGCTGGACC -/T TTTATCTGTC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 3 4 354903 CASAVA_Build 8 18579800 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2813 het 386 hom 13 1 8 4 A 13 14 354904 CASAVA_Build 8 18580490 1D AATCCCAGCT A/- ACTTGGGAGG 3070 hom 54 het 20 0 19 2 A 2 1 354905 CASAVA_Build 8 18580773 5D8M23D8M1I AATTTATGAG GTTAAAAATGTACTCCTTCAACTTAGGAATAACAAAAATATGTA-/-----ACATTTGC-----------------------AATATATAT AAGACATTTG 3070 hom 63 het 15 0 22 3 N/A 0 0 354906 CASAVA_Build 8 18582791 1I ACCATTATGT -/A TTTAATGGCC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 0 1 354907 CASAVA_Build 8 18589276 1D AATTTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 1189 het 1189 ref 30 22 3 7 T 12 11 354908 CASAVA_Build 8 18596613 1I ATCTCCACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 10 11 354909 CASAVA_Build 8 18597075 1D ACTGCAGACA C/- AACAGTCATT 3070 hom 120 het 45 0 40 7 C 1 0 354910 CASAVA_Build 8 18598816 14I GAGGATCACT --------------/TGAGCCCAGGGGTC TGAGCCCAGG 3070 hom 42 het 24 0 15 9 TGAGCCCAGGGGTC 0 1 354911 CASAVA_Build 8 18599899 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 T 6 7 354912 CASAVA_Build 8 18619685 3I CTTGGTAAAT ---/AGA AGAACACAAA 3070 het 3070 ref 21 9 10 2 AGA 1 2 354913 CASAVA_Build 8 18623086 17D CAGGCTCCAA AGGGGTGGGGAAGGCAC/----------------- CCAGGGGTGC 3070 hom 120 het 40 0 40 5 AGGGGTGGGGAAGGCAC 1 0 354914 CASAVA_Build 8 18630596 11D ATATGTCAAT TTTGAAAAATA/----------- TAAAACTTTT 3070 hom 129 het 46 0 43 6 TTTGAAAAATA 1 0 354915 CASAVA_Build 8 18640692 1D ATTCTAGTCA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 159 hom 26 1 19 6 T 8 7 354916 CASAVA_Build 8 18659772 1D AACTGCCCCA T/- TTTTTTTTTT 2534 het 2534 ref 54 35 6 15 T 11 10 354917 CASAVA_Build 8 18675971 4D AGTTATTCCT TTAA/---- TTTTGTTTTA 3070 hom 102 het 38 0 35 5 TTAA 1 0 354918 CASAVA_Build 8 18682139 1D AGTTAAGTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 41 0 35 6 T 10 9 354919 CASAVA_Build 8 18697958 3D ACTGAATTCT CCC/--- CCCAAATATT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 6 3 354920 CASAVA_Build 8 18700487 10D TAGTCCCAGG TTCATTTATT/---------- TTAAAGAGTA 3070 het 3070 ref 30 18 10 5 TTCATTTATT 1 0 354921 CASAVA_Build 8 18701169 1D AGAAAAAAAA G/- CATGAATTCG 3070 het 3070 hom 40 17 23 2 G 1 0 354922 CASAVA_Build 8 18704163 1D GATGGGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 17 18 8 A 10 9 354923 CASAVA_Build 8 18705749 1I CTAACACGAT -/A AAAAAAACGA 3070 het 117 hom 37 1 31 5 A 7 8 354924 CASAVA_Build 8 18706213 2D ATGGAGGTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 132 hom 27 3 9 16 A 12 10 354925 CASAVA_Build 8 18711633 1D TCTCTAACGT C/- CTCTAAATAC 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 C 2 1 354926 CASAVA_Build 8 18717567 1I ACATAACTTC -/T ACTTTCTCTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 T 0 1 354927 CASAVA_Build 8 18718653 1D GACAGTGACA T/- TCATAAGTGC 3070 het 3070 ref 54 27 23 4 T 2 1 354928 CASAVA_Build 8 18720474 1D CCTCTCCATA C/- CCCCCCCAAC 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 C 8 7 354929 CASAVA_Build 8 18720864 2I CTTCCCGGCA --/AT AGACTACCTA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 AT 0 1 354930 CASAVA_Build 8 18722440 1I CAACCATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 9 10 354931 CASAVA_Build 8 18722668 4I TTCAGCCTCC ----/TGAG TAACTGGGAC 3070 hom 68 het 27 0 22 5 TGAG 0 1 354932 CASAVA_Build 8 18723186 1I TCCAAAAAAA -/C ATAATACCAG 3070 het 89 hom 26 1 18 7 C 0 1 354933 CASAVA_Build 8 18738693 1I CTCACAGATA -/G CCAGGGCTGA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 G 0 1 354934 CASAVA_Build 8 18738743 1D TTCTTACGTG T/- TTTTTTTTTT 2495 het 2495 ref 39 19 7 14 T 15 14 354935 CASAVA_Build 8 18739716 1I GAAGATGCCA -/T GTTGTCTATC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 0 1 354936 CASAVA_Build 8 18749922 1I TTCGAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 60 33 14 13 A 11 12 354937 CASAVA_Build 8 18755817 6D AGGAAGTTTC TACAAT/------ TACAATTATA 3070 het 3070 hom 36 13 15 9 TACAAT 2 1 354938 CASAVA_Build 8 18757491 3I AAGTGTGTGA ---/AAC AACACTGTCT 3070 het 3070 ref 59 28 25 6 AAC 1 2 354939 CASAVA_Build 8 18764166 1D TCCTTTGTGG T/- TTTTAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 T 5 4 354940 CASAVA_Build 8 18781636 1D GATCCTCCCA C/- CCTTGGCCTC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 C 3 2 354941 CASAVA_Build 8 18818168 1D ACACACACAC A/- AACAGAATAC 2207 hom 12 het 6 0 5 1 A 3 2 354942 CASAVA_Build 8 18832360 3D ACTTTTTCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2794 het 686 hom 26 7 8 11 T 19 16 354943 CASAVA_Build 8 18840817 1I AAAACATCAG -/A AAAGAACATT 3070 hom 120 het 49 0 41 8 A 3 4 354944 CASAVA_Build 8 18843217 1D ACTTCACTAC G/- GGAGCAGTAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 G 3 2 354945 CASAVA_Build 8 18846858 2I TTTCAGACAG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 56 30 16 10 AC 8 9 354946 CASAVA_Build 8 18847102 1D AAAAGAAAGA T/- TATGAGGCAG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 2 1 354947 CASAVA_Build 8 18847654 1I AATCCCAGCT -/G CTCAGGAGGC 3070 hom 81 het 29 0 24 5 G 0 1 354948 CASAVA_Build 8 18848357 4I GGCATGGAAC ----/AACA AACACCTTGT 3070 hom 42 het 18 0 13 5 AACA 1 2 354949 CASAVA_Build 8 18850657 4D GAATCATGAG AAGT/---- AAGTGTCTTC 3070 het 3070 hom 35 16 18 3 AAGT 2 1 354950 CASAVA_Build 8 18851657 1I TCTTGATAAA -/T TTTTTTCATC 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 T 6 7 354951 CASAVA_Build 8 18855107 2D GTGTGTATGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 17 12 11 TG 8 7 354952 CASAVA_Build 8 18856174 1D TTTTTATAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 A 9 8 354953 CASAVA_Build 8 18859160 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 25 2 13 10 A 15 14 354954 CASAVA_Build 8 18859326 3I CCCTCCAGTC ---/ATT ACTAGCATTG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 ATT 0 1 354955 CASAVA_Build 8 18860720 2I TTTTTTTTTT --/TC TTTTCTTTTG 3070 het 830 hom 32 7 16 9 TC 0 1 354956 CASAVA_Build 8 18861377 1I ATTTAATGCC -/T TATGACTCCA 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 T 1 2 354957 CASAVA_Build 8 18866255 1I CCTTAATGAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 34 10 16 8 T 8 9 354958 CASAVA_Build 8 18871847 2I GCCAGGTGCG --/GT GGCTCACACC 3070 hom 27 het 14 0 13 1 GT 0 1 354959 CASAVA_Build 8 18876200 3I TCTGAAACTG ---/ACC ACATTTCCCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ACC 0 1 354960 CASAVA_Build 8 18877980 5D CAAAATCTAA TTTCT/----- TTATTTTACA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 TTTCT 1 0 354961 CASAVA_Build 8 18883448 2I TAAAGTGAAT --/CA CACTCCAGTG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 CA 1 2 354962 CASAVA_Build 8 18889903 2D ATAAATAAAT AC/-- ATATATATAT 3070 hom 27 het 10 0 10 1 AC 1 0 354963 CASAVA_Build 8 18889979 5D GAAAAGCTGC TTGAA/----- TTGAATTCTG 3070 hom 54 het 19 0 19 1 TTGAA 2 1 354964 CASAVA_Build 8 18890399 1D CCCAACCCCC A/- ATGCCAAGCT 3070 hom 111 het 44 0 38 8 A 2 1 354965 CASAVA_Build 8 18894100 1D AGTGATACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 104 het 39 0 35 4 A 14 13 354966 CASAVA_Build 8 18894605 4I52M1I TCATTTTCTT ----TCTGTTTCCTCATTTGCAAAATGACATGAGACTCCAAGATTTCTAAGGTCCG-/TCTCTCTGTTTCCTCATTTGCAAAATGACATCAGACTCCAAGATTTCTAAGGTCCGT TCTGAGCTCT 3070 hom 132 het 36 0 45 10 N/A 0 0 354967 CASAVA_Build 8 18896038 2D TAGGTCCTCA TC/-- TCTGTTAGCC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 TC 2 1 354968 CASAVA_Build 8 18899564 2D CCCGGTGCAC TT/-- ACCTTCCTTC 3070 hom 90 het 34 0 30 5 T 2 0 354969 CASAVA_Build 8 18900621 3I CTTTATAGTT ---/ATA ATGATACATA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 ATA 0 1 354970 CASAVA_Build 8 18901345 2D TAAGCATAAT GA/-- GAGAGAGAGG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 GA 5 4 354971 CASAVA_Build 8 18902311 2D CTATCAGAAG TC/-- TCTGCCAGAA 3070 hom 33 het 14 0 12 3 TC 2 1 354972 CASAVA_Build 8 18909853 1I GGCTGGTCTC -/G AACTCCGCTG 3070 hom 27 het 13 0 10 3 G 0 1 354973 CASAVA_Build 8 18913560 1D GCTCGCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 457 hom 34 3 21 11 A 13 12 354974 CASAVA_Build 8 18920150 1D TGCTCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 12 11 354975 CASAVA_Build 8 18926981 3D TTACACACTC ATT/--- AACACCCTAA 3070 hom 129 het 45 0 44 2 ATT 1 0 354976 CASAVA_Build 8 18935356 1D TTAAAATCTG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 82 het 33 0 28 7 T 9 8 354977 CASAVA_Build 8 18937305 1I AGGATTTGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 9 10 354978 CASAVA_Build 8 18954261 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 17 2 13 2 A 15 14 354979 CASAVA_Build 8 18954598 1D CCATTGGGTG C/- CCCCAAGACT 3070 hom 88 het 35 0 29 6 C 5 4 354980 CASAVA_Build 8 18973122 1D CCTCCTAATC T/- TTTTTTATTC 3070 hom 60 het 23 0 20 4 T 7 6 354981 CASAVA_Build 8 18974943 1I CATTTTTTTT -/C CCCATAAGGC 3070 hom 81 het 34 0 26 8 C 3 4 354982 CASAVA_Build 8 18977896 1I TGCTCTCAAT -/A AAAAATACGG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 5 6 354983 CASAVA_Build 8 18979801 2I TATCCTATAG --/TC TCTATAAATC 3070 hom 63 het 27 0 21 6 TC 1 2 354984 CASAVA_Build 8 18992005 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1119 het 1119 ref 26 12 4 10 A 11 12 354985 CASAVA_Build 8 18993423 4I AAAAGTATAC ----/TTTA TTTGTGCTAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTA 0 1 354986 CASAVA_Build 8 19009627 2I TATATTTAAA --/AG AGAATATATT 1021 hom 12 het 8 0 5 3 AG 1 2 354987 CASAVA_Build 8 19019180 4D TTTCTGAAAG TTCC/---- TTGACTCTGT 3070 hom 166 het 60 0 56 8 TTCC 1 0 354988 CASAVA_Build 8 19052850 1I TTTAAAAAAA -/C TTTTTTTGGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 354989 CASAVA_Build 8 19069473 1I GGTAGTACTT -/A AGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 18 20 8 A 1 2 354990 CASAVA_Build 8 19069818 8I CAGGAAGTTA --------/CCCCATAC CCCCATACGG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 CCCCATAC 1 2 354991 CASAVA_Build 8 19072158 9I CTTCTGGTTT ---------/CTTCATTTG CTTATATTAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CTTCATTTG 0 1 354992 CASAVA_Build 8 19079585 2D4M14D TGTCAGAACT CAATATCAAGAACTCAGAAC/--ATAT-------------- AAAATATCAA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 N/A 0 0 354993 CASAVA_Build 8 19091555 1I TAACTTGTGT -/A AAACTTAACT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 3 4 354994 CASAVA_Build 8 19092319 2I3M9I TTTGTATTTT --GTA---------/TAGTAGAGACAGGG TTTCACCATG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 N/A 0 0 354995 CASAVA_Build 8 19098862 1I AAAAAACATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 14 15 7 A 9 10 354996 CASAVA_Build 8 19102213 1I TACTTCTGCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 A 9 10 354997 CASAVA_Build 8 19104116 6I TAATATTTGT ------/ATAATA GCATGATTAT 3070 het 2923 hom 34 9 24 1 ATA 0 2 354998 CASAVA_Build 8 19104361 1D ATTTCATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2401 hom 27 8 13 6 T 11 10 354999 CASAVA_Build 8 19105192 1D AAGAGTGATG C/- TTTGAAGATT 3070 het 3070 hom 35 12 22 1 C 1 0 355000 CASAVA_Build 8 19110326 6D GAAAAGAAAG AAAGAA/------ AGAGAGAAAG 1510 het 1510 ref 20 10 6 4 AAAGAA 1 0 355001 CASAVA_Build 8 19110866 1I TCTCTGCCTC -/A AAAGATAGTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 4 355002 CASAVA_Build 8 19115484 1D GCTGAGGTTG C/- CCTGCTTGTG 3070 het 3070 hom 48 18 28 2 C 3 2 355003 CASAVA_Build 8 19119652 1D GAAAAGATGC A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 7 6 355004 CASAVA_Build 8 19144328 14D GAAGGAAAAG GAAAGAAAGAAAAA/-------------- GAAAGAAAGA 3070 hom 33 het 17 0 12 6 GAAAGAAAGAAAAA 2 1 355005 CASAVA_Build 8 19145238 1I TTTGTGACAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 8 9 355006 CASAVA_Build 8 19145402 1I GCCCAGCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 238 hom 19 1 14 4 T 15 16 355007 CASAVA_Build 8 19171998 1D GGAAGAACTT G/- GGCAGTGCTC 3070 hom 93 het 36 0 31 6 G 3 2 355008 CASAVA_Build 8 19225173 1D TTCCTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1970 het 1970 ref 46 24 6 16 T 15 14 355009 CASAVA_Build 8 19234414 1I CTTGAACCCA -/G GAGGCGGAGG 1345 hom 18 het 7 0 7 0 G 1 2 355010 CASAVA_Build 8 19294525 1D AATATATTCC T/- TTTTTTTTTG 1627 het 1627 ref 32 23 5 4 T 10 9 355011 CASAVA_Build 8 19318657 1I GAAAACTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 374 hom 50 1 36 13 T 11 12 355012 CASAVA_Build 8 19331258 1D GTGAGCCACT G/- GCACCTGGCC 3070 hom 81 het 30 0 28 3 G 2 1 355013 CASAVA_Build 8 19333605 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 11 9 355014 CASAVA_Build 8 19344508 2I CTTAAAGTAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 13 15 355015 CASAVA_Build 8 19351571 1D CAGTCAAAAT A/- AAAAAATCAA 3070 hom 57 het 20 0 20 4 A 7 6 355016 CASAVA_Build 8 19354210 1D CCCCTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 24 0 19 7 A 13 12 355017 CASAVA_Build 8 19367643 1I CTGGGATAAA -/C CCCCCACTGA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 5 6 355018 CASAVA_Build 8 19369969 1I ATAGCAGATG -/T TTTTTTTACC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 7 8 355019 CASAVA_Build 8 19382984 1D TCTAACTTTA T/- TTTGCCACCG 3070 hom 96 het 41 0 33 8 T 4 3 355020 CASAVA_Build 8 19390985 3D AATCAGTATG ATT/--- ATTACAACAG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 ATT 2 1 355021 CASAVA_Build 8 19433963 1I TTTGGAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 805 hom 41 3 33 5 A 12 13 355022 CASAVA_Build 8 19438145 1I TTAAAAAAAA -/T CAAATGCATC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 0 1 355023 CASAVA_Build 8 19442880 1D TGGGTGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 32 0 23 9 T 11 10 355024 CASAVA_Build 8 19445881 1D TTTTTTTTTT A/- AACAAGTTGT 3070 het 112 hom 33 1 30 2 A 3 2 355025 CASAVA_Build 8 19449242 1I GGGGTGGTTT -/C CCCCATACTG 3070 hom 93 het 33 0 29 4 C 4 5 355026 CASAVA_Build 8 19456337 38I ATTGAGCAAA --------------------------------------/GGAGGGAAGAGAGATGGAAGAGTGTAGCAGGAAACCAG CTGACAGTTT 3070 hom 54 het 19 0 19 3 GGAGGGAAGAGAGATGGAAGAGTGTAGCAGGAAACCAG 0 1 355027 CASAVA_Build 8 19478117 1I CTCCCCAATA -/C CTGGGATTAC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 1 2 355028 CASAVA_Build 8 19534713 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTCT 597 hom 15 het 25 0 9 16 T 9 8 355029 CASAVA_Build 8 19539631 1I GCCTGACCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1155 hom 40 6 20 14 T 17 18 355030 CASAVA_Build 8 19539932 31D TCATTTCTAG CTTCCCAGGCCCTCCTTTGTATTGAAACTCC/------------------------------- CTTCCCTGCC 3070 het 3070 ref 42 28 18 6 CTTCCCAGGCCCTCCTTTGTATTGAAACTCC 1 0 355031 CASAVA_Build 8 19557351 2D ACATATATAT AC/-- ACACACACAC 1525 het 1525 ref 29 12 7 10 AC 10 9 355032 CASAVA_Build 8 19566438 2D AAACACACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 52 18 20 14 AC 9 8 355033 CASAVA_Build 8 19569332 2D GAACTGCAAT GA/-- GAGAGTCAGT 3070 het 3070 ref 48 23 21 6 GA 3 2 355034 CASAVA_Build 8 19574509 3I CCAACCATAG ---/CAT TATTTAGCTG 3070 het 3070 hom 45 22 20 3 CAT 0 1 355035 CASAVA_Build 8 19593856 3I AGCAAGCAAG ---/AGT AGTAGGGAAA 3070 het 3070 hom 37 10 20 7 AGT 1 2 355036 CASAVA_Build 8 19595742 1I ATTAAGTGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 9 10 355037 CASAVA_Build 8 19599860 1I GCTCCACTGC -/G GGGGGCTGAA 3070 het 3070 ref 41 20 11 10 G 5 6 355038 CASAVA_Build 8 19600562 1D GATAACCCAC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 18 18 2 A 9 8 355039 CASAVA_Build 8 19612714 1I TCCTCTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 10 11 355040 CASAVA_Build 8 19616546 1D TCCTGGGATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 13 12 355041 CASAVA_Build 8 19638308 1D TCCCAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 10 17 9 A 14 13 355042 CASAVA_Build 8 19649050 1D GAGAGAAAGC A/- AAAAAAAAAG 1129 het 1129 ref 44 30 3 11 A 10 9 355043 CASAVA_Build 8 19649846 1I AAACGTACTC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 A 8 9 355044 CASAVA_Build 8 19655141 1I TAGACCTTGA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 49 27 16 6 T 6 7 355045 CASAVA_Build 8 19655832 1I TGTGGCTCCA -/T TTTTCTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 4 5 355046 CASAVA_Build 8 19665782 2D TGAGCAGACA CT/-- GTTAGTCGCT 3070 het 3070 ref 33 16 15 3 CT 1 0 355047 CASAVA_Build 8 19676376 3D TAGAGTAGAA GTT/--- GTTGCTGCAA 3070 het 3070 hom 46 19 21 8 GTT 2 1 355048 CASAVA_Build 8 19685834 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1252 het 1252 ref 28 12 7 9 A 19 18 355049 CASAVA_Build 8 19726291 1D TCTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 9 A 11 10 355050 CASAVA_Build 8 19727316 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 17 1 14 2 A 12 13 355051 CASAVA_Build 8 19730125 1I AACTGGAGTT -/G GGGGGGTGGC 3070 hom 90 het 35 0 26 9 G 6 7 355052 CASAVA_Build 8 19731157 1I TACCTTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 24 0 22 2 T 11 12 355053 CASAVA_Build 8 19732026 1D GTATAAAGAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 8 355054 CASAVA_Build 8 19738017 1I ATAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 A 11 12 355055 CASAVA_Build 8 19748225 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 11 10 355056 CASAVA_Build 8 19752278 1D CAAAGCTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 8 24 1 T 10 9 355057 CASAVA_Build 8 19754846 1D ATTAGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 92 het 40 0 30 10 T 11 10 355058 CASAVA_Build 8 19767577 1D AAGAAAGGTA G/- GAAGGAAAGA 3070 het 431 hom 23 2 18 3 G 2 1 355059 CASAVA_Build 8 19767741 1I TGATATTTAA -/T TTAGCCTTTA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 2 3 355060 CASAVA_Build 8 19773712 1D AACATAACTT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 32 8 20 5 A 8 7 355061 CASAVA_Build 8 19779559 2I TTTTTCTCTA --/AC AGACCTCCTT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 AC 0 1 355062 CASAVA_Build 8 19789212 1I CTGGGCTCAA -/G CCATCCTCCT 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 G 0 1 355063 CASAVA_Build 8 19860359 1I GTTCTTTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 2491 hom 19 6 11 2 A 8 9 355064 CASAVA_Build 8 19863051 2D TTTGGGGGGC AG/-- GGGGGGGGAA 3070 hom 48 het 21 0 15 7 AG 1 0 355065 CASAVA_Build 8 19872595 1I TCCACCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 28 1 15 12 T 13 14 355066 CASAVA_Build 8 19879121 1I TATTCATGAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 8 9 355067 CASAVA_Build 8 19882668 1I ATATTTCCAC -/A AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 A 6 7 355068 CASAVA_Build 8 19895997 1D AGGGCTGTGT C/- CCATGGAGGT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 C 3 2 355069 CASAVA_Build 8 19896457 2D AGATTTTTAT TC/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 TC 1 0 355070 CASAVA_Build 8 19900125 6D TAGGGAATGG TATTTT/------ TATTTTTATT 3070 het 3070 hom 36 12 17 13 TATTTT 3 2 355071 CASAVA_Build 8 19908120 1I AGGCTGAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 A 10 11 355072 CASAVA_Build 8 19913186 1I AATAAAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 96 het 37 0 30 7 T 9 10 355073 CASAVA_Build 8 19918305 2D CTTTTGTTTC TG/-- TGTTTACATA 3070 het 3070 ref 43 22 17 5 TG 2 1 355074 CASAVA_Build 8 19920582 1I ACTATATAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 9 10 355075 CASAVA_Build 8 19926333 1I TATATATGTA -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 T 6 7 355076 CASAVA_Build 8 19930385 1D TATTGGCTGT G/- GGTTTGTCAT 3070 het 2272 hom 16 6 8 2 G 3 2 355077 CASAVA_Build 8 19949958 1D TCGAAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 A 13 12 355078 CASAVA_Build 8 19954603 6I TAGCCCTTAG ------/TGTTGT TGTGCCTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 TGT 1 3 355079 CASAVA_Build 8 19964147 5D GAATGCGGTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 1546 hom 31 7 17 10 T 15 10 355080 CASAVA_Build 8 19964859 1D ACTGTTCTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 53 19 20 15 A 11 10 355081 CASAVA_Build 8 19966885 1I AATGAGATAC -/A AAAAAGAAAA 3070 het 3070 hom 47 21 22 4 A 5 6 355082 CASAVA_Build 8 19968729 1D AAGTACTGCA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 8 7 355083 CASAVA_Build 8 19973478 1D TGAAACCAGT C/- CCTGGTGCCA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 C 3 2 355084 CASAVA_Build 8 19978481 7I AGACTCCAGG -------/ACGTTTC ACTGAAGTTT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 ACGTTTC 0 1 355085 CASAVA_Build 8 19984218 2I AGAGCAAGAC --/TT TTTTTTTTTT 1400 het 7 hom 12 0 6 6 T 10 12 355086 CASAVA_Build 8 19984503 2I ATCAAGACTC --/TT TTTAATGTCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 3 5 355087 CASAVA_Build 8 19984747 1I ACAAAAGGAA -/T TTTTTTAGAA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 6 7 355088 CASAVA_Build 8 19986432 1I TCCTAGTTTT -/A AAAAAATCTG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 6 7 355089 CASAVA_Build 8 19994027 1D ATTTAAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 12 10 A 12 11 355090 CASAVA_Build 8 20010190 1D TTCAAGTGAC T/- TTTATTCACT 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 4 3 355091 CASAVA_Build 8 20038601 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1699 het 524 hom 14 3 5 7 A 17 16 355092 CASAVA_Build 8 20047020 1I AAAAATAAAT -/G GAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 1 2 355093 CASAVA_Build 8 20058110 1I CTAGTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 1717 het 1717 ref 21 8 5 8 A 13 14 355094 CASAVA_Build 8 20070186 3D GTAAATAGAG TGA/--- TGAACTACAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 5 TGA 2 1 355095 CASAVA_Build 8 20071250 1I GACATTACAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 9 10 355096 CASAVA_Build 8 20072024 2D ATTGGCACTC TA/-- AAAGTATTGA 3070 het 3070 ref 33 21 10 4 TA 1 0 355097 CASAVA_Build 8 20072628 8D TGTCGAATAT ATAGATAG/-------- ATAGATAGAT 3070 het 978 hom 41 7 20 16 ATAG 5 3 355098 CASAVA_Build 8 20075687 1D AATTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 999 hom 35 11 20 4 T 19 18 355099 CASAVA_Build 8 20084115 18D ATGGTGGATT ATTAAGCGGCTCTTAAAA/------------------ ATTATATTTT 3070 het 3070 ref 33 18 17 2 ATTAAGCGGCTCTTAAAA 1 0 355100 CASAVA_Build 8 20086159 22D CAGTTCTGGA GGTCAGAAGTCCAAAATACATC/---------------------- ACACCGGGTT 3070 het 3070 ref 36 27 12 3 GGTCAGAAGTCCAAAATACATC 1 0 355101 CASAVA_Build 8 20093423 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 1403 hom 24 5 13 12 A 8 9 355102 CASAVA_Build 8 20097919 1D ATTACAAAAA T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 T 8 7 355103 CASAVA_Build 8 20139662 4I ACATACACAT ----/ACAC ACACTCTCAC 3070 het 3070 ref 54 24 20 10 AC 2 4 355104 CASAVA_Build 8 20141218 1I GCCTGGAAAA -/G CCAGTCAAGC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 G 0 1 355105 CASAVA_Build 8 20149139 1D TCCTGGAGTT G/- GGGGGGGGTC 2622 het 2622 ref 35 13 11 11 G 9 8 355106 CASAVA_Build 8 20159767 2I ACTGGGCACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 10 12 355107 CASAVA_Build 8 20175571 1I TTATATTTGT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 A 0 1 355108 CASAVA_Build 8 20177144 3D AGTAAGCCGA GAT/--- GATCGCGCCA 499 het 499 ref 13 3 2 8 GAT 2 1 355109 CASAVA_Build 8 20221763 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTTCCTC 3070 hom 98 het 37 0 32 5 AG 2 1 355110 CASAVA_Build 8 20222393 1D AAAAACACCA T/- TTTTTTTTTT 746 het 746 ref 33 23 3 8 T 12 11 355111 CASAVA_Build 8 20227306 1I GGGGGATGTG -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 83 het 35 0 27 8 C 8 9 355112 CASAVA_Build 8 20228441 3D ACCTGGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 5 het 38 1 24 14 A 19 16 355113 CASAVA_Build 8 20231619 1I CGGGGATTAG -/A AAAAACGGAG 3070 hom 62 het 26 0 18 8 A 5 6 355114 CASAVA_Build 8 20232295 1D GCCCGGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 92 hom 22 1 16 6 T 13 12 355115 CASAVA_Build 8 20234156 1D CTTTTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 26 1 15 10 T 16 15 355116 CASAVA_Build 8 20235488 2D ACAAAATGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 11 10 A 16 14 355117 CASAVA_Build 8 20250516 1D CCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1667 het 853 hom 22 6 5 11 A 15 14 355118 CASAVA_Build 8 20256037 1D TCCACAGGGG C/- CTGGGGATGG 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 C 2 1 355119 CASAVA_Build 8 20258407 4D ACAAACAAAG AAAC/---- AAACAAAAAC 2966 het 2966 ref 29 16 11 3 AAAC 2 1 355120 CASAVA_Build 8 20263114 1D GACCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2640 hom 26 8 9 9 A 11 10 355121 CASAVA_Build 8 20276770 1D AAGAACCTCA C/- CCCCCACCCT 3070 het 3070 hom 33 11 22 0 C 6 5 355122 CASAVA_Build 8 20286255 1D CATGGTATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2489 hom 47 12 18 17 T 13 12 355123 CASAVA_Build 8 20297769 1D TCCTTAGAAG C/- CTTTGAGCAA 3070 het 3070 hom 51 19 25 7 C 2 1 355124 CASAVA_Build 8 20309549 2I CTGCAAAACG --/AT ATTAATGAAA 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 AT 1 2 355125 CASAVA_Build 8 20326722 4D AGAGATAGAC AGAG/---- AGAAAGAGAG 3070 het 3070 hom 29 8 17 5 AG 3 1 355126 CASAVA_Build 8 20336641 5I CAGGTAGCCA -----/GCATC GCTGTGCAAA 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 GCATC 0 1 355127 CASAVA_Build 8 20340328 1I ATGACATAGC -/A AAGTGATTGG 3070 het 3070 hom 54 21 22 11 A 2 3 355128 CASAVA_Build 8 20366959 1D CTGGGAAAGA G/- GCAGGGGCAT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 G 2 1 355129 CASAVA_Build 8 20370918 1D CTCTGGCATC A/- GCCAGGCCTG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 1 0 355130 CASAVA_Build 8 20375810 1D GCTGTCTCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 13 12 355131 CASAVA_Build 8 20379659 1D CTGCTGTTTT C/- TCTTTGGAAC 3070 het 3070 hom 50 18 25 8 C 1 0 355132 CASAVA_Build 8 20387760 4I CCTATGTCAA ----/CTCT CTCTCATTCT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 CT 2 4 355133 CASAVA_Build 8 20389776 1D GAAGTCAAGA C/- CATATAGAAT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 2 1 355134 CASAVA_Build 8 20396702 1I AGTTTTGGAA -/G GTCTGCTGAG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 G 1 2 355135 CASAVA_Build 8 20397040 1D AAAAAATGTT A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 32 13 16 5 A 7 6 355136 CASAVA_Build 8 20399997 1I TCCTGGAGCA -/G GGGGTCTGGT 3070 hom 87 het 33 0 28 5 G 4 5 355137 CASAVA_Build 8 20404591 1I ATTGATTTGG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 A 8 9 355138 CASAVA_Build 8 20406238 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 T 10 11 355139 CASAVA_Build 8 20410992 2D GCATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 AC 10 9 355140 CASAVA_Build 8 20411278 3D GGAAGCGTAA GAG/--- GAGGAGAGGA 3070 het 3070 hom 43 17 19 8 GAG 3 2 355141 CASAVA_Build 8 20413449 1D TATTGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2737 hom 33 9 13 11 T 12 11 355142 CASAVA_Build 8 20418520 1D CATTAAGTGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 9 8 355143 CASAVA_Build 8 20422574 1D TATATACACT G/- GAGAAAGATA 3070 hom 135 het 52 0 46 7 G 2 1 355144 CASAVA_Build 8 20436786 3D AGCAAAAAAA AAG/--- GTTATCTGTA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 AAG 1 0 355145 CASAVA_Build 8 20453323 1I AACCGTGGGT -/G TTCACTCTCA 3067 het 3067 ref 19 9 7 3 G 0 1 355146 CASAVA_Build 8 20459313 2I TTCCCATGGA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 14 14 6 T 9 11 355147 CASAVA_Build 8 20463208 1D GTGTCCACTT G/- GGGTGGGGGG 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 G 4 3 355148 CASAVA_Build 8 20464257 2D CCGCCCCCCC CG/-- CCCGGCCCCG 2908 het 1708 hom 20 10 8 4 CG 1 0 355149 CASAVA_Build 8 20469770 1I CCAATACAGG -/T TTTTGGTCAG 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 T 4 5 355150 CASAVA_Build 8 20484291 1I CATCTATTTC -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 7 8 355151 CASAVA_Build 8 20486574 1I GCATGCCATG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 7 8 355152 CASAVA_Build 8 20489410 1D GGGGGGGGGG A/- TTGGTAGAAT 2558 het 150 hom 17 2 10 5 A 1 0 355153 CASAVA_Build 8 20494312 1I CTGAGGGGAA -/G GGAGAGCATG 3070 het 3070 hom 56 23 20 13 G 2 3 355154 CASAVA_Build 8 20503083 2D TACCGAAAAC AG/-- GGTTTTGAGT 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 AG 1 0 355155 CASAVA_Build 8 20513611 1D ATTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2531 het 89 hom 18 1 6 11 T 12 11 355156 CASAVA_Build 8 20520466 1D ATTAAAAAAA G/- TTTTCCTGGG 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 G 1 0 355157 CASAVA_Build 8 20522653 1D CCATGTTGGT G/- GTGGGTGGTT 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 G 2 1 355158 CASAVA_Build 8 20525301 1I TTGTCCTTAG -/T TTTTCCCTTA 3070 het 3070 ref 59 24 22 13 T 4 5 355159 CASAVA_Build 8 20526245 1I CAACCTGTGA -/C TTAAAATTTC 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 C 0 1 355160 CASAVA_Build 8 20544364 1I CAGTGGTGCA -/T TTGTCATAGC 3070 het 3070 ref 67 33 26 8 T 2 3 355161 CASAVA_Build 8 20546427 1D ATCACAATTT A/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 6 A 1 0 355162 CASAVA_Build 8 20548747 2I AGGCACATTG --/CC CCCTAGAGAA 3070 het 3070 ref 47 21 20 6 C 3 5 355163 CASAVA_Build 8 20552032 1D TCCTCTATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 15 8 T 12 11 355164 CASAVA_Build 8 20561966 1I TATTTTAATC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 8 9 355165 CASAVA_Build 8 20564144 14D GAGTTCAATG TTTATATATATATA/-------------- TTTATATATA 3070 het 1401 hom 27 5 14 9 TTTATATATATATA 1 0 355166 CASAVA_Build 8 20565639 1D TGGAATAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 T 10 9 355167 CASAVA_Build 8 20570411 1I GGGCAATCAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 A 7 8 355168 CASAVA_Build 8 20572135 2I GTGTGCACAC --/GT GTCTGTGTGT 3070 het 3070 ref 49 23 18 8 GT 1 2 355169 CASAVA_Build 8 20575905 22I AACTAACATA ----------------------/ACCACTGGTGTTTGTAAGAGTT ACAAACACCA 3070 het 3070 hom 46 16 28 3 ACCACTGGTGTTTGTAAGAGTT 0 1 355170 CASAVA_Build 8 20576553 1D TCATACTCCC A/- ATACCACCAG 3070 het 3070 hom 41 14 24 4 A 2 1 355171 CASAVA_Build 8 20576863 1I TCACATCTCC -/A AGGGCCACCA 3070 het 3070 hom 54 22 28 4 A 1 2 355172 CASAVA_Build 8 20579777 1I CAAAATTGCA -/C CACCGCACTC 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 C 1 2 355173 CASAVA_Build 8 20579843 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 A 8 7 355174 CASAVA_Build 8 20583748 2I GCTATTAAAC --/AT ATATTAAATT 3070 het 3070 ref 19 10 9 0 AT 2 3 355175 CASAVA_Build 8 20596069 1D TGTCAGTGTT A/- AAAAAACTGT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 7 6 355176 CASAVA_Build 8 20612490 3I CGAGGCAGTT ---/GTG GTAGTATTGA 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 GTG 0 1 355177 CASAVA_Build 8 20614416 15D CCCGCCTTGT CCTCCCAAAGTGCTG/--------------- GGATTACAGG 2498 het 2498 ref 19 13 7 2 CCTCCCAAAGTGCTG 1 0 355178 CASAVA_Build 8 20615075 2D ACACTGTGCG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 42 13 18 12 T 11 9 355179 CASAVA_Build 8 20620598 1I ACAAGCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 21 19 8 T 10 11 355180 CASAVA_Build 8 20620797 2I GGGATTTTGC --/CT CTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 51 27 19 5 CT 2 3 355181 CASAVA_Build 8 20623763 1I ATTGTCATAG -/A AAATACTGGA 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 3 4 355182 CASAVA_Build 8 20625266 1I TTTTTTTTTT -/A AAGGATACAT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 2 3 355183 CASAVA_Build 8 20625891 1D GCTTCTTGCA T/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 hom 39 15 14 11 T 7 6 355184 CASAVA_Build 8 20629630 4D TGAAAGCTCT TAAG/---- TGAGACATCC 3070 het 3070 hom 45 19 22 6 TAAG 1 0 355185 CASAVA_Build 8 20631621 1I TTTAAGAAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 T 8 9 355186 CASAVA_Build 8 20634909 1D AAATCTACTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 44 19 21 5 T 9 8 355187 CASAVA_Build 8 20639760 4D AGAGACTTTG TGTA/---- TCCACAGGCA 3070 het 3070 hom 39 16 18 9 TGTA 1 0 355188 CASAVA_Build 8 20658259 2D AACAAATACA AC/-- AGAGGTCAAA 3070 het 3070 ref 44 19 20 6 AC 1 0 355189 CASAVA_Build 8 20664310 1D GTGAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 14 8 A 11 10 355190 CASAVA_Build 8 20679882 1I AAACTTAGGG -/A AAAAAAACTT 3070 het 760 hom 15 3 12 0 A 7 8 355191 CASAVA_Build 8 20698646 1I TCTGTAACAG -/A AAACAGGATC 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 A 3 4 355192 CASAVA_Build 8 20702531 1D AAGGCTGCTA T/- TTTTTTTTTA 2549 het 2549 ref 18 8 7 3 T 10 9 355193 CASAVA_Build 8 20759218 1I CTTGTACTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 10 11 355194 CASAVA_Build 8 20848415 1I TGCAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 11 12 355195 CASAVA_Build 8 20851628 1I TATATATATA -/G TATATATATA 1239 het 1057 hom 11 5 3 3 G 0 1 355196 CASAVA_Build 8 20851854 1D TCACCAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 17 10 T 12 11 355197 CASAVA_Build 8 20854027 4D ATTATAGAGC ACAG/---- ACAAAGTAAA 3070 het 3070 ref 54 33 18 5 ACAG 1 0 355198 CASAVA_Build 8 20854182 4D GATACACGTT ATTA/---- ATTAAGAATT 3070 het 3070 hom 51 20 30 3 ATTA 2 1 355199 CASAVA_Build 8 20854571 5I GCTCAGGTCA -----/TATTC TATTCTGGTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 TATTC 1 2 355200 CASAVA_Build 8 20871774 2I TCCTGTGCCA --/CT CAGCTACCTC 3070 het 3070 ref 57 25 23 9 CT 0 1 355201 CASAVA_Build 8 20872925 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 A 6 7 355202 CASAVA_Build 8 20877900 1I TTCACAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2870 hom 32 13 12 7 T 13 14 355203 CASAVA_Build 8 20909687 4D CCAGGAGAGG ACTA/---- ACTGAGTCTG 3070 het 3070 ref 33 19 12 3 ACTA 1 0 355204 CASAVA_Build 8 20920945 2I AGGAACTCAG --/GA GAGAGATTAC 3070 hom 105 het 40 0 35 5 GA 3 4 355205 CASAVA_Build 8 20921262 2I ACCATTCTCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 35 0 24 11 T 12 14 355206 CASAVA_Build 8 20923516 1I CCATTTCTAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 34 15 10 9 A 8 9 355207 CASAVA_Build 8 20925712 1I AGGGAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 A 10 11 355208 CASAVA_Build 8 20925897 3D AGAGGACATA CCT/--- CCTGTCTCAA 2135 het 2135 ref 16 11 5 1 CCT 2 1 355209 CASAVA_Build 8 20934186 2D CCTCGCCCGA CT/-- CTGACAAGCA 3070 het 3070 hom 58 25 28 5 CT 2 1 355210 CASAVA_Build 8 20934437 1D TTGGAGCATC T/- TTTTTTCTGC 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 7 6 355211 CASAVA_Build 8 20958554 1I TCAATAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 17 12 7 A 11 12 355212 CASAVA_Build 8 20966662 1D CTTGTAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 12 11 355213 CASAVA_Build 8 21009235 6D AATATATATC TATAGA/------ TATAGATATA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TATAGA 4 3 355214 CASAVA_Build 8 21195395 1I TTGTCATGTC -/T TTTTTTTTTT 1184 het 1184 ref 41 29 3 9 T 13 14 355215 CASAVA_Build 8 21196013 2D AGTATAATAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2625 hom 15 6 7 2 AT 7 6 355216 CASAVA_Build 8 21233809 1I CAATAGGAAG -/C AAAAATCACA 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 C 0 1 355217 CASAVA_Build 8 21241162 5D GTATAATAAT AATAA/----- AATAAAATAA 3070 het 1878 hom 12 5 7 2 AATAA 4 3 355218 CASAVA_Build 8 21256193 1D TGCCTGGCAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 9 8 355219 CASAVA_Build 8 21258200 5I AGGTGTTTTT -----/TTTTG TTGTTGTTGT 2045 het 2045 ref 22 11 5 6 TTTTG 0 1 355220 CASAVA_Build 8 21264958 2D TATTTTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 26 het 26 1 20 5 AT 9 8 355221 CASAVA_Build 8 21274086 15D TACAATAATT TCTGCCATCTGACAA/--------------- ATATCCAAAC 3070 hom 108 het 41 0 36 6 TCTGCCATCTGACAA 1 0 355222 CASAVA_Build 8 21274431 1D TTACTTGATA T/- TGAGTCATTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 T 2 1 355223 CASAVA_Build 8 21274741 1D GAGAATTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 12 11 355224 CASAVA_Build 8 21289017 20I AGAGAGAGTG --------------------/AGCGAGCAAGACTGAGAGTA AGCGAGCAAG 3070 hom 133 het 53 0 43 10 AGCGAGCAAGACTGAGAGTA 0 1 355225 CASAVA_Build 8 21302002 1D CTCTTCTCTC A/- AAAAAAACAG 3070 hom 114 het 40 0 39 2 A 8 7 355226 CASAVA_Build 8 21303602 1D AGTGTTTATA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 96 het 43 0 33 11 T 9 8 355227 CASAVA_Build 8 21313489 1I GCAGAAACTG -/C CCCCCCCCAG 2209 hom 32 het 29 0 12 17 C 8 9 355228 CASAVA_Build 8 21326933 4D ATTATTGTAT TAAA/---- TATTTTGTAT 1615 het 1615 ref 9 4 4 2 TAAA 1 0 355229 CASAVA_Build 8 21327813 3D TAATATTGTC ACT/--- ACTACAATTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 ACT 2 1 355230 CASAVA_Build 8 21331203 1I AGAGAGGGCA -/G GGGGGCACAA 3070 hom 115 het 48 0 39 9 G 5 6 355231 CASAVA_Build 8 21333250 1I GCTGCAGGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 503 hom 24 3 16 5 T 9 10 355232 CASAVA_Build 8 21338609 1I GGTGATCATT -/A AAAAAGTCAG 2779 het 2779 ref 23 15 7 1 A 5 6 355233 CASAVA_Build 8 21344535 1D ACCGTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 111 hom 33 2 19 13 A 16 15 355234 CASAVA_Build 8 21347212 2D ACTAAGATGC AG/-- AGAGGTGATG 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 AG 3 2 355235 CASAVA_Build 8 21350128 2D ACATACAAAC AG/-- GGAAAAAATC 3070 het 3070 hom 41 17 19 6 AG 1 0 355236 CASAVA_Build 8 21351231 21I CAAAGATATT ---------------------/TGGGGGAGGGGGATCCTATTC TGCCTGTACA 3070 het 3070 ref 38 17 14 9 TGGGGGAGGGGGATCCTATTC 0 1 355237 CASAVA_Build 8 21352466 1D TTCATCCCCA C/- AATGCCCAGC 3070 het 3070 ref 54 25 21 9 C 1 0 355238 CASAVA_Build 8 21363646 2I CTAAATTAGG --/CC CCCCCCCCCA 2816 het 1760 hom 25 5 11 9 C 9 11 355239 CASAVA_Build 8 21372691 1D GTTAAGTTCC T/- TTTTTTTTTT 1239 het 528 hom 20 3 7 10 T 17 16 355240 CASAVA_Build 8 21376839 1I GCTCCGTCTT -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 8 9 355241 CASAVA_Build 8 21378669 18D CACCTTGAAT GTCCCTTCCACCACATTA/------------------ GTCCCTTCCA 3070 het 3070 ref 45 20 17 16 GTCCCTTCCACCACATTA 2 1 355242 CASAVA_Build 8 21388871 1D TTTTACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 12 11 355243 CASAVA_Build 8 21396756 1D CATCTACATA T/- TTTTCACAGC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 5 4 355244 CASAVA_Build 8 21400000 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 T 9 10 355245 CASAVA_Build 8 21413845 1D AGACTCCACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 864 hom 20 3 9 10 A 15 14 355246 CASAVA_Build 8 21420024 2I CATGTGTGTG --/TT TGTGTGTGTG 243 het 243 ref 48 21 3 24 T 1 3 355247 CASAVA_Build 8 21433678 1D GTAAGGAGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 10 9 355248 CASAVA_Build 8 21450892 1D GTCCCCTGAG T/- TTTTTTATCC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 T 7 6 355249 CASAVA_Build 8 21463866 1D TTCAGTAGAG C/- ACGGGGTTTC 544 het 27 hom 7 1 3 3 C 1 0 355250 CASAVA_Build 8 21463935 1D GCCTCAGCTT G/- CCCAAAGTGC 3070 hom 69 het 24 0 22 2 G 1 0 355251 CASAVA_Build 8 21468459 1D GGCATCCTAT G/- TGGGCAGACT 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 G 1 0 355252 CASAVA_Build 8 21472055 6D CAGGCCAAGG ACTGGT/------ ACTGGTACTG 2968 het 2549 hom 35 9 12 19 ACTGGT 3 2 355253 CASAVA_Build 8 21474896 1I CACCAATGTT -/A AAAAAAAAAA 2788 het 2788 ref 30 7 8 15 A 13 14 355254 CASAVA_Build 8 21481150 1I ATAGCAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 143 hom 29 1 20 8 T 11 12 355255 CASAVA_Build 8 21482133 2D ACAACAGAGA TC/-- TCTCTCTTTC 3070 het 3070 ref 49 23 14 12 TC 4 3 355256 CASAVA_Build 8 21490433 1D TACAACGTGA G/- GGGCTGGACC 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 G 4 3 355257 CASAVA_Build 8 21490857 1D AGTGAGACAT C/- TACCTTAAGG 3070 het 3070 ref 39 17 15 8 C 1 0 355258 CASAVA_Build 8 21498464 3D TGCAACACGT AAC/--- AATGTTTTGG 3070 het 3070 ref 62 33 24 6 AAC 1 0 355259 CASAVA_Build 8 21500404 1I GGGCAGTACA -/C CTGTCAAACA 3070 het 3070 hom 92 27 57 8 C 1 2 355260 CASAVA_Build 8 21501383 1I ATTTTCCCAC -/A AGAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 1 2 355261 CASAVA_Build 8 21505519 1D TTTTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 42 0 34 8 T 13 12 355262 CASAVA_Build 8 21517176 1D TTACCACTTA C/- CCCTATCATC 3070 het 3070 ref 32 18 9 7 C 4 3 355263 CASAVA_Build 8 21523581 8D CCCCACCACC CAGTATAG/-------- CAGTCACCAT 3070 het 1776 hom 19 5 10 4 CAGTATAG 1 0 355264 CASAVA_Build 8 21541545 1I AATAAAGCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 A 10 11 355265 CASAVA_Build 8 21546425 1D CAGGGGAAAC T/- TTTTTTCCTT 3010 het 3010 ref 27 13 8 7 T 7 6 355266 CASAVA_Build 8 21549045 1D GGCCTCCTCC A/- AATCTGCCTT 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 3 2 355267 CASAVA_Build 8 21621948 1I TCAAATCACA -/T TTCCTGACAC 3070 hom 135 het 50 0 45 5 T 2 3 355268 CASAVA_Build 8 21636326 1D TCTGGACAGA T/- TTGATTCTGT 2937 het 2937 ref 28 17 9 3 T 3 2 355269 CASAVA_Build 8 21639161 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 518 het 518 ref 40 26 2 12 A 11 12 355270 CASAVA_Build 8 21659998 2D GCCCACTCCC CA/-- CACACACACA 3070 het 2400 hom 42 9 15 18 CA 11 10 355271 CASAVA_Build 8 21660681 2I CACCGAGGTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 46 17 13 16 CA 8 9 355272 CASAVA_Build 8 21732394 1D TGTCTTCCCT C/- CCCACCCTCC 3070 hom 81 het 32 0 24 8 C 4 3 355273 CASAVA_Build 8 21752443 1D GTGATGGGCC G/- GGGGCGGGGG 2501 hom 36 het 16 0 9 8 G 5 4 355274 CASAVA_Build 8 21758392 1I TCCCTCACCT -/C ATCTTGTCCT 3070 hom 93 het 37 0 30 7 C 0 1 355275 CASAVA_Build 8 21762693 1I TATGGGGGGG -/A AAAAGTGGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 4 5 355276 CASAVA_Build 8 21765704 1D GTTTTCTGTC T/- TTTTTCCATT 3070 hom 63 het 35 0 19 17 T 6 5 355277 CASAVA_Build 8 21774172 2D AGAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 26 0 23 3 A 12 10 355278 CASAVA_Build 8 21776166 4I GCCCTGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 79 het 30 0 27 3 TTTG 2 3 355279 CASAVA_Build 8 21776804 1D TCAAAAAAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 119 het 46 0 39 7 C 1 0 355280 CASAVA_Build 8 21789574 1I TGGAAGGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 24 0 19 5 T 12 13 355281 CASAVA_Build 8 21793084 1D11M1I CCGCGCCCGG CCCCATCAATAT-/-CCCATCAATATC TTTTGTGGGA 3070 hom 61 het 23 0 18 7 N/A 0 0 355282 CASAVA_Build 8 21795576 1D ACTGCAAACT C/- CCACCTCCCA 3070 hom 23 het 12 0 8 4 C 3 2 355283 CASAVA_Build 8 21805637 1I ACTCCATCTC -/A AGAAAAAAAA 1334 het 1120 hom 16 3 7 6 A 1 2 355284 CASAVA_Build 8 21812768 1D TCCATCTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 9 7 A 11 10 355285 CASAVA_Build 8 21814619 1I AAAAAAAAAA -/C ATCTCCCTGT 3070 het 222 hom 41 5 26 10 C 0 1 355286 CASAVA_Build 8 21840085 3D CCAAAAAGAC GTT/--- GTCTAAAATT 3070 hom 99 het 37 0 34 8 GTT 1 0 355287 CASAVA_Build 8 21872166 1D CTATAATCCC A/- AGTGCTTTGG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 A 2 1 355288 CASAVA_Build 8 21975716 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 33 3 20 11 A 13 12 355289 CASAVA_Build 8 21984545 3D TTTATTTTAT TTA/--- TTTATTTATT 1277 hom 15 het 16 0 5 11 TTA 1 0 355290 CASAVA_Build 8 21987117 12D AAAGAAAGAA AAAAAAAAAGAG/------------ AAAAAAGAAA 1557 het 17 hom 16 1 13 6 AAAAAAAAAGAG 1 0 355291 CASAVA_Build 8 21990511 1D GTCCACAGCT G/- GGGGCAGGAT 3070 hom 94 het 37 0 28 9 G 5 4 355292 CASAVA_Build 8 21991963 1D ACAAAAATGC T/- TGTGGAAACA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 2 1 355293 CASAVA_Build 8 22000894 1I ACTGTGGAAG -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 7 8 355294 CASAVA_Build 8 22001896 1D TAGCCCTGTC A/- AAAAAGTAAA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 6 5 355295 CASAVA_Build 8 22008956 1D GTTCTGAACC T/- ATCTCTTCAG 3070 hom 42 het 15 0 14 1 T 1 0 355296 CASAVA_Build 8 22011999 1I TCGTCCGGCA -/C CTTTGCCAGT 3070 hom 72 het 25 0 22 3 C 1 2 355297 CASAVA_Build 8 22014789 4I TGAGTTTTAC ----/TCTT TCTTTGGCCA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TCTT 1 2 355298 CASAVA_Build 8 22018969 9I TGGGCCAGTG ---------/GGTCCCTTA GGTCCCTTAG 3070 hom 84 het 35 0 27 8 GGTCCCTTA 1 2 355299 CASAVA_Build 8 22027592 1D AAGCCCTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 27 0 21 7 T 11 10 355300 CASAVA_Build 8 22039722 1I GCCAGGTGCA -/G GGGCATTTGG 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 G 3 4 355301 CASAVA_Build 8 22077685 1I CACTCCCCTG -/A ATTCTCTCTG 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 A 1 2 355302 CASAVA_Build 8 22153313 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1228 het 394 hom 10 2 5 3 A 17 18 355303 CASAVA_Build 8 22157675 5D AAAAAAAAAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 1865 het 1865 ref 22 9 8 7 AAAGA 3 2 355304 CASAVA_Build 8 22174015 1I CTCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 1104 het 1104 ref 26 7 4 15 A 15 16 355305 CASAVA_Build 8 22188810 2D CGGTCTTCCC CT/-- GAGGCCGCGC 2698 het 1242 hom 20 8 8 4 CT 1 0 355306 CASAVA_Build 8 22208796 1I TATGCTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 9 12 12 T 10 11 355307 CASAVA_Build 8 22214450 1D TAAAGGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 11 10 355308 CASAVA_Build 8 22215185 1I AGATTTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 11 12 355309 CASAVA_Build 8 22248886 4D GTGGTGTGAT CATA/---- CATAGCTCAC 3070 hom 161 het 58 0 54 5 CATA 2 1 355310 CASAVA_Build 8 22255616 1I GAAAAAAATC -/A AAAGAATATC 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 3 4 355311 CASAVA_Build 8 22272857 1I AACTAGTCAG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 T 7 8 355312 CASAVA_Build 8 22276795 1I CCGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2166 hom 23 6 12 5 A 11 12 355313 CASAVA_Build 8 22284873 10D AATACATGTC TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 1383 het 761 hom 7 2 3 3 T 37 27 355314 CASAVA_Build 8 22288033 3I CCAGAGTGGC ---/TGA TGAGAGGGAG 3070 het 3070 hom 44 19 15 10 TGA 1 2 355315 CASAVA_Build 8 22288693 19D4M1I ACACAGAATT CCCCCAAACAATTGTTTGGTATT-/-------------------TATTA TTTGTCGACT 3070 het 3070 ref 35 20 17 2 N/A 0 0 355316 CASAVA_Build 8 22296341 1D CCCCCGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2076 het 1723 hom 28 10 7 11 T 15 14 355317 CASAVA_Build 8 22302332 4I TGGGCTTTTC ----/CTTT CTTTCTTTCA 3070 het 3070 ref 42 22 12 8 CTTT 2 3 355318 CASAVA_Build 8 22310168 1I AGGTGCACCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 12 10 T 11 12 355319 CASAVA_Build 8 22332486 1I GGAAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1306 het 1306 ref 19 8 5 6 A 10 11 355320 CASAVA_Build 8 22334956 3I TTTCCTGGTG ---/GGA GGATTATGGT 3070 het 3070 ref 36 25 10 1 GGA 1 2 355321 CASAVA_Build 8 22336285 3I AAGGTTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 TTG 3 4 355322 CASAVA_Build 8 22337439 1D AATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2288 het 2288 ref 22 10 6 6 T 13 12 355323 CASAVA_Build 8 22339252 3I TTCCAAGATG ---/GTA GTAGCATCAA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 GTA 1 2 355324 CASAVA_Build 8 22343671 4D AGATCCTCCC ACCT/---- ACCTCAACCA 3070 het 3070 ref 45 22 17 7 ACCT 2 1 355325 CASAVA_Build 8 22345840 4I19M2D AAGTGCTTCC ----TTCTTTTTCTTTCACTCTGTC/TTCTTTCTTTTTCTTTCACTCTG-- TCTCTTTCTC 3070 het 3070 ref 31 20 13 2 N/A 0 0 355326 CASAVA_Build 8 22357720 1D GTCTCAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 38 1 33 4 A 16 15 355327 CASAVA_Build 8 22366273 3D CGCCATCGCT ATC/--- ATCATCATCA 3070 hom 108 het 41 0 36 7 ATC 5 4 355328 CASAVA_Build 8 22383422 2D GCTCAAAGAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 58 hom 24 1 19 5 AT 9 8 355329 CASAVA_Build 8 22419727 1I ACCCCATTTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 9 10 355330 CASAVA_Build 8 22425438 1D TTTAGATGAT A/- ACGGTTTCAT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 A 2 1 355331 CASAVA_Build 8 22430902 1D GTATTAATTC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 8 7 355332 CASAVA_Build 8 22433391 1D TGGGATTACA G/- GCACGAGCCA 3070 hom 49 het 21 0 12 9 G 2 1 355333 CASAVA_Build 8 22433569 1D GGTTGGCAGG T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 62 het 26 0 18 10 T 9 8 355334 CASAVA_Build 8 22435433 1D AAAAAAAAAA C/- AAACCTATAT 3070 het 518 hom 20 3 16 1 C 1 0 355335 CASAVA_Build 8 22435598 4D CACACACACG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 76 het 35 0 28 8 CA 11 9 355336 CASAVA_Build 8 22438604 2D CAAGACCCTG TC/-- TCTAAAAAAT 3070 hom 75 het 27 0 26 2 TC 2 1 355337 CASAVA_Build 8 22452727 1D TAGAAACTCT C/- CCCCACCCCA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 C 5 4 355338 CASAVA_Build 8 22454680 1D TGCAAGAAGA T/- TTTTTTCCTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 7 6 355339 CASAVA_Build 8 22464630 1D CGGCACGCCC G/- GGGGGGCCGC 3070 hom 45 het 20 0 11 9 G 7 6 355340 CASAVA_Build 8 22471101 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 A 11 10 355341 CASAVA_Build 8 22472021 1D AGCCAACCCT G/- GGGGTGCCTA 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 G 5 4 355342 CASAVA_Build 8 22476905 1I ACTAGGCCCA -/G GGGAGCAGAA 3070 hom 98 het 38 0 29 9 G 3 4 355343 CASAVA_Build 8 22486597 1I CTGGCAGCCC -/A ACCCTTCCTG 2664 het 923 hom 18 3 10 5 A 1 2 355344 CASAVA_Build 8 22487869 2I GGAGTGACTC --/TG TGCTGTGTAC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 TG 1 2 355345 CASAVA_Build 8 22548025 1I TGCCTCTATT -/A GGGACATTTC 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 A 0 1 355346 CASAVA_Build 8 22561903 3I TGCCAGTTTT ---/AAG AAGTGCTGGT 3070 hom 124 het 47 0 40 7 AAG 1 2 355347 CASAVA_Build 8 22562830 5D ATCTCCTTAA AAAGT/----- AAAGTATTCA 3070 het 3070 hom 25 10 14 2 AAAGT 2 1 355348 CASAVA_Build 8 22575397 3D TACAGGTATG CAC/--- CACCACCATG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CAC 3 2 355349 CASAVA_Build 8 22613749 1D CGCCTTGCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 35 het 15 0 10 5 T 10 9 355350 CASAVA_Build 8 22624376 1D TGGGGGCTGT G/- GGGGAGAAGG 3070 hom 50 het 20 0 16 4 G 5 4 355351 CASAVA_Build 8 22626853 1D CTCCGCCTGG T/- TTTTGTGCTT 3070 hom 26 het 26 1 19 7 T 5 4 355352 CASAVA_Build 8 22627301 6D ACTGCCTTCT CGCTCC/------ CGCTCCCGGG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 CGCTCC 2 1 355353 CASAVA_Build 8 22628878 12I GTGGGTGCAC ------------/GTGTGTATGCTG GTGTGTGTGC 3070 hom 113 het 43 0 36 7 GTGTGTATGCTG 0 1 355354 CASAVA_Build 8 22630905 16D AGTATTTCCG TCCTGATGTATTTCCA/---------------- TCCTGATGTA 3070 hom 90 het 35 0 27 11 TCCTGATGTATTTCCA 1 0 355355 CASAVA_Build 8 22635641 1D TTTCTCACTT A/- AAAAAAAAAA 2823 het 1662 hom 23 8 8 7 A 12 11 355356 CASAVA_Build 8 22636229 1D GGGAGGGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 13 12 355357 CASAVA_Build 8 22645608 1I ATTCTGGGCC -/T TTCTAAGTTT 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 2 3 355358 CASAVA_Build 8 22659584 1I ACTTCCTTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 T 9 10 355359 CASAVA_Build 8 22672812 1I AAGGACAGCC -/T TTTTTTTTTT 2319 het 2319 ref 36 12 9 15 T 13 14 355360 CASAVA_Build 8 22705322 1D CACTGGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2139 hom 25 8 12 6 T 12 11 355361 CASAVA_Build 8 22706892 1D GCCCAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 370 hom 5 het 5 0 2 4 T 19 18 355362 CASAVA_Build 8 22707755 1D GTACGCACAA T/- TTTTTTTTTT 2980 het 2980 ref 30 15 9 6 T 13 12 355363 CASAVA_Build 8 22710712 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1195 het 84 hom 17 2 5 11 A 19 18 355364 CASAVA_Build 8 22758828 1D GCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1400 het 1400 ref 28 8 10 10 A 17 16 355365 CASAVA_Build 8 22761937 1D GAAGGGGAAG T/- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 50 26 19 6 T 2 1 355366 CASAVA_Build 8 22777905 1D ACTTAAGAGG A/- AGTGAGAAGG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 2 1 355367 CASAVA_Build 8 22786929 1I GAAAAAGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 11 3 A 11 12 355368 CASAVA_Build 8 22789497 1D CCACTGGAGT A/- AGCTGGGATT 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 A 2 1 355369 CASAVA_Build 8 22789854 1D ATCCAGTGTG T/- GTTGAAGGAC 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 1 0 355370 CASAVA_Build 8 22791115 8D GGGCCCACCA CCCCACCT/-------- CCCCACCTCC 2724 hom 30 het 13 0 9 4 CCCCACCT 2 1 355371 CASAVA_Build 8 22794022 1D TTCCTGAACC G/- GATCTCCATC 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 G 2 1 355372 CASAVA_Build 8 22801021 1I CCCAGGAGTT -/C GAGACCAGCC 3070 hom 74 het 28 0 20 8 C 0 1 355373 CASAVA_Build 8 22803118 23D GCATCTACCG TATGTTTTTATAAAGTGCAGAAA/----------------------- TATGTTTTTA 3070 hom 51 het 27 0 17 14 TATGTTTTTATAAAGTGCAGAAA 2 1 355374 CASAVA_Build 8 22809075 3I CTTCAAATAG ---/TTC TTCTACTCTG 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 TTC 1 2 355375 CASAVA_Build 8 22824013 3D CCAGTGAAGG AAC/--- AACAATTCTC 3070 het 3070 ref 45 25 17 4 AAC 2 1 355376 CASAVA_Build 8 22830587 1D GGGCGGGGGA G/- GGGGGGGTGT 3070 hom 68 het 29 0 17 13 G 8 7 355377 CASAVA_Build 8 22836052 3D ACAAAAAAAA AAC/--- ACCATGGTAG 1210 het 194 hom 29 3 4 23 AAC 1 0 355378 CASAVA_Build 8 22836273 1I CATGGAATTC -/A TTCTAATTTC 3070 hom 108 het 39 0 35 4 A 0 1 355379 CASAVA_Build 8 22845042 6D GTTTTTTTTG TTTGTT/------ TTTGTTTTTG 3070 hom 105 het 42 0 36 8 TTTGTT 3 2 355380 CASAVA_Build 8 22846464 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 24 3 15 6 A 15 14 355381 CASAVA_Build 8 22851012 1I AAAATGTCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 292 hom 39 1 31 7 T 9 10 355382 CASAVA_Build 8 22853949 1D TGAATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 1785 het 1785 ref 31 14 5 12 T 15 14 355383 CASAVA_Build 8 22859118 3D TGTTCCAATG ACA/--- ACAACAGCTT 3070 het 3070 hom 60 19 36 10 ACA 3 2 355384 CASAVA_Build 8 22872702 4D TTTTTCTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 70 het 30 0 22 8 TTTG 4 3 355385 CASAVA_Build 8 22876992 1D TAACAAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 11 10 355386 CASAVA_Build 8 22878879 1I TGCAGAAATA -/T GAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 0 1 355387 CASAVA_Build 8 22881189 2D GGGCAGAATG GA/-- GAGTTATTGT 3070 het 3070 hom 33 16 16 2 GA 2 1 355388 CASAVA_Build 8 22882248 1I GACTATTAAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 A 8 9 355389 CASAVA_Build 8 22884650 1D TTTTTCTGTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 9 8 355390 CASAVA_Build 8 22884809 1D CGCCCATCTA T/- TTTTTTTTTT 2405 het 2405 ref 30 13 9 9 T 13 12 355391 CASAVA_Build 8 22895367 2I TTCCATATCC --/GG GCCACTTTAC 3070 hom 45 het 19 0 15 4 G 1 3 355392 CASAVA_Build 8 22898420 1D TCAGTTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 29 1 23 6 A 12 11 355393 CASAVA_Build 8 22910719 3D GGAGGAACTC TGA/--- TGATAAGAGG 3070 hom 74 het 30 0 22 8 TGA 2 1 355394 CASAVA_Build 8 22937983 1D GTCTTGATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2891 hom 32 7 11 14 T 13 12 355395 CASAVA_Build 8 22939725 1I TAAGATCTAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 9 10 355396 CASAVA_Build 8 22949537 3I AGACTTGCCA ---/GAT TCCTCTGCAG 3070 hom 105 het 39 0 34 5 GAT 0 1 355397 CASAVA_Build 8 22959400 1I GTATCAACAC -/A AAAAAAAGCC 3070 het 3070 hom 62 27 28 7 A 7 8 355398 CASAVA_Build 8 22963752 1I TTTCCATTTG -/T TTTGTGTGTC 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 T 3 4 355399 CASAVA_Build 8 22964659 4I GCTCAAAGAA ----/AAAT AAAAGCACTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 AAAT 0 1 355400 CASAVA_Build 8 22966940 6D TAAGTTGGAT AAAATA/------ AAAATGAAAG 1958 het 1958 ref 22 13 6 4 AAAATA 1 0 355401 CASAVA_Build 8 22969675 4I ACTGAAGCAC ----/ATAT ATACTGTCCT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 AT 1 3 355402 CASAVA_Build 8 22972973 4I GTGTGTTGTT ----/TTTG TTTGTTTTTT 2603 het 1099 hom 18 4 9 6 TTTG 1 2 355403 CASAVA_Build 8 23005560 9I AAAAAAAATA ---------/AAGTACCTG AAGTAAACAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 AAGTACCTG 0 1 355404 CASAVA_Build 8 23023093 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2698 het 2698 ref 16 8 6 4 A 12 11 355405 CASAVA_Build 8 23024976 1D CTTGCCTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 17 2 9 6 T 15 14 355406 CASAVA_Build 8 23026421 3I TTTTTCTCCC ---/CAT CATCATCAAC 3070 hom 101 het 42 0 33 9 CAT 2 3 355407 CASAVA_Build 8 23028640 1D TTTGGGGAAG T/- CCCCCAAGGC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 1 0 355408 CASAVA_Build 8 23062284 4I TTAATTTTAA ----/CTAT CTATTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 CTAT 1 2 355409 CASAVA_Build 8 23062360 1I ATATTTTATC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 1765 hom 21 9 9 3 T 7 8 355410 CASAVA_Build 8 23095548 1D CCCCGTCTCT A/- CTAAAAATAC 1048 hom 7 het 3 0 3 0 A 1 0 355411 CASAVA_Build 8 23096967 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAAGT 1378 het 673 hom 13 6 5 2 G 0 1 355412 CASAVA_Build 8 23103395 1D ATAAGTGTTC T/- TTTTTTTTGA 2132 het 2132 ref 13 6 5 2 T 9 8 355413 CASAVA_Build 8 23131125 1I CATGAAACAT -/A GTCTATGAAA 3070 het 3070 hom 36 14 14 8 A 0 1 355414 CASAVA_Build 8 23142769 7D GCCTGGCTAA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1320 het 100 hom 7 2 4 2 T 23 16 355415 CASAVA_Build 8 23146690 1I AGAAGGAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 9 10 355416 CASAVA_Build 8 23150268 7D AGCCTTAGGG AGCTTTT/------- AGCTTTTATT 3070 hom 105 het 43 0 31 16 AGCTTTT 2 1 355417 CASAVA_Build 8 23153480 1D TTAACTGAGA C/- CCGTCTCAGA 3010 het 3010 ref 18 9 7 2 C 3 2 355418 CASAVA_Build 8 23154089 5D GTTTGTTTTG CTTAA/----- CTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 CTTAA 1 0 355419 CASAVA_Build 8 23159162 1I CTGGTACAAC -/T TTTTTTCTTA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 T 6 7 355420 CASAVA_Build 8 23159952 3D CTGAAAAGAA CTT/--- CATCATACTG 3070 het 3070 ref 28 10 11 8 CTT 1 0 355421 CASAVA_Build 8 23165531 1I ACTTATTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 A 10 11 355422 CASAVA_Build 8 23167644 2I TCTGCTCAAC --/CT TTTTTTTTTT 2814 het 2814 ref 40 14 11 15 CT 0 1 355423 CASAVA_Build 8 23174440 1I AGTTCCCACT -/C CCCCCCTGCG 2572 het 2572 ref 32 14 11 7 C 6 7 355424 CASAVA_Build 8 23178867 1I ATCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 A 10 11 355425 CASAVA_Build 8 23180282 1D CAGAAAATAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 8 7 355426 CASAVA_Build 8 23187110 1I ACTCTGTCTC -/G GGGGGAAAAA 1888 het 999 hom 14 3 7 4 G 5 6 355427 CASAVA_Build 8 23194995 2I TTTTCCTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 T 10 12 355428 CASAVA_Build 8 23208356 2D ATAGGGAGGC TG/-- TGTGTGTGTG 1473 het 1473 ref 47 29 6 13 TG 8 7 355429 CASAVA_Build 8 23210299 3D GCCTGGTGGC TGT/--- TGTTTAAATC 3070 hom 96 het 33 0 33 1 TGT 2 1 355430 CASAVA_Build 8 23219278 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 10 9 355431 CASAVA_Build 8 23228296 3D AAAAGAAAAA AAT/--- AAAAATAAAA 2685 het 217 hom 16 1 10 5 AAT 1 0 355432 CASAVA_Build 8 23230599 1I AACAAATGGT -/G GGGTACATCA 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 G 3 4 355433 CASAVA_Build 8 23231367 3D GGGAGGTCTT CTC/--- GGGATCGTCA 3070 het 3070 ref 44 27 14 5 CTC 1 0 355434 CASAVA_Build 8 23231535 3D GCTGTTTTTA GAT/--- GAGATTAACA 3070 het 3070 ref 33 15 13 9 GAT 1 0 355435 CASAVA_Build 8 23232882 1I TGCATTAGGC -/T ACAGATGCCA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 T 0 1 355436 CASAVA_Build 8 23234359 2I GAGCAAGACC --/CT GTCTCAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 CT 0 1 355437 CASAVA_Build 8 23234535 2D TTTATCTCTC GT/-- CTCTCTCCAA 3070 hom 103 het 36 0 33 4 GT 1 0 355438 CASAVA_Build 8 23234780 1D ACAGAGAGAA G/- GGTTTGACTG 3070 hom 42 het 21 0 15 7 G 3 2 355439 CASAVA_Build 8 23237075 2I TGAATCCTTG --/GA GAGTGATAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 GA 1 2 355440 CASAVA_Build 8 23241512 1D GAACCCTGGC G/- TTTTTTGGTA 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 G 1 0 355441 CASAVA_Build 8 23244068 1I AAATATGATG -/T TAAGGCACGC 3070 hom 84 het 36 0 29 7 T 1 2 355442 CASAVA_Build 8 23245224 1D ATCGGCCAGT G/- GGCTCACATC 3070 hom 70 het 25 0 21 4 G 3 2 355443 CASAVA_Build 8 23245723 4D ACACACCACC CACA/---- CATACACACA 1477 hom 18 het 7 0 6 1 CA 3 1 355444 CASAVA_Build 8 23248231 6I AAATCAGAAG ------/TAGTAA TAGTATCTGC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TAGTAA 0 1 355445 CASAVA_Build 8 23268771 1I AGAACCATCT -/C CCCCCCATAT 3070 het 3070 ref 36 15 11 10 C 6 7 355446 CASAVA_Build 8 23314293 2D TCTCTAGTTC AG/-- AGAGGGCAGC 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 AG 3 2 355447 CASAVA_Build 8 23327233 2D TGCCGACTCC AG/-- AGTGTCCCAT 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 AG 2 1 355448 CASAVA_Build 8 23356628 1I CCCTAGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 11 9 A 11 12 355449 CASAVA_Build 8 23397908 2D TGGACATGAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 16 18 16 T 14 12 355450 CASAVA_Build 8 23402409 1D TGCACAGCAT A/- AAAACCACTT 3070 het 3070 hom 56 20 32 4 A 5 4 355451 CASAVA_Build 8 23447407 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 92 het 36 0 30 7 T 9 8 355452 CASAVA_Build 8 23459869 4D AGACTGGAGA TCTC/---- TCTGTTAATG 2720 het 2720 ref 21 13 6 3 TC 3 1 355453 CASAVA_Build 8 23467512 2D TTTGTGAGAG AT/-- AGGATAGCCT 3070 het 3070 ref 46 24 16 7 AT 1 0 355454 CASAVA_Build 8 23469549 2D GTTCTTCTAA CT/-- CTGCTTGAGT 3070 het 3070 hom 27 11 15 2 CT 2 1 355455 CASAVA_Build 8 23474698 1D CCAGTTGACC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 16 20 8 T 9 8 355456 CASAVA_Build 8 23478948 1D GCTTTTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 41 0 28 14 A 13 12 355457 CASAVA_Build 8 23480075 1D TTCTTTTGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 265 hom 23 1 19 3 T 9 8 355458 CASAVA_Build 8 23483228 3D TCTTAGCCGG GTA/--- CTCGTGTCTG 3070 het 3020 hom 29 8 16 8 GTA 1 0 355459 CASAVA_Build 8 23483517 2D TCTGACCTTC AG/-- GGTTGTGATG 3070 het 3070 hom 45 14 19 12 AG 1 0 355460 CASAVA_Build 8 23485394 1I ACGTAGATCA -/T TTTTTTTTTT 3062 het 2902 hom 27 9 9 9 T 10 11 355461 CASAVA_Build 8 23486079 1I TGCAGCTACC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 9 10 355462 CASAVA_Build 8 23497165 1D TTGGCAATTA C/- AAATGAAGCT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 C 1 0 355463 CASAVA_Build 8 23504138 4I CAAAAATTAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 AAAC 3 4 355464 CASAVA_Build 8 23507348 1I GAAAGTAGTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 60 29 23 8 A 9 10 355465 CASAVA_Build 8 23509105 1I CAAACCCCTC -/T GAGAGGTTCA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 0 1 355466 CASAVA_Build 8 23511545 1D GTGGAACTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2569 hom 33 12 12 11 A 15 14 355467 CASAVA_Build 8 23515103 1I AGAGTTTTAG -/C CCCTGTCCCC 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 C 3 4 355468 CASAVA_Build 8 23517662 1D AAATAATGGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 9 8 355469 CASAVA_Build 8 23518966 1D GGAGACCGTG C/- ATATATATAA 3070 het 3070 ref 40 15 16 9 C 1 0 355470 CASAVA_Build 8 23522685 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1651 hom 15 het 11 0 5 6 T 14 13 355471 CASAVA_Build 8 23524356 4D CAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAATG 3070 het 3070 hom 52 20 27 7 AG 5 3 355472 CASAVA_Build 8 23527057 1D ATTAATACTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 36 15 20 1 T 9 8 355473 CASAVA_Build 8 23529295 18D CTTGTCCTCC TTTGTAGCCAGTCCTCCT/------------------ TTTCTTGTCC 1239 het 1239 ref 42 26 6 16 TTTGTAGCCAGTCCTCCT 1 0 355474 CASAVA_Build 8 23532754 1D GAGATGGGGG A/- GTCACTTGAC 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 1 0 355475 CASAVA_Build 8 23532956 2I AGCCTGGGCA --/AC AGAGCAAGAG 3070 het 3070 hom 40 10 25 5 AC 0 1 355476 CASAVA_Build 8 23537270 2I GCTCTCTGTG --/AC ACACACACAC 3070 het 136 hom 56 1 37 18 AC 8 9 355477 CASAVA_Build 8 23537810 1I GGTAGGCCTT -/G GGGGGTCTAC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 G 5 6 355478 CASAVA_Build 8 23548966 1D AATCAAACAT C/- TTTTCTTCTG 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 C 1 0 355479 CASAVA_Build 8 23551221 8D5M1D TCTCAAAAAA AAAGAAAGAAAAGA/--------AAAAG- AAAGAAAAGA 3070 het 1347 hom 29 6 12 13 N/A 0 0 355480 CASAVA_Build 8 23552118 2I AGTCCTTCCC --/CT CTTTGCTCAC 3070 het 3070 hom 50 19 19 12 CT 1 2 355481 CASAVA_Build 8 23557973 1D GTTTAGCTAA C/- TTTGTACTTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 C 1 0 355482 CASAVA_Build 8 23576393 8D AATCATTCAG AGAATCAC/-------- AGAATGACAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 10 AGAATCAC 1 0 355483 CASAVA_Build 8 23580197 1D ATTTTTATCG T/- TAATACTGTT 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 2 1 355484 CASAVA_Build 8 23581669 1I ACTTAAAATA -/T TTTAGGCACC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 3 4 355485 CASAVA_Build 8 23591024 18D TAAAAGGGGA TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 1415 het 1414 ref 17 4 6 9 T 36 18 355486 CASAVA_Build 8 23592506 3D ACAAAGACAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 15 12 355487 CASAVA_Build 8 23594166 4D CTCTTGGAGA CTCT/---- CTATTTGCCC 3070 het 3070 hom 46 19 24 5 CT 3 1 355488 CASAVA_Build 8 23597547 1D CAAGAGAATA T/- TTTTAGGAAA 3070 het 3070 ref 58 31 21 7 T 5 4 355489 CASAVA_Build 8 23599132 1I GACAAAGGTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 60 25 28 7 A 8 9 355490 CASAVA_Build 8 23611301 1I TGTCTCAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 9 10 355491 CASAVA_Build 8 23615863 1I CGGAGGGGAA -/G GGGAACGAGC 2168 het 2073 hom 25 11 7 7 G 3 4 355492 CASAVA_Build 8 23617173 3D ACAAACAAAA AAC/--- AAACAAACAA 1265 het 228 hom 16 1 6 10 AAC 1 0 355493 CASAVA_Build 8 23637007 2D ACATGGACAA AC/-- AACTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 AC 1 0 355494 CASAVA_Build 8 23645359 1I TGTTGTATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 11 12 355495 CASAVA_Build 8 23651007 1D TTCATAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1335 het 1335 ref 35 28 3 4 A 11 10 355496 CASAVA_Build 8 23659182 2I TTTTTTTTTT --/TA AGTCTCAAAT 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 TA 0 1 355497 CASAVA_Build 8 23659757 4D CTTCCTTCCT TCCC/---- TCCCTCCTTC 1408 het 333 hom 14 3 5 6 TCCC 2 1 355498 CASAVA_Build 8 23660464 1D ACACAGAGGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 T 10 9 355499 CASAVA_Build 8 23677179 1I TTTGTAGGAA -/T TTTTTTTTTT 1717 het 473 hom 12 1 9 3 T 13 14 355500 CASAVA_Build 8 23682295 1I TTCTCTTCCC -/T CCCGCCCACC 3070 hom 68 het 26 0 19 7 T 0 1 355501 CASAVA_Build 8 23698533 3D TTTAATTAAT TAA/--- TTTTTTTTTT 105 het 105 ref 10 5 1 4 TAA 1 0 355502 CASAVA_Build 8 23702044 1D CTCAATCCAC A/- AAATGACTGC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 4 3 355503 CASAVA_Build 8 23721776 8I TGAGCCTTGT --------/CAACTGAC AAAGCAAGAA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 CAACTGAC 0 1 355504 CASAVA_Build 8 23728736 2D AGTTTACACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 17 9 25 A 16 14 355505 CASAVA_Build 8 23729033 1D AAAACCAAAA C/- ATTTTACTAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 C 1 0 355506 CASAVA_Build 8 23733842 1D AGTCAGGAGG A/- AAAAAAAGTC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 A 8 7 355507 CASAVA_Build 8 23751123 2D CAGCTGAAAG AC/-- AGATGGTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 AC 1 0 355508 CASAVA_Build 8 23754120 1D CCCAGGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2930 hom 31 11 15 5 T 13 12 355509 CASAVA_Build 8 23763438 1I CCACTTGAGA -/G AAATGGTTGG 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 G 0 1 355510 CASAVA_Build 8 23765148 1I CTAAGGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 19 21 7 A 12 13 355511 CASAVA_Build 8 23775427 2I CTTTAGAAGC --/TA TGAGGTTTTC 3070 het 3070 ref 52 23 20 9 TA 0 1 355512 CASAVA_Build 8 23784427 1D CATGTGGCTT C/- TCTATGTGGC 3070 het 3070 ref 61 33 22 7 C 1 0 355513 CASAVA_Build 8 23792360 1I CCATTTTAGC -/T TTTTTTTTTT 2821 het 2821 ref 31 12 12 7 T 13 14 355514 CASAVA_Build 8 23806404 1D TCCTGCCAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 T 10 9 355515 CASAVA_Build 8 23807470 1D TATTTTATTA T/- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 7 6 355516 CASAVA_Build 8 23814262 4D GAGTCCAGAT ACTC/---- ACAGATGCCG 3070 het 3070 ref 38 17 17 5 ACTC 1 0 355517 CASAVA_Build 8 23819308 4D GCACACACAA ACAC/---- ACACACACAC 1311 het 1311 ref 45 20 3 22 AC 9 7 355518 CASAVA_Build 8 23820592 4D GGAAAAGGCA ACAC/---- ACTCTACAAC 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 AC 3 1 355519 CASAVA_Build 8 23824430 1I ATCAAGTTAC -/T GTGTTTTTTG 3070 het 3070 hom 57 20 30 7 T 0 1 355520 CASAVA_Build 8 23829944 1D TTTTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 12 11 355521 CASAVA_Build 8 23830179 1I CTCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 9 10 355522 CASAVA_Build 8 23840533 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2107 het 2107 ref 23 12 5 6 T 12 11 355523 CASAVA_Build 8 23841234 2D GTTTTGTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 12 10 355524 CASAVA_Build 8 23850330 1D TGGGGTAGGA G/- GGGGAGGTGT 3070 hom 90 het 35 0 29 7 G 5 4 355525 CASAVA_Build 8 23855682 8D CATGTTGTAG TATATGTC/-------- TATAATTCAT 3070 het 3070 ref 37 28 10 1 TATATGTC 1 0 355526 CASAVA_Build 8 23860442 1I GACTCCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2239 hom 21 7 11 3 A 10 11 355527 CASAVA_Build 8 23860534 1I GTAACATTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 6 7 355528 CASAVA_Build 8 23866479 1D GTAGAGAGAA T/- TTGAGAGACA 1132 het 716 hom 11 2 3 6 T 3 2 355529 CASAVA_Build 8 23873402 1I TTCAAGCCAT -/C CTCCCACCTC 3070 hom 141 het 48 0 48 0 C 1 2 355530 CASAVA_Build 8 23874038 1I GTCTTGAGCC -/T ATCTAGTGGT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 0 1 355531 CASAVA_Build 8 23897408 1D ACTGCAAGCT C/- CCGCCTCCCG 3070 hom 33 het 13 0 10 3 C 3 2 355532 CASAVA_Build 8 23898462 2I ACATACCTAG --/AT ATATATATCA 3070 het 3070 ref 49 22 15 12 AT 4 5 355533 CASAVA_Build 8 23911055 1I TAGAAGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 15 12 T 12 13 355534 CASAVA_Build 8 23969364 2I ATTAATTAGC --/TT TTTTAATTGT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 4 6 355535 CASAVA_Build 8 23986895 1D TGTCTAACTT C/- CCCTTGTGGT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 C 4 3 355536 CASAVA_Build 8 24013509 1D GAGCTATGCA T/- TGTATTTTGC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 2 1 355537 CASAVA_Build 8 24027852 1D TAATTGGGTC T/- GGTTTATAAG 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 T 1 0 355538 CASAVA_Build 8 24042639 1D AGCCTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 98 het 38 0 33 6 A 11 10 355539 CASAVA_Build 8 24062918 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2175 het 1377 hom 34 11 10 13 T 19 18 355540 CASAVA_Build 8 24067980 1I CAACAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 11 11 A 13 14 355541 CASAVA_Build 8 24098970 1I AAATCGTCTA -/T TAAAAAAATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 2 355542 CASAVA_Build 8 24109207 5I TTGTGTTTCT -----/CTTGA CTTGTCTGAA 3070 hom 154 het 59 0 51 8 CTTGA 0 1 355543 CASAVA_Build 8 24144133 1D CTCTCTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 9 17 9 T 12 11 355544 CASAVA_Build 8 24149180 10I AATCCCTGTC ----------/CTGTTCTGTT CTGATTACCG 3070 hom 63 het 28 0 22 6 CTGTT 0 2 355545 CASAVA_Build 8 24151238 1I GTTATCGTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 18 1 13 4 A 10 11 355546 CASAVA_Build 8 24157450 1D TAGGACTTTT A/- AAAAAAATGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 8 7 355547 CASAVA_Build 8 24166675 1I GCCAGACACC -/T TTTTTTTTTT 2034 het 5 hom 15 0 7 8 T 15 16 355548 CASAVA_Build 8 24176864 1D CCTCTCTCGC T/- TTTTTTTTTT 3020 het 166 hom 23 1 9 13 T 15 14 355549 CASAVA_Build 8 24212921 1D TGTGACATAG T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 9 8 355550 CASAVA_Build 8 24250039 14D CTCCGTCTCC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAGAAAA 1467 het 766 hom 9 3 5 2 A 19 5 355551 CASAVA_Build 8 24266887 1I ACATTTGAGA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 7 8 355552 CASAVA_Build 8 24267830 4I TTAGAAGTTA ----/TGTC TGTCTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TGTC 1 2 355553 CASAVA_Build 8 24267939 4D GAGAAATATA CTAT/---- CTATCTCACC 3070 hom 87 het 33 0 29 4 CTAT 2 1 355554 CASAVA_Build 8 24268851 4I AAAGAATATC ----/CTAT CTATCTAATC 3070 hom 90 het 40 0 31 9 CTAT 1 2 355555 CASAVA_Build 8 24269121 8I AGGCTGAAAA --------/AGATAGAT AGATAGATAG 3070 hom 90 het 41 0 31 10 AGAT 2 4 355556 CASAVA_Build 8 24270587 2D AAGCTTGGAA TT/-- TTAGATTCCT 3070 hom 78 het 31 0 27 6 T 4 2 355557 CASAVA_Build 8 24271234 4I TTCCTTTCTT ----/TCTC TGTGTCTCTA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TC 0 2 355558 CASAVA_Build 8 24271571 3I ATTTCCAGAT ---/ATG ATTTTAAAAA 3070 hom 110 het 43 0 37 6 ATG 0 1 355559 CASAVA_Build 8 24273633 3I23M1I TTTACACTGT ---TGGGAGTGTAAATTAGTTCAACC-/TGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCA ATTGTGAAAG 3070 hom 69 het 23 0 24 4 N/A 0 0 355560 CASAVA_Build 8 24274292 1D AGTACTAAGA C/- AAAAATTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 1 0 355561 CASAVA_Build 8 24274360 2D TTTTCCTCTC TT/-- TTCTGTCTGG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 4 2 355562 CASAVA_Build 8 24276714 1D TAATTTACAA T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 93 het 38 0 31 9 T 8 7 355563 CASAVA_Build 8 24276829 1D AGAACCACAT C/- CATTGTTTCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 2 1 355564 CASAVA_Build 8 24278463 3I TTTTATTCTC ---/CTT CTGATGTGCT 3070 hom 77 het 33 0 26 7 CTT 0 1 355565 CASAVA_Build 8 24280888 1D TTGCTTGATT C/- CCCACCCTGG 3070 hom 123 het 42 0 41 1 C 4 3 355566 CASAVA_Build 8 24289606 1D ACACAGCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2710 hom 29 10 12 7 A 13 12 355567 CASAVA_Build 8 24299403 1D TGATTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 129 hom 39 1 34 4 A 11 10 355568 CASAVA_Build 8 24314430 1D GAACTCATCA T/- TTTTTTATGG 1641 het 1641 ref 14 6 5 3 T 7 6 355569 CASAVA_Build 8 24332454 2D AGAACTAGGT AG/-- AGAGACACCT 3070 het 3070 hom 53 24 23 6 AG 3 2 355570 CASAVA_Build 8 24344126 1I TATTGATTTT -/A AAACATTTTC 3070 hom 99 het 41 0 34 7 A 3 4 355571 CASAVA_Build 8 24356280 1I CACCAACAGC -/T TTTCAGGCTG 3070 hom 105 het 43 0 35 8 T 3 4 355572 CASAVA_Build 8 24358741 55I GCCTCCCACG -------------------------------------------------------/TGGGGATTCTGTGTCTTTATGATAAAGCTGTAATTTTATTGTTCAACTTGCAGTC AAAACAACCT 3070 hom 117 het 35 0 39 5 TGGGGATTCTGTGTCTTTATGATAAAGCTGTAATTTTATTGTTCAACTTGCAGTC 0 1 355573 CASAVA_Build 8 24374741 2I TGATGTTCTC --/CT CTCTTCTGGC 3070 hom 123 het 43 0 41 2 CT 2 3 355574 CASAVA_Build 8 24375192 2I CAAGTAAAAC --/TT TTATCTAGGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 2 4 355575 CASAVA_Build 8 24395787 1D AAATTAACAG A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 8 7 355576 CASAVA_Build 8 24406888 6D TATCTAATTA GACATG/------ GATTATAGAC 3070 het 3070 ref 51 28 22 3 GACATG 1 0 355577 CASAVA_Build 8 24408116 1D GATGTGAGTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 53 19 29 6 A 9 8 355578 CASAVA_Build 8 24416323 2D TTACAAGAAG AA/-- AAAGCACTAC 3070 het 3070 hom 50 19 27 5 A 5 3 355579 CASAVA_Build 8 24417847 1D CATTAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 11 10 355580 CASAVA_Build 8 24421048 2D CTGTACTTAT CA/-- CAACAGATTA 1059 het 1059 ref 33 11 4 18 CA 2 1 355581 CASAVA_Build 8 24423194 1I AATTTGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 A 11 12 355582 CASAVA_Build 8 24434529 1I AGGTGCAAAG -/T ATTTCCTTAG 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 0 1 355583 CASAVA_Build 8 24434612 1D TTTAGTTTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 696 hom 35 3 26 6 T 15 14 355584 CASAVA_Build 8 24445558 2D GATCAGACTC CT/-- CTCTGTAAAC 3070 hom 154 het 56 0 52 5 CT 3 2 355585 CASAVA_Build 8 24453973 1I TGCACTGGGG -/T ATTTGTCCTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 0 1 355586 CASAVA_Build 8 24467401 1I AGGATTTTTA -/C CAAGACAGTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 C 1 2 355587 CASAVA_Build 8 24497241 1D AATACATTGA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 8 7 355588 CASAVA_Build 8 24558548 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1685 het 1685 ref 38 13 9 16 T 15 16 355589 CASAVA_Build 8 24584458 2I TGATAAGGAA --/AC ACAGGATAAT 3070 hom 120 het 45 0 40 5 AC 1 2 355590 CASAVA_Build 8 24585317 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 9 8 355591 CASAVA_Build 8 24593904 1I AATGCAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 473 hom 42 2 35 5 A 11 12 355592 CASAVA_Build 8 24598680 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 787 hom 12 het 6 0 4 2 A 14 13 355593 CASAVA_Build 8 24605986 3D GGCAGAGGTC AAG/--- AAGATCAGTT 3070 hom 108 het 42 0 36 7 AAG 2 1 355594 CASAVA_Build 8 24608189 1D AAGCCTACTC A/- GAGACATTTG 3070 hom 96 het 40 0 33 8 A 1 0 355595 CASAVA_Build 8 24609465 4I CATAGGAAGA ----/GAGT GAGAGCAAGT 3070 hom 108 het 42 0 35 7 GAGT 0 1 355596 CASAVA_Build 8 24612260 1I TAGTGAGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 38 1 25 12 T 11 12 355597 CASAVA_Build 8 24616126 1I AAAGTACGAG -/A AAAAAAGAAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 6 7 355598 CASAVA_Build 8 24616606 2I TGTTAATCAC --/AG AGTTACCTCA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AG 1 2 355599 CASAVA_Build 8 24618668 4I AGTGATACAA ----/TTTT TTTATTATTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 3 7 355600 CASAVA_Build 8 24619017 1I AAAAAATAAA -/T TTAGCCTGGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 3 355601 CASAVA_Build 8 24623020 11D AAAAGGAAGA GAAAAGGTGAG/----------- GAAAGCACAT 3070 het 3070 hom 38 13 23 10 GAAAAGGTGAG 1 0 355602 CASAVA_Build 8 24626754 2D AGCAAAAGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3061 het 1371 hom 34 4 9 22 A 16 14 355603 CASAVA_Build 8 24632973 1D CTTCTGTGTT A/- AGGGCAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 2 1 355604 CASAVA_Build 8 24647350 1D TTCCACTTAA C/- GTCATTTTCA 3070 hom 72 het 29 0 25 5 C 1 0 355605 CASAVA_Build 8 24648599 1I TAAAATTACT -/A AAAAAATAGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 6 7 355606 CASAVA_Build 8 24650100 13D CCATGCTGCT TATTACGACCTTG/------------- TATTACGACC 3070 hom 123 het 46 0 41 11 TATTACGACCTTG 2 1 355607 CASAVA_Build 8 24651022 4I GGTGGGAGAG ----/AGTA AGAACAGGTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AGTA 0 1 355608 CASAVA_Build 8 24658754 2D ACTTACTTAT TG/-- TATCTTATTT 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 TG 1 0 355609 CASAVA_Build 8 24660422 7D TGACATGCAT GTAAGAA/------- GCGTCACTGA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 GTAAGAA 1 0 355610 CASAVA_Build 8 24661332 1D TCCTATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2924 hom 36 8 18 10 A 13 12 355611 CASAVA_Build 8 24665475 1I TGAGTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 T 10 11 355612 CASAVA_Build 8 24685405 4I AAATGGGCTT ----/AAAC AAAGTGTGAA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AAAC 0 1 355613 CASAVA_Build 8 24718838 3I TGAGTTTTCT ---/ATG ATAATATTGA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 ATG 0 1 355614 CASAVA_Build 8 24722130 4I AGCTAAAATA ----/GTTT GTTAATGGAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 GTTT 0 1 355615 CASAVA_Build 8 24723538 1D ACAAGCATTT A/- AGCTAGATTC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 A 2 1 355616 CASAVA_Build 8 24742471 4D TTTTCCCTTT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 TTTC 2 1 355617 CASAVA_Build 8 24744651 1I TTATTCTGAA -/T ATAGAAAAGG 3070 hom 54 het 25 0 22 3 T 0 1 355618 CASAVA_Build 8 24749892 1D TTAAATCTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 A 15 14 355619 CASAVA_Build 8 24749968 1I ATCTGCTGTC -/T TTTTTTTTTT 2338 het 2338 ref 23 11 6 6 T 12 13 355620 CASAVA_Build 8 24762497 1I ACCATAAAAT -/G GGGGGGGGGC 1913 het 1913 ref 22 6 7 9 G 9 10 355621 CASAVA_Build 8 24766445 1I AATATCTGAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 8 9 355622 CASAVA_Build 8 24771002 1D CATCCAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 19 9 T 11 10 355623 CASAVA_Build 8 24772371 1D CCCTCCTTCC A/- AGCCTCTTGG 3070 het 3070 hom 50 23 20 7 A 2 1 355624 CASAVA_Build 8 24778059 1I AATTAAAAAT -/A AAAAAAACTT 3070 het 896 hom 31 6 13 12 A 7 8 355625 CASAVA_Build 8 24783879 1I CTGAGCCCAC -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 7 8 355626 CASAVA_Build 8 24790088 2D GCTTATAAAC AG/-- AAATTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 AG 1 0 355627 CASAVA_Build 8 24791745 1D GAGGGGGGGG A/- AAAAGTGCTG 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 A 5 4 355628 CASAVA_Build 8 24792381 1D AGTATTTTAG A/- ATAATCACAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 A 2 1 355629 CASAVA_Build 8 24808949 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 25 19 12 T 12 11 355630 CASAVA_Build 8 24814514 6I CTAGTGCAAG ------/CCACAT CCACATACCT 3070 het 3070 ref 52 23 16 13 CCACAT 1 2 355631 CASAVA_Build 8 24815983 1D GCAATTTGCC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 355 hom 40 1 36 3 A 10 9 355632 CASAVA_Build 8 24819945 1D GGCATTCATT C/- CTTAATAATT 3070 het 3070 hom 48 17 25 6 C 2 1 355633 CASAVA_Build 8 24823974 3D TAGCTTATGA AAC/--- AACAATTCAG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 AAC 2 1 355634 CASAVA_Build 8 24833733 1D TATAATCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 13 9 A 15 14 355635 CASAVA_Build 8 24837850 1D AGTTATTAAC T/- TTTGGGCGGG 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 4 3 355636 CASAVA_Build 8 24851674 4I GGGAAGGGAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 AG 6 8 355637 CASAVA_Build 8 24854168 1D TAAAGCTGAC A/- AAAACTGACC 3070 hom 122 het 50 0 38 12 A 5 4 355638 CASAVA_Build 8 24855347 1D GAGGGGGTCC A/- AAACTGCATT 3070 hom 50 het 19 0 14 5 A 4 3 355639 CASAVA_Build 8 24855946 3D CTCGCTGCCG CCT/--- CCTCCTCCGG 3070 hom 47 het 20 0 15 5 CCT 3 2 355640 CASAVA_Build 8 24863685 1D AAGAGGTCAA G/- GGAGGCTTCC 3070 het 3070 hom 49 22 19 9 G 3 2 355641 CASAVA_Build 8 24866982 1D CTCCTTCAGA G/- GGGGGGCTCA 3070 hom 86 het 35 0 27 8 G 7 6 355642 CASAVA_Build 8 24870691 6D CGCGCGCGCG CACACA/------ CACACACACA 3070 hom 29 het 28 1 23 4 CA 13 10 355643 CASAVA_Build 8 24871656 1D CCTTTCTCAT C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 C 10 9 355644 CASAVA_Build 8 24873186 3I AAACATTCTA ---/CTT CTTCTCCAGT 3070 hom 126 het 46 0 42 4 CTT 1 2 355645 CASAVA_Build 8 24890330 4D ACCTTTTTTT AAAA/---- AAAAAAAAAA 872 het 342 hom 24 6 3 16 A 22 18 355646 CASAVA_Build 8 24901917 2I TATATTTATC --/AT TACATGTTGC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 AT 0 1 355647 CASAVA_Build 8 24907297 1I CAAAATGGGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 T 7 8 355648 CASAVA_Build 8 24912463 1D TTCCTGTGTA C/- CAGTACCTTT 3070 hom 84 het 43 0 37 8 C 2 1 355649 CASAVA_Build 8 24914647 1I AAGGCCAGTG -/C CCCCCTTCCG 2674 het 2674 ref 34 18 7 9 C 5 6 355650 CASAVA_Build 8 24918089 4D ATAAAAAAAT ACTC/---- AAATTAATAG 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 ACTC 1 0 355651 CASAVA_Build 8 24924559 1I TCCTCAAAAG -/A AAAAAGGGGT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 5 6 355652 CASAVA_Build 8 24936862 1D TTTACTCCAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 A 9 8 355653 CASAVA_Build 8 24937629 1I TAACACGGTG -/A AACCCCGTCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 2 3 355654 CASAVA_Build 8 24941883 2D CAAGACTAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 9 9 A 14 12 355655 CASAVA_Build 8 24942999 3D TGTCTTTACG TAT/--- TATGTCTATC 3070 het 3070 ref 24 12 10 4 TAT 2 1 355656 CASAVA_Build 8 24948942 1I CTTTTTTTAG -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 7 8 355657 CASAVA_Build 8 24952964 1D ATTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 11 10 355658 CASAVA_Build 8 24954359 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1406 hom 12 het 7 0 5 3 A 15 14 355659 CASAVA_Build 8 24967963 3I ATTGAGTTGA ---/ATG ATGTCTTTCC 3070 het 3070 ref 48 22 23 3 ATG 1 2 355660 CASAVA_Build 8 24975503 1D AACTGTACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 A 15 14 355661 CASAVA_Build 8 25033123 1D TAGGTATAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 T 13 12 355662 CASAVA_Build 8 25038359 2D ACGCATATGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 AT 9 8 355663 CASAVA_Build 8 25047057 1D AGTAGCGTGG A/- AAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 39 16 16 8 A 7 6 355664 CASAVA_Build 8 25056938 1D14M1I GCAAATCCAT AGTAACAGAAAGTAG-/-GTAACAGAAAGTAGA TAAGTCATTG 3070 het 3070 ref 54 36 16 5 N/A 0 0 355665 CASAVA_Build 8 25061749 1I TTGCCTCCCC -/T GGGGAAGAGC 3070 het 3070 ref 61 32 26 3 T 0 1 355666 CASAVA_Build 8 25065600 1D GAAAACAGCA T/- GGGAGGCTTC 3070 het 3070 ref 49 24 22 3 T 1 0 355667 CASAVA_Build 8 25066290 1I GTAGCATGTT -/G TAAAAATGTT 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 G 0 1 355668 CASAVA_Build 8 25069478 1D CATGACAGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 185 hom 40 6 11 23 A 10 9 355669 CASAVA_Build 8 25070416 1D AACTCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 297 hom 24 1 18 6 A 12 11 355670 CASAVA_Build 8 25071668 4I GTTTTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 TTTG 3 4 355671 CASAVA_Build 8 25080523 2I CACCCAACTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2679 hom 30 7 14 9 T 10 12 355672 CASAVA_Build 8 25102250 4D TCTCATCTTT TTTC/---- TTTCTTTGTT 2453 het 2453 ref 33 21 6 8 TTTC 2 1 355673 CASAVA_Build 8 25105647 1I TATTGTGAAT -/A GTGCCACAAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 0 1 355674 CASAVA_Build 8 25106814 1I ACATTACAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 11 13 T 12 13 355675 CASAVA_Build 8 25107030 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2803 hom 22 8 10 4 A 9 10 355676 CASAVA_Build 8 25107272 1D AATATGTTAG C/- CTGAAAAAAG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 C 2 1 355677 CASAVA_Build 8 25108353 1D TGCAACGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 410 hom 34 4 24 6 T 13 12 355678 CASAVA_Build 8 25110472 1D TCTATTATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1021 hom 20 4 11 6 A 10 9 355679 CASAVA_Build 8 25110544 21D GAATATGCCT ACTCTCCGTGGACATTAAAGG/--------------------- ACATAATAAG 3070 het 3070 ref 27 19 10 2 ACTCTCCGTGGACATTAAAGG 1 0 355680 CASAVA_Build 8 25112005 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 A 13 12 355681 CASAVA_Build 8 25112745 1D TGATGTCATC T/- TCTGAAGACT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 2 1 355682 CASAVA_Build 8 25113264 6D TGGAACCAGA GGTGCT/------ GGTGCTGGTG 3070 het 3070 ref 34 13 11 12 GGTGCT 4 3 355683 CASAVA_Build 8 25113397 1D TTGTTTTAGA T/- TTGTTAATTT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 T 3 2 355684 CASAVA_Build 8 25114335 6I AAATGGCTAT ------/TTCTTC TTCTTCTTCT 3070 hom 87 het 36 0 30 7 TTC 4 6 355685 CASAVA_Build 8 25117406 2I AAAATGAAAC --/AT GTGTTCTTTC 3070 hom 135 het 52 0 46 6 AT 0 1 355686 CASAVA_Build 8 25118458 1I GGATTAGTGC -/T TTTTTTTAAA 2915 het 2915 ref 19 8 6 5 T 7 8 355687 CASAVA_Build 8 25142166 1I AACTATTTTT -/A AACCTTTTTT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 2 3 355688 CASAVA_Build 8 25142914 1I ACTCTGTATC -/A AAAAAAAAAA 2846 het 2846 ref 23 8 7 8 A 11 12 355689 CASAVA_Build 8 25145762 7I GGCTGAGCTA -------/GTTATTG GGAAACGTAT 3070 hom 138 het 53 0 47 6 GTTATTG 0 1 355690 CASAVA_Build 8 25176670 2I TGTTTGGGAC --/TG GTTGTGCTTT 3070 hom 132 het 50 0 44 6 TG 0 1 355691 CASAVA_Build 8 25180274 1D ATAGGAGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2559 hom 27 8 14 5 A 10 9 355692 CASAVA_Build 8 25184598 1I AAATTCTGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 8 9 355693 CASAVA_Build 8 25194406 1D GGGAAAGGAG T/- TTTTTTTTTT 1031 het 1031 ref 34 14 3 17 T 17 16 355694 CASAVA_Build 8 25195323 2D AAAAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2937 het 112 hom 19 3 12 5 A 18 16 355695 CASAVA_Build 8 25197064 1I AGCTTCTCTC -/T TTACCCGACT 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 2 3 355696 CASAVA_Build 8 25202534 1D CAGTTTTGTT C/- ATTGCCCCCT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 C 1 0 355697 CASAVA_Build 8 25204071 6D TTATCTCTGA AATTAT/------ AATTATTTCT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 AATTAT 2 1 355698 CASAVA_Build 8 25213990 1D TTAAGAGCAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 364 hom 44 1 34 9 T 9 8 355699 CASAVA_Build 8 25214298 1D AAAATCGGGG A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 98 het 39 0 31 8 A 8 7 355700 CASAVA_Build 8 25227385 4D AGAACAGCCC TCTT/---- TCTGTCTCAC 3070 hom 101 het 36 0 31 7 TCTT 1 0 355701 CASAVA_Build 8 25231688 1D GCTCGACTGA T/- TTTTTTTATA 3070 het 2922 hom 25 8 10 7 T 8 7 355702 CASAVA_Build 8 25250924 1D AAAAAAAATC T/- TATCAGGTAT 3070 het 3070 ref 34 23 9 2 T 2 1 355703 CASAVA_Build 8 25256277 1I GACTACAAGG -/C ACCTGCCACC 531 hom 5 het 3 0 2 2 C 0 1 355704 CASAVA_Build 8 25263788 8D GTTGCATGTG GGTAAGTC/-------- GGAGCCAAAT 3070 het 3070 ref 36 17 17 4 GGTAAGTC 1 0 355705 CASAVA_Build 8 25270180 5D TAAATGTCAG AGTGA/----- AGTGTTCAAT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AGTGA 1 0 355706 CASAVA_Build 8 25272818 5I CAGTAACTAC -----/TCATG TCATGGCAAG 3070 hom 141 het 50 0 46 4 TCATG 1 2 355707 CASAVA_Build 8 25283936 1I TTACAATTTG -/T TTTTTGGTGT 3070 het 2121 hom 34 11 17 6 T 5 6 355708 CASAVA_Build 8 25284592 2D TGCTCCCAAC TG/-- TATTCTTTTT 3070 het 3070 ref 39 23 13 5 TG 1 0 355709 CASAVA_Build 8 25285343 5I TCTTTTAATT -----/ATCTA ATCTAATAAG 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 ATCTA 1 2 355710 CASAVA_Build 8 25287035 1I TCTGTGATCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 18 13 7 T 8 9 355711 CASAVA_Build 8 25296398 1I GTGGTGTTCT -/G GCAGGTCTTT 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 G 1 2 355712 CASAVA_Build 8 25304252 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 32 0 26 8 T 9 8 355713 CASAVA_Build 8 25307785 1D AAGGAGATAC T/- TTTTTTTTTT 2166 het 2166 ref 35 26 5 4 T 13 12 355714 CASAVA_Build 8 25307987 1D CACTTACCTC T/- TTTCATGGAG 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 4 3 355715 CASAVA_Build 8 25337790 1I TGGACTATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 14 15 T 12 13 355716 CASAVA_Build 8 25364185 1I TCAGCCTCCC -/A AAGTGCTGGG 3070 hom 56 het 23 0 20 3 A 2 3 355717 CASAVA_Build 8 25376480 1D TATTTCTCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 9 8 355718 CASAVA_Build 8 25380589 1I TTTTTCAGTC -/T TTTTTTTTTT 965 het 965 ref 36 26 3 7 T 10 11 355719 CASAVA_Build 8 25383139 57D ACACTTTGAG ATACACTTTATGAGATAAAGTGTACACTTTTCTCAGGATAAAGTATCTCCTGTACAC/--------------------------------------------------------- TTTATGAGAT 3070 hom 78 het 27 0 27 3 ATACACTTTATGAGATAAAGTGTACACTTTTCTCAGGATAAAGTATCTCCTGTACAC 1 0 355720 CASAVA_Build 8 25384575 4I ATTTCTTATG ----/TTGT TTGTTTTTTC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 TTGT 1 2 355721 CASAVA_Build 8 25385636 2D ATAGCCTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 12 10 355722 CASAVA_Build 8 25385691 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 2847 het 1169 hom 21 4 7 10 T 12 11 355723 CASAVA_Build 8 25398023 2D GTATAGATGA TT/-- TTTTTTTTTT 901 het 901 ref 21 12 3 6 T 20 18 355724 CASAVA_Build 8 25400515 1D TTTTTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 21 1 18 2 A 12 11 355725 CASAVA_Build 8 25410946 2I AAATAAAAAA --/AT AAAAAAAACT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AT 0 1 355726 CASAVA_Build 8 25421701 1D TTTTCTTTAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 53 het 21 0 17 4 A 10 9 355727 CASAVA_Build 8 25422672 1D ATTTATAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 10 355728 CASAVA_Build 8 25423526 2I TATTTTTACT --/CA TTTTTCTTAC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 CA 0 1 355729 CASAVA_Build 8 25428161 1D GGGGTCAAAC A/- GTTGAAACGT 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 1 0 355730 CASAVA_Build 8 25440235 1I CCTGCCAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1485 hom 18 4 11 3 A 12 13 355731 CASAVA_Build 8 25443216 1I TTTGTGAATA -/T TTTTTCCCAT 2855 het 2283 hom 15 5 8 2 T 5 6 355732 CASAVA_Build 8 25461998 1D CCCAGCTAAA T/- TTTTTTTTTT 1745 het 1745 ref 24 7 7 10 T 17 16 355733 CASAVA_Build 8 25501077 1I CATCTTCAGA -/C CAGGAACCAT 3070 het 3070 hom 69 26 29 14 C 1 2 355734 CASAVA_Build 8 25510332 1D CCTGATTGCA G/- GTGTCTAAGG 3070 het 3070 ref 40 24 13 4 G 2 1 355735 CASAVA_Build 8 25511144 1I GCTGCTTTGC -/T TTTTGAAAGT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 4 5 355736 CASAVA_Build 8 25512734 1I CTACAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2322 hom 23 6 16 1 A 10 11 355737 CASAVA_Build 8 25519798 5I CTATCATTAG -----/CTTTT CTTTTCTTCC 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 CTTTT 1 2 355738 CASAVA_Build 8 25526610 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 18 9 7 2 T 10 9 355739 CASAVA_Build 8 25533438 1I ATCAAATAGG -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 7 8 355740 CASAVA_Build 8 25539574 2I ATATAATGTG --/TC TGTGTGTGTA 3070 het 2161 hom 40 11 25 4 TC 0 1 355741 CASAVA_Build 8 25541441 1I GAAATAACCC -/A AATATCCATC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 2 3 355742 CASAVA_Build 8 25548901 1D AATTTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 34 1 25 8 T 11 10 355743 CASAVA_Build 8 25551817 2D GCTTGGGACT TC/-- TTTTACCAAA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 TC 1 0 355744 CASAVA_Build 8 25560311 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 T 10 11 355745 CASAVA_Build 8 25563782 7I ATCGTTTGTA -------/TTTTTGT TTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 8 6 TTTTTGT 2 3 355746 CASAVA_Build 8 25565140 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 11 10 355747 CASAVA_Build 8 25578829 1I TGTCTGGCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 9 10 355748 CASAVA_Build 8 25583690 2I AGAGAAAAAC --/TT TTGCTTCTGA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 2 4 355749 CASAVA_Build 8 25587835 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 T 6 7 355750 CASAVA_Build 8 25608963 1D CTTGGAATTA T/- TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 8 7 355751 CASAVA_Build 8 25613337 1I AACAAACAAA -/C AACTGAAACA 3070 het 3070 ref 34 19 14 1 C 0 1 355752 CASAVA_Build 8 25613921 1D GAAACTCCCT G/- GTGCATGAAT 3070 het 3070 ref 33 20 9 5 G 2 1 355753 CASAVA_Build 8 25614096 1D TATACTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1033 hom 32 8 11 13 T 17 16 355754 CASAVA_Build 8 25619704 1I AGCAAAGCTC -/T TATACATTTA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 1 2 355755 CASAVA_Build 8 25629835 1I AAAAATCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1211 hom 33 3 28 2 T 13 14 355756 CASAVA_Build 8 25631025 4I GATTGTATTA ----/ATAT ATATGTGAAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AT 2 4 355757 CASAVA_Build 8 25643417 1D TTCTACTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 444 hom 26 1 20 5 T 10 9 355758 CASAVA_Build 8 25652708 13D TCTGTAAAAT GGGGGGGAAAAAA/------------- GTCCATATCT 3070 hom 81 het 29 0 28 4 GGGGGGGAAAAAA 1 0 355759 CASAVA_Build 8 25656219 1D TCAAGGAAAA C/- CCCCATCTGT 3070 hom 111 het 46 0 38 8 C 5 4 355760 CASAVA_Build 8 25659412 4D TGCTTCTGAT AGAC/---- AGACTTATGA 3070 het 3070 hom 30 12 14 6 AGAC 2 1 355761 CASAVA_Build 8 25661255 1D TCCCAACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2883 hom 33 8 17 9 A 11 10 355762 CASAVA_Build 8 25662844 1D GTACAGAGAG A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 7 6 355763 CASAVA_Build 8 25673402 2D ACTTTTAGGG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 T 11 9 355764 CASAVA_Build 8 25677598 2I ATATATACAC --/AG AGTGTAAAGT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AG 1 2 355765 CASAVA_Build 8 25681404 18D ATATATGTTG ACAGATATCTAGATCTAT/------------------ ACAGATAGAG 3070 hom 63 het 23 0 22 4 ACAGATATCTAGATCTAT 1 0 355766 CASAVA_Build 8 25688727 3I ACATCTCCGT ---/TTG TTGATTTGAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTG 1 2 355767 CASAVA_Build 8 25691921 1D CAGTTGTATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 10 9 355768 CASAVA_Build 8 25693582 2I AGTTTCACTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 652 hom 29 4 12 13 T 12 14 355769 CASAVA_Build 8 25697251 2D CTGAAAGGAC TG/-- TTATGATTCC 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 TG 1 0 355770 CASAVA_Build 8 25702230 5D ATGGGTCCCT CAGCA/----- CAGCACTCAC 3070 het 3070 ref 50 32 16 5 CAGCA 2 1 355771 CASAVA_Build 8 25703833 1D TAATCATGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 T 10 9 355772 CASAVA_Build 8 25707184 1D ATAATAATAA T/- AAAAAAAAGA 3070 het 864 hom 19 4 10 5 T 1 0 355773 CASAVA_Build 8 25708048 1I TGGATCTGCC -/A AAAAAATTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 6 7 355774 CASAVA_Build 8 25710181 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAATAC 793 hom 9 het 4 0 3 1 A 8 7 355775 CASAVA_Build 8 25711420 1D TTTTCTCTGG A/- AAAAAATGTA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 A 7 6 355776 CASAVA_Build 8 25714614 3D ATAGATGGTG AAC/--- AACAACATGA 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 AAC 3 2 355777 CASAVA_Build 8 25718658 1D ATTGGTCACA G/- GGCTGCTTCT 3070 het 3070 hom 53 20 27 8 G 3 2 355778 CASAVA_Build 8 25720549 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 626 hom 28 2 14 12 A 11 10 355779 CASAVA_Build 8 25745361 7I CCTTCTGATT -------/CTAAGTC CTAAGTCCTT 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 CTAAGTC 1 2 355780 CASAVA_Build 8 25758773 6D TGATTCTCCT GCCTCA/------ GCCTCTGCCT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 GCCTCA 1 0 355781 CASAVA_Build 8 25764832 1I TAATGTTTAG -/A AAAAAACACC 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 A 6 7 355782 CASAVA_Build 8 25765768 4I AAAAATCCCC ----/AACT AACTTTTCAT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 AACT 1 2 355783 CASAVA_Build 8 25767273 2D TCTTCAGATG AA/-- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 A 9 7 355784 CASAVA_Build 8 25775051 1I TTACCAAAAC -/A AAAAAACAAC 3070 het 3070 ref 28 18 7 3 A 6 7 355785 CASAVA_Build 8 25775708 3I TTCATAGAAA ---/TTT TTTTATACAG 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 4 7 355786 CASAVA_Build 8 25781908 2D ATATACACAC TT/-- TTTGTTGTTG 3070 het 3070 hom 43 21 16 6 T 5 3 355787 CASAVA_Build 8 25800551 2D TATGTCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 48 12 18 18 TC 9 8 355788 CASAVA_Build 8 25813289 7D CATGATCCAA CCACCCT/------- GTGGACGCCA 3070 het 3070 ref 37 19 13 8 CCACCCT 1 0 355789 CASAVA_Build 8 25813893 1I CCCTGTCTGT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 37 13 21 3 A 7 8 355790 CASAVA_Build 8 25814255 1D TGAGAAAACT A/- AAAAAAAAAT 1709 het 1709 ref 16 8 5 3 A 10 9 355791 CASAVA_Build 8 25817813 2D GATGTAACAA TT/-- TTGGTCTGAT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 T 4 2 355792 CASAVA_Build 8 25822015 1I ATGTGTTACA -/T TTTTTCAGTA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 T 5 6 355793 CASAVA_Build 8 25834141 1D GGCTAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 23 6 T 11 10 355794 CASAVA_Build 8 25834509 1D CCTTTGTGCC A/- AAAAAAGGAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 7 6 355795 CASAVA_Build 8 25835684 1D GTTTTTGCTT A/- AAAAAAAAAA 1827 het 1827 ref 28 15 6 7 A 12 11 355796 CASAVA_Build 8 25836388 1I CTACTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1265 hom 41 4 25 12 A 15 16 355797 CASAVA_Build 8 25837371 1D TGCTTCTCCT A/- ATGAGATGAT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 A 2 1 355798 CASAVA_Build 8 25848336 1I TGCCAGAACT -/A AGTACCACCA 3065 het 3065 ref 25 10 9 6 A 1 2 355799 CASAVA_Build 8 25850386 1D AATTCCTATT A/- AAGACCGATA 3070 het 3070 hom 31 11 19 1 A 3 2 355800 CASAVA_Build 8 25854055 1D TGAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 6 het 32 1 22 9 A 11 10 355801 CASAVA_Build 8 25882372 4I ACTACTGAAC ----/TGCA TGCACACTTA 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 TGCA 1 2 355802 CASAVA_Build 8 25884778 8D TGGGCAACAG AGTTCAGT/-------- CTCATTTTGC 3070 het 3070 ref 36 22 14 3 AGTTCAGT 1 0 355803 CASAVA_Build 8 25890069 1I GGGCTTTCTT -/A AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 15 0 A 5 6 355804 CASAVA_Build 8 25891721 2D GTAACGTGGC CG/-- CGCCACATGG 3070 hom 71 het 25 0 17 8 CG 2 1 355805 CASAVA_Build 8 25893350 1D CCCTTTTAGC A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 23 9 10 5 A 8 7 355806 CASAVA_Build 8 25894344 1D GGTGACCCCC T/- TCACCCCTGG 3070 hom 79 het 35 0 22 13 T 2 1 355807 CASAVA_Build 8 25894385 1D GGGAAGGTGT A/- ACCAGCTCAG 834 het 834 ref 31 15 3 13 A 2 1 355808 CASAVA_Build 8 25898115 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 25 2 13 11 A 12 11 355809 CASAVA_Build 8 25899258 1D CACAGAGAGA C/- CCCCCATCTC 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 C 6 5 355810 CASAVA_Build 8 25900110 1D CAACAACTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 51 24 20 7 A 9 8 355811 CASAVA_Build 8 25900482 1D CCCTGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 11 10 355812 CASAVA_Build 8 25906335 1I GCCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 748 hom 39 4 24 11 A 14 15 355813 CASAVA_Build 8 25909729 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 23 2 10 12 A 17 16 355814 CASAVA_Build 8 25916000 1I TACGGCCCTT -/C CCTCAAAGCA 3070 hom 78 het 28 0 25 3 C 2 3 355815 CASAVA_Build 8 25922178 1D AAACCAAACA G/- AAAAGAGGAA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 G 1 0 355816 CASAVA_Build 8 25924896 1D TTCAGGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 698 hom 41 2 32 8 T 12 11 355817 CASAVA_Build 8 25927128 1D ACCCACTATT A/- AAAAAAAAAA 840 het 840 ref 46 39 3 4 A 12 11 355818 CASAVA_Build 8 25931546 1D GTTGGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 9 13 T 13 12 355819 CASAVA_Build 8 25934190 1D CAAAGTCAGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 T 9 8 355820 CASAVA_Build 8 25939310 1D ATTTTCACTT A/- AAAAAAAAAA 1846 het 1846 ref 36 26 4 8 A 11 10 355821 CASAVA_Build 8 25939619 1I CAAAAAGAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 T 8 9 355822 CASAVA_Build 8 25945862 1I ATGGGAATAT -/G GGGGTTTCTT 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 G 4 5 355823 CASAVA_Build 8 25947179 5D12M1I CCCCTGAACT TAAAATAAAAGTTGAAG-/-----TAAAAGTTGAAGA AAAAAAAAAT 3070 het 815 hom 30 3 14 16 N/A 0 0 355824 CASAVA_Build 8 25949982 1D CAAATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 11 10 355825 CASAVA_Build 8 25950119 4D CTACACTCCC CAAA/---- CAGTGTGGAA 3070 het 3070 ref 25 10 8 9 CAAA 1 0 355826 CASAVA_Build 8 25958089 1D CGGGGTGCGC G/- GGGGGGGTGC 1048 het 1048 ref 21 9 5 7 G 8 7 355827 CASAVA_Build 8 25966318 1D TACCCCTTCT G/- GCCCTCACCC 3070 hom 120 het 45 0 40 6 G 2 1 355828 CASAVA_Build 8 25967759 1I AAAAATTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 24 0 21 3 C 0 1 355829 CASAVA_Build 8 25968583 1I AAATAAATTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 9 10 355830 CASAVA_Build 8 25973232 1I AACCACAGCA -/T TTCAGGAGGC 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 2 3 355831 CASAVA_Build 8 25982090 1D TTCCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 16 7 T 12 11 355832 CASAVA_Build 8 25982959 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3059 het 1625 hom 35 13 9 13 T 18 16 355833 CASAVA_Build 8 25983681 1D ACAGAAAGAA C/- CACTTCTTAG 3070 het 3070 ref 55 28 25 2 C 2 1 355834 CASAVA_Build 8 25984202 2D ATTACTGAGC TT/-- TTTTTTTTTT 2394 het 175 hom 25 4 11 10 T 16 14 355835 CASAVA_Build 8 26001090 2D ACTCCACCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 39 1 27 11 A 12 10 355836 CASAVA_Build 8 26001760 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 19 18 13 T 13 14 355837 CASAVA_Build 8 26002062 4I AATGTCGGTA ----/TTTC TTTTCCGCTG 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTTC 0 1 355838 CASAVA_Build 8 26007897 1D CAAAATAAAC A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 8 7 355839 CASAVA_Build 8 26016147 1D AGTTAAGAAG T/- TTAGTGCATC 3070 het 3070 ref 43 24 16 4 T 3 2 355840 CASAVA_Build 8 26019888 1D GATATTTATA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 7 T 9 8 355841 CASAVA_Build 8 26022481 1I GTGTATCCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 774 hom 38 2 32 4 T 9 10 355842 CASAVA_Build 8 26031389 1I GGTGGAGAAG -/A GCACTGTTTA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 A 0 1 355843 CASAVA_Build 8 26038005 1I AAATAGCCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 9 10 355844 CASAVA_Build 8 26041092 1I TCCACATACC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 T 8 9 355845 CASAVA_Build 8 26050516 1D GTGACCGTAT A/- AAAGGGGCAA 3070 het 3070 ref 50 26 15 10 A 4 3 355846 CASAVA_Build 8 26051341 1I TCTTCCAGTA -/T TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 6 7 355847 CASAVA_Build 8 26060574 1D TAATCCCAGC A/- ATTTGGGAGG 3070 het 3057 hom 27 8 14 5 A 2 1 355848 CASAVA_Build 8 26060672 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAAGAA 3070 het 1219 hom 29 14 12 3 G 0 1 355849 CASAVA_Build 8 26065608 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 30 1 27 3 A 13 12 355850 CASAVA_Build 8 26069600 1I TTCAAATCTG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 7 8 355851 CASAVA_Build 8 26078364 4I AATCAATCAA ----/TCAG TCAATCAATC 3070 het 55 hom 41 4 27 10 TCAG 0 1 355852 CASAVA_Build 8 26083459 1D ACTGTTTTCA T/- TGTTAGGAGG 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 T 2 1 355853 CASAVA_Build 8 26090412 2I AATGTTTTCG --/TT TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 26 8 14 4 T 6 8 355854 CASAVA_Build 8 26126761 49D TTTATCTGAT TGCCACCAAACTAGATAGGGTGGTTGCCTCCTATTTACTCTCCTAGAAA/------------------------------------------------- TGCCACCAAA 3070 hom 43 het 29 0 12 17 TGCCACCAAACTAGATAGGGTGGTTGCCTCCTATTTACTCTCCTAGAAA 1 0 355855 CASAVA_Build 8 26130243 1D AAAACCCTAC A/- AAACAAATAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 4 3 355856 CASAVA_Build 8 26133489 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 10 11 355857 CASAVA_Build 8 26133808 1D CCCACCAAAA T/- TGGCCTCACT 3070 hom 67 het 35 0 23 12 T 2 1 355858 CASAVA_Build 8 26134139 1D ATGGAGTGGG T/- TGGGGGGAAG 3070 hom 144 het 50 0 48 2 T 2 1 355859 CASAVA_Build 8 26135866 1D TTTCATGTGA C/- CGGGAGGTCA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 2 1 355860 CASAVA_Build 8 26138643 1I CTAAAATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 785 hom 44 3 28 13 T 13 14 355861 CASAVA_Build 8 26143266 1D ATGTAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 A 12 11 355862 CASAVA_Build 8 26144598 2D TACAGCAAAC AT/-- GTGTGCCCTA 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 AT 1 0 355863 CASAVA_Build 8 26144883 2I AAGAGAGTAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 24 3 A 10 12 355864 CASAVA_Build 8 26146314 1I AGTTAATGAC -/G CTCCAGTACC 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 G 0 1 355865 CASAVA_Build 8 26146799 1D ACAGTCTACA T/- TTTTTTTTTT 2067 het 214 hom 25 2 9 14 T 17 16 355866 CASAVA_Build 8 26149632 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 ref 32 16 8 8 T 8 7 355867 CASAVA_Build 8 26152295 8I ATTAATGTAC --------/GCATGTAT GCATGTATGC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 GCATGTAT 1 2 355868 CASAVA_Build 8 26154242 2D TAAAATGTAT TC/-- TCTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 TC 2 1 355869 CASAVA_Build 8 26157296 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 29 0 24 6 A 9 10 355870 CASAVA_Build 8 26159371 1D GCAATTCTAC T/- GCCTCAGCCT 2661 het 2661 ref 17 10 7 0 T 1 0 355871 CASAVA_Build 8 26160297 2D ACACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 18 0 12 6 A 15 13 355872 CASAVA_Build 8 26160838 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 14 7 T 15 14 355873 CASAVA_Build 8 26166189 1I CTTTCTCTAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 A 8 9 355874 CASAVA_Build 8 26175654 3D TGTAAAAATA TTG/--- TTTTCTTAGA 3070 het 3070 ref 30 11 12 8 TTG 1 0 355875 CASAVA_Build 8 26176181 9D AAGTGCTAGG ATTACAGGT/--------- GTGAGCCACG 3070 het 3070 hom 36 17 18 3 ATTACAGGT 1 0 355876 CASAVA_Build 8 26186531 19D CAAAGATGAT TGCAAAGTCATCATCAATG/------------------- TGTAAACCAA 3070 het 3070 ref 25 16 12 1 TGCAAAGTCATCATCAATG 1 0 355877 CASAVA_Build 8 26189740 1I AAGCCACACT -/C CTAGATCAAT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 C 1 2 355878 CASAVA_Build 8 26190676 1D ACCATATATA T/- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 7 6 355879 CASAVA_Build 8 26193900 8D TACGCCGATA TCAAAGGC/-------- TAATTCCCAG 3070 het 3070 ref 43 22 12 14 TCAAAGGC 1 0 355880 CASAVA_Build 8 26212695 1D ACTCTGTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 8 19 4 A 12 11 355881 CASAVA_Build 8 26217638 1D CTCTTATTAC T/- TTTTCCTGAG 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 T 5 4 355882 CASAVA_Build 8 26217713 1I TGTTCCCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 12 13 355883 CASAVA_Build 8 26224100 1D TTTTTTTTTT C/- CTTTTTTTTT 2366 het 2366 ref 34 18 10 6 C 2 1 355884 CASAVA_Build 8 26235208 13D GCTAAGTCAC ACCTAGATTCCTG/------------- ACCTGTTATG 3070 het 3070 ref 41 25 16 6 ACCTAGATTCCTG 1 0 355885 CASAVA_Build 8 26247442 1I ATTACATTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 67 het 33 0 28 5 T 9 10 355886 CASAVA_Build 8 26269302 1D GACTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2487 het 339 hom 12 3 7 3 A 17 16 355887 CASAVA_Build 8 26271921 3D GCTTAGAAGA AAT/--- AATAGATTAC 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 AAT 2 1 355888 CASAVA_Build 8 26273082 1D AGGGGAAAGG T/- TTTAAAAAGG 3070 hom 94 het 34 0 31 4 T 4 3 355889 CASAVA_Build 8 26273487 1D CAGATTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 39 0 24 15 T 13 12 355890 CASAVA_Build 8 26290088 1I GAACCTATCC -/A AAAAAAAAAA 1514 het 1514 ref 28 11 5 12 A 15 16 355891 CASAVA_Build 8 26297331 1D GCCCAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 18 0 11 7 T 13 12 355892 CASAVA_Build 8 26316965 1D ACTCAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 21 6 T 15 14 355893 CASAVA_Build 8 26323373 1D GCTTTTAAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 35 0 30 6 T 10 9 355894 CASAVA_Build 8 26340138 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 39 het 17 0 11 6 A 8 9 355895 CASAVA_Build 8 26346352 2I TGAAGTCTTC --/AA AAAAAAAAAA 1638 het 636 hom 34 2 9 23 A 12 14 355896 CASAVA_Build 8 26347279 1D ACTTCCACCT C/- CCCCTCCACC 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 C 5 4 355897 CASAVA_Build 8 26352866 4D TGCTGTTATC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2011 het 177 hom 23 4 10 11 T 20 16 355898 CASAVA_Build 8 26367731 1D TTGTCTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 33 4 T 14 13 355899 CASAVA_Build 8 26368159 1D CTACAAAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 16 9 7 0 T 11 10 355900 CASAVA_Build 8 26373596 1D TTGCAGTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 9 8 355901 CASAVA_Build 8 26374585 3D TAGTTGCCTG AGA/--- AGAAGGAGGG 3070 het 3070 ref 46 23 18 7 AGA 2 1 355902 CASAVA_Build 8 26382931 1I TAAAAAAAAA -/T AAATTAGGAA 3070 het 404 hom 33 1 18 14 T 0 1 355903 CASAVA_Build 8 26383037 1I TTGGGTTAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 10 11 355904 CASAVA_Build 8 26384240 4D ATTGACAAAT AAAC/---- AAAATTTAAG 3070 het 3070 ref 35 18 17 1 AAAC 1 0 355905 CASAVA_Build 8 26385252 2I AAAAAGAGAT --/AA GACTATTATT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 A 0 2 355906 CASAVA_Build 8 26386920 1I TCTTCCTTTC -/T TTTTTTTTCT 981 hom 18 het 14 0 6 8 T 8 9 355907 CASAVA_Build 8 26391395 1D ATCACCTCTT C/- CCTGGGACTA 3070 het 3070 hom 38 13 20 8 C 3 2 355908 CASAVA_Build 8 26409501 3I AGAAACACCC ---/ATA ATATTTGGAA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 ATA 1 2 355909 CASAVA_Build 8 26413956 2D ATTTCTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 38 4 16 18 T 14 12 355910 CASAVA_Build 8 26423954 3D ACGGCTCACT GTA/--- GTAGCCTTGA 3070 hom 65 het 29 0 22 8 GTA 2 1 355911 CASAVA_Build 8 26434779 4D GCTCTGCCAT TGAC/---- TGACTGTGTG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TGAC 2 1 355912 CASAVA_Build 8 26434909 1D ATGGCTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 236 hom 39 2 24 13 T 13 12 355913 CASAVA_Build 8 26450475 1D ATAATACGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 658 hom 43 2 33 9 T 11 10 355914 CASAVA_Build 8 26453704 1D CAAGCATAAG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 37 24 12 1 A 9 8 355915 CASAVA_Build 8 26455833 1D TGTTTCCAGG T/- TTTTAAAAAT 2330 het 2330 ref 22 15 6 1 T 5 4 355916 CASAVA_Build 8 26457490 10I4M5I ATTTTCACAA ----------ACAA-----/TTTCACTTCCATAAGGGTT AAGAACAGTC 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 N/A 0 0 355917 CASAVA_Build 8 26463989 8I AACCCACCCT --------/AAATATAA AAATATAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 10 11 AAATATAA 1 2 355918 CASAVA_Build 8 26466802 1I CTGATCCTCT -/C CCCTCCTCCC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 C 3 4 355919 CASAVA_Build 8 26467800 1I TTTTTAATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 23 1 15 7 T 11 12 355920 CASAVA_Build 8 26468516 6I AGTGATAGAT ------/ACTCTC AGAAAGCTAA 3070 hom 123 het 42 0 42 0 ACTCTC 0 1 355921 CASAVA_Build 8 26478688 3I GGAGTGCAGG ---/TGT TGTCTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 TGT 1 2 355922 CASAVA_Build 8 26483675 1D TATGAGGGGA G/- GGCCAGAGCC 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 G 3 2 355923 CASAVA_Build 8 26493325 1I GTGTGGGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 A 9 10 355924 CASAVA_Build 8 26496763 1D TAGTGTTCAC T/- TTTTTTTTTT 1546 het 1546 ref 32 14 4 14 T 15 14 355925 CASAVA_Build 8 26518912 1D TTAGTAGAGA T/- GGGATTTCAC 3070 het 1924 hom 24 4 20 1 T 1 0 355926 CASAVA_Build 8 26528972 4I GTTCCATGAC ----/TGAG TCCCTTGGAG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 TGAG 0 1 355927 CASAVA_Build 8 26530225 12I GGGCTTGGTG ------------/GAGGGCTCTCCA ACCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 46 18 17 11 GAGGGCTCTCCA 0 1 355928 CASAVA_Build 8 26531771 2I CTTAATAGAC --/AG AGTCTTTATC 756 het 756 ref 26 5 2 19 AG 1 2 355929 CASAVA_Build 8 26543427 2D CATACACACA CG/-- TCCATAGGCA 3070 hom 173 het 65 0 57 13 CG 1 0 355930 CASAVA_Build 8 26544045 1I CACAACTCCA -/G GGGATGCCAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 3 4 355931 CASAVA_Build 8 26549115 4D AAGGGTCCCC TTCT/---- TTCTTCCTTC 3070 hom 137 het 52 0 44 10 TTCT 2 1 355932 CASAVA_Build 8 26578670 1D CCTGTTATCC A/- AAGTCAGAGC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 A 3 2 355933 CASAVA_Build 8 26587430 2D CTCTCCCTCC CT/-- CTCTCTCTCT 1210 hom 7 het 8 0 3 5 CT 8 7 355934 CASAVA_Build 8 26588941 3I TCAGAATCTC ---/CTT CTTTATCAAG 3070 hom 101 het 40 0 34 6 CTT 1 2 355935 CASAVA_Build 8 26596442 1D TGCCCATGGT G/- GGGGGGCACC 3070 het 3070 hom 41 13 14 14 G 7 6 355936 CASAVA_Build 8 26599031 2D CACTTTGAAG AA/-- AGTCTTCAGT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 3 1 355937 CASAVA_Build 8 26605961 1D TTGCCATCCC A/- AGCTACTATA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 355938 CASAVA_Build 8 26622618 1I TTCTCAGCTC -/A TTTGTTTGTC 3070 hom 78 het 35 0 26 9 A 0 1 355939 CASAVA_Build 8 26624854 1I AACAGTAGTT -/C CTTCATTTTC 3070 hom 126 het 45 0 43 2 C 1 2 355940 CASAVA_Build 8 26635667 3D TTAATAATAT TAA/--- TGTTTTTGTT 3070 het 3065 hom 24 9 13 4 TAA 1 0 355941 CASAVA_Build 8 26638771 1D ATTAAACCTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 T 9 8 355942 CASAVA_Build 8 26652611 1D TATTTATAGT A/- AAAAAAAAAA 1117 het 1117 ref 39 30 3 6 A 11 10 355943 CASAVA_Build 8 26654386 1D TTTATAAATT A/- CCCAGTCTCA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 1 0 355944 CASAVA_Build 8 26656439 1D TTTTCAAGAC A/- AAAAAAAGTA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 A 8 7 355945 CASAVA_Build 8 26657166 1I TAAGGCTGCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 50 15 22 13 T 9 10 355946 CASAVA_Build 8 26666885 1D ATACTTTCTA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 9 8 355947 CASAVA_Build 8 26669913 1I ACTGATTTAC -/A AAAAAATCGA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 6 7 355948 CASAVA_Build 8 26670624 1D CGAAAGTGAC T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 7 6 355949 CASAVA_Build 8 26677034 14I CTCATGCAGG --------------/TTGAGAACATGAAT TTAGCCAAGT 3070 het 3070 ref 45 21 18 7 TTGAGAACATGAAT 0 1 355950 CASAVA_Build 8 26679395 13I CAGTTTTCAC -------------/TTGTGAAAAGAAA TTAGGAACAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 TTGTGAAAAGAAA 0 1 355951 CASAVA_Build 8 26697425 1D ACAGGGACAC A/- ATGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 31 18 11 3 A 2 1 355952 CASAVA_Build 8 26715119 1I AATGTTCATA -/C AACACAAAGC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 C 0 1 355953 CASAVA_Build 8 26719735 1I ACACCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 814 het 814 ref 35 18 4 13 T 15 16 355954 CASAVA_Build 8 26721009 2I GGGGAGGACC --/AT ATAGCATGTT 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 AT 1 2 355955 CASAVA_Build 8 26727627 1D TCCTATGGTG A/- AAAAAAAAAA 619 het 619 ref 41 34 2 5 A 11 10 355956 CASAVA_Build 8 26735194 1D TTCTGCCCCA C/- CCCGATCTTC 3070 het 3070 hom 51 22 25 4 C 4 3 355957 CASAVA_Build 8 26738470 1I GTGTGGAATT -/G GAGTTACCAG 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 G 1 2 355958 CASAVA_Build 8 26750579 1I TTGTCAATAG -/A AAAAAAAAAA 2391 het 2391 ref 36 23 9 4 A 11 12 355959 CASAVA_Build 8 26751242 1D TGAGCTGACA T/- GTTTGGAGAA 3070 het 3070 ref 60 30 23 8 T 1 0 355960 CASAVA_Build 8 26766556 3D GAATAATATT AAA/--- AATGCAAACA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 A 5 2 355961 CASAVA_Build 8 26767830 1I TGTCTGGAAC -/A AAAAAAATGC 932 het 932 ref 17 6 4 7 A 7 8 355962 CASAVA_Build 8 26768848 1I GCTTACCGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 15 7 A 11 12 355963 CASAVA_Build 8 26778910 10D5M9D GGGACCGATG GTTGGGTAGCGCAGCGCTACAGGT/----------GCATC--------- TGGGCGCTGC 3070 hom 78 het 29 0 24 8 N/A 0 0 355964 CASAVA_Build 8 26779337 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAACAA 1676 het 1676 ref 18 9 7 2 A 7 8 355965 CASAVA_Build 8 26781466 2D ATAAAGTCAC AT/-- GTGTTTCAGA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 AT 1 0 355966 CASAVA_Build 8 26786670 1I GCATAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 10 11 355967 CASAVA_Build 8 26789038 21D ACATTATATA ATGTAAATTATATAATTATAT/--------------------- ATGTAAATTA 3070 het 3070 hom 22 9 12 3 ATGTAAATTATATAATTATAT 1 0 355968 CASAVA_Build 8 26790002 1D CTGGGAAAGC T/- TTTTTTTTTC 1566 het 1566 ref 42 30 4 8 T 10 9 355969 CASAVA_Build 8 26790853 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3030 het 1642 hom 22 8 10 5 T 15 14 355970 CASAVA_Build 8 26791619 1D CTGATCCTGG A/- TGGGCCAGCT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 A 1 0 355971 CASAVA_Build 8 26796210 1I TAAAAATATA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 6 7 355972 CASAVA_Build 8 26796903 4D AGCAAGCAAG CAAT/---- CAACAGAAAA 3070 het 3069 hom 22 11 10 2 CAAT 1 0 355973 CASAVA_Build 8 26808827 9I CAGTAATACA ---------/TACTGTATG TACTGTATGT 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 TACTGTATG 1 2 355974 CASAVA_Build 8 26816592 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2247 het 489 hom 9 1 5 3 A 13 12 355975 CASAVA_Build 8 26816710 5D AATTTGCACA ATTTG/----- ATTTATTTTA 2770 het 2770 ref 18 11 6 2 ATTTG 1 0 355976 CASAVA_Build 8 26820661 1I TTAGTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 11 12 355977 CASAVA_Build 8 26824638 3D AACACTGCTT CTC/--- CCCAGTGCAT 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 CTC 1 0 355978 CASAVA_Build 8 26826024 6D GGTAACTGAT TATATA/------ TATATATATA 3070 hom 27 het 16 0 9 8 TA 11 8 355979 CASAVA_Build 8 26829066 2I CCTGGTGCCC --/CT GACTGAACAA 3070 het 2828 hom 34 10 20 4 CT 0 1 355980 CASAVA_Build 8 26831353 5I TTTACATTTG -----/TTAAT TTATTCAATC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TTAAT 0 1 355981 CASAVA_Build 8 26857934 1D TTTGATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 T 12 11 355982 CASAVA_Build 8 26858801 1D ATTCATAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 1 T 11 10 355983 CASAVA_Build 8 26859291 1I TGTTGAATGC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 43 17 17 9 T 8 9 355984 CASAVA_Build 8 26861053 2I GAATTTTTGG --/TT TTTTTTTTTT 1725 het 124 hom 45 1 11 33 T 12 14 355985 CASAVA_Build 8 26861169 3I CTGATTAGCT ---/TAA TAACTAACCT 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 TAA 1 2 355986 CASAVA_Build 8 26868605 1D CTCCTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 2276 het 815 hom 31 5 8 19 T 11 10 355987 CASAVA_Build 8 26872300 1I AGGTTTGATC -/T TTTTTATATA 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 5 6 355988 CASAVA_Build 8 26877846 2I ATAGAAAGAC --/TA TATATATATA 3065 het 1915 hom 18 5 9 4 TA 7 8 355989 CASAVA_Build 8 26878478 1D TTAGTTCTTC T/- TTTATATCTT 3070 het 3070 ref 35 20 8 8 T 4 3 355990 CASAVA_Build 8 26884121 7D CTTTCACTAT TTTCAGA/------- TTTATCCTTG 3070 het 3070 ref 40 25 13 5 TTTCAGA 1 0 355991 CASAVA_Build 8 26885817 1I TTTTTTTTTT -/C TGTCCTTGGA 3070 het 36 hom 34 2 13 19 C 0 1 355992 CASAVA_Build 8 26885992 20D GCAGAGGTGA GCTTCATGAGATCACACACG/-------------------- GCCGTAGGCA 3070 het 3070 ref 32 22 11 6 GCTTCATGAGATCACACACG 1 0 355993 CASAVA_Build 8 26892962 4D AACTTTCCAT TTTA/---- TTTATTTATC 274 het 224 hom 44 3 6 35 TTTA 3 2 355994 CASAVA_Build 8 26898160 1I ATTCTTCGTG -/A AAAAATGAAT 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 5 6 355995 CASAVA_Build 8 26898595 2D AAATTTACTC AA/-- GTCTTAATAC 3070 het 3070 hom 50 16 24 11 A 2 0 355996 CASAVA_Build 8 26899191 1D TAATTTATTT A/- AAAAAACAGT 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 A 7 6 355997 CASAVA_Build 8 26899614 1D CTGCCACTTT A/- AAAAAATATT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 7 6 355998 CASAVA_Build 8 26901795 9D ATTGACTAAT TAGACCTGA/--------- TAGACCTGAT 3070 hom 51 het 20 0 16 6 TAGACCTGA 2 1 355999 CASAVA_Build 8 26906544 1I TTACCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 10 11 356000 CASAVA_Build 8 26908285 1D CCTCACTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 37 1 24 12 T 13 12 356001 CASAVA_Build 8 26915932 1D TCCCATGTTT G/- GTGGTGATGC 3070 hom 169 het 59 0 57 2 G 2 1 356002 CASAVA_Build 8 26916320 1D TATAAAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 11 10 356003 CASAVA_Build 8 26923543 1D ACCCTGGAGG C/- GGAGGTTGCA 3070 hom 21 het 11 0 8 3 C 1 0 356004 CASAVA_Build 8 26923721 1I CACGTGCATA -/C CGACTCCCAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 1 2 356005 CASAVA_Build 8 26928983 2D ATCCTTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 28 0 20 8 A 13 11 356006 CASAVA_Build 8 26931143 1D TTCAGCATTT A/- TTTAACTAGT 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 A 1 0 356007 CASAVA_Build 8 26932493 18D GCATGGATTC TTTTTTTTTTTTTTTTTT/------------------ TTTTTTTTTT 2620 hom 20 het 14 0 10 4 T 29 11 356008 CASAVA_Build 8 26935110 1D GAAGAAGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 32 het 29 0 17 14 A 10 9 356009 CASAVA_Build 8 26950548 4D ACTAAAAATC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 235 hom 42 6 16 21 TG 11 9 356010 CASAVA_Build 8 26952921 1I GGAGTCTTGA -/C TTGCTATCTT 3070 hom 81 het 31 0 24 7 C 0 1 356011 CASAVA_Build 8 26957738 1I TAGATATGGA -/G GGCAAAGCCT 3070 het 3070 ref 60 32 21 7 G 2 3 356012 CASAVA_Build 8 26960774 1I TTATTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 60 28 20 12 A 10 11 356013 CASAVA_Build 8 26960980 2D ATTCACAATA TG/-- TGTGTGCCCT 3070 het 3070 hom 44 18 16 11 TG 4 3 356014 CASAVA_Build 8 26962351 5D GTAAAGTAAT TAAAG/----- TAATGACAAA 1005 het 1005 ref 21 6 5 11 TAAAG 1 0 356015 CASAVA_Build 8 26964623 1I TTAAAAGAGG -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 35 8 20 7 T 6 7 356016 CASAVA_Build 8 26965912 1D AGTGGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 10 9 356017 CASAVA_Build 8 26967735 1I GAGGTTGCAG -/T TAAGCCGAGA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 1 2 356018 CASAVA_Build 8 26969225 1D TGTTGCAGAT A/- TTTTTCCCAG 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 1 0 356019 CASAVA_Build 8 26969377 3D TTTTTCTAAA AAG/--- AATACCCCTC 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 AAG 1 0 356020 CASAVA_Build 8 26971272 5I TAGTCTTTTC -----/TTTTT TTGTGTGCAG 3070 het 3070 ref 41 24 14 3 T 2 7 356021 CASAVA_Build 8 26971613 1I CATGAACTCA -/T CCTTTTTTAT 3070 het 2937 hom 17 8 9 0 T 0 1 356022 CASAVA_Build 8 26976550 1D CCACTCCAGA C/- CCCTGTTTTC 3070 hom 27 het 11 0 9 2 C 4 3 356023 CASAVA_Build 8 26977706 1D ACATTCACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 11 10 356024 CASAVA_Build 8 26982407 1D ATGATTCTGG A/- AAAACCGGAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 5 4 356025 CASAVA_Build 8 26982696 1I ATTCAGCAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 9 10 356026 CASAVA_Build 8 26985369 2D CCTGTGAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 26 3 13 10 A 12 10 356027 CASAVA_Build 8 26986218 2D GTCACTGAGA GT/-- GTCTTTCTTC 3070 het 3070 ref 60 29 25 6 GT 2 1 356028 CASAVA_Build 8 26989919 1D AAATGCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 11 10 356029 CASAVA_Build 8 26991321 2D AGGAATAACA CC/-- CCCCCCCCAT 3070 hom 47 het 31 0 26 5 C 10 8 356030 CASAVA_Build 8 26991537 1D CATAGTAAAT A/- AAATTAGAAA 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 4 3 356031 CASAVA_Build 8 26994414 3D AATGGAAATG ATA/--- ATAATATTTT 3070 het 3070 hom 41 18 20 4 ATA 3 2 356032 CASAVA_Build 8 26996506 1I AGAAAAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 16 10 T 11 12 356033 CASAVA_Build 8 26999002 1I TTCAATGGGC -/A AAATGTCTCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 3 4 356034 CASAVA_Build 8 26999130 2D TTATTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 30 2 18 11 A 16 14 356035 CASAVA_Build 8 27001344 1I CTTACATAAT -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 A 6 7 356036 CASAVA_Build 8 27033081 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAATTA 1956 het 1110 hom 22 6 10 6 G 0 1 356037 CASAVA_Build 8 27036902 1D GTCCGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 T 8 7 356038 CASAVA_Build 8 27041537 4I TGGCATTGAT ----/AAAG AAGGAGCAGT 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 AAAG 0 1 356039 CASAVA_Build 8 27042810 1I TGTAAATCAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 52 21 27 4 A 7 8 356040 CASAVA_Build 8 27043284 3I AATAGAAGTT ---/AAA AAGAAGTAGA 3070 hom 65 het 25 0 22 3 A 2 5 356041 CASAVA_Build 8 27045920 1D ATATCAATCA C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 3 het 32 2 28 2 C 9 8 356042 CASAVA_Build 8 27052858 8D GAGCCGAGAT TGCACCAC/-------- TGCACTCCAG 3031 het 926 hom 12 3 7 3 TGCACCAC 1 0 356043 CASAVA_Build 8 27053405 1D GCCCCCTCAG A/- TAACCCAGGA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 1 0 356044 CASAVA_Build 8 27072197 1D ACTTACAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 11 10 356045 CASAVA_Build 8 27090521 1D AAGTAAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 9 8 356046 CASAVA_Build 8 27091953 1D CAACAAAAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 21 0 17 5 C 1 0 356047 CASAVA_Build 8 27093368 1D TTCCACCAGG A/- AAATCTGCTA 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 4 3 356048 CASAVA_Build 8 27096354 1I GCACTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 A 12 13 356049 CASAVA_Build 8 27111934 1I TCACCACGCC -/T GGGTAATTTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 0 1 356050 CASAVA_Build 8 27114903 1I GGAAACTAAC -/A TTCCTGGAAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 0 1 356051 CASAVA_Build 8 27137592 1I ATAGGGTCTT -/G CGTTGCTGCC 3070 het 10 hom 16 1 13 2 G 0 1 356052 CASAVA_Build 8 27147042 1I ATTAAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 A 11 12 356053 CASAVA_Build 8 27160035 1I CAAGAAGAGA -/T CATTCCTGCT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 T 0 1 356054 CASAVA_Build 8 27165243 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 129 hom 20 1 12 7 T 11 10 356055 CASAVA_Build 8 27167224 1D AAAGGAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 11 10 356056 CASAVA_Build 8 27177073 2D TTGTTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 12 10 356057 CASAVA_Build 8 27182034 8D AAACGGGTCA GTTATGTG/-------- GTTATGTGTG 3070 hom 111 het 43 0 34 13 GTTATGTG 2 1 356058 CASAVA_Build 8 27185017 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 77 het 33 0 25 8 A 9 10 356059 CASAVA_Build 8 27187575 2I GCATACGTAA --/AT ATATATTTAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 AT 3 4 356060 CASAVA_Build 8 27194888 1D CTCATTAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1201 hom 34 5 16 13 T 17 16 356061 CASAVA_Build 8 27208257 1D AAAAAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 39 0 30 9 T 11 10 356062 CASAVA_Build 8 27223417 1D TAGAGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 885 hom 21 4 13 4 A 15 14 356063 CASAVA_Build 8 27244911 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 7 8 356064 CASAVA_Build 8 27245131 1D ATATTAGCCA G/- GCTGGTCTCG 3070 hom 84 het 32 0 27 6 G 2 1 356065 CASAVA_Build 8 27258362 1I ATCCCAGCAC -/T TTGGGAGGCC 3070 hom 66 het 23 0 22 1 T 2 3 356066 CASAVA_Build 8 27260964 1D TTTCTTCTGA G/- GCCTCTCTAT 3070 het 3070 ref 44 20 15 9 G 2 1 356067 CASAVA_Build 8 27263813 4D GAGACTTCCC CCAG/---- CCAGGCAATT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 CCAG 2 1 356068 CASAVA_Build 8 27264010 5I ATCAGTAGAG -----/CCTCC CCTCCTGTTA 3070 het 3070 hom 33 16 14 3 CCTCC 1 2 356069 CASAVA_Build 8 27266995 2I TCTCTCTCTA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 66 30 27 9 AC 6 7 356070 CASAVA_Build 8 27293970 1D AAAACACCTA T/- TTTTTTTTTC 1799 het 1799 ref 21 8 9 4 T 10 9 356071 CASAVA_Build 8 27301252 1D TGGGGAAGGC T/- TTTTTTTTTT 875 het 875 ref 41 26 3 12 T 15 14 356072 CASAVA_Build 8 27317474 2D GTCTCATCCC CA/-- GTTTCTATAC 3070 hom 75 het 30 0 22 9 CA 1 0 356073 CASAVA_Build 8 27319698 5D TCTTGAGATC CTTAA/----- CTTAATTACA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 CTTAA 2 1 356074 CASAVA_Build 8 27323794 1I AGCCTTAGAG -/C CCAGAAGAGC 3070 hom 81 het 29 0 25 4 C 2 3 356075 CASAVA_Build 8 27326474 1D AAAAAGTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 20 0 15 5 A 12 11 356076 CASAVA_Build 8 27327688 1D CTGCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 27 0 20 7 T 11 10 356077 CASAVA_Build 8 27338306 1D CATCTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 37 0 31 7 A 11 10 356078 CASAVA_Build 8 27338519 2D TAAAACACGT TA/-- TGTTTCTATA 3070 hom 108 het 40 0 37 5 TA 1 0 356079 CASAVA_Build 8 27339511 3D AAAACAACAG CAA/--- CAACAACTAC 3070 het 3070 ref 38 18 16 8 CAA 3 2 356080 CASAVA_Build 8 27345429 1I TTTTGTGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 299 hom 33 1 26 6 T 11 12 356081 CASAVA_Build 8 27362032 10D ACACTTATAA ACTTACAAAT/---------- ACTTACAAAT 3070 hom 114 het 40 0 37 5 ACTTACAAAT 2 1 356082 CASAVA_Build 8 27382756 2D GACTGGAGGA GG/-- GGGGCCCTCA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 G 6 4 356083 CASAVA_Build 8 27387984 4D GTTCCCAGTA TATG/---- TATGGAATGA 3070 hom 117 het 45 0 37 10 TATG 2 1 356084 CASAVA_Build 8 27390433 1I TGTAAGTAAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 2578 hom 32 11 14 7 G 0 1 356085 CASAVA_Build 8 27404073 1I ACTGGATATG -/C CCCCTCCCCC 3070 hom 59 het 22 0 18 4 C 4 5 356086 CASAVA_Build 8 27435575 3I GGGAGGAAAA ---/AGG AGAAAAGAAC 3070 hom 111 het 42 0 35 7 AGG 0 1 356087 CASAVA_Build 8 27453003 4D TTCCTTCACA CCGT/---- CTGTCACTCA 3070 het 3070 hom 46 16 22 9 CCGT 1 0 356088 CASAVA_Build 8 27465071 1I GTCAAAGGCC -/T TTTGTGCATC 3070 het 1487 hom 29 11 14 4 T 3 4 356089 CASAVA_Build 8 27493479 1D GGGAGGCTCC T/- TTCCCGGTCT 3070 hom 78 het 30 0 22 8 T 3 2 356090 CASAVA_Build 8 27517690 1D ACAAGGGATC A/- GGGGGGACGG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 A 1 0 356091 CASAVA_Build 8 27522830 1I CTTGGCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 11 12 356092 CASAVA_Build 8 27529661 1D TATTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2097 hom 28 7 12 9 A 12 11 356093 CASAVA_Build 8 27533396 1D TTATAACTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 T 10 9 356094 CASAVA_Build 8 27549058 1I CATGCATGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 T 14 15 356095 CASAVA_Build 8 27568226 1I ACTGTCTCAC -/A AAAAAAAAAA 2036 het 2036 ref 26 13 8 5 A 13 14 356096 CASAVA_Build 8 27594769 1D TACTAGCTAC A/- AAAAAATTTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 6 356097 CASAVA_Build 8 27603738 1I ATTTAAAGAA -/G GGGGGCAAAT 3070 hom 83 het 40 0 33 7 G 5 6 356098 CASAVA_Build 8 27606561 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2458 het 589 hom 27 3 9 15 A 17 16 356099 CASAVA_Build 8 27610835 2I TGAGGCATCA --/AC ACTACTGAGA 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 AC 1 2 356100 CASAVA_Build 8 27611709 1I AATGCATGGA -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 7 8 356101 CASAVA_Build 8 27614525 1I ACTCACCAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 10 11 356102 CASAVA_Build 8 27618152 1I CGTCTGCAAT -/G GGGGGTTGTT 3070 het 3070 ref 47 24 15 8 G 5 6 356103 CASAVA_Build 8 27620917 1I TTAATAAGTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 402 hom 39 1 34 4 A 9 10 356104 CASAVA_Build 8 27643930 1I TTTGATTTTT -/C TTTTTTTTTT 2570 het 111 hom 16 2 10 4 C 0 1 356105 CASAVA_Build 8 27645346 2D CCGAATATTT TC/-- TCTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 35 16 16 5 TC 2 1 356106 CASAVA_Build 8 27648026 12I GAATCAACAC ------------/AGAGGAGGTTGG AGAGCTATGA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AGAGGAGGTTGG 0 1 356107 CASAVA_Build 8 27651698 5D TAACTTATGG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 35 13 10 14 AAACA 5 4 356108 CASAVA_Build 8 27652382 8I CTGGATAAGG --------/TATAAAAA TATGACTATT 3070 het 3070 hom 50 24 23 3 TATAAAAA 0 1 356109 CASAVA_Build 8 27653962 1D TCCTAGAAGG A/- AAAAAACACA 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 A 7 6 356110 CASAVA_Build 8 27655782 4I AACAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 55 22 25 8 AAAC 3 4 356111 CASAVA_Build 8 27679073 3D TTAAAAAAAA AAG/--- AAAAGAAAAG 1052 het 1052 ref 52 22 9 21 AAG 1 0 356112 CASAVA_Build 8 27681475 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 10 9 356113 CASAVA_Build 8 27682353 5D CTGGACTTAT TAGAC/----- TAATGTTCAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 6 TAGAC 1 0 356114 CASAVA_Build 8 27684177 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2977 hom 27 het 15 0 10 5 A 14 13 356115 CASAVA_Build 8 27686975 1I CTCTACATTC -/T TTTTTTTTTT 2534 het 2534 ref 26 10 6 10 T 11 12 356116 CASAVA_Build 8 27697626 4D GGAGAATAAT ATTG/---- AGAATAGGGT 3070 het 3070 ref 39 22 15 3 ATTG 1 0 356117 CASAVA_Build 8 27700852 8I ATTGCCCAGG --------/TAAAATGT TGCTGGGTCA 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 TAAAATGT 0 1 356118 CASAVA_Build 8 27701968 1D TCTTTTTTTT C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 C 8 7 356119 CASAVA_Build 8 27704002 3I CAAAGAAAAC ---/AAA ATTTTTATTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 1 4 356120 CASAVA_Build 8 27705346 1I TTAATGTTGG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 8 9 356121 CASAVA_Build 8 27706916 1D TTTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 2461 het 1300 hom 27 8 10 9 T 17 16 356122 CASAVA_Build 8 27712588 2I TTTAAGAAAC --/TT GAAATGCCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 0 2 356123 CASAVA_Build 8 27715570 4D CTCAATTTTG ATTA/---- ATTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 17 5 ATTA 1 0 356124 CASAVA_Build 8 27732764 5D TTGAATATTC AACTT/----- AACTTCATAA 2905 het 2905 ref 29 18 7 4 AACTT 2 1 356125 CASAVA_Build 8 27740344 1D AAAAAGGGGG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 27 14 8 5 A 7 6 356126 CASAVA_Build 8 27742540 2I GCAGAGAACT --/AA AGAGAGCTCC 3070 hom 132 het 53 0 44 9 A 1 3 356127 CASAVA_Build 8 27747149 1I GCACTTAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 A 10 11 356128 CASAVA_Build 8 27749351 35D TGCACACACT GAGCACATACAATGTGCTCTAACAGTGCACTGTTC/----------------------------------- GAGCACATAC 3070 hom 123 het 39 0 39 6 GAGCACATACAATGTGCTCTAACAGTGCACTGTTC 1 0 356129 CASAVA_Build 8 27750624 1D ACTGTTTAAG A/- GGCAGCATTA 3070 het 3070 ref 42 19 13 11 A 1 0 356130 CASAVA_Build 8 27758248 3D ACTCCATCAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 306 hom 36 3 13 20 A 13 10 356131 CASAVA_Build 8 27758782 7D CTGTCTCTCC AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 het 262 hom 26 4 13 10 A 19 12 356132 CASAVA_Build 8 27759143 4I CCTCAGGCAT ----/AGCA AAGGGGTAGG 3070 hom 123 het 50 0 42 8 AGCA 0 1 356133 CASAVA_Build 8 27759386 6D GGAGGAGAGA TTGCAT/------ TTGCATTTTA 3070 hom 90 het 34 0 30 5 TTGCAT 2 1 356134 CASAVA_Build 8 27761561 15D TAATGGTTAG TTTCTAACACTTTAT/--------------- TTTCTTAGAG 3070 het 3070 ref 28 16 14 4 TTTCTAACACTTTAT 1 0 356135 CASAVA_Build 8 27761867 2D CCTAAAAATC CT/-- CTGTGCTCTA 3070 het 3070 ref 41 23 18 1 CT 2 1 356136 CASAVA_Build 8 27765060 1D AATGCTTGAA T/- GAAGATTTAG 3070 het 3070 ref 30 16 13 1 T 1 0 356137 CASAVA_Build 8 27766639 2D CTCTAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 13 13 A 13 11 356138 CASAVA_Build 8 27769363 1D ATTGCTTGAA C/- CCGGGGAGGT 2880 het 2880 ref 26 12 8 6 C 3 2 356139 CASAVA_Build 8 27771467 1I GTTTTTAAAA -/G TCCTTTCTGG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 G 0 1 356140 CASAVA_Build 8 27774752 1D GTAGGATCAA G/- GGAATCGCAT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 G 3 2 356141 CASAVA_Build 8 27777497 1D GCTTTTTTTA C/- CCCCCGGCTT 3070 het 2365 hom 35 10 21 5 C 6 5 356142 CASAVA_Build 8 27778268 3D TTTTTATCTG ATA/--- ATATTTTTTC 3070 hom 42 het 31 1 26 5 ATA 2 1 356143 CASAVA_Build 8 27778953 8I CTTGATTCTG --------/TCTTGATA TCTTGATATT 1885 het 1885 ref 18 10 5 3 TCTTGATA 1 2 356144 CASAVA_Build 8 27780344 1D AGGTTGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 85 het 34 0 29 5 T 11 10 356145 CASAVA_Build 8 27788631 24D CCCTCCCTCC CTTCACTCCTCCCTCCCTCCCTCT/------------------------ CTTCACTCCT 3070 het 487 hom 21 3 14 8 CTTCACTCCTCCCTCCCTCCCTCT 1 0 356146 CASAVA_Build 8 27793596 3D GAATGAAACT GGA/--- GGACCCCTAC 3070 hom 93 het 34 0 31 3 GGA 2 1 356147 CASAVA_Build 8 27797412 1D GTCCCGAAGG A/- GATGGCAGAA 3070 hom 111 het 42 0 37 5 A 1 0 356148 CASAVA_Build 8 27802521 3D GACCAACCCC ATG/--- GTCCTCAGCC 3054 het 3054 ref 37 20 9 10 ATG 1 0 356149 CASAVA_Build 8 27810528 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 64 hom 23 2 17 4 A 10 11 356150 CASAVA_Build 8 27811125 3I CAACACACAT ---/AAG AAGAACAGGG 3070 hom 81 het 31 0 24 7 AAG 1 2 356151 CASAVA_Build 8 27811686 1I CTGCACACAG -/C CAGTGTAGAA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 C 1 2 356152 CASAVA_Build 8 27812332 7D GTGCAGTGCT GAACACA/------- GAACACATCG 3070 hom 72 het 31 0 24 9 GAACACA 2 1 356153 CASAVA_Build 8 27817238 1I CTGAGTGTCC -/G GGGGGGAAGC 3070 het 2858 hom 28 8 15 5 G 6 7 356154 CASAVA_Build 8 27817468 2D ACATGTAGCC CT/-- CTCTAGGGGA 3070 hom 86 het 33 0 26 9 CT 3 2 356155 CASAVA_Build 8 27821775 6I CCACCTCCTG ------/CGGTGA CGGTGACGGT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 CGGTGA 1 2 356156 CASAVA_Build 8 27824683 1I AGTAATCTCA -/C CCTGCCTTGT 3070 hom 126 het 48 0 41 7 C 2 3 356157 CASAVA_Build 8 27825129 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 28 16 9 3 A 9 8 356158 CASAVA_Build 8 27829853 2I ATGTGCAAAC --/AT GTGTACACAT 3070 het 3070 hom 65 23 37 5 AT 0 1 356159 CASAVA_Build 8 27831898 1D43M9D TAGAAAGGTT GGGGGGGGTTCAGTAGGATTTGGGTGGGCGAGGAGGAGGAAAAAGAGGAAAAG/-GGGGGGGTTCAGTAGGATTTGGGTGGGCGAGGAGGAGGAAAAA--------- GAGGAAAAGG 3070 het 3070 hom 35 17 17 5 N/A 0 0 356160 CASAVA_Build 8 27832678 9I GGAAGAGACG ---------/GAGGAGGAC GAGGAGGAAG 3070 hom 98 het 37 0 27 10 GAGGAGGAC 0 1 356161 CASAVA_Build 8 27835800 1I ATAGACGAAT -/A AAAATCACAG 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 4 5 356162 CASAVA_Build 8 27836227 3I TCATAGTAAG ---/AGA GGGGGTCTTT 3070 het 2732 hom 31 10 16 5 AGA 0 1 356163 CASAVA_Build 8 27845412 1D ATTTTTAATT C/- TTTTATTTTT 1918 het 1918 ref 16 9 5 2 C 1 0 356164 CASAVA_Build 8 27851792 1I TAACTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 9 10 356165 CASAVA_Build 8 27860377 1I TGTTTTTTTT -/C CACTGTTCTC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 C 1 2 356166 CASAVA_Build 8 27860926 1D GTCCACTGAC A/- GATGGATGGA 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 A 1 0 356167 CASAVA_Build 8 27863624 17D CCTGCCAACT GCATGCCAGCCCCAGGG/----------------- GCTGAGGCAG 3070 hom 63 het 22 0 18 9 GCATGCCAGCCCCAGGG 1 0 356168 CASAVA_Build 8 27863850 1D GCCCGTGCTT G/- GGGGGCATCC 3070 het 3070 ref 42 19 14 10 G 6 5 356169 CASAVA_Build 8 27865492 10I TGGGTTGGGG ----------/TGGTCCTAAA ACCAATATGA 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TGGTCCTAAA 0 1 356170 CASAVA_Build 8 27865967 1D AGAGCTACTT C/- CCTTAGCCCT 3070 het 3070 hom 53 23 25 6 C 3 2 356171 CASAVA_Build 8 27874251 4I TTATGAAATA ----/AATG AATGAGTTGT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 AATG 1 2 356172 CASAVA_Build 8 27888360 1D GAATCCTGGC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 76 het 30 0 25 5 A 9 8 356173 CASAVA_Build 8 27888951 1I AACCTGTGGG -/A AATCCAAGGC 3070 hom 117 het 42 0 39 3 A 2 3 356174 CASAVA_Build 8 27889133 1I AACATTTTGG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 9 10 356175 CASAVA_Build 8 27907788 1I ATCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 18 9 A 10 11 356176 CASAVA_Build 8 27910106 1I TAAACTTTTT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 7 8 356177 CASAVA_Build 8 27911171 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2231 hom 22 8 10 4 A 12 11 356178 CASAVA_Build 8 27939079 1I GAGTCCGTTA -/G GATCAGGTTA 3070 hom 122 het 48 0 37 11 G 1 2 356179 CASAVA_Build 8 27952671 2D CTTATCTAGA TT/-- TTTTTTTTTT 2369 het 2369 ref 35 10 7 18 T 16 14 356180 CASAVA_Build 8 27979439 4I GTAGAAGGCC ----/AACT TTGATTCTAG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 AACT 0 1 356181 CASAVA_Build 8 27984022 1D CCCTTGTCTC A/- AAAAAAAATT 2239 het 2239 ref 29 11 8 10 A 9 8 356182 CASAVA_Build 8 27994783 1D AAAGAGTTCG T/- TGTGAGAATT 3070 het 3070 hom 36 15 18 4 T 2 1 356183 CASAVA_Build 8 28005665 3D GCTTAACTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 54 17 25 13 TTG 7 6 356184 CASAVA_Build 8 28026902 54I CATGAATGTC ------------------------------------------------------/TTTTCAGCCTTAGGCTGGTCTAAATGACAGTAGTTTTGATTGGCCTGATTGAGT TTTTCAGCCC 2457 het 2457 ref 19 14 6 2 TTTTCAGCCTTAGGCTGGTCTAAATGACAGTAGTTTTGATTGGCCTGATTGAGT 0 1 356185 CASAVA_Build 8 28037265 8I AATTTAGCCG --------/TCACAGCC TCATGTGCTT 3070 het 3070 hom 54 25 26 3 TCACAGCC 0 1 356186 CASAVA_Build 8 28047323 1I TCCCCTCAGT -/A AACTAATAGC 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 A 2 3 356187 CASAVA_Build 8 28059064 1I GACCTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 G 0 1 356188 CASAVA_Build 8 28064741 1I TTTCTTCAGA -/T TTTCCATCTT 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 3 4 356189 CASAVA_Build 8 28074227 9D GCCTCCCTGG TTCAAGTGA/--------- TTCTCCTGCC 3070 het 881 hom 18 2 12 4 TTCAAGTGA 1 0 356190 CASAVA_Build 8 28084789 1D GAGATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2268 het 2268 ref 30 14 7 11 T 13 12 356191 CASAVA_Build 8 28086990 1I TTGATTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 11 12 356192 CASAVA_Build 8 28095403 1D TTCTTTGTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 47 19 27 1 G 1 0 356193 CASAVA_Build 8 28098398 1I GAGCAAAACT -/C CCATCTCAAA 3070 hom 56 het 20 0 17 3 C 2 3 356194 CASAVA_Build 8 28101793 19D GCAGGGGTTC AAGGGGCATCTTTTGTTCT/------------------- AATCTGGTGA 3070 het 3070 ref 31 19 10 7 AAGGGGCATCTTTTGTTCT 1 0 356195 CASAVA_Build 8 28105861 1D TGAGTTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1064 hom 24 6 15 3 A 13 12 356196 CASAVA_Build 8 28113065 1D CCTATCTCGG A/- AAAAAAAAAA 2312 het 2312 ref 25 13 5 8 A 11 10 356197 CASAVA_Build 8 28117316 1D GAACTTGATT A/- AAAATAAACT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 5 4 356198 CASAVA_Build 8 28120702 2I GCAGTCAAAC --/AT GTGTGTACAA 3070 hom 154 het 57 0 52 5 AT 0 1 356199 CASAVA_Build 8 28125436 3D ATGAATAATT ACA/--- ACTTCTCAGT 3070 het 3070 hom 57 22 29 6 ACA 1 0 356200 CASAVA_Build 8 28126388 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 224 hom 32 2 21 9 A 13 12 356201 CASAVA_Build 8 28137451 5D ACAGAGATTC TGTTA/----- TGTTATATCT 3070 het 3070 ref 35 18 14 6 TGTTA 2 1 356202 CASAVA_Build 8 28153083 1D GCCATAGGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 10 9 356203 CASAVA_Build 8 28155887 12I TCGGGGAGCT ------------/TAGCTGGGAGGA TAGCTTGGGC 3070 hom 57 het 27 0 20 7 TAGCTGGGAGGA 0 1 356204 CASAVA_Build 8 28160043 1I CTTACCTGAA -/T TTGCAGCCTG 3070 hom 60 het 25 0 19 6 T 2 3 356205 CASAVA_Build 8 28160868 1I CTGATTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1469 het 57 hom 23 1 8 14 T 17 18 356206 CASAVA_Build 8 28161577 4I CATTAGACTA ----/TCTT TATTTCTTTT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TCTT 0 1 356207 CASAVA_Build 8 28162269 1D AGAGGCAGGC G/- GATCACCTAA 3070 hom 31 het 18 0 14 4 G 2 1 356208 CASAVA_Build 8 28163622 4D TAAAATGTCA GCTT/---- GCAGAGAGCA 3070 hom 138 het 52 0 45 8 GCTT 1 0 356209 CASAVA_Build 8 28166875 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 10 5 A 17 15 356210 CASAVA_Build 8 28176497 1I TAGGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1288 hom 33 6 16 11 T 11 12 356211 CASAVA_Build 8 28179601 21D TACACTGAAC AACGGAGACGGGGTTATTTAT/--------------------- AACCTGACAC 3070 het 2260 hom 23 8 13 2 AACGGAGACGGGGTTATTTAT 1 0 356212 CASAVA_Build 8 28184584 2D ATTTAATAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 12 hom 34 1 19 14 T 16 14 356213 CASAVA_Build 8 28189203 1I TATGACACTT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 A 8 9 356214 CASAVA_Build 8 28203343 1I GATGAACCAC -/G ATACATCACC 3070 hom 81 het 31 0 25 6 G 0 1 356215 CASAVA_Build 8 28206336 1I AGAGGTTAAA -/C TAGAAGATCT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 0 1 356216 CASAVA_Build 8 28206436 1D CTCTAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 17 0 12 5 T 11 10 356217 CASAVA_Build 8 28213790 1D CTCAATACAT A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 8 7 356218 CASAVA_Build 8 28219910 1I GTATCTTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 11 12 356219 CASAVA_Build 8 28222063 1I TTCAGCAGGT -/G CCGGTCAGTC 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 G 0 1 356220 CASAVA_Build 8 28222556 1I TTTCTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1270 hom 32 4 22 6 A 13 14 356221 CASAVA_Build 8 28223128 1I TCCCCACTGG -/T GTAAAGTGTA 3070 het 3070 ref 47 25 15 7 T 0 1 356222 CASAVA_Build 8 28227074 2I AGTTCTTGTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 CA 7 8 356223 CASAVA_Build 8 28228270 3I GTTTTTTTTG ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 20 8 2 T 10 13 356224 CASAVA_Build 8 28238725 1I GGGATGATGC -/T TAGAGGTGTG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 T 1 2 356225 CASAVA_Build 8 28240037 1D GTAGCATATG C/- CTGTAATCTC 2401 het 2401 ref 24 17 6 1 C 2 1 356226 CASAVA_Build 8 28241957 1I TTCGGGGTAT -/A GGGGGGTTGG 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 0 1 356227 CASAVA_Build 8 28249453 1D ACAGGAGCTG C/- CTGCAACAGT 3070 het 3070 ref 23 10 8 6 C 2 1 356228 CASAVA_Build 8 28250747 2I GATCACCTTT --/TA TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 TA 0 1 356229 CASAVA_Build 8 28258047 1D CCAAGATATT A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 99 het 37 0 32 5 A 8 7 356230 CASAVA_Build 8 28314122 4I TGTTGCCAGA ----/GATG GATGGAATCC 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 GATG 1 2 356231 CASAVA_Build 8 28315009 2I CCGTGTGTGT --/GC GCGCGTGTAT 3070 het 3070 hom 43 18 14 11 GC 2 3 356232 CASAVA_Build 8 28334314 3D CTCTCTCTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 771 het 771 ref 28 11 4 13 CTC 1 0 356233 CASAVA_Build 8 28335683 1I TCTAAGAAAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2742 hom 34 7 18 10 T 9 10 356234 CASAVA_Build 8 28337397 1I AGAGCGATAC -/T TTTAAAAAAA 176 het 176 ref 21 9 3 9 T 3 4 356235 CASAVA_Build 8 28353290 1D7M9D GCTTCTGCAG AAACTCTGTTCTATAAA/-AACTCTG--------- TTCTTCTGTT 3070 hom 36 het 12 0 13 3 N/A 0 0 356236 CASAVA_Build 8 28353411 3D ATGTAACGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 13 10 356237 CASAVA_Build 8 28353472 1I TTCAGGCATC -/A GGGGAGAAAG 3070 hom 27 het 13 0 10 4 A 0 1 356238 CASAVA_Build 8 28353542 3D ATTTTATTAC TAT/--- TATTATTATT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TAT 6 5 356239 CASAVA_Build 8 28359069 1D GCTCTAAGCT C/- CCCCGTTCCC 3070 hom 115 het 44 0 37 7 C 5 4 356240 CASAVA_Build 8 28365951 1I AAAACACTAT -/A AATACGCTGG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 A 2 3 356241 CASAVA_Build 8 28369636 1D AAGCCACTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 10 9 356242 CASAVA_Build 8 28374993 1I GTTGTTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 T 10 11 356243 CASAVA_Build 8 28375314 1I TTTATCTGTC -/T TTTTATCCTA 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 T 4 5 356244 CASAVA_Build 8 28376875 2D TATATGTGTA TG/-- TGTGTGTTTA 3070 het 3070 hom 60 25 23 13 TG 4 3 356245 CASAVA_Build 8 28378547 1I TTTATTTGAT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 8 7 G 0 1 356246 CASAVA_Build 8 28390543 1D GATGACGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 18 14 11 T 11 10 356247 CASAVA_Build 8 28394494 1I CACTCGGGGG -/C CCCCGAGCCG 2548 het 2548 ref 34 15 14 5 C 4 5 356248 CASAVA_Build 8 28396174 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1897 hom 12 het 7 0 5 2 T 13 12 356249 CASAVA_Build 8 28402438 9I CACAGTAGTA ---------/TATCATAGG TACTCAATAT 3070 hom 102 het 44 0 35 10 TATCATAGG 0 1 356250 CASAVA_Build 8 28403153 2I AAAAACCAAC --/CA AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 25 5 CA 0 1 356251 CASAVA_Build 8 28404722 1D TTTTGGGGGG A/- ACGGAGTTTT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 A 2 1 356252 CASAVA_Build 8 28404903 1D CGGGGTTTCA C/- CATGTTGGCC 3070 hom 73 het 27 0 25 2 C 2 1 356253 CASAVA_Build 8 28410895 5I TAATTTCCTT -----/AAGAG AAGAAGCTCT 3070 hom 184 het 63 0 62 1 AAGAG 0 1 356254 CASAVA_Build 8 28421226 1D AACTCAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1288 hom 30 4 19 7 T 14 13 356255 CASAVA_Build 8 28423543 6I TTTTCTGTTT ------/TTTTTG TTTTTGTTTT 3070 hom 75 het 35 0 26 9 TTTTTG 2 3 356256 CASAVA_Build 8 28427754 1D TGTTAAGGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 421 hom 29 1 23 5 A 10 9 356257 CASAVA_Build 8 28433167 2D CCCTGTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 2663 hom 42 het 22 0 14 8 A 18 16 356258 CASAVA_Build 8 28439345 1I CTGGTAGATT -/G TCATAGGTAT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 G 0 1 356259 CASAVA_Build 8 28439536 1I GTTGGCAGTT -/A AGATATACAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 1 2 356260 CASAVA_Build 8 28444233 1D ACGTAGTTAT A/- AAAAAATGTT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 7 6 356261 CASAVA_Build 8 28444648 4D ATACTGTCGC TGAG/---- TGTTTATCCA 3070 hom 141 het 50 0 46 7 TGAG 1 0 356262 CASAVA_Build 8 28447397 1I CAAAAAAGAT -/A AAAGTACTAT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 3 4 356263 CASAVA_Build 8 28450943 27D TTTGCTGCAG CTACTCAGCTTTGCTGCTATGGTACAA/--------------------------- CTACTCAGCT 3070 hom 66 het 33 0 22 17 CTACTCAGCTTTGCTGCTATGGTACAA 2 1 356264 CASAVA_Build 8 28452249 4D CTTTTATAAA ATTC/---- ATTCATTAAT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 ATTC 2 1 356265 CASAVA_Build 8 28453291 1I CACAATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 9 10 356266 CASAVA_Build 8 28461664 1I TCCTTGAAAT -/A AAAGCTTTCA 3070 hom 39 het 18 0 13 5 A 3 4 356267 CASAVA_Build 8 28464203 14D GCTGGGATTA CATGCATGAACCAC/-------------- CACGCCTGGC 3070 hom 51 het 17 0 18 3 CATGCATGAACCAC 1 0 356268 CASAVA_Build 8 28471873 2D TATTTATTTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 22 8 T 12 10 356269 CASAVA_Build 8 28473666 1I ACTGTAGTAT -/C TTTTTGACAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 356270 CASAVA_Build 8 28478507 2I CCTTTAAAAC --/AA AAACTGCCAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 3 5 356271 CASAVA_Build 8 28479413 1I TTTCAGCAAC -/A TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 0 1 356272 CASAVA_Build 8 28482619 1I TGCTTATTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 4 T 11 12 356273 CASAVA_Build 8 28491652 2I TTTCTGGAGC --/CA CACTGCTGCA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CA 1 2 356274 CASAVA_Build 8 28496442 2D AAGTAAACAC TG/-- TCCTACAGCA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 TG 1 0 356275 CASAVA_Build 8 28512590 1D TTGTTTTAAA T/- TTTTTTTTTT 1418 het 68 hom 12 1 7 4 T 11 10 356276 CASAVA_Build 8 28520183 1I TACAGATGGG -/T TTTCACCATG 3070 hom 63 het 24 0 20 4 T 3 4 356277 CASAVA_Build 8 28522571 2I ACATTTGAGG --/CA CAGAAATAAG 3070 het 3070 hom 43 14 23 6 CA 1 2 356278 CASAVA_Build 8 28527284 2I CACAGGTGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2264 hom 43 11 20 12 T 12 14 356279 CASAVA_Build 8 28529179 1I AACTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 477 hom 19 2 14 3 T 11 12 356280 CASAVA_Build 8 28539569 1D GATTGCACCA T/- TGCACTACAA 2100 het 2100 ref 17 8 7 3 T 2 1 356281 CASAVA_Build 8 28539607 1D GACCCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2377 het 14 hom 13 1 7 6 A 15 14 356282 CASAVA_Build 8 28548006 7D TGCCCATCCT GGAAGAG/------- GGAAGAGATG 1619 het 1619 ref 20 11 8 4 GGAAGAG 2 1 356283 CASAVA_Build 8 28551086 4D AAAACAATCA ATCT/---- GTGGATTGGC 3070 het 3070 hom 38 17 17 6 ATCT 1 0 356284 CASAVA_Build 8 28556391 1D AAATAATAAC A/- ACGGTGGGCC 3070 hom 63 het 22 0 20 3 A 2 1 356285 CASAVA_Build 8 28563293 1I AAAGGTTTGA -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 8 9 356286 CASAVA_Build 8 28566123 2I ATATATAGCC --/AT ATATATATAT 2476 het 1747 hom 21 7 7 7 AT 7 8 356287 CASAVA_Build 8 28571640 1D GACGGTGGGT G/- GGGGGGGTCC 3070 hom 66 het 27 0 22 6 G 8 7 356288 CASAVA_Build 8 28598837 1I TTCCTTCCTC -/T CCCCCTCCCC 3070 het 2111 hom 27 6 13 8 T 0 1 356289 CASAVA_Build 8 28613296 2D GCAATGTGTT AA/-- GTTACTCCAA 3070 het 3070 ref 38 19 14 7 A 2 0 356290 CASAVA_Build 8 28616858 2I GAAGTAAGTC --/AG GGGCCAGGCC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 AG 0 1 356291 CASAVA_Build 8 28637417 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2536 hom 19 8 7 4 T 11 10 356292 CASAVA_Build 8 28643646 3I TGCAGTTAAT ---/TCA TCATGCCAGG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 TCA 1 2 356293 CASAVA_Build 8 28644234 1I CGTTAGAATT -/G GGGAGTCAGA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 G 3 4 356294 CASAVA_Build 8 28648551 1I ACACGATAAT -/A AGTAGCTGAC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 1 2 356295 CASAVA_Build 8 28651388 1I GCACTGGGCT -/A AAAGACACCT 3070 het 3070 hom 50 21 21 8 A 3 4 356296 CASAVA_Build 8 28660125 1I TTTTTGTTTC -/T TTTTTTGAGA 2761 het 2761 ref 25 13 8 4 T 6 7 356297 CASAVA_Build 8 28660443 1I TTACATGATT -/A AAAACATTTG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 4 5 356298 CASAVA_Build 8 28668196 1I CAAGGTTTAC -/A AAAATGTGTT 3070 het 3070 hom 58 20 22 16 A 4 5 356299 CASAVA_Build 8 28675176 1I CATCAAATGC -/T TTTTTTCCTG 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 T 6 7 356300 CASAVA_Build 8 28675329 2D TGCTGGTAAG TT/-- TTTTTTTTTT 2878 het 224 hom 39 4 10 26 T 20 18 356301 CASAVA_Build 8 28686243 10D ACTCCGTCTC AAAAAAAGAA/---------- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 ref 27 16 10 5 AAAAAAAGAA 1 0 356302 CASAVA_Build 8 28707477 6D GGGCAGTGTT ATAAAG/------ ATAAACTTGT 3070 het 3070 hom 41 20 21 1 ATAAAG 1 0 356303 CASAVA_Build 8 28714942 1D AACAAACAAA C/- AAAAAAACAA 2718 het 2718 ref 24 14 9 1 C 1 0 356304 CASAVA_Build 8 28722389 1D CCATTATAAC T/- TTTTTTTTTT 2459 het 999 hom 23 6 10 7 T 15 14 356305 CASAVA_Build 8 28723789 1I GCTGGCTACT -/A AGAGATACAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 1 2 356306 CASAVA_Build 8 28724218 1I TACAAATACC -/T AAAAAGGAGT 3070 het 3070 hom 47 20 26 1 T 0 1 356307 CASAVA_Build 8 28734353 1D GTAAAAGTGT A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 46 14 26 6 A 9 8 356308 CASAVA_Build 8 28735740 1D GGTAGAAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 10 9 356309 CASAVA_Build 8 28737032 1D CTTCTGTTAA C/- CTGTTTTATG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 C 2 1 356310 CASAVA_Build 8 28737194 5D CAAGGTAATT AACTC/----- AAGGGAAAAC 3070 het 3070 hom 33 12 18 6 AACTC 1 0 356311 CASAVA_Build 8 28759806 17I TACAGTTTAC -----------------/TGGCATTGGCTAAATAA TAGCAATTGT 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 TGGCATTGGCTAAATAA 0 1 356312 CASAVA_Build 8 28765731 2D TGATAAACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1709 hom 23 9 12 2 T 16 14 356313 CASAVA_Build 8 28781014 3D CAGCCAGCCA ACT/--- ACTTAATCTC 3070 het 3070 ref 28 14 11 5 ACT 2 1 356314 CASAVA_Build 8 28801887 3D GGAGACTGAC GCG/--- GCGAGAGGAT 3070 hom 93 het 37 0 30 10 GCG 2 1 356315 CASAVA_Build 8 28811677 1I AATTTCTATT -/G AAAAAAAGAC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 356316 CASAVA_Build 8 28816210 1I CATGCAGGCC -/T TGCCTGTGTT 3070 het 3070 hom 54 26 25 3 T 1 2 356317 CASAVA_Build 8 28832204 4D ATTTTAAAGT AGTA/---- AGTATCACTG 3070 het 3070 hom 48 22 25 1 AGTA 2 1 356318 CASAVA_Build 8 28837887 1D ATTTATCTAA T/- TTTTTTTTTT 2275 het 1300 hom 22 5 11 6 T 19 18 356319 CASAVA_Build 8 28839077 1D CCTGGCAGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 A 10 9 356320 CASAVA_Build 8 28851316 4D TATATTATGA TACT/---- TAGTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 14 7 TACT 1 0 356321 CASAVA_Build 8 28852228 3I CTGGAGTAGT ---/AGC CTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 30 14 12 4 AGC 0 1 356322 CASAVA_Build 8 28871008 4I AAAAGTTGAA ----/AAAC AAACAAAGCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAAC 1 2 356323 CASAVA_Build 8 28882978 3D TTAGCTTAGC AAA/--- TCATTTGTTC 3070 het 3070 hom 43 18 22 7 A 3 0 356324 CASAVA_Build 8 28899708 3D CACTGAATTA TAT/--- TCCATTGTCT 3070 het 3070 hom 46 21 23 2 TAT 1 0 356325 CASAVA_Build 8 28902711 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1593 het 1593 ref 18 11 4 3 A 13 12 356326 CASAVA_Build 8 28906486 1D CAACACCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 5 T 11 10 356327 CASAVA_Build 8 28909706 3D6M1I GTTCATATAC AAGTTGAAT-/---TTACATA TCTTTATATA 3070 het 3070 ref 31 18 13 3 N/A 0 0 356328 CASAVA_Build 8 28927523 1D TGCTTATAGT C/- CCCTCACCCA 3070 hom 138 het 53 0 45 8 C 4 3 356329 CASAVA_Build 8 28927707 1D AGATGGGGGG A/- AAAAAGATTT 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 6 5 356330 CASAVA_Build 8 28935426 4I TATATTGATT ----/GGGC GGGCTGTAGA 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 GGGC 1 2 356331 CASAVA_Build 8 28954563 4D AAATAGCATG TGTT/---- TATTTCAGAA 3070 het 3070 hom 29 12 16 6 TGTT 1 0 356332 CASAVA_Build 8 28967093 4D TAAAGGAACA GACT/---- GACTCAAACT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GACT 2 1 356333 CASAVA_Build 8 29010686 33D TAGGCCACTC TATCAGGAAGATATAACAATCTTAAATGTGTTA/--------------------------------- TATCAGGAAG 3070 het 3070 ref 26 14 13 7 TATCAGGAAGATATAACAATCTTAAATGTGTTA 1 0 356334 CASAVA_Build 8 29038320 1D ACTCCATCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 36 3 22 11 A 17 16 356335 CASAVA_Build 8 29043083 1D AAAGTATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 571 hom 33 6 9 19 A 12 11 356336 CASAVA_Build 8 29049401 6I ACAAACCAGA ------/TAATTT TATTTTCTTC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TAATTT 0 1 356337 CASAVA_Build 8 29051846 6D CTATACAAAT TATCTC/------ TGTAGAGCAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 9 TATCTC 1 0 356338 CASAVA_Build 8 29053223 1I TATAAGAACT -/G GTTCCTGCAG 2650 het 2650 ref 35 17 10 8 G 1 2 356339 CASAVA_Build 8 29059242 1I AAAGAACCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1358 hom 35 7 18 10 A 16 17 356340 CASAVA_Build 8 29066950 1D GGAAATAATT A/- AGAGTATGCA 3070 hom 148 het 53 0 50 5 A 2 1 356341 CASAVA_Build 8 29070132 1I TTTTTTTTTT -/A TTTTTTGTAG 1073 het 1073 ref 29 11 6 12 A 0 1 356342 CASAVA_Build 8 29096027 1D ATTCATTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 T 13 12 356343 CASAVA_Build 8 29118632 1I ACCAAAAAAG -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 7 8 356344 CASAVA_Build 8 29119357 1D CATTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 443 hom 20 2 11 7 A 13 12 356345 CASAVA_Build 8 29124878 6I3M15I GATACTTTCC ------TGG---------------/AGACCATGGGCCAGGAAGGGGGAA CCCAGGCCAG 3070 hom 89 het 33 0 26 8 N/A 0 0 356346 CASAVA_Build 8 29136601 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1682 hom 20 het 14 0 7 7 A 14 13 356347 CASAVA_Build 8 29137613 1D TGTGTGTGTA T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 24 het 11 0 8 4 T 8 7 356348 CASAVA_Build 8 29153764 1D CGCAGCAGGG A/- AAAAAAAAAA 1561 het 1561 ref 38 21 6 11 A 13 12 356349 CASAVA_Build 8 29180480 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTT 3070 hom 48 het 21 0 15 6 A 8 7 356350 CASAVA_Build 8 29204135 1D TATTAATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 449 hom 37 2 30 5 A 11 10 356351 CASAVA_Build 8 29210239 1D CATAGCAAGA C/- CCCCATCTCT 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 C 5 4 356352 CASAVA_Build 8 29213331 2D CACAATATCC GG/-- GGGGGGGGGG 1836 het 674 hom 33 11 11 12 G 12 10 356353 CASAVA_Build 8 29258268 2D GTCATGGATC TT/-- TTTTTTTTTT 20 het 20 ref 42 30 2 10 T 16 14 356354 CASAVA_Build 8 29259057 1D AAGGAATTTC T/- TGGCTCGGGA 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 2 1 356355 CASAVA_Build 8 29261892 2D TTGGAGGAGC AA/-- AAGACAGCCC 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 A 4 2 356356 CASAVA_Build 8 29271109 1I TAAGCAACCT -/C TCCCCATCTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 356357 CASAVA_Build 8 29271875 1D ATTTTATCTA T/- TTTTTTTTTT 2589 het 2589 ref 27 13 8 6 T 11 10 356358 CASAVA_Build 8 29276532 1D GTGTGTGTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 18 11 6 T 10 9 356359 CASAVA_Build 8 29281994 1D GAGCCAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 A 11 10 356360 CASAVA_Build 8 29285574 1D AAAGTAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 A 9 8 356361 CASAVA_Build 8 29291133 1I CCTTGTTGAT -/A AAACTCACAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 3 4 356362 CASAVA_Build 8 29298296 1D CCAGGAGCTC G/- AGGCTGCAGT 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 G 1 0 356363 CASAVA_Build 8 29298719 1D TCCTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 23 1 11 11 A 12 11 356364 CASAVA_Build 8 29301199 7I GGGTCTTGCT -------/CTGTGGC CTGTGGCCTG 3070 het 3070 ref 27 9 8 10 CTGTGGC 2 3 356365 CASAVA_Build 8 29311581 10I AGAATGCTGT ----------/AAATGCAAGC AAATGCCCAA 3070 hom 131 het 46 0 42 4 AAATGCAAGC 0 1 356366 CASAVA_Build 8 29318543 1D TTTAGATTCA G/- GGGGTACATG 3070 hom 72 het 26 0 25 2 G 5 4 356367 CASAVA_Build 8 29320961 1D TCTCCTTTCC T/- CCCCTTCTCC 1846 hom 15 het 10 0 6 5 T 1 0 356368 CASAVA_Build 8 29330050 1D CTCAGAAATT A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 8 7 356369 CASAVA_Build 8 29332595 1D AAGTAATGTT C/- CCCCCCCCCT 3070 het 13 hom 52 1 29 22 C 10 9 356370 CASAVA_Build 8 29334719 1D AGGCACTCAG A/- AGGGGACAGT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 2 1 356371 CASAVA_Build 8 29342931 1I GCAGCATATT -/A AGAGGGTCTG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 1 2 356372 CASAVA_Build 8 29352653 4I TTAAAATTTT ----/GATA GATAGCCAAA 3070 hom 99 het 44 0 33 11 GATA 1 2 356373 CASAVA_Build 8 29372434 1D AACTGTTATG A/- AAAAAAAAAA 793 het 793 ref 44 34 3 7 A 11 10 356374 CASAVA_Build 8 29373331 2I TGTAGGACTC --/AA GAGGTTTATG 3070 hom 122 het 50 0 39 11 A 0 2 356375 CASAVA_Build 8 29376278 1D ATTGTCAAGT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 9 8 356376 CASAVA_Build 8 29379643 1D TAGAGCCTCA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 T 9 8 356377 CASAVA_Build 8 29384212 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 27 0 17 10 A 15 14 356378 CASAVA_Build 8 29390073 1I TTAAAAATTC -/G GTGAAAAATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 G 1 2 356379 CASAVA_Build 8 29393517 1I TTCAGTGTCA -/T TTTTTTTATA 3070 hom 59 het 27 0 20 7 T 7 8 356380 CASAVA_Build 8 29411930 1I CCTGTCTAAC -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 7 8 356381 CASAVA_Build 8 29425719 1D GTCTCTTAAT A/- AAAAAATAAA 3070 hom 49 het 22 0 17 5 A 7 6 356382 CASAVA_Build 8 29425889 1D CTCTGTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 27 0 18 10 A 11 10 356383 CASAVA_Build 8 29441005 7I GCACAATCTA -------/AGTTTAT AGTTTATACC 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 AGTTTAT 1 2 356384 CASAVA_Build 8 29442721 1I GAGCCACAAC -/A TCCGGCCCAG 2601 het 2098 hom 22 6 8 8 A 0 1 356385 CASAVA_Build 8 29482707 1D GTTCTTTATA G/- CGATATGCGA 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 G 1 0 356386 CASAVA_Build 8 29484843 1I ATATTGAAGT -/G GTAGAAAGTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 G 1 2 356387 CASAVA_Build 8 29488107 2D AGTAGCGCGC GA/-- GCGCGCACAC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 GA 1 0 356388 CASAVA_Build 8 29490267 1I TACCCTGCAG -/C CCCTCAGGGT 3070 hom 87 het 36 0 29 7 C 3 4 356389 CASAVA_Build 8 29496954 1I ACTCGACCTC -/T TTTTTTTTTT 2881 het 2881 ref 45 16 14 15 T 13 14 356390 CASAVA_Build 8 29518314 6D GGAAGGACTA TATCTT/------ TATGTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 15 10 4 TATCTT 1 0 356391 CASAVA_Build 8 29522375 1I AGATTTTCCT -/G CCTCAGCCTC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 G 0 1 356392 CASAVA_Build 8 29523942 1I CCATGCCCGA -/T TTTTTTTTTG 1412 het 522 hom 12 2 5 5 T 9 10 356393 CASAVA_Build 8 29527029 1D CAGTTGTCAT A/- AGCTTTTGTC 3070 het 3070 ref 54 29 19 7 A 2 1 356394 CASAVA_Build 8 29529364 2D TGTGTGTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 19 8 T 13 11 356395 CASAVA_Build 8 29529665 5D AAAAAGACAT GGGAG/----- GGGAGGAGAG 3070 het 3070 hom 34 12 15 9 GGGAG 2 1 356396 CASAVA_Build 8 29532838 2I GCCAACACTA --/AC ACACACACAC 3070 het 738 hom 54 2 37 15 AC 8 9 356397 CASAVA_Build 8 29535403 4D CCAGGCTGGA GTGC/---- GTGCCATGGC 3070 hom 63 het 23 0 20 3 GTGC 2 1 356398 CASAVA_Build 8 29535558 1I GTTTCACCAT -/G GTTGGCCAGG 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 G 1 2 356399 CASAVA_Build 8 29552970 1D AGTCAGCACT A/- AAAAAATGGT 3070 hom 132 het 47 0 43 4 A 7 6 356400 CASAVA_Build 8 29555305 2D ACTTCCTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 28 1 17 10 A 16 14 356401 CASAVA_Build 8 29560709 1I GGATGCTTTT -/A AAAACCTTTT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 4 5 356402 CASAVA_Build 8 29560807 8I CAGGGACGTA --------/AAGAGGTG AAGAGGCTTA 3070 hom 148 het 59 0 48 11 AAGAGGTG 0 1 356403 CASAVA_Build 8 29565869 4I GGAGGAAGAG ----/AAGA AAGAAAGAGG 3070 hom 139 het 54 0 41 13 AAGA 2 3 356404 CASAVA_Build 8 29573783 2D ACATACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 53 het 68 1 60 11 AC 6 5 356405 CASAVA_Build 8 29575699 1I GTCTGTGCCA -/G GGCAGTATGG 3070 hom 141 het 50 0 48 2 G 2 3 356406 CASAVA_Build 8 29582078 1I AACTTCTTCT -/A GTTTTAACAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 0 1 356407 CASAVA_Build 8 29583071 1D TCACTCTCCC G/- GCACAGCACC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 G 2 1 356408 CASAVA_Build 8 29609831 1D ATCTTCATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 11 10 356409 CASAVA_Build 8 29612424 2I CAGCTTTAAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2050 hom 33 9 15 9 A 13 15 356410 CASAVA_Build 8 29614433 1D ATAAGCACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 10 9 356411 CASAVA_Build 8 29618460 1I GTAATCGTGC -/T GCTATAGACA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 0 1 356412 CASAVA_Build 8 29623617 1I ACTCCCAGTC -/T TTTTTTCTCT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 T 6 7 356413 CASAVA_Build 8 29633047 2I ACATTCACAT --/CC CTCACTATTC 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 C 1 3 356414 CASAVA_Build 8 29633589 2D ACAAACAACA TT/-- TTTTTTTTTT 2828 het 120 hom 23 3 8 12 T 16 14 356415 CASAVA_Build 8 29637481 1D TTCAGAAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 51 22 20 10 A 10 9 356416 CASAVA_Build 8 29665233 1I TTCTTTTTTT -/A AAAAAAAAAG 2908 het 2423 hom 19 5 10 4 A 9 10 356417 CASAVA_Build 8 29684431 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTG 1738 het 1399 hom 14 5 6 3 A 8 7 356418 CASAVA_Build 8 29694104 2D TTGATCTCGC AG/-- AGTCTCAGTT 3070 hom 111 het 43 0 37 7 AG 2 1 356419 CASAVA_Build 8 29695788 4D GAAAGAAAAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 31 10 14 10 AG 8 6 356420 CASAVA_Build 8 29705987 1D TTTAGGGCAG T/- TGAAACTACC 3070 hom 102 het 37 0 35 3 T 2 1 356421 CASAVA_Build 8 29706876 1D TATGGATTTT G/- GGTGAGAATG 3070 het 3070 hom 46 18 20 10 G 3 2 356422 CASAVA_Build 8 29716628 1I TCTTGGTGGC -/A AAGAAGTAAA 3070 hom 101 het 37 0 32 5 A 2 3 356423 CASAVA_Build 8 29723772 1I GCCAAGACCC -/A AAAAAGGTGA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 A 5 6 356424 CASAVA_Build 8 29726885 1D ACAGTTTCAT C/- CCGAAACCAT 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 C 3 2 356425 CASAVA_Build 8 29727884 1I AGACTCCCAT -/A AATGGATTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 2 3 356426 CASAVA_Build 8 29728323 2D CATGCCCACG CA/-- CACACACACA 1320 het 1320 ref 59 46 3 12 CA 8 7 356427 CASAVA_Build 8 29802280 2D TTGCAAAATC TT/-- TTAGAGCCCC 3070 het 3070 hom 41 13 25 3 T 4 2 356428 CASAVA_Build 8 29811640 1D TAAAAAAAAA T/- CTTCTACTCT 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 T 1 0 356429 CASAVA_Build 8 29848191 1I AGGTGACGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 9 10 356430 CASAVA_Build 8 29850268 1I ACCTCTTTCC -/T TTATAAATTA 3070 het 3070 ref 31 16 15 0 T 2 3 356431 CASAVA_Build 8 29858612 1I TGAATGAGGT -/G GAAATCAATG 3070 hom 65 het 30 0 19 11 G 1 2 356432 CASAVA_Build 8 29864328 2D TGGAAATTCT AA/-- GTCACCAAAG 3070 hom 120 het 42 0 41 2 A 2 0 356433 CASAVA_Build 8 29876500 1D GTCCCACAGG A/- AAAAAAAAAA 856 het 856 ref 42 32 2 8 A 12 11 356434 CASAVA_Build 8 29894631 4D TGCAGGTGAC ACAA/---- ACAAACAGAA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 ACAA 2 1 356435 CASAVA_Build 8 29896274 1I ATCTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 588 hom 36 2 20 14 A 14 15 356436 CASAVA_Build 8 29907881 1I GTGGAATCAC -/A AAAAAAAATA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 8 9 356437 CASAVA_Build 8 29910389 1D AGCCACCACA C/- CCCAGCCCAT 3070 hom 29 het 16 0 12 4 C 4 3 356438 CASAVA_Build 8 29919701 6D TCAGCTTAAA CTTTAT/------ CTTTAGCTTA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 CTTTAT 1 0 356439 CASAVA_Build 8 29929759 2D ATAAACAAAT AG/-- AGATGGAAGG 3070 hom 81 het 32 0 27 8 AG 2 1 356440 CASAVA_Build 8 29940118 1I GTGGACAGAC -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 7 8 356441 CASAVA_Build 8 29949712 18D CTTTGACATG TGGGGATTACGGAGATTA/------------------ TGGGGATTAC 3070 het 3070 ref 36 26 12 8 TGGGGATTACGGAGATTA 1 0 356442 CASAVA_Build 8 29960536 1I CTAAATACTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 6 7 356443 CASAVA_Build 8 29962676 1I ATGTTGATTT -/A TTTTTTTTTT 1492 het 1492 ref 46 21 8 17 A 0 1 356444 CASAVA_Build 8 29984473 1D ACAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 10 9 356445 CASAVA_Build 8 29990338 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2869 het 2869 ref 29 12 8 9 T 11 10 356446 CASAVA_Build 8 29992143 1D GAGACTGTTT C/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 C 1 0 356447 CASAVA_Build 8 29992833 1I CCCAGCTCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 A 9 10 356448 CASAVA_Build 8 29999880 1D GAATTGAGGG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 8 7 356449 CASAVA_Build 8 30007474 3D ATGTTCTACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 10 9 T 14 11 356450 CASAVA_Build 8 30009165 1D ACATTCCTTC T/- CATCAAGCTA 3070 hom 111 het 46 0 38 9 T 1 0 356451 CASAVA_Build 8 30015087 1D TTTAAACACC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 9 8 356452 CASAVA_Build 8 30017289 1I TCTGATTTTC -/T TTTTTTTCTT 1937 hom 15 het 6 0 6 0 T 7 8 356453 CASAVA_Build 8 30019360 15D GGACTCCGAA GTCTCACTCAATCAT/--------------- GTCATCAGGG 3070 hom 62 het 21 0 21 3 GTCTCACTCAATCAT 1 0 356454 CASAVA_Build 8 30027856 1D GCTAATGAGA T/- TTTTGGTCTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 5 4 356455 CASAVA_Build 8 30028062 1D GAGACCAGTT A/- CAGCAGACTA 3070 hom 119 het 47 0 39 8 A 1 0 356456 CASAVA_Build 8 30034391 1I11M1D GCAAGACTAT -TCTGAAAAAAGA/GTCTGAAAAAAG- AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 28 0 32 3 N/A 0 0 356457 CASAVA_Build 8 30048892 1I GGATATACCA -/C CTTTTATTTA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 C 1 2 356458 CASAVA_Build 8 30058790 1D GTTGTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 15 14 356459 CASAVA_Build 8 30058998 1I TACCATCACT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 78 het 34 0 27 7 A 8 9 356460 CASAVA_Build 8 30061004 1I AACATTGATG -/A AAAAACAGGG 3070 hom 128 het 51 0 42 9 A 5 6 356461 CASAVA_Build 8 30069299 1D GATTACCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 28 8 A 11 10 356462 CASAVA_Build 8 30070948 2D TTACATTTTT TG/-- TGTGTCTGTC 3070 hom 113 het 43 0 38 6 TG 3 2 356463 CASAVA_Build 8 30073260 1D CTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 12 11 356464 CASAVA_Build 8 30074392 5D GTATGACTGG AAGAT/----- GAGATGTCAC 3070 hom 102 het 39 0 35 5 AAGAT 1 0 356465 CASAVA_Build 8 30076554 1D AGCTACTCAG A/- AAGGCTGAGG 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 3 2 356466 CASAVA_Build 8 30076872 2D AAGGGACAAA GT/-- GTGCACAGGC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 GT 2 1 356467 CASAVA_Build 8 30079392 1I AAACACAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 14 0 11 3 A 9 10 356468 CASAVA_Build 8 30084811 1I TCTACTGGAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 197 hom 41 1 37 3 T 8 9 356469 CASAVA_Build 8 30092415 1D ACCCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 19 0 17 4 A 11 10 356470 CASAVA_Build 8 30094380 2D ACCCTGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 27 0 20 7 T 14 12 356471 CASAVA_Build 8 30097141 7D ATAAATAAAT AAATAAA/------- TAAATAAATA 3070 hom 48 het 18 0 17 3 AAATAAA 1 0 356472 CASAVA_Build 8 30097542 1D TATGTATATA T/- TTTTTTAACT 1764 hom 15 het 22 0 6 17 T 7 6 356473 CASAVA_Build 8 30098931 1I TTTTATCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 56 het 31 0 20 11 A 9 10 356474 CASAVA_Build 8 30104098 1D ACTGTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1428 het 1428 ref 19 12 3 4 A 12 11 356475 CASAVA_Build 8 30104744 2D AAAAAAAAAT AC/-- ACACACACAC 1305 hom 35 het 21 0 12 9 AC 10 9 356476 CASAVA_Build 8 30105955 1D TCTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 509 hom 38 2 29 7 T 13 12 356477 CASAVA_Build 8 30116350 2I GCCCTGGAAC --/CT CTCTCTTTGA 3070 hom 90 het 31 0 29 2 CT 3 4 356478 CASAVA_Build 8 30116852 1D CCCATCTCTA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 1 0 356479 CASAVA_Build 8 30120411 42D GTCTCAAAAA AAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATAT/------------------------------------------ ATATATAAAA 2660 hom 18 het 4 0 7 1 AAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATAT 1 0 356480 CASAVA_Build 8 30136301 1I GGATTATTAG -/T TTTTTTCTAT 3070 hom 79 het 35 0 27 8 T 6 7 356481 CASAVA_Build 8 30140051 1D TCATTCCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 25 0 16 9 T 11 10 356482 CASAVA_Build 8 30140758 1D TTTTTCCATC T/- TTTTTTTTTT 1887 het 1887 ref 33 15 7 11 T 17 16 356483 CASAVA_Build 8 30147232 1I CTCTGTATCC -/A AAAAAAAAAA 1933 het 1933 ref 28 12 6 10 A 15 16 356484 CASAVA_Build 8 30147827 1I AGCCTCCCAA -/G TAGCTGGGAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 G 0 1 356485 CASAVA_Build 8 30149513 1D TATTTACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 13 12 356486 CASAVA_Build 8 30153432 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAATT 1959 het 1959 ref 10 5 5 0 A 9 8 356487 CASAVA_Build 8 30153592 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1731 hom 13 4 7 2 A 9 10 356488 CASAVA_Build 8 30163969 11D CAGATGTATT ACAAGGGTACA/----------- ACTCAGGAAC 3070 het 3070 hom 48 22 25 4 ACAAGGGTACA 1 0 356489 CASAVA_Build 8 30171790 1D CACACTTTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 13 6 A 14 13 356490 CASAVA_Build 8 30175321 1I AGCAAATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 14 19 13 T 11 12 356491 CASAVA_Build 8 30183846 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 25 1 22 2 A 11 10 356492 CASAVA_Build 8 30205657 9I TTTGTCATAG ---------/CAGCTTAGC CAGTGCTATG 3070 hom 24 het 11 0 9 3 CAGCTTAGC 0 1 356493 CASAVA_Build 8 30222421 1D AGAATCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1593 het 539 hom 17 4 5 8 A 17 16 356494 CASAVA_Build 8 30258539 1D GGGAGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 788 het 788 ref 26 11 4 11 T 17 16 356495 CASAVA_Build 8 30271625 4D GCACCTTCCC CTCT/---- CTCTCTTGCT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 CT 5 3 356496 CASAVA_Build 8 30285870 1I TTTAGATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 62 24 29 9 T 10 11 356497 CASAVA_Build 8 30297306 1I GGCACACACC -/T GTAATCCCAA 3070 het 1864 hom 21 4 16 1 T 0 1 356498 CASAVA_Build 8 30299003 4I5M4I TAAATGTTGA ----CTTCT----/CTTTCTTCTAGTG TCAGAAACTG 3070 het 3070 ref 38 21 14 7 N/A 0 0 356499 CASAVA_Build 8 30300187 1I TTTAATGTCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 16 21 8 T 9 10 356500 CASAVA_Build 8 30314991 1I TTGTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 10 11 356501 CASAVA_Build 8 30371497 1D ACAGTGGAGG C/- CCCCCCTGGG 3070 het 3070 hom 27 14 11 3 C 7 6 356502 CASAVA_Build 8 30375923 1D TCCCTGCTCC T/- TTTTTTTTTT 2740 het 2564 hom 36 15 8 14 T 17 16 356503 CASAVA_Build 8 30377301 1D ACCTGGCTAC T/- TTTTTTTTTT 1316 het 957 hom 17 3 4 10 T 11 10 356504 CASAVA_Build 8 30400883 1I GGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 1608 het 1608 ref 31 15 8 8 T 8 9 356505 CASAVA_Build 8 30408416 4I TTTTTCTTTC ----/TCTT TCTTTCTTTC 3070 het 2468 hom 27 10 12 5 TCTT 3 4 356506 CASAVA_Build 8 30432494 1I TGAAACAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 423 hom 30 1 27 2 A 9 10 356507 CASAVA_Build 8 30433453 1D GTAAGGCTAA G/- GGGTCCATAT 3070 hom 121 het 43 0 40 3 G 4 3 356508 CASAVA_Build 8 30433556 1I ACTAAAAAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 9 10 356509 CASAVA_Build 8 30445977 2I AAGTAACTAT --/AC ACAGTCATTC 3070 hom 126 het 50 0 42 8 AC 1 2 356510 CASAVA_Build 8 30453269 3I TGAAACTTGG ---/AGC AGCTGAATAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AGC 1 2 356511 CASAVA_Build 8 30454685 2D ATGCAAACAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 90 het 40 0 29 11 GT 8 7 356512 CASAVA_Build 8 30456871 1D ATGCAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 13 9 A 12 11 356513 CASAVA_Build 8 30463693 8D TCTCTCTCAA AAAAAAAT/-------- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 6 AAAAAAAT 2 1 356514 CASAVA_Build 8 30468177 1D AGTGACATCT C/- CCCCCAACCC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 C 6 5 356515 CASAVA_Build 8 30469519 1I CCTTTGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 10 11 356516 CASAVA_Build 8 30473233 1I TGCGCATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 33 0 20 13 T 13 14 356517 CASAVA_Build 8 30480100 3I TCATGCTCAT ---/GAA GAAGTTCCAC 3070 hom 117 het 46 0 39 7 GAA 1 2 356518 CASAVA_Build 8 30485682 1D ACATAATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 11 10 356519 CASAVA_Build 8 30505953 1I CAACTCAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 9 10 356520 CASAVA_Build 8 30508412 1I AACCAGCCTT -/C CTGCTGACCC 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 C 1 2 356521 CASAVA_Build 8 30516693 1I AAATCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2207 het 2167 hom 20 6 5 9 T 10 11 356522 CASAVA_Build 8 30525426 3I TTCTCGAAAC ---/ACA ACACCATACA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 ACA 1 2 356523 CASAVA_Build 8 30539857 1I AAAGAACAGA -/T AGACGAGCAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 0 1 356524 CASAVA_Build 8 30543429 2I GGTGAGTAAC --/AG AGTCAGGGCT 3070 hom 74 het 26 0 24 2 AG 1 2 356525 CASAVA_Build 8 30544700 1I TTAGACATGA -/T TTTTAAATGC 3070 het 3070 hom 38 11 22 5 T 4 5 356526 CASAVA_Build 8 30549948 1D ATAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2079 hom 34 12 15 7 A 15 14 356527 CASAVA_Build 8 30550023 1I TCACCTACTC -/T TTTTTTCCCC 2693 het 1417 hom 29 8 10 11 T 6 7 356528 CASAVA_Build 8 30550210 1I GTAACTGTAG -/A AGGCCAAACG 3070 hom 101 het 36 0 31 5 A 1 2 356529 CASAVA_Build 8 30561257 1D CTTGCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1708 hom 32 7 13 12 T 13 12 356530 CASAVA_Build 8 30564530 1D AAATAATAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 20 6 A 13 12 356531 CASAVA_Build 8 30579080 1D TTTTTTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 34 3 22 9 T 15 14 356532 CASAVA_Build 8 30582685 1D ATTTCTTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2719 hom 21 6 11 4 T 13 12 356533 CASAVA_Build 8 30586410 1D TGGAATGTTT A/- AACTGGTATA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 3 2 356534 CASAVA_Build 8 30593564 3I TTGAGGGGAG ---/AGA AGGATGAACA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 AGA 0 1 356535 CASAVA_Build 8 30593867 2D AAACTGCTCT AA/-- AAAAAAAAGT 3070 het 50 hom 24 2 8 16 A 10 8 356536 CASAVA_Build 8 30595329 12I GCACTCCAGC ------------/CTGGGCAACAGA GCAACACTCT 3070 hom 76 het 33 0 27 6 CTGGGCAACAGA 0 1 356537 CASAVA_Build 8 30597774 4D ACCTGAGTTC AGTA/---- AGTAGTTCAA 3070 hom 51 het 19 0 15 4 AGTA 2 1 356538 CASAVA_Build 8 30599498 1I ACAAGATAAT -/A AGAGTATCAC 1813 hom 8 het 6 0 4 2 A 1 2 356539 CASAVA_Build 8 30619705 2I CTCTGCAGAT --/AC ACAAGCAAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AC 1 2 356540 CASAVA_Build 8 30621647 1D AAGAATCCAC A/- AGGCTAATGA 3070 het 3070 hom 38 16 17 6 A 2 1 356541 CASAVA_Build 8 30628073 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 13 14 356542 CASAVA_Build 8 30629608 1D AGCTATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 34 1 28 6 A 13 12 356543 CASAVA_Build 8 30629621 1D AAAAAAAAAA C/- AGAATTTCAA 3070 het 248 hom 37 7 25 5 C 1 0 356544 CASAVA_Build 8 30637896 1D CTGTAATCCC A/- GCACTTTGGG 2621 hom 30 het 11 0 9 2 A 1 0 356545 CASAVA_Build 8 30653866 7I GCACACAGGC -------/AGCAGAA AGGATAAATA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 AGCAGAA 0 1 356546 CASAVA_Build 8 30673090 2D AAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 2783 het 2783 ref 21 11 7 3 CT 2 1 356547 CASAVA_Build 8 30675924 2I TTGGGTCCCT --/CC CCACCTGTTT 3070 het 3070 hom 51 16 31 4 C 2 4 356548 CASAVA_Build 8 30678695 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 8 9 356549 CASAVA_Build 8 30682322 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAAATTT 3070 hom 37 het 16 0 13 4 A 7 8 356550 CASAVA_Build 8 30695980 1D AGGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 12 11 356551 CASAVA_Build 8 30696333 2D ACCTGGATAA AT/-- TTTTTTTTTT 1753 hom 12 het 5 0 5 0 AT 1 0 356552 CASAVA_Build 8 30697731 2I AGAAAAAGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 212 hom 35 1 28 6 A 10 12 356553 CASAVA_Build 8 30697916 6D TGGCTCACAC ACAGGT/------ GTGTAATCCT 3070 hom 84 het 29 0 28 3 ACAGGT 1 0 356554 CASAVA_Build 8 30698194 4I TAATTGTTAC ----/TCTG GGGCATCCGG 275 het 11 hom 18 0 2 16 TCTG 0 1 356555 CASAVA_Build 8 30698211 4D CGGGGAGAAG AAGA/---- AAGAGTTTTG 1170 hom 18 het 16 0 6 12 AAGA 2 1 356556 CASAVA_Build 8 30698718 1D TGTCAAGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 17 hom 17 1 13 3 A 11 10 356557 CASAVA_Build 8 30714717 1D ACTGCACTCC A/- GCCTAAGCAA 3070 hom 105 het 41 0 33 8 A 1 0 356558 CASAVA_Build 8 30715157 1D GTGTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 19 7 A 15 14 356559 CASAVA_Build 8 30717543 2D45M2D6M26D6M2I TAGAGAATCA CTTGAGACCAGGTGTTCAAGATCAGCCTGAACAATATAGTAAGACCCCATCTCCTGGAAAAAAAAAAAAAGAAAGGAAAGAAAAAAT--/--TGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCCAACATGATGAAACCC--TCTACT--------------------------AAAAATAC AAAAATTAGC 2316 het 2316 ref 24 41 7 7 N/A 0 0 356560 CASAVA_Build 8 30720218 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1489 hom 13 het 16 0 6 10 T 16 14 356561 CASAVA_Build 8 30721153 1D TTGACCCTCT C/- CCAGCCGGCC 3070 hom 53 het 25 0 13 12 C 3 2 356562 CASAVA_Build 8 30726460 5I TCAAAAAAAA -----/AAAAT AAAATAAAAT 1440 hom 9 het 7 0 3 4 AAAAT 2 3 356563 CASAVA_Build 8 30726668 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2341 het 61 hom 17 1 9 7 T 15 14 356564 CASAVA_Build 8 30727832 1D45M1D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAGAAGAGCAACACCCTGTCTCTTAAAAAAAGAAGGA/-AAAAAAAAAAAGAAGAGCAACACCCTGTCTCTTAAAAAAAGAAGG- AAAAAAAAAA 3070 het 207 hom 17 2 14 15 N/A 0 0 356565 CASAVA_Build 8 30732649 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 28 1 25 2 A 10 9 356566 CASAVA_Build 8 30737283 1I CATCATGCCT -/G GATAATTTTT 3070 hom 63 het 22 0 20 2 G 1 2 356567 CASAVA_Build 8 30739121 1I CTTGGAAACC -/T TTTTTTTTTT 1816 het 762 hom 29 6 13 10 T 17 18 356568 CASAVA_Build 8 30739936 1D TTATAATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 141 hom 31 1 22 8 T 12 11 356569 CASAVA_Build 8 30740383 1I GAGGAGAAGG -/T TTTTGAAGTC 3070 hom 175 het 66 0 59 7 T 4 5 356570 CASAVA_Build 8 30743069 1I CTCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 520 hom 23 2 14 7 A 15 16 356571 CASAVA_Build 8 30745418 1I CAAGCGTGGT -/G GCTTATGCCT 3070 hom 74 het 29 0 25 4 G 1 2 356572 CASAVA_Build 8 30747546 2D CTCAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 717 het 443 hom 13 4 3 7 AT 1 0 356573 CASAVA_Build 8 30749811 1I ACGGCCTTGG -/C CTCCTGGGCT 3070 hom 98 het 38 0 32 6 C 1 2 356574 CASAVA_Build 8 30763700 6D TAATATTATT TAATAA/------ TAATAATAAT 2274 hom 20 het 10 0 7 3 TAA 5 3 356575 CASAVA_Build 8 30800158 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 408 hom 21 1 16 4 A 14 13 356576 CASAVA_Build 8 30800418 1I CGTTTGGAGT -/A AAAAAAATGC 3070 hom 87 het 37 0 30 7 A 7 8 356577 CASAVA_Build 8 30803957 1I CTCTATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 11 12 356578 CASAVA_Build 8 30807561 1D TTGACTGGAA T/- TGACAACTAT 3070 hom 151 het 55 0 51 4 T 2 1 356579 CASAVA_Build 8 30808138 1D CACATTTACG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 8 7 356580 CASAVA_Build 8 30811539 2D CTTTTTTCCC CT/-- CTTTTATCGT 3070 hom 108 het 37 0 37 0 CT 2 1 356581 CASAVA_Build 8 30815756 2D TTATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AC 10 9 356582 CASAVA_Build 8 30841019 1D CATTCAAAGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 114 het 44 0 39 7 A 10 9 356583 CASAVA_Build 8 30881919 1D ATTAAAAAAA T/- GTATTACTTG 3070 het 3070 hom 43 17 26 1 T 1 0 356584 CASAVA_Build 8 30908802 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 920 het 920 ref 20 13 3 4 T 15 14 356585 CASAVA_Build 8 30945479 6I TGGGCCTTGG ------/CTCTCT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 CT 5 8 356586 CASAVA_Build 8 30945745 1D AGTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 18 3 A 12 11 356587 CASAVA_Build 8 30950844 4I GGATGTTAAC ----/CAAT CAGTTATTTC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 CAAT 0 1 356588 CASAVA_Build 8 30977037 1D CCTTTAAAAT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 9 8 356589 CASAVA_Build 8 30980448 1I GGTACCATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 10 11 356590 CASAVA_Build 8 30994471 6D TAAGAGATTA TATATC/------ TATATCTATA 3070 het 3070 hom 30 8 17 7 TATATC 3 2 356591 CASAVA_Build 8 31015476 1D TTTAATTGAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 2575 hom 32 8 21 3 T 9 8 356592 CASAVA_Build 8 31026630 1I TGAGGTCCAA -/T TGGGTCAGAA 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 T 1 2 356593 CASAVA_Build 8 31038586 1I CAGCTGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 799 hom 39 2 31 6 T 13 14 356594 CASAVA_Build 8 31047503 1I TGGTAGCTAA -/T AAACACCAAA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 T 0 1 356595 CASAVA_Build 8 31057511 1I ATCAAACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 225 hom 33 1 24 8 T 11 12 356596 CASAVA_Build 8 31063258 1D GGTTGATGAG A/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 1 0 356597 CASAVA_Build 8 31064117 1I ACTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 9 10 356598 CASAVA_Build 8 31077896 1D TGTGTTTTTC T/- TTTTTTACAG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 7 6 356599 CASAVA_Build 8 31080621 2I CACATGACTA --/TT TTTTTCGGTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 5 7 356600 CASAVA_Build 8 31082163 2I ATATTAAAAC --/AG AACAAACCAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AG 0 1 356601 CASAVA_Build 8 31082523 1D TGTTATTTTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 31 0 29 3 T 8 7 356602 CASAVA_Build 8 31083844 3D TTTCTGTGAG TTC/--- TTCTTCACTA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 TTC 3 2 356603 CASAVA_Build 8 31084314 1I GATTTCCATT -/C AATTTAGAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 0 1 356604 CASAVA_Build 8 31087179 4I GCTTTACTGT ----/GAGA GTGAGAATGT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 GA 0 2 356605 CASAVA_Build 8 31091951 1D TTTAAAATAA G/- GTTTTTTTTT 1806 het 1452 hom 27 7 16 4 G 2 1 356606 CASAVA_Build 8 31092934 1D GTAAAAGCAA T/- CTTTCAATAT 3070 hom 126 het 45 0 43 4 T 1 0 356607 CASAVA_Build 8 31098772 3D TCAAATCTGA AAG/--- AAGAATAGGA 3070 hom 111 het 41 0 38 4 AAG 2 1 356608 CASAVA_Build 8 31104608 1I ACAAATACTT -/C CTTCACTAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 C 1 2 356609 CASAVA_Build 8 31107238 1D TAACAACAAC A/- AAAAAAACTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 8 7 356610 CASAVA_Build 8 31114117 1D TTTAATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 15 14 356611 CASAVA_Build 8 31124560 1I CATGTGTTCT -/C ATTTATTTCC 3070 hom 135 het 50 0 44 6 C 0 1 356612 CASAVA_Build 8 31128960 1D TAGCCTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 10 9 356613 CASAVA_Build 8 31138046 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 867 hom 25 3 14 9 A 13 12 356614 CASAVA_Build 8 31163547 5I AGAAAAAAGA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 3070 hom 27 het 11 0 8 3 AAAAG 2 3 356615 CASAVA_Build 8 31166420 3I CTCAGAGCTG ---/TCC TTAGAGGGGA 3070 hom 87 het 30 0 28 2 TCC 0 1 356616 CASAVA_Build 8 31168154 1D GAAGTCCTAG C/- CCCCAGTGCC 3070 hom 62 het 25 0 20 7 C 5 4 356617 CASAVA_Build 8 31170775 1I TATTTCCTAC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 8 9 356618 CASAVA_Build 8 31174332 1D GTTTATCGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 12 11 356619 CASAVA_Build 8 31175061 1I CTCCGCCTCC -/A AGTTGTGGGT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 1 2 356620 CASAVA_Build 8 31179183 1I TTAATCTTGA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 T 7 8 356621 CASAVA_Build 8 31185580 4D TTACTTTACT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 39 het 21 0 12 9 TTTC 5 4 356622 CASAVA_Build 8 31187320 2I AGTAACCAAT --/GA GAAACCTTTA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 GA 1 2 356623 CASAVA_Build 8 31189194 1D TAATTAATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 12 11 356624 CASAVA_Build 8 31190868 1D TCTCTATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 414 hom 46 1 29 16 T 13 12 356625 CASAVA_Build 8 31227959 1I GGTCTTCTCC -/T TATGGCTTCT 3070 hom 68 het 29 0 24 5 T 1 2 356626 CASAVA_Build 8 31234586 1D GAGAGAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2268 hom 46 15 15 16 T 15 14 356627 CASAVA_Build 8 31236425 1I GCTCTTTGAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 48 23 15 10 T 8 9 356628 CASAVA_Build 8 31237134 2I GTGGTTGCTA --/AG AGGTCAGTGT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AG 1 2 356629 CASAVA_Build 8 31238925 1D ATGATGATTT A/- CTTTTGCTTC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 A 1 0 356630 CASAVA_Build 8 31245897 1D TTTTTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 12 11 356631 CASAVA_Build 8 31249104 1D AATAAATTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 15 11 T 11 10 356632 CASAVA_Build 8 31256844 1I ATTGAATTTG -/T TTTTTCTTTT 3070 hom 58 het 21 0 20 2 T 5 6 356633 CASAVA_Build 8 31258112 1D26M1D ACATGTACCC TTGAACTTAAAAGGTTAAAAAAAGTTTA/-TGAACTTAAAAGGTTAAAAAAAGTTT- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 32 0 36 4 N/A 0 0 356634 CASAVA_Build 8 31259904 1D ATTTCATCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 34 0 34 0 T 10 9 356635 CASAVA_Build 8 31261254 1I AGAATGAAAA -/C CCAAAGAGAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 C 2 3 356636 CASAVA_Build 8 31268786 2D TAGGGTTTTT AA/-- AAAGTTTTGG 3070 het 3070 ref 41 28 13 0 A 5 3 356637 CASAVA_Build 8 31269162 1D CAAGTTAAAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 T 8 7 356638 CASAVA_Build 8 31269789 6I TCACCAACAC ------/TTATTA TTATTATTAT 2899 het 2899 ref 34 21 6 7 TTA 4 6 356639 CASAVA_Build 8 31271137 3D CTCAAAAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 2161 het 2161 ref 25 15 8 3 A 14 11 356640 CASAVA_Build 8 31272064 4D TTCTTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 481 het 481 ref 30 17 3 10 TTTC 1 0 356641 CASAVA_Build 8 31273770 12D ACCACCTGGA AGGAAGAGGAAG/------------ AGGAAGAGGA 3070 het 3070 hom 40 17 23 1 AGGAAG 4 2 356642 CASAVA_Build 8 31278948 2D TAGATAGTTG AA/-- AGAGTAAAAA 3070 hom 156 het 60 0 52 9 A 3 1 356643 CASAVA_Build 8 31279630 4D TTAATTATAC ATTT/---- ATTTATTTAC 3070 hom 78 het 27 0 26 1 ATTT 3 2 356644 CASAVA_Build 8 31283096 1D CATTAAGTTG C/- CTTTAACTCT 3070 hom 57 het 20 0 20 1 C 2 1 356645 CASAVA_Build 8 31284570 1D CATCCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 400 hom 35 1 23 12 T 12 11 356646 CASAVA_Build 8 31296326 1I CAGGGTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 121 het 50 0 41 9 T 8 9 356647 CASAVA_Build 8 31305885 1I TCACAAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 39 hom 25 1 23 1 T 10 11 356648 CASAVA_Build 8 31309822 1D TATTCAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 32 1 19 12 T 12 11 356649 CASAVA_Build 8 31311814 1I GTGTAGAAAT -/G GGCAGGGCAT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 G 2 3 356650 CASAVA_Build 8 31318672 1D TGAAACTGGC T/- TTTTTTTTTT 2240 het 1279 hom 34 11 8 15 T 19 18 356651 CASAVA_Build 8 31320198 2D TTTATGTATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 57 het 26 0 20 6 TA 9 8 356652 CASAVA_Build 8 31334230 2D AAAAATTATG TA/-- TATATATATA 2179 hom 27 het 16 0 10 7 TA 7 6 356653 CASAVA_Build 8 31341469 2D CATATATATG TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TA 6 5 356654 CASAVA_Build 8 31355135 1D CATTATAGTC T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 T 8 7 356655 CASAVA_Build 8 31374341 1I CAAATTTCAT -/C CCCCCTCAGA 3070 hom 127 het 47 0 39 8 C 5 6 356656 CASAVA_Build 8 31376562 3D GTGCCACAAA AAC/--- AACAAAGTTG 3070 hom 114 het 40 0 38 2 AAC 2 1 356657 CASAVA_Build 8 31379254 4I TTAGAAGGAC ----/ACAA ACACACACAC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 ACAA 0 1 356658 CASAVA_Build 8 31379500 1D TACAGATCTT C/- CTGTCACCTA 3070 hom 96 het 38 0 32 6 C 2 1 356659 CASAVA_Build 8 31382180 1D AAACCATACC T/- TCAGTCCCCT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 T 2 1 356660 CASAVA_Build 8 31396862 1D TCACCATCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 582 hom 45 3 26 16 T 15 14 356661 CASAVA_Build 8 31400787 2I TCTTTTCTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TC 0 1 356662 CASAVA_Build 8 31413518 1D TATAGTAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 37 8 A 12 11 356663 CASAVA_Build 8 31422914 1I ACAGTGTGGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 23 het 51 1 42 8 A 8 9 356664 CASAVA_Build 8 31425130 5I2M1D TACACCACCA -----ACA/TTTATAC- ACCCATTAAC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 N/A 0 0 356665 CASAVA_Build 8 31447289 1I GTAAAATAAT -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 8 356666 CASAVA_Build 8 31447736 1I GTTAGTGTTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 7 8 356667 CASAVA_Build 8 31474885 4I CATATGTCTC ----/TATA TGTATATATA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TA 0 2 356668 CASAVA_Build 8 31479801 1I ATTATTTTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 47 het 26 0 22 4 T 8 9 356669 CASAVA_Build 8 31481988 5D TATGAAGCTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 453 hom 35 4 15 17 T 19 14 356670 CASAVA_Build 8 31487725 1I ATATTGAAAG -/C TTTTTTGCAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 0 1 356671 CASAVA_Build 8 31489130 1D CAAAAAGTAC T/- TGTTTTATGA 3070 hom 128 het 51 0 43 8 T 2 1 356672 CASAVA_Build 8 31497753 1D CTGAAGAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 314 hom 54 1 46 7 T 11 10 356673 CASAVA_Build 8 31499562 14D GGCAAGAAAA AAGGAAGAAGAAAG/-------------- AAGGAAGAAG 3070 het 19 hom 22 1 17 7 AAGGAAGAAGAAAG 1 0 356674 CASAVA_Build 8 31512276 1D TAAATAGATC A/- AGATGGTATA 3070 hom 129 het 46 0 42 4 A 2 1 356675 CASAVA_Build 8 31514020 1I ACATGGACCC -/A CAGGAGGCCC 3070 hom 87 het 39 0 30 9 A 0 1 356676 CASAVA_Build 8 31522946 1I CTGTATTCCT -/G GCAATGGAAT 3070 het 65 hom 56 1 51 4 G 1 2 356677 CASAVA_Build 8 31524861 12I AACCTCTAGA ------------/AGAGTGCCTGGT ACATAGTAAG 3070 hom 78 het 35 0 26 9 AGAGTGCCTGGT 0 1 356678 CASAVA_Build 8 31531304 3I AGAACCAAAA ---/GAT GATTGTTATG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 GAT 1 2 356679 CASAVA_Build 8 31534689 2D ATTAAAATTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 20 1 15 4 A 15 13 356680 CASAVA_Build 8 31539031 22D AATGATAGCC TGCTAGCCATATTAGCAAAGAT/---------------------- AAAAGGAGAT 3070 hom 99 het 31 0 34 3 TGCTAGCCATATTAGCAAAGAT 1 0 356681 CASAVA_Build 8 31542723 1D CACAAACACT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 87 het 35 0 30 6 A 10 9 356682 CASAVA_Build 8 31558919 21D GGAGAACTGA CTCCTTTATCATTATGCAGTG/--------------------- CTCCTTTTTA 3070 hom 78 het 27 0 27 3 CTCCTTTATCATTATGCAGTG 1 0 356683 CASAVA_Build 8 31560068 1D CGCTGCTGAT A/- AAGACATACC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 3 2 356684 CASAVA_Build 8 31560810 1D GTTGTCTATC T/- TTTTCTGTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 5 4 356685 CASAVA_Build 8 31563968 1D GCAGATTACA T/- TTCCTGATTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 3 2 356686 CASAVA_Build 8 31564821 1D GTCGTTCAAA G/- GGTATATTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 3 2 356687 CASAVA_Build 8 31578729 1I AATTTTAGCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 9 10 356688 CASAVA_Build 8 31587957 8D ACATGTACTT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCTC 1461 het 1092 hom 34 9 12 14 TC 11 7 356689 CASAVA_Build 8 31591281 1D AAAGTCACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 234 hom 31 1 28 3 T 11 10 356690 CASAVA_Build 8 31592496 1I TCAATACGTC -/T AAGTTAATAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 T 0 1 356691 CASAVA_Build 8 31599221 1D AACACTAAAT A/- AAAAAATAGG 3070 hom 144 het 50 0 48 2 A 7 6 356692 CASAVA_Build 8 31601050 1I ATGAATATTC -/A AAAAAAACCT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 7 8 356693 CASAVA_Build 8 31602498 11I ACCTTGAGAA -----------/CTTCTAACATT CCTCCCAAAT 3070 hom 75 het 28 0 24 4 CTTCTAACATT 0 1 356694 CASAVA_Build 8 31602754 1D ATATTAACAG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 105 het 46 0 35 12 A 9 8 356695 CASAVA_Build 8 31606460 2D TACTAAAATT TG/-- TGTGTGTGAG 3070 hom 105 het 38 0 36 3 TG 5 4 356696 CASAVA_Build 8 31618393 1I TTGGTGGGGG -/T TTTTTTTTTT 2969 het 2969 ref 39 24 9 6 T 11 12 356697 CASAVA_Build 8 31627830 1D CAACACTATT C/- TTGTGTTTGG 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 C 1 0 356698 CASAVA_Build 8 31648198 1I CATGATCTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 8 9 356699 CASAVA_Build 8 31650941 14D ATTTAGAGTT GTATGAAGCCAACA/-------------- CCATAATCTA 3070 het 3070 ref 35 22 14 1 GTATGAAGCCAACA 1 0 356700 CASAVA_Build 8 31651617 1D ATCTGGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 853 hom 34 3 23 8 T 13 12 356701 CASAVA_Build 8 31667300 2I GTCATTTATA --/CC AATTTCCTCT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 C 0 2 356702 CASAVA_Build 8 31670556 2I AAAATGCAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 15 15 14 A 12 14 356703 CASAVA_Build 8 31672922 1I TAATCAAATA -/T TGAGAAATAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 1 2 356704 CASAVA_Build 8 31674955 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2981 het 2981 ref 30 14 9 7 T 12 13 356705 CASAVA_Build 8 31676257 1I GTTAATAACA -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 109 het 46 0 36 10 T 7 8 356706 CASAVA_Build 8 31676763 1I TTTTCCTTCC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 399 hom 24 4 11 9 T 7 8 356707 CASAVA_Build 8 31679510 1D TCCCATAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 10 11 8 T 13 12 356708 CASAVA_Build 8 31686264 1D AATCAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 13 5 T 11 10 356709 CASAVA_Build 8 31696900 1I GGGATTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 T 11 12 356710 CASAVA_Build 8 31701668 1D GATGCCAACA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 52 20 23 9 T 9 8 356711 CASAVA_Build 8 31702525 3I TACAGATAGA ---/TGT TGTCAGCATT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 TGT 1 2 356712 CASAVA_Build 8 31703847 1I GCAAGGAGGA -/G GGGTTTGTAC 3070 hom 104 het 38 0 33 5 G 3 4 356713 CASAVA_Build 8 31706296 2D ATAAACAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 20 6 T 14 12 356714 CASAVA_Build 8 31726939 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTGGAAG 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 T 5 6 356715 CASAVA_Build 8 31750833 3D AATATCCTTC AGG/--- AGATGTTTAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 AGG 1 0 356716 CASAVA_Build 8 31756518 1I CCCAGAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 13 14 356717 CASAVA_Build 8 31778075 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 93 hom 14 1 10 3 T 12 11 356718 CASAVA_Build 8 31786394 2I CTCTCTCTCC --/AT ATATATATAT 2373 het 2004 hom 31 12 10 9 AT 6 7 356719 CASAVA_Build 8 31786463 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2912 het 2912 ref 26 16 7 3 TA 6 7 356720 CASAVA_Build 8 31808486 1I GGGTTTGAGA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 8 9 356721 CASAVA_Build 8 31819721 4I TCAATTAGAC ----/TGAG TATTTCTTGA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TGAG 0 1 356722 CASAVA_Build 8 31821856 5D AATTTTTTTT TTTCC/----- TTTTCCTTTT 4 het 4 ref 34 23 2 11 TTTCC 1 0 356723 CASAVA_Build 8 31824380 2D AGCCAAAAAC AG/-- AGTTTCTCTA 3070 hom 120 het 49 0 40 11 AG 2 1 356724 CASAVA_Build 8 31844655 1I TTGGGAAAAT -/A AAGGCTGTAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 2 3 356725 CASAVA_Build 8 31854542 2I CATGTATGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 2447 hom 30 7 14 9 TG 7 8 356726 CASAVA_Build 8 31865728 1I CCCAAATCTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 412 hom 38 1 30 8 T 9 10 356727 CASAVA_Build 8 31870761 1I GGTCAATGTC -/T TTTAAAGGCT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 T 3 4 356728 CASAVA_Build 8 31874919 4I CTAAAAATAC ----/AAAA AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 10 14 356729 CASAVA_Build 8 31876168 1D TTAAGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 105 hom 22 1 14 7 T 12 11 356730 CASAVA_Build 8 31880207 8D AGCCTTCAAC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 22 4 12 6 T 18 10 356731 CASAVA_Build 8 31884284 1D TCCTGATGGG T/- TGATGCCACA 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 2 1 356732 CASAVA_Build 8 31891469 1I CAGTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 2999 het 2999 ref 27 11 8 8 T 12 13 356733 CASAVA_Build 8 31892130 1I GTTCAGACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 10 11 356734 CASAVA_Build 8 31897362 1D GCTTTAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 10 9 356735 CASAVA_Build 8 31898536 2D ACACACACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 77 het 44 1 39 4 AC 11 10 356736 CASAVA_Build 8 31901677 2I AATTTGTGCC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 10 12 356737 CASAVA_Build 8 31902769 3D TATTAATTAA TCT/--- TCTTCTTCTG 3070 hom 87 het 35 0 30 7 TCT 4 3 356738 CASAVA_Build 8 31918141 3I CCAAAGCCAG ---/AGA AGGACATAAC 3070 hom 102 het 40 0 33 7 AGA 0 1 356739 CASAVA_Build 8 31923671 4D TGTATATCAC TCTT/---- TATGATTACA 3070 hom 138 het 50 0 46 8 TCTT 1 0 356740 CASAVA_Build 8 31924365 14D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 12 0 13 3 A 26 12 356741 CASAVA_Build 8 31925837 1I GCAGCCTGTA -/T GGTGATTCAT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 T 0 1 356742 CASAVA_Build 8 31939054 4I TGGAGGCATT ----/GGTG ACTCATGAAC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 GGTG 0 1 356743 CASAVA_Build 8 31942286 1D ATGTCTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 864 hom 25 3 15 7 T 13 12 356744 CASAVA_Build 8 31943303 2I GTTTCTGCAA --/CT CACCTATATC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CT 0 1 356745 CASAVA_Build 8 31943912 1I TTCTCAGTGG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 8 9 356746 CASAVA_Build 8 31966381 1D CATGGGAGAA C/- ATCTTGATAG 3070 hom 48 het 21 0 16 7 C 1 0 356747 CASAVA_Build 8 31974191 1I AATATGGGCA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 33 12 12 9 T 7 8 356748 CASAVA_Build 8 31974243 4D TAGTGTAACC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2236 het 335 hom 37 5 9 23 T 18 14 356749 CASAVA_Build 8 31998362 1D GGGGCTTTTA T/- TCTGCATCAT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 2 1 356750 CASAVA_Build 8 31998771 2D AAAAAATGTA TC/-- TATCAATCTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TC 1 0 356751 CASAVA_Build 8 32000900 1I TTTGCAGTAA -/C CTCTCCCTAA 3070 hom 114 het 42 0 37 5 C 1 2 356752 CASAVA_Build 8 32003132 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2199 het 364 hom 14 1 8 5 T 13 12 356753 CASAVA_Build 8 32005954 1D AATGAGTGAT G/- AAAAAGTTTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 1 0 356754 CASAVA_Build 8 32006906 1D GCTGGTTTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 38 0 32 7 A 10 9 356755 CASAVA_Build 8 32013393 1D TAAGTGACCT G/- GCCTTTTTCT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 2 1 356756 CASAVA_Build 8 32023195 2D GGCAAAAGTC TT/-- GAACAGATTG 3070 hom 99 het 39 0 33 7 T 2 0 356757 CASAVA_Build 8 32035116 1D ATTATACCGA C/- TTGATCTTTA 3070 hom 96 het 42 0 33 9 C 1 0 356758 CASAVA_Build 8 32050067 1I CAGGTCTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 10 11 356759 CASAVA_Build 8 32052365 1I ATACCAGAGT -/A ACAGGAATAA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 1 2 356760 CASAVA_Build 8 32052710 26D TATTTTAACC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 10 0 8 4 T 39 13 356761 CASAVA_Build 8 32053500 1I GGGTGTTTCA -/G GCATGTTATT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 1 2 356762 CASAVA_Build 8 32053779 1I GAACTTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 17 12 12 A 14 15 356763 CASAVA_Build 8 32058831 26D ATAAGCAGGG AGAGCTTGGTGTTTAAGTCCTTAGGA/-------------------------- ATGGGTCATG 3070 hom 117 het 37 0 40 4 AGAGCTTGGTGTTTAAGTCCTTAGGA 1 0 356764 CASAVA_Build 8 32059261 1I AACCTAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 673 hom 36 2 28 6 T 11 12 356765 CASAVA_Build 8 32060769 1D72M1I ACAGGTCAGC AACAAAATAATGGGAGGGGGAAATTAGAAAACATTAAGTCTTATTTCATGTCATGTGATACAGTATATATGTA-/-ACAAAATAATGGGAGGGGGAAATTAGAAAACATTAAGTCTTATTTCATGTCATGTGATACAGTATATATGTAT TTTTTTTAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 30 N/A 0 0 356766 CASAVA_Build 8 32071902 1D ACTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 10 9 356767 CASAVA_Build 8 32075192 3I12M2I GGGAAGAAAC ---CAAGAGGGCCTG--/CGTCATAAAGGCATGAA ATGTCATAAA 3070 het 3070 ref 42 25 20 3 N/A 0 0 356768 CASAVA_Build 8 32078091 1D CCCATATTGC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 106 hom 54 4 48 2 T 9 8 356769 CASAVA_Build 8 32084279 1D GTCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 11 10 356770 CASAVA_Build 8 32113037 3D TTTGAAAAAG AGA/--- AGGTTGACAG 3070 het 3070 ref 45 20 17 11 AGA 1 0 356771 CASAVA_Build 8 32126577 1D CAAATCATTT A/- ATACAAATTT 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 2 1 356772 CASAVA_Build 8 32127250 1D ACATGAAGGG A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 36 15 19 2 A 8 7 356773 CASAVA_Build 8 32130148 1D TCTAAAAAAA T/- TAGCAATTCA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 2 1 356774 CASAVA_Build 8 32138625 1D CATGCAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 26 22 7 A 12 11 356775 CASAVA_Build 8 32161149 2D TATATATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 40 0 31 11 TG 7 6 356776 CASAVA_Build 8 32191720 2D AGAAAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 108 het 42 0 34 8 AG 9 8 356777 CASAVA_Build 8 32212915 1D AAGGTAGTCC T/- TGAATCACTT 3070 het 3070 hom 37 17 18 3 T 2 1 356778 CASAVA_Build 8 32216336 1D GATGAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 1415 het 1415 ref 31 21 3 7 A 12 11 356779 CASAVA_Build 8 32284511 4D GGTTCAGAGG TGTT/---- TGTTTGTCTT 3070 hom 75 het 32 0 26 8 TGTT 2 1 356780 CASAVA_Build 8 32291512 1I GCGTGAAGAC -/G TAAGTAGACG 3070 hom 108 het 43 0 34 9 G 0 1 356781 CASAVA_Build 8 32298910 1D GTTTCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 34 0 22 12 T 11 10 356782 CASAVA_Build 8 32299921 2I ATTCTCTGGG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 28 0 20 8 T 12 14 356783 CASAVA_Build 8 32306900 15D AAAACCACAA CCTTTAGGTTTTGGG/--------------- GGGTTTTGGT 3070 hom 108 het 36 0 36 4 CCTTTAGGTTTTGGG 1 0 356784 CASAVA_Build 8 32322369 1I TGGCTCTGTT -/G GTCTGGAAGC 3070 hom 156 het 57 0 52 5 G 1 2 356785 CASAVA_Build 8 32323611 1D ATCTTTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 426 hom 48 2 34 14 A 13 12 356786 CASAVA_Build 8 32328266 3I CATACCCCTT ---/TTC TTCTCTTTTT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TTC 1 2 356787 CASAVA_Build 8 32331443 2I CAACAACAAC --/AA AAAAAGTGTA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 5 7 356788 CASAVA_Build 8 32331852 1D ATGAAGCTGC T/- TTTTTTAAAA 2889 het 1581 hom 16 4 7 5 T 7 6 356789 CASAVA_Build 8 32332728 1I AAGAAGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 31 1 25 5 A 10 11 356790 CASAVA_Build 8 32350543 1I TCTCTACAAC -/A GAGAAAAATG 3070 hom 72 het 32 0 25 7 A 0 1 356791 CASAVA_Build 8 32352210 1D CTGGATATAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 76 het 34 0 26 8 T 10 9 356792 CASAVA_Build 8 32356141 1I TAAACATATC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 7 8 356793 CASAVA_Build 8 32364783 1D GATGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 479 hom 31 3 25 3 A 12 11 356794 CASAVA_Build 8 32365714 1D TACAAGACGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 23 1 17 5 T 11 10 356795 CASAVA_Build 8 32366818 3D TCTTTCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 19 16 356796 CASAVA_Build 8 32383632 1I GAATTATTTT -/C TACAGATTTA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 0 1 356797 CASAVA_Build 8 32385702 2D GGGAAGAAGA CT/-- CTGTTGAGCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CT 2 1 356798 CASAVA_Build 8 32405401 1I GAGTGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 42 1 27 14 T 13 14 356799 CASAVA_Build 8 32408798 1D TCTCTCAGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 10 9 356800 CASAVA_Build 8 32414132 1I AATGGGAGAG -/A ATATTTGGCC 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 A 1 2 356801 CASAVA_Build 8 32416830 1D GAATAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 2346 het 24 hom 19 1 8 10 T 17 16 356802 CASAVA_Build 8 32420898 1I TTAAAGAGAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 84 hom 34 1 29 4 A 8 9 356803 CASAVA_Build 8 32426472 1D TCTCCAGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 12 11 12 A 12 11 356804 CASAVA_Build 8 32457494 1D CAAATTGCTT A/- AAAAAAAAAA 1328 het 1328 ref 36 28 4 4 A 14 13 356805 CASAVA_Build 8 32501511 1D TTTCCTGGGA G/- CTGTATTTTC 3070 hom 126 het 46 0 42 4 G 1 0 356806 CASAVA_Build 8 32516187 1D CCACAATGCA C/- CAGGAGAAGA 3070 hom 90 het 34 0 29 6 C 2 1 356807 CASAVA_Build 8 32523368 1D TTTTGAGCTT C/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 C 1 0 356808 CASAVA_Build 8 32531976 2I GCTTTTTTCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 TC 7 8 356809 CASAVA_Build 8 32546023 1D CTTGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 41 1 30 10 A 14 13 356810 CASAVA_Build 8 32548978 4D CCATAAAAAT AGTC/---- AGAGACTGAG 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 AGTC 1 0 356811 CASAVA_Build 8 32550431 1D GTGCTCCAAT A/- AAACTTTATT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 A 4 3 356812 CASAVA_Build 8 32555531 1D TCTGTCCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 33 1 22 13 T 12 11 356813 CASAVA_Build 8 32555634 1I TGCTGATAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 392 hom 38 1 29 8 T 9 10 356814 CASAVA_Build 8 32557905 9D TTCTAAATGA CATAGTACC/--------- CATTGAGCAG 3070 het 3070 ref 38 25 13 2 CATAGTACC 1 0 356815 CASAVA_Build 8 32570571 1D ACAGTTAGCC A/- GGGGTGGTAT 1580 het 1580 ref 25 13 6 6 A 1 0 356816 CASAVA_Build 8 32573660 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 614 hom 15 3 9 3 A 14 15 356817 CASAVA_Build 8 32575426 1D AGAAAATGAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 48 28 17 3 T 7 6 356818 CASAVA_Build 8 32581937 1D TGCCCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 A 11 10 356819 CASAVA_Build 8 32592112 5I ACTTACAGCC -----/TGACA TTTAAAAATG 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 TGACA 0 1 356820 CASAVA_Build 8 32592944 1I AGAAAAAAAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 A 8 9 356821 CASAVA_Build 8 32608222 1I CTGTAGTAAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 T 7 8 356822 CASAVA_Build 8 32611857 1D AAGTCTTCTT C/- CCATACTTTG 3070 hom 102 het 41 0 34 7 C 3 2 356823 CASAVA_Build 8 32621863 1I GCCCAGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 20 15 12 T 14 15 356824 CASAVA_Build 8 32633915 1D AGCTTCCTCA G/- GTAAAATATT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 G 2 1 356825 CASAVA_Build 8 32635683 2D ATTTTATCAC AG/-- AGAGACAAGC 3070 het 3070 ref 38 18 16 5 AG 3 2 356826 CASAVA_Build 8 32638686 1D CATTTAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1003 het 1003 ref 39 27 4 8 T 13 12 356827 CASAVA_Build 8 32649113 1D CATCTCCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 T 13 12 356828 CASAVA_Build 8 32649839 1I CAATAACAAT -/A ATAGTAATAA 3070 het 3070 hom 39 19 17 3 A 1 2 356829 CASAVA_Build 8 32653171 1I TTGCCATGGA -/G GTCAGTATCA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 1 2 356830 CASAVA_Build 8 32655972 2I TATTGGTGAC --/TT GAGCTGGGTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 0 2 356831 CASAVA_Build 8 32661917 2I TATTTTCAGG --/AA AAAAAAAACG 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 8 10 356832 CASAVA_Build 8 32667620 2I GAACCCAGTA --/TT TTAGGCCTTG 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 2 4 356833 CASAVA_Build 8 32684788 1D CATTTTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 10 9 356834 CASAVA_Build 8 32685001 2D AAGTTATATG TA/-- TATGAAGTAT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TA 2 1 356835 CASAVA_Build 8 32692702 1D AATCAGGCCC T/- TTTTTTTTTT 2725 hom 30 het 14 0 10 4 T 15 14 356836 CASAVA_Build 8 32693882 2D GTGCATGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 32 10 10 14 GT 10 9 356837 CASAVA_Build 8 32700219 1I CTTTGGTATC -/T CATTTTTGCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 0 1 356838 CASAVA_Build 8 32713071 1D GATTGTCATT A/- AAAAAAAAAT 1218 het 1218 ref 37 31 3 3 A 10 9 356839 CASAVA_Build 8 32742091 1I ACTGTGATTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 104 het 48 0 42 6 A 8 9 356840 CASAVA_Build 8 32771466 1I CACCAATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 35 1 26 8 T 13 14 356841 CASAVA_Build 8 32777721 5D ATGCTTATTT CCCCC/----- CCCCCCCCAT 3070 hom 141 het 54 0 47 9 C 13 8 356842 CASAVA_Build 8 32779313 1D TAGGTAAACC T/- GAACTGATTT 3070 hom 138 het 49 0 46 3 T 1 0 356843 CASAVA_Build 8 32780038 4I ACACTCCTAA ----/CACT CAGGAGATTC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 CACT 0 1 356844 CASAVA_Build 8 32781394 5I TTAAAAAGAG -----/TTTCC TTTCAAATCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTTCC 0 1 356845 CASAVA_Build 8 32781832 1D CACATCATGA T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 8 7 356846 CASAVA_Build 8 32781899 1I TTTTCTAACT -/A AAAAAAGTAC 3070 hom 57 het 23 0 20 4 A 6 7 356847 CASAVA_Build 8 32783075 1I GACTATATAT -/A AAAAAATCAA 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 6 7 356848 CASAVA_Build 8 32784047 1I TTACACATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 848 hom 32 2 24 6 A 9 10 356849 CASAVA_Build 8 32784196 3I AAAAAAAAAA ---/AAC AAAAACCAGA 3070 hom 66 het 30 0 21 9 AAC 0 1 356850 CASAVA_Build 8 32784900 2I CTTCAAAGAT --/GG GGAGAAACTG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 4 356851 CASAVA_Build 8 32787442 1I AATTTACAAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 A 8 9 356852 CASAVA_Build 8 32792031 1D TTAAATGAAG A/- AAAAAAATGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 8 7 356853 CASAVA_Build 8 32812893 1D TTTCACCTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 44 0 33 11 T 10 9 356854 CASAVA_Build 8 32815522 1I AAAAAAAAAA -/C CATGAATCTC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 1 2 356855 CASAVA_Build 8 32816022 2D GCAAAACGAG TT/-- TTCATTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 4 2 356856 CASAVA_Build 8 32840349 1I TTCTAATACC -/A AAACCTGGCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 4 356857 CASAVA_Build 8 32877883 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2165 het 64 hom 17 1 9 7 T 13 14 356858 CASAVA_Build 8 32902142 1I GTCTCATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 37 0 27 10 A 11 12 356859 CASAVA_Build 8 32937155 1D ACTGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2083 het 1401 hom 23 7 6 10 A 19 18 356860 CASAVA_Build 8 32955023 1I CCAACATCTA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 62 het 27 0 21 6 T 8 9 356861 CASAVA_Build 8 32962561 1I TATCATGAGA -/G GGGAAAAAAG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 3 4 356862 CASAVA_Build 8 33014218 1I GTGGCCCTGC -/T TTTTCATCCT 3070 hom 87 het 32 0 28 4 T 4 5 356863 CASAVA_Build 8 33092888 1I ATTCTGGGGG -/A AAAAAACACT 3070 hom 117 het 42 0 40 2 A 6 7 356864 CASAVA_Build 8 33106796 1D AAAAGGCATT G/- GGGGGGGTAC 2365 het 2365 ref 28 14 6 8 G 8 7 356865 CASAVA_Build 8 33121475 1D GCCTATGGAG A/- AAAACGGAAC 3070 hom 113 het 43 0 36 7 A 5 4 356866 CASAVA_Build 8 33168506 1D TCAAATATCA T/- TTATATGCTT 3070 het 3070 hom 40 14 22 5 T 3 2 356867 CASAVA_Build 8 33173804 10D ACTCCATCTC AAAAAAAAGA/---------- AAAAAAAAGA 2084 het 2084 ref 20 11 7 5 AAAAAAAAGA 2 1 356868 CASAVA_Build 8 33177623 3I AATATAGTAA ---/TGT TGGGATTAAT 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 TGT 0 1 356869 CASAVA_Build 8 33182244 1I CTTGATTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 27 21 9 T 11 12 356870 CASAVA_Build 8 33182972 2D ACGTGGAAAG CA/-- CACACACTGA 3070 het 3070 ref 43 25 16 5 CA 4 3 356871 CASAVA_Build 8 33183446 1D GAGATAAAAC A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 42 19 22 5 A 6 5 356872 CASAVA_Build 8 33195609 1I CTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 617 hom 26 3 20 4 T 10 11 356873 CASAVA_Build 8 33200227 1I AATATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1583 hom 32 5 23 4 A 10 11 356874 CASAVA_Build 8 33210535 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 25 0 22 3 A 10 11 356875 CASAVA_Build 8 33218028 4D TGCGCGCGCA CGTG/---- CACACACACA 3070 hom 48 het 28 0 22 6 CGTG 1 0 356876 CASAVA_Build 8 33221519 1I GTACCCACAA -/G AAATAAATGA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 G 0 1 356877 CASAVA_Build 8 33223440 1D GATTCTCTAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 7 356878 CASAVA_Build 8 33224815 2I CCATTCTGAC --/TG GCGTGAGATG 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TG 0 1 356879 CASAVA_Build 8 33228432 1D TATTGGCCCC T/- AATCTCTTCT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 1 0 356880 CASAVA_Build 8 33257089 1D CTCTGTTCCA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 9 8 356881 CASAVA_Build 8 33258542 4D ACTACTGAGT ACTA/---- ACTAGGCTTA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 ACTA 2 1 356882 CASAVA_Build 8 33267358 1I CTTTTTAAAT -/A AAAACCAGTT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 4 5 356883 CASAVA_Build 8 33268006 1D GACTCTCTTT G/- GGGTCTTGAA 3070 hom 141 het 54 0 45 9 G 4 3 356884 CASAVA_Build 8 33268097 8D TGGAGTTATA ATAGGGAT/-------- ATAGGGATAT 3070 hom 141 het 50 0 48 5 ATAGGGAT 2 1 356885 CASAVA_Build 8 33270092 3D AGACAGTATC TGA/--- AGGTGTGGAA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 TGA 1 0 356886 CASAVA_Build 8 33270661 1D GTTAGGGAGG C/- CTCAGGAAAC 3070 hom 45 het 18 0 16 3 C 2 1 356887 CASAVA_Build 8 33274547 1I TTTAAGAAGG -/A AAAAAACATC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 A 6 7 356888 CASAVA_Build 8 33274835 1I TTGAAGAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 370 hom 31 1 27 3 T 9 10 356889 CASAVA_Build 8 33276045 11I GCCCCAGGAG -----------/ACAGCCCCAAA ACTGTGAGTG 3070 hom 72 het 31 0 24 7 ACAGCCCCAAA 0 1 356890 CASAVA_Build 8 33281776 1I CCCCCCAAAA -/C CTTTGAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 1 2 356891 CASAVA_Build 8 33282031 1D CAAGCAACTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 9 356892 CASAVA_Build 8 33287340 2I GTTTTTTACA --/CT GTGTGCTTTA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 CT 0 1 356893 CASAVA_Build 8 33293634 3D TACAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 1106 hom 10 het 5 0 4 1 AAG 1 0 356894 CASAVA_Build 8 33303847 4D TTCGTTTGTC TGTT/---- TGTTTGAAAT 3070 het 3070 ref 52 28 21 7 TGTT 2 1 356895 CASAVA_Build 8 33306220 1I CATCAAGTGT -/C CCGTCTTTCC 3070 het 3070 hom 43 15 22 6 C 2 3 356896 CASAVA_Build 8 33314701 1I TTTACAGAAA -/T CCAAAGGAAT 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 0 1 356897 CASAVA_Build 8 33325361 4D AAGAAAGAAA AACT/---- AATAAAATGT 3070 het 3070 ref 35 21 14 4 AACT 1 0 356898 CASAVA_Build 8 33344952 1I TCATAATCAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 15 8 5 T 8 9 356899 CASAVA_Build 8 33356451 1D TCCAGGAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 10 A 13 12 356900 CASAVA_Build 8 33359454 1D AGCAAGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 16 8 T 11 10 356901 CASAVA_Build 8 33360850 2I CAGAGTGAGA --/CT CTGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 CT 1 2 356902 CASAVA_Build 8 33371733 1I CTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 2161 het 2161 ref 28 17 5 6 A 14 15 356903 CASAVA_Build 8 33376722 1I TTATTTATTT -/A GTTTTTTTTT 3070 het 149 hom 28 2 26 0 A 0 1 356904 CASAVA_Build 8 33381398 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 334 hom 17 2 10 5 A 15 14 356905 CASAVA_Build 8 33385209 6D TATAGCAAGA CTCTAT/------ CTCTACAAAA 3070 hom 54 het 22 0 19 5 CTCTAT 1 0 356906 CASAVA_Build 8 33389084 5I CACACTGAGA -----/GTCAC GTTTCCTCAT 3070 hom 98 het 36 0 31 5 GTCAC 0 1 356907 CASAVA_Build 8 33390080 1I CACAAACACA -/C CAAAACTTCA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 C 1 2 356908 CASAVA_Build 8 33391654 1D ATGGCTTTTT C/- CCCCTATTAA 3070 het 6 hom 45 1 39 5 C 5 4 356909 CASAVA_Build 8 33398653 1D AGGGAAAGAA C/- CCATCTGTTT 3070 het 3070 hom 49 16 23 10 C 3 2 356910 CASAVA_Build 8 33399005 1I53M1D TCCTAAAAGG -AAAAAAGAACAAACTTTTTAGGCCAACTTCCCTAGATCAAATGGTTTTTGTCTA/AAAAAAAGAACAAACTTTTTAGGCCAACTTCCCTAGATCAAATGGTTTTTGTCT- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 30 16 8 N/A 0 0 356911 CASAVA_Build 8 33400334 1D ATTCTTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1932 hom 31 6 17 8 T 13 12 356912 CASAVA_Build 8 33401199 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 13 14 356913 CASAVA_Build 8 33402821 1D TATCTCTACC A/- AAAAAAATAC 3070 het 2137 hom 25 6 14 7 A 8 7 356914 CASAVA_Build 8 33405695 1I AAGCATGTGT -/C TGGAAACTTA 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 C 0 1 356915 CASAVA_Build 8 33407056 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2988 het 1941 hom 24 9 12 4 A 17 16 356916 CASAVA_Build 8 33408608 23D ACCCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2118 hom 14 7 11 2 A 39 16 356917 CASAVA_Build 8 33415347 2D TCAGCAAGAC AT/-- AGATTCTGGC 3070 het 3070 hom 40 18 20 3 AT 1 0 356918 CASAVA_Build 8 33416024 1I CAATTCAAGA -/T GAGATTTGGG 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 T 0 1 356919 CASAVA_Build 8 33417731 1D AACCATCAAG T/- TAGTCCAATG 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 2 1 356920 CASAVA_Build 8 33424514 1D ATCTCAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2697 het 2697 ref 19 9 9 1 A 13 12 356921 CASAVA_Build 8 33435323 1D CCTGAACTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 A 10 9 356922 CASAVA_Build 8 33436537 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAATTA 1593 het 1593 ref 22 15 4 3 A 7 8 356923 CASAVA_Build 8 33445300 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1466 het 1466 ref 34 10 7 18 A 18 17 356924 CASAVA_Build 8 33452644 7D AACTCGATTT AAAATAA/------- AAAATAAAAA 2208 het 2026 hom 12 6 6 3 AAAATAA 3 2 356925 CASAVA_Build 8 33455170 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1765 hom 15 6 9 0 A 10 11 356926 CASAVA_Build 8 33460938 1I TCTTGGTTTT -/C GTGGGTCTTG 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 C 0 1 356927 CASAVA_Build 8 33462564 7D GTCGCGTCAT GCTGTCA/------- GCTGTCAGCT 2368 het 1836 hom 26 6 10 14 GCTGTCA 3 2 356928 CASAVA_Build 8 33470007 1I AATTTTAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 9 10 356929 CASAVA_Build 8 33470979 1D ACAGAACAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 15 5 T 12 11 356930 CASAVA_Build 8 33471846 1D GCTGTAGCCC T/- TTTTTTTTTT 1142 het 1142 ref 28 17 4 7 T 11 10 356931 CASAVA_Build 8 33476104 1D TAAAAGGAAA G/- GAAGGAAGGA 3070 het 3070 hom 41 14 25 2 G 2 1 356932 CASAVA_Build 8 33477997 2I TTCTGGGACT --/TA GTGTCAAGTT 3070 het 3070 ref 45 37 8 0 TA 0 1 356933 CASAVA_Build 8 33479518 1I GACCACAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 11 10 9 T 13 14 356934 CASAVA_Build 8 33480250 2I GCGATTTAAC --/AG TGTCAGAATC 2739 het 2739 ref 22 11 6 5 AG 0 1 356935 CASAVA_Build 8 33482546 1I CCACTGCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 10 11 356936 CASAVA_Build 8 33488535 1I ATTTGCCACT -/A ATCCAGTTAT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 1 2 356937 CASAVA_Build 8 33490738 1I TTTTCGGGTG -/C CCCTTTTTTC 3070 het 3070 ref 52 32 15 5 C 3 4 356938 CASAVA_Build 8 33491995 1D CTTCTGACCT G/- GGGTAGGGTG 1780 het 1780 ref 23 10 8 5 G 4 3 356939 CASAVA_Build 8 33501106 3D TGGTGAAGGA GTG/--- GTCAATAGCT 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 GTG 1 0 356940 CASAVA_Build 8 33502100 2D TAAAGGAGCC CA/-- CAGTCTTTAG 3070 het 3070 ref 38 24 12 3 CA 2 1 356941 CASAVA_Build 8 33514437 1D CTGTCTCGAT A/- AAAAATATAA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 A 6 5 356942 CASAVA_Build 8 33535846 1I AAAGGGAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2491 hom 22 7 13 2 A 9 10 356943 CASAVA_Build 8 33536380 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 17 7 A 12 13 356944 CASAVA_Build 8 33538169 1D AAGGTTACTT C/- CCCCCGCCAA 3070 het 2071 hom 36 12 14 10 C 6 5 356945 CASAVA_Build 8 33541452 4D CAAAAAGTAG ATTA/---- ATTAATTAAT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 ATTA 5 4 356946 CASAVA_Build 8 33541633 1I ACCCTCTCTC -/A AAAAAAAAAA 2621 het 685 hom 14 2 7 5 A 10 11 356947 CASAVA_Build 8 33542442 1I TAAAGAATGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 T 7 8 356948 CASAVA_Build 8 33546350 1D TAAAGTCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 A 10 9 356949 CASAVA_Build 8 33553717 2D ATTTGGTGAC TT/-- TTTCTTAAAA 1689 het 1689 ref 19 8 5 6 T 5 3 356950 CASAVA_Build 8 33553759 1D TAATTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1307 het 1307 ref 19 8 5 6 T 15 14 356951 CASAVA_Build 8 33556214 6I TTTCTTTCTT ------/TCTCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 TC 6 9 356952 CASAVA_Build 8 33561927 1I TTTTAATTTT -/A TTTTTTTATA 1491 het 1491 ref 9 5 4 0 A 0 1 356953 CASAVA_Build 8 33567131 1D TATTAAGTGA T/- TTTTTTTTTG 1385 het 1385 ref 32 26 3 3 T 10 9 356954 CASAVA_Build 8 33580133 2D GGATTCACTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 2651 hom 30 10 14 6 T 11 9 356955 CASAVA_Build 8 33605748 1D TCTCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1053 hom 19 4 10 5 A 13 12 356956 CASAVA_Build 8 33614013 1I ATGAAGAAAG -/A TATTCTGCAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 0 1 356957 CASAVA_Build 8 33615127 3D AGGATTTTGT TGA/--- TGATGCTTCT 3070 het 3070 hom 45 21 21 5 TGA 2 1 356958 CASAVA_Build 8 33627301 1I TTAATTTTTT -/A TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 0 1 356959 CASAVA_Build 8 33630313 2I GGTAAGAGGG --/GT GTGTGTGTGT 2168 het 2168 ref 38 12 9 17 GT 8 9 356960 CASAVA_Build 8 33648873 1D GGTTGGAATT C/- CTACCCAAGG 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 C 2 1 356961 CASAVA_Build 8 33684637 2D AGCTTACTGC AA/-- AGAGTGAGGT 3070 het 3070 ref 46 25 19 3 A 3 1 356962 CASAVA_Build 8 33689622 2I CCTGTCTCAG --/AA AAAAAAAAAA 2348 het 2348 ref 32 9 11 12 A 14 16 356963 CASAVA_Build 8 33695512 2I TATAACACTT --/TA TTGCTCTATG 3070 het 3070 ref 46 22 14 10 TA 0 1 356964 CASAVA_Build 8 33709272 4I ATGATGATGA ----/AGAT AGATAGATAG 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 AGAT 3 4 356965 CASAVA_Build 8 33712216 1D AGGTAGGTGC A/- AAAGTAATTG 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 A 4 3 356966 CASAVA_Build 8 33717666 4I CTTGGCTTAC ----/TGCA TGCAGCCTCT 3070 het 2375 hom 23 7 10 6 TGCA 1 2 356967 CASAVA_Build 8 33733779 1I TGTTTTATTC -/T TTTTTTCAGA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 T 6 7 356968 CASAVA_Build 8 33736021 1D ACATGGTGGT A/- AGGGAAGGAA 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 2 1 356969 CASAVA_Build 8 33736894 2D GCCCCCCCTC TT/-- AATGCTATCA 3070 het 3070 hom 28 13 13 4 T 2 0 356970 CASAVA_Build 8 33742678 2I CAAGGAGGAC --/AG AGAGAGAAAT 3070 het 3070 hom 45 15 19 11 AG 3 4 356971 CASAVA_Build 8 33749171 1D AGGTAAAGAG T/- TCGATATTTT 3070 het 3070 hom 46 13 22 11 T 2 1 356972 CASAVA_Build 8 33762879 1D TTTTTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 57 22 22 16 T 11 10 356973 CASAVA_Build 8 33766519 4D GAAGTAGAGA CAGT/---- CAGGGAGAGA 3070 het 3070 ref 38 20 13 6 CAGT 1 0 356974 CASAVA_Build 8 33768460 12D28M10D GATATATATA TATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTATATACAGGGCTCGGCG/------------TGTGTGTGTGTGTGTATATGTATATACA---------- CACACACATA 2716 het 1033 hom 19 9 8 4 N/A 0 0 356975 CASAVA_Build 8 33782212 3D TACAGGCACG TGC/--- CACCACCCTA 2431 het 2431 ref 22 11 7 5 TGC 1 0 356976 CASAVA_Build 8 33785420 2D TTGCTATAAC AG/-- AATACCTGAG 3070 het 3070 hom 40 13 23 4 AG 1 0 356977 CASAVA_Build 8 33798667 11I TAATTCATTT -----------/TACTTTATATA TTCTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 TACTTTATATA 0 1 356978 CASAVA_Build 8 33809128 2D TTTCTACTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2168 hom 30 9 15 7 T 16 14 356979 CASAVA_Build 8 33814827 1I ATCATCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 10 11 356980 CASAVA_Build 8 33825301 1D ACCTGCTGGG A/- AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 38 18 18 3 A 8 7 356981 CASAVA_Build 8 33827531 2I ATATGGACAC --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 TA 6 7 356982 CASAVA_Build 8 33831187 1D AATAATGTAA C/- CGTTTGTTTC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 C 2 1 356983 CASAVA_Build 8 33836396 1I CCTAATCATG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 8 19 3 T 9 10 356984 CASAVA_Build 8 33846088 3D GCTGGCAAAA AAT/--- AATAAGAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 19 9 AAT 2 1 356985 CASAVA_Build 8 33853090 1I TTCAATGGGA -/T TGTTTTTTTC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 1 2 356986 CASAVA_Build 8 33853981 1I CTAAGTATTT -/C TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 0 1 356987 CASAVA_Build 8 33857392 1D TTGGTTTTCT G/- GGTTCCTTCT 1553 het 1553 ref 13 6 4 4 G 3 2 356988 CASAVA_Build 8 33860871 1D ATGTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2513 het 2513 ref 36 17 11 8 T 14 13 356989 CASAVA_Build 8 33861164 4D AAGGTTTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 1106 het 1106 ref 31 13 8 14 TTTG 1 0 356990 CASAVA_Build 8 33879905 1D GTTTGACACC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 T 9 8 356991 CASAVA_Build 8 33889473 1I AGTATCTGGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 9 10 356992 CASAVA_Build 8 33904331 1D GTCTCTGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 10 9 356993 CASAVA_Build 8 33905700 1I CAACATGTGA -/T TTTTTGGGAG 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 5 6 356994 CASAVA_Build 8 33919884 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 812 hom 25 6 15 5 A 13 12 356995 CASAVA_Build 8 33923756 4I GCCACAAAAG ----/GTTT GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 GTTT 3 4 356996 CASAVA_Build 8 33927820 1I TAGGGGAGAA -/T TTTTTCCTGA 3070 het 3070 ref 43 26 12 5 T 5 6 356997 CASAVA_Build 8 33928204 2D GGTTCTCAGT CC/-- CCTGGGCATC 3070 het 3070 hom 23 8 10 5 C 4 2 356998 CASAVA_Build 8 33929776 1I TCTATTACTT -/A AAATGATTTT 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 A 3 4 356999 CASAVA_Build 8 33950741 4I CAAAGAAAAT ----/AAAG AAATCAAATG 3070 het 1806 hom 16 5 11 0 AAAG 0 1 357000 CASAVA_Build 8 33951620 1I CTCTGAATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 A 13 14 357001 CASAVA_Build 8 33952297 2D GTGCTGGACA CT/-- CTGAAAGATG 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 CT 2 1 357002 CASAVA_Build 8 33954779 5I GTAAAGATGT -----/ACAGA ACAGAATCGT 3070 het 3070 hom 44 16 18 10 ACAGA 1 2 357003 CASAVA_Build 8 33970903 1D GATGTCCCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 141 hom 44 1 35 9 T 10 9 357004 CASAVA_Build 8 33975838 4D CTTTCTTTTC TTTT/---- TTTTTTTTCT 3070 hom 40 het 28 0 23 5 T 12 8 357005 CASAVA_Build 8 33993394 1D CTTTCCCCCA T/- TTTTCTCAGA 3070 hom 114 het 44 0 37 7 T 5 4 357006 CASAVA_Build 8 33997194 3D GGTTATGCCA TTC/--- TTCTTCTTCT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 TTC 4 3 357007 CASAVA_Build 8 34003790 1D TGATAAACTT C/- TTTATCTCTG 3070 hom 148 het 55 0 50 5 C 1 0 357008 CASAVA_Build 8 34012283 2I TTGACATGAG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 TA 7 8 357009 CASAVA_Build 8 34044484 1I TCTAAGTTAT -/A AAAAATTAAT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 5 6 357010 CASAVA_Build 8 34110819 4D CTAAGTGAAT AGTA/---- AGTATTCTTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 4 AGTA 2 1 357011 CASAVA_Build 8 34117807 1D TGCTGCACTA T/- CTACTTTAAG 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 T 1 0 357012 CASAVA_Build 8 34129823 1I CTACAAATAC -/A AAAATTAGCC 2867 het 1438 hom 12 4 8 0 A 4 5 357013 CASAVA_Build 8 34150110 1I GGTCTTAAAG -/A GGTAATACAA 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 0 1 357014 CASAVA_Build 8 34158996 2D GCATTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 14 12 357015 CASAVA_Build 8 34161622 1D GGGTCTCTAA T/- CCATTTGTTT 3070 hom 120 het 46 0 41 6 T 1 0 357016 CASAVA_Build 8 34162262 1I TGCAGCAAAG -/C CTTTCCTGAC 3070 hom 78 het 28 0 24 4 C 1 2 357017 CASAVA_Build 8 34164136 1D TCCTCAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 103 het 42 0 35 7 T 11 10 357018 CASAVA_Build 8 34179342 1D CAGTTAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 11 10 357019 CASAVA_Build 8 34182048 1D ATAAAAAATA T/- AAAAAAAAGC 1404 het 1404 ref 34 26 5 3 T 1 0 357020 CASAVA_Build 8 34184459 1D AAAGTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 11 10 357021 CASAVA_Build 8 34184847 1I ACTAACAAGA -/C AGGCCTGATA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 C 0 1 357022 CASAVA_Build 8 34197982 1D TTTTGGGGTA G/- GGGGAAGGGG 2418 het 550 hom 8 2 6 0 G 5 4 357023 CASAVA_Build 8 34198132 9I TAATAATAAT ---------/AAAAGAAAA AAAAGAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AAAAGAAAA 1 2 357024 CASAVA_Build 8 34202385 3I AACATCTAAT ---/TCC ATGCACGCAG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 TCC 0 1 357025 CASAVA_Build 8 34202942 18D CCTTGAATTT ATGCACTAATCTAAAAGG/------------------ ATGCACTAAT 3070 het 3070 ref 48 23 21 16 ATGCACTAATCTAAAAGG 2 1 357026 CASAVA_Build 8 34204855 1I AGAGTTGTTA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 125 hom 41 1 36 4 T 8 9 357027 CASAVA_Build 8 34204945 5I2M1I CAGAAGTGTG -----AC-/TGTCTACT CCTTGTATTC 3070 het 3070 hom 27 9 17 2 N/A 0 0 357028 CASAVA_Build 8 34209321 2D AAAGACAAAC AT/-- CATGTTGACC 3070 het 3070 hom 44 21 21 3 AT 1 0 357029 CASAVA_Build 8 34212138 4I GTCTATTTAC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 TTAT 3 4 357030 CASAVA_Build 8 34214059 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 15 0 9 6 A 15 14 357031 CASAVA_Build 8 34215396 6D AGAGAAAAAA AGTAAG/------ AGTAAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 AGTAAG 2 1 357032 CASAVA_Build 8 34222105 2D TTTGGGACTC AT/-- ATGTGTATCT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 AT 2 1 357033 CASAVA_Build 8 34222348 1I TTCATTATTA -/T CTAGCTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 T 0 1 357034 CASAVA_Build 8 34236899 1D AAATAAAACA G/- TGAAGTAATT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 G 1 0 357035 CASAVA_Build 8 34241238 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTG 2888 het 2888 ref 19 9 9 1 T 9 10 357036 CASAVA_Build 8 34244074 1I AAAAGACTCA -/T GCTAGCTTAA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 0 1 357037 CASAVA_Build 8 34247291 1I GACAAGAGAC -/A AAAAAAAAAA 1673 het 1673 ref 39 25 4 10 A 13 14 357038 CASAVA_Build 8 34263758 2I AGAGCAGCTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 T 9 11 357039 CASAVA_Build 8 34273294 5D AATTCAGATC TGATT/----- TAAGACTTCA 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 TGATT 1 0 357040 CASAVA_Build 8 34280877 2I GGTCTCTAAC --/GT CCCTTCTGAG 3070 het 3070 hom 51 21 26 4 GT 0 1 357041 CASAVA_Build 8 34292807 1D TTTCTGAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 21 5 T 11 10 357042 CASAVA_Build 8 34319793 1I TTTTGGTGAG -/A AAAAAGCAGG 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 5 6 357043 CASAVA_Build 8 34341175 2I TGGGCTTTTT --/TG TGTTTTGATT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TG 1 2 357044 CASAVA_Build 8 34346188 1D CTCTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 11 10 357045 CASAVA_Build 8 34348395 2D CGTGTGCATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 29 0 21 11 TG 10 9 357046 CASAVA_Build 8 34349120 3I CAAAAAAGAA ---/AAT AAATAAACAA 3070 hom 57 het 25 0 20 5 AAT 0 1 357047 CASAVA_Build 8 34350621 1I GGATATAAGC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 9 10 357048 CASAVA_Build 8 34360358 1I AAGTAAAGTA -/C CCCCCCCCAT 3070 hom 80 het 29 0 26 3 C 8 9 357049 CASAVA_Build 8 34366193 1I62M7I AATAGACAAA -GGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATGACAGTGAACAGG-------/TGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATGACAGTGAACAGGCAACCTA CAGAATGGGA 3070 hom 78 het 25 0 27 11 N/A 0 0 357050 CASAVA_Build 8 34367404 1I GAAGTAAAGG -/A AGTCTTTGTA 3070 hom 138 het 48 0 45 3 A 1 2 357051 CASAVA_Build 8 34374638 3D AATTACAGTG ATA/--- ATGATAGTGA 3070 het 3070 ref 30 15 14 3 ATA 1 0 357052 CASAVA_Build 8 34375390 1I AGCTACAGAT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 A 8 9 357053 CASAVA_Build 8 34376209 1I AGTAGAGACA -/T TTTTTTTTTT 2391 het 2391 ref 22 8 7 7 T 13 14 357054 CASAVA_Build 8 34376371 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 1134 hom 13 3 8 2 T 9 8 357055 CASAVA_Build 8 34378949 11D ACCCGGCTAA TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 2073 het 1206 hom 19 6 7 6 T 25 14 357056 CASAVA_Build 8 34379983 2D CCTTCATGAC TT/-- TTTTATAGAT 3070 het 3070 hom 56 22 25 9 T 6 4 357057 CASAVA_Build 8 34385421 1D TTACATCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 475 hom 33 2 22 9 T 11 10 357058 CASAVA_Build 8 34386654 1I ATTACTTTTG -/C ACCAACCTAT 3070 hom 32 het 18 0 12 6 C 0 1 357059 CASAVA_Build 8 34390750 1I TGCCTCAGCC -/T TCTGAGTGGC 3070 hom 17 het 17 0 14 3 T 1 2 357060 CASAVA_Build 8 34396075 20I AGTCATCAGA --------------------/CTCACTCACATCACTGCCAT GGCAGAGGCA 3070 het 3070 ref 43 18 11 14 CTCACTCACATCACTGCCAT 0 1 357061 CASAVA_Build 8 34400298 3D TTGGAGACTT CTC/--- CTCATCACCA 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 CTC 2 1 357062 CASAVA_Build 8 34407945 2I TTAAAAGAAC --/AT AAACTCATTA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 AT 0 1 357063 CASAVA_Build 8 34412714 5D ATGTCCAGTA TTATG/----- TTATGTTGAG 3070 het 3070 ref 34 17 13 7 TTATG 2 1 357064 CASAVA_Build 8 34415169 1D CAACCAAGGA C/- CCTTACAGAA 3070 het 3070 ref 61 29 25 7 C 3 2 357065 CASAVA_Build 8 34415980 1D CCAGTTTTGT G/- GGGGGAGGGG 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 G 6 5 357066 CASAVA_Build 8 34421188 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1335 hom 21 4 13 4 A 10 9 357067 CASAVA_Build 8 34424397 1I AGTCCTTTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 15 2 T 9 10 357068 CASAVA_Build 8 34439772 4D TTTCTTCTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 2504 hom 36 15 12 10 T 16 12 357069 CASAVA_Build 8 34444959 1D TTCCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 19 11 14 T 13 12 357070 CASAVA_Build 8 34447606 1I ATTACTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 T 10 11 357071 CASAVA_Build 8 34455399 1D CAGGACCAAA G/- GGGAAATCCA 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 G 4 3 357072 CASAVA_Build 8 34456892 3I TCCAGTTCCC ---/AAT AAGTTCCTCA 3070 het 3070 ref 48 22 18 9 AAT 0 1 357073 CASAVA_Build 8 34458919 1I CATTTGAACA -/G GCACGTTAGT 3070 het 3070 ref 49 21 21 7 G 1 2 357074 CASAVA_Build 8 34459292 1D TAGTCGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 9 8 357075 CASAVA_Build 8 34461841 3D TGGCTTTTTT TTC/--- TTTTTTATTC 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 TTC 1 0 357076 CASAVA_Build 8 34475041 1D AAAAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 T 11 10 357077 CASAVA_Build 8 34477144 1I TTTTTTTTTT -/G GAACATAAAT 3070 het 3070 ref 32 18 8 6 G 1 2 357078 CASAVA_Build 8 34483003 1D TCATCCCCTC T/- TTTTTAACTA 3070 het 3070 hom 47 18 21 9 T 6 5 357079 CASAVA_Build 8 34494423 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1984 het 1984 ref 30 12 9 9 T 16 15 357080 CASAVA_Build 8 34497624 2D AGAACCATAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 AT 6 5 357081 CASAVA_Build 8 34514788 1I AAATGGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 9 10 357082 CASAVA_Build 8 34526566 1D TTTGTTGGCC T/- TTTTTTTTTT 1986 het 1890 hom 29 11 7 11 T 15 14 357083 CASAVA_Build 8 34535984 2D AAGGAAGAGA AG/-- GGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 AG 1 0 357084 CASAVA_Build 8 34537603 1I TTTCATGTGA -/T TTTTAAGAGT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 4 5 357085 CASAVA_Build 8 34545504 1I ATCAGCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 T 10 11 357086 CASAVA_Build 8 34546562 1D AGGACAGCTA C/- AAAAAAAAAA 2551 het 2551 ref 35 12 15 8 C 1 0 357087 CASAVA_Build 8 34549980 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATACA 2342 het 2342 ref 26 11 8 7 TA 4 5 357088 CASAVA_Build 8 34550213 1D ATATATATAC A/- CATACACATA 3070 het 3070 hom 24 11 12 2 A 1 0 357089 CASAVA_Build 8 34560806 1I TATACATATG -/A AAAAAAAAAA 674 het 674 ref 55 40 6 9 A 11 12 357090 CASAVA_Build 8 34569508 4D ATGTCATCTG CAAA/---- CAGAGACAAT 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 CAAA 1 0 357091 CASAVA_Build 8 34608545 1I CTAATTTTGT -/A TTTTTAGTAG 3070 het 158 hom 22 1 19 3 A 0 1 357092 CASAVA_Build 8 34626341 2I CAAACAATAC --/AA AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 8 10 357093 CASAVA_Build 8 34633059 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 40 22 13 7 AC 9 8 357094 CASAVA_Build 8 34634134 1D TGTGTACTGA T/- TTTTTTGGCA 3070 het 3070 ref 25 10 8 7 T 7 6 357095 CASAVA_Build 8 34635524 1I ATTCTAAGTG -/A AAGTAACTCA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 2 3 357096 CASAVA_Build 8 34639834 1I AAACTCAATC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 9 10 357097 CASAVA_Build 8 34640228 1D GTTAACTCTC A/- GGGGTAAAGT 3070 het 3070 hom 46 21 24 2 A 1 0 357098 CASAVA_Build 8 34640562 1D TTTTATTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 12 11 357099 CASAVA_Build 8 34644442 1D TCTTGTCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 227 hom 32 2 18 12 A 17 16 357100 CASAVA_Build 8 34651472 1D GTGTGGGGGC G/- AGGGGGAGGG 3070 hom 66 het 27 0 21 8 G 1 0 357101 CASAVA_Build 8 34653662 1I GAAAAGTACA -/T TTTTTTTATG 3070 het 3070 ref 48 26 20 2 T 7 8 357102 CASAVA_Build 8 34662143 1I ATAATACATG -/C ATTATATATA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 C 0 1 357103 CASAVA_Build 8 34666554 4D TCATGGCTCA ATCT/---- ATCTATTCTC 3070 hom 132 het 51 0 45 6 ATCT 2 1 357104 CASAVA_Build 8 34686872 1D TTTGTGTTTC T/- GAGATCCCAC 3070 hom 75 het 29 0 26 4 T 1 0 357105 CASAVA_Build 8 34687452 3D CCTTATCCAG ATC/--- ATCTTCTATG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 ATC 2 1 357106 CASAVA_Build 8 34690297 4D CCAAATTTAA ATAG/---- ATAGACAGAT 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 ATAG 2 1 357107 CASAVA_Build 8 34690659 4D CTCAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 69 het 35 0 24 12 AAAC 5 4 357108 CASAVA_Build 8 34692690 1D CAACTGTTAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 9 8 357109 CASAVA_Build 8 34695132 27D TAGCCAGTTA TCCTGGCACTGTTTATTAACGAGAGAG/--------------------------- TCCTTTCCCC 3070 hom 93 het 33 0 31 7 TCCTGGCACTGTTTATTAACGAGAGAG 1 0 357110 CASAVA_Build 8 34696853 1D AAGAACTTAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 89 het 37 0 36 1 T 9 8 357111 CASAVA_Build 8 34697217 1D CCCGGAAAAA C/- ACAAGTCACA 3070 hom 111 het 42 0 37 6 C 1 0 357112 CASAVA_Build 8 34698751 7D CACTGCAACC CCCGCCT/------- CCCGGGCTCA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CCCGCCT 1 0 357113 CASAVA_Build 8 34699960 1D TTGTCTTGGC T/- TTTCTCTGTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 4 3 357114 CASAVA_Build 8 34707697 1D TAGCCAAACA T/- ACATTAGAGC 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 1 0 357115 CASAVA_Build 8 34711532 2D TACATGTATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 20 1 10 9 T 16 14 357116 CASAVA_Build 8 34714867 4D ATTGCTATTG AGTA/---- AGTGAGAAGA 3070 hom 114 het 42 0 37 5 AGTA 1 0 357117 CASAVA_Build 8 34721262 4I AAGTTTAAAA ----/AAAT AAATAAAGTA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAAT 1 2 357118 CASAVA_Build 8 34725188 1D TTTTCATTTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 9 8 357119 CASAVA_Build 8 34732621 1I ATGCTACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 647 hom 43 2 30 11 T 10 11 357120 CASAVA_Build 8 34743358 1D GCCAACATGG T/- TGAAACCCTG 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 2 1 357121 CASAVA_Build 8 34745901 2D GGCTCAAAGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 30 0 24 6 A 14 12 357122 CASAVA_Build 8 34749140 2I GAGCATACAA --/AC ACACAAGTAT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 AC 2 3 357123 CASAVA_Build 8 34749666 63D CTTTGGTTTT GGAGATCTGTTATGAAGTTTCTGGGTGTCACATAGTTACTGCTAGAGCCACAAAAAGAGAGAG/--------------------------------------------------------------- GGAGATCTGT 2281 hom 21 het 19 0 8 17 GGAGATCTGTTATGAAGTTTCTGGGTGTCACATAGTTACTGCTAGAGCCACAAAAAGAGAGAG 2 1 357124 CASAVA_Build 8 34757071 3D TATGAGGGAG CAA/--- CAACAACAAC 3070 hom 141 het 62 0 47 16 CAA 5 4 357125 CASAVA_Build 8 34766272 1I TGCATTAGGG -/C CTGGGTAGGT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 C 1 2 357126 CASAVA_Build 8 34766676 2I GGGGCAAGAT --/TA TATGCACTGC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 TA 1 2 357127 CASAVA_Build 8 34772853 1D GCCCTATGAG A/- AAAAATATAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 6 5 357128 CASAVA_Build 8 34787875 1I TAGTCCTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1061 hom 15 4 9 2 A 13 14 357129 CASAVA_Build 8 34793463 1I CAAGCAGAAG -/A AAAAAAGTGT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 6 7 357130 CASAVA_Build 8 34796992 3D57M10D TTTGCTGTAG GAAAAAAAAAAAAAAAGCCAGGCATCAACAAAAACACCTTCCACAAAATGACTAGGTAATAAAGATTAAG/---AAAAAAAAAAAAAGCCAGGCATCAACAAAAACACCTTCCACAAAATGACTAGGTAAT---------- AATAGAGTAA 3070 het 334 hom 35 2 37 8 N/A 0 0 357131 CASAVA_Build 8 34799915 4D TACACATGGC TATA/---- TATATATATA 3070 hom 108 het 44 0 37 8 TA 8 6 357132 CASAVA_Build 8 34803650 1I GTCATAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1163 hom 26 3 19 4 T 11 12 357133 CASAVA_Build 8 34893716 1I GCAAGTTGAT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 52 27 17 8 A 7 8 357134 CASAVA_Build 8 34920222 1I GTAGAGACAA -/G GTTAGAACCC 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 G 1 2 357135 CASAVA_Build 8 34928753 1I GAGCCGGGAC -/A AAAAAAAAAA 2307 het 1852 hom 29 6 11 12 A 13 14 357136 CASAVA_Build 8 34932551 2I GAAAATGAAT --/GA AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 GA 0 1 357137 CASAVA_Build 8 34932713 18D AACACAAAAT ACCTAAGAATATAAGAAC/------------------ ACCTAAGAAT 3070 het 3070 ref 34 19 12 11 ACCTAAGAATATAAGAAC 1 0 357138 CASAVA_Build 8 34933479 1I CTACCTTGAC -/T TTTTTTGCCA 3070 het 3070 ref 37 14 17 6 T 6 7 357139 CASAVA_Build 8 34943314 3I TGTGGAAGAC ---/ACA ACAATTCTGA 3070 het 3070 hom 55 24 25 6 ACA 1 2 357140 CASAVA_Build 8 34944056 1I GGATTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 20 19 9 T 10 11 357141 CASAVA_Build 8 34949754 17I ATGATGAAAA -----------------/TGTTCTATACTTTGCAT TGTCCAATAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 TGTTCTATACTTTGCAT 0 1 357142 CASAVA_Build 8 34952209 1D TAAAATAAAT A/- AATATATTCC 3070 het 3070 hom 30 13 17 1 A 3 2 357143 CASAVA_Build 8 34954789 1D AAATTACTAG A/- AAAAATATAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 6 5 357144 CASAVA_Build 8 34959905 1D AGGTTGCAGT A/- GAGCCGAGCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 1 0 357145 CASAVA_Build 8 34973651 1D TTTTGATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 17 18 9 A 11 10 357146 CASAVA_Build 8 34974936 2D GGCCAAAAAC AA/-- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 30 15 12 5 A 9 7 357147 CASAVA_Build 8 34981234 1I TCTTAGAGAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 8 9 357148 CASAVA_Build 8 34981520 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1180 het 1180 ref 33 19 3 11 T 13 12 357149 CASAVA_Build 8 35003084 1I GTATATAAAG -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 6 7 357150 CASAVA_Build 8 35013820 1I AACATCCACC -/A AAAAAACCAA 3070 hom 129 het 51 0 42 9 A 6 7 357151 CASAVA_Build 8 35022153 1D TCTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 864 hom 22 4 13 5 T 15 14 357152 CASAVA_Build 8 35025619 1D AGACTGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 24 6 A 13 12 357153 CASAVA_Build 8 35026527 3D AACCCTGTCT CTA/--- CTACTAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CTA 3 2 357154 CASAVA_Build 8 35036258 1D ATGGGATTAC T/- TTTTTCTTGC 3070 het 3070 ref 29 16 7 6 T 6 5 357155 CASAVA_Build 8 35040278 1D TGCTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 2648 het 2648 ref 47 29 8 10 A 13 12 357156 CASAVA_Build 8 35042178 1I19M3I GAAAAAAGGT -AAAAAAAAAATAAAAAAAA---/AAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAG AAGTCAGAAC 3070 hom 75 het 30 0 26 9 N/A 0 0 357157 CASAVA_Build 8 35051517 1D AAAAGTAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 103 het 41 0 34 7 A 10 9 357158 CASAVA_Build 8 35062747 2D CTAATCTTTA TT/-- ACTTCCTTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 2 0 357159 CASAVA_Build 8 35064475 1D TAATGTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 892 hom 38 2 26 10 T 12 11 357160 CASAVA_Build 8 35066926 74D ACGTATATAA ATATATATATACACGTATATATATATACACGTATATATATATATACACGTATATATATACATACACGTATATAT/-------------------------------------------------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 54 het 17 0 19 5 ATATATATATACACGTATATATATATACACGTATATATATATATACACGTATATATATACATACACGTATATAT 1 0 357161 CASAVA_Build 8 35068418 4D TTATTAGAAG TCAC/---- TCCTGTTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 5 TCAC 1 0 357162 CASAVA_Build 8 35075947 5I CATGTAAATA -----/TATAT TATATGTTTA 2518 hom 15 het 6 0 6 0 TATAT 1 2 357163 CASAVA_Build 8 35100164 5D TTGGCATTAT CTTGA/----- CTTCTACCCC 3070 het 3070 ref 35 26 9 2 CTTGA 1 0 357164 CASAVA_Build 8 35102213 18D TGTCAGTGGT CTCTGCTGGTGCAGAAGC/------------------ CTCTGCTGGT 3070 hom 99 het 38 0 31 12 CTCTGCTGGTGCAGAAGC 2 1 357165 CASAVA_Build 8 35108207 1D TCTGGAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1325 hom 25 5 12 8 T 13 12 357166 CASAVA_Build 8 35124453 1D ACAACCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 12 21 15 A 12 11 357167 CASAVA_Build 8 35129411 13I AATCTGCCTT -------------/TTGCATTTTGCAA GAAGCCAGTT 3070 hom 79 het 33 0 23 11 TTGCATTTTGCAA 0 1 357168 CASAVA_Build 8 35156511 2D AACAAAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 12 10 357169 CASAVA_Build 8 35161448 1D CTCTTCACTC A/- AAAAAAACTA 3070 hom 90 het 35 0 30 6 A 8 7 357170 CASAVA_Build 8 35173652 1D ACCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2904 hom 33 13 16 4 A 16 15 357171 CASAVA_Build 8 35176419 1D AACAGCAAGT A/- AAATAGCAAT 3070 hom 93 het 38 0 32 7 A 4 3 357172 CASAVA_Build 8 35176819 2I TGAATATATC --/TT GTTTTATAAA 3054 hom 21 het 8 0 8 0 T 0 2 357173 CASAVA_Build 8 35193612 1I TTTCTTTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 38 0 28 10 T 11 12 357174 CASAVA_Build 8 35207287 1D ACCATGCTGT A/- ATGGGGGGCC 3070 hom 63 het 28 0 21 8 A 2 1 357175 CASAVA_Build 8 35221829 1D CCAGCACTTT G/- GGAGGCTGAG 3070 het 2354 hom 19 8 9 3 G 3 2 357176 CASAVA_Build 8 35224295 1I42M1D CCTTTTATTT -AAATGTTTATATTTTTCTAAAATATCTTTGAAATTACAGAGAT/AAAATGTTTATATTTTTCTAAAATATCTTTGAAATTACAGAGA- TTTTTTTTTT 3070 hom 108 het 24 0 37 5 N/A 0 0 357177 CASAVA_Build 8 35234025 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 1490 hom 29 9 12 8 G 0 1 357178 CASAVA_Build 8 35236808 1I CTGACTGATC -/T TTTTTTTTTT 1556 het 1556 ref 32 15 5 12 T 15 16 357179 CASAVA_Build 8 35239229 1D ATAATGAAAC T/- TTTTTTATTA 3070 hom 132 het 48 0 45 4 T 7 6 357180 CASAVA_Build 8 35241790 13D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 21 0 21 4 A 24 11 357181 CASAVA_Build 8 35242267 4D CTGTGACCTT ATCA/---- TAGTCTGATG 3070 het 3070 ref 56 29 23 6 ATCA 1 0 357182 CASAVA_Build 8 35243867 1I GTTAATGGAG -/C CACCTACACA 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 C 1 2 357183 CASAVA_Build 8 35245348 1I TGAAACTAAC -/A AAAAAAACCT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 A 7 8 357184 CASAVA_Build 8 35247986 2D GCCCCTATGG TA/-- TATATATATA 3070 hom 54 het 28 0 18 11 TA 7 6 357185 CASAVA_Build 8 35255646 4D AAATTTATTT ATTA/---- TTTATTATTT 3070 het 3070 hom 20 8 11 3 ATTA 1 0 357186 CASAVA_Build 8 35258483 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 13 11 357187 CASAVA_Build 8 35260862 2I GACTCCGAAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 380 hom 19 1 17 1 A 13 15 357188 CASAVA_Build 8 35263035 2D AGTCACAGTT TG/-- TGAGTATGTC 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 TG 2 1 357189 CASAVA_Build 8 35264626 1I GGGCTGAGGC -/A GGCTAATCAT 3070 hom 53 het 23 0 17 6 A 0 1 357190 CASAVA_Build 8 35265170 1D GAAGCTCAGA G/- GTTGCCAATC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 2 1 357191 CASAVA_Build 8 35271758 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2262 het 1062 hom 35 12 7 16 T 17 16 357192 CASAVA_Build 8 35274838 1I GATGTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 T 10 11 357193 CASAVA_Build 8 35284182 1D GCTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 10 9 357194 CASAVA_Build 8 35291633 1I GAATATATGT -/A AAAATCATCT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 4 5 357195 CASAVA_Build 8 35296866 1D AGAAATGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 11 10 357196 CASAVA_Build 8 35301504 2I GTTTTTGTGC --/TG TTTTTGAGTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TG 0 1 357197 CASAVA_Build 8 35313852 1I GGAAATAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 588 hom 32 4 18 10 T 12 13 357198 CASAVA_Build 8 35325605 3I ACACCAAGTT ---/CTC CTCATCTAGT 3070 het 3070 hom 41 13 21 7 CTC 1 2 357199 CASAVA_Build 8 35341321 4D TCTCTTATAC TTTA/---- TTTCTTTATA 3070 het 3070 ref 36 17 15 7 TTTA 1 0 357200 CASAVA_Build 8 35352612 3I ATGCCCATAC ---/AAT AATAATAGTA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 AAT 2 3 357201 CASAVA_Build 8 35367550 1D ACAATAGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 5 A 10 9 357202 CASAVA_Build 8 35387070 11I ATTTCCTTCG -----------/CATCACCCAGC CATGGCCTCC 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 CATCACCCAGC 0 1 357203 CASAVA_Build 8 35397803 1I TACCATGGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 10 8 T 10 11 357204 CASAVA_Build 8 35407365 13D AACATCTGGA TGTTTCTGGAGGC/------------- TGGCACACCC 3070 het 3070 ref 40 21 17 4 TGTTTCTGGAGGC 1 0 357205 CASAVA_Build 8 35447662 2D CAAAAAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 23 0 14 9 A 20 18 357206 CASAVA_Build 8 35495509 1D TTCTGCAACA T/- TTTTTTATGC 3070 hom 102 het 36 0 35 2 T 7 6 357207 CASAVA_Build 8 35505100 1D AAACAGCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 24 2 T 22 21 357208 CASAVA_Build 8 35512498 1I GTTGTTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 16 10 T 11 12 357209 CASAVA_Build 8 35537769 1I ATAATATACC -/T TTTTGTGGGA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 4 5 357210 CASAVA_Build 8 35546988 1D GCCCACATGA C/- CTATACTCTG 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 C 2 1 357211 CASAVA_Build 8 35551282 2D TAACCCTTGG CC/-- GGGCAAACTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 C 2 0 357212 CASAVA_Build 8 35583056 1I TTATTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 1795 het 1425 hom 15 3 7 6 T 10 11 357213 CASAVA_Build 8 35585867 4I ACATTTTCTT ----/TATC TAAATTCATT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 TATC 0 1 357214 CASAVA_Build 8 35608374 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 327 hom 23 1 17 5 A 14 15 357215 CASAVA_Build 8 35647846 4I TGATGACAGG ----/TTGA TTGATAGGTG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TTGA 1 2 357216 CASAVA_Build 8 35648049 4I TCAAGATGAG ----/AAAT AAATAACCTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AAAT 1 2 357217 CASAVA_Build 8 35653965 1I CATGAATATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 15 10 T 10 11 357218 CASAVA_Build 8 35654951 2D TGTGAGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 51 25 16 10 TG 8 7 357219 CASAVA_Build 8 35697900 1D TCAGATGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 15 11 T 13 12 357220 CASAVA_Build 8 35727050 1I AAATAGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1099 hom 32 5 21 6 A 12 13 357221 CASAVA_Build 8 35804771 7D GCTCCTACAT ATGAATG/------- AGAGCAGGCA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 ATGAATG 1 0 357222 CASAVA_Build 8 35822796 1I TTAGCTTAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 A 8 9 357223 CASAVA_Build 8 35877423 1D TAAGTCTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 289 hom 22 2 14 6 T 17 16 357224 CASAVA_Build 8 35995458 4D GAGACATCAT AGAC/---- AGAGAAGGCA 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 AGAC 1 0 357225 CASAVA_Build 8 36079053 1I ACCTAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2386 het 2341 hom 24 10 10 4 T 13 14 357226 CASAVA_Build 8 36090643 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1266 hom 17 4 9 4 A 11 10 357227 CASAVA_Build 8 36106457 1I GGCAAATATT -/A AAAAAAAAAC 2607 het 2607 ref 26 13 7 6 A 9 10 357228 CASAVA_Build 8 36114959 4D CCGAAATAAT AAAC/---- AAATAGAAGC 3070 het 3070 ref 28 13 13 4 AAAC 1 0 357229 CASAVA_Build 8 36119251 1I TTTGTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 25 0 19 6 A 13 14 357230 CASAVA_Build 8 36125002 4I ACAGACAGAC ----/AGAT AGATAGATAG 3070 hom 81 het 42 0 26 17 AGAT 3 4 357231 CASAVA_Build 8 36147847 1D GCTTGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 18 8 T 11 10 357232 CASAVA_Build 8 36246251 2I CTTACTTCTC --/AG GGTATGTGAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AG 0 1 357233 CASAVA_Build 8 36278971 4D TCTGATAAGT TATC/---- TATCTATCTA 3070 het 3070 ref 44 14 13 17 TATC 6 5 357234 CASAVA_Build 8 36294354 9I GTGCTCCATG ---------/TCCTTCTCA TCCTTCTCAT 2535 het 2535 ref 29 9 7 13 TCCTTCTCA 1 2 357235 CASAVA_Build 8 36296719 1D ACCATAACTT A/- TTTTGTTGAA 3070 hom 18 het 8 0 7 7 A 1 0 357236 CASAVA_Build 8 36296925 1D GTGTTTTTTG C/- ATGCTTCTGA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 1 0 357237 CASAVA_Build 8 36299470 1D CCGCCTGGAG C/- CCAGGCCCGC 2254 hom 44 het 18 0 10 8 C 3 2 357238 CASAVA_Build 8 36301020 1D68M1D12M1D GATTTACAGC ACTGCTAAAGGCAATGGTAGCCTGTGGATTTGTGTGTAACTCTGAGTGATTGACAACATCTGCCTGGAGAAATTGGGATGAGA/-CTGCTAAAGGCAATGGTAGCCTGTGGATTTGTGTGTAACTCTGAGTGATTGACAACATCTGCCTGGAG-AATTGGGATGAG- AACGATTTTG 3070 hom 147 het 40 0 47 23 N/A 0 0 357239 CASAVA_Build 8 36320014 1D CCCAAGAGAG T/- TTCCGTAATA 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 3 2 357240 CASAVA_Build 8 36345363 2I AAAATGGGAA --/AC CAAATCTGTT 3070 hom 160 het 57 0 54 4 AC 0 1 357241 CASAVA_Build 8 36350352 1D40M1D TTGAATGCAG AAATTTGAATCCAGTTCTGCCTGACACCAGAACTCTTTAAAC/-AATTTGAATTCAGATCTGCCTGACACCAGAGCTCTTTAAA- CACCATTATG 3070 hom 96 het 35 0 32 24 N/A 0 0 357242 CASAVA_Build 8 36365250 1D CTCAGTGTGG T/- TTCACGAATC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 3 2 357243 CASAVA_Build 8 36376626 1D TGTCTAAGAC T/- TTTTTTTTTT 1534 het 1534 ref 51 33 4 14 T 11 10 357244 CASAVA_Build 8 36379008 1I CCTGTTGGAA -/T TTTTTTTTTC 2643 het 2643 ref 21 11 7 3 T 9 10 357245 CASAVA_Build 8 36383405 1D TAGTGCACAT A/- AAAATATGTA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 5 4 357246 CASAVA_Build 8 36428728 1I TGTTGTTTCT -/G TTATCATTAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 0 1 357247 CASAVA_Build 8 36430336 1D GAAGGAATCA G/- GTAGACTTTT 3070 het 3070 ref 50 28 17 5 G 2 1 357248 CASAVA_Build 8 36431442 1D ATTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1403 het 1403 ref 47 33 4 10 T 12 11 357249 CASAVA_Build 8 36514454 2D TGCTATAAGA AT/-- ATATATATAT 606 het 606 ref 15 9 4 2 AT 10 9 357250 CASAVA_Build 8 36564565 2I TTTCCTTTCT --/CC CCCACACCAG 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 3 5 357251 CASAVA_Build 8 36713901 1I ATTCATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 942 hom 27 2 21 4 A 10 11 357252 CASAVA_Build 8 36778108 1D TGTTTCTATC T/- TTTTTTTTTC 812 het 812 ref 37 32 3 2 T 10 9 357253 CASAVA_Build 8 36869811 1I CTACTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 2898 het 1646 hom 21 8 10 3 T 9 10 357254 CASAVA_Build 8 36882137 1I AATCTAAGGC -/A AAAAAAAAAA 1773 het 1773 ref 26 10 6 10 A 15 16 357255 CASAVA_Build 8 36882858 1I CTCTGCAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1173 hom 37 3 23 11 T 14 15 357256 CASAVA_Build 8 36909342 1D AAGGACAAGC A/- CAACAACATG 3070 het 3070 hom 41 17 21 3 A 1 0 357257 CASAVA_Build 8 36980990 1D TCCTATAATC A/- GGTCATAAAC 3070 het 3070 hom 50 17 26 9 A 1 0 357258 CASAVA_Build 8 36987594 10D TGTGTGTGTG TGTGTGTGTC/---------- TGTGTGTGTG 3070 het 1208 hom 35 8 17 11 TGTGTGTGTC 1 0 357259 CASAVA_Build 8 36988696 1I CAGAACTAGC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 48 21 20 7 A 7 8 357260 CASAVA_Build 8 36991672 1I TCACTCATTA -/G GTTCAGCTCT 3070 het 3070 hom 38 10 23 5 G 1 2 357261 CASAVA_Build 8 37007394 1I AGACATCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 T 14 15 357262 CASAVA_Build 8 37008879 4I GTCTATTCAA ----/TTTG TTTGTTCACC 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 TTTG 1 2 357263 CASAVA_Build 8 37010062 2D CTCAGATTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2909 hom 25 8 13 5 T 13 11 357264 CASAVA_Build 8 37012670 2D TATCTTGAAA CC/-- CCCCCCCCTA 3070 het 617 hom 22 5 10 8 C 10 8 357265 CASAVA_Build 8 37022757 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATCT 3070 het 2649 hom 26 8 14 5 AT 5 4 357266 CASAVA_Build 8 37029114 1D ATGCAAATAG C/- CCTCACATAA 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 C 3 2 357267 CASAVA_Build 8 37053692 6I GCATTCGATT ------/TTGTTC TTGTTGTTGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TTGTTC 0 1 357268 CASAVA_Build 8 37055556 1D AATGAACCTG T/- TTTTTTTTGT 1005 het 1005 ref 34 17 5 12 T 9 8 357269 CASAVA_Build 8 37056336 1I AAAGTGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 10 11 357270 CASAVA_Build 8 37060860 3D GTATATGATT AAC/--- AATACACACA 3070 het 3070 ref 51 27 22 5 AAC 1 0 357271 CASAVA_Build 8 37062995 1I AGAAGAGAAC -/T GAAACTCCTT 3070 hom 162 het 61 0 51 10 T 0 1 357272 CASAVA_Build 8 37065796 1I AAAATGGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 15 10 T 9 10 357273 CASAVA_Build 8 37066476 1D GTGTTTTGGC A/- GCCATTTCTC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 A 1 0 357274 CASAVA_Build 8 37067106 1I AGGAGGCCGA -/G GGCAGGAGAA 3070 het 886 hom 15 4 9 2 G 2 3 357275 CASAVA_Build 8 37073113 1D GTTTTTGATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 14 16 4 A 10 9 357276 CASAVA_Build 8 37090855 1D TGCATTGTAC A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 A 8 7 357277 CASAVA_Build 8 37093352 1D CCCAGCCTGC T/- TGGCCTACAC 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 2 1 357278 CASAVA_Build 8 37102826 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2980 het 2980 ref 25 9 8 8 TA 6 7 357279 CASAVA_Build 8 37106383 1I TATTTTATTT -/G GTTCAAGTTT 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 G 1 2 357280 CASAVA_Build 8 37128315 4D GTGGTTTGAC ACTT/---- AATTGATTAA 3070 hom 123 het 46 0 40 8 ACTT 1 0 357281 CASAVA_Build 8 37128940 1I GCTCCCGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 12 13 357282 CASAVA_Build 8 37145266 1I AAATAGAGGG -/A AAAATGTAAA 3070 het 3070 ref 27 17 7 3 A 4 5 357283 CASAVA_Build 8 37156486 4I GGAGTGCTCA ----/CCCC CCCCTCTCCC 2855 het 2014 hom 22 10 9 3 C 4 8 357284 CASAVA_Build 8 37160192 1D AAAATTCCCA T/- TTTTCCTCCA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 5 4 357285 CASAVA_Build 8 37160597 16I AACATCCACA ----------------/CGCGCACACGTATGCG CGCGCACACG 3070 het 2234 hom 48 9 20 19 CGCGCACACGTATGCG 1 2 357286 CASAVA_Build 8 37164488 1I CAACAACAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 A 9 10 357287 CASAVA_Build 8 37184642 1I AATTATCATG -/A ATACTTTTGG 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 A 1 2 357288 CASAVA_Build 8 37208255 5D GGGGGGAGAA AGGAG/----- AGGAGAGGAG 3070 het 3070 hom 29 12 12 7 AGGAG 4 3 357289 CASAVA_Build 8 37220783 1I TAGCTCCCAT -/A AATTCCCACG 3070 het 3070 hom 26 9 9 8 A 2 3 357290 CASAVA_Build 8 37228997 4D TTACTGTGAT TAAA/---- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 TAAA 1 0 357291 CASAVA_Build 8 37233247 1D GGATGTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3059 hom 39 15 14 10 T 13 12 357292 CASAVA_Build 8 37235519 4D GACAGCTATC TCTG/---- TCTAAGATGC 3070 het 3070 ref 40 23 13 5 TCTG 1 0 357293 CASAVA_Build 8 37235798 6D GGTAGGAAGA TATAAT/------ TATATTCATG 3070 het 3070 ref 45 21 19 7 TATAAT 1 0 357294 CASAVA_Build 8 37239425 3I GACCTGAAAA ---/TCT TCTCCCTCAT 3070 het 3070 hom 39 13 16 10 TCT 1 2 357295 CASAVA_Build 8 37240625 3I GACAAAATGT ---/ATA ATAACAAATG 3070 het 3070 ref 56 26 23 7 ATA 1 2 357296 CASAVA_Build 8 37241291 1I12M1I ATACCAACAC -AAAAAAAAATGA-/AAAAAAAAAATGAT TAAGTGTTTG 3070 het 3070 ref 26 16 12 7 N/A 0 0 357297 CASAVA_Build 8 37244367 2I GAGCAGGTGG --/GC AGCTGGGTTT 3070 het 3070 ref 52 24 24 4 GC 0 1 357298 CASAVA_Build 8 37245046 4D ACTTTGAGAT ATAG/---- ATAGATAGAT 3070 hom 78 het 31 0 27 5 ATAG 4 3 357299 CASAVA_Build 8 37256968 1D AGAGTCAATG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 29 13 11 6 A 7 6 357300 CASAVA_Build 8 37262665 1D TTCTACTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 11 10 357301 CASAVA_Build 8 37265053 5I GTTTCCAGGA -----/ATAAT ATAATATGTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 ATAAT 1 2 357302 CASAVA_Build 8 37265594 1D CAAGATGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 10 16 6 T 12 11 357303 CASAVA_Build 8 37271271 2D CACAGGTGAC TA/-- TTTCAAACGA 3070 het 3070 ref 31 14 12 7 TA 1 0 357304 CASAVA_Build 8 37272016 1I CTAACGGTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 19 13 A 13 14 357305 CASAVA_Build 8 37283525 2D TTCCAAACTT TC/-- TGTTTCCCCT 3070 hom 102 het 42 0 35 8 TC 1 0 357306 CASAVA_Build 8 37303238 2D CTTTATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 26 6 T 13 11 357307 CASAVA_Build 8 37311576 1I GAAAACTTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 68 hom 42 3 20 19 A 16 17 357308 CASAVA_Build 8 37313608 4D TATTCACTTG CTCT/---- CTCTCTCTCT 3070 hom 10 het 43 1 27 16 CT 11 9 357309 CASAVA_Build 8 37344905 3I TGGAGATGCA ---/AAG AAGAAGAATA 3070 het 3070 hom 56 22 25 9 AAG 2 3 357310 CASAVA_Build 8 37356340 1D ATGTTTGTTT C/- CCCCTCAATA 3070 het 3070 hom 44 21 22 1 C 5 4 357311 CASAVA_Build 8 37357354 1D16M1D TGAGCCCCTC TTTTTTTCTCCCCACCCT/-TTTTTTCTCCCCACCC- TTTTCCACCT 3070 het 1360 hom 23 6 13 10 N/A 0 0 357312 CASAVA_Build 8 37359833 1D CTCTTGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 280 hom 42 2 17 24 T 11 10 357313 CASAVA_Build 8 37361358 9D ATGTTTCCAA TCTTGGAAT/--------- TTTCTAGCAT 3070 het 3070 ref 50 28 21 4 TCTTGGAAT 1 0 357314 CASAVA_Build 8 37365961 1D GTCTCCTTCA G/- GAGGTCAGAC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 G 2 1 357315 CASAVA_Build 8 37369401 1I AAAATAAGGA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 T 6 7 357316 CASAVA_Build 8 37373471 1D CACTGTCCAA T/- CCCCTTCTAG 3070 het 3070 hom 50 17 23 11 T 1 0 357317 CASAVA_Build 8 37393642 4D CATCACTGCC TGTT/---- TGTCTCTGGA 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 TGTT 1 0 357318 CASAVA_Build 8 37405946 5I CTTAAGCCAT -----/TTTTC TTCTTAAGCC 3070 het 3070 hom 47 18 27 2 TTTTC 0 1 357319 CASAVA_Build 8 37415086 2I CTCTTGCTTT --/TC TAGTCTTTAA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 TC 0 1 357320 CASAVA_Build 8 37457222 1I GTTCATCCCC -/T CCCGCCTGTC 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 T 0 1 357321 CASAVA_Build 8 37462780 1D AATTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2969 hom 23 10 11 2 A 11 10 357322 CASAVA_Build 8 37471033 4D GTGTCAGAGT GTGA/---- GTGTGTCCAA 3070 het 3070 hom 70 27 30 19 GTGA 1 0 357323 CASAVA_Build 8 37471280 4D GCTTGTGTGT GTGA/---- GTGTGTCCGA 3070 het 3070 ref 76 40 22 16 GTGA 1 0 357324 CASAVA_Build 8 37473585 1D AAAATTGGTA C/- TAGAAAGAAG 3070 het 3070 hom 44 19 17 8 C 1 0 357325 CASAVA_Build 8 37480058 1D GCACAAAAGC A/- AAAAAAATTC 3070 hom 120 het 42 0 37 6 A 8 7 357326 CASAVA_Build 8 37481101 3D TTGAAATTCT TAA/--- TAATTTCTGA 3070 het 3070 ref 60 32 23 6 TAA 2 1 357327 CASAVA_Build 8 37489150 2D TGCAGCCTGG GC/-- AACAGAGTGA 3070 hom 114 het 43 0 36 7 GC 1 0 357328 CASAVA_Build 8 37521312 1D TAATTTATGA T/- TTTTTTTTTT 2170 het 2170 ref 25 13 6 6 T 13 12 357329 CASAVA_Build 8 37529089 1D AGACCTCTAG A/- AAAAAAAAAA 2324 het 1084 hom 29 8 11 10 A 14 13 357330 CASAVA_Build 8 37533860 1D GATTCTTTCA C/- CCCCCCCAAT 3070 het 3070 hom 27 10 15 4 C 8 7 357331 CASAVA_Build 8 37535093 1D ACATAGATAT A/- AAAATAATAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 5 4 357332 CASAVA_Build 8 37546139 1I GCACGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 A 11 12 357333 CASAVA_Build 8 37563487 1I AGACCTTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 A 12 13 357334 CASAVA_Build 8 37598942 3D TGCCCAGCTA TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 2808 hom 29 14 11 5 T 12 9 357335 CASAVA_Build 8 37614244 1D TCTGGACACT G/- GAATGACTCA 3070 het 3070 hom 34 13 11 10 G 2 1 357336 CASAVA_Build 8 37621614 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 11 0 8 3 A 13 12 357337 CASAVA_Build 8 37622186 4D CGTCTCTACT AAAA/---- AAAAATACAA 822 het 822 ref 8 5 3 0 A 9 5 357338 CASAVA_Build 8 37630014 1D ACTGGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 789 het 789 ref 34 24 3 8 T 15 14 357339 CASAVA_Build 8 37719179 1D GTCCTTTGCA C/- GGGACATGGA 3070 hom 27 het 14 0 10 4 C 1 0 357340 CASAVA_Build 8 37723805 1D CTAAATACAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 7 357341 CASAVA_Build 8 37769082 1I CCAGTACTTA -/G GGGGGCCTGA 3070 het 288 hom 20 1 18 1 G 5 6 357342 CASAVA_Build 8 37781003 4D GCTTCTCAGA CCTC/---- TTGAAAGCTT 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 CCTC 1 0 357343 CASAVA_Build 8 37829463 1D ACCCTGACTC A/- AAAAAAAAAA 1565 het 1565 ref 40 29 5 7 A 13 12 357344 CASAVA_Build 8 37841608 2D ACTTAATGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1611 hom 38 7 13 19 T 16 14 357345 CASAVA_Build 8 37843356 1D CCAAGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2793 hom 27 9 12 6 A 12 11 357346 CASAVA_Build 8 37857444 2D TATCCCTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 974 het 974 ref 33 22 4 7 A 18 16 357347 CASAVA_Build 8 37894064 3I GTACACTGAC ---/ATT GTTGTGTAAC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 ATT 0 1 357348 CASAVA_Build 8 37913463 1I ACACAAAGTA -/T TGTAAGATTC 3070 hom 132 het 54 0 43 11 T 1 2 357349 CASAVA_Build 8 37981737 3D GAGGTCACTC TCA/--- TCACCATCTT 3070 het 1933 hom 16 5 8 3 TCA 2 1 357350 CASAVA_Build 8 37998717 1I CACCCAGCTA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 T 8 9 357351 CASAVA_Build 8 38024167 1I TTTTGTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 301 hom 36 1 30 5 G 0 1 357352 CASAVA_Build 8 38050284 1D TAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 2273 hom 12 het 6 0 5 1 T 1 0 357353 CASAVA_Build 8 38068163 3D GGTCTCAAAT CTC/--- CTGCATCCTG 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 CTC 1 0 357354 CASAVA_Build 8 38083042 5D AGCGCTTTCA TTATC/----- TTATAGGGAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 TTATC 1 0 357355 CASAVA_Build 8 38099390 4I TGTGAATAAT ----/TAGA TAGATAATTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TAGA 1 2 357356 CASAVA_Build 8 38104721 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 17 2 14 1 A 11 12 357357 CASAVA_Build 8 38119150 1D ATCCTCCCTA C/- CCCCCTCCCA 2704 hom 33 het 14 0 10 4 C 6 5 357358 CASAVA_Build 8 38123671 1I TTTTTTCTTG -/T TTTTTTTTTT 2035 het 1421 hom 24 6 9 9 T 12 13 357359 CASAVA_Build 8 38125488 1D ATGGACCACT C/- CCACCCCCTC 3070 hom 72 het 28 0 24 5 C 3 2 357360 CASAVA_Build 8 38257431 1D CATTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1628 het 1628 ref 36 20 5 12 T 15 14 357361 CASAVA_Build 8 38287752 1I CCCTGATTAC -/T TTTTTTTTTT 1827 het 530 hom 24 4 9 11 T 17 18 357362 CASAVA_Build 8 38294437 1D GCTCAAACCG A/- AAAAAAAAAA 1251 het 1251 ref 33 25 3 5 A 11 10 357363 CASAVA_Build 8 38335598 1I GAACAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 8 7 T 10 11 357364 CASAVA_Build 8 38349903 1D TGTTCACTTC T/- TTTTTTTTTT 1085 het 1085 ref 37 26 3 9 T 11 10 357365 CASAVA_Build 8 38406910 5I GCATTAAGCG -----/GATCA CATTTCATTT 3070 hom 108 het 42 0 34 8 GATCA 0 1 357366 CASAVA_Build 8 38411005 1D TTGCTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 1860 het 1860 ref 31 19 6 6 T 17 16 357367 CASAVA_Build 8 38446964 2D CTAGTGGCCA AC/-- ACAGTGTTAT 3070 het 3070 ref 32 15 15 3 AC 2 1 357368 CASAVA_Build 8 38452026 2I AATAATAATA --/AT TATAGTGATT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AT 0 1 357369 CASAVA_Build 8 38452895 1I GGTGCTTTGC -/T TTTTTTTTTT 2921 het 2864 hom 34 11 12 11 T 13 14 357370 CASAVA_Build 8 38489358 10D CATGCAGTGG AGACACAGAC/---------- AGACACAGAC 3070 hom 102 het 43 0 32 13 AGACACAGAC 2 1 357371 CASAVA_Build 8 38503164 1D GAAAGCATCC T/- TTTTTTTTTT 2848 het 1370 hom 21 4 10 7 T 15 14 357372 CASAVA_Build 8 38514340 1D TTGGCTGGGT G/- GTGGTGGCTC 2155 hom 21 het 8 0 8 0 G 2 1 357373 CASAVA_Build 8 38523718 2I TTATATAAAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 23 0 14 9 T 10 12 357374 CASAVA_Build 8 38525795 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 27 2 20 5 A 12 13 357375 CASAVA_Build 8 38527127 3D TTTATTCCCA CTT/--- CTTCTTGTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 CTT 3 2 357376 CASAVA_Build 8 38550155 1I GGAGGTGAAA -/G GGGTACAGCT 3070 het 3070 hom 43 14 22 7 G 3 4 357377 CASAVA_Build 8 38555772 1I TTGAAACTTC -/T TTTTTTTTTT 2749 het 983 hom 25 6 11 8 T 14 15 357378 CASAVA_Build 8 38556436 1D GCTCAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 1944 het 1944 ref 32 17 6 9 T 17 16 357379 CASAVA_Build 8 38560877 3D CTTTGGAAAA ATT/--- ATGATAGAGG 3070 het 3070 hom 62 20 36 6 ATT 1 0 357380 CASAVA_Build 8 38563572 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1828 hom 30 7 17 7 T 13 12 357381 CASAVA_Build 8 38568255 1D GAATCCTAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 5 het 31 1 12 18 A 10 9 357382 CASAVA_Build 8 38575690 5I CACCCATCAC -----/CTAAG CTAAGCAGTG 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 CTAAG 1 2 357383 CASAVA_Build 8 38577710 3I TCTGGCCGTG ---/TCT CCAGCCACTG 3070 hom 66 het 25 0 17 8 TCT 0 1 357384 CASAVA_Build 8 38583204 8I TGAAAGTGCC --------/GGCATGTG GGCATGTGTC 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 GGCATGTG 1 2 357385 CASAVA_Build 8 38584059 1D TATTTATTTA T/- TTTAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 T 4 3 357386 CASAVA_Build 8 38586706 5D CTGAAATCTG AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 2876 hom 36 15 11 10 A 25 20 357387 CASAVA_Build 8 38589489 2D AAGCTGCCTA GC/-- TTCTTGGGGT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 GC 1 0 357388 CASAVA_Build 8 38591947 1I6M1D TGATACATGA -ACAGAAG/TACATGA- TATAGTGGCC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 N/A 0 0 357389 CASAVA_Build 8 38595833 1D TCTCATCCCA C/- CCCCCCCCAT 2005 hom 6 het 10 0 5 5 C 9 8 357390 CASAVA_Build 8 38603647 4I GTGTTCAAAT ----/AGAG AGAATTTGGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AG 1 3 357391 CASAVA_Build 8 38612872 1D CTATGATTTC T/- TTTTTTTTCT 1417 hom 21 het 14 0 8 6 T 9 8 357392 CASAVA_Build 8 38628416 1D AATTCAGGTT C/- CACCGATAAC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 C 2 1 357393 CASAVA_Build 8 38629518 4D CCAGGTCTAA TACT/---- TACTAATTGT 3070 het 3070 hom 33 15 17 3 TACT 2 1 357394 CASAVA_Build 8 38640926 20D GGAAGGAAAC AAAGAAAGAAGGAAAGAAAG/-------------------- AAAGAAAGAA 3070 hom 50 het 23 0 17 8 AAAGAAAGAAGGAAAGAAAG 2 1 357395 CASAVA_Build 8 38650854 1D CCTTGCCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 22 2 9 12 A 14 13 357396 CASAVA_Build 8 38664689 4D GATGAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 2424 het 2086 hom 19 7 6 7 AAAG 5 4 357397 CASAVA_Build 8 38666731 1D AAGGGAAAGA T/- TTTTTTTTTT 2563 het 1751 hom 18 6 7 5 T 12 11 357398 CASAVA_Build 8 38685822 10D CTCAACCACC CTCCTCCTGG/---------- CTCATTATAC 446 het 446 ref 25 12 2 13 CTCCTCCTGG 1 0 357399 CASAVA_Build 8 38686290 2D GTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 13 11 357400 CASAVA_Build 8 38686452 32D CAGCTAATAT TTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG/-------------------------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 31 11 19 5 TTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 1 0 357401 CASAVA_Build 8 38692848 1I GAAATGAAAC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 A 6 7 357402 CASAVA_Build 8 38787930 1D CCACTCCAAC T/- AGTCCCCAAG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 1 0 357403 CASAVA_Build 8 38825861 2D AATGAGCAGT AA/-- AAGTCACATG 3070 het 3070 ref 53 26 24 4 A 4 2 357404 CASAVA_Build 8 38835013 1I ATAAACAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 8 9 357405 CASAVA_Build 8 38835291 1I CACCCCCACC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 A 8 9 357406 CASAVA_Build 8 38847010 1D ATTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 15 15 7 T 12 11 357407 CASAVA_Build 8 38854123 1I CATCTCTACT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 9 10 357408 CASAVA_Build 8 38872494 1I ATTCCTGTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 T 7 8 357409 CASAVA_Build 8 38882134 1D CCCTGCCTCT A/- AAAAAAAAAA 2549 hom 24 het 11 0 9 2 A 12 11 357410 CASAVA_Build 8 38886143 1I AGCCCCTCTA -/G TGCCTCTGTG 3070 hom 78 het 31 0 26 5 G 0 1 357411 CASAVA_Build 8 38887920 1I GAACACTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 T 10 11 357412 CASAVA_Build 8 38946343 1D GAGGGCAGCG C/- CTCCTGGGGT 2746 hom 27 het 15 0 9 7 C 2 1 357413 CASAVA_Build 8 38952999 11I GAGGCAGGAG -----------/AATTGCTTGAA CCTGGGAGGT 3070 hom 50 het 22 0 20 2 AATTGCTTGAA 0 1 357414 CASAVA_Build 8 38960486 1I TTATAAAGGC -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 53 het 19 0 17 2 T 7 8 357415 CASAVA_Build 8 38963773 3D TTGCGTTAAG CTT/--- CTTCTTTTTA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 CTT 3 2 357416 CASAVA_Build 8 38975073 1D TAATCTGTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 48 het 37 1 33 3 T 9 8 357417 CASAVA_Build 8 38976005 1D TTCAGTAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 808 hom 43 3 27 13 T 15 14 357418 CASAVA_Build 8 38984850 1I CTTAATATCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 13 13 13 T 13 14 357419 CASAVA_Build 8 38990060 1I TTGTCTTAAA -/T TTTTTTGGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 6 7 357420 CASAVA_Build 8 38991501 5I CAAAAAAATC -----/TTTAG TTTAGATTAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTAG 1 2 357421 CASAVA_Build 8 38997569 1D CTGTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 13 12 357422 CASAVA_Build 8 39003500 4I AGTACCTGGG ----/TTCT TTCTTCTTCT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 TTCT 1 2 357423 CASAVA_Build 8 39007356 1D CCAAATTGTC T/- TCCAAAGTAG 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 T 2 1 357424 CASAVA_Build 8 39013050 1D CTTAAGACTT C/- CTAATCCTAG 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 C 2 1 357425 CASAVA_Build 8 39018172 1D TTGCAGAGCT C/- CTAATAAGTG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 C 2 1 357426 CASAVA_Build 8 39021259 27D AATAATTTGT CAGCCCTCACTCTCCTCCTACCCTCTC/--------------------------- CAGCCCTCAC 3070 het 3070 ref 35 18 10 12 CAGCCCTCACTCTCCTCCTACCCTCTC 2 1 357427 CASAVA_Build 8 39022247 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 2562 het 2174 hom 23 9 10 4 TA 9 8 357428 CASAVA_Build 8 39036103 1I CAGCAACAAT -/A GCCAGGTCAG 3070 hom 110 het 43 0 33 10 A 0 1 357429 CASAVA_Build 8 39056862 1I ACTTAATAAC -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 A 7 8 357430 CASAVA_Build 8 39059450 16D AAATAATGAG AAATCTCAGGACTAGA/---------------- TGAGAGTTCC 3070 het 3070 ref 52 27 25 8 AAATCTCAGGACTAGA 1 0 357431 CASAVA_Build 8 39064916 4D TTCAGTTGGG ATAA/---- ATATTGTTTC 3070 het 2972 hom 20 7 10 4 ATAA 1 0 357432 CASAVA_Build 8 39074788 1D GGCTGACAGC T/- TTTTTTTTTC 1291 het 1291 ref 46 33 3 10 T 10 9 357433 CASAVA_Build 8 39082122 4D GATATTTGAC TAGT/---- TAAGTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 TAGT 1 0 357434 CASAVA_Build 8 39086677 1I TTGGATGGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 26 14 6 T 9 10 357435 CASAVA_Build 8 39089306 3I CAAATGGATA ---/ATG AATACTGATA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 ATG 0 1 357436 CASAVA_Build 8 39090675 1D GGAATCTATA T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 37 14 9 14 T 7 6 357437 CASAVA_Build 8 39121341 1I CTTAACACAA -/T AAATGTCATA 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 0 1 357438 CASAVA_Build 8 39125158 1D TTCCTTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 31 0 21 10 T 12 11 357439 CASAVA_Build 8 39127752 4D TACAATTGCT TTAA/---- TTGAGACACT 3070 hom 102 het 36 0 35 3 TTAA 1 0 357440 CASAVA_Build 8 39129397 18D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 18 0 20 4 A 29 11 357441 CASAVA_Build 8 39134921 23I GATATTCAAG -----------------------/TGGATGACTTGGCAGTACTTTTT CATGCTGTTG 3070 hom 123 het 43 0 40 5 TGGATGACTTGGCAGTACTTTTT 0 1 357442 CASAVA_Build 8 39138677 2D TATTTTATTT TA/-- TATATATATA 981 hom 10 het 7 0 4 3 TA 10 9 357443 CASAVA_Build 8 39140152 3D GGAGGAATCA AAT/--- TTTAAGAGAC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AAT 1 0 357444 CASAVA_Build 8 39151144 1D TTCCATATGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 59 het 23 0 19 4 T 10 9 357445 CASAVA_Build 8 39162023 8I GTCTACAAAA --------/AAAAAAAC AAAAAACAAA 3070 hom 47 het 25 0 23 2 AAAAAAAC 0 1 357446 CASAVA_Build 8 39165048 4D TGTCTATCTA TCTG/---- TCTGTCTGTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TCTG 4 3 357447 CASAVA_Build 8 39167725 1I ATAATGGCCT -/C CCAGCTCCAT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 C 2 3 357448 CASAVA_Build 8 39200312 2I GTTACCATTT --/TC TTTTTTATCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TC 0 1 357449 CASAVA_Build 8 39202465 1I TGGAGTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 12 357450 CASAVA_Build 8 39208056 5I CCTCTGAAGG -----/GGATT TAAACCTCAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 GGATT 0 1 357451 CASAVA_Build 8 39300897 1I ATGGAGGCTG -/T TATCAGGATT 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 T 1 2 357452 CASAVA_Build 8 39301307 2I TGTAAAATAT --/TC TTTTTCTTCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 TC 0 1 357453 CASAVA_Build 8 39301874 2D CTCATGACTC AT/-- GTGTGTTTTT 3070 het 3070 ref 51 26 22 4 AT 1 0 357454 CASAVA_Build 8 39303152 4D GCTTATTAAG GAGA/---- GAGAGATAAG 3070 het 3070 hom 41 19 18 6 GA 5 3 357455 CASAVA_Build 8 39307199 13I AAGTAAGAAA -------------/TGTTTCAGGGGGT TGTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 TGTTTCAGGGGGT 0 1 357456 CASAVA_Build 8 39310548 1I CAACATATTG -/T TTTTTCCAAA 3070 het 3070 hom 51 19 24 8 T 5 6 357457 CASAVA_Build 8 39312872 1D AAAGTTTAAC T/- TTTTAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 T 5 4 357458 CASAVA_Build 8 39313923 1D TCTTGATGGA C/- CCTTCTAAAT 3070 het 3070 ref 47 26 19 2 C 3 2 357459 CASAVA_Build 8 39314438 1I GTCCAGCCAA -/T TTTTTTTTTT 2156 het 1705 hom 12 5 5 2 T 10 11 357460 CASAVA_Build 8 39330713 1D TTCATTTTGG C/- CAATTTCTCC 3070 het 1612 hom 20 6 14 0 C 2 1 357461 CASAVA_Build 8 39338489 1D CTACAAAGGT G/- CCAAGAATAC 3070 het 3070 ref 41 26 14 1 G 1 0 357462 CASAVA_Build 8 39339999 1I TAACATTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 6 A 10 11 357463 CASAVA_Build 8 39341318 1D AGTTGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 18 9 A 11 10 357464 CASAVA_Build 8 39345682 2D CACACACACA CG/-- CACACATGCA 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 CG 1 0 357465 CASAVA_Build 8 39370159 1I GTCAACATGC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 8 9 357466 CASAVA_Build 8 39378244 1D GAAAGACAAG A/- AAAATGTATT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 5 4 357467 CASAVA_Build 8 39386682 4I TTAAGTATTA ----/TCTC TCTCTCTCTC 2969 hom 18 het 7 0 7 0 TC 5 7 357468 CASAVA_Build 8 39397080 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 385 hom 11 1 9 1 A 11 10 357469 CASAVA_Build 8 39398588 2D AAAAAAAAAA AG/-- TGAATGCTGA 3070 hom 70 het 27 0 22 5 AG 1 0 357470 CASAVA_Build 8 39400564 1D TGATCTGTTT C/- CCTTTTAAAA 3070 hom 45 het 16 0 15 2 C 3 2 357471 CASAVA_Build 8 39402343 1D CCTATTCCTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 10 9 357472 CASAVA_Build 8 39412913 1D CCAGGAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 12 11 357473 CASAVA_Build 8 39414557 1I CAAACCTGGC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 8 9 357474 CASAVA_Build 8 39416591 1D CTTTCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 347 hom 18 2 13 3 T 15 14 357475 CASAVA_Build 8 39424690 1D GGCAAAGTGG A/- AAGAGCTTTG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 3 2 357476 CASAVA_Build 8 39429282 1D TGAAGCGCCA T/- CTTTTCTCTC 3070 hom 63 het 26 0 22 5 T 1 0 357477 CASAVA_Build 8 39436221 1D CTTAATGGTG A/- AATACTAAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 3 2 357478 CASAVA_Build 8 39436895 1I AGCAATTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 307 hom 18 1 15 2 A 11 12 357479 CASAVA_Build 8 39437728 1I TTTTTTGCAG -/C GTTTGTAAAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 0 1 357480 CASAVA_Build 8 39440352 1I GAATGGTTAA -/C GGTTACAAAA 3070 hom 36 het 15 0 12 3 C 0 1 357481 CASAVA_Build 8 39440486 3D AATACAAATA AAT/--- AATAAAGGCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AAT 2 1 357482 CASAVA_Build 8 39474720 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 10 9 357483 CASAVA_Build 8 39495011 2I TGTGGCATAT --/AC TTGTACTCAT 3070 hom 33 het 13 0 12 1 AC 0 1 357484 CASAVA_Build 8 39509831 1I TTTATACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3013 hom 25 7 8 10 T 13 14 357485 CASAVA_Build 8 39520299 2I ACAGTCCAAA --/GT CTCATCTGAG 3070 het 3070 ref 31 17 8 6 GT 0 1 357486 CASAVA_Build 8 39525360 1I TGTTTGTTGA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 7 8 357487 CASAVA_Build 8 39540989 1D TCTTTTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 806 hom 27 3 17 7 T 13 12 357488 CASAVA_Build 8 39549411 1D AAGACATGAA C/- ATGTGTATTT 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 C 1 0 357489 CASAVA_Build 8 39557365 9I AGATGCCCAC ---------/GGTCATGCT AACTGCTCCC 3070 hom 138 het 51 0 46 5 GGTCATGCT 0 1 357490 CASAVA_Build 8 39584490 1D TGCATTCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 17 15 9 T 11 10 357491 CASAVA_Build 8 39588100 1I GTGAATCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 11 357492 CASAVA_Build 8 39596250 1D CATAAAAAAA C/- AGTATCATTT 3070 het 3070 ref 39 18 17 5 C 1 0 357493 CASAVA_Build 8 39600184 1D CATGCACACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 37 4 27 6 T 14 13 357494 CASAVA_Build 8 39614944 1D TGAATTGATT A/- AAGTCAATGA 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 A 3 2 357495 CASAVA_Build 8 39617492 1I TGGCCACATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1169 hom 37 4 22 11 T 10 11 357496 CASAVA_Build 8 39626057 2I CACATACATG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 50 21 18 11 TA 7 8 357497 CASAVA_Build 8 39626499 1I TCCTTTCTCC -/T TTGTGAGGAA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 T 2 3 357498 CASAVA_Build 8 39628284 1D ACAGCACATG T/- TTTCAGGGAG 1965 hom 12 het 12 0 5 7 T 4 3 357499 CASAVA_Build 8 39628649 1D TGACAATAAA G/- GATGTTTACT 3070 hom 84 het 36 0 29 9 G 2 1 357500 CASAVA_Build 8 39631341 1I TCCATTAACA -/G TGTGCAAGCG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 G 0 1 357501 CASAVA_Build 8 39641611 3D TTTTTTTGTT GAA/--- TTTAGCTATT 3070 het 3070 ref 34 21 13 0 GAA 1 0 357502 CASAVA_Build 8 39693976 4I TAACGTATTT ----/TTAG TTATAGTTAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 TTAG 0 1 357503 CASAVA_Build 8 39696747 3D TAAATCAACA GAT/--- GATGGCTAAA 3070 het 3070 ref 52 26 24 2 GAT 2 1 357504 CASAVA_Build 8 39699679 1I TGGAGAGGAG -/A AAGGATTAGG 3070 hom 135 het 46 0 46 0 A 2 3 357505 CASAVA_Build 8 39701627 1I AAATTTAAAA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 6 7 357506 CASAVA_Build 8 39713948 1D GACTGGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2850 hom 27 13 11 4 T 12 11 357507 CASAVA_Build 8 39715062 1D ACTCTGTATC A/- AAAAAAAAAA 2261 het 903 hom 17 4 8 5 A 17 16 357508 CASAVA_Build 8 39717635 1I TACTTATCAT -/G TGTAACATAA 3070 het 3070 hom 52 23 27 2 G 0 1 357509 CASAVA_Build 8 39719424 2I ATTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 2706 het 2706 ref 28 15 9 4 A 14 16 357510 CASAVA_Build 8 39720752 1D TGAATAAATG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 A 9 8 357511 CASAVA_Build 8 39726260 2I TGTGTGTGTG --/CA TGCGTGTGTG 3070 het 670 hom 39 6 19 14 CA 0 1 357512 CASAVA_Build 8 39728190 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTGCTTTA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 5 4 357513 CASAVA_Build 8 39742597 1D ATCCTAAATG T/- TTCCTCTGTC 3070 hom 138 het 51 0 47 4 T 3 2 357514 CASAVA_Build 8 39751159 4D AATAAAAATT AATC/---- AATACCATTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 6 AATC 1 0 357515 CASAVA_Build 8 39764258 2D ACATAATATA TG/-- TATATATATT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TG 1 0 357516 CASAVA_Build 8 39775682 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTGGAG 3070 hom 50 het 19 0 17 2 T 7 6 357517 CASAVA_Build 8 39796548 1I TGGTTTTCTA -/T TTCTCTGGAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 3 357518 CASAVA_Build 8 39807928 5D AATGAAAACT CTAAA/----- CTATATCTCA 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 CTAAA 1 0 357519 CASAVA_Build 8 39809511 4D AACCACATTA TATG/---- TATGTAAGGT 3070 het 3070 hom 33 15 17 3 TATG 2 1 357520 CASAVA_Build 8 39813215 1D CTACCAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 A 12 11 357521 CASAVA_Build 8 39819923 1D CCTCAGGATG A/- AAAAATAAAG 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 A 6 5 357522 CASAVA_Build 8 39826858 4I GAAGTAAGAG ----/AGAC AGAGTCCCTG 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 AGAC 0 1 357523 CASAVA_Build 8 39827754 1I CTTGATCTGC -/T ACCCCATAAG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 0 1 357524 CASAVA_Build 8 39841230 1I CTGCAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 A 9 10 357525 CASAVA_Build 8 39841501 1D GACAATAGAA T/- ACTTCTGGGA 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 1 0 357526 CASAVA_Build 8 39844403 3D TTCTTCTTCC TCT/--- TCTTCTTCTT 2549 het 2549 ref 28 11 9 8 TCT 6 5 357527 CASAVA_Build 8 39845698 1I TAACTCCTAC -/A AAAAAAAAAA 2437 het 2437 ref 31 14 6 11 A 14 15 357528 CASAVA_Build 8 39848599 4D TCTCTTAAAA AGGT/---- AATTACAGAT 2620 het 2620 ref 31 23 6 2 AGGT 1 0 357529 CASAVA_Build 8 39855931 1I ATGGACTGAG -/C CCCATTTTGC 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 C 3 4 357530 CASAVA_Build 8 39874344 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2110 het 351 hom 20 4 6 10 A 17 18 357531 CASAVA_Build 8 39875072 1I GACATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 11 12 357532 CASAVA_Build 8 39878838 3I ATTTACCCCA ---/CTT CTTCTTCCCT 3070 hom 96 het 40 0 32 8 CTT 2 3 357533 CASAVA_Build 8 39878969 1I TATTAATCTG -/C CTTTGTCATT 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 C 1 2 357534 CASAVA_Build 8 39880856 4I TAATTTTTAC ----/TTTA TTTATTTTTT 3070 hom 30 het 13 0 11 6 TTTA 1 2 357535 CASAVA_Build 8 39883244 2I AAAGAGTTCC --/TT CTTAGATTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 0 2 357536 CASAVA_Build 8 39886394 1I TTCAGGAAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 9 10 357537 CASAVA_Build 8 39907957 1D GCTAAGGATC T/- TTTTTTTTTT 2819 het 2819 ref 52 33 8 11 T 13 12 357538 CASAVA_Build 8 39914963 6I TACAAAAAAT ------/TATCTA TCTCTATCTA 3070 het 51 hom 25 2 19 4 TATCTA 0 1 357539 CASAVA_Build 8 39915247 1D GCAATCAATG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 36 15 19 3 A 8 7 357540 CASAVA_Build 8 39916637 1I GGCCATTTCC -/A AAAAAGCCCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 5 6 357541 CASAVA_Build 8 39916709 4I ATTCATGGAA ----/AGCT AGCTGATCAT 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 AGCT 1 2 357542 CASAVA_Build 8 39919307 2D CAGAATGAGA CT/-- CTGTATAACA 3070 het 3070 ref 33 17 15 2 CT 2 1 357543 CASAVA_Build 8 39920952 7I AAGGATCCAC -------/ACTAAAT TTTGGGATTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 ACTAAAT 0 1 357544 CASAVA_Build 8 39929667 8D TGGTCTCAAA CTCCCAAC/-------- CTCAGGTGAT 3070 het 2539 hom 18 9 9 0 CTCCCAAC 1 0 357545 CASAVA_Build 8 39933437 1I CTCATAGTAG -/T TCTTGGATGG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 1 2 357546 CASAVA_Build 8 39935960 1D ATTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1685 het 137 hom 8 1 5 2 T 12 11 357547 CASAVA_Build 8 39937006 3I TCTAGATCTT ---/CTC CTACTGCTGC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 CTC 0 1 357548 CASAVA_Build 8 39942574 9D CTTAATTTGG GACTTCTAT/--------- GACTTCTATC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 GACTTCTAT 2 1 357549 CASAVA_Build 8 39951836 1D AACATTGGAG T/- TTTTTTTTTT 435 het 435 ref 22 8 3 11 T 11 10 357550 CASAVA_Build 8 39958913 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 1087 het 1087 ref 20 5 10 5 TA 8 7 357551 CASAVA_Build 8 39960540 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 9 10 357552 CASAVA_Build 8 39960730 4I TGAAAAAAAT ----/AATA AATATATGTG 3070 het 3070 hom 25 10 10 5 AATA 1 2 357553 CASAVA_Build 8 39972492 2D AAGTGACCAG AA/-- GAGTGTGAGC 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 A 2 0 357554 CASAVA_Build 8 39973685 1I TACACTGTTG -/A AAAAATGCTG 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 5 6 357555 CASAVA_Build 8 39974184 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 16 8 8 0 A 7 8 357556 CASAVA_Build 8 39980074 2I AAAAGAAAAC --/AA GAGAATATAT 1556 het 1453 hom 22 9 8 5 A 0 2 357557 CASAVA_Build 8 39981365 10I AACAACCTTC ----------/AAAAGTTGAT GAAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 AAAAGTTGAT 0 1 357558 CASAVA_Build 8 39986724 1I GGGTGGGGGG -/T ATGGACAATT 3070 hom 110 het 42 0 36 6 T 0 1 357559 CASAVA_Build 8 39990456 3I TTTTTTTTTT ---/TAA CCAATTGATA 3070 hom 91 het 36 0 30 6 TAA 0 1 357560 CASAVA_Build 8 39991834 1D TCATCTAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 35 0 32 4 A 10 9 357561 CASAVA_Build 8 39999091 1I GTCCTGCACC -/A CACTGTCTGA 3070 hom 36 het 16 0 10 6 A 0 1 357562 CASAVA_Build 8 39999581 2D GAGTAATTTT TC/-- TTTTTTTTTT 1869 het 65 hom 10 1 6 3 TC 1 0 357563 CASAVA_Build 8 40002341 1D CTTGCTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 12 9 T 12 11 357564 CASAVA_Build 8 40003364 6I GGGACTTGTA ------/AGTATT CGTATTTTTT 3070 het 2826 hom 30 9 13 8 AGTATT 0 1 357565 CASAVA_Build 8 40007743 3I AGGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AGG 0 1 357566 CASAVA_Build 8 40008713 4I TGACAGGAAG ----/AGAA AGAGAGAGAG 3070 hom 77 het 27 0 25 2 AGAA 0 1 357567 CASAVA_Build 8 40009571 4D ATAATCATAT AATA/---- AATAATTATG 3070 het 2822 hom 18 7 9 2 AATA 2 1 357568 CASAVA_Build 8 40012066 2D CTAATAGTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 12 10 357569 CASAVA_Build 8 40013023 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 10 9 357570 CASAVA_Build 8 40024800 4D GAATCCTAGT TTGA/---- TTGATTAATG 3070 het 3070 ref 34 23 10 4 TTGA 2 1 357571 CASAVA_Build 8 40028326 1I GAGGAGCATG -/T TGAGGGGGGC 3070 het 3070 hom 50 19 18 13 T 1 2 357572 CASAVA_Build 8 40028417 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 867 het 867 ref 38 20 3 16 T 12 11 357573 CASAVA_Build 8 40030558 3I ATGGAGAAAG ---/ATA ATAATAAATG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 ATA 2 3 357574 CASAVA_Build 8 40039423 7I GGCCGAGGGG -------/GGCAAAT GGCAAATCAC 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 GGCAAAT 1 2 357575 CASAVA_Build 8 40039642 2D CAGAGTGAAA CT/-- CTGTCTTGAA 3070 het 3070 hom 27 11 16 7 CT 2 1 357576 CASAVA_Build 8 40041031 2D CATTAAAACT GA/-- GAACACAGAC 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 GA 2 1 357577 CASAVA_Build 8 40041469 1I CAACAAGAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 A 8 9 357578 CASAVA_Build 8 40041686 2D TCTTCATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2535 hom 28 7 13 9 A 13 11 357579 CASAVA_Build 8 40042534 40D AAAAAAATGT TTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------------- TATATATATA 3070 hom 27 het 8 0 10 0 TTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 357580 CASAVA_Build 8 40072372 1D TCAGCTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1017 hom 31 4 17 10 T 15 14 357581 CASAVA_Build 8 40078416 1D ATACATTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 T 11 10 357582 CASAVA_Build 8 40080397 4I ATATCTCTCT ----/CTGC CTGCCTACCT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CTGC 1 2 357583 CASAVA_Build 8 40083796 1D AAAAAACCCA T/- TTTTTTAGTT 3070 hom 105 het 37 0 35 3 T 7 6 357584 CASAVA_Build 8 40094843 1I ATACTTTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 130 hom 20 1 15 4 T 9 10 357585 CASAVA_Build 8 40095219 90D CCTCGTGATC CACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCCAATACTTTCTTAACTATAGTCTGTGTGGCTTA/------------------------------------------------------------------------------------------ CAGTCTAAGT 1754 het 1754 ref 10 21 5 5 CACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCCAATACTTTCTTAACTATAGTCTGTGTGGCTTA 1 0 357586 CASAVA_Build 8 40097495 1I GCCTTCAGGC -/G GGGGGGAGGG 3070 het 36 hom 28 2 22 4 G 6 7 357587 CASAVA_Build 8 40099943 1D TCTGGGAGAT A/- AAAAAAGTGA 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 A 7 6 357588 CASAVA_Build 8 40100013 1D TCAAGAAATA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 7 6 T 7 6 357589 CASAVA_Build 8 40105111 2D GTGTGTGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 32 14 14 5 GT 6 5 357590 CASAVA_Build 8 40118819 1D TTGACTTTTT A/- ATCCAATTTG 3070 hom 27 het 14 0 10 4 A 2 1 357591 CASAVA_Build 8 40139293 2D CACTAAAAAC TT/-- TGTTTGCTTT 3070 hom 144 het 52 0 48 8 T 3 1 357592 CASAVA_Build 8 40140679 4I TAAATAAATT ----/AATA AATAAACAGA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AATA 1 2 357593 CASAVA_Build 8 40150260 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 409 hom 22 1 17 4 A 15 16 357594 CASAVA_Build 8 40162627 1D AGCCTAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1346 hom 21 8 11 2 T 15 14 357595 CASAVA_Build 8 40174999 1I TTTTACATAT -/G TATCTTTCCC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 0 1 357596 CASAVA_Build 8 40180271 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1532 het 126 hom 14 1 8 5 T 17 16 357597 CASAVA_Build 8 40199878 1I CTTCTTTTTC -/A AGATTGTTTG 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 1 2 357598 CASAVA_Build 8 40247714 2D GGATAACTAC AT/-- ATGTTTCTAT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 AT 2 1 357599 CASAVA_Build 8 40254363 1I ACTTGCGGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 9 10 357600 CASAVA_Build 8 40255645 2D TAAATTGAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 24 7 14 3 TA 6 5 357601 CASAVA_Build 8 40258710 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2029 het 1115 hom 23 6 7 10 T 16 15 357602 CASAVA_Build 8 40260096 1D AAGTAACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 13 12 T 15 14 357603 CASAVA_Build 8 40260841 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1142 hom 16 4 8 4 A 14 15 357604 CASAVA_Build 8 40266219 11D AATTCAATCA GATTGAGCCCT/----------- GGTGTCACCC 3070 het 3070 ref 38 25 12 1 GATTGAGCCCT 1 0 357605 CASAVA_Build 8 40267759 1I ATAGAGCAAA -/T TTTTTTTATC 2553 het 2553 ref 27 16 8 3 T 7 8 357606 CASAVA_Build 8 40275946 1I CCATTCTTTA -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 T 6 7 357607 CASAVA_Build 8 40338278 1D CCATGAACAT G/- TTTGGCTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 G 1 0 357608 CASAVA_Build 8 40340385 1D TCTGCAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 14 17 19 A 17 16 357609 CASAVA_Build 8 40344686 1I AGAAAATGGA -/T TGTAGTGTTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 1 2 357610 CASAVA_Build 8 40362652 2I GCTAATTTTG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 62 het 33 0 20 13 T 9 11 357611 CASAVA_Build 8 40374555 1D AAGTTAACAC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 7 6 357612 CASAVA_Build 8 40379824 5I2M1I TAGTGAGTTA -----AG-/TCTAGAGA TTCCCTGAAG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 N/A 0 0 357613 CASAVA_Build 8 40384703 3D CAAACAAACA AAC/--- AAAAAAACGA 3070 hom 123 het 47 0 40 8 AAC 1 0 357614 CASAVA_Build 8 40388515 1I TTTCCTTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 9 10 357615 CASAVA_Build 8 40398165 4D TCTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2933 hom 5 het 19 0 9 10 T 20 16 357616 CASAVA_Build 8 40400053 2D AGTGATGCAT AG/-- ACTGAATCCA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AG 1 0 357617 CASAVA_Build 8 40401924 5D AGTTTGTGTT TGTGC/----- TGCATCTGCA 3070 hom 147 het 53 0 48 10 TGTGC 1 0 357618 CASAVA_Build 8 40418634 1D TCTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 271 hom 29 1 21 7 T 13 12 357619 CASAVA_Build 8 40434052 2I TCCATCAGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 27 8 T 12 14 357620 CASAVA_Build 8 40435591 1D ATAACCAAAC A/- GGGGGGGAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 0 357621 CASAVA_Build 8 40440954 3D AAAACTATGA TAT/--- TATAATAGTT 3070 hom 82 het 33 0 27 7 TAT 2 1 357622 CASAVA_Build 8 40446708 12D CTGTGAGCAC CAGGAGGGCAGG/------------ CAGGAGGGCA 3070 hom 78 het 36 0 26 12 CAGGAGGGCAGG 2 1 357623 CASAVA_Build 8 40447786 2I GTGAAAGTGT --/GA GAGGATCACT 3070 het 3070 hom 41 13 23 5 GA 1 2 357624 CASAVA_Build 8 40451167 2D CAATGCCTGG GC/-- GCATTACTTG 3070 hom 141 het 55 0 46 11 GC 2 1 357625 CASAVA_Build 8 40458354 1I ATAACAGATA -/G ACCTTCCAAA 3070 hom 154 het 59 0 52 7 G 0 1 357626 CASAVA_Build 8 40462645 8I ATGTGCACAC --------/AGGACCAA AGAACCAAAG 3070 hom 90 het 36 0 27 10 AGGACCAA 0 1 357627 CASAVA_Build 8 40491497 1D GTTCTTTTTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 8 7 357628 CASAVA_Build 8 40495542 4I TGCCTTAATA ----/TCCC TCGGGAACAT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 TCCC 0 1 357629 CASAVA_Build 8 40496023 1D AGCACCAAGT G/- GGTGTTCTCC 3070 hom 90 het 35 0 28 7 G 3 2 357630 CASAVA_Build 8 40500542 1D ATGAAGCTGG T/- TTTTTTTATA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 8 7 357631 CASAVA_Build 8 40501209 1D AGTCAACAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 A 10 9 357632 CASAVA_Build 8 40501523 4I ACTAAAGAAC ----/AAGA AGGAATGTCA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 AAGA 0 1 357633 CASAVA_Build 8 40508070 1I CAAACATCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 A 9 10 357634 CASAVA_Build 8 40509091 2D CTGTATATAT AA/-- AATATCTCCA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 4 2 357635 CASAVA_Build 8 40509373 1D AGAAGAATAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 10 9 357636 CASAVA_Build 8 40512344 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 508 hom 33 3 24 6 A 15 14 357637 CASAVA_Build 8 40539165 1D TTCTGCTGTT A/- TAATTTGAGT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 1 0 357638 CASAVA_Build 8 40544399 1I AAGAAAGAAC -/A AAAAAAAAAC 2757 het 2637 hom 20 9 7 4 A 9 10 357639 CASAVA_Build 8 40547984 1I GTGCAACTTA -/G GAAAAATAGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 1 2 357640 CASAVA_Build 8 40568288 1D AAAGATGCAG A/- AAAAACAGCC 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 6 5 357641 CASAVA_Build 8 40574736 1I GCTCCCTGAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 8 9 357642 CASAVA_Build 8 40575504 1I CCAAATGCAG -/T TTTTTAGATG 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 T 5 6 357643 CASAVA_Build 8 40601958 3D ATAGTGTGAG TCT/--- TACACACCCT 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 TCT 1 0 357644 CASAVA_Build 8 40602520 1D GGCGCGGTGG A/- ATCATGCCTG 3070 hom 48 het 18 0 16 3 A 2 1 357645 CASAVA_Build 8 40602825 1D TGGAAGTCTT G/- GGGGGTAAAT 2060 het 2060 ref 21 10 6 5 G 6 5 357646 CASAVA_Build 8 40605684 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1093 hom 34 7 17 10 T 13 12 357647 CASAVA_Build 8 40606045 1D TATTGGGAAA T/- TTTTTTTTGA 2630 het 770 hom 16 6 6 4 T 9 8 357648 CASAVA_Build 8 40606073 1I TGCAATGGAG -/T TTTTTTTTTT 1784 het 1241 hom 12 3 4 5 T 10 11 357649 CASAVA_Build 8 40607656 1I GAAATGCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 64 het 36 0 29 7 T 9 10 357650 CASAVA_Build 8 40607869 2I TTGTTTATTT --/AA GACAGAGTCT 3070 het 3070 hom 37 13 15 9 A 0 2 357651 CASAVA_Build 8 40608190 1D GCTTAGAAAA G/- CTGAGCAACT 3070 het 3070 hom 52 18 30 4 G 1 0 357652 CASAVA_Build 8 40609784 1D TTCATTACAG A/- AGAAATGCGA 3070 het 3070 ref 54 24 24 6 A 2 1 357653 CASAVA_Build 8 40617303 1I CAGAAAAAAG -/A AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 5 A 7 8 357654 CASAVA_Build 8 40620466 1D GTGTGTGTGC A/- AAAAAAAAAA 2486 het 417 hom 26 6 7 13 A 13 12 357655 CASAVA_Build 8 40631497 1I AGTATTTAAG -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 6 7 357656 CASAVA_Build 8 40634042 1I CAGATGTGCT -/G GGCAACAAAT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 G 2 3 357657 CASAVA_Build 8 40638820 1D GCTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 22 1 8 13 T 11 10 357658 CASAVA_Build 8 40674194 4I CTGCAAGCTG ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TC 5 7 357659 CASAVA_Build 8 40708099 4I ATGATCAGAC ----/AGAG AGAGAGAGAG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AG 6 8 357660 CASAVA_Build 8 40708963 5D AAGGGACCTT AGAAG/----- AGTGCCTACA 3070 hom 78 het 27 0 25 4 AGAAG 1 0 357661 CASAVA_Build 8 40713494 2I GGTGGAAGAA --/AC AGAGATGAGG 3070 hom 157 het 55 0 53 2 AC 0 1 357662 CASAVA_Build 8 40713595 1D CTGGGCAGGC T/- TCATTGACCA 3070 hom 135 het 51 0 46 6 T 2 1 357663 CASAVA_Build 8 40748018 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 8 9 357664 CASAVA_Build 8 40750186 1I TGGCATCTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 700 hom 30 2 22 6 A 10 11 357665 CASAVA_Build 8 40769453 4D GAAAAGAAAA TAAC/---- TAAGCAATCA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 TAAC 1 0 357666 CASAVA_Build 8 40775588 1I TGGAAGGGGC -/T TTTTTTCAGG 3070 hom 59 het 24 0 18 6 T 6 7 357667 CASAVA_Build 8 40777029 4D AGAAACTAAT AAGA/---- AAGAACATAA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 AAGA 2 1 357668 CASAVA_Build 8 40777347 1I TCAAAAAAAA -/T CTCAAGAAAC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 0 1 357669 CASAVA_Build 8 40784937 1I AAGAAAATAA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 8 9 357670 CASAVA_Build 8 40785956 21D AAGATGGGAA CAATGGACATAAAGATGGGAT/--------------------- CAACAGACAC 3070 hom 121 het 40 0 37 8 CAATGGACATAAAGATGGGAT 1 0 357671 CASAVA_Build 8 40797285 2I GGAGTGCATG --/TA TGTGTGTATG 3070 hom 156 het 64 0 51 13 TA 0 1 357672 CASAVA_Build 8 40797440 2D47M3D3M1I TGCATATGCA TGTGTATATGTGTTTATGGGTGTGTCTGTGTGTGTATATATGTGTGGGTGTGTGT-/--TGTAGGTGTGTTTACGTGTGTGTATGTATGTGCATATGTGTGGGGAT---TGTC ATGTGTATGT 3070 het 3070 ref 19 52 12 4 N/A 0 0 357673 CASAVA_Build 8 40798117 4I AACGCTTAGC ----/AAGT AAGAAAAATA 3070 hom 96 het 41 0 33 8 AAGT 0 1 357674 CASAVA_Build 8 40800382 14D CACACACACA CGTGTGTGTGTGTG/-------------- CGTGTGTGTT 3070 hom 54 het 20 0 18 5 CGTGTGTGTGTGTG 1 0 357675 CASAVA_Build 8 40809918 1D TTTAGAGGGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 60 het 26 0 20 7 A 9 8 357676 CASAVA_Build 8 40813383 1I GATACAACTC -/T TAAAAATGTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 357677 CASAVA_Build 8 40844001 1I TCTAAGCCAT -/C CTGGGCCACG 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 C 1 2 357678 CASAVA_Build 8 40861102 1I TGACATTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 9 11 T 12 13 357679 CASAVA_Build 8 40863555 1D ATTTAAAAAG C/- CCAGTTTTGA 3070 het 3070 hom 39 11 22 6 C 3 2 357680 CASAVA_Build 8 40871832 2D AGTGGTTAAA AG/-- AGAGAGAGAT 3070 het 3070 ref 42 17 18 8 AG 5 4 357681 CASAVA_Build 8 40882576 1D CCACAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 11 10 357682 CASAVA_Build 8 40884002 1D TGATGCTGAA G/- GTCTTGAGTG 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 G 2 1 357683 CASAVA_Build 8 40891504 4D CCTGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 2525 hom 23 8 11 6 AAAT 4 3 357684 CASAVA_Build 8 40901850 1I TGGTAGAGAT -/G GGGGGGGTCT 3070 het 2893 hom 21 8 11 2 G 7 8 357685 CASAVA_Build 8 40924112 4I AGGAAGGAAA ----/GAAG GAAGGAAGGA 2795 het 2795 ref 27 10 13 4 GAAG 3 4 357686 CASAVA_Build 8 40928082 5D AAGAAACAAA TGTAT/----- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 21 8 8 5 TGTAT 1 0 357687 CASAVA_Build 8 40938273 1I CTTTCATGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 9 10 357688 CASAVA_Build 8 40943589 1I CATCGCAATT -/A AAAGAACTAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 3 4 357689 CASAVA_Build 8 40955961 1I ATATATTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 T 10 11 357690 CASAVA_Build 8 40985479 4D AGATGAACAC ATAG/---- ATAGGTAGTT 3070 het 3070 ref 36 16 17 4 ATAG 2 1 357691 CASAVA_Build 8 41004781 1I AGACTGTTCT -/C CTGAGCTCTA 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 C 1 2 357692 CASAVA_Build 8 41009083 3I CCCAAGACAA ---/TTC TTCTTCTTCC 3070 het 2644 hom 28 6 18 4 TTC 3 4 357693 CASAVA_Build 8 41014861 1D TATTTTGCCC T/- TTTTTTTTTT 2336 het 2336 ref 29 12 5 12 T 13 12 357694 CASAVA_Build 8 41016395 1D AATACCATGC T/- GTTTTGGTGA 3070 het 3070 hom 28 12 13 5 T 1 0 357695 CASAVA_Build 8 41026865 4D ATTCAGAAGG TTGA/---- TTGATTATTA 3070 het 3070 ref 41 22 18 4 TTGA 2 1 357696 CASAVA_Build 8 41028067 1D AGCAACAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 11 10 357697 CASAVA_Build 8 41032503 1I CCATATTGCA -/T GGTAAATAAG 3070 het 3070 hom 49 21 24 4 T 0 1 357698 CASAVA_Build 8 41042498 1I TAAATCAGAT -/A AACTCGAGCG 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 A 2 3 357699 CASAVA_Build 8 41047745 2D TAAGGGAAAA AG/-- AGTATTTTTT 3070 het 3070 hom 35 18 15 3 AG 2 1 357700 CASAVA_Build 8 41049783 2D AGGTTAAGAT AA/-- AAGTTTGTGG 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 A 4 2 357701 CASAVA_Build 8 41057719 1I AGATAGATGG -/A AAAAAAAAAA 1945 het 1945 ref 19 11 5 3 A 10 11 357702 CASAVA_Build 8 41058598 1I TGCAAATTCT -/C ACCCCCAAAG 3070 het 3070 ref 33 20 11 2 C 0 1 357703 CASAVA_Build 8 41066303 1D AGCTCACTGC A/- AATCTCTGCC 3070 hom 66 het 27 0 21 6 A 3 2 357704 CASAVA_Build 8 41069615 1D AGGAGGCTCC G/- GTTCGGTTAA 3070 het 3070 hom 37 15 17 6 G 2 1 357705 CASAVA_Build 8 41083333 1D ACCACATCTC A/- AAAAAAAAAA 2210 het 2210 ref 30 16 9 5 A 12 11 357706 CASAVA_Build 8 41087221 1D GGCGTGTGCA T/- TAGGAGGCTG 3070 hom 92 het 39 0 29 11 T 2 1 357707 CASAVA_Build 8 41091951 1I5M1I CTGGGCAACA -AGTCA-/GAGTCAG ACCCTGCTCA 3070 hom 48 het 18 0 14 6 N/A 0 0 357708 CASAVA_Build 8 41093334 1D GTACATATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 10 9 357709 CASAVA_Build 8 41099304 1D GTCTCTTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 128 het 50 0 43 7 T 10 9 357710 CASAVA_Build 8 41101897 3D AGGCTCAGGT CTC/--- CTCCGTGCAC 3070 het 3070 ref 35 17 13 7 CTC 2 1 357711 CASAVA_Build 8 41105805 5I ACATGGCACA -----/GAGAC GAGACGCTTC 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 GAGAC 1 2 357712 CASAVA_Build 8 41109763 1D GAAATGATAA G/- GGGGATGTCA 1731 het 1731 ref 12 8 4 1 G 5 4 357713 CASAVA_Build 8 41110023 3D CAGAGATACA AAG/--- AAGAGCTGGT 3070 het 3070 ref 19 9 9 2 AAG 2 1 357714 CASAVA_Build 8 41110437 15D GTATTGAAGG AACGTACCTCAAAAT/--------------- AACAAGAGCC 3070 het 3070 ref 36 34 10 2 AACGTACCTCAAAAT 1 0 357715 CASAVA_Build 8 41114813 1D TTGTTGCAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 T 10 9 357716 CASAVA_Build 8 41120165 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 A 9 10 357717 CASAVA_Build 8 41128019 1D TGTAAGCAAA T/- TTTTTTTTTT 1243 het 1243 ref 20 10 4 6 T 15 14 357718 CASAVA_Build 8 41144851 1I AGTTTTAATG -/A AAAAATCAAC 3070 het 3070 hom 30 11 9 10 A 5 6 357719 CASAVA_Build 8 41149345 2I CTGTGAGCTG --/CA GAGACGTATG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CA 0 1 357720 CASAVA_Build 8 41195456 4I TCATCACTTT ----/AGTC AGTCATGGAA 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 AGTC 1 2 357721 CASAVA_Build 8 41234232 1D CAGTTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 1616 het 1616 ref 38 25 5 8 T 12 11 357722 CASAVA_Build 8 41248060 1I AGGGAGTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 A 11 12 357723 CASAVA_Build 8 41249614 2D AGAAAAGGGT AG/-- ACATCTAATA 3070 het 3070 ref 44 24 19 3 AG 1 0 357724 CASAVA_Build 8 41250064 1D CTACTCAGGA G/- GGCTGAGGCA 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 G 3 2 357725 CASAVA_Build 8 41262227 1D GTCGTTTCCT A/- AAAAGAAATG 2993 het 2993 ref 20 10 9 1 A 5 4 357726 CASAVA_Build 8 41269314 1D TCTTCCCAGG C/- CCTGGGAAGA 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 C 3 2 357727 CASAVA_Build 8 41272206 1I AGGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1419 hom 30 7 12 11 A 15 16 357728 CASAVA_Build 8 41272801 1I AGACTGCAGT -/G CCAGGTCCTC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 0 1 357729 CASAVA_Build 8 41275092 1D AATTACACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 8 T 11 10 357730 CASAVA_Build 8 41281119 1D TATCAAGCAG C/- CTGGAGCTTA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 C 2 1 357731 CASAVA_Build 8 41282850 1I TTTGCAGGGG -/A AAAAATGTCA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 A 5 6 357732 CASAVA_Build 8 41297228 1I TCCCTTTCTA -/C CCCCCCTCTC 2147 hom 16 het 8 0 6 2 C 6 7 357733 CASAVA_Build 8 41302132 5D TGAGCCACAG AAGGA/----- AAGACTAGAA 3070 het 3070 hom 41 17 19 7 AAGGA 1 0 357734 CASAVA_Build 8 41304235 4D ACATACACAT ACAC/---- ACATGCACAC 3070 het 3070 ref 69 35 26 10 AC 3 1 357735 CASAVA_Build 8 41314666 2D AGAAGGCAGT CA/-- CAGAGTATGT 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 CA 2 1 357736 CASAVA_Build 8 41320647 1I CCCAGCTCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 8 9 357737 CASAVA_Build 8 41324660 1I AAAGAAAGAG -/A ATAGCTCTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 1 2 357738 CASAVA_Build 8 41327120 22I AGGCCCAATT ----------------------/GGAAAATCCCAAAGTTAATTCA AAGTCAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 5 GGAAAATCCCAAAGTTAATTCA 0 1 357739 CASAVA_Build 8 41342872 1D ACCTGGGGGG A/- TGGAGGTTGC 3070 hom 72 het 25 0 24 1 A 1 0 357740 CASAVA_Build 8 41350566 1I TGTTCACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 30 2 20 8 A 11 12 357741 CASAVA_Build 8 41351986 2I ACACACAGCT --/AC ACACACACAC 3070 hom 93 het 40 0 32 8 AC 6 7 357742 CASAVA_Build 8 41359950 1D GTGGAGTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 9 8 357743 CASAVA_Build 8 41369684 6D AGAGGGAGAG AGAGAC/------ AGAGACAGAG 3070 hom 75 het 36 0 26 10 AGAGAC 4 3 357744 CASAVA_Build 8 41373599 2D ACTTAAAAAA AT/-- ATATATATAT 1565 hom 11 het 7 0 5 2 AT 8 7 357745 CASAVA_Build 8 41379858 1D GTATCTTATG A/- ATGACACATT 3070 hom 62 het 26 0 20 6 A 2 1 357746 CASAVA_Build 8 41386514 4I TCGTAGTGTG ----/GTTA GTTAGTTACT 3070 hom 135 het 55 0 45 10 GTTA 2 3 357747 CASAVA_Build 8 41406013 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 8 9 357748 CASAVA_Build 8 41407175 1D CTTTATACGT A/- AAAAAAGAGT 3070 hom 90 het 34 0 30 5 A 7 6 357749 CASAVA_Build 8 41416126 1D CTATGGGAAT G/- GGGGGGCCTT 3070 hom 93 het 34 0 31 4 G 7 6 357750 CASAVA_Build 8 41426854 1D GGAGTGCAGT G/- GCGCGACATC 3070 hom 24 het 10 0 9 2 G 2 1 357751 CASAVA_Build 8 41427370 1D35M3D TTTTTCAGGA TTTTTTTCTTTATCTTTGATTTTTTGTAGTTTGAATATA/-TTTTTTCTTTATCTTTGATTTTTCGTAGTTTGAAT--- ATAATGTGCC 3070 hom 126 het 37 0 43 4 N/A 0 0 357752 CASAVA_Build 8 41428277 2D TCTTTTAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 16 6 T 14 12 357753 CASAVA_Build 8 41428525 1I ACTTTTGGTA -/T TCCCATTATA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 1 2 357754 CASAVA_Build 8 41432235 11D GGGAGGAGAG AAAAAAAAGAC/----------- GAAAAGAAAG 3070 hom 90 het 36 0 34 6 AAAAAAAAGAC 1 0 357755 CASAVA_Build 8 41444147 1D AGAATTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 185 hom 27 1 13 13 T 15 14 357756 CASAVA_Build 8 41452010 1D GGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 48 5 21 22 T 17 16 357757 CASAVA_Build 8 41452376 1I TCTTTTCCCA -/T TTTTTAATTG 3070 hom 144 het 54 0 49 5 T 5 6 357758 CASAVA_Build 8 41465966 4D ATGAATGGAT AAAC/---- AAACTGTGGG 3070 hom 117 het 45 0 38 9 AAAC 2 1 357759 CASAVA_Build 8 41468352 2D GCAAAACTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 800 hom 40 9 15 16 A 16 14 357760 CASAVA_Build 8 41479883 1D TAAAGTTTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 30 1 20 9 A 13 12 357761 CASAVA_Build 8 41491014 1I CAAAATTCTC -/T TAAGGACCTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 1 2 357762 CASAVA_Build 8 41496623 1D GTTAGGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 11 10 357763 CASAVA_Build 8 41515363 3I ATCAACCCCC ---/TTG TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 TTG 0 1 357764 CASAVA_Build 8 41521428 1D TTTGCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 A 12 11 357765 CASAVA_Build 8 41524620 4I TTGTTAAGAC ----/AAAG AAAACCACTC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 AAAG 0 1 357766 CASAVA_Build 8 41527800 9D ACCATGCCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAGAA 3070 het 1774 hom 20 5 12 7 A 16 7 357767 CASAVA_Build 8 41528305 1D CAGGGGGGGG T/- GGTGGGTGGA 2247 het 2211 hom 12 6 6 0 T 1 0 357768 CASAVA_Build 8 41531659 5D GAAAACAATA ATTAC/----- ATTAATCAGT 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 ATTAC 1 0 357769 CASAVA_Build 8 41532300 4I GCACTGCAGA ----/TATT TATTTTCTGT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TATT 1 2 357770 CASAVA_Build 8 41537907 1I GCTATGATTG -/T TATCACCGCA 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 T 1 2 357771 CASAVA_Build 8 41539513 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 707 hom 14 2 10 2 A 7 8 357772 CASAVA_Build 8 41540855 1D TAGACAACAA G/- GGAAATCAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 4 G 3 2 357773 CASAVA_Build 8 41548744 6I TGAAGTGAGT ------/CCCTAA CATATGAGCG 3070 het 3070 hom 38 11 21 6 CCCTAA 0 1 357774 CASAVA_Build 8 41572368 4D CTTGTATATC TCTT/---- TCTTTCTCTC 3070 het 3070 hom 25 11 12 4 TCTT 2 1 357775 CASAVA_Build 8 41577817 1D AGCATTGCTT A/- AGGATGGACT 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 A 2 1 357776 CASAVA_Build 8 41578634 2I CAGTGGCCCA --/TG AATGTATTTA 3070 het 2064 hom 26 7 17 2 TG 0 1 357777 CASAVA_Build 8 41585496 1D TGAATCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 T 11 10 357778 CASAVA_Build 8 41587728 1I CATGGCGAAA -/C CCTGTCTCTA 2153 het 2153 ref 11 6 5 0 C 2 3 357779 CASAVA_Build 8 41596991 4I GGGCTGCTGC ----/AGGG AGGGAGGCAC 3070 het 2875 hom 30 13 14 3 AGGG 1 2 357780 CASAVA_Build 8 41599704 2D ATTTATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 37 20 15 3 AC 6 5 357781 CASAVA_Build 8 41600462 4I TTGTGGTTCT ----/CAGA CAGACAGCCT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 CAGA 1 2 357782 CASAVA_Build 8 41607257 1I CCCAGTCCCT -/A ACTGAGAAGG 2106 het 1864 hom 22 8 7 7 A 1 2 357783 CASAVA_Build 8 41607544 27D CTGGGGCACA CAGGCACGCACAGTCCCAACCCTGCCT/--------------------------- CAGGCACGCA 3070 hom 42 het 21 0 14 8 CAGGCACGCACAGTCCCAACCCTGCCT 2 1 357784 CASAVA_Build 8 41618977 1I GCCCAATGAT -/A ACAGAGAGTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 A 1 2 357785 CASAVA_Build 8 41624119 1I CGGTTTCCCC -/G GGGTCTATTT 2211 het 1722 hom 20 7 5 8 G 3 4 357786 CASAVA_Build 8 41631739 14D CAATTTATCC ACAGCAGAGTCTAT/-------------- ACAGCTTCAG 3070 het 3070 ref 34 18 11 8 ACAGCAGAGTCTAT 1 0 357787 CASAVA_Build 8 41662321 1D TTTTATGTTA T/- TTTTTTTAGA 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 T 8 7 357788 CASAVA_Build 8 41673760 1D TGCAGACCCG C/- CCCCCTTCTC 3070 hom 65 het 32 0 21 11 C 6 5 357789 CASAVA_Build 8 41686808 1I GAAGCAGCGC -/A ATGGGTTTAC 3070 het 3070 hom 27 13 10 4 A 1 2 357790 CASAVA_Build 8 41708256 1D CTTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1400 het 1400 ref 28 20 3 5 T 12 11 357791 CASAVA_Build 8 41712635 1I TGTGTGTGTA -/G GGGAGAGGGG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 3 4 357792 CASAVA_Build 8 41714878 8I GATGAGAAGT --------/GTATCTGA GTTTAGATTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 GTATCTGA 0 1 357793 CASAVA_Build 8 41716838 1D TTGTTTTTGA T/- TTTTTTTTTT 1198 het 13 hom 18 1 7 10 T 16 15 357794 CASAVA_Build 8 41717131 1D CACCACGCCC A/- ATTGCCTGCT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 A 2 1 357795 CASAVA_Build 8 41721212 2D ATTTCTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1302 het 37 hom 12 1 3 8 T 18 16 357796 CASAVA_Build 8 41721767 4D GCGTGAGAAA ACAG/---- ACAGAGACAG 3070 hom 78 het 28 0 25 3 ACAG 2 1 357797 CASAVA_Build 8 41725710 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 A 13 14 357798 CASAVA_Build 8 41727241 1D ACATTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 18 13 T 11 10 357799 CASAVA_Build 8 41729474 1I CACACACAGG -/C CCCCCCCCCA 2462 het 211 hom 21 1 9 11 C 9 10 357800 CASAVA_Build 8 41730450 2I GTGACTCTCG --/CC CCCCTACCTG 3070 het 3070 hom 45 21 15 9 C 4 6 357801 CASAVA_Build 8 41737653 3D TGGAACCTGT GAA/--- GGTGACCTTA 3070 het 3070 ref 42 24 16 4 GAA 1 0 357802 CASAVA_Build 8 41737881 2D CACACAGATT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 74 28 29 18 CA 8 7 357803 CASAVA_Build 8 41740843 1D GTCATGTGCA T/- TGCATGCACC 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 2 1 357804 CASAVA_Build 8 41742087 1I ACACCTGGCT -/A AATTTCTTTA 3067 het 3067 ref 30 15 8 7 A 2 3 357805 CASAVA_Build 8 41750716 11D AAATAGAACC AGAATTCCTAA/----------- AGAACAAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 14 5 AGAATTCCTAA 1 0 357806 CASAVA_Build 8 41768592 1I GAGAAGGGCT -/G GGGGTCAGAA 3070 hom 45 het 19 0 15 4 G 4 5 357807 CASAVA_Build 8 41788218 1D CCACCGCCTT C/- CCCCTCAGTC 3070 hom 109 het 40 0 34 6 C 5 4 357808 CASAVA_Build 8 41804361 10D CCTCATATAT ACACACTCAC/---------- ACACACTCAC 3070 hom 100 het 41 0 33 12 ACACACTCAC 2 1 357809 CASAVA_Build 8 41804410 2I CACACACATC --/CA CACACACGCA 3070 hom 86 het 49 0 27 22 CA 3 4 357810 CASAVA_Build 8 41872005 1I3M4D CCTGAATCCA -GAGTTCA/GGAG---- GCATCTCCGA 3070 hom 96 het 32 0 32 2 N/A 0 0 357811 CASAVA_Build 8 41877457 1D CTGATCATAT A/- ACCAAACATT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 A 2 1 357812 CASAVA_Build 8 41894696 1D TTCCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1301 het 1301 ref 21 9 4 8 T 19 18 357813 CASAVA_Build 8 41898326 5D CACGGTGGCT CACGC/----- CTGTAATCCC 3070 hom 69 het 26 0 23 5 CACGC 1 0 357814 CASAVA_Build 8 41906863 5D TTCACGGCCC TCATT/----- TCAACAGCTT 3070 hom 45 het 16 0 15 3 TCATT 1 0 357815 CASAVA_Build 8 41925470 1D TACAGTAAGT A/- AACGGCACAT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 A 3 2 357816 CASAVA_Build 8 41931699 1I AATTTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 104 hom 38 1 30 7 A 10 11 357817 CASAVA_Build 8 41935827 2I CAGAGCCAGA --/CT CTGTCTCGAA 1171 het 228 hom 14 1 7 6 CT 1 2 357818 CASAVA_Build 8 41946777 4D GTGTTTATTA TCTG/---- TCTGTTTGTG 3070 hom 117 het 40 0 40 4 TCTG 2 1 357819 CASAVA_Build 8 41948286 1D GAACAGACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 129 hom 27 1 13 13 T 15 14 357820 CASAVA_Build 8 41969680 1I TTCTAACTGC -/A AAAAAAAATG 3070 het 387 hom 36 1 31 4 A 8 9 357821 CASAVA_Build 8 41983854 2D TTCTACAATG AC/-- ACAGTTTATA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AC 2 1 357822 CASAVA_Build 8 41999056 1D GTAACAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 11 10 357823 CASAVA_Build 8 42002116 1D TCGAACTCCT A/- CACCTCAGGT 3070 hom 30 het 13 0 10 3 A 1 0 357824 CASAVA_Build 8 42015202 1I ACTATAAAGC -/A AGTACTACAG 3070 hom 92 het 36 0 29 7 A 1 2 357825 CASAVA_Build 8 42021614 2I TCAATTCTGC --/AT ATAGCAACTG 3070 het 3070 ref 42 24 17 1 AT 1 2 357826 CASAVA_Build 8 42026732 4D CAAACTGCGT GTAA/---- GTAATTCAGA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 GTAA 2 1 357827 CASAVA_Build 8 42030000 1D AAGTCATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 820 hom 31 2 23 6 T 12 11 357828 CASAVA_Build 8 42033759 1D CCCCCTCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 33 1 28 4 A 13 12 357829 CASAVA_Build 8 42057448 1D TTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2098 het 248 hom 17 3 8 6 T 17 16 357830 CASAVA_Build 8 42062778 1D AAAAAAAAAA T/- AATAGTTTAA 3070 het 1657 hom 19 4 15 0 T 1 0 357831 CASAVA_Build 8 42069018 2D GCAGGCAGAT CA/-- CACCTGAAGT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 CA 2 1 357832 CASAVA_Build 8 42072260 1D TACCTTGCCC T/- TGTGTCCCAG 3070 hom 167 het 62 0 53 9 T 2 1 357833 CASAVA_Build 8 42077083 1I ACACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2565 het 2565 ref 29 9 7 13 A 12 13 357834 CASAVA_Build 8 42079460 1D TGTCGGGAGT C/- CCGGGGGGCT 3070 hom 59 het 22 0 20 2 C 3 2 357835 CASAVA_Build 8 42080290 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 2424 het 1566 hom 14 4 7 3 T 10 9 357836 CASAVA_Build 8 42085986 2D ACTCTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1606 het 229 hom 14 2 6 6 A 16 14 357837 CASAVA_Build 8 42091950 1D AAAAAACTGC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 69 het 32 0 27 7 A 9 8 357838 CASAVA_Build 8 42095730 7D GTGTGCTCTT GAGTTAC/------- ATAAGCTGAT 3070 het 3070 ref 46 23 22 5 GAGTTAC 1 0 357839 CASAVA_Build 8 42125659 1I ACCTTGGGCA -/G GTTATTTAAG 3070 het 3070 hom 50 23 24 3 G 1 2 357840 CASAVA_Build 8 42132721 3I AAACGTAAGT ---/ATG ATAAGTCCCA 3070 hom 111 het 42 0 36 6 ATG 0 1 357841 CASAVA_Build 8 42134310 2I TGATAAGCAC --/AT ATAATCAAGA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 AT 1 2 357842 CASAVA_Build 8 42163699 4I ACCACCTATC ----/ATCT ATCTATCATC 3070 hom 138 het 53 0 47 7 ATCT 1 2 357843 CASAVA_Build 8 42170391 1D TAGCATGTCC T/- TTTTTTTTTT 2387 hom 19 het 13 0 7 6 T 13 12 357844 CASAVA_Build 8 42171470 1D TCCACGCCCA C/- CCCCCCCACC 2801 hom 26 het 15 0 9 6 C 8 7 357845 CASAVA_Build 8 42177197 1D AAAAAAATAC A/- AAAAATTATT 3070 hom 65 het 24 0 21 3 A 6 5 357846 CASAVA_Build 8 42177508 1I CAATTGTAAC -/T TTTTTTTTTT 83 het 83 ref 33 19 2 12 T 13 14 357847 CASAVA_Build 8 42232702 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2154 het 363 hom 8 1 6 1 A 12 11 357848 CASAVA_Build 8 42236657 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1395 het 396 hom 9 2 6 1 A 13 14 357849 CASAVA_Build 8 42255390 1I GAGATATTTA -/G GCCTGGTGCA 3070 hom 54 het 23 0 19 5 G 1 2 357850 CASAVA_Build 8 42286900 4D TGCTCAAAAT TTAC/---- TTACTTCAAG 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 TTAC 2 1 357851 CASAVA_Build 8 42292370 1D AGTCTCCCTC T/- TGTCACCCAG 3070 hom 75 het 28 0 25 4 T 2 1 357852 CASAVA_Build 8 42292595 1D9M1I GCTTTGGCCT CCCCAAAGTG-/-CCCAAAGTGC TGGGATTACA 3070 hom 115 het 37 0 36 6 N/A 0 0 357853 CASAVA_Build 8 42309329 1I GAAAAGAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 8 9 357854 CASAVA_Build 8 42314084 3D AATTCAAAAA AAG/--- AAGAATTACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AAG 2 1 357855 CASAVA_Build 8 42320192 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 9 10 357856 CASAVA_Build 8 42320305 3D ATTTTAAAAA AGG/--- GGGCCCAATG 3070 hom 90 het 35 0 31 5 AGG 1 0 357857 CASAVA_Build 8 42327548 1D ATTACAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 36 1 26 10 T 15 14 357858 CASAVA_Build 8 42366669 1D GGGGTTCAAG T/- TGATTCTCCT 2090 het 1297 hom 14 4 5 5 T 2 1 357859 CASAVA_Build 8 42373948 1D CATGTTATCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 T 10 9 357860 CASAVA_Build 8 42374637 1D TAAAAAAAAA C/- ATTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 C 1 0 357861 CASAVA_Build 8 42398542 1I AACAGAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 T 11 12 357862 CASAVA_Build 8 42400009 1D ATCTTTAAAC T/- TTTTTTTTTT 2409 het 2409 ref 24 12 9 3 T 13 12 357863 CASAVA_Build 8 42408019 1I CCCTTAAGTC -/A AAAGCCTAAT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 3 4 357864 CASAVA_Build 8 42418657 1I TTGCCCAAGG -/T GGAGTGCAAT 3069 het 3069 ref 22 9 8 5 T 0 1 357865 CASAVA_Build 8 42422390 1D CAACAAGAGT A/- AAACTCCATC 3070 het 2800 hom 20 8 9 4 A 4 3 357866 CASAVA_Build 8 42424021 1D ATCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2672 het 834 hom 19 5 8 6 A 16 15 357867 CASAVA_Build 8 42431297 1D CTTACACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1307 hom 24 8 10 6 T 15 14 357868 CASAVA_Build 8 42432703 1I TATTATTCTT -/A AGAGTCTCAT 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 1 2 357869 CASAVA_Build 8 42433597 5D AAACAAATTT TTTTG/----- TTTTGTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TTTTG 2 1 357870 CASAVA_Build 8 42451798 1I TGGCTTTTCC -/T TTTTTTTTGC 2658 het 2658 ref 23 11 9 3 T 8 9 357871 CASAVA_Build 8 42459412 2D AAAACAAAAC TG/-- TATTTGGCTG 3070 hom 61 het 25 0 18 7 TG 1 0 357872 CASAVA_Build 8 42481785 1D CCCCCCAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 9 hom 18 1 13 4 T 13 12 357873 CASAVA_Build 8 42482637 4I TTCTCTGTAT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 TTTA 3 4 357874 CASAVA_Build 8 42494044 2D ATCCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 21 0 16 5 A 15 13 357875 CASAVA_Build 8 42496121 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 160 hom 24 2 15 9 A 17 16 357876 CASAVA_Build 8 42497147 7I GTAGCTAAGA -------/CTATAGG TATGCATCAC 2648 hom 18 het 8 0 7 1 CTATAGG 0 1 357877 CASAVA_Build 8 42500970 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2442 hom 30 het 12 0 9 3 A 14 13 357878 CASAVA_Build 8 42501680 1I AAAATTAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 19 0 12 7 A 11 12 357879 CASAVA_Build 8 42589918 2D AAATTAAAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AT 7 6 357880 CASAVA_Build 8 42617854 1D CCATACCCAC A/- AAGGGTGAGA 3070 hom 111 het 40 0 37 3 A 3 2 357881 CASAVA_Build 8 42623308 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 501 hom 23 2 13 8 A 15 14 357882 CASAVA_Build 8 42623670 3D CTTGCTTCAA CCC/--- CCCCCCCCCA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 C 12 9 357883 CASAVA_Build 8 42630124 2D TAATGCAGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 13 11 357884 CASAVA_Build 8 42643392 2I GACTGAAAAG --/TT TTTTTTTTTT 1377 het 634 hom 44 2 9 33 T 12 14 357885 CASAVA_Build 8 42650139 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 A 6 7 357886 CASAVA_Build 8 42653988 1I CAGGCATGCA -/C CACCATGCCA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 1 2 357887 CASAVA_Build 8 42663339 8D TGAGGCAGGC AGATCAGG/-------- AGATCAGGAG 3070 hom 27 het 17 0 10 9 AGATCAGG 3 2 357888 CASAVA_Build 8 42664820 1D CCACCGGGAG T/- GAACGAACAA 3070 hom 62 het 23 0 21 2 T 1 0 357889 CASAVA_Build 8 42678980 2D GAGCTAATAG GT/-- GTGTGTGTGT 2721 het 2721 ref 49 27 6 17 GT 10 9 357890 CASAVA_Build 8 42700781 1D ATTAAATGAC T/- TTTTTTTTTT 2499 het 446 hom 17 1 12 4 T 17 16 357891 CASAVA_Build 8 42746311 2I ATCACACCAC --/TA TATATTCCAT 2803 het 1273 hom 16 3 8 5 TA 2 3 357892 CASAVA_Build 8 42790311 1I TGGAGTGCAG -/T TGGTGTGATC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 357893 CASAVA_Build 8 42796312 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1235 het 348 hom 7 2 4 1 A 17 16 357894 CASAVA_Build 8 42826058 1I CCCACTTCAG -/C CTCTGGAGTA 3070 hom 99 het 35 0 32 3 C 1 2 357895 CASAVA_Build 8 42839101 1I AGGAAAAAAA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 92 het 34 0 31 3 T 8 9 357896 CASAVA_Build 8 42886962 18D TTCCCACATC CTCCTTGCCCACCACACA/------------------ CTCCTTGCCC 3070 hom 117 het 45 0 40 10 CTCCTTGCCCACCACACA 2 1 357897 CASAVA_Build 8 42939657 4D GTGTGTTTAT AGAG/---- ATAGACTTAT 3070 het 3070 hom 42 16 22 7 AG 2 0 357898 CASAVA_Build 8 42991348 1I AAAGCCATGA -/C CTGTTTTCCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 2 357899 CASAVA_Build 8 43001713 5I CATTCTGTCA -----/TTTGT TTTGTTCTGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTTGT 1 2 357900 CASAVA_Build 8 43018905 1D CACTTTTGCC T/- TTTTTTTTTT 819 het 819 ref 35 26 4 5 T 11 10 357901 CASAVA_Build 8 43024098 1I CATTATTATT -/A TTTTTTTTGA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 0 1 357902 CASAVA_Build 8 43034106 1D TACAAAAGCA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 8 7 357903 CASAVA_Build 8 43034976 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 20 0 17 3 A 18 14 357904 CASAVA_Build 8 43049658 4D ATAGGAGATT CTTA/---- CTTTTTTGCT 3070 hom 90 het 31 0 31 2 CTTA 1 0 357905 CASAVA_Build 8 43053816 3D CTTTGAGGTC TGT/--- TGTTCAGAAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TGT 2 1 357906 CASAVA_Build 8 43082998 1I CCTTTATTCT -/A ATGTCATAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 1 2 357907 CASAVA_Build 8 43109491 1D GAACAGTAAA T/- TTTTTTTTTT 1293 het 1293 ref 30 17 3 10 T 15 14 357908 CASAVA_Build 8 43131792 1I AATAAGAACC -/T TTGGCCAGGC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 2 3 357909 CASAVA_Build 8 43149298 19I AATAATTGGA -------------------/ACATGTGAAGTTTGTCTTC ACATGGCTTA 3070 hom 91 het 36 0 29 7 ACATGTGAAGTTTGTCTTC 0 1 357910 CASAVA_Build 8 43168353 1I TTATATTCTC -/A AAAAAAATTC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 7 8 357911 CASAVA_Build 8 43177936 2I10M2I AGCAAGACTC --TCTCAAAAAC--/TGTCTCAAAAACAA AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 30 0 31 0 N/A 0 0 357912 CASAVA_Build 8 43208436 4I TTACCTAATC ----/TTTG AACTTAAGAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TTTG 0 1 357913 CASAVA_Build 8 43210420 1I ATGCACTGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 61 het 28 0 21 7 T 8 9 357914 CASAVA_Build 8 43214688 2D15M2I ATCAAGTATC AAAAAGTACATCATATA--/--AAAGTACACCATTTACG TATTATATAC 730 het 730 ref 36 34 2 16 N/A 0 0 357915 CASAVA_Build 8 43219559 1D10M10D13M59D GCTGTTCACA GTATTCTCCTATAATCCTTTTTTATTTCTGTAAAGTTGGTAGTAATGGCTCTACTTTCATTTATGATTTTAGTGATGAAAGTCTTCCATCTTT/-TATTAACATA----------TTAACTGTGCAAA----------------------------------------------------------- TGCTCAGTCA 3070 hom 51 het 15 0 18 2 N/A 0 0 357916 CASAVA_Build 8 43222808 1I AATTTTTTAC -/T TATATATAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 1 2 357917 CASAVA_Build 8 43225328 1I TAGCAAACTC -/A AAACTCCTGG 3070 hom 90 het 31 0 31 0 A 3 4 357918 CASAVA_Build 8 43226048 2D TTAATTAAAC AT/-- GTGGATTTGT 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AT 1 0 357919 CASAVA_Build 8 43227161 1D GTTAGACCAA G/- GCAAATTAGT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 G 2 1 357920 CASAVA_Build 8 43233492 1D GTAATTTGTT A/- AAAAAAGTGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 7 6 357921 CASAVA_Build 8 43241078 1D ATTTCTTCTG C/- CAGATACCCT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 C 2 1 357922 CASAVA_Build 8 43246013 1D TTTTCCCCCA T/- TTTTTTCCAT 3070 hom 58 het 29 0 23 8 T 7 6 357923 CASAVA_Build 8 43269040 1I CTTCTGTGAA -/T TTTTTTTTTT 2574 het 2574 ref 28 15 8 5 T 13 14 357924 CASAVA_Build 8 43272417 1D AGAATGACAG T/- TTTTTAGTTT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 T 6 5 357925 CASAVA_Build 8 43285520 7I TACAGCACAC -------/TGATGAG ACTCGACTCT 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TGATGAG 0 1 357926 CASAVA_Build 8 43292653 2I TTTTAATGAC --/TA AAATTATGAC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TA 0 1 357927 CASAVA_Build 8 43313569 1I GATAAAAAAA -/T GTGACAAATA 3070 het 22 hom 36 1 26 9 T 0 1 357928 CASAVA_Build 8 43321444 1I GAGATTCAAC -/T TCTTGCTGGT 2315 hom 12 het 5 0 5 0 T 1 2 357929 CASAVA_Build 8 43329670 4D TGACTTTGTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 90 het 41 0 31 10 TTTG 5 4 357930 CASAVA_Build 8 43344715 1I TTGGCTCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 589 hom 29 2 20 7 T 12 13 357931 CASAVA_Build 8 43347549 4I TTAAATGTTC ----/TTGT TTGTTTACAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 TTGT 1 2 357932 CASAVA_Build 8 43349030 1I TTTTACACCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 391 hom 39 2 28 9 T 11 12 357933 CASAVA_Build 8 43358247 3I4M2I TTTAACCAAT ---ATGT--/TTAAAGTAA TCACACACAG 3070 het 3070 ref 22 13 8 3 N/A 0 0 357934 CASAVA_Build 8 43398035 1D AATGTAAGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 14 16 8 T 10 9 357935 CASAVA_Build 8 43437972 1D CTCCAACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 32 0 26 6 A 15 14 357936 CASAVA_Build 8 43487786 1I TTTGGCCTTG -/C CTGGCATGCA 3070 hom 101 het 39 0 29 10 C 1 2 357937 CASAVA_Build 8 43522823 2D ACTTTGGTTG CC/-- CCACACACAC 3070 het 3070 hom 35 17 13 7 C 4 2 357938 CASAVA_Build 8 43561094 1D ACCAAACAAC A/- AAAAAAACTT 3070 hom 100 het 42 0 34 8 A 8 7 357939 CASAVA_Build 8 43580602 1I TATTCAAAGA -/T TAAAAACTAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 357940 CASAVA_Build 8 43592534 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 27 0 16 11 A 13 12 357941 CASAVA_Build 8 43592758 1D CTCTCCTGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 22 0 20 3 A 11 10 357942 CASAVA_Build 8 43596522 1D GGACACACTG T/- TTTTGTAGCA 3070 het 3070 ref 43 22 16 6 T 5 4 357943 CASAVA_Build 8 43601205 1D GAGTTAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1378 hom 50 3 31 17 T 12 11 357944 CASAVA_Build 8 43608761 1I CCCATTGAGG -/C CTATGGTGGA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 C 1 2 357945 CASAVA_Build 8 43623662 1I ATATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 445 hom 21 1 19 1 A 10 11 357946 CASAVA_Build 8 43624326 5D AAAGAAGTTA TACAT/----- TACATTAAAC 3070 hom 99 het 36 0 32 4 TACAT 2 1 357947 CASAVA_Build 8 43628326 1D TTTAACACTC T/- TTATGTAGAA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 3 2 357948 CASAVA_Build 8 43637188 1I ATCCCAAGAC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 7 8 357949 CASAVA_Build 8 43641784 9I AGAGCCCATG ---------/ATGATTTTT ATGGTCTACC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 ATGATTTTT 0 1 357950 CASAVA_Build 8 43644561 1D TAGAAAGAAG C/- TTTTTGTGAA 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 C 1 0 357951 CASAVA_Build 8 43646218 1I GACACATTAA -/C CCCCCCTTGA 3070 hom 101 het 42 0 33 9 C 6 7 357952 CASAVA_Build 8 43669187 1D AAAAAAGTTG T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 114 het 48 0 38 10 T 8 7 357953 CASAVA_Build 8 43684905 1D GGTCAGTACT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 83 het 33 0 28 7 A 8 7 357954 CASAVA_Build 8 43688702 7D CTCCAGATAA AAACGAG/------- AAATGAAATG 3070 hom 96 het 34 0 31 6 AAACGAG 1 0 357955 CASAVA_Build 8 43690130 1D GCTTATGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 530 hom 40 2 30 8 A 11 10 357956 CASAVA_Build 8 43698673 2I GGGAACACTC --/TT TTTTTTTTCA 3070 hom 30 het 15 0 11 4 T 8 10 357957 CASAVA_Build 8 43704252 1D GGACTTTGGG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 A 7 6 357958 CASAVA_Build 8 43705634 2I CAAATATCCC --/CA GATGAAAACT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 CA 0 1 357959 CASAVA_Build 8 43719124 1I AGGCCCATGT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 8 9 357960 CASAVA_Build 8 43733109 1D AGGCCAATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 A 10 9 357961 CASAVA_Build 8 43737040 1I GTAAAACTTC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 7 8 357962 CASAVA_Build 8 43739215 1I AGAAGCTACC -/T TTGAAACTGC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 2 3 357963 CASAVA_Build 8 43759289 1D TTTGTAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 855 hom 29 2 20 7 T 12 11 357964 CASAVA_Build 8 43760293 1I ATGTTAAGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 338 hom 41 1 31 9 T 9 10 357965 CASAVA_Build 8 43765113 3I AAAAAGAACA ---/AAG AAGACTCTAC 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AAG 1 2 357966 CASAVA_Build 8 43769776 3D GAAAGAGGCT ATC/--- ATCTGTGAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 8 ATC 2 1 357967 CASAVA_Build 8 43775654 1D TTCATATCTT C/- TTTCTGATGT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 1 0 357968 CASAVA_Build 8 43778514 1I GGCTTATGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 404 hom 39 1 33 5 A 9 10 357969 CASAVA_Build 8 43783971 2I CAGTTAAACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 11 13 357970 CASAVA_Build 8 43795356 4D TAGAAAGAAG CTAT/---- CTATCTGTGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CTAT 2 1 357971 CASAVA_Build 8 43805142 7I4M8I GTTGGAAACG -------TCCA--------/TTGTTTTTACAGGATCTGC AAATGGACAT 3070 hom 157 het 49 0 53 2 N/A 0 0 357972 CASAVA_Build 8 43885610 4D CATAAAAACT AAAC/---- AAACAGAGTC 3070 hom 65 het 24 0 22 3 AAAC 2 1 357973 CASAVA_Build 8 43890818 1D GATGTTTGCA T/- TCAGCACACA 1878 het 1878 ref 37 27 4 6 T 2 1 357974 CASAVA_Build 8 43901094 4I CATAAAAAAT ----/AGAC AGAAACATTC 3070 het 310 hom 28 3 23 2 AGAC 0 1 357975 CASAVA_Build 8 43910686 4I CTTTGAGGCC ----/TTCT TTGGAAACGG 3070 het 25 hom 23 1 20 2 TTCT 0 1 357976 CASAVA_Build 8 43910896 2D AAAGAGAACC AA/-- ACACAAAAAC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 3 1 357977 CASAVA_Build 8 43918346 3D GAAAGCTAGA CAG/--- AAGAATTCTC 1157 het 1157 ref 23 17 3 4 CAG 1 0 357978 CASAVA_Build 8 43945676 1I GCTGTGAGGA -/T TTCGTTGGGA 3070 het 3070 hom 26 13 10 3 T 2 3 357979 CASAVA_Build 8 43951743 2D CACTTTTGAA AC/-- ACTCTTTTTG 1422 het 664 hom 13 2 3 18 AC 2 1 357980 CASAVA_Build 8 43954991 1I24M1I GAATCTGCAA -TGGATATTTGGATAGCTGTGAGGA-/GTGGATATTTGGATAGCTGTGAGGAT TTCGTTGGGA 3070 het 3070 ref 36 34 8 2 N/A 0 0 357981 CASAVA_Build 8 46974083 1D AGCATTCTCA G/- AAACTTCTTT 3070 het 2136 hom 15 6 8 1 G 1 0 357982 CASAVA_Build 8 46976763 3I AAAAGGAAAT ---/ATC TACCCATAGA 2127 het 2127 ref 42 25 8 9 ATC 0 1 357983 CASAVA_Build 8 47017539 1D TGAGACTCTC T/- TTTTGTAGAA 605 het 605 ref 68 37 3 28 T 5 4 357984 CASAVA_Build 8 47031469 4D AATCACTACA CTGT/---- CTTTGACAAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 CTGT 1 0 357985 CASAVA_Build 8 47032395 2D TTTAAACCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 12 10 357986 CASAVA_Build 8 47043228 1D ATGCCACGAG C/- CCCCCCCCAA 3070 hom 72 het 29 0 21 8 C 9 8 357987 CASAVA_Build 8 47062656 1D CCAACTGAAG A/- AAAAAAAAAA 1491 hom 15 het 11 0 5 6 A 12 11 357988 CASAVA_Build 8 47063682 1D AGAAAACAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 392 hom 24 1 22 2 A 10 9 357989 CASAVA_Build 8 47066026 4I TGCATCTGTG ----/TATT TATTTCTGTA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 TATT 1 2 357990 CASAVA_Build 8 47072567 1D AACATGGGTA T/- TTTTTCTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 6 5 357991 CASAVA_Build 8 47075747 1D CTTTTGGTAG A/- AATCTGCAAA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 3 2 357992 CASAVA_Build 8 47093858 1I TTGGAAAAAC -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 8 9 357993 CASAVA_Build 8 47097005 1D GTTCTATAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 A 10 9 357994 CASAVA_Build 8 47099295 1I TTGCAAACAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 4 hom 37 1 30 6 T 8 9 357995 CASAVA_Build 8 47108073 1I TCTTTTTTTT -/A TTTTTCAGAT 3070 het 453 hom 27 2 22 3 A 0 1 357996 CASAVA_Build 8 47157717 1D GCTCCAGACA C/- CCCCTCCCTT 3070 hom 111 het 44 0 36 9 C 5 4 357997 CASAVA_Build 8 47170262 8D CCTTAACATC CCCCTGAG/-------- CCCCTGCGGC 3070 het 3070 ref 36 19 14 4 CCCCTGAG 1 0 357998 CASAVA_Build 8 47200685 1D AAAATGTCTC T/- TCACAGATTC 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 T 2 1 357999 CASAVA_Build 8 47203917 1D CAGATTCTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 77 het 29 0 25 4 A 10 9 358000 CASAVA_Build 8 47210701 2I CACGGGAGAC --/AG AGTCACCCAG 3070 hom 69 het 28 0 21 7 AG 1 2 358001 CASAVA_Build 8 47254524 1D ATGGTGTCCT G/- GGGGGGCAGC 3070 hom 60 het 25 0 18 7 G 7 6 358002 CASAVA_Build 8 47259223 8D AAGAGAGAAT GAGGTGGC/-------- GAGGTGGCAT 3070 hom 49 het 20 0 16 5 GAGGTGGC 2 1 358003 CASAVA_Build 8 47277273 1I TTGAGCAGGC -/A GAGAGGAAAA 3070 hom 87 het 34 0 27 7 A 0 1 358004 CASAVA_Build 8 47278923 2D AGAGGTGGCT CA/-- CACCTGTAAT 3070 hom 54 het 20 0 16 4 CA 2 1 358005 CASAVA_Build 8 47288677 1I ACCAGGCTTT -/G GGGGGGGGTG 1663 het 3 hom 15 1 8 6 G 8 9 358006 CASAVA_Build 8 47296405 1D TATTCTGCAG T/- TTTGAACAGA 1806 het 1806 ref 43 33 4 6 T 4 3 358007 CASAVA_Build 8 47296457 6D GTAGCTGTGA CTGCAG/------ TAAGACCCAT 1098 het 1098 ref 50 42 4 8 CTGCAG 1 0 358008 CASAVA_Build 8 47298757 7D AAATGTTTTA AAAATTT/------- AAAGTATAGA 3070 hom 96 het 34 0 33 2 AAAATTT 1 0 358009 CASAVA_Build 8 47317013 1D TGGTGGCCCC A/- ACCACCACCC 3070 hom 47 het 22 0 13 9 A 2 1 358010 CASAVA_Build 8 47332984 1I ACTGCTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 A 14 15 358011 CASAVA_Build 8 47334734 1I CCTGCTGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 13 14 358012 CASAVA_Build 8 47335307 1I AACAAAACAA -/C TTCACAGATA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 0 1 358013 CASAVA_Build 8 47338430 1I GTTCGCTCTG -/A AATATTCCAT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 2 3 358014 CASAVA_Build 8 47350665 1D CAGCTGAATC A/- AAAGTAAAGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 4 3 358015 CASAVA_Build 8 47351816 1I AGACTCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 34 1 24 9 A 11 12 358016 CASAVA_Build 8 47355379 1I CCAAAATGTC -/T TTTCACAGAT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 3 4 358017 CASAVA_Build 8 47382085 1I TCTATTCAGA -/G ATTCAACTTC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 0 1 358018 CASAVA_Build 8 47383601 1D CACAAATTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 34 1 21 12 T 11 10 358019 CASAVA_Build 8 47384296 3D TCACAAAATA GTT/--- GTTTCAAATA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GTT 2 1 358020 CASAVA_Build 8 47390493 1I TCCTTAATCT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 59 het 23 0 20 3 A 8 9 358021 CASAVA_Build 8 47394176 1D TTTATTTCTA T/- TTTTTTGTGA 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 7 6 358022 CASAVA_Build 8 47399619 1I GAATGTACAC -/A TTACAAAGCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 0 1 358023 CASAVA_Build 8 47400952 1D AGCTGAACCC G/- CCCCCCCAAA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 G 1 0 358024 CASAVA_Build 8 47426327 4I GGATGTTCGA ----/TATT TATTTCACTA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 TATT 1 2 358025 CASAVA_Build 8 47437682 2I GCAGGGACTC --/AG GGGAACGTTG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 AG 0 1 358026 CASAVA_Build 8 47464305 1I CCAGGGCTGT -/C CCGGGCTGGC 3070 hom 81 het 34 0 26 8 C 2 3 358027 CASAVA_Build 8 47482492 1D CTGTTGAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 32 0 25 9 A 12 11 358028 CASAVA_Build 8 47483326 1D CAGATTCTAC A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 8 7 358029 CASAVA_Build 8 47493093 1D CCAACCTGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 437 hom 30 2 16 13 A 13 12 358030 CASAVA_Build 8 47500429 2D GGTTTAACTC TG/-- TGAGATGAAT 3070 het 3070 hom 24 11 13 0 TG 2 1 358031 CASAVA_Build 8 47524913 1I GATATTCAGA -/T TTTTTATTAT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 5 6 358032 CASAVA_Build 8 47537063 1I AGTAGATTCC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 40 0 31 9 A 8 9 358033 CASAVA_Build 8 47548400 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 9 10 358034 CASAVA_Build 8 47554528 1D TCATTCAGCA G/- GTTGGAAGCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 2 1 358035 CASAVA_Build 8 47559353 1D ATGCCATGAT A/- AAAAAAATAG 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 8 7 358036 CASAVA_Build 8 47562005 2I GAGTGTATCT --/CA CAGAGATAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 CA 1 2 358037 CASAVA_Build 8 47569979 1D TTGAAAATCA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 8 7 358038 CASAVA_Build 8 47578244 1D TCTCCATCAG A/- AAAAAAGAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 7 6 358039 CASAVA_Build 8 47596743 1I AGCAGTTTGG -/A CAAATCCTCA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 0 1 358040 CASAVA_Build 8 47606779 1I TGCTCCCAAT -/A AAAAGCCTTT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 4 5 358041 CASAVA_Build 8 47611683 1I GATTGGGAAA -/T TCCAGCCTGG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 1 2 358042 CASAVA_Build 8 47615318 1D CCAAGGTTCC T/- TGTTTCCATT 3070 hom 88 het 31 0 28 3 T 2 1 358043 CASAVA_Build 8 47619679 3D AAGACGTGGC AGA/--- AGAAGATAAA 3070 hom 54 het 21 0 19 3 AGA 3 2 358044 CASAVA_Build 8 47625061 1I GAAGACACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 32 0 25 7 T 11 12 358045 CASAVA_Build 8 47627547 1I TTGTTATACA -/C TATATGTAAA 3070 het 3070 ref 55 34 19 2 C 0 1 358046 CASAVA_Build 8 47628685 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2173 hom 29 het 12 0 9 3 T 15 14 358047 CASAVA_Build 8 47629428 3I TTAGGAGGAA ---/GAG GAGGGAGAGG 3070 het 3070 ref 76 35 30 11 GAG 1 2 358048 CASAVA_Build 8 47630035 1I TAGCCATTTC -/A AAAAGTAGTC 3070 het 3070 ref 65 40 17 8 A 4 5 358049 CASAVA_Build 8 47630127 1I ATGTCTACAC -/A AAAACTTGTA 3070 hom 114 het 42 0 37 5 A 4 5 358050 CASAVA_Build 8 47631337 1I CAGTATCCAG -/T AAAAAAATTG 2834 het 2834 ref 48 35 8 5 T 0 1 358051 CASAVA_Build 8 47631516 2D31M1I TTCACTAATA ATATTTTTATTGCAAAGTTGCTTCAGTATTTCT-/--ATTTTTATCACAAAGTTGCTTCAGTATTTCTG GAGCTCTATA 849 het 849 ref 52 62 4 9 N/A 0 0 358052 CASAVA_Build 8 47631867 4D TTTTTATTTA TTTG/---- TTTATTTTTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 TTTG 1 0 358053 CASAVA_Build 8 47638927 7I GAAAAAATCC -------/TAAGAGT TAAGAGTTGG 2761 hom 21 het 8 0 7 1 TAAGAGT 1 2 358054 CASAVA_Build 8 47645502 1D TAATTTACTT A/- ACTAGTATTC 981 het 981 ref 42 36 4 2 A 2 1 358055 CASAVA_Build 8 47647085 1I13M6I ATATACTAGT -AGCCCCATTAAAA------/AAGCCCCATTAAAAGAAAAG AAAAGGTGAA 802 het 802 ref 38 39 2 3 N/A 0 0 358056 CASAVA_Build 8 47650119 1D ACAAAATTGA G/- GCTGGGTGCA 3070 hom 138 het 49 0 45 4 G 2 1 358057 CASAVA_Build 8 47658359 1D TGGGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1099 het 1099 ref 34 11 4 19 T 17 16 358058 CASAVA_Build 8 47669649 1I CTTGTCTGGG -/T TTTTTTCCTC 3070 hom 105 het 44 0 34 10 T 6 7 358059 CASAVA_Build 8 47692124 1D CTGTCAAAAC A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 90 het 36 0 30 7 A 9 8 358060 CASAVA_Build 8 47696586 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 371 hom 37 1 23 13 A 15 16 358061 CASAVA_Build 8 47698675 1D TCAAATGGAT C/- CTGAACTCAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 2 1 358062 CASAVA_Build 8 47702727 1D AGTGTCTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 39 1 29 9 T 13 12 358063 CASAVA_Build 8 47703567 2D TTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 31 0 29 2 T 16 14 358064 CASAVA_Build 8 47707249 1D TTAATGTATA T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 T 8 7 358065 CASAVA_Build 8 47711030 6D AGCACTGCTT TTGCTG/------ TATCCCAGAG 3070 hom 42 het 17 0 15 3 TTGCTG 1 0 358066 CASAVA_Build 8 47711263 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 A 7 8 358067 CASAVA_Build 8 47726139 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 70 hom 22 2 18 2 T 13 12 358068 CASAVA_Build 8 47728009 1I ACCAGTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 30 0 25 5 A 10 11 358069 CASAVA_Build 8 47742320 3D AAGAGTCAAG TGT/--- TGTTGTTGCT 3070 hom 113 het 43 0 38 5 TGT 3 2 358070 CASAVA_Build 8 47792273 3D TGGTACTATG CTT/--- CTTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 CTT 3 2 358071 CASAVA_Build 8 47792906 1D TCATTAAGAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 29 0 25 5 T 10 9 358072 CASAVA_Build 8 47799461 1D AACATTTTTT A/- AAAAAATTAT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 A 7 6 358073 CASAVA_Build 8 47804962 3I ATGCAATACG ---/TTA TTATTAACTG 3070 hom 105 het 47 0 36 11 TTA 2 3 358074 CASAVA_Build 8 47805853 1I ATATTAAGGA -/T TTTTTTCATA 3070 het 399 hom 42 1 35 6 T 6 7 358075 CASAVA_Build 8 47869751 3D TTTGGAGGGC ATG/--- ATGATTGTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 ATG 2 1 358076 CASAVA_Build 8 47871402 2I CCCTGCACTT --/AA ACAGTGCATT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 1 3 358077 CASAVA_Build 8 47930566 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAGGATG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 5 6 358078 CASAVA_Build 8 47939533 3D GCCGCCATGT GAA/--- GAAGGACACG 3070 hom 96 het 38 0 31 7 GAA 2 1 358079 CASAVA_Build 8 47949199 1D AGCCAGGCTG C/- CCCCAGAGCC 3070 hom 62 het 25 0 21 5 C 5 4 358080 CASAVA_Build 8 47992349 1D CCACAAGCCA T/- TTTCCAGGAG 3070 hom 114 het 47 0 32 15 T 4 3 358081 CASAVA_Build 8 47995000 1D GGTGGTGGGG A/- AAAGGGCCCA 3070 hom 95 het 37 0 30 7 A 4 3 358082 CASAVA_Build 8 47999396 121D TTAGTCATGT GAGAGCTGATTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGGGATCTCGGCTCACTGCAAG/------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- GAGAGCTGAT 3070 hom 27 het 12 0 10 9 GAGAGCTGATTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGGGATCTCGGCTCACTGCAAG 1 0 358083 CASAVA_Build 8 48014601 1I TTATTTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 446 hom 22 1 19 2 T 11 12 358084 CASAVA_Build 8 48019551 2D ATATAGATCC TA/-- TATATATATA 1268 het 1268 ref 12 8 3 1 TA 7 6 358085 CASAVA_Build 8 48024368 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 7 8 358086 CASAVA_Build 8 48040154 1I AGACTGTCAG -/A AAAAAAAAAA 1557 het 1557 ref 28 15 5 8 A 11 12 358087 CASAVA_Build 8 48046921 4I TATAGATGTC ----/TGTT TATTTAGGGT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TGTT 0 1 358088 CASAVA_Build 8 48049009 1I GTTGCAGACA -/G AATTAAAATT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 358089 CASAVA_Build 8 48055531 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 921 hom 16 2 11 3 A 10 11 358090 CASAVA_Build 8 48060411 1D GGCATCAAGA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 T 9 8 358091 CASAVA_Build 8 48062913 1D GAGATGTGAA G/- TACTATTCTA 3070 hom 117 het 41 0 40 1 G 1 0 358092 CASAVA_Build 8 48065605 1I ACTAATATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 9 10 358093 CASAVA_Build 8 48066422 1D AATGTGATAT A/- TTCATAAAAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 0 358094 CASAVA_Build 8 48066607 1I TTATTGGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1079 hom 28 3 20 5 A 11 12 358095 CASAVA_Build 8 48070413 4I GCATCAGGTC ----/CTAA CTAAGAAGTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 CTAA 1 2 358096 CASAVA_Build 8 48104067 1D AATTTACAAT A/- AAAAAAAAAA 2896 het 1617 hom 13 4 7 2 A 11 10 358097 CASAVA_Build 8 48112640 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAATATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 6 7 358098 CASAVA_Build 8 48114297 1D CTCATAGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 31 8 A 13 12 358099 CASAVA_Build 8 48116564 1I GGACAGGGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 15 hom 45 2 40 3 T 9 10 358100 CASAVA_Build 8 48139845 1I AGAATCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 25 0 20 5 A 10 11 358101 CASAVA_Build 8 48143822 2D ACTCCCAAAA GT/-- AAAAAAAAAA 55 het 55 ref 29 2 1 27 GT 1 0 358102 CASAVA_Build 8 48145648 1D GACAATGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 A 11 10 358103 CASAVA_Build 8 48146886 1D ACATTTTGGT A/- AAAAAAAAAA 2628 het 109 hom 26 1 11 14 A 19 18 358104 CASAVA_Build 8 48148720 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 19 0 12 7 A 14 13 358105 CASAVA_Build 8 48181238 1D TCTGGTTAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 38 1 31 6 A 12 11 358106 CASAVA_Build 8 48187804 1I AATGTACAAG -/A AAAAAAACAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 7 8 358107 CASAVA_Build 8 48188591 2D ATTACCAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 A 12 10 358108 CASAVA_Build 8 48195334 2D ATGGCACATG TA/-- TATACATATG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 TA 3 2 358109 CASAVA_Build 8 48200098 1I GCTGGTGTCT -/G GGCCATAAAT 3070 hom 120 het 43 0 40 3 G 2 3 358110 CASAVA_Build 8 48313891 1D TATTAAACAT A/- GCTGTTTCAC 3070 hom 186 het 67 0 61 7 A 1 0 358111 CASAVA_Build 8 48316459 1D GGGTCAGAGT G/- GGGGGGGGGG 2979 hom 43 het 27 0 10 17 G 12 11 358112 CASAVA_Build 8 48393337 1I TAAAAATCTT -/G GAAAAAAATT 1467 hom 7 het 3 0 3 0 G 1 2 358113 CASAVA_Build 8 48431862 1D AGCAGGGGAT A/- GGGGGTGGTT 3070 hom 96 het 36 0 32 6 A 1 0 358114 CASAVA_Build 8 48443570 2D AACTAAGATA AG/-- ATTTCAGTAA 3070 hom 111 het 38 0 38 0 AG 1 0 358115 CASAVA_Build 8 48475791 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 7 het 36 1 23 12 T 17 16 358116 CASAVA_Build 8 48483117 1D TGTAAAAAAA T/- ATTTTAGTTA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 1 0 358117 CASAVA_Build 8 48501523 1D TTGGCTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 362 hom 34 1 30 3 T 12 11 358118 CASAVA_Build 8 48505622 1I CGCTGGACTC -/T TGTCAGTTCA 3070 hom 123 het 50 0 41 9 T 1 2 358119 CASAVA_Build 8 48508607 1I CACATTTAGT -/C CTAGGCAGAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 C 1 2 358120 CASAVA_Build 8 48509029 1I AGGGTATACA -/C CCTTCTTCAT 3070 hom 132 het 57 0 45 12 C 2 3 358121 CASAVA_Build 8 48572215 1I CCTTCTCTCA -/T TTTTTTCTTG 3070 het 3070 hom 40 20 18 2 T 6 7 358122 CASAVA_Build 8 48600626 28D3M5D CTTATAAAAA GAGGTCACAGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAA/----------------------------GCC----- TCCCAGCATT 3070 hom 57 het 21 0 20 2 N/A 0 0 358123 CASAVA_Build 8 48605597 1D ATGGTGTCAG A/- AAAAAAAAAT 1122 het 1122 ref 26 17 3 6 A 10 9 358124 CASAVA_Build 8 48611205 2I TAATCTAAAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AT 7 8 358125 CASAVA_Build 8 48633748 1I TAGCTTCACC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 97 het 38 0 33 5 T 9 10 358126 CASAVA_Build 8 48670613 1I TTTGAGGCTG -/T TGACAGTTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 1 2 358127 CASAVA_Build 8 48690588 2D GAAAATAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 18 het 38 1 21 18 T 18 16 358128 CASAVA_Build 8 48751634 1D ATTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 27 1 19 9 T 11 10 358129 CASAVA_Build 8 48816747 1D ACAATAGCGA T/- TTTTTTTTTT 1037 het 1037 ref 27 14 3 10 T 15 14 358130 CASAVA_Build 8 48837804 1I TGGGTCATTG -/T TTAAATGGAA 3070 hom 83 het 31 0 26 5 T 2 3 358131 CASAVA_Build 8 48912850 1D TATTTGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 5 A 12 11 358132 CASAVA_Build 8 48968370 1I GGCCCCCGAA -/G GTACAAGAGG 3070 hom 62 het 28 0 18 10 G 1 2 358133 CASAVA_Build 8 49010554 1I CAGTGGTTGC -/A AGTGAGCCAA 2188 het 282 hom 7 1 5 1 A 1 2 358134 CASAVA_Build 8 49082855 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 305 hom 19 1 9 9 T 12 11 358135 CASAVA_Build 8 49101208 1D TGTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 969 het 969 ref 27 15 3 9 T 11 10 358136 CASAVA_Build 8 49106338 1D AACAAACAAA C/- CCCCCCCAAC 3070 hom 52 het 31 0 25 6 C 8 7 358137 CASAVA_Build 8 49124889 1D GTACTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1841 het 1841 ref 47 38 5 4 T 12 11 358138 CASAVA_Build 8 49137701 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 18 1 9 8 A 17 16 358139 CASAVA_Build 8 49145869 10I AGTCAATTTC ----------/TTAGACACCT TTGGTGCTAA 3070 hom 81 het 29 0 27 2 TTAGACACCT 0 1 358140 CASAVA_Build 8 49149064 4I TTTTTGGGTT ----/GAGC TGGCCAATTT 3070 het 3070 ref 77 44 28 7 GAGC 0 1 358141 CASAVA_Build 8 49195247 1I GCTCCCAGCT -/C CAGGTTTCAC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 1 2 358142 CASAVA_Build 8 49254594 1D AAAATATACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 41 1 28 14 T 12 11 358143 CASAVA_Build 8 49280899 1I CAATTTTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 366 hom 57 1 45 11 A 10 11 358144 CASAVA_Build 8 49309833 1D GTAGGTTATT G/- GGGGGGGGGA 2140 het 21 hom 20 1 10 10 G 10 9 358145 CASAVA_Build 8 49311389 1I CAGTCCCCCC -/T CTCAACAGGA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 0 1 358146 CASAVA_Build 8 49326488 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 9 10 358147 CASAVA_Build 8 49329759 1I GATCTATGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 8 9 358148 CASAVA_Build 8 49340621 3D CACAGACAAC AGG/--- AGGAGGAGAG 2862 het 2862 ref 46 20 12 15 AGG 3 2 358149 CASAVA_Build 8 49348981 4I GTGAACACAC ----/TGTT TGTGGCAGAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 TGTT 0 1 358150 CASAVA_Build 8 49354919 2I TGCAGGTGGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 41 0 24 17 A 11 13 358151 CASAVA_Build 8 49359415 1D TGACACAGTG C/- AGGACAACAC 3070 het 3070 ref 88 46 36 7 C 1 0 358152 CASAVA_Build 8 49367750 1D GTACTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 23 14 8 T 13 12 358153 CASAVA_Build 8 49378869 1I CAAATCTCAT -/G TTGAATTGTA 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 G 0 1 358154 CASAVA_Build 8 49382350 3I GCTCCTGAAT ---/ATA ATAACATATT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 ATA 1 2 358155 CASAVA_Build 8 49415006 1D GTCCGACACT C/- CCCAGTGAGA 3070 het 2874 hom 28 8 14 6 C 4 3 358156 CASAVA_Build 8 49420231 12I GTAAGACAGA ------------/TAGGCTGATGGC TAGACTAATA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 TAGGCTGATGGC 0 1 358157 CASAVA_Build 8 49420489 1I TATCAACCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1687 hom 44 5 30 9 A 10 11 358158 CASAVA_Build 8 49423543 1I ATAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 2552 het 2552 ref 36 14 10 12 A 10 11 358159 CASAVA_Build 8 49454709 2D GTCTGGCCTC TT/-- AGCAGGACTG 3070 hom 77 het 31 0 25 8 T 2 0 358160 CASAVA_Build 8 49460296 1D CGGAGGCAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 551 hom 28 3 24 1 A 10 9 358161 CASAVA_Build 8 49516568 2D CATGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 1072 het 1072 ref 65 46 3 21 TG 9 8 358162 CASAVA_Build 8 49516809 2D TATGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 1229 het 1229 ref 62 51 3 10 TG 9 8 358163 CASAVA_Build 8 49568171 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 1829 het 1829 ref 38 17 6 15 A 17 16 358164 CASAVA_Build 8 49644433 1D GAAGCACAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 122 het 49 0 41 8 T 10 9 358165 CASAVA_Build 8 49718205 1D GCCAGTTCTT C/- CCTGCCTACA 3070 het 3070 hom 38 15 22 1 C 3 2 358166 CASAVA_Build 8 49731111 2I GATTCTGTGA --/AT ATAAGGCTAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 AT 1 2 358167 CASAVA_Build 8 49733330 2I AAGTTCATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 AT 5 6 358168 CASAVA_Build 8 49770118 1I GCCAGGCTAA -/G GAGGGCAGGC 3070 hom 78 het 32 0 22 10 G 1 2 358169 CASAVA_Build 8 49778642 2D TTGCCTTGAG CA/-- CACACACTCC 3070 het 3070 ref 51 25 18 9 CA 4 3 358170 CASAVA_Build 8 49788103 1D CTCCTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1489 het 850 hom 17 4 6 7 A 19 18 358171 CASAVA_Build 8 49797878 2I TCTCCCCATT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 46 17 14 15 AC 8 9 358172 CASAVA_Build 8 49806828 1D ATGTTTAGGG A/- AAAAAATACG 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 7 6 358173 CASAVA_Build 8 49821869 1D CCAAACTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 14 7 T 13 12 358174 CASAVA_Build 8 49866624 1D AAAAAAGACC A/- AAAAAAAAAA 1241 het 1241 ref 37 18 7 12 A 13 12 358175 CASAVA_Build 8 49943084 1D TATTTTTGTA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 T 9 8 358176 CASAVA_Build 8 49950856 2D TCTTTTTTTT TA/-- AAAAAAAAGC 2836 het 2836 ref 25 14 9 2 TA 1 0 358177 CASAVA_Build 8 50011646 2D ATTTAGTCTC TT/-- TTGTTCTCTA 3070 het 3070 ref 47 24 21 2 T 4 2 358178 CASAVA_Build 8 50015050 1I TTTTTGATGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 62 hom 25 1 23 1 T 8 9 358179 CASAVA_Build 8 50023911 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1866 hom 32 11 13 8 A 15 14 358180 CASAVA_Build 8 50027488 1D GTACCATGTC T/- TTCTCTCTCA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 3 2 358181 CASAVA_Build 8 50036014 1I AATAAAAGCA -/T TGGATAAAAT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 1 2 358182 CASAVA_Build 8 50045999 1D TTAAGTCTTT G/- GGGGGGAGCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 7 6 358183 CASAVA_Build 8 50046857 1D AAACAAAAAG A/- AAAAAATATA 2029 het 2029 ref 19 12 5 2 A 7 6 358184 CASAVA_Build 8 50051227 1D TTCACTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1991 hom 27 9 11 8 T 13 12 358185 CASAVA_Build 8 50072440 1I TTTTGTGGTG -/C TGAAAAGAAT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 0 1 358186 CASAVA_Build 8 50080014 4I TCTGACAGAC ----/TGTT TGTTATGATG 3070 het 3070 ref 24 13 7 4 TGTT 1 2 358187 CASAVA_Build 8 50089123 1D TTTAAAGCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 10 9 358188 CASAVA_Build 8 50109401 1I CTTAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 A 10 11 358189 CASAVA_Build 8 50114019 1D GACATAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 13 12 358190 CASAVA_Build 8 50121956 10D2M6D TCGGAGCCCC ATAGGAGCTGCCAGCAGA/----------CC------ GTCCCAATGG 2882 het 2882 ref 24 18 9 7 N/A 0 0 358191 CASAVA_Build 8 50123583 18D TATGGGTGCA GCATTGATGGCAAGCAAC/------------------ AGCAAGTAGG 3070 het 3070 ref 33 24 7 4 GCATTGATGGCAAGCAAC 1 0 358192 CASAVA_Build 8 50125851 1I TGATTCTGTG -/A AAAATGATGG 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 A 4 5 358193 CASAVA_Build 8 50129833 1D CACAGTGGGA G/- GAAATTAAAG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 G 2 1 358194 CASAVA_Build 8 50130318 3I TCCTGCTCCT ---/CTC AATTGCTACA 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 CTC 0 1 358195 CASAVA_Build 8 50153025 3D70M1I CCCTATAAAA TCTTCTAACCTAACACATCAAAGCCAAGTTCATGATCTCTATACCCCACCATATCTCCTTGTAGTATCTTTGC-/---TCTAACCTAACACATCAAAGCCAAGTTCATGATCTCTATACCCCACCATATCTCCTTGTAGTATCTTTGCT TTCAGATAAT 3070 hom 99 het 34 0 34 27 N/A 0 0 358196 CASAVA_Build 8 50159591 1I GTGTGACTAT -/G GGGGTGGTTG 3070 hom 146 het 55 0 46 9 G 4 5 358197 CASAVA_Build 8 50167910 1I ATCCCCTGTG -/C CCCCCCCCAT 3058 het 68 hom 14 1 10 3 C 8 9 358198 CASAVA_Build 8 50185481 1I CCTATTCAAG -/T TTTTTTTTTT 1646 het 1646 ref 34 18 6 10 T 15 16 358199 CASAVA_Build 8 50186864 2I TGAATAGAAT --/TG TGTGTTTTAA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 TG 2 3 358200 CASAVA_Build 8 50189157 5I GATTTAACTT -----/AAAAC TAAACTTCTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 AAAAC 0 1 358201 CASAVA_Build 8 50194493 1D AATTTATCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 11 10 358202 CASAVA_Build 8 50200891 1D CCTGTTCCTG C/- CCCCCCATAC 3070 hom 91 het 33 0 30 4 C 7 6 358203 CASAVA_Build 8 50204908 2D GGTTTTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 454 hom 35 2 27 9 GT 10 9 358204 CASAVA_Build 8 50214719 2D TTAGAATCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 39 0 30 10 T 13 11 358205 CASAVA_Build 8 50227043 8I TTCCTTCCCT --------/CTCCACCC CTCCACTCCC 3070 hom 63 het 25 0 18 7 CTCCACCC 0 1 358206 CASAVA_Build 8 50240268 1I ATCACAAAGA -/T TTTTTTCCTG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 6 7 358207 CASAVA_Build 8 50247186 1I TTTTTGCTGA -/G GAGGCTTTCT 3070 hom 123 het 45 0 42 3 G 1 2 358208 CASAVA_Build 8 50248427 1I GGATTCTTTG -/A ACGTCTTCAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 1 2 358209 CASAVA_Build 8 50249779 2D CTTAATGTTG TT/-- TTAAAAGTAT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 T 4 2 358210 CASAVA_Build 8 50251787 1D AAATTGAAAT A/- AAAAAATTAA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 A 7 6 358211 CASAVA_Build 8 50252284 1D ATACATTGAG A/- AAATAAAACT 3070 hom 66 het 23 0 23 3 A 4 3 358212 CASAVA_Build 8 50256052 2I GAGCAAAACC --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 33 0 26 7 A 9 11 358213 CASAVA_Build 8 50267680 1I AGTGTGAAAA -/G GGGTCTTTCT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 3 4 358214 CASAVA_Build 8 50269871 2D CAAACATGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 TA 7 6 358215 CASAVA_Build 8 50270141 6I TCATTATAAA ------/AATATG CATTATTATG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AATATG 0 1 358216 CASAVA_Build 8 50279717 5I37M4D ATTCTGAGCC -----TTTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTTCCTTTCTTCCTTACTTT/TTTCTTTTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTTCCTTTCTTCCTTA---- CTTTATTTCT 3070 hom 76 het 20 0 26 2 N/A 0 0 358217 CASAVA_Build 8 50283440 2D AGACCTGGCT AG/-- AGGATCCATA 3070 hom 144 het 55 0 49 6 AG 2 1 358218 CASAVA_Build 8 50284216 1D ATTCCATTAC T/- TTGCTAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 3 2 358219 CASAVA_Build 8 50285791 1D GCTCATGGAA G/- GGCTTTGATT 3070 hom 154 het 55 0 52 3 G 3 2 358220 CASAVA_Build 8 50287922 2I ATTAATCAGA --/TT TTTTTTTTGC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 10 358221 CASAVA_Build 8 50288261 1D TGTGTTCTAA C/- CTCAAAAGCA 3070 hom 84 het 31 0 29 3 C 2 1 358222 CASAVA_Build 8 50291811 17I CTTTTGAAAA -----------------/ATTAGCCATAATTTTTT GGCCAGACCA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 ATTAGCCATAATTTTTT 0 1 358223 CASAVA_Build 8 50312981 1D GCTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 10 9 358224 CASAVA_Build 8 50313663 1I TCTAGCAGCA -/C CATCGTGGAC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 1 2 358225 CASAVA_Build 8 50332586 1D ATTATTAATC A/- ATATTTCCTG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 2 1 358226 CASAVA_Build 8 50340777 1D TTTGATGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 491 hom 24 4 18 2 T 13 12 358227 CASAVA_Build 8 50343950 2D GCCTGTGTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 40 0 34 6 T 14 12 358228 CASAVA_Build 8 50344959 1I TGTGATTTGT -/G GGGGGGCGGG 3070 hom 46 het 19 0 15 4 G 6 7 358229 CASAVA_Build 8 50346955 1I TAATGGTGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 9 10 358230 CASAVA_Build 8 50358113 1I TAACTACAAA -/C CTTTTAGATA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 1 2 358231 CASAVA_Build 8 50363093 2I TTGCTATTTT --/AA AAAAAATTGT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 6 8 358232 CASAVA_Build 8 50365893 1D ATCCTGGCAC T/- TTTTTTTTTT 1153 het 1153 ref 46 22 5 20 T 13 12 358233 CASAVA_Build 8 50368798 1D TATTTTACTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 81 het 36 0 28 9 T 10 9 358234 CASAVA_Build 8 50384549 4D TTTTTGTAAG TTAC/---- TTAAGTTACC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 TTAC 1 0 358235 CASAVA_Build 8 50389110 2D AGATATATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 167 hom 26 1 18 7 A 18 16 358236 CASAVA_Build 8 50389412 1I TAATGCAGGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 9 10 358237 CASAVA_Build 8 50395784 3I CCAAGTGGAC ---/AGT AGTAGCTTAA 3070 hom 151 het 55 0 51 4 AGT 1 2 358238 CASAVA_Build 8 50405717 1I ACAACATTTG -/A AAGAAAAGTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 2 3 358239 CASAVA_Build 8 50410566 2I AGATGTGTAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 10 12 358240 CASAVA_Build 8 50428063 5I TATTAAAACT -----/TATAA TATAGGAATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TATAA 0 1 358241 CASAVA_Build 8 50439419 1I TTTATTTGAG -/T TTTTCTCTCT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 T 4 5 358242 CASAVA_Build 8 50440634 5D TATAACACTT CATAA/----- CATATGTTAA 3070 het 3070 ref 24 12 12 0 CATAA 1 0 358243 CASAVA_Build 8 50446118 1I ATTTTACTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 T 9 10 358244 CASAVA_Build 8 50450661 1I TACAAAAGTA -/T TTTTTAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 5 6 358245 CASAVA_Build 8 50451357 8D3M3D TTATAGCGAT ACCCAAAAGTTGGA/--------GTT--- ATACCCAATA 3070 hom 108 het 36 0 37 2 N/A 0 0 358246 CASAVA_Build 8 50457933 9D ACTTTGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 28 0 16 16 A 25 16 358247 CASAVA_Build 8 50460444 1D GTTATTAAAG A/- AAAAAATTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 5 A 7 6 358248 CASAVA_Build 8 50460612 4I AAAAAAGTAT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TTTG 2 3 358249 CASAVA_Build 8 50468613 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 33 1 23 9 A 13 14 358250 CASAVA_Build 8 50489108 1D CCCAGAAGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 98 het 37 0 31 6 T 10 9 358251 CASAVA_Build 8 50491733 1D TTGATGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 11 10 358252 CASAVA_Build 8 50492887 1D TTGTGTCTGG A/- AAAATTTTCT 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 5 4 358253 CASAVA_Build 8 50547947 1I ACAAATGGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 9 10 358254 CASAVA_Build 8 50568440 2D TGACTCTGGA CT/-- CTCTTTCAAA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 3 2 358255 CASAVA_Build 8 50577810 1I GACTCGGGGA -/G GGTTGTGGGC 3070 hom 99 het 35 0 31 4 G 2 3 358256 CASAVA_Build 8 50584498 1D TCGGAAGGTA T/- TTTTTTTTTG 1283 het 1283 ref 30 23 3 4 T 10 9 358257 CASAVA_Build 8 50585288 4I TATAGAGCTG ----/TCTA TCTATTTTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TCTA 1 2 358258 CASAVA_Build 8 50597367 2I TGTTTTTGGA --/CT CTCTGTCTCA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 CT 2 3 358259 CASAVA_Build 8 50608267 1D AGGGTAGCGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 568 hom 33 7 11 16 T 17 16 358260 CASAVA_Build 8 50650395 1D TCTTCATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 50 4 28 18 A 13 12 358261 CASAVA_Build 8 50667130 3I GAAAAAAGAA ---/AAG AAGGAATAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAG 1 2 358262 CASAVA_Build 8 50675646 1I AAAGGACCTA -/T TATCTTGTTC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 T 1 2 358263 CASAVA_Build 8 50676455 31I TTACGCAAGA -------------------------------/AAATGCATAAAGACTTCATTCATAAAACCCC AAATTTGGAG 3070 hom 96 het 35 0 33 4 AAATGCATAAAGACTTCATTCATAAAACCCC 0 1 358264 CASAVA_Build 8 50680861 1I AAACACACAG -/A AAAAAAGATC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 A 6 7 358265 CASAVA_Build 8 50681999 4I TTTAAATGAT ----/AAAG AACAGAGTCT 3070 hom 123 het 43 0 41 2 AAAG 0 1 358266 CASAVA_Build 8 50686039 31D TATTAGTACA TGCTACTGGAAAGCACATGGATATCACAATG/------------------------------- TGCTGATAAG 3070 hom 102 het 31 0 35 3 TGCTACTGGAAAGCACATGGATATCACAATG 1 0 358267 CASAVA_Build 8 50686637 1D TACTGGCCCC T/- AAGACCGAAG 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 1 0 358268 CASAVA_Build 8 50697368 1D CTAAAAAAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 9 8 358269 CASAVA_Build 8 50700124 1I GCCAGTTTTC -/A AAAAAAAAAA 1308 het 1308 ref 35 22 7 6 A 12 13 358270 CASAVA_Build 8 50712359 1D ATTTTTTTTC T/- TTGTTGGTCC 3070 hom 115 het 45 0 37 8 T 3 2 358271 CASAVA_Build 8 50713020 2I GATAACAGGG --/TT ATTTTGTAAT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 0 2 358272 CASAVA_Build 8 50718313 14D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 2669 hom 21 het 9 0 8 1 A 25 11 358273 CASAVA_Build 8 50747510 1I AATACCTAGG -/A ATACAGCTAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 358274 CASAVA_Build 8 50759757 1I ATCATTTCAC -/T TTCTACTTTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 358275 CASAVA_Build 8 50768370 1D ATTCTGATGC A/- AATAAATATT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 3 2 358276 CASAVA_Build 8 50776549 6D CTTATTATAA ATGTAG/------ ATGTAATACA 3070 hom 138 het 48 0 47 3 ATGTAG 1 0 358277 CASAVA_Build 8 50801010 1I AAATGGGGCT -/G GGCGAGGTGG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 G 2 3 358278 CASAVA_Build 8 50802082 37D CCTCTGTGTA CTTTCCTTGTAGGGCCCATGAGAATGCCTCTGTGGCC/------------------------------------- CTTTCCTTGC 3070 hom 45 het 12 0 15 5 CTTTCCTTGTAGGGCCCATGAGAATGCCTCTGTGGCC 1 0 358279 CASAVA_Build 8 50806553 4D CTACACACCA AATT/---- AATTATTTGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AATT 2 1 358280 CASAVA_Build 8 50811670 1D GTATTTGGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 T 9 8 358281 CASAVA_Build 8 50817316 1I TCTCCCAACT -/G GGGGACAATG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 4 5 358282 CASAVA_Build 8 50823817 1D CTCAATGGAC T/- TTAAAAAGAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 3 2 358283 CASAVA_Build 8 50824263 2D ACAAAAAGAC AT/-- ATACTGTACA 3070 hom 123 het 46 0 42 5 AT 2 1 358284 CASAVA_Build 8 50824675 4I AGAAAGAAAG ----/GAAA GAAAGGAGGG 2738 hom 22 het 14 0 10 4 GAAA 1 2 358285 CASAVA_Build 8 50831028 3I GGCCTTAGAA ---/AAT AATAGTACTG 3070 hom 95 het 35 0 32 3 AAT 1 2 358286 CASAVA_Build 8 50838525 5D CCCTTATAGG CTTTT/----- TATCCTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CTTTT 1 0 358287 CASAVA_Build 8 50841982 1D CATGAGATTT G/- GTCATTTAAC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 G 2 1 358288 CASAVA_Build 8 50842944 2I CAAATAATGG --/CA CACACACACA 3070 hom 122 het 46 0 40 6 CA 5 6 358289 CASAVA_Build 8 50843204 5D70M1D ATACATACAT TCACCACATACACCACATATATACACACACACCACACAAACATACACACATACAACAAACACACAGTACACACATA/-----ACATACACCACATATATACACACACACCACACAAACATACACACATACAACAAACACACACTACACACAT- CCCACACACA 2096 het 2096 ref 28 17 5 46 N/A 0 0 358290 CASAVA_Build 8 50856131 1D TATTGCCCTG A/- AAAAAGTCTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 6 5 358291 CASAVA_Build 8 50864250 4D AAATGTAAAG CTAT/---- CTATCATATG 3070 hom 129 het 46 0 44 3 CTAT 2 1 358292 CASAVA_Build 8 50882754 1D GTAACAGGAT A/- AAAAAAGGTC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 7 6 358293 CASAVA_Build 8 50900230 1D CTCTTCATTC T/- TTTTTTAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 7 6 358294 CASAVA_Build 8 50908275 4D ATATAGTATT TAAG/---- TGAGAGGAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 4 TAAG 1 0 358295 CASAVA_Build 8 50914033 1I TTTGCCTTTG -/T TTTCACAAAG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 T 3 4 358296 CASAVA_Build 8 50919576 3I GCTGAGGACA ---/AGG AGGAAAGGGG 3070 hom 114 het 46 0 39 7 AGG 1 2 358297 CASAVA_Build 8 50922362 1D CCTGGGCAGT G/- GGGCTCTCAG 3070 hom 96 het 37 0 26 11 G 4 3 358298 CASAVA_Build 8 50927130 1D CAAAGTTAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 15 het 30 1 25 4 A 10 9 358299 CASAVA_Build 8 50932998 1I ATCATGATTT -/G GGGCATAGGT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 G 3 4 358300 CASAVA_Build 8 50934351 1I AGTACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 483 hom 33 2 29 2 T 11 12 358301 CASAVA_Build 8 50936242 5D AGAACATAAC CGCAG/----- CGCAGCCAGA 3070 hom 129 het 53 0 39 16 CGCAG 2 1 358302 CASAVA_Build 8 50938771 1D TACCATCCCA C/- CCTTCTGAGT 3070 hom 66 het 24 0 22 5 C 3 2 358303 CASAVA_Build 8 50943708 2I TCTAAAATTT --/AA AGTCTGGCAA 3070 hom 126 het 48 0 43 5 A 1 3 358304 CASAVA_Build 8 50958246 3D2M1I TACTTATGGT ATATG-/---TGT GCGACCAATA 3070 hom 114 het 42 0 39 7 N/A 0 0 358305 CASAVA_Build 8 50959585 5D CTTTTAAAGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 36 0 25 12 T 16 11 358306 CASAVA_Build 8 50959731 1D ATTGCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 13 0 10 3 T 11 10 358307 CASAVA_Build 8 50960878 1I ATATTGACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 30 1 24 5 A 10 11 358308 CASAVA_Build 8 50961118 4I ATTAATTAAC ----/TAAT TAATTAAACA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TAAT 1 2 358309 CASAVA_Build 8 50961420 2D TCCCCCTTCA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 CT 6 5 358310 CASAVA_Build 8 50963385 5D ATTGGAGTGT TTAAG/----- TTATTTATTG 3070 hom 89 het 35 0 30 7 TTAAG 1 0 358311 CASAVA_Build 8 50963863 3D5M1D8M11D TTATATATAT ATAATATATATAAATATATATATAATAA/---ATATA-ATAAATAT----------- ATATATATAT 772 hom 7 het 3 0 3 1 N/A 0 0 358312 CASAVA_Build 8 50963959 1D AAATAAATAT A/- TATATATATA 820 hom 7 het 4 0 3 1 A 1 0 358313 CASAVA_Build 8 50965197 2D AAAATATTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 14 12 358314 CASAVA_Build 8 50965646 4D AAAAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 2917 hom 39 het 20 0 18 3 AAAG 1 0 358315 CASAVA_Build 8 50967687 1D AATAAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 27 1 21 6 A 12 11 358316 CASAVA_Build 8 50968899 2D AAAGCATTGA TG/-- AGAGAGTTGA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TG 1 0 358317 CASAVA_Build 8 50969912 1D ACATCTACTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 8 7 358318 CASAVA_Build 8 50973346 1D AAATTCATTC A/- TTTTTTTCAA 3070 hom 157 het 58 0 53 5 A 1 0 358319 CASAVA_Build 8 50975252 1I TGTTCTCTGT -/A AATTTGACAC 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 2 3 358320 CASAVA_Build 8 50979264 6I CGTGGAAATA ------/TATAAG TATATTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TATAAG 0 1 358321 CASAVA_Build 8 50979565 14D TTTCTGTGTC TATTGAGATGATCA/-------------- TATGATTTTT 3070 hom 117 het 42 0 39 4 TATTGAGATGATCA 1 0 358322 CASAVA_Build 8 50989475 1D TTTCCCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 79 hom 33 1 24 8 A 15 14 358323 CASAVA_Build 8 50991290 1I16M2D ATAATTCAGA -TTTTTTTTTGTCAAATAC/TTTTTTTTTTGTCAAAT-- ACACACACAC 3070 hom 89 het 30 0 30 6 N/A 0 0 358324 CASAVA_Build 8 50992153 1D TATTAAAAAT A/- ATAAATTTTA 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 2 1 358325 CASAVA_Build 8 51003350 1D TTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 9 8 358326 CASAVA_Build 8 51005377 1I CAGGAATAGT -/A AAAAAAAATC 3070 het 406 hom 23 1 20 2 A 8 9 358327 CASAVA_Build 8 51005605 7D GATGAAGGAG ATATATA/------- ATATATATGT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 ATATATA 2 1 358328 CASAVA_Build 8 51008103 2D CATTGTATGA TT/-- TTTTTACCAC 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 7 5 358329 CASAVA_Build 8 51012283 4D ACAAACAAAT AAAC/---- AAACCCAGTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 AAAC 2 1 358330 CASAVA_Build 8 51018408 1D TCGATCTAGT G/- GAGAAACTGG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 G 2 1 358331 CASAVA_Build 8 51042709 1I TTTGGACAGG -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 7 8 358332 CASAVA_Build 8 51056555 4D CTGAAATGAT AAAG/---- AAAGAATCTG 3070 hom 81 het 33 0 27 9 AAAG 2 1 358333 CASAVA_Build 8 51068483 1I TTTTCTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 34 0 23 11 T 10 11 358334 CASAVA_Build 8 51068726 12D TGTGTCCATG TGTTCTCATTTT/------------ TCAACTCCCA 3070 hom 78 het 25 0 26 2 TGTTCTCATTTT 1 0 358335 CASAVA_Build 8 51069370 1D TTTATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 24 1 15 8 T 17 16 358336 CASAVA_Build 8 51070127 1I AGAATGTTGA -/G GTCCAATGGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 1 2 358337 CASAVA_Build 8 51071957 1D AGAAGCTCAT A/- ATTACATAGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 1 358338 CASAVA_Build 8 51080586 1I GTATTACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 30 0 23 7 A 10 11 358339 CASAVA_Build 8 51086739 1D AGGTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 32 2 23 8 A 13 12 358340 CASAVA_Build 8 51089569 3D GATCTACACA ATG/--- ATAAGGACTA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 ATG 1 0 358341 CASAVA_Build 8 51090128 1D ACATGCACAG A/- AAAAAAAAAA 1977 het 1977 ref 50 36 5 9 A 11 10 358342 CASAVA_Build 8 51097061 2D CAAAAAAAAA AT/-- AAAAATAAAA 2538 hom 24 het 10 0 9 1 AT 1 0 358343 CASAVA_Build 8 51151733 4D CTCAGGTGTC TAAA/---- TAGGTATTTC 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TAAA 1 0 358344 CASAVA_Build 8 51156398 3I TATTTCTAAT ---/AAG AAGTCAAGCA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AAG 1 2 358345 CASAVA_Build 8 51160108 1D AGACAAGAAA C/- AAAAACAACA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 C 1 0 358346 CASAVA_Build 8 51195702 1D CTACCACCAC A/- AACTACTACT 3070 hom 140 het 63 0 45 18 A 3 2 358347 CASAVA_Build 8 51304771 1I TTTATCACCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 390 hom 40 1 38 1 T 8 9 358348 CASAVA_Build 8 51305437 1I ATTGAGAAAG -/A AAAACAGAGA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 4 5 358349 CASAVA_Build 8 51305954 1I TTTGGGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1665 hom 42 5 25 12 T 12 13 358350 CASAVA_Build 8 51308848 1I TAGAAAATGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 9 10 358351 CASAVA_Build 8 51318293 3I TGAATTATCT ---/TAA TATATATTTG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TAA 0 1 358352 CASAVA_Build 8 51321618 2D AGTGTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 35 0 22 13 T 15 13 358353 CASAVA_Build 8 51322795 1I AAGTTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 16 hom 25 1 20 4 T 11 12 358354 CASAVA_Build 8 51326114 1I TCAAAAAGGT -/A AAAAACACCA 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 5 6 358355 CASAVA_Build 8 51328790 2D ATATATGTAT AC/-- ACACACACAT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AC 5 4 358356 CASAVA_Build 8 51329967 5D CTCCTCAAAG AAAAA/----- AAAAAAAAAG 235 het 43 hom 28 1 2 25 A 14 9 358357 CASAVA_Build 8 51331313 1I TTGTGAGTAT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 A 8 9 358358 CASAVA_Build 8 51331899 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 75 het 32 0 25 7 GT 9 8 358359 CASAVA_Build 8 51335624 2I CCAGCTTTTA --/AC ACACACACAC 3070 het 1020 hom 47 3 31 13 AC 8 9 358360 CASAVA_Build 8 51348019 1D CTGGATACTT A/- AAAAAAAAAA 2028 het 1721 hom 21 7 11 3 A 17 16 358361 CASAVA_Build 8 51353955 3I AACTTAACTT ---/AAA AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 54 26 26 2 A 6 9 358362 CASAVA_Build 8 51357721 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAATT 2303 het 2303 ref 19 9 6 4 A 9 8 358363 CASAVA_Build 8 51360926 1D CAATATATTT C/- CAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 10 6 C 2 1 358364 CASAVA_Build 8 51362610 23D GGTTTCCCAA CAAGCACAAAGGTGCCCTGGGGT/----------------------- CAAGCAGCAG 3070 het 3070 ref 49 31 20 10 CAAGCACAAAGGTGCCCTGGGGT 1 0 358365 CASAVA_Build 8 51368249 1I TTGTCTTGTC -/A ACGTGATTGT 3070 het 3070 ref 64 30 25 9 A 1 2 358366 CASAVA_Build 8 51371939 1D AAACGAAAAC A/- AAAAACAGTT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 A 6 5 358367 CASAVA_Build 8 51375732 1I GAAGAAAAAA -/T TTAAAAAACA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 2 3 358368 CASAVA_Build 8 51377852 5D TCAGCATGTT ATAAC/----- ATAACACGGG 3070 het 3070 hom 41 18 19 6 ATAAC 2 1 358369 CASAVA_Build 8 51380244 1I AAACTCCTGA -/C CCTCAGGTGC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 2 3 358370 CASAVA_Build 8 51381017 1I ATATTTATTT -/A AAAAAAAAAA 2895 het 17 hom 14 1 8 5 A 13 14 358371 CASAVA_Build 8 51382904 1D CTGTTCTTCA T/- TTTTGTAGAC 3070 het 3070 hom 37 16 20 1 T 5 4 358372 CASAVA_Build 8 51384014 1I TGATGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 T 9 10 358373 CASAVA_Build 8 51384474 3D TTTTTAAGAC AAA/--- AAAAAAAAAA 2240 het 2240 ref 21 11 7 4 A 13 10 358374 CASAVA_Build 8 51395651 1I TTTATTATTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 T 9 10 358375 CASAVA_Build 8 51400182 1I ATAGACCCAC -/A CAAATATATG 2940 het 2940 ref 18 9 6 3 A 0 1 358376 CASAVA_Build 8 51401694 1D GTCTTGTCTC T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 9 8 358377 CASAVA_Build 8 51401787 1D TCTCTATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 24 9 11 5 T 10 9 358378 CASAVA_Build 8 51403287 1D ATCATTTTAC T/- TCACTCTTAA 3070 het 3070 ref 29 17 10 4 T 2 1 358379 CASAVA_Build 8 51403488 1I GGTGTATTAG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 T 8 9 358380 CASAVA_Build 8 51407569 1D TTTTTTTTTT A/- AAATGTGTTT 3070 het 2558 hom 25 10 12 3 A 4 3 358381 CASAVA_Build 8 51409628 2I TAAAAAAAAA --/AG AAAAAGGAAA 3070 het 192 hom 30 5 9 16 AG 0 1 358382 CASAVA_Build 8 51413208 2I GAGATTGCGC --/CA CTGCACTCCA 1829 hom 10 het 5 0 4 1 CA 0 1 358383 CASAVA_Build 8 51419059 7I AGGAATAAGA -------/TCCAGGG TGGCTGGTGT 3070 het 3070 ref 54 27 22 5 TCCAGGG 0 1 358384 CASAVA_Build 8 51427511 1I GTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTT 1099 het 1099 ref 41 31 3 7 T 11 12 358385 CASAVA_Build 8 51430361 11D7M3I ATTAAATAAT TAATTAATTAAATAAATT---/-----------GTAGATTTTC AAATAGTCAT 3070 het 3070 hom 31 13 19 3 N/A 0 0 358386 CASAVA_Build 8 51437630 1I AAAGATAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 10 11 358387 CASAVA_Build 8 51438632 2I GGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 54 16 29 9 TG 7 8 358388 CASAVA_Build 8 51447330 2D GATCTTTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 30 18 11 4 TG 9 8 358389 CASAVA_Build 8 51461606 1D GTCCTTCTTT A/- TGTGGCCCGA 3070 het 3070 hom 45 21 22 2 A 1 0 358390 CASAVA_Build 8 51470478 2D AACCTTTCTC AT/-- GTGCTACACT 3070 het 3070 ref 28 14 11 5 AT 1 0 358391 CASAVA_Build 8 51474324 2D34M1I GTGTTTGTGA GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTCTGTGATTTATTCT-/--GTGTGTGTGTGTGTGTGCTTCTGTGATTTATTCTA AAAAAAAATC 3070 hom 132 het 37 0 45 7 N/A 0 0 358392 CASAVA_Build 8 51474809 1I AGAGTGGCTT -/C CCCCCCTCAA 3070 hom 81 het 33 0 26 7 C 6 7 358393 CASAVA_Build 8 51474877 1I GACTTTGTGT -/A AAAAACATAG 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 5 6 358394 CASAVA_Build 8 51491982 4D GGAGTCAAGC AGAT/---- AGATACTTGT 3070 hom 159 het 55 0 52 3 AGAT 2 1 358395 CASAVA_Build 8 51497730 1D AAGGTAGGTT G/- GGGGGAAGGG 3070 hom 95 het 39 0 31 9 G 6 5 358396 CASAVA_Build 8 51500360 7D5M1I6M5I GGTACCAGTC AGCAGGAGGTGA-CTGCTG-----/-------CGTGACCTGTTGGGAAC CTGGTCACAC 3070 hom 72 het 24 0 25 3 N/A 0 0 358397 CASAVA_Build 8 51509601 1I ATGTTTGAAC -/T AGTTTACAGT 3070 hom 27 het 13 0 10 3 T 0 1 358398 CASAVA_Build 8 51524015 1D GCATGGCGCA C/- CTGTAGTCCC 2016 het 756 hom 10 3 6 1 C 2 1 358399 CASAVA_Build 8 51529055 2D GTGGCAAGAC TG/-- TGTGAAAAAT 3070 het 3070 ref 60 26 25 10 TG 3 2 358400 CASAVA_Build 8 51533314 2I CTAAAACAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 10 12 358401 CASAVA_Build 8 51533890 3I ATTGGGTTCA ---/CTT CTTCTTACTG 3070 hom 90 het 33 0 30 3 CTT 2 3 358402 CASAVA_Build 8 51537633 1I TCCTTTCATG -/A AAAAATTTTC 3070 hom 86 het 32 0 29 3 A 5 6 358403 CASAVA_Build 8 51543126 1I ATAATAAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 32 0 25 7 T 9 10 358404 CASAVA_Build 8 51546358 1I AATCATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 18 0 14 4 T 13 14 358405 CASAVA_Build 8 51572095 2I AGAAAAATTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 35 0 27 8 A 10 12 358406 CASAVA_Build 8 51601760 2D ATATACACGC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 85 het 36 0 29 7 AT 8 7 358407 CASAVA_Build 8 51633750 1D GGCTGCAGTG T/- TTTTTTTTTC 1391 het 1391 ref 29 24 3 2 T 10 9 358408 CASAVA_Build 8 51652694 1I AGGATTGGTG -/T TAGTACTTCT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 358409 CASAVA_Build 8 51653537 2D TGAGAGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 37 0 28 10 AG 7 6 358410 CASAVA_Build 8 51659375 7I TAGCAGCATG -------/ATTTATA ATCCTTTGGG 3070 hom 33 het 12 0 12 0 ATTTATA 0 1 358411 CASAVA_Build 8 51675609 1I TGGTATTGGA -/T TTCTTCCTGA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 2 3 358412 CASAVA_Build 8 51681748 8I CTGATAAACA --------/TGCATATT CATACCTTGT 3070 hom 105 het 34 0 36 0 TGCATATT 0 1 358413 CASAVA_Build 8 51686090 1I AAGAAATAGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 405 hom 38 1 33 4 A 9 10 358414 CASAVA_Build 8 51708273 10D CATTGCCTAT TAATGTGGAG/---------- TAATTTGAGA 3070 hom 105 het 35 0 36 1 TAATGTGGAG 1 0 358415 CASAVA_Build 8 51711226 2D TTCCTCATGA CT/-- CTGCCTGAGG 3070 het 3070 ref 41 17 18 7 CT 2 1 358416 CASAVA_Build 8 51714334 1I CTTTTCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2992 hom 34 11 17 6 A 12 13 358417 CASAVA_Build 8 51720255 27D3M2D3M13D TATAGAAACA TGTTTATTTTATAGAAGGTTCTATAATGAACCTTGAAACATATAGAAA/---------------------------GAA--TTG------------- ATATGTTTAT 2711 het 2711 ref 22 27 7 5 N/A 0 0 358418 CASAVA_Build 8 51734111 3D GTTGTTACCA TGT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 10 6 TGT 1 0 358419 CASAVA_Build 8 51735516 24D GAAAAAGAGA AAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAG/------------------------ AAGAAAGAAA 1586 het 1586 ref 15 4 7 7 AAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAG 1 0 358420 CASAVA_Build 8 51747650 1D GGGTTGTTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 8 7 358421 CASAVA_Build 8 51774338 1D AAGAAAAAAA G/- TCTGGGTAGG 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 G 1 0 358422 CASAVA_Build 8 51777189 1D GTCTGGAACT C/- CCCAACCTCA 3070 hom 48 het 17 0 14 3 C 4 3 358423 CASAVA_Build 8 51791847 1I TTTCTTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1683 hom 24 8 10 6 T 11 12 358424 CASAVA_Build 8 51795441 3I CCATTTTCAA ---/TAT TATTACTAAC 3070 het 3070 hom 60 25 29 6 TAT 1 2 358425 CASAVA_Build 8 51810050 2D9M18D ACATATATAG ATATATATGGACATATATATCTATATATC/--ATATATGGA------------------ CATATATATC 1829 het 1829 ref 10 8 6 2 N/A 0 0 358426 CASAVA_Build 8 51822551 1I CAAGTTTTTT -/G TGTGCATGTG 3070 het 3070 ref 39 14 13 12 G 0 1 358427 CASAVA_Build 8 51823074 1I TAAGACACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 T 9 10 358428 CASAVA_Build 8 51827095 1I ACTTACATTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 8 9 358429 CASAVA_Build 8 51836717 1I GCCTGAGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 11 12 358430 CASAVA_Build 8 51851063 1D TTCTTCATCC A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 42 16 19 8 A 7 6 358431 CASAVA_Build 8 51860855 1D TATCCCTAAT G/- GGGGTAGATG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 G 5 4 358432 CASAVA_Build 8 51865864 1D GGTATAAAAA G/- TTTAAAGTGT 3070 het 3070 hom 31 16 14 2 G 1 0 358433 CASAVA_Build 8 51870178 2D TACATGGGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 10 19 1 TA 6 5 358434 CASAVA_Build 8 51873474 3I GTGACTTCTC ---/ATT GTTGTTTTAA 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 ATT 0 1 358435 CASAVA_Build 8 51883690 1D GACTCCATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 17 10 14 A 12 11 358436 CASAVA_Build 8 51886472 1D TTTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 6 T 11 10 358437 CASAVA_Build 8 51893241 1D TTATGGCCTA C/- CACAGGAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 C 2 1 358438 CASAVA_Build 8 51894142 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 C 0 1 358439 CASAVA_Build 8 51906246 2D TTTACTTTAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 12 10 358440 CASAVA_Build 8 51909095 1I AAAATTAAAG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 7 8 358441 CASAVA_Build 8 51913702 1D GTCTTACGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 38 20 12 7 T 8 7 358442 CASAVA_Build 8 51916987 3D GCCATCATAT CCC/--- CTGTGACCTG 3070 het 3070 ref 27 13 9 8 C 4 1 358443 CASAVA_Build 8 51922256 3I CTTGTGTGGC ---/CTT CTATTTTCTA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 CTT 0 1 358444 CASAVA_Build 8 51932259 1I TAGAGAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 13 10 A 10 11 358445 CASAVA_Build 8 51959479 1I TTTACATTTA -/C CCCCCCCATA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 C 7 8 358446 CASAVA_Build 8 51962835 1I GTGAAAATTG -/A TTGCTTTCCC 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 A 0 1 358447 CASAVA_Build 8 51972972 1I AAGGAAATAC -/A ACAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 14 14 4 A 1 2 358448 CASAVA_Build 8 51975654 1D AACAATTTGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 A 9 8 358449 CASAVA_Build 8 51978947 38D ATGTGGTTAC TACCTTTGTAACCACGAGGTTACAAAGGTAACCTTCGT/-------------------------------------- TACCTTTGTA 3070 het 3070 ref 43 33 16 6 TACCTTTGTAACCACGAGGTTACAAAGGTAACCTTCGT 1 0 358450 CASAVA_Build 8 51983275 6D AGCTTAAATG TTAATA/------ TTAATATAAA 3070 het 3070 ref 29 16 13 1 TTAATA 2 1 358451 CASAVA_Build 8 51983788 2I TCAGCAATAT --/AG AGATGAAGAA 3070 het 3070 hom 45 14 24 7 AG 1 2 358452 CASAVA_Build 8 51996273 1I CTTTTTATAA -/C CTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 C 1 2 358453 CASAVA_Build 8 51997892 3I AAGCTTTGTT ---/GTC TATTTTCCTT 3070 het 3070 hom 42 15 21 6 GTC 0 1 358454 CASAVA_Build 8 52000695 1D TAAATATTCA T/- TTTTTTTTTT 2316 het 1946 hom 18 8 8 2 T 15 14 358455 CASAVA_Build 8 52001614 1I TACATCTTGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 7 8 358456 CASAVA_Build 8 52003819 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1137 het 1137 ref 20 11 4 5 T 13 12 358457 CASAVA_Build 8 52005658 1D ATGCATGAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 9 8 358458 CASAVA_Build 8 52015071 1I AGTGGAAGAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 A 9 10 358459 CASAVA_Build 8 52017558 1D ATAGTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 11 10 358460 CASAVA_Build 8 52026306 1I TAAGTTAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2824 hom 33 9 16 8 T 13 14 358461 CASAVA_Build 8 52037171 1D GAAAGGCAGC A/- AAAAAAAAAA 1800 het 1800 ref 23 11 5 7 A 13 12 358462 CASAVA_Build 8 52045005 1I ATTCTTTCCC -/G GGGGGGAATA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 G 6 7 358463 CASAVA_Build 8 52051051 2D TATCTAGGCT TC/-- TCTCTCTCTC 842 het 842 ref 26 12 3 12 TC 10 9 358464 CASAVA_Build 8 52068131 2I CATACAGAAA --/CT CTGTTCGATT 3070 het 3070 hom 34 12 18 4 CT 1 2 358465 CASAVA_Build 8 52070982 1D AAATAATTTT A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 A 8 7 358466 CASAVA_Build 8 52074925 4I TCTTGCTGCC ----/TATG TATGGGCTCT 3070 het 3070 hom 41 15 16 10 TATG 1 2 358467 CASAVA_Build 8 52077604 1I GGATAGCATT -/G GGAGATATAC 2524 het 245 hom 8 1 6 1 G 2 3 358468 CASAVA_Build 8 52079443 1I AGAAGAAGAT -/A AAAAAAGATA 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 A 6 7 358469 CASAVA_Build 8 52087437 1I AAATGTTAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 T 9 10 358470 CASAVA_Build 8 52092086 1I TCAAACCCTG -/C CCACTGCTTT 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 C 2 3 358471 CASAVA_Build 8 52096939 1I TTGAAATAAT -/A AAAACAAACA 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 4 5 358472 CASAVA_Build 8 52098498 1D TTTGACTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 15 12 T 15 14 358473 CASAVA_Build 8 52100151 3D AGCAGAGAAG AGA/--- AGATTTGTGA 3070 het 3070 hom 31 15 16 2 AGA 2 1 358474 CASAVA_Build 8 52122251 1D ATGATCAGAT A/- TTTTTTATTG 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 A 1 0 358475 CASAVA_Build 8 52128090 4D GAATAAATGA TATT/---- TATTCGACAT 3070 het 3070 hom 37 12 25 0 TATT 2 1 358476 CASAVA_Build 8 52130028 1D TATGCTTTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 42 18 18 7 A 9 8 358477 CASAVA_Build 8 52133602 1I TTACTACTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 9 10 358478 CASAVA_Build 8 52138827 1D CTGTTTCTAG T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 hom 36 14 22 0 T 8 7 358479 CASAVA_Build 8 52143083 3D CCCTCACACT ATG/--- ATATGTTCCA 3070 het 3070 ref 30 17 9 6 ATG 1 0 358480 CASAVA_Build 8 52212512 1D CAGGAAGAGC G/- GGAGCTTGCA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 3 2 358481 CASAVA_Build 8 52213982 1I AGCTCTGCCT -/C CTGGGTTCAT 2810 hom 18 het 7 0 7 0 C 1 2 358482 CASAVA_Build 8 52216429 1D AATTGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 40 0 35 5 T 12 11 358483 CASAVA_Build 8 52220314 5D TGGAAGAAAC TACTT/----- TAAACTTCAT 3070 het 3070 ref 31 19 12 0 TACTT 1 0 358484 CASAVA_Build 8 52277280 1D CCAAAGTGCT G/- GGGATTACAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 G 4 3 358485 CASAVA_Build 8 52362335 1D CACATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1853 het 1458 hom 27 6 8 13 T 17 16 358486 CASAVA_Build 8 52424284 3D GGGTGTGTGT GTG/--- GGGGTGTGTG 3070 hom 114 het 43 0 37 7 GTG 1 0 358487 CASAVA_Build 8 52430062 1I TTCAGGGCTA -/C TTATTTGCCC 3070 hom 141 het 50 0 48 2 C 0 1 358488 CASAVA_Build 8 52434268 1I GAGCCAAGAT -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 7 8 358489 CASAVA_Build 8 52434674 2D TTTCAGAAGG AA/-- AAAAAAATAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 9 7 358490 CASAVA_Build 8 52444767 2I ATAGTGCCAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 40 0 25 15 A 11 13 358491 CASAVA_Build 8 52447208 1I GTAGTCAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 40 0 27 13 A 10 11 358492 CASAVA_Build 8 52452375 1D TTCTAGGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 11 10 358493 CASAVA_Build 8 52455083 1I ATATGAGCCC -/T TTTTTCTTGT 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 T 5 6 358494 CASAVA_Build 8 52455241 2D CTGACGAGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 21 6 A 13 11 358495 CASAVA_Build 8 52457397 16D AGGAAAAGCA AAGGATTCTCTCCTCC/---------------- AAGGTCCTGA 3070 het 3070 ref 38 22 19 3 AAGGATTCTCTCCTCC 1 0 358496 CASAVA_Build 8 52459491 1D GGTGAATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 12 11 A 12 11 358497 CASAVA_Build 8 52459681 1I CAATTAAAAA -/C GTATGCATTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 C 0 1 358498 CASAVA_Build 8 52461938 1I CTTCATCTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2209 hom 21 7 12 2 A 13 14 358499 CASAVA_Build 8 52478202 1D CTCCCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 1131 het 1131 ref 20 14 4 2 A 15 14 358500 CASAVA_Build 8 52485783 1D CATTCACTTA T/- TTCATTTGAA 3070 het 3070 ref 35 17 16 2 T 3 2 358501 CASAVA_Build 8 52503436 1I AATTCTCATT -/A AAATCCCAGC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 3 4 358502 CASAVA_Build 8 52505782 5D TGTTCGCTGG AATAA/----- AGTCTCTGCT 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 AATAA 1 0 358503 CASAVA_Build 8 52510609 2D CAAGTTAAAA TT/-- TTTAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 10 T 5 3 358504 CASAVA_Build 8 52515563 3D TCCATTGAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 45 het 18 0 15 4 AAT 7 6 358505 CASAVA_Build 8 52517986 1I GCTTGTTTTT -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 6 7 358506 CASAVA_Build 8 52520027 1I TATTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 T 10 11 358507 CASAVA_Build 8 52539478 39I CCCCATCTCT ---------------------------------------/AATTTTTTAAAAAATCAATTTTTATAAGTAAAATAACCA AAATCAGAGC 3070 hom 54 het 15 0 17 3 AATTTTTTAAAAAATCAATTTTTATAAGTAAAATAACCA 0 1 358508 CASAVA_Build 8 52551724 2I GAGATTTATG --/GT ATATACCTCC 3070 hom 84 het 39 0 29 10 GT 0 1 358509 CASAVA_Build 8 52561720 13D TAGTTTCCTT TTTTTCTTTCTTC/------------- TTTCCAACTT 1312 het 1312 ref 20 15 5 5 TTTTTCTTTCTTC 1 0 358510 CASAVA_Build 8 52578516 1D TTTTTCAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 8 7 358511 CASAVA_Build 8 52579169 1D CAATGACCCC T/- CTGTCTCCCT 3070 het 3070 hom 26 9 14 4 T 1 0 358512 CASAVA_Build 8 52588050 5I TCCCACCAAC -----/TCTCA AGGGGCAAGC 3070 hom 105 het 43 0 36 7 TCTCA 0 1 358513 CASAVA_Build 8 52596442 1D TGGAAACTAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 9 8 358514 CASAVA_Build 8 52599262 3I GAGTCATACC ---/AAT TGATATATGA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AAT 0 1 358515 CASAVA_Build 8 52603404 4D TATAACAAAA ACTG/---- AAGACAAAAA 3070 het 3070 hom 33 15 18 3 ACTG 1 0 358516 CASAVA_Build 8 52610851 1D AATAAATAAA T/- AAAAATAAAG 3070 het 1388 hom 17 6 10 1 T 1 0 358517 CASAVA_Build 8 52620022 1I AAGGCAGTAT -/A AAAAACAAAC 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 A 5 6 358518 CASAVA_Build 8 52620591 1D TACTGCTCTT A/- AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 34 21 12 2 A 8 7 358519 CASAVA_Build 8 52636053 1D AACAACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 23 13 5 A 11 10 358520 CASAVA_Build 8 52651190 1D TAGTTAAAGA T/- TTTAATACCC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 4 3 358521 CASAVA_Build 8 52666226 1D GGGATTTCAA C/- CCCCCTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 23 1 C 6 5 358522 CASAVA_Build 8 52666632 17I11M4I AGCTAAAGAT -----------------TGGAATGGTGT----/TGTTAGCTCTGTAAAGATGTAAAGATGTAAAG CTTCTCTTTA 3070 het 3070 ref 42 24 20 7 N/A 0 0 358523 CASAVA_Build 8 52670944 1D AAACTGTAGG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 42 18 16 9 A 9 8 358524 CASAVA_Build 8 52671863 4D TTTATTGAGG TTAT/---- TTGTTTTTTG 3070 het 3070 hom 46 20 21 8 TTAT 1 0 358525 CASAVA_Build 8 52677220 1D TTGTATGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 21 15 9 T 10 9 358526 CASAVA_Build 8 52677501 1I ATTTTCTTCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 T 8 9 358527 CASAVA_Build 8 52680001 2D ACATCATCAC AT/-- GACTTCCATT 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 AT 1 0 358528 CASAVA_Build 8 52681192 1I ATCTCTTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 A 7 8 358529 CASAVA_Build 8 52686419 1I AAAATAGCAA -/T TTTCAGCATA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 T 3 4 358530 CASAVA_Build 8 52689917 2D AAGTAAATAT AA/-- GACTCCTCAG 3070 het 3070 ref 29 16 12 2 A 2 0 358531 CASAVA_Build 8 52691719 1D TGTAAGATGA T/- TGTAGTATTG 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 T 2 1 358532 CASAVA_Build 8 52695824 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 1716 het 1716 ref 19 12 6 1 T 9 10 358533 CASAVA_Build 8 52709873 2D GATTGCACTC TT/-- GATATGGCTC 3070 hom 111 het 41 0 38 5 T 2 0 358534 CASAVA_Build 8 52711915 1D TTCCAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 32 1 27 4 T 13 12 358535 CASAVA_Build 8 52712051 1D TGGGAGGTAA C/- CCCCAGTAGG 3070 hom 24 het 12 0 8 4 C 5 4 358536 CASAVA_Build 8 52719739 2I CGCCCAGCTA --/AT TTTTTGTATT 2893 hom 18 het 9 0 7 2 AT 0 1 358537 CASAVA_Build 8 52801883 1D GCCACTAAAA G/- CTTATTTAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 1 0 358538 CASAVA_Build 8 52804440 1I ATAAGAAAAC -/A AAAAAATGGG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 6 7 358539 CASAVA_Build 8 52805330 3I AAGATGGCAT ---/ATG ATGGGCCCTC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 ATG 1 2 358540 CASAVA_Build 8 52812870 1D CACTGTCAGA C/- CCCCCCCACC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 8 7 358541 CASAVA_Build 8 52813745 1D TTGACAGTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 38 0 29 9 A 10 9 358542 CASAVA_Build 8 52816553 1I CTTCTTTGTC -/T TTTTTTATCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 T 6 7 358543 CASAVA_Build 8 52819352 1D AGAAAGAAAG A/- AAAGAGAGGA 310 het 310 ref 21 7 4 10 A 4 3 358544 CASAVA_Build 8 52824614 1D ACATAGAAAA G/- GTACAGTAAA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 1 358545 CASAVA_Build 8 52826194 1I GCTTTCAGAC -/A ATTGCAAAGA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 1 2 358546 CASAVA_Build 8 52833026 1I TCTAAAGAAA -/T TTTAAAAAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 3 4 358547 CASAVA_Build 8 52841849 1I GTGATGCATC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 8 9 358548 CASAVA_Build 8 52843373 1D TTTATCAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 503 hom 26 2 18 6 T 13 12 358549 CASAVA_Build 8 52853393 1I AATCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 10 11 358550 CASAVA_Build 8 52855657 3D GCTGTAATAA ACT/--- ACTACCATAC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 ACT 2 1 358551 CASAVA_Build 8 52857210 3D CTCAGATGAT AAG/--- AAGGAAAGAC 3070 hom 93 het 35 0 30 6 AAG 2 1 358552 CASAVA_Build 8 52859120 1D TCTTTCCCCC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 9 8 358553 CASAVA_Build 8 52864310 1I ATTGTACCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1692 hom 31 6 19 6 T 14 15 358554 CASAVA_Build 8 52865291 1I AACAAGTCAA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 33 het 30 0 12 18 T 7 8 358555 CASAVA_Build 8 52882470 4D CTTGTGATAC CTCA/---- CTCTCGCCAT 3070 hom 135 het 48 0 46 3 CTCA 1 0 358556 CASAVA_Build 8 52885770 4I TCCTTTAAAT ----/CCCC CCCAACAATC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 3 7 358557 CASAVA_Build 8 52893617 7D ATTCAAGGTA ACTAGGT/------- ACTTCAAAAG 3070 het 3070 ref 100 81 20 5 ACTAGGT 1 0 358558 CASAVA_Build 8 52894169 4I TTAGGAAAAC ----/AAAG AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 100 31 54 15 AAAG 0 1 358559 CASAVA_Build 8 52894233 1D GCTCAAATAT G/- GACAGTTTAA 3070 het 3070 ref 99 45 40 17 G 2 1 358560 CASAVA_Build 8 52894780 2I GTATAGACTT --/CC TGTTTTAATA 3070 het 3070 hom 76 22 50 5 C 0 2 358561 CASAVA_Build 8 52895447 1I AGTAGGCATT -/C TTTCTTCTTG 3070 het 3070 hom 101 19 72 10 C 0 1 358562 CASAVA_Build 8 52895894 1I CTATTGTTTA -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 7 8 358563 CASAVA_Build 8 52897479 1I TGAGGGAGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 741 hom 34 2 28 4 A 9 10 358564 CASAVA_Build 8 52901031 11D GTGTAAATTA GTTCAACCATT/----------- GTTCAACCAT 3070 hom 27 het 15 0 10 5 GTTCAACCATT 2 1 358565 CASAVA_Build 8 52903101 2I GCATATTATC --/TA TGTCATTAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 TA 0 1 358566 CASAVA_Build 8 52906111 1I TTATTTTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 259 hom 34 2 18 14 A 13 14 358567 CASAVA_Build 8 52906410 1D GACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 31 1 18 12 A 15 14 358568 CASAVA_Build 8 52908497 4D TTTTCTAAAC AAAT/---- AAGATAAATC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 AAAT 1 0 358569 CASAVA_Build 8 52909717 3D AAAAGCACAC TAT/--- TATTTGAGGA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 TAT 2 1 358570 CASAVA_Build 8 52911597 4D CATTTTTAAA ATTT/---- ATTTTCCTGC 3070 hom 69 het 25 0 24 1 ATTT 2 1 358571 CASAVA_Build 8 52914210 1D TTATTCTTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 9 358572 CASAVA_Build 8 52916790 1D AGCTGGAGAT A/- ATTTTTTTAA 3070 hom 75 het 33 0 26 8 A 2 1 358573 CASAVA_Build 8 52918290 1D CAAAAGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 430 hom 39 2 32 5 A 11 10 358574 CASAVA_Build 8 52921852 1I ACTTTTAACC -/A AAAAAATCAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 6 7 358575 CASAVA_Build 8 52923039 1I ATAAACTAAA -/C AAAAAAGTAG 3070 hom 95 het 38 0 30 8 C 0 1 358576 CASAVA_Build 8 52928548 1I ACAGGGAGAT -/A AGAGATTCAC 3070 het 278 hom 40 1 31 8 A 1 2 358577 CASAVA_Build 8 52929490 1D TGAGAGGGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 38 0 30 9 A 10 9 358578 CASAVA_Build 8 52930692 2D AAAAAGTGTA AC/-- ACAGTATAGA 3070 hom 33 het 13 0 11 5 AC 2 1 358579 CASAVA_Build 8 52933433 1D CACTGTTTAT G/- GGGGAGCACC 3070 hom 87 het 32 0 29 4 G 5 4 358580 CASAVA_Build 8 52935021 2I CTGTTGATTT --/TA TGTCTTCTCA 3070 hom 144 het 53 0 49 5 TA 0 1 358581 CASAVA_Build 8 52949737 4I GCCAAACAGT ----/GTGA GTAAAATTAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 GTGA 0 1 358582 CASAVA_Build 8 52951054 6D AAAATGTGTT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 34 0 26 11 TG 10 7 358583 CASAVA_Build 8 52951241 4D ATCCTTCCAT AAAC/---- AAACATATTA 3070 hom 117 het 41 0 40 3 AAAC 2 1 358584 CASAVA_Build 8 52951509 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 36 0 29 8 A 9 8 358585 CASAVA_Build 8 52955322 1D CCTTTTAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 78 hom 26 1 14 11 A 10 9 358586 CASAVA_Build 8 52956366 3D GTGCCTGTGT TGG/--- TGGTGCCACT 3070 hom 120 het 41 0 41 0 TGG 2 1 358587 CASAVA_Build 8 52956762 4D GCATTCAACC AACT/---- GTTTTAGAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AACT 1 0 358588 CASAVA_Build 8 52957180 1I CTTTTCAGGC -/T GTCATAACAA 3070 hom 129 het 49 0 43 6 T 0 1 358589 CASAVA_Build 8 52957584 3I TCAAACACCC ---/TGA GCCTATGTAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TGA 0 1 358590 CASAVA_Build 8 52960929 1D ATGTCTCTAC A/- GGGGCATACG 3070 hom 144 het 50 0 49 1 A 1 0 358591 CASAVA_Build 8 52962075 1I GTCCATCTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 11 12 358592 CASAVA_Build 8 52966981 3I ACCTGGTATC ---/CCA CCACCACCAC 3070 hom 45 het 22 0 15 7 CCA 3 4 358593 CASAVA_Build 8 52967969 2D AAATAAAAAA AT/-- AGTTTCCATT 3070 hom 93 het 35 0 31 4 AT 1 0 358594 CASAVA_Build 8 52971997 1I GCACTATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1093 hom 38 3 26 9 A 15 16 358595 CASAVA_Build 8 52976419 2I GTGCAGTGGC --/GT AACCTCTGCT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 GT 0 1 358596 CASAVA_Build 8 52984530 1I TTTTTTTTTT -/G ATATACAGAT 3070 het 1781 hom 27 6 14 7 G 0 1 358597 CASAVA_Build 8 52985628 1D CCAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 358598 CASAVA_Build 8 52990343 4D TTGCTTGTTG GTTT/---- GTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 GTTT 3 2 358599 CASAVA_Build 8 53005773 1I CCATTTAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 A 10 11 358600 CASAVA_Build 8 53009308 1I GTTAGGGTCT -/C CCCTGACAGA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 C 3 4 358601 CASAVA_Build 8 53009808 3I ATGCTTTATG ---/AAT ATATTGTCAT 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 AAT 0 1 358602 CASAVA_Build 8 53013837 1I CCCATACTCA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 7 8 358603 CASAVA_Build 8 53016870 4D CATGCCTGGC TATA/---- TATATTTTTT 1978 het 1978 ref 22 14 5 4 TA 4 2 358604 CASAVA_Build 8 53020430 1I GCTTTTGAAA -/C CCCTCCTCAT 3070 hom 59 het 25 0 20 5 C 3 4 358605 CASAVA_Build 8 53020843 1I AGGCCCAGAG -/A TGTAAATCTG 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 0 1 358606 CASAVA_Build 8 53027058 1I CCAGCTACTA -/G AGAGGCTGAG 3070 hom 75 het 27 0 24 3 G 0 1 358607 CASAVA_Build 8 53030183 1I AAATGTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 12 7 T 11 12 358608 CASAVA_Build 8 53030615 1I GATTTTCAAG -/A GGGACTAGCA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 0 1 358609 CASAVA_Build 8 53032847 1I GGGTTATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 55 14 29 12 A 10 11 358610 CASAVA_Build 8 53034099 1I GGCTGGTGCC -/T GTAATCCTAG 3070 het 3070 hom 23 11 9 3 T 0 1 358611 CASAVA_Build 8 53043097 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2399 hom 27 10 14 3 A 13 12 358612 CASAVA_Build 8 53044138 1I AAAAATAGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 10 11 358613 CASAVA_Build 8 53051622 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1793 hom 27 6 12 9 A 13 14 358614 CASAVA_Build 8 53068879 1I AAAAAAAGTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 A 7 8 358615 CASAVA_Build 8 53073338 1I TTTTTAGTAG -/A AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 6 7 358616 CASAVA_Build 8 53073936 1I GGGCTCAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 9 8 T 11 12 358617 CASAVA_Build 8 53074406 1D AGTTAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 13 9 T 13 12 358618 CASAVA_Build 8 53074918 1D ACCTCCTGGG T/- TCACGCCATT 1507 het 458 hom 8 2 4 2 T 2 1 358619 CASAVA_Build 8 53084326 1D CAAAGTTGTC A/- AAAGTACTTA 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 4 3 358620 CASAVA_Build 8 53084403 1I CTAACTTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 10 11 358621 CASAVA_Build 8 53101144 1D CCAAAATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 23 5 A 11 10 358622 CASAVA_Build 8 53108303 1D CTGGGCCCTA T/- TTTCTCTTCC 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 T 4 3 358623 CASAVA_Build 8 53111536 1I TTTCTAGAGG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 7 8 358624 CASAVA_Build 8 53125687 2D TCTGAAGAGC CA/-- CATCTTCTCT 3070 het 3070 ref 35 22 9 4 CA 2 1 358625 CASAVA_Build 8 53126889 2D ACACGCGCGC GG/-- GCACAGACAC 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 G 3 1 358626 CASAVA_Build 8 53130535 1I GTGGTTCCTC -/T GCCTGCTTGG 3070 hom 87 het 33 0 27 6 T 0 1 358627 CASAVA_Build 8 53137074 4D GTCCAATTTT TTTA/---- TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 49 25 21 3 TTTA 1 0 358628 CASAVA_Build 8 53138446 4I ATAACATATA ----/TTTG TTTGTAGTTT 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 TTTG 1 2 358629 CASAVA_Build 8 53142146 1I TGTAGTTTTC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 7 8 358630 CASAVA_Build 8 53143811 1I TAAGGAGGTT -/C TATTTTGGTG 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 C 0 1 358631 CASAVA_Build 8 53151884 1I CCTTGGTTCT -/G CACTGTTGTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 0 1 358632 CASAVA_Build 8 53166008 3I CAGTGGCACA ---/ATC GAGGCTCACT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 ATC 0 1 358633 CASAVA_Build 8 53166438 1I TTTTGAAATA -/C GGGATACAGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 358634 CASAVA_Build 8 53175482 1D ACCCCAGGCA G/- GGGGCACACC 3070 hom 44 het 27 0 19 10 G 5 4 358635 CASAVA_Build 8 53180163 1D GGTAATTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 704 hom 40 7 20 13 A 17 16 358636 CASAVA_Build 8 53199975 8I ACAGTAGGAA --------/GCTCGAGT GCTTTCCCTC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 GCTCGAGT 0 1 358637 CASAVA_Build 8 53200774 1D TGGGCTAATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3025 hom 28 9 9 11 T 12 11 358638 CASAVA_Build 8 53202926 1D ATCTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2085 hom 29 7 15 7 A 13 12 358639 CASAVA_Build 8 53204171 2D GTCATCCTGC AT/-- ATATATACAT 3070 het 3070 ref 48 22 23 4 AT 4 3 358640 CASAVA_Build 8 53209714 1D AGGGAACAAA T/- TGCCTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 2 1 358641 CASAVA_Build 8 53216759 3I ACATAAGTGA ---/TGT TTGAGAGAAG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TGT 0 1 358642 CASAVA_Build 8 53218597 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 A 9 10 358643 CASAVA_Build 8 53220169 1D TAGATGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 T 15 14 358644 CASAVA_Build 8 53230315 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 14 15 358645 CASAVA_Build 8 53274225 1I TTACATAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 416 hom 33 2 18 13 T 15 16 358646 CASAVA_Build 8 53276449 1I AGCACTTTGT -/G GAGTCTAGGA 3070 hom 114 het 48 0 37 11 G 1 2 358647 CASAVA_Build 8 53281809 1D GCTTATAGGT A/- AAAAGGGTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 6 A 5 4 358648 CASAVA_Build 8 53283930 8D GGCTTCGCCA AAATAAAT/-------- AAATAAATAA 3070 het 1677 hom 15 4 8 3 AAAT 7 5 358649 CASAVA_Build 8 53293502 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1935 hom 22 7 10 5 T 11 10 358650 CASAVA_Build 8 53293591 1D ACCTCTGCCT C/- CCGGGTTCAA 1690 het 1690 ref 14 8 5 2 C 3 2 358651 CASAVA_Build 8 53297023 1D GATTGCAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 9 9 A 13 12 358652 CASAVA_Build 8 53305784 1D GATTTTTTTT A/- AAAAATCCTT 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 6 5 358653 CASAVA_Build 8 53305930 9D GAAAGAGGCG AACTTCACC/--------- AACTTCACCA 3070 hom 90 het 34 0 30 9 AACTTCACC 2 1 358654 CASAVA_Build 8 53323184 1D GTACTTCATG A/- AAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 37 17 9 11 A 8 7 358655 CASAVA_Build 8 53325775 2I ATCACCATCC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 36 1 28 7 A 13 15 358656 CASAVA_Build 8 53326718 1D CAGTAAAAGG A/- AAGACAATGC 3070 hom 108 het 43 0 37 7 A 3 2 358657 CASAVA_Build 8 53327619 1D TGGCCACTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 34 0 31 5 A 11 10 358658 CASAVA_Build 8 53328011 1D AAAGAAAAAT A/- AAAAAGCAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 5 358659 CASAVA_Build 8 53332943 8D TTGTGCTTTG GTGTCATA/-------- GCTAAGAAAC 3070 het 3070 ref 25 16 9 3 GTGTCATA 1 0 358660 CASAVA_Build 8 53333176 1I TGCTTTGACA -/C CCTTGTTGGA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 C 2 3 358661 CASAVA_Build 8 53351151 9D5M1D60M2D12M3D CACACACCAC ATGCACACTGCACACCAGACATCACACATACACATCACACATGTAAGCCACACACCACACACATGAAACACACACCGCACCTATCACATACC/---------GCACA-CACACACCACACACACACATCACACATGCAAGCCACACACCACACACATCAAACACACAC--AACATACCACAT--- ACACACACAC 2481 het 2481 ref 87 111 6 13 N/A 0 0 358662 CASAVA_Build 8 53351257 2D7M5D4M2I ACACACCACA TGCACACCACGCACCACA--/--CATACCA-----CACAGG CATACCATAT 3070 het 3070 ref 45 24 9 19 N/A 0 0 358663 CASAVA_Build 8 53385502 8D TACTGTGTCT TTTATTCC/-------- TTTATTCCCC 3070 hom 108 het 36 0 37 6 TTTATTCC 2 1 358664 CASAVA_Build 8 53385730 1I AGTCTACTCA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 32 14 12 6 T 8 9 358665 CASAVA_Build 8 53405654 1D GGCCCAGGAA C/- CTTTTGGTAG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 2 1 358666 CASAVA_Build 8 53408264 7D ATTGATGAGC TCAAATA/------- TGTAAAGTGA 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 TCAAATA 1 0 358667 CASAVA_Build 8 53408414 2D ATTTTCTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1788 hom 23 8 11 4 A 14 12 358668 CASAVA_Build 8 53416992 1I GCTGGTGTGG -/C AGGATCCCCT 3070 hom 56 het 23 0 14 9 C 0 1 358669 CASAVA_Build 8 53417489 1I ATAACTCTCA -/C CCCCCAAATA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 5 6 358670 CASAVA_Build 8 53419366 1I AGAAGCCTTA -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 6 7 358671 CASAVA_Build 8 53440227 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 10 11 358672 CASAVA_Build 8 53440338 4I TTACAAAATG ----/CTTT CTGTGATCTG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CTTT 0 1 358673 CASAVA_Build 8 53440697 1D AAACTAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 20 8 A 11 10 358674 CASAVA_Build 8 53457866 1D TCATTTACAA T/- TTTTTTTTTT 1753 het 1753 ref 24 14 5 6 T 15 14 358675 CASAVA_Build 8 53460711 1D ACTCCGACTC A/- AAAAAAAAAA 1826 het 12 hom 15 1 6 8 A 17 16 358676 CASAVA_Build 8 53482574 1D TATTTTTATC A/- AAAAAATCAC 3070 hom 99 het 38 0 34 7 A 7 6 358677 CASAVA_Build 8 53484654 1I AGCCAATGTG -/A ATAGCACCTT 3070 hom 114 het 44 0 37 7 A 1 2 358678 CASAVA_Build 8 53488083 1D CTCCTCCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 740 hom 31 4 8 20 A 13 12 358679 CASAVA_Build 8 53488292 1D TAAGAAGCTA T/- TACTATGAGC 3070 het 3070 hom 42 18 21 5 T 2 1 358680 CASAVA_Build 8 53491710 1I ACTGTTGGGG -/T TTTTTTTGTA 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 7 8 358681 CASAVA_Build 8 53491796 2D TCATTCAAGA TC/-- TTGAAACTAT 3070 het 3070 ref 46 24 20 2 TC 1 0 358682 CASAVA_Build 8 53510855 2D GGTGGGGGGT GG/-- GAGTTGGTAT 3070 het 3070 ref 30 11 11 9 G 3 1 358683 CASAVA_Build 8 53515727 1I AAAACAGCAC -/A ACTTTACCAA 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 A 1 2 358684 CASAVA_Build 8 53526998 1I20M1I GTTGTGAATT -AAAAAAAAAAATCACTGAAT-/AAAAAAAAAAAATCACTGAATA AAGTCTAACA 3070 het 3070 ref 28 13 9 9 N/A 0 0 358685 CASAVA_Build 8 53529419 1D TTAAAACAAA C/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 C 1 0 358686 CASAVA_Build 8 53530517 1D GGCATTTAAC A/- AAAAAAAAAA 2159 het 2159 ref 20 12 5 3 A 11 10 358687 CASAVA_Build 8 53535537 1I CAGAATGTGG -/A AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 A 6 7 358688 CASAVA_Build 8 53537255 2I TTAAAAAAAC --/TG TGTTAAAGTT 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 TG 1 2 358689 CASAVA_Build 8 53539450 1I GATATCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 14 17 18 T 13 14 358690 CASAVA_Build 8 53541619 1D TATTTCTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 10 9 358691 CASAVA_Build 8 53543576 1D CTCTGTGCTC T/- GCCTATTCAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 T 1 0 358692 CASAVA_Build 8 53547329 1D TCTACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 22 15 12 A 12 11 358693 CASAVA_Build 8 53547979 1I GTGTGTCACC -/A CCTTCCCCAA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 0 1 358694 CASAVA_Build 8 53557403 1D ACTAATAAGT A/- ATTTGAGTCA 3070 het 3070 ref 47 23 20 5 A 2 1 358695 CASAVA_Build 8 53558289 6I GATGGGGAGA ------/AGTTGG CCAACAGATA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AGTTGG 0 1 358696 CASAVA_Build 8 53561483 4D GTCAATATCC TATA/---- TATAAGGCTC 3070 hom 90 het 31 0 30 2 TA 4 2 358697 CASAVA_Build 8 53562138 1D GTTCAGGCAT A/- TTCATGCATG 3070 het 3070 hom 45 12 27 6 A 1 0 358698 CASAVA_Build 8 53563354 1D CCTGGGTGAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 362 hom 37 3 20 14 A 10 9 358699 CASAVA_Build 8 53563448 1D TAAAAGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 12 11 358700 CASAVA_Build 8 53565735 1I GAAAATAACT -/A AAAAATATAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 5 6 358701 CASAVA_Build 8 53568743 6D CCTGGAGATG TTGACC/------ ACTTCGGTAT 3070 het 3070 ref 40 22 15 6 TTGACC 1 0 358702 CASAVA_Build 8 53576068 2I CTTCTCAGAT --/GG GGTACTGAAG 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 G 2 4 358703 CASAVA_Build 8 53576672 1D AGGGGGTGTT A/- ACACGGAAGT 3070 het 3070 hom 37 13 11 13 A 2 1 358704 CASAVA_Build 8 53580735 1I TCTGTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 1585 het 490 hom 19 2 8 9 A 15 16 358705 CASAVA_Build 8 53600573 1D AAAGTCTGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 16 hom 37 1 21 15 A 10 9 358706 CASAVA_Build 8 53608431 1I AAAAGTAGTC -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 6 7 358707 CASAVA_Build 8 53615042 1D ACAGGAAAAG A/- ATGCTTATTA 3070 het 3070 ref 32 19 8 5 A 2 1 358708 CASAVA_Build 8 53625549 2D AGCTGCAGAG AC/-- AGAGTTGAGT 3070 het 3070 hom 39 17 18 6 AC 1 0 358709 CASAVA_Build 8 53635885 4I CATCTCAGAA ----/TTTC TGAGTATTTA 3070 het 3070 ref 40 25 13 2 TTTC 0 1 358710 CASAVA_Build 8 53641722 1I CAAAGCAAGC -/T TTTGCAGGAG 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 T 3 4 358711 CASAVA_Build 8 53642392 1I GAGAGGCTGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 13 15 10 A 8 9 358712 CASAVA_Build 8 53643248 4D ATATAAATAT AGAG/---- ATATATGTAA 3056 het 2685 hom 18 8 7 4 AG 2 0 358713 CASAVA_Build 8 53647230 1D TGACACTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 11 10 358714 CASAVA_Build 8 53651897 4D AAATAATATT TATG/---- TATTTAATAT 3070 het 3070 hom 41 16 23 3 TATG 1 0 358715 CASAVA_Build 8 53655268 1D TCTAGGTATT A/- AGTCCAGCAT 2839 het 2839 ref 30 20 6 4 A 2 1 358716 CASAVA_Build 8 53661133 3D TTCGTTCCTA AGG/--- AGGAGGGCCT 3070 het 3070 hom 38 13 23 4 AGG 3 2 358717 CASAVA_Build 8 53665766 1D AGTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 16 9 5 A 11 10 358718 CASAVA_Build 8 53665943 3I TTTTTTTAAC ---/TTG TTGTTTGTAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTG 1 2 358719 CASAVA_Build 8 53671244 1D ACATCGGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 11 8 15 T 15 14 358720 CASAVA_Build 8 53674055 1D GGCCAGACGT G/- GGTAGCTCAC 3070 hom 117 het 46 0 39 8 G 3 2 358721 CASAVA_Build 8 53692628 1I TGAAACAGAG -/A AAGAAACTGT 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 A 2 3 358722 CASAVA_Build 8 53693603 3D ATGATAGAAA ACG/--- ACGACAACAC 3070 het 3070 ref 45 23 16 9 ACG 2 1 358723 CASAVA_Build 8 53694887 1D ATGGGCATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 28 1 20 7 T 15 14 358724 CASAVA_Build 8 53698318 1I TTACAGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 T 11 12 358725 CASAVA_Build 8 53699058 1D CCCAAAAAAC A/- AAAAGAAACA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 5 4 358726 CASAVA_Build 8 53701929 1D GAGTTGTCAT G/- GGGAAAGTGG 3070 hom 96 het 37 0 30 8 G 4 3 358727 CASAVA_Build 8 53703878 2D CTTTACAGCC TT/-- TTTCAGAACT 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 T 5 3 358728 CASAVA_Build 8 53712143 1I GACTTTGTTA -/T TTTTTCAAGA 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 T 5 6 358729 CASAVA_Build 8 53729576 2D GGCAAGTAAC TG/-- AGAACTATCC 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 TG 1 0 358730 CASAVA_Build 8 53745074 5D TCCTAAAAAA AATTT/----- ATTTTTGAGC 3070 het 3070 ref 49 25 21 10 AATTT 1 0 358731 CASAVA_Build 8 53749884 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1770 het 1770 ref 29 14 6 9 A 16 15 358732 CASAVA_Build 8 53781257 1I CATATCCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 A 10 11 358733 CASAVA_Build 8 53781475 1D AACTGTTATC T/- TTTTTTTTTT 2958 het 1481 hom 23 7 8 8 T 15 14 358734 CASAVA_Build 8 53799077 1D TTTGTGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2415 hom 27 9 13 5 T 12 11 358735 CASAVA_Build 8 53802693 1D CACTCCTAGG T/- TATATACTCA 3070 het 3070 hom 39 18 17 4 T 2 1 358736 CASAVA_Build 8 53837419 2D TTTATGTAGG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 12 19 5 T 11 9 358737 CASAVA_Build 8 53838291 5D CTTTCCATGT GTTAC/----- CATAAGGGTA 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 GTTAC 1 0 358738 CASAVA_Build 8 53842598 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1753 hom 27 9 10 8 A 13 12 358739 CASAVA_Build 8 53848703 1I CACACAGAAG -/A AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 7 8 358740 CASAVA_Build 8 53871260 3D ATAAAGAAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 hom 26 10 12 5 AAT 5 4 358741 CASAVA_Build 8 53872659 1D TGTATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1360 hom 25 5 14 6 T 11 10 358742 CASAVA_Build 8 53875859 1I TGAAACTACC -/G GTACCAGGTG 3070 het 3070 hom 39 15 17 7 G 1 2 358743 CASAVA_Build 8 53878521 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAAGGAAAAG 3070 het 54 hom 22 1 16 5 AAG 0 1 358744 CASAVA_Build 8 53881141 1I TCCAAAAAGG -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 A 6 7 358745 CASAVA_Build 8 53886477 1I AGGATTTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 8 9 358746 CASAVA_Build 8 53891008 1D TATAAATAAT A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 8 7 358747 CASAVA_Build 8 53894117 6I CAAAGTCTTG ------/AGCTCC AGAATATGGT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AGCTCC 0 1 358748 CASAVA_Build 8 53901717 1D ATTTCTCTGG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 98 het 39 0 33 6 A 9 8 358749 CASAVA_Build 8 53902238 1I TTAGCAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 544 hom 27 2 18 7 T 12 13 358750 CASAVA_Build 8 53904287 1I AGCAAACATG -/T ACAGCTTCTG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 0 1 358751 CASAVA_Build 8 53905473 1D TCATGCTTAA T/- AATATGGGTT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 T 1 0 358752 CASAVA_Build 8 53908295 6I ACCCCTAAGG ------/ATCTAA GGTTGCATCC 3070 hom 93 het 33 0 32 1 ATCTAA 0 1 358753 CASAVA_Build 8 53916437 1I GCTTTCCCCC -/T ACCACTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 0 1 358754 CASAVA_Build 8 53938777 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2670 hom 32 9 9 14 T 15 14 358755 CASAVA_Build 8 53975499 2I TGATTGAGAC --/AT ATTTTTATTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 AT 1 2 358756 CASAVA_Build 8 53977255 1I TGTAGTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 13 16 6 T 12 13 358757 CASAVA_Build 8 53982103 4I AATCATCTAC ----/CTAT CTATCTATCA 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 CTAT 2 3 358758 CASAVA_Build 8 53998684 17I TCTTCTAATA -----------------/TAAATATAAGTTCTTCT TATCTAAATA 3070 het 3070 hom 37 16 19 3 TAAATATAAGTTCTTCT 0 1 358759 CASAVA_Build 8 54004045 4I AAGATACTAT ----/CAAA CAGTCTTCCA 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 CAAA 0 1 358760 CASAVA_Build 8 54005218 1D TTCTTTTTTT G/- AAGTTGGACA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 G 1 0 358761 CASAVA_Build 8 54008976 4D CAAATTTGAA GTCT/---- GATGACCATC 323 het 323 ref 30 15 2 14 GTCT 1 0 358762 CASAVA_Build 8 54011438 1D AATTGAAATT C/- CCCCCCCCCG 2696 het 1721 hom 22 6 10 6 C 10 9 358763 CASAVA_Build 8 54013526 1D AAATGTGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 A 11 10 358764 CASAVA_Build 8 54024203 1D GTTTTATTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1612 hom 20 8 9 3 A 12 11 358765 CASAVA_Build 8 54026517 1D CAACTTCATT A/- AAAAGAACTC 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 A 5 4 358766 CASAVA_Build 8 54028699 1I TAAGAATAAG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 7 8 358767 CASAVA_Build 8 54034583 9D TGCCAAAGGA AGTTTATGG/--------- AGTTTATGGC 3070 het 3070 ref 36 27 8 5 AGTTTATGG 2 1 358768 CASAVA_Build 8 54038657 1I ATTTGGATTT -/G GGGGGGGCCA 3070 het 2639 hom 24 8 11 5 G 7 8 358769 CASAVA_Build 8 54038840 1D CTTTTTAGTA T/- GGATTCCTGA 3070 het 3070 ref 49 24 19 6 T 1 0 358770 CASAVA_Build 8 54041152 1I TTTTGTAAGG -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 hom 27 14 13 0 A 6 7 358771 CASAVA_Build 8 54050951 1D GGAAACTAGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 21 14 8 T 10 9 358772 CASAVA_Build 8 54053979 1D TGAAGGGAAC T/- TTTTTTTTTT 2785 het 1690 hom 23 9 9 6 T 19 18 358773 CASAVA_Build 8 54058287 1I AACAGTCACT -/G GGGCAACTAC 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 G 3 4 358774 CASAVA_Build 8 54058748 2D TGAATTAAAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 34 15 12 9 AC 7 6 358775 CASAVA_Build 8 54062122 5D TTCTTTCCAA TAACT/----- TAACTATTCT 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 TAACT 2 1 358776 CASAVA_Build 8 54078654 4D TCTAATTTTG TCTA/---- TCTATCTATC 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 TCTA 3 2 358777 CASAVA_Build 8 54099617 2D ATTTATGGTG CA/-- CACACACACA 1315 het 1315 ref 41 32 3 7 CA 7 6 358778 CASAVA_Build 8 54101655 5D TTGGGAGAGA AATGT/----- AATAATAGAG 3070 het 3070 hom 46 23 22 2 AATGT 1 0 358779 CASAVA_Build 8 54101989 1I TTTAAACAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 12 10 T 10 11 358780 CASAVA_Build 8 54112227 1I ATACAGTGCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 14 10 A 9 10 358781 CASAVA_Build 8 54113301 2I GTGACAGTTT --/CA CACAGAGTTC 3070 het 3070 ref 44 24 19 1 CA 2 3 358782 CASAVA_Build 8 54129471 4D AAATTGTATA TATT/---- TACCATATAC 3070 het 3070 ref 29 15 13 4 TATT 1 0 358783 CASAVA_Build 8 54132328 1D TAAAAGATTC T/- TTTTTTTATG 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 8 7 358784 CASAVA_Build 8 54133972 4D TACAAGAAAA AAAC/---- AAACAACTCC 3070 het 3070 ref 29 19 9 1 AAAC 2 1 358785 CASAVA_Build 8 54135786 1D ATATAATCTC T/- TTTTTTTTGG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 9 8 358786 CASAVA_Build 8 54138490 1I GTATTGACTT -/A AAAACGTAAG 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 4 5 358787 CASAVA_Build 8 54154991 1D CCAATAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 T 12 11 358788 CASAVA_Build 8 54158366 3D GTCCAATAAA CCT/--- CCTTCTTTTG 3070 het 3070 ref 46 30 13 6 CCT 2 1 358789 CASAVA_Build 8 54162216 1D TAAAAAATAA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 T 9 8 358790 CASAVA_Build 8 54162666 1I TCTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 2351 het 1596 hom 29 6 9 14 T 17 18 358791 CASAVA_Build 8 54167339 1I GTATAATGTT -/G GCTGTGGGTT 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 G 1 2 358792 CASAVA_Build 8 54170409 3I ATGAAAGAGT ---/CAA TTTATCAGAA 3070 het 3070 ref 30 14 8 8 CAA 0 1 358793 CASAVA_Build 8 54178797 1D CTCTGTCTCT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 A 8 7 358794 CASAVA_Build 8 54191831 1D AAATCTTCAC T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 T 7 6 358795 CASAVA_Build 8 54198425 1I AACTTTTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2892 hom 29 7 16 6 T 9 10 358796 CASAVA_Build 8 54199408 1D TTTGTATTTA T/- TTTTTTGTCT 3070 het 3070 ref 36 17 14 7 T 7 6 358797 CASAVA_Build 8 54204821 4I GCTGAGATGC ----/CGCT CCAGCTTGAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 CGCT 0 1 358798 CASAVA_Build 8 54204936 1I30M1I TTAAGTTCAG -TTTTTTTTTGTTTATTTAACTATTTATTGA-/TTTTTTTTTTGTTTATTTAACTATTTATTGAT TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 17 13 8 N/A 0 0 358799 CASAVA_Build 8 54205109 2I TTTCTCACCC --/CT CTTATACCCT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CT 1 2 358800 CASAVA_Build 8 54213040 4D CTGTCTCTTC CTCT/---- CTCTCTCTTT 3070 het 3070 hom 24 11 10 4 CT 6 4 358801 CASAVA_Build 8 54218554 1D2M3I4M2D TAGCTAGTCA TGA---CAATTA/-GAGAGCACT-- GATTGGTGCA 2959 het 2959 ref 25 14 8 4 N/A 0 0 358802 CASAVA_Build 8 54222385 4I TTTTAATGTT ----/AGAC AGTATGAAAA 3070 hom 126 het 51 0 43 8 AGAC 0 1 358803 CASAVA_Build 8 54226429 1I ACAGGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 9 7 A 10 11 358804 CASAVA_Build 8 54227100 1I CCATAAAATA -/T TCTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 T 1 2 358805 CASAVA_Build 8 54233598 4I CTTTGTTAGC ----/TTGT TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 34 15 12 7 TTGT 3 4 358806 CASAVA_Build 8 54236816 5I ATTTGCTTAG -----/TATAA TGGCCTTCAG 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 TATAA 0 1 358807 CASAVA_Build 8 54247030 1I CTGTTTTGCT -/G AAGTGAGAGA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 G 0 1 358808 CASAVA_Build 8 54258945 1I AATTCTAGTA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 7 8 358809 CASAVA_Build 8 54260307 1D TTTGTTTTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 30 16 10 5 T 9 8 358810 CASAVA_Build 8 54268978 3D AGTGTGTGAG AGA/--- AGAAGAGACA 3070 het 3070 hom 43 19 19 5 AGA 3 2 358811 CASAVA_Build 8 54287218 1I GAAGCAGGTT -/G TTTCATTTCC 3070 het 3070 hom 48 20 25 3 G 0 1 358812 CASAVA_Build 8 54289593 1D CTGGAGGTGG T/- TATTAGCATG 3070 het 3070 hom 54 20 27 7 T 2 1 358813 CASAVA_Build 8 54291391 1D GTCAGGAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 13 12 358814 CASAVA_Build 8 54293017 1D GCGCGTGTGT G/- GGGGGGGTGT 3070 het 1288 hom 28 7 15 6 G 8 7 358815 CASAVA_Build 8 54298220 1D ATGGTCTCTT C/- CCCTAAATAA 3070 het 3070 hom 54 20 27 7 C 4 3 358816 CASAVA_Build 8 54299385 1I TAAATTCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 42 4 26 12 T 13 14 358817 CASAVA_Build 8 54319346 1I AACCTAAGAT -/G ATCCCAGCAG 3070 het 3070 ref 54 26 20 8 G 0 1 358818 CASAVA_Build 8 54322801 1I GAAGTCAGGA -/G ACCACAGGAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 G 0 1 358819 CASAVA_Build 8 54352469 5D GGACATTAAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 32 12 12 8 AAAGA 4 3 358820 CASAVA_Build 8 54419079 4I GACACTTGTC ----/CAAA CAAAGGTCAG 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 CAAA 1 2 358821 CASAVA_Build 8 54421916 18I ATCAAAGACA ------------------/AATTTTTGTCCCAGACTG AATTCCAAGC 2281 het 2281 ref 24 13 6 5 AATTTTTGTCCCAGACTG 0 1 358822 CASAVA_Build 8 54453933 2I AAAGTATCAA --/GC AATCCAAGTG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 GC 0 1 358823 CASAVA_Build 8 54468718 1D AGGCTCAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1544 hom 32 6 19 8 T 15 14 358824 CASAVA_Build 8 54478066 1I ATACCAAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 T 11 12 358825 CASAVA_Build 8 54479703 1D GACATTAAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 20 8 A 10 9 358826 CASAVA_Build 8 54480112 1D TGTGTAAAGC A/- AACACACAAC 3070 het 3070 ref 34 15 15 5 A 3 2 358827 CASAVA_Build 8 54482053 28D GTGTGTGTGC ATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------- ATATATATAT 3070 hom 102 het 36 0 35 5 AT 20 6 358828 CASAVA_Build 8 54489287 1I AAAAAAAAGA -/T TTTTTTGATT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 6 7 358829 CASAVA_Build 8 54498564 1D TTCTACCCTA T/- TGAAAGGCAT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 2 1 358830 CASAVA_Build 8 54501009 2I TGGTGGAAAC --/TA GGTTTCTCGC 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 TA 0 1 358831 CASAVA_Build 8 54508438 3D ATCCTCAAAT GAA/--- GGAGGATTGC 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 GAA 1 0 358832 CASAVA_Build 8 54521796 1I AGTAGGGGGA -/G GGGGGAGGGA 3070 het 2343 hom 20 7 7 6 G 5 6 358833 CASAVA_Build 8 54532254 1D AACAAACATG A/- AAAAAAAAAA 2849 het 2849 ref 24 10 8 6 A 13 12 358834 CASAVA_Build 8 54537667 3D AACCTTGGTG GTT/--- CAGAGAGGAC 3070 het 3070 hom 28 11 14 5 GTT 1 0 358835 CASAVA_Build 8 54538243 1I CATTTGTTGT -/C CCCTGCTTGA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 C 3 4 358836 CASAVA_Build 8 54548676 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 9 10 10 A 15 16 358837 CASAVA_Build 8 54551009 1D GCAATTTGGT A/- AAGTATATTT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 3 2 358838 CASAVA_Build 8 54555247 1D TTTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 2757 het 1793 hom 26 9 11 6 T 13 12 358839 CASAVA_Build 8 54564791 1I AAATCCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 18 17 11 A 10 11 358840 CASAVA_Build 8 54565558 2D TTTAAAATGG AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 11 hom 34 1 11 23 A 10 8 358841 CASAVA_Build 8 54568552 1D CATGCAGCAC T/- TTTCTGTTTC 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 T 4 3 358842 CASAVA_Build 8 54570598 1I CTTGTTATTT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 A 7 8 358843 CASAVA_Build 8 54572273 1I AACCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 23 het 21 0 15 6 A 13 14 358844 CASAVA_Build 8 54619686 2D TGGATTTAAT AA/-- ATATATATTT 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 3 1 358845 CASAVA_Build 8 54636220 3D AATAGGCAGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 28 het 29 1 23 6 A 16 13 358846 CASAVA_Build 8 54642921 1D CATATGCAGG T/- TTTTTTATAC 3070 hom 46 het 22 0 15 7 T 7 6 358847 CASAVA_Build 8 54643003 4I TAGCACTGGA ----/TAGT TATTTTTTTC 3070 hom 51 het 19 0 18 2 TAGT 0 1 358848 CASAVA_Build 8 54644430 3I GTAGTTTGAT ---/AGG AGTAGCATTG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AGG 0 1 358849 CASAVA_Build 8 54646463 1D GAGAACCTCT A/- TTAGGGTAAT 3070 het 3070 ref 41 26 12 3 A 1 0 358850 CASAVA_Build 8 54646809 1I GACTGCCCTG -/T TGGGTTTTGG 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 1 2 358851 CASAVA_Build 8 54649537 1D ACCAAAATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 89 het 40 0 31 9 A 10 9 358852 CASAVA_Build 8 54650247 3I CTGAAAACTA ---/ATG AAAGAGAAGA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 ATG 0 1 358853 CASAVA_Build 8 54650443 3D GTTTCACACT CAC/--- CATGCCCAGG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 CAC 1 0 358854 CASAVA_Build 8 54652560 3D TTCTGAGAAA GTT/--- GTTCTATATG 3070 hom 93 het 35 0 32 4 GTT 2 1 358855 CASAVA_Build 8 54655144 1D TATTTTTAAA T/- TTTCCATGAT 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 4 3 358856 CASAVA_Build 8 54671105 1I CAGTAATTTT -/A AAAATTCCTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 4 5 358857 CASAVA_Build 8 54673289 2D CTATAACAAA AT/-- ACCTGAGACT 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 AT 1 0 358858 CASAVA_Build 8 54676524 7D TTTGCCATGT TCTATTC/------- ACTAGAAACG 3070 het 3070 ref 55 26 23 10 TCTATTC 1 0 358859 CASAVA_Build 8 54677666 10D TCAAAGATTA GAGAAACATC/---------- ATCCCACAGA 3070 het 3070 ref 48 31 16 8 GAGAAACATC 1 0 358860 CASAVA_Build 8 54678087 1D AAAAATATAG A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 27 15 8 5 A 7 6 358861 CASAVA_Build 8 54684485 1I CAGGGCACAG -/C CCCAGCACAC 2889 het 2889 ref 22 12 7 3 C 3 4 358862 CASAVA_Build 8 54698772 1D CTGTGACATG C/- CTTGTGATGG 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 C 2 1 358863 CASAVA_Build 8 54705541 1I TTGCTGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 A 11 12 358864 CASAVA_Build 8 54706032 1I AAATGTCAGG -/T TACATACACA 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 1 2 358865 CASAVA_Build 8 54712546 1I TGATATTGAG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 T 7 8 358866 CASAVA_Build 8 54730088 1D AATTTTGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1961 hom 26 6 15 5 T 11 10 358867 CASAVA_Build 8 54742625 1I TAGCAGCCAG -/T TTTTTATTGC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 5 6 358868 CASAVA_Build 8 54746168 2I CAACACACAC --/AT ATCACATCAC 3070 het 3070 hom 69 28 33 8 AT 1 2 358869 CASAVA_Build 8 54746386 7D CTCTTCACCT ACACACC/------- ACACACAACA 3070 het 3070 hom 77 26 42 14 ACACACC 1 0 358870 CASAVA_Build 8 54750705 13D GAATAAATGA AAATATAAATTAT/------------- GTTTACAAAT 3070 het 3070 ref 38 23 18 6 AAATATAAATTAT 1 0 358871 CASAVA_Build 8 54752944 1D AATTCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 A 11 10 358872 CASAVA_Build 8 54762338 1D AAGTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 17 8 A 13 12 358873 CASAVA_Build 8 54768091 1I TCGTGCGAGG -/C CCTGGAAATA 3070 het 3058 hom 29 9 14 6 C 2 3 358874 CASAVA_Build 8 54768705 1D ATTGTCTGAA T/- TTTTTTTTTT 1039 het 1039 ref 29 16 4 9 T 19 18 358875 CASAVA_Build 8 54817431 2D ACCTCCACCC CT/-- GAGTGTCACA 3070 het 3070 ref 63 27 25 14 CT 1 0 358876 CASAVA_Build 8 54839661 1I GATGATGTGC -/A AAAAAAAAAA 1326 het 1326 ref 54 36 3 15 A 11 12 358877 CASAVA_Build 8 54931330 1D TATTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 913 het 656 hom 18 7 3 8 T 17 16 358878 CASAVA_Build 8 54990258 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 715 hom 34 5 18 11 A 15 14 358879 CASAVA_Build 8 55021001 1D CTTGGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2133 het 2133 ref 54 39 5 10 A 13 12 358880 CASAVA_Build 8 55028634 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 14 13 A 12 13 358881 CASAVA_Build 8 55050240 4I TATACATCTC ----/AAAT AAACTATTCT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 AAAT 0 1 358882 CASAVA_Build 8 55080132 1D CCTTCAACCC A/- ATACCCACCT 3070 hom 75 het 33 0 25 8 A 2 1 358883 CASAVA_Build 8 55080741 1D ATTCCTCCAC T/- CCTTCACCTC 3070 het 3070 hom 54 16 29 9 T 1 0 358884 CASAVA_Build 8 55139384 1D AAAAAATTAG C/- CCAGGCATGG 3058 hom 24 het 9 0 9 0 C 3 2 358885 CASAVA_Build 8 55146533 2I GTGATAGGAA --/AT CATGTTTGCA 3070 hom 87 het 38 0 30 8 AT 0 1 358886 CASAVA_Build 8 55178084 1D CCATCCTGCC T/- TAACACGGTG 3058 hom 30 het 11 0 7 4 T 2 1 358887 CASAVA_Build 8 55242594 1D TGATTAAAAT A/- AAAAAATAGG 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 7 6 358888 CASAVA_Build 8 55244546 1D TCTGTGCACA T/- AAAAGGTTGA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 1 0 358889 CASAVA_Build 8 55245248 4D ATGGACATGA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 34 15 10 10 TG 11 9 358890 CASAVA_Build 8 55246724 3I GCTCAAGCAA ---/TCC TCCTGCCTTA 3070 het 3070 hom 23 8 9 6 TCC 1 2 358891 CASAVA_Build 8 55249622 1I CCCGCGAGCA -/T TTACTCACCG 1144 het 1144 ref 22 10 4 8 T 2 3 358892 CASAVA_Build 8 55250053 1D CCATCACATA C/- CCAGGATGTG 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 C 3 2 358893 CASAVA_Build 8 55251755 2D ACACATACAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 44 18 17 10 AC 8 7 358894 CASAVA_Build 8 55257168 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 TG 6 5 358895 CASAVA_Build 8 55297977 1I TCAGCTGATT -/A AGTCAAAGCA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 2 358896 CASAVA_Build 8 55302067 1I CTGTCTCAAA -/G AAAAAAAAAA 1421 het 16 hom 14 1 7 6 G 0 1 358897 CASAVA_Build 8 55313835 2I CAGCCCCACC --/AA AAAAGATTTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 4 6 358898 CASAVA_Build 8 55323100 1D TTATTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 34 3 20 12 A 15 14 358899 CASAVA_Build 8 55327761 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 25 0 17 10 A 15 14 358900 CASAVA_Build 8 55336788 1D CAAGCTGCTA T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 7 6 358901 CASAVA_Build 8 55345301 1I GCAACATAGT -/G AGAACTTGTC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 0 1 358902 CASAVA_Build 8 55447126 1D AAATATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1073 hom 24 7 11 6 T 15 14 358903 CASAVA_Build 8 55449550 2D CATTGTACTC TT/-- GTATCAAAAT 3070 het 3070 ref 45 24 15 7 T 2 0 358904 CASAVA_Build 8 55460812 1I TCTAAAAAAA -/C AATGTATAGA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 C 0 1 358905 CASAVA_Build 8 55464423 1I AAAGTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 14 10 T 10 11 358906 CASAVA_Build 8 55465716 2I TTTCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 2894 hom 28 8 13 7 T 9 11 358907 CASAVA_Build 8 55466831 1I AAAACCCCAT -/A ATCTACTAAA 2819 het 385 hom 17 3 9 5 A 1 2 358908 CASAVA_Build 8 55473854 1D TGTCTTGTAA C/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 C 1 0 358909 CASAVA_Build 8 55473960 1D CCCCGCCGCC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 A 10 9 358910 CASAVA_Build 8 55486175 5D CCCTAAAACT TAAAG/----- TATAGTAATA 3070 het 1933 hom 13 4 9 2 TAAAG 1 0 358911 CASAVA_Build 8 55490684 2I AGTTTCACTC --/TT GTTGCCCAGG 3070 het 3070 hom 28 10 16 3 T 0 2 358912 CASAVA_Build 8 55507074 2I TTCCCACCAA --/AG AGAGAGCAGA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AG 3 4 358913 CASAVA_Build 8 55527770 2I GAGTATTGAC --/AA AGTTTTGCAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 1 3 358914 CASAVA_Build 8 55531251 1I CTGAAGCCCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 9 10 358915 CASAVA_Build 8 55532070 1D CACTGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 82 het 30 0 27 5 T 11 10 358916 CASAVA_Build 8 55533634 2I AACCCCAAAC --/AG TGTTCTTTGC 3070 hom 40 het 19 0 10 9 AG 0 1 358917 CASAVA_Build 8 55537465 4I CTTATTCCTT ----/CTAA CTATGTTTTT 2803 hom 36 het 30 0 12 18 CTAA 0 1 358918 CASAVA_Build 8 55541281 1D ACGTCATATG A/- AAAAAAATAC 3070 hom 55 het 30 0 24 7 A 8 7 358919 CASAVA_Build 8 55542990 1I AAGTTAAAAG -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 8 9 358920 CASAVA_Build 8 55543169 1D AGAGCTCTAG T/- TTGTTGCTGA 3070 hom 86 het 34 0 27 7 T 3 2 358921 CASAVA_Build 8 55545768 1D CTCAGGCCTC T/- TGAGTTGCGT 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 T 2 1 358922 CASAVA_Build 8 55559361 1D TGGAGCTGGA G/- GCTATTATCC 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 G 2 1 358923 CASAVA_Build 8 55565731 1I TTGTCTACTT -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 6 7 358924 CASAVA_Build 8 55569999 2D CATATGTGTA TG/-- TGTGTATATA 861 hom 12 het 18 0 5 14 TG 3 2 358925 CASAVA_Build 8 55575767 2D TATATATATT TA/-- TATATATATA 985 hom 10 het 5 0 4 1 TA 6 5 358926 CASAVA_Build 8 55580030 1D CCGTGGGGGG T/- TTGGGGGCGA 3070 hom 37 het 21 0 13 8 T 3 2 358927 CASAVA_Build 8 55584487 3D ATTTCTTTGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1571 hom 34 7 14 14 T 15 12 358928 CASAVA_Build 8 55585189 3I GTGCTAAAAC ---/AAA AATACTAGTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 A 2 5 358929 CASAVA_Build 8 55590906 1I GGAAAGAACA -/T CTTTTCAATA 3070 hom 153 het 58 0 51 7 T 0 1 358930 CASAVA_Build 8 55594007 1I ACAGAGAAAA -/G GCAAACAAAA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 G 1 2 358931 CASAVA_Build 8 55595603 2D CTCCCTGACC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 36 0 28 9 TG 9 8 358932 CASAVA_Build 8 55595744 1I GTCTCCATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 321 hom 29 1 19 9 A 10 11 358933 CASAVA_Build 8 55597598 1I TAGAATTTTC -/T TTTTTTTTGG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 8 9 358934 CASAVA_Build 8 55598610 4I ACCCATCTAT ----/CCAA CCAACCATCC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 CCAA 1 2 358935 CASAVA_Build 8 55608241 1I TTAGAAAAAG -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 A 6 7 358936 CASAVA_Build 8 55614525 1I AACATCCTTA -/T CCCTAATCTT 3070 hom 46 het 41 1 28 12 T 0 1 358937 CASAVA_Build 8 55614628 4I ATTTCATTTC ----/TATT TATTTATTTA 3070 het 3070 hom 39 11 20 8 TATT 3 4 358938 CASAVA_Build 8 55617416 4D TTGATCTATA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 48 het 26 0 17 11 TG 11 9 358939 CASAVA_Build 8 55625536 1D CTGACTATAC T/- TTTTTTTTTT 1966 het 377 hom 15 3 6 6 T 12 11 358940 CASAVA_Build 8 55631924 3D CTAGCAAGCC TAT/--- TACACAGCAT 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 TAT 1 0 358941 CASAVA_Build 8 55634268 1I CATTGCAGTT -/C CCTAGGTCCA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 C 2 3 358942 CASAVA_Build 8 55636637 1I TACCATGGTT -/G GAAGGATTCC 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 1 2 358943 CASAVA_Build 8 55641463 2I AGGCAGTGAG --/CT CTGACCCCAA 3070 het 3070 hom 47 19 18 10 CT 1 2 358944 CASAVA_Build 8 55645750 1I CTAGGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 2899 het 2026 hom 24 5 9 10 T 15 16 358945 CASAVA_Build 8 55646275 1D ACTGTGCCCT C/- CCCCTCCTTA 3070 hom 111 het 40 0 36 4 C 5 4 358946 CASAVA_Build 8 55649830 1I TTGTTGGATT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 9 358947 CASAVA_Build 8 55650499 1I AGAAAAATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 T 10 11 358948 CASAVA_Build 8 55652680 2D TTCTTAAGTC GT/-- GTGTTATGAA 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 GT 3 2 358949 CASAVA_Build 8 55653061 1I AAACATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 20 5 T 10 11 358950 CASAVA_Build 8 55654574 2D GTGATGAAGA CT/-- CTGGTGTCTT 3070 het 3070 hom 49 23 22 7 CT 2 1 358951 CASAVA_Build 8 55655267 4I TGTAGAATGA ----/AGTG AGTAACTGCT 3070 hom 95 het 35 0 30 5 AGTG 0 1 358952 CASAVA_Build 8 55691924 1I11M1D TGACGCATGT -ACTCTGTCATGT/AACTCTGTCATG- TTTTGTCAAG 3070 hom 132 het 47 0 45 6 N/A 0 0 358953 CASAVA_Build 8 55706959 1I AGGGATAAGA -/T TTTTTTTTTT 2903 het 2903 ref 29 13 9 7 T 13 14 358954 CASAVA_Build 8 55709620 1D CCCAAGAGGG C/- TTGATAAGGC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 C 1 0 358955 CASAVA_Build 8 55713551 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 158 hom 16 1 14 1 A 16 15 358956 CASAVA_Build 8 55721357 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTGGC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 8 7 358957 CASAVA_Build 8 55730565 15I ATGGATCAGG ---------------/TATAATAGGTAACCA TATAAATAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TATAATAGGTAACCA 0 1 358958 CASAVA_Build 8 55749847 1D ATAATCCATG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 9 19 5 A 9 8 358959 CASAVA_Build 8 55875165 2D TTCCTCAGTT TC/-- TGTTTGTATG 3070 het 3070 ref 38 21 14 4 TC 1 0 358960 CASAVA_Build 8 55879258 1D TTACATATGT G/- GGGGGGGGCT 3070 het 2145 hom 22 8 11 3 G 9 8 358961 CASAVA_Build 8 55884706 1D TGCTGTACAT A/- AAAAAAGACT 3070 het 3070 hom 46 20 24 2 A 7 6 358962 CASAVA_Build 8 55893108 5D2M3D TCCTGTCATA AAACTTGACC/-----TG--- AAATGAAATG 3070 het 3070 hom 28 13 15 5 N/A 0 0 358963 CASAVA_Build 8 55934457 6I ACTGTAGGGT ------/GGTGTC GGTGTCCCTG 3070 het 3070 hom 66 28 28 10 GGTGTC 1 2 358964 CASAVA_Build 8 55989356 2D TTTCTACACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 12 10 358965 CASAVA_Build 8 56005941 1D ATCAAAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 A 9 8 358966 CASAVA_Build 8 56007799 1I ATATTAAAAT -/A AAAAAAACTT 2905 het 2905 ref 23 12 8 3 A 7 8 358967 CASAVA_Build 8 56038476 1D AAAACAAGAC A/- AAAAAAAAAA 1397 het 1397 ref 42 24 6 12 A 15 14 358968 CASAVA_Build 8 56055180 1D CCAAAAAAAA T/- CAATGAATCT 3070 het 3070 hom 19 8 11 0 T 1 0 358969 CASAVA_Build 8 56055679 1I GAGACACAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 21 13 7 1 A 8 9 358970 CASAVA_Build 8 56077559 1D AACTTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 12 11 358971 CASAVA_Build 8 56094119 6D TTTTATTGTA TTATTT/------ TTATTTTTAT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TTATTT 4 3 358972 CASAVA_Build 8 56094715 1D AATAGACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 27 1 19 7 A 13 12 358973 CASAVA_Build 8 56094824 1D ATATTTGCAG A/- AAATAATGGC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 4 3 358974 CASAVA_Build 8 56098873 1I GCAAATTAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 33 1 28 4 A 10 11 358975 CASAVA_Build 8 56102794 5D TTAAATTAAA TTACT/----- TTAATTTAAT 3070 hom 57 het 21 0 20 3 TTACT 1 0 358976 CASAVA_Build 8 56108500 1D ATATCACACT A/- AATGCTCAGG 3070 hom 84 het 33 0 29 6 A 3 2 358977 CASAVA_Build 8 56113487 2D TTAAAAAAAA AT/-- AGCTTTAAAT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 AT 1 0 358978 CASAVA_Build 8 56120606 1I AATGAAATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 8 9 358979 CASAVA_Build 8 56121109 1I GTATTGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 82 hom 43 1 29 13 A 9 10 358980 CASAVA_Build 8 56131107 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 A 7 8 358981 CASAVA_Build 8 56155510 2I CTTGTCAAGG --/TT TAAGATTTCA 3070 hom 99 het 38 0 33 5 T 1 3 358982 CASAVA_Build 8 56171832 13I ATGTAATTTG -------------/AAGGTAGAACCAA AAGTATTTTC 3070 hom 148 het 56 0 50 6 AAGGTAGAACCAA 0 1 358983 CASAVA_Build 8 56172156 1D AAGTATCAAG A/- GAGTGAGAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 1 0 358984 CASAVA_Build 8 56179392 1D TTACATCTAT A/- AAAATTACTT 3070 hom 169 het 59 0 57 2 A 5 4 358985 CASAVA_Build 8 56179860 1I TTGATGTTGG -/A AACCTTCATA 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 2 3 358986 CASAVA_Build 8 56200448 4D GGGTTCAAGC GATT/---- GATTCTCCTG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 GATT 2 1 358987 CASAVA_Build 8 56202355 2D TGCCTAACTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 14 12 358988 CASAVA_Build 8 56206868 1I GTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 10 11 358989 CASAVA_Build 8 56210066 1D AGAAGCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 31 4 18 9 T 13 12 358990 CASAVA_Build 8 56211004 1D ACATGCTCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 472 hom 35 2 19 14 T 15 14 358991 CASAVA_Build 8 56211436 5D TGCACTTCCT TCACA/----- GAGAACAGTC 3070 hom 93 het 34 0 32 4 TCACA 1 0 358992 CASAVA_Build 8 56230668 1D TAGAAGTGTG A/- AAAAAAAAAA 1861 het 1861 ref 37 25 4 8 A 13 12 358993 CASAVA_Build 8 56257936 1I TAACATATAC -/A AAAAAATTAT 3070 hom 148 het 50 0 50 0 A 6 7 358994 CASAVA_Build 8 56268274 1D CCCCCCATTA C/- CCGTCGAACT 3070 het 3070 ref 40 20 16 6 C 3 2 358995 CASAVA_Build 8 56279274 9D ATACCAAGTG CCAACATAC/--------- CCTGCTAATT 3070 het 3070 ref 40 20 15 8 CCAACATAC 1 0 358996 CASAVA_Build 8 56282747 16D CACACATGCG CGCGCACACACACACA/---------------- CGCGCACACA 3070 hom 91 het 34 0 30 5 CGCGCACACACACACA 2 1 358997 CASAVA_Build 8 56282845 18I TCATAAAGAA ------------------/GAGGAGGAAGAGGAAGAG GAGGAGGAAG 3070 hom 85 het 33 0 26 7 GAGGAGGAAGAGGAAGAG 0 1 358998 CASAVA_Build 8 56285201 3D ATCCTCTCCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 27 0 12 16 T 17 14 358999 CASAVA_Build 8 56290189 1I GAGTATGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2783 hom 29 10 9 10 A 15 16 359000 CASAVA_Build 8 56308501 1I CCATCTGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 29 0 20 9 T 13 14 359001 CASAVA_Build 8 56310642 4D CTATTGTATT AGTA/---- AGTTAAAAGA 3070 het 3070 hom 56 24 27 10 AGTA 1 0 359002 CASAVA_Build 8 56342739 3I47M1I ACCAAAGTGT ---TAAGGGTTGTGATAGTTTGGTGGGTTTAGGGTTTTATTCCTATTATC-/TAATAAGGGTTGTGATAGTTTGGTGGGTTTAGGGTTTTATTCCTATTATCT TTTTTTTTCA 3070 hom 94 het 38 1 50 7 N/A 0 0 359003 CASAVA_Build 8 56362246 2D40M1I ATTATTGGGT GGGGGGGGGGAACCTTCAATAATACAGGAAGAAATTTAAATT-/--GGGGGGGGAACCTTCAATAATACAGGAAGAAATTTAAATTA AAAAAAAATA 3070 hom 111 het 29 0 38 5 N/A 0 0 359004 CASAVA_Build 8 56397105 4D CCATCTCGAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 AAAC 5 4 359005 CASAVA_Build 8 56406622 1I CTTGTTCATC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 61 21 32 8 T 8 9 359006 CASAVA_Build 8 56431709 4I GAAATTACTA ----/TCTT TATTTGTAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TCTT 0 1 359007 CASAVA_Build 8 56450831 1I CTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 11 12 359008 CASAVA_Build 8 56462513 2D ACTTCCACAT TC/-- TCTGTTACAG 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 TC 2 1 359009 CASAVA_Build 8 56463608 1I GATGAAAGCA -/C CAGCAGTTTC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 1 2 359010 CASAVA_Build 8 56500514 6I TTTCATTCAA ------/CGCACT CGCACTCTCG 3070 het 3070 ref 52 24 20 8 CGCACT 1 2 359011 CASAVA_Build 8 56510815 1I TCCTGAATAG -/C TGGGACCCCA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 C 0 1 359012 CASAVA_Build 8 56515715 1D AACTAGCAGC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 27 10 16 1 A 9 8 359013 CASAVA_Build 8 56521277 1I AGGAAGGCAG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 54 20 21 13 A 6 7 359014 CASAVA_Build 8 56524201 1I CTCTCAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 A 11 12 359015 CASAVA_Build 8 56528341 1D CAGGAAGGCT G/- TGACCAGAGG 3070 het 3070 ref 52 30 14 8 G 1 0 359016 CASAVA_Build 8 56532138 2I TCTTGAAAAA --/AG AGAAAAAAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AG 1 2 359017 CASAVA_Build 8 56541740 1D CCTAAAACTT A/- AAAGTATAAT 3070 het 3070 hom 38 11 23 4 A 4 3 359018 CASAVA_Build 8 56551683 2I TGCAGCACAC --/TG TGAGCAAGCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TG 1 2 359019 CASAVA_Build 8 56552226 1I GGGTCCCTGA -/C CCCCGAGCAG 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 4 5 359020 CASAVA_Build 8 56552825 1D AGTCCTTAAA G/- GAGCTGATGG 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 G 2 1 359021 CASAVA_Build 8 56557675 4D ATAAAATTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 20 9 11 1 AAAT 4 3 359022 CASAVA_Build 8 56558880 1D TCCCTTAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 A 10 9 359023 CASAVA_Build 8 56563566 4I CCTTTGATAG ----/ATAA ATAAATAGAT 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 ATAA 1 2 359024 CASAVA_Build 8 56565916 2D AGTATGTATA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 GT 6 5 359025 CASAVA_Build 8 56566045 1D ATTTTTTCTG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 39 het 23 0 14 9 C 10 9 359026 CASAVA_Build 8 56566651 1D TATTCTAAGG C/- TAGTTTAGCT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 1 0 359027 CASAVA_Build 8 56568469 1I CTGCAGGCAT -/C TATGCTCACC 3070 hom 123 het 43 0 39 4 C 0 1 359028 CASAVA_Build 8 56576601 1D CTGGCAACCA C/- CATTCAACTT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 C 2 1 359029 CASAVA_Build 8 56577503 1D TGCTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 36 0 32 4 T 11 10 359030 CASAVA_Build 8 56577722 1D TGAGTTATAG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 78 het 28 0 27 2 T 9 8 359031 CASAVA_Build 8 56582468 1D TACTGTTGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 2431 hom 25 6 14 5 T 9 8 359032 CASAVA_Build 8 56592409 1I AAAATTAAAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 23 19 1 T 9 10 359033 CASAVA_Build 8 56619450 1I AATCAATAAC -/G CCCCCCCCCA 2170 het 2170 ref 23 10 9 4 G 0 1 359034 CASAVA_Build 8 56626950 1I CAATTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3064 het 3064 ref 34 12 10 12 A 10 11 359035 CASAVA_Build 8 56633342 7D CAGCAAGAGA TATTTAC/------- CAGCAAACAT 3070 het 3070 hom 38 14 21 5 TATTTAC 1 0 359036 CASAVA_Build 8 56653641 11I ATCTTCATTA -----------/AAACCTTAAAG AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 AAACCTTAAAG 0 1 359037 CASAVA_Build 8 56653735 1D AGCAGCAGAA C/- CCCCATTCAC 3070 het 3070 hom 32 10 18 6 C 5 4 359038 CASAVA_Build 8 56658581 4I GAAAATGTGG ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 TA 7 9 359039 CASAVA_Build 8 56661245 1D ACTTGAAACC T/- TTTTTTTTTT 2240 het 2240 ref 36 22 6 8 T 13 12 359040 CASAVA_Build 8 56661489 1I TACAGCCAAG -/A AAAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 49 26 17 6 A 5 6 359041 CASAVA_Build 8 56665128 1D AGGGCAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 39 7 11 22 A 12 11 359042 CASAVA_Build 8 56681254 1D TGAAACACAC A/- TTTTTGGATA 3070 het 3070 ref 55 26 19 10 A 1 0 359043 CASAVA_Build 8 56690589 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2887 het 2887 ref 27 12 9 6 A 11 12 359044 CASAVA_Build 8 56718598 1D AGTACCATGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 T 10 9 359045 CASAVA_Build 8 56722559 1D CTCTGAGATT C/- TTTCCTCAGC 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 C 1 0 359046 CASAVA_Build 8 56729920 1D TTGTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1164 het 1164 ref 22 9 5 10 A 14 13 359047 CASAVA_Build 8 56729953 1D CCAAGGTATT A/- AAAAAAAAAA 1675 het 1675 ref 27 8 4 15 A 12 11 359048 CASAVA_Build 8 56743588 1D AATAATTTAT A/- AAAGACAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 4 3 359049 CASAVA_Build 8 56776453 6I TTCTTGCTGT ------/GGCTCA GGCTCACACC 2933 het 1938 hom 18 8 8 2 GGCTCA 1 2 359050 CASAVA_Build 8 56779694 1D GAAAAGATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 T 12 11 359051 CASAVA_Build 8 56785084 1I GGGAAAAAAA -/G GCCATCTATA 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 G 1 2 359052 CASAVA_Build 8 56792564 1I TGCACCCCTT -/C CCACCTGCCA 2802 het 2802 ref 21 13 7 1 C 2 3 359053 CASAVA_Build 8 56807871 4D AGAGAAAAAA AGAG/---- AGAGTGAGAG 3070 het 3070 hom 34 17 15 4 AG 4 2 359054 CASAVA_Build 8 56814603 2D TGGACATGAC AT/-- AATTTAAACA 3070 het 3070 hom 29 8 19 2 AT 1 0 359055 CASAVA_Build 8 56817919 1I ATTTGTAGGG -/T TTTTTTTTTT 2135 het 2135 ref 25 12 7 6 T 13 14 359056 CASAVA_Build 8 56832094 1D ATGAGTTGTA G/- GGGAAGGCAG 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 G 4 3 359057 CASAVA_Build 8 56841319 4D GCAGAAACCT GAGG/---- GAGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 49 22 21 8 GAGG 2 1 359058 CASAVA_Build 8 56850354 1D CTCTGTCCCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 10 3 A 11 10 359059 CASAVA_Build 8 56852403 1D ATTACAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 644 hom 32 3 21 8 T 15 14 359060 CASAVA_Build 8 56853016 1D ATAATTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 84 hom 24 1 18 6 T 14 13 359061 CASAVA_Build 8 56853387 1D GTAGTGGCCT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 A 8 7 359062 CASAVA_Build 8 56854989 1D TTTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 13 12 359063 CASAVA_Build 8 56863009 2D AGAGAGAGCA AG/-- AGAGAGGGGG 35 het 35 ref 48 38 1 10 AG 4 3 359064 CASAVA_Build 8 56863392 3D CCTTTTACTT AAC/--- AATCAGATTT 3070 het 3070 ref 45 27 15 5 AAC 1 0 359065 CASAVA_Build 8 56865618 1D AGTACATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 97 het 43 0 30 13 T 15 14 359066 CASAVA_Build 8 56871084 1I CTTTTGATCT -/G GTCACAGATA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 G 1 2 359067 CASAVA_Build 8 56876559 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTAG 2399 het 1547 hom 10 4 6 0 T 9 8 359068 CASAVA_Build 8 56878075 1D CTTTATCACG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 10 9 359069 CASAVA_Build 8 56878806 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2484 hom 24 9 9 6 T 11 10 359070 CASAVA_Build 8 56879890 1D ATAATTTTTT A/- AAAAGGGAAA 3070 het 3070 ref 28 14 12 3 A 5 4 359071 CASAVA_Build 8 56881499 1D AAGACAAAAG A/- AAAAAAAAAA 856 het 856 ref 21 9 5 7 A 11 10 359072 CASAVA_Build 8 56883625 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 29 0 20 9 T 15 14 359073 CASAVA_Build 8 56889948 1I GAGACTGTCT -/A AAAAAAAAAA 1924 het 155 hom 10 1 5 4 A 11 12 359074 CASAVA_Build 8 56899064 1D CATTTCTACT A/- AAAAAAATAC 3070 hom 55 het 22 0 19 3 A 8 7 359075 CASAVA_Build 8 56901006 2D TTTTTTAGAC AG/-- AGTCTTGCTC 3070 het 257 hom 22 1 13 8 AG 2 1 359076 CASAVA_Build 8 56906881 2I TGTCAAGAAA --/AT ATGTGTGGTA 3070 het 3070 hom 26 11 12 3 AT 1 2 359077 CASAVA_Build 8 56931804 1I GCTAGGCGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 763 hom 16 3 10 3 T 10 11 359078 CASAVA_Build 8 56932447 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 26 1 23 2 T 11 12 359079 CASAVA_Build 8 56944660 1I ACCAGAAAAA -/G TAAGAGGTAG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 0 1 359080 CASAVA_Build 8 56947090 2D TTTTTGGAGT CA/-- GAGTCTCGCT 2737 het 1520 hom 23 5 9 9 CA 1 0 359081 CASAVA_Build 8 56949079 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 A 8 9 359082 CASAVA_Build 8 56952396 1I TTTTTATTGT -/G GGGGGGGGTC 2257 het 2257 ref 24 14 7 3 G 8 9 359083 CASAVA_Build 8 56968913 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 T 9 10 359084 CASAVA_Build 8 56974105 1D GCTGGGCTAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 33 15 12 8 T 8 7 359085 CASAVA_Build 8 56977717 1D TATAGCATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 11 23 6 A 10 9 359086 CASAVA_Build 8 56979445 12D AATTTCTTAG AATATGATATGA/------------ AATATGATAT 3070 het 3070 ref 44 17 14 15 AATATGATATGA 2 1 359087 CASAVA_Build 8 56980528 9D GTCTCAAAAA AAAAGAAAG/--------- AAAGAAAGAA 3070 hom 68 het 24 0 23 2 AAAAGAAAG 1 0 359088 CASAVA_Build 8 56986794 2D CCTATGAGCT GC/-- GGGGCACCTG 3070 het 3070 ref 42 20 11 11 GC 1 0 359089 CASAVA_Build 8 57002956 1D CCCAAGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2977 hom 42 10 19 15 A 10 9 359090 CASAVA_Build 8 57007527 4I ATATATATTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 TTTG 3 4 359091 CASAVA_Build 8 57009000 1I AACTAGATGA -/C CCCTGGGTCT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 C 3 4 359092 CASAVA_Build 8 57010324 1I TTGCCTAAAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 8 9 359093 CASAVA_Build 8 57012089 1D CCCTTTTCTA C/- CCCCCACGTC 3070 het 3070 ref 50 28 19 3 C 6 5 359094 CASAVA_Build 8 57023094 1I TTTAAAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 11 12 359095 CASAVA_Build 8 57031232 1D ATTAAAAAAA G/- AATGACTTGG 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 G 1 0 359096 CASAVA_Build 8 57032304 2I ACTCCAATCT --/TA TCAGTTGTTC 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 TA 0 1 359097 CASAVA_Build 8 57040147 1I CTTCTCCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 188 hom 24 2 20 2 T 10 11 359098 CASAVA_Build 8 57041482 1I GAAGTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 459 hom 18 1 15 2 T 13 14 359099 CASAVA_Build 8 57044068 1D AGGTAGGTTT C/- CACTTTTTTC 3070 hom 104 het 39 0 34 5 C 2 1 359100 CASAVA_Build 8 57062520 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2061 het 1871 hom 26 8 7 11 A 17 16 359101 CASAVA_Build 8 57085843 1I TCAGACCTGC -/T TAGACATGCC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 1 2 359102 CASAVA_Build 8 57095317 3D CCAAATTCCC TCT/--- TCTTATAACA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 TCT 2 1 359103 CASAVA_Build 8 57101468 1D CGGCGACCCG T/- TGCTGCACAG 3070 het 2485 hom 29 11 14 4 T 2 1 359104 CASAVA_Build 8 57106822 1D CACTATATAC A/- AAAAACCAAA 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 A 6 5 359105 CASAVA_Build 8 57116558 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1881 het 1769 hom 24 9 5 10 A 17 16 359106 CASAVA_Build 8 57123854 5I AGATCACCTG -----/AGGTT AGGAGTTCAA 2975 het 2625 hom 19 8 9 2 AGGTT 0 1 359107 CASAVA_Build 8 57132310 2D TGTCTCTACT AA/-- AAAAAAAAAA 1710 hom 15 het 6 0 6 0 A 13 11 359108 CASAVA_Build 8 57142799 1D ACTCCGTCTG A/- AAAAAAAAAA 2278 het 1840 hom 18 9 7 3 A 13 12 359109 CASAVA_Build 8 57145263 1I GCACATCCTG -/T TATCAGTGAG 3070 het 3070 hom 62 28 29 5 T 1 2 359110 CASAVA_Build 8 57151825 1D ACAAGTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 10 9 359111 CASAVA_Build 8 57161660 1I AGTAATTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 A 10 11 359112 CASAVA_Build 8 57167047 3I CTTTTCAGAT ---/TGG TGTTTATATT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TGG 0 1 359113 CASAVA_Build 8 57172436 2D AGCTCTTTAC TA/-- TTTTCTAGCT 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 TA 1 0 359114 CASAVA_Build 8 57175097 1I TTAAGGCAGG -/C TTGTGCAGAT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 C 0 1 359115 CASAVA_Build 8 57175266 1D AGATAACGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 11 10 359116 CASAVA_Build 8 57195835 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2965 hom 29 8 15 6 T 12 11 359117 CASAVA_Build 8 57203375 20I TCTATCTATC --------------------/ATCTGTCATCTGTCTGTTGA TATCTATCAT 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 ATCTGTCATCTGTCTGTTGA 0 1 359118 CASAVA_Build 8 57216575 1I TGGTCATACT -/A AAAGAAGCCC 3070 het 3070 hom 42 16 20 6 A 3 4 359119 CASAVA_Build 8 57237485 1D TGTAAAAAAA T/- AAACCATTGT 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 T 1 0 359120 CASAVA_Build 8 57239434 2I TATGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TG 8 9 359121 CASAVA_Build 8 57248703 1I TTTTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 12 13 359122 CASAVA_Build 8 57253190 3I2M4D CACATGGAAC ---TACAGG/CTGTA---- TTGATCATGA 3070 het 3070 hom 38 15 21 4 N/A 0 0 359123 CASAVA_Build 8 57254867 5I51M4I TTATTCACAT -----TTTTGATAAATTATTTCAAGTTTACTGTCATTTCTCAAAACTGCTGCTTAT----/TTTTATTTTGATAAATTATTTCAAGTTTACTGTCATTTCTCAAAACTGCTGCTTATTTTC TTTATTTATG 3070 het 3070 ref 34 25 15 8 N/A 0 0 359124 CASAVA_Build 8 57262868 3D AGGCTCATAT ATA/--- ATGAGATTTG 3070 het 3070 ref 53 29 23 1 ATA 1 0 359125 CASAVA_Build 8 57346325 1D TCCCAAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3017 hom 29 9 13 7 T 12 11 359126 CASAVA_Build 8 57398797 1D GGGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 16 10 3 A 11 10 359127 CASAVA_Build 8 57401688 1D AATACTGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 591 hom 33 4 16 14 A 13 12 359128 CASAVA_Build 8 57414089 1D TTTCTAAGTT C/- TTTACACGTA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 C 1 0 359129 CASAVA_Build 8 57422203 1D ATTCCTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 859 hom 31 6 15 10 T 15 14 359130 CASAVA_Build 8 57441636 2I GCACTTATGC --/AT AAATAACTGT 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 AT 0 1 359131 CASAVA_Build 8 57442516 3I ATTACAAAAG ---/CTT CTCATGGTTT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CTT 0 1 359132 CASAVA_Build 8 57444958 1D TCAACTTTTT A/- AAAAAGGACA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 A 6 5 359133 CASAVA_Build 8 57445697 2I AAGATTTTAG --/TT TTAAGTTGCA 2786 het 2786 ref 23 15 6 2 T 2 4 359134 CASAVA_Build 8 57445803 1D AGCTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 1988 het 13 hom 21 1 9 11 T 15 14 359135 CASAVA_Build 8 57459425 1D TCTATCAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 T 11 10 359136 CASAVA_Build 8 57465825 1I TCTTCAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 209 hom 40 1 30 9 A 13 14 359137 CASAVA_Build 8 57473267 1D ACATTTTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 12 11 359138 CASAVA_Build 8 57481993 6D AATATGTAGC TCACAG/------ TCTCCATTCA 2178 het 2178 ref 19 10 5 5 TCACAG 1 0 359139 CASAVA_Build 8 57483455 1I TCTAAGGTTT -/G TTTTTTTTTT 2362 het 1170 hom 26 9 10 7 G 0 1 359140 CASAVA_Build 8 57485974 1D CTGGTGACCT G/- GGAGGTTGCA 3070 hom 132 het 52 0 44 9 G 3 2 359141 CASAVA_Build 8 57487661 1D CTCATTGTGG T/- TTTGATGTGC 3070 het 3070 ref 47 20 15 14 T 4 3 359142 CASAVA_Build 8 57488118 1I ACTTTGATAG -/T TTTTTTATAT 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 T 6 7 359143 CASAVA_Build 8 57489540 1I GAGGCAGGGA -/G CATTACCAGA 3070 hom 93 het 41 0 30 11 G 0 1 359144 CASAVA_Build 8 57504206 1I TATGAAGTGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 9 10 359145 CASAVA_Build 8 57511565 2I TATACCTGAT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 9 11 359146 CASAVA_Build 8 57516381 1D AGTGGGAAAA G/- ATATTAAAAT 2862 het 2862 ref 35 20 8 7 G 1 0 359147 CASAVA_Build 8 57517714 2D ACAGATCTTT TG/-- TTTTTTTCCT 3011 het 3011 ref 31 18 8 5 TG 1 0 359148 CASAVA_Build 8 57517990 5D TCGAATGATC TTAAG/----- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 24 11 11 3 TTAAG 1 0 359149 CASAVA_Build 8 57543566 2D TAGAGATTAC TT/-- TTTTTTTTTT 2373 het 2373 ref 25 12 8 5 T 18 16 359150 CASAVA_Build 8 57547142 3I ACAATGGGGG ---/GGC GGTGGTGGTG 3070 hom 59 het 25 0 19 6 GGC 0 1 359151 CASAVA_Build 8 57548998 4D GATTTTCTCC CATA/---- CACCAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 24 22 5 CATA 1 0 359152 CASAVA_Build 8 57559207 1I TGGAAGTATT -/G GGGTTACTCA 3070 het 3070 hom 32 8 19 5 G 3 4 359153 CASAVA_Build 8 57559368 1D TGAGATAGCA T/- TTTTTTTTTT 2862 het 599 hom 33 3 7 23 T 11 10 359154 CASAVA_Build 8 57560537 1D AAAACCACAG A/- AAACCTAGTC 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 A 4 3 359155 CASAVA_Build 8 57562677 5D ATTTAAGAAA TATAT/----- TATAAATGAG 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 TATAT 1 0 359156 CASAVA_Build 8 57563562 2D AAATATCACT AC/-- AGACATTAAA 3070 het 3070 hom 53 20 23 13 AC 1 0 359157 CASAVA_Build 8 57569685 1I GAATTGTTTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 8 9 359158 CASAVA_Build 8 57571489 1I GCTACTACGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 48 15 20 13 T 8 9 359159 CASAVA_Build 8 57576029 1I CTTCCATGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 19 3 T 11 12 359160 CASAVA_Build 8 57580963 2I AATTGGCATG --/TT TTAAGGATCC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 2 4 359161 CASAVA_Build 8 57586852 2D AGCAGGCCAG AA/-- ATGGCGCCCA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 A 3 1 359162 CASAVA_Build 8 57589490 1D AAAAAAAAAA C/- AACCCACTGA 3070 het 1277 hom 31 8 19 4 C 1 0 359163 CASAVA_Build 8 57592208 1I CTGAACACCA -/G GGGGCAATTC 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 G 4 5 359164 CASAVA_Build 8 57597013 1D TACTTATAGT A/- GATGGATATA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 1 0 359165 CASAVA_Build 8 57615467 3I AGCCACCTCT ---/GCA GAGGTCCCAG 3070 het 3070 hom 49 21 22 6 GCA 0 1 359166 CASAVA_Build 8 57637251 1I CCACTGGAAC -/A AAAAAAAACT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 8 9 359167 CASAVA_Build 8 57641316 1I AATAATATGC -/T TTTTTTGTTA 3070 hom 81 het 40 0 28 12 T 6 7 359168 CASAVA_Build 8 57652200 1D TTTTTTTTTT G/- CATGTGGATG 2843 het 1446 hom 31 9 10 13 G 1 0 359169 CASAVA_Build 8 57652685 1I TACTTAGTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 46 19 18 9 T 8 9 359170 CASAVA_Build 8 57655721 3I TTTCCGGAGA ---/AAG AAGAAGAGAA 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 AAG 2 3 359171 CASAVA_Build 8 57657735 1D GCTGAGGGGC G/- GGGCTGTGAG 3070 het 3070 ref 42 22 13 7 G 4 3 359172 CASAVA_Build 8 57661782 1I GCTTTAGAAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 23 14 9 0 A 7 8 359173 CASAVA_Build 8 57665181 2I ATACTTCTGA --/GT GTAGACTGAA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 GT 1 2 359174 CASAVA_Build 8 57665631 38D CAGTTTCCAC GTCCCTGATACAGGCCCCTCTCTGCTCCAGCAAAGCTA/-------------------------------------- GTCTTTCCAT 3070 het 3070 ref 25 18 12 8 GTCCCTGATACAGGCCCCTCTCTGCTCCAGCAAAGCTA 1 0 359175 CASAVA_Build 8 57685337 1D AAACTCAGGA C/- CCCAGTTCAC 3070 het 3070 ref 46 23 20 4 C 4 3 359176 CASAVA_Build 8 57690709 1I35M1I TCTCTTTTTG -TTTTTCTCAGTCTTGCTAGAGATGTATTGATGTTA-/TTTTTTCTCAGTCTTGCTAGAGATGTATTGATGTTAT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 23 4 N/A 0 0 359177 CASAVA_Build 8 57695166 1I TTTTGCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 T 11 12 359178 CASAVA_Build 8 57697887 1I CTATGGATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 11 12 359179 CASAVA_Build 8 57701267 1D TTTAGTTAGG T/- TCCTGAAACT 3070 het 3070 ref 43 26 16 3 T 2 1 359180 CASAVA_Build 8 57703710 1I TCTTGGTCAC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 T 7 8 359181 CASAVA_Build 8 57719120 2I ATATATATAT --/AG ATAGAGAGAG 3070 hom 51 het 26 0 18 8 AG 0 1 359182 CASAVA_Build 8 57722728 1D CACAATCTCA T/- AATAAACAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 0 359183 CASAVA_Build 8 57726539 2D AGGAACTGAC AG/-- AGTGAGAGCT 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 AG 2 1 359184 CASAVA_Build 8 57728001 1D ATACAGGGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 103 het 42 0 34 8 T 10 9 359185 CASAVA_Build 8 57733333 1D TCTAGAGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 5 A 11 10 359186 CASAVA_Build 8 57747720 4I AGGACACACT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 TTTG 3 4 359187 CASAVA_Build 8 57751767 4D AAGAGAAAGT CTTG/---- CTTGCACTTA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 CTTG 2 1 359188 CASAVA_Build 8 57763908 4D AGAATTCACC ATTA/---- GTCATCTCAA 3070 het 3070 hom 48 16 24 8 ATTA 1 0 359189 CASAVA_Build 8 57764145 1D CAGTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 12 11 359190 CASAVA_Build 8 57774066 1D CTTTCACTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 T 10 9 359191 CASAVA_Build 8 57776039 1D CTCTCTCCAC T/- TGATTTCTAC 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 2 1 359192 CASAVA_Build 8 57785151 1D GCTCAAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 371 hom 39 1 33 5 A 10 9 359193 CASAVA_Build 8 57789162 5D2M9D TGCCCTGCAC TGGTGCAGCTGAGGGT/-----CA--------- GCTGGCATCA 3070 het 3070 ref 38 20 13 10 N/A 0 0 359194 CASAVA_Build 8 57791132 2D TGCAACTCCA AC/-- ATCAGGTCAC 3070 hom 96 het 33 0 32 1 AC 1 0 359195 CASAVA_Build 8 57815256 1I ATCTAGCTTA -/T TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 38 11 17 10 T 6 7 359196 CASAVA_Build 8 57851953 1I GGTAAAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 12 13 359197 CASAVA_Build 8 57856269 14D TATTTGAATT ATATTATAATTATA/-------------- ATTATAATCT 3070 het 3070 hom 24 7 19 1 ATATTATAATTATA 1 0 359198 CASAVA_Build 8 57858236 2D AAAATAATAC AG/-- AGACTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 6 AG 2 1 359199 CASAVA_Build 8 57859184 1I ATCTTACTGA -/T TTTTTCCAAT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 5 6 359200 CASAVA_Build 8 57861128 4I AAAGTATGTG ----/GTAA GTAAGAAAGA 3070 het 3070 hom 48 22 20 6 GTAA 1 2 359201 CASAVA_Build 8 57862846 2D AGAAGGATAT TA/-- TATAGAAAGA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 TA 3 2 359202 CASAVA_Build 8 57870648 1I CAATAAATAC -/T TTTTTGAATT 3070 het 3070 ref 35 22 9 4 T 5 6 359203 CASAVA_Build 8 57880098 1D CAAATTAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 13 4 A 11 10 359204 CASAVA_Build 8 57892519 3I CACATATAAT ---/ATC ATAAGATATA 3070 hom 78 het 34 0 27 7 ATC 0 1 359205 CASAVA_Build 8 57900613 2D ATGAGGTATC TA/-- TAGAGTAGTC 3070 hom 138 het 49 0 45 6 TA 2 1 359206 CASAVA_Build 8 57903369 1D AGAGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 21 5 A 11 10 359207 CASAVA_Build 8 57904098 1I ATAGATGCAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 138 het 53 0 46 7 A 8 9 359208 CASAVA_Build 8 57905551 1D AATAAGCATA T/- AAAGGACACT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 1 0 359209 CASAVA_Build 8 57908468 2I ATTTTCCAAC --/TA TATAGTATTC 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TA 2 3 359210 CASAVA_Build 8 57914795 1D ACTTTTTTTG C/- CAAATGTGCT 3070 hom 96 het 36 0 33 5 C 2 1 359211 CASAVA_Build 8 57919120 4I GGCAAGAGGC ----/CCTT CTACGAATTC 3070 hom 102 het 38 0 33 5 CCTT 0 1 359212 CASAVA_Build 8 57920397 1D CAGGTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 T 14 13 359213 CASAVA_Build 8 57923256 4D TTCATATCTG GCCA/---- GCCAAACTAA 3070 hom 45 het 16 0 16 1 GCCA 2 1 359214 CASAVA_Build 8 57925515 1I GAAAAAAAAA -/T GACAAAATTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 0 1 359215 CASAVA_Build 8 57925995 2I AATGTGGTAC --/AT ATATACACCA 3070 hom 62 het 26 0 20 6 AT 2 3 359216 CASAVA_Build 8 57926374 1D ATCTAAAAAA T/- AAATAAAAAG 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 1 0 359217 CASAVA_Build 8 57927463 1I GTGCCATGTT -/G GTGTGCTGCA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 G 1 2 359218 CASAVA_Build 8 57929377 1D TTCCTTCTCC T/- GCCTGATTGC 1998 hom 12 het 5 0 5 0 T 1 0 359219 CASAVA_Build 8 57930128 2I TCAAAATTAC --/AT GTTTGTTTCA 3070 hom 69 het 32 0 23 9 AT 0 1 359220 CASAVA_Build 8 57933035 1D ATTACAAGAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 10 9 359221 CASAVA_Build 8 57939333 1D AAAATACAAT A/- AAAAAATAAT 3070 hom 33 het 13 0 12 4 A 7 6 359222 CASAVA_Build 8 57940311 1I CGCGACTTTG -/C GGGCAATTTA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 C 0 1 359223 CASAVA_Build 8 57940558 6D ACGAAGGTGA GAAGAG/------ GAAGAGGAAG 3070 hom 117 het 47 0 37 12 GAAGAG 3 2 359224 CASAVA_Build 8 57942376 105D27M1I ATCCTGGGTG AAACCCTGGCAAGGTTTGTTTTTACTATAGAAAAAAAAATCCCAAGATTGCTTCACCTCTGCAGTGAATTTCCTTCATCTATACATTTGGTGTAAGAGATTTTATTAAAGATCAGACTTAAGGTGTTAAAAT-/---------------------------------------------------------------------------------------------------------TTAAGATCAGACTTAAGGTGTTAAAATA TTTTTTCAGA 3070 hom 30 het 13 0 10 13 N/A 0 0 359225 CASAVA_Build 8 57943291 1I AATTTGATAT -/A AAAAATGTGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 5 6 359226 CASAVA_Build 8 57945564 1D GAAGTTGCAA C/- CCCCCCCGAT 3070 hom 129 het 50 0 41 9 C 8 7 359227 CASAVA_Build 8 57951249 1I AAAAGCAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 35 0 27 8 T 12 13 359228 CASAVA_Build 8 57958601 1D AGTGGACTTT G/- GGGGATCCAG 3070 hom 74 het 32 0 24 8 G 5 4 359229 CASAVA_Build 8 57960510 6D CCAAATTCAG ACCAAA/------ TTCAGGTGTT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 ACCAAA 1 0 359230 CASAVA_Build 8 57964116 2I CAGTCAAGAC --/TG TGAATATCTA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 TG 1 2 359231 CASAVA_Build 8 57965833 2D TGTAATGAGA AG/-- AGTCTTCACC 3070 het 3070 hom 38 12 18 9 AG 2 1 359232 CASAVA_Build 8 57979314 1D CAAAAATTTA C/- CCCTATCATT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 4 3 359233 CASAVA_Build 8 57994979 1I AGTCAGGGTC -/A GGGGGGGTTT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 0 1 359234 CASAVA_Build 8 57996680 1I GAAAATGGCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 8 9 359235 CASAVA_Build 8 58044699 1D AGTAAACATC A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 A 9 8 359236 CASAVA_Build 8 58049499 6I TCTAAGAATT ------/TCAAAC TCAAGGAATT 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TCAAAC 0 1 359237 CASAVA_Build 8 58052890 1D ATAAGCCAAT G/- AACACCACAG 3070 het 3070 ref 49 25 20 5 G 1 0 359238 CASAVA_Build 8 58056122 1I GATTGCTCAA -/C TTTGGCACGA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 C 0 1 359239 CASAVA_Build 8 58057756 1D CATGTAGTAT G/- CTGGATAGTG 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 G 1 0 359240 CASAVA_Build 8 58059919 3D CAGACTCCTT ATC/--- ATAATCTACA 3070 het 3070 hom 61 28 30 3 ATC 1 0 359241 CASAVA_Build 8 58062845 1D AACTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2164 het 149 hom 20 2 6 12 T 15 14 359242 CASAVA_Build 8 58064323 2D CGTCTCTACT AA/-- AAATACAAAA 2787 het 2319 hom 15 7 7 1 A 5 3 359243 CASAVA_Build 8 58084214 1D TTCTTTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 38 2 23 13 T 15 14 359244 CASAVA_Build 8 58104664 1D TGGGTAAATG A/- AAAAAAAAAG 641 het 641 ref 34 25 2 8 A 10 9 359245 CASAVA_Build 8 58111183 1D AATTTGTCTG T/- TTTTTTTTTT 1178 het 1178 ref 34 25 4 5 T 12 11 359246 CASAVA_Build 8 58211854 1D ATTTAACATC T/- TTTTTTTTTC 1333 het 1333 ref 40 34 3 3 T 10 9 359247 CASAVA_Build 8 58215421 1D TATGCATTCA T/- TTGCTTAACT 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 T 3 2 359248 CASAVA_Build 8 58285606 5I ATGTGCCCGA -----/CTCCT GGTGGAGTAC 2785 hom 155 het 71 0 13 58 CTCCT 0 1 359249 CASAVA_Build 8 58290624 1I GAGAAGGTTG -/C CATGGTGGAC 1652 het 1652 ref 71 51 4 16 C 1 2 359250 CASAVA_Build 8 58504565 1D ACATTTCCGT G/- GCATGTGTCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 2 1 359251 CASAVA_Build 8 58537136 1I TACTCCTGGC -/G GGGGGGGGTC 2866 het 2467 hom 30 10 11 9 G 8 9 359252 CASAVA_Build 8 58552588 1D AGCTCAAATC T/- TTTTTTTTTT 1753 het 1753 ref 25 18 4 3 T 13 12 359253 CASAVA_Build 8 58612290 2I TGTCACAACG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 CA 7 8 359254 CASAVA_Build 8 58619263 1D AAATATTATC T/- TTTTTTTTTT 1510 het 1510 ref 22 10 7 5 T 17 16 359255 CASAVA_Build 8 58621566 1D GCAGCGATGA G/- AGCCACAGAG 3070 het 3070 ref 62 28 27 7 G 1 0 359256 CASAVA_Build 8 58623561 1D ATTCAATACC T/- TTCTTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 T 3 2 359257 CASAVA_Build 8 58640045 1I GAGGAAGCCC -/G GGCAAGGCAG 3070 het 2590 hom 30 7 17 6 G 2 3 359258 CASAVA_Build 8 58641487 2D TCTGATTGTC AA/-- AGTCTTTCAG 2942 het 2942 ref 24 14 7 3 A 3 1 359259 CASAVA_Build 8 58642597 4I AAATGCTCCT ----/TTTG TTTGTTGTTT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TTTG 1 2 359260 CASAVA_Build 8 58651999 3D AACACTCATA TGT/--- TGTTGGTGGC 3070 het 3070 ref 52 30 19 6 TGT 2 1 359261 CASAVA_Build 8 58653911 1D TTGAAAAAAA T/- ATCTTGATTT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 1 0 359262 CASAVA_Build 8 58656243 1D TACAGCATTG A/- AAAAAAAAAA 1088 het 1088 ref 28 21 3 4 A 13 12 359263 CASAVA_Build 8 58658356 1I TCTTTTTACT -/A AGCAGTATTA 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 A 1 2 359264 CASAVA_Build 8 58674853 1I AGTACCAGCA -/T GGAGATTAGC 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 0 1 359265 CASAVA_Build 8 58679880 1D TCCCACCAAC A/- ATAAAAGAAG 3070 het 3070 hom 27 8 15 4 A 2 1 359266 CASAVA_Build 8 58688190 1D AATAACAAGA G/- GGAATTTTGA 3070 hom 42 het 19 0 15 5 G 3 2 359267 CASAVA_Build 8 58697891 4D AGGATAGTGT TCCA/---- TCCATCCTTT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 TCCA 2 1 359268 CASAVA_Build 8 58710908 8D GATATGGGCT AAGGATAC/-------- ACACATGAAT 3070 het 3070 hom 20 8 11 2 AAGGATAC 1 0 359269 CASAVA_Build 8 58719143 7I ATTTGTTTGC -------/TCTTACT TCTCTAGTTC 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 TCTTACT 0 1 359270 CASAVA_Build 8 58794787 5D AAGGCTGTTT CAAGG/----- CTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 43 21 22 2 CAAGG 1 0 359271 CASAVA_Build 8 58805999 1D CTGCTTAATA T/- TCTTTAAATG 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 2 1 359272 CASAVA_Build 8 58813728 2D TGTGTGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 49 20 22 8 TG 10 9 359273 CASAVA_Build 8 58822462 1I TGTCTTTGAT -/A AAAAAAACTC 2077 het 2077 ref 27 18 6 3 A 7 8 359274 CASAVA_Build 8 58824334 1D GCATTCTACT C/- CGGTTGGCAG 3070 het 3070 ref 39 16 11 12 C 2 1 359275 CASAVA_Build 8 58828072 1D CAAAAGCAAG A/- GATGCATGAG 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 A 1 0 359276 CASAVA_Build 8 58863240 1D TTGTCTTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 147 hom 21 1 17 3 A 11 10 359277 CASAVA_Build 8 58865635 1D AAAACCTATG A/- GTAAGACTTT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 A 1 0 359278 CASAVA_Build 8 58865875 5I AACATTTCTG -----/AAAAA AAAAAACATA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 6 11 359279 CASAVA_Build 8 58878699 1D AGTGCAATGG C/- ACAGTCTCGG 3070 het 3070 ref 18 8 8 2 C 1 0 359280 CASAVA_Build 8 58896826 1D GGACTTAATT A/- AAAAAAGCTT 3070 het 3070 ref 36 20 12 5 A 7 6 359281 CASAVA_Build 8 58914394 2D ATACCATAGC AT/-- AGGTGGCTCA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 AT 1 0 359282 CASAVA_Build 8 58921144 1D GCACCACTGC A/- ACTCCAGCCT 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 2 1 359283 CASAVA_Build 8 58927968 2I AAAGCCTGGC --/CA CAGAGACATA 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 CA 1 2 359284 CASAVA_Build 8 58940616 1D ACGATAATCC T/- TTTTTTTTTT 2631 het 2631 ref 41 18 9 14 T 19 18 359285 CASAVA_Build 8 58964864 2D CACACACACG CA/-- CACACACACA 1326 het 1326 ref 45 36 3 8 CA 7 6 359286 CASAVA_Build 8 58971670 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTA 2730 het 2479 hom 19 8 8 3 T 10 9 359287 CASAVA_Build 8 59018896 1I TAAATCTCAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 A 9 10 359288 CASAVA_Build 8 59021314 3D AGTTGAGAAG AAT/--- GTGTATTCTG 3070 het 3070 ref 53 31 18 6 AAT 1 0 359289 CASAVA_Build 8 59025063 3D ACTTACTTGG TTC/--- TTCTCACTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 TTC 2 1 359290 CASAVA_Build 8 59034333 1D TCTGGCATGA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 10 9 359291 CASAVA_Build 8 59045918 1I CCTTTACTCC -/T TTTTACATAC 3070 het 3070 hom 51 20 21 10 T 4 5 359292 CASAVA_Build 8 59051189 1D TAGTGGTGAC T/- TTTTTTTTTT 1085 het 1085 ref 33 23 3 7 T 13 12 359293 CASAVA_Build 8 59076489 2D GTGTGTGCAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 38 13 16 11 GT 8 7 359294 CASAVA_Build 8 59081718 1D CCTTAATTGA T/- TTTTTTTTTT 178 het 178 ref 32 21 2 9 T 15 14 359295 CASAVA_Build 8 59087373 1I GTTTTCCTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 56 23 25 8 T 9 10 359296 CASAVA_Build 8 59089926 3I CAAACCTATT ---/ATG ATCTTTATTT 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 ATG 0 1 359297 CASAVA_Build 8 59093228 4D TTTAAATGCT CAAA/---- CAAATGTATT 3070 het 3070 ref 45 21 20 5 CAAA 2 1 359298 CASAVA_Build 8 59096022 1I TAGACGAGGC -/A GTCCTCAGAT 3070 het 3070 ref 40 15 14 11 A 0 1 359299 CASAVA_Build 8 59102098 7I TGAGTTTCTT -------/CTTGGAA CTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 CTTGGAA 0 1 359300 CASAVA_Build 8 59102537 1D GAACACTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 T 12 11 359301 CASAVA_Build 8 59105660 14D GAGGACGCTG GCATAGATCTTAAT/-------------- GAAGTAGTTT 3070 het 3070 ref 40 28 15 4 GCATAGATCTTAAT 1 0 359302 CASAVA_Build 8 59112246 1I GTATGTTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 9 10 359303 CASAVA_Build 8 59113869 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 13 14 359304 CASAVA_Build 8 59124063 1I AGTCTCTCAC -/T TTAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 T 2 3 359305 CASAVA_Build 8 59133449 1I GACAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 10 9 5 A 11 12 359306 CASAVA_Build 8 59138583 4I CTCATACATC ----/CATT ATTTGAAATG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 CATT 0 1 359307 CASAVA_Build 8 59139508 1D ATGTATACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 T 11 10 359308 CASAVA_Build 8 59218152 2I CTCGTACAAA --/GT GTCTACACTA 3070 hom 129 het 46 0 43 3 GT 1 2 359309 CASAVA_Build 8 59223253 1D GAATGCCTTT A/- AAAAAAAAAA 1608 het 373 hom 24 6 8 10 A 13 12 359310 CASAVA_Build 8 59226464 1I ATCAGTGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 16 20 13 T 13 14 359311 CASAVA_Build 8 59235014 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 22 hom 19 1 10 8 A 15 14 359312 CASAVA_Build 8 59238420 4D AAGAAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 37 het 24 0 18 6 AAAG 3 2 359313 CASAVA_Build 8 59238590 3I GAAAGAAAAG ---/AAA AAGAAAGAAA 3070 hom 92 het 38 0 29 9 A 2 5 359314 CASAVA_Build 8 59245214 1D GCAGTACTGT A/- AGACAGCATG 3070 hom 128 het 50 0 42 8 A 2 1 359315 CASAVA_Build 8 59246829 1D ACTGTAAATG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 41 het 17 0 13 4 C 10 9 359316 CASAVA_Build 8 59247382 1D AAATGGAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 12 11 359317 CASAVA_Build 8 59251330 1D ACTCTGCCCC T/- CTGCCAGCTC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 T 1 0 359318 CASAVA_Build 8 59256205 2I ATGGAGTGTC --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 42 1 35 6 TG 7 8 359319 CASAVA_Build 8 59256808 1D GAAGTCATAG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 9 8 359320 CASAVA_Build 8 59270049 1D TTTTATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 349 hom 27 2 20 5 A 13 12 359321 CASAVA_Build 8 59270273 1D CTGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 26 1 17 8 T 12 11 359322 CASAVA_Build 8 59282406 1D ATTTTTTTGG T/- TTGGGGGGGG 3070 hom 60 het 26 0 21 6 T 3 2 359323 CASAVA_Build 8 59288440 1D GACATACCAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 87 het 36 0 30 8 A 9 8 359324 CASAVA_Build 8 59291819 2I GACTTTAAAT --/AA AGTTAGTAAG 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 1 3 359325 CASAVA_Build 8 59312746 1I TTAGAGCCAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 6 hom 29 1 22 6 A 8 9 359326 CASAVA_Build 8 59314389 3D GCCCCCCATG CCC/--- CCCCCCCCCA 2329 het 6 hom 17 1 9 7 C 12 9 359327 CASAVA_Build 8 59318815 1I AACATTCTGG -/A AAAAAGAGAT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 A 5 6 359328 CASAVA_Build 8 59322854 1I GTATGGAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 34 1 27 6 A 11 12 359329 CASAVA_Build 8 59329833 4D AATAAGTGGA AGAT/---- AGATAGAAAA 3070 hom 111 het 39 0 38 2 AGAT 2 1 359330 CASAVA_Build 8 59330736 2I TAAAAGTTAC --/AA AAAAAAAAGT 3070 hom 99 het 43 0 34 9 A 8 10 359331 CASAVA_Build 8 59335620 1I ACTGTACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2529 hom 50 12 28 10 T 10 11 359332 CASAVA_Build 8 59339426 4D TATATGCCTT TTAA/---- TTGTTTTCCT 3070 het 3070 hom 33 11 16 8 TTAA 1 0 359333 CASAVA_Build 8 59339902 1D CATTCCTCCT G/- CTGGAAGGAT 3070 het 3070 ref 54 26 22 6 G 1 0 359334 CASAVA_Build 8 59343709 1D GGAAAAAAAA C/- ATTATAAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 1 0 359335 CASAVA_Build 8 59344428 1D ACAAACAAAC A/- AACAACAACA 353 het 353 ref 34 18 2 14 A 3 2 359336 CASAVA_Build 8 59355730 13I TGCATCAAAT -------------/TGGGCTCCCTGGA GAATCAAACC 3070 hom 114 het 40 0 38 3 TGGGCTCCCTGGA 0 1 359337 CASAVA_Build 8 59356618 1I CCCTTAGGGA -/T GTGATCAAAC 3070 hom 144 het 55 0 49 6 T 0 1 359338 CASAVA_Build 8 59362070 1D ATCACAATTT G/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 12 16 0 G 1 0 359339 CASAVA_Build 8 59376703 7I TAAATATTAA -------/TATATTT ATATATAAAT 1708 hom 10 het 5 0 4 1 TATATTT 0 1 359340 CASAVA_Build 8 59379372 3I AAAAAGTGTT ---/ATC ATTTAAATGA 3070 hom 135 het 49 0 46 3 ATC 0 1 359341 CASAVA_Build 8 59383468 2D AGCACAGGAA AG/-- AGCCACCCCC 2800 het 2800 ref 19 12 7 0 AG 2 1 359342 CASAVA_Build 8 59384519 1I AAACTGCTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 1551 hom 26 5 13 8 A 9 10 359343 CASAVA_Build 8 59394113 1D AGTGTTTTAC G/- TTTTTTATTG 3003 het 3003 ref 28 15 7 6 G 1 0 359344 CASAVA_Build 8 59396530 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 13 14 359345 CASAVA_Build 8 59404051 4D AGAAAGACTT AAAG/---- AGACACTTCA 3070 het 3070 hom 43 21 19 4 AAAG 1 0 359346 CASAVA_Build 8 59405790 5I AATAAGTAGA -----/ATTTT ATTAAATGGA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 ATTTT 0 1 359347 CASAVA_Build 8 59405933 1D32M1D TTTATCCAGG AAAAAAAGTTGCTTTTTTAGTTGTTGGTGGTGGT/-AAAAAAGTTGCTTTTTTAGTTGTTGTTGGTGG- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 31 16 11 N/A 0 0 359348 CASAVA_Build 8 59409702 22D ATCAGAATCT CTAGGATGCAGCTGAAACTGTG/---------------------- TTAAGAGGGA 3070 het 3070 ref 23 13 10 2 CTAGGATGCAGCTGAAACTGTG 1 0 359349 CASAVA_Build 8 59409861 4I GACAGGAAAT ----/AATC AATTTCAGAG 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 AATC 0 1 359350 CASAVA_Build 8 59422140 3I TGTTGTTGTT ---/GTC GTCAAATCAT 3070 het 3070 hom 54 23 27 4 GTC 1 2 359351 CASAVA_Build 8 59423314 2I GAGTGGTGTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 10 hom 49 2 24 23 GT 8 9 359352 CASAVA_Build 8 59424621 4I ATCTAGCAAA ----/GTCT GTCATGATCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 GTCT 0 1 359353 CASAVA_Build 8 59429881 2I AGATAATGAG --/TA TACAGCAGTG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TA 1 2 359354 CASAVA_Build 8 59435329 1D GAAATAAGAA T/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 3 T 1 0 359355 CASAVA_Build 8 59440185 1D GGTGAAAAAA G/- TCTCTACACT 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 G 1 0 359356 CASAVA_Build 8 59441419 1D GAGGCTGAGG C/- AAGAGGATTG 3070 het 3070 hom 38 19 17 3 C 1 0 359357 CASAVA_Build 8 59442317 1I ATCTCTGTTT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 8 9 359358 CASAVA_Build 8 59443920 13D CATTTATCCT GAGCACCTAGCCG/------------- GAACTTCTGA 3070 het 3070 ref 27 18 7 7 GAGCACCTAGCCG 1 0 359359 CASAVA_Build 8 59445243 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 1104 het 103 hom 7 1 4 2 A 17 16 359360 CASAVA_Build 8 59455719 1D GTAAAATAAC A/- AGGATAAAAT 3070 het 3070 ref 23 12 10 2 A 2 1 359361 CASAVA_Build 8 59455933 1D AAGGTTAAAG A/- AAAAAAATTA 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 8 7 359362 CASAVA_Build 8 59458031 3D AAATAAATAA AAT/--- AATAAAAAAT 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AAT 2 1 359363 CASAVA_Build 8 59463095 1I AAATGAACCT -/A AAAAAAAAAG 1225 het 1225 ref 11 8 3 0 A 9 10 359364 CASAVA_Build 8 59463527 1I ATGCCTTTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 T 8 9 359365 CASAVA_Build 8 59465071 1I ATGACTTTAT -/G GGATTTCATT 2941 het 2661 hom 17 7 6 4 G 2 3 359366 CASAVA_Build 8 59478929 1D CCCCCAAACC A/- AATACATGCA 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 A 3 2 359367 CASAVA_Build 8 59479104 2D TGTTTTTCAC AT/-- GTTTGTGCTT 3070 het 3070 hom 60 19 28 13 AT 1 0 359368 CASAVA_Build 8 59484164 14D AGGGTGAAGT TAGTCTTCATCATC/-------------- TGGTTTCCTC 3070 het 3070 ref 33 22 11 6 TAGTCTTCATCATC 1 0 359369 CASAVA_Build 8 59500043 16D AACACCTTTC TCTCTGTTGATGTCAG/---------------- TCAGAATATC 3070 het 3070 ref 42 27 19 7 TCTCTGTTGATGTCAG 1 0 359370 CASAVA_Build 8 59509483 1D TATATATATA T/- TTTTTTTTTT 775 het 775 ref 17 5 3 9 T 12 11 359371 CASAVA_Build 8 59511240 1D TCTAGCACTT C/- CTATGTAAAT 3070 het 3070 ref 54 28 18 8 C 2 1 359372 CASAVA_Build 8 59516462 2D TGTGATCAAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 38 hom 18 1 13 4 AT 10 9 359373 CASAVA_Build 8 59521369 4D AAATATGTGG TATT/---- TAAACAGTCT 3070 het 3070 ref 32 20 11 2 TATT 1 0 359374 CASAVA_Build 8 59523695 3D TTTATTCATT CAA/--- CACATTTTTC 3070 het 3070 ref 44 21 21 3 CAA 1 0 359375 CASAVA_Build 8 59577887 4D AGGCATTCAG TTTT/---- TTTTGTTTTT 290 het 151 hom 20 1 6 13 T 8 4 359376 CASAVA_Build 8 59579399 1I AACAACTGTC -/A AAAAAAAAAA 1512 het 1512 ref 37 28 5 4 A 14 15 359377 CASAVA_Build 8 59585188 1D AGTCCTCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 18 15 13 T 12 11 359378 CASAVA_Build 8 59585830 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 T 11 10 359379 CASAVA_Build 8 59592428 5I GACCATAGTA -----/TAGTT TAAACATAAC 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 TAGTT 0 1 359380 CASAVA_Build 8 59594193 32I GAGGCCTTAG --------------------------------/TGACTTGCTTGGTCAATAGAATATAGCAGAAA TGAGAATCCG 2453 het 2453 ref 25 12 6 7 TGACTTGCTTGGTCAATAGAATATAGCAGAAA 0 1 359381 CASAVA_Build 8 59596460 2D TTGTCCCCAA TG/-- TGTGTTTTTT 3027 het 1862 hom 39 9 14 16 TG 3 2 359382 CASAVA_Build 8 59600595 4I CCTTAGTAAA ----/CTGT CTATTTACAT 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 CTGT 0 1 359383 CASAVA_Build 8 59603531 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTCTTT 1476 het 1476 ref 29 16 6 7 T 7 6 359384 CASAVA_Build 8 59624550 1D CATCTCCCCT A/- AACCCCTGGC 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 3 2 359385 CASAVA_Build 8 59626617 1I TGGCTCTTCT -/G GGTCTTTCAT 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 G 2 3 359386 CASAVA_Build 8 59634667 1D AGAATGTGAA T/- TTTTTTTTTT 1395 het 1395 ref 33 22 3 8 T 13 12 359387 CASAVA_Build 8 59637668 4I TTATGATCAC ----/TTGA TTTTCAATAA 3070 het 3070 ref 59 31 23 5 TTGA 0 1 359388 CASAVA_Build 8 59642239 1I GGGGCACCCC -/T AACCCCTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 T 0 1 359389 CASAVA_Build 8 59654353 1D AATGATTTGG C/- TCTAGAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 C 1 0 359390 CASAVA_Build 8 59658217 4I46M1I TTGAGGCTAC ----TGATTGTCCCTAGCAATACCTGAGACCAGGTAATATTTAATAACAC-/TGATTGATTGTCCCTAGCAATACCTGAGACCAGGTAATATTTAATAACACT TGAAACTGAC 3070 het 3070 ref 30 26 23 7 N/A 0 0 359391 CASAVA_Build 8 59660431 1I TGTTTCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 9 11 6 T 12 13 359392 CASAVA_Build 8 59667679 1D AAACAAACAG A/- AAAAAACAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 7 6 359393 CASAVA_Build 8 59668023 2D5M1D AACAAAAACA ACAACAAC/--AACAA- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 15 13 2 N/A 0 0 359394 CASAVA_Build 8 59670799 1D AAATTTTTGC T/- AAGTCAACTA 3070 het 3070 hom 31 11 18 4 T 1 0 359395 CASAVA_Build 8 59673963 2I TGGTGAAACC --/CT GTCACGACCA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 CT 0 1 359396 CASAVA_Build 8 59675884 3I GTGTGGTGGG ---/TAA ATACCAAGTA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 TAA 0 1 359397 CASAVA_Build 8 59679671 4I GATATATATA ----/ATAT ATATATATAT 2430 het 780 hom 9 2 6 1 AT 6 8 359398 CASAVA_Build 8 59681166 12I TTCAAAAAGA ------------/AAATAATAAAAT AAATAATAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AAATAATAAAAT 1 2 359399 CASAVA_Build 8 59698414 2I AAAAAAAGTA --/CG TTTATAAGTA 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 CG 0 1 359400 CASAVA_Build 8 59704523 4D GTTAATATTC TCTT/---- TGTTAAAATT 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 TCTT 1 0 359401 CASAVA_Build 8 59715669 1D TTGCAACTGG A/- AAAGTTTACA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 4 3 359402 CASAVA_Build 8 59718648 1D GGGACAGATC T/- TTTTTTTTTT 2917 het 2917 ref 45 11 13 22 T 15 14 359403 CASAVA_Build 8 59720380 1I TTTTCTATTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 8 9 359404 CASAVA_Build 8 59735213 1D CTCCATTGTG A/- AAAAAAAAAA 2960 het 2960 ref 36 15 7 14 A 13 12 359405 CASAVA_Build 8 59761850 3D ATTTTGCTAA GAT/--- ATATAAGTAA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 GAT 1 0 359406 CASAVA_Build 8 59762541 1I TGGCCCGAGA -/G GCATGTCACT 3070 hom 138 het 51 0 45 6 G 1 2 359407 CASAVA_Build 8 59765913 1D AAACCAGAAT A/- AAAAGCTGTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 5 4 359408 CASAVA_Build 8 59768003 3D AGGTAGAGAG AGA/--- AGAAGAGACA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AGA 3 2 359409 CASAVA_Build 8 59771068 1I AATATGAAGG -/C CCCCCCATGC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 C 6 7 359410 CASAVA_Build 8 59771974 1I TCTTGTGTCA -/T TTAGGCCACT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 2 3 359411 CASAVA_Build 8 59779985 1I ATTCCTGTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2711 hom 20 7 10 3 T 9 10 359412 CASAVA_Build 8 59781955 1I CACCTGTCTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 7 8 359413 CASAVA_Build 8 59792522 2D TTGTACATGA TC/-- ACACAACTAG 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 TC 1 0 359414 CASAVA_Build 8 59798523 1I TTAAAAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 10 13 10 A 10 11 359415 CASAVA_Build 8 59818974 1I TAATATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 103 hom 31 1 20 10 T 10 11 359416 CASAVA_Build 8 59833686 1D GAATGCCCCT G/- GAATCTTAGA 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 2 1 359417 CASAVA_Build 8 59834836 1I GCCCAGGGAG -/C CAGCCATCAC 2738 het 2738 ref 35 19 6 10 C 1 2 359418 CASAVA_Build 8 59841967 1D GTCAAGATTT A/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 26 14 11 1 A 1 0 359419 CASAVA_Build 8 59845609 1I TGCATGAACT -/A CCACTAAGCG 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 A 0 1 359420 CASAVA_Build 8 59893750 1D GCAATCCTCC A/- GGCAGCCACC 3070 het 3070 ref 59 30 23 6 A 1 0 359421 CASAVA_Build 8 59899200 1D CTCTGAGGCA C/- TGGGTATTTT 3070 het 3070 hom 47 15 23 9 C 1 0 359422 CASAVA_Build 8 59915950 7D GAATCCAGTG GATGCTT/------- GATGCTTGAG 3070 het 3070 ref 44 24 9 16 GATGCTT 2 1 359423 CASAVA_Build 8 59921338 1D AATAGAATAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 9 8 359424 CASAVA_Build 8 59938867 2I CTGAACACTT --/AA ACTCTGTGCC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 1 3 359425 CASAVA_Build 8 59939094 1I GAATTAAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 10 11 359426 CASAVA_Build 8 59943899 1D AGAGCAATTT A/- AGCCTAAACC 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 A 2 1 359427 CASAVA_Build 8 59951582 1I ATGCTGGGGT -/A GGGGGGAAAG 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 0 1 359428 CASAVA_Build 8 59952972 1D CCTACATATT A/- AAAAAAAAAA 1976 het 1976 ref 42 27 5 10 A 13 12 359429 CASAVA_Build 8 59953319 2D TGGTATTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 9 A 13 11 359430 CASAVA_Build 8 59954642 6I AACATATTTT ------/TAGTTA TAGTTATTAC 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 TAGTTA 1 2 359431 CASAVA_Build 8 59956523 1I ATCCTTGCAT -/G GGCACATGTG 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 G 2 3 359432 CASAVA_Build 8 59965370 2D CACAGGACTT AA/-- GACATGCATC 3070 hom 117 het 42 0 39 4 A 2 0 359433 CASAVA_Build 8 59968324 1I TCCATAATCT -/C CCCCCCCACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 7 8 359434 CASAVA_Build 8 59972817 4I AATGGAAGTC ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 36 0 19 17 T 10 14 359435 CASAVA_Build 8 59973461 35I TCATATACAG -----------------------------------/CTTTAAGAAGGGCTCTCACCCCTAAAAGCTGTCTT CTTTTATCTC 3070 hom 105 het 30 0 36 2 CTTTAAGAAGGGCTCTCACCCCTAAAAGCTGTCTT 0 1 359436 CASAVA_Build 8 59989874 1D CGCAGAAGAC G/- GGTGATTTCT 3070 hom 44 het 18 0 13 5 G 3 2 359437 CASAVA_Build 8 59995863 1I AAAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 1582 hom 22 het 14 0 9 5 A 12 13 359438 CASAVA_Build 8 59996198 2D AAGGAAACAC AG/-- AGAACCAGGA 3070 hom 108 het 43 0 37 8 AG 2 1 359439 CASAVA_Build 8 60002001 1I AATTACTGGG -/T TTTTGACAAA 3070 hom 74 het 28 0 25 3 T 4 5 359440 CASAVA_Build 8 60013180 1I TGCCAATGAG -/T TCTCCCCTCT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 1 2 359441 CASAVA_Build 8 60046810 1D TTTCGTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 het 435 hom 29 1 23 5 T 9 8 359442 CASAVA_Build 8 60048738 4D CCATATAGTA TAAG/---- TAATTCCATT 3070 het 3070 ref 37 23 12 2 TAAG 1 0 359443 CASAVA_Build 8 60051186 1D TCCGTCTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 32 het 21 0 17 5 A 13 12 359444 CASAVA_Build 8 60080158 1D TATCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 12 11 359445 CASAVA_Build 8 60083698 1D AAGCTCACCT C/- CCCCCCATGA 3070 hom 24 het 30 1 20 9 C 7 6 359446 CASAVA_Build 8 60088527 1I CAGATAGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 325 hom 27 1 18 8 T 12 13 359447 CASAVA_Build 8 60098458 30I AAAATACCTG ------------------------------/AAGAGACTACCTTTATTAAAAACCATTATA AAGGTACTCT 3070 hom 90 het 33 0 31 4 AAGAGACTACCTTTATTAAAAACCATTATA 0 1 359448 CASAVA_Build 8 60100591 5D GCAGCAAAGT TTACG/----- TTCTTAGCCA 3070 hom 168 het 59 0 52 7 TTACG 1 0 359449 CASAVA_Build 8 60101236 2I TAATTTTATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 46 1 32 13 T 10 12 359450 CASAVA_Build 8 60102015 1D GAGAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 644 hom 29 4 16 10 A 16 15 359451 CASAVA_Build 8 60102564 1I AGGAACAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 166 hom 54 2 46 6 T 11 12 359452 CASAVA_Build 8 60108147 1I ACTCCAACTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 13 14 359453 CASAVA_Build 8 60112281 1I TCCAAGCTCC -/T TTTTTTTTTT 2840 het 2840 ref 38 11 12 15 T 13 14 359454 CASAVA_Build 8 60118053 1D CATTTTTCGT G/- ATGAGAACAT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 G 1 0 359455 CASAVA_Build 8 60135020 1D GTTATGTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2549 hom 32 9 15 8 A 15 14 359456 CASAVA_Build 8 60144763 1D CAGCACACTT C/- CATCAGAGAT 3070 het 3070 ref 30 21 8 1 C 2 1 359457 CASAVA_Build 8 60145496 4D CATGCAAACC TCTA/---- TCTATGCTTC 3070 het 3070 ref 28 20 8 0 TCTA 2 1 359458 CASAVA_Build 8 60210633 1D CCTACCTGGG A/- TTAGGGTGTT 3070 het 3070 hom 51 15 23 15 A 1 0 359459 CASAVA_Build 8 60213016 3D GCGTGTGGTA GAG/--- GAAGAAGCTG 3070 het 3070 ref 44 26 16 5 GAG 1 0 359460 CASAVA_Build 8 60214307 4D AGTGGAAATA TATG/---- TATGTATGTA 2687 het 2687 ref 19 8 7 6 TATG 5 4 359461 CASAVA_Build 8 60243768 13I TCAAAATGTC -------------/TTTCTTTTTTTTT TTTCTTTTTT 2277 het 2277 ref 22 7 8 7 TTTCTTTTTTTTT 0 1 359462 CASAVA_Build 8 60259213 1D CCCCTCCTTT A/- AAAAAGTCTA 3070 het 3070 ref 43 18 17 9 A 6 5 359463 CASAVA_Build 8 60263369 1I TTTGCCAAGG -/T TTTGTCTATT 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 3 4 359464 CASAVA_Build 8 60267067 1D TGTAAAAAAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 8 7 359465 CASAVA_Build 8 60271680 1D TTCTAAAATT A/- AAAAAACACC 3070 het 3070 ref 38 22 13 4 A 7 6 359466 CASAVA_Build 8 60273276 1D CACAAATTTT A/- AAAAAATAAT 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 7 6 359467 CASAVA_Build 8 60274289 1I CTTCCAAAGA -/C TACAGTATGG 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 C 0 1 359468 CASAVA_Build 8 60274813 1D TCCTGGCAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 24 9 1 A 10 9 359469 CASAVA_Build 8 60276613 1D GCTCATGCTA T/- TGCGGAACCT 3070 het 3070 hom 28 8 19 1 T 2 1 359470 CASAVA_Build 8 60284049 3I ATTCCATCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 A 13 16 359471 CASAVA_Build 8 60286780 1I TTTGAGGTCC -/T TTTTGTGTTT 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 T 4 5 359472 CASAVA_Build 8 60289425 4D AATTTTTCAC TGAT/---- TGAGTTGATT 3070 het 3070 ref 26 15 9 3 TGAT 1 0 359473 CASAVA_Build 8 60292048 1D TTCTGTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 13 12 359474 CASAVA_Build 8 60305949 2I AAAATGACTT --/AA GAGTTCTTAA 3070 het 3070 ref 27 10 10 7 A 0 2 359475 CASAVA_Build 8 60306481 1D AAATTAATTG A/- ATTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 A 2 1 359476 CASAVA_Build 8 60307441 26D TTTCAATATC ATATATATATATATATATATATATAT/-------------------------- ATATATATAT 3070 hom 27 het 10 0 10 3 AT 19 6 359477 CASAVA_Build 8 60318217 1I CTGCTTAAAA -/T CAGCTAGTGA 3070 het 3070 hom 54 24 23 7 T 0 1 359478 CASAVA_Build 8 60330597 2D TCAACGTGTC TA/-- TCTTTAACTT 3070 het 1584 hom 24 4 14 12 TA 1 0 359479 CASAVA_Build 8 60332391 1D TCAAATGAGA T/- TTTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 34 20 12 3 T 7 6 359480 CASAVA_Build 8 60338573 4I ACTGAAACTT ----/AATC AAGAGCAACA 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 AATC 0 1 359481 CASAVA_Build 8 60342329 44D2M6D TTTCAACCAA CCTTTAAGTGAATCGTGAAGTTCTGCTAAATACACTGGTGGTGGTAAGGAAC/--------------------------------------------TA------ CAGGGTGGAA 3070 het 3070 ref 41 34 19 4 N/A 0 0 359482 CASAVA_Build 8 60355219 1D CCATACGTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 10 9 359483 CASAVA_Build 8 60363688 2I TGGGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 TG 5 6 359484 CASAVA_Build 8 60370886 9D TTGAGAATTC TGAAACTAG/--------- AAGAAAAAAT 3070 het 3070 ref 50 30 17 7 TGAAACTAG 1 0 359485 CASAVA_Build 8 60372048 1D CACAGATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 21 5 A 12 11 359486 CASAVA_Build 8 60377170 5D TTGTATCCTA TTATT/----- TTATTTAATT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TTATT 2 1 359487 CASAVA_Build 8 60378230 4D TAAAAAAAAC AAAA/---- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 42 20 14 8 A 11 7 359488 CASAVA_Build 8 60379511 1I GTCACATGAG -/T TCATAGGGAG 3070 het 3070 hom 47 18 20 9 T 1 2 359489 CASAVA_Build 8 60382102 37I AGGATGAGGC -------------------------------------/TTACCAAATCTCCTTCCGAGTGTACTCTCCTACCCTT TTAAAAACAA 3070 het 3070 ref 42 15 17 10 TTACCAAATCTCCTTCCGAGTGTACTCTCCTACCCTT 0 1 359490 CASAVA_Build 8 60389097 3I6M4I ACATACATAG ---TTATAT----/TTATTATATTGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 19 8 8 3 N/A 0 0 359491 CASAVA_Build 8 60391588 2I TGTGCTATAA --/AT ATGTGTAATT 3070 het 1279 hom 14 4 8 2 AT 1 2 359492 CASAVA_Build 8 60391636 1I GATGTTAATA -/T TTTTTTAAAT 2160 het 2160 ref 14 6 5 3 T 6 7 359493 CASAVA_Build 8 60392504 3D GAGGAAACAA CAG/--- GTGACAGGGA 3070 het 3070 hom 46 15 28 3 CAG 1 0 359494 CASAVA_Build 8 60396749 3I TGATGCTGGC ---/TAA TAAAGTAGGG 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 TAA 1 2 359495 CASAVA_Build 8 60406586 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 509 hom 38 2 27 9 T 13 12 359496 CASAVA_Build 8 60418926 2D AGTCTTTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1382 hom 24 7 11 6 T 15 13 359497 CASAVA_Build 8 60436698 4I TAAATAGAAG ----/TACT TACTTCTTTA 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 TACT 1 2 359498 CASAVA_Build 8 60455731 1D TCATATGTTG A/- AAAAAAATTG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 A 8 7 359499 CASAVA_Build 8 60458259 1D AATGGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 16 1 14 2 A 12 11 359500 CASAVA_Build 8 60478993 1D TCCCAATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 31 8 T 11 10 359501 CASAVA_Build 8 60493664 1I TTCCTAGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 4 hom 24 1 18 5 T 9 10 359502 CASAVA_Build 8 60511738 1D TGGCCACTTC T/- TTCTTTCTTT 3070 hom 90 het 33 0 29 5 T 3 2 359503 CASAVA_Build 8 60517112 1D TACCCCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 803 hom 26 3 14 9 T 17 16 359504 CASAVA_Build 8 60545654 1I AAAGAATGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1624 hom 29 5 19 5 T 14 15 359505 CASAVA_Build 8 60551522 7I AAACATGAAA -------/AAAGGTC AAAGGTCAAC 3070 hom 48 het 22 0 17 7 AAAGGTC 1 2 359506 CASAVA_Build 8 60566509 13D GATAATCATG TGGTTTTTGTGAT/------------- TGGTTCTCTT 3070 hom 27 het 11 0 10 4 TGGTTTTTGTGAT 1 0 359507 CASAVA_Build 8 60572258 1D ATATTTCCAA T/- AGTGATAACT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 1 0 359508 CASAVA_Build 8 60603628 3D61M1I GACCACATTG GAAGAAGAATAATTGTCTTAGGCCACACATAAAATACACTAACATTAACAATAGCTGATGAGCT-/---GAAGAATAATTGTCTTAGGCCACACATAAAATACACTAACATTAACAATAGCTGATGAGCTA AAAAAAAAAA 3070 het 506 hom 33 2 32 16 N/A 0 0 359509 CASAVA_Build 8 60608738 1D GCAATTCGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 34 0 33 2 A 10 9 359510 CASAVA_Build 8 60616070 1D ATAATGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 11 10 359511 CASAVA_Build 8 60619123 1I CTGAGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 136 hom 35 1 24 10 A 13 14 359512 CASAVA_Build 8 60631297 1D ATCTCAACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 357 hom 28 1 17 11 T 13 12 359513 CASAVA_Build 8 60669253 1D ATCCACTGGA G/- GGGGTTGGAA 3070 hom 132 het 50 0 44 6 G 5 4 359514 CASAVA_Build 8 60718055 1D GTAAGAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1785 het 1785 ref 42 25 4 13 T 11 10 359515 CASAVA_Build 8 60748811 3D GGTCATCTAA AGT/--- AGTAGATTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 3 AGT 2 1 359516 CASAVA_Build 8 60803764 1D AAGCATCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 419 hom 36 1 27 8 A 12 11 359517 CASAVA_Build 8 60809961 1D TAATTAAAAA G/- CTCAAGAAAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 G 1 0 359518 CASAVA_Build 8 60812802 1I ATTTAATCAT -/G GGGGGCCGGT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 G 5 6 359519 CASAVA_Build 8 60814616 1I GAGCAAGTCC -/T ATTTTCAGTT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 0 1 359520 CASAVA_Build 8 60831405 1D TAAGACAATG T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 120 het 48 0 41 7 T 8 7 359521 CASAVA_Build 8 60831564 1D GGCTGTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 29 1 16 12 A 15 14 359522 CASAVA_Build 8 60832670 1I AATGAAATAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 7 8 359523 CASAVA_Build 8 60835709 1D TGTTCTGGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 11 10 359524 CASAVA_Build 8 60838104 1D GAGTTAAAGG T/- TTTTACTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 2 T 5 4 359525 CASAVA_Build 8 60846898 1D TACAAGATTA T/- TTTTTTATAC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 7 6 359526 CASAVA_Build 8 60858546 11D TTGTGATATA TTTTATTTTAT/----------- TTTTATTTTA 3070 hom 132 het 54 0 45 10 TTTTATTTTAT 2 1 359527 CASAVA_Build 8 60868629 2I AGCTCAGCCC --/AG AGAGAGGGAG 3070 hom 123 het 46 0 42 4 AG 3 4 359528 CASAVA_Build 8 60871090 1I AAAAAACACA -/T TTTAAAATGG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 3 4 359529 CASAVA_Build 8 60872476 1D TTCAGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 31 1 27 3 A 11 10 359530 CASAVA_Build 8 60879209 1D CAATAATTTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 T 10 9 359531 CASAVA_Build 8 60883302 2D ATATAAGAAA CT/-- CTTAGGAAGA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 CT 2 1 359532 CASAVA_Build 8 60909170 2D ACACACCACC CA/-- CACACACACA 3070 hom 125 het 53 0 38 15 CA 9 8 359533 CASAVA_Build 8 60916168 4I GTCTACTAAC ----/AGTT AGAAAAGCAT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 AGTT 0 1 359534 CASAVA_Build 8 60918406 1I AACCCATGTA -/T TTACATTCAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 3 359535 CASAVA_Build 8 60973541 4I AATAAAAGTT ----/CTTA CTTATTCAGA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 CTTA 1 2 359536 CASAVA_Build 8 61004370 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 2987 hom 21 het 10 0 8 2 T 10 9 359537 CASAVA_Build 8 61119062 2D TATACAACTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 81 het 34 0 28 7 TG 7 6 359538 CASAVA_Build 8 61128428 1I GTAAATTCAA -/T GTGTGCAGAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 0 1 359539 CASAVA_Build 8 61179976 1I AGTTTATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 37 2 29 6 A 10 11 359540 CASAVA_Build 8 61213404 3D TGTGTGACAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 35 0 31 5 A 13 10 359541 CASAVA_Build 8 61216152 1D GCCCCCTGGG A/- AAAAATCCAT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 6 5 359542 CASAVA_Build 8 61217920 1I GATTTTTTTT -/A AAAAACCTGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 5 6 359543 CASAVA_Build 8 61222354 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 355 hom 36 1 35 1 A 9 10 359544 CASAVA_Build 8 61225024 1I TAAATGACAC -/A AAAAAAATAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 7 8 359545 CASAVA_Build 8 61225951 1I TGTGGCTTCT -/C TCTTTTAACT 3070 hom 63 het 25 0 20 5 C 0 1 359546 CASAVA_Build 8 61233090 4I TCTTTTTCAG ----/ACAA ACAAATGCTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 ACAA 1 2 359547 CASAVA_Build 8 61233933 12I AGAAATGGAG ------------/ATATGATAAGCC ATATGATAAG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 ATATGATAAGCC 1 2 359548 CASAVA_Build 8 61248338 4I CAGAATAACA ----/GTTT TTTTTATGTT 3070 hom 66 het 28 0 22 6 GTTT 0 1 359549 CASAVA_Build 8 61281745 1I CTGCTCCTAT -/C CCATCTTCAC 3070 het 3070 ref 48 19 20 9 C 2 3 359550 CASAVA_Build 8 61291444 1I CTAAATTGCA -/T TTTTAATATA 3070 het 3070 hom 42 19 21 2 T 4 5 359551 CASAVA_Build 8 61297451 2D CTTTACGTCC AG/-- ACTTTCCATT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 AG 1 0 359552 CASAVA_Build 8 61301417 6D TATTCTACCT GATAAG/------ ACTGTTTCTG 3070 het 3070 hom 35 11 21 7 GATAAG 1 0 359553 CASAVA_Build 8 61302649 2D AAATACTGTT AA/-- ATATAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 3 1 359554 CASAVA_Build 8 61304274 1I GAACCACCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 15 14 11 T 10 11 359555 CASAVA_Build 8 61315846 1I CTCAGCCCCC -/A AAAAAATCCA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 6 7 359556 CASAVA_Build 8 61316862 1D TTTATTTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 12 11 359557 CASAVA_Build 8 61321395 1I ATGCATTTCT -/G GGGGGGGGTT 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 G 8 9 359558 CASAVA_Build 8 61327951 1D CCAAACTGTG A/- AAAAAATTCA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 7 6 359559 CASAVA_Build 8 61331022 1I ACGCTATTAA -/T TTTTTTTTTT 1845 het 1845 ref 25 6 10 9 T 17 18 359560 CASAVA_Build 8 61341231 1D CATTAGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 11 10 359561 CASAVA_Build 8 61347020 2D CAAGATTCCT GA/-- GAGACAGTGA 3070 het 3070 ref 62 42 14 7 GA 3 2 359562 CASAVA_Build 8 61347503 1I TTTATCCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 A 12 13 359563 CASAVA_Build 8 61352237 1I GTCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2784 het 313 hom 21 1 16 4 A 13 14 359564 CASAVA_Build 8 61352302 1I CATAGCTTAC -/A TACCAAAGCA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 0 1 359565 CASAVA_Build 8 61353240 4I AAAGAAAATT ----/GTGA GTGTTTGAGA 3070 het 3070 hom 45 22 19 4 GTGA 0 1 359566 CASAVA_Build 8 61360366 1D TTCTTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 11 10 359567 CASAVA_Build 8 61361500 1D GGGAGGAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 11 10 A 11 10 359568 CASAVA_Build 8 61396144 1I ATTTTGATCT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 48 20 19 9 A 7 8 359569 CASAVA_Build 8 61412857 1I TTGTGTTTAA -/G AACACCAGAA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 G 0 1 359570 CASAVA_Build 8 61434627 13I TTCATTTGAA -------------/AGGCAATTGAGAG AGGCTCAGAG 3070 het 3070 hom 54 27 24 3 AGGCAATTGAGAG 0 1 359571 CASAVA_Build 8 61447276 1I TGACAGACAA -/G ATAATTCATC 3070 het 3070 hom 39 20 17 2 G 0 1 359572 CASAVA_Build 8 61563185 3I AGGCTGAAGC ---/AGG AGGATTGCTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 AGG 1 2 359573 CASAVA_Build 8 61579799 1D CCACTGAGTC T/- TTTTTTTTTA 1343 het 1343 ref 35 24 4 7 T 10 9 359574 CASAVA_Build 8 61594266 1D CTTGACACTG T/- TATAGTCTGC 3070 hom 158 het 57 0 54 3 T 2 1 359575 CASAVA_Build 8 61597973 1D GTGTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 1622 het 1622 ref 37 25 4 9 A 11 10 359576 CASAVA_Build 8 61619446 1D AGCCACCACG C/- CCCAGCCCAA 3070 hom 29 het 14 0 10 4 C 4 3 359577 CASAVA_Build 8 61665075 1I ATATTGTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 T 10 11 359578 CASAVA_Build 8 61750946 1I GTGCACATTA -/T CCCCCTCACC 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 0 1 359579 CASAVA_Build 8 61806332 4I AAAAGCTCAT ----/AAAG AAAGAAAAAA 3070 hom 117 het 44 0 40 4 AAAG 1 2 359580 CASAVA_Build 8 61947108 1D ATGTTCAAGT A/- AAAAAAAAAA 1866 het 1866 ref 39 29 5 6 A 13 12 359581 CASAVA_Build 8 61973240 1D AAAATAAATT A/- AAAAAAAATA 2825 het 2755 hom 24 9 9 6 A 9 8 359582 CASAVA_Build 8 61976586 1I TTCTAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 A 14 15 359583 CASAVA_Build 8 61977328 1I GAAACTTTGA -/C TCAGGGGTGT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 C 0 1 359584 CASAVA_Build 8 61980433 3D GTAAGGAGGC ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 ATA 7 6 359585 CASAVA_Build 8 61986659 1D TTTTTTCTTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 9 8 359586 CASAVA_Build 8 61995994 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 83 het 36 0 28 8 A 8 7 359587 CASAVA_Build 8 61997331 6D CCTCGGACAG ACCCAC/------ AGCTGTCTGG 2988 het 2891 hom 29 14 11 5 ACCCAC 1 0 359588 CASAVA_Build 8 61999888 1D AGTTTAGACA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 9 8 359589 CASAVA_Build 8 62003514 1I CCTGGGTGAT -/A ATGGCGAGAC 1367 het 1027 hom 13 3 5 5 A 1 2 359590 CASAVA_Build 8 62012041 2D GGCTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 12 10 3 T 20 18 359591 CASAVA_Build 8 62014407 1I CCCAACCTCC -/T TTTTCTCTGC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 4 5 359592 CASAVA_Build 8 62021159 4I TACCAACTGG ----/GTGC GTGCTCTTGG 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 GTGC 1 2 359593 CASAVA_Build 8 62030197 2I TCTTTTAATA --/TC TCTCTCTCAT 3070 het 1527 hom 14 4 10 0 TC 4 5 359594 CASAVA_Build 8 62033026 2D GACAAACAGG TT/-- TTTTTTTTTT 2610 het 2610 ref 21 8 9 4 T 14 12 359595 CASAVA_Build 8 62033707 2I AGATATTGAC --/AT ATAAAATTGT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AT 1 2 359596 CASAVA_Build 8 62036281 2D CCTCAGTGCA GT/-- GTCTTTCTGC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 GT 2 1 359597 CASAVA_Build 8 62046155 1D ATCTAGCAAC T/- TTTTTTTTTT 1159 het 1159 ref 15 3 3 9 T 11 10 359598 CASAVA_Build 8 62055922 1D GAGAAAGGGT C/- TTTGCAGATG 3070 het 3034 hom 27 9 15 3 C 1 0 359599 CASAVA_Build 8 62056018 4D GCACCCTCAT AAGA/---- GAGAGGCAGA 3070 het 3070 ref 33 15 13 8 AAGA 1 0 359600 CASAVA_Build 8 62069770 1I TGATGACATT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 A 7 8 359601 CASAVA_Build 8 62075753 3D CAAAACAGTT CTC/--- CTCATGCTTG 3070 het 3070 hom 50 23 26 2 CTC 2 1 359602 CASAVA_Build 8 62077099 1I ATCAACCCAC -/T TTTTTTTTTT 2960 het 1706 hom 24 6 9 9 T 11 12 359603 CASAVA_Build 8 62083344 1I TTAAGCTTTG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 T 7 8 359604 CASAVA_Build 8 62084652 1I GAGGTTGAAC -/T TTTTTTCATA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 6 7 359605 CASAVA_Build 8 62109484 1D ATACTTATCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 70 het 26 0 24 2 T 10 9 359606 CASAVA_Build 8 62113551 2D CTGTCGTTTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2437 hom 27 7 12 9 TA 9 8 359607 CASAVA_Build 8 62125758 4D GAGGGTCCTC AGGG/---- AGGGACATTT 3070 het 3070 ref 43 24 14 6 AGGG 2 1 359608 CASAVA_Build 8 62139651 2D TCTTTGCCCA TT/-- TTTTTTTTTT 1504 het 1424 hom 24 8 5 11 T 20 18 359609 CASAVA_Build 8 62158104 1I TCTTAAACAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 73 het 36 0 25 11 A 9 10 359610 CASAVA_Build 8 62163601 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1264 het 1264 ref 28 11 6 11 A 19 18 359611 CASAVA_Build 8 62166102 1I ATGACCCATG -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 C 7 8 359612 CASAVA_Build 8 62230667 1I GTAGGAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 10 11 359613 CASAVA_Build 8 62235735 1D TGTTAAGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 T 10 9 359614 CASAVA_Build 8 62236323 1I AAGTGAACCC -/T TTGTACACAG 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 T 2 3 359615 CASAVA_Build 8 62237107 1D ACTTTTTGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 12 24 9 A 12 11 359616 CASAVA_Build 8 62241660 3D TAATAAAAGC TTT/--- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 T 10 7 359617 CASAVA_Build 8 62247910 1I TTTCCATCTG -/T TGGCTCTCCC 3070 het 3070 hom 48 18 25 5 T 1 2 359618 CASAVA_Build 8 62258005 3I GACATGGAAC ---/CAA CAACCCTAAT 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 CAA 1 2 359619 CASAVA_Build 8 62262246 1I CATTGCAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 58 22 30 6 T 9 10 359620 CASAVA_Build 8 62262750 9D CTTTAGACTT TGCCAGATA/--------- TGCCAGATAT 3070 het 3070 ref 26 12 10 5 TGCCAGATA 2 1 359621 CASAVA_Build 8 62263614 5D GATTATGCTT AAATA/----- AATTAGAGAA 3070 het 3070 ref 38 20 18 2 AAATA 1 0 359622 CASAVA_Build 8 62268632 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2862 hom 26 7 19 1 A 10 9 359623 CASAVA_Build 8 62269179 2I AGAAAGAGGG --/TA TATTCATTTC 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 TA 1 2 359624 CASAVA_Build 8 62270046 2D AGAAAATTCT TA/-- TATGTTTTGA 3070 het 3070 ref 21 11 9 1 TA 2 1 359625 CASAVA_Build 8 62278658 1D TTAATAAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 15 8 5 A 12 11 359626 CASAVA_Build 8 62283792 1I ACCTCTGCCT -/C CCAGGTTCAA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 C 2 3 359627 CASAVA_Build 8 62290641 1I AACGGATGTC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 T 8 9 359628 CASAVA_Build 8 62295441 1I CTTGAGTTAA -/T TTTTTGTATA 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 T 5 6 359629 CASAVA_Build 8 62298103 1I CTAGGATTGC -/A AAAAAAAAAG 2659 het 2659 ref 23 11 6 6 A 9 10 359630 CASAVA_Build 8 62299086 1I GTTAATACTT -/A ATGTATGCTT 3070 het 3070 ref 60 32 25 3 A 1 2 359631 CASAVA_Build 8 62302408 1I CGAGAAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 11 15 T 14 15 359632 CASAVA_Build 8 62306705 1I CTAAGTATAA -/C AGAACATTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 C 0 1 359633 CASAVA_Build 8 62310281 1D GCTGGTTAGA T/- TGTGGAGTAA 3070 het 3070 hom 51 21 26 5 T 2 1 359634 CASAVA_Build 8 62317157 1D TATGTAATAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 10 9 359635 CASAVA_Build 8 62319298 1I GGGCATTGCA -/T TTTTTTTTTT 3013 het 3013 ref 25 10 8 7 T 10 11 359636 CASAVA_Build 8 62320463 1I GCCTGGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1431 hom 21 5 12 4 T 10 11 359637 CASAVA_Build 8 62339667 1D GTTTCGCCCT A/- AAAGGGCAGG 3070 het 3070 ref 38 23 12 4 A 4 3 359638 CASAVA_Build 8 62340416 6D CTCTGCATGG AAGTCT/------ GCCAAGTGTT 3070 het 3070 hom 38 18 20 5 AAGTCT 1 0 359639 CASAVA_Build 8 62354744 1I ATATCCACTG -/A AAGCTTTGGG 3070 het 3070 hom 52 18 27 7 A 2 3 359640 CASAVA_Build 8 62355107 1D TAAATAAGAT A/- AAAAATCAGC 3070 het 2914 hom 19 6 10 4 A 6 5 359641 CASAVA_Build 8 62367231 1D CAAAGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 2181 het 2181 ref 34 21 7 6 T 13 12 359642 CASAVA_Build 8 62420008 1D GACTGGCCAG A/- AAAAAAAAAA 977 het 977 ref 44 29 3 12 A 12 11 359643 CASAVA_Build 8 62445310 1D GTTTTTTTAT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 33 12 19 3 A 8 7 359644 CASAVA_Build 8 62453007 13I TTGTCCTGGG -------------/TGGCTACATCATA TAGTGTATTT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 TGGCTACATCATA 0 1 359645 CASAVA_Build 8 62471572 1D TTTTGGTGTA T/- TTTTCCTTTT 3070 het 3070 ref 22 12 8 3 T 5 4 359646 CASAVA_Build 8 62484595 3D GAACTCCCTC CTT/--- ATTTCTTTTG 3070 het 3070 ref 50 23 22 6 CTT 1 0 359647 CASAVA_Build 8 62528201 1I CTTGCTAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 69 hom 23 1 19 3 T 11 12 359648 CASAVA_Build 8 62538463 1I TTGTGTGTTC -/A ACTGAAGTAG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 2 359649 CASAVA_Build 8 62569773 2I GAGACATGTT --/TG TCAGTGAGCA 3070 hom 140 het 54 0 46 8 TG 0 1 359650 CASAVA_Build 8 62571775 4I AATGGATTGA ----/TAGT TAGTTACAGT 3070 hom 156 het 56 0 52 4 TAGT 1 2 359651 CASAVA_Build 8 62574480 4I TTAAAAAGAG ----/AAAT AAATATAAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AAAT 1 2 359652 CASAVA_Build 8 62582773 4I TTGGGAAAGG ----/ATGA ATGTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 ATGA 0 1 359653 CASAVA_Build 8 62594790 3I CTTAAATGTG ---/GGA GGAGGAGGCA 3070 hom 93 het 34 0 30 4 GGA 2 3 359654 CASAVA_Build 8 62603723 1D TTTTGTTACT A/- AAAATAGGGC 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 5 4 359655 CASAVA_Build 8 62635055 2D GGTGAGGGTT GG/-- GGGGGGGAGC 3070 hom 91 het 36 0 28 8 G 9 7 359656 CASAVA_Build 8 62638309 1I ATTCCTCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 640 hom 36 2 27 7 A 10 11 359657 CASAVA_Build 8 62640739 35D CTAAGATCAT TGATGAAGTGATCTACACTAAACAGCTAAGATCAC/----------------------------------- TGATGAAGTG 3070 hom 72 het 37 0 25 18 TGATGAAGTGATCTACACTAAACAGCTAAGATCAC 1 0 359658 CASAVA_Build 8 62658655 1D GGCTCTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 26 0 13 14 A 19 18 359659 CASAVA_Build 8 62658976 1I ACACTTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 741 hom 33 2 25 6 T 14 15 359660 CASAVA_Build 8 62660699 1D GTGTGCCCCC T/- GGTGGGAATT 3070 hom 120 het 47 0 37 11 T 1 0 359661 CASAVA_Build 8 62681990 1I CACCTGTGAT -/A TTTTTTTCCA 3070 hom 114 het 44 0 38 6 A 0 1 359662 CASAVA_Build 8 62682738 1D GAGTTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 17 9 A 11 10 359663 CASAVA_Build 8 62684506 2I CACTGCCTGT --/GG GAGATGCCTA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 1 3 359664 CASAVA_Build 8 62687488 1D ATGAACAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 367 hom 25 2 13 10 T 17 16 359665 CASAVA_Build 8 62695532 4D TTGCAAAGAG TTGA/---- TTGATTTTAT 3070 hom 105 het 37 0 35 4 TTGA 2 1 359666 CASAVA_Build 8 62700757 1D CTGAAATATT A/- AATTTTTCTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 3 2 359667 CASAVA_Build 8 62709536 3D AAAAGAAAGA TTT/--- TTTTAACAGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 7 4 359668 CASAVA_Build 8 62735986 1D GGACCAGAGT A/- AAAAAAAAAT 1482 het 1482 ref 36 26 5 5 A 10 9 359669 CASAVA_Build 8 62771775 1I GGTCTCATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 634 hom 29 2 22 5 A 10 11 359670 CASAVA_Build 8 62777394 13D TAGCTACTTC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 1568 het 753 hom 12 5 5 2 T 24 11 359671 CASAVA_Build 8 62780931 4I AGCTACAGGC ----/ACAT ACATGTAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 ACAT 1 2 359672 CASAVA_Build 8 62820340 2I AGAAAAAAGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 43 0 31 12 T 10 12 359673 CASAVA_Build 8 62829259 1D GTAGGGAGCT A/- GGGGTACACT 871 het 871 ref 31 20 3 8 A 1 0 359674 CASAVA_Build 8 62835740 1D ATAACATTTC T/- TCTCATTATT 3070 het 3070 ref 40 20 17 4 T 2 1 359675 CASAVA_Build 8 62847533 1I AGAATCTCCA -/T TTTTTTTTTT 2221 het 1730 hom 18 5 8 5 T 11 12 359676 CASAVA_Build 8 62848150 1I TTACTGAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 A 9 10 359677 CASAVA_Build 8 62851951 1D TGTTCAGGGT A/- AGGCCTCTAT 3070 het 3070 hom 54 21 21 12 A 2 1 359678 CASAVA_Build 8 62853798 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 7 8 359679 CASAVA_Build 8 62856621 1I AAAGTGTAGT -/A AAATATTTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 3 4 359680 CASAVA_Build 8 62860061 14D TAATGTTATC AGATCTAGAAGTTT/-------------- AGGAAGAGTC 3070 het 2827 hom 24 7 15 5 AGATCTAGAAGTTT 1 0 359681 CASAVA_Build 8 62860278 1I AGGTAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 T 11 12 359682 CASAVA_Build 8 62863598 2D TTTTCTATGC GT/-- GTGTGTGTGT 965 het 965 ref 46 37 3 8 GT 7 6 359683 CASAVA_Build 8 62865630 1I GAAAATCTAA -/G TGGATTTACT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 G 0 1 359684 CASAVA_Build 8 62877200 1D GTGACAAGAA C/- CCCATGGGGT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 C 4 3 359685 CASAVA_Build 8 62879112 1I AAGTTAACTA -/C CCCACAAGTT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 C 3 4 359686 CASAVA_Build 8 62883028 2I GGCGGCCAGA --/GT CCACTGTGGT 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 GT 0 1 359687 CASAVA_Build 8 62891288 4I TCAGATCATC ----/TCCA TCCAACTCCA 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 TCCA 1 2 359688 CASAVA_Build 8 62897208 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 13 12 359689 CASAVA_Build 8 62899915 2I CAGAATTTCT --/TC TCTGTCTGAA 3070 het 3070 ref 43 23 10 10 TC 1 2 359690 CASAVA_Build 8 62902304 2I TTGAAACAGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2672 hom 27 8 10 9 T 11 13 359691 CASAVA_Build 8 62918961 2D TTTTAATAGG GA/-- GGGAGGTTTA 3070 hom 69 het 26 0 23 4 GA 1 0 359692 CASAVA_Build 8 62930966 1I AATTACACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 A 11 12 359693 CASAVA_Build 8 62942461 3D CCTTTACCAC TAT/--- TATTAATTAG 3070 het 3070 ref 39 19 13 7 TAT 2 1 359694 CASAVA_Build 8 62945884 1D ACTTCATATA G/- GGGGTGTGGC 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 G 5 4 359695 CASAVA_Build 8 62955421 2D CATTTTTTAG GA/-- AGAAGTCCTC 3070 het 3070 ref 42 26 14 2 GA 1 0 359696 CASAVA_Build 8 62956543 1D CACAAAGCCA T/- TTTTTTTTTT 2195 het 2195 ref 42 21 8 13 T 17 16 359697 CASAVA_Build 8 62975265 1D ATCAGCAACA T/- TTTAAACAAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 T 4 3 359698 CASAVA_Build 8 62976142 1I CTCCATCTCC -/A AAAAAAAAAA 1859 het 1859 ref 20 11 6 3 A 11 12 359699 CASAVA_Build 8 62984235 1I ACAAGCAGAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 9 10 359700 CASAVA_Build 8 62992397 3I CTCTCTGGAG ---/ACT ACTACTGATT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 ACT 2 3 359701 CASAVA_Build 8 62992886 5I AATTAGACCC -----/TAGAA TAGATCTACT 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 TAGAA 0 1 359702 CASAVA_Build 8 63031551 1I ATATGTCTCA -/T TTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 T 6 7 359703 CASAVA_Build 8 63033035 1I CAAAATAAAC -/T GCATTATCAG 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 0 1 359704 CASAVA_Build 8 63036004 2I TGTGTGTGTG --/TA TATATATATA 2298 het 2298 ref 34 17 9 8 TA 6 7 359705 CASAVA_Build 8 63042905 9I AAGAATGTGT ---------/ATTCTGTTG ATTTGGCATA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 ATTCTGTTG 0 1 359706 CASAVA_Build 8 63045192 4D TTAGTGAGAG TCTA/---- TCTATGACAG 3070 het 3070 ref 32 16 15 4 TCTA 2 1 359707 CASAVA_Build 8 63047705 7I GGCTAACATC -------/AAATTAA AGAGAAGCTA 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 AAATTAA 0 1 359708 CASAVA_Build 8 63165819 1D TCAGAAGACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 14 24 8 T 10 9 359709 CASAVA_Build 8 63251001 1D AAACAAACAG A/- AAAAAAAAAA 2184 het 2184 ref 26 16 6 4 A 12 11 359710 CASAVA_Build 8 63304673 2D CATTCTGCAC AT/-- GTGTCCCAAA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 AT 1 0 359711 CASAVA_Build 8 63327723 1D ATCCTCCTGA T/- TTTCCTAGAT 3070 het 3070 hom 35 11 19 6 T 4 3 359712 CASAVA_Build 8 63329742 1D TATCTTTTGA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 19 20 5 T 9 8 359713 CASAVA_Build 8 63349381 1D AAAAAAGCAA T/- TTTTTGGAGA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 6 5 359714 CASAVA_Build 8 63353496 1D CTACTGCTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2375 hom 27 8 14 5 T 12 11 359715 CASAVA_Build 8 63353700 2I GTCCAAGTGT --/TC TCTCATTGTT 3070 het 2324 hom 19 6 10 3 TC 2 3 359716 CASAVA_Build 8 63355284 4D TTTGGCTCTC TGTT/---- TGTCTGTTAT 2732 het 1529 hom 11 4 6 1 TGTT 1 0 359717 CASAVA_Build 8 63357108 1D TCAAGTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 12 10 T 12 11 359718 CASAVA_Build 8 63358394 1D TACGTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 11 10 359719 CASAVA_Build 8 63379916 16D GTTGTGTCCT TGGTGTGTGGACATTC/---------------- GGCATGACGT 3070 het 3070 ref 45 23 21 5 TGGTGTGTGGACATTC 1 0 359720 CASAVA_Build 8 63406126 4D46M2D TCTCTCTCTC TATATATATGTATGTATCTCCCTTCCTCCCTCCTCTTCTACCTCCTCCTCCT/----TATATGTATGTATCTCCCTTCCTCCCTCCTCTTCTACCTCCTCCTC-- CTCTCTCTCT 1449 het 1449 ref 25 29 4 11 N/A 0 0 359721 CASAVA_Build 8 63409359 1I TTATTCACTT -/A ACAGTTCTTG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 A 1 2 359722 CASAVA_Build 8 63412688 6I AGTATAGTAC ------/ATATAT ATATATATAT 3070 hom 78 het 35 0 26 9 AT 5 8 359723 CASAVA_Build 8 63418926 1I TCTATCTCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 9 10 359724 CASAVA_Build 8 63420372 2I70M2D GTATATATAT --ACACACACACACACACATATACACGCACATATACACACATATATATGTATATATACACACATATATACACAT/ACACACACACACACACACATATACACGCACATATACACACATATATATGTATATATACACACATATATACAC-- ATATGTATAT 3070 het 3070 hom 33 12 24 8 N/A 0 0 359725 CASAVA_Build 8 63423139 1D ATTTTTTATT G/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 G 1 0 359726 CASAVA_Build 8 63436124 7D TTCCCCAGCT AAAAAAA/------- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 31 0 19 13 A 21 14 359727 CASAVA_Build 8 63437454 1I GGCATGTATC -/T ATCAGCTCAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 0 1 359728 CASAVA_Build 8 63439165 1I TTCTCTGTAT -/A AGATGCTTAT 3070 het 3070 hom 47 22 23 2 A 1 2 359729 CASAVA_Build 8 63439509 1I AATCTGATCC -/T TAAAGGATGT 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 1 2 359730 CASAVA_Build 8 63440482 1I TATGGTATTG -/T TTTGCATATT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 3 4 359731 CASAVA_Build 8 63440889 1I CACTATAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 24 0 12 12 T 10 11 359732 CASAVA_Build 8 63443668 4D CCACAAATAC AGCT/---- AGCTGGGGAA 3070 hom 141 het 50 0 46 4 AGCT 2 1 359733 CASAVA_Build 8 63443936 1D CTTTTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 9 8 T 12 11 359734 CASAVA_Build 8 63447330 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 8 9 359735 CASAVA_Build 8 63449227 5D CTCCATCTCC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2975 het 970 hom 15 6 7 4 A 24 19 359736 CASAVA_Build 8 63454802 1I TTTCCTGAGG -/C CCTCCCAAGC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 C 2 3 359737 CASAVA_Build 8 63458995 4I ATGAATTTTC ----/TTTT TTTTTTTTTT 1943 het 1943 ref 38 16 11 11 T 13 17 359738 CASAVA_Build 8 63462418 1D AGTTTCGGAT G/- GAGTTGTTAT 3070 het 3070 hom 36 12 15 10 G 2 1 359739 CASAVA_Build 8 63469593 1D GTAATTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 27 0 19 8 T 12 11 359740 CASAVA_Build 8 63472376 1D CTTTTTCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 6 A 10 9 359741 CASAVA_Build 8 63472473 5I TTTATTTTGT -----/TTAAA TTAAAGGATT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 TTAAA 1 2 359742 CASAVA_Build 8 63473563 1I AACATGAAAA -/G CTAGAGCTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 0 1 359743 CASAVA_Build 8 63475815 1I AAGTTAACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 16 9 T 11 12 359744 CASAVA_Build 8 63476452 3D CTTCTCTGTG TCA/--- TCATGAATTT 3070 het 3070 ref 31 14 14 4 TCA 2 1 359745 CASAVA_Build 8 63477655 4D TTCTCATGAT AGTG/---- AGTAAGTTCT 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 AGTG 1 0 359746 CASAVA_Build 8 63479933 3I TTCCTCAATC ---/AGA AGTAGTTTCT 3070 het 3070 hom 64 28 28 8 AGA 0 1 359747 CASAVA_Build 8 63486875 1I CAACAATAAT -/G TCCTGGCTAA 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 G 0 1 359748 CASAVA_Build 8 63487431 2I ACAAACAAAC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 2948 hom 23 7 13 3 A 9 11 359749 CASAVA_Build 8 63489521 1I TGGGAAGTGT -/G GGAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 G 2 3 359750 CASAVA_Build 8 63490153 2D TTAGAAATAT TA/-- TATATATATA 2879 hom 21 het 9 0 8 1 TA 7 6 359751 CASAVA_Build 8 63490252 5I ACTATAGTAT -----/ATATA ATATGTATTA 1623 hom 10 het 4 0 4 0 ATATA 0 1 359752 CASAVA_Build 8 63499564 1D ACTCAATAGC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 8 7 359753 CASAVA_Build 8 63510566 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAGATGT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 5 6 359754 CASAVA_Build 8 63512269 1I GTAGAATAGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 T 8 9 359755 CASAVA_Build 8 63521883 7I TCTTCAAGGT -------/GTCAGAA TGTAGAATGT 3070 het 3070 ref 51 30 12 9 GTCAGAA 0 1 359756 CASAVA_Build 8 63531632 1D ACTCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3039 het 998 hom 22 3 8 11 A 15 14 359757 CASAVA_Build 8 63535298 1I GGCCGAGGCA -/G GTGGATCATC 1552 het 1552 ref 14 5 6 3 G 1 2 359758 CASAVA_Build 8 63539109 2D CACACAAAAC TG/-- GGGATATTCC 3070 het 3070 ref 54 27 23 6 TG 1 0 359759 CASAVA_Build 8 63552459 2I CACTGGCAGT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 26 16 6 A 9 11 359760 CASAVA_Build 8 63572546 1I GTATAACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 T 11 12 359761 CASAVA_Build 8 63573828 1D GATGTATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 16 20 11 T 13 12 359762 CASAVA_Build 8 63574919 4D CTGTGATCAG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 45 19 18 9 GTTT 4 3 359763 CASAVA_Build 8 63581257 1D ACCTCCCCAT A/- ACAAGATCCT 3070 het 3070 ref 44 23 20 2 A 2 1 359764 CASAVA_Build 8 63587854 2D CAAAGAAAAC TG/-- TGTCTTTCAC 3070 het 3070 ref 52 26 24 3 TG 2 1 359765 CASAVA_Build 8 63607530 3I3M7I CCTGAAGCCC ---TGG-------/CCAGGGAAGAAAA CTGCATTCTA 3070 het 3070 ref 54 34 14 6 N/A 0 0 359766 CASAVA_Build 8 63608618 2I CACCTCCTAA --/AC CAGGGCTTCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 AC 0 1 359767 CASAVA_Build 8 63619841 4I GTACAAACAA ----/TCCT TCCTTGAACA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TCCT 1 2 359768 CASAVA_Build 8 63630274 1D CTTAAATATA T/- GCAATATAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 T 1 0 359769 CASAVA_Build 8 63652580 1I TTTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 23 2 14 7 T 10 11 359770 CASAVA_Build 8 63652600 1I GGTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 hom 43 het 25 0 19 6 G 0 1 359771 CASAVA_Build 8 63653777 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 T 8 7 359772 CASAVA_Build 8 63657947 3D GAGGAATGAG ATC/--- ATCAGTGGGG 3070 hom 105 het 40 0 31 10 ATC 2 1 359773 CASAVA_Build 8 63678340 3D AGTACAGTCT TGA/--- TGATGAAGAA 3070 het 3070 hom 43 16 18 10 TGA 3 2 359774 CASAVA_Build 8 63707860 1I AGGTGATCCA -/C CCCCCCTCGG 3070 het 1646 hom 13 4 8 1 C 6 7 359775 CASAVA_Build 8 63734475 1D CACTTGCCAG T/- TTCTATATCA 3070 hom 90 het 36 0 30 6 T 3 2 359776 CASAVA_Build 8 63786708 1D TTGTTTATTG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 72 het 25 0 24 1 T 7 6 359777 CASAVA_Build 8 63807671 3I TAGCTGCATG ---/TAT TATTAGATCA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TAT 1 2 359778 CASAVA_Build 8 63810964 1D GTGGTGCTCT C/- CCCCCTTTCC 3070 hom 107 het 42 0 33 11 C 6 5 359779 CASAVA_Build 8 63815758 2I GTGAATATTG --/TT TTTTTTTTAG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 8 10 359780 CASAVA_Build 8 63834608 1I GGGGGCTTAT -/G AAAGCCTGAG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 0 1 359781 CASAVA_Build 8 63834846 1I CTAAAACACC -/A AAAGCAATGG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 3 4 359782 CASAVA_Build 8 63837430 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 112 het 42 0 37 5 A 12 11 359783 CASAVA_Build 8 63839588 1I CAAATAAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 444 hom 27 1 20 6 T 9 10 359784 CASAVA_Build 8 63846187 4D TACATTTTAT CAGA/---- CAAAGACTTC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 CAGA 1 0 359785 CASAVA_Build 8 63861609 1I CTCCTCATAT -/A AAAGGATTCA 3070 hom 66 het 26 0 22 4 A 3 4 359786 CASAVA_Build 8 63863143 8D TTTATAATCC TTTGGGTA/-------- TTTGGGTATA 1112 hom 7 het 3 0 3 0 TTTGGGTA 2 1 359787 CASAVA_Build 8 63886749 1I AATGGAGAAT -/A ATGTTTTTTG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 1 2 359788 CASAVA_Build 8 63888472 1D AATTTTAGGA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 8 359789 CASAVA_Build 8 63894266 2D ATATATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 AT 7 6 359790 CASAVA_Build 8 63903746 2D ACACCCACTC TT/-- TGAATCTGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 3 1 359791 CASAVA_Build 8 63914341 1I CTTAATTTTC -/T TTTTTTCAAC 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 6 7 359792 CASAVA_Build 8 63915538 1D GGAGGGTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 27 1 14 12 A 14 13 359793 CASAVA_Build 8 63922908 1I TTTTCTTCTA -/T GGTTTTTATA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 T 0 1 359794 CASAVA_Build 8 63933163 6D TTGTTGTTGT TTTCTG/------ TGTTTTTTTT 948 het 948 ref 27 9 8 11 TTTCTG 1 0 359795 CASAVA_Build 8 63939445 3D AACATTGAGA AAG/--- AAGATGATGT 3070 hom 141 het 51 0 47 6 AAG 2 1 359796 CASAVA_Build 8 63942213 2D TTGTTTCCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2751 het 306 hom 18 5 9 4 A 16 14 359797 CASAVA_Build 8 63943455 1D GTTCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 56 hom 35 2 13 21 T 12 11 359798 CASAVA_Build 8 63945440 2D GATATATAAA CT/-- CTATTTTGTA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 CT 2 1 359799 CASAVA_Build 8 63946003 5I AATGAAGCCG -----/TCTAC TCTTACTGTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 TCTAC 0 1 359800 CASAVA_Build 8 63967807 1D TTTATTTGGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2620 hom 24 6 15 3 A 10 9 359801 CASAVA_Build 8 63971099 1I AGATCCTGGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 13 15 11 T 9 10 359802 CASAVA_Build 8 63972158 1I CATTTTTGAA -/G GCAGAAGGGA 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 G 1 2 359803 CASAVA_Build 8 63972484 1D GTTGGTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 18 14 4 T 11 10 359804 CASAVA_Build 8 63973342 1I GAATCAAAGG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 A 7 8 359805 CASAVA_Build 8 63973955 1I CTGTCAAGGG -/A GTACTAACTA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 0 1 359806 CASAVA_Build 8 63974081 1D GGGAAATAGA C/- ATATGAAAAA 3070 het 3070 ref 22 12 9 2 C 1 0 359807 CASAVA_Build 8 63975350 1I CATATCTTGT -/A ATTCTTGTGC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 1 2 359808 CASAVA_Build 8 63983637 2I TAATTCCCAC --/AT GTCATGGGAG 2284 het 2284 ref 22 12 5 5 AT 0 1 359809 CASAVA_Build 8 63984814 9I TCACAATAGC ---------/AAAAGTAAT AAAAGTAATT 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 AAAAGTAAT 1 2 359810 CASAVA_Build 8 63985868 1D CGGGACAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 497 hom 36 7 15 14 T 13 12 359811 CASAVA_Build 8 63988266 3D GCATTGAACA TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 52 23 25 6 T 12 9 359812 CASAVA_Build 8 63995020 1I TTACACAGAG -/T TTTTTTTTTT 2872 het 2872 ref 40 10 10 20 T 15 16 359813 CASAVA_Build 8 63999554 11D ACCCTACACT ATTTTCAATGA/----------- ATAAATATTA 3070 het 3070 ref 29 20 11 1 ATTTTCAATGA 1 0 359814 CASAVA_Build 8 64009493 2D CCTGTCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 66 hom 32 2 19 12 A 12 10 359815 CASAVA_Build 8 64024837 1D ATTGTGTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 22 4 T 11 10 359816 CASAVA_Build 8 64032253 1D TATAGCAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2547 hom 30 8 17 5 T 12 11 359817 CASAVA_Build 8 64045248 3I TGAGGGAAGG ---/GAA GAAGATTACT 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 GAA 1 2 359818 CASAVA_Build 8 64046188 2I GACTCCTCTC --/TT ATTGCTTCAT 3070 het 2762 hom 32 7 18 7 T 0 2 359819 CASAVA_Build 8 64046757 1I AAAAAAAAGC -/G GGGGGGGGCT 1826 het 1826 ref 29 8 7 14 G 8 9 359820 CASAVA_Build 8 64052856 1D CCATTCAGTA T/- TGTTCCCTTG 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 T 2 1 359821 CASAVA_Build 8 64097625 3I TGTGTCTAAC ---/CTT CTGATTAACA 3070 hom 114 het 46 0 38 8 CTT 0 1 359822 CASAVA_Build 8 64122783 1D TAGAATGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 38 1 20 17 T 11 10 359823 CASAVA_Build 8 64122831 1D CTTATTGAGC T/- TTTTCACTGT 3070 hom 69 het 36 0 24 13 T 5 4 359824 CASAVA_Build 8 64125875 1I CTGGGAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 23 0 17 6 A 11 12 359825 CASAVA_Build 8 64131373 1D CCACTTAACC T/- TTTTTTTTTT 2231 het 969 hom 35 11 8 16 T 17 16 359826 CASAVA_Build 8 64133834 6D ATCACCAAAA AAATCT/------ AATTTAAAGG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AAATCT 1 0 359827 CASAVA_Build 8 64135787 3D ACTCTGTCTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 27 0 20 7 A 15 12 359828 CASAVA_Build 8 64138619 3D TTTTATTTGC ATT/--- AATAATAAAT 3070 hom 141 het 52 0 48 8 ATT 1 0 359829 CASAVA_Build 8 64141213 1D CCAGTGTGCT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 81 het 36 0 27 9 A 8 7 359830 CASAVA_Build 8 64146109 2I GAAATTCAAA --/GG TAACTGGGCA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 2 359831 CASAVA_Build 8 64158749 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2001 hom 17 5 10 2 A 12 11 359832 CASAVA_Build 8 64161469 1D CTAGAGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 11 10 359833 CASAVA_Build 8 64163888 9I CCTTTTTTTT ---------/TTTTTTTTC TTTTGAGACG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 TTTTTTTTC 0 1 359834 CASAVA_Build 8 64164647 2I TTCTATGCTC --/AA ATATTTTACT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 3 359835 CASAVA_Build 8 64167458 1I AAGAAACTTT -/C CCAGGAACAG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 C 2 3 359836 CASAVA_Build 8 64186612 1D ATCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 151 hom 34 3 9 23 A 11 10 359837 CASAVA_Build 8 64187610 1D CTTAAAAATT A/- AATTGATTTA 2738 het 2738 ref 26 14 9 3 A 3 2 359838 CASAVA_Build 8 64189489 1I CTACTTATAA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 T 7 8 359839 CASAVA_Build 8 64191264 1D GTCTCAAACT C/- CTGACCTCAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 2 1 359840 CASAVA_Build 8 64191722 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAAATC 1725 het 194 hom 7 1 5 1 A 8 9 359841 CASAVA_Build 8 64192677 2D ATGAAAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 148 hom 33 4 11 18 A 13 11 359842 CASAVA_Build 8 64196495 1I AAAAATTGGC -/A AAAAAAATGC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 7 8 359843 CASAVA_Build 8 64205215 1D CCCAAACTTG T/- TTTTCTCTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 5 4 359844 CASAVA_Build 8 64205828 2D GTCTCAAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 36 15 13 10 TG 10 9 359845 CASAVA_Build 8 64216393 3D CATATTTTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 1506 hom 19 4 10 5 TTA 4 3 359846 CASAVA_Build 8 64253489 1I CTTTACTTGT -/A AAAAAAAAAA 225 het 225 ref 35 29 2 4 A 11 12 359847 CASAVA_Build 8 64258020 1D TAAATAAAGG A/- TATGTTTAAC 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 1 0 359848 CASAVA_Build 8 64258069 1I CAGTTTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 60 hom 27 1 16 10 T 15 16 359849 CASAVA_Build 8 64259129 3D TTATACTGTA TTG/--- TTTAGGGAAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 TTG 1 0 359850 CASAVA_Build 8 64261284 1I ACCAATGTCA -/G ATCCATACAT 3070 hom 135 het 50 0 46 4 G 0 1 359851 CASAVA_Build 8 64274125 4I ATAAAAACAT ----/TGAG TGGTATTTTG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TGAG 0 1 359852 CASAVA_Build 8 64274887 1I GGCTTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 10 11 359853 CASAVA_Build 8 64287549 1D AGTTTGCAAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 15 16 2 A 9 8 359854 CASAVA_Build 8 64297588 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAGAG 3070 het 2543 hom 25 9 12 4 A 7 8 359855 CASAVA_Build 8 64307435 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTCT 1310 hom 36 het 18 0 13 5 T 8 9 359856 CASAVA_Build 8 64321958 1I27M1I GTTTAAAGTC -GGTAACATAATGCCTCCACTTTTGTTC-/AGGTAACATAATGCCTCCACTTTTGTTCT TTTTTGCTTA 3070 het 3070 ref 38 24 17 1 N/A 0 0 359857 CASAVA_Build 8 64323396 1I GATGGGGATG -/T GGTTCCTAGG 3070 hom 99 het 36 0 30 6 T 0 1 359858 CASAVA_Build 8 64324816 1I AAATATATTT -/A GGGGGTACAA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 A 0 1 359859 CASAVA_Build 8 64331013 5D CTTAAATGGA ATCAT/----- ATCATAATTT 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 ATCAT 2 1 359860 CASAVA_Build 8 64333052 4I GTATAGTCTA ----/TCTC TTATTGTCAT 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 TC 0 2 359861 CASAVA_Build 8 64341829 1I GCTTGCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 11 12 5 T 13 14 359862 CASAVA_Build 8 64343752 1I TAAATTTACC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 7 8 359863 CASAVA_Build 8 64344841 1D GAGTGAATGC T/- TAATAGGTAT 3070 het 3070 ref 35 22 11 3 T 2 1 359864 CASAVA_Build 8 64346083 1D ATCACGGTGG C/- CTGCCTCTGT 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 C 2 1 359865 CASAVA_Build 8 64346235 1I GGGTTTATTT -/A AAAAAATGGC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 6 7 359866 CASAVA_Build 8 64347122 9I GGGCTCAAGT ---------/GATCCTCCC GATCCTCCCA 2297 het 1343 hom 15 4 7 4 GATCCTCCC 1 2 359867 CASAVA_Build 8 64347940 1D GGGTGGTGGT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 25 hom 20 1 15 4 G 10 9 359868 CASAVA_Build 8 64350374 1D TTTTGACTAG T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 18 18 2 T 9 8 359869 CASAVA_Build 8 64356140 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2000 hom 27 10 12 5 A 15 14 359870 CASAVA_Build 8 64361997 1D AATCCTTTTT C/- CCCCCCATCC 3070 het 2126 hom 27 6 17 4 C 7 6 359871 CASAVA_Build 8 64362084 1D CCCTTTATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 12 17 4 T 10 9 359872 CASAVA_Build 8 64368920 3D6M1D6M4I ATTTCACATA GCTGTTTAATATAGGC----/---GTTTAA-ATAGACTGCT ATTCTTGGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 3 N/A 0 0 359873 CASAVA_Build 8 64369056 2I TTTTTAAAGC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 83 het 35 0 27 8 T 9 11 359874 CASAVA_Build 8 64374852 2D TAGATGCCTT GC/-- GCTCACAATT 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 GC 2 1 359875 CASAVA_Build 8 64382411 1I CCATTTCATT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 A 7 8 359876 CASAVA_Build 8 64384573 1I CTAGATTGTA -/C CCTTAGAAGG 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 C 2 3 359877 CASAVA_Build 8 64404467 1I GTCTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 3011 het 3011 ref 29 11 10 8 T 10 11 359878 CASAVA_Build 8 64416995 1I CCAACTGATT -/A AAAAAAAAAA 899 het 899 ref 20 9 6 5 A 10 11 359879 CASAVA_Build 8 64419490 1I GGGTTTCTTT -/A ATTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 1 2 359880 CASAVA_Build 8 64430385 1D ACACCACACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2591 hom 25 8 13 4 T 12 11 359881 CASAVA_Build 8 64434622 12I ATGAGTGCAT ------------/TTTATGTGACTC TTTATACTCA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 TTTATGTGACTC 0 1 359882 CASAVA_Build 8 64454570 1I TTTTTCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 T 10 11 359883 CASAVA_Build 8 64456239 3I TGGAGGGATC ---/AGA AGAAGTCAGG 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 AGA 1 2 359884 CASAVA_Build 8 64461561 1D CTAGACCATT A/- TATAGAAAAA 3070 het 3070 ref 25 13 9 4 A 1 0 359885 CASAVA_Build 8 64469654 1D CACTGCCATA G/- TGTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 60 29 24 7 G 1 0 359886 CASAVA_Build 8 64470951 2D ATCTTAAGTA TT/-- TTTAATCTAT 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 T 5 3 359887 CASAVA_Build 8 64472016 2I AAATGATAGC --/TT TGTCAATTAG 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 T 1 3 359888 CASAVA_Build 8 64479613 2D TAGACCATCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 4 T 13 11 359889 CASAVA_Build 8 64487250 1I TGTTTTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 T 10 11 359890 CASAVA_Build 8 64491962 1D TCCTGGGCTA T/- CCAGATGAAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 1 0 359891 CASAVA_Build 8 64492286 1D TTGGATTCAG T/- TTTTTTCAGC 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 T 7 6 359892 CASAVA_Build 8 64497649 1I TTACATTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 T 12 13 359893 CASAVA_Build 8 64499382 1I ACAGAGGGTC -/G GGAGATTTCC 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 G 2 3 359894 CASAVA_Build 8 64501133 4D TGGTAGAAAA AAAC/---- AAACAACCCC 2221 het 2221 ref 24 16 5 3 AAAC 2 1 359895 CASAVA_Build 8 64527014 1D TTTTTCTACA T/- TTTTTTCTCT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 7 6 359896 CASAVA_Build 8 64529009 1I TCAAGTCCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 14 14 13 T 11 12 359897 CASAVA_Build 8 64535760 12D GAAAATCAGT TTTTTGTTTTTG/------------ TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 13 13 TTTTTG 5 3 359898 CASAVA_Build 8 64558961 2D GTTGATGGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 T 13 11 359899 CASAVA_Build 8 64559419 1D GGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 6 T 12 11 359900 CASAVA_Build 8 64566350 1D AATTGCAAAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 10 9 359901 CASAVA_Build 8 64570363 3D CTTTTGTTAC CAT/--- CATGTTGGGT 3070 hom 111 het 39 0 37 2 CAT 2 1 359902 CASAVA_Build 8 64577759 1D CTTACTGTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 21 0 19 3 T 10 9 359903 CASAVA_Build 8 64585384 3I GAGAGAACCA ---/CTG CTTTCTTCAG 3070 hom 78 het 32 0 24 8 CTG 0 1 359904 CASAVA_Build 8 64587343 3D CCTCATTGCA TTG/--- TTGAGATATT 3070 het 3070 hom 32 15 16 2 TTG 2 1 359905 CASAVA_Build 8 64592436 1I CTATTTTCCT -/C CCCATTTCTT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 C 3 4 359906 CASAVA_Build 8 64597635 1D CATGAGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 811 hom 35 2 24 9 T 11 10 359907 CASAVA_Build 8 64604225 1D AATTAGAGTT C/- CCTTAAAATA 3070 hom 69 het 28 0 22 6 C 3 2 359908 CASAVA_Build 8 64610432 1D AAGTGTAATT A/- AAAAAAAAAA 1089 het 1089 ref 24 17 4 3 A 12 11 359909 CASAVA_Build 8 64623790 1I AAAGAAAATG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 8 9 359910 CASAVA_Build 8 64625265 1I TACTAATCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 8 9 359911 CASAVA_Build 8 64632613 1I AAGTAATACA -/T GTGTTGGTGA 3070 het 3070 hom 55 22 22 11 T 0 1 359912 CASAVA_Build 8 64637769 1I AGATAAAAAA -/T AACACCCTTG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 T 0 1 359913 CASAVA_Build 8 64642273 1D GGGTTTAGTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 38 12 24 2 T 9 8 359914 CASAVA_Build 8 64642752 2I ACTTCTAGGC --/AA AAACCTTCTG 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 3 5 359915 CASAVA_Build 8 64643978 5D AAATTCATAC GGGAA/----- CCTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 50 18 26 9 GGGAA 1 0 359916 CASAVA_Build 8 64650930 1D GGTTGGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1897 hom 34 8 13 13 A 12 11 359917 CASAVA_Build 8 64658111 5I TGCAAGACAG -----/TATGA TATGATAATG 3070 het 3070 hom 45 17 20 8 TATGA 1 2 359918 CASAVA_Build 8 64670883 1I CCTACTTTTA -/C CCTCTTCATG 3070 het 3070 hom 44 14 25 5 C 2 3 359919 CASAVA_Build 8 64685878 1I TCCACAGCTG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 8 9 359920 CASAVA_Build 8 64692424 1D GATTTTGTAT C/- CCGAGACTTT 3070 het 3070 hom 21 10 9 2 C 3 2 359921 CASAVA_Build 8 64697640 1D AAATTGTTTT A/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 1 0 359922 CASAVA_Build 8 64703483 1D TAAAAAAAGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 46 21 21 5 A 9 8 359923 CASAVA_Build 8 64746591 1I CTAGGTCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 10 11 359924 CASAVA_Build 8 64760599 1I ATCTTTACCA -/C AGTCCTAGGA 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 C 0 1 359925 CASAVA_Build 8 64772927 1D AACATTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 14 6 A 12 11 359926 CASAVA_Build 8 64781757 4I TATTTACAAA ----/TAGT TGGGTGTGTT 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 TAGT 0 1 359927 CASAVA_Build 8 64782417 1I TATAACCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 12 10 T 10 11 359928 CASAVA_Build 8 64784668 1D CATGTGTAAG A/- AAAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 33 14 17 4 A 7 6 359929 CASAVA_Build 8 64785499 1I CTTTGTGTAA -/T TTTTTTAATG 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 6 7 359930 CASAVA_Build 8 64791979 21I TTTCCACTGT ---------------------/AAAAACAGAGATATTCATTTA AAAAATAATA 3070 hom 75 het 23 0 26 0 AAAAACAGAGATATTCATTTA 0 1 359931 CASAVA_Build 8 64806353 3D ACAGGGATTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 TTG 4 3 359932 CASAVA_Build 8 64810130 1D TTTTGTGAAC A/- AAAAAAACCA 3070 hom 105 het 44 0 35 9 A 8 7 359933 CASAVA_Build 8 64812727 1D AAAATATTGC T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 32 10 15 7 T 8 7 359934 CASAVA_Build 8 64832052 2D2M5D TTGCTTACCA GCTTAAGAA/--TT----- GCTTTTGGGC 3070 hom 63 het 21 0 22 0 N/A 0 0 359935 CASAVA_Build 8 64839504 1I ATCTTTTCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 419 hom 35 1 28 6 T 9 10 359936 CASAVA_Build 8 64847803 1I GTAATTTTTA -/T AAAGCTAAGA 3070 hom 105 het 39 0 34 5 T 0 1 359937 CASAVA_Build 8 64849022 1I CCCGCCCGAA -/G GCCCCACCTC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 G 1 2 359938 CASAVA_Build 8 64870536 2I GATTATCTGG --/TT TCCACTCAGG 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 T 1 3 359939 CASAVA_Build 8 64871980 1D AATATAAAGC A/- TGTTTTCTTT 3070 het 2653 hom 25 7 12 6 A 1 0 359940 CASAVA_Build 8 64872259 1D CAGACAAGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 A 10 9 359941 CASAVA_Build 8 64880118 4D TAAAACAGTA TTTC/---- TTTATTTTAT 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 TTTC 1 0 359942 CASAVA_Build 8 64883380 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 47 22 21 4 T 9 10 359943 CASAVA_Build 8 64883962 1D AGTTGTTCAG T/- AAATTCTTAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 1 0 359944 CASAVA_Build 8 64889940 4I CTCTTTTGCA ----/TACC TGATCCTCCC 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 TACC 0 1 359945 CASAVA_Build 8 64942417 1I ATTTTCATGT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 6 7 359946 CASAVA_Build 8 64942646 1D AAGTTAGTAC T/- TTTTTTTTTC 758 het 758 ref 54 49 3 3 T 10 9 359947 CASAVA_Build 8 64972487 1I TAAAGGCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 10 11 359948 CASAVA_Build 8 64977765 1D CTGACTGATG T/- TTTTTCTCGT 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 6 5 359949 CASAVA_Build 8 64982484 1D ATACTTCCAG A/- AAAACTTGGC 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 5 4 359950 CASAVA_Build 8 64994630 2D GTATCTCCCC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2590 hom 48 10 21 17 GT 9 8 359951 CASAVA_Build 8 65002783 3I AGAGTATAAC ---/AAT AATAATCACA 3070 het 3070 hom 48 15 26 7 AAT 2 3 359952 CASAVA_Build 8 65014776 3I GTGAATTTTC ---/TCT TCTTATCATT 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 TCT 1 2 359953 CASAVA_Build 8 65060104 2I ATATTTTAGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 1352 hom 28 5 15 8 GT 8 9 359954 CASAVA_Build 8 65066881 1D AAACTATAGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 39 14 17 9 A 9 8 359955 CASAVA_Build 8 65069949 1I AGCTTTGGCA -/T TTCCATCTCT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 T 2 3 359956 CASAVA_Build 8 65125722 4I AAAAACTTTA ----/TCTC TCTCTATCTC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 TC 2 4 359957 CASAVA_Build 8 65171190 18D ACGCCTGTAA TTCCAGCTACTAGGTAGG/------------------ TTGAAGCTGG 2502 het 2502 ref 16 11 6 5 TTCCAGCTACTAGGTAGG 1 0 359958 CASAVA_Build 8 65224731 1I CCATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1215 hom 32 3 23 6 T 11 12 359959 CASAVA_Build 8 65245545 2D CAGGCTGAAG AA/-- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 hom 38 14 20 5 A 10 8 359960 CASAVA_Build 8 65258681 1I GATTTTTTTT -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 47 20 20 7 A 6 7 359961 CASAVA_Build 8 65259010 1D AACTGACATG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 A 8 7 359962 CASAVA_Build 8 65259674 1D CTCCAGAAAG A/- TACTTCACAA 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 A 1 0 359963 CASAVA_Build 8 65265199 1I ACAGAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 A 9 10 359964 CASAVA_Build 8 65272106 1D TTAAGTAGAG T/- AACACAGTCA 3070 het 3070 ref 47 26 14 7 T 1 0 359965 CASAVA_Build 8 65275739 1I AAAAAAATGG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 8 9 359966 CASAVA_Build 8 65287249 2D CCAACATGGT GA/-- GCCCCTGTCT 3070 het 1889 hom 17 5 9 3 GA 1 0 359967 CASAVA_Build 8 65288078 1D AATGTACAGA T/- TTAAGCACAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 3 2 359968 CASAVA_Build 8 65291012 6D ACAAATATAT ATAATA/------ ATGAGTTAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 5 ATA 2 0 359969 CASAVA_Build 8 65300304 1D TTCACACAAT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 53 24 26 3 A 8 7 359970 CASAVA_Build 8 65301914 1D AGACCTAATA T/- TTTAAATTTA 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 4 3 359971 CASAVA_Build 8 65314767 2I CAGGAGTAGT --/TA TATATTAGGC 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 TA 2 3 359972 CASAVA_Build 8 65332836 4D TAAGAAATAA CACT/---- CAAAAGCCTC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 CACT 1 0 359973 CASAVA_Build 8 65337557 1I GTGGAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2966 het 2852 hom 23 9 8 6 A 11 12 359974 CASAVA_Build 8 65338277 1D AAAAGGAAGA T/- TTTTTTGCAA 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 T 7 6 359975 CASAVA_Build 8 65338607 1I AGAACTTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 52 25 20 7 T 9 10 359976 CASAVA_Build 8 65341282 1D TTTGACAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 A 10 9 359977 CASAVA_Build 8 65343734 4D ATAAGGTAAA TATT/---- TATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 9 TATT 2 1 359978 CASAVA_Build 8 65354556 1D AACAATTTGA C/- AAGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 C 1 0 359979 CASAVA_Build 8 65366987 2I AAATTCCAAT --/TA TATATATATA 3070 het 2991 hom 22 7 12 3 TA 7 8 359980 CASAVA_Build 8 65415422 1D AAAAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 14 7 A 13 12 359981 CASAVA_Build 8 65416089 5I AGTACAAAAA -----/CTAGC CTAGCCGGTC 2964 het 1992 hom 21 6 9 6 CTAGC 1 2 359982 CASAVA_Build 8 65430849 1D TATTTTTGGT A/- AAAAAAAAAA 1280 het 1273 hom 34 6 7 21 A 16 15 359983 CASAVA_Build 8 65438666 1D CACTAGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 834 hom 34 5 18 11 A 15 14 359984 CASAVA_Build 8 65440232 1D ACCTTCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 7 A 11 10 359985 CASAVA_Build 8 65444428 1I GAGAAAGGGG -/A AGGGGGGAGG 1261 hom 23 het 11 0 7 4 A 1 2 359986 CASAVA_Build 8 65450019 8D TGCTCTTAGC GTGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 3070 hom 69 het 33 0 24 9 GT 12 8 359987 CASAVA_Build 8 65458016 2I ATACATTTAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AC 5 6 359988 CASAVA_Build 8 65468677 1D TATTGTAAGC T/- TGTGTACTTA 3070 hom 108 het 41 0 37 6 T 2 1 359989 CASAVA_Build 8 65480996 2I CATGCTTTGG --/CT CACCCTCCAT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 CT 0 1 359990 CASAVA_Build 8 65506781 1I TCCAGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 1575 het 1575 ref 47 25 6 16 T 13 14 359991 CASAVA_Build 8 65536965 1I TCAGTTGGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 35 1 27 7 T 11 12 359992 CASAVA_Build 8 65537390 1D GTGAGCATGA T/- TTTTTTTTTT 2064 het 2064 ref 37 18 5 14 T 15 14 359993 CASAVA_Build 8 65553192 1D TTCTGTAATG A/- AAAAAAAAAA 1919 het 1919 ref 40 28 5 8 A 12 11 359994 CASAVA_Build 8 65654608 4I TGAGAAACCG ----/GTTT GTTTGTTTGT 3070 hom 96 het 41 0 33 8 GTTT 4 5 359995 CASAVA_Build 8 65787892 2D TTTTATATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 25 0 23 3 TA 6 5 359996 CASAVA_Build 8 65788483 1D AACATAGAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 116 het 46 0 42 6 A 10 9 359997 CASAVA_Build 8 65888515 1D AGACTTAGAG T/- TTTTCTTTCT 3070 hom 98 het 35 0 33 2 T 5 4 359998 CASAVA_Build 8 65890399 8I CTATTATAAA --------/AGCCTTTT AGCCTTTTGG 3070 hom 99 het 40 0 34 7 AGCCTTTT 1 2 359999 CASAVA_Build 8 65897086 1D TTTATTTCTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 9 8 360000 CASAVA_Build 8 65903865 2D TATGATATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AT 7 6 360001 CASAVA_Build 8 65907419 2D CATTACTGTA CT/-- CTCTTATTAG 3070 het 3070 hom 38 15 20 4 CT 3 2 360002 CASAVA_Build 8 65916251 1D GTCTGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 56 hom 26 1 18 7 A 14 13 360003 CASAVA_Build 8 65916537 1D CCATGTGTTG T/- TATTTGTCAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 2 1 360004 CASAVA_Build 8 65918922 1I TTAGAAATTA -/C CCAGTCTATG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 C 2 3 360005 CASAVA_Build 8 65931554 3D TGAACATATG ATA/--- ATAAATATCA 3070 hom 105 het 37 0 34 7 ATA 2 1 360006 CASAVA_Build 8 65945383 4D19M3D AAAAATAAAC AAATAAGTAAAATAAATAAATTTAAA/----AAGTAAAATAAATAAATTT--- AAAAAAAAAC 2805 hom 18 het 7 0 7 1 N/A 0 0 360007 CASAVA_Build 8 65947251 1D GTACAGATGG A/- AAAATAAACA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 4 360008 CASAVA_Build 8 65949115 1I AAAGTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 11 12 360009 CASAVA_Build 8 65949925 4D ACAGCGAGAC TCCG/---- TCTCAAAAAA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 TCCG 1 0 360010 CASAVA_Build 8 65966123 1D TCCAACCTAT A/- AGTATAATAA 3070 hom 108 het 38 0 37 2 A 2 1 360011 CASAVA_Build 8 65978526 1I GGAAATTGTA -/T TTTTTTTTTT 1797 het 1797 ref 59 43 4 12 T 10 11 360012 CASAVA_Build 8 66068557 1D CCATTCCATG C/- CGGCGCTGTT 3070 hom 105 het 41 0 36 6 C 2 1 360013 CASAVA_Build 8 66114116 1I AAAAAAAAAA -/C AACTTATACT 3070 hom 51 het 24 0 18 6 C 0 1 360014 CASAVA_Build 8 66123783 1I ATCAATCAGA -/G GACACTTTGG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 G 1 2 360015 CASAVA_Build 8 66143623 1D TGTTGTATGC T/- TTTTGATTTG 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 5 4 360016 CASAVA_Build 8 66166584 1I CATCAACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1481 hom 35 4 28 3 A 11 12 360017 CASAVA_Build 8 66182602 1I ATGTTTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 47 hom 35 1 29 5 A 10 11 360018 CASAVA_Build 8 66189209 1I TTTAGGACAA -/G ATAACTAGAC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 0 1 360019 CASAVA_Build 8 66201437 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 69 hom 9 1 8 0 A 10 9 360020 CASAVA_Build 8 66217769 3D ATAGAAGATA GAT/--- GATAGATGAT 1841 het 1357 hom 29 9 11 13 GAT 2 1 360021 CASAVA_Build 8 66229290 1D GCATGAAGTC A/- AAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 A 5 4 360022 CASAVA_Build 8 66233180 1D GTGTTCATTC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 A 9 8 360023 CASAVA_Build 8 66233360 1D TTTTCTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1939 hom 27 6 8 13 T 15 14 360024 CASAVA_Build 8 66240213 1I GTTTTTTTTT -/A ATTTTAATTC 3070 het 3070 hom 43 21 20 2 A 1 2 360025 CASAVA_Build 8 66245352 4I TCTTCATGTA ----/AAGT AAGAGAACCA 3070 hom 99 het 39 0 32 8 AAGT 0 1 360026 CASAVA_Build 8 66273924 1D TGAAAGTTGG A/- AAAAAAAAAA 1010 het 1010 ref 42 32 4 6 A 12 11 360027 CASAVA_Build 8 66282028 24I TATATACCCT ------------------------/ATACATTGATATATAGATATATAG ATATATCTTT 3037 het 3037 ref 25 14 8 5 ATACATTGATATATAGATATATAG 0 1 360028 CASAVA_Build 8 66292632 1I ACCACCCCCC -/G ACCCCCACTC 3070 het 3070 ref 26 10 12 4 G 0 1 360029 CASAVA_Build 8 66293905 1I CAATACAACA -/G GGACTTACTT 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 G 2 3 360030 CASAVA_Build 8 66296418 1D TTACATATTG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 9 8 360031 CASAVA_Build 8 66297440 1D AGATTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 12 11 360032 CASAVA_Build 8 66298096 1D AGAAAGCATG T/- TTATGGCCTT 3070 hom 54 het 22 0 19 4 T 3 2 360033 CASAVA_Build 8 66307502 6I GAGTGGTCCC ------/AGTCAG AGTCAGAGTG 3070 het 3070 hom 44 17 18 9 AGTCAG 1 2 360034 CASAVA_Build 8 66310331 1I CACTGAGCTG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 A 7 8 360035 CASAVA_Build 8 66318145 8I TAAAATGGCG --------/TATATATA TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 TA 5 9 360036 CASAVA_Build 8 66320810 2I GTGAATAGAC --/AT ATGACTTAGC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AT 1 2 360037 CASAVA_Build 8 66322569 1D CTATGTAAAG T/- TATGTATATA 3070 het 2211 hom 22 6 15 1 T 2 1 360038 CASAVA_Build 8 66323051 1I TATTTAGGTT -/C TTTCAGAGGG 3070 het 2698 hom 29 8 14 7 C 0 1 360039 CASAVA_Build 8 66329667 1I CCCTTACTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 8 9 360040 CASAVA_Build 8 66342840 1I ATGGGCCTAG -/T TTAATGGTAT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 T 2 3 360041 CASAVA_Build 8 66364445 2D TTCTTTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 149 het 65 0 49 16 T 13 11 360042 CASAVA_Build 8 66375930 1D TCCACCTTGT A/- AAAAAAAAAA 1090 het 1090 ref 36 18 5 13 A 19 18 360043 CASAVA_Build 8 66378044 1D CTAATACCAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 9 8 360044 CASAVA_Build 8 66379917 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAT 142 het 142 ref 12 4 2 9 A 9 11 360045 CASAVA_Build 8 66383582 1I TCAGCCAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 T 10 11 360046 CASAVA_Build 8 66392435 2I AAATATCCAA --/GC AATATCATAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 GC 0 1 360047 CASAVA_Build 8 66395400 4D ATTTCAAATG GTTT/---- TTTTCCCTAT 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 GTTT 1 0 360048 CASAVA_Build 8 66397459 2I TCTATCTATC --/TA TATATATATA 3070 het 2103 hom 18 6 11 1 TA 6 7 360049 CASAVA_Build 8 66400707 1D GGAGAGCGGA G/- GGCGTCCTGC 3070 het 3070 ref 51 21 17 13 G 3 2 360050 CASAVA_Build 8 66401140 2D TCTCATTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 27 0 16 11 T 16 14 360051 CASAVA_Build 8 66401402 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 81 het 35 0 25 10 A 8 7 360052 CASAVA_Build 8 66404282 4I AGGGAGAGAC ----/AGAG AGAGAGAGCA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 AG 4 6 360053 CASAVA_Build 8 66409364 3D ATACTTACAA TCT/--- TCTTCTTCAT 3070 hom 93 het 41 0 32 10 TCT 3 2 360054 CASAVA_Build 8 66409860 1D GGATTTGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 45 0 38 8 A 10 9 360055 CASAVA_Build 8 66414002 4D TCGGGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 28 het 17 0 10 10 TTTG 5 4 360056 CASAVA_Build 8 66417313 4D GAAGAAACAT AGTC/---- AGAAAATTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 2 AGTC 1 0 360057 CASAVA_Build 8 66421407 1I AAAGAATAGT -/G TTTTCAACAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 G 0 1 360058 CASAVA_Build 8 66425638 3D GCTTTCAGCA TCT/--- TCATCATGAA 3070 het 3070 ref 29 12 12 6 TCT 1 0 360059 CASAVA_Build 8 66429323 1D TCATTTGACC T/- TTAAAAATCT 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 T 3 2 360060 CASAVA_Build 8 66432579 1I TTGAAAAAGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 269 hom 52 1 44 7 A 7 8 360061 CASAVA_Build 8 66434582 2I TATACATGTA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 1655 hom 26 6 13 7 TG 4 5 360062 CASAVA_Build 8 66438149 1D ACAACTAAAA T/- TTTTTTTATC 3070 het 2592 hom 24 9 13 2 T 8 7 360063 CASAVA_Build 8 66440084 1D AAACTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 3 A 11 10 360064 CASAVA_Build 8 66446475 1I AACCCTCAAC -/A AAGTAGGTAT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 2 3 360065 CASAVA_Build 8 66447169 2D ATATGAAACG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 566 hom 29 3 12 14 A 16 14 360066 CASAVA_Build 8 66447635 1I GGCTGGGTAT -/G GTGGCTCATG 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 G 1 2 360067 CASAVA_Build 8 66448970 1D TTGAAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 15 14 360068 CASAVA_Build 8 66449993 1D GAAGTTTTTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 63 het 24 0 21 3 A 9 8 360069 CASAVA_Build 8 66450142 2D GTCTCTTGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 18 hom 27 1 17 9 A 16 14 360070 CASAVA_Build 8 66454056 1D AAGAAAGAAA G/- AAGAAAGAAA 2259 hom 24 het 22 0 9 14 G 1 0 360071 CASAVA_Build 8 66457952 1I CCAGGAGCTG -/T TTTTTTTTTA 3033 het 909 hom 11 2 9 0 T 9 10 360072 CASAVA_Build 8 66460382 3I TGTGGAAGAC ---/GTT GTGGTGATTC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 GTT 0 1 360073 CASAVA_Build 8 66481882 7D19M28D GAGAATGAAA ATCCAATCTCATGAGAAAATTATTCTCCTAAGAATTAATCCAATCTCATGAGAA/-------CTCATGAGAGTGCCATTCT---------------------------- TGGCACTCAC 3070 het 3070 ref 41 45 11 10 N/A 0 0 360074 CASAVA_Build 8 66497647 1D TACATACCCT C/- CCCCACTCCC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 C 5 4 360075 CASAVA_Build 8 66502509 3I CGATGCGATC ---/AAA AACTGGAAGA 2757 het 2530 hom 14 7 6 1 A 2 5 360076 CASAVA_Build 8 66523865 1D AAAGAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 2851 het 486 hom 11 1 6 4 A 11 10 360077 CASAVA_Build 8 66527601 11I GACCCAGAGG -----------/CCTCTCTAAGA CCTTGAAGAG 3070 hom 93 het 35 0 30 5 CCTCTCTAAGA 0 1 360078 CASAVA_Build 8 66528553 1D GTAACAGTGA G/- GACTGCACAG 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 G 2 1 360079 CASAVA_Build 8 66530799 1D TCCAAGCCTG A/- AACTGCATTG 3070 hom 108 het 40 0 34 6 A 3 2 360080 CASAVA_Build 8 66540159 1I TGACCTATGG -/A AAAAAAAAAC 1096 het 1096 ref 43 34 3 6 A 9 10 360081 CASAVA_Build 8 66543320 1D ATGATCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 22 11 A 13 12 360082 CASAVA_Build 8 66561272 5D TTTAGGAATC AATTT/----- AATTTAAGTG 3070 het 3070 ref 40 17 18 6 AATTT 2 1 360083 CASAVA_Build 8 66562899 1I TTTTCTTTAC -/A ATGGAATGCC 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 A 1 2 360084 CASAVA_Build 8 66564984 1D TCGTTTGTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 10 17 12 A 10 9 360085 CASAVA_Build 8 66575861 1D TGGTCTCAAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 41 18 15 9 T 8 7 360086 CASAVA_Build 8 66581506 1I ACCTCCTGAA -/T TTTTTTTTTT 2250 het 2250 ref 21 9 5 7 T 11 12 360087 CASAVA_Build 8 66586865 1I CATTTTGGGA -/G GCCAAGGTGG 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 G 1 2 360088 CASAVA_Build 8 66591510 1D TGTTGTGTGT G/- TTTTTTTTTG 3070 het 137 hom 26 3 12 11 G 1 0 360089 CASAVA_Build 8 66592169 1I TCCCACAAAA -/G CTTCATCCCC 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 G 0 1 360090 CASAVA_Build 8 66620973 1D CCACCACCCC T/- GGCCTATGTC 1856 het 1493 hom 13 5 4 5 T 1 0 360091 CASAVA_Build 8 66635336 1I ACCGTGGAGG -/A AATCGAAGAG 3070 het 3070 ref 31 12 10 9 A 2 3 360092 CASAVA_Build 8 66635460 2D GGCCTCACAG GT/-- GTGTGAAGAC 2257 het 2257 ref 28 12 7 9 GT 3 2 360093 CASAVA_Build 8 66640136 4D AATCCCTTTT AAAG/---- AAAGATGGGA 2271 het 2271 ref 21 10 6 5 AAAG 2 1 360094 CASAVA_Build 8 66640450 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGAAAGC 2891 het 1660 hom 25 11 8 6 G 6 5 360095 CASAVA_Build 8 66654094 2D ACCCCCAATC AT/-- GCGTACAGGA 3070 het 3070 ref 54 25 22 8 AT 1 0 360096 CASAVA_Build 8 66654996 4I TTTTTTATTT ----/TTTA TTTATTTATT 2733 het 2733 ref 19 10 6 3 TTTA 3 4 360097 CASAVA_Build 8 66660295 6D TAAAATAATC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 T 17 11 360098 CASAVA_Build 8 66667168 3I TTTTGTTTGC ---/ATA ATAAGTTGTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 ATA 1 2 360099 CASAVA_Build 8 66672021 3I GTATTAGCGT ---/TAA TGTGTTCTAA 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 TAA 0 1 360100 CASAVA_Build 8 66683864 1I CATTTTGGAC -/T TTGGTAATCA 3070 het 3070 ref 39 19 12 8 T 2 3 360101 CASAVA_Build 8 66684647 3D28M2I ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAG--/---AAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAA AAAAAAGCTG 398 het 336 hom 9 4 3 7 N/A 0 0 360102 CASAVA_Build 8 66684892 1I AAAATTAAAA -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 T 7 8 360103 CASAVA_Build 8 66685243 1I CCAACACTTT -/G GGAGACCAAA 3070 hom 17 het 11 0 8 3 G 2 3 360104 CASAVA_Build 8 66686272 1D TTCTAGTTTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 21 8 5 T 9 8 360105 CASAVA_Build 8 66692640 1D TATTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 33 1 24 8 A 12 11 360106 CASAVA_Build 8 66692712 1I TTTCGGCGGG -/T GGGGGAGGGA 3070 het 422 hom 16 2 9 5 T 0 1 360107 CASAVA_Build 8 66694332 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 A 9 10 360108 CASAVA_Build 8 66695332 1I CTCAGGTGAT -/C CACCTGCCTC 3070 het 2371 hom 21 7 8 6 C 1 2 360109 CASAVA_Build 8 66698576 17D AAGTAAAATC TTTTTTTTTTTTTTTTT/----------------- TTTTTTTTGG 3070 het 1397 hom 18 6 10 6 T 25 8 360110 CASAVA_Build 8 66701792 1D TAGATGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2798 hom 29 10 12 7 A 13 12 360111 CASAVA_Build 8 66706729 3D TTTAAATGAA TAT/--- TTCAGGATTC 2700 het 2700 ref 32 19 7 6 TAT 1 0 360112 CASAVA_Build 8 66707615 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 31 1 27 3 A 11 10 360113 CASAVA_Build 8 66709537 1D GGGGAAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 83 het 29 0 27 3 T 13 12 360114 CASAVA_Build 8 66722596 1D GATAAGCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 31 0 25 6 A 11 10 360115 CASAVA_Build 8 66723854 5D CAATACAAAT AAAAC/----- AATACAGTAG 3070 het 3070 ref 26 17 9 4 AAAAC 1 0 360116 CASAVA_Build 8 66725790 1I CATTTTAACT -/G GGGTGAGATG 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 G 3 4 360117 CASAVA_Build 8 66726092 2D GACTTGATGT GA/-- TCTCATTTGT 3070 het 3070 hom 30 15 14 2 GA 1 0 360118 CASAVA_Build 8 66732885 3D ATTCTATTAA TCT/--- TCTTATTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 13 3 TCT 2 1 360119 CASAVA_Build 8 66738421 1I ATTGCTAAAA -/T TAAAAAAGTA 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 T 1 2 360120 CASAVA_Build 8 66740704 1D TTTATGCATT A/- ATCTCTATTA 3070 het 3070 ref 36 20 16 0 A 2 1 360121 CASAVA_Build 8 66741085 1I AATCCCAGCT -/A CTCAGGAGGC 3070 het 2612 hom 27 6 17 4 A 0 1 360122 CASAVA_Build 8 66777613 1I ATATGGGTGA -/T GGAGCTAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 T 0 1 360123 CASAVA_Build 8 66784269 4D TGTTATCTTC GTTT/---- GTTTTCAATG 3070 het 3070 ref 40 18 20 5 GTTT 2 1 360124 CASAVA_Build 8 66788866 3D ACAACCCAAC ACT/--- ACTGATACCA 2957 het 2957 ref 27 10 6 13 ACT 2 1 360125 CASAVA_Build 8 66795900 2D ATGGACCAGC CT/-- CTCTCTTGGA 3070 het 2254 hom 30 7 17 7 CT 4 3 360126 CASAVA_Build 8 66796854 1D TGCTGGGTTA C/- AAGTATGAGC 2702 het 2702 ref 25 13 8 4 C 1 0 360127 CASAVA_Build 8 66799768 1D TATTTATTGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 2702 hom 28 7 16 5 T 8 7 360128 CASAVA_Build 8 66813064 2I GTATATAACC --/AA AAATAAATTA 3070 het 3070 hom 32 16 15 1 A 3 5 360129 CASAVA_Build 8 66824823 1D ATGAATATGT G/- GGGGAGGAGA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 G 5 4 360130 CASAVA_Build 8 66831562 1I TATCAAATTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 29 11 10 8 T 9 10 360131 CASAVA_Build 8 66835728 1I GAGAGGATAC -/G ATGAGGAACT 3070 hom 96 het 39 0 32 7 G 0 1 360132 CASAVA_Build 8 66849109 6I AGTGAGAATA ------/TTATAC TTATAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 10 14 3 TTATAC 0 1 360133 CASAVA_Build 8 66854254 1D CTTTTTAAAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 8 7 360134 CASAVA_Build 8 66860626 1D ATTATTATGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 16 25 2 T 9 8 360135 CASAVA_Build 8 66862570 1I CATCTCTACA -/G GGGGGGGGAA 2899 het 2063 hom 19 7 7 5 G 8 9 360136 CASAVA_Build 8 66866732 6D AATTAAATTT TAATAA/------ TAATAAAATT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 TAA 4 2 360137 CASAVA_Build 8 66869044 4D ATGAAAGAAG TCTT/---- TCTAAGAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 14 10 TCTT 1 0 360138 CASAVA_Build 8 66879636 5I CCAAGTTTTC -----/TTTTA TTTTATTTTG 3070 het 2749 hom 22 8 13 1 TTTTA 1 2 360139 CASAVA_Build 8 66880548 1I CTTCTGTTCG -/T TAAGTCCCTA 3070 het 3070 hom 47 14 21 12 T 1 2 360140 CASAVA_Build 8 66888854 1D CATTACTGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 10 13 5 T 10 9 360141 CASAVA_Build 8 66890432 4D CAAAGTGTGC TACA/---- TACAGGGAGA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 TACA 2 1 360142 CASAVA_Build 8 66890533 1D GTAACAGTAC A/- AAAAAATTCG 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 7 6 360143 CASAVA_Build 8 66890855 2D CATTTAACAC AT/-- GTTATTTATG 3070 het 3070 ref 39 24 15 2 AT 1 0 360144 CASAVA_Build 8 66892231 4I CAACAAAACA ----/AACT AAAATATAGA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 AACT 0 1 360145 CASAVA_Build 8 66892917 5I TTATACTTTA -----/AATAT AATTTCCTTT 3070 het 3070 hom 31 15 13 3 AATAT 0 1 360146 CASAVA_Build 8 66896186 4I TAAACCAAGA ----/AACT TACAGCCCAA 3070 het 3070 ref 34 23 10 1 AACT 0 1 360147 CASAVA_Build 8 66904167 4D TGTTAATTAA AAGT/---- AACTCAGATA 3070 het 3070 ref 53 30 18 6 AAGT 1 0 360148 CASAVA_Build 8 66905029 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 10 9 360149 CASAVA_Build 8 66914013 2I TCTTTTTTTT --/TA AAAAAAAAAA 2674 het 2674 ref 27 16 8 3 TA 0 1 360150 CASAVA_Build 8 66914134 1I GCATTTGATT -/A AACCAAATGT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 2 3 360151 CASAVA_Build 8 66919955 1I TCTCTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 955 het 955 ref 57 44 3 10 T 10 11 360152 CASAVA_Build 8 66921681 1D CCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2409 het 2049 hom 13 5 5 3 A 11 10 360153 CASAVA_Build 8 66948253 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAT 964 het 964 ref 7 3 3 1 A 9 10 360154 CASAVA_Build 8 67002027 1D CTCCTACCCC T/- GATAGGCCCC 3070 het 3070 ref 27 17 8 2 T 1 0 360155 CASAVA_Build 8 67011029 1I GATGCCTGTA -/C CCTCATTGTG 3070 hom 81 het 30 0 27 3 C 2 3 360156 CASAVA_Build 8 67025047 1D AACCTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3038 hom 26 11 12 3 A 13 12 360157 CASAVA_Build 8 67037293 1D GTGTTCTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 12 10 A 15 14 360158 CASAVA_Build 8 67038085 1I CTAATCAATT -/A AAAAAAACAT 3061 het 3061 ref 33 22 8 3 A 7 8 360159 CASAVA_Build 8 67039201 1D ACAATGTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2610 hom 32 10 16 7 A 12 11 360160 CASAVA_Build 8 67041416 1I CAAAAAACAA -/C AAAAAAAAAA 3070 het 2731 hom 25 11 11 3 C 0 1 360161 CASAVA_Build 8 67044097 1I TACGCAATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 19 8 T 11 12 360162 CASAVA_Build 8 67052680 1D AGCCCACTGC G/- GGGGGGGTTG 3070 hom 47 het 23 0 14 9 G 8 7 360163 CASAVA_Build 8 67066245 1I CCCTTAATTC -/T CTTTCAAAAT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 T 0 1 360164 CASAVA_Build 8 67067648 1I TCTTTTTTAA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 21 10 11 0 T 8 9 360165 CASAVA_Build 8 67074828 3D CAGCCTGTCT GAG/--- GAGTGGCACA 3070 het 2041 hom 21 8 12 3 GAG 2 1 360166 CASAVA_Build 8 67080649 7I TGTCAATTTA -------/GTCAGTG GTTCTAGAGC 2433 het 2433 ref 31 15 6 10 GTCAGTG 0 1 360167 CASAVA_Build 8 67081572 2D AACAACAACA AC/-- AAAAAAAAAA 1542 het 1542 ref 32 13 5 14 AC 1 0 360168 CASAVA_Build 8 67083655 1I CTGTAGTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 11 9 T 11 12 360169 CASAVA_Build 8 67085108 16D GGGGGTGCTG TTCAGCAAATGTTCTC/---------------- TTCAGCAAAT 3070 het 3070 ref 46 19 20 10 TTCAGCAAATGTTCTC 2 1 360170 CASAVA_Build 8 67090023 6D GTCTGTCTTC TAGCTG/------ TAGCTGTAGC 3070 het 3070 hom 45 12 21 14 TAGCTG 3 2 360171 CASAVA_Build 8 67093173 2D TGGGCGTGGT GG/-- GGGGGGTGCC 1280 het 672 hom 10 5 4 2 G 8 6 360172 CASAVA_Build 8 67102359 1I AATATTGTTG -/A TCACAAAAGG 3070 het 3070 hom 53 17 24 12 A 0 1 360173 CASAVA_Build 8 67115819 3I ATCTTAGATA ---/CTG GAGTGGTAGT 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 CTG 0 1 360174 CASAVA_Build 8 67155425 1D ATCACTATAG T/- AGGAGAGCTC 3070 het 3070 hom 31 12 19 1 T 1 0 360175 CASAVA_Build 8 67167736 1D CAATAGTTAC T/- TTTTCAACCC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 5 4 360176 CASAVA_Build 8 67170191 2D ATTTCTGCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 36 10 20 7 TC 7 6 360177 CASAVA_Build 8 67175054 1D TGAAGAGTTA T/- TTTACCCTCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 6 T 4 3 360178 CASAVA_Build 8 67180488 1D TATCAAAGAA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 7 6 360179 CASAVA_Build 8 67186500 1D AAGCCAGGAG T/- TCAAGACCAG 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 T 2 1 360180 CASAVA_Build 8 67187342 1I GAATAACTTT -/G TTAAAATTAA 3070 het 3070 hom 33 16 16 1 G 0 1 360181 CASAVA_Build 8 67208187 1D GAGATGCAGC A/- AAAAAAAAAA 2373 het 2373 ref 38 22 7 10 A 13 12 360182 CASAVA_Build 8 67240742 1D TTTTCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2871 hom 28 12 8 9 T 11 10 360183 CASAVA_Build 8 67246760 5I TTCTTATTGG -----/GGGTC GGTGCTATTG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 GGGTC 0 1 360184 CASAVA_Build 8 67255001 1D TATTGTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 11 12 T 13 12 360185 CASAVA_Build 8 67256452 1D GTGACCTTTG A/- AAAAAGTGAT 2729 het 2729 ref 38 25 7 6 A 6 5 360186 CASAVA_Build 8 67261672 1D CAACCAGGCA C/- CCCCAAACAG 3070 hom 93 het 40 0 31 10 C 5 4 360187 CASAVA_Build 8 67268004 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 13 12 360188 CASAVA_Build 8 67272075 1D TAGCTTTTTT A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 A 8 7 360189 CASAVA_Build 8 67272773 7I ATAAATACAG -------/CCATGCA CCATGCACCT 3070 het 3070 hom 37 8 17 12 CCATGCA 1 2 360190 CASAVA_Build 8 67282152 1D CCCAGATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 7 T 11 10 360191 CASAVA_Build 8 67284953 1I GCACCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 10 11 360192 CASAVA_Build 8 67290695 1I ATTTTGGAAG -/A AAAAAAATCA 3070 hom 105 het 41 0 35 6 A 7 8 360193 CASAVA_Build 8 67320937 1D ATAAAAAGAA G/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 G 1 0 360194 CASAVA_Build 8 67358233 2I ATATATATAC --/AT ATATATATGT 1959 het 1959 ref 26 15 7 4 AT 4 5 360195 CASAVA_Build 8 67361235 3D ACTGAGACAG AAC/--- AACAACATCT 3070 het 3070 ref 32 19 10 6 AAC 3 2 360196 CASAVA_Build 8 67366209 1D TGTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2985 hom 26 9 11 7 A 12 11 360197 CASAVA_Build 8 67366513 1D GATAAATACC A/- CCCATTCCTC 3070 het 3070 ref 44 20 18 8 A 1 0 360198 CASAVA_Build 8 67378203 1I AAGCCATGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 9 10 360199 CASAVA_Build 8 67384253 1I GAGAGTCAAT -/G GAGGCAAAGG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 G 1 2 360200 CASAVA_Build 8 67407118 5D TTTAATGTGG CCAGA/----- CAAGACAACA 3070 hom 87 het 35 0 30 6 CCAGA 1 0 360201 CASAVA_Build 8 67416127 1I GTCAGATTTG -/T TTTGGTGTTT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 3 4 360202 CASAVA_Build 8 67417308 1I AACAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 10 11 360203 CASAVA_Build 8 67418757 5I CTTCAGCTGA -----/CAAAG CAAAGTGGCA 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 CAAAG 1 2 360204 CASAVA_Build 8 67420481 1I ATACAATTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 A 11 12 360205 CASAVA_Build 8 67422287 26D4M1D GTGCAACAGG TTTAACTGACCTTACTTAACTACTTCTGTTG/--------------------------TGTT- GGTGTTAAGC 3070 het 3070 ref 29 28 9 3 N/A 0 0 360206 CASAVA_Build 8 67424508 1D CACCCTGCTA G/- GGCTGTTCTT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 G 3 2 360207 CASAVA_Build 8 67425913 1D GTTTTGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 552 hom 36 3 23 11 A 13 12 360208 CASAVA_Build 8 67430386 1I ACTCTGACTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 A 8 9 360209 CASAVA_Build 8 67431085 1D GACCTTCCCC T/- GACCTTCTTT 3070 het 2797 hom 19 6 9 4 T 1 0 360210 CASAVA_Build 8 67435765 1I AATCTTGACA -/T ATTTTTAGAT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 T 0 1 360211 CASAVA_Build 8 67440740 1I AGAATTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 18 18 2 T 9 10 360212 CASAVA_Build 8 67441724 1I TGCTTATATT -/A AAAAAAGGAG 2799 het 2799 ref 36 19 8 9 A 6 7 360213 CASAVA_Build 8 67450368 4I GCGGTGAGAG ----/AAAC AAACAAAATT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 AAAC 1 2 360214 CASAVA_Build 8 67452757 1D AAAGTGAGCG C/- CCCGATGCCA 3070 het 3070 ref 31 21 9 2 C 4 3 360215 CASAVA_Build 8 67471826 1D TGGCCAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 22 11 4 A 10 9 360216 CASAVA_Build 8 67472858 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 31 0 20 12 A 14 13 360217 CASAVA_Build 8 67473462 2I TATATATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 TA 5 6 360218 CASAVA_Build 8 67480998 4D CAATGGGAGA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 AG 9 7 360219 CASAVA_Build 8 67497540 1I TGGCAAATGC -/A AAAAAGCTGC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 5 6 360220 CASAVA_Build 8 67505600 1D TGTTTACTTT C/- TGAAAAACAC 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 C 1 0 360221 CASAVA_Build 8 67513657 1D CTTGGGGAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 42 het 23 0 13 10 A 10 9 360222 CASAVA_Build 8 67518614 1I TAGTCAATTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 A 11 12 360223 CASAVA_Build 8 67532561 5I TATTGAGAGT -----/GTTAC ATTTGTAGTA 3070 hom 54 het 20 0 18 2 GTTAC 0 1 360224 CASAVA_Build 8 67536755 1D CCAAATCACT A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 59 22 26 12 A 7 6 360225 CASAVA_Build 8 67540830 1D AGTTTATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 888 hom 22 3 15 4 T 11 10 360226 CASAVA_Build 8 67541343 5I2M1I ACCAGACAAA -----AC-/TACTGACT AAATACCTAC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 N/A 0 0 360227 CASAVA_Build 8 67541817 1D TTTATACTGG A/- AAAAAATCAC 3070 hom 102 het 44 0 33 11 A 7 6 360228 CASAVA_Build 8 67550994 1I TACTCTGTGA -/T ATTTATGCTT 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 T 0 1 360229 CASAVA_Build 8 67556521 1I CAAAGTGAGA -/C CCGATCTCGA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 C 2 3 360230 CASAVA_Build 8 67604074 5D AGAAAGAAAG AAAGA/----- AAAGAAAAGA 3070 het 3070 ref 27 12 9 9 AAAGA 3 2 360231 CASAVA_Build 8 67629306 1D CAGAGAAAAT A/- AACTATTTGC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 3 2 360232 CASAVA_Build 8 67638962 1I ACTGCTTCTG -/A AAAAAAAAAA 742 het 742 ref 39 33 2 4 A 10 11 360233 CASAVA_Build 8 67640420 1D ATCCCAACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 10 9 360234 CASAVA_Build 8 67646682 2D AAAAAAAAGG AA/-- AAAGGAAAAG 2687 het 2687 ref 22 12 8 3 A 5 3 360235 CASAVA_Build 8 67650057 1D AAAGGAAAAA C/- CTCAGTGGGC 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 C 2 1 360236 CASAVA_Build 8 67659878 4D CTGAGCAAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 2787 hom 33 6 20 9 AAAC 5 4 360237 CASAVA_Build 8 67678755 1D AATTCATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 11 10 360238 CASAVA_Build 8 67696255 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 het 461 hom 8 1 7 0 A 6 7 360239 CASAVA_Build 8 67715502 1D ATGGCTTGAC G/- GGGGGTACTT 3070 hom 90 het 36 0 29 8 G 6 5 360240 CASAVA_Build 8 67718118 1I TCTCAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 14 9 A 10 11 360241 CASAVA_Build 8 67720768 3I CAAAAGACTC ---/ATT GTTGTCAAGA 3070 het 3070 ref 36 22 12 2 ATT 0 1 360242 CASAVA_Build 8 67724849 1I TAATAATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 T 10 11 360243 CASAVA_Build 8 67725975 1D ATTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1669 het 730 hom 14 3 4 7 A 19 18 360244 CASAVA_Build 8 67728008 6D ACACAGAAGT TTAATA/------ TTAATAAGAG 3070 het 3070 ref 33 18 13 5 TTAATA 2 1 360245 CASAVA_Build 8 67730483 1D AAATAATAGC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 31 11 17 4 A 9 8 360246 CASAVA_Build 8 67738407 2D TTACCATCCA TC/-- TCTGTTTATG 3070 het 3070 ref 42 24 15 5 TC 2 1 360247 CASAVA_Build 8 67753659 6D ACTCTTAACC CTTATT/------ CTTAGCCACT 3070 het 3070 ref 58 31 23 9 CTTATT 1 0 360248 CASAVA_Build 8 67764699 1D GCTTGTCTGG C/- CTTAGAATGT 3070 het 3070 ref 37 20 13 5 C 2 1 360249 CASAVA_Build 8 67769364 1I TGTTTTGGTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 44 het 16 0 15 1 T 7 8 360250 CASAVA_Build 8 67771365 1D GCCGGGCGTA G/- TGGTGCACAC 3070 het 3070 hom 20 9 10 1 G 1 0 360251 CASAVA_Build 8 67774775 1I TGGCCAATTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 8 9 360252 CASAVA_Build 8 67783059 2I AAAGATACCC --/TA TAAAAGCAAT 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 TA 1 2 360253 CASAVA_Build 8 67789222 3I TCTTGTTATT ---/ATG GTGACTATGA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 ATG 0 1 360254 CASAVA_Build 8 67796475 1I CTATTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 T 13 14 360255 CASAVA_Build 8 67804261 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2554 het 1463 hom 11 4 7 0 A 11 10 360256 CASAVA_Build 8 67808520 1I ACTCATGTAG -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 7 8 360257 CASAVA_Build 8 67808846 1I GTACTGATGG -/A ATTTGTTGCA 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 A 1 2 360258 CASAVA_Build 8 67820389 3I AAAACAAAAA ---/AAC AACAACAAAA 3070 het 3059 hom 25 8 11 6 AAC 2 3 360259 CASAVA_Build 8 67830404 1I CTCTGAAACT -/C CCCCCATTTT 3070 het 3070 ref 45 21 18 6 C 5 6 360260 CASAVA_Build 8 67842890 6D CTTATAGAAT ACTTAC/------ ACTTATAGGA 3070 het 3070 hom 41 17 22 9 ACTTAC 1 0 360261 CASAVA_Build 8 67843209 1D ATTTTTCAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1087 hom 27 4 15 8 T 12 11 360262 CASAVA_Build 8 67854472 2D AAATTAGGGC AT/-- ATATATATAT 1896 het 1896 ref 12 6 5 2 AT 6 5 360263 CASAVA_Build 8 67865625 4I GCACAGGTAG ----/TAGT TTGAGCAATC 3070 het 3070 ref 59 28 26 5 TAGT 0 1 360264 CASAVA_Build 8 67883303 1D AATCCTGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1123 hom 35 10 11 14 T 17 16 360265 CASAVA_Build 8 67899250 1D CTACCAAATT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 38 14 17 8 A 9 8 360266 CASAVA_Build 8 67901218 1I GTTTTTATTA -/T TGATTTGTTT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 T 1 2 360267 CASAVA_Build 8 67907700 1D GTTTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 T 11 10 360268 CASAVA_Build 8 67946690 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 11 7 8 A 14 15 360269 CASAVA_Build 8 67968655 1D AACTGCACTT G/- GTTCCACACT 3070 hom 111 het 41 0 38 4 G 2 1 360270 CASAVA_Build 8 67990700 1I TCTTTCTAAG -/A AATGAGAGTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 2 3 360271 CASAVA_Build 8 68003573 15D TTTTGACATA TGTGAAACCATCACC/--------------- TGTGAAACCA 3070 het 3070 ref 43 25 16 8 TGTGAAACCATCACC 2 1 360272 CASAVA_Build 8 68093064 1D TGCTACCACG C/- CCCAGCTAAT 3070 hom 43 het 16 0 14 2 C 4 3 360273 CASAVA_Build 8 68133486 1I GAGTTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3056 het 3056 ref 19 9 8 2 A 10 11 360274 CASAVA_Build 8 68144847 1D AGAATATTTA G/- GGAAGATTAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 3 2 360275 CASAVA_Build 8 68173192 1D AAACGTTTAC T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 T 8 7 360276 CASAVA_Build 8 68232853 1D ATCACTATAG A/- ATAATATAAT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 A 2 1 360277 CASAVA_Build 8 68261208 1D GTTTTAAATT A/- AAAAAAAAAA 2656 het 1060 hom 21 4 9 8 A 17 16 360278 CASAVA_Build 8 68284064 1I GAATTACTGA -/T TTATGCTACA 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 T 2 3 360279 CASAVA_Build 8 68293200 1I TTTGATTATT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 8 9 360280 CASAVA_Build 8 68350040 2I CTGCAATATT --/AG AGAGGTGGGC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AG 2 3 360281 CASAVA_Build 8 68356255 2D TTAATTTGAT AA/-- AGAGTATCCT 3070 het 3070 ref 24 17 7 1 A 3 1 360282 CASAVA_Build 8 68357637 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1166 het 1166 ref 17 5 4 8 A 13 14 360283 CASAVA_Build 8 68358548 4I TTTCACTCAT ----/AGTC AGAGAAATGC 3070 het 3070 ref 50 23 22 5 AGTC 0 1 360284 CASAVA_Build 8 68363058 3I AGTCAATTTC ---/AAT AATGATTCCT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 AAT 1 2 360285 CASAVA_Build 8 68372895 1D ATGCCCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2481 hom 28 11 10 9 T 13 12 360286 CASAVA_Build 8 68374246 1I GAATATACAT -/A AAAATTTTTA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 4 5 360287 CASAVA_Build 8 68381354 2I CTTTTTCCAC --/TT TGACAGTACA 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 T 1 3 360288 CASAVA_Build 8 68389444 1I GGGTCCTGCA -/G AAGCAGTCCA 2361 het 1844 hom 13 5 5 3 G 0 1 360289 CASAVA_Build 8 68403254 4D TTCTCCAGCA TCTC/---- TCTGATTATT 3070 het 3070 ref 37 21 15 3 TC 3 1 360290 CASAVA_Build 8 68409074 1D TCCAAAGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2563 hom 37 11 14 13 A 17 16 360291 CASAVA_Build 8 68438635 1I GTCTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 A 10 11 360292 CASAVA_Build 8 68551343 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 2041 het 2041 ref 52 32 6 14 T 13 12 360293 CASAVA_Build 8 68572725 1D AAGTGATTCA T/- TCCGCCTCAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 2 1 360294 CASAVA_Build 8 68637910 1D GAATGAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 11 10 360295 CASAVA_Build 8 68639959 1D CTTTTTCTTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 C 1 0 360296 CASAVA_Build 8 68653408 1D TGCTCCTTAT G/- GGTCCCTGTT 3070 het 3070 hom 29 13 15 3 G 3 2 360297 CASAVA_Build 8 68657536 3I TTTTCATGTC ---/ATT AGTCATGGTT 3070 het 3070 hom 44 21 23 0 ATT 0 1 360298 CASAVA_Build 8 68658259 1I TCAGCTTGTG -/A ATAGGCCTAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 1 2 360299 CASAVA_Build 8 68660753 1D TATGGGCTCA C/- TCATAGTTTG 3070 het 3070 ref 46 24 17 6 C 1 0 360300 CASAVA_Build 8 68680877 4D AAGGACAAAA AAAC/---- AAACACCGCA 3070 het 1276 hom 23 4 16 3 AAAC 2 1 360301 CASAVA_Build 8 68685878 2D TCACTCCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2741 hom 28 10 10 8 T 12 10 360302 CASAVA_Build 8 68690306 1D TGACCTACAT A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 39 14 13 13 A 8 7 360303 CASAVA_Build 8 68692715 4D ACGGCATGGC TGTT/---- TGTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 TGTT 2 1 360304 CASAVA_Build 8 68708698 1I TTCCTCCTTC -/T TTTCTCCATG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 3 4 360305 CASAVA_Build 8 68717120 3D AAAAAAAAAA AAT/--- ATTGATTAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 4 AAT 1 0 360306 CASAVA_Build 8 68718336 1D TATATGGTAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 10 9 360307 CASAVA_Build 8 68732126 2D AATAATCTGA TG/-- TTGCTGGAGA 3070 het 3070 ref 48 22 23 3 TG 1 0 360308 CASAVA_Build 8 68761891 2I CTCCAGTGAT --/AA GTTAGCATTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 A 0 2 360309 CASAVA_Build 8 68764061 1I AAACTTCTTC -/A TTCAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 A 0 1 360310 CASAVA_Build 8 68764827 1I TGATAATGAA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 T 7 8 360311 CASAVA_Build 8 68772556 1I CAGTCGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 10 11 360312 CASAVA_Build 8 68775305 1I TTGGTATTTT -/G GGGGAGACAA 3070 het 3070 hom 54 23 23 8 G 4 5 360313 CASAVA_Build 8 68808835 1D GCAAACTTAA T/- TTTTTTTTTT 2309 het 2309 ref 26 15 7 4 T 12 11 360314 CASAVA_Build 8 68809259 3I ATATTACATT ---/AAG AAGATTTCTG 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 AAG 1 2 360315 CASAVA_Build 8 68813554 3D ATTACGCATT AAA/--- GCACTGTACC 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 A 3 0 360316 CASAVA_Build 8 68847823 1D CTCTCAAGTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 334 hom 47 1 41 5 T 10 9 360317 CASAVA_Build 8 68848483 1I AAAAAATATG -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 9 10 360318 CASAVA_Build 8 68850439 1D AAAAAAAAAA T/- GTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 23 0 14 11 T 1 0 360319 CASAVA_Build 8 68851278 1I GAGGATAAGA -/T CCTGATGCCT 3070 hom 121 het 49 0 41 8 T 0 1 360320 CASAVA_Build 8 68861762 1I AAAATGAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 339 hom 38 2 24 12 A 13 14 360321 CASAVA_Build 8 68863547 1I ATCACAAGTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 7 8 360322 CASAVA_Build 8 68863979 1D AGCTGGATGT G/- GGTGGTGCAT 3070 hom 91 het 38 0 28 10 G 3 2 360323 CASAVA_Build 8 68864413 1D AATTTATTGA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 8 7 360324 CASAVA_Build 8 68873483 1D TTCAGATGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 102 het 36 0 35 2 A 10 9 360325 CASAVA_Build 8 68876033 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 120 hom 21 2 15 4 A 17 16 360326 CASAVA_Build 8 68876792 10D CCAAAAACAA AAAATAACAT/---------- AAAATAACAT 3070 hom 60 het 29 0 21 12 AAAATAACAT 2 1 360327 CASAVA_Build 8 68881845 5D TATATATAAT TTATA/----- TTATAAGTTT 3070 hom 45 het 16 0 16 1 TTATA 2 1 360328 CASAVA_Build 8 68884339 1D ACATCTAAGG T/- TGATGTGGCC 3070 hom 59 het 26 0 20 6 T 2 1 360329 CASAVA_Build 8 68889313 1D AACAAAAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 357 hom 41 2 34 5 A 12 11 360330 CASAVA_Build 8 68890686 1I GATTTAGCTT -/C ACCATAGTGT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 0 1 360331 CASAVA_Build 8 68902909 1D TGTATTTAAA T/- TTTTAAAAAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 5 4 360332 CASAVA_Build 8 68909155 1D AAAAGAATTT A/- AAAAATAAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 6 5 360333 CASAVA_Build 8 68920000 1D TTCCTTTTCC T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 80 het 31 0 26 6 T 7 6 360334 CASAVA_Build 8 68925720 1D GTCCTCTCTA T/- TTTTTTCCAA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 7 6 360335 CASAVA_Build 8 68930766 3I CACTTCTGAC ---/CTT CTTTTCTCCT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 CTT 1 2 360336 CASAVA_Build 8 68934452 1D CATGACCAGC T/- CCTCAAGATA 3070 hom 111 het 39 0 36 4 T 1 0 360337 CASAVA_Build 8 68992874 1I GTTTGATTTC -/A AGATTGAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 1 2 360338 CASAVA_Build 8 69002256 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2153 het 1220 hom 20 6 8 6 A 15 14 360339 CASAVA_Build 8 69005245 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 9 10 360340 CASAVA_Build 8 69005488 1I AGTTTATGTC -/A AAAAAATGCC 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 A 6 7 360341 CASAVA_Build 8 69007619 1D TAGCACATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 10 9 360342 CASAVA_Build 8 69012701 1I TGTTTCCTGA -/T TTTTTTAATG 3070 het 575 hom 19 2 15 2 T 6 7 360343 CASAVA_Build 8 69014724 1I AGTAGAAGCA -/G GGGATGAATA 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 G 3 4 360344 CASAVA_Build 8 69025903 4I AGTTTTAGAC ----/TGTT TGAAGTTGAT 3070 het 3070 hom 34 9 21 4 TGTT 0 1 360345 CASAVA_Build 8 69030162 2I TGCCCCCAGG --/CA CACACACCGC 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 CA 3 4 360346 CASAVA_Build 8 69032090 3I TATTCCAGGT ---/AAC AACAACCACA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAC 2 3 360347 CASAVA_Build 8 69041220 1I AATCTACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 30 1 25 4 T 11 12 360348 CASAVA_Build 8 69049202 2I GTGAAAATTG --/TT ATGAACATTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 2 360349 CASAVA_Build 8 69051616 2I GACAGAGAGA --/GG GAGAAGCCAA 3070 hom 122 het 46 0 35 11 G 1 3 360350 CASAVA_Build 8 69055181 1D GACTTTTGAG C/- AGCACAAAGA 3070 het 3070 ref 53 31 18 4 C 1 0 360351 CASAVA_Build 8 69055263 1D GCAACATGTT C/- TCAGAACAAA 3070 hom 102 het 42 0 34 9 C 1 0 360352 CASAVA_Build 8 69061134 3D GATTTGAACT GAA/--- GAAGTCTTGT 3070 hom 108 het 43 0 35 8 GAA 2 1 360353 CASAVA_Build 8 69061263 15D GGTGGCTTGA CTACAGGTGGCTTGT/--------------- CTACGTGCAA 3070 het 3070 ref 45 29 13 8 CTACAGGTGGCTTGT 1 0 360354 CASAVA_Build 8 69065287 1D TCCCAGGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2119 hom 23 6 11 6 T 13 12 360355 CASAVA_Build 8 69076093 4D TTTTCAAAAG AAGA/---- AAGACATGCA 3070 hom 123 het 42 0 42 3 AAGA 2 1 360356 CASAVA_Build 8 69076878 1I AAATAAACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 205 hom 17 1 13 3 A 10 11 360357 CASAVA_Build 8 69077453 1I TGCTTCTTAA -/T TCATTTTTTT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 1 2 360358 CASAVA_Build 8 69078153 4D ACAATGTGAC TCTT/---- TCAGTATCTA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 TCTT 1 0 360359 CASAVA_Build 8 69080670 4D TCATAGAGTG GGTT/---- GGTTCACAGT 3070 hom 111 het 39 0 38 2 GGTT 2 1 360360 CASAVA_Build 8 69082349 1I TAAGAAATAG -/A AAAAAATAGT 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 A 6 7 360361 CASAVA_Build 8 69083228 3D TGGTCATGAG AGA/--- AGGAGAGAAT 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 AGA 1 0 360362 CASAVA_Build 8 69083386 5D AGTTGGAGAC AAGTT/----- AATATGGTTT 3070 het 3070 ref 48 29 13 7 AAGTT 1 0 360363 CASAVA_Build 8 69086222 1I CTTTGTATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 13 14 16 A 9 10 360364 CASAVA_Build 8 69101469 2I TTCCAGTGTC --/TT TGGTGCAGTG 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 T 1 3 360365 CASAVA_Build 8 69118181 1I GAATATGCAA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 49 24 15 10 T 7 8 360366 CASAVA_Build 8 69129183 2I AAACCCCCAA --/AG ACGAGAAGAA 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 AG 0 1 360367 CASAVA_Build 8 69130250 1I TATTGCATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 8 9 360368 CASAVA_Build 8 69131404 1D CAGGTAGCTC T/- TTTTTAGGCC 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 T 6 5 360369 CASAVA_Build 8 69133229 1D ATTGACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2163 hom 28 6 14 9 T 12 11 360370 CASAVA_Build 8 69134083 1I CCACGTGACC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 9 10 360371 CASAVA_Build 8 69139329 1D AGCTAATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 T 14 13 360372 CASAVA_Build 8 69151632 1D AATGATCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 T 11 10 360373 CASAVA_Build 8 69153595 2I TAAAGCACCA --/AC ACACAGTAAT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 AC 2 3 360374 CASAVA_Build 8 69154373 1I CTGGGATCAC -/T TTTCTTTTAG 3070 het 3070 ref 35 21 10 4 T 3 4 360375 CASAVA_Build 8 69154778 1I14M1I TGTTCACACA -AGAAGGCAACACTT-/CAGAAGGCAACACTTA AACCCATTTG 3070 het 3070 ref 38 20 19 4 N/A 0 0 360376 CASAVA_Build 8 69155067 4I5M1I AAATTATAGA ----AAGAG-/AAGGAAGAGA AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 N/A 0 0 360377 CASAVA_Build 8 69156821 8D AAACTTCTGA TCATTCAT/-------- TCATTCATTC 2012 het 2012 ref 27 18 5 8 TCAT 7 5 360378 CASAVA_Build 8 69157965 1D TTCCAATTTT G/- TGAAAAACTC 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 G 1 0 360379 CASAVA_Build 8 69163465 1I AGAAAGCTGT -/C GTTTCTCTCA 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 C 0 1 360380 CASAVA_Build 8 69164020 3D ACTGTCATGG TTA/--- TTGAATTAGT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 TTA 1 0 360381 CASAVA_Build 8 69165564 1D ACCTAAGGGG T/- TGAGGTGGGA 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 T 2 1 360382 CASAVA_Build 8 69170428 1I TTCCTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 10 9 T 12 13 360383 CASAVA_Build 8 69172116 1I TTCAAACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 T 13 14 360384 CASAVA_Build 8 69204676 1D AATAGTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 26 1 11 14 A 13 12 360385 CASAVA_Build 8 69205072 2I GAGCAAGATG --/CT CTCTCTTAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 CT 3 4 360386 CASAVA_Build 8 69206367 1I AAAAGTTGAC -/T GTTAATTGCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 1 360387 CASAVA_Build 8 69218355 6D TGTTGAGTTT GAAGAG/------ TTATCTGTGT 3070 het 3070 ref 42 26 16 3 GAAGAG 1 0 360388 CASAVA_Build 8 69222676 1I GAAAAGGAAG -/A AGAACAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 A 1 2 360389 CASAVA_Build 8 69226573 1D ACCTCCTATG A/- AAAAAAAAAA 2436 het 2436 ref 23 12 8 3 A 12 11 360390 CASAVA_Build 8 69232852 2D GTGTGTGTGA AT/-- ATATATATGT 2750 het 819 hom 19 3 9 7 AT 5 4 360391 CASAVA_Build 8 69269590 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 23 0 13 10 A 14 13 360392 CASAVA_Build 8 69316146 1D GACAGGAGAG A/- AAGTGGGTGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 3 2 360393 CASAVA_Build 8 69317365 1I TAGGTGATTC -/T TTTTGCACAC 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 4 5 360394 CASAVA_Build 8 69318932 1I TTGTAAAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 10 11 360395 CASAVA_Build 8 69350115 1D TTTTTTTTTT A/- GCAATTGAGT 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 A 1 0 360396 CASAVA_Build 8 69361518 1D ACTGCACCAT A/- AAAAAACAAG 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 A 7 6 360397 CASAVA_Build 8 69362557 2D GTGTGAGAAA GT/-- GTAGCTAACC 3070 het 3070 hom 49 23 24 3 GT 2 1 360398 CASAVA_Build 8 69364393 2D TGGGATGAAC AT/-- ATAGATAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 20 7 AT 2 1 360399 CASAVA_Build 8 69365398 1I TAAAATGGTG -/A AAAAAAGATA 3070 het 2460 hom 27 8 11 8 A 6 7 360400 CASAVA_Build 8 69386670 4I CCTTCCCTGT ----/CTCC CTCCCTCCCT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 CTCC 3 4 360401 CASAVA_Build 8 69393175 2D TTTTTATAAT TG/-- TGTGTGTGTG 2750 het 2750 ref 30 8 8 16 TG 10 9 360402 CASAVA_Build 8 69396642 1I CAACCAAGGG -/T TGTTTAGATC 3070 het 3070 ref 47 20 19 8 T 1 2 360403 CASAVA_Build 8 69414279 1D AAAAACTCTT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 A 8 7 360404 CASAVA_Build 8 69421090 4I TCATATTGTT ----/AGAG AGGATTTAGG 2551 het 2551 ref 27 12 9 6 AG 1 3 360405 CASAVA_Build 8 69424297 2D TTGGGGAGGA CT/-- CTCTCCTCCT 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 CT 3 2 360406 CASAVA_Build 8 69427205 5I GTTTTGGTCA -----/CTTTT CTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 CTTTT 1 2 360407 CASAVA_Build 8 69451074 1I GCTTATAAAT -/G GGGGGGTCTT 3070 het 3070 hom 29 11 12 6 G 6 7 360408 CASAVA_Build 8 69452191 6D GTCTCAAATT AAGGAG/------ AAGGAGAAGG 3070 het 3070 ref 36 15 9 13 AAGGAG 3 2 360409 CASAVA_Build 8 69468380 1I ACACCATGGC -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 A 7 8 360410 CASAVA_Build 8 69468877 1D AGGCATGCCA T/- TTTTTTTTTA 2956 het 2464 hom 16 8 7 1 T 10 9 360411 CASAVA_Build 8 69470030 1D AGAACAAGGG T/- TTTTTTTTTC 1253 het 1253 ref 38 31 3 5 T 10 9 360412 CASAVA_Build 8 69476419 30D AAATGAAGCC TTTTCTTCATCTCTTGAAATGGCCATTTGT/------------------------------ TTTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 47 36 7 8 TTTTCTTCATCTCTTGAAATGGCCATTTGT 1 0 360413 CASAVA_Build 8 69489393 10D GAGATGTCTA AGACATGCTT/---------- CCTGACCTCA 3070 het 3070 ref 39 24 15 3 AGACATGCTT 1 0 360414 CASAVA_Build 8 69500519 1I TTTTGGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 A 13 14 360415 CASAVA_Build 8 69541303 6D ATATTTGTAG AAATAA/------ AAATAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 16 18 4 AAATAA 3 2 360416 CASAVA_Build 8 69542250 2D AAAAATTTTT AG/-- AGACTTCTCT 3070 het 3070 ref 39 20 18 3 AG 2 1 360417 CASAVA_Build 8 69557775 1I ACAATTGGCA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 46 17 20 9 T 7 8 360418 CASAVA_Build 8 69559597 1D ATAAGAAGTT A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 8 7 360419 CASAVA_Build 8 69562257 1D TGTGGATGGT G/- GGGGAAGGAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 G 5 4 360420 CASAVA_Build 8 69563114 1D GCAAAATAAC T/- TCATAACACT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 T 2 1 360421 CASAVA_Build 8 69563778 1I CGAATTTACG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 14 25 4 T 9 10 360422 CASAVA_Build 8 69566032 1D TTTTTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 1190 het 1190 ref 30 22 3 5 T 12 11 360423 CASAVA_Build 8 69568084 4D AAAACTAATT ACTC/---- AATTAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 ACTC 1 0 360424 CASAVA_Build 8 69578476 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1777 het 1777 ref 43 23 6 14 T 15 16 360425 CASAVA_Build 8 69584341 1D GAGGTGTGTG T/- TCTCATAGTA 3070 hom 50 het 22 0 17 5 T 2 1 360426 CASAVA_Build 8 69600572 3I TAGCCATGCT ---/TCA TCATCACAGT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 TCA 2 3 360427 CASAVA_Build 8 69615635 1D CGTCTCAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 24 0 21 4 A 10 9 360428 CASAVA_Build 8 69627629 5I TTTTATTCTT -----/TATTC TATTAATATG 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 TATTC 0 1 360429 CASAVA_Build 8 69628674 1I AAGTTTTATG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 8 9 360430 CASAVA_Build 8 69642521 1D GTCTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1072 het 1072 ref 17 10 4 4 T 12 11 360431 CASAVA_Build 8 69646353 1D TGTTGTTGGT G/- GGTTGAGTTC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 G 3 2 360432 CASAVA_Build 8 69664247 4D AGAATGAAAG AGAA/---- AGAAAGAAGA 2991 het 2676 hom 21 10 8 4 AGAA 3 2 360433 CASAVA_Build 8 69664363 1D AGAGAAAGGT G/- GGGGAAGGAA 264 het 264 ref 19 11 2 6 G 5 4 360434 CASAVA_Build 8 69667022 13I TAATTTTTTA -------------/GATTCACAAAAAT TTCCTTATGG 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 GATTCACAAAAAT 0 1 360435 CASAVA_Build 8 69672897 1D CCTCCTTCCT C/- ACTCCTACCC 3070 het 3070 hom 50 22 25 4 C 1 0 360436 CASAVA_Build 8 69676538 2D CTTGGGTGTC TT/-- TTCTCATTCA 3070 het 3070 hom 32 11 17 5 T 4 2 360437 CASAVA_Build 8 69699485 10D AAATAGCGAT ACAGCAGCGA/---------- ATATAGACAG 3070 het 3070 ref 36 20 13 10 ACAGCAGCGA 1 0 360438 CASAVA_Build 8 69708662 1D CTTGTAGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2870 hom 37 11 19 7 T 12 11 360439 CASAVA_Build 8 69724847 1I TATATTTTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 10 11 360440 CASAVA_Build 8 69733115 2D TGAGCTATCC AT/-- TACTGTTCCA 3070 het 3070 ref 44 22 17 7 AT 1 0 360441 CASAVA_Build 8 69736755 6D TTGAGTCTAT AAAATA/------ AATTGACAGT 3070 het 3070 ref 45 22 21 4 AAAATA 1 0 360442 CASAVA_Build 8 69740610 3D GTATCGTCAC TTA/--- TTATTGATTT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 TTA 2 1 360443 CASAVA_Build 8 69752398 1I CACCTGCCTT -/G GCCTAACAAA 3025 het 3025 ref 23 13 9 1 G 1 2 360444 CASAVA_Build 8 69753010 1I CTATGGTCCA -/G TATTACCCTG 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 G 0 1 360445 CASAVA_Build 8 69862421 1I CAACTTCTGT -/A AAAAAAAAAA 818 het 818 ref 46 31 3 12 A 13 14 360446 CASAVA_Build 8 69869204 1D AAGCAATCCT C/- CCCTCCCTGC 2523 het 25 hom 7 1 6 0 C 4 3 360447 CASAVA_Build 8 69878605 1D CAGTGGGTCA T/- TTTTTTTTAA 1314 het 1314 ref 32 25 3 4 T 9 8 360448 CASAVA_Build 8 69916024 2D TCTCTTTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 1107 het 1107 ref 45 29 3 14 TG 8 7 360449 CASAVA_Build 8 69990551 1I ACTGAAGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2796 hom 37 10 16 11 A 11 12 360450 CASAVA_Build 8 70046831 1D ACTTTTAAAC A/- AACACATTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 3 2 360451 CASAVA_Build 8 70072591 39I TTTTTAAAAA ---------------------------------------/AGGGTACTGAGAGATATATTAAAATTCCCCAGTTTGATT ATAGGTTTGC 3070 hom 93 het 30 0 31 6 AGGGTACTGAGAGATATATTAAAATTCCCCAGTTTGATT 0 1 360452 CASAVA_Build 8 70077920 1D TGTAATAGTC A/- GTGAAAAAGT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 0 360453 CASAVA_Build 8 70089882 1I ATTAATTTCA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 7 8 360454 CASAVA_Build 8 70101987 1D TCTTTGGGGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 59 het 27 0 18 10 A 9 8 360455 CASAVA_Build 8 70102866 4D AAATTTCAAC AAAT/---- AAACTGTGAT 3070 hom 78 het 29 0 27 3 AAAT 1 0 360456 CASAVA_Build 8 70107249 2D GTCTTCTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 19 1 15 3 A 14 12 360457 CASAVA_Build 8 70139227 4D TATGAACTAA ATCT/---- ATCTATCTAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 ATCT 6 5 360458 CASAVA_Build 8 70148286 11D AGACTCTGTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2885 hom 25 het 13 0 10 5 A 25 14 360459 CASAVA_Build 8 70150421 1D TGTGTATGTG A/- AAAAAAAAAA 1135 het 1135 ref 47 40 3 4 A 11 10 360460 CASAVA_Build 8 70154408 1D TTTATTTAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 36 0 28 8 A 10 9 360461 CASAVA_Build 8 70157903 1D ACTGGCAGAA G/- GTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 40 17 14 9 G 2 1 360462 CASAVA_Build 8 70183955 1D CAAAAAGGGG A/- AAAAAATATA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 7 6 360463 CASAVA_Build 8 70189605 4I ATACCTGCAG ----/CTAA CTAACTAGCA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 CTAA 1 2 360464 CASAVA_Build 8 70195772 1D CCATGAGAGC A/- AGTCAGTTCT 3070 hom 120 het 50 0 40 10 A 2 1 360465 CASAVA_Build 8 70196425 2D TGCTATAAAC AT/-- GTGTGTGCAA 3070 hom 90 het 32 0 31 2 AT 1 0 360466 CASAVA_Build 8 70197474 1I TTTTTTTTTT -/C GTTATGTGAA 3070 het 332 hom 40 1 35 4 C 0 1 360467 CASAVA_Build 8 70198698 3D GGGCTATGGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 34 16 12 8 TTG 5 4 360468 CASAVA_Build 8 70200298 1I CTGAATATGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 181 hom 44 3 34 7 T 10 11 360469 CASAVA_Build 8 70211955 1D ATGTGAAAGC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 123 het 44 0 42 2 A 9 8 360470 CASAVA_Build 8 70216502 4D CAATTTTTAT TGAG/---- TATTTTTTTC 3070 het 3070 ref 30 14 13 4 TGAG 1 0 360471 CASAVA_Build 8 70223930 1I TAATTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 27 hom 24 1 20 3 T 9 10 360472 CASAVA_Build 8 70226138 1D GACTGTGAAT G/- GAATTCTAGC 3070 hom 129 het 45 0 44 2 G 2 1 360473 CASAVA_Build 8 70226356 1D CTTTTCTTAA G/- GGGGGAAGGC 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 G 6 5 360474 CASAVA_Build 8 70228972 6I TGCAAGCACG ------/GCTAAA GCTAAACTCC 3070 het 3070 ref 42 20 12 10 GCTAAA 1 2 360475 CASAVA_Build 8 70230437 5D CCTCTTTTTT TCTTC/----- TTTTCATTCT 3070 het 3070 hom 37 13 21 5 TCTTC 1 0 360476 CASAVA_Build 8 70230852 3D GTTTACTATG TAA/--- TAATGTACAA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 TAA 2 1 360477 CASAVA_Build 8 70236019 1I TAATATCTTA -/T TTGCTTGTTA 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 2 3 360478 CASAVA_Build 8 70237504 1D TTCTTGAGAT A/- AGAGTCTTGC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 2 1 360479 CASAVA_Build 8 70238010 1I GGTTTTATTC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 T 8 9 360480 CASAVA_Build 8 70240843 1I GTCTTTTTTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 26 5 A 0 1 360481 CASAVA_Build 8 70243162 2I TTGTTGAATG --/CA CAGACTCCCT 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 CA 1 2 360482 CASAVA_Build 8 70247629 5I TCTTATTGCC -----/TTCTT TTGTGTTTTG 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 TTCTT 0 1 360483 CASAVA_Build 8 70255695 4D TGAAGGTATA TTCT/---- TTAACTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 16 3 TTCT 1 0 360484 CASAVA_Build 8 70257817 1I CTGAACAAAA -/G GGAGAGAGCA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 G 2 3 360485 CASAVA_Build 8 70273321 4D CTGCAGCAAT TAAA/---- ACAGTATGGT 3070 het 3070 ref 35 23 12 1 TAAA 1 0 360486 CASAVA_Build 8 70280226 1I ACAGAGCAAG -/A ACTGTCTCAA 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 A 1 2 360487 CASAVA_Build 8 70303482 11D AATTGTATTT AAATAATATAA/----------- AAATAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 15 19 4 AAATAATATAA 1 0 360488 CASAVA_Build 8 70303861 1I AAAACTTAGG -/A AAAAAATTTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 6 7 360489 CASAVA_Build 8 70310942 6D TTACATTTAC ATTTAT/------ ATTTTATGCC 3070 het 3070 hom 32 16 14 5 ATTTAT 1 0 360490 CASAVA_Build 8 70314346 1D GTTTAAATAA T/- TTTTCTCCAA 3070 het 3070 hom 48 17 27 5 T 5 4 360491 CASAVA_Build 8 70317872 2D AAAATGATAA GT/-- GTTTGAGGTG 3070 het 3070 hom 43 18 23 3 GT 2 1 360492 CASAVA_Build 8 70338786 1D GATACACACA C/- ACACATACTC 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 C 1 0 360493 CASAVA_Build 8 70339453 3D TTGGAGCTAA CAG/--- CAGCAGCCTT 3070 hom 105 het 39 0 35 8 CAG 3 2 360494 CASAVA_Build 8 70339758 1D AAGAATTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 T 10 9 360495 CASAVA_Build 8 70342898 1I CCCAAGTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 23 5 T 10 11 360496 CASAVA_Build 8 70344330 1I AGACATTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 40 1 33 6 T 10 11 360497 CASAVA_Build 8 70344572 1D TCCCAAAACC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 7 6 360498 CASAVA_Build 8 70351459 1D AATGGTGGGG A/- AAAAAAACCC 3070 hom 103 het 43 0 34 9 A 8 7 360499 CASAVA_Build 8 70366090 1I GGAGATCTCA -/G CGCTACAAAA 3070 hom 87 het 31 0 29 2 G 0 1 360500 CASAVA_Build 8 70382054 1D CCGTAAGCAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 40 0 34 7 A 10 9 360501 CASAVA_Build 8 70383577 2I CTGGAATATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 42 1 32 9 T 12 14 360502 CASAVA_Build 8 70386543 1I TTTTGAAAAA -/G GGAATAAAAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 G 2 3 360503 CASAVA_Build 8 70437589 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 8 7 360504 CASAVA_Build 8 70439100 4I52M1D GTGTGTGTGT ----GAGAGAGAGAGAGAATGTGAGTGTGTGTGGGTGTGTGTGGGTGTAGGCTAAGA/GAGAGAGAGAGAGAGAGAATGTGAGTGTGTGTGGGTGTGTGTGGGTGTAGGCTAAG- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 25 0 17 27 N/A 0 0 360505 CASAVA_Build 8 70441151 1I ATAATTGAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 114 het 39 0 39 0 T 9 10 360506 CASAVA_Build 8 70441573 3D CTTCAGGAAA TGT/--- TGTTCGTGAC 3070 hom 101 het 36 0 34 4 TGT 2 1 360507 CASAVA_Build 8 70443383 1D TGTATCTTTA G/- GTTTTCATTC 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 2 1 360508 CASAVA_Build 8 70457056 3I CTCCAAATGC ---/CAA CAACACCTCT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 CAA 1 2 360509 CASAVA_Build 8 70463014 4D TTCTTTTGGA GAGT/---- GAGTATTAGT 3070 hom 90 het 38 0 31 10 GAGT 2 1 360510 CASAVA_Build 8 70488070 1I AGCACATTAA -/T AAAAACTATA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 T 0 1 360511 CASAVA_Build 8 70495452 1D ATAAAGCATC T/- TGTGCAAGTT 3070 hom 114 het 43 0 39 6 T 2 1 360512 CASAVA_Build 8 70496573 1D CATTTCTGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 10 9 360513 CASAVA_Build 8 70498015 2D TACATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 72 het 28 0 25 5 TA 7 6 360514 CASAVA_Build 8 70508219 1D CCCAGAACTT A/- AAAAAAAAAA 2972 hom 30 het 19 0 10 9 A 13 12 360515 CASAVA_Build 8 70508263 1D GAGAAAAAAA G/- GAAGGGGAGA 3070 hom 39 het 17 0 12 5 G 2 1 360516 CASAVA_Build 8 70509441 3I CCACATGCAA ---/AAT AATAAAACCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAT 1 2 360517 CASAVA_Build 8 70511253 1I AAGATAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 9 10 360518 CASAVA_Build 8 70531281 1I TCCAAGGTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 9 10 360519 CASAVA_Build 8 70534082 1I GATGGTTTTA -/C CCCCCTTAAA 3070 hom 89 het 33 0 29 4 C 5 6 360520 CASAVA_Build 8 70534849 1D AGGGGTGCCC T/- TTTTTTTAAG 3070 hom 44 het 22 0 15 9 T 8 7 360521 CASAVA_Build 8 70535710 4I TTGAGGCCTA ----/AAAG AAAGAAACTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AAAG 1 2 360522 CASAVA_Build 8 70536220 1I TGGCTATAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 257 hom 34 1 28 5 A 10 11 360523 CASAVA_Build 8 70539474 1I CATCCTTGTA -/T TTTTTTATTT 3070 hom 135 het 49 0 46 3 T 6 7 360524 CASAVA_Build 8 70542777 1D ATTTATAGTA T/- TAAAAAAAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 3 T 2 1 360525 CASAVA_Build 8 70546190 1D ACAGGAAACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 184 hom 33 2 21 10 A 13 12 360526 CASAVA_Build 8 70550205 1I CAAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 10 11 360527 CASAVA_Build 8 70585410 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 20 2 16 2 T 14 13 360528 CASAVA_Build 8 70591176 1D CTACACACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 365 hom 42 2 31 10 A 12 11 360529 CASAVA_Build 8 70598960 1I AGGGACAGAG -/A AAGAAAAGCA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 2 3 360530 CASAVA_Build 8 70610282 1I AGCAAAGAGG -/A AAAAATTATT 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 A 5 6 360531 CASAVA_Build 8 70612712 1I TAGAAAATTG -/A AAAAAAAAGT 2973 het 2973 ref 20 9 9 2 A 8 9 360532 CASAVA_Build 8 70615712 5D TAACTTCACT CTAAA/----- CTAACCCAAA 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 CTAAA 1 0 360533 CASAVA_Build 8 70629173 5I TATTTTACAT -----/ATAAG ATAAGTAACA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 ATAAG 1 2 360534 CASAVA_Build 8 70629450 2I TAGCCTTTCT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 2912 hom 19 9 9 1 A 9 11 360535 CASAVA_Build 8 70644703 1D GTTTGGGTAG A/- AAAAAAAATA 2372 het 2372 ref 23 11 5 7 A 9 8 360536 CASAVA_Build 8 70654354 1D ACACACACAC A/- AAAAAAAAAA 1705 het 1705 ref 32 19 5 9 A 15 14 360537 CASAVA_Build 8 70675828 1D CAATAAAGAA T/- TGATGGAGCT 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 T 2 1 360538 CASAVA_Build 8 70702216 1I GAAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 A 11 12 360539 CASAVA_Build 8 70744605 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 4 A 13 12 360540 CASAVA_Build 8 70757285 1I TCAACAATTA -/T TTTTGTGACT 3070 hom 132 het 48 0 44 4 T 4 5 360541 CASAVA_Build 8 70758357 2D AAGACTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 24 10 T 13 11 360542 CASAVA_Build 8 70759591 3D AAGCCAAGAA CTC/--- CTCCTAGCTG 3070 hom 117 het 43 0 40 5 CTC 2 1 360543 CASAVA_Build 8 70761834 5I AAGATATTGG -----/TGTGC TATCTTTCCG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 TGTGC 0 1 360544 CASAVA_Build 8 70772757 1D ATCACTCAGG T/- AATCAGCACA 3070 het 3070 hom 57 25 24 8 T 1 0 360545 CASAVA_Build 8 70774357 1D CACACACAGC A/- AACTGCTCAG 3070 hom 111 het 47 0 37 11 A 3 2 360546 CASAVA_Build 8 70783350 2D ACACTGTTTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 26 0 22 6 A 15 13 360547 CASAVA_Build 8 70785802 1D CTTCATACTG T/- CCCCCCCACT 3070 hom 66 het 24 0 22 3 T 1 0 360548 CASAVA_Build 8 70786690 1D ATTATCTGCC T/- AATATTATGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 1 0 360549 CASAVA_Build 8 70787661 1D TGATTTGCTC A/- TTAATTTCCA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 1 0 360550 CASAVA_Build 8 70791572 1D GTGTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 28 1 18 10 T 15 14 360551 CASAVA_Build 8 70795966 11D AGACATAATA ACTGGACTGCC/----------- ACTTTGGACT 3070 hom 87 het 31 0 29 6 ACTGGACTGCC 1 0 360552 CASAVA_Build 8 70810506 1I TAATGCATGT -/G GGGGCTTAAT 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 G 4 5 360553 CASAVA_Build 8 70813174 2I TTTTCTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 11 11 T 12 14 360554 CASAVA_Build 8 70824542 1D AAAAAAAAAA C/- ATTCCTGTCT 3070 het 3070 hom 37 13 18 8 C 1 0 360555 CASAVA_Build 8 70827429 1D CATTTTTAGC A/- AAAACATTTT 2242 het 2242 ref 20 10 8 2 A 5 4 360556 CASAVA_Build 8 70832571 10D GTCCTTACCC ATCAGGCACT/---------- ATCAGGCACT 3070 hom 51 het 23 0 16 8 ATCAGGCACT 2 1 360557 CASAVA_Build 8 70844109 7D CTAGGTTAGA CAGACTT/------- CAGACTTTGA 3070 het 3070 ref 47 24 19 10 CAGACTT 2 1 360558 CASAVA_Build 8 70854833 1D CAGGCATATG A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 39 20 16 4 A 7 6 360559 CASAVA_Build 8 70882888 1I TGAACACTTA -/G GTTGTTTCCA 3070 hom 90 het 32 0 29 3 G 1 2 360560 CASAVA_Build 8 70887987 1D TTCTCTTTAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 10 9 360561 CASAVA_Build 8 70888864 1I AAACTACAAG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 A 7 8 360562 CASAVA_Build 8 70890312 2D TCTTGATGTC CA/-- GTTACTTCAT 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 CA 1 0 360563 CASAVA_Build 8 70903052 3D GCATTCATCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 11 5 T 14 11 360564 CASAVA_Build 8 70905942 4I CCCAGCTACT ----/CGGG CGGGGGCTGA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 CGGG 1 2 360565 CASAVA_Build 8 70906055 1D TCTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 31 1 21 9 A 14 13 360566 CASAVA_Build 8 70911978 1I AACCTATGGA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 T 7 8 360567 CASAVA_Build 8 70947778 1I AGCTCCGCCT -/C CCGAGCTCAC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 2 3 360568 CASAVA_Build 8 70950530 4D AAAGAGAGGG AGGA/---- AGGAAGGAAG 2562 het 304 hom 18 2 11 5 AGGA 6 5 360569 CASAVA_Build 8 70973380 1D GGCTGGTCTC A/- AAACTCCTGG 3070 hom 92 het 33 0 31 2 A 4 3 360570 CASAVA_Build 8 70992206 1I TGAAACAAGG -/T TTTGCTCTGT 3070 hom 51 het 19 0 17 2 T 3 4 360571 CASAVA_Build 8 71039066 5D CTCCCAGGTT CAAGC/----- CAAGCAATTC 3070 het 3070 hom 28 11 15 4 CAAGC 2 1 360572 CASAVA_Build 8 71054592 1I TTTGCAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 9 16 14 A 12 13 360573 CASAVA_Build 8 71070772 1I TTGAATTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 12 9 T 12 13 360574 CASAVA_Build 8 71073682 4I AAACAAAACA ----/AAAT AAATAAACAA 3070 het 2982 hom 32 9 20 3 AAAT 1 2 360575 CASAVA_Build 8 71081716 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 1888 hom 14 5 8 1 T 9 8 360576 CASAVA_Build 8 71085643 1D TCGTCCCAGC T/- TACTCAAGAG 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 2 1 360577 CASAVA_Build 8 71089595 3D TCTCCTTCTC CTT/--- CTTCTTCTTT 3070 hom 85 het 34 0 26 8 CTT 4 3 360578 CASAVA_Build 8 71092491 1D TTATTTAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 44 het 21 0 15 6 A 10 9 360579 CASAVA_Build 8 71105555 10D CAGAGAGAGG TTATTTTATT/---------- TTATTTTATT 3070 het 523 hom 16 4 7 5 TTATT 6 4 360580 CASAVA_Build 8 71117459 3D8M2I GTCACACCAG CCACATGTCAC--/---CTTTTGACTG ACCAGCCATA 3070 hom 99 het 36 0 31 5 N/A 0 0 360581 CASAVA_Build 8 71118856 1I TAGAGATGCC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 A 8 9 360582 CASAVA_Build 8 71120518 4D GGAGTTTGAG AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 4 AATA 6 5 360583 CASAVA_Build 8 71124473 4I TGAGATGGAG ----/TCTC TCTCTGTCAC 3070 hom 51 het 23 0 15 8 TC 2 4 360584 CASAVA_Build 8 71128113 3D58M4D CTTACTGGTT TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTAATTTAAACTTTTTGAGATGGTTTGTAGGTTTGTTTTATTTG/---TTCTTCTTCTTCTTCTTTTTAATTTAAACTTTTTGAGATGGTTTGTAGGTTTGTTTTA---- TTTGTTTGTT 3070 hom 66 het 28 0 23 19 N/A 0 0 360585 CASAVA_Build 8 71129438 19D CTCCCAAGTA GCTGGGATTACAGGAACGT/------------------- GCCACCATGC 2998 hom 27 het 9 0 8 5 GCTGGGATTACAGGAACGT 1 0 360586 CASAVA_Build 8 71130299 2D AATTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 42 1 37 4 T 14 12 360587 CASAVA_Build 8 71158301 1D GATTTTAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 25 1 15 9 T 11 10 360588 CASAVA_Build 8 71205976 1D TGACATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 44 0 38 8 T 10 9 360589 CASAVA_Build 8 71217659 3D TCTAGAAAGC AAA/--- AAAGAGAATG 3070 hom 36 het 13 0 13 1 A 6 3 360590 CASAVA_Build 8 71220114 12I GCCCGGCTAA ------------/TTTTTTCTTTCT TTTTTTCTTT 3070 hom 31 het 14 0 9 5 TTTTTTCTTTCT 0 1 360591 CASAVA_Build 8 71250658 1I ACCTTAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 27 3 13 11 T 13 14 360592 CASAVA_Build 8 71272626 1D TCTCTAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1014 hom 29 3 17 10 T 15 14 360593 CASAVA_Build 8 71281083 2I CTGTGTCCAG --/CT CTCTGTCATT 3070 hom 135 het 48 0 45 3 CT 2 3 360594 CASAVA_Build 8 71291675 2I CCAGTAATTA --/AC ACATTGTTTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 AC 1 2 360595 CASAVA_Build 8 71301450 2D TTTAATTATT TA/-- TATATATATA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 TA 10 9 360596 CASAVA_Build 8 71307899 1D CTGTACTCCC A/- AGCTACTCAG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 2 1 360597 CASAVA_Build 8 71312216 2D AGTATTTTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1014 het 780 hom 24 4 3 17 T 16 14 360598 CASAVA_Build 8 71313225 4D GAAGTTACAT GACC/---- GACCTCTCCA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 GACC 2 1 360599 CASAVA_Build 8 71318581 1I TAAAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 974 het 974 ref 32 16 5 11 A 17 18 360600 CASAVA_Build 8 71323560 1D AAGTCTGCAC A/- TGTTCAGTAC 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 1 0 360601 CASAVA_Build 8 71354875 2I ATTAAGAGAC --/TA TATACCTACC 3070 het 3070 ref 54 22 22 10 TA 2 3 360602 CASAVA_Build 8 71415872 1D TAAAAAGTTG A/- AAAAAAAAAA 2151 het 2151 ref 28 11 7 10 A 15 14 360603 CASAVA_Build 8 71444667 1D CTCATTAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 T 12 11 360604 CASAVA_Build 8 71452693 4D CAAGTCTGAT AGTC/---- AGTACTCCAG 3070 het 3070 hom 39 18 21 2 AGTC 1 0 360605 CASAVA_Build 8 71472251 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 1363 het 1363 ref 18 9 4 6 A 17 16 360606 CASAVA_Build 8 71515845 2D26M4I AAGAAAAGAA AGAGAGAAAGAAAGAAGAAAGGAAAGAG----/--AGAGAAAGAAAGAAGAAAGGAAAGAGAGAA AGAGGAAAGA 3070 het 14 hom 23 1 21 9 N/A 0 0 360607 CASAVA_Build 8 71516190 3I AAAGAAAGAA ---/AAG AAGAAGAGAG 3070 hom 33 het 23 0 19 4 AAG 2 3 360608 CASAVA_Build 8 71518018 2D TAGCTGGGTG GT/-- GGGGGGCGCA 3070 hom 44 het 18 0 15 4 GT 1 0 360609 CASAVA_Build 8 71520830 1I GTAATTCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1392 hom 53 4 34 15 T 11 12 360610 CASAVA_Build 8 71522927 1D CCTGAACAAA G/- GGATAAAATG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 G 3 2 360611 CASAVA_Build 8 71523595 1D GTTGCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 31 0 19 12 T 15 14 360612 CASAVA_Build 8 71524795 1I AATATATACC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 140 hom 33 2 28 3 T 8 9 360613 CASAVA_Build 8 71537693 1I TTTATGATAT -/C CCCTTTATCA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 3 4 360614 CASAVA_Build 8 71551583 1I AGATTATTTC -/T TTTTTTGCCT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 6 7 360615 CASAVA_Build 8 71563443 1D GTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 A 11 10 360616 CASAVA_Build 8 71584964 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2271 hom 21 het 11 0 6 5 T 10 11 360617 CASAVA_Build 8 71591393 1I ATAGTATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 29 5 T 10 11 360618 CASAVA_Build 8 71597087 1I GAAATATACT -/C TATCGCTTGA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 C 0 1 360619 CASAVA_Build 8 71598123 1I ACCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 28 0 20 8 A 11 12 360620 CASAVA_Build 8 71620441 2I TCAAGGAATT --/TG TCTTAGTTCA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TG 0 1 360621 CASAVA_Build 8 71645387 3I GCAAGAAAAA ---/AAC AATTCCATCA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AAC 0 1 360622 CASAVA_Build 8 71645553 1D GGCCATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 A 12 11 360623 CASAVA_Build 8 71661068 1I GTTGTGGGGT -/G GGGGGAGGGG 2738 hom 18 het 7 0 7 0 G 5 6 360624 CASAVA_Build 8 71678093 12D TATGTTTTAT ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 2332 het 1090 hom 25 5 6 16 AC 15 9 360625 CASAVA_Build 8 71679029 3I TCATAAATAC ---/AAT AACATTTCTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 AAT 0 1 360626 CASAVA_Build 8 71693121 1D CAATTACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 11 10 360627 CASAVA_Build 8 71700048 1I GCCCACCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2792 hom 27 10 14 3 T 13 14 360628 CASAVA_Build 8 71706864 1D AACAAAACAC T/- TAGTATTGGC 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 2 1 360629 CASAVA_Build 8 71713450 1I AAAAAATTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 168 hom 26 1 19 6 T 9 10 360630 CASAVA_Build 8 71716566 7D GTACACATTA ATATTAT/------- ATATTATATA 3070 het 3070 ref 40 20 18 4 ATATTAT 2 1 360631 CASAVA_Build 8 71718307 1D AGTTGATATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 T 10 9 360632 CASAVA_Build 8 71719837 2I GTTTACATCA --/TT TTTTATATAT 3070 het 1645 hom 33 6 25 2 T 4 6 360633 CASAVA_Build 8 71721406 1I CAATTTTCAG -/T TTTTTGTTGA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 T 5 6 360634 CASAVA_Build 8 71722740 1I ACAATATACT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 360635 CASAVA_Build 8 71727691 7I CATGATTCTA -------/TGATAAC TGTGATAAAC 3070 hom 129 het 51 0 44 7 TGATAAC 0 1 360636 CASAVA_Build 8 71737485 1I GATCCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 10 11 360637 CASAVA_Build 8 71738396 1D2M1D AACCACCAGG ATAT/-TA- TTGTTAAACA 3070 het 3070 hom 46 20 25 5 N/A 0 0 360638 CASAVA_Build 8 71756218 3D CAAAGATCCC TTA/--- TTTGCATGAA 3070 het 3070 hom 33 13 18 4 TTA 1 0 360639 CASAVA_Build 8 71757460 1D TCTAGGGAAC T/- TGAGAGTATG 3070 het 3070 ref 51 26 17 9 T 2 1 360640 CASAVA_Build 8 71759363 4D TATTTAATTG GTCT/---- GTCTTAATTT 3070 het 3070 ref 21 11 10 1 GTCT 2 1 360641 CASAVA_Build 8 71761878 1I CATTAACCAT -/C CCCACTTCTG 3070 het 3070 ref 49 30 13 6 C 3 4 360642 CASAVA_Build 8 71764233 2D CATATTGCAA AT/-- ATATATATAT 2066 het 1970 hom 18 6 6 6 AT 8 7 360643 CASAVA_Build 8 71766818 3I ATGATATTGA ---/TTC TTCTTATTTA 3070 het 2669 hom 22 8 12 2 TTC 1 2 360644 CASAVA_Build 8 71767196 1I ATGCCCTTTG -/T TTTTTTTTTC 2221 het 2221 ref 22 11 6 5 T 9 10 360645 CASAVA_Build 8 71777957 1D TTTCCAAGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 T 10 9 360646 CASAVA_Build 8 71781649 3D CTTTTTCCAA ATT/--- ATTATGTGTA 3070 het 3070 ref 40 20 14 7 ATT 2 1 360647 CASAVA_Build 8 71782397 3D GTTAATTTAG GTT/--- GTTTCTTATA 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 GTT 2 1 360648 CASAVA_Build 8 71788459 3D CTATGTGGTT AAG/--- AAGAAGAATG 3070 het 3070 ref 30 15 13 3 AAG 3 2 360649 CASAVA_Build 8 71791223 1D GGGCTGCGGT G/- GGGGGCCTTA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 G 6 5 360650 CASAVA_Build 8 71800277 1D AGAAGAGTTG A/- TAGTGATTTC 3070 het 3070 ref 32 14 13 6 A 1 0 360651 CASAVA_Build 8 71802117 1D AGAAGACAAG T/- TTTTTTTTTT 2622 het 1771 hom 19 6 8 6 T 15 14 360652 CASAVA_Build 8 71805377 1I TTTTTTTTTT -/A AAATAAGATT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 A 3 4 360653 CASAVA_Build 8 71806114 1I TTTCATATGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 T 10 11 360654 CASAVA_Build 8 71813863 2I ATGAGGTGTT --/AA AGTCTCCCAT 1405 het 1405 ref 12 8 3 1 A 1 3 360655 CASAVA_Build 8 71816755 1D TTGTATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 12 11 360656 CASAVA_Build 8 71819100 1D ACTTCGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1679 hom 27 4 18 8 A 12 11 360657 CASAVA_Build 8 71823663 4I CAGCCAGACT ----/CACA CAGACATTGG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 CA 1 3 360658 CASAVA_Build 8 71832975 16D ACCCCTGCCC CTACGTTGTTAAGCCT/---------------- CTGATGTCGT 3070 het 3070 ref 29 20 13 3 CTACGTTGTTAAGCCT 1 0 360659 CASAVA_Build 8 71836690 1I CCAGTTTCAA -/T TTTTTTTTTG 1636 het 1369 hom 18 6 5 7 T 9 10 360660 CASAVA_Build 8 71837964 2D TTAAGGGGTC TT/-- TGATAGTATA 3070 het 3070 hom 37 19 18 0 T 3 1 360661 CASAVA_Build 8 71843542 2D AAACCCCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2464 hom 26 10 8 9 T 14 12 360662 CASAVA_Build 8 71848785 1D TACTTTTCAA T/- TTTTCTTTGT 3070 het 3070 ref 49 26 21 2 T 5 4 360663 CASAVA_Build 8 71856932 1I GAAACATGTA -/G GGAATGTGAA 3070 het 3070 ref 52 29 18 5 G 2 3 360664 CASAVA_Build 8 71859200 1D AGTGTACAGA T/- TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 T 8 7 360665 CASAVA_Build 8 71860356 1I TAGTTTCTTC -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 T 7 8 360666 CASAVA_Build 8 71863320 1D CAGCGCAGAT G/- TTCATAAATT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 G 1 0 360667 CASAVA_Build 8 71864519 7I TTTTAGTTAA -------/TAAATTC TAAAACAGAA 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 TAAATTC 0 1 360668 CASAVA_Build 8 71873207 5D TTTTTGCTTG TTAAT/----- TTAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 39 28 8 7 TTAAT 1 0 360669 CASAVA_Build 8 71889953 1I TATTCATTTA -/T TTTTTAATTT 3070 het 3053 hom 21 7 12 2 T 5 6 360670 CASAVA_Build 8 71891526 12I GATTCTCATC ------------/AAAATATTAGCA AACCAAACCC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 AAAATATTAGCA 0 1 360671 CASAVA_Build 8 71892986 1D TGTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 11 10 360672 CASAVA_Build 8 71901252 5I GACATCAGTT -----/TAATC TAATTAAAGC 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 TAATC 0 1 360673 CASAVA_Build 8 71904096 6I GAACATTTAA ------/ACTGGC TATGACTATT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 ACTGGC 0 1 360674 CASAVA_Build 8 71924775 1D ATAGCCTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1654 hom 18 8 10 0 A 12 11 360675 CASAVA_Build 8 71931280 1D TAGAGACCTA C/- AAAGAGACTT 2200 het 446 hom 6 1 5 0 C 1 0 360676 CASAVA_Build 8 71936278 1I TGTGTCTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 14 8 A 12 13 360677 CASAVA_Build 8 71940257 1I TCACTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 12 10 A 10 11 360678 CASAVA_Build 8 71983000 1D TAAACTTTTA C/- CTGACTATCA 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 C 2 1 360679 CASAVA_Build 8 72005938 1I AAGCTTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 10 13 A 15 16 360680 CASAVA_Build 8 72013762 1D AGAGGTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1848 hom 34 10 11 13 T 13 12 360681 CASAVA_Build 8 72017854 1I TTTTTATTAG -/C CAAATTAATA 2207 het 2207 ref 21 14 5 2 C 1 2 360682 CASAVA_Build 8 72018932 1I TCCCCCCGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 A 10 11 360683 CASAVA_Build 8 72020371 1D CTAATCGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 10 9 360684 CASAVA_Build 8 72025469 1D CTATTCTTTG T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 T 7 6 360685 CASAVA_Build 8 72026684 1D CCTTGTAGGA C/- CCCCCCAGTG 3070 hom 41 het 18 0 13 6 C 7 6 360686 CASAVA_Build 8 72035039 1D CGTCCCCCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 A 12 11 360687 CASAVA_Build 8 72043362 1D CTTTGTGGGC T/- TTAATGATCT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 3 2 360688 CASAVA_Build 8 72048077 2I CTTCTGTATT --/TC TGTGGTATTA 3070 het 3070 hom 30 8 19 4 TC 0 1 360689 CASAVA_Build 8 72066715 1D GTTGACTTCT C/- CCTACATCCA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 3 2 360690 CASAVA_Build 8 72070795 1I CTACCTTCTA -/T TTGTATGTAT 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 T 2 3 360691 CASAVA_Build 8 72078091 1I GCAAATGAGT -/G GGGGGGAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 16 10 G 6 7 360692 CASAVA_Build 8 72081122 1D ATTTAAAAAA G/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 17 13 4 G 1 0 360693 CASAVA_Build 8 72084188 3I CCCAAGAGAA ---/TTC TTCTTCTTCC 3070 het 3070 hom 53 19 26 8 TTC 3 4 360694 CASAVA_Build 8 72086825 1I CTATAGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 15 13 7 A 9 10 360695 CASAVA_Build 8 72090567 1D ATTAGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 A 12 11 360696 CASAVA_Build 8 72090886 1D TGGCATTAAA T/- TTGTATAGGA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 T 3 2 360697 CASAVA_Build 8 72091627 2D TCATATGCTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 11 9 360698 CASAVA_Build 8 72099934 16I AAAGTGGCAT ----------------/AGCTAGTAAATGGCAG AGCTGCCGTA 3070 het 3070 hom 40 17 17 6 AGCTAGTAAATGGCAG 0 1 360699 CASAVA_Build 8 72128426 1D AGTTTGTGGT A/- AGTAATACCT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 2 1 360700 CASAVA_Build 8 72132577 8I GCCCTTTAAA --------/TATAATTT TATAATTTAG 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 TATAATTT 1 2 360701 CASAVA_Build 8 72141470 1I ATACATACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 T 9 10 360702 CASAVA_Build 8 72148577 1D TTGGCCTCCT A/- AAAGTTCTGG 3070 hom 105 het 41 0 36 7 A 4 3 360703 CASAVA_Build 8 72150430 1D13M35I TTAAAAATTG TTTTTTTATCTATC-----------------------------------/-TTTTTTATCTATCTTGTGTTTCTTTTGGTCCTCTTTTACTTTCTTCTT GTCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 29 19 18 4 N/A 0 0 360704 CASAVA_Build 8 72157885 6I TCATTTTGAA ------/GAATAG GAATAGTCTC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 GAATAG 1 2 360705 CASAVA_Build 8 72164294 1I GAATACTGTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 9 10 360706 CASAVA_Build 8 72173699 2D TAGATTATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 14 12 360707 CASAVA_Build 8 72178242 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAACAA 3070 het 2332 hom 22 5 13 4 A 7 8 360708 CASAVA_Build 8 72180970 1I AGCCCACAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 63 het 22 0 22 0 T 8 9 360709 CASAVA_Build 8 72189656 2D CTGCTAGGAA AT/-- CACAGCCTAG 3070 het 3070 ref 50 26 19 6 AT 1 0 360710 CASAVA_Build 8 72193085 1D GTGGCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 307 hom 28 3 12 13 T 11 10 360711 CASAVA_Build 8 72194963 4D TCTCATGAGA ACTC/---- ACTCACTATC 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 ACTC 2 1 360712 CASAVA_Build 8 72197284 4D CTAATTTTTA TTTC/---- TTTTCATTTG 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 TTTC 1 0 360713 CASAVA_Build 8 72198153 4I AATCCAATTT ----/ATTA ATTATTTTTT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATTA 1 2 360714 CASAVA_Build 8 72199428 2D AAGAAATATC TT/-- TTTGGCCAGA 3070 het 3070 hom 45 13 27 5 T 5 3 360715 CASAVA_Build 8 72207011 5I CTTTACTGTG -----/TAGGA TAGGATTTCA 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 TAGGA 1 2 360716 CASAVA_Build 8 72208243 1I GGTATTTAAA -/G GGGGGCAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 20 6 G 5 6 360717 CASAVA_Build 8 72212386 11I GACAATGGTG -----------/GTTGCTCCAGT TATTTGTTGT 3070 het 3070 ref 52 25 23 5 GTTGCTCCAGT 0 1 360718 CASAVA_Build 8 72213934 1D AAATAGCAGC T/- TCTTCATGAC 3070 het 3070 ref 38 23 13 2 T 2 1 360719 CASAVA_Build 8 72224933 1D GAGATGAGTA C/- CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 28 10 10 8 C 9 8 360720 CASAVA_Build 8 72258838 2I GGAGGCAGAC --/AT AAATAGTTTT 3070 hom 121 het 48 0 40 8 AT 0 1 360721 CASAVA_Build 8 72259480 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 10 11 360722 CASAVA_Build 8 72265560 1I ATTTTTCAGG -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 6 7 360723 CASAVA_Build 8 72283527 1I TAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 13 2 A 9 10 360724 CASAVA_Build 8 72297125 2D GGCCAGTGCA AG/-- AGGCAAAGTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 AG 2 1 360725 CASAVA_Build 8 72310068 1I CTGCAATTAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 8 9 360726 CASAVA_Build 8 72317755 1D TAATAGAGAC G/- GGGGTTTCTC 2672 het 2672 ref 15 8 6 1 G 5 4 360727 CASAVA_Build 8 72326621 2D TGTTTATTGA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 21 9 10 3 T 10 8 360728 CASAVA_Build 8 72330661 1D ATGACTCAAT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 8 7 360729 CASAVA_Build 8 72357917 1I CCTTTACCCT -/C CCCACTTTCC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 C 3 4 360730 CASAVA_Build 8 72369249 4I CCGTCTCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 2110 hom 17 6 9 2 AAAC 3 4 360731 CASAVA_Build 8 72381054 1I GAATAGAAAG -/T TTTTGGGAAG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 T 4 5 360732 CASAVA_Build 8 72384152 3D CAATTTAAGC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 2824 hom 30 7 16 10 A 14 11 360733 CASAVA_Build 8 72440938 1I GCCTATCAGA -/T TTTTTTTTTA 2183 het 2183 ref 18 9 6 3 T 9 10 360734 CASAVA_Build 8 72443027 1I TGGTGGCTTG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 T 7 8 360735 CASAVA_Build 8 72450094 4I TACCTCATGC ----/TAGA TAGAAGAGCT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 TAGA 1 2 360736 CASAVA_Build 8 72457884 1I ACAGCACCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 10 11 360737 CASAVA_Build 8 72466842 1I AAGATTAAAG -/A AAGAGAAAGA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 2 3 360738 CASAVA_Build 8 72475328 3D TGAAAAAAGC ACA/--- ACATCACTGA 3070 het 3070 ref 34 19 15 1 ACA 2 1 360739 CASAVA_Build 8 72480042 3D TTAAAAAACA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 42 15 18 12 AAC 5 4 360740 CASAVA_Build 8 72500081 1I CGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 444 hom 22 1 18 3 A 10 11 360741 CASAVA_Build 8 72502768 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 912 hom 30 3 18 9 A 14 13 360742 CASAVA_Build 8 72503690 1I CTTTTCCATA -/C TTCCTAGGGG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 360743 CASAVA_Build 8 72505693 2D TAGAAAGGAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1557 hom 33 8 17 9 A 14 12 360744 CASAVA_Build 8 72534428 1I TTCTGAGAGC -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 T 6 7 360745 CASAVA_Build 8 72554499 4I ATAATTCTAT ----/ATAG GGCCCAAGCA 2220 het 2220 ref 24 15 5 4 ATAG 0 1 360746 CASAVA_Build 8 72560365 1I TAAACCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2180 hom 23 6 12 5 A 10 11 360747 CASAVA_Build 8 72571703 1D ACTGTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 32 4 A 13 12 360748 CASAVA_Build 8 72581715 1D TATAAAGGGC T/- AATCTGAACA 3070 het 3070 ref 51 29 22 0 T 1 0 360749 CASAVA_Build 8 72604522 1D AAACCATGGT G/- GGTTAGCCAG 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 G 3 2 360750 CASAVA_Build 8 72609863 1I TGAAATATGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 T 8 9 360751 CASAVA_Build 8 72614021 1D AGGGTCAACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 91 het 38 0 29 9 A 10 9 360752 CASAVA_Build 8 72614919 1I TACATAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 86 het 33 0 27 6 A 9 10 360753 CASAVA_Build 8 72624040 1D CAAAGACTGA T/- TTTTTTTTGG 1133 het 1133 ref 53 40 3 11 T 9 8 360754 CASAVA_Build 8 72630559 17I CAAATGCCAA -----------------/ATGCCTGTGGTTTACGT ATGCTTCTTA 3070 het 2773 hom 22 8 10 4 ATGCCTGTGGTTTACGT 0 1 360755 CASAVA_Build 8 72631796 1I GGTGACACCA -/G GGGCAGAGTA 1636 het 1636 ref 23 9 7 7 G 3 4 360756 CASAVA_Build 8 72638994 4I AAGGCTTTGA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 TG 7 9 360757 CASAVA_Build 8 72676933 5I ATTGATGGGG -----/ATTCT ATTCTAAGCT 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 ATTCT 1 2 360758 CASAVA_Build 8 72677267 1D TTAATATAAA G/- TTTCTACTAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 G 1 0 360759 CASAVA_Build 8 72684248 1I49M2I AGTGAAATAA -TTTTAAACATTTAAATAATAAATTTTTACTCAGCAGTAATTTTATTGAC--/TTTTTAAACATTTAAATAATAAATTTTTACTCAGCAGTAATTTTATTGACTA ATTTATTTTT 3070 het 3070 ref 27 21 16 4 N/A 0 0 360760 CASAVA_Build 8 72696108 1I ATGTCTCTTA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 9 360761 CASAVA_Build 8 72710819 1I TTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 18 17 6 T 8 9 360762 CASAVA_Build 8 72722223 10D ATGGAAAAAC TACCTATGCT/---------- TACCTATGCT 3070 het 3070 hom 29 12 11 12 TACCTATGCT 2 1 360763 CASAVA_Build 8 72729009 3D GATCAAATAA CTT/--- CTTCTATTGT 3070 het 3070 hom 47 19 20 8 CTT 2 1 360764 CASAVA_Build 8 72735097 1I TCTTGGAGGT -/A AAAAAAAACC 2779 het 2779 ref 23 9 10 5 A 8 9 360765 CASAVA_Build 8 72735394 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2996 het 2700 hom 21 7 8 6 A 13 14 360766 CASAVA_Build 8 72756486 1D AATGTTTTCC A/- ATTTATTTAC 3070 hom 108 het 37 0 37 0 A 2 1 360767 CASAVA_Build 8 72756910 2D GTCTCTTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 11 hom 23 1 11 12 AT 9 8 360768 CASAVA_Build 8 72757850 3I ATATTTCCAT ---/TAC TACTACTACT 3070 hom 99 het 45 0 34 11 TAC 3 4 360769 CASAVA_Build 8 72759826 2D AAAGAAACCC AA/-- AAAAAAAACA 3070 hom 120 het 42 0 41 3 A 10 8 360770 CASAVA_Build 8 72779082 2D AGCTCATGAG AC/-- ACAGTTACAA 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 AC 2 1 360771 CASAVA_Build 8 72780415 1D CTTCCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 2699 het 2699 ref 23 12 6 5 T 12 11 360772 CASAVA_Build 8 72780995 1I TATTGTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 10 11 360773 CASAVA_Build 8 72784300 1I AACACAATTC -/T TTTTTGAAAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 5 6 360774 CASAVA_Build 8 72784872 1I TCCTCCAGGT -/G GAAATAGATA 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 G 1 2 360775 CASAVA_Build 8 72787733 1D CTCCAAAGGA C/- TAGGAAGGTC 3070 het 3070 ref 42 21 15 8 C 1 0 360776 CASAVA_Build 8 72791879 2I ATAAATCTGC --/AG AGTGTTAACC 3070 het 3070 hom 29 14 14 1 AG 1 2 360777 CASAVA_Build 8 72793367 1D AAGTTGGAGA C/- CAGCCTGGAC 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 C 2 1 360778 CASAVA_Build 8 72800611 1I ACATATGAAA -/G GTTTGTAAGA 3070 het 219 hom 23 1 20 2 G 1 2 360779 CASAVA_Build 8 72803636 2D ATAGCATTTT TG/-- TGCTTTTTAG 3070 hom 129 het 47 0 44 4 TG 2 1 360780 CASAVA_Build 8 72838032 4D GGTGACACTT AATC/---- TAGGAATTGA 3070 hom 126 het 45 0 42 6 AATC 1 0 360781 CASAVA_Build 8 72850534 1D GTGAAGCTAT A/- AAAAACCAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 6 A 6 5 360782 CASAVA_Build 8 72851868 1I GCTAGTGATT -/A AACAGCGCAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 2 3 360783 CASAVA_Build 8 72854789 1D GAATCTCAGA T/- TAGTGAGTTA 3070 het 3070 ref 45 18 17 10 T 2 1 360784 CASAVA_Build 8 72859348 1I AACTATTTTC -/T TTTTTTTTTT 2788 het 460 hom 10 2 6 2 T 11 12 360785 CASAVA_Build 8 72869745 1D GAGCTATTTC T/- TTTTTTTCTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 7 360786 CASAVA_Build 8 72873675 2D TGACATGCGT TA/-- TATATATATA 3070 hom 5 het 19 1 12 6 TA 9 8 360787 CASAVA_Build 8 72879098 1I GGCATCTGGC -/A GGGGCTGTTG 3070 hom 93 het 35 0 31 5 A 0 1 360788 CASAVA_Build 8 72880111 1D AACTGCTTAC A/- TAGAAGTATT 3070 hom 63 het 27 0 20 8 A 1 0 360789 CASAVA_Build 8 72881002 3D AAAAACTCTG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 17 14 360790 CASAVA_Build 8 72891832 4D ATCAGAATTC ACAG/---- ATAGAGAGCG 3070 hom 93 het 33 0 32 4 ACAG 1 0 360791 CASAVA_Build 8 72892883 2I CTTGTTTGGT --/AA AAAAAAAGTC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 7 9 360792 CASAVA_Build 8 72901022 1I CGTCACACAC -/T TGAGGCCTGT 3070 hom 33 het 19 0 12 7 T 1 2 360793 CASAVA_Build 8 72910567 1D GATTCCCTCG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 197 hom 33 1 29 3 T 10 9 360794 CASAVA_Build 8 72921361 2D CTGTCTTCTT TC/-- TCTGTCTTCC 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 TC 2 1 360795 CASAVA_Build 8 72932081 1D CTCTAGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 10 8 4 T 12 11 360796 CASAVA_Build 8 72932211 1I ATTACTTAGG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 T 6 7 360797 CASAVA_Build 8 72945704 3D TATTAAGGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 T 13 10 360798 CASAVA_Build 8 72963871 2I ATCAGGGACT --/CC CCCCTCTGGC 3070 het 3070 hom 48 21 24 3 C 4 6 360799 CASAVA_Build 8 72967830 1D GGCTTTTGTA G/- GGGAAGACTT 3070 het 3070 hom 41 14 21 6 G 4 3 360800 CASAVA_Build 8 72970218 1D GCAAGGTGCC T/- TTGTAGTGCT 3070 het 3070 hom 45 18 20 8 T 3 2 360801 CASAVA_Build 8 72976334 2D AATGTTATGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1808 hom 31 7 16 10 A 14 12 360802 CASAVA_Build 8 72984046 1D GCTCTTAAGA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 T 7 6 360803 CASAVA_Build 8 72984669 1D GTGTGATTTT G/- GGGGGGTTGT 3070 hom 105 het 38 0 34 6 G 7 6 360804 CASAVA_Build 8 72985841 3D CTCAAGACAA TTC/--- TTCTTCTTCC 3070 het 3070 hom 49 19 23 7 TTC 4 3 360805 CASAVA_Build 8 73001533 1I ATTGGTTTTG -/A TCAAGAGACT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 A 0 1 360806 CASAVA_Build 8 73018776 1D TTTCTCTAAA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 T 8 7 360807 CASAVA_Build 8 73034902 1D CAAAGGCCAA C/- ACTGTCAGCC 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 C 1 0 360808 CASAVA_Build 8 73045105 3I GCCAGGCACA ---/TAG TAGTCACTCA 3070 hom 128 het 49 0 42 7 TAG 1 2 360809 CASAVA_Build 8 73049739 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 2500 het 2053 hom 15 6 7 2 A 15 14 360810 CASAVA_Build 8 73057406 1D TATTAAGAAA C/- AGGTCCACCT 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 C 1 0 360811 CASAVA_Build 8 73057634 2D CAGTCTCTAC TA/-- TATATATGTG 3070 het 3070 ref 41 18 12 11 TA 4 3 360812 CASAVA_Build 8 73058054 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAAAG 164 het 164 ref 29 13 3 14 AAG 1 0 360813 CASAVA_Build 8 73062755 1I CTGGCCCCTC -/A GCTCCCAGAG 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 0 1 360814 CASAVA_Build 8 73081786 4I ACTACTATAA ----/TAAT TTATTCATGG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAAT 0 1 360815 CASAVA_Build 8 73084283 2D ACGCACAGGG AC/-- ACACACACAC 1371 het 1371 ref 32 16 5 12 AC 9 8 360816 CASAVA_Build 8 73123947 4D GTCCTTGTTC AATA/---- AATAAAGAAC 3070 hom 141 het 51 0 46 9 AATA 2 1 360817 CASAVA_Build 8 73129981 9D TATTCTGTGA ACAGAATAT/--------- TCTTGAACAA 3070 hom 60 het 23 0 21 6 ACAGAATAT 1 0 360818 CASAVA_Build 8 73138174 1D ATCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 38 0 28 11 A 11 10 360819 CASAVA_Build 8 73139054 2D TATATATATA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 37 het 22 0 16 7 AT 7 6 360820 CASAVA_Build 8 73139610 11I18M18D ATGGAGCACT -----------GAGGAAGTCATGTAGACAATCATCTCCATCATCTCC/GCCAGAAGCAGGAGGAAGTCATGTAGACA------------------ ATCATCTCCA 3070 hom 99 het 29 0 32 8 N/A 0 0 360821 CASAVA_Build 8 73141517 1I TGGAAAATAG -/C CTACCAAAGT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 1 2 360822 CASAVA_Build 8 73167400 2D GTCATACTGA GT/-- GTTGAAATTT 3070 hom 84 het 35 0 29 8 GT 2 1 360823 CASAVA_Build 8 73170930 1D AGCAAGCAGG A/- AAAAAAATCC 3070 hom 96 het 35 0 28 7 A 8 7 360824 CASAVA_Build 8 73183810 8D TGTTGTTTTT TTTTAAAA/-------- AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 TTTTAAAA 1 0 360825 CASAVA_Build 8 73188865 1I TAAGCTCATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 32 1 28 3 T 11 12 360826 CASAVA_Build 8 73190427 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 360827 CASAVA_Build 8 73193831 1I TTAATTGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 36 0 32 4 T 10 11 360828 CASAVA_Build 8 73216227 1D GGCCTCATCA C/- CTTTTTACTA 3070 hom 17 het 46 1 30 16 C 2 1 360829 CASAVA_Build 8 73216700 1D TTCTCTTGGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 A 9 8 360830 CASAVA_Build 8 73218633 3I AGCATAAGCA ---/GAG TACTCTTCTC 3070 het 3070 ref 46 20 22 4 GAG 0 1 360831 CASAVA_Build 8 73228936 1I AATCCAATGC -/T GGGGATCATG 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 0 1 360832 CASAVA_Build 8 73230216 2D CTAAATAGCT TC/-- TGTTTTTCTT 3070 hom 80 het 32 0 26 6 TC 1 0 360833 CASAVA_Build 8 73247394 1I TTTAATGTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 T 9 10 360834 CASAVA_Build 8 73253088 4I AAACATCCTA ----/CTAG CTAAAGTGCT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 CTAG 0 1 360835 CASAVA_Build 8 73257242 2I AGAGATTATG --/GC GCTCAATGAG 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 GC 1 2 360836 CASAVA_Build 8 73258867 1D ACATTATAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 13 15 4 T 10 9 360837 CASAVA_Build 8 73261844 2D GTAAGAAACT CA/-- CATGGAAACT 2994 het 2994 ref 22 15 7 2 CA 2 1 360838 CASAVA_Build 8 73271287 1D TAGTATTCGG A/- GGAGGAAGCG 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 A 1 0 360839 CASAVA_Build 8 73293949 1I TTCTTGGGGG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 37 24 12 1 A 7 8 360840 CASAVA_Build 8 73301654 9I TTAAAATTGT ---------/GATTAATGG GATTAATGGC 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 GATTAATGG 1 2 360841 CASAVA_Build 8 73305281 1D AATATCATAC A/- AATAACTCTG 2603 het 2603 ref 32 23 6 3 A 3 2 360842 CASAVA_Build 8 73308725 1I AATCATATGA -/T TTTTTTCAAC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 6 7 360843 CASAVA_Build 8 73310192 3I GAGGTTAGTC ---/TAT TATTGAGTTT 3070 het 3070 hom 31 9 17 5 TAT 1 2 360844 CASAVA_Build 8 73311711 1I GTCTGATGAC -/T TTCATCAGCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 2 3 360845 CASAVA_Build 8 73314391 5D ATACACATAA AAATT/----- AAATTGGCAA 3070 het 3070 ref 31 19 8 4 AAATT 2 1 360846 CASAVA_Build 8 73318343 1D GAACAACAAT A/- AAAACCAGCT 3070 het 3070 hom 60 23 30 7 A 5 4 360847 CASAVA_Build 8 73320341 1D CAAAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 61 hom 43 1 31 11 A 13 12 360848 CASAVA_Build 8 73323116 2D CTTTTTAACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 22 7 A 14 12 360849 CASAVA_Build 8 73325397 2I TGTGTAAGCA --/TT TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 8 10 360850 CASAVA_Build 8 73328993 1I ATTTTTATGG -/A AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 6 7 360851 CASAVA_Build 8 73330694 3D CTGATGAAGC ATT/--- ATTTCTGGGT 3070 het 3070 ref 41 27 14 1 ATT 2 1 360852 CASAVA_Build 8 73333352 1I GGATGAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 10 11 360853 CASAVA_Build 8 73334866 1D GGGTTTTTTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 24 10 14 0 A 9 8 360854 CASAVA_Build 8 73347709 1D GTGAATATTA T/- GCATTATTTT 3070 het 3070 hom 43 17 23 4 T 1 0 360855 CASAVA_Build 8 73348279 1I TGCAAACTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1107 hom 30 3 24 3 A 10 11 360856 CASAVA_Build 8 73351976 3I CAGAAACAGA ---/ATG ATATGATTTG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 ATG 0 1 360857 CASAVA_Build 8 73352153 5D CCTGAACAAG TTCTC/----- TTCTCTTGTC 3070 het 3070 hom 42 20 20 5 TTCTC 2 1 360858 CASAVA_Build 8 73352850 1D GGTCCCTATT C/- AGATATAAGC 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 C 1 0 360859 CASAVA_Build 8 73354475 1D TAATCAGGTC A/- GGGGAGGGCT 3070 het 3070 ref 56 26 22 8 A 1 0 360860 CASAVA_Build 8 73354577 1D GCAGCCAGCA C/- CAGGGAAAGG 3070 het 3070 ref 62 35 24 5 C 2 1 360861 CASAVA_Build 8 73356181 1D TTTTTACCCC T/- TTAGGATGGC 3070 het 3070 hom 48 19 22 8 T 3 2 360862 CASAVA_Build 8 73360365 1D GTAAAGAGAG A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 A 7 6 360863 CASAVA_Build 8 73364238 3I TTTTAATTTA ---/ATT ATTTGAATTA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 ATT 1 2 360864 CASAVA_Build 8 73365762 1I TCATAATGGA -/T TATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 T 1 2 360865 CASAVA_Build 8 73370685 1D AACCAAAACA G/- CATGGTACTG 1385 hom 7 het 4 0 3 1 G 1 0 360866 CASAVA_Build 8 73373572 1I TGACTTACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 324 hom 33 1 28 4 T 12 13 360867 CASAVA_Build 8 73379370 1D TCTCTTTTTT G/- TTTTCTTTTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 G 1 0 360868 CASAVA_Build 8 73391550 1D AGTAGTGACA G/- TTGCCGGCAA 3070 het 3070 ref 41 22 11 9 G 1 0 360869 CASAVA_Build 8 73395007 1I CTGGGTTTTG -/T TTTATGATCT 3070 hom 123 het 46 0 41 5 T 3 4 360870 CASAVA_Build 8 73396379 10D TGGGGGCAGG GCATAGCCGA/---------- ACAAAAGGCA 3070 het 3070 ref 23 9 10 4 GCATAGCCGA 1 0 360871 CASAVA_Build 8 73408261 2I5M8D TTTTTGTTGT --TGTTCATATAAAA/TGTGTTC-------- CTTGAATTTT 3070 het 3070 ref 35 24 11 5 N/A 0 0 360872 CASAVA_Build 8 73411365 1I TGTTTTATTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 9 10 360873 CASAVA_Build 8 73444000 1D ACTGAGCTGC A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 A 7 6 360874 CASAVA_Build 8 73478067 1I TGTTTCTTTC -/T TTTCTTTTTT 2367 het 2367 ref 38 18 14 6 T 3 4 360875 CASAVA_Build 8 73482481 1D GTGACCTAGA C/- CCCCCACACA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 C 6 5 360876 CASAVA_Build 8 73516658 5I CACTTGAATG -----/ATTTT ATTACTTCAG 3070 het 3070 ref 29 18 9 2 ATTTT 0 1 360877 CASAVA_Build 8 73533855 1I TAAAGTGACG -/T TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 T 6 7 360878 CASAVA_Build 8 73541904 1I TCTTACATCA -/C CCCCACTGCT 3070 hom 135 het 46 0 45 1 C 4 5 360879 CASAVA_Build 8 73544880 1D ATTGTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 12 11 360880 CASAVA_Build 8 73547133 3I AATCAACAAC ---/TCT TCTTATATCC 3070 hom 105 het 36 0 36 0 TCT 1 2 360881 CASAVA_Build 8 73549649 2D TGCCCTTTAC AA/-- AAAAAAAAAA 2793 het 800 hom 24 5 7 13 A 13 11 360882 CASAVA_Build 8 73564172 1D GTAGGAAAAT G/- CTTATGCCTG 3070 hom 138 het 47 0 46 2 G 1 0 360883 CASAVA_Build 8 73566506 1I GCGGACTATT -/G TTTTTTCCAC 3070 hom 54 het 22 0 18 4 G 0 1 360884 CASAVA_Build 8 73571834 2I CAGAGTAATT --/AA TACTTTGTTT 3070 het 3070 ref 47 25 17 5 A 0 2 360885 CASAVA_Build 8 73573323 1I AAATAAAAAC -/T CTTCAATTCA 3070 het 3070 hom 45 16 22 7 T 0 1 360886 CASAVA_Build 8 73595787 3D CTGCAGGGGG GTA/--- GTAGTAATAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 GTA 3 2 360887 CASAVA_Build 8 73607961 1I TATTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 38 1 33 4 T 11 12 360888 CASAVA_Build 8 73613863 2I TTTAGGGGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 156 hom 40 1 30 9 TG 7 8 360889 CASAVA_Build 8 73615790 1I TTTTAGGGGG -/A AAAAAAACTT 3070 het 407 hom 34 1 32 1 A 7 8 360890 CASAVA_Build 8 73620981 1D TCACAGGTTT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 A 9 8 360891 CASAVA_Build 8 73633623 1I CCTGGTTCTA -/T AAGTTCTTAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 360892 CASAVA_Build 8 73639931 2I AATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 2190 hom 38 5 24 9 TA 7 8 360893 CASAVA_Build 8 73643589 2D GGGCAAGTGC CA/-- CACACATGAG 3070 hom 84 het 38 0 29 11 CA 4 3 360894 CASAVA_Build 8 73663534 1I AAAAATAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 221 hom 24 1 18 5 A 10 11 360895 CASAVA_Build 8 73664503 4D AATCTAAGAC TGAT/---- TGTACTTTCT 3070 het 3070 ref 61 30 26 6 TGAT 1 0 360896 CASAVA_Build 8 73665902 1D CAGTCAGCTC T/- TTTTTGTTAA 3070 het 3070 hom 46 19 22 6 T 6 5 360897 CASAVA_Build 8 73670288 1D CTAATTTTTG T/- ATTTTTAGTA 3070 het 467 hom 14 1 12 1 T 1 0 360898 CASAVA_Build 8 73680724 1I CCAGCAATTG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 A 8 9 360899 CASAVA_Build 8 73692387 1I ACAGAAGTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2793 hom 41 11 15 15 A 15 16 360900 CASAVA_Build 8 73694321 2I ATTACCTCCA --/TT TTTTTTTTTT 2840 het 2838 ref 32 9 13 10 T 14 16 360901 CASAVA_Build 8 73706872 1D TAAAAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 11 10 360902 CASAVA_Build 8 73708777 1D CTGGAACACC T/- TGCCACTCTG 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 2 1 360903 CASAVA_Build 8 73728246 1I TTTATTTTTA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 8 9 360904 CASAVA_Build 8 73741442 1D AAATAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 2359 hom 19 het 13 0 9 4 T 17 16 360905 CASAVA_Build 8 73751898 2I GGACACAGAC --/AT GTACACATGG 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 AT 0 1 360906 CASAVA_Build 8 73754748 1I ACTGTGTAAT -/G GGGTCCTGTT 3070 het 3070 ref 46 18 18 10 G 3 4 360907 CASAVA_Build 8 73774235 1I GGGTTGTTTG -/T TTTTTTTTCT 2880 het 2880 ref 19 10 7 2 T 8 9 360908 CASAVA_Build 8 73776333 1D TTTATGTAGA T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 T 7 6 360909 CASAVA_Build 8 73779750 3I TAATTTTTTA ---/TTG TTGTATTGTT 3070 het 3070 ref 33 21 11 1 TTG 1 2 360910 CASAVA_Build 8 73783101 1D GCTTAGTTTC T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 51 23 23 7 T 7 6 360911 CASAVA_Build 8 73785249 2D CATGCTCTGC AT/-- ATATATATAT 1687 het 1687 ref 37 25 4 9 AT 8 7 360912 CASAVA_Build 8 73797585 1D AAATCAACTA C/- ATTAAATACA 3070 het 3070 ref 47 25 15 8 C 1 0 360913 CASAVA_Build 8 73810962 2I CTTAATGTGA --/AT ATTGAAACAT 3070 hom 108 het 38 0 36 2 AT 1 2 360914 CASAVA_Build 8 73811821 1D GTAGTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 40 31 4 5 T 12 11 360915 CASAVA_Build 8 73813132 4D ACCCTGAACT CTGA/---- CTGTAGGCAG 3070 het 3070 ref 34 17 15 6 CTGA 1 0 360916 CASAVA_Build 8 73821127 4I GAAAAGTGGT ----/GAGA GAAAGGCAAC 3070 hom 126 het 50 0 42 8 GA 1 3 360917 CASAVA_Build 8 73823401 1D TTTTTTTGTT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 1383 hom 24 8 14 2 G 1 0 360918 CASAVA_Build 8 73836585 1I ATACTGTTAC -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 97 het 39 0 33 6 A 7 8 360919 CASAVA_Build 8 73837023 1D TGTGATCGAT G/- GGGGATGTGC 3070 het 3070 hom 42 19 18 6 G 5 4 360920 CASAVA_Build 8 73838115 1I CTGAGTCTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 T 9 10 360921 CASAVA_Build 8 73842335 2D ATATTATAAC AT/-- GTGTCACTAC 3070 het 3070 hom 53 17 32 5 AT 1 0 360922 CASAVA_Build 8 73848723 3I GTCCTGTGAA ---/CTT CTCAGATTCT 3070 het 3070 hom 36 12 15 9 CTT 0 1 360923 CASAVA_Build 8 73860844 1D CCCAAAAACG A/- AAAAAAAAAA 2266 het 2266 ref 36 25 5 7 A 13 12 360924 CASAVA_Build 8 73862209 1I TACATCTGAA -/T TTTTTTTTTT 2907 het 1915 hom 13 4 7 2 T 10 11 360925 CASAVA_Build 8 73874192 16I TCAAGAGCAC ----------------/ATTATTATTATTTATT ATTATTATTT 2007 het 2007 ref 26 18 5 3 ATTATTATTATTTATT 0 1 360926 CASAVA_Build 8 73896431 3D AAAAAAAAAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 870 hom 28 11 12 5 A 19 16 360927 CASAVA_Build 8 73913603 1D TAAAGAATAT A/- AAAATCCTTG 3070 hom 84 het 31 0 27 5 A 5 4 360928 CASAVA_Build 8 73916112 1I GTATAGTTTG -/A AGTCAGGTAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 1 2 360929 CASAVA_Build 8 73916906 7D ACCTAGTTTA TTGAGAG/------- TTGAGAGTTT 3070 hom 33 het 18 0 12 6 TTGAGAG 2 1 360930 CASAVA_Build 8 73920574 1D AGATGCCCCT C/- CCCCCCATCA 3070 het 115 hom 20 1 15 4 C 7 6 360931 CASAVA_Build 8 73921347 1D ACAAATTTAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 304 hom 17 1 14 2 A 9 8 360932 CASAVA_Build 8 73925700 1I GGGAATCCAA -/T ATTTGTGGCT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 0 1 360933 CASAVA_Build 8 73926868 1I TAAAAAAATT -/A TAAAAAATAA 3070 hom 30 het 14 0 10 4 A 0 1 360934 CASAVA_Build 8 73927540 1I TACTGAAAAG -/T TTTTAATTGT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 4 5 360935 CASAVA_Build 8 73932348 1I CCTACGAGAT -/G GTTGTTTGCA 3070 hom 78 het 32 0 25 7 G 1 2 360936 CASAVA_Build 8 73934717 20D CATGTTCGTC AGCCTGGTCTCAAACTCCCG/-------------------- ACCTCAGGTG 3070 het 2749 hom 16 6 11 2 AGCCTGGTCTCAAACTCCCG 1 0 360937 CASAVA_Build 8 73935962 5I TCAGCTTAAG -----/TGTCT TGTCTGAACA 3070 hom 120 het 42 0 40 2 TGTCT 1 2 360938 CASAVA_Build 8 73940541 1I TCACTGCCTC -/T TTACTTATCC 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 T 2 3 360939 CASAVA_Build 8 73944289 1D ACTCAATAGC A/- AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 A 6 5 360940 CASAVA_Build 8 73992190 1I TTAAAAAGGC -/A AAAGGAGACA 3070 het 3070 hom 42 17 22 3 A 3 4 360941 CASAVA_Build 8 73999151 2D CCAATTCTGA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 10 8 360942 CASAVA_Build 8 74002061 2D CTTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 37 1 22 14 T 12 10 360943 CASAVA_Build 8 74003733 1D AGATAAACAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 T 10 9 360944 CASAVA_Build 8 74006804 4I ACTGTCTCAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 45 het 26 0 16 10 AAAC 3 4 360945 CASAVA_Build 8 74019143 1I ACATCTCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 14 10 T 10 11 360946 CASAVA_Build 8 74019956 1D ATTAAACCAT A/- AAAAAATTCA 3070 hom 116 het 44 0 39 5 A 7 6 360947 CASAVA_Build 8 74023092 1I CTCAAAAAAA -/G AAAGTTCCTA 3070 het 3070 ref 42 19 19 4 G 0 1 360948 CASAVA_Build 8 74024304 3D AAAAAAAAAC TTG/--- TTGTGAGTAA 3070 het 3070 hom 41 16 19 6 TTG 2 1 360949 CASAVA_Build 8 74028458 1I CATCATTACA -/G GGATGGCAGA 3070 het 3070 ref 52 27 21 4 G 2 3 360950 CASAVA_Build 8 74028627 16I CAAAACTATT ----------------/CAGTGTTTTTTATCAC CAGATAGACA 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 CAGTGTTTTTTATCAC 0 1 360951 CASAVA_Build 8 74034023 1I TCATTTGATC -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 T 7 8 360952 CASAVA_Build 8 74036351 4D AAAAAAACAA AAAC/---- AAAAACAACA 3070 het 2581 hom 21 7 12 4 AAAC 1 0 360953 CASAVA_Build 8 74038333 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 85 hom 29 1 15 16 A 14 11 360954 CASAVA_Build 8 74066527 1D CAGGCTCCTA G/- GCAGAGGGAC 3070 het 2863 hom 33 8 22 4 G 2 1 360955 CASAVA_Build 8 74076085 2I TTTATGAATT --/TG TGTTGGGCCG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 TG 1 2 360956 CASAVA_Build 8 74084089 12I GTCGCCGAGG ------------/GAGGTCGGGAGA GAGGGGCTGC 1840 hom 21 het 10 0 6 4 GAGGTCGGGAGA 0 1 360957 CASAVA_Build 8 74085931 2I TTAGTCCCTA --/AC AGGAGAGTCA 3070 het 3070 hom 49 18 23 8 AC 0 1 360958 CASAVA_Build 8 74086611 1D GCTGGTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 40 hom 49 2 23 25 T 11 10 360959 CASAVA_Build 8 74089033 1D AGGGCTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 26 0 18 8 A 13 12 360960 CASAVA_Build 8 74089221 1I ACACACTCTG -/T TTTTTACTGG 3070 het 3070 ref 38 15 12 11 T 5 6 360961 CASAVA_Build 8 74090471 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 9 10 360962 CASAVA_Build 8 74097868 2I ATACAAAAAA --/AG TCTGTATGTG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 AG 0 1 360963 CASAVA_Build 8 74109230 1I CCTTTTTGTG -/T TTTTTTGTAG 3070 het 2066 hom 22 6 11 5 T 6 7 360964 CASAVA_Build 8 74109571 1I AGATTAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1696 hom 27 6 12 9 T 11 12 360965 CASAVA_Build 8 74139520 1I GATTATAGTT -/C ACCTTATTCC 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 C 0 1 360966 CASAVA_Build 8 74146989 4D GTGAGATAAT AGAG/---- AGCATGAAGA 3070 het 3070 hom 28 11 16 2 AG 3 1 360967 CASAVA_Build 8 74156431 1I CATAAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 17 10 A 10 11 360968 CASAVA_Build 8 74160220 1I GAATATGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 16 9 14 A 13 14 360969 CASAVA_Build 8 74161463 1I CATTTACTGG -/A CTAGTTCCTG 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 0 1 360970 CASAVA_Build 8 74163478 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 9 10 360971 CASAVA_Build 8 74169288 2I CATATATATT --/TA TATATATATG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 TA 4 5 360972 CASAVA_Build 8 74170037 1D TTTGTCGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 20 7 A 12 11 360973 CASAVA_Build 8 74172630 1I CCTGTCACTG -/A AAAAAAATGT 2899 het 2899 ref 30 14 9 7 A 7 8 360974 CASAVA_Build 8 74173384 1I TGATGACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 10 11 360975 CASAVA_Build 8 74175511 1D AGAGTCCACA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 8 7 360976 CASAVA_Build 8 74176297 1I TTGGGTTCCA -/T TTTTTATATT 3070 het 3070 ref 37 22 11 4 T 5 6 360977 CASAVA_Build 8 74178306 1I GTTATGTGCT -/G AGCACTGTGG 3070 hom 117 het 45 0 40 5 G 0 1 360978 CASAVA_Build 8 74185984 3D TGCCTGAAGA CTG/--- CTTGCATAAC 3070 het 3070 ref 48 26 19 6 CTG 1 0 360979 CASAVA_Build 8 74201429 6I CTCCTGAGAA ------/CTTGTT AGAAAGGCCT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 CTTGTT 0 1 360980 CASAVA_Build 8 74202770 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 T 8 7 360981 CASAVA_Build 8 74204806 1I CAAGTTACTT -/C CTCCTTCCTT 3070 hom 45 het 18 0 16 7 C 1 2 360982 CASAVA_Build 8 74221017 1I AATGGCCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 A 9 10 360983 CASAVA_Build 8 74226111 1I TCTACCTCCA -/T TTTTTCCTCC 3070 het 1715 hom 31 5 20 6 T 5 6 360984 CASAVA_Build 8 74227795 2D TATTTCATAA AC/-- ACACACACAC 2620 het 2620 ref 37 19 9 10 AC 8 7 360985 CASAVA_Build 8 74228837 1D TGCCTCACTA G/- GGATGGATGA 3070 het 3070 ref 33 16 12 7 G 3 2 360986 CASAVA_Build 8 74231206 1I TTTGCATAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 9 10 360987 CASAVA_Build 8 74234400 2D CTAACACACA CT/-- CTCACACACG 3070 het 3070 hom 66 24 35 10 CT 2 1 360988 CASAVA_Build 8 74234925 2I TTCCTTTTTA --/AC GACCATGTTT 3070 hom 126 het 44 0 42 2 AC 0 1 360989 CASAVA_Build 8 74238802 1D GGTCTGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 11 10 360990 CASAVA_Build 8 74239330 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2816 hom 33 14 13 6 A 13 12 360991 CASAVA_Build 8 74239557 4I CTAATATATC ----/TTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 T 12 16 360992 CASAVA_Build 8 74242245 1I AATGGAGGAC -/A AGAGCGGGGT 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 A 1 2 360993 CASAVA_Build 8 74242933 1I TCTCAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 14 5 A 10 11 360994 CASAVA_Build 8 74252770 1I GAGAAGTTCA -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 T 6 7 360995 CASAVA_Build 8 74253601 2D CAACTCTCTC TT/-- GAGACTCTGA 3070 het 3070 hom 48 19 21 10 T 2 0 360996 CASAVA_Build 8 74254609 4D TTTTTTGGGG TACA/---- GGTGGTTTTT 3070 het 3070 ref 35 19 13 5 TACA 1 0 360997 CASAVA_Build 8 74258880 1D CCCAGCTAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 9 8 360998 CASAVA_Build 8 74259863 4D GCTCTAACAG CTTT/---- CTATTTTATG 3070 het 3070 ref 43 27 13 3 CTTT 1 0 360999 CASAVA_Build 8 74268160 7D AGAGACATTA TGTAATG/------- TGTAATGACA 3070 het 3070 hom 31 14 17 2 TGTAATG 2 1 361000 CASAVA_Build 8 74268515 2D TCTTGTTAAC TG/-- TAATTCTCAT 3070 het 3070 hom 49 22 20 9 TG 1 0 361001 CASAVA_Build 8 74272703 1I TGCAATGGAG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 8 9 361002 CASAVA_Build 8 74277074 1D TGATTTAGGT A/- AAAAAATGAC 3070 hom 105 het 41 0 36 6 A 7 6 361003 CASAVA_Build 8 74280507 4D GAGGATTATA TAAT/---- TATTTTGCGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAAT 1 0 361004 CASAVA_Build 8 74282465 5I AAAAAAAAAA -----/AAAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 35 het 17 0 12 5 AAAAG 0 1 361005 CASAVA_Build 8 74290600 2I CTGAGACACA --/CC AGGACAGGAG 3070 het 3070 hom 44 16 16 12 C 0 2 361006 CASAVA_Build 8 74291315 2D TGCACACATT GG/-- ACTCATCAAT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 G 2 0 361007 CASAVA_Build 8 74299268 2D CATGGAAAGG AT/-- ATCAAAAATG 3070 het 3070 ref 48 22 19 10 AT 2 1 361008 CASAVA_Build 8 74322062 1I GGACATGATC -/T TGTTCTTTTT 3070 hom 57 het 26 0 19 7 T 1 2 361009 CASAVA_Build 8 74337606 1D ATCCTGGCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 5 A 13 12 361010 CASAVA_Build 8 74348538 1D GTGATGCCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 T 15 14 361011 CASAVA_Build 8 74356421 4D GTAGGAAGGT TTTC/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 10 22 3 TTTC 1 0 361012 CASAVA_Build 8 74361006 1D AGGAAGCACA T/- ATAGGGCAAA 3070 het 3070 ref 36 18 13 8 T 1 0 361013 CASAVA_Build 8 74361238 1D ATTCCATGTT C/- TGACTCCTTT 3070 het 3070 ref 60 32 23 5 C 1 0 361014 CASAVA_Build 8 74361526 1D CATTTGGTTA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 120 het 42 0 39 3 T 8 7 361015 CASAVA_Build 8 74364730 2I GGAGCTGTTT --/CA CAGTGTGTCA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 CA 1 2 361016 CASAVA_Build 8 74368265 1D TCACACAGCG T/- TCACAATCAA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 2 1 361017 CASAVA_Build 8 74372745 2D CGCTTCGGGA CT/-- CTCTCGGGTT 3070 het 3070 hom 34 14 15 6 CT 3 2 361018 CASAVA_Build 8 74376402 4I CAAAAAAAGT ----/AGCC AGCCGTGGTG 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AGCC 1 2 361019 CASAVA_Build 8 74380435 4D CTGGACCTGG GAAA/---- GAAAGTCCTA 3070 het 3070 hom 41 19 21 2 GAAA 2 1 361020 CASAVA_Build 8 74383876 1D ATACACACAC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 9 8 361021 CASAVA_Build 8 74385219 3I TTACAGGGGT ---/TGA TGATGATGGG 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 TGA 2 3 361022 CASAVA_Build 8 74385797 1D ATATTTTTGC T/- GATCACTCAA 3070 het 3070 hom 37 10 21 8 T 1 0 361023 CASAVA_Build 8 74386794 1I AATGAAGATT -/G TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 G 0 1 361024 CASAVA_Build 8 74392272 1I AGTTGGGAGT -/G GGGGTACTAC 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 G 4 5 361025 CASAVA_Build 8 74395904 1I TAAAAAGAAT -/A ATGTTGGGAG 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 1 2 361026 CASAVA_Build 8 74401479 3D CCCTAGAAAG TTT/--- TTTTTAGCAG 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 T 8 5 361027 CASAVA_Build 8 74415288 6D TTGACTCCTT AGAGAA/------ AGGGGACACA 3070 het 3070 hom 45 17 25 8 AGAGAA 1 0 361028 CASAVA_Build 8 74427079 17I37M1I GCTGCAGTGA -----------------GCACTCCAGACTAGGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTT-/GCTATGATTATTCCACTGCACTCCAGACTAGGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 22 11 7 N/A 0 0 361029 CASAVA_Build 8 74432019 1I CCCAAGGGCA -/T TTTTTTCAGG 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 6 7 361030 CASAVA_Build 8 74460253 1I TGGCAAGGTG -/C CTTGAAGAGC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 2 361031 CASAVA_Build 8 74486126 1I GAAGAAGACT -/C CCCCCTCAGG 2568 het 2568 ref 39 21 7 11 C 5 6 361032 CASAVA_Build 8 74489809 1I GTTCCAGACC -/A AAAAAAAAAA 2571 het 2490 hom 27 11 10 6 A 15 16 361033 CASAVA_Build 8 74497502 4D63M8I CTAAAAATGA AAACAAACAGAGAGAGCCATTCACTGACTCTAGTGTAATGAACAAGTAACTGAAAGAAAGCTGAGAT--------/----AAACAGAGAGAGCCATTCACTGACTCTAGTGTAATGAACAAGTAACTGAAAGAAAGCTGAGATAGAAAGAC AGAAAGACTC 3070 het 3070 ref 46 39 36 10 N/A 0 0 361034 CASAVA_Build 8 74532012 4D AGAAACACAC AGAA/---- AGAAATTTCA 3070 het 3070 ref 51 25 23 6 AGAA 2 1 361035 CASAVA_Build 8 74546312 2I TTCTGTAATT --/AA AAAAAAAAAA 748 hom 10 het 7 0 4 3 A 14 16 361036 CASAVA_Build 8 74549350 1I GAGCATTGTT -/C ATGGTTGGGT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 C 0 1 361037 CASAVA_Build 8 74555947 4D CACTCTCTCC CTCT/---- GAGTGGGAAC 3070 het 3070 ref 39 19 19 5 CT 2 0 361038 CASAVA_Build 8 74556976 1I CAGGTAGAGC -/A ACTGGCCTGT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 A 1 2 361039 CASAVA_Build 8 74557133 1I TTATGATCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2909 hom 25 8 12 5 A 9 10 361040 CASAVA_Build 8 74557841 6I CCCCATACAC ------/AGAGTA ATCAGTGGTC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 AGAGTA 0 1 361041 CASAVA_Build 8 74558315 1D CTTAACATTT A/- AGCAAAGCTG 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 A 2 1 361042 CASAVA_Build 8 74563479 1I AGAAATCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2310 hom 31 9 15 7 A 13 14 361043 CASAVA_Build 8 74565672 1D CAAAAATCAC A/- AAAATTAGAG 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 5 4 361044 CASAVA_Build 8 74569903 1I TTGGGTATGA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 T 7 8 361045 CASAVA_Build 8 74572245 3I AATAATAAAT ---/ATC ATTGCAATTC 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 ATC 0 1 361046 CASAVA_Build 8 74572590 2D CAAATTTATA AC/-- AGACTAGTAA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 AC 1 0 361047 CASAVA_Build 8 74577058 1I GAAGCACCAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 8 9 361048 CASAVA_Build 8 74586039 2D AGCACTTCTC TT/-- TTGGTTTAGT 3070 het 3070 hom 40 20 19 2 T 4 2 361049 CASAVA_Build 8 74602680 21I GTCTAGATTT ---------------------/CAGGAAAATTCAAATAATTTA CACAGAACAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 CAGGAAAATTCAAATAATTTA 0 1 361050 CASAVA_Build 8 74605635 4I CCAGCCAAAG ----/TAAC TAACACTCAC 3070 het 3070 ref 62 31 19 12 TAAC 1 2 361051 CASAVA_Build 8 74612117 1I TTCAAAAAAG -/T TAACAGCTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 1 2 361052 CASAVA_Build 8 74613448 3D AAGCTTTCTC CTT/--- AAGTCAGAGT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 CTT 1 0 361053 CASAVA_Build 8 74616875 1D CCATTATTTT A/- CAGTTCTAAG 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 A 1 0 361054 CASAVA_Build 8 74622138 1I AAACATAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 407 hom 37 1 32 4 T 10 11 361055 CASAVA_Build 8 74622799 1D TAAAGTATAA G/- GGAGGATGTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 3 2 361056 CASAVA_Build 8 74624373 7D TGAAACAAAA TTAAAAG/------- TTAAAACAAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 6 TTAAAAG 1 0 361057 CASAVA_Build 8 74627231 1D TGCCAAACAA G/- TATCTTTGTC 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 G 1 0 361058 CASAVA_Build 8 74630126 2I AAGAGCATAC --/AG AGAGTCAGAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 2 3 361059 CASAVA_Build 8 74630463 3D TAATATTTGA TGT/--- TGTGTAATCT 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 TGT 2 1 361060 CASAVA_Build 8 74631810 5D TTATATATAT TTTAG/----- TTTAAAGAAT 3070 het 3070 ref 31 15 14 3 TTTAG 1 0 361061 CASAVA_Build 8 74633603 1I AAAAGCTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 10 11 361062 CASAVA_Build 8 74643398 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 231 hom 29 1 21 7 A 11 10 361063 CASAVA_Build 8 74649918 1D CCTACCAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 494 hom 26 3 18 5 A 15 14 361064 CASAVA_Build 8 74650615 4I ACACACAAAA ----/AAAC AACCACAAGT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAAC 0 1 361065 CASAVA_Build 8 74653777 1I CCCCTACCCA -/C CCCCCCCAAA 3070 het 1755 hom 21 5 12 4 C 7 8 361066 CASAVA_Build 8 74656562 1D TCACTGAAAT A/- ATTCTTTTCA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 A 2 1 361067 CASAVA_Build 8 74657939 1D AAAATAAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1777 hom 22 8 11 3 T 15 14 361068 CASAVA_Build 8 74664674 6D GGATGACAAA GATGAG/------ GATGAGGATG 3070 het 3070 hom 37 16 16 8 GATGAG 3 2 361069 CASAVA_Build 8 74676900 1I TAACATCTCC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 9 10 361070 CASAVA_Build 8 74680517 3D TAATTTCAAG ATT/--- ATAAAACTAT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 ATT 1 0 361071 CASAVA_Build 8 74689541 1I TGTAGCCTTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 A 8 9 361072 CASAVA_Build 8 74691587 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 4 A 10 11 361073 CASAVA_Build 8 74694723 5D CAGTTTTCTA TTAAT/----- TTAAGATAAC 3070 het 3070 ref 39 24 14 2 TTAAT 1 0 361074 CASAVA_Build 8 74697083 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTGTAT 1850 hom 10 het 4 0 4 0 T 6 7 361075 CASAVA_Build 8 74700579 1I GACAAGACAG -/T TTTTTGTAGG 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 5 6 361076 CASAVA_Build 8 74711652 1I CTCTGTATTC -/A AAAAAAAAAA 596 het 596 ref 27 11 3 13 A 15 16 361077 CASAVA_Build 8 74711776 4D AAAAAGTAGC CAAA/---- CAAATTCTAG 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 CAAA 2 1 361078 CASAVA_Build 8 74711965 1D AATTAAAATT A/- AAAAAAAGGT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 8 7 361079 CASAVA_Build 8 74713182 1D ACAGTGACTG T/- GTATTGCTTA 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 T 1 0 361080 CASAVA_Build 8 74717316 1D GTCCAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2821 hom 27 11 10 6 A 12 11 361081 CASAVA_Build 8 74720291 4D GGTGAAAGAC TGAA/---- TGTTTTGTAC 3070 het 3070 ref 35 21 14 1 TGAA 1 0 361082 CASAVA_Build 8 74721834 4I ATAACTACAC ----/ATCT ATCAGAATGA 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 ATCT 0 1 361083 CASAVA_Build 8 74733733 1I CAAAAACAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 107 hom 31 2 17 12 A 12 13 361084 CASAVA_Build 8 74738420 1D TAATTTTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 A 13 12 361085 CASAVA_Build 8 74738515 5D TAGAGTCTTC TTTAA/----- TTTGAGCAGT 3070 het 3070 ref 31 19 10 3 TTTAA 1 0 361086 CASAVA_Build 8 74743845 1I AAGGAAAAGA -/G CATCTCCTTG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 G 0 1 361087 CASAVA_Build 8 74747176 1D TCAGAGGTGA T/- TGGGAACATT 3070 hom 144 het 55 0 49 6 T 2 1 361088 CASAVA_Build 8 74754461 3I GCTTGAGCCC ---/AGG AGTTTGAGAC 2352 het 2018 hom 16 6 6 4 AGG 0 1 361089 CASAVA_Build 8 74773725 1I AAAAAAAAAA -/G AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 G 0 1 361090 CASAVA_Build 8 74791452 1I GTTAATTAAC -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 30 19 9 2 T 6 7 361091 CASAVA_Build 8 74792130 4D AAATTATTAC CTAA/---- CTGAGGTCTA 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 CTAA 1 0 361092 CASAVA_Build 8 74792587 1I ATTTTACAGC -/T TTTTAATTCT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 4 5 361093 CASAVA_Build 8 74798556 3D GAATACAGTT ATA/--- ATGTTTTAAT 3070 het 3070 hom 51 25 24 4 ATA 1 0 361094 CASAVA_Build 8 74823430 1I CTATATAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 10 11 12 T 12 13 361095 CASAVA_Build 8 74827972 1D AACTAATAAG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 8 7 361096 CASAVA_Build 8 74830649 1I CACACACAAT -/G GCAGTGATAC 2517 hom 19 het 11 0 6 5 G 1 2 361097 CASAVA_Build 8 74836213 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 13 14 361098 CASAVA_Build 8 74869965 4I ATTTTACAGA ----/CTGT CTGATATGGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CTGT 0 1 361099 CASAVA_Build 8 74871700 1I AATAAAAAAA -/C ATCAGAGTAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 C 0 1 361100 CASAVA_Build 8 74878559 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 727 het 727 ref 20 6 4 10 T 15 14 361101 CASAVA_Build 8 74879345 1I AGAATCTCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 12 13 361102 CASAVA_Build 8 74904365 1D GTGTATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 45 1 34 11 T 13 12 361103 CASAVA_Build 8 74904946 2D AAAATGTACC AA/-- AGATAGTTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 3 1 361104 CASAVA_Build 8 74914803 2I GGGATTACAG --/GT GTGTTGAGCC 3070 het 2892 hom 19 8 7 4 GT 2 3 361105 CASAVA_Build 8 74918964 6I CCTCCCCCTC ------/CCTCTT TGCACGGACT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 CCTCTT 0 1 361106 CASAVA_Build 8 74922430 1I GTGGCTCACA -/C CCTGTAATCC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 C 2 3 361107 CASAVA_Build 8 74923816 1D18M1I CAACAAAAGC AAAAAAAAGTTTATTAAAC-/-AAAAAAAGTTTATTAAACA AAAAAAAGAA 3070 hom 144 het 45 0 49 3 N/A 0 0 361108 CASAVA_Build 8 74932246 10D AAAGATTGCA AGTATGTAAG/---------- AGTATGTAAG 3070 hom 69 het 26 0 24 3 AGTATGTAAG 2 1 361109 CASAVA_Build 8 74943494 1I GCTTGGTGTG -/A AAAAAAAAAA 1180 het 1180 ref 43 23 3 17 A 15 16 361110 CASAVA_Build 8 74995811 1D TATCTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1468 hom 26 7 14 5 T 14 13 361111 CASAVA_Build 8 75006798 1I GCACTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 1170 het 1170 ref 21 6 5 10 A 13 14 361112 CASAVA_Build 8 75013778 1D AATGCAACAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 34 17 12 6 A 10 9 361113 CASAVA_Build 8 75015444 1D TTTTTCGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 556 hom 39 2 33 4 T 11 10 361114 CASAVA_Build 8 75017110 1D CACCATGGCT G/- GGGCGCGGTG 3070 hom 69 het 28 0 22 7 G 4 3 361115 CASAVA_Build 8 75031453 1I AGACTAAGAC -/A AAATATTTAA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 A 3 4 361116 CASAVA_Build 8 75031962 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2003 het 1366 hom 19 5 7 7 A 15 14 361117 CASAVA_Build 8 75037365 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 763 hom 29 2 24 4 A 11 10 361118 CASAVA_Build 8 75047712 1I CGCCTGCCAA -/C ACCGTTACTC 3070 hom 81 het 32 0 27 5 C 0 1 361119 CASAVA_Build 8 75052139 1D CCCCGGCTGA T/- TTTTTTTTTG 2758 het 1581 hom 16 5 7 4 T 10 9 361120 CASAVA_Build 8 75058249 1I ATTTTTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 311 hom 25 1 20 4 T 10 11 361121 CASAVA_Build 8 75073765 1I CTTGTTATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 22 0 10 12 T 13 14 361122 CASAVA_Build 8 75077992 3D TGTGGGAATC AGG/--- AGGACGAGAG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 AGG 2 1 361123 CASAVA_Build 8 75119366 1I TTGGCAGGGT -/A AAAAAAAAAA 3043 het 3043 ref 45 25 9 11 A 11 12 361124 CASAVA_Build 8 75165893 1D TGTACAGAAA G/- GAGTGGCATG 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 G 2 1 361125 CASAVA_Build 8 75197171 3I CCTAGCCAGA ---/TTT TTTTTTTTTT 2587 het 2587 ref 23 9 8 6 T 12 15 361126 CASAVA_Build 8 75201539 1I AATTTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2753 hom 26 8 13 5 T 9 10 361127 CASAVA_Build 8 75209906 1I GAAAGCCCAG -/A ACTTCAGCAC 3070 het 3070 ref 34 22 9 3 A 1 2 361128 CASAVA_Build 8 75213974 2D TTTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 AG 2 1 361129 CASAVA_Build 8 75218551 1D AGAAAGACAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2935 hom 33 9 13 11 A 10 9 361130 CASAVA_Build 8 75225587 4I ATTTGCTGGA ----/ATGT ATGTGTGTAT 1431 het 1431 ref 46 20 11 15 ATGT 1 2 361131 CASAVA_Build 8 75230537 2D GTGTATAGAA CC/-- CCCCCCCCCC 3070 het 1119 hom 33 9 12 12 C 12 10 361132 CASAVA_Build 8 75232656 1I AAGCATACAC -/A AGTATCAATA 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 1 2 361133 CASAVA_Build 8 75240196 1I GTATTCATTT -/G GTCTTTGACA 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 G 1 2 361134 CASAVA_Build 8 75243666 1I TTTCAAGATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2433 hom 21 7 10 4 T 10 11 361135 CASAVA_Build 8 75251458 1I TGCATTCACA -/G ATGGTTAAGG 3070 het 3070 ref 51 26 22 3 G 0 1 361136 CASAVA_Build 8 75252829 1D GGAGTCTCTG T/- TGCCCAGGCT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 2 1 361137 CASAVA_Build 8 75262708 2D AAATGAAAAC AT/-- GTTTAAATTG 3070 hom 54 het 26 0 19 8 AT 1 0 361138 CASAVA_Build 8 75269032 1I ACCAAGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 110 het 41 0 36 5 T 10 11 361139 CASAVA_Build 8 75295959 5D ACACTATATA TTATG/----- TTATATTGTC 3070 het 3070 hom 24 13 11 2 TTATG 1 0 361140 CASAVA_Build 8 75299094 1I ATCTTAATTT -/A AAAAAATCTA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 6 7 361141 CASAVA_Build 8 75300695 1D AAACTGAATG C/- CTTTAACAGT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 C 2 1 361142 CASAVA_Build 8 75304054 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 24 1 16 7 A 14 15 361143 CASAVA_Build 8 75304919 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTAGTAGA 2061 hom 12 het 5 0 5 0 T 4 5 361144 CASAVA_Build 8 75305662 1D TATAAAAAAA C/- ATTAGGAAGC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 C 1 0 361145 CASAVA_Build 8 75310289 1D AATATGGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 162 hom 39 2 24 13 A 15 14 361146 CASAVA_Build 8 75315843 1D TACATATATA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 T 7 6 361147 CASAVA_Build 8 75321391 1I ATAGCAACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 968 hom 44 3 37 4 A 9 10 361148 CASAVA_Build 8 75338620 1D GCTGTGAGCC T/- TTCTTTTGGA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 2 361149 CASAVA_Build 8 75358720 1I CAGTGGCAAG -/C TAGCGCTTGG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 C 0 1 361150 CASAVA_Build 8 75360422 2D ATCCCACCTA GT/-- GTGATTATTC 3070 hom 114 het 42 0 39 4 GT 2 1 361151 CASAVA_Build 8 75361357 2D CTCCTGATCC CT/-- CTCTTCCCCA 3070 hom 90 het 33 0 31 4 CT 3 2 361152 CASAVA_Build 8 75365130 4I ATACACAATA ----/ATAG ACAGACAGAG 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 ATAG 0 1 361153 CASAVA_Build 8 75367440 4I CACTGCTGTT ----/AAAA AAAAAACAAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 6 10 361154 CASAVA_Build 8 75372691 4I ATGAAATTAT ----/ATAA ATAGAGAAAT 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 ATAA 0 1 361155 CASAVA_Build 8 75379455 1I ATTGATAGGG -/A TTTCTAGACC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 0 1 361156 CASAVA_Build 8 75381768 15I ATAACTTGAT ---------------/ATAAATGCATATGCC ATTTCCTTGC 3070 hom 96 het 36 0 33 4 ATAAATGCATATGCC 0 1 361157 CASAVA_Build 8 75388346 1I TAGAGGAATT -/A AAAAAAAAAA 1483 het 1483 ref 15 8 5 2 A 10 11 361158 CASAVA_Build 8 75389317 1I TCCTTCTTAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 8 9 361159 CASAVA_Build 8 75399682 2I ATTTACAAAC --/AT TCAAGAAATT 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 AT 0 1 361160 CASAVA_Build 8 75414628 1D TGAGAACTTG C/- TGTTGTCTGC 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 C 1 0 361161 CASAVA_Build 8 75414799 4I GAATATCTCC ----/CTTA CTTCAAAACT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 CTTA 0 1 361162 CASAVA_Build 8 75415433 2D TTGGTGTCTC TG/-- TAAAATTCAG 3070 het 3070 hom 41 15 18 10 TG 1 0 361163 CASAVA_Build 8 75422005 1I GGAAGCCTAT -/C CTGTGTTAGG 3070 hom 126 het 49 0 42 7 C 1 2 361164 CASAVA_Build 8 75423016 1D GGAAGAAGGG A/- AAAATAGGTA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 5 4 361165 CASAVA_Build 8 75427211 1I TAATAGGGTA -/G GGTGAAAGCA 3070 hom 105 het 44 0 36 8 G 2 3 361166 CASAVA_Build 8 75428298 3I AAAAACAGCG ---/TTA TTATCACAAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TTA 1 2 361167 CASAVA_Build 8 75434775 4D TTTCAAACTT TGAA/---- TGAATGTCTG 3070 hom 181 het 68 0 61 7 TGAA 2 1 361168 CASAVA_Build 8 75444427 2D GTGTGTGTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1538 hom 29 5 14 11 AT 8 7 361169 CASAVA_Build 8 75444606 1D TTAGAAGGGG A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 7 361170 CASAVA_Build 8 75449873 1I ATCCCAGATC -/T TTGGGAGGTC 3070 hom 54 het 20 0 18 2 T 2 3 361171 CASAVA_Build 8 75450117 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 4 A 11 10 361172 CASAVA_Build 8 75451457 5D TTTCATTATC TTATT/----- TTAAGACTTA 2647 het 2400 hom 18 9 9 1 TTATT 1 0 361173 CASAVA_Build 8 75452026 3I TTCTTAAAGA ---/CAC CATTAAGAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 CAC 0 1 361174 CASAVA_Build 8 75453931 23I TCCGACTTTC -----------------------/AGGGTGATAGTGTACATGAGGAA AGGGTCCGAC 3070 hom 90 het 31 0 30 2 AGGGTGATAGTGTACATGAGGAA 0 1 361175 CASAVA_Build 8 75455293 1I CTACAGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2880 hom 31 10 12 9 T 12 13 361176 CASAVA_Build 8 75482490 4D CTAGAAAACC CTGA/---- CTAATATACC 3070 het 3070 ref 35 22 11 3 CTGA 1 0 361177 CASAVA_Build 8 75515395 1D TTTAGAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 43 0 31 12 T 13 12 361178 CASAVA_Build 8 75515798 9I TTGCATATTA ---------/GTGTTGCTG ACGTCTGCCC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 GTGTTGCTG 0 1 361179 CASAVA_Build 8 75523045 1I TATAGTATGT -/C CTTTTTATGT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 C 1 2 361180 CASAVA_Build 8 75524878 1I ATTTCCTTTG -/T GTTTTTTTTT 3070 het 1917 hom 22 6 13 3 T 0 1 361181 CASAVA_Build 8 75525616 1I GAATAATGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 T 8 9 361182 CASAVA_Build 8 75533652 11I CACACACACC -----------/AGCTATGGTAG AGGTGGGGAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 AGCTATGGTAG 0 1 361183 CASAVA_Build 8 75535576 12D ATGAATATAC AGAGAAAGAGAG/------------ AGAGAATGAG 3070 het 3070 hom 39 19 17 7 AGAGAAAGAGAG 1 0 361184 CASAVA_Build 8 75538251 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 8 4 A 11 10 361185 CASAVA_Build 8 75538732 3I GCATAAAGGG ---/AAA AAAAAATCCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 6 9 361186 CASAVA_Build 8 75540568 1D TCACACCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 T 15 14 361187 CASAVA_Build 8 75546237 1D TAAATTTTCC T/- TTTTTTTTTA 2553 het 2553 ref 22 9 10 3 T 10 9 361188 CASAVA_Build 8 75547874 3D GCTGCATGTA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1202 hom 20 6 9 5 T 14 11 361189 CASAVA_Build 8 75548611 1D TTTAGAATAG T/- TTTTTTCCTG 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 T 7 6 361190 CASAVA_Build 8 75551720 1D AATGAGTCAT A/- AATTTGGTCT 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 3 2 361191 CASAVA_Build 8 75552254 1D CTTTGGATGG T/- TTTTTTTTTT 1009 het 1009 ref 54 42 4 8 T 11 10 361192 CASAVA_Build 8 75587710 1I ATTACCTAAC -/A AAGGAGGACC 3070 het 3070 hom 50 16 27 7 A 2 3 361193 CASAVA_Build 8 75603207 1I TTAGACTAAG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 41 14 23 4 A 7 8 361194 CASAVA_Build 8 75608464 1I CAATGAAATG -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 39 21 18 0 T 7 8 361195 CASAVA_Build 8 75617451 5D CATGATAAAA ATATT/----- ATATTCTATG 3070 het 3070 ref 42 22 20 2 ATATT 2 1 361196 CASAVA_Build 8 75623340 1I5M1I TGAAGTTTTT -GAAGA-/GGAAGAG GTATTGCCAC 3070 hom 53 het 21 0 17 6 N/A 0 0 361197 CASAVA_Build 8 75629441 1D AGTTACTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 18 6 T 11 10 361198 CASAVA_Build 8 75630529 1D TTTGATGTGG T/- TTGGCTGTGT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 T 3 2 361199 CASAVA_Build 8 75639067 1D AGGGACATGA T/- TTTTTTTTTT 1799 het 1799 ref 51 37 5 9 T 12 11 361200 CASAVA_Build 8 75658302 1D TTTGACCAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 10 9 361201 CASAVA_Build 8 75663858 1I TGCTTGTTTT -/G TTTTTTTGTT 655 het 655 ref 17 10 3 4 G 0 1 361202 CASAVA_Build 8 75668442 4D ATACTCAAGG AGGA/---- AGGACTCTCA 3070 het 3070 hom 43 18 21 7 AGGA 2 1 361203 CASAVA_Build 8 75669030 1D GTTTTATTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2586 hom 19 6 11 2 T 10 9 361204 CASAVA_Build 8 75705319 7D GATTTCTCTG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 39 18 19 4 A 16 9 361205 CASAVA_Build 8 75953147 1D ATACTAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 A 11 10 361206 CASAVA_Build 8 75981374 1I GAAGAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2880 hom 30 9 15 6 A 12 13 361207 CASAVA_Build 8 75987902 5I ATATGTAAAA -----/TTACT TTAAGTTCCA 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 TTACT 0 1 361208 CASAVA_Build 8 75997444 2D ACACACACTC AT/-- GTGTGTACAC 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 AT 1 0 361209 CASAVA_Build 8 75999904 2I TTGCAGTCTC --/TT GATTATTCTA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 0 2 361210 CASAVA_Build 8 76000942 1I TTCAATAGTA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 8 9 361211 CASAVA_Build 8 76003943 1D AACAGACTTT C/- CCCCATTGAA 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 C 5 4 361212 CASAVA_Build 8 76110447 1D AGCTCAGTTT A/- AAAAAAAAAA 2039 het 2039 ref 44 26 5 13 A 15 14 361213 CASAVA_Build 8 76176189 1D ATATGTTTAG A/- AAGTGGGAAG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 3 2 361214 CASAVA_Build 8 76179571 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 935 het 935 ref 15 9 2 5 T 12 13 361215 CASAVA_Build 8 76203091 2I TTAAAAATTG --/TT TGTTTCTCAT 3070 het 3070 hom 39 12 21 6 T 1 3 361216 CASAVA_Build 8 76222339 1D ATTAAGACTT G/- GGAGAGTTTG 3070 het 3070 ref 25 13 12 0 G 3 2 361217 CASAVA_Build 8 76227386 2D AAAATCAAAC TG/-- TATTCTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 TG 1 0 361218 CASAVA_Build 8 76237341 1D ATAGTGGGTC T/- TTTTTTTTTT 1418 het 1418 ref 40 30 4 6 T 12 11 361219 CASAVA_Build 8 76242111 1D GCCTCCTGGT A/- AAAATGGTGA 3070 het 3070 hom 34 16 18 1 A 5 4 361220 CASAVA_Build 8 76242624 1I TTTCAAAATT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 G 0 1 361221 CASAVA_Build 8 76243068 1D AAGCATTCAT A/- AAAAATTCAC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 A 6 5 361222 CASAVA_Build 8 76246197 1D AATTCTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 13 12 361223 CASAVA_Build 8 76247926 1I GTGGAATCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 11 9 A 13 14 361224 CASAVA_Build 8 76274331 1D ATTTTAGAAT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 G 1 0 361225 CASAVA_Build 8 76283875 1D TTCTTGGACT C/- TGAGGTTTGA 3070 het 3070 ref 50 22 21 8 C 1 0 361226 CASAVA_Build 8 76290404 3I TTTTTTTGAG ---/AGA AGAAGTCTTA 388 het 388 ref 23 8 2 13 AGA 1 2 361227 CASAVA_Build 8 76291672 1I ATGTATATAT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 44 19 20 5 A 0 1 361228 CASAVA_Build 8 76296443 3D ATAGGTTCTT TTA/--- TTTTCTCTAT 3070 het 3070 hom 24 7 16 2 TTA 1 0 361229 CASAVA_Build 8 76300690 57D TCTGTATTCA TTCCCGTTGTTACATCATTTTGCAAGTTCCTCAACAATAACTGAGATACACTTTTCT/--------------------------------------------------------- CCCTCTTTAG 3070 het 3070 ref 37 43 15 3 TTCCCGTTGTTACATCATTTTGCAAGTTCCTCAACAATAACTGAGATACACTTTTCT 1 0 361230 CASAVA_Build 8 76305798 5D GAGATATACC TAAAG/----- TAAAGGACGA 2145 het 2145 ref 11 6 5 1 TAAAG 2 1 361231 CASAVA_Build 8 76307354 1D TGTTGATAAT G/- GGGGGGGCTG 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 G 8 7 361232 CASAVA_Build 8 76329671 10I TGAAACCAAA ----------/AAAAGAGCCC AAATAGCCAA 3070 het 3070 ref 39 22 12 5 AAAAGAGCCC 0 1 361233 CASAVA_Build 8 76330287 1I ATGACTCAAC -/A GTAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 A 0 1 361234 CASAVA_Build 8 76346227 1D AGACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2275 hom 32 10 14 9 A 17 16 361235 CASAVA_Build 8 76352150 1D AGGCAGGCTA T/- TTGAAAATGC 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 3 2 361236 CASAVA_Build 8 76369723 1I TAGTCTCACC -/A AACTTGCTAG 3070 het 3070 ref 60 28 27 5 A 2 3 361237 CASAVA_Build 8 76373859 1I ATTGTTTTCC -/A AGGTGTCATC 3070 het 3070 ref 54 28 24 2 A 1 2 361238 CASAVA_Build 8 76380654 2I TATGAGAGAA --/AG AGAGAGAGAG 1245 het 1245 ref 38 22 8 8 AG 8 9 361239 CASAVA_Build 8 76388028 1I TTTATTTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2405 hom 37 7 17 13 A 11 12 361240 CASAVA_Build 8 76405015 2D TATAATAAAA AT/-- ATATATATAT 1125 het 1125 ref 12 6 3 3 AT 6 5 361241 CASAVA_Build 8 76405064 1I AGTGATTACC -/T TTTGTACACT 3070 het 2520 hom 20 7 9 4 T 3 4 361242 CASAVA_Build 8 76413090 9I CTTTACATTA ---------/GATTTTTTC GCAGTTTGAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 GATTTTTTC 0 1 361243 CASAVA_Build 8 76451029 3I TCTATGTCTT ---/CTC CTCACCTTTC 3070 het 3070 ref 29 17 8 4 CTC 1 2 361244 CASAVA_Build 8 76463381 2D TTTTTGCCCC CT/-- GTTATCCACA 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 CT 1 0 361245 CASAVA_Build 8 76464650 2I AGTTAATTGC --/AT AGTTACCACA 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 AT 0 1 361246 CASAVA_Build 8 76468469 1D CACTTGTGAG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 A 8 7 361247 CASAVA_Build 8 76476031 1D GCAACCATTC A/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 25 5 A 1 0 361248 CASAVA_Build 8 76477192 5I AAATACCCTA -----/TTTAT TTTATTTTTA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TTTAT 1 2 361249 CASAVA_Build 8 76488655 1I TAAAAGATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 9 10 361250 CASAVA_Build 8 76497429 1I CTGCATTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 566 hom 23 4 9 10 T 13 14 361251 CASAVA_Build 8 76506717 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2187 hom 22 9 8 5 A 11 12 361252 CASAVA_Build 8 76511629 1I AGGCCAGGAG -/T TTGCAACCAG 3070 hom 123 het 43 0 41 2 T 2 3 361253 CASAVA_Build 8 76530110 4D CAACTGTCTT TATC/---- TAGAAAGATT 3070 het 3070 hom 30 13 13 7 TATC 1 0 361254 CASAVA_Build 8 76534685 1I ATACAAATGG -/A AAAATCATAC 3070 het 3070 ref 36 15 13 8 A 4 5 361255 CASAVA_Build 8 76534869 1D CGTTCTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 38 1 30 8 A 11 10 361256 CASAVA_Build 8 76536520 2I CTGTATATAT --/TA TGTTTTTTTC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 TA 0 1 361257 CASAVA_Build 8 76539028 1I ATTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 25 14 7 T 10 11 361258 CASAVA_Build 8 76544085 6I AAATATACCC ------/CACCCA CACCCACAGT 3070 het 3070 hom 46 21 20 5 CACCCA 1 2 361259 CASAVA_Build 8 76550981 2D TAGAACATGT GG/-- TATTTGATTT 3070 het 3070 hom 37 11 22 5 G 2 0 361260 CASAVA_Build 8 76556296 1I TATTTTTGAG -/A CACTTACCTG 3070 het 3070 ref 40 23 14 3 A 0 1 361261 CASAVA_Build 8 76556620 1I ATGCCCAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 9 10 361262 CASAVA_Build 8 76565204 2D TTGCCCATAT TA/-- TGACTATGCC 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 TA 1 0 361263 CASAVA_Build 8 76571595 2I ACATTATTAC --/TA TATATATATA 3070 het 2551 hom 23 6 9 8 TA 8 9 361264 CASAVA_Build 8 76571863 1D TAGCTTTGAT G/- GGGGTATATA 3070 het 3070 ref 46 27 19 4 G 5 4 361265 CASAVA_Build 8 76574376 3I AAGAAAATTT ---/AAC AACAACAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AAC 2 3 361266 CASAVA_Build 8 76579296 6D ACATATATAC ACATAT/------ ACATATACTT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 ACATAT 2 1 361267 CASAVA_Build 8 76580478 1I CAAGATTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 11 12 361268 CASAVA_Build 8 76588689 7D CATTTTTAGG TTAAGAC/------- TTTCTCTATA 3070 het 3070 ref 26 16 12 3 TTAAGAC 1 0 361269 CASAVA_Build 8 76589145 1D TTCTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 30 hom 22 1 15 6 T 11 10 361270 CASAVA_Build 8 76589161 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 24 1 16 7 T 12 11 361271 CASAVA_Build 8 76592771 1I ACCTCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3035 het 1119 hom 14 4 9 1 T 10 11 361272 CASAVA_Build 8 76603572 1I AAACTTCTAC -/T TTTTTTCATG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 6 7 361273 CASAVA_Build 8 76605221 1I CACCAGTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 15 17 10 A 12 13 361274 CASAVA_Build 8 76609772 2D GAATTTTTAC AT/-- GTTATAATAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 AT 1 0 361275 CASAVA_Build 8 76610143 2I GGAAATATGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 9 11 361276 CASAVA_Build 8 76617530 1I TATGAATTAC -/T TACAGCAATA 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 T 1 2 361277 CASAVA_Build 8 76619441 1D TTTTCTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 T 12 11 361278 CASAVA_Build 8 76630371 1I GATTTTTTTT -/A ATCTCTACTC 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 1 2 361279 CASAVA_Build 8 76630865 2D TTTGGGTAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 8 19 5 T 12 10 361280 CASAVA_Build 8 76634063 1D5M2I CGTTTTTTTT GTTTGT--/-TTTGTTG TTTTTTTTTT 3070 het 2566 hom 26 11 13 5 N/A 0 0 361281 CASAVA_Build 8 76636927 1D AGCTACAGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 10 9 361282 CASAVA_Build 8 76638221 1D ATTTTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 A 12 11 361283 CASAVA_Build 8 76641615 1D AAAAACTGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 10 9 361284 CASAVA_Build 8 76649241 1D TCACGAATGG A/- AAAAAAAAAA 94 het 94 ref 43 21 3 19 A 12 11 361285 CASAVA_Build 8 76651308 1D GAAGGTGAAA G/- GCAGGTCTTA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 G 2 1 361286 CASAVA_Build 8 76652352 2I AAGAAAACAC --/TT TACTTATACA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 3 361287 CASAVA_Build 8 76652886 3D TTTCTTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 148 hom 27 2 14 11 T 18 15 361288 CASAVA_Build 8 76653889 1D GTAGTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 26 0 20 6 T 11 10 361289 CASAVA_Build 8 76655525 2I13M1I CATTGAATGC --ATATATCAGAAAG-/ATATATATCAGAAAGA AAAAAAATCT 3070 hom 105 het 32 0 36 3 N/A 0 0 361290 CASAVA_Build 8 76656290 1I TTCAGGTATG -/C AGGATTGGTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 C 0 1 361291 CASAVA_Build 8 76662211 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 11 10 361292 CASAVA_Build 8 76662758 1I TTTGAGTTGA -/T TTTTGTATGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 4 5 361293 CASAVA_Build 8 76678594 2I TTCTTTTCAT --/GA GAGAGTAGAT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 GA 2 3 361294 CASAVA_Build 8 76680299 5D AAATACCTTG AATAT/----- AATAATTGAT 3070 het 3070 ref 28 14 13 2 AATAT 1 0 361295 CASAVA_Build 8 76681233 4I TAAATAACTT ----/ACTG ACACCTTAAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 ACTG 0 1 361296 CASAVA_Build 8 76682737 1D CTATTTTTTA T/- ATCTCTATTT 3070 het 3070 hom 27 8 14 6 T 1 0 361297 CASAVA_Build 8 76687263 1D ATTAGTCTCT G/- TTTTCCAAAT 3070 het 3070 ref 41 23 17 1 G 1 0 361298 CASAVA_Build 8 76687482 1D AGAAGATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 13 9 A 11 10 361299 CASAVA_Build 8 76707039 1D TATCTTGATG T/- TTTAAAAATT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 3 361300 CASAVA_Build 8 76721895 1D CTGAGGAATT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 A 9 8 361301 CASAVA_Build 8 76727059 3D CGTTCCCAAT TAC/--- TACTACCTAG 3070 hom 75 het 37 0 25 13 TAC 3 2 361302 CASAVA_Build 8 76729891 3D CTATCTATCT ATC/--- ATCATCTATG 1242 het 299 hom 46 2 3 42 ATC 3 2 361303 CASAVA_Build 8 76735879 1D TATGGTGAAA C/- CCCCATCTCT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 C 5 4 361304 CASAVA_Build 8 76737793 4I GAAAAGAAAG ----/AGAA AGAAAGAAAG 3070 hom 104 het 40 0 33 7 AGAA 3 4 361305 CASAVA_Build 8 76748173 4I ATTTGCCCTC ----/TCTT TCTCCTGTAG 3070 het 3070 ref 54 25 24 5 TCTT 0 1 361306 CASAVA_Build 8 76755757 2I TATTGAAAAC --/AG ATGTTTGATA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 AG 0 1 361307 CASAVA_Build 8 76758449 4I GAATGTGCAG ----/TATT TAGTTTTTCA 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 TATT 0 1 361308 CASAVA_Build 8 76763229 1D GGAGCCATGT A/- AAATTGCCAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 A 4 3 361309 CASAVA_Build 8 76774623 1I ACATATACTC -/T TAATTATTAT 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 T 1 2 361310 CASAVA_Build 8 76777393 1D CATTGAGCAA G/- ATTTCATCAA 3070 het 3070 ref 34 16 16 3 G 1 0 361311 CASAVA_Build 8 76795762 1I CTCAATATAC -/A ACAGATATGT 3070 het 3070 ref 44 30 10 4 A 1 2 361312 CASAVA_Build 8 76796065 5D TCAATTACTC TACAT/----- TGATATAAAA 3070 het 3070 hom 22 8 11 5 TACAT 1 0 361313 CASAVA_Build 8 76800457 1I CAAAGGTGGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 T 7 8 361314 CASAVA_Build 8 76806032 8D TTGAGAATTA AGGAGTCC/-------- AGAGCTGATT 2519 het 2519 ref 27 20 6 3 AGGAGTCC 1 0 361315 CASAVA_Build 8 76808479 3D TTGCTTTCTG GGA/--- GGAGGTAGCT 3070 het 2512 hom 26 6 17 4 GGA 2 1 361316 CASAVA_Build 8 76811736 1I ATTTTCACTT -/A ACCAATACAC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 A 1 2 361317 CASAVA_Build 8 76812160 4D TCAATATCTC AGAA/---- TGAGATCAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 AGAA 1 0 361318 CASAVA_Build 8 76812938 1I GAAGTGCCCT -/A AAGGCTGTCA 3070 het 3070 ref 50 23 22 5 A 2 3 361319 CASAVA_Build 8 76816559 1I ATCTTGGCTC -/T TTTTTTCAGT 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 T 6 7 361320 CASAVA_Build 8 76824903 1D ATCCTAATCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 12 18 10 T 10 9 361321 CASAVA_Build 8 76825093 5D AACTACACTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 868 hom 24 5 8 12 T 17 12 361322 CASAVA_Build 8 76829207 3D TATGCCTAAG ATA/--- ATAATAATAA 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 ATA 6 5 361323 CASAVA_Build 8 76830025 8D CCTTCTGCTT GAGGAGAG/-------- GAGAGGGAAG 3070 het 3070 ref 43 27 15 3 GAGGAGAG 1 0 361324 CASAVA_Build 8 76831978 2D ACCTTTTCTG CA/-- CACACACACA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 CA 8 7 361325 CASAVA_Build 8 76832873 1D AGATTGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 10 9 361326 CASAVA_Build 8 76833136 1D TTCTGTGGCG A/- AAGATAGTTT 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 3 2 361327 CASAVA_Build 8 76836677 5D ACTATTACCA GTTCT/----- GTCTATAAGA 3070 het 3070 hom 25 11 11 5 GTTCT 1 0 361328 CASAVA_Build 8 76841350 1I CTTCTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 852 het 852 ref 31 11 4 16 C 0 1 361329 CASAVA_Build 8 76846903 5D GCACACTTTC TTAAG/----- TTAAGAAGAA 3070 het 3070 hom 33 14 19 1 TTAAG 2 1 361330 CASAVA_Build 8 76858083 4D ATAGATCATG TAAT/---- TAATCTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 16 6 TAAT 2 1 361331 CASAVA_Build 8 76858284 1D TCTCTCAAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 9 8 361332 CASAVA_Build 8 76862726 4D TTGATAAATA TTTG/---- TTTATAAGAA 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 TTTG 1 0 361333 CASAVA_Build 8 76868100 1I ATTATTTGTA -/G TTTATTATAT 3070 hom 126 het 48 0 43 5 G 0 1 361334 CASAVA_Build 8 76869083 1I CTCTCATGGT -/G GGGGGGCAAG 3070 het 3070 ref 26 16 10 0 G 6 7 361335 CASAVA_Build 8 76871637 2D TTTGTCAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 541 hom 30 3 12 15 T 12 10 361336 CASAVA_Build 8 76873611 1D ACCCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1648 het 1648 ref 25 11 6 8 A 16 15 361337 CASAVA_Build 8 76880320 1D GTTGGAGTGA T/- TTTTGAGGGG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 5 4 361338 CASAVA_Build 8 76882885 1D ACCCAAACTG C/- AAACTCAGGA 3070 het 3070 ref 45 28 12 6 C 1 0 361339 CASAVA_Build 8 76886614 1D GTTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1451 het 1451 ref 36 17 5 14 T 15 14 361340 CASAVA_Build 8 76910066 1D ACTCCAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1659 hom 16 5 8 3 A 15 14 361341 CASAVA_Build 8 76916785 2I AGCTTAACTT --/TA TGTTAATTTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 TA 0 1 361342 CASAVA_Build 8 76922425 1I ATTTTTCTCA -/T TTTTTTGCCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 6 7 361343 CASAVA_Build 8 76930094 1D TTTGTGAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 10 11 A 17 16 361344 CASAVA_Build 8 76931451 1D TAAAGATTAA C/- ATTAAGGGTG 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 C 1 0 361345 CASAVA_Build 8 76934277 2D TCTTTGGAAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 AG 7 6 361346 CASAVA_Build 8 76936911 9D TACTCAGTCT TTATTAGCA/--------- GCAGTATGTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 6 TTATTAGCA 1 0 361347 CASAVA_Build 8 76952004 1I TTTCATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 24 8 4 T 10 11 361348 CASAVA_Build 8 76970084 1D ATTTAATTCT C/- TCACATCTTG 3070 het 3070 hom 38 8 25 5 C 1 0 361349 CASAVA_Build 8 76973504 1I ATTTAAGGAT -/A AAAATCAGAG 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 A 4 5 361350 CASAVA_Build 8 76977147 1D TCTCCAACCA C/- CCCCCCAAGT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 C 7 6 361351 CASAVA_Build 8 76994615 1I ATTACTCATG -/A AAAAAAATCT 3070 het 79 hom 34 1 26 7 A 7 8 361352 CASAVA_Build 8 77019254 1I ACTTCTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 420 hom 43 1 33 9 T 11 12 361353 CASAVA_Build 8 77023086 1D AGTAAGGCTT A/- AAAAAATTTT 3070 hom 54 het 23 0 18 5 A 7 6 361354 CASAVA_Build 8 77024762 1I GAAAAAAAAA -/C ACGTGTATAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 C 0 1 361355 CASAVA_Build 8 77057996 1I TATTTTATTT -/A AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 A 6 7 361356 CASAVA_Build 8 77062448 1D CCATGACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 118 het 46 0 37 9 T 12 11 361357 CASAVA_Build 8 77073612 4I GTGTGTTGTT ----/AAAC AAAAGTTCCT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AAAC 0 1 361358 CASAVA_Build 8 77081783 1D GATGGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 123 hom 50 1 38 12 T 11 10 361359 CASAVA_Build 8 77087506 1I CTCAAATGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 890 hom 35 5 20 10 A 16 17 361360 CASAVA_Build 8 77142964 4I TCATCCAATC ----/TAAA TTTAAAAAGC 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 TAAA 0 1 361361 CASAVA_Build 8 77225088 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTTT 2779 het 1662 hom 15 6 7 2 T 10 11 361362 CASAVA_Build 8 77328946 1D AAACTGAATG A/- AAATATATTA 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 A 4 3 361363 CASAVA_Build 8 77347678 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2925 het 2536 hom 32 9 8 15 A 15 16 361364 CASAVA_Build 8 77376651 1I CACATTTTAG -/T TTTTTTTTTT 2604 het 2604 ref 36 21 7 8 T 14 15 361365 CASAVA_Build 8 77400679 2D ATACTGTAGC AG/-- AGAGAGAGAG 1367 het 1367 ref 43 31 3 10 AG 9 8 361366 CASAVA_Build 8 77450766 1D ACTTGTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 382 hom 26 2 17 7 A 15 14 361367 CASAVA_Build 8 77511374 1I TAGTCCCCCA -/C CCCCCCACAG 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 C 6 7 361368 CASAVA_Build 8 77570635 1D CTACTCCTGC T/- TTTTTTTTTT 2039 het 2039 ref 44 28 6 10 T 13 12 361369 CASAVA_Build 8 77571130 3D TCTCATCCCC CAA/--- CTTTTTAACT 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 CAA 1 0 361370 CASAVA_Build 8 77597613 1D GCTAAAAAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 35 10 17 8 A 9 8 361371 CASAVA_Build 8 77602911 1I TAAAAGAAGG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 47 26 15 6 A 8 9 361372 CASAVA_Build 8 77611498 3D AATGAAGCAT ATA/--- ATAATTAAAA 3070 het 3070 hom 47 16 26 6 ATA 2 1 361373 CASAVA_Build 8 77626210 3D TTGTACATCT ACA/--- ACAACATTCC 3070 het 3070 ref 52 27 20 7 ACA 3 2 361374 CASAVA_Build 8 77628565 1I TAATGTTTTT -/A AAAGATCACA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 3 4 361375 CASAVA_Build 8 77637475 1I ATTTTGTGTG -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 T 7 8 361376 CASAVA_Build 8 77665412 1D AAAGTGCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 T 11 10 361377 CASAVA_Build 8 77673444 4D CATTTTTTCA CAGT/---- CATTTTTTAC 3070 het 3070 ref 40 21 19 1 CAGT 1 0 361378 CASAVA_Build 8 77709407 1I GTAAAACCAC -/A ATGAGATAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 1 2 361379 CASAVA_Build 8 77711082 1I AATTAAAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 A 10 11 361380 CASAVA_Build 8 77729239 1I AATCAACACC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 8 9 361381 CASAVA_Build 8 77731821 2D GCTCAGGAGA CT/-- CTCTTGAACC 1427 het 1427 ref 15 9 5 1 CT 3 2 361382 CASAVA_Build 8 77732693 1I AGTAGGAGAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 46 18 22 6 T 8 9 361383 CASAVA_Build 8 77742787 1D AGATGATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 A 12 11 361384 CASAVA_Build 8 77753465 1I TAGCCACCAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 T 8 9 361385 CASAVA_Build 8 77771425 1D CTTTCAGGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 987 hom 32 5 15 12 A 17 16 361386 CASAVA_Build 8 77773384 2I AGAAAAGAAT --/GA GAGAGGGAGA 3070 het 3070 hom 50 17 26 7 GA 2 3 361387 CASAVA_Build 8 77795237 1D CACTTGTTGT C/- CTATTATGGA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 C 2 1 361388 CASAVA_Build 8 77798765 10D AAAACAAAAC AAAAACCCCA/---------- AAAAACATTT 3070 het 3070 hom 49 18 25 10 AAAAACCCCA 1 0 361389 CASAVA_Build 8 77811393 1D CTGATTTTAC T/- TGGAAGAATG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 T 2 1 361390 CASAVA_Build 8 77817757 2I TTGTGAGAAA --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 AC 4 5 361391 CASAVA_Build 8 77820372 2D TTTCTAAAAG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 32 14 16 3 AT 6 5 361392 CASAVA_Build 8 77828735 1I TTTTATATGC -/A AAAAAAATTA 3070 het 426 hom 24 1 19 4 A 7 8 361393 CASAVA_Build 8 77829287 1D CTCAAAAAAA C/- AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 C 1 0 361394 CASAVA_Build 8 77838025 10D CTGTTCCCGT CTGATAGCTC/---------- CAGGTTTCCA 3070 het 3070 ref 37 18 17 7 CTGATAGCTC 1 0 361395 CASAVA_Build 8 77841656 1D AATGGAACCT G/- TGCTTTTTCA 3070 het 3070 hom 23 11 11 1 G 1 0 361396 CASAVA_Build 8 77844609 2I ATAAAAAAAC --/TT TGAATATTTT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 1 3 361397 CASAVA_Build 8 77852656 1I TGTTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 G 0 1 361398 CASAVA_Build 8 77854849 1I AAGTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 A 11 12 361399 CASAVA_Build 8 77879542 1I TTATTTAACC -/A ATCCACTGGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 1 2 361400 CASAVA_Build 8 77932631 1D CAATGACAGA T/- TTTTTTTTTT 1923 het 1923 ref 34 20 6 8 T 15 14 361401 CASAVA_Build 8 77939404 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 10 9 361402 CASAVA_Build 8 77941601 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAACT 3070 het 337 hom 37 2 32 3 A 8 9 361403 CASAVA_Build 8 77954187 2D AGGTATATAT AC/-- ACACACAAGC 3070 hom 111 het 42 0 38 7 AC 4 3 361404 CASAVA_Build 8 77973084 1I TAGCATGAAG -/A GTTGTTCAAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 0 1 361405 CASAVA_Build 8 77976599 1D ATGGCGGACG C/- CCCCTCCCCC 3070 hom 44 het 18 0 15 3 C 5 4 361406 CASAVA_Build 8 77982554 1D ATGCACCTAT G/- TACAGCTTCC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 0 361407 CASAVA_Build 8 77984185 1I CCTTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 33 1 24 8 T 11 12 361408 CASAVA_Build 8 78015600 4I TTTCACATCT ----/CTAA CTAAGACAAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 CTAA 1 2 361409 CASAVA_Build 8 78018205 1D TTATTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 12 0 9 3 T 15 14 361410 CASAVA_Build 8 78022925 1I GTGGATATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 665 hom 40 4 31 5 A 11 12 361411 CASAVA_Build 8 78038822 2D TTCTTCATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 236 hom 35 4 16 16 T 13 11 361412 CASAVA_Build 8 78040181 9D AATTTTCACC ATAGTAAAT/--------- AGAGATGCAC 3070 hom 84 het 30 0 29 2 ATAGTAAAT 1 0 361413 CASAVA_Build 8 78040761 1D ACCTTTTTTT G/- AAATTTTTTT 3070 hom 63 het 29 0 26 3 G 1 0 361414 CASAVA_Build 8 78040940 4D ACCCTTGCTG TGTA/---- TGTAACCTTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 TGTA 2 1 361415 CASAVA_Build 8 78047032 11D TGGTAGAATA GGGCCCTTTCT/----------- GCTCCATGCC 3070 het 3070 ref 41 17 14 14 GGGCCCTTTCT 1 0 361416 CASAVA_Build 8 78059967 2D CACCCATGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 31 0 22 11 A 16 14 361417 CASAVA_Build 8 78065070 3D GCTGGTTTGA TCT/--- TCTATCTAGA 3070 hom 111 het 42 0 34 10 TCT 2 1 361418 CASAVA_Build 8 78065711 1I TGATTGACTC -/A GGTTTGCTAC 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 0 1 361419 CASAVA_Build 8 78069421 1I TCCTGTAAAC -/T TTTGTCAGCA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 3 4 361420 CASAVA_Build 8 78070712 4I CTAAAAAAAG ----/AAAC AAACAAAAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AAAC 1 2 361421 CASAVA_Build 8 78073749 1I GTTACTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 169 hom 35 1 22 12 T 11 12 361422 CASAVA_Build 8 78074542 2D CAACTGCAGC TG/-- TGTGTGTGTT 3070 hom 129 het 49 0 44 7 TG 5 4 361423 CASAVA_Build 8 78095342 3I AGCCCATCTC ---/AAA AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 21 0 15 6 A 9 12 361424 CASAVA_Build 8 78109179 1I ACAGAACACA -/T TTTTTCCCTG 3070 hom 168 het 71 0 56 15 T 5 6 361425 CASAVA_Build 8 78112103 1I CATAGGCACC -/A AAAACAGTAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 4 5 361426 CASAVA_Build 8 78113121 1D TTTTTTTAAA T/- AAAGAAGTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 T 1 0 361427 CASAVA_Build 8 78126959 2I CCACAAAGAT --/GA GAGATGGGTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 GA 2 3 361428 CASAVA_Build 8 78136087 11I AAATCATGCG -----------/TTGCACAGGGA TTGAAGTAGA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TTGCACAGGGA 0 1 361429 CASAVA_Build 8 78136720 1I GTTTGATATG -/T TTTTATCAAA 3070 hom 123 het 50 0 42 8 T 4 5 361430 CASAVA_Build 8 78139911 1D ACTATTAAAA T/- TTTTTTATTG 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 7 6 361431 CASAVA_Build 8 78145858 1D GATAGTACCA T/- TGTACTCCTG 3070 hom 99 het 38 0 33 6 T 2 1 361432 CASAVA_Build 8 78155783 1D TTTTTTTTTT C/- ATATGTCTCT 3070 hom 32 het 37 1 31 5 C 1 0 361433 CASAVA_Build 8 78164114 1I AAAGATGGGG -/A AAAAAACAGA 2858 hom 18 het 8 0 7 1 A 6 7 361434 CASAVA_Build 8 78174064 1D TCTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 8 A 12 11 361435 CASAVA_Build 8 78185013 1I ACAAGGAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 300 hom 40 5 12 23 A 13 14 361436 CASAVA_Build 8 78186485 1I AGTGGAGAAG -/T CCATGGGTTC 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 0 1 361437 CASAVA_Build 8 78207042 1I CTTGTTCTCC -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 32 18 9 5 T 7 8 361438 CASAVA_Build 8 78219193 1I GGAATAGAAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 8 9 361439 CASAVA_Build 8 78223220 1I CCATAACTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 14 24 6 A 9 10 361440 CASAVA_Build 8 78230236 1D ATGCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 12 11 361441 CASAVA_Build 8 78233933 3I ACTTTGCAAT ---/ACA ACAACAGTTG 3070 het 3070 ref 62 32 22 8 ACA 2 3 361442 CASAVA_Build 8 78243430 2I CTGTATACTC --/TG TACCTTTATA 3070 het 3070 hom 59 24 28 7 TG 0 1 361443 CASAVA_Build 8 78247816 1D CCACAAAAAT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 A 9 8 361444 CASAVA_Build 8 78250260 1D GTCTTGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 13 7 9 A 13 12 361445 CASAVA_Build 8 78257579 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 A 7 6 361446 CASAVA_Build 8 78261085 1I CCAAAATCAA -/T TTTTTTTTTT 2837 het 2837 ref 36 17 10 9 T 14 15 361447 CASAVA_Build 8 78273410 1D AGTACATGAC T/- TTTTTTTTCT 2426 het 2426 ref 23 13 5 5 T 9 8 361448 CASAVA_Build 8 78280017 1D34M3D TTTTCTGCTC TTTTTTTTCAGAAAAGGAAACTCTCAGAGAAAAATAAA/-TTTTTTTCAGAAAAGGAAACTCTCAGAGAAAAAT--- AAGGTCACCA 3070 het 2083 hom 30 8 23 14 N/A 0 0 361449 CASAVA_Build 8 78286370 1D ACCAGTGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 414 hom 35 1 30 4 T 10 9 361450 CASAVA_Build 8 78299567 1I GACCTTTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 418 hom 39 1 28 10 T 10 11 361451 CASAVA_Build 8 78302666 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 597 hom 37 3 25 9 T 12 13 361452 CASAVA_Build 8 78304632 1I TTATTCAAAG -/T TTTTTTATTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 6 7 361453 CASAVA_Build 8 78305184 1D GTACTATTTG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 30 13 8 9 A 9 8 361454 CASAVA_Build 8 78309612 1D AACATTTGAG T/- TTTTTTTATC 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 8 7 361455 CASAVA_Build 8 78331390 3D GAGAAGCTCT TAA/--- TAAGGGTTTA 3070 het 3070 hom 19 9 8 3 TAA 2 1 361456 CASAVA_Build 8 78331856 2D ATAACTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 43 hom 29 2 11 16 T 13 11 361457 CASAVA_Build 8 78333712 1I ATGTTGTCTG -/A AAAAAATACT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 A 6 7 361458 CASAVA_Build 8 78336764 4D GCATTGTAAG AAAC/---- AATTAGTATT 3070 hom 84 het 33 0 29 5 AAAC 1 0 361459 CASAVA_Build 8 78340107 5D ATGTGTTGTG TTGTT/----- TTGTTTTATT 3070 het 3070 ref 32 17 13 6 TTGTT 2 1 361460 CASAVA_Build 8 78346345 2I TCAGTGTGGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 10 12 361461 CASAVA_Build 8 78349683 1D GTGTGATGTT C/- CCCTTCCTGT 1381 hom 7 het 4 0 3 1 C 4 3 361462 CASAVA_Build 8 78354642 1D AGTTAAATCA T/- TTTTATCATA 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 T 5 4 361463 CASAVA_Build 8 78357183 10I TCCAATAGTC ----------/AATGATAAAT TGAAAAAACT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 AATGATAAAT 0 1 361464 CASAVA_Build 8 78373159 5I TTGGACAAGA -----/AGAAG AGGAGTATAG 3070 het 3070 ref 42 22 14 6 AGAAG 0 1 361465 CASAVA_Build 8 78374496 2I ATACACACAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 AT 4 5 361466 CASAVA_Build 8 78376234 5I TATTTAAACT -----/GTAGA GTATTCATAG 3070 hom 84 het 35 0 29 6 GTAGA 0 1 361467 CASAVA_Build 8 78378468 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1585 hom 16 4 11 2 A 10 9 361468 CASAVA_Build 8 78385041 1I ACCACAACAT -/C CCACTGAAAG 3070 hom 84 het 31 0 29 3 C 2 3 361469 CASAVA_Build 8 78389676 2D AGTCCTAAAG AC/-- ACAGATAGTT 3070 het 3070 hom 51 20 26 5 AC 2 1 361470 CASAVA_Build 8 78395394 1D TAAGAAAATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 A 10 9 361471 CASAVA_Build 8 78399801 1D TTAAAAAAAA T/- ACCAAATAAG 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 T 1 0 361472 CASAVA_Build 8 78406095 4I AACTTTTGAG ----/AAAT AACCCATGAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 AAAT 0 1 361473 CASAVA_Build 8 78407400 1D TAGAAATTTC A/- CAACTAACAA 3070 het 3070 ref 54 29 22 4 A 1 0 361474 CASAVA_Build 8 78413099 2D TTGCTTCCTC TT/-- TGTCTTCTGC 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 T 3 1 361475 CASAVA_Build 8 78413310 1D TTCTTTATGG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 18 10 4 T 10 9 361476 CASAVA_Build 8 78417324 1I CAATGCCCCC -/T GGATGGGTAA 2118 het 2118 ref 14 6 5 3 T 0 1 361477 CASAVA_Build 8 78421682 1I AGTAGGTAGG -/T TTTTACTCTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 4 5 361478 CASAVA_Build 8 78424809 1D ACGTAATGGA T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 120 het 43 0 41 2 T 8 7 361479 CASAVA_Build 8 78433502 4I CACACATATA ----/TGTG TGTGTGTGTT 3070 het 101 hom 42 5 35 2 TG 4 6 361480 CASAVA_Build 8 78434115 1D ATATCTTCAA T/- TAGTGTTTTG 3070 hom 111 het 44 0 38 6 T 2 1 361481 CASAVA_Build 8 78438314 1D ACAAATATAT A/- ACTCTGTTAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 2 1 361482 CASAVA_Build 8 78445422 1D TATGGTGTTC T/- TTTTTTAACT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 7 6 361483 CASAVA_Build 8 78453880 4I TTAATGGACT ----/TAAA TAATACTTCA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 TAAA 0 1 361484 CASAVA_Build 8 78454935 1D TTTTAGTAAT A/- GGGGATGCCT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 1 0 361485 CASAVA_Build 8 78479573 1D TTTAGTGAAC T/- CCAGTGGGAG 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 T 1 0 361486 CASAVA_Build 8 78489545 1D TAGCAACCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 7 T 10 9 361487 CASAVA_Build 8 78492814 5D AAACAAAAAA CAAAC/----- AAAAAAAAAA 877 het 877 ref 32 20 4 12 CAAAC 1 0 361488 CASAVA_Build 8 78503343 1D CACCAACTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 9 T 11 10 361489 CASAVA_Build 8 78503911 4D ATGTGTATAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 39 het 24 0 14 10 TA 9 7 361490 CASAVA_Build 8 78533411 3D TAATTGAAAC ATT/--- GTTGTGTGTT 3070 het 3070 hom 62 28 28 9 ATT 1 0 361491 CASAVA_Build 8 78540810 2D GAATAATGTT AA/-- GTTAAGGATG 1702 het 1702 ref 11 7 4 0 A 2 0 361492 CASAVA_Build 8 78550716 1D TTTTAAGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 257 hom 31 1 26 4 T 10 9 361493 CASAVA_Build 8 78551333 1D ATTATTTGTC T/- TTTTATATTA 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 5 4 361494 CASAVA_Build 8 78553916 1I AAATGTGTGC -/A TGTGCATGTG 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 A 0 1 361495 CASAVA_Build 8 78557501 1D ATTTAATATG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 8 7 361496 CASAVA_Build 8 78563743 1I CTCTGTTCTC -/T TTTCCTCCTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 4 361497 CASAVA_Build 8 78574401 1D AGTTGTACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 13 20 8 T 13 12 361498 CASAVA_Build 8 78593768 2D ATATGTATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 AT 7 6 361499 CASAVA_Build 8 78608524 2D GCTTCTGTTG TT/-- TTACTTAGAC 3070 het 3070 ref 38 18 17 5 T 4 2 361500 CASAVA_Build 8 78609783 1I TATTTTACTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 27 11 15 1 T 7 8 361501 CASAVA_Build 8 78618726 1D TTTATAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 A 10 9 361502 CASAVA_Build 8 78621977 1D GTATTTTATC A/- AAAAGCTATT 3070 het 3070 ref 35 15 16 4 A 5 4 361503 CASAVA_Build 8 78634544 1I ATTTACAGTT -/C CACATAGCTG 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 C 1 2 361504 CASAVA_Build 8 78637020 1I AGTTAAATAG -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 7 8 361505 CASAVA_Build 8 78640225 1D TTGTTTGTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 T 10 9 361506 CASAVA_Build 8 78640477 1I CTTTTGGTTT -/C CTCACCCTTT 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 C 1 2 361507 CASAVA_Build 8 78641371 3I AAAAACACAG ---/TTA TTATTTTAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 4 TTA 1 2 361508 CASAVA_Build 8 78643151 1D ACATAGCTAG A/- GTTGCACTTG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 1 0 361509 CASAVA_Build 8 78646496 1I GCATTTTATG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 9 10 361510 CASAVA_Build 8 78652570 4D CCAGACAAAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 32 13 10 9 AC 11 9 361511 CASAVA_Build 8 78654308 2I AATGCCACTC --/GT GTAGGTATGT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 GT 1 2 361512 CASAVA_Build 8 78659775 1I ATTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 A 10 11 361513 CASAVA_Build 8 78660037 13D AAAAGTATTC ATTTTTATACTCA/------------- ATTTTTATAT 3070 het 3070 ref 32 18 14 4 ATTTTTATACTCA 1 0 361514 CASAVA_Build 8 78660164 4D TGGATTCATC TCTT/---- TATCTTAGGC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 TCTT 1 0 361515 CASAVA_Build 8 78662757 3I GGTTTTTCTC ---/AAT GATGCTAATG 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 AAT 0 1 361516 CASAVA_Build 8 78665516 1I AGCAATGAAG -/A AAAAAAACAA 2580 het 2580 ref 21 13 6 2 A 7 8 361517 CASAVA_Build 8 78669143 1D GAATTTTCAT C/- CCCCTGGTTA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 C 5 4 361518 CASAVA_Build 8 78670935 1I CACTCACAAC -/A AAAAAAAGAG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 7 8 361519 CASAVA_Build 8 78671577 1I CATAGGACTG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 9 10 361520 CASAVA_Build 8 78672410 5I AAATTAAGCT -----/TAAAC TAAACTGTCA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TAAAC 1 2 361521 CASAVA_Build 8 78673345 4D AGTGCAACTA AATC/---- AATAATTTTT 3070 het 3070 ref 30 18 9 4 AATC 1 0 361522 CASAVA_Build 8 78675067 1I AAACTCCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 49 0 41 8 A 10 11 361523 CASAVA_Build 8 78679311 2D TTTAGTCTTG GA/-- AGAGTGTATG 2569 hom 15 het 7 0 6 1 GA 1 0 361524 CASAVA_Build 8 78681120 4D CCTCTGTCAG TTTT/---- TTATTTGGTG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 6 2 361525 CASAVA_Build 8 78681890 1D ACAATCTCCA T/- TTGAAGAAAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 3 2 361526 CASAVA_Build 8 78683597 1D AATTTTTTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 8 7 361527 CASAVA_Build 8 78685537 2I AATTTACAGC --/AA AGTCTATGTG 3070 hom 87 het 30 0 30 0 A 1 3 361528 CASAVA_Build 8 78697947 2D ATTTTGACAC AT/-- GTGGTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AT 1 0 361529 CASAVA_Build 8 78702633 1D TCCTTCTTTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 35 hom 36 1 31 4 T 9 8 361530 CASAVA_Build 8 78704463 1D TGAGAGTCCA G/- CTTTCTGGGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 1 0 361531 CASAVA_Build 8 78706927 2D TCTCTGATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 A 13 11 361532 CASAVA_Build 8 78707792 1D TTCCCATTCC T/- TTTTTTGTGC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 6 361533 CASAVA_Build 8 78709457 12D25M1I ATCTATCTAT CTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAACTATCCATCCCTA-/------------CTAGCTAGCTAACTATCCATCCCTAT TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 30 0 20 18 N/A 0 0 361534 CASAVA_Build 8 78712318 2I TAATAAAAAA --/AT ATATGTATTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AT 2 3 361535 CASAVA_Build 8 78713533 4I TTCTGTTTTA ----/ATGG AAATGTTCTA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 ATGG 0 1 361536 CASAVA_Build 8 78713657 6D TAAAATCAAT TTAAAC/------ TTAAACTTAA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 TTAAAC 2 1 361537 CASAVA_Build 8 78714947 1D TTTTGTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 725 hom 30 2 25 4 T 13 12 361538 CASAVA_Build 8 78715158 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 772 het 772 ref 34 10 6 18 T 10 9 361539 CASAVA_Build 8 78717359 3I ATACATGATA ---/ATG ATAATAAACA 3070 hom 163 het 60 0 55 5 ATG 0 1 361540 CASAVA_Build 8 78747342 1D ACTATGTAAG A/- AAAAAACTCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 7 6 361541 CASAVA_Build 8 78752272 1I ACAGAAATAG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 8 9 361542 CASAVA_Build 8 78754551 1D TCTAGGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 767 hom 29 2 21 6 T 15 14 361543 CASAVA_Build 8 78767834 1I CTTATGCTCA -/C AATATTCATG 3070 hom 151 het 59 0 51 8 C 0 1 361544 CASAVA_Build 8 78781398 3D TAAATTATTG GTT/--- GTTGTTGTTG 3070 hom 94 het 35 0 32 4 GTT 4 3 361545 CASAVA_Build 8 78781887 1D GTAGAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 12 11 361546 CASAVA_Build 8 78791943 1I ACTTATAAAA -/G ATTCTAAATA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 0 1 361547 CASAVA_Build 8 78794248 1I AAAGTCATTT -/G GGATCAAAGA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 2 3 361548 CASAVA_Build 8 78794637 1D GTGCCAGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 13 12 361549 CASAVA_Build 8 78795116 4D ATCCTAATAT ATAG/---- ATAATTAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 ATAG 1 0 361550 CASAVA_Build 8 78797313 1I CCTTGTTACT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 A 9 10 361551 CASAVA_Build 8 78797994 1D ATTTTACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2607 hom 42 13 10 20 A 17 16 361552 CASAVA_Build 8 78802521 1I ACAAGTGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2600 hom 25 6 13 6 A 9 10 361553 CASAVA_Build 8 78802697 4D GGGGGTCAGG ATTT/---- ATTTGGCTCT 3070 het 3070 ref 31 16 15 2 ATTT 2 1 361554 CASAVA_Build 8 78814006 1D TCAGTAAATA T/- TTATTGAATG 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 T 3 2 361555 CASAVA_Build 8 78816096 1D CATTTGCAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 A 10 9 361556 CASAVA_Build 8 78829615 1I GTTTCTATAG -/A AAAATTATAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 4 5 361557 CASAVA_Build 8 78830511 1I TCACTGTTAT -/A AGTGGTCTCA 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 A 1 2 361558 CASAVA_Build 8 78834398 2I CTATTTATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2465 hom 32 9 16 7 A 10 12 361559 CASAVA_Build 8 78835215 4D GGCTTTTCCA ATTT/---- ATTTATTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 ATTT 3 2 361560 CASAVA_Build 8 78839783 1D CCAAACCTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 15 11 6 T 10 9 361561 CASAVA_Build 8 78845941 1D CAATCTCGGT A/- GGTTGTACCT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 1 0 361562 CASAVA_Build 8 78848067 4I CATAAATATA ----/TATC TATTATGTAT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 TATC 0 1 361563 CASAVA_Build 8 78849385 1D ATTATAAAAT A/- ATTTTCATAT 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 A 2 1 361564 CASAVA_Build 8 78856048 1I TTTGTTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 T 11 12 361565 CASAVA_Build 8 78858503 1I TGGACTTTAA -/T TTTTTTAAGG 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 T 6 7 361566 CASAVA_Build 8 78865201 2I GTAGCATAAG --/GA AGTATAATTA 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 GA 0 1 361567 CASAVA_Build 8 78865450 1D CAGAACAAAT A/- AAGAGACTTT 3070 het 3070 hom 63 26 30 8 A 3 2 361568 CASAVA_Build 8 78867670 1I CTAGAGATGG -/A AAAAAATTAT 3070 het 3070 ref 39 23 14 2 A 6 7 361569 CASAVA_Build 8 78871319 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAATAAA 3070 het 1157 hom 18 4 12 2 A 7 6 361570 CASAVA_Build 8 78872177 1D AGCACCACTT A/- ACTGAATGTG 3070 het 3070 ref 40 20 19 1 A 2 1 361571 CASAVA_Build 8 78872672 23D ATCTCCTTTG TTAAATATATTCCCAGGCATTTT/----------------------- TTAAGTAGCT 3070 het 3070 ref 33 19 17 4 TTAAATATATTCCCAGGCATTTT 1 0 361572 CASAVA_Build 8 78900299 1D CCATGCCTAA T/- TTTTTTTTTC 2163 het 2163 ref 20 8 7 6 T 10 9 361573 CASAVA_Build 8 78910808 1D AGGAGAGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 11 10 361574 CASAVA_Build 8 78914739 1D AAGTGACTTC A/- TTTTGATTCT 3070 het 3070 ref 44 20 18 7 A 1 0 361575 CASAVA_Build 8 78917959 1D TGTGTCTTTA T/- TTTTCTTTCC 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 T 5 4 361576 CASAVA_Build 8 78918286 18D TATATATATA TATAATTATATATATATG/------------------ TAATATATAT 1889 het 742 hom 9 2 4 4 TATAATTATATATATATG 1 0 361577 CASAVA_Build 8 78918463 1I GTATATTATA -/T TATAAAGTTT 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 1 2 361578 CASAVA_Build 8 78919858 1I GAATAAAGAT -/A GGGGAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 A 0 1 361579 CASAVA_Build 8 78920720 1I57M1I AGGATAAATA -TTTTTTTTCAGTAGAAATAAAAGTAGGGAATAGCATTCAGGCCATGAATATATCTTA-/TTTTTTTTTCAGTAGAAATAAAAGTAGGGAATAGCATTCAGGCCATGAATATATCTTAT CTCTATCTTA 3070 het 3070 ref 34 28 16 6 N/A 0 0 361580 CASAVA_Build 8 78921241 2D ATATTCTATC AA/-- AGTTATTGTT 3070 het 3070 ref 23 11 11 1 A 3 1 361581 CASAVA_Build 8 78921639 1I TTATTTGACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 T 11 12 361582 CASAVA_Build 8 78922269 1D CAAATAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 14 4 A 11 10 361583 CASAVA_Build 8 78923693 1I GTTTTCTCTT -/A ACGTTATCTT 3070 het 3070 hom 34 11 18 5 A 1 2 361584 CASAVA_Build 8 78929675 1D AGGGTTGGCG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 T 9 8 361585 CASAVA_Build 8 78942351 1D ACACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2814 hom 33 10 15 8 A 12 11 361586 CASAVA_Build 8 78955699 4D TTGTGATTAT ACAA/---- ACAAAGTAAG 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 ACAA 2 1 361587 CASAVA_Build 8 78957738 2I AAGATATCAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 12 14 361588 CASAVA_Build 8 78958656 4D AAATGAGATT TATA/---- TATATAGAAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 6 TA 5 3 361589 CASAVA_Build 8 78960880 1I TCCATACGTA -/T ATATATACAC 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 0 1 361590 CASAVA_Build 8 78962832 1I AAATACAAGC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 8 9 361591 CASAVA_Build 8 78973001 9I TTCCATGTGT ---------/GCAGCACAG GCAGCATAGA 3070 hom 87 het 33 0 29 4 GCAGCACAG 0 1 361592 CASAVA_Build 8 78976266 1D TTTCATCTCC A/- AGTATTCTGT 3070 het 3070 hom 54 22 28 5 A 2 1 361593 CASAVA_Build 8 78978858 1D TTGCTTACCC T/- TGTTTGTGAT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 2 1 361594 CASAVA_Build 8 78979775 1D TTCTGCAAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 34 13 16 6 A 8 7 361595 CASAVA_Build 8 78983159 1I TTAATAGCCA -/T TTTTTTCTAG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 6 7 361596 CASAVA_Build 8 78989138 1I TCAAAAGTCT -/A ACTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 1 2 361597 CASAVA_Build 8 78990715 1D TCTCATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2641 hom 27 7 14 6 T 12 11 361598 CASAVA_Build 8 78990755 2D GGATTGTTAC AT/-- ATATATATAT 2312 hom 19 het 22 0 8 14 AT 10 9 361599 CASAVA_Build 8 78999815 1D TCAAAATAAA T/- AAATAAATAA 2756 het 2756 ref 20 11 8 2 T 1 0 361600 CASAVA_Build 8 79003036 1D TTTGTATGTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 48 19 19 11 T 9 8 361601 CASAVA_Build 8 79005099 1D TATTGTTGTG A/- AAATACCAGC 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 A 4 3 361602 CASAVA_Build 8 79009221 2D TATGTGTTTT AC/-- AGTTTCTCTA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 AC 1 0 361603 CASAVA_Build 8 79013830 1D CCATATTATT A/- ATCAGCATTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 1 361604 CASAVA_Build 8 79025246 3D CATAATTCTA TAT/--- TATTTCATTA 3070 het 3070 ref 29 15 13 2 TAT 2 1 361605 CASAVA_Build 8 79027367 1D TCTACTTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 95 het 47 0 37 10 T 10 9 361606 CASAVA_Build 8 79028222 1I TCTCCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 T 10 11 361607 CASAVA_Build 8 79033132 1I AATATGCTTT -/A AAAAATTGAT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 5 6 361608 CASAVA_Build 8 79033227 2D GCTTAGACTC AG/-- AGGAATAGAC 3070 het 3070 hom 42 17 21 6 AG 2 1 361609 CASAVA_Build 8 79035894 1D AATCAATATA T/- TTTTTTTCAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 8 7 361610 CASAVA_Build 8 79036866 2D CAAGGACAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 41 0 32 9 AC 8 7 361611 CASAVA_Build 8 79037463 1I TAAACTCACT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 306 hom 41 1 36 4 A 9 10 361612 CASAVA_Build 8 79043245 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 2998 hom 34 12 16 6 AT 5 6 361613 CASAVA_Build 8 79045902 1I AGGATTGCGC -/T TAGGAAGAAC 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 1 2 361614 CASAVA_Build 8 79046064 2I AAATAAAATC --/TA TGAGAAAGGT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 TA 0 1 361615 CASAVA_Build 8 79047861 1I CCATTGCTTG -/T TTTTTGTCAG 3070 het 1959 hom 15 4 9 2 T 5 6 361616 CASAVA_Build 8 79051413 2I ATTTGATTCT --/TC TCTCTTTTCT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 TC 2 3 361617 CASAVA_Build 8 79052625 1I TCATAGCATC -/A ATGGTCTTTA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 1 2 361618 CASAVA_Build 8 79055673 4D AAGCCTGTCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 het 3070 hom 31 13 14 6 CAAA 4 3 361619 CASAVA_Build 8 79060325 2I ATTTGTATAC --/AT ATATATATAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AT 4 5 361620 CASAVA_Build 8 79060735 2D AATATTTTAT TG/-- TCACAAAATG 3070 hom 99 het 35 0 34 2 TG 1 0 361621 CASAVA_Build 8 79061416 4D AAAATTAGAG CTTT/---- CTAAGTAAAC 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 CTTT 1 0 361622 CASAVA_Build 8 79062323 1D35M2D TTCATCTATG AAAAAGGTAATGTATACAATTGATGCAAGCATGCTAAT/-AAAAGGTAATGTATACAATTGATGCAAGCATGCTA-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 17 12 11 4 N/A 0 0 361623 CASAVA_Build 8 79063852 1I CTTATCAGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2477 hom 28 7 12 9 A 13 14 361624 CASAVA_Build 8 79066573 1D ACTTTCCTTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 18 25 3 A 10 9 361625 CASAVA_Build 8 79069744 2I CTTACCAAAC --/TT TATTTTGCCA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 1 3 361626 CASAVA_Build 8 79069969 1D GTACAAGTAG C/- CTTATAGGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 C 2 1 361627 CASAVA_Build 8 79073223 1D GGTAGTTTTT A/- AAAAAAAAAA 547 het 547 ref 51 40 2 9 A 11 10 361628 CASAVA_Build 8 79076046 1I CAAAATCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 13 12 T 14 15 361629 CASAVA_Build 8 79090888 1I AAACTGGCTC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 7 8 361630 CASAVA_Build 8 79096258 1I ATGCCTGGTT -/A AAAAAAAGTC 3070 het 3070 ref 36 20 14 2 A 7 8 361631 CASAVA_Build 8 79102169 8D ACACACAGAG ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 107 het 49 0 34 17 AC 12 8 361632 CASAVA_Build 8 79108360 2I ATTCTGCAGA --/AC ACAGAGATTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AC 1 2 361633 CASAVA_Build 8 79112729 1I CCTCCTCCCA -/C CCTCCCCCAT 3070 het 202 hom 19 1 17 1 C 2 3 361634 CASAVA_Build 8 79113937 1D CTTCCAATGG A/- AAAAAAATGT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 7 361635 CASAVA_Build 8 79115045 1I GCTTGAACTC -/A ATTGATAATA 3070 het 3043 hom 31 8 19 4 A 1 2 361636 CASAVA_Build 8 79117100 3I2M7I AAAGTGCTCA ---AC-------/TGTACTTTTTCT ATCGTTGATC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 N/A 0 0 361637 CASAVA_Build 8 79120062 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAAGAGAGA 3070 hom 17 het 26 1 20 5 AAAG 0 1 361638 CASAVA_Build 8 79128967 1I CTCAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 870 hom 22 4 15 3 A 12 13 361639 CASAVA_Build 8 79129199 1D TTAATAAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 20 0 15 5 T 11 10 361640 CASAVA_Build 8 79129509 1D CCATGTCCCT A/- ACAAAGGACA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 2 1 361641 CASAVA_Build 8 79134305 1I ATTCACATGC -/A AATATAAAAT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 2 3 361642 CASAVA_Build 8 79139092 1I ATACAACTCA -/C CATAATGTAG 3070 hom 54 het 20 0 17 3 C 1 2 361643 CASAVA_Build 8 79143398 1I GGATGAGAAA -/G TCCTGGGAAC 3070 hom 102 het 38 0 34 4 G 0 1 361644 CASAVA_Build 8 79146103 1D ATTATCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 32 1 21 10 A 13 12 361645 CASAVA_Build 8 79148062 1D TAGCATTATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 10 9 361646 CASAVA_Build 8 79159781 2I TTCTTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 2094 hom 32 het 27 0 11 16 T 10 12 361647 CASAVA_Build 8 79185537 4D TTTTTCCCAT TCAG/---- TGAAAATTTT 3070 het 3070 ref 28 15 13 2 TCAG 1 0 361648 CASAVA_Build 8 79194998 1I GAAAAAAAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 12 18 6 A 8 9 361649 CASAVA_Build 8 79198331 4D AGACTACCTA TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 849 hom 38 8 15 16 T 16 12 361650 CASAVA_Build 8 79198937 1D ACCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1808 hom 24 10 13 2 A 15 14 361651 CASAVA_Build 8 79199074 1I CTTGGTTCCA -/T TTTTTTTTTT 1203 het 863 hom 24 4 9 11 T 15 16 361652 CASAVA_Build 8 79199544 1I TATTTAAAGG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 32 17 14 1 T 6 7 361653 CASAVA_Build 8 79204744 1D TGTGTTTATC T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 43 23 15 5 T 8 7 361654 CASAVA_Build 8 79205019 1D TTAAAAGTTA T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 108 het 43 0 37 8 T 7 6 361655 CASAVA_Build 8 79214219 4I ACAAAATACG ----/CAGA CAAACACAAC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 CAGA 0 1 361656 CASAVA_Build 8 79216322 1D TGTATGTGTG T/- TATGTATGCA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 2 1 361657 CASAVA_Build 8 79217318 1D GTTTTGTTTG T/- TTGTTTGTTT 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 T 3 2 361658 CASAVA_Build 8 79230856 8D TAATAAACTC ATATATAT/-------- ATATATATAT 768 het 394 hom 17 4 6 8 AT 11 7 361659 CASAVA_Build 8 79235135 1D AATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 903 hom 24 5 13 7 T 12 11 361660 CASAVA_Build 8 79238869 1I GTGCTAACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 2 A 10 11 361661 CASAVA_Build 8 79245811 4I TGATTTGATG ----/TACT TACTTCAGTA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 TACT 1 2 361662 CASAVA_Build 8 79250991 1D TATAAGCCAC T/- TTTTTTTTTT 1112 het 1112 ref 40 27 3 10 T 12 11 361663 CASAVA_Build 8 79266321 1I ATTAATCGTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 9 10 361664 CASAVA_Build 8 79266758 4I ATCAAATTTT ----/TTTC TTTTTCTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 2 TTTC 0 1 361665 CASAVA_Build 8 79280932 1I AATATTCACA -/T TTTTTTAGGA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 6 7 361666 CASAVA_Build 8 79302949 6D AATTTATACG TTTGTT/------ TTTGTTTTTG 1373 het 1373 ref 13 5 5 3 TTTGTT 3 2 361667 CASAVA_Build 8 79303623 1D CAGCAAAAGT G/- AGCTTCTGCT 3070 het 3070 ref 46 27 14 6 G 1 0 361668 CASAVA_Build 8 79307767 1I TTTTCCCCTT -/A AAAAAAAAAA 2864 het 2864 ref 31 14 12 5 A 12 13 361669 CASAVA_Build 8 79361896 1D AAGTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 17 6 T 11 10 361670 CASAVA_Build 8 79366399 1D CCCATCCTAA G/- GGGAGCTCTG 3070 hom 120 het 42 0 40 2 G 4 3 361671 CASAVA_Build 8 79379757 1D ACAAAAAATC A/- AAAATTGTTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 5 4 361672 CASAVA_Build 8 79383479 1D CGAGTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2909 hom 22 8 11 3 A 11 10 361673 CASAVA_Build 8 79384086 6D CAACATTCTC TTAACA/------ TTAAGAATGA 3070 het 3070 ref 32 21 9 4 TTAACA 1 0 361674 CASAVA_Build 8 79385197 1D AAGGAATCTG T/- TTTTTTTTTT 1349 het 1349 ref 39 28 3 8 T 13 12 361675 CASAVA_Build 8 79385829 7I AAATGTGATC -------/AAAAGAA AAAATGATTA 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 AAAAGAA 0 1 361676 CASAVA_Build 8 79396509 1I TGTAATCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2955 hom 28 9 10 9 A 12 13 361677 CASAVA_Build 8 79413549 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 12 12 2 A 12 10 361678 CASAVA_Build 8 79422912 1D GTTTGGGATT C/- CCCCCCCCCC 3070 het 1019 hom 32 9 16 7 C 12 11 361679 CASAVA_Build 8 79442708 1D CTAACCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 11 10 361680 CASAVA_Build 8 79443107 3I TAGACAGATG ---/GAA GAAGGACAAT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 GAA 1 2 361681 CASAVA_Build 8 79444631 1D TTGCTTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 8 9 A 12 11 361682 CASAVA_Build 8 79445785 1I ACATAATATT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 A 9 10 361683 CASAVA_Build 8 79446557 1I GCTGACAAAC -/T TGAGAGCGCT 3070 het 3070 hom 44 17 20 7 T 1 2 361684 CASAVA_Build 8 79455317 1I AGAATGCCTC -/A AAAAAAAAAA 2036 het 2036 ref 18 8 6 4 A 13 14 361685 CASAVA_Build 8 79455778 1I CAACTAAAAA -/T TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 15 5 T 3 4 361686 CASAVA_Build 8 79456005 1I GTATATCTCC -/T AATGCTATCC 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 T 0 1 361687 CASAVA_Build 8 79457526 2D AGAAAGAATA GT/-- AATACAATTA 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 GT 1 0 361688 CASAVA_Build 8 79459618 1I AAAAAAAAAA -/C CATTTTCTGG 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 C 1 2 361689 CASAVA_Build 8 79460503 4I ATCTAGGAAG ----/TAAC TAACTTGCTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 TAAC 1 2 361690 CASAVA_Build 8 79465522 1I GACAATGTGC -/T GAGTAATCCA 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 0 1 361691 CASAVA_Build 8 79466395 1I TTTTAGATGT -/A AATGCTATTG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 A 2 3 361692 CASAVA_Build 8 79466754 4D CTGGGAAACC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2681 het 1971 hom 21 7 8 7 A 18 14 361693 CASAVA_Build 8 79472909 1I CAATGATATT -/A AAAAAAACTT 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 A 7 8 361694 CASAVA_Build 8 79475983 2D ATATGTGCAC AT/-- ATGTTTTTCT 3070 het 2663 hom 30 6 21 4 AT 2 1 361695 CASAVA_Build 8 79480107 1D AACTGTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 16 16 8 A 12 11 361696 CASAVA_Build 8 79482487 1D TTGTTGAATG A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 A 8 7 361697 CASAVA_Build 8 79487099 5D ATGTTGAAAT TTACA/----- TTACTTTATG 3070 het 3070 ref 37 21 12 6 TTACA 1 0 361698 CASAVA_Build 8 79511001 1I AATTAAAATC -/A AAAACCACAA 3070 het 3070 hom 19 9 9 1 A 4 5 361699 CASAVA_Build 8 79543607 1D AAAAAAAACA C/- CCTATTCAAT 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 C 3 2 361700 CASAVA_Build 8 79549802 2I AATCTGAAAA --/TT TTGAGGAAAC 3070 het 3070 ref 42 26 12 4 T 2 4 361701 CASAVA_Build 8 79550707 1I AAGAGAAATG -/T TTTTTTTTTT 2776 het 2776 ref 30 12 11 7 T 15 16 361702 CASAVA_Build 8 79560738 4D CTGTTTGTTC CTCA/---- CTGTTTCTCC 3070 het 3070 hom 40 17 19 5 CTCA 1 0 361703 CASAVA_Build 8 79567132 1D TTGTCCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 9 19 4 A 11 10 361704 CASAVA_Build 8 79575254 2I TATATATTAG --/AT ATATATATAT 1545 het 1545 ref 21 10 5 6 AT 8 9 361705 CASAVA_Build 8 79586903 1I AAACTACACT -/G GGGGGGTCAA 3070 het 3070 ref 70 34 24 12 G 6 7 361706 CASAVA_Build 8 79600722 1I TCAACCTCTG -/T TGAGTTGTTT 3070 het 3070 ref 48 22 21 5 T 1 2 361707 CASAVA_Build 8 79604681 4I TGAGATCACG ----/TTTT TTATTTCCAA 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 T 2 6 361708 CASAVA_Build 8 79621124 4D AAGAAGGAAG AGAC/---- AGACGGTCAG 3070 het 3070 ref 30 16 12 3 AGAC 2 1 361709 CASAVA_Build 8 79622669 1I AGCTCATCTT -/A AGTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 A 1 2 361710 CASAVA_Build 8 79625895 9I AATTAATACT ---------/TGTTAAAAA TGACTGAATT 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 TGTTAAAAA 0 1 361711 CASAVA_Build 8 79628220 6I ATCTAATAAT ------/TCTGAG TCTATGTCCA 3070 het 3070 ref 38 21 14 3 TCTGAG 0 1 361712 CASAVA_Build 8 79629268 1I GGGCAAGCTA -/C AGAAATTGTT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 C 0 1 361713 CASAVA_Build 8 79631233 1D TGGGATTTTG T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 31 10 14 8 T 9 8 361714 CASAVA_Build 8 79632661 1I GTCTGTGTTT -/C CCCTGTAACA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 3 4 361715 CASAVA_Build 8 79632903 5D TCAAATTATC TAATA/----- TTTTACATTA 3070 het 3070 hom 33 13 16 6 TAATA 1 0 361716 CASAVA_Build 8 79639991 1I ATTTCAAGAT -/A TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 A 0 1 361717 CASAVA_Build 8 79642375 3D GAGATAGTCG TCA/--- TCATCAGGTT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 TCA 3 2 361718 CASAVA_Build 8 79647591 1D TCTTGCTATC T/- GCATTTCAGT 3070 het 3070 ref 37 17 13 7 T 1 0 361719 CASAVA_Build 8 79653340 2I ATTATTTTTT --/TC TGTTTGCTAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TC 0 1 361720 CASAVA_Build 8 79656964 1D ATATTTCGTG T/- TTTTTTTTTT 1635 het 1635 ref 35 21 5 9 T 15 14 361721 CASAVA_Build 8 79664066 1I AAGAGCATAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 8 9 361722 CASAVA_Build 8 79717040 1D AATTATCATG T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 99 het 37 0 34 5 T 8 7 361723 CASAVA_Build 8 79717856 1I TACCCAGTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2105 hom 32 8 13 11 T 10 11 361724 CASAVA_Build 8 79718420 1I TAAAGATCGT -/A AAACCCAAAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 3 4 361725 CASAVA_Build 8 79724509 1I AACTATCCAG -/C TCGCAGCCAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 C 0 1 361726 CASAVA_Build 8 79727539 1I AGCTAGAGGT -/G GCTAACCTAG 3070 het 3070 ref 36 23 9 4 G 1 2 361727 CASAVA_Build 8 79727988 1D GTGGGAAAAA T/- TAATATCCTA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 T 2 1 361728 CASAVA_Build 8 79731034 1D CTTGTTTGTG C/- TTTGTGCTTT 3070 het 3070 hom 71 32 35 4 C 1 0 361729 CASAVA_Build 8 79733402 4I ATATACACTC ----/TAAG TAAGAAATCA 3070 het 3070 hom 42 16 25 1 TAAG 1 2 361730 CASAVA_Build 8 79742750 1I TACTTTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 20 12 9 T 12 13 361731 CASAVA_Build 8 79743869 2D CATCAAAATT TC/-- TGTTTTGTTT 3070 het 953 hom 17 5 10 2 TC 1 0 361732 CASAVA_Build 8 79746463 1I TATATGATTA -/G TCATATATTT 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 G 0 1 361733 CASAVA_Build 8 79752145 1D ACAACTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 A 11 10 361734 CASAVA_Build 8 79756692 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 9 11 T 14 13 361735 CASAVA_Build 8 79760043 1D AACTGCATAG C/- CATGTTAAAA 3070 het 3070 hom 44 16 24 4 C 2 1 361736 CASAVA_Build 8 79763825 1I ACCAGCAGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 T 13 14 361737 CASAVA_Build 8 79769077 1D ATGTTCCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 T 13 12 361738 CASAVA_Build 8 79773924 3I TGATTCTGTT ---/AAG AGGAAAATGT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AAG 0 1 361739 CASAVA_Build 8 79782646 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2631 het 2631 ref 38 23 9 6 T 13 12 361740 CASAVA_Build 8 79784510 1I CTGATGAACT -/A AAAAAAAAAA 1596 het 1596 ref 36 14 6 16 A 17 18 361741 CASAVA_Build 8 79791808 1I TGAGTCAGTT -/A AAACCTCTTT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 3 4 361742 CASAVA_Build 8 79794025 1D TTGTCAAGTA T/- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 T 7 6 361743 CASAVA_Build 8 79797196 3D TTTAAAATTT TTA/--- TTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 16 8 8 0 TTA 1 0 361744 CASAVA_Build 8 79799333 2I GGGAAAACTC --/AT ATAAACTCTT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 AT 1 2 361745 CASAVA_Build 8 79800168 1I CAAGTTTGGA -/G GCTGTTCAGC 3070 hom 28 het 31 0 14 17 G 1 2 361746 CASAVA_Build 8 79807751 1D TTATTTAGAC A/- AGTTATAATC 3070 het 3070 ref 34 15 13 6 A 2 1 361747 CASAVA_Build 8 79811021 2D TGCTTCTTCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2218 hom 21 8 9 4 A 14 12 361748 CASAVA_Build 8 79824823 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 896 het 896 ref 26 18 2 6 A 10 11 361749 CASAVA_Build 8 79825882 1D GCAAAAATTC A/- AAAAAAAAAA 2875 het 2547 hom 24 9 8 7 A 13 12 361750 CASAVA_Build 8 79837443 1I TCCCAATGCA -/T TTTTTTTTTT 1931 het 1931 ref 18 9 6 3 T 11 12 361751 CASAVA_Build 8 79917271 1I GCCCTGAGAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 9 10 361752 CASAVA_Build 8 79920730 1I TAGTTTAAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 9 10 361753 CASAVA_Build 8 79925008 1I CACAGAAGGG -/T TTTTTTTTTT 2114 het 2114 ref 27 11 6 10 T 13 14 361754 CASAVA_Build 8 79926992 2I GTCTATCATA --/TC TTAAAAATAA 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 TC 0 1 361755 CASAVA_Build 8 79927340 1D TGTTTTTATG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 T 9 8 361756 CASAVA_Build 8 79934811 2I AGTAAAACCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2969 hom 23 8 12 3 T 10 12 361757 CASAVA_Build 8 79945468 1I TTTTATTCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2936 hom 27 8 15 4 T 9 10 361758 CASAVA_Build 8 79956256 1I TATATTTAAA -/T TTTTTTGAAG 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 6 7 361759 CASAVA_Build 8 79960854 1I ACTCACTCCA -/T GGCTGTTGGT 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 0 1 361760 CASAVA_Build 8 79978040 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2193 hom 16 6 7 4 TA 7 6 361761 CASAVA_Build 8 79978135 4D CTCTGCTCTT TCTC/---- TCTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 27 12 12 4 TC 4 2 361762 CASAVA_Build 8 79985196 1I AAATTCATAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 T 9 10 361763 CASAVA_Build 8 79986820 1D TTTGCTTCTG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 59 23 24 12 T 9 8 361764 CASAVA_Build 8 79996743 2D TAAAACTGAT AA/-- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 27 9 15 4 A 10 8 361765 CASAVA_Build 8 80012033 3I8M2I CAACTAATTA ---AATCAGTA--/AATAATCTGTACT CCCACCAGAT 3070 het 3070 ref 35 26 10 1 N/A 0 0 361766 CASAVA_Build 8 80012641 2D CCCAGCCTGC TT/-- TTTTTTTTTT 2877 het 1571 hom 20 8 9 3 T 14 12 361767 CASAVA_Build 8 80015214 2D CAAAAATATA TC/-- TGAGAGATCA 3070 het 3070 ref 44 22 20 3 TC 1 0 361768 CASAVA_Build 8 80015470 2I AATTTGTAAC --/AT AGGCTAGTGG 3070 het 3070 ref 48 26 18 4 AT 0 1 361769 CASAVA_Build 8 80019908 3I GTCCTGCACT ---/TCC TCTTTTATTT 3070 het 3070 hom 26 9 16 1 TCC 0 1 361770 CASAVA_Build 8 80026138 1I ACAATGGGAG -/A AATTTTTGCA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 2 3 361771 CASAVA_Build 8 80029111 1D TGGCGTAGGA T/- TTTTTTCTTG 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 T 7 6 361772 CASAVA_Build 8 80032104 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2458 hom 18 8 8 2 A 8 9 361773 CASAVA_Build 8 80051879 3I GCCCTGAGAA ---/ATC CTTCTGTCTC 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 ATC 0 1 361774 CASAVA_Build 8 80052155 1I TATTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2173 hom 33 9 12 12 T 15 16 361775 CASAVA_Build 8 80053901 1I TTTTCTCTCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 899 hom 43 2 34 7 T 9 10 361776 CASAVA_Build 8 80056025 1D TATCCCCCCC T/- CCCACCATGA 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 1 0 361777 CASAVA_Build 8 80066394 1D TAGCGGAACC A/- AAAAAAAAAA 1589 het 1589 ref 29 16 5 9 A 17 16 361778 CASAVA_Build 8 80087643 4D TTTTAGAATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 10 20 4 TTTG 3 2 361779 CASAVA_Build 8 80130000 1D ATTGCCACCT C/- CCCACCCACC 3070 hom 120 het 46 0 39 7 C 4 3 361780 CASAVA_Build 8 80160673 1D ATGTTTTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 55 het 25 0 22 3 A 10 9 361781 CASAVA_Build 8 80276069 1D CCTTACTAAT A/- AAAAACAATT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 6 5 361782 CASAVA_Build 8 80295275 2D AGTTTCATTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 35 16 13 8 AT 6 5 361783 CASAVA_Build 8 80296975 1D ATCTTTTCTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 T 9 8 361784 CASAVA_Build 8 80301210 4I TCTGTCTCTC ----/TCTA TCTGTCTCTC 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 TCTA 0 1 361785 CASAVA_Build 8 80301779 5I CTATTTTGTC -----/TGATA TAAGTATAGC 2735 het 2735 ref 15 9 6 0 TGATA 0 1 361786 CASAVA_Build 8 80307019 1D GACAAACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 21 15 6 A 13 12 361787 CASAVA_Build 8 80307339 1D CAAAAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 8 A 11 10 361788 CASAVA_Build 8 80308756 1D ATCCTCAAAT G/- AATACTAGCA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 G 1 0 361789 CASAVA_Build 8 80314502 21I GGTAGTGGTG ---------------------/ATAGTAGTGTAGGAAGTAGTA ATAGTAATAA 3070 het 3070 hom 46 15 25 8 ATAGTAGTGTAGGAAGTAGTA 0 1 361790 CASAVA_Build 8 80314754 1D AGCCAGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2361 hom 29 9 13 7 A 15 14 361791 CASAVA_Build 8 80315600 1I TACAGTTGGG -/A AAAAAACTGT 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 6 7 361792 CASAVA_Build 8 80316046 1D TATAACATCT C/- CCCCCCAAGC 3070 hom 60 het 41 1 32 8 C 7 6 361793 CASAVA_Build 8 80323726 1D AGGGACTTGG A/- AAAAAAAAAA 1433 het 1433 ref 42 33 4 5 A 11 10 361794 CASAVA_Build 8 80350793 1I GCTTATGTGG -/T TAGCAGGTGT 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 T 1 2 361795 CASAVA_Build 8 80361438 1D GGCAGTCCCA T/- TTTCAGAAGC 3070 het 3070 ref 40 13 12 15 T 4 3 361796 CASAVA_Build 8 80365330 4I TCTATTCCTC ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 10 25 3 TG 5 7 361797 CASAVA_Build 8 80372470 1I TAAGGGGCTT -/C CCCCTTTGCT 2648 het 2648 ref 28 19 7 2 C 4 5 361798 CASAVA_Build 8 80372713 3D CGGATAGTTA AAT/--- AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 46 22 23 2 AAT 1 0 361799 CASAVA_Build 8 80375368 1I TTAAAAAAAA -/T CTTGCCTTGG 3070 het 2484 hom 39 7 28 4 T 0 1 361800 CASAVA_Build 8 80376238 1I TTGGTTTAGG -/T TTTCTCAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 T 3 4 361801 CASAVA_Build 8 80393699 4D ATAAACATCA CTTT/---- CTTTATCTTC 3070 het 3070 hom 38 17 20 3 CTTT 2 1 361802 CASAVA_Build 8 80396224 12D ATTTCTGAGC TCTGTCAATAAT/------------ TCTGCAATTG 3070 het 3070 hom 42 20 22 5 TCTGTCAATAAT 1 0 361803 CASAVA_Build 8 80399126 2D TAATCTCTGC TT/-- TTTGGGTCTC 3070 het 3070 ref 42 21 14 9 T 5 3 361804 CASAVA_Build 8 80400122 1I TGATCTTGCA -/T TTAGTACGGA 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 T 2 3 361805 CASAVA_Build 8 80400513 6D TGGTTTTGTC TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 36 18 16 3 TTTTTG 2 1 361806 CASAVA_Build 8 80401250 4D ACTGTAGTCA TCCT/---- TCCTTCTCAC 3070 het 3070 hom 40 18 21 3 TCCT 2 1 361807 CASAVA_Build 8 80402113 1I TCAGAATGGG -/T TACAATGTGA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 1 2 361808 CASAVA_Build 8 80412074 2D TTTAATATGC TG/-- TGTGATATAT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 TG 3 2 361809 CASAVA_Build 8 80413193 4I17M3D ATTCTATTTG ----TTTTGTCTTAAATATTTATC/CTTTTTTTGTCTTAAATATTT--- ATAAGTTCCT 3070 het 3070 ref 29 16 13 3 N/A 0 0 361810 CASAVA_Build 8 80413825 4D CTACTCATTC ACAA/---- ACAAACTTTG 3070 het 3070 hom 41 15 22 6 ACAA 2 1 361811 CASAVA_Build 8 80424413 3I AGGCCAGGTG ---/TTT TTTAAGATTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 3 6 361812 CASAVA_Build 8 80425100 1D GCTTTATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 572 hom 37 3 19 15 A 16 15 361813 CASAVA_Build 8 80432633 1I TTTAATGTGA -/T TTTTTCCATT 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 T 5 6 361814 CASAVA_Build 8 80433139 3D ATCCTTCTCT TAA/--- TAATGTTTTA 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 TAA 2 1 361815 CASAVA_Build 8 80440760 1D AAGTAATGGG A/- AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 48 18 23 8 A 8 7 361816 CASAVA_Build 8 80448755 1D GGTTATTATT A/- AAAAGATAAA 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 A 5 4 361817 CASAVA_Build 8 80460594 1D ATGCAGCTGA C/- TTCATTTGGT 3070 het 3070 hom 20 8 10 2 C 1 0 361818 CASAVA_Build 8 80461940 2D GGTGTCAAAT GA/-- GACTGGGGCC 3070 het 974 hom 11 4 7 0 GA 2 1 361819 CASAVA_Build 8 80469732 1D TTTAAATGAC A/- AAAAAAAAAA 1130 het 1130 ref 35 30 3 3 A 13 12 361820 CASAVA_Build 8 80474519 1I CTTTATCATC -/T CTCTGGGGGT 3070 het 3070 hom 38 15 17 6 T 0 1 361821 CASAVA_Build 8 80482543 2D TTCTTTTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 2394 het 2062 hom 29 9 9 11 T 18 16 361822 CASAVA_Build 8 80485258 2I CATGATACCT --/TG TGATAGAGCT 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 TG 1 2 361823 CASAVA_Build 8 80507927 2I TATTTCTCAT --/TA TGTTATTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TA 0 1 361824 CASAVA_Build 8 80509816 1I TCAAAGTGAA -/G GGAAACATTA 3070 het 3070 ref 54 27 26 1 G 2 3 361825 CASAVA_Build 8 80536812 1D15M1D TGGACTAATA GAGATGGGTATGCAAAG/-AGATGGGTATGCAAA- TTCTCACTTC 3070 het 3070 ref 29 19 11 2 N/A 0 0 361826 CASAVA_Build 8 80537833 2I ATTACACCTT --/TA TTGATTCTTT 3070 het 3070 ref 62 30 29 3 TA 0 1 361827 CASAVA_Build 8 80555651 2I GAATGGTAGT --/TC TGAGTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TC 0 1 361828 CASAVA_Build 8 80571160 4I GGTCCTGGTC ----/TTTG TTTGGTTGGT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TTTG 1 2 361829 CASAVA_Build 8 80572278 1I TTCTTTGCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 T 9 10 361830 CASAVA_Build 8 80583128 2D TATATATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 38 14 16 11 TA 8 7 361831 CASAVA_Build 8 80583964 1I TTCATATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 T 11 12 361832 CASAVA_Build 8 80609950 2I TATTGGATGC --/AT ATATATATTT 2323 het 2323 ref 17 9 5 3 AT 4 5 361833 CASAVA_Build 8 80614922 11D AGTCCTTTGC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTGA 3070 het 1457 hom 26 7 14 8 T 19 8 361834 CASAVA_Build 8 80627726 1D TCCCACTACT G/- GGCATCAACC 3070 het 3070 hom 51 21 20 10 G 3 2 361835 CASAVA_Build 8 80643382 1I GTCTCTAAAG -/A AAAAAAATGA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 A 7 8 361836 CASAVA_Build 8 80652165 1D TAGTTATCAC T/- TTAGTGACAT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 3 2 361837 CASAVA_Build 8 80654868 2I CAGAGAGAGG --/GA GAGAGAGAGA 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 GA 6 7 361838 CASAVA_Build 8 80680809 16D GTTTTTTTTC TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 2364 het 1270 hom 16 6 7 3 T 27 11 361839 CASAVA_Build 8 80735723 1D CTTCACTTAG A/- ATAATGGCCT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 A 2 1 361840 CASAVA_Build 8 80739479 4I CCATATTTTC ----/CTCT CTTCTGAAAT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 CT 1 3 361841 CASAVA_Build 8 80746891 2I AACCCAATAA --/CT CTCTCTCTCT 3070 het 3070 ref 51 25 24 2 CT 5 6 361842 CASAVA_Build 8 80766399 2I AGCCCATCTC --/TG GGTGGGAGAC 3070 hom 99 het 39 0 32 7 TG 0 1 361843 CASAVA_Build 8 80769382 1I GGATCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 12 13 361844 CASAVA_Build 8 80772856 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 10 8 361845 CASAVA_Build 8 80777533 1I GGGAAAACTC -/T TGTTTCTGAC 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 1 2 361846 CASAVA_Build 8 80795719 4I ATAGTTACTG ----/CTCT CTCTCAAACA 3070 het 3070 hom 47 21 21 5 CT 2 4 361847 CASAVA_Build 8 80814144 7D CCTTTGGATA AATATCC/------- AGGAGTGGAA 3070 hom 120 het 42 0 40 6 AATATCC 1 0 361848 CASAVA_Build 8 80818247 10D GAGTTGAGTA TTGTTTTGTT/---------- TTGTTTTGTT 3070 het 3070 hom 39 15 13 12 TTGTT 6 4 361849 CASAVA_Build 8 80819880 1D GGGCATATTG C/- CCCCAAGTAA 3070 hom 71 het 26 0 23 3 C 5 4 361850 CASAVA_Build 8 80829356 1D GGAAGGAAGG A/- AAGGAAGGAA 151 het 107 hom 16 1 1 14 A 3 2 361851 CASAVA_Build 8 80840856 1I CAACAACAAC -/A AAAAAATACA 3070 hom 96 het 39 0 33 6 A 6 7 361852 CASAVA_Build 8 80845626 2D CAGAATGAGA CT/-- CTGTCTCTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 CT 2 1 361853 CASAVA_Build 8 80869481 1D TTGAAAGTGT G/- GGGGTGTGTA 3070 hom 87 het 32 0 27 5 G 5 4 361854 CASAVA_Build 8 80870376 1D GGCCAGGATG T/- GTACTTTTAA 3070 hom 72 het 25 0 24 1 T 1 0 361855 CASAVA_Build 8 80872549 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 103 het 42 0 35 9 A 9 8 361856 CASAVA_Build 8 80878854 1I CCAGCACTTT -/G GGGGGCTGAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 G 5 6 361857 CASAVA_Build 8 80885052 2D TGTACCTTTT AC/-- ACAAGCACTA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 AC 2 1 361858 CASAVA_Build 8 80905448 1D ACCTGGTGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 6 T 10 9 361859 CASAVA_Build 8 80906200 1D GATTTTCATC A/- AAAATGTTTA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 5 4 361860 CASAVA_Build 8 80914566 1I AAAAAATGAT -/A ACAATTTTCT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 1 2 361861 CASAVA_Build 8 80925777 1I AGCTTTCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 21 18 9 A 10 11 361862 CASAVA_Build 8 80938491 6D CATCACCATG TCCAGC/------ TCCAGCTAAT 3070 het 3070 ref 28 11 13 5 TCCAGC 2 1 361863 CASAVA_Build 8 80947756 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 9 8 361864 CASAVA_Build 8 80951397 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 152 hom 39 2 27 10 A 15 14 361865 CASAVA_Build 8 80955225 1D TGTGATTTGA T/- TTTTTTTTTT 1296 het 1296 ref 36 25 4 7 T 11 10 361866 CASAVA_Build 8 80963466 1D CCCAGGCTGG A/- AGTGCAGTGG 3070 hom 91 het 40 0 31 9 A 2 1 361867 CASAVA_Build 8 80966136 1D GTTATTAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 13 0 9 4 T 11 10 361868 CASAVA_Build 8 80970253 1I GTCTCACAAA -/G AGACACCAGA 3070 hom 117 het 46 0 38 8 G 0 1 361869 CASAVA_Build 8 80971716 1D AAGCTTTCAA T/- TACGTTATCT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 T 2 1 361870 CASAVA_Build 8 80972527 1I AAAAAGAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 44 0 35 9 A 9 10 361871 CASAVA_Build 8 80985474 1I GCTGGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 258 hom 36 2 27 7 T 13 14 361872 CASAVA_Build 8 80994141 1D TTTTGTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 364 hom 28 2 17 10 A 14 13 361873 CASAVA_Build 8 80994728 7I CTAATGCTAT -------/CCCTCCC CCCTCCCCCC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 CCCTCCC 1 2 361874 CASAVA_Build 8 81002272 3D GAAAACTTCT AAA/--- AAATTTGTTG 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 6 3 361875 CASAVA_Build 8 81013020 1I AGACATAGGT -/G GGGGGGGGGC 3070 het 549 hom 30 2 16 12 G 9 10 361876 CASAVA_Build 8 81016236 4D ATCTTAAAGC CAGA/---- CAGAGTTTCA 3070 hom 99 het 40 0 34 9 CAGA 2 1 361877 CASAVA_Build 8 81053128 1D GACAGTTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 10 9 361878 CASAVA_Build 8 81065424 1D GCATACACAG C/- AAAAAGAAAA 3070 hom 117 het 45 0 39 6 C 1 0 361879 CASAVA_Build 8 81065780 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2946 hom 31 het 17 0 12 5 A 17 16 361880 CASAVA_Build 8 81086918 3I TTTCTCCTCC ---/ATT ATTTTTTGCC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 ATT 1 2 361881 CASAVA_Build 8 81088425 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2985 het 258 hom 36 2 11 23 A 19 18 361882 CASAVA_Build 8 81129535 1D AGCTGCCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 41 hom 32 2 20 10 A 13 12 361883 CASAVA_Build 8 81134250 5D GATTAGATAT TAGAG/----- TAAAGATAAA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 TAGAG 1 0 361884 CASAVA_Build 8 81134550 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATCGCTT 3070 hom 30 het 13 0 9 4 AGG 1 0 361885 CASAVA_Build 8 81135962 1I TCACAACCAG -/C CTGACCAATA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 361886 CASAVA_Build 8 81144468 1I ATAAAGCAGG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 43 het 25 0 24 2 T 9 10 361887 CASAVA_Build 8 81151467 4I AAAAGGGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 35 0 26 9 TTTG 3 4 361888 CASAVA_Build 8 81154614 1D GTTTTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 329 hom 31 2 21 9 A 13 12 361889 CASAVA_Build 8 81157984 1D TATACTGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 31 0 28 4 A 11 10 361890 CASAVA_Build 8 81167567 1D ACCACAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 A 13 12 361891 CASAVA_Build 8 81168740 2I GCTTCAAAAC --/CA TTTCTTTGCC 3070 het 3070 hom 44 18 24 2 CA 0 1 361892 CASAVA_Build 8 81170492 1I ATCCAAGCAC -/T TTGGGAGGCC 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 T 2 3 361893 CASAVA_Build 8 81171931 1I CAAACCAGCT -/A CAACACTCCC 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 A 0 1 361894 CASAVA_Build 8 81179229 2I19M2I GTACACACAC --GATCTTGAACATCTCAGAA--/ATGATCTTGAACATCTCAGAAAC AGTGGGAAGG 3070 het 3070 ref 40 24 14 8 N/A 0 0 361895 CASAVA_Build 8 81183518 4I GCAGAACAAG ----/AATT AATTACATAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 AATT 1 2 361896 CASAVA_Build 8 81191240 29D TCCTGAAATT GACTCAAGAATAAACAGAAAATCTGAAAA/----------------------------- GACCTCTAAC 3070 het 3070 ref 31 19 15 4 GACTCAAGAATAAACAGAAAATCTGAAAA 1 0 361897 CASAVA_Build 8 81191568 1D TAGGAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1016 hom 31 4 16 11 A 15 14 361898 CASAVA_Build 8 81196751 3I TATGTTTATC ---/ATT ATTATTTCTA 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 ATT 2 3 361899 CASAVA_Build 8 81196814 2I CCTTCAAAAG --/AA AAAAAAAAAA 2056 het 2056 ref 25 14 6 5 A 11 13 361900 CASAVA_Build 8 81198963 1D TCTCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 12 26 11 T 12 11 361901 CASAVA_Build 8 81212210 1D ATATGTTAGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 T 10 9 361902 CASAVA_Build 8 81214204 1D TATTTTTATG A/- AAAAAAAAAT 2513 het 2513 ref 19 9 7 4 A 10 9 361903 CASAVA_Build 8 81216824 4I CTTCCCTAGG ----/TCTA TCTATCAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 27 2 TCTA 1 2 361904 CASAVA_Build 8 81217405 2I GGCACAAGAA --/GG TTGCTTGAAC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 G 0 2 361905 CASAVA_Build 8 81218000 1D GTATATACCA C/- CAAGAACAAT 3070 het 3070 hom 56 23 29 5 C 2 1 361906 CASAVA_Build 8 81218743 4D AGTCACATTA GTTT/---- GTTTGTTGAT 3070 het 3070 ref 43 24 15 6 GTTT 2 1 361907 CASAVA_Build 8 81222949 1D CACTTCTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2346 hom 20 7 9 4 T 12 11 361908 CASAVA_Build 8 81226965 1D GCCTTTCATG C/- CCCCCCGACC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 C 7 6 361909 CASAVA_Build 8 81234981 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 942 hom 18 4 10 4 A 11 12 361910 CASAVA_Build 8 81237748 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 8 9 361911 CASAVA_Build 8 81238661 1D TTGGGGAAAC T/- TTTTTTAATG 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 T 7 6 361912 CASAVA_Build 8 81240678 1D AACCCTAAAA G/- GGTAGGGAGA 3070 het 2726 hom 22 7 12 3 G 3 2 361913 CASAVA_Build 8 81299903 1D GATTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 T 13 12 361914 CASAVA_Build 8 81330807 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 15 6 A 13 12 361915 CASAVA_Build 8 81333779 2I ATATCCATTT --/AC TTAGTTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 AC 0 1 361916 CASAVA_Build 8 81339661 3D TGTCGCTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 34 1 25 8 T 23 20 361917 CASAVA_Build 8 81343331 1I ACTTTTTTTT -/C CTTTAGTATT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 1 2 361918 CASAVA_Build 8 81344384 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 894 het 894 ref 9 3 3 3 A 15 16 361919 CASAVA_Build 8 81346218 1I ACAGTTAACA -/G GTACTTTCAC 3070 hom 148 het 54 0 50 4 G 1 2 361920 CASAVA_Build 8 81346496 1D TTGTTGCCCA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 8 7 361921 CASAVA_Build 8 81346804 1I AATTATAAAT -/A AAAAAAGTTA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 6 7 361922 CASAVA_Build 8 81355291 1I CGTGTGTGGG -/A AAGCCTTTGG 3070 hom 108 het 40 0 34 6 A 2 3 361923 CASAVA_Build 8 81373416 9D GATAGAACCA TTTTCTTTT/--------- TTTTCTTTTC 1776 het 48 hom 17 1 10 6 TTTTCTTTT 2 1 361924 CASAVA_Build 8 81390997 2D9M1I CACCACCACG CCCCCACCCAA-/--CCCACCCAAT TTTGTATTTT 3070 hom 54 het 20 0 18 3 N/A 0 0 361925 CASAVA_Build 8 81394378 1D ACAAGTTTAT G/- GGGCTGGGTG 3070 hom 63 het 22 0 22 0 G 4 3 361926 CASAVA_Build 8 81420089 2D TTTGATGAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 14 12 361927 CASAVA_Build 8 81425664 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 34 0 33 1 A 13 11 361928 CASAVA_Build 8 81426271 1D TAACAAGAAA G/- AACATCATTG 3070 hom 119 het 49 0 42 8 G 1 0 361929 CASAVA_Build 8 81428888 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 17 1 15 1 A 10 11 361930 CASAVA_Build 8 81433910 2D TTAAGAAGTT AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 11 9 361931 CASAVA_Build 8 81436932 4I AAAAAAAAAG ----/AGTT AGGTAGCAGG 2100 het 50 hom 30 1 11 18 AGTT 0 1 361932 CASAVA_Build 8 81446671 1D ACTCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 347 hom 24 1 20 3 A 13 12 361933 CASAVA_Build 8 81448105 1I TGTCTCAACG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 13 14 361934 CASAVA_Build 8 81450549 1D18M14I CTTGTATAAG AAATGTCACTGGCAGCAGC--------------/-AATGTCACTGGCAGCAGCTTTATTTTTTTATT TTTATTTTTT 3070 hom 62 het 19 0 21 2 N/A 0 0 361935 CASAVA_Build 8 81452596 1D TGAGGGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 502 hom 34 2 24 9 A 14 13 361936 CASAVA_Build 8 81453281 1I TGCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2660 het 436 hom 13 1 10 2 T 12 13 361937 CASAVA_Build 8 81456505 1D CTCTTGCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 32 0 22 10 T 11 10 361938 CASAVA_Build 8 81462337 1D TTGTTTGTTT G/- TTTTTTTGAG 3070 hom 70 het 28 0 24 4 G 1 0 361939 CASAVA_Build 8 81464568 1I AAGTTTTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 117 het 49 0 40 9 A 9 10 361940 CASAVA_Build 8 81501558 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 10 9 361941 CASAVA_Build 8 81505435 1I CATGGAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 9 10 361942 CASAVA_Build 8 81541591 1D TGTCTCAGGG A/- AAAAAAAAAG 662 het 662 ref 54 46 3 5 A 10 9 361943 CASAVA_Build 8 81607428 1D AATTGGATAA T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 7 6 361944 CASAVA_Build 8 81612937 1D TGAGCCGAGA T/- TCATGCCACT 3070 hom 79 het 31 0 27 4 T 2 1 361945 CASAVA_Build 8 81614358 1D TATCTTTTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 38 16 20 2 T 9 8 361946 CASAVA_Build 8 81617928 1D TGCAACGCAC G/- GGTGGTAGCC 3070 het 3070 ref 37 19 16 4 G 3 2 361947 CASAVA_Build 8 81620592 2I ATTGAGTCAC --/AA AGAGAAAAGG 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 A 1 3 361948 CASAVA_Build 8 81636111 1I TTATTTTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 11 12 361949 CASAVA_Build 8 81638426 1D GAATTACCAT G/- GCACCTTTGT 3070 het 3070 hom 42 15 26 1 G 2 1 361950 CASAVA_Build 8 81640250 1D AATAATACTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 T 10 9 361951 CASAVA_Build 8 81660577 1I GCAATAAGCC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 285 hom 36 1 25 10 T 9 10 361952 CASAVA_Build 8 81666168 1D TTATTTTGTC T/- TTCCGTAGTT 3070 het 3070 ref 36 21 10 5 T 3 2 361953 CASAVA_Build 8 81688312 1I TCTGCAACAA -/T TTTTTTTTTT 2203 het 983 hom 21 5 10 6 T 16 17 361954 CASAVA_Build 8 81713091 1D GTCAAAGGAT A/- AAAAAAAAAT 958 het 958 ref 45 34 4 7 A 10 9 361955 CASAVA_Build 8 81757428 1D CGGTCAGTGT G/- GGTCAGGGTG 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 G 3 2 361956 CASAVA_Build 8 81780926 1D CTCACTCTTA C/- GTCTGTGTCC 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 C 1 0 361957 CASAVA_Build 8 81825148 1I TAGCTACACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 693 hom 28 3 20 5 A 10 11 361958 CASAVA_Build 8 81882639 3I TATTTTTAAA ---/ACC ACAAAATGGG 3070 het 3070 hom 35 11 17 7 ACC 0 1 361959 CASAVA_Build 8 81886196 1D GAGCTATACC T/- TTTTTTTTGG 1218 het 1218 ref 35 26 3 6 T 9 8 361960 CASAVA_Build 8 81905436 24D ATAGAGCTGA GGAAGGAAGGATGGAAGGATGGAC/------------------------ GGAAGGAAGG 2655 het 2655 ref 42 35 7 6 GGAAGGAAGGATGGAAGGATGGAC 1 0 361961 CASAVA_Build 8 81954031 1I TGCATGTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1837 hom 29 7 16 6 T 14 15 361962 CASAVA_Build 8 82014646 1D TTTCACTCAG A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 8 7 361963 CASAVA_Build 8 82031764 2I CAGTTGGCTA --/CT CTCTTATTTT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 CT 2 3 361964 CASAVA_Build 8 82033287 5D TAGAGCTGGT CTTTA/----- CTTAGCACTA 3070 het 3070 hom 61 23 29 12 CTTTA 1 0 361965 CASAVA_Build 8 82033906 6D ATAGAAGTTA ACAGAG/------ AACCCCCCAG 3070 het 3070 ref 43 21 17 9 ACAGAG 1 0 361966 CASAVA_Build 8 82034920 25D CCTTCCCTTC CCTGCCCTGCCTTGCCCTGCCCTGT/------------------------- CCTGCCCTCC 2010 het 2010 ref 30 20 8 5 CCTGCCCTGCCTTGCCCTGCCCTGT 1 0 361967 CASAVA_Build 8 82036718 4D TGCTTGCCAG CTCT/---- CTACTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 11 18 6 CT 3 1 361968 CASAVA_Build 8 82037888 2D AGAGGGGTTG GC/-- GGGGGGGGTC 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 GC 1 0 361969 CASAVA_Build 8 82038161 4D TTTATGGAGT CAAA/---- CAGATCAGTG 3070 het 3070 ref 29 13 15 1 CAAA 1 0 361970 CASAVA_Build 8 82038268 4I CAGCAGAATT ----/TTGA TTAAGAACTC 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 TTGA 0 1 361971 CASAVA_Build 8 82042809 1I AGAAACATAC -/A GAAAACAAAT 3070 het 3070 hom 46 21 22 3 A 0 1 361972 CASAVA_Build 8 82045066 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 T 8 9 361973 CASAVA_Build 8 82048622 1I TCAGTAAATA -/T ACTTCAGTAA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 0 1 361974 CASAVA_Build 8 82071222 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 6 7 361975 CASAVA_Build 8 82072556 2D GTACATTAAT TC/-- TGTTTGCTAT 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 TC 1 0 361976 CASAVA_Build 8 82073386 2I CCAACAGGAG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 8 hom 28 1 11 16 A 10 12 361977 CASAVA_Build 8 82073396 1I AAAAAAAAAA -/G CCACACAAAT 3070 hom 5 het 25 1 14 10 G 0 1 361978 CASAVA_Build 8 82082874 2D CCATCGGATT AA/-- ATAATATAAG 3070 het 3070 hom 37 16 18 4 A 3 1 361979 CASAVA_Build 8 82090353 1D TCATCTGATA T/- TCTATAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 T 2 1 361980 CASAVA_Build 8 82115481 1D TTCAAACTGA T/- TTGTTTATAG 3070 hom 117 het 40 0 40 0 T 3 2 361981 CASAVA_Build 8 82127209 16I GGCATTGAGA ----------------/CAGTATTTTAGCTTAC CATCCTTAAC 3070 het 3070 hom 30 13 17 1 CAGTATTTTAGCTTAC 0 1 361982 CASAVA_Build 8 82137479 1I AACAGAAATC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 9 10 361983 CASAVA_Build 8 82145446 1I TCTTTTCAGC -/A ACAAAAAAAA 3070 het 2342 hom 32 9 18 5 A 1 2 361984 CASAVA_Build 8 82164365 1D CTCAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 13 12 361985 CASAVA_Build 8 82172501 1D TAAGAACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 A 15 14 361986 CASAVA_Build 8 82173779 4I GAAAACAGAG ----/TTTC TTTGTTATTT 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 TTTC 0 1 361987 CASAVA_Build 8 82178869 1D TCTTCCCCCC A/- TCCCCTTTCC 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 A 1 0 361988 CASAVA_Build 8 82181171 1D TTCTTCCGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 11 10 361989 CASAVA_Build 8 82183320 22D TTAAATCAGT CTGTGATTTAAATTAAATCAGA/---------------------- CTGTGAGCAG 3070 het 3070 ref 35 20 17 4 CTGTGATTTAAATTAAATCAGA 1 0 361990 CASAVA_Build 8 82199485 1I TAATTTATTT -/G GTAATGCAAG 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 G 1 2 361991 CASAVA_Build 8 82202938 2D TGTATTTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 24 18 6 A 12 10 361992 CASAVA_Build 8 82204367 1I GTAGATATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 19 21 1 T 11 12 361993 CASAVA_Build 8 82205267 1D GTAGGGGATT A/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 5 A 1 0 361994 CASAVA_Build 8 82221091 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 6 7 361995 CASAVA_Build 8 82246277 1D AGGTGAGTCC A/- GCTGAGTGGG 3070 hom 45 het 16 0 15 1 A 1 0 361996 CASAVA_Build 8 82247202 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 7 8 361997 CASAVA_Build 8 82248090 4D ATAGTTAGAT GATA/---- GATAGATAGA 3070 het 3070 hom 40 16 17 8 GATA 4 3 361998 CASAVA_Build 8 82262918 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 T 8 9 361999 CASAVA_Build 8 82263256 1I AAGCATTCAT -/A ATAATCTACC 3070 het 3070 ref 51 26 18 7 A 1 2 362000 CASAVA_Build 8 82264661 1I TCCTTCAGCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 T 9 10 362001 CASAVA_Build 8 82271625 1D AATCTCCCCA C/- CCCCCCACTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 2 C 7 6 362002 CASAVA_Build 8 82271965 1I TATGCCATAG -/A AAAGTGTTCC 3070 het 3070 ref 29 12 10 7 A 3 4 362003 CASAVA_Build 8 82289979 7I ACAGATTCAT -------/CTGTACA CTTAAAAGAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 CTGTACA 0 1 362004 CASAVA_Build 8 82293766 6D TTCTTTAATC TTAAGA/------ TTATCTACAG 3070 het 3070 ref 23 15 8 1 TTAAGA 1 0 362005 CASAVA_Build 8 82303941 2I CTTAAAAAAA --/AC AAACACACAC 3070 het 35 hom 37 1 17 19 AC 0 1 362006 CASAVA_Build 8 82319364 1I TTCAAAATAA -/T TTTTTTATTA 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 6 7 362007 CASAVA_Build 8 82342343 1D CTTAGTTGTC T/- TTTTTTTTTT 1171 het 1171 ref 34 28 3 4 T 13 12 362008 CASAVA_Build 8 82373027 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 25 7 T 12 11 362009 CASAVA_Build 8 82377741 1I CAAGGCGGGT -/G GATCACGAGG 3070 hom 57 het 23 0 18 5 G 1 2 362010 CASAVA_Build 8 82379406 4I AAGGCAAGGT ----/TAAA TAAATTAGGG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 TAAA 1 2 362011 CASAVA_Build 8 82393040 1I GCGGGTTTTT -/A CTTTGTAGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 362012 CASAVA_Build 8 82408690 1D TGTTTATTGG A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 8 7 362013 CASAVA_Build 8 82411905 1I AAAATTTGCC -/T TTTGACTCCT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 3 4 362014 CASAVA_Build 8 82422330 1I GTTAGACAAG -/T TAAGTTTTTG 3070 het 3070 ref 59 34 21 4 T 1 2 362015 CASAVA_Build 8 82434056 1D ACCCAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1156 hom 27 3 17 8 A 18 17 362016 CASAVA_Build 8 82439201 2D TTGTGTTTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1859 het 1859 ref 46 33 5 8 GT 9 8 362017 CASAVA_Build 8 82508218 3D GCTTTTTCGT ATA/--- ATGATTTTTT 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 ATA 1 0 362018 CASAVA_Build 8 82513040 1D GCTTTGTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 66 het 29 0 22 8 T 10 9 362019 CASAVA_Build 8 82547397 1I TTTTTGAAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 346 hom 48 2 32 14 T 14 15 362020 CASAVA_Build 8 82574358 1D AGCAGATGAG T/- TGGGGGGGGG 1775 hom 36 het 17 0 9 8 T 2 1 362021 CASAVA_Build 8 82577152 1I TATTGCTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 39 hom 33 1 26 6 A 11 12 362022 CASAVA_Build 8 82577358 9I CCACACCCAC ---------/ATGACTGAT AGCAGTCTCC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 ATGACTGAT 0 1 362023 CASAVA_Build 8 82583073 3I ATAAGAACTA ---/TAT AAGGGGAACT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TAT 0 1 362024 CASAVA_Build 8 82586631 3I AAAAAGAAAT ---/GAA GAAGGATACA 3070 hom 93 het 34 0 32 2 GAA 1 2 362025 CASAVA_Build 8 82595444 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 284 hom 40 6 17 17 T 17 16 362026 CASAVA_Build 8 82599624 3I15M1I TCTCTGAAAA ---TATCCCAGCCTTGCA-/TATTATCCCAGCCTTGCAT TTGAACAGGA 3070 hom 99 het 30 0 34 5 N/A 0 0 362027 CASAVA_Build 8 82604088 1I ATCTTCACAT -/G TGACATCCTT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 G 0 1 362028 CASAVA_Build 8 82611866 2I TTTTCATTTA --/AC AGATTTTTCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AC 0 1 362029 CASAVA_Build 8 82631356 4I TAATGGTAAA ----/AGAT AGGCTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 AGAT 0 1 362030 CASAVA_Build 8 82647683 36D TTCTCCCACT CTGTGGGTTGTTTGTTTGCTGCTAACTGTTCTTTTG/------------------------------------ CCCTGCAAAA 794 het 30 hom 14 1 4 13 CTGTGGGTTGTTTGTTTGCTGCTAACTGTTCTTTTG 1 0 362031 CASAVA_Build 8 82695252 5D CAACTGCTAC CTCTT/----- CTCTTGGATT 3070 hom 144 het 52 0 49 3 CTCTT 2 1 362032 CASAVA_Build 8 82739688 1D GGAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 32 0 28 4 A 11 10 362033 CASAVA_Build 8 82756420 4D AATTATAGAA TAGT/---- TAGTTCACAA 3070 hom 78 het 27 0 27 2 TAGT 2 1 362034 CASAVA_Build 8 82758577 1D GAGTCTGGAT A/- ATCACTGGAT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 A 2 1 362035 CASAVA_Build 8 82765926 18D CCCCCCGCCC AAAAAAAAAAAAGAAAAA/------------------ AAAAAAAAAC 3070 hom 35 het 14 0 12 3 AAAAAAAAAAAAGAAAAA 1 0 362036 CASAVA_Build 8 82776246 1I CCTGGGAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 29 het 25 1 23 1 A 9 10 362037 CASAVA_Build 8 82778898 1D CATTAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 415 hom 32 1 20 11 A 13 12 362038 CASAVA_Build 8 82779743 1D TAGCCTTATC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 10 9 362039 CASAVA_Build 8 82783688 1D AAAACTAGAG C/- CACAAAACTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 C 2 1 362040 CASAVA_Build 8 82787922 1D TTTTTGTTCG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 9 8 362041 CASAVA_Build 8 82789991 1D TATTCATTTT A/- TTTTTGCTTA 3070 hom 138 het 55 0 47 9 A 1 0 362042 CASAVA_Build 8 82804465 1I CCTTTGTAGG -/C GACCTCACCA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 0 1 362043 CASAVA_Build 8 82814265 1I ACCAATACCT -/A AGGCCAGATC 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 A 1 2 362044 CASAVA_Build 8 82828032 4D ATGAAAACAT GTGA/---- GTGACTCTGG 3070 het 3070 hom 51 16 28 7 GTGA 2 1 362045 CASAVA_Build 8 82841574 1D GAGGAGTAAT A/- AAAAATGCAT 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 A 6 5 362046 CASAVA_Build 8 82850802 1I TAGCATGGTA -/T TTTTTTTTTT 1916 het 1916 ref 19 12 4 3 T 10 11 362047 CASAVA_Build 8 82853575 2D ATAATTTAAC TT/-- TGTTGACCCT 3070 het 3070 ref 36 19 13 5 T 3 1 362048 CASAVA_Build 8 82854895 1I TAGCTGAAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 9 10 362049 CASAVA_Build 8 82859203 1D TCACAGTTGC T/- TCTGTGGGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 362050 CASAVA_Build 8 82861345 5I ACTCAATAGA -----/TTTTT TTTTTCTTTT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 T 5 10 362051 CASAVA_Build 8 82863867 1D TTAATCTTCC T/- TTTTTTATTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 7 6 362052 CASAVA_Build 8 82867799 1D CCCTTGAGGG A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 A 7 6 362053 CASAVA_Build 8 82869391 1I TTTGAATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 A 11 12 362054 CASAVA_Build 8 82873976 1D ACATAGATAA T/- TTATCTAAGC 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 T 3 2 362055 CASAVA_Build 8 82874798 2I GCACTTTGAC --/AA AGACTAAAAA 3070 hom 123 het 49 0 42 7 A 1 3 362056 CASAVA_Build 8 82876486 4I CTTATAGAAA ----/GAGT ATTTACATAC 3070 hom 89 het 31 0 29 2 GAGT 0 1 362057 CASAVA_Build 8 82879814 1I ATTAGTAAGT -/A TTGATATGAT 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 A 0 1 362058 CASAVA_Build 8 82881742 1D TGAAGAACTT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 31 12 15 5 A 9 8 362059 CASAVA_Build 8 82884230 1I TAATTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 11 12 362060 CASAVA_Build 8 82888320 2D GGTTAGGCAA AG/-- AGTTTTTATA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 AG 2 1 362061 CASAVA_Build 8 82895022 1D TTAGGAGGGA T/- TTCCCCCCCT 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 3 2 362062 CASAVA_Build 8 82900822 1D TTTTTTTTTT C/- CCCTTAAAAA 3070 het 2202 hom 23 7 13 3 C 4 3 362063 CASAVA_Build 8 82904132 1I AATTTGACTC -/A ATTAACAAAG 1306 het 1306 ref 17 9 3 5 A 1 2 362064 CASAVA_Build 8 82907963 1I CACCTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 11 12 362065 CASAVA_Build 8 82908190 1I TTTGAAGTTT -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 A 7 8 362066 CASAVA_Build 8 82915744 3D AAGACTACAC ACA/--- ACAATAACTG 3070 het 3070 ref 45 24 15 7 ACA 2 1 362067 CASAVA_Build 8 82918778 14D CCTCTTTTTT CTGCGTGGCAGTTG/-------------- CTGCGTGGCA 3070 het 3070 hom 45 16 21 11 CTGCGTGGCAGTTG 2 1 362068 CASAVA_Build 8 82920156 1I CCAAATTCAG -/T TTTTTTTTTT 2530 het 2530 ref 35 16 8 11 T 10 11 362069 CASAVA_Build 8 82928360 2D CTCTTTTGAC AT/-- ATGTTTTTGT 3070 het 3070 ref 48 27 18 3 AT 2 1 362070 CASAVA_Build 8 82935784 1I GTTAAAGCTA -/C CAATATTTTC 3070 het 3070 ref 48 20 20 8 C 1 2 362071 CASAVA_Build 8 82937553 1D TGGCACACAA G/- GGACCTTTAT 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 G 3 2 362072 CASAVA_Build 8 82949893 1D AGGTGTCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 13 6 T 12 11 362073 CASAVA_Build 8 82950462 5D CATGAATGAA ACAGT/----- ACATTGGACA 3070 het 3070 hom 23 10 12 3 ACAGT 1 0 362074 CASAVA_Build 8 82959067 1D CTTAGAGGCG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 A 10 9 362075 CASAVA_Build 8 82966065 1D TCTCCATAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 T 9 8 362076 CASAVA_Build 8 82972968 1I GCGGAAAATT -/A ACAGTCAAAG 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 1 2 362077 CASAVA_Build 8 82974615 1D GGAAGTTTCA T/- CTGAGAGAGT 3070 hom 72 het 27 0 24 4 T 1 0 362078 CASAVA_Build 8 82995715 5I GTACTACCAC -----/TCTCT TCTCTTAATA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TCTCT 1 2 362079 CASAVA_Build 8 83002221 1I GCTAAAACCA -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 T 6 7 362080 CASAVA_Build 8 83009415 1I TATAAAAGTT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 9 362081 CASAVA_Build 8 83021922 3D ATAGCTTTAT ATA/--- ATAATAATAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 ATA 4 3 362082 CASAVA_Build 8 83035154 13I ATTGATTATG -------------/TATTTTTTCATTT CATTGGTTAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 TATTTTTTCATTT 0 1 362083 CASAVA_Build 8 83038741 1I TCTTCATATT -/A AAAACAACAG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 4 5 362084 CASAVA_Build 8 83040416 1I ATTAGTACAT -/A AAAAGCCCTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 4 5 362085 CASAVA_Build 8 83048741 1D TTGTTAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 13 9 T 14 13 362086 CASAVA_Build 8 83053627 1I TGTGTGTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 9 10 362087 CASAVA_Build 8 83071333 1D TGTGATAGTT A/- ACTGCATAGG 3070 het 3070 hom 37 11 18 9 A 2 1 362088 CASAVA_Build 8 83079860 5D TAAACTAGCT AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 39 15 14 12 AAAAG 4 3 362089 CASAVA_Build 8 83086487 1I CTTTATACAG -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 7 8 362090 CASAVA_Build 8 83089281 2D CAGATTTCAC GT/-- GTGTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 11 13 6 GT 3 2 362091 CASAVA_Build 8 83091682 4I GCTGAAGGTC ----/TGAT TAATTTGGTG 3070 het 3070 hom 36 10 24 2 TGAT 0 1 362092 CASAVA_Build 8 83092711 8I TGTGAATTTC --------/AAACTATT AAACACTGTG 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 AAACTATT 0 1 362093 CASAVA_Build 8 83096392 1I TTTCCTAAAG -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 27 17 9 1 T 7 8 362094 CASAVA_Build 8 83100607 1I AGGAGCACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1180 hom 35 4 25 6 T 13 14 362095 CASAVA_Build 8 83111211 6I GAAATAATAA ------/AACTTG AACTTGATAG 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 AACTTG 1 2 362096 CASAVA_Build 8 83127545 1D AATACAAAAT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 A 8 7 362097 CASAVA_Build 8 83131809 3D CAGACAAAAT AAC/--- AAACTCTCTC 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 AAC 1 0 362098 CASAVA_Build 8 83134428 1D TCCTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 1350 het 1350 ref 25 11 4 10 T 17 16 362099 CASAVA_Build 8 83169014 1I AAGTTAACAC -/A AAAATCTAAC 3070 hom 132 het 52 0 44 8 A 4 5 362100 CASAVA_Build 8 83179416 1I ATCAATATTT -/G GGGGGGGGGG 2300 het 168 hom 16 3 6 7 G 11 12 362101 CASAVA_Build 8 83216317 1D ATGTGATAGA G/- GGAGGTTTAT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 3 2 362102 CASAVA_Build 8 83216508 3I TATACACATA ---/CAC ACACACACAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CAC 0 1 362103 CASAVA_Build 8 83226235 3D AAATAATAAC AAA/--- AGAATAAGAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 4 1 362104 CASAVA_Build 8 83252092 2D GATACTCTCA TG/-- TTTTTTTTTT 2457 het 2310 hom 36 11 10 15 TG 1 0 362105 CASAVA_Build 8 83255188 1I TGATTTTTAC -/A AGGCAGGATT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 1 2 362106 CASAVA_Build 8 83261257 1D GCAGCTAAGA G/- AAAAGAATGC 3070 het 3070 ref 44 30 11 3 G 1 0 362107 CASAVA_Build 8 83284361 1I CTAAAACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 49 22 16 11 T 13 14 362108 CASAVA_Build 8 83291153 1D TTAAATACAA T/- TTAATACAAT 3070 het 3070 hom 30 11 19 0 T 3 2 362109 CASAVA_Build 8 83292931 1D TTTTTCACTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 16 17 4 T 10 9 362110 CASAVA_Build 8 83294376 1D GAATTAGGGG A/- AAAAGGTCTG 3070 het 3070 hom 37 14 19 5 A 5 4 362111 CASAVA_Build 8 83295361 2I AACAAGAAAC --/AT GTGTATATGT 3070 het 3070 ref 42 18 19 5 AT 0 1 362112 CASAVA_Build 8 83308845 6D TAGATAAATT TAAATC/------ TAAATGCCAA 3070 het 3070 hom 42 18 18 10 TAAATC 1 0 362113 CASAVA_Build 8 83315715 1I TAGAAGTTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 T 8 9 362114 CASAVA_Build 8 83317241 3D TTCAGATGAC AAT/--- GATGATGTCT 3070 het 3070 ref 31 16 10 8 AAT 1 0 362115 CASAVA_Build 8 83329423 1I AATTCTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 14 9 A 11 12 362116 CASAVA_Build 8 83332346 1I TGATGCCTTT -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 7 8 362117 CASAVA_Build 8 83333802 1D AAGTAATAAC T/- TTTTTTGTGC 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 T 7 6 362118 CASAVA_Build 8 83336855 2D8M1D TTTATTTATT TATTTTTTGAT/--TTTTTTGA- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 33 17 18 3 N/A 0 0 362119 CASAVA_Build 8 83342036 1I ACTGTAGCTA -/T TACTATGATT 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 T 1 2 362120 CASAVA_Build 8 83350810 4D TTAGTTTTCT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 TTTG 3 2 362121 CASAVA_Build 8 83365698 1I GCACTAATTC -/T TTTTTTTTTT 2915 het 2915 ref 25 8 9 8 T 11 12 362122 CASAVA_Build 8 83380949 1I TAAATTAACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 8 9 362123 CASAVA_Build 8 83381499 2D AAATTGGGTT AA/-- ATTTTTGAAT 3070 het 3070 ref 31 18 10 3 A 3 1 362124 CASAVA_Build 8 83382637 5D GGTTGGGAAA AGGAT/----- AGAAGAGCTA 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 AGGAT 1 0 362125 CASAVA_Build 8 83398875 1I TCTTTATATA -/T TTTGAATACT 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 T 3 4 362126 CASAVA_Build 8 83401078 3D CAAAAACAGA TCT/--- TCTAAGAATT 3070 het 3070 ref 37 20 14 5 TCT 2 1 362127 CASAVA_Build 8 83424031 1D TTATAATAAC T/- TTATTACCTC 3070 het 3070 hom 32 12 18 3 T 3 2 362128 CASAVA_Build 8 83426290 9I TACATTCATT ---------/TCTGAAAAG TCTGAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 TCTGAAAAG 1 2 362129 CASAVA_Build 8 83428467 1D TATAAACAAA T/- AAATTTCCTA 3070 het 3070 hom 37 18 19 0 T 1 0 362130 CASAVA_Build 8 83430374 1I TAATATCAAT -/A GAGATGATTC 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 A 0 1 362131 CASAVA_Build 8 83432719 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 9 10 362132 CASAVA_Build 8 83432819 2D TTTAAGAAAA AG/-- ATATGATTTG 3070 het 3070 hom 44 18 20 9 AG 1 0 362133 CASAVA_Build 8 83434647 5D AAAACCTGAT TAGAG/----- TAAAGACTAA 3070 het 3070 hom 25 7 13 5 TAGAG 1 0 362134 CASAVA_Build 8 83434852 36D AAAGTTGTGG CCTGGAAAAAAAAAGCCTTTCATTTTTAACTTAATT/------------------------------------ CCTAGTTAGG 3070 het 3070 ref 30 26 11 2 CCTGGAAAAAAAAAGCCTTTCATTTTTAACTTAATT 1 0 362135 CASAVA_Build 8 83435181 1I CTTTGCAGGT -/C AATTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 C 0 1 362136 CASAVA_Build 8 83440508 1D TCTAATACCC G/- GGGGGGGGGA 3070 het 50 hom 26 1 19 6 G 10 9 362137 CASAVA_Build 8 83442490 1I GGGGTGTCCA -/C CCACAGACAT 3070 hom 55 het 24 0 17 7 C 2 3 362138 CASAVA_Build 8 83442912 1I TCATCCTCTT -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 C 7 8 362139 CASAVA_Build 8 83443369 1D GATATTGGGA G/- TAATATCCTC 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 G 1 0 362140 CASAVA_Build 8 83445770 1D AATATAATCT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2326 hom 28 8 13 7 C 10 9 362141 CASAVA_Build 8 83451919 1D ATGGCAGGGA G/- TGTACATTTC 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 G 1 0 362142 CASAVA_Build 8 83454473 1D AGAAAACGGG T/- ATTATATTTA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 T 1 0 362143 CASAVA_Build 8 83455756 2D ATTTTTAAAC TA/-- TGTGTATTTT 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TA 1 0 362144 CASAVA_Build 8 83471797 2I TTTATTTGAC --/TT AGGATCAGAA 3070 het 3070 ref 21 13 8 0 T 0 2 362145 CASAVA_Build 8 83481928 2I AAAACAAAAC --/AA AAAAAAAAAA 2365 het 2365 ref 18 6 10 2 A 10 12 362146 CASAVA_Build 8 83483906 1D TTGAAGAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 17 16 6 T 13 12 362147 CASAVA_Build 8 83489595 1D TGCTGTTAGG A/- AGTGCTAGGG 3070 het 3070 ref 44 23 18 4 A 2 1 362148 CASAVA_Build 8 83495253 1D AGGATTATTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1962 hom 22 6 15 1 T 14 13 362149 CASAVA_Build 8 83518350 13I TTATAAATAA -------------/TCAATGACTAGTT TTAAAGTTAA 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 TCAATGACTAGTT 0 1 362150 CASAVA_Build 8 83532570 4I TAAACAACAT ----/ACTC AATCAATGGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 ACTC 0 1 362151 CASAVA_Build 8 83542811 1I CAACAGCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 33 0 22 11 A 10 11 362152 CASAVA_Build 8 83578269 2D CCTGGATGAC AG/-- AGTGAGACTC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 AG 2 1 362153 CASAVA_Build 8 83597187 1D TTCATTCTGC T/- TTTTTTTTTT 2400 het 2400 ref 40 26 6 8 T 13 12 362154 CASAVA_Build 8 83604496 4D TAAGCCATTA TTCT/---- TTCTAATACT 3070 het 3070 ref 35 17 17 2 TTCT 2 1 362155 CASAVA_Build 8 83631012 1D ATTCCAGCTG A/- AAAAAAAAAA 983 het 983 ref 34 26 4 4 A 12 11 362156 CASAVA_Build 8 83698093 1D ATAAGTGTGC T/- TTTTTTTTTT 1083 het 1083 ref 17 8 3 6 T 15 14 362157 CASAVA_Build 8 83704430 3D TTTTATATTA ATT/--- ATTATATATT 1779 het 1779 ref 16 6 6 4 ATT 2 1 362158 CASAVA_Build 8 83706858 3I AAATTGGTAG ---/AAA AATCTGAAGT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 2 5 362159 CASAVA_Build 8 83716843 1I TGGACTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2457 hom 24 7 12 5 T 13 14 362160 CASAVA_Build 8 83718709 1D CTAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1003 het 1003 ref 30 21 3 7 A 13 12 362161 CASAVA_Build 8 83732768 1I TTTCACAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 20 7 5 A 10 11 362162 CASAVA_Build 8 83735410 1D TGCCAGCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 T 11 10 362163 CASAVA_Build 8 83775565 3D GCTTCATCAC AAT/--- AATAACCTTT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 AAT 2 1 362164 CASAVA_Build 8 83790369 1D ACCTTTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3063 hom 33 12 9 12 A 13 12 362165 CASAVA_Build 8 83795489 1D CACTGTAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 12 5 T 11 10 362166 CASAVA_Build 8 83801092 4D GCTTATGAAT AGAA/---- AGAATCAATA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 AGAA 2 1 362167 CASAVA_Build 8 83815109 1D TTAGTGGAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 27 2 17 8 T 11 10 362168 CASAVA_Build 8 83819544 1I ATCTTGGTCT -/A AAGAGTCCAG 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 A 2 3 362169 CASAVA_Build 8 83823146 1D TGGTTAGATT C/- TTTTTTTGCA 3070 het 291 hom 43 5 18 21 C 1 0 362170 CASAVA_Build 8 83824655 4I TTTAACCTCT ----/TTTC TTTCTAAGTT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 TTTC 1 2 362171 CASAVA_Build 8 83824688 1I26M1D TATTTCTGGG -TTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGT/TTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTG- TTTTTTTGAG 3070 het 1193 hom 14 3 8 6 N/A 0 0 362172 CASAVA_Build 8 83825260 1I TAGTCCAACA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 T 6 7 362173 CASAVA_Build 8 83829176 3D TTAAAGACAC ATT/--- AGAGTTAATG 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 ATT 1 0 362174 CASAVA_Build 8 83829797 3D ACATAGTAAC ATT/--- AACCCAATGC 3070 het 3070 ref 47 21 19 8 ATT 1 0 362175 CASAVA_Build 8 83830402 1D GTTTTCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 T 11 10 362176 CASAVA_Build 8 83831450 1I GAATTTTCTA -/G TTTTTACACT 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 G 0 1 362177 CASAVA_Build 8 83833481 1I ACAGGACTGG -/A AAAAATGCCA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 A 5 6 362178 CASAVA_Build 8 83836878 1D AATTAATCTA G/- GTCAACTATA 3070 het 3070 ref 40 17 19 4 G 2 1 362179 CASAVA_Build 8 83838320 2D CCTTGTACAA GT/-- GAGAAAACTG 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 GT 1 0 362180 CASAVA_Build 8 83842507 1I AAAAAATGAG -/A AATGCGAATA 3070 het 3070 hom 38 11 12 15 A 2 3 362181 CASAVA_Build 8 83842543 3D TATAGTTTCA ATT/--- ATTGCCAATT 3070 het 2264 hom 33 5 16 14 ATT 2 1 362182 CASAVA_Build 8 83848123 1D TGCTTCACTT A/- AATTTTCCTC 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 A 3 2 362183 CASAVA_Build 8 83850104 1D TACTAAACTA G/- ATTTTAGAGG 3070 hom 126 het 48 0 42 6 G 1 0 362184 CASAVA_Build 8 83853412 1I TGTTCAGGCT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 438 hom 27 1 22 4 A 9 10 362185 CASAVA_Build 8 83853557 1I ATATTTAGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 9 10 362186 CASAVA_Build 8 83854683 1D TAATTTTAGG T/- TTTTTTTTTT 1469 het 1469 ref 42 33 5 5 T 11 10 362187 CASAVA_Build 8 83855036 1D CCAATGTTAA T/- TTTTTTATAG 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 T 7 6 362188 CASAVA_Build 8 83858005 1I ATAAAGAGTT -/A AAAAACAAAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 5 6 362189 CASAVA_Build 8 83860947 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 923 hom 27 8 12 7 A 11 10 362190 CASAVA_Build 8 83866391 1D AACCCCCGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2129 hom 35 11 11 13 A 12 11 362191 CASAVA_Build 8 83869307 2I AGAGTAAACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 2063 hom 29 8 10 11 A 12 14 362192 CASAVA_Build 8 83871794 3I ATTTAATATC ---/ATA ATAATGTAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 ATA 1 2 362193 CASAVA_Build 8 83878266 1I AAACTAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2818 hom 29 9 12 8 A 9 10 362194 CASAVA_Build 8 83888292 6D ATAATCAAAG TTATTC/------ TTATGCTTTG 3070 het 3070 ref 35 23 9 5 TTATTC 1 0 362195 CASAVA_Build 8 83893063 1I CTTCTCAGAG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 T 8 9 362196 CASAVA_Build 8 83906793 4I GTTTTTATGT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 TTTG 3 4 362197 CASAVA_Build 8 83912534 2D TATGTGTCTG TA/-- TATATATATA 1608 het 289 hom 10 2 5 4 TA 9 8 362198 CASAVA_Build 8 83922125 1D TGGAAATGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 A 11 10 362199 CASAVA_Build 8 83923247 1D GATCCACCCA C/- CCTTGGCCTC 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 3 2 362200 CASAVA_Build 8 83937984 3D GGTCGCAGGT ACA/--- ACAACTAGGC 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 ACA 2 1 362201 CASAVA_Build 8 83948120 1I ATCAATGAAT -/A AAAAAATCAT 3070 hom 64 het 28 0 24 4 A 6 7 362202 CASAVA_Build 8 83948459 1D TGTGGGGGTT G/- GGGGGGCAAT 3070 het 3070 ref 29 12 15 2 G 7 6 362203 CASAVA_Build 8 83953663 1D AAATTATCTG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 T 8 7 362204 CASAVA_Build 8 83966913 2D TTAAATTGAC AT/-- AATGTTTTAT 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 AT 1 0 362205 CASAVA_Build 8 83968961 5I CTTCAAATGG -----/AAATA AAATAATAAT 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 AAATA 1 2 362206 CASAVA_Build 8 83972555 1I TTTAGAATTG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 6 7 362207 CASAVA_Build 8 83985645 2I AAATTATGCA --/TT GTTTAAGAAT 3070 het 3070 ref 40 29 8 3 T 0 2 362208 CASAVA_Build 8 83997149 1D TAGGTGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 T 11 10 362209 CASAVA_Build 8 84002639 1I GAAAAACGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 11 12 362210 CASAVA_Build 8 84005940 1D ACAAGATACT G/- GGAAGCCAAG 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 G 3 2 362211 CASAVA_Build 8 84013116 1D GGGATTATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 11 9 A 14 13 362212 CASAVA_Build 8 84014012 1D AACAATGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 7 A 12 11 362213 CASAVA_Build 8 84014863 1I ACTAATAAAG -/A AAAAAAAGGG 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 7 8 362214 CASAVA_Build 8 84016004 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 het 2789 hom 40 10 26 4 AC 7 6 362215 CASAVA_Build 8 84016442 2D GAGTCCAGAA AT/-- AAAACCACAC 3070 het 3070 ref 44 27 15 2 AT 1 0 362216 CASAVA_Build 8 84016656 1D AAAATTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 A 13 12 362217 CASAVA_Build 8 84019109 1D GTAAAAAAAA T/- ATATAACCCA 2929 het 2929 ref 23 11 8 4 T 1 0 362218 CASAVA_Build 8 84021270 1D ATTACTAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 12 8 A 12 11 362219 CASAVA_Build 8 84026108 4I TTGTAGGGTT ----/TAAA TAAATTCACT 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 TAAA 1 2 362220 CASAVA_Build 8 84026861 2I TATGCTCCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 13 6 A 10 12 362221 CASAVA_Build 8 84028120 8I ATTTACTGCT --------/TTGGTCTC TTGGTCTCTT 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 TTGGTCTC 1 2 362222 CASAVA_Build 8 84030238 6D GGGTTTTCAG AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 2801 hom 47 14 15 20 A 20 14 362223 CASAVA_Build 8 84031058 1D TGTTACATCT A/- AAAAAAGATT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 A 7 6 362224 CASAVA_Build 8 84032063 2D GCAGCCATAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 18 9 A 14 12 362225 CASAVA_Build 8 84034271 5I AAATTTAAAC -----/TTAAA TTAATGAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 17 8 TTAAA 0 1 362226 CASAVA_Build 8 84036965 1D CTAGAAAACT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 31 10 17 5 A 9 8 362227 CASAVA_Build 8 84037428 2D GAGAGAGAGA AC/-- CAGAGAGAGA 638 het 638 ref 54 30 6 19 AC 1 0 362228 CASAVA_Build 8 84041996 1I GAAAGAGAAT -/A AAAAAAAAAT 1192 het 1056 hom 8 4 3 1 A 9 10 362229 CASAVA_Build 8 84043389 1I CCTGGCCAGG -/T TTTTTTTTTT 3062 het 3062 ref 20 9 9 2 T 12 13 362230 CASAVA_Build 8 84046551 2I TTAATATAAC --/TG TAGATTTTAA 3070 hom 48 het 23 0 17 6 TG 0 1 362231 CASAVA_Build 8 84048190 1D TTTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1798 hom 20 6 9 5 T 10 9 362232 CASAVA_Build 8 84059984 1I TGCATTTCTG -/T TAAGTGCTCA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 1 2 362233 CASAVA_Build 8 84070755 1D AATTTAGTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 16 14 6 T 10 9 362234 CASAVA_Build 8 84072594 1I CTGAATTGCC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 A 8 9 362235 CASAVA_Build 8 84119147 1D CCAACAGTGT A/- AAAGTGTTCC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 4 3 362236 CASAVA_Build 8 84121987 8D ACATCATATC TGAAAGCA/-------- TGCTTATAAC 3070 hom 96 het 37 0 32 6 TGAAAGCA 1 0 362237 CASAVA_Build 8 84125447 1I TAATATCAAG -/A AACTATAATG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 2 3 362238 CASAVA_Build 8 84129665 2I CCCGGTTAGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 9 11 362239 CASAVA_Build 8 84139966 4D TTTTTTTTTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 T 14 10 362240 CASAVA_Build 8 84142560 1I GATAGCCTAC -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 7 8 362241 CASAVA_Build 8 84144898 1D GATAAGGTAC T/- TGTTAAAACA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 T 2 1 362242 CASAVA_Build 8 84147957 1D CGTTAAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 49 0 38 11 T 12 11 362243 CASAVA_Build 8 84149097 1D TAGAATTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 9 8 362244 CASAVA_Build 8 84152367 1D ATAATACTGC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 42 0 32 11 A 10 9 362245 CASAVA_Build 8 84189629 1D TCCTAATACT G/- GTCCCTCCCC 2270 hom 12 het 6 0 5 1 G 2 1 362246 CASAVA_Build 8 84195613 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1967 hom 30 9 14 7 A 15 14 362247 CASAVA_Build 8 84197083 3I ATATTTATGT ---/TAA TAATTATGTA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 TAA 1 2 362248 CASAVA_Build 8 84202053 4D AGATATATGG ATAT/---- ATATATATAT 1939 het 1001 hom 8 3 4 1 AT 9 7 362249 CASAVA_Build 8 84205298 6D GCTCCACTAG CAAAAA/------ CAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 44 20 15 11 CAAAAA 3 2 362250 CASAVA_Build 8 84212424 1D TATGCAAACA T/- TTTTTCTAGT 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 T 6 5 362251 CASAVA_Build 8 84220659 3I ATAATGTGAC ---/AAG AAGAACATTT 3070 het 3070 hom 72 32 35 5 AAG 1 2 362252 CASAVA_Build 8 84225006 2D TAACAGAAGC AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 12 14 3 A 10 8 362253 CASAVA_Build 8 84227829 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 AT 5 6 362254 CASAVA_Build 8 84230388 2I11M1D ATTTGTTTTG --TTTTTTTGTTGT/TTTTTTTTTGTTG- TTGTTTGTTT 542 het 542 ref 38 31 4 9 N/A 0 0 362255 CASAVA_Build 8 84235770 1D ACATATATTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 T 8 7 362256 CASAVA_Build 8 84239681 1I ATATTAGTAT -/A AAAATATAAT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 4 5 362257 CASAVA_Build 8 84242889 1D CATAGACAGA T/- TTTTTTTTTT 1218 het 1218 ref 40 31 3 6 T 13 12 362258 CASAVA_Build 8 84255528 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 A 13 14 362259 CASAVA_Build 8 84262554 1D CTCACCAAAC T/- TACTGGAGTC 3070 het 3070 ref 29 15 10 6 T 2 1 362260 CASAVA_Build 8 84265663 5D AACTTGAAAT TTATC/----- TTATAAAGTA 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 TTATC 1 0 362261 CASAVA_Build 8 84266543 2D TCTAAATGTT AA/-- GTTTATTGAT 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 A 2 0 362262 CASAVA_Build 8 84272328 1I CTGGAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 22 20 9 A 10 11 362263 CASAVA_Build 8 84273971 2I CAATTTTTTT --/TA AAATTGAGAC 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 TA 0 1 362264 CASAVA_Build 8 84285877 4D CTGTTTTCAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 45 16 17 12 AC 7 5 362265 CASAVA_Build 8 84289715 2D ACCACCTTAT TA/-- TATACTATTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 TA 3 2 362266 CASAVA_Build 8 84296427 1I TCCTATCAAA -/T TACCACTGTA 3070 hom 117 het 45 0 38 7 T 1 2 362267 CASAVA_Build 8 84298108 4I AAGGGTGAAG ----/AGCC AGCCAGTTAT 3070 het 3070 ref 51 23 20 8 AGCC 1 2 362268 CASAVA_Build 8 84298448 1I GGATATTAAC -/A AAAATAAACA 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 4 5 362269 CASAVA_Build 8 84301135 1I ATGGGGTAAT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 48 32 14 2 A 7 8 362270 CASAVA_Build 8 84304224 2D TACAAGTAAC TT/-- TTTTCATCAG 3070 het 3070 ref 34 16 15 4 T 6 4 362271 CASAVA_Build 8 84310545 3D TACAACTGAT TTA/--- TTTTTAGTCA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 TTA 1 0 362272 CASAVA_Build 8 84310747 2I TAGGGTTTTA --/TT TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 7 9 362273 CASAVA_Build 8 84320513 1D11M1D ACTCCTGACC TTCAGGTGATCCG/-TCAGGTGATCC- GCCGGCCTCG 3070 hom 33 het 11 0 10 3 N/A 0 0 362274 CASAVA_Build 8 84321609 1I GTGGGGGAAA -/G GGGAAACTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 G 3 4 362275 CASAVA_Build 8 84322167 1I TGTCTTCGTA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 6 7 362276 CASAVA_Build 8 84322540 5D AAAACAGAAA TGTCT/----- TTCTACAATT 3070 het 3070 ref 23 15 8 3 TGTCT 1 0 362277 CASAVA_Build 8 84324007 3D GAAAAGATGT ACA/--- ACATCATATG 3070 het 3070 ref 51 30 17 7 ACA 2 1 362278 CASAVA_Build 8 84333631 1I AAAATAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 13 14 362279 CASAVA_Build 8 84334938 3D ATACCCCCAG GTT/--- GTTAAGAATA 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 GTT 2 1 362280 CASAVA_Build 8 84343374 1I AATCCCACAG -/A AAATACAAAC 3070 het 3070 hom 17 8 7 2 A 3 4 362281 CASAVA_Build 8 84357722 1D GTTCAGCTGA T/- TTTTTTGTAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 6 362282 CASAVA_Build 8 84363558 1D TTAAGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 8 22 12 T 11 10 362283 CASAVA_Build 8 84365138 1D AGGCAGGTGT G/- GGGGGGAGAG 3070 hom 36 het 16 0 12 4 G 7 6 362284 CASAVA_Build 8 84369475 1D TTAAACATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 16 10 T 12 11 362285 CASAVA_Build 8 84380553 3I AGGCTCCAAA ---/AGG AGTTTTCTCA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 AGG 0 1 362286 CASAVA_Build 8 84385378 16D AGGCTCTCCA AAATCATGTTTGACAT/---------------- AAATATATGT 3070 het 3070 ref 44 26 15 7 AAATCATGTTTGACAT 1 0 362287 CASAVA_Build 8 84385919 1D CATTTGCCAA T/- GTTTCAAAAT 3070 het 3070 ref 46 29 13 4 T 1 0 362288 CASAVA_Build 8 84386472 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 13 12 362289 CASAVA_Build 8 84389657 6D ACACACACAA ATACAC/------ ATACACATAC 3070 het 3070 ref 45 18 16 12 ATACAC 4 3 362290 CASAVA_Build 8 84390637 1I AAAAAAATTA -/G CCAGGCATGG 3070 hom 62 het 24 0 20 4 G 0 1 362291 CASAVA_Build 8 84395227 1I CAGACTTAAG -/A AATTTTTTCT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 2 3 362292 CASAVA_Build 8 84395944 3D ATAAAAATAC AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 51 het 28 0 18 12 AAT 7 6 362293 CASAVA_Build 8 84401658 1D GCTTCTGCAC A/- AGCGAAAGAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 2 1 362294 CASAVA_Build 8 84403394 1I TGAGCTTACA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 8 9 362295 CASAVA_Build 8 84406999 1D CCAAGGTCTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 9 8 362296 CASAVA_Build 8 84408610 1D AAGACAGAGT G/- GGGGTTTTAT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 G 5 4 362297 CASAVA_Build 8 84412095 2D ATATATAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 69 het 29 0 24 8 TG 11 10 362298 CASAVA_Build 8 84413754 9D7M13D TATCTTCATG AGAGGGTACATATATAACCATAAATTGTC/---------ATATATA------------- AAATGACCAC 3070 hom 69 het 23 0 24 3 N/A 0 0 362299 CASAVA_Build 8 84464661 2I GAGGAAAATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 T 10 12 362300 CASAVA_Build 8 84520898 1I GATAGATAGC -/A GAATGATTTT 3070 het 3070 ref 50 23 20 7 A 0 1 362301 CASAVA_Build 8 84528672 2I TGTTCCTCGG --/CA CAGTGAGCAT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 CA 1 2 362302 CASAVA_Build 8 84536028 5D GGATTTCAAA TTTAT/----- TTTCCTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 TTTAT 1 0 362303 CASAVA_Build 8 84549010 4D ATGCAATAAT AGTG/---- AGGTACATGA 3070 het 3070 ref 37 23 12 4 AGTG 1 0 362304 CASAVA_Build 8 84549523 2D AACAACCTAA CT/-- CTATACCACA 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 CT 2 1 362305 CASAVA_Build 8 84552361 3D ATAGTCTGAA ATT/--- ATTGACCAGA 3070 het 3070 hom 63 25 33 7 ATT 2 1 362306 CASAVA_Build 8 84563067 1D AAATATGAGA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 T 8 7 362307 CASAVA_Build 8 84577707 5D ATCCATAAGC ATGGG/----- ATGGGATGTG 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 ATGGG 2 1 362308 CASAVA_Build 8 84587078 6D GAGAGAGAGA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 het 2331 hom 28 7 9 12 GT 13 10 362309 CASAVA_Build 8 84590483 1I CAAATATGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 T 8 9 362310 CASAVA_Build 8 84590941 1D CTAAAATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2095 hom 30 10 11 9 T 17 16 362311 CASAVA_Build 8 84591982 1I AAGGAACTTA -/C AACTAGGACA 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 0 1 362312 CASAVA_Build 8 84592622 1I GGGAAAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 10 19 8 A 10 11 362313 CASAVA_Build 8 84593441 1D GCGGCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2379 hom 32 10 12 10 A 15 14 362314 CASAVA_Build 8 84606665 1D ATTTTCTAAG T/- TTTGGTCTTA 3070 het 3070 ref 29 19 10 0 T 4 3 362315 CASAVA_Build 8 84606755 1D TTTCCATATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 A 11 10 362316 CASAVA_Build 8 84607481 1D ATTCAGTCAG C/- AAAGATAACT 3070 het 3070 ref 42 21 18 4 C 1 0 362317 CASAVA_Build 8 84611454 1D TTTTTTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 T 12 11 362318 CASAVA_Build 8 84621447 1I CAACTTGGAC -/A ATATTCTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 A 1 2 362319 CASAVA_Build 8 84628664 1I TATGGGAACT -/A AAAATTCAAG 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 A 4 5 362320 CASAVA_Build 8 84633988 1I TATCTCTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 61 28 20 13 T 9 10 362321 CASAVA_Build 8 84636109 13I AAGAGTAAAA -------------/CTGCTGAGTAAAT TTGCTGAGTA 3070 het 3070 hom 41 21 19 1 CTGCTGAGTAAAT 0 1 362322 CASAVA_Build 8 84636643 1I ATACTTTATT -/G TTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 G 0 1 362323 CASAVA_Build 8 84645777 2D CATATATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 1689 hom 21 4 11 6 TA 8 7 362324 CASAVA_Build 8 84664567 2D TAGTTTAAAC TT/-- TTAAGATCAT 3070 het 3070 ref 40 19 14 8 T 4 2 362325 CASAVA_Build 8 84668035 2I ATACATTAAC --/TG GGAATGGAGA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 TG 0 1 362326 CASAVA_Build 8 84669324 1D TATAAAATTG C/- AAAAAACATC 3070 het 3070 ref 28 15 13 0 C 1 0 362327 CASAVA_Build 8 84669525 1D ATCTTTTCAG A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 A 7 6 362328 CASAVA_Build 8 84671904 1I ATAGAAAGGC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 7 8 362329 CASAVA_Build 8 84672339 1I GTTTAAAAGG -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 22 8 12 2 A 8 9 362330 CASAVA_Build 8 84673450 1D AGAACAGAAC T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 T 9 8 362331 CASAVA_Build 8 84678189 1I CCCAAGACAC -/A ATAGTTGTCA 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 1 2 362332 CASAVA_Build 8 84681756 3I TTTACACTGT ---/TGG TGGGAGTGTA 2723 het 2723 ref 21 11 6 4 TGG 1 2 362333 CASAVA_Build 8 84682686 6I CTGTACAAAA ------/TATACT TAACGAGGTT 3070 het 3070 ref 43 21 21 2 TATACT 0 1 362334 CASAVA_Build 8 84683598 4D ATACAATGGA GAGG/---- GAACATATAT 3070 het 3070 ref 37 18 18 3 GAGG 1 0 362335 CASAVA_Build 8 84687235 1D CAATAAAAGC A/- ACTAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 2 1 362336 CASAVA_Build 8 84688208 1D TATTGTCTAT G/- GGAGTATGAG 3070 het 3070 ref 33 14 15 5 G 3 2 362337 CASAVA_Build 8 84689145 2D TCTCTCTCTC TT/-- TTTCCTTTCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 5 3 362338 CASAVA_Build 8 84696782 1I TTTTCGTTTC -/T TTTTACTCTT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 4 5 362339 CASAVA_Build 8 84699053 1D TGACATTGAG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 8 7 362340 CASAVA_Build 8 84701581 2I TTTTCAGCAA --/TT TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 44 25 18 1 T 7 9 362341 CASAVA_Build 8 84703417 1I TGTGTGGGTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 19 15 6 T 8 9 362342 CASAVA_Build 8 84706260 5D TAATATGTAT ATATG/----- ATATATCTAC 3070 het 3070 hom 18 7 10 2 ATATG 1 0 362343 CASAVA_Build 8 84707965 6I ATACTATTTC ------/TTTCAG TTTCTGATTT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 TTTCAG 0 1 362344 CASAVA_Build 8 84714820 1I TGTCTTAAAT -/A AAAAAAAAAA 2987 het 2987 ref 30 18 7 5 A 10 11 362345 CASAVA_Build 8 84716941 1D GGACAATTAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 A 10 9 362346 CASAVA_Build 8 84720731 1D TATTCTTTTT A/- AAAAAATTTA 3070 het 2818 hom 22 9 9 4 A 7 6 362347 CASAVA_Build 8 84732583 5I ATATTACATT -----/ATGTA ATATATGATA 3070 het 2321 hom 21 7 9 5 ATGTA 0 1 362348 CASAVA_Build 8 84733485 1D ATGAAGGAGG T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 T 7 6 362349 CASAVA_Build 8 84734678 3D TGAAAAACAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 42 17 17 10 AAT 4 3 362350 CASAVA_Build 8 84742629 2I ATTGTTCTTG --/TT TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 8 10 362351 CASAVA_Build 8 84750288 4I CTAAAAAGAA ----/AGAC AAATATTGAA 3059 het 3059 ref 28 14 9 5 AGAC 0 1 362352 CASAVA_Build 8 84750770 1I ACAAGTATTA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 T 6 7 362353 CASAVA_Build 8 84751529 1D TTATGGAGTT G/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 G 1 0 362354 CASAVA_Build 8 84759545 2D ATGTAGGTGA GT/-- ACACTATATG 3070 het 3070 hom 32 8 20 4 GT 1 0 362355 CASAVA_Build 8 84759889 2D TATATTCGTG TA/-- TATATATATT 3070 het 1499 hom 20 4 14 2 TA 5 4 362356 CASAVA_Build 8 84765940 1I CTCCGAACAG -/A AAAAAAATTG 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 A 7 8 362357 CASAVA_Build 8 84784580 4D AACTTATAAA TGTT/---- TGTCTTTCAT 3070 het 3070 ref 40 24 14 3 TGTT 1 0 362358 CASAVA_Build 8 84796137 1D AATGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 15 12 A 12 11 362359 CASAVA_Build 8 84805084 1I GGCCTAATAA -/G GTGCCTCCCA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 G 1 2 362360 CASAVA_Build 8 84813498 3D ATAGCCTACT TAC/--- TTAATATACC 3070 het 3070 ref 43 20 20 3 TAC 1 0 362361 CASAVA_Build 8 84815065 19I CAACTCAAAA -------------------/GACTTAGATCTCATCTTCC GAGTTATCTA 3070 het 3070 ref 38 16 16 7 GACTTAGATCTCATCTTCC 0 1 362362 CASAVA_Build 8 84816398 2D TAACCATCAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 24 4 A 12 10 362363 CASAVA_Build 8 84824015 1I GTTTTAAAAC -/T TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 5 6 362364 CASAVA_Build 8 84826725 1D TTCTGATATT A/- AAAAATGATT 3070 het 3070 hom 27 10 14 4 A 6 5 362365 CASAVA_Build 8 84827280 1I AACAACATGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 T 8 9 362366 CASAVA_Build 8 84834157 1D ACTAGATGCC A/- AAAATATGCT 3070 het 3070 ref 30 20 10 0 A 5 4 362367 CASAVA_Build 8 84839928 1I ACGCTTCTTC -/A AATGGAAGGA 3070 het 3070 hom 32 14 13 5 A 2 3 362368 CASAVA_Build 8 84841054 6D TAAACTATTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2824 het 797 hom 19 6 9 4 A 18 12 362369 CASAVA_Build 8 84845857 1D AACTTAGAAC A/- AAAAAATCTC 3070 het 3070 hom 37 13 22 3 A 7 6 362370 CASAVA_Build 8 84848528 4I TAATGACACA ----/TTTC TTTCTTTATA 3070 het 3070 ref 38 22 13 3 TTTC 1 2 362371 CASAVA_Build 8 84853694 1I ATATGTGATA -/T TATAATATAT 3070 het 3070 ref 16 8 7 1 T 1 2 362372 CASAVA_Build 8 84856549 1I CTAATATTTC -/T TTTTTTTTTT 2853 het 2853 ref 30 16 10 4 T 10 11 362373 CASAVA_Build 8 84858769 1I GCAAATCCTG -/A AAAAAGGAAC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 A 5 6 362374 CASAVA_Build 8 84861872 1D TTAATAACTC A/- AAAAAACCTA 3070 het 3070 ref 47 24 19 5 A 7 6 362375 CASAVA_Build 8 84862065 1I AAATAAGGCA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 T 7 8 362376 CASAVA_Build 8 84862848 1I TCCAAGCCTA -/G GGGGGTATAA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 G 5 6 362377 CASAVA_Build 8 84868108 1D AGTCATGTAA T/- AGGTGTCATA 3070 het 3070 ref 60 32 20 8 T 1 0 362378 CASAVA_Build 8 84871274 1D GATTTTTTTG A/- GAAACCACTA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 A 1 0 362379 CASAVA_Build 8 84876928 2I TAAATATTCC --/CG CCCCCGGACA 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 CG 0 1 362380 CASAVA_Build 8 84878577 1I CCTAATTCTT -/C CACTTACTAG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 C 1 2 362381 CASAVA_Build 8 84879099 1D TGCTCACGCT A/- TTTTGTGAGC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 1 0 362382 CASAVA_Build 8 84880609 1D CCATGGCTAT A/- ATCTTACAAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 2 1 362383 CASAVA_Build 8 84883073 1D ACATCCACCC T/- TGATCTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 T 2 1 362384 CASAVA_Build 8 84883482 7I CTTCAAGTTG -------/TCTCACC TTTTTGGACC 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 TCTCACC 0 1 362385 CASAVA_Build 8 84892342 1I GAATAGCCAC -/T TGCACTCCAG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 T 1 2 362386 CASAVA_Build 8 84895460 2D AATGTGGAAA AC/-- AAAATATTTA 3070 het 3070 hom 54 20 28 6 AC 1 0 362387 CASAVA_Build 8 84896656 1I TTTACCAGAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 7 8 362388 CASAVA_Build 8 84898656 4I AAAATATAAA ----/TAAT TAAATGAATG 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 TAAT 0 1 362389 CASAVA_Build 8 84899033 1D CTAAAAATAT A/- AAAAAAAATT 1508 hom 10 het 4 0 4 0 A 9 8 362390 CASAVA_Build 8 84901639 1D CCTTAACACA T/- TAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 18 0 13 6 T 2 1 362391 CASAVA_Build 8 84901870 1D TAAAAATACA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 23 10 2 T 10 9 362392 CASAVA_Build 8 84902781 2I GCATATCTAT --/AG AGTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 50 19 23 8 AG 1 2 362393 CASAVA_Build 8 84903393 1D CTAAGAATCC A/- AAAGCTGAAC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 A 4 3 362394 CASAVA_Build 8 84913045 1D ATAAAATGTT A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 41 21 20 0 A 9 8 362395 CASAVA_Build 8 84914309 2D CATGAGCTCA GG/-- GGGTGTGAAA 3070 het 3070 hom 42 18 16 9 G 5 3 362396 CASAVA_Build 8 84923171 1D CACACACACA C/- CATATATATT 3070 hom 78 het 34 0 26 8 C 2 1 362397 CASAVA_Build 8 84926479 1D TTGGTTTTGA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 10 9 362398 CASAVA_Build 8 84931452 11D AATCCCACTG CTAGGTATATA/----------- CTAGGTATAT 3070 hom 120 het 44 0 41 4 CTAGGTATATA 2 1 362399 CASAVA_Build 8 84937337 1D GAATGAAACC A/- AAAAAAAGCA 3070 hom 69 het 38 1 32 5 A 8 7 362400 CASAVA_Build 8 84939521 1I GCATGCCTTA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 T 7 8 362401 CASAVA_Build 8 84945797 1I TGTTTGTTTC -/T TTGTGAATCA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 2 3 362402 CASAVA_Build 8 84946010 1D GGTAGAAAGT A/- AAAGAAAGCC 3070 het 3070 hom 53 19 29 6 A 4 3 362403 CASAVA_Build 8 84946807 1D TTCTTTCTCA G/- TCTCCTTCAC 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 G 1 0 362404 CASAVA_Build 8 84956279 1D GGAAATTAAT C/- CATTAGAGTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 5 C 2 1 362405 CASAVA_Build 8 84956892 1D TCATTTTTGT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 7 362406 CASAVA_Build 8 84959172 1D CCTTCATTAA T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 8 7 362407 CASAVA_Build 8 84964951 1I TAGTAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 A 10 11 362408 CASAVA_Build 8 84984259 4D GCAGAGGGGC CTGA/---- CTGTTAGAAG 3070 hom 75 het 28 0 26 3 CTGA 1 0 362409 CASAVA_Build 8 84986885 1D AAAGAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 453 hom 23 1 18 4 A 13 12 362410 CASAVA_Build 8 84988535 6I AAAGATTATT ------/AGAAAC AGAATAAATT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AGAAAC 0 1 362411 CASAVA_Build 8 85014000 1I CACCCCCAGG -/C CATGACAACC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 C 1 2 362412 CASAVA_Build 8 85014757 2D CCATTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 11 7 T 12 10 362413 CASAVA_Build 8 85017052 1D GAGTTGTTGC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 T 9 8 362414 CASAVA_Build 8 85023860 12D ACTAACACAA TACTTTTGACTG/------------ TACAGATAAA 3070 het 3070 ref 44 30 14 4 TACTTTTGACTG 1 0 362415 CASAVA_Build 8 85029537 2D AAACAAACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 AC 8 7 362416 CASAVA_Build 8 85031074 1I TTAGTACTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 T 11 12 362417 CASAVA_Build 8 85044896 1D CTCTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 T 11 10 362418 CASAVA_Build 8 85046530 1D TTTTAATTAG A/- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 35 13 21 1 A 7 6 362419 CASAVA_Build 8 85048182 1I TAATAATGTC -/T TGAGACTGGT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 1 2 362420 CASAVA_Build 8 85056627 4D TATTAATAGT CTTA/---- CTTAATCCAA 3070 het 191 hom 20 1 10 10 CTTA 2 1 362421 CASAVA_Build 8 85056646 1I TCCAAATATG -/A AAAAAAGGAT 3070 het 279 hom 24 1 13 10 A 6 7 362422 CASAVA_Build 8 85057043 1I ATAAGAGATG -/A CGGCATTTTG 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 A 0 1 362423 CASAVA_Build 8 85062995 1D GTTTCCAGAA T/- TTTTTTTGGG 1795 het 1795 ref 23 10 6 7 T 8 7 362424 CASAVA_Build 8 85063438 4I ATAGGTAGAT ----/GATA GATAGACTCC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 GATA 1 2 362425 CASAVA_Build 8 85072394 1D AATTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2803 het 2315 hom 39 12 13 15 A 16 15 362426 CASAVA_Build 8 85077732 3I TGTGTGTGAA ---/TAT TATTAAGATT 3070 het 3070 ref 42 21 21 0 TAT 1 2 362427 CASAVA_Build 8 85083547 2I ATCTCAGGTG --/AC ACACACCTGG 2053 het 2053 ref 12 6 5 1 AC 3 4 362428 CASAVA_Build 8 85085353 1I GGACTGGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 51 23 17 11 A 10 11 362429 CASAVA_Build 8 85087719 1I CAGAATGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 11 12 14 A 15 16 362430 CASAVA_Build 8 85096243 2D CTCCTGCCAC TG/-- TGTCTTATTA 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 TG 2 1 362431 CASAVA_Build 8 85104594 2I CCTGTCAACC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 AT 7 8 362432 CASAVA_Build 8 85106659 1D GCTGCAGAGA G/- GAGCTGACAA 2700 het 2700 ref 35 22 7 6 G 2 1 362433 CASAVA_Build 8 85106925 1D TCTTCCTGGG C/- CATGGAATAA 3070 het 3070 ref 52 23 20 10 C 2 1 362434 CASAVA_Build 8 85108118 1D CTTAGATAAC A/- ATCTCTAAAC 3070 het 3070 ref 41 21 15 6 A 2 1 362435 CASAVA_Build 8 85118616 4I GTATAAAATA ----/AAAT AAATAATTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AAAT 1 2 362436 CASAVA_Build 8 85118761 1I TATTCTATAC -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 A 7 8 362437 CASAVA_Build 8 85119782 1I CCAGTTCTGC -/A AGCTCCGTTT 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 1 2 362438 CASAVA_Build 8 85122069 5D GTCCAAGGCC ATGGT/----- ATAGGAACAG 3070 het 3070 hom 19 8 10 1 ATGGT 1 0 362439 CASAVA_Build 8 85122338 1D CAGGAGCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 19 2 A 12 11 362440 CASAVA_Build 8 85126430 23D CTTATTTTGT AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/----------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 2450 hom 29 10 15 7 A 38 15 362441 CASAVA_Build 8 85127523 1I CACATAAATT -/A TTGCTTTGCA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 A 0 1 362442 CASAVA_Build 8 85130063 7I CAAACAAAAA -------/GGCAAAG GGCAAAGGAA 3070 het 3070 ref 51 28 16 7 GGCAAAG 1 2 362443 CASAVA_Build 8 85131704 1D CTCAATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2337 hom 26 9 9 9 T 13 12 362444 CASAVA_Build 8 85132253 1D ATTGAATGAT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 59 het 22 0 13 9 G 11 10 362445 CASAVA_Build 8 85147810 1D ATCCCAGAGG T/- TTTTGGTAAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 5 4 362446 CASAVA_Build 8 85168692 1D ATAACTTAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 4 T 10 9 362447 CASAVA_Build 8 85209181 9I TGTCATCTTT ---------/AAGTATGAC AAGTATGACT 3070 hom 111 het 43 0 37 8 AAGTATGAC 1 2 362448 CASAVA_Build 8 85209367 1I GCTGCAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 16 10 T 14 15 362449 CASAVA_Build 8 85215616 1D TGGTGATAAG A/- GATATGAAGA 3070 hom 141 het 49 0 48 1 A 1 0 362450 CASAVA_Build 8 85217058 2D TTCTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 11 9 362451 CASAVA_Build 8 85221518 1I TAATAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 39 1 31 7 T 10 11 362452 CASAVA_Build 8 85231099 2D AGTTCCCTTC AG/-- AGTCTATAAA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 AG 2 1 362453 CASAVA_Build 8 85235394 1D CTTTGGAAGT A/- AATCGTTAAG 3070 hom 132 het 48 0 45 3 A 3 2 362454 CASAVA_Build 8 85241417 1D GTAATCCAAG T/- TTTTTTTATT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 8 7 362455 CASAVA_Build 8 85246372 1D AATCTTAGCA T/- TTTTGGGAGG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 5 4 362456 CASAVA_Build 8 85259136 1I GTTTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 18 0 13 5 A 11 12 362457 CASAVA_Build 8 85272564 1D CAGAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3040 het 362 hom 22 3 11 8 A 13 12 362458 CASAVA_Build 8 85274812 3D ATCCCAGTAC TTA/--- TTATGTAATT 3070 het 3070 ref 33 16 14 5 TTA 2 1 362459 CASAVA_Build 8 85276031 4I TATAGAATGT ----/TAAA TAATCTGTAT 3070 het 3070 hom 45 16 25 4 TAAA 0 1 362460 CASAVA_Build 8 85278829 1I AGTGTATAAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 7 8 362461 CASAVA_Build 8 85285167 1I TCAAATTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1778 hom 18 5 12 1 T 10 11 362462 CASAVA_Build 8 85285283 1I TCATTGGCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 9 10 362463 CASAVA_Build 8 85285674 2D CTAGTGTGTG CT/-- CTCGGCATTG 3070 het 3070 hom 22 9 11 4 CT 2 1 362464 CASAVA_Build 8 85290329 1D ATGCATAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 T 11 10 362465 CASAVA_Build 8 85291188 2D GGGAAGTTAT AA/-- GAGACAACCT 3070 het 3070 hom 26 9 15 2 A 2 0 362466 CASAVA_Build 8 85294366 3D AGTGTAACTT AAA/--- AATAAATAAG 3070 het 3070 ref 32 13 11 11 A 5 2 362467 CASAVA_Build 8 85296077 2D TGGAAAGCGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 GT 8 7 362468 CASAVA_Build 8 85299452 1I TCATTATTAC -/T TTTTTTTTTT 3038 het 3038 ref 30 12 9 9 T 13 14 362469 CASAVA_Build 8 85301411 1I TGACTTAAAA -/G GGAGATAATT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 G 2 3 362470 CASAVA_Build 8 85302945 6D ATAGTCTAGC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2479 het 2047 hom 35 14 9 12 A 22 16 362471 CASAVA_Build 8 85303196 1I AGGTATCTGA -/G GGTAGTACTA 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 G 2 3 362472 CASAVA_Build 8 85309560 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 1810 het 558 hom 13 3 6 4 T 13 14 362473 CASAVA_Build 8 85316361 1D AGGTCAAGAG T/- TCAAGACCAG 3070 het 1892 hom 16 4 7 6 T 2 1 362474 CASAVA_Build 8 85326722 4D ATTTTAGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3019 het 3019 ref 19 10 7 3 TTTG 3 2 362475 CASAVA_Build 8 85331154 4I ATTTTGCTAC ----/CTAA CTATTTTCAT 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 CTAA 0 1 362476 CASAVA_Build 8 85333406 1D CTAATTCTCA T/- TCTTAAGATT 3070 het 3070 hom 43 17 25 1 T 2 1 362477 CASAVA_Build 8 85335898 1I TATTTACAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 11 12 362478 CASAVA_Build 8 85359032 5I GGTGTGAAAA -----/TATCT TATTTAGTAA 3070 het 3070 hom 43 19 21 3 TATCT 0 1 362479 CASAVA_Build 8 85362423 1I GCCATGGGGG -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 A 8 9 362480 CASAVA_Build 8 85392038 3I GCAAAACAAA ---/GAT GAATGAAACA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 GAT 0 1 362481 CASAVA_Build 8 85409330 5D AATTACATAT TAAAG/----- TAAATTAAAA 3070 het 3070 ref 19 9 9 2 TAAAG 1 0 362482 CASAVA_Build 8 85411759 19D GAAATCTGCA CACTACTAGTGTTTGTATT/------------------- CATATTTTTT 3070 het 3070 ref 36 22 17 4 CACTACTAGTGTTTGTATT 1 0 362483 CASAVA_Build 8 85412120 1D GAATGAATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 20 6 T 12 11 362484 CASAVA_Build 8 85413256 1D TACTGCAATT A/- AAAAAAAAAA 2443 het 2443 ref 26 13 7 6 A 15 14 362485 CASAVA_Build 8 85415949 2D AACCAGGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 2755 het 1366 hom 33 9 8 17 T 18 16 362486 CASAVA_Build 8 85422019 1D CATTACAGTA T/- TTTTTAGCCC 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 T 6 5 362487 CASAVA_Build 8 85434030 1D TTTTGAGAGC T/- TTTTTTTTTT 2535 het 2535 ref 21 11 8 2 T 12 11 362488 CASAVA_Build 8 85476701 1D TTACCCTGTC A/- AAAATCTTGT 3070 hom 99 het 34 0 34 0 A 5 4 362489 CASAVA_Build 8 85490337 3I CGACACTCTT ---/GTA GTTCATCCAG 3070 hom 73 het 33 0 25 8 GTA 0 1 362490 CASAVA_Build 8 85504280 1D TGCTTTTTCC A/- GAAAAATAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 1 0 362491 CASAVA_Build 8 85508599 6D29M2D GTGCATGTAT GTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTA/------GTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTG-- TATATATATA 3070 het 28 hom 20 1 19 10 N/A 0 0 362492 CASAVA_Build 8 85513174 4D ATTATTTTAC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 51 het 29 0 18 11 TTAT 5 4 362493 CASAVA_Build 8 85513737 1I TCTATGTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 646 hom 30 2 24 4 T 10 11 362494 CASAVA_Build 8 85515606 11D AGCTACATTA AGCTACATAAT/----------- AGCTACATAA 3070 hom 63 het 31 0 22 9 AGCTACATAAT 1 0 362495 CASAVA_Build 8 85521174 1I TAGTGGGTGC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 839 hom 54 2 44 8 A 8 9 362496 CASAVA_Build 8 85527103 1I AAGTCAATTG -/T CTTTAGATTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 0 1 362497 CASAVA_Build 8 85537232 1I CTCTCTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 15 17 6 A 12 13 362498 CASAVA_Build 8 85538933 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 110 hom 13 1 10 2 T 11 12 362499 CASAVA_Build 8 85545259 1D ATTGTATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 120 hom 42 1 34 8 T 12 11 362500 CASAVA_Build 8 85552158 1I TTTACATATA -/T TTTTAATATA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 4 5 362501 CASAVA_Build 8 85552500 5I TTAGTGAAAA -----/GAATT GAATTAAAGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 GAATT 1 2 362502 CASAVA_Build 8 85556272 1I TCTATTCCTA -/T TTTTGAAATT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 4 5 362503 CASAVA_Build 8 85561082 4I TACATATATA ----/TAAG TAATTTTAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TAAG 0 1 362504 CASAVA_Build 8 85572748 2D GCTTTTTAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 6 T 14 12 362505 CASAVA_Build 8 85577704 1D CCCACTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 18 5 A 12 11 362506 CASAVA_Build 8 85581181 6I GATTACATCC ------/ATATTT ATAAGTTAAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 ATATTT 0 1 362507 CASAVA_Build 8 85583642 5I TTATAATAAA -----/AACTC AACAATCTTT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AACTC 0 1 362508 CASAVA_Build 8 85589640 3D CAGGTGCTAG TAT/--- TATTAAAGAT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TAT 2 1 362509 CASAVA_Build 8 85593002 3D GTAAGATCTT AGC/--- AAACTTTAAC 3070 hom 99 het 35 0 32 5 AGC 1 0 362510 CASAVA_Build 8 85605278 1D TATCCAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 94 het 40 0 30 10 A 15 14 362511 CASAVA_Build 8 85607173 1D TTATACCTTT G/- TTTTTGATGA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 G 1 0 362512 CASAVA_Build 8 85615347 1D CCATCATGAT A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 82 het 35 0 28 7 A 8 7 362513 CASAVA_Build 8 85617306 1D ATTGAATCAT G/- GGGGGCAGTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 G 6 5 362514 CASAVA_Build 8 85621750 1I CTAATTTTAA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 T 7 8 362515 CASAVA_Build 8 85622472 1I CTCAGCCAAG -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 6 7 362516 CASAVA_Build 8 85626910 1D GGAGAGGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 30 2 20 9 T 14 13 362517 CASAVA_Build 8 85642968 1D AGGTATATCT C/- CCTAATGCTA 2988 hom 18 het 7 0 7 0 C 3 2 362518 CASAVA_Build 8 85707909 1D AGAATTGAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 108 het 39 0 36 4 T 10 9 362519 CASAVA_Build 8 85710146 3I TCTATAGAAG ---/AAC AACTATTTCC 3070 hom 81 het 33 0 28 5 AAC 1 2 362520 CASAVA_Build 8 85713662 34D GCACGCATAA ATATATATATATATATATATATATATATATATAT/---------------------------------- ATATATATAT 3070 hom 36 het 17 0 13 7 AT 25 8 362521 CASAVA_Build 8 85817721 15D TACTACTTAT TGAGATCCTTGAATG/--------------- TGAGATCCTT 3070 het 3070 hom 57 23 32 10 TGAGATCCTTGAATG 1 0 362522 CASAVA_Build 8 85819855 2D CCCAAAACAA AC/-- ACACACACAC 697 het 697 ref 65 47 3 15 AC 10 9 362523 CASAVA_Build 8 85871548 2D TAAGTATATT AA/-- GTTATTTATA 3070 het 3070 ref 33 19 10 5 A 2 0 362524 CASAVA_Build 8 85873120 1D CTCAGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 11 10 362525 CASAVA_Build 8 85875442 1I GATAAAAAAA -/C ATTCCTTTCT 3070 het 3070 hom 31 9 20 2 C 0 1 362526 CASAVA_Build 8 85899053 2I CAATAGCTGC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 11 13 362527 CASAVA_Build 8 85953397 1I CTTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 A 10 11 362528 CASAVA_Build 8 86018893 3I ATTTGGGCTT ---/CTC CTTTCCTACT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 CTC 0 1 362529 CASAVA_Build 8 86019034 1D TAGACAATCT C/- CCCCCTCCTC 3070 hom 78 het 29 0 26 4 C 6 5 362530 CASAVA_Build 8 86042709 1I CAATATTTAA -/T TTTTCCATAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 4 5 362531 CASAVA_Build 8 86054347 4I GTTGTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 TTTG 2 3 362532 CASAVA_Build 8 86058460 1I32M1I ATTCCAGTAG -TTTGTATATTAACTCATGGTAAATTGAGAATT-/TTTTGTATATTAACTCATGGTAAATTGAGAATTA AGAATACCGT 3070 hom 132 het 41 0 45 7 N/A 0 0 362533 CASAVA_Build 8 86063258 1D AGGTAATGTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 180 hom 33 1 30 2 T 10 9 362534 CASAVA_Build 8 86064126 4D ACTGGTGATT TTTC/---- TTTCTTTTTC 3070 hom 126 het 48 0 43 8 TTTC 2 1 362535 CASAVA_Build 8 86065273 1D TTCTGGTAAA G/- AATCTAGAAT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 G 1 0 362536 CASAVA_Build 8 86200885 1I TTCAATGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 29 0 24 5 T 12 13 362537 CASAVA_Build 8 86235253 1D ATAATTCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 11 10 362538 CASAVA_Build 8 86236479 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 2821 hom 19 7 11 1 T 7 8 362539 CASAVA_Build 8 86242346 2D AAAAGAAAAG AA/-- AAATTATAAT 3070 het 136 hom 28 4 16 8 A 5 3 362540 CASAVA_Build 8 86245147 4D TTTGATCAAG TATT/---- TATTAATTGT 3070 hom 84 het 31 0 29 4 TATT 2 1 362541 CASAVA_Build 8 86245732 1I TCATATGCTA -/T GTATGCAGAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 0 1 362542 CASAVA_Build 8 86248538 5D CCAAGGATAT CAAAG/----- AAGATAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CAAAG 1 0 362543 CASAVA_Build 8 86281449 1D ACTGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 A 12 11 362544 CASAVA_Build 8 86286448 1I ATCCAAGCAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 19 0 15 4 A 9 10 362545 CASAVA_Build 8 86299031 9D AGTGGTGATA GTGGTGGTG/--------- GTGGTGGTGG 3070 hom 105 het 39 0 35 13 GTG 7 4 362546 CASAVA_Build 8 86299854 4D AGTATTTGAG AAAT/---- AATGTTTAGT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AAAT 1 0 362547 CASAVA_Build 8 86301778 3I TCTGAAACCT ---/TTA TTTTTCTTCT 3070 hom 77 het 30 0 25 5 TTA 0 1 362548 CASAVA_Build 8 86307227 4I CATTTAGCTC ----/AAAT AAAGTCAATT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AAAT 0 1 362549 CASAVA_Build 8 86312261 1I AATGTTATAG -/T TAACTAGAGA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 T 1 2 362550 CASAVA_Build 8 86314080 6I TAGCTTCATC ------/AACATT AACTGGTTTG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AACATT 0 1 362551 CASAVA_Build 8 86318037 1I CTGTCCTTGT -/A AGTAAAGTTT 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 1 2 362552 CASAVA_Build 8 86334093 2D AGTGCATTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 19 0 16 3 T 13 11 362553 CASAVA_Build 8 86340216 1D TCCCCACTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 9 12 11 A 10 9 362554 CASAVA_Build 8 86342282 4D CCTGGGCGAC AGAG/---- AGAGACTCCA 3070 hom 42 het 17 0 14 8 AG 4 2 362555 CASAVA_Build 8 86345470 5D GGTTCCTCTT TAAAC/----- TAAGCAGCAC 3070 hom 96 het 35 0 31 6 TAAAC 1 0 362556 CASAVA_Build 8 86347402 1I AAACATTGGT -/A AAACCAGTGA 3070 hom 87 het 36 0 34 2 A 3 4 362557 CASAVA_Build 8 86350483 3D GACTATACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1221 het 320 hom 27 4 3 20 T 19 16 362558 CASAVA_Build 8 86351109 1D AATGCCATTT A/- AGTACCTGCT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 2 1 362559 CASAVA_Build 8 86351915 1D CTATTAGTAC T/- TTTTTCTAGA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 6 5 362560 CASAVA_Build 8 86368159 1D GAAACTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1405 hom 41 7 19 15 T 17 16 362561 CASAVA_Build 8 86378129 2D GCAAATGGAA AG/-- AGAGCTTTGG 3070 hom 114 het 44 0 39 7 AG 3 2 362562 CASAVA_Build 8 86382409 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 5 het 34 1 29 4 T 10 9 362563 CASAVA_Build 8 86405011 1I TCAATCATCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2818 hom 27 10 10 7 A 11 12 362564 CASAVA_Build 8 86408672 4D AATTTGTAAT TATC/---- TATATATTTT 3070 het 3070 ref 45 24 17 4 TATC 1 0 362565 CASAVA_Build 8 86414677 5I TTAGATGAGT -----/AATAA AATAAAATAA 3070 hom 63 het 35 0 22 13 AATAA 2 3 362566 CASAVA_Build 8 86419539 1I GTAAGGAGAT -/A AAAGAGAAAG 3070 het 3070 ref 42 21 18 3 A 3 4 362567 CASAVA_Build 8 86420659 1I ACAAAAATAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 9 10 362568 CASAVA_Build 8 86422034 3I TTTTTATAAT ---/AAG ACTTCTTCTG 3070 hom 102 het 36 0 34 2 AAG 0 1 362569 CASAVA_Build 8 86422837 1I TATACTCTAG -/T TTTTGAGAGA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 4 5 362570 CASAVA_Build 8 86434498 4I TAACGACAAA ----/AAAT AAATAAAGAC 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AAAT 1 2 362571 CASAVA_Build 8 86440598 1I TGCACTCTAG -/C CTGGGCGACA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 C 1 2 362572 CASAVA_Build 8 86440628 1I TGTGTCAAAG -/A AAAAAAAAAT 1135 het 1135 ref 27 6 3 18 A 9 10 362573 CASAVA_Build 8 86440960 1I ATAATTATTT -/A AAAGCAGACA 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 A 3 4 362574 CASAVA_Build 8 86464477 1D CCTCTGCTCT C/- CCTCTGTGGG 3070 het 3070 hom 34 13 11 10 C 3 2 362575 CASAVA_Build 8 86470913 4I ATACACACAT ----/ACTC ACAATTTTGA 3070 het 3070 hom 36 11 22 3 ACTC 0 1 362576 CASAVA_Build 8 86475000 1D TTTTCTTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 12 11 362577 CASAVA_Build 8 86491151 1I TTTTTCTTTG -/C CTACAAAATT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 1 2 362578 CASAVA_Build 8 86496851 19I TTGCCAATTC -------------------/TAACCTTCAGAGAAGAAAG TATTAGTGTT 3070 hom 120 het 36 0 41 1 TAACCTTCAGAGAAGAAAG 0 1 362579 CASAVA_Build 8 86513697 1I GAATAAACAT -/G GGAATTCAGG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 2 3 362580 CASAVA_Build 8 86547711 1D TTCTGGTGCT C/- CTTACTCCAA 3070 hom 132 het 47 0 43 4 C 2 1 362581 CASAVA_Build 8 86551284 2D CAAAAATGAC TA/-- TGACATTAAA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TA 1 0 362582 CASAVA_Build 8 86551412 1D CTATGCAAAA G/- AAAAGAGAGT 3070 hom 132 het 46 0 45 1 G 1 0 362583 CASAVA_Build 8 86555769 1D CATGAGCTAC T/- GGGAGCTGTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 T 1 0 362584 CASAVA_Build 8 86565609 2D TGCTCACTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 27 1 13 15 A 17 15 362585 CASAVA_Build 8 86568318 1D ACTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 14 13 362586 CASAVA_Build 8 86569284 4D TTTTTAAATC TGTT/---- TGTTATTTCA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 TGTT 2 1 362587 CASAVA_Build 8 86570867 2D GCACTTTATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 33 0 23 10 T 13 11 362588 CASAVA_Build 8 86574783 1I AGCCTAGGGG -/T TTGAGGTTGC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 2 3 362589 CASAVA_Build 8 86582829 1I TCATCTCTAC -/A AAAAAATGTA 3070 het 3070 hom 49 19 19 11 A 6 7 362590 CASAVA_Build 8 86597399 4I TGATGCTCTT ----/GAAA GAGAGGTGAG 3070 hom 135 het 49 0 45 4 GAAA 0 1 362591 CASAVA_Build 8 86597494 2D GTGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 781 het 781 ref 40 28 3 10 GT 8 7 362592 CASAVA_Build 8 86611134 3I CTCATTTAGT ---/CAA CAAGTGTTGA 3070 hom 126 het 50 0 43 7 CAA 1 2 362593 CASAVA_Build 8 86613676 1I CCCTTCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 423 hom 30 1 25 4 A 10 11 362594 CASAVA_Build 8 86664141 1I CCTCAGCCTC -/T TGAAGTAGCT 3070 het 2567 hom 17 6 8 3 T 1 2 362595 CASAVA_Build 8 86666205 2D GAAAGTAAGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 23 9 12 2 AT 7 6 362596 CASAVA_Build 8 86666552 1D TTTTAGCTGG C/- CCAGGCAGGC 3070 hom 98 het 36 0 32 4 C 3 2 362597 CASAVA_Build 8 86667402 1D ATAGGAATTC A/- AATATATATA 3070 het 3070 hom 34 16 16 3 A 3 2 362598 CASAVA_Build 8 86686428 3D GAAAGAAACT TGA/--- TAGAGGTATC 3070 het 3070 hom 35 8 23 4 TGA 1 0 362599 CASAVA_Build 8 86698401 1D GAAGTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 15 hom 27 1 23 3 T 13 12 362600 CASAVA_Build 8 86706158 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 710 het 710 ref 12 5 3 4 A 10 11 362601 CASAVA_Build 8 86708630 1I GCTTTTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 17 het 24 0 17 7 T 12 13 362602 CASAVA_Build 8 86711442 1D GAGAGCTCGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 T 9 8 362603 CASAVA_Build 8 86718895 1I TCATTTATTG -/T TTTTTTTTTC 1244 het 1244 ref 42 36 3 3 T 9 10 362604 CASAVA_Build 8 86720940 1D TGTTACTAAT A/- AAAAAATTAC 3070 het 3070 ref 27 14 10 5 A 7 6 362605 CASAVA_Build 8 86728363 1I AATTTCGTTC -/T CATTTCTAAG 3070 het 3070 hom 48 20 22 6 T 0 1 362606 CASAVA_Build 8 86729822 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATAGC 3070 het 3070 ref 41 16 15 10 A 7 6 362607 CASAVA_Build 8 86736858 1I CTCTTTGAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 11 12 362608 CASAVA_Build 8 86870558 1D TTGCTTGACA G/- GCTATTAATT 2785 het 2785 ref 36 28 6 2 G 2 1 362609 CASAVA_Build 8 86881348 1D AATAGGGAAT C/- CTTTCCCCAT 1042 het 1042 ref 79 65 3 11 C 2 1 362610 CASAVA_Build 8 87000793 1I TTAGAAGCGA -/C TCAAGGGTGT 979 het 979 ref 39 25 3 11 C 0 1 362611 CASAVA_Build 8 87010205 1D CCTTTTATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 16 8 A 11 10 362612 CASAVA_Build 8 87027417 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1743 het 1743 ref 28 17 6 6 A 17 16 362613 CASAVA_Build 8 87060081 12D GGAGAAATGC CTGATTTCAGGT/------------ CTGGAATAAG 3070 het 3070 ref 44 24 20 6 CTGATTTCAGGT 1 0 362614 CASAVA_Build 8 87087551 1I CACACACACA -/C AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 28 5 C 0 1 362615 CASAVA_Build 8 87092640 2D TCTTAAGGAG TT/-- CTGATGAGGG 3070 hom 108 het 43 0 34 9 T 2 0 362616 CASAVA_Build 8 87100399 1I GAACTAGAAT -/A AGGCAGTATT 3070 hom 141 het 56 0 47 9 A 1 2 362617 CASAVA_Build 8 87102357 7D CCCCATACCT TGCTCTA/------- TGTACCTCTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 8 TGCTCTA 1 0 362618 CASAVA_Build 8 87104079 1I AAAAACATCA -/T TTTTGCACAA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 4 5 362619 CASAVA_Build 8 87105692 6D ATAAACACAA TATGTG/------ TAAATACATG 3070 het 3070 ref 45 25 15 8 TATGTG 1 0 362620 CASAVA_Build 8 87105966 1I TTGTGACCCC -/A AAAAAGATAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 5 6 362621 CASAVA_Build 8 87120000 1I ATTTATTAAC -/A ATAGGATTTA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 1 2 362622 CASAVA_Build 8 87131568 1D GAAAAGAAAC A/- ATTTAATCTG 3070 hom 117 het 43 0 39 4 A 2 1 362623 CASAVA_Build 8 87135556 1D AATTAAATAA T/- TTTTTTAAAG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 7 6 362624 CASAVA_Build 8 87143978 2D TGTGAGAAGG TC/-- CAAGCTTGCT 3070 het 2702 hom 24 7 12 6 TC 1 0 362625 CASAVA_Build 8 87151759 2D TATATATTAT AC/-- ACACACAGTA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 AC 4 3 362626 CASAVA_Build 8 87155779 1I ACCTAGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 159 hom 28 1 19 8 T 15 16 362627 CASAVA_Build 8 87161718 4I TAAAAAAAAT ----/AAAG AGAGTGATGG 3070 hom 107 het 43 0 36 7 AAAG 0 1 362628 CASAVA_Build 8 87174041 8I ACGGCAAAAA --------/AATAAAAT AATAAAATAA 3070 het 3070 hom 21 9 9 3 AATAAAAT 1 2 362629 CASAVA_Build 8 87183680 5I GAAGAAATCA -----/AGGGC ACTTGTTGGA 3070 het 3070 ref 51 26 20 5 AGGGC 0 1 362630 CASAVA_Build 8 87186470 1I TTCAACTTTA -/T GCTCCACGGT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 T 0 1 362631 CASAVA_Build 8 87187457 1D AACATGGTGC T/- TTTTTTTTTT 1089 het 1089 ref 39 29 3 7 T 11 10 362632 CASAVA_Build 8 87188380 1I GAATCTGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 206 hom 35 1 31 3 A 10 11 362633 CASAVA_Build 8 87196025 5I AAAAATAAAA -----/TAAAT TAAATTAAAA 3070 het 2996 hom 27 8 15 4 TAAAT 1 2 362634 CASAVA_Build 8 87199581 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTTA 2924 het 3 hom 10 0 8 2 T 9 10 362635 CASAVA_Build 8 87203088 1D AGTATATCTT G/- CAAATTCGAG 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 G 1 0 362636 CASAVA_Build 8 87218410 1I ATATATCTGG -/T TTTTCTCTTC 3070 hom 156 het 59 0 52 7 T 4 5 362637 CASAVA_Build 8 87220573 1D ACTTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 102 hom 30 2 14 14 A 17 16 362638 CASAVA_Build 8 87224391 1D TATCTTTGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 18 14 3 T 9 8 362639 CASAVA_Build 8 87225824 1I AGGTAAAAAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 7 8 362640 CASAVA_Build 8 87228354 1I ACTTCATATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 122 het 50 0 41 9 A 9 10 362641 CASAVA_Build 8 87238788 1I TGGCCTTCCA -/T TAGTGGCTTT 3070 het 3070 ref 55 31 18 6 T 1 2 362642 CASAVA_Build 8 87241189 2D TAAAAATAAT AA/-- TAATAATAAT 1493 het 666 hom 13 2 4 7 A 2 0 362643 CASAVA_Build 8 87246509 1I CACTTAGCTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 42 18 20 4 T 9 10 362644 CASAVA_Build 8 87247950 1D GTTTTAGGGA T/- TTCACATTTT 3070 het 3070 hom 38 17 16 7 T 3 2 362645 CASAVA_Build 8 87249821 3I TAAATTTGTA ---/TTG CTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 TTG 0 1 362646 CASAVA_Build 8 87250044 6D ATTGTTCAAT TCCCAC/------ CTATGAGTGA 1504 het 1504 ref 25 17 4 6 TCCCAC 1 0 362647 CASAVA_Build 8 87254533 1I CTTTTTTAAC -/T TTTTTCTGTA 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 T 5 6 362648 CASAVA_Build 8 87265616 4D ATTTTTCTCT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2420 hom 25 5 14 7 TTTA 4 3 362649 CASAVA_Build 8 87269653 1D GCAAGGACTC T/- TGAGTTAGGA 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 T 2 1 362650 CASAVA_Build 8 87279373 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1187 het 245 hom 11 2 3 7 A 15 14 362651 CASAVA_Build 8 87289107 1D AATGAACCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 A 10 9 362652 CASAVA_Build 8 87289456 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 A 9 10 362653 CASAVA_Build 8 87295751 8D GTTTGCACTT CCGACATC/-------- TATTCCTCAG 3070 het 3070 hom 38 16 18 6 CCGACATC 1 0 362654 CASAVA_Build 8 87310505 1D AATAAAATAT A/- AAACATAACT 3070 het 3070 hom 22 9 12 2 A 4 3 362655 CASAVA_Build 8 87310914 1I TGATTTTAGA -/T TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 55 21 29 5 T 7 8 362656 CASAVA_Build 8 87316664 1D CTTTATTGCT A/- AAAAAATATG 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 7 6 362657 CASAVA_Build 8 87318534 1I TCTATCCAGA -/C CACTTAAACT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 C 1 2 362658 CASAVA_Build 8 87323046 1D CCCTAAAGGG C/- TTCCTTCAGC 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 C 1 0 362659 CASAVA_Build 8 87328472 1D CATTGTAGGT G/- TGTGGATTTG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 1 0 362660 CASAVA_Build 8 87348862 1D ATTTTTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2499 hom 17 8 7 3 A 12 11 362661 CASAVA_Build 8 87350017 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2263 het 2263 ref 26 11 8 7 T 15 14 362662 CASAVA_Build 8 87362979 1D TTTCCCACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 38 1 29 8 A 13 12 362663 CASAVA_Build 8 87408839 2D GCAGATATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 27 0 21 6 T 15 13 362664 CASAVA_Build 8 87414817 1I TATAATATGA -/G GGCACTTCAA 3070 hom 57 het 28 0 20 8 G 2 3 362665 CASAVA_Build 8 87423098 2D GCAGGCAGTG GA/-- GAGGAGCAGG 3070 het 3070 hom 43 15 21 11 GA 2 1 362666 CASAVA_Build 8 87437511 1D AGGTTCCGTG T/- TTTAAGACTG 3070 het 3070 hom 33 14 18 1 T 4 3 362667 CASAVA_Build 8 87439824 1D TTTATTGAGG A/- GTTTTTTTTT 3070 het 3017 hom 31 12 17 2 A 1 0 362668 CASAVA_Build 8 87449816 1I GTATCCTGAG -/T TTTTTCTTTC 3070 het 3070 hom 43 22 20 1 T 5 6 362669 CASAVA_Build 8 87454417 1D TCTTAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 14 13 362670 CASAVA_Build 8 87455860 1I GTACTCATTA -/C TATGAATTTA 3070 het 3070 hom 41 14 20 7 C 0 1 362671 CASAVA_Build 8 87457931 4D AAAGAAAGAA AAAG/---- AAAAGAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 4 AAAG 1 0 362672 CASAVA_Build 8 87458434 1I TCTGTATTGA -/T TTTTTTCTTT 3070 het 2145 hom 18 7 11 0 T 6 7 362673 CASAVA_Build 8 87462424 8I AAATTATTTC --------/CATATAGA CATTTTCTCT 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 CATATAGA 0 1 362674 CASAVA_Build 8 87464528 1D TGCCATGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 T 11 10 362675 CASAVA_Build 8 87466369 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 14 9 3 A 14 13 362676 CASAVA_Build 8 87474353 1D GATAAAAAAA T/- GAGAAGTTTT 3070 het 3070 hom 33 8 21 4 T 1 0 362677 CASAVA_Build 8 87476755 2D TTTTGAGGAG AT/-- ATATTTTAAG 3070 het 3070 ref 45 24 20 2 AT 3 2 362678 CASAVA_Build 8 87477911 1D GGTTTAAACA T/- TTTTTTTTTT 1258 het 1258 ref 29 18 4 7 T 15 14 362679 CASAVA_Build 8 87478774 2I16M1I TTAACATATC --TCACCTCAAATACTTA-/TATCACCTCAAATACTTAT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 37 23 13 7 N/A 0 0 362680 CASAVA_Build 8 87482895 1D TCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1813 het 998 hom 22 5 5 13 A 16 15 362681 CASAVA_Build 8 87483274 2D AAAAAGAAAC TT/-- AAGAGAATTT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 2 0 362682 CASAVA_Build 8 87487199 2D TAAATTCCAA AG/-- AAAGTTATGA 3070 het 3070 hom 36 16 17 5 AG 1 0 362683 CASAVA_Build 8 87496233 1I ATCCCCCCCC -/T CATCCCCCCA 1130 hom 10 het 4 0 4 0 T 0 1 362684 CASAVA_Build 8 87497923 1I TCCACATTTC -/T TTTTTTTTTT 2487 het 2487 ref 24 10 6 8 T 13 14 362685 CASAVA_Build 8 87509723 1I AGAGGAGTGG -/A AAAAAACAAA 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 6 7 362686 CASAVA_Build 8 87515267 1D CCATCTTAGG A/- AAAAAAAAAA 1319 het 1319 ref 23 14 3 6 A 12 11 362687 CASAVA_Build 8 87522970 3I CTGAATCAGA ---/GTT GTTGTTTCCC 3070 hom 117 het 45 0 39 6 GTT 2 3 362688 CASAVA_Build 8 87527861 13I TGTTTTTGTT -------------/GCAATTCTTTTGA GGACTTAGCC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GCAATTCTTTTGA 0 1 362689 CASAVA_Build 8 87546266 2D ATGCGCGCGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 2642 hom 27 11 10 8 GT 6 5 362690 CASAVA_Build 8 87552689 4I CCATTTGATG ----/ACCT ACCTAGTATT 3070 het 3070 hom 36 16 19 1 ACCT 1 2 362691 CASAVA_Build 8 87558679 2D CCTGTCAAAA AC/-- ACAAAGAGCC 3070 het 3070 ref 28 17 8 3 AC 2 1 362692 CASAVA_Build 8 87565664 2I GACACTGTAG --/TC TCTCAGCTGA 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 TC 2 3 362693 CASAVA_Build 8 87568251 1D AATATCTTTG C/- ATTCAAATTC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 C 1 0 362694 CASAVA_Build 8 87569326 2D CTATTTAGCC AT/-- ATGACTTACT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 AT 2 1 362695 CASAVA_Build 8 87574913 3D AGTGGAGGAC ATG/--- ATGTTAAGTG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 ATG 2 1 362696 CASAVA_Build 8 87576756 1I AGAGAACTCT -/A AGTCTTTGTG 3070 het 3070 hom 44 20 18 6 A 1 2 362697 CASAVA_Build 8 87579988 7D TACCCAGGCG TAGTGGT/------- ATACAACTGT 2300 het 2300 ref 20 9 8 3 TAGTGGT 1 0 362698 CASAVA_Build 8 87580219 2I TACACCACAA --/CC AAGTAGGCTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 C 0 2 362699 CASAVA_Build 8 87581027 1I ACAGAGTTAC -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 6 7 362700 CASAVA_Build 8 87583024 1D AAAAAAAAAA T/- AAGTTCTAAT 3070 hom 42 het 22 0 15 8 T 1 0 362701 CASAVA_Build 8 87583059 3I TTTGACTTTC ---/AAG AAGTTTAACT 1625 het 1625 ref 18 4 4 10 AAG 1 2 362702 CASAVA_Build 8 87587218 4I ATGGAAACTC ----/TTGT TTAATTTCCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TTGT 0 1 362703 CASAVA_Build 8 87592334 2D TTGTTGTTTG TT/-- TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 T 6 4 362704 CASAVA_Build 8 87593156 2D CAAGAACCTG TC/-- TCTCAAAAAA 3070 hom 73 het 35 0 26 9 TC 3 2 362705 CASAVA_Build 8 87594070 15I AATGCACATA ---------------/GTAGGCAATCAGGAT GTGTTTGTTG 3070 het 3070 hom 48 20 24 5 GTAGGCAATCAGGAT 0 1 362706 CASAVA_Build 8 87595808 1I TCTCCTGAAT -/C CCTGCGGTCC 2672 hom 21 het 8 0 8 0 C 2 3 362707 CASAVA_Build 8 87600107 1D CTTCTTTTTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 A 9 8 362708 CASAVA_Build 8 87616418 1I TGGATAATTT -/C CTTGCTCTGT 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 C 1 2 362709 CASAVA_Build 8 87628898 1D CATGGCACAT A/- GGGGAAGGGG 3070 het 3070 hom 25 8 16 1 A 1 0 362710 CASAVA_Build 8 87636579 1D AGGTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 2035 het 2035 ref 44 32 5 7 A 13 12 362711 CASAVA_Build 8 87641951 1I TTTAAAATTT -/A AAAACATTTA 3070 hom 84 het 34 0 29 5 A 4 5 362712 CASAVA_Build 8 87650799 2I CATGCACACT --/CA CACACACACC 3070 hom 151 het 61 0 49 12 CA 4 5 362713 CASAVA_Build 8 87661537 1I AATAGCACGG -/A GGGGGGTGGC 3070 het 2596 hom 36 13 11 12 A 0 1 362714 CASAVA_Build 8 87662391 1I GTTAATTGTT -/A AAAAAACTTA 3070 het 2999 hom 29 9 14 6 A 6 7 362715 CASAVA_Build 8 87663080 1I CCATACCTTA -/C CCCCCCCACC 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 C 7 8 362716 CASAVA_Build 8 87663424 1I28M4I AGAAATAGAC -GAAATATGACACAGATATTGGAGTTATT----/TGAAATATGACACAGATATTGGAGTTATTAGAC AGGAAATATT 3070 het 3070 ref 35 22 14 4 N/A 0 0 362717 CASAVA_Build 8 87663738 1D ACCCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2718 het 1638 hom 18 6 8 4 A 15 14 362718 CASAVA_Build 8 87665916 1D AAATAGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 16 17 9 T 12 11 362719 CASAVA_Build 8 87699320 1D TAGAATCAGT G/- GGAGCCCTGA 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 G 3 2 362720 CASAVA_Build 8 87702253 1D AAAAAAAAAG T/- TTTTTTCATG 3070 het 3070 hom 38 11 24 3 T 7 6 362721 CASAVA_Build 8 87708446 1D TGAGAGTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 9 8 362722 CASAVA_Build 8 87716309 1I CATAGGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 13 7 T 12 13 362723 CASAVA_Build 8 87717358 4D GAAACATTTT AAAC/---- AAACAGAAAA 3070 het 3070 ref 26 17 8 2 AAAC 2 1 362724 CASAVA_Build 8 87780032 3D GAGTGAGGTA GGT/--- GGTGGTGGTT 3070 het 3070 ref 97 47 16 38 GGT 4 3 362725 CASAVA_Build 8 87819550 1I CATTTTTGTA -/T TTTATTTGGT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 3 4 362726 CASAVA_Build 8 87829908 8D CTTTGCATTC AAAAAATA/-------- AATATTCAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 5 AAAAAATA 1 0 362727 CASAVA_Build 8 87833004 3D AAGGGATCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 44 1 32 12 T 14 11 362728 CASAVA_Build 8 87839485 1D ATCTGGTAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 67 het 33 0 24 9 T 10 9 362729 CASAVA_Build 8 87839852 2I TTCTCAATTC --/AT ATATATATAT 3070 hom 57 het 29 0 19 10 AT 6 7 362730 CASAVA_Build 8 87843299 1D AAAGTTAATA T/- TTATTCCTTT 1768 hom 12 het 5 0 5 0 T 3 2 362731 CASAVA_Build 8 87867875 5I AAAAATAAAT -----/AAAAG AAAAGAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 AAAAG 1 2 362732 CASAVA_Build 8 87868909 1I GTTTTCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 T 10 11 362733 CASAVA_Build 8 87875566 1I CTGTTTTCTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 60 20 32 8 T 8 9 362734 CASAVA_Build 8 87879401 1I CATAGCGAAT -/A AAAACCATCA 3070 hom 138 het 57 0 47 10 A 4 5 362735 CASAVA_Build 8 87881327 6D CAGGGAAGAA AGAAAC/------ AGAAATATAA 3070 het 3070 ref 37 23 13 5 AGAAAC 1 0 362736 CASAVA_Build 8 87882838 2I ACATTTCACC --/TA TATACCCTGC 3070 het 3070 hom 50 20 20 10 TA 2 3 362737 CASAVA_Build 8 87884253 1D TGTTTAATAG A/- TTTTTTTGGA 2076 het 2076 ref 18 11 5 2 A 1 0 362738 CASAVA_Build 8 87884754 1D ATTCCTTTTT G/- TTACCTTGAA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 G 1 0 362739 CASAVA_Build 8 87897498 3D TTATATATAA TAT/--- TATATATTAC 1506 het 241 hom 8 2 4 2 TAT 2 1 362740 CASAVA_Build 8 87898013 1D AAAGGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 T 11 10 362741 CASAVA_Build 8 87905074 1I TTGTAGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 10 11 362742 CASAVA_Build 8 87907656 13D TGGGGAGGTG ATTATCTGTTCGT/------------- ATTATCTTTT 3070 het 3070 hom 29 14 15 7 ATTATCTGTTCGT 1 0 362743 CASAVA_Build 8 87911021 1I AGTAGGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 470 hom 23 1 18 4 A 11 12 362744 CASAVA_Build 8 87915596 2D TATTTGTGTA TC/-- TAAGAACATC 3070 het 3070 ref 44 18 21 7 TC 1 0 362745 CASAVA_Build 8 87925763 2I AGAATGCATC --/AG AGTCTTTTAA 3070 het 3070 ref 45 25 18 2 AG 1 2 362746 CASAVA_Build 8 87926584 1I GTGCTGAAGG -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 hom 40 15 15 10 A 7 8 362747 CASAVA_Build 8 87929361 1D TATCTCAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 24 12 5 A 10 9 362748 CASAVA_Build 8 87930375 1D AGATGCGTTC T/- CGATGGGTTA 2043 het 2043 ref 28 6 6 17 T 1 0 362749 CASAVA_Build 8 87932086 8D ACAACTTTCC TGCTATAA/-------- TGCTCCCTGG 3070 het 3070 ref 44 24 17 6 TGCTATAA 1 0 362750 CASAVA_Build 8 87933723 2I ACACAAAAGC --/AA ATTGTGATGA 3070 hom 111 het 46 0 38 8 A 1 3 362751 CASAVA_Build 8 87941954 1I ATCCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1510 hom 29 6 17 6 A 10 11 362752 CASAVA_Build 8 87946224 1D GAAAAGTTAT A/- ACCTGAGTAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 2 1 362753 CASAVA_Build 8 87947489 1I CTGGACTATG -/T GAAGACCAAG 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 T 0 1 362754 CASAVA_Build 8 87949919 1I TCGTGATCTG -/C CCCCCCTCAG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 6 7 362755 CASAVA_Build 8 87950294 4I AAGGCGAGAG ----/AGTC AGTCAGAATG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 AGTC 1 2 362756 CASAVA_Build 8 87958010 4D TCTTGTAATA TCAG/---- TCATTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 TCAG 1 0 362757 CASAVA_Build 8 87959812 4I TTCCAAAGGT ----/TCTG TCTGTGTAGT 3070 het 3070 hom 40 15 21 4 TCTG 1 2 362758 CASAVA_Build 8 87959922 2D CTTTATTCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 15 13 A 15 13 362759 CASAVA_Build 8 87961214 1D AGAGTCCGTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 16 0 12 4 A 10 9 362760 CASAVA_Build 8 87961579 3I CTGATTAACG ---/ACA ATCCTTATTG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 ACA 0 1 362761 CASAVA_Build 8 87961685 1I TAGAAAAAAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 9 10 362762 CASAVA_Build 8 87962109 1I AACAGCAATG -/A AAAAAATCCT 3070 het 3070 hom 50 16 28 6 A 6 7 362763 CASAVA_Build 8 87964527 2D CTTAAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 10 15 4 A 12 10 362764 CASAVA_Build 8 87985210 1D ACAAACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 14 21 12 T 13 12 362765 CASAVA_Build 8 87997903 1D AAACTCTGCC A/- TTTTACCTCA 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 A 1 0 362766 CASAVA_Build 8 87998505 4D AAAAAAAGAA TATC/---- TAGATAGTTA 3070 het 3070 ref 31 16 14 3 TATC 1 0 362767 CASAVA_Build 8 88002226 1I GTAATACTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 11 20 9 T 9 10 362768 CASAVA_Build 8 88012823 1I TCATTGCACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 9 10 362769 CASAVA_Build 8 88028054 3D ATTACAGATT TAA/--- TAACAATGGA 3070 het 3070 ref 33 20 11 3 TAA 2 1 362770 CASAVA_Build 8 88035923 3I ATTTACATTC ---/CCA CGTGTTCTTA 3070 het 3070 hom 47 20 21 6 CCA 0 1 362771 CASAVA_Build 8 88058606 11I TCTCAGGCTA -----------/GTGAAGTTTTC TGCCATTATT 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 GTGAAGTTTTC 0 1 362772 CASAVA_Build 8 88073058 1I GTAAGTTGTG -/T CCCTACTTTC 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 T 0 1 362773 CASAVA_Build 8 88085840 4D CACTCACACC CTTA/---- CTTTGTCCTA 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 CTTA 1 0 362774 CASAVA_Build 8 88095620 1D TTGTTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 939 hom 25 2 18 5 T 12 11 362775 CASAVA_Build 8 88102017 1D TGAGACAGGG A/- AAAAAAATGT 2773 het 2773 ref 23 15 7 1 A 8 7 362776 CASAVA_Build 8 88103874 1D TACCATAAAG A/- AATGAAAATA 3070 het 3070 ref 32 16 16 2 A 3 2 362777 CASAVA_Build 8 88104634 1D TGGAACACAG T/- TAACAAGTTA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 2 1 362778 CASAVA_Build 8 88108542 1I TTGTTTGCTC -/A AATAGGTAAT 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 2 3 362779 CASAVA_Build 8 88153927 9I TTTGGCCAGA ---------/AGTTTCACT TATGAACTTC 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 AGTTTCACT 0 1 362780 CASAVA_Build 8 88160393 1I AAACTACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 11 12 362781 CASAVA_Build 8 88162326 1I CTTTCACCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 T 9 10 362782 CASAVA_Build 8 88163998 2D AACTGAACCC TG/-- TGTGTGTGTG 1115 het 1115 ref 32 22 3 8 TG 10 9 362783 CASAVA_Build 8 88173142 1I TTTACATAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 T 9 10 362784 CASAVA_Build 8 88178149 1D TTTTCTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1690 het 1690 ref 41 25 5 11 T 13 12 362785 CASAVA_Build 8 88187059 1D AGGCTAAGCC T/- TTTTTTTTTG 1062 het 1062 ref 40 32 3 5 T 10 9 362786 CASAVA_Build 8 88194098 1I TCAGATGACA -/C CTTTGTCCAG 3070 het 3070 hom 60 25 25 10 C 1 2 362787 CASAVA_Build 8 88195935 1I CCTCAGGTGA -/T CCGCCCAGTG 3070 het 3070 hom 27 11 12 4 T 0 1 362788 CASAVA_Build 8 88198820 4D GATGAGAGAC ACTT/---- ACTAGTTATT 3070 het 3070 ref 43 23 16 5 ACTT 1 0 362789 CASAVA_Build 8 88212474 1I TCCAAATATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 8 9 362790 CASAVA_Build 8 88214439 4D TAATTTTTAT TTGA/---- TTGATTTTTA 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 TTGA 2 1 362791 CASAVA_Build 8 88224250 4I TCAACAAATG ----/TTTA TTGAGTTTCT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TTTA 0 1 362792 CASAVA_Build 8 88226165 1D ACTATGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2260 het 2179 hom 31 8 9 14 A 19 18 362793 CASAVA_Build 8 88233784 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 2426 het 2384 hom 34 14 10 10 A 17 16 362794 CASAVA_Build 8 88253155 1D CTAATTTTTC T/- TTTTTTTGCT 3070 het 1523 hom 20 8 9 3 T 8 7 362795 CASAVA_Build 8 88255009 2I TTATATGTTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 T 11 13 362796 CASAVA_Build 8 88263699 2D TGTGATAGAC AT/-- ATGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 30 15 11 6 AT 2 1 362797 CASAVA_Build 8 88268475 1D ATCAATCTCC A/- AAAAGGCAAC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 5 4 362798 CASAVA_Build 8 88283545 5D AACATCAGTT TAAAA/----- TATGTTAACA 3070 hom 84 het 31 0 29 7 TAAAA 1 0 362799 CASAVA_Build 8 88288319 5D AGATCATGAC ATTTA/----- AAACTTAACT 3070 hom 87 het 31 0 30 2 ATTTA 1 0 362800 CASAVA_Build 8 88301844 1D ACTGTCCAAG T/- TTTTTTTTTT 1954 het 1954 ref 43 25 5 13 T 17 16 362801 CASAVA_Build 8 88302211 2I TTAATATCTC --/TT GATAGTTGTC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 0 2 362802 CASAVA_Build 8 88326819 3I TTTACATCTT ---/CCC CCCATTTTTT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 3 6 362803 CASAVA_Build 8 88332370 1D GAGGTGATAG A/- TACCCCAATT 3070 hom 102 het 35 0 35 0 A 1 0 362804 CASAVA_Build 8 88349170 1D GATTATAAAA G/- TAGAGCATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 1 0 362805 CASAVA_Build 8 88377965 4I ATATATACAC ----/ACGT ATATATATAC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 ACGT 0 1 362806 CASAVA_Build 8 88379047 2D AGAATGTGGG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 81 het 31 0 25 6 GT 9 8 362807 CASAVA_Build 8 88379511 1I ACTACATTGC -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 8 9 362808 CASAVA_Build 8 88382046 1I TATGTGTGTG -/T ATACACACAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 0 1 362809 CASAVA_Build 8 88382814 3I TAACTAAATC ---/CAA CAACAACATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 CAA 2 3 362810 CASAVA_Build 8 88395652 1D AAGCATCTCA T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 5 362811 CASAVA_Build 8 88395949 3D GGGGAGGCAG TAT/--- TATTATTTTT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TAT 3 2 362812 CASAVA_Build 8 88398570 4D TAAATTCTTC TGTT/---- TGTTTGGGGT 2683 het 2683 ref 26 17 8 2 TGTT 2 1 362813 CASAVA_Build 8 88399225 8I TCTAATATGT --------/ATATGTGC ATGTGTATAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 ATATGTGC 0 1 362814 CASAVA_Build 8 88399527 1D TCTTATTTCT G/- GTTTTCTTTC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 2 1 362815 CASAVA_Build 8 88402482 36D ATAATGCTAC AACAGGACATAGTAGTTTTTTGAGATCCTGATTTCA/------------------------------------ ATTCTTTTGA 3070 hom 108 het 33 0 37 6 AACAGGACATAGTAGTTTTTTGAGATCCTGATTTCA 1 0 362816 CASAVA_Build 8 88410391 1I AGGAGTTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 9 10 362817 CASAVA_Build 8 88415923 2I TATGTTTTTC --/TT TGTTTTTATT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 1 3 362818 CASAVA_Build 8 88419964 2I TTTTTCTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 34 0 27 7 T 11 13 362819 CASAVA_Build 8 88420472 3D TTCTCTTGAG AGA/--- AGATCTTGTT 3070 hom 155 het 60 0 52 8 AGA 2 1 362820 CASAVA_Build 8 88420688 1D GCTCCAACAA T/- TTGTCAGTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 7 T 3 2 362821 CASAVA_Build 8 88427302 1D TAGTTCTTTG A/- AATGGAAATA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 3 2 362822 CASAVA_Build 8 88435617 1D ACACAATAGT A/- AGTGAAAGCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 2 1 362823 CASAVA_Build 8 88437446 1D GCCATGCTTG T/- TAGACCCTGG 3070 hom 87 het 34 0 30 5 T 2 1 362824 CASAVA_Build 8 88439910 2I AAAGTTCTTC --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 A 8 10 362825 CASAVA_Build 8 88445313 1D GAAATTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 T 13 12 362826 CASAVA_Build 8 88445842 5D AATATTTTAA ATTTT/----- ATTTTATGTT 3070 hom 50 het 20 0 17 4 ATTTT 2 1 362827 CASAVA_Build 8 88449506 5D ATTCCATCTA AAAAG/----- AAAAGAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 4 AAAAG 5 4 362828 CASAVA_Build 8 88464262 4I AAGTAGTTGT ----/AAAC AAAAAATTAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 AAAC 0 1 362829 CASAVA_Build 8 88469720 3I TGAAGAAAAA ---/AAG AGAGAAGAAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AAG 0 1 362830 CASAVA_Build 8 88484474 1D CATAGAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 A 10 9 362831 CASAVA_Build 8 88486186 1I GGCAACAATG -/T TTTTGCAAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 T 4 5 362832 CASAVA_Build 8 88495098 1I TTATGCAGCC -/A AAAAAACACA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 6 7 362833 CASAVA_Build 8 88496135 1D TTAAAAAGGA T/- TTTTTTTACA 3070 hom 91 het 35 0 31 4 T 8 7 362834 CASAVA_Build 8 88500452 4I TGTATATATA ----/TAAT TATTCATTCA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TAAT 0 1 362835 CASAVA_Build 8 88509478 1D CCTCCCCCAA C/- CAAAAAAAAG 3070 het 215 hom 33 1 28 4 C 2 1 362836 CASAVA_Build 8 88509832 8I GCAATTGCTC --------/TATCTTTT TTTTTATGAA 3070 hom 84 het 29 0 29 0 TATCTTTT 0 1 362837 CASAVA_Build 8 88510551 1D TGATGAATAT G/- AACAGCATTC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 G 1 0 362838 CASAVA_Build 8 88520496 4I CAAACCAGTG ----/ATAA ATGAATGAAG 3070 hom 78 het 28 0 27 1 ATAA 0 1 362839 CASAVA_Build 8 88527984 3D ACAAAAATAA ATG/--- ATGATACGAG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 ATG 2 1 362840 CASAVA_Build 8 88536174 1I GATTGACATC -/T AATTTTTTCT 3070 hom 117 het 47 0 40 7 T 0 1 362841 CASAVA_Build 8 88538564 3I TATGGGAAAA ---/CAT CATCAGTATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 CAT 1 2 362842 CASAVA_Build 8 88547605 1D TTGTAATAAT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 30 0 28 3 A 9 8 362843 CASAVA_Build 8 88613122 1I ATTTTCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 887 hom 33 2 26 5 T 11 12 362844 CASAVA_Build 8 88628382 1D AAAACCTATG A/- AACCAAAATT 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 3 2 362845 CASAVA_Build 8 88634572 1D TCAAAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 T 11 10 362846 CASAVA_Build 8 88647728 1D CTAATTTGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1488 hom 18 5 10 3 T 10 9 362847 CASAVA_Build 8 88650920 5I GAGGAAAAAA -----/TTGTT TTGTTTTGTG 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 TTGTT 1 2 362848 CASAVA_Build 8 88652492 1D CAAGCAATCC T/- TCTGTCTCAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 T 2 1 362849 CASAVA_Build 8 88653381 1D AGGGTCATTA T/- TTCTGCCTAC 3070 het 3070 hom 38 18 20 1 T 3 2 362850 CASAVA_Build 8 88666608 3I GCAAATAGAA ---/AAG AAGTTCTTGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 AAG 1 2 362851 CASAVA_Build 8 88671030 1I ATTTGTAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 10 11 362852 CASAVA_Build 8 88672874 4D CAGAAGCTTA TTAC/---- TTACTTAGTT 3070 het 3070 ref 30 18 12 0 TTAC 2 1 362853 CASAVA_Build 8 88672985 3I AGATGAATCG ---/TTT TCAATCCCTG 3070 hom 123 het 44 0 41 3 T 1 4 362854 CASAVA_Build 8 88675645 1D GGGAACTTCT A/- AAAGTTTGTG 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 A 4 3 362855 CASAVA_Build 8 88676469 1I ACAGGATGAA -/T TTTTTTCCAT 3070 het 374 hom 43 1 38 4 T 6 7 362856 CASAVA_Build 8 88680890 1D AAAAATATTA T/- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 27 7 17 3 T 7 6 362857 CASAVA_Build 8 88684354 1D CAAAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 11 10 362858 CASAVA_Build 8 88685321 4I ACTTTGTGTA ----/TATC TATCTCTCTC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 TATC 1 2 362859 CASAVA_Build 8 88685987 1I GGATATCATT -/A AGCTAATACT 3070 het 3070 hom 44 13 25 6 A 1 2 362860 CASAVA_Build 8 88686744 1D GCCTAGAGTT C/- AGCAGTGATT 3070 het 3070 hom 50 22 24 4 C 1 0 362861 CASAVA_Build 8 88687322 1I TACTATAACA -/T TTTTCCATCC 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 T 4 5 362862 CASAVA_Build 8 88688725 4I TAATATATGT ----/AACA AACTGTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AACA 0 1 362863 CASAVA_Build 8 88689039 1I GTGTTGTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 37 0 24 13 T 10 11 362864 CASAVA_Build 8 88689734 1D AAAAAAAAAA C/- CCCAAAATCA 3070 het 3070 ref 51 23 21 7 C 4 3 362865 CASAVA_Build 8 88695476 2D CAACACACAC AA/-- AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 38 18 17 4 A 8 6 362866 CASAVA_Build 8 88696534 1D CCAGAACGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 A 15 14 362867 CASAVA_Build 8 88702107 1D ATAAACTAAC A/- AAAAACTTTA 3070 het 3070 ref 36 24 10 2 A 6 5 362868 CASAVA_Build 8 88704379 3I TCTGTATCTC ---/AAG AAGATAGCTC 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AAG 1 2 362869 CASAVA_Build 8 88705323 5I GTAAACCAAA -----/CTTAT CTTATAAATA 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 CTTAT 1 2 362870 CASAVA_Build 8 88712732 2D GCCATCTCTC TT/-- TGTTTCTTCT 3070 het 3070 hom 38 17 15 9 T 3 1 362871 CASAVA_Build 8 88714978 1D ATAAGTGTAC A/- TTTTTTTATC 1542 het 1542 ref 27 22 4 2 A 1 0 362872 CASAVA_Build 8 88716025 1D CATGCATACA T/- TTGGACATTT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 T 3 2 362873 CASAVA_Build 8 88722572 1I GCCACTGGAA -/T TTTTTTGGGA 3070 het 3070 ref 36 20 10 6 T 6 7 362874 CASAVA_Build 8 88723394 4D TATAGATATA AGTC/---- AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 42 21 20 5 AGTC 1 0 362875 CASAVA_Build 8 88725052 3D AGCATGCTTC TTT/--- ATTTTTCAAA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 3 0 362876 CASAVA_Build 8 88739180 1I CACACAGCCC -/T TTACTTTCTG 3070 het 2550 hom 29 6 17 6 T 2 3 362877 CASAVA_Build 8 88743341 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2331 het 1170 hom 24 9 10 5 A 17 15 362878 CASAVA_Build 8 88746997 1I AATGAAGTGG -/A AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 35 15 15 5 A 6 7 362879 CASAVA_Build 8 88755947 1I TTTCTTGATG -/T TTTCTAGGTT 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 3 4 362880 CASAVA_Build 8 88758219 1D TTGCTGAGAG A/- AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 27 12 11 5 A 7 6 362881 CASAVA_Build 8 88760297 1D TTAATTTTTC A/- AAAAAAATTG 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 A 8 7 362882 CASAVA_Build 8 88768968 1I AAATGGGAAA -/C AGAATGTAAC 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 C 0 1 362883 CASAVA_Build 8 88771173 1D CCACTAATCT C/- CATGCTTATA 3070 het 3070 hom 59 25 27 7 C 2 1 362884 CASAVA_Build 8 88784758 1D GCCTTGAAGG A/- AAAGACCAAG 3070 het 3070 ref 48 25 20 5 A 4 3 362885 CASAVA_Build 8 88795763 1D AAAGTTTGTT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 25 8 14 3 A 8 7 362886 CASAVA_Build 8 88795956 5I TTTTCATTTA -----/TTTGT TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 TTTGT 1 2 362887 CASAVA_Build 8 88803078 1D CGTATTGGCT A/- AAAAAATGTT 3070 het 3070 hom 29 8 15 8 A 7 6 362888 CASAVA_Build 8 88804039 4D GATTTTACAG ATTT/---- ATTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 ATTT 2 1 362889 CASAVA_Build 8 88804774 2I GAGGGCAATC --/AG GGGAATTTCA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 AG 0 1 362890 CASAVA_Build 8 88812192 1D TTTACCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 15 22 5 T 11 10 362891 CASAVA_Build 8 88813032 2I GGTGATGATA --/AG AGAGTGAGAA 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 AG 2 3 362892 CASAVA_Build 8 88818095 2D TCTATTCATT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 30 11 15 6 TA 7 6 362893 CASAVA_Build 8 88829393 1I TTTCTTTTAC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 8 9 362894 CASAVA_Build 8 88830636 1D ATTGACTTCT C/- CCATAAAGAT 3070 hom 105 het 42 0 36 7 C 3 2 362895 CASAVA_Build 8 88830874 2I4M12D TTGAAAGACT --AATATACTTCAAGTGG/TCAATA------------ AATCTTACAA 373 het 373 ref 28 20 1 14 N/A 0 0 362896 CASAVA_Build 8 88841721 1D CCTAGCCCCA C/- CCCCACTAAC 3070 hom 169 het 63 0 56 7 C 5 4 362897 CASAVA_Build 8 88845540 1I AGTCTAATCG -/T TGACCATACA 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 1 2 362898 CASAVA_Build 8 88847595 2D TCCTTCCTGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 14 11 T 12 10 362899 CASAVA_Build 8 88848228 2D GCACAGTGGC TA/-- TAGTTAATTA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 TA 2 1 362900 CASAVA_Build 8 88849998 1I TTTTTCTGTG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 8 9 362901 CASAVA_Build 8 88852816 1D7M1I TCTTTTTTTT CCTTTCTA-/-CTTTCTAT TTTTTTTTTA 2811 het 2811 ref 35 19 14 6 N/A 0 0 362902 CASAVA_Build 8 88860610 1I TATTAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 T 11 12 362903 CASAVA_Build 8 88862785 1I GAAAAGCAAG -/A AAAAAACAAG 3070 het 3070 hom 24 8 12 4 A 6 7 362904 CASAVA_Build 8 88862894 1D GAAACATTGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 9 8 362905 CASAVA_Build 8 88865632 1I CACATCTTAC -/G TGGAAAGCAG 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 G 0 1 362906 CASAVA_Build 8 88868174 4I CATTTAATTC ----/TTTG TTTATTTTCC 1752 het 1752 ref 28 8 10 10 TTTG 0 1 362907 CASAVA_Build 8 88868903 2D ACATAATGAG AC/-- AGACCGGTTG 3070 het 3070 ref 50 24 22 4 AC 1 0 362908 CASAVA_Build 8 88869558 1I CCTCTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 10 9 9 T 10 11 362909 CASAVA_Build 8 88885058 1I CAGCCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1980 het 1980 ref 38 21 8 9 A 10 11 362910 CASAVA_Build 8 88897356 3I ATCTCAAGAG ---/AAC AACAACAACA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 AAC 3 4 362911 CASAVA_Build 8 88910645 1I TCTTTTTTAC -/A AAAAAAAAAA 2518 het 2375 hom 19 8 7 4 A 11 12 362912 CASAVA_Build 8 88917176 6D ATCATTTAAA ACTTTT/------ ACTTTAACTA 3070 het 3070 ref 27 16 10 2 ACTTTT 1 0 362913 CASAVA_Build 8 88947203 4D TTTCTCTCTC TCTT/---- TATTTTCCTG 2845 het 2845 ref 36 18 9 12 TCTT 1 0 362914 CASAVA_Build 8 88958037 1D AAATATGTGA T/- TAAAAATTAT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 T 2 1 362915 CASAVA_Build 8 88960138 1D AGAAAGAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 35 1 29 5 T 12 11 362916 CASAVA_Build 8 88960786 1D AAATAGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 T 15 14 362917 CASAVA_Build 8 88992665 1D AAATGCATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 18 19 13 A 11 10 362918 CASAVA_Build 8 89014547 1I GGCTAATTTT -/C TGTATTTTTA 1138 het 1138 ref 21 18 3 0 C 0 1 362919 CASAVA_Build 8 89015531 1I AAAGTGGGAT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 9 362920 CASAVA_Build 8 89022651 1D TACATGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 9 12 A 13 12 362921 CASAVA_Build 8 89033157 4I TTTTACACAT ----/TTTG TTTGTTTGCT 3070 het 3070 ref 48 27 16 5 TTTG 2 3 362922 CASAVA_Build 8 89060100 1D TTGTTTCTTT A/- AGGTTAAGCC 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 A 2 1 362923 CASAVA_Build 8 89100056 1D TGTATCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 19 10 A 13 12 362924 CASAVA_Build 8 89110999 3D AGAGTGTAGA AAT/--- AATAAAGGAA 3070 hom 74 het 36 0 32 4 AAT 2 1 362925 CASAVA_Build 8 89112544 1D TTTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 1128 het 1128 ref 20 17 3 0 T 11 10 362926 CASAVA_Build 8 89114051 1D AAGCTATCTG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 10 9 362927 CASAVA_Build 8 89120590 1I GTATTTGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 10 11 362928 CASAVA_Build 8 89141329 1D GAGAAGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 13 18 10 A 13 12 362929 CASAVA_Build 8 89150851 1I GATTATAGAT -/A AGAGTGTCTC 3070 het 3070 hom 46 13 26 7 A 1 2 362930 CASAVA_Build 8 89166415 2I TACCATGCAA --/AT ACATTATAAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 AT 0 1 362931 CASAVA_Build 8 89172912 4D CAAACACACA CACT/---- CACACACACA 3070 het 3070 hom 36 17 18 4 CACT 1 0 362932 CASAVA_Build 8 89185971 4I TAATAATAAA ----/TGAC TATGTTAATA 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 TGAC 0 1 362933 CASAVA_Build 8 89189625 1D TAAGCTTTAG A/- AAAGTGTTGG 3070 hom 78 het 31 0 27 5 A 4 3 362934 CASAVA_Build 8 89199036 1D AAAACTGACC T/- TTTTTTACAA 3070 het 3070 hom 48 24 21 3 T 7 6 362935 CASAVA_Build 8 89214578 1D GATTCTTAAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 8 7 362936 CASAVA_Build 8 89214674 1I TGAAATGAAG -/T TGTTTATGCT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 1 2 362937 CASAVA_Build 8 89219441 1I TGTGTATGTG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 8 9 362938 CASAVA_Build 8 89220555 2D CTCAATCATC TG/-- TTAGTTCCCC 3070 het 3070 hom 38 17 20 3 TG 1 0 362939 CASAVA_Build 8 89230083 3D CTTTAGTAGT AAG/--- AAGAATCTCT 3070 het 3070 ref 38 19 17 3 AAG 2 1 362940 CASAVA_Build 8 89264168 4D CTTCAATAAG TGAA/---- TGAATAAATA 3070 hom 114 het 43 0 39 8 TGAA 2 1 362941 CASAVA_Build 8 89278268 1I TTCATTCATA -/T TTTCTTTACT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 3 4 362942 CASAVA_Build 8 89289041 1I GACCATTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1047 hom 29 5 20 4 A 13 14 362943 CASAVA_Build 8 89289534 1I AAGAGAACCA -/G GCACCAAGCT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 G 1 2 362944 CASAVA_Build 8 89290968 47D6M8D ATGTATTTGA CTGTATGTATTCTACTCTCTCTATGTATTCTACTCTCTCTATGTATTCTACTCTCTCTATG/-----------------------------------------------CTACTC-------- TATGTAACTC 3070 hom 51 het 15 0 18 2 N/A 0 0 362945 CASAVA_Build 8 89302963 1D CTGGAAGATT A/- AAAAATATAA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 6 5 362946 CASAVA_Build 8 89320875 1D TGTTATAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 260 hom 30 1 24 5 T 15 14 362947 CASAVA_Build 8 89325399 1D TCATCCAGTG A/- AAAGTTCTAG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 4 3 362948 CASAVA_Build 8 89333992 1D ACCTCTTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 139 hom 28 1 20 7 A 14 13 362949 CASAVA_Build 8 89334542 2D TAGACAACAC TT/-- AATATTATTC 3070 hom 154 het 62 0 51 14 T 2 0 362950 CASAVA_Build 8 89337542 1D TAAATACTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 T 8 7 362951 CASAVA_Build 8 89347692 1I GCTATTTTTT -/A AACATACTTT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 2 3 362952 CASAVA_Build 8 89349341 1D CTGTATAAAA T/- AGAAGATCCT 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 T 1 0 362953 CASAVA_Build 8 89350173 1D GTTATTGTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 135 het 52 0 45 7 T 10 9 362954 CASAVA_Build 8 89353866 1D ACCTGAGATT A/- AAAAACAAAA 3070 het 3070 ref 45 25 15 6 A 6 5 362955 CASAVA_Build 8 89363428 1D TTTCTTTTTT G/- GGGGGGGGGG 2370 het 209 hom 16 4 7 5 G 13 12 362956 CASAVA_Build 8 89366182 1D TCTCTATGCC T/- TTTTTTTTTT 1084 het 1084 ref 39 20 5 14 T 15 14 362957 CASAVA_Build 8 89367926 1D TGGAACTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2612 hom 23 9 9 5 T 13 12 362958 CASAVA_Build 8 89376980 2I TTAAAGAAAG --/AT ATTTTCAAGT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 AT 1 2 362959 CASAVA_Build 8 89411946 1D AACTATAAGG C/- CTGGACTAGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 C 2 1 362960 CASAVA_Build 8 89414012 1D CAGTATGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 T 11 10 362961 CASAVA_Build 8 89416426 1I CTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2281 het 730 hom 19 4 8 7 T 13 14 362962 CASAVA_Build 8 89417668 1D AAGTATTTCA T/- GTTTTAATCA 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 T 1 0 362963 CASAVA_Build 8 89421044 96D AAAAAGTGCT TAAGGGTTGCCAGATTTTGCAAATGAAAATACAGGATTCACAGTTAAATTTGAGTTTCAGATAAACAACAAATAATTTGTAGTATATCTTTTGCAA/------------------------------------------------------------------------------------------------ TATTTGGAAT 2756 het 2756 ref 39 50 6 5 TAAGGGTTGCCAGATTTTGCAAATGAAAATACAGGATTCACAGTTAAATTTGAGTTTCAGATAAACAACAAATAATTTGTAGTATATCTTTTGCAA 1 0 362964 CASAVA_Build 8 89423921 2I ACTTAATGAC --/AG GGATGCATTC 3070 hom 87 het 36 0 30 6 AG 0 1 362965 CASAVA_Build 8 89426513 1D ATGCTAGCAA T/- TTTTTGCACA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 6 5 362966 CASAVA_Build 8 89442000 3I TTTTCTTTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 105 het 41 0 35 6 TTG 5 6 362967 CASAVA_Build 8 89442378 1D TAGAGCTTTA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 8 7 362968 CASAVA_Build 8 89463806 1D TTCCTTCCTT C/- CTTCCTTCCT 1485 hom 16 het 11 0 5 6 C 2 1 362969 CASAVA_Build 8 89464349 4D CCTTCTTTCC TTCT/---- TTCTTTTCTT 2862 het 1337 hom 21 7 7 7 TTCT 2 1 362970 CASAVA_Build 8 89470199 1D84M1I TAAATTAATA GTCAAATGAATAAAGACAACAGCATGATAGGAAGAAGGGATAGATATATATCAACTAGATTAGAAATGTCCTCATAGAGAAGGTG-/-TCAAATGAATAAAGACAACAGCATGATAGGAAGAAGGGATAGATATATATCAACTAGATTAGAAATGTCCTCATAGAGAAGGTGA CATTTCAGAT 3070 het 3070 hom 39 31 39 6 N/A 0 0 362971 CASAVA_Build 8 89473710 4D TATCCAACTC TATT/---- TGTTTCCTTC 2600 het 2600 ref 37 23 7 10 TATT 1 0 362972 CASAVA_Build 8 89473764 1I GAGCAAGGGT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 37 19 10 8 A 7 8 362973 CASAVA_Build 8 89475699 1I TATCTTAGTG -/A CTACAATCAA 3070 het 3070 ref 24 11 8 5 A 0 1 362974 CASAVA_Build 8 89478108 1D ATGTTGAGAC T/- TTGGTGAATT 3070 het 3070 hom 48 17 28 4 T 3 2 362975 CASAVA_Build 8 89480188 9D ATTCCGTCTC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 2282 het 1012 hom 12 4 6 3 A 26 17 362976 CASAVA_Build 8 89481091 6D AGCCACTTGG GAGGTT/------ GAGGTGGGAG 3070 het 3070 hom 38 12 20 6 GAGGTT 1 0 362977 CASAVA_Build 8 89481204 2D ACCTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1909 hom 30 11 13 7 A 15 13 362978 CASAVA_Build 8 89481669 1I GACAAAGTTT -/G GTAAGAAAAA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 G 1 2 362979 CASAVA_Build 8 89483801 1D CTTTCCTCTC A/- AAAATCCGGT 3070 het 3070 hom 41 16 21 5 A 5 4 362980 CASAVA_Build 8 89484089 1I TGTTTTTAAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 36 11 16 9 T 8 9 362981 CASAVA_Build 8 89486466 1D GAAGAAGTGC T/- TTTTTCACTC 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 6 5 362982 CASAVA_Build 8 89490209 1D ATAGTTTTAT G/- TTTCACTTCT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 G 1 0 362983 CASAVA_Build 8 89494859 1D ATTGCTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1925 hom 38 9 16 13 T 15 14 362984 CASAVA_Build 8 89495313 1D GAGCAAGCCA T/- TTCATACCAG 3070 het 3070 hom 47 20 21 7 T 3 2 362985 CASAVA_Build 8 89497081 5D ACAAACTGAG AATTA/----- AATTAAAGTC 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 AATTA 2 1 362986 CASAVA_Build 8 89498065 6D TTGAAAAACA TTTTCT/------ TTTTAAGTTG 3070 het 3070 hom 46 18 26 6 TTTTCT 1 0 362987 CASAVA_Build 8 89499202 1I ACAGATATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 A 10 11 362988 CASAVA_Build 8 89500570 2D TTTTATTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 1172 het 1172 ref 24 11 9 4 T 13 11 362989 CASAVA_Build 8 89501005 6I GGAGATGAAG ------/ATATGT ATATGTATAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 ATATGT 1 2 362990 CASAVA_Build 8 89504557 4D ATGAATTTAA ATTG/---- ATTATTTTCC 3070 het 3070 ref 42 22 17 5 ATTG 1 0 362991 CASAVA_Build 8 89505629 1I GATTTTTTTT -/G ATAAAGAACT 2478 het 2478 ref 22 10 6 6 G 0 1 362992 CASAVA_Build 8 89506380 1I TGAGTCAGGC -/T TGAGCGGGGG 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 T 1 2 362993 CASAVA_Build 8 89507191 1I TTGAGCCCAG -/A AAGTACAAGA 2351 het 2351 ref 23 12 6 5 A 2 3 362994 CASAVA_Build 8 89508635 2I ATTAAAGTAA --/CC ACCACAACAA 3070 het 3070 hom 24 8 15 6 C 0 2 362995 CASAVA_Build 8 89511121 1D GTTTATTTCA T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 37 25 12 1 T 7 6 362996 CASAVA_Build 8 89512667 4D GAACCCCTTG GCCA/---- GCCATTATAG 3070 het 3070 hom 56 26 24 9 GCCA 2 1 362997 CASAVA_Build 8 89514983 1I GTTAAAAAAA -/C ATTGGATATA 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 C 0 1 362998 CASAVA_Build 8 89519070 1I CAGTTTGCAA -/C CCCTTGGGAG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 C 3 4 362999 CASAVA_Build 8 89521890 1I ACTTTCATCA -/T TTTTTAGCAC 3070 het 3070 hom 39 13 23 3 T 5 6 363000 CASAVA_Build 8 89524969 2I ATGATCAAAA --/AT AATTTTAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 20 1 AT 0 1 363001 CASAVA_Build 8 89527063 2I CACTAACCTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 17 22 10 T 10 12 363002 CASAVA_Build 8 89529479 1I TATTATTACA -/T TATGAGATGT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 1 2 363003 CASAVA_Build 8 89532240 1D TAACAATGAT A/- AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 51 21 25 5 A 8 7 363004 CASAVA_Build 8 89534025 2D3M1D CAATTCCAAA ATAAGT/--CAG- TACAATTGTG 3070 het 3070 hom 37 16 17 7 N/A 0 0 363005 CASAVA_Build 8 89541230 1D TGAAGATGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 58 het 41 1 34 6 A 10 9 363006 CASAVA_Build 8 89541991 4D TTTTCAAATC AGTT/---- AGGTAAATGG 3070 het 3070 ref 39 21 14 6 AGTT 1 0 363007 CASAVA_Build 8 89544110 1D GTTTTGCAAA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 T 8 7 363008 CASAVA_Build 8 89550138 1I CTTGAGATCA -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 T 7 8 363009 CASAVA_Build 8 89566696 1D CTGGATACCA G/- GCAAAGGAAA 3070 het 3070 hom 40 16 19 6 G 2 1 363010 CASAVA_Build 8 89569561 1D AATAAAAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 A 10 9 363011 CASAVA_Build 8 89574834 4I TGAAAATCTT ----/AAAG AAGAAAATTA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 AAAG 0 1 363012 CASAVA_Build 8 89577118 1D ATTGGAAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 43 24 15 5 T 10 9 363013 CASAVA_Build 8 89583116 2D ATTCTGTCTC TG/-- TAGATTTTCT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 TG 1 0 363014 CASAVA_Build 8 89583897 1D AGAATTTGGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 A 9 8 363015 CASAVA_Build 8 89584732 1I AGTTACATGT -/A AAAAAGTTCT 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 A 5 6 363016 CASAVA_Build 8 89586246 2I ACACTCCACA --/CT CTATTCTCTT 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 CT 1 2 363017 CASAVA_Build 8 89588545 1I ATGGATACAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 7 8 363018 CASAVA_Build 8 89589705 4D TTGAAAAGAT AAAC/---- AAAATAGAAA 3070 het 3070 ref 29 16 13 0 AAAC 1 0 363019 CASAVA_Build 8 89592340 1I CAACCATCTG -/A AAAGTAAATC 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 A 3 4 363020 CASAVA_Build 8 89593207 1D AGTTAAATAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 35 15 14 6 T 9 8 363021 CASAVA_Build 8 89596112 8D ATAAATTAAG TAAATAAA/-------- TAAATAAATA 3070 het 3070 ref 31 15 15 6 TAAA 5 3 363022 CASAVA_Build 8 89601466 2I TGCCTGACCC --/CT GTTTGTACTT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 CT 0 1 363023 CASAVA_Build 8 89613402 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2552 het 2552 ref 23 11 7 5 T 11 10 363024 CASAVA_Build 8 89617432 1I CTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 9 10 363025 CASAVA_Build 8 89646800 1I TAAAGCAATT -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 38 22 11 5 A 7 8 363026 CASAVA_Build 8 89650299 1I TCTTTGTGGG -/A AAAAATGAAC 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 5 6 363027 CASAVA_Build 8 89685858 1D TTCAATATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1023 hom 25 3 13 9 T 13 12 363028 CASAVA_Build 8 89757668 1I ATCGTTAGGT -/G GGGGGAGGAG 3070 hom 84 het 31 0 27 4 G 5 6 363029 CASAVA_Build 8 89761096 1D TTATAGTAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2196 hom 23 6 11 6 A 15 14 363030 CASAVA_Build 8 89761274 5I CAGTCAATTT -----/AAGAA AAGTGCTGCC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AAGAA 0 1 363031 CASAVA_Build 8 89797736 3I TAAATGGATT ---/TAC TACATTAGGT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 TAC 1 2 363032 CASAVA_Build 8 89832690 3I GACTGAAAAT ---/ATC ATCATTTTAA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 ATC 1 2 363033 CASAVA_Build 8 89839707 5D GTAATGGCAT ATCTA/----- ATCTAATCTG 3070 het 3070 ref 51 23 22 8 ATCTA 2 1 363034 CASAVA_Build 8 89841383 1D TTATGAATTT A/- AAAAAGACAC 3070 het 3070 ref 43 19 20 5 A 6 5 363035 CASAVA_Build 8 89858232 13D GGTGGTTCAT GCCTCTAATCCCA/------------- GCACTTTGGG 3070 het 3070 hom 29 12 13 6 GCCTCTAATCCCA 1 0 363036 CASAVA_Build 8 89859098 4D CAACATTAAG TAAA/---- TTTAGTAATG 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 TAAA 1 0 363037 CASAVA_Build 8 89859692 1I ATACTTTTTT -/G TGTGTGTACC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 0 1 363038 CASAVA_Build 8 89866191 1I CTTACTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 7 T 9 10 363039 CASAVA_Build 8 89871370 1I TTTTTTTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 11 12 363040 CASAVA_Build 8 89871441 1I GCAAATGCAC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 8 9 363041 CASAVA_Build 8 89874352 5I AAATACAACT -----/TAACA TAATATGTGA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TAACA 0 1 363042 CASAVA_Build 8 89880374 1I TATCTCATTC -/G TCTATTTTTG 3070 het 3070 ref 50 20 17 13 G 0 1 363043 CASAVA_Build 8 89881258 1I TAAAAAAAAA -/T AATATAATAT 1931 het 1931 ref 11 5 5 1 T 0 1 363044 CASAVA_Build 8 89899575 4D CGGCCTCCCA AAGT/---- AAGTGCTGGG 2012 het 2012 ref 22 9 6 8 AAGT 2 1 363045 CASAVA_Build 8 89912286 2D ACATATATAT AC/-- ACACACACAC 2560 het 2560 ref 32 17 8 8 AC 6 5 363046 CASAVA_Build 8 89915088 1D AACTTGATCC A/- GCAGCATATA 3070 het 3070 ref 47 23 17 8 A 1 0 363047 CASAVA_Build 8 89926324 1I AAAATCTATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 33 1 28 4 T 12 13 363048 CASAVA_Build 8 89965658 2D CACTAATGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 38 1 31 7 T 13 11 363049 CASAVA_Build 8 89970199 1D GGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 31 0 22 9 T 13 12 363050 CASAVA_Build 8 89973758 1D ACCTGGAGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 10 9 363051 CASAVA_Build 8 90004311 1I CCTCTCCATG -/C CCCCCCCCCG 3070 het 459 hom 24 1 12 11 C 9 10 363052 CASAVA_Build 8 90007000 1D GACCTGGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 18 11 A 14 13 363053 CASAVA_Build 8 90014491 1I TAATTTTTTC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 7 8 363054 CASAVA_Build 8 90020850 1D TATATATTAG A/- AAAACTTTTC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 5 4 363055 CASAVA_Build 8 90022249 5D TTTAAGGTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 5 T 15 10 363056 CASAVA_Build 8 90044983 8I TCTTTTATCC --------/TACAAGCA TAAGTCATGA 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TACAAGCA 0 1 363057 CASAVA_Build 8 90054966 1I TTACTTTTGC -/A CCAACCTAAT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 0 1 363058 CASAVA_Build 8 90069787 1D ATGTGCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1166 hom 42 3 32 7 A 13 12 363059 CASAVA_Build 8 90079069 4I TTTCAATTAA ----/AAAT AAATTAATAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 AAAT 1 2 363060 CASAVA_Build 8 90081241 1D TGCCATGTAT G/- TTTGATACTT 3070 hom 126 het 46 0 43 4 G 1 0 363061 CASAVA_Build 8 90081443 1D GGTTTTCAAG C/- CTCACCCTCA 3070 hom 123 het 45 0 42 3 C 2 1 363062 CASAVA_Build 8 90090165 6I AATACATATA ------/TATGTG TGTGTGTGTG 3070 hom 114 het 43 0 39 4 TATGTG 0 1 363063 CASAVA_Build 8 90096880 1D CAGACACCAG A/- AAAAAACACA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 7 6 363064 CASAVA_Build 8 90099342 1I AAATGTCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 47 0 36 11 A 9 10 363065 CASAVA_Build 8 90103816 1I CAGGACCTAG -/T GTGTGATGTT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 T 0 1 363066 CASAVA_Build 8 90106109 1D CTCTTTTTTT G/- TTGTGTCTCT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 1 0 363067 CASAVA_Build 8 90106532 5D TTGATTCTTC TCTTT/----- TCTTCTTTAT 3070 hom 54 het 20 0 19 4 TCTTT 1 0 363068 CASAVA_Build 8 90120983 1I GTACATATTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 179 hom 39 2 35 2 T 9 10 363069 CASAVA_Build 8 90126254 1D GTATTTGGCA T/- TTTTTTTTCG 3070 hom 90 het 38 0 31 7 T 9 8 363070 CASAVA_Build 8 90126749 2D GTTTTTTCTC TT/-- GTTTTACTAA 3070 hom 81 het 29 0 28 4 T 2 0 363071 CASAVA_Build 8 90127185 1D CAACTTCTGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 119 het 48 0 41 7 A 10 9 363072 CASAVA_Build 8 90131114 1I GTCATGAAAA -/C AGCATGGTAG 3070 hom 138 het 50 0 47 3 C 0 1 363073 CASAVA_Build 8 90136757 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAACAGAT 3070 hom 63 het 27 0 20 7 C 0 1 363074 CASAVA_Build 8 90137035 1I GGGCAATTCT -/C CTAATCTTTA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 1 2 363075 CASAVA_Build 8 90151236 1I TGATTGCAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1011 hom 36 4 22 10 T 13 14 363076 CASAVA_Build 8 90154431 1D ATGAAAAATG T/- ATCATAAGTT 3070 hom 98 het 39 0 36 3 T 1 0 363077 CASAVA_Build 8 90158573 1D TTTAAAATAG T/- TTTTAAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 5 4 363078 CASAVA_Build 8 90159252 1D GTATAGTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 8 363079 CASAVA_Build 8 90159782 1I ACAATTCTTA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 7 8 363080 CASAVA_Build 8 90166512 1D TGCCTGCCTC G/- GCCTCCCAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 G 2 1 363081 CASAVA_Build 8 90179491 9D CCATCTCTAC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 1426 hom 5 het 17 0 5 14 A 25 16 363082 CASAVA_Build 8 90180127 2I TTATTCATAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 57 het 26 0 20 6 AT 5 6 363083 CASAVA_Build 8 90180459 1I AAATATAGAG -/T TATCACTCAC 3070 hom 141 het 54 0 48 6 T 1 2 363084 CASAVA_Build 8 90191097 1I AAAAGGGTAG -/A AAAAAAATAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 7 8 363085 CASAVA_Build 8 90192213 1D TCAGAAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 52 1 42 9 A 11 10 363086 CASAVA_Build 8 90194051 1D AATATGCAGC A/- AAGGATAAGA 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 3 2 363087 CASAVA_Build 8 90194837 4D CAAAAAGAGA GAAG/---- GAAGCCTCAA 3070 hom 123 het 42 0 40 3 GAAG 2 1 363088 CASAVA_Build 8 90195865 1D TATTAAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 43 0 38 6 A 10 9 363089 CASAVA_Build 8 90202254 1I GCTGAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 61 het 31 0 21 10 A 9 10 363090 CASAVA_Build 8 90204032 1D ATGTTCTGAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 31 0 28 6 A 10 9 363091 CASAVA_Build 8 90211958 1I CTCATAGAAG -/C AAAAAGCAGA 3070 hom 70 het 29 0 22 7 C 0 1 363092 CASAVA_Build 8 90215768 1D AAAAAAAAAA C/- CAAAACCTGG 3070 het 409 hom 19 1 16 2 C 2 1 363093 CASAVA_Build 8 90224256 1D CAGAATCTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 33 0 23 10 T 10 9 363094 CASAVA_Build 8 90225703 4D TCGCTTTCTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 51 het 22 0 18 4 TCTT 4 3 363095 CASAVA_Build 8 90230779 2I TGTTGGGTGC --/AT ATATATATAT 3070 het 459 hom 26 4 12 10 AT 7 8 363096 CASAVA_Build 8 90236575 2D GCTGTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 18 hom 26 1 13 13 T 14 12 363097 CASAVA_Build 8 90243092 4D TGGCAGACCA ATAT/---- ATATATATAT 2142 het 17 hom 16 1 7 8 AT 11 9 363098 CASAVA_Build 8 90249558 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 A 13 12 363099 CASAVA_Build 8 90249735 1D TGTAATAAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 36 het 18 0 13 5 T 9 8 363100 CASAVA_Build 8 90252727 1D TTAAATAAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 10 9 363101 CASAVA_Build 8 90257568 1I AAAATTAAAG -/A AAAAAAACCC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 7 8 363102 CASAVA_Build 8 90264593 3D TACTTTGCCT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 33 hom 35 1 25 10 TTC 1 0 363103 CASAVA_Build 8 90264878 1D AATAAAAGAT G/- TTTTTTATCC 3070 hom 123 het 49 0 42 8 G 1 0 363104 CASAVA_Build 8 90265198 4D TACTGGGCTC TTAT/---- TTATTACTTG 3070 hom 78 het 29 0 27 3 TTAT 2 1 363105 CASAVA_Build 8 90266424 2I ATGGCATTAA --/AG AAAAAAATTC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 AG 0 1 363106 CASAVA_Build 8 90269127 1I AGAGGTGGGG -/C CCTTTGGGAA 3070 hom 126 het 47 0 42 5 C 2 3 363107 CASAVA_Build 8 90278776 4I TTAGAAGGAT ----/AGAC AGATTTAAAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AGAC 0 1 363108 CASAVA_Build 8 90279077 49D ACAGCTCTAG AGAACTGAATTTGAATCTTGTGTAAACTAGTCAAGTTACCTAATTTTTT/------------------------------------------------- AGAACTGAAT 2735 het 170 hom 29 1 10 28 AGAACTGAATTTGAATCTTGTGTAAACTAGTCAAGTTACCTAATTTTTT 1 0 363109 CASAVA_Build 8 90280635 1I GTTTGCCTCC -/T TTTTTTTATC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 8 363110 CASAVA_Build 8 90283536 1I TCTTTTACAG -/T ATCTGTGCAC 3070 hom 129 het 51 0 43 8 T 0 1 363111 CASAVA_Build 8 90320481 1D ACCTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 1537 het 1537 ref 20 14 4 2 T 13 12 363112 CASAVA_Build 8 90354388 1D ATTGGGGAAA G/- CTTCAAGGAT 3070 het 3070 ref 57 28 25 4 G 1 0 363113 CASAVA_Build 8 90379405 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 2439 hom 24 het 14 0 10 5 A 16 14 363114 CASAVA_Build 8 90381293 2I GCATTATTCA --/TG TGTTTGTAGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 TG 1 2 363115 CASAVA_Build 8 90381912 2D ATGTTATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 A 13 11 363116 CASAVA_Build 8 90383012 1I ATGCAGCCAT -/A AAAAAATGAT 2564 hom 15 het 7 0 6 1 A 6 7 363117 CASAVA_Build 8 90385448 3D27M2D AATGAGGTTT TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGACAG/---TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGAC-- AGTCTCACTC 3070 hom 69 het 35 0 24 11 N/A 0 0 363118 CASAVA_Build 8 90388448 1I AGTACCATGA -/G GCCATTATGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 2 363119 CASAVA_Build 8 90390539 2D GAGATGGAAG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 131 het 50 0 44 7 GA 6 5 363120 CASAVA_Build 8 90399379 2D AGAAACCAAT TA/-- AATTAGTCAT 3070 hom 148 het 55 0 50 8 TA 1 0 363121 CASAVA_Build 8 90402963 4D ATTATTGAGG ATAA/---- ATACTCAGCC 3070 hom 106 het 40 0 35 6 ATAA 1 0 363122 CASAVA_Build 8 90403441 1D GAAAGTACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 180 hom 28 2 21 5 A 12 11 363123 CASAVA_Build 8 90405397 1D CCAGGTAGAC A/- CCACTTTGAA 3070 hom 87 het 31 0 29 3 A 1 0 363124 CASAVA_Build 8 90412081 3D AAGTATAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 27 0 23 5 A 14 11 363125 CASAVA_Build 8 90433008 1I ATTTGTAATT -/C ATTTCAAACT 3070 hom 114 het 41 0 38 3 C 0 1 363126 CASAVA_Build 8 90435070 12D TGGGATTTTC TTTTTAATCACA/------------ TTATCAGACT 3070 hom 27 het 10 0 10 1 TTTTTAATCACA 1 0 363127 CASAVA_Build 8 90445143 1D AAGATATAAA T/- TTTAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 13 14 3 T 4 3 363128 CASAVA_Build 8 90453374 2D AGACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1026 het 322 hom 11 5 3 3 A 20 18 363129 CASAVA_Build 8 90524865 21D GTTAATATAT CAGGATAGTCAAAAACATACC/--------------------- CATGTATGTG 3070 het 3070 ref 29 19 11 3 CAGGATAGTCAAAAACATACC 1 0 363130 CASAVA_Build 8 90562474 1D CTTTTGGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 355 hom 41 1 31 10 T 12 11 363131 CASAVA_Build 8 90578347 1I AGATTTGAAC -/T CTGATTCCAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 0 1 363132 CASAVA_Build 8 90582684 2D TAATAAATAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 18 het 10 0 7 4 AT 8 7 363133 CASAVA_Build 8 90589258 1D AGAGAGAGAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 10 9 363134 CASAVA_Build 8 90613713 1D CTAATGCTAT C/- CCCTCCCCCC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 4 3 363135 CASAVA_Build 8 90622603 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 22 0 18 4 A 12 11 363136 CASAVA_Build 8 90632504 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1403 het 1372 hom 18 9 5 4 A 14 13 363137 CASAVA_Build 8 90652173 2D TCTTAAGAAA AT/-- CTCATCAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 4 AT 1 0 363138 CASAVA_Build 8 90654082 1D TGAGAAAAGC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 137 het 51 0 46 5 A 9 8 363139 CASAVA_Build 8 90666343 1D TGTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 A 12 11 363140 CASAVA_Build 8 90675529 1I ATGTGGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 10 11 363141 CASAVA_Build 8 90689609 3D AAAACTTATC ACA/--- ACAAGATTAT 3070 het 3070 hom 51 18 31 5 ACA 2 1 363142 CASAVA_Build 8 90698518 1I AAAGGAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 16 12 1 A 9 10 363143 CASAVA_Build 8 90704282 3D GAGACTTCCC AAG/--- AAGAAGTCAT 3070 het 3070 hom 37 17 17 5 AAG 3 2 363144 CASAVA_Build 8 90710256 1I CAGGAATGAA -/T TTGGCAAGAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 3 363145 CASAVA_Build 8 90719680 1I TCAAGAAGTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2717 hom 23 9 11 3 A 9 10 363146 CASAVA_Build 8 90719787 1D24M1D GCAAGATCTT GGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCG/-GGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCC- GGGTTCACGC 3070 hom 26 het 10 0 9 2 N/A 0 0 363147 CASAVA_Build 8 90720640 1D TCTTAAAGCA G/- GATAAAAGCA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 G 2 1 363148 CASAVA_Build 8 90722275 1I AAACCTATAC -/A ACAAACCAAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 2 363149 CASAVA_Build 8 90722369 1I TGCACATCGA -/G GAATGGGAAG 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 1 2 363150 CASAVA_Build 8 90722949 2D12M1D29M1D7M1D5M1D CCCTGTTACC CAAAACCCAGGCAAGGGACACAACAACAAACTACAAGCTAATTTCCCCCAATGGAACAC/--AAAACCAAGCAA-GGACACAACAACAAACTACAAGCTAATAT-CCCCAAT-GAACA- CAGGTGCCAA 3070 hom 69 het 18 0 24 1 N/A 0 0 363151 CASAVA_Build 8 90725335 1I TAAAATAGTA -/G TTACCAGAGG 3070 hom 87 het 32 0 29 3 G 0 1 363152 CASAVA_Build 8 90728389 2D TACTGGAATC AT/-- GTGTAGCGTT 3070 het 3070 ref 47 26 13 8 AT 1 0 363153 CASAVA_Build 8 90729511 1D TGTAATCCAG A/- AGACTAGATG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 2 1 363154 CASAVA_Build 8 90736776 1D AATGAAGAAT A/- AAAAACCATG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 6 5 363155 CASAVA_Build 8 90740704 6D AGTATACACA TATATT/------ TATATGCATA 3070 het 3070 ref 38 24 13 4 TATATT 1 0 363156 CASAVA_Build 8 90741311 1I AAACAATTTT -/A AAACTTCTGA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 3 4 363157 CASAVA_Build 8 90749479 1D ATTAAATCAG A/- AAACAAAAAC 3070 hom 72 het 36 0 25 11 A 4 3 363158 CASAVA_Build 8 90751616 1D AAGAGAAAAC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 8 7 363159 CASAVA_Build 8 90754300 1I TGACTTGGAT -/G GGGCTAAGAA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 G 3 4 363160 CASAVA_Build 8 90766058 2D CATATAGTGT AA/-- ACCAAAAGGC 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 A 3 1 363161 CASAVA_Build 8 90769886 1D ATATCCATTA T/- TTTTAACAAG 3070 het 3070 hom 32 11 20 2 T 5 4 363162 CASAVA_Build 8 90772250 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1791 hom 24 7 12 6 A 10 9 363163 CASAVA_Build 8 90778404 1D GTGCTCTATG C/- ATTGTTTATT 3070 het 3070 hom 47 16 28 3 C 1 0 363164 CASAVA_Build 8 90783862 1D AACCTCCCCC T/- TATGAGTCTC 3070 het 3070 hom 51 23 28 0 T 2 1 363165 CASAVA_Build 8 90799463 1D CATTATTCTG C/- CCCCCCCCAC 3070 het 2655 hom 28 11 12 5 C 9 8 363166 CASAVA_Build 8 90828345 1D TTCAGATATC A/- AAAGCCCCAG 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 4 3 363167 CASAVA_Build 8 90832882 3D AAAAGAAAGA AAG/--- AAAGAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AAG 1 0 363168 CASAVA_Build 8 90842625 3D GAACTAACTT ATC/--- ATCATTACTT 3070 het 3070 ref 32 15 13 6 ATC 2 1 363169 CASAVA_Build 8 90849670 1D TCTTAAGACC T/- TTTTGAATGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 5 4 363170 CASAVA_Build 8 90852736 1D CTGAGAGCAG A/- AAAAAGGCAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 6 5 363171 CASAVA_Build 8 90861885 1D TTTAAAACGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 827 hom 26 3 16 8 A 15 14 363172 CASAVA_Build 8 90875933 1D GACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 15 0 12 5 A 11 10 363173 CASAVA_Build 8 90879398 1D TTGACAGCAC T/- TAATCAGACA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 2 1 363174 CASAVA_Build 8 90887466 1D AAAGTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 26 0 22 5 T 12 11 363175 CASAVA_Build 8 90889476 3D GAGGTGTCTT ATG/--- ATGCCATGAT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 ATG 2 1 363176 CASAVA_Build 8 90889834 8D CAAAATGCTG ATAGTGAT/-------- ATGGACAATA 3070 hom 42 het 17 0 15 5 ATAGTGAT 1 0 363177 CASAVA_Build 8 90898346 1D CTGGAGCTGT A/- AAAAAATACA 3070 hom 123 het 48 0 41 7 A 7 6 363178 CASAVA_Build 8 90927600 15D GAGCTTACGT CCACATTATCTGAAC/--------------- CCACATTATC 3070 hom 85 het 42 0 28 17 CCACATTATCTGAAC 2 1 363179 CASAVA_Build 8 90927761 3D CAATGCTGTT ATA/--- ATATTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 ATA 2 1 363180 CASAVA_Build 8 90928038 1D CAGATGATTA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 42 22 16 5 T 8 7 363181 CASAVA_Build 8 90939199 1D TAAAAAAAAA T/- TTTGAGTATA 3070 het 321 hom 36 1 33 2 T 4 3 363182 CASAVA_Build 8 90955189 1D ACATGATAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 20 16 3 T 10 9 363183 CASAVA_Build 8 90964559 1D TACTCATGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 10 9 363184 CASAVA_Build 8 90965766 1D GTATTTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2517 hom 23 6 11 6 T 12 11 363185 CASAVA_Build 8 90976953 4D TTTTGCTTGC TTGT/---- TTGTTTATGC 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 TTGT 2 1 363186 CASAVA_Build 8 90988683 1D CATTTGTCAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 31 14 8 9 T 10 9 363187 CASAVA_Build 8 90993340 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2989 hom 19 7 9 3 A 12 11 363188 CASAVA_Build 8 90997674 2D TAAAAAAGTT AG/-- AAAGTATGGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 1 0 363189 CASAVA_Build 8 91003381 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1882 hom 18 6 10 2 A 11 10 363190 CASAVA_Build 8 91011921 1D TGCCATATTG T/- CCCAGGGTGA 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 1 0 363191 CASAVA_Build 8 91013733 1I GGAATCTGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2698 hom 32 8 16 8 A 13 14 363192 CASAVA_Build 8 91017932 4D ATTATAATAG GTTT/---- GTTAGGCCTG 3070 het 3070 hom 40 16 23 3 GTTT 1 0 363193 CASAVA_Build 8 91154407 1I GGAAAAAAAA -/C CCAACAACTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 C 2 3 363194 CASAVA_Build 8 91166812 1D TATCTAAAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 10 9 363195 CASAVA_Build 8 91169065 2I ATATAAAAAT --/GA GAGTCAGATT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 GA 1 2 363196 CASAVA_Build 8 91177678 1D AAAATTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 10 9 363197 CASAVA_Build 8 91179284 1D TCTCAGTAGA G/- TGGGTAGATC 3070 hom 101 het 39 0 31 8 G 1 0 363198 CASAVA_Build 8 91179830 6D TCCCACTGCC ATTCAA/------ ATTCAAGGCC 3070 hom 86 het 32 0 20 14 ATTCAA 2 1 363199 CASAVA_Build 8 91180520 4D TTTTCTTTTC TTCT/---- TTCTAACTGC 3070 hom 135 het 47 0 45 4 TTCT 2 1 363200 CASAVA_Build 8 91186080 1I TGATTTGCTG -/C ATACATCAAC 3070 hom 72 het 26 0 24 2 C 0 1 363201 CASAVA_Build 8 91190887 1I TACTGGGTAG -/A AAAAACTGCT 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 5 6 363202 CASAVA_Build 8 91198163 5D TGTATTTATG TATAA/----- TATATGTATG 3070 hom 144 het 52 0 48 5 TATAA 1 0 363203 CASAVA_Build 8 91208490 1D TTTCAAGACC T/- TTTTTTTTTT 1207 het 1207 ref 35 23 3 11 T 12 11 363204 CASAVA_Build 8 91209704 1D ACAAAATGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 48 het 39 1 31 7 T 10 9 363205 CASAVA_Build 8 91230460 1I GCTGCTATAT -/C GTCTTTGTGG 3070 hom 81 het 36 0 26 10 C 0 1 363206 CASAVA_Build 8 91232756 1D GTGTTCTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 15 het 27 1 18 8 A 15 14 363207 CASAVA_Build 8 91233207 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 A 7 8 363208 CASAVA_Build 8 91234844 1I AAATATAGAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 402 hom 46 1 34 11 T 8 9 363209 CASAVA_Build 8 91236683 2I TCTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 105 hom 26 1 20 5 T 11 13 363210 CASAVA_Build 8 91271110 4D TAAACCACAG TTCT/---- TTTCAGAACC 3070 het 3070 ref 55 31 20 5 TTCT 1 0 363211 CASAVA_Build 8 91272465 4D TGGTTAGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 32 13 12 8 TTTG 4 3 363212 CASAVA_Build 8 91273587 13D CCATCTCAAA AGCATTAATAAAT/------------- AAAATAAATA 3070 het 3070 ref 23 15 10 3 AGCATTAATAAAT 1 0 363213 CASAVA_Build 8 91280931 2D TTTTTTGTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 21 9 10 T 11 9 363214 CASAVA_Build 8 91284191 1D TTTTTATTGT A/- AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 7 6 363215 CASAVA_Build 8 91299955 1D TTCTCATCAA T/- TGGGCACTTG 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 T 2 1 363216 CASAVA_Build 8 91306981 4I TACAATCTTT ----/AGAA AGAGTGATAG 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 AGAA 0 1 363217 CASAVA_Build 8 91309508 1I CTTATAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 63 23 26 14 T 10 11 363218 CASAVA_Build 8 91320203 3I CAAGGATAGT ---/ATC ATATCTATGA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 ATC 0 1 363219 CASAVA_Build 8 91338071 1D CAGATTGATT A/- AAAAAAAAAA 2323 het 2323 ref 37 24 6 7 A 13 12 363220 CASAVA_Build 8 91355385 5I AAACAAACAT -----/ATAAA ATAGTGTTTC 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 ATAAA 0 1 363221 CASAVA_Build 8 91360403 1D ATGCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 13 12 363222 CASAVA_Build 8 91374591 11D ACACTGGCTT CCTAACTATTC/----------- CCTGAACACA 3070 het 3070 ref 36 22 15 5 CCTAACTATTC 1 0 363223 CASAVA_Build 8 91379495 1D GTGTTTACAC A/- AGCCACACCG 3070 het 3070 hom 39 12 21 7 A 2 1 363224 CASAVA_Build 8 91390802 2D ACTCATAGAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 23 20 7 AC 8 7 363225 CASAVA_Build 8 91399163 1D AGCTAAGCAC A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 48 20 23 7 A 8 7 363226 CASAVA_Build 8 91404525 1I TTTGGTTCCC -/T TTTTGCTATG 3070 hom 87 het 34 0 28 6 T 4 5 363227 CASAVA_Build 8 91408577 1I15M1D ATTTACAAGA -TTATAATTCTCCAAAC/TTTATAATTCTCCAAA- TTTGACCATC 3070 het 3070 hom 34 19 18 4 N/A 0 0 363228 CASAVA_Build 8 91410909 9D CGGCCTTCCT CTGCTCTTG/--------- CTGCTCTTGA 3070 het 3070 ref 48 26 17 7 CTGCTCTTG 2 1 363229 CASAVA_Build 8 91411480 1I AGGGCGAGGT -/G GGCGGATCAT 3070 het 3070 hom 22 7 12 3 G 2 3 363230 CASAVA_Build 8 91412605 1I TTAACTTGCA -/T TTTCTCTGGT 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 T 3 4 363231 CASAVA_Build 8 91414437 1I CACAGACATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 T 10 11 363232 CASAVA_Build 8 91421555 2D CAGTTAAACT TC/-- TTTTTCTTCC 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 TC 1 0 363233 CASAVA_Build 8 91426950 1D TAGGAAATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 46 1 30 18 A 11 10 363234 CASAVA_Build 8 91434855 4D TTCTATTTTT AAAC/---- AAACATTTTT 3070 het 3070 ref 34 19 12 6 AAAC 2 1 363235 CASAVA_Build 8 91434984 2I TGCCTCCACA --/TC TTGTCCCACC 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 TC 0 1 363236 CASAVA_Build 8 91438394 1D TGAAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 725 hom 30 9 11 10 A 26 25 363237 CASAVA_Build 8 91443822 1D TGTGGGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1703 het 1703 ref 38 24 5 9 T 13 12 363238 CASAVA_Build 8 91444176 5D TTGCTTTGTA TGATT/----- TTTTTTTTTT 2003 het 2003 ref 25 16 5 4 TGATT 1 0 363239 CASAVA_Build 8 91453100 3D AGAGCAGAGA GAT/--- AATGAATGCC 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 GAT 1 0 363240 CASAVA_Build 8 91459289 2I ACTATCCTAA --/AT ATATATATGC 2917 het 1911 hom 13 6 6 1 AT 4 5 363241 CASAVA_Build 8 91464595 1D TACAACTTTG C/- ATAACCAAGT 3070 het 3070 ref 47 26 16 5 C 1 0 363242 CASAVA_Build 8 91467026 1D ACTCCAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 13 11 T 11 10 363243 CASAVA_Build 8 91467158 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 A 8 9 363244 CASAVA_Build 8 91469915 3I AATTTATTCT ---/TGA TGGTACATGT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 TGA 0 1 363245 CASAVA_Build 8 91481866 4I TTCCATATTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 TTTG 3 4 363246 CASAVA_Build 8 91490231 11I3M2D TCTTAATCTC -----------AATCA/TTTTCTAGAGTATT-- CATTGTTGGT 3070 het 3070 ref 26 18 9 0 N/A 0 0 363247 CASAVA_Build 8 91495157 1I TTTAACTGGA -/G GACCACAATG 3070 het 3070 ref 45 24 14 7 G 1 2 363248 CASAVA_Build 8 91501882 2D TGATATCCAC AT/-- GTTTTCTTCC 3070 het 3070 ref 44 23 14 8 AT 1 0 363249 CASAVA_Build 8 91506643 2D ATTTTTTAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2790 hom 24 9 10 5 T 13 11 363250 CASAVA_Build 8 91510366 6I AAGTTGAGTC ------/TTAATA TTAAGGATAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 TTAATA 0 1 363251 CASAVA_Build 8 91510667 1I GCCTGGAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 A 10 11 363252 CASAVA_Build 8 91512910 1I TCCCTTGTGC -/T ACAAATGGAT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 0 1 363253 CASAVA_Build 8 91513468 1D TGAATTGCTG C/- AATCTCAGAA 3070 het 3070 ref 39 22 15 2 C 1 0 363254 CASAVA_Build 8 91534827 4D AGGGTTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 2827 hom 23 8 8 7 TTTG 5 4 363255 CASAVA_Build 8 91536430 1I AAAATGTCAG -/T GACAGCTGAA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 0 1 363256 CASAVA_Build 8 91537867 3D ATTAGTTTGT TTG/--- TAATTCTTTC 3070 het 3070 hom 33 12 19 2 TTG 1 0 363257 CASAVA_Build 8 91538296 5I AAGGAAGTAC -----/ATATT ATATTATATG 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 ATATT 1 2 363258 CASAVA_Build 8 91545578 1D ATTGGAAATG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 A 9 8 363259 CASAVA_Build 8 91550443 1I CCATAAAAAC -/A AAAAATAGAG 3070 het 3070 hom 26 10 16 0 A 5 6 363260 CASAVA_Build 8 91556201 4D GTCAGATCAA TCTT/---- TCTTAGTAGA 3070 het 3070 ref 39 19 17 5 TCTT 2 1 363261 CASAVA_Build 8 91560802 1I TTTTTAGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 15 10 A 13 14 363262 CASAVA_Build 8 91561190 1D23M1D43M1D CTTCTTTTCT CCTTTGTAATGTTAGTGAGAAGGATTTTTTAATTCCCCTCCTTTGATAATAGAAGTGTCAATGACCCCT/-CTTTGTAATGTTAGTGAGAAGGA-TTTTTAATTCCCCTCCTTTGATAATAGAAGTGTCAATGACCCC- TGGCTCTTAG 3070 hom 169 het 47 0 57 9 N/A 0 0 363263 CASAVA_Build 8 91573772 1I CTGATAAATG -/A ATTCAGCAAA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 1 2 363264 CASAVA_Build 8 91582472 1D TTGTGGTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 7 T 13 12 363265 CASAVA_Build 8 91601892 3D AGAAAAAGAG AAC/--- AAGAGAGGAA 3070 het 3070 ref 27 16 9 3 AAC 1 0 363266 CASAVA_Build 8 91604750 5I AGGAGTCCAG -----/CAGGT CAGGTCCTAG 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 CAGGT 1 2 363267 CASAVA_Build 8 91605818 2D GGTGTGTTTC TG/-- TGTGTGTGTG 1515 het 1515 ref 43 34 4 5 TG 8 7 363268 CASAVA_Build 8 91611026 1I CCCCCTCTTC -/T TTTTTTTTTT 1608 het 301 hom 22 2 9 11 T 14 15 363269 CASAVA_Build 8 91617226 1D AAATACTTGT G/- TGAAAGTAAG 3070 het 3070 ref 44 21 18 6 G 1 0 363270 CASAVA_Build 8 91620739 2I TTTTTTTTTT --/TC CAGATTGTTC 845 het 845 ref 35 15 7 13 TC 0 1 363271 CASAVA_Build 8 91623780 1I TAGTAAGAAC -/A ACTTAAAATA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 A 1 2 363272 CASAVA_Build 8 91628329 1I CCCAATGTAG -/A AAAAAAAAAA 2253 het 2253 ref 30 13 8 9 A 13 14 363273 CASAVA_Build 8 91634263 1I CATTCTGTTG -/A AAAAAAAGAG 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 A 7 8 363274 CASAVA_Build 8 91634813 1I GCCTCCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2487 hom 31 7 11 13 T 11 12 363275 CASAVA_Build 8 91634974 1I TGCCTGGCTA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3011 hom 20 8 10 2 T 7 8 363276 CASAVA_Build 8 91639105 3D GTGTCTGACT AAC/--- AACAGATAGT 3070 het 3070 ref 56 29 21 7 AAC 2 1 363277 CASAVA_Build 8 91641007 1D TGATCCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 11 10 363278 CASAVA_Build 8 91644977 1D TGGTGGTGAG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 9 8 363279 CASAVA_Build 8 91647073 1D TGACTAGCTA T/- TTTTTTTTTT 1620 het 1620 ref 30 13 6 11 T 14 13 363280 CASAVA_Build 8 91647626 2D AAATCTTCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 12 10 363281 CASAVA_Build 8 91656857 1D AAAATATATC A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 13 16 7 A 9 8 363282 CASAVA_Build 8 91657679 1I TCTTTTAAAG -/T TAATGTAAGA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 T 1 2 363283 CASAVA_Build 8 91660382 1I TTCAACTTGC -/A ACCATAAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 A 1 2 363284 CASAVA_Build 8 91661524 30D TGAAATGCTG TGAAGGAGTTATTATTTCCTGAAATTGTCT/------------------------------ TGATGAAAAA 3070 het 3070 ref 39 31 21 4 TGAAGGAGTTATTATTTCCTGAAATTGTCT 1 0 363285 CASAVA_Build 8 91667725 1I CCTTTGGCCC -/A ATTTATTTCA 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 1 2 363286 CASAVA_Build 8 91669557 1D TTGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 A 10 9 363287 CASAVA_Build 8 91674023 3I TCAAGTATAA ---/ATT ATTACTATTA 3070 hom 39 het 16 0 14 2 ATT 1 2 363288 CASAVA_Build 8 91682559 4I CCAGAAAAAG ----/AGAA AGAAAGCAAT 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 AGAA 1 2 363289 CASAVA_Build 8 91687115 1I GTATAGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 15 13 T 13 14 363290 CASAVA_Build 8 91693837 6D AATAATAACA ATCATC/------ ATCATCATCA 3070 het 3070 ref 25 12 12 6 ATC 6 4 363291 CASAVA_Build 8 91710040 2I GTTTTGGTTA --/GT GTAGATACAT 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 GT 1 2 363292 CASAVA_Build 8 91744472 2I GTATGTTGTG --/TC TCTGTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 TC 1 2 363293 CASAVA_Build 8 91745685 3D TTTAAGTGTC TTT/--- TTGAGGGAGC 3070 het 3070 ref 55 26 21 9 T 5 2 363294 CASAVA_Build 8 91750512 1I TCAAGCTGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2859 hom 25 8 12 5 T 11 12 363295 CASAVA_Build 8 91750876 1I GTGACACCCC -/T GATGAATAAG 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 T 0 1 363296 CASAVA_Build 8 91751761 2I CTTCAAGCCA --/CT CTACAAAGCT 3070 het 3070 ref 40 22 11 7 CT 1 2 363297 CASAVA_Build 8 91759883 27D TTTGGAGAGG CTATCAACTAAAGCGTACTTACTTTAC/--------------------------- CTAGTCAGAG 3070 het 3070 ref 32 26 10 6 CTATCAACTAAAGCGTACTTACTTTAC 1 0 363298 CASAVA_Build 8 91762347 1I TTATTAGTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 A 9 10 363299 CASAVA_Build 8 91768746 1I AACCAAGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2659 hom 34 9 11 14 T 13 14 363300 CASAVA_Build 8 91774430 1I GCATCTTTAA -/C AAGTGCTGTG 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 C 0 1 363301 CASAVA_Build 8 91779483 1D ATACAAACAC A/- AATATAAATT 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 A 3 2 363302 CASAVA_Build 8 91805108 1I TCAGTAGTTT -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 A 7 8 363303 CASAVA_Build 8 91806349 1I TATATTTTCA -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 hom 27 12 14 1 T 6 7 363304 CASAVA_Build 8 91808315 1D AACACCACCA C/- CCCCAGTGAA 3070 hom 76 het 35 0 23 12 C 5 4 363305 CASAVA_Build 8 91808813 1I AAAAGGGGGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 A 9 10 363306 CASAVA_Build 8 91824983 5I GTGACACTTG -----/TTTTT TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 44 24 18 2 T 6 11 363307 CASAVA_Build 8 91834294 1D ATCTAACCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1539 hom 23 5 12 6 A 15 14 363308 CASAVA_Build 8 91889423 1D ATAGTATGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 31 15 9 8 T 9 8 363309 CASAVA_Build 8 91889842 1D GGGCTCAAAT C/- CCCATTCCAC 3070 het 3070 ref 45 22 16 7 C 4 3 363310 CASAVA_Build 8 91892736 1I GCATCAATAA -/T TTTCAATGCG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 T 3 4 363311 CASAVA_Build 8 91894342 1I CGCCTGTAAT -/C CCAGCACTTT 3070 hom 30 het 11 0 10 1 C 2 3 363312 CASAVA_Build 8 91898871 2I TTTTTTGTAG --/TT TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 8 10 363313 CASAVA_Build 8 91901674 3I AAGGACAGAA ---/ATG ATGACATCTA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 ATG 1 2 363314 CASAVA_Build 8 91905451 1D TTTGTTACCC A/- AAACTCCCAT 3070 hom 117 het 44 0 39 6 A 4 3 363315 CASAVA_Build 8 91914795 1I TATTCCTCCC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 1929 hom 33 6 25 2 A 8 9 363316 CASAVA_Build 8 91922673 1D CAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2142 hom 20 8 9 5 A 12 11 363317 CASAVA_Build 8 91926192 3D CTGAGCTACG TTC/--- TTCTAAATCT 3070 het 3070 hom 34 13 21 1 TTC 2 1 363318 CASAVA_Build 8 91933811 1D TGTACATACA C/- ACTGGTTGTA 3070 het 3070 ref 57 29 23 6 C 1 0 363319 CASAVA_Build 8 91934881 1I TTTTAAATAG -/A AAAAAAACTG 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 7 8 363320 CASAVA_Build 8 91935341 1I GAATTAGGGA -/G GAGTAAGGAA 3070 het 3070 ref 57 25 25 7 G 1 2 363321 CASAVA_Build 8 91940385 1D TCCAACCTGC A/- AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 42 13 20 9 A 7 6 363322 CASAVA_Build 8 91949488 4D TCACTCTCTC TCTT/---- TCTCCTGCTC 3070 het 3070 hom 27 10 14 8 TCTT 1 0 363323 CASAVA_Build 8 91955296 1I ATGGAACTAG -/A TTAGGTCCCT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 0 1 363324 CASAVA_Build 8 91975255 1I AAGAATGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 10 11 363325 CASAVA_Build 8 91978479 1I AAGAAAATTT -/A AAAAAAAATA 2753 het 2753 ref 21 12 7 2 A 8 9 363326 CASAVA_Build 8 91985670 1D TACTGAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 14 4 A 11 10 363327 CASAVA_Build 8 91986494 2D GTTGTATATC AA/-- AAGACAGCAC 3070 het 3070 hom 45 17 24 4 A 4 2 363328 CASAVA_Build 8 91991073 5D GGTAATCTAG ATTTT/----- ATTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 33 18 12 8 ATTTT 2 1 363329 CASAVA_Build 8 91991626 3D TTTTCTTAAT ATC/--- TTCTAGCTTA 3070 het 3070 ref 36 20 13 4 ATC 1 0 363330 CASAVA_Build 8 91994777 1I AATAATTATC -/A ATGACACGAA 3070 het 3070 hom 51 18 23 10 A 1 2 363331 CASAVA_Build 8 91998829 1D ATGGTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 12 11 363332 CASAVA_Build 8 92003079 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 857 het 857 ref 38 32 4 2 A 10 11 363333 CASAVA_Build 8 92004795 2I AGGGCTCAGA --/CC CTCCAGTTGG 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 C 1 3 363334 CASAVA_Build 8 92009414 1D GGCAATTACA T/- TAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 T 2 1 363335 CASAVA_Build 8 92012419 5I GCTCAAACTT -----/ATTTC ATGCCTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 ATTTC 0 1 363336 CASAVA_Build 8 92032643 1D TTCTGTGTCC T/- TTTGTATTTT 3070 het 3070 ref 38 17 18 3 T 4 3 363337 CASAVA_Build 8 92033170 1I ATTTTAGCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 10 11 363338 CASAVA_Build 8 92036409 2D ATATGTACAC AT/-- ATGCATATAT 3070 het 2150 hom 15 5 10 0 AT 2 1 363339 CASAVA_Build 8 92042905 1D CATGTCCAGT G/- GGGGGGAAAA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 G 7 6 363340 CASAVA_Build 8 92056251 3D AATTATCATC ATA/--- ATAAGCACAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 ATA 2 1 363341 CASAVA_Build 8 92067535 1I CAAGTTATTG -/C GAGCTGTCTC 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 C 0 1 363342 CASAVA_Build 8 92067947 5I AGAGAGAAAT -----/TAGAG TAGACTAGAC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 TAGAG 0 1 363343 CASAVA_Build 8 92075120 1D ACTTAGAACG T/- TTTTTTCTTA 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 T 7 6 363344 CASAVA_Build 8 92076574 1D TTACACTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 6 T 13 12 363345 CASAVA_Build 8 92081804 1D CATTTAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 16 13 T 14 13 363346 CASAVA_Build 8 92104800 4I GAAGTGACAT ----/ATTG ATTGCTACAC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 ATTG 1 2 363347 CASAVA_Build 8 92129089 1D TCAGTAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 T 13 12 363348 CASAVA_Build 8 92131184 2D CTCTGAAAAA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 55 18 24 14 TG 10 9 363349 CASAVA_Build 8 92131689 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTAT 2031 het 2031 ref 13 6 6 1 T 8 9 363350 CASAVA_Build 8 92133920 4D ATTTAAAATT TTAC/---- TTACTTATTT 3070 het 2440 hom 16 5 8 5 TTAC 2 1 363351 CASAVA_Build 8 92162550 1D TCAGAAATGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 10 9 363352 CASAVA_Build 8 92178471 34D TTGAGAAGGA CGATAAAACGAAAAGATAAACCTTCATGCACTGT/---------------------------------- TAGTAGGAGT 3070 het 3070 ref 26 22 10 2 CGATAAAACGAAAAGATAAACCTTCATGCACTGT 1 0 363353 CASAVA_Build 8 92190566 1D TCTCCAGGAA C/- CGTTCATGTC 3070 het 3070 hom 49 17 27 5 C 2 1 363354 CASAVA_Build 8 92192008 1D ATGCCATTGC A/- CACCAGCCTG 3070 het 2922 hom 17 7 7 3 A 1 0 363355 CASAVA_Build 8 92196483 2D CAAAGGGCAC AA/-- AGTTTCAGTT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 A 3 1 363356 CASAVA_Build 8 92212640 1I TTGATTTGTC -/T TTTTTTTTTT 1342 het 1342 ref 23 7 10 6 T 13 14 363357 CASAVA_Build 8 92215904 1I TTTTTTTCAT -/C CAAGTCACTA 3070 het 3070 ref 50 25 16 9 C 1 2 363358 CASAVA_Build 8 92220933 1D CCCACTTCGG C/- CCTCTCAAAG 3070 hom 33 het 15 0 11 4 C 3 2 363359 CASAVA_Build 8 92227939 4I TTAGATGATT ----/TCTC TCTCTCTCCC 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TC 4 6 363360 CASAVA_Build 8 92250141 1D GTGTTTTGTG T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 41 19 18 4 T 9 8 363361 CASAVA_Build 8 92250928 1D GTGTATATAA T/- TTTTTTTTTA 1282 het 954 hom 7 3 3 1 T 10 9 363362 CASAVA_Build 8 92252702 2I TTTTAGTATT --/AG AGTTATTCCA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 AG 1 2 363363 CASAVA_Build 8 92253363 1I GTTTTTTTTT -/A TAAAAAATGG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 A 0 1 363364 CASAVA_Build 8 92256294 1D ACTGGCTTTT A/- AAACCTGAAA 3070 het 3070 ref 49 20 22 7 A 4 3 363365 CASAVA_Build 8 92257220 1D ACCACCGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 12 11 363366 CASAVA_Build 8 92261882 1D TCTGAAGTTG T/- GCACATCACT 3070 het 3070 ref 38 17 15 7 T 1 0 363367 CASAVA_Build 8 92266987 1I AGATATTTTT -/G TCTTTCTTAT 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 G 0 1 363368 CASAVA_Build 8 92279982 4I TCAAAAATTA ----/TAAG TAAGGAAAAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 4 TAAG 1 2 363369 CASAVA_Build 8 92282919 1I TTTATTTTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 9 10 363370 CASAVA_Build 8 92299759 17I5M1D ATTTTGTACA -----------------AATTAT/CTAAGAAGTGAGATTAGAAATA- TTTGAAGTAC 3070 het 3070 ref 30 17 13 4 N/A 0 0 363371 CASAVA_Build 8 92301793 1D TATTTCTTCT A/- AAAAAAAAAA 1228 het 1228 ref 31 23 3 5 A 12 11 363372 CASAVA_Build 8 92306139 1D GTGTTGTGCT G/- GGGGGAAACC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 G 6 5 363373 CASAVA_Build 8 92315884 1D GGCCCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 17 14 T 13 12 363374 CASAVA_Build 8 92322737 1I TTAAAAAGCT -/A GAACAAACTA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 0 1 363375 CASAVA_Build 8 92332452 1D AAGTGATGAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 T 10 9 363376 CASAVA_Build 8 92350348 1D ATCACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 49 20 18 13 A 10 9 363377 CASAVA_Build 8 92366714 3I TCACATGCCT ---/TCA TCATCACATG 3070 het 3070 ref 73 38 26 9 TCA 2 3 363378 CASAVA_Build 8 92370023 1I TCGGCCCTAC -/T TGCTGTGACA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 T 1 2 363379 CASAVA_Build 8 92403313 1D TTGTCTTGTC T/- GTTTTGTGCA 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 T 1 0 363380 CASAVA_Build 8 92419360 1D ATTTGGAGAC T/- TGTCAGTGCT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 2 1 363381 CASAVA_Build 8 92430124 1D TTTTTTTTTT C/- CTGAGATTAA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 C 2 1 363382 CASAVA_Build 8 92430645 1D GCTAACATAA C/- CCATTTGCTT 3070 het 3070 hom 50 21 25 5 C 3 2 363383 CASAVA_Build 8 92431844 1D ACTTTTTTTG A/- AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 19 0 18 2 A 9 8 363384 CASAVA_Build 8 92445346 1D CATGGTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 951 hom 54 9 24 21 T 17 16 363385 CASAVA_Build 8 92446452 3I CTCTTCCATC ---/TCT TCTTCATGTG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TCT 1 2 363386 CASAVA_Build 8 92446568 1D AACAAATACA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 8 7 363387 CASAVA_Build 8 92448982 1I TTGAGGCCAA -/G CTGCCTGGGT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 0 1 363388 CASAVA_Build 8 92450774 1D TACAGAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 36 0 27 9 T 13 12 363389 CASAVA_Build 8 92451583 1I TCTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTC 143 het 12 hom 18 0 2 16 T 9 10 363390 CASAVA_Build 8 92455790 1D CTTAACACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 19 6 T 11 10 363391 CASAVA_Build 8 92457065 1D CTTTAAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3050 hom 36 13 11 12 T 14 13 363392 CASAVA_Build 8 92469033 4D TCCTTTTTGG AATC/---- AATCTGATAT 3070 het 3070 ref 52 27 23 4 AATC 2 1 363393 CASAVA_Build 8 92473207 1I AACACTAGGA -/T TTTTTTTTTT 3001 het 3001 ref 22 8 7 7 T 13 14 363394 CASAVA_Build 8 92556000 1I23M1D GCTAATCATA -TATTCAGTGGCTATAAAATCCACT/TTATTCAGTGGCTATAAAATCCAC- TTTTGTTGGA 3070 hom 132 het 39 0 45 6 N/A 0 0 363395 CASAVA_Build 8 92556125 1I CATCAGCAAT -/C CTTCACTTGG 3070 hom 132 het 49 0 45 4 C 1 2 363396 CASAVA_Build 8 92582452 1D TCTGACATAT C/- CCCCCCCCTC 3070 het 26 hom 25 1 16 10 C 9 8 363397 CASAVA_Build 8 92600859 5I TCTCAGTGAT -----/AACTC AACAAATTGC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AACTC 0 1 363398 CASAVA_Build 8 92631491 1D TTAAACGAGG A/- AAAAAAAAAA 1002 het 1002 ref 49 36 3 10 A 11 10 363399 CASAVA_Build 8 92645958 1I AGGGATAGCA -/T TGGGAGATAT 1796 hom 12 het 5 0 5 0 T 1 2 363400 CASAVA_Build 8 92646225 1D CTGATTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 28 0 21 8 A 15 14 363401 CASAVA_Build 8 92668979 1I GAGCTTCCAT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 8 9 363402 CASAVA_Build 8 92678953 1D CACAGTATGG T/- TTCCTAGTGA 3070 het 3070 ref 53 23 25 5 T 3 2 363403 CASAVA_Build 8 92682134 1D TAGGCTACAA G/- GCCTGTACAG 3070 hom 169 het 61 0 57 4 G 2 1 363404 CASAVA_Build 8 92691256 3D TAAACAAACC AGT/--- AGTAGTCCCT 3070 hom 72 het 26 0 24 4 AGT 3 2 363405 CASAVA_Build 8 92692295 7D CTTCTCGGAA ATGCATG/------- CCCTTGGAAG 3070 het 3070 ref 43 22 20 2 ATGCATG 1 0 363406 CASAVA_Build 8 92693801 1I GGACAGAAGT -/A AAAAAAGTTC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 A 6 7 363407 CASAVA_Build 8 92697624 1I AGGCAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 10 11 363408 CASAVA_Build 8 92708223 4D GTCTTGTGGT TTTC/---- TTTTAGTGCC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TTTC 1 0 363409 CASAVA_Build 8 92709307 1D TTTCTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 419 hom 34 1 21 12 T 12 11 363410 CASAVA_Build 8 92814081 1D CAGTTTAAGT A/- AGGATTTAAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 2 1 363411 CASAVA_Build 8 92832608 1D TTCTGTTTTG T/- TTCCCCCCTC 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 3 2 363412 CASAVA_Build 8 92834870 3I TTCCAGGACT ---/TTG TTATCAGTTT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 TTG 0 1 363413 CASAVA_Build 8 92854096 1D GTTTTAGGTG A/- AAAAAAAAAG 1077 het 1077 ref 51 44 3 4 A 10 9 363414 CASAVA_Build 8 92902489 2D TCAACAAGAC AG/-- AAAATTAACA 3070 het 1662 hom 15 4 11 0 AG 1 0 363415 CASAVA_Build 8 92904702 3D TATATAGACC GAT/--- GATGGAACAG 3070 het 3070 ref 30 20 9 3 GAT 2 1 363416 CASAVA_Build 8 92908317 1D TAAATAATAT A/- AATATGATGT 3070 het 3070 hom 34 16 17 2 A 3 2 363417 CASAVA_Build 8 92909002 1I AGGTTGGGCA -/G GGCCTCGCTT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 G 2 3 363418 CASAVA_Build 8 92912815 1D TTTTTAAAAC A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 A 8 7 363419 CASAVA_Build 8 92915147 5D ATTACTCAGT GAAAA/----- GAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 40 13 13 15 GAAAA 5 4 363420 CASAVA_Build 8 92928657 1I GTCAGAGGAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 A 9 10 363421 CASAVA_Build 8 92929566 1D GTGATATAAA G/- TAAGTTGTCA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 G 1 0 363422 CASAVA_Build 8 92930097 1I ACAAAAATAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 9 10 363423 CASAVA_Build 8 92932348 1D GGAAAACAAA C/- AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 26 1 19 6 C 1 0 363424 CASAVA_Build 8 92934669 5D AGCAAAGAGG TCTCC/----- TCTCCTTCAA 3070 hom 150 het 56 0 50 8 TCTCC 2 1 363425 CASAVA_Build 8 92956928 1D AAGTATAATT A/- AAAAAAAAAA 2526 het 2526 ref 16 7 6 4 A 11 10 363426 CASAVA_Build 8 92962593 1D ATGAAAAAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 13 4 A 10 9 363427 CASAVA_Build 8 92971644 1D TTAAGAAATC G/- TATGTTAAGG 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 G 1 0 363428 CASAVA_Build 8 92980796 1D TCTTAGTTAA C/- TTTTTTGGAG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 1 0 363429 CASAVA_Build 8 92995718 1I TACTTTCTCA -/T TTTTTAACTT 3070 het 3070 hom 33 11 20 2 T 5 6 363430 CASAVA_Build 8 93002488 4D TAATGCTCAG AAAA/---- AAAAAAAAGT 1360 het 1360 ref 41 34 3 7 A 12 8 363431 CASAVA_Build 8 93008705 1D CAATCACTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 17 11 A 11 10 363432 CASAVA_Build 8 93013458 1I GACCACATGC -/T TTGTCAATGA 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 2 3 363433 CASAVA_Build 8 93021182 4I GATCACACTT ----/AGAC AGCCCACACA 3070 het 3070 hom 41 13 24 4 AGAC 0 1 363434 CASAVA_Build 8 93028787 4I TTCTAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 42 het 21 0 15 6 AAAG 3 4 363435 CASAVA_Build 8 93038906 1D GAGTTAGGGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 52 24 19 11 T 9 8 363436 CASAVA_Build 8 93040345 2D ACAACCAAAA AG/-- AGTCTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 13 9 5 AG 2 1 363437 CASAVA_Build 8 93040941 1I TATTATGGCA -/T TTTTTTTTTC 2201 het 2201 ref 13 6 5 2 T 9 10 363438 CASAVA_Build 8 93050904 5I TAAAAAACAT -----/AAAAC AAAGTCCTTA 3070 het 3070 ref 53 26 19 8 AAAAC 0 1 363439 CASAVA_Build 8 93072614 1I GCTCAAAAAA -/T ATCAAAATAA 3070 het 3070 hom 43 20 20 3 T 0 1 363440 CASAVA_Build 8 93088088 1I TTTTTTTTTT -/G TGAGTTCCAG 2153 het 2153 ref 23 12 6 5 G 0 1 363441 CASAVA_Build 8 93094157 1I TCACTCCCTC -/A AAAAAAAAAA 1599 het 1599 ref 18 8 4 6 A 14 15 363442 CASAVA_Build 8 93094236 7D GTTTAACAGA AGTCTGC/------- TACTCAATGA 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 AGTCTGC 1 0 363443 CASAVA_Build 8 93101250 2I CACACTTGTA --/AC ACGACTCCTA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 AC 1 2 363444 CASAVA_Build 8 93103556 4D GAGGATTCTT AATA/---- AATATGTAGT 3070 het 3070 hom 34 14 18 3 AATA 2 1 363445 CASAVA_Build 8 93112887 4D TGTGTGTTTG TTTA/---- TTTGAGACAG 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 TTTA 1 0 363446 CASAVA_Build 8 93122637 4D AAGCCAAGGG GCAT/---- GCATGATTTC 3070 het 3070 hom 38 16 16 9 GCAT 2 1 363447 CASAVA_Build 8 93150538 4D TTATTCCCTA TTTT/---- TTTATTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 15 3 T 7 3 363448 CASAVA_Build 8 93150813 1D ACACAGCAAT A/- AAAAAAAAAA 1053 het 1053 ref 33 28 3 3 A 11 10 363449 CASAVA_Build 8 93152018 4I CATTACTTCC ----/ATAA ATGTGATATG 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 ATAA 0 1 363450 CASAVA_Build 8 93152903 1D TTCTTAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 19 10 T 12 11 363451 CASAVA_Build 8 93168802 1I CTCCTCCAAA -/G GTCTTTTCCA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 G 1 2 363452 CASAVA_Build 8 93199204 1D CTCTTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2695 het 2695 ref 25 12 7 6 A 13 12 363453 CASAVA_Build 8 93209984 1D GCTTTTATGC A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 8 7 363454 CASAVA_Build 8 93216376 1I GCCTCCACCT -/C CTGGGCTCAA 3070 hom 96 het 33 0 32 1 C 1 2 363455 CASAVA_Build 8 93239273 1I TAGATCCCTG -/C TCAAATATCA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 0 1 363456 CASAVA_Build 8 93240360 2D CAAAAAAAAA AT/-- AATAATAATA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 AT 1 0 363457 CASAVA_Build 8 93247040 1D TTTGTGTGTG T/- TTTTTTTTTT 1845 het 557 hom 19 4 7 8 T 13 12 363458 CASAVA_Build 8 93248368 1D TATTCACTTC T/- TTTTTTTTTT 2794 het 2794 ref 23 9 9 5 T 12 11 363459 CASAVA_Build 8 93262722 1I TCATCATCAG -/A AAAAAATATA 3070 het 2617 hom 24 10 9 5 A 6 7 363460 CASAVA_Build 8 93273577 1I ATAACTTTTT -/A AAAAGTGAGA 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 4 5 363461 CASAVA_Build 8 93274093 1D CTAAAAATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 A 10 9 363462 CASAVA_Build 8 93275898 1D GAAAATCTCC T/- TTTTTATCAT 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 T 6 5 363463 CASAVA_Build 8 93278029 1D CTATTGGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2956 hom 49 20 9 20 T 17 16 363464 CASAVA_Build 8 93285814 2D CCAGGGTCTC TT/-- ATATTCAGGA 3070 het 3070 hom 24 9 11 5 T 2 0 363465 CASAVA_Build 8 93286790 1I AAGCATATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 11 12 363466 CASAVA_Build 8 93288671 4I GACAAAATAT ----/TTTA TTTAAGCACT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TTTA 1 2 363467 CASAVA_Build 8 93292984 4D GCTAATAAAT ATTA/---- ATTAATAATA 3070 het 3070 hom 33 15 16 3 ATTA 2 1 363468 CASAVA_Build 8 93323087 3D AGCCACACTA TGT/--- TCAGCTGGTC 3070 het 2480 hom 25 7 15 4 TGT 1 0 363469 CASAVA_Build 8 93331226 1D TGGGAGAGTC T/- TTTTTTTTTC 668 het 668 ref 34 21 3 10 T 10 9 363470 CASAVA_Build 8 93331275 1I GTGCTATCTA -/T TGAGAGTGGG 3070 het 3070 ref 48 23 21 4 T 1 2 363471 CASAVA_Build 8 93335101 1D TAAAGTATAA T/- TAAAAAAAAA 2275 het 32 hom 7 1 6 0 T 2 1 363472 CASAVA_Build 8 93337025 25D GAAAACAAAC ATAAACAAAAGCCCTATTGTATTTT/------------------------- ATCCAGACCC 3070 het 3070 ref 42 22 20 5 ATAAACAAAAGCCCTATTGTATTTT 1 0 363473 CASAVA_Build 8 93347316 4D CAGTGATTCC GAGA/---- GAGACTTGGT 3070 het 3070 ref 30 15 14 2 GA 4 2 363474 CASAVA_Build 8 93355042 1I GAAAATCAAA -/G GGGGGAAGAA 3070 het 3070 hom 23 9 10 4 G 5 6 363475 CASAVA_Build 8 93358251 5D GCCAAAAGTT TACTA/----- TACAAAACAA 3070 het 3070 ref 41 26 12 5 TACTA 1 0 363476 CASAVA_Build 8 93359255 4I GTAAGAAAAT ----/AGAG AGTGAAGAGA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 AG 1 3 363477 CASAVA_Build 8 93365148 1D ATTCATTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 13 12 363478 CASAVA_Build 8 93375493 1I GATTCATTGA -/T TTTTTTGAAG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 6 7 363479 CASAVA_Build 8 93389763 1D TCTTTAGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 98 het 37 0 33 4 T 11 10 363480 CASAVA_Build 8 93397531 12I ACAAATGATA ------------/AGAAAGTGAGTC AGACTTATTG 3070 het 3070 hom 48 23 24 2 AGAAAGTGAGTC 0 1 363481 CASAVA_Build 8 93406399 1D TTATTGGGAG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 A 9 8 363482 CASAVA_Build 8 93424498 11D TGGTTCCTTT GTGCACTATGG/----------- GTGCACTATG 3070 hom 123 het 46 0 41 8 GTGCACTATGG 2 1 363483 CASAVA_Build 8 93428742 1D ATGTCAGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 24 1 22 1 T 12 11 363484 CASAVA_Build 8 93439793 2I GTATATATAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AT 8 9 363485 CASAVA_Build 8 93443873 1I AATTCAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1717 hom 18 5 8 5 T 11 12 363486 CASAVA_Build 8 93521544 1D AAGGAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 9 het 29 1 12 17 A 12 11 363487 CASAVA_Build 8 93529597 1D GAAAGTGTTA T/- TTTTTTTTTT 2233 het 2233 ref 28 15 6 7 T 15 14 363488 CASAVA_Build 8 93529793 1D TAAAGAGAAG T/- TTTTTTTTTT 2891 het 2891 ref 30 9 12 9 T 12 11 363489 CASAVA_Build 8 93533572 1D CTTGATTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 A 12 11 363490 CASAVA_Build 8 93540704 1I ATCTGAACAT -/A ATTGCCCTTT 3070 het 3070 hom 58 25 29 4 A 1 2 363491 CASAVA_Build 8 93541749 1D ACCATATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 11 12 A 12 11 363492 CASAVA_Build 8 93553500 21I TTGACCAAAA ---------------------/TTTACATGACATTAATTTTGT TTGTGTGTTT 3070 het 3070 ref 54 25 22 9 TTTACATGACATTAATTTTGT 0 1 363493 CASAVA_Build 8 93560457 1D TAGCATGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2621 hom 28 6 16 6 A 13 12 363494 CASAVA_Build 8 93561668 1D TTTCCATTCA T/- TTTTTTTTCC 2756 het 2756 ref 32 16 7 9 T 9 8 363495 CASAVA_Build 8 93586156 2D AATAAAAAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1329 hom 29 5 19 5 A 12 10 363496 CASAVA_Build 8 93587139 1D GTTTTATTAA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 T 6 5 363497 CASAVA_Build 8 93592851 3D ATAAAGCAAC AAG/--- AAGGAGGGTA 3070 het 3070 ref 55 29 23 5 AAG 2 1 363498 CASAVA_Build 8 93593474 1D CACTTCTAGT A/- TATTTTTAGT 3070 het 3070 hom 51 21 21 10 A 1 0 363499 CASAVA_Build 8 93595849 2D CCATTGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 1329 het 1329 ref 62 40 3 19 TG 9 8 363500 CASAVA_Build 8 93601378 1I CCAACACTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 23 13 4 A 9 10 363501 CASAVA_Build 8 93601745 1D TAAAGGATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1781 hom 35 9 10 17 A 17 16 363502 CASAVA_Build 8 93626372 2I ATATTTCAGA --/AT ATGTTACTCG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 1 2 363503 CASAVA_Build 8 93721009 1I TAAGTGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 38 1 35 2 T 10 11 363504 CASAVA_Build 8 93729388 1D TCTCAGCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 12 10 T 12 11 363505 CASAVA_Build 8 93731849 1D ACTATGCAGT C/- AAGACTTCTC 3070 het 3070 ref 51 26 23 2 C 1 0 363506 CASAVA_Build 8 93778209 1D ACATGATTCT A/- TGTGTTAAAT 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 A 1 0 363507 CASAVA_Build 8 93854357 1D ATTCTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 11 10 363508 CASAVA_Build 8 93867024 8I CCTATGCACG --------/CGCACGCA CGCGCACACA 1168 het 1168 ref 34 15 6 13 CGCA 0 2 363509 CASAVA_Build 8 93869127 2D TACTATTATG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 8 AT 7 6 363510 CASAVA_Build 8 93871322 1D GGTCCAGTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 10 10 T 17 16 363511 CASAVA_Build 8 93897886 1I GAAATAAACC -/T TTCTTGTAAT 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 T 2 3 363512 CASAVA_Build 8 93903974 1D CTTACCATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 12 9 T 11 10 363513 CASAVA_Build 8 93919413 4D CATGTCTGAC AAAG/---- AAAGACAGGA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AAAG 2 1 363514 CASAVA_Build 8 93944447 1D TCGATACTTA T/- TTTTACAGCA 3070 hom 105 het 41 0 34 7 T 5 4 363515 CASAVA_Build 8 93944520 16D TTAAATCTAG GGGTAATGCCATGGAC/---------------- ACTCCGTTAG 3070 het 3070 ref 34 25 10 6 GGGTAATGCCATGGAC 1 0 363516 CASAVA_Build 8 93968279 13D CTTTTTGTTT ACCATTTTTTGCC/------------- GTTAAGAAAC 3070 het 3070 ref 31 16 16 3 ACCATTTTTTGCC 1 0 363517 CASAVA_Build 8 94018704 2I ACCTATACCA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 50 18 21 11 AC 7 8 363518 CASAVA_Build 8 94018988 1D ATCTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2451 hom 33 7 17 10 T 12 11 363519 CASAVA_Build 8 94021739 1D TAGATTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 21 hom 30 1 17 12 A 17 16 363520 CASAVA_Build 8 94031759 1D TATTTACATA C/- TTAGTGCATG 3070 het 3070 ref 55 28 22 5 C 1 0 363521 CASAVA_Build 8 94045869 2I TATATATATC --/TA TATATATATA 3070 het 244 hom 14 2 9 3 TA 8 9 363522 CASAVA_Build 8 94051192 1I AAAAAATTAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 1878 hom 15 5 7 3 T 8 9 363523 CASAVA_Build 8 94055225 3D TGTTCTTTAC AGA/--- AGGAGGAGTT 3070 het 3070 ref 50 26 22 3 AGA 1 0 363524 CASAVA_Build 8 94076332 1I TCCTTCTCTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 9 10 363525 CASAVA_Build 8 94082835 1D GAAAATGAAG C/- TGTTGAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 C 1 0 363526 CASAVA_Build 8 94084943 1D TGTCATTCCT C/- CCCCGGTCCC 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 C 5 4 363527 CASAVA_Build 8 94086898 4D TCATAAGGGT GCAA/---- GCATGGTTCA 3070 het 3070 hom 35 12 19 6 GCAA 1 0 363528 CASAVA_Build 8 94088533 2I CCCCTGTGGT --/AC AGAGATCCCA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 AC 0 1 363529 CASAVA_Build 8 94099685 1I TTCTCACCAC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 A 8 9 363530 CASAVA_Build 8 94100446 1I ACACAAACAC -/A AAAAAAGGGA 3070 het 3070 ref 59 32 20 7 A 6 7 363531 CASAVA_Build 8 94105951 10I57M1D AGGGAAACTT ----------TGATTCTGAAGAACTGTTAACAATTCTAACCTGGCAGACAATAAATCCACTTCTGCCT/TGATTCTGAATGATTCTGAAGAACTGTTAACAATTCTAACCTGGCAGACAATAAATCCACTTCTGCC- TTTAATCAAT 3070 hom 49 het 32 0 15 34 N/A 0 0 363532 CASAVA_Build 8 94106797 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2760 hom 33 11 11 12 A 15 14 363533 CASAVA_Build 8 94112331 1I CTTGGCATAA -/T TTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 25 10 14 1 T 6 7 363534 CASAVA_Build 8 94118740 1D TAAATCCCCA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 120 het 43 0 41 3 T 8 7 363535 CASAVA_Build 8 94119513 2I CTGAGCTGAG --/CT CTGTCAGCTG 3070 het 3070 ref 59 27 23 9 CT 1 2 363536 CASAVA_Build 8 94124544 1I AATGTGGATA -/T TTTTTTATCT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 T 6 7 363537 CASAVA_Build 8 94133148 1D CCTCAAGAAT C/- TTTTACACAT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 C 1 0 363538 CASAVA_Build 8 94133432 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 10 11 363539 CASAVA_Build 8 94140516 1I GTGATTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 T 10 11 363540 CASAVA_Build 8 94141027 1I AAGATTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2325 hom 32 9 19 4 T 9 10 363541 CASAVA_Build 8 94147026 7I GTAATGCAAA -------/GAATGGT GACTACAGTT 3070 het 3070 ref 47 25 19 3 GAATGGT 0 1 363542 CASAVA_Build 8 94153909 1D ATGAACCAAA C/- CCCCTGGTCA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 5 4 363543 CASAVA_Build 8 94161192 1I CCCGCTTCTC -/A AATTGTTAAA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 A 2 3 363544 CASAVA_Build 8 94162999 6D CCATTGTTCA ATGAAT/------ ATTCGTTTAA 3070 het 3070 ref 38 23 14 5 ATGAAT 1 0 363545 CASAVA_Build 8 94173938 1D TAAACATACC A/- AAAAAAAAAA 1483 het 352 hom 8 1 6 1 A 15 14 363546 CASAVA_Build 8 94180808 1I TTAGATATTA -/T TATTATATCT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 1 2 363547 CASAVA_Build 8 94186570 1I GTTCCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 13 10 A 11 12 363548 CASAVA_Build 8 94203749 17D4M11D TTGTGTCACA TTGTGTTAATTGTATTGTGTCACTGTGTTCCA/-----------------TGTC----------- CAGTGTGGAA 3070 hom 108 het 37 0 37 8 N/A 0 0 363549 CASAVA_Build 8 94207317 1I GCTGGAGGCC -/T TTGTACCAGC 3070 hom 78 het 30 0 24 6 T 2 3 363550 CASAVA_Build 8 94207560 1D ATACAATGAG T/- GGCCTAATTA 3070 hom 135 het 48 0 45 4 T 1 0 363551 CASAVA_Build 8 94214718 8I ATGTAAGTAT --------/GTGTGTAC GTGTGTATGC 3070 hom 152 het 60 0 51 9 GTGTGTAC 0 1 363552 CASAVA_Build 8 94245569 4D AAGTACTGTT GAAA/---- GAATTATTAC 3070 hom 129 het 49 0 44 5 GAAA 1 0 363553 CASAVA_Build 8 94254724 1I CGAGATCTGG -/T TGTTTAAAAG 3070 hom 160 het 58 0 53 5 T 1 2 363554 CASAVA_Build 8 94260916 1D GAGCAGGCCA C/- AGTAGGTGAG 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 1 0 363555 CASAVA_Build 8 94261612 1I CTGTTCAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2689 hom 34 10 16 8 T 13 14 363556 CASAVA_Build 8 94265160 1I TAATTTCACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 999 hom 33 3 21 9 A 14 15 363557 CASAVA_Build 8 94278291 1D ATGTATGGTT A/- TTTTTTTAAT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 1 0 363558 CASAVA_Build 8 94306885 1D CTAAAATTAC A/- AAAAAAAATT 3070 hom 34 het 13 0 11 2 A 9 8 363559 CASAVA_Build 8 94309414 1I TGTCCTCTTC -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 87 het 38 0 30 8 A 8 9 363560 CASAVA_Build 8 94312430 1D ATCATTTGAA C/- CCAAGAAGCC 3070 het 3070 ref 17 9 8 0 C 3 2 363561 CASAVA_Build 8 94312650 11D ATGGATGCAT GATCAACAGAG/----------- GGTCAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 22 21 7 GATCAACAGAG 1 0 363562 CASAVA_Build 8 94319095 1I CTACAATGAA -/T TTTTATTGTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 T 4 5 363563 CASAVA_Build 8 94322328 1D GGAACACGGT G/- GGTGCCCAGA 3070 hom 84 het 29 0 26 3 G 3 2 363564 CASAVA_Build 8 94339253 1D ACTGAAATGT A/- AAAAAAAAAA 1640 het 1640 ref 23 14 4 6 A 17 16 363565 CASAVA_Build 8 94348485 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3041 het 3012 hom 21 10 8 3 A 12 11 363566 CASAVA_Build 8 94356600 1D TTCATTTTAG T/- TTTGAGTGGA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 4 3 363567 CASAVA_Build 8 94363169 2I CCATTATGGT --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 9 11 363568 CASAVA_Build 8 94368831 2D TGCGACACAC AT/-- GTCAGCACAC 3070 het 3070 ref 37 21 10 8 AT 1 0 363569 CASAVA_Build 8 94372124 1D TGCAACCTCT A/- GCCTCCTGGG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 1 0 363570 CASAVA_Build 8 94380119 2D GTCACTCCCG TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 22 0 15 8 TA 9 8 363571 CASAVA_Build 8 94381005 1D AGTCAGATCA C/- GTCTGGTGTA 3070 het 3070 ref 51 26 21 4 C 1 0 363572 CASAVA_Build 8 94386892 1D TGAGTACTTT C/- TCACATAGAA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 C 1 0 363573 CASAVA_Build 8 94387346 1I CAACTTGCAT -/G GAAGAGCAAA 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 G 1 2 363574 CASAVA_Build 8 94402769 1D CATGAATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 11 10 363575 CASAVA_Build 8 94403645 1D AGGCTTCCGG T/- TCCTCTCTAA 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 2 1 363576 CASAVA_Build 8 94405373 4D ATTGTGTGTG TATA/---- TATATATATA 3070 het 2198 hom 38 9 15 15 TA 9 7 363577 CASAVA_Build 8 94410501 1I CATGATGAAA -/T TTCAGTAAAC 3070 hom 138 het 52 0 46 6 T 2 3 363578 CASAVA_Build 8 94426236 1I AACTCCATCC -/A AAAAAAAAAA 1406 het 1406 ref 26 7 11 8 A 14 15 363579 CASAVA_Build 8 94441447 1D AGTAATAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 21 14 4 A 11 10 363580 CASAVA_Build 8 94445825 1D TGTTTTTTTT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 A 9 8 363581 CASAVA_Build 8 94456380 1I AGGCTTGAGG -/A AATAGGTAGC 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 A 2 3 363582 CASAVA_Build 8 94465001 1D GGAAGAAAAT C/- TTCTTACATT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 C 1 0 363583 CASAVA_Build 8 94471177 28I AAGGAAAACT ----------------------------/GTGCCAGATCCTGCCAACATAAGAAATG GTCCCAGATC 3070 hom 93 het 31 0 31 4 GTGCCAGATCCTGCCAACATAAGAAATG 0 1 363584 CASAVA_Build 8 94471634 1I TTAATAGACT -/A TTTACTGATA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 0 1 363585 CASAVA_Build 8 94481639 2D AGAATGTGGT GA/-- GAGGACATCA 3070 het 3070 hom 51 22 22 8 GA 2 1 363586 CASAVA_Build 8 94481880 1I TGATATATAT -/A TTTTTTTGCT 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 A 0 1 363587 CASAVA_Build 8 94483479 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3052 hom 33 10 18 5 T 13 12 363588 CASAVA_Build 8 94493801 1D ATCAGATAGA T/- TTGGGCTTGA 1801 het 1801 ref 39 34 4 1 T 3 2 363589 CASAVA_Build 8 94504732 1I TTTTCATTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 9 10 363590 CASAVA_Build 8 94521860 1D CACAAATCCT A/- AAAAAAAAAA 1840 het 1840 ref 29 17 4 9 A 13 12 363591 CASAVA_Build 8 94538488 1I AACAATAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 A 11 12 363592 CASAVA_Build 8 94629981 1D GAAGAAAATC T/- TAGACATTAC 2721 het 2721 ref 24 17 6 1 T 2 1 363593 CASAVA_Build 8 94631589 1D AAATCAGGGA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 43 21 14 9 T 7 6 363594 CASAVA_Build 8 94641813 6D AAAATTCGTC TAGAAA/------ TAAAGTTACT 3070 het 3070 hom 36 17 16 4 TAGAAA 1 0 363595 CASAVA_Build 8 94648551 2I CTCCTTTCTC --/AA AAAGTTTTGC 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 A 3 5 363596 CASAVA_Build 8 94654777 4D TCCAAAAGGC CAGA/---- CAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 CAGA 1 0 363597 CASAVA_Build 8 94666280 1D AGGAGGGAGA G/- GGGTAGAAAA 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 G 4 3 363598 CASAVA_Build 8 94677275 1D38M2D TTCACACCCC TGAACCTCCACCCATACTGTTCCCTCTGCCTAGAGTACCCT/-GAACCTCCACCCATACTGTTCCCTCTGCCTAGAGTACC-- CTTCCAATCC 3070 het 3070 ref 56 33 27 11 N/A 0 0 363599 CASAVA_Build 8 94681598 4D CCGATAATAT TAAA/---- TAAATACATT 3070 het 3070 hom 39 11 24 5 TAAA 2 1 363600 CASAVA_Build 8 94702596 6I65M1I TTGTACTCTC ------TCAATAAAATCTTTGGCTATTTCTCTAAATAAAAACACAAACATACACTCTTTTTAAAAAGATGG-/TGTTTTTCAATAAAATCTTTGGCTATTTCTCTAAATAAAAACACAAACATACACTCTTTTTAAAAAGATGGA AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 45 31 22 13 N/A 0 0 363601 CASAVA_Build 8 94713551 1D GTTTCTCGTT A/- AAAAAAAAAA 1209 het 1209 ref 43 34 3 6 A 11 10 363602 CASAVA_Build 8 94715906 1D CTTTATTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 A 10 9 363603 CASAVA_Build 8 94718502 1I CTTTTTTTTT -/G TTAAAGCAAG 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 G 0 1 363604 CASAVA_Build 8 94728474 1D AGCTCTTTGA G/- TCGTCCATGT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 G 1 0 363605 CASAVA_Build 8 94741352 2I TCTACTTTAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 AT 7 8 363606 CASAVA_Build 8 94758019 1D AATATATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 12 11 363607 CASAVA_Build 8 94759295 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 33 0 21 12 A 15 14 363608 CASAVA_Build 8 94768331 4D TGAGTAGAAC ATAG/---- ATAGTCTGCC 3070 hom 81 het 28 0 28 2 ATAG 2 1 363609 CASAVA_Build 8 94770130 31D ATGCCAACAC TTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCAGGAGT/------------------------------- TTTGAGACCA 1716 het 1716 ref 11 11 4 3 TTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCAGGAGT 1 0 363610 CASAVA_Build 8 94772898 5I GTGTGTAACA -----/TATAT TATATATAAC 3070 het 3070 hom 14 7 7 0 TATAT 1 2 363611 CASAVA_Build 8 94780803 2I TGAAGCAGAT --/AA AAAGTCTGAA 3045 het 3045 ref 34 18 9 7 A 3 5 363612 CASAVA_Build 8 94789009 1I CTGTTAGAGA -/T TTTTTTCATA 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 T 6 7 363613 CASAVA_Build 8 94803228 1D TCCTATAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 34 1 29 4 A 11 10 363614 CASAVA_Build 8 94809497 1D TGACATGGAC A/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 27 10 17 0 A 1 0 363615 CASAVA_Build 8 94812119 2I GACATATCAC --/TA TAAAGGCAGA 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 TA 1 2 363616 CASAVA_Build 8 94831176 1D GTGTGCCGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 8 14 T 15 14 363617 CASAVA_Build 8 94834111 1D AAATGTCGTG T/- TACCTTTTAG 3070 het 3070 hom 51 20 23 8 T 2 1 363618 CASAVA_Build 8 94840707 1I CTCTACAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 11 12 363619 CASAVA_Build 8 94842082 1I CTGTGTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 10 11 363620 CASAVA_Build 8 94844501 1D TAATTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 23 0 16 7 T 13 12 363621 CASAVA_Build 8 94849684 4D ATACATACAT ACAC/---- ACACACATCT 3070 het 3070 hom 30 13 16 2 AC 5 3 363622 CASAVA_Build 8 94855430 1I TTAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 1349 het 1349 ref 24 18 4 2 T 13 14 363623 CASAVA_Build 8 94892730 7D GAGAAAGAGG CAAAGAC/------- ATTCATGCAG 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 CAAAGAC 1 0 363624 CASAVA_Build 8 94897234 15I TCAGCACCAA ---------------/AGGGAAGCCCCCTTT AGCTTGCAGC 3070 hom 123 het 41 0 40 2 AGGGAAGCCCCCTTT 0 1 363625 CASAVA_Build 8 94924966 1I ATGGGAAGCC -/T TAAAGCAGGA 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 1 2 363626 CASAVA_Build 8 94926005 2D GATTGGATAT AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 138 het 50 0 47 4 AG 7 6 363627 CASAVA_Build 8 94944445 3D GCAAAACAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 63 het 31 0 22 12 AAC 7 6 363628 CASAVA_Build 8 94958109 1D ATACCTCTGG C/- ACTAGGGTAA 3070 hom 111 het 38 0 36 2 C 1 0 363629 CASAVA_Build 8 94963944 1D TATTGTAAAG A/- AAAAAACAGA 3070 hom 75 het 27 0 26 3 A 7 6 363630 CASAVA_Build 8 94964489 4I CACACCTTGT ----/CATG CATGGGAAGA 3070 het 3070 ref 40 18 16 6 CATG 1 2 363631 CASAVA_Build 8 94966197 1D TCCTTTTACA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 8 7 363632 CASAVA_Build 8 94967033 1I TTTTTTTTTT -/A AAAGAGATGG 3070 het 500 hom 30 5 17 8 A 3 4 363633 CASAVA_Build 8 94967665 1I GAAGTGAGTG -/T TATTTTGACC 3070 hom 108 het 44 0 36 8 T 1 2 363634 CASAVA_Build 8 94972515 1I33M1D AATAATTTCC -AAAAAAATGGCAATATATCAAGACCCAGATTTCA/AAAAAAAATGGCAATATATCAAGACCCAGATTTC- AAAAAGATAA 3070 hom 123 het 38 0 42 4 N/A 0 0 363635 CASAVA_Build 8 94977649 13I GCATGCCCGC -------------/AAGGCCTGTGCCA AAGGTCTGGA 3070 hom 90 het 35 0 27 8 AAGGCCTGTGCCA 0 1 363636 CASAVA_Build 8 94977842 4I CCTGTTTTGC ----/ATAT ATATATATAT 2628 het 2628 ref 21 7 7 7 AT 7 9 363637 CASAVA_Build 8 94985215 1D TGCAAGAAAT A/- AAAAAAAAAA 1590 het 64 hom 15 1 7 7 A 15 14 363638 CASAVA_Build 8 94990459 1D TTTGTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 10 14 10 T 12 11 363639 CASAVA_Build 8 94995708 1I TTGGACTCTG -/T TTTTTTTTTT 2651 het 2651 ref 27 12 7 8 T 10 11 363640 CASAVA_Build 8 94996428 1D TCAGTTAAGT G/- GGTCTCTATG 3070 het 3070 hom 57 22 27 9 G 3 2 363641 CASAVA_Build 8 95002500 1D TAATCATGAA G/- GGCACGGTAG 3070 het 2060 hom 35 9 17 10 G 3 2 363642 CASAVA_Build 8 95045237 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 T 8 9 363643 CASAVA_Build 8 95062102 11D TGACTTCAAG ACACTTTAGGA/----------- ACTCAAAGCC 3070 het 3070 ref 35 25 9 4 ACACTTTAGGA 1 0 363644 CASAVA_Build 8 95063260 1D TCTTTGACTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 A 10 9 363645 CASAVA_Build 8 95172679 1I ATTACAGCGG -/A AAAAAATGCA 3070 hom 99 het 39 0 33 6 A 6 7 363646 CASAVA_Build 8 95181068 1I ACCTAGGAGA -/G GGGGGAGATG 3070 hom 81 het 29 0 26 3 G 5 6 363647 CASAVA_Build 8 95181645 1I ACAGGGCTAT -/C CCCTTTACAT 3070 hom 95 het 34 0 32 2 C 3 4 363648 CASAVA_Build 8 95183348 1I CTGATTCAGC -/A GCTCAGTGAT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 0 1 363649 CASAVA_Build 8 95186995 1D GCCTATTCAT C/- CCTCCCTCCC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 3 2 363650 CASAVA_Build 8 95187933 1I TTTACATTTT -/G TAATTCCTGT 3070 hom 84 het 34 0 28 6 G 0 1 363651 CASAVA_Build 8 95190145 1I ATTTTGAAAT -/G GTCAAGTTGA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 G 1 2 363652 CASAVA_Build 8 95192224 1D AGGGTTCTGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 10 9 363653 CASAVA_Build 8 95192819 2I AATGCTCACT --/TG TGCCCTCAAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TG 1 2 363654 CASAVA_Build 8 95207891 3I GTGATCATTT ---/GGA GGAGAAGAGG 3070 hom 66 het 26 0 22 4 GGA 1 2 363655 CASAVA_Build 8 95219106 1D TGCAAAAAGT A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 9 8 363656 CASAVA_Build 8 95221308 1D AAAAATAAAT A/- AAAAAAAAGG 2586 het 65 hom 20 1 7 12 A 9 8 363657 CASAVA_Build 8 95221710 1I AGCTCATACG -/T TGTAGTCCCA 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 1 2 363658 CASAVA_Build 8 95222383 1D CTTGTCCAGA T/- AATTGAAGAT 3070 het 3070 ref 50 31 17 2 T 1 0 363659 CASAVA_Build 8 95222676 1I CCAATTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 10 11 363660 CASAVA_Build 8 95223497 1D AATTCAATGT A/- AAAAAAGGAT 3070 het 3070 hom 45 18 19 9 A 7 6 363661 CASAVA_Build 8 95224147 4D CATTGTTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 46 21 18 10 AAAC 4 3 363662 CASAVA_Build 8 95249462 1D GACACGAGTT C/- CACAAGATAC 1514 het 1514 ref 16 10 4 2 C 2 1 363663 CASAVA_Build 8 95272558 1I ATATTCCTGA -/T TTTTAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 28 13 9 T 4 5 363664 CASAVA_Build 8 95272854 1D AAGAAAATGC T/- TTTTTTTTTT 1538 het 444 hom 23 6 6 11 T 19 18 363665 CASAVA_Build 8 95273002 1D ATTACAGGCA C/- CCCCCCACCA 3070 het 1739 hom 18 4 9 5 C 7 6 363666 CASAVA_Build 8 95280866 1I CTTGAACTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 11 15 12 T 13 14 363667 CASAVA_Build 8 95286675 1I GTGGCTTGAC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 T 8 9 363668 CASAVA_Build 8 95287100 1I TCATGAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 10 8 9 T 11 12 363669 CASAVA_Build 8 95290127 1D GACTTTGTAT C/- AAAAGAAGTT 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 C 1 0 363670 CASAVA_Build 8 95291326 1D AATTTATGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 11 10 363671 CASAVA_Build 8 95294030 1I AATGCTGTTT -/A AAAAATCTTA 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 A 5 6 363672 CASAVA_Build 8 95294989 1D ATGACCATCA T/- TCTTATTGGT 3070 het 3070 ref 58 28 26 4 T 2 1 363673 CASAVA_Build 8 95296219 4I ATCAAAAAAT ----/AGAC AAAGGATCTG 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 AGAC 0 1 363674 CASAVA_Build 8 95299964 3I GCTCTGGGGC ---/TCT TCTTCAGCCT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 TCT 1 2 363675 CASAVA_Build 8 95300987 1I AGTTACTTTG -/C TGACCTCTAG 3070 het 3070 ref 48 27 15 6 C 0 1 363676 CASAVA_Build 8 95304494 2D TTAGTTTTTA AG/-- AAGAGTTCTT 3070 het 3070 hom 35 17 16 2 AG 1 0 363677 CASAVA_Build 8 95325004 1I TGTCTCAAAA -/T AAAAAAAATT 3070 het 2722 hom 34 10 15 9 T 0 1 363678 CASAVA_Build 8 95332853 1I AATTGTACCA -/G GGATCAAATC 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 G 2 3 363679 CASAVA_Build 8 95347418 4D TGTTTCTTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 TTTC 4 3 363680 CASAVA_Build 8 95355242 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTTTTTG 3070 het 838 hom 33 12 17 4 G 0 1 363681 CASAVA_Build 8 95393216 1I TTCCTTGCCC -/T AACATTTCCT 3070 hom 90 het 41 0 27 14 T 0 1 363682 CASAVA_Build 8 95393954 2D TTGAGAATCC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 71 het 29 0 24 6 T 11 9 363683 CASAVA_Build 8 95395234 2D GAGGAGTTTC AT/-- AGTTTGAAGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AT 1 0 363684 CASAVA_Build 8 95411668 2I GAATTCCACA --/CT GAGACCAAAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CT 0 1 363685 CASAVA_Build 8 95412070 2D TGTTTTTTTG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 205 hom 23 4 12 7 GT 1 0 363686 CASAVA_Build 8 95414984 20D ATCATAATAT TAATAATTATAATATATTAA/-------------------- TAATAGCTAC 3070 hom 81 het 28 0 28 3 TAATAATTATAATATATTAA 1 0 363687 CASAVA_Build 8 95420308 1D AGCAGTGCAG A/- AAAAAAAAAG 1132 het 1132 ref 34 26 3 6 A 10 9 363688 CASAVA_Build 8 95428153 1I AAAATAAAGC -/A AAAAAAAAAA 2295 het 936 hom 26 3 11 12 A 15 16 363689 CASAVA_Build 8 95432953 2I TAAAAACACG --/CA CACACACACA 3070 hom 85 het 35 0 29 6 CA 5 6 363690 CASAVA_Build 8 95434219 1D GTGGGCCAGG A/- AAAATGGACT 3070 hom 66 het 26 0 21 5 A 5 4 363691 CASAVA_Build 8 95442532 3I TGACAGATTA ---/AAT AATAATCATA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 AAT 2 3 363692 CASAVA_Build 8 95443989 2D TCATATTGTT TC/-- TGTTTCTCTG 3070 hom 81 het 36 0 28 9 TC 1 0 363693 CASAVA_Build 8 95444482 1D AAAAAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 808 hom 28 2 21 5 A 12 11 363694 CASAVA_Build 8 95447544 1I CAAAAAATAA -/T TTTTTAATAA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 5 6 363695 CASAVA_Build 8 95450055 3I TTACATTATT ---/ATG ATATGTTAGG 3070 hom 151 het 60 0 51 9 ATG 0 1 363696 CASAVA_Build 8 95454814 1D GAGTCTGGCC T/- TATGGAATGC 3070 hom 93 het 37 0 32 6 T 2 1 363697 CASAVA_Build 8 95459225 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1722 hom 10 het 4 0 4 0 A 6 7 363698 CASAVA_Build 8 95465146 4D GGGGATTCCC AAGG/---- ATAAGATAGC 3070 hom 111 het 41 0 38 6 AAGG 1 0 363699 CASAVA_Build 8 95465925 24D TTTAATAGAT TTCAGTTTTGTTTGCAAAACTGAA/------------------------ ATAGTATTTC 3070 hom 96 het 31 0 32 3 TTCAGTTTTGTTTGCAAAACTGAA 1 0 363700 CASAVA_Build 8 95466754 4D CCCTTCAGAG AAAA/---- AAAAAAGTCC 3070 hom 106 het 38 0 35 4 A 10 6 363701 CASAVA_Build 8 95467649 1D GACTGACACT G/- TGGGATAAAT 3070 hom 69 het 24 0 24 3 G 1 0 363702 CASAVA_Build 8 95472068 2D GGGGATGGTA AT/-- ACTAGTACTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AT 1 0 363703 CASAVA_Build 8 95475812 1D AAACTCAGAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 363704 CASAVA_Build 8 95485082 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 781 het 781 ref 34 21 4 9 A 15 16 363705 CASAVA_Build 8 95489272 1I CATTTTGGTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 587 hom 43 2 38 3 A 8 9 363706 CASAVA_Build 8 95493775 2D GCCAATTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 49 het 42 1 37 4 T 14 12 363707 CASAVA_Build 8 95495242 3D TTTTTTTTTT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 31 1 24 6 TTC 1 0 363708 CASAVA_Build 8 95498885 1D GACTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 25 hom 41 2 31 8 A 15 14 363709 CASAVA_Build 8 95502089 1D ACACATACAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 9 8 363710 CASAVA_Build 8 95509336 1D ATGACTCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 11 10 363711 CASAVA_Build 8 95521606 1I AGGCAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 80 hom 35 1 23 11 A 13 14 363712 CASAVA_Build 8 95526181 4I TTCTTAGAGC ----/ACTA ACTAAGAAGA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 ACTA 1 2 363713 CASAVA_Build 8 95528381 1I GATAAGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 440 hom 38 2 26 10 A 13 14 363714 CASAVA_Build 8 95533936 1I4M2I GATAGAGTCT -GCAC--/CGCTCTG TCACCCAGGC 3070 hom 66 het 23 0 22 3 N/A 0 0 363715 CASAVA_Build 8 95535995 15D ACACATCTTT TGTGTTTAACAAGCC/--------------- TTTTATCCAA 3070 hom 87 het 29 0 30 3 TGTGTTTAACAAGCC 1 0 363716 CASAVA_Build 8 95546521 1I ACTCTATCAA -/T ACCTAAATAA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 0 1 363717 CASAVA_Build 8 95551999 2D AACTTCGTCT AA/-- AAAAAAAAAA 865 hom 12 het 8 0 4 4 A 14 12 363718 CASAVA_Build 8 95552175 1D GAAAACAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 11 10 363719 CASAVA_Build 8 95552673 1D AATGGGTGGC G/- GGGGGGGGCA 3070 hom 69 het 24 0 24 0 G 9 8 363720 CASAVA_Build 8 95554455 5I TTTGTTGATA -----/CATTT CAAAGTAAAA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 CATTT 0 1 363721 CASAVA_Build 8 95558951 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 531 hom 24 2 20 2 A 10 11 363722 CASAVA_Build 8 95562393 1D CTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 9 8 363723 CASAVA_Build 8 95562974 1D TTGTAGAGAT G/- GGGGGGTCTC 3070 hom 59 het 23 0 20 3 G 7 6 363724 CASAVA_Build 8 95564050 1D CTGTCTCAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 389 hom 21 1 14 6 A 16 15 363725 CASAVA_Build 8 95572719 1I CTCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2839 hom 25 het 13 0 9 4 A 10 11 363726 CASAVA_Build 8 95586795 1D TTCTCCCAGC A/- AATAAAAACA 3070 hom 79 het 32 0 27 7 A 3 2 363727 CASAVA_Build 8 95586886 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 404 hom 42 1 35 6 T 9 10 363728 CASAVA_Build 8 95588542 1D AAAGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 118 hom 22 3 13 6 T 15 14 363729 CASAVA_Build 8 95592408 1I TTATTTAAAA -/T TGTTACCCCC 3070 hom 114 het 41 0 39 2 T 1 2 363730 CASAVA_Build 8 95595482 2D GGCTTATATA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 CT 6 5 363731 CASAVA_Build 8 95602447 1D TTTTTATCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 41 0 30 11 T 12 11 363732 CASAVA_Build 8 95609161 1I TTTTAAGACC -/A AAAAAAAACT 3070 het 1457 hom 33 4 24 5 A 8 9 363733 CASAVA_Build 8 95609755 1I GGGGAAAGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 9 10 363734 CASAVA_Build 8 95620473 1D ACTGGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2073 het 1724 hom 25 10 6 9 T 17 16 363735 CASAVA_Build 8 95630379 1D AGGCTGTCCT C/- CCAACTCCTG 3070 hom 82 het 32 0 25 7 C 3 2 363736 CASAVA_Build 8 95636558 1I TTCTTGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 27 1 18 8 T 11 12 363737 CASAVA_Build 8 95636877 1D ATTGATATCC T/- TTTTTTTTTT 1893 het 1893 ref 33 24 4 5 T 11 10 363738 CASAVA_Build 8 95638166 1D GGATAATTTA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 6 het 26 1 20 5 T 7 6 363739 CASAVA_Build 8 95638891 1D TGAATTTATA G/- ATTGCTTTTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 G 1 0 363740 CASAVA_Build 8 95647548 1D TAGATGAGGT A/- AGGCCGGGCA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 A 2 1 363741 CASAVA_Build 8 95651299 1D CAAAAAAAAA T/- AAATAAATAA 2996 hom 18 het 8 0 7 1 T 1 0 363742 CASAVA_Build 8 95656539 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 A 10 9 363743 CASAVA_Build 8 95660465 2I CCACCTGCAA --/AG AGAGAACAGA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 AG 2 3 363744 CASAVA_Build 8 95664061 1D CTAAAATCCC T/- TTTTTTTTTT 2409 het 116 hom 24 2 11 11 T 15 14 363745 CASAVA_Build 8 95668184 1D ACCTCTCAGG T/- TCAAGCAATT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 2 1 363746 CASAVA_Build 8 95673768 3D AAAAAATAAA TTT/--- AAAAAAAAAA 666 hom 15 het 7 0 6 1 T 3 0 363747 CASAVA_Build 8 95675430 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 19 0 16 3 T 12 10 363748 CASAVA_Build 8 95675594 1D TTAAGAGGTG T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 71 het 30 0 22 8 T 9 8 363749 CASAVA_Build 8 95679689 1D TTTTTTTTTT A/- AATTATTTGT 3070 hom 50 het 23 0 17 7 A 3 2 363750 CASAVA_Build 8 95680269 2D CTTACATAGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 99 het 40 0 34 8 GT 8 7 363751 CASAVA_Build 8 95682931 1I AACTTTTTTT -/C TTTTTTTTTG 3070 hom 45 het 21 0 16 5 C 0 1 363752 CASAVA_Build 8 95689673 1D AAAAAAATTT A/- AAAAAAACAA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 A 8 7 363753 CASAVA_Build 8 95690767 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2179 het 2179 ref 32 22 5 6 A 15 14 363754 CASAVA_Build 8 95696212 1D ATGAAAAGAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 4 het 17 1 13 3 T 8 7 363755 CASAVA_Build 8 95697073 2D TTCTGGAGAC AG/-- AGTCTCACTC 2759 hom 24 het 16 0 9 8 AG 2 1 363756 CASAVA_Build 8 95697760 1D GGTGGTTCCA G/- GGGAGGAAGG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 4 3 363757 CASAVA_Build 8 95698597 2D CTTCATGCTT TC/-- TCTCTCTCTC 1487 het 1487 ref 42 29 4 10 TC 9 8 363758 CASAVA_Build 8 95704018 3I TGGGAGGATC ---/ACT ACTGGGGCCC 3070 hom 45 het 16 0 16 0 ACT 1 2 363759 CASAVA_Build 8 95706593 1I TCAAGTGATT -/C CCCCCCACCT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 C 6 7 363760 CASAVA_Build 8 95713238 2D TGTATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 117 het 43 0 40 4 TA 6 5 363761 CASAVA_Build 8 95713937 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 16 0 11 5 A 17 16 363762 CASAVA_Build 8 95720146 5D ACACAAGGCA TAAAC/----- TAAACAGGAA 3070 hom 99 het 36 0 33 4 TAAAC 2 1 363763 CASAVA_Build 8 95725156 2I ATGCATGACA --/CT CTTCCCTTTT 3070 hom 129 het 47 0 43 4 CT 1 2 363764 CASAVA_Build 8 95726832 1D TTTTGTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 33 0 26 8 A 11 10 363765 CASAVA_Build 8 95727091 1D CAGGAATTTA C/- TATTCTAATC 3070 hom 111 het 41 0 38 4 C 1 0 363766 CASAVA_Build 8 95727464 1I AAATTTTAAA -/T TTTTTCCATT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 5 6 363767 CASAVA_Build 8 95727739 4I TTCCAGAAAA ----/AAAT GGTAATTCAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AAAT 0 1 363768 CASAVA_Build 8 95730845 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 CTC 0 1 363769 CASAVA_Build 8 95731668 1I GTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 399 hom 47 1 35 11 T 9 10 363770 CASAVA_Build 8 95734547 1I CATTATCAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 763 hom 55 3 47 5 A 9 10 363771 CASAVA_Build 8 95735207 2I TATGAAAGGG --/AT ATATATATAT 3070 het 1069 hom 31 4 19 8 AT 7 8 363772 CASAVA_Build 8 95735569 1I CTAAAAATAC -/A AAAATTATCT 3070 hom 52 het 19 0 18 1 A 4 5 363773 CASAVA_Build 8 95748622 1I ACTGTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2952 hom 23 8 11 4 A 10 11 363774 CASAVA_Build 8 95748840 2I TTTCTTAATT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 12 14 363775 CASAVA_Build 8 95754331 1I AAATACTGAA -/T TTTTTTTCCC 3070 hom 99 het 43 0 34 9 T 7 8 363776 CASAVA_Build 8 95756582 1D GTCTACGAAG T/- TCTAGTTAGT 3070 hom 123 het 45 0 42 4 T 2 1 363777 CASAVA_Build 8 95765547 1I CACTGCGCAC -/G GCCTTGGGGT 3070 hom 51 het 22 0 17 5 G 1 2 363778 CASAVA_Build 8 95766427 1D GCCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 40 1 32 7 A 13 12 363779 CASAVA_Build 8 95767191 1D AGACAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 26 0 18 8 A 11 10 363780 CASAVA_Build 8 95769642 1D ATGGTGCACA T/- TGAATGTCCT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 2 1 363781 CASAVA_Build 8 95770724 2D TTAGATGATC TT/-- TTTTCTTTTA 3070 hom 72 het 26 0 25 3 T 6 4 363782 CASAVA_Build 8 95774431 1D AAATTAAGGC T/- TTTTCCATGC 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 5 4 363783 CASAVA_Build 8 95806413 1I AATGTACAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 20 13 12 T 9 10 363784 CASAVA_Build 8 95821271 1I TGCCTCCCCT -/C CCCCAACAGT 3070 het 3070 ref 35 21 9 5 C 4 5 363785 CASAVA_Build 8 95860901 1D TAATTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 16 1 11 4 T 13 12 363786 CASAVA_Build 8 95864884 1D TCTTCAGCAC A/- AGTGTCTGCT 3070 hom 120 het 44 0 38 7 A 2 1 363787 CASAVA_Build 8 95870041 4D CCTAAGACTG ACGC/---- ACGCGCGCGC 2919 het 2244 hom 27 11 11 5 ACGC 2 1 363788 CASAVA_Build 8 95885212 2I ATAAAGTATG --/TA TATATATATA 3070 het 225 hom 18 1 12 5 TA 5 6 363789 CASAVA_Build 8 95888674 1D GTCATTGGAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 26 16 7 3 T 9 8 363790 CASAVA_Build 8 95889078 1D TAGTTGGCTC A/- AATTTTTTAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 A 3 2 363791 CASAVA_Build 8 95893065 1I CTGGGATTAT -/A AGGCATGAGC 3070 het 3070 hom 41 16 22 3 A 1 2 363792 CASAVA_Build 8 95895201 1I CGATTTCAAG -/T TTTTTTGTTT 2430 het 2430 ref 17 10 5 2 T 6 7 363793 CASAVA_Build 8 95903703 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2410 het 2410 ref 27 9 10 8 T 11 12 363794 CASAVA_Build 8 95905406 1D TATTTAAACA T/- TTTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 T 7 6 363795 CASAVA_Build 8 95906616 1I GCACTTTGGG -/A GGCCAAGGCT 3070 het 2304 hom 23 8 11 4 A 0 1 363796 CASAVA_Build 8 95907238 1I AGGAGAGGGG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 28 11 16 1 T 8 9 363797 CASAVA_Build 8 95909450 2D TTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 2609 het 171 hom 27 3 12 12 T 12 10 363798 CASAVA_Build 8 95920584 1D AGAAACAGAG C/- CCACCTGCTC 3070 het 3070 ref 30 17 10 4 C 3 2 363799 CASAVA_Build 8 95932205 1I TGAACAGCTT -/G GGCAGTATTG 3070 het 3070 ref 36 20 12 4 G 2 3 363800 CASAVA_Build 8 95935563 10I GAGGTTGGAG ----------/TGAGCTGAAA TTGCATCATT 3070 het 3070 hom 33 12 14 7 TGAGCTGAAA 0 1 363801 CASAVA_Build 8 95936798 2I ACTTATAGAA --/TC TCTCAACTTG 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 TC 2 3 363802 CASAVA_Build 8 95941177 2D GTTAAAGGAT AG/-- AGTTTTTGAT 3070 het 3070 hom 41 17 21 5 AG 2 1 363803 CASAVA_Build 8 95941687 1I TTTTACAGTT -/A AAAAAAAAAA 2705 het 2705 ref 31 15 9 7 A 10 11 363804 CASAVA_Build 8 95953639 2D AAACAGTGAA TT/-- TTTTTTTGTG 3070 het 2241 hom 20 8 11 1 T 9 7 363805 CASAVA_Build 8 95955652 1D ATTTTGTCCG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 36 0 28 10 T 11 10 363806 CASAVA_Build 8 95961031 1D AAAAAAAACC T/- TTTTTTTTTT 2771 het 186 hom 18 2 10 6 T 14 13 363807 CASAVA_Build 8 95965746 1D GGATCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 2540 het 644 hom 19 3 8 8 T 15 14 363808 CASAVA_Build 8 95967003 1D ATTGAGATAG A/- AATTAATTAC 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 A 3 2 363809 CASAVA_Build 8 95974722 1D AGCAGGGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 11 6 T 15 14 363810 CASAVA_Build 8 95989218 3I TCAACCTTTC ---/TTT TTTTAGTCCT 3070 het 3070 hom 53 20 27 6 T 4 7 363811 CASAVA_Build 8 95991218 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 1654 het 353 hom 9 1 6 2 AC 8 7 363812 CASAVA_Build 8 95996525 1D GCATCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2017 hom 24 8 11 5 T 12 11 363813 CASAVA_Build 8 96002380 1D CCTCTTCAAT A/- AGGCTAGAAC 3070 het 3070 ref 52 25 23 4 A 2 1 363814 CASAVA_Build 8 96005251 1I GCCCGACTAA -/T TTTTTTTTTT 1541 het 797 hom 10 4 4 2 T 13 14 363815 CASAVA_Build 8 96007307 1I TTTGGACAAA -/C AAAACTAAAC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 C 0 1 363816 CASAVA_Build 8 96007804 1I TTTACTTGAG -/A AAAAAAAAAC 2627 het 408 hom 28 2 15 11 A 9 10 363817 CASAVA_Build 8 96009647 1D GGAAATCTGG A/- AAAAAAGGCC 3070 hom 117 het 46 0 39 7 A 7 6 363818 CASAVA_Build 8 96012806 1D TGAATAACAC A/- ATCTTAAAAT 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 A 2 1 363819 CASAVA_Build 8 96013010 4I ACACACACAC ----/ATAT ACACATAAAA 3070 het 89 hom 18 2 12 4 AT 0 2 363820 CASAVA_Build 8 96015554 1D ACAGGCACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2578 hom 22 7 12 3 A 11 10 363821 CASAVA_Build 8 96021093 4D TGAGACACTG TGAC/---- TGGTCAACAA 3070 het 3070 hom 43 18 21 5 TGAC 1 0 363822 CASAVA_Build 8 96021850 6D ACAGAAATTC TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 106 hom 52 3 28 23 TG 12 9 363823 CASAVA_Build 8 96023333 1D CAAAGATAGG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 T 7 6 363824 CASAVA_Build 8 96027511 1D TTTTCTTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 11 10 363825 CASAVA_Build 8 96035215 1D TATTGGATTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 76 het 47 1 41 5 T 10 9 363826 CASAVA_Build 8 96035554 1I ACAACCTCCG -/C CCCCCCGGGT 1487 het 1487 ref 18 9 5 4 C 6 7 363827 CASAVA_Build 8 96036081 1D TAGAAGAGTC T/- TTGCTGTGCT 3070 hom 111 het 40 0 38 4 T 3 2 363828 CASAVA_Build 8 96040480 2D GCTGCGGGAA AG/-- AGGGGGTGAT 3070 hom 90 het 36 0 29 7 AG 2 1 363829 CASAVA_Build 8 96041839 4I CTGATGACTT ----/AGAC GTCTAAGTTC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 AGAC 0 1 363830 CASAVA_Build 8 96046664 1I TTAAAGGACC -/A GGGGCAGTAT 3070 hom 122 het 44 0 39 5 A 0 1 363831 CASAVA_Build 8 96058077 2D GACTTCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 19 1 17 1 A 13 11 363832 CASAVA_Build 8 96061618 2I GCATTTTTAT --/TA TATATATATA 2696 het 2664 hom 15 7 7 1 TA 7 8 363833 CASAVA_Build 8 96062121 1I TCCCGAAGTT -/C TGGGTTTGAA 3070 hom 75 het 28 0 24 4 C 0 1 363834 CASAVA_Build 8 96068914 1I CAGCCACAAC -/A AGAGCATTAC 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 1 2 363835 CASAVA_Build 8 96078457 2D AGTCAAGGAA AG/-- AGCTGATTTT 3070 het 3070 ref 48 21 16 11 AG 2 1 363836 CASAVA_Build 8 96090774 2I TGAAAATACC --/CT GTTTCAACTG 3070 hom 129 het 47 0 43 4 CT 0 1 363837 CASAVA_Build 8 96105394 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1913 hom 25 5 14 6 A 16 15 363838 CASAVA_Build 8 96110777 1D GATTCCCTCA T/- TTTTTAACAC 3070 het 3070 hom 43 18 21 4 T 6 5 363839 CASAVA_Build 8 96116983 1I TATGGAAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 351 hom 22 1 15 6 A 13 14 363840 CASAVA_Build 8 96122959 2D ACTTATAATG CT/-- CTTTGTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 20 3 CT 2 1 363841 CASAVA_Build 8 96126470 1I TATGTGGGTT -/C CCCGTCCCCA 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 C 3 4 363842 CASAVA_Build 8 96164666 2I TCCACTAAAC --/TG GGGCTCTGTC 3070 hom 111 het 45 0 38 7 TG 0 1 363843 CASAVA_Build 8 96171555 2I ATTATGTCTG --/GT TCTATTCGGT 3070 hom 67 het 24 0 20 4 GT 0 1 363844 CASAVA_Build 8 96173212 1D CCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1437 hom 23 5 12 7 T 13 12 363845 CASAVA_Build 8 96173349 2D AGCCCAACTC TG/-- TTTACCTCCA 3070 het 3070 ref 42 28 12 3 TG 1 0 363846 CASAVA_Build 8 96173471 1D ATATCAGGAC T/- TAGTGTTCCC 3070 het 3070 ref 41 20 17 6 T 2 1 363847 CASAVA_Build 8 96177070 1D ATCATTTCGC T/- TTTTTTTTTT 3069 het 3069 ref 28 12 9 7 T 13 12 363848 CASAVA_Build 8 96181665 1D GTCTGCATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 8 A 15 14 363849 CASAVA_Build 8 96183400 1D TAAAAAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 13 hom 28 1 22 5 T 13 12 363850 CASAVA_Build 8 96186769 1D TTTAGGCGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 775 hom 35 3 21 11 T 13 12 363851 CASAVA_Build 8 96196463 5D GAGACTGTTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 A 17 12 363852 CASAVA_Build 8 96228216 1I AAGACAACGT -/A AAAAAAAAAA 1680 het 1680 ref 31 24 4 3 A 11 12 363853 CASAVA_Build 8 96245833 1D AAATAATATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1555 hom 37 4 29 4 T 11 10 363854 CASAVA_Build 8 96254770 1D GGGTAAGGGC T/- TTTTTTTTTT 1090 het 1090 ref 32 25 4 3 T 12 11 363855 CASAVA_Build 8 96255322 7D ATGAAAATAA AGCAATC/------- AGCAATCAGA 3070 het 3070 hom 38 14 19 9 AGCAATC 2 1 363856 CASAVA_Build 8 96275690 1D CATCCTTTAA T/- TTTTTTTTTT 2256 het 2256 ref 47 29 7 12 T 15 14 363857 CASAVA_Build 8 96277774 1I CAGGTATGGG -/T TTTTTTCTGT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 T 6 7 363858 CASAVA_Build 8 96286855 1D GAAGGAAGAA T/- AGAAGTTTGC 3070 het 3070 hom 44 19 17 8 T 1 0 363859 CASAVA_Build 8 96289695 9I ATTGCAGTCA ---------/CTGCTGTGT CTGCTGGGCC 3070 hom 62 het 27 0 18 9 CTGCTGTGT 0 1 363860 CASAVA_Build 8 96290613 1D CTTCCTGGTG C/- CCCCCTGTCC 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 C 6 5 363861 CASAVA_Build 8 96294495 4D9M13D GCAAGGGCAC CTGACCATGGCCTTGGCTCCCGTGCA/----CCGTGCCCT------------- TGCACTGGGT 3070 het 3070 ref 32 19 15 8 N/A 0 0 363862 CASAVA_Build 8 96294975 8I TGCCCAGGCT --------/GGAGTGCA GTGGCACCAT 2710 het 2710 ref 27 16 7 4 GGAGTGCA 0 1 363863 CASAVA_Build 8 96296202 1I AAAGGAGAAG -/A CAAAACTATC 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 A 0 1 363864 CASAVA_Build 8 96307127 3D TTCCAAGTGA GCT/--- TTCAGCTGAA 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 GCT 1 0 363865 CASAVA_Build 8 96310517 8D CATATTTTAA GCAGAGAC/-------- GCAGAGACAC 3070 het 3070 ref 38 19 16 8 GCAGAGAC 2 1 363866 CASAVA_Build 8 96314142 1I TGGCGCTGGA -/G GGCACTTGGC 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 2 3 363867 CASAVA_Build 8 96377923 1D AGCCATTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 T 11 10 363868 CASAVA_Build 8 96378783 1D AGTATGGGGG A/- AACCACCCTC 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 A 3 2 363869 CASAVA_Build 8 96381505 1D TGTTGTTGGT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 86 het 34 0 28 6 G 9 8 363870 CASAVA_Build 8 96381601 3I TCGTTACTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 47 14 20 13 TTG 3 4 363871 CASAVA_Build 8 96421477 1D AAGCTCTCTT A/- ACGTGGAATA 3070 het 3070 hom 43 16 22 6 A 2 1 363872 CASAVA_Build 8 96428089 11I AAGAACTGGG -----------/AGACGCCCCTC AGGTCTCCGC 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 AGACGCCCCTC 0 1 363873 CASAVA_Build 8 96428200 1I TTTTCTTATC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 6 7 363874 CASAVA_Build 8 96430471 1I ACAATGCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 10 11 363875 CASAVA_Build 8 96442099 1I GGCATGGTCT -/A AAGCAGCTGT 3070 het 3070 ref 30 13 10 7 A 2 3 363876 CASAVA_Build 8 96468510 8D TAGAAAAATA ATATGGCC/-------- ATATGGCCAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 5 ATATGGCC 2 1 363877 CASAVA_Build 8 96474854 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTAGA 3070 hom 137 het 48 0 45 3 T 7 8 363878 CASAVA_Build 8 96475085 1D TGGGATTGAT G/- GGAGGAACTG 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 G 3 2 363879 CASAVA_Build 8 96475956 1D ATCAGGAATA G/- TGTCCTCTGG 3070 het 3070 ref 48 28 18 2 G 1 0 363880 CASAVA_Build 8 96513615 1I AAAATAAGCA -/C CCCTTTTGTG 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 C 3 4 363881 CASAVA_Build 8 96520638 9I CTTACCACAA ---------/ATCTCTAAG ATTTGAGTTT 3070 hom 123 het 48 0 40 8 ATCTCTAAG 0 1 363882 CASAVA_Build 8 96524288 2D AAAGTTGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 8 A 12 10 363883 CASAVA_Build 8 96529558 2D GTCTTGATGA CC/-- CCTCCCTGTC 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 C 4 2 363884 CASAVA_Build 8 96530509 1I GGTGAACCTT -/C TGAATTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 C 0 1 363885 CASAVA_Build 8 96551924 2I TGCCTGACTC --/TT GTCTTAACCA 3070 het 3070 hom 52 18 29 5 T 0 2 363886 CASAVA_Build 8 96555565 3I CCACCACTCT ---/TGG TGGCCACATC 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 TGG 1 2 363887 CASAVA_Build 8 96556691 2D AAAAAAAAAA TC/-- TCTGAATCTC 3070 het 3070 hom 35 17 13 5 TC 2 1 363888 CASAVA_Build 8 96557205 1I CAAATGGTCA -/T TTCACCAGAA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 2 3 363889 CASAVA_Build 8 96560223 2I AATCTATAAT --/GA GAGTCAGCAG 3070 hom 102 het 39 0 35 4 GA 1 2 363890 CASAVA_Build 8 96567082 3I TTGGTAGAAA ---/TTT TGAGATAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 1 4 363891 CASAVA_Build 8 96568139 2I AAAAAAATAC --/CT ACAATCAAAG 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 CT 0 1 363892 CASAVA_Build 8 96572113 5D GTCAATTTTA AAAAT/----- AAAATAAAAC 3070 het 3070 hom 32 10 16 7 AAAAT 2 1 363893 CASAVA_Build 8 96576280 3I TATTAATAAC ---/AAG AATATATTGT 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 AAG 0 1 363894 CASAVA_Build 8 96593133 1D TAAATTTTTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 9 8 363895 CASAVA_Build 8 96597177 1I CAACAGAAAT -/A AAAAAAAATT 2678 het 2678 ref 19 9 8 2 A 8 9 363896 CASAVA_Build 8 96599582 1I TGCTGCTTGC -/T TGTGTATCAG 3070 het 3070 ref 68 33 29 6 T 1 2 363897 CASAVA_Build 8 96611676 1D TCAAAAACAG C/- CTTGAATCAT 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 C 2 1 363898 CASAVA_Build 8 96612639 2D CTTTGATTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 T 14 12 363899 CASAVA_Build 8 96616639 3I TATAGAGAAA ---/CAT CATATTGCTT 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 CAT 1 2 363900 CASAVA_Build 8 96630150 1D GGATAGGACT A/- TCCTGTTGGC 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 1 0 363901 CASAVA_Build 8 96643989 1D TACTTTTTTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 9 8 363902 CASAVA_Build 8 96645923 3D CGAACATTTA AAG/--- AAGAACTAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AAG 2 1 363903 CASAVA_Build 8 96649652 4D8M1D AAAAGAAGAC AAATAAATAGCCA/----AAATAGCC- ACAGGTATAT 3070 hom 111 het 38 0 38 8 N/A 0 0 363904 CASAVA_Build 8 96650636 1D TTGTTGAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 26 0 25 1 T 10 9 363905 CASAVA_Build 8 96651860 1D AAGTTGTTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 9 8 363906 CASAVA_Build 8 96657618 2D ATAAATTAAA GT/-- GTGTGTAATA 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 GT 4 3 363907 CASAVA_Build 8 96658589 1I TAATAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 15 0 A 11 12 363908 CASAVA_Build 8 96663787 1D AAGATGGAGG T/- TTATTTTGAG 2894 het 2894 ref 28 19 7 2 T 3 2 363909 CASAVA_Build 8 96676139 4D AAATAAAATG AATA/---- GTTTTATTGC 3070 hom 96 het 34 0 33 3 AATA 1 0 363910 CASAVA_Build 8 96678337 1I GAATATCTAT -/G GGGGGCAGGT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 G 5 6 363911 CASAVA_Build 8 96681609 1I AGGCAGAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 10 11 363912 CASAVA_Build 8 96688064 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1360 hom 40 5 31 4 A 13 14 363913 CASAVA_Build 8 96690129 1I TCATGATTAA -/G TGATGGGCTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 0 1 363914 CASAVA_Build 8 96704440 1D TCTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 383 hom 40 1 33 6 A 12 11 363915 CASAVA_Build 8 96705652 1I TGACATCTTA -/T GGTTGGTGAA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 0 1 363916 CASAVA_Build 8 96722923 1D AATATCAAAG T/- CCTGCTGACA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 1 0 363917 CASAVA_Build 8 96726808 1I TGGAAATGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 9 10 363918 CASAVA_Build 8 96732712 1D CCATTCCTCC T/- TTTTTTTTCT 3070 hom 60 het 39 1 33 5 T 9 8 363919 CASAVA_Build 8 96739621 1D TTGTTAGATA T/- TTTTTTTGCA 3070 hom 87 het 32 0 30 3 T 8 7 363920 CASAVA_Build 8 96753592 3D AAGAGATGTT GAC/--- CCTTTTAGTT 3070 hom 84 het 30 0 29 3 GAC 1 0 363921 CASAVA_Build 8 96755421 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 82 hom 24 1 12 11 T 14 13 363922 CASAVA_Build 8 96758612 4D AATGTACAAA TGTG/---- TGTGTGTGTG 217 hom 9 het 12 0 3 9 TG 11 9 363923 CASAVA_Build 8 96775677 1D TATTCCTAGT G/- CCACTCAGAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 G 1 0 363924 CASAVA_Build 8 96775761 1D GATGTGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 34 0 24 10 T 15 14 363925 CASAVA_Build 8 96806262 1I TTAGTGGAGG -/T TGGGGGGGAA 3070 hom 77 het 29 0 24 5 T 1 2 363926 CASAVA_Build 8 96807628 1D TATTCATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1550 hom 30 5 18 8 T 12 11 363927 CASAVA_Build 8 96809746 2D ATTCTCCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2639 hom 28 7 15 6 A 13 11 363928 CASAVA_Build 8 96809932 1D CACCTGTAAT C/- CCAGCACTTT 2768 het 1384 hom 13 4 7 2 C 3 2 363929 CASAVA_Build 8 96815411 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 585 het 585 ref 14 6 3 5 A 15 14 363930 CASAVA_Build 8 96819957 3D AAAATAAATA AAT/--- AAATAAAAGG 672 het 672 ref 30 5 7 19 AAT 1 0 363931 CASAVA_Build 8 96824294 4D TGGTGAGACC CTGT/---- CTGTCTCTAC 3070 hom 27 het 11 0 7 4 CTGT 2 1 363932 CASAVA_Build 8 96826948 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3043 hom 25 8 13 5 A 11 12 363933 CASAVA_Build 8 96831298 1D CCTTTCCATG C/- CCTTCGCTCT 3070 het 3070 hom 48 20 20 10 C 3 2 363934 CASAVA_Build 8 96833164 3I TTGTGCCACT ---/CCA CCACTCAGCT 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 CCA 1 2 363935 CASAVA_Build 8 96836797 1D ATGCAGCAGT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 44 20 20 5 A 8 7 363936 CASAVA_Build 8 96845603 6I AATAAAGAAA ------/TTAAAT TTAAAAACCC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 TTAAAT 0 1 363937 CASAVA_Build 8 96846449 4I TCCAGGAATT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 TTTG 2 3 363938 CASAVA_Build 8 96852114 1D AGTTCCAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 42 1 36 6 T 13 12 363939 CASAVA_Build 8 96856884 2I AACCAAGGGG --/GA GATGGCTGGG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 GA 1 2 363940 CASAVA_Build 8 96874844 1D CACTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 40 0 29 11 A 11 10 363941 CASAVA_Build 8 96875015 1I AACTAGATTT -/A AAAAAAAAAA 1652 het 1652 ref 36 15 8 13 A 15 16 363942 CASAVA_Build 8 96881635 3D GGCCTGTGAA CCC/--- CCGGGGGTGG 3070 hom 99 het 37 0 33 5 C 5 2 363943 CASAVA_Build 8 96881881 1D ATGTGACTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 9 8 363944 CASAVA_Build 8 96882313 1I TGTCTTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 36 1 23 12 T 11 12 363945 CASAVA_Build 8 96885419 1D TTTTATTTTG T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 108 het 43 0 37 7 T 7 6 363946 CASAVA_Build 8 96897722 1I CTTGGTTAAT -/C TTGCTAATGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 C 0 1 363947 CASAVA_Build 8 96901411 2D CCAAAGATGG CT/-- CTTTCTTTCC 3070 hom 72 het 26 0 23 5 CT 2 1 363948 CASAVA_Build 8 96912143 4D TAGAAAATCT GAAA/---- GAATTAAAAA 3070 hom 99 het 36 0 34 4 GAAA 1 0 363949 CASAVA_Build 8 96914832 1D TTCATTTCAA T/- CTACCTTATT 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 T 1 0 363950 CASAVA_Build 8 96918686 1I AATGGAAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 T 9 10 363951 CASAVA_Build 8 96922066 4I CTGGAGAACC ----/CTGA CTAATATGCA 3070 hom 147 het 54 0 48 6 CTGA 0 1 363952 CASAVA_Build 8 96922358 1D TCTTTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 2671 het 2671 ref 37 18 7 14 T 13 12 363953 CASAVA_Build 8 96924957 1I AATCATGAAT -/G GGGGCTACTT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 G 4 5 363954 CASAVA_Build 8 96925544 1D CTTTTTGTAA G/- GACACTAGTC 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 G 2 1 363955 CASAVA_Build 8 96940450 1I ATACACTGTC -/A TTTGAGGTCC 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 A 0 1 363956 CASAVA_Build 8 96942542 1D TTTATTTGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 15 13 5 T 12 11 363957 CASAVA_Build 8 96951114 1D26M1D TTAGAGAAAG AAAAAAAAAGAGAAAGAGAAAACAAAGA/-AAAAAAAAGAGAAAGAGAAAACAAAG- AGTAAAATTA 3070 het 3070 hom 38 16 27 5 N/A 0 0 363958 CASAVA_Build 8 96961542 1D GTGTGGGGTC A/- GGGGCAGTGG 2320 het 2320 ref 31 17 9 5 A 1 0 363959 CASAVA_Build 8 96962262 1I ATGATTGCTG -/T TCTGTTTATG 3070 het 3070 hom 59 13 24 22 T 1 2 363960 CASAVA_Build 8 96965650 1D TGTTATGGCT C/- CCCCTGAAAG 3070 hom 92 het 34 0 31 4 C 5 4 363961 CASAVA_Build 8 96972943 1I AAAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 95 het 37 0 30 7 A 9 10 363962 CASAVA_Build 8 96981145 1D77M1D CTAATATCTT AAGACACTGAAGAAGAAAAGATCAATAAACTTGATCAAATAGCAACAGAACCTATACAAATGACACACAGAGAGAAAGA/-AGACACTGAAGAAGAAAAGATCAATAAACTTGAACAAATAGCAACAGAACCTATACAAATGACACACAGAGAGAAAG- AAAAAGTTGT 3070 hom 90 het 21 0 31 8 N/A 0 0 363963 CASAVA_Build 8 96981607 1I ATAAGGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 731 hom 33 3 22 8 A 11 12 363964 CASAVA_Build 8 96989075 2D TGTATATAAC AA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 A 2 0 363965 CASAVA_Build 8 97007673 28D TGTCTGATTA AATTGTTGTCTGATTAAATTGTTGTCTG/---------------------------- ATTAAGTTGT 3070 hom 96 het 34 0 32 5 AATTGTTGTCTGATTAAATTGTTGTCTG 1 0 363966 CASAVA_Build 8 97011501 1I TTAGCACGAA -/G GGCTGTTGAA 3070 hom 42 het 16 0 14 2 G 2 3 363967 CASAVA_Build 8 97024776 2D AGTGTCTGAC TA/-- TATGTTTTGG 3070 hom 105 het 40 0 35 7 TA 2 1 363968 CASAVA_Build 8 97036873 1D TTCTAAAATG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 116 het 44 0 39 5 T 9 8 363969 CASAVA_Build 8 97040013 3I GAATATATAA ---/TAT TAGCTATAAT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TAT 0 1 363970 CASAVA_Build 8 97043315 2D CAGGAAGCAG AA/-- GTTGCAGCGA 3070 hom 52 het 24 0 16 8 A 2 0 363971 CASAVA_Build 8 97043861 4D GATTTGCAAA CAAT/---- CAATTTCTGA 3070 hom 78 het 27 0 27 2 CAAT 2 1 363972 CASAVA_Build 8 97045868 4I TTGTTAAGTA ----/AAGT AAGACAAGTA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAGT 0 1 363973 CASAVA_Build 8 97073414 5D GCCTGCTGCT AGAAG/----- AGGACTGGCT 3070 het 3070 ref 57 30 23 7 AGAAG 1 0 363974 CASAVA_Build 8 97074771 1D ATTATTAAAA G/- AACTATAAAT 1499 het 1499 ref 13 7 5 1 G 1 0 363975 CASAVA_Build 8 97080993 2I35M2D ATATGTGCGC --ATATATATATATAACAATTTTTCTCATTTTTCGTCTT/ATATATATATATATAACAATTTTTCTCATTTTTCGTC-- CTTAATTGAC 3070 het 3070 hom 19 10 18 11 N/A 0 0 363976 CASAVA_Build 8 97084845 1I CTGTTACGTT -/A AAAATATGAA 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 A 4 5 363977 CASAVA_Build 8 97092525 1D CAGAACCTCT C/- CCACCCTTAC 3070 hom 112 het 44 0 36 9 C 3 2 363978 CASAVA_Build 8 97106683 1I44M6D AGTTTGTGTA -CTATGTCACATTTGAGTAATTCTTACAATATTTCAAACTTTTTCATTATT/TCTATGTCACATTTGAGTAATTCTTACAATATTTCAAACTTTTTC------ ATTATATCTG 3070 het 3070 ref 49 35 27 4 N/A 0 0 363979 CASAVA_Build 8 97109300 1I CATATCTCGA -/C CCCCCCCGCT 3070 het 3070 ref 31 14 10 7 C 7 8 363980 CASAVA_Build 8 97138271 1D GTGTAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1701 hom 25 5 15 5 A 11 10 363981 CASAVA_Build 8 97139465 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTAGTA 3070 hom 27 het 17 0 10 7 T 6 7 363982 CASAVA_Build 8 97140670 2D AAACAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2974 hom 25 10 9 7 A 13 11 363983 CASAVA_Build 8 97141969 1D GCGTATGTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 38 13 23 2 T 10 9 363984 CASAVA_Build 8 97161120 1D AGAGCCAGCC T/- TTTTTTAGGA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 7 6 363985 CASAVA_Build 8 97173318 2D TTTGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 2789 hom 32 13 13 6 T 11 9 363986 CASAVA_Build 8 97177536 1D TGTAACTCGG A/- AAAAAAAATC 1112 het 1112 ref 37 33 3 1 A 9 8 363987 CASAVA_Build 8 97244527 13I TAATCCAGGG -------------/ATAGATATTATGT ATAGATATTA 3070 het 3070 hom 33 10 16 9 ATAGATATTATGT 1 2 363988 CASAVA_Build 8 97269848 1D GACTATATGT C/- CATGGAAATT 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 C 2 1 363989 CASAVA_Build 8 97271715 1I TTCCAGCTTT -/G GGGGGGGTCA 3070 het 3070 hom 41 13 19 9 G 7 8 363990 CASAVA_Build 8 97272068 1D CTAGTCCCCC A/- ACCCCACAAC 2007 het 2007 ref 21 16 5 0 A 2 1 363991 CASAVA_Build 8 97287477 1D ATAGCTACTT A/- CAGCGAAAGG 3070 het 3070 ref 59 30 22 7 A 1 0 363992 CASAVA_Build 8 97292088 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2597 het 2597 ref 21 9 8 5 A 13 12 363993 CASAVA_Build 8 97300528 1I CCGGAATGTA -/T TTAAAGTGTA 3070 het 3070 ref 47 23 16 8 T 2 3 363994 CASAVA_Build 8 97304533 4I ATGGTGACTA ----/TAAT TAATTATATT 3070 het 3070 ref 47 25 19 4 TAAT 1 2 363995 CASAVA_Build 8 97305054 2I GAATTTAGAC --/AG AGAGTATGGT 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 AG 2 3 363996 CASAVA_Build 8 97311310 2D GTTTTTCACA CT/-- GTTTTGTTAT 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 CT 1 0 363997 CASAVA_Build 8 97318176 1I AGGTTTTGGG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 T 8 9 363998 CASAVA_Build 8 97331874 3D CCAGCACTTT GGA/--- GGCCAAGATG 3070 het 2780 hom 22 8 9 5 GGA 1 0 363999 CASAVA_Build 8 97332189 1I GGTCTATAAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 8 9 364000 CASAVA_Build 8 97340818 1I CAAAACTAGT -/A AACAAAACCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 2 3 364001 CASAVA_Build 8 97350039 1D GAGTGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 1342 het 1342 ref 28 10 4 15 T 19 18 364002 CASAVA_Build 8 97395840 1I GATGTTGGGA -/G GGGGGGTCCC 3070 hom 97 het 39 0 31 8 G 6 7 364003 CASAVA_Build 8 97398834 1I TCAAAAGCAC -/T GGTCTTCAGA 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 0 1 364004 CASAVA_Build 8 97399162 1I AAAAAAACAG -/A AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 6 7 364005 CASAVA_Build 8 97399727 1I GACTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 2521 het 1777 hom 25 6 9 11 A 11 12 364006 CASAVA_Build 8 97400900 2I GGCGTTTCTT --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 A 9 11 364007 CASAVA_Build 8 97410752 1D AGGTGTGGCC G/- GGGAGATTCA 3070 het 3070 hom 45 18 17 11 G 4 3 364008 CASAVA_Build 8 97412503 6D ACAAAAGGTA TCTTGT/------ TCTTGTTCGT 3070 het 3070 ref 45 28 13 7 TCTTGT 2 1 364009 CASAVA_Build 8 97422150 1D TTATCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 32 1 27 4 A 12 11 364010 CASAVA_Build 8 97423319 1I GGAAGTGATC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 47 18 25 4 A 8 9 364011 CASAVA_Build 8 97435540 1I ACAAGACTTT -/A GTTCTTAGAA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 0 1 364012 CASAVA_Build 8 97438111 1I TGTAAGGGTC -/A GGGGTGGGGT 3070 het 3070 hom 49 17 17 15 A 0 1 364013 CASAVA_Build 8 97442519 8D GAAAACACAG GAGGCAGA/-------- GCAGATCTCG 3070 het 3070 ref 57 29 20 11 GAGGCAGA 1 0 364014 CASAVA_Build 8 97442737 1I CATCCTTCTC -/T TAGCTCTCCC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 1 2 364015 CASAVA_Build 8 97449164 1D TGGAATTGGC T/- TTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 45 23 15 7 T 8 7 364016 CASAVA_Build 8 97453802 1I CTGGATCTCA -/G GGACCCGACT 3070 het 3070 ref 37 14 15 8 G 2 3 364017 CASAVA_Build 8 97476923 5I TACCTGGGAG -----/GCAGA GCTTGCAGTG 3070 hom 39 het 14 0 14 0 GCAGA 0 1 364018 CASAVA_Build 8 97478082 1I TTTAGATAAA -/T ATTGTAAATA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 0 1 364019 CASAVA_Build 8 97478795 4I GGGACTTTAC ----/ATCA ATCAGGTATG 3070 het 3070 hom 48 22 21 5 ATCA 1 2 364020 CASAVA_Build 8 97480195 1I AACCATATCC -/T TCTCCTCCTC 2687 het 2687 ref 28 16 6 6 T 1 2 364021 CASAVA_Build 8 97480330 1I CAGACACACA -/C CACACACTTC 3070 het 3070 ref 32 19 9 4 C 1 2 364022 CASAVA_Build 8 97481161 5D GCCTGGCCCT ACGTG/----- AAACACTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 18 4 ACGTG 1 0 364023 CASAVA_Build 8 97481476 3D ATGTAGTCAA TTT/--- TTTTTTTTTT 2931 het 2584 hom 33 11 10 12 T 15 12 364024 CASAVA_Build 8 97485057 1D ACTTATTATG A/- AAAAAACAAT 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 7 6 364025 CASAVA_Build 8 97489430 2I ATGGCAGCTC --/CA GAGTCATCAG 3070 het 3070 ref 44 21 14 9 CA 0 1 364026 CASAVA_Build 8 97518278 1I TTGCTTCCCC -/T ACCAACCTCC 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 T 0 1 364027 CASAVA_Build 8 97519671 1I ATTAATGTCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 T 9 10 364028 CASAVA_Build 8 97520207 1D AACAAATAAC T/- ATTAAAAAGT 3070 het 3070 ref 43 24 13 7 T 1 0 364029 CASAVA_Build 8 97566489 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2407 het 1709 hom 15 5 6 4 A 13 14 364030 CASAVA_Build 8 97566786 1I TGGAAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 16 11 A 12 13 364031 CASAVA_Build 8 97583401 1D TACTAGGAGT G/- GTATACATTG 3070 het 3070 ref 43 19 16 8 G 2 1 364032 CASAVA_Build 8 97617940 3I TGCCTAGGCC ---/AAT AATCTCCAAC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 AAT 1 2 364033 CASAVA_Build 8 97618888 1D ACTTAAGGGA C/- CACACGCATG 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 C 2 1 364034 CASAVA_Build 8 97619349 6D AAAGCTTATG TTTTGT/------ TTTTTGTTTG 3070 het 2600 hom 27 8 10 9 TTTTGT 1 0 364035 CASAVA_Build 8 97619810 1D TACTAAAGAT A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 A 8 7 364036 CASAVA_Build 8 97619922 1D TATAGAGGTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 T 9 8 364037 CASAVA_Build 8 97620247 1I16M1I CGTATTGAGT -CAGCCTTACCTGTCCA-/CCAGCCTTACCTGTCCAG CTAATCAAGG 3070 het 3070 hom 35 14 22 6 N/A 0 0 364038 CASAVA_Build 8 97622469 4I GATTAAAAGG ----/TATT TATTATAGAT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 TATT 1 2 364039 CASAVA_Build 8 97634855 2D AAATTACAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3028 hom 39 9 17 15 T 14 12 364040 CASAVA_Build 8 97640224 2I CATTTGAATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 40 16 14 10 TG 8 9 364041 CASAVA_Build 8 97667258 16D TGGCAAGAGG TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 15 15 6 T 25 9 364042 CASAVA_Build 8 97676911 1I ATGGCACCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 T 12 13 364043 CASAVA_Build 8 97679673 2D TTAGGTTTTA AC/-- ACATGGATTT 2860 het 2860 ref 31 19 7 8 AC 2 1 364044 CASAVA_Build 8 97687676 1I ATTTTAAAAA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 7 8 364045 CASAVA_Build 8 97695497 2I TAGCACTTAG --/AA CTAAGCCCCT 3070 hom 111 het 38 0 37 1 A 0 2 364046 CASAVA_Build 8 97703428 1D CTGACTGGGC A/- AAGTTAAAGT 3070 het 3070 ref 52 21 19 14 A 3 2 364047 CASAVA_Build 8 97709268 1I TCTATATTAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 T 8 9 364048 CASAVA_Build 8 97710177 2D GCCTACTGAC TG/-- TTTTTGCCTC 3070 het 3070 ref 51 27 18 6 TG 1 0 364049 CASAVA_Build 8 97711755 1I TCTCAGGTCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 T 8 9 364050 CASAVA_Build 8 97720888 1I TAAAAAAAAA -/C AACAACTTGT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 C 0 1 364051 CASAVA_Build 8 97722225 2I GTTGTAGGTT --/CA GTCTTTTTAC 3070 hom 83 het 30 0 28 2 CA 0 1 364052 CASAVA_Build 8 97724690 3D GACAAGAATA AAT/--- AATTAAAACA 3070 het 3070 ref 48 23 22 4 AAT 2 1 364053 CASAVA_Build 8 97733105 5D TTTAATAGTA TATTT/----- TATTATTAAT 3070 hom 87 het 33 0 29 5 TATTT 1 0 364054 CASAVA_Build 8 97744724 7I TCATCTGCAT -------/ACATGAC ACATGACATT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 ACATGAC 1 2 364055 CASAVA_Build 8 97748506 1I CTTCTCCCAC -/A AAAAAAATCT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 7 8 364056 CASAVA_Build 8 97753502 2D AAAAATAAAC TA/-- TGAAAACAAA 3070 hom 78 het 30 0 26 6 TA 1 0 364057 CASAVA_Build 8 97755392 1I AGTGGAGGAG -/T GGGGGATACT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 0 1 364058 CASAVA_Build 8 97765171 2D CTGAGTTATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 64 het 27 0 22 6 A 12 10 364059 CASAVA_Build 8 97807680 3D TTCTGTGCTC ATT/--- ATGGATTAAT 3070 het 3070 hom 35 14 18 6 ATT 1 0 364060 CASAVA_Build 8 97811260 2I TGTGTGTGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 41 12 14 15 TG 6 7 364061 CASAVA_Build 8 97819119 1D ATCCCTCAGT C/- CAATCAAGTT 3070 het 3070 hom 26 13 13 0 C 2 1 364062 CASAVA_Build 8 97848898 2I TCCAAGTATC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 65 het 29 0 21 8 T 12 14 364063 CASAVA_Build 8 97888627 1I AAAACTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3065 het 1876 hom 20 7 8 5 T 10 11 364064 CASAVA_Build 8 97915941 3D GTTGTTGTAG GTT/--- GTTTAGCAAC 3070 het 3070 ref 37 21 11 6 GTT 2 1 364065 CASAVA_Build 8 97921405 2I ATTCAAACTC --/AG AGTCTCTGGC 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 AG 1 2 364066 CASAVA_Build 8 97923923 2I CATGCAGGTG --/GA GGGCCACTGT 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 GA 0 1 364067 CASAVA_Build 8 97946022 4I CAAAAGGGTC ----/TTGT ACAAACCAGG 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 TTGT 0 1 364068 CASAVA_Build 8 97951571 1D TATATATATA T/- TTTTTTGGTA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 T 7 6 364069 CASAVA_Build 8 97967385 1D ATCTCAACAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 48 het 18 0 17 2 A 10 9 364070 CASAVA_Build 8 97968998 2D CTAAACTGGA CT/-- CTCTCTCACC 3070 het 3070 ref 45 22 18 6 CT 4 3 364071 CASAVA_Build 8 97979456 3D GCTTGAGAAC GTT/--- GTTTTTGTCT 3070 het 3070 hom 40 18 19 5 GTT 2 1 364072 CASAVA_Build 8 97985633 2D CCAACATTTC CT/-- CTCCTCAGTT 3070 hom 131 het 49 0 41 8 CT 2 1 364073 CASAVA_Build 8 97987476 1D CCTGCCACAG C/- CCCAGGCAAT 3070 het 3070 ref 30 11 10 10 C 4 3 364074 CASAVA_Build 8 98004334 4D GTGTCAGAAT AGTC/---- AGTCCTCTGG 3070 het 3070 hom 51 22 27 3 AGTC 2 1 364075 CASAVA_Build 8 98013360 1D AACTTCCCCA G/- GGAGAAACTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 G 3 2 364076 CASAVA_Build 8 98014572 1D TGTTACACTC T/- TTTGCCATCT 3070 het 3070 hom 59 22 32 7 T 4 3 364077 CASAVA_Build 8 98015226 7D AGAAAAAAAA ATGGCTT/------- CACAACCAGA 3070 het 3070 ref 49 25 22 5 ATGGCTT 1 0 364078 CASAVA_Build 8 98017472 1I CTTTCCCTCA -/T TTTTTGTGGC 3070 het 3070 ref 47 28 11 8 T 5 6 364079 CASAVA_Build 8 98025920 1D AAACAATAAT A/- AAAAAAGGAC 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 A 7 6 364080 CASAVA_Build 8 98027860 1I TAATTTTCTA -/T TTTTTTTATT 2685 het 1702 hom 12 4 6 2 T 7 8 364081 CASAVA_Build 8 98030661 3D GTTTTCTTGA TTT/--- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 32 11 15 8 T 12 9 364082 CASAVA_Build 8 98039856 5I TCTTCTACTT -----/AAGAG AAGATCATCT 3070 het 3070 ref 47 32 14 1 AAGAG 0 1 364083 CASAVA_Build 8 98049450 1D TTTAATATAA G/- AGAAGATGAT 3070 het 3070 hom 50 19 25 7 G 1 0 364084 CASAVA_Build 8 98056716 11I AGAATCTCTG -----------/AACAGACCAGT AACAGGCAGT 2721 het 2721 ref 33 24 6 3 AACAGACCAGT 0 1 364085 CASAVA_Build 8 98058729 1D ATCCGTAATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 13 9 A 15 14 364086 CASAVA_Build 8 98060455 1D AGGAAGTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 A 12 11 364087 CASAVA_Build 8 98089544 1D CTCTTTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 30 0 23 7 A 11 10 364088 CASAVA_Build 8 98136022 1D TATCTTCTGC A/- GCAACTTGGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 A 1 0 364089 CASAVA_Build 8 98136454 1D ACACCCCTGT C/- CCCCTGTCCA 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 C 5 4 364090 CASAVA_Build 8 98143548 4D ACCAGGAAAC ACTT/---- AATGAACACA 3070 het 3070 ref 41 21 17 4 ACTT 1 0 364091 CASAVA_Build 8 98146616 1I GAAGGATCTT -/A AAAGTTGCAA 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 A 3 4 364092 CASAVA_Build 8 98157016 1D AAATTACTTG A/- AAAGCCAGTG 3070 het 2665 hom 23 8 11 4 A 4 3 364093 CASAVA_Build 8 98163788 1I GCCTGGCTCC -/A ATCCCTGTGG 3070 het 3070 ref 45 22 20 3 A 1 2 364094 CASAVA_Build 8 98168810 1I GTGCCGACTT -/G GGGGGGTCAA 3070 het 3070 hom 37 14 14 9 G 6 7 364095 CASAVA_Build 8 98168915 1D TTTTTGTTAT A/- ATGGTAATTA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 2 1 364096 CASAVA_Build 8 98176161 2I CGCCATTAAA --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 37 14 14 9 AT 7 8 364097 CASAVA_Build 8 98180955 1D GATATGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2927 hom 25 7 11 7 T 12 11 364098 CASAVA_Build 8 98200848 1I CTTACACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 287 hom 28 1 21 6 A 14 15 364099 CASAVA_Build 8 98202524 1I CTAAATAGTT -/A ACAGTGCTGT 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 A 1 2 364100 CASAVA_Build 8 98212305 1I GTTTTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 11 12 364101 CASAVA_Build 8 98221417 1I AGCAAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 A 10 11 364102 CASAVA_Build 8 98221772 1I CAGAATGTAT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 8 9 364103 CASAVA_Build 8 98228008 1D ATGGGACCAT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 29 11 14 5 A 9 8 364104 CASAVA_Build 8 98230513 1D GACTGGGGAG T/- TTTTTTTTTT 2487 het 2487 ref 36 19 7 10 T 13 12 364105 CASAVA_Build 8 98316721 1D GTCTATGGAA C/- CATAACAGCC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 C 2 1 364106 CASAVA_Build 8 98365057 1I AAAAGGTATT -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 30 15 15 0 A 7 8 364107 CASAVA_Build 8 98365636 1D CTTACCCCTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 T 9 8 364108 CASAVA_Build 8 98392937 1D TTCATTGAGG A/- AGGTAATGGC 3070 het 3070 ref 37 18 14 7 A 2 1 364109 CASAVA_Build 8 98393662 17I ATGCACCCAC -----------------/ACGTCCTCAAGCCACCT AGTTTACAAG 3070 het 3070 hom 50 23 21 6 ACGTCCTCAAGCCACCT 0 1 364110 CASAVA_Build 8 98398811 1I CACATCTGGT -/G AATAAAAGAA 3070 hom 105 het 42 0 35 7 G 0 1 364111 CASAVA_Build 8 98423226 1D AGTATTTAAT A/- AAAGTCAACA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 4 3 364112 CASAVA_Build 8 98432045 1D TTTCCCTGGT A/- AAAAAAAGCT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 8 7 364113 CASAVA_Build 8 98437100 3I CCACAGCCTT ---/AAA AAAAAAAACC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 8 11 364114 CASAVA_Build 8 98437468 1D AGAACGCAGC A/- AATTTGATTC 3070 hom 105 het 44 0 36 8 A 3 2 364115 CASAVA_Build 8 98445829 1I ATTTTTCCAC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 9 10 364116 CASAVA_Build 8 98447167 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2874 het 282 hom 16 1 11 4 T 15 14 364117 CASAVA_Build 8 98447334 1D GAACTTTCCA C/- CCTTTTTTTT 3070 hom 98 het 38 0 32 6 C 3 2 364118 CASAVA_Build 8 98451352 4I ACAATGCCTC ----/CTAT CTCCCCCAAC 3070 hom 38 het 19 0 12 7 CTAT 0 1 364119 CASAVA_Build 8 98451731 1I TCAGCCATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 421 hom 45 1 32 12 A 11 12 364120 CASAVA_Build 8 98456351 1I AAGGAAGAGA -/G GCCCTCTCCA 3070 hom 123 het 47 0 42 5 G 1 2 364121 CASAVA_Build 8 98466574 1I CTTCCATAGA -/T TCCCCAGGGC 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 1 2 364122 CASAVA_Build 8 98468758 1D63M1D ACCAATTTGC AAGGTGGTTTTCAGAAAGGATACTTTCAAGCAGGACTTTTTTTAGTTTCACAACAATTGTTATCT/-AGGTCGTTTTCAGAAAGGATACTTTCAAGCAGGACTTTTTTTAGTTTCACAACAATTGTTATC- TTTTTATTGA 3070 hom 60 het 25 0 21 33 N/A 0 0 364123 CASAVA_Build 8 98480152 2I GTGGAAGGGC --/AA GAGAGAGAGA 1653 het 414 hom 49 2 13 34 A 0 2 364124 CASAVA_Build 8 98483773 1D AATTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 34 0 25 10 T 11 10 364125 CASAVA_Build 8 98497627 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 19 1 A 11 12 364126 CASAVA_Build 8 98503105 1D TTCTACTTAT G/- ATCCCATTGG 3070 hom 120 het 48 0 41 7 G 1 0 364127 CASAVA_Build 8 98511343 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 721 hom 28 2 21 5 A 11 12 364128 CASAVA_Build 8 98528784 31I CACCCGCCTT -------------------------------/AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATG AGCCACCACG 3070 hom 24 het 11 0 9 3 AGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATG 0 1 364129 CASAVA_Build 8 98531254 4D ACTTGGGCAG CTCT/---- CTCTGTGTCC 3070 het 3070 hom 50 21 23 8 CT 4 2 364130 CASAVA_Build 8 98534131 1D GCATGTCCTG T/- TTGTTACCTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 T 3 2 364131 CASAVA_Build 8 98540352 5D CAGAGTTCTT AACTC/----- AAGAAGAATG 3070 hom 111 het 39 0 38 1 AACTC 1 0 364132 CASAVA_Build 8 98592685 1D TAAAGGAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 11 10 364133 CASAVA_Build 8 98594124 1I TAGTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 625 hom 31 2 23 6 A 12 13 364134 CASAVA_Build 8 98603452 1I CTGTTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 22 1 11 10 A 15 16 364135 CASAVA_Build 8 98620174 1I GGAGTTCCTT -/G GGGGATGGAC 3070 hom 129 het 61 0 44 17 G 4 5 364136 CASAVA_Build 8 98636588 1D CTCTGTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 12 11 364137 CASAVA_Build 8 98825173 1D AGACCTTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2618 hom 32 9 12 11 A 10 9 364138 CASAVA_Build 8 98832773 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1240 hom 20 5 10 5 A 15 14 364139 CASAVA_Build 8 98833801 1I TTGCCTCAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 9 10 364140 CASAVA_Build 8 98834009 1I AGGTAACTCT -/G GGGAAAGAGG 3070 het 3070 ref 64 32 25 7 G 3 4 364141 CASAVA_Build 8 98834729 3D GAGAAGAAGA AGG/--- AGGAGGTCGG 3070 het 3070 hom 32 13 11 11 AGG 3 2 364142 CASAVA_Build 8 98835491 1D CTCCGTCATG A/- AAAAAAAAAA 2488 het 1748 hom 26 8 6 12 A 15 14 364143 CASAVA_Build 8 98842077 3D AGGCTGAAGC AGG/--- AGAATTGCTT 3070 het 2961 hom 18 8 10 0 AGG 1 0 364144 CASAVA_Build 8 98853111 1D TTCTCTCTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 14 3 T 10 9 364145 CASAVA_Build 8 98854237 1D GCGCCATTGC A/- ACTGCAGCCT 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 A 2 1 364146 CASAVA_Build 8 98854406 1I GATGGCTCTT -/G GGTTCCAGGA 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 G 2 3 364147 CASAVA_Build 8 98858095 1I GTGAATGGGT -/C CCCCCCCCCG 1903 het 1903 ref 21 7 6 8 C 9 10 364148 CASAVA_Build 8 98866497 1I TTTATCACAC -/T TTTTTTTTTT 1049 het 1049 ref 34 23 3 8 T 13 14 364149 CASAVA_Build 8 98870780 1I GCCTGGCCTG -/T TTTTTTTGAG 2197 het 2197 ref 17 9 5 3 T 7 8 364150 CASAVA_Build 8 98871590 1D AGTGCAGCTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 10 9 364151 CASAVA_Build 8 98874448 1D CTCTAGAATG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 42 het 32 0 15 18 A 9 8 364152 CASAVA_Build 8 98876006 1I TTATTTTGAT -/A ATCAGAACAG 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 A 1 2 364153 CASAVA_Build 8 98877463 1D CTTGCCTTGG C/- CCCCCCAGTA 3070 hom 79 het 35 0 29 6 C 7 6 364154 CASAVA_Build 8 98878543 1I GAATTACAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 18 1 13 4 T 13 14 364155 CASAVA_Build 8 98879096 1I TTCATAAGGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 26 17 8 1 T 8 9 364156 CASAVA_Build 8 98879424 8D TAGCTGAATT AGAGCATA/-------- AGTGTGTCCC 780 het 780 ref 50 26 4 26 AGAGCATA 1 0 364157 CASAVA_Build 8 98886736 1I TTCTTTTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 518 hom 41 6 18 17 G 0 1 364158 CASAVA_Build 8 98887082 1I TTACCCACTT -/A AAAAATGATT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 5 6 364159 CASAVA_Build 8 98891796 4D ACAGTTTAAT TAAC/---- AGTGTTGTAC 3070 het 3070 ref 45 23 21 2 TAAC 1 0 364160 CASAVA_Build 8 98894844 23D GGTACCCATA CAGATTGAGGGTGGGTCTTCGTC/----------------------- TCCCAGTCCA 3070 het 3070 ref 42 28 14 9 CAGATTGAGGGTGGGTCTTCGTC 1 0 364161 CASAVA_Build 8 98895115 3D ATGCATTTTA TTG/--- TTGTTGTTTA 3070 het 3070 ref 40 17 15 10 TTG 3 2 364162 CASAVA_Build 8 98896172 1I ATCTCGGCTC -/A ACTGCAAGCT 3070 het 923 hom 17 3 11 3 A 1 2 364163 CASAVA_Build 8 98897392 3I TAATAAAATA ---/CTT CTTTGAATTT 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 CTT 1 2 364164 CASAVA_Build 8 98898343 4D GATCTCATCT AAAA/---- AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 13 1 A 9 5 364165 CASAVA_Build 8 98899763 1I AATGGTGAAG -/A GGAGATAAAA 3070 het 3070 ref 56 31 22 3 A 0 1 364166 CASAVA_Build 8 98901029 3D ATAAATTACT TGA/--- TGAGCATTGA 3070 het 3070 ref 28 17 10 2 TGA 2 1 364167 CASAVA_Build 8 98903816 12D CCTCACAATT ATCTTTAAAAAG/------------ ACTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 ATCTTTAAAAAG 1 0 364168 CASAVA_Build 8 98904242 2I CTTTTAGTTA --/TT TTTTTTTTAT 2395 het 2395 ref 24 10 9 5 T 8 10 364169 CASAVA_Build 8 98907948 17I AACTTTTTTT -----------------/GTTTATTTGTTTTTTGA GTTCGCCCAG 3070 het 3070 ref 24 13 8 3 GTTTATTTGTTTTTTGA 0 1 364170 CASAVA_Build 8 98915952 2D TGTCCCTGGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 84 het 36 0 27 10 TG 10 9 364171 CASAVA_Build 8 98917287 6D GAGGTGAGCA GCGGGC/------ GCGGGCAAGC 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 GCGGGC 2 1 364172 CASAVA_Build 8 98919204 1I GGAATTGGAC -/T TGGAAGAGTT 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 T 1 2 364173 CASAVA_Build 8 98925500 1D TTTTGGGGGT G/- GGGGGAGCAG 2362 het 1819 hom 17 7 8 3 G 6 5 364174 CASAVA_Build 8 98926751 1I TCCTAAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2974 hom 26 9 12 5 T 11 12 364175 CASAVA_Build 8 98934106 1D GCTTTTTTTT G/- GGGGGGGGAG 2863 het 1494 hom 31 9 11 11 G 9 8 364176 CASAVA_Build 8 98940723 2D GAGCCTGGCC TT/-- TTTTTTTTTT 2141 hom 17 het 20 0 8 13 T 18 16 364177 CASAVA_Build 8 98961488 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1466 het 392 hom 23 4 5 17 T 18 16 364178 CASAVA_Build 8 98980319 1D TATCCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 10 6 T 11 10 364179 CASAVA_Build 8 98983902 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2065 het 1721 hom 14 5 7 2 A 13 14 364180 CASAVA_Build 8 98984655 2D CACCCTTTCC TG/-- TACCTTTGGA 3070 het 3070 ref 60 35 20 6 TG 1 0 364181 CASAVA_Build 8 98986233 1I TGGGATCCAT -/G GTCCCTCAAA 3070 het 3070 ref 43 20 16 7 G 1 2 364182 CASAVA_Build 8 99002877 1D TAAGGGAATT G/- GAGAGGGGAG 3070 het 3070 hom 50 22 22 6 G 2 1 364183 CASAVA_Build 8 99002973 1D GCACTGTGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 A 10 9 364184 CASAVA_Build 8 99006100 1D AGGCAGGCAA G/- CATCTGTTTT 3070 hom 77 het 45 0 26 23 G 1 0 364185 CASAVA_Build 8 99008531 6D TTCTGTTTTG TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 3070 hom 87 het 40 0 30 10 TTTTGT 5 4 364186 CASAVA_Build 8 99008733 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTTT 2621 hom 15 het 8 0 6 2 A 0 1 364187 CASAVA_Build 8 99020519 1D GACCTCAACT G/- ATCCACCCAC 2608 het 2341 hom 18 7 6 5 G 1 0 364188 CASAVA_Build 8 99021954 2I ACTCCAATGT --/AA AGAGACATAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 1 3 364189 CASAVA_Build 8 99024727 1D CTCCCCTCTG C/- CCCGGATGCT 3070 hom 81 het 29 0 26 4 C 4 3 364190 CASAVA_Build 8 99029851 1D ATTTCAAGAC T/- AAGTATAAAA 3070 het 3070 ref 37 23 11 4 T 1 0 364191 CASAVA_Build 8 99030273 6D ATCAATATAT TTAATC/------ ACAATGAAAA 3070 het 3070 hom 44 20 25 2 TTAATC 1 0 364192 CASAVA_Build 8 99031860 1D GAGTGGGGCA G/- GGATGCCTTC 3070 het 3070 hom 45 17 25 5 G 3 2 364193 CASAVA_Build 8 99033146 4D TTTTTGTTTG TTTA/---- TTTATTATTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 9 TTTA 2 1 364194 CASAVA_Build 8 99034006 2I CTGGGGAAAC --/TG TGGTTGGGTT 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TG 1 2 364195 CASAVA_Build 8 99034565 1D TGCGTTGGCC T/- CCCAAAGTGC 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 T 1 0 364196 CASAVA_Build 8 99054976 2D TTTACAAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 25 1 15 9 T 18 16 364197 CASAVA_Build 8 99060962 5D TAAAATTCGA TAAAC/----- TAAAGATGAT 3070 het 3070 hom 27 13 13 2 TAAAC 1 0 364198 CASAVA_Build 8 99061737 9D AACTGTAAAA TAGCAGCCT/--------- GTGCTGTCGT 3070 het 3070 ref 54 31 20 7 TAGCAGCCT 1 0 364199 CASAVA_Build 8 99062425 1I ACAAAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 9 11 6 T 10 11 364200 CASAVA_Build 8 99069870 4D TCTCTACAAA AAAT/---- AAATAAATTA 3070 het 3070 ref 31 15 11 7 AAAT 3 2 364201 CASAVA_Build 8 99071287 1D TATGAAATTT A/- AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 A 7 6 364202 CASAVA_Build 8 99074905 3I AAAAAAAGAA ---/AAT AAAGAACAAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 AAT 0 1 364203 CASAVA_Build 8 99075512 4D GAAGAAAGGA AAGG/---- AAGGAAGGAA 1344 het 561 hom 12 3 5 4 AAGG 5 4 364204 CASAVA_Build 8 99106677 2D CGCACTCACG CA/-- CACACACACA 913 het 913 ref 51 38 3 10 CA 9 8 364205 CASAVA_Build 8 99112069 1I CATGAACTCC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3004 hom 30 11 15 4 T 9 10 364206 CASAVA_Build 8 99127391 2D CAGAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 2004 het 2004 ref 21 9 6 6 CT 2 1 364207 CASAVA_Build 8 99138232 1I CATCTCTATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 12 9 1 A 9 10 364208 CASAVA_Build 8 99150786 1D TATTTTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 39 0 30 9 T 11 10 364209 CASAVA_Build 8 99153320 2D TTTTATTTTA TT/-- TTTTTTTTTT 1904 het 194 hom 20 4 5 11 T 12 10 364210 CASAVA_Build 8 99154339 2D TGATATAAAC CA/-- CAGAGTTTCT 3070 het 3070 hom 40 14 22 6 CA 2 1 364211 CASAVA_Build 8 99155831 1I TTTAATTTAC -/T TTTTTTTTTT 1744 het 1140 hom 14 4 10 0 T 15 16 364212 CASAVA_Build 8 99157481 2D TGAGATGGAG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 48 het 34 1 31 2 TC 6 5 364213 CASAVA_Build 8 99158223 1I TTCAGCATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 16 7 A 10 11 364214 CASAVA_Build 8 99158505 1D TGTCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1801 hom 28 5 13 12 A 12 11 364215 CASAVA_Build 8 99166965 1I CATTTGTGTA -/T TAAATGTATG 3070 het 3070 hom 27 12 12 3 T 1 2 364216 CASAVA_Build 8 99178701 1D GGCAAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 34 1 17 16 T 16 15 364217 CASAVA_Build 8 99178989 1D GAGTATCCTA T/- TTTTATGAAG 3070 het 3070 hom 24 10 11 4 T 5 4 364218 CASAVA_Build 8 99191774 3I TCAAACAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 2440 hom 15 het 6 0 6 0 CTC 0 1 364219 CASAVA_Build 8 99194955 2I GGCTGGTGGC --/TT TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 52 21 21 10 T 7 9 364220 CASAVA_Build 8 99195579 1D TGACACAGCG A/- AACACTGTCT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 A 3 2 364221 CASAVA_Build 8 99196959 2D TTAATTAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 1693 het 1693 ref 16 6 4 6 T 14 12 364222 CASAVA_Build 8 99199450 1D TTAAAAAAAA T/- AATAATAAAA 3070 het 3070 hom 38 21 16 3 T 1 0 364223 CASAVA_Build 8 99211950 3D GGATAAGATG GGA/--- GGAGAGGGGG 3070 het 3070 ref 55 35 16 5 GGA 2 1 364224 CASAVA_Build 8 99219724 1D TTTCTCCTCA C/- CCTTCTACAC 3070 het 3070 hom 56 27 25 4 C 3 2 364225 CASAVA_Build 8 99221133 1I AGACTGTGTC -/A AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 2 3 364226 CASAVA_Build 8 99221446 1D GGTGGATTCA T/- TGTTCGTCCA 3070 het 3070 hom 35 17 15 3 T 2 1 364227 CASAVA_Build 8 99223017 4D CTGGAGTGCA ATGG/---- ATGGCGTCAT 3070 het 3070 hom 28 12 10 6 ATGG 2 1 364228 CASAVA_Build 8 99225562 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAACC 3070 het 1789 hom 17 6 9 3 A 9 8 364229 CASAVA_Build 8 99231189 8D AATAAATAAG TAAATAAA/-------- TAAATAAATA 3070 het 1125 hom 12 4 8 1 TAAA 5 3 364230 CASAVA_Build 8 99233369 7I AATTCCTGGG -------/CTCAAGT CTCAAGTGAT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 CTCAAGT 1 2 364231 CASAVA_Build 8 99234399 2I TTTTTGAGAC --/AG GGTCTCGCTC 3070 het 2847 hom 28 10 14 4 AG 0 1 364232 CASAVA_Build 8 99245656 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 21 1 14 6 A 15 14 364233 CASAVA_Build 8 99260191 1D GATCTGTGGA C/- CCCGGGCCAG 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 C 4 3 364234 CASAVA_Build 8 99267439 1I CGTCCTTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 T 10 11 364235 CASAVA_Build 8 99272886 1I TCCTTTGCAG -/C CCAGGTTTGG 3070 het 3070 hom 44 16 20 8 C 2 3 364236 CASAVA_Build 8 99279551 3D CAGGCATGAA AAC/--- AACATTCATC 3070 het 3070 ref 36 20 16 1 AAC 2 1 364237 CASAVA_Build 8 99295572 2D TTTTAACATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1922 hom 23 6 8 11 T 14 12 364238 CASAVA_Build 8 99298743 13D AGTGGGTGCC GCACTATTATGAT/------------- TCCTTTTGTG 643 het 643 ref 35 17 3 18 GCACTATTATGAT 1 0 364239 CASAVA_Build 8 99307080 1I CTCGGGGTAG -/T CTTCTTTGGG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 0 1 364240 CASAVA_Build 8 99313094 2I TGACTTAATA --/AT ACCTGGCGAT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 AT 0 1 364241 CASAVA_Build 8 99320013 1D ATTTGTTTCC T/- TTTTTTTTTT 1895 het 1895 ref 55 39 7 9 T 13 12 364242 CASAVA_Build 8 99338036 1I GGCTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 24 0 17 7 A 11 12 364243 CASAVA_Build 8 99338754 31D TTTCTTTCTT TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCG/------------------------------- CTCTGTCACC 3070 hom 48 het 19 0 17 2 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCG 1 0 364244 CASAVA_Build 8 99340184 1D GCCACTTCCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 10 9 364245 CASAVA_Build 8 99350027 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 2228 het 1403 hom 12 4 6 2 A 14 13 364246 CASAVA_Build 8 99358456 2D TTACAGGCGT GA/-- GCCAGTATAC 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 GA 1 0 364247 CASAVA_Build 8 99368511 1I GTCTTTCAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 9 10 364248 CASAVA_Build 8 99379140 1I GAATAAAATG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 T 8 9 364249 CASAVA_Build 8 99380453 1D GCTGGTTGGC A/- AAAAAAAAAA 1009 het 1009 ref 35 28 3 4 A 11 10 364250 CASAVA_Build 8 99398872 4I TCATTTGGTT ----/TGAC TGTAATACAC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TGAC 0 1 364251 CASAVA_Build 8 99420935 1I GGCATGTGAA -/G GGGGTGGGAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 G 4 5 364252 CASAVA_Build 8 99422237 1D TGGGCAGGCA C/- TTTGAAGGTC 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 C 1 0 364253 CASAVA_Build 8 99422357 1I CTCTAAAAAA -/T GGGGCCCAGG 3070 hom 63 het 26 0 20 6 T 0 1 364254 CASAVA_Build 8 99427689 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2380 het 757 hom 23 2 10 11 A 17 16 364255 CASAVA_Build 8 99446376 2D TGGACCACAA TT/-- TTACACTGTT 3070 het 3070 hom 44 13 19 14 T 4 2 364256 CASAVA_Build 8 99449470 1D GGGTCAGAAT A/- AACAGAGAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 9 A 3 2 364257 CASAVA_Build 8 99456493 1I5M1I AAAAACAAAC -AACAA-/AAACAAC AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 N/A 0 0 364258 CASAVA_Build 8 99457915 1I GTCGCATAGA -/T TTTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 29 14 12 3 T 6 7 364259 CASAVA_Build 8 99460504 1I TAGCTCAGAT -/A GGGGGTTAGG 3070 hom 97 het 42 0 32 10 A 0 1 364260 CASAVA_Build 8 99482181 1D TGTCTTTTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 10 9 364261 CASAVA_Build 8 99485042 1D GGGGACAGGG A/- TCATATCTGT 3070 hom 128 het 51 0 42 10 A 1 0 364262 CASAVA_Build 8 99539519 2D ACACACATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 39 11 15 14 AC 10 9 364263 CASAVA_Build 8 99539942 1I TGATTTGTAC -/A CACTGATTTT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 0 1 364264 CASAVA_Build 8 99540390 1I CTATAAAGAT -/A ACTTGAAATG 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 1 2 364265 CASAVA_Build 8 99543368 1D ATTAAAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 458 hom 37 2 29 6 T 11 10 364266 CASAVA_Build 8 99550513 1I CTCCATCTTT -/A AAAAAAAAAA 1648 het 1648 ref 21 14 6 1 A 11 12 364267 CASAVA_Build 8 99581579 1D TCATGTGACC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 A 9 8 364268 CASAVA_Build 8 99582577 1D ATGATGAGTA T/- TTTTTCATGT 2903 het 2903 ref 16 9 6 1 T 6 5 364269 CASAVA_Build 8 99591864 1I CATCAGAGGG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 9 10 364270 CASAVA_Build 8 99610412 1I ATTCTAGTCT -/C ACTGTTCCTC 3070 het 3070 ref 50 24 19 7 C 0 1 364271 CASAVA_Build 8 99623617 5D TCCATTTCCA AAAAT/----- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 43 19 20 6 AAAAT 4 3 364272 CASAVA_Build 8 99624597 1D GGCATTGCAA G/- TGGCCAAAGG 3070 het 3070 ref 34 15 13 7 G 1 0 364273 CASAVA_Build 8 99644421 1I AGAATGTGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 13 14 364274 CASAVA_Build 8 99656747 1I TAGTGACTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 T 13 14 364275 CASAVA_Build 8 99679228 1D ACTTGTGCAG A/- AAAAAAAAAA 2069 het 2069 ref 41 29 6 7 A 13 12 364276 CASAVA_Build 8 99683627 1D GTTTGTGTCT C/- TTGCAAAATT 3070 het 3070 ref 39 21 17 1 C 1 0 364277 CASAVA_Build 8 99691599 1D TTCAAAACAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 A 11 10 364278 CASAVA_Build 8 99712323 1I TAAACATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 19 8 8 T 9 10 364279 CASAVA_Build 8 99713065 1I ATAGTTTTCG -/T TTTTTTTGTG 3070 het 3070 hom 47 17 23 7 T 7 8 364280 CASAVA_Build 8 99718460 1D ATTTGTAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 25 9 12 T 18 17 364281 CASAVA_Build 8 99723773 2D ACCATCCTTA TC/-- TCTTATTCAC 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 TC 2 1 364282 CASAVA_Build 8 99737890 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 18 8 10 0 A 10 9 364283 CASAVA_Build 8 99756411 2I ATATGTTGAC --/AG CAGTCAAAGA 3070 het 3070 hom 46 22 21 3 AG 0 1 364284 CASAVA_Build 8 99762851 1D AAAAAAAAAT A/- AAAATATAAA 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 5 4 364285 CASAVA_Build 8 99775271 3I TTGAGCAGGA ---/AAG AAGGAGGACA 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 AAG 1 2 364286 CASAVA_Build 8 99804386 1I TAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 20 17 5 A 10 11 364287 CASAVA_Build 8 99838472 1I CCCCGTGGAG -/C CCCCTGTGAC 2618 het 2618 ref 31 18 8 5 C 4 5 364288 CASAVA_Build 8 99840762 1I GGAGATGGGG -/C CCCACGGCCT 3070 het 3070 ref 42 20 15 7 C 3 4 364289 CASAVA_Build 8 99842133 1D TTGAGGGGGT G/- GGGGGCTTCT 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 G 6 5 364290 CASAVA_Build 8 99842531 1D TGACTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1687 hom 27 9 11 7 T 15 14 364291 CASAVA_Build 8 99846269 1I AGATGGAACA -/T TGAAGGACCT 3070 het 3070 hom 45 16 24 5 T 1 2 364292 CASAVA_Build 8 99854386 2D CCTGTAAAAA TC/-- TCTTATTTTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 TC 2 1 364293 CASAVA_Build 8 99864116 1I TTTATCTGCT -/A AAAAAAAAAA 1337 het 1337 ref 35 20 3 12 A 15 16 364294 CASAVA_Build 8 99891991 4I GAGAAATCTC ----/TATT TAAGTTCCTT 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 TATT 0 1 364295 CASAVA_Build 8 99894819 4D TTATGGGGGT TTAA/---- TTAATTATTG 3070 het 3070 hom 29 10 19 0 TTAA 2 1 364296 CASAVA_Build 8 99913649 1D CCTTTTCGTG A/- AAAAAAAAAA 1638 het 546 hom 11 4 4 3 A 12 11 364297 CASAVA_Build 8 99925880 1I TGTGTTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 37 14 13 10 T 8 9 364298 CASAVA_Build 8 99927102 1D TTGCTAATGA C/- AGAAAATCAA 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 C 1 0 364299 CASAVA_Build 8 99963828 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 158 hom 23 1 15 8 T 13 12 364300 CASAVA_Build 8 99978418 6D ATAAAAGAAA AGAAAG/------ AGAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 4 AGAAAG 3 2 364301 CASAVA_Build 8 99993252 4I AATAAAAAAT ----/AAAC AAAGCTTATT 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 AAAC 0 1 364302 CASAVA_Build 8 99993811 1I ATAACAAACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 9 16 A 12 13 364303 CASAVA_Build 8 100011500 2I ATAAATCTCT --/AG AGTCCCATCC 3070 het 3070 hom 61 24 27 10 AG 1 2 364304 CASAVA_Build 8 100019558 1I ATTAAAGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 30 0 25 5 A 11 12 364305 CASAVA_Build 8 100020758 2D GCTTGCTCAA AC/-- ACAGATTGCC 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 AC 2 1 364306 CASAVA_Build 8 100031490 2D GTCTTGAGGT CA/-- CCGAATTTAC 3070 het 2204 hom 15 5 7 3 CA 1 0 364307 CASAVA_Build 8 100056560 5D TTTATTATAA TATAT/----- TATAGTATAC 3070 het 3041 hom 27 7 18 4 TATAT 1 0 364308 CASAVA_Build 8 100057324 2D TGTACCAGGG AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 27 13 10 5 AT 8 7 364309 CASAVA_Build 8 100096967 1I TACTGTCCAA -/T TAAAAAAATG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 T 1 2 364310 CASAVA_Build 8 100100192 1D AATGAGTTTT A/- AAAAATCATA 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 A 6 5 364311 CASAVA_Build 8 100103842 6D ATTAATTATC TTTCTG/------ TTACTGATTT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 TTTCTG 1 0 364312 CASAVA_Build 8 100117144 3I TGTTGAGGAA ---/CCT CCTCCATATT 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 CCT 1 2 364313 CASAVA_Build 8 100125819 2I AGTCAATGTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1395 hom 18 3 9 6 TG 8 9 364314 CASAVA_Build 8 100126805 1D GATGGGATTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 10 9 364315 CASAVA_Build 8 100129444 1D GGTTTTGATA G/- GTCGTGTCAC 3070 het 3070 ref 35 19 14 3 G 2 1 364316 CASAVA_Build 8 100142988 4I CTTCTTTGGG ----/ATTA ATTGAGTATA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 ATTA 0 1 364317 CASAVA_Build 8 100166419 1I TCCTTGTTAA -/C TTTCTGTCTC 2895 het 2895 ref 22 15 6 1 C 0 1 364318 CASAVA_Build 8 100198458 1I AGATGAAAGG -/A ATGACTGATT 3070 het 3070 hom 57 27 26 4 A 1 2 364319 CASAVA_Build 8 100218655 1D ATTTCAACAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 T 10 9 364320 CASAVA_Build 8 100221978 6D CCTTTCTTCT TGCTGC/------ TGCTGCTGCT 3070 het 3070 ref 28 10 10 8 TGC 5 3 364321 CASAVA_Build 8 100229459 1D CATATATGGA T/- TTTTTTTTTT 2172 het 293 hom 31 3 10 18 T 17 16 364322 CASAVA_Build 8 100229794 2D AAAAGATAAA AG/-- TATCTGCTTA 2604 het 2431 hom 16 8 7 2 AG 1 0 364323 CASAVA_Build 8 100232514 1D ATTGTTTTGA T/- TTTTTATTTC 3070 het 3070 ref 51 23 20 9 T 6 5 364324 CASAVA_Build 8 100235563 3I GGTTTTTTTT ---/TTG GTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 TTG 0 1 364325 CASAVA_Build 8 100239798 3D TTAGCCGGGT GTG/--- GTGGTGTGTG 1742 het 1142 hom 9 3 4 4 GTG 3 2 364326 CASAVA_Build 8 100246116 4D CTTCGACTTC TTCT/---- TTGTCTCTTC 3070 het 3070 ref 32 20 10 5 TTCT 1 0 364327 CASAVA_Build 8 100251038 5D GTAGTTAATG TTATT/----- TTAGTCATAA 3070 het 3070 ref 32 17 13 6 TTATT 1 0 364328 CASAVA_Build 8 100270941 1D TTAGACAAGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 T 9 8 364329 CASAVA_Build 8 100284451 2D AGACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1430 het 1039 hom 21 7 6 8 A 16 14 364330 CASAVA_Build 8 100294065 13I GGTGGTCTTT -------------/TTCTCTTCCTACC TTCTCTTCTT 3070 het 3070 hom 41 15 22 7 TTCTCTTCCTACC 0 1 364331 CASAVA_Build 8 100295225 1D GCTGGATGCC T/- TTTTTTTTTT 2774 het 2128 hom 48 13 13 23 T 15 14 364332 CASAVA_Build 8 100310033 1D AGTTTTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 15 1 T 11 10 364333 CASAVA_Build 8 100319276 1D GTTGGGGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 532 hom 27 2 16 9 T 15 14 364334 CASAVA_Build 8 100328254 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1608 hom 23 7 13 4 A 13 12 364335 CASAVA_Build 8 100355118 9D AACCCGGGAG GCAGAGCTT/--------- GCAGAGCTTG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 GCAGAGCTT 2 1 364336 CASAVA_Build 8 100360931 1D CCCAAAGTGC T/- TGAGATTACA 3070 het 3070 ref 31 13 14 5 T 2 1 364337 CASAVA_Build 8 100378791 2D CATTTGTAAC TT/-- TATATTTTGG 3070 het 3070 hom 38 19 17 3 T 3 1 364338 CASAVA_Build 8 100378940 4I AAATCATGTG ----/CTGA CTAATTCTTT 3070 het 3070 hom 49 19 25 5 CTGA 0 1 364339 CASAVA_Build 8 100396742 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 16 14 1 T 13 12 364340 CASAVA_Build 8 100407001 1D GTGTATATCT G/- TGGCTCAAGC 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 G 1 0 364341 CASAVA_Build 8 100407150 11I CACTTTTGGG -----------/AAGAAACAGAC ATATCAGCTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 AAGAAACAGAC 0 1 364342 CASAVA_Build 8 100432823 6D TCCTTCCTCA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 393 het 393 ref 31 19 4 12 AG 9 6 364343 CASAVA_Build 8 100454513 1I GTGGGAGTTG -/A AAAAATGAGA 3070 het 3070 hom 40 15 16 9 A 5 6 364344 CASAVA_Build 8 100459119 1D AAATATTAAA G/- CTGGGTGTCT 3070 het 2528 hom 20 6 13 1 G 1 0 364345 CASAVA_Build 8 100462121 1I TATATATCAG -/T TTTCATAGGG 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 3 4 364346 CASAVA_Build 8 100472770 2I TGTGTGTGTG --/TA AGAGAGAGAG 2763 het 2123 hom 29 9 12 8 TA 0 1 364347 CASAVA_Build 8 100480219 1D GGGACAAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 692 hom 30 2 22 6 T 14 13 364348 CASAVA_Build 8 100500848 3D TTCATAGTCA TCT/--- TCTCTGTCTG 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 TCT 2 1 364349 CASAVA_Build 8 100504836 2I AATTTTTTTT --/TG TTTTTTTTGT 3070 het 464 hom 29 7 16 6 TG 0 1 364350 CASAVA_Build 8 100531216 1D AGAAGAATGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 11 10 364351 CASAVA_Build 8 100542563 1I GTATTACTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 T 11 12 364352 CASAVA_Build 8 100542944 1I GCTAGATAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 9 10 364353 CASAVA_Build 8 100545454 23D AAACACTCTC AGCAATTTTGGCCTATTTATGTT/----------------------- TGTAGTACAT 3070 het 3070 ref 27 16 9 5 AGCAATTTTGGCCTATTTATGTT 1 0 364354 CASAVA_Build 8 100553916 1I GAATGACACT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 9 10 364355 CASAVA_Build 8 100579831 8D AATGTAAATG ATGAGTTA/-------- ATGAGTTAAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ATGAGTTA 2 1 364356 CASAVA_Build 8 100591253 1D TTGAGGAAGA T/- TTTTTTCAAG 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 7 6 364357 CASAVA_Build 8 100614166 1D TTTTATTGTA T/- TTTTTGTGTT 3070 hom 64 het 36 1 31 4 T 6 5 364358 CASAVA_Build 8 100628731 1D ATTATTATAT C/- CCCTGTCCTA 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 C 4 3 364359 CASAVA_Build 8 100632658 2I CAGGCAGTAA --/CT CTATTTTTAA 3070 hom 148 het 56 0 50 6 CT 1 2 364360 CASAVA_Build 8 100633982 1D TTTTATTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 T 13 12 364361 CASAVA_Build 8 100635977 1I TGACCTCAAG -/A AATGTGTGGT 3070 hom 122 het 47 0 41 6 A 2 3 364362 CASAVA_Build 8 100638290 1I GTTAGCATAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 A 9 10 364363 CASAVA_Build 8 100638370 1D TATTGTATTT G/- GGGTCAATTG 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 G 4 3 364364 CASAVA_Build 8 100646770 1D CTCTGTGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 27 0 20 8 T 12 11 364365 CASAVA_Build 8 100647850 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 41 0 28 13 T 13 12 364366 CASAVA_Build 8 100657782 1I ACGGTGACTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 9 10 364367 CASAVA_Build 8 100673957 1I TGTTTGTTAG -/A AAAAAAACTT 3070 het 2910 hom 26 9 14 3 A 7 8 364368 CASAVA_Build 8 100680376 1I ATTTCTAAAC -/T ATTTCTAAAG 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 T 0 1 364369 CASAVA_Build 8 100699367 1I CAGCTGTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 T 9 10 364370 CASAVA_Build 8 100708349 2I AGCCTTAAAA --/AG AGGGGAAAAT 3070 hom 105 het 49 0 36 14 AG 1 2 364371 CASAVA_Build 8 100712087 2I AATGTAGGGG --/AA AAAAAAAACC 3070 het 2506 hom 19 7 8 4 A 8 10 364372 CASAVA_Build 8 100712590 3D TATGTCTGTC TTG/--- TTGTTCCAGG 3070 het 3070 ref 33 23 8 4 TTG 2 1 364373 CASAVA_Build 8 100728800 8D ACCCCGTCTC TACAAAAA/-------- TACAAAAATT 1685 het 1685 ref 14 7 5 2 TACAAAAA 2 1 364374 CASAVA_Build 8 100730354 2D TGCGAGTACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3023 hom 33 12 17 4 T 12 10 364375 CASAVA_Build 8 100734870 1D TGTGACTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 338 hom 30 1 23 6 T 17 16 364376 CASAVA_Build 8 100743845 4D TTTATTTAAT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2744 hom 21 7 13 1 TTTA 5 4 364377 CASAVA_Build 8 100748703 2I AAAATTATAC --/AT ATGACTTATC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AT 1 2 364378 CASAVA_Build 8 100749760 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2437 het 1794 hom 30 11 10 17 A 17 16 364379 CASAVA_Build 8 100750671 1I TGAAATGCAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 9 10 364380 CASAVA_Build 8 100751651 14D TTTTCTGGAG TAGAAAATGAGGAA/-------------- TAAATAATGT 3070 het 3070 ref 38 20 18 6 TAGAAAATGAGGAA 1 0 364381 CASAVA_Build 8 100757967 1D CTCTGAATTT G/- CTACTTGGGG 3070 het 3070 hom 32 10 20 3 G 1 0 364382 CASAVA_Build 8 100759145 1I GTCATTTAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 16 19 8 T 9 10 364383 CASAVA_Build 8 100759974 1I TCTGATTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 30 2 24 4 T 12 13 364384 CASAVA_Build 8 100764801 3I TATTTCTGGG ---/ATT ATTATTGGAA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 ATT 2 3 364385 CASAVA_Build 8 100769240 1D GTTAAGTTCC T/- TTTTTTTTTA 1781 het 1781 ref 46 37 4 5 T 10 9 364386 CASAVA_Build 8 100780150 3I TGCTCTGTCT ---/TAA TGATGCTTAT 3070 het 3070 hom 65 26 30 9 TAA 0 1 364387 CASAVA_Build 8 100792051 1D GGTTTACTAT C/- CTGTAAGTGA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 2 1 364388 CASAVA_Build 8 100796497 1I AATAGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3044 het 1198 hom 21 4 8 9 T 13 14 364389 CASAVA_Build 8 100802973 2I TTGTTATTCC --/CT GAGTTTAATA 3070 het 3070 hom 52 23 28 1 CT 0 1 364390 CASAVA_Build 8 100813306 1I TCTAAGCCTG -/A AATCAACCCT 3070 het 3070 ref 36 15 12 9 A 2 3 364391 CASAVA_Build 8 100818163 1I TTTTTACTTA -/T TTTTATATTT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 4 5 364392 CASAVA_Build 8 100832736 3D TTATTATATG AGA/--- AGAAGATCTC 3070 het 3070 hom 43 17 21 7 AGA 3 2 364393 CASAVA_Build 8 100846761 2D TTTGAATCTC TT/-- TGAGTATTGG 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 T 3 1 364394 CASAVA_Build 8 100847792 1I CTGGCTGGCA -/C CCTTCATTGC 3070 het 3070 ref 31 16 14 1 C 2 3 364395 CASAVA_Build 8 100852810 1I TTCATGTGAT -/A AAAAATTAAA 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 A 5 6 364396 CASAVA_Build 8 100868690 2D ATGAAGAGAA AC/-- ATGGACACAA 3070 het 3070 ref 41 21 18 3 AC 1 0 364397 CASAVA_Build 8 100873847 4I ATTTTTAGTT ----/AATC AAGAGAGAAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 AATC 0 1 364398 CASAVA_Build 8 100877752 1D TGAGCATGAA T/- TTTTTTTTTT 2547 het 2547 ref 31 18 6 7 T 13 12 364399 CASAVA_Build 8 100883572 1D AAAAAAAAAA C/- AAGCTGTGGC 3070 het 3070 hom 36 18 12 6 C 1 0 364400 CASAVA_Build 8 100886472 2D TATTACCAGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 2605 hom 16 6 8 2 AT 8 7 364401 CASAVA_Build 8 100886647 1D TATAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 A 11 10 364402 CASAVA_Build 8 100890201 1D AGTACATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 A 12 11 364403 CASAVA_Build 8 100896964 3D ACACACCCAG AAT/--- AATGTTTGAC 3070 het 3070 ref 61 28 25 13 AAT 2 1 364404 CASAVA_Build 8 100897062 4I ATACTGTGTA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 62 25 22 15 TG 6 8 364405 CASAVA_Build 8 100902454 1I CATTGTGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1469 hom 23 5 10 8 A 13 14 364406 CASAVA_Build 8 100936039 17D TAGCAACTTG CAGGCACAGAGCCCTTT/----------------- CTTAGCACAC 3070 het 3070 ref 37 23 13 6 CAGGCACAGAGCCCTTT 1 0 364407 CASAVA_Build 8 100957499 3D AATTTGGGTC TAT/--- TATTAACTCT 3070 het 3070 hom 38 17 18 4 TAT 2 1 364408 CASAVA_Build 8 100957769 3D TACAACAGTC TGA/--- TGATTGATTG 3070 het 3070 hom 67 29 30 9 TGA 2 1 364409 CASAVA_Build 8 100963986 1I TAAACAAAAT -/A GACTACAATA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 A 0 1 364410 CASAVA_Build 8 100964155 4D AATTATATGT AAAC/---- AAACTGGATG 3070 het 3070 ref 25 12 10 5 AAAC 2 1 364411 CASAVA_Build 8 100964196 1D TACATAACTC A/- AAAAAAAATT 1578 het 1578 ref 19 12 4 5 A 9 8 364412 CASAVA_Build 8 100968082 5D GCTTTAAAAA GAAAG/----- GAAATTCTGA 3070 het 3070 ref 54 34 20 2 GAAAG 1 0 364413 CASAVA_Build 8 100987634 1D GAGCCACAAC T/- TTTTTTTTTT 2526 het 2526 ref 29 13 8 8 T 11 10 364414 CASAVA_Build 8 101022170 1D TGCATGTCTT G/- TGTTTATCTT 3070 het 3070 hom 28 12 13 3 G 1 0 364415 CASAVA_Build 8 101040535 1I TGTTGAAAGG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 417 hom 33 1 29 3 A 9 10 364416 CASAVA_Build 8 101043470 1D TTTTTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 36 0 29 7 T 11 10 364417 CASAVA_Build 8 101045474 2D ATCATCCCTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 TC 7 6 364418 CASAVA_Build 8 101056550 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 16 1 A 10 11 364419 CASAVA_Build 8 101065842 1D TTATAACTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 10 9 364420 CASAVA_Build 8 101079802 1I TATGTGGCAG -/T TGTTGAGATT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 1 2 364421 CASAVA_Build 8 101097776 1I GCCCTTCCAC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 397 hom 41 1 34 6 T 8 9 364422 CASAVA_Build 8 101099834 4D ATAAATGAAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 96 het 41 0 33 10 AC 9 7 364423 CASAVA_Build 8 101101350 16D GTGCAATGGT GCAATCTCGGCTCACC/---------------- GCAACCTCCG 2958 het 183 hom 11 1 7 3 GCAATCTCGGCTCACC 1 0 364424 CASAVA_Build 8 101115152 1D GCAGCACATC A/- AAAAGCTTAT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 A 5 4 364425 CASAVA_Build 8 101119738 2D TCCCCCTCTA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 35 0 27 8 T 11 9 364426 CASAVA_Build 8 101124723 1I TTGAACCTGT -/C CCCTCTATTC 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 C 3 4 364427 CASAVA_Build 8 101129367 1D TGTGTGTACT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 53 het 21 0 18 5 G 9 8 364428 CASAVA_Build 8 101150339 1D22M1I ACCCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAG-/-AAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAGA AAAAAATACT 3070 het 12 hom 27 1 24 5 N/A 0 0 364429 CASAVA_Build 8 101153824 1D CCCTGGTACG T/- TTTTAATTCT 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 T 5 4 364430 CASAVA_Build 8 101154834 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 44 0 32 12 A 12 11 364431 CASAVA_Build 8 101173470 2D GCATAGATAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 93 het 41 0 32 9 AT 7 6 364432 CASAVA_Build 8 101185045 1I AAGTCCCACG -/A AAACAGGGGT 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 A 3 4 364433 CASAVA_Build 8 101191349 1D GATGTAGCTG A/- AAAACACAGC 3070 het 3070 ref 42 23 14 5 A 5 4 364434 CASAVA_Build 8 101194350 4D TGCACCAATA ACAG/---- ACAAACAGAG 3070 het 3070 ref 27 17 10 0 ACAG 1 0 364435 CASAVA_Build 8 101214702 4D GTCTTCCTAG TTAT/---- TAATATTCAG 3070 het 3070 hom 28 15 13 1 TTAT 1 0 364436 CASAVA_Build 8 101218459 1D CAAGATGTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 408 hom 33 1 32 0 T 10 9 364437 CASAVA_Build 8 101224015 1I TAAACACCTT -/G GGGAATGTGT 3070 hom 129 het 51 0 43 8 G 3 4 364438 CASAVA_Build 8 101224534 5D AATAAATCTT AACTC/----- AAAGCTAACA 3070 het 3070 ref 36 20 15 2 AACTC 1 0 364439 CASAVA_Build 8 101225053 5I AATATTAAAT -----/TAATA AAGTAGAATG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 TAATA 0 1 364440 CASAVA_Build 8 101229648 5D GTGAAAGACT ATATC/----- ATATCTCCTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 4 ATATC 2 1 364441 CASAVA_Build 8 101238499 1D TCATTTACTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 27 0 24 5 T 9 8 364442 CASAVA_Build 8 101251389 1I AAGAGGCTGG -/A AAAAAAAAAA 2827 het 2632 hom 19 7 7 5 A 10 11 364443 CASAVA_Build 8 101256375 2D ATTTCATGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 31 0 19 13 T 16 14 364444 CASAVA_Build 8 101275166 4D TATTTTAAAT AAAC/---- AAACAGCGTA 3070 het 3070 hom 42 17 23 4 AAAC 2 1 364445 CASAVA_Build 8 101275395 1I AAAGGCCACC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 2671 hom 26 7 15 4 A 8 9 364446 CASAVA_Build 8 101275636 3I AGAAGGAAAA ---/GAC AGCGGAAGAA 3070 het 3070 ref 35 22 11 2 GAC 0 1 364447 CASAVA_Build 8 101279674 4D TCCAGGAGTT CAAA/---- CAATCAACAA 3070 het 3070 ref 40 25 13 4 CAAA 1 0 364448 CASAVA_Build 8 101282196 4D TTTGATGGGG TTGT/---- TTGTTTTTTT 1313 hom 7 het 3 0 3 1 TTGT 2 1 364449 CASAVA_Build 8 101283747 1I CCATTTGTTT -/A AAAAAAAAAA 2660 het 2660 ref 24 12 6 6 A 11 12 364450 CASAVA_Build 8 101285917 1D TTGGAGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 31 1 24 7 A 12 11 364451 CASAVA_Build 8 101291031 2D TAATAACAAT AA/-- GTCTTCCTAT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 2 0 364452 CASAVA_Build 8 101291596 1D GTTTTCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 13 11 T 14 13 364453 CASAVA_Build 8 101294298 1D GGAAGCCGCA G/- GGGGCCTCGA 2331 hom 41 het 17 0 13 4 G 5 4 364454 CASAVA_Build 8 101301598 8D TTTGAGAGTT CAGTACTG/-------- CAGTATCTAT 3070 het 3070 ref 46 33 11 5 CAGTACTG 1 0 364455 CASAVA_Build 8 101315764 1I GGTGTGTGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 42 0 36 6 A 9 10 364456 CASAVA_Build 8 101320170 3D TTTAAGCCAC TTA/--- TTATTTGTTC 3070 hom 99 het 37 0 34 5 TTA 2 1 364457 CASAVA_Build 8 101326876 3D GCTATTATAT TTC/--- TTTTTTTTCT 1909 het 336 hom 21 3 11 8 TTC 1 0 364458 CASAVA_Build 8 101329159 1D CTTCATTTGC A/- AAAAAAACTG 3070 hom 120 het 49 0 40 10 A 8 7 364459 CASAVA_Build 8 101338222 1D AAATTCAACC A/- ATTTACTCAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 2 1 364460 CASAVA_Build 8 101359194 1D AAAGACCCTA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 34 10 17 7 T 8 7 364461 CASAVA_Build 8 101376017 1D AGTAAGACTC T/- TGATTTTCTG 3070 het 3070 ref 49 21 16 12 T 2 1 364462 CASAVA_Build 8 101414485 1D TCTAGTATGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2848 hom 35 7 20 9 A 10 9 364463 CASAVA_Build 8 101453644 2I TGTGTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 48 17 19 12 TG 7 8 364464 CASAVA_Build 8 101464318 2I TTCAAAATCT --/AA AATGGTGCAT 2514 het 2514 ref 13 6 6 1 A 2 4 364465 CASAVA_Build 8 101499218 8I CATCCTGAGT --------/AGCTGGGA TTACAGGCGC 3070 het 3070 hom 18 8 8 2 AGCTGGGA 0 1 364466 CASAVA_Build 8 101500870 1D GTGGTTAGGA G/- GGAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 47 24 19 6 G 3 2 364467 CASAVA_Build 8 101505093 1I CCTCCTACTA -/G GTTCTCAATA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 G 1 2 364468 CASAVA_Build 8 101508025 3D CACCACCACT ACC/--- ACCACCACCA 985 het 985 ref 66 27 6 36 ACC 5 4 364469 CASAVA_Build 8 101578955 2D CAGATGGTTG GC/-- GGGGGGGCCT 3070 het 2597 hom 28 9 13 7 GC 1 0 364470 CASAVA_Build 8 101579090 1I CCTGGCTAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 11 5 T 10 11 364471 CASAVA_Build 8 101588720 4I CTTTCTTTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 TTTC 2 3 364472 CASAVA_Build 8 101604568 1I ACCATCTCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 T 9 10 364473 CASAVA_Build 8 101605908 1I ACACCCAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 12 13 364474 CASAVA_Build 8 101606419 6D TAAAAAGGAA TTAAAC/------ TTAGAGTTAT 3070 het 3070 hom 32 17 15 4 TTAAAC 1 0 364475 CASAVA_Build 8 101619644 1I AATAAATATG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 2595 hom 21 6 12 3 A 8 9 364476 CASAVA_Build 8 101629515 1I CTCAATACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 12 13 364477 CASAVA_Build 8 101631932 1I ATTTTCTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 11 13 T 14 15 364478 CASAVA_Build 8 101635722 1D GAACAGCACT A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 23 9 12 3 A 8 7 364479 CASAVA_Build 8 101642097 1D ACATTATGAG T/- TTTTTTTTTT 2631 het 2631 ref 27 12 8 7 T 13 12 364480 CASAVA_Build 8 101642652 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 16 4 A 12 11 364481 CASAVA_Build 8 101657355 1I GCATGCTGCT -/A AAAATGGGTG 3070 het 3070 ref 48 23 19 6 A 4 5 364482 CASAVA_Build 8 101662732 6D4M2D TCTATATCTA TCTATCTATCTA/------TATC-- TATATATATA 1523 het 375 hom 6 2 4 1 N/A 0 0 364483 CASAVA_Build 8 101670706 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1758 hom 15 het 13 0 4 9 A 17 16 364484 CASAVA_Build 8 101731468 1I ATACCAGAAG -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 31 13 12 6 C 8 9 364485 CASAVA_Build 8 101741022 1I TTTTTAAGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 8 9 364486 CASAVA_Build 8 101744644 1D TGCGCAGATA C/- CCCCCCCAAT 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 C 8 7 364487 CASAVA_Build 8 101746357 1I TACCTCCCCA -/T CCCTGAGCCG 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 T 0 1 364488 CASAVA_Build 8 101749065 1I ATGATGCAAC -/A ATAACAAAGC 3070 het 3070 hom 44 18 19 7 A 1 2 364489 CASAVA_Build 8 101760232 2I CCTAACAAAC --/TA TGTTATAAAC 3070 het 3070 ref 41 18 20 3 TA 0 1 364490 CASAVA_Build 8 101768637 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 A 10 11 364491 CASAVA_Build 8 101776559 1D TGGGTGTAAT A/- AAAACAAAGA 3070 het 3070 ref 33 22 11 0 A 5 4 364492 CASAVA_Build 8 101782673 2D CATAGCACTC AA/-- CAGACCATGA 3070 het 3070 hom 62 22 29 12 A 2 0 364493 CASAVA_Build 8 101783202 1I AAAATCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 A 11 12 364494 CASAVA_Build 8 101791559 1I TGCCTTTGAG -/A AAAAAAGTAG 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 A 6 7 364495 CASAVA_Build 8 101794213 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 103 hom 31 3 15 13 A 12 11 364496 CASAVA_Build 8 101795330 1I AAAGACAGGG -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 42 22 16 4 A 8 9 364497 CASAVA_Build 8 101809016 6D GGGGAGGGGC AAAAAT/------ AAAAATAAAA 2739 het 2739 ref 29 16 9 6 AAAAAT 2 1 364498 CASAVA_Build 8 101829019 1D AAAACAACAA C/- AAAAAAACCA 3070 het 2054 hom 36 8 21 7 C 1 0 364499 CASAVA_Build 8 101848821 1D CAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 11 10 364500 CASAVA_Build 8 101868933 4I TGGAAGACTT ----/TATC TATAGGGGAG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 TATC 0 1 364501 CASAVA_Build 8 101869887 1I GTAAAAAGCC -/A AAAAAAAGGG 3070 het 2746 hom 27 9 12 6 A 7 8 364502 CASAVA_Build 8 101875248 1I AATGGCACTG -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 44 13 19 12 C 8 9 364503 CASAVA_Build 8 101898428 1I TTGTGGGGGG -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 25 0 22 3 A 8 9 364504 CASAVA_Build 8 101903393 4I CTTTGCTGTT ----/GAAA GAAAGGAGTT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 GAAA 1 2 364505 CASAVA_Build 8 101907478 2I CAGCTGAGAC --/AG AGATGCAGAA 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 AG 1 2 364506 CASAVA_Build 8 101930161 1D TCTGTAAGTT G/- GGGGTAACAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 5 4 364507 CASAVA_Build 8 101969840 1I GGTTCCTCAA -/G GTCTCCATGC 3070 hom 135 het 49 0 43 6 G 1 2 364508 CASAVA_Build 8 101972669 1D AGCAGGCAGT C/- CCCACCTGCA 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 C 4 3 364509 CASAVA_Build 8 101987918 1I TTCAGTAGAC -/T GATAGATATA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 0 1 364510 CASAVA_Build 8 101988624 16D CCTGGAAGGC TGTCAGGAGACAGTTT/---------------- TGTCACAGGA 3070 het 3070 ref 38 17 13 15 TGTCAGGAGACAGTTT 1 0 364511 CASAVA_Build 8 101996007 1D GTTTTCCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 22 17 2 A 10 9 364512 CASAVA_Build 8 101997210 2D AAGAAAAAAG CC/-- CCCTTTTTTT 3070 het 504 hom 25 4 16 6 C 5 3 364513 CASAVA_Build 8 101998303 5D TTTCACACTT AGAAA/----- AGAATCCAAG 3070 het 3070 ref 44 23 21 0 AGAAA 1 0 364514 CASAVA_Build 8 101998835 1D TTAAAAAAAA C/- ATACCAGGGT 2138 het 2138 ref 24 13 6 5 C 1 0 364515 CASAVA_Build 8 102007454 1D CCATTCTTAC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 28 11 12 6 A 9 8 364516 CASAVA_Build 8 102037718 1I CCAGCTACTT -/G GGGGGGCTGA 3070 het 3070 hom 26 8 16 2 G 6 7 364517 CASAVA_Build 8 102044980 13D ACTAAAAATT AAAAAAAAAAAAA/------------- AAAAAAAAAA 2895 het 1282 hom 17 5 10 3 A 24 11 364518 CASAVA_Build 8 102063833 4I GGCCATGGAC ----/CAGG CAGGCTTCAT 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 CAGG 1 2 364519 CASAVA_Build 8 102070263 2D GCTTCTTTGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2799 hom 32 10 16 7 T 12 10 364520 CASAVA_Build 8 102077079 1I TTTCTATGCA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 8 9 364521 CASAVA_Build 8 102081673 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2031 het 623 hom 17 5 9 3 A 15 16 364522 CASAVA_Build 8 102130721 4I TCCTTCCTTC ----/TCTT TCTTTCTTTT 1656 het 1656 ref 17 9 5 3 TCTT 2 3 364523 CASAVA_Build 8 102148362 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2578 hom 33 7 18 8 A 13 14 364524 CASAVA_Build 8 102166012 2D GCCCTGCCAA TT/-- TTTTTTTTTT 1350 het 196 hom 15 2 5 8 T 18 16 364525 CASAVA_Build 8 102169609 1D TTATTCATAC T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 44 23 14 7 T 9 8 364526 CASAVA_Build 8 102174266 3D TCTTCTTTCT TTC/--- TTTCTTTCCT 1275 het 1275 ref 23 13 4 6 TTC 1 0 364527 CASAVA_Build 8 102183577 2I TAATTATGAT --/TA TGATTATTGT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 TA 0 1 364528 CASAVA_Build 8 102186677 1I ATCCAAATAG -/T TTTTTTTTTT 2203 het 2203 ref 25 9 6 10 T 11 12 364529 CASAVA_Build 8 102192095 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 4 A 11 10 364530 CASAVA_Build 8 102204429 5I GAGTTGTTTT -----/TTTTG TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 TTTTG 0 1 364531 CASAVA_Build 8 102218349 20I AGGAAGTTAA --------------------/CCCGGCTGTGCCTAGTGACC CCTTTCCAGT 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 CCCGGCTGTGCCTAGTGACC 0 1 364532 CASAVA_Build 8 102284576 1D GGATTAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1310 het 1310 ref 41 33 4 4 A 11 10 364533 CASAVA_Build 8 102307377 1I TTTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1231 het 489 hom 21 2 5 14 T 17 18 364534 CASAVA_Build 8 102356017 2I GTGTTGCATA --/AC ACAAATGACC 3070 het 3070 ref 26 9 11 6 AC 1 2 364535 CASAVA_Build 8 102368128 1D AAAATGGAGA T/- TAAAATCTAC 2846 het 2846 ref 23 16 6 1 T 2 1 364536 CASAVA_Build 8 102382988 4D TAGAACTGGG TTTA/---- TTTGTCTAAG 3070 het 3070 ref 37 18 12 12 TTTA 1 0 364537 CASAVA_Build 8 102446309 1D ATTTAAAACA T/- TTTTTTTTTT 1396 het 1396 ref 33 24 3 7 T 11 10 364538 CASAVA_Build 8 102503523 1I AGACTCCATT -/A AAAAAAAAAA 1450 het 1450 ref 23 9 7 7 A 14 15 364539 CASAVA_Build 8 102506514 1D GCCATTTCCA T/- TTTTTTTTTT 1021 het 1021 ref 25 9 7 9 T 17 16 364540 CASAVA_Build 8 102525457 1I AAATAATAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 8 9 364541 CASAVA_Build 8 102526959 2I GGCTAACACA --/GT GAAACCCCGT 931 hom 5 het 7 0 3 4 GT 0 1 364542 CASAVA_Build 8 102533414 1D GACTCAGAAG T/- TTTCAGCAGC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 T 4 3 364543 CASAVA_Build 8 102534764 1D CTACCTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 11 10 364544 CASAVA_Build 8 102538582 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 29 0 23 6 A 11 10 364545 CASAVA_Build 8 102564786 5D TTTTCTTTTC TTTTT/----- ATTGTCCATT 3070 het 3070 hom 27 11 13 5 T 5 0 364546 CASAVA_Build 8 102567669 2D TCTTAAAATT TA/-- AAAAAAAAAA 1469 het 1469 ref 48 18 11 19 TA 1 0 364547 CASAVA_Build 8 102582256 4D TGGAAATGGT AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 13 8 A 14 10 364548 CASAVA_Build 8 102583442 1D CAAATCATTG T/- TTTTTGGTTC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 6 5 364549 CASAVA_Build 8 102588649 1I TTCAAGATTT -/A AAAAATGTTC 3070 hom 67 het 28 0 23 5 A 5 6 364550 CASAVA_Build 8 102589793 1D TTTACTCAGG T/- TTTTTTTTTT 1370 het 1370 ref 30 16 3 11 T 15 14 364551 CASAVA_Build 8 102599129 21D TCAGACTTTC ATGTCCGTTTGCAGTCATTTG/--------------------- ATGCAAGCAT 3070 het 3070 ref 36 27 14 5 ATGTCCGTTTGCAGTCATTTG 1 0 364552 CASAVA_Build 8 102600455 10D ACACAATTTC TGTCCATTTT/---------- TGTTAGGTTT 3070 het 3070 ref 39 27 12 3 TGTCCATTTT 1 0 364553 CASAVA_Build 8 102600815 1D ATTACTTGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 63 het 25 0 22 4 T 9 8 364554 CASAVA_Build 8 102606355 1I TCAACATATC -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 26 0 20 6 T 9 10 364555 CASAVA_Build 8 102610837 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 20 0 13 7 A 15 16 364556 CASAVA_Build 8 102612627 2D ACCTTATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 40 2 21 17 A 18 16 364557 CASAVA_Build 8 102628639 2D CAGCAGTCTG TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 11 9 364558 CASAVA_Build 8 102631583 2D TATGCAGGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 12 10 364559 CASAVA_Build 8 102636266 4D TTAGTTTTAA TTAT/---- TCATTTTTTA 3070 hom 78 het 31 0 26 6 TTAT 1 0 364560 CASAVA_Build 8 102642560 1I TTCGAAGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 11 5 T 13 14 364561 CASAVA_Build 8 102647794 10D CTGTTATTTA ACTTTGCAGC/---------- ACCATTTGAC 3070 hom 75 het 28 0 26 5 ACTTTGCAGC 1 0 364562 CASAVA_Build 8 102677171 1D ATACCCTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 52 het 21 0 18 3 A 10 9 364563 CASAVA_Build 8 102677537 1I AAATAAAAAT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 8 9 364564 CASAVA_Build 8 102758932 1D CTGGTATTGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 38 0 31 7 A 10 9 364565 CASAVA_Build 8 102778230 1I TTATAGCACT -/A AAATGCCCAC 3070 hom 96 het 38 0 31 7 A 3 4 364566 CASAVA_Build 8 102783637 1D AGTGTCATTC T/- TTTTTTTTTT 1634 het 1634 ref 38 20 5 13 T 12 11 364567 CASAVA_Build 8 102784557 1D TCTGTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 366 hom 30 1 21 9 T 13 12 364568 CASAVA_Build 8 102788285 12D TTTGCAATAA GATAAATCCCCT/------------ GATAAGAAAG 3070 hom 144 het 54 0 49 10 GATAAATCCCCT 1 0 364569 CASAVA_Build 8 102794898 1D CAAGGAACTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 9 8 364570 CASAVA_Build 8 102802573 2D CGTCTATTGG AA/-- AAAAAAAACC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 10 8 364571 CASAVA_Build 8 102819957 5D TCAAAAAAAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 2686 hom 22 het 15 0 8 7 A 20 15 364572 CASAVA_Build 8 102823039 1D CAGTGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 26 2 20 4 A 11 10 364573 CASAVA_Build 8 102823495 1D GTCTCTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 69 hom 13 1 10 2 A 13 12 364574 CASAVA_Build 8 102823635 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 11 10 364575 CASAVA_Build 8 102824687 1D CAGTAGGTCC A/- AAGCATGATA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 A 3 2 364576 CASAVA_Build 8 102828598 3D CTGGCGTCTT CTC/--- CTCCTTCCCA 3070 hom 141 het 51 0 46 6 CTC 2 1 364577 CASAVA_Build 8 102831627 1D CCCACCGGGT C/- CCCCCCCCAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 C 9 8 364578 CASAVA_Build 8 102840238 1D TGTAAAATAC T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 T 9 8 364579 CASAVA_Build 8 102847777 1I CATAAAAAAT -/A ACATGAAAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 364580 CASAVA_Build 8 102849794 3D GTTGTAGGAG GGC/--- GGCCAATGAG 3070 hom 85 het 31 0 28 3 GGC 2 1 364581 CASAVA_Build 8 102862588 2D ATATACCAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 AT 6 5 364582 CASAVA_Build 8 102863476 5D AGTATATATA TATTG/----- TATGTTTTAT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 TATTG 1 0 364583 CASAVA_Build 8 102881770 4D TACTAAAAAT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 AAAC 3 2 364584 CASAVA_Build 8 102898981 2I AGCAGCTACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 122 het 48 0 39 9 A 10 12 364585 CASAVA_Build 8 102909964 1I AATTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 549 hom 25 2 17 6 T 12 13 364586 CASAVA_Build 8 103025384 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 33 0 30 3 A 9 8 364587 CASAVA_Build 8 103104752 1D TCACACTGGG T/- TTAGAACGAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 3 2 364588 CASAVA_Build 8 103116642 1I TCAAAAAGGT -/G GAGCCATGCT 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 G 1 2 364589 CASAVA_Build 8 103118796 3I ATTATACTAT ---/AGA AGAATATTTA 2257 het 2257 ref 18 12 5 1 AGA 1 2 364590 CASAVA_Build 8 103118862 5D TGAAGCTACC AAATT/----- ATAGTTCGTA 3070 het 3070 ref 32 21 11 1 AAATT 1 0 364591 CASAVA_Build 8 103119059 1D TTTTTTTTTT G/- ATTAACATAT 2644 het 2644 ref 27 18 9 0 G 1 0 364592 CASAVA_Build 8 103121876 2D AGAATCCATC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 12 10 364593 CASAVA_Build 8 103122100 7I TGGTTGCTTC -------/CTTTTGT CCAACAGGAT 3070 het 3070 ref 52 28 18 6 CTTTTGT 0 1 364594 CASAVA_Build 8 103122369 5D TTTAAGGGGT GGTTA/----- GGTTACAGGT 3070 het 3070 hom 46 18 23 6 GGTTA 2 1 364595 CASAVA_Build 8 103124118 9I AATCAGTGAA ---------/GAGCCAGAG GACAGAGGGC 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 GAGCCAGAG 0 1 364596 CASAVA_Build 8 103128556 1D GATCTCGTTC T/- TTTTACATGG 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 T 5 4 364597 CASAVA_Build 8 103132844 1I CTCCCCAAAG -/C CAATTCTCAC 3070 het 3070 hom 43 16 22 5 C 1 2 364598 CASAVA_Build 8 103141632 6D TGATCTGCCC GCCTTG/------ GCCTCCCAAA 3070 het 2791 hom 30 8 19 4 GCCTTG 1 0 364599 CASAVA_Build 8 103150602 1D TTCTCACCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 11 10 364600 CASAVA_Build 8 103153138 4D ATTTTAAAAC AATA/---- AATACCATTT 3070 hom 90 het 34 0 30 4 AATA 2 1 364601 CASAVA_Build 8 103153482 1D AAGACCTACT A/- TAAAACTATA 3070 het 3070 hom 42 19 22 1 A 1 0 364602 CASAVA_Build 8 103154936 1D TATTTTATGC T/- TTTTTTTTTT 2603 het 1772 hom 16 4 6 6 T 11 10 364603 CASAVA_Build 8 103158118 1I ACCATGTACC -/T CAAATGCTGG 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 0 1 364604 CASAVA_Build 8 103158846 1D AATGCCTCTG A/- AATTGTTTCG 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 A 3 2 364605 CASAVA_Build 8 103167003 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 9 8 364606 CASAVA_Build 8 103169394 1D GATTAATGGG A/- AAAAAAAGGA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 8 7 364607 CASAVA_Build 8 103179635 1I TGTCCCCTTA -/C CCTCTGGCTT 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 2 3 364608 CASAVA_Build 8 103181410 9I GAAGAAGAAG ---------/AAGAAGAAA AAGAAAAAGA 2523 het 2523 ref 28 16 8 4 AAGAAGAAA 0 1 364609 CASAVA_Build 8 103184650 1I ACACACTCTA -/C CCCTTTCTCT 3070 hom 87 het 34 0 26 8 C 3 4 364610 CASAVA_Build 8 103190705 1D AAATGAAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 9 11 T 12 11 364611 CASAVA_Build 8 103207706 1I CTCTACTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 10 11 364612 CASAVA_Build 8 103231192 5I AAAGATTAGC -----/AAGTA GAGTAACCTG 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 AAGTA 0 1 364613 CASAVA_Build 8 103232933 3I AATAAGTTGT ---/GCC GCCTAATTTA 3070 het 3070 ref 53 27 20 6 GCC 1 2 364614 CASAVA_Build 8 103269986 2D GCTTGCAAGG GA/-- GAACAAAATG 3070 het 3070 hom 42 11 24 8 GA 2 1 364615 CASAVA_Build 8 103271804 9D AGAGGTGCCG TGGAAGTTC/--------- AAAACCCAGC 3070 het 3070 ref 38 22 14 5 TGGAAGTTC 1 0 364616 CASAVA_Build 8 103276747 28D CGTACATATG TGTATATACACACACATATGTACATATA/---------------------------- TGTATATACA 2926 het 2926 ref 34 18 12 11 TGTATATACACACACATATGTACATATA 2 1 364617 CASAVA_Build 8 103284875 1I GTACTTTTTT -/C TTTCTTCCAG 3070 het 3070 hom 28 9 15 4 C 0 1 364618 CASAVA_Build 8 103287321 20D GTTAGGTTTA TTGCTATTATAAATAAGCTT/-------------------- CACATTAAGG 3070 het 3070 ref 26 17 9 6 TTGCTATTATAAATAAGCTT 1 0 364619 CASAVA_Build 8 103287643 1I TACAACCTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 46 25 12 9 A 9 10 364620 CASAVA_Build 8 103295099 2D54M1I GTTATTAAAA ATACAAAACAAATAAAAAATCATCACTGTTCTCCAGTCACTAAAAATGTAAAAAAA-/--ACAAAACAAATAAAAAATCATCACTGTTCTCCAGTCACTAAAAATGTAAAAAAAC AAAGCTACTA 3070 het 3070 hom 37 22 22 14 N/A 0 0 364621 CASAVA_Build 8 103299232 1I AAAAAGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 446 hom 37 3 25 9 A 13 14 364622 CASAVA_Build 8 103305873 1D CCACCATGCC T/- TGGCCTCACT 3070 het 3070 ref 26 17 8 1 T 2 1 364623 CASAVA_Build 8 103310999 1I ACCCCTCAGG -/T TTTTTTTTCG 3070 het 357 hom 41 1 38 2 T 8 9 364624 CASAVA_Build 8 103314129 1I CTCTCTGATA -/C AGATTGCTGG 3070 hom 135 het 46 0 45 1 C 0 1 364625 CASAVA_Build 8 103320016 1I GCAGAGCAGC -/G GAGCGGGACG 3070 het 1402 hom 26 6 10 10 G 1 2 364626 CASAVA_Build 8 103321277 2D CTGGGGGAAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 62 het 26 0 19 8 GT 9 8 364627 CASAVA_Build 8 103322547 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 13 14 364628 CASAVA_Build 8 103322802 2D GGATCAAAAG AT/-- AACATTGGGG 3070 het 3070 ref 28 11 11 7 AT 1 0 364629 CASAVA_Build 8 103325268 3D TGGCCACAAC AAT/--- ATTTCTGGTA 3070 het 3070 ref 44 22 18 8 AAT 1 0 364630 CASAVA_Build 8 103328507 4D GTTTTTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 TTTG 3 2 364631 CASAVA_Build 8 103364069 1D AACTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 1130 het 907 hom 16 7 5 4 A 17 16 364632 CASAVA_Build 8 103364756 6D GGGGGGGGGG GGGGGT/------ GAGTAGGGGA 3070 het 92 hom 18 2 15 7 GGGGGT 1 0 364633 CASAVA_Build 8 103365676 4D GTGATTTGAG AAAA/---- AAAGAGCAGC 3070 het 3070 hom 36 16 20 2 A 7 3 364634 CASAVA_Build 8 103369449 1D AAAAAATAAG T/- TTGACCATTT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 T 3 2 364635 CASAVA_Build 8 103371772 1I GCCTTCAAAC -/A AAACAGATAA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 A 3 4 364636 CASAVA_Build 8 103373739 3D CACATGAGAT CTC/--- CTTCTGGGAA 3070 het 3070 ref 53 28 18 7 CTC 1 0 364637 CASAVA_Build 8 103375994 1D GGTTGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 14 het 32 1 23 11 T 11 10 364638 CASAVA_Build 8 103379245 1D ACACACTATA C/- ATCAGCCATC 3070 het 3070 hom 50 17 30 3 C 1 0 364639 CASAVA_Build 8 103381888 2I ACATTAAAAC --/AA AAAAAGTTTC 3070 hom 117 het 43 0 40 3 A 5 7 364640 CASAVA_Build 8 103393078 1D CCAGACCCCC T/- AACCTCACAA 3070 het 3070 hom 41 13 25 4 T 1 0 364641 CASAVA_Build 8 103396002 1I AAGGTTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 12 9 9 A 12 13 364642 CASAVA_Build 8 103396639 1I AATTTAACTG -/A AAAAAAAAAA 2637 het 2637 ref 29 16 8 5 A 11 12 364643 CASAVA_Build 8 103406768 1D CCTTGTAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 420 hom 32 1 28 3 A 12 11 364644 CASAVA_Build 8 103416605 2D ATGTGAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 33 0 21 13 T 13 11 364645 CASAVA_Build 8 103431061 1I CAGTAGCGTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 19 9 8 A 9 10 364646 CASAVA_Build 8 103431871 1D CACTTAGGGG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 34 17 14 4 A 9 8 364647 CASAVA_Build 8 103444724 1D TTCCATTAAC A/- AAACATGTTT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 4 3 364648 CASAVA_Build 8 103451895 19D GTACATGTAC ACAATGTGTATACATGTAT/------------------- ACAATGTGTT 3070 het 3070 hom 36 16 21 7 ACAATGTGTATACATGTAT 1 0 364649 CASAVA_Build 8 103459113 1D CTTATCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 51 hom 26 1 17 8 A 11 10 364650 CASAVA_Build 8 103461787 1D AGCTAGACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 518 hom 29 2 17 10 A 16 15 364651 CASAVA_Build 8 103474220 2I GCCTGTTATC --/AG AGGTCTCCCC 3070 hom 93 het 37 0 31 6 AG 1 2 364652 CASAVA_Build 8 103476893 4D ATACATACAC ACAA/---- ACAGTGTGTG 3070 het 3070 ref 47 21 24 3 ACAA 1 0 364653 CASAVA_Build 8 103477824 1I CCTCCTAACT -/C CCAACTCTAC 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 C 2 3 364654 CASAVA_Build 8 103480682 1D TCTCATCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 21 1 15 5 T 15 14 364655 CASAVA_Build 8 103482387 2D AAAAGAGGGT AA/-- AAGAGCCTTT 3070 het 3070 hom 57 20 34 3 A 4 2 364656 CASAVA_Build 8 103488102 1D CCTAATGTCT G/- GGGGGTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 G 6 5 364657 CASAVA_Build 8 103505334 2I AAACACACAC --/AT ATATATATAT 2048 het 2048 ref 27 15 9 3 AT 7 8 364658 CASAVA_Build 8 103510152 5D GCCTTTAAAG TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 36 16 14 10 TTTTA 3 2 364659 CASAVA_Build 8 103518552 1I AAAATAATGT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 A 8 9 364660 CASAVA_Build 8 103529460 1D TAAAATAAAA T/- CTTACTGGTT 3070 het 1288 hom 17 4 11 3 T 1 0 364661 CASAVA_Build 8 103538699 1D GGTGTTCTAA T/- TTTTTTTTTT 2317 het 2203 hom 36 13 8 15 T 19 18 364662 CASAVA_Build 8 103546409 1I AAACCCTGCC -/G GTCCTTTATC 3070 hom 84 het 30 0 27 3 G 1 2 364663 CASAVA_Build 8 103562533 1D GAGCATAGAG C/- CCTGAACTGT 3070 hom 66 het 28 0 23 6 C 3 2 364664 CASAVA_Build 8 103582914 1D GCCTGCCTTA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 66 het 26 0 22 5 T 7 6 364665 CASAVA_Build 8 103583563 1D GGGGTCTGAT G/- GGGGGGGGGG 63 hom 5 het 6 0 1 5 G 11 10 364666 CASAVA_Build 8 103583587 19I CACTTTGTTG -------------------/CCTGGGCTGGTCTCGAACC CCTGGGCTCA 2693 hom 15 het 8 0 6 2 CCTGGGCTGGTCTCGAACC 0 1 364667 CASAVA_Build 8 103589557 1I AAATCTATTT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 75 het 28 0 25 3 A 8 9 364668 CASAVA_Build 8 103592421 1D TCCCCATCTG T/- TTTTTTTTTT 2927 het 199 hom 14 1 9 4 T 12 11 364669 CASAVA_Build 8 103596403 1D TCAAAGATTA T/- GCTGAGGCTT 3070 hom 135 het 50 0 46 5 T 1 0 364670 CASAVA_Build 8 103603655 1I ATTAAGCCTG -/A AAGCCCACAA 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 3 364671 CASAVA_Build 8 103606700 1D ACAGCTAATT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 67 het 29 0 22 9 A 10 9 364672 CASAVA_Build 8 103607827 2I CTCTAGGTCC --/CT CTACTGAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 CT 1 2 364673 CASAVA_Build 8 103610043 14D GTTGCATGCT CTGTGCTGTGTGCG/-------------- CTGTGCTGTG 3070 hom 78 het 51 0 23 29 CTGTGCTGTGTGCG 2 1 364674 CASAVA_Build 8 103612372 1D10M1D CAGAGAAGAG TAACTCTGCTAT/-AACTCTGCTA- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 13 10 3 N/A 0 0 364675 CASAVA_Build 8 103618844 1I ATGATGGGGT -/G GGGGGGTCTG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 G 6 7 364676 CASAVA_Build 8 103621358 1D AGTTGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2978 het 2978 ref 29 12 9 8 T 11 10 364677 CASAVA_Build 8 103627140 2D AGGGTAAGAA AG/-- AGAAGAAACT 3070 het 3070 ref 39 20 12 8 AG 2 1 364678 CASAVA_Build 8 103635437 1D CCTTGTGAAA T/- TTCTATGCTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 3 2 364679 CASAVA_Build 8 103644131 1D TGTAATAGAC T/- TGAGATGCAA 3070 het 3070 ref 26 15 10 2 T 2 1 364680 CASAVA_Build 8 103644702 1D ACTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 11 10 364681 CASAVA_Build 8 103649562 2D GTCAAATGGG TT/-- TTTTAGCCTT 3070 hom 99 het 35 0 33 3 T 6 4 364682 CASAVA_Build 8 103652118 1D ATTCTAGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 862 hom 30 2 18 10 A 13 12 364683 CASAVA_Build 8 103657444 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 9 10 364684 CASAVA_Build 8 103674474 1I AAGAAAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 442 hom 29 1 21 7 T 13 14 364685 CASAVA_Build 8 103715509 1D AGTTTAAATT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 9 8 364686 CASAVA_Build 8 103727476 1I AAATATAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 10 11 364687 CASAVA_Build 8 103730536 6D ATTAACAGGA CAACAT/------ CAACATTTGT 3070 het 3070 ref 41 24 15 6 CAACAT 2 1 364688 CASAVA_Build 8 103732225 4D CAGAATCATC ATTT/---- GAGAGACTGA 3070 het 3070 ref 45 20 22 7 ATTT 1 0 364689 CASAVA_Build 8 103737778 1D GGCGCGGGAT G/- GGGGACCCTG 1710 het 1710 ref 14 6 5 3 G 5 4 364690 CASAVA_Build 8 103749430 2I CTTCAAAAGC --/AT CCCTTTTCTC 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 AT 0 1 364691 CASAVA_Build 8 103763926 1D ACCTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 881 het 881 ref 19 11 3 5 T 15 14 364692 CASAVA_Build 8 103774029 1I ACTCTTCATA -/C CTGACTCTCA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 C 1 2 364693 CASAVA_Build 8 103785895 8D CTTTCTTTCA CTTTCTTT/-------- CTTTCTTTCT 3070 het 2574 hom 30 10 10 10 CTTT 7 5 364694 CASAVA_Build 8 103785967 1D TCCTTCTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 T 12 11 364695 CASAVA_Build 8 103793129 1D TCCATCATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 827 hom 46 5 27 14 T 15 14 364696 CASAVA_Build 8 103796495 1D CACACACACA C/- ACAAGCTCCA 3070 het 188 hom 27 3 11 13 C 1 0 364697 CASAVA_Build 8 103797549 1I TCTCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 11 12 364698 CASAVA_Build 8 103803049 1D CTTGGGATGA T/- TTTTTCCCAA 3070 het 3070 hom 55 23 27 6 T 6 5 364699 CASAVA_Build 8 103840223 1I GGGAGCTGTG -/T TTTTTGAGCA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 T 5 6 364700 CASAVA_Build 8 103876394 1I AAATTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2132 hom 23 7 14 2 A 10 11 364701 CASAVA_Build 8 103920483 2I GCAGCCTCCA --/TC TCTCTGGGGC 3070 het 3070 hom 48 15 27 6 TC 2 3 364702 CASAVA_Build 8 103937498 1D GTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1122 het 1122 ref 37 22 4 13 T 15 14 364703 CASAVA_Build 8 103992534 1I TTTAACTTTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 9 10 364704 CASAVA_Build 8 104006027 6D ACAAATAATC ATAAGA/------ ATAATATCAA 3070 het 3070 hom 37 15 20 2 ATAAGA 1 0 364705 CASAVA_Build 8 104013222 2I CAAGAGTGAC --/TT TAAATATGCA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 1 3 364706 CASAVA_Build 8 104032326 2D AGGGAAAGGG AA/-- AATAGACTAT 3070 het 3070 hom 27 11 12 6 A 4 2 364707 CASAVA_Build 8 104032721 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 1306 het 1306 ref 61 47 3 11 A 10 9 364708 CASAVA_Build 8 104033030 1I CCTAAGCACA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 30 14 14 2 T 8 9 364709 CASAVA_Build 8 104040453 2D TAAAGCAGTC AT/-- ACTGCAGAGA 3070 het 3070 hom 40 13 19 9 AT 1 0 364710 CASAVA_Build 8 104081395 1I CAGTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 9 10 364711 CASAVA_Build 8 104083283 1D CCATCTCGAA G/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 40 15 17 8 G 1 0 364712 CASAVA_Build 8 104087268 1I AAAATGTAGA -/T TTTTTTCCTC 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 T 6 7 364713 CASAVA_Build 8 104087579 2D TTAACTTTGG GT/-- AATGCCCTTG 3070 het 3070 ref 38 22 15 2 GT 1 0 364714 CASAVA_Build 8 104110687 2D CTCTCTCTCT TC/-- TTTTTTTTTT 1953 het 1953 ref 23 10 8 5 TC 1 0 364715 CASAVA_Build 8 104111551 1D GCTGCAGCTG T/- TTTTTTTTTT 914 het 914 ref 38 27 3 9 T 12 11 364716 CASAVA_Build 8 104115974 1D TCAAGGATAA T/- TTTTTTTTTT 2462 het 2462 ref 29 10 7 12 T 17 16 364717 CASAVA_Build 8 104159206 1I GGACTAACCT -/G GGCTGGGAAT 3070 het 3070 ref 50 22 15 13 G 2 3 364718 CASAVA_Build 8 104159420 1I GAACTCAGAC -/T TTTTTTCTTC 3070 het 7 hom 45 1 27 17 T 6 7 364719 CASAVA_Build 8 104159434 1D TTCTTCTAGC A/- AAGGGAACCC 3070 het 337 hom 38 1 12 25 A 3 2 364720 CASAVA_Build 8 104159785 4D TGATTTCTTC ACAA/---- ACATAGTCAT 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 ACAA 1 0 364721 CASAVA_Build 8 104162892 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1934 het 886 hom 20 4 7 9 A 15 16 364722 CASAVA_Build 8 104164881 1I TAGTAGTAAA -/T TTAAGAATAG 3070 het 3070 hom 47 19 21 7 T 2 3 364723 CASAVA_Build 8 104179094 1D AAGTCATGTT A/- ATCTAGATGG 3070 hom 135 het 50 0 42 8 A 2 1 364724 CASAVA_Build 8 104192128 4D CAGACATTGT GGTA/---- GGTTTTTATG 3070 het 3070 ref 42 21 17 8 GGTA 1 0 364725 CASAVA_Build 8 104212207 1D TCTGACATTT A/- AAATATCAGC 3070 het 3070 ref 65 30 27 8 A 4 3 364726 CASAVA_Build 8 104215652 1I ACTTTTTTTT -/C CTGCTCTGCC 3070 het 3070 hom 45 19 23 3 C 1 2 364727 CASAVA_Build 8 104226835 1D GGTAGGCCTG A/- CCACATTCTC 3070 het 3070 hom 54 19 31 4 A 1 0 364728 CASAVA_Build 8 104230575 1D GTAGTACCCT C/- CCCCCACCCC 3070 hom 123 het 44 0 41 4 C 6 5 364729 CASAVA_Build 8 104233163 1I CTCTGAATAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 646 hom 40 3 27 10 A 11 12 364730 CASAVA_Build 8 104236079 1I GATCCCACAG -/C CCCACCTGTC 3070 hom 43 het 23 0 12 11 C 3 4 364731 CASAVA_Build 8 104244161 3D ATGGTAGTTT TAA/--- TAATAACTAT 3070 hom 66 het 24 0 23 2 TAA 3 2 364732 CASAVA_Build 8 104251640 1I TCAATGAGCC -/T TTTTTTTTTT 2427 het 2427 ref 27 15 8 4 T 13 14 364733 CASAVA_Build 8 104252790 16I38M11D AAAGGCAAGA ----------------GAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAGAAAAGAGAGAGAATGAAAATAAAAA/GAGGAAGGAAGGAAAGGAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAGAAAAGAGAGAGAAT----------- GAAAGAGAAA 3070 het 3070 ref 37 27 13 13 N/A 0 0 364734 CASAVA_Build 8 104258572 3D23M2D TGCGGGTTTT TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTT/---TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTG-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 15 4 N/A 0 0 364735 CASAVA_Build 8 104273938 4D CTTTCTAAAT AGTC/---- AGTTGCATTT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 AGTC 1 0 364736 CASAVA_Build 8 104275775 5D TATAATGTAG TCTTT/----- TCTTTAATTT 3070 het 3070 hom 59 30 26 5 TCTTT 2 1 364737 CASAVA_Build 8 104279955 2I TGTGTGTATA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 2343 hom 28 9 12 7 TG 4 5 364738 CASAVA_Build 8 104281200 1I TTTTCCTGAT -/C TTTTCCTCCC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 0 1 364739 CASAVA_Build 8 104285217 4D CATAAAATAC TTTA/---- TTTATCTATT 3070 het 3070 hom 38 17 18 10 TTTA 2 1 364740 CASAVA_Build 8 104296891 1D TGAGACAACA C/- CCTCCCGCCA 3070 hom 89 het 36 0 25 11 C 3 2 364741 CASAVA_Build 8 104298869 1I TGATATACTG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 7 8 364742 CASAVA_Build 8 104299770 2D TTACTGACTC CA/-- GAGTGTCTGA 3070 hom 80 het 33 0 27 6 CA 1 0 364743 CASAVA_Build 8 104305036 2I GGATTACAAT --/TA TATATATATA 3070 het 208 hom 35 1 29 5 TA 6 7 364744 CASAVA_Build 8 104305520 4D TGCGTGCGTC TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 60 het 33 0 19 18 TG 11 9 364745 CASAVA_Build 8 104312646 1D AGCTGCTGTG T/- TTAGCCGTCA 3070 het 3070 hom 51 24 20 8 T 3 2 364746 CASAVA_Build 8 104334060 4D AGAGGAAGGA ATAG/---- ATTTTCAAAT 3070 het 3070 ref 37 20 16 3 ATAG 1 0 364747 CASAVA_Build 8 104343137 1I GGGTGGGAGT -/G GGGGGGGCAT 3049 het 3049 ref 20 8 8 4 G 7 8 364748 CASAVA_Build 8 104344351 1I TACATTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 11 12 364749 CASAVA_Build 8 104354153 1I GAAATTACTA -/T TTTAAGTACT 3070 hom 126 het 51 0 43 8 T 3 4 364750 CASAVA_Build 8 104360336 1D AGCACCTTTG T/- TTAAGTCAGA 3070 het 3070 ref 43 19 19 5 T 3 2 364751 CASAVA_Build 8 104360419 1D ATAAAAAAAA T/- AATTTCATTG 3070 het 3070 hom 39 16 20 4 T 1 0 364752 CASAVA_Build 8 104365381 1I ACCACCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1825 hom 24 7 12 5 T 11 12 364753 CASAVA_Build 8 104372281 1D AGGAGCTTTT C/- CCTTATGTTT 3070 hom 81 het 32 0 27 7 C 3 2 364754 CASAVA_Build 8 104378799 1I CCATCCTGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 A 10 11 364755 CASAVA_Build 8 104383442 1D ACTAATGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 17 6 T 11 10 364756 CASAVA_Build 8 104385330 2D TATGAGTCAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 42 1 35 6 T 12 10 364757 CASAVA_Build 8 104391709 2D GGTCTCACTC TG/-- TTGCCTGGGC 3070 het 1847 hom 21 4 14 3 TG 1 0 364758 CASAVA_Build 8 104392426 1D GACTAAGCAG A/- AAATTGATGG 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 A 4 3 364759 CASAVA_Build 8 104399230 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 137 het 90 hom 5 1 1 3 A 16 15 364760 CASAVA_Build 8 104401510 1I TGTGGATATA -/G GTAGGTTTGT 3070 hom 132 het 49 0 42 7 G 1 2 364761 CASAVA_Build 8 104401996 1D CCCAATGAGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 105 het 43 0 36 7 T 10 9 364762 CASAVA_Build 8 104404746 2I AAGCTGGTAG --/AT TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AT 0 1 364763 CASAVA_Build 8 104408108 1D CAAAAAAAAA C/- AAACAAACAA 3070 het 453 hom 34 2 29 3 C 1 0 364764 CASAVA_Build 8 104410816 3I GATTCTTGCC ---/TTT TTAATTTCTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 2 5 364765 CASAVA_Build 8 104412592 1I CAAAAAAAAA -/T ATTTGTATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 0 1 364766 CASAVA_Build 8 104413115 1D CTGAAAACAG A/- AAATGTGCAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 4 3 364767 CASAVA_Build 8 104449669 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 29 0 22 7 T 10 9 364768 CASAVA_Build 8 104460400 1I ATGCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 18 4 A 12 13 364769 CASAVA_Build 8 104462892 2D AAGAGAAGAC TT/-- TGGTAAGATG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 3 1 364770 CASAVA_Build 8 104481651 1D GGCAAAAAGC A/- AGAAAAACAT 3070 hom 128 het 45 0 42 3 A 2 1 364771 CASAVA_Build 8 104543356 1D TTCTGTGACA T/- TTTTTTTTTT 1934 het 1934 ref 56 37 5 15 T 12 11 364772 CASAVA_Build 8 104549772 1I TGTTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 T 10 11 364773 CASAVA_Build 8 104551396 1D CTCCCGGGTT C/- ATGCCATTCT 1259 hom 7 het 3 0 3 0 C 1 0 364774 CASAVA_Build 8 104554991 3D ATCAATTAAC ACA/--- ACATCATGGA 3070 het 3070 hom 38 17 17 5 ACA 2 1 364775 CASAVA_Build 8 104566204 1I ATTTATAGTG -/A AACTTGGGTA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 A 2 3 364776 CASAVA_Build 8 104569936 1D GTTTGACTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 10 10 T 12 11 364777 CASAVA_Build 8 104573864 1I TAGACTGGAT -/A AAAAAAAAAA 2070 het 2070 ref 23 11 5 7 A 10 11 364778 CASAVA_Build 8 104576370 2D TTTGCTGCCC AA/-- CTTAGACAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 6 A 2 0 364779 CASAVA_Build 8 104582703 1I GCGAGCCTTA -/G GGCGGTGTGA 3070 hom 30 het 13 0 10 3 G 2 3 364780 CASAVA_Build 8 104595446 1I TAACTGGATT -/C CCTTCTCTGA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 C 2 3 364781 CASAVA_Build 8 104605647 1I AGTTGAAGAG -/A AGAGTATAGA 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 A 1 2 364782 CASAVA_Build 8 104606585 1I AAGACTCTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 T 8 9 364783 CASAVA_Build 8 104616016 2D AATGAAATAC AT/-- AAAATCATAT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 AT 1 0 364784 CASAVA_Build 8 104623359 4D TAAGGCTAAC AAGT/---- AAGGAATCAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 6 AAGT 1 0 364785 CASAVA_Build 8 104627206 4D GGAGAAATAA GATC/---- GATCCTTTTT 3070 het 3070 hom 53 24 27 5 GATC 2 1 364786 CASAVA_Build 8 104628407 1I AAATTAGGGT -/G GTCTTCCCCT 3070 het 3070 ref 46 29 12 5 G 1 2 364787 CASAVA_Build 8 104635258 4D AAAAACAGAC AGAT/---- AGACCAATGG 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 AGAT 1 0 364788 CASAVA_Build 8 104635366 1I AAGGACCCCC -/T GTTCAATAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 0 1 364789 CASAVA_Build 8 104651013 1D GTATTTTTTT C/- TTTTTGATTT 3070 het 3070 hom 26 12 11 3 C 1 0 364790 CASAVA_Build 8 104665845 1I AAAACACAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 8 9 364791 CASAVA_Build 8 104666330 1I CTTTCCAATC -/A AAAGATATAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 3 4 364792 CASAVA_Build 8 104670745 1I CTCTATATCA -/T TGATAATCAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 1 2 364793 CASAVA_Build 8 104702091 4I ATCATCAGGA ----/ACTT ACTTTATTTC 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 ACTT 1 2 364794 CASAVA_Build 8 104757645 1I AAGGGTTTTT -/A ATATAGACTG 3070 het 3070 ref 37 24 12 1 A 1 2 364795 CASAVA_Build 8 104766509 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 900 het 900 ref 34 25 3 6 T 12 11 364796 CASAVA_Build 8 104769294 1D ATATACCGCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 T 9 8 364797 CASAVA_Build 8 104770264 2I CTGATTTCTG --/CT CTGATACGTA 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 CT 1 2 364798 CASAVA_Build 8 104809356 1I AATTTTAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 18 9 8 T 9 10 364799 CASAVA_Build 8 104824968 4I AGCATCTATA ----/TTTC TTTATTACTT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 TTTC 0 1 364800 CASAVA_Build 8 104903489 1I AAATTGATAG -/A AAAAAAGCCA 3070 het 3070 ref 42 23 15 4 A 6 7 364801 CASAVA_Build 8 104910491 1D TAATAATAGG T/- TTTTTTTTTT 2103 het 2103 ref 30 11 5 14 T 17 16 364802 CASAVA_Build 8 104935959 1D TTGTTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 1663 het 1663 ref 44 33 4 7 T 11 10 364803 CASAVA_Build 8 104942193 1D TAAAATAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 22 5 T 10 9 364804 CASAVA_Build 8 104951540 1D AGGACAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 489 hom 36 2 21 13 T 15 14 364805 CASAVA_Build 8 104957784 1D CAGTGTATGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 34 14 12 8 T 9 8 364806 CASAVA_Build 8 104972247 4D TTGTAATTTG ATCT/---- ATTATTTTCT 3070 het 3070 ref 44 26 15 4 ATCT 1 0 364807 CASAVA_Build 8 104987067 1D CTTTGAATAC T/- TTTTTTTTTT 2709 het 2709 ref 34 18 8 8 T 13 12 364808 CASAVA_Build 8 105022879 5I4M3I TGACATAGCA -----AGAC---/GGCTGAGACATT CCTGTCTCAA 3070 het 3070 hom 36 16 19 3 N/A 0 0 364809 CASAVA_Build 8 105029031 1I AAATGATATA -/C CGTGAATAGG 3070 het 3070 ref 52 26 23 3 C 1 2 364810 CASAVA_Build 8 105040628 1I GGAAGTGAAA -/G GAGAAATTGC 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 G 1 2 364811 CASAVA_Build 8 105063896 1I GCAGAAATCC -/A AAAAAAAAAA 2612 het 824 hom 20 2 9 9 A 15 16 364812 CASAVA_Build 8 105099461 1D CCTGGGTGAC A/- GTGAGACTCC 3070 het 3070 hom 28 13 13 3 A 1 0 364813 CASAVA_Build 8 105103795 1I TCTTTTTTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 2647 hom 30 8 17 5 T 8 9 364814 CASAVA_Build 8 105108043 4I GAAATGGAAA ----/GAGG GAGGAGAGGG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 GAGG 1 2 364815 CASAVA_Build 8 105115867 13D TTGCAGTATC TTTTTTTTTTTTT/------------- TTTTTTTTTT 3070 het 2052 hom 24 8 11 8 T 25 12 364816 CASAVA_Build 8 105116657 1D AAAATAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 8 15 7 T 11 10 364817 CASAVA_Build 8 105124606 1D GATGGAAAAG A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 A 7 6 364818 CASAVA_Build 8 105127327 1I TGTGTTGTAA -/T TATAATGTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 3 T 1 2 364819 CASAVA_Build 8 105130132 2I TTAGAAACAC --/TT ATTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 T 0 2 364820 CASAVA_Build 8 105147799 2D TATCTATATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 TG 7 6 364821 CASAVA_Build 8 105229440 1D TAAGTAAAGT G/- AAATAAAGTT 3070 het 3070 hom 25 9 14 3 G 1 0 364822 CASAVA_Build 8 105232990 1D CCAACTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 12 13 A 11 10 364823 CASAVA_Build 8 105236368 1I TAGAGTTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 9 4 T 10 11 364824 CASAVA_Build 8 105237707 1D ACCTGGGAAG T/- TTTTACGGAC 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 5 4 364825 CASAVA_Build 8 105245591 3I4M2D CCTGGAATTA ---TCTTTC/GAGCCAT-- CTGTGTGAAA 3070 het 3070 hom 42 19 22 4 N/A 0 0 364826 CASAVA_Build 8 105245824 1D TCCAAAAAAA T/- AAGGACAAAA 3070 het 3070 ref 25 15 9 1 T 1 0 364827 CASAVA_Build 8 105252713 1I CATAATCCCA -/T TTTTTTTTTG 2828 het 2828 ref 27 13 7 7 T 9 10 364828 CASAVA_Build 8 105252907 2D TTTTTTTTGT TA/-- TATATATATA 3070 het 1893 hom 21 5 12 5 TA 6 5 364829 CASAVA_Build 8 105255819 1I ACAAAGAGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 A 9 10 364830 CASAVA_Build 8 105259093 1I AGTAAACAAA -/T TTGTAATTCA 3070 het 3070 ref 41 21 17 3 T 2 3 364831 CASAVA_Build 8 105266341 2I GAAGAAAAAG --/AT AGAAATTTAT 3070 het 3070 hom 31 15 14 2 AT 0 1 364832 CASAVA_Build 8 105271791 1D CCATCTTTCT A/- GGAACTTTTA 3070 het 3070 ref 37 18 11 9 A 1 0 364833 CASAVA_Build 8 105272340 1D TCTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 10 20 9 T 12 11 364834 CASAVA_Build 8 105278191 1I AAATATCCAT -/C ATTTAATTTA 3070 het 3070 hom 38 15 22 1 C 0 1 364835 CASAVA_Build 8 105287163 1I TTTATTTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2722 hom 37 9 11 17 T 15 16 364836 CASAVA_Build 8 105289982 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 A 11 10 364837 CASAVA_Build 8 105292982 1I TTTTTTTTTT -/G TTTTTGAGAC 3070 het 2606 hom 35 11 17 7 G 0 1 364838 CASAVA_Build 8 105293412 1D TAAAGGAGGA T/- GTCCAGATTT 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 T 1 0 364839 CASAVA_Build 8 105301683 1D10M1D AGATCCTAGG AAAAAAATATCA/-AAAATATATC- AAAAAGCTTC 3070 het 3070 ref 34 21 14 5 N/A 0 0 364840 CASAVA_Build 8 105311718 1D GTTTAAATGA G/- ACTAAAAGGA 2805 het 2805 ref 21 11 6 4 G 1 0 364841 CASAVA_Build 8 105313451 3I GCCTTGCATT ---/ATC ATTATTTGTG 3070 hom 144 het 55 0 49 6 ATC 0 1 364842 CASAVA_Build 8 105314379 1D CAGTGGTAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 10 9 364843 CASAVA_Build 8 105315968 3D CAAGAAAAAC AAG/--- AAAGTACCAA 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 AAG 1 0 364844 CASAVA_Build 8 105330509 1D ATATTTTGAC T/- TTTTTTTTGT 2526 het 2526 ref 21 12 7 3 T 9 8 364845 CASAVA_Build 8 105332017 4D CACCACCACC AGTA/---- AGTAAGTACT 3070 hom 99 het 43 0 34 13 AGTA 3 2 364846 CASAVA_Build 8 105333932 1I TGCAACTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 11 11 A 14 15 364847 CASAVA_Build 8 105339520 1I GCCTGAGTTC -/A AAATATTGCT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 4 364848 CASAVA_Build 8 105345288 1D TGTTGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 568 het 568 ref 28 17 2 9 T 11 10 364849 CASAVA_Build 8 105348251 1I AAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1379 het 1379 ref 13 6 5 2 A 10 11 364850 CASAVA_Build 8 105348423 1D AAAAAAAAAA G/- AAAAAGAAAA 3070 hom 12 het 32 1 22 9 G 1 0 364851 CASAVA_Build 8 105351076 1D GAGCAGAGCA G/- GTGCCTTAGG 3070 het 3070 hom 50 21 19 10 G 2 1 364852 CASAVA_Build 8 105352929 2D AACCTAGATC AT/-- ATGTGTGTGT 3070 het 973 hom 24 6 16 2 AT 2 1 364853 CASAVA_Build 8 105355523 1I TACTCTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 T 11 12 364854 CASAVA_Build 8 105356823 2D GCATGAGGCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 15 2 A 12 10 364855 CASAVA_Build 8 105358383 1I TAGTGTTTCC -/T TTTTTTTTCG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 8 9 364856 CASAVA_Build 8 105358994 1I TTATTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 459 hom 26 1 14 11 A 10 11 364857 CASAVA_Build 8 105365257 1I CCACGCAGGA -/C CCCCCTTCTC 3070 hom 73 het 29 0 24 5 C 5 6 364858 CASAVA_Build 8 105365314 1D TTAAACGTCC T/- TTTTTTTTTT 2745 hom 19 het 19 0 7 15 T 11 10 364859 CASAVA_Build 8 105373144 1I CACGTATACA -/T TCCAGATGGC 3070 het 2908 hom 13 6 7 0 T 1 2 364860 CASAVA_Build 8 105373445 1I GCCTGCACCC -/A GGTGAAATAA 3070 hom 66 het 24 0 21 3 A 0 1 364861 CASAVA_Build 8 105379845 4I ATGGGCTGAA ----/TTAT TTATTTACTT 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 TTAT 1 2 364862 CASAVA_Build 8 105380281 1I TGACCTAGGG -/A AAAAAAAGGA 3070 hom 76 het 28 0 24 4 A 7 8 364863 CASAVA_Build 8 105381216 1D TTTTTAGGGC A/- ATGAAACTAC 3070 het 3070 ref 63 31 27 6 A 2 1 364864 CASAVA_Build 8 105381921 2D42M1I TAGAGGTAGT TAAAGTAGTTAATAATATTTAACAATCTTTTATGATTAAAAATA-/--AAGTAGTTAATAATATTTAACAATCTTTTATGATTAAAAATAT TTTTTTAATC 3070 het 3070 hom 24 9 12 16 N/A 0 0 364865 CASAVA_Build 8 105389125 1D ATGTGGCCGA C/- CTTGCATCAA 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 C 2 1 364866 CASAVA_Build 8 105391356 1D CAATTCAATC A/- AGTGGAAGAA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 2 1 364867 CASAVA_Build 8 105411645 12I TCACAAAACC ------------/GCTGCGGTAACA GCTGCTTCCC 3070 hom 78 het 33 0 20 13 GCTGCGGTAACA 0 1 364868 CASAVA_Build 8 105414113 1D ATTACATCTC T/- GTACTAAAAC 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 1 0 364869 CASAVA_Build 8 105419073 4D TGGCCTCTCC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 55 het 27 0 16 11 CTTT 4 3 364870 CASAVA_Build 8 105438482 2D ACGCCCAGCT TA/-- TATATATATA 3070 hom 18 het 15 0 11 4 TA 8 7 364871 CASAVA_Build 8 105439192 1I TACCTGGGAT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 8 9 364872 CASAVA_Build 8 105439801 2I GTCCATGAAC --/TT TTTACTTTTG 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 3 5 364873 CASAVA_Build 8 105444888 4D TGGGTTCATA GTCT/---- CGCTAAGTTT 3070 het 3070 ref 22 9 8 6 GTCT 1 0 364874 CASAVA_Build 8 105449853 12D CCCTCTCTCC AACTTTTCTTTA/------------ AACTTTTCAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 9 AACTTTTCTTTA 1 0 364875 CASAVA_Build 8 105451983 1D AAGAATTAGC T/- TTCATATCTC 3070 het 3070 ref 39 18 14 8 T 3 2 364876 CASAVA_Build 8 105453496 2D CAGCAAAAAA CT/-- CTCTCTCTCT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CT 6 5 364877 CASAVA_Build 8 105456198 3I TATATAATAA ---/AAT AATAATATTG 2467 hom 12 het 7 0 5 2 AAT 2 3 364878 CASAVA_Build 8 105458755 1I TAAAGTATAA -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 2 3 364879 CASAVA_Build 8 105470946 3I TCCTTTTATT ---/TTA TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 TTA 0 1 364880 CASAVA_Build 8 105471685 5I TGCCTCCAAC -----/TTAGA TTAATTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 TTAGA 0 1 364881 CASAVA_Build 8 105477253 2D ATGCTGCAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 24 1 17 6 A 13 11 364882 CASAVA_Build 8 105481513 1D TGGGCTCCAA C/- CATTCCAAGC 3070 hom 72 het 34 0 23 12 C 2 1 364883 CASAVA_Build 8 105498063 2D GTGCATGTGA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 58 14 24 21 GT 9 8 364884 CASAVA_Build 8 105499028 1D ACACATACTT C/- CGTCATAAGC 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 C 2 1 364885 CASAVA_Build 8 105501463 1I TGGAACTAGA -/C CTCAAGAATA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 C 1 2 364886 CASAVA_Build 8 105510242 1I TTCTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 40 1 33 6 T 10 11 364887 CASAVA_Build 8 105511768 1I TGAGGCCATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 22 15 5 A 10 11 364888 CASAVA_Build 8 105515572 1I GGTAGATGTC -/A AAATTTTCTG 3070 hom 99 het 42 0 34 8 A 3 4 364889 CASAVA_Build 8 105524726 14D ATGAGTATTT ACATACTAGGCTGA/-------------- ACATACTAGG 3070 hom 93 het 39 0 32 11 ACATACTAGGCTGA 2 1 364890 CASAVA_Build 8 105531564 4I GAAGGGAGGA ----/AGGG AGGGAGGGAG 1474 hom 17 het 9 0 5 4 AGGG 4 5 364891 CASAVA_Build 8 105548742 2I CTTGGTTGGG --/CC GGTGTGTTTG 3070 hom 87 het 33 0 28 5 C 0 2 364892 CASAVA_Build 8 105635769 1D AACTTTAAGA T/- TTTTTTTTTA 1366 het 1366 ref 34 26 3 6 T 10 9 364893 CASAVA_Build 8 105761410 1D GCTCTTATCG C/- CCCAGGCTGG 1629 hom 10 het 4 0 4 0 C 4 3 364894 CASAVA_Build 8 105777476 9I TTTTGTGAGA ---------/GGTGATCTG GGTGATCTGC 3070 het 3070 ref 45 23 16 7 GGTGATCTG 1 2 364895 CASAVA_Build 8 105778814 3D TACAGAAAAT ATC/--- ATATGTCATA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 ATC 1 0 364896 CASAVA_Build 8 105795471 1D AACAAATACC A/- AAAAAAAAAA 1728 het 1728 ref 26 14 5 7 A 16 15 364897 CASAVA_Build 8 105853135 1I CTCCTTCCGT -/C TAAGCCTGTC 3070 hom 90 het 35 0 30 5 C 0 1 364898 CASAVA_Build 8 105890603 11I TCCTTGGCTC -----------/CCCGTATCATG CCCTACAACC 3070 hom 147 het 52 0 49 3 CCCGTATCATG 0 1 364899 CASAVA_Build 8 105890732 2I CTTCCTCACA --/CT CTCTGGGAGG 3070 hom 141 het 53 0 44 9 CT 2 3 364900 CASAVA_Build 8 105900093 1D GAGGCAGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 152 hom 29 2 15 13 T 11 10 364901 CASAVA_Build 8 105905087 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 8 7 364902 CASAVA_Build 8 105908240 1I CTGACATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 29 0 26 3 T 15 16 364903 CASAVA_Build 8 105912424 1I CATCAACCCC -/A CCTTTTCCAA 3070 hom 138 het 48 0 46 2 A 0 1 364904 CASAVA_Build 8 105914883 8I ATTTTTTCCT --------/TTTTTTTC TTTTTTTCTA 3070 hom 69 het 26 0 23 3 TTTTTTTC 1 2 364905 CASAVA_Build 8 105915778 2D TATTATTAAC TT/-- GTCACTTCAG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 T 2 0 364906 CASAVA_Build 8 105918054 2I CCTCCTTGAC --/TG TGTGGATATT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 TG 2 3 364907 CASAVA_Build 8 105918798 1I TGATAATAAA -/C ATGGTAATTA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 C 0 1 364908 CASAVA_Build 8 105921122 22D CATAATGCCC AGGATGGTGCTTGGCACGGAAA/---------------------- AGGAATTCAA 3070 hom 138 het 40 0 47 3 AGGATGGTGCTTGGCACGGAAA 1 0 364909 CASAVA_Build 8 105921845 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 23 2 18 3 T 13 12 364910 CASAVA_Build 8 105927801 2D TTTTTTTTTT TC/-- CATATGTTTG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TC 1 0 364911 CASAVA_Build 8 105930814 1I CTAAACAAAC -/A AAAAACTAGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 5 6 364912 CASAVA_Build 8 105948950 1I AGATGAAAAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 948 hom 39 4 22 13 A 9 10 364913 CASAVA_Build 8 105954168 1D AGTTTTTGTG A/- ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 A 2 1 364914 CASAVA_Build 8 105967492 4I GAGTGACCTC ----/AAAG AGAATGCTTG 3070 hom 126 het 44 0 42 2 AAAG 0 1 364915 CASAVA_Build 8 105967721 2D AAAAAAAAAA AC/-- AAAACAAAAC 3070 het 22 hom 27 1 18 10 AC 1 0 364916 CASAVA_Build 8 105972617 2I GGTTAAGATG --/TT GCCAATTCAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 0 2 364917 CASAVA_Build 8 105976963 1D TGGAAAACAG T/- TAATTTTAAC 3070 hom 87 het 31 0 29 2 T 2 1 364918 CASAVA_Build 8 105981238 18D TCCATGTGTA TGTGTATGTGTGTGTGTG/------------------ TGTGTGTGTG 3070 het 1189 hom 34 6 19 9 TGTGTATGTGTGTGTGTG 1 0 364919 CASAVA_Build 8 105987465 1D ACAGTAATTG A/- AAAAAAACAA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 A 8 7 364920 CASAVA_Build 8 105988616 1D TCTTACCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 32 3 18 11 T 16 15 364921 CASAVA_Build 8 105989972 1I AATATAATCG -/T TAAAAGATAT 3070 hom 114 het 45 0 38 7 T 1 2 364922 CASAVA_Build 8 105992629 1I GCAAAAATTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 122 het 49 0 44 5 T 8 9 364923 CASAVA_Build 8 106006448 2D TGTTTTTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 31 1 15 17 T 14 12 364924 CASAVA_Build 8 106017238 4D TTTACAAAGA TTGG/---- TTTTTCTTAG 3070 het 3070 ref 25 16 9 3 TTGG 1 0 364925 CASAVA_Build 8 106022081 1I AGGTTGATGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 8 9 364926 CASAVA_Build 8 106027682 2D TGCTCATCTC TG/-- TAAGATTTTA 3070 het 3070 ref 41 24 13 6 TG 1 0 364927 CASAVA_Build 8 106028400 1D TTTGAATGTC T/- GGACAAGAAA 3070 het 3070 ref 45 23 16 6 T 1 0 364928 CASAVA_Build 8 106047045 17I TAATGGACCC -----------------/TCAGATAAGTTATCTAA TCTTTCAAAG 3070 het 3070 hom 39 18 17 5 TCAGATAAGTTATCTAA 0 1 364929 CASAVA_Build 8 106055095 1D AAAAGATGGC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 35 0 26 9 T 10 9 364930 CASAVA_Build 8 106061308 1D AGGAGGCTTA T/- CTTTGCTATA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 1 0 364931 CASAVA_Build 8 106063039 9I GTACACAGGA ---------/CATTGGGAT CATTGGGATA 3070 het 3070 ref 62 30 21 12 CATTGGGAT 1 2 364932 CASAVA_Build 8 106070240 1D ATTTTGAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 52 1 44 7 T 13 12 364933 CASAVA_Build 8 106077915 1D ATAGCCTTGA T/- TTGTGAAGGG 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 3 2 364934 CASAVA_Build 8 106081571 1I GTTGGGGAGT -/G GGGGGGTGAG 3070 het 2571 hom 36 10 19 7 G 6 7 364935 CASAVA_Build 8 106085458 3D TAGTATCATC TCT/--- TCATCCTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 24 2 TCT 1 0 364936 CASAVA_Build 8 106094574 3D TATCTTTAGT AAA/--- AAAAACCATT 3070 hom 72 het 28 0 25 5 A 8 5 364937 CASAVA_Build 8 106095935 1D TTGGCCTCCC A/- AAAGTGCTGG 3070 hom 30 het 13 0 11 2 A 4 3 364938 CASAVA_Build 8 106099458 1D TGTCTATTTC T/- TTTTTTTTTT 2918 het 14 hom 19 1 10 8 T 15 14 364939 CASAVA_Build 8 106116328 1D TCTAAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 76 het 38 0 30 9 A 12 11 364940 CASAVA_Build 8 106121463 1D TGGCAACCAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 52 20 23 9 A 9 8 364941 CASAVA_Build 8 106123615 1I CTTAAAAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 9 18 8 A 10 11 364942 CASAVA_Build 8 106126209 1D AAAGTTTTCC T/- TTCTTGTGTG 3070 hom 96 het 40 0 32 8 T 3 2 364943 CASAVA_Build 8 106129374 1D CTCTATCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 128 hom 30 1 23 6 A 13 12 364944 CASAVA_Build 8 106131332 1I TTAAAAGATT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 A 8 9 364945 CASAVA_Build 8 106146432 1I AGCTTGTTTC -/A TATAAAATGT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 A 0 1 364946 CASAVA_Build 8 106156766 4I TCTATTGGTA ----/TAAT TAGATATTAG 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TAAT 0 1 364947 CASAVA_Build 8 106158016 4I ATTGTTTACT ----/AGTG AAGTTCAGGT 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AGTG 0 1 364948 CASAVA_Build 8 106163945 2I TTCAGGACCT --/AC ACTGAGGGTC 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 AC 1 2 364949 CASAVA_Build 8 106167676 1I TGTACCTCAA -/G GGTAACTAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 G 2 3 364950 CASAVA_Build 8 106169741 4I AAAGAAAACC ----/ATGT ATGTCTTCCA 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 ATGT 1 2 364951 CASAVA_Build 8 106174800 11I CCTGGCTGCA -----------/GAGTGTGTACT GATAACCATC 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 GAGTGTGTACT 0 1 364952 CASAVA_Build 8 106176068 1D CTTATATCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 205 hom 25 1 21 3 A 12 11 364953 CASAVA_Build 8 106182663 1I TCAAATTGGT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 7 8 364954 CASAVA_Build 8 106183396 1D GATTTGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 48 0 39 9 T 12 11 364955 CASAVA_Build 8 106197402 1D GGTTAATTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 399 hom 38 1 35 2 A 11 10 364956 CASAVA_Build 8 106205313 1I TTTATTTCCA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 7 8 364957 CASAVA_Build 8 106206675 4D ATGTAATATA TTTT/---- TTATCTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 3 T 6 2 364958 CASAVA_Build 8 106214280 1I GTTTTTGCTA -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 7 8 364959 CASAVA_Build 8 106214501 1D TTTGCTTCTG C/- CCCCAAATTT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 5 4 364960 CASAVA_Build 8 106216214 1D CATATTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 269 hom 36 1 31 5 T 11 10 364961 CASAVA_Build 8 106285856 1D AGGTTGGGGT G/- GGCTGTGGCA 3070 hom 67 het 26 0 22 4 G 3 2 364962 CASAVA_Build 8 106290723 1D ACTGTGGCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 6 A 10 9 364963 CASAVA_Build 8 106298678 1I AAATTAGTAC -/T TTTTACTTTG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 4 5 364964 CASAVA_Build 8 106302551 5I CATTTTAAAT -----/AATTA AATTCTCTTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AATTA 0 1 364965 CASAVA_Build 8 106307360 1I ACCTTCAGGC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 7 8 364966 CASAVA_Build 8 106308739 4I TATAAGATAT ----/TAAA TTAATAAAAC 3070 hom 21 het 9 0 8 1 TAAA 0 1 364967 CASAVA_Build 8 106318649 1D AATTTCATTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 117 het 43 0 39 5 T 10 9 364968 CASAVA_Build 8 106319103 3D CTTACTCGGA TTT/--- TTTTTTTTTA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 T 12 9 364969 CASAVA_Build 8 106319931 1D CCCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 250 hom 36 1 32 4 A 10 9 364970 CASAVA_Build 8 106324693 2D TGTATGTAAC AT/-- ATATAATAAA 3070 het 1875 hom 12 4 8 1 AT 3 2 364971 CASAVA_Build 8 106325828 1D CTCATCATCA T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 54 21 27 7 T 8 7 364972 CASAVA_Build 8 106326698 1I TGTACGTTAC -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 hom 56 27 26 3 A 6 7 364973 CASAVA_Build 8 106330993 1I TCTGGATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 T 11 12 364974 CASAVA_Build 8 106331982 1D CTTCCTTCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 59 het 25 0 20 5 T 10 9 364975 CASAVA_Build 8 106335270 1I TTTCATAGAT -/G TTTTTTACTG 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 G 0 1 364976 CASAVA_Build 8 106342706 8D TTTTATTTTC ATATTTTT/-------- ATTATTTATT 2532 het 2532 ref 15 8 7 1 ATATTTTT 1 0 364977 CASAVA_Build 8 106344906 1I GACTGCTCCT -/C CCCCCCCAGG 3070 het 3070 hom 47 12 20 15 C 7 8 364978 CASAVA_Build 8 106346022 3D TTATAGTGTT ATA/--- ATATTCTTTT 3070 hom 78 het 29 0 27 2 ATA 2 1 364979 CASAVA_Build 8 106347992 1I GCCTCTTTTC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 34 9 17 8 T 8 9 364980 CASAVA_Build 8 106358785 5I TTTGGGAGGC -----/CAACG CAACGCGGGT 2883 het 2883 ref 16 7 6 3 CAACG 1 2 364981 CASAVA_Build 8 106361884 1D GTGGTCACAT A/- ACATCCTTCC 3070 hom 124 het 48 0 40 8 A 2 1 364982 CASAVA_Build 8 106363914 1I GTTACAATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 11 12 364983 CASAVA_Build 8 106375707 2D CAACCCTAAC AT/-- GTGCATAATT 3070 het 3070 ref 68 35 27 6 AT 1 0 364984 CASAVA_Build 8 106375821 1D GTGATTAATG A/- TTTTCTTTAG 3070 het 3070 ref 46 24 20 3 A 1 0 364985 CASAVA_Build 8 106376352 1D CAAATAGACC T/- CAGAATTTCT 3070 het 3070 hom 39 19 18 2 T 1 0 364986 CASAVA_Build 8 106376566 1D TGATTCCCGC T/- ATTTTTGCAC 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 1 0 364987 CASAVA_Build 8 106378178 9I TCCAGGCACA ---------/ATGCTGTTG GTGTGCAAGC 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 ATGCTGTTG 0 1 364988 CASAVA_Build 8 106415199 1I TCGTAAAATG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 8 9 364989 CASAVA_Build 8 106430570 1I AGGTTCTGGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 7 8 364990 CASAVA_Build 8 106439660 1I CCAAGATTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1712 hom 32 7 15 10 T 14 15 364991 CASAVA_Build 8 106446062 1D CAAGAATACC A/- AAAAAAAAAA 749 het 749 ref 34 20 3 11 A 15 14 364992 CASAVA_Build 8 106447902 1D TCTTTTTTTT A/- ATTTTTTTCA 2700 hom 15 het 8 0 6 2 A 2 1 364993 CASAVA_Build 8 106463680 1I GTACTTAAGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 T 9 10 364994 CASAVA_Build 8 106481120 1D TATTTTTTTA T/- TTTTTGATAG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 T 6 5 364995 CASAVA_Build 8 106482656 4D GTTTTACATT CTTC/---- CTTCAGTCAT 3070 het 3070 ref 27 14 13 2 CTTC 2 1 364996 CASAVA_Build 8 106484984 1D AAGTTGAGTC T/- TTTTTTTTTC 1063 het 1063 ref 42 34 3 5 T 10 9 364997 CASAVA_Build 8 106488513 1D AATGCTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3032 hom 35 10 14 11 T 17 16 364998 CASAVA_Build 8 106496283 1D CTGCAGATCA T/- TGAAACAACC 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 T 2 1 364999 CASAVA_Build 8 106500467 1D CCACTGTAAC A/- AAAAAAGGCT 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 A 7 6 365000 CASAVA_Build 8 106500766 1I GTAATGTTTT -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 A 7 8 365001 CASAVA_Build 8 106504467 3I AAGTTTTTCT ---/ACA AGTCTCAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 ACA 0 1 365002 CASAVA_Build 8 106517206 1I CTATTGTGAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 A 8 9 365003 CASAVA_Build 8 106518899 6I CATCTTGACA ------/TTTTCT TTTTCTATCA 3070 hom 120 het 49 0 41 8 TTTTCT 1 2 365004 CASAVA_Build 8 106520425 1I GAAAGCACTG -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 T 8 9 365005 CASAVA_Build 8 106524304 1I AAGTTCAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 11 14 7 T 10 11 365006 CASAVA_Build 8 106537560 1D GTTTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 G 1 0 365007 CASAVA_Build 8 106542196 1D TCCTGAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 12 14 4 A 10 9 365008 CASAVA_Build 8 106556272 3I ACATCTTTAG ---/CTT CTTCTTCTTT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 CTT 3 4 365009 CASAVA_Build 8 106581086 1D GAAACACTCA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 T 9 8 365010 CASAVA_Build 8 106583981 4D AGCAAATCGT CAAA/---- CAATCAATTT 3070 het 3070 ref 60 32 22 7 CAAA 1 0 365011 CASAVA_Build 8 106597137 1I TACTTTGGGC -/T TTTAGACTTA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 T 3 4 365012 CASAVA_Build 8 106599684 2I CATACAGGAG --/TC TCTGCTGCAA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 TC 1 2 365013 CASAVA_Build 8 106604155 1I TCCATCTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 11 12 365014 CASAVA_Build 8 106614268 1D TGGCATTAAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 146 hom 44 1 36 7 T 10 9 365015 CASAVA_Build 8 106618602 1D TTAATTCAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 10 9 365016 CASAVA_Build 8 106631353 3I AATGCATAAT ---/ATA ATGTCATTTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 ATA 0 1 365017 CASAVA_Build 8 106633087 1I TTTGTGACCT -/A AAAAATCACC 3070 het 149 hom 34 1 31 2 A 5 6 365018 CASAVA_Build 8 106633360 5I TGATAAGTTC -----/TCTTA TAAGTGAATT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TCTTA 0 1 365019 CASAVA_Build 8 106634066 8I TGTTTCTTTG --------/TTCATATA TTCATATAAA 3070 hom 72 het 34 0 25 9 TTCATATA 1 2 365020 CASAVA_Build 8 106640193 2I GTGTGTAAAA --/AG AAGCAAATTA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 AG 0 1 365021 CASAVA_Build 8 106641593 5I AAAAAAAAAG -----/AAAGA AAAGAAAATA 3070 hom 36 het 14 0 12 2 AAAGA 1 2 365022 CASAVA_Build 8 106656345 1D CTCCTATAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 44 0 36 8 A 11 10 365023 CASAVA_Build 8 106658874 1I CTTATGAAGT -/A AAAGCACACC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 3 4 365024 CASAVA_Build 8 106659819 1I GTTTTACTCC -/A AGTTTCTCCA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 1 2 365025 CASAVA_Build 8 106661543 3D CTTATGTCTT CTC/--- TTCTTTGGTC 3070 hom 114 het 40 0 38 2 CTC 1 0 365026 CASAVA_Build 8 106667760 3I CTTTCTTTTT ---/TTC TATCGCTTTC 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 TTC 0 1 365027 CASAVA_Build 8 106669039 1I GAAGAGCACA -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 T 8 9 365028 CASAVA_Build 8 106671301 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 het 1794 hom 27 7 14 6 T 6 5 365029 CASAVA_Build 8 106673470 1I AAACCCTCTG -/A AAAAATGGTT 3070 het 3070 ref 42 24 18 0 A 5 6 365030 CASAVA_Build 8 106675057 1I CCATTCCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 15 8 A 15 16 365031 CASAVA_Build 8 106675227 1D TTTTTCAAGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 A 9 8 365032 CASAVA_Build 8 106677408 2D CTTTTATCTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 734 hom 40 6 17 18 A 14 12 365033 CASAVA_Build 8 106678859 2D AACCTCTCCC CT/-- GTGTGATTTT 3070 het 3070 ref 57 25 25 7 CT 1 0 365034 CASAVA_Build 8 106693782 1I CGTCCAATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 10 11 365035 CASAVA_Build 8 106715421 2D ATCATTTAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 21 24 6 A 12 10 365036 CASAVA_Build 8 106727456 3D CTCCATCTGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 24 hom 21 1 16 5 A 17 14 365037 CASAVA_Build 8 106735980 2D TTTTCTATCC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 11 9 365038 CASAVA_Build 8 106737350 1I CATTCATTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 18 16 3 T 9 10 365039 CASAVA_Build 8 106744075 1D TTCAAAAAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 9 8 365040 CASAVA_Build 8 106799040 1D TTGAACTGTT A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 A 8 7 365041 CASAVA_Build 8 106809359 1D TAGTATGATT A/- AAAAAAAAAA 1401 het 1401 ref 48 30 5 14 A 13 12 365042 CASAVA_Build 8 106817020 6D GGTTTTTTGA ACAGAC/------ ACAGTCAAGG 3070 het 3070 ref 29 16 10 8 ACAGAC 1 0 365043 CASAVA_Build 8 106821857 2I CAAAATTAAC --/TT TAATTATAGC 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 T 1 3 365044 CASAVA_Build 8 106826070 1I72M1I CTTCCTTGAA -GAGTGATGCCTACATCAGCTCTATTTGAAGGATAAACTTAGATAAGCGTAGGGTGAAGTTTTCTAGCCGGAA-/GGAGTGATGCCTACATCAGCTCTATTTGAAGGATAAACTTAGATAAGCGTAGGGTGAAGTTTTCTAGCCGGAAG AAACAGCATG 3070 hom 157 het 33 0 53 6 N/A 0 0 365045 CASAVA_Build 8 106833199 1I GTAGATTGTT -/A AAAAAAAAAA 1367 het 1367 ref 44 25 5 14 A 15 16 365046 CASAVA_Build 8 106836086 2D AGTAGCAACC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 T 13 11 365047 CASAVA_Build 8 106838170 3I AGAGGCTTTT ---/GTA GTAGATTTCA 3070 hom 126 het 46 0 42 4 GTA 1 2 365048 CASAVA_Build 8 106853438 3I GAATACAACA ---/TGT TGTTTATTAC 3070 het 3070 ref 47 19 19 9 TGT 1 2 365049 CASAVA_Build 8 106885171 5D CATAGCTGTG GTTAT/----- GTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 21 4 GTTAT 2 1 365050 CASAVA_Build 8 106912078 2D TATATGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 75 het 35 0 24 11 TA 7 6 365051 CASAVA_Build 8 106967483 1I ATCTGGACCT -/A AACTATTCTT 3070 het 3070 ref 58 30 22 6 A 2 3 365052 CASAVA_Build 8 106968879 1D GCAAAATAGC A/- AGAGAGGATC 3070 het 3070 ref 55 27 20 9 A 2 1 365053 CASAVA_Build 8 106974767 1D TGGATAAAAT A/- ATAAAATGCA 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 A 2 1 365054 CASAVA_Build 8 106975999 3I AAATAAATGT ---/AGA AGAAGGGACA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 AGA 1 2 365055 CASAVA_Build 8 106987057 2D GATTTTTTTT TG/-- TTTGTTTTTA 3070 het 3070 ref 47 22 20 6 TG 1 0 365056 CASAVA_Build 8 106995954 1D GAGGCAAAAA G/- AAAAATCTGA 3070 het 3070 ref 50 25 22 3 G 1 0 365057 CASAVA_Build 8 107001445 2D ACAACAAGAA CC/-- TATCTGCTGC 3070 het 3070 ref 48 27 15 7 C 2 0 365058 CASAVA_Build 8 107009337 1I CTTGGAACAG -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 42 18 22 2 A 8 9 365059 CASAVA_Build 8 107012464 3I ATTTTCAGAA ---/TAT TTTTTAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 12 1 TAT 0 1 365060 CASAVA_Build 8 107026224 5D TTAAAATAAA TTAGT/----- TTAGCTAGCT 3070 het 3070 ref 18 10 8 0 TTAGT 1 0 365061 CASAVA_Build 8 107052972 3D ACATGTGGCC AAG/--- AAGCGTGTGA 3070 het 3070 ref 33 18 9 8 AAG 2 1 365062 CASAVA_Build 8 107053754 3D AAAAGTTTTA AAT/--- AATAACAATA 3070 het 3070 ref 29 16 12 3 AAT 2 1 365063 CASAVA_Build 8 107054216 6D AAAAATGATT TTATTA/------ TTATTTTCAC 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 TTA 3 1 365064 CASAVA_Build 8 107055326 1I TCTTATTTTG -/T TTTCATCAAT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 T 3 4 365065 CASAVA_Build 8 107059862 1I AATTCAGTGA -/C CCCCCCAAGG 3070 hom 76 het 30 0 24 6 C 6 7 365066 CASAVA_Build 8 107064619 1I TTCACAGAGA -/T TTTTTTTTTT 1368 het 1368 ref 26 14 4 8 T 11 12 365067 CASAVA_Build 8 107070312 2I TCCCCCATGG --/CT TGGTGCTGTC 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 CT 0 1 365068 CASAVA_Build 8 107085378 32D TATGTTAGAT GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA/-------------------------------- GATAGATAGA 3070 het 3070 hom 52 16 24 21 GATA 12 4 365069 CASAVA_Build 8 107087048 1D GTGTAATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 17 19 7 A 13 12 365070 CASAVA_Build 8 107090806 8D ATTAGAAAAC ATATATAT/-------- ATATATATAT 3070 het 1857 hom 20 5 13 2 AT 10 6 365071 CASAVA_Build 8 107113626 1D CCCGCTAATA T/- TTTTTTTTGT 1768 het 1768 ref 16 8 6 2 T 9 8 365072 CASAVA_Build 8 107113911 3I AATTGTTCTC ---/ATT ATCATTTTAA 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 ATT 0 1 365073 CASAVA_Build 8 107122142 1D ATCCAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 19 12 2 A 12 11 365074 CASAVA_Build 8 107123984 1D TTTACTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 T 11 10 365075 CASAVA_Build 8 107124823 1I GTTTTTTGTT -/G TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 0 1 365076 CASAVA_Build 8 107125727 6D ATTCTTACTC TTTCTT/------ ATTAGCTCAG 3070 het 3070 ref 39 18 19 4 TTTCTT 1 0 365077 CASAVA_Build 8 107127805 2I TTACAAAGGA --/AG AGTCAACAGG 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 AG 1 2 365078 CASAVA_Build 8 107133591 1D AGATGCTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 16 15 9 A 11 10 365079 CASAVA_Build 8 107157364 5I ATTAAAATAA -----/ATAAG ATAATATTTT 3070 hom 39 het 19 0 14 5 ATAAG 0 1 365080 CASAVA_Build 8 107159806 4I TGCAAATATG ----/CTTA TTTATTTATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CTTA 0 1 365081 CASAVA_Build 8 107161828 1I ACATTTATTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 8 9 365082 CASAVA_Build 8 107180486 1D AGAAAGGAAA G/- GATGTTAATG 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 G 2 1 365083 CASAVA_Build 8 107187769 22I GGCAGATTTT ----------------------/TCTGGATCGTGATTTGAATCAG GTGTTTCAAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 TCTGGATCGTGATTTGAATCAG 0 1 365084 CASAVA_Build 8 107234870 1D CTCTCCTAGG T/- ACTCTACTTA 3070 het 3070 ref 46 22 19 6 T 1 0 365085 CASAVA_Build 8 107237942 5D ACAAAAATTA GCCAG/----- GCATGGTGGT 3070 het 1784 hom 30 9 14 11 GCCAG 1 0 365086 CASAVA_Build 8 107238084 1I AATCCATCTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 8 9 365087 CASAVA_Build 8 107277184 1D TCATCTTGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 25 13 8 5 A 10 9 365088 CASAVA_Build 8 107279503 2D TCTTATATTC CT/-- CTGTCTTTTT 3070 het 3070 hom 35 15 14 7 CT 2 1 365089 CASAVA_Build 8 107284798 14I13M5I ATGTTTTCAA --------------CCATCATAACTAC-----/CCATGACTTTAAATCCATCATAACTACCTTTT CTTGTTTGTC 3070 het 3070 ref 45 30 24 5 N/A 0 0 365090 CASAVA_Build 8 107286723 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAC 2267 het 2267 ref 14 6 6 2 A 10 9 365091 CASAVA_Build 8 107300180 1D TTCTAGTTCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 T 8 7 365092 CASAVA_Build 8 107302807 1D ACATACTTCT A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 8 7 365093 CASAVA_Build 8 107306464 4I AAAAAAACAC ----/AGAA AGACAAACAT 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 AGAA 0 1 365094 CASAVA_Build 8 107316650 1I ACTACACTTT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 A 8 9 365095 CASAVA_Build 8 107333107 5D GTCTCAAAAC AGAAA/----- AGAAAAGAAA 1927 het 1927 ref 22 14 5 5 AGAAA 3 2 365096 CASAVA_Build 8 107333214 1D ACCACAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 10 9 365097 CASAVA_Build 8 107334024 1I TTAGATAGGC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 A 7 8 365098 CASAVA_Build 8 107350522 5D TCTGTACCTC TTACT/----- TTAAAGAACA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 TTACT 1 0 365099 CASAVA_Build 8 107361398 2D TAGAAAGGAC AG/-- AGAGAGAGAG 1415 het 1415 ref 50 40 4 6 AG 9 8 365100 CASAVA_Build 8 107368092 6D CTACAGAAAC AAACAT/------ AAATGAGCTG 3070 het 3070 ref 49 27 21 3 AAACAT 1 0 365101 CASAVA_Build 8 107369061 1I ATCCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 18 11 A 13 14 365102 CASAVA_Build 8 107380147 1D TTTCTGGAGG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 34 20 14 0 A 8 7 365103 CASAVA_Build 8 107390381 1I TAAATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2881 hom 30 9 14 7 T 10 11 365104 CASAVA_Build 8 107395045 1I CGTTTATTCT -/C CCTTTTGCTA 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 C 2 3 365105 CASAVA_Build 8 107399775 1D AAGTCATGGT A/- ATCTCTTCCT 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 A 2 1 365106 CASAVA_Build 8 107422795 2I GTCAATCTAC --/AT ATATATATAT 1530 het 1530 ref 20 12 4 4 AT 8 9 365107 CASAVA_Build 8 107423279 1D CCCACCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 10 14 T 12 11 365108 CASAVA_Build 8 107423449 1I CCAGCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 25 1 19 5 A 11 12 365109 CASAVA_Build 8 107427503 1D GTTTATTCCA C/- CCCCCCTACC 3070 het 2869 hom 26 11 11 4 C 7 6 365110 CASAVA_Build 8 107435267 2D TCTAACTGAA TT/-- TTTTGTGTCA 3070 het 3070 ref 44 25 16 4 T 6 4 365111 CASAVA_Build 8 107435509 1I CCTTTGCCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 9 7 T 11 12 365112 CASAVA_Build 8 107438144 1D AAATAATAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 9 8 365113 CASAVA_Build 8 107446024 1D AAAGTAATAA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 9 8 365114 CASAVA_Build 8 107448469 1D TATGTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 28 2 13 13 T 16 15 365115 CASAVA_Build 8 107452436 1D GGTCCTGGGC T/- TTTTTTTTTT 2736 het 2363 hom 21 8 7 6 T 11 10 365116 CASAVA_Build 8 107466136 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 14 13 365117 CASAVA_Build 8 107472801 1I GTGGTAGTAT -/A AAAATAATAA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 4 5 365118 CASAVA_Build 8 107476373 1I72M6D AAATCTAACG -TTTACAAATGTATGTTATAACCTCACTAAAAGTAGTGGGGGGAAAAGTAATTGACCTGAATAACTTTAGAAAACATTG/TTTTACAAATGTATGTTATAACCTCACTAAAAGTAGTGGGGGGAAAAGTAATTGACCTGAATAACTTTAGAAA------ ACATTGTTTT 3070 hom 214 het 48 0 71 9 N/A 0 0 365119 CASAVA_Build 8 107492491 1D TATATTTGAG A/- TGAGTGTAAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 1 0 365120 CASAVA_Build 8 107494003 4I TTTCAAGGTG ----/GAGT GAGTGAGTAC 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GAGT 2 3 365121 CASAVA_Build 8 107494543 1D ACTTTTGTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 9 365122 CASAVA_Build 8 107495128 3D GCTGTATCTA CTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 CTT 1 0 365123 CASAVA_Build 8 107500336 4D ATGAGCATAT GTTA/---- GTTTTCAGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GTTA 1 0 365124 CASAVA_Build 8 107503201 37I AGTAGACTGG -------------------------------------/GAGGGGGACACAAAATTGAAGGACAAAAGGCATGAAT GAGAGGCCAT 3070 hom 78 het 27 0 27 4 GAGGGGGACACAAAATTGAAGGACAAAAGGCATGAAT 0 1 365125 CASAVA_Build 8 107503936 1I ATAAAATAGT -/A AAAAAAAGAC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 A 7 8 365126 CASAVA_Build 8 107515547 1D ATTTTCTCCT A/- AAAAAAACTA 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 8 7 365127 CASAVA_Build 8 107517927 1I GTGCCTATGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 8 A 12 13 365128 CASAVA_Build 8 107532169 1I AAGAGGGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 98 hom 45 2 30 13 T 13 14 365129 CASAVA_Build 8 107535283 1I CTAAGATGGT -/G GTGATCAGAA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 G 1 2 365130 CASAVA_Build 8 107539065 1I AGGGAAACCT -/A AAATCTTCTT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 3 4 365131 CASAVA_Build 8 107557126 1I CTAATGTCAG -/T TTTGTTTTCT 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 T 3 4 365132 CASAVA_Build 8 107566458 5I TTCATATTGC -----/TAAAT TAAAGAAGCC 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 TAAAT 0 1 365133 CASAVA_Build 8 107566578 4D AAGGAGAGAG AGAT/---- AAACAGGTAG 3070 het 3070 hom 49 14 26 12 AGAT 1 0 365134 CASAVA_Build 8 107574926 1I ATAAGCAGTG -/T TAATTAACTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 1 2 365135 CASAVA_Build 8 107598988 3I CACCAGCAGG ---/GCA GCAGAATTCC 3070 het 3070 hom 43 17 22 4 GCA 1 2 365136 CASAVA_Build 8 107602924 3I GCTGGAGGAG ---/TGT TGTTGTTGTT 3070 het 2992 hom 34 9 16 10 TGT 3 4 365137 CASAVA_Build 8 107624598 4D TGAATGTTTT ATTG/---- ATTAAGTACT 3070 het 3070 ref 38 19 15 7 ATTG 1 0 365138 CASAVA_Build 8 107625612 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1822 hom 38 11 14 13 T 15 14 365139 CASAVA_Build 8 107627220 1I TGGTGAGCAT -/G GCAAAACCTG 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 G 1 2 365140 CASAVA_Build 8 107628142 1I AGACAGTTAA -/C CTTTCATCTG 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 C 1 2 365141 CASAVA_Build 8 107634725 1D AATTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2586 het 2107 hom 21 9 10 2 T 15 14 365142 CASAVA_Build 8 107642183 1D TGCAGAAGGT G/- GGTGATTTCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 G 3 2 365143 CASAVA_Build 8 107648920 1D TCTATGAGCA G/- ATGGCCAGAT 3070 het 3070 hom 53 22 25 6 G 1 0 365144 CASAVA_Build 8 107657104 2D AGAATATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2414 hom 31 13 16 4 A 15 13 365145 CASAVA_Build 8 107665531 2I TTCAGGAAAC --/AA AAATTTCTAG 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 A 3 5 365146 CASAVA_Build 8 107670451 4D AGGTGCAGGC TCCT/---- TCCTGCCTTT 3070 het 3070 ref 38 20 16 5 TCCT 2 1 365147 CASAVA_Build 8 107691264 2I ACACACACAC --/AT ATTTATGAGA 3070 hom 126 het 44 0 43 1 AT 1 2 365148 CASAVA_Build 8 107693346 1I ACATAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 14 8 4 A 10 11 365149 CASAVA_Build 8 107693504 1I TCTCCTTCAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 T 9 10 365150 CASAVA_Build 8 107717720 1D AAGCACATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 53 14 22 18 T 13 12 365151 CASAVA_Build 8 107718153 3I AAATGAGTAG ---/AAT AATAGGATAG 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 AAT 1 2 365152 CASAVA_Build 8 107723348 1I GCCTATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2515 hom 24 7 12 5 T 10 11 365153 CASAVA_Build 8 107738723 1D CCTTAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2988 hom 33 12 12 10 A 13 12 365154 CASAVA_Build 8 107758590 16I TAAATTGCAA ----------------/AATGAGGAGTGTTTTT GTTTAATTTG 3070 het 3070 ref 28 15 15 0 AATGAGGAGTGTTTTT 0 1 365155 CASAVA_Build 8 107773380 2D TGTGTGTGTG TC/-- TATATATATA 2956 het 2091 hom 29 9 14 6 TC 1 0 365156 CASAVA_Build 8 107777413 3I AGATTCTCTC ---/TTG TTGTACATTC 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 TTG 1 2 365157 CASAVA_Build 8 107785718 6D TACATATATG GAGAGA/------ GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 24 15 8 1 GA 9 6 365158 CASAVA_Build 8 107793599 1I ATATAATTCC -/A AAAAATTAAT 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 A 5 6 365159 CASAVA_Build 8 107799229 2I GTAGTAAATA --/TT TTTTCATAAA 3070 het 3070 ref 42 21 19 2 T 4 6 365160 CASAVA_Build 8 107808602 1D38M1D AACACCGTTG TTTTTTTTTTAAACCAAGAACAATGAAGCTATTCATACAT/-TTTTTTTTTAAACCAAGAACAATGAAGCTATTCATACA- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 35 20 14 14 N/A 0 0 365161 CASAVA_Build 8 107815394 8D TAATTCTGGA TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2270 het 620 hom 15 3 5 8 T 19 11 365162 CASAVA_Build 8 107817570 1D TTATCTGACA C/- CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 26 14 10 3 C 9 8 365163 CASAVA_Build 8 107820164 2D TCCACCAAGC AA/-- AAAAGCATGT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 A 6 4 365164 CASAVA_Build 8 107821251 1I TGTAGTTGTT -/A ACAACAGCTG 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 A 1 2 365165 CASAVA_Build 8 107827704 42I TAATGGAAAT ------------------------------------------/GGGTATTTCTGCAGAAAATTGTAGGGACCCCTCAAGTTTTCA GGGGTTTTTG 3070 hom 78 het 24 0 27 4 GGGTATTTCTGCAGAAAATTGTAGGGACCCCTCAAGTTTTCA 0 1 365166 CASAVA_Build 8 107831562 1I ACACATACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 3 A 10 11 365167 CASAVA_Build 8 107833630 2D ATGTTTAAAG GT/-- GTAGTTTTGT 3070 hom 66 het 32 0 23 10 GT 2 1 365168 CASAVA_Build 8 107837077 1I TGTTCTGCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 12 9 T 11 12 365169 CASAVA_Build 8 107854037 1I AAATGCGGAG -/A AAAAAAAAAA 2957 het 2957 ref 28 14 8 6 A 11 12 365170 CASAVA_Build 8 107857051 1D GCTGTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 2822 hom 27 het 14 0 10 4 T 12 11 365171 CASAVA_Build 8 107871162 1D TCCCATTGGT G/- GGGGGGGACT 3070 hom 61 het 27 0 22 5 G 8 7 365172 CASAVA_Build 8 107884004 1I AAAAGTAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1354 hom 37 4 24 9 T 11 12 365173 CASAVA_Build 8 107888339 4I TGGTTTTGTC ----/TGTT TGTCTCTTAT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 TGTT 0 1 365174 CASAVA_Build 8 107905977 1I CCAAACTCGG -/A TCTACTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 0 1 365175 CASAVA_Build 8 107907380 1D TGAAAAATAC A/- AAAAAAAATT 756 hom 10 het 5 0 3 2 A 9 8 365176 CASAVA_Build 8 107931394 8D AGTGGAATTG GCTTTAAA/-------- GCTTTAAACT 3070 hom 117 het 40 0 40 3 GCTTTAAA 2 1 365177 CASAVA_Build 8 107940655 1D ACCCAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 1657 het 1657 ref 41 25 5 11 A 13 12 365178 CASAVA_Build 8 107957112 2D AATAATAAAC AG/-- AGTGTTGGTA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AG 2 1 365179 CASAVA_Build 8 107957906 1I AAAGAAATGG -/A AAAATATGAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 4 5 365180 CASAVA_Build 8 107968930 1D AACGAAACAT A/- AAAATAAATA 3070 hom 87 het 36 0 30 6 A 5 4 365181 CASAVA_Build 8 107987464 4I ATCTCAATTG ----/AAAC AAACAAAAAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AAAC 1 2 365182 CASAVA_Build 8 107989456 1D GCCTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1134 het 89 hom 10 1 5 4 T 19 18 365183 CASAVA_Build 8 107990165 2D TAAATCTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 31 0 23 8 T 13 11 365184 CASAVA_Build 8 107991675 17I TTCAACCCGG -----------------/GAGGCGGAGGTTAAAGT GAGCCGAGAT 3070 hom 24 het 10 0 8 2 GAGGCGGAGGTTAAAGT 0 1 365185 CASAVA_Build 8 108010814 10D TTAAAAACTT TATATATATA/---------- TATATATATA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 TA 12 7 365186 CASAVA_Build 8 108011471 1D CCCTTCCCCA T/- CGCTCCCAAG 3070 hom 66 het 28 0 22 6 T 1 0 365187 CASAVA_Build 8 108029220 1I CGAGTCCATG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 42 0 33 9 T 9 10 365188 CASAVA_Build 8 108030754 1D TCTCCTATGG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 10 9 365189 CASAVA_Build 8 108043923 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 11 10 365190 CASAVA_Build 8 108053513 2D TGTGAGCTTA TT/-- TTTTAACTAC 3070 hom 108 het 38 0 35 4 T 6 4 365191 CASAVA_Build 8 108064633 44D TGCCCACCAA GCACCAAAGACTACAATAAAGTGCTTCAGTGGCTGAATTTCTTG/-------------------------------------------- GCACCAAAGA 2837 het 2837 ref 27 14 8 21 GCACCAAAGACTACAATAAAGTGCTTCAGTGGCTGAATTTCTTG 2 1 365192 CASAVA_Build 8 108070075 2I GTATATAGTT --/TA TGTTAGATTA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 TA 0 1 365193 CASAVA_Build 8 108079485 2I TTACCAAATT --/AA AAAGTTTCTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 3 5 365194 CASAVA_Build 8 108079809 6D TAGGACCTCA ATTGAG/------ ATTAAGTTGT 3070 hom 116 het 42 0 39 4 ATTGAG 1 0 365195 CASAVA_Build 8 108083693 4D AAAGAGACTT AAAC/---- AAACACCCCA 3070 hom 60 het 24 0 21 4 AAAC 2 1 365196 CASAVA_Build 8 108084363 2D CAGTTTTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 1669 het 457 hom 22 6 6 10 A 16 14 365197 CASAVA_Build 8 108087078 8I GAGAACACAT --------/GGACACAG GGAGGGGAAC 3070 hom 75 het 26 0 25 1 GGACACAG 0 1 365198 CASAVA_Build 8 108088715 1I TATTACAACC -/A AATACCATAG 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 2 3 365199 CASAVA_Build 8 108095646 1I AGGAGGGAAT -/G GTTAATAAGA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 G 1 2 365200 CASAVA_Build 8 108097448 1I CAATTCAACC -/A AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 8 9 365201 CASAVA_Build 8 108101992 2I CTGTGGGACT --/AG AGAGAGTCTG 3070 hom 72 het 28 0 23 5 AG 3 4 365202 CASAVA_Build 8 108103208 4D GGCTACCTAT CAGG/---- CAGGTATTAT 3070 hom 93 het 36 0 31 6 CAGG 2 1 365203 CASAVA_Build 8 108107187 3I TCTTGCTTTT ---/TTG CCCAGGCTGG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 TTG 0 1 365204 CASAVA_Build 8 108109369 1D AAGATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 32 1 25 6 T 12 11 365205 CASAVA_Build 8 108114860 1D CAGTATATGT A/- AATAAATAAA 3070 hom 99 het 35 0 33 2 A 3 2 365206 CASAVA_Build 8 108115014 19I GTTGGCACAA -------------------/CGTACATTTACGTTTACAT TTCAAACCAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 CGTACATTTACGTTTACAT 0 1 365207 CASAVA_Build 8 108116722 1D TTATAAGGGA T/- TTCCCCCTTA 3070 hom 104 het 45 0 35 10 T 3 2 365208 CASAVA_Build 8 108117295 1I GGGAGGGAGT -/A AAAACCTCAT 3070 hom 126 het 43 0 43 0 A 4 5 365209 CASAVA_Build 8 108119292 3I AGGGAAGAGA ---/CAC CATTGCTGAA 3070 hom 114 het 43 0 39 4 CAC 0 1 365210 CASAVA_Build 8 108120466 2D TAATATCCTA TT/-- TACATATAAG 3070 hom 78 het 32 0 27 7 T 3 1 365211 CASAVA_Build 8 108126595 1I ATACAGCCAC -/T GTAGAAAACA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 0 1 365212 CASAVA_Build 8 108127554 2D TATTCAATAA AT/-- ATGTTTTCCT 3070 hom 87 het 37 0 30 7 AT 2 1 365213 CASAVA_Build 8 108129296 1I AAAGAAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 815 hom 43 2 31 10 A 12 13 365214 CASAVA_Build 8 108132343 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAACT 3070 hom 138 het 52 0 44 8 A 9 8 365215 CASAVA_Build 8 108134298 3D TCATTACAGA CTT/--- CTTATTTCTA 3070 hom 69 het 27 0 24 6 CTT 2 1 365216 CASAVA_Build 8 108145386 1I CTTTTTATTC -/T TTTTTTCTCT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 6 7 365217 CASAVA_Build 8 108154332 4D GGAGAGCAGA TAGT/---- TAGGTTGATT 3070 hom 87 het 30 0 30 4 TAGT 1 0 365218 CASAVA_Build 8 108154857 7I TGCATTTTGA -------/ACTATTC ACTTTTCCAG 3070 hom 87 het 34 0 30 4 ACTATTC 0 1 365219 CASAVA_Build 8 108155800 1I GATTAAAGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 22 0 18 4 A 9 10 365220 CASAVA_Build 8 108155970 1I8M4I AAATCGTATT -TAAATAAT----/GTAAATAATAGTC AGGTGATTGG 3070 hom 129 het 43 0 43 6 N/A 0 0 365221 CASAVA_Build 8 108156519 1I ATGAATCAGG -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 T 7 8 365222 CASAVA_Build 8 108204347 4D CGGCAGGAGG CAGA/---- CAGGCTCTTG 2280 het 2280 ref 30 15 8 10 CAGA 1 0 365223 CASAVA_Build 8 108205822 1D AACACCCCCC A/- CTCCAGACAG 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 A 1 0 365224 CASAVA_Build 8 108211108 1D GTAGCAAAGC A/- AAAAAGGTTT 3070 hom 101 het 40 0 34 6 A 6 5 365225 CASAVA_Build 8 108211606 1I CTTTGCTGCA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 7 8 365226 CASAVA_Build 8 108215129 1D TGCCAGGAAT G/- GTACCATGCT 3070 het 3070 hom 38 18 19 1 G 2 1 365227 CASAVA_Build 8 108231130 2I13M2D ATTATACATA --GTTATTTATTGAGAT/ATGTTATTTATTGAG-- ATATATATAT 3070 het 662 hom 31 4 17 10 N/A 0 0 365228 CASAVA_Build 8 108235678 1I AAGAAGAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 42 21 17 4 A 9 10 365229 CASAVA_Build 8 108247868 1D TGGGGAACAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 23 13 9 2 A 8 7 365230 CASAVA_Build 8 108250355 1I TATTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 22 0 15 7 T 13 14 365231 CASAVA_Build 8 108255463 1D CAGATGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 12 11 365232 CASAVA_Build 8 108257243 17I AATTACTATC -----------------/ATAGCAGGGCACCTGTG CACATGTCCA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 ATAGCAGGGCACCTGTG 0 1 365233 CASAVA_Build 8 108265184 5D27M1I ATTTGAATCC TTGAGTTTAGAAGGTAATCATTCTTAAACCTC-/-----TTTAGAAGGTAATCATTCTTAAACCTCT TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 42 27 22 7 N/A 0 0 365234 CASAVA_Build 8 108268376 1D ACACTATGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 A 10 9 365235 CASAVA_Build 8 108277397 1D GTCTCCAACA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 135 het 50 0 44 6 T 9 8 365236 CASAVA_Build 8 108281188 1D TGTATGACCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 T 11 10 365237 CASAVA_Build 8 108286345 40D TACAAAATTG TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------------- TATATATATA 3066 hom 21 het 12 0 8 8 TA 27 7 365238 CASAVA_Build 8 108294197 1I AGAAACAATA -/G GACAAGCCAA 3070 hom 146 het 56 0 47 9 G 1 2 365239 CASAVA_Build 8 108296141 1I CTGCAAACAC -/T TTTCTAGATC 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 3 4 365240 CASAVA_Build 8 108302722 1D GTGTATATAA C/- ATGTCATGTA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 C 1 0 365241 CASAVA_Build 8 108306688 1D CTGTTGCCTG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 A 8 7 365242 CASAVA_Build 8 108328167 1I ACTGTAAGAG -/A AACTCAGGTA 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 2 3 365243 CASAVA_Build 8 108328706 1I TGTGTTTGTG -/T TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 T 1 2 365244 CASAVA_Build 8 108331016 5I TGAAACAATT -----/AAATG AAAAGAATAC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 AAATG 0 1 365245 CASAVA_Build 8 108341884 1I GTTTAAAAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 A 8 9 365246 CASAVA_Build 8 108348116 5D TTAAGCTCAC TAATA/----- AAGACAGACT 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 TAATA 1 0 365247 CASAVA_Build 8 108354294 1D AAGAATACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 19 0 16 4 A 14 13 365248 CASAVA_Build 8 108358033 1D TTAATGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 146 hom 34 1 29 5 A 12 11 365249 CASAVA_Build 8 108365774 2I GAGTATGAAA --/CT CTTATCAGTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CT 1 2 365250 CASAVA_Build 8 108389627 1D TGAACGCTAT A/- CCCATGATTA 3070 hom 108 het 44 0 37 7 A 1 0 365251 CASAVA_Build 8 108392360 2D TGTGTATGTA TG/-- TGTGTGTGTA 3070 hom 140 het 60 0 43 18 TG 5 4 365252 CASAVA_Build 8 108399039 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 13 0 10 3 T 14 13 365253 CASAVA_Build 8 108417296 3D TGAGATTTGA ACT/--- ACTACCATTA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 ACT 2 1 365254 CASAVA_Build 8 108436479 1D CTAATTTTTG T/- TTTTTTAGTA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 T 7 6 365255 CASAVA_Build 8 108444492 1D ACCTGAGTGC T/- TTTTTTTTTT 2024 het 988 hom 34 7 8 20 T 17 16 365256 CASAVA_Build 8 108446376 1I CAGAAGGGGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 73 hom 42 2 32 8 A 9 10 365257 CASAVA_Build 8 108452376 1D TGATTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 36 0 26 11 A 13 12 365258 CASAVA_Build 8 108453587 5I TCCATGTGTT -----/ATAAG ATATGTAGCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 ATAAG 0 1 365259 CASAVA_Build 8 108454677 3I CAAAATAGAT ---/TTA TTTTTTTTTT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 TTA 0 1 365260 CASAVA_Build 8 108456562 4D GACTCCATCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 CAAA 6 5 365261 CASAVA_Build 8 108459337 1I GAAAAAAAAA -/T CATATCAGTT 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 0 1 365262 CASAVA_Build 8 108460338 2D ATACACATAC AT/-- ATATATATAT 481 het 481 ref 14 10 4 0 AT 7 6 365263 CASAVA_Build 8 108460955 1I AGAGGAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 911 hom 44 3 36 5 A 10 11 365264 CASAVA_Build 8 108461539 2I ATACAAATAG --/CT AGGAAAAATT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 CT 0 1 365265 CASAVA_Build 8 108461764 10D GCAGGATGTT TGTGTGTGTG/---------- TGTGTGTGTG 3070 hom 61 het 37 0 27 16 TG 14 9 365266 CASAVA_Build 8 108463942 1I TTTGAAAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 9 10 365267 CASAVA_Build 8 108465855 1D TGTTAATTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 150 het 53 0 50 4 A 10 9 365268 CASAVA_Build 8 108469192 1D TCTACCTAGG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 9 8 365269 CASAVA_Build 8 108469445 3I ATTGTTTCTC ---/AAT AAGTTTGCTC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 AAT 0 1 365270 CASAVA_Build 8 108471361 1D7M2D AAAATCATGC TGCAGTAAGC/-AAAGTAA-- TCTTTGAGAG 2912 het 2912 ref 27 15 8 10 N/A 0 0 365271 CASAVA_Build 8 108479905 6D TTCTTTTCTA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 het 791 hom 19 4 12 5 T 17 11 365272 CASAVA_Build 8 108482291 1I TAACTTGAAA -/G TGTAAAGATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 G 0 1 365273 CASAVA_Build 8 108489482 1D ATTTTCTTAC A/- AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 A 7 6 365274 CASAVA_Build 8 108489928 1D AGGGTTGGGA G/- GGTGAGGGCT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 G 3 2 365275 CASAVA_Build 8 108491124 1I GAAAAATGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 18 8 T 10 11 365276 CASAVA_Build 8 108498940 1I TGCAGAGCCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 8 9 365277 CASAVA_Build 8 108508545 1I CCTGGGATAT -/A AGTGGGCTTG 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 1 2 365278 CASAVA_Build 8 108513139 1D CTACTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 42 0 30 13 T 12 11 365279 CASAVA_Build 8 108516021 9I AAAAATACTA ---------/AACTTCAAT AACTTCAATA 3070 het 3070 ref 46 26 17 3 AACTTCAAT 1 2 365280 CASAVA_Build 8 108521735 1I CAGCATCAAA -/T TTTTACACAC 3070 het 3070 ref 41 28 11 2 T 4 5 365281 CASAVA_Build 8 108533909 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 hom 21 10 7 4 T 8 7 365282 CASAVA_Build 8 108535265 1I GCTGAGATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 35 hom 27 1 22 4 A 11 12 365283 CASAVA_Build 8 108541177 5I ATTGCCTTTC -----/TAGAA TAGAATGTCA 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 TAGAA 1 2 365284 CASAVA_Build 8 108542965 10D CAACCACTGG TGTCCTAGAA/---------- TGTCCTAGAA 3070 het 3070 hom 30 15 16 6 TGTCCTAGAA 2 1 365285 CASAVA_Build 8 108548722 2D TTATTTATTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 AT 8 7 365286 CASAVA_Build 8 108551551 4D TTGAGAATAT TTTG/---- TTTTACAATA 3070 het 3070 ref 43 21 19 3 TTTG 1 0 365287 CASAVA_Build 8 108551893 1I CAAAGGTCTG -/T GTTTTTACAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 T 0 1 365288 CASAVA_Build 8 108555620 2I GAATCCAGCA --/AC ACATCAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 AC 1 2 365289 CASAVA_Build 8 108560545 1I ATCTTCCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 18 17 9 T 10 11 365290 CASAVA_Build 8 108565018 1D AAGGTCTTTT A/- AGTGATGACT 3070 het 3070 hom 38 14 23 1 A 2 1 365291 CASAVA_Build 8 108568953 1D TTCATCTGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 12 17 8 A 10 9 365292 CASAVA_Build 8 108571770 1I ATTCAGGTGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 9 10 365293 CASAVA_Build 8 108572556 1I AGAAATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 A 10 11 365294 CASAVA_Build 8 108573454 1I TCTGAAAGGG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 T 8 9 365295 CASAVA_Build 8 108590747 2D ATACGCATTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 11 9 365296 CASAVA_Build 8 108597564 1D TTAAGAAAGA T/- TTTTTTAAGT 3070 het 3070 hom 23 9 13 1 T 7 6 365297 CASAVA_Build 8 108603771 1I ACCAGGAAAG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 84 het 39 0 29 10 A 8 9 365298 CASAVA_Build 8 108617535 1I AAATTCTTTG -/C CTGTATCTTC 3070 hom 120 het 48 0 40 8 C 1 2 365299 CASAVA_Build 8 108624521 2I TATATATACG --/TA TATATGTATA 1123 hom 12 het 5 0 5 0 TA 2 3 365300 CASAVA_Build 8 108654375 1I TCTAATATTT -/G GGGGGGGGAG 3070 hom 60 het 26 0 21 5 G 8 9 365301 CASAVA_Build 8 108664820 8I ATTTCTCCCA --------/GTGGATAT TGAGAACAAT 3070 hom 83 het 30 0 27 3 GTGGATAT 0 1 365302 CASAVA_Build 8 108669925 1D ATAATTTTCA G/- GGGGGGGGAG 3070 hom 62 het 26 0 21 6 G 9 8 365303 CASAVA_Build 8 108696159 1I GAAGTGTCAC -/A AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 34 17 5 12 A 15 16 365304 CASAVA_Build 8 108696260 2D ACTTTGTGTC AT/-- ATATATATAT 1188 het 1188 ref 33 17 4 12 AT 9 8 365305 CASAVA_Build 8 108712472 2D AGAAACAGGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 34 1 21 12 A 13 11 365306 CASAVA_Build 8 108713198 1I CATGAATGAT -/A AAACTCAATT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 A 3 4 365307 CASAVA_Build 8 108714254 1D TATTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 28 2 19 8 T 19 18 365308 CASAVA_Build 8 108735658 1D GTGGGCTGCA C/- CCACTGTCTA 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 C 3 2 365309 CASAVA_Build 8 108744601 1D AAATAAAAGG A/- AAAAATAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 6 5 365310 CASAVA_Build 8 108745776 1D TCTTTCCCCA G/- CCATAAAGTG 3070 het 3070 hom 39 14 19 7 G 1 0 365311 CASAVA_Build 8 108754731 2D TCTTGAATGT AC/-- ACACACACAC 1379 het 1379 ref 40 24 3 14 AC 9 8 365312 CASAVA_Build 8 108757211 2I AGTCTCTCCC --/TG GTTGATATTC 3070 hom 120 het 44 0 41 3 TG 0 1 365313 CASAVA_Build 8 108823746 4D TTTTTCCTCC TATT/---- TATTTAAATT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TATT 2 1 365314 CASAVA_Build 8 108828274 5I ACTAATGTTG -----/TATAA TATAATAATC 3070 hom 120 het 51 0 41 10 TATAA 1 2 365315 CASAVA_Build 8 108832722 1D TACCCTATAA T/- TTTCAGGAAC 3070 hom 99 het 37 0 34 4 T 4 3 365316 CASAVA_Build 8 108833557 2I21M1D CATATTTCCA --TTTTTTTTTTAACCTATTAGTG/TGTTTTTTTTTTAACCTATTAGT- GGGGAAAAAA 3070 hom 166 het 51 0 55 6 N/A 0 0 365317 CASAVA_Build 8 108834092 4D AGGTGAAGTT AAAC/---- AAATTTCAAG 3070 hom 129 het 51 0 44 12 AAAC 1 0 365318 CASAVA_Build 8 108843461 1D TTGCTTATTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 15 0 10 5 A 13 12 365319 CASAVA_Build 8 108848367 2I ATGAAATAAA --/TC TGTTTGACAC 3070 hom 105 het 41 0 36 5 TC 0 1 365320 CASAVA_Build 8 108853383 1D CTAAGCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 48 3 25 21 T 17 16 365321 CASAVA_Build 8 108861583 12D ATAGATTTTC AATAATAATAAT/------------ AATAATAATA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 AAT 10 6 365322 CASAVA_Build 8 108883938 2I GGTCAGAAAC --/AT AGAGTTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 26 6 AT 0 1 365323 CASAVA_Build 8 108923776 2I GATAAAAAGT --/AG AGTTCTGGAG 3070 hom 69 het 30 0 23 7 AG 1 2 365324 CASAVA_Build 8 108942329 1I AAGTCAGCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 T 8 9 365325 CASAVA_Build 8 108944070 1D TTTGTGGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 32 0 25 7 T 11 10 365326 CASAVA_Build 8 108944340 1D TCCTAAGTAC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 10 9 365327 CASAVA_Build 8 108952187 1D AACCATCTGA C/- CCTTTGACAA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 C 3 2 365328 CASAVA_Build 8 108954139 1I ATTTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 2040 het 2040 ref 42 28 5 9 T 10 11 365329 CASAVA_Build 8 108959129 2D TAAATAAAAC TT/-- TTCTTACTGC 3070 hom 120 het 42 0 41 4 T 4 2 365330 CASAVA_Build 8 108959693 1D TATGTAGAAA T/- TACTTTATAC 3070 hom 63 het 26 0 22 7 T 2 1 365331 CASAVA_Build 8 108961411 1I CTCTATTTCA -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 7 8 365332 CASAVA_Build 8 108980841 1D AAAATAGTGT A/- AATAGACATG 3070 hom 72 het 30 0 24 6 A 3 2 365333 CASAVA_Build 8 108985434 1D TAAGATTTTC A/- AACATGAGAA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 3 2 365334 CASAVA_Build 8 108985763 1D GGATCATTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 309 hom 36 2 25 9 A 13 12 365335 CASAVA_Build 8 109001532 11I GAGGAAGAGA -----------/GAGAAGGAGGG AAGAAGGAGG 3070 hom 120 het 42 0 40 3 GAGAAGGAGGG 0 1 365336 CASAVA_Build 8 109005498 1D ACATACAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 11 10 365337 CASAVA_Build 8 109015776 2D CTCATTTCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 26 2 17 7 T 16 14 365338 CASAVA_Build 8 109017218 1D GCAGACACCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 104 het 40 0 35 6 T 8 7 365339 CASAVA_Build 8 109018907 1D CATAGTTATT A/- AGTGGTAGTC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 2 1 365340 CASAVA_Build 8 109019020 3I CATTTGAAGG ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 28 0 24 4 A 11 14 365341 CASAVA_Build 8 109020883 7D TTAAATTATC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 36 0 23 14 T 21 14 365342 CASAVA_Build 8 109021721 1D GTGTGTTTTA T/- TAACAGACAC 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 2 1 365343 CASAVA_Build 8 109031543 2I ACCTCCCTGA --/AC ACACATGCAC 3070 hom 144 het 54 0 49 5 AC 2 3 365344 CASAVA_Build 8 109031897 1I TTTTGGGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 403 hom 40 1 30 9 T 10 11 365345 CASAVA_Build 8 109033599 1I ATCTTTGTTT -/A AACACCAACT 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 2 3 365346 CASAVA_Build 8 109037043 1I ACTGTTTTTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 8 9 365347 CASAVA_Build 8 109039441 2I CGGGAGAATT --/CA CAGGAAGCAC 3070 hom 150 het 54 0 50 4 CA 1 2 365348 CASAVA_Build 8 109047044 1D GCCATTCAAG T/- TTTTTTTTTT 1315 het 1315 ref 49 35 4 11 T 12 11 365349 CASAVA_Build 8 109055447 1D ATCCTCAAAC A/- AACATGCATT 3070 hom 102 het 41 0 35 8 A 3 2 365350 CASAVA_Build 8 109062928 4I GTCTCAGAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 79 het 40 0 31 9 AAAG 4 5 365351 CASAVA_Build 8 109084456 1D ACCTCAATAA T/- TTTTTTTTTT 2346 het 877 hom 26 6 9 11 T 17 16 365352 CASAVA_Build 8 109091466 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2930 het 2930 ref 20 10 7 3 A 11 10 365353 CASAVA_Build 8 109094665 1I TCTTTTTCTA -/T TTTTTGGTTG 3070 het 3070 ref 42 20 20 2 T 5 6 365354 CASAVA_Build 8 109096249 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAA 3030 het 1558 hom 21 5 12 4 A 14 15 365355 CASAVA_Build 8 109105554 1I AAAAAACAAG -/T TGACATATAT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 1 2 365356 CASAVA_Build 8 109110364 1D AAATATCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 12 11 365357 CASAVA_Build 8 109115597 1I GAGGTTCTGG -/A GGGTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 0 1 365358 CASAVA_Build 8 109125004 2D AGTATCTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 21 4 A 12 10 365359 CASAVA_Build 8 109125558 1D CTGTTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1361 het 1361 ref 34 23 4 7 A 12 11 365360 CASAVA_Build 8 109129261 1D GCTCAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1741 hom 24 6 12 7 A 14 13 365361 CASAVA_Build 8 109149483 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 1399 het 1399 ref 25 20 3 3 A 10 9 365362 CASAVA_Build 8 109171568 3I ATATAAGCAC ---/AAT GTCTGTTTTG 3070 het 3070 ref 45 22 17 6 AAT 0 1 365363 CASAVA_Build 8 109175018 1D TGAAATCATT C/- TCCTTTAGTA 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 C 1 0 365364 CASAVA_Build 8 109195912 3I AGACTGTTCC ---/TTG TTGTTTTAAC 3070 het 3070 ref 48 19 21 8 TTG 1 2 365365 CASAVA_Build 8 109196246 1I AACTGAGTTT -/G GGGGGGGGTC 1067 het 1067 ref 23 11 3 9 G 8 9 365366 CASAVA_Build 8 109207157 4D AATAATAGAC AGAG/---- AGCCAAATCA 3070 het 3070 ref 28 19 9 0 AG 3 1 365367 CASAVA_Build 8 109212360 1D CCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 11 10 365368 CASAVA_Build 8 109217338 1I CACAAATTTG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 37 12 23 2 T 8 9 365369 CASAVA_Build 8 109219565 1I CACCTAGACC -/T GATCTTGATT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 0 1 365370 CASAVA_Build 8 109226207 1D GTAGAATGAA G/- TGGGGTAAGG 3070 het 3070 ref 58 26 25 7 G 1 0 365371 CASAVA_Build 8 109226874 1D GTATCTGGAG C/- CCAGCACACT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 C 3 2 365372 CASAVA_Build 8 109235096 1I ACAAAATTAG -/A AAAAAAAAAG 2712 het 2712 ref 23 9 7 7 A 9 10 365373 CASAVA_Build 8 109237552 5D TTCCTTTAGA GAAAG/----- GAAAGGGAGG 3070 het 3070 ref 35 18 11 9 GAAAG 2 1 365374 CASAVA_Build 8 109243025 1I ATCCGGGTAA -/T TTTTTTTTTT 2584 het 2267 hom 18 5 7 6 T 10 11 365375 CASAVA_Build 8 109247789 1D ATGTATGTTT A/- ATTTTATAAA 3070 het 3070 hom 46 16 24 6 A 2 1 365376 CASAVA_Build 8 109254843 4D AGTATATATC TTTA/---- TTTATTTAGG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 TTTA 3 2 365377 CASAVA_Build 8 109254984 1D TACATTTAAA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 T 8 7 365378 CASAVA_Build 8 109258397 2D ATAGTAAAAT TA/-- TATAGTACAT 3070 het 3070 hom 28 9 15 5 TA 3 2 365379 CASAVA_Build 8 109259221 1I GATGATAGAT -/A AATGTTCTCA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 2 3 365380 CASAVA_Build 8 109259986 2I AAACTTAAAC --/AA AAAAAAAAAA 2937 het 2937 ref 23 10 8 5 A 10 12 365381 CASAVA_Build 8 109260609 2I CCAAAAAGGC --/GT ATATCAAGCA 3070 het 3070 hom 44 20 21 3 GT 0 1 365382 CASAVA_Build 8 109261616 1I AACAATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 10 11 365383 CASAVA_Build 8 109263058 1I22M1I GTTTTATTAT -GATCTAGATAGAGGTTTTTTTG-/AGATCTAGATAGAGGTTTTTTTGT TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 19 10 10 4 N/A 0 0 365384 CASAVA_Build 8 109263613 5D AGACTGAGGT GAGAG/----- GAGAGGATCG 3070 het 1374 hom 17 5 9 4 GAGAG 2 1 365385 CASAVA_Build 8 109263778 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1602 hom 23 6 13 4 A 14 13 365386 CASAVA_Build 8 109264444 1I CACAATTCAT -/A AGGCTTATCT 3070 het 3070 hom 49 20 25 4 A 1 2 365387 CASAVA_Build 8 109265499 1D CCTGGGTGAT G/- GGATCATTCA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 G 3 2 365388 CASAVA_Build 8 109265649 1I AAGAAAATAG -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 34 19 10 5 A 7 8 365389 CASAVA_Build 8 109267463 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1830 hom 23 5 15 3 A 11 12 365390 CASAVA_Build 8 109268473 1D GTGAAACCAC A/- GCTATATTGT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 A 1 0 365391 CASAVA_Build 8 109268560 1D GCTTCGCTTT C/- CCCTGGATCC 3070 het 3070 ref 46 21 19 7 C 4 3 365392 CASAVA_Build 8 109272011 3I TTTTGGGGTT ---/AAA AAAAAAAGAC 2950 het 2950 ref 32 19 8 5 A 7 10 365393 CASAVA_Build 8 109279985 1I GGTAAATGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 T 8 9 365394 CASAVA_Build 8 109287189 1I AGGAACCATT -/A TTTTACTTAG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 0 1 365395 CASAVA_Build 8 109290504 4I AATTACAAAT ----/AGAA AGAGTTATTT 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 AGAA 0 1 365396 CASAVA_Build 8 109291448 1D ACAGTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 12 9 T 15 14 365397 CASAVA_Build 8 109294212 1D GTCTCCCCCC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 A 7 6 365398 CASAVA_Build 8 109294282 1D TAAAACATTG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 21 10 8 4 A 9 8 365399 CASAVA_Build 8 109298706 1D TTAGGTATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 8 7 A 11 10 365400 CASAVA_Build 8 109299588 2D CTCAGAATTA TC/-- TGTCAATAAA 3070 het 3070 hom 49 21 21 8 TC 1 0 365401 CASAVA_Build 8 109301560 1I CAAAAAAAAA -/C AAAAAGGAAA 3070 het 1768 hom 30 10 19 1 C 0 1 365402 CASAVA_Build 8 109303581 1I CCAAGTAGTT -/G GGGGCCACAG 3070 het 3070 ref 37 16 14 7 G 4 5 365403 CASAVA_Build 8 109314300 1I GCTGGAACTC -/T TAACATGACA 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 T 1 2 365404 CASAVA_Build 8 109320972 1D GCAGCAGTGC T/- TGTCCTATGC 3070 hom 69 het 41 0 30 11 T 2 1 365405 CASAVA_Build 8 109322385 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 20 0 17 3 A 11 10 365406 CASAVA_Build 8 109327690 4D AAGGGGGTGT GGGG/---- GGGGGGGGCT 3070 het 244 hom 25 4 12 10 G 12 8 365407 CASAVA_Build 8 109333063 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 18 8 9 1 A 11 12 365408 CASAVA_Build 8 109336569 13D AAAGTGGTGT CCTAGAAGTCAAA/------------- GGAGAGTGGC 3070 hom 111 het 40 0 38 7 CCTAGAAGTCAAA 1 0 365409 CASAVA_Build 8 109342692 1D TATTTGCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 35 0 30 5 T 12 11 365410 CASAVA_Build 8 109348301 11D AATAAATAAC TTTATGAAAAA/----------- TATGGTCTTA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TTTATGAAAAA 1 0 365411 CASAVA_Build 8 109351791 1D TTTCTGGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 18 5 T 13 12 365412 CASAVA_Build 8 109355369 3D GAAATTGGTG TTA/--- TTATCTTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 21 3 TTA 2 1 365413 CASAVA_Build 8 109362195 8D ACAGTGAATA GGGTTTGG/-------- CTTGTTGACT 3070 het 3070 hom 32 13 15 6 GGGTTTGG 1 0 365414 CASAVA_Build 8 109368812 1D CTGTCCCCAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 10 9 365415 CASAVA_Build 8 109374045 2D CCTCCTCTAG AA/-- AAAGAGTGAG 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 A 5 3 365416 CASAVA_Build 8 109384725 2D ATTGTTTGGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2569 hom 27 10 14 3 T 17 15 365417 CASAVA_Build 8 109390260 31D TTTTCCAATC TTTAGTCTTCATTTACCCATTTCTTTATATG/------------------------------- TTTAGTCTTC 3070 hom 81 het 35 0 28 14 TTTAGTCTTCATTTACCCATTTCTTTATATG 2 1 365418 CASAVA_Build 8 109390594 1D GGGGGAGGTC T/- GGTTTTCTCC 3070 het 3070 hom 42 14 22 6 T 1 0 365419 CASAVA_Build 8 109398048 1I TAATTAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2882 hom 23 8 13 2 T 11 12 365420 CASAVA_Build 8 109399033 2I GCAGATTTCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 het 2954 hom 27 9 10 8 TC 7 8 365421 CASAVA_Build 8 109406943 1D AATCATTAAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 8 7 365422 CASAVA_Build 8 109418662 1I TTACATATGC -/A ATTCATGGTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 A 1 2 365423 CASAVA_Build 8 109419661 1I AATTTATAAA -/G AAAAAAAGGT 3070 hom 58 het 23 0 20 3 G 0 1 365424 CASAVA_Build 8 109421823 2D AAAAAAACAA AC/-- AAAAAAAAAA 1684 het 637 hom 19 6 9 4 AC 1 0 365425 CASAVA_Build 8 109422917 1I AGATCTGGGT -/G GGGACACAGA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 3 4 365426 CASAVA_Build 8 109434017 1D GCCCAGACAC T/- GACAAACATC 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 1 0 365427 CASAVA_Build 8 109435093 1D GGATTTCAAG A/- CCAGCCTGGC 1684 hom 4 het 7 0 4 4 A 1 0 365428 CASAVA_Build 8 109438347 1D GCATCTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 32 1 24 7 A 13 12 365429 CASAVA_Build 8 109438836 1D TAAAGCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 11 10 365430 CASAVA_Build 8 109440645 1I GAAAATGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 T 9 10 365431 CASAVA_Build 8 109442498 4D AAAGAAGTGG TATA/---- TATAGTCCAT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TA 4 2 365432 CASAVA_Build 8 109448280 3D CCTTAGATGC GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 het 39 hom 22 1 16 7 G 13 10 365433 CASAVA_Build 8 109449379 1D GAACCAAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 612 hom 37 2 27 8 T 12 11 365434 CASAVA_Build 8 109453954 2I ATTGAATGAC --/AT GAGACTTGTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AT 0 1 365435 CASAVA_Build 8 109464012 1I CTCTGTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2269 hom 20 5 13 2 A 11 12 365436 CASAVA_Build 8 109466268 1I TAAAAGCGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 9 10 365437 CASAVA_Build 8 109473597 1I CCATGGCCTC -/T TAACATAAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 2 365438 CASAVA_Build 8 109478967 1D CCTGTATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 9 A 12 11 365439 CASAVA_Build 8 109484617 5D GCTAAAAGTA AAGTT/----- ATTACAGGAA 3070 het 3070 ref 45 24 18 7 AAGTT 1 0 365440 CASAVA_Build 8 109485510 1D ATTTAAGAGA C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2302 hom 29 7 11 11 C 10 9 365441 CASAVA_Build 8 109504054 5D TATATTTATA TTTTC/----- TTTGACATAC 850 het 850 ref 23 18 3 6 TTTTC 1 0 365442 CASAVA_Build 8 109504997 4I TCAAAAACAG ----/TTAC TTTATATAAT 3070 hom 57 het 27 0 20 7 TTAC 0 1 365443 CASAVA_Build 8 109505753 1D GTGTGTGTGT G/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 G 1 0 365444 CASAVA_Build 8 109505962 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 333 hom 27 2 17 8 T 13 12 365445 CASAVA_Build 8 109507860 1I CCTGAAGCCA -/C CCCCCCAAAA 3070 hom 39 het 23 0 14 9 C 6 7 365446 CASAVA_Build 8 109512553 1D GGAAAGAGAG A/- AAAAAATTCT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 7 6 365447 CASAVA_Build 8 109513924 9D GACAGTATCC AAAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 3070 het 2086 hom 39 13 16 14 A 20 11 365448 CASAVA_Build 8 109514356 1D TATTAAGCAC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 9 8 365449 CASAVA_Build 8 109522749 1I TGCAGTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 405 hom 47 1 32 14 T 10 11 365450 CASAVA_Build 8 109523155 1D CCAGACTGGG T/- TTTGGGAAGG 3070 hom 134 het 51 0 44 8 T 4 3 365451 CASAVA_Build 8 109532621 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAATCAA 3070 hom 63 het 25 0 21 4 A 7 6 365452 CASAVA_Build 8 109533082 1I GAGGTGACCG -/T TTTTATGTCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 4 5 365453 CASAVA_Build 8 109537407 4I AGGAAATAAT ----/AGAA AGATACATAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 AGAA 0 1 365454 CASAVA_Build 8 109541258 2D CAAACCTATC TG/-- TAATAAAAAA 3028 het 3028 ref 23 11 7 6 TG 1 0 365455 CASAVA_Build 8 109543616 3D TGTGTGTGTG TTT/--- TGTGTGCGTG 761 het 761 ref 30 13 3 15 T 4 1 365456 CASAVA_Build 8 109544148 2D TTTAATATTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 37 0 31 6 T 12 10 365457 CASAVA_Build 8 109548913 13D ACCACCACGC TCAGCTAATTTTT/------------- TTGTTTGATT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 TCAGCTAATTTTT 1 0 365458 CASAVA_Build 8 109555078 1I ATTCCATATC -/A AACGGAATTA 3070 hom 135 het 49 0 45 4 A 2 3 365459 CASAVA_Build 8 109555960 4D GGATGAGAGT ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 82 het 37 0 27 10 AC 11 9 365460 CASAVA_Build 8 109556298 9D ATGAGTTAAT ACATGTAAC/--------- ACATTTAGAA 3070 het 3070 hom 48 21 24 6 ACATGTAAC 1 0 365461 CASAVA_Build 8 109564015 4D AGACAGAATC TGGT/---- TGGTTCTGTT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 TGGT 2 1 365462 CASAVA_Build 8 109566958 6D GTATATATAT ATACAC/------ ACACACACAC 3070 het 22 hom 8 1 7 0 ATACAC 1 0 365463 CASAVA_Build 8 109567612 2I TTTTTATTTC --/AT ATTATTTTGG 3070 hom 87 het 38 0 30 8 AT 1 2 365464 CASAVA_Build 8 109571336 3D TTAATTAAAT AAA/--- AAGGTAAATT 3070 het 2398 hom 21 5 13 6 A 5 2 365465 CASAVA_Build 8 109590494 4I ATGAAGAAAA ----/AGTC AGTGTAATTC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AGTC 0 1 365466 CASAVA_Build 8 109594171 1I ATTGAACTTT -/A AAAAAAAGTT 3070 hom 107 het 46 0 38 8 A 7 8 365467 CASAVA_Build 8 109594573 2I4M6D AAATTGACAC --ATCCCTTTGG/AAATAC------ ACATATATAG 3070 het 3070 hom 30 14 14 4 N/A 0 0 365468 CASAVA_Build 8 109597003 2D GGTATTAGTG TC/-- TCTCTCCAAT 3070 het 2737 hom 19 7 11 1 TC 4 3 365469 CASAVA_Build 8 109604342 1D AGAATTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 11 10 365470 CASAVA_Build 8 109605477 1I TAAAAGTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 10 11 365471 CASAVA_Build 8 109608000 1D TTTCATAGAT C/- CTGCAACAGC 3070 hom 101 het 35 0 33 2 C 2 1 365472 CASAVA_Build 8 109610108 1D ATTTTTATTT A/- TTTTTTTATT 2872 het 1296 hom 11 4 6 1 A 1 0 365473 CASAVA_Build 8 109612680 1I TTATAATTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 10 11 365474 CASAVA_Build 8 109614547 21I TTACCTTTGG ---------------------/CAGTGTTTTCCCAGCATCTCT CAAATCATAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CAGTGTTTTCCCAGCATCTCT 0 1 365475 CASAVA_Build 8 109629517 1D TGTGATGACC T/- GATGTTGAAG 3070 het 3070 ref 46 23 22 1 T 1 0 365476 CASAVA_Build 8 109630595 2I AGGCAAAGTG --/CT CTGAGCATCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 CT 1 2 365477 CASAVA_Build 8 109632138 3D AGATGAGATA CTT/--- CTTTGAATAT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 CTT 2 1 365478 CASAVA_Build 8 109636401 1I TCAGTAAGTT -/G GGGAAACACT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 3 4 365479 CASAVA_Build 8 109650080 1D TATATATTTA T/- GATCTTTTTC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 1 0 365480 CASAVA_Build 8 109652260 2D CAGCTTAAGA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 87 het 35 0 29 8 AG 6 5 365481 CASAVA_Build 8 109654698 2I TTTTTTTTGT --/TG TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 25 0 25 2 TG 0 1 365482 CASAVA_Build 8 109711726 1I GCACCCAGAT -/C TCATAAAACA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 C 0 1 365483 CASAVA_Build 8 109719720 1D AATTTCAAAG T/- TTTTAAGGTT 3070 het 3070 hom 39 12 20 8 T 5 4 365484 CASAVA_Build 8 109723509 2D ATTTAGGAAA AT/-- ATATGTGTTC 3070 het 3070 hom 32 13 13 8 AT 3 2 365485 CASAVA_Build 8 109745595 7D ATAGGAATAG CACTGAA/------- GCTGTACATT 3070 het 3070 ref 31 19 9 7 CACTGAA 1 0 365486 CASAVA_Build 8 109751059 3I ATATACTTGA ---/CTG CTATTTCCAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 CTG 0 1 365487 CASAVA_Build 8 109758952 1D TATTCTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 T 13 12 365488 CASAVA_Build 8 109766099 1I TTTCTAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 17 13 3 T 12 13 365489 CASAVA_Build 8 109768771 4I GACTGGGAGA ----/AACT ATTTGCGGCA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 AACT 0 1 365490 CASAVA_Build 8 109801593 1I CAAATTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 11 12 365491 CASAVA_Build 8 109804852 2D TTCGTGTGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 46 19 18 9 TG 7 6 365492 CASAVA_Build 8 109816826 1I GTATCTACAG -/A TTTCTCTATT 3070 hom 129 het 48 0 43 5 A 0 1 365493 CASAVA_Build 8 109824172 2D GCTCTCTGAG AA/-- AGCCTGGATT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 A 3 1 365494 CASAVA_Build 8 109825441 1D GTGGGCAATG T/- TTAGTGCACC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 3 2 365495 CASAVA_Build 8 109844713 4D AGGCAAAGAG ATGA/---- ATGAATTTTA 3070 het 3070 ref 37 16 16 6 ATGA 2 1 365496 CASAVA_Build 8 109847337 2D TGAAAAAAAA AG/-- TGTGTAAGAA 2663 het 2663 ref 24 13 6 5 AG 1 0 365497 CASAVA_Build 8 109848066 3D GAAAGGGAGT TTA/--- TTAAGGAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 TTA 2 1 365498 CASAVA_Build 8 109863868 2D TATGCCCATC CT/-- CTCTTTTTAC 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 CT 3 2 365499 CASAVA_Build 8 109873233 1I TGAGTCAGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 24 11 2 A 10 11 365500 CASAVA_Build 8 109885159 1I ATAAATAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 9 10 365501 CASAVA_Build 8 109897086 2D GGTTGGTGGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 T 11 9 365502 CASAVA_Build 8 109907264 2I ATCACCACTG --/GA AAAAAAAAAA 3070 het 2041 hom 31 10 15 6 GA 0 1 365503 CASAVA_Build 8 109921055 2I ACACACACAC --/GT GTGTGTGTGT 1055 het 1055 ref 34 16 9 9 GT 7 8 365504 CASAVA_Build 8 109938770 7I AGCAACAAGG -------/AAACAGA AAACAGAAGG 3070 hom 114 het 46 0 38 8 AAACAGA 1 2 365505 CASAVA_Build 8 109940040 34D ATATATATTT TTTATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------- TATATATATA 3070 hom 36 het 15 0 13 4 TTTATATATATATATATATATATATATATATATA 1 0 365506 CASAVA_Build 8 109946971 1D AATCAGCCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 436 hom 42 2 31 9 T 11 10 365507 CASAVA_Build 8 109976920 1I7M1I AAATGGGATA -TTTAACT-/TTTTAACTA AAAAAGTTTA 3070 het 3070 ref 28 17 11 2 N/A 0 0 365508 CASAVA_Build 8 109986823 1D ATACTCAAAC T/- TTTTTTATAT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 T 7 6 365509 CASAVA_Build 8 109990100 1I TATATTACTG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 7 8 365510 CASAVA_Build 8 109990782 2D AGTTATAGGA AT/-- ATATAAGACA 3070 het 3070 ref 52 28 21 3 AT 3 2 365511 CASAVA_Build 8 110003987 1I ACACTAGAGG -/A AGGTTTACAT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 1 2 365512 CASAVA_Build 8 110008507 1D AGCTTTGAAC A/- AAAGAGGTTT 3070 het 3070 hom 49 14 29 7 A 4 3 365513 CASAVA_Build 8 110024399 1D AAAGAACCTA C/- GTTGAAATAC 3070 het 3070 ref 35 19 12 5 C 1 0 365514 CASAVA_Build 8 110039157 1D TGAGAAAAGG A/- AACAACTACG 3070 het 3070 hom 50 20 24 7 A 3 2 365515 CASAVA_Build 8 110058580 1D CACCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1073 het 1073 ref 52 36 4 12 A 13 12 365516 CASAVA_Build 8 110061647 1D TGTGCAGATG A/- AAAAAAAATC 1331 het 1331 ref 31 24 3 4 A 9 8 365517 CASAVA_Build 8 110064328 4D CATTTATTGA TTTG/---- TTTATGTTGA 3070 hom 42 het 15 0 13 2 TTTG 1 0 365518 CASAVA_Build 8 110079605 1I GAATATTCTA -/T TTAAAATACC 3070 hom 39 het 20 0 14 6 T 2 3 365519 CASAVA_Build 8 110100560 1I TGTTTTCTGT -/G GGTTTGTTCA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 G 2 3 365520 CASAVA_Build 8 110109810 8I GAGAGAGCAG --------/AACAATAT AATATGATGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AACAATAT 0 1 365521 CASAVA_Build 8 110117955 1D GGAGGCCGAA G/- GGGGGGGCGG 2289 hom 23 het 11 0 7 4 G 8 7 365522 CASAVA_Build 8 110123004 4I TTTAAAAATA ----/TAAC TAACTGCAAT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TAAC 1 2 365523 CASAVA_Build 8 110141063 1D AATACATAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 12 11 365524 CASAVA_Build 8 110141904 6I GTCAGGAAAA ------/AAAGAT AAAGGTAAAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AAAGAT 0 1 365525 CASAVA_Build 8 110144694 2D TGGCACTCAC AT/-- GTGTGCTTGC 3070 hom 147 het 58 0 49 10 AT 1 0 365526 CASAVA_Build 8 110157092 1I AAACTAGCCT -/G GGCTATATAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 2 3 365527 CASAVA_Build 8 110158577 1I ACCCCACCCA -/C CTTCTCTGAG 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 C 1 2 365528 CASAVA_Build 8 110167165 1D TCTCAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1683 hom 24 6 13 5 A 13 12 365529 CASAVA_Build 8 110167974 4D TGTGAATGTA TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 42 12 20 12 TG 10 8 365530 CASAVA_Build 8 110169889 4D AGATCTAAAA ATAG/---- ATAGGGAAAA 3070 het 3070 hom 41 18 21 5 ATAG 2 1 365531 CASAVA_Build 8 110175642 1D TCATCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 2809 het 2809 ref 34 13 9 12 T 12 11 365532 CASAVA_Build 8 110226877 3I ATTATAGACA ---/ATT ATCTGCTTTT 3070 het 3070 ref 21 9 8 4 ATT 0 1 365533 CASAVA_Build 8 110232331 2D AACAGGGCGT AC/-- ACGCCTGGCG 3070 het 2548 hom 23 7 13 3 AC 2 1 365534 CASAVA_Build 8 110233897 1I CTTTAGATGA -/T TTTTTTTAAG 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 7 8 365535 CASAVA_Build 8 110235751 4I AGTGCCCCTG ----/CTTA CTTACATGGA 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 CTTA 1 2 365536 CASAVA_Build 8 110235795 1D CCCATACTCC T/- TTTTTTTTCT 2790 het 2790 ref 35 16 7 12 T 9 8 365537 CASAVA_Build 8 110236196 2D CCAAATTTTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 19 7 A 13 11 365538 CASAVA_Build 8 110239345 1D AGTACCAATC T/- TTTTGGCACC 3070 het 3070 ref 46 25 19 3 T 5 4 365539 CASAVA_Build 8 110242428 2D AGAAAATGAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 26 11 11 A 12 10 365540 CASAVA_Build 8 110242658 20I TGTTCAAACA --------------------/AGTCTAAAAAGCAACATGTC AGTTTCCATA 3070 het 3070 ref 42 26 16 3 AGTCTAAAAAGCAACATGTC 0 1 365541 CASAVA_Build 8 110244681 1D ATGCTTATTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 T 10 9 365542 CASAVA_Build 8 110248089 1D TTAAATTCTA T/- GTTCTGTGAG 3070 het 3070 ref 35 17 16 3 T 1 0 365543 CASAVA_Build 8 110248344 2D TACTTATAAC TT/-- CTCTATTAGT 3070 het 3070 ref 42 20 18 7 T 2 0 365544 CASAVA_Build 8 110248448 1D TCGCCAAGAA T/- TTTTTTCAGG 3070 het 3070 hom 45 16 23 7 T 7 6 365545 CASAVA_Build 8 110251983 3D TTTAATAATT ATC/--- ATATTATTTT 3070 het 3070 ref 38 23 14 3 ATC 1 0 365546 CASAVA_Build 8 110253550 1I GCTCGGCTAA -/T TTTTTTGTAC 977 het 977 ref 8 4 3 1 T 6 7 365547 CASAVA_Build 8 110254061 1I CCCCACACTT -/A ACAATATGCT 3070 het 3070 ref 51 25 21 5 A 1 2 365548 CASAVA_Build 8 110260667 2D CAGGTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 11 18 8 T 11 9 365549 CASAVA_Build 8 110260991 1I CCAGGTTTTT -/C CCCATCTTCA 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 C 3 4 365550 CASAVA_Build 8 110261338 3D GTTTTTATTA TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 TTG 4 3 365551 CASAVA_Build 8 110263378 3I AATAGAGAGG ---/AGA AGAACATGTA 3070 het 3070 ref 57 27 24 6 AGA 1 2 365552 CASAVA_Build 8 110267881 1D TCAGAGAGGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 50 24 18 9 A 10 9 365553 CASAVA_Build 8 110282842 4I ATACAAGTGA ----/TTAC TTAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 44 18 22 4 TTAC 0 1 365554 CASAVA_Build 8 110283322 4D TGAAATCTTG TTCT/---- TTGACACTCT 3070 het 3070 hom 41 17 18 8 TTCT 1 0 365555 CASAVA_Build 8 110285959 5I TTAATTGGTC -----/ATTTT ATTTTAATAC 2185 het 2185 ref 21 14 6 1 ATTTT 1 2 365556 CASAVA_Build 8 110286892 4I TGATCTATTT ----/TGTG TCCCTATAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 TG 0 2 365557 CASAVA_Build 8 110288378 4I TTTGAAGATC ----/TGTT TATTTCTCCA 3070 het 3070 hom 41 14 25 2 TGTT 0 1 365558 CASAVA_Build 8 110289048 3I GGTAGGAAAA ---/AAC AACAGGTGCT 3070 het 3070 ref 33 16 15 3 AAC 1 2 365559 CASAVA_Build 8 110292984 1D TTCTTTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 15 6 T 12 11 365560 CASAVA_Build 8 110293298 3I TATGATTTTC ---/TTA TTGTTTTCTT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 TTA 0 1 365561 CASAVA_Build 8 110293464 1D AACACCATAC T/- TTTTTTTATA 1476 het 1476 ref 26 15 5 6 T 8 7 365562 CASAVA_Build 8 110293501 2I TCTGGGACAC --/AT GTGCGGAACG 1216 het 1216 ref 19 10 4 6 AT 0 1 365563 CASAVA_Build 8 110296418 1I TTGAATACAC -/T TTTATTTCTT 3070 het 3070 hom 18 9 8 1 T 3 4 365564 CASAVA_Build 8 110301409 3D AATAAGTTAT AAG/--- AAGACATGGA 3070 het 3070 ref 33 19 11 4 AAG 2 1 365565 CASAVA_Build 8 110306716 22D ATCTGAGGGC TGTCACTGGGATTTTTCAGATT/---------------------- TAAGCAGATT 3070 het 3070 ref 45 24 25 2 TGTCACTGGGATTTTTCAGATT 1 0 365566 CASAVA_Build 8 110311749 2I AGCAGGTTTT --/AA AAGTGGCTGA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 2 4 365567 CASAVA_Build 8 110315931 4D TGCTAACAAT TCTC/---- TCTGCTAACA 3070 het 3070 hom 48 22 23 4 TC 3 1 365568 CASAVA_Build 8 110318416 1I ATGTTACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 T 10 11 365569 CASAVA_Build 8 110319352 1I GCAACACAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 10 11 365570 CASAVA_Build 8 110323107 4I TTTCCTCCTC ----/TCTG TCTGTCATTC 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 TCTG 1 2 365571 CASAVA_Build 8 110324192 1D ATCTTCACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 8 T 11 10 365572 CASAVA_Build 8 110329338 2D ACCTGTGAAT AA/-- GTTACCTTAT 3070 het 3070 ref 36 15 16 8 A 2 0 365573 CASAVA_Build 8 110332588 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1882 het 1882 ref 19 8 8 3 T 10 11 365574 CASAVA_Build 8 110337866 4I GTTGAGTCTC ----/AATT AAACACGTAT 3070 het 3070 hom 55 19 27 9 AATT 0 1 365575 CASAVA_Build 8 110347563 2I CTTTAATAAC --/AT ATTTTATTAA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 AT 1 2 365576 CASAVA_Build 8 110354614 2D GTGCTTGGGA GT/-- CAAAAATTAG 3070 het 3070 ref 50 23 23 7 GT 1 0 365577 CASAVA_Build 8 110360902 1D AAAGTCCTTT G/- GTTTAAGATG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 G 2 1 365578 CASAVA_Build 8 110362361 1D AAGTAAAATT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 9 8 365579 CASAVA_Build 8 110365081 2D CCCACTAAAC TA/-- TAAGCTTCAT 3070 het 3070 hom 39 14 20 6 TA 2 1 365580 CASAVA_Build 8 110366412 1D ACAGAAATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 10 9 A 10 9 365581 CASAVA_Build 8 110366688 3D AAAAAAATCG AGA/--- AGGAGGAACT 3070 het 3070 ref 46 26 15 5 AGA 1 0 365582 CASAVA_Build 8 110373840 4I TTAGATAGAC ----/AGAT AGATAGCTGT 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 AGAT 1 2 365583 CASAVA_Build 8 110375490 2D TTTCTTATAC CA/-- CAAACACAAG 3070 het 3070 hom 48 18 25 6 CA 2 1 365584 CASAVA_Build 8 110375607 1D TTGAGAAAAA G/- CCTAACTGAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 G 1 0 365585 CASAVA_Build 8 110378928 1I AGTTTGTCTC -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 T 5 6 365586 CASAVA_Build 8 110381749 1D GTAAGGAAAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 A 9 8 365587 CASAVA_Build 8 110382427 2D TGAAGGAAAG AC/-- ACAGTCTTCT 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 AC 2 1 365588 CASAVA_Build 8 110396591 1I CCACTCTTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 7 8 365589 CASAVA_Build 8 110400025 1I CAGATTGCAT -/C TCCTCTGATC 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 C 0 1 365590 CASAVA_Build 8 110418761 1D TTGTATGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 18 7 T 12 11 365591 CASAVA_Build 8 110423920 1D ATATATACCC T/- TTTTTTTTTT 1986 het 1382 hom 13 5 5 3 T 13 12 365592 CASAVA_Build 8 110424678 1D TAACTTTACC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 T 8 7 365593 CASAVA_Build 8 110432436 6I GTGCCAAGAC ------/CAATGT CAAGGAGCCT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 CAATGT 0 1 365594 CASAVA_Build 8 110440563 1I ATTATGGGGC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 1765 hom 26 5 13 8 T 9 10 365595 CASAVA_Build 8 110450622 1D TTCAGGTGAT A/- ACACCAGTCT 2665 het 2665 ref 21 9 7 6 A 2 1 365596 CASAVA_Build 8 110451030 2D TGATAGGAAA AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 hom 33 11 15 8 AT 9 8 365597 CASAVA_Build 8 110463608 3D GTTATTATAC TTG/--- TTGTCCTTTT 3070 het 3070 hom 52 20 24 10 TTG 2 1 365598 CASAVA_Build 8 110469875 1I CATAACTTGA -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 6 7 365599 CASAVA_Build 8 110482005 4D ATAAAATTCA TCTC/---- TCTATTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TC 3 1 365600 CASAVA_Build 8 110482370 1D GTTGTGTAAG T/- TTAAATTGCT 3070 het 3070 ref 47 23 20 6 T 3 2 365601 CASAVA_Build 8 110482726 1D TTGATAATTT A/- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 27 9 11 7 A 8 7 365602 CASAVA_Build 8 110488334 1D CTGCAGTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 10 19 13 A 10 9 365603 CASAVA_Build 8 110498927 4I AGTCAAGACA ----/AAAT AAATTTATCC 3070 het 3070 hom 39 16 20 3 AAAT 1 2 365604 CASAVA_Build 8 110501317 1I AGTTAACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 18 8 11 T 11 12 365605 CASAVA_Build 8 110503033 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 1325 het 384 hom 8 3 4 1 A 7 8 365606 CASAVA_Build 8 110507637 4D TACAAATTAA CATT/---- GTTATTAATT 3070 het 3070 hom 29 13 14 3 CATT 1 0 365607 CASAVA_Build 8 110525528 1I CCTCCCCCCC -/G CCAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 14 6 G 0 1 365608 CASAVA_Build 8 110525954 1D AATAAAAGAT A/- TTTATTTGCA 3070 het 3070 ref 45 26 18 1 A 1 0 365609 CASAVA_Build 8 110539826 1I AATCAAAACC -/T GTTATTGAGT 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 T 0 1 365610 CASAVA_Build 8 110540850 1D GAATAAAATA T/- TTTTTCTAAT 3070 het 3070 hom 25 11 13 2 T 6 5 365611 CASAVA_Build 8 110540973 1D TATTAATTTT A/- AAATTTTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 A 4 3 365612 CASAVA_Build 8 110543142 1I GATTCCGACA -/T ATTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 T 0 1 365613 CASAVA_Build 8 110544835 4I AAATATGGAC ----/TAAG TGAGATTGCT 3070 het 3070 ref 51 25 23 3 TAAG 0 1 365614 CASAVA_Build 8 110552049 2D ACTAGAATTG AA/-- AAGTTTGATA 3070 het 3070 ref 31 21 7 3 A 4 2 365615 CASAVA_Build 8 110553491 1I ATTGTGTTTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 6 7 365616 CASAVA_Build 8 110554121 1D TCTGTGTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 11 10 365617 CASAVA_Build 8 110557327 1I TCTAATTTAT -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 27 13 12 2 A 7 8 365618 CASAVA_Build 8 110560838 1I AAAGCGTGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 52 23 24 5 T 8 9 365619 CASAVA_Build 8 110563517 1D AAGCAAATGG C/- TTGAAAGAGT 3070 het 3070 hom 40 13 22 5 C 1 0 365620 CASAVA_Build 8 110564071 5I ACAGTATTAG -----/TATAT TAAACTTTAT 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 TATAT 0 1 365621 CASAVA_Build 8 110564939 4D TATTAATATA TATG/---- TAAGTCATAA 3070 het 3070 ref 18 10 8 4 TATG 1 0 365622 CASAVA_Build 8 110573265 3D TCTTTTTTTC TTT/--- TTTTAAACAG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 T 7 4 365623 CASAVA_Build 8 110573532 1I GGCCATTGAT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 A 0 1 365624 CASAVA_Build 8 110579200 4I AATCTTGAAA ----/TAGT TAGTTAAATT 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 TAGT 1 2 365625 CASAVA_Build 8 110584674 21I CACACCACTG ---------------------/GACTCCAGCCTGGGCTACAGA GACCCCATCT 3070 hom 20 het 11 0 8 3 GACTCCAGCCTGGGCTACAGA 0 1 365626 CASAVA_Build 8 110602185 2I ATGAGCAGAC --/AG AGTCCTACAG 3070 het 3070 hom 59 23 28 8 AG 1 2 365627 CASAVA_Build 8 110607260 1D AAAGTTATAT A/- ATGAATTGCA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 2 1 365628 CASAVA_Build 8 110611520 1I GAATAGGCTG -/A AAACAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 3 4 365629 CASAVA_Build 8 110611878 1D TAATACTTGA G/- GGGGGGGGTT 3050 het 3050 ref 27 13 7 7 G 9 8 365630 CASAVA_Build 8 110613644 2D GCTTCTTAGC CA/-- CACAGACTTT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 CA 3 2 365631 CASAVA_Build 8 110616314 1I TTATTAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 21 9 2 T 10 11 365632 CASAVA_Build 8 110617377 1I CTTTAAAACA -/T AAGGGAACAA 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 T 0 1 365633 CASAVA_Build 8 110626863 1D CCGCCTCCCA G/- GGTTCAAGTG 2524 hom 18 het 7 0 7 0 G 3 2 365634 CASAVA_Build 8 110640439 1D TTTACTTTTT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 A 8 7 365635 CASAVA_Build 8 110671816 1D TATACAGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1806 hom 21 5 11 5 T 11 10 365636 CASAVA_Build 8 110692855 1I AGATAAACAC -/G TAAGTCCACT 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 G 0 1 365637 CASAVA_Build 8 110693936 14D TTTTCCACTC TATGGAGACACTGT/-------------- TAAAATGCTT 3070 het 3070 ref 30 17 15 3 TATGGAGACACTGT 1 0 365638 CASAVA_Build 8 110694389 14D14M1I TGTTAAAAAA AAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAAAG-/--------------AAGAAGAAGAAAAGA AAAAAAAAAA 3070 het 1224 hom 11 4 12 2 N/A 0 0 365639 CASAVA_Build 8 110697470 4I AGGCTGGAGT ----/GCAG GCAGTGGCAT 1892 het 993 hom 6 2 4 4 GCAG 1 2 365640 CASAVA_Build 8 110698539 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1229 hom 32 3 20 10 A 11 10 365641 CASAVA_Build 8 110704437 6D TGCGCGCGCG CACACA/------ CACACACACA 3070 het 2469 hom 31 8 13 12 CA 9 6 365642 CASAVA_Build 8 110706217 4I ATTTGGTCCA ----/CTGC CTGTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 17 16 1 CTGC 0 1 365643 CASAVA_Build 8 110706535 1D GAAAATGTGC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 44 18 21 5 T 7 6 365644 CASAVA_Build 8 110708462 3I GACACTTAAA ---/AAC AACATTAATG 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AAC 1 2 365645 CASAVA_Build 8 110708558 1I TAATTTTTGT -/G GGGGGGGAAG 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 G 7 8 365646 CASAVA_Build 8 110714054 1D CTTCTTTTTT A/- AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 8 7 365647 CASAVA_Build 8 110727625 3I GAATATTCCA ---/AGC AGCAGTGCGA 3070 het 3070 ref 57 31 22 4 AGC 1 2 365648 CASAVA_Build 8 110733770 3I CCTCCTCCTC ---/CTT CTTCTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 11 14 13 CTT 2 3 365649 CASAVA_Build 8 110740082 1I ATTCATGGCC -/G GGCATGGTGG 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 G 2 3 365650 CASAVA_Build 8 110740360 1D GACTCTGCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 A 11 10 365651 CASAVA_Build 8 110748914 1I GTAGTGCCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 11 12 365652 CASAVA_Build 8 110752679 1D GTGTTTTCTT A/- AAAAGAGAGG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 5 4 365653 CASAVA_Build 8 110768123 1D ATTTTTAAGG T/- TTTTAAGTCA 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 T 5 4 365654 CASAVA_Build 8 110792216 1D TCCTGGATTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 10 9 365655 CASAVA_Build 8 110797213 1D GACTTCTTTT A/- AAAAAATATT 3070 het 3070 hom 40 16 18 8 A 7 6 365656 CASAVA_Build 8 110805192 1D GTCTTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3038 hom 31 10 14 8 A 13 12 365657 CASAVA_Build 8 110809605 40D TTGAGGGACT TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------------- TATATATATA 3070 hom 21 het 7 0 8 3 TA 28 8 365658 CASAVA_Build 8 110815794 1I AGCTGTATTT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 7 8 365659 CASAVA_Build 8 110826486 1D AGGATCTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 49 19 22 8 T 9 8 365660 CASAVA_Build 8 110833767 1I CATAATTTTT -/A AAAGTATTGC 3070 het 3070 hom 39 11 25 3 A 3 4 365661 CASAVA_Build 8 110835372 2D TTTCGATAGG AA/-- TACAGTTTAT 3070 het 3070 hom 47 21 22 5 A 2 0 365662 CASAVA_Build 8 110848582 21D3M11D TCACCATGGA CACTTAAGGGATGAGAATAGGTGATTTTCATTATG/---------------------TGA----------- GATTTTAATC 3070 het 3070 ref 46 39 14 8 N/A 0 0 365663 CASAVA_Build 8 110850980 1I GGGCTTAAAC -/T TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 7 8 365664 CASAVA_Build 8 110856166 1D CAACCCCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 71 hom 11 1 9 1 T 12 11 365665 CASAVA_Build 8 110868810 1I TGTGTAAATA -/T AAAAGTAAAG 3070 het 3070 hom 21 7 10 4 T 0 1 365666 CASAVA_Build 8 110869808 1D CATAATGACA T/- TTTCATCAAT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 T 4 3 365667 CASAVA_Build 8 110880415 2D ATGTTTACTC TG/-- TTTGCTGTGT 3070 het 3070 ref 49 25 16 8 TG 1 0 365668 CASAVA_Build 8 110887294 1I TTTCCTTTTC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 7 8 365669 CASAVA_Build 8 110901278 1D TTAAGTTTTA G/- GGTACATGTG 2272 het 2272 ref 16 9 6 1 G 3 2 365670 CASAVA_Build 8 110904543 1D TTTCTTTCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 10 9 365671 CASAVA_Build 8 110911366 1I CCCTGATGAT -/A CCAAAAATTA 3070 hom 18 het 9 0 7 2 A 0 1 365672 CASAVA_Build 8 110912220 1I ACAAAAATGG -/A AAAACAATGA 3070 het 3070 ref 27 15 10 2 A 4 5 365673 CASAVA_Build 8 110915096 1I AATAAAAGTT -/A TAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 0 1 365674 CASAVA_Build 8 110916592 1I TTCCTACTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 10 11 365675 CASAVA_Build 8 110922969 1I TTCTTTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 20 7 T 10 11 365676 CASAVA_Build 8 110923295 2I CCCAGTGGGA --/TT TTAAGTTCCA 3070 het 3070 hom 54 21 27 6 T 2 4 365677 CASAVA_Build 8 110923562 1D GTCAGTGGAC A/- TTTGTGTTGC 3070 het 3070 hom 53 21 28 4 A 1 0 365678 CASAVA_Build 8 110925441 1D TTTTCCCCCC T/- ATATAGATAT 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 T 1 0 365679 CASAVA_Build 8 110925878 1D GTCTCTTTAG T/- TTTTTTTCAG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 8 7 365680 CASAVA_Build 8 110929311 1D ATTCTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 14 13 365681 CASAVA_Build 8 110931726 1I TCTTTGTTCA -/T TTTCTATTTA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 3 4 365682 CASAVA_Build 8 110932105 1D AGATGTCCCA T/- TTTGTCTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 T 4 3 365683 CASAVA_Build 8 110938004 1I TGTAATCATG -/C CCTGGTATTT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 2 3 365684 CASAVA_Build 8 110952907 1I AAAATTTGTG -/T TTTGTATCTC 3070 hom 96 het 39 0 33 6 T 3 4 365685 CASAVA_Build 8 110953170 1D GTGAAAAAAA T/- TAAAAGGGAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 T 2 1 365686 CASAVA_Build 8 110953275 1I CCTCTAAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 10 20 9 T 9 10 365687 CASAVA_Build 8 110962088 2I TTTGGAAGAC --/AT GTGTATGGTT 3070 hom 123 het 49 0 42 7 AT 0 1 365688 CASAVA_Build 8 110987625 1D TGAGACTCCA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 24 hom 19 1 15 3 T 3 2 365689 CASAVA_Build 8 110989594 1D GGTCTGGCTG A/- AAAAAATGTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 7 6 365690 CASAVA_Build 8 111002181 1D ACTCCACCTC A/- AAAAAAAAAA 1510 het 847 hom 20 7 5 9 A 17 16 365691 CASAVA_Build 8 111054401 1D TTTTTTTTTT G/- AGACGGAGTC 3068 het 204 hom 22 3 11 8 G 1 0 365692 CASAVA_Build 8 111073563 1D CTCTTATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2404 hom 36 11 13 12 T 15 14 365693 CASAVA_Build 8 111100572 4I ACTTGGTCAT ----/TATA TATATATATA 1211 hom 18 het 10 0 7 3 TA 5 7 365694 CASAVA_Build 8 111118588 12I GTTTTGGTTG ------------/AAGTCTCTAAAT AAGATAATTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AAGTCTCTAAAT 0 1 365695 CASAVA_Build 8 111120766 4I CAAAAGAAAA ----/AAAT AAATAAGCAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 AAAT 1 2 365696 CASAVA_Build 8 111125050 1D TGCAGGTGCA C/- TGCCACTAAG 3070 het 3070 ref 41 26 10 5 C 1 0 365697 CASAVA_Build 8 111126967 1D TTGAAGCAGT A/- ATAATAGGAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 4 A 2 1 365698 CASAVA_Build 8 111127404 1D GAGGCAGACA G/- GGGATTCAGA 3070 het 3070 hom 42 16 23 4 G 4 3 365699 CASAVA_Build 8 111127630 1I AGTGAATGTG -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 49 23 17 9 T 8 9 365700 CASAVA_Build 8 111129310 1I AAATTTCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 13 9 T 12 13 365701 CASAVA_Build 8 111129917 1D CCGGCCCGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 28 0 17 11 T 11 10 365702 CASAVA_Build 8 111138333 1D TTATTTAAAC T/- TTGGTATACA 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 T 3 2 365703 CASAVA_Build 8 111146762 1D AAAAAGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 25 0 19 6 T 13 12 365704 CASAVA_Build 8 111147106 4I TGTGGAAAAC ----/ACTT ACATGTGCTG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 ACTT 0 1 365705 CASAVA_Build 8 111148068 1D TGATTTGCCC T/- TTTTTTTTTT 2000 het 2000 ref 49 37 5 7 T 11 10 365706 CASAVA_Build 8 111166749 1I GATTGGTACG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 150 hom 32 1 23 8 T 10 11 365707 CASAVA_Build 8 111208435 1D ATTATTTAAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 1672 hom 19 4 13 2 T 9 8 365708 CASAVA_Build 8 111213526 1I TTTGTCTAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 117 het 45 0 40 5 T 9 10 365709 CASAVA_Build 8 111215128 4D TTGGACCATC AGGA/---- AGTATATTTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 4 AGGA 1 0 365710 CASAVA_Build 8 111230157 2I GAAGTTTCTC --/TG TGGAGCAATG 3070 het 3070 ref 53 24 23 6 TG 1 2 365711 CASAVA_Build 8 111240752 1D AGCACTTTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 2309 hom 30 5 22 3 T 9 8 365712 CASAVA_Build 8 111279635 1D ACAAAAAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 25 0 23 3 A 10 9 365713 CASAVA_Build 8 111285964 4D ATATGGTAAC CAAA/---- CAAATTTTAA 3070 hom 132 het 50 0 45 9 CAAA 2 1 365714 CASAVA_Build 8 111307751 4D TGTTAACTAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 54 het 23 0 19 4 AAAT 4 3 365715 CASAVA_Build 8 111329162 4D CTGACAGTAT TAGA/---- TAGAACATTG 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 TAGA 2 1 365716 CASAVA_Build 8 111330900 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 851 hom 35 3 27 5 A 9 10 365717 CASAVA_Build 8 111334269 3I TTGATAGACA ---/TAT TAATAATTCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TAT 0 1 365718 CASAVA_Build 8 111344642 4I CCATCCATCT ----/TTCC TTCCTTCCTT 3070 hom 85 het 36 0 25 11 TTCC 3 4 365719 CASAVA_Build 8 111345639 6D GTCAATAGAT TATATC/------ TAGGCTTTTC 3070 hom 115 het 41 0 36 9 TATATC 1 0 365720 CASAVA_Build 8 111348242 4I ATTTAAAGGG ----/ACCA ACCATGGGGT 3070 het 3070 ref 54 28 21 5 ACCA 1 2 365721 CASAVA_Build 8 111358452 1D TAACATTGCT A/- AAAAAAAAAA 950 het 950 ref 37 23 5 9 A 15 14 365722 CASAVA_Build 8 111366430 1D TCATTGAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 33 0 26 8 A 10 9 365723 CASAVA_Build 8 111376878 1I TTAAAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 1904 het 1904 ref 22 13 5 4 A 14 15 365724 CASAVA_Build 8 111533547 1I CCTTGTGACT -/A AGACCACCTT 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 1 2 365725 CASAVA_Build 8 111553102 1D AGAATCGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 16 9 A 13 12 365726 CASAVA_Build 8 111562212 1I TTATAATATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 A 9 10 365727 CASAVA_Build 8 111578028 3D TTGTATAAAT AAC/--- AATATCATTT 3070 het 3070 ref 42 24 14 5 AAC 1 0 365728 CASAVA_Build 8 111604124 1I ACTATATTTC -/T TTTTTTTTTT 1737 het 1737 ref 18 6 5 7 T 14 15 365729 CASAVA_Build 8 111644375 1D GTATTGTATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 20 16 2 A 10 9 365730 CASAVA_Build 8 111667371 4D ATATTTCGTT AGTC/---- AGTTGTCAAC 3070 het 3070 hom 34 15 19 1 AGTC 1 0 365731 CASAVA_Build 8 111699339 1D CTTTTCTGAT C/- CTCACAGAGA 3070 het 3070 ref 43 22 17 4 C 2 1 365732 CASAVA_Build 8 111745764 1D TACATACCAG T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 32 13 11 11 T 8 7 365733 CASAVA_Build 8 111763073 5D AAATACTGAG TTAAA/----- TTAAATTAAT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TTAAA 2 1 365734 CASAVA_Build 8 111775506 1D AATGAATTCA G/- GGCGAGCCCA 3070 hom 81 het 32 0 29 5 G 3 2 365735 CASAVA_Build 8 111779097 1I TGCCCATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1450 hom 38 7 19 12 T 16 17 365736 CASAVA_Build 8 111780562 10D CAGAAGATAT ATGCTACATA/---------- ATGCTACATA 3070 hom 75 het 31 0 26 6 ATGCTACATA 2 1 365737 CASAVA_Build 8 111786658 1I CTGAGCATCT -/A AAAAAATTTT 3070 hom 75 het 38 0 26 12 A 6 7 365738 CASAVA_Build 8 111800738 1D TTATTCACAA C/- CTTTAAAGCT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 C 2 1 365739 CASAVA_Build 8 111807411 3D AAGAATAAAA AAT/--- AATAACTATT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAT 2 1 365740 CASAVA_Build 8 111822067 1D ATCACATTAC A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 57 20 30 7 A 8 7 365741 CASAVA_Build 8 111822384 1I TTTCCATCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 942 hom 25 2 21 2 T 10 11 365742 CASAVA_Build 8 111829118 1I TTTTCTATAC -/T TTAGGTGAGG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 T 2 3 365743 CASAVA_Build 8 111830320 1D AATAAAAAAA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 8 7 365744 CASAVA_Build 8 111850593 14D CACAAAGAAT CCATGATCAAACTG/-------------- CCAACCACCA 3070 hom 33 het 15 0 12 5 CCATGATCAAACTG 1 0 365745 CASAVA_Build 8 111851009 4I CAATTGAAGA ----/CACT CACGTTTCTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 CACT 0 1 365746 CASAVA_Build 8 111868241 1I TACATGTGAG -/T TTTTTTTTTT 1209 het 1209 ref 41 18 8 15 T 17 18 365747 CASAVA_Build 8 111876512 2I TTTAAAGTAC --/AA GATATATACT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 A 0 2 365748 CASAVA_Build 8 111877279 1I AACTTATCTA -/T TTTTTTGTTA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 6 7 365749 CASAVA_Build 8 111898977 3D TGTAATCATG CAC/--- CACATCAGTA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 CAC 2 1 365750 CASAVA_Build 8 111909757 2I GATGTTCAAA --/AT TATAAGACTG 3070 hom 132 het 46 0 44 2 AT 0 1 365751 CASAVA_Build 8 111920645 1I CTGTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 244 hom 35 2 26 7 T 12 13 365752 CASAVA_Build 8 111921472 2D GTAGCAGCCT AA/-- ATCCTCATAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 3 1 365753 CASAVA_Build 8 111925638 15I ACCACAGAAC ---------------/TGGTAAAAATATGTG AAGAGTTGAA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 TGGTAAAAATATGTG 0 1 365754 CASAVA_Build 8 111930318 1I AGGTTTTATG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 A 9 10 365755 CASAVA_Build 8 111969446 1I ATATATATAT -/A CACACACATA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 0 1 365756 CASAVA_Build 8 112017790 2I AACAAATAAC --/TT TAAGCTGAGT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 1 3 365757 CASAVA_Build 8 112020189 3D TGAGGATGCA GAG/--- GAGTAGCAGA 3070 hom 129 het 47 0 41 6 GAG 2 1 365758 CASAVA_Build 8 112020793 1D AACTGAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 10 9 365759 CASAVA_Build 8 112042272 1I TTTCTTTTGA -/T TTTTTTTCTC 3070 hom 60 het 27 0 20 7 T 7 8 365760 CASAVA_Build 8 112042679 2D CACATGCATT TG/-- TGTGTGTTTG 3070 hom 102 het 37 0 34 5 TG 4 3 365761 CASAVA_Build 8 112055904 1I AAGATAAAAT -/A AAACTGATCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 3 4 365762 CASAVA_Build 8 112060179 1D AACAAACCAT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 9 8 365763 CASAVA_Build 8 112064388 1I AGAAAATAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 37 0 30 7 T 12 13 365764 CASAVA_Build 8 112065240 1D AAATTACAAT A/- AAAAAAATTA 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 8 7 365765 CASAVA_Build 8 112067703 8D AGGTCCTTCA TGTCCCTT/-------- TGTCCCTTGT 1386 hom 7 het 3 0 3 0 TGTCCCTT 2 1 365766 CASAVA_Build 8 112074791 1D GTGAACAATT A/- AAAAAAATCT 3070 hom 86 het 45 1 43 1 A 8 7 365767 CASAVA_Build 8 112076907 2D TGTATAAAAA AT/-- ATGATTGTTT 3070 hom 114 het 45 0 39 6 AT 2 1 365768 CASAVA_Build 8 112080459 1I TTCCTGTAGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 233 hom 15 1 13 1 T 9 10 365769 CASAVA_Build 8 112098114 4D GGCTGATACT ATAA/---- ATATTTCTAA 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 ATAA 1 0 365770 CASAVA_Build 8 112098252 3I AAAATTTATT ---/TTC TTTTTTGGAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 TTC 0 1 365771 CASAVA_Build 8 112107152 1D AAACTAAATA T/- TTAAAAATTA 3070 hom 123 het 44 0 42 2 T 3 2 365772 CASAVA_Build 8 112108693 1I ATACTTAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 282 hom 35 1 28 6 A 12 13 365773 CASAVA_Build 8 112110251 1I TTTATTTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 28 1 22 5 T 13 14 365774 CASAVA_Build 8 112113476 3D AGAAGAGGGA GTC/--- TGAATAAATA 3070 hom 144 het 51 0 49 2 GTC 1 0 365775 CASAVA_Build 8 112118968 1D TACTTATACT A/- AGTACATACA 3070 hom 27 het 10 0 10 1 A 2 1 365776 CASAVA_Build 8 112127383 1I AAGTTGCTCT -/A ATCTATGCCT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 A 1 2 365777 CASAVA_Build 8 112132944 2I TATCTGGAAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 21 1 17 3 T 12 14 365778 CASAVA_Build 8 112133104 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 436 hom 26 1 23 2 A 10 11 365779 CASAVA_Build 8 112144135 1I GCTAATTTTT -/A TTTTTTTTTT 1064 hom 12 het 5 0 4 1 A 0 1 365780 CASAVA_Build 8 112146029 1I TTTGACTGGC -/A AAAAAAAAAA 2199 het 30 hom 33 2 11 20 A 13 14 365781 CASAVA_Build 8 112148465 1I CTATTAGTAC -/G GGGATACTTA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 3 4 365782 CASAVA_Build 8 112155431 1D TATAAATTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 35 1 22 12 A 17 16 365783 CASAVA_Build 8 112163278 4D CAAAGGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 150 het 65 0 49 21 TG 10 8 365784 CASAVA_Build 8 112165029 1D AATGAAATAC T/- TTTAATATAG 3070 hom 90 het 36 0 30 7 T 4 3 365785 CASAVA_Build 8 112169272 1I ATGTTGTTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 367 hom 37 1 32 4 A 10 11 365786 CASAVA_Build 8 112170253 1D GTTTGTTTAA T/- TCATTAATAC 3070 hom 154 het 57 0 52 5 T 2 1 365787 CASAVA_Build 8 112173642 2D TGCATGTCTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TG 8 7 365788 CASAVA_Build 8 112179036 1I CTTTATTTTC -/A AAAACTTCTA 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 4 5 365789 CASAVA_Build 8 112189480 4I CTGCAATTAA ----/CATG TAAGTGCAGG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 CATG 0 1 365790 CASAVA_Build 8 112190992 1I TTGAATTCGC -/A AAAAAATTGT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 6 7 365791 CASAVA_Build 8 112194371 9I AGCTGATTGC ---------/TTGATGTCT TTGATGTCTT 3070 hom 87 het 38 0 29 10 TTGATGTCT 1 2 365792 CASAVA_Build 8 112197604 1I ATATATATAT -/A TTTTTAAATT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 0 1 365793 CASAVA_Build 8 112199930 4D AAATTATAAC AAAT/---- AATTAAAAAT 3070 hom 120 het 42 0 41 3 AAAT 1 0 365794 CASAVA_Build 8 112200731 3D ATCAAAAAAA CAT/--- ATATAAGTCT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 CAT 1 0 365795 CASAVA_Build 8 112202321 5I TCAGCTCCTT -----/TTTCA TTTGATTACC 3070 hom 75 het 32 0 26 6 TTTCA 0 1 365796 CASAVA_Build 8 112202848 4D TCAAAGCTTA TTTG/---- TTTAATTTTC 3070 hom 60 het 21 0 21 0 TTTG 1 0 365797 CASAVA_Build 8 112203026 1D TTATAATCAG T/- TTTTTTGTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 2 T 7 6 365798 CASAVA_Build 8 112203154 2D GCTAATAGTA AT/-- AAATTTTATA 3070 hom 72 het 26 0 25 4 AT 1 0 365799 CASAVA_Build 8 112203964 2I21M2I TTAGGAAAAC --ATCATCAACAACAACAAAAAA--/TTATCATCAACAACAACAAAAAAAC AATGAAACAA 3070 hom 62 het 21 0 21 4 N/A 0 0 365800 CASAVA_Build 8 112205706 1D TTTTCCTTCT G/- CCAGGCTTCT 3070 hom 117 het 41 0 39 2 G 1 0 365801 CASAVA_Build 8 112206848 1D TACTAAAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 39 0 37 3 A 10 9 365802 CASAVA_Build 8 112207501 14D CTTTTCTTTC TTTCTTTCTTTCTT/-------------- TTTTTTTTTT 2873 hom 39 het 19 0 13 9 TTTCTTTCTTTCTT 1 0 365803 CASAVA_Build 8 112210028 1D ATATAGTTTA T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 135 het 51 0 46 6 T 8 7 365804 CASAVA_Build 8 112213271 1I CGGAAAAATG -/T TTTTTTTAAT 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 7 8 365805 CASAVA_Build 8 112214556 1D ATCCAGCAAG C/- CTGCTTCTGG 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 2 1 365806 CASAVA_Build 8 112219587 1I GCATGTAATT -/G ACTCATAGTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 365807 CASAVA_Build 8 112219680 2D TAAATATTTG CT/-- CTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 35 20 14 1 CT 2 1 365808 CASAVA_Build 8 112239743 19I TTCTGGGGAC -------------------/TTTCACAGAAAATGTGAAT TTTCACAGAA 3070 hom 66 het 29 0 23 8 TTTCACAGAAAATGTGAAT 0 1 365809 CASAVA_Build 8 112251219 2D ATACACACAA AC/-- ACACACACAC 1259 het 1259 ref 63 50 3 12 AC 8 7 365810 CASAVA_Build 8 112259105 1D AAAGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 273 hom 30 1 22 8 A 14 13 365811 CASAVA_Build 8 112259820 1I TTTTATTCAC -/T ATCATAATTA 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 0 1 365812 CASAVA_Build 8 112260774 3I CTGGAATTCA ---/AGG AGAAGGGAAG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AGG 0 1 365813 CASAVA_Build 8 112265162 4I AAAACAAACG ----/AACA AACAAACACA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AACA 2 3 365814 CASAVA_Build 8 112318038 5D TTTCCCCCCG AAACA/----- AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 46 21 14 12 AAACA 3 2 365815 CASAVA_Build 8 112338012 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 441 hom 27 1 20 6 T 10 11 365816 CASAVA_Build 8 112343882 1D TCACCAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 38 1 25 12 T 13 12 365817 CASAVA_Build 8 112347156 1I ATCATGGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 48 2 34 12 T 12 13 365818 CASAVA_Build 8 112347490 1I TGTTATAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 745 hom 31 2 24 5 T 10 11 365819 CASAVA_Build 8 112354928 1D GGATTGATTG T/- TTTTTTCTTA 3070 het 13 hom 43 1 36 7 T 7 6 365820 CASAVA_Build 8 112378255 1D ATTACCTGGC T/- TTTTTTCTGC 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 7 6 365821 CASAVA_Build 8 112399994 1D TTGGTATTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 T 10 9 365822 CASAVA_Build 8 112407631 1I ATTGCACACA -/T TTTTTTCCTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 6 7 365823 CASAVA_Build 8 112409326 2D GCTAAGGAAG AC/-- AGGGCAGGGA 3070 hom 105 het 42 0 36 6 AC 1 0 365824 CASAVA_Build 8 112410275 5I TGAAAATATA -----/CTTAT CTTGTTTCAA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 CTTAT 0 1 365825 CASAVA_Build 8 112411295 4D TTATTTGATA TTTC/---- TTAATCTTAG 3070 hom 102 het 36 0 35 5 TTTC 1 0 365826 CASAVA_Build 8 112413279 1I GAGCAAAGCC -/A ATTCATTTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 1 2 365827 CASAVA_Build 8 112423778 1D CCCCTTCATA G/- AGTAAGCCTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 1 0 365828 CASAVA_Build 8 112426980 1D AGTCTTGCTC T/- GTCACCCAGG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 1 0 365829 CASAVA_Build 8 112431317 5I CACATATAAA -----/TAAAT TAAACTGTGG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 TAAAT 0 1 365830 CASAVA_Build 8 112440599 1D AAAAATTTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 11 10 365831 CASAVA_Build 8 112442509 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 279 hom 26 1 18 7 A 13 14 365832 CASAVA_Build 8 112456370 1I TGATGCCTCT -/C CCTCAGCTCA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 C 2 3 365833 CASAVA_Build 8 112465496 1I TGTTCCTGGG -/C ATTTTTGGTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 0 1 365834 CASAVA_Build 8 112467999 1D TAGTCCATTG T/- TTGAACTTTC 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 T 3 2 365835 CASAVA_Build 8 112474899 1D ACACAATATC T/- TAAGTGTTTA 3070 het 3070 ref 31 13 13 5 T 2 1 365836 CASAVA_Build 8 112477636 4D GGCAGATGTT TGTC/---- TGTCAAGCTT 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 TGTC 2 1 365837 CASAVA_Build 8 112480638 1I GCCAGGAGAC -/T TTTTTTTTTT 2484 het 2239 hom 19 6 6 7 T 11 12 365838 CASAVA_Build 8 112489947 1D AGTGATAACA T/- TTTTTTTTAA 2588 het 2588 ref 22 11 7 4 T 9 8 365839 CASAVA_Build 8 112491106 4D AAAAGAAAAC TCTT/---- TCCAACAAGT 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 TCTT 1 0 365840 CASAVA_Build 8 112495053 1I CTCTTCAGGG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 35 23 9 3 T 8 9 365841 CASAVA_Build 8 112497491 1D TTCATGTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 39 19 13 8 T 10 9 365842 CASAVA_Build 8 112497657 4I TGTGCTAATT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 102 het 41 0 33 8 TTTG 3 4 365843 CASAVA_Build 8 112499024 1D ATAGACAGAT G/- TTTGTCAATT 3070 het 3070 hom 43 18 20 6 G 1 0 365844 CASAVA_Build 8 112501931 1D CGTGGTACTG T/- TAAGTCCAAT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 2 1 365845 CASAVA_Build 8 112513698 4I AGAGAGAGAA ----/AGAG AGAGAGATTG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 AG 3 5 365846 CASAVA_Build 8 112518547 1I AATAAAAGTG -/T TTTTTCTACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 T 5 6 365847 CASAVA_Build 8 112528179 2D TATTTTCACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 113 het 50 0 38 13 T 12 10 365848 CASAVA_Build 8 112537027 1I TTTTTTTCTG -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 8 9 365849 CASAVA_Build 8 112549626 1I TTATAGCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 A 10 11 365850 CASAVA_Build 8 112565466 4D GTCAGTATTG CTAT/---- CTATCTACAT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 CTAT 2 1 365851 CASAVA_Build 8 112566957 1D AGAAAGAAAG A/- AGAAAGAAAG 706 het 706 ref 24 8 5 11 A 2 1 365852 CASAVA_Build 8 112581589 1D ATTTATATAA T/- TTTTTTAGGT 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 7 6 365853 CASAVA_Build 8 112584488 2D CTATCAAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 71 het 36 0 23 13 A 16 14 365854 CASAVA_Build 8 112585223 1D TATTTTTGCA T/- TTTTTCTAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 6 5 365855 CASAVA_Build 8 112585924 1D GAACTTTTAG C/- CTATACTATC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 C 2 1 365856 CASAVA_Build 8 112619276 1D GAATTACGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 23 1 16 7 A 15 14 365857 CASAVA_Build 8 112622886 1D GATTGTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 T 13 12 365858 CASAVA_Build 8 112638264 1D GCTTCTTTTT G/- TCAGGTTTGT 3070 het 3070 hom 20 8 9 4 G 1 0 365859 CASAVA_Build 8 112661265 1I TTATCAAAGC -/T TATTGTTCTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 1 2 365860 CASAVA_Build 8 112664879 1D TTGTTCTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 13 12 365861 CASAVA_Build 8 112679933 4I TATCTAAAAT ----/TAAC TAATATTTTA 3070 hom 117 het 49 0 40 9 TAAC 0 1 365862 CASAVA_Build 8 112688757 3I ATATAGTAGG ---/AGA AGAAGAAGAA 2682 het 2682 ref 22 9 7 6 AGA 5 6 365863 CASAVA_Build 8 112721177 1I TCTGCTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 10 12 9 T 13 14 365864 CASAVA_Build 8 112736553 2D25M1D AGGGGAACAT CACACACACCGGGGCCTGTCACGGGGTG/--CACACACCGGGGCCTGTCACGGGGT- GGGGGAGGGG 1404 het 495 hom 3 2 3 0 N/A 0 0 365865 CASAVA_Build 8 112742092 2I TAATTTTCAC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 A 10 12 365866 CASAVA_Build 8 112745530 1D TTATCAGAAA T/- TTTTTTTGGA 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 T 8 7 365867 CASAVA_Build 8 112750368 2I ATAGCATCCA --/AC AAGATGGCAG 2349 het 2349 ref 26 12 6 8 AC 0 1 365868 CASAVA_Build 8 112758622 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTCCAGA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 6 5 365869 CASAVA_Build 8 112768973 3I ATTATTTGTT ---/ATA ATATTATTAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 ATA 1 2 365870 CASAVA_Build 8 112772622 2D31M4D TTTCTTTCTC TTTTTCTTTCTTTCTCTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTG/--TTTCTTTCTTTCTCTTCTTTCTTTCTCTTTC---- TTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 31 19 11 10 N/A 0 0 365871 CASAVA_Build 8 112775204 1D GTTGTGGTAG A/- GGGTCTTTCA 3070 het 3070 ref 44 21 15 9 A 1 0 365872 CASAVA_Build 8 112779756 1D TGTCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1276 het 1276 ref 39 26 3 10 T 11 10 365873 CASAVA_Build 8 112781824 1D GCATTTCATT G/- GGGGGTAACT 3070 het 3070 ref 32 12 14 7 G 6 5 365874 CASAVA_Build 8 112784022 1D GATAAAAATG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 49 22 24 3 A 9 8 365875 CASAVA_Build 8 112787067 2I ACAGAAAAAC --/AG AGAGTTAGGG 3070 het 3070 hom 37 19 17 1 AG 2 3 365876 CASAVA_Build 8 112807270 1I TGGGGAGAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 43 18 19 6 A 9 10 365877 CASAVA_Build 8 112812461 1I TTTCACTGGG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 7 8 365878 CASAVA_Build 8 112814544 1I AAAGAGTAAG -/A TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 A 0 1 365879 CASAVA_Build 8 112818524 1D AGTTTTTTTT G/- TTTGTTTGTT 2570 het 2570 ref 25 11 7 7 G 1 0 365880 CASAVA_Build 8 112819866 1I AAGGAGAACT -/A AAAAAATTTG 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 6 7 365881 CASAVA_Build 8 112823748 1D CTGTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 11 7 T 12 11 365882 CASAVA_Build 8 112824747 3I TCAGGAAAGA ---/TCT TCTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 TCT 1 2 365883 CASAVA_Build 8 112825608 3D GTTATCTGAG TAT/--- CAGTGCAAAA 2160 het 2160 ref 14 8 5 4 TAT 1 0 365884 CASAVA_Build 8 112829468 1I CAACAGAATC -/T GAGACTCATG 3070 het 3070 ref 38 16 17 5 T 0 1 365885 CASAVA_Build 8 112829579 2I GGAAACAAAA --/AG AAATGACAGA 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 AG 0 1 365886 CASAVA_Build 8 112832323 1D AACCCCTGGA C/- CCAAGGACTG 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 C 3 2 365887 CASAVA_Build 8 112842448 1I AGAGAGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 A 10 11 365888 CASAVA_Build 8 112843268 7D AAATATAACA TTAAAAT/------- TTAAAATTTC 3070 het 3070 ref 36 22 14 4 TTAAAAT 2 1 365889 CASAVA_Build 8 112854927 7D TTCTGCTAGA TTTTCTT/------- TTTTCCCTGA 3070 het 3070 ref 22 11 10 1 TTTTCTT 1 0 365890 CASAVA_Build 8 112855038 2D AGTTTTGCTC TT/-- GTCACCCAGG 2809 het 2496 hom 19 8 8 3 T 2 0 365891 CASAVA_Build 8 112855811 1I AAAGGTATGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 19 14 6 T 9 10 365892 CASAVA_Build 8 112859507 5D TTCACTCTAC TAATA/----- TGAGTATTAG 1062 het 1062 ref 25 18 3 5 TAATA 1 0 365893 CASAVA_Build 8 112860934 1I CAAAGCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2292 hom 25 7 13 5 T 10 11 365894 CASAVA_Build 8 112866722 2D TTCATAAAAC AT/-- ATCAATTTTC 3070 het 3070 ref 24 11 12 1 AT 2 1 365895 CASAVA_Build 8 112870641 2D TTATTTTAAA GC/-- TCTTCTTGAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 GC 1 0 365896 CASAVA_Build 8 112873251 1D GAAAAAGAAG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 A 8 7 365897 CASAVA_Build 8 112883779 1D CTGTACAATG T/- TTGAATTACT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 3 2 365898 CASAVA_Build 8 112886145 4D TATATAAAAA TGTT/---- TATTTATCAA 3070 het 3070 ref 28 16 9 4 TGTT 1 0 365899 CASAVA_Build 8 112888666 1D CTCAAGGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 11 6 A 10 9 365900 CASAVA_Build 8 112889082 1D TGTGGCTTAT A/- AAAAAACAGA 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 A 7 6 365901 CASAVA_Build 8 112891014 1I GTTTATTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 51 20 22 9 T 9 10 365902 CASAVA_Build 8 112898601 1D GTAATACTGA T/- TTTTGGACTT 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 T 5 4 365903 CASAVA_Build 8 112901325 1D TGTATAACCA C/- CCACATATTC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 C 3 2 365904 CASAVA_Build 8 112916053 1D GTTTTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 7 8 T 12 11 365905 CASAVA_Build 8 112918402 1I CCAGTGACCC -/G GGGCTTCAGA 3070 het 2377 hom 24 7 13 4 G 3 4 365906 CASAVA_Build 8 112922316 6D ATGAATGATA ATAAGT/------ ATGAGTGACA 3070 het 3070 ref 37 18 15 8 ATAAGT 1 0 365907 CASAVA_Build 8 112922998 2I AATGTAATAC --/AT ATGTTAATTA 3070 het 3070 ref 44 22 18 4 AT 1 2 365908 CASAVA_Build 8 112929944 1I GAAACTGTCC -/T TTTTTTTTTT 1196 het 1196 ref 24 9 4 11 T 15 16 365909 CASAVA_Build 8 112938088 1I GATAACTAAG -/A AAAAAAAAAA 2542 het 2542 ref 30 20 7 3 A 11 12 365910 CASAVA_Build 8 112948981 1D ATCAGCAAAC T/- TTTTTTTTTT 2447 het 2447 ref 49 36 6 8 T 13 12 365911 CASAVA_Build 8 112961000 1D TATATATTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1975 hom 29 7 14 9 T 13 12 365912 CASAVA_Build 8 112967037 1I AGCAGATCCA -/G GTTCAGATAC 3070 het 3070 ref 48 27 19 2 G 1 2 365913 CASAVA_Build 8 112967720 3D AAGGAGAGGA AAG/--- AAGAAGAAGA 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 AAG 4 3 365914 CASAVA_Build 8 112973102 2I CATGACACAC --/TT AATTGAAAAA 3070 het 3070 ref 24 14 8 2 T 0 2 365915 CASAVA_Build 8 112974345 1D AGTGCCAGGC A/- AAAAAAAAAA 845 het 845 ref 30 24 3 4 A 11 10 365916 CASAVA_Build 8 112976741 1D TTGTGGAATG A/- AAAAAAAAAA 1601 het 1601 ref 46 34 4 8 A 12 11 365917 CASAVA_Build 8 112978663 2D ATATGTAAAC TT/-- GACTATTTTG 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 2 0 365918 CASAVA_Build 8 113000168 1D GTGCGTGTGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 A 10 9 365919 CASAVA_Build 8 113011180 1D CTATGTGATA C/- TAAAATGTAC 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 C 1 0 365920 CASAVA_Build 8 113024666 1I CTTGGAGAAC -/A ATTATGTTAA 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 1 2 365921 CASAVA_Build 8 113028949 1D TATTGATTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 40 18 15 7 T 10 9 365922 CASAVA_Build 8 113034821 1D CAGTATTTGG A/- TGTTATAAAT 3070 het 3070 ref 55 32 19 4 A 1 0 365923 CASAVA_Build 8 113043598 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 23 11 12 0 A 10 9 365924 CASAVA_Build 8 113052550 9D GCATGACTGG GAGGCCTCA/--------- GAGGCCTCAG 3070 hom 71 het 27 0 21 8 GAGGCCTCA 2 1 365925 CASAVA_Build 8 113058144 1I GCTACATTTG -/T TTTTTTGAAC 3070 het 3070 ref 33 16 11 6 T 6 7 365926 CASAVA_Build 8 113066269 2I CATCCTATTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 T 11 13 365927 CASAVA_Build 8 113069349 1D ATAATACAGA C/- TTTAAACCAA 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 C 1 0 365928 CASAVA_Build 8 113070285 1I TCACCACTGA -/T CCCACAGAAA 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 0 1 365929 CASAVA_Build 8 113076496 11I AACAAGAGAG -----------/ATATTAAGACT GTATGAATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 5 ATATTAAGACT 0 1 365930 CASAVA_Build 8 113077308 1I TAAGATGGTT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 50 20 22 8 A 8 9 365931 CASAVA_Build 8 113082476 4D TGCCCTATGA TTGT/---- TTTTTAATTT 3070 het 3070 ref 27 16 9 3 TTGT 1 0 365932 CASAVA_Build 8 113082749 1D CAGTCATTCT A/- ATTTTTACGC 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 A 2 1 365933 CASAVA_Build 8 113089586 4I ATTCCTTCTG ----/TTAT TTATTTATTT 3070 hom 105 het 44 0 36 8 TTAT 4 5 365934 CASAVA_Build 8 113090292 1D TTTAGAAACA T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 90 het 39 0 31 8 T 8 7 365935 CASAVA_Build 8 113094636 1I GTCTCATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 24 1 16 7 A 13 14 365936 CASAVA_Build 8 113096634 6I CAGACATAAC ------/AAGAAA AAGAACTAAA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 AAGAAA 0 1 365937 CASAVA_Build 8 113102642 1D TTCTAAAATC A/- AAAAAAAATC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 9 8 365938 CASAVA_Build 8 113109580 4D TTGCTTTTTT GTAA/---- GTGAGCTTAT 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 GTAA 1 0 365939 CASAVA_Build 8 113110186 1I ATGTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 T 11 12 365940 CASAVA_Build 8 113111921 4D ATTTTTTCAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 41 19 18 5 AC 9 7 365941 CASAVA_Build 8 113117069 1D CAATTAGCTT G/- GTTTTTTTTT 3070 het 1774 hom 36 9 15 13 G 2 1 365942 CASAVA_Build 8 113126596 2D TATCCTAAGA CT/-- CTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 40 21 18 2 CT 2 1 365943 CASAVA_Build 8 113140259 1I TTTGGATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 T 10 11 365944 CASAVA_Build 8 113149743 1D TCAATTGGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 17 21 4 A 10 9 365945 CASAVA_Build 8 113150925 2I CAAATTTATT --/AA GATATGATGC 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 A 0 2 365946 CASAVA_Build 8 113164845 3I AGCCCAGGCA ---/GAG GAGGAGCCGA 1940 het 1698 hom 12 5 5 2 GAG 2 3 365947 CASAVA_Build 8 113170858 1D TTCCTTTACC T/- TTTTTTTTTT 2622 het 2622 ref 26 14 7 5 T 12 11 365948 CASAVA_Build 8 113242298 1D GAAATTTTTC T/- TTTTTAAGAA 3070 het 3070 ref 35 21 13 1 T 6 5 365949 CASAVA_Build 8 113255412 3D GTTCAAAACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 1051 hom 32 8 18 6 A 17 14 365950 CASAVA_Build 8 113261716 1D TCTAAAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 11 10 365951 CASAVA_Build 8 113270515 1D TACAGACAGG C/- GTAGTATTCG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 1 0 365952 CASAVA_Build 8 113272920 2I GATATTCTGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 340 hom 45 1 39 5 GT 5 6 365953 CASAVA_Build 8 113273301 1D TAGCAAAAAC A/- TGTAGTTTGG 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 1 0 365954 CASAVA_Build 8 113274655 1I GGAAACCACA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 7 T 9 10 365955 CASAVA_Build 8 113275618 1I GTTGAATAAC -/G GGCCATCCAA 3070 het 3070 hom 45 19 20 6 G 2 3 365956 CASAVA_Build 8 113275676 1D CCTTATTTGG A/- AAAAAAAAAA 1007 het 1007 ref 39 25 4 10 A 13 12 365957 CASAVA_Build 8 113282926 1D AGTTGTAAAA G/- GGCTGCCATA 3070 het 3070 hom 31 12 14 5 G 3 2 365958 CASAVA_Build 8 113283968 2I TGAGAATATC --/AG AGAAAATTCT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 AG 1 2 365959 CASAVA_Build 8 113292797 1I GTGTGTTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 10 11 365960 CASAVA_Build 8 113297725 1D TTTATTACAA T/- TAAGTTTCTG 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 1 365961 CASAVA_Build 8 113298888 1D AGCCTTTTAA G/- GCTCTTTAAA 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 G 2 1 365962 CASAVA_Build 8 113304851 1D TGAAGTAAAA C/- AGCTATAAAA 3070 hom 72 het 29 0 23 6 C 1 0 365963 CASAVA_Build 8 113316989 1D AGCTGGAGGG A/- AAAAATTGTT 3070 hom 94 het 37 0 32 5 A 6 5 365964 CASAVA_Build 8 113319623 1I ATTCAAGGTA -/C CCCAACCCTC 3070 hom 114 het 46 0 38 8 C 3 4 365965 CASAVA_Build 8 113321845 12D TATTCTTTGA TTGCCTCAATGG/------------ CATTCAGCAT 3070 het 3070 ref 43 30 13 1 TTGCCTCAATGG 1 0 365966 CASAVA_Build 8 113324641 1I TTTCAATCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 20 10 7 A 10 11 365967 CASAVA_Build 8 113327527 1D TCCTTTAAGG A/- ATTTTCCATA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 2 1 365968 CASAVA_Build 8 113354687 1I TATTCATTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 23 1 20 2 A 10 11 365969 CASAVA_Build 8 113355341 1I GGTAACATAC -/A AAAAAAAAAA 1711 het 1711 ref 31 9 10 12 A 15 16 365970 CASAVA_Build 8 113378655 1D GTAAAGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1439 hom 23 5 11 7 A 17 16 365971 CASAVA_Build 8 113380598 3D CTCAGGTTAT GGA/--- GGAGGAGAGT 3070 het 3070 ref 32 15 13 6 GGA 3 2 365972 CASAVA_Build 8 113381677 2D GTATGTATAA AT/-- ATATATTTCT 1493 het 1459 hom 10 4 4 2 AT 4 3 365973 CASAVA_Build 8 113412970 1D AAAACATACA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 ref 30 17 13 1 T 7 6 365974 CASAVA_Build 8 113413705 3D TCAAATTATC AAG/--- AAGTGGAGGA 3070 het 3070 hom 47 18 26 4 AAG 2 1 365975 CASAVA_Build 8 113419673 1D TAAAATGAAC T/- TTGTACTTCA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 3 2 365976 CASAVA_Build 8 113434355 1I TTATTTGCTA -/T TTTTGTCTTC 1471 het 1471 ref 18 11 4 3 T 4 5 365977 CASAVA_Build 8 113442933 2I TAATTCTGAA --/TG TGTGTGTGTG 2507 het 925 hom 11 3 6 2 TG 5 6 365978 CASAVA_Build 8 113444093 3D TGATTTGACA GAT/--- GATGATTAGA 3070 het 3070 hom 37 18 18 1 GAT 3 2 365979 CASAVA_Build 8 113446516 16D CTTCTCTCTA ATGAATAGAGAGAAAT/---------------- GTGTCCACCA 3070 het 3070 ref 37 20 21 5 ATGAATAGAGAGAAAT 1 0 365980 CASAVA_Build 8 113452136 1D TCTCCATCTA T/- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 T 7 6 365981 CASAVA_Build 8 113454428 3D TATATATATA TTT/--- TTTTTCTCAT 1461 het 170 hom 4 1 3 2 T 8 5 365982 CASAVA_Build 8 113454955 1I TACATGCATT -/A AAAAACACAG 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 5 6 365983 CASAVA_Build 8 113455606 3D ACAAGAAACA TAT/--- TATAAAATTT 3070 het 3070 hom 26 12 13 2 TAT 2 1 365984 CASAVA_Build 8 113459174 1I CAATGAATGC -/A AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 A 7 8 365985 CASAVA_Build 8 113459572 1D TCAAACACAC A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 9 8 365986 CASAVA_Build 8 113466960 1I AGTAAAAGTG -/A AAAGACAATT 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 A 3 4 365987 CASAVA_Build 8 113467315 1D GGAGATATCA G/- GTTCTGATCT 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 G 2 1 365988 CASAVA_Build 8 113475293 1D TGCACTCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 16 8 T 12 11 365989 CASAVA_Build 8 113482706 4D TTCTTCACTC ACTT/---- CTCTTCGCTT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 ACTT 1 0 365990 CASAVA_Build 8 113487421 5D CATTTGGAAA TAACT/----- TAAAGAGTAT 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 TAACT 1 0 365991 CASAVA_Build 8 113489672 1D AATACATCAT G/- GGAAAATTAT 3070 hom 141 het 51 0 48 3 G 3 2 365992 CASAVA_Build 8 113491699 1D TCTGAACATT G/- GCTGTGCTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 G 2 1 365993 CASAVA_Build 8 113492528 1D AAAATTCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1992 hom 29 11 12 6 T 17 16 365994 CASAVA_Build 8 113493767 3D AACAAGCTCC GTG/--- GTGGTCTGTT 3070 het 3070 ref 27 16 8 3 GTG 2 1 365995 CASAVA_Build 8 113498305 1D TAAAATACGT A/- AGAGGTTGTA 3070 het 3070 hom 36 12 20 5 A 2 1 365996 CASAVA_Build 8 113502581 1I TGTTTGCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 10 11 365997 CASAVA_Build 8 113512481 9D GTCATTCCCT GCCCTCACA/--------- GATATTTAGG 3070 het 3070 ref 43 27 15 4 GCCCTCACA 1 0 365998 CASAVA_Build 8 113514315 4D GCTCCACTGG AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 2642 hom 34 10 13 13 A 15 11 365999 CASAVA_Build 8 113514659 10I CAGAAATAAC ----------/CTATAGCAGG AAAGAAATAA 3070 het 3070 hom 41 16 20 5 CTATAGCAGG 0 1 366000 CASAVA_Build 8 113515259 1I TAGTGCTAAG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 T 9 10 366001 CASAVA_Build 8 113518041 1D GTATACATAT A/- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 41 17 24 0 A 7 6 366002 CASAVA_Build 8 113521268 1D GCCACTAGGT C/- CCCCCCCGCC 3070 het 2623 hom 30 10 13 7 C 8 7 366003 CASAVA_Build 8 113539711 7I AGCCTAAAAT -------/ATTTCAA ATTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 37 11 23 3 ATTTCAA 0 1 366004 CASAVA_Build 8 113541937 2D AAGGCATGGA TT/-- TTTTAGTTCA 3070 het 3070 ref 43 21 16 7 T 6 4 366005 CASAVA_Build 8 113574319 1I AGTAATCTAG -/A AATGATTTAA 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 A 2 3 366006 CASAVA_Build 8 113575735 4I TTCTTTCTTC ----/CTTT CTTTCTTTTG 3070 hom 51 het 24 0 18 6 CTTT 2 3 366007 CASAVA_Build 8 113582310 3I CCTTTTGCAT ---/AAG AAGATTAGGG 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 AAG 1 2 366008 CASAVA_Build 8 113652038 4D TGTGGGTAAC TATT/---- TAGATAGTTG 3070 het 3070 ref 32 19 12 4 TATT 1 0 366009 CASAVA_Build 8 113654326 1D ATGAAACCCA C/- CCTACCCCTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 C 3 2 366010 CASAVA_Build 8 113657471 4D AAATACAATC AATT/---- GTTTCTTGGA 3070 hom 54 het 19 0 19 0 AATT 1 0 366011 CASAVA_Build 8 113658125 1I TTATACAAAT -/G GGGTTTTGCC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 G 3 4 366012 CASAVA_Build 8 113658237 14D38M1I ACCAGGCAGC ATACATATATATATATATATATATATGAAAGAAGCTTTTTATAAGACACATT-/--------------ATATATATATATGAAAGAAGCTTTTTATGAGACACATTA AAAAAAATAA 3070 hom 109 het 32 0 37 6 N/A 0 0 366013 CASAVA_Build 8 113661944 1D AAGAGGTAGG A/- AAAAAAAAAA 2959 het 1651 hom 32 10 11 11 A 15 14 366014 CASAVA_Build 8 113664019 1D AACAAAAAAA G/- GTTTAGAGCC 3070 het 3070 ref 43 22 15 6 G 2 1 366015 CASAVA_Build 8 113687064 1D GGCAAGGATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 A 11 10 366016 CASAVA_Build 8 113691740 1D AGCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 A 12 11 366017 CASAVA_Build 8 113700082 4D AGGAGTAAGG ACCA/---- ACCATAAAGA 3070 het 3070 ref 43 20 18 7 ACCA 2 1 366018 CASAVA_Build 8 113724130 1I CTGAAGATAG -/A AAAAAAGCAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 5 A 6 7 366019 CASAVA_Build 8 113724820 1I CTTCATGTAA -/C ATTTGCTACA 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 C 0 1 366020 CASAVA_Build 8 113726974 3I AGAAAATGAA ---/TTG TTAACTGTAT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 TTG 0 1 366021 CASAVA_Build 8 113732267 1I2M7I TACACTTCAG -TG-------/ATGTACTAGA TCTCCTGATA 3070 het 3070 ref 38 21 7 12 N/A 0 0 366022 CASAVA_Build 8 113735442 1I AGAATGGGGT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 A 6 7 366023 CASAVA_Build 8 113760113 2I ACAACAATCC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 AT 6 7 366024 CASAVA_Build 8 113767381 1D ATAATAGCAA T/- TTTTTGACAT 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 6 5 366025 CASAVA_Build 8 113771993 1D CCCAACTAGA C/- CCCCCCCCCC 2104 het 759 hom 25 5 8 12 C 11 10 366026 CASAVA_Build 8 113775467 1I CATAGTCTTC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 T 7 8 366027 CASAVA_Build 8 113779867 1I GTACCCAGAT -/G TTGGTTTCTA 3070 het 3070 hom 35 10 21 4 G 0 1 366028 CASAVA_Build 8 113791295 1D CCTCCCTTTA T/- CTCAGATAAC 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 T 1 0 366029 CASAVA_Build 8 113795346 1I ATAGTGGAAG -/A AAAAACCAGT 3070 het 3070 ref 43 25 10 8 A 5 6 366030 CASAVA_Build 8 113801711 10D CTAGAAATTT TTTTCTTTTC/---------- TTTTCTTTTC 3070 het 3070 hom 33 15 19 4 TTTTC 4 2 366031 CASAVA_Build 8 113814786 1I TGCTTGTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 11 12 366032 CASAVA_Build 8 113815054 1D CATTTACAAC T/- TTTATTAAAC 3070 het 3070 hom 46 16 27 3 T 4 3 366033 CASAVA_Build 8 113821776 1D CTTTTTTGTG T/- TTTTTTCACT 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 T 7 6 366034 CASAVA_Build 8 113828041 2I ATAGAATAGT --/TA TATATATATT 3070 het 1018 hom 14 4 7 3 TA 4 5 366035 CASAVA_Build 8 113831269 4D AAAATATTTC TCTG/---- TCAGTCACAG 3070 het 3070 ref 31 19 11 4 TCTG 1 0 366036 CASAVA_Build 8 113832480 1D GCTTTGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 39 1 33 6 A 12 11 366037 CASAVA_Build 8 113835386 4I AAGAAGAATG ----/GAGC GAGCTGTGTG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 GAGC 1 2 366038 CASAVA_Build 8 113839756 1I GACTCCATTT -/C CAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 1 2 366039 CASAVA_Build 8 113853579 2D GACTAAAAAC TG/-- TGGGGAAAAG 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 TG 2 1 366040 CASAVA_Build 8 113856937 2I ATTTTAAATC --/AT GTAGCAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 AT 0 1 366041 CASAVA_Build 8 113860588 2I GTGTGTTTGC --/GT GTGTGTGTGT 2551 het 2551 ref 40 21 8 11 GT 8 9 366042 CASAVA_Build 8 113862486 2I AGGATAGAGT --/AA AGAGGATTTG 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 3 366043 CASAVA_Build 8 113863624 1D CCTACCAAAT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 26 10 15 2 A 9 8 366044 CASAVA_Build 8 113880654 3D TGTCTCTCTG ACA/--- ACATCATGCA 3070 hom 126 het 43 0 43 0 ACA 2 1 366045 CASAVA_Build 8 113886825 1I AATGGCCATG -/T GTCAAACAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 366046 CASAVA_Build 8 113887533 1I TGAATTTCAG -/C TTTTGTAAAG 3070 hom 97 het 35 0 32 3 C 0 1 366047 CASAVA_Build 8 113891789 4I TAATTAACAG ----/ACAA ACAAATCTGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 ACAA 1 2 366048 CASAVA_Build 8 113892570 5D CAAACTGCCC AGAGA/----- AGAGTAGAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 2 AGAGA 1 0 366049 CASAVA_Build 8 113892820 2I AGAAAACACT --/TA TACAAGTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 TA 1 2 366050 CASAVA_Build 8 113896388 1D GCTTTTTATG A/- AAAATGCATT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 5 4 366051 CASAVA_Build 8 113898858 4I TCTGTGAAAC ----/AATT AAAGTTCTTT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 AATT 0 1 366052 CASAVA_Build 8 113923955 1D TAATATTTTG A/- ACATATATAT 3070 hom 105 het 37 0 35 3 A 2 1 366053 CASAVA_Build 8 113934329 4D TCCACCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 AAAT 6 5 366054 CASAVA_Build 8 113939135 1I TGAGAGACTT -/A ACAAGGATTA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 1 2 366055 CASAVA_Build 8 113942293 5D TCTGAATAGT TAAAC/----- TAATTCATTT 3070 het 3070 ref 36 17 17 4 TAAAC 1 0 366056 CASAVA_Build 8 113945275 1I GTAGAAAAAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 8 9 366057 CASAVA_Build 8 113950330 1I AGAAAACAGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 39 18 12 9 A 7 8 366058 CASAVA_Build 8 113951109 1D ATGCAGCCAT A/- AAAAGGAATG 2957 het 2957 ref 28 17 7 4 A 5 4 366059 CASAVA_Build 8 113957779 1D GAGACACAAC A/- AAAAAAAAGA 2262 het 2262 ref 18 10 6 3 A 9 8 366060 CASAVA_Build 8 113965272 1I AGATTAGTAT -/A AAAAAATCAG 3070 het 3070 ref 59 29 26 4 A 6 7 366061 CASAVA_Build 8 113977977 1D CTTATAGATT C/- TTTTCCTACT 3070 het 3070 ref 42 22 19 1 C 1 0 366062 CASAVA_Build 8 113992679 1I ATATCTCCAG -/C CTTATTAAGA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 C 1 2 366063 CASAVA_Build 8 113993047 8D TACATATATA TGTGTGTG/-------- TGTGTGTGTG 1872 het 1872 ref 17 9 5 4 TG 13 9 366064 CASAVA_Build 8 114005437 1D AAATAAAGAG A/- GGGGTATGTG 3070 het 3070 ref 50 24 17 10 A 1 0 366065 CASAVA_Build 8 114010783 1D AAAGCATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1809 hom 18 7 10 1 A 10 9 366066 CASAVA_Build 8 114017111 1D CTCAATTATG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 A 10 9 366067 CASAVA_Build 8 114024770 1D TCGATTATAC T/- TTTTGGTGTT 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 5 4 366068 CASAVA_Build 8 114029514 1D TGTATTAGTC T/- TGCCTATTAA 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 T 2 1 366069 CASAVA_Build 8 114048587 1D CTCCAAGAAA C/- TATCAACTGT 3070 het 3070 hom 65 27 33 6 C 1 0 366070 CASAVA_Build 8 114080598 1D TAGCACTATG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 A 9 8 366071 CASAVA_Build 8 114098850 1D AGGAGATCTA T/- TTTTTTGCTC 3070 het 3070 hom 33 11 18 5 T 7 6 366072 CASAVA_Build 8 114104317 3I TTACTGCAGA ---/AAT AATAATGATT 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 AAT 2 3 366073 CASAVA_Build 8 114106434 4D TGTCTCCAGT TCCC/---- TCCATGTTCC 3070 het 3070 ref 36 17 17 3 TCCC 1 0 366074 CASAVA_Build 8 114129489 3D ACTTCAATTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1254 het 973 hom 26 9 4 13 T 21 18 366075 CASAVA_Build 8 114141401 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 14 2 9 3 T 10 11 366076 CASAVA_Build 8 114141541 1D AATGCTATCC T/- CTCCCCCCTC 838 hom 9 het 5 0 3 2 T 1 0 366077 CASAVA_Build 8 114150449 1D AAAACAAACC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 45 18 21 6 A 9 8 366078 CASAVA_Build 8 114154234 1D TTCTGTTGGT C/- TTTAACCTGG 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 C 1 0 366079 CASAVA_Build 8 114154438 1I AAACCTTCAG -/A AAAAAAAAAT 2216 het 2216 ref 24 14 6 4 A 9 10 366080 CASAVA_Build 8 114163593 2D TCTTCAGCAA TG/-- GGGCAGCTGT 3070 het 3070 ref 31 14 11 9 TG 1 0 366081 CASAVA_Build 8 114166028 1D GAATGGAACC A/- AAAAAAAAAA 1495 het 1495 ref 23 12 5 6 A 16 15 366082 CASAVA_Build 8 114167912 11D GGCAAAATAA ATTCAAAATAT/----------- ATTCAAAATA 3070 het 3070 ref 26 11 10 7 ATTCAAAATAT 2 1 366083 CASAVA_Build 8 114170780 1I AAGGTAGCTA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 T 7 8 366084 CASAVA_Build 8 114173128 1I TAATCTTTTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 A 7 8 366085 CASAVA_Build 8 114187288 1D ATATACAGTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 18 2 A 10 9 366086 CASAVA_Build 8 114188296 2D TATAACTCAC AT/-- GTGTTCACCC 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 AT 1 0 366087 CASAVA_Build 8 114201370 5I TCAAATTTAT -----/TTAAG TTATTTAATA 3070 het 3070 hom 41 13 26 2 TTAAG 0 1 366088 CASAVA_Build 8 114204503 1D GAAATGCCAG T/- TAACTATTGT 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 T 2 1 366089 CASAVA_Build 8 114205898 1I GGGAAAAAAG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 8 9 366090 CASAVA_Build 8 114238443 6I ATTAGTTTAC ------/TATTAA TAACAAAAAT 2988 het 2988 ref 38 28 8 2 TATTAA 0 1 366091 CASAVA_Build 8 114244925 1D TTTTCTATAT A/- AAATGTGAAA 3070 het 3070 hom 25 8 17 1 A 4 3 366092 CASAVA_Build 8 114251699 1D AGTTTTAATG A/- AAAAAATTGG 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 A 7 6 366093 CASAVA_Build 8 114252412 1D ATGGCAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 47 19 20 10 A 12 11 366094 CASAVA_Build 8 114252948 1D AGTTTTATGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 48 0 39 9 T 10 9 366095 CASAVA_Build 8 114274911 1D GACTTCTCTC T/- GTTACTACTG 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 T 1 0 366096 CASAVA_Build 8 114292284 1D ACTCATTCTC A/- AAAAAAAAAA 778 het 778 ref 48 38 3 7 A 12 11 366097 CASAVA_Build 8 114329873 1D GTGTGTGTGT G/- ATATATATGT 1975 hom 10 het 4 0 4 0 G 1 0 366098 CASAVA_Build 8 114332949 1D CACTAAAAGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 10 9 366099 CASAVA_Build 8 114335590 3I CAAAAAAGAA ---/ATT ATTTAGGCAG 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 ATT 1 2 366100 CASAVA_Build 8 114349809 1D TAAAACCTAA G/- TTCTGTGAAA 3070 het 3070 hom 34 12 19 3 G 1 0 366101 CASAVA_Build 8 114370530 1I AATGTAGATG -/A AAATGGTACC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 A 3 4 366102 CASAVA_Build 8 114398223 1I CAAAAATGCT -/G GGATTACAGG 3070 hom 93 het 34 0 27 7 G 2 3 366103 CASAVA_Build 8 114407766 1D TTATTTCTAG T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 87 het 35 0 29 9 T 8 7 366104 CASAVA_Build 8 114408333 1D ATTAACGGTA G/- AAATACAAAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 G 1 0 366105 CASAVA_Build 8 114411108 2D GTTGAAAGAC AA/-- AGTGAGAATC 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 A 3 1 366106 CASAVA_Build 8 114413903 1D AATGCACAAT C/- CAACAAATAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 2 1 366107 CASAVA_Build 8 114415838 1I CAATAGGCCC -/T ACTTGGTCAT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 366108 CASAVA_Build 8 114422274 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 28 0 16 13 A 14 13 366109 CASAVA_Build 8 114433679 2D TAAGAAACGG AA/-- AAAGAGAAGA 3070 het 3070 ref 45 28 16 4 A 5 3 366110 CASAVA_Build 8 114443128 1D GAAATTGTAA T/- TTTTAGGCAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 5 4 366111 CASAVA_Build 8 114470440 5I TTGTAAAAAT -----/AAATC AAGATGTAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 AAATC 0 1 366112 CASAVA_Build 8 114474361 4D TATATATATA TATG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 TATG 1 0 366113 CASAVA_Build 8 114476490 1D TTAGTGACTA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 T 9 8 366114 CASAVA_Build 8 114481354 2I CTATTCTGTG --/TA TATATATATA 2884 het 2884 ref 29 14 8 7 TA 7 8 366115 CASAVA_Build 8 114491291 1D AGCTTTGTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2780 hom 28 9 13 6 A 13 12 366116 CASAVA_Build 8 114494215 1I TGTTACAGGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 A 9 10 366117 CASAVA_Build 8 114510644 2D ATAATTGTCT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 TA 6 5 366118 CASAVA_Build 8 114511776 1I TTGTCATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 11 12 366119 CASAVA_Build 8 114517963 3I GAATCAACTC ---/CTT CTTTAGTATT 3070 het 3070 ref 32 14 15 3 CTT 1 2 366120 CASAVA_Build 8 114533926 1D AGAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 348 hom 12 het 5 0 5 0 A 12 11 366121 CASAVA_Build 8 114536163 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 51 19 22 10 AC 7 6 366122 CASAVA_Build 8 114537949 3I TTTGTTGCCG ---/CGT CGTCCTCTGG 3070 het 3070 hom 40 14 21 5 CGT 1 2 366123 CASAVA_Build 8 114539094 4I GATAAATAAT ----/TTAA TTAATTAATT 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 TTAA 2 3 366124 CASAVA_Build 8 114539847 1D GTCCGCCTCT A/- AAAAAAAAAA 2148 het 504 hom 25 4 12 9 A 17 16 366125 CASAVA_Build 8 114573147 4I ATAAATCTGT ----/TAAA TAAATAAGTC 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 TAAA 1 2 366126 CASAVA_Build 8 114577185 2D CTATATGTTC AA/-- AGAGAAAGAG 3070 het 3070 ref 43 22 12 9 A 3 1 366127 CASAVA_Build 8 114585182 4I GTTTGACCAT ----/AAAG AAAGATTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 AAAG 1 2 366128 CASAVA_Build 8 114599505 3D AAAAAACTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TTA 6 5 366129 CASAVA_Build 8 114603785 1D TTAGACTGTA T/- TTGTATAAAT 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 T 3 2 366130 CASAVA_Build 8 114611865 1I ATAAATACTA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 42 het 21 0 15 6 T 7 8 366131 CASAVA_Build 8 114612172 1I ATATTTCTAC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 2908 hom 20 9 9 2 T 7 8 366132 CASAVA_Build 8 114627311 1D TTCCTAATGT G/- ACTGGTGTAA 3070 het 3070 ref 61 32 21 10 G 1 0 366133 CASAVA_Build 8 114659274 4D ATTGAATCTT TCTA/---- TCCATGAACA 3070 het 3070 ref 35 23 12 1 TCTA 1 0 366134 CASAVA_Build 8 114667793 1D TCCTTCAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2273 hom 32 6 15 11 T 13 12 366135 CASAVA_Build 8 114671352 2I GTACATACAC --/AT ATGTGTACAC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 AT 1 2 366136 CASAVA_Build 8 114680108 1I AATAATACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 T 11 12 366137 CASAVA_Build 8 114702256 1I GAATTTAACA -/T TTTTAAATAG 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 T 4 5 366138 CASAVA_Build 8 114705714 3D AAAAGGGGAA AAC/--- AACAACAACA 2842 het 2842 ref 29 15 8 8 AAC 4 3 366139 CASAVA_Build 8 114707572 4D AATGAGAAGG AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 48 21 17 10 AAAC 3 2 366140 CASAVA_Build 8 114712696 1D AACAATGAAG A/- AAAAAAAAAG 3039 het 3039 ref 29 14 8 7 A 10 9 366141 CASAVA_Build 8 114717070 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2009 het 1237 hom 22 8 8 6 T 15 14 366142 CASAVA_Build 8 114719233 1D GATGGTAGAG A/- AACCAGGTTA 3070 het 3070 ref 31 14 9 9 A 3 2 366143 CASAVA_Build 8 114721228 1D TTTGCTGAGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 656 hom 19 3 11 5 T 10 9 366144 CASAVA_Build 8 114725099 2D ACAATCTCAA TG/-- TTCATATAAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TG 1 0 366145 CASAVA_Build 8 114733334 2D AAAATGTAGA CT/-- CTGTAGCCTG 3070 het 3070 hom 28 13 12 3 CT 2 1 366146 CASAVA_Build 8 114735488 1D ATTGCACCAT G/- TTTTATAAAT 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 G 1 0 366147 CASAVA_Build 8 114737557 1I CTTTTAGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 13 9 T 10 11 366148 CASAVA_Build 8 114741169 1D GTTAATCCTC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 T 8 7 366149 CASAVA_Build 8 114741912 1D GTTTATGGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 A 13 12 366150 CASAVA_Build 8 114748956 10I TAATCTTCCC ----------/ACTGTTTCAT ACTTATTGAT 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 ACTGTTTCAT 0 1 366151 CASAVA_Build 8 114758960 1D CACAAGACAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 A 10 9 366152 CASAVA_Build 8 114761164 1I ATGTCTTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 24 13 7 T 10 11 366153 CASAVA_Build 8 114761491 5I CATGCCTAAA -----/TAAAG TAGTTTAAAA 3070 het 3070 ref 48 24 18 6 TAAAG 0 1 366154 CASAVA_Build 8 114766911 1I GATGTAAAGA -/G AATACAGATT 3070 het 3070 ref 36 18 12 6 G 0 1 366155 CASAVA_Build 8 114769378 1I TGGGAAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 19 11 T 11 12 366156 CASAVA_Build 8 114773070 3D AAGTATCCTC TCT/--- TCTTTAAATA 2209 het 2209 ref 21 11 5 5 TCT 2 1 366157 CASAVA_Build 8 114783546 1D CTTCCCAACA G/- GTACCACAAA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 G 2 1 366158 CASAVA_Build 8 114788275 1I TTATTAAAAG -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 T 6 7 366159 CASAVA_Build 8 114789069 4D CTTACTTTTC TTAG/---- TTAAACAATG 3070 het 3070 hom 40 14 24 3 TTAG 1 0 366160 CASAVA_Build 8 114789172 23D TGTCATATCG GTAGAGTGAGGAAATATGGAGTC/----------------------- TTAGAGTGAG 3070 het 3070 hom 53 24 28 5 GTAGAGTGAGGAAATATGGAGTC 1 0 366161 CASAVA_Build 8 114790378 7D AATAATGCTT ATTGATC/------- TAGTTTCTAA 3070 het 3070 ref 43 19 23 8 ATTGATC 1 0 366162 CASAVA_Build 8 114792208 2I TACATGAAAC --/TG TGAATCTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 TG 1 2 366163 CASAVA_Build 8 114803405 2D TGTTCTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 11 5 A 12 10 366164 CASAVA_Build 8 114806700 1I TTAAAAGAGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 36 24 12 0 T 8 9 366165 CASAVA_Build 8 114813053 1D AAATACAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 15 7 T 12 11 366166 CASAVA_Build 8 114817930 4D AAAAAATGAG AAAC/---- AAATAGCTAA 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 AAAC 1 0 366167 CASAVA_Build 8 114819997 1I CTGTTAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 10 11 366168 CASAVA_Build 8 114823594 2D TAGAGATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 2801 het 2801 ref 31 11 8 12 A 14 12 366169 CASAVA_Build 8 114824439 1I GAGCAGTGTA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 7 8 366170 CASAVA_Build 8 114827799 1D51M2D TCTCTTTTTT GGGGGGGGGAAATTATGCTTAGAATTCTTCATTTATGACATACTTTTAAAACAT/-GGGGGGGGAAATTATGCTTAGAATTCTTCATTTATGACATACTTTTAAAAC-- ATCATTTGTA 3070 het 3070 ref 30 15 13 19 N/A 0 0 366171 CASAVA_Build 8 114835185 1D CTGTGATTTT A/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 1 0 366172 CASAVA_Build 8 114840553 2D TTCTAATAAC AT/-- ATATTTTCAT 3070 het 3070 ref 46 28 16 2 AT 3 2 366173 CASAVA_Build 8 114842445 1I GTCAGATATC -/T TTTTATTATA 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 T 4 5 366174 CASAVA_Build 8 114847779 1D AAGACATTAC A/- AAAAAATTGT 3070 het 3070 hom 37 13 17 8 A 7 6 366175 CASAVA_Build 8 114850772 1I TGACAATGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 10 11 366176 CASAVA_Build 8 114867180 1D CCTACACAGT A/- AAAAAATGAC 3070 het 3070 ref 25 11 10 6 A 7 6 366177 CASAVA_Build 8 114868125 1I TTTAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 16 6 A 10 11 366178 CASAVA_Build 8 114869495 2I GTCCTTTTTA --/CT CTGTTATTTC 3070 het 3070 ref 26 14 7 5 CT 1 2 366179 CASAVA_Build 8 114875639 1D TTGTTTTCTA T/- TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 T 7 6 366180 CASAVA_Build 8 114882544 1D TTATAACAAC T/- TTTGGGTATT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 4 3 366181 CASAVA_Build 8 114890670 2I GTCAATATAT --/AG AGTGATGGTA 3070 het 3070 ref 40 18 19 3 AG 1 2 366182 CASAVA_Build 8 114900003 1D ATTGGACAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 A 10 9 366183 CASAVA_Build 8 114901197 1D ATGGTAGTTC T/- TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 T 8 7 366184 CASAVA_Build 8 114902704 2D GCCATAAAAA AG/-- ATACTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 17 15 6 AG 1 0 366185 CASAVA_Build 8 114903930 1D CTAAAAAGGA G/- AAAAAAGTTG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 G 1 0 366186 CASAVA_Build 8 114905704 1D TTAAAAAGAA T/- TACCTTTTCT 3070 het 3070 ref 39 19 18 2 T 2 1 366187 CASAVA_Build 8 114909797 1I TTGTCTTTAC -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 T 7 8 366188 CASAVA_Build 8 114910896 1D TTATGTTTTT A/- TCTCATATTT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 A 1 0 366189 CASAVA_Build 8 114911896 8D17M14I TCACACACAT ACACACACACACACACACATCCTAT--------------/--------ACACACACGCATCCTATTGGTTTTTTTTCTC TGGAGAACCC 3070 het 3070 ref 40 25 12 12 N/A 0 0 366190 CASAVA_Build 8 114921324 1I TACAGAAGTG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 34 17 16 1 A 8 9 366191 CASAVA_Build 8 114921919 1D CAGGTTATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 12 11 366192 CASAVA_Build 8 114922390 5D TTTCATAAAT TAAAA/----- TAATATATAT 3070 het 3070 hom 28 13 14 1 TAAAA 1 0 366193 CASAVA_Build 8 114930585 1I TTTCCATAGA -/G GTTGGACTAA 3070 het 3070 ref 46 24 15 7 G 1 2 366194 CASAVA_Build 8 114932332 4D GATTTTGCCC AAAG/---- AAATATGTAC 3070 het 3070 ref 28 15 9 5 AAAG 1 0 366195 CASAVA_Build 8 114939643 1D ACCCTATAGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 65 het 27 0 22 5 A 10 9 366196 CASAVA_Build 8 114939976 1I AAATAACTGG -/T TTTTTTTTTC 3019 het 3019 ref 28 13 9 6 T 9 10 366197 CASAVA_Build 8 114942322 1I TGAAAAAAAA -/T ATTGTCATAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 0 1 366198 CASAVA_Build 8 114949359 1I TATTAGCTGT -/G GGTTTTTAAT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 2 3 366199 CASAVA_Build 8 114957480 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2078 het 142 hom 6 1 5 0 A 11 12 366200 CASAVA_Build 8 114959406 1D AAAAACTTCT C/- CAGTAATTAT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 C 2 1 366201 CASAVA_Build 8 114976910 1I TAGTTGATAA -/T TGTACAAAAG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 2 366202 CASAVA_Build 8 114981368 1D CAAATTCATG A/- AAATATAAAT 3070 het 3070 hom 31 13 17 2 A 4 3 366203 CASAVA_Build 8 114982882 1D CATTTTAACT A/- ATACTAATAT 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 2 1 366204 CASAVA_Build 8 114983648 4I ATTTCTCCTT ----/TGTC TGTTCTCCTG 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 TGTC 0 1 366205 CASAVA_Build 8 114986520 1I TGTTATCACT -/A AAGCAATTCA 3070 het 3070 ref 52 26 21 5 A 2 3 366206 CASAVA_Build 8 114987128 1D TGTTGCACTG A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 56 26 22 9 A 8 7 366207 CASAVA_Build 8 114993987 1D ACATTCATAC T/- TGTGGCATAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 T 2 1 366208 CASAVA_Build 8 115000400 4I AATATTAATG ----/AAGT AATATTTGAA 3070 het 3070 ref 27 12 13 2 AAGT 0 1 366209 CASAVA_Build 8 115004784 2D ATGATTTTAC AA/-- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 A 10 8 366210 CASAVA_Build 8 115008187 4I TAGGTTTTTC ----/AATG AATGAAGAGA 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 AATG 1 2 366211 CASAVA_Build 8 115009944 1I GGCAGTCATG -/A AAAAGTTACC 3070 het 3070 hom 49 14 26 9 A 4 5 366212 CASAVA_Build 8 115012529 4D TTTTAGAAAT AAAC/---- AAACAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 23 15 0 AAAC 2 1 366213 CASAVA_Build 8 115013709 2D CTCTCAAAAC CG/-- TGTGAGAACT 3070 het 3070 hom 40 19 21 0 CG 1 0 366214 CASAVA_Build 8 115016671 1D GCAGGTTGTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 21 13 12 T 10 9 366215 CASAVA_Build 8 115021512 1I TCCACCTTCA -/T CCCACACCCT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 T 0 1 366216 CASAVA_Build 8 115024184 1I GCTTGTTTTA -/T TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 T 7 8 366217 CASAVA_Build 8 115024764 2D GACATATTTT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 35 14 16 6 CA 7 6 366218 CASAVA_Build 8 115059475 4D TTTATCTATA TATC/---- TATATATTAA 3070 het 2685 hom 18 7 9 2 TATC 1 0 366219 CASAVA_Build 8 115061762 1D CAGGCCCCCC T/- ATCCATCAGT 3036 het 2120 hom 30 9 13 8 T 1 0 366220 CASAVA_Build 8 115073758 6I GCTTTTCTTC ------/TTTAAG TTTATCTCCA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 TTTAAG 0 1 366221 CASAVA_Build 8 115080062 3D CTATTCAGTT ATG/--- ATAAGAACAC 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 ATG 1 0 366222 CASAVA_Build 8 115081687 1D TACCTTTCTT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 14 8 1 C 1 0 366223 CASAVA_Build 8 115092015 4I TAGCATTTCC ----/TTGT TTATTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 TTGT 0 1 366224 CASAVA_Build 8 115092125 4I TTGTTTAATG ----/ACTC ACTACTCAGC 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 ACTC 0 1 366225 CASAVA_Build 8 115095373 1I ATTTTTGTTG -/T GTTTTTTTTT 2379 het 2379 ref 19 11 6 2 T 0 1 366226 CASAVA_Build 8 115096299 3I CTTGTAACAG ---/ATA ATTAGACTGA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 ATA 0 1 366227 CASAVA_Build 8 115096982 4D GCATATGTCT TAAA/---- TATAGTCTGC 3070 het 3070 ref 39 20 18 4 TAAA 1 0 366228 CASAVA_Build 8 115099422 2D TATATATATA TC/-- TCTAAACCAG 3070 het 2677 hom 20 11 7 2 TC 2 1 366229 CASAVA_Build 8 115106738 6D ACTTTTGTCT TTGTAA/------ TTGTGTTTCA 3070 het 3070 hom 39 17 21 2 TTGTAA 1 0 366230 CASAVA_Build 8 115107745 1D AAATGTCATA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 T 10 9 366231 CASAVA_Build 8 115108450 1I AATGTGTTTT -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 44 23 19 2 A 8 9 366232 CASAVA_Build 8 115119051 1D GAAATAAACA T/- TTTTTAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 6 5 366233 CASAVA_Build 8 115119731 4D AAAATAAAAA AGAG/---- AGAAACACTT 3070 het 3070 ref 25 13 11 1 AG 3 1 366234 CASAVA_Build 8 115129003 2D ATATGATATT TA/-- TATGTTATCA 3070 het 3070 hom 27 7 18 3 TA 2 1 366235 CASAVA_Build 8 115131370 1D ATACATAATC T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 T 8 7 366236 CASAVA_Build 8 115132914 3I CTCATGAAAA ---/CAC CAATAAGTAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 CAC 0 1 366237 CASAVA_Build 8 115133562 1I TGTCACTTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 T 8 9 366238 CASAVA_Build 8 115136409 2I GTTTACTAAC --/TA TATATTCTGC 3070 het 3070 ref 43 23 17 3 TA 2 3 366239 CASAVA_Build 8 115138102 4I GAGAGGATAG ----/AAGC AAGCCTAATT 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 AAGC 1 2 366240 CASAVA_Build 8 115138747 1D GCATAACACA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 37 20 11 7 T 9 8 366241 CASAVA_Build 8 115140687 1I ACTGTCGGTG -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 42 19 16 7 A 7 8 366242 CASAVA_Build 8 115146953 2D CTGAAAAGCA AC/-- AGTTTTCATT 3070 het 3070 ref 35 18 17 2 AC 1 0 366243 CASAVA_Build 8 115147790 2D5M15I AACAGAAAAC ATAAGGT---------------/--AATGTCCAAGAGAAAATCAA AAGTACCTTA 3070 het 3070 ref 37 18 16 6 N/A 0 0 366244 CASAVA_Build 8 115149981 1I ACATGCTACA -/C ATTCTACAAT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 C 0 1 366245 CASAVA_Build 8 115151172 4I21M1D ATTTGTAAAT ----ATGCATGCTGTTGATAAAAGGA/ATTCATGCGTGCTGTTGATAAAAGG- AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 37 20 21 4 N/A 0 0 366246 CASAVA_Build 8 115154790 5I TGCTATATCA -----/AAATG AAATGCTATA 3070 het 3070 ref 46 20 17 9 AAATG 1 2 366247 CASAVA_Build 8 115156546 1D ATAGCAACTG A/- AAAAAATAGT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 A 7 6 366248 CASAVA_Build 8 115157251 4I AGTGTATGAC ----/ACTA ACAGGAGACC 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 ACTA 0 1 366249 CASAVA_Build 8 115159517 1I CACCAATGAG -/A AAAAAAAAAG 2421 het 2421 ref 19 11 6 2 A 9 10 366250 CASAVA_Build 8 115160658 1I AGTAATTTAA -/G TTACGGAGGT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 G 0 1 366251 CASAVA_Build 8 115161461 1I CTCACTCTGT -/C CACCCAGGCT 3070 het 760 hom 19 3 8 8 C 1 2 366252 CASAVA_Build 8 115162493 4D TTAATAACAC CTTA/---- CTTAATATAT 3070 het 3070 ref 28 17 10 3 CTTA 2 1 366253 CASAVA_Build 8 115166714 5I GTACTTTGAA -----/AAAAT AGAGGATAGT 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 AAAAT 0 1 366254 CASAVA_Build 8 115168877 3I TCAAAGTTCT ---/ATG ATGTTTTTAC 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 ATG 1 2 366255 CASAVA_Build 8 115174859 4I AAGGAATCAC ----/AAAG AAAGAATAAA 3070 het 3070 ref 53 26 23 4 AAAG 1 2 366256 CASAVA_Build 8 115175714 1I TATCAGCTAG -/T CAATAATAAA 3070 het 3070 ref 32 18 13 1 T 0 1 366257 CASAVA_Build 8 115187818 1D AAAAATTTGA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 163 het 60 0 55 6 T 9 8 366258 CASAVA_Build 8 115189362 4I TAAGTATAAT ----/TATA TATTCAATAT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 TA 1 3 366259 CASAVA_Build 8 115192274 3D ACAATTTCCT TTG/--- TTATGTTCTC 3070 het 3070 ref 35 20 12 4 TTG 1 0 366260 CASAVA_Build 8 115197055 2D AGGCAGTCTC TT/-- TTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 T 8 6 366261 CASAVA_Build 8 115206324 1D CCCCTTTCCA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 22 10 11 1 T 9 8 366262 CASAVA_Build 8 115211353 1D TCATTTTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 17 15 9 A 10 9 366263 CASAVA_Build 8 115240755 4I TTCTGATGAA ----/AGTT AGTTAGAGAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AGTT 1 2 366264 CASAVA_Build 8 115266419 1I GGCCTAGGGA -/T TTATTTGCCA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 T 2 3 366265 CASAVA_Build 8 115275717 1I CTTAAACATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 A 11 12 366266 CASAVA_Build 8 115283875 1I TGAGGGAAGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 9 10 366267 CASAVA_Build 8 115286941 1I AATATAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 A 10 11 366268 CASAVA_Build 8 115287320 4D TATTTTTGTC TCTT/---- TTTTTAACTG 3070 het 3070 ref 31 18 12 2 TCTT 1 0 366269 CASAVA_Build 8 115287440 1I TCATTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 35 0 24 11 T 10 11 366270 CASAVA_Build 8 115290326 1I CTAGAGATAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 47 22 18 7 A 9 10 366271 CASAVA_Build 8 115293633 1I AGCACAGAAT -/G GAATGGGGGT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 G 1 2 366272 CASAVA_Build 8 115293819 5D TCTAGTGCTC TGCTT/----- TAAGCAAGAA 3070 hom 93 het 35 0 32 7 TGCTT 1 0 366273 CASAVA_Build 8 115298396 5I AAAAAATAAA -----/AGAAC AGACCCATCT 3070 hom 132 het 47 0 45 2 AGAAC 0 1 366274 CASAVA_Build 8 115301339 2I CACCATTAAA --/CT CTGCAAAATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 CT 1 2 366275 CASAVA_Build 8 115303521 1I TGCCTTCAAA -/T TTACTAGAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 2 3 366276 CASAVA_Build 8 115360857 1I ATTATAGATG -/T TCATTAATTG 3070 hom 172 het 62 0 57 5 T 1 2 366277 CASAVA_Build 8 115376027 1I GTAACTTAAA -/C CAACATCCAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 1 2 366278 CASAVA_Build 8 115379806 2D GCAAATTAAC AG/-- AGGAACAGAA 3070 hom 119 het 44 0 39 5 AG 2 1 366279 CASAVA_Build 8 115380117 1D GCTGTAGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 950 hom 40 6 25 9 A 12 11 366280 CASAVA_Build 8 115380235 4D TTGGCCTTGT TCTC/---- TCTAACTTCA 3070 hom 111 het 39 0 37 6 TC 3 1 366281 CASAVA_Build 8 115380996 4I TTCTCCTCTC ----/CTTT CTTCTAGTAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 CTTT 0 1 366282 CASAVA_Build 8 115385275 2I TTTTTACGTA --/TT TTTTTTTTTA 1159 hom 19 het 28 0 6 22 T 9 11 366283 CASAVA_Build 8 115394513 4I ATAGAGTAAG ----/TAGT TAGTGAATTT 3070 hom 132 het 51 0 45 6 TAGT 1 2 366284 CASAVA_Build 8 115395539 4D CAGGCAATGG AGTT/---- GCTGGGTTAA 3070 hom 120 het 43 0 40 3 AGTT 1 0 366285 CASAVA_Build 8 115396888 1D AATTTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 35 3 18 15 A 13 12 366286 CASAVA_Build 8 115403372 1I TTGAAAAAAA -/G AAAAGTAGTC 3070 hom 75 het 30 0 26 4 G 0 1 366287 CASAVA_Build 8 115404144 1D TTATTACTTT G/- ATATTTTGAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 0 366288 CASAVA_Build 8 115406362 1D GGGTGGGGGG A/- AGGGGGGAGG 3070 hom 32 het 14 0 11 3 A 2 1 366289 CASAVA_Build 8 115406496 1D AACTTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 2328 het 4 hom 18 0 7 11 A 19 18 366290 CASAVA_Build 8 115412451 1I ACAGAGAGGC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 141 het 54 0 48 6 T 6 7 366291 CASAVA_Build 8 115412803 6I ACTTACCTTG ------/CTTTAC CTTTCAGCCA 3070 hom 151 het 57 0 51 6 CTTTAC 0 1 366292 CASAVA_Build 8 115418269 1D AGTACTATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 11 10 366293 CASAVA_Build 8 115420233 1I AAACTCATTG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 7 8 366294 CASAVA_Build 8 115422209 1I ACATAGAGCA -/G GGGTGCCTCC 3070 hom 144 het 55 0 49 6 G 3 4 366295 CASAVA_Build 8 115424118 5I AAAGTGTGAA -----/TGAGT TAACTAAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TGAGT 0 1 366296 CASAVA_Build 8 115427555 1I GGTAGAAACC -/A AAAAAAGGTC 3070 het 327 hom 37 1 33 3 A 6 7 366297 CASAVA_Build 8 115441532 1D TAATACAATG A/- AAAAAGAAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 6 5 366298 CASAVA_Build 8 115445137 7D ATAGCATTCC CACTATG/------- CACTATGGTA 3070 hom 114 het 41 0 39 3 CACTATG 2 1 366299 CASAVA_Build 8 115447510 1D30M1I TGACACAAAT AAAAATGGAAATACAATATTCCAAAACCTAC-/-AAAATGGAAATACAATATTCCAAAACCTACG GGATACAGCA 3070 hom 75 het 27 0 26 9 N/A 0 0 366300 CASAVA_Build 8 115447736 3I ATATGAAGAA ---/AAC AATAAAAATC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 AAC 0 1 366301 CASAVA_Build 8 115449560 1I AAAGACAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 96 het 38 0 34 4 A 8 9 366302 CASAVA_Build 8 115450229 1D ACTCCATAGG A/- AAAAAATCTA 3070 hom 93 het 37 0 31 6 A 7 6 366303 CASAVA_Build 8 115451522 1I TTGACCCAGC -/A AATCCCATTA 3070 hom 138 het 54 0 47 7 A 2 3 366304 CASAVA_Build 8 115463048 1I TAAATGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 11 12 366305 CASAVA_Build 8 115465510 1I CACATGGAAA -/C ACCTGGCCTC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 0 1 366306 CASAVA_Build 8 115469340 1I AAAGCTTATG -/A AAAAATATAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 5 6 366307 CASAVA_Build 8 115470861 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 8 7 366308 CASAVA_Build 8 115471636 1I GTTGTTTCAA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 241 hom 28 1 25 2 T 8 9 366309 CASAVA_Build 8 115475036 1D GTAATTGACC A/- AAAAAATACG 3070 hom 123 het 45 0 42 4 A 7 6 366310 CASAVA_Build 8 115477419 4D TTGTTTTTTG GTTT/---- GTTTGTTTGT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 GTTT 4 3 366311 CASAVA_Build 8 115479638 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 22 1 14 7 T 15 14 366312 CASAVA_Build 8 115480483 1I TCAAAGAACT -/A AATTTTGGTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 2 3 366313 CASAVA_Build 8 115493397 1D GGCCTGTGAC T/- GAGCCTACCT 3070 hom 109 het 42 0 32 10 T 1 0 366314 CASAVA_Build 8 115495389 2I AACTTTCTAA --/AT ATCTTTCTAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 AT 1 2 366315 CASAVA_Build 8 115495978 1I TGGAAACATA -/C CCTGCATCAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 2 3 366316 CASAVA_Build 8 115508336 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 105 het 39 0 34 6 AC 7 6 366317 CASAVA_Build 8 115536066 9I GTGGTAATCT ---------/GTAGAATTA GTAGAATTAC 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 GTAGAATTA 1 2 366318 CASAVA_Build 8 115541296 1D GTGGTTAGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 38 het 33 1 27 5 T 10 9 366319 CASAVA_Build 8 115544592 4D TCTCATTTCT TGAA/---- TATTTTGAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 TGAA 1 0 366320 CASAVA_Build 8 115545423 1D TTTTTCCAAG A/- AACTTTTCTT 3070 het 1965 hom 20 4 14 2 A 3 2 366321 CASAVA_Build 8 115548781 2D TTTTTACTTA TG/-- TGGAAATTTA 3070 het 3070 hom 42 18 21 6 TG 2 1 366322 CASAVA_Build 8 115549683 1I AAAAATAAAA -/G TCTAGTCAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 G 0 1 366323 CASAVA_Build 8 115556905 1I ATGTAACAAT -/A AAAAAGCCCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 5 6 366324 CASAVA_Build 8 115564738 1D GTGGGGAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1448 hom 34 5 22 8 T 14 13 366325 CASAVA_Build 8 115568282 1D TCACTTCTGC T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 41 15 20 7 T 7 6 366326 CASAVA_Build 8 115569228 1I CTACTCAAAG -/A AAAAGCAGTC 3070 hom 126 het 44 0 43 1 A 4 5 366327 CASAVA_Build 8 115570450 3I ACTTGTATAA ---/ATG ATGATAATAT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ATG 1 2 366328 CASAVA_Build 8 115595094 1D TAGAATGGTT A/- AAAATTCAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 6 A 5 4 366329 CASAVA_Build 8 115603330 2D CCATATACTT TC/-- TGTCTTATAT 2244 het 2244 ref 28 13 6 12 TC 1 0 366330 CASAVA_Build 8 115605967 1I ATAGTGTTAT -/G TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 0 1 366331 CASAVA_Build 8 115607283 1I GTCACTTAGT -/A GCCATCTCAG 3070 het 3070 hom 19 9 10 0 A 0 1 366332 CASAVA_Build 8 115609196 1I TTTATATTAA -/T TTTCCAAAAT 3070 het 3070 hom 41 15 24 2 T 3 4 366333 CASAVA_Build 8 115612302 1D TATAGATAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 11 11 T 11 10 366334 CASAVA_Build 8 115615995 1I ATACAATGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 T 11 12 366335 CASAVA_Build 8 115620700 1I CAATAGTAAG -/A AAAAAAAACA 2403 het 2403 ref 32 16 6 10 A 8 9 366336 CASAVA_Build 8 115622181 2I ATATGGAGAC --/AG AAAGTTCATT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 AG 0 1 366337 CASAVA_Build 8 115626766 2D AACTAATTGC AT/-- ATATATATAT 3070 het 1876 hom 24 4 16 4 AT 6 5 366338 CASAVA_Build 8 115631194 1I TTCACTGGGC -/T TTTATCTAAC 3070 het 3070 hom 38 9 24 5 T 3 4 366339 CASAVA_Build 8 115640002 2I TTAATAGTAC --/AT CTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 AT 0 1 366340 CASAVA_Build 8 115672990 1D CTTTCCTATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 17 12 T 15 14 366341 CASAVA_Build 8 115683055 1D CCAGAGAAAT A/- AAAAATTATA 3070 het 3070 ref 29 14 15 2 A 6 5 366342 CASAVA_Build 8 115703953 4I CTAGAAACTA ----/TTTC TTTTTACTGG 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 TTTC 0 1 366343 CASAVA_Build 8 115706904 1I AGTCCTGGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 9 10 366344 CASAVA_Build 8 115779001 1D GGTCAACATT A/- AGAAAAATGT 3070 het 3070 hom 55 22 25 9 A 2 1 366345 CASAVA_Build 8 115797418 1I TAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 A 9 10 366346 CASAVA_Build 8 115809523 1I ATATCCCAGT -/A AAAAAAAAAA 2526 het 2526 ref 28 14 6 8 A 10 11 366347 CASAVA_Build 8 115818144 1I TCATCAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2473 hom 24 6 11 7 T 11 12 366348 CASAVA_Build 8 115827312 2D ATAGAAAAAC AG/-- AGGAAGGAAG 3070 het 3070 hom 28 11 11 8 AG 2 1 366349 CASAVA_Build 8 115835000 1D TTTTAGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 T 12 11 366350 CASAVA_Build 8 115842757 1D TCAAGAACAG T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 8 7 366351 CASAVA_Build 8 115848411 1D TCTCTGTAAG A/- AGAGCAAGTC 3070 het 3070 hom 50 22 23 6 A 2 1 366352 CASAVA_Build 8 115852909 2D ATATATATGC AT/-- ATATATATAT 1323 het 1323 ref 25 18 3 4 AT 7 6 366353 CASAVA_Build 8 115861103 2D CCATTGTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 9 10 7 A 16 14 366354 CASAVA_Build 8 115863887 1D AGGCAGGCAG A/- TCATGAGGTC 3070 het 3003 hom 18 8 10 0 A 1 0 366355 CASAVA_Build 8 115864352 1D TTGGAATGAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 12 20 7 T 9 8 366356 CASAVA_Build 8 115864577 1D GAGGTTTTCA T/- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 10 T 7 6 366357 CASAVA_Build 8 115867124 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 422 het 214 hom 10 2 4 4 T 15 14 366358 CASAVA_Build 8 115867706 2D ACTTGTGTTT TC/-- TCATTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 TC 2 1 366359 CASAVA_Build 8 115870713 1I ATGATTTTAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 8 9 366360 CASAVA_Build 8 115879820 2I TACCCTTCCT --/AA AGTCAGAAAT 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 A 1 3 366361 CASAVA_Build 8 115912808 6I CTTAAAAGAA ------/ATAATT ATAGTTTTAC 3070 het 3070 hom 42 17 21 4 ATAATT 0 1 366362 CASAVA_Build 8 115918215 1I ACCAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 19 7 A 10 11 366363 CASAVA_Build 8 115936418 1D TTTAAAAAAA T/- AAATTTAAGA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 1 0 366364 CASAVA_Build 8 115945262 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2923 het 2923 ref 44 24 9 11 A 17 16 366365 CASAVA_Build 8 115957207 1D GCGCGCCACC A/- ATGCCCGGCT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 2 1 366366 CASAVA_Build 8 115967922 1I CTAAAAATAG -/A AAAAAAAAAA 714 het 3 hom 9 0 5 4 A 15 16 366367 CASAVA_Build 8 116001699 1I CACAGAAACC -/A AAAAAAAAAA 1234 het 1234 ref 49 36 3 10 A 10 11 366368 CASAVA_Build 8 116050666 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1891 het 1891 ref 33 14 7 13 A 17 16 366369 CASAVA_Build 8 116081821 1I GATTATTGCC -/A AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 8 9 366370 CASAVA_Build 8 116084478 1D ATTTCCATAT A/- AAAAATAATG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 6 5 366371 CASAVA_Build 8 116109157 4D GTGTTCTGTG AAAT/---- AAATACTTTC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 AAAT 2 1 366372 CASAVA_Build 8 116113850 3D GATCACTGTA CTT/--- CTGTTTTTGC 3070 hom 138 het 52 0 46 7 CTT 1 0 366373 CASAVA_Build 8 116120038 1I CTTGTATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 T 12 13 366374 CASAVA_Build 8 116152497 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 87 het 40 0 30 11 AC 10 9 366375 CASAVA_Build 8 116167184 3I ATGAAATGCA ---/AAG AAGATCTCAT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 AAG 1 2 366376 CASAVA_Build 8 116199573 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 A 11 10 366377 CASAVA_Build 8 116248026 2I AATTAAAACC --/AG AGAGGGCAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 AG 2 3 366378 CASAVA_Build 8 116249463 1I AAATCAATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 10 11 366379 CASAVA_Build 8 116251316 1I TATTACATGG -/A AAAATTCCAG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 A 4 5 366380 CASAVA_Build 8 116272538 1D TAACTTGCCC T/- TTTTTTTTTT 1821 het 1821 ref 38 26 5 7 T 13 12 366381 CASAVA_Build 8 116275471 1I CACAGCCTAG -/T AAGGTTATGT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 1 366382 CASAVA_Build 8 116280739 4D CACTGCTTGA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TTTG 4 3 366383 CASAVA_Build 8 116283764 1I CCAGGCATGC -/T TTTTTGAAAT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 5 6 366384 CASAVA_Build 8 116285441 1D CTGAAAGGTT G/- GGAACCCCAA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 G 3 2 366385 CASAVA_Build 8 116335310 1I CTCCATTTCC -/A AAAAAAAAAA 2290 het 2290 ref 28 13 7 8 A 10 11 366386 CASAVA_Build 8 116341804 1D ATTTGTTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 T 10 9 366387 CASAVA_Build 8 116343679 2D TAATATACTC AT/-- AATATTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 AT 1 0 366388 CASAVA_Build 8 116345265 1D72M1D GGAGGAGGAA TTAAAAAAAGATAGTTAATAAGCATAGATACCCTGAGGGGAGAAATAGCATGACTTATTTGTGAAATTTGGAGA/-TAAAAAAAGATAGTTAATAAGCATAGATACCCTGAGGGGAGAAATAGCATGACTTATTTGTGAAATTTGGAG- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 34 17 11 N/A 0 0 366389 CASAVA_Build 8 116360796 1I TTGAAAAACA -/C TATAGACCAA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 C 0 1 366390 CASAVA_Build 8 116361309 1D TGGAGAATAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 35 15 19 1 A 8 7 366391 CASAVA_Build 8 116377493 1I TGGCTCATTA -/C CCATGAGAAC 3070 hom 123 het 48 0 42 6 C 2 3 366392 CASAVA_Build 8 116433631 9D TTTCTTTTTC TTTCTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TTTCTTTTT 1 0 366393 CASAVA_Build 8 116480500 1I GGGGAGGGAT -/A GCATTAGGAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 A 0 1 366394 CASAVA_Build 8 116480622 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 1123 het 1123 ref 21 13 4 4 A 17 16 366395 CASAVA_Build 8 116481690 1I CTTTTTCAGA -/T TCTTCTATAT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 T 1 2 366396 CASAVA_Build 8 116483708 2D ATTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 T 13 11 366397 CASAVA_Build 8 116489565 1D22M1I7M1I4M1I TGATACTCAA CTGAATGTTTTTGAAATAAACAC-ATTTTTA-TGTT-/-TGAATGTTTTTGAAATAAACACAATTTTTATTGTTA ATCTCTCTGG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 N/A 0 0 366398 CASAVA_Build 8 116491324 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3011 het 531 hom 32 5 13 14 T 13 14 366399 CASAVA_Build 8 116493447 1I GCAAAAAAAA -/C ATCAGCGTTG 3070 hom 4 het 40 1 33 6 C 0 1 366400 CASAVA_Build 8 116502614 1D GTCTCAAACT C/- CCAATCTCAA 1535 het 1535 ref 13 8 5 0 C 3 2 366401 CASAVA_Build 8 116513625 1D AATGACACTT C/- AAGGACCCAG 3070 hom 57 het 21 0 20 8 C 1 0 366402 CASAVA_Build 8 116515476 1I20M1I6M1I16M1I ATGCAAAAGG -CCATACGCTGCATGATAATT-AGCCCA-GGATATCCATTCAGAC-/CCCATACGCTGCATGATAATTAAGCCCAGGGATATCCATTCAGACT TACCTTGGTG 3070 hom 99 het 23 0 34 6 N/A 0 0 366403 CASAVA_Build 8 116538723 1I AACATGGATG -/A ACCTTGAGGA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 A 1 2 366404 CASAVA_Build 8 116545485 1D TGTTTATTAT A/- AAAAAACAAA 3070 hom 93 het 34 0 31 4 A 7 6 366405 CASAVA_Build 8 116556670 22D GAATCACAGT TATATATATATATATATATATA/---------------------- TATATATATA 3070 hom 54 het 22 0 19 6 TA 19 8 366406 CASAVA_Build 8 116568660 1I TACTTCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 645 hom 36 2 21 13 A 11 12 366407 CASAVA_Build 8 116568801 1D AGCCTGTGGA C/- CCCAGGAGTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 4 3 366408 CASAVA_Build 8 116577092 1D ATCATCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 32 0 28 4 A 11 10 366409 CASAVA_Build 8 116582409 1I8M1I AGGTAATTTA -TTCATCTT-/TTTCATCTTG GGTTTCGGGG 1081 hom 5 het 27 0 4 28 N/A 0 0 366410 CASAVA_Build 8 116587354 1I GTAGAAGGGG -/A AAAACTTCAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 4 5 366411 CASAVA_Build 8 116595107 1D TTTACTATAG A/- AAAAGGTTTG 3070 hom 135 het 52 0 45 7 A 5 4 366412 CASAVA_Build 8 116596999 1D AAAAATTTTT G/- GTAATTGTAA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 G 2 1 366413 CASAVA_Build 8 116597528 1I66M1I GCAATGAATA -CTCTTATTACCAATGTGTTAACAATGTTACTTTAAGACCAATTTTTAAGAAAATTATCACCGTAGG-/CCTCTTATTACCAATGTGTTAACAATGTTACTTTAAGACCAATTTTTAAGAAAATTATCACCGTAGGT TTTTAAAAGA 3070 hom 141 het 31 0 48 5 N/A 0 0 366414 CASAVA_Build 8 116597672 1I10M1I8M1I3M1I TTGTACAAAT -AGCAAATGAA-CTAAAGTA-TCG-/AAGCAAATGAACCTAAAGTATTCGT TAATGAGTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 4 N/A 0 0 366415 CASAVA_Build 8 116598978 1I TGAAAAGAAG -/T TCCTATGATT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 1 2 366416 CASAVA_Build 8 116599379 1I26M1I21M1I4M1I8M1I ATCCAGTAGA -TGTTCAGCAAGCCGCTCTGGTGTAGG-AAGGCTTCCAAACATCCACCA-GTGT-AGGACAGG-/TTGTTCAGCAAGCCGCTCTGGTGTAGGAAAGGCTTCCAAACATCCACCAGGTGTAAGGACAGGA AAATGAAGGG 3070 hom 33 het 15 0 12 3 N/A 0 0 366417 CASAVA_Build 8 116599469 6I10M1I6M1I5M1I6M1I5M1I ATCCAGAGAA ------TTTCAACATG-CCAGCA-TACAC-ATTCTT-GTAGT-/GAAACTTTCCAACATGCCCAGCACTACACAATTCTTGGTAGTA AAAGAGCAAC 3070 hom 30 het 8 0 10 4 N/A 0 0 366418 CASAVA_Build 8 116601035 1D GTCAGAAAAT A/- ACAGGATACA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 2 1 366419 CASAVA_Build 8 116602127 1D8M1D TTAATTAAAG TTCTTAGACT/-TCTTAGAC- TCTGTGAAGT 3070 hom 126 het 42 0 43 4 N/A 0 0 366420 CASAVA_Build 8 116602561 1D TGTGTTACTA T/- TTTCTGGTTC 3070 hom 120 het 45 0 41 4 T 4 3 366421 CASAVA_Build 8 116602890 1D GCTCTCTGTG T/- TTTCTGTGTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 4 3 366422 CASAVA_Build 8 116661034 1D TAATGGTAGC A/- AAAATTATAA 3070 hom 72 het 31 0 25 8 A 5 4 366423 CASAVA_Build 8 116672364 1D AACCATGACC A/- AAAAAAAAAA 1419 het 1419 ref 45 33 5 7 A 12 11 366424 CASAVA_Build 8 116674203 1I TGTGATAATT -/C TTTTATTTCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 C 0 1 366425 CASAVA_Build 8 116676015 1I10M1I6M1I AACCTCTGTG -AAAAATGTTA-TTCTTA-/AAAAAATGTTATTTCTTAT TCTACTTTAT 3070 hom 127 het 43 0 43 5 N/A 0 0 366426 CASAVA_Build 8 116682939 1I GATTAGAGAT -/A AACTACTCAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 2 3 366427 CASAVA_Build 8 116687362 1I11M1D AAATTCAGAG -TTAAAATAGAGT/TTTAAAATAGAG- TTTTTGAATG 3070 hom 75 het 26 0 26 4 N/A 0 0 366428 CASAVA_Build 8 116693558 1I AAAAGAACAG -/A AAAAAGAGGC 3070 hom 81 het 33 0 26 7 A 5 6 366429 CASAVA_Build 8 116723645 1I AAAAGAACAC -/A TGTGTGTATA 3070 hom 51 het 23 0 22 2 A 0 1 366430 CASAVA_Build 8 116723720 1I CGATATGAAT -/A CCAACAGAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 0 1 366431 CASAVA_Build 8 116727003 1I GAGGAAGAGG -/A AAAAATTTCA 3070 hom 78 het 31 0 27 4 A 5 6 366432 CASAVA_Build 8 116729684 1I AGGCAGCGCT -/G GGAGAGGGAG 3070 hom 41 het 16 0 12 4 G 2 3 366433 CASAVA_Build 8 116735642 1I AGTTGAGAAA -/T TTTAAAAGAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 3 4 366434 CASAVA_Build 8 116750119 6D TTATTAAAAA AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 1812 hom 15 het 8 0 5 3 AG 12 9 366435 CASAVA_Build 8 116770524 1I TGTATTTTCA -/T TTACTTCCAC 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 2 3 366436 CASAVA_Build 8 116772106 1D9M1D15M3D5M1D CAAATCAGAT AAAAATACCACCTCTATATATATATAGGGTCCGTC/-AAAATATCA-CTATATATATATATA---TTCAT- CATTAAGCTG 3070 hom 33 het 14 0 12 8 N/A 0 0 366437 CASAVA_Build 8 116781011 1D AACTCAACTT A/- AAATTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 4 3 366438 CASAVA_Build 8 116782036 3D13M1D5M2I24M1I CATTTGTGGG TTTTTTTTTTTCAAGTACAATG--TGAGTATTTAGCTTTGCCTTTTAG-/---TTTTTTTTCAAGT-CAATGGTTAAGTATTTAGCTTTGCCTTTAAGA AAAGAAACTC 3070 hom 93 het 28 0 32 5 N/A 0 0 366439 CASAVA_Build 8 116782968 1D TGGGAGGCAA T/- TTGGCAGTCC 3070 hom 93 het 34 0 32 2 T 3 2 366440 CASAVA_Build 8 116797066 1D TTATCAACCA T/- AAAATTTAAT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 T 1 0 366441 CASAVA_Build 8 116799891 1I CCATACAGGC -/T TCCAAAGTAG 3070 hom 138 het 54 0 45 9 T 1 2 366442 CASAVA_Build 8 116815165 1I TCACACACAC -/T AGATCGTTTG 3070 hom 157 het 58 0 53 5 T 0 1 366443 CASAVA_Build 8 116816488 4I TTTCTTCCTT ----/TCTC TCTCTTTCTC 3070 hom 57 het 22 0 19 3 TC 2 4 366444 CASAVA_Build 8 116822928 1I AAAAAATAAA -/T TTTTTTTACA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 7 8 366445 CASAVA_Build 8 116849028 1D GAAACTGATC T/- TTTTTTTTTT 1738 het 1738 ref 31 11 8 13 T 19 18 366446 CASAVA_Build 8 116854745 1D TAACCTTTGC T/- TTTCTGGAAT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 4 3 366447 CASAVA_Build 8 116855316 1I AGGCATTCTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 T 8 9 366448 CASAVA_Build 8 116861773 4D TATATGTGTT TGTG/---- TGTGTGTGTG 3070 hom 63 het 29 0 22 8 TG 11 9 366449 CASAVA_Build 8 116862589 1D ACATTATGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 832 hom 27 3 17 7 A 14 13 366450 CASAVA_Build 8 116864132 5D TTATTGAAGA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 58 het 22 0 20 4 AAAAC 3 2 366451 CASAVA_Build 8 116866993 1I TGAGCAAATT -/A AAAAAAAATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 8 9 366452 CASAVA_Build 8 116874055 1D TCTTATACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 26 0 20 6 A 12 11 366453 CASAVA_Build 8 116877333 1D TTTATACGCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 212 hom 32 1 28 3 T 10 9 366454 CASAVA_Build 8 116881761 3I AAGCTTGTAT ---/GAA GAATATATAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 GAA 1 2 366455 CASAVA_Build 8 116884576 2I ACTGAAAATA --/AC AGTCAGAGCA 3070 hom 135 het 47 0 46 1 AC 0 1 366456 CASAVA_Build 8 116888066 7D34M5D11M5D GACAGAAAGA AAGAAAGAAGAAGAAAAGAAGGAAGAAAGAAAAAGAAAGGGAGGAAAGGAAGGAAGGAAAGA/-------AAGAAGAAAAGAAGGAAGAAAGAAAAAGAAAGGG-----AGGAAGGAAGG----- AAGGAAGGAA 3070 hom 39 het 12 0 14 5 N/A 0 0 366457 CASAVA_Build 8 116888200 2D AAGAGAAAAG AA/-- AAAAAAAAGG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 10 8 366458 CASAVA_Build 8 116893305 1I AAACCTGATT -/A AAAAAAATGA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 7 8 366459 CASAVA_Build 8 116898878 2I CTCTTGTATT --/CC CCCCCACCTT 3070 hom 27 het 12 0 10 2 C 5 7 366460 CASAVA_Build 8 116903632 1I GGTTAGCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 T 10 11 366461 CASAVA_Build 8 116905446 2I TTCTTATGCT --/TG TCTCTCCTCT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 TG 0 1 366462 CASAVA_Build 8 116907438 4I ATCTGGAGAC ----/TCTT TATTTATTTT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TCTT 0 1 366463 CASAVA_Build 8 116910413 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 12 hom 32 2 25 6 A 13 11 366464 CASAVA_Build 8 116927709 1D TGCTCTACCC T/- TTTTCCTAAT 3070 hom 129 het 53 0 43 10 T 5 4 366465 CASAVA_Build 8 116929230 1I TTTTTTAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 832 hom 29 3 24 2 T 10 11 366466 CASAVA_Build 8 116940859 1I TCTTTCCATG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 39 0 32 7 T 10 11 366467 CASAVA_Build 8 116952771 1D AGAGTAAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 10 9 366468 CASAVA_Build 8 116961354 1D TAGAAGTTAG T/- TCAGTCTTGG 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 2 1 366469 CASAVA_Build 8 116968595 1I ATTGATGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 38 1 31 6 T 10 11 366470 CASAVA_Build 8 116970329 1D TCCAGCAAAA T/- TTTTAAATGT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 5 4 366471 CASAVA_Build 8 116971569 1D3M1D ACTGGCACAG TTAGA/-TAG- AATTCAAACA 3070 hom 144 het 53 0 49 5 N/A 0 0 366472 CASAVA_Build 8 116977466 1I GTCTTCTAGA -/T TTGTAACATT 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 2 3 366473 CASAVA_Build 8 116990357 3D TTCACCTGAA TTG/--- TTGTAGTAGT 3070 het 3070 hom 46 15 24 7 TTG 2 1 366474 CASAVA_Build 8 117008249 1I CAAAAAAAGT -/A AAAAAAATAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 7 8 366475 CASAVA_Build 8 117022821 2D GCTGGGCTGT AG/-- ATTGGCCACT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 AG 1 0 366476 CASAVA_Build 8 117024080 1I TTATTCTATA -/T TTTTCTTATT 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 4 5 366477 CASAVA_Build 8 117043746 1I GTAAGTTTCA -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 T 8 9 366478 CASAVA_Build 8 117052243 2D GTCAAGGAGA TC/-- TCTCTTTTTC 3070 hom 62 het 31 0 22 10 TC 3 2 366479 CASAVA_Build 8 117073888 1D CATTGCCCAC A/- GGAGAAATAA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 0 366480 CASAVA_Build 8 117081867 1I TACTTAAATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 417 hom 32 1 29 2 A 11 12 366481 CASAVA_Build 8 117082201 1D TAACAGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 32 0 26 7 A 11 10 366482 CASAVA_Build 8 117084546 1I AAGACTGGAG -/A AAAAAAGCAT 3070 hom 81 het 34 0 31 3 A 6 7 366483 CASAVA_Build 8 117084629 2I AGAGAGTAAC --/AG AAAAAATATA 3070 hom 90 het 39 0 31 8 AG 0 1 366484 CASAVA_Build 8 117104365 1D ATTTTGTTCT C/- CTTTCTCCTG 3070 hom 102 het 41 0 35 7 C 2 1 366485 CASAVA_Build 8 117105477 1D AGTATCATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 A 10 9 366486 CASAVA_Build 8 117119194 4D CCCTCTCACA ATAG/---- ATAGATACAA 3070 hom 81 het 38 0 25 15 ATAG 2 1 366487 CASAVA_Build 8 117120904 3I GTATACAAAA ---/GAT GATAAGGCCT 3070 hom 123 het 44 0 42 2 GAT 1 2 366488 CASAVA_Build 8 117121728 7I AGACTTGAAA -------/ACTTCTG ACTTCTGGTA 3070 hom 106 het 39 0 35 4 ACTTCTG 1 2 366489 CASAVA_Build 8 117144384 1I CTCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 797 hom 27 2 22 3 C 0 1 366490 CASAVA_Build 8 117153740 5D GAAAAGAAAG GAAAA/----- GAAAAGAAAA 2354 het 166 hom 31 2 16 17 GAAAA 5 4 366491 CASAVA_Build 8 117162722 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 465 hom 29 3 21 5 T 13 12 366492 CASAVA_Build 8 117168140 1D TCAGGGACTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 27 het 20 0 10 10 T 10 9 366493 CASAVA_Build 8 117168750 2D TAATATACGG AT/-- ATATATATAT 3070 hom 72 het 39 0 25 14 AT 9 8 366494 CASAVA_Build 8 117191281 1D AATGAAAACT A/- AAAAAAAAAA 1370 het 1370 ref 38 27 3 8 A 13 12 366495 CASAVA_Build 8 117199511 5D TTTCAGCACA TATCT/----- TAAACTGAAC 3070 hom 129 het 46 0 44 4 TATCT 1 0 366496 CASAVA_Build 8 117209577 1I CTAAGAAGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 T 9 10 366497 CASAVA_Build 8 117217549 1I AAAAAAAAAA -/G AAGAAGAAGA 1650 het 725 hom 20 5 7 8 G 0 1 366498 CASAVA_Build 8 117218747 1I ACAAAGCTTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 24 18 3 A 9 10 366499 CASAVA_Build 8 117219607 1D AAGATTAGGG T/- TTTTTTTTTT 1018 het 1018 ref 44 26 3 15 T 12 11 366500 CASAVA_Build 8 117231206 1I TATTAGAACC -/T TTTTTTTAAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 7 8 366501 CASAVA_Build 8 117233105 1D AAATCCATAG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 10 9 366502 CASAVA_Build 8 117246641 1I GATACATCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 T 11 12 366503 CASAVA_Build 8 117257998 5I GGAAGGAAGG -----/AAGGA AGTCAGTCAA 3070 het 3070 ref 29 16 9 4 AAGGA 0 1 366504 CASAVA_Build 8 117258108 1I35M1D11M1D TGCCAAACAT -AAGCCATGATTGCTTTTTTTTTTTTTTCCTTGGCATTTTGGCTCTTGT/AAAGCCATGATTACTATTTGTATTTAGTCAGTGGCA-TTTGCCACTTG- TTTACCAATC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 N/A 0 0 366505 CASAVA_Build 8 117259089 1I TTTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 17 5 A 11 12 366506 CASAVA_Build 8 117297481 1D CCCCCTTATC T/- TTTTTTTTTT 1378 het 869 hom 23 8 6 10 T 17 16 366507 CASAVA_Build 8 117326729 1D30M1D GCAGACAAAC TTTTTGCTGTTGTTTTTATTAGGATCTGTAAG/-TTTTGCTGTTGTTTTTATTAGGATCTGTAA- GGGAGGGAGA 3070 hom 42 het 19 0 15 14 N/A 0 0 366508 CASAVA_Build 8 117330941 1I AAGGAGGTAT -/A AAGAGAAAGC 3070 hom 87 het 33 0 28 5 A 2 3 366509 CASAVA_Build 8 117332417 1D13M1D26M1I GGGCTGGAAA TTTTACCAGTAAACAAAACAAAGTCATGGAGTTTACATCCT-/-TATAGCAGTAAAC-AAACAAAGTCATGGAGTTTACATCCTA ATTAGGTGTG 3070 hom 57 het 17 0 18 3 N/A 0 0 366510 CASAVA_Build 8 117333904 1I4M1I AAGTAGAAGG -AATA-/AAATAT TGTGAAATCG 2322 hom 21 het 15 0 7 8 N/A 0 0 366511 CASAVA_Build 8 117333933 1I23M1I19M1I22M1I AATTCTAGAT -TATTTTGATGACAGAAAAAATGG-ATTTGCTAATAGAGTGGAT-CCCGATATCAGAGGAGGAGTGG-/ATATTTTGATGACAGAAAAAATGGAATTTGCTAATAGAGTGGATATCAGATATAAGAGGAGGAGTGGA ATTCAGGATT 3070 hom 24 het 17 0 9 23 N/A 0 0 366512 CASAVA_Build 8 117361117 1I CTAGGGCCTC -/A AAAATAGGGA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 4 5 366513 CASAVA_Build 8 117367350 1D29M1D47M1D ACTAACCTGT AAGTAAGCACTGGCTATAAGTCCAGCCCTTAAATATTGTTTGGGTTAATAACGGCTGAGGTTTATTGAGCGTTGGCTGA/-AGTAAGCACTGGCTATAAGTCCAGCCCTT-AATATTGTTTGGGTTAATAACGGCTGAGGTTTATTGAGCGTTGGCTG- AAAAAGTTCC 3070 hom 148 het 28 0 50 5 N/A 0 0 366514 CASAVA_Build 8 117375238 1D16M1D40M1D TTTAGAATGG TTTTCTTTCTGATTATTAAACAGATTTTGCATTAATTAAACATGTCAACTGAGAGGTTA/-TTTCTTTCTGATTATT-AACAGATTTTGCATTAATTAAACATGTCAACTGAGAGGTT- ACTATGGTGT 3070 hom 157 het 41 0 53 8 N/A 0 0 366515 CASAVA_Build 8 117432463 1D GCACCATTCT C/- CCCCCACCCA 3070 hom 108 het 38 0 36 3 C 6 5 366516 CASAVA_Build 8 117521187 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 267 hom 37 1 28 8 T 10 11 366517 CASAVA_Build 8 117535039 1D AAGACGGTAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 77 het 31 0 26 5 T 10 9 366518 CASAVA_Build 8 117535513 1I AAAAAAAAAA -/T TTTAAATGGT 3070 het 353 hom 30 1 20 9 T 3 4 366519 CASAVA_Build 8 117553065 1I GCATAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 299 hom 37 1 27 9 A 10 11 366520 CASAVA_Build 8 117554089 1I AAACCCTGCT -/C CACTGATGAT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 C 1 2 366521 CASAVA_Build 8 117557318 3I TGCTATGTTT ---/CCA CCACATAATC 3070 hom 93 het 33 0 31 2 CCA 1 2 366522 CASAVA_Build 8 117562901 4I GAGCTTTCTT ----/TATC TAGAATCTTC 3070 hom 120 het 53 0 40 13 TATC 0 1 366523 CASAVA_Build 8 117565978 2D GACCCCACTC TT/-- TGGCTAATAC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 T 3 1 366524 CASAVA_Build 8 117586296 1I AATAGCAGCA -/T TCATGTAATG 3070 hom 129 het 46 0 44 2 T 1 2 366525 CASAVA_Build 8 117641641 1I AGCATGACCA -/T TTTTTTTCCA 3070 het 376 hom 34 1 30 3 T 7 8 366526 CASAVA_Build 8 117658518 1D CCACTGTGTA G/- GGGGCTGTGC 3070 hom 82 het 35 0 27 8 G 5 4 366527 CASAVA_Build 8 117660483 2I TACAATCATG --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 102 het 40 0 35 5 A 10 12 366528 CASAVA_Build 8 117680598 1D TAGGATGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 417 hom 39 1 29 9 T 11 10 366529 CASAVA_Build 8 117699224 1I AATTTAGAGA -/T TTTTTTTTTT 2378 het 2378 ref 41 21 8 12 T 15 16 366530 CASAVA_Build 8 117714677 1D AAATTGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 20 19 8 T 11 10 366531 CASAVA_Build 8 117716192 1D AAAATACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 26 0 21 5 A 12 11 366532 CASAVA_Build 8 117717153 1D CTTTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2328 het 1175 hom 20 6 7 7 A 15 14 366533 CASAVA_Build 8 117719716 2I AGTTCCTCTC --/TT GTTCTAAAGT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 0 2 366534 CASAVA_Build 8 117720373 9I ATATTGCATA ---------/AATAGGAAG ATATCTTGAA 3070 het 3070 ref 54 25 24 5 AATAGGAAG 0 1 366535 CASAVA_Build 8 117721162 2I AATTAAAATC --/TT TGTGACTGTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 T 1 3 366536 CASAVA_Build 8 117722002 2I TGAGTCAATG --/AA AAGATTGAAA 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 A 2 4 366537 CASAVA_Build 8 117748885 1I ACAACTTCAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 14 15 366538 CASAVA_Build 8 117756530 1D TATAAAAAAA T/- CTCTTTGTAT 3070 het 3019 hom 24 8 14 2 T 1 0 366539 CASAVA_Build 8 117770153 4I CTTCATAATT ----/ATTA ATTAAGTTGT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 ATTA 1 2 366540 CASAVA_Build 8 117781214 2I TGACAGTGCA --/GG GGTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 G 2 4 366541 CASAVA_Build 8 117786254 1D ATTTCAAGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 9 8 366542 CASAVA_Build 8 117793376 2D AAGTGCCCAG CA/-- CACAGTTTCC 3070 het 3070 hom 30 14 12 5 CA 3 2 366543 CASAVA_Build 8 117801210 1I CATGTATAAG -/A AAAATGACAA 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 4 5 366544 CASAVA_Build 8 117804846 1D AGCATAGCCA G/- GTTAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 G 2 1 366545 CASAVA_Build 8 117809710 1D AGGTACTGTT A/- ATACTCATTT 3070 het 3070 ref 48 24 20 5 A 2 1 366546 CASAVA_Build 8 117814075 8D TTTCATTCCC TCATTCAT/-------- TCATTCATTC 3070 het 3070 hom 47 16 18 16 TCAT 6 4 366547 CASAVA_Build 8 117818717 1D CCTGGGGAAG A/- AAAAAAAAAG 2781 het 2781 ref 24 11 7 6 A 10 9 366548 CASAVA_Build 8 117819978 1I CAGAAAGGCC -/T GTTTAAGAGA 3070 het 3070 hom 56 20 26 10 T 0 1 366549 CASAVA_Build 8 117821412 2I TGAAAATAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 15 14 9 AC 7 8 366550 CASAVA_Build 8 117836087 1D CTAACTTGCC T/- TAAAGTCACA 3070 het 3070 ref 42 19 17 6 T 2 1 366551 CASAVA_Build 8 117854474 10D AGAAATGTCA TTCTCATTTG/---------- AATTCAGAGA 3070 het 3070 ref 41 22 21 1 TTCTCATTTG 1 0 366552 CASAVA_Build 8 117870373 1I CAAATACCTC -/A TGACCTCACT 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 A 0 1 366553 CASAVA_Build 8 117870507 1D AAGTTTGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 17 7 A 15 14 366554 CASAVA_Build 8 117874615 1D AATTTTTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 19 0 15 4 T 12 11 366555 CASAVA_Build 8 117876401 3I TAATGCTCTT ---/CTC CTCCACTGCA 3070 het 3070 hom 42 18 17 7 CTC 1 2 366556 CASAVA_Build 8 117887856 1I GCCACAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 11 12 366557 CASAVA_Build 8 117910233 3D CTTCCTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGA 3070 het 3070 ref 33 16 13 5 TTG 4 3 366558 CASAVA_Build 8 117915466 1D CCTAAGTGTA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 T 8 7 366559 CASAVA_Build 8 117916948 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2119 hom 19 5 13 1 A 11 10 366560 CASAVA_Build 8 117927788 2I AAGTTAAGAC --/AT ATTCTGATAA 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 AT 1 2 366561 CASAVA_Build 8 117932547 3I CACGGCAGCA ---/AAT AATAATAGGA 3070 het 3070 ref 41 21 15 5 AAT 2 3 366562 CASAVA_Build 8 117937129 1I TCTAGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 T 10 11 366563 CASAVA_Build 8 117938423 1D TTAAAAAATA T/- TTTACTTAAC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 4 3 366564 CASAVA_Build 8 117939033 6D ATCTAGTTTA AACTTT/------ AATTCTTTAG 2710 het 2710 ref 20 11 6 3 AACTTT 1 0 366565 CASAVA_Build 8 117939218 3D CTTTCCCGTT ATA/--- ATGTGTTTCA 3070 het 3070 ref 43 20 19 5 ATA 1 0 366566 CASAVA_Build 8 117946857 1I GCATACCTAT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 48 21 21 6 A 8 9 366567 CASAVA_Build 8 117956303 1D CCAGCCCAAG C/- CCCCCCCTCC 2127 hom 19 het 10 0 7 3 C 8 7 366568 CASAVA_Build 8 117969307 5I GTGGTTATTT -----/ACACA ACACAGGGTA 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 ACACA 1 2 366569 CASAVA_Build 8 117971121 6D GCACTTTGAA AGGCTG/------ AGGCTGAGGC 3070 hom 61 het 25 0 22 6 AGGCTG 3 2 366570 CASAVA_Build 8 117976284 1D TTAAACATGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 73 het 35 0 27 8 A 11 10 366571 CASAVA_Build 8 117978027 1I AAGTGGGATT -/C ATTCTAGGGA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 C 0 1 366572 CASAVA_Build 8 117978699 1I ACAGAGACAG -/A AAAAAAAAAT 1046 het 1046 ref 32 23 3 6 A 9 10 366573 CASAVA_Build 8 117984123 11I GCATAAGCAG -----------/AGCAGAGCATA AGCTATTCAG 3070 hom 87 het 33 0 30 4 AGCAGAGCATA 0 1 366574 CASAVA_Build 8 117987457 8D TGTGGGACGT TGTGATTA/-------- TGTGAGTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 15 6 TGTGATTA 1 0 366575 CASAVA_Build 8 117987879 1I GCCTGGACAA -/T TTTTTTTTTT 1852 het 1852 ref 13 6 4 3 T 10 11 366576 CASAVA_Build 8 117988033 7D TATCTTAAAG GCAATGA/------- GCAATCATTA 3070 het 3070 hom 22 9 9 5 GCAATGA 1 0 366577 CASAVA_Build 8 117996545 1I TAGTCTGTTA -/T TTTTTTTTTT 2579 het 2579 ref 30 19 7 4 T 10 11 366578 CASAVA_Build 8 117997057 1I TTTGCTCGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1249 hom 36 3 25 8 T 10 11 366579 CASAVA_Build 8 118000023 1D TCACCAGCAG C/- CCCAAAGCAC 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 C 4 3 366580 CASAVA_Build 8 118004729 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2443 hom 17 het 7 0 6 1 T 17 16 366581 CASAVA_Build 8 118007034 4D AATAAAAAAT AGAC/---- AGCCAGAGTG 103 het 103 ref 9 6 1 4 AGAC 1 0 366582 CASAVA_Build 8 118010869 1D CACTCTGTGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 ref 46 21 23 3 T 7 6 366583 CASAVA_Build 8 118059880 17I TGATGCTTTA -----------------/TAAAAATGTCATAAAAC TATAGTCTTT 3070 hom 141 het 49 0 48 2 TAAAAATGTCATAAAAC 0 1 366584 CASAVA_Build 8 118068851 6I CCCTAAAAGT ------/ATAATA ATAATAAAAT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 ATA 2 4 366585 CASAVA_Build 8 118074396 1D AGTAAAGAAG A/- TATAGAGATT 3070 hom 138 het 51 0 47 4 A 1 0 366586 CASAVA_Build 8 118091060 19D GAAGGCAGGC TGGGTTTTGTAAAACTTTG/------------------- TAAAGGAGAA 3070 hom 90 het 31 0 31 7 TGGGTTTTGTAAAACTTTG 1 0 366587 CASAVA_Build 8 118199597 1I TCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1164 het 1164 ref 31 16 3 12 A 17 18 366588 CASAVA_Build 8 118263666 5D TGAAAGATAT TAAAA/----- TAATGTGATG 3070 het 3070 hom 41 18 22 1 TAAAA 1 0 366589 CASAVA_Build 8 118285928 1I TTGTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 A 11 12 366590 CASAVA_Build 8 118308038 1I GGAGAAACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 11 12 366591 CASAVA_Build 8 118310191 3I CTTTGACCGT ---/TTC TTGATAAATA 3070 hom 75 het 38 0 26 12 TTC 0 1 366592 CASAVA_Build 8 118313904 1D ATCCAGAATA G/- GGATCAGGGC 3070 hom 160 het 57 0 54 3 G 3 2 366593 CASAVA_Build 8 118317624 2D AATTTCTATC TT/-- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 10 8 366594 CASAVA_Build 8 118328994 1D CCTGCACACC T/- TCTCAAGTGA 3070 hom 137 het 54 0 36 18 T 2 1 366595 CASAVA_Build 8 118335304 1D AGCGACTCCT C/- CCCTAACCAT 3070 hom 129 het 50 0 43 7 C 4 3 366596 CASAVA_Build 8 118336433 1I15M1D TACAGTAACC -AACCATCATGGTACTG/AAACCATCATGGTACT- GGTACAAAAA 3070 hom 78 het 26 0 26 1 N/A 0 0 366597 CASAVA_Build 8 118336851 2I AACTATCAAC --/AG AGAGTACACA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 AG 2 3 366598 CASAVA_Build 8 118346797 5I ATTTTATTTT -----/ATTTC ATTTCACACT 3070 het 3070 hom 54 26 23 5 ATTTC 1 2 366599 CASAVA_Build 8 118348503 1D CACATTCAAT C/- CAAAAGTCCA 2996 het 2996 ref 38 24 9 5 C 2 1 366600 CASAVA_Build 8 118352175 2I TTCCCTACTC --/TT TTTCCATCTT 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 3 5 366601 CASAVA_Build 8 118355659 2D TATATATATA TT/-- AATACATCAT 3070 het 3070 ref 35 18 16 1 T 2 0 366602 CASAVA_Build 8 118358178 1I AAAAGCTAGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 9 10 366603 CASAVA_Build 8 118365188 1I ACCTTTTATA -/T TTTTTAACAG 3070 het 3070 hom 33 15 14 4 T 5 6 366604 CASAVA_Build 8 118365441 1D TACAGTCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 11 10 366605 CASAVA_Build 8 118365947 2I CCTGTCTCTG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 749 hom 39 2 22 15 A 14 16 366606 CASAVA_Build 8 118366158 1D ACTTGACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 A 11 10 366607 CASAVA_Build 8 118392752 2I GGAAAGCACT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 38 14 16 8 CA 7 8 366608 CASAVA_Build 8 118398788 1I AATGGGCTCG -/T TTTTTAGACC 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 T 5 6 366609 CASAVA_Build 8 118403785 2I ACTGGGTGCC --/AT ATATATATAT 2231 het 2231 ref 23 10 6 7 AT 8 9 366610 CASAVA_Build 8 118404857 1D ACTAAGAAAG A/- AAAAATGATA 3070 het 3070 hom 27 7 16 4 A 6 5 366611 CASAVA_Build 8 118410680 2I CCATCCTTTC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 52 16 18 18 GT 8 9 366612 CASAVA_Build 8 118418886 2D TTTTTGTGTG TA/-- TATATATATA 1230 het 1230 ref 12 8 3 2 TA 9 8 366613 CASAVA_Build 8 118423689 1D ATAAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 517 hom 23 3 11 9 T 19 18 366614 CASAVA_Build 8 118438580 2D TGTGGATGAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 15 14 15 T 14 12 366615 CASAVA_Build 8 118440220 1I GTGCAATACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 10 11 366616 CASAVA_Build 8 118441362 1D AAATAAACAA T/- TGATAGTCAT 3070 het 3070 ref 42 24 11 8 T 2 1 366617 CASAVA_Build 8 118446327 8D ATTTTTAATT TGTGCATA/-------- TGTGTGTATG 3070 het 2824 hom 32 7 24 3 TGTGCATA 1 0 366618 CASAVA_Build 8 118447203 1D CCAAGTGAAA T/- AAGCCAGTCA 3070 het 3070 hom 56 21 28 7 T 1 0 366619 CASAVA_Build 8 118453165 1D ATATATAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 10 12 T 15 14 366620 CASAVA_Build 8 118454894 4D ATTTACATAT TAAC/---- TTTTTTCAGA 3070 het 3070 hom 30 9 18 4 TAAC 1 0 366621 CASAVA_Build 8 118458803 4D TTATTGTGAC ACAT/---- ACGTAGTATG 3070 het 3070 ref 60 31 26 8 ACAT 1 0 366622 CASAVA_Build 8 118461085 1I AGTGACTAGG -/A AAAAACAGTT 3070 hom 114 het 46 0 39 7 A 5 6 366623 CASAVA_Build 8 118465434 3D TCAACAAGTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 86 het 37 0 31 7 A 18 15 366624 CASAVA_Build 8 118481816 1I GTAAATACTA -/T TTTTTTACAT 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 T 6 7 366625 CASAVA_Build 8 118498781 1I TACCAAGAGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 222 hom 33 1 25 7 A 9 10 366626 CASAVA_Build 8 118503284 1I CAAGAGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 20 1 16 3 T 12 13 366627 CASAVA_Build 8 118519732 3D AAAGTATAAT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 24 0 23 1 A 15 12 366628 CASAVA_Build 8 118527730 1I CTTTGTTTCC -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 7 8 366629 CASAVA_Build 8 118541973 13I TTGGTTGTTA -------------/AGATTATGCCCTC AGAGCAACTC 3070 hom 83 het 35 0 27 8 AGATTATGCCCTC 0 1 366630 CASAVA_Build 8 118549981 1I TTTGTCTTTA -/T TTTTAGGTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 4 5 366631 CASAVA_Build 8 118558048 1D CAAGTACATC T/- AATCCCAGTT 3070 hom 111 het 40 0 38 3 T 1 0 366632 CASAVA_Build 8 118562659 1I ATATGTTTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 58 28 19 11 A 10 11 366633 CASAVA_Build 8 118566131 1I TTGGTAGGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 T 9 10 366634 CASAVA_Build 8 118578544 1D AAATTTCTTT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 9 8 366635 CASAVA_Build 8 118601110 5D GTAAGTGAGA GACAT/----- TGTGAGAGAC 219 het 219 ref 33 22 1 13 GACAT 1 0 366636 CASAVA_Build 8 118604616 1D CAAAGCCAAC T/- TTTTTTTTTT 2461 het 2461 ref 33 16 10 7 T 12 11 366637 CASAVA_Build 8 118609057 7D TTTTTCTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1840 hom 33 8 17 10 T 18 11 366638 CASAVA_Build 8 118615046 4I TCTTACCTCT ----/TTAA TTAATTTTCT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 TTAA 1 2 366639 CASAVA_Build 8 118615944 3I GATATCAAAC ---/TGA TGATGGGTTA 3070 het 3070 ref 48 29 17 2 TGA 1 2 366640 CASAVA_Build 8 118623274 3D GGTGAATTAA GTT/--- GTTGTAATGT 3070 het 3070 ref 36 19 12 8 GTT 2 1 366641 CASAVA_Build 8 118624408 1D AGATAGAAGA T/- TTTTTCAGCT 3070 het 3070 hom 41 15 20 6 T 6 5 366642 CASAVA_Build 8 118633242 15D GCATGGTGAC TGTAGTTAATAATAA/--------------- TGGAATGTAC 3070 het 3070 hom 27 13 17 1 TGTAGTTAATAATAA 1 0 366643 CASAVA_Build 8 118663227 1D CCAAGGTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 A 13 12 366644 CASAVA_Build 8 118739608 1D TTGATAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 665 hom 39 2 32 5 A 12 11 366645 CASAVA_Build 8 118758886 1D ATACTGCTAT A/- AAAAATGGAA 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 6 5 366646 CASAVA_Build 8 118768160 7I CATCCTTTTT -------/TTTTTTC TTTTTTTAAA 3070 hom 56 het 32 0 24 8 TTTTTTC 0 1 366647 CASAVA_Build 8 118769590 19D TATTTTAGTG CATCAGAATCAATGTAGTA/------------------- CATCAGAATC 3070 het 3070 hom 40 15 13 18 CATCAGAATCAATGTAGTA 2 1 366648 CASAVA_Build 8 118785999 1D ATATCAACTA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 99 hom 31 2 12 17 T 8 7 366649 CASAVA_Build 8 118786325 2I GTACCCACAC --/TG TGACTAAAAG 2910 het 2910 ref 38 14 7 18 TG 1 2 366650 CASAVA_Build 8 118786364 1I TTTTGCTATT -/C CCCAATCCAA 3070 hom 71 het 30 0 24 6 C 3 4 366651 CASAVA_Build 8 118805499 1I TTAGAGAGAG -/A AAAAAAACAT 3070 hom 86 het 32 0 29 3 A 7 8 366652 CASAVA_Build 8 118808179 1D ATCAAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 15 10 A 15 14 366653 CASAVA_Build 8 118810890 1I TATGGAAATG -/C AATGCAAAGC 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 C 0 1 366654 CASAVA_Build 8 118817776 1D CTAGGCAACC A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 42 18 18 6 A 9 8 366655 CASAVA_Build 8 118825764 1D TGGTTGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 20 18 12 T 12 11 366656 CASAVA_Build 8 118837416 1I TTTTCTCTTA -/G CATCTGGAAT 3070 hom 123 het 44 0 41 3 G 0 1 366657 CASAVA_Build 8 118842987 1D ATAATACATT A/- AATCTCTTAC 3070 het 3070 ref 41 19 15 9 A 3 2 366658 CASAVA_Build 8 118850765 1D AATTAACTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 19 8 T 13 12 366659 CASAVA_Build 8 118855293 4D AGCAAAACAC AACA/---- AACAAACACA 3070 het 3070 hom 44 15 25 5 AACA 3 2 366660 CASAVA_Build 8 118859980 1D AGACTACATC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2458 hom 29 8 13 8 A 15 14 366661 CASAVA_Build 8 118877391 1D GAGGCTGATA G/- TGAAAGAAAT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 G 1 0 366662 CASAVA_Build 8 118880988 1D CTCATTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 16 18 12 T 11 10 366663 CASAVA_Build 8 118893499 6D GAAAAAAGAC AGGGAG/------ AGGGAGGGGA 3070 het 3070 ref 54 31 20 5 AGGGAG 2 1 366664 CASAVA_Build 8 118894764 3I AAGGCCTCAT ---/AGA AGAAGTGACA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 AGA 1 2 366665 CASAVA_Build 8 118901999 1I GTCCCAGTTA -/C TCGGGAGGCT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 C 0 1 366666 CASAVA_Build 8 118905532 1I CCTTTTTTTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 15 13 9 T 7 8 366667 CASAVA_Build 8 118906743 1I AGAAAGATCA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 7 8 366668 CASAVA_Build 8 118916042 6I ACAAACACAC ------/ACACAT ACACATACAC 3070 hom 57 het 23 0 19 4 ACACAT 1 2 366669 CASAVA_Build 8 118926977 1D AAAAGTAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 28 2 12 14 A 12 11 366670 CASAVA_Build 8 118939133 1D CTCAAAAAAA C/- AAAGTAATTT 3070 hom 81 het 33 0 27 6 C 1 0 366671 CASAVA_Build 8 118943303 1I TCTTGCAGAG -/A AGGTAATCCC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 1 2 366672 CASAVA_Build 8 118969103 4D TTAGTTTCTC TCTT/---- TCTCATTGCT 3070 hom 51 het 21 0 18 5 TCTT 1 0 366673 CASAVA_Build 8 118972949 1D CCCTTGAGTG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 9 8 366674 CASAVA_Build 8 118988463 2D GCTGACCATG CA/-- CATTCACTTA 3070 hom 129 het 48 0 44 7 CA 2 1 366675 CASAVA_Build 8 118990552 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 66 het 23 0 22 1 A 10 9 366676 CASAVA_Build 8 118996773 2D AGATATAACC AT/-- ATATATATAT 1422 het 1422 ref 22 14 3 5 AT 9 8 366677 CASAVA_Build 8 119000927 1I GAGTTAAAAC -/T TTTTTTTTTT 2208 het 717 hom 33 5 13 15 T 16 17 366678 CASAVA_Build 8 119003396 1D ATTTGTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 37 1 24 13 T 13 12 366679 CASAVA_Build 8 119004437 12I GATTTAGCAA ------------/AAGTCATTTAAC AAGTCATTTA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 AAGTCATTTAAC 0 1 366680 CASAVA_Build 8 119008827 31I AAGCTAGATT -------------------------------/TTTAAAACTCATGTCCCTAGAAGAAGTGGTC CCTCTGGGGG 3070 hom 69 het 25 0 24 2 TTTAAAACTCATGTCCCTAGAAGAAGTGGTC 0 1 366681 CASAVA_Build 8 119009017 1D ACTGTCACTT A/- AAATAATAAT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 4 3 366682 CASAVA_Build 8 119016742 1D TATCTATCAC T/- TTTTTTTTTT 2208 het 131 hom 24 2 9 13 T 19 18 366683 CASAVA_Build 8 119027800 2D TATGTCAACG CT/-- CTGAGGGAGG 3070 hom 114 het 42 0 38 5 CT 2 1 366684 CASAVA_Build 8 119037598 1D TTTTAACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 32 1 18 13 A 13 12 366685 CASAVA_Build 8 119039536 1D TTACCAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 42 0 28 15 T 11 10 366686 CASAVA_Build 8 119043555 4I GATTTCTTCC ----/TCAT TCAGTCACCA 3070 hom 120 het 45 0 39 6 TCAT 0 1 366687 CASAVA_Build 8 119048947 3I TAAATGGAAA ---/CAT CATAAAATAT 3070 hom 129 het 47 0 44 3 CAT 1 2 366688 CASAVA_Build 8 119053569 1I AAACTCCAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 19 2 15 2 A 14 15 366689 CASAVA_Build 8 119062115 20D TCGGGTGTTG GTGGTTTTTTTTTTTTTTTT/-------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 21 0 19 5 GTGGTTTTTTTTTTTTTTTT 1 0 366690 CASAVA_Build 8 119084442 2D TTTATATGTG TA/-- TATATATATA 1330 het 1330 ref 30 21 3 6 TA 7 6 366691 CASAVA_Build 8 119100820 4D GTTTGTGGAC AGAG/---- AGAAAGACAG 3070 het 3070 ref 39 19 20 2 AG 3 1 366692 CASAVA_Build 8 119117493 1D TATCTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1247 het 1247 ref 45 30 5 10 T 15 14 366693 CASAVA_Build 8 119125832 1I TTCTTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 9 10 10 T 13 14 366694 CASAVA_Build 8 119133192 1I TAACAATATC -/G GTAAGATCAA 3070 het 3070 ref 36 23 10 3 G 1 2 366695 CASAVA_Build 8 119137496 1D ATGAGCTAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 26 2 A 10 9 366696 CASAVA_Build 8 119170105 1D ATGCCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 32 1 21 10 T 14 13 366697 CASAVA_Build 8 119190863 4D GAATGAATGA ATGC/---- ATGCATGCAT 3070 hom 69 het 32 0 22 11 ATGC 6 5 366698 CASAVA_Build 8 119219347 1I TGAGAAAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 139 hom 41 2 30 9 T 12 13 366699 CASAVA_Build 8 119219622 4D CAACGCTTAC TGAG/---- TGAGTGACTC 3070 hom 108 het 41 0 37 5 TGAG 2 1 366700 CASAVA_Build 8 119228452 1I AGGCAGGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 406 hom 34 1 27 6 T 11 12 366701 CASAVA_Build 8 119243130 3D AATAAATTAT TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 51 het 20 0 18 3 TTA 5 4 366702 CASAVA_Build 8 119243580 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 27 0 22 7 A 13 10 366703 CASAVA_Build 8 119246113 1D CTATAGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 10 13 9 T 11 10 366704 CASAVA_Build 8 119259164 1D AATAAAAAAA C/- AACATAAAGG 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 C 1 0 366705 CASAVA_Build 8 119259523 11D GAGTACAGTA TTTTCTTATGT/----------- TTTTCTTATT 3070 het 3070 ref 30 14 12 5 TTTTCTTATGT 1 0 366706 CASAVA_Build 8 119265904 4D TTCTGAATAA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 2032 hom 30 7 9 14 TTTC 5 4 366707 CASAVA_Build 8 119266802 1D TTATCCTTCA C/- CCCCTTCTCC 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 C 5 4 366708 CASAVA_Build 8 119267976 1I TTACCCTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 86 het 36 0 29 7 T 14 15 366709 CASAVA_Build 8 119270195 1I ATTCAGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 52 28 21 3 T 10 11 366710 CASAVA_Build 8 119271929 4D ATTAGAAAAA GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 het 125 hom 32 2 17 13 GT 11 9 366711 CASAVA_Build 8 119277922 1D AGACATAGTT A/- AAAAAAAAAA 959 het 959 ref 38 28 3 7 A 13 12 366712 CASAVA_Build 8 119283585 7I GCGTGGTGTT -------/TAGTAAA TAGTAAATAA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TAGTAAA 1 2 366713 CASAVA_Build 8 119288799 1I AGTGATTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 262 hom 39 1 25 13 T 10 11 366714 CASAVA_Build 8 119296887 3I ATTGAGTGCT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 13 3 TTC 0 1 366715 CASAVA_Build 8 119299095 1D AAAGGAGAAA G/- GGTATTTTAG 3070 hom 101 het 38 0 33 5 G 3 2 366716 CASAVA_Build 8 119331924 1D CAAAAATGGA T/- TTTTTTTTTT 1683 het 1683 ref 29 11 6 12 T 17 16 366717 CASAVA_Build 8 119379504 2I CTACCTGGTA --/GG TTTATTGTGA 3070 hom 137 het 50 0 43 7 G 0 2 366718 CASAVA_Build 8 119389226 9I CCTGTACAGA ---------/ATGCCTCAC GGGATGCTCT 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 ATGCCTCAC 0 1 366719 CASAVA_Build 8 119390135 1D TACACATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 3 T 11 10 366720 CASAVA_Build 8 119397965 1D AACAAACAAA C/- AAAAATTTGG 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 C 1 0 366721 CASAVA_Build 8 119403053 5I AATGAAAAGA -----/AAGAG AAAAGTTGTT 3070 het 3070 ref 51 29 17 5 AAGAG 0 1 366722 CASAVA_Build 8 119404303 1I TTAAAAAAAA -/T TTTAAAAATA 3070 het 3070 hom 36 13 14 9 T 3 4 366723 CASAVA_Build 8 119410546 1I AAAAGTAAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 A 8 9 366724 CASAVA_Build 8 119421763 1D ACCTTGCCAA G/- GGGGCCCATG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 G 5 4 366725 CASAVA_Build 8 119424823 1I AACCAGAAAT -/G GCAACATGCA 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 G 1 2 366726 CASAVA_Build 8 119428621 1I AGTGCTGGAA -/T TTACAGGCAT 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 T 2 3 366727 CASAVA_Build 8 119431032 4D TTATCTACCC CTAA/---- CTAACACACT 3070 het 3070 ref 37 18 13 8 CTAA 2 1 366728 CASAVA_Build 8 119445556 3D CTTCTTCCTC TCT/--- TCTTTATTCA 3070 het 3070 ref 42 23 18 1 TCT 2 1 366729 CASAVA_Build 8 119452368 1I TTAAATAAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 T 8 9 366730 CASAVA_Build 8 119456322 2I ATATGTGATT --/TA TATATATATT 3070 het 3070 hom 35 17 17 1 TA 4 5 366731 CASAVA_Build 8 119468905 3I CTCATAATTG ---/TAA TAATAATATC 3070 het 3070 hom 59 17 24 18 TAA 2 3 366732 CASAVA_Build 8 119471834 3D GGAGTGGACT CCA/--- CCAAGTTCTG 3070 het 3070 ref 35 15 15 6 CCA 2 1 366733 CASAVA_Build 8 119475443 10D CCTATTTGAT AAGTGACAAA/---------- AATTTGAGGA 3070 het 3070 hom 29 11 14 7 AAGTGACAAA 1 0 366734 CASAVA_Build 8 119479212 5I GGGACTTGCA -----/AATTT AATTAATTAA 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 AATTT 0 1 366735 CASAVA_Build 8 119480622 2D TTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2387 hom 26 10 13 3 T 13 11 366736 CASAVA_Build 8 119486831 1I ATAAATCTGA -/C AGACGAAATG 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 C 0 1 366737 CASAVA_Build 8 119490806 1D GTCATTCTGG T/- TTTTAAGGAT 3070 het 3070 hom 50 20 27 4 T 5 4 366738 CASAVA_Build 8 119491141 1I CTGGCTAAAT -/G GGCTTATAAT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 G 2 3 366739 CASAVA_Build 8 119491309 3D TCCACTCTTT AAG/--- AAGATGGCCT 3070 het 3070 ref 33 15 15 4 AAG 2 1 366740 CASAVA_Build 8 119493036 6I AGTTAAAGGA ------/ATACAT GTTTTGAAGA 3070 het 3070 ref 50 26 21 3 ATACAT 0 1 366741 CASAVA_Build 8 119494565 3D AGACAAGTGA CGG/--- AGCCCAGCCA 3070 hom 83 het 34 0 25 12 CGG 1 0 366742 CASAVA_Build 8 119495807 1I CCACATCTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 31 11 12 8 T 9 10 366743 CASAVA_Build 8 119511792 1D TGTAATTGCC T/- TTTTTTTTTT 1303 het 1303 ref 41 33 3 5 T 12 11 366744 CASAVA_Build 8 119554307 1I TTTTGACAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 992 hom 34 3 25 6 A 11 12 366745 CASAVA_Build 8 119558491 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1083 hom 26 4 17 5 T 13 12 366746 CASAVA_Build 8 119563159 1D TACCTAAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 500 hom 34 3 26 5 A 11 10 366747 CASAVA_Build 8 119563883 1I ACGGGAAATA -/T TATATTTTTT 3070 het 558 hom 30 2 26 2 T 1 2 366748 CASAVA_Build 8 119567846 2I AAAAAAAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 AG 6 7 366749 CASAVA_Build 8 119568145 1I TAAATAACGT -/A AAAAAAATAT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 7 8 366750 CASAVA_Build 8 119569648 1D AATTTTACCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 T 9 8 366751 CASAVA_Build 8 119572356 1D AAGAAGTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 23 0 15 8 A 12 11 366752 CASAVA_Build 8 119576120 4D TCAAGGAGTT AGTC/---- AGTCCTTCTG 3070 hom 102 het 38 0 35 4 AGTC 2 1 366753 CASAVA_Build 8 119586764 1D GGCAGAGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1492 hom 37 12 13 13 T 17 16 366754 CASAVA_Build 8 119590351 1I TCATACTGAA -/T GTGATGGGTC 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 T 0 1 366755 CASAVA_Build 8 119603088 4I TCTTCCAAGA ----/GTGT CTGGGCTGTG 3070 het 3070 hom 48 19 23 6 GT 0 2 366756 CASAVA_Build 8 119609453 1D ATATATATAT A/- TTTTTTTTCC 3070 het 519 hom 15 2 11 2 A 1 0 366757 CASAVA_Build 8 119613819 1I TAAAATTCTC -/T TTTTTTTTGT 1870 het 1870 ref 15 9 4 2 T 8 9 366758 CASAVA_Build 8 119616469 1D AATTTTCAGC T/- TTTTGCTCTG 3070 het 3070 ref 38 19 17 2 T 5 4 366759 CASAVA_Build 8 119619581 16D GGAGTTAGTC TCTGTCTGTCTGTCTG/---------------- TCTGTCTGTC 3070 het 3070 ref 38 16 15 12 TCTG 7 3 366760 CASAVA_Build 8 119622121 1I AACTGGCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 A 10 11 366761 CASAVA_Build 8 119660626 5D TAACTTTTCT CTCTA/----- CTCTAATTTT 3070 het 3070 hom 41 17 23 1 CTCTA 2 1 366762 CASAVA_Build 8 119672654 1I TTTATTTTTC -/A AAAGCGTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 3 4 366763 CASAVA_Build 8 119704615 1D GGTCATCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 126 hom 23 1 15 7 A 13 12 366764 CASAVA_Build 8 119708242 1D GTTTTTGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 6 T 11 10 366765 CASAVA_Build 8 119740908 4D AAGGTCATAT AGTA/---- AGTGAGGAGT 3070 hom 127 het 48 0 43 5 AGTA 1 0 366766 CASAVA_Build 8 119748284 1I TTTCAATAAG -/C CCCAATTAAC 3070 hom 108 het 41 0 37 4 C 3 4 366767 CASAVA_Build 8 119840186 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 2909 het 805 hom 16 4 9 3 A 11 10 366768 CASAVA_Build 8 119842763 3I GAGATGAAAG ---/TCC TGCCTTTTTG 3070 het 3070 ref 51 28 18 5 TCC 0 1 366769 CASAVA_Build 8 119843194 1I GACAGTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 21 10 8 3 T 11 12 366770 CASAVA_Build 8 119852916 1D TGCCAGGAAA C/- CAAATACCAC 3070 hom 99 het 36 0 34 3 C 2 1 366771 CASAVA_Build 8 119861595 1I TGGATCTTGC -/A AACAGACTGA 3070 hom 103 het 38 0 30 8 A 2 3 366772 CASAVA_Build 8 119871225 1D CTTCATCACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 22 het 38 2 30 6 T 10 9 366773 CASAVA_Build 8 119871993 1I67M4I GGCTCTTGAG -CCCATGAAGTCTCCTCAAAATAGGATAAATCATTAATTAAAATGTTTAATGAGGAGAAAAAGAACAT----/CCCCATGAAGTCTCCTCAAAATAGGATAAATCATTAATTAAAATGTTTAATGAGGAGAAAAAGAACATAGAG AGAAAAAAGG 3070 hom 172 het 36 0 58 3 N/A 0 0 366774 CASAVA_Build 8 119873619 1D CTGCATTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 19 19 10 A 12 11 366775 CASAVA_Build 8 119882671 1I AATTATTATG -/T TTTTTTCAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 6 7 366776 CASAVA_Build 8 119891140 1I TAACATTTAG -/C CAATCGTGTT 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 C 1 2 366777 CASAVA_Build 8 119902652 1D TCTTTTTTTT A/- ACAACGTCTG 3070 hom 105 het 46 0 36 11 A 2 1 366778 CASAVA_Build 8 119909381 1D AGATCTTACC A/- TTAGAATATT 3070 het 3070 hom 41 17 22 2 A 1 0 366779 CASAVA_Build 8 119933952 1I TATATCAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 T 10 11 366780 CASAVA_Build 8 119944238 1D ACCTTAAATC A/- GACCCTCAAA 3070 het 3070 ref 43 20 19 4 A 1 0 366781 CASAVA_Build 8 119958515 1I TGAGATACTA -/T TTTTTAATTA 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 T 5 6 366782 CASAVA_Build 8 119959933 1I TACAGATATA -/T TTTTTGTTTA 3070 het 3070 ref 41 19 17 5 T 5 6 366783 CASAVA_Build 8 119966140 3D TGTTTTATAT TCA/--- TCATCATCTT 3070 het 3070 ref 39 19 18 5 TCA 3 2 366784 CASAVA_Build 8 119967300 1D GAAGACATAA C/- CTAAGACTGG 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 C 2 1 366785 CASAVA_Build 8 119968411 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAC 1204 het 1204 ref 13 8 3 2 A 11 9 366786 CASAVA_Build 8 119969023 2D ACAATTAAAA AG/-- AGTATTAAAA 2821 het 2821 ref 31 20 7 4 AG 2 1 366787 CASAVA_Build 8 119973143 1I CATGGAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 11 16 T 15 16 366788 CASAVA_Build 8 119975788 1D TATGGCTTGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 T 9 8 366789 CASAVA_Build 8 119986388 2D CTAATTACAC TT/-- TTTTTTTTTT 1264 het 91 hom 37 3 3 31 T 13 11 366790 CASAVA_Build 8 120003728 1I CCCCGCCCCC -/G CTCCCAAAAA 2462 het 2462 ref 20 11 7 2 G 0 1 366791 CASAVA_Build 8 120009683 7I CTCAAGTGAT -------/CTGCCTA CTGCCTACCT 3070 het 3070 hom 30 12 16 2 CTGCCTA 1 2 366792 CASAVA_Build 8 120010102 2D TGTTCAACTC AG/-- AGAGAGAGAT 3070 het 3070 hom 50 17 24 10 AG 5 4 366793 CASAVA_Build 8 120015191 8D GCCTGGGGAT TTAAAACA/-------- CCTGCAGTGT 3070 het 3070 ref 33 19 13 7 TTAAAACA 1 0 366794 CASAVA_Build 8 120023161 3D AAACAAAAAC AAG/--- AAAATCTCTG 3070 het 3070 ref 33 22 10 2 AAG 1 0 366795 CASAVA_Build 8 120023659 2D CCATGACAGG CC/-- CCCCCGTGTG 3070 hom 55 het 23 0 18 5 C 7 5 366796 CASAVA_Build 8 120026697 6I AATGCACAAT ------/TGTGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 42 10 23 9 TG 5 8 366797 CASAVA_Build 8 120028633 45D GTGAACTATC TGGCAGTAAGCTAAATTCTGTTGGAACATCCATGGAAATTGCCAG/--------------------------------------------- TGGCAGTAAG 3070 hom 63 het 37 0 22 21 TGGCAGTAAGCTAAATTCTGTTGGAACATCCATGGAAATTGCCAG 2 1 366798 CASAVA_Build 8 120030028 3I GTTTCAGCTT ---/AAG AAGTAAAATT 3070 hom 83 het 31 0 28 3 AAG 1 2 366799 CASAVA_Build 8 120030213 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 9 10 366800 CASAVA_Build 8 120032941 2D CAAACAAGTT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 74 het 38 0 24 14 TC 10 9 366801 CASAVA_Build 8 120040815 2I ATTCATTTGC --/TA TAGTTTTGTC 3070 hom 126 het 48 0 43 5 TA 1 2 366802 CASAVA_Build 8 120048099 1D ATGTTCCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 16 6 T 12 11 366803 CASAVA_Build 8 120050028 6D TACGTATATG TATGTA/------ TATGTATATG 3070 het 3070 ref 27 12 12 4 TATGTA 3 2 366804 CASAVA_Build 8 120050400 2I GTGTTAACTT --/AC ATAGCAAAAG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 AC 0 1 366805 CASAVA_Build 8 120052045 1D TTTCTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 22 15 11 T 11 10 366806 CASAVA_Build 8 120055686 4I CTGGAGCAAA ----/GACT GACTATTTTA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 GACT 1 2 366807 CASAVA_Build 8 120059981 4I TATTTGCATT ----/TTTA TTTGTTCTCT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 TTTA 0 1 366808 CASAVA_Build 8 120061623 1D TAAAACATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1013 hom 32 6 16 10 T 17 16 366809 CASAVA_Build 8 120062176 1I AGACACGTTC -/A AAAAATTCAG 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 5 6 366810 CASAVA_Build 8 120062448 2D GTAGTTTTCC TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 TA 8 7 366811 CASAVA_Build 8 120063417 1I TCACCCCTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 309 hom 32 1 26 5 T 11 12 366812 CASAVA_Build 8 120065574 1D TATAGTAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 10 9 366813 CASAVA_Build 8 120071503 1I TACGTAATTT -/C CAAATCACTA 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 C 1 2 366814 CASAVA_Build 8 120073245 20D TGAGATAAAT TATATTTATATTCAATTGAA/-------------------- TATATTTATA 3070 het 3070 ref 32 16 13 6 TATATTTATATTCAATTGAA 1 0 366815 CASAVA_Build 8 120077293 1I TTTCTTTCTG -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 T 8 9 366816 CASAVA_Build 8 120079588 1D34M1D ATGAAATGAG AAAAAAATATAAAGATTTTATATTCCTCTAAAATTG/-AAAAAATATAAAGATTTTATATTCCTCTAAAATT- GTGTGAATTT 3070 hom 90 het 29 0 31 2 N/A 0 0 366817 CASAVA_Build 8 120081330 1D CTTTAAAGAG T/- TTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 36 18 17 1 T 7 6 366818 CASAVA_Build 8 120082338 1D AGTCAACCAT A/- AATGCAGAGG 3070 het 3070 ref 47 29 15 3 A 3 2 366819 CASAVA_Build 8 120083129 4I AAACAGTAAA ----/ACAG ACAAACAAAC 3070 hom 25 het 31 1 21 9 ACAG 0 1 366820 CASAVA_Build 8 120086312 3I AATGTTTCCT ---/ATC ATCATCTTTC 3070 hom 109 het 42 0 37 5 ATC 2 3 366821 CASAVA_Build 8 120088159 1I TCTTTACCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 20 16 8 T 9 10 366822 CASAVA_Build 8 120090419 6D TAGAATTCTT AAACAC/------ AAACACATAC 3070 het 3070 ref 52 27 21 11 AAACAC 2 1 366823 CASAVA_Build 8 120090783 2D CAGACTAAGT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 hom 41 17 13 11 TC 7 6 366824 CASAVA_Build 8 120091215 3D50M3D CCCAATAGTT ATAATAAAAGAGTGTAACAACTTACCCGCAATTGAAAGCTCAGCTCTTTTTTTTAA/---ATAAAAGAGTGTAACAACTTACCCGCAATTGAAAGCTCAGCTCTTTTTTT--- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 32 16 13 30 N/A 0 0 366825 CASAVA_Build 8 120092903 1I CCATATAAAC -/T TTATATTTAT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 T 2 3 366826 CASAVA_Build 8 120094436 1D TTTGCTGCTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 T 10 9 366827 CASAVA_Build 8 120096603 1I TTGCTCTTAG -/T TAGGCCTTTA 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 T 1 2 366828 CASAVA_Build 8 120098422 1I GGGTGAGCCA -/C CGCACCTGGC 3070 hom 57 het 20 0 18 2 C 1 2 366829 CASAVA_Build 8 120105321 1D GTGCATGGTA G/- TCCTGTACAC 3070 het 3070 ref 43 24 12 7 G 1 0 366830 CASAVA_Build 8 120109624 4D TGGCATATTA AATG/---- AATAACTGCT 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 AATG 1 0 366831 CASAVA_Build 8 120111150 1I TCTCATTGAA -/G AACACAAATA 3070 hom 141 het 48 0 48 0 G 0 1 366832 CASAVA_Build 8 120111824 1I ATGATTCATG -/C CTGTAATCTC 3070 het 2028 hom 26 7 17 2 C 1 2 366833 CASAVA_Build 8 120113324 1I GTGCCTTAAT -/A AAAATAGTAA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 4 5 366834 CASAVA_Build 8 120114666 1D AGTAATTCAC T/- TTCTTCAGAT 3070 het 3070 hom 31 12 11 8 T 3 2 366835 CASAVA_Build 8 120114783 1I CTATAACACC -/A AAAGCAATGG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 A 3 4 366836 CASAVA_Build 8 120116718 10I CTGCTATCTA ----------/TGATTATTTG TGATTATTTG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 TGATTATTTG 1 2 366837 CASAVA_Build 8 120116977 1I ATGTCCACAG -/A AAAACCTTTC 3070 hom 123 het 46 0 42 4 A 4 5 366838 CASAVA_Build 8 120122687 1I TGAAGCAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1114 hom 56 3 45 8 T 10 11 366839 CASAVA_Build 8 120127658 1D ATTTGTGATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 T 9 8 366840 CASAVA_Build 8 120129208 2I GGCTTATCTC --/AA AGTTGTTAGA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 1 3 366841 CASAVA_Build 8 120134912 1D ACAGTGTGAA G/- GATTGCATTT 3070 het 3070 hom 48 14 28 7 G 2 1 366842 CASAVA_Build 8 120135108 2I AAAAAAGGTG --/GC GGGGGGGCTT 3070 hom 18 het 26 0 16 10 GC 0 1 366843 CASAVA_Build 8 120136524 1D TTATCTCCAT A/- AAAGCAGAAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 3 A 4 3 366844 CASAVA_Build 8 120140683 4I TTTTGGTGTA ----/CTAT CTAAGAAACT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 CTAT 0 1 366845 CASAVA_Build 8 120142862 1D AGCTGGTATT G/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 3 G 1 0 366846 CASAVA_Build 8 120143900 1D GAATATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 13 12 366847 CASAVA_Build 8 120147245 4I31M1I GCGACTGTAC ----TCCAGCCTGGGCAACAGCGAGACTCCATCTC-/TCCATCCAGCCTGGGCAACAGCGAGACTCCATCTCA AAAAAAAAAA 3070 het 929 hom 17 3 10 9 N/A 0 0 366848 CASAVA_Build 8 120154399 1D CAGCCCCCAA C/- ACAAATAGGA 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 C 1 0 366849 CASAVA_Build 8 120155374 8D ATATACACAT ATATACAC/-------- ATATACACAT 3070 het 3070 ref 22 13 9 2 ATATACAC 2 1 366850 CASAVA_Build 8 120160248 1D CTTTAACACC A/- ACCTAATAAC 3070 het 3070 hom 41 16 23 3 A 2 1 366851 CASAVA_Build 8 120167807 1I TCGGCGGGGA -/G GGTGGGGGGG 2903 het 2903 ref 33 16 12 5 G 2 3 366852 CASAVA_Build 8 120177482 3D CATGTATAAA AAT/--- AATAATCTCG 3070 het 3070 hom 41 18 18 8 AAT 3 2 366853 CASAVA_Build 8 120183627 20D TAAATTCACT CCTTCCTCCCTCCCTCCCTC/-------------------- CCTCCCTCCC 2983 het 858 hom 19 10 8 2 CCTTCCTCCCTCCCTCCCTC 1 0 366854 CASAVA_Build 8 120194209 18I CTTAGAAATT ------------------/AAAAATCTAGATCTGATA TTGCAACTGC 3070 het 3070 ref 42 20 18 6 AAAAATCTAGATCTGATA 0 1 366855 CASAVA_Build 8 120204877 30I GTTCACGCCA ------------------------------/TTCTCCTGCCTCAGCCTCCATTCATGCTGG TTCTTCCTGG 3070 hom 59 het 22 0 18 6 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCATTCATGCTGG 0 1 366856 CASAVA_Build 8 120235476 7I GGACTATTAG -------/AGATAGT CCTGGGATTT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 AGATAGT 0 1 366857 CASAVA_Build 8 120236026 1D GAAGCAGCTG T/- TATTGTACTG 3070 het 3070 hom 48 14 31 3 T 2 1 366858 CASAVA_Build 8 120247487 12D TGTGTGTGTG TATATATATATA/------------ TATATATATA 3070 het 645 hom 20 2 9 10 TA 15 9 366859 CASAVA_Build 8 120250769 8D AGACAGACAG ACACACAC/-------- ACACTAGTTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 10 AC 6 2 366860 CASAVA_Build 8 120250830 1I AAGACTACTG -/C TTTTCAAAGG 3070 hom 135 het 54 0 46 8 C 0 1 366861 CASAVA_Build 8 120253528 1D AAAACTAATT A/- AATGTGGTAT 3070 het 3070 hom 44 17 24 4 A 3 2 366862 CASAVA_Build 8 120253729 2D GGGCTAAAAC TG/-- AGTATGATTT 3070 het 3070 hom 57 19 33 6 TG 1 0 366863 CASAVA_Build 8 120259398 1D TTAGATCTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 T 12 11 366864 CASAVA_Build 8 120268104 5D TGCTTAAAAT ATCTC/----- ATAAAAGAGG 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 ATCTC 1 0 366865 CASAVA_Build 8 120275163 1I AAGAGAGAAA -/G GGGGGGGGGT 3070 het 67 hom 25 1 13 11 G 9 10 366866 CASAVA_Build 8 120275425 3D AGTAAGAAAC AAG/--- AGTCTCTGTC 3070 hom 120 het 43 0 39 7 AAG 1 0 366867 CASAVA_Build 8 120275812 1I AGTAGTTTTC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 T 6 7 366868 CASAVA_Build 8 120282602 2D GATATTCTAC TT/-- TTTTTTTTAT 3070 hom 102 het 42 0 35 8 T 10 8 366869 CASAVA_Build 8 120283059 6I TATCTTCCTA ------/CTTTCT CTTTGTTTCA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 CTTTCT 0 1 366870 CASAVA_Build 8 120284355 1D GCTCTGTTCA T/- TTTTTCAGCT 3070 het 3070 hom 41 14 17 10 T 6 5 366871 CASAVA_Build 8 120284398 6D TTTTAAATAG TTTCTA/------ TTTCTATATC 3070 het 3070 hom 37 11 14 14 TTTCTA 2 1 366872 CASAVA_Build 8 120290490 1D TGTGGAAAGT G/- GGGGCGGGAG 3070 het 3070 hom 30 10 15 6 G 5 4 366873 CASAVA_Build 8 120294803 4I ATTGCCTGGA ----/AAAT AAATGTTGAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 AAAT 1 2 366874 CASAVA_Build 8 120305224 4D TGTGTGGGTC TTTT/---- TTTTATTATT 3070 het 3070 ref 39 18 18 4 T 8 4 366875 CASAVA_Build 8 120308045 18D CAAGAGCACA TGAAGGCAATTAAGAAAG/------------------ TGAAGGCAAT 3070 het 3070 ref 33 16 13 13 TGAAGGCAATTAAGAAAG 2 1 366876 CASAVA_Build 8 120309419 4D ATTGCTACAC TTGT/---- TTGTTTTTAG 3070 het 3070 ref 54 25 23 10 TTGT 2 1 366877 CASAVA_Build 8 120309887 3D TGTAGGAAGC TCT/--- TCTTCAGTGT 3070 het 3070 hom 45 18 24 3 TCT 2 1 366878 CASAVA_Build 8 120314430 2D TACTTCCAAC TA/-- TGTGGTCAAT 3070 hom 75 het 27 0 24 3 TA 1 0 366879 CASAVA_Build 8 120316970 2D AGCCAGAGAG AA/-- AGGTCGGGTT 2831 hom 18 het 7 0 7 0 A 3 1 366880 CASAVA_Build 8 120327199 4I GTTCTGTTTT ----/AAAC AAACATTTCT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 AAAC 1 2 366881 CASAVA_Build 8 120331814 7I GTTGTGGGGT -------/GGGGGGA GGGGGGAGGG 2877 hom 15 het 6 0 6 0 GGGGGGA 1 2 366882 CASAVA_Build 8 120349065 1I AATGGAAACC -/A AAAAGTGAGT 3070 het 3070 hom 45 14 21 10 A 4 5 366883 CASAVA_Build 8 120350467 1D TTAATTTTTG A/- AAAAAATTCA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 6 366884 CASAVA_Build 8 120354068 15I TCAAAACCCC ---------------/AGCAGTGGAAACCCA AGCAAAACCT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 AGCAGTGGAAACCCA 0 1 366885 CASAVA_Build 8 120357842 1I GCCCTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 15 7 T 10 11 366886 CASAVA_Build 8 120384109 1D AAAAAGTGAG A/- AAAAAAAGTA 3070 het 3070 hom 38 16 18 4 A 8 7 366887 CASAVA_Build 8 120387140 3D TCAATACACT AAC/--- AACAAACTAT 3070 het 3070 ref 41 21 18 2 AAC 2 1 366888 CASAVA_Build 8 120389950 4I AAGGTCTGGT ----/AATA AATAAAGGGA 3070 hom 60 het 24 0 20 4 AATA 1 2 366889 CASAVA_Build 8 120395404 1I ATTTCACCAT -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 A 6 7 366890 CASAVA_Build 8 120395582 1D AGGGGTTTGA G/- GGGGGTGCCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 G 6 5 366891 CASAVA_Build 8 120406634 1D GGTTTTTGCT G/- TTACTTTTAA 3070 hom 38 het 30 0 15 15 G 1 0 366892 CASAVA_Build 8 120415046 2I ATCACCATCA --/CC CCCGGGCACT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 C 3 5 366893 CASAVA_Build 8 120423090 1D59M1I TCAGGGAAAT AAAAAAAAAATTTAAATGAGATAACCACTATATACTTTTTAGAATGGCTGAAATTCAAAA-/-AAAAAAAAATTTAAATGAGATAACCACTATATACTTTTTAGAATGGCTGAAATTCAAAAC ACTGACAACA 3070 het 396 hom 35 1 36 21 N/A 0 0 366894 CASAVA_Build 8 120424875 1I ATTACCCTTC -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 T 5 6 366895 CASAVA_Build 8 120426161 1D TTTTCAGTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 19 5 A 11 10 366896 CASAVA_Build 8 120429538 5D TGTGTCTAGA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1440 het 374 hom 35 6 3 26 T 17 12 366897 CASAVA_Build 8 120431583 1D ATAAACAAAA C/- GTTAACTAGC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 1 0 366898 CASAVA_Build 8 120432309 3D TATTTTGTTA TTG/--- TTCTTATTGT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 TTG 1 0 366899 CASAVA_Build 8 120432404 1I TATTATGTTT -/A AAAAAAAACC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 8 9 366900 CASAVA_Build 8 120438147 1I GTCTAAAAAA -/T AATTGACATT 3070 hom 129 het 49 0 44 5 T 0 1 366901 CASAVA_Build 8 120439814 3I CTCTTCTTTT ---/TTC TTTTCTTTTT 3070 hom 75 het 27 0 26 1 TTC 0 1 366902 CASAVA_Build 8 120443382 1I GCTAAAACCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 29 1 20 8 A 12 13 366903 CASAVA_Build 8 120451174 1D ACTGCCTATC A/- GGTACTATGC 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 0 366904 CASAVA_Build 8 120506639 1D TGAGGAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 15 14 14 A 13 12 366905 CASAVA_Build 8 120522943 2D TTTCTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTA 2798 het 1686 hom 17 6 9 2 T 11 9 366906 CASAVA_Build 8 120530926 1I TTCTTTTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 9 10 366907 CASAVA_Build 8 120555281 4D TTTTTTTTTA ATTT/---- ATTTATTTAT 2961 het 116 hom 11 1 8 2 ATTT 3 2 366908 CASAVA_Build 8 120562187 1D GGGACCTTGG T/- TGTCTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 2 1 366909 CASAVA_Build 8 120571444 12D TTGCACATAT ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 het 2381 hom 28 10 11 10 AC 15 9 366910 CASAVA_Build 8 120572227 2I CCATCTTATT --/TC ATAGAGTGGA 2432 het 2432 ref 28 20 6 2 TC 0 1 366911 CASAVA_Build 8 120573376 1I TTAAAAATAC -/T TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 T 6 7 366912 CASAVA_Build 8 120576650 1D TGCTGGGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1543 hom 18 7 9 3 T 15 14 366913 CASAVA_Build 8 120596024 1D TTCATCAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 11 16 16 T 15 14 366914 CASAVA_Build 8 120608567 1I AGTATAATTT -/A AAAAAAAAAA 1721 het 1721 ref 14 7 6 1 A 10 11 366915 CASAVA_Build 8 120623566 1I AAAGTAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2094 hom 24 6 15 3 T 10 11 366916 CASAVA_Build 8 120635152 1D GTTCAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2386 hom 29 8 11 10 T 12 11 366917 CASAVA_Build 8 120647302 2D CACGCACATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 54 25 25 5 CA 8 7 366918 CASAVA_Build 8 120649728 1I TATATCAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 36 0 23 13 A 10 11 366919 CASAVA_Build 8 120650432 3D GTAAGGCGGG ACA/--- CAGAAGATTC 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 ACA 1 0 366920 CASAVA_Build 8 120650921 1D ATTTTTTATC T/- TTGATAGTCT 3070 het 3070 hom 33 16 17 0 T 3 2 366921 CASAVA_Build 8 120655382 1I TAATAAGGGG -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 6 7 366922 CASAVA_Build 8 120674037 2I CTCAGCACAT --/GA ATCATTGGGA 3070 het 3070 ref 47 25 18 4 GA 0 1 366923 CASAVA_Build 8 120684648 1I TTTCCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 10 7 A 11 12 366924 CASAVA_Build 8 120686009 1D AGAAATGGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 32 1 13 18 A 16 15 366925 CASAVA_Build 8 120687145 1I CACCTCAGCC -/T CCCAAAGTGC 3070 het 1785 hom 19 5 11 3 T 0 1 366926 CASAVA_Build 8 120698737 1D ATTTTATAAA C/- ACTCAGACAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 7 C 1 0 366927 CASAVA_Build 8 120700839 1D GGGATATAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 813 hom 39 4 22 13 A 15 14 366928 CASAVA_Build 8 120758707 1I AAGTAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 14 15 1 A 10 11 366929 CASAVA_Build 8 120759653 1D ATGATTATTC T/- TGACCAAGAG 3070 het 3070 ref 43 26 14 3 T 2 1 366930 CASAVA_Build 8 120763103 1D CTGTTTCTAT A/- AAAAAAAAAA 1642 het 1642 ref 15 10 4 1 A 15 14 366931 CASAVA_Build 8 120782892 2I TGTGCACAAA --/CT CTGAATGCCG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 CT 1 2 366932 CASAVA_Build 8 120783178 4I TGTGCAGGCG ----/CACA CACACACACG 3070 hom 123 het 51 0 43 8 CA 4 6 366933 CASAVA_Build 8 120797734 1I TGTCTCTACC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 35 19 13 3 A 7 8 366934 CASAVA_Build 8 120802071 1D CCCAGAGGGT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 27 0 22 6 A 10 9 366935 CASAVA_Build 8 120805661 1I CTCAAAAAAA -/G AAAAAAAACA 3070 het 2656 hom 38 15 17 6 G 0 1 366936 CASAVA_Build 8 120806301 2D20M5I GAGACAAAGG GAGACTATAATAGAACCTCTGC-----/--GACTATAATAGAACCTCTGCTTGTA TTTATTTCTG 3070 het 3070 ref 46 32 18 10 N/A 0 0 366937 CASAVA_Build 8 120820451 1D TTTTTTTTTT A/- AATTAAAAAA 3070 het 1801 hom 25 7 9 10 A 3 2 366938 CASAVA_Build 8 120822114 3I AAGAAAAGAA ---/AAG AAGAAGAAGA 2457 hom 27 het 11 0 9 2 AAG 5 6 366939 CASAVA_Build 8 120823759 1D TAATAGGAAT A/- CATTACTTTT 3070 het 2940 hom 30 7 22 1 A 1 0 366940 CASAVA_Build 8 120826753 6D GAGCAAGAAT TATAAA/------ TATATCAATT 3070 het 3070 hom 42 19 21 3 TATAAA 1 0 366941 CASAVA_Build 8 120830351 1I AAAAAAAAAA -/C ACAAAAAACA 3070 het 3044 hom 28 11 14 3 C 0 1 366942 CASAVA_Build 8 120837311 1D TACTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 17 4 A 11 10 366943 CASAVA_Build 8 120843222 1D ACTTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1594 het 1594 ref 17 10 4 3 A 15 14 366944 CASAVA_Build 8 120845476 3I CGGCTGAAGC ---/AGG AGAACTGCTT 1392 het 1392 ref 10 7 3 0 AGG 0 1 366945 CASAVA_Build 8 120849908 1D CCTCTTGGTA T/- TGATTTCTAA 3070 het 3070 hom 30 8 16 7 T 2 1 366946 CASAVA_Build 8 120854514 1D GGATTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 1559 het 1559 ref 25 18 4 3 A 14 13 366947 CASAVA_Build 8 120855900 1D AATATTGTGA T/- TTTTTTTTGC 1756 hom 23 het 32 0 11 21 T 9 8 366948 CASAVA_Build 8 120858321 1I CACTATAGCT -/G GACCCTCTCT 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 G 1 2 366949 CASAVA_Build 8 120859560 1I TCTACAAAAG -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 22 21 6 A 8 9 366950 CASAVA_Build 8 120861571 3I CTCTGCCTTC ---/ATT ATTATGAAAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 ATT 1 2 366951 CASAVA_Build 8 120864430 4D ACACCCACAG ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 9 hom 38 2 19 18 AC 10 8 366952 CASAVA_Build 8 120872407 1I TTTTTGAGAT -/G GGGGGGGGTC 2923 het 2923 ref 23 11 7 5 G 8 9 366953 CASAVA_Build 8 120873574 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 2663 het 2247 hom 22 9 11 2 C 0 1 366954 CASAVA_Build 8 120878887 5D GATGAGCCTT TTGAG/----- TTATCTCAAA 3070 het 3070 ref 51 25 24 5 TTGAG 1 0 366955 CASAVA_Build 8 120880573 4D TTTTTTAAAA TTTT/---- TTTATATTAT 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 T 7 3 366956 CASAVA_Build 8 120887331 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2565 hom 24 8 13 3 T 13 12 366957 CASAVA_Build 8 120888858 1D AAATTAGTTT A/- AAAAAATACG 3070 het 3070 hom 44 17 23 5 A 7 6 366958 CASAVA_Build 8 120893747 1D TGCTGCCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 21 10 T 13 12 366959 CASAVA_Build 8 120894233 1I13M1I ATACATACAC -CACACATACACAC-/ACACACATACACACA CATTTCCTTT 3070 hom 78 het 26 0 24 7 N/A 0 0 366960 CASAVA_Build 8 120902452 1I AAGATTAAAG -/A AAGTACTGTC 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 2 3 366961 CASAVA_Build 8 120904914 4I TTTTTGCCTG ----/CCAC CCACCATCCA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 CCAC 1 2 366962 CASAVA_Build 8 120928099 4D CGTACCTCAG CCTC/---- CCTCCCTAGT 3070 het 3070 ref 22 9 10 5 CCTC 2 1 366963 CASAVA_Build 8 120931949 1I TAGAAATTAT -/A ATATATCGTA 3070 het 3070 hom 31 14 17 0 A 1 2 366964 CASAVA_Build 8 120935117 6D TTCCCGAAGA AAGGCC/------ AAGGCCAAGC 3070 het 3070 ref 39 20 15 6 AAGGCC 2 1 366965 CASAVA_Build 8 120937320 1I CTGAGCGTTT -/C GAAAGCGCGC 1169 het 1169 ref 16 11 4 1 C 0 1 366966 CASAVA_Build 8 120938043 2I GAAGGGAAAA --/AC ACAAGTCACA 3070 het 3070 ref 37 14 16 7 AC 1 2 366967 CASAVA_Build 8 120938400 3I CAGAGTAGGG ---/CAT CATCCCAGGA 3070 het 3070 ref 54 27 21 6 CAT 1 2 366968 CASAVA_Build 8 120941026 4D TTAGCAAGAT AAAG/---- AAAATGATAG 3070 het 3070 ref 36 20 14 3 AAAG 1 0 366969 CASAVA_Build 8 120942329 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 T 11 12 366970 CASAVA_Build 8 120945218 1I ATCTCCATTG -/C CCCCACACCC 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 4 5 366971 CASAVA_Build 8 120948954 4D CTGTTTTTAC ATTT/---- ATTTATTTAT 3070 het 2825 hom 31 6 13 12 ATTT 6 5 366972 CASAVA_Build 8 120953144 1I ATTAATTTTG -/T TTTTTTTTTT 1359 het 1359 ref 27 20 3 4 T 10 11 366973 CASAVA_Build 8 120960532 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2490 het 2363 hom 20 7 7 6 A 11 12 366974 CASAVA_Build 8 120965992 1D AAGGATTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 58 20 26 12 T 13 12 366975 CASAVA_Build 8 120969362 2I CTGCCTCAGC --/CT CTCTGAGTAG 3070 het 794 hom 19 3 9 7 CT 2 3 366976 CASAVA_Build 8 120977490 1D TATTATGCTA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 34 12 19 5 T 8 7 366977 CASAVA_Build 8 120978339 3D CATCACAAAT GAA/--- GAAATATTTA 3070 het 2804 hom 28 7 19 4 GAA 2 1 366978 CASAVA_Build 8 120987054 3D TTATATGGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 18 13 9 T 16 13 366979 CASAVA_Build 8 120989207 1D CTCAAAAAAC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 28 12 13 5 A 9 8 366980 CASAVA_Build 8 120990410 9D AAAACCATGA CAGCCAGCC/--------- CACTAATTCT 3070 het 3070 hom 46 23 27 5 CAGCCAGCC 1 0 366981 CASAVA_Build 8 120991738 3I AGACATAGAA ---/AAG AAGATTTTCC 3070 het 3070 ref 33 19 8 6 AAG 1 2 366982 CASAVA_Build 8 120995455 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2405 het 1336 hom 20 7 7 6 T 13 12 366983 CASAVA_Build 8 121002409 4I AGGTTTTTTT ----/TTTG TTTTTTTGAG 3070 het 1352 hom 26 6 16 4 TTTG 0 1 366984 CASAVA_Build 8 121004444 3I TTGTCAAAAG ---/GAA GAAGAACTGA 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 GAA 2 3 366985 CASAVA_Build 8 121005794 1I TTCAACTGTC -/T CCTAATCAGA 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 T 0 1 366986 CASAVA_Build 8 121013838 3I GCAAGACAGT ---/AAG AAGAAGAGTT 3070 het 3070 hom 61 22 28 11 AAG 2 3 366987 CASAVA_Build 8 121046002 3D ACAGCACTTG TCT/--- TCTTAGCACA 3070 het 2941 hom 18 8 9 1 TCT 2 1 366988 CASAVA_Build 8 121054044 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 het 11 hom 20 1 11 10 A 23 12 366989 CASAVA_Build 8 121056305 1I TCAGAAAAAG -/C ACCTTATACA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 C 0 1 366990 CASAVA_Build 8 121060366 7D TATCTTCCCT CTCCCTG/------- CTCCCTGCTC 3070 hom 73 het 27 0 25 3 CTCCCTG 4 3 366991 CASAVA_Build 8 121061100 2D GCGTATCAGG GT/-- TCATATTCTT 3070 het 2260 hom 21 8 10 3 GT 1 0 366992 CASAVA_Build 8 121065176 1I AGTAGGTGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 83 hom 23 1 10 12 T 9 10 366993 CASAVA_Build 8 121065191 3D TTTTCCTGCA TCT/--- TCTTTTTTAA 3070 het 1092 hom 26 4 10 13 TCT 2 1 366994 CASAVA_Build 8 121073524 1I TTATCTGTGA -/T TTTGAGCAAT 3070 hom 174 het 64 0 58 6 T 3 4 366995 CASAVA_Build 8 121075559 1D CTCCATCTCG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1210 hom 28 5 11 12 A 10 9 366996 CASAVA_Build 8 121092038 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 181 hom 24 1 18 6 A 14 13 366997 CASAVA_Build 8 121095237 1I TCCAGTGAGA -/T TTTTCACACT 3070 het 23 hom 23 0 9 14 T 4 5 366998 CASAVA_Build 8 121101490 1D GTTCTTCTCA T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 14 19 4 T 9 8 366999 CASAVA_Build 8 121104127 1I TCTATTTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 T 9 10 367000 CASAVA_Build 8 121116443 2D TGTGTTAAGA CT/-- CTGTGTCTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 CT 2 1 367001 CASAVA_Build 8 121116746 8D CCCAGAAAAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 3070 hom 99 het 33 0 33 4 AAAG 5 3 367002 CASAVA_Build 8 121120981 3I TCAAAATAAT ---/AAC TTTTCTTTCA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 AAC 0 1 367003 CASAVA_Build 8 121122086 2D AATGTTAACC AA/-- AAATGCATAG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 5 3 367004 CASAVA_Build 8 121124500 2I AGAACTCTTC --/TT TTTTTTTTTA 1633 hom 18 het 8 0 7 1 T 9 11 367005 CASAVA_Build 8 121129303 1D CCTCTCTACC A/- AAAATACAAA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 A 5 4 367006 CASAVA_Build 8 121130799 1D ACTAAAACGA T/- TTTTTTTTTT 1576 het 1576 ref 36 27 4 5 T 13 12 367007 CASAVA_Build 8 121131734 2I TGGCATTAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 362 hom 38 1 32 5 A 11 13 367008 CASAVA_Build 8 121137365 1D CTGTGCCTGG C/- CCCACATTTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 4 3 367009 CASAVA_Build 8 121141115 1D ATGGGAGTGG T/- TTCCCCCATG 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 3 2 367010 CASAVA_Build 8 121145429 1I ACCTTTTTAA -/T TTTTTTTTAC 3070 hom 90 het 38 0 30 8 T 8 9 367011 CASAVA_Build 8 121151163 2I CCCTTATATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 120 het 42 0 41 1 TG 8 9 367012 CASAVA_Build 8 121155739 1D ATTTGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 650 hom 22 3 11 8 T 17 16 367013 CASAVA_Build 8 121156708 1D TGCCCAGCTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 55 het 24 0 18 6 T 9 8 367014 CASAVA_Build 8 121159045 1I GCCTAAAACC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 54 het 27 0 19 8 T 7 8 367015 CASAVA_Build 8 121159758 2D GGACTCTGTC AA/-- AAAAAAAAAA 2188 het 45 hom 27 2 10 16 A 20 18 367016 CASAVA_Build 8 121167451 3I ATATATATAT ---/ATA TTTTTTTTTT 970 hom 7 het 3 0 3 0 ATA 0 1 367017 CASAVA_Build 8 121170915 1D AAAACCCTAG A/- AACTGGACTG 3070 hom 110 het 46 0 36 12 A 3 2 367018 CASAVA_Build 8 121174812 3D TTTCTTTCTC TTT/--- TTTTTTTTTT 2412 het 191 hom 32 4 10 18 T 21 18 367019 CASAVA_Build 8 121177288 1I AAAAAACCCG -/A AAATAGCAAC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 4 367020 CASAVA_Build 8 121180023 2D TGTGATAATC AT/-- GTGTTTTTTG 3070 hom 80 het 29 0 27 2 AT 1 0 367021 CASAVA_Build 8 121186044 1D CAGCCTGGCC T/- AACATGATGA 3070 hom 65 het 23 0 21 2 T 1 0 367022 CASAVA_Build 8 121186592 2I ACCAATATAT --/AA GAGTGCTCAT 3070 hom 126 het 45 0 43 2 A 0 2 367023 CASAVA_Build 8 121187791 2D TTTGTAAATC AT/-- ATGTTTTATT 3070 hom 87 het 34 0 30 5 AT 2 1 367024 CASAVA_Build 8 121194412 1D AGTCAAAATA C/- TTACCTTGGC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 C 1 0 367025 CASAVA_Build 8 121196644 1D ACTTTATAGA C/- CCCCTAGAGA 3070 hom 100 het 37 0 32 5 C 5 4 367026 CASAVA_Build 8 121197874 4D GATGGAATTC CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 114 het 39 0 39 1 CAAA 3 2 367027 CASAVA_Build 8 121212789 1D TGCAAATCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 415 hom 22 2 13 8 T 13 12 367028 CASAVA_Build 8 121213984 1I TTGTTTAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 381 hom 46 1 29 16 T 12 13 367029 CASAVA_Build 8 121214651 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 141 hom 18 2 15 1 A 14 13 367030 CASAVA_Build 8 121217806 2I CACACACTAC --/AT ATATATATAT 3070 hom 48 het 24 0 17 7 AT 7 8 367031 CASAVA_Build 8 121227858 2I TATACCTTAC --/TA TATAGTAAGG 3070 hom 123 het 45 0 42 3 TA 2 3 367032 CASAVA_Build 8 121231108 1D TGTTTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 88 hom 30 2 16 12 T 17 16 367033 CASAVA_Build 8 121237595 1I GGGTGACTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 11 12 367034 CASAVA_Build 8 121248766 5D GCTGATTTCC ATGAA/----- ATGAATGTAG 3070 hom 117 het 41 0 40 3 ATGAA 2 1 367035 CASAVA_Build 8 121252352 1D TATTTGCATT A/- AAAAAATTCT 3070 hom 93 het 34 0 32 3 A 7 6 367036 CASAVA_Build 8 121255306 4D CTGCAAAAAG ACAA/---- ACAAATCTAT 3070 het 3070 hom 42 20 20 6 ACAA 2 1 367037 CASAVA_Build 8 121255683 1D TGGATTGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 50 2 36 14 T 13 12 367038 CASAVA_Build 8 121283340 2I GAAGCAAAAT --/TC TGGGCCTATT 3070 hom 117 het 45 0 40 5 TC 0 1 367039 CASAVA_Build 8 121284774 1D AGATGGGGGT G/- GGGGGGGGTC 2706 het 2029 hom 25 7 8 10 G 9 8 367040 CASAVA_Build 8 121286520 1I TGTGGCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 737 hom 41 2 30 9 T 10 11 367041 CASAVA_Build 8 121288843 1I TATTTGTGCA -/T TTTTTTCTAC 3070 hom 105 het 42 0 36 6 T 6 7 367042 CASAVA_Build 8 121295325 1I ATTATATTGC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 888 hom 41 2 32 7 T 8 9 367043 CASAVA_Build 8 121296195 1I ATATACGGTG -/A AAAAAAAATA 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 8 9 367044 CASAVA_Build 8 121303420 1I TTAACATGGG -/T TTGTATTTTC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 2 3 367045 CASAVA_Build 8 121304192 1I CTATTCACTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 29 0 24 5 A 9 10 367046 CASAVA_Build 8 121314888 1I TGCCTGTTTC -/T TTTTTTTGTC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 8 367047 CASAVA_Build 8 121315534 4I TTTGGCTCTC ----/TGTT TGTCTATTAT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 TGTT 0 1 367048 CASAVA_Build 8 121321268 4I TTTTTGTTTG ----/TTTC TTTGCTTTTT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TTTC 0 1 367049 CASAVA_Build 8 121321604 1D TGCAAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 11 10 367050 CASAVA_Build 8 121328850 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 43 hom 20 1 17 2 A 11 12 367051 CASAVA_Build 8 121340059 1I TATGGCCAAG -/A AAAAAAAAAA 1265 het 1265 ref 44 32 3 9 A 10 11 367052 CASAVA_Build 8 121355226 1D ACAGTTTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 21 11 A 13 12 367053 CASAVA_Build 8 121356410 1I TTAGAAAAAA -/C AATCCTGAAA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 367054 CASAVA_Build 8 121358258 1I GTATAATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 A 9 10 367055 CASAVA_Build 8 121360973 1D TCTACTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 787 hom 33 5 14 14 A 16 15 367056 CASAVA_Build 8 121371818 1D CATTACCCAC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 105 het 43 0 36 8 A 8 7 367057 CASAVA_Build 8 121374888 1I GCAGTGTGTA -/T TTTTCCTGGG 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 4 5 367058 CASAVA_Build 8 121376016 1I ATATGAGATC -/T TTTGACATAC 3070 hom 108 het 43 0 36 7 T 3 4 367059 CASAVA_Build 8 121383748 2D CTATGTCCTG AA/-- AATGGTATTG 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 4 2 367060 CASAVA_Build 8 121395304 2D TCTAGATGTC AG/-- AGAGTCTAAC 3070 het 3070 hom 42 16 23 3 AG 3 2 367061 CASAVA_Build 8 121397565 1I CTATCCTGCA -/T CTATTTCCCT 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 T 0 1 367062 CASAVA_Build 8 121409818 1I TTTTTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2695 hom 33 12 14 7 T 13 14 367063 CASAVA_Build 8 121415806 7D CAATGTCATT CAAAATA/------- CAAAATACTT 3070 het 3070 ref 35 21 13 4 CAAAATA 2 1 367064 CASAVA_Build 8 121427652 1I TTTTCTTCCA -/C CATCTACAGG 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 C 1 2 367065 CASAVA_Build 8 121438148 1I ACTCTTTCTC -/A AAAAAAAAAA 1293 het 1293 ref 40 31 4 5 A 13 14 367066 CASAVA_Build 8 121438418 1I CTTTTATTGA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 46 18 24 4 T 8 9 367067 CASAVA_Build 8 121449194 1D CATTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1596 het 1596 ref 36 24 4 9 A 13 12 367068 CASAVA_Build 8 121458851 1I TATTTGGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 10 11 367069 CASAVA_Build 8 121475649 1I AAGCCTCTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 9 10 367070 CASAVA_Build 8 121478645 2D AGAGCTGTGC AG/-- AGTCTTGGCA 3070 het 3070 ref 29 19 8 4 AG 2 1 367071 CASAVA_Build 8 121495607 2D TACTTCATAA GT/-- GTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 12 4 GT 2 1 367072 CASAVA_Build 8 121496264 1D GGACCACTTT C/- CCCCCTACTA 3070 hom 97 het 39 0 30 10 C 6 5 367073 CASAVA_Build 8 121529288 5I AGAATGAACA -----/TCTTT TCTTTTATTG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 TCTTT 1 2 367074 CASAVA_Build 8 121535094 3I TACAGTTGAG ---/ATA ATAATAGTAT 3070 hom 39 het 27 0 22 5 ATA 2 3 367075 CASAVA_Build 8 121549502 3I GTATGCAAGA ---/AAG AAGAACTAGG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AAG 1 2 367076 CASAVA_Build 8 121553883 1I TTGCTTATAG -/T TTTGCAGTCT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 3 4 367077 CASAVA_Build 8 121562870 1D GAAGAGATCA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 T 9 8 367078 CASAVA_Build 8 121563533 11D CAAATCTCTG GGGTGGACCCA/----------- GGGTGTCAGT 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 GGGTGGACCCA 1 0 367079 CASAVA_Build 8 121564187 1D GTAGCGTGAT C/- TCGGCTCACT 2800 het 1248 hom 19 3 8 8 C 1 0 367080 CASAVA_Build 8 121566465 1I ATATACCACA -/T TTTTATTTAT 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 4 5 367081 CASAVA_Build 8 121574917 1D ATATATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 T 13 12 367082 CASAVA_Build 8 121578129 1D TGTTCCATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 11 10 A 13 12 367083 CASAVA_Build 8 121579007 3I ATTTTAGTTC ---/TTT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 T 0 3 367084 CASAVA_Build 8 121588045 2D TTTTCCCGAC TG/-- TGCTTTTTTT 580 het 580 ref 34 14 6 14 TG 2 1 367085 CASAVA_Build 8 121589032 1I ATTATACTGT -/G ATAAATATTG 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 G 0 1 367086 CASAVA_Build 8 121589405 1I TACTCTTTTT -/G ACAGAATGTC 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 G 0 1 367087 CASAVA_Build 8 121593956 1D ATCATTTATC A/- AAATATTAAA 3070 het 3070 hom 26 10 14 2 A 4 3 367088 CASAVA_Build 8 121595447 1D AGATCAGAGA T/- TTTTCAGTCC 3070 het 3070 ref 17 10 7 0 T 5 4 367089 CASAVA_Build 8 121596468 1D AGGAAATGAT A/- ACACTCCTTG 3070 het 3070 ref 34 19 12 3 A 2 1 367090 CASAVA_Build 8 121599566 2D ATAGGAAGAC TT/-- TTTAAATTTG 3070 het 3070 ref 40 22 17 2 T 5 3 367091 CASAVA_Build 8 121599973 1D ATGTTAGATC T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 47 17 25 5 T 8 7 367092 CASAVA_Build 8 121602209 7D TCTAGAATTA AAAAAAG/------- AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 7 AAAAAAG 3 2 367093 CASAVA_Build 8 121606584 1D TCTCAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 21 17 11 A 11 10 367094 CASAVA_Build 8 121608313 1D TTGCCTGGAA T/- TTTTTTTTTT 1725 het 1725 ref 42 22 5 15 T 17 16 367095 CASAVA_Build 8 121618357 2D ATGTATTTTA AT/-- ATGTTATTTA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 AT 2 1 367096 CASAVA_Build 8 121618562 1I CTAAAGCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 A 12 13 367097 CASAVA_Build 8 121620717 10D GGATTTGACA CAGTATGAAG/---------- CAGTACTAAA 3070 het 3070 ref 52 30 21 3 CAGTATGAAG 1 0 367098 CASAVA_Build 8 121641363 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 106 hom 31 1 23 8 A 10 9 367099 CASAVA_Build 8 121654816 4I TTTGAATCAG ----/TTTT TTTTCTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 4 8 367100 CASAVA_Build 8 121667158 1D GCAAATCCTG T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 8 7 367101 CASAVA_Build 8 121669953 1D GGAATAGCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 228 hom 36 1 31 5 T 12 11 367102 CASAVA_Build 8 121691960 1D AGGACTAAAG T/- TTTTTGTTTG 3070 hom 66 het 28 0 23 6 T 6 5 367103 CASAVA_Build 8 121692777 1I GAAGCTCTGG -/A AAAAAAAATC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 8 9 367104 CASAVA_Build 8 121694773 1I GCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1696 hom 28 4 19 5 A 12 13 367105 CASAVA_Build 8 121706154 4I ACATCAGATA ----/TGAG TGAGACTCAA 3070 hom 114 het 42 0 39 3 TGAG 1 2 367106 CASAVA_Build 8 121722527 1I ACTGTCAATC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 37 9 19 9 A 9 10 367107 CASAVA_Build 8 121725583 1I GAAATCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 149 hom 26 1 19 6 T 12 13 367108 CASAVA_Build 8 121748576 24D TTGCTGCAGT GGGACCATCATAGTTCACTGCAGC/------------------------ GGCACCATCA 3070 hom 47 het 20 0 14 8 GGGACCATCATAGTTCACTGCAGC 1 0 367109 CASAVA_Build 8 121755174 1D TGTCCCTCCC A/- AAGGCCAACC 2491 het 73 hom 26 1 12 13 A 3 2 367110 CASAVA_Build 8 121766077 1D AAAAATTGAA T/- TTTTTTTTTT 1859 het 1859 ref 29 13 8 8 T 17 16 367111 CASAVA_Build 8 121815868 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 25 13 6 6 A 15 14 367112 CASAVA_Build 8 121868885 1D GTAAAAAAAA C/- AACATAAATA 3070 het 3070 ref 25 14 8 3 C 1 0 367113 CASAVA_Build 8 121896165 1D ATTCCAGCAC T/- TTGGGAGGCC 2120 het 59 hom 10 1 6 3 T 3 2 367114 CASAVA_Build 8 121904189 1D AAAATAAAAT A/- AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 4 3 367115 CASAVA_Build 8 121917540 1D ATTGTGAGAC A/- GTAAATTTCT 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 A 1 0 367116 CASAVA_Build 8 121926770 1D TTTACAGGCT C/- CCCGGGAGTC 3070 hom 123 het 50 0 39 11 C 4 3 367117 CASAVA_Build 8 121940907 8I CCTATACATA --------/TTAGATAC TTAGATACTC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 TTAGATAC 1 2 367118 CASAVA_Build 8 121948179 12D TGTGTGTGTC TATATCTATCTA/------------ TATATCTATC 3070 het 3070 ref 41 20 15 12 TATATCTATCTA 2 1 367119 CASAVA_Build 8 121953165 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 364 hom 27 2 17 8 T 14 15 367120 CASAVA_Build 8 121962734 3I TCTCTGAAAT ---/AAG AAGAATGTGA 3070 hom 144 het 52 0 46 6 AAG 1 2 367121 CASAVA_Build 8 121994949 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 56 21 24 11 T 12 11 367122 CASAVA_Build 8 121999787 108D GATAAGAAGC ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACACATATATATATATATATATATATATATATATACACATATATATATATATATATATATACACAT/------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ATATATATAT 3070 hom 27 het 14 0 10 7 ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACACATATATATATATATATATATATATATATATACACATATATATATATATATATATATACACAT 1 0 367123 CASAVA_Build 8 122005351 2D CTCCAGTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2581 hom 41 12 21 8 T 14 12 367124 CASAVA_Build 8 122008342 1D CTGCAGGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1564 hom 39 9 12 18 T 17 16 367125 CASAVA_Build 8 122045725 6I GAAACACTTG ------/TTGTAC TTGTATTTTG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TTGTAC 0 1 367126 CASAVA_Build 8 122078882 3D TGACTTTTTA ATG/--- ATCTCCATTC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 ATG 1 0 367127 CASAVA_Build 8 122101914 1D AGAACTGGGT A/- AAAAGAGAAT 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 A 5 4 367128 CASAVA_Build 8 122151419 1I CCATCTCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 A 11 12 367129 CASAVA_Build 8 122156823 1D AAATGAAAGT A/- AAAAAAAAAA 1231 het 1231 ref 45 34 3 10 A 11 10 367130 CASAVA_Build 8 122191715 1I TTTTTCTAAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 8 9 367131 CASAVA_Build 8 122201260 1D AGCATCCTGG A/- AAAAAAAAAA 831 het 831 ref 34 23 3 8 A 13 12 367132 CASAVA_Build 8 122201923 1I ATAATGATAC -/T TTATAATATT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 3 367133 CASAVA_Build 8 122210349 1D AAGAAACTGG A/- AAACCCTATG 3070 het 3070 ref 37 25 9 3 A 4 3 367134 CASAVA_Build 8 122221796 1D TTTGCTTTGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 9 8 367135 CASAVA_Build 8 122230276 1I GTGTAAGGAA -/G GGGGTCCATT 3070 het 3070 ref 37 19 17 1 G 4 5 367136 CASAVA_Build 8 122230723 1I GAGCATGGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 8 9 367137 CASAVA_Build 8 122237819 4D TACTTCTAAA ACTC/---- AATAATAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 16 4 ACTC 1 0 367138 CASAVA_Build 8 122245507 1D TAAAAGGACT A/- AAAAAAAAAA 1138 het 1138 ref 58 46 3 10 A 11 10 367139 CASAVA_Build 8 122252785 1I AAATTTGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 32 0 26 6 T 11 12 367140 CASAVA_Build 8 122255344 1D ATCTCCTATG A/- AACTAGATAT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 2 367141 CASAVA_Build 8 122261135 18D CACAAATGGC TATTTGTGTAAATGACTG/------------------ TAAGAGTGAC 3070 hom 114 het 35 0 37 4 TATTTGTGTAAATGACTG 1 0 367142 CASAVA_Build 8 122261675 1D TGAAGATGTG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 46 19 23 4 A 9 8 367143 CASAVA_Build 8 122268606 2D CTTCCTAAAC TT/-- TATCAAATGT 3070 hom 147 het 54 0 49 7 T 3 1 367144 CASAVA_Build 8 122277138 1I ATATCTGCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 8 9 367145 CASAVA_Build 8 122299029 1D TTGCTTTGGC T/- ATGATAAACT 3070 het 3070 hom 33 10 20 3 T 1 0 367146 CASAVA_Build 8 122306843 2D AAAGAGCATA CT/-- CTTTTTGTTT 3070 hom 82 het 30 0 28 2 CT 2 1 367147 CASAVA_Build 8 122307834 1I TGTCTTGATG -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 84 het 37 0 29 8 A 9 10 367148 CASAVA_Build 8 122309052 1I CTTGGAAGAG -/T TTTTATAAGC 3070 hom 87 het 32 0 29 3 T 4 5 367149 CASAVA_Build 8 122309866 1I GTTTGAAAAT -/A TAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 0 1 367150 CASAVA_Build 8 122310958 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 25 0 21 5 AAG 1 0 367151 CASAVA_Build 8 122311620 1I TTTATCTCAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 219 hom 31 1 25 5 T 8 9 367152 CASAVA_Build 8 122312273 1I ATTTTCTTTT -/C CCCCAAATAC 3070 hom 66 het 28 0 22 6 C 4 5 367153 CASAVA_Build 8 122312359 1I GGAAAAGCTG -/T TTTTTTTACA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 T 7 8 367154 CASAVA_Build 8 122315143 2D GGTTTTCCTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 102 het 43 0 34 9 GT 8 7 367155 CASAVA_Build 8 122320034 1D GTGTTCAATA T/- GTGTTTAGTA 3070 hom 141 het 50 0 47 3 T 1 0 367156 CASAVA_Build 8 122320953 1I TAAGAAACAG -/A AAAAAAGTAA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 A 6 7 367157 CASAVA_Build 8 122321703 1D AAATTTAGGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 89 het 35 0 30 5 A 9 8 367158 CASAVA_Build 8 122323559 4I ACTCTCAATG ----/TTTC TTTCTGTAAA 3070 hom 132 het 48 0 45 3 TTTC 1 2 367159 CASAVA_Build 8 122327943 2D TTTTTTATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 29 4 9 16 T 14 12 367160 CASAVA_Build 8 122330049 1I AGGACATCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 A 9 10 367161 CASAVA_Build 8 122334726 1D AATGCATGAG T/- TTCCTAAGGC 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 T 3 2 367162 CASAVA_Build 8 122336458 1I CCTTCATATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 53 23 25 5 A 9 10 367163 CASAVA_Build 8 122340249 1D GTGTGATTCA G/- GGATGGATGT 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 G 3 2 367164 CASAVA_Build 8 122341433 6D TGCTAGTTCA ATAGAG/------ ATAGAGTTCC 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 ATAGAG 2 1 367165 CASAVA_Build 8 122343785 2D ATAAAAAATT AA/-- AACATTCAAC 3070 het 3070 hom 48 18 27 4 A 4 2 367166 CASAVA_Build 8 122352055 1I TCATTGTTAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 10 367167 CASAVA_Build 8 122379223 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 1818 hom 12 het 7 0 4 3 T 8 9 367168 CASAVA_Build 8 122382945 1D GGCAGTACAC A/- TAGCATTTAG 3070 het 3070 ref 40 20 15 9 A 1 0 367169 CASAVA_Build 8 122383237 16D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAAAA/---------------- AAAAAAAAAA 1668 het 1182 hom 12 5 6 2 A 27 11 367170 CASAVA_Build 8 122385074 2I ACCTTCTGAA --/AG AGGTGTGCAG 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 AG 1 2 367171 CASAVA_Build 8 122386500 2I TGTGTGTGCA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 14 16 7 TG 7 8 367172 CASAVA_Build 8 122391771 2I ATCTTCACTC --/TG TTGTTTACTT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 TG 0 1 367173 CASAVA_Build 8 122394727 1D TGTTCAGTTA T/- TTTTTTTAAC 3024 het 3024 ref 30 13 8 9 T 8 7 367174 CASAVA_Build 8 122398395 2D ACTCAAAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 21 9 T 13 11 367175 CASAVA_Build 8 122417739 1D ATTCAAGGAA T/- TTTTTTTTTT 2510 hom 8 het 27 0 8 19 T 19 18 367176 CASAVA_Build 8 122421807 1I TGATTAGTTG -/A AAAAATAAAC 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 5 6 367177 CASAVA_Build 8 122422465 2D GTTAACTAAC AT/-- ATCAATCATT 3070 het 3070 hom 33 11 16 9 AT 2 1 367178 CASAVA_Build 8 122426758 2I ATATTACCAT --/CA CTCTGCCAGT 3070 hom 123 het 44 0 40 4 CA 0 1 367179 CASAVA_Build 8 122441659 2D CTGCTATGTC AG/-- AGAGTTTCTC 2583 het 2583 ref 22 13 7 2 AG 3 2 367180 CASAVA_Build 8 122442612 1I ATAAAACACA -/T TTTTTTGAGA 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 T 6 7 367181 CASAVA_Build 8 122445282 1I TAAAATTCAA -/T TTTTTTGAAT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 6 7 367182 CASAVA_Build 8 122449025 10D TCTGTCTCCA AAAACAAAAC/---------- AAAACAAAAC 3070 hom 75 het 28 0 26 8 AAAAC 4 2 367183 CASAVA_Build 8 122455602 1I AGACAATGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 A 10 11 367184 CASAVA_Build 8 122462058 2D GAGCATAGGC AT/-- ATCTTCCAGA 3070 hom 114 het 41 0 38 3 AT 2 1 367185 CASAVA_Build 8 122465856 2I AGGAGCAGGC --/AA AGAGAGGAAG 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 1 3 367186 CASAVA_Build 8 122465955 3I AATGTGTCTT ---/CTC CACTCACCAG 3070 hom 107 het 44 0 36 8 CTC 0 1 367187 CASAVA_Build 8 122474940 3D CTACATTGAC TAA/--- TAATACATGA 3070 het 3070 hom 43 16 23 6 TAA 2 1 367188 CASAVA_Build 8 122478822 1D AAAAAAAAAA C/- AAAACAGGTA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 1 0 367189 CASAVA_Build 8 122479702 4D AAAGAAAGAA AAAC/---- AAAGAACTGA 3070 het 3070 hom 36 13 22 2 AAAC 1 0 367190 CASAVA_Build 8 122482359 1I GTTATTCTCC -/T TTTTTTTAAA 3070 het 720 hom 22 2 16 4 T 7 8 367191 CASAVA_Build 8 122506148 1D AAAAAAAACT A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 34 12 18 5 A 9 8 367192 CASAVA_Build 8 122511686 1D ATTTATATAG A/- AAAAAAAACC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 9 8 367193 CASAVA_Build 8 122517443 2D AGTCTGAAGG AA/-- AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 50 24 18 11 A 8 6 367194 CASAVA_Build 8 122519004 1I TAGCTACTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 105 het 41 0 35 6 T 9 10 367195 CASAVA_Build 8 122536695 1D ATCAACGCTG A/- AAAAAATTCC 3070 het 3070 hom 29 9 18 2 A 7 6 367196 CASAVA_Build 8 122537160 6I AGATTATTTT ------/TATTAA TATTAAGTAG 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 TATTAA 1 2 367197 CASAVA_Build 8 122538860 1D TAATCTTAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 T 11 10 367198 CASAVA_Build 8 122539225 4I AGCTTCTGAG ----/TATT TATTATGTGC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 TATT 1 2 367199 CASAVA_Build 8 122540578 1I CCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1781 hom 16 4 11 1 T 8 9 367200 CASAVA_Build 8 122545136 1I GGGCAGGGAC -/A GGGGCAGAAA 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 A 0 1 367201 CASAVA_Build 8 122578791 4I AATAAAAATA ----/TAAG TAAGTCCATA 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 TAAG 1 2 367202 CASAVA_Build 8 122584516 3D CTTGAGCTCT CTG/--- CTTTGATTGA 3070 het 3070 hom 38 15 22 3 CTG 1 0 367203 CASAVA_Build 8 122601739 1I ATTCATGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 A 10 11 367204 CASAVA_Build 8 122611323 1D CTGTAATCTT G/- GGAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 G 3 2 367205 CASAVA_Build 8 122626288 4D TCATTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTAAG 3070 het 3070 hom 35 13 19 3 TTTC 2 1 367206 CASAVA_Build 8 122628755 6D27M1I CAAAAAAGAA TATATGTATATATATGTATATATAATGATTTCA-/------TATATATATGTATATATAATGATTTCAG TTATATAAAA 3070 het 3070 hom 24 14 16 0 N/A 0 0 367207 CASAVA_Build 8 122629076 1D CCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 11 10 367208 CASAVA_Build 8 122639225 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTA 2282 het 2282 ref 25 10 8 7 T 10 9 367209 CASAVA_Build 8 122640794 3I ACACAAAACC ---/ACA ACAACAACAA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 ACA 3 4 367210 CASAVA_Build 8 122653389 1I TAACAATATG -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 7 8 367211 CASAVA_Build 8 122654959 1I TTGTGAAAAA -/G GGAGATAAAG 3070 het 3070 hom 36 17 16 3 G 2 3 367212 CASAVA_Build 8 122661323 2I TATTTCTTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 21 16 10 T 13 15 367213 CASAVA_Build 8 122664339 5D TTATTATTAA TAAAT/----- TTAATGTTAT 3070 het 3070 ref 27 17 10 2 TAAAT 1 0 367214 CASAVA_Build 8 122670940 2I ATTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 14 0 9 5 A 13 15 367215 CASAVA_Build 8 122673042 3I TGTCTTAAAA ---/AAC AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AAC 0 1 367216 CASAVA_Build 8 122681425 3D ACTTAAACAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 238 hom 42 3 16 25 A 17 14 367217 CASAVA_Build 8 122683981 2I AAAAAAAAAA --/CT CTGTATAGAA 1389 het 30 hom 22 1 11 10 CT 1 2 367218 CASAVA_Build 8 122684780 1D GAATCTCCAC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 45 het 23 0 14 10 T 8 7 367219 CASAVA_Build 8 122685530 2D AATCTAAGAC AG/-- AGAATAAAAA 3070 hom 104 het 41 0 35 7 AG 2 1 367220 CASAVA_Build 8 122688024 2D TGCCCGGCCT CA/-- CACAGTTCCT 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 CA 3 2 367221 CASAVA_Build 8 122688966 1D AGCTAATTTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 8 7 367222 CASAVA_Build 8 122692733 7D ATTCTTAGAA AACAGAT/------- AACACAAAAG 3070 het 3070 hom 38 17 17 6 AACAGAT 1 0 367223 CASAVA_Build 8 122693229 1I ATATCTTTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 8 9 367224 CASAVA_Build 8 122704108 1D TCATACAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 17 17 11 A 15 14 367225 CASAVA_Build 8 122734227 2I TGTCTACGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 41 16 16 9 TA 6 7 367226 CASAVA_Build 8 122735725 2D TATGCTGGGA TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 10 8 367227 CASAVA_Build 8 122744033 2D TATTATTAAT TA/-- TATATGTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 14 4 TA 3 2 367228 CASAVA_Build 8 122747060 1I ACCTTTTAGC -/A AATAAAAAGA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 2 3 367229 CASAVA_Build 8 122748594 2D TTAGCTAGAC AT/-- AAAGATTCTC 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 AT 1 0 367230 CASAVA_Build 8 122753372 1I AATCTGTAGA -/G GAAAGGATTC 3070 het 3070 ref 48 25 21 2 G 1 2 367231 CASAVA_Build 8 122761405 1D TTGAGACCCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 T 10 9 367232 CASAVA_Build 8 122762811 1D ATATGCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1970 hom 28 8 10 10 T 11 10 367233 CASAVA_Build 8 122766829 4I TCAGGGTCAT ----/AGAG AGATATAGCT 3070 het 3070 hom 33 10 18 5 AG 1 3 367234 CASAVA_Build 8 122769903 13D AGCTGCTTAC ATTTTCTATTGTA/------------- CATTTTCTAT 3070 het 3070 ref 33 19 13 6 ATTTTCTATTGTA 1 0 367235 CASAVA_Build 8 122772169 1D TTTAGATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 15 11 T 11 10 367236 CASAVA_Build 8 122773060 1D ACAGCACATC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 19 13 9 A 10 9 367237 CASAVA_Build 8 122779616 4I ACTCTCACAC ----/AGAG AGAGTATTTT 3070 het 3070 hom 37 13 19 5 AG 2 4 367238 CASAVA_Build 8 122783878 4D GTGAGTTGGG TTTT/---- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 13 9 367239 CASAVA_Build 8 122812878 1I AAAGTCTTGC -/A ATTTTTCAAA 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 A 1 2 367240 CASAVA_Build 8 122813114 4I CCATTTTAAT ----/TTTC TTTCTAAGAT 3070 het 3070 ref 45 24 16 5 TTTC 1 2 367241 CASAVA_Build 8 122826538 4D ATTATTTTTT CTTA/---- CTTATCATAC 3070 het 3070 ref 36 19 16 2 CTTA 2 1 367242 CASAVA_Build 8 122828562 1D TAACTTTATC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 37 17 16 5 A 8 7 367243 CASAVA_Build 8 122833345 1I ATGTAAGAGC -/T AATAATACTC 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 T 0 1 367244 CASAVA_Build 8 122833632 1D ATATGAGCAC A/- AAAAAATTAT 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 A 7 6 367245 CASAVA_Build 8 122834302 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2442 hom 19 7 11 1 A 15 14 367246 CASAVA_Build 8 122836487 1D CATAGAACTA T/- TATAAATATT 3070 het 3070 ref 30 13 13 5 T 2 1 367247 CASAVA_Build 8 122837504 1I TTCCTGCTTA -/G TACCATGTTT 3070 het 3070 hom 49 21 26 2 G 0 1 367248 CASAVA_Build 8 122847869 1D ACTTATTCAA G/- GGGGGAAAAA 2982 het 2982 ref 29 16 9 4 G 6 5 367249 CASAVA_Build 8 122881222 1I TCCATGCCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 33 1 27 5 T 12 13 367250 CASAVA_Build 8 122885844 1I AATCAAGGCC -/T TGGAGCATTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 1 2 367251 CASAVA_Build 8 122886408 1D ACCCAGAAGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 9 8 367252 CASAVA_Build 8 122889289 1D TTTAAAAAAC A/- AATAAGGACT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 A 3 2 367253 CASAVA_Build 8 122900748 2I ATTGGTTGAG --/TT TTTATCTAAA 3070 hom 108 het 37 0 37 0 T 3 5 367254 CASAVA_Build 8 122907677 1D TAGTTTACTG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 85 het 35 0 29 6 A 9 8 367255 CASAVA_Build 8 122909447 8D CAAAGTGCTG GGATTACA/-------- GGCATGAGCT 3070 hom 36 het 13 0 12 4 GGATTACA 1 0 367256 CASAVA_Build 8 122914353 1I AGGCAGCTTG -/C AGCTGGGGAT 3070 hom 123 het 46 0 40 6 C 0 1 367257 CASAVA_Build 8 122917029 1I TTATCATCAT -/C CTCCAAGCAC 3070 hom 111 het 40 0 37 3 C 1 2 367258 CASAVA_Build 8 122917174 1D AGAACTTCTC A/- AAAAGTTTCT 3070 hom 86 het 37 0 28 10 A 5 4 367259 CASAVA_Build 8 122918656 1D TTTTTTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 11 10 367260 CASAVA_Build 8 122920148 1D ACTGACAGTT C/- CCAAAGTTCA 3070 hom 113 het 41 0 38 3 C 3 2 367261 CASAVA_Build 8 122921481 1I TTTTTTCTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 T 9 10 367262 CASAVA_Build 8 122926047 5I25M1D GGCACAACAT -----AGAAATTGTATAACAACAGCTAAAAG/TTAGCTGTTGTTGTATAACAACAGCTAAAA- CTTCCTTCTT 3070 hom 103 het 52 1 57 4 N/A 0 0 367263 CASAVA_Build 8 122948360 1D GCTAATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 10 9 367264 CASAVA_Build 8 122949325 2I AGCACTGACA --/AC ACAACTCTAA 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AC 1 2 367265 CASAVA_Build 8 122964503 1D CATTGTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 30 1 26 4 T 13 12 367266 CASAVA_Build 8 122967583 1D27M2I AGAAAGAAAG AAAAAAAAAGAAATTCTGATTCTGGAAG--/-AAAAAAAAGAAATTCTGATTCTGGAAGAT ATATAGAGCC 3070 het 5 hom 11 1 11 5 N/A 0 0 367267 CASAVA_Build 8 122969712 2D TTGTCCATGA AG/-- AGAGATAGGA 3070 hom 81 het 31 0 28 4 AG 3 2 367268 CASAVA_Build 8 122970213 1D GGCCTGACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 53 hom 33 2 23 8 T 15 14 367269 CASAVA_Build 8 123008981 1D ACACTTCTAA T/- TTGTAATTTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 7 T 3 2 367270 CASAVA_Build 8 123013381 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 18 4 T 10 11 367271 CASAVA_Build 8 123027245 1D TTCCCCTGAA G/- GGTTCAGGAG 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 G 3 2 367272 CASAVA_Build 8 123049963 1D TATTCAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 12 8 A 11 10 367273 CASAVA_Build 8 123061256 1D ATTTACTTAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 13 15 4 T 9 8 367274 CASAVA_Build 8 123064696 1D TTTTTCAGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 T 16 15 367275 CASAVA_Build 8 123081095 4D CCCTCACTAG GGAT/---- GCCTCTAGGT 3070 het 3070 ref 45 29 11 6 GGAT 1 0 367276 CASAVA_Build 8 123082488 3I TCAGGTACTG ---/TGA TGATAGAAAT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 TGA 1 2 367277 CASAVA_Build 8 123091958 2I ATGTGCATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 41 24 13 4 AT 6 7 367278 CASAVA_Build 8 123092698 13D CCAGGAATGC TATGAAAGCTTTG/------------- TAGGAAAGCT 3070 het 3070 ref 43 22 21 2 TATGAAAGCTTTG 1 0 367279 CASAVA_Build 8 123093587 1D GCCTCCAGCT C/- CCATCTGTGG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 C 3 2 367280 CASAVA_Build 8 123094394 1I CAATTTTTGT -/A ATATAATGTA 3070 het 3070 ref 37 18 12 7 A 1 2 367281 CASAVA_Build 8 123097949 1D TGTATGTATA T/- TTTTTATCAC 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 T 6 5 367282 CASAVA_Build 8 123102614 1D TTTATTTGAC A/- AAAAAAAAAA 2209 het 2209 ref 18 6 6 6 A 12 11 367283 CASAVA_Build 8 123105108 4I8M5I GAGAAATGTC ----TATGTCTT-----/TATTTATGTCTTTTCTC TATTTTATTT 3070 het 3070 hom 28 11 19 2 N/A 0 0 367284 CASAVA_Build 8 123108082 6I CTCTCTCTCT ------/CTCTCC CTCTCCCTCT 3070 het 376 hom 40 2 28 10 CTCTCC 1 2 367285 CASAVA_Build 8 123118934 4D TATTTTTATG TATT/---- TATTTATTTA 3070 het 1501 hom 26 5 18 3 TATT 7 6 367286 CASAVA_Build 8 123131008 4D TTTCCCCTGG TTAA/---- TTGAGAGTAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 6 TTAA 1 0 367287 CASAVA_Build 8 123170221 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2088 het 2088 ref 23 14 7 2 T 15 14 367288 CASAVA_Build 8 123176944 2I CATAACCAGG --/TT TTTTTTTTTT 2277 het 2277 ref 20 7 7 6 T 13 15 367289 CASAVA_Build 8 123238415 1I AAATGGGGAT -/A ACAGAAGAAG 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 1 2 367290 CASAVA_Build 8 123238656 1I AAATAAATCA -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 T 6 7 367291 CASAVA_Build 8 123239330 1D TTCTACTCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 14 20 10 A 13 12 367292 CASAVA_Build 8 123245960 1D AAAATTTCCA C/- CCCCCCTAAG 3070 het 3070 hom 27 12 15 0 C 7 6 367293 CASAVA_Build 8 123247717 3I AAGATATTAA ---/AAC AACAAGAGTC 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 AAC 1 2 367294 CASAVA_Build 8 123250172 1D CCAGCACTTT G/- GGAGTCCAAG 2840 het 2664 hom 15 6 8 1 G 3 2 367295 CASAVA_Build 8 123250506 1I TTCACTCTAG -/T TTTTTTCTGT 3070 het 3070 ref 35 17 10 8 T 6 7 367296 CASAVA_Build 8 123251683 1I8M1I TCAGGATACA -TTTTAATC-/TTTTTAATCT TTTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 45 25 21 1 N/A 0 0 367297 CASAVA_Build 8 123252521 8D GGTGTTTGTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 T 19 11 367298 CASAVA_Build 8 123252876 3I AAAATATTTA ---/ATG ATGATTATAT 2740 het 2740 ref 20 8 7 5 ATG 1 2 367299 CASAVA_Build 8 123253226 12D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 het 1693 hom 22 6 13 5 A 23 11 367300 CASAVA_Build 8 123256539 1D AGGTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1220 het 1220 ref 23 14 5 4 T 17 16 367301 CASAVA_Build 8 123257805 1I TTTGAAATTA -/T TTTGCTCAAT 3070 het 1002 hom 25 3 18 4 T 3 4 367302 CASAVA_Build 8 123257818 1I GCTCAATTTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 839 hom 23 4 14 5 A 9 10 367303 CASAVA_Build 8 123260841 2I GACCTCCCTC --/AT ATTTTACTGA 3070 het 3070 ref 43 25 16 2 AT 1 2 367304 CASAVA_Build 8 123267053 1I ATTTATAATG -/A TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 34 14 13 7 A 0 1 367305 CASAVA_Build 8 123286691 16I CATATATAAC ----------------/CCAAGACTCCACATTT CCATCCATTT 3070 het 3070 ref 30 17 12 3 CCAAGACTCCACATTT 0 1 367306 CASAVA_Build 8 123286899 1D ATGTATGTAT G/- GCTGCATTTG 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 G 2 1 367307 CASAVA_Build 8 123294182 10I ACCCTCAATA ----------/AATGCAAATT AATGCAAATT 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 AATGCAAATT 1 2 367308 CASAVA_Build 8 123299348 1I GAATTGGTAC -/A AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 8 9 367309 CASAVA_Build 8 123303587 3I GAAATCTGAA ---/ATG ATGAATCCTT 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 ATG 1 2 367310 CASAVA_Build 8 123314851 1D ATAACATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 25 17 6 T 11 10 367311 CASAVA_Build 8 123316362 1I AGCATTTTTT -/A AAGAGTAATT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 A 2 3 367312 CASAVA_Build 8 123335492 1D GTTGGAAGAA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 39 13 20 7 T 9 8 367313 CASAVA_Build 8 123337491 4D GATTTCAACC CAGA/---- CAGTCTGAGT 3070 het 3070 ref 45 22 20 5 CAGA 1 0 367314 CASAVA_Build 8 123339989 1D GTAAAGTCAC A/- AAAATGCATG 3070 het 3070 hom 42 14 25 3 A 5 4 367315 CASAVA_Build 8 123352493 2D TGCTTGACTC TT/-- ATTAATTTTC 3070 het 3070 hom 62 26 34 2 T 2 0 367316 CASAVA_Build 8 123357973 1I CGATTTTTTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 A 9 10 367317 CASAVA_Build 8 123367248 1I TATTTATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 9 9 T 10 11 367318 CASAVA_Build 8 123367387 1D ACAAATGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 T 15 14 367319 CASAVA_Build 8 123391171 1D ATATAGTACA G/- GGGGAAAGAT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 G 5 4 367320 CASAVA_Build 8 123393785 29D GTCTGATGCT GCCATTAGCTTATGTGAATTGAGCTTGGA/----------------------------- GCCATTAGCT 3070 hom 81 het 33 0 27 18 GCCATTAGCTTATGTGAATTGAGCTTGGA 2 1 367321 CASAVA_Build 8 123394212 1D TCACCACTTG A/- TACTTAACCA 3070 het 3070 hom 39 17 20 3 A 1 0 367322 CASAVA_Build 8 123403998 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 27 1 24 3 A 13 12 367323 CASAVA_Build 8 123426275 1I AAAGCAGAAT -/A AGGGAAAGGG 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 A 1 2 367324 CASAVA_Build 8 123431286 1I ACATTGCCTG -/C CCCCCCCACC 1696 het 1696 ref 34 17 8 9 C 7 8 367325 CASAVA_Build 8 123437246 8D TTGCCTGACG ACTTACCA/-------- ACTTACCAGG 3070 het 3070 hom 44 17 22 6 ACTTACCA 2 1 367326 CASAVA_Build 8 123439617 3I3M1I GTTTATAGAA ---CCA-/ATGCTAC AGATTTTTGC 3070 hom 51 het 19 0 18 1 N/A 0 0 367327 CASAVA_Build 8 123440423 1I TGGTCCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 10 16 16 T 14 15 367328 CASAVA_Build 8 123453163 1D ATGAGGAGGG T/- TTTTTTTTTT 2676 het 2220 hom 33 14 9 10 T 17 16 367329 CASAVA_Build 8 123468183 3I ACATAACAAA ---/TGT TGTCTGATTC 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 TGT 1 2 367330 CASAVA_Build 8 123470719 1I GGGAAGGGGA -/G GGGGGAAGAG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 G 5 6 367331 CASAVA_Build 8 123472998 4I GTTGTGAGAA ----/ACTG ACAGACATAC 3070 het 3070 hom 47 24 22 1 ACTG 0 1 367332 CASAVA_Build 8 123475046 1I TATTTTCACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 T 10 11 367333 CASAVA_Build 8 123475190 1I ATTCTTGTAA -/G GGATGTGTTA 3070 het 3070 hom 53 21 26 6 G 2 3 367334 CASAVA_Build 8 123476294 1D TTAATGCCCA G/- GGCTATCTCA 3070 het 3070 ref 45 25 19 1 G 3 2 367335 CASAVA_Build 8 123480935 2I TCCAAATAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 A 10 12 367336 CASAVA_Build 8 123482529 4D CAGCAAAGAG ACTT/---- ACAGCTGAAA 3070 het 3070 ref 37 20 14 4 ACTT 1 0 367337 CASAVA_Build 8 123493510 2D GCATCCTGTG TA/-- GAGAGCTATA 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 TA 1 0 367338 CASAVA_Build 8 123508262 1I ACAAAAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 14 5 A 10 11 367339 CASAVA_Build 8 123513325 11D ATACCACAAA TTGTTACTCCT/----------- TTGTATGTGG 3070 het 3070 ref 44 26 17 4 TTGTTACTCCT 1 0 367340 CASAVA_Build 8 123515786 1D TTCTTTTTTG T/- TTACCCATGA 981 het 981 ref 30 12 4 14 T 3 2 367341 CASAVA_Build 8 123531472 1D TGTTGTCGGG T/- TTTTTTGTAT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 7 6 367342 CASAVA_Build 8 123536066 1D AGTCAGGAAT C/- AATAGAGGTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 1 0 367343 CASAVA_Build 8 123575663 2I GTTTGAAGTT --/GG GTAACATGAT 3070 hom 72 het 25 0 25 0 G 1 3 367344 CASAVA_Build 8 123586391 2I ATTAACAGAC --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 51 21 27 3 T 9 11 367345 CASAVA_Build 8 123604638 1D CCTTTATAAG A/- AAAAAAACAG 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 8 7 367346 CASAVA_Build 8 123617243 1I AGACTCTCTT -/C CTGGCCCGTG 3070 het 3070 ref 39 16 13 10 C 1 2 367347 CASAVA_Build 8 123618015 1D CCTCCCCCCC A/- ACCCCCCACC 2422 hom 16 het 16 0 6 10 A 2 1 367348 CASAVA_Build 8 123619263 1I CAGCTCAGTT -/A AAAACCGCCA 3070 het 3070 ref 31 17 12 2 A 4 5 367349 CASAVA_Build 8 123637482 1I CTCAAGCCCT -/A ACTGAGTCGC 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 1 2 367350 CASAVA_Build 8 123642415 1I CAGGAATCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 T 11 12 367351 CASAVA_Build 8 123652362 1D TAGCCCCCTG C/- CCCCCCGACA 1494 het 331 hom 8 2 4 2 C 7 6 367352 CASAVA_Build 8 123676703 4I TCTCAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 1804 het 1804 ref 16 10 4 2 AAAC 2 3 367353 CASAVA_Build 8 123677959 1I CTTGCACCAT -/C CCTATGGCTA 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 C 2 3 367354 CASAVA_Build 8 123681061 1D AATACTGGTA T/- TGATAAGATT 3070 het 3070 ref 46 21 20 6 T 2 1 367355 CASAVA_Build 8 123682652 4I CATGGTTCTC ----/TTAA TTATCATTTT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 TTAA 0 1 367356 CASAVA_Build 8 123692878 1I AGAAAGATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 24 6 A 12 13 367357 CASAVA_Build 8 123693238 1I18M1D TTGTAACTGG -CAGTGGTCTTCTCCACCTC/CCAGTGGTCTTCTCCACCT- CCCGTGTCTT 3070 het 3070 hom 37 17 25 9 N/A 0 0 367358 CASAVA_Build 8 123695657 1I CACAACTTGG -/C CCCATAACCC 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 C 3 4 367359 CASAVA_Build 8 123724624 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1299 hom 22 7 8 7 T 11 10 367360 CASAVA_Build 8 123744147 5D TCCACCCCAT CCCAG/----- CCAACTGTTC 3070 hom 74 het 30 0 23 9 CCCAG 1 0 367361 CASAVA_Build 8 123754056 1I GTATAAATAA -/G GGTTTTATTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 G 2 3 367362 CASAVA_Build 8 123769036 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 465 hom 21 1 11 10 A 13 12 367363 CASAVA_Build 8 123773064 4D TAAATAAATT AATA/---- AATAAATAAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 AATA 4 3 367364 CASAVA_Build 8 123779325 1D TGGTTGCCCC T/- CTTATTTGAT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 T 1 0 367365 CASAVA_Build 8 123785515 1I CACTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 A 12 13 367366 CASAVA_Build 8 123853589 1D CCACGCTCAT C/- CCCCACACTG 3070 hom 129 het 45 0 44 2 C 5 4 367367 CASAVA_Build 8 123858167 1I AATAGTGCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 37 0 28 9 T 10 11 367368 CASAVA_Build 8 123858847 2I TCTATAAACT --/TC TGTTTTCTCC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 TC 0 1 367369 CASAVA_Build 8 123879044 1I GACACTTAGT -/C CAGCGCCGTC 3070 het 3070 ref 50 26 18 6 C 1 2 367370 CASAVA_Build 8 123880826 1I AATTTTTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 51 22 21 8 G 0 1 367371 CASAVA_Build 8 123882705 4D AATAAAATAA TTAC/---- TTAAGTAAAC 3070 het 3070 hom 36 10 26 2 TTAC 1 0 367372 CASAVA_Build 8 123887073 2D TAAGAGCTTC TG/-- TCCTAATAGA 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 TG 1 0 367373 CASAVA_Build 8 123887157 3D ACATCGAAAT TTC/--- TAAGTTGTGT 3070 het 3070 ref 40 21 18 1 TTC 1 0 367374 CASAVA_Build 8 123959493 2D GTAAAAGTTC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 75 het 37 0 25 12 TG 10 9 367375 CASAVA_Build 8 123984390 1D TCCACTCGGG A/- AGCTGGTGAG 3070 hom 111 het 42 0 37 6 A 2 1 367376 CASAVA_Build 8 124012388 1D GGTCCTGGTG T/- TATCATGGGA 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 T 2 1 367377 CASAVA_Build 8 124013732 3I CACAAGTTTA ---/TTC TTCTCTTTAA 3070 het 3070 hom 52 21 26 5 TTC 1 2 367378 CASAVA_Build 8 124014827 4I CATAAAACCA ----/GAAT TGATTGTTTC 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 GAAT 0 1 367379 CASAVA_Build 8 124018309 1D CCAATAAAAG C/- CCCAGAATGG 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 C 4 3 367380 CASAVA_Build 8 124023085 1D TAGTTGCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2286 hom 32 9 10 13 A 16 15 367381 CASAVA_Build 8 124036671 1D GGGGAGGGCT G/- GTGGGAGGGA 1016 het 1016 ref 15 9 4 4 G 2 1 367382 CASAVA_Build 8 124046146 1D GTATCAATTC T/- TTTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 5 T 8 7 367383 CASAVA_Build 8 124059966 1D CCCTCCGTGA C/- CCCCTGTCTG 3070 het 3070 hom 48 19 26 3 C 5 4 367384 CASAVA_Build 8 124071393 2I ATATAAACAG --/AT ATGTTATATA 2873 het 2873 ref 36 22 7 7 AT 1 2 367385 CASAVA_Build 8 124071454 2I15M2I ATGTAACATA --TGTTACATATATAAC--/TGTGTTACATATATAACAT ATGTAACATA 3070 het 3070 ref 40 35 9 6 N/A 0 0 367386 CASAVA_Build 8 124098271 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTG 2578 het 2578 ref 20 9 8 3 T 9 10 367387 CASAVA_Build 8 124113557 1D TGGATTTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 60 het 25 0 20 5 T 10 9 367388 CASAVA_Build 8 124117278 1I GAATCTAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 18 10 T 11 12 367389 CASAVA_Build 8 124141091 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 27 1 20 6 T 11 12 367390 CASAVA_Build 8 124158841 1I CGAAAGTGGG -/A AAAAAACAGA 3070 hom 63 het 28 0 22 6 A 6 7 367391 CASAVA_Build 8 124158955 3I TTATTGCTAA ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 22 0 18 4 T 13 16 367392 CASAVA_Build 8 124160265 1I TCACAAAGTA -/C CCCCCCCACA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 C 7 8 367393 CASAVA_Build 8 124161023 4I ATTTCATGAC ----/AGAA TAATGAACTT 3070 hom 96 het 38 0 33 5 AGAA 0 1 367394 CASAVA_Build 8 124162813 1I GATTGGGCTC -/T CCAGGAGCCA 3070 hom 85 het 47 1 42 4 T 0 1 367395 CASAVA_Build 8 124163306 2D CTCCCACAAC AT/-- GTGGGAATTA 3070 hom 48 het 23 0 12 13 AT 1 0 367396 CASAVA_Build 8 124166196 1D TCCATCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 17 9 T 11 10 367397 CASAVA_Build 8 124167610 1I CACGCTGCTA -/C CCCCTCCTCC 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 C 4 5 367398 CASAVA_Build 8 124169407 6D AGTTCAAGAA CAGCCT/------ CAGCCTGGCC 3070 het 3070 ref 23 10 10 4 CAGCCT 2 1 367399 CASAVA_Build 8 124169611 1I CTCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 683 hom 31 3 16 12 A 13 14 367400 CASAVA_Build 8 124184851 1I CCTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 24 3 16 5 T 11 12 367401 CASAVA_Build 8 124192152 3I CTTTAACATA ---/AGT AGTACACTAT 3070 het 3070 ref 33 19 14 0 AGT 1 2 367402 CASAVA_Build 8 124199687 1I TGAATAGCAT -/C GTGCCAGTGT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 0 1 367403 CASAVA_Build 8 124209989 3I TTATAAACAT ---/AAA AAGAAAGTTT 3070 het 3070 ref 36 23 11 2 A 2 5 367404 CASAVA_Build 8 124213185 1D CAGTTTCAGC T/- GTTTTAAGTC 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 1 0 367405 CASAVA_Build 8 124219813 1I AGCAAATTAT -/A AAGGTAATTA 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 2 3 367406 CASAVA_Build 8 124232559 18I CATATCAAAT ------------------/GGTTATTTGGTAACCTTA GGTTATTTGG 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 GGTTATTTGGTAACCTTA 0 1 367407 CASAVA_Build 8 124241214 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2357 het 1657 hom 13 6 7 0 A 13 12 367408 CASAVA_Build 8 124246143 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 8 19 1 A 12 13 367409 CASAVA_Build 8 124269465 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1960 hom 15 5 8 2 T 11 12 367410 CASAVA_Build 8 124278520 1D TGAGCCAGTT A/- CCTGTGGCTG 1990 het 1990 ref 22 9 9 4 A 1 0 367411 CASAVA_Build 8 124281611 2I AACAAAACCT --/CA CTCTTTCATA 3070 het 3070 ref 45 25 14 6 CA 0 1 367412 CASAVA_Build 8 124297372 1D ATAAGCCATT A/- AAAAAAAAAA 1149 het 1149 ref 27 14 3 11 A 12 11 367413 CASAVA_Build 8 124351395 1D TTTAACCTCT C/- CCCCCACAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 C 6 5 367414 CASAVA_Build 8 124354395 1D GCTCTTCGCA T/- TTTTTTTTTT 1859 het 1859 ref 35 20 5 10 T 13 12 367415 CASAVA_Build 8 124372395 1D AGTTTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 1591 het 1591 ref 32 13 6 13 T 17 16 367416 CASAVA_Build 8 124402858 1D AAGGTACTGA T/- GTAGTTAGAG 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 T 1 0 367417 CASAVA_Build 8 124414278 2D TATATATATA TT/-- CTTGCTTAAA 3070 hom 105 het 40 0 35 7 T 2 0 367418 CASAVA_Build 8 124431296 1D CATCTCTATT A/- AAAAAAAAAA 1477 het 1477 ref 30 17 4 9 A 17 16 367419 CASAVA_Build 8 124467442 1D GGCTACTCAC A/- AAAAAAAAAA 2045 het 2045 ref 35 23 6 6 A 15 14 367420 CASAVA_Build 8 124484237 3D TCTCAATGCC AAT/--- AATAATAATA 3070 hom 54 het 26 0 19 7 AAT 9 8 367421 CASAVA_Build 8 124491974 1I TCCCAAAGTG -/C TGGGATTACA 2739 hom 21 het 9 0 7 2 C 0 1 367422 CASAVA_Build 8 124497022 1D ATAAACACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 52 hom 30 2 19 9 T 12 11 367423 CASAVA_Build 8 124502516 1D TATTTATTCA T/- TTTTTTGAGA 3070 hom 8 het 16 0 10 7 T 7 6 367424 CASAVA_Build 8 124503531 4I GCCACTGTGC ----/CTGT CTATCTGCTT 3070 hom 24 het 11 0 9 2 CTGT 0 1 367425 CASAVA_Build 8 124518089 2D ACAGAGGTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 11 9 367426 CASAVA_Build 8 124519129 11D ATCTCAAAAA AAAAAAAAAAC/----------- AAAAAACAAA 2959 het 569 hom 16 4 8 10 AAAAAAAAAAC 1 0 367427 CASAVA_Build 8 124522462 1I CCAAAGACTC -/A GGGGGTCCCC 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 A 0 1 367428 CASAVA_Build 8 124525471 1I CTATTTAAAC -/T TTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 T 5 6 367429 CASAVA_Build 8 124526952 1I TTGGTGTGCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 A 8 9 367430 CASAVA_Build 8 124527958 11I TCCTCCCTCT -----------/GTGTCTGTACA GGAGAGCTTT 3070 het 3070 ref 35 20 13 3 GTGTCTGTACA 0 1 367431 CASAVA_Build 8 124528453 4D GCTTGAATAT TCTG/---- TCTGTCTATC 3070 het 3070 ref 41 18 12 11 TCTG 2 1 367432 CASAVA_Build 8 124528566 1I ATAAATATGC -/T TTTTTCACTG 3070 het 3070 ref 28 14 8 6 T 5 6 367433 CASAVA_Build 8 124528764 1I TATGAACGTG -/T TTCTTTTTTA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 T 2 3 367434 CASAVA_Build 8 124531964 1D TCCAAGGAGA C/- CTCTCATGAC 3070 het 3070 hom 51 18 26 8 C 2 1 367435 CASAVA_Build 8 124532187 2D CCAATAACTC TT/-- TGCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 24 21 4 T 3 1 367436 CASAVA_Build 8 124559910 1D TTTGCAAATT A/- TGATAAGTGC 3070 hom 96 het 36 0 33 3 A 1 0 367437 CASAVA_Build 8 124573722 2D23M1D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGAAAGA/--AAAAAAAAAAAGAAGAAAGAAAG- AAAAAAAGAA 3070 hom 36 het 13 0 12 5 N/A 0 0 367438 CASAVA_Build 8 124576477 1D TTAGTAGAGA G/- GGGGGTTTCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 6 5 367439 CASAVA_Build 8 124623116 1D CGGCACCGCG C/- CCGCCGGGCG 1959 hom 19 het 9 0 7 2 C 3 2 367440 CASAVA_Build 8 124628212 1I TCTGAAAGGG -/T TTTTTTTTTT 1595 het 1595 ref 29 18 4 7 T 12 13 367441 CASAVA_Build 8 124639120 1D CAGTGAGCTG A/- AATTGTGCCA 3070 hom 60 het 22 0 18 4 A 3 2 367442 CASAVA_Build 8 124652892 1I ATTAAGTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 11 12 367443 CASAVA_Build 8 124653552 5D TTTACAAAGG GGGGA/----- GGGGAGGGGC 3070 het 3070 hom 33 12 15 10 GGGGA 2 1 367444 CASAVA_Build 8 124667525 1D ACTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 348 hom 39 7 11 21 T 15 14 367445 CASAVA_Build 8 124673586 1D AAAGACTGCC T/- TTGTTCTGAC 3070 het 3070 ref 35 20 10 6 T 3 2 367446 CASAVA_Build 8 124688139 1I GGATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 10 11 15 T 13 14 367447 CASAVA_Build 8 124723337 1D AAACAAAAAC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 62 het 26 0 24 2 A 9 8 367448 CASAVA_Build 8 124723473 55D3M5D GGTGTGCAAG GTGTAAGTCGAAATTATGTAGGGTGAAGAGGTAAGAGAGGTGTGTATCAGGTAGTGGCAACTG/-------------------------------------------------------GGC----- CACATGCCAA 3070 hom 57 het 14 0 19 3 N/A 0 0 367449 CASAVA_Build 8 124740359 1D CAAGGAAGTG T/- TATTTATCCA 3070 het 3070 hom 48 24 22 3 T 2 1 367450 CASAVA_Build 8 124741853 2D ATTTGGTGAC AG/-- AGAGTTTGAC 3070 hom 90 het 31 0 31 0 AG 3 2 367451 CASAVA_Build 8 124751646 2D CTTCCTCCTC CT/-- CCTCCTTTGA 383 het 383 ref 10 4 3 4 CT 1 0 367452 CASAVA_Build 8 124777979 1D CTGCTCCCCC A/- CCCCCCCCAC 3070 hom 72 het 30 0 23 7 A 1 0 367453 CASAVA_Build 8 124781676 1I GCATTATATA -/C AGCTGCAGAG 3070 hom 102 het 38 0 35 3 C 0 1 367454 CASAVA_Build 8 124783678 1I AAATGGAGAG -/T TTTTTTTGGT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 T 7 8 367455 CASAVA_Build 8 124792439 1I GATACAGGGG -/A AAAATCACAC 3070 hom 105 het 42 0 32 10 A 4 5 367456 CASAVA_Build 8 124816535 1D AGTAAAACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2003 hom 45 11 14 20 A 17 16 367457 CASAVA_Build 8 124818833 1D CAACAGTTTT C/- CCCCCGGACA 3070 hom 126 het 44 0 42 2 C 6 5 367458 CASAVA_Build 8 124826203 2D GAAAGGAGAC AA/-- GAGAGAGAGA 3070 het 3070 ref 45 28 12 8 A 2 0 367459 CASAVA_Build 8 124832365 1I TTTTTTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 595 hom 30 3 21 6 T 10 11 367460 CASAVA_Build 8 124850720 1I TTCCAGGGGG -/T AGGGAAAGTC 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 0 1 367461 CASAVA_Build 8 124851136 4I TACTAAAGAA ----/AGAT AGACGTAAAC 3070 het 3070 hom 47 15 26 6 AGAT 0 1 367462 CASAVA_Build 8 124851408 3I ACAGAGTCTC ---/CTT CTGTTGCCCA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 CTT 0 1 367463 CASAVA_Build 8 124869075 1I ATTTTGTTTC -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 T 7 8 367464 CASAVA_Build 8 124896127 3D TGGTCCTCTT AAG/--- GAGGGAGAGT 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 AAG 1 0 367465 CASAVA_Build 8 124904183 1D AGACCATTTA G/- AATACTCTAT 3070 het 3070 hom 27 10 13 4 G 1 0 367466 CASAVA_Build 8 124917918 5D ATCTATAATC ACTTG/----- ACTTGACTTT 3070 het 3070 ref 47 23 18 7 ACTTG 2 1 367467 CASAVA_Build 8 124927127 1D ATTTCTTAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2570 hom 20 6 12 2 T 11 10 367468 CASAVA_Build 8 124941113 1D CCAATGCTAT C/- CCCTCCCCCT 3070 hom 19 het 10 0 9 1 C 4 3 367469 CASAVA_Build 8 124957908 1I CTTGGCTACA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 8 9 367470 CASAVA_Build 8 124961095 5I GTGCCACTAA -----/TATCT TATGTGTATT 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TATCT 0 1 367471 CASAVA_Build 8 124969119 2D TTGAAATTGT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 90 het 36 0 29 7 TG 6 5 367472 CASAVA_Build 8 124969539 1I TGATATTCTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 16 het 26 1 16 9 T 9 10 367473 CASAVA_Build 8 124980065 2I TATTCCATTT --/TA TATATATATA 2675 het 196 hom 11 1 6 4 TA 7 8 367474 CASAVA_Build 8 124980270 2D ATACATATAT AC/-- ACACACACAC 2029 hom 21 het 15 0 8 7 AC 10 9 367475 CASAVA_Build 8 124982962 5D GCTGGGTTTG GGTTT/----- GGTTTGGTTT 3070 hom 51 het 26 0 18 9 GGTTT 3 2 367476 CASAVA_Build 8 124988230 2D TCTCCGGAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 4 hom 25 1 16 9 A 16 14 367477 CASAVA_Build 8 124989221 1I ATAGGAAGGA -/G GTTCAAACAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 G 1 2 367478 CASAVA_Build 8 124991171 29D GTGACAATGA TAGCTGTCCTTGTCAACTAGGGGATGATG/----------------------------- TAGCTGTCCT 3070 hom 87 het 39 0 29 18 TAGCTGTCCTTGTCAACTAGGGGATGATG 2 1 367479 CASAVA_Build 8 124993708 4I TTTAAAAAAA ----/AAAG AAGAAGAAGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AAAG 0 1 367480 CASAVA_Build 8 125011388 1I GATGGCACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 T 13 14 367481 CASAVA_Build 8 125011771 2I CTCCCTGACA --/TT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 9 11 367482 CASAVA_Build 8 125030201 1I GCATCTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3005 het 3005 ref 33 18 9 6 T 13 14 367483 CASAVA_Build 8 125073755 1D GGCCCTAGGA T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 7 6 367484 CASAVA_Build 8 125094460 1I ATCCCTATGT -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 A 6 7 367485 CASAVA_Build 8 125103277 1I GCTTTATTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 9 10 367486 CASAVA_Build 8 125104247 3D AGATGAGAAA AGT/--- AGGCTACCAA 3070 het 3070 hom 30 15 13 2 AGT 1 0 367487 CASAVA_Build 8 125104337 8D ACTTTATTTA TTTATTTT/-------- TTTTTTTGAG 2661 het 2661 ref 16 6 7 3 TTTATTTT 1 0 367488 CASAVA_Build 8 125106638 4I ACAATTTATT ----/TATG TTTTTGTTGC 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 TATG 0 1 367489 CASAVA_Build 8 125107266 1I TCATCTATGA -/T TTCTTAGAAT 3070 het 3070 ref 33 19 13 1 T 2 3 367490 CASAVA_Build 8 125108132 2D ATAGATGTGA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 22 13 6 T 11 9 367491 CASAVA_Build 8 125113671 1D CATGGTGAAA C/- CCTATCTCTA 789 het 789 ref 8 5 3 0 C 3 2 367492 CASAVA_Build 8 125114467 1D TTTGGTGATA G/- GCTTGCAGGC 3070 hom 111 het 46 0 37 11 G 2 1 367493 CASAVA_Build 8 125139401 1D GCTTAGTTTC T/- TCTTGTTAAT 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 2 1 367494 CASAVA_Build 8 125154486 1I TACCTTTTTT -/C CCCCTGCAGA 3070 het 33 hom 40 1 36 3 C 4 5 367495 CASAVA_Build 8 125156716 10D TTCTATTTTA AAATTGTTTT/---------- ATTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 36 17 20 4 AAATTGTTTT 1 0 367496 CASAVA_Build 8 125160885 1D AATTACATCT A/- AAAAAATGCC 3070 hom 141 het 54 0 48 6 A 7 6 367497 CASAVA_Build 8 125164590 4D TCAAATTATA CTCT/---- CTTAGTTATT 3070 hom 102 het 35 0 35 2 CT 3 1 367498 CASAVA_Build 8 125166840 4I GTTGTTGGTA ----/TGTT TGTTTCCATT 3070 hom 51 het 21 0 17 4 TGTT 1 2 367499 CASAVA_Build 8 125167588 2I CATTCAGCCA --/CT CTGTGTCTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CT 1 2 367500 CASAVA_Build 8 125175130 3D ATTCATTGAT TTC/--- TTGTTTGTCT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 TTC 1 0 367501 CASAVA_Build 8 125175348 1D CTGTGGCCCC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 5 T 8 7 367502 CASAVA_Build 8 125178511 8D ATATATATAT ATATATAC/-------- ATACATACAT 3070 hom 69 het 25 0 23 3 ATATATAC 1 0 367503 CASAVA_Build 8 125180771 4D TACAACACTG TTTC/---- TTCTCTACGG 3070 hom 175 het 63 0 59 5 TTTC 1 0 367504 CASAVA_Build 8 125189768 2D TAAAGTATGT AC/-- ACCTCATGAG 3070 hom 111 het 43 0 38 8 AC 2 1 367505 CASAVA_Build 8 125203361 4I ATGGCATATA ----/ATAT ATATATACAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AT 3 5 367506 CASAVA_Build 8 125208613 1D CATTCATGAG T/- TTAGGGGTTG 3070 hom 120 het 42 0 41 4 T 3 2 367507 CASAVA_Build 8 125213104 1D ACAGAAAACA G/- GAAAAAAAAA 3070 het 313 hom 29 1 25 4 G 2 1 367508 CASAVA_Build 8 125226822 1D AATACCCATT C/- CCCCTCGCCT 3070 hom 126 het 46 0 43 3 C 5 4 367509 CASAVA_Build 8 125227657 1D TGGTAATCAG A/- AAAAAAAGAT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 8 7 367510 CASAVA_Build 8 125232253 1I TCATAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1182 hom 32 3 23 6 A 10 11 367511 CASAVA_Build 8 125234591 2I AGTGCATTTT --/AA AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 9 11 367512 CASAVA_Build 8 125235742 1D TAAAAACTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 38 het 19 0 13 6 T 10 9 367513 CASAVA_Build 8 125236067 1D TCAATTCATC A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 93 het 37 0 32 5 A 8 7 367514 CASAVA_Build 8 125238284 4I AAAGGGATTG ----/TTTC TTTCTTGTTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 TTTC 1 2 367515 CASAVA_Build 8 125239051 1I ATATTTATTC -/T TCTAATCCAT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 1 2 367516 CASAVA_Build 8 125245994 1D TACTCCCATT C/- CCCAGTGGTA 3070 hom 108 het 39 0 35 4 C 4 3 367517 CASAVA_Build 8 125288153 1D GTTTTAGAAT A/- AAACCATGTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 A 4 3 367518 CASAVA_Build 8 125292640 26D AGTGTGATTG ACACCAGATTCACCTGCCATTTATGC/-------------------------- ACACCAGATT 3070 het 3070 hom 35 16 16 8 ACACCAGATTCACCTGCCATTTATGC 2 1 367519 CASAVA_Build 8 125312631 1I TTAGTTTCCA -/T TTTTTAATTT 3070 hom 84 het 29 0 29 0 T 5 6 367520 CASAVA_Build 8 125318199 2I AAAAAGAGAA --/AG AAGAGGAAAA 3070 hom 126 het 45 0 43 2 AG 0 1 367521 CASAVA_Build 8 125337149 1D GAGACTTGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 23 18 8 T 10 9 367522 CASAVA_Build 8 125337994 1I CTTTTTCCAT -/A AGCTCAAGGA 3070 het 3070 ref 29 18 8 3 A 1 2 367523 CASAVA_Build 8 125338642 6D GCCATCTGTG CTCAGC/------ CTCCATTAGT 3070 het 3070 hom 53 23 28 3 CTCAGC 1 0 367524 CASAVA_Build 8 125340102 3I AGGAAAAAGT ---/TCA TCAAGGAAAT 3070 het 3070 hom 48 24 23 1 TCA 1 2 367525 CASAVA_Build 8 125341686 1D AATGAGGTTT A/- TTTTTATGTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 A 1 0 367526 CASAVA_Build 8 125344743 2I TATCTAGTCC --/AG AGAGACGATG 3070 hom 117 het 46 0 36 10 AG 2 3 367527 CASAVA_Build 8 125352097 1D GGTGCTTTCC A/- AGCCTTTCTG 3070 het 3070 hom 47 18 21 9 A 2 1 367528 CASAVA_Build 8 125352285 3D ACTTCTAGCA TAG/--- TAGTTCTAGC 3070 het 3070 ref 63 32 25 6 TAG 2 1 367529 CASAVA_Build 8 125354379 1I AAAATGGGGT -/A AAAAAATGTC 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 A 6 7 367530 CASAVA_Build 8 125360160 1D TAATCTTGGC T/- GTGTCTCTGA 3070 hom 144 het 51 0 49 2 T 1 0 367531 CASAVA_Build 8 125369871 1I GTAGGGCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 A 11 12 367532 CASAVA_Build 8 125371977 1I AACTGGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 770 hom 26 2 18 6 T 14 15 367533 CASAVA_Build 8 125386578 1D ATTGGTAAAT A/- TTTTTTTAAA 2800 het 2800 ref 21 14 6 1 A 1 0 367534 CASAVA_Build 8 125393710 18D AGAATGTCAC ATTATTTGTGCATGTTAT/------------------ ATATTTATTT 3070 het 3070 ref 28 18 12 5 ATTATTTGTGCATGTTAT 1 0 367535 CASAVA_Build 8 125393967 6D CCAAAATACT ATTTTA/------ ATTTTAAGTT 3070 het 3070 hom 27 12 15 2 ATTTTA 2 1 367536 CASAVA_Build 8 125396737 1D TATCCTACAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 27 0 23 4 T 10 9 367537 CASAVA_Build 8 125397123 2I TTTTCAACTC --/TG TTATTTTGAG 3070 hom 50 het 18 0 17 1 TG 0 1 367538 CASAVA_Build 8 125409208 2D CTGACATTAA TC/-- TCTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 TC 2 1 367539 CASAVA_Build 8 125410533 3D AAGATCAAGG ACA/--- ACATTTTTAA 3070 het 3070 hom 29 12 16 3 ACA 2 1 367540 CASAVA_Build 8 125419774 2D AGAATAGATT CC/-- TATAAGTGGC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 2 0 367541 CASAVA_Build 8 125420788 1D AAGCTATAGC A/- AAAAAGTTAT 2921 het 2921 ref 17 8 6 3 A 6 5 367542 CASAVA_Build 8 125421946 6D TCTTCACAGT CATTAA/------ CATTAAAATT 3070 het 3070 ref 44 24 19 5 CATTAA 2 1 367543 CASAVA_Build 8 125422102 1D TAAGCAATCC A/- AGCATAATTA 3070 het 3070 ref 50 25 23 3 A 2 1 367544 CASAVA_Build 8 125423247 1I CTTAATAAAG -/T TTTTTTTTTT 1610 het 1610 ref 44 29 4 11 T 11 12 367545 CASAVA_Build 8 125429313 1D ATAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 20 2 12 6 T 17 16 367546 CASAVA_Build 8 125429703 1D TTCATGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 1 T 11 10 367547 CASAVA_Build 8 125430758 1I TTCAGATACA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 11 11 10 T 8 9 367548 CASAVA_Build 8 125438240 1I AGTGTTCTTC -/A CCACCTCAGC 3070 het 3001 hom 25 10 10 5 A 0 1 367549 CASAVA_Build 8 125438481 2D CTAGGATATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 32 0 23 11 T 14 12 367550 CASAVA_Build 8 125439229 1D CTTTTTTTTT A/- TATATATTTT 3070 het 93 hom 12 2 10 0 A 1 0 367551 CASAVA_Build 8 125460353 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAGATT 3070 hom 66 het 26 0 23 4 A 7 6 367552 CASAVA_Build 8 125463371 1I ACCTCAAGAG -/A AAAAAAAATT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 8 9 367553 CASAVA_Build 8 125466054 1D TAGTCTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 311 hom 38 2 24 16 A 17 16 367554 CASAVA_Build 8 125469427 1I TCAAATGGAC -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 129 het 48 0 42 6 T 8 9 367555 CASAVA_Build 8 125485441 1I TCTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2101 het 135 hom 12 1 7 4 A 15 16 367556 CASAVA_Build 8 125492269 1D CTGAATGGGC A/- AAAAACTGAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 6 5 367557 CASAVA_Build 8 125499678 1D CTTCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1546 hom 22 5 12 6 A 10 9 367558 CASAVA_Build 8 125500746 5D TTAATAACAT TATAA/----- TATAATTTAA 748 het 748 ref 16 7 4 7 TATAA 2 1 367559 CASAVA_Build 8 125500799 1D ACCAGACTGC T/- CTACTTATTT 2990 hom 18 het 12 0 7 6 T 1 0 367560 CASAVA_Build 8 125500937 1I TTTTGAGACA -/G GAGTCTCGCT 2688 het 2688 ref 23 15 7 1 G 1 2 367561 CASAVA_Build 8 125502298 4D ATTAACCCGT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 33 18 11 5 TTTA 4 3 367562 CASAVA_Build 8 125527655 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1108 het 338 hom 18 3 5 11 T 17 16 367563 CASAVA_Build 8 125545680 4I ATAGGTGGAT ----/AGAC AGACTGTCTC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 AGAC 1 2 367564 CASAVA_Build 8 125546223 1D19M1I AGTAGGCTGC TTGAATGCCAAGATATCCCC-/-TGAATGCCAAGATATCCCCA TTCACAGTAA 3070 het 3070 hom 44 20 21 6 N/A 0 0 367565 CASAVA_Build 8 125547980 1D CAGCAAAGGA G/- GTGTATCAGC 3070 het 3070 hom 60 18 38 6 G 2 1 367566 CASAVA_Build 8 125552967 2D TGTGTGTATT CA/-- CACACACACA 1733 het 766 hom 29 7 8 16 CA 10 9 367567 CASAVA_Build 8 125554088 1D AAGCTGTGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2450 hom 30 9 13 9 A 12 11 367568 CASAVA_Build 8 125561562 1D CCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 12 5 A 12 11 367569 CASAVA_Build 8 125570246 4I TAACAGTTAT ----/TAAG TAAGTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 19 5 TAAG 1 2 367570 CASAVA_Build 8 125570826 1I CTTTCCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 34 1 23 10 T 10 11 367571 CASAVA_Build 8 125572177 1D CAGGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 13 20 12 T 12 11 367572 CASAVA_Build 8 125577649 1I TTTAGAGCAG -/T TTTTAGGTTT 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 4 5 367573 CASAVA_Build 8 125584094 4I GCAACTGACG ----/GAAC GAACTATTAG 3070 het 3070 ref 29 17 11 1 GAAC 1 2 367574 CASAVA_Build 8 125586959 2D AAACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1425 het 1425 ref 33 15 5 13 A 16 14 367575 CASAVA_Build 8 125597899 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 2128 het 2128 ref 22 9 6 7 T 13 14 367576 CASAVA_Build 8 125598084 4D TTGGTATATT TTTG/---- TTTGTTTAAC 3070 het 3070 hom 37 14 21 3 TTTG 2 1 367577 CASAVA_Build 8 125614889 1D TGAGGCCTGA G/- GGGGTGGCAA 3070 het 3070 ref 44 22 15 8 G 5 4 367578 CASAVA_Build 8 125619370 1D AACGTCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 11 10 367579 CASAVA_Build 8 125621708 1D TATTGATTTG A/- CAGAATTTGC 3070 het 3070 ref 48 27 18 4 A 1 0 367580 CASAVA_Build 8 125627054 1D GGGCTCAAGC A/- ATCCTCCTGT 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 2 1 367581 CASAVA_Build 8 125629412 1I ATCCCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2327 hom 29 6 14 9 A 10 11 367582 CASAVA_Build 8 125633172 1D CCAAAAAACA T/- TTACCCAGAA 3070 hom 70 het 27 0 24 3 T 3 2 367583 CASAVA_Build 8 125653793 1D TTATATTTAT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 9 8 367584 CASAVA_Build 8 125654310 1D CTGGGATTAC A/- GGCATGTACC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 1 0 367585 CASAVA_Build 8 125655769 3D TTCCTTAATC ATT/--- ATTACATAAC 3070 hom 117 het 44 0 39 7 ATT 2 1 367586 CASAVA_Build 8 125656994 2I GTAGGGTGGG --/TT TTTTTTGTTG 3070 hom 70 het 34 0 23 11 T 6 8 367587 CASAVA_Build 8 125658331 4D TAAGAAAAAT ACTC/---- AGCTCCCGGC 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 ACTC 1 0 367588 CASAVA_Build 8 125661595 5I CTTGCAGCTC -----/TGTTT TGTTTGTGGC 3070 hom 72 het 30 0 25 5 TGTTT 1 2 367589 CASAVA_Build 8 125672442 1I GATGCCTAAC -/A AATACTCAGG 3070 hom 98 het 37 0 31 6 A 2 3 367590 CASAVA_Build 8 125675416 1D AATCAGTACC A/- ACAGGGATTG 3070 het 3070 ref 51 26 20 6 A 2 1 367591 CASAVA_Build 8 125680652 1D CGCCTGTAAT C/- CCCAACACTT 1726 het 1726 ref 16 8 5 3 C 4 3 367592 CASAVA_Build 8 125681465 13D TGTACTACAA AAAAAAAAAAAAC/------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 19 13 10 AAAAAAAAAAAAC 1 0 367593 CASAVA_Build 8 125686285 1D GGAAACAAAA C/- CCACACACAA 3070 hom 88 het 34 0 30 4 C 3 2 367594 CASAVA_Build 8 125690709 1D AACCACACTC T/- TCCATTTAAC 3070 het 2710 hom 43 7 24 12 T 2 1 367595 CASAVA_Build 8 125698437 34D ATTAGGATTA CATAAGTGGTAAACCAACAGATGGAAATGCTGTC/---------------------------------- CATAAGTGGT 3070 het 3070 ref 36 20 11 16 CATAAGTGGTAAACCAACAGATGGAAATGCTGTC 2 1 367596 CASAVA_Build 8 125701095 1D CTTTTCAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 45 13 23 9 T 10 9 367597 CASAVA_Build 8 125707430 2D AGCAGGAAAC TG/-- TGCAGAGTCT 3070 het 3070 ref 42 23 16 3 TG 2 1 367598 CASAVA_Build 8 125710093 1D ATTATAGGCA T/- TTTGTCAGCT 3070 het 3070 hom 36 15 18 5 T 4 3 367599 CASAVA_Build 8 125716127 1D TTGTAGCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 14 30 5 A 12 11 367600 CASAVA_Build 8 125718030 14D CCTGACTGCC TCTGTGTCCATTTA/-------------- TCTATGATCA 3070 het 3070 ref 36 22 18 5 TCTGTGTCCATTTA 1 0 367601 CASAVA_Build 8 125719054 4I TGGGGCCTAC ----/AGGA AGGAAACAGG 3070 het 3070 hom 44 14 19 11 AGGA 1 2 367602 CASAVA_Build 8 125723385 1I ATAAGTGTGA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 T 8 9 367603 CASAVA_Build 8 125726250 4I ATTATGATTC ----/AGTA AGTATAAGAG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 AGTA 1 2 367604 CASAVA_Build 8 125727521 1D TTTTAAAGGC A/- TTCCTGGGCC 3070 het 3070 ref 42 18 19 6 A 1 0 367605 CASAVA_Build 8 125729027 1I GTTCTAATAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 108 het 38 0 35 3 A 9 10 367606 CASAVA_Build 8 125736882 1D AGAACAGGGA G/- GGGTTGCCAC 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 G 4 3 367607 CASAVA_Build 8 125755334 2D GCCACCCAAC TG/-- TGAAATCCAT 3070 het 3070 ref 37 22 11 6 TG 2 1 367608 CASAVA_Build 8 125763667 1D AGTCAGAGCA G/- GGGTGGGGAC 3070 hom 96 het 35 0 33 3 G 4 3 367609 CASAVA_Build 8 125766591 1I ATCTCCAGAA -/C CTTTTCATCA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 C 1 2 367610 CASAVA_Build 8 125769770 2I GTATGTGTGT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 54 het 70 1 60 9 TG 5 6 367611 CASAVA_Build 8 125772653 1D TAAAACAATA T/- TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 30 15 9 7 T 8 7 367612 CASAVA_Build 8 125773801 1D TTTTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2510 het 2510 ref 22 8 9 5 A 11 10 367613 CASAVA_Build 8 125780852 1D GCTCAGCTCT G/- ATAACTTAAG 3070 het 3070 hom 60 23 31 7 G 1 0 367614 CASAVA_Build 8 125781561 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 886 het 886 ref 11 6 3 2 A 11 12 367615 CASAVA_Build 8 125788744 1D TGAGGCAGGA G/- GATCACTTGA 3070 het 1818 hom 19 6 11 2 G 2 1 367616 CASAVA_Build 8 125791873 1D AAGTTGGTCT C/- CCCCACCCCA 3070 hom 111 het 43 0 33 10 C 5 4 367617 CASAVA_Build 8 125797108 1D TCCATAGCCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 46 19 15 13 T 10 9 367618 CASAVA_Build 8 125797710 1I GAAACAAAGA -/G GGGAGGAAGC 3070 hom 157 het 61 0 53 8 G 3 4 367619 CASAVA_Build 8 125803102 15I CAGAGTGATG ---------------/GGATTACAGGTGTGA GGCACCTCGC 3070 hom 45 het 17 0 14 3 GGATTACAGGTGTGA 0 1 367620 CASAVA_Build 8 125804941 1D TAAATAGGGA G/- GGGGTTTTCA 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 5 4 367621 CASAVA_Build 8 125806778 4I AAATTATTCC ----/CTTT TTTTATTGTT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTTT 0 1 367622 CASAVA_Build 8 125814912 1D GCCCAGGTAT G/- GGATGTTTTA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 3 2 367623 CASAVA_Build 8 125820191 2D AGCAGACAGC AG/-- ACTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 AG 1 0 367624 CASAVA_Build 8 125820939 1I GAGCACAACA -/C CCCCTGGCTC 3070 het 3070 hom 51 19 23 9 C 4 5 367625 CASAVA_Build 8 125825166 2D TTTATGTAAA TC/-- TCTCTCTCTT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 TC 5 4 367626 CASAVA_Build 8 125825621 4I TGAAAGAGAA ----/AGAG AGCGGGATTT 3031 hom 24 het 15 0 8 7 AG 1 3 367627 CASAVA_Build 8 125826056 2D TAGGCATAAC TA/-- TGTGAAATGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 TA 1 0 367628 CASAVA_Build 8 125828551 1I CAAGAAAATT -/A AAAAACATAT 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 A 5 6 367629 CASAVA_Build 8 125829199 1D GCAATCCACC T/- GCCTTAGATT 3070 het 3070 ref 32 19 13 0 T 1 0 367630 CASAVA_Build 8 125897136 1I TGCTGGTTTT -/C ATTTCAACCT 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 C 0 1 367631 CASAVA_Build 8 125900408 2I34M4I GAAGTTGCAA --ATATATATATGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGT----/ATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGAGA GAGAGTGTGT 3070 het 3070 ref 38 26 19 8 N/A 0 0 367632 CASAVA_Build 8 125903036 1I ATGTTAGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 13 14 367633 CASAVA_Build 8 125928121 6I GACACTTGTT ------/TGAGTA TGAGAGCATG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 TGAGTA 0 1 367634 CASAVA_Build 8 125932838 2I TCTACACTTC --/TG CACCAACCCA 3070 hom 94 het 39 0 29 10 TG 0 1 367635 CASAVA_Build 8 125938908 8I AGGAGCAGGG --------/CTCTCACA CTCCCACTGG 3070 hom 112 het 42 0 37 6 CTCTCACA 0 1 367636 CASAVA_Build 8 125947598 1D CATCCATTAG A/- AATCTCACAA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 3 2 367637 CASAVA_Build 8 125955957 9I CGATGTGGAC ---------/ATTTTAAAG ATATTGATTC 3070 hom 102 het 44 0 35 9 ATTTTAAAG 0 1 367638 CASAVA_Build 8 125956323 2I TGACTTTCTC --/TT TTTTTATTTG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 5 7 367639 CASAVA_Build 8 125970208 1D ATTGAGGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 43 0 26 17 T 16 15 367640 CASAVA_Build 8 125972756 1D ATTATTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 141 hom 28 2 20 6 T 12 11 367641 CASAVA_Build 8 125977291 1I GGAAGTCCTT -/A AAGACACAAC 3070 het 3070 hom 54 22 25 7 A 2 3 367642 CASAVA_Build 8 125978241 1D TTTCATCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 21 8 A 11 10 367643 CASAVA_Build 8 125978252 1D AAAAAAAAAA C/- AGTCGATAAC 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 C 1 0 367644 CASAVA_Build 8 125978711 1D GCCTCCTGTT C/- CTAAGAACTC 3070 het 3070 ref 45 30 12 3 C 2 1 367645 CASAVA_Build 8 125981239 1I GGCAGGCTGC -/T CCCAAAATGG 1764 het 925 hom 32 7 11 14 T 0 1 367646 CASAVA_Build 8 125991109 1D TCATCTTTGG A/- AAAAAAAAAA 2820 het 1992 hom 19 6 8 6 A 13 12 367647 CASAVA_Build 8 125993106 1D ACCGTGAGGT C/- CCACTCCAGC 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 C 3 2 367648 CASAVA_Build 8 125999991 3D GTTGTTCCCA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1110 hom 42 14 19 9 T 24 21 367649 CASAVA_Build 8 126007042 1I ACTTGTTTGC -/T TTTATCTCCT 3070 het 3070 ref 53 25 19 9 T 3 4 367650 CASAVA_Build 8 126009351 1I GATGGCTCTT -/C CCATTTTTCC 3070 het 3070 ref 48 27 13 8 C 2 3 367651 CASAVA_Build 8 126012449 2D ACCCACTGAC TG/-- TGAGAGATGA 3070 het 3070 hom 40 16 19 7 TG 2 1 367652 CASAVA_Build 8 126030683 1D GGCAGACCTA C/- CCTCAATATG 3070 het 3070 ref 36 17 13 6 C 3 2 367653 CASAVA_Build 8 126035910 1I GAAATGCAGC -/A AAAATGTGTT 3070 het 3070 hom 45 18 19 8 A 4 5 367654 CASAVA_Build 8 126040249 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 T 7 6 367655 CASAVA_Build 8 126063249 5D AGAGTTGTAA TCACT/----- TCATAACAGC 3070 het 3070 ref 51 27 20 6 TCACT 1 0 367656 CASAVA_Build 8 126064045 3I AATGTATCAT ---/ATC ATTTAATTTA 3070 het 3070 hom 33 11 21 1 ATC 0 1 367657 CASAVA_Build 8 126064956 1D TAAAAATAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 18 8 7 3 A 8 7 367658 CASAVA_Build 8 126065696 2D GCCATGAATA AG/-- AGTGTGGGGA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 AG 2 1 367659 CASAVA_Build 8 126065950 1D ATTAAAGTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 13 13 4 A 10 9 367660 CASAVA_Build 8 126074777 4I GTTGGCTGTA ----/TACT TAATGTTTTA 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 TACT 0 1 367661 CASAVA_Build 8 126075706 4D AATAAAAAAT AAAG/---- AAAATTTTGA 3070 het 3070 hom 35 15 19 2 AAAG 1 0 367662 CASAVA_Build 8 126083218 4D TCCTTTTTGC TTGA/---- TTATTTTTTA 3070 het 3070 ref 44 21 20 4 TTGA 1 0 367663 CASAVA_Build 8 126086794 1D TCCAGAAGCA T/- TCACAGTTTC 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 T 2 1 367664 CASAVA_Build 8 126088871 1D ATGTTGTGAT G/- GGGAGTTCAG 3070 hom 84 het 34 0 27 8 G 4 3 367665 CASAVA_Build 8 126092348 3I TTAACAGAGG ---/CTT CTTCTGCTCC 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 CTT 1 2 367666 CASAVA_Build 8 126095531 3D TTATTCTGTC AAT/--- GATGATAAAA 3031 het 3031 ref 29 16 8 7 AAT 1 0 367667 CASAVA_Build 8 126097348 2D51M2D TGTCTTGCCC CTCTCTCCTGGCCTGTAAGATTTCCACTAAGTCTACTGCCAGACATACTAGAGCT/--CTCTCCTGGCCTGTAAGATTTCCACTAAGTCTACTGCCAGACATACTAGAG-- CCATTGTTTG 3070 het 3070 ref 30 27 13 12 N/A 0 0 367668 CASAVA_Build 8 126097633 4I CCCTCATCTT ----/TCTC TCTATCTCCT 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 TC 1 3 367669 CASAVA_Build 8 126100905 3I GCTATTTGGG ---/ACT ACTATATAGC 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 ACT 1 2 367670 CASAVA_Build 8 126103855 3I44M1D GACCTTGATT ---TCCTCATCTATCCAGTGAAGCAATTTGATAAGGTTATTTTCTTTA/TCCTCCTCATCTATCCAGTGAAGCAATTTGATAAGGTTATTTTCTTT- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 30 19 24 2 N/A 0 0 367671 CASAVA_Build 8 126105526 2D CACATGACAC AG/-- ATTGTGTGGC 3070 het 3070 hom 50 14 27 10 AG 1 0 367672 CASAVA_Build 8 126114287 2D GCAGAAATCA AG/-- AGAGTGGAAG 3070 het 3070 ref 39 20 16 5 AG 3 2 367673 CASAVA_Build 8 126115481 1I ATAAAAAAAA -/C AATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 C 0 1 367674 CASAVA_Build 8 126125398 1I CCGCCTCAGG -/C TAGTTTCAGG 3070 hom 102 het 39 0 33 6 C 0 1 367675 CASAVA_Build 8 126143068 3D TTGGAGGGCA AAG/--- AAGAGACCAA 3070 het 3070 ref 36 18 12 7 AAG 2 1 367676 CASAVA_Build 8 126158169 1D GTCTTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2368 hom 33 9 14 10 A 17 16 367677 CASAVA_Build 8 126161689 3D GGCTTCATAA GCC/--- AATATTTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 14 8 GCC 1 0 367678 CASAVA_Build 8 126171354 5D TATATAAACT TTATA/----- TTAAATTTTT 3070 het 3070 hom 26 9 15 3 TTATA 1 0 367679 CASAVA_Build 8 126189458 1D AGCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 16 12 5 A 10 9 367680 CASAVA_Build 8 126198963 5D CCTTTTTTAT TTTTA/----- TTTTATTTTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 6 TTTTA 2 1 367681 CASAVA_Build 8 126210778 2D GGATACTTAA AC/-- ATCTTTTTAA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 AC 1 0 367682 CASAVA_Build 8 126243150 5I GAACCCAGGA -----/GGCAG GGGTTGCAGT 3070 het 2379 hom 19 6 11 2 GGCAG 0 1 367683 CASAVA_Build 8 126251156 1D GAACATTTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 10 9 367684 CASAVA_Build 8 126251352 1D CTGGGAGTGC T/- TTTTTTTTTT 1542 het 1542 ref 37 25 5 8 T 11 10 367685 CASAVA_Build 8 126251523 1D CATTTGTAGC T/- GTAACCTAGT 3070 het 3070 ref 44 25 17 2 T 1 0 367686 CASAVA_Build 8 126273951 4I ATATGGTAGC ----/AATT AAATAGGGAA 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 AATT 0 1 367687 CASAVA_Build 8 126329149 2I ATTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 137 hom 30 1 26 4 A 15 17 367688 CASAVA_Build 8 126342955 1D ATTCAGCACA C/- TTCAGGCATT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 1 0 367689 CASAVA_Build 8 126344353 1D TGCCTCCGCG A/- AAAAAGGTTG 3070 hom 91 het 33 0 31 4 A 6 5 367690 CASAVA_Build 8 126346584 1I CTTTATTTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 73 het 30 0 24 6 T 9 10 367691 CASAVA_Build 8 126354271 2I ACACGTATAT --/AC ACACACACAC 2576 hom 21 het 8 0 8 0 AC 5 6 367692 CASAVA_Build 8 126357196 1I AATATCCAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 34 15 12 7 T 9 10 367693 CASAVA_Build 8 126365622 1D TTTAGAGAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 50 het 21 0 17 4 A 12 11 367694 CASAVA_Build 8 126367740 1D CTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3017 het 1809 hom 20 5 11 4 T 15 14 367695 CASAVA_Build 8 126372228 1D TACCACCACC A/- AAAACCCAAG 3070 het 3070 hom 52 22 23 7 A 5 4 367696 CASAVA_Build 8 126373645 1D CTATGGGAGG A/- AAAAAAAAAA 1514 het 1514 ref 45 33 5 7 A 12 11 367697 CASAVA_Build 8 126375806 2I ACTGCCAGAC --/TG TTTTCCAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 16 1 TG 0 1 367698 CASAVA_Build 8 126379258 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 A 10 11 367699 CASAVA_Build 8 126394625 4D AAAGAGAGAG AGAA/---- AGAAAGAAAG 3070 het 3070 ref 39 18 13 10 AGAA 4 3 367700 CASAVA_Build 8 126396536 1D GACTAGAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 16 13 4 T 10 9 367701 CASAVA_Build 8 126397223 1I16M6D GTTGGTACCC -TTTTTTTTCCCTCTCTTTTTTA/TTTTTTTTTCCCTCTCT------ AAGTCAGGGT 3070 het 3070 ref 37 15 17 7 N/A 0 0 367702 CASAVA_Build 8 126406367 1I TGTGTTGGAG -/T TGGGGAGTAG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 1 2 367703 CASAVA_Build 8 126410277 1I TCCAAGGTCA -/T TTAGTCCCAA 2779 het 2779 ref 26 17 6 3 T 2 3 367704 CASAVA_Build 8 126413013 1I AAAAACGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 T 11 12 367705 CASAVA_Build 8 126419709 1I TGTTGGGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1904 hom 36 5 26 5 A 14 15 367706 CASAVA_Build 8 126437660 1D CTGTGTGTAT G/- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 hom 32 14 15 5 G 9 8 367707 CASAVA_Build 8 126442492 1D TATGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 21 3 13 5 T 13 12 367708 CASAVA_Build 8 126458353 4D CTTCCAGGCT CAAA/---- CAATTTTCCC 3070 het 3070 hom 25 10 15 2 CAAA 1 0 367709 CASAVA_Build 8 126459106 22D GCATAAACAA GGCTATTTAGGGATGGTAAAAC/---------------------- TTGGATGCTA 3070 hom 72 het 26 0 25 6 GGCTATTTAGGGATGGTAAAAC 1 0 367710 CASAVA_Build 8 126474935 1I TTTTCTTCTT -/C TTTTTTTTTT 387 het 387 ref 25 7 6 12 C 0 1 367711 CASAVA_Build 8 126475630 1I TATTTATTTA -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 T 6 7 367712 CASAVA_Build 8 126506097 1I GGTCTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 T 10 11 367713 CASAVA_Build 8 126513692 2I AATAGGGAGG --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 1944 hom 20 7 10 3 A 9 11 367714 CASAVA_Build 8 126516351 1D AGGAAGGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 702 hom 55 4 37 16 A 13 12 367715 CASAVA_Build 8 126526598 1D CAAATCCCAG C/- TCTATTGCTG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 1 0 367716 CASAVA_Build 8 126528004 1I AATTTTTGTA -/T TTTTCTGTAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 T 4 5 367717 CASAVA_Build 8 126544013 1I AAAAATCTGA -/T TTTTTTTGAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 8 367718 CASAVA_Build 8 126550886 2I CTGTACTTCC --/TT TTTTTTTTCC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 10 367719 CASAVA_Build 8 126552105 1I GTTGGGGGGT -/A GGGGTTGAAG 3070 hom 83 het 31 0 27 4 A 0 1 367720 CASAVA_Build 8 126552573 1I TTTTAAATCA -/T TAAAAAACAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 1 2 367721 CASAVA_Build 8 126553026 2D CAAAACATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 15 13 367722 CASAVA_Build 8 126553165 5D TGTCTCAATT AATAA/----- AATAAAATAA 3070 hom 66 het 28 0 23 6 AATAA 3 2 367723 CASAVA_Build 8 126554410 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 66 het 28 0 21 7 T 7 8 367724 CASAVA_Build 8 126557890 3D GCCACACAGA TTG/--- TTATTATTAG 3070 hom 84 het 31 0 27 6 TTG 1 0 367725 CASAVA_Build 8 126560194 1I TTTATTTTTT -/G GTATCTCTCC 3070 hom 132 het 47 0 45 2 G 1 2 367726 CASAVA_Build 8 126562109 1I CACTGCAACC -/T ATGCCTCTCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 0 1 367727 CASAVA_Build 8 126563576 1I AAACTTCGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 358 hom 31 1 26 4 T 10 11 367728 CASAVA_Build 8 126568421 4D ATTTAAGAGC CAGT/---- CGAGCATGAG 3070 hom 135 het 51 0 46 9 CAGT 1 0 367729 CASAVA_Build 8 126570682 1I ACCCTGTCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 27 0 18 9 A 16 17 367730 CASAVA_Build 8 126573539 33D GAGTTACAAC CACCGTCACCACCACCACCACCACCACCACCAT/--------------------------------- CACCATCACC 3070 hom 132 het 44 0 43 6 CACCGTCACCACCACCACCACCACCACCACCAT 1 0 367731 CASAVA_Build 8 126575424 1I CACGGTGAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 hom 87 het 30 0 26 4 C 3 4 367732 CASAVA_Build 8 126577751 1I CTGTCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2898 het 306 hom 19 1 11 7 A 13 14 367733 CASAVA_Build 8 126611559 2D ACCAGATGAC TT/-- TTTAAGAGTC 3070 hom 135 het 48 0 46 6 T 5 3 367734 CASAVA_Build 8 126638062 2D CCTTTGGCCT CC/-- CCCCCTCCTC 3070 hom 71 het 27 0 20 7 C 7 5 367735 CASAVA_Build 8 126691265 1D TAGAGGGGCC A/- GGGGTCATTT 3070 hom 86 het 31 0 28 3 A 1 0 367736 CASAVA_Build 8 126695760 4D CTGTATGTGT GAGG/---- GAGAGTCGTG 3070 hom 177 het 63 0 56 9 GAGG 1 0 367737 CASAVA_Build 8 126720267 13D GAGGGTGTCG GGGTGAGCCTGTA/------------- GGGTGAGCCT 3070 hom 54 het 22 0 15 12 GGGTGAGCCTGTA 1 0 367738 CASAVA_Build 8 126723384 1D CCTCTGTGCA G/- GCACAGGTCT 3070 hom 57 het 25 0 18 8 G 2 1 367739 CASAVA_Build 8 126725380 1D AAAATGCATT C/- CTGGTCCTCG 3070 hom 102 het 39 0 35 5 C 2 1 367740 CASAVA_Build 8 126732612 1I CACATAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 673 hom 22 2 13 7 A 15 16 367741 CASAVA_Build 8 126749837 2D TAAGCAGAGA TG/-- TGTGGAGTTG 3070 hom 111 het 41 0 35 6 TG 3 2 367742 CASAVA_Build 8 126751052 1D CACAGAGAGG T/- TAAAGTCAAT 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 2 1 367743 CASAVA_Build 8 126751586 1I15M1I TTTTCTTTTC -TTTTTTTTTGTTTTC-/TTTTTTTTTTGTTTTCT TTGGAGATAG 3070 hom 57 het 24 0 19 8 N/A 0 0 367744 CASAVA_Build 8 126752862 6I AAATCTCCAC ------/ACTGTT TTCCATAGTG 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ACTGTT 0 1 367745 CASAVA_Build 8 126755255 5D ATCTTTTGTA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 12 het 17 0 12 7 T 16 11 367746 CASAVA_Build 8 126755342 1D GGTTTGGTTT G/- GTTCTTGTTT 1842 het 317 hom 6 1 5 1 G 2 1 367747 CASAVA_Build 8 126766378 1D GTAAAAGTGT G/- GATAATAGAT 3070 hom 123 het 44 0 42 3 G 2 1 367748 CASAVA_Build 8 126837062 3D TTTGTTACCA AGG/--- AGGTATATTG 3070 hom 114 het 41 0 38 4 AGG 2 1 367749 CASAVA_Build 8 126852542 1D AGTTTAGGTG A/- AAAAAAAAAA 1640 het 1640 ref 29 15 5 10 A 12 11 367750 CASAVA_Build 8 126854836 1D CAATATCTTT A/- AAAAAAAAAA 1479 het 1479 ref 40 34 4 3 A 11 10 367751 CASAVA_Build 8 126962522 1D TATTGGGAGG T/- TTTTTTTTTT 1926 het 1926 ref 42 28 5 9 T 13 12 367752 CASAVA_Build 8 126988526 1D AACAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 39 0 31 8 A 11 10 367753 CASAVA_Build 8 126999974 1D GTTAGATGGA T/- TAAAAACAAC 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 T 2 1 367754 CASAVA_Build 8 127010302 1D TTATTGAGTA G/- GGGGAAGGTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 G 5 4 367755 CASAVA_Build 8 127015368 1D TAGAGGTGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 1983 hom 34 6 22 6 A 10 9 367756 CASAVA_Build 8 127024220 2D GTGCTGGATT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 43 14 19 10 TG 10 9 367757 CASAVA_Build 8 127024610 4D ATTGACTTAG AACT/---- AACTAAAGTC 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 AACT 2 1 367758 CASAVA_Build 8 127036855 1D GGGTGAGGGG A/- AGGGAGAGCA 2387 hom 18 het 7 0 7 0 A 2 1 367759 CASAVA_Build 8 127038112 1I TACTATTAAT -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 6 7 367760 CASAVA_Build 8 127086382 6D CTTTGGGGAA ATATAC/------ ATATTACTAA 3070 het 3070 ref 28 16 11 1 ATATAC 1 0 367761 CASAVA_Build 8 127089207 1I GGCCATAAAC -/A AAAATCTCTG 2920 het 1685 hom 18 6 7 5 A 4 5 367762 CASAVA_Build 8 127091277 1D GCAAGGTTTG A/- AAAAAACCAC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 7 6 367763 CASAVA_Build 8 127103356 3D AATGCCACTT ACC/--- ACTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 46 19 25 4 ACC 1 0 367764 CASAVA_Build 8 127106122 2D GCCAGAGATC AG/-- GGTATAGTTA 3070 het 3070 ref 45 27 15 4 AG 1 0 367765 CASAVA_Build 8 127116627 1I TGTAGGAGAT -/A AATGTTCCCA 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 2 3 367766 CASAVA_Build 8 127122870 2I AAGCTCTCTC --/TT TGCCTGCTGC 3070 het 2917 hom 36 11 16 9 T 1 3 367767 CASAVA_Build 8 127126773 1I GCTTTTCTAG -/C TGCCTTTAAG 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 C 0 1 367768 CASAVA_Build 8 127135745 1D AGTATACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 20 14 9 T 11 10 367769 CASAVA_Build 8 127169416 1I TTAGAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 10 11 367770 CASAVA_Build 8 127174319 2D AAGTATAATA AT/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 AT 1 0 367771 CASAVA_Build 8 127177382 1I AACTGATGGA -/C AAATTATGAC 3070 het 3070 hom 23 8 12 3 C 0 1 367772 CASAVA_Build 8 127179449 8I TTACTGGGCT --------/ACTGGAGG ACTGGAGGAT 3070 het 3070 ref 42 27 10 5 ACTGGAGG 1 2 367773 CASAVA_Build 8 127186511 1I TTTGTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 10 11 367774 CASAVA_Build 8 127188973 1I AAAACATGGA -/T TTTTTTCTCC 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 T 6 7 367775 CASAVA_Build 8 127192839 5I34M2D TTGCTGTATT -----TGCGAAGTAACAGGGAACATGATTTTTTGGAAACTA/AAAGCTGCGAAGTAACAGGGAACATGATTTTTTGGAAAC-- TATGGACGAA 3070 het 3070 hom 37 19 19 9 N/A 0 0 367776 CASAVA_Build 8 127205803 2D GCCACATTAC AT/-- ATGTCTGCAG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 AT 2 1 367777 CASAVA_Build 8 127213200 2D CAAAGGTATT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 56 35 10 12 TC 9 8 367778 CASAVA_Build 8 127224096 1D CTCTACAATG A/- AACACATGGT 3070 het 3070 ref 42 22 16 5 A 3 2 367779 CASAVA_Build 8 127245015 1D TCATGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 17 15 11 T 15 14 367780 CASAVA_Build 8 127264092 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2192 het 1806 hom 37 11 12 14 A 19 18 367781 CASAVA_Build 8 127271190 1D ATCATGGCTA C/- ACTATCTTGC 3070 het 3070 hom 52 17 27 8 C 1 0 367782 CASAVA_Build 8 127317382 1D TGACTAAAAC A/- AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 46 22 18 7 A 8 7 367783 CASAVA_Build 8 127325365 1D TTCTGAACAA C/- CCCCAAATAA 3070 hom 119 het 46 0 38 8 C 5 4 367784 CASAVA_Build 8 127332355 1D ACTAGCTCAG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 43 17 20 7 T 9 8 367785 CASAVA_Build 8 127333924 1D AAAAACAGAG A/- AAAAATCACC 3070 het 3070 hom 35 13 20 2 A 6 5 367786 CASAVA_Build 8 127335517 1I TCATTCTAAC -/A ATTAGGTGTT 3070 het 3070 hom 53 23 22 8 A 1 2 367787 CASAVA_Build 8 127341559 4I TATCTAACTC ----/TAAT TATTTTAAAT 3070 het 3070 ref 35 20 10 5 TAAT 0 1 367788 CASAVA_Build 8 127343443 1D GTCTGTTTTT C/- CTCAGTTTTG 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 C 2 1 367789 CASAVA_Build 8 127343862 3D CGCTAGCAGA TAT/--- TATAATTGGA 3070 het 3070 hom 41 17 20 5 TAT 2 1 367790 CASAVA_Build 8 127347835 1D AGGGTGGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2829 hom 30 9 18 3 A 11 10 367791 CASAVA_Build 8 127366587 2D CTAGTCTGGA CT/-- CTCTCAAAAA 2638 het 2638 ref 19 10 8 2 CT 3 2 367792 CASAVA_Build 8 127367009 6D AATGACTAAA TAAGGT/------ TAATAATCCT 2493 het 2493 ref 22 16 7 1 TAAGGT 1 0 367793 CASAVA_Build 8 127370409 1D CAGCAATGTC A/- AAGAAACCCT 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 A 3 2 367794 CASAVA_Build 8 127371908 4I ATAGTGTAAT ----/ACAC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 AC 7 9 367795 CASAVA_Build 8 127377059 1D TTTCTCAAAT A/- TTTTTTTTCT 3070 hom 42 het 32 1 27 4 A 1 0 367796 CASAVA_Build 8 127377516 6I CTTTTTCAGG ------/CTATTC CTGTGTGTAT 3070 het 3070 hom 47 20 23 4 CTATTC 0 1 367797 CASAVA_Build 8 127378948 2D CTGATGAGCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 106 hom 23 1 19 3 A 12 10 367798 CASAVA_Build 8 127383927 2D GAACTTGCCC AA/-- AGTTACATGA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 3 1 367799 CASAVA_Build 8 127391222 1D CATCCCTGGA G/- GGGGGTCTGT 3070 het 3070 hom 46 19 22 5 G 6 5 367800 CASAVA_Build 8 127391859 1I CCCTCTGAGT -/G GGGGTTAAAC 3070 hom 145 het 55 0 49 6 G 4 5 367801 CASAVA_Build 8 127405404 1I CTTGTGCAAC -/A ACAACAGGTG 3070 het 3070 hom 40 16 17 7 A 1 2 367802 CASAVA_Build 8 127467254 1D AGGTAGGTGG C/- CTGCTTATGA 3070 hom 105 het 45 0 36 11 C 2 1 367803 CASAVA_Build 8 127476801 6D ACGTAACATG GTCTTC/------ TGTTCTTTTG 3070 hom 141 het 52 0 48 4 GTCTTC 1 0 367804 CASAVA_Build 8 127485795 1D CAATCAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 12 11 367805 CASAVA_Build 8 127507290 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 25 12 11 2 A 10 9 367806 CASAVA_Build 8 127508694 1D TGAGACTGGT A/- AAGAATACAC 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 3 2 367807 CASAVA_Build 8 127514559 1I33M1D CACACAGACA -TTTTTTTTTGGGAGAAGAAAGTTAATAGTAGAGT/TTTTTTTTTTGGGAGAAGAAAGTTAATAGTAGAG- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 44 29 20 7 N/A 0 0 367808 CASAVA_Build 8 127516861 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 T 11 10 367809 CASAVA_Build 8 127517359 1I AAGTTTTTTA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 6 7 367810 CASAVA_Build 8 127521006 5D CAAAACTAAT ATATC/----- ATATTTTATG 3070 het 3070 hom 36 11 13 12 ATATC 1 0 367811 CASAVA_Build 8 127521035 1D ATTTAGAATA T/- TTTTTTGTGG 3070 het 2178 hom 30 6 16 8 T 7 6 367812 CASAVA_Build 8 127525647 1I ATTTTTTTTT -/G GTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 40 11 24 5 G 1 2 367813 CASAVA_Build 8 127532823 1I AACCAAAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 A 10 11 367814 CASAVA_Build 8 127535445 2I ATATACATAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 38 16 13 9 AT 6 7 367815 CASAVA_Build 8 127541961 2I AAAGAAGAAA --/AT AGAGAAGAAT 2766 hom 15 het 6 0 6 0 AT 0 1 367816 CASAVA_Build 8 127542865 1I AAGAAATAAA -/G GGTATTCAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 2 3 367817 CASAVA_Build 8 127546443 2I GAATAAACTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 37 het 18 0 13 5 T 9 11 367818 CASAVA_Build 8 127548203 14D12M2D TTCAATGGGG GCAATTGAATTGTTGCACTTACTGTCAG/--------------GCACTTACTGTC-- AGAATTGAAG 3070 het 3070 hom 32 15 16 7 N/A 0 0 367819 CASAVA_Build 8 127552381 2I CCCCCCCCCC --/AA AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 A 9 11 367820 CASAVA_Build 8 127556326 3I CAATAGATTT ---/AGA AGAACACTTT 3070 het 3070 ref 50 34 14 2 AGA 1 2 367821 CASAVA_Build 8 127557124 1D GATAGAAAAC T/- GTATAATTAG 3070 het 2279 hom 27 6 16 6 T 1 0 367822 CASAVA_Build 8 127575240 1D GAGATTACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 278 hom 49 4 26 19 T 17 16 367823 CASAVA_Build 8 127586879 1D AGATGTTGGA G/- GGGTCTTGGA 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 G 4 3 367824 CASAVA_Build 8 127591728 1D TCAATTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2977 hom 31 9 9 13 T 13 12 367825 CASAVA_Build 8 127600799 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 609 hom 28 5 17 6 A 10 9 367826 CASAVA_Build 8 127610954 1D CTAAAAATAC A/- AAAATTAGCC 2258 het 2258 ref 14 9 5 0 A 5 4 367827 CASAVA_Build 8 127617712 1D AAACAATAAC A/- AAAATCATTA 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 A 5 4 367828 CASAVA_Build 8 127622663 1I GGGGCCTGAG -/A ATTTGCTTTC 3070 hom 53 het 20 0 16 4 A 1 2 367829 CASAVA_Build 8 127628210 21I CCTGCCACTA ---------------------/CACCCAGGTAATTTTTATATT TTTAGTAGAG 3070 hom 75 het 29 0 23 6 CACCCAGGTAATTTTTATATT 0 1 367830 CASAVA_Build 8 127629378 1D GGTGCATGCT G/- GGTAGTCCCA 3070 hom 92 het 36 0 31 5 G 3 2 367831 CASAVA_Build 8 127636780 1I GATGGGGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 16 16 13 A 9 10 367832 CASAVA_Build 8 127641757 4I TTATGGGGCT ----/GTAA GTGAGTGAGT 3070 het 3070 ref 47 23 18 6 GTAA 0 1 367833 CASAVA_Build 8 127652079 2D CCTGTTAAAA AG/-- AGCAAACTTC 3070 het 3070 ref 49 27 17 6 AG 2 1 367834 CASAVA_Build 8 127655965 4D TTGTGTTCAC AGTA/---- AGGCAGACAT 3070 het 3070 ref 43 30 11 2 AGTA 1 0 367835 CASAVA_Build 8 127656714 3D CAAGCCAAAA AAG/--- GGCCATACCA 3070 het 3070 hom 52 23 21 9 AAG 1 0 367836 CASAVA_Build 8 127670884 4D CTTTTCTTTC TTTG/---- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 34 15 17 3 TTTG 1 0 367837 CASAVA_Build 8 127741718 1I AAGAATGAGT -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 28 14 10 4 A 8 9 367838 CASAVA_Build 8 127765870 1I CCAAGTGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 16 13 12 T 10 11 367839 CASAVA_Build 8 127767787 4I TCTATATATG ----/GATT GATTGATAGA 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 GATT 1 2 367840 CASAVA_Build 8 127772031 2D AAAACTACTC AA/-- GAGAGACTTT 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 A 2 0 367841 CASAVA_Build 8 127774229 1D GTGGGGAAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 10 9 367842 CASAVA_Build 8 127800369 1I CTCAAAAAAA -/T ATAAGGAAAA 3070 het 1743 hom 17 5 12 0 T 0 1 367843 CASAVA_Build 8 127824080 1I GTTTTGTTTT -/G TTGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 G 0 1 367844 CASAVA_Build 8 127828514 1D CCAAGATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 A 15 14 367845 CASAVA_Build 8 127828839 4I TAATTACAGT ----/TAGA TAGAAGGAAT 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 TAGA 1 2 367846 CASAVA_Build 8 127830803 6I TCTGTTTCTA ------/TACGTT TAACTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 TACGTT 0 1 367847 CASAVA_Build 8 127837706 2D AAGGTGTTTC TT/-- ATCACCACCC 2635 het 2635 ref 20 12 6 4 T 2 0 367848 CASAVA_Build 8 127858188 1D ACGAAGCCAG A/- AGTAGAATTA 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 A 2 1 367849 CASAVA_Build 8 127863254 1I TCCTTACTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2935 hom 38 9 20 9 A 9 10 367850 CASAVA_Build 8 127864806 1I AATCCTCCTC -/T TTTTTTTTTT 1732 het 746 hom 16 3 8 5 T 12 13 367851 CASAVA_Build 8 127878535 1D TATTGCAAGC T/- TTTTTTTTTT 1831 het 1831 ref 38 25 5 8 T 13 12 367852 CASAVA_Build 8 127890370 1I TTTTGTGTGT -/G GGGGGGGGTC 3070 het 2977 hom 27 10 11 6 G 8 9 367853 CASAVA_Build 8 127901441 1D GCTGGCAGAC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 51 21 23 7 A 10 9 367854 CASAVA_Build 8 127915292 3I ATCTGCAGTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 1761 hom 32 7 16 9 TTG 3 4 367855 CASAVA_Build 8 127924168 4D24M2D GCAAAGAATC TGTTTGTTTCTTCATTTTACTTATATACAT/----TGTTTCTTCATTTTACTTATATAC-- GTTTGCTTTT 3070 het 3070 ref 51 28 27 9 N/A 0 0 367856 CASAVA_Build 8 127934940 1D CCAAGAAGGG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 A 8 7 367857 CASAVA_Build 8 127944916 1D GCACTGCTGG A/- AAAAAAAAAA 1744 het 1744 ref 25 13 4 8 A 13 12 367858 CASAVA_Build 8 127949910 2I GTTGAAAAAC --/AT ATTACTCTGA 3070 het 3070 ref 36 20 15 1 AT 1 2 367859 CASAVA_Build 8 127951683 3I GCAAGGCAGC ---/AAG AAGAGTTTTC 3070 het 3070 ref 45 20 19 6 AAG 1 2 367860 CASAVA_Build 8 127952963 4D TTCTATTAGC AGTT/---- AGTTAAGTCT 3070 het 3070 hom 41 18 17 7 AGTT 2 1 367861 CASAVA_Build 8 127956606 2I CTCTCTAAGA --/CT CTCTGTATGA 3070 het 3070 hom 42 19 17 6 CT 2 3 367862 CASAVA_Build 8 127979637 4I TAACAAAAGT ----/GCTA GCTAGTCTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 GCTA 1 2 367863 CASAVA_Build 8 127987206 4I CTCCATCTCA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 AAAT 2 3 367864 CASAVA_Build 8 128050257 1I GAGAACATGT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 81 het 32 0 27 5 A 8 9 367865 CASAVA_Build 8 128051523 1I CATGTATGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 12 13 367866 CASAVA_Build 8 128056600 2I TGCCAGTCAC --/TT GTCATTGGTG 3070 hom 166 het 60 0 53 7 T 0 2 367867 CASAVA_Build 8 128070038 1D TGTACATTGG T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 T 8 7 367868 CASAVA_Build 8 128070652 1D CTTAGACATC A/- TTAGTTTCAT 3070 het 3070 hom 38 14 22 2 A 1 0 367869 CASAVA_Build 8 128072325 1D TAATACGAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 50 19 27 6 A 9 8 367870 CASAVA_Build 8 128079358 2I GAACAGGGAA --/TT TTTGGTTCAC 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 T 3 5 367871 CASAVA_Build 8 128083356 3I TCATTTTAAA ---/AAT AATAATAGTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 AAT 2 3 367872 CASAVA_Build 8 128089352 1I TATGTTATAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 19 7 A 11 12 367873 CASAVA_Build 8 128093143 1I TCTGGCATTT -/A AAAATCACAT 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 4 5 367874 CASAVA_Build 8 128096121 1I CACTATTATT -/A AAAAATGCAT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 A 5 6 367875 CASAVA_Build 8 128103698 1I AATGGATATT -/A AAAACTTATC 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 4 5 367876 CASAVA_Build 8 128105659 1D CCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2022 het 1216 hom 26 11 7 8 T 17 16 367877 CASAVA_Build 8 128106915 5D AAAATAAAAT AAAAC/----- AAAATAAAAA 2199 het 566 hom 11 5 6 2 AAAAC 1 0 367878 CASAVA_Build 8 128110128 5D GACAGCTGTT AACTC/----- TACTCTAGAA 3070 het 3070 ref 43 22 19 4 AACTC 1 0 367879 CASAVA_Build 8 128114044 1I GGTATTGGCC -/A AAAAAAAAAA 1372 het 1372 ref 41 18 6 17 A 15 16 367880 CASAVA_Build 8 128131175 1D CATCTACATA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 T 7 6 367881 CASAVA_Build 8 128138018 3D CTTTTACTCA ATT/--- ATTGTTGTTG 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 ATT 2 1 367882 CASAVA_Build 8 128145433 4D ATCTTACAGT TTAA/---- TTACTCTGAC 3070 het 3070 hom 31 13 12 7 TTAA 1 0 367883 CASAVA_Build 8 128148344 1D ACAAGTTAAC A/- AGAGAAAAAG 3070 het 3070 hom 50 23 25 2 A 2 1 367884 CASAVA_Build 8 128149014 4D AAAGTAAAAA AAAC/---- AAATCTAGAC 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 AAAC 1 0 367885 CASAVA_Build 8 128149266 1I AGAAGGAGCT -/A AAATTCTGGC 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 3 4 367886 CASAVA_Build 8 128149995 3I TATTTTCAAT ---/GTC GTCATCTTAT 3070 het 3070 ref 47 30 13 4 GTC 1 2 367887 CASAVA_Build 8 128150397 2D TGAGCAGTGA TC/-- TTTGATGTTA 3070 het 3070 hom 36 10 19 7 TC 1 0 367888 CASAVA_Build 8 128153449 1D CAGAATCTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 A 10 9 367889 CASAVA_Build 8 128161117 1D CTCTGTATTC T/- TTTCATCTCA 3070 het 3070 ref 38 24 12 2 T 4 3 367890 CASAVA_Build 8 128163039 1D ATGAGAGTAT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 37 10 21 6 A 9 8 367891 CASAVA_Build 8 128166914 1D TTGGGCAGTT C/- TTTATAGCAG 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 C 1 0 367892 CASAVA_Build 8 128169876 13D TTTTGTTTTG ATTTTTTTTTTTT/------------- ATTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 ATTTTTTTTTTTT 1 0 367893 CASAVA_Build 8 128169958 1D TTAAAAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1627 hom 22 7 12 3 A 12 11 367894 CASAVA_Build 8 128219607 1D GAACTCTCGG T/- TTTTTTTTTT 1481 het 1275 hom 20 7 8 5 T 19 18 367895 CASAVA_Build 8 128227391 1I AGAAACAAGG -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 29 10 14 5 T 6 7 367896 CASAVA_Build 8 128230349 1I ATCCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 10 13 10 A 10 11 367897 CASAVA_Build 8 128232832 2I TGAAATGGTG --/CA CAGTCTTCTC 3070 het 3070 hom 60 25 27 8 CA 1 2 367898 CASAVA_Build 8 128247106 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 783 hom 11 2 8 1 T 5 6 367899 CASAVA_Build 8 128249849 1D TTAATATAAC T/- TTTTTTTTTT 1829 het 1829 ref 37 27 4 7 T 15 14 367900 CASAVA_Build 8 128250055 1D ATTTACTGGG C/- ATTTTCATTG 3070 het 3070 ref 51 30 19 3 C 1 0 367901 CASAVA_Build 8 128250551 1I GACCCTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 9 10 A 10 11 367902 CASAVA_Build 8 128257057 1D TAAATTGTTG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 A 10 9 367903 CASAVA_Build 8 128266166 1D AAAGAAACAG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 71 hom 23 1 13 9 T 10 9 367904 CASAVA_Build 8 128268936 1D ACTTTTAGAA G/- TAAGTGTACA 3070 het 3070 ref 41 24 16 2 G 1 0 367905 CASAVA_Build 8 128272207 2I GTAGAATCTT --/TC TGTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 TC 0 1 367906 CASAVA_Build 8 128304268 2D CACAAACCAA CC/-- AAAAAAAAAA 52 het 52 ref 31 19 3 10 C 2 0 367907 CASAVA_Build 8 128305011 3I TTGGCCTCCT ---/GAA GAAAAGGCGT 3070 het 3070 hom 49 16 27 6 GAA 1 2 367908 CASAVA_Build 8 128305577 1D TACTCCTCCT C/- CATTTCCAAA 3070 het 3070 hom 55 22 23 12 C 2 1 367909 CASAVA_Build 8 128307660 1D AGACCCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1420 het 1420 ref 30 9 5 16 A 16 15 367910 CASAVA_Build 8 128341402 1I GTTGTGAGAA -/G TTAAATGGAC 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 G 0 1 367911 CASAVA_Build 8 128343233 1D AGAGGTATGG C/- TTGCAAATTT 3070 het 3070 hom 38 15 16 8 C 1 0 367912 CASAVA_Build 8 128355649 1D AGCTGCACTT A/- AGAGGAAGCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 2 1 367913 CASAVA_Build 8 128363175 3D CTTTAAACAT GAG/--- GAGGGTAAGC 3070 het 3070 hom 32 14 17 3 GAG 2 1 367914 CASAVA_Build 8 128364426 40D TTAACAAATG TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------------- TATATATATA 3046 het 107 hom 10 1 8 4 TA 26 6 367915 CASAVA_Build 8 128379896 1I TTGGAAACTG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 7 8 367916 CASAVA_Build 8 128391881 1D GCAATAAAAT A/- ATCCAAAAGC 2681 het 2681 ref 27 17 6 4 A 2 1 367917 CASAVA_Build 8 128392794 1D AATAAATAGG A/- AAAAAAAATG 3070 hom 87 het 32 0 30 3 A 9 8 367918 CASAVA_Build 8 128399977 4I TCTGTTAATG ----/TTAA TTAATGTTAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 TTAA 1 2 367919 CASAVA_Build 8 128402287 3I AAAGTATAAT ---/AAA AAAAAAAAAA 2834 het 149 hom 10 1 7 2 A 10 13 367920 CASAVA_Build 8 128403333 2D CCTCTCTCTC TT/-- GGTCCTGCTC 3070 het 3070 hom 49 18 23 10 T 2 0 367921 CASAVA_Build 8 128403630 1D GCCCACCACC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 34 het 16 0 12 4 A 10 9 367922 CASAVA_Build 8 128405182 2I GGAAGGATAT --/AA GTCTCAGATG 3070 het 3070 hom 32 11 17 4 A 0 2 367923 CASAVA_Build 8 128406232 2I ACATGCAAAC --/AG AGCAAGAGTA 3070 het 3070 ref 55 28 17 10 AG 1 2 367924 CASAVA_Build 8 128406558 1D CAGCAAAGCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 32 15 13 4 A 10 9 367925 CASAVA_Build 8 128411250 4D CAAACAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 1427 hom 18 3 13 3 AAAC 4 3 367926 CASAVA_Build 8 128413829 1I TGCTCCTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 435 hom 31 1 23 7 T 10 11 367927 CASAVA_Build 8 128415798 2D29M1D TAGTTCCAGG AAAAAAAAATGACAGATTAGATGGGAGGAAAT/--AAAAAAATGACAGATTAGATGGGAGGAAA- TATCTAGGAA 3070 hom 75 het 24 0 26 6 N/A 0 0 367928 CASAVA_Build 8 128419890 1D TCAGGAGCTC A/- GGCAAGGAGA 3070 hom 141 het 52 0 48 4 A 1 0 367929 CASAVA_Build 8 128420707 1I ATCTCCTGCA -/G GAGGTGCTTA 3070 hom 132 het 54 0 45 9 G 1 2 367930 CASAVA_Build 8 128423114 1D GCTCTTTCTT A/- ATCACTCAAA 3070 hom 117 het 43 0 39 5 A 2 1 367931 CASAVA_Build 8 128423798 2I GCTCTGAAGC --/CA CACTGAGGCT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 CA 1 2 367932 CASAVA_Build 8 128424734 1I ACAATAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 12 het 39 1 32 6 A 10 11 367933 CASAVA_Build 8 128431979 3I TATTTTCTTC ---/TTT GAGTGCAATC 3070 het 3070 hom 52 18 30 4 T 0 3 367934 CASAVA_Build 8 128457981 1I TGAGAGAGCT -/G GGTCACAACC 3070 hom 72 het 28 0 24 4 G 2 3 367935 CASAVA_Build 8 128464979 1D GTTTCTTAAG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 9 8 367936 CASAVA_Build 8 128465383 1D GATATTAGTG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 65 het 31 0 20 12 C 12 11 367937 CASAVA_Build 8 128468261 2I CGAAATTTTC --/AA AAGTTTCAAA 3070 het 3070 hom 35 15 16 4 A 2 4 367938 CASAVA_Build 8 128468405 1D ATCTTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 A 11 10 367939 CASAVA_Build 8 128487392 1D TGGTGTATAG A/- AAAAAAAAAA 1186 het 1186 ref 37 25 4 10 A 11 10 367940 CASAVA_Build 8 128500055 3I TAGATCGAAA ---/ATG ATGTGATAAT 3070 hom 120 het 46 0 41 5 ATG 1 2 367941 CASAVA_Build 8 128500494 1D TTCAATGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 84 hom 49 1 34 14 T 10 9 367942 CASAVA_Build 8 128505973 2D TAAAGGACTC TT/-- TCTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 40 26 13 1 T 3 1 367943 CASAVA_Build 8 128519833 3I TAAAGATCCT ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 26 10 11 5 AAC 5 6 367944 CASAVA_Build 8 128520514 1D TTCAAATAAG A/- AAAAAACAAT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 7 6 367945 CASAVA_Build 8 128521603 4D TAGGAAACTT AAAC/---- AAATCAACAA 3070 hom 93 het 32 0 31 1 AAAC 1 0 367946 CASAVA_Build 8 128531078 1D ACTGAGGCCC A/- AAAAAATGTG 3070 hom 104 het 40 0 33 7 A 7 6 367947 CASAVA_Build 8 128535811 16D TGTTATGGCC TTAACCCATTCTATTA/---------------- TGCCTCCAAG 3070 hom 123 het 44 0 42 6 TTAACCCATTCTATTA 1 0 367948 CASAVA_Build 8 128538762 8D ATCTTATTGG CTCTCTCT/-------- CTCTCTCTCT 3070 het 2187 hom 56 14 23 22 CT 12 8 367949 CASAVA_Build 8 128549171 2D GGGGCGTTTA TC/-- TGTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 TC 1 0 367950 CASAVA_Build 8 128550126 1D AACAAAAAAA C/- ACTTCATCAA 3070 hom 130 het 50 0 43 7 C 1 0 367951 CASAVA_Build 8 128550508 2D AGTGAAATAA TG/-- TGTCCAAAGG 3070 hom 129 het 50 0 44 7 TG 2 1 367952 CASAVA_Build 8 128566727 3D ATAATGTGAA AAT/--- AACAGAGAGG 3070 het 3070 hom 37 17 19 2 AAT 1 0 367953 CASAVA_Build 8 128568827 14D CACTGATTTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 2826 het 411 hom 12 2 8 2 T 29 15 367954 CASAVA_Build 8 128584958 1I GTATAATAAA -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 48 het 36 1 30 5 T 8 9 367955 CASAVA_Build 8 128591767 1D GTCAAGAAGG A/- AAAAACAGAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 6 5 367956 CASAVA_Build 8 128600610 3D CCAGTAGACT ATG/--- ATAAGCTATG 3070 hom 84 het 33 0 29 5 ATG 1 0 367957 CASAVA_Build 8 128603292 7D GAAATTAACA AAATGAC/------- AAATGGAAAA 3070 hom 102 het 37 0 35 3 AAATGAC 1 0 367958 CASAVA_Build 8 128613570 1D AAAATCAAAA G/- ATATGTGTTC 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 G 1 0 367959 CASAVA_Build 8 128614184 1D TCAATTATGC A/- AAAAAAAGTC 3070 hom 84 het 34 0 28 6 A 8 7 367960 CASAVA_Build 8 128616104 1I TCTGCTCTTG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 9 10 367961 CASAVA_Build 8 128666802 4D CGCACATAAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 het 950 hom 53 12 17 25 AC 11 9 367962 CASAVA_Build 8 128670718 2D CAAATAAAGT CA/-- CATTGTCTTA 3070 hom 138 het 53 0 47 6 CA 2 1 367963 CASAVA_Build 8 128671054 1D CACTGATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2729 hom 40 8 21 12 T 13 12 367964 CASAVA_Build 8 128686430 1I CCATTTGTCA -/C CCCCCAGGGC 3070 het 3070 ref 55 27 19 9 C 5 6 367965 CASAVA_Build 8 128687448 2D CCAGTCCTGG GA/-- GAGAAACGAG 3070 het 3070 hom 39 19 18 4 GA 3 2 367966 CASAVA_Build 8 128692099 3I AACTACAAAC ---/CTT CAAGGTGAAA 3070 het 3070 hom 41 20 19 3 CTT 0 1 367967 CASAVA_Build 8 128692249 1I GTGATATAGT -/A AAAAATAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 12 3 A 5 6 367968 CASAVA_Build 8 128692764 1I GGCCCCAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1968 hom 30 8 16 6 A 12 13 367969 CASAVA_Build 8 128694689 1I CTATTAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 A 9 10 367970 CASAVA_Build 8 128695424 17I GGCTGAGGCA -----------------/CAAGAATCACTTGAACC CAAGAGGCAG 3070 het 3070 ref 29 17 10 3 CAAGAATCACTTGAACC 0 1 367971 CASAVA_Build 8 128700179 1I GAATAATTGT -/G GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 G 3 4 367972 CASAVA_Build 8 128704798 1I AGATATCACA -/G TACTCTTCAA 3070 het 3070 ref 48 28 17 3 G 0 1 367973 CASAVA_Build 8 128718418 1D TTAATTTAAT A/- AATAATAACT 3070 het 3070 hom 31 10 19 2 A 3 2 367974 CASAVA_Build 8 128720460 1I AGAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 20 10 9 A 11 12 367975 CASAVA_Build 8 128727089 1D TCTGAACTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 9 8 367976 CASAVA_Build 8 128748598 1D AGACTGAGAT G/- GGTAGGGTCC 3070 hom 84 het 31 0 29 2 G 3 2 367977 CASAVA_Build 8 128765544 1I CCAGGGCCCC -/T TGCTAGGTAC 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 T 1 2 367978 CASAVA_Build 8 128769049 1I ATTCTAAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 15 16 8 A 9 10 367979 CASAVA_Build 8 128769241 2I GAACATAGAC --/TT TTAACAGTCC 3070 het 3070 ref 38 18 13 8 T 2 4 367980 CASAVA_Build 8 128769642 1I GTTGGGCTAC -/A AGAGGGCTTT 3070 het 3070 ref 43 20 18 5 A 1 2 367981 CASAVA_Build 8 128793152 1D GTCTAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 914 hom 30 3 24 4 A 14 13 367982 CASAVA_Build 8 128796700 1D CTAGGGAGGC T/- TGAGATAGAT 3070 hom 34 het 17 0 12 6 T 2 1 367983 CASAVA_Build 8 128821085 1D AAAACTGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2454 hom 25 7 14 4 T 13 12 367984 CASAVA_Build 8 128827262 1D AAAACATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 T 11 10 367985 CASAVA_Build 8 128831544 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TCTCTCTTCC 2713 het 2047 hom 24 9 13 3 TCTT 1 0 367986 CASAVA_Build 8 128836974 5D TTTGTTTTTT TTTGG/----- TTTTTGGTTT 1699 het 1139 hom 30 7 10 13 TTTGG 1 0 367987 CASAVA_Build 8 128836996 5I TTTTGTTTTG -----/TTTTT TTTTGTTTTG 3070 het 194 hom 28 1 14 13 T 4 9 367988 CASAVA_Build 8 128843662 2D ACTCTGCCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2690 het 1631 hom 30 9 10 11 A 16 14 367989 CASAVA_Build 8 128850138 7D ACCTGGCTAA TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 1135 hom 22 6 11 5 T 21 14 367990 CASAVA_Build 8 128860083 1I TACATAATAG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 A 8 9 367991 CASAVA_Build 8 128897555 4I CCGTCTCAAC ----/ACAA ACAAACAAAA 3070 hom 59 het 24 0 19 5 ACAA 2 3 367992 CASAVA_Build 8 128914890 1D GCTTTATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 254 hom 27 1 16 10 T 13 12 367993 CASAVA_Build 8 128923685 1D CTGCTCTGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 17 0 11 6 T 16 15 367994 CASAVA_Build 8 128925183 1D TGTTTGGCTG T/- TTTTTTAATA 3070 hom 69 het 35 0 23 13 T 7 6 367995 CASAVA_Build 8 128928656 13I GTCGAACTCT -------------/TGGCCACCGCGCC TGGCCCCAAA 3070 hom 52 het 23 0 17 7 TGGCCACCGCGCC 0 1 367996 CASAVA_Build 8 128935589 2I GCTCCTGTTT --/TC TGCCTGTTTA 3070 hom 59 het 23 0 19 4 TC 0 1 367997 CASAVA_Build 8 128983338 1D CCAAGGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 27 0 16 11 T 14 13 367998 CASAVA_Build 8 128985784 25I AGTTTTGCAG -------------------------/GTTGGTACCAGGAGAGAGGATGCAT GTTGGTACCA 3070 hom 84 het 36 0 29 9 GTTGGTACCAGGAGAGAGGATGCAT 0 1 367999 CASAVA_Build 8 129002768 1D TAAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 11 10 368000 CASAVA_Build 8 129007077 2D TTTGTTTTTG TT/-- TTTTTTTTGA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 T 10 8 368001 CASAVA_Build 8 129014186 4I TCAATAAGCT ----/GATA GATATATAGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 GATA 1 2 368002 CASAVA_Build 8 129033247 1D ACAGAATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 32 0 19 13 T 15 14 368003 CASAVA_Build 8 129046282 1I AAGAATGGGG -/T TTTTACCATG 3070 het 2961 hom 19 7 8 4 T 4 5 368004 CASAVA_Build 8 129055109 1I TGCCTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 2542 het 602 hom 26 3 11 12 A 13 14 368005 CASAVA_Build 8 129055187 1D TGGGTGGATC A/- ACGAGGTCAG 3070 het 2836 hom 24 11 11 2 A 2 1 368006 CASAVA_Build 8 129059587 1D TCTCTTTCTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 T 9 8 368007 CASAVA_Build 8 129059751 1I TGGCTAATTT -/A AAAAAAAAAT 2426 het 2426 ref 18 7 6 5 A 9 10 368008 CASAVA_Build 8 129077333 1D TCAAATGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 126 het 53 0 41 12 T 11 10 368009 CASAVA_Build 8 129100204 8D TCCTCAGGAC AGGCAGTT/-------- AGTGTTGCTG 3070 het 3070 hom 43 17 19 11 AGGCAGTT 1 0 368010 CASAVA_Build 8 129101496 3I GGGTAAAGTC ---/CTT CTTCTCCATG 3070 hom 115 het 44 0 38 6 CTT 1 2 368011 CASAVA_Build 8 129120681 1D CCCTTCCCCC T/- TTCCTCCCTC 3070 hom 74 het 33 0 25 9 T 3 2 368012 CASAVA_Build 8 129184860 2I GGAGATTCTC --/TT TTGGTAGCCT 3070 hom 66 het 27 0 20 7 T 2 4 368013 CASAVA_Build 8 129187336 1I CTTTCGCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 A 12 13 368014 CASAVA_Build 8 129187577 1I GGCAATCTTA -/T TTTTTTTCTT 2777 het 2777 ref 21 10 6 5 T 7 8 368015 CASAVA_Build 8 129198699 1D ATTGAATGAC T/- TTTTGAAAAC 3070 het 3070 ref 33 21 9 4 T 5 4 368016 CASAVA_Build 8 129204198 1D GAGGCCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 11 10 368017 CASAVA_Build 8 129207838 1I GTTAATCTGC -/T TTTTTTTCAC 3070 het 3070 ref 54 31 18 5 T 7 8 368018 CASAVA_Build 8 129241044 1D AAAAAAAAAA G/- CTTTCATTAT 921 het 921 ref 23 10 4 10 G 1 0 368019 CASAVA_Build 8 129243799 1I TAGTAGAGAC -/G GGGTTTCACC 3070 hom 35 het 14 0 12 2 G 3 4 368020 CASAVA_Build 8 129267964 1I CCCTCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 249 hom 25 1 17 7 T 11 12 368021 CASAVA_Build 8 129268022 1D CGGTGAACTT G/- GGCTAAAAAG 3070 hom 63 het 29 0 22 7 G 3 2 368022 CASAVA_Build 8 129292454 1I ATGAGAAGTG -/C CAAGAGTGGG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 1 2 368023 CASAVA_Build 8 129295440 1I ACAAAATAAA -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 8 9 368024 CASAVA_Build 8 129306630 5I TCTGCTCTTC -----/CATCT CATCTCATCT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 CATCT 2 3 368025 CASAVA_Build 8 129308502 1I TGTTTAAGTC -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 6 7 368026 CASAVA_Build 8 129310630 1D TTCCACCAGC G/- AAGAAGTAAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 1 0 368027 CASAVA_Build 8 129310904 1I AAGCTTAGGT -/A AAAAAACATG 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 6 7 368028 CASAVA_Build 8 129311444 1I CACTCCCTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 33 16 9 8 T 9 10 368029 CASAVA_Build 8 129342653 1D AAAAGATTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 8 368030 CASAVA_Build 8 129344084 1D TGTATATATG T/- ATTTTATTGT 3070 het 3070 hom 43 14 26 3 T 1 0 368031 CASAVA_Build 8 129352330 1D GATATAATCA T/- TAACAATAGC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 T 2 1 368032 CASAVA_Build 8 129367625 1I CTGTAATCCC -/A GCACTTTGGG 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 A 0 1 368033 CASAVA_Build 8 129444400 3I AGTAATGGCT ---/TAA TAATGATACA 3070 het 3070 hom 37 19 15 3 TAA 1 2 368034 CASAVA_Build 8 129449791 1I GTATCGTGGG -/A AGAAGGTGGG 3070 hom 114 het 47 0 39 8 A 1 2 368035 CASAVA_Build 8 129483299 1D TTTTGTCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 965 hom 36 4 18 14 T 15 14 368036 CASAVA_Build 8 129491525 5I GGCAAGAGGT -----/TTTTG TTTTGTTTTG 3070 hom 93 het 44 0 30 14 TTTTG 3 4 368037 CASAVA_Build 8 129506229 3D TCCTCCTCTA CTC/--- CTCCTCCTCC 3070 hom 34 het 17 0 12 6 CTC 6 5 368038 CASAVA_Build 8 129512526 1D AGCCAAGTCA C/- CAGCCATGTA 3070 hom 148 het 56 0 50 6 C 2 1 368039 CASAVA_Build 8 129514306 1D ACAATCCTAG A/- AAAACACCTA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 5 4 368040 CASAVA_Build 8 129515046 2I AGTAAATGTG --/AT ATATATATAT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 AT 5 6 368041 CASAVA_Build 8 129518738 2D ATAACTTTAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 AT 7 6 368042 CASAVA_Build 8 129531637 1I GCCAAGGCAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 9 368043 CASAVA_Build 8 129543870 1I ATATCCATGG -/A AAACCCTGTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 3 4 368044 CASAVA_Build 8 129549749 3D CCTAAATCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 24 0 18 6 A 17 14 368045 CASAVA_Build 8 129557005 1D ATCTTCCCAA G/- CTACTTTCTG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 1 0 368046 CASAVA_Build 8 129559465 1I TTTGTTCATG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 18 4 A 12 13 368047 CASAVA_Build 8 129559615 1D ATTGATTGAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 10 9 368048 CASAVA_Build 8 129567446 4D ATCCTATCCG ATTA/---- ATTCAGTGGA 3070 het 3070 ref 30 16 14 1 ATTA 1 0 368049 CASAVA_Build 8 129578070 2I CATATACTGT --/AG GTCCAAGGCG 3070 het 3070 hom 46 14 26 6 AG 0 1 368050 CASAVA_Build 8 129661884 1I GGCTTACATT -/A TTTTCTACTG 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 0 1 368051 CASAVA_Build 8 129682360 1D TCACCTGCTC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 48 21 21 7 T 9 8 368052 CASAVA_Build 8 129684127 2I TTTTAAACCT --/CA GTCTTCTCAG 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 CA 0 1 368053 CASAVA_Build 8 129686000 1D AAGAGATGTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 27 19 8 T 10 9 368054 CASAVA_Build 8 129689553 3D CATTGGACTT CTC/--- CTGCCCTCTG 3070 het 3070 ref 54 28 23 3 CTC 1 0 368055 CASAVA_Build 8 129690287 2I TAACTGGAAC --/TA ACTCAATTTA 3070 het 3070 hom 53 23 27 3 TA 0 1 368056 CASAVA_Build 8 129690801 1I ATTTACACAT -/A AAACAAAATG 3070 het 3070 ref 31 19 11 1 A 3 4 368057 CASAVA_Build 8 129692003 1I TTCCTTTCTT -/C TTCTCTAATC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 C 0 1 368058 CASAVA_Build 8 129721538 4D ATACAGTTTG GAAA/---- TTTTACAAAT 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 GAAA 1 0 368059 CASAVA_Build 8 129733698 1I GCTATTCACA -/T TTATCACCTG 3070 het 3070 ref 55 26 26 3 T 2 3 368060 CASAVA_Build 8 129758282 1D GACTGGTTGG T/- TTTTTTTCTA 3070 hom 90 het 35 0 31 6 T 8 7 368061 CASAVA_Build 8 129758541 1D TGGAACTGCC A/- AAATTATATA 3070 hom 108 het 40 0 37 4 A 4 3 368062 CASAVA_Build 8 129762206 1I ATTCAATTTG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 36 hom 34 1 30 3 T 8 9 368063 CASAVA_Build 8 129765250 1I AACTGATAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 A 9 10 368064 CASAVA_Build 8 129765610 1I CGTAAATTAG -/A AAAAAAGTAA 3070 het 3070 ref 45 29 10 6 A 6 7 368065 CASAVA_Build 8 129767046 1I GACTGAGACA -/G GAAGATTGCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 G 1 2 368066 CASAVA_Build 8 129771517 2D GGCTTTTTTT TC/-- TTTTTTTACT 3070 het 582 hom 45 8 16 23 TC 1 0 368067 CASAVA_Build 8 129772795 4D TAAAAAAACT CTCA/---- CTGAGATTTT 3070 het 3070 hom 36 12 22 5 CTCA 1 0 368068 CASAVA_Build 8 129772943 1D TATTTTGTAA T/- TTTTCAGCAT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 5 4 368069 CASAVA_Build 8 129773688 1I TTGTCAGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 96 het 38 0 32 6 T 10 11 368070 CASAVA_Build 8 129774931 1I ATATTTTTTT -/C CTCAATCTAT 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 C 1 2 368071 CASAVA_Build 8 129775903 1D CCTGAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 11 10 368072 CASAVA_Build 8 129782903 16D TCATTTTCTA TGGAGAGCAATTTCTT/---------------- TGGAAGCGTT 3070 het 3070 ref 33 15 18 4 TGGAGAGCAATTTCTT 1 0 368073 CASAVA_Build 8 129783620 1D TCTTAGGTGC T/- TTGGGTTGAG 3070 het 3070 ref 43 20 15 10 T 3 2 368074 CASAVA_Build 8 129786167 2I ATTTTAAATG --/TC TCTTCTGAAG 3070 het 3070 ref 40 17 19 4 TC 1 2 368075 CASAVA_Build 8 129787220 1I TAAATTAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 A 10 11 368076 CASAVA_Build 8 129787997 4I CCATAAAAAT ----/ATAG ATAAAGTTTC 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 ATAG 0 1 368077 CASAVA_Build 8 129794298 1D GAACCATCCA G/- AAAAGAAGGT 3070 het 3070 ref 49 22 23 4 G 1 0 368078 CASAVA_Build 8 129801660 1D GTTGTGGGGT G/- GGGGGAGGGG 1035 hom 7 het 3 0 3 0 G 6 5 368079 CASAVA_Build 8 129808224 1D GATATTAAAT C/- CCTAGAAACA 2363 het 2363 ref 24 16 6 2 C 3 2 368080 CASAVA_Build 8 129811615 1D TTTGGATAGC T/- TTTATTAATT 3070 het 3070 ref 30 14 15 2 T 4 3 368081 CASAVA_Build 8 129812854 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 10 11 368082 CASAVA_Build 8 129813462 1D ATCTAGATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 T 11 10 368083 CASAVA_Build 8 129813563 1I AAACTTATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 T 10 11 368084 CASAVA_Build 8 129813651 1D GCGGACCTTG C/- CCCCATATTT 3070 het 3070 ref 41 23 15 3 C 5 4 368085 CASAVA_Build 8 129814860 1D GGAAATTAAA C/- ATATTCTCCC 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 C 1 0 368086 CASAVA_Build 8 129816423 1D ATTGTATTAG A/- AAAAAATGTG 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 A 7 6 368087 CASAVA_Build 8 129816667 4D TCTAAGATAC ATCA/---- ATCACTTTTG 3070 het 3070 ref 42 18 20 7 ATCA 2 1 368088 CASAVA_Build 8 129839555 1I AAAAGATTCC -/A AAAAAATTGA 2934 het 2934 ref 37 20 8 9 A 6 7 368089 CASAVA_Build 8 129853536 2D CAAACATATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 A 12 10 368090 CASAVA_Build 8 129861757 1I GTCTCATATA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 8 9 368091 CASAVA_Build 8 129863415 1D GATTACTTGG T/- TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 38 13 19 6 T 7 6 368092 CASAVA_Build 8 129892220 4I ATAGACAGAT ----/GATA GATAGATAGA 3070 hom 78 het 33 0 27 6 GATA 2 3 368093 CASAVA_Build 8 129901685 3D CCCATGTTGT TCA/--- AGGATAGACA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 TCA 1 0 368094 CASAVA_Build 8 129916430 4D TGGCAGCCAG CAGA/---- CAGAAATAGC 3070 hom 49 het 20 0 17 3 CAGA 2 1 368095 CASAVA_Build 8 129933658 1D CCCACCTCGG C/- CCCCCCAAAG 3070 hom 58 het 28 0 19 11 C 7 6 368096 CASAVA_Build 8 129940982 10I GAATAGTCTG ----------/TTTGGTGGTC ACCAGGTGAT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TTTGGTGGTC 0 1 368097 CASAVA_Build 8 129947547 1I ATTTTCATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 642 hom 23 3 14 6 T 11 12 368098 CASAVA_Build 8 129947991 1I ACATAACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1164 hom 36 4 27 5 T 12 13 368099 CASAVA_Build 8 129952905 3I TATGAATGTC ---/ATT GTTGTTAGTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 ATT 0 1 368100 CASAVA_Build 8 129954349 1I TATACATAGA -/T TTTTTTAAGG 3070 het 387 hom 41 1 34 6 T 6 7 368101 CASAVA_Build 8 129963843 2I TTGTTTTTAC --/TG TGTGTGATTA 3070 hom 114 het 44 0 39 5 TG 3 4 368102 CASAVA_Build 8 129980947 1D ACACAAGAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 24 1 15 9 T 13 12 368103 CASAVA_Build 8 129999545 4I CACCCTAGCT ----/CTCC CTGACTCATC 3070 hom 31 het 12 0 11 1 CTCC 0 1 368104 CASAVA_Build 8 130005985 1D AAAAAATCCT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 361 hom 38 1 34 4 A 10 9 368105 CASAVA_Build 8 130042054 1I GAAACTGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 13 11 A 13 14 368106 CASAVA_Build 8 130054139 1D TCTGAAATGC A/- AATTTGGATG 3070 het 3070 hom 44 14 27 3 A 3 2 368107 CASAVA_Build 8 130063677 1I AGTGTTTAAG -/A GGTGTAATTG 3070 het 3070 ref 48 22 22 4 A 0 1 368108 CASAVA_Build 8 130077560 1D AAACCCCACT A/- AAAAAAAAAA 1914 het 82 hom 14 1 10 4 A 17 16 368109 CASAVA_Build 8 130080313 2D ATCTTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 TA 9 8 368110 CASAVA_Build 8 130082546 3D ACACAAAATA GCC/--- GCCGGGTATG 3070 hom 60 het 26 0 20 6 GCC 2 1 368111 CASAVA_Build 8 130084287 9I CAATAAACAC ---------/TAAATATAA TATTTAGTGC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TAAATATAA 0 1 368112 CASAVA_Build 8 130086490 1I TTCTGTTGTT -/A ACTTAACTCA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 A 1 2 368113 CASAVA_Build 8 130089709 2D AAGTTTGATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 89 het 34 0 29 6 A 13 11 368114 CASAVA_Build 8 130094305 1D TATAATCAAT A/- AATCACAAAT 3070 hom 93 het 40 0 31 10 A 3 2 368115 CASAVA_Build 8 130097553 2I ACTTACTACC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 27 0 21 6 A 10 12 368116 CASAVA_Build 8 130114101 1I CCTTGCTATG -/A AAAAAATTGC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 6 7 368117 CASAVA_Build 8 130118231 3I TAACTGATTG ---/AGA AGAAGGAAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 AGA 1 2 368118 CASAVA_Build 8 130119090 1I ATTTCTCAAA -/G ATAGTATAGA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 0 1 368119 CASAVA_Build 8 130121283 1D GCATTTACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 12 11 368120 CASAVA_Build 8 130121957 2D AGAGAGAGAG AA/-- AAAGAACCTA 3070 hom 78 het 30 0 26 5 A 5 3 368121 CASAVA_Build 8 130124697 1D ATAAAAAAAA T/- ATATATATAT 3070 hom 57 het 23 0 20 4 T 1 0 368122 CASAVA_Build 8 130139844 2D ACACAACACC GT/-- GTGTGTGTGT 1981 het 1981 ref 54 40 5 11 GT 8 7 368123 CASAVA_Build 8 130176293 1D TTTAAAAAAA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 8 7 368124 CASAVA_Build 8 130205514 1I AATCATACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 823 hom 28 2 20 6 T 13 14 368125 CASAVA_Build 8 130332782 1I CAAGACCCCA -/C CCTCCCACCT 2679 het 2679 ref 26 12 9 5 C 2 3 368126 CASAVA_Build 8 130334055 1I TAGGCAATCT -/G GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 G 8 9 368127 CASAVA_Build 8 130336349 1D TAAGAGAATT C/- CCAACATCGA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 C 3 2 368128 CASAVA_Build 8 130340225 4I TACCAGGTTG ----/GTGA GTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 19 0 12 7 GTGA 0 1 368129 CASAVA_Build 8 130348925 1I AGACAGCCAG -/A AAAAAAATAG 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 A 7 8 368130 CASAVA_Build 8 130353234 5I AACTCCACTT -----/TAAGA TAAGGAGGAC 3070 het 3070 hom 38 12 25 1 TAAGA 0 1 368131 CASAVA_Build 8 130357384 8D CAGCGGGTAT GGGAAAGG/-------- GGGAAAGGGA 3070 het 3070 ref 41 22 20 5 GGGAAAGG 2 1 368132 CASAVA_Build 8 130363829 1D TTTCAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 T 11 10 368133 CASAVA_Build 8 130379726 1D CCTTGCCCCC T/- TTTTTAGGAG 3070 het 3070 hom 42 20 19 4 T 6 5 368134 CASAVA_Build 8 130385140 2D TCAGGGGGTT GG/-- GGGGGGGGGG 1631 het 1040 hom 24 6 9 9 G 12 10 368135 CASAVA_Build 8 130399515 2D CTAAAAATTG CT/-- CTCAGTCTTC 3070 het 3070 hom 24 8 12 5 CT 2 1 368136 CASAVA_Build 8 130401587 3I CTCAGGCCAA ---/TAT TATATAATTT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 TAT 1 2 368137 CASAVA_Build 8 130404353 1D CTGATATAAA T/- ATACTCTGCA 3070 het 3070 ref 41 18 15 9 T 1 0 368138 CASAVA_Build 8 130428845 1I AGAAGAGAGC -/A AAAAAATTCA 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 A 6 7 368139 CASAVA_Build 8 130430220 1D ATGAGACAAA T/- TTTTAAAATA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 5 4 368140 CASAVA_Build 8 130435977 6D CATGAAAAAA AAGTCC/------ GACTTGAGTT 3070 het 3070 hom 43 19 22 4 AAGTCC 1 0 368141 CASAVA_Build 8 130436094 3I TAGTAGTAGC ---/AGT AGTAGTAGTA 3070 het 3070 ref 46 24 18 4 AGT 4 5 368142 CASAVA_Build 8 130442309 1I GGGAAAAGCA -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 37 18 17 2 T 7 8 368143 CASAVA_Build 8 130442776 1I ATTGTCAGTC -/T TTTTTTTTTT 2746 het 2746 ref 33 15 10 8 T 14 15 368144 CASAVA_Build 8 130443360 1I TTTTTGAGAT -/G GTGTTTCACT 2152 het 2152 ref 42 12 9 21 G 1 2 368145 CASAVA_Build 8 130450739 5D TTTAAACTCT AGTCC/----- AGCCTTCCTA 3070 het 3070 hom 41 16 22 4 AGTCC 1 0 368146 CASAVA_Build 8 130457154 14D TTGCATTGTA TGTGTGTGTGTGTG/-------------- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 46 25 16 8 TG 13 6 368147 CASAVA_Build 8 130457940 14I CTTTCAGCTT --------------/CAGTAAACATTAAA CAATGCTAAC 3070 het 3070 ref 50 27 17 7 CAGTAAACATTAAA 0 1 368148 CASAVA_Build 8 130473815 3D TCTCAGACTG TCT/--- TCTTCTTGCT 3070 het 3070 hom 35 13 18 7 TCT 3 2 368149 CASAVA_Build 8 130512338 1I GAGGTTGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 9 10 368150 CASAVA_Build 8 130520349 21D AAATCTGTCT GACTCTACAGTCAAACTGTCC/--------------------- GACTCTACAG 3070 het 3070 ref 40 20 16 13 GACTCTACAGTCAAACTGTCC 2 1 368151 CASAVA_Build 8 130524691 2I AGCTGTTTTG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 18 8 T 11 13 368152 CASAVA_Build 8 130529401 2I AATGAAAGTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 8 17 5 A 10 12 368153 CASAVA_Build 8 130542688 1D CTCCTGCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2336 hom 23 6 13 5 A 13 12 368154 CASAVA_Build 8 130551800 2D ATGGAATTTC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 93 het 38 0 32 8 AG 7 6 368155 CASAVA_Build 8 130555423 10I GCTCAGCTCA ----------/GCTTAACATG GCTTAACATG 3070 hom 102 het 47 0 33 14 GCTTAACATG 1 2 368156 CASAVA_Build 8 130558856 2D AGTGTGTGTG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 87 het 44 0 28 18 AC 9 8 368157 CASAVA_Build 8 130632312 1I TGCTTAATCT -/C CCTCAGTCTC 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 C 2 3 368158 CASAVA_Build 8 130654441 6I3M3D TGTTCTCAGA ------TCATTG/TGTATCTCA--- TGATGATAAA 3070 het 3070 hom 47 16 28 5 N/A 0 0 368159 CASAVA_Build 8 130655146 2D ATTGGCAAGC AA/-- AAAAGAAAAG 3070 hom 84 het 32 0 28 7 A 6 4 368160 CASAVA_Build 8 130666223 1D CTGCCTCCCG T/- TTTTTTTTTT 1879 het 1252 hom 31 6 6 19 T 12 11 368161 CASAVA_Build 8 130742272 8D TTTATACTTT TTAGAGAA/-------- TACATTTTAT 3070 het 3070 ref 43 27 17 2 TTAGAGAA 1 0 368162 CASAVA_Build 8 130743544 5D TCCCAATTAC TACAT/----- TATCCTTAGT 3070 het 3070 hom 54 20 31 4 TACAT 1 0 368163 CASAVA_Build 8 130750866 4D AGGGCTGGAG GCCT/---- AGGAGGAAAA 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 GCCT 1 0 368164 CASAVA_Build 8 130753107 7D AAACTGGTTG AAAGTTC/------- AGCTACAAAA 3070 het 3070 ref 45 27 17 2 AAAGTTC 1 0 368165 CASAVA_Build 8 130763950 6D TTGTTATTAT TGAGAC/------ AGGGTCTCAC 3070 het 3070 ref 47 21 21 7 TGAGAC 1 0 368166 CASAVA_Build 8 130769855 4D GACCACCCAC CCAT/---- CCAAAGCTCC 3070 hom 114 het 41 0 37 5 CCAT 1 0 368167 CASAVA_Build 8 130774929 1D ACCTCCCTCT C/- CCCCCAGATC 3070 hom 59 het 50 1 29 21 C 6 5 368168 CASAVA_Build 8 130775125 4D CAAAAACAAC ATCT/---- ATCTTAGAAT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 ATCT 2 1 368169 CASAVA_Build 8 130775682 1I ATTTTTATGT -/A AAAAAATATA 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 6 7 368170 CASAVA_Build 8 130775866 1I AAACATTAAG -/T TTTTTTGCTC 3070 hom 90 het 36 0 29 7 T 6 7 368171 CASAVA_Build 8 130786169 2I ACAGGAATCC --/TT TTTGTCAGGC 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 T 3 5 368172 CASAVA_Build 8 130794835 1I TGGCCTCAGT -/G GAAAGGGAGG 3070 het 3070 ref 55 27 18 10 G 1 2 368173 CASAVA_Build 8 130810737 1I ATGAAATTTG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 T 8 9 368174 CASAVA_Build 8 130823240 3I TGAAATCAAT ---/AAG AAGTTAGAGA 3070 het 3070 hom 25 9 14 2 AAG 1 2 368175 CASAVA_Build 8 130827432 2D GAGAAAAACT CA/-- TTTACCCTAT 3070 het 3070 ref 27 13 13 1 CA 1 0 368176 CASAVA_Build 8 130830392 1D AAATAAAACT C/- CCCTTGTAGA 3070 het 3070 hom 43 15 21 7 C 4 3 368177 CASAVA_Build 8 130835728 2I GGCTCAGTAC --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 AG 5 6 368178 CASAVA_Build 8 130842065 18I GGTTATTCCT ------------------/GCCTGAGTCTTTCCCATA GCCTGAACCT 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 GCCTGAGTCTTTCCCATA 0 1 368179 CASAVA_Build 8 130848957 6D5M9D GCAACCACAC AGAGCTACACATGTGGGCTC/------CCAAA--------- TGTGGGACAC 3070 het 3070 ref 47 27 17 7 N/A 0 0 368180 CASAVA_Build 8 130850157 1I CAAGTGAAAC -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 A 7 8 368181 CASAVA_Build 8 130851761 1I TGTCTCTACT -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 8 A 5 6 368182 CASAVA_Build 8 130860193 2D AATTTACAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 19 6 A 13 11 368183 CASAVA_Build 8 130869131 2I TTGAATCAAT --/TA TCTTTGCTTA 3070 het 3070 hom 38 14 21 3 TA 0 1 368184 CASAVA_Build 8 130887335 1D AGGTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1839 hom 25 5 13 8 T 11 10 368185 CASAVA_Build 8 130889670 3D AAAGCCTGCC CTG/--- CTGGATTTCA 3070 het 3070 hom 40 17 19 7 CTG 2 1 368186 CASAVA_Build 8 130892277 1I ATTTCCTGGG -/T TTTTTTTTTT 2691 het 2691 ref 23 14 6 3 T 10 11 368187 CASAVA_Build 8 130893696 3D GTTCTTCCTC CTT/--- GATACTTTGG 3070 het 3070 hom 43 22 18 5 CTT 1 0 368188 CASAVA_Build 8 130896218 4D ATGATGTTTA TCTT/---- TCTTGTCTTT 3070 het 3070 ref 28 18 7 4 TCTT 2 1 368189 CASAVA_Build 8 130897448 1D AAGAGCCATG A/- AAAAATGCCT 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 A 6 5 368190 CASAVA_Build 8 130898673 2D GGCTCTCTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 T 14 12 368191 CASAVA_Build 8 130901951 3D AAAAACGAAA TCT/--- TCTTCCAACC 3070 het 3070 ref 40 22 15 3 TCT 2 1 368192 CASAVA_Build 8 130915201 2I GGGGAGCTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 13 15 368193 CASAVA_Build 8 130916164 1I GATAAAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 14 17 7 T 10 11 368194 CASAVA_Build 8 130940152 4I GAAGGGACTT ----/ACTC ATTATGACCC 3070 hom 114 het 46 0 38 8 ACTC 0 1 368195 CASAVA_Build 8 130948830 1D TAGGATTACA G/- GGTGTGTGCC 3070 hom 54 het 19 0 19 0 G 3 2 368196 CASAVA_Build 8 130965285 3D TTAAATGGGT TAA/--- TAATAAGCAC 3070 het 3070 hom 30 14 14 4 TAA 3 2 368197 CASAVA_Build 8 130972838 1I TATCTAACTC -/A ACTGCTATCA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 1 2 368198 CASAVA_Build 8 130978030 1D TAGTTTTCTG C/- TTTTTGCACA 3070 hom 81 het 38 0 27 12 C 1 0 368199 CASAVA_Build 8 130979523 1I AGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 20 0 18 2 T 11 12 368200 CASAVA_Build 8 130990380 1I TAAAGATTTT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 7 8 368201 CASAVA_Build 8 131004668 20I CAAAACTCTT --------------------/ATCTCAAAAAAAAGAAAAAG AAAAAGAAAA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 ATCTCAAAAAAAAGAAAAAG 0 1 368202 CASAVA_Build 8 131005538 2D TCTCCACCCC AA/-- AAAAAAAAAA 2105 het 80 hom 17 2 7 9 A 18 16 368203 CASAVA_Build 8 131028496 1I TTATTTATTT -/A TTTTTTTTGA 3070 het 1295 hom 19 4 8 7 A 0 1 368204 CASAVA_Build 8 131033134 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2091 het 899 hom 14 3 7 4 A 12 11 368205 CASAVA_Build 8 131033483 2D TTTTTGTTTA TT/-- TTTTTTGAGA 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 8 6 368206 CASAVA_Build 8 131035954 1D CCTGGCCTAG T/- TTTTTAATTT 991 het 991 ref 16 11 3 2 T 6 5 368207 CASAVA_Build 8 131040707 3D GCCACACCCC ACT/--- ACTTGCTTCC 3029 het 3029 ref 30 12 12 7 ACT 2 1 368208 CASAVA_Build 8 131043502 1I ACATGGGAGA -/C CCCCTTCTCT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 C 4 5 368209 CASAVA_Build 8 131072745 1D AGTCTTCTCC A/- AAACTCATAC 3070 het 3070 hom 42 13 26 3 A 4 3 368210 CASAVA_Build 8 131087242 1D CTCATCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1090 het 991 hom 23 5 5 13 A 17 16 368211 CASAVA_Build 8 131093962 1I CTGAGCACCT -/A CTAGGTGCCA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 A 0 1 368212 CASAVA_Build 8 131101311 2D GCTTTCAAGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 28 3 9 19 A 13 11 368213 CASAVA_Build 8 131102256 1D GCTTTTTGTG T/- TTTTTGAGGG 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 T 6 5 368214 CASAVA_Build 8 131103550 1D TAACTTTTTG T/- GGGGGGACAG 3070 het 3070 hom 40 14 14 12 T 1 0 368215 CASAVA_Build 8 131104514 1I AACAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 33 0 29 4 A 9 10 368216 CASAVA_Build 8 131115288 1D AAAGGCTACT A/- CCCAGCCTCT 3070 het 3070 ref 41 25 14 2 A 1 0 368217 CASAVA_Build 8 131117828 1I AGATCTTTTT -/C TTTCTTTATT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 C 0 1 368218 CASAVA_Build 8 131126192 1D TTAAAACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 21 4 T 11 10 368219 CASAVA_Build 8 131159421 1I GTTTAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 492 het 492 ref 32 14 4 14 T 17 18 368220 CASAVA_Build 8 131163018 1I GGCAGGGCTG -/A AAAAAAAACT 3070 hom 111 het 42 0 36 6 A 8 9 368221 CASAVA_Build 8 131171726 1I ATTAAAACTT -/A AAGAGAAATT 3070 het 3070 hom 50 20 25 5 A 2 3 368222 CASAVA_Build 8 131173755 1I AAATTTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3027 hom 27 9 12 6 A 10 11 368223 CASAVA_Build 8 131175217 1I TCTTCATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 16 13 A 10 11 368224 CASAVA_Build 8 131179191 2D TCTCCTGAGA CT/-- CTCTCCCAGG 3070 hom 92 het 34 0 28 8 CT 3 2 368225 CASAVA_Build 8 131184422 4D TCCAGCCTAG CTGT/---- CTGTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 21 11 4 CTGT 2 1 368226 CASAVA_Build 8 131195065 1I AGTTAACTGC -/T TTATAAGGAA 3070 het 3070 hom 47 20 24 3 T 2 3 368227 CASAVA_Build 8 131197207 1I TTAAATGCTG -/A AAACATCCCA 3070 het 3070 hom 52 20 23 9 A 3 4 368228 CASAVA_Build 8 131200517 4D TCGTCTGATA TAAC/---- TCTCTATTTT 3070 het 3070 hom 28 12 15 2 TAAC 1 0 368229 CASAVA_Build 8 131205356 1I GCACCCAGCC -/A AAAAAAAAAA 1497 het 530 hom 17 5 6 6 A 13 14 368230 CASAVA_Build 8 131216957 2D AAAACAAAAC AA/-- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 8 6 368231 CASAVA_Build 8 131217989 1D ACCTAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 2448 het 1887 hom 38 10 8 20 T 15 14 368232 CASAVA_Build 8 131229650 1D GCAGCTGAGG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 41 16 19 7 A 9 8 368233 CASAVA_Build 8 131241974 1D GTGAAAAGTG T/- TATGATGTCG 3070 het 3070 hom 43 19 19 7 T 2 1 368234 CASAVA_Build 8 131243746 1D TTTGTTGTTG T/- TTTTTTAAGA 3070 hom 75 het 31 0 24 7 T 7 6 368235 CASAVA_Build 8 131248743 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 12 11 368236 CASAVA_Build 8 131251621 1D AAGGAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 36 1 27 8 T 12 11 368237 CASAVA_Build 8 131252868 3D CAGGAGAGAG AAT/--- AATGCCAGCA 2668 het 2668 ref 33 22 8 5 AAT 2 1 368238 CASAVA_Build 8 131262336 1I GTCATTATTT -/A AAAAAAAAAA 3068 het 3068 ref 27 11 9 7 A 12 13 368239 CASAVA_Build 8 131269481 1I TTGAAAGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 12 12 2 A 10 11 368240 CASAVA_Build 8 131272478 1D CGGGAAATAG T/- TTTTTTTTTT 1790 het 69 hom 22 2 8 12 T 15 14 368241 CASAVA_Build 8 131278874 12D AGACTGTCTC AAAAGAAAAAAG/------------ AAAAGAAAAG 3070 het 3070 ref 35 20 15 4 AAAAGAAAAAAG 1 0 368242 CASAVA_Build 8 131290979 1I CTCTTACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 13 13 20 A 14 15 368243 CASAVA_Build 8 131291224 1I GTGGAACACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 T 9 10 368244 CASAVA_Build 8 131293194 1D CATAATAGAC T/- TTTGGTACTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 4 T 4 3 368245 CASAVA_Build 8 131310129 1D ACCCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1889 hom 25 7 14 4 A 15 14 368246 CASAVA_Build 8 131311494 20D CCTGTCTCCA AAACAAACAAACAAACAAAC/-------------------- AAACAAACAA 3070 het 1362 hom 33 9 15 13 AAAC 10 5 368247 CASAVA_Build 8 131326835 1D TTGACCAAAG A/- ACAGGAAAGA 3070 het 3070 ref 48 23 17 8 A 2 1 368248 CASAVA_Build 8 131327610 1I CTCCCCTTCG -/C CCCCCCCATG 3070 het 3070 ref 43 18 14 11 C 7 8 368249 CASAVA_Build 8 131339215 1D CTCAAGAGCA C/- CCCCCCCCCA 3032 het 150 hom 24 3 8 13 C 10 9 368250 CASAVA_Build 8 131345568 3D CCTCCAGATA AGG/--- AGAAGAGAAT 3070 het 3070 ref 52 29 19 4 AGG 1 0 368251 CASAVA_Build 8 131352328 4D AATCTTTCCT GTAA/---- GTATTACCTG 3070 het 3070 ref 30 14 12 6 GTAA 1 0 368252 CASAVA_Build 8 131367815 2D TACTTCCATT CA/-- CAGTTTAAGT 3070 het 3070 hom 41 16 20 6 CA 2 1 368253 CASAVA_Build 8 131369752 1I TCCTTAGGGT -/A AATTCCATTC 1733 het 1733 ref 17 8 4 5 A 2 3 368254 CASAVA_Build 8 131376768 1I ATAGTAACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 12 13 368255 CASAVA_Build 8 131388784 1I ATCCTGTGGC -/A AAAAAATAAA 3070 het 3070 ref 40 19 14 7 A 6 7 368256 CASAVA_Build 8 131402072 1D AGGAAGAGTT A/- AAAATGAAAA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 5 4 368257 CASAVA_Build 8 131403037 2D CTAATAAAGA CT/-- CTGTTTTATC 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 CT 2 1 368258 CASAVA_Build 8 131403732 1D ATCTGTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 24 0 16 9 A 15 14 368259 CASAVA_Build 8 131414345 1I AAAAAAGAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2245 hom 21 6 11 4 T 11 12 368260 CASAVA_Build 8 131417487 2D CAACTCCAAA CT/-- CTGTCTCATC 3070 het 3070 ref 48 25 14 9 CT 2 1 368261 CASAVA_Build 8 131424183 3I ACTCTCAGAA ---/ACG ACAAGTTAAA 3070 het 3070 hom 49 23 23 3 ACG 0 1 368262 CASAVA_Build 8 131454310 8D ACTCATGCAT ATGGACAC/-------- ATGGACACAT 3070 het 3070 ref 40 15 15 13 ATGGACAC 2 1 368263 CASAVA_Build 8 131482051 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAAATA 907 het 907 ref 6 3 3 0 A 9 8 368264 CASAVA_Build 8 131484348 4D CTTTTGTGGG GTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 het 1261 hom 26 7 15 5 GTTT 1 0 368265 CASAVA_Build 8 131486706 1I TTTATAGATG -/A AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 A 6 7 368266 CASAVA_Build 8 131490690 1D ACGGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 8 14 9 A 11 10 368267 CASAVA_Build 8 131500205 1D AAAATAGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 13 12 368268 CASAVA_Build 8 131580250 11D GGGCAATGGT GAGCCACTGAA/----------- GAGCCACTGA 2874 het 2874 ref 41 23 11 15 GAGCCACTGAA 2 1 368269 CASAVA_Build 8 131585785 15I GGGGAATGTC ---------------/AGTTTTTGCTCTTAA AGTCTTCAAC 3070 hom 69 het 24 0 22 4 AGTTTTTGCTCTTAA 0 1 368270 CASAVA_Build 8 131594538 9I GGCAAAACCA ---------/GGTAAAGCT GGGAGCAGGG 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 GGTAAAGCT 0 1 368271 CASAVA_Build 8 131603713 2I ATTCCCTCTC --/AA AAAAAAAAAA 93 het 93 ref 31 10 2 22 A 16 18 368272 CASAVA_Build 8 131607643 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1842 het 1459 hom 16 6 5 5 A 13 14 368273 CASAVA_Build 8 131623056 1D TGGCCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 2386 het 2386 ref 43 16 9 19 T 17 16 368274 CASAVA_Build 8 131623574 3D CAGTTTCAAA AGG/--- AGGAGAGAAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 AGG 2 1 368275 CASAVA_Build 8 131624426 4D CTGCAGGTAT TTAG/---- TTAGACTGTG 3070 het 3070 ref 35 19 14 4 TTAG 2 1 368276 CASAVA_Build 8 131624753 1D GATTCTTTTT G/- TTCAAGGTAG 3070 het 3070 ref 22 11 7 4 G 1 0 368277 CASAVA_Build 8 131629504 1D AGAAATATTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 12 7 T 10 9 368278 CASAVA_Build 8 131632244 2I CATCATTCTA --/CT CTCTACTGCC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 CT 2 3 368279 CASAVA_Build 8 131635729 1D TTTCCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2591 het 2591 ref 22 9 9 4 T 11 10 368280 CASAVA_Build 8 131640366 1I CCTGAAGGGG -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 A 7 8 368281 CASAVA_Build 8 131651994 4I AATTAAAAAC ----/AAAT AGACATGCAA 3070 het 1624 hom 26 4 13 9 AAAT 0 1 368282 CASAVA_Build 8 131652038 1D ATCAAAAAAA C/- AATAGAGGTA 3070 het 2197 hom 24 6 13 5 C 1 0 368283 CASAVA_Build 8 131652976 5D ACTAAAAAAA AGTAG/----- AGTATTCTTC 3070 het 3070 hom 55 20 28 9 AGTAG 1 0 368284 CASAVA_Build 8 131653566 2I TCTGATCTTT --/AA AAAGAGTCAC 3070 het 3070 hom 38 12 21 5 A 3 5 368285 CASAVA_Build 8 131654865 1D ACTCCATGTT C/- TTCGGCTTTG 2646 het 2646 ref 21 13 6 2 C 1 0 368286 CASAVA_Build 8 131713081 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 22 0 11 11 A 15 16 368287 CASAVA_Build 8 131734798 1I GCCTCTGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1065 hom 34 6 16 12 A 15 16 368288 CASAVA_Build 8 131750540 1I TTTAAATCCC -/G GCCAGAAAGC 3070 het 3070 ref 50 25 18 7 G 1 2 368289 CASAVA_Build 8 131756688 1I ATTTAGACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2367 hom 16 6 9 1 T 10 11 368290 CASAVA_Build 8 131759936 1D ATGGGTGGGG T/- CTCGATCTGA 3070 het 3070 hom 45 18 21 8 T 1 0 368291 CASAVA_Build 8 131762078 6D AGTGGGGAGA AAATGC/------ AAATGCACCT 3070 het 3070 ref 46 22 16 8 AAATGC 2 1 368292 CASAVA_Build 8 131764170 5I GGAGGCCTGG -----/GATCT GTGGCTGAAG 3070 het 3070 hom 62 27 25 10 GATCT 0 1 368293 CASAVA_Build 8 131772211 1I TTCTTTGTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 T 10 11 368294 CASAVA_Build 8 131789900 2I TAGTCAACAC --/AA GAGAAACATG 3070 het 3070 ref 50 32 18 0 A 0 2 368295 CASAVA_Build 8 131796568 3I TACGTTAGAG ---/CAA GTATCACGCT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 CAA 0 1 368296 CASAVA_Build 8 131804835 1I CTTTATAGTA -/G AAAATTTATA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 G 0 1 368297 CASAVA_Build 8 131810666 4D TGTGGAGGAG AGAA/---- AGAAAAGATG 3070 het 3070 ref 57 31 23 7 AGAA 2 1 368298 CASAVA_Build 8 131819982 4D ACCTATGCAC CTGA/---- CTAAGGTCTA 3070 het 3070 ref 28 18 9 1 CTGA 1 0 368299 CASAVA_Build 8 131838946 1D TTGAGAAAAA G/- AAAAAGTGTT 3070 het 3070 ref 38 17 15 6 G 1 0 368300 CASAVA_Build 8 131841876 2I AAGTGCAGAC --/AT GTGTTAAATA 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 AT 0 1 368301 CASAVA_Build 8 131848150 1I AAATCCCCCC -/T GGCTTCTTGT 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 0 1 368302 CASAVA_Build 8 131850490 2I AGGTGGAGAC --/TG TGTAAGATAC 3070 het 3070 ref 51 24 16 11 TG 1 2 368303 CASAVA_Build 8 131853976 26D ATCATGAATG TAGCATTCATGATTCATGTAGCAAAA/-------------------------- TGCTTAATGG 3070 het 3070 ref 27 22 10 8 TAGCATTCATGATTCATGTAGCAAAA 1 0 368304 CASAVA_Build 8 131856448 1I GGGGTTGGAG -/C CCCCACACAG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 C 4 5 368305 CASAVA_Build 8 131864555 1I GAATGGCAAA -/T TATAAAGGAT 3070 hom 106 het 47 0 35 12 T 1 2 368306 CASAVA_Build 8 131870990 5D CTTCTCACCT CAGTG/----- CAGTTTAAGA 3070 het 3070 ref 49 28 16 7 CAGTG 1 0 368307 CASAVA_Build 8 131871566 1I AGTGCATGCT -/G GCTTTGAGGG 3070 het 3070 hom 50 15 29 6 G 1 2 368308 CASAVA_Build 8 131881363 1D GTGAGCATTT C/- CCCCCACAGA 3070 het 3070 ref 50 24 21 6 C 6 5 368309 CASAVA_Build 8 131890325 3D78M1I TTTTCAACAA CTCCTCATAAAGCCATGATGAGCCAGTGGGTTTCCCGGGACTCAGAGCTAGCCTGCTTGACATTGATGAGATACTCAGGCC-/---CTCATAAAGCCATGATGAGCCAGCGGGTTTCCCGGGACTCAGAGCTAGCCTGCTTGACATTGATGAGATACTCAGGCCT GGACCTCCAG 3070 het 3070 ref 51 36 23 22 N/A 0 0 368310 CASAVA_Build 8 131891018 1I ATTAACATCT -/G GGTCCTAGGA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 G 2 3 368311 CASAVA_Build 8 131904667 1D AAGAAAAAGT A/- AAAATTATGA 3070 het 3070 hom 35 12 20 3 A 5 4 368312 CASAVA_Build 8 131935006 7D AAAATTGATG TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 3070 het 283 hom 53 5 15 35 T 18 11 368313 CASAVA_Build 8 131936546 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 1776 het 480 hom 21 2 6 13 T 13 12 368314 CASAVA_Build 8 131938664 2I AAACTTAAAG --/TA TAATAATAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 2 TA 1 2 368315 CASAVA_Build 8 131938775 1D CATTTCTTTA T/- TAGTTTTATC 3070 hom 78 het 28 0 26 2 T 2 1 368316 CASAVA_Build 8 131944611 3D ATATTGCTCG TTC/--- TTCTTAGAGA 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TTC 2 1 368317 CASAVA_Build 8 131944822 1D TATTGGGGCC T/- TTTTTTTTTT 921 het 921 ref 36 26 3 8 T 11 10 368318 CASAVA_Build 8 131947763 4D AACTTGAACA TCTT/---- TCTTCCACAG 3070 het 3070 ref 30 21 7 2 TCTT 2 1 368319 CASAVA_Build 8 131948990 1I TCTTATACCT -/A ATTTTCTGCA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 1 2 368320 CASAVA_Build 8 131949627 5D TGAACTAACA TTATT/----- TTAACAGAAC 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 TTATT 1 0 368321 CASAVA_Build 8 131949786 1I TCTTTCTGCC -/T TCCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 24 23 4 T 1 2 368322 CASAVA_Build 8 131952372 9I GGCGTTAATG ---------/TAGTTTATA TAGTTCATAA 3070 het 3070 ref 40 22 13 5 TAGTTTATA 0 1 368323 CASAVA_Build 8 131953371 2D ACTTGGCAAT CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 30 9 14 7 CA 7 6 368324 CASAVA_Build 8 131958149 1D GTAGGGGGGC A/- GGGGGGAATG 3070 het 3070 ref 43 22 14 8 A 1 0 368325 CASAVA_Build 8 131965483 1I CACAACCCAT -/C TTCTTTCTAC 3070 het 3070 ref 44 27 13 4 C 0 1 368326 CASAVA_Build 8 131966652 2D ATGGCTTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 15 15 7 T 14 12 368327 CASAVA_Build 8 131967092 1I ACCAAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 19 9 A 10 11 368328 CASAVA_Build 8 131968411 1I AGAAAGGGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 7 hom 24 1 19 4 T 10 11 368329 CASAVA_Build 8 131969293 9D CATACACTGA TATATTCAC/--------- TATATTCACA 3070 hom 111 het 41 0 38 6 TATATTCAC 2 1 368330 CASAVA_Build 8 131973775 1D TGCTAACTTT G/- ATAGGGATGA 3070 hom 111 het 43 0 36 8 G 1 0 368331 CASAVA_Build 8 131979131 1D3M4D ACACCTCACA TCATATGC/-CAT---- ACATACACAC 1954 het 1954 ref 26 19 6 5 N/A 0 0 368332 CASAVA_Build 8 131985794 1D AAAACAGTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 120 het 50 0 41 9 T 10 9 368333 CASAVA_Build 8 131988761 1D ACCCAAGGCT C/- AGTGGTGTTA 3070 het 2055 hom 34 8 21 5 C 1 0 368334 CASAVA_Build 8 131988796 1D AAAAAAGTGG A/- AAAATATATA 3070 het 1204 hom 32 3 16 13 A 5 4 368335 CASAVA_Build 8 131989940 5D CACAGTGTAC AAAAA/----- AAAGCGCTTC 3070 hom 102 het 39 0 33 9 A 8 3 368336 CASAVA_Build 8 131992372 1I ACCTTCATTG -/C CCCCCAAATG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 C 5 6 368337 CASAVA_Build 8 131993034 5D AATTTAAAAT TTTAA/----- ATTTTAAATT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 TTTAA 1 0 368338 CASAVA_Build 8 132008369 2D ATTCCATTAC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 26 0 13 13 AT 10 9 368339 CASAVA_Build 8 132010906 1I CTAGTGTTAT -/A ACCCTTGTGG 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 1 2 368340 CASAVA_Build 8 132014643 2D TTATATTAAC AT/-- ATAACATTAT 3070 het 3070 ref 37 20 16 2 AT 2 1 368341 CASAVA_Build 8 132032598 3D CAAAGTGGCT AAG/--- AAGATGCTTA 3070 hom 78 het 34 0 27 8 AAG 2 1 368342 CASAVA_Build 8 132041880 7I AAACCTATTT -------/ATGACTC ATCCTGGGAA 3070 hom 117 het 41 0 35 7 ATGACTC 0 1 368343 CASAVA_Build 8 132054270 1I TCAGCATCAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 56 20 23 13 T 9 10 368344 CASAVA_Build 8 132057448 1D TCAGTATGCT A/- AAAAAAACCA 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 8 7 368345 CASAVA_Build 8 132070855 1I TTCTTTATGA -/T TTTTTGCAAA 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 T 5 6 368346 CASAVA_Build 8 132084094 2D AAGAAAAGGT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 22 8 8 6 A 11 9 368347 CASAVA_Build 8 132084473 1I TACTAAAAAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 1079 hom 12 3 8 1 A 7 8 368348 CASAVA_Build 8 132085050 11I TATGGACAGT -----------/CCAATAGCAAC CCTGCTTGGG 3070 het 3070 hom 31 11 13 7 CCAATAGCAAC 0 1 368349 CASAVA_Build 8 132088502 5D TGAATGAATG TTTTT/----- TACAAACAGT 3070 het 3070 hom 45 21 22 4 T 6 1 368350 CASAVA_Build 8 132089469 1D AATTTATTGT C/- CAATCAGAAT 3070 het 3070 hom 53 24 24 5 C 2 1 368351 CASAVA_Build 8 132090821 1D CATGGGGTGG T/- TTCCCCCTTT 3070 het 3070 ref 38 16 18 4 T 3 2 368352 CASAVA_Build 8 132092603 1D TTATTGAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 25 8 A 13 12 368353 CASAVA_Build 8 132093596 1D CATGACTTTC A/- CCTGAGCATG 3070 het 3070 ref 53 28 19 6 A 1 0 368354 CASAVA_Build 8 132094953 1D AAGACCCCCT C/- CCCCAGTGAT 3070 het 3070 ref 38 16 14 8 C 5 4 368355 CASAVA_Build 8 132099252 1D CATGTAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 13 16 9 A 12 11 368356 CASAVA_Build 8 132103550 1D ACACCAATCT G/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 G 1 0 368357 CASAVA_Build 8 132115050 2I CATTTTACAA --/CT CTCTCTAAAT 3070 het 3070 hom 57 24 26 7 CT 3 4 368358 CASAVA_Build 8 132137963 1D TCACTTTCAT G/- GGAGCTTATA 3070 hom 93 het 36 0 28 8 G 3 2 368359 CASAVA_Build 8 132158979 1D TGATAGGACC A/- AAAGATTTCA 3070 het 3070 ref 47 26 17 4 A 4 3 368360 CASAVA_Build 8 132161576 1I ACCTGGAATG -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 T 7 8 368361 CASAVA_Build 8 132173461 3I AATGATACAT ---/ATG ATAATTTGTT 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 ATG 0 1 368362 CASAVA_Build 8 132224274 3I TCCAAAATTC ---/TTT TTTATTCTTC 3070 hom 104 het 46 0 35 11 T 3 6 368363 CASAVA_Build 8 132243781 2I TCTTCGGGCC --/CT GATTCCAGTA 3070 het 3070 ref 48 24 21 3 CT 0 1 368364 CASAVA_Build 8 132258373 1I TTTCTGTGAG -/T GGGTGCATGG 3070 het 3070 hom 47 18 24 5 T 0 1 368365 CASAVA_Build 8 132266046 2I AGAGAGAGAG --/AA AAACAGAAGT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 A 3 5 368366 CASAVA_Build 8 132275456 1D TTGCTGAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 34 0 10 24 T 13 12 368367 CASAVA_Build 8 132278723 3D CTTTTGTCAA TTT/--- TTGGCTTTGC 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 T 5 2 368368 CASAVA_Build 8 132285611 1I TTAAAAATAT -/A AAAAAAAAAT 754 het 495 hom 4 1 3 0 A 9 10 368369 CASAVA_Build 8 132296892 6I CCCTGTGCAG ------/CATTTA CATTACTGAA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 CATTTA 0 1 368370 CASAVA_Build 8 132301477 2D AAATAAAGAC CT/-- AGATCTCTGC 3070 het 3070 hom 46 20 20 7 CT 1 0 368371 CASAVA_Build 8 132301801 7I ACCTGGCACT -------/TAGTGGG TTCCAAGTTA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 TAGTGGG 0 1 368372 CASAVA_Build 8 132318628 3D GCAGAGGTTA CTG/--- CTGCTGTCTT 3070 hom 60 het 25 0 19 6 CTG 3 2 368373 CASAVA_Build 8 132322356 2D AACATCTGTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 29 0 11 18 T 16 14 368374 CASAVA_Build 8 132326575 1D TACCGGCCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 51 het 36 1 29 7 T 10 9 368375 CASAVA_Build 8 132327480 1I TGTTTTACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 15 12 0 T 10 11 368376 CASAVA_Build 8 132330745 1D ATGAGGTATC T/- GATGGTTCAC 3070 het 3070 ref 45 25 15 5 T 1 0 368377 CASAVA_Build 8 132331645 1I ACAAGCAAGA -/T TTTTTGTTCC 3070 het 3070 ref 24 12 10 2 T 5 6 368378 CASAVA_Build 8 132338588 1D ACTAAATTGT A/- AGGCAGATTA 3070 het 3070 ref 40 20 18 2 A 2 1 368379 CASAVA_Build 8 132346249 1I ACTGCACCTA -/T TCCAAAATTG 3070 hom 36 het 16 0 13 3 T 1 2 368380 CASAVA_Build 8 132346591 1I ATTGACACCC -/T AACACCACAA 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 0 1 368381 CASAVA_Build 8 132353030 1I TTTTCATGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 592 hom 24 3 17 4 A 11 12 368382 CASAVA_Build 8 132355999 2D GGAATGTTCT GG/-- CAAGTGAATA 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 G 2 0 368383 CASAVA_Build 8 132357878 1D GTGCATTGCC T/- TTTTCCAGGG 3070 hom 117 het 46 0 40 6 T 5 4 368384 CASAVA_Build 8 132363546 1D ACATGGCTAC T/- TTTTTGTAAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 T 6 5 368385 CASAVA_Build 8 132370800 4D ATTTACTCAA ATCT/---- ATCTATCTTT 3070 hom 91 het 36 0 31 8 ATCT 3 2 368386 CASAVA_Build 8 132384288 1I TTTGCTTGTT -/G GTCATTTGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 1 2 368387 CASAVA_Build 8 132384876 1I TCCGTGTGTC -/T TATTTTTACA 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 1 2 368388 CASAVA_Build 8 132400538 1D CCCTATCCCC T/- ATGCCTCCTC 3070 hom 141 het 55 0 44 12 T 1 0 368389 CASAVA_Build 8 132400640 4D TTATCTATGC AAAA/---- ACACTGCATG 3070 hom 126 het 47 0 43 4 A 5 1 368390 CASAVA_Build 8 132405485 1D ACAGAATTGG A/- AAAAAACTAC 1972 hom 10 het 4 0 4 0 A 7 6 368391 CASAVA_Build 8 132407003 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 9 8 368392 CASAVA_Build 8 132407624 1I GGGCTTCGCC -/T TCATGAATGG 3070 hom 132 het 52 0 45 7 T 1 2 368393 CASAVA_Build 8 132408196 5D CACAGAAAAT AAAAC/----- AAAACAAAAT 3070 het 3070 hom 21 7 14 5 AAAAC 2 1 368394 CASAVA_Build 8 132410366 4D CTCAGATAAC TTAA/---- TTAACCTCCT 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 TTAA 2 1 368395 CASAVA_Build 8 132412893 1D CCTTTATTAG T/- TGATATATGA 2668 het 2668 ref 20 11 6 3 T 2 1 368396 CASAVA_Build 8 132416433 1D AAAACACTAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 406 hom 23 1 20 4 A 10 9 368397 CASAVA_Build 8 132416799 2I GGTGATATAC --/AT ATATATATAT 2116 hom 12 het 8 0 5 3 AT 8 9 368398 CASAVA_Build 8 132417882 2I AAGCATGAGG --/CA CAGTGACTGA 3070 hom 99 het 41 0 34 7 CA 1 2 368399 CASAVA_Build 8 132419175 1I CACTTTATGG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 T 9 10 368400 CASAVA_Build 8 132419256 1I ATTTGAGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 9 10 368401 CASAVA_Build 8 132422777 1D AGAGGGTGAG A/- AACAAAGAGA 3070 het 3070 ref 29 12 11 7 A 3 2 368402 CASAVA_Build 8 132427582 2D AGACCAGGTC AT/-- AGAGAGGCCA 3070 het 3070 hom 47 16 27 5 AT 1 0 368403 CASAVA_Build 8 132428522 1D TGCAGATACA T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 ref 53 26 22 5 T 8 7 368404 CASAVA_Build 8 132432209 2D TGTCAGAAAG CA/-- CAGTTTCAGG 3070 het 3070 hom 41 16 20 7 CA 2 1 368405 CASAVA_Build 8 132434437 1D AAGACAGAAT A/- TGGGTTAATT 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 A 1 0 368406 CASAVA_Build 8 132437992 1I ATGCTACTGA -/T TTTTCATAAA 3070 het 3070 ref 34 15 11 8 T 4 5 368407 CASAVA_Build 8 132442216 1I GGAAGGTTTT -/C TTATATAACT 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 C 0 1 368408 CASAVA_Build 8 132444127 1I AATTTGCACA -/C AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 27 10 12 5 C 0 1 368409 CASAVA_Build 8 132447218 1I GCCATTCAAA -/G ATGTTCAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 10 3 G 0 1 368410 CASAVA_Build 8 132448220 1D AAAAGTAGTC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 8 7 368411 CASAVA_Build 8 132451786 1I CAAATAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 11 12 368412 CASAVA_Build 8 132456627 1D CTCTGATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 19 2 A 13 12 368413 CASAVA_Build 8 132457958 1D TAAGACATTG T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 9 8 368414 CASAVA_Build 8 132459152 8D2M3D CTGAGAACCA GGAAAGCCTATGC/--------TA--- TATAACTTCC 3070 het 3070 ref 26 17 9 7 N/A 0 0 368415 CASAVA_Build 8 132461013 4I AGAAATAATT ----/TTTA TTTATTTATT 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 TTTA 3 4 368416 CASAVA_Build 8 132469860 2D TGAAAAATTC AA/-- AGTCACCGTT 3070 het 3070 hom 39 16 21 3 A 3 1 368417 CASAVA_Build 8 132477177 1I CAATGGAAAG -/A AAAAAAATCC 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 7 8 368418 CASAVA_Build 8 132494913 1I AAATGAATAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 31 14 13 4 A 8 9 368419 CASAVA_Build 8 132499206 1I GTCCCCCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 10 11 368420 CASAVA_Build 8 132503982 3D ACAACCAAAG CAA/--- CAACAACAAC 3070 het 3070 hom 48 20 20 9 CAA 5 4 368421 CASAVA_Build 8 132522039 2I TTTAACAGGA --/TC TCTCTCACTG 3070 het 3070 ref 56 31 21 4 TC 3 4 368422 CASAVA_Build 8 132528924 2I TCCATTTCTC --/AG AGTGTTCTTA 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 AG 1 2 368423 CASAVA_Build 8 132531952 4D ATCCATTGTA CTTT/---- CTTTTTTTTT 2018 het 2018 ref 26 17 6 3 CTTT 2 1 368424 CASAVA_Build 8 132538395 1I GAAATTACAT -/A AATTTCAGCC 3070 het 3070 ref 31 17 9 5 A 2 3 368425 CASAVA_Build 8 132543270 2D TTCATGGTTT GG/-- TGCTGACCTC 3070 het 3070 hom 37 19 16 2 G 2 0 368426 CASAVA_Build 8 132545391 2D TCCTTATTGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 8 9 A 12 10 368427 CASAVA_Build 8 132546172 1I CCTGAGTGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 20 8 9 3 A 8 9 368428 CASAVA_Build 8 132571579 4I GAGAAATAAT ----/GTAA GTAATTTAAA 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 GTAA 1 2 368429 CASAVA_Build 8 132577605 5I TGAGGAAATA -----/ATTAT ATTTACTTAC 3070 het 3070 hom 36 15 20 2 ATTAT 0 1 368430 CASAVA_Build 8 132581387 4D CACCCTACTA TTTG/---- TTTATTTCAT 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 TTTG 1 0 368431 CASAVA_Build 8 132582208 1D ACAAGAACAA C/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 15 16 5 C 1 0 368432 CASAVA_Build 8 132582694 1D TGGAGCATTT G/- GAACTCTGAT 3070 het 3070 ref 37 17 18 2 G 2 1 368433 CASAVA_Build 8 132583145 1D AAAGATGGGG A/- AAAAAATGAT 3070 het 3070 ref 31 16 13 3 A 7 6 368434 CASAVA_Build 8 132585623 1D TTTAGCTTCA T/- TTTTTTCCCT 3070 het 3070 hom 44 20 19 6 T 7 6 368435 CASAVA_Build 8 132585922 1D TCTTTCTGTC A/- TTGATTTCTA 3070 het 3070 ref 36 17 16 4 A 1 0 368436 CASAVA_Build 8 132589693 1I TCTCACTTTG -/T TTGCCCAGCC 3070 het 2740 hom 20 8 11 1 T 2 3 368437 CASAVA_Build 8 132590534 1D AGCCTTCCCT A/- AAAAAATCAT 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 A 7 6 368438 CASAVA_Build 8 132595840 1I AGTCTCAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 11 12 368439 CASAVA_Build 8 132596326 3I TGTCCCCTTT ---/ACA ACAATATGGA 3070 het 3070 ref 57 27 23 7 ACA 1 2 368440 CASAVA_Build 8 132622523 2D ACAACAAAAC TG/-- TGTGGATGAT 3070 het 3070 ref 40 23 16 2 TG 3 2 368441 CASAVA_Build 8 132626317 4D CTTTATCAAA TCTC/---- TCTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 4 TC 3 1 368442 CASAVA_Build 8 132627001 1D CTTTCCTCCC T/- TTTCTTGTGG 3070 het 3070 hom 46 19 22 7 T 4 3 368443 CASAVA_Build 8 132627397 40D CCTATTCTTC TCACCTAGTTACCTCACTACAGACGACCTCTAGCTTGGTG/---------------------------------------- ACATGTGTGA 3070 het 3070 ref 49 42 16 2 TCACCTAGTTACCTCACTACAGACGACCTCTAGCTTGGTG 1 0 368444 CASAVA_Build 8 132628255 1I TATTTTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1024 het 1024 ref 12 3 5 4 A 15 16 368445 CASAVA_Build 8 132637685 1I CAAAATTTAA -/G GGAAGATAAT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 2 3 368446 CASAVA_Build 8 132638792 1I GTTCTCCAAG -/A CAAACAAAAG 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 A 0 1 368447 CASAVA_Build 8 132642319 1D AATAGAGAAC T/- CCAGAAGAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 1 0 368448 CASAVA_Build 8 132643168 1D GTATATACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 27 hom 34 1 24 9 A 14 13 368449 CASAVA_Build 8 132649756 3D GACAGGCACG CAC/--- CACCACACCT 3070 het 2826 hom 21 8 11 3 CAC 3 2 368450 CASAVA_Build 8 132651097 1D AGTCCAGGCT A/- TTTTTCTTTA 3070 het 3070 hom 33 15 14 5 A 1 0 368451 CASAVA_Build 8 132651947 1I TTCTTTTATG -/A AGTTCTAGGA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 1 2 368452 CASAVA_Build 8 132656121 2D AACAACAAAC AT/-- GTGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 AT 1 0 368453 CASAVA_Build 8 132661698 2I TAAAGTGTGT --/AC GCACACACAC 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 AC 0 1 368454 CASAVA_Build 8 132662622 1I TATCCTTTCC -/A AAAAAAAAAA 2640 het 2640 ref 25 13 8 4 A 10 11 368455 CASAVA_Build 8 132672888 1D TAAAAGAAAG A/- AAAAAAAGGA 3070 het 3070 ref 38 17 18 4 A 8 7 368456 CASAVA_Build 8 132674689 10I CTCACCTTAA ----------/CTAACTATAG CTGCAGTGAT 3070 het 3070 hom 54 17 32 5 CTAACTATAG 0 1 368457 CASAVA_Build 8 132688562 2D GATAACTGTT TA/-- TATATTTGAC 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 TA 3 2 368458 CASAVA_Build 8 132692837 1I CCTCAGGAGC -/T TTTTTTTCAT 3070 hom 101 het 41 0 32 9 T 7 8 368459 CASAVA_Build 8 132701873 1I GAAATATACG -/A AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 27 12 9 6 A 7 8 368460 CASAVA_Build 8 132702379 1D TTAGGAACAG A/- AAAACCAATG 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 5 4 368461 CASAVA_Build 8 132703981 2D ATTTTTTGAA AG/-- AGATTATAGG 3070 het 3070 ref 32 15 15 2 AG 2 1 368462 CASAVA_Build 8 132709074 1D TATCTACATG A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 31 14 14 3 A 8 7 368463 CASAVA_Build 8 132714367 2D TTTGCTATTT TC/-- TGTCTCCTAC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 TC 1 0 368464 CASAVA_Build 8 132715685 1D CCTGCCATTT A/- AAAAAAAAAA 1631 het 1631 ref 40 25 5 10 A 13 12 368465 CASAVA_Build 8 132732749 1D CAACTCCTGT A/- AAAAATTATC 3070 het 3070 ref 44 22 19 4 A 6 5 368466 CASAVA_Build 8 132734940 1D GAGAAGGCAG A/- AAGAAATGAC 3070 het 3070 ref 36 19 14 5 A 3 2 368467 CASAVA_Build 8 132740190 4D TTGGGTTTTT TTTG/---- TTTATTTGTT 2746 het 2349 hom 20 7 10 5 TTTG 1 0 368468 CASAVA_Build 8 132741215 13I CCAGCATCCA -------------/CATGTTTACACAC CATACAGGCT 3070 het 3070 hom 49 21 26 2 CATGTTTACACAC 0 1 368469 CASAVA_Build 8 132743059 1D GCACCAGGCA T/- TTTTTTTTTT 2850 het 2850 ref 32 15 9 9 T 15 14 368470 CASAVA_Build 8 132743074 1D TTTTTTTTTT C/- TGCACAGGGA 2439 het 2439 ref 37 18 8 11 C 1 0 368471 CASAVA_Build 8 132743545 4D ATCCTTGAAC GACT/---- GACTGTCAAG 3070 het 3070 hom 53 27 26 2 GACT 2 1 368472 CASAVA_Build 8 132745927 1I CAACCAATGG -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 hom 37 11 18 8 A 7 8 368473 CASAVA_Build 8 132747051 1I CTGGGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2409 hom 25 8 12 5 T 11 12 368474 CASAVA_Build 8 132747817 1D AAAAGATATG A/- AAAAAAAGTT 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 A 8 7 368475 CASAVA_Build 8 132749561 4I CATTGATAGT ----/CTTC CTTCCTGCCA 3070 het 3070 hom 37 16 15 6 CTTC 1 2 368476 CASAVA_Build 8 132750866 1D ATCATATTTT A/- AAAGGTTTAA 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 4 3 368477 CASAVA_Build 8 132751048 1I GTTCCTCCCC -/T GTCACTAGCT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 T 0 1 368478 CASAVA_Build 8 132752167 4D TTGGCTAAAT ACTC/---- AGTAGAGAGA 3070 het 3070 ref 43 21 18 6 ACTC 1 0 368479 CASAVA_Build 8 132752692 4I AATGATAGGT ----/TAAA TAAATTGTGA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TAAA 1 2 368480 CASAVA_Build 8 132764398 2I CTTATTTATT --/TA TTTATTTTTA 220 het 220 ref 38 7 5 26 TA 0 1 368481 CASAVA_Build 8 132772160 2I CTATTTCTGT --/TA AAAAAAAAAA 1345 het 1345 ref 26 20 5 1 TA 0 1 368482 CASAVA_Build 8 132773305 2I TGCTTATAAC --/TA TTTCTTGCTA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 TA 0 1 368483 CASAVA_Build 8 132776322 1I ACATGGGTGA -/C CTTTGCTCCA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 C 1 2 368484 CASAVA_Build 8 132779874 1I TGTGTCTCTA -/T TTTTTTAAAA 3070 het 55 hom 42 1 36 5 T 6 7 368485 CASAVA_Build 8 132783172 2D CATTTTTGAA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 44 het 33 1 29 3 T 11 9 368486 CASAVA_Build 8 132783264 1I TCTTACTCTA -/T TTCTTCACTT 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 T 2 3 368487 CASAVA_Build 8 132788541 4D GCTATTACAT AGAC/---- AGATAAATCT 3070 het 3070 hom 35 16 18 2 AGAC 1 0 368488 CASAVA_Build 8 132797857 8I CCTTTTAGTG --------/TTCCTTTA GTAGAACCCC 3070 hom 154 het 55 0 52 3 TTCCTTTA 0 1 368489 CASAVA_Build 8 132867046 1D GGACAGGGGA G/- GGGGGATGGT 3070 hom 120 het 55 0 48 8 G 6 5 368490 CASAVA_Build 8 132887284 1D TTCAATAAAA G/- TTACAGCAAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 G 1 0 368491 CASAVA_Build 8 132895015 1D AAAAAAAAAC A/- ATTTAAAATG 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 A 2 1 368492 CASAVA_Build 8 132898309 1D GGTTTGGTTG A/- AAAAAAAAAA 1385 het 1385 ref 42 28 4 10 A 11 10 368493 CASAVA_Build 8 132929095 1D AACAATTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 4 A 12 11 368494 CASAVA_Build 8 132982853 1D CAAACTAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 20 9 6 A 12 11 368495 CASAVA_Build 8 132988428 1D ATCGGGAAGC T/- GAGCCTTCTG 3070 het 3070 ref 47 22 21 5 T 1 0 368496 CASAVA_Build 8 132994894 1I ACTAGTCAGG -/T TTTTTTTTTT 2906 het 2906 ref 26 12 8 6 T 11 12 368497 CASAVA_Build 8 133000515 1D TTGTCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 13 12 368498 CASAVA_Build 8 133003225 7D TCAAGGGAGG AGTTAAA/------- TTCTCTGGAG 3070 het 3070 hom 30 14 14 4 AGTTAAA 1 0 368499 CASAVA_Build 8 133014900 3I AAGGGAATGA ---/TAT TATCTGATTT 3070 het 3070 hom 46 17 26 3 TAT 1 2 368500 CASAVA_Build 8 133040018 1D ATTTCAGGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 T 12 11 368501 CASAVA_Build 8 133046330 1D GAGCCCTCAG A/- AATAATGCCA 1695 het 1695 ref 14 8 4 2 A 3 2 368502 CASAVA_Build 8 133049341 5I ATTTTGTCCT -----/ATTAA ATTATAAAAG 3070 het 2767 hom 30 8 20 2 ATTAA 0 1 368503 CASAVA_Build 8 133067818 9D TTTGTGTCTG TCATTTAAT/--------- TCATTTAATT 3070 het 2479 hom 18 5 10 4 TCATTTAAT 2 1 368504 CASAVA_Build 8 133069609 8D5M1D TATATTTTCT CTGTGAACTATATA/--------TCTAT- TTTTCCCATT 3070 het 3070 hom 41 21 23 3 N/A 0 0 368505 CASAVA_Build 8 133081010 2D GTTTTCCCTC TA/-- TAGAGTTGGA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TA 2 1 368506 CASAVA_Build 8 133110228 12D AAAGAAGAAG GAAAGAAAGAAA/------------ GAAAGAAAGA 1551 het 182 hom 17 4 7 11 GAAA 6 3 368507 CASAVA_Build 8 133110358 4D AGGAAGGAAG GGAA/---- GGAAGGAAGG 637 het 637 ref 57 37 10 11 GGAA 4 3 368508 CASAVA_Build 8 133116126 4I TTTCATTTGG ----/AACC AACCCAGTTG 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 AACC 1 2 368509 CASAVA_Build 8 133123534 7D CTTTTCTAGC AACGAAT/------- AAAGGCAAGT 3070 het 3070 hom 31 13 15 6 AACGAAT 1 0 368510 CASAVA_Build 8 133140499 4D CCCTTCTACC CTCT/---- CTTTCTCCCT 3070 het 3070 hom 42 14 23 8 CT 3 1 368511 CASAVA_Build 8 133141022 1D TCAGAGGAGA C/- CTCAGGCTCT 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 C 2 1 368512 CASAVA_Build 8 133142243 1I ATCATTTTTT -/C CCCATAGCTT 3070 het 3070 ref 47 25 20 2 C 3 4 368513 CASAVA_Build 8 133156032 1I TGTGGCATGA -/T TTTTTTTTTT 3012 het 3012 ref 38 20 12 6 T 10 11 368514 CASAVA_Build 8 133168281 1I TGAAGTGGAG -/T TTGCAGATTT 3070 het 3070 hom 48 21 23 4 T 2 3 368515 CASAVA_Build 8 133175622 1I TGGTGGAAGG -/T GTTAATATTA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 0 1 368516 CASAVA_Build 8 133189265 8I CATCCATAGT --------/TTGGAGAG TTGGAGAGAG 3070 hom 92 het 54 0 30 24 TTGGAGAG 1 2 368517 CASAVA_Build 8 133190863 1D TAAGCATATG A/- AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 A 8 7 368518 CASAVA_Build 8 133199976 1D GGCAGACAGG T/- TTTAAGATGG 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 T 4 3 368519 CASAVA_Build 8 133200259 4D GATGTCCTCA GTCT/---- AACAACCCTC 3070 het 3070 hom 53 21 27 6 GTCT 1 0 368520 CASAVA_Build 8 133201233 3D TCTCTACTTC CTT/--- CTTCATTTTT 3070 het 3070 ref 51 25 21 8 CTT 2 1 368521 CASAVA_Build 8 133201454 3I ATGCTTGGTA ---/TAT TATGGTAGAT 3070 het 3070 hom 40 18 17 5 TAT 1 2 368522 CASAVA_Build 8 133201945 1I TTGCAGATTG -/C CCCCATACCA 3070 het 3070 hom 56 26 25 5 C 4 5 368523 CASAVA_Build 8 133205945 4I TGTATGATTC ----/CTGT CTCTTTTACA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 CTGT 0 1 368524 CASAVA_Build 8 133214091 1I AGGTGGAGAA -/G GGGGTCATCT 3070 hom 96 het 40 0 33 7 G 4 5 368525 CASAVA_Build 8 133228773 3I TATAACCATC ---/ATT ATAAGCTATT 3070 hom 175 het 63 0 58 5 ATT 0 1 368526 CASAVA_Build 8 133232402 3D AAATAAAAAC ATT/--- ATTGTTGGTT 3070 het 3070 ref 29 18 10 2 ATT 2 1 368527 CASAVA_Build 8 133234498 2D AGTTGTTTTT AA/-- AAGTTTTTGC 3070 het 3070 ref 34 16 15 3 A 4 2 368528 CASAVA_Build 8 133235164 1D ACCCCGCAAG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 4 het 29 0 13 16 C 10 9 368529 CASAVA_Build 8 133235419 1D GACGCCTTTG A/- AAAAAAATGC 3070 het 270 hom 26 2 10 15 A 8 7 368530 CASAVA_Build 8 133235432 1I AAAAATGCCA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 687 hom 27 5 12 10 T 8 9 368531 CASAVA_Build 8 133245771 1D TGTAGTCTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 T 12 11 368532 CASAVA_Build 8 133253422 1D TCATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 1692 het 1692 ref 19 13 4 3 A 12 11 368533 CASAVA_Build 8 133273031 4I TGTGTGTGTA ----/TGTG TGTGTGTGTA 2929 hom 21 het 9 0 8 1 TG 4 6 368534 CASAVA_Build 8 133281340 1D CTCAGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 2082 het 1860 hom 29 9 8 12 A 17 16 368535 CASAVA_Build 8 133284407 1D AATTTATTTT A/- AAAAAAATTG 3070 hom 43 het 28 1 25 2 A 8 7 368536 CASAVA_Build 8 133306184 1D ATTTTGATAC T/- TTTTTTTGAG 3070 het 3070 ref 45 24 16 6 T 8 7 368537 CASAVA_Build 8 133323454 2I GAACTTATTC --/CT CTCTGCACAA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 CT 2 3 368538 CASAVA_Build 8 133327413 8I ACCAACTTAT --------/TAAATGAA TAAATGAATA 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 TAAATGAA 1 2 368539 CASAVA_Build 8 133329400 3I GAGTGAGCAC ---/TAT TATTATTATC 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 TAT 3 4 368540 CASAVA_Build 8 133333748 1I TTCCAGTGGG -/T TCATGGTCTC 2901 het 2641 hom 17 7 7 3 T 1 2 368541 CASAVA_Build 8 133337407 4I AAAAGAAAAT ----/AAAC AAACAAACCA 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 AAAC 2 3 368542 CASAVA_Build 8 133346521 5D AAGGACTGCT AAAAA/----- GGTAATAAAG 3070 het 3070 ref 48 24 17 8 A 5 0 368543 CASAVA_Build 8 133347608 2I CATTATTTAC --/AG AGTCAAAGCA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 AG 1 2 368544 CASAVA_Build 8 133351560 1I GATTTTCCTG -/A AAAAAAAAAA 2998 het 2406 hom 18 7 8 3 A 12 13 368545 CASAVA_Build 8 133362950 4D24M2D ATATGGAATC TGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTA/----TGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTG-- TATATATATA 3070 het 2920 hom 28 11 20 3 N/A 0 0 368546 CASAVA_Build 8 133364686 1D TCAGAGAGGC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 45 15 25 5 A 10 9 368547 CASAVA_Build 8 133365918 1I ACTCTATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 16 7 T 10 11 368548 CASAVA_Build 8 133381220 10I TTTTCTGAGG ----------/TCTCAACCAA GCGGTATTTT 3070 het 3070 hom 39 17 19 4 TCTCAACCAA 0 1 368549 CASAVA_Build 8 133392811 2I AGATTGTCCC --/CT GTTTACTAAT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CT 0 1 368550 CASAVA_Build 8 133410925 1I TAAACCTTCA -/T TTGCCATCAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 2 3 368551 CASAVA_Build 8 133415166 1D ATGAAACAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 29 10 T 15 14 368552 CASAVA_Build 8 133423753 1I TTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 50 12 24 14 T 9 10 368553 CASAVA_Build 8 133425372 10D CCAATTTTAA GACTGTGGCT/---------- GAACAGATGA 3070 het 3070 ref 56 34 17 5 GACTGTGGCT 1 0 368554 CASAVA_Build 8 133439506 1I GTGTCCTCAC -/A AAAAAAGGAG 3070 het 3070 hom 48 18 26 4 A 6 7 368555 CASAVA_Build 8 133450347 1I TTACTGACCC -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 43 16 20 7 T 6 7 368556 CASAVA_Build 8 133456776 1D AATGGCACTG T/- TTTTGCCTTT 3070 het 3070 ref 36 15 15 7 T 5 4 368557 CASAVA_Build 8 133460736 1I ATTAGCTCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 18 8 T 9 10 368558 CASAVA_Build 8 133465446 1I AACTAAGGAG -/A AATGGGAGTC 3070 het 3070 ref 71 34 26 11 A 2 3 368559 CASAVA_Build 8 133467365 1I CTATCCGGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 A 10 11 368560 CASAVA_Build 8 133483398 4I CTGGTGCAGT ----/CAGC CGGGCAGTTG 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 CAGC 0 1 368561 CASAVA_Build 8 133484682 2I TTGTCTCAAA --/AG AGAGCCATGA 3070 hom 41 het 20 0 13 7 AG 2 3 368562 CASAVA_Build 8 133487964 4D ACACACACAG ACAC/---- ACACACAGGC 3070 het 3070 hom 57 23 24 12 AC 5 3 368563 CASAVA_Build 8 133513054 1D ATGGGTTGAA C/- TGTGGTTGGT 3070 het 3070 hom 37 14 14 10 C 1 0 368564 CASAVA_Build 8 133523012 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 2400 het 2255 hom 13 6 6 1 AAAC 5 4 368565 CASAVA_Build 8 133524807 4D AGAAAATTGC TTCT/---- TTAATTGGGT 3070 hom 105 het 39 0 35 6 TTCT 1 0 368566 CASAVA_Build 8 133529812 1D GATGGGTTTC T/- GCTACCAGCC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 T 1 0 368567 CASAVA_Build 8 133534451 1I GGCTGAGAGT -/G AAGGTGGTCA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 G 0 1 368568 CASAVA_Build 8 133536444 1D GAGGCTGGGG A/- GAGGGGGAAG 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 A 1 0 368569 CASAVA_Build 8 133538030 3D TATTTTTTTT TTA/--- TTTTATTTAT 2760 het 708 hom 11 3 7 2 TTA 1 0 368570 CASAVA_Build 8 133541394 5D CCAGTATTAC TTTAT/----- TTTTTGTCTC 3070 het 3070 hom 28 11 15 4 TTTAT 1 0 368571 CASAVA_Build 8 133551536 1I AAAGAACTAT -/G GCTCATCTCC 3070 hom 104 het 43 0 34 9 G 1 2 368572 CASAVA_Build 8 133554701 1I TGAGCTAAAT -/A AGAGTCAGGG 3070 het 3070 ref 64 34 22 8 A 1 2 368573 CASAVA_Build 8 133557660 2D AGAGAACCTC TG/-- TGAGGGCAGT 3070 het 3070 ref 25 12 11 4 TG 2 1 368574 CASAVA_Build 8 133558780 1D ATTTTAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1753 hom 33 7 12 14 A 15 14 368575 CASAVA_Build 8 133576611 1I GGCAGGGATC -/T TTTGTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 T 3 4 368576 CASAVA_Build 8 133577948 1D GCAGTTAAGA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 65 28 23 15 T 8 7 368577 CASAVA_Build 8 133578390 1D TGAGCAAAAG A/- AAAAATCAGT 3070 het 3070 ref 48 23 15 11 A 6 5 368578 CASAVA_Build 8 133578969 1D ACAGAAAATA T/- TAGTGTCTGT 3070 het 3070 ref 34 19 15 0 T 2 1 368579 CASAVA_Build 8 133594918 1D GGCCTTATAC G/- GGAAAAAGTT 3070 het 3070 ref 39 20 15 5 G 3 2 368580 CASAVA_Build 8 133597094 8I GTACTAGGAT --------/AAAATCAA ACCCTCCATC 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 AAAATCAA 0 1 368581 CASAVA_Build 8 133608741 1I AATTAACTTT -/A AAAAAAACGT 3070 het 3070 ref 36 21 14 1 A 7 8 368582 CASAVA_Build 8 133631044 4D AGAAAGAAAG AAAA/---- AGAAAGAAAG 2111 het 1585 hom 20 8 11 1 A 5 1 368583 CASAVA_Build 8 133633963 1I CAGGTAGTCA -/G GAGTAAAAAG 2504 het 2504 ref 27 16 9 2 G 1 2 368584 CASAVA_Build 8 133638128 1D TTCCTACTCC T/- TTTTTTTTTC 1813 het 1813 ref 52 37 5 10 T 10 9 368585 CASAVA_Build 8 133644690 3I GGGAGTCAAG ---/ATC ATCGTGCTAC 3070 het 2959 hom 29 8 14 7 ATC 1 2 368586 CASAVA_Build 8 133648655 1I ACAGCCTCCT -/G GGGCCTATCA 3070 hom 121 het 45 0 37 8 G 3 4 368587 CASAVA_Build 8 133650564 1D ACAGGCAAAG A/- AAGGAAGTTA 3070 hom 151 het 58 0 50 8 A 3 2 368588 CASAVA_Build 8 133651606 1I CTGGAGGCCA -/G AAGTCCAAGA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 G 0 1 368589 CASAVA_Build 8 133659406 1I CAGGCACTTT -/C TAGTTTGGAA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 0 1 368590 CASAVA_Build 8 133667808 1I GTGCAACTTA -/G AAACTAAAGT 3070 hom 74 het 27 0 24 3 G 0 1 368591 CASAVA_Build 8 133672469 1I ATGGTGTCTA -/C CCATGTACAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 C 2 3 368592 CASAVA_Build 8 133737173 5D AAGGTAAACG CAAAT/----- CAAATCAGAA 3070 het 3070 ref 41 19 20 3 CAAAT 2 1 368593 CASAVA_Build 8 133765259 4D CTCAAGTGAC CCCT/---- CCCTCCTATT 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 CCCT 2 1 368594 CASAVA_Build 8 133766453 4I GAGTTTTTAC ----/TTAG TTAGTTTATT 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 TTAG 1 2 368595 CASAVA_Build 8 133770934 5D TGTCATTCCC TGAAA/----- TGAAATGAAC 3070 hom 88 het 35 0 30 6 TGAAA 2 1 368596 CASAVA_Build 8 133777166 1D AGAAAGGCCC G/- GATGTGTGTT 3070 het 3070 ref 34 18 12 5 G 2 1 368597 CASAVA_Build 8 133779806 1I CAGCCAGCTG -/C CCACCCCTTG 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 C 2 3 368598 CASAVA_Build 8 133783991 3D TACTGTCACC ACT/--- ACTATTATTA 3070 het 3070 ref 33 17 13 4 ACT 2 1 368599 CASAVA_Build 8 133795938 1D ATTTACATGC A/- AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 55 28 18 9 A 7 6 368600 CASAVA_Build 8 133819581 1I CTATATGCTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 7 8 368601 CASAVA_Build 8 133824623 1I GGGAAGAAGA -/G GCCGCAGGGA 3070 hom 132 het 49 0 44 5 G 1 2 368602 CASAVA_Build 8 133840052 1D AAAACGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 T 11 10 368603 CASAVA_Build 8 133840845 1I ACAGAGAGTG -/T ATTTTAATAG 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 T 0 1 368604 CASAVA_Build 8 133841616 1I TAACAGTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 13 7 A 10 11 368605 CASAVA_Build 8 133868482 1I TTGTAGCTTG -/A AAAAAACTGT 3070 het 3070 hom 39 14 23 2 A 6 7 368606 CASAVA_Build 8 133870029 1D CATGGTTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2405 hom 27 8 14 5 T 11 10 368607 CASAVA_Build 8 133881470 1D AAAGTCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 17 11 9 T 17 16 368608 CASAVA_Build 8 133882357 1I AAAATAAGAT -/C CCCTCTTTTT 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 3 4 368609 CASAVA_Build 8 133883200 6D AGAACTCAAC ATAAAA/------ ATAAAAGAGC 3070 het 3070 ref 34 16 17 3 ATAAAA 2 1 368610 CASAVA_Build 8 133883572 1D CTCTCAATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2362 hom 41 9 16 16 T 13 12 368611 CASAVA_Build 8 133912785 1D TGGAATCACA C/- CCCCACCTCC 3070 het 3070 hom 34 14 14 7 C 5 4 368612 CASAVA_Build 8 133928258 1D TTGCCTTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 A 11 10 368613 CASAVA_Build 8 133934885 2D TTTTTTTTTT TG/-- TTGTTGTTGT 1636 het 1636 ref 34 18 8 9 TG 1 0 368614 CASAVA_Build 8 133936527 1I AGTTAGTATT -/A TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 37 16 18 3 A 0 1 368615 CASAVA_Build 8 133942356 2D TATTTGAACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 12 9 T 14 12 368616 CASAVA_Build 8 133971554 1I AGTAATTGGC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 T 8 9 368617 CASAVA_Build 8 134012111 1D AAACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 1076 het 739 hom 21 6 3 12 A 15 14 368618 CASAVA_Build 8 134013545 1I AACAGAATTA -/T TTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 20 10 9 1 T 7 8 368619 CASAVA_Build 8 134015761 1D AGACTCCATC A/- AAAAAACAAA 3070 het 3070 ref 28 10 14 4 A 7 6 368620 CASAVA_Build 8 134019190 1D TAAGTGTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 T 10 9 368621 CASAVA_Build 8 134029065 2D TATATTGCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 99 hom 26 2 13 11 T 12 10 368622 CASAVA_Build 8 134029607 1I CTTACTCCGT -/C CCCCCCCCAA 1460 het 1460 ref 32 18 6 8 C 8 9 368623 CASAVA_Build 8 134030482 1D TATACTTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 658 hom 38 6 27 5 A 15 14 368624 CASAVA_Build 8 134035425 1D AATTTGATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 12 11 368625 CASAVA_Build 8 134040111 2I3M5I24M3I TGCTGCTGCA --CCA-----GGCAACAGAGCAAGACTTTGTCTC---/CTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAA AAAAAAAAAA 3070 het 1207 hom 15 3 15 7 N/A 0 0 368626 CASAVA_Build 8 134043195 1I GAGGCATGAG -/A AAAAAGCCTC 3070 het 3070 ref 51 28 20 3 A 5 6 368627 CASAVA_Build 8 134049487 1I TTTCTTATTT -/A AAAAAACATT 3070 het 3070 hom 52 22 23 7 A 6 7 368628 CASAVA_Build 8 134061150 1I GCTATTTTTT -/A ACTCACAACA 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 1 2 368629 CASAVA_Build 8 134062364 1D TAAATGAGAT A/- ACTGCATGCC 3070 het 3070 ref 45 22 19 4 A 2 1 368630 CASAVA_Build 8 134068859 2D TCTTTATGTA CT/-- CTCTATTCAG 3070 het 3070 hom 31 11 19 2 CT 3 2 368631 CASAVA_Build 8 134069149 2I TGTGTGTGTG --/GT GTGTGTGTGT 1802 het 1802 ref 32 13 5 14 GT 7 8 368632 CASAVA_Build 8 134069877 12D AAGCGTAAAG TGCATTGGATAC/------------ TGCAGATCCT 3070 het 3070 ref 53 28 22 8 TGCATTGGATAC 1 0 368633 CASAVA_Build 8 134071986 1I ACCCTTAACT -/A AACCTCCCTG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 2 3 368634 CASAVA_Build 8 134077968 1D CTATTGCCAA T/- TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 9 8 368635 CASAVA_Build 8 134080745 1D AAGAATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 15 25 2 A 11 10 368636 CASAVA_Build 8 134084651 4D GAAAGGAAAT AAGG/---- AAGGAGGGAG 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 AAGG 2 1 368637 CASAVA_Build 8 134085619 1I TCCTCCAAGG -/T CTTAGGGCCT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 T 0 1 368638 CASAVA_Build 8 134092829 1I TGGTCCTGCA -/G GGGGGGTCTC 3041 het 3041 ref 27 14 7 6 G 6 7 368639 CASAVA_Build 8 134110669 2D AAAAAAAAAA AT/-- AGTGTTGAGT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 AT 1 0 368640 CASAVA_Build 8 134149314 31D AGGAAGGAAG TATGTATGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA/------------------------------- AGAGAGAGAG 3070 het 832 hom 13 5 7 5 TATGTATGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA 1 0 368641 CASAVA_Build 8 134151782 1I TTTGGAACAG -/T TTGCCCACAG 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 T 2 3 368642 CASAVA_Build 8 134160388 1I GAGGGGGCCA -/G TAGAGGAGAC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 G 0 1 368643 CASAVA_Build 8 134163013 2D AGGAAGAAGA AG/-- AAAAAAAAAG 243 het 243 ref 34 17 3 15 AG 1 0 368644 CASAVA_Build 8 134163151 1D GGGAGATCTT A/- CTGTTCTCAG 3070 het 3070 ref 49 30 17 2 A 1 0 368645 CASAVA_Build 8 134164249 1D ATGGCATATA C/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 50 26 17 8 C 1 0 368646 CASAVA_Build 8 134182388 1I TTTAACACGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 15 8 T 8 9 368647 CASAVA_Build 8 134183008 8D CAATTGCAGT AAATTGCC/-------- ACATCCACCT 3070 het 3070 ref 48 23 19 10 AAATTGCC 1 0 368648 CASAVA_Build 8 134198313 1D GGGGAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 24 16 8 A 11 10 368649 CASAVA_Build 8 134229691 1D CTAAAAATAC A/- AAAAACTAGC 2469 het 2469 ref 17 10 6 1 A 6 5 368650 CASAVA_Build 8 134237094 1D TTTAAAATGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 14 15 3 A 9 8 368651 CASAVA_Build 8 134241462 2D CAGTGTGAGA AT/-- GAACTAACAC 3070 het 3070 ref 47 21 21 5 AT 1 0 368652 CASAVA_Build 8 134244314 1D ATTTTTGATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 18 9 T 11 10 368653 CASAVA_Build 8 134246134 1D TTACTCCACA T/- CCCCTCCATT 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 1 0 368654 CASAVA_Build 8 134246968 1D ACTGCTGAGG C/- CTCCCCTCCA 3070 het 3070 hom 49 17 22 10 C 2 1 368655 CASAVA_Build 8 134248422 1D GAGCATGTTT G/- GTGAAGAAAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 G 2 1 368656 CASAVA_Build 8 134254299 1D AAAAAATAAT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 27 13 11 4 A 8 7 368657 CASAVA_Build 8 134265266 1I AGGAAAGGAC -/A AAGTCCCAAG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 2 3 368658 CASAVA_Build 8 134275719 2I GGTGTGTCTG --/GT GTGTGTGTGT 1555 het 1555 ref 26 13 6 7 GT 6 7 368659 CASAVA_Build 8 134294579 1I GTAAGTGAGT -/C CCTCCATACC 3070 hom 70 het 27 0 23 4 C 2 3 368660 CASAVA_Build 8 134295703 1D12M1D GCTCCTCAAT AACCACCTGATATA/-ACCACCTGATAT- ACCCCTACCT 3070 hom 60 het 20 0 21 2 N/A 0 0 368661 CASAVA_Build 8 134295852 1I CTTATGATGC -/T TTTTGTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 23 15 T 4 5 368662 CASAVA_Build 8 134314354 1D CGGCTGAATT G/- GGGGGGGGAA 1587 het 1587 ref 23 14 5 4 G 9 8 368663 CASAVA_Build 8 134324220 1D CAAAAGGAAG A/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 hom 48 22 24 2 A 7 6 368664 CASAVA_Build 8 134350152 2I CTCCGCTGGG --/CC CCCTTGCTCC 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 C 3 5 368665 CASAVA_Build 8 134351953 1D CCTGTAGCTT C/- AAGGAGAGTT 3070 het 3070 ref 38 17 12 10 C 1 0 368666 CASAVA_Build 8 134353273 2D ACCAGGGGAG GT/-- GTGTGTGTAG 3070 het 3070 ref 37 16 11 11 GT 5 4 368667 CASAVA_Build 8 134354598 2D GAGCACACAA AC/-- ACAGATTCCC 3070 het 3070 ref 28 13 10 7 AC 2 1 368668 CASAVA_Build 8 134354685 1D GCAAATCCAA C/- AGAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 C 1 0 368669 CASAVA_Build 8 134359734 1I AAAAGAGGAT -/C TGCTACCATA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 C 0 1 368670 CASAVA_Build 8 134397733 1D CCTTTAAGCC T/- TTTTTTTTTT 1147 het 1147 ref 25 16 3 6 T 12 11 368671 CASAVA_Build 8 134411523 4D GAACTGTAAC TAAA/---- TAAGCCTTCT 3070 het 3070 hom 34 11 21 2 TAAA 1 0 368672 CASAVA_Build 8 134425269 8I CTGAAAGTTG --------/GTTGCTTT GGGATGTTGG 3070 het 3070 ref 53 29 19 5 GTTGCTTT 0 1 368673 CASAVA_Build 8 134431407 1I TGAGACCTAA -/G GGGCTCTCGC 3070 hom 99 het 40 0 30 10 G 3 4 368674 CASAVA_Build 8 134434277 1D CATCCACGTT G/- GGGGTGATCC 3070 hom 93 het 34 0 29 5 G 5 4 368675 CASAVA_Build 8 134447045 3I TTTTTATTAC ---/TAT TATTATTATT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 TAT 4 5 368676 CASAVA_Build 8 134452120 3D ATGCTAACTG TCA/--- TCATTCCTTA 3070 het 3070 ref 50 29 16 5 TCA 2 1 368677 CASAVA_Build 8 134454055 6D CAGAATAGCA TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 45 22 14 10 TG 12 9 368678 CASAVA_Build 8 134454952 1D GACTCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1655 hom 33 8 19 7 A 14 13 368679 CASAVA_Build 8 134460283 4D ACACACACAC ACAT/---- GAGAGTGGTA 3070 het 3070 hom 38 19 17 3 ACAT 1 0 368680 CASAVA_Build 8 134466609 1D AGCCATCAGC A/- TTTCAAGCCC 3070 het 3070 ref 30 17 11 2 A 1 0 368681 CASAVA_Build 8 134470416 2D AATACTATTC TT/-- TTTTTTTTTT 1948 het 10 hom 23 1 6 16 T 18 16 368682 CASAVA_Build 8 134471352 1D TCCAGCCCCA G/- GTTAGCTCAG 2841 het 2841 ref 36 22 8 6 G 2 1 368683 CASAVA_Build 8 134473111 1D TCGTAGTTTA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 29 16 8 6 T 8 7 368684 CASAVA_Build 8 134476639 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1065 hom 21 het 13 0 8 5 T 17 16 368685 CASAVA_Build 8 134495011 1D GAGACTATGA T/- TATCTCTATT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 2 1 368686 CASAVA_Build 8 134506634 1D TGTCCCCCCC G/- CCACCCAAAT 3070 hom 68 het 27 0 20 7 G 1 0 368687 CASAVA_Build 8 134507408 1D44M1D CACTATATGG AAAGTGCTTAATAACTCAGTACATGGTACTTAATATTTCCCTTGCT/-AAGTGCTTAATAACTCAGTACATGGTACTTAATATTTCCCTTGC- TTGTTCTTTG 3070 hom 175 het 43 0 59 6 N/A 0 0 368688 CASAVA_Build 8 134513816 2D CAACAACCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 35 0 30 5 T 12 10 368689 CASAVA_Build 8 134518886 2D ACAAAGAAAA CT/-- CACACATCTC 3070 het 3070 hom 41 12 25 5 CT 1 0 368690 CASAVA_Build 8 134520016 8D ACATGAATAT TATAATAA/-------- TATAAGATTC 777 hom 10 het 9 0 4 7 TATAATAA 1 0 368691 CASAVA_Build 8 134527458 1D GGTCCTCTCT G/- TGGGGCTGCT 3070 hom 108 het 40 0 37 4 G 1 0 368692 CASAVA_Build 8 134528180 1D CTGGCATACC A/- GGGGGGTCAG 3070 hom 78 het 30 0 26 5 A 1 0 368693 CASAVA_Build 8 134532147 2D CTGCATCTTC CT/-- CTCTCTACTG 3070 hom 67 het 27 0 22 6 CT 4 3 368694 CASAVA_Build 8 134534393 5D GGCCATCGAC AAAAG/----- AAAAGAAAGA 3070 hom 63 het 30 0 18 12 AAAAG 2 1 368695 CASAVA_Build 8 134534971 1D CTGTGATGTG A/- GGCCAACCAG 2172 het 1602 hom 16 5 7 4 A 1 0 368696 CASAVA_Build 8 134535135 3D AAACAACTTA AAG/--- AAGATACACA 3070 hom 59 het 22 0 19 4 AAG 2 1 368697 CASAVA_Build 8 134537234 1I CTTGGTTTCC -/T TTTCACTTGT 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 3 4 368698 CASAVA_Build 8 134537446 1D CTCCACCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 13 10 T 11 10 368699 CASAVA_Build 8 134537721 1D GGGAGACCCA G/- GGGGTTGGGA 3070 het 3070 hom 29 10 13 7 G 5 4 368700 CASAVA_Build 8 134563209 1D GCATGAGCCA C/- CATGCCCAGT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 C 2 1 368701 CASAVA_Build 8 134567199 4I GCAACTGAAA ----/AGAG AGAGAGGGTG 3070 hom 66 het 30 0 21 9 AG 3 5 368702 CASAVA_Build 8 134568774 6D AAAAGAATAT TTAACA/------ TTAACATTAA 3070 hom 45 het 29 0 16 15 TTAACA 3 2 368703 CASAVA_Build 8 134569392 1I GACTCTGTCG -/A AAAAAAAAAA 2619 het 458 hom 18 3 9 6 A 13 14 368704 CASAVA_Build 8 134570294 1I CTGGCAGACA -/G GGGGGGGCCA 3070 hom 44 het 20 0 12 8 G 7 8 368705 CASAVA_Build 8 134571740 2I ACTGCCGTAC --/CT CTCACCCAGG 3070 hom 147 het 51 0 48 3 CT 1 2 368706 CASAVA_Build 8 134584664 1I TATTCTAACG -/C CCCCCCAACA 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 C 6 7 368707 CASAVA_Build 8 134587707 3D GTAAGATGAG AAC/--- AACAGGACTG 3070 het 3070 hom 44 18 23 4 AAC 2 1 368708 CASAVA_Build 8 134616951 1D TATTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 12 12 T 11 10 368709 CASAVA_Build 8 134620346 1D TGTGTGACTG T/- TAAGTTACTT 3070 het 3070 ref 39 17 14 10 T 2 1 368710 CASAVA_Build 8 134623535 4D CACACACACA CACC/---- CACGCACACA 3070 het 3070 hom 43 20 16 10 CACC 1 0 368711 CASAVA_Build 8 134626331 3D ATCAGCCTTC CTT/--- CTTCTTCTGC 3070 het 3070 hom 46 19 21 8 CTT 3 2 368712 CASAVA_Build 8 134630829 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2065 hom 27 8 11 9 A 13 12 368713 CASAVA_Build 8 134641672 1D CAATTACTAT G/- TGTCAGTTTT 3070 hom 102 het 41 0 34 8 G 1 0 368714 CASAVA_Build 8 134649350 2D CCTTGCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 44 1 31 12 T 16 14 368715 CASAVA_Build 8 134658120 4I ATCTTGTGAG ----/AACT AACTCACTAT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 AACT 1 2 368716 CASAVA_Build 8 134660337 2I TTATGAACAC --/TG TACACTTGGG 3070 het 3070 hom 42 18 21 3 TG 0 1 368717 CASAVA_Build 8 134663800 1I AAATATGGGG -/T TAAAAGATAG 3070 het 3070 ref 42 23 17 2 T 1 2 368718 CASAVA_Build 8 134666080 2I AGATGGGCAC --/TG TGTGTGTTCT 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 TG 3 4 368719 CASAVA_Build 8 134667441 1D TTTACATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 492 hom 28 2 22 4 T 11 10 368720 CASAVA_Build 8 134676746 7D GCAGAATGTC TGTACTA/------- TTTCCCATCA 3070 het 3070 ref 49 23 20 10 TGTACTA 1 0 368721 CASAVA_Build 8 134685507 1D AGCCCCTCCT G/- TGCAGTGCCA 3070 het 3070 ref 50 21 20 9 G 1 0 368722 CASAVA_Build 8 134687560 4D CTGAAAGTGT CTGA/---- CTGTGTGGTC 3070 het 3070 hom 29 11 17 3 CTGA 1 0 368723 CASAVA_Build 8 134694955 10I AGTGCAGAGG ----------/CCGAAGGAGA CCACCTGGTG 3070 het 3070 hom 55 27 23 5 CCGAAGGAGA 0 1 368724 CASAVA_Build 8 134695109 1I ATTGCTATCT -/C CCTTTTCCTA 3070 het 3070 hom 56 24 28 4 C 2 3 368725 CASAVA_Build 8 134695480 1D AATTTCGGTT A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 A 8 7 368726 CASAVA_Build 8 134698439 6I GTTTTTTTTT ------/TGTTCG TTTTTTTTTT 2177 het 105 hom 17 2 12 3 TGTTCG 0 1 368727 CASAVA_Build 8 134699825 2D TTAGGGAATC AG/-- GGAGTGGAGG 3070 hom 141 het 51 0 45 7 AG 1 0 368728 CASAVA_Build 8 134702655 2I GGCAGAAGTT --/GA GAGTGACAAT 3070 hom 162 het 58 0 53 5 GA 1 2 368729 CASAVA_Build 8 134703291 9I AAGGGAACAC ---------/CTCTGCGGA AAATTGCATT 1734 het 18 hom 16 0 4 12 CTCTGCGGA 0 1 368730 CASAVA_Build 8 134703315 1D TCCAAGTCTC A/- ACCCTCAGAC 3018 het 1768 hom 22 7 9 6 A 2 1 368731 CASAVA_Build 8 134703696 1I GCAAGAAGTT -/A GTGCACAAGA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 0 1 368732 CASAVA_Build 8 134707149 1D TCTGTCTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1500 hom 27 7 10 10 A 13 12 368733 CASAVA_Build 8 134707693 1D CAGCCCATGT C/- CTATAGAAAA 3070 het 3070 ref 35 15 14 7 C 2 1 368734 CASAVA_Build 8 134718610 2D ACTGCAAATA AG/-- AGAGGTGGTG 3070 het 3070 hom 35 13 17 7 AG 3 2 368735 CASAVA_Build 8 134719957 1I ACTCCACCTC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 A 8 9 368736 CASAVA_Build 8 134723381 1D TCTTCACCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 14 13 14 A 11 10 368737 CASAVA_Build 8 134745940 1D TGGTTCTCAG T/- TCTGTTGCCA 3070 het 3070 hom 64 26 32 6 T 2 1 368738 CASAVA_Build 8 134747238 1D TTTCATGTGT C/- CGCTCAGCTA 3070 het 3070 ref 29 13 11 7 C 2 1 368739 CASAVA_Build 8 134747461 1I TGCCTGAGTT -/C CTAGCCTGCT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 1 2 368740 CASAVA_Build 8 134750164 1D TTTTGTGGAG T/- TTCTGTAAGA 3070 hom 119 het 48 0 39 9 T 3 2 368741 CASAVA_Build 8 134772633 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 12 15 9 A 12 11 368742 CASAVA_Build 8 134772787 1I AAAGAACTCT -/G AATAATAACT 3070 hom 90 het 40 0 31 9 G 0 1 368743 CASAVA_Build 8 134774058 1D ACATATTCAC A/- GGGTCAAATG 3070 het 3070 ref 47 28 12 10 A 1 0 368744 CASAVA_Build 8 134780325 4I9M1I AATTTTAAAA ----AGCTGTCTC-/AGTTAGCTGTCTCA AAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 N/A 0 0 368745 CASAVA_Build 8 134780729 1D AGGTTAGGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 16 14 15 T 12 11 368746 CASAVA_Build 8 134782281 1D GGGTCTTGAG T/- TAGGTAGGAC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 T 2 1 368747 CASAVA_Build 8 134782459 1I ATGAAGGCGG -/C CATGGCCCAC 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 C 1 2 368748 CASAVA_Build 8 134783460 1I CGTAGATTGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 35 14 16 5 T 9 10 368749 CASAVA_Build 8 134792660 2D GCCCTGCCAA TT/-- TTTTTTTTGT 1858 het 1858 ref 21 15 6 2 T 10 8 368750 CASAVA_Build 8 134796138 1D TGGAGTGAAT A/- AACACTCCTG 3070 het 3070 hom 42 16 17 10 A 3 2 368751 CASAVA_Build 8 134800855 1D TGAAGTGGAT C/- TGGTCCCTGC 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 C 1 0 368752 CASAVA_Build 8 134800988 1D TCCCAGATAG A/- AAAACAAAAC 3070 het 3070 hom 39 17 19 3 A 5 4 368753 CASAVA_Build 8 134816796 12D TTGGGTGAAG ATTTGGGGATGA/------------ TGATGATTCA 3070 hom 138 het 46 0 44 5 ATTTGGGGATGA 1 0 368754 CASAVA_Build 8 134842846 4D TGTTGGCTAC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 hom 96 het 43 0 30 15 TGTT 6 5 368755 CASAVA_Build 8 134877431 1D AAAACCCTCC A/- AAAAAATCAA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 A 7 6 368756 CASAVA_Build 8 134878455 1D GCGATGACGA T/- TTTTTTTGCT 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 8 7 368757 CASAVA_Build 8 134882279 4D TATGTGTGTT TGTA/---- TGTGCGTGTG 3070 hom 187 het 69 0 63 12 TGTA 1 0 368758 CASAVA_Build 8 134885101 2D TTTGTGACTG GC/-- GCTTATTTCA 3070 hom 132 het 50 0 44 8 GC 2 1 368759 CASAVA_Build 8 134896146 2D TCTGTGCCAG CC/-- CTAGGCTGGC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 C 3 1 368760 CASAVA_Build 8 134902785 2I AAGTGGTAGC --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 445 hom 53 2 29 22 GT 6 7 368761 CASAVA_Build 8 134911922 3D TAACAAGTGT AAG/--- AAGAGTAGTA 3070 hom 84 het 32 0 28 6 AAG 2 1 368762 CASAVA_Build 8 134931849 1I AGCCAAAGTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 35 15 14 6 T 9 10 368763 CASAVA_Build 8 134933154 1D ACTCTTGGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3021 hom 29 9 10 10 T 15 14 368764 CASAVA_Build 8 134950924 1D TTAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1452 hom 17 5 11 1 A 15 14 368765 CASAVA_Build 8 134961860 1D ACTCAATCTC A/- AAAAAAAAAA 2357 het 365 hom 22 3 9 10 A 19 18 368766 CASAVA_Build 8 134962894 4I GGTGCCAGTG ----/CCAA CCATGGATGG 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 CCAA 0 1 368767 CASAVA_Build 8 134971817 1D ATTAATCAGT G/- GGGGAGCTCC 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 G 5 4 368768 CASAVA_Build 8 134978587 1I CACAGATCCT -/G CTTGTAGCAA 3070 het 3070 ref 40 22 14 4 G 0 1 368769 CASAVA_Build 8 134980445 3I TTTCGCCAGC ---/TAT TATTTCCCCT 3070 het 3070 hom 54 21 28 5 TAT 1 2 368770 CASAVA_Build 8 134990180 7I TCACAGTGTG -------/GCACTGT GGATGCCACA 3070 het 3070 hom 56 25 27 4 GCACTGT 0 1 368771 CASAVA_Build 8 134991249 3D GCAGCAGCAA TAG/--- TAGTAACCGT 3070 het 3070 hom 68 18 37 14 TAG 2 1 368772 CASAVA_Build 8 134994297 1I TCACAGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2073 hom 32 7 16 9 T 13 14 368773 CASAVA_Build 8 135002444 1D CCTGGGCACT A/- AAAAAAAAAA 1735 het 1735 ref 52 41 5 6 A 12 11 368774 CASAVA_Build 8 135014308 3D TGACCCAATC CTT/--- CTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 CTT 2 1 368775 CASAVA_Build 8 135018888 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1226 het 44 hom 9 1 3 5 T 12 11 368776 CASAVA_Build 8 135019091 1I TGACTTTTTT -/A AAGTATCAAT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 2 3 368777 CASAVA_Build 8 135021925 1I AGGAAAAAAA -/G AAATAAAATC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 G 0 1 368778 CASAVA_Build 8 135022399 1I CACACACACA -/C AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 C 0 1 368779 CASAVA_Build 8 135024961 2I TATATACACG --/TA TATATACATA 3070 het 3070 hom 34 15 12 7 TA 3 4 368780 CASAVA_Build 8 135026068 1D CATTTGTAAT A/- GGTCTAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 A 1 0 368781 CASAVA_Build 8 135026232 4I CTAGAATTAG ----/AAGA AAGAGGGAGG 3070 het 3070 ref 42 18 17 7 AAGA 1 2 368782 CASAVA_Build 8 135032925 1I TTGAAGTTTC -/T GTCTGAGAAG 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 0 1 368783 CASAVA_Build 8 135056351 5D TTCCCCTGTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 het 847 hom 26 5 14 9 T 16 11 368784 CASAVA_Build 8 135077095 1I TGTTACAGTG -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 8 9 368785 CASAVA_Build 8 135081157 3D TATATTAAAA CAT/--- CATATTTTAT 3070 het 3070 ref 42 30 12 3 CAT 2 1 368786 CASAVA_Build 8 135084320 1I AATGGACTGT -/G GCATGCATGA 3070 het 3070 hom 51 16 25 10 G 1 2 368787 CASAVA_Build 8 135087004 1D TGAAATCTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1820 hom 34 10 13 12 T 15 14 368788 CASAVA_Build 8 135091826 1D TGGAAAGGTG A/- CTGCCTACAG 3070 het 3070 hom 52 18 25 9 A 1 0 368789 CASAVA_Build 8 135093037 20D CAAGAGTCTT TTTATTTATTTATTTATTTA/-------------------- TTTATTTATT 2430 hom 15 het 11 0 6 6 TTTA 10 5 368790 CASAVA_Build 8 135096488 1I GTCACAGTTT -/A AAACCATCAG 3070 het 3070 hom 54 22 24 8 A 3 4 368791 CASAVA_Build 8 135100599 1I AGACACTGAT -/G GGGAAATTAC 3070 hom 163 het 62 0 54 8 G 3 4 368792 CASAVA_Build 8 135101780 1D AGCACATGTA T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 T 8 7 368793 CASAVA_Build 8 135103958 1D CTCTAGGGAT G/- GGGGCTGTGT 3070 het 3070 hom 50 24 22 5 G 5 4 368794 CASAVA_Build 8 135107869 11D TCATCTGGGG CCAGCATAAAA/----------- CCACCTTTGC 3070 het 3070 ref 42 27 14 3 CCAGCATAAAA 1 0 368795 CASAVA_Build 8 135122434 1D TAAATAAATA T/- TTTTTACATT 1509 het 1509 ref 9 4 4 1 T 6 5 368796 CASAVA_Build 8 135124230 1D GGATGCTGCC T/- TTCTTATTTA 3070 het 3070 hom 44 21 20 4 T 3 2 368797 CASAVA_Build 8 135126619 1D GGAAGAACAA G/- TACCCCAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 18 9 G 1 0 368798 CASAVA_Build 8 135141453 2D AATATACGTT AA/-- GTCAAAAACT 3070 het 3070 ref 36 19 13 6 A 2 0 368799 CASAVA_Build 8 135144443 1D ACCTCAAACT A/- AAAAAGTTTC 3070 het 3070 hom 49 12 30 7 A 6 5 368800 CASAVA_Build 8 135149042 3D AGAGTTATTG TTA/--- TTATTATAAT 3070 het 3070 ref 37 19 16 2 TTA 3 2 368801 CASAVA_Build 8 135149965 1D TGCTCACAAA T/- GTATCTTAAC 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 T 1 0 368802 CASAVA_Build 8 135151001 1I TAATTTCTAC -/T TTTTTTTCTG 3070 het 1579 hom 19 5 10 4 T 7 8 368803 CASAVA_Build 8 135164150 1I ACTTTTATAC -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 44 16 25 3 A 6 7 368804 CASAVA_Build 8 135177207 9D AACCTGAGAG GCAGAGGTT/--------- GCAGTGAGCA 2291 het 2291 ref 23 15 5 4 GCAGAGGTT 1 0 368805 CASAVA_Build 8 135187275 1D ACTTTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1966 hom 25 6 11 8 T 13 12 368806 CASAVA_Build 8 135190999 1D CATTTATAAC T/- TTTTTTTTTT 1195 het 1195 ref 41 29 3 10 T 11 10 368807 CASAVA_Build 8 135191273 8D AGTGGTGGGA TTATAGGC/-------- TTGAGCCACT 3070 het 3070 ref 35 19 13 7 TTATAGGC 1 0 368808 CASAVA_Build 8 135212287 3D ATTTTTCATT TTG/--- TTGTTATTAT 3070 het 3070 ref 32 18 12 3 TTG 2 1 368809 CASAVA_Build 8 135216687 1D GAACCATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 A 12 11 368810 CASAVA_Build 8 135217608 1D TAAAATTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 12 7 T 11 10 368811 CASAVA_Build 8 135222327 2D CAACCACACA GT/-- GCTAAAATGT 3070 het 3070 hom 66 26 29 13 GT 1 0 368812 CASAVA_Build 8 135236495 1D AAAATAGAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 9 8 368813 CASAVA_Build 8 135242277 1D TCATTCTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 48 21 19 8 A 12 11 368814 CASAVA_Build 8 135248972 1I CACTGCTTTT -/G GCATATTTGG 3070 het 3070 hom 24 11 9 4 G 1 2 368815 CASAVA_Build 8 135255541 4I TTTTCCTGAA ----/AGAC AGGTAAATGG 3070 het 3070 hom 38 13 16 9 AGAC 0 1 368816 CASAVA_Build 8 135260965 34D TGTGTGTGTG TATATATATATATATATATATATATATATATATA/---------------------------------- TATATATATA 2814 het 876 hom 8 2 8 2 TA 25 8 368817 CASAVA_Build 8 135265055 4I AATTAATGAG ----/TACT TACTCTGTAT 3070 het 3070 hom 44 16 21 7 TACT 1 2 368818 CASAVA_Build 8 135266893 4I TTTCTCTCTG ----/TTTC TTTCTTTCTG 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 TTTC 2 3 368819 CASAVA_Build 8 135270662 1D ACCTTTCTCA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 34 18 10 8 T 8 7 368820 CASAVA_Build 8 135274189 4D ATAGGCACTT TGTC/---- TGTTTGTCAG 3070 het 3070 hom 44 21 22 3 TGTC 1 0 368821 CASAVA_Build 8 135278008 1D TGCGCAGGGG A/- AAAAATATAT 3070 het 3070 hom 28 10 15 4 A 6 5 368822 CASAVA_Build 8 135283355 1D AATTTGTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 51 19 23 9 T 11 10 368823 CASAVA_Build 8 135286124 1I GCCTTATGCC -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 A 8 9 368824 CASAVA_Build 8 135294835 1I TGACTAGATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 T 10 11 368825 CASAVA_Build 8 135301589 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 74 hom 45 1 27 17 A 12 11 368826 CASAVA_Build 8 135310522 15D TGGGAGAGAG AAGAAGAGAAAAAAT/--------------- GAGAAAGAGA 3070 het 3070 hom 44 19 20 10 AAGAAGAGAAAAAAT 1 0 368827 CASAVA_Build 8 135316314 1I ATTCCACCCC -/T GGCCTCTCCC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 0 1 368828 CASAVA_Build 8 135317327 2D GCTCCTCATT AC/-- TTATTCAGAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 AC 1 0 368829 CASAVA_Build 8 135321237 3D GGAAAAAGTG AGA/--- AGATGTTTCT 3070 hom 111 het 43 0 38 7 AGA 2 1 368830 CASAVA_Build 8 135324269 1D TCCCTCTTTG T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 80 het 30 0 25 6 T 9 8 368831 CASAVA_Build 8 135324481 3I TGGATGTAAT ---/AAC AGAAAAGCTT 3070 hom 69 het 27 0 24 3 AAC 0 1 368832 CASAVA_Build 8 135327202 1I CAATAATTTT -/G CGTTTGTCTC 3070 hom 120 het 45 0 40 5 G 0 1 368833 CASAVA_Build 8 135344616 4D GCAATATACA CTTG/---- TTTATTAACT 3070 het 3070 ref 43 21 18 5 CTTG 1 0 368834 CASAVA_Build 8 135344783 1D CTTAAATATC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 52 21 29 2 A 9 8 368835 CASAVA_Build 8 135345473 1I TTCATTGAGC -/A AAAACTAAGA 3070 het 3070 ref 44 21 19 4 A 4 5 368836 CASAVA_Build 8 135347361 1D ACTGACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 35 0 16 19 A 11 10 368837 CASAVA_Build 8 135347869 1D TATTTCTGTA T/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 T 8 7 368838 CASAVA_Build 8 135352708 1I AGACCCCCCT -/G GCTGGTTAGT 3070 het 3070 hom 45 19 22 4 G 1 2 368839 CASAVA_Build 8 135364972 1D AGGGGCACAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 760 hom 31 5 14 12 T 11 10 368840 CASAVA_Build 8 135370710 1I AAAGTGTCCC -/T CTTTCCTTCT 3070 hom 126 het 47 0 43 4 T 0 1 368841 CASAVA_Build 8 135393569 1D AGTATGGTTG A/- AAGAGGGGTG 3070 hom 120 het 43 0 38 5 A 3 2 368842 CASAVA_Build 8 135401092 26D CCACAGCAGC CCAGGGAGAGGGTGTGAGGGGTCAAT/-------------------------- CCAGGGAGAG 3070 het 3070 ref 43 21 21 10 CCAGGGAGAGGGTGTGAGGGGTCAAT 1 0 368843 CASAVA_Build 8 135402725 1I ATAAAACCTT -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 A 8 9 368844 CASAVA_Build 8 135430950 1D TTGCTTGTTT G/- TGTCAGGTTT 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 G 1 0 368845 CASAVA_Build 8 135431187 1D TGTGAAGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1739 hom 32 9 14 9 T 13 12 368846 CASAVA_Build 8 135435109 1I AACACCAGTT -/G GGGGGGTCTC 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 G 6 7 368847 CASAVA_Build 8 135452365 5D TTCATTCTTC TCTAG/----- TCTAATTAAC 3070 het 3070 ref 64 34 26 7 TCTAG 1 0 368848 CASAVA_Build 8 135453494 1I ATACTTTTTT -/A AAAAAAAAAT 2778 het 2778 ref 37 24 6 7 A 9 10 368849 CASAVA_Build 8 135456357 2I GCAAAATCAG --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 12 13 8 A 9 11 368850 CASAVA_Build 8 135473343 1D GAGAGAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 16 7 A 13 12 368851 CASAVA_Build 8 135520481 1I GTCTAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 1918 het 1918 ref 41 11 8 22 A 15 16 368852 CASAVA_Build 8 135549596 1I TGTCCCTGCC -/T TGGCGCCTGT 3070 hom 91 het 35 0 31 4 T 1 2 368853 CASAVA_Build 8 135550442 1D CACAGCACTC T/- TGAGTGATGA 3070 hom 138 het 52 0 47 6 T 2 1 368854 CASAVA_Build 8 135567193 2I TCATTAAGAG --/GA GAGAGAGCTG 3070 hom 99 het 41 0 33 8 GA 3 4 368855 CASAVA_Build 8 135575795 3D AGCCTGAAGG GCA/--- GCAGGTGCTC 3070 het 2980 hom 32 12 16 6 GCA 2 1 368856 CASAVA_Build 8 135589521 2D CTCGACTCCT GA/-- GAGAAATCAC 3070 het 3070 ref 39 19 14 7 GA 3 2 368857 CASAVA_Build 8 135608259 1D GTTCATATTC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 T 9 8 368858 CASAVA_Build 8 135612221 1I AATACAAATT -/A AAAACCAAAG 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 4 5 368859 CASAVA_Build 8 135620310 1I TGAATGTGTT -/A AAGGCTGAAA 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 A 2 3 368860 CASAVA_Build 8 135625872 1I CTGGTTGAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 28 0 20 8 T 9 10 368861 CASAVA_Build 8 135672220 3D CTGCCACCAT CAC/--- CACCACCACC 2119 het 2119 ref 48 17 7 24 CAC 6 5 368862 CASAVA_Build 8 135678585 1I TTATCAGATC -/A AAAAGAGTCT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 4 5 368863 CASAVA_Build 8 135693339 3I CCACAGAAAG ---/AAC AACAGCTAAT 3070 hom 101 het 42 0 33 9 AAC 1 2 368864 CASAVA_Build 8 135715919 9I GCTTTCTGGG ---------/GAGAAATCT CGCAATATTA 3070 het 3070 hom 59 28 28 3 GAGAAATCT 0 1 368865 CASAVA_Build 8 135731316 1I TGGATGTAAT -/G GGATCACTGG 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 G 2 3 368866 CASAVA_Build 8 135732605 2I CCACTCCTTG --/GT GTATATATCC 3070 het 3070 hom 55 22 24 9 GT 1 2 368867 CASAVA_Build 8 135779749 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2927 het 1830 hom 29 6 12 11 A 15 16 368868 CASAVA_Build 8 135785171 1D TATGACCAGA C/- CCTATCTTAT 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 C 3 2 368869 CASAVA_Build 8 135786803 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1867 het 1867 ref 32 12 12 8 T 13 14 368870 CASAVA_Build 8 135795321 1D TACCTCTGTC A/- ATGGTCACCC 3070 hom 81 het 34 0 26 8 A 2 1 368871 CASAVA_Build 8 135795463 5I TCATATAAAG -----/TTTTC TTTTTAAATT 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 TTTTC 0 1 368872 CASAVA_Build 8 135818963 14I TGGGGAAGGT --------------/CAAAGCGTGTCTTA CAAAGCAAAG 3070 het 3070 ref 39 22 13 4 CAAAGCGTGTCTTA 0 1 368873 CASAVA_Build 8 135834690 1I ATCTATTTTG -/T GGGGGGCAGA 3070 het 2833 hom 33 12 13 8 T 0 1 368874 CASAVA_Build 8 135841030 2I TTCATTTAGG --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 A 10 12 368875 CASAVA_Build 8 135847135 1D GTTTTTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 12 10 A 12 11 368876 CASAVA_Build 8 135852392 2D CCTGATAAGA TG/-- TGTTATCAAT 3070 hom 27 het 11 0 10 2 TG 2 1 368877 CASAVA_Build 8 135867204 1D TTTCCTGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 A 12 11 368878 CASAVA_Build 8 135868266 1D GATATCAAGC T/- TTTTTTTTTT 2930 het 1566 hom 30 8 9 13 T 17 16 368879 CASAVA_Build 8 135869229 1D ATTTAGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 32 12 13 8 A 10 9 368880 CASAVA_Build 8 135876893 2I CAAGTATAAC --/AA AGTTATTACA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 1 3 368881 CASAVA_Build 8 135879414 1D GACATTTACT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 A 10 9 368882 CASAVA_Build 8 135881676 11I TTTAAAGGAA -----------/TTTTAATAAAT TTTTAATAAA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 TTTTAATAAAT 1 2 368883 CASAVA_Build 8 135886674 10I GCAAAAATAA ----------/GTTTTCTTCT GTTTTCTTCT 3070 het 3070 ref 40 19 13 8 GTTTTCTTCT 1 2 368884 CASAVA_Build 8 135888864 1I AATATTCTGG -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 46 24 16 6 A 8 9 368885 CASAVA_Build 8 135892172 1I AAAATTATGT -/G GGTACAAAAA 3070 het 3070 hom 47 12 23 12 G 2 3 368886 CASAVA_Build 8 135898820 24D CTCTCTCTCT ACACACACACACACACACACACAC/------------------------ ACACACACAC 3070 het 194 hom 18 1 17 8 AC 21 9 368887 CASAVA_Build 8 135902711 1D AAAAAGACAA G/- GTTTTAGTTG 3070 het 3070 hom 40 16 19 7 G 2 1 368888 CASAVA_Build 8 135907446 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1002 het 1002 ref 14 5 5 5 A 15 14 368889 CASAVA_Build 8 135924238 1D CTGGTCATGG A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 48 23 16 10 A 9 8 368890 CASAVA_Build 8 135927132 2I TCTGAACAAC --/TT TTTTTTTTAT 2876 het 1020 hom 13 3 7 4 T 8 10 368891 CASAVA_Build 8 135934076 3D TGTCTCAAAG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 11 9 A 14 11 368892 CASAVA_Build 8 135943080 1D CATGATGAGA T/- TTGTGCTGGT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 3 2 368893 CASAVA_Build 8 135952263 4D GAGCGTAGGA CTTC/---- CAGAGGTGGA 3070 hom 117 het 43 0 39 5 CTTC 1 0 368894 CASAVA_Build 8 135953641 2D TTTAGACATC TG/-- TGTTCAAGCT 3070 het 3070 hom 36 13 22 3 TG 2 1 368895 CASAVA_Build 8 135954401 1I GGGCAAGTAA -/T TTAGTTGTAT 2009 het 2009 ref 20 12 5 3 T 2 3 368896 CASAVA_Build 8 135956392 1I CATTTAAAGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 T 8 9 368897 CASAVA_Build 8 135958530 1I GCAACCATTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 A 9 10 368898 CASAVA_Build 8 135959978 1D CCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 84 het 36 0 28 9 T 9 8 368899 CASAVA_Build 8 135960338 1D TAGTGATCCT A/- AAAAAAAACA 3070 hom 111 het 45 0 38 8 A 9 8 368900 CASAVA_Build 8 135961216 1D TGAGGGCACT A/- ATTCCATTCT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 2 1 368901 CASAVA_Build 8 135967517 1D GCAGATCAAG C/- CCTCCAGCCT 3070 het 3070 hom 43 16 18 9 C 3 2 368902 CASAVA_Build 8 135971076 5I ATTCGTAAGT -----/ATTTA ATTTATTTTG 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 ATTTA 1 2 368903 CASAVA_Build 8 135971300 1I CCTTTTCTTG -/C ATAGTGGTCC 3070 het 3070 hom 44 23 20 1 C 0 1 368904 CASAVA_Build 8 135971978 2I GATCTCGGCT --/CA CACTGCAAGC 1758 het 554 hom 7 2 5 0 CA 1 2 368905 CASAVA_Build 8 135973835 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 999 het 999 ref 12 6 3 3 T 15 16 368906 CASAVA_Build 8 135981394 1D TTGTCTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 10 16 8 T 10 9 368907 CASAVA_Build 8 135982749 4D CAAAATAAGA AAAG/---- AAAGAAAGTG 2488 het 2488 ref 36 19 8 10 AAAG 3 2 368908 CASAVA_Build 8 135984788 3I AGAGGGAGTC ---/TCT TCTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 TCT 1 2 368909 CASAVA_Build 8 135987316 1I AACGCCACCA -/C CTTGCCTATG 3070 het 3070 ref 70 31 27 12 C 1 2 368910 CASAVA_Build 8 135999517 4I ATAATGTAAT ----/GTAA GTAAGTGCCA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 GTAA 1 2 368911 CASAVA_Build 8 136005828 1D CTTCTTCTCC T/- TTTTTTTTTT 2777 het 394 hom 24 4 14 6 T 17 16 368912 CASAVA_Build 8 136008433 2I GTAGCTGAGA --/AC ACACGGGAGC 3070 hom 153 het 57 0 51 6 AC 2 3 368913 CASAVA_Build 8 136009066 1I12M1I CAAAAAAAAC -AAACAAAACAAA-/AAAAAAAAACAAAC AAAAAAAAAC 3070 het 130 hom 28 3 15 13 N/A 0 0 368914 CASAVA_Build 8 136018648 1D AACCCAACAA T/- TTTTTTTTTT 1155 het 609 hom 16 5 3 8 T 17 16 368915 CASAVA_Build 8 136039458 2I TGGGCCCAGG --/TA TGGCAGAAGA 3070 hom 72 het 28 0 21 7 TA 0 1 368916 CASAVA_Build 8 136040805 1D14M1I GATAGAGTGT GGGTGGGGAAGAAAT-/-GGTGGGGAGGAAATA ACATATAATT 3070 hom 87 het 33 0 26 8 N/A 0 0 368917 CASAVA_Build 8 136040890 1I GCCTCAGTTT -/C CACTATTGTA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 C 1 2 368918 CASAVA_Build 8 136043444 1I AAGTGGAATG -/A AGAGACTTGT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 A 1 2 368919 CASAVA_Build 8 136060826 1D TTTAAAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 11 10 368920 CASAVA_Build 8 136062557 2D TATATTATCT TA/-- TATATATATA 1386 het 839 hom 7 2 4 1 TA 8 7 368921 CASAVA_Build 8 136065223 15D GAGAAAAGAA AGGACTTTTTTAGAT/--------------- AGGCAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 19 16 3 AGGACTTTTTTAGAT 1 0 368922 CASAVA_Build 8 136082516 2I TTTTTTTTAA --/AT TTTTTTTTAG 3070 het 3070 hom 27 9 17 1 AT 0 1 368923 CASAVA_Build 8 136095843 1I ATACTACCTG -/C TACTTAGCAG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 C 0 1 368924 CASAVA_Build 8 136110422 1I ATAGCGACAG -/A AAAATAGAAT 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 4 5 368925 CASAVA_Build 8 136110886 7D GGGACCGATC TCCAGAG/------- AAGCTGCCTG 3070 hom 111 het 41 0 35 10 TCCAGAG 1 0 368926 CASAVA_Build 8 136128950 1D AGTAGAGACA G/- GGTTTCGCCA 3070 hom 96 het 34 0 32 2 G 3 2 368927 CASAVA_Build 8 136132601 2I GAGGAGAAAC --/AG AGTATGACAA 3070 hom 157 het 59 0 53 6 AG 1 2 368928 CASAVA_Build 8 136133542 2I CAAGGAAGAG --/TT TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 9 11 368929 CASAVA_Build 8 136155870 3D AATTACTTAA TTC/--- TCTTTCTGTG 3070 hom 108 het 39 0 35 6 TTC 1 0 368930 CASAVA_Build 8 136155972 1D AAGGTCAAGT G/- TTTGTCATAT 3070 hom 138 het 52 0 47 5 G 1 0 368931 CASAVA_Build 8 136156610 1I TGACATCGTC -/A GAGATATGCT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 0 1 368932 CASAVA_Build 8 136156827 1D TTTAAAACTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 101 het 42 0 34 9 T 11 10 368933 CASAVA_Build 8 136157727 1I AGCAGAAATT -/A AATTCTCCCA 3070 hom 96 het 35 0 32 3 A 2 3 368934 CASAVA_Build 8 136158176 1D CTTCCCATGA T/- GGTATCCCTC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 1 0 368935 CASAVA_Build 8 136161705 2D ACCTGAAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 234 hom 33 6 11 16 A 16 14 368936 CASAVA_Build 8 136166215 1I CAGGCCATGT -/A ACACAAATCT 3070 hom 60 het 23 0 20 3 A 1 2 368937 CASAVA_Build 8 136168922 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 39 0 24 16 T 15 14 368938 CASAVA_Build 8 136170787 1I GGGCTTGATA -/T TTTCATTAGC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 3 4 368939 CASAVA_Build 8 136171348 5I ATTATCTGAT -----/AAAAG AAAAGATACC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AAAAG 1 2 368940 CASAVA_Build 8 136179343 2D GCAAACAAAC AA/-- AAAAAAGTTT 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 8 6 368941 CASAVA_Build 8 136185614 1I CTTCCATTCT -/G TAGGTGGGTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 G 0 1 368942 CASAVA_Build 8 136217604 1D CTGTAACTGG A/- AAAAAAAAAA 2219 het 2219 ref 46 19 7 20 A 17 16 368943 CASAVA_Build 8 136223486 1D GAAAGAAAAG A/- AAAAAAAGTG 3070 hom 54 het 21 0 17 5 A 8 7 368944 CASAVA_Build 8 136230828 1I TATGGCTACA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 79 het 42 0 30 12 T 11 12 368945 CASAVA_Build 8 136237805 1D ACTGATACCC T/- TTTTTTTCCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 T 8 7 368946 CASAVA_Build 8 136249084 1I TTTTTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 10 11 368947 CASAVA_Build 8 136255120 2D CAAAAGACCA GT/-- GTGTGGCTGG 3070 hom 85 het 33 0 29 4 GT 3 2 368948 CASAVA_Build 8 136327406 1I CACTTTTTGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 426 hom 34 1 26 7 T 8 9 368949 CASAVA_Build 8 136329496 1I CAAAGAACCA -/T TTTTTTATCT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 T 6 7 368950 CASAVA_Build 8 136367458 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 27 0 23 4 A 10 9 368951 CASAVA_Build 8 136379996 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 12 11 368952 CASAVA_Build 8 136382672 1D AAGGCAAGAT A/- AAAATCTATG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 A 5 4 368953 CASAVA_Build 8 136384009 12I CACATGTCTC ------------/TCTGAAAAGAAG GCTGAAAAGC 3070 hom 99 het 37 0 31 6 TCTGAAAAGAAG 0 1 368954 CASAVA_Build 8 136422977 6I AATAAAAAAT ------/AAAATA AAAATAAAAA 1965 hom 10 het 8 0 4 4 AAAATA 2 3 368955 CASAVA_Build 8 136433600 1D AGCACATGGC T/- TTTTTTATCT 3070 hom 143 het 58 0 48 10 T 7 6 368956 CASAVA_Build 8 136434221 1I TCTGGAAACG -/C CCCCCCGAGT 3070 hom 61 het 28 0 19 9 C 6 7 368957 CASAVA_Build 8 136434752 1I TCCCCCAAAA -/G TGCACACTAA 3070 hom 163 het 63 0 54 9 G 0 1 368958 CASAVA_Build 8 136471940 1D AAAAGATATA T/- TTTTTTCCCA 3070 hom 72 het 33 0 24 10 T 7 6 368959 CASAVA_Build 8 136479672 4I TAGAGGATTA ----/AATT AATTATCTCT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 AATT 1 2 368960 CASAVA_Build 8 136513762 3D ATGCTTTCAC CTT/--- CTATACATAG 3070 hom 108 het 39 0 34 6 CTT 1 0 368961 CASAVA_Build 8 136519581 3I TCAGGGAACA ---/ATG ATGCCAAGCT 3070 het 3070 hom 57 28 23 6 ATG 1 2 368962 CASAVA_Build 8 136522238 1D ATGGATGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 32 0 27 6 T 11 10 368963 CASAVA_Build 8 136522435 1D GCTACAGGCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 67 het 30 0 23 7 T 10 9 368964 CASAVA_Build 8 136554462 1D ATTTGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 694 hom 43 4 29 10 T 15 14 368965 CASAVA_Build 8 136561553 7D CATGATAAAA AACACCC/------- AACAAATTAG 3070 hom 75 het 28 0 26 4 AACACCC 1 0 368966 CASAVA_Build 8 136562875 2D TCTGTCATAG TC/-- TCTGTCACAC 3070 het 3070 hom 27 9 14 5 TC 2 1 368967 CASAVA_Build 8 136563797 7D TTGCCCTGGG AAATGGT/------- AAATGGTAAA 3070 hom 86 het 39 0 27 13 AAATGGT 3 2 368968 CASAVA_Build 8 136566622 4I AACAGCACTT ----/TGTC TGTTTATTGC 3070 hom 151 het 63 0 51 12 TGTC 0 1 368969 CASAVA_Build 8 136573358 1D TGCCAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 31 het 34 1 26 7 T 15 14 368970 CASAVA_Build 8 136576083 1I CATTTGTATC -/A AATGCAGGAT 3070 hom 93 het 39 0 28 11 A 2 3 368971 CASAVA_Build 8 136577615 1D AAGGTCATGC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 14 het 29 0 13 16 A 10 9 368972 CASAVA_Build 8 136577991 1D TAGGGGTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 124 hom 23 1 19 3 A 11 10 368973 CASAVA_Build 8 136588327 1I ATAAGTTTGA -/T TTCTCTCCTG 3070 hom 63 het 26 0 22 4 T 2 3 368974 CASAVA_Build 8 136600204 2D ATTTTCAAAC TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 TG 7 6 368975 CASAVA_Build 8 136611146 2D AAGACTAGAA AC/-- AGTCTATTAC 3070 het 3070 ref 27 16 10 1 AC 1 0 368976 CASAVA_Build 8 136612849 1I CTGCAACAAC -/A AAAAAAAATC 3070 het 378 hom 27 1 22 4 A 8 9 368977 CASAVA_Build 8 136615643 1I TTCTCAGGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1047 hom 32 3 26 3 T 10 11 368978 CASAVA_Build 8 136632725 1D CCTTATGACA C/- TGACTAGAAC 3070 het 3070 ref 47 22 20 5 C 1 0 368979 CASAVA_Build 8 136639741 1I ATGACTATCT -/C CAAATTTATT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 C 1 2 368980 CASAVA_Build 8 136640204 1D TTACCACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 T 11 10 368981 CASAVA_Build 8 136642965 1I AAGTAATAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 30 1 25 4 T 13 14 368982 CASAVA_Build 8 136643961 1I TATTTACTCC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 61 28 21 12 T 7 8 368983 CASAVA_Build 8 136658533 1I TTATTTACGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 58 22 23 13 T 10 11 368984 CASAVA_Build 8 136658871 1I TAACTACTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 54 28 16 10 T 10 11 368985 CASAVA_Build 8 136667754 1D AAACAAAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 249 hom 41 1 34 7 A 11 10 368986 CASAVA_Build 8 136667961 1I AAATGAACTG -/T TTAGGAAGAA 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 T 2 3 368987 CASAVA_Build 8 136674188 1I CGAACTCTGG -/T TTATATAGCA 3070 hom 82 het 31 0 27 4 T 2 3 368988 CASAVA_Build 8 136684002 1I AATATTTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 14 14 3 T 10 11 368989 CASAVA_Build 8 136685370 1D TGTTCAAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 33 14 15 5 T 10 9 368990 CASAVA_Build 8 136685742 1I TATGTTTGAA -/C CTAAAGTGTG 3070 het 3070 ref 34 16 16 2 C 1 2 368991 CASAVA_Build 8 136695438 1I GAATTCCCAT -/A AAAAAAATTC 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 7 8 368992 CASAVA_Build 8 136714474 3I TCTTAGCTGC ---/TCT TCTAACTCTC 3070 het 3070 ref 36 23 13 0 TCT 1 2 368993 CASAVA_Build 8 136720292 3D CGGCTGAGGC AGG/--- AGAATTGCTT 3070 het 3070 ref 26 12 11 4 AGG 1 0 368994 CASAVA_Build 8 136730313 1D CAATAGCATG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 10 9 368995 CASAVA_Build 8 136742439 1D TATTCAACTC A/- AAAGTTCTAC 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 A 4 3 368996 CASAVA_Build 8 136773420 1D CCAGTCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1511 hom 29 7 10 12 T 15 14 368997 CASAVA_Build 8 136773469 1D TCTAAGAATG C/- CCACGTGGCT 3070 het 3070 hom 32 9 12 11 C 3 2 368998 CASAVA_Build 8 136777939 1D ATTTTAAATT A/- TTCTCCTCTA 3070 hom 96 het 34 0 33 1 A 1 0 368999 CASAVA_Build 8 136779971 1I AAACATGGTC -/T TGGGTTGCCA 3070 het 3070 hom 48 17 27 4 T 1 2 369000 CASAVA_Build 8 136780152 1D TGACATACTT A/- ACACTAAGCA 3070 het 3070 hom 51 20 24 7 A 2 1 369001 CASAVA_Build 8 136789245 8D AGCACTTTGG GAGGCCAA/-------- GAGGCCAAGG 3070 het 3070 ref 21 8 9 4 GAGGCCAA 2 1 369002 CASAVA_Build 8 136802778 1I CACGCGGGAC -/A AAAAAAGGAG 2137 het 2137 ref 20 7 8 5 A 6 7 369003 CASAVA_Build 8 136806745 2I CTGTCCTCTC --/TT GGTAGAAAAG 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 T 0 2 369004 CASAVA_Build 8 136812064 1D AAAAAGTCTC T/- TGTTTCAACT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 2 1 369005 CASAVA_Build 8 136818008 1D TGATTTACAC T/- CCCACTAGCA 3070 het 3070 ref 43 24 14 6 T 1 0 369006 CASAVA_Build 8 136820014 5I TTCTTTTCCT -----/GTGCA GAAGCTCTTT 3070 het 2179 hom 28 5 21 2 GTGCA 0 1 369007 CASAVA_Build 8 136855518 1I TTTTTTTTTT -/A TAAAAAGACA 3070 het 3070 hom 20 8 11 1 A 0 1 369008 CASAVA_Build 8 136868720 1I CTAAAGTTTT -/C CTTTTTTTGT 1676 het 1676 ref 20 10 5 5 C 1 2 369009 CASAVA_Build 8 136877411 1D TTGACTTTTT C/- TTTTTAATCA 3070 het 3070 ref 42 22 18 4 C 1 0 369010 CASAVA_Build 8 136883640 4D CAAACAGAAC AAAA/---- AAAAGCAGAT 3070 het 3070 ref 43 20 20 4 A 8 4 369011 CASAVA_Build 8 136888115 1I CATCATTGGG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 T 8 9 369012 CASAVA_Build 8 136888346 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 289 hom 27 3 18 6 T 13 12 369013 CASAVA_Build 8 136891386 7I CTTGCCTCCC -------/TGGAGGT TGGAGGTGGA 3070 het 3070 hom 45 12 23 10 TGGAGGT 1 2 369014 CASAVA_Build 8 136904488 1D GGCCTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 23 7 T 13 12 369015 CASAVA_Build 8 136910428 2D CGTGTGGAAC TG/-- TGAGTCCTAT 3070 het 3070 ref 38 23 8 7 TG 2 1 369016 CASAVA_Build 8 136936881 2I CAAGAGAGAC --/AG GGGAAGTGCT 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 AG 0 1 369017 CASAVA_Build 8 136938886 4D GGAAGGTGTG TGTT/---- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 37 17 14 8 TGTT 1 0 369018 CASAVA_Build 8 136938948 2D TGTGTGCATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 2048 hom 34 10 17 8 TG 10 9 369019 CASAVA_Build 8 137039846 1D GCTAGCAGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 12 11 369020 CASAVA_Build 8 137059874 1D TAAAATTTTC T/- TTTTTTGTTG 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 T 7 6 369021 CASAVA_Build 8 137064423 1D GAATGCAGCC T/- TTGGAGGAGC 3070 het 3070 ref 40 22 15 4 T 3 2 369022 CASAVA_Build 8 137064684 1I CAGGAAAGGC -/A GTGGCTAGTG 3070 het 3070 hom 55 21 25 9 A 0 1 369023 CASAVA_Build 8 137070732 2I CAAAACTTAA --/TT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 9 11 369024 CASAVA_Build 8 137072460 1I TTTTGTATGT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 7 8 369025 CASAVA_Build 8 137076893 3I TTCAACCCCC ---/ATT GATCAACATA 3070 het 3070 ref 37 16 15 6 ATT 0 1 369026 CASAVA_Build 8 137082106 1I CCACACAGCA -/G TAAAATTATT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 G 0 1 369027 CASAVA_Build 8 137085891 1I TGGGAAGGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 A 11 12 369028 CASAVA_Build 8 137098985 4I AGAGGTAGAT ----/GATA GATAGATGTC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 GATA 1 2 369029 CASAVA_Build 8 137099320 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 32 0 23 9 A 14 13 369030 CASAVA_Build 8 137102116 4I CCTACTACTT ----/TCTC TCTTACTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 TC 1 3 369031 CASAVA_Build 8 137103481 2D CTGCAGGTGG CT/-- CTCTGCTGAT 3070 het 3070 hom 49 19 24 6 CT 3 2 369032 CASAVA_Build 8 137111322 4I TTGAGCAAGT ----/TACA TAATGAGCCT 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 TACA 0 1 369033 CASAVA_Build 8 137111683 5D GACTGTACTA AACTC/----- AGCATACAGA 3070 het 3070 ref 36 18 17 5 AACTC 1 0 369034 CASAVA_Build 8 137116644 1I TGCTCCTGAC -/A AACAGAACCA 3070 het 3070 ref 45 20 20 5 A 2 3 369035 CASAVA_Build 8 137118305 4D AACAGAAAAT AAAC/---- AATAAATAAA 3070 het 3070 hom 33 16 15 3 AAAC 1 0 369036 CASAVA_Build 8 137119238 1D AAATATAGTC T/- ATTTTTTTTT 3070 het 2089 hom 23 6 13 4 T 1 0 369037 CASAVA_Build 8 137120853 3D TCACATCTGT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 52 24 19 10 TTG 7 6 369038 CASAVA_Build 8 137122690 1I CAGGTGCTGA -/T TTTTTTATGC 3070 het 3070 hom 51 23 22 6 T 6 7 369039 CASAVA_Build 8 137123777 1D TGTTGTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 26 2 16 8 T 12 11 369040 CASAVA_Build 8 137124446 1I TCTCCTACTT -/C CCCCCTTCTC 3070 het 3070 hom 40 10 23 7 C 5 6 369041 CASAVA_Build 8 137125258 1I TCAAAATAAG -/T TTTTTTTGGA 3070 het 3070 hom 39 12 19 8 T 7 8 369042 CASAVA_Build 8 137125710 1I AAGTATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 A 12 13 369043 CASAVA_Build 8 137126335 2I ATTAGGAAGT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 24 14 1 A 9 11 369044 CASAVA_Build 8 137129113 1I TTTTATTCAG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 62 27 24 11 T 7 8 369045 CASAVA_Build 8 137134906 1D TGAAATCACA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 10 6 T 4 3 369046 CASAVA_Build 8 137141578 1I ACTACAACAC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 A 8 9 369047 CASAVA_Build 8 137144517 1I CGTTCATGAT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 A 8 9 369048 CASAVA_Build 8 137144771 1I ATCAAGCTAT -/C CTTTTTTCAC 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 C 1 2 369049 CASAVA_Build 8 137147820 1D AAATGAAAAT G/- GGGGAGTTTG 3070 het 3070 hom 45 21 24 0 G 5 4 369050 CASAVA_Build 8 137149128 1I CCCATGGCTA -/T TTTTTTTTTT 2860 het 2860 ref 36 19 7 10 T 10 11 369051 CASAVA_Build 8 137149779 2D TGTGCTTGAG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 31 14 9 10 CA 9 8 369052 CASAVA_Build 8 137150514 3D CCAAAATAGC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 817 hom 51 5 25 22 A 12 9 369053 CASAVA_Build 8 137152618 3D ATATTATACA TTG/--- TTGAGTTAAA 3070 het 3070 ref 47 26 17 7 TTG 2 1 369054 CASAVA_Build 8 137163203 4I CTTTTTATTA ----/CTGT CTGTATTTCC 3070 het 3070 ref 43 21 18 4 CTGT 1 2 369055 CASAVA_Build 8 137164293 20D CCTCTACTCC TTCAGCATCCTTTCCAGCAT/-------------------- TTCAGCATCC 3070 het 3070 ref 46 19 13 18 TTCAGCATCCTTTCCAGCAT 2 1 369056 CASAVA_Build 8 137170163 5D TATATAAAAT AAAAC/----- AAAATGAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 16 4 AAAAC 1 0 369057 CASAVA_Build 8 137172970 1D TTGAGCTCAA G/- TCTCGGCTCT 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 G 1 0 369058 CASAVA_Build 8 137183709 5I CATTCATGAA -----/TCATC TACTCTCTAA 3070 het 3070 hom 46 20 23 3 TCATC 0 1 369059 CASAVA_Build 8 137185315 1D GCAGCTGGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1851 hom 29 8 15 6 T 13 12 369060 CASAVA_Build 8 137191043 1D CTCTTTATCA T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 T 8 7 369061 CASAVA_Build 8 137192902 1D28M1D TATCTTTGAA TTTTTTGTAAGAAAATATGCATTAGCTGCA/-TTTTTGTAAGAAAATATGCATTAGCTGC- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 17 24 2 N/A 0 0 369062 CASAVA_Build 8 137194705 1I GTCTATGGTA -/T TTTTTTACAG 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 6 7 369063 CASAVA_Build 8 137207193 1I TTTCTTCAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1669 hom 45 7 25 13 T 13 14 369064 CASAVA_Build 8 137289196 1D CCTTCTGTCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 33 18 8 8 T 10 9 369065 CASAVA_Build 8 137337224 2D ATTTTCTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 8 hom 31 1 23 10 T 16 14 369066 CASAVA_Build 8 137342581 1I TTTGCAAATG -/C CCCAAATTTC 3070 hom 124 het 46 0 42 4 C 3 4 369067 CASAVA_Build 8 137342845 1D TTAGAATCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 83 het 38 0 27 12 T 10 9 369068 CASAVA_Build 8 137347672 1I TTAAATTAAC -/T TTTTTTTATT 3070 hom 39 het 16 0 14 5 T 7 8 369069 CASAVA_Build 8 137359545 1I TTCATTTGGC -/T TACAGCTAGG 3070 het 3070 ref 44 26 13 5 T 1 2 369070 CASAVA_Build 8 137366603 4D TCTCTCTCTC TCTA/---- TCTCTCTCTC 3070 het 2995 hom 28 11 15 4 TCTA 1 0 369071 CASAVA_Build 8 137385108 4D TTTGTTTTTG TAAC/---- TAACTAAGCA 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 TAAC 2 1 369072 CASAVA_Build 8 137390588 1D GAGGAATAAA C/- CATCCCAATT 3070 het 3070 ref 50 27 18 5 C 2 1 369073 CASAVA_Build 8 137395215 1D GGTTTAAACA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 hom 39 20 15 5 T 8 7 369074 CASAVA_Build 8 137402085 1D TTTTTGAAGC T/- TTTTTTTTTT 1215 het 1215 ref 35 24 4 7 T 12 11 369075 CASAVA_Build 8 137412689 1I58M1D CTGTAGTGAG -AAAAAAAAAAAATTGCCATTGCACTTCAGCCTGGACAATCAGAGTGAGACCCTGTCTCA/AAAAAAAAAAAAATTGACATTGCACTCCAGCCTGGACAATCAGAGTGAGACCCTGTCTC- AAAAAACAAA 3070 hom 54 het 29 0 18 33 N/A 0 0 369076 CASAVA_Build 8 137413832 1I ATCTCAGCAA -/T TGAGAACCAG 3070 het 3070 hom 49 20 24 5 T 1 2 369077 CASAVA_Build 8 137414376 1D CTGGGCACAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 10 9 369078 CASAVA_Build 8 137419433 1D TTTGTAGCCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 48 hom 47 1 33 13 T 10 9 369079 CASAVA_Build 8 137423907 31D TAACATAATA ACCTCCAGTTCCATCCATTTTGCTGCAAGTG/------------------------------- ACAGGATTTT 2439 het 2439 ref 32 32 6 5 ACCTCCAGTTCCATCCATTTTGCTGCAAGTG 1 0 369080 CASAVA_Build 8 137429232 1I TAAAGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 2123 het 2123 ref 33 20 5 8 A 11 12 369081 CASAVA_Build 8 137431742 9I ATGCTATCTA ---------/GATGTAATG GATGTAATGG 3070 hom 138 het 56 0 47 10 GATGTAATG 1 2 369082 CASAVA_Build 8 137446347 1D AGGAAAGTTC T/- TTAGCAGGAA 3070 hom 138 het 51 0 46 5 T 3 2 369083 CASAVA_Build 8 137460221 4D TGGAAGAAAA TAGC/---- TAGTCTGGAA 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 TAGC 1 0 369084 CASAVA_Build 8 137461837 1D CCTCAAAAAG A/- AAAAAAATAA 3070 hom 48 het 21 0 17 5 A 8 7 369085 CASAVA_Build 8 137467292 1I GATATGATGG -/T TTGGAGGCCT 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 2 3 369086 CASAVA_Build 8 137468669 1I AAAACATTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 11 8 T 10 11 369087 CASAVA_Build 8 137484472 1D ATCCGAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2026 hom 26 6 13 7 A 14 13 369088 CASAVA_Build 8 137485877 1D GACTCCACCT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 A 8 7 369089 CASAVA_Build 8 137488445 2D GCCCTGGTTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 22 0 15 8 TA 9 8 369090 CASAVA_Build 8 137495666 1I AGTGCTGGGA -/T TTACAGGCGT 3070 het 3070 hom 32 11 20 1 T 2 3 369091 CASAVA_Build 8 137498984 1I ATTATTATTA -/T TTTTTTTTTT 2506 het 2506 ref 23 9 8 6 T 11 12 369092 CASAVA_Build 8 137501007 10D AAGAAAAGCT GCTCAGGGAA/---------- AAAGAGAGAA 3070 het 3070 ref 25 15 9 3 GCTCAGGGAA 1 0 369093 CASAVA_Build 8 137509815 1D TCCTGTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 18 14 13 A 15 14 369094 CASAVA_Build 8 137518533 1I CATTTATTTA -/T TTTATTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 T 3 4 369095 CASAVA_Build 8 137528088 6I ATATTTTAAT ------/TTATAA TTATAAGTAT 1957 het 1122 hom 9 3 4 2 TTATAA 1 2 369096 CASAVA_Build 8 137531185 1D AAGTGAGGAC A/- GGGGCATATG 3070 het 3070 ref 55 23 22 12 A 1 0 369097 CASAVA_Build 8 137532365 3I TGGCTCTCAG ---/GGA GGTGGATGGG 3070 het 3070 ref 65 34 20 11 GGA 0 1 369098 CASAVA_Build 8 137534279 1I CAAGAGATTA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 T 8 9 369099 CASAVA_Build 8 137542212 2I ATGGAAAAAC --/AG AAAGAACAAG 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 AG 0 1 369100 CASAVA_Build 8 137557697 2I AAAAGACAAA --/AC ACACATGAAT 3070 het 3070 hom 43 20 21 2 AC 2 3 369101 CASAVA_Build 8 137558037 3D AAATGAAATA TAT/--- TATTTAATGA 3070 het 3070 ref 35 22 12 1 TAT 2 1 369102 CASAVA_Build 8 137559749 3I TTATTGTTGT ---/TAG TAGCGTAGTG 3070 het 3070 ref 51 21 22 8 TAG 1 2 369103 CASAVA_Build 8 137560456 1I ATAGCCAAGT -/C TAAAACTGGC 3070 hom 96 het 34 0 33 1 C 0 1 369104 CASAVA_Build 8 137560607 1I GATTGTGGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 20 22 4 A 9 10 369105 CASAVA_Build 8 137564273 2D GAAAGAAAGA TC/-- TCTCAGCAAA 3070 hom 132 het 48 0 44 4 TC 3 2 369106 CASAVA_Build 8 137579610 1D ATAAAAAAAA T/- AAAGATGTTG 3070 het 3070 ref 24 13 11 0 T 1 0 369107 CASAVA_Build 8 137581401 1I TCTTAATTTT -/C TTTTGTTATT 3070 het 3070 hom 35 10 20 5 C 0 1 369108 CASAVA_Build 8 137581652 2D TCTTGAAACC AG/-- AGAGAGTCTT 3070 het 3070 hom 38 14 20 5 AG 4 3 369109 CASAVA_Build 8 137584519 1I TGTAGAGAGG -/C GGTTGCTGTG 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 C 0 1 369110 CASAVA_Build 8 137585409 1I ACCTAAAATT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 31 10 14 7 A 9 10 369111 CASAVA_Build 8 137587146 1D CAGCATCGGC A/- AAGAGATGTG 3070 het 3070 ref 49 25 17 8 A 3 2 369112 CASAVA_Build 8 137594921 1I GTAGCTACCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 T 9 10 369113 CASAVA_Build 8 137598889 2I GCCTTGAAAC --/TA TGTGTAGTAA 3070 het 3070 hom 55 24 24 7 TA 0 1 369114 CASAVA_Build 8 137617065 3I TTGCTGATAC ---/ATG ATATTATTTT 3070 het 3070 hom 33 13 13 7 ATG 0 1 369115 CASAVA_Build 8 137622486 1D GAGGATTTCC T/- TTTTTTTTTT 990 het 990 ref 46 24 3 19 T 15 14 369116 CASAVA_Build 8 137624800 1D AATTCATCGG T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 41 14 24 3 T 8 7 369117 CASAVA_Build 8 137625520 1D CTTAAAATTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 9 8 369118 CASAVA_Build 8 137632602 1D GTTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 9 19 8 T 10 9 369119 CASAVA_Build 8 137639195 2I TCAGGACGCA --/CT CTCTAGTCAT 3070 het 3070 hom 39 12 23 4 CT 2 3 369120 CASAVA_Build 8 137658664 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 1102 het 1102 ref 36 29 4 5 AC 10 9 369121 CASAVA_Build 8 137665010 2I AAAAGAAGAC --/AT ATATGTGGCC 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 AT 2 3 369122 CASAVA_Build 8 137667182 1I ATAAAATCAC -/T TGACATTTCC 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 T 1 2 369123 CASAVA_Build 8 137673173 1I TGCTTAAGAG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 9 10 369124 CASAVA_Build 8 137675720 12D AAGTAAGAAA GTAGAGATGTTG/------------ GCATCTCTAA 3070 het 3070 ref 24 15 7 3 GTAGAGATGTTG 1 0 369125 CASAVA_Build 8 137693933 1D TTCCTCCAGA G/- GGAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 8 14 5 G 3 2 369126 CASAVA_Build 8 137707025 2I GAGGATCAAC --/TG AACTCAGGAA 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 TG 0 1 369127 CASAVA_Build 8 137714439 2I TTCTTGACTC --/TT TAAGGCTTTT 3070 het 3070 ref 39 16 14 9 T 1 3 369128 CASAVA_Build 8 137716056 1D TAATACCTCC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 9 8 369129 CASAVA_Build 8 137730317 3D GTGCATCCAC ACA/--- ACAACTCAGG 3070 het 3070 ref 71 36 31 5 ACA 2 1 369130 CASAVA_Build 8 137731731 1I TAATTTAAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 A 11 12 369131 CASAVA_Build 8 137737337 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAG 2796 het 1479 hom 13 4 6 3 A 9 10 369132 CASAVA_Build 8 137738062 2D GGCTACATTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 24 6 13 5 T 22 20 369133 CASAVA_Build 8 137752940 1I ATCTATTATG -/T AGCACCCCAG 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 T 0 1 369134 CASAVA_Build 8 137753252 1I TTATGTTGAG -/A TACGTGGAGC 3070 hom 120 het 43 0 40 3 A 0 1 369135 CASAVA_Build 8 137775535 27D AGTGGATAAG TCTCCTGAGATCTGATAGTTTTATAAA/--------------------------- TCTCCTGAGA 3070 hom 60 het 28 0 20 14 TCTCCTGAGATCTGATAGTTTTATAAA 2 1 369136 CASAVA_Build 8 137783100 1I AAAAGGAGAC -/T TTTTTTTACA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 7 8 369137 CASAVA_Build 8 137784724 1I TTTGATCTCA -/C CATATGCCCA 3070 het 3070 hom 36 12 19 5 C 1 2 369138 CASAVA_Build 8 137793746 24D TCAGAATGGT TGTCTGCTCTCGAACCCTGTATCC/------------------------ TGTCTGCTCT 3070 het 3070 ref 45 16 15 21 TGTCTGCTCTCGAACCCTGTATCC 2 1 369139 CASAVA_Build 8 137801665 4D TGATTTCATT ATTA/---- ATTAATTAAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 5 ATTA 3 2 369140 CASAVA_Build 8 137811159 4I GCCCTCCAGC ----/CAAA CACTCATGAG 3070 hom 132 het 48 0 44 4 CAAA 0 1 369141 CASAVA_Build 8 137813301 2I CCTTTTCATT --/TC TGTTGAGAAC 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 TC 0 1 369142 CASAVA_Build 8 137814627 1I TATTTTTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 17 18 10 T 12 13 369143 CASAVA_Build 8 137821849 1I CCCCCACAGT -/C CCTCATCCTC 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 C 2 3 369144 CASAVA_Build 8 137824179 1D GTAATTTAAA G/- CGTTTGTTAA 3070 het 3070 ref 53 27 17 9 G 1 0 369145 CASAVA_Build 8 137825695 1I CTAGTCAACA -/T TCTCACCCAT 3070 hom 132 het 52 0 45 7 T 1 2 369146 CASAVA_Build 8 137832170 1D TTTGTTTTAG T/- TTAAATATCT 3070 het 3070 ref 35 15 17 3 T 3 2 369147 CASAVA_Build 8 137836275 2D CATGCTCGGC TT/-- TTTTTTTTTT 2257 het 253 hom 14 4 6 4 T 15 13 369148 CASAVA_Build 8 137837230 1D ACACATTAAA C/- TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 39 15 19 5 C 1 0 369149 CASAVA_Build 8 137840203 1D ATTTCATAAT A/- AAAATGAGAA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 A 5 4 369150 CASAVA_Build 8 137847963 14D CTGTGGGATA TCTGAAGTGAAATC/-------------- TCTTTTATTC 3070 het 3070 ref 30 18 15 3 TCTGAAGTGAAATC 1 0 369151 CASAVA_Build 8 137848102 4I GTAAAATCTG ----/AAAT AAATTAATTA 3070 hom 44 het 17 0 15 2 AAAT 1 2 369152 CASAVA_Build 8 137854083 8D TATGTGTGTG TATATATA/-------- TATATATATA 3070 het 301 hom 17 4 9 5 TA 11 7 369153 CASAVA_Build 8 137854579 2D AAAAGGAAAA AG/-- AAATTTGTGC 3070 het 3070 ref 41 20 18 3 AG 1 0 369154 CASAVA_Build 8 137857866 2I GTGTATACAC --/AT ATATGTGTGT 3070 hom 63 het 24 0 21 3 AT 2 3 369155 CASAVA_Build 8 137857996 2I ATATATATAA --/AT ATATATATAT 1703 het 678 hom 13 2 7 4 AT 5 6 369156 CASAVA_Build 8 137864158 4D TTAAATTCTC TATT/---- TATGCTATTG 3070 het 3070 hom 33 14 16 6 TATT 1 0 369157 CASAVA_Build 8 137867808 1I AAGAAAAATG -/T AGAAGAGGAT 3070 het 3070 hom 53 16 29 8 T 0 1 369158 CASAVA_Build 8 137869312 1D TAATACAGAC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 A 8 7 369159 CASAVA_Build 8 137874384 1I ACACAGTCTC -/A AAAATCAACA 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 4 5 369160 CASAVA_Build 8 137876757 5D TCCTCTCCTG AAAAT/----- AAAAGTGCTG 3070 het 3070 hom 31 10 19 3 AAAAT 1 0 369161 CASAVA_Build 8 137880940 12D AATCTGAGGG TTTCACAGAACC/------------ TGTGATAGTA 3070 hom 96 het 36 0 33 6 TTTCACAGAACC 1 0 369162 CASAVA_Build 8 137885494 1I TAGTGATAGT -/A AAATGCTCTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 3 4 369163 CASAVA_Build 8 137886019 11I TTTAAAGTAT -----------/TTTTACATATA ATTTAAACAA 3070 hom 72 het 28 0 25 6 TTTTACATATA 0 1 369164 CASAVA_Build 8 137887152 3I GACAACTTGA ---/AGG AGAAGAGACT 3070 hom 93 het 32 0 30 2 AGG 0 1 369165 CASAVA_Build 8 137887515 5D TACCTATCTC ACCTT/----- ACAGAATGAA 3070 hom 102 het 38 0 35 4 ACCTT 1 0 369166 CASAVA_Build 8 137892474 2I GTGTTATTTA --/CC CCTGGCTGAG 3070 hom 107 het 43 0 33 10 C 2 4 369167 CASAVA_Build 8 137896896 1I CCAGATGAGA -/T TTTTTTGAGA 3070 hom 103 het 39 0 35 4 T 6 7 369168 CASAVA_Build 8 137901454 4D TCATTAAAAC TCTT/---- TCCTTTATAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 TCTT 1 0 369169 CASAVA_Build 8 137902272 1I TCTAAGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 728 hom 32 3 24 5 T 10 11 369170 CASAVA_Build 8 137904567 1I AAAATAACTA -/T TTGAGTATTA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 369171 CASAVA_Build 8 137907258 1D CATAGCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 51 19 17 16 A 12 11 369172 CASAVA_Build 8 137914883 1D GTCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 10 9 369173 CASAVA_Build 8 137915452 1D CTGGAAAAAC A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 A 8 7 369174 CASAVA_Build 8 137916519 1D TCAAAACAAA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 11 15 4 T 9 8 369175 CASAVA_Build 8 137917302 1I TCTCATTCTG -/T TTTTTTTTTT 1157 het 1157 ref 44 30 4 10 T 10 11 369176 CASAVA_Build 8 137917891 1D TTAGAATCAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 15 18 4 T 10 9 369177 CASAVA_Build 8 137933441 2D AACTGAGAGG GA/-- GAGAGAGAGC 3070 het 3070 hom 37 16 16 6 GA 5 4 369178 CASAVA_Build 8 137938006 12I AGAGTTTTTA ------------/GTATGAAGGATT GTTGAATTTT 3070 hom 27 het 10 0 10 0 GTATGAAGGATT 0 1 369179 CASAVA_Build 8 137940421 4I TTATGTACTC ----/TGAG TGTATTTTCA 3070 het 3070 hom 45 14 25 6 TGAG 0 1 369180 CASAVA_Build 8 137944266 4I CTGGCAACAC ----/TGAA TGTTAGCAAC 3070 hom 141 het 51 0 46 5 TGAA 0 1 369181 CASAVA_Build 8 137947836 1I ACACAATATT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 A 8 9 369182 CASAVA_Build 8 137947907 5D GACAGAATCA GTTTG/----- GTGATCACTA 3070 het 3070 ref 25 16 7 4 GTTTG 1 0 369183 CASAVA_Build 8 137957294 2I CTGTGTGCAA --/AT ATATATATAT 2956 het 1551 hom 17 4 8 5 AT 7 8 369184 CASAVA_Build 8 137958603 1D ACCTAACAGT A/- AAAAAAAATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 9 8 369185 CASAVA_Build 8 137960464 1D TGTATAGGCC T/- TTTTTTTTTT 1383 het 1383 ref 34 21 5 8 T 15 14 369186 CASAVA_Build 8 137960818 1D TAATAATAAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 10 9 369187 CASAVA_Build 8 137965012 1D CTGATCATTG A/- AAAATCAGAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 A 5 4 369188 CASAVA_Build 8 137970079 1D CTGTGATTTC T/- TTTTTTTTTT 2748 het 1050 hom 22 4 10 8 T 17 16 369189 CASAVA_Build 8 137976445 4I TTACTTTGTG ----/TATA TATATATATA 1781 het 1781 ref 28 18 6 4 TA 7 9 369190 CASAVA_Build 8 137979040 1D GTCTATGGTG T/- TTTTTTTACA 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 8 7 369191 CASAVA_Build 8 137992835 1D TCCACAGATT C/- CTGTTGGGAC 3070 het 3070 hom 40 14 21 6 C 2 1 369192 CASAVA_Build 8 137998036 1D GAAAGATGGG A/- AAAAAAGAGT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 7 6 369193 CASAVA_Build 8 138004460 8I ATAACAGTGA --------/TGTACATT TCAAAGTCAC 3070 hom 78 het 29 0 25 5 TGTACATT 0 1 369194 CASAVA_Build 8 138008029 1D GTATTCATTT A/- CAAGTATTCA 3070 het 3070 ref 39 22 16 1 A 1 0 369195 CASAVA_Build 8 138013687 1D ATGTCTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 46 16 26 5 A 10 9 369196 CASAVA_Build 8 138023652 4I ACTCTGACTC ----/ACTG ACTGCTAGCT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 ACTG 1 2 369197 CASAVA_Build 8 138026261 2D ATTAGTGTTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 11 9 369198 CASAVA_Build 8 138027494 2I AGTAATATAC --/AT CTATTGAAGC 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 AT 0 1 369199 CASAVA_Build 8 138034701 1D AGAGAATTGC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 8 7 369200 CASAVA_Build 8 138034778 1D TGTGAATTAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 69 het 29 0 24 11 A 9 8 369201 CASAVA_Build 8 138038074 1D AGCTCTGACA G/- GAACATTGCC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 G 2 1 369202 CASAVA_Build 8 138060253 1D CAATACTGCA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 77 het 46 1 38 7 T 10 9 369203 CASAVA_Build 8 138061501 6D ACAAAAAGAA ATATAG/------ ATAATATATA 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 ATATAG 1 0 369204 CASAVA_Build 8 138069356 2D CTTATTCCAC AT/-- AGTTACCTCT 3070 het 3070 hom 40 14 22 7 AT 1 0 369205 CASAVA_Build 8 138075344 1D TCTGCCTGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 10 9 369206 CASAVA_Build 8 138076015 3D CACCACAATG TTA/--- TTATTTCAAA 3070 het 3070 hom 40 12 23 6 TTA 2 1 369207 CASAVA_Build 8 138080970 4I CTTCTCTTAT ----/TTTA TTTATTAGTC 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 TTTA 1 2 369208 CASAVA_Build 8 138095660 1I ATTTTTCAAT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2168 hom 35 5 23 7 G 0 1 369209 CASAVA_Build 8 138095915 3D TTTAAACGTC TTT/--- TTTTTTCTGG 3070 het 3070 hom 46 17 22 8 T 9 6 369210 CASAVA_Build 8 138111278 4D TTGCTAATAT TGAG/---- TGTTTGTCTA 3070 het 3070 ref 55 26 22 10 TGAG 1 0 369211 CASAVA_Build 8 138111954 4D GAAAAAAAAT AAAG/---- GAAGGAAGAA 3070 hom 93 het 33 0 32 3 AAAG 1 0 369212 CASAVA_Build 8 138114754 1I ATCTTAGCAC -/T TTCTTTGTTA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 T 2 3 369213 CASAVA_Build 8 138125629 3I ACCATAATGG ---/AGA AGAAGAGATT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 AGA 2 3 369214 CASAVA_Build 8 138170036 2I AGTGCCCTTC --/AT ATTATGATTA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 AT 1 2 369215 CASAVA_Build 8 138179691 1I AATTATGCTC -/G GGGGGTAGGA 3070 het 3070 hom 39 13 21 5 G 5 6 369216 CASAVA_Build 8 138278786 1I TGCTGGGTCC -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 26 11 9 6 T 8 9 369217 CASAVA_Build 8 138289042 1I GAGACCAGTT -/A AGAGTGAGCA 3070 hom 169 het 63 0 57 6 A 1 2 369218 CASAVA_Build 8 138302331 1I CAAAAAAAAA -/T AATAATAAAA 3070 het 3070 ref 47 23 22 2 T 0 1 369219 CASAVA_Build 8 138307804 1I GACAGAATAA -/G AAAAATACGG 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 G 0 1 369220 CASAVA_Build 8 138308704 1I ACTTGAACCC -/G GGAGGCAGAG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 2 3 369221 CASAVA_Build 8 138321376 1I AATTGCGTCT -/C CCCTTCATAT 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 C 3 4 369222 CASAVA_Build 8 138333090 1I CAAATGTTAC -/T GTGATGTCCT 3070 het 3070 hom 54 17 25 12 T 0 1 369223 CASAVA_Build 8 138333538 1I ATTTTTTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 7 8 369224 CASAVA_Build 8 138343362 1I TTTTAATGGC -/A AGAAACCGTG 3070 hom 126 het 46 0 43 3 A 1 2 369225 CASAVA_Build 8 138351885 1D GCAAAAAAAA T/- AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 31 10 18 3 T 1 0 369226 CASAVA_Build 8 138369874 1D TTCAATTCAA C/- CCCCCTCCTT 3070 het 3070 ref 37 16 13 8 C 6 5 369227 CASAVA_Build 8 138377810 1D GGTGAATCCT A/- ACAAACTTTA 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 2 1 369228 CASAVA_Build 8 138380409 1I GAATACCCAA -/G GGGGGGTCTC 3070 het 3070 ref 43 24 17 2 G 6 7 369229 CASAVA_Build 8 138385440 6I CTATCAATAC ------/TATTAA TATTATCAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 TATTAA 0 1 369230 CASAVA_Build 8 138385936 1D TGAAGAGGTG C/- CTTCCACCAT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 C 2 1 369231 CASAVA_Build 8 138388191 2D TAAATGCTGC AT/-- GTTTTCATTT 3070 hom 96 het 36 0 32 4 AT 1 0 369232 CASAVA_Build 8 138390719 1D CCATTTAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 39 0 32 8 A 11 10 369233 CASAVA_Build 8 138398693 10D ATATTAGTTC AAACTACATA/---------- AAAATGCTGA 3070 het 3070 ref 44 26 21 6 AAACTACATA 1 0 369234 CASAVA_Build 8 138398862 1D AATAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 17 17 7 T 12 11 369235 CASAVA_Build 8 138405142 1D CACAAAAGCA T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 48 23 19 7 T 8 7 369236 CASAVA_Build 8 138410221 2D ATTCTTCATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 18 15 12 T 12 10 369237 CASAVA_Build 8 138419579 2I ATTTAAACAC --/TT TTTTCTGAAA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 4 6 369238 CASAVA_Build 8 138420467 1D ATGGCTCTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 A 13 12 369239 CASAVA_Build 8 138444233 1I AATACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2048 het 2048 ref 43 22 7 14 T 16 17 369240 CASAVA_Build 8 138449870 1I GCTATTAATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 14 11 5 A 8 9 369241 CASAVA_Build 8 138450601 1D AAAATTTATG C/- AGAGAAAATT 3070 het 3070 hom 26 11 14 1 C 1 0 369242 CASAVA_Build 8 138451818 1I AGTCACTGAA -/C ATGAAATCTC 3070 het 3070 hom 48 19 24 5 C 0 1 369243 CASAVA_Build 8 138452648 1D CATGTAACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 T 12 11 369244 CASAVA_Build 8 138455293 3I GACACAGGAG ---/TTC TTCTCCTTTC 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 TTC 1 2 369245 CASAVA_Build 8 138458765 1D GCCTTTAGCC A/- TGATTGTGAG 3070 het 3070 ref 37 24 7 7 A 1 0 369246 CASAVA_Build 8 138458856 4D TCTCAAGTAG TTTC/---- TTTATAGCTG 3070 het 3070 hom 30 11 18 2 TTTC 1 0 369247 CASAVA_Build 8 138461964 1D TCTTTCTCAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 3 A 10 9 369248 CASAVA_Build 8 138463601 1I AATATTATTG -/A AAAAACAAAC 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 5 6 369249 CASAVA_Build 8 138465516 1D TGTAAGGCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 10 9 369250 CASAVA_Build 8 138479319 1D TTATGGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 T 11 10 369251 CASAVA_Build 8 138482715 1D AAGCTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2618 het 2618 ref 28 15 8 5 A 11 10 369252 CASAVA_Build 8 138483180 1I ACACAAAAAT -/A AAAAAAAAGA 1989 het 1989 ref 29 20 8 1 A 8 9 369253 CASAVA_Build 8 138489348 12D CAGTGTGTGA TGTTCCTCTCCC/------------ TGTGTCTACA 3070 het 3070 ref 44 26 16 7 TGTTCCTCTCCC 1 0 369254 CASAVA_Build 8 138489774 2I GATATGTTGG --/AC ACAGAGTTCT 3070 het 3070 hom 57 24 28 5 AC 1 2 369255 CASAVA_Build 8 138490785 1D GGCTCTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2710 hom 24 7 12 5 A 12 11 369256 CASAVA_Build 8 138495370 10I ATGGACAAAA ----------/ACACAAAATT TGAGAATTCC 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 ACACAAAATT 0 1 369257 CASAVA_Build 8 138498193 2D TTTAATCTTA TC/-- TCTGGCTGAA 3070 het 3070 ref 39 24 10 5 TC 2 1 369258 CASAVA_Build 8 138505305 4I ATATAAATGT ----/TTAA TTAAATACCT 3070 het 3070 ref 37 22 12 3 TTAA 1 2 369259 CASAVA_Build 8 138505428 1I TGCTACTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 16 14 14 A 15 16 369260 CASAVA_Build 8 138509593 1D ACTTTTTCTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 T 10 9 369261 CASAVA_Build 8 138525977 1I CCATTCTTTA -/T TTTTTTTCAG 3070 het 3070 ref 59 31 21 7 T 7 8 369262 CASAVA_Build 8 138529447 1I ACAATCAAGT -/A AAGGTAAAGA 3070 het 3070 hom 53 19 29 5 A 2 3 369263 CASAVA_Build 8 138536920 4D TGTTACTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 16 het 25 0 15 11 T 16 12 369264 CASAVA_Build 8 138537496 1D TAGCTAAATA T/- TTTTTTCTCT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 7 6 369265 CASAVA_Build 8 138574588 1D GCATGCAGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 19 16 12 A 13 12 369266 CASAVA_Build 8 138578236 1D TTTTTTTTTT C/- CCAAAACAAG 3070 het 3070 ref 44 26 16 2 C 3 2 369267 CASAVA_Build 8 138582272 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1720 het 1367 hom 21 7 7 8 T 15 14 369268 CASAVA_Build 8 138584251 2I CATAGGAAAC --/AG GGGGAAAAAA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 AG 0 1 369269 CASAVA_Build 8 138585723 1D CAGTAATAAG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2949 hom 27 7 13 7 A 10 9 369270 CASAVA_Build 8 138590560 5D AAAGCACTCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 3070 het 1779 hom 36 6 16 15 CAAAA 5 4 369271 CASAVA_Build 8 138590942 3I AAGACAAAGA ---/AAT AATGAGATAA 2383 het 2383 ref 19 9 6 4 AAT 1 2 369272 CASAVA_Build 8 138609143 4D ACACATATAT AAAG/---- ACATTAAGAT 2945 het 2945 ref 27 13 9 8 AAAG 1 0 369273 CASAVA_Build 8 138613244 1D CAGGTACACC T/- GAGACCACTG 3070 het 2888 hom 27 8 16 4 T 1 0 369274 CASAVA_Build 8 138617749 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 het 2755 hom 25 9 13 3 A 9 8 369275 CASAVA_Build 8 138619587 1I GAACCCCCCC -/A AAACAAATAA 3070 het 3070 ref 36 16 14 6 A 3 4 369276 CASAVA_Build 8 138631149 2D TTGTTAATAT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 16 13 11 TA 7 6 369277 CASAVA_Build 8 138634803 1D GAAACAACAA G/- CTCTCAAAAC 3070 het 3070 ref 44 24 17 3 G 1 0 369278 CASAVA_Build 8 138635872 1I ATTTATTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 10 4 T 11 12 369279 CASAVA_Build 8 138636610 1I AGATTAAATT -/A TGCATAGGGT 3070 het 3070 hom 37 15 19 3 A 0 1 369280 CASAVA_Build 8 138649642 3I TTTGTGAAGC ---/CCT CACAGTGACT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 CCT 0 1 369281 CASAVA_Build 8 138652220 4D AAATTCCTAG GCCC/---- GCCCTCAATC 2637 het 2637 ref 20 11 6 4 GCCC 2 1 369282 CASAVA_Build 8 138664431 23D ATAATTGTAC TTAGTAAACTGGTTTCAATTATT/----------------------- TTAGTAAACT 2174 het 2174 ref 22 12 5 9 TTAGTAAACTGGTTTCAATTATT 2 1 369283 CASAVA_Build 8 138665020 1D TTACACACAG A/- AAACTCCAAT 3070 het 3070 ref 34 17 14 4 A 4 3 369284 CASAVA_Build 8 138673187 1I CACCCCTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 30 0 20 10 T 10 11 369285 CASAVA_Build 8 138676593 1I GAGGAGCACA -/G GGTAGCTTAC 3070 hom 154 het 56 0 52 4 G 2 3 369286 CASAVA_Build 8 138679554 1D AACCTCTGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 T 10 9 369287 CASAVA_Build 8 138685469 4D AATTTACTTC TCTT/---- TGACTTATTT 3070 hom 63 het 24 0 22 4 TCTT 1 0 369288 CASAVA_Build 8 138695925 3D CAAATTGGAG GAA/--- GGGCCTGGTG 3070 hom 84 het 33 0 27 7 GAA 1 0 369289 CASAVA_Build 8 138699958 2D ATAATCTACC AT/-- ATGTGTTAAT 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 AT 2 1 369290 CASAVA_Build 8 138701433 4D TCTTCCCTCC CTCT/---- GTCTCTTCCT 3070 het 3070 ref 51 25 18 9 CT 2 0 369291 CASAVA_Build 8 138708463 1I AAAATTATTA -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 T 6 7 369292 CASAVA_Build 8 138709752 1D TGGCTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 1937 het 1937 ref 24 9 5 10 T 15 14 369293 CASAVA_Build 8 138710171 3D TATTTTTAAT AAA/--- AATTAAAATT 2026 het 2026 ref 14 9 5 1 A 5 2 369294 CASAVA_Build 8 138714122 4D TCACTTTAAT TTTA/---- TTTATTATCA 3070 het 3070 hom 27 10 13 6 TTTA 2 1 369295 CASAVA_Build 8 138715816 3I CTTTAAATAA ---/TAT TATCTGACAG 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 TAT 1 2 369296 CASAVA_Build 8 138721907 5D GCCCAGATCA ATGTC/----- ATGAAGTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 3 ATGTC 1 0 369297 CASAVA_Build 8 138726487 1I TTATAATAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 928 hom 35 2 25 8 A 13 14 369298 CASAVA_Build 8 138731073 1D AAGAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 108 het 42 0 37 6 A 9 8 369299 CASAVA_Build 8 138736996 2D GTCTTTTATG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 26 0 19 9 T 14 12 369300 CASAVA_Build 8 138739173 5I TTTTGCAAAG -----/ATAAA ATAAAGTAAG 3070 hom 105 het 43 0 36 7 ATAAA 1 2 369301 CASAVA_Build 8 138748156 1D GAGGTTTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 427 hom 39 2 28 9 T 11 10 369302 CASAVA_Build 8 138750858 20D GAGACCCTGC TAAATAAATAAATAAATAAA/-------------------- TAAATAGATA 3070 het 512 hom 13 2 11 2 TAAA 6 1 369303 CASAVA_Build 8 138755201 3D AAAAAAAAAT AGC/--- AGCAACACCA 3070 het 3070 hom 48 21 25 2 AGC 2 1 369304 CASAVA_Build 8 138755592 2I ATATTCAGAC --/AA ATTTGATTGT 3070 hom 126 het 52 0 43 9 A 1 3 369305 CASAVA_Build 8 138757273 2D TCATTACTTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 11 9 369306 CASAVA_Build 8 138769511 1I CTAACAATTT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 A 7 8 369307 CASAVA_Build 8 138771007 6I GCTTACCTGG ------/AATGTT AATGTTATAC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 AATGTT 1 2 369308 CASAVA_Build 8 138773128 3D AGTTATAAGG CTT/--- CTTCCACTTC 3070 hom 132 het 47 0 44 4 CTT 2 1 369309 CASAVA_Build 8 138774038 1D ATGAGATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 21 15 4 T 11 10 369310 CASAVA_Build 8 138774769 1D ATGGACATTC T/- TTTTTTTTTT 2744 het 13 hom 17 1 10 6 T 15 14 369311 CASAVA_Build 8 138775413 1D TCTGGTTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2301 hom 20 7 8 5 T 10 9 369312 CASAVA_Build 8 138776780 1D CTTTTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 T 11 10 369313 CASAVA_Build 8 138779017 4D ACAAAAAACA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 10 19 9 AAAC 4 3 369314 CASAVA_Build 8 138799152 4I AGAGTTTTTT ----/TTTG TTTTTTTTTT 3070 het 813 hom 42 14 14 14 TTTG 0 1 369315 CASAVA_Build 8 138806031 1I CTAAATATAG -/A AAAAAAGGAT 3070 het 3070 ref 43 28 11 4 A 6 7 369316 CASAVA_Build 8 138811257 2I CCAGGAGATA --/AG AGAGAAAATA 3070 hom 108 het 40 0 36 4 AG 2 3 369317 CASAVA_Build 8 138813767 1I AATAAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 377 het 377 ref 45 17 4 24 A 10 11 369318 CASAVA_Build 8 138814133 5I GTGTGGCATG -----/GCATA AGGTGGTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 GCATA 0 1 369319 CASAVA_Build 8 138817877 4D AGATTCCTGC TATA/---- TATAATACTG 3070 het 3070 ref 41 22 14 6 TA 4 2 369320 CASAVA_Build 8 138827837 1I TCTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2609 hom 31 8 12 11 T 11 12 369321 CASAVA_Build 8 138834249 4I CTCATATATC ----/TCTG TCTTTTATCT 3070 het 3070 hom 42 18 19 5 TCTG 0 1 369322 CASAVA_Build 8 138835366 3D ACAAACAAAC AAA/--- AAAAGCACCT 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 A 7 4 369323 CASAVA_Build 8 138839157 1I CACAGATCAC -/T TTCATTCTTG 3070 het 3070 ref 40 25 10 5 T 2 3 369324 CASAVA_Build 8 138840001 2D CCACTAAATG CT/-- ATATAGTGAA 3070 het 3070 ref 48 24 20 4 CT 1 0 369325 CASAVA_Build 8 138842753 1I GTCTAACAGA -/C ATGTCTATCT 3070 het 3070 hom 36 14 21 1 C 0 1 369326 CASAVA_Build 8 138842859 1I ACACGTGAGT -/A AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 A 6 7 369327 CASAVA_Build 8 138845742 5I GAAGAATGAA -----/TACTT TACTTTCTAT 3070 het 3070 hom 37 9 17 11 TACTT 1 2 369328 CASAVA_Build 8 138845920 1D ATCCTATGAT A/- AAAAAAACCC 3070 het 3070 hom 33 12 17 4 A 8 7 369329 CASAVA_Build 8 138852470 17I TGTGGAATTC -----------------/TTGGGTTGGGGGCTTCA ATGGCCATGC 3070 het 3070 ref 41 23 14 4 TTGGGTTGGGGGCTTCA 0 1 369330 CASAVA_Build 8 138854364 12I GTCAATATGA ------------/GACAGTCAATAT GACAGCTAAT 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 GACAGTCAATAT 0 1 369331 CASAVA_Build 8 138855017 10I ACCATAATGC ----------/CAGAAGTCCT CATGAAACAA 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 CAGAAGTCCT 0 1 369332 CASAVA_Build 8 138855288 2D GCATATACAC AT/-- ATGTGTACAT 3070 het 3070 hom 44 22 21 2 AT 2 1 369333 CASAVA_Build 8 138860221 1D ATTAAGCAAG A/- AAGGGAGTTG 3070 het 3070 ref 40 19 18 4 A 3 2 369334 CASAVA_Build 8 138868317 3I TTAAGGCTTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 78 het 33 0 27 6 TTG 3 4 369335 CASAVA_Build 8 138870872 2D CACCAACCTA AT/-- AGTCTAACGC 3070 het 3070 ref 45 23 18 5 AT 1 0 369336 CASAVA_Build 8 138874936 1I TTAAAAAAAT -/A AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 38 12 23 3 A 7 8 369337 CASAVA_Build 8 138878312 3D TATTTGTCAT AAG/--- AAGCTATGGA 3070 het 3070 hom 33 14 16 6 AAG 2 1 369338 CASAVA_Build 8 138880085 2I TGAAATAAAC --/AT AGAGTAGAGG 3070 het 3070 ref 55 27 21 7 AT 0 1 369339 CASAVA_Build 8 138882948 1D AGGTAGTTAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 A 10 9 369340 CASAVA_Build 8 138887331 1D ACATGAGCCT G/- GTTAGGCTGA 3070 hom 148 het 56 0 50 7 G 2 1 369341 CASAVA_Build 8 138891288 3D GTATCTATCT ATC/--- ATCTATATAT 3070 het 3070 hom 53 24 24 8 ATC 2 1 369342 CASAVA_Build 8 138903748 1D TAGACCGGTC G/- GGGGGGCAGG 3070 het 3070 ref 34 16 12 9 G 7 6 369343 CASAVA_Build 8 138911712 13D GAGATGGGGG TGGGGCCATTTTA/------------- TAGGATTTGG 3044 het 3044 ref 26 14 9 3 TGGGGCCATTTTA 1 0 369344 CASAVA_Build 8 138918696 4I TTATAATCTC ----/CAGA CAGAGAAGCC 3070 het 3070 ref 35 24 10 1 CAGA 1 2 369345 CASAVA_Build 8 138923259 2D ACAGAGTCCT AC/-- CATCTTGTCC 3070 het 3070 ref 43 25 15 5 AC 1 0 369346 CASAVA_Build 8 138925962 4I TAATTTAATA ----/AAAT AAATAAAGGT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 AAAT 1 2 369347 CASAVA_Build 8 138926305 1D GGACTGTACC T/- TGCATAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 T 2 1 369348 CASAVA_Build 8 138926886 1D ATTTTAGAGT A/- ACCCTGTGAG 3070 het 3070 hom 38 16 19 4 A 2 1 369349 CASAVA_Build 8 138928501 1I GAAAAAAGAC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 19 16 5 A 9 10 369350 CASAVA_Build 8 138936808 4D TAATTAGAAC AATT/---- AATATTGTGT 3070 het 3070 hom 31 15 16 1 AATT 1 0 369351 CASAVA_Build 8 138943275 1D GTAAAGTGTG T/- TTAAGATTCT 3070 het 3070 ref 31 18 12 1 T 3 2 369352 CASAVA_Build 8 138946989 6I ATTCAGAATG ------/GCCCCC TATAATGTAT 1800 het 1800 ref 39 19 5 15 GCCCCC 0 1 369353 CASAVA_Build 8 138948924 1D GGAAAATGTC T/- TAAGGGCATG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 2 1 369354 CASAVA_Build 8 138949659 1D AGCCCCTTTG T/- TTTGGCCAAT 2954 het 2954 ref 25 16 8 2 T 4 3 369355 CASAVA_Build 8 138950469 2I TCACTCTCTG --/AC AGCACTAAGT 3070 het 3070 hom 41 19 20 2 AC 0 1 369356 CASAVA_Build 8 138952236 2I TTATAATAGA --/CT CTACTAGGAC 3070 hom 93 het 37 0 32 5 CT 1 2 369357 CASAVA_Build 8 138955479 3I TGGAAATAGG ---/GTT GTTGCAGGTG 3070 hom 135 het 47 0 45 2 GTT 1 2 369358 CASAVA_Build 8 138956997 3I ATGAGTGAGT ---/CAA CAACCCAGCG 3070 hom 108 het 37 0 36 1 CAA 1 2 369359 CASAVA_Build 8 138960938 4D GTCTGTGCTT TGTG/---- TGTGTTACAT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 TG 4 2 369360 CASAVA_Build 8 138976591 3I ACGCACTGCT ---/CTA CTATTTTATA 3070 hom 150 het 56 0 49 7 CTA 1 2 369361 CASAVA_Build 8 138981279 3D GAAGAATGGC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 42 0 33 10 T 14 11 369362 CASAVA_Build 8 138984302 3I GCTTGAGATG ---/AGA AGGAGGACCA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 AGA 0 1 369363 CASAVA_Build 8 138986165 1D AAAGTGATAA C/- CTTTGAGTAG 3070 hom 59 het 30 0 24 8 C 2 1 369364 CASAVA_Build 8 138986326 3I TACTAAAAAT ---/ACA ACAAGTTAGC 3070 hom 60 het 22 0 20 2 ACA 1 2 369365 CASAVA_Build 8 138986482 4D TCTATCTCGG GGAA/---- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 19 1 15 4 GGAA 1 0 369366 CASAVA_Build 8 138996982 2D GGTATGTGAC AT/-- AGACAAAATA 3070 hom 81 het 33 0 28 7 AT 1 0 369367 CASAVA_Build 8 139004421 18D CCCTCAACAT ATTGACTGCTGCCCACAC/------------------ ATTGACTGCT 3070 hom 72 het 31 0 24 9 ATTGACTGCTGCCCACAC 2 1 369368 CASAVA_Build 8 139004704 1I CAATTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 1787 het 378 hom 19 1 12 6 A 15 16 369369 CASAVA_Build 8 139006484 10I ATAATTAATG ----------/AATATGTTTA AATATGAGAA 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AATATGTTTA 0 1 369370 CASAVA_Build 8 139030978 1D CAAATAGACA T/- TTTTTTATGG 3070 hom 99 het 35 0 34 1 T 7 6 369371 CASAVA_Build 8 139074273 1D GCCCGGTGGC T/- TGTGGTTCCC 3070 hom 90 het 37 0 30 8 T 2 1 369372 CASAVA_Build 8 139079586 1D ATAGTCCAAC A/- AATGAGATAA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 3 2 369373 CASAVA_Build 8 139084206 5D TCCATGTTAT TAAGA/----- TATCTATTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TAAGA 1 0 369374 CASAVA_Build 8 139090527 2D TCTACAAACA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 21 10 10 2 T 10 8 369375 CASAVA_Build 8 139091440 1I AGATTTAAGA -/G CTCTCATGGC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 0 1 369376 CASAVA_Build 8 139095424 4D TTTTACACTC TTAT/---- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 TTAT 1 0 369377 CASAVA_Build 8 139099269 2I5M7I AGATGAGGCC --TTGGA-------/TTTTGGATTAAAAG CTGGACTTTT 3070 het 3070 ref 37 24 12 3 N/A 0 0 369378 CASAVA_Build 8 139109407 17D GGCAAAGTCC ATTTTAGAAGCAGCCTA/----------------- ATTCCTGAAA 3070 het 3070 ref 57 33 22 4 ATTTTAGAAGCAGCCTA 1 0 369379 CASAVA_Build 8 139112707 2D ATACATATAC AT/-- ATATATATAC 2381 het 2381 ref 36 21 8 7 AT 5 4 369380 CASAVA_Build 8 139123214 1D CTCTCCTTTG C/- CCCACATTAT 3070 het 3070 ref 53 30 17 6 C 4 3 369381 CASAVA_Build 8 139132696 5D AAGAGAAGAA AGTTT/----- AGAAGAGAAG 3070 het 3070 hom 46 15 27 5 AGTTT 1 0 369382 CASAVA_Build 8 139143310 1I GCTTGATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 9 7 A 11 12 369383 CASAVA_Build 8 139143501 1D TCCTTTCCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 31 2 12 17 A 17 16 369384 CASAVA_Build 8 139143983 2I AATTCACTCT --/CA GTTACGAATG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 CA 0 1 369385 CASAVA_Build 8 139146576 3I GCAGTTTCTT ---/TTC TTCTTCTTTT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 TTC 2 3 369386 CASAVA_Build 8 139148462 1D AAAGAAGAAG A/- AGATATTTGG 3070 het 3070 ref 38 22 15 1 A 2 1 369387 CASAVA_Build 8 139148884 5I TTACCAGGGT -----/GGGTA GGTGGGAGAA 3070 het 3070 ref 47 25 11 11 GGGTA 0 1 369388 CASAVA_Build 8 139152141 1D AACCCTGACC T/- TAAACCTCTC 3070 het 3070 hom 27 12 11 4 T 2 1 369389 CASAVA_Build 8 139154315 1I TAAAATCATG -/T TTTTTTTGCA 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 7 8 369390 CASAVA_Build 8 139157632 2D TTTTAAATTC TT/-- TTTTTTTTTC 3070 hom 102 het 43 0 35 9 T 11 9 369391 CASAVA_Build 8 139170968 1I ATTGTATCAA -/G TACCATGGAT 3070 het 3070 hom 38 17 18 3 G 0 1 369392 CASAVA_Build 8 139171351 1I AGAACCAGCA -/C TTAAAAACAA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 C 0 1 369393 CASAVA_Build 8 139171997 2I AGCTTAACTC --/AT GGGTCAAACA 3070 het 3070 hom 53 23 24 6 AT 0 1 369394 CASAVA_Build 8 139175532 2D GGGGAGAGAC AG/-- GGGTCAGTGG 1442 het 1442 ref 28 18 6 7 AG 1 0 369395 CASAVA_Build 8 139176690 3D GGAAAATAAC AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 12 11 4 A 12 9 369396 CASAVA_Build 8 139177709 1I TTGATTCATG -/A AAAAGATACA 3070 het 3070 ref 50 27 17 6 A 4 5 369397 CASAVA_Build 8 139178835 1D TACAAAAAAA T/- ATCGTAAAAC 3070 het 3070 hom 24 12 11 1 T 1 0 369398 CASAVA_Build 8 139179294 2D CATATTATTG TC/-- TCTGTAAAAT 3070 het 3070 ref 44 26 14 5 TC 2 1 369399 CASAVA_Build 8 139180194 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2931 het 1778 hom 13 4 8 1 A 10 11 369400 CASAVA_Build 8 139186622 1I GAGGTGAATG -/A ATAAATGAAG 3070 het 3070 ref 43 25 13 5 A 1 2 369401 CASAVA_Build 8 139191696 1D CCATTAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 32 6 T 12 11 369402 CASAVA_Build 8 139197574 1D AAACGGCTTT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 30 9 16 5 A 9 8 369403 CASAVA_Build 8 139206364 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 39 15 15 10 TA 7 6 369404 CASAVA_Build 8 139209282 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 32 14 13 5 A 9 8 369405 CASAVA_Build 8 139220611 2I AACGTTAAAC --/TG TGAATTTTAG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 TG 1 2 369406 CASAVA_Build 8 139222075 8D TTCTATGATA CACATATG/-------- CACATATGCA 3070 hom 121 het 45 0 41 15 CACATATG 2 1 369407 CASAVA_Build 8 139225944 1D CAACATATAC A/- TTATTTAAAC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 A 1 0 369408 CASAVA_Build 8 139228706 1D CTGCCTTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 13 14 6 A 12 11 369409 CASAVA_Build 8 139229205 1D TGCATGATGG A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 38 21 15 2 A 9 8 369410 CASAVA_Build 8 139232092 12D ACTCTGTCTC AATAAATAAATA/------------ AATAAATAAA 3070 hom 35 het 12 0 12 4 AATA 9 6 369411 CASAVA_Build 8 139234646 1D TATGCCCTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 69 het 33 0 24 9 A 10 9 369412 CASAVA_Build 8 139235701 1I CACACCAAAA -/C CCCATCTGTA 3070 hom 18 het 8 0 7 1 C 3 4 369413 CASAVA_Build 8 139241201 1D AGAATTTGGC T/- TTTTTTCATT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 7 6 369414 CASAVA_Build 8 139242265 1I TTTAACTTAT -/C CAAAGTATGT 3070 hom 117 het 46 0 40 6 C 1 2 369415 CASAVA_Build 8 139242657 6D TCCCAGAACC ATTGTG/------ ATCTTCATAA 3070 hom 87 het 31 0 29 3 ATTGTG 1 0 369416 CASAVA_Build 8 139243380 1D GCTAGTACAT A/- GGTGATGAAT 3070 het 3070 ref 49 22 20 9 A 1 0 369417 CASAVA_Build 8 139257145 6I ATGAGATTAC ------/TAGTCA TACCCCATTT 3070 het 3070 ref 55 26 19 10 TAGTCA 0 1 369418 CASAVA_Build 8 139260126 1I CTGGAGAGGC -/A AAAAAAGGTG 3070 het 3070 ref 39 21 11 7 A 6 7 369419 CASAVA_Build 8 139263122 1D TCCTTGTTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 10 9 369420 CASAVA_Build 8 139276926 5D ATTGGAGCCA TGGAC/----- TGGACTGAGC 3070 het 3070 ref 48 25 16 10 TGGAC 2 1 369421 CASAVA_Build 8 139280247 1I GGTGAATTTC -/A AAAGAGATTT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 A 3 4 369422 CASAVA_Build 8 139283671 5D AAACAGTCTG TTTTT/----- TTTTTTTTGT 3070 hom 48 het 22 0 17 10 T 13 8 369423 CASAVA_Build 8 139284219 1I TCGGTGAACG -/T TGTCTATGGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 1 2 369424 CASAVA_Build 8 139287551 1I CTACACACAG -/C GCCAGCAGCA 3070 hom 69 het 29 0 22 7 C 0 1 369425 CASAVA_Build 8 139294756 3D AAGTAATAAG TAT/--- TATTGTCATT 3070 het 3070 hom 58 27 30 3 TAT 2 1 369426 CASAVA_Build 8 139295383 3I CAGGATGGCT ---/TTG TTGTGGGGGC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 TTG 1 2 369427 CASAVA_Build 8 139306881 1D CCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 A 10 9 369428 CASAVA_Build 8 139309677 1I TGGGGTAATA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 T 9 10 369429 CASAVA_Build 8 139310243 1I CCCTGATGCC -/T CCCTGGTTCC 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 0 1 369430 CASAVA_Build 8 139310468 2D ACACTCACAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 52 17 23 13 GT 9 8 369431 CASAVA_Build 8 139313673 1D AGGACATAGT G/- GGGGGGAGCC 3070 het 3070 hom 58 26 23 11 G 7 6 369432 CASAVA_Build 8 139316660 1D CAATGTGTCA G/- AAACTAATGA 3070 het 3070 ref 56 27 23 6 G 1 0 369433 CASAVA_Build 8 139324520 1I TGAAAGGGTG -/A AAAAAGGAGG 3070 het 3070 hom 52 22 24 6 A 5 6 369434 CASAVA_Build 8 139337565 17I TAGTTGGCCT -----------------/GACAGCTCAGCCCAGGG GACAGCTCAG 3070 het 3070 ref 37 12 10 15 GACAGCTCAGCCCAGGG 1 2 369435 CASAVA_Build 8 139340229 14D ACACACACAC CACACACACACACA/-------------- CACACACACA 3070 het 1740 hom 37 7 24 11 CA 16 9 369436 CASAVA_Build 8 139343194 3I CACAACTGAA ---/TCT TCTTCATGTC 3070 hom 174 het 64 0 58 6 TCT 1 2 369437 CASAVA_Build 8 139348033 2D TATGTATATG TA/-- TATATATGTA 1614 het 1614 ref 14 6 7 1 TA 4 3 369438 CASAVA_Build 8 139348201 26D ATACATATAT ATACACACACACACACATACACACAC/-------------------------- ATACACACAC 3070 het 644 hom 26 4 13 11 ATACACACACACACACATACACACAC 1 0 369439 CASAVA_Build 8 139359675 1D TAAGCCTTGG C/- CTGACACCCA 3070 hom 93 het 33 0 32 2 C 2 1 369440 CASAVA_Build 8 139362892 2I GCATCAGTTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 31 het 25 0 16 9 A 12 14 369441 CASAVA_Build 8 139364847 1I TGGATACAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 198 hom 33 1 24 8 A 12 13 369442 CASAVA_Build 8 139381692 1I GGGAATAATT -/A AAAAAAAAAA 1956 het 1956 ref 26 12 6 8 A 11 12 369443 CASAVA_Build 8 139383560 3D GAAGGAAGTG TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 48 het 24 0 16 9 TTA 7 6 369444 CASAVA_Build 8 139384009 1I CTTCTCATTT -/C TGAGCAGATG 3070 hom 102 het 39 0 33 6 C 0 1 369445 CASAVA_Build 8 139386939 1I ATACCAATTA -/C TTTGTAACCC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 C 0 1 369446 CASAVA_Build 8 139389602 1D CAGCTATCAT G/- TAAGAAGTCT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 G 1 0 369447 CASAVA_Build 8 139390056 1I AAGAAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 114 het 44 0 37 7 T 10 11 369448 CASAVA_Build 8 139397100 1D TTCAGCCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 45 24 19 2 A 10 9 369449 CASAVA_Build 8 139400512 1D AATCTACAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 12 11 369450 CASAVA_Build 8 139406552 1D CCCTTAGATT A/- AAAAAAAATC 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 9 8 369451 CASAVA_Build 8 139413066 10I AGCAACCTCA ----------/CCTGATGACT CCTGATGACT 3070 het 3070 hom 51 18 21 12 CCTGATGACT 1 2 369452 CASAVA_Build 8 139422960 3D GAATGTACTT ATG/--- AAGACCAAAG 3070 hom 48 het 26 0 17 10 ATG 1 0 369453 CASAVA_Build 8 139426989 1I GTGGTACCCC -/T AACCCATTTG 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 0 1 369454 CASAVA_Build 8 139431070 4D GATAAAATAG ATGA/---- ATGAATGAAT 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ATGA 4 3 369455 CASAVA_Build 8 139434221 1I CCCTAATTCA -/T GGGAAGAGAG 3070 hom 107 het 41 0 36 5 T 0 1 369456 CASAVA_Build 8 139435217 3D CCTGTGCTAG TGT/--- TGTATAGTCA 3070 het 3070 hom 46 19 23 6 TGT 2 1 369457 CASAVA_Build 8 139436896 1D TCACAAGGAC A/- AAAAAATCAT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 A 7 6 369458 CASAVA_Build 8 139437712 4I AGAGAGAAAG ----/AAAA AGAGAGCCAG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 A 1 5 369459 CASAVA_Build 8 139442354 1D CCATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 514 hom 32 3 18 12 T 15 14 369460 CASAVA_Build 8 139454329 1D GCAATGAACT C/- CCCCCATCAC 3070 hom 93 het 36 0 32 6 C 6 5 369461 CASAVA_Build 8 139456678 3D TATGAGCTGA TTG/--- TTTTGTCAAA 3070 het 3070 hom 56 19 33 4 TTG 1 0 369462 CASAVA_Build 8 139462253 2D TGATGAATCT CA/-- GTTATACCCA 3070 het 3070 ref 32 16 14 4 CA 1 0 369463 CASAVA_Build 8 139462412 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 21 15 10 A 9 10 369464 CASAVA_Build 8 139483629 4I GAACACTGCC ----/TTTT TTTTCAACAG 3070 het 3070 ref 58 26 20 12 T 4 8 369465 CASAVA_Build 8 139487480 1D ACTTTTTGAT G/- GGGGTTGTTT 2635 hom 15 het 8 0 6 2 G 5 4 369466 CASAVA_Build 8 139495307 1D GAATAAACCT G/- GGGGGGTGGG 3070 het 3070 hom 29 13 11 5 G 7 6 369467 CASAVA_Build 8 139495395 1D CCTCTAACAT C/- AACCTTATTT 3070 het 3070 hom 34 16 15 3 C 1 0 369468 CASAVA_Build 8 139496081 1D AACTGATTAA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 33 11 18 4 T 7 6 369469 CASAVA_Build 8 139501642 1I AGACTATTAC -/A AACACCTCTA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 2 3 369470 CASAVA_Build 8 139506973 1I ATAGTGGCCA -/T TCCAGAATCC 3070 hom 96 het 36 0 31 5 T 1 2 369471 CASAVA_Build 8 139514847 1D CTCAGGAGGC T/- TGAGGCAAGA 3070 hom 42 het 15 0 13 2 T 2 1 369472 CASAVA_Build 8 139523150 1D GCTTCTCTGC T/- TTTTTTTTTT 1053 het 1053 ref 41 30 3 8 T 11 10 369473 CASAVA_Build 8 139534126 1D GGATCCTCTA G/- TCTAGGGTCT 3070 het 3070 hom 48 21 20 7 G 1 0 369474 CASAVA_Build 8 139536056 1D CAGGTCTTAA T/- TTTAAAAGTT 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 T 4 3 369475 CASAVA_Build 8 139538451 1D TAAAAGGAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 12 11 369476 CASAVA_Build 8 139541363 1D GTACTCTGCT C/- CATCAGCTGT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 C 2 1 369477 CASAVA_Build 8 139542135 1I TCTGGAAGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 32 14 9 9 T 9 10 369478 CASAVA_Build 8 139550480 10D AAAGAGAAAG AGAGACAGAA/---------- AGAGAGAGAA 1997 het 1997 ref 17 8 8 2 AGAGACAGAA 1 0 369479 CASAVA_Build 8 139554036 3D GAGAAAGAGC AGA/--- AGGAGAAAAA 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 AGA 1 0 369480 CASAVA_Build 8 139556525 5D GTTTGAAAGT ATATC/----- CTTAGCTTAT 3070 het 3070 hom 61 31 29 3 ATATC 1 0 369481 CASAVA_Build 8 139569758 1I CCTTGCACCG -/T GGGAGGTCAC 3070 hom 93 het 34 0 30 4 T 0 1 369482 CASAVA_Build 8 139583292 1D CTAAAAATGC A/- AAAAAAAAAT 2758 het 2758 ref 17 9 6 3 A 10 9 369483 CASAVA_Build 8 139587872 1D GTAATAGAGT A/- GGTGCACTGC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 A 1 0 369484 CASAVA_Build 8 139590508 1I AGATGATTCT -/C CCCACTTCAG 3070 het 3070 hom 28 9 12 7 C 3 4 369485 CASAVA_Build 8 139592972 3D AAAATAATTA GGG/--- GGGGGGGTTC 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 G 10 7 369486 CASAVA_Build 8 139597461 1D GGGACTCTGT A/- ACACATGCCT 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 A 2 1 369487 CASAVA_Build 8 139602812 9D CCCAAATTAG GCACCATTA/--------- GCTGTGTCTT 3070 het 3070 ref 43 22 19 5 GCACCATTA 1 0 369488 CASAVA_Build 8 139604643 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 12 9 11 A 12 10 369489 CASAVA_Build 8 139605301 1I ACAAGTACTG -/A AAAAGCTCCA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 A 4 5 369490 CASAVA_Build 8 139607374 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2601 het 2224 hom 23 9 8 6 A 15 16 369491 CASAVA_Build 8 139636241 1D ATGTGGGTGG T/- TTTTTTTTTG 1344 het 1344 ref 47 33 3 11 T 10 9 369492 CASAVA_Build 8 139660199 2D CAGGGCTTCC CT/-- CTCAGGAGAA 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 CT 2 1 369493 CASAVA_Build 8 139661923 1I TGCTGAATTT -/A AAAAAATGGT 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 6 7 369494 CASAVA_Build 8 139664712 2I ATGGAATACT --/AC ACACAGCCAT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 AC 2 3 369495 CASAVA_Build 8 139674159 4D TTATTCCTAA TCGG/---- TCGGACAGGA 3070 hom 78 het 30 0 26 7 TCGG 2 1 369496 CASAVA_Build 8 139679656 4D CCAGCTTTGG AGAA/---- AGAGAGACGC 3070 het 3070 ref 38 17 15 8 AGAA 1 0 369497 CASAVA_Build 8 139698799 1I TAGGTCCTGT -/G GGCCCCTTCC 3070 hom 90 het 35 0 28 7 G 2 3 369498 CASAVA_Build 8 139710451 1D TTCCCAGGAT G/- GGTCTCGATC 3070 hom 51 het 20 0 16 4 G 3 2 369499 CASAVA_Build 8 139713122 1I CATATGCACA -/G GCCTCATACC 3070 het 3070 ref 63 30 24 9 G 1 2 369500 CASAVA_Build 8 139760003 1I TAGAGGGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 34 0 30 4 A 10 11 369501 CASAVA_Build 8 139770591 1I CCCGGGGGGG -/C GGGCTGGCCT 2492 het 1314 hom 20 7 7 6 C 0 1 369502 CASAVA_Build 8 139777880 6I AGAACCTGAG ------/GTTGGC TAGTTCTAAC 3070 het 3070 ref 56 28 23 5 GTTGGC 0 1 369503 CASAVA_Build 8 139781062 1I TCTGTCCATC -/T GGCACACCCC 3070 het 3070 ref 52 27 22 3 T 0 1 369504 CASAVA_Build 8 139784039 1I ATTAAAGTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 15 20 10 A 12 13 369505 CASAVA_Build 8 139795139 3D GAGTCCACCC CCA/--- CCGCCCCGCC 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 CCA 1 0 369506 CASAVA_Build 8 139797758 1D GGAAGGCTCT C/- CCAGGGGCCA 3070 het 3070 hom 43 19 14 10 C 3 2 369507 CASAVA_Build 8 139799547 1I AGAGAAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 18 15 14 A 10 11 369508 CASAVA_Build 8 139802272 1D TGGATTAAAC A/- ACACAAAGTA 3070 hom 123 het 48 0 41 8 A 2 1 369509 CASAVA_Build 8 139804492 1D AAGTTGAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 11 16 8 A 10 9 369510 CASAVA_Build 8 139835691 3I CTCAACAGTT ---/ACA ACAATTGTGG 3070 hom 126 het 43 0 43 0 ACA 1 2 369511 CASAVA_Build 8 139838899 1I ATTACACCAC -/A AAAAGTGAGT 3070 hom 90 het 32 0 31 2 A 4 5 369512 CASAVA_Build 8 139841173 4D ATGACCAATA AAGT/---- AAGATACAAC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAGT 1 0 369513 CASAVA_Build 8 139844034 1D CACACACACA C/- AACAGCCCTA 3070 hom 60 het 40 0 19 21 C 1 0 369514 CASAVA_Build 8 139844188 3I CATCTCACGG ---/TTC TTCATGGGGG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 TTC 1 2 369515 CASAVA_Build 8 139847890 10D GAGACAGATG GAGACAGAGA/---------- GAGACAGAGA 3070 hom 79 het 27 0 25 14 GAGACAGAGA 2 1 369516 CASAVA_Build 8 139872307 6D TTTACTCTTA AGAGTT/------ AATCATTCTC 3070 hom 84 het 33 0 28 5 AGAGTT 1 0 369517 CASAVA_Build 8 139876519 1D AAACTCATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 19 12 7 A 10 9 369518 CASAVA_Build 8 139879405 3D CAGTTTTCTG TTT/--- TTTATTTTCA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 T 6 3 369519 CASAVA_Build 8 139883306 1I ACTTTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 35 1 23 11 A 10 11 369520 CASAVA_Build 8 139886218 2I GTGCGTGTGG --/TA TGTGTGTGTG 3070 hom 101 het 44 0 31 13 TA 0 1 369521 CASAVA_Build 8 139886490 2D GTGTGTGATG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 51 het 47 0 24 23 GT 7 6 369522 CASAVA_Build 8 139886562 2D GTGTGATGGG GT/-- GTGTGTGCAT 3070 hom 123 het 48 0 34 14 GT 4 3 369523 CASAVA_Build 8 139886709 2I GTGTGTGATG --/GT GTGTGTGTGG 3070 hom 168 het 69 0 52 17 GT 4 5 369524 CASAVA_Build 8 139894730 2D GACCCGGTGG GA/-- GATAACTGAA 3070 hom 51 het 19 0 16 5 GA 2 1 369525 CASAVA_Build 8 139901519 1I TGCTTTAGCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 54 20 26 8 A 9 10 369526 CASAVA_Build 8 139903215 1D GTGAGACCAG C/- CAGAAATCCC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 C 2 1 369527 CASAVA_Build 8 139913215 1I ACACTGGAGG -/C AATTAAATAT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 C 0 1 369528 CASAVA_Build 8 139916058 1D CACTGGCTTT A/- TTTCATCTGT 3070 het 3070 ref 55 28 23 4 A 1 0 369529 CASAVA_Build 8 139917263 2I TAATAATAAC --/AG AGTGTAGTAG 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 AG 1 2 369530 CASAVA_Build 8 139926703 1I AGGCCAAGAC -/A GGGGGGGGAT 3070 het 2876 hom 29 11 14 4 A 0 1 369531 CASAVA_Build 8 139941320 1I CAACGGTGGC -/T TGTAGGCTTT 3070 het 2940 hom 38 13 17 8 T 1 2 369532 CASAVA_Build 8 139943981 1I CCTCCCACTG -/T TGTTTATGTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 T 1 2 369533 CASAVA_Build 8 139944185 3D AGATACAAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1508 hom 33 7 11 17 T 17 14 369534 CASAVA_Build 8 139948251 1I ATGGGAGGCA -/G GGGGAATATC 3070 het 3070 hom 32 16 14 2 G 4 5 369535 CASAVA_Build 8 139950160 1I ATTGTCCTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2561 hom 41 11 15 15 T 13 14 369536 CASAVA_Build 8 139975704 2D ATTTAGGAAA CT/-- CTGTTGACAA 3070 hom 117 het 43 0 40 5 CT 2 1 369537 CASAVA_Build 8 139987795 2I ACTCCGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 24 2 A 12 14 369538 CASAVA_Build 8 139988011 1I CTTTCTTGTA -/T TTTTTAATTG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 5 6 369539 CASAVA_Build 8 140001549 1I GGACAGGGTA -/C TTCGTGAGGG 3070 het 3070 ref 31 17 10 4 C 0 1 369540 CASAVA_Build 8 140004974 1D TAGTACGGTT C/- TTTTATTAAT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 C 1 0 369541 CASAVA_Build 8 140005601 5D TAGCAAAAAT ATAAA/----- ATAAGGTTTG 3070 hom 129 het 47 0 44 6 ATAAA 1 0 369542 CASAVA_Build 8 140007422 1I GGTGCTCAGT -/G GGGGGAGCTT 3070 hom 27 het 11 0 10 4 G 5 6 369543 CASAVA_Build 8 140008581 1D GTTAAATTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 863 hom 37 3 30 4 A 12 11 369544 CASAVA_Build 8 140017284 2I ATCATTAATT --/CA CAGTGTTTGT 3070 hom 126 het 47 0 41 6 CA 1 2 369545 CASAVA_Build 8 140019297 1D ACCAACACGG A/- GAAACCCCGC 2922 hom 22 het 10 0 8 2 A 1 0 369546 CASAVA_Build 8 140019551 1I ACAAATCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 331 hom 29 1 25 3 T 10 11 369547 CASAVA_Build 8 140020283 19D GGTGGCTCAG GCTGGGCGCGGTGGCTCAC/------------------- GCCTGTAATC 2504 hom 38 het 14 0 10 4 GCTGGGCGCGGTGGCTCAC 1 0 369548 CASAVA_Build 8 140022603 2D GTGTAGGCAC GT/-- GTGTGTGTGT 1246 het 1246 ref 63 48 3 13 GT 7 6 369549 CASAVA_Build 8 140043353 2I CTCATGTCTC --/TG TAAAATGCAT 3070 hom 105 het 37 0 34 3 TG 0 1 369550 CASAVA_Build 8 140046677 1I GAATAAAACA -/C CCCCCCACAC 3070 hom 123 het 49 0 42 7 C 6 7 369551 CASAVA_Build 8 140047702 2D CGTCTCTACC AA/-- AAAAAAAAAA 2934 hom 24 het 12 0 9 3 A 13 11 369552 CASAVA_Build 8 140053719 1I CTCCTCTCAC -/A ACAGACTCCA 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 1 2 369553 CASAVA_Build 8 140054189 1D AAATTGAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 42 1 34 7 T 11 10 369554 CASAVA_Build 8 140054910 1D TTTTTTGATT G/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 G 1 0 369555 CASAVA_Build 8 140055974 1I AATGAGACTG -/C AGCCCTGGCT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 C 0 1 369556 CASAVA_Build 8 140056410 1D TGTATAATGG A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 132 het 50 0 43 7 A 8 7 369557 CASAVA_Build 8 140059169 1I GGAAAGTTCA -/T TTTTTTCCCA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 6 7 369558 CASAVA_Build 8 140059759 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 10 9 369559 CASAVA_Build 8 140060295 1D TTTCTGTTCC T/- TTTTTTCAGA 3070 hom 124 het 46 0 41 6 T 7 6 369560 CASAVA_Build 8 140070580 13D TATCCCCAAA TATTTTCATTCTG/------------- TAATTCTGGG 3070 hom 81 het 29 0 28 5 TATTTTCATTCTG 1 0 369561 CASAVA_Build 8 140097493 1D ATATCCAATT A/- ACAGGGCTTA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 2 1 369562 CASAVA_Build 8 140130191 1D TTAAGCCGCT A/- ACTGTGTGGT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 A 2 1 369563 CASAVA_Build 8 140138957 4I TGAACACACT ----/CAGA CAGGCTATAG 3070 hom 85 het 32 0 26 6 CAGA 0 1 369564 CASAVA_Build 8 140140579 1I TTGTGGTGTG -/T TTAAGTGTGT 3070 hom 102 het 44 0 35 9 T 2 3 369565 CASAVA_Build 8 140141512 1D CCTCTTGCCC T/- TGTCTCTCCT 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 2 1 369566 CASAVA_Build 8 140143619 1D GAATTGACAT C/- AGGGTCTTAA 3070 hom 72 het 27 0 25 3 C 1 0 369567 CASAVA_Build 8 140147118 1I AAATGTAAAA -/G GGGGAATGAC 3070 het 56 hom 49 1 42 6 G 4 5 369568 CASAVA_Build 8 140164044 1I TTTGTGTGTA -/T TTTTTTTACC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 T 7 8 369569 CASAVA_Build 8 140164350 9I CTGAGCTTCA ---------/GTTCTTGAT GTCCTTGATG 3070 hom 118 het 43 0 39 4 GTTCTTGAT 0 1 369570 CASAVA_Build 8 140221495 1D GGACTTAAAC A/- AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 47 18 25 5 A 5 4 369571 CASAVA_Build 8 140230780 1I CATGGCTGGC -/T TTTTTTTTTT 2183 het 2183 ref 39 10 11 18 T 16 17 369572 CASAVA_Build 8 140334051 2I CACTCCTGAC --/AG GGAATGTGCT 3070 hom 111 het 48 0 33 15 AG 0 1 369573 CASAVA_Build 8 140338192 1I CTCAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 10 11 369574 CASAVA_Build 8 140363141 2I TAGAAAACAG --/AC ATTTGGTAAC 3070 hom 144 het 54 0 47 7 AC 0 1 369575 CASAVA_Build 8 140365049 7D GGATAGAGGT TGTCTTC/------- TGTAAAATCT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 TGTCTTC 1 0 369576 CASAVA_Build 8 140368255 1D GTCTTCCCCC T/- TCACCTTGTT 3070 het 3070 hom 36 15 14 8 T 2 1 369577 CASAVA_Build 8 140369694 1I TGAGCCTTCT -/G TGAGCTGAAC 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 0 1 369578 CASAVA_Build 8 140373829 3D AGTGAAAGGC CTT/--- CTTCCTTCAT 3070 hom 90 het 32 0 30 4 CTT 2 1 369579 CASAVA_Build 8 140378220 31D ATGGAATGCC AGAGAGTATCACCAAACCACCAGAAGCTAGA/------------------------------- AGAGAGTATC 3070 hom 59 het 37 0 25 19 AGAGAGTATCACCAAACCACCAGAAGCTAGA 1 0 369580 CASAVA_Build 8 140378705 2D CGCCACCAGG GA/-- GAGAGGGGAG 3070 hom 105 het 41 0 33 8 GA 3 2 369581 CASAVA_Build 8 140384254 1D AAAACGCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1952 hom 18 7 8 3 T 12 11 369582 CASAVA_Build 8 140404570 1D GGTTCCCCCA T/- TTTTTTTTTT 1347 het 856 hom 35 8 6 21 T 19 18 369583 CASAVA_Build 8 140412410 1I GCCCAAGGTC -/A AAGGGGCCAC 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 A 2 3 369584 CASAVA_Build 8 140426059 1I ACCCTGCTAA -/T TTTTTTTTTT 984 het 984 ref 12 9 3 0 T 11 12 369585 CASAVA_Build 8 140428811 1I TCTCCACAGG -/C CCCTGCCAGT 3070 het 3070 ref 42 25 11 6 C 3 4 369586 CASAVA_Build 8 140433083 1I AGAGAAGGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 261 hom 34 1 19 14 T 13 14 369587 CASAVA_Build 8 140433701 1I CTAAGGAAAT -/A AAAAAATACC 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 A 6 7 369588 CASAVA_Build 8 140434974 3D GGCAGTTAAC TTA/--- TTATCAGAAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 TTA 2 1 369589 CASAVA_Build 8 140438712 1I CTGGCTCCTG -/A AGGTAAGAGG 3070 hom 96 het 37 0 31 6 A 1 2 369590 CASAVA_Build 8 140441675 1I TCATTAGGAG -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 T 8 9 369591 CASAVA_Build 8 140443253 1I TGTGTGCTAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 A 9 10 369592 CASAVA_Build 8 140448968 1I CAGTTCACGG -/C CCCCCCAGAG 2662 het 2662 ref 22 9 8 5 C 6 7 369593 CASAVA_Build 8 140456169 1I ATATCTGGGC -/A AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 47 24 13 10 A 8 9 369594 CASAVA_Build 8 140461411 1D TAGAGGCAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 T 13 12 369595 CASAVA_Build 8 140465632 1I GCTAGGGAAA -/C CAGATTTGGA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 C 1 2 369596 CASAVA_Build 8 140470149 1I TGGGGGTGTG -/C CCCACCCGCC 3070 hom 53 het 23 0 15 8 C 3 4 369597 CASAVA_Build 8 140471431 4D AAGATAGAAA TACT/---- TACTTAGAGA 3070 hom 66 het 26 0 23 5 TACT 2 1 369598 CASAVA_Build 8 140478741 1I GACACTGTTT -/A AAAAAGAGAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 A 5 6 369599 CASAVA_Build 8 140490474 2I TGGCTGTATG --/AT ATTCTATTTT 3070 het 3070 ref 33 19 12 2 AT 1 2 369600 CASAVA_Build 8 140491430 1I TGTTTAAGAC -/T TTTTTTCTTA 2907 het 2907 ref 20 9 7 4 T 6 7 369601 CASAVA_Build 8 140491870 1I AAAGAATCTA -/T TTTTTGCATG 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 T 5 6 369602 CASAVA_Build 8 140492318 1D ATGGGTAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 T 11 10 369603 CASAVA_Build 8 140492906 1D GTTCTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 155 hom 18 3 12 3 T 12 11 369604 CASAVA_Build 8 140493718 8I CTCTATTGTT --------/ACAATAGA AGAGATTATT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ACAATAGA 0 1 369605 CASAVA_Build 8 140497534 2I GCTGTAAAGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 16 10 A 12 14 369606 CASAVA_Build 8 140498542 1I AAAAAAACAC -/A AAAAAAACAG 3070 het 2363 hom 18 6 9 3 A 7 8 369607 CASAVA_Build 8 140500002 1D AAGAGGTCCC A/- ACAGCTTCTG 3070 hom 85 het 33 0 29 4 A 2 1 369608 CASAVA_Build 8 140500396 1D GAGGCAAAGG A/- AAAACTTCCC 3070 het 3070 ref 50 25 21 4 A 5 4 369609 CASAVA_Build 8 140502120 1I AAGGAGAATC -/T TTTTTAAAAT 3070 hom 89 het 37 0 28 9 T 5 6 369610 CASAVA_Build 8 140521473 1I TTGCATCTCC -/T TGTTTTCTTC 3070 het 3070 ref 53 24 18 11 T 1 2 369611 CASAVA_Build 8 140530578 1I TACGATAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 47 1 37 9 T 10 11 369612 CASAVA_Build 8 140535960 1I TTTAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 10 11 369613 CASAVA_Build 8 140538201 1D GAGGATGACT C/- CTTTCCCCAT 3070 hom 102 het 42 0 35 8 C 2 1 369614 CASAVA_Build 8 140544845 1I AGATAAAGTC -/A AAAAAAACAG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 A 7 8 369615 CASAVA_Build 8 140552681 1D TCTACATATC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 55 23 27 5 A 8 7 369616 CASAVA_Build 8 140552830 2I TTAATATATC --/TG TGTCCAACAG 3070 het 3070 hom 41 15 23 3 TG 1 2 369617 CASAVA_Build 8 140558961 1I TTGTGCCTTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 52 14 26 12 T 9 10 369618 CASAVA_Build 8 140561648 1D GCATAATAAC A/- AAAAAACTGA 3070 het 3070 hom 42 16 22 4 A 7 6 369619 CASAVA_Build 8 140573523 2I CTGCGAGTGA --/TT TTTTTCCCAG 3070 het 3070 hom 43 12 19 12 T 5 7 369620 CASAVA_Build 8 140574335 1D TTTCAGCCCC T/- GCTCTTTCGC 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 0 369621 CASAVA_Build 8 140574666 1I CGTCAAGCCA -/C CCTGCATACA 3070 het 3070 hom 42 15 24 3 C 2 3 369622 CASAVA_Build 8 140576098 2I AAACAAAAAC --/TT TTAATTCACT 3070 het 3070 hom 38 17 16 5 T 2 4 369623 CASAVA_Build 8 140578989 1I AAGCGGCCTC -/T TTTTTTCTGC 3070 het 3070 ref 46 22 21 3 T 6 7 369624 CASAVA_Build 8 140580912 2I TGTGAATCTC --/AA AGTGACGGAG 3070 hom 135 het 51 0 46 5 A 1 3 369625 CASAVA_Build 8 140586924 16D ACTGGGGTGG GTTACTTCCTGGATGT/---------------- GTTACTTCCT 3070 het 3070 ref 54 28 18 14 GTTACTTCCTGGATGT 2 1 369626 CASAVA_Build 8 140589414 1I GAAGCTGAGC -/T TGAGAGAACT 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 T 1 2 369627 CASAVA_Build 8 140597029 2I AATCGGATCC --/AT AGAGTCCGGG 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 AT 0 1 369628 CASAVA_Build 8 140598141 1I TATCTCTACT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 A 6 7 369629 CASAVA_Build 8 140602730 3D GACTAGAATT TTA/--- TTATTGCTCA 3070 het 3070 ref 28 12 14 2 TTA 2 1 369630 CASAVA_Build 8 140603675 1D TCAGATTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 19 7 T 15 14 369631 CASAVA_Build 8 140603826 1D CTGTTCAGAA T/- TTTTCTAGTC 3070 het 3070 ref 44 23 15 6 T 5 4 369632 CASAVA_Build 8 140603922 3D TAGTTGTTCA TAG/--- TAGTATCTAA 3070 het 3070 ref 50 22 19 11 TAG 2 1 369633 CASAVA_Build 8 140605023 1I GTTTTCTGGT -/G GGTTTTATGT 3070 het 3070 hom 44 18 23 3 G 2 3 369634 CASAVA_Build 8 140607868 1I TCAACTTCAA -/T TTGTTCCCCT 3070 het 3070 ref 55 28 20 7 T 2 3 369635 CASAVA_Build 8 140609625 3I ATACAGATGT ---/CTG CTAACTTCTG 3070 het 3070 hom 80 32 41 7 CTG 0 1 369636 CASAVA_Build 8 140611720 1I GGTGATGTCC -/T TAATAGATGC 3070 het 3070 hom 57 24 28 5 T 1 2 369637 CASAVA_Build 8 140614006 4D CCCTCAAGGA GCAG/---- GCAAGTTACT 3070 het 3070 ref 62 29 24 9 GCAG 1 0 369638 CASAVA_Build 8 140615119 1I CAGAGACTGC -/T TTCTATACCC 3070 het 3070 hom 47 14 24 9 T 2 3 369639 CASAVA_Build 8 140616555 4D AGAACCCCTA AAGT/---- GAGTAGGGGA 3070 het 3070 ref 50 25 21 6 AAGT 1 0 369640 CASAVA_Build 8 140622233 1I GAACTGGTGA -/C CCACAGTTCA 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 C 2 3 369641 CASAVA_Build 8 140622457 3I AATCTTGAGA ---/GTC GTCTAGTCAA 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 GTC 1 2 369642 CASAVA_Build 8 140623068 4D GAGATGTAAA GGGG/---- GGGGGGGTGA 3070 het 2884 hom 26 10 12 5 G 11 7 369643 CASAVA_Build 8 140626534 1I CCAAAGAAAC -/A TGACCATTTT 3070 hom 163 het 63 0 55 8 A 0 1 369644 CASAVA_Build 8 140628201 3I GGAGCAGGGC ---/TTG TTGTTGTCTT 3070 hom 78 het 30 0 26 4 TTG 2 3 369645 CASAVA_Build 8 140631749 1D TTTTTTAAGC T/- TGAAGGCATT 2054 hom 5 het 21 0 14 7 T 2 1 369646 CASAVA_Build 8 140633296 2D TCTCCCCCCC CA/-- CCACCACACA 3070 hom 19 het 41 1 16 25 CA 1 0 369647 CASAVA_Build 8 140637948 4D CTATGAAAAC TGTT/---- TGTCTTGCAA 3070 het 3070 ref 56 28 24 5 TGTT 1 0 369648 CASAVA_Build 8 140640024 2I TCCTAGAAAA --/CT CTTCCAAGAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 CT 1 2 369649 CASAVA_Build 8 140641435 1I TAACTAGAAC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 6 7 369650 CASAVA_Build 8 140647879 3I6M2D CTTATTAACA ---AATTTTAA/GGGCTTGTT-- TCTGGAGATT 3070 hom 120 het 42 0 41 6 N/A 0 0 369651 CASAVA_Build 8 140648878 11D CTCCTCGCAA AGGCTGAGCAG/----------- ATGCCGGCTC 3070 het 3070 ref 33 18 15 4 AGGCTGAGCAG 1 0 369652 CASAVA_Build 8 140653449 1I ATTATTTCTG -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 46 17 24 5 A 8 9 369653 CASAVA_Build 8 140653989 1I CAGTCCATCC -/T TGTACCACCC 3070 hom 84 het 36 0 27 9 T 1 2 369654 CASAVA_Build 8 140663822 2D GAAATACATA GT/-- GACTTTGTTT 3070 het 3070 hom 47 19 25 3 GT 1 0 369655 CASAVA_Build 8 140664885 6D TGAACACCTG CTGCCC/------ CGTGAGCCCT 3070 het 3070 hom 37 13 19 7 CTGCCC 1 0 369656 CASAVA_Build 8 140669303 2D CACATACATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 17 17 9 CA 9 8 369657 CASAVA_Build 8 140693981 1I AATGAGTAGA -/G GCATTCGCCC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 G 1 2 369658 CASAVA_Build 8 140698333 1I GCCTGAACTA -/C CCCCACCACC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 4 5 369659 CASAVA_Build 8 140723056 3D CTCTGGCCTG CCC/--- CCCCCCCGCA 3070 het 65 hom 26 2 16 8 C 10 7 369660 CASAVA_Build 8 140729186 1I GAGTTCTGAG -/C CCCTAAGGGA 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 C 3 4 369661 CASAVA_Build 8 140748561 1D GGCCCAAGGC A/- CACACCATCT 3070 hom 82 het 34 0 26 8 A 1 0 369662 CASAVA_Build 8 140749309 1D CCGTCTTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 17 8 A 15 14 369663 CASAVA_Build 8 140750543 1I CTCTACTGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1561 hom 49 5 36 8 A 11 12 369664 CASAVA_Build 8 140766532 4D CTTTATACAC AAAA/---- AAAGAAATAA 3070 hom 81 het 31 0 27 5 A 7 3 369665 CASAVA_Build 8 140770008 12D CAACACGTGG GGATTACAACTT/------------ GAGATGAAAT 3070 het 3070 ref 46 28 19 5 GGATTACAACTT 1 0 369666 CASAVA_Build 8 140774371 22D CAATACCACC CAGCTCACCCTGCCCACCTGAG/---------------------- CAGCTCACCC 3070 hom 98 het 41 0 30 14 CAGCTCACCCTGCCCACCTGAG 1 0 369667 CASAVA_Build 8 140778611 8D ACAGATGGAT GGTGGATG/-------- GGTGGATGAG 3070 hom 143 het 50 0 39 18 GGTGGATG 2 1 369668 CASAVA_Build 8 140829870 1D GAGGTGTGCA G/- GGATCAGAGA 3070 het 274 hom 22 1 12 9 G 3 2 369669 CASAVA_Build 8 140909529 2I CTTGGAGGGG --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 59 24 15 20 AC 7 8 369670 CASAVA_Build 8 140918404 18I GGAGGACTTG ------------------/TCTTGAACCCAGAACCCA GGGCCTAGCG 3070 het 3070 ref 50 25 20 5 TCTTGAACCCAGAACCCA 0 1 369671 CASAVA_Build 8 140938498 20I CAGACAGAGG --------------------/GGGGTGCCTGCCCTGCATTT TGAAAGAGCA 3070 het 3070 ref 31 15 11 5 GGGGTGCCTGCCCTGCATTT 0 1 369672 CASAVA_Build 8 140940638 2D CCACGTGCCC CT/-- GTGTGGCCGT 2640 het 2640 ref 19 8 8 4 CT 1 0 369673 CASAVA_Build 8 140943341 1I TCACCTCCCT -/G GGAAAGGGGA 3070 het 3070 ref 42 18 18 6 G 2 3 369674 CASAVA_Build 8 140947444 1D GTGGGGACAT G/- GGGGGCCTTC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 G 6 5 369675 CASAVA_Build 8 140950710 1D AGGCAGGGGT G/- GGTAGTTATA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 G 3 2 369676 CASAVA_Build 8 140959924 1D ATTTGAACCT G/- GGGGCTGTTC 3070 hom 72 het 27 0 25 2 G 5 4 369677 CASAVA_Build 8 140992211 1D CCTCCCACAG C/- CCCCCCTCAG 3070 hom 62 het 24 0 17 7 C 7 6 369678 CASAVA_Build 8 140993154 1I AAAGTAGGCC -/T TTTTTTTTTT 1507 het 1507 ref 27 14 8 5 T 10 11 369679 CASAVA_Build 8 140993850 1I TTCCAAGTTT -/A AAAAAAAATG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 8 9 369680 CASAVA_Build 8 140996576 6D GCTCCTGGAG GGTGGC/------ GGTGGCGGTG 3053 hom 44 het 20 0 12 9 GGTGGC 2 1 369681 CASAVA_Build 8 141003611 1D TGGTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 12 11 12 T 13 12 369682 CASAVA_Build 8 141004519 32D ACACAGTATT AGGGTCCTGGGATGCCATCCGTTCCGGAGGTG/-------------------------------- AATGAAAATC 3070 het 3070 ref 47 31 19 3 AGGGTCCTGGGATGCCATCCGTTCCGGAGGTG 1 0 369683 CASAVA_Build 8 141007254 4D CACGCACACG CACA/---- CACACACACA 2192 hom 39 het 23 0 13 14 CA 9 7 369684 CASAVA_Build 8 141008681 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 19 15 7 T 11 10 369685 CASAVA_Build 8 141010947 1D GGATCATGAG A/- AAAAAAAAAA 2120 het 2120 ref 24 11 6 7 A 12 11 369686 CASAVA_Build 8 141019446 15D TTTGAAAACA GAGTTCTCCTTGTGG/--------------- GAGATCAACT 3070 het 3070 hom 27 14 16 3 GAGTTCTCCTTGTGG 1 0 369687 CASAVA_Build 8 141023852 1D TTTTATTTTT A/- AAAAAAATCA 3070 hom 87 het 35 0 29 6 A 8 7 369688 CASAVA_Build 8 141044014 2D TTAAGAAAAC AT/-- AAAGAGATGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 1 0 369689 CASAVA_Build 8 141044418 1D GGGGGTCTCT G/- GGGGGACACA 3070 hom 91 het 35 0 27 8 G 6 5 369690 CASAVA_Build 8 141047536 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 27 1 25 1 A 11 10 369691 CASAVA_Build 8 141052842 1D GCCTGCTCTC A/- CACTGACCGT 3060 het 3060 ref 26 14 9 3 A 1 0 369692 CASAVA_Build 8 141059441 1I CCTGCAGGTA -/C CCCCCCAGTG 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 C 6 7 369693 CASAVA_Build 8 141060199 1D CAGACAGGGT G/- GGGCGTGGGA 3070 hom 42 het 18 0 13 6 G 4 3 369694 CASAVA_Build 8 141094928 1I CAATAAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 10 11 369695 CASAVA_Build 8 141098161 3I ACGTGCCTTG ---/TTC TTATTCTTAG 3070 hom 96 het 39 0 33 6 TTC 0 1 369696 CASAVA_Build 8 141104845 1D AGCAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 354 hom 38 1 25 12 A 15 14 369697 CASAVA_Build 8 141108921 2I AAAATTAAAA --/AT ATATATATAT 2337 hom 15 het 7 0 6 1 AT 7 8 369698 CASAVA_Build 8 141111686 1D AACTTTTCCT C/- CCCCCCCACC 3070 het 3070 hom 38 12 18 9 C 8 7 369699 CASAVA_Build 8 141116997 2D ACACATACAC CA/-- CACACCCAAT 3070 hom 110 het 45 0 26 21 CA 3 2 369700 CASAVA_Build 8 141126998 1D TGGGTGCCAG C/- CCCCGAGTTC 3070 hom 58 het 23 0 16 7 C 5 4 369701 CASAVA_Build 8 141135691 1D TCCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAC 1094 het 1094 ref 41 33 3 5 A 10 9 369702 CASAVA_Build 8 141140565 23D ACTGCCATTC CCAAGGCTGCCCGGCAGCCTGTT/----------------------- GTGTCCTCTC 3070 hom 78 het 28 0 27 5 CCAAGGCTGCCCGGCAGCCTGTT 1 0 369703 CASAVA_Build 8 141142256 18D ATGCCTGGGG AAGCCTCAGGAAACTTAC/------------------ AATCGTGGCA 3070 hom 92 het 31 0 28 5 AAGCCTCAGGAAACTTAC 1 0 369704 CASAVA_Build 8 141145540 3D GAAATCCACC ACT/--- GATGAACAGG 3070 hom 120 het 43 0 39 6 ACT 1 0 369705 CASAVA_Build 8 141147302 1I TCCATTTTTT -/G GTTGCCCGTA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 G 1 2 369706 CASAVA_Build 8 141148831 4I TTAGACAACT ----/TTGA TTGTGGCCTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 TTGA 0 1 369707 CASAVA_Build 8 141156958 1D GAGGACCCTT C/- CCCACTGTGG 3070 hom 99 het 39 0 31 8 C 4 3 369708 CASAVA_Build 8 141161529 1I CCAGCAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 440 hom 27 1 21 5 T 11 12 369709 CASAVA_Build 8 141162474 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2479 hom 23 8 13 4 A 11 10 369710 CASAVA_Build 8 141185630 1I ACTGAAGATC -/A AAAAAGAATT 3070 het 3070 ref 37 21 15 1 A 5 6 369711 CASAVA_Build 8 141194913 1I TATGGTTGCC -/T TGAATCTAAG 3070 het 3070 hom 28 9 11 8 T 1 2 369712 CASAVA_Build 8 141203848 1D ATCTTTGGGC G/- GGGGGGCATT 3070 het 3070 hom 34 17 13 6 G 7 6 369713 CASAVA_Build 8 141213820 14I GCTGGGATTA --------------/CAGGTGTGAGCCAC CATGGTTGGC 3070 hom 38 het 16 0 13 3 CAGGTGTGAGCCAC 0 1 369714 CASAVA_Build 8 141222171 1D GAAAAATGCC T/- CGCACCTGGT 3070 hom 132 het 50 0 45 5 T 1 0 369715 CASAVA_Build 8 141222658 5D TTATAGTCTA CATAC/----- CAGTCCTCTG 3070 het 3070 ref 36 21 12 7 CATAC 1 0 369716 CASAVA_Build 8 141225138 3D ATTTTTTATT TTC/--- TTCCTTCACA 3070 hom 87 het 33 0 29 5 TTC 2 1 369717 CASAVA_Build 8 141229121 2I CGAGTGCGAG --/CC CAGTGGAGCC 3070 hom 138 het 51 0 45 6 C 1 3 369718 CASAVA_Build 8 141230102 2I GGCTCGGCCA --/CC CCCCTCTGTC 3070 hom 115 het 46 0 37 9 C 4 6 369719 CASAVA_Build 8 141240696 1I ACATCTCCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 572 hom 37 2 31 4 T 11 12 369720 CASAVA_Build 8 141246427 1D CATAGCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 42 0 29 14 A 14 13 369721 CASAVA_Build 8 141247656 1D TTTTTAACCC A/- AAAAGGAAAC 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 5 4 369722 CASAVA_Build 8 141259275 3D TATATCTTGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2100 het 670 hom 34 9 8 18 T 21 18 369723 CASAVA_Build 8 141262309 1D ATTATTGGGG A/- AAAAAAAAAA 1137 het 1137 ref 43 34 3 7 A 12 11 369724 CASAVA_Build 8 141268263 1D TTTCTAACCC A/- GGGGATGGCT 2091 het 2091 ref 40 17 8 15 A 1 0 369725 CASAVA_Build 8 141269749 3I AAAAGAGCAG ---/CAA CAACAACAAC 3070 het 3070 ref 42 16 12 14 CAA 5 6 369726 CASAVA_Build 8 141276259 2I AATGTCATTT --/TA TATCTTTTAT 3070 het 3070 ref 47 24 19 4 TA 1 2 369727 CASAVA_Build 8 141283155 1I TATTAAGCTC -/T CAAAGACTAA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 T 0 1 369728 CASAVA_Build 8 141292367 1I AAAAAAAAAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 41 hom 18 1 15 2 T 7 8 369729 CASAVA_Build 8 141296889 2D TACAGACACA TG/-- TAAACACCTG 3070 hom 45 het 20 0 14 9 TG 1 0 369730 CASAVA_Build 8 141297299 2D CTCTGTCTCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 40 het 24 0 17 7 A 14 12 369731 CASAVA_Build 8 141298252 1D AAATTAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 25 0 23 3 A 11 10 369732 CASAVA_Build 8 141305873 1D ACTCGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2330 het 7 hom 15 1 6 8 A 15 14 369733 CASAVA_Build 8 141306130 1I AGCACTTTGC -/A AAAAAAAAAA 1034 het 1034 ref 37 24 3 10 A 11 12 369734 CASAVA_Build 8 141310068 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 70 het 26 0 21 5 A 9 8 369735 CASAVA_Build 8 141311711 4D TTTGTCCTTT TCTC/---- TCTCTATTAC 3070 hom 117 het 42 0 40 2 TC 4 2 369736 CASAVA_Build 8 141312491 1D TCTTAAGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 30 2 18 10 T 13 12 369737 CASAVA_Build 8 141319541 1D CATTTTTCTA G/- GGGGGGACAG 3070 hom 102 het 45 0 31 14 G 7 6 369738 CASAVA_Build 8 141332392 2D GCAATCACCC CT/-- GTTTATGAAG 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 CT 1 0 369739 CASAVA_Build 8 141341510 1D TTTTTCCTCA T/- TTTTTTTTAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 9 8 369740 CASAVA_Build 8 141368966 1D TTTTAAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 41 1 32 8 A 11 10 369741 CASAVA_Build 8 141369834 3D GAGAAAGCTC GTG/--- GTGGTGGTGG 3070 hom 105 het 41 0 36 6 GTG 5 4 369742 CASAVA_Build 8 141374047 1D CGCCACCATG C/- CCGGCTAAAT 3070 hom 60 het 22 0 20 2 C 3 2 369743 CASAVA_Build 8 141376453 3D GCCTGTTCAT CCA/--- CCACGTCTAC 3070 hom 123 het 45 0 38 9 CCA 2 1 369744 CASAVA_Build 8 141377937 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 52 0 43 9 A 10 11 369745 CASAVA_Build 8 141392589 1I ATACACACTC -/T TCGGTAAATG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 T 1 2 369746 CASAVA_Build 8 141403178 1D AAAAAATATA T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 9 8 369747 CASAVA_Build 8 141416192 4I AGGATATGGG ----/GTAA GTAAGACAAT 3070 hom 123 het 47 0 42 5 GTAA 1 2 369748 CASAVA_Build 8 141419269 3D AATTACAGGC GTG/--- GTGCACCACC 3070 hom 78 het 27 0 26 1 GTG 2 1 369749 CASAVA_Build 8 141439920 2D GCTAAATTAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 A 11 9 369750 CASAVA_Build 8 141449410 1D CTCAAAAATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 11 10 369751 CASAVA_Build 8 141450912 1I CAGGGTTTAC -/A AAAAGTTTTC 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 A 4 5 369752 CASAVA_Build 8 141473953 1I TCAGCCTGCG -/T TTGGGGCCTC 3070 het 3070 hom 50 22 21 7 T 2 3 369753 CASAVA_Build 8 141476251 4I CAACGCCCTC ----/CTCA CTAAGTATCT 3070 het 3070 ref 47 25 16 6 CTCA 0 1 369754 CASAVA_Build 8 141476668 4I CTTCTCCAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 AAAC 2 3 369755 CASAVA_Build 8 141482713 1I CTGTCTCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 16 0 15 1 A 13 14 369756 CASAVA_Build 8 141508368 1I TCTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2216 het 2216 ref 32 11 10 11 T 13 14 369757 CASAVA_Build 8 141508736 4D GTTCCTCAAC CTGT/---- CTATGCCTCA 3070 het 3070 ref 33 20 10 4 CTGT 1 0 369758 CASAVA_Build 8 141514532 21D CTGGGCATTA AGAAAACAAAAAACAAAAACC/--------------------- AGAAAACAAA 3070 het 3070 ref 38 19 8 15 AGAAAACAAAAAACAAAAACC 2 1 369759 CASAVA_Build 8 141519143 1D AGATAGATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 33 13 17 4 T 10 9 369760 CASAVA_Build 8 141532796 25I3M5I GGGGCTATCC -------------------------TGG-----/CATTCTGCATATGCAGAGCCCACAATGGACTAT ACATCACAAC 3070 hom 83 het 31 0 23 11 N/A 0 0 369761 CASAVA_Build 8 141548560 1D TGTTTATATT A/- TATATAATTG 2475 het 1334 hom 10 3 6 1 A 1 0 369762 CASAVA_Build 8 141550452 1D GCTCTCAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1401 hom 25 4 11 10 T 14 13 369763 CASAVA_Build 8 141581663 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1831 het 1831 ref 18 6 7 5 A 11 12 369764 CASAVA_Build 8 141583575 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 27 het 10 0 9 1 T 10 9 369765 CASAVA_Build 8 141584563 43D AAGCTCGGGC ATGGAAACCCAGACAAAACGCCGAAGTTCCCTCCTTCTCCAAG/------------------------------------------- AAGGAAGATT 3070 het 3070 ref 28 24 13 3 ATGGAAACCCAGACAAAACGCCGAAGTTCCCTCCTTCTCCAAG 1 0 369766 CASAVA_Build 8 141585945 2D GCCCTAAAGC AA/-- AAAATTTTTT 3070 het 2781 hom 25 7 15 4 A 6 4 369767 CASAVA_Build 8 141594908 1D ATATATGTAT A/- TTTTGGAATC 3070 hom 78 het 29 0 27 3 A 1 0 369768 CASAVA_Build 8 141595429 1D TTTCATTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 170 hom 25 2 18 5 T 17 16 369769 CASAVA_Build 8 141597576 3I GTTATTTGCC ---/TGA TGATAGGAGA 3070 hom 69 het 26 0 21 5 TGA 1 2 369770 CASAVA_Build 8 141599982 1I GTGTTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 724 hom 27 3 17 7 A 11 12 369771 CASAVA_Build 8 141618529 1D GCAGGTTCTC T/- TGTGAGTGTG 3028 het 2764 hom 25 10 9 7 T 2 1 369772 CASAVA_Build 8 141620873 10D TACATAGTTT AAACAAAACA/---------- AAACAAAACA 3070 het 2769 hom 26 6 14 8 AAACA 6 4 369773 CASAVA_Build 8 141623857 6D GGCTGGGGCT CAGGCC/------ CAGGCCCAGG 3070 hom 86 het 36 0 22 14 CAGGCC 2 1 369774 CASAVA_Build 8 141632007 4D ACACGCACAT GCAC/---- GCGCGCGCGC 509 het 509 ref 33 12 6 16 GCAC 1 0 369775 CASAVA_Build 8 141632022 14D CGCGCGCGCG CACACACACACACA/-------------- CACACACACA 3070 hom 36 het 31 1 21 15 CA 16 9 369776 CASAVA_Build 8 141633658 1I GGGACACAGA -/C CCCCCCCACG 1590 het 1590 ref 28 14 5 9 C 7 8 369777 CASAVA_Build 8 141647569 1I TGTCTGGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 579 hom 26 3 15 8 A 13 14 369778 CASAVA_Build 8 141649673 1I TGCTTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 17 hom 27 1 21 5 T 10 11 369779 CASAVA_Build 8 141660801 1I TCCTGTCTCT -/A AAAAAAAAAA 676 het 676 ref 46 34 2 10 A 11 12 369780 CASAVA_Build 8 141667702 2I TGTAATAGCA --/TT GTGTGTAAAT 3070 hom 69 het 30 0 24 6 T 0 2 369781 CASAVA_Build 8 141684108 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 17 4 A 12 11 369782 CASAVA_Build 8 141695794 3I ACAATTGCTC ---/ATA ATAACTAAAT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 ATA 1 2 369783 CASAVA_Build 8 141696308 1I GATGCTGGAT -/G CGGAGATGCA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 0 1 369784 CASAVA_Build 8 141705399 1D TTCATGGCCC G/- GGGGGGCACA 3070 hom 66 het 27 0 21 6 G 7 6 369785 CASAVA_Build 8 141708214 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 34 het 15 0 11 4 A 10 9 369786 CASAVA_Build 8 141719286 1I CAAGTTGCCA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 9 10 369787 CASAVA_Build 8 141736407 1D TCTAAAAACC A/- AAATTTTCTT 3070 hom 105 het 39 0 34 5 A 4 3 369788 CASAVA_Build 8 141739001 1D TTTTCAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 95 het 40 0 31 10 T 11 10 369789 CASAVA_Build 8 141746746 4D TCTCTCTCTC TCTT/---- TTTTTTTTTT 2695 hom 33 het 17 0 12 5 TCTT 1 0 369790 CASAVA_Build 8 141755681 14D ATTAATTAAT TAATTAATTAATTA/-------------- ATATATATAT 2932 hom 18 het 9 0 7 3 TAATTAATTAATTA 1 0 369791 CASAVA_Build 8 141782883 3D CAACAAGAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 75 het 28 0 25 4 AAC 4 3 369792 CASAVA_Build 8 141786833 1I ATTACAGGCA -/C GCGGCACCTC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 C 0 1 369793 CASAVA_Build 8 141795065 1D AATATCTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 10 9 369794 CASAVA_Build 8 141809447 2I AGGTGATACT --/TA TGAGACTGGT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TA 0 1 369795 CASAVA_Build 8 141818235 1I AAAGAGATAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 9 10 369796 CASAVA_Build 8 141823344 6I AGCTATGAGC ------/GCGGTG CACCGCGCCC 1895 hom 12 het 15 0 6 9 GCGGTG 0 1 369797 CASAVA_Build 8 141824367 3D AAATAATAAT AAC/--- AACTGGAAGA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 AAC 2 1 369798 CASAVA_Build 8 141846731 1D TATATATGAG T/- TTCATATGTA 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 3 2 369799 CASAVA_Build 8 141851236 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 18 0 11 7 T 14 13 369800 CASAVA_Build 8 141876419 2D3M3D CAATCATGAG TCATTCTG/--AGT--- GCATTCTCCA 3070 hom 129 het 44 0 44 3 N/A 0 0 369801 CASAVA_Build 8 141893022 16D CTAGAGAACC AACCCCAAACTAGAAG/---------------- AAGAGCAAAC 3070 hom 60 het 23 0 21 2 AACCCCAAACTAGAAG 1 0 369802 CASAVA_Build 8 141893113 1I AGAGTGAGAT -/G GGAAAAACCA 3070 hom 59 het 22 0 19 3 G 2 3 369803 CASAVA_Build 8 141899864 2D TTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 33 1 18 14 T 16 14 369804 CASAVA_Build 8 141902749 2D13M4I GAATCTGCTC TTGAGGTTAAAATGC----/--GAGGTTAAAATGCATAT ATATATATAT 3070 hom 36 het 22 0 20 5 N/A 0 0 369805 CASAVA_Build 8 141908570 1D AAGGGATACT G/- TTACTTTCTG 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 1 0 369806 CASAVA_Build 8 141927744 4I ATGCATAAAC ----/AAAT GAATGAACAA 3070 hom 90 het 38 0 30 8 AAAT 0 1 369807 CASAVA_Build 8 141929380 1I AGATCCTTCC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 93 het 40 0 32 8 A 9 10 369808 CASAVA_Build 8 141949221 2I GTAGCAAAAC --/AT ATATATGTGT 3070 hom 111 het 43 0 38 5 AT 3 4 369809 CASAVA_Build 8 141955822 2I TTTGGGATTT --/TA TGTTAATCCT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 TA 0 1 369810 CASAVA_Build 8 141980179 1I CAGAAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 429 hom 33 1 24 8 A 10 11 369811 CASAVA_Build 8 141992579 2D AAAATTAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 26 hom 22 1 15 7 T 18 16 369812 CASAVA_Build 8 142012144 4I TTCCTTCCCC ----/TTTT TTTTTTTGAG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 T 7 11 369813 CASAVA_Build 8 142013723 1D AAAAAATAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 99 het 37 0 34 5 T 10 9 369814 CASAVA_Build 8 142024874 1I TTTATTTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 36 het 28 0 20 8 A 9 10 369815 CASAVA_Build 8 142027875 2D AAGCTAAACC TT/-- TATATCCCAA 3070 hom 111 het 42 0 38 5 T 3 1 369816 CASAVA_Build 8 142031178 1I AAGAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 302 hom 35 3 26 6 A 13 14 369817 CASAVA_Build 8 142039593 1I AATTCTCCTG -/C CTCAGCCTCC 3070 hom 54 het 20 0 19 2 C 1 2 369818 CASAVA_Build 8 142052142 1I TGACAAATTT -/C CACCCTATGG 3070 hom 114 het 48 0 39 9 C 1 2 369819 CASAVA_Build 8 142069192 1I TCTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 521 hom 23 4 13 6 A 15 16 369820 CASAVA_Build 8 142082711 16I CTGTGAAGCA ----------------/TTCAGCCCACTGCAGC TACATAAGAC 3070 hom 111 het 39 0 38 3 TTCAGCCCACTGCAGC 0 1 369821 CASAVA_Build 8 142086461 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 21 8 T 12 11 369822 CASAVA_Build 8 142089147 1I ACGCACACAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 51 het 19 0 17 2 A 8 9 369823 CASAVA_Build 8 142093309 1I CACAAATTAG -/A AAAAAAAAAT 2992 het 2992 ref 24 11 8 5 A 9 10 369824 CASAVA_Build 8 142105208 1I CTAAACATAC -/A AAAAAAAAAA 1651 hom 15 het 6 0 6 0 A 11 12 369825 CASAVA_Build 8 142106644 1I GGGAACTGTG -/T GGTACCCCCA 3070 hom 65 het 25 0 20 5 T 0 1 369826 CASAVA_Build 8 142112432 2D TATATATATA TT/-- TTTTTTGCTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 8 6 369827 CASAVA_Build 8 142116955 2D AAGACCCCTC CA/-- CACACACACA 3070 hom 82 het 36 0 24 13 CA 7 6 369828 CASAVA_Build 8 142125753 1I TAACCCAGAC -/T TTGAGATGAG 3070 hom 78 het 32 0 24 8 T 2 3 369829 CASAVA_Build 8 142135110 1I ACTTTTGCAT -/C CCCCCCCACC 3070 hom 67 het 24 0 20 4 C 7 8 369830 CASAVA_Build 8 142167546 4D CATACACATG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 80 36 30 16 CA 7 5 369831 CASAVA_Build 8 142177064 1D TGTGCCTGGC T/- TATTTCACTT 3070 hom 120 het 43 0 41 4 T 2 1 369832 CASAVA_Build 8 142179455 1D ACACAGCTAA T/- TTTTTGTGTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 6 5 369833 CASAVA_Build 8 142188139 1I ATACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 19 1 14 4 A 11 12 369834 CASAVA_Build 8 142219197 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 T 12 11 369835 CASAVA_Build 8 142240345 8D GGTGACTGTG CCTTACTA/-------- CCTTACTAAC 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 CCTTACTA 2 1 369836 CASAVA_Build 8 142268897 1D GAGCAGAGGC T/- CATGGTGGGG 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 T 1 0 369837 CASAVA_Build 8 142272592 1I GCAAAATACA -/C CCCCCTCCAT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 C 5 6 369838 CASAVA_Build 8 142276737 1I TTCTTACCCC -/G GAGCCCTCAG 3070 het 2015 hom 22 8 8 6 G 1 2 369839 CASAVA_Build 8 142289715 1D TGAAGTCTTG A/- AAGTCAGCCC 3070 hom 68 het 28 0 21 7 A 3 2 369840 CASAVA_Build 8 142292354 4I TACTACCATT ----/AGAC AGCATCTCTG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AGAC 0 1 369841 CASAVA_Build 8 142292487 4I TTCAGAAAAT ----/AGAC AGAAGCAGGA 3070 hom 114 het 42 0 37 5 AGAC 0 1 369842 CASAVA_Build 8 142297260 18D TGGGCAGAGA GAGCGGCCCCGCTCCGGT/------------------ GGCCGAGCAC 3070 hom 57 het 22 0 16 9 GAGCGGCCCCGCTCCGGT 1 0 369843 CASAVA_Build 8 142301386 2I ACACAGGGCT --/GA GAGCCCCTCC 3070 hom 59 het 23 0 17 6 GA 1 2 369844 CASAVA_Build 8 142324235 5D AAGAAGACGT GGGTG/----- GGGGGGGGGG 2712 hom 42 het 18 0 13 6 GGGTG 1 0 369845 CASAVA_Build 8 142335024 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAACAA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 A 8 7 369846 CASAVA_Build 8 142349660 1D TAAATACATT A/- AAAAAAAAAA 2137 hom 18 het 12 0 7 5 A 13 12 369847 CASAVA_Build 8 142377217 1D CCAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 30 0 27 3 A 11 10 369848 CASAVA_Build 8 142377323 1I4M1I CTGCTGTGCG -ACAG-/CACAGC CCCTGCGGCA 3070 hom 52 het 19 0 15 6 N/A 0 0 369849 CASAVA_Build 8 142382275 3D TTACAATGTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1689 het 270 hom 23 5 4 14 T 19 16 369850 CASAVA_Build 8 142383352 1D TCACTAGACA G/- GAAGGTGGGC 3070 hom 52 het 21 0 17 4 G 2 1 369851 CASAVA_Build 8 142385177 1D ATCGGGAAAG T/- GGGGAGCTGC 1978 hom 20 het 19 0 10 9 T 1 0 369852 CASAVA_Build 8 142385738 3I CCTCTTCTCA ---/TCC TCAAGTGGCT 3070 hom 60 het 22 0 19 3 TCC 0 1 369853 CASAVA_Build 8 142400205 7I CAACTCATCC -------/CCAGAGA CCAGAGACAG 3070 hom 45 het 17 0 13 4 CCAGAGA 1 2 369854 CASAVA_Build 8 142411568 1I AGCCTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 187 hom 30 1 26 3 T 11 12 369855 CASAVA_Build 8 142430946 1D CTCAGTGAGG C/- CCGAGGAAAG 2430 hom 36 het 17 0 8 9 C 3 2 369856 CASAVA_Build 8 142435110 1I CTCTGCCCCC -/G GGGGGGAGGA 3070 hom 90 het 34 0 26 8 G 6 7 369857 CASAVA_Build 8 142435579 1D GAGACATGCA C/- CCCCCCCCAC 3070 hom 66 het 26 0 17 9 C 9 8 369858 CASAVA_Build 8 142437933 1I CAGGTCAATG -/C CCCTGGATGG 3070 het 2012 hom 26 9 11 6 C 3 4 369859 CASAVA_Build 8 142500171 1D CCCCATTCCC T/- GAGGATGGGC 3070 hom 56 het 26 0 16 10 T 1 0 369860 CASAVA_Build 8 142514245 1I GGGACGGGCT -/G GGGGGCCCTG 1315 hom 26 het 11 0 7 4 G 5 6 369861 CASAVA_Build 8 142517843 1D GTGGGTGGAC G/- GGGGGATCTA 3070 hom 112 het 44 0 37 7 G 6 5 369862 CASAVA_Build 8 142527915 11D TGGAAGGCAG AGTCAGCTGAT/----------- AGCAGCCCCC 3070 hom 53 het 20 0 18 2 AGTCAGCTGAT 1 0 369863 CASAVA_Build 8 142537809 1I CTCCCCCTGG -/A AAAAAATCAC 3070 hom 140 het 54 0 47 7 A 6 7 369864 CASAVA_Build 8 142539572 1I TTAATGCAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1600 hom 25 4 11 10 T 15 16 369865 CASAVA_Build 8 142540031 1D AATTCTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 129 het 51 0 44 8 A 12 11 369866 CASAVA_Build 8 142550931 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 76 hom 14 1 12 2 A 14 13 369867 CASAVA_Build 8 142553549 1I GCCACGCCCA -/G GTGGACGCAG 3070 hom 75 het 31 0 24 7 G 1 2 369868 CASAVA_Build 8 142564305 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 428 hom 31 1 25 5 A 9 10 369869 CASAVA_Build 8 142565557 2D AGAGAATGTA CT/-- CTGTTTGATA 3070 het 3070 hom 26 11 13 3 CT 2 1 369870 CASAVA_Build 8 142570181 2D ATTTCTACTC TT/-- TTCTCAGTCT 3070 hom 88 het 33 0 25 8 T 4 2 369871 CASAVA_Build 8 142575172 4I TAAATTTATT ----/CACC CACCCACCCA 3070 het 3070 ref 39 18 10 11 CACC 2 3 369872 CASAVA_Build 8 142612909 6D AAGGAATGGA CAAAGG/------ CACGAGAAAC 3070 het 3070 ref 36 17 13 8 CAAAGG 1 0 369873 CASAVA_Build 8 142617646 1I TCTGCCTCCT -/C CCATCGCACC 3070 het 2315 hom 40 9 24 7 C 2 3 369874 CASAVA_Build 8 142619127 2D GCAATACATG CA/-- CACACACACA 1870 het 1870 ref 69 41 5 24 CA 7 6 369875 CASAVA_Build 8 142619224 2D TGCACACTTC CA/-- CACACACACA 3070 hom 183 het 66 0 54 15 CA 6 5 369876 CASAVA_Build 8 142621158 1I TCCTGTCCCA -/C CCAGGACAGC 3070 hom 102 het 37 0 32 5 C 2 3 369877 CASAVA_Build 8 142621326 1D GGGATGCCCC T/- CTGGGGGCAG 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 T 1 0 369878 CASAVA_Build 8 142633387 1I TGGTGAGGCT -/G GGGGGAAGAG 3070 hom 99 het 36 0 33 3 G 5 6 369879 CASAVA_Build 8 142641261 7I2M6I TGCACCCAGC -------CT------/TCCCAGGCTAGGAGA CAGCAGCCCT 3070 het 3070 ref 47 30 11 7 N/A 0 0 369880 CASAVA_Build 8 142647865 2D GCTGTAATTT TC/-- TCTCTGTTTC 3070 het 3070 hom 32 12 14 7 TC 3 2 369881 CASAVA_Build 8 142648074 2I AAGAAGGGAC --/CA GTGGGAGTGG 3070 hom 81 het 33 0 26 7 CA 0 1 369882 CASAVA_Build 8 142676596 1D AGCAGCTGTG C/- CTGACCCCTG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 2 1 369883 CASAVA_Build 8 142701544 1D CGGAGGCAGC G/- GCAGGAGACG 3070 het 3070 hom 46 17 21 8 G 2 1 369884 CASAVA_Build 8 142701748 3I ATCACCTCAT ---/CTC CACCGCTGTC 3070 hom 119 het 43 0 35 8 CTC 0 1 369885 CASAVA_Build 8 142726131 12D GCCTCTGGTG CCCCGGTGGCCC/------------ CCCTACTATC 3070 hom 64 het 21 0 19 5 CCCCGGTGGCCC 1 0 369886 CASAVA_Build 8 142735791 1I TATGAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 58 31 18 9 T 11 12 369887 CASAVA_Build 8 142750830 1D GAGCCCCTGT G/- GGTTTACCAG 2672 het 2672 ref 30 12 8 10 G 3 2 369888 CASAVA_Build 8 142770799 1I CTTACCTCTT -/G GGGGACGCCA 3070 het 3070 hom 40 16 15 9 G 4 5 369889 CASAVA_Build 8 142774022 1D ACAAACTGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1089 hom 29 3 20 7 A 13 12 369890 CASAVA_Build 8 142781291 14D9M2D GCGTGAGTGT GTGTGAGTGTGAGAGTGAGTGAGCA/--------------GTGAGTGAG-- TGTGTGTGAG 3062 het 261 hom 64 4 24 54 N/A 0 0 369891 CASAVA_Build 8 142782212 3D CCTTTTCTCC CTT/--- CTTCTCGTCC 3070 hom 108 het 42 0 31 12 CTT 2 1 369892 CASAVA_Build 8 142802982 1D AGGGTGGGGG T/- TTCGGAGTGT 3070 hom 64 het 26 0 18 9 T 3 2 369893 CASAVA_Build 8 142835322 3I6M3D57M5I17M6I ATGGTAATGA ---TGAAGGTAATGGTGGTGATGGTGGTGATGATGATGATGGTGATGGTGATGACTGTGATGGTGGTGA-----TGATGGTGGCGGTGATG------/CTGTGATGG---TGGTGATGATGGTGGCGGTGATGATAATGGTGATGGTGATGGTGGTGATAATGGTGATGATGTGATGGTGGTGGTGATGATGATA ATAATGGTGA 1618 het 1618 ref 74 64 5 32 N/A 0 0 369894 CASAVA_Build 8 142844741 1I GAGGTGGCCA -/G GTAGAGCCCA 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 G 1 2 369895 CASAVA_Build 8 142854553 19D AGCACGATTT GGACCTTGGACACTTTTTA/------------------- GCATAATCCA 3070 het 3070 ref 43 24 15 10 GGACCTTGGACACTTTTTA 1 0 369896 CASAVA_Build 8 142894303 1D CGTGTGTATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 118 het 47 0 42 5 T 10 9 369897 CASAVA_Build 8 142901005 9D TGCCTGGCTT ACGATGGGC/--------- ACACAAGAAA 3070 het 3070 hom 46 22 23 3 ACGATGGGC 1 0 369898 CASAVA_Build 8 142915699 1I GTGTACTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 19 10 3 T 10 11 369899 CASAVA_Build 8 142917807 1D CATTTTCCCC T/- GATAATATTT 3070 het 3070 hom 43 20 22 1 T 1 0 369900 CASAVA_Build 8 142919692 1D CCTGTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 13 12 8 A 15 14 369901 CASAVA_Build 8 142926864 4D ATTTAATTAA TTAT/---- TTAATACATT 3070 hom 53 het 19 0 18 1 TTAT 1 0 369902 CASAVA_Build 8 142932587 2D CACACGCACG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 62 27 19 19 CA 7 6 369903 CASAVA_Build 8 142932800 2D ACACACATGT AC/-- ACACACACAG 3070 het 3070 hom 73 34 28 11 AC 5 4 369904 CASAVA_Build 8 142932872 2I AGTGCCTTTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 65 23 23 19 CA 8 9 369905 CASAVA_Build 8 142933521 27I CAGGCATACA ---------------------------/CACACATGCTCACACATCAGAGCCTTT CACACATACT 3070 hom 158 het 67 0 50 17 CACACATGCTCACACATCAGAGCCTTT 0 1 369906 CASAVA_Build 8 142934787 1D AGGGGCAGGA G/- GGCAGGAGAG 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 G 3 2 369907 CASAVA_Build 8 142936569 1D GGTGAGCCCC T/- GGCTGACAGG 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 1 0 369908 CASAVA_Build 8 142940017 1D TCCCCCTGCA C/- CCCCATTAGT 3070 hom 61 het 23 0 18 6 C 5 4 369909 CASAVA_Build 8 142951090 3I GTCAGGTGAG ---/GGT GGTGGTGGTG 1853 het 1255 hom 54 12 9 33 GGT 3 4 369910 CASAVA_Build 8 142966775 2D CAACTGTGTT AA/-- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 51 23 20 10 A 11 9 369911 CASAVA_Build 8 142973824 1I TCCATCTTGG -/A AAAAAAAAAA 2386 het 1932 hom 24 8 11 5 A 15 16 369912 CASAVA_Build 8 143005178 1I GGAGGAGGGA -/G GGGGGGGTTG 3070 hom 78 het 37 0 22 15 G 7 8 369913 CASAVA_Build 8 143024782 2D GCGTGTGTGC GT/-- GTGTACGTGT 3070 het 100 hom 40 1 24 15 GT 3 2 369914 CASAVA_Build 8 143024822 12D20M16D ATGTGTATGT GCATGTGTGTGCGTGTGGGTGCATGTGTGTGAGTGCATGTGTGTGCGT/------------GTGTGGGTGCATGTGTGTGA---------------- GTGCATGTGT 3070 het 146 hom 36 2 27 31 N/A 0 0 369915 CASAVA_Build 8 143034077 2I CATGCAAATG --/CA CACACACATG 3070 hom 163 het 69 0 55 14 CA 4 5 369916 CASAVA_Build 8 143066485 1D CTCTCCCAGA G/- GCCCAGAGCC 2237 het 2237 ref 25 15 6 4 G 2 1 369917 CASAVA_Build 8 143075335 1D CATGAATTTT G/- GGGGGGGCAC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 G 8 7 369918 CASAVA_Build 8 143099122 14D AAGCAAAGGG CTCCCGTACAAACC/-------------- CTTGTCTCAA 3070 het 3070 ref 41 21 19 4 CTCCCGTACAAACC 1 0 369919 CASAVA_Build 8 143099858 1I GGAGGAGGGA -/G CTGCTGATGG 3070 hom 80 het 29 0 25 4 G 0 1 369920 CASAVA_Build 8 143100440 6I CAAATGAGGA ------/GGGTGT GGCTTTGATC 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 GGGTGT 0 1 369921 CASAVA_Build 8 143105131 1D GCTGATTTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 41 14 18 9 A 10 9 369922 CASAVA_Build 8 143107474 1D AAATACACAG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 123 het 45 0 42 4 A 8 7 369923 CASAVA_Build 8 143108110 1I CGTCTCTACT -/A AAAAAAAATA 3070 het 1726 hom 13 5 8 0 A 8 9 369924 CASAVA_Build 8 143116212 1I AAGAAGACCC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 8 9 369925 CASAVA_Build 8 143122270 1D CAGCTGAGCA G/- GTGCTGAGCA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 G 2 1 369926 CASAVA_Build 8 143132808 2I GGGTGTCAAC --/AA AAAATACTCA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 A 4 6 369927 CASAVA_Build 8 143132932 1D ATAAAGCAAA C/- TTCACAGCAA 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 C 1 0 369928 CASAVA_Build 8 143146428 1I TGGGAATGCA -/G ATCAGTACAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 G 0 1 369929 CASAVA_Build 8 143150581 1I17M2D CGGGGAATGC -GTTGAAGAGGTGCATCTCC/GGTTGAAGAGGTGCATCT-- CCCCCCGACC 3070 het 3070 hom 31 14 10 10 N/A 0 0 369930 CASAVA_Build 8 143158640 2I GTATGTACAT --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 39 23 13 3 AC 4 5 369931 CASAVA_Build 8 143191006 2I TGAGCGTACA --/AC AGAGTCTCCT 3070 het 1073 hom 29 7 17 5 AC 0 1 369932 CASAVA_Build 8 143195216 1D ATCTATCTAT C/- CATCCATCCA 3070 het 3070 hom 35 16 15 4 C 2 1 369933 CASAVA_Build 8 143196318 1I TTCCAACTGT -/C CCCCCCCAGC 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 C 7 8 369934 CASAVA_Build 8 143202011 3I GTCCATCTGA ---/TGG TGAAGTATGC 3070 het 3070 hom 61 22 26 13 TGG 0 1 369935 CASAVA_Build 8 143202141 4D ACCCGATGTG CACA/---- CACACACACA 3070 het 464 hom 71 9 21 42 CA 8 6 369936 CASAVA_Build 8 143203672 5D TGTGAGCCCA CGGAG/----- CCCATCCACG 3070 hom 60 het 23 0 20 3 CGGAG 1 0 369937 CASAVA_Build 8 143207398 13I GAAAAGGTGA -------------/GGAGGGCAGGGCT GGAGGACATG 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 GGAGGGCAGGGCT 0 1 369938 CASAVA_Build 8 143209419 4I CAGACGCCAC ----/CCAG CCAGCCGTGG 2594 het 2088 hom 39 12 13 14 CCAG 1 2 369939 CASAVA_Build 8 143212725 1D CACCCCGGGT G/- GGGGTGGGGA 3070 hom 42 het 17 0 14 3 G 5 4 369940 CASAVA_Build 8 143212844 1D AAGCAGTTCC T/- TTGAAGGCTC 2034 het 2034 ref 22 10 6 6 T 3 2 369941 CASAVA_Build 8 143215110 1I GCACCACCCC -/T GGTACGGGAC 3070 hom 39 het 17 0 13 4 T 0 1 369942 CASAVA_Build 8 143225992 1I GGGAGGGGCA -/G GGAGGTTTCC 2751 hom 43 het 19 0 8 11 G 2 3 369943 CASAVA_Build 8 143228175 1D AGGAGAGGGG T/- CCCGGCCCGG 2188 het 1553 hom 26 10 8 8 T 1 0 369944 CASAVA_Build 8 143231595 1D GGGTCAAGAA G/- CTGAGCGGTG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 1 0 369945 CASAVA_Build 8 143243488 4D TGGATGGGTA GATG/---- GATGGATGGA 294 het 294 ref 80 56 3 26 GATG 5 4 369946 CASAVA_Build 8 143245554 2D ATGCATGTGG GT/-- GGGGGGCTGG 3070 hom 55 het 23 0 17 6 GT 1 0 369947 CASAVA_Build 8 143249291 1D AATTCACCCC G/- GGGGCCTGAG 3070 hom 55 het 20 0 16 4 G 5 4 369948 CASAVA_Build 8 143262522 1I CCCCCAGTGA -/C CCCTGACTGC 3070 hom 42 het 17 0 12 5 C 3 4 369949 CASAVA_Build 8 143264994 5D2M4D TCATCATCAC CCACATAATCT/-----TA---- TCACCATCAT 3070 het 3070 ref 62 30 16 23 N/A 0 0 369950 CASAVA_Build 8 143267076 4D CAGTTCTGAG AGTT/---- AGTCCCATCA 3070 hom 72 het 29 0 22 9 AGTT 1 0 369951 CASAVA_Build 8 143269079 3D CCGCAGGGAG GCA/--- GCAATGCCAG 3070 hom 70 het 25 0 21 4 GCA 2 1 369952 CASAVA_Build 8 143269622 2D CTCATTCATG CA/-- CACACACACG 3070 hom 147 het 57 0 48 14 CA 5 4 369953 CASAVA_Build 8 143278069 2D TCCCTCCCGT AC/-- ACCTGGAAAC 3070 hom 71 het 26 0 18 8 AC 2 1 369954 CASAVA_Build 8 143280041 1D GTCTCTACAG A/- AAAAAATTAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 7 6 369955 CASAVA_Build 8 143284332 2D ACACACACAA AC/-- ACGCATATAC 3070 het 3070 ref 77 47 20 11 AC 2 1 369956 CASAVA_Build 8 143284348 2I ATATACACAG --/AC ACACACACGG 3018 het 3018 ref 79 40 25 14 AC 4 5 369957 CASAVA_Build 8 143290232 7D4M14D AAATCTGAGA AGGTGGCAGCAGCTCGGGGGCGGAC/-------AGCA-------------- CGTCTGCCCA 3070 hom 60 het 16 0 17 5 N/A 0 0 369958 CASAVA_Build 8 143296892 2I CTCCAGGGAA --/AC ACAGTGTGCA 3070 het 3070 hom 58 25 23 10 AC 1 2 369959 CASAVA_Build 8 143297413 1I CCAGGATCAG -/A GCTCAGTGTG 1504 het 1504 ref 34 18 5 11 A 0 1 369960 CASAVA_Build 8 143304005 1I TCTGGGGGCT -/G GGCCTCTTGG 2299 hom 23 het 16 0 8 8 G 2 3 369961 CASAVA_Build 8 143316334 1I10M1D GCCTGAGGTT -CCAGAACGGCG/CCCAGAACGGC- GGGTGGGCGG 2203 hom 48 het 16 0 12 7 N/A 0 0 369962 CASAVA_Build 8 143323709 4D GAAAATCATC ACTT/---- ACATGTATTT 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 ACTT 1 0 369963 CASAVA_Build 8 143342016 4D CACCATGATT GTAA/---- GTTCCCTGAG 2201 het 2201 ref 30 13 7 14 GTAA 1 0 369964 CASAVA_Build 8 143351420 4I TCCTTCTATT ----/CATC CATCCATCCA 3070 het 3070 ref 45 15 14 16 CATC 3 4 369965 CASAVA_Build 8 143363821 1D CACCTGAAAG T/- TTCCCATGGA 3070 hom 60 het 24 0 17 7 T 3 2 369966 CASAVA_Build 8 143374454 2D CAGCTCCCAC AT/-- GTGACTGGCA 2707 het 2707 ref 31 14 9 9 AT 1 0 369967 CASAVA_Build 8 143480675 2I AGCCACAGAC --/TA TGCAGGAAAA 3070 hom 105 het 42 0 34 8 TA 0 1 369968 CASAVA_Build 8 143487231 1D GGGGGCACCC G/- GGGGGATGGG 3070 hom 53 het 19 0 18 1 G 6 5 369969 CASAVA_Build 8 143502306 6D ACAGATGAGC GAGCCA/------ GACTAGAGGC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 GAGCCA 1 0 369970 CASAVA_Build 8 143510727 3D20M6I CAGCCATCAT CACCACCACCATCACCATCGCTC------/---CACCACCATCACCATCGCTCCCATCA CCATCACCAC 3070 hom 111 het 58 1 43 17 N/A 0 0 369971 CASAVA_Build 8 143510814 3D ATATCACCAT CAC/--- CACCACCATC 500 het 500 ref 41 20 4 19 CAC 3 2 369972 CASAVA_Build 8 143513225 2I56M2I ATTCACACAC --GCTCACATATGCACCATCATGCACACACAGTGCACTCATACACACTCACACATCCA--/ATGCTCACATATGCACCATCATGCACACACAGTGCACTCATACACACTCACACATCCACT TTCACACACA 3070 het 164 hom 85 2 77 51 N/A 0 0 369973 CASAVA_Build 8 143513564 2I CACTCACAGT --/CA CATGCACACA 3070 hom 193 het 73 0 65 8 CA 1 2 369974 CASAVA_Build 8 143513857 2D CACGTGTGCT CA/-- GTCACTTGCA 3070 hom 248 het 97 0 77 27 CA 1 0 369975 CASAVA_Build 8 143536049 1D GTGTGGTTGG C/- ACAAGCTGGG 3070 het 2355 hom 20 8 10 2 C 1 0 369976 CASAVA_Build 8 143557999 7D ACCTTCCAGA GCCAGCT/------- GCCGGCTCTC 3070 hom 55 het 24 0 17 7 GCCAGCT 1 0 369977 CASAVA_Build 8 143578285 1I GGCTTATGGG -/T TTGGGCCCAA 3070 hom 51 het 23 0 17 6 T 2 3 369978 CASAVA_Build 8 143578342 1I ACCCAGATGG -/C CCCTGGCAGC 1136 hom 20 het 13 0 5 11 C 3 4 369979 CASAVA_Build 8 143580342 3D ATGGAGGTAG GGT/--- GGTGGTGGTG 3070 hom 41 het 37 1 24 13 GGT 4 3 369980 CASAVA_Build 8 143581026 9I GTGATGGTGA ---------/TGCTGGGGC TGGTGGTAGT 3070 hom 108 het 40 0 35 5 TGCTGGGGC 0 1 369981 CASAVA_Build 8 143596785 1I CCTCCACAGG -/T TCCTGAGGCC 2331 hom 21 het 8 0 8 0 T 1 2 369982 CASAVA_Build 8 143598069 3D GTGATGGTGT TGG/--- TGGTGCTGGT 3070 hom 7 het 61 2 33 31 TGG 2 1 369983 CASAVA_Build 8 143599003 3D GATGATTGTG TGA/--- TGATGATGAT 3070 het 3070 ref 79 26 25 30 TGA 4 3 369984 CASAVA_Build 8 143601768 1I CTGAGTGGGA -/G GGGCGGAGCA 3070 hom 50 het 20 0 15 5 G 3 4 369985 CASAVA_Build 8 143712452 1I GCGAGGAGCC -/A GAGGGAGAAG 3070 hom 56 het 22 0 15 7 A 0 1 369986 CASAVA_Build 8 143713582 1D CACAGCTGCT C/- CCCCCAGGGT 3070 hom 80 het 33 0 22 11 C 6 5 369987 CASAVA_Build 8 143728148 1D AGGGGCAGGA C/- CCTCATGGAG 3070 het 3070 ref 34 20 9 5 C 3 2 369988 CASAVA_Build 8 143735194 1D TGCTGTATCT C/- CCCCAACTTT 3070 hom 128 het 47 0 41 9 C 5 4 369989 CASAVA_Build 8 143736808 1D TTTTATTTCC T/- TTTTTTTTTT 1415 het 1415 ref 39 23 7 9 T 13 12 369990 CASAVA_Build 8 143743090 2D TTCTGAACTC CA/-- CACACAACCT 3070 hom 45 het 19 0 12 7 CA 4 3 369991 CASAVA_Build 8 143750696 3I CAACTGCCCT ---/CCC CCCCAATCCA 3070 het 3070 ref 41 19 13 9 C 4 7 369992 CASAVA_Build 8 143757369 4D GCCGCTGCCA CCAC/---- CCACCGCCCA 1751 het 1751 ref 36 16 7 14 CCAC 2 1 369993 CASAVA_Build 8 143757839 1I CTGTGTCAAC -/A AAGAGCCAAA 3070 het 3070 hom 38 10 18 10 A 2 3 369994 CASAVA_Build 8 143760262 1I TAGGCAGGGT -/G GGGACAGGAG 3070 het 3070 ref 35 17 13 5 G 3 4 369995 CASAVA_Build 8 143766563 1I AGGACACACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 T 11 12 369996 CASAVA_Build 8 143770357 1I ATAAAATCTT -/G GTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 20 18 5 G 1 2 369997 CASAVA_Build 8 143773718 2D ATGGAACCAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2324 hom 33 14 13 6 A 18 16 369998 CASAVA_Build 8 143776625 2D TAAATAAAAC TT/-- TCAACCTTCT 3070 het 3070 hom 42 18 21 4 T 3 1 369999 CASAVA_Build 8 143780243 1D GAAAGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 2503 het 2503 ref 29 15 7 7 T 13 12 370000 CASAVA_Build 8 143786534 4D TTAGAAGTGT TCTA/---- TCTAAGTGCA 3070 het 3070 ref 39 18 14 10 TCTA 2 1 370001 CASAVA_Build 8 143796669 1I AAGGAGCACA -/T TTCCCCATCT 3070 het 3070 hom 41 12 17 12 T 2 3 370002 CASAVA_Build 8 143803072 2I GAGGGTGGGT --/AG AGAGACCTTG 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 AG 2 3 370003 CASAVA_Build 8 143812700 2I TGCTGGACTC --/TG TATGTCTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 TG 0 1 370004 CASAVA_Build 8 143833234 3I TCAACTTGTG ---/ACT AGGATCAGGG 2756 het 2756 ref 50 35 12 3 ACT 0 1 370005 CASAVA_Build 8 143836327 2D TTGATCACAC TG/-- AGAACTGGAG 3070 het 3070 ref 46 27 12 7 TG 1 0 370006 CASAVA_Build 8 143854444 2I ATCCAACTCA --/GG GGTGGCGCAC 3070 hom 91 het 36 0 24 12 G 2 4 370007 CASAVA_Build 8 143860118 1I TATGCCTAAG -/A CATCTCCCTG 3070 het 2505 hom 24 9 12 3 A 0 1 370008 CASAVA_Build 8 143870048 4I TCATTCACTT ----/ATCC ATCCATCCAT 3070 het 3070 hom 59 22 19 18 ATCC 2 3 370009 CASAVA_Build 8 143870193 15D ATCCAGCCTT CATCCATCCATCCTC/--------------- CATCCATCCA 3070 het 3070 hom 67 21 25 28 CATCCATCCATCCTC 2 1 370010 CASAVA_Build 8 143874908 1D AAGGTCAAGC A/- GGGCTCAGTG 3070 het 3070 ref 35 14 14 7 A 1 0 370011 CASAVA_Build 8 143876293 1D GTTGTGTGCC A/- AGCTGCCCGG 1160 het 1160 ref 18 8 6 5 A 2 1 370012 CASAVA_Build 8 143887156 4I GTATAGTGTA ----/TGTT TGAGTGTGAG 3070 hom 198 het 85 0 65 20 TGTT 0 1 370013 CASAVA_Build 8 143887455 2I GAGTGTGTGT --/GA GTGTGTGAGT 3070 het 3070 ref 99 44 38 17 GA 0 1 370014 CASAVA_Build 8 143895710 2D CAATACACAG AC/-- ACACACACGC 3070 het 3070 hom 96 40 41 18 AC 5 4 370015 CASAVA_Build 8 143903203 2D TTTTTTTTTT TC/-- TTAAAACCAA 2535 het 2535 ref 27 15 7 5 TC 1 0 370016 CASAVA_Build 8 143906421 1D TCCTTCAGCA T/- TTTTTTGTCG 3070 het 2982 hom 24 8 11 5 T 7 6 370017 CASAVA_Build 8 143906645 1D AAACACTGTT C/- CTGTGTCTGA 3070 het 3070 ref 23 13 7 4 C 2 1 370018 CASAVA_Build 8 143907160 1I TTTTCTATTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 A 10 11 370019 CASAVA_Build 8 143908847 1I GCTTATGACC -/T TTTTCTTTAA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 T 4 5 370020 CASAVA_Build 8 143913630 1D CCATCAGGGT C/- CCAGGGAGAC 1876 het 874 hom 10 2 6 2 C 3 2 370021 CASAVA_Build 8 143922496 10I GAACTATCAA ----------/AATTATTCAT ACCGTTTCCT 3070 hom 81 het 32 0 26 6 AATTATTCAT 0 1 370022 CASAVA_Build 8 143938280 1I TTTTCTGATA -/T TTTTAATAAT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 4 5 370023 CASAVA_Build 8 143938600 4I GGTTTTTAGT ----/TTAA TTAAGTCTCA 3070 hom 60 het 21 0 21 0 TTAA 1 2 370024 CASAVA_Build 8 143941415 4I TTGTTTTATT ----/TCTG TCTTAATTTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 TCTG 0 1 370025 CASAVA_Build 8 143942451 1I CTTGGCTGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 31 2 24 5 T 10 11 370026 CASAVA_Build 8 143942590 1I GCCCTTACGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 T 8 9 370027 CASAVA_Build 8 143942850 1I GCTTTGTTCA -/T TTTTTTATAA 3070 het 3070 hom 34 9 18 7 T 6 7 370028 CASAVA_Build 8 143944999 2I CTCCCAACTC --/TG TGCCTGTACC 3070 hom 108 het 39 0 36 3 TG 1 2 370029 CASAVA_Build 8 143951653 1D ACAAATGCTC T/- GATCCTCATC 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 T 1 0 370030 CASAVA_Build 8 143956480 2D ACACAGACAC AT/-- GTGCACACAC 3070 hom 130 het 72 0 41 33 AT 1 0 370031 CASAVA_Build 8 143962040 1D TGAAATATAA T/- TTTGGCCACA 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 T 4 3 370032 CASAVA_Build 8 143964018 2D GTGCAGAAGA TT/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 38 het 35 0 12 23 T 11 9 370033 CASAVA_Build 8 143965603 2D ATTTATCCTT TC/-- TGTTACAAGC 3070 het 3070 ref 44 25 17 4 TC 1 0 370034 CASAVA_Build 8 143966409 1I GAAATTGGCC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 8 9 370035 CASAVA_Build 8 143974135 1I TTTTTTTGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 20 7 9 4 T 9 10 370036 CASAVA_Build 8 143975163 1D TGAGATTTTT C/- TTCTTTTTTC 1555 het 1555 ref 33 22 6 7 C 1 0 370037 CASAVA_Build 8 143976471 2D AAACCACAAG CT/-- CCTAGGGCAG 3070 het 3070 ref 31 16 12 4 CT 1 0 370038 CASAVA_Build 8 143978270 1I AGCCAAAAGC -/A GTAACATTCC 3070 hom 114 het 39 0 38 1 A 0 1 370039 CASAVA_Build 8 143979679 4I CCAGGACAGT ----/GGAA GGAAGGCTCA 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 GGAA 1 2 370040 CASAVA_Build 8 143990104 3I GCCAGCGCTG ---/GGA GGAGTAGAGT 3070 hom 78 het 31 0 26 5 GGA 1 2 370041 CASAVA_Build 8 143991981 1D TGCCCTGAGC A/- AAAACAGAGC 3070 hom 60 het 29 0 21 8 A 5 4 370042 CASAVA_Build 8 143994512 2I ACACAGACAC --/AT GTGCACACAC 3070 het 3070 ref 50 28 15 7 AT 0 1 370043 CASAVA_Build 8 143997841 3D CAGGCATGTG CCA/--- CCACCACGCC 1568 hom 12 het 5 0 5 0 CCA 3 2 370044 CASAVA_Build 8 144129296 4D CCCCAAGGAC TGAG/---- TATCAGGAGG 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 TGAG 1 0 370045 CASAVA_Build 8 144131185 2I GATGAGAAAA --/CT CACATTTGTT 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 CT 0 1 370046 CASAVA_Build 8 144135584 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTGT 2595 het 134 hom 10 1 7 2 T 8 9 370047 CASAVA_Build 8 144137141 1I ACAGGGACAG -/C CCAGTGTTCT 3070 hom 75 het 27 0 25 2 C 2 3 370048 CASAVA_Build 8 144146245 1D AGACTTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2198 hom 10 het 22 1 11 11 A 15 14 370049 CASAVA_Build 8 144146446 3I AAAAGGCCTC ---/AGA AGAAGAAGGG 3070 hom 105 het 41 0 36 5 AGA 2 3 370050 CASAVA_Build 8 144148099 1D TTGCCATATA G/- GCCTGTCTTA 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 G 2 1 370051 CASAVA_Build 8 144150981 1I TTCACAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 11 12 370052 CASAVA_Build 8 144164519 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1505 het 751 hom 13 2 8 3 T 16 17 370053 CASAVA_Build 8 144165837 1D TCAAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 het 129 hom 40 1 33 6 C 1 0 370054 CASAVA_Build 8 144190183 29D8M1D TCATGTGAGG TCATGGTCCTCACATTTGGCTCAGAATAAACCTCTTCA/-----------------------------ACCTCTTC- AATATTTTAG 3070 het 3070 ref 34 36 12 2 N/A 0 0 370055 CASAVA_Build 8 144190399 1I CCTCATCTCT -/A AAAAAAAAAA 2838 het 2838 ref 37 25 7 5 A 10 11 370056 CASAVA_Build 8 144193030 1I AGATTTGGGG -/T GGTCTGGAAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 0 1 370057 CASAVA_Build 8 144213773 11I AAGAAAGATA -----------/AAAAACAGCTG GGAAAAATAA 3070 het 3070 ref 38 20 16 2 AAAAACAGCTG 0 1 370058 CASAVA_Build 8 144214054 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 10 13 9 A 14 15 370059 CASAVA_Build 8 144214519 1I TATATTTAGT -/A GAGATGGGTT 3070 het 3070 hom 27 7 17 4 A 0 1 370060 CASAVA_Build 8 144221547 1D TAATAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 11 6 T 11 10 370061 CASAVA_Build 8 144227055 2D TCCAATACAC AT/-- GTTAGACAGT 3070 het 3070 hom 54 24 25 6 AT 1 0 370062 CASAVA_Build 8 144244048 6I TAGAAGTTAA ------/AACAAC AACAACAACA 3070 het 3070 ref 40 15 13 12 AAC 4 6 370063 CASAVA_Build 8 144244449 8D CTTCCAGGGT TGAGTGCC/-------- TGAGTGCCTG 3070 hom 115 het 43 0 37 10 TGAGTGCC 3 2 370064 CASAVA_Build 8 144246089 4D TTCTTATTTA TTTG/---- TTTATTATTT 3070 hom 48 het 20 0 17 4 TTTG 1 0 370065 CASAVA_Build 8 144251508 1D TTTGAGATCT G/- GGACAAGACA 3070 het 3070 hom 36 16 18 2 G 3 2 370066 CASAVA_Build 8 144258736 1I TCCTTTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 6 T 10 11 370067 CASAVA_Build 8 144260891 12D TTCTTTACAG CAACAAAAGAAC/------------ AGCCTAATAT 3070 het 3070 hom 41 22 21 4 CAACAAAAGAAC 1 0 370068 CASAVA_Build 8 144261110 1D AATTCACATC T/- TTTTTTTTTT 2574 het 1341 hom 21 7 8 6 T 15 14 370069 CASAVA_Build 8 144266469 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1679 het 63 hom 11 2 6 4 A 12 11 370070 CASAVA_Build 8 144272644 3I AACTTAAAGT ---/ATA ATAATAAAAT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 ATA 2 3 370071 CASAVA_Build 8 144275631 4D GTATACACCC CACA/---- CACCCACATA 3070 het 3070 hom 69 14 29 28 CA 3 1 370072 CASAVA_Build 8 144275652 2D ATATATGTAT AC/-- ACACCTTCAC 3070 het 1045 hom 68 7 30 32 AC 3 2 370073 CASAVA_Build 8 144276591 2I CATGTACACT --/CA CACATGTATA 3070 hom 192 het 69 0 63 6 CA 2 3 370074 CASAVA_Build 8 144277215 4D CACACACCCC CACA/---- CACACACTCA 3070 het 3070 ref 89 39 30 22 CA 5 3 370075 CASAVA_Build 8 144280317 1I2M1I GGGGCATGGG -TG-/CTGT ACAGGGACCA 3070 hom 30 het 11 0 10 1 N/A 0 0 370076 CASAVA_Build 8 144282389 1I ACTGCTCGTC -/G CCGTCCAGCT 3070 het 3070 hom 55 22 26 7 G 0 1 370077 CASAVA_Build 8 144285042 1D ACAAAAATGC A/- AAAAAAAAAA 3007 het 3007 ref 32 14 11 7 A 14 13 370078 CASAVA_Build 8 144289512 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 401 hom 19 1 15 3 T 11 10 370079 CASAVA_Build 8 144291549 1D CACACTGGGT G/- GGGGGATGCT 3070 het 3070 hom 32 14 14 4 G 6 5 370080 CASAVA_Build 8 144298800 6D GGATTTATTC TGTGGG/------ TGTGGGTGGT 2519 het 2375 hom 16 7 6 7 TGTGGG 2 1 370081 CASAVA_Build 8 144304835 4I CTGGGTGTGT ----/CCTG CCTGCCTCAC 3070 het 3028 hom 26 9 11 6 CCTG 1 2 370082 CASAVA_Build 8 144308742 1I TGAGAACAAA -/C CCCTACACCC 3070 het 3070 ref 56 27 24 5 C 3 4 370083 CASAVA_Build 8 144310299 4I GTGTGTGAAG ----/GAGT GAGCAGGGCG 3070 hom 64 het 26 0 20 6 GAGT 0 1 370084 CASAVA_Build 8 144333945 1D TATCCACAGA T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 T 7 6 370085 CASAVA_Build 8 144334897 14D6M8D TCTGTGTCTC CATGTGTGTCTGTGTCTGTGTGTGTCTC/--------------TCTGTG-------- TCTCTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 28 16 9 N/A 0 0 370086 CASAVA_Build 8 144335245 2I44M2D GGAGCATGTC --TGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCATGTATGTGCATGTGAGCATGTCTG/TGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCATGTATGTGCATGTGAGCATGTC-- TGTGTGCATG 3070 het 3070 ref 67 52 21 26 N/A 0 0 370087 CASAVA_Build 8 144369535 1I CCATCTAGGG -/T CAGTACCTGC 3070 het 1175 hom 17 6 9 2 T 0 1 370088 CASAVA_Build 8 144392477 1D TGGAAATCCC T/- TTTTTTTTTT 1657 het 904 hom 31 8 7 16 T 19 18 370089 CASAVA_Build 8 144397694 4I GCTTTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 75 het 39 0 26 13 TTTG 3 4 370090 CASAVA_Build 8 144402232 2D GGCACCAGGG CC/-- CACCCCCTGC 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 C 3 1 370091 CASAVA_Build 8 144406681 16D TTGTAGACTC CAGGCACAGTCAACTG/---------------- CAGGCACAGT 3070 hom 95 het 32 0 32 5 CAGGCACAGTCAACTG 2 1 370092 CASAVA_Build 8 144433180 1D ACAATGGTGG T/- TAGCGCAGCC 1335 het 1335 ref 32 16 5 11 T 2 1 370093 CASAVA_Build 8 144435111 1I CGATGAAGCT -/G CTTCTGCGAA 3070 hom 38 het 16 0 13 3 G 0 1 370094 CASAVA_Build 8 144447234 1D CACGTATGTG T/- CCCCTTCTCA 3070 het 3070 hom 44 19 17 8 T 1 0 370095 CASAVA_Build 8 144448629 4I CCTGGCTCAC ----/AAGA AAGAAAGGAA 3070 het 1784 hom 36 8 19 9 AAGA 1 2 370096 CASAVA_Build 8 144460097 1D ACCTAGAGAG C/- CAGCTCTAGG 2780 het 2780 ref 25 11 7 8 C 2 1 370097 CASAVA_Build 8 144466065 1D TCTTCATGAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 15 16 11 A 10 9 370098 CASAVA_Build 8 144471232 1D GGGCCGTGCT C/- CCCCCGCGCT 2875 hom 36 het 16 0 9 7 C 6 5 370099 CASAVA_Build 8 144472839 1D AATTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1569 hom 26 7 15 4 T 11 10 370100 CASAVA_Build 8 144477302 2I ATGCACGCCC --/CA CACACAGACA 3070 hom 53 het 27 0 15 12 CA 3 4 370101 CASAVA_Build 8 144481314 1I TCAGGCCAAA -/G GAAGAGGGTC 3070 hom 86 het 33 0 23 10 G 1 2 370102 CASAVA_Build 8 144498902 1D CTGGTGGCTG A/- AAAGGTCTGA 3070 hom 79 het 33 0 24 9 A 4 3 370103 CASAVA_Build 8 144506964 1I CTGTCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 1257 het 1257 ref 33 21 3 9 A 15 16 370104 CASAVA_Build 8 144508258 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 923 het 923 ref 20 15 3 2 A 13 12 370105 CASAVA_Build 8 144519689 1I ATTTTTTTTT -/C CTTTATAAAT 3070 hom 60 het 21 0 20 1 C 1 2 370106 CASAVA_Build 8 144530190 3I2M2D TATATGTGTG ---TGCA/CATTG-- TGTGTGTGCA 3070 het 988 hom 56 6 20 31 N/A 0 0 370107 CASAVA_Build 8 144530375 2I CTGTGTGTGC --/GT GCGTGTGTGT 3070 het 565 hom 60 3 48 9 GT 0 1 370108 CASAVA_Build 8 144543750 15D TGTGGGGTGA ATGACCGTGCAGTGT/--------------- GTGACATGGT 3070 het 3070 ref 67 30 19 28 ATGACCGTGCAGTGT 1 0 370109 CASAVA_Build 8 144544466 1D CATCCTGTCT C/- CCCCCCCGCC 1133 het 1133 ref 26 9 7 11 C 8 7 370110 CASAVA_Build 8 144549524 1I TATTTTAGCA -/C CCAGAGAAGT 3070 hom 108 het 38 0 34 4 C 2 3 370111 CASAVA_Build 8 144564749 5I TGGGCATTGC -----/AAGGA GAGAGTGGCA 3070 hom 64 het 25 0 18 7 AAGGA 0 1 370112 CASAVA_Build 8 144572157 2I CTATCCTCCC --/CT GTTCCTACCC 3070 hom 75 het 30 0 24 6 CT 0 1 370113 CASAVA_Build 8 144573279 10D CCTTCTGGGA GCTGAGCTGG/---------- GCTGAGCTGG 3070 hom 37 het 20 0 12 9 GCTGAGCTGG 2 1 370114 CASAVA_Build 8 144574890 7D GACAGGCGAG CCGTGCT/------- CCGTGCTCCG 1382 hom 17 het 8 0 6 2 CCGTGCT 3 2 370115 CASAVA_Build 8 144586117 2D GCTTGGACTC AG/-- TGGCACCCCC 3070 hom 55 het 21 0 13 9 AG 1 0 370116 CASAVA_Build 8 144599014 1D TCTGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 20 13 9 A 13 12 370117 CASAVA_Build 8 144607393 2D TAACTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 25 1 11 13 T 16 14 370118 CASAVA_Build 8 144608334 1D TCAACTTCAG A/- AAAAAAAAAA 659 het 659 ref 26 20 3 3 A 11 10 370119 CASAVA_Build 8 144610881 1D TCATCCCTAT A/- AAAAAATACA 3070 het 1076 hom 16 3 8 5 A 7 6 370120 CASAVA_Build 8 144616301 1I CCTGAGTCTC -/T TTTTTTTTTT 1799 het 1799 ref 20 8 6 6 T 13 14 370121 CASAVA_Build 8 144627482 1D AGTCCCTCAA G/- GTACGGGTGG 3070 het 3070 hom 43 15 19 10 G 2 1 370122 CASAVA_Build 8 144676233 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAATATA 234 het 234 ref 18 8 1 9 A 7 6 370123 CASAVA_Build 8 144685543 4I AAATTACGCG ----/ATCA ATTACCAAAA 3070 hom 96 het 35 0 30 5 ATCA 0 1 370124 CASAVA_Build 8 144690988 1D CCCTGCGCCT G/- GCCTGGCACA 3070 het 2438 hom 25 7 12 7 G 2 1 370125 CASAVA_Build 8 144693531 1D TTTTTAAAGC T/- TTTTTTTGTT 2714 het 2714 ref 20 10 8 2 T 8 7 370126 CASAVA_Build 8 144696232 1D ACTTTGCCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 2214 hom 20 7 11 4 A 10 9 370127 CASAVA_Build 8 144727047 10D GCGCGGGTGC CCTGGGGGTG/---------- CCTGGGGTGT 3070 het 2482 hom 29 11 16 4 CCTGGGGGTG 1 0 370128 CASAVA_Build 8 144731840 1I TCCTCTCGGA -/C CCCCCCAACC 2559 het 1144 hom 22 4 9 9 C 6 7 370129 CASAVA_Build 8 144736048 1D ATGCTGACTC A/- GGGGGGACTA 3070 het 3070 ref 31 13 14 5 A 1 0 370130 CASAVA_Build 8 144738019 6I CTTCTAGAAC ------/AACCTA AACCTAAACT 3070 hom 93 het 35 0 32 3 AACCTA 1 2 370131 CASAVA_Build 8 144747719 2I CAGCCCCGGC --/AA AGACTCCTAC 3070 hom 75 het 29 0 24 5 A 1 3 370132 CASAVA_Build 8 144748211 1D TCTTCCTGCG T/- GGAGTGAGGC 3070 hom 30 het 11 0 9 2 T 1 0 370133 CASAVA_Build 8 144755531 3D TTAAAAAGCA TCT/--- TCTCCCTAGC 3070 hom 57 het 26 0 18 9 TCT 2 1 370134 CASAVA_Build 8 144761076 4D GCACATGAGC ACAT/---- ACATACACAC 3070 het 3070 hom 70 26 38 10 ACAT 2 1 370135 CASAVA_Build 8 144775932 8D AGGATCACTT GAGCCCAG/-------- GAGGTCGAGG 3070 hom 32 het 12 0 10 2 GAGCCCAG 1 0 370136 CASAVA_Build 8 144779364 1D ACGCCTGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 12 0 9 3 T 12 11 370137 CASAVA_Build 8 144790850 8D TTTCAAGTGA TATTTATT/-------- TATTTATTTA 3070 hom 43 het 28 0 15 13 TATT 7 5 370138 CASAVA_Build 8 144798745 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2579 hom 33 het 14 0 9 6 A 14 12 370139 CASAVA_Build 8 144808971 1D TCTTTTCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 18 6 T 13 12 370140 CASAVA_Build 8 144844140 1D TTTGCTGAGT G/- GGGGGGCTCC 3070 hom 75 het 28 0 22 6 G 7 6 370141 CASAVA_Build 8 144844725 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2714 het 1999 hom 24 9 9 6 A 11 12 370142 CASAVA_Build 8 144849731 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 10 9 370143 CASAVA_Build 8 144855889 1D TGTGGAAGGA C/- ACAGCCTGCA 3070 hom 108 het 42 0 34 9 C 1 0 370144 CASAVA_Build 8 144873336 1D ACATCCCCAA C/- CCCCCCTCCA 3070 hom 47 het 18 0 14 5 C 7 6 370145 CASAVA_Build 8 144885277 2D ATAAAACGAA CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 53 het 20 0 18 3 C 11 9 370146 CASAVA_Build 8 144906089 1D TTTTTGCCAG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 10 9 370147 CASAVA_Build 8 144908210 2D TTTCTAATTT CC/-- CCAGTATATA 3070 hom 54 het 24 0 19 7 C 4 2 370148 CASAVA_Build 8 144916045 2D ATATCCTAAC AT/-- ATATGATGTA 3070 hom 75 het 29 0 26 4 AT 3 2 370149 CASAVA_Build 8 144928336 1D AGCACAATCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 713 hom 33 4 20 9 A 15 14 370150 CASAVA_Build 8 144932358 1D GTCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 269 hom 27 1 23 3 A 12 11 370151 CASAVA_Build 8 144933728 4D ATTAATTTAC TCAT/---- TCATTCATCA 3070 het 3070 ref 51 33 16 3 TCAT 3 2 370152 CASAVA_Build 8 144936613 4D CTTGTCAGTG CTTA/---- CTTTCTTGCT 2459 hom 15 het 11 0 6 6 CTTA 1 0 370153 CASAVA_Build 8 144941336 4D AAGCAAGCAG GGTC/---- GGTCTAAATG 3070 hom 120 het 43 0 40 3 GGTC 2 1 370154 CASAVA_Build 8 144955125 1D AGAAAACACA T/- TGACAATAGA 3070 hom 117 het 42 0 38 5 T 2 1 370155 CASAVA_Build 8 144966691 1I CTACCTTGCC -/T CCACAAGCCT 3070 hom 69 het 26 0 19 7 T 0 1 370156 CASAVA_Build 8 144981092 3I CTCATCAGTA ---/TTG TTAACAACAT 3070 hom 99 het 37 0 31 6 TTG 0 1 370157 CASAVA_Build 8 144997058 4D CCATTGCTGT AATA/---- AATAGTACCC 3070 hom 101 het 37 0 33 6 AATA 2 1 370158 CASAVA_Build 8 144998904 2I CTTTTATCTC --/TT TGTCTTGTGT 3070 hom 73 het 27 0 23 4 T 1 3 370159 CASAVA_Build 8 145008213 1D AGTCTAGGCG T/- TTTGAGACCA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 4 3 370160 CASAVA_Build 8 145019909 14I ATCTCCCCAC --------------/CTTTGGGTGCCTCT CTTTTGTTCT 1025 het 1025 ref 22 13 5 4 CTTTGGGTGCCTCT 0 1 370161 CASAVA_Build 8 145022097 1D GGCACAGTGG C/- CCCCACCCCC 1303 het 1303 ref 22 11 6 5 C 5 4 370162 CASAVA_Build 8 145025988 1I CTTCCTGCGG -/C TGAGCCATTG 3070 hom 71 het 27 0 21 6 C 0 1 370163 CASAVA_Build 8 145028576 1I CTAGGCCCCT -/C CCCAGCAGCT 3070 het 2168 hom 26 7 10 9 C 3 4 370164 CASAVA_Build 8 145038084 1I TGAGAGGAGG -/C CCGGGAACCG 2468 het 2157 hom 23 10 9 4 C 2 3 370165 CASAVA_Build 8 145043054 1D TTTCTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 2261 het 1311 hom 14 4 6 5 T 11 10 370166 CASAVA_Build 8 145128058 15D GAGTGGTGAA GGTGGTGGTGATGAT/--------------- GGTGATGGTG 3070 het 890 hom 41 11 20 20 GGTGGTGGTGATGAT 1 0 370167 CASAVA_Build 8 145171194 1D CTTGAAGGAA T/- TTTTTTTTTT 1439 het 1074 hom 21 8 5 8 T 15 14 370168 CASAVA_Build 8 145223654 27D CCTCCAGTCT GGCAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCC/--------------------------- ACTACCCCCA 3070 hom 81 het 26 0 24 7 GGCAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCC 1 0 370169 CASAVA_Build 8 145228134 1I ATTATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 763 hom 13 2 8 3 T 11 12 370170 CASAVA_Build 8 145231697 1D CGCGGAGCGA C/- CCAGCCCAGC 3023 hom 28 het 12 0 9 3 C 3 2 370171 CASAVA_Build 8 145232190 3I TGGCTGGAGC ---/TCT TCTTTTGGAG 3070 hom 69 het 24 0 23 1 TCT 1 2 370172 CASAVA_Build 8 145240287 1I TGTCCAGGCT -/G GGGGAATCCA 3070 hom 71 het 29 0 22 7 G 4 5 370173 CASAVA_Build 8 145253848 3D AGGCTGAGAC AGG/--- AGAATTGCTT 3070 hom 34 het 13 0 10 3 AGG 1 0 370174 CASAVA_Build 8 145254221 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 11 10 370175 CASAVA_Build 8 145289718 1I GGTTCAAGTG -/A ATTCTCATGC 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 1 2 370176 CASAVA_Build 8 145302511 19D GAGTGTCTAG ATTATGAAAGTCAGAAACA/------------------- ATAGGCTGGG 3070 hom 56 het 18 0 16 5 ATTATGAAAGTCAGAAACA 1 0 370177 CASAVA_Build 8 145303625 1D GAGGCTAAGG C/- AGGAGAATCA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 1 0 370178 CASAVA_Build 8 145304668 3D AAGCATGTGG CTT/--- CTTCTCTTCC 3070 hom 89 het 32 0 28 6 CTT 2 1 370179 CASAVA_Build 8 145305081 1I CTGGAGTGCA -/G GTGGCGCGAT 1377 hom 21 het 11 0 6 5 G 1 2 370180 CASAVA_Build 8 145323759 1I AGACCGAGGC -/G GGTGGACCAC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 G 2 3 370181 CASAVA_Build 8 145323873 1D TAATCCCAGC T/- TACTCAGGAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 2 1 370182 CASAVA_Build 8 145334349 1D AGTGCTGGGA T/- TTACAGGCGT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 T 3 2 370183 CASAVA_Build 8 145337576 4D GGAGACTCTG TCTC/---- TCTCTCTCTC 3070 hom 36 het 21 0 13 8 TC 8 6 370184 CASAVA_Build 8 145343576 12D TTTTTACTGC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 26 8 T 23 11 370185 CASAVA_Build 8 145348927 21D10M11D GGCTCAACTC CTAGGATTGCTGGGGTGACAACTGCAGATTCAGGGACCAGAT/---------------------CTGCATGTCC----------- TTATGGTACA 2585 het 2585 ref 23 21 6 8 N/A 0 0 370186 CASAVA_Build 8 145468173 8I TGCACCCCAG --------/ACTCCAGA CCCCAGACTC 2766 hom 24 het 10 0 8 2 ACTCCAGA 0 1 370187 CASAVA_Build 8 145473085 17I CAAGGACGAG -----------------/GTGCCAGGAGCTCGGCA GTGCCAGCAG 2426 het 1752 hom 25 9 11 5 GTGCCAGGAGCTCGGCA 0 1 370188 CASAVA_Build 8 145474222 1D CACGGGCCAA G/- ACCACCATGG 1425 het 1425 ref 36 21 7 10 G 1 0 370189 CASAVA_Build 8 145484828 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2305 het 837 hom 14 2 6 6 A 15 14 370190 CASAVA_Build 8 145487444 9D GACCCTGTCT AAGAAAAAA/--------- AAGAAAAAAA 2051 het 2051 ref 27 15 6 6 AAGAAAAAA 2 1 370191 CASAVA_Build 8 145498632 5D TTTGGGAATT GAGGG/----- GAGAAGGGTC 3070 het 3070 ref 36 18 13 6 GAGGG 1 0 370192 CASAVA_Build 8 145546786 1D CTCCCACCTT A/- AGCCTCCTGA 3070 hom 63 het 23 0 21 3 A 2 1 370193 CASAVA_Build 8 145598365 1D GCTGCCTCTC T/- TATCTCCTCC 3070 het 3070 ref 32 14 12 7 T 2 1 370194 CASAVA_Build 8 145603581 7I CCCAGCTAAC -------/TTTTATA TTTTATATTT 3070 hom 81 het 35 0 28 7 TTTTATA 1 2 370195 CASAVA_Build 8 145651748 1I CCTCTCACAG -/C CCCCCCGCCC 3070 hom 47 het 18 0 13 5 C 6 7 370196 CASAVA_Build 8 145659548 3D CGGAATCTAA TCC/--- TCTGCTCGTC 2816 het 2816 ref 24 12 10 3 TCC 1 0 370197 CASAVA_Build 8 145666445 1D CAGGTGGCCA G/- GGTCACCCTG 3070 hom 109 het 44 0 37 7 G 3 2 370198 CASAVA_Build 8 145709576 1D ACCACCACCC G/- GCAACTGGCC 1563 hom 38 het 22 0 10 12 G 2 1 370199 CASAVA_Build 8 145754786 1I CGCCTGGCCA -/T TAAATTCTAG 3070 hom 45 het 20 0 14 6 T 1 2 370200 CASAVA_Build 8 145801703 1D CCCGGGCAGC T/- TCCGCAGGTC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 T 2 1 370201 CASAVA_Build 8 145804350 11D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 2687 hom 31 het 15 0 8 8 A 25 14 370202 CASAVA_Build 8 145809684 1I TGGTGGACAG -/T TTTTTTTTTT 1116 het 1116 ref 37 21 4 12 T 13 14 370203 CASAVA_Build 8 145820557 3I ATAAAGAGGA ---/AAG AAGAGGAAGC 3070 hom 63 het 23 0 22 1 AAG 1 2 370204 CASAVA_Build 8 145883956 1D TTCCCACCCC T/- GTGACCACAC 3070 het 3070 ref 93 35 24 35 T 1 0 370205 CASAVA_Build 8 145894800 1I CTCTAATCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 14 19 9 T 10 11 370206 CASAVA_Build 8 145921211 1D TTCTTTCTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2322 hom 24 9 9 6 T 10 9 370207 CASAVA_Build 8 145932403 1D CCCTCCCTCC T/- TTCCCGACTT 3070 hom 51 het 20 0 17 3 T 3 2 370208 CASAVA_Build 8 145953434 1I AAATACATCA -/T TACTAGTTGT 3070 hom 81 het 36 0 28 8 T 1 2 370209 CASAVA_Build 8 145959440 2D TCGTGGAGTG CA/-- CAGTCTGCTG 3070 hom 96 het 36 0 31 5 CA 2 1 370210 CASAVA_Build 8 145963120 1D CTGGCTGGGT A/- GGCTCTGCCC 3070 hom 76 het 29 0 24 5 A 1 0 370211 CASAVA_Build 8 145980352 1I ACGTCTCCAG -/A AAAAAAAAAA 591 het 591 ref 24 12 3 9 A 15 16 370212 CASAVA_Build 8 145989695 1I GAGGGTGGAA -/G GGGTGTCCTG 3070 hom 41 het 18 0 12 6 G 3 4 370213 CASAVA_Build 8 145992176 3D CTAAGAAAAA TTC/--- TTCTGCCTTG 3070 hom 36 het 13 0 13 0 TTC 2 1 370214 CASAVA_Build 8 146001402 1I17M1I CTAGTGGCCC -TGTCCGGGCGTGACAGA-/TTCTCTGGGCGTGAATGAG GGCTCACACT 3070 het 3070 ref 43 33 12 2 N/A 0 0 370215 CASAVA_Build 8 146013397 1D TTTCCTTCTG T/- TTTTCCCCCA 3070 hom 116 het 42 0 38 4 T 5 4 370216 CASAVA_Build 8 146014016 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 20 0 17 3 A 14 13 370217 CASAVA_Build 8 146017297 1D AAGGAGTCTA G/- GGGAGCTCAG 3070 hom 90 het 31 0 28 3 G 4 3 370218 CASAVA_Build 8 146043381 1D GAGAGGGAGA G/- GAAGAGGGGC 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 G 2 1 370219 CASAVA_Build 8 146044493 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3050 het 2937 hom 17 8 7 2 A 9 10 370220 CASAVA_Build 8 146044688 1I CTCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3056 hom 31 10 12 9 A 13 14 370221 CASAVA_Build 8 146050093 1I GCCATTTCAT -/A ACCATTAGAA 3070 het 3070 ref 34 17 14 3 A 1 2 370222 CASAVA_Build 8 146051330 6I TAGGGGTTGA ------/TATTAT TATTATTAAC 3070 het 3070 ref 41 26 9 6 TAT 2 4 370223 CASAVA_Build 8 146079532 1D AAATAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2789 hom 35 13 12 11 T 15 14 370224 CASAVA_Build 8 146102277 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 24 1 19 4 A 12 11 370225 CASAVA_Build 8 146103123 3D CTCTGTCTTC TTT/--- GAGATGGACT 3070 het 2690 hom 24 8 13 3 T 3 0 370226 CASAVA_Build 8 146104846 4D TTTTTTCTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2865 hom 30 het 14 0 11 3 TTTC 3 2 370227 CASAVA_Build 8 146117283 1D TCCTCACACT C/- CATGAGGTTG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 C 2 1 370228 CASAVA_Build 8 146119994 1D CGTACTGAAA T/- TAAAATTCCC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 1 370229 CASAVA_Build 8 146131399 1D TTAAGAAAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 T 10 9 370230 CASAVA_Build 8 146132133 5D GAGGTGAAAT TAACA/----- TAACATAAAA 3070 het 3070 ref 38 21 12 7 TAACA 2 1 370231 CASAVA_Build 8 146140265 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 493 het 493 ref 18 12 3 3 T 11 10 370232 CASAVA_Build 8 146148722 2I ACACACACAC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 AT 5 6 370233 CASAVA_Build 8 146158214 1D TTTTTTTTTG T/- TTGTTATGTT 2902 het 640 hom 18 5 8 6 T 3 2 370234 CASAVA_Build 8 146164559 3D TTAAAAAATG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 17 11 4 A 15 12 370235 CASAVA_Build 8 146168931 4D ACTGGACTTG TTTT/---- TTTTTCTTTT 3070 het 488 hom 40 5 18 17 T 9 5 370236 CASAVA_Build 8 146171842 1I GACTCACCTT -/A ATTCCTTGAC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 1 2 370237 CASAVA_Build 8 146177001 1I AAATAAGACA -/G TCATAGAAGG 3070 het 3070 hom 57 22 32 3 G 0 1 370238 CASAVA_Build 8 146177084 14D AGTGCAATCG TGGTTGCCAGGGGT/-------------- TGGTTGCCAG 3070 het 3070 ref 38 16 17 10 TGGTTGCCAGGGGT 2 1 370239 CASAVA_Build 8 146181033 1D TTAACAAACA T/- TAAGTTGTTA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 2 1 370240 CASAVA_Build 8 146181440 1D ATTTAAAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 30 het 18 0 10 8 A 9 8 370241 CASAVA_Build 8 146182903 1I TGAAATTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 T 10 11 370242 CASAVA_Build 8 146187461 2D CTCAATGCCT AC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 15 10 AC 1 0 370243 CASAVA_Build 8 146210042 4I TTTTTTTATT ----/ATTA TACTTTAAAT 3070 het 3070 hom 40 19 19 3 ATTA 0 1 370244 CASAVA_Build 8 146221035 1D GAAGTACTTT C/- TCCTGTCTGG 3070 het 3070 ref 30 15 10 7 C 1 0 370245 CASAVA_Build 8 146221369 1D CCTTAGTTAA T/- TGCCCTGGTA 2925 het 2925 ref 44 35 7 6 T 2 1 370246 CASAVA_Build 8 146223939 3D CGGGAATCTC TCG/--- TCGGCTGTCC 3070 het 3070 ref 53 32 19 4 TCG 2 1 370247 CASAVA_Build 8 146237266 3D TCCCTGATAA TTT/--- TTTTTCTTTC 3070 het 3070 ref 32 17 12 4 T 8 5 370248 CASAVA_Build 8 146241561 9D TAAAACCTCA GCAGGTTAG/--------- GCTCTGGTAA 3070 hom 108 het 39 0 37 7 GCAGGTTAG 1 0 370249 CASAVA_Build 8 146242506 1I TTTTCTATGC -/T TTTTTTCTTG 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 6 7 370250 CASAVA_Build 8 146247663 1D AAACCCTACT C/- AGCCTCACCT 3070 hom 101 het 38 0 30 10 C 1 0 370251 CASAVA_Build 8 146253232 1I TTTTCCCCCC -/T AATCAGACTC 3070 hom 77 het 32 0 26 6 T 0 1 370252 CASAVA_Build 8 146262720 1D CAAGGAAGGG C/- CCCCTGTCCA 3070 hom 92 het 35 0 29 6 C 5 4 370253 CASAVA_Build 8 146263059 1D CACTGCATAC T/- TTTTTTTCTT 2980 hom 57 het 24 0 19 5 T 8 7 370254 CASAVA_Build 8 146269710 1D TCTTGAGTTA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 178 hom 29 2 10 18 T 8 7 370255 CASAVA_Build 8 146269898 9D TTTCATTGGT CTATGTGTC/--------- TGTTTTTGTA 714 het 714 ref 14 11 3 0 CTATGTGTC 1 0 370256 CASAVA_Build 8 146271888 1D TGGAATTCTC G/- GGGCAGAGGA 3070 het 3070 ref 83 52 17 15 G 4 3 370257 CASAVA_Build 17 303 1I GACACACAGT -/A GCCTGCGACA 3070 hom 126 het 50 0 41 9 A 0 1 370258 CASAVA_Build 17 5523 2I CCCTGAGTTA --/GT GTCTCTCCCC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 GT 1 2 370259 CASAVA_Build 17 26188 2I TTGGTGCGGG --/GA GGGTGCGGGG 2083 het 2083 ref 20 8 7 5 GA 0 1 370260 CASAVA_Build 17 29464 1D GCAGAGGGGA G/- GGGGGGTGGA 3070 hom 57 het 22 0 16 6 G 7 6 370261 CASAVA_Build 17 29571 1D AGCCCCCACG C/- CCCAGGGCAG 2871 hom 40 het 18 0 13 5 C 4 3 370262 CASAVA_Build 17 38640 3D GAGTTTCTTT AAG/--- AGAGTTTCTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 AAG 1 0 370263 CASAVA_Build 17 40517 1D TACAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 23 4 A 11 10 370264 CASAVA_Build 17 44067 1D ACCATCCCAT G/- GGGGGGCTCA 3070 hom 95 het 37 0 32 7 G 7 6 370265 CASAVA_Build 17 44987 5I AGGCTGATCT -----/CAAAC TACTGGGCTA 3070 hom 87 het 32 0 27 5 CAAAC 0 1 370266 CASAVA_Build 17 48422 34D CAGGATCCCA AGCTTGGAACCCAGGTGTCCACAGCAGGATCCCG/---------------------------------- AGCTTGGAAC 3070 het 951 hom 38 9 20 16 AGCTTGGAACCCAGGTGTCCACAGCAGGATCCCG 1 0 370267 CASAVA_Build 17 48617 1D CCTTTAATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 10 9 370268 CASAVA_Build 17 55519 1I CGTCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 505 hom 26 2 18 6 T 15 16 370269 CASAVA_Build 17 55995 1D GCCCCCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 271 hom 31 6 12 14 A 11 10 370270 CASAVA_Build 17 66205 4D TTAACCTAAT GAGA/---- GAGAGATGTT 3070 hom 78 het 29 0 26 5 GA 5 3 370271 CASAVA_Build 17 72988 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 565 hom 19 3 15 1 A 13 14 370272 CASAVA_Build 17 74744 1D ATCACACACC G/- GGGCCTGTCA 1727 hom 12 het 7 0 4 3 G 4 3 370273 CASAVA_Build 17 77264 1D GCACTGCGCT G/- GGGATGTGGG 3070 hom 59 het 23 0 19 4 G 4 3 370274 CASAVA_Build 17 84263 1D AGAGCTCCAG T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 57 het 22 0 17 5 T 7 6 370275 CASAVA_Build 17 87783 1I CTACAGATAC -/A AAAAAAATTA 2411 het 2411 ref 26 13 8 5 A 7 8 370276 CASAVA_Build 17 87961 4D GAAGAGAGAA AGAG/---- AGAGAGAGAG 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 AG 7 5 370277 CASAVA_Build 17 93799 1D CTATTGATTA C/- CCTTCCTCTA 624 het 624 ref 41 26 3 12 C 3 2 370278 CASAVA_Build 17 94228 1D GGGAAGAGAA T/- GGGGGGGGAG 3070 het 3070 ref 40 20 14 6 T 1 0 370279 CASAVA_Build 17 115645 1I CTTCTCTCCT -/G TGTGAGTGTT 3070 hom 84 het 31 0 27 4 G 0 1 370280 CASAVA_Build 17 134992 2D CTCGGTCCCC CT/-- GAGCCTGCAC 2359 het 2359 ref 33 14 8 12 CT 1 0 370281 CASAVA_Build 17 144090 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 11 10 370282 CASAVA_Build 17 148504 2I TCAAAAAAAA --/AC AAAAAAACTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AC 0 1 370283 CASAVA_Build 17 149086 1D CTGGGCAGAA G/- GGTCTCACCC 3070 hom 49 het 19 0 15 4 G 3 2 370284 CASAVA_Build 17 180667 1I ACATAATCTC -/A AAAAAAAAAA 2946 hom 5 het 16 0 11 5 A 14 15 370285 CASAVA_Build 17 185813 62D TGCCTAGGCC AGGGCGACAGGGAGGAGATGGGGTTTAGAGGAGGGAAAAGAAGCTGGGACAAACATAAAAGA/-------------------------------------------------------------- ATACTTGCCA 3070 hom 63 het 13 0 17 9 AGGGCGACAGGGAGGAGATGGGGTTTAGAGGAGGGAAAAGAAGCTGGGACAAACATAAAAGA 1 0 370286 CASAVA_Build 17 186914 1I GCACCAATAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 29 0 22 7 T 11 12 370287 CASAVA_Build 17 188221 1I TGCCCTCCAG -/C CTGGGTAACA 2478 hom 30 het 19 0 8 11 C 1 2 370288 CASAVA_Build 17 193723 6I TCATCATCAC ------/CATCAT CATCATCATC 3070 hom 131 het 55 0 41 14 CAT 4 6 370289 CASAVA_Build 17 197374 1I GACTCTGTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 12 14 14 A 10 11 370290 CASAVA_Build 17 197795 1I CATCTCTACC -/A AAAAAAAAAA 2759 het 1372 hom 27 4 10 13 A 13 14 370291 CASAVA_Build 17 202932 1I CTGAAGCCCC -/A GCTGCCTGGA 3070 hom 72 het 25 0 23 2 A 0 1 370292 CASAVA_Build 17 203210 1D TTTCATGCTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 A 10 9 370293 CASAVA_Build 17 204229 2I GACCACACAC --/CA CACACACATA 2755 het 2494 hom 22 9 9 4 CA 4 5 370294 CASAVA_Build 17 205331 1I GATCCCCAGG -/T TGCCAGGCCC 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 T 1 2 370295 CASAVA_Build 17 208453 1I AGTGGCTAAC -/A AAGCCAGAAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 A 2 3 370296 CASAVA_Build 17 209497 1I TTTTTTTTTT -/C CAGAGACAGG 3070 het 1303 hom 16 3 10 3 C 1 2 370297 CASAVA_Build 17 211033 1I TTTGTCAGGC -/G GGCATGGACC 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 G 2 3 370298 CASAVA_Build 17 214589 3D CTGGTCTCTT CTC/--- CTCACTATCC 1962 het 1962 ref 22 13 5 4 CTC 2 1 370299 CASAVA_Build 17 215349 4D CATCTCAAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 1353 het 1353 ref 20 13 5 4 AAAG 3 2 370300 CASAVA_Build 17 218850 2D TAATTTCTCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2015 hom 31 10 13 8 T 12 10 370301 CASAVA_Build 17 221410 42I GCTCCTTCTA ------------------------------------------/GGCAGGGTCCTCATGGGACGCTCAACCTGCAAAAATGAGTCT GGCAGACCCA 3070 het 3070 ref 38 17 14 8 GGCAGGGTCCTCATGGGACGCTCAACCTGCAAAAATGAGTCT 0 1 370302 CASAVA_Build 17 236437 1D TCACTGTAGG C/- CCCTCAGCTG 3070 het 3070 hom 24 9 10 6 C 4 3 370303 CASAVA_Build 17 238225 2D AGAACAAAAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 927 hom 19 4 13 2 T 13 11 370304 CASAVA_Build 17 238884 1I CCTGTGTTTT -/C CCCTTCACCC 2801 het 534 hom 20 3 13 4 C 3 4 370305 CASAVA_Build 17 239796 1D GCAGGGAAGA G/- GGGGGGGTGG 3070 hom 36 het 15 0 13 2 G 8 7 370306 CASAVA_Build 17 250357 3D TATCCAAACC AAG/--- AAGTCAAACA 3070 het 3070 ref 19 10 8 1 AAG 2 1 370307 CASAVA_Build 17 251217 3D AGGAGCGTGT CTC/--- CTCCTCCCTT 3070 het 3070 ref 39 17 17 5 CTC 3 2 370308 CASAVA_Build 17 256292 1D AATGGGAAAA G/- GAATGTCTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 G 2 1 370309 CASAVA_Build 17 261789 1D ACACCTTCAC A/- AACACACATA 3070 het 3070 ref 60 30 16 15 A 3 2 370310 CASAVA_Build 17 267665 3I TTCACCTCTG ---/CCT CCTCCATATC 3070 hom 126 het 46 0 41 5 CCT 1 2 370311 CASAVA_Build 17 279967 1D AAAGAAAATA T/- GGCAAATGTA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 T 1 0 370312 CASAVA_Build 17 285060 4D ATATTTAGTT ATTA/---- ATTCTAATAA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 ATTA 1 0 370313 CASAVA_Build 17 285160 1D TCCTTTCCAA T/- TTTTTTTTTT 2586 het 431 hom 18 4 9 5 T 17 16 370314 CASAVA_Build 17 286939 1I CATTTCTTGG -/C CGGGCGCAGT 3070 hom 33 het 15 0 11 4 C 1 2 370315 CASAVA_Build 17 287634 1I AGGGCTGAGT -/G GAACAGATCT 3070 hom 138 het 54 0 47 7 G 1 2 370316 CASAVA_Build 17 292550 1D CTTTTTTTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 26 10 10 8 A 10 9 370317 CASAVA_Build 17 343704 1D AAGCAATCCA C/- CCCCGTCCTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 C 5 4 370318 CASAVA_Build 17 347783 7D CCCTTGCCCT TTGCCCC/------- TTGCCCCTTG 1743 het 1743 ref 31 13 7 12 TTGCCCC 2 1 370319 CASAVA_Build 17 352540 1I TGGCGTCTCG -/C CCTATTGCCC 3070 hom 22 het 14 0 13 1 C 2 3 370320 CASAVA_Build 17 353298 1D CAAGATTTTC T/- TTTGATTTCT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 T 4 3 370321 CASAVA_Build 17 367234 5D CTCGCAACAC TTCTT/----- TTCTCCTCCG 3070 het 3070 ref 32 15 10 8 TTCTT 1 0 370322 CASAVA_Build 17 368275 1D CAGGAAGGGC G/- GGGGGGGCGG 2022 het 780 hom 15 4 9 3 G 8 7 370323 CASAVA_Build 17 374294 3I AAAAATAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 2886 het 2886 ref 24 10 7 7 AAG 5 6 370324 CASAVA_Build 17 380017 1I GCAATACAGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 9 11 6 A 11 12 370325 CASAVA_Build 17 399574 1D GATTTTATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 14 14 12 A 11 10 370326 CASAVA_Build 17 412744 1I TCCTAGGAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 22 8 A 11 12 370327 CASAVA_Build 17 418410 1I TTTTGTGGGC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 829 hom 14 3 8 3 T 8 9 370328 CASAVA_Build 17 421520 17D CCCTCTCCCT ACGGTCTCCCTCTCCCC/----------------- ACGGTCTCCC 1975 het 1891 hom 22 10 7 8 ACGGTCTCCCTCTCCCC 1 0 370329 CASAVA_Build 17 438964 2D ATTTAATTTG TC/-- TAACTCTATA 3070 het 3070 hom 32 11 15 7 TC 1 0 370330 CASAVA_Build 17 453582 1D TGACAAAGCC T/- TGTGGTGATG 3070 het 3070 ref 48 26 19 4 T 2 1 370331 CASAVA_Build 17 472379 1D CCCGCAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 6 A 12 11 370332 CASAVA_Build 17 494594 1I TTTTTCCCCC -/T GAGACGGGTC 3070 het 2289 hom 25 9 10 6 T 0 1 370333 CASAVA_Build 17 505306 15I TCTACTTTAT ---------------/AAAAAGTAGATTGAA AAAAAAAAGT 3070 hom 110 het 40 0 35 5 AAAAAGTAGATTGAA 0 1 370334 CASAVA_Build 17 513804 10D ATTGGGAATC CAATGGTAAA/---------- CAAGACAGTA 3070 het 3070 ref 41 21 16 9 CAATGGTAAA 1 0 370335 CASAVA_Build 17 517295 1I TGGTATAGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 T 9 10 370336 CASAVA_Build 17 526057 1D AAGCCAAAAC A/- GATGTATTAT 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 A 1 0 370337 CASAVA_Build 17 528922 1D AGCCACCGCG C/- CCCCGCCATT 3070 hom 44 het 18 0 14 5 C 5 4 370338 CASAVA_Build 17 537565 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1161 het 1052 hom 25 8 5 12 A 17 16 370339 CASAVA_Build 17 543817 1I TTTGTCCATA -/T TGCCACTCCC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 1 2 370340 CASAVA_Build 17 557148 2I GAAGCCTAAC --/TT ATTTAAAATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 0 2 370341 CASAVA_Build 17 566730 1I TATTTTGGAC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 9 10 370342 CASAVA_Build 17 573394 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1501 hom 14 3 9 3 A 10 9 370343 CASAVA_Build 17 578057 12D CCCCCTGTGC CGTATCTTTCTA/------------ TGTCTCTTCC 3070 het 3070 ref 29 11 12 9 CGTATCTTTCTA 1 0 370344 CASAVA_Build 17 583071 3I GCGCGCTGTT ---/CTC CTCTCCGCCC 1773 het 911 hom 12 3 6 3 CTC 1 2 370345 CASAVA_Build 17 589164 1I AAGGCATGCG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2911 hom 25 7 15 3 T 11 12 370346 CASAVA_Build 17 592888 1D TTTAATTGTC T/- TTTTTTTTTA 1481 het 1481 ref 28 19 4 5 T 10 9 370347 CASAVA_Build 17 593453 1I CTTAAACTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 9 10 370348 CASAVA_Build 17 593773 1I ATTTTTGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 25 0 19 6 T 10 11 370349 CASAVA_Build 17 594174 2D CAACAAAGAC TG/-- TACACACTCC 3070 hom 119 het 46 0 39 10 TG 1 0 370350 CASAVA_Build 17 604876 1I ATAAAGTTTT -/A AAAAAAAAAA 1048 het 1048 ref 40 33 3 4 A 11 12 370351 CASAVA_Build 17 628381 1D GACAGCCGGC T/- GGTGTTAGAG 2812 het 2812 ref 29 17 7 6 T 1 0 370352 CASAVA_Build 17 633047 1D TAGTTACCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 12 11 370353 CASAVA_Build 17 670446 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAATTA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 A 7 8 370354 CASAVA_Build 17 673391 2I TCTGGCTCAG --/AA AAAAAAAAAA 2994 hom 42 het 17 0 15 2 A 12 14 370355 CASAVA_Build 17 678907 1I AATTCTTGGA -/G GAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 1 2 370356 CASAVA_Build 17 715241 1I GGAGTTACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 30 0 20 10 T 10 11 370357 CASAVA_Build 17 737977 2D CGTGTAAAAC AG/-- AGAGGTCTGT 3070 hom 97 het 39 0 29 10 AG 3 2 370358 CASAVA_Build 17 745647 1D CTTAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2211 hom 15 het 6 0 6 0 A 12 11 370359 CASAVA_Build 17 747677 1I TCTTTTATTC -/T TTTTTTCGAG 3070 hom 56 het 22 0 19 6 T 6 7 370360 CASAVA_Build 17 750271 1D CAAAAAAAGG A/- AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 33 0 31 3 A 9 8 370361 CASAVA_Build 17 751240 2I TTTGTATCCA --/GT AAACCCCTCT 3070 hom 51 het 18 0 17 1 GT 0 1 370362 CASAVA_Build 17 754432 2D GGCTGTAAAG TC/-- TCTCTCTCTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 TC 5 4 370363 CASAVA_Build 17 755313 1I TTCAGGAGGT -/G GGGAAAATCC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 G 3 4 370364 CASAVA_Build 17 756563 3D GGTTTCTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 27 0 21 6 T 14 11 370365 CASAVA_Build 17 757333 2D TCAATACCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 25 0 21 4 T 16 14 370366 CASAVA_Build 17 763286 2D CCCAAATGAC AG/-- AACTCATCCA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 AG 1 0 370367 CASAVA_Build 17 774706 5D AAAGACTAAC TCCGT/----- TCCGTTCCGT 3070 hom 121 het 45 0 38 7 TCCGT 4 3 370368 CASAVA_Build 17 776740 1I TCGTCATGTT -/G CCCAAGCTGC 3070 hom 42 het 20 0 13 7 G 0 1 370369 CASAVA_Build 17 780765 1D TTGAGTTTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 44 hom 23 1 14 8 T 15 14 370370 CASAVA_Build 17 789947 1D TTTTTTCTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 17 0 12 6 T 10 9 370371 CASAVA_Build 17 797457 12D GCGTGGTGGC TCACACCTGTAA/------------ TCCCAGCAAT 2179 het 2179 ref 20 12 5 6 TCACACCTGTAA 1 0 370372 CASAVA_Build 17 800933 1D CTGTCAACTC T/- TGACTTTCTG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 T 2 1 370373 CASAVA_Build 17 807622 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 346 hom 23 2 15 6 A 14 15 370374 CASAVA_Build 17 810606 1I GTAGCTGAAC -/T TACAGGCACA 3070 hom 72 het 27 0 25 2 T 1 2 370375 CASAVA_Build 17 817962 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1362 het 1362 ref 26 13 4 9 A 15 16 370376 CASAVA_Build 17 826180 2D ATTTTTGTCC TT/-- TTTTTTTTTG 3000 het 3000 ref 33 16 10 7 T 11 9 370377 CASAVA_Build 17 826759 1I AAATAATTCC -/T TTTTTTTTTT 2042 het 1633 hom 20 6 8 6 T 15 16 370378 CASAVA_Build 17 828412 1D AGTTGACAGC A/- AAGTATCCAT 3070 het 3070 hom 36 14 17 5 A 3 2 370379 CASAVA_Build 17 850320 2D TATCAGCTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 28 0 19 9 A 17 15 370380 CASAVA_Build 17 879093 1D GATTTGAGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 268 hom 21 1 13 7 A 15 14 370381 CASAVA_Build 17 882686 4D TTGACCTTCA ATTT/---- ATTTAGTGAA 3070 het 3070 hom 27 10 16 2 ATTT 2 1 370382 CASAVA_Build 17 898388 1D GGGGCAATGC T/- ACCAAGGACC 3070 het 3070 ref 28 12 12 5 T 1 0 370383 CASAVA_Build 17 911551 1D TTTTTTTTTT G/- AGATGGAGTC 2973 het 2382 hom 25 7 9 9 G 1 0 370384 CASAVA_Build 17 955453 2I AAATCACCAC --/AT GTGGGGCCCG 3070 hom 30 het 15 0 11 4 AT 0 1 370385 CASAVA_Build 17 956181 1I TTTACCTCTG -/C CCCCCCAGGA 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 C 6 7 370386 CASAVA_Build 17 966280 1D ACTGTTTATA C/- AGTGAAACAA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 C 1 0 370387 CASAVA_Build 17 969503 1I TGAGCCTTCC -/T TTGCTCCTCC 3070 hom 63 het 29 0 22 7 T 2 3 370388 CASAVA_Build 17 969887 1I TCACCCAGGC -/A GGGGTACAAT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 0 1 370389 CASAVA_Build 17 970601 2D GTCTAATCCC CT/-- GTTTCGATTT 3070 het 3070 ref 51 26 21 5 CT 1 0 370390 CASAVA_Build 17 973287 1I AAGGCAGGTG -/C CGCGGATGGG 3070 hom 51 het 22 0 14 8 C 1 2 370391 CASAVA_Build 17 979378 3D5M11I TGGTGAAGCC ATACTGGC-----------/---CTGTCTCTACTAAAAA TACAAAAAAA 3070 hom 69 het 24 0 22 2 N/A 0 0 370392 CASAVA_Build 17 983209 1I CTCCGTCTCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1064 hom 30 4 19 7 A 15 16 370393 CASAVA_Build 17 984377 1D ACTCCCTCTC A/- AAAAAATAAA 79 het 3 hom 12 0 1 12 A 7 6 370394 CASAVA_Build 17 985841 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAATAA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 A 8 7 370395 CASAVA_Build 17 985923 1I AATTTTAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 3 het 19 1 16 2 T 10 11 370396 CASAVA_Build 17 986971 2I AAATCATTTC --/TT TTTTTTTTTC 3070 het 328 hom 42 1 29 12 T 9 11 370397 CASAVA_Build 17 989067 2I TAAAGGAATT --/TC TCTTTCTTTT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TC 1 2 370398 CASAVA_Build 17 991722 1D ACTTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 27 hom 30 2 18 10 T 12 11 370399 CASAVA_Build 17 997236 1I GTTTTGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 967 hom 27 3 13 11 T 14 15 370400 CASAVA_Build 17 1011463 1D TTTTTTAAAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 29 11 14 4 T 8 7 370401 CASAVA_Build 17 1017209 4D TGGCTGGGCG GAGA/---- GAGAGGCCAC 3070 het 3070 ref 36 16 12 10 GA 4 2 370402 CASAVA_Build 17 1022995 1D AGGTAATCCA C/- CCCCCCCATC 2639 het 2079 hom 17 6 7 5 C 8 7 370403 CASAVA_Build 17 1034712 1I TATTGAGTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 14 12 T 12 13 370404 CASAVA_Build 17 1039733 5D CCCTTCTGGT CTTAA/----- CTTAAGTATC 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 CTTAA 2 1 370405 CASAVA_Build 17 1043649 1D CATTCACTCA G/- GAAGAGCTCG 3070 het 3070 hom 48 20 23 7 G 2 1 370406 CASAVA_Build 17 1049970 1I CTCTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2035 het 2035 ref 21 12 5 4 T 11 12 370407 CASAVA_Build 17 1051722 4D GCATTTTTGC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 het 1357 hom 25 6 14 5 TTGT 3 2 370408 CASAVA_Build 17 1057140 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAGCC 3070 het 7 hom 15 1 9 5 C 0 1 370409 CASAVA_Build 17 1061332 16D CAAAAAAATG AATAAATAAATAAATA/---------------- AATAAATAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 AATA 7 3 370410 CASAVA_Build 17 1064384 2I GATGTGTGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 36 16 13 7 TA 6 7 370411 CASAVA_Build 17 1076972 1I CACTTCCTCA -/C CGAGGAGGCT 3070 hom 150 het 55 0 49 6 C 1 2 370412 CASAVA_Build 17 1080161 4I ATTGATTGAC ----/TGAT TGATTGATTG 3070 hom 43 het 18 0 15 3 TGAT 3 4 370413 CASAVA_Build 17 1082386 4D CCAAAAAGAC AAAA/---- AAATCCACTA 2979 het 2979 ref 28 13 8 7 A 7 3 370414 CASAVA_Build 17 1086682 1I GAGGCCGAGG -/C GGGCAGATCA 3070 hom 42 het 16 0 11 5 C 0 1 370415 CASAVA_Build 17 1094645 1I GGATGAAAGG -/T GTAAGCCACC 2964 het 2787 hom 19 10 7 2 T 0 1 370416 CASAVA_Build 17 1095499 1I AAAAAAAAAA -/C AAACTGTTAC 3070 het 582 hom 21 2 15 4 C 0 1 370417 CASAVA_Build 17 1098375 5I TAACATGTTA -----/ATTTT ATTTTATTAT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 ATTTT 1 2 370418 CASAVA_Build 17 1098854 1D AAAAAAAAAA T/- TAGGCTAGCC 2120 het 1289 hom 22 7 8 7 T 2 1 370419 CASAVA_Build 17 1101787 6I CAGAGCAAGA ------/CTCCGT CTCAAAAAAA 48 het 48 ref 19 9 1 9 CTCCGT 0 1 370420 CASAVA_Build 17 1102382 1D GAAATCAAAC A/- AAAACCTACC 3070 het 3070 hom 32 10 18 4 A 5 4 370421 CASAVA_Build 17 1114906 2D CCCAGCACTT GA/-- TGGGAGGCTG 3070 hom 39 het 20 0 13 7 GA 1 0 370422 CASAVA_Build 17 1116313 1I TGACTGCTTA -/C TCTCTACGCT 3070 hom 108 het 43 0 34 9 C 0 1 370423 CASAVA_Build 17 1125447 2D TGTGTGTGTG AA/-- TGAGTGTGCG 3070 het 3070 ref 49 23 21 5 A 2 0 370424 CASAVA_Build 17 1127777 1D TCTCTCTTTT A/- TTTTTTTGAG 2981 het 1925 hom 22 6 12 4 A 1 0 370425 CASAVA_Build 17 1131420 1I TAGGTGTGGA -/G GGGGGGTTCC 3070 hom 54 het 23 0 16 7 G 6 7 370426 CASAVA_Build 17 1132080 2D36M6I GTACATATAT ACACACATATGTACACATATGTACATGTATACACATAT------/--ACACATATGTACACATATGTACATGTATACACATATATACAC ATACATATAT 3070 het 1930 hom 36 8 17 20 N/A 0 0 370427 CASAVA_Build 17 1142264 1I CAGGAAATGT -/A AAGCTGGCCT 2859 het 2474 hom 22 7 8 7 A 2 3 370428 CASAVA_Build 17 1152384 1I CCACCACACC -/T GGCTAATTTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 0 1 370429 CASAVA_Build 17 1156441 6D CTGTCTCAAT TAAAAA/------ AAAAAAAAGA 640 het 640 ref 18 11 4 6 TAAAAA 1 0 370430 CASAVA_Build 17 1161636 2I CAGGAAAACG --/GT GAATGACATC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 GT 0 1 370431 CASAVA_Build 17 1171746 1I AGGAGGCTGA -/G GGCAGGAGAA 3070 hom 96 het 33 0 32 1 G 2 3 370432 CASAVA_Build 17 1172992 2I ATTTTTGGGG --/TT TTTTTTTTGT 2325 hom 15 het 6 0 6 0 T 8 10 370433 CASAVA_Build 17 1175187 12D TATCTGATCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 34 het 20 0 13 8 T 22 10 370434 CASAVA_Build 17 1179675 1I CCACTGCCCC -/T GGGGTGAGTT 3070 hom 67 het 26 0 20 6 T 0 1 370435 CASAVA_Build 17 1189411 1I CGTCTCTCCT -/A AAAACACAAA 3070 hom 30 het 14 0 10 4 A 4 5 370436 CASAVA_Build 17 1189701 1D TCTCTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 9 7 A 13 12 370437 CASAVA_Build 17 1190276 5D GCTATACACC TTTGG/----- TTTGGTTTAT 3070 hom 93 het 36 0 32 5 TTTGG 2 1 370438 CASAVA_Build 17 1201997 1I GCACCCGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 470 hom 28 3 16 9 T 14 15 370439 CASAVA_Build 17 1203808 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 23 0 13 10 A 14 12 370440 CASAVA_Build 17 1215308 1I TCCAGAAGGT -/C AGTTAGGTGG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 0 1 370441 CASAVA_Build 17 1216034 1I AGGCCGAGGT -/G GGCACATCAC 3070 hom 50 het 18 0 16 2 G 2 3 370442 CASAVA_Build 17 1224364 1D TGGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 31 0 17 14 A 15 14 370443 CASAVA_Build 17 1226427 18D ACAGAAAGAA AGAAAAAGAAAGAGAGAG/------------------ AAAGAAAGAA 3070 hom 75 het 30 0 25 8 AGAAAAAGAAAGAGAGAG 1 0 370444 CASAVA_Build 17 1233622 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTCGCC 3070 hom 48 het 18 0 15 3 G 3 4 370445 CASAVA_Build 17 1234580 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 30 het 14 0 11 4 A 8 7 370446 CASAVA_Build 17 1248386 3I TATCCCCCCC ---/CCT CCCAACAGGA 3070 hom 112 het 41 0 33 8 CCT 0 1 370447 CASAVA_Build 17 1254924 1D ACTCCATATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 18 9 A 14 13 370448 CASAVA_Build 17 1259473 1D TTATTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 396 hom 24 2 11 11 T 15 14 370449 CASAVA_Build 17 1260941 1D CACTCTGGAC T/- TTTTTTTTTT 773 het 773 ref 20 7 4 9 T 17 16 370450 CASAVA_Build 17 1263682 4I ATAGAGTAAC ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 120 het 50 0 41 9 TTTG 2 3 370451 CASAVA_Build 17 1266372 1I TCTGTCTCGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 217 hom 21 2 17 2 A 13 14 370452 CASAVA_Build 17 1267476 2D CCCAGGTTCA AG/-- AGAGTCTCCC 3070 hom 39 het 14 0 14 1 AG 3 2 370453 CASAVA_Build 17 1270688 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 822 hom 26 2 15 9 A 13 14 370454 CASAVA_Build 17 1271332 6D TATCAAAGTC AAAGGA/------ AAAGAAAATA 3070 hom 102 het 36 0 35 3 AAAGGA 1 0 370455 CASAVA_Build 17 1276897 2I CAGAGTTACA --/CT CTGTCTCAAA 3070 hom 53 het 20 0 18 2 CT 1 2 370456 CASAVA_Build 17 1285512 2D AGCAGAGAGG AA/-- AAAAAAAAAA 2274 het 1661 hom 37 10 6 22 A 12 10 370457 CASAVA_Build 17 1292060 1D CTACCATGCC T/- GTATTTTTTT 3070 hom 39 het 19 0 12 7 T 1 0 370458 CASAVA_Build 17 1292203 1D GCCCGGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 21 0 12 9 T 14 13 370459 CASAVA_Build 17 1297200 2D CGGCTCCTTT TC/-- TCTCTTTCCT 3070 hom 107 het 38 0 31 9 TC 3 2 370460 CASAVA_Build 17 1364372 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 23 1 19 3 A 12 11 370461 CASAVA_Build 17 1367388 2D CAGCCTGGCC TT/-- AACATGGTGA 2089 hom 5 het 8 0 6 2 T 2 0 370462 CASAVA_Build 17 1379904 1D GTTTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1178 het 1178 ref 22 13 3 6 A 13 12 370463 CASAVA_Build 17 1390638 1D TTTTTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 897 het 897 ref 34 19 4 11 T 13 12 370464 CASAVA_Build 17 1415928 1D GGTCCATGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 11 10 370465 CASAVA_Build 17 1417045 3D TCAGTCTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 2306 hom 19 het 18 0 10 9 T 17 14 370466 CASAVA_Build 17 1434864 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1614 het 471 hom 9 1 6 2 A 12 13 370467 CASAVA_Build 17 1457178 3I GCTTCCACAG ---/CAA CGCCGTCCCC 3070 hom 75 het 28 0 25 3 CAA 0 1 370468 CASAVA_Build 17 1461956 2I GCGAGCCCAC --/AG AGAGTTCCCT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AG 2 3 370469 CASAVA_Build 17 1466088 1D CTCCGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 1198 het 1069 hom 13 5 4 4 A 19 18 370470 CASAVA_Build 17 1478747 2I CTCTCTCCTC --/TT GTTCCCACGT 1102 hom 12 het 7 0 3 4 T 0 2 370471 CASAVA_Build 17 1480550 1I TTTTCTTTTT -/C TTTTTTTTTT 1923 het 422 hom 19 1 10 8 C 0 1 370472 CASAVA_Build 17 1485830 5I ACTTCTACAC -----/TCTTT TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 27 0 21 6 TCTTT 0 1 370473 CASAVA_Build 17 1506098 1D CCGAGTAGCT G/- GGACTACAGG 3070 het 2278 hom 16 5 10 1 G 3 2 370474 CASAVA_Build 17 1509076 3I ATTATTATTA ---/TTG TTATTTTTCT 3070 het 464 hom 15 1 12 2 TTG 0 1 370475 CASAVA_Build 17 1512875 1D25M1I ACTGTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAG-/-AAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGA AAAAAAAAAA 2934 het 1159 hom 23 6 15 7 N/A 0 0 370476 CASAVA_Build 17 1513347 1D AAAATAATTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 A 10 9 370477 CASAVA_Build 17 1513576 10D5M1D CATGGTGAGA CCCCCCGTCTCTACTA/----------CTACT- AAAATACAAA 3070 het 376 hom 14 1 9 7 N/A 0 0 370478 CASAVA_Build 17 1514653 1D GAGTTTGGGT C/- CAACCTAGGC 2067 het 2067 ref 37 20 6 12 C 2 1 370479 CASAVA_Build 17 1516038 1I AAACCGCGTC -/T GTAGTAAAAA 3070 hom 42 het 15 0 13 2 T 0 1 370480 CASAVA_Build 17 1516210 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1841 het 1464 hom 13 5 6 2 A 13 12 370481 CASAVA_Build 17 1517548 1I ATGTCTTCAT -/A AAAAAACAAG 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 6 7 370482 CASAVA_Build 17 1529548 1D TTTTTATGGG A/- AAAAAAAAAA 3018 het 2307 hom 26 9 10 7 A 13 12 370483 CASAVA_Build 17 1532129 3D CTGCCTCCCA ACC/--- ACCACCACCA 3070 het 3070 ref 54 22 21 15 ACC 7 6 370484 CASAVA_Build 17 1535575 1I GAATCGCTTG -/A ACCCGGGAGG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 A 1 2 370485 CASAVA_Build 17 1536600 1I CACTCTGTTG -/C CCAGGCTGGA 3070 het 3070 ref 24 13 9 2 C 2 3 370486 CASAVA_Build 17 1542392 1D TCTTTCTTAG T/- TTTTTTTTTT 2430 hom 27 het 23 0 8 15 T 13 12 370487 CASAVA_Build 17 1550077 1D AGCCACCATG C/- CCCAGCCTGT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 C 4 3 370488 CASAVA_Build 17 1551018 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 980 het 772 hom 5 2 3 1 A 7 6 370489 CASAVA_Build 17 1553959 1I CAGATATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 T 10 11 370490 CASAVA_Build 17 1556055 1D TCTCACTCTG T/- TTGCCCAGGC 3070 hom 37 het 21 0 15 6 T 3 2 370491 CASAVA_Build 17 1561563 4I TCTTAAATTA ----/TATT TATTATATGA 3070 het 2620 hom 17 7 8 2 TATT 1 2 370492 CASAVA_Build 17 1584822 1D GACTCTGTCT C/- AAAAAAAAAA 2438 het 1026 hom 25 10 7 8 C 1 0 370493 CASAVA_Build 17 1610591 1I GAAGAAGAGA -/T TTTTTTAAAA 3070 hom 66 het 29 0 22 7 T 6 7 370494 CASAVA_Build 17 1637054 2D ATTGAAAGCA AG/-- AGAGAGTCAA 3070 hom 130 het 50 0 41 12 AG 4 3 370495 CASAVA_Build 17 1686312 2I CACGCCACCA --/CG CCTGGCTAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 CG 0 1 370496 CASAVA_Build 17 1699334 7D TTGGCTGTTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTT 1115 het 30 hom 16 1 8 9 T 21 14 370497 CASAVA_Build 17 1706399 2D CCAAAACTTT TG/-- GGGAAGCTGA 1881 hom 30 het 12 0 7 5 TG 1 0 370498 CASAVA_Build 17 1717216 13D TTGCAGTAGT AACGTTTTGTTAA/------------- AATGAGCGAA 3070 hom 126 het 47 0 43 6 AACGTTTTGTTAA 1 0 370499 CASAVA_Build 17 1717382 2D TTCTAGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 85 het 39 0 29 12 TG 9 8 370500 CASAVA_Build 17 1725662 5D AAAAGCTAAG TAGAA/----- TAGTAATAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 4 TAGAA 1 0 370501 CASAVA_Build 17 1731933 15I AAGGGCCGCC ---------------/TCTCTCCTTGCTCTG TTGACTCCTG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TCTCTCCTTGCTCTG 0 1 370502 CASAVA_Build 17 1734386 1I TCCGCCTCAG -/T GTCAGACATG 3070 het 3070 ref 35 21 12 2 T 0 1 370503 CASAVA_Build 17 1735519 1I TGAATGTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 T 10 11 370504 CASAVA_Build 17 1739133 3I ACTTGCCTGC ---/TGA TAACTGCTAT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 TGA 0 1 370505 CASAVA_Build 17 1739380 1I TTTAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 16 9 T 15 16 370506 CASAVA_Build 17 1743489 6D AAGTCCATTT GGTTTG/------ GGTTTGGGTT 3070 het 3070 ref 34 16 10 11 GGTTTG 2 1 370507 CASAVA_Build 17 1747596 1D GTGGTGACCA C/- CCCCCCCCAT 2210 het 2210 ref 32 12 8 13 C 9 8 370508 CASAVA_Build 17 1750172 2I GACTATTGAC --/TA TTTCTTATGC 3070 hom 66 het 27 0 23 5 TA 0 1 370509 CASAVA_Build 17 1765263 1I AATAGAGACA -/T TTTTTAGGAG 3070 hom 64 het 25 0 20 5 T 5 6 370510 CASAVA_Build 17 1771569 2D TAATTAAAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 11 9 370511 CASAVA_Build 17 1793978 1I TTGAATCCTA -/T TTTTTTTTTT 2786 het 2786 ref 29 16 9 4 T 10 11 370512 CASAVA_Build 17 1802108 1I CTCTACCCAG -/A AAGCTGCTGC 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 A 2 3 370513 CASAVA_Build 17 1803609 1D AAATTGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1272 hom 13 5 8 0 A 10 9 370514 CASAVA_Build 17 1807919 4I CAAACAAACG ----/AACA AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 AACA 3 4 370515 CASAVA_Build 17 1808473 2D CATTCCTCCC CT/-- GTTTTCATTA 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 CT 1 0 370516 CASAVA_Build 17 1812988 1D CTCTATTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 2704 hom 25 10 13 2 T 10 9 370517 CASAVA_Build 17 1828678 1I TCCGGAAAAT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 430 hom 26 1 18 7 G 8 9 370518 CASAVA_Build 17 1837017 1D TGCAAAATGA G/- GGGGCTGGAC 2226 het 2226 ref 34 15 7 12 G 5 4 370519 CASAVA_Build 17 1840128 1I ATTAAAAAAC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 8 9 370520 CASAVA_Build 17 1849502 2D AAAAAATAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 69 het 33 0 24 10 AC 10 9 370521 CASAVA_Build 17 1849718 1I CCTATACATG -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 90 het 33 0 29 4 C 8 9 370522 CASAVA_Build 17 1877198 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 2996 hom 24 9 11 4 A 9 8 370523 CASAVA_Build 17 1879976 1I GGAGAGGAGT -/G GGGAGACTAA 3070 hom 48 het 20 0 15 5 G 3 4 370524 CASAVA_Build 17 1921915 2I TGAGTGGCGC --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1955 hom 32 7 15 10 TG 8 9 370525 CASAVA_Build 17 1924282 1D CACCATGCCC G/- CGCTTCTGAT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 G 1 0 370526 CASAVA_Build 17 1929523 1D CGAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 26 10 15 1 A 8 7 370527 CASAVA_Build 17 1943834 1D GCTAATTTTT A/- AAAATTGTTT 3070 het 2248 hom 17 7 9 1 A 5 4 370528 CASAVA_Build 17 1946888 1I AGGAACCTCA -/C CACTAACCTC 3070 het 3070 ref 53 25 23 5 C 1 2 370529 CASAVA_Build 17 1980182 1I CGGGCGCCTG -/T TAGTCCCAGC 1685 hom 10 het 5 0 4 1 T 1 2 370530 CASAVA_Build 17 1984931 1D TTTTAATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2981 hom 29 9 12 8 T 11 10 370531 CASAVA_Build 17 1985987 1I CTGGCCTCTC -/A AAAGTGCTGG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 3 4 370532 CASAVA_Build 17 1988197 1I AGGAGGCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 A 10 11 370533 CASAVA_Build 17 1990716 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1684 het 1435 hom 16 5 7 4 A 17 18 370534 CASAVA_Build 17 2035599 4D TAAATACACC CAGA/---- CAGACACACA 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 CAGA 2 1 370535 CASAVA_Build 17 2046798 1D GAAAGGGGCC G/- GGCATGGTGG 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 G 3 2 370536 CASAVA_Build 17 2061146 1I GGATTTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 A 13 14 370537 CASAVA_Build 17 2061711 1D CCATCTAATT A/- AAAAAAAAAA 918 het 613 hom 32 7 5 20 A 17 16 370538 CASAVA_Build 17 2065257 2I TACATTATAA --/AC ACACACACAC 3004 het 744 hom 21 2 9 10 AC 6 7 370539 CASAVA_Build 17 2080364 18D AAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAG/------------------ GGAAAACCAC 2018 het 1468 hom 26 8 14 10 AAAAAAAAAAAAAAAAAG 1 0 370540 CASAVA_Build 17 2086492 4D TACATTAATC TCTA/---- TCTGTCTATA 3070 het 3070 ref 30 14 14 2 TCTA 1 0 370541 CASAVA_Build 17 2106833 4D AAAAATAGAT AGAC/---- AGATTTGATA 3070 hom 71 het 26 0 23 5 AGAC 1 0 370542 CASAVA_Build 17 2122974 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1840 het 1840 ref 27 21 4 2 A 13 12 370543 CASAVA_Build 17 2130315 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1571 hom 23 5 14 5 T 10 11 370544 CASAVA_Build 17 2142684 1D ACTAGAACAG A/- AAAAACAGTA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 6 5 370545 CASAVA_Build 17 2143507 1D TACTCTATTC T/- TTTTTTTCCC 3070 het 107 hom 25 4 17 4 T 8 7 370546 CASAVA_Build 17 2147230 4D TACCTAACAC TAGA/---- TAAACGCTTA 3070 het 3070 hom 40 14 20 8 TAGA 1 0 370547 CASAVA_Build 17 2160160 6D TAAATCTCAA CACCTC/------ CACCTTGTGC 2821 het 2821 ref 32 23 7 2 CACCTC 1 0 370548 CASAVA_Build 17 2172722 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1521 het 401 hom 10 3 5 2 T 12 11 370549 CASAVA_Build 17 2208756 1I ACCCGGTCTC -/A AAAAAAAACG 2898 het 2898 ref 20 10 8 2 A 8 9 370550 CASAVA_Build 17 2223152 3D CCCATGGGGC TGA/--- TGAGATGGGG 2253 het 2253 ref 20 9 7 4 TGA 2 1 370551 CASAVA_Build 17 2234284 1I GTTTTTGTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 13 14 370552 CASAVA_Build 17 2246166 1I CTCACAAGAG -/C CCCCACGTCA 3070 het 3070 ref 61 35 18 8 C 4 5 370553 CASAVA_Build 17 2259269 1D TTATATTACT A/- AATGAAAAAG 3070 het 3070 hom 21 8 10 4 A 3 2 370554 CASAVA_Build 17 2263447 1I GCGATTCTCC -/T TGCCTCAGCC 1831 hom 12 het 5 0 4 2 T 1 2 370555 CASAVA_Build 17 2268195 6I TTGACCCCTT ------/TGTCTG TGTCTGTGTC 3070 het 3070 hom 34 11 14 9 TGTCTG 2 3 370556 CASAVA_Build 17 2272894 1I CGGGTGTGGT -/G GGCCGCGCCT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 G 2 3 370557 CASAVA_Build 17 2277026 1D TAAAAATACG A/- AAAAAAAAAA 2359 hom 27 het 10 0 8 2 A 13 12 370558 CASAVA_Build 17 2283487 1I GGATGAATCC -/A AGTCACTCGC 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 A 1 2 370559 CASAVA_Build 17 2285169 4I ACATTAGGAC ----/CTGT CTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 42 17 21 4 CTGT 0 1 370560 CASAVA_Build 17 2286821 13I GCTGTTCTGT -------------/CACTGCCTCTCAG CACTGCCCGG 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 CACTGCCTCTCAG 0 1 370561 CASAVA_Build 17 2287585 1D TTTAAAAAAA T/- TTTTATTTAT 3070 het 1926 hom 17 7 10 0 T 5 4 370562 CASAVA_Build 17 2308478 1D TTCAGGGCCA G/- GGTGTGGTGA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 G 3 2 370563 CASAVA_Build 17 2308850 1D GGTGAGTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1534 hom 36 8 16 12 T 12 11 370564 CASAVA_Build 17 2331906 1I GGCTTACAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 248 hom 32 1 30 1 A 9 10 370565 CASAVA_Build 17 2336287 1I AAAGTGAAAG -/T AAAAACTATT 3070 hom 64 het 23 0 22 1 T 0 1 370566 CASAVA_Build 17 2339156 1I CTTTTCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 34 1 24 9 T 10 11 370567 CASAVA_Build 17 2361263 1D AGGCTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 534 hom 48 2 34 13 T 13 12 370568 CASAVA_Build 17 2364267 2D ACATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AC 6 5 370569 CASAVA_Build 17 2397321 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2100 het 2100 ref 27 11 7 9 A 10 11 370570 CASAVA_Build 17 2399315 1I CTGTCTCAGG -/A AAAAAAAAGA 2657 het 2154 hom 18 5 6 7 A 8 9 370571 CASAVA_Build 17 2409947 1D GGGAGGATCT G/- GGGGAAGATT 3070 het 3070 ref 27 11 10 6 G 5 4 370572 CASAVA_Build 17 2411172 2D TTCCATCTCG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 A 14 12 370573 CASAVA_Build 17 2415482 4D AAAAAAAAAA AGAG/---- AGAGAGAAAT 2645 het 2645 ref 18 9 8 2 AG 5 3 370574 CASAVA_Build 17 2420288 4I AATAGAAAAG ----/AAAT AAAAGAAGCC 3070 hom 30 het 15 0 11 4 AAAT 0 1 370575 CASAVA_Build 17 2426692 13I ATTCCCAGTG -------------/AAACAATCTAGTA ATCATCTGAG 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 AAACAATCTAGTA 0 1 370576 CASAVA_Build 17 2428125 4D TCCCCCGCCA AAAC/---- AAACAAACAA 2889 het 1991 hom 26 8 9 11 AAAC 4 3 370577 CASAVA_Build 17 2433984 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 965 hom 12 3 8 1 A 10 11 370578 CASAVA_Build 17 2452296 1I CCACCTACTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 18 4 A 10 11 370579 CASAVA_Build 17 2469579 11D GGCCCTTACC TGTTTTTTTTT/----------- TGTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 14 8 6 TGTTTTTTTTT 1 0 370580 CASAVA_Build 17 2475068 1I ATACTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2267 hom 28 5 10 13 T 13 14 370581 CASAVA_Build 17 2487461 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 73 hom 39 1 31 8 A 10 9 370582 CASAVA_Build 17 2496481 10D TGGATCACTT GAGGTCAGGA/---------- GTTTGAGACC 3070 hom 48 het 16 0 14 4 GAGGTCAGGA 1 0 370583 CASAVA_Build 17 2502206 1I CTGTAATCCC -/A ACACTTTGGG 3070 hom 27 het 12 0 9 3 A 1 2 370584 CASAVA_Build 17 2504235 1D CTTTTAAACC T/- TTTTTTTTTT 2572 het 548 hom 24 2 9 13 T 17 16 370585 CASAVA_Build 17 2506916 6D TCCTACATAG TCTGTT/------ TCTGTTTCTA 3070 hom 102 het 37 0 35 2 TCTGTT 2 1 370586 CASAVA_Build 17 2513163 4D GTCTCTAAAT AAAG/---- AAAGAAAGAG 1682 het 1682 ref 12 7 5 4 AAAG 3 2 370587 CASAVA_Build 17 2513618 1D GTCTTTACTT A/- ACTTATTACT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 A 2 1 370588 CASAVA_Build 17 2513746 1I ATTCTCTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1069 hom 25 3 15 7 T 14 15 370589 CASAVA_Build 17 2515026 4I CCCTTGAGTG ----/TATA TATAACAAGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 TA 2 4 370590 CASAVA_Build 17 2535473 2D CCAGATTGTT AA/-- GAGTTCACTG 3070 het 3070 ref 53 28 23 2 A 2 0 370591 CASAVA_Build 17 2537876 1I TCTGTGGGGA -/G GGGGGGGGTC 2014 het 2014 ref 33 8 12 13 G 8 9 370592 CASAVA_Build 17 2549223 1D TGAACTTGAA C/- AGATAAAGGT 3070 het 3070 ref 46 26 18 2 C 1 0 370593 CASAVA_Build 17 2570378 1D GAGGAACAGC T/- TTTTTTTTTT 925 het 925 ref 26 11 3 12 T 17 16 370594 CASAVA_Build 17 2575279 3D TTAGCCGGGC GTG/--- GTGGTGGTGG 3070 hom 54 het 22 0 18 4 GTG 6 5 370595 CASAVA_Build 17 2576227 4D TATATATATA TTTT/---- TTTTTTTTTG 3070 hom 24 het 10 0 9 1 T 13 9 370596 CASAVA_Build 17 2591549 2D GGCAAAATCC TG/-- TGTCTCTACT 2722 het 2722 ref 22 11 8 3 TG 2 1 370597 CASAVA_Build 17 2610993 4I TTTCTTTTCT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 TTTC 2 3 370598 CASAVA_Build 17 2642145 1D CTCAGGTGAT C/- CGCTTGCCTC 3070 het 58 hom 23 1 15 7 C 2 1 370599 CASAVA_Build 17 2643198 1D TGCAACAGGA T/- TTTTTTTTTT 1685 het 610 hom 18 5 4 9 T 17 16 370600 CASAVA_Build 17 2650472 22D TGGTGGTTTG GGCTGTCCCGGGGACTCCTCCA/---------------------- TACAGATGCT 3070 het 3070 ref 27 15 8 6 GGCTGTCCCGGGGACTCCTCCA 1 0 370601 CASAVA_Build 17 2650880 4D TCTTTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 1073 het 10 hom 26 1 6 19 TTTC 5 4 370602 CASAVA_Build 17 2650897 3D CTTTCTTTCT TTC/--- TTTTTTTTTT 3070 het 305 hom 22 1 16 5 TTC 1 0 370603 CASAVA_Build 17 2651519 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2194 het 1324 hom 15 6 7 2 A 13 14 370604 CASAVA_Build 17 2662655 4D ACAGCAAATA GTTT/---- GTTTGTTCCT 3070 hom 56 het 22 0 18 8 GTTT 2 1 370605 CASAVA_Build 17 2663568 1I TGGGCGTGAG -/C CCCTCTGGGC 3070 hom 110 het 39 0 33 6 C 3 4 370606 CASAVA_Build 17 2675998 1I GCAGGGGGCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 47 het 23 0 15 8 T 8 9 370607 CASAVA_Build 17 2685454 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGTTTCAC 1914 het 1375 hom 8 3 4 1 G 4 5 370608 CASAVA_Build 17 2686677 10D CTCAGTCTCA AAAACAAAAC/---------- AAAACAAAAC 3070 het 3070 ref 24 15 10 3 AAAAC 4 2 370609 CASAVA_Build 17 2687652 1D GCCCTGCTTC T/- TTTTTTTTTT 1248 het 197 hom 22 2 6 19 T 17 16 370610 CASAVA_Build 17 2698546 1D CTTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 2399 het 136 hom 18 2 8 8 T 13 12 370611 CASAVA_Build 17 2714133 1I GGGAGCCCCC -/T GGTTCCTCAC 2162 hom 38 het 18 0 9 9 T 0 1 370612 CASAVA_Build 17 2718737 1D AATTTCTGTA T/- TTTTTAGTAG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 T 6 5 370613 CASAVA_Build 17 2725989 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1922 het 1697 hom 18 5 6 7 T 11 12 370614 CASAVA_Build 17 2729770 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2401 het 2220 hom 26 8 11 7 A 14 15 370615 CASAVA_Build 17 2738697 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1669 het 193 hom 24 3 5 16 T 17 16 370616 CASAVA_Build 17 2745630 1I TCCCCGCTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 276 hom 13 1 11 1 T 9 10 370617 CASAVA_Build 17 2753803 4D CCACAGGGAG GGCT/---- GGCTGGTCAA 1851 het 1849 ref 19 6 8 5 GGCT 2 1 370618 CASAVA_Build 17 2757143 1I GTATTTTTTT -/C CCCCCAGTAG 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 C 5 6 370619 CASAVA_Build 17 2778117 9D ATCCCCCAGC AACTGATGG/--------- AACTGATGGA 3070 hom 123 het 45 0 40 8 AACTGATGG 2 1 370620 CASAVA_Build 17 2791494 1I CAACAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 2278 het 2278 ref 14 9 5 0 A 8 9 370621 CASAVA_Build 17 2793723 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 72 het 30 0 24 7 A 9 8 370622 CASAVA_Build 17 2799729 1D CCTGAGCGTT A/- ACTGAGTGCC 3070 het 246 hom 35 1 31 5 A 2 1 370623 CASAVA_Build 17 2817430 3D CAACAACGAT GAC/--- AACAACAACG 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 GAC 1 0 370624 CASAVA_Build 17 2839137 1I AAAACAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 13 8 A 10 11 370625 CASAVA_Build 17 2839891 1I CTAACTCCAG -/A ACATTTTCAT 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 A 1 2 370626 CASAVA_Build 17 2845998 2D TCTATAAAAT GG/-- GGGGTAACAC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 G 6 4 370627 CASAVA_Build 17 2864027 2D GGAAAGAGAC AG/-- GGAGGAATAC 3070 hom 132 het 46 0 45 1 AG 1 0 370628 CASAVA_Build 17 2865263 3I AGGGAGTGAG ---/AGA AGATGTCCCT 3070 hom 87 het 30 0 30 0 AGA 1 2 370629 CASAVA_Build 17 2865867 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 336 hom 39 1 30 9 A 11 10 370630 CASAVA_Build 17 2868288 1D CCCAGGGAGG C/- CCCCCCCAGA 1992 het 1992 ref 26 9 7 10 C 8 7 370631 CASAVA_Build 17 2893932 1I CTTTGTCAGC -/T GGCACCGTGT 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 0 1 370632 CASAVA_Build 17 2898196 3D ATATCTATAG TCT/--- TCTTTCCTTT 3070 hom 113 het 40 0 38 3 TCT 2 1 370633 CASAVA_Build 17 2898372 1D TGCCCCCCAG T/- TTTAACCGCC 3070 hom 65 het 28 0 20 8 T 4 3 370634 CASAVA_Build 17 2898584 1D TTTCATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 386 hom 17 1 13 3 T 12 11 370635 CASAVA_Build 17 2921854 4I CAGGGGGCAA ----/AGAG AGAGAGAGAG 1982 het 1982 ref 39 23 5 11 AG 6 8 370636 CASAVA_Build 17 2925112 1D9M11I GCAAATGCTT GGTATTAGGT-----------/-GTATTAGGTTGGGGCAAATG TGATTGCGGT 2983 hom 15 het 6 0 6 0 N/A 0 0 370637 CASAVA_Build 17 2926051 3I GCCTCTAAAA ---/CAC CACCACCACC 3070 hom 89 het 38 0 29 9 CAC 5 6 370638 CASAVA_Build 17 2936481 1I GGTCTATCAG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 157 hom 28 1 22 5 T 9 10 370639 CASAVA_Build 17 2938745 2D CAATGCTTTT CC/-- ATACAATGTC 3070 hom 69 het 27 0 24 4 C 2 0 370640 CASAVA_Build 17 2940046 1I TTCAGGTTTC -/T TGTTTTCCTG 3070 hom 86 het 34 0 27 7 T 1 2 370641 CASAVA_Build 17 2974678 1D AAGCAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 13 4 A 13 12 370642 CASAVA_Build 17 3005915 6I CTTGAACCAG ------/GGAGGC GGAGGCTGGT 3070 hom 38 het 17 0 13 4 GGAGGC 1 2 370643 CASAVA_Build 17 3011882 1I ACATCTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 49 het 33 1 27 5 A 10 11 370644 CASAVA_Build 17 3015675 1D ATTGAATCAG A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 57 24 27 6 A 8 7 370645 CASAVA_Build 17 3023943 1I CAAAGGAGGC -/A AAAAAAAAAA 2874 het 1440 hom 23 3 10 10 A 13 14 370646 CASAVA_Build 17 3036887 1I AGGTTATTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 8 18 4 A 9 10 370647 CASAVA_Build 17 3050292 2D CCACTAAAAG AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 A 11 9 370648 CASAVA_Build 17 3059070 1D TTCTTTTTAA T/- TTTTTTAAAT 3070 het 3070 ref 20 10 10 0 T 7 6 370649 CASAVA_Build 17 3059974 1I TTATTTTATG -/T GTTAAAATTT 3070 het 3070 ref 43 26 17 1 T 0 1 370650 CASAVA_Build 17 3060108 1I TCACTACTAA -/G AAAATAGCAC 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 G 0 1 370651 CASAVA_Build 17 3060206 2D TTTCTTTTCC AT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1936 hom 29 8 14 7 AT 1 0 370652 CASAVA_Build 17 3061385 1D CCTAAATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 14 2 T 12 11 370653 CASAVA_Build 17 3062029 6D14M1D TTTAGTGTTT AAGTACAAGAATAGTATTGAT/------AAGAATAGTATTGA- TTTTGAAATA 3070 het 3070 hom 32 14 15 4 N/A 0 0 370654 CASAVA_Build 17 3064580 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2581 het 785 hom 18 6 8 4 A 15 14 370655 CASAVA_Build 17 3079113 1I TTTGCCCCAA -/C CTAATACAAG 3070 hom 65 het 28 0 22 6 C 1 2 370656 CASAVA_Build 17 3082323 1I ACCAGCACTT -/A ACTTCCACTA 3070 het 3070 ref 56 37 9 10 A 1 2 370657 CASAVA_Build 17 3099365 1I CAAAGAACTT -/A ACAACAGAAC 2795 het 1307 hom 14 3 6 5 A 1 2 370658 CASAVA_Build 17 3113501 2I AAGGATAATA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 41 14 22 5 GT 7 8 370659 CASAVA_Build 17 3131706 2I TGTTTTGTTT --/TC TCTCATTTTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 TC 2 3 370660 CASAVA_Build 17 3154040 2D TATACTAATA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 AT 9 8 370661 CASAVA_Build 17 3155651 4D AATTGAAAAC TAAG/---- TATGCAATGG 3070 het 3070 hom 35 13 18 5 TAAG 1 0 370662 CASAVA_Build 17 3159948 1I CTGCTTCCCC -/T GAAGCTTCCC 3070 het 3070 hom 44 18 20 6 T 0 1 370663 CASAVA_Build 17 3164547 2D TGATGTAAAC AT/-- GTGTATGGGC 3070 het 3070 ref 33 17 12 5 AT 1 0 370664 CASAVA_Build 17 3194374 1I GCAATTTAGA -/G CCTTCCTGCT 3070 het 3070 ref 35 18 13 4 G 0 1 370665 CASAVA_Build 17 3195481 2I AGAGAGAGAG --/AT AGATAGAGAC 3070 het 3070 ref 45 23 14 8 AT 0 1 370666 CASAVA_Build 17 3197284 2D GTATGTCTTC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 het 1665 hom 24 7 13 4 T 11 9 370667 CASAVA_Build 17 3203163 2D TTATAAGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 13 17 13 T 13 11 370668 CASAVA_Build 17 3203958 1I TATTCATCCA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 32 14 12 6 T 9 10 370669 CASAVA_Build 17 3207912 2D TGGTGTATTT TA/-- TGTTATGTAT 3070 het 3070 hom 35 14 18 4 TA 1 0 370670 CASAVA_Build 17 3214961 1D GCACTAAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 18 14 9 A 12 11 370671 CASAVA_Build 17 3226525 1D TGGGGGACGG A/- AGGGGTGGTT 3070 hom 133 het 52 0 43 9 A 2 1 370672 CASAVA_Build 17 3226846 1D TTTGGCCCCT C/- CCCCAATTCT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 C 5 4 370673 CASAVA_Build 17 3236034 4I GGTGGACGGA ----/ACAG ACAGACGCCC 3070 het 3070 hom 37 11 17 9 ACAG 1 2 370674 CASAVA_Build 17 3236962 1I ACAGTTACAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 A 9 10 370675 CASAVA_Build 17 3239586 4I ATTAAAATAG ----/CTAA CTAATTTACT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 CTAA 1 2 370676 CASAVA_Build 17 3255455 2D TGCTCTGATG AT/-- AGTTTCTTTT 3070 het 3070 hom 22 9 11 2 AT 1 0 370677 CASAVA_Build 17 3256261 11I TTCTTTTTAT -----------/TGCCCTTTCTC TGCCCTTTCT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 TGCCCTTTCTC 1 2 370678 CASAVA_Build 17 3259494 1I TTGTAATAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 11 12 370679 CASAVA_Build 17 3262661 2D TGGGTGTCTC AG/-- GGTGACCTGA 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 AG 1 0 370680 CASAVA_Build 17 3264957 2D CATTAAAAAA AT/-- AATATAGGTA 3070 het 3070 hom 34 9 20 5 AT 1 0 370681 CASAVA_Build 17 3266498 1I CACACTTCGC -/A AAAAAAAAAA 1655 het 1655 ref 16 7 4 5 A 10 11 370682 CASAVA_Build 17 3271921 2D AGAAAAAAGC TG/-- GTAAGACAGG 3070 het 3070 ref 32 16 15 2 TG 1 0 370683 CASAVA_Build 17 3279834 1D TGAAGAGGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2657 hom 29 12 15 2 A 12 11 370684 CASAVA_Build 17 3291886 3I ACAGCTACAC ---/ACA ACAACATAGA 3070 hom 108 het 41 0 37 4 ACA 2 3 370685 CASAVA_Build 17 3293916 1D CCATAGTTAT C/- CTTTGTGTGT 3070 het 3070 ref 29 16 10 4 C 2 1 370686 CASAVA_Build 17 3296385 2I TTATTAAAAC --/TT CAGTTCTTTG 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 0 2 370687 CASAVA_Build 17 3297499 3I CCTGTTGATG ---/ATT ATGGCCACAG 3070 hom 163 het 57 0 54 3 ATT 0 1 370688 CASAVA_Build 17 3299206 2I39M1I GTAATAGTGC --AAAAAAAAAGCATTTGTTTCTATATGGTTTCTTAATTAC-/AAAAAAAAAAAGCATTTGTTTCTATATGGTTTCTTAATTACA AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 37 16 26 9 N/A 0 0 370689 CASAVA_Build 17 3300804 5I ACTCTCTGTT -----/GGTAA CAGCACATTT 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 GGTAA 0 1 370690 CASAVA_Build 17 3301236 1I ACTTTAAGTT -/A AAAAGTTGTT 3070 het 3070 ref 45 28 12 5 A 4 5 370691 CASAVA_Build 17 3307555 1D CACAAAAGAC T/- CTGAATAGCC 3070 het 3070 ref 26 15 10 3 T 1 0 370692 CASAVA_Build 17 3307691 5I ATCAACAGAA -----/GAGAG TAGAGAGCCC 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 GAGAG 0 1 370693 CASAVA_Build 17 3309098 12I2M10I ACAGAAAGAA ------------TG----------/AAATACCATATGTGCCTACTTACA TGTGGGATCT 3070 het 3070 ref 40 28 11 3 N/A 0 0 370694 CASAVA_Build 17 3313705 1I CTACATTTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 9 10 370695 CASAVA_Build 17 3323911 6I TTTGTAATGC ------/TGGAAG TGGAAGTTAT 3070 het 3070 ref 29 13 9 7 TGGAAG 1 2 370696 CASAVA_Build 17 3329948 1D TTATATCTAG A/- AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 41 18 19 4 A 8 7 370697 CASAVA_Build 17 3330091 2I TGGAGAGGTT --/AC AGACTCTGAA 3070 hom 99 het 38 0 34 4 AC 0 1 370698 CASAVA_Build 17 3332813 1D GTAGCGATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2811 hom 29 9 9 11 T 11 10 370699 CASAVA_Build 17 3335979 1D GGAGGGAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 206 hom 24 5 11 8 T 15 14 370700 CASAVA_Build 17 3340582 3I CCTCAGATCG ---/TGC TGCGCACCCC 3070 het 3070 ref 47 25 13 9 TGC 1 2 370701 CASAVA_Build 17 3349492 6D TCACGGATAC TGTACT/------ TGTACTTTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 3 TGTACT 2 1 370702 CASAVA_Build 17 3350113 1I AACCAGCCAC -/A ACATTAAGCC 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 1 2 370703 CASAVA_Build 17 3350995 1D ACTGCTTGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 33 0 29 4 A 11 10 370704 CASAVA_Build 17 3353592 1D TTTTGGCAAG A/- ATATTCTTCC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 A 2 1 370705 CASAVA_Build 17 3354574 1I AATCCATGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 578 hom 29 5 15 9 A 10 11 370706 CASAVA_Build 17 3355140 1I57M1I TTTGCCCACA -TTTTCCCACTTACTGAAACGCTTCCCCATCTCCACACTTCCATTAGCTAAATGACGC-/TTTTTCCCACTTACTGAAACGCTTCCCCATCTCCACACTTCCATTAGCTAAATGACGCT TACTCTTAAA 3070 hom 196 het 42 0 66 10 N/A 0 0 370707 CASAVA_Build 17 3357031 4I AAGGAAAAGA ----/GAAG GAAGGAAGGG 3070 hom 48 het 22 0 13 9 GAAG 2 3 370708 CASAVA_Build 17 3359892 1I ACTTTTTAAT -/A AATCGCCATT 1801 hom 10 het 4 0 4 0 A 2 3 370709 CASAVA_Build 17 3362370 1D TGTGAAGCCT C/- ACACACCCCA 3070 hom 66 het 26 0 19 7 C 1 0 370710 CASAVA_Build 17 3364870 3D TCACACCAAA GTT/--- GTTGGAGTTT 3070 hom 81 het 30 0 26 6 GTT 2 1 370711 CASAVA_Build 17 3365738 1I TAAGGACTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 A 10 11 370712 CASAVA_Build 17 3366231 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 21 het 11 0 8 3 A 9 8 370713 CASAVA_Build 17 3375210 1D ATTACAGGCA C/- CCGCCACCAC 2551 het 713 hom 13 3 8 2 C 3 2 370714 CASAVA_Build 17 3381101 1I CTCTAGTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 2290 hom 26 7 13 6 A 8 9 370715 CASAVA_Build 17 3387405 4I GTTAGATAAG ----/TAAA TAAATAAAAC 3070 hom 81 het 32 0 28 4 TAAA 2 3 370716 CASAVA_Build 17 3396477 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTATCTCAAA 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 CT 2 1 370717 CASAVA_Build 17 3396822 9I AGGAGTTTGA ---------/GACCAGCCT GGCCAATGCG 1112 het 1112 ref 12 6 4 2 GACCAGCCT 0 1 370718 CASAVA_Build 17 3401714 1D CTGTATCTCT G/- TCTCTGGGCA 3070 hom 96 het 36 0 32 5 G 1 0 370719 CASAVA_Build 17 3415343 2D ACACACACGT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 41 0 31 12 AC 8 7 370720 CASAVA_Build 17 3422719 4D CCTCAGTGCC TCAT/---- TCATTCAAAA 3070 hom 93 het 33 0 31 2 TCAT 2 1 370721 CASAVA_Build 17 3425529 1D CCTTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 411 hom 33 1 25 8 A 14 13 370722 CASAVA_Build 17 3432895 13I CCCAGCTACT -------------/CAGGAGGCTGAGG CAGGAGAATT 2716 het 2026 hom 14 6 7 1 CAGGAGGCTGAGG 0 1 370723 CASAVA_Build 17 3437897 1D CCATCAAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1536 hom 25 9 11 6 A 12 11 370724 CASAVA_Build 17 3438857 1D AACCTCATCT A/- AAAAAAAAAA 2008 het 581 hom 20 6 7 7 A 17 16 370725 CASAVA_Build 17 3451272 3D CTGGGAGCCC CTT/--- CTTCTCACCT 3070 het 2670 hom 23 9 10 4 CTT 2 1 370726 CASAVA_Build 17 3462797 1D CTCAGGGATC T/- TTTTTTTTTT 2256 hom 24 het 17 0 7 10 T 16 15 370727 CASAVA_Build 17 3471587 4D TCCCTCCCTC CCTT/---- CTCTTTACTC 3070 het 1890 hom 17 7 8 2 CCTT 1 0 370728 CASAVA_Build 17 3485446 1I GCCCCGCTAA -/T TTTTTTGTAT 723 hom 7 het 3 0 3 0 T 6 7 370729 CASAVA_Build 17 3487411 1D ACCTACCCCC T/- TCCCATAAAA 3070 hom 87 het 30 0 28 2 T 2 1 370730 CASAVA_Build 17 3488270 13D ATCAATCTGG TTTTTTTTTTGTT/------------- TTTTTTTTTT 2484 het 2484 ref 29 12 10 7 TTTTTTTTTTGTT 1 0 370731 CASAVA_Build 17 3493636 4D TAAACGGATT CTCA/---- CTCAGTTGCA 3070 het 3070 ref 28 12 10 6 CTCA 2 1 370732 CASAVA_Build 17 3496019 1D AACTGGGCCT G/- GGGGGTCTGA 3070 het 672 hom 20 4 12 4 G 6 5 370733 CASAVA_Build 17 3496832 1I TCCCTCATCT -/G GGGGGCCTGT 3070 hom 70 het 28 0 22 6 G 5 6 370734 CASAVA_Build 17 3499808 1I TGCTCCCACC -/T TTACTGAGCA 3070 het 3070 ref 64 35 23 6 T 2 3 370735 CASAVA_Build 17 3503925 1I ATCTCGGGGG -/A AAAAATAAAG 3070 het 197 hom 30 1 24 5 A 5 6 370736 CASAVA_Build 17 3509236 1I CCTGCCTCAC -/G GGGGGGAAGG 2220 het 2216 hom 24 8 8 8 G 6 7 370737 CASAVA_Build 17 3511443 3I GCCCAAAGCT ---/GTC GTCCTTCCTA 1898 het 1898 ref 27 14 7 6 GTC 1 2 370738 CASAVA_Build 17 3511586 2D CCTTTCTGCA CT/-- CTGTGTGCTC 3070 het 3070 hom 31 10 14 8 CT 2 1 370739 CASAVA_Build 17 3512355 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 396 hom 27 2 22 3 A 15 14 370740 CASAVA_Build 17 3512795 1I CCCGGGCTTT -/C CAGGCAGGTG 3070 hom 45 het 20 0 13 7 C 1 2 370741 CASAVA_Build 17 3526490 1I CTGACTATCC -/T TTTGCACCTT 3070 het 3070 hom 47 19 22 6 T 3 4 370742 CASAVA_Build 17 3526749 1D TGATTTGGGT G/- GGGGGCGGGG 3070 het 630 hom 25 5 18 2 G 6 5 370743 CASAVA_Build 17 3527404 4D TGGTGGAGTC AGAT/---- GGAGCAGAGG 2153 het 2153 ref 30 17 7 6 AGAT 1 0 370744 CASAVA_Build 17 3541026 1D GCCGCTGGTT G/- GGGGTCACAA 3070 hom 56 het 22 0 17 6 G 5 4 370745 CASAVA_Build 17 3544340 1D ATAGGCAAAT C/- CATAGAGACA 3070 het 3070 ref 26 10 10 6 C 2 1 370746 CASAVA_Build 17 3554162 4I ACAAACAAAC ----/AAAA AAAACCCAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 4 8 370747 CASAVA_Build 17 3556644 1D GCACATGCCG A/- AAAATGCGGA 3054 het 3054 ref 35 15 10 10 A 5 4 370748 CASAVA_Build 17 3561987 1D CCTGATGTAG T/- TCCCCCGATT 3070 het 3070 ref 35 17 11 9 T 2 1 370749 CASAVA_Build 17 3562050 4D GTAAGTCAAT AACA/---- AACAGGCTTC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 AACA 2 1 370750 CASAVA_Build 17 3566214 1D52M2D ACTCCGTCTC AAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGCAACACTTAAGGGCAGAGACGGGTAGCGGACAG/-AAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGCAACACTTAAGGGCAGAGACGGGTAGCGGAC-- AGAGGAGAGG 2595 het 2595 ref 21 16 8 12 N/A 0 0 370751 CASAVA_Build 17 3570628 1D TTCAACTTCC T/- TTTTTTTTTT 2409 het 2142 hom 31 8 9 14 T 15 14 370752 CASAVA_Build 17 3581379 12D TTTCCCTTCC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2817 het 2660 hom 26 10 8 8 T 24 12 370753 CASAVA_Build 17 3584281 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTGT 1858 het 1270 hom 12 3 5 4 T 9 8 370754 CASAVA_Build 17 3604647 2D GCTGTGCCTG GT/-- GTGTACCTGA 1875 hom 38 het 16 0 6 10 GT 3 2 370755 CASAVA_Build 17 3611227 3I TTTTCTTTAA ---/ATT AAACACACAT 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 ATT 0 1 370756 CASAVA_Build 17 3623359 1I ATTGGTGAAA -/C CCCCGTCTCT 1417 het 1417 ref 11 5 5 1 C 4 5 370757 CASAVA_Build 17 3629377 1D TATTAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 531 hom 27 2 20 5 T 12 11 370758 CASAVA_Build 17 3637152 1I TCAGAGGGAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 9 10 370759 CASAVA_Build 17 3640555 2D TCTCAAACAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 AC 10 9 370760 CASAVA_Build 17 3667078 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2964 het 2962 ref 26 11 9 6 A 11 12 370761 CASAVA_Build 17 3670973 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 2857 het 2262 hom 29 10 10 9 A 16 17 370762 CASAVA_Build 17 3675725 5I AGAAAAAACG -----/TAACT TAACTAAGTC 3070 het 3070 ref 50 28 14 8 TAACT 1 2 370763 CASAVA_Build 17 3684876 1D TGGATGAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 A 12 11 370764 CASAVA_Build 17 3697085 4D TGATTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 het 2920 hom 39 11 10 20 TTTC 5 4 370765 CASAVA_Build 17 3698131 4D ATATGTACGG GTGT/---- GTGTGTGTGT 3070 hom 69 het 24 0 24 1 GT 10 8 370766 CASAVA_Build 17 3702354 3D GAAATCTTCA TTG/--- TTGTTGTTGT 3050 het 3050 ref 23 13 7 4 TTG 5 4 370767 CASAVA_Build 17 3726800 14D TTTTTTTTTG GTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTGAGAC 1915 het 1843 hom 19 9 6 7 GTTTTTTTTTTTTT 1 0 370768 CASAVA_Build 17 3730827 1I TGGCAACTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 855 hom 32 3 20 9 T 14 15 370769 CASAVA_Build 17 3741153 1D GGGCAAGGTT G/- GGGGGGGGGT 1996 het 78 hom 29 2 9 18 G 10 9 370770 CASAVA_Build 17 3745996 1I CAAAAAAAAA -/T ATATTGATTA 3070 hom 68 het 25 0 20 5 T 0 1 370771 CASAVA_Build 17 3746177 1D GTGACTGGGT G/- GGGGATGCTG 3070 hom 75 het 31 0 25 7 G 5 4 370772 CASAVA_Build 17 3763904 1I GTGCACTCTT -/G GGGGGGGGTG 3070 het 2749 hom 27 11 10 6 G 8 9 370773 CASAVA_Build 17 3770911 1D TTTTTTTTTT C/- TTTAAATCCA 1533 het 438 hom 13 4 6 3 C 1 0 370774 CASAVA_Build 17 3772422 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 45 hom 18 1 14 3 T 9 10 370775 CASAVA_Build 17 3788997 1I GATTGCTTGA -/G TCCAGGAGTT 2695 het 2695 ref 21 9 8 4 G 0 1 370776 CASAVA_Build 17 3812770 1I AAGACAGACC -/T TGGCTAGGGT 3070 hom 99 het 37 0 31 6 T 1 2 370777 CASAVA_Build 17 3826210 1D GGCCTCAGCT G/- GAAGTGGGTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 G 2 1 370778 CASAVA_Build 17 3827766 1D TGGCCCCAGA G/- CCCAGGCTCG 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 G 1 0 370779 CASAVA_Build 17 3828438 1D GTCTTCAATT A/- AAAAAAAAAA 2869 het 2323 hom 24 8 10 6 A 11 10 370780 CASAVA_Build 17 3842716 3D GATCTCAACA TTT/--- TTTTTTTTTT 2050 het 1559 hom 15 6 7 3 T 16 13 370781 CASAVA_Build 17 3875725 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2495 hom 25 9 8 8 A 17 16 370782 CASAVA_Build 17 3879424 1I CAGAGCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 11 10 7 A 10 11 370783 CASAVA_Build 17 3880071 1D AGATCCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 14 13 A 15 14 370784 CASAVA_Build 17 3889336 1D CACAGTGAAA C/- CCCATCTCTA 2623 het 2119 hom 18 8 6 4 C 4 3 370785 CASAVA_Build 17 3894574 1I TTTTTGTGTG -/T TTTTTTTGAG 3070 het 3070 hom 28 14 14 0 T 7 8 370786 CASAVA_Build 17 3895874 1D TTTGTTCTTG T/- TTTTTTTTTT 2564 het 785 hom 23 5 8 10 T 15 14 370787 CASAVA_Build 17 3909178 1I AAAAAATACA -/T TTTTTTTTCT 2321 het 2321 ref 26 13 7 6 T 8 9 370788 CASAVA_Build 17 3911839 1D TGAATCTCAT C/- CTTTCCTCCC 3070 het 3070 ref 41 19 16 7 C 2 1 370789 CASAVA_Build 17 3914107 1D TGTAGATGGA G/- GGGGGGGGGT 1761 het 1761 ref 19 8 4 7 G 10 9 370790 CASAVA_Build 17 3916883 18I CAAAATTTCA ------------------/TCCTATTCTACTCTGAAT GAGGGGACAT 3070 het 3070 ref 33 19 11 3 TCCTATTCTACTCTGAAT 0 1 370791 CASAVA_Build 17 3926015 4D TATGTATAAT TAAG/---- TAAGGGAGAA 3070 het 3070 ref 29 17 9 5 TAAG 2 1 370792 CASAVA_Build 17 3930371 11D GAATTTTTTT TTTGTTTTTTG/----------- TTTGTTTGTT 2663 het 2663 ref 27 13 9 5 TTTGTTTTTTG 1 0 370793 CASAVA_Build 17 3930794 2D AACACATATC TG/-- TGTGTTGGGC 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 TG 3 2 370794 CASAVA_Build 17 3935992 1I CAGGCAGTAT -/A AAAAAAATAT 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 A 7 8 370795 CASAVA_Build 17 3947674 1D CCACAGAACT A/- AACACTGTGT 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 A 3 2 370796 CASAVA_Build 17 3949966 1D GATAACAGGG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 93 het 37 0 31 7 A 10 9 370797 CASAVA_Build 17 3969907 3D AGTCACTAAA CTC/--- CTTGATTCTC 3070 het 3070 ref 55 33 18 7 CTC 1 0 370798 CASAVA_Build 17 3981531 1I GATGTATAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 281 hom 32 1 25 6 A 9 10 370799 CASAVA_Build 17 3982245 1D AAATTTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 101 hom 43 2 20 21 T 17 16 370800 CASAVA_Build 17 3983342 1D CTATTAACCT C/- CCCGTCTTAT 3070 het 3070 ref 56 28 26 3 C 4 3 370801 CASAVA_Build 17 3985517 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 17 4 A 11 10 370802 CASAVA_Build 17 3986387 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 20 het 26 1 20 5 A 13 12 370803 CASAVA_Build 17 3987097 1I GTGGCTGCTT -/A AAAGAGCACT 3070 hom 114 het 48 0 36 12 A 3 4 370804 CASAVA_Build 17 3991764 1D TGAAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 31 3 21 9 A 13 12 370805 CASAVA_Build 17 3992298 3D AGAATCTGAT AGA/--- AGATCTCCAG 3070 hom 126 het 46 0 43 4 AGA 2 1 370806 CASAVA_Build 17 3993573 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 2903 het 1529 hom 23 8 7 9 A 15 14 370807 CASAVA_Build 17 3998995 1D CAATGTGGAC T/- TTTTTTTTTT 2099 het 1385 hom 30 8 10 12 T 15 14 370808 CASAVA_Build 17 4013436 1D AGGTGACGGT G/- ACTGAGACTG 3070 het 3070 ref 38 20 16 3 G 1 0 370809 CASAVA_Build 17 4021199 1D TCGCGCAGGT G/- GGGGAGGGAT 3070 hom 84 het 29 0 28 1 G 5 4 370810 CASAVA_Build 17 4035785 1D TTTATAATTC T/- TTTTTTTCTA 2997 het 2979 hom 21 8 8 6 T 8 7 370811 CASAVA_Build 17 4045323 1I CAATGACACA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 447 hom 39 2 31 6 T 9 10 370812 CASAVA_Build 17 4055786 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 63 hom 20 2 14 4 A 13 14 370813 CASAVA_Build 17 4059104 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 841 hom 31 2 22 7 A 13 12 370814 CASAVA_Build 17 4061937 4D CTCAAAAAAA AAAC/---- AAAACAAAAA 1607 het 380 hom 36 4 15 18 AAAC 1 0 370815 CASAVA_Build 17 4061963 5D AACAAACAAA CAAAC/----- AAAAAACATC 1501 het 290 hom 36 5 5 28 CAAAC 1 0 370816 CASAVA_Build 17 4065966 4I CACCAAAACA ----/AACT AACAAACAAA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 AACT 0 1 370817 CASAVA_Build 17 4075002 1I TTTTTTTTTT -/A AAATAAACTG 2193 het 2193 ref 30 11 12 7 A 3 4 370818 CASAVA_Build 17 4086595 6D CAAATAGATA TTTATG/------ TTTAACTCTG 3070 het 3070 hom 43 19 18 9 TTTATG 1 0 370819 CASAVA_Build 17 4093107 4D TTTTTTGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3054 hom 30 9 11 10 TTTG 6 5 370820 CASAVA_Build 17 4100717 1I ATGATTCTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 72 het 31 0 25 6 T 9 10 370821 CASAVA_Build 17 4124037 1I AACTTACCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2025 hom 26 7 16 3 T 11 12 370822 CASAVA_Build 17 4126698 4D CAACTAAGTA AGGC/---- AGGCAGGCAG 3070 hom 126 het 46 0 43 6 AGGC 3 2 370823 CASAVA_Build 17 4127837 1I CTGAAAACAC -/A AAAAAATACT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 6 7 370824 CASAVA_Build 17 4128491 1I AAGAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 A 9 10 370825 CASAVA_Build 17 4129320 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2297 het 584 hom 15 3 6 7 A 17 16 370826 CASAVA_Build 17 4138816 1D AATTTAAGTG T/- TCTCACAATA 3070 het 3070 ref 38 21 13 5 T 2 1 370827 CASAVA_Build 17 4154608 4I AATCCTTGAA ----/CGGT CGGTACCGGT 3070 het 3070 ref 37 16 18 3 CGGT 1 2 370828 CASAVA_Build 17 4162082 1D TCTGAGGTGA G/- GGAGTTCGAG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 3 2 370829 CASAVA_Build 17 4166378 4D GATCATAGAT AGAC/---- AGACCCCTTT 3070 het 3070 ref 60 29 26 8 AGAC 2 1 370830 CASAVA_Build 17 4168423 1D GCCCCCGGTA C/- CCCAAGGCCA 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 C 4 3 370831 CASAVA_Build 17 4180127 2D TAAAAGACTA GT/-- TTAGCTAGAC 3070 het 3070 ref 47 26 18 3 GT 1 0 370832 CASAVA_Build 17 4184031 5I AGAAAACAAA -----/GAGGT GACTGGCATT 3070 het 3070 hom 37 17 18 2 GAGGT 0 1 370833 CASAVA_Build 17 4199557 1D CATTGTTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 451 hom 32 1 22 9 A 10 9 370834 CASAVA_Build 17 4209913 5D AAAAAAAAAC AAACA/----- AAAAAAAACT 723 het 723 ref 28 22 5 3 AAACA 1 0 370835 CASAVA_Build 17 4224241 1D CAATATCTGT A/- AAAAAAAAAA 2162 het 2154 hom 30 10 8 12 A 17 16 370836 CASAVA_Build 17 4231289 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 15 0 13 2 T 11 10 370837 CASAVA_Build 17 4244957 4D TCTCTCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 3070 hom 51 het 22 0 18 8 TCTT 6 5 370838 CASAVA_Build 17 4245513 3D CAGATAAGGA ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 ATT 6 5 370839 CASAVA_Build 17 4248908 2D TCATCAAGAC AG/-- GGGAATTGCA 3070 het 3070 hom 34 17 15 2 AG 1 0 370840 CASAVA_Build 17 4248986 1I TGTTTGTTTG -/T TTTTTGTGAC 1853 het 1853 ref 16 11 4 3 T 5 6 370841 CASAVA_Build 17 4251202 1D GAATCTGTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 30 11 17 3 T 10 9 370842 CASAVA_Build 17 4253108 1I GTGCCATTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 A 10 11 370843 CASAVA_Build 17 4260463 1D AGGTAATGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 27 0 11 16 T 17 16 370844 CASAVA_Build 17 4262481 1I GTTTTTTTTG -/C TTTTTTTTTG 2908 het 2908 ref 25 13 7 5 C 0 1 370845 CASAVA_Build 17 4265085 1D GATAATGAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 81 het 28 0 27 1 T 10 9 370846 CASAVA_Build 17 4266768 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 19 7 T 10 11 370847 CASAVA_Build 17 4267705 1D CTGTCTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 20 5 T 12 11 370848 CASAVA_Build 17 4268188 4D TTTATTTCAT TTTA/---- TTTATTTATT 2679 het 2679 ref 29 17 8 4 TTTA 3 2 370849 CASAVA_Build 17 4272073 1I AAAGCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 625 hom 31 2 29 0 A 10 11 370850 CASAVA_Build 17 4273460 1I ACTCCATTTC -/A AAAAAAAAAA 981 het 157 hom 7 1 3 3 A 14 15 370851 CASAVA_Build 17 4293122 1D TTGCTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 113 het 41 0 37 4 T 11 10 370852 CASAVA_Build 17 4305706 1I AGGGAGGCCT -/C CCCCCACTGC 3070 het 2539 hom 29 9 13 7 C 5 6 370853 CASAVA_Build 17 4305962 2D TGCCCTCTGT GG/-- GGGGGGGGTG 2287 het 1892 hom 15 6 6 3 G 10 8 370854 CASAVA_Build 17 4324903 2D CTCGCCACAC AT/-- GTTTTGGTAT 3070 het 3070 ref 59 29 18 13 AT 1 0 370855 CASAVA_Build 17 4327543 4D TTTTTTTCTC TCTT/---- TCTTCTTGCT 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 TCTT 2 1 370856 CASAVA_Build 17 4330143 1I AAGATGTCTG -/C CCCCTCCCCG 1554 het 1554 ref 33 14 9 10 C 4 5 370857 CASAVA_Build 17 4330871 3D CAATGCTTTG CAC/--- CACCATCCCA 3070 hom 39 het 20 0 13 8 CAC 2 1 370858 CASAVA_Build 17 4339577 18I AGGTGGCTCC ------------------/CTGACTCCCTGAGAGCCA CTGACTCCCT 3070 hom 83 het 35 0 27 10 CTGACTCCCTGAGAGCCA 0 1 370859 CASAVA_Build 17 4341174 1D TTAGTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 58 het 32 0 18 14 T 15 14 370860 CASAVA_Build 17 4342530 1D TCCTTCTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 869 hom 26 4 14 8 A 15 14 370861 CASAVA_Build 17 4346111 1I TTCTTTTTTT -/C CCCCCCACTT 3070 het 1818 hom 26 8 13 5 C 6 7 370862 CASAVA_Build 17 4347537 1I GGAGGGGGGC -/G GGGGGGGGTG 1230 hom 10 het 5 0 4 1 G 8 9 370863 CASAVA_Build 17 4350753 1I CCACCTGGTG -/C CCTTCTCTGG 3070 het 3070 hom 27 9 13 5 C 2 3 370864 CASAVA_Build 17 4351367 2D GGGCAGAGCC AG/-- AGAGGGTGGG 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 AG 3 2 370865 CASAVA_Build 17 4362878 1D CCAGAGGGCT C/- CCCGCAGCTT 2537 het 1504 hom 29 8 9 12 C 4 3 370866 CASAVA_Build 17 4366647 1I GCCGGTGGCC -/G GCGGAGAACA 3070 het 3070 ref 33 19 10 4 G 1 2 370867 CASAVA_Build 17 4368580 4I AACAAAACAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 1413 hom 21 5 11 5 AAAC 3 4 370868 CASAVA_Build 17 4369650 27I GTGGGCTCAG ---------------------------/CACACGTGAGCTGAGCGAGGGCTTCCC CACACCCTCC 3070 hom 39 het 17 0 12 5 CACACGTGAGCTGAGCGAGGGCTTCCC 0 1 370869 CASAVA_Build 17 4379725 1I AAAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 9 10 370870 CASAVA_Build 17 4386476 1I CAGCAGTGAG -/T TGGGGGGGAG 2631 hom 25 het 13 0 8 5 T 1 2 370871 CASAVA_Build 17 4388515 4D AGTGACCCCA GGGG/---- GGGGCCAGGC 2675 het 1764 hom 23 6 8 10 G 8 4 370872 CASAVA_Build 17 4390263 2D CTTGAGTGCA TG/-- TGTGTGCAGC 2688 het 2688 ref 31 17 8 7 TG 4 3 370873 CASAVA_Build 17 4402885 1D CCACCCCTTA T/- TTTTTTTTTT 2855 hom 32 het 17 0 9 8 T 12 11 370874 CASAVA_Build 17 4416996 1D GAGGGGAAGT C/- CCCCGTAGCA 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 C 5 4 370875 CASAVA_Build 17 4419693 1I GAAAAAATGC -/A AAAAAAAAAG 2512 het 2512 ref 32 18 7 7 A 9 10 370876 CASAVA_Build 17 4424924 1I CTGCCCACTT -/C CCCCCTGCCT 3070 het 3070 hom 44 18 14 12 C 5 6 370877 CASAVA_Build 17 4427774 7I GGGTAGCCTG -------/GGCCTCC GGCCTCCGCA 3070 hom 67 het 29 0 20 9 GGCCTCC 1 2 370878 CASAVA_Build 17 4450147 1D GACTCATCCG T/- AAGATTATCT 2333 het 2333 ref 21 13 5 4 T 1 0 370879 CASAVA_Build 17 4451459 1I ACCTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 256 hom 34 2 23 9 A 11 12 370880 CASAVA_Build 17 4451734 1D CACTTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1915 het 53 hom 22 1 9 12 T 13 12 370881 CASAVA_Build 17 4461066 6I TGATTTTTTG ------/TTTGTT TTTGTTTTTG 3070 hom 87 het 42 0 30 15 TTTGTT 2 3 370882 CASAVA_Build 17 4463712 2I TTTCTTTTTC --/TT TTTTTTTGAG 2263 het 2263 ref 19 7 8 4 T 7 9 370883 CASAVA_Build 17 4465540 1D CATAGTGAGA C/- CCCCCCCATC 3070 hom 51 het 21 0 15 6 C 8 7 370884 CASAVA_Build 17 4473317 1I AATTATCAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 T 9 10 370885 CASAVA_Build 17 4473633 4D CCTTCCTTCC TTCT/---- TTCTTTCTTT 2758 het 2561 hom 25 10 10 5 TTCT 3 2 370886 CASAVA_Build 17 4490677 2D GTGCGCATTT TC/-- TCTCTTCCTG 1966 hom 21 het 9 0 6 3 TC 3 2 370887 CASAVA_Build 17 4491728 3I CTTCTGGTGG ---/AGA AGAAGGGTGG 3070 hom 50 het 20 0 15 5 AGA 1 2 370888 CASAVA_Build 17 4492108 2I CGCACGCGTG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 ref 49 15 16 18 CA 7 8 370889 CASAVA_Build 17 4494613 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTAGTAG 3070 het 1314 hom 13 3 8 2 T 5 6 370890 CASAVA_Build 17 4496369 2D ACCTCTTCCT CC/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2076 hom 28 10 13 7 C 2 0 370891 CASAVA_Build 17 4499705 1I AGCTACCGTG -/C CCCGGCCTCA 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 C 3 4 370892 CASAVA_Build 17 4504508 1I GACAGAGTAT -/G TTAACATAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 G 0 1 370893 CASAVA_Build 17 4505224 24D CTCCGTCTCC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------------ AAAAAAAAAA 1440 het 1440 ref 16 7 4 6 A 36 12 370894 CASAVA_Build 17 4506031 4D TACAAACAGC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 120 hom 32 2 14 17 ACAA 4 3 370895 CASAVA_Build 17 4509106 1I AACATCCCAG -/A AAAAAAAGAC 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 A 7 8 370896 CASAVA_Build 17 4509771 1I GCCCATCAAA -/C TTCTTAATGG 3070 hom 66 het 25 0 21 4 C 0 1 370897 CASAVA_Build 17 4511404 1I AAACAAAAAC -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 A 8 9 370898 CASAVA_Build 17 4512505 2D CAGCTCTCTC TT/-- GGGGCACCCA 3070 het 3070 ref 37 15 16 6 T 2 0 370899 CASAVA_Build 17 4515703 2D AGCCATAGTC TA/-- TAAACCCTGT 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 TA 2 1 370900 CASAVA_Build 17 4516596 1D AGACGTCAGG A/- AAAAAATGTG 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 7 6 370901 CASAVA_Build 17 4516737 2I CTAAAAGTCA --/AG AGAGAAAAAC 3070 hom 93 het 32 0 32 0 AG 2 3 370902 CASAVA_Build 17 4516861 1D AACATTTCAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 11 10 370903 CASAVA_Build 17 4517787 1I TGCCTCACTG -/C CCCCCCCATC 2483 het 2483 ref 33 11 8 14 C 7 8 370904 CASAVA_Build 17 4519789 1D TCAGAGGAGG A/- AAAAAAAAAA 2637 het 849 hom 27 3 8 17 A 16 15 370905 CASAVA_Build 17 4519824 4D ACAGTTTAGG AATT/---- AATAGGAAAA 3070 het 3070 hom 33 8 13 15 AATT 1 0 370906 CASAVA_Build 17 4522186 3D CTCCTCCTCA TCC/--- TCCTCTTCTT 3070 het 2445 hom 37 10 20 9 TCC 2 1 370907 CASAVA_Build 17 4531420 1I TCCCAGCTAC -/T TTGCATACAT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 T 2 3 370908 CASAVA_Build 17 4533003 1D GGGTCTAAAG A/- AAAAAATAAT 3070 hom 35 het 29 0 13 16 A 7 6 370909 CASAVA_Build 17 4534674 1I CCCACCACAT -/G GACTCTTCCC 3070 hom 104 het 39 0 34 5 G 1 2 370910 CASAVA_Build 17 4535671 1D CCATCTGTAC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 63 het 22 0 20 3 A 9 8 370911 CASAVA_Build 17 4542511 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 5 A 13 12 370912 CASAVA_Build 17 4546077 2D CCAGGAAAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 58 het 25 0 18 7 A 14 12 370913 CASAVA_Build 17 4547260 5I CAGGAGAATC -----/GAGAG GAGAGGAGAG 3070 het 3070 ref 50 23 16 11 GAGAG 3 4 370914 CASAVA_Build 17 4551369 1I GATGAGAGTT -/G GGGGGGGTGG 1699 het 1699 ref 17 7 6 4 G 7 8 370915 CASAVA_Build 17 4553647 1D AGTGACCGGG C/- CTGGAACCTA 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 C 2 1 370916 CASAVA_Build 17 4554979 1D TCTCTGTCGA T/- TTTTACAGAG 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 5 4 370917 CASAVA_Build 17 4555632 2D TTTTTTAAAC TG/-- TGGTATGAAT 2443 het 2443 ref 25 17 6 2 TG 2 1 370918 CASAVA_Build 17 4556172 5D CCCAATAGCG TTAAT/----- TTTTCTCCAT 3070 het 3070 ref 42 23 13 8 TTAAT 1 0 370919 CASAVA_Build 17 4556469 1D ACAAGTACCC T/- TTTCCTTCTC 3070 hom 145 het 54 0 46 8 T 4 3 370920 CASAVA_Build 17 4557477 1I AGGTGATCCA -/C CCCCCCTCGG 2211 het 969 hom 10 3 6 1 C 6 7 370921 CASAVA_Build 17 4557669 2D ACGTGCCTTG TC/-- TCTCTCTTTG 3070 het 3070 hom 36 13 16 8 TC 4 3 370922 CASAVA_Build 17 4558280 2D TCTCACTGAC TT/-- TAAGAATGAA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 T 3 1 370923 CASAVA_Build 17 4558529 3I GAACCTGCAG ---/ACC ACCTTCCCAG 3070 het 3070 hom 37 14 15 8 ACC 1 2 370924 CASAVA_Build 17 4577645 4D TCAAGGGTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 35 17 15 4 TTTG 4 3 370925 CASAVA_Build 17 4583387 1D GGAAAAACTG A/- AGCCCGAGCC 3070 het 3070 hom 35 16 15 5 A 2 1 370926 CASAVA_Build 17 4584081 1I GTGAAACCCC -/G GTCTCTACTA 1536 het 1403 hom 11 4 5 2 G 1 2 370927 CASAVA_Build 17 4584336 1D ATTTTATAGT A/- TAACCGTTTT 3070 het 3070 hom 39 18 20 2 A 1 0 370928 CASAVA_Build 17 4585768 1I AAAGACCCGA -/G GAAAAGTGCA 3070 hom 93 het 33 0 31 3 G 1 2 370929 CASAVA_Build 17 4586312 4I ACAGAAAAAC ----/AGAA AGAGCAGAGT 3070 hom 81 het 37 0 26 11 AGAA 0 1 370930 CASAVA_Build 17 4588115 1D CAGAGGTTGC A/- GTGAGCCAAG 2676 het 10 hom 11 0 8 3 A 1 0 370931 CASAVA_Build 17 4594528 1D GCTGAGGGGG C/- CCTGCTTTTC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 3 2 370932 CASAVA_Build 17 4604375 2I TCCAATTATA --/CT CTTTTAGTTA 3070 het 2754 hom 17 7 8 2 CT 1 2 370933 CASAVA_Build 17 4605245 1I ACTCCCACAG -/T CAAACCGTAG 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 T 0 1 370934 CASAVA_Build 17 4606362 3D TTTGTCTCTT AAA/--- AAAAAAAAAA 2506 hom 20 het 16 0 6 10 A 13 10 370935 CASAVA_Build 17 4610132 2D ATATATATAG TA/-- TCATACAAAG 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 TA 1 0 370936 CASAVA_Build 17 4612081 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 36 0 28 8 A 13 11 370937 CASAVA_Build 17 4613750 1D AAAAATAGGG T/- TTTTTTGTTG 3070 hom 141 het 53 0 48 6 T 7 6 370938 CASAVA_Build 17 4620302 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 10 11 370939 CASAVA_Build 17 4633211 13I CCTTCCTGGA -------------/CGCCTACCTGGCT CGCTCACTCC 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 CGCCTACCTGGCT 0 1 370940 CASAVA_Build 17 4643863 10D AAAGAAAAGG AGAAAAGAAA/---------- AGAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 31 17 15 2 AGAAA 4 2 370941 CASAVA_Build 17 4671463 1I GTGCCCGGCC -/A AAAAAAAAAA 1622 hom 17 het 7 0 4 3 A 10 11 370942 CASAVA_Build 17 4673733 3I CTCGTTCCAG ---/CCT CCTCCCGTTC 3070 hom 100 het 45 0 38 7 CCT 1 2 370943 CASAVA_Build 17 4682241 4D AGGACTTCTA AATT/---- AAACTCTCTT 2629 het 2629 ref 65 55 7 6 AATT 1 0 370944 CASAVA_Build 17 4684306 2D AGGCATTTCT TC/-- TCTTTGGAAA 3070 het 3070 ref 38 22 11 6 TC 2 1 370945 CASAVA_Build 17 4684583 1I TTCTGTAGCA -/T TTTATGTTTT 3070 het 3070 hom 44 13 25 6 T 3 4 370946 CASAVA_Build 17 4690461 1I GGGTCTGTAG -/A TTTAGATGTG 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 0 1 370947 CASAVA_Build 17 4694375 1D GGAGACTTTT G/- GAATATGGCC 3070 het 3070 hom 32 12 12 9 G 2 1 370948 CASAVA_Build 17 4700474 1D TTCCTGCTGG C/- CCCCCCCCGC 3070 hom 66 het 25 0 21 4 C 9 8 370949 CASAVA_Build 17 4708479 1D ACACCAGGCA C/- CCGGGGCAGC 2590 het 2270 hom 21 9 9 3 C 3 2 370950 CASAVA_Build 17 4709967 4D CTTGGGAAAT AATC/---- AAACCCTTTG 3070 het 3070 ref 45 24 17 7 AATC 1 0 370951 CASAVA_Build 17 4714758 2D TCTACTAAAA AC/-- ACACAAAAAA 1208 het 733 hom 7 2 4 1 AC 3 2 370952 CASAVA_Build 17 4715362 2D AGGTGACAGA GT/-- GAGAACCTGT 3070 het 3070 hom 44 14 28 3 GT 1 0 370953 CASAVA_Build 17 4731015 1I CAGTCCCGGT -/C CCTGTCCAGG 1247 het 1247 ref 18 8 7 3 C 2 3 370954 CASAVA_Build 17 4737287 12D TGCTAACCTT TCCTAACCTCTC/------------ TCCTAACCTC 3070 hom 62 het 30 0 19 12 TCCTAACCTCTC 3 2 370955 CASAVA_Build 17 4740957 1I GCAGAGTTCT -/G GGGGAGAGGA 2970 het 1483 hom 18 7 8 3 G 4 5 370956 CASAVA_Build 17 4751258 1D AAAAAAACTT A/- AGAGTGTAAT 3070 het 3070 ref 23 11 7 5 A 2 1 370957 CASAVA_Build 17 4751310 1I TGGGGGAATT -/A AAAAAAAAAA 2041 het 2041 ref 27 11 8 8 A 10 11 370958 CASAVA_Build 17 4753059 4D ACACACCCAG ACAC/---- ACACACACAC 1442 het 1442 ref 27 14 7 8 AC 9 7 370959 CASAVA_Build 17 4756953 4I GAGACAGAGT ----/CTCA CTCTGTTGCC 1245 het 1245 ref 15 7 3 5 CTCA 0 1 370960 CASAVA_Build 17 4766533 4I CTCCTCAAAA ----/AAAT AAATAATTTT 2935 hom 24 het 9 0 8 1 AAAT 1 2 370961 CASAVA_Build 17 4769003 1D TGTACAAATT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 1309 hom 31 10 17 4 C 1 0 370962 CASAVA_Build 17 4786854 3D TGAGTAGAAG GTT/--- GTGAGTCCCC 3070 het 3070 ref 48 23 20 7 GTT 1 0 370963 CASAVA_Build 17 4789599 2I ACCTTGTAGT --/AC ACCTCAACCT 2558 het 2558 ref 38 17 8 13 AC 1 2 370964 CASAVA_Build 17 4803369 2D ACACACACAC AT/-- GCCACGCACA 2494 het 2494 ref 32 19 8 5 AT 1 0 370965 CASAVA_Build 17 4819904 2I GAACAAAAAC --/AA TCCCAGATTT 3070 hom 132 het 48 0 43 5 A 0 2 370966 CASAVA_Build 17 4839955 5D TGTCTCTAAC AAAAT/----- AAAAAAAGAA 3070 hom 66 het 23 0 23 1 AAAAT 1 0 370967 CASAVA_Build 17 4845600 1D TCTTCGCCCC T/- ATCAGAGGCA 3070 het 3070 ref 37 18 12 8 T 1 0 370968 CASAVA_Build 17 4856938 1I CAGAGCAGCG -/T TAACAATCAC 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 1 2 370969 CASAVA_Build 17 4862368 1D ATGCCTTTTT C/- CCCCCCTCTT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 7 6 370970 CASAVA_Build 17 4868567 2I CGTCTGTCTG --/TC TCTGTCTGTG 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 TC 1 2 370971 CASAVA_Build 17 4874294 1D ACTCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1061 het 410 hom 14 6 6 2 A 14 13 370972 CASAVA_Build 17 4879827 1I GATCCTCCCA -/C CTCAGCCTCT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 C 1 2 370973 CASAVA_Build 17 4883074 1D GGCGCGGTGG C/- CTCATGCCTG 3070 hom 30 het 15 0 10 5 C 2 1 370974 CASAVA_Build 17 4901150 2I GTTTGACTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 23 0 22 3 T 10 12 370975 CASAVA_Build 17 4901266 2D CCTGCCCCAG CC/-- TCCCGAGTAG 3070 het 2340 hom 18 7 9 2 C 2 0 370976 CASAVA_Build 17 4902164 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1329 het 639 hom 13 5 5 3 T 13 12 370977 CASAVA_Build 17 4904353 1I AACGTATGAA -/T TTTTTTGGGA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 T 6 7 370978 CASAVA_Build 17 4904451 1D GTGAGAGCAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 1829 hom 25 6 17 2 T 10 9 370979 CASAVA_Build 17 4904804 3I TCATAGTAGA ---/AAG AAGACTTATG 3070 het 3070 ref 32 20 9 3 AAG 1 2 370980 CASAVA_Build 17 4908290 1D ACCGTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2325 hom 31 het 19 0 8 11 A 17 16 370981 CASAVA_Build 17 4911414 1D CATATAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2203 hom 24 6 13 5 T 13 12 370982 CASAVA_Build 17 4914620 1D TGGTGTTAGG A/- AAACTGGCTA 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 4 3 370983 CASAVA_Build 17 4937195 1D GATGAGGCAC T/- TTTTTTTTTT 1696 het 495 hom 28 4 9 15 T 18 17 370984 CASAVA_Build 17 4937640 1D CTCCTGTCCA C/- TGTTTAGCAT 3070 het 3070 ref 35 20 12 3 C 1 0 370985 CASAVA_Build 17 4940548 4I ATACAGTGTA ----/CATT CATTCTGTGT 3070 het 3070 ref 42 20 17 5 CATT 1 2 370986 CASAVA_Build 17 4945664 1I TTTGTTTCTA -/T TTTTTTTTTT 2441 het 2441 ref 27 14 7 6 T 10 11 370987 CASAVA_Build 17 4947501 1D TAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2377 hom 35 11 19 5 T 13 12 370988 CASAVA_Build 17 4956978 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 1999 het 1999 ref 12 6 5 1 A 10 9 370989 CASAVA_Build 17 4959575 2D GTCTCCAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 1075 hom 26 5 12 11 AC 10 9 370990 CASAVA_Build 17 4967939 4D CACACACACG CACA/---- CACACACACA 3070 hom 63 het 32 0 15 21 CA 9 7 370991 CASAVA_Build 17 4969420 1I CGTGGAAGAG -/T TTGTCTTCAA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 T 2 3 370992 CASAVA_Build 17 4986355 2I TAGGCATCTT --/TG TGCCCACATG 3070 hom 57 het 24 0 20 4 TG 1 2 370993 CASAVA_Build 17 5022198 1I CAAATATTCT -/A AAAAAAAACC 3070 het 934 hom 32 2 24 6 A 8 9 370994 CASAVA_Build 17 5022453 2I TAATCTCATT --/AA GTTTGTCTAA 2387 het 2387 ref 36 25 5 7 A 0 2 370995 CASAVA_Build 17 5033266 1I TGCCAGGCCA -/T TTTTTTTTTC 2149 het 2149 ref 19 12 6 1 T 9 10 370996 CASAVA_Build 17 5038686 2D TTGGCAAGAC TT/-- ATATATTTCT 3070 het 1723 hom 21 6 11 5 T 2 0 370997 CASAVA_Build 17 5044719 1D CCTAATTTGT A/- AAAAAAAAAA 2804 het 2495 hom 29 11 9 9 A 17 16 370998 CASAVA_Build 17 5056067 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 1449 hom 17 3 9 5 A 9 10 370999 CASAVA_Build 17 5062305 1I TGGGCCTCCC -/A AAGTGCTGGG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 A 2 3 371000 CASAVA_Build 17 5082138 6D GGGGTTTTTG TTTGTT/------ TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 25 12 9 6 TTTGTT 3 2 371001 CASAVA_Build 17 5087181 1I CACACACACT -/A AAAAAAGGTT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 A 6 7 371002 CASAVA_Build 17 5092485 4D TAGTAGAGAC AGGG/---- AGGGTTTCAC 2354 het 2354 ref 13 8 5 0 AGGG 2 1 371003 CASAVA_Build 17 5096691 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAAAGAA 2693 het 2328 hom 21 11 9 3 G 1 0 371004 CASAVA_Build 17 5098480 6D TAAAGCTGTC AAAAAA/------ AAAAAAAAGA 104 het 104 ref 21 3 2 17 A 14 8 371005 CASAVA_Build 17 5100833 1I CTTGTCTCTA -/T TTTTTTTTTT 1313 het 1313 ref 12 5 3 4 T 10 11 371006 CASAVA_Build 17 5106485 9I CCAAAGACAT ---------/AAACAAAAC AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 39 23 12 4 AAACAAAAC 0 1 371007 CASAVA_Build 17 5113629 1I ATAGCCACAC -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 hom 58 21 28 9 A 7 8 371008 CASAVA_Build 17 5114419 1I TGAACTATGA -/T TTTTTTTTTT 1360 het 1360 ref 19 10 3 6 T 10 11 371009 CASAVA_Build 17 5118650 1D CTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAGT 3070 hom 30 het 14 0 10 5 A 9 8 371010 CASAVA_Build 17 5123131 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 hom 33 het 13 0 12 1 CTC 0 1 371011 CASAVA_Build 17 5123928 4D TAATAAAATA AAAT/---- AAAATTACAA 3070 hom 42 het 18 0 15 3 AAAT 1 0 371012 CASAVA_Build 17 5125506 1D CTCTATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2850 het 886 hom 16 7 7 2 A 15 14 371013 CASAVA_Build 17 5129888 3D AGACGATCTT ATC/--- ATATGCATGT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 ATC 1 0 371014 CASAVA_Build 17 5130526 5D AAAAAAAGAG TTGTA/----- TTGTTCAATT 3070 het 3070 hom 46 21 20 7 TTGTA 1 0 371015 CASAVA_Build 17 5132890 1I ACCTGGCTCA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 7 8 371016 CASAVA_Build 17 5133197 3I TTCTTCTTCC ---/TCT TCTTCCTTTT 3070 hom 79 het 28 0 23 5 TCT 1 2 371017 CASAVA_Build 17 5135150 1D ACTAGACTTG C/- TGAGCGTGGT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 C 1 0 371018 CASAVA_Build 17 5137314 1I CTCCCCCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1865 hom 16 5 10 1 A 11 12 371019 CASAVA_Build 17 5138600 1D TTTTGGTATC T/- GAGAGGTCCT 3070 het 3070 ref 25 14 10 2 T 1 0 371020 CASAVA_Build 17 5139408 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2539 hom 28 11 10 7 A 15 14 371021 CASAVA_Build 17 5139511 1I ATTGTTTTTA -/T TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 7 8 371022 CASAVA_Build 17 5141036 1D GGATTACAGG C/- GTGAGCCACT 3070 het 3070 ref 38 20 12 6 C 1 0 371023 CASAVA_Build 17 5143607 6I CGTGGTTCTG ------/AATTCC AATTCATTTT 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 AATTCC 0 1 371024 CASAVA_Build 17 5146922 1I TAAAAAATGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 8 9 371025 CASAVA_Build 17 5152628 4I CACGTATAGC ----/AATT AATGTACAGC 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 AATT 0 1 371026 CASAVA_Build 17 5166494 1D GTACTTCCAA G/- TACATATAAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 G 1 0 371027 CASAVA_Build 17 5173838 16D ATATATGTTC ATATATATATATATAT/---------------- ATATATATAT 3070 hom 42 het 18 0 15 4 AT 13 5 371028 CASAVA_Build 17 5183694 1D GCCACGCGCC T/- TGTAGTCCCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 2 1 371029 CASAVA_Build 17 5189317 12D TACCACGTAC ATTTTTCTGAAT/------------ AGGTGGCTTT 3070 het 3070 ref 38 24 13 8 ATTTTTCTGAAT 1 0 371030 CASAVA_Build 17 5202291 3I CAATTTTTCG ---/TTA TTATAAGTAA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TTA 1 2 371031 CASAVA_Build 17 5202447 9I CGCAGCACTT ---------/GTGATTGGA TTGGAGGCTG 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 GTGATTGGA 0 1 371032 CASAVA_Build 17 5209081 1D AGTTAGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2785 hom 30 9 16 5 A 13 12 371033 CASAVA_Build 17 5226103 1D GAACTTCGGA T/- TTTTTTTTTT 1292 het 1292 ref 31 20 5 6 T 15 14 371034 CASAVA_Build 17 5227586 25D GACATCCCAG TAGTGTTTGGAATTTTCTGTTCATA/------------------------- TAGTGTTTGG 3070 hom 81 het 37 0 27 15 TAGTGTTTGGAATTTTCTGTTCATA 2 1 371035 CASAVA_Build 17 5227783 19I ACTGACTGTA -------------------/TTTCCCTTGCTCAGTACAT TTTTGTTTTC 1764 het 1764 ref 36 21 6 9 TTTCCCTTGCTCAGTACAT 0 1 371036 CASAVA_Build 17 5239369 1D GGATTTCACA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 10 9 371037 CASAVA_Build 17 5252063 1D ACACTCACTC T/- TTTAACGAGG 3070 het 3070 hom 33 10 19 4 T 4 3 371038 CASAVA_Build 17 5254532 1D CCAGCACTTT G/- GGGAGGCTGA 3070 het 3070 hom 40 17 19 6 G 4 3 371039 CASAVA_Build 17 5275245 2D AATATGAGAA AC/-- ACAGCCAGGC 3070 het 3070 ref 38 18 17 3 AC 2 1 371040 CASAVA_Build 17 5281113 1D AAGAGGCAAT C/- CCATAGAGAA 3070 het 3070 ref 27 14 11 2 C 3 2 371041 CASAVA_Build 17 5283283 1I CTGCTGGAGA -/C CTCCGGTGCA 2671 hom 36 het 15 0 10 5 C 1 2 371042 CASAVA_Build 17 5283623 4I AGGAAACAGA ----/CTCT CTCTCCCCTT 3070 het 3070 hom 42 14 21 7 CT 2 4 371043 CASAVA_Build 17 5285200 10D CACAGTTCCA GGCAGTTCCT/---------- GGTAGCTGGA 3070 het 3070 hom 39 18 19 5 GGCAGTTCCT 1 0 371044 CASAVA_Build 17 5287875 4D GTACGTGTGT CGTG/---- CGTGCTCCAG 3070 het 3070 ref 31 20 10 2 CGTG 2 1 371045 CASAVA_Build 17 5303434 1D AATATAGTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 15 15 1 A 10 9 371046 CASAVA_Build 17 5307749 1D AGAGAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2190 hom 30 7 16 7 A 12 11 371047 CASAVA_Build 17 5329293 4I TAAAGCAAAT ----/CAAC CAAGAAACAA 3070 het 3070 hom 59 23 31 5 CAAC 0 1 371048 CASAVA_Build 17 5332703 1D TCAGAGAGGC A/- AAGAGTTTAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 A 3 2 371049 CASAVA_Build 17 5334509 4I TACCTAATAT ----/TTAA TTATTTATTC 3070 het 3070 hom 59 22 29 8 TTAA 0 1 371050 CASAVA_Build 17 5342080 1I GTCTCAGTCT -/A AAAAAAAAAA 3067 het 2206 hom 21 7 9 5 A 12 13 371051 CASAVA_Build 17 5343659 1D CTTTTGAGTC T/- TAAGATGACA 3070 het 3070 ref 28 14 9 6 T 2 1 371052 CASAVA_Build 17 5352550 8I CCCTTTGATA --------/CAATCATC CTATCCCTTA 3070 het 3070 ref 51 25 19 7 CAATCATC 0 1 371053 CASAVA_Build 17 5356764 1I TGACATTCTT -/A ATCATTTTTG 2283 het 2283 ref 34 16 5 13 A 1 2 371054 CASAVA_Build 17 5358235 1D AAATTTAAGT A/- AAAAATTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 13 0 A 6 5 371055 CASAVA_Build 17 5362618 2I TTTGTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 656 het 558 hom 22 6 7 9 TC 0 1 371056 CASAVA_Build 17 5371232 3D GGTCACATTG GAA/--- GAAGAAGAAT 3070 het 3070 hom 25 10 12 4 GAA 4 3 371057 CASAVA_Build 17 5373332 4I TTTTTTCCCT ----/TCTC TCTATCTTAT 3070 hom 87 het 31 0 29 2 TC 1 3 371058 CASAVA_Build 17 5376536 1D TTAAAATACT G/- TAACAATAAC 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 G 1 0 371059 CASAVA_Build 17 5378897 3D CCTGGGCCAC TTT/--- TTCCTGGCTC 3070 het 3070 hom 28 9 11 10 T 5 2 371060 CASAVA_Build 17 5379568 4I GGTCAAATAG ----/GCCC GCCCATAGGT 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 GCCC 1 2 371061 CASAVA_Build 17 5385881 1D CACCTCCCCC T/- GCCCACCAAG 2442 het 2442 ref 46 19 13 15 T 1 0 371062 CASAVA_Build 17 5394184 1D GGCCTGCAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 T 11 10 371063 CASAVA_Build 17 5397761 2I CTGTCTGCCC --/CT GTCACCCAGG 3070 hom 66 het 24 0 22 2 CT 0 1 371064 CASAVA_Build 17 5404474 1I GGGTTGTAGG -/T TCATGGAGGA 3070 het 3070 hom 47 15 20 12 T 1 2 371065 CASAVA_Build 17 5404627 1D GGGTGGGCCA G/- AAATACTGGA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 G 1 0 371066 CASAVA_Build 17 5412182 15D TTGAATAAAA CTTCTACTCCTATTT/--------------- CTTTCACTAC 3070 het 3070 ref 37 28 10 3 CTTCTACTCCTATTT 1 0 371067 CASAVA_Build 17 5413021 1D CGTGGCCACC T/- ACCACTATGA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 T 1 0 371068 CASAVA_Build 17 5414420 1D ACTAATAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 10 9 371069 CASAVA_Build 17 5435528 5D TCCCCTCCTC TCCTT/----- TCCTTTCCTT 3070 het 97 hom 29 2 13 14 TCCTT 3 2 371070 CASAVA_Build 17 5435544 1D CCTTTCCTTC T/- TTTTTTTTTT 281 het 281 ref 27 6 2 19 T 15 14 371071 CASAVA_Build 17 5445647 1D ACTTCTGCTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 82 het 38 0 32 6 A 10 9 371072 CASAVA_Build 17 5452002 1I CTGTTTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1998 hom 44 5 31 8 A 11 12 371073 CASAVA_Build 17 5453979 1I CCCAGATTCT -/G GGCATGGCCT 3070 hom 93 het 40 0 30 10 G 2 3 371074 CASAVA_Build 17 5457163 12D TGTGTCTATG TATGTGTATGAC/------------ TATGTGCAGG 3070 hom 151 het 53 0 51 8 TATGTGTATGAC 1 0 371075 CASAVA_Build 17 5461715 4D GACTTTCTGA TCAT/---- TCATGTGGCA 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TCAT 2 1 371076 CASAVA_Build 17 5462881 1D TGTTTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 176 hom 34 1 26 7 T 15 14 371077 CASAVA_Build 17 5466867 3D CACATATCCA AAT/--- ATCCACTCTT 2609 het 2213 hom 27 8 9 16 AAT 1 0 371078 CASAVA_Build 17 5468744 1I TCCTACAAAG -/A AGTCATATTG 3070 hom 151 het 55 0 51 4 A 1 2 371079 CASAVA_Build 17 5473096 1D ACAGTGTCAG C/- CCGAACTGGC 3070 hom 113 het 44 0 36 8 C 3 2 371080 CASAVA_Build 17 5476067 2D TTCTTCACTC CT/-- CTCTCTCTCT 1302 het 1302 ref 50 33 3 16 CT 7 6 371081 CASAVA_Build 17 5482299 1I TTATTCACAT -/A AACAAAAATA 3070 hom 132 het 50 0 45 5 A 2 3 371082 CASAVA_Build 17 5484443 1I GCAAAGAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 880 hom 53 3 41 9 T 10 11 371083 CASAVA_Build 17 5489545 1D TCCTTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 2871 hom 32 het 15 0 10 6 T 13 12 371084 CASAVA_Build 17 5490605 1D CAGCCTCCCC A/- AACTGCTGGG 3070 hom 72 het 29 0 25 5 A 3 2 371085 CASAVA_Build 17 5490853 1D GTCTGTTTTT G/- GTCAATCCTC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 2 1 371086 CASAVA_Build 17 5491848 2I TTTCTTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 19 5 T 13 15 371087 CASAVA_Build 17 5493447 2D TGAGCCAGAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 33 0 19 15 T 14 12 371088 CASAVA_Build 17 5493668 1I CATCTGTTTC -/T TTTTTTTAAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 T 7 8 371089 CASAVA_Build 17 5499579 4I ACTAACCTCA ----/CAGT CAGCTTGGGC 3070 hom 106 het 41 0 33 8 CAGT 0 1 371090 CASAVA_Build 17 5501371 1D GGTGGCTTTG C/- AGAGGGAACC 3070 het 3070 ref 39 22 13 5 C 1 0 371091 CASAVA_Build 17 5509709 1D CACATGCAGG C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 66 het 26 0 21 5 C 10 9 371092 CASAVA_Build 17 5520273 5D TGCTTTACAA CTTAG/----- CTGGCAGAGG 3070 het 3070 ref 42 23 11 10 CTTAG 1 0 371093 CASAVA_Build 17 5529496 4D ACTCTATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 1583 het 40 hom 18 1 7 11 A 20 16 371094 CASAVA_Build 17 5530493 2I AGACAGCTGG --/CT CTCTCTTGCC 3070 hom 132 het 46 0 45 1 CT 3 4 371095 CASAVA_Build 17 5532954 1I GCCTGTTCTG -/A CCCTAGGGAG 3070 hom 102 het 38 0 34 4 A 0 1 371096 CASAVA_Build 17 5536154 1D CACACCAAAT C/- CCACTGTAGG 3070 hom 138 het 53 0 47 6 C 3 2 371097 CASAVA_Build 17 5539433 1I AACTCCATTT -/A ATCTTCACAA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 1 2 371098 CASAVA_Build 17 5541631 1D TTGATGGCTG A/- ATGAAGAGCT 3070 het 3070 hom 47 15 21 11 A 2 1 371099 CASAVA_Build 17 5542375 1I TTTAACGTGA -/C CCCCCACGGT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 C 5 6 371100 CASAVA_Build 17 5544109 1D GTGTCAGAAG A/- GGGGGTGGGG 3070 het 3070 ref 36 21 10 7 A 1 0 371101 CASAVA_Build 17 5544766 2I AAACTCAGGG --/AC ACAGGGGAAA 3070 hom 78 het 28 0 22 6 AC 1 2 371102 CASAVA_Build 17 5553984 1I ATTTATTTAC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 T 9 10 371103 CASAVA_Build 17 5560451 6I CTATTTTTAC ------/TATTAT TATTATTATT 2921 het 2921 ref 25 11 6 8 TAT 3 5 371104 CASAVA_Build 17 5564502 5I AGTCTGACTC -----/CTTTT CTTTTCTTTT 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 CTTTT 2 3 371105 CASAVA_Build 17 5579920 2D CAAGAGAAAC AT/-- AGGAAAAAAG 3070 het 3070 hom 57 23 25 10 AT 1 0 371106 CASAVA_Build 17 5580978 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 26 0 17 9 A 16 15 371107 CASAVA_Build 17 5584024 1D TTTTTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 20 0 17 4 A 13 12 371108 CASAVA_Build 17 5585793 3D CTAGTATCTT CTC/--- CTTTAGACCA 3070 het 1239 hom 25 3 15 9 CTC 1 0 371109 CASAVA_Build 17 5586930 1I TGTGGTAGAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 9 10 371110 CASAVA_Build 17 5609812 1I CGCTCAGCCC -/A AGGTTCCATT 3070 hom 87 het 33 0 27 6 A 1 2 371111 CASAVA_Build 17 5613513 2I CATATGGCAG --/CT CTCTGTATTG 3070 het 3070 ref 55 28 21 6 CT 2 3 371112 CASAVA_Build 17 5617406 8D CCTGTAGTCC CAGCTACT/-------- CAGCTACTCA 3070 hom 51 het 20 0 16 4 CAGCTACT 3 2 371113 CASAVA_Build 17 5617547 1I CAAGAAAAAC -/A AAAAACCAAA 3070 het 2094 hom 22 9 9 4 A 5 6 371114 CASAVA_Build 17 5617685 2D TTATCTGATT TG/-- TCTGTCTCTC 3070 het 3070 ref 35 19 12 4 TG 1 0 371115 CASAVA_Build 17 5618157 1I TTTCTCTGTT -/A AAAGATCTTG 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 A 3 4 371116 CASAVA_Build 17 5619698 4I AACAAAAAAA ----/CACC CACACATATA 3070 hom 111 het 38 0 37 1 CACC 0 1 371117 CASAVA_Build 17 5620677 2D GGAAAATAGA CT/-- CTGCCTCCTG 3070 het 3070 ref 39 24 12 3 CT 2 1 371118 CASAVA_Build 17 5624648 1D CAAAGTCATA T/- GACCGGAAGG 3070 het 3070 hom 36 15 18 5 T 1 0 371119 CASAVA_Build 17 5635659 1D TGTGGAAGCC A/- AACAAATGAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 A 3 2 371120 CASAVA_Build 17 5636430 1I CTTTGCTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 12 17 15 T 10 11 371121 CASAVA_Build 17 5639163 2D CCACCAAAAA AG/-- AGAAACCTCC 3070 het 3070 ref 41 20 15 8 AG 2 1 371122 CASAVA_Build 17 5640932 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 26 0 11 16 T 15 14 371123 CASAVA_Build 17 5641990 1D ATTCTCAGTC A/- GGGGTGATTT 3070 het 3070 ref 54 25 20 9 A 1 0 371124 CASAVA_Build 17 5643537 1D GGCAGCATGA C/- CCCAAGAGAA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 C 4 3 371125 CASAVA_Build 17 5647484 4I TAAAACTGAT ----/AGAC AGGAAAGAAT 3070 hom 163 het 58 0 55 3 AGAC 0 1 371126 CASAVA_Build 17 5647718 1D GTTCTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 78 hom 37 1 26 10 T 13 12 371127 CASAVA_Build 17 5648812 1I TCGTTTTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 43 16 11 16 T 13 14 371128 CASAVA_Build 17 5659568 3D CCGGCTGTGT CTG/--- CTGCTGCTGC 3070 hom 78 het 36 0 19 17 CTG 7 6 371129 CASAVA_Build 17 5661117 1D AGGGAGCTCA T/- TTTCCGTGAG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 4 3 371130 CASAVA_Build 17 5673962 1D ACCCTCCAAT A/- AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 46 20 20 6 A 8 7 371131 CASAVA_Build 17 5675512 4I AAAAAAAAGA ----/AGTG AGTGAAAGAG 3070 het 3070 ref 25 15 8 2 AGTG 1 2 371132 CASAVA_Build 17 5680609 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1351 hom 22 3 13 6 A 11 12 371133 CASAVA_Build 17 5685558 1I AATATGATAT -/A ATATGTTATA 1468 hom 7 het 6 0 3 3 A 1 2 371134 CASAVA_Build 17 5688758 2D ATAAATTCTA TG/-- TGAGATAAGT 3070 hom 84 het 32 0 29 6 TG 2 1 371135 CASAVA_Build 17 5690732 4D TTGGCAGTAT TTTC/---- TTTTAGTCCA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 TTTC 1 0 371136 CASAVA_Build 17 5692966 1D AGCAAAATGG T/- TTGCCATTAT 3070 het 3070 hom 31 9 19 3 T 3 2 371137 CASAVA_Build 17 5693566 1D AACTTTAATC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 17 0 14 3 T 10 9 371138 CASAVA_Build 17 5701599 1D32M1D TGGCACAAAA TTGGCTAATATCAAGCTACAACAGCAAAGCTGAG/-TGGCTAATATCAAGCTACAACAGCAAAGCTGA- GTAGATGTGT 3070 hom 184 het 57 0 62 10 N/A 0 0 371139 CASAVA_Build 17 5703185 1I CCCCTGACAA -/T TTTTTTTATG 3070 het 2555 hom 26 9 11 6 T 7 8 371140 CASAVA_Build 17 5703253 1I TTTTTGTTTA -/T TTTTTTTATC 3070 het 3070 hom 30 9 17 4 T 7 8 371141 CASAVA_Build 17 5716144 4D AGACTCCGTC ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 ref 41 19 15 10 ACAA 4 3 371142 CASAVA_Build 17 5717528 1D GGAAAAACCC A/- AAACCAGAAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 A 4 3 371143 CASAVA_Build 17 5718682 1D AGGAAACCCC G/- GCTGTCTCTA 3070 het 3070 hom 48 17 22 9 G 2 1 371144 CASAVA_Build 17 5729363 1D GACAGTATGT C/- CTGCAAGGAT 3070 het 3070 hom 35 16 16 3 C 2 1 371145 CASAVA_Build 17 5730299 1D TGTTTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1490 hom 19 5 10 4 A 12 11 371146 CASAVA_Build 17 5733701 2D ATTACTGATT TC/-- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 TC 1 0 371147 CASAVA_Build 17 5741004 1I AAAAAAGAAG -/A AAAAAAAAAA 2510 het 415 hom 21 4 13 4 A 10 11 371148 CASAVA_Build 17 5742959 4I CTTTTATTTA ----/TTTG TTTATTTGTT 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 TTTG 0 1 371149 CASAVA_Build 17 5748692 1D ATTAAAGAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 44 15 22 7 A 9 8 371150 CASAVA_Build 17 5750808 2D CACTGTACAC TT/-- AGGCTACACT 3070 het 3070 ref 33 18 11 6 T 2 0 371151 CASAVA_Build 17 5773306 1I CTTCTCCCCC -/T CTTCTCTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 9 12 T 0 1 371152 CASAVA_Build 17 5773877 3D TAAGAGGAAG AGA/--- AGGAGAGCCA 3070 het 3070 ref 44 23 16 5 AGA 1 0 371153 CASAVA_Build 17 5781079 14I GGGAGTAGAG --------------/TAGAGATCTGGGTA TAGAGCCCAG 2234 het 2234 ref 39 23 7 9 TAGAGATCTGGGTA 0 1 371154 CASAVA_Build 17 5786722 4I AGAGGAGTGT ----/TCTG TCTGAGCTGG 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 TCTG 1 2 371155 CASAVA_Build 17 5792408 1D TGATCCACCT G/- CCTCAGCCTC 2823 het 2326 hom 18 6 7 5 G 1 0 371156 CASAVA_Build 17 5793300 4D GCACACAGAT TGTC/---- TGACTCCAGA 3070 het 3070 hom 50 24 23 6 TGTC 1 0 371157 CASAVA_Build 17 5799807 1D CTCTTGGTAT G/- TTCATTCGTG 3070 het 3070 hom 59 21 30 8 G 1 0 371158 CASAVA_Build 17 5804823 1D ACTTAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 22 3 A 11 10 371159 CASAVA_Build 17 5811121 1D CTATTTTTTT C/- CAATTATTGC 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 C 2 1 371160 CASAVA_Build 17 5814520 1I GCACTTTGGG -/A GGCCCAGGCG 2340 het 1804 hom 16 6 8 2 A 0 1 371161 CASAVA_Build 17 5816775 1D CTGCTTATGG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 82 het 33 0 28 5 A 10 9 371162 CASAVA_Build 17 5823766 1I GAAGAGACGA -/T TTCCTCCCAG 3070 het 3070 ref 45 25 16 4 T 2 3 371163 CASAVA_Build 17 5825601 1I TGCCTGGCTA -/T TTTTTTTTTT 1165 het 1165 ref 17 9 7 1 T 14 15 371164 CASAVA_Build 17 5828652 1D CTAGCCATCT C/- CTATTAAGCT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 C 2 1 371165 CASAVA_Build 17 5828752 5I ATTTAAAAAC -----/ATGTT ATGTTAGCAT 3070 het 3070 ref 34 18 15 1 ATGTT 1 2 371166 CASAVA_Build 17 5836589 1I TTGTCAGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 10 11 371167 CASAVA_Build 17 5851619 1I CTCACTGCAA -/C CTCTGCCTCC 3070 het 2162 hom 21 6 11 4 C 1 2 371168 CASAVA_Build 17 5853883 1D AAAAAGTTCC A/- AAAGACAGCA 1730 het 1730 ref 18 11 4 3 A 4 3 371169 CASAVA_Build 17 5856186 1D AACCGGGACT G/- TTGTGTTGTT 3070 het 3070 hom 42 18 22 3 G 1 0 371170 CASAVA_Build 17 5856582 1D GTGACCTAGA T/- TTTTAAAATG 3070 het 3070 ref 44 17 16 12 T 5 4 371171 CASAVA_Build 17 5858500 6D AGGAAGCCAA GCCGAT/------ GACCACAGAT 3070 het 3070 hom 50 22 27 2 GCCGAT 1 0 371172 CASAVA_Build 17 5859002 1D CCCGTCTCCA C/- CAAAAAATTC 2673 het 2673 ref 17 7 8 2 C 2 1 371173 CASAVA_Build 17 5869468 4I AGGCACACAG ----/AATC AATCACTGTG 3070 het 3070 hom 58 23 29 6 AATC 1 2 371174 CASAVA_Build 17 5870675 6I GGAGCGCCGG ------/GGTCTA GGTCTATGTG 3070 het 3070 hom 34 18 15 1 GGTCTA 1 2 371175 CASAVA_Build 17 5884096 3D TAATAACACG TTT/--- TTTTTTTTTT 2296 het 2296 ref 27 8 6 14 T 15 12 371176 CASAVA_Build 17 5898072 1I GCAGGCGGTG -/C CCCTGCAGGG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 C 3 4 371177 CASAVA_Build 17 5901412 1I TTTTTTTTTT -/A AAACCTCTCA 3070 hom 25 het 33 1 27 5 A 3 4 371178 CASAVA_Build 17 5901507 1I TGCTTTCCCT -/A AAAAAATGAA 3070 het 3070 ref 41 17 16 8 A 6 7 371179 CASAVA_Build 17 5934255 2D AACAAAAAAC AA/-- AAAAAAAACA 3070 het 1884 hom 31 4 21 8 A 10 8 371180 CASAVA_Build 17 5941085 1D TGAGAGCCCT C/- AAACACAGGC 3070 het 3070 hom 31 11 14 6 C 1 0 371181 CASAVA_Build 17 5941999 1I GTTCTTTCTT -/C TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 23 0 17 6 C 0 1 371182 CASAVA_Build 17 5943113 3D CAGGGTTACT TGG/--- GGGGCTGTGA 3070 hom 69 het 25 0 21 4 TGG 1 0 371183 CASAVA_Build 17 5955125 10D CCACTGTGTG CCATACTCAC/---------- CCTTCAGGTA 3070 het 3070 ref 46 22 18 9 CCATACTCAC 1 0 371184 CASAVA_Build 17 5959559 1D CAAATTTGGC A/- AAAATGTATT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 A 5 4 371185 CASAVA_Build 17 5960445 2D ACAGAGTGAT CA/-- CACACACACA 2244 het 2244 ref 42 18 9 17 CA 10 9 371186 CASAVA_Build 17 5965804 4D3M5I AGAGCTAGTT AGTACTC-----/----CTCATGAG AGCCTGACCC 3070 het 3070 hom 33 13 17 7 N/A 0 0 371187 CASAVA_Build 17 5968989 1D AGCCCCTTCA G/- GGGACATGCT 3070 het 3070 ref 57 25 23 9 G 4 3 371188 CASAVA_Build 17 5969739 1I ATTATTATTT -/C CCATGTGGAG 3070 het 3070 ref 55 29 20 6 C 2 3 371189 CASAVA_Build 17 5970266 5I TTTGGTGGGT -----/CTGAG CCCAGCAGTA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 CTGAG 0 1 371190 CASAVA_Build 17 5976695 17D ATGGAGATCT GAGAAGAAAATAACCCA/----------------- GAGAGAGGCT 3070 het 3070 ref 25 20 10 0 GAGAAGAAAATAACCCA 1 0 371191 CASAVA_Build 17 5979775 1I CCCAGCTACA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 T 7 8 371192 CASAVA_Build 17 5981015 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 het 311 hom 15 1 12 2 A 8 7 371193 CASAVA_Build 17 5997887 1I AACTTACAAG -/A AAAAAACAAC 3070 hom 63 het 23 0 22 2 A 6 7 371194 CASAVA_Build 17 6012265 1I TCTATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2136 hom 28 7 12 9 A 14 15 371195 CASAVA_Build 17 6012393 1I TAACAGGAGA -/G GGGGAGGCCT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 G 4 5 371196 CASAVA_Build 17 6021230 2D CTCACAAAAA TC/-- TCTCTTTGTA 3070 hom 131 het 51 0 43 8 TC 3 2 371197 CASAVA_Build 17 6042797 6D TCCCAGAGCA AGTTCC/------ AGTCCTGAAA 3070 het 3070 ref 28 17 10 4 AGTTCC 1 0 371198 CASAVA_Build 17 6053331 1D CTTTGTTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 T 10 9 371199 CASAVA_Build 17 6055562 1I ATCATCTTAA -/T GTGTCCCGAG 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 T 0 1 371200 CASAVA_Build 17 6061052 1D AAATAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 2469 het 2060 hom 23 8 6 9 T 12 11 371201 CASAVA_Build 17 6061289 1I CTTGTGAAGG -/T TTCTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 10 11 3 T 2 3 371202 CASAVA_Build 17 6065731 1D TTCCTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 32 2 21 9 A 15 14 371203 CASAVA_Build 17 6071143 1D AAATAAAAAT A/- AAAAAAAAAG 1271 hom 12 het 6 0 5 1 A 10 9 371204 CASAVA_Build 17 6071182 1I CATTTAAATT -/A AAAAAAAAAA 1345 het 760 hom 12 4 3 5 A 15 16 371205 CASAVA_Build 17 6081308 1D ATCTTTTTTC T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 25 10 11 4 T 9 8 371206 CASAVA_Build 17 6090927 1I ATTATCTCAG -/T TAAGTCCTTG 3070 het 3070 ref 44 22 14 8 T 1 2 371207 CASAVA_Build 17 6092160 2D GGCCTAAGAC AG/-- GGGGAAGCAG 3070 het 3070 ref 42 22 20 1 AG 1 0 371208 CASAVA_Build 17 6100906 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 691 hom 28 3 19 7 A 17 16 371209 CASAVA_Build 17 6103183 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1824 het 1824 ref 15 7 6 2 A 13 14 371210 CASAVA_Build 17 6107208 1I TCCCAGCTAA -/T TTTTTTGTAT 3070 hom 61 het 26 0 21 5 T 6 7 371211 CASAVA_Build 17 6109387 3D TCTCAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 677 het 542 hom 28 11 7 13 AAG 1 0 371212 CASAVA_Build 17 6111568 2D ACCCACCTCT AC/-- ACACACACAC 3070 het 394 hom 45 6 32 8 AC 12 11 371213 CASAVA_Build 17 6115136 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 439 hom 24 1 21 2 A 12 13 371214 CASAVA_Build 17 6115337 2D GCCTAAAGAC AA/-- AGAAGGGAAT 3070 het 3070 ref 44 22 18 5 A 3 1 371215 CASAVA_Build 17 6119602 1D GTGTTGCTAC T/- TGGGGGTCTC 3070 hom 77 het 33 0 24 9 T 2 1 371216 CASAVA_Build 17 6121215 3I AGGGATATTG ---/GGA GGATTTTAAA 3070 het 3070 hom 47 18 23 6 GGA 1 2 371217 CASAVA_Build 17 6121772 1D GAGTGGCTCC T/- TGGCCTCCTT 3070 hom 95 het 36 0 31 6 T 2 1 371218 CASAVA_Build 17 6123346 1I GCTAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 11 het 29 1 24 4 A 10 11 371219 CASAVA_Build 17 6132896 4I AAGGGAAACT ----/GTCA GTCATCCCTA 3070 hom 78 het 29 0 26 3 GTCA 1 2 371220 CASAVA_Build 17 6134197 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1993 hom 38 het 23 0 10 13 A 15 14 371221 CASAVA_Build 17 6155911 3D ACCCTGTACC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 25 0 15 11 A 17 14 371222 CASAVA_Build 17 6157358 1D GGTCAGTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 14 22 10 A 11 10 371223 CASAVA_Build 17 6159198 1I CAGAGCACTT -/A AAAGTCTTCA 3070 het 3070 hom 58 26 24 8 A 3 4 371224 CASAVA_Build 17 6166989 2I ATTTTTTGTA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1240 hom 24 6 14 4 T 11 13 371225 CASAVA_Build 17 6167545 1D TTTTAAATAT A/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 1 0 371226 CASAVA_Build 17 6213400 6D TTGCCCAGGC TGGTGT/------ CAAACTCCTG 3070 het 3070 hom 21 9 11 3 TGGTGT 1 0 371227 CASAVA_Build 17 6220565 2D ACATCTTCAA TT/-- TTTTTTTTTT 2621 het 38 hom 25 1 7 17 T 18 16 371228 CASAVA_Build 17 6220773 4D TCACCATGTT AGTC/---- AGGATGGTTT 1851 het 1530 hom 15 4 7 5 AGTC 1 0 371229 CASAVA_Build 17 6234885 1D CCCATCTCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 25 0 20 5 A 10 9 371230 CASAVA_Build 17 6235240 1D TCTGGTCCAG A/- AGACCTAACT 3070 het 3070 hom 36 16 15 5 A 2 1 371231 CASAVA_Build 17 6240509 1D TGTTAGCTCC G/- CCGTGCCCCA 3070 het 3070 hom 45 21 20 7 G 1 0 371232 CASAVA_Build 17 6257145 1D GAAACTAACA T/- TTCACAGATC 3070 het 3070 ref 46 20 18 8 T 3 2 371233 CASAVA_Build 17 6260914 1D AAGAAACCTA T/- TAGTTTCCCC 2662 het 2662 ref 38 22 12 7 T 2 1 371234 CASAVA_Build 17 6271855 1D CCAAGTGGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 153 hom 32 1 23 8 T 13 12 371235 CASAVA_Build 17 6276418 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2918 het 2517 hom 18 8 8 2 A 11 12 371236 CASAVA_Build 17 6276681 1D TAATATCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 19 0 13 6 T 13 12 371237 CASAVA_Build 17 6280461 1D TGGTGGTGCG C/- ACCTGTAATC 3070 hom 59 het 23 0 19 4 C 1 0 371238 CASAVA_Build 17 6281892 3I CAAATCCCCC ---/CCT CCCTCTGTCT 3070 hom 56 het 25 0 19 6 CCT 0 1 371239 CASAVA_Build 17 6284529 1I TAATGGAAAT -/A AAAAAACGTA 3070 het 3070 ref 33 14 13 6 A 6 7 371240 CASAVA_Build 17 6285457 3I ATGGGGGAGG ---/AGA AGGAGGATTG 3070 hom 105 het 40 0 35 5 AGA 0 1 371241 CASAVA_Build 17 6286020 1I GGGGGCCCCA -/C TCTGTTTGAT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 0 1 371242 CASAVA_Build 17 6291151 4D GGTTTTTTTT TTTG/---- TTGTTGTTTG 2991 het 2991 ref 31 14 10 8 TTTG 1 0 371243 CASAVA_Build 17 6295827 1D TTTACGAAGG T/- TTCCCCCAAG 3070 hom 49 het 18 0 13 5 T 3 2 371244 CASAVA_Build 17 6298800 1I CCAGACCCCA -/C CCCCCGAGGG 3070 hom 53 het 22 0 15 7 C 5 6 371245 CASAVA_Build 17 6301117 1I TCTAGCCCCG -/C CCCCCCCACC 1749 het 1749 ref 20 8 7 5 C 7 8 371246 CASAVA_Build 17 6305908 6I TGCCTCCCTC ------/CCTCCT CCTCCTCCTC 2576 het 2558 hom 23 7 8 8 CCT 4 6 371247 CASAVA_Build 17 6336254 1D ACTACAGGCG C/- CCCCCCACCA 1764 het 1697 hom 12 4 5 3 C 7 6 371248 CASAVA_Build 17 6350424 2D CCTTTCTCTC TT/-- TTTTTTTTTT 1848 het 1848 ref 22 8 7 7 T 13 11 371249 CASAVA_Build 17 6351466 1D CGTCTCTACT A/- AAAATACAAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 5 4 371250 CASAVA_Build 17 6358354 1I AGACATTATC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 A 11 12 371251 CASAVA_Build 17 6359774 1I ATCTAACCTA -/C CAGAAAACTC 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 C 1 2 371252 CASAVA_Build 17 6372847 2D AGCAACAAGA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 53 15 13 26 AC 10 9 371253 CASAVA_Build 17 6373041 27D TGGTTGATTT TGCTTTTCACCTTCTGATGACTGTCTC/--------------------------- CTGCATGCTA 3070 het 3070 ref 60 36 22 8 TGCTTTTCACCTTCTGATGACTGTCTC 1 0 371254 CASAVA_Build 17 6373637 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2125 het 2125 ref 24 13 6 5 A 15 14 371255 CASAVA_Build 17 6493250 9D AGGTGGGTTG GTTTTTTTT/--------- GTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 23 0 20 4 GTTTTTTTT 3 2 371256 CASAVA_Build 17 6496271 1I CCGACCCCGC -/G GGCCAAGCCG 2570 hom 54 het 24 0 15 9 G 2 3 371257 CASAVA_Build 17 6514662 1D TTTTAAAAAA T/- ATTCATGGCG 3070 het 3022 hom 25 10 10 5 T 1 0 371258 CASAVA_Build 17 6520236 2D TTTGCAGTTG CA/-- CACACACACA 1129 het 1129 ref 52 41 3 10 CA 6 5 371259 CASAVA_Build 17 6521274 2D ACTGGCTATG GC/-- ACCACAGGGG 3070 het 3070 hom 32 14 14 6 GC 1 0 371260 CASAVA_Build 17 6523213 2D TGCCAACCCA TT/-- TTTTTTTTTT 883 het 883 ref 24 9 4 11 T 20 18 371261 CASAVA_Build 17 6529024 1I TACAGGGGGG -/C TTCTGAAGAT 3070 hom 87 het 34 0 29 5 C 0 1 371262 CASAVA_Build 17 6558720 1I CGCCTTTCCT -/C GTGTCCCCAG 3070 het 3070 ref 35 16 10 9 C 0 1 371263 CASAVA_Build 17 6559466 5I ACTTCAGTTC -----/TTTTT TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 T 6 11 371264 CASAVA_Build 17 6583875 1I TATTTCTGCA -/T TTTTCCCTCT 3070 het 3070 hom 44 17 19 8 T 4 5 371265 CASAVA_Build 17 6592667 1D CAGAAAAAAA T/- CTTGCAGAAC 3070 hom 56 het 40 1 34 5 T 1 0 371266 CASAVA_Build 17 6599120 5I CCATTTTCTC -----/TTTTT TTTTTTCATT 3070 hom 74 het 37 0 25 13 T 6 11 371267 CASAVA_Build 17 6601036 2D TTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2360 het 1657 hom 34 12 8 14 T 16 14 371268 CASAVA_Build 17 6603869 1D CTGACCACTC T/- TTTCACCCCA 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 T 4 3 371269 CASAVA_Build 17 6605198 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1100 hom 15 5 8 2 A 10 9 371270 CASAVA_Build 17 6612173 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 971 het 971 ref 34 24 3 7 T 11 12 371271 CASAVA_Build 17 6613084 1I CATGACTCTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 269 hom 39 1 31 7 T 8 9 371272 CASAVA_Build 17 6620495 1D CAGGCCAACT C/- CCCCTCCCGC 3070 hom 53 het 21 0 17 4 C 5 4 371273 CASAVA_Build 17 6635060 1I CATCTGGTCA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 33 15 15 5 T 8 9 371274 CASAVA_Build 17 6637712 1I AGTTCAAAGA -/T GTTAGTTCTC 3070 het 3070 ref 45 26 19 0 T 0 1 371275 CASAVA_Build 17 6639751 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 11 10 371276 CASAVA_Build 17 6668343 11I ATCTTTATGT -----------/GATTACCTCCA GATTTCTGGC 3070 hom 124 het 48 0 39 10 GATTACCTCCA 0 1 371277 CASAVA_Build 17 6673559 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2282 hom 28 7 12 10 T 14 13 371278 CASAVA_Build 17 6677722 4I ACACAGACCC ----/CTGT CTATTAAAAT 3070 het 3070 ref 28 16 8 4 CTGT 0 1 371279 CASAVA_Build 17 6684649 2D AGGAAAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 25 7 T 13 11 371280 CASAVA_Build 17 6695849 1D CAGTGACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 14 21 6 T 12 11 371281 CASAVA_Build 17 6702517 4I TGTTTTTCCA ----/TTTG TTTGTGTCAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTTG 1 2 371282 CASAVA_Build 17 6736549 1I CATCTCCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 278 hom 31 1 27 3 A 11 12 371283 CASAVA_Build 17 6739112 3D GCTTCCTTGA TCT/--- TCTTGCACTC 3070 hom 117 het 44 0 39 8 TCT 2 1 371284 CASAVA_Build 17 6750704 6I AGTGATACTT ------/TTTTTG TTTTTGTCTG 3070 hom 66 het 31 0 23 8 TTTTTG 1 2 371285 CASAVA_Build 17 6756965 1D CCTCCGTGGA T/- TTTTTTTCCT 3070 hom 73 het 28 0 25 4 T 8 7 371286 CASAVA_Build 17 6770020 1I TCATAGAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 34 0 26 8 A 10 11 371287 CASAVA_Build 17 6780791 2D ATTTCCCCCC CT/-- GAGAGACAGG 3070 het 3070 hom 43 18 18 8 CT 1 0 371288 CASAVA_Build 17 6785250 1D ATATACAGTC A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 A 8 7 371289 CASAVA_Build 17 6789643 2D TTCTACAAAC AG/-- AGTGGGGGGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AG 2 1 371290 CASAVA_Build 17 6793984 20D CTTGGAGAAA GAATGTGTGATCAAACAAAT/-------------------- GTGGCCAACG 3070 hom 60 het 22 0 21 1 GAATGTGTGATCAAACAAAT 1 0 371291 CASAVA_Build 17 6794408 2D AAAACTCAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 2 A 13 11 371292 CASAVA_Build 17 6795742 4I GGTTGGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 2185 hom 26 11 9 6 TTTG 3 4 371293 CASAVA_Build 17 6836016 2I AAAAAAAAAA --/AC ACACACACAG 3070 het 1806 hom 22 7 11 4 AC 4 5 371294 CASAVA_Build 17 6838568 1D AAACTCTTTT C/- TAGGCAAAAG 3070 het 3070 hom 51 22 26 3 C 1 0 371295 CASAVA_Build 17 6838822 1I TATTTATTTA -/T TTTATTTATT 3070 het 2787 hom 24 8 14 2 T 3 4 371296 CASAVA_Build 17 6846810 1I TACAGGGAAC -/T TTGGCAGAGG 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 T 2 3 371297 CASAVA_Build 17 6848063 1I GGACCATGCC -/T TTTTTTAATA 3070 hom 27 het 12 0 9 3 T 6 7 371298 CASAVA_Build 17 6874365 1I TTATAGAATA -/C CTGAATCTGG 3070 hom 84 het 35 0 26 9 C 1 2 371299 CASAVA_Build 17 6876902 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTGAGATG 1675 het 301 hom 14 6 7 1 C 0 1 371300 CASAVA_Build 17 6903367 6I ACAGAACCCA ------/ATGAGG AATGTAGCTC 3070 hom 152 het 55 0 52 3 ATGAGG 0 1 371301 CASAVA_Build 17 6904617 1I CTTGCCATTC -/T TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 T 7 8 371302 CASAVA_Build 17 6906374 1D TCTCAACGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 185 hom 28 4 10 14 A 12 11 371303 CASAVA_Build 17 6913520 1D TCTCTGTCCA C/- CCCGTGACCC 3070 hom 31 het 39 0 15 24 C 4 3 371304 CASAVA_Build 17 6956282 1D AAAAGAAAAA G/- GGGGTAGCAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 G 5 4 371305 CASAVA_Build 17 6958983 2D CTCCACACGC CA/-- CTCACCCCAC 2691 het 2691 ref 28 13 10 5 CA 1 0 371306 CASAVA_Build 17 6960195 1D GAAGTAGCCA C/- CCCCCCAGTA 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 C 7 6 371307 CASAVA_Build 17 6960684 1I TGGCCACCCC -/A TTTGACTGAA 3070 hom 104 het 43 0 33 10 A 0 1 371308 CASAVA_Build 17 6963216 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2539 hom 22 7 11 4 T 11 12 371309 CASAVA_Build 17 6970139 4D TTACCTTGCT CAAA/---- CAAAGCCTGA 3070 het 3070 ref 41 24 15 4 CAAA 2 1 371310 CASAVA_Build 17 6972110 1D ATAAAATGTT A/- AAAAAAAAAA 2173 het 2173 ref 12 5 5 3 A 11 10 371311 CASAVA_Build 17 6973665 2I ATCAGGAGAC --/TG TGTGCACCCC 3070 hom 82 het 41 0 22 19 TG 2 3 371312 CASAVA_Build 17 6980052 1D AATACAAAAA T/- TAGCTGGGCG 2099 het 1832 hom 9 4 5 0 T 2 1 371313 CASAVA_Build 17 6980201 3D TTCTCTCTCC AAA/--- AAAAAAAAAA 2529 het 1308 hom 24 10 10 6 A 17 14 371314 CASAVA_Build 17 6980961 3I GCTACACTTA ---/CTT CTTATTATCT 3070 hom 84 het 38 0 30 8 CTT 1 2 371315 CASAVA_Build 17 6984813 3D GGACTTGTTT GCA/--- GCAGCAGCAT 1323 het 1323 ref 16 10 3 4 GCA 4 3 371316 CASAVA_Build 17 6997821 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 2262 het 2262 ref 30 12 8 10 T 8 9 371317 CASAVA_Build 17 6999002 1I TCTCCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 1778 het 1778 ref 43 22 6 15 A 15 16 371318 CASAVA_Build 17 7000323 1D ATCAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 2960 het 2960 ref 35 21 7 7 A 12 11 371319 CASAVA_Build 17 7017499 1I TTTTACTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 A 11 12 371320 CASAVA_Build 17 7020090 2I CTCCCTCATT --/CA CACACAGACT 3070 hom 183 het 71 0 58 13 CA 3 4 371321 CASAVA_Build 17 7020481 2D CATTCTCACA CT/-- CTCACACACA 3070 het 3070 hom 54 21 26 9 CT 2 1 371322 CASAVA_Build 17 7031305 1D CATGCAGGCC A/- GGCGCGGTGG 3020 het 457 hom 8 1 7 0 A 1 0 371323 CASAVA_Build 17 7065464 17D CAGGTCAGGC ACTGCCCTAGGTCAGGA/----------------- ACTGCCCTAG 3070 het 3070 ref 51 18 10 32 ACTGCCCTAGGTCAGGA 2 1 371324 CASAVA_Build 17 7085954 4D CAACTATCTT AATC/---- AGACGGAGGT 3070 het 3070 hom 44 20 19 7 AATC 1 0 371325 CASAVA_Build 17 7086217 1I TGCCTGTCCC -/A GATCCAAGGC 3070 hom 71 het 25 0 20 5 A 0 1 371326 CASAVA_Build 17 7088075 1I CATCCAGACT -/C CCAAGTGGAG 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 C 2 3 371327 CASAVA_Build 17 7107657 1I TGTCTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 17 16 5 G 0 1 371328 CASAVA_Build 17 7108333 1I TCATGAACTC -/T TTTTTTTTTT 1800 het 1050 hom 22 5 8 9 T 15 16 371329 CASAVA_Build 17 7110728 2D ACACTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2188 het 471 hom 12 2 7 3 A 14 12 371330 CASAVA_Build 17 7111206 7D ATGAATGAAT AAATTGC/------- AAATAAACAA 2966 het 2966 ref 20 13 7 1 AAATTGC 1 0 371331 CASAVA_Build 17 7117600 1I AATCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1386 het 1059 hom 11 3 5 3 A 15 16 371332 CASAVA_Build 17 7118431 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1699 hom 27 6 16 5 A 14 15 371333 CASAVA_Build 17 7133780 1D TAAGGCAAGG A/- ACAAGGCTCT 2690 het 1320 hom 16 5 9 2 A 2 1 371334 CASAVA_Build 17 7139306 2D TCTTTTCTTT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 15 0 14 1 TC 1 0 371335 CASAVA_Build 17 7146699 1I TTGTGTGTGT -/G TTTTTTTTTT 1326 het 1312 hom 18 9 9 0 G 0 1 371336 CASAVA_Build 17 7149002 1I TTTGTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 T 12 13 371337 CASAVA_Build 17 7169194 2D CCTTGCCCCG CC/-- CCCCCCCCCC 2179 hom 18 het 14 0 8 6 C 13 11 371338 CASAVA_Build 17 7199808 1I TGATCAGGGA -/G GGGGCTGCGT 3070 het 2659 hom 30 11 12 7 G 4 5 371339 CASAVA_Build 17 7206586 1I TTACGTCCGT -/A ATCCCAGCAC 3070 hom 54 het 22 0 17 5 A 1 2 371340 CASAVA_Build 17 7209939 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2772 het 2772 ref 20 11 8 1 A 12 10 371341 CASAVA_Build 17 7226770 1I CCCGGATGCC -/G TGGGCACGGG 3070 hom 158 het 58 0 51 7 G 0 1 371342 CASAVA_Build 17 7229633 2I ATTTTGAGAC --/AG AGTCTTGCTC 3070 hom 60 het 25 0 21 4 AG 1 2 371343 CASAVA_Build 17 7231258 1D GTCCAGGAGC T/- TCTCTGGAAG 3070 het 2739 hom 21 8 12 1 T 2 1 371344 CASAVA_Build 17 7231512 1D TGGGTGTGGT G/- GACTCCAGAG 2275 het 2275 ref 23 11 6 6 G 2 1 371345 CASAVA_Build 17 7237051 4D AGCTCTATCA TCTG/---- TCTATTTGGC 3070 het 2042 hom 20 7 12 1 TCTG 1 0 371346 CASAVA_Build 17 7258372 1I CACCTGCCCA -/C CCCCTCCCCA 2889 hom 36 het 17 0 8 9 C 4 5 371347 CASAVA_Build 17 7260428 1D CCGACCCCCC T/- AGGGCTCTGC 3070 het 3070 hom 29 11 12 7 T 1 0 371348 CASAVA_Build 17 7265880 1I TTGTTTTCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 674 hom 32 3 16 13 T 15 16 371349 CASAVA_Build 17 7277171 1I CCCGTCTCTA -/T TAAAAATACA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 T 1 2 371350 CASAVA_Build 17 7286544 5I CCCCCAAAAA -----/GGTAC GGATTTGTGC 3070 hom 75 het 29 0 23 6 GGTAC 0 1 371351 CASAVA_Build 17 7304155 1D TTTTTAGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 150 hom 33 1 24 9 T 11 10 371352 CASAVA_Build 17 7308406 1D GGAGGTGAGG T/- TGCAGTGAGC 3070 hom 90 het 33 0 30 3 T 2 1 371353 CASAVA_Build 17 7312417 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 9 8 371354 CASAVA_Build 17 7324982 1D TGGGGTGGAT C/- ACTTGAGGTA 1665 het 1665 ref 14 9 4 1 C 1 0 371355 CASAVA_Build 17 7335210 1D TAATCTGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 T 11 10 371356 CASAVA_Build 17 7338018 1I AAGACTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2305 hom 25 8 12 5 A 10 11 371357 CASAVA_Build 17 7338582 1I AGCATTACAA -/T TTTTTTTTTT 1870 het 96 hom 24 2 6 16 T 15 16 371358 CASAVA_Build 17 7343888 4D TTAAGAACAA AAAC/---- AAAAATTTCA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 AAAC 1 0 371359 CASAVA_Build 17 7348553 1D GAGTAAATAG A/- AAAAAAGATT 3070 het 3070 hom 35 13 15 8 A 7 6 371360 CASAVA_Build 17 7350649 2D AACAGAAAAC AT/-- ATGGCCACAC 3070 het 3070 ref 55 28 19 9 AT 2 1 371361 CASAVA_Build 17 7351377 1I ACTCTATCTC -/G AAAAAAAAAA 2222 het 2222 ref 39 18 9 12 G 0 1 371362 CASAVA_Build 17 7359422 2I TACTTTGGTA --/TT TTTTTAATAG 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 T 5 7 371363 CASAVA_Build 17 7359933 2I GAACCATTGG --/GA GAGAGATATA 3070 hom 39 het 30 0 13 17 GA 3 4 371364 CASAVA_Build 17 7361884 1D GCTCATGTCT G/- CAAATGGCCA 3070 het 3070 ref 26 12 11 3 G 1 0 371365 CASAVA_Build 17 7363261 4D TCAATTTTTT TTTG/---- TTTGTTTTTG 3070 het 3070 ref 26 11 11 8 TTTG 2 1 371366 CASAVA_Build 17 7363806 2D TTATTTACTT CA/-- CAGTTATCTT 3070 het 159 hom 33 1 27 6 CA 2 1 371367 CASAVA_Build 17 7363918 1I GCTTTATGTC -/T TATTTTGTGT 3070 het 3070 hom 34 11 10 13 T 1 2 371368 CASAVA_Build 17 7363955 1I ATTATTTTTC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 1613 hom 33 4 16 13 T 8 9 371369 CASAVA_Build 17 7366988 1I GGTGAAAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 A 9 10 371370 CASAVA_Build 17 7372626 1I GAACCCATTC -/T TTTTTATGGC 3070 hom 48 het 23 0 17 6 T 5 6 371371 CASAVA_Build 17 7375264 4D CAAACAAAAC ACAA/---- ACAAACAAAG 3070 het 3070 ref 22 10 10 2 ACAA 3 2 371372 CASAVA_Build 17 7377486 2D GTGTGTGCAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 88 het 33 0 29 4 GT 9 8 371373 CASAVA_Build 17 7380380 1D TCATTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 76 hom 25 2 17 6 T 14 13 371374 CASAVA_Build 17 7384026 2D ATACAAGCTC TA/-- TGAGTGTGTG 3070 hom 42 het 18 0 14 4 TA 1 0 371375 CASAVA_Build 17 7386461 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 222 hom 22 1 16 5 A 21 20 371376 CASAVA_Build 17 7391593 2D TTGCATACTC TT/-- TTTTTTTTTT 552 hom 23 het 17 0 6 11 T 20 18 371377 CASAVA_Build 17 7399189 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 78 het 27 0 27 0 A 9 10 371378 CASAVA_Build 17 7411010 1D ACTCCGTACC A/- AAGGGTTATG 3070 hom 102 het 36 0 34 3 A 3 2 371379 CASAVA_Build 17 7417643 1I GTGGATTGTT -/C CATGGAGGGG 1808 hom 21 het 8 0 6 2 C 1 2 371380 CASAVA_Build 17 7435070 3D GCCCCCCTCC TCT/--- GAACCAGGAG 3070 hom 107 het 39 0 33 7 TCT 1 0 371381 CASAVA_Build 17 7435887 1D AAACCCCATT C/- CACCATACTA 3070 hom 54 het 21 0 17 4 C 2 1 371382 CASAVA_Build 17 7436104 2D CATGATCCAG TC/-- TCTCTTACTT 3070 het 3070 hom 29 8 13 8 TC 3 2 371383 CASAVA_Build 17 7452660 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 28 0 21 7 A 13 14 371384 CASAVA_Build 17 7462013 1D TGTAATCCCA G/- CACTTTGGGA 2072 hom 33 het 14 0 8 6 G 1 0 371385 CASAVA_Build 17 7462490 6D AGGTTTGTTT TTTTTG/------ TTTTTGTTTT 2682 hom 15 het 8 0 6 2 TTTTTG 4 3 371386 CASAVA_Build 17 7464164 1I ATCCCTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 394 hom 28 2 19 7 A 15 16 371387 CASAVA_Build 17 7465478 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 9 8 371388 CASAVA_Build 17 7473539 1I ACTGAGAGGC -/G GGGGGGCAGG 1590 het 1590 ref 22 15 6 1 G 6 7 371389 CASAVA_Build 17 7480762 1D TCTTGCTGCG C/- CCCCCCCCCA 2648 het 100 hom 28 1 9 19 C 10 9 371390 CASAVA_Build 17 7484784 17D GCTGGCAGCC CTCACAGCCCTCGCTCG/----------------- CTCTCAGCAC 3070 hom 41 het 17 0 12 5 CTCACAGCCCTCGCTCG 1 0 371391 CASAVA_Build 17 7486878 1I CTATCTTTGG -/T TAGCTCTATG 3070 hom 75 het 32 0 26 6 T 1 2 371392 CASAVA_Build 17 7489117 1D AGATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 19 1 11 7 A 13 12 371393 CASAVA_Build 17 7489398 1D CCTGGACGAC A/- AGAGACTCCG 3070 hom 54 het 21 0 18 3 A 2 1 371394 CASAVA_Build 17 7505089 1D TTCTCGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 65 hom 32 1 13 19 T 15 14 371395 CASAVA_Build 17 7565581 8D GTTGGATCAT CTCACCTA/-------- CTCACCTACT 3070 het 3070 ref 32 15 8 10 CTCACCTA 2 1 371396 CASAVA_Build 17 7566700 1I CATGACTGGC -/T TTTTTTCACT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 6 7 371397 CASAVA_Build 17 7569955 4I CTGGAAACTT ----/TAAG TAAGAGAGAT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 TAAG 1 2 371398 CASAVA_Build 17 7595160 12D AAAAATCAAG TTATTTATTTAT/------------ TTATTTATTT 3070 hom 39 het 21 0 14 11 TTAT 8 5 371399 CASAVA_Build 17 7599371 25D TGTGGTCATG TGACCTTCTCCAGCCTTTCCCACAA/------------------------- TGACCTTCTC 3070 hom 72 het 32 0 22 17 TGACCTTCTCCAGCCTTTCCCACAA 1 0 371400 CASAVA_Build 17 7605951 1D AGGAGTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 26 0 20 6 A 14 13 371401 CASAVA_Build 17 7626915 1D AAGCTACTAG A/- AAAACGTGCT 3070 hom 111 het 39 0 35 4 A 5 4 371402 CASAVA_Build 17 7633210 6D CTCTGTCTCA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 hom 42 het 20 0 13 10 AAAAAC 3 2 371403 CASAVA_Build 17 7634758 1D TCTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 25 0 19 6 T 13 12 371404 CASAVA_Build 17 7647865 2D AAAAAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AG 7 6 371405 CASAVA_Build 17 7654775 5I GGCACTGTGC -----/TGATA CCTGGGCCCT 3070 hom 75 het 29 0 25 4 TGATA 0 1 371406 CASAVA_Build 17 7655590 1I TTGATATCTT -/A ACAGTTCCGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 1 2 371407 CASAVA_Build 17 7658331 3I GAAAAATGTC ---/CTT ATTATTATTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 CTT 0 1 371408 CASAVA_Build 17 7660340 1D TACCCAGCTA C/- CCTGAAACTA 3070 hom 128 het 47 0 39 8 C 3 2 371409 CASAVA_Build 17 7694737 1I CCAAATGGGG -/A AAAAAAGAAG 3070 hom 103 het 39 0 35 4 A 6 7 371410 CASAVA_Build 17 7698451 1I GGTATTTTGT -/A AAAAAAAATA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 8 9 371411 CASAVA_Build 17 7725316 1I GAAGTTAACT -/G GGAAAAAGAA 3070 hom 102 het 43 0 34 9 G 2 3 371412 CASAVA_Build 17 7753596 1D GATAGCATTC A/- CATCCGTGCC 3070 het 2808 hom 21 8 10 3 A 1 0 371413 CASAVA_Build 17 7756821 1D TATTTTTTAT G/- GGGGGGGGGA 3070 het 1664 hom 20 4 10 6 G 10 9 371414 CASAVA_Build 17 7761448 2D CTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 822 het 822 ref 24 7 3 14 T 16 14 371415 CASAVA_Build 17 7765214 1D AAAGGAAGGC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 T 10 9 371416 CASAVA_Build 17 7776574 6D AAAGTACAAG GGAGCT/------ GGAGCTGACC 3070 hom 92 het 35 0 28 9 GGAGCT 2 1 371417 CASAVA_Build 17 7784667 4D AATAACTTGT ATTA/---- ATTTCTCTGA 3070 het 3070 ref 31 16 14 2 ATTA 1 0 371418 CASAVA_Build 17 7785245 1I ATAAAATGTG -/T TAAGGACAAA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 T 1 2 371419 CASAVA_Build 17 7786007 1D ACCGAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1955 het 1955 ref 20 8 8 4 A 12 11 371420 CASAVA_Build 17 7790471 1D GGTGTCTCAG T/- TTTTTTAGGT 3070 het 3070 ref 49 27 15 7 T 7 6 371421 CASAVA_Build 17 7799455 5D TGTTGTAAAC AAGTT/----- AAGGGCAAGA 3070 het 3070 ref 30 13 14 4 AAGTT 1 0 371422 CASAVA_Build 17 7802743 1I CAGGCATGGT -/G GCTCAAGCCT 3070 hom 22 het 13 0 8 5 G 1 2 371423 CASAVA_Build 17 7804406 4D TCCGTCGCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 28 12 10 7 AAAT 6 5 371424 CASAVA_Build 17 7811248 1I GTCTTGAACT -/C CTGACCTCAG 1760 hom 12 het 5 0 5 0 C 1 2 371425 CASAVA_Build 17 7811957 1D TGCTGGACTT A/- ACCTGATAAC 3070 het 3070 ref 46 22 17 8 A 2 1 371426 CASAVA_Build 17 7814414 4D AACTGCCAGA TTGT/---- TTGTAAAGTG 3070 het 3070 hom 38 20 18 1 TTGT 2 1 371427 CASAVA_Build 17 7820522 1D CACCACCACG C/- CCCAGCTAAT 3070 hom 98 het 40 0 30 11 C 4 3 371428 CASAVA_Build 17 7838814 1I GAAATAAAAG -/A AAAAAAAAAG 2543 het 2543 ref 27 15 7 5 A 9 10 371429 CASAVA_Build 17 7844148 2I TTTAATTAAC --/TT TTTATTTGGA 2938 het 2938 ref 17 10 6 1 T 3 5 371430 CASAVA_Build 17 7876766 1D ATTCCGAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 10 6 A 15 14 371431 CASAVA_Build 17 7884949 22I GGAGTTGGGG ----------------------/ATAACAGAGGACTTGGAGATAA CCGCTAGTGA 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 ATAACAGAGGACTTGGAGATAA 0 1 371432 CASAVA_Build 17 7890041 3D TTTGAGAGAC CAA/--- CAAGTTCTCT 2463 het 2463 ref 24 12 10 3 CAA 2 1 371433 CASAVA_Build 17 7904407 1D GGAACGCCCC A/- GTTTTTGTAA 3070 het 3070 ref 49 23 18 9 A 1 0 371434 CASAVA_Build 17 7919153 1I ACCTTCACCA -/C CTGTCTTTTT 3070 het 3070 ref 54 26 25 3 C 1 2 371435 CASAVA_Build 17 7926655 1D ATAGATTACG C/- CTGTGACGCA 3070 het 3070 ref 36 15 14 9 C 2 1 371436 CASAVA_Build 17 7928197 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2868 het 2868 ref 19 8 8 3 A 11 12 371437 CASAVA_Build 17 7938191 1I CACCTCTTTA -/T GCACAGTGGT 2988 het 2988 ref 29 17 8 4 T 0 1 371438 CASAVA_Build 17 7942387 1D GATCAAGTGA T/- TTCTCCTGCC 3070 het 3070 hom 21 8 10 4 T 3 2 371439 CASAVA_Build 17 7943414 3I TGCCCTTCTT ---/AAG AGTACTACCA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 AAG 0 1 371440 CASAVA_Build 17 7945075 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 35 0 12 23 T 13 12 371441 CASAVA_Build 17 7956825 2D GTGAGCACTA TT/-- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 36 18 14 4 T 10 8 371442 CASAVA_Build 17 7964299 12D AGGTGTAACC TCACAGAACTGT/------------ TAACAGAACT 3070 het 3070 ref 34 17 16 5 TCACAGAACTGT 1 0 371443 CASAVA_Build 17 7996710 2D TGGAAGGGAG GA/-- GAGAGGGAGA 3070 hom 58 het 26 0 19 8 GA 3 2 371444 CASAVA_Build 17 8000867 26I CAGGCGCAGC --------------------------/GAGCGTGACCTGCACGCAGGCGCAGA CGTGAGCGGT 3070 hom 75 het 28 0 22 6 GAGCGTGACCTGCACGCAGGCGCAGA 0 1 371445 CASAVA_Build 17 8009481 3D TTTCTTTTTC TTT/--- TTTTTTTCTT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 T 10 7 371446 CASAVA_Build 17 8012078 1D TTATAGAGAT G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 68 het 26 0 19 7 G 8 7 371447 CASAVA_Build 17 8023763 1I ATTATTATTA -/T TTATTATTTT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 2 3 371448 CASAVA_Build 17 8024879 15D GACCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 34 0 28 7 A 25 10 371449 CASAVA_Build 17 8041312 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2874 hom 26 het 18 0 8 10 T 13 12 371450 CASAVA_Build 17 8044161 12I TCTTGCAACA ------------/GAGAAAACACCT GGAGTTAGCA 3070 hom 111 het 43 0 37 6 GAGAAAACACCT 0 1 371451 CASAVA_Build 17 8048176 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 30 0 24 7 T 11 10 371452 CASAVA_Build 17 8059601 2D GACTCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 25 0 15 10 A 16 14 371453 CASAVA_Build 17 8060291 2D GTTTCTTTTT GG/-- GGGGGGGGTG 3070 hom 84 het 34 0 26 9 G 10 8 371454 CASAVA_Build 17 8060446 1D ATAAAATATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 413 hom 40 1 30 9 T 12 11 371455 CASAVA_Build 17 8064619 1D GTCTCAAGGG A/- AAAAAAAATA 3070 hom 55 het 25 0 19 6 A 9 8 371456 CASAVA_Build 17 8065289 3I GAGATGATAA ---/ATC ATCATGGTGT 3070 hom 89 het 32 0 28 4 ATC 1 2 371457 CASAVA_Build 17 8081087 1I CCAAGTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 803 hom 45 4 29 12 C 0 1 371458 CASAVA_Build 17 8095009 1D TGTGGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 27 7 T 13 12 371459 CASAVA_Build 17 8120449 3D ACTCTAGAAA AAC/--- AACAATATTT 3070 hom 105 het 38 0 36 4 AAC 2 1 371460 CASAVA_Build 17 8137596 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2000 het 429 hom 29 2 7 20 T 17 16 371461 CASAVA_Build 17 8207403 1D TAGAAAACAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 T 10 9 371462 CASAVA_Build 17 8210172 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 A 10 11 371463 CASAVA_Build 17 8214747 2D AACTGAATAG GA/-- GAGAGGATAA 3070 hom 87 het 33 0 30 5 GA 3 2 371464 CASAVA_Build 17 8219580 2D TTTTCTTTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 22 0 18 4 T 14 12 371465 CASAVA_Build 17 8222572 5D AGAAAAATAA TAAAG/----- TAACTTCAGA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TAAAG 1 0 371466 CASAVA_Build 17 8225074 1D ATTTGTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 437 hom 33 1 19 13 T 11 10 371467 CASAVA_Build 17 8231278 1I GGGTGGGGGG -/A GTGTGTTTCA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 A 0 1 371468 CASAVA_Build 17 8238482 2D AGATGGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1339 het 1192 hom 44 14 6 24 T 17 15 371469 CASAVA_Build 17 8247971 1D GTATTCCCTG T/- TTTTTTTTTT 1125 het 1125 ref 28 16 3 9 T 11 10 371470 CASAVA_Build 17 8253225 1D TTTTGGGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 376 hom 21 1 9 11 T 13 12 371471 CASAVA_Build 17 8259146 8D TTCCTTTCTT CCTCCCTC/-------- CCTCCCTCCC 1795 het 683 hom 25 3 7 16 CCTC 6 4 371472 CASAVA_Build 17 8268845 2D CCGCGCCCAC AG/-- CCCTTTGTTT 3070 het 3010 hom 19 10 9 2 AG 1 0 371473 CASAVA_Build 17 8279325 4D CCAACGAATC CATT/---- CATTCATTCA 3070 hom 154 het 61 0 51 10 CATT 3 2 371474 CASAVA_Build 17 8286459 4I TCAGTTCACA ----/TATT TATTTATTTA 3070 hom 75 het 34 0 25 9 TATT 4 5 371475 CASAVA_Build 17 8289534 4D CTTACTTTTC ATAA/---- ATATTGTAAT 3070 hom 102 het 40 0 35 8 ATAA 1 0 371476 CASAVA_Build 17 8290710 1I TCCTTGGGTT -/C CCCCCCCACC 3070 hom 66 het 27 0 22 5 C 7 8 371477 CASAVA_Build 17 8298304 1D TACAAATTGA T/- TACAGGAAAG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 2 1 371478 CASAVA_Build 17 8301872 1D CCTGTATTTC A/- GCCTTTTACT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 1 0 371479 CASAVA_Build 17 8316777 4I GCATTAAAGA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 59 het 25 0 20 5 AAAT 2 3 371480 CASAVA_Build 17 8323302 2D CAAACCCCCT AC/-- ACTCCCTCTT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 AC 2 1 371481 CASAVA_Build 17 8324070 1I TGGTGGGGAG -/C CCCCCCCGAA 3070 hom 123 het 49 0 37 12 C 7 8 371482 CASAVA_Build 17 8325002 38I TTCAGTTCAG --------------------------------------/TAATTAAGTGGAGAAATCAACTGAATTGGAAAAAAAGA TAATGACTTT 3070 hom 94 het 29 0 32 4 TAATTAAGTGGAGAAATCAACTGAATTGGAAAAAAAGA 0 1 371483 CASAVA_Build 17 8328164 4I GAACAAATGG ----/ATGA ATAAGTAACA 3070 hom 108 het 39 0 37 2 ATGA 0 1 371484 CASAVA_Build 17 8330772 4I CTACACCATA ----/TTTT TTTTCCTTTA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 T 4 8 371485 CASAVA_Build 17 8335214 2D CTGCTGTGCA CC/-- CCCTCTGGGG 3070 hom 95 het 36 0 29 7 C 5 3 371486 CASAVA_Build 17 8346524 6D GGAAAATAGT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 3070 hom 91 het 42 0 31 13 TG 12 9 371487 CASAVA_Build 17 8349186 1D TAGATTCCAG C/- CCCAGCCCCC 3070 hom 75 het 27 0 26 2 C 4 3 371488 CASAVA_Build 17 8357732 1D AATTAAGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 33 0 27 6 T 13 12 371489 CASAVA_Build 17 8363925 2D TTAAAAATAA CT/-- CTCAACATAT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 CT 2 1 371490 CASAVA_Build 17 8370670 3D CATATTCGCA TAG/--- CTTTAAGAGA 3070 hom 93 het 36 0 31 7 TAG 1 0 371491 CASAVA_Build 17 8392470 1D TGATAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 10 9 371492 CASAVA_Build 17 8393001 1D CAAACATACA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 T 7 6 371493 CASAVA_Build 17 8395196 1I ATAAATAAAT -/A AATAAATTTA 94 het 94 ref 17 12 3 2 A 2 3 371494 CASAVA_Build 17 8399935 7D ACACATGTGA TAAAAGG/------- CTTGTTGCCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TAAAAGG 1 0 371495 CASAVA_Build 17 8403458 4D GGGGTGATAT AATA/---- AATAAATTAA 3070 hom 72 het 29 0 25 6 AATA 2 1 371496 CASAVA_Build 17 8413265 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 125 hom 31 3 18 10 A 15 14 371497 CASAVA_Build 17 8418582 5D TATATCTCAT TTAAA/----- TTGTTTCAAA 3070 hom 105 het 39 0 36 7 TTAAA 1 0 371498 CASAVA_Build 17 8419312 3D TGTTAACAAC AAT/--- GATTTATGTG 3070 hom 114 het 44 0 39 5 AAT 1 0 371499 CASAVA_Build 17 8433347 2D TTATTATGCC AG/-- AGTCTCTGGG 3070 hom 129 het 49 0 44 6 AG 2 1 371500 CASAVA_Build 17 8437469 4D CAATACACAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 105 het 46 0 36 13 AAAC 5 4 371501 CASAVA_Build 17 8439837 1I TTCACAGGGT -/G GGTGAGGAGG 3070 hom 149 het 58 0 48 10 G 2 3 371502 CASAVA_Build 17 8441825 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1901 hom 18 het 7 0 7 0 T 10 11 371503 CASAVA_Build 17 8464522 1I CTGAGAAATT -/G GGGGGTCAGA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 G 5 6 371504 CASAVA_Build 17 8471182 1I CACGTGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 T 10 11 371505 CASAVA_Build 17 8476538 2D CAAAGACTCC CT/-- CTCTGAGGCC 3070 het 3070 ref 34 22 9 4 CT 3 2 371506 CASAVA_Build 17 8486852 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 34 0 28 7 T 9 8 371507 CASAVA_Build 17 8490300 3I GAGCTCAGTT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 het 362 hom 50 1 47 2 TTG 5 6 371508 CASAVA_Build 17 8491945 3D TGCACTGCTA TTT/--- TTTTTTTTTT 1956 hom 22 het 12 0 8 4 T 15 12 371509 CASAVA_Build 17 8492147 1I TTCCTGCTCT -/G CCCTTAAATG 3070 hom 114 het 43 0 38 5 G 0 1 371510 CASAVA_Build 17 8498300 1I AAATAGAGGC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 45 27 12 6 A 9 10 371511 CASAVA_Build 17 8532464 17D CCCTCCCTCT CTCCTTTCTTTCTTTCC/----------------- CTTTCTTTCT 2633 het 2633 ref 29 12 8 13 CTCCTTTCTTTCTTTCC 1 0 371512 CASAVA_Build 17 8576390 8D TCCTGAACCT AAAATTAA/-------- AAAAATAAAA 2150 hom 15 het 7 0 6 2 AAAATTAA 1 0 371513 CASAVA_Build 17 8578055 1D CAGAGAGGAG T/- TTCCATGACA 3070 hom 81 het 30 0 27 3 T 3 2 371514 CASAVA_Build 17 8581021 4D38M7D AGAAGAAGAA AGAGAGAGAGGGAGGGAGGGAGAAAGGAAGGAAAAGAAAAAAAGAAAAG/----AGAGAGGGAGGGAGGGAGAAAGGAAGGAAAAGAAAAAA------- AAGAGGGAGG 3070 het 1663 hom 22 8 10 23 N/A 0 0 371515 CASAVA_Build 17 8581104 4I AAGAAAAAAG ----/AAAA AAAAGAAAAA 3070 hom 84 het 35 0 29 6 A 4 8 371516 CASAVA_Build 17 8582054 1I TTGCAGATTT -/G GGGGGGGGTC 3070 hom 36 het 16 0 12 4 G 8 9 371517 CASAVA_Build 17 8582508 3D TGATTTGAGA TTT/--- TTTTTTTTTT 2671 het 93 hom 23 2 13 8 T 19 16 371518 CASAVA_Build 17 8583939 1I TTACTTCCTG -/C CCCCCCCAAC 3070 hom 81 het 30 0 26 4 C 7 8 371519 CASAVA_Build 17 8591060 1D TTTCAGAGAG T/- TTTTTTCCCC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 7 6 371520 CASAVA_Build 17 8593311 1D AAGTTTCGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 22 0 12 11 T 12 11 371521 CASAVA_Build 17 8627285 1I CTAAAAATAC -/A AAAAATTAGC 3070 het 3055 hom 22 7 12 5 A 5 6 371522 CASAVA_Build 17 8628233 3D TGTTTTTTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 38 18 10 11 TTG 4 3 371523 CASAVA_Build 17 8633752 1D CCGATCGGAC G/- GGGGGGGTAG 3070 het 3070 hom 41 11 15 16 G 8 7 371524 CASAVA_Build 17 8634876 1I TTTTGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 11 11 9 T 10 11 371525 CASAVA_Build 17 8639967 5D GACTCTGTCT CAAAA/----- CAAAACAAAA 2487 het 2487 ref 17 9 6 2 CAAAA 5 4 371526 CASAVA_Build 17 8644694 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2203 het 829 hom 16 7 7 2 A 18 17 371527 CASAVA_Build 17 8650032 1D GCACAGTGGG A/- AGGTTGTGGT 3070 hom 66 het 27 0 21 6 A 2 1 371528 CASAVA_Build 17 8665940 1I GTGGCCCGCA -/G GGAAACGGTG 3070 hom 92 het 36 0 28 8 G 2 3 371529 CASAVA_Build 17 8673235 4I AGACAGACAT ----/ACAG ACACACACGT 3070 het 3070 ref 81 38 14 29 ACAG 0 1 371530 CASAVA_Build 17 8673544 2D21M4D ACACACACTG ACACACACTCATGCATACACACACACT/--ACACACTCATGCATACACACA---- GACACACGCA 3070 het 3070 hom 78 19 38 43 N/A 0 0 371531 CASAVA_Build 17 8678593 1I GCGTCTGGTA -/T TTTTTTTTTT 2762 het 2762 ref 35 11 9 15 T 13 14 371532 CASAVA_Build 17 8682936 2D GGCAGGTGGG AC/-- ACACCAGTGG 3070 hom 57 het 21 0 18 3 AC 3 2 371533 CASAVA_Build 17 8683401 1D AAAACAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 63 het 26 0 19 7 A 10 9 371534 CASAVA_Build 17 8693117 1I16M1D23M1D GACTTAGGGT -AAGAGTCCAGGCTTTGAAAATCAGCCGGACTAGGCCCCACT/GAAGAGTCCAGGCTTTG-AAATCAGCCGGACTAGGCCCCAC- TTCTGGCTTT 3070 het 3070 hom 29 11 18 9 N/A 0 0 371535 CASAVA_Build 17 8695167 1D AAAGGTAGTT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 33 16 12 6 A 10 9 371536 CASAVA_Build 17 8695460 1D ATGGCGTGAA C/- CCCGGGAGGC 2546 het 918 hom 13 4 6 3 C 4 3 371537 CASAVA_Build 17 8703075 1D GGGAAGCCGG A/- ATAAGCACAT 3070 hom 90 het 35 0 29 6 A 2 1 371538 CASAVA_Build 17 8703351 1I CCCCCTGGGG -/C TGCGTGGTCT 3070 hom 129 het 52 0 44 8 C 0 1 371539 CASAVA_Build 17 8704973 2I CCGGGCACGG --/GC TCACGCCTGT 3070 hom 63 het 23 0 21 2 GC 0 1 371540 CASAVA_Build 17 8717932 1I TCTTCCCACT -/C CCCCCCGTGC 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 C 6 7 371541 CASAVA_Build 17 8726921 5D GCTGCCCTAA TTTCT/----- CTTCTGGACC 3070 het 3070 ref 40 19 14 10 TTTCT 1 0 371542 CASAVA_Build 17 8755831 12I GTGGAAAGGG ------------/ACCTGCCTTGCC CACTGGGCAG 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 ACCTGCCTTGCC 0 1 371543 CASAVA_Build 17 8764864 1I ATATTAAGTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 T 9 10 371544 CASAVA_Build 17 8768288 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 270 hom 18 2 15 1 T 15 14 371545 CASAVA_Build 17 8778815 3D ATAGTATACA TGT/--- TGTTCTATGC 3070 het 3070 ref 52 24 23 5 TGT 2 1 371546 CASAVA_Build 17 8784448 1D GGCCATCCTC A/- AGAGCTCATC 3070 hom 86 het 36 0 27 10 A 2 1 371547 CASAVA_Build 17 8787928 1I AATATACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 173 hom 27 1 22 4 T 11 12 371548 CASAVA_Build 17 8790217 1I ACACAGCAAT -/A GTATCTGGAA 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 0 1 371549 CASAVA_Build 17 8791132 5D AGAGAAGCGC ATGGG/----- ATGGGATCAC 3070 hom 105 het 39 0 36 4 ATGGG 2 1 371550 CASAVA_Build 17 8802323 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 603 hom 27 4 12 12 A 17 16 371551 CASAVA_Build 17 8807569 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 802 hom 39 3 26 10 T 13 12 371552 CASAVA_Build 17 8810960 1I ATGGAAGAGT -/A AGCACTTCAT 3070 het 3070 hom 52 20 23 9 A 1 2 371553 CASAVA_Build 17 8815917 2I GAAACTCTTT --/TA TATATATATA 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 TA 5 6 371554 CASAVA_Build 17 8825530 33I AACAAACAAA ---------------------------------/AAGCCCTCAAAAGATAAAGTGTAGTAAAGCTAT AGATTTCATC 3070 het 3070 ref 27 16 11 1 AAGCCCTCAAAAGATAAAGTGTAGTAAAGCTAT 0 1 371555 CASAVA_Build 17 8860393 1D CAGCAGAAGT C/- CCCCTCTTAT 3070 het 3070 ref 42 24 14 4 C 5 4 371556 CASAVA_Build 17 8870945 13D CTCAGCTGTA ACCCAAAACCCAC/------------- ACAAAAGGTG 3070 het 3070 hom 42 20 23 5 ACCCAAAACCCAC 1 0 371557 CASAVA_Build 17 8874033 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2732 hom 20 8 9 3 A 10 11 371558 CASAVA_Build 17 8877658 1I CTACAAAAAT -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 20 7 12 1 A 6 7 371559 CASAVA_Build 17 8880256 2D AAAGTGGTTG TA/-- CAAATTTATA 3070 het 3070 ref 36 23 11 3 TA 1 0 371560 CASAVA_Build 17 8884840 1I TCTTTCTTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 T 10 11 371561 CASAVA_Build 17 8888277 1D TTTCCGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 25 0 17 8 T 11 10 371562 CASAVA_Build 17 8888784 1D TGCTTGGGGC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 99 het 37 0 34 4 A 9 8 371563 CASAVA_Build 17 8892357 2D GAAAGGAATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 10 het 25 1 19 5 T 14 12 371564 CASAVA_Build 17 8900107 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2509 het 2509 ref 26 15 7 4 T 11 12 371565 CASAVA_Build 17 8903871 5D CCTCAATTAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 97 hom 37 3 12 24 A 19 14 371566 CASAVA_Build 17 8903886 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- ACCCTTGCAG 2615 het 437 hom 36 7 11 18 AAAAG 1 0 371567 CASAVA_Build 17 8907884 1I GCCCCAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 32 0 29 4 T 10 11 371568 CASAVA_Build 17 8911309 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 352 hom 22 2 13 7 A 15 16 371569 CASAVA_Build 17 8919867 1I TGTTTCCCCA -/G GGGGGAAAAT 3070 hom 79 het 32 0 24 8 G 5 6 371570 CASAVA_Build 17 8933456 2D GATTCCATCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 17 6 A 16 14 371571 CASAVA_Build 17 8944223 6D TATGTGTATA TGTGTG/------ TATATATATA 3070 hom 45 het 17 0 16 2 TG 3 0 371572 CASAVA_Build 17 8944814 1I ATTTATAGAG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 T 7 8 371573 CASAVA_Build 17 8946375 3I CAAACATGTC ---/CTT CTTCACATGG 3070 hom 84 het 31 0 29 5 CTT 1 2 371574 CASAVA_Build 17 8954314 1I CTCCTGCCTC -/T TTTTTTTTTT 2927 het 279 hom 20 1 12 7 T 10 11 371575 CASAVA_Build 17 8987523 1I TTTGCTGTGC -/T CCTTTTGGTT 3070 hom 98 het 40 0 32 8 T 0 1 371576 CASAVA_Build 17 9007520 26D CCCCCCCGAA ACACACACACACACACACACACACAC/-------------------------- ACACACACAC 3070 hom 81 het 23 0 27 5 AC 22 9 371577 CASAVA_Build 17 9011814 1I CACAGTCTTG -/C CCCCCTCTGT 3070 hom 135 het 51 0 45 6 C 5 6 371578 CASAVA_Build 17 9014963 1I CAAGACCTGT -/G CTTTTCTCCT 3070 hom 72 het 34 0 25 9 G 0 1 371579 CASAVA_Build 17 9020214 1D CCCTCCCCTG C/- CCCCCCGTGG 1480 het 1350 hom 21 6 6 9 C 7 6 371580 CASAVA_Build 17 9041818 4I CATCTACCAG ----/CCTC CCTCCCTCTT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 CCTC 2 3 371581 CASAVA_Build 17 9058050 1I GTGTTTTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 17 16 9 T 10 11 371582 CASAVA_Build 17 9071271 4I ACCATCACAT ----/CAAA CACATACACC 3070 hom 176 het 71 0 57 14 CAAA 0 1 371583 CASAVA_Build 17 9071431 4I CACCACACAC ----/ACTT TATCACACAG 3070 hom 185 het 75 0 59 23 ACTT 0 1 371584 CASAVA_Build 17 9071532 1D75M2D AGCACACACA CATGCACATACACACCATCACACACACCACACACATCAAACACAGATACACCATCACACACAGGCACACACACTATCA/-ATGCACATACACACCATCACACACACCACACACATCAAACACAGATACACCATCACACACAGGCACACACACTAT-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 79 44 37 34 N/A 0 0 371585 CASAVA_Build 17 9071865 4D CCACACTATT ACAC/---- ACATACCACA 3070 het 3070 ref 86 44 30 18 AC 3 1 371586 CASAVA_Build 17 9072908 8D35M8I38M4D GTGTATGAGA GTGTGTCTGTGTGTGACTACGCATGTGTGATTGTGTTCGTGAC--------TGTGTGTGACTGCGTGTGTGACTGGGTGTGTGGCTGTGTGAC/--------GTGTGTGACTACGCATGTGTGATTGTGTTCGTGACTGATTGTGTGTGTGTGACTGCGTGTGTGACTGGGTGTGTGGCTGTG---- TCTGCGTGTG 3070 het 90 hom 28 4 40 16 N/A 0 0 371587 CASAVA_Build 17 9073069 2D TGTGTGAGAC TG/-- TGTGACTGGG 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TG 3 2 371588 CASAVA_Build 17 9073117 24D TGATTGTGTT TGTGACTGTGTGTGTGACTGAGAC/------------------------ TGTGACTGTG 3070 hom 87 het 27 0 29 11 TGTGACTGTGTGTGTGACTGAGAC 1 0 371589 CASAVA_Build 17 9073223 2I TGTGTGTGAC --/TG TGTGCTCTCT 3070 hom 107 het 44 0 34 10 TG 2 3 371590 CASAVA_Build 17 9073463 1D GATTTTCATT C/- CTGTCAATAG 3070 hom 71 het 28 0 25 3 C 2 1 371591 CASAVA_Build 17 9074108 1D TGACGGACTC T/- TCCCCCTCAG 3070 hom 62 het 24 0 17 7 T 2 1 371592 CASAVA_Build 17 9074721 1I AGGAGGCTCT -/G GGGGGGATGC 2949 het 2949 ref 21 11 8 2 G 6 7 371593 CASAVA_Build 17 9079516 1I GGCCGAGGCT -/A AATTAGCTTG 3070 hom 96 het 36 0 32 4 A 2 3 371594 CASAVA_Build 17 9079778 12D TTCTTCTTTC TTCTTTTTTTTT/------------ TTCTTTTTTT 2206 het 59 hom 27 2 10 15 TTCTTTTTTTTT 2 1 371595 CASAVA_Build 17 9080172 1I AATTTGGGGG -/T GGGGGGTACT 3070 hom 71 het 26 0 23 3 T 0 1 371596 CASAVA_Build 17 9087478 5I ACTGGGGAAT -----/GGTTC GGTTCCTGCC 3070 hom 104 het 38 0 32 6 GGTTC 1 2 371597 CASAVA_Build 17 9088988 6I TGCTGCCTTG ------/GGGGTC GGGGTCTGGC 3070 hom 75 het 29 0 20 9 GGGGTC 1 2 371598 CASAVA_Build 17 9096975 1I AGGAGATGTG -/A ACACCGTCTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 1 2 371599 CASAVA_Build 17 9099350 2D GGGCGGATCA TC/-- TGAGGTCAGG 2361 hom 28 het 11 0 8 3 TC 1 0 371600 CASAVA_Build 17 9103094 1D TAGAATCTCC A/- AAAACAGATC 3070 het 3070 hom 44 21 19 4 A 5 4 371601 CASAVA_Build 17 9118225 1D TCACTTGGTC T/- TCTTAAGGTA 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 2 1 371602 CASAVA_Build 17 9120145 2D TATCTACCCC CT/-- GATCCCACCC 3028 het 3028 ref 32 17 10 8 CT 1 0 371603 CASAVA_Build 17 9121057 1D AGTGTGATCA T/- TAACACACGA 2685 het 2685 ref 24 12 7 5 T 2 1 371604 CASAVA_Build 17 9123111 1D TTGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 41 hom 23 2 16 5 T 12 11 371605 CASAVA_Build 17 9123758 3D CTCATGCTGC CAA/--- CAACAACCCT 3070 het 3070 ref 42 18 21 3 CAA 3 2 371606 CASAVA_Build 17 9126947 1I GAGATGAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1468 hom 28 5 17 6 T 12 13 371607 CASAVA_Build 17 9127172 2I TACAGATGTT --/GA GTGACCCTGG 3070 hom 93 het 33 0 30 3 GA 0 1 371608 CASAVA_Build 17 9134359 8I GCATGCCACT --------/GTGCCTTA GTGTGTGGAT 3070 hom 102 het 38 0 33 6 GTGCCTTA 0 1 371609 CASAVA_Build 17 9137513 1D TTTTAGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 14 9 T 13 12 371610 CASAVA_Build 17 9140371 4I CTGGGCGACA ----/GAGT GAGACTCTGT 2948 het 1836 hom 14 4 7 3 GAGT 0 1 371611 CASAVA_Build 17 9142203 2D GGAAAGCACA CT/-- CTGTTTCTGA 3070 het 3070 ref 35 21 12 3 CT 2 1 371612 CASAVA_Build 17 9179666 4D GAATTTTTAT TTTG/---- TTTATTGTTC 3070 hom 90 het 36 0 31 9 TTTG 1 0 371613 CASAVA_Build 17 9187478 4D CTGTTTTCTC TCTT/---- AAAATAAACC 3070 het 3070 ref 40 21 14 8 TCTT 1 0 371614 CASAVA_Build 17 9197146 3D CTATGTTGAC CGT/--- CAGACTGGCC 3070 hom 108 het 40 0 34 7 CGT 1 0 371615 CASAVA_Build 17 9213497 4D TTTGTTCCAG ATTA/---- ATTGCTTATT 3070 het 3070 ref 36 24 9 5 ATTA 1 0 371616 CASAVA_Build 17 9214965 1I TAGAAGCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 11 17 13 A 13 14 371617 CASAVA_Build 17 9215678 1D TGGATTATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 8 9 T 13 12 371618 CASAVA_Build 17 9224010 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 15 18 2 A 11 10 371619 CASAVA_Build 17 9228169 1D TCATTTGTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 13 12 371620 CASAVA_Build 17 9233810 1I GACAAATGTT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 8 9 371621 CASAVA_Build 17 9235714 1I AAGATGAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 A 10 11 371622 CASAVA_Build 17 9240137 9D TAACAACAAT AAGAAAAGA/--------- AAGAAAAGAA 3070 het 3070 ref 43 31 11 7 AAGAAAAGA 2 1 371623 CASAVA_Build 17 9246775 1I GGCTGAACTC -/T TAAGAATTCC 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 2 371624 CASAVA_Build 17 9248075 2I CAGTCAATTA --/AC ACATATTTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AC 1 2 371625 CASAVA_Build 17 9251560 1D GTGACCATGG C/- CGTGTCACAG 3070 het 2119 hom 14 5 8 1 C 2 1 371626 CASAVA_Build 17 9260357 1D CTGGCTGTCC T/- TTGCTCAGTC 3070 het 3070 ref 51 26 16 9 T 3 2 371627 CASAVA_Build 17 9270108 1I ACAATCTGTC -/T TTTAATCTGA 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 3 4 371628 CASAVA_Build 17 9270696 3I TTAGCTACTC ---/AGG AGGAGGCTGA 3070 hom 42 het 15 0 15 0 AGG 2 3 371629 CASAVA_Build 17 9275470 3D AGCAGGGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 TTG 7 6 371630 CASAVA_Build 17 9278054 1D TGTCAGGATC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 84 het 34 0 28 6 T 10 9 371631 CASAVA_Build 17 9285510 1I CCAACCTGGC -/G ACAGAGCGAG 2435 het 23 hom 11 0 6 7 G 0 1 371632 CASAVA_Build 17 9288220 2D TTATAGAGAC AG/-- AGTCTTGCTA 3070 hom 123 het 43 0 41 2 AG 2 1 371633 CASAVA_Build 17 9295833 2D ACATATATAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 75 het 33 0 26 9 AG 10 9 371634 CASAVA_Build 17 9296413 1D CCAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 326 hom 44 1 38 6 A 11 10 371635 CASAVA_Build 17 9316072 3D CACACAGATC ATA/--- ATATTAAATC 3070 het 3070 hom 43 17 17 10 ATA 2 1 371636 CASAVA_Build 17 9329180 6I AAAAAAATTA ------/ATAATG TAATAAGATC 3070 hom 105 het 39 0 35 4 ATAATG 0 1 371637 CASAVA_Build 17 9329634 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1457 hom 23 5 10 8 T 12 11 371638 CASAVA_Build 17 9334424 1I ATAACTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 8 9 371639 CASAVA_Build 17 9335347 1I CTCCTCAAGC -/A CAAGAGCCTT 3070 het 3070 ref 31 13 14 4 A 0 1 371640 CASAVA_Build 17 9338036 1D13M1D ATATGTTTTG TTTTTTTTTGTTTTG/-TTTTTTTTGTTTT- TTTTTTTGTT 3070 hom 36 het 20 0 13 8 N/A 0 0 371641 CASAVA_Build 17 9340077 3D AAAAGAAAAA AAG/--- AAGAAGAAAC 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 AAG 3 2 371642 CASAVA_Build 17 9341647 2I TCTCTACTAT --/TA TACACGTTTG 3070 het 3070 hom 44 19 22 3 TA 1 2 371643 CASAVA_Build 17 9342201 1D AGCCTGAGGT G/- GGGGGGGATC 3070 hom 71 het 30 0 21 10 G 8 7 371644 CASAVA_Build 17 9348138 2D GGTGTGGAAT TA/-- TATATATATA 2891 het 2891 ref 25 15 7 4 TA 6 5 371645 CASAVA_Build 17 9353881 1D TAACTAGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1082 hom 41 5 28 8 A 13 12 371646 CASAVA_Build 17 9370212 2D TCAAAAGTAC GA/-- GAGACAAAGC 3070 het 3070 ref 42 18 19 6 GA 3 2 371647 CASAVA_Build 17 9372361 1D ACTTTTTTGA C/- ACGGACTCTC 3070 het 2659 hom 25 6 14 5 C 1 0 371648 CASAVA_Build 17 9373220 1I TCTAGCAACT -/G GGGATGGGCT 3070 het 3070 ref 33 18 14 1 G 3 4 371649 CASAVA_Build 17 9375306 1I TCTCTTTGCA -/T TTAACCATAT 3070 het 3070 hom 44 20 18 6 T 2 3 371650 CASAVA_Build 17 9375864 1D AGATTTCATG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 T 11 10 371651 CASAVA_Build 17 9378229 3D TTTTCATATA AAC/--- AACAACAATA 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 AAC 3 2 371652 CASAVA_Build 17 9381618 4I ACGTCCTGGC ----/TCAG TCAATCTTTC 3070 hom 120 het 47 0 41 6 TCAG 0 1 371653 CASAVA_Build 17 9383306 3I GAAGAGAAAA ---/GAG GAGGGAAAAG 3070 hom 153 het 57 0 46 11 GAG 1 2 371654 CASAVA_Build 17 9383706 1I ACCCAACTGA -/C CCCCCCCCAC 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 C 8 9 371655 CASAVA_Build 17 9386047 1D AACATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1782 hom 27 7 16 4 T 15 14 371656 CASAVA_Build 17 9390524 10I TGCGGCGCGT ----------/GCGCATGGGC GCGCATGAAG 3070 hom 52 het 23 0 15 8 GCGCATGGGC 0 1 371657 CASAVA_Build 17 9390947 3D ACACAAGTTT TTG/--- TTTGTTTGTT 3070 het 57 hom 18 1 12 6 TTG 1 0 371658 CASAVA_Build 17 9395652 1D GGGGTGTTGG T/- AACCACCTTT 3070 het 3070 ref 39 20 14 5 T 1 0 371659 CASAVA_Build 17 9402865 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1061 hom 21 4 16 1 A 14 15 371660 CASAVA_Build 17 9403900 1I CGCCTCCCGT -/G TTTAAGCGAG 2397 hom 12 het 5 0 5 0 G 0 1 371661 CASAVA_Build 17 9404790 1D CACAGTTTGG T/- TTTTTTTTTT 2044 het 2044 ref 23 11 5 8 T 13 12 371662 CASAVA_Build 17 9406644 4D CAGTTCACAG AAAA/---- AAAAAAAAAT 213 het 118 hom 17 3 3 12 A 13 9 371663 CASAVA_Build 17 9416759 1I CTTTTATAGG -/T TTTTTCAAGT 3070 het 3070 hom 27 10 11 6 T 5 6 371664 CASAVA_Build 17 9418392 2D CTGTTTATAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 48 het 19 0 16 3 TA 7 6 371665 CASAVA_Build 17 9418585 1I GGGTTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 54 het 21 0 18 4 T 9 10 371666 CASAVA_Build 17 9424731 1D ACCTGGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 246 hom 26 2 15 10 A 16 15 371667 CASAVA_Build 17 9428642 10I TTAGCAGATT ----------/TCAAATATAC AATGCAGTAT 3070 hom 27 het 23 0 10 13 TCAAATATAC 0 1 371668 CASAVA_Build 17 9429660 1D TTGCAGTGAG C/- CCAAGACTGC 3070 hom 87 het 32 0 28 4 C 3 2 371669 CASAVA_Build 17 9431059 1I TCCTCTCCCT -/C CTCCCACCCT 3070 hom 72 het 28 0 25 3 C 1 2 371670 CASAVA_Build 17 9435268 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGTCTCTT 3070 hom 45 het 19 0 16 11 G 5 4 371671 CASAVA_Build 17 9446435 1D TCTGTTCCTG T/- TTTAGTTTGC 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 4 3 371672 CASAVA_Build 17 9453282 1D ATAAAAGATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 A 10 9 371673 CASAVA_Build 17 9455288 1D ATGTATATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 64 hom 37 1 32 4 T 11 10 371674 CASAVA_Build 17 9457946 1I TTTCTAACAG -/T TGAAAATGGC 3070 hom 96 het 35 0 32 3 T 1 2 371675 CASAVA_Build 17 9515322 2D GGAGGAGGGA GT/-- GTGTGTGTGT 1680 het 1680 ref 49 31 6 13 GT 10 9 371676 CASAVA_Build 17 9589864 1D CTTAATTTTG A/- GCTTTCCTAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 1 0 371677 CASAVA_Build 17 9590682 1D CACAGCGTTG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 91 hom 40 2 29 9 A 9 8 371678 CASAVA_Build 17 9592088 1D CAATATTCCA T/- TTTTTAAGGT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 6 5 371679 CASAVA_Build 17 9592325 1D CTAGTGTTTA C/- TTTAACATTT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 0 371680 CASAVA_Build 17 9592627 1D TTAGGTCTTT A/- AAAATTTCTC 3070 hom 90 het 34 0 31 3 A 5 4 371681 CASAVA_Build 17 9621579 1I CACTGATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 28 0 21 7 T 13 14 371682 CASAVA_Build 17 9640958 4D TCTTTTTTTC TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 81 het 29 0 27 3 TTAT 4 3 371683 CASAVA_Build 17 9641658 1D TCAAGTGATT C/- TCCTGCCTCA 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 1 0 371684 CASAVA_Build 17 9657987 1I CAGTTTTTTC -/T TGTTTTTTTT 3070 het 398 hom 25 1 20 4 T 1 2 371685 CASAVA_Build 17 9661132 4I ACGCTGAGTT ----/ACAC ACACACACAC 3070 hom 56 het 31 0 16 15 AC 5 7 371686 CASAVA_Build 17 9662829 1D CTAACAAAGG C/- GGATGACTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 C 1 0 371687 CASAVA_Build 17 9664529 1I CTGTGGAGGT -/C CCTAAATAGC 3070 het 3070 hom 30 12 14 4 C 2 3 371688 CASAVA_Build 17 9693071 4D AATTTAATTA ATAC/---- ATACATATGA 3070 hom 57 het 23 0 20 3 ATAC 2 1 371689 CASAVA_Build 17 9694767 7I GGGATCTCTC -------/TCTCTCT TCTCTCTCAC 1730 het 1730 ref 30 10 4 16 TCTCTCT 1 2 371690 CASAVA_Build 17 9699076 4D AACTATTTAT TTAA/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 TTAA 1 0 371691 CASAVA_Build 17 9701815 1I GAAACCAAAA -/G CAGAAGGGTT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 G 0 1 371692 CASAVA_Build 17 9705739 1D TGTGATCCCA T/- TTTTTTCCTC 3070 het 3070 hom 48 18 20 10 T 7 6 371693 CASAVA_Build 17 9707174 1I ATAGTGTGCC -/A AGATGAGGTC 3070 het 3070 hom 44 16 17 11 A 1 2 371694 CASAVA_Build 17 9726624 1D AAAGTAAAAG C/- CAGGGAAGGC 3070 het 3070 hom 53 23 27 3 C 2 1 371695 CASAVA_Build 17 9727433 2D TAACATACAC AT/-- AGGAGAGTCC 3070 het 3070 hom 29 9 17 4 AT 1 0 371696 CASAVA_Build 17 9729783 3D TTGTATCAGT AAA/--- AAAAGGAGTC 3070 het 3070 ref 45 22 17 10 A 7 4 371697 CASAVA_Build 17 9735098 1D ATGTTGCTAT G/- GGACTAAATA 3070 het 3070 ref 44 18 17 10 G 3 2 371698 CASAVA_Build 17 9735825 1D TCCTTTCTGC A/- AATGTCCCTG 3070 het 3070 ref 40 19 13 9 A 3 2 371699 CASAVA_Build 17 9741465 2D3M3D AATCTCCCTT CGTCAGGG/--TAA--- ATGTGGTCCC 3070 het 3070 hom 27 9 16 6 N/A 0 0 371700 CASAVA_Build 17 9747035 2D CTGTCTGAAG AA/-- AAAAAAAAAG 3070 het 2808 hom 32 7 19 6 A 11 9 371701 CASAVA_Build 17 9762340 1I TTACTTCCTG -/A AAATCCTGCT 3070 hom 87 het 35 0 26 9 A 3 4 371702 CASAVA_Build 17 9767420 1D ACAAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 402 hom 33 1 25 7 A 12 11 371703 CASAVA_Build 17 9768570 1I CCCTTCTGTG -/C CCCCCCCTTC 3070 hom 10 het 21 0 12 9 C 7 8 371704 CASAVA_Build 17 9769230 1I GGCGGAAAAC -/A AAAAAAAGCC 2867 het 2866 ref 26 8 8 10 A 7 8 371705 CASAVA_Build 17 9769474 3D GTGCCCTCTC CTT/--- CTGTGTGCAC 3070 het 3070 hom 39 12 18 9 CTT 1 0 371706 CASAVA_Build 17 9770164 1D GCAGTTTGAG C/- CCCCTTCTCC 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 C 5 4 371707 CASAVA_Build 17 9771088 1D TGTTAACTAC T/- TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 25 11 13 1 T 7 6 371708 CASAVA_Build 17 9771223 6I GGGCACGGTG ------/GCTCAT GCTCATGCCT 3070 het 1800 hom 18 4 12 2 GCTCAT 1 2 371709 CASAVA_Build 17 9786417 2I TATGTGCAGC --/TG TGTGGGTATG 3070 het 3070 hom 58 23 27 8 TG 2 3 371710 CASAVA_Build 17 9786924 14D TCCAGATTTT AATATGAAATCTAC/-------------- CCATTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 11 11 4 AATATGAAATCTAC 1 0 371711 CASAVA_Build 17 9793809 8D CTCCTTCCCT TCCTCCCC/-------- TCCTCCCTTC 3070 het 1647 hom 19 7 11 5 TCCTCCCC 1 0 371712 CASAVA_Build 17 9798514 7D TGATGGGGGA TGGGGGG/------- TGGGGGGTGG 3070 hom 90 het 36 0 27 13 TGGGGGG 3 2 371713 CASAVA_Build 17 9801167 1D TTTCTCTGGC A/- AAAAAATTCT 3070 het 3070 hom 35 13 19 4 A 7 6 371714 CASAVA_Build 17 9803875 2I ACTCAGTCTT --/TA TATATTGCCT 3070 het 3030 hom 37 11 13 13 TA 2 3 371715 CASAVA_Build 17 9806123 1D GTTCCACGTG T/- TAGGTGTCAG 3070 het 3070 hom 55 22 25 9 T 2 1 371716 CASAVA_Build 17 9808256 18D CCTGGCAGGG GGTGATACCACACAGGAA/------------------ GTGCTTGGTA 3070 het 3070 ref 27 16 11 3 GGTGATACCACACAGGAA 1 0 371717 CASAVA_Build 17 9811461 2D GCCAGTAGCA CC/-- CCCCCTCCCC 3070 het 3070 hom 39 20 15 5 C 7 5 371718 CASAVA_Build 17 9811657 3I TGTGTCCTAC ---/TTT TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 37 13 12 12 T 9 12 371719 CASAVA_Build 17 9816670 1I GCCCTGGAAC -/A ATGTAAAAAC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 371720 CASAVA_Build 17 9819389 2I AAGTGCGAAA --/CT CTGTCTCCAA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 CT 1 2 371721 CASAVA_Build 17 9820018 3D CTCCTTCCTC CCA/--- CCACATCCTG 3070 het 3070 hom 64 21 32 11 CCA 2 1 371722 CASAVA_Build 17 9825266 1I CCCAGAAGGG -/A GAGGTTGCAG 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 A 0 1 371723 CASAVA_Build 17 9829055 1I ACCCTCTCCT -/C CCGAGTCTCC 3070 het 2959 hom 29 10 12 7 C 2 3 371724 CASAVA_Build 17 9836605 1D TCCCAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 945 het 945 ref 12 6 4 2 T 11 10 371725 CASAVA_Build 17 9838762 2I ACAGCAAAAG --/AA ACTACCATCA 3070 het 2265 hom 14 5 9 0 A 1 3 371726 CASAVA_Build 17 9851944 1D TAATTCCAGC T/- CCCCCCCGCA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 1 0 371727 CASAVA_Build 17 9852245 1I TGCATGCACA -/G CTTTTTGTGT 3070 het 3070 hom 48 23 23 2 G 0 1 371728 CASAVA_Build 17 9859203 4D CTCAAAAAAA AAAG/---- AAAAGAAAAG 3070 het 2162 hom 21 7 12 4 AAAG 1 0 371729 CASAVA_Build 17 9883180 5I ATGGCTGCAC -----/AAACA AAACACGTGG 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 AAACA 1 2 371730 CASAVA_Build 17 9908795 4D CTGCTGACAC TGTT/---- TGTTTAAGCC 3070 hom 87 het 32 0 28 5 TGTT 2 1 371731 CASAVA_Build 17 9909052 1D TTATACAGAT G/- GGGGTCTCAC 3070 hom 68 het 24 0 23 1 G 5 4 371732 CASAVA_Build 17 9912634 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 2705 het 563 hom 24 4 13 7 A 15 16 371733 CASAVA_Build 17 9918850 1D AGAAAAACAA T/- TGGGAGAAGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 2 1 371734 CASAVA_Build 17 9920533 1D AAAGGAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 A 9 8 371735 CASAVA_Build 17 9920895 2I CACCAGAGCC --/TT GGAATCAAGC 3070 hom 135 het 49 0 45 4 T 0 2 371736 CASAVA_Build 17 9925372 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTGTAG 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 6 371737 CASAVA_Build 17 9934601 8I ATCCTGAACT --------/CGAGTCCA CTTTCAAACT 3070 hom 110 het 42 0 34 9 CGAGTCCA 0 1 371738 CASAVA_Build 17 9936010 1I GTCTCAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 201 hom 35 2 21 12 A 13 14 371739 CASAVA_Build 17 9945151 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 49 24 20 5 A 8 9 371740 CASAVA_Build 17 9950823 2D CTTGAAAGTG CC/-- CCCCCCCCCA 3070 hom 72 het 27 0 22 5 C 11 9 371741 CASAVA_Build 17 9959683 2D ACAACTCTTG CC/-- CATACTTATT 3070 het 3070 ref 59 31 21 7 C 3 1 371742 CASAVA_Build 17 9960357 1D CTCTTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1421 het 684 hom 16 5 5 6 A 13 12 371743 CASAVA_Build 17 9962235 10D TGATAGAGAT GGAGTAAACA/---------- GGGATATCGC 3070 het 3070 ref 38 23 14 4 GGAGTAAACA 1 0 371744 CASAVA_Build 17 9968422 2D GCGCAGCCTC CA/-- CACAACACAG 3070 hom 69 het 25 0 23 3 CA 3 2 371745 CASAVA_Build 17 9970375 2D31M10I CACACACGCT CACACACACACTCATACACTCACACACACTCTT----------/--CACACACACTCATACACTCACACACACTCTTGCACACACAC GCACACACAC 3070 hom 30 het 47 2 52 15 N/A 0 0 371746 CASAVA_Build 17 9970587 2I ACACAAAGAG --/CA CGCACACACG 3070 hom 54 het 58 2 44 12 CA 0 1 371747 CASAVA_Build 17 9972893 4D GATCTCCTGA CCTC/---- CCTCGTGATC 3070 het 2335 hom 17 7 9 2 CCTC 2 1 371748 CASAVA_Build 17 9974372 1D GCTATGATTT A/- AAAAAAAAAA 1647 het 1647 ref 38 18 6 14 A 19 18 371749 CASAVA_Build 17 9976348 1I GGCACCTTCT -/C CCCCTGAAGA 3070 hom 126 het 49 0 42 7 C 4 5 371750 CASAVA_Build 17 9976804 1D TGTCTCAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 11 10 371751 CASAVA_Build 17 9977175 3D TTTTTTTTTT TTC/--- TTTTTTGAGA 1863 het 1863 ref 12 8 4 0 TTC 1 0 371752 CASAVA_Build 17 9978095 1D TTTTTGAGAT G/- GGAGTCTCGC 3070 het 155 hom 26 1 21 4 G 3 2 371753 CASAVA_Build 17 9981167 2I AAAGAAAAAA --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 89 het 34 0 28 6 AG 7 8 371754 CASAVA_Build 17 9984645 2D TACAACTGCA TG/-- TGTGTTTATG 3070 het 3070 hom 57 21 29 8 TG 3 2 371755 CASAVA_Build 17 9986029 1I CCAGCACTTT -/G GGGGGGCCGA 3070 hom 39 het 16 0 14 3 G 6 7 371756 CASAVA_Build 17 9988176 2D TTGCAGGAGA CT/-- CTAGTAACTC 3070 hom 70 het 28 0 24 5 CT 2 1 371757 CASAVA_Build 17 9992497 2D CTAAAATTAC AA/-- AAAAAAAAAA 1540 het 860 hom 13 4 5 4 A 14 12 371758 CASAVA_Build 17 9999369 1D CCAATAACTC T/- TTTTAAGACA 3070 hom 51 het 20 0 18 3 T 5 4 371759 CASAVA_Build 17 10006285 1I TGAAGAAGCA -/G GCGCTGCCCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 1 2 371760 CASAVA_Build 17 10006474 1I CAAGTTTCCT -/G GGGTCCCCCC 3070 hom 65 het 26 0 21 5 G 3 4 371761 CASAVA_Build 17 10011575 1D TGGCTCATAT C/- CCCTTCGTAA 3070 het 3070 ref 40 22 13 6 C 4 3 371762 CASAVA_Build 17 10015821 5I CCTCTCTGAG -----/CCTTA CCTTTATCTG 3070 het 3070 hom 46 18 19 9 CCTTA 0 1 371763 CASAVA_Build 17 10022373 1I GGCAAGTCCA -/T TACCAACATC 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 1 2 371764 CASAVA_Build 17 10023525 5I TCACCTTATC -----/TAAGA TAAGATTCCC 3070 het 3070 ref 46 28 11 7 TAAGA 1 2 371765 CASAVA_Build 17 10030170 1D ATTTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 1240 het 1240 ref 12 7 4 1 T 11 10 371766 CASAVA_Build 17 10041446 1I TGGAAGGTCA -/C CCCCCCCACA 2821 het 2228 hom 22 8 7 7 C 7 8 371767 CASAVA_Build 17 10068253 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1050 het 1050 ref 30 25 3 2 A 13 14 371768 CASAVA_Build 17 10072923 1D ACATTCTACA C/- CCTAGGAGCC 3070 het 3070 ref 49 25 20 5 C 3 2 371769 CASAVA_Build 17 10076661 4I TATCTAGTCC ----/ATGT ATGTATACAT 3070 het 3070 hom 47 14 28 5 ATGT 1 2 371770 CASAVA_Build 17 10089109 8D GACCATGGTC GCGTGCCA/-------- GCGTGCCAGC 3070 het 3070 hom 22 10 9 6 GCGTGCCA 2 1 371771 CASAVA_Build 17 10097486 1I AGAGAAAAGT -/A AAAAAGCAAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 5 6 371772 CASAVA_Build 17 10101734 1D GTATAACAAT A/- AAAAAAAAAG 2803 het 2803 ref 24 15 6 3 A 10 9 371773 CASAVA_Build 17 10105650 1D GAAGACTATC T/- TTTTTTTTTT 1071 het 1071 ref 35 6 7 22 T 19 18 371774 CASAVA_Build 17 10122030 1I CCCAAAGAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 15 3 A 11 12 371775 CASAVA_Build 17 10123998 1D CCCGCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1421 hom 16 4 7 6 A 13 12 371776 CASAVA_Build 17 10130136 1D GAGCACAGAT G/- ACAGCTTCTC 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 G 1 0 371777 CASAVA_Build 17 10135347 1D TTATTTGCAG T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 T 9 8 371778 CASAVA_Build 17 10152454 2I ATACTTTGAC --/TA TATATATATA 422 het 422 ref 19 10 2 7 TA 5 6 371779 CASAVA_Build 17 10166279 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 32 1 29 5 A 12 11 371780 CASAVA_Build 17 10170680 1D ACCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 T 13 12 371781 CASAVA_Build 17 10182281 1I CAAGACCTAC -/A TACAAGCCAA 3070 hom 120 het 49 0 39 10 A 0 1 371782 CASAVA_Build 17 10182387 2D CAGATAATGC AT/-- ATATCACAAT 3070 hom 123 het 49 0 42 8 AT 3 2 371783 CASAVA_Build 17 10186720 4I ACAGTAACCT ----/GAGA GAAAGAAGCC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 GA 1 3 371784 CASAVA_Build 17 10190614 1I TCTTAATGTG -/A AAAGCTGATT 3070 hom 151 het 54 0 51 3 A 3 4 371785 CASAVA_Build 17 10198879 1D CTCTGGGTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 128 het 48 0 41 8 T 10 9 371786 CASAVA_Build 17 10207010 1I CAGCTCTAGC -/A ACCAACTCTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 A 1 2 371787 CASAVA_Build 17 10218266 1D TACTTAGGAG T/- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 47 17 23 8 T 7 6 371788 CASAVA_Build 17 10270099 1D TCTTATTGAG T/- TTTTTTTATG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 8 7 371789 CASAVA_Build 17 10272295 1D AAAAACAAAG A/- AGTATTGAAG 3070 het 3070 ref 35 18 13 5 A 2 1 371790 CASAVA_Build 17 10335658 1D TGACCTATTG C/- TATCAATATA 3070 hom 114 het 40 0 39 2 C 1 0 371791 CASAVA_Build 17 10354829 1D CTGTGGCCTA G/- GGGGAGGACA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 G 5 4 371792 CASAVA_Build 17 10365623 2D TATTGATGTC AT/-- ATATATATAT 1342 het 1342 ref 24 11 4 9 AT 10 9 371793 CASAVA_Build 17 10376051 1I CATGCAGATG -/A AAAAAATTCT 3070 hom 138 het 50 0 46 4 A 6 7 371794 CASAVA_Build 17 10382355 1D ATGTGAAATG A/- AAAAAAAAAA 1283 het 1283 ref 34 23 4 7 A 12 11 371795 CASAVA_Build 17 10384402 2D AGTCAATTGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 92 het 36 0 31 7 A 13 11 371796 CASAVA_Build 17 10390817 1D GTGAAATTTG T/- TTTTAAAAAA 3070 hom 54 het 19 0 18 1 T 5 4 371797 CASAVA_Build 17 10397495 1I GGAGAATCAC -/T TTTTTTTTTT 1153 het 407 hom 9 1 5 3 T 11 12 371798 CASAVA_Build 17 10429826 1D GCTGCTGATT G/- ACAGCTATAG 3070 hom 111 het 40 0 37 3 G 1 0 371799 CASAVA_Build 17 10430094 1D TTTTTAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 41 het 26 0 12 14 T 15 14 371800 CASAVA_Build 17 10431525 1D CTGGAGGCTC T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 48 het 28 0 16 13 T 8 7 371801 CASAVA_Build 17 10438157 3D TTAGTACTAC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 77 het 52 1 37 16 T 17 14 371802 CASAVA_Build 17 10442398 1I CTAAGATTAT -/G TATCCAAGAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 G 0 1 371803 CASAVA_Build 17 10443530 1I TCATTCCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 914 hom 32 2 29 1 A 9 10 371804 CASAVA_Build 17 10469501 1I AGTTGACAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 18 14 8 T 11 12 371805 CASAVA_Build 17 10470408 1D GCGCCAGCTC T/- TTTGAGGGAT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 T 4 3 371806 CASAVA_Build 17 10474321 1I GGGTTCCTCC -/T TGCACACACC 3070 hom 60 het 23 0 19 4 T 1 2 371807 CASAVA_Build 17 10481106 1I TCCCTTAAAC -/T TTTTTTTTTT 2075 het 356 hom 16 1 8 7 T 13 14 371808 CASAVA_Build 17 10484007 2D TAGAAGAGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 39 0 32 9 A 14 12 371809 CASAVA_Build 17 10485422 1D TTCCTAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 99 het 36 0 33 3 A 10 9 371810 CASAVA_Build 17 10485547 12D GATTTAACTC TGTCTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 hom 6 het 18 1 16 2 TGTCTTTTTTTT 1 0 371811 CASAVA_Build 17 10486158 4I ACTTCACCTC ----/AGTA AGTGACAGTA 3070 hom 126 het 45 0 42 3 AGTA 0 1 371812 CASAVA_Build 17 10488208 4D CAAAAAAAAA AAAC/---- AAACAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 25 8 AAAC 2 1 371813 CASAVA_Build 17 10489087 1I CTTCCATCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 117 hom 28 3 18 7 T 13 14 371814 CASAVA_Build 17 10491571 5D CCCCTAAAAT TTTTG/----- TTTTGTTTTG 3070 hom 45 het 24 0 16 8 TTTTG 5 4 371815 CASAVA_Build 17 10491952 1I TTTGGGGTTT -/C TCCTTATTTC 3070 hom 66 het 25 0 19 6 C 0 1 371816 CASAVA_Build 17 10492726 1I AGAGGAAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 81 het 33 0 27 6 T 9 10 371817 CASAVA_Build 17 10498178 4D25M1D TCTCTTTTAT TTTCTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTC/----TTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTT- CTTCCTTCCT 3070 hom 74 het 33 0 25 12 N/A 0 0 371818 CASAVA_Build 17 10500663 1D GTGACCCACA G/- GAAGCCAGGC 3070 hom 60 het 22 0 21 2 G 2 1 371819 CASAVA_Build 17 10507791 4D CTATTCCAAA AACT/---- AACTAACACT 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 AACT 2 1 371820 CASAVA_Build 17 10509190 4D TTATTTTTTA TTTT/---- TTTATTTTTG 1600 het 1600 ref 13 8 5 0 T 7 3 371821 CASAVA_Build 17 10514765 1I GGTTTGGGTA -/T TTTTTTGTGC 3070 het 3070 ref 37 22 9 6 T 6 7 371822 CASAVA_Build 17 10517398 4D GTTGACGTCG TCAA/---- TCAATCAGTG 3070 hom 117 het 44 0 38 8 TCAA 2 1 371823 CASAVA_Build 17 10541859 1I CGCTGGGGGC -/G CCCCGCTTTG 1936 hom 34 het 13 0 6 7 G 0 1 371824 CASAVA_Build 17 10547237 5D ATTTGAAACC TAACA/----- TAAGGCTAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 5 TAACA 1 0 371825 CASAVA_Build 17 10547594 4D CCTAATTCTC AAAT/---- AAGTCAAATT 3070 het 3070 hom 36 13 21 4 AAAT 1 0 371826 CASAVA_Build 17 10551591 1D CCTCAAGGTA G/- GGAAGCCCTG 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 G 3 2 371827 CASAVA_Build 17 10554124 4D ATGCCTAAAC TGTT/---- TGTTTATTTA 3070 het 3070 ref 41 25 13 3 TGTT 2 1 371828 CASAVA_Build 17 10554777 1D GAGATAGCAA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 37 17 15 6 T 9 8 371829 CASAVA_Build 17 10557601 1I AGTCTGTTTT -/G TTTTTTGCAT 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 G 0 1 371830 CASAVA_Build 17 10559391 4I AGTTTTAAAA ----/AACT CTATTAGCCC 3070 het 3070 ref 35 18 15 2 AACT 0 1 371831 CASAVA_Build 17 10559763 2D GAAATATAAC AT/-- TGATTTATAG 3070 het 3070 ref 24 12 11 1 AT 1 0 371832 CASAVA_Build 17 10560043 4I43M1D ATACTGCCCT ----GACACAAAATGTTCTTGATAATGGTAATTAAAAACTACTCCCAC/GATAGACACAAAATGTTCTTGATAATGGTAATTAAAAACTACTCCCA- CCCCCCATGT 2751 het 2751 ref 22 22 6 8 N/A 0 0 371833 CASAVA_Build 17 10563212 7D ATCTACTTTC TAATAAG/------- TGGTGTTGAG 3070 het 3070 hom 23 10 12 4 TAATAAG 1 0 371834 CASAVA_Build 17 10566009 1I GTTGTCTTTT -/G TAAGCAGTGT 2380 het 2095 hom 22 6 6 10 G 0 1 371835 CASAVA_Build 17 10567815 3D TCTGTGTATA TAC/--- TACAAGAGAT 3070 het 3070 ref 32 15 14 5 TAC 2 1 371836 CASAVA_Build 17 10571236 1I TTTTGGAGAT -/G GGGGGGGGTC 3070 het 3070 ref 29 16 11 2 G 8 9 371837 CASAVA_Build 17 10589515 1I CCACTCAGAC -/T TTAAAAAAAA 3070 hom 104 het 43 0 34 9 T 2 3 371838 CASAVA_Build 17 10589758 1I TCTCCTGCTT -/A TTCTTCTTGG 3070 hom 54 het 25 0 19 6 A 0 1 371839 CASAVA_Build 17 10591327 1I CTCATGCCCC -/T GTTTTGGGAC 3070 hom 99 het 37 0 31 6 T 0 1 371840 CASAVA_Build 17 10596060 13I CTATTGAGCC -------------/ACTAATATGTGTA CATCTCTGGG 3070 hom 90 het 35 0 30 5 ACTAATATGTGTA 0 1 371841 CASAVA_Build 17 10604411 1D TGATATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 16 11 T 11 10 371842 CASAVA_Build 17 10627683 1D ATGTCCACAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 234 hom 31 2 12 17 T 15 14 371843 CASAVA_Build 17 10629917 1D GTTGGTCAGG C/- CGATCTCGAA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 2 1 371844 CASAVA_Build 17 10635651 1D TACATTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 183 hom 35 1 23 11 T 15 14 371845 CASAVA_Build 17 10643081 1D TGGGGGTGCC T/- TTGAGGTTTA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 T 3 2 371846 CASAVA_Build 17 10644280 2D GGCCGGAAAC CA/-- CATCTTTAAC 2929 het 1262 hom 12 4 7 3 CA 2 1 371847 CASAVA_Build 17 10645096 1D CTTTTTACTG T/- TTTTTTTTTT 879 het 244 hom 15 2 5 8 T 15 14 371848 CASAVA_Build 17 10649185 1D TCTGATTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 57 het 23 0 19 4 T 10 9 371849 CASAVA_Build 17 10652889 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 17 0 13 4 A 12 11 371850 CASAVA_Build 17 10658649 3D ATTTCTAGAA TTT/--- ATTCATTTTG 3070 hom 111 het 39 0 38 2 T 3 0 371851 CASAVA_Build 17 10685847 1D AAAAAAAAAA T/- ATATATATAT 128 het 128 ref 15 7 1 7 T 1 0 371852 CASAVA_Build 17 10694482 4I CTGCAATCTC ----/TCTT TCTTTCTAAC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TCTT 1 2 371853 CASAVA_Build 17 10709320 1I CCTTCACATT -/G CAACATAAAT 3070 hom 126 het 51 0 41 10 G 0 1 371854 CASAVA_Build 17 10709524 2D CCACAGAGAT AG/-- CCCTCAGTAT 3070 hom 157 het 54 0 48 7 AG 1 0 371855 CASAVA_Build 17 10711495 1I CTTTTCCATG -/C TGTTCTCACG 3070 hom 69 het 26 0 24 2 C 0 1 371856 CASAVA_Build 17 10712160 9I TTTTTTTTTG ---------/CTTTCCTTA CTTTCCTTAC 3070 hom 66 het 36 0 22 14 CTTTCCTTA 1 2 371857 CASAVA_Build 17 10716221 2D CCTCTTCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2246 hom 32 10 12 11 A 14 12 371858 CASAVA_Build 17 10729797 12I GGGATTACAG ------------/GCGTGAGCCACC GCACTCAGCC 2722 het 2722 ref 20 10 6 4 GCGTGAGCCACC 0 1 371859 CASAVA_Build 17 10733631 1D TTTGTTAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 T 10 9 371860 CASAVA_Build 17 10753649 1D TAGAGACGGG T/- TTTCACCAAG 3070 het 3070 hom 22 9 12 1 T 4 3 371861 CASAVA_Build 17 10761452 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 102 hom 20 1 13 6 T 17 16 371862 CASAVA_Build 17 10769288 4D TCATTCACTC ACTT/---- ATTTATTTAC 3070 hom 102 het 37 0 35 6 ACTT 1 0 371863 CASAVA_Build 17 10773445 1I ACCTTGAAGG -/A AAGAGGGGTA 3070 hom 123 het 51 0 42 9 A 2 3 371864 CASAVA_Build 17 10795698 1D CTGTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1619 het 716 hom 25 3 9 13 T 17 16 371865 CASAVA_Build 17 10807944 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 15 14 371866 CASAVA_Build 17 10808332 5D GTGTGGGTAA GTTGT/----- GTTATTTGTG 3070 hom 114 het 40 0 39 3 GTTGT 1 0 371867 CASAVA_Build 17 10809394 1D TTATATGTTA T/- TTGTTAACTA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 3 2 371868 CASAVA_Build 17 10809878 3D TAGGTCTGTC AAT/--- GATGAGATTA 3070 hom 111 het 45 0 38 9 AAT 1 0 371869 CASAVA_Build 17 10815656 1I AGATAAAAAC -/A AAGTGATTGA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 A 2 3 371870 CASAVA_Build 17 10817848 2I GAGAGTAGGT --/AG AGAGAGAGAG 3070 hom 51 het 32 0 25 7 AG 5 6 371871 CASAVA_Build 17 10837467 1I AGGGACTTGG -/C TTTGTCTCTT 3070 hom 138 het 50 0 47 3 C 0 1 371872 CASAVA_Build 17 10843519 1D ATTGGACTAC A/- AAATTCTCTC 3070 hom 114 het 42 0 38 4 A 4 3 371873 CASAVA_Build 17 10859807 1D GTAGGTGGTC T/- TTTTCTTTCT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 T 5 4 371874 CASAVA_Build 17 10865166 1D ATTGATTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 106 het 37 0 36 1 T 11 10 371875 CASAVA_Build 17 10866751 2I TGAATGGAGT --/TC TAGAGACCAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 TC 0 1 371876 CASAVA_Build 17 10867336 1I CATCAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 9 10 371877 CASAVA_Build 17 10879230 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 38 hom 18 1 16 2 A 10 9 371878 CASAVA_Build 17 10887802 2D TTTTAATGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 34 0 23 11 A 13 11 371879 CASAVA_Build 17 10890910 3I ATTCAACAAC ---/AAA AAGACAACCC 3070 hom 126 het 47 0 42 5 A 2 5 371880 CASAVA_Build 17 10893038 1I CCTGGTCTCT -/A ACTAATAATA 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 1 2 371881 CASAVA_Build 17 10895242 1I ATGCTACTTT -/A AAAAAAAACT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 8 9 371882 CASAVA_Build 17 10910778 2I GTGTGTGTGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 314 hom 38 2 29 7 GT 7 8 371883 CASAVA_Build 17 11054811 1D GGCCCCTGTA T/- TTTTTTGATA 3070 hom 42 het 17 0 15 2 T 7 6 371884 CASAVA_Build 17 11074346 1I TTTAAAGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 11 12 371885 CASAVA_Build 17 11082925 1I TGCTCACACA -/C CCTTAACCAC 3070 hom 162 het 59 0 54 5 C 2 3 371886 CASAVA_Build 17 11090906 1D TGCTTTAGCA G/- GGCAACCATG 3070 hom 169 het 61 0 57 7 G 3 2 371887 CASAVA_Build 17 11095297 1I CTACCTATGA -/G GGGCTCTGTG 3070 hom 96 het 37 0 32 5 G 3 4 371888 CASAVA_Build 17 11097354 1D CTGGGCAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 860 hom 31 5 18 8 T 15 14 371889 CASAVA_Build 17 11101703 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 19 0 14 5 A 12 13 371890 CASAVA_Build 17 11109351 1D AAAACCTAAG C/- CCAATGGTTC 3070 hom 108 het 39 0 37 3 C 3 2 371891 CASAVA_Build 17 11117959 6I CGAGGAAGCG ------/TTAATT CATCATTTTA 3070 hom 123 het 46 0 41 5 TTAATT 0 1 371892 CASAVA_Build 17 11126444 1D GTATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 T 12 11 371893 CASAVA_Build 17 11133595 1D GAAAAGAATC T/- TTTAAAATAT 1423 hom 12 het 7 0 5 2 T 4 3 371894 CASAVA_Build 17 11134280 1I ATGGCATATG -/A TACAACTAAT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 0 1 371895 CASAVA_Build 17 11144712 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1236 het 1236 ref 26 14 3 9 T 15 14 371896 CASAVA_Build 17 11151186 1I GTTTGTTTTC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 9 10 371897 CASAVA_Build 17 11157298 1D TCCAATCTGA G/- TTTTAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 21 13 3 G 1 0 371898 CASAVA_Build 17 11160203 3I TAGTGTTTTT ---/TTA AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 39 0 27 12 TTA 0 1 371899 CASAVA_Build 17 11161904 1D TTTTGTTAAC T/- TTTTTTATTA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 7 6 371900 CASAVA_Build 17 11162180 1I TTATCACAGG -/A AAAAAATGGA 3070 hom 96 het 42 0 32 10 A 6 7 371901 CASAVA_Build 17 11164702 1D CTCCATCACC A/- AAAAAAAAAA 1653 hom 44 het 22 0 13 11 A 11 10 371902 CASAVA_Build 17 11169739 1D TGCCATGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3027 hom 32 15 11 6 A 15 14 371903 CASAVA_Build 17 11174845 1I ATGAATAAAA -/T TTAGGTTGGC 3070 het 3070 hom 40 17 19 4 T 2 3 371904 CASAVA_Build 17 11175786 2D GCTCTCTCAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 11 18 15 AC 9 8 371905 CASAVA_Build 17 11176286 1D AGCGTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 37 2 26 9 A 12 11 371906 CASAVA_Build 17 11183469 1I ATTCACTACA -/C CCCCCCCTCC 3070 hom 75 het 33 0 20 13 C 7 8 371907 CASAVA_Build 17 11205088 1D TTTTTTCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 31 0 25 6 T 11 10 371908 CASAVA_Build 17 11217459 4D AAAAAATTGT TTAA/---- TTGTCAAGCA 3070 hom 102 het 37 0 35 4 TTAA 1 0 371909 CASAVA_Build 17 11220368 1D TTTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 862 hom 28 2 20 6 T 13 12 371910 CASAVA_Build 17 11259790 1I GCTGTTGTTC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 357 hom 59 1 49 9 T 8 9 371911 CASAVA_Build 17 11261242 2D TCTGTTCACC AG/-- AGTCTAAAAT 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AG 2 1 371912 CASAVA_Build 17 11267041 1I AGATTCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 412 hom 30 1 19 10 A 10 11 371913 CASAVA_Build 17 11267886 1I AGATCCTATT -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 A 8 9 371914 CASAVA_Build 17 11292272 4I GCGGGCTTAA ----/TTGT TCTTTTAAAA 2779 het 2593 hom 20 8 7 5 TTGT 0 1 371915 CASAVA_Build 17 11292850 2D CCTGGGTGAC AA/-- GAGCAAAACT 3070 het 3070 hom 24 12 12 2 A 2 0 371916 CASAVA_Build 17 11294747 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3067 hom 33 11 17 5 A 9 10 371917 CASAVA_Build 17 11295049 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAACAG 3070 het 960 hom 27 8 13 6 C 0 1 371918 CASAVA_Build 17 11300054 2D CACCCAGACC TG/-- TCCTCCCAAC 3070 het 3070 ref 44 25 16 3 TG 1 0 371919 CASAVA_Build 17 11301618 2D CTAAAAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 2699 het 2233 hom 21 12 8 1 A 16 14 371920 CASAVA_Build 17 11308982 1D AAAACTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 24 4 16 5 A 15 14 371921 CASAVA_Build 17 11314809 2D CCCTGACAAA TG/-- TGTGCAGCAT 3070 hom 78 het 31 0 25 6 TG 3 2 371922 CASAVA_Build 17 11318448 3D TTTTTGATGG TTT/--- TTTTTTTTTT 2663 het 69 hom 12 1 7 9 T 15 12 371923 CASAVA_Build 17 11321358 6I GTTTTCTGTG ------/TTGTTC TTGTTCTTTA 3070 hom 62 het 44 0 23 21 TTGTTC 1 2 371924 CASAVA_Build 17 11321373 3I CTTTATGTTT ---/ATG TTGTTTCCAT 3070 het 1720 hom 44 8 25 11 ATG 0 1 371925 CASAVA_Build 17 11324432 8D AAATACTCAT TGAGTGAA/-------- TGAGTGAATG 3070 het 3070 hom 33 14 17 4 TGAGTGAA 2 1 371926 CASAVA_Build 17 11327343 1D AACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2457 hom 27 8 15 4 A 15 14 371927 CASAVA_Build 17 11328057 4I GACTATTCAA ----/TAAT TAATTATTTC 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 TAAT 1 2 371928 CASAVA_Build 17 11329716 1D AGGATTGGAG T/- TGGCCCCATT 3070 het 3070 ref 28 12 12 4 T 2 1 371929 CASAVA_Build 17 11329804 2D TTGCCAGCAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 12 21 3 T 14 12 371930 CASAVA_Build 17 11335030 4I GGCTCTTGCC ----/TGAA CAATCTCAGC 3070 het 3070 ref 41 20 16 5 TGAA 0 1 371931 CASAVA_Build 17 11370153 1D ACCAAGGGGA C/- CCCCCCCCGC 3000 het 1919 hom 38 12 10 16 C 9 8 371932 CASAVA_Build 17 11388266 6D TAAATCAGAC TTAAAA/------ TTAAAACATT 3070 het 3070 ref 35 20 15 1 TTAAAA 2 1 371933 CASAVA_Build 17 11392483 2D TGCATATTTC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 33 11 12 10 AT 9 8 371934 CASAVA_Build 17 11409268 2D CATAGCTAGT AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 52 20 23 9 AC 10 9 371935 CASAVA_Build 17 11413194 9D TCAATGAGCC AAGCTTGGA/--------- AAGCTTGAGT 3070 het 3070 ref 37 16 17 8 AAGCTTGGA 1 0 371936 CASAVA_Build 17 11417761 1D AATACATTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 10 14 A 16 15 371937 CASAVA_Build 17 11420856 2I AGAAAGTTTC --/AT ATATATATAT 3070 het 3070 hom 23 7 11 5 AT 6 7 371938 CASAVA_Build 17 11431959 1I AACTCAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 A 13 14 371939 CASAVA_Build 17 11450048 1I AGTCCCTGCC -/T TTTGAGATCC 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 T 3 4 371940 CASAVA_Build 17 11450618 10I AGCCTCCTGA ----------/AGTAGCTGGG AGTAGCTGGG 2068 het 1537 hom 16 4 5 7 AGTAGCTGGG 1 2 371941 CASAVA_Build 17 11458822 1I GACGGTGGAA -/G GGCAAGCCAG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 G 2 3 371942 CASAVA_Build 17 11463333 1I CCCCAGCTAG -/C CCAACAAAGT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 C 2 3 371943 CASAVA_Build 17 11465968 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 24 0 23 1 A 11 10 371944 CASAVA_Build 17 11468551 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2505 hom 25 8 11 6 A 10 11 371945 CASAVA_Build 17 11469119 4D TGCATCAGTG CACA/---- CACACACACA 3070 het 3070 ref 42 17 15 11 CA 10 8 371946 CASAVA_Build 17 11476022 1I TGGACATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 37 1 29 7 A 11 12 371947 CASAVA_Build 17 11490223 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2820 het 165 hom 9 1 8 0 T 10 11 371948 CASAVA_Build 17 11499659 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 94 het 41 0 29 13 AC 8 7 371949 CASAVA_Build 17 11501010 4I ATATAACAGA ----/ATTC ATTCATCCAG 3070 hom 126 het 49 0 43 6 ATTC 1 2 371950 CASAVA_Build 17 11511338 2I TTTTATAAAC --/TT ATAGTAGTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 T 0 2 371951 CASAVA_Build 17 11518785 4D TTTGTCTTGT TAAA/---- TAAATCCATT 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 TAAA 2 1 371952 CASAVA_Build 17 11519047 1D TTTGTAGAAG A/- AAAAAATCTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 4 A 7 6 371953 CASAVA_Build 17 11522047 2D CCCCAGGAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 39 het 18 0 14 5 TA 6 5 371954 CASAVA_Build 17 11522705 1D AATTTTAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 T 10 9 371955 CASAVA_Build 17 11524286 1I TTTGGTTGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 A 11 12 371956 CASAVA_Build 17 11533137 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 16 7 9 0 A 10 11 371957 CASAVA_Build 17 11533409 1D CCTGAGTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2408 hom 33 9 12 12 T 13 12 371958 CASAVA_Build 17 11534729 1D CCTCATTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 20 19 3 A 11 10 371959 CASAVA_Build 17 11536111 1I CCCAAAGTGC -/T TGGATTACAG 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 1 2 371960 CASAVA_Build 17 11536242 1I CTTGCAGCTG -/T TGGGACCTTG 3070 het 3070 ref 39 23 11 5 T 1 2 371961 CASAVA_Build 17 11542874 1D TAGAGGACCT C/- TACTCCTCAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 4 C 1 0 371962 CASAVA_Build 17 11545724 4I TGTTTTGTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 51 23 17 12 TTTG 3 4 371963 CASAVA_Build 17 11550336 1D AGCTTGCATG T/- TTTTTTTAGA 3070 hom 84 het 30 0 29 1 T 8 7 371964 CASAVA_Build 17 11556897 1D TCTTTGCTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2215 hom 26 6 14 7 T 10 9 371965 CASAVA_Build 17 11561429 1D AGGGAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3 hom 29 1 18 11 A 13 12 371966 CASAVA_Build 17 11569591 1D GAAAGGTGGG T/- TTTATTTTTC 3070 het 3070 hom 40 10 25 6 T 4 3 371967 CASAVA_Build 17 11575087 6D25M4D GTGTCAGTGA TGATGGTGATGGTGATGATGATGGTGATGATAGTG/------TGATGGTGATGATGATGGTGATGAT---- ATGATGATGG 3070 het 3070 ref 83 42 26 43 N/A 0 0 371968 CASAVA_Build 17 11575440 1I AGGTCTTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 16 7 T 11 12 371969 CASAVA_Build 17 11576689 1I TGTCAATTCC -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 41 15 22 4 A 9 10 371970 CASAVA_Build 17 11585028 2I AATGTTTCTT --/TG TGTCATTATA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 TG 1 2 371971 CASAVA_Build 17 11598176 1D TCATGTTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 A 12 11 371972 CASAVA_Build 17 11603139 3D TTTTTTTTTT TTC/--- TTTTTTTGAG 3070 hom 69 het 28 0 23 6 TTC 1 0 371973 CASAVA_Build 17 11605221 12D TCTGATCACT TCTAGTCACACA/------------ GTCATACATA 3070 het 3070 ref 54 31 22 2 TCTAGTCACACA 1 0 371974 CASAVA_Build 17 11608752 1I CCTTTTTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 19 15 9 A 11 12 371975 CASAVA_Build 17 11614489 1I ATGCTGATGG -/A GGGGGAGCAC 3070 het 3070 ref 36 22 11 3 A 0 1 371976 CASAVA_Build 17 11618263 4I CCTTATTAAC ----/TAGA TAGAGTACTA 2875 het 2875 ref 37 18 8 11 TAGA 1 2 371977 CASAVA_Build 17 11618988 3D ACATCATGAA ATC/--- ATCATAATTG 3070 het 3070 ref 44 20 18 8 ATC 2 1 371978 CASAVA_Build 17 11626034 1D ACTTACTAGG A/- AAAAAAAAAA 2711 het 2711 ref 24 10 8 6 A 13 12 371979 CASAVA_Build 17 11630128 1I TTTTCAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 744 hom 41 2 34 5 A 10 11 371980 CASAVA_Build 17 11634161 1D TCGATGTGCA G/- GGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 16 14 4 G 3 2 371981 CASAVA_Build 17 11637775 1I ATGATCACCC -/A AATGATAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 2 3 371982 CASAVA_Build 17 11639116 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 25 12 13 0 A 7 8 371983 CASAVA_Build 17 11643736 3I TCAAGCCATT ---/CTC CTGCCTCAGC 2596 het 1768 hom 17 6 8 3 CTC 0 1 371984 CASAVA_Build 17 11650712 4I CAATGTATGT ----/ACAA ACATATATAT 3070 het 3070 ref 42 19 18 5 ACAA 0 1 371985 CASAVA_Build 17 11653250 2I CATTTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 TG 7 8 371986 CASAVA_Build 17 11659011 2I AGAAAAAAAA --/AC AACAATAAAG 3070 het 3070 hom 37 16 17 4 AC 0 1 371987 CASAVA_Build 17 11659242 1I TAATAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 738 hom 43 3 29 11 T 11 12 371988 CASAVA_Build 17 11660371 2D TACTCTGTGC AG/-- AGTCTTGTTT 3070 het 3070 ref 49 26 20 4 AG 2 1 371989 CASAVA_Build 17 11671730 1D TCCTTGGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 13 12 371990 CASAVA_Build 17 11687062 3D GTAGGAATAA AAT/--- AATATTTGGC 3070 het 3070 hom 43 18 22 6 AAT 2 1 371991 CASAVA_Build 17 11688082 4I GTATATACTC ----/TTAA TTAATAAATG 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 TTAA 1 2 371992 CASAVA_Build 17 11694693 3D ACTCCATGTC AAA/--- AAAAAAAAAA 2805 het 701 hom 14 3 10 1 A 17 14 371993 CASAVA_Build 17 11695903 3I GACTGGAAGG ---/AGA AGGAGTTACT 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 AGA 0 1 371994 CASAVA_Build 17 11718800 1I CATGGAGGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 A 10 11 371995 CASAVA_Build 17 11719303 1I AGATTTTAAG -/C CCCAGTGAAT 3070 het 3070 ref 33 18 11 4 C 3 4 371996 CASAVA_Build 17 11722280 7D GTTCAATTAA TTCTTAG/------- TTCATGTCCA 3070 het 3070 ref 33 16 15 3 TTCTTAG 1 0 371997 CASAVA_Build 17 11767094 1I CAAGTGCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 607 hom 34 2 25 8 T 10 11 371998 CASAVA_Build 17 11793524 1D AGCTTGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 16 16 11 T 13 12 371999 CASAVA_Build 17 11803142 1D TTAAAATATC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 10 9 372000 CASAVA_Build 17 11823172 1I TATGGTAACT -/A AAAAAAAAAA 1057 het 1057 ref 32 21 3 8 A 11 12 372001 CASAVA_Build 17 11839312 3I TTAACCGGGC ---/GTG GTGGTGGTGA 3060 hom 21 het 9 0 8 1 GTG 3 4 372002 CASAVA_Build 17 11856998 1D TTTGTAGGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 22 het 15 0 8 7 T 15 14 372003 CASAVA_Build 17 11861920 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 29 0 22 7 A 15 14 372004 CASAVA_Build 17 11880749 1D AGCATTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 447 hom 27 1 19 8 T 13 12 372005 CASAVA_Build 17 11880946 1I CCCCGCCACC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 445 hom 27 1 17 9 T 8 9 372006 CASAVA_Build 17 11881673 2I TATATAAGTT --/TA TATATATATA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TA 5 6 372007 CASAVA_Build 17 11886686 4I TTCTGTCAGA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AAAC 3 4 372008 CASAVA_Build 17 11920764 1I GGCAGTTTTT -/C CTGGGTGTAT 3070 hom 102 het 42 0 33 9 C 1 2 372009 CASAVA_Build 17 11955879 16I AAGCACAATA ----------------/TGACTAGGGGTCAAGT TGCTCCTCTT 3070 hom 129 het 48 0 43 6 TGACTAGGGGTCAAGT 0 1 372010 CASAVA_Build 17 11959584 1I ACGGGCCGGA -/G GAAAGATGGA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 G 1 2 372011 CASAVA_Build 17 11961640 1D ACTCACTGTA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 158 het 59 0 52 7 T 9 8 372012 CASAVA_Build 17 11964577 1I CTCCCTCATT -/C CCCCCCCCCA 3070 het 32 hom 17 1 11 5 C 9 10 372013 CASAVA_Build 17 11968120 1D TATTTACAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 8 372014 CASAVA_Build 17 11980712 4D TAATTCAGAA AAAG/---- AAGACAGTCA 3070 hom 84 het 29 0 28 3 AAAG 1 0 372015 CASAVA_Build 17 11984257 1I TTAGTGAAAA -/G TTTGTGTTTA 3070 hom 78 het 27 0 27 0 G 0 1 372016 CASAVA_Build 17 11997632 4D AGAAGACAAG AAAT/---- AACCAAGATC 3070 hom 81 het 29 0 28 3 AAAT 1 0 372017 CASAVA_Build 17 11999002 1I CAAACAAATG -/A AAAAACATTC 3070 hom 75 het 30 0 25 5 A 5 6 372018 CASAVA_Build 17 12005639 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 10 11 372019 CASAVA_Build 17 12019319 3I TAGTGGAAAT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 41 0 30 11 A 10 13 372020 CASAVA_Build 17 12020193 1I GCAAATCAGT -/A AAAAAAAAGT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 8 9 372021 CASAVA_Build 17 12020275 1I GGCTGGAGTG -/C AGTGGTGTGA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 0 1 372022 CASAVA_Build 17 12021031 2I ATTAAAAATG --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 9 11 372023 CASAVA_Build 17 12021935 1D TTGAGACCAG C/- CTGGCCAACA 3070 het 26 hom 15 1 10 4 C 2 1 372024 CASAVA_Build 17 12023629 1I AATTGTTTTT -/A AAAATTGCAG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 A 4 5 372025 CASAVA_Build 17 12025740 1I CTTTGTGTTT -/C CCCTAAACCT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 C 3 4 372026 CASAVA_Build 17 12026090 3D CTAAAAATAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 16 0 15 2 A 21 18 372027 CASAVA_Build 17 12027240 1I TTAGCACAGA -/C CCCCCACAGG 3070 hom 126 het 46 0 41 5 C 5 6 372028 CASAVA_Build 17 12028104 1I CATGGCGAAA -/C CCCGTCTCTA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 C 3 4 372029 CASAVA_Build 17 12034523 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2796 het 337 hom 13 1 7 5 A 11 12 372030 CASAVA_Build 17 12034800 8D CTGCATCATC TCATTCAT/-------- TCATTCATTC 3070 hom 53 het 30 0 18 13 TCAT 7 5 372031 CASAVA_Build 17 12035334 1I TTACTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 31 hom 25 1 21 3 T 10 11 372032 CASAVA_Build 17 12036721 1I CACCTGGGAG -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 8 9 372033 CASAVA_Build 17 12037967 3I CCTTCCAGAT ---/TTC TTCTTCTTGA 3070 hom 131 het 49 0 44 5 TTC 2 3 372034 CASAVA_Build 17 12041301 1D CAGGTGCGGT G/- GCTTATACCT 3070 hom 39 het 18 0 14 5 G 2 1 372035 CASAVA_Build 17 12043035 1I TCAAGTTTTA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 9 10 372036 CASAVA_Build 17 12057633 2I GTGACCACTC --/AG AGCAGAGCAG 3070 hom 96 het 34 0 32 2 AG 1 2 372037 CASAVA_Build 17 12094912 2I GTGTGGTAAG --/AC ACACAGACGG 3070 hom 120 het 45 0 37 8 AC 2 3 372038 CASAVA_Build 17 12108717 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 14 10 A 15 14 372039 CASAVA_Build 17 12115515 3I CAATGCTTGA ---/CAT CATCTAGCCA 3070 hom 39 het 14 0 14 0 CAT 1 2 372040 CASAVA_Build 17 12120917 1D ATTTCTGAAG C/- AGGAAATGTG 3070 hom 111 het 42 0 38 4 C 1 0 372041 CASAVA_Build 17 12123714 8D TTTCCCTCTT TGTGTCCA/-------- TGTGTCCATG 3070 hom 104 het 38 0 33 5 TGTGTCCA 2 1 372042 CASAVA_Build 17 12128110 4D GGACATGTGT TCTG/---- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 15 8 TCTG 1 0 372043 CASAVA_Build 17 12129608 1D GTAACTTCAC T/- TTTTTTCTGA 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 7 6 372044 CASAVA_Build 17 12132342 1I TCAAGTTGTG -/T GTCTGTTTTT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 T 0 1 372045 CASAVA_Build 17 12134169 1D TCCTCTCTTG C/- TAGCTAAATA 3070 het 3070 ref 44 20 18 6 C 1 0 372046 CASAVA_Build 17 12141375 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 27 0 23 4 T 14 13 372047 CASAVA_Build 17 12149348 3D ATCTCCTTTT TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 640 hom 22 3 14 5 TTA 5 4 372048 CASAVA_Build 17 12152204 8I TAGTGCTGAG --------/CAAAGTGC GATGGTTTCT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 CAAAGTGC 0 1 372049 CASAVA_Build 17 12157175 1D TAACATTCCC T/- TAAGGACTTC 3070 het 3070 ref 41 22 14 5 T 2 1 372050 CASAVA_Build 17 12157858 1D TTGAAGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 11 10 5 T 11 10 372051 CASAVA_Build 17 12158193 1I TCCTTTGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 19 7 T 14 15 372052 CASAVA_Build 17 12162111 1D ACCTAGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 42 0 34 8 T 11 10 372053 CASAVA_Build 17 12171193 1I CAGGTAATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 11 12 372054 CASAVA_Build 17 12173352 1I GTATTACTTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 32 15 14 3 T 7 8 372055 CASAVA_Build 17 12175022 1D TATCCCTTGT C/- CCCCCGATTC 3070 het 3070 ref 47 22 16 10 C 6 5 372056 CASAVA_Build 17 12175209 1I TAATTCATTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 36 18 13 5 T 8 9 372057 CASAVA_Build 17 12188642 1D TCTCTGTTGA T/- TTTTTTGTTA 3070 hom 129 het 45 0 44 1 T 7 6 372058 CASAVA_Build 17 12198994 2D CCATTTAAGA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 75 het 29 0 26 4 AT 6 5 372059 CASAVA_Build 17 12200854 3I CAGAGAGGTG ---/GAA GAACATCTGA 3070 het 3070 hom 46 14 30 2 GAA 1 2 372060 CASAVA_Build 17 12216155 1D20M3D CTTTTAAAGA TTTTTTTTTTAATTGGGAAACAAA/-TTTTTTTTTAATTGGGAAAC--- AAGAAGTCAG 3070 het 3070 ref 36 19 18 9 N/A 0 0 372061 CASAVA_Build 17 12223523 1D TATGTATATC T/- TTTTTGTCCC 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 T 6 5 372062 CASAVA_Build 17 12236316 1D AGAGACGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2803 hom 31 11 12 8 T 17 16 372063 CASAVA_Build 17 12246013 1D AAGAAATTAG A/- AAAAAAGGAA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 7 6 372064 CASAVA_Build 17 12246540 4D ACTCAGTTTC TTAG/---- TTAATATAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 3 TTAG 1 0 372065 CASAVA_Build 17 12246670 4D AATAAATATT AAAA/---- AACTCAACTC 3070 het 3070 hom 36 12 22 2 A 6 2 372066 CASAVA_Build 17 12254910 1D CGGCTGACCT C/- TTTTTTTTCT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 C 1 0 372067 CASAVA_Build 17 12255215 4I TCTTAGACAC ----/TATT TATTCACCCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TATT 1 2 372068 CASAVA_Build 17 12262004 7D GAGTAAGAAC TCACTCA/------- TCACCCAGGA 3070 het 3070 ref 48 26 14 14 TCACTCA 1 0 372069 CASAVA_Build 17 12262682 1D ATGTATGTGG T/- TTTTTTATTC 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 7 6 372070 CASAVA_Build 17 12263703 1I ACTCCGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2125 hom 26 7 13 6 A 11 12 372071 CASAVA_Build 17 12277198 4D CGTATGTGAT TAAA/---- TAGTTACTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 TAAA 1 0 372072 CASAVA_Build 17 12307077 1D AAATGTAAAA G/- AAAAGAATCT 3070 het 3070 hom 35 15 16 5 G 1 0 372073 CASAVA_Build 17 12307548 2D CTTTATTCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 42 17 8 17 TC 9 8 372074 CASAVA_Build 17 12307613 1I GTCTTCTGGG -/T TCTCAGTTGA 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 T 1 2 372075 CASAVA_Build 17 12308758 1D TACATTTGTT A/- ACAATTTATT 3070 het 3070 hom 33 15 13 5 A 2 1 372076 CASAVA_Build 17 12309425 1I CTGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 227 hom 35 1 26 8 T 12 13 372077 CASAVA_Build 17 12309669 1I GTTATGCCCC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 40 16 18 6 T 8 9 372078 CASAVA_Build 17 12317978 1D TTATTTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2502 hom 32 12 16 4 T 13 12 372079 CASAVA_Build 17 12322228 1D TTCTCAAAAC A/- AAAAAAAAAA 2682 het 2682 ref 24 11 7 6 A 15 14 372080 CASAVA_Build 17 12361208 1I AAGTACAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 10 12 4 A 11 12 372081 CASAVA_Build 17 12366135 2D TCATTTTATC AG/-- AGTCAATATA 3070 het 3070 hom 31 8 17 6 AG 2 1 372082 CASAVA_Build 17 12368540 2D TTACATTTAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 11 11 A 13 11 372083 CASAVA_Build 17 12369127 4I TTAGGTAAAT ----/ACTC ACTGCTAATT 3070 het 3070 hom 34 11 19 4 ACTC 0 1 372084 CASAVA_Build 17 12384185 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 55 hom 23 2 14 7 T 17 16 372085 CASAVA_Build 17 12415771 4D CTAGGTTTTA TTCT/---- TTCTAACTAC 3070 het 3070 ref 30 13 11 8 TTCT 2 1 372086 CASAVA_Build 17 12418006 1I AAATCTCTTT -/A AAAAATGTTC 3070 het 3070 ref 48 24 22 2 A 5 6 372087 CASAVA_Build 17 12440586 2D CTCATTACTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1302 hom 27 8 12 7 T 16 14 372088 CASAVA_Build 17 12441369 1I TTTAGCCAGT -/C CCCTCCTCTC 2518 het 2518 ref 30 17 6 7 C 3 4 372089 CASAVA_Build 17 12444786 9D AGGTGGTCTG CTTCTAGTC/--------- CCTAAATTTG 3070 het 3070 hom 37 16 20 5 CTTCTAGTC 1 0 372090 CASAVA_Build 17 12452722 1D AGCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 50 18 18 14 A 11 10 372091 CASAVA_Build 17 12454229 2I AATATATTTT --/CA CAGTTTTGAG 3070 het 3070 hom 36 15 19 2 CA 1 2 372092 CASAVA_Build 17 12456061 4I TTCCAGATGA ----/CACT AATGCTGTTG 3070 het 3070 hom 40 14 20 6 CACT 0 1 372093 CASAVA_Build 17 12457197 1D TCAGGGTGAA T/- TTTTTTTTTT 2243 het 2243 ref 22 11 6 5 T 15 14 372094 CASAVA_Build 17 12477819 3D TCAAGCAATT CTC/--- CTGCCTCAGC 2565 het 2565 ref 21 9 8 4 CTC 1 0 372095 CASAVA_Build 17 12479939 1I TTCCACAATG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 9 21 6 T 12 13 372096 CASAVA_Build 17 12481928 2I AATTAATCCT --/CA CACAACAACC 3070 het 3070 hom 52 24 25 3 CA 2 3 372097 CASAVA_Build 17 12488329 4I AATAGGAAGG ----/AAGA AAGAGTTTCA 3070 het 3070 ref 38 19 13 6 AAGA 1 2 372098 CASAVA_Build 17 12488563 3I CCTAGAGTCC ---/ATG ATGTCTAGAA 3070 het 3070 hom 53 20 26 7 ATG 1 2 372099 CASAVA_Build 17 12520591 1I ATTATTTGCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 T 9 10 372100 CASAVA_Build 17 12522356 1D TTTTCCTTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3008 hom 27 14 10 3 A 12 11 372101 CASAVA_Build 17 12529647 1D AGACTGGCTT A/- AAAAAAAAAA 2741 het 1687 hom 22 6 9 7 A 17 16 372102 CASAVA_Build 17 12546727 1D ATTTATTGGG T/- TTTTTTTAGT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 8 7 372103 CASAVA_Build 17 12559353 2I GCTACTCCCC --/CT GTTTGAGGCT 3070 het 3070 ref 47 22 19 6 CT 0 1 372104 CASAVA_Build 17 12560406 2D GACCCCTCTC AG/-- GGGGCCACTG 3070 het 3070 hom 31 10 15 6 AG 1 0 372105 CASAVA_Build 17 12578157 3I TAGAATATGT ---/AGA AGATTTTGCA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AGA 1 2 372106 CASAVA_Build 17 12578942 1I TTATAAATAA -/C CCTTGGAGCA 3070 hom 75 het 31 0 22 9 C 2 3 372107 CASAVA_Build 17 12579384 11I GCAAATAAAA -----------/ACGTAAGGGAC ATGTAAGGAT 3070 hom 135 het 51 0 46 5 ACGTAAGGGAC 0 1 372108 CASAVA_Build 17 12582992 2D ATGATAAGTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 66 het 32 0 23 13 TA 6 5 372109 CASAVA_Build 17 12585083 1D CCTGGCCTAT A/- CCCAAATAAC 3070 hom 102 het 36 0 35 1 A 1 0 372110 CASAVA_Build 17 12591414 4I AATGACAGAA ----/AGAG GGAGAGTAGA 3070 hom 123 het 46 0 40 6 AG 0 2 372111 CASAVA_Build 17 12593577 4I TCTCAAAACT ----/TATA TATATATATA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 TA 6 8 372112 CASAVA_Build 17 12605042 4D GCTGCACTTC TTCT/---- TTCTATGTTC 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 TTCT 2 1 372113 CASAVA_Build 17 12605449 1D TCTCCGTGCT A/- TGATCAGACA 3070 het 3070 ref 52 26 23 3 A 1 0 372114 CASAVA_Build 17 12606578 2D GCATGAACAC TG/-- TGATTTCCAA 3070 het 3070 ref 57 29 24 4 TG 2 1 372115 CASAVA_Build 17 12614526 1I ACCCTGTCTC -/T TACCAAAAAC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 T 1 2 372116 CASAVA_Build 17 12618068 1I TATCCAAAGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 296 hom 37 1 31 5 A 8 9 372117 CASAVA_Build 17 12619852 4I AGATGATGGC ----/AAAT AAATAAGAAT 3070 hom 151 het 57 0 49 8 AAAT 1 2 372118 CASAVA_Build 17 12620273 1I TCTTTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 10 11 372119 CASAVA_Build 17 12624585 14D TACATTGAAA TGCTGTCTTTTTTC/-------------- TGCTTGTCAG 3070 het 3070 hom 49 17 29 5 TGCTGTCTTTTTTC 1 0 372120 CASAVA_Build 17 12663622 2I TGATACTGTC --/TA AAGTTTTTTT 3070 het 2548 hom 25 12 12 1 TA 0 1 372121 CASAVA_Build 17 12669380 1I CTCCCAGCCC -/T TTGATTACTA 3070 het 3070 hom 28 12 12 4 T 2 3 372122 CASAVA_Build 17 12677996 1D AGATTGTGAA T/- TTTTTTTTTT 916 het 916 ref 34 20 4 10 T 15 14 372123 CASAVA_Build 17 12679649 10I TGGCATGGTC ----------/ACATTGCCAA ACAATTGCTG 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 ACATTGCCAA 0 1 372124 CASAVA_Build 17 12690141 1D GGTTTCCAGG A/- AAAAAAAAAA 1990 het 1990 ref 33 24 5 4 A 12 11 372125 CASAVA_Build 17 12692432 1D TAATTCTGCA T/- GATAACACCA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 1 0 372126 CASAVA_Build 17 12692587 1I AAACCCGTGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 8 9 372127 CASAVA_Build 17 12699569 1D CAGCATTTTA T/- TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 T 9 8 372128 CASAVA_Build 17 12704899 12D TTTTCTATTC TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 35 hom 23 1 16 6 T 23 11 372129 CASAVA_Build 17 12713478 1D CATTTTTAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 250 hom 47 1 41 6 T 10 9 372130 CASAVA_Build 17 12716498 1I AAACTTTCTC -/A GAAAGATAGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 A 0 1 372131 CASAVA_Build 17 12719998 1D AAAAAAAAAA T/- GTATTGATGA 3070 hom 90 het 32 0 31 3 T 1 0 372132 CASAVA_Build 17 12724712 19D TGGCCCACTC ACTAGTGGTAGTGAAATCA/------------------- ACTAGTGGTA 3070 het 3070 ref 45 21 15 12 ACTAGTGGTAGTGAAATCA 2 1 372133 CASAVA_Build 17 12727218 1I TTTGTCTAAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 11 9 9 T 10 11 372134 CASAVA_Build 17 12735841 1I ATTTTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 1098 het 1098 ref 25 9 4 13 T 14 15 372135 CASAVA_Build 17 12736030 7I GCAGAGATGG -------/GGTTTGA CCATGTTGGC 2668 het 2668 ref 14 8 6 0 GGTTTGA 0 1 372136 CASAVA_Build 17 12736836 1D ATCAACTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 12 11 372137 CASAVA_Build 17 12739248 1D CTCGATGTGG T/- TAAAACTGCT 3070 het 3070 ref 41 20 19 3 T 2 1 372138 CASAVA_Build 17 12741304 1I CATTTAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1308 hom 38 3 28 7 T 10 11 372139 CASAVA_Build 17 12755368 1D AATATGGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 14 18 10 T 11 10 372140 CASAVA_Build 17 12756361 3I TGAAATTCTC ---/AGT AGGAGGTTGG 3070 het 3070 ref 32 18 14 0 AGT 0 1 372141 CASAVA_Build 17 12766793 1I GGCACCTGCC -/A ATCACACTCA 3070 het 3070 hom 33 12 18 3 A 1 2 372142 CASAVA_Build 17 12778742 1I AAATTATTCT -/C TAGGATACTA 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 C 0 1 372143 CASAVA_Build 17 12784276 1D GCAGCTGCAC A/- AGGGAGGAAC 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 A 2 1 372144 CASAVA_Build 17 12790521 1I GATGCTCTCT -/A AAAAAAAAAA 2136 het 2136 ref 19 10 7 2 A 15 16 372145 CASAVA_Build 17 12790842 3I GACTCTATCT ---/AAA AAAAAAAAAA 1754 het 1754 ref 22 10 6 6 A 11 14 372146 CASAVA_Build 17 12802525 1D TTTTACAAAC T/- TTTTTTTTTT 1424 het 1424 ref 47 33 5 9 T 13 12 372147 CASAVA_Build 17 12810198 1I ACGCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2182 het 2182 ref 47 19 6 22 A 17 18 372148 CASAVA_Build 17 12822721 7D TTTTTTTTTC TTTTCTT/------- TTTTCTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 TTTTCTT 3 2 372149 CASAVA_Build 17 12826363 1D TTTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 630 hom 35 3 26 6 T 13 12 372150 CASAVA_Build 17 12836400 7D CCTGCTCTGT AGCAGCA/------- GCAGGAGGAA 3070 hom 123 het 44 0 38 7 AGCAGCA 1 0 372151 CASAVA_Build 17 12866042 13I CATTATAATA -------------/GAATCAGGACAGG GATGCTTTTG 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 GAATCAGGACAGG 0 1 372152 CASAVA_Build 17 12869050 6I ATGTGTTATG ------/TGTGTC TGTGTATGTG 3070 hom 154 het 55 0 52 3 TGTGTC 0 1 372153 CASAVA_Build 17 12869232 4D TGTACATGTG TATA/---- TATGTTTGTA 3070 hom 173 het 64 0 54 12 TA 3 1 372154 CASAVA_Build 17 12881594 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 648 hom 28 3 19 6 A 15 14 372155 CASAVA_Build 17 12885235 1D TTGTCTAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 326 hom 28 1 21 6 T 13 12 372156 CASAVA_Build 17 12898157 1I ATTCTTATTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 255 hom 35 1 22 12 T 12 13 372157 CASAVA_Build 17 12902917 1D TAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 24 1 14 9 A 12 11 372158 CASAVA_Build 17 12913425 1D GCCAGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 2239 het 2239 ref 12 7 5 0 T 8 7 372159 CASAVA_Build 17 12913894 1I TGTTGATGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 36 11 19 6 A 9 10 372160 CASAVA_Build 17 12914651 1D GAAGATGCAG A/- AAGGGACTGA 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 A 3 2 372161 CASAVA_Build 17 12914714 1I TGGAAATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 10 11 372162 CASAVA_Build 17 12919587 1D GCTATGGGTT A/- CTAATATGAT 3070 hom 102 het 36 0 35 2 A 1 0 372163 CASAVA_Build 17 12919946 8D CAACTAAATG ACTAATAA/-------- ACTAATAAAT 3070 hom 148 het 55 0 50 7 ACTAATAA 2 1 372164 CASAVA_Build 17 12920604 1I TAGAACAATG -/T TTTTTTATTT 3070 hom 107 het 39 0 36 3 T 6 7 372165 CASAVA_Build 17 12922399 1D CCTGTTCTTC T/- TTTTTTTGTC 3070 hom 72 het 28 0 25 4 T 8 7 372166 CASAVA_Build 17 12930683 1D AGAGGCTGGC A/- AAGACCCTGC 3070 het 2142 hom 38 11 17 10 A 3 2 372167 CASAVA_Build 17 12934615 2D TTAAACTAAC AG/-- AAAAAATTAA 3070 het 3070 hom 23 8 11 6 AG 1 0 372168 CASAVA_Build 17 12953917 4D GAGATGAGGT TGGC/---- CAGGCTGGTC 3070 hom 48 het 19 0 17 5 TGGC 1 0 372169 CASAVA_Build 17 12955175 1I TTCCATTTGT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 97 het 43 0 36 7 A 9 10 372170 CASAVA_Build 17 12971560 2I TGTTTGTTTG --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 9 11 372171 CASAVA_Build 17 12981026 6I TATTGTCTAA ------/TGATCT TGATCTTTAA 3070 het 3070 hom 33 13 14 6 TGATCT 1 2 372172 CASAVA_Build 17 12986421 1D CAGACCTGGA C/- TTTTTTCAGT 3070 het 3070 ref 34 21 12 1 C 1 0 372173 CASAVA_Build 17 13005179 1D TCCAATCTGC A/- AAAAGAACTG 3070 het 3070 ref 52 26 22 6 A 5 4 372174 CASAVA_Build 17 13006210 1I AATCACCTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 266 hom 44 1 36 7 T 9 10 372175 CASAVA_Build 17 13014175 2D TATCAAAAAA AC/-- AAAACAAAAC 3070 het 402 hom 37 2 19 17 AC 1 0 372176 CASAVA_Build 17 13015840 17D TACTGACAAA ATTCAAAAAGGTATTAT/----------------- ATAGCTTTTC 3070 hom 78 het 23 0 26 4 ATTCAAAAAGGTATTAT 1 0 372177 CASAVA_Build 17 13018215 3I GTTAGATGCA ---/CTT CTTCTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 16 5 CTT 2 3 372178 CASAVA_Build 17 13053522 1D TACAAGAGAG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 23 13 8 2 T 10 9 372179 CASAVA_Build 17 13054924 1D TTTGGATGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 18 8 T 13 12 372180 CASAVA_Build 17 13059936 6D AACACAGGAG ATATAT/------ ATATATATAT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AT 11 8 372181 CASAVA_Build 17 13063042 1D TTTCCTTTCA T/- TTTTTTTTTT 2164 het 2164 ref 20 13 5 2 T 11 10 372182 CASAVA_Build 17 13064137 1D GATTATCTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 9 8 372183 CASAVA_Build 17 13068819 2I TATATTATAC --/AT ATATTTATTC 3070 het 3070 ref 28 17 10 1 AT 2 3 372184 CASAVA_Build 17 13069379 1D AACAGGGGGT A/- GGGGTAGAAA 3070 het 3070 ref 32 19 11 2 A 1 0 372185 CASAVA_Build 17 13081119 1I TGTCCAGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 22 0 19 3 A 10 11 372186 CASAVA_Build 17 13085454 4D AATTATTGAT AATG/---- TATGTCATAC 3070 het 3070 ref 41 22 17 3 AATG 1 0 372187 CASAVA_Build 17 13088287 1D TACTACAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 A 11 10 372188 CASAVA_Build 17 13088973 1I CACAAATATT -/C CCCCAAGTTG 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 C 4 5 372189 CASAVA_Build 17 13105867 1D TATAAAGAGC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 1486 hom 21 6 13 3 T 9 8 372190 CASAVA_Build 17 13108171 1D TTTTTTTTTT C/- CTTTCAAGCT 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 C 2 1 372191 CASAVA_Build 17 13114102 1D TATTTCTATT A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 48 22 23 3 A 9 8 372192 CASAVA_Build 17 13115001 1I CAATGTACTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 T 9 10 372193 CASAVA_Build 17 13116687 1I9M1I TGCCGTGGTG -ATTTTTGTT-/CTTTTTTGTTG TAAGTGTGTT 3070 het 3070 hom 31 13 15 5 N/A 0 0 372194 CASAVA_Build 17 13146139 1D AAATCAGAGG A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 15 10 11 A 9 8 372195 CASAVA_Build 17 13164138 10D4M9D CTCTATTTCA TAGATGAGGGGAAATCTATGGTG/----------GCAA--------- TAGGGACCTT 3070 het 3070 ref 41 32 19 3 N/A 0 0 372196 CASAVA_Build 17 13167270 3D CTCTCTCCCC TTT/--- TTTCTTTTTC 3070 het 2679 hom 21 7 10 5 T 6 3 372197 CASAVA_Build 17 13187267 3I GAGAATTCAT ---/AGA AGAAGAAAAT 2957 het 2957 ref 23 12 8 3 AGA 2 3 372198 CASAVA_Build 17 13199121 1I AATGCTAATG -/A TTTTTTTAAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 A 0 1 372199 CASAVA_Build 17 13199561 1I GTCTTGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 34 0 31 3 T 10 11 372200 CASAVA_Build 17 13216511 1D TCTCTTGATG C/- TTTGATTTGA 3070 hom 79 het 32 0 27 5 C 1 0 372201 CASAVA_Build 17 13235081 4D TTTGAATTTG TATT/---- TATTTATTTA 3070 hom 33 het 13 0 12 1 TATT 6 5 372202 CASAVA_Build 17 13246203 1I GCTCTCTAAT -/G GGGGTCACTC 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 G 4 5 372203 CASAVA_Build 17 13246319 1D TCACACAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 T 11 10 372204 CASAVA_Build 17 13247169 2D CGGCCCTGAA TT/-- TTTTTTTTTT 1672 het 85 hom 14 1 7 6 T 20 18 372205 CASAVA_Build 17 13280304 1D CTTTAAAGAT A/- AAAATCAATA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 A 5 4 372206 CASAVA_Build 17 13283156 1D GTATCGTATC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 449 hom 25 1 17 7 A 10 9 372207 CASAVA_Build 17 13285928 1I ACATTGCATC -/T TCTGCCTGTG 3070 het 3070 ref 41 17 17 7 T 1 2 372208 CASAVA_Build 17 13299877 2I CTTTTGAGTG --/TT TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 T 7 9 372209 CASAVA_Build 17 13305565 2I CTCCAATATG --/CA CACACACACT 3070 het 3070 ref 54 25 23 6 CA 4 5 372210 CASAVA_Build 17 13330844 1D GCTACAGAGA T/- TTTTTTCCAG 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 T 7 6 372211 CASAVA_Build 17 13342988 1I CCTATTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2936 het 2707 hom 32 8 13 11 T 12 13 372212 CASAVA_Build 17 13344107 1D GGATATAAAA T/- TTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 24 10 10 4 T 8 7 372213 CASAVA_Build 17 13345522 3I ATTAAACATT ---/ACA ACAAGGTACT 3070 hom 69 het 26 0 24 2 ACA 1 2 372214 CASAVA_Build 17 13366274 1I GGATTATGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 20 12 13 A 12 13 372215 CASAVA_Build 17 13374689 1I CTCCCTTTGT -/A AAGACTTGGG 3070 het 3070 hom 43 16 24 3 A 2 3 372216 CASAVA_Build 17 13379702 1D ATGGATGTAT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 34 17 16 2 A 9 8 372217 CASAVA_Build 17 13383772 1D AGACGTTAGC T/- TCCAATGTCA 3070 het 3070 hom 51 24 24 3 T 2 1 372218 CASAVA_Build 17 13387460 1I AGAAAAAATA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 46 22 15 9 T 9 10 372219 CASAVA_Build 17 13389863 1D ATAACAATAC A/- AAAATTAGCC 2216 het 2140 hom 11 5 5 1 A 5 4 372220 CASAVA_Build 17 13395109 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2042 het 639 hom 13 4 5 5 A 16 12 372221 CASAVA_Build 17 13395658 1D TCATTCCAAG A/- AAAAAAAAAG 2939 het 2437 hom 34 13 10 11 A 10 9 372222 CASAVA_Build 17 13396120 1I GAACACTTTA -/T TTTTTTTATT 3070 het 2240 hom 19 6 13 0 T 7 8 372223 CASAVA_Build 17 13406650 1I TCAAGCTTCA -/G GCCCTTCCCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 1 2 372224 CASAVA_Build 17 13409188 3D CAGTTTAGAA ATT/--- ATTATTTCAG 3070 hom 63 het 23 0 22 3 ATT 3 2 372225 CASAVA_Build 17 13409585 4D AAAAAATAAA TAAG/---- TAAGTAAAAT 3070 hom 60 het 22 0 21 4 TAAG 2 1 372226 CASAVA_Build 17 13418177 1D CATATCACTC T/- TTTTTTTTTT 1389 het 1389 ref 28 12 5 11 T 17 16 372227 CASAVA_Build 17 13418813 1D AAAAACACAC A/- AAAAAAATGA 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 8 7 372228 CASAVA_Build 17 13419080 2I TTTTTCTCAG --/TC TCTCTCTGTT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 TC 3 4 372229 CASAVA_Build 17 13429869 1I AGACCTGTTA -/T TTCCTCCTTC 2221 hom 24 het 10 0 9 1 T 2 3 372230 CASAVA_Build 17 13432732 1I TGTAGTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 25 1 14 10 T 13 14 372231 CASAVA_Build 17 13488625 1D TGTCTCTACT A/- AAAAAAAATA 3070 hom 57 het 20 0 20 0 A 9 8 372232 CASAVA_Build 17 13495873 1D GTGTCCAATC T/- TTTGGCTTCC 3070 hom 76 het 32 0 23 9 T 4 3 372233 CASAVA_Build 17 13500893 10I ATGCTAAAGG ----------/TTCTAAAAAA TTCTACCATC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 TTCTAAAAAA 0 1 372234 CASAVA_Build 17 13502549 2D AAGATATAAA AT/-- ATATGTTTGT 3070 hom 72 het 27 0 25 4 AT 3 2 372235 CASAVA_Build 17 13507243 4I GTCTCAGAAT ----/TCTC TCTCTCCAGA 3070 hom 147 het 50 0 49 1 TC 3 5 372236 CASAVA_Build 17 13511618 1D AAATCAGAGA C/- CCCCCCAGCG 3070 hom 95 het 39 0 28 11 C 7 6 372237 CASAVA_Build 17 13513286 1D AAGATCATTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 10 9 372238 CASAVA_Build 17 13513747 1I AGCCACTTAT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 A 9 10 372239 CASAVA_Build 17 13516859 1I TGCATGCCAC -/G GGGGGGGATA 3070 hom 80 het 32 0 27 5 G 7 8 372240 CASAVA_Build 17 13518730 1D CCCAGTGTAC A/- AAAAAAAATA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 A 9 8 372241 CASAVA_Build 17 13522324 1I TTAAAAAGTC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 8 372242 CASAVA_Build 17 13522939 2D GAAATGATCC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 12 10 372243 CASAVA_Build 17 13524260 4D AAGGCTAAAC ACTT/---- ACACATATCT 3070 het 3070 ref 48 34 7 10 ACTT 1 0 372244 CASAVA_Build 17 13531449 1I ATCTCAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 274 hom 28 1 24 3 A 12 13 372245 CASAVA_Build 17 13556713 4I CATCAAAAAA ----/AGAG AGAGAAGAAG 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 AG 2 4 372246 CASAVA_Build 17 13573314 1D CTGGCCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 402 hom 35 5 10 20 T 15 14 372247 CASAVA_Build 17 13583049 1D TCTTTTCTTC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 90 het 34 0 30 6 T 10 9 372248 CASAVA_Build 17 13587667 1D ATTGCTTGAG C/- CTCAGGAGTT 1368 het 1368 ref 18 10 5 3 C 2 1 372249 CASAVA_Build 17 13591309 1D CCATATTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1140 hom 31 3 20 9 T 11 10 372250 CASAVA_Build 17 13591675 1I AAGTAATGTA -/T TTTTTTGCAG 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 6 7 372251 CASAVA_Build 17 13592235 2D CTTGCTCTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 36 0 24 13 A 13 11 372252 CASAVA_Build 17 13612497 1I TAAAAGAATA -/T TTTAAATTTA 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 3 4 372253 CASAVA_Build 17 13619449 1D ACAGCCTCAT G/- GCTTGATGGT 3070 hom 129 het 51 0 44 7 G 2 1 372254 CASAVA_Build 17 13619844 1I TTCTTGAACT -/C TTATGATGTG 3070 het 3070 ref 55 26 22 7 C 0 1 372255 CASAVA_Build 17 13625564 4D6M3I GCAAGTATGG TCTTTATATA---/----TATAAAGAC CATATAAGAG 3070 het 3070 ref 33 20 13 2 N/A 0 0 372256 CASAVA_Build 17 13631292 4I CAGAAAAAAG ----/AGAT AGAAAGACAA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 AGAT 0 1 372257 CASAVA_Build 17 13633877 5D TACTTTACTT AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1762 hom 35 10 15 11 A 17 12 372258 CASAVA_Build 17 13634625 1D GTAATAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 175 hom 25 2 14 9 A 15 14 372259 CASAVA_Build 17 13636092 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 het 1462 hom 25 4 20 2 A 6 7 372260 CASAVA_Build 17 13636708 1I AGCAACACAG -/T TGCCATGTCA 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 1 2 372261 CASAVA_Build 17 13637105 2I CTATTTGATA --/AC ACAACAGGGT 3070 het 1985 hom 34 6 24 4 AC 1 2 372262 CASAVA_Build 17 13663854 1D AATCTCTTCT A/- GAAACACCTG 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 A 1 0 372263 CASAVA_Build 17 13665658 1D CCCATCTTGG A/- GTTCCCAAAG 3070 hom 108 het 37 0 33 4 A 1 0 372264 CASAVA_Build 17 13675815 1D CATATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1347 hom 33 8 16 9 T 15 14 372265 CASAVA_Build 17 13680980 1D AGTACAACTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 A 11 10 372266 CASAVA_Build 17 13684230 1D AGGTTCTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 36 10 20 6 T 10 9 372267 CASAVA_Build 17 13693069 1I TCTCCCTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 13 14 14 A 13 14 372268 CASAVA_Build 17 13695168 12D CCTGCTCTAC TGCTGGAGTCAT/------------ TGCTGCCACC 3070 het 3070 hom 30 15 18 3 TGCTGGAGTCAT 1 0 372269 CASAVA_Build 17 13696209 1I GACTGATAAA -/C CATGGTTTAC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 C 1 2 372270 CASAVA_Build 17 13696334 2I GCAAAATTTT --/TC TCTCTTTTTT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 TC 2 3 372271 CASAVA_Build 17 13703415 1I CAATAGATGC -/A AAAAAAGGCC 3070 het 2208 hom 20 7 13 0 A 6 7 372272 CASAVA_Build 17 13706233 2I ATTTTGTTTT --/AG TTGTCTTTCC 3070 hom 102 het 38 0 35 3 AG 0 1 372273 CASAVA_Build 17 13716168 1D GGCATCATCA T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 31 het 24 0 15 10 T 9 8 372274 CASAVA_Build 17 13728340 1D TCTCAATCTC T/- TGACCTCATG 2108 het 144 hom 9 1 6 2 T 2 1 372275 CASAVA_Build 17 13737359 1D GATGGAATTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 35 0 30 6 A 12 11 372276 CASAVA_Build 17 13738064 1I CAAAATCATC -/T CAAAAATTAA 3070 hom 108 het 42 0 37 5 T 0 1 372277 CASAVA_Build 17 13745528 2D AGAGACCAGC CT/-- GGGCAACATG 3070 hom 57 het 22 0 20 2 CT 1 0 372278 CASAVA_Build 17 13748076 2I AGTTCATTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 19 9 T 12 14 372279 CASAVA_Build 17 13760914 2D CGGGGTTTCA CT/-- CTGTGTTAGG 2374 hom 12 het 6 0 5 1 CT 2 1 372280 CASAVA_Build 17 13784880 1D TTCAGCCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 A 13 12 372281 CASAVA_Build 17 13790884 1D CAATTATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1100 hom 34 7 8 19 T 17 16 372282 CASAVA_Build 17 13797277 3I TATACATAAC ---/ATG ATATGTATAT 3070 hom 99 het 38 0 34 4 ATG 0 1 372283 CASAVA_Build 17 13814900 1D GTCCTTTCCC T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 hom 32 9 18 7 T 8 7 372284 CASAVA_Build 17 13815372 1D GTCATGGGTT G/- GGGGGGATCC 3070 hom 123 het 44 0 40 4 G 7 6 372285 CASAVA_Build 17 13817436 1I TCACCCCCCC -/T GTCCCGTAAC 3070 het 2308 hom 25 7 13 5 T 0 1 372286 CASAVA_Build 17 13828773 2D TCATTTTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 153 hom 27 3 11 15 A 20 18 372287 CASAVA_Build 17 13830312 1I AGGTTTTATT -/C CCCCCTCAAA 3070 hom 108 het 43 0 37 6 C 5 6 372288 CASAVA_Build 17 13832329 1D CTTAAAAAGA T/- TTAGGAATTT 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 T 3 2 372289 CASAVA_Build 17 13834139 1D GAAATGAGAG A/- AAAAAAATAC 3070 het 3070 ref 34 20 13 2 A 8 7 372290 CASAVA_Build 17 13865719 1D GAATATTTTC T/- TTTTTTTTGA 2336 het 2336 ref 16 9 5 2 T 9 8 372291 CASAVA_Build 17 13911730 3D TCTAGGTTTA AAC/--- AACAAGTGTT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AAC 2 1 372292 CASAVA_Build 17 13912277 1I AGAATCGGGT -/G GGGGGGGGTG 3070 hom 46 het 25 0 15 10 G 8 9 372293 CASAVA_Build 17 13918539 4I ACTTTCTGCC ----/TTTA TTTTTCTCTG 3070 hom 87 het 36 0 30 6 TTTA 0 1 372294 CASAVA_Build 17 13920493 1I AGGAGATGAA -/T TAACAAGTAA 3070 hom 54 het 24 0 19 5 T 1 2 372295 CASAVA_Build 17 13923899 4D TATATATATA TATG/---- TATGTATGTA 3070 hom 62 het 28 0 21 7 TATG 5 4 372296 CASAVA_Build 17 13935939 1I CAACTAACAA -/T TTTTTTTGCC 3070 het 274 hom 30 1 27 2 T 7 8 372297 CASAVA_Build 17 13944875 1I AAAGCTCTTA -/T TGGCAATTGC 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 1 2 372298 CASAVA_Build 17 13950064 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 87 het 39 0 29 10 T 9 8 372299 CASAVA_Build 17 13951266 1I TCTACTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 28 6 T 10 11 372300 CASAVA_Build 17 13952719 1D GAAATAAGGT A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 A 7 6 372301 CASAVA_Build 17 13953044 4I TATTGAACAT ----/CATA CATACATATA 3070 het 3070 ref 42 23 13 7 CATA 2 3 372302 CASAVA_Build 17 13971008 4I AAAAAATAGA ----/TAGT TAGTGACTCG 3070 hom 102 het 36 0 35 1 TAGT 1 2 372303 CASAVA_Build 17 13974575 1I TCCATCATCT -/C ATTTAAACTC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 C 0 1 372304 CASAVA_Build 17 13981993 3D CACAATTCAG TTT/--- TTTTTTTTTT 2952 het 148 hom 31 3 10 18 T 21 18 372305 CASAVA_Build 17 13991860 1D ACACAGGGTC T/- TTATAGACAG 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 3 2 372306 CASAVA_Build 17 13998911 2D CAGTTTGCTC TG/-- TTCCTGAGAT 3070 hom 90 het 34 0 28 7 TG 1 0 372307 CASAVA_Build 17 13999372 2D ACATCTACAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 33 0 25 9 A 17 15 372308 CASAVA_Build 17 14003725 3D CCTAGTGCAA ATT/--- ATTGTTGTTG 3070 hom 69 het 26 0 24 4 ATT 2 1 372309 CASAVA_Build 17 14014481 4D ATGAAAAATG TTAC/---- TTAACTGACT 3070 hom 84 het 32 0 29 4 TTAC 1 0 372310 CASAVA_Build 17 14019244 1D TATGTTTACC T/- TTTTTTTTTT 2163 het 486 hom 13 1 6 6 T 13 12 372311 CASAVA_Build 17 14026047 1I TATTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 16 1 10 5 T 12 13 372312 CASAVA_Build 17 14029792 4D TAGTTACCCC TTTA/---- TTTAACTTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TTTA 2 1 372313 CASAVA_Build 17 14030233 1D TAGTCCTTCT A/- AAAAAGCAGA 3070 het 3070 ref 46 31 8 8 A 6 5 372314 CASAVA_Build 17 14031028 1D TATTTTAAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 24 0 19 5 T 12 11 372315 CASAVA_Build 17 14032492 1D AAGATTATGG A/- AAAAATAGAA 3070 hom 24 het 12 0 9 3 A 6 5 372316 CASAVA_Build 17 14033122 1D CATTTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2465 het 513 hom 22 4 9 9 T 17 16 372317 CASAVA_Build 17 14046136 1I ATCTCTCTCT -/C TTTTTTTTTT 706 het 706 ref 31 10 7 14 C 0 1 372318 CASAVA_Build 17 14046266 1I TGGCAACAAC -/T TTTTTTTTTT 2673 het 646 hom 32 5 11 16 T 17 18 372319 CASAVA_Build 17 14048824 1I GTTAAGATCC -/T TCTGTGGCTT 3070 hom 132 het 47 0 43 4 T 1 2 372320 CASAVA_Build 17 14049186 1D ACCACCTTCC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 85 het 32 0 26 6 T 9 8 372321 CASAVA_Build 17 14056411 2D GTGTCGGGGA GC/-- GAGATGCACC 3070 hom 51 het 19 0 15 4 GC 1 0 372322 CASAVA_Build 17 14070935 1D GATATACGGA T/- AATGTGGTAA 3070 het 3070 ref 41 16 14 11 T 1 0 372323 CASAVA_Build 17 14074424 1I CTTTCCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 12 11 6 T 11 12 372324 CASAVA_Build 17 14083871 1D GCATCAAAAA T/- TAAAAAAAAA 1833 hom 12 het 5 0 5 0 T 2 1 372325 CASAVA_Build 17 14108162 1I TCAGAAACAG -/A AAAGTCAAAT 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 A 3 4 372326 CASAVA_Build 17 14112511 2I TATAAGGTCA --/GT GTAGGTGGCG 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 GT 1 2 372327 CASAVA_Build 17 14120390 1D TGTCAAAAAA G/- TCTAAATGTC 3070 het 3070 ref 36 21 11 5 G 1 0 372328 CASAVA_Build 17 14123933 1D CATAGGGAAG A/- AAAATTAACA 3070 het 3070 hom 44 20 19 5 A 5 4 372329 CASAVA_Build 17 14127366 1D ATTACTAGTT A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 27 10 12 6 A 9 8 372330 CASAVA_Build 17 14134502 1I CCCAAATGAG -/C TGAAAACTTA 3070 hom 99 het 37 0 33 4 C 0 1 372331 CASAVA_Build 17 14137987 1I CCCGTTACCC -/T AAAAAAACAA 3070 hom 102 het 45 0 35 10 T 0 1 372332 CASAVA_Build 17 14150872 1I GGGTGAAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2190 hom 32 7 20 5 A 12 13 372333 CASAVA_Build 17 14156144 1D CTGTGTGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 19 19 12 A 11 10 372334 CASAVA_Build 17 14161958 1I CAGAGAAAGC -/A AGAAAACACA 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 A 1 2 372335 CASAVA_Build 17 14165747 1D ATGGCGGTTG A/- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 A 9 8 372336 CASAVA_Build 17 14166116 1I AACCCAAACC -/T TTTTTTTTTT 2521 het 2220 hom 19 8 8 3 T 10 11 372337 CASAVA_Build 17 14193657 1I TTAGGGTGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 23 0 18 5 T 10 11 372338 CASAVA_Build 17 14194785 1D CTAAAATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2400 hom 32 7 16 9 T 12 11 372339 CASAVA_Build 17 14195461 1D AAAAAAGAAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 115 hom 25 1 19 5 A 9 8 372340 CASAVA_Build 17 14199201 1D ACTTCTGCTC T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 78 het 33 0 27 6 T 9 8 372341 CASAVA_Build 17 14201459 3I TGGCATTTGT ---/ACA ACATCAAAGC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 ACA 1 2 372342 CASAVA_Build 17 14217137 1I GCTTAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 A 9 10 372343 CASAVA_Build 17 14219905 1I CTTGTGATTA -/C CCCCACCTCG 2751 het 2199 hom 18 8 7 3 C 4 5 372344 CASAVA_Build 17 14224547 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 2424 het 2424 ref 21 12 7 2 T 8 7 372345 CASAVA_Build 17 14229452 1D CAAACCACTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 1458 hom 23 5 10 8 A 10 9 372346 CASAVA_Build 17 14230373 1D GTACTAAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 133 hom 33 2 18 13 T 15 14 372347 CASAVA_Build 17 14235179 1D AGGATAGGCA C/- CGAAAAAGCC 3070 het 3070 ref 43 23 18 2 C 2 1 372348 CASAVA_Build 17 14236673 1D ACTCAACAAC A/- AAAAAACTCA 3070 het 3070 hom 38 17 16 7 A 7 6 372349 CASAVA_Build 17 14276147 2D ACCTGTACCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 112 hom 33 1 16 16 A 14 12 372350 CASAVA_Build 17 14279765 2D CGAGCCAGGC AT/-- GGTGGCTCAT 2960 het 2960 ref 21 7 8 6 AT 1 0 372351 CASAVA_Build 17 14281569 1I TCATTCTTAT -/A AGTAATCTCT 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 A 1 2 372352 CASAVA_Build 17 14284142 4I27M1D GGAGGCAGAA ----AGAGAGAGAAAGAAAGAGAGGAGAAAGA/AGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAGAGGAGAAAG- AAGAAAGAAG 3054 het 3054 ref 21 14 8 4 N/A 0 0 372353 CASAVA_Build 17 14284234 4I AAAGAAAGAG ----/GAAA GAAAGAAAGA 2657 het 2657 ref 31 13 11 7 GAAA 2 3 372354 CASAVA_Build 17 14284558 1D AAACAGGGCC T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 ref 29 16 8 5 T 8 7 372355 CASAVA_Build 17 14284747 1D GGCAAATATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 A 11 10 372356 CASAVA_Build 17 14285200 1I ATTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 9 4 T 11 12 372357 CASAVA_Build 17 14288697 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTGT 1376 hom 7 het 3 0 3 0 T 8 9 372358 CASAVA_Build 17 14307992 1I CTTTAAATCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 T 10 11 372359 CASAVA_Build 17 14312891 2D TATGTACATT TG/-- TGTGTGTGTG 971 het 971 ref 57 46 3 10 TG 8 7 372360 CASAVA_Build 17 14313565 2I TACAGTTCTC --/AA AGTGTGTGCT 3070 het 3070 hom 59 24 27 8 A 1 3 372361 CASAVA_Build 17 14331140 1I ACGCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1484 het 1484 ref 19 10 5 4 A 10 11 372362 CASAVA_Build 17 14333898 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2295 het 1417 hom 17 4 6 7 A 12 11 372363 CASAVA_Build 17 14334666 1I CCTTTTCTTT -/C CCCCCCACTG 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 C 6 7 372364 CASAVA_Build 17 14337776 1D GAACACACAC T/- TTTTTTTATA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 T 8 7 372365 CASAVA_Build 17 14345446 1I AGCTAGAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2446 hom 29 6 16 7 T 10 11 372366 CASAVA_Build 17 14348115 1I ACTCTGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1333 hom 19 4 11 4 A 11 12 372367 CASAVA_Build 17 14349656 2I CAAGTAACAC --/CA CAGAGTTACA 3070 het 3070 ref 57 27 24 6 CA 1 2 372368 CASAVA_Build 17 14366669 1I AGTTATTTAG -/A AAAAAAACAG 2674 het 2674 ref 32 22 7 3 A 7 8 372369 CASAVA_Build 17 14367412 3D CTGTAGAGAC TTG/--- TTGTAGCCAG 3070 het 3070 ref 33 17 14 4 TTG 2 1 372370 CASAVA_Build 17 14368078 1I ATATTGCCAT -/A AAAAAAGAAT 3070 het 3070 hom 38 11 20 7 A 6 7 372371 CASAVA_Build 17 14369122 1I TTTTAACCCC -/A TCAATTTTTA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 A 0 1 372372 CASAVA_Build 17 14370459 4I AGCCTTCAAC ----/GAGA GAGATTGAGT 3070 het 3070 hom 45 17 23 5 GA 2 4 372373 CASAVA_Build 17 14371090 1D CTGGGTTCAA G/- TGATTCTCCT 2620 het 743 hom 10 2 7 1 G 1 0 372374 CASAVA_Build 17 14385893 1I TCTCTCCCTC -/T TTTTTTCTCC 3070 hom 80 het 31 0 26 5 T 6 7 372375 CASAVA_Build 17 14390442 1D TCTCCAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 T 11 10 372376 CASAVA_Build 17 14392668 1I CTGATATTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 9 10 372377 CASAVA_Build 17 14393752 2D GCAACAGTTA TC/-- TCTCTCTGGA 3070 het 3070 ref 31 15 13 4 TC 4 3 372378 CASAVA_Build 17 14413245 3I GTCTTCTAAT ---/AAC AACACCAGTC 3070 het 3070 ref 43 20 17 6 AAC 1 2 372379 CASAVA_Build 17 14417548 8D CCAGGTGATT CTAATATG/-------- CAGCCAAATT 3070 het 3070 hom 46 20 23 6 CTAATATG 1 0 372380 CASAVA_Build 17 14418157 4D CCTGGTTAAC ACTT/---- ATTTATCCTT 3043 het 2601 hom 15 6 7 3 ACTT 1 0 372381 CASAVA_Build 17 14418327 1I TTTATTATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 25 0 18 7 T 10 11 372382 CASAVA_Build 17 14418337 1I TTTTTTTTTT -/A AAATCTCCAG 3070 hom 59 het 23 0 20 3 A 3 4 372383 CASAVA_Build 17 14423846 1I TAAAAAATCC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 34 14 14 6 T 8 9 372384 CASAVA_Build 17 14426891 3D TCTCAAAATT AAA/--- AAAAAAAAAA 1645 het 1645 ref 25 13 8 4 A 15 12 372385 CASAVA_Build 17 14432695 2I TGGGATTTGC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 455 hom 31 1 19 11 T 12 14 372386 CASAVA_Build 17 14435515 2I AATTAATGAA --/AT ATATATATAT 3070 hom 93 het 38 0 32 6 AT 5 6 372387 CASAVA_Build 17 14442030 2I GTCCCACTCC --/CA CAGAGCCCAG 3070 hom 74 het 26 0 23 3 CA 1 2 372388 CASAVA_Build 17 14447149 2D AAAGTGGGTG AC/-- ACATATGAAC 3070 het 3070 ref 20 10 8 4 AC 2 1 372389 CASAVA_Build 17 14477200 1D TGCCTGGCTA T/- TTTTTTTTTT 1173 het 1173 ref 25 10 5 10 T 15 14 372390 CASAVA_Build 17 14527229 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 17 10 7 A 13 14 372391 CASAVA_Build 17 14529296 1D TATTCCTTAA C/- CCCCTTATTC 3070 het 3070 ref 32 16 13 3 C 5 4 372392 CASAVA_Build 17 14546477 1I TTACTTTGGG -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 39 19 17 3 A 7 8 372393 CASAVA_Build 17 14570259 1D TGTTTACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 6 T 13 12 372394 CASAVA_Build 17 14574193 1D TGTGTTTTAA G/- TACTAAGACT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 1 0 372395 CASAVA_Build 17 14586311 7D TATTTATTTA TTTATTT/------- TTTTTTTTTT 3070 hom 13 het 15 0 12 4 TTTATTT 1 0 372396 CASAVA_Build 17 14588126 1D TATACTTAGA T/- TTTTTTAAGT 3070 hom 114 het 44 0 39 6 T 7 6 372397 CASAVA_Build 17 14594331 1I ACTCCGCCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 A 10 11 372398 CASAVA_Build 17 14598720 1I TAGCTCCTGG -/T AAGGGAGACA 3070 het 3070 hom 40 18 16 6 T 0 1 372399 CASAVA_Build 17 14602671 2D ATGGCCGGGT GC/-- GCGGTGGCTC 3070 het 3070 hom 26 9 11 6 GC 2 1 372400 CASAVA_Build 17 14603980 1D CAAGAAGTGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 A 10 9 372401 CASAVA_Build 17 14605622 1D CTTGTCATGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 10 9 372402 CASAVA_Build 17 14632164 3I GGGTTGTCTC ---/TAA TAATATGTTA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 TAA 1 2 372403 CASAVA_Build 17 14636326 3I AAACTGAAAA ---/CTC CTATTCATTT 3070 hom 87 het 31 0 28 3 CTC 0 1 372404 CASAVA_Build 17 14643695 2D TATTATACTT GA/-- TAAGTTTTAG 3070 hom 63 het 25 0 21 4 GA 1 0 372405 CASAVA_Build 17 14644242 1I ATTGAATTGG -/A AATGACACCA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 3 372406 CASAVA_Build 17 14655611 2D GAAAATAATC AT/-- ATATATATAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 AT 7 6 372407 CASAVA_Build 17 14656602 15I AGTGTGTCCG ---------------/GACACTGTACACAGT TCCTCAGGCT 3070 hom 135 het 50 0 46 5 GACACTGTACACAGT 0 1 372408 CASAVA_Build 17 14658376 1I TTTACTATGA -/T TTTTTTAAAT 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 6 7 372409 CASAVA_Build 17 14662305 8I TGAAGGACAC --------/GATCTTGT GATCTTGTTC 3070 het 3070 ref 35 18 10 7 GATCTTGT 1 2 372410 CASAVA_Build 17 14683923 1I TAGGGAAAAA -/T CATTTATTTA 3070 het 3070 hom 31 15 15 1 T 0 1 372411 CASAVA_Build 17 14689069 2D AAGAGGAAAC TG/-- TATCACATTT 3070 het 3070 ref 50 22 20 8 TG 1 0 372412 CASAVA_Build 17 14691361 1D TGGGAGGGCC T/- TTTAAAGCAT 3070 het 3070 ref 28 13 12 3 T 4 3 372413 CASAVA_Build 17 14696712 1I AAGAAATACC -/T GAGGCTGGGT 3070 hom 120 het 44 0 41 3 T 0 1 372414 CASAVA_Build 17 14699551 1D AAAATTTCTA C/- TCCGATTATG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 C 1 0 372415 CASAVA_Build 17 14700094 2D CATGTCTCAT TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 135 het 53 0 45 10 TC 7 6 372416 CASAVA_Build 17 14700728 6D GGTCTGAGTC CTTCAG/------ CTTCAGCGTG 3070 hom 98 het 39 0 29 12 CTTCAG 2 1 372417 CASAVA_Build 17 14703359 3I GTAACCAAAA ---/CAG CACGGTACTG 3070 hom 57 het 20 0 20 0 CAG 0 1 372418 CASAVA_Build 17 14713746 3D TTAGGCGATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 17 13 7 A 13 10 372419 CASAVA_Build 17 14738857 3I AAGAAAAAGA ---/TTT ACCTAACATT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 0 3 372420 CASAVA_Build 17 14756541 1I CAGATTAGGG -/A GGTACATCAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 0 1 372421 CASAVA_Build 17 14774892 1D TGGAAGTGAT A/- AAAAAAAAGA 3070 hom 87 het 37 0 29 9 A 9 8 372422 CASAVA_Build 17 14780929 1I CTATTGGAGG -/C CCAGATGGAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 2 3 372423 CASAVA_Build 17 14782436 2D ACCTAAGGTC TA/-- TATATTCCAA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 TA 3 2 372424 CASAVA_Build 17 14784589 1D GAACTAGCCA C/- CCCATTGGCT 3070 hom 152 het 54 0 48 7 C 4 3 372425 CASAVA_Build 17 14796731 1I CCTTCCCTTT -/A CACAAATGCT 3070 hom 108 het 44 0 36 8 A 0 1 372426 CASAVA_Build 17 14843465 7D TTTAGTTAGG TTTTGTT/------- TTTTGTTTTT 3070 het 1638 hom 24 7 14 4 TTTTGTT 2 1 372427 CASAVA_Build 17 14844530 1D ATTAGGCTAC A/- AAAAAGAATG 3070 het 3070 ref 38 26 12 0 A 6 5 372428 CASAVA_Build 17 14845246 4D TTAATAGGAC ATTA/---- ATTATGTCTG 3070 het 3070 ref 39 21 17 3 ATTA 2 1 372429 CASAVA_Build 17 14849887 4D ACTTTCACTT ACTC/---- ATTCATTCAT 3070 het 3070 ref 43 22 12 11 ACTC 1 0 372430 CASAVA_Build 17 14858135 1I CTGTCACTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1008 hom 44 3 30 11 A 10 11 372431 CASAVA_Build 17 14858388 1D CATCTACTTT G/- GGGCTGGACA 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 4 3 372432 CASAVA_Build 17 14860215 5D AAACAACAAC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 317 hom 28 5 14 11 A 15 10 372433 CASAVA_Build 17 14861247 1D AGAAAAAAAA T/- ACATATTTAT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 1 0 372434 CASAVA_Build 17 14865414 2I CCACAGGCCC --/CT AAGTGGGAGT 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 CT 0 1 372435 CASAVA_Build 17 14877790 1D CAAGCTCAGC A/- GCTGCAGCAA 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 A 1 0 372436 CASAVA_Build 17 14881970 1I AAAAAAAAAA -/C CAAATAAAAA 3070 het 240 hom 39 3 26 10 C 1 2 372437 CASAVA_Build 17 14889237 4D CATTCTGCCA TATT/---- TATTTATATA 2983 het 2983 ref 24 15 8 1 TATT 2 1 372438 CASAVA_Build 17 14919117 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 A 6 7 372439 CASAVA_Build 17 14926083 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2236 hom 20 6 10 4 A 10 11 372440 CASAVA_Build 17 14928619 4D GCTGATTTTT TTTG/---- TTTTGTTTTG 118 het 118 ref 22 13 2 8 TTTG 1 0 372441 CASAVA_Build 17 14950309 1D ATTATATTGA G/- GGTTAGGATT 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 G 3 2 372442 CASAVA_Build 17 14955066 3I CAGTTAAAAA ---/CTT CTTATTCTGC 3070 het 3070 ref 34 13 11 10 CTT 1 2 372443 CASAVA_Build 17 14970218 1D GAGCTAAAGT A/- AAAAAAAAAA 2424 het 2424 ref 41 17 11 13 A 17 16 372444 CASAVA_Build 17 14989551 1D AGGCTGCCCT A/- ATGTGTGAAT 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 A 2 1 372445 CASAVA_Build 17 14993964 1I TCATAATAGT -/A GTCTCCCTGG 3070 het 3070 hom 28 8 17 3 A 0 1 372446 CASAVA_Build 17 14994347 1D ACAGACCAGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 T 10 9 372447 CASAVA_Build 17 14994690 3I3M2D TGGAGGTGTA ---ATAAG/GGCACA-- ACTGTAGCCT 3070 het 3070 hom 40 15 22 5 N/A 0 0 372448 CASAVA_Build 17 14999483 1I CTTTTAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 16 15 10 A 10 11 372449 CASAVA_Build 17 14999912 1I GCAAGACGTG -/T TTTTTTTTTT 1937 het 1937 ref 34 13 9 12 T 11 12 372450 CASAVA_Build 17 15001206 3I AGTTGTAGGA ---/CTC CTCAGTTCCC 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 CTC 1 2 372451 CASAVA_Build 17 15001528 1D TGGTGAAGGT C/- CACTGACAGT 3070 het 3070 hom 62 23 33 6 C 2 1 372452 CASAVA_Build 17 15001927 1I TTTAAAAGAT -/A ATTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 11 12 2 A 1 2 372453 CASAVA_Build 17 15005144 2D TAAGACTTAC AT/-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 AT 7 6 372454 CASAVA_Build 17 15010667 1I TTTTCATGGT -/A AAAAAAATGG 3070 het 3070 hom 34 11 20 3 A 7 8 372455 CASAVA_Build 17 15023164 1D ACCAAAAAAA C/- AACCACTTAG 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 C 1 0 372456 CASAVA_Build 17 15023260 4I GAGGCAGAAG ----/GCAA GCAAGCTGGG 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 GCAA 1 2 372457 CASAVA_Build 17 15030204 1D CCAGATTAAT A/- AAAACTTTGC 3070 hom 99 het 39 0 34 6 A 5 4 372458 CASAVA_Build 17 15033194 3I GAGCAAGGAG ---/GAA GAAGAAGATA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 GAA 2 3 372459 CASAVA_Build 17 15036034 1D CTTTACTCAA G/- TATAAACTGC 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 G 1 0 372460 CASAVA_Build 17 15036620 3D CCACCTTCTT CTC/--- ATTTCTCTTA 3070 het 3070 ref 40 22 16 2 CTC 1 0 372461 CASAVA_Build 17 15039879 4D AAAAATACAA AAAT/---- TAATTGGGTG 3070 het 2587 hom 20 8 11 3 AAAT 1 0 372462 CASAVA_Build 17 15040031 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 2433 het 420 hom 33 2 14 17 A 15 16 372463 CASAVA_Build 17 15060026 1D ATATACTAAT G/- TTTCTTTTCC 3070 hom 111 het 40 0 38 2 G 1 0 372464 CASAVA_Build 17 15062759 1I ACCATTTCCT -/A AAAAAATATC 3070 het 3070 ref 35 16 14 5 A 6 7 372465 CASAVA_Build 17 15063844 1I AATTAATTGG -/A AAAAATATTA 3070 het 3070 ref 38 16 16 6 A 5 6 372466 CASAVA_Build 17 15099552 1D AGAAAGTGTC T/- GCATCTCTGA 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 T 1 0 372467 CASAVA_Build 17 15113144 1D AGACACACAC A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 A 9 8 372468 CASAVA_Build 17 15118733 1I ACCATTAACA -/T TTTTCTTTGA 3070 hom 108 het 38 0 36 2 T 4 5 372469 CASAVA_Build 17 15123997 2I25M1I TGTGATGTTT --TCTCTGTTTGTCACCCAACATCTCC-/TCTCTCTGTTTGTCACCCAACATCTCCA AAAAAACCAT 3070 hom 129 het 41 0 44 7 N/A 0 0 372470 CASAVA_Build 17 15136506 2I32M4D CCGTGCTTCT --TACAGCCTTTAGAACTGTGAGCTACATAAATCTCTT/TCTACAGCCTTTAGAACTGTGAGCTACATAAATC---- TCTTTATCAA 3070 hom 135 het 35 0 41 10 N/A 0 0 372471 CASAVA_Build 17 15136690 1I AGCTAACACC -/T TCCTGGTCTA 3070 hom 156 het 57 0 52 5 T 1 2 372472 CASAVA_Build 17 15142494 4I CTTATGGCTA ----/CCAG GGTTGGTTTT 3070 hom 123 het 48 0 39 9 CCAG 0 1 372473 CASAVA_Build 17 15150601 2D CAGGAATAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 108 hom 33 2 12 19 A 14 12 372474 CASAVA_Build 17 15163261 1I ACAATGTAAC -/A AAACATCAAT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 A 3 4 372475 CASAVA_Build 17 15163495 1D TTAAAACAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 12 11 372476 CASAVA_Build 17 15167481 13D TTGGCTCCAA AGTCCAAGGAGTC/------------- AGTACGGTCT 3008 het 3008 ref 31 21 9 5 AGTCCAAGGAGTC 1 0 372477 CASAVA_Build 17 15168997 1I TTTGTATGTT -/G TGATTTGGAA 3070 het 3070 hom 47 21 24 2 G 0 1 372478 CASAVA_Build 17 15169710 1I GCCAAGTACC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 41 22 12 7 A 8 9 372479 CASAVA_Build 17 15177064 1I ATTGTAGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2970 hom 26 7 11 8 T 14 15 372480 CASAVA_Build 17 15179079 1I GCATCATAGG -/A CTCTGATCCT 3070 het 3070 hom 43 15 25 3 A 0 1 372481 CASAVA_Build 17 15179945 1D GAGCTCAGAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 9 8 372482 CASAVA_Build 17 15180604 1D TGCTAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 14 8 5 A 11 10 372483 CASAVA_Build 17 15181106 1I TTTGTTTCAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 2742 hom 23 7 14 2 A 8 9 372484 CASAVA_Build 17 15183964 2I TCATCTCTTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 10 12 372485 CASAVA_Build 17 15188138 8D ACTGGCTTTT TTTGTTTG/-------- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 45 15 18 17 TTTG 6 4 372486 CASAVA_Build 17 15191329 5D GTTGTTATAC TTTAT/----- TTTTTTATTT 3070 het 3070 hom 23 9 14 0 TTTAT 1 0 372487 CASAVA_Build 17 15196032 1D GTGTTCCCCA C/- CCCCATTTAT 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 C 5 4 372488 CASAVA_Build 17 15198522 1I CAATCGTGTG -/C CACCTCTCCA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 C 1 2 372489 CASAVA_Build 17 15198890 1I AGTTTTGAAC -/A GCTTCTTCTT 3070 hom 98 het 39 0 30 9 A 0 1 372490 CASAVA_Build 17 15205077 1I AAATAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2503 het 2503 ref 24 9 7 8 A 11 12 372491 CASAVA_Build 17 15209695 2D ATACTCAGAA TT/-- TTTTTTTTTT 1689 hom 16 het 15 0 6 9 T 20 18 372492 CASAVA_Build 17 15215715 2D TCCATTTGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2543 hom 39 14 15 11 T 13 11 372493 CASAVA_Build 17 15216688 1D TTACTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 16 0 13 3 T 11 10 372494 CASAVA_Build 17 15218495 1D TGTTGTCTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 T 10 9 372495 CASAVA_Build 17 15223290 1I AATTGAATTG -/A AAAAAACTTT 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 6 7 372496 CASAVA_Build 17 15239420 7D TACAGGGTGT GATAAAC/------- GATAAACATT 3070 hom 110 het 45 0 37 10 GATAAAC 2 1 372497 CASAVA_Build 17 15274516 1I TGCTCCCCCT -/A AAGTTTGACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 2 3 372498 CASAVA_Build 17 15284250 3I CCAACCCTAC ---/CTT CTTCTTTCTT 3070 hom 47 het 19 0 14 5 CTT 2 3 372499 CASAVA_Build 17 15293746 2D CCTCACCCTC CT/-- CTCATCCTCC 3070 het 3070 hom 37 13 22 2 CT 2 1 372500 CASAVA_Build 17 15306202 1I GGCGTGGTCG -/C TCACGCCTGT 3070 hom 45 het 18 0 15 3 C 0 1 372501 CASAVA_Build 17 15313791 5D TCCCTCAGTG TATCT/----- TGCTGGCCTC 3070 hom 108 het 43 0 30 13 TATCT 1 0 372502 CASAVA_Build 17 15337704 2D CTTTTCCTTC CT/-- CTCTCCCTCC 3041 hom 32 het 20 0 10 10 CT 3 2 372503 CASAVA_Build 17 15341628 1D CTATCATTCT A/- AAAAAAAAAA 1580 het 1580 ref 23 9 8 6 A 15 14 372504 CASAVA_Build 17 15345957 4I TCCACAATGG ----/GGCA GGCAGCCAGC 3070 het 3070 hom 62 16 34 12 GGCA 1 2 372505 CASAVA_Build 17 15346334 1I AATGGGGGGT -/G GGGGGGGCAC 3070 het 1868 hom 32 9 13 10 G 7 8 372506 CASAVA_Build 17 15348064 1I GGACACTCAG -/A AAAAAAGAGC 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 A 6 7 372507 CASAVA_Build 17 15348609 1I ATAAAGACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 2598 hom 27 7 14 6 T 9 10 372508 CASAVA_Build 17 15360575 2I GTCCTTCCTC --/TG TGTGTGTCTG 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 TG 3 4 372509 CASAVA_Build 17 15368751 4I CCCAGAGGGA ----/CCCC TGCACACAGT 1865 het 1865 ref 41 29 7 5 C 0 4 372510 CASAVA_Build 17 15370206 5D2M8D ATTGTTACAG CTTCAACTCTGCTCT/-----AC-------- ACAGAGATGC 3070 het 3070 ref 32 19 13 6 N/A 0 0 372511 CASAVA_Build 17 15376604 2I CTTATTGATC --/AT ACGGAAAGTC 1841 het 1841 ref 39 33 4 2 AT 0 1 372512 CASAVA_Build 17 15384839 1I ACAACTGCTC -/T TATGTGCCAG 3070 het 3070 ref 66 44 14 8 T 1 2 372513 CASAVA_Build 17 15392905 3I ACAGTAAGAG ---/ATT AATAAGAAAT 2356 het 2356 ref 27 19 5 3 ATT 0 1 372514 CASAVA_Build 17 15395723 1I TTGTGTGCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 T 10 11 372515 CASAVA_Build 17 15403056 11D GCAGAAATAG GGTCTCGTTAT/----------- GTTGCCCAGG 2194 hom 18 het 4 0 5 3 GGTCTCGTTAT 1 0 372516 CASAVA_Build 17 15415918 1D GACAAAAGAC A/- GCATGTCGTA 1341 het 1341 ref 42 35 3 4 A 1 0 372517 CASAVA_Build 17 15421608 2I AGTAACTTAG --/TC TCTATCACTT 3070 het 3070 hom 38 18 17 3 TC 1 2 372518 CASAVA_Build 17 15423871 4D TTCTCTCTTA TTTG/---- TTCTTAATTT 2877 het 2877 ref 32 25 6 2 TTTG 1 0 372519 CASAVA_Build 17 15424594 2I GTATATTCAT --/AA GTCTTTATAA 3070 het 3070 ref 27 19 7 1 A 0 2 372520 CASAVA_Build 17 15425090 2I TTATTGAGCC --/TT TTTACCTAAG 3070 het 3070 ref 43 33 9 1 T 3 5 372521 CASAVA_Build 17 15426664 4D TAGTTACCCC TTTA/---- TTTAACTTTT 2224 het 2224 ref 42 28 6 10 TTTA 2 1 372522 CASAVA_Build 17 15427036 1D AGCCTCTCTT G/- GTGAGGTGAA 3070 het 3070 ref 31 20 7 5 G 2 1 372523 CASAVA_Build 17 15428572 1I ATGTTTTAGG -/A AAAAATGAAA 2813 het 2813 ref 36 28 6 2 A 5 6 372524 CASAVA_Build 17 15440816 4D GAGCCCATCA AGTC/---- AGATTCTAGA 3070 hom 60 het 22 0 20 5 AGTC 1 0 372525 CASAVA_Build 17 15441815 3D GACAAAATAT AAC/--- AACAACCAGA 3070 hom 96 het 42 0 33 12 AAC 3 2 372526 CASAVA_Build 17 15444932 1I ACTAAAATAC -/A AAAAAAACAT 1339 het 122 hom 7 1 4 2 A 7 8 372527 CASAVA_Build 17 15462596 1D AGAGTGAATG A/- AAAAAAAAAA 2516 het 2515 ref 20 9 7 5 A 13 12 372528 CASAVA_Build 17 15463629 1D GAACGGGGGG A/- AATGAATAAA 1800 het 1800 ref 34 22 4 8 A 3 2 372529 CASAVA_Build 17 15468439 3I TGCCCAACTC ---/TCT TTTTTTTTTT 996 het 996 ref 24 6 7 11 TCT 0 1 372530 CASAVA_Build 17 15511926 1D TCAGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1035 het 1035 ref 39 20 4 15 T 12 11 372531 CASAVA_Build 17 15515355 4I ATAACTCATG ----/TATA AATAGATAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 TA 0 2 372532 CASAVA_Build 17 15523976 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1885 het 1616 hom 18 5 6 7 A 15 14 372533 CASAVA_Build 17 15524368 16I ATATTGAGTA ----------------/GGCCCTTAATAATAAG GGCCCTTAAT 3070 het 3070 ref 23 8 9 6 GGCCCTTAATAATAAG 1 2 372534 CASAVA_Build 17 15528890 2D CTTTTTTATA TC/-- TCTGTTAAAT 3070 het 2538 hom 23 6 9 8 TC 2 1 372535 CASAVA_Build 17 15535344 1D ACAAGAACTC T/- TGACAGGTAG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 T 2 1 372536 CASAVA_Build 17 15536219 3D4M4D TGTCATGAGG GTTTAAAGCAG/---TAAA---- CCATCATAAA 3070 het 3070 ref 46 33 11 2 N/A 0 0 372537 CASAVA_Build 17 15540385 1D TTTTTTTTTT C/- ACGTCGATAC 3070 het 2177 hom 27 6 15 6 C 1 0 372538 CASAVA_Build 17 15541534 1I ACACTGAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 11 9 5 T 10 11 372539 CASAVA_Build 17 15552069 4D AATTAAAAAA AAAG/---- AAAGAAAGTT 2914 het 2458 hom 17 6 10 1 AAAG 3 2 372540 CASAVA_Build 17 15553840 1D GAACAGTTTA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 20 11 9 0 T 8 7 372541 CASAVA_Build 17 15554328 1D AATAACAAAC T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 32 14 17 2 T 9 8 372542 CASAVA_Build 17 15558221 1D TAAAACTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 157 hom 22 1 17 4 T 15 14 372543 CASAVA_Build 17 15561725 3D TTACATCCTT ATC/--- ATCAGGAAGA 3070 hom 69 het 25 0 24 2 ATC 2 1 372544 CASAVA_Build 17 15572705 2D CATTTTACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 84 het 39 0 26 15 AC 9 8 372545 CASAVA_Build 17 15579776 1I ATGGGTTTTG -/T TTTTTAGAAA 2121 het 917 hom 15 3 7 5 T 5 6 372546 CASAVA_Build 17 15585628 1D CCCTACAGAT G/- GGCCAACAAA 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 G 3 2 372547 CASAVA_Build 17 15595309 1D TTTTGTTATC T/- GTTTTTTAGC 3070 het 3070 hom 18 8 7 4 T 1 0 372548 CASAVA_Build 17 15598864 1I ACATCCCCCC -/A ACCATGCCAC 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 1 2 372549 CASAVA_Build 17 15599867 3D CACAGGGTAT ATC/--- ATCAAATGAT 3070 hom 32 het 12 0 11 2 ATC 2 1 372550 CASAVA_Build 17 15600176 2D CAAAAAGTCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 20 1 12 7 T 13 11 372551 CASAVA_Build 17 15608576 1D CCTGAGTAGG T/- CTTATGGAAG 3070 het 3070 ref 36 21 13 2 T 1 0 372552 CASAVA_Build 17 15611459 1D GGGAACAAAC A/- TTTAACTAGT 3070 hom 138 het 53 0 46 7 A 1 0 372553 CASAVA_Build 17 15619774 1D TATGAGATCT G/- GTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 43 18 17 8 G 2 1 372554 CASAVA_Build 17 15623515 1D AGAAAATGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2487 hom 21 7 10 4 T 12 11 372555 CASAVA_Build 17 15630936 1D GCTGGGGACA C/- CCCCGCGGCG 3070 hom 30 het 18 0 10 8 C 5 4 372556 CASAVA_Build 17 15643862 1I TAGCCGATGG -/C AGTGGCGGGC 1256 hom 10 het 4 0 4 0 C 0 1 372557 CASAVA_Build 17 15668531 1I TATGCATCCA -/C CCCAACAAAT 3070 het 3070 ref 47 33 12 2 C 3 4 372558 CASAVA_Build 17 15676669 8I CCCCGAGACA --------/CATGGATC CAGCCCTAGA 1873 het 1873 ref 30 19 4 7 CATGGATC 0 1 372559 CASAVA_Build 17 15694783 2I TTTATACATA --/TG TGTGTGTGTG 1064 het 489 hom 11 2 3 6 TG 8 9 372560 CASAVA_Build 17 15768891 4D CAAATGTTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2482 het 2482 ref 27 12 8 7 TTTC 5 4 372561 CASAVA_Build 17 15792237 1D GAGACCACAG C/- CCCCACCTGC 3070 hom 59 het 25 0 14 11 C 5 4 372562 CASAVA_Build 17 15796587 1D CCCGAGGTCA C/- CCCCAAACAC 3070 hom 108 het 41 0 36 5 C 5 4 372563 CASAVA_Build 17 15804311 1D GGCACAAATT G/- GGCCGGGCGC 2814 hom 18 het 10 0 7 3 G 3 2 372564 CASAVA_Build 17 15805204 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 13 het 22 1 18 3 A 13 12 372565 CASAVA_Build 17 15811334 4D GTGGTGCAAT CTCA/---- CTCAGTTCAC 1489 het 1489 ref 14 6 5 3 CTCA 2 1 372566 CASAVA_Build 17 15821575 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAAAT 1829 het 1829 ref 13 7 6 0 A 10 9 372567 CASAVA_Build 17 15821748 1I ATCTCAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2938 het 2399 hom 19 7 10 2 A 11 12 372568 CASAVA_Build 17 15830119 2I AGTTCTGCTC --/TT GTCACTCAGG 3070 het 2224 hom 20 7 9 4 T 0 2 372569 CASAVA_Build 17 15834287 1D GCAATAAACC A/- AAATTTAAGA 1466 het 1466 ref 22 13 5 4 A 4 3 372570 CASAVA_Build 17 15861894 1I AATTCCTTTG -/T TTTTCAGTTC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 T 4 5 372571 CASAVA_Build 17 15862295 1I CTTAGTCCCT -/G GGTGAACCTT 3070 het 3070 hom 41 22 19 0 G 2 3 372572 CASAVA_Build 17 15863633 2D AAGTTGAACC TG/-- TTTTTTCTGT 3070 het 3070 hom 51 21 28 2 TG 1 0 372573 CASAVA_Build 17 15866127 6I CTTTTCCTGG ------/GGTTGT GGTTGTGGTC 3070 het 3070 hom 47 16 21 10 GGTTGT 1 2 372574 CASAVA_Build 17 15868327 9D TTACCTTAAA TTCTTTTTT/--------- TTCTTTTTTT 3070 het 56 hom 18 1 12 5 TTCTTTTTT 2 1 372575 CASAVA_Build 17 15870193 1I AACAACATAA -/T TACAGTGGGG 3070 het 3070 hom 39 17 18 4 T 1 2 372576 CASAVA_Build 17 15877692 5I AATATCCCAG -----/TTTTA TTTTAAAAGT 3070 het 3070 hom 32 10 17 5 TTTTA 1 2 372577 CASAVA_Build 17 15882475 1D TTTCCTACTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 14 19 3 T 11 10 372578 CASAVA_Build 17 15886200 4I TTAAACTGAC ----/AAAG AGAGGAGAAA 3070 het 3070 ref 49 23 20 6 AAAG 0 1 372579 CASAVA_Build 17 15886339 4I GGAACAGGAG ----/TCAT TCATTCATTT 3070 het 3070 hom 58 25 30 3 TCAT 2 3 372580 CASAVA_Build 17 15891734 1D TAACACATTT A/- AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 35 14 12 10 A 9 8 372581 CASAVA_Build 17 15894774 1I TTAAACATGT -/A TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 A 0 1 372582 CASAVA_Build 17 15900138 3D GACCATTTAG CTT/--- CTTATTTATA 3070 het 3070 hom 32 13 16 4 CTT 2 1 372583 CASAVA_Build 17 15906422 4D GAAAAAAGAA AAAC/---- AAGATAAGAA 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 AAAC 1 0 372584 CASAVA_Build 17 15922620 1D AAATGGAGAC T/- TTTTTTTTTT 2566 het 1683 hom 23 11 10 2 T 13 12 372585 CASAVA_Build 17 15927396 1D GACTTTGTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 8 6 A 12 11 372586 CASAVA_Build 17 15935590 4I GACAACAATT ----/CTCA CTCACTCTGA 3070 het 3070 ref 44 21 17 6 CTCA 1 2 372587 CASAVA_Build 17 15950477 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 40 20 15 5 A 9 10 372588 CASAVA_Build 17 15960758 3I GGTATAGAGC ---/AGA AGAACTTTAT 3070 het 3070 hom 29 10 17 2 AGA 1 2 372589 CASAVA_Build 17 15987905 3D TGTCACCTAT TAA/--- TAACAATTTA 3070 het 3070 ref 28 13 13 2 TAA 2 1 372590 CASAVA_Build 17 15995249 1I ATTTTTTTTT -/A TAAAAAAAAG 3008 het 3008 ref 22 11 10 1 A 0 1 372591 CASAVA_Build 17 16003126 1D GATAGAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 A 11 10 372592 CASAVA_Build 17 16006128 2D CAATGAAAGC AA/-- AAAAAAAATT 1386 het 1386 ref 37 26 3 8 A 10 8 372593 CASAVA_Build 17 16008283 1I CCAAATCTGG -/A AAAAAAAAAA 1201 het 1201 ref 28 12 5 11 A 15 16 372594 CASAVA_Build 17 16009509 4D CAATCATGAC AAAG/---- GAAGATACCA 3070 het 3070 ref 65 39 20 6 AAAG 1 0 372595 CASAVA_Build 17 16012118 1I AATAAAAAAA -/T GTTAAGTTTT 2786 het 2786 ref 41 31 7 4 T 0 1 372596 CASAVA_Build 17 16013203 1I AAGCAAAAGT -/A AAGTTAAACA 3070 het 3070 ref 43 28 9 7 A 2 3 372597 CASAVA_Build 17 16013491 1D TAACATTTAA C/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 ref 50 34 11 5 C 1 0 372598 CASAVA_Build 17 16013679 1D AGGAGTTACT A/- ACCTAGGTCA 3070 het 3070 ref 45 19 14 14 A 2 1 372599 CASAVA_Build 17 16014256 1I TTCATTGCAT -/G AAAACTCAAA 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 G 0 1 372600 CASAVA_Build 17 16019874 1D TGTCTCTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 877 hom 28 6 17 5 A 17 16 372601 CASAVA_Build 17 16023001 1D AAAAAAGTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1360 hom 16 3 10 3 T 10 9 372602 CASAVA_Build 17 16025430 2D ATGGAATATT AA/-- AAAAAAAAAA 2522 het 694 hom 42 7 6 30 A 13 11 372603 CASAVA_Build 17 16025711 4I GTATCCCATA ----/ACAC ACACCATGTA 2836 het 2836 ref 33 17 7 9 AC 2 4 372604 CASAVA_Build 17 16033203 1I GAGGCCAAGG -/T TGGGAGGGTT 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 T 1 2 372605 CASAVA_Build 17 16035630 2I TAATGGATTT --/AA AAAAAAAATA 3070 het 3070 hom 41 18 20 3 A 8 10 372606 CASAVA_Build 17 16037669 1D AAATTCAACA C/- CCAATCATGA 3070 het 3070 ref 67 34 27 6 C 3 2 372607 CASAVA_Build 17 16038328 3I AAGCCACAGT ---/AAG AAGACAGAAA 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 AAG 1 2 372608 CASAVA_Build 17 16039941 4I ATAATTAATA ----/TGGG TGTATTTTAC 1787 het 1787 ref 39 31 4 4 TGGG 0 1 372609 CASAVA_Build 17 16047452 3I GGTCTTTGTC ---/CTT CTTTACTCTC 3026 het 3026 ref 48 29 9 10 CTT 1 2 372610 CASAVA_Build 17 16053298 1D37M3D GTTTGGAAGA GTAAGGGAGGAAAGGAGTATTCCAGAAACAAGCATAGTAAC/-TAAGGGAGGAAAGGAGTATTCCAGAAACAAGCATAGT--- AAGAAAAAAA 3070 het 3070 ref 62 59 17 26 N/A 0 0 372611 CASAVA_Build 17 16055303 1D TTTTTATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 7 10 7 T 11 10 372612 CASAVA_Build 17 16075468 2D TTGTGAAAAC AG/-- GGTCTCACTA 3070 het 2807 hom 28 8 15 6 AG 1 0 372613 CASAVA_Build 17 16101456 1I AACTCCATCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 A 9 10 372614 CASAVA_Build 17 16103398 1I AAGACAATTC -/A ATGGGGAAAG 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 1 2 372615 CASAVA_Build 17 16107133 1D TGGTTTATTT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 44 het 17 0 13 5 G 11 10 372616 CASAVA_Build 17 16108246 5I GAGATGGGGT -----/TTCAC CATGTTGGCC 2366 het 2366 ref 15 9 5 1 TTCAC 0 1 372617 CASAVA_Build 17 16112413 2D CCTCTTCCTC TT/-- TTAAGTGAAA 3070 het 3070 ref 56 25 22 9 T 4 2 372618 CASAVA_Build 17 16113799 1I AGAACCTGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 19 16 7 T 11 12 372619 CASAVA_Build 17 16114930 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1142 hom 19 4 12 4 A 13 12 372620 CASAVA_Build 17 16117664 3I GGAAATTGAG ---/AGA AGGAGATAGT 3070 het 3070 ref 46 25 17 4 AGA 0 1 372621 CASAVA_Build 17 16121582 1D CAGTCTTCTG T/- TAGGTCAATC 3070 het 3070 ref 25 12 10 4 T 2 1 372622 CASAVA_Build 17 16136436 1D CTTTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 12 14 14 A 13 12 372623 CASAVA_Build 17 16146844 1I TCACCATGTT -/G GCCAGGATGG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 G 1 2 372624 CASAVA_Build 17 16147753 1D CATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 994 het 346 hom 5 1 4 0 T 11 10 372625 CASAVA_Build 17 16153802 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 A 11 10 372626 CASAVA_Build 17 16161997 1I CTGCCCCAGA -/C CCCCTGTCTC 3070 hom 102 het 37 0 35 2 C 4 5 372627 CASAVA_Build 17 16177943 1D CAGGACTACA G/- GGGTGTGCCA 2899 het 2899 ref 27 15 7 6 G 4 3 372628 CASAVA_Build 17 16179272 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2321 het 2321 ref 23 9 8 6 A 13 12 372629 CASAVA_Build 17 16182283 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 827 hom 28 7 14 7 A 17 16 372630 CASAVA_Build 17 16191560 1I TCTTTCTCTC -/T TTTTTTTTTA 1936 het 1936 ref 27 16 6 5 T 9 10 372631 CASAVA_Build 17 16191742 2D GCAATGATGC AG/-- AGACAGTGAT 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 AG 2 1 372632 CASAVA_Build 17 16192232 2I AGTTTCACTC --/TT GTCACCCAGG 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 0 2 372633 CASAVA_Build 17 16192890 6D GCCTCTGGTT TGCAGG/------ TACAGCAGAG 3070 het 3070 ref 47 25 16 8 TGCAGG 1 0 372634 CASAVA_Build 17 16203674 1I GGGGACAGAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 33 0 26 7 T 8 9 372635 CASAVA_Build 17 16227463 5D TTGAATAGTG GTAAC/----- GTAACTGCTT 3070 het 3070 ref 46 25 16 8 GTAAC 2 1 372636 CASAVA_Build 17 16233949 1D TTGATCACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 693 hom 25 5 11 9 T 15 14 372637 CASAVA_Build 17 16234301 2D AATACTGCAT AA/-- GAGAGAGTAT 3070 het 2344 hom 22 7 13 3 A 2 0 372638 CASAVA_Build 17 16242232 2D GCCTTAAGAC AT/-- ACCACAAAGT 2736 het 1204 hom 11 4 7 1 AT 1 0 372639 CASAVA_Build 17 16264334 4D TGTGAGCTGA TAGT/---- TAGGTGGGCT 3070 hom 86 het 36 0 25 11 TAGT 1 0 372640 CASAVA_Build 17 16277978 1D CTCCTGGTGA T/- CTCAGACTCC 3070 het 3070 ref 46 22 14 10 T 1 0 372641 CASAVA_Build 17 16285040 2I CATTAATTGA --/CT CTGTCATCAG 3070 hom 51 het 20 0 18 2 CT 1 2 372642 CASAVA_Build 17 16285616 1D TTTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 1604 het 1604 ref 45 24 7 14 T 17 16 372643 CASAVA_Build 17 16285959 1D GTTGGTGGGC A/- AAGTTCTTTA 3070 hom 123 het 43 0 42 2 A 3 2 372644 CASAVA_Build 17 16291379 1I AGGGAGTGCT -/C TGTTGCTCAG 3070 hom 99 het 36 0 34 2 C 0 1 372645 CASAVA_Build 17 16295975 1D TAGTAGAGAC G/- GGGGGTCTCA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 6 5 372646 CASAVA_Build 17 16299396 1D30M1I TAATGAGTGA GGGAAAAGTACCACACAGTTCTGCCCTACAA-/-GGAAAAGTACCACACAGTTCTGCCCTACAAT TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 4 N/A 0 0 372647 CASAVA_Build 17 16300517 3D GGAGAAAGAA GAG/--- GAGGAGGAAG 3070 hom 110 het 43 0 31 13 GAG 3 2 372648 CASAVA_Build 17 16301163 7D GGCAGTGATA CCATCTG/------- CCATCTTCAC 3070 hom 131 het 48 0 43 7 CCATCTG 1 0 372649 CASAVA_Build 17 16301846 1D TCTCTACAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 27 0 20 8 A 11 10 372650 CASAVA_Build 17 16308869 1I CACAGCCCTG -/C CCTCCCTGAG 3070 hom 84 het 33 0 27 6 C 2 3 372651 CASAVA_Build 17 16336864 2I ACCTGGAAAC --/TG TGTGCGAGCT 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 TG 2 3 372652 CASAVA_Build 17 16345689 2I CACTCACACG --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 40 13 13 14 CA 7 8 372653 CASAVA_Build 17 16361146 1D TGTGTCTGTC T/- TTTTTTGTTC 3070 het 3070 hom 43 18 19 6 T 7 6 372654 CASAVA_Build 17 16367228 1I GATTAATTAA -/T TTTTTTTTTT 1802 het 1474 hom 25 5 8 12 T 15 16 372655 CASAVA_Build 17 16429548 1D CACCACGCCC G/- GGCGAGTTGC 3070 hom 26 het 14 0 12 2 G 3 2 372656 CASAVA_Build 17 16475033 4D CAATACTCAA TACC/---- TACCTATAGG 3070 hom 72 het 28 0 25 5 TACC 2 1 372657 CASAVA_Build 17 16536528 1I GAACCTCTGG -/A AAAAATACAC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 5 6 372658 CASAVA_Build 17 16545033 1D TATTCAATCA T/- TTTTGTGAAT 3070 het 3070 ref 23 10 9 4 T 5 4 372659 CASAVA_Build 17 16547034 2D CAGCAAATCA TG/-- TGTGTGTGTG 2371 het 2371 ref 38 31 5 3 TG 6 5 372660 CASAVA_Build 17 16550885 5I TAGAAAAATC -----/ATTAA AGTTCTAGGG 2379 het 2379 ref 32 23 5 4 ATTAA 0 1 372661 CASAVA_Build 17 16555134 3I ACTTGTATTT ---/CAG CAGTAAGCAC 1443 het 1443 ref 19 6 3 10 CAG 1 2 372662 CASAVA_Build 17 16569194 1D TTTAAAGTGC T/- TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 30 19 8 3 T 8 7 372663 CASAVA_Build 17 16573896 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2266 het 1626 hom 10 4 5 2 A 12 11 372664 CASAVA_Build 17 16578181 1D CCCTATCTCG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 355 hom 24 2 8 14 A 17 16 372665 CASAVA_Build 17 16585661 1D TATTGATGTA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 T 9 8 372666 CASAVA_Build 17 16588518 2D GCATTTTTTC AT/-- ATGTTTGCTC 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 AT 2 1 372667 CASAVA_Build 17 16590384 3I TTCTAACTCT ---/CTC CTCCTCCGTT 2837 het 2837 ref 24 13 7 4 CTC 2 3 372668 CASAVA_Build 17 16599598 4D CTTTTTCAGT TTTA/---- TTTATTTATT 1686 het 1686 ref 47 37 4 8 TTTA 4 3 372669 CASAVA_Build 17 16602246 2D CACTTGAAAA AC/-- ACACTAATTT 3070 het 3070 ref 52 33 15 4 AC 3 2 372670 CASAVA_Build 17 16604672 1I ATTGGAATCC -/T TTTTTTTTTT 1886 het 1886 ref 14 7 6 1 T 12 13 372671 CASAVA_Build 17 16606971 5I AAAATACTAA -----/TGAAT TTAATTAATT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 TGAAT 0 1 372672 CASAVA_Build 17 16624843 1D ACACGTTTAT A/- AGCAGCAAAA 3070 het 3070 hom 35 12 20 5 A 2 1 372673 CASAVA_Build 17 16630463 1D TTCTCCACAA C/- CTTGCCAGCT 3070 het 3070 ref 69 55 10 4 C 2 1 372674 CASAVA_Build 17 16637796 1D CCTGTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 20 7 3 T 11 10 372675 CASAVA_Build 17 16645205 4I GTTAGAAACA ----/GAAT ATCAACAGAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 GAAT 0 1 372676 CASAVA_Build 17 16647598 1I TGTCCACTAA -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 40 24 14 2 T 7 8 372677 CASAVA_Build 17 16665304 2D GAATAAGAAG AT/-- ATATTGGCCC 3070 het 2981 hom 35 7 24 4 AT 3 2 372678 CASAVA_Build 17 16680883 1D AGCATGAGGC A/- GGAGATCATA 3070 het 3070 hom 36 15 15 6 A 1 0 372679 CASAVA_Build 17 16683881 2D TGGTCAGCTC AT/-- AGAGGGTGCC 3070 het 3070 ref 37 16 16 5 AT 1 0 372680 CASAVA_Build 17 16706527 1D TCAGGTTTAG T/- TCTCAGACAG 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 2 1 372681 CASAVA_Build 17 16712143 1D AGCAGCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 T 11 10 372682 CASAVA_Build 17 16716853 1D CGGGCTCCAG A/- ACCTACTTTT 3070 het 3070 ref 35 18 11 7 A 2 1 372683 CASAVA_Build 17 16735156 1I TCTTCTTCAC -/A AATAGACACA 3070 het 3070 ref 70 46 15 9 A 2 3 372684 CASAVA_Build 17 16738733 2I TACATACGCT --/AA GAGTTATTTA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 A 0 2 372685 CASAVA_Build 17 16739911 1D TAAACCAACG T/- TTTTTTTTTT 1728 het 1728 ref 17 7 6 4 T 13 12 372686 CASAVA_Build 17 16743961 1I GGTAAGTTGG -/T TTTTTAAATG 3070 het 3070 hom 24 9 13 2 T 5 6 372687 CASAVA_Build 17 16750127 1D CATTTTTTCA T/- ACGTTTGTTG 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 1 0 372688 CASAVA_Build 17 16760266 18D CATGGGGCTG CCCAAGTATCTGCTCCTC/------------------ CCCAAGTATC 3070 hom 78 het 30 0 25 7 CCCAAGTATCTGCTCCTC 2 1 372689 CASAVA_Build 17 16761117 24D ACCCGGACTG CAGTGCAGTGGTGCAGTTGTAGCT/------------------------ CAGTGCAGTG 3070 het 3070 hom 27 12 13 9 CAGTGCAGTGGTGCAGTTGTAGCT 2 1 372690 CASAVA_Build 17 16762123 1I CATAGCATTT -/G TCCAGACCCA 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 G 0 1 372691 CASAVA_Build 17 16781035 1I CTGTGGCTAC -/T TTAGGGCTGC 2310 het 2310 ref 26 12 7 7 T 2 3 372692 CASAVA_Build 17 16783498 3D CTCTCTCTCC TCA/--- TATCTCTCTC 3070 het 970 hom 15 3 10 3 TCA 1 0 372693 CASAVA_Build 17 16790941 1D CTTTTTACAA T/- TTTTTTTCCC 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 T 8 7 372694 CASAVA_Build 17 16793105 2D CATCAAAGTT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 14 6 A 11 9 372695 CASAVA_Build 17 16797814 1I ATGTTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 T 10 11 372696 CASAVA_Build 17 16800440 3I TTACAGGAAA ---/CCC TACAGACTAT 3070 het 3070 hom 48 21 22 5 C 0 3 372697 CASAVA_Build 17 16801134 1I GAGGCTGTGC -/G GGGGGGATGT 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 G 6 7 372698 CASAVA_Build 17 16802452 1D CTCTGCTAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 8 12 5 A 11 10 372699 CASAVA_Build 17 16814499 1D CTCTGTGGTC G/- GATTAGTTTG 3070 het 3070 ref 29 15 10 4 G 2 1 372700 CASAVA_Build 17 16815401 2I23M1I AAACAAAAAC --AAAAACAAAACAACAAAACAAAA-/AAAAAAACAAAACAACAAAACAAAAC AAAAAGAAAG 3070 hom 31 het 15 0 11 4 N/A 0 0 372701 CASAVA_Build 17 16820022 1D CCTCCATACC T/- TTTTTTTTTT 2558 het 252 hom 36 5 13 18 T 16 15 372702 CASAVA_Build 17 16820959 1D GTGTGTCCAC A/- AGGCACCTCC 3070 hom 87 het 32 0 30 2 A 2 1 372703 CASAVA_Build 17 16821675 1I TTCCCCTTTG -/A AAAAAAAATA 3070 het 295 hom 43 1 38 4 A 8 9 372704 CASAVA_Build 17 16821825 3I TCCCCCAACT ---/CCC CCCTATTCTA 3070 het 3070 hom 41 17 20 4 C 3 6 372705 CASAVA_Build 17 16823773 1D AAAAAAAAAA T/- AGATAAAAAA 3070 het 106 hom 18 2 11 5 T 1 0 372706 CASAVA_Build 17 16826505 1I TGACAAAAAC -/A AAAAAGCAAT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 5 6 372707 CASAVA_Build 17 16828980 3I TCTGGGCCTC ---/CTT CTGGGCTTCA 3070 het 3070 ref 50 25 19 6 CTT 0 1 372708 CASAVA_Build 17 16836039 2D GTCACTGACT AC/-- ACACACTCTC 3070 het 3070 hom 43 17 24 2 AC 4 3 372709 CASAVA_Build 17 16839330 1I TGCAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 11 4 A 10 11 372710 CASAVA_Build 17 16859581 1D CCCTGATTTG T/- TATGGCAGTG 3070 het 3070 ref 38 23 13 3 T 2 1 372711 CASAVA_Build 17 16862671 1I TGTTGTTGGA -/G GGATGGTGAG 3070 hom 71 het 31 0 20 11 G 2 3 372712 CASAVA_Build 17 16870492 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 13 12 372713 CASAVA_Build 17 16872048 1D TTATAACATG T/- TTTTTTTTTT 1345 het 1345 ref 37 28 3 6 T 11 10 372714 CASAVA_Build 17 16873659 1I GGGGATAGGT -/G GGGTGGTAGT 3070 het 3070 ref 38 16 12 10 G 3 4 372715 CASAVA_Build 17 16900656 1I TTTTGAGGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 11 16 10 T 10 11 372716 CASAVA_Build 17 16948077 1I TTCCTCAGGA -/G TAAAACTAAG 3070 het 3070 ref 50 24 20 6 G 0 1 372717 CASAVA_Build 17 16958469 1D CTAGTTTATC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 41 19 14 9 T 10 9 372718 CASAVA_Build 17 16958743 1D TTCCCATCTA C/- CCCCCGCCCA 3070 hom 60 het 25 0 16 10 C 6 5 372719 CASAVA_Build 17 16965538 2I GAGAGGACAC --/AG GGGAAGAGTT 3070 het 3070 hom 55 18 29 8 AG 0 1 372720 CASAVA_Build 17 16979329 2I CCCTCGGAGC --/AA TACCACTTCC 3070 het 3070 hom 51 18 25 8 A 0 2 372721 CASAVA_Build 17 16997684 1I TAGGGCTTGT -/C CTAGGTGCTC 3070 hom 69 het 27 0 18 9 C 1 2 372722 CASAVA_Build 17 16998110 7D ACTGAGAGAA GATACCG/------- GATTTACCAT 3070 het 3070 hom 52 19 23 13 GATACCG 1 0 372723 CASAVA_Build 17 17005501 1I TGAGCAGGGG -/C TGTCTCCCAG 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 C 0 1 372724 CASAVA_Build 17 17037425 4D TTACAGTGGA TTTT/---- TTTTTTTTTT 2823 het 1908 hom 19 6 7 7 T 14 10 372725 CASAVA_Build 17 17044954 1D GCCCCCCCCC G/- CAAAATTATA 2953 het 1902 hom 18 6 9 4 G 1 0 372726 CASAVA_Build 17 17047623 4D AGGAAGGGCC CTAA/---- CTAACAACGC 3070 het 3070 hom 34 14 15 7 CTAA 2 1 372727 CASAVA_Build 17 17053432 4D TAGTTATTAG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 2146 hom 19 6 8 5 TTTA 5 4 372728 CASAVA_Build 17 17066079 1I GATTTGCTTT -/A AAAAAAAAAA 823 het 328 hom 18 1 4 13 A 15 16 372729 CASAVA_Build 17 17073544 2D CCTCAAAGCC AT/-- AGAGACAGAG 3070 het 3070 hom 37 13 17 8 AT 1 0 372730 CASAVA_Build 17 17082776 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2126 het 997 hom 18 6 9 3 A 17 16 372731 CASAVA_Build 17 17088803 4I CAGCTCACAG ----/TAGT TACTTTTCAC 3070 het 3070 hom 36 11 23 3 TAGT 0 1 372732 CASAVA_Build 17 17120484 2I AGAAATGCAC --/AT GTTACTATTA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 AT 0 1 372733 CASAVA_Build 17 17125906 4I CACCACACAC ----/AAAA AGAAAGTGAA 3070 het 3070 ref 53 27 23 3 A 1 5 372734 CASAVA_Build 17 17127571 1I TTATGCAAGC -/A GGTGGCAGGA 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 A 0 1 372735 CASAVA_Build 17 17129054 1D ATTCAAAACA G/- CTAAATTCCA 3070 het 3070 ref 31 19 10 2 G 1 0 372736 CASAVA_Build 17 17135215 1D ATTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 1436 het 1436 ref 22 10 4 8 T 12 11 372737 CASAVA_Build 17 17155378 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2012 het 2012 ref 22 7 6 9 A 13 14 372738 CASAVA_Build 17 17166729 5I TGTGGGCATG -----/AGGGC AGGGCGCAGG 1864 het 1864 ref 29 17 5 7 AGGGC 1 2 372739 CASAVA_Build 17 17175329 2I GGCCCATACC --/GT GTGTTTATTT 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 GT 2 3 372740 CASAVA_Build 17 17179709 4D TCTTGCTCTG TCAC/---- TCAGGCTGGA 2734 het 2076 hom 13 6 6 1 TCAC 1 0 372741 CASAVA_Build 17 17189674 1D CTGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2043 het 400 hom 30 5 9 17 A 17 16 372742 CASAVA_Build 17 17199676 1D TTTGCACCTG C/- CGCTCACCTG 1938 het 1938 ref 19 9 7 4 C 2 1 372743 CASAVA_Build 17 17201310 3I ACGTCATGAA ---/TCC TCCTGGTGAG 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 TCC 1 2 372744 CASAVA_Build 17 17205017 1D CAGGCACGCA C/- CACAATGCCT 3070 het 1909 hom 12 4 8 1 C 2 1 372745 CASAVA_Build 17 17225638 1I AGCTGCTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 17 7 T 10 11 372746 CASAVA_Build 17 17239767 1D AAAAAAATTA G/- GGGGGTGTGG 3070 hom 28 het 17 0 12 5 G 6 5 372747 CASAVA_Build 17 17252415 4D AAAGAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 37 18 13 7 AAAG 5 4 372748 CASAVA_Build 17 17253906 1D GCTTCTGAGG C/- CCCCTGAGCT 3070 het 3070 ref 33 21 10 2 C 5 4 372749 CASAVA_Build 17 17278431 1I CTCTTTTTTT -/C CCATACCCCT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 C 2 3 372750 CASAVA_Build 17 17284110 1D AACATAGTAC A/- AAACACGACT 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 4 3 372751 CASAVA_Build 17 17301461 3D AACTTCCCCA GGG/--- GGGGCTGGGC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 7 4 372752 CASAVA_Build 17 17317034 1I AGGGTTTTTG -/A AAAAAAAAAA 1007 het 1007 ref 45 34 3 8 A 13 14 372753 CASAVA_Build 17 17330098 1I ATCAGTACAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 42 hom 31 1 24 6 T 10 11 372754 CASAVA_Build 17 17341361 1I CCACAGCGAG -/C CCAGGAAGGC 3070 hom 78 het 31 0 27 4 C 2 3 372755 CASAVA_Build 17 17341765 3I CCAGCTGTCA ---/GGT GGTGGTGGTC 3070 hom 110 het 44 0 30 14 GGT 3 4 372756 CASAVA_Build 17 17344727 6D TCTTTTTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 2145 het 307 hom 19 2 9 8 T 20 14 372757 CASAVA_Build 17 17351772 1I ACACCTGGAA -/G GCCCATCTCC 3070 hom 45 het 21 0 14 7 G 1 2 372758 CASAVA_Build 17 17370037 4D TGTATCAAAC AACA/---- AACAAACAAA 3070 het 3070 ref 42 23 17 4 AACA 5 4 372759 CASAVA_Build 17 17382603 1D CCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 12 15 4 A 10 9 372760 CASAVA_Build 17 17386277 1D GCCTCAGCCT C/- CCAAAGAGCT 3070 het 780 hom 21 4 10 7 C 3 2 372761 CASAVA_Build 17 17408413 1I TGTTTCCAAG -/C CCCTCTTCCC 2776 het 2285 hom 24 10 7 7 C 3 4 372762 CASAVA_Build 17 17446883 1I TATACAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 T 11 12 372763 CASAVA_Build 17 17451268 2D CAATGGAAAC AG/-- AGAGGAGGGG 3070 het 3070 ref 38 19 13 8 AG 3 2 372764 CASAVA_Build 17 17454604 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 T 9 8 372765 CASAVA_Build 17 17457554 2I CCAATGAGGA --/CT GTTTCCCTTG 2671 het 2671 ref 30 12 10 8 CT 0 1 372766 CASAVA_Build 17 17463356 1D CCAGTTATAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2853 hom 19 7 10 2 A 10 9 372767 CASAVA_Build 17 17518663 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 1301 het 1301 ref 21 14 4 3 A 14 13 372768 CASAVA_Build 17 17570765 1D CACAGAAAAG C/- TGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 13 5 C 1 0 372769 CASAVA_Build 17 17600695 1I TTCCGCAAAT -/A CCTTGAGCGC 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 0 1 372770 CASAVA_Build 17 17605290 1D CTTCTAAGGC T/- TTTTTTTTTT 1594 het 1594 ref 29 10 8 11 T 15 14 372771 CASAVA_Build 17 17607091 1I GCTTTTCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2695 hom 32 11 16 5 A 15 16 372772 CASAVA_Build 17 17619574 15I CCAGTCAATT ---------------/AACACACATTTTGTA AACACACATT 3070 het 3070 ref 27 12 9 7 AACACACATTTTGTA 0 1 372773 CASAVA_Build 17 17621642 1D CTGCAGTCAT G/- GGGATGGGGG 3070 hom 73 het 36 0 23 13 G 4 3 372774 CASAVA_Build 17 17622145 2D TGCAGAACCC CT/-- GTCCCACCTG 2764 het 2764 ref 40 21 10 10 CT 1 0 372775 CASAVA_Build 17 17627067 1I CGGCTGACTT -/C CGAGGGCGGC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 C 1 2 372776 CASAVA_Build 17 17662705 1I CCCTCACCAT -/C CCTCTTCCTG 3070 het 3070 hom 57 20 20 17 C 2 3 372777 CASAVA_Build 17 17682223 4I CCTATCTGGC ----/CACG CACGCCCTAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 CACG 1 2 372778 CASAVA_Build 17 17696157 2D AAAATGCCAG CT/-- CTGTCTATAG 3070 het 3070 hom 29 10 15 4 CT 2 1 372779 CASAVA_Build 17 17702266 2I TTTTCCTACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 2912 hom 25 8 12 5 T 10 12 372780 CASAVA_Build 17 17723447 1I TATAATCAGG -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 7 8 372781 CASAVA_Build 17 17770300 1D ACATACAGAC T/- TAAGGATAAA 3070 het 3070 hom 27 8 12 7 T 2 1 372782 CASAVA_Build 17 17772196 1I TTTCTGTAAC -/A AACAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 15 5 A 2 3 372783 CASAVA_Build 17 17782806 1I GTTGAAAGGG -/T TTTTTTTTTT 2932 het 1757 hom 35 8 13 14 T 15 16 372784 CASAVA_Build 17 17790317 2D TACATATATT CA/-- CAGAGTTGTG 3070 het 3070 ref 39 25 13 2 CA 2 1 372785 CASAVA_Build 17 17806272 1D GGTAGTTGCC A/- GGGGCTGGGG 3070 het 3070 hom 28 12 14 3 A 1 0 372786 CASAVA_Build 17 17806364 1D TTGTTGCATA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 11 8 T 13 12 372787 CASAVA_Build 17 17817171 1I TACAGTCGTG -/C TGAGACAGCC 1474 het 1377 hom 14 4 4 6 C 0 1 372788 CASAVA_Build 17 17832319 1I TACCATGCTT -/A ACCCAACAAA 3070 het 3070 hom 34 13 17 4 A 1 2 372789 CASAVA_Build 17 17846015 1D GAGACCAGCC T/- TGCCAACATG 2180 het 2180 ref 16 7 6 3 T 2 1 372790 CASAVA_Build 17 17847849 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1360 het 674 hom 9 2 4 3 T 15 14 372791 CASAVA_Build 17 17860911 2D TCCCCTACTC AT/-- AAAAAAAAAA 1969 het 903 hom 20 8 5 7 AT 1 0 372792 CASAVA_Build 17 17907250 1D GGAGTTCGAC A/- CCAGCCTGGC 2048 het 43 hom 9 1 5 3 A 1 0 372793 CASAVA_Build 17 17912691 2I TGTGGAAGCA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 12 11 8 T 10 12 372794 CASAVA_Build 17 17914622 3D TCTCAAAAAA AAC/--- AACAACAAAA 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 AAC 3 2 372795 CASAVA_Build 17 17914740 1I AATAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 18 7 A 10 11 372796 CASAVA_Build 17 17923065 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2597 hom 20 8 12 0 A 10 9 372797 CASAVA_Build 17 17923559 2D CTTGGGGGAC TA/-- TGTGAGATGC 3070 het 3070 hom 32 13 17 3 TA 1 0 372798 CASAVA_Build 17 17928325 1D CGTAGTTAGA T/- TTCTTCCAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 T 3 2 372799 CASAVA_Build 17 17929759 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1598 hom 10 het 5 0 4 1 A 15 14 372800 CASAVA_Build 17 17946537 6D GCGTGTGCCT ATAATC/------ CCAGCTACTC 3070 hom 27 het 12 0 10 2 ATAATC 1 0 372801 CASAVA_Build 17 17955381 15D CTCAAAAGAG AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 19 20 8 A 25 10 372802 CASAVA_Build 17 17956894 2D GTATTATTAT TA/-- TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 19 0 14 5 TA 1 0 372803 CASAVA_Build 17 17988397 1I CCCTCACCAG -/C CCTCAGTTTC 3070 hom 79 het 33 0 22 11 C 2 3 372804 CASAVA_Build 17 17988498 1I GCCTGTCAGT -/C CCAGCTCTGT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 C 2 3 372805 CASAVA_Build 17 17996659 1D TGCCCCTGAT A/- AAAAACCCTC 3070 hom 68 het 42 1 33 9 A 6 5 372806 CASAVA_Build 17 18005936 2D TATGGAGAAA GG/-- GGGGGCCACT 3070 het 1433 hom 27 4 19 5 G 7 5 372807 CASAVA_Build 17 18012616 5D CAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGAAAAGA 3070 het 980 hom 21 6 12 6 AAAAG 1 0 372808 CASAVA_Build 17 18013492 6D TCCGTCTCAA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 3070 ref 17 8 8 2 AAT 8 6 372809 CASAVA_Build 17 18024815 1I ACTCGGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 10 het 21 0 13 8 A 14 15 372810 CASAVA_Build 17 18029435 1D TGCTTTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 68 het 28 0 22 7 T 14 13 372811 CASAVA_Build 17 18045048 2D TCATTAGATC CA/-- CAGAGTTCGA 3070 het 3070 ref 53 28 20 6 CA 2 1 372812 CASAVA_Build 17 18051407 1I TTTTTAAAGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 31 10 17 4 A 8 9 372813 CASAVA_Build 17 18052528 7D CATTGGGGGG TTTTTGT/------- TTTTTGTTTT 3070 het 3070 hom 31 13 11 10 TTTTTGT 3 2 372814 CASAVA_Build 17 18056434 2D CACAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 1483 het 1483 ref 21 10 9 2 CT 2 1 372815 CASAVA_Build 17 18109726 3D CCCAAGTGAC CCT/--- CCTCCTGCCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 6 CCT 3 2 372816 CASAVA_Build 17 18111845 24D AGGTGGGAGA CACTTGGCTGAGGTCCATTCCAAT/------------------------ CACTTGGCTG 2736 het 2736 ref 46 24 7 23 CACTTGGCTGAGGTCCATTCCAAT 2 1 372817 CASAVA_Build 17 18112340 13I GAGTTAAAAG -------------/TGTTCGTGGTTCA TGTTCGTGGT 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 TGTTCGTGGTTCA 0 1 372818 CASAVA_Build 17 18113358 1D CAACATTTGC T/- TTTTTTTTTT 891 het 891 ref 34 22 4 8 T 15 14 372819 CASAVA_Build 17 18115168 4D AGAGGAAAAC ACTT/---- AACCCAACAG 3070 het 3070 ref 31 16 8 10 ACTT 1 0 372820 CASAVA_Build 17 18124213 2I TTAAATAAAA --/TT ATTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 0 2 372821 CASAVA_Build 17 18132512 1D ATTATTATTA T/- TTTTTTGTAA 2705 het 2705 ref 22 15 6 1 T 7 6 372822 CASAVA_Build 17 18144225 2I TTACAAGGTC --/AA GAGAGCTAGA 3070 hom 36 het 13 0 12 1 A 0 2 372823 CASAVA_Build 17 18148605 4D ACTGCAACAA TTAT/---- TTATTAATAG 3070 het 3070 ref 28 15 12 3 TTAT 2 1 372824 CASAVA_Build 17 18149526 2D CACACACACA CG/-- CGCGCGCGCG 1841 het 13 hom 20 1 7 13 CG 9 8 372825 CASAVA_Build 17 18150738 1I TACCATTCAT -/A AAAAAAAGTT 3070 het 173 hom 39 1 29 9 A 7 8 372826 CASAVA_Build 17 18179992 3D TGATGGCATC TCT/--- TCTTAACACA 3070 het 3070 ref 27 16 9 2 TCT 2 1 372827 CASAVA_Build 17 18185193 1I GACCAAAATG -/A CCTGCTAATA 3070 het 3070 hom 54 18 28 8 A 0 1 372828 CASAVA_Build 17 18189718 4D CCTGCCTTTC TTAT/---- TTATTTATTT 2692 het 2692 ref 24 15 6 3 TTAT 3 2 372829 CASAVA_Build 17 18193768 1I TAAAAAAAAT -/A AAATAGGCCG 3070 het 2070 hom 19 6 10 3 A 3 4 372830 CASAVA_Build 17 18197229 2D AATATAACAC TG/-- TAATTCTGAG 3070 het 3070 hom 53 24 25 4 TG 1 0 372831 CASAVA_Build 17 18199692 1I AGTGATCTCT -/C CCCCTTCTCG 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 C 4 5 372832 CASAVA_Build 17 18200059 2D TGGGAAAAAC AT/-- GTGTAGCTTC 3070 het 3070 hom 22 8 11 3 AT 1 0 372833 CASAVA_Build 17 18210167 3I26M1D GATTACAGGC ---ATAAGCCACTGTGCCCAACCCGTGAGT/ATAATAAGCCACTGTGCCCAACCCGTGAG- TTTTTAATAT 3070 het 168 hom 23 1 11 16 N/A 0 0 372834 CASAVA_Build 17 18214379 11D AAACAAACAT CAAACAAACAC/----------- AAAGAAATGG 2421 het 2421 ref 22 14 7 4 CAAACAAACAC 1 0 372835 CASAVA_Build 17 18218143 3D ATGAAGAAGA AGG/--- AGAAGAGTCA 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 AGG 1 0 372836 CASAVA_Build 17 18230472 1D AGGCCCTCCC T/- GAGGCCACCT 3022 hom 24 het 10 0 9 1 T 1 0 372837 CASAVA_Build 17 18231582 1I TACTCAGCTT -/C TCCACTGCAG 3070 hom 48 het 18 0 16 2 C 0 1 372838 CASAVA_Build 17 18231958 1D AGGCTGAGGT G/- GGGAGGATTG 2774 hom 18 het 9 0 7 2 G 4 3 372839 CASAVA_Build 17 18232004 1I AGTGAGCTGT -/G TTTGGGCCAC 3070 hom 24 het 10 0 9 1 G 0 1 372840 CASAVA_Build 17 18232158 6D TTTAATTAAT CACAGC/------ CAACCCTCAA 3070 het 429 hom 13 1 12 0 CACAGC 1 0 372841 CASAVA_Build 17 18244608 1I CCAGGTGGGC -/T TGGGAAGGGC 2534 het 2534 ref 27 15 6 6 T 1 2 372842 CASAVA_Build 17 18248577 1I TCTATACAAC -/A AACCCCCATG 3070 het 3070 ref 28 17 9 2 A 2 3 372843 CASAVA_Build 17 18248643 2D AAAAGTTAAA TT/-- TTTTTTTAAA 3070 hom 36 het 28 0 13 15 T 9 7 372844 CASAVA_Build 17 18253342 3D TAAGTCATTG TTT/--- TAAGTCTAGT 3070 het 3070 ref 41 31 7 6 T 4 1 372845 CASAVA_Build 17 18257321 3D CTCCTGGTTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 TTG 7 6 372846 CASAVA_Build 17 18258258 1D GAGTCTGGAG T/- TACGCTGCCT 2741 het 2663 hom 22 9 7 6 T 2 1 372847 CASAVA_Build 17 18258898 4I ACTTGAAAAT ----/ACTC AGAAGACTTC 3070 het 3070 ref 29 19 7 3 ACTC 0 1 372848 CASAVA_Build 17 18260336 1I GTCAGGAGTT -/G GGAGACCACC 3070 het 3070 ref 32 14 11 7 G 2 3 372849 CASAVA_Build 17 18286537 1D AGGCTCCTGA G/- GCTCCCCGGC 2951 het 2858 hom 19 9 8 2 G 2 1 372850 CASAVA_Build 17 18286679 2D TTCTCTCTCC CA/-- CAGTCTTCAC 2102 het 2102 ref 35 20 5 10 CA 2 1 372851 CASAVA_Build 17 18290603 5D ATTGGAATAT GTGTA/----- TATGTGTATG 3070 hom 30 het 12 0 11 2 GTGTA 1 0 372852 CASAVA_Build 17 18319802 1I GTTCGTCTGC -/A AAATTCTAGT 3070 het 453 hom 15 1 12 2 A 3 4 372853 CASAVA_Build 17 18346169 1I GCCTCCAACC -/A AACTGCAGAG 3070 het 3070 ref 21 12 9 0 A 2 3 372854 CASAVA_Build 17 18365977 1D TAAGACTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 38 het 15 0 13 2 A 11 10 372855 CASAVA_Build 17 18391139 17D AACCTGTAAG TAAAAATCAGTAAAACA/----------------- TAGGCATAGC 3070 hom 24 het 8 0 9 2 TAAAAATCAGTAAAACA 1 0 372856 CASAVA_Build 17 18396559 1I CAAGGTGTTA -/T TTTTTTATCA 2819 het 2819 ref 35 25 6 4 T 6 7 372857 CASAVA_Build 17 18428395 4I CAGGTAAGAG ----/AAAT AAATAAAGGG 3070 het 3070 ref 38 18 11 9 AAAT 1 2 372858 CASAVA_Build 17 18430037 4D AAATGACATG AACA/---- AACATTTTTC 2854 het 2854 ref 43 37 6 4 AACA 2 1 372859 CASAVA_Build 17 18438785 1I TAAGTTGTTC -/A ATCAGCAACA 3070 het 3070 ref 28 16 10 2 A 1 2 372860 CASAVA_Build 17 18452497 2I ATCTTTTAAA --/AC AGACTGCTAA 3070 het 3070 ref 44 26 15 3 AC 0 1 372861 CASAVA_Build 17 18453084 1I CTGAGCAGAA -/G TCACATTATG 3070 het 3070 ref 91 50 32 9 G 0 1 372862 CASAVA_Build 17 18455622 1I TCTAAAGGCT -/A TTGGAATGTA 3070 het 3070 ref 51 29 17 5 A 0 1 372863 CASAVA_Build 17 18482578 2D2M4I CTGAGAGGCA CCCA----/--GATGGT CCCAGGCCAA 3070 het 1996 hom 19 7 10 5 N/A 0 0 372864 CASAVA_Build 17 18486104 1I GGGGAACCGT -/C CCCCCCCAGG 798 het 798 ref 31 16 3 12 C 7 8 372865 CASAVA_Build 17 18491920 1D TTCTCACCAC A/- AAAAAAAAAA 2890 het 2890 ref 31 18 6 7 A 11 10 372866 CASAVA_Build 17 18492885 1I ATTTTTGGGA -/T TTTTGTCAGT 2341 het 2052 hom 11 5 6 0 T 4 5 372867 CASAVA_Build 17 18496188 1D TAAATGTCAT G/- GGGGGGAAAT 3070 het 3070 hom 43 20 17 6 G 7 6 372868 CASAVA_Build 17 18501354 1D AAACACATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2838 hom 25 10 11 4 T 11 10 372869 CASAVA_Build 17 18510369 1I TGTATACAGA -/T TTTTTTTTCC 2841 het 2841 ref 37 24 6 7 T 8 9 372870 CASAVA_Build 17 18514011 3D TAAACCCTTT TTG/--- GGTGACATTT 2832 het 2832 ref 22 16 6 2 TTG 1 0 372871 CASAVA_Build 17 18520503 1D TAAAATGAAT A/- AACATAATTC 2313 het 2313 ref 35 27 5 4 A 3 2 372872 CASAVA_Build 17 18524767 2D AATAATCAGC AG/-- ACTCACTCAC 1345 het 1345 ref 45 36 3 6 AG 1 0 372873 CASAVA_Build 17 18527834 4I CAGGAAAATT ----/TAAC TAATTCCACT 3070 het 3070 ref 41 18 16 7 TAAC 0 1 372874 CASAVA_Build 17 18528512 1I AATCACAATT -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 30 13 9 8 A 8 9 372875 CASAVA_Build 17 18529985 4I ATTAAAGATT ----/CTAA CTTATTCTTT 3070 het 3070 ref 20 13 7 0 CTAA 0 1 372876 CASAVA_Build 17 18544563 2I AATAATAAAC --/TG TAAAATATTA 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 TG 0 1 372877 CASAVA_Build 17 18546828 1I TTAATCTGAC -/G TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 36 17 15 4 G 0 1 372878 CASAVA_Build 17 18552624 2I ATTTTTTGGT --/TA TGCTGTGACT 1836 het 1836 ref 13 6 5 2 TA 0 1 372879 CASAVA_Build 17 18553467 1D CATTATAGTG A/- TGAAATATTT 3070 het 3070 ref 42 22 16 7 A 1 0 372880 CASAVA_Build 17 18555317 14I AAGATTGCTA --------------/GGATACAGCAACAC GGTGAATAAA 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 GGATACAGCAACAC 0 1 372881 CASAVA_Build 17 18562373 2D CAGTCTGGGA TT/-- TTTTCTTCTC 2635 het 2635 ref 33 25 6 2 T 6 4 372882 CASAVA_Build 17 18590738 4I CCAGGGCATC ----/TGAA TGACTTTGCT 2344 het 2344 ref 39 30 5 4 TGAA 0 1 372883 CASAVA_Build 17 18594669 1I GTAACTTGGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 15 8 6 T 8 9 372884 CASAVA_Build 17 18596031 12D CCCACTCTGC TTAAAGTCTATT/------------ TTAAAGTCTA 3070 het 3070 hom 20 9 10 4 TTAAAGTCTATT 2 1 372885 CASAVA_Build 17 18601727 1I TAAAAAACTC -/T TCAGTTTGGA 3070 het 3070 ref 67 38 22 7 T 1 2 372886 CASAVA_Build 17 18602679 5I TACCTTCAGC -----/TTATT TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 40 17 18 5 TTATT 0 1 372887 CASAVA_Build 17 18602866 1I GGGAACGTGG -/T TTTTTATGGG 3070 het 3070 hom 33 11 17 5 T 5 6 372888 CASAVA_Build 17 18603515 2I TACATGGAAC --/TA TGTTTTTGAG 1248 het 1248 ref 34 27 4 3 TA 0 1 372889 CASAVA_Build 17 18603948 1D CCACCGCGCC G/- GGCCCTTGTT 3070 het 3070 hom 21 12 9 0 G 3 2 372890 CASAVA_Build 17 18611572 1D GAACAGAGAA T/- TTTTTTTTCT 1254 het 1254 ref 28 25 3 0 T 9 8 372891 CASAVA_Build 17 18612157 3D GGCTGGAGCA CAG/--- CAGTGGTGAG 3070 het 3070 ref 19 11 7 2 CAG 2 1 372892 CASAVA_Build 17 18624342 1I TCTTGCCTTT -/G AGAAACGCGT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 G 0 1 372893 CASAVA_Build 17 18624848 1D TTTCTTAACG T/- TTTACTTCTC 2480 het 2480 ref 17 9 6 2 T 4 3 372894 CASAVA_Build 17 18627668 4I ACTAGCTGCC ----/TATT TAGTTGCATG 1330 het 1330 ref 48 41 3 4 TATT 0 1 372895 CASAVA_Build 17 18632132 1I ATCCCAGCAA -/T TGGGAGGCCG 3070 hom 59 het 21 0 18 3 T 1 2 372896 CASAVA_Build 17 18643229 13I ATGGTTGGTA -------------/ATCTGTTTTGGTT ACCTATTGCT 3070 hom 45 het 23 0 16 7 ATCTGTTTTGGTT 0 1 372897 CASAVA_Build 17 18646569 3I GGGGATGGTA ---/ATT ATTAGTGAAA 3070 het 3045 hom 27 8 13 6 ATT 1 2 372898 CASAVA_Build 17 18649728 2D ACTTAAAAAC TT/-- TATTTATAAA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 3 1 372899 CASAVA_Build 17 18656147 1I GCTTTACAGA -/T TTTAAACAGG 3070 het 3070 ref 26 15 9 2 T 3 4 372900 CASAVA_Build 17 18665992 1D TAATTGCAGC A/- ACATGGCTAA 3070 het 3070 ref 31 18 10 5 A 2 1 372901 CASAVA_Build 17 18688333 2I CAAAAATGCC --/AT ATATATATCA 3070 hom 27 het 11 0 10 1 AT 4 5 372902 CASAVA_Build 17 18698038 1D GAACCCGGGA G/- GGTGGAGGTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 G 3 2 372903 CASAVA_Build 17 18699493 1D CTTAGAAAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2359 hom 26 8 10 8 T 11 10 372904 CASAVA_Build 17 18702895 3I TTTGGGGCTT ---/GAG GAGGTGTGAT 3070 het 3070 hom 31 11 16 4 GAG 1 2 372905 CASAVA_Build 17 18706490 2I15M1I TAGGGGGTGT --AAAAAAAATGCCCCT-/AAAAAAAAAATGCCCCTC CCCCCCATGG 3070 het 3070 ref 41 26 14 3 N/A 0 0 372906 CASAVA_Build 17 18707032 1D CTAATTTTTT G/- TATTTTTAGT 1609 het 1036 hom 7 3 4 0 G 1 0 372907 CASAVA_Build 17 18707565 5D TTTCTTCTTC TCTTT/----- TCTTTTCTTT 3070 het 1945 hom 26 8 13 5 TCTTT 4 3 372908 CASAVA_Build 17 18712762 2I TAAAAAAACA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 248 hom 29 1 21 7 T 14 16 372909 CASAVA_Build 17 18715692 9D TATAATTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2576 het 1220 hom 13 5 7 1 T 24 15 372910 CASAVA_Build 17 18723518 4I TTTATTTTTG ----/AGTC AGTCTCACCT 2686 het 1368 hom 11 3 6 2 AGTC 1 2 372911 CASAVA_Build 17 18723908 1I26M1I GAGAACCAGG -GGGCGATCACCTGAGGTTGGGAGTTC-/TGGGCGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCG AGAGCAGCCT 1608 hom 17 het 8 0 6 2 N/A 0 0 372912 CASAVA_Build 17 18728385 1D AAATTTTATG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 9 16 4 T 10 9 372913 CASAVA_Build 17 18734833 4D GAACTCAGAA ATTG/---- ATTAACAGAA 3070 het 3070 hom 41 19 20 3 ATTG 1 0 372914 CASAVA_Build 17 18752203 1I TCTCAACAAC -/A AAAAAAAAGC 2705 het 619 hom 18 2 9 7 A 8 9 372915 CASAVA_Build 17 18752828 1D CGATCATGCC A/- AAAAAAGTGG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 A 7 6 372916 CASAVA_Build 17 18755387 2I GTTTTTTTTT --/TA AGTTGGCAAA 3070 het 3070 ref 47 22 15 10 TA 0 1 372917 CASAVA_Build 17 18785297 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 8 7 372918 CASAVA_Build 17 18786504 1I CAAAGATATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 11 12 372919 CASAVA_Build 17 18793136 2I CTGTCGCTAT --/AA AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 A 7 9 372920 CASAVA_Build 17 18796773 1D GGAGGGCCCT G/- GGAACTGGGG 3070 het 1642 hom 20 5 10 6 G 3 2 372921 CASAVA_Build 17 18815411 3I GGGTCTTTGC ---/GGT GGTCCCGGGG 3070 hom 66 het 25 0 18 7 GGT 1 2 372922 CASAVA_Build 17 18817923 8D TTTTTTTAAG TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 946 het 822 hom 11 5 3 3 T 22 14 372923 CASAVA_Build 17 18834841 1D GCCTGGTGCT C/- CCCCAGGCAA 3070 hom 87 het 32 0 23 9 C 5 4 372924 CASAVA_Build 17 18854697 1I TTCTGAAACA -/T TATATGGCTG 2739 het 2739 ref 22 11 7 4 T 1 2 372925 CASAVA_Build 17 18911150 1D TTCTGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 874 hom 25 7 17 1 T 25 24 372926 CASAVA_Build 17 18956322 1I GCCACCCCGA -/G GAAAACCCAA 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 G 1 2 372927 CASAVA_Build 17 18958772 4D CCAACAAAAC AAAA/---- AAAAAAACAT 2153 het 2152 ref 85 9 12 64 A 11 7 372928 CASAVA_Build 17 19032218 1I CCTGCTTGGC -/A ATGTCGCGAG 3070 het 2420 hom 15 6 8 1 A 1 2 372929 CASAVA_Build 17 19040836 1I AAAGAGATGG -/A GGGGGGGGCG 3070 het 11 hom 13 1 11 1 A 0 1 372930 CASAVA_Build 17 19118773 1D GCCTTGGAAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 33 15 10 9 T 9 8 372931 CASAVA_Build 17 19142803 5D GATTTTCACC AGTGT/----- AAATAATGCT 3070 hom 120 het 49 0 39 12 AGTGT 1 0 372932 CASAVA_Build 17 19152911 8I CAAAAGTGTC --------/TGCATGTG TGCATTTTTA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 TGCATGTG 0 1 372933 CASAVA_Build 17 19158224 1I CAGGAGTCCA -/G GGAGTGTGAG 3070 het 256 hom 39 4 16 19 G 2 3 372934 CASAVA_Build 17 19165617 1I GGCTCCAGTC -/T TGTTATCCAG 3070 het 3070 hom 59 18 30 11 T 1 2 372935 CASAVA_Build 17 19166504 1I AAAATCAGCC -/A AGCATGGGGG 3070 hom 75 het 29 0 25 4 A 1 2 372936 CASAVA_Build 17 19166647 1D ACCTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 1019 het 402 hom 27 7 8 12 A 19 18 372937 CASAVA_Build 17 19169740 3D GAAAAAATTT CTA/--- CAGATAAGTT 3070 hom 90 het 34 0 31 5 CTA 1 0 372938 CASAVA_Build 17 19181154 4I GCTGTGCAAC ----/AGCT AGCTGACCGA 3070 hom 53 het 25 0 13 12 AGCT 1 2 372939 CASAVA_Build 17 19239645 1D TCCGTTTTCT G/- GAAGATATTT 3070 het 3070 ref 39 21 16 2 G 2 1 372940 CASAVA_Build 17 19243559 1I ACAGAGCAAG -/A CTCCGTCTCA 3070 het 347 hom 27 6 16 5 A 0 1 372941 CASAVA_Build 17 19244229 1I TGCTCAAGGT -/G GTCTTCTAAC 3070 het 3070 hom 32 11 14 7 G 1 2 372942 CASAVA_Build 17 19254896 1I TTCTGCCGGA -/G GGCGCCTCCA 3070 hom 83 het 31 0 24 7 G 2 3 372943 CASAVA_Build 17 19256675 1I GCGGCCGCTG -/C CCCCTGCACT 3070 hom 60 het 24 0 17 7 C 4 5 372944 CASAVA_Build 17 19366244 4D TATTTTTAGT AGAG/---- ACAGTGTTTC 3070 hom 48 het 17 0 17 0 AG 2 0 372945 CASAVA_Build 17 19374500 1I CAACTCTACT -/A AAAAAAAAAA 2026 het 458 hom 11 2 7 2 A 13 14 372946 CASAVA_Build 17 19402376 1D ATTTTACTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 17 8 T 13 12 372947 CASAVA_Build 17 19413276 1D ACTCTACCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 8 5 A 11 10 372948 CASAVA_Build 17 19417433 1D AAAGAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 T 12 11 372949 CASAVA_Build 17 19421186 1I TATAAAAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2969 hom 29 7 16 6 A 10 11 372950 CASAVA_Build 17 19427659 1I AAAGGACTAA -/T TAAAAATGTG 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 2 372951 CASAVA_Build 17 19429934 1D TTATTTTTTA T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 87 het 35 0 30 6 T 8 7 372952 CASAVA_Build 17 19433303 24I AAGTTTTAGT ------------------------/TCATTTTGCTGTATTCACTCCACC TTTCATGCTA 3070 hom 99 het 37 0 33 5 TCATTTTGCTGTATTCACTCCACC 0 1 372953 CASAVA_Build 17 19435334 1D ATGCAAGAAC T/- TTAGCAACTT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 T 3 2 372954 CASAVA_Build 17 19445270 2D ATAAAAACTC AA/-- AAAAAAAAAA 3012 het 1747 hom 28 10 8 10 A 16 14 372955 CASAVA_Build 17 19448889 1I TACTACTCCT -/C CCCCCCAGTT 3070 het 3070 ref 45 23 18 4 C 6 7 372956 CASAVA_Build 17 19451123 1I GGCCGGGCAC -/G GTGGCTCACG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 G 1 2 372957 CASAVA_Build 17 19453111 1D AGCATTCATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 12 12 A 11 10 372958 CASAVA_Build 17 19458497 2D TTTTAAGTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1275 het 685 hom 27 8 6 13 T 20 18 372959 CASAVA_Build 17 19461803 4I CAATGTCTGC ----/CATA CAATTAATAA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 CATA 0 1 372960 CASAVA_Build 17 19470204 3D CATTGCAAAA GAG/--- AAGAAGAGGG 3070 het 3070 ref 39 20 16 8 GAG 1 0 372961 CASAVA_Build 17 19478371 1I CTACTCAGGA -/G TCTGAGGTGG 3070 hom 108 het 42 0 36 6 G 0 1 372962 CASAVA_Build 17 19496780 2D AAACAGATTC TG/-- TGTTTGTCTG 3070 het 3070 ref 46 25 19 3 TG 2 1 372963 CASAVA_Build 17 19501604 8D TGAATATTTG ACTGAATT/-------- ACTGAATTAT 3070 hom 99 het 36 0 34 5 ACTGAATT 2 1 372964 CASAVA_Build 17 19507735 1D ATGTTAATCC A/- CAGGGCATTG 3070 het 3070 ref 46 23 15 8 A 1 0 372965 CASAVA_Build 17 19509079 1D GAGGGAGACC T/- TTTCCTGGTC 3070 hom 149 het 55 0 47 9 T 4 3 372966 CASAVA_Build 17 19517261 1D GTTTGTTTTT G/- TTTTTGTTTT 2954 hom 36 het 22 0 12 10 G 1 0 372967 CASAVA_Build 17 19521353 2D GTCTACTAAT AC/-- ACATCTGCTT 3070 het 3070 hom 53 22 23 9 AC 2 1 372968 CASAVA_Build 17 19532303 5D GACCCACAGC TAGTA/----- TCATACCAAA 3070 hom 140 het 48 0 43 9 TAGTA 1 0 372969 CASAVA_Build 17 19532772 1I TGGTGATATC -/T TTTTTTTTTT 1159 het 1159 ref 25 14 3 8 T 15 16 372970 CASAVA_Build 17 19537035 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 17 11 3 A 9 8 372971 CASAVA_Build 17 19540366 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1446 het 742 hom 17 5 7 6 A 18 16 372972 CASAVA_Build 17 19542742 1D GATCAAAAAT A/- TTTGAAAAAC 3070 het 3070 ref 42 25 16 1 A 1 0 372973 CASAVA_Build 17 19554366 1I GGGTTAAGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 9 T 10 11 372974 CASAVA_Build 17 19559344 17D CCAGAAGGGT CAGTGCCTGGCGCAGCG/----------------- CAGTGCCTGG 3070 het 3070 ref 35 21 10 7 CAGTGCCTGGCGCAGCG 1 0 372975 CASAVA_Build 17 19612901 3I TTGGGAGGCT ---/GAG GTGGGCGGAT 3070 hom 27 het 10 0 10 1 GAG 0 1 372976 CASAVA_Build 17 19613512 1I AAAAACACAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 37 het 18 0 13 5 A 6 7 372977 CASAVA_Build 17 19617937 1I GCAAACCCTT -/A AGAGCAGGAA 3070 hom 117 het 46 0 39 7 A 1 2 372978 CASAVA_Build 17 19648142 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 242 hom 26 1 20 5 A 11 12 372979 CASAVA_Build 17 19648960 3D ACTAAGAATT ATA/--- ATAACCTGGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 ATA 2 1 372980 CASAVA_Build 17 19650183 2D GTAAGTAAAC AG/-- AGTTTTTGAA 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 AG 2 1 372981 CASAVA_Build 17 19654995 1D TCCCATTCTC A/- AAAAAAAAAC 1391 het 1391 ref 38 23 3 12 A 10 9 372982 CASAVA_Build 17 19665334 1D TTTTTGTTTT G/- GGGGGGGCCT 3070 hom 97 het 37 0 32 5 G 8 7 372983 CASAVA_Build 17 19673025 1D AAGACACAAA T/- ATTTGAAAGC 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 T 1 0 372984 CASAVA_Build 17 19724414 1D AACAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3061 hom 29 11 13 6 A 11 10 372985 CASAVA_Build 17 19730112 1D GGCTGGATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 15 7 T 11 10 372986 CASAVA_Build 17 19743067 1I TCACCATGTT -/G GGCCAGGATG 2115 hom 12 het 5 0 5 0 G 2 3 372987 CASAVA_Build 17 19772823 23I AACTTGTACA -----------------------/TGGTCTGTGTACTGTGTACTGTG CAAATGGTCA 3070 het 3070 ref 36 19 17 0 TGGTCTGTGTACTGTGTACTGTG 0 1 372988 CASAVA_Build 17 19781011 1D TAAATGCGAG A/- AAAAAAAAAA 1446 het 1446 ref 45 33 4 8 A 11 10 372989 CASAVA_Build 17 19791278 1D TTTTTTGTCA T/- TTTTTTTTTG 1091 het 1091 ref 37 31 3 3 T 10 9 372990 CASAVA_Build 17 19818612 1D CCTAGAATGA T/- TTTTTTTTTT 2358 het 2358 ref 40 18 7 15 T 15 14 372991 CASAVA_Build 17 19830383 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 163 hom 23 2 12 9 T 14 13 372992 CASAVA_Build 17 19863759 15D GGGCCTTTCA TCACTGGCTTCTTTG/--------------- TCACTGGCTT 1744 het 1744 ref 30 18 8 8 TCACTGGCTTCTTTG 1 0 372993 CASAVA_Build 17 19867715 1D GGCAGAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1520 het 1520 ref 26 18 5 3 A 12 11 372994 CASAVA_Build 17 19872174 2D TCCAACTTCA TT/-- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 hom 42 13 20 11 T 10 8 372995 CASAVA_Build 17 19878511 3D CTATTTTTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 1661 het 746 hom 16 6 4 6 T 17 14 372996 CASAVA_Build 17 19884057 2D ACATTATATG TA/-- TATATATATA 3070 het 2477 hom 33 7 15 11 TA 7 6 372997 CASAVA_Build 17 19899170 1D TAGAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 22 14 12 T 12 11 372998 CASAVA_Build 17 19901563 1D GCCTGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 1948 het 1948 ref 34 15 6 13 T 15 14 372999 CASAVA_Build 17 19903468 3D TGAAGTGCAA CTT/--- CTTCTACTCT 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 CTT 2 1 373000 CASAVA_Build 17 19909300 3I CCCATGACTC ---/CTT CTCTGGGTTC 3070 het 3070 hom 32 13 16 3 CTT 0 1 373001 CASAVA_Build 17 19910657 1I GCTTAAGTAG -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 A 0 1 373002 CASAVA_Build 17 19919011 1D TTTCAGCATG T/- TGTCCAGGCT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 T 2 1 373003 CASAVA_Build 17 19923984 2D TAAAACTGAC TT/-- AACATTATTA 3070 het 3070 hom 48 17 23 9 T 2 0 373004 CASAVA_Build 17 19926975 2I TATTATTCTT --/TC TGAGTCCTGA 3070 het 3070 ref 31 16 12 3 TC 0 1 373005 CASAVA_Build 17 19930156 1D GGCCTCAGAA T/- TTTCCTGGGG 3070 het 3070 hom 33 12 13 8 T 4 3 373006 CASAVA_Build 17 19934497 1D ACACTATTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 11 13 12 A 15 14 373007 CASAVA_Build 17 19938584 1D CAGTCCTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 T 12 11 373008 CASAVA_Build 17 19955712 1D CTCAGGACCC A/- GGGGGGGGGC 3070 hom 36 het 19 0 12 7 A 1 0 373009 CASAVA_Build 17 19960400 1D GAGCATCTAT A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 38 23 11 4 A 8 7 373010 CASAVA_Build 17 19965268 4D TTCTGAATTC TTTT/---- TTTTGTTGTT 1088 het 1088 ref 27 18 5 4 T 8 4 373011 CASAVA_Build 17 19969109 1D AAAACAAAAC A/- AAACAAAAAA 451 het 451 ref 8 3 3 2 A 4 3 373012 CASAVA_Build 17 19970418 1D TAGATACTTT A/- AAAAATATTT 3070 het 3070 hom 41 19 19 3 A 6 5 373013 CASAVA_Build 17 19973631 3D AGAGCCAGTT TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 39 16 10 13 TTG 7 6 373014 CASAVA_Build 17 19986733 1I TATCTTTACC -/A AAAAAAAAAA 1033 het 1033 ref 31 14 6 11 A 13 14 373015 CASAVA_Build 17 19996370 1I TGCCATAACC -/A AATTGCACAG 3070 het 3070 ref 31 14 13 4 A 2 3 373016 CASAVA_Build 17 20004054 1I TTAGTTATAG -/T TTAATGCTAA 3070 het 3070 ref 36 19 15 2 T 2 3 373017 CASAVA_Build 17 20017834 1D GTTTTTGGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 198 hom 33 2 23 8 T 12 11 373018 CASAVA_Build 17 20018513 1D ATCAGTCTCT C/- CCCCCCATCA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 C 7 6 373019 CASAVA_Build 17 20023012 10I TTGGTTGGCT ----------/TAGGAAGAAA AATAAATTTT 3070 het 3070 ref 45 20 18 7 TAGGAAGAAA 0 1 373020 CASAVA_Build 17 20024905 1D AATTAGTGGT A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 35 11 19 5 A 9 8 373021 CASAVA_Build 17 20032162 1D AAAGACATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 17 9 7 T 12 11 373022 CASAVA_Build 17 20039282 4D AATAACACAC TAAA/---- TAATATTAGA 3070 het 3070 ref 30 16 11 6 TAAA 1 0 373023 CASAVA_Build 17 20041412 2D CACGGGACAG TC/-- TCTGTTTCCT 3070 het 3070 ref 46 25 16 6 TC 2 1 373024 CASAVA_Build 17 20053467 6D TTTCTTCTCA TTTCTT/------ TTTCTTCATT 3070 het 3070 ref 38 23 12 3 TTTCTT 2 1 373025 CASAVA_Build 17 20057783 1D CTCTGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 14 3 T 11 10 373026 CASAVA_Build 17 20074421 1D TTCTGTTTTG T/- TTTTGTTTTT 335 het 335 ref 53 36 4 13 T 5 4 373027 CASAVA_Build 17 20079785 1D CCCCTCTTGG A/- GGTGAGCAGT 3070 het 3070 ref 64 31 26 7 A 1 0 373028 CASAVA_Build 17 20080904 1I AAGAGCCCAG -/T TTGTCTCCTT 3070 het 3070 ref 44 24 16 4 T 2 3 373029 CASAVA_Build 17 20083250 1D CAGTGTTAAC A/- GTGTGTACAT 3070 het 3070 hom 35 11 21 3 A 1 0 373030 CASAVA_Build 17 20094790 3I GAAGGTGGTT ---/TTA AATATTGAAG 3070 het 3070 ref 47 23 15 9 TTA 0 1 373031 CASAVA_Build 17 20116245 1D TAATTTTGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 13 19 2 T 11 10 373032 CASAVA_Build 17 20117370 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 2352 het 1162 hom 25 5 9 12 A 13 12 373033 CASAVA_Build 17 20122605 2D TGAGACCCTG TC/-- TCTCTCTCTC 2313 het 2313 ref 30 16 8 6 TC 10 9 373034 CASAVA_Build 17 20140722 4D AATTCGGCTC TCTG/---- TCTGTTATTG 3070 het 3070 hom 34 14 18 4 TCTG 2 1 373035 CASAVA_Build 17 20146675 1I TGAAAACACA -/G GCGGTGCCAG 3070 hom 28 het 19 0 14 5 G 1 2 373036 CASAVA_Build 17 20148245 4D GTAGAGAAAC ATTT/---- ATATCTCAAT 3070 het 3070 hom 24 9 12 3 ATTT 1 0 373037 CASAVA_Build 17 20150855 2I CTATTTAAAC --/AT ATGAAAGAGA 3070 het 3070 ref 29 14 12 3 AT 1 2 373038 CASAVA_Build 17 20156265 3I ATTCTCAAAT ---/ATG ATGTTAACAA 3070 het 3070 ref 41 17 18 6 ATG 1 2 373039 CASAVA_Build 17 20175245 1I CTTAAACAAT -/A AAAAAATTGT 3070 het 3070 ref 29 15 13 1 A 6 7 373040 CASAVA_Build 17 20177194 3I TGCACTTAAA ---/AAG AAGATCAGGC 3070 het 3070 hom 40 18 20 2 AAG 1 2 373041 CASAVA_Build 17 20190862 1D AAAAGCAATT A/- TTAATTTTGT 3070 het 3070 hom 27 14 13 0 A 1 0 373042 CASAVA_Build 17 20218711 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2557 het 2557 ref 20 10 6 4 T 12 11 373043 CASAVA_Build 17 20220272 6D CTTTCTTCTT CTCTTC/------ TTCTTCTTTT 1194 het 1194 ref 18 6 3 10 CTCTTC 1 0 373044 CASAVA_Build 17 20220550 1D GAAGATATAT C/- CCATCAAAAC 3070 hom 42 het 18 0 15 3 C 3 2 373045 CASAVA_Build 17 20220751 2I GCTGCGGGGA --/GC GCGCGGCCGT 1601 hom 15 het 7 0 6 1 GC 2 3 373046 CASAVA_Build 17 20221519 1D TGTTTTGCCA T/- TTTTTTTGGT 2683 het 2683 ref 25 11 7 7 T 8 7 373047 CASAVA_Build 17 20221551 1D GGTGTCATGA T/- TTTTTTTCAG 1500 het 1500 ref 19 11 4 4 T 8 7 373048 CASAVA_Build 17 20222431 1D TTTTGATGTG T/- TTGCTGGATT 3070 het 3070 ref 33 23 8 2 T 3 2 373049 CASAVA_Build 17 20225891 1D GTAGTTTTGT C/- CCCCAGCCTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 C 5 4 373050 CASAVA_Build 17 20227404 2D TTTTTTTTTT TG/-- TAAAGCTCTT 915 het 915 ref 27 13 3 13 TG 1 0 373051 CASAVA_Build 17 20229216 1D ACTCCTTTCA T/- TTTATTAATT 3070 het 3070 ref 45 29 13 4 T 4 3 373052 CASAVA_Build 17 20237117 1I ACTAAGTGAT -/A AAAAAATAAC 2854 het 2854 ref 37 27 6 4 A 6 7 373053 CASAVA_Build 17 20245452 4I CACAATGATC ----/ATTA ATTTAGTGTG 3070 het 3070 ref 57 37 17 3 ATTA 0 1 373054 CASAVA_Build 17 20266209 1I CTTAGGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 T 12 13 373055 CASAVA_Build 17 20279371 4D GTGCATGTGA GTGT/---- GTGTGTGGAT 3070 het 3070 ref 60 33 11 16 GT 5 3 373056 CASAVA_Build 17 20309691 1D CAGCAGGACA G/- TGAACCGCGT 3070 hom 33 het 12 0 11 1 G 1 0 373057 CASAVA_Build 17 20311531 3I GAGAGAGAAA ---/GGT GGTAGGGTGT 2592 het 2592 ref 20 12 7 1 GGT 1 2 373058 CASAVA_Build 17 20334372 1D GGGGTGGGGG T/- GGTGTGTGTG 879 het 879 ref 25 21 3 1 T 1 0 373059 CASAVA_Build 17 20369591 1I GTTCTTTTAA -/G GTGATGCTCT 1368 het 1368 ref 36 32 3 1 G 1 2 373060 CASAVA_Build 17 20372122 5D TTTTTAAGTA TTATT/----- TTATCTCTTT 3070 het 1872 hom 24 8 16 3 TTATT 1 0 373061 CASAVA_Build 17 20373520 3D ACTTAGATAT ATG/--- ATAAATAAAA 1837 het 1837 ref 38 34 4 0 ATG 1 0 373062 CASAVA_Build 17 20379074 4I TGTGTACTAT ----/ACTA ACTAAGTCTC 3070 het 3070 ref 46 23 18 5 ACTA 1 2 373063 CASAVA_Build 17 20383051 1D GTCAAAGCAA C/- TAGAATTAGT 3070 het 1451 hom 15 3 11 1 C 1 0 373064 CASAVA_Build 17 20383845 1D GTACCCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 13 4 T 11 10 373065 CASAVA_Build 17 20403284 1D AGGTGGCCTC G/- GGGATGGCCT 1252 het 1252 ref 40 33 4 3 G 4 3 373066 CASAVA_Build 17 20428615 3D GAGATGAGTT CTC/--- CCTCCTCCTC 3070 het 3070 ref 40 19 11 10 CTC 1 0 373067 CASAVA_Build 17 20429380 3I GTGCTGTCAG ---/TAC TACTGTTAGT 3070 het 3070 hom 43 14 20 9 TAC 1 2 373068 CASAVA_Build 17 20438014 1I GTTTTACCCC -/A CCTACTCTAA 3070 hom 60 het 25 0 19 6 A 0 1 373069 CASAVA_Build 17 20456216 30D CAGATATGGT GGCACCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGA/------------------------------ GGCTGAAGCA 3070 het 3070 ref 26 17 9 5 GGCACCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGA 1 0 373070 CASAVA_Build 17 20467709 1I AGAACAAACA -/T GTCTTTTTAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 T 0 1 373071 CASAVA_Build 17 20470880 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAGAGGA 3070 hom 45 het 19 0 14 5 G 0 1 373072 CASAVA_Build 17 20472269 7D GATAAACAGG AACATTT/------- GTTAATTTTA 3070 hom 36 het 14 0 13 2 AACATTT 1 0 373073 CASAVA_Build 17 20492663 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 14 0 11 3 A 15 14 373074 CASAVA_Build 17 20495597 4I TCTATCCTGC ----/TTTA TTTATCTTGG 3070 hom 92 het 39 0 32 7 TTTA 1 2 373075 CASAVA_Build 17 20500911 9D GGAAAGCTAG TATCTATTT/--------- TATCCAAAGG 3070 hom 51 het 18 0 18 3 TATCTATTT 1 0 373076 CASAVA_Build 17 20503538 1D TAACTTAGTG T/- TTTCTTTTGT 3070 hom 45 het 16 0 16 1 T 4 3 373077 CASAVA_Build 17 20531267 2I TGGGATGACA --/GC GCGTCAGGAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 GC 1 2 373078 CASAVA_Build 17 20561459 1D TTGGAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 1498 het 1498 ref 29 14 5 10 T 15 14 373079 CASAVA_Build 17 20599920 1D GTCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 18 9 11 A 17 16 373080 CASAVA_Build 17 20625307 5I TTCTTGCTTA -----/TTGAG TTATGAATTA 3070 hom 87 het 37 0 30 7 TTGAG 0 1 373081 CASAVA_Build 17 20626367 1D ACTCTATCTG A/- ATATGATACC 2011 hom 15 het 10 0 5 5 A 2 1 373082 CASAVA_Build 17 20661222 1D CTGTTAGTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 100 hom 27 1 18 8 A 11 10 373083 CASAVA_Build 17 20706448 3D ATTAAAATTA CTC/--- CTTAGTATTT 3070 het 3070 ref 30 16 13 2 CTC 1 0 373084 CASAVA_Build 17 20708213 2D34M1I ATACAAGATC CTCTCTCATATAACATTTCTTTCCTTCATAACTTTT-/--CTCTCATATAACATTTCTTTCCTTCACAACTTTTC TTACCATAAA 3070 het 3070 ref 46 30 20 12 N/A 0 0 373085 CASAVA_Build 17 20709088 7I ACATATTCTT -------/CCATATA CCAACAGTAT 3070 het 3070 hom 85 29 43 13 CCATATA 0 1 373086 CASAVA_Build 17 20709341 2D CATTAGACAC AT/-- GATTCTTCCC 1173 het 1173 ref 52 42 4 6 AT 1 0 373087 CASAVA_Build 17 20709432 1D ATGGTGGCAG A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 69 42 22 14 A 9 8 373088 CASAVA_Build 17 20709521 2D39M2I CCAGAAAAAA ATATGTGAGAGAGATGAAATGGCTGTTTGCTACCAATATTT--/--GTGTGAGAGAGATGAAATGGCTGTTTGCTACCAATATTTTA TGTGATGCTT 3070 het 3070 ref 60 47 22 30 N/A 0 0 373089 CASAVA_Build 17 20709784 1I ATACAACTGA -/T TTTTTTTTCC 1187 het 1187 ref 83 68 3 13 T 8 9 373090 CASAVA_Build 17 20709874 1D TCAGTTTTGG T/- TTGTTAAGGC 3070 het 3070 ref 87 51 27 9 T 3 2 373091 CASAVA_Build 17 20709992 2D TGAGAAGAAA AT/-- ACACAATGGA 3070 het 3070 ref 74 42 25 11 AT 1 0 373092 CASAVA_Build 17 20710228 3I CAGAGATTGC ---/AGG AGAAGGGGGA 2461 het 2461 ref 60 40 10 19 AGG 0 1 373093 CASAVA_Build 17 20710748 3I AAGTCCAACC ---/TCT CCTCCTGGCA 3070 het 3070 ref 57 24 18 15 TCT 0 1 373094 CASAVA_Build 17 20711797 1I GCAGGCCAGG -/A AAAACTCACC 3070 het 3070 ref 70 46 18 6 A 4 5 373095 CASAVA_Build 17 20712216 1D ATTGGATGAG A/- AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 84 54 20 11 A 8 7 373096 CASAVA_Build 17 20712311 4D6M8D5M10D13M7D4M2I4M3D5M5D4M3I ACATGATCAT AAAGTCCAATCAGAGTAAGCCTGGAGGTTTTTTTCTCATCCAATCAAGACATGCAGT--CCAGGAACCTCCGTGGGCATT---/----TCCCAT--------TCCTG----------ACACCTCCACCCA-------CAGTGCCCTG---TCTCC-----CACTTCC ACCGCAGTAT 3070 het 3070 ref 46 54 14 8 N/A 0 0 373097 CASAVA_Build 17 20713349 1D GAAAAGACGG A/- GGGAAATGTT 2271 het 2271 ref 45 28 9 8 A 1 0 373098 CASAVA_Build 17 20713402 2I AAGGAGGAAC --/GG GGGGAAAGAC 3070 het 3070 ref 64 40 15 9 G 4 6 373099 CASAVA_Build 17 20714670 1D AGTTGCTTTT A/- AAAAATGTAT 2728 het 2728 ref 48 34 7 7 A 6 5 373100 CASAVA_Build 17 20714889 2I ATATAAAGAC --/AG AATGCATTAA 3070 het 3070 ref 58 31 18 9 AG 0 1 373101 CASAVA_Build 17 20715126 3I CACGTGAAAA ---/AAT AATGCCAATG 3070 het 3070 hom 73 29 35 12 AAT 1 2 373102 CASAVA_Build 17 20715475 3D AACTTGGCTT AAG/--- AAGTATATGA 3070 het 3070 ref 58 40 10 9 AAG 2 1 373103 CASAVA_Build 17 20716313 3I TATTCCATCT ---/TAC TTAATTTGGC 3070 het 3070 ref 73 50 17 6 TAC 0 1 373104 CASAVA_Build 17 20716753 1D TTGAATGATC T/- TTTACCCTTG 3070 het 3070 ref 68 35 26 7 T 4 3 373105 CASAVA_Build 17 20717396 2I43M12I21M2I TTTATATGAC --GAGACCAATTTGATGGAAAGAAGGCAAACTGTGAATGGTAATT------------TTGTTTTCATTGTGTGTACTC--/ATGAGACCAATTTGATGGAAAGAAGGCGAACTGTGAATGGTAATTTTGTTTTTTTAGTTGTTTTCATTGTGTGTACTCAT ATCTGAAAAT 905 het 905 ref 62 67 4 21 N/A 0 0 373106 CASAVA_Build 17 20717501 1D ACTTACAACA C/- AAATAAGACT 781 het 781 ref 46 32 4 10 C 1 0 373107 CASAVA_Build 17 20718366 5I CTTGCATTCC -----/TGAGA TAAGTCCTGC 3070 het 3070 ref 48 23 18 7 TGAGA 0 1 373108 CASAVA_Build 17 20718651 1I GGCTAGAAGA -/T TTTGTTGCTG 1834 het 1834 ref 32 24 4 4 T 3 4 373109 CASAVA_Build 17 20719214 3I TTTAATAGCA ---/TGT TGTTTAATTT 1536 het 1536 ref 49 27 5 17 TGT 1 2 373110 CASAVA_Build 17 20719703 1D TTAAAGTCTA T/- TTTTTTTCTG 2839 het 2839 ref 33 18 7 8 T 8 7 373111 CASAVA_Build 17 20719931 4I GTTACTAGTA ----/TAGT TAGATTTACA 3070 het 3070 hom 28 11 13 4 TAGT 0 1 373112 CASAVA_Build 17 20720209 3I51M1D2M2D TTTTGTGCTA ---TTGCTGTACACATTACATCTATATATGCTATATACCCAATAATTTATTGTTATAAC/TTGTTGCTGTACACATTACATCTATATTTGCTATATACCCAATAATTTATTGTT-TA-- TGTTACTTGA 3070 het 3070 ref 64 50 25 24 N/A 0 0 373113 CASAVA_Build 17 20720320 2I55M1I ATTTTGAAAC --AATTTCAATGTGACAGCATTAAGAGCTGGAACCTTGAGGATATGATTAGGCTATT-/TTAATTTCAATGTGACAGCATTAAGAGCTGGAACCTTGAGGGTATGATTAGGCTATTA GGGGTCTGTC 3070 het 3070 ref 50 54 16 18 N/A 0 0 373114 CASAVA_Build 17 20721081 2I CTTTGAGACT --/GG GTCACTGGGA 3070 het 3070 ref 45 16 16 13 G 1 3 373115 CASAVA_Build 17 20721118 1D TAATCTCAGC T/- TTGCCACTCC 2524 het 2524 ref 45 21 8 17 T 3 2 373116 CASAVA_Build 17 20721481 1I20M4D GATCAAATGC -AAAAAACTCTTACTGTTCTTAGTG/AAAAAAACTCTTACTGTTCTT---- AGTTTCAGTA 3070 het 3070 ref 49 38 16 6 N/A 0 0 373117 CASAVA_Build 17 20721663 4D GAACTTCTAC ATTT/---- ATTTCTTAGG 3070 het 3070 ref 46 27 11 11 ATTT 2 1 373118 CASAVA_Build 17 20721890 4I21M2I CATTCATTGT ----ATATTATCTTTTCATTCAGAA--/ATGAATATTATGTTTTCATTCAGAAAG AGTTACAATA 3070 het 3070 ref 66 42 27 12 N/A 0 0 373119 CASAVA_Build 17 20722079 4I CTTACTTGCA ----/CAGT CATTTATATT 3070 het 3070 ref 62 30 22 10 CAGT 0 1 373120 CASAVA_Build 17 20722199 5I TTGATACATA -----/TTTCT TTTTTTCTGA 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 TTTCT 0 1 373121 CASAVA_Build 17 20722248 2I CTAAAACAAC --/AT ATAGAAAACA 3070 het 3070 ref 54 22 19 13 AT 1 2 373122 CASAVA_Build 17 20722404 1I TTAACTTTTT -/A TTCCAGATTT 3070 het 3070 ref 59 25 23 11 A 0 1 373123 CASAVA_Build 17 20723620 2D25M1D CTTTTTTGAA TGTGAGGGTATGTCATGAGCATCAAAAG/--TGAGGGTGTGTCATGAGCATCAAAA- GGGAAAAAAA 747 het 747 ref 48 55 2 11 N/A 0 0 373124 CASAVA_Build 17 20723832 2I TAGCCCTGAC --/TT CTCTCTCCAG 3070 het 3070 ref 72 51 12 13 T 0 2 373125 CASAVA_Build 17 20723959 1D21M4I TCAAGGCATA CTTCTCTAATATTTACTAGCTA----/-TTCTCTAGTATTTGCTAGCTACTGT CTATTATTTT 2350 het 2350 ref 66 54 6 19 N/A 0 0 373126 CASAVA_Build 17 20724389 4I ACCTATTAAA ----/ATTT ATTTAATAAT 3070 het 3070 ref 48 31 10 7 ATTT 1 2 373127 CASAVA_Build 17 20724445 2I AAATCACAGT --/TG TGTCTGATAC 2012 het 2012 ref 41 27 7 7 TG 1 2 373128 CASAVA_Build 17 20724867 2D GCTTCTTTAC AT/-- GTTTGGCTCC 3070 het 3070 ref 47 26 13 10 AT 1 0 373129 CASAVA_Build 17 20725273 1I TACATACGCA -/T TTTTTATAAT 3070 het 3070 ref 43 21 17 5 T 5 6 373130 CASAVA_Build 17 20725508 4D TTGTTTTAAA AATT/---- AAGTCTTCTA 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 AATT 1 0 373131 CASAVA_Build 17 20726927 7D GGCCTGTCAT GGGGTGG/------- GGGGAGGGGG 1925 het 530 hom 8 2 5 1 GGGGTGG 1 0 373132 CASAVA_Build 17 20730988 1I AAAAAAGTCC -/A AAAAAAAAAA 2482 het 2482 ref 33 12 10 11 A 14 15 373133 CASAVA_Build 17 20748273 3I TCAAGCAATT ---/CTC CTGCCTCAGC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 CTC 0 1 373134 CASAVA_Build 17 20750559 1D AGGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 9 5 A 13 12 373135 CASAVA_Build 17 20754961 1D AATAAATGAT A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 42 18 20 4 A 8 7 373136 CASAVA_Build 17 20758167 3D ACATTACAGA CTT/--- CATGATAAAA 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 CTT 1 0 373137 CASAVA_Build 17 20758471 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 519 hom 17 2 10 5 A 13 12 373138 CASAVA_Build 17 20767933 6D ACATTTCTGA TGTACT/------ CTGCACATTG 3070 het 3070 ref 36 18 16 3 TGTACT 1 0 373139 CASAVA_Build 17 20769934 1I AACAATGCTG -/C TTTGAACGTG 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 C 0 1 373140 CASAVA_Build 17 20778880 5D ATAAGGAAAA TTAAC/----- TTAAACTTAG 3070 het 3070 ref 36 18 16 5 TTAAC 1 0 373141 CASAVA_Build 17 20782425 6I AGTTCAGAAG ------/CGATGA CGACCGGGAG 3070 het 3070 ref 40 20 12 8 CGATGA 0 1 373142 CASAVA_Build 17 20786721 1D GTCCTGCACT G/- GGGGAAAAAG 3070 het 3070 ref 46 24 15 8 G 5 4 373143 CASAVA_Build 17 20789341 5I TTTTCTTTTA -----/TTTAT TTGTTTAACT 3070 het 3070 hom 42 17 20 5 TTTAT 0 1 373144 CASAVA_Build 17 20796902 1D CTTAAAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 8 9 7 T 11 10 373145 CASAVA_Build 17 20803751 1D TTTCCTGGGG T/- TTTTTTTTTT 1497 het 1318 hom 19 6 7 6 T 13 12 373146 CASAVA_Build 17 20812365 2I CTGATTGGTG --/AA AGTTACTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 A 1 3 373147 CASAVA_Build 17 20817464 1I CTGTTACTCT -/C AATTATATTC 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 C 0 1 373148 CASAVA_Build 17 20819611 1D GCTGTCCTTT C/- CCCACCACAG 3070 het 3070 ref 42 21 16 6 C 4 3 373149 CASAVA_Build 17 20836301 1D CATAGAAAAG C/- CCCTCTTAAA 3070 het 3070 hom 48 19 25 4 C 4 3 373150 CASAVA_Build 17 20840129 1I CTGTCTTGAA -/G GGGGGTTCTG 3070 hom 93 het 35 0 32 3 G 5 6 373151 CASAVA_Build 17 20841092 1I ACCCGTGCCC -/A TTCACTTCTC 3070 hom 75 het 30 0 23 7 A 0 1 373152 CASAVA_Build 17 20842774 1D AACAATGGTT C/- TATTTAATAT 3070 het 3070 ref 56 31 20 5 C 1 0 373153 CASAVA_Build 17 20844568 1D CCAGTAAACT G/- GGGCGTCCCA 3070 het 3070 hom 35 11 15 9 G 4 3 373154 CASAVA_Build 17 20845935 16D CTGCCAGGCA GCGGTAGCCAGGCAAT/---------------- GGGATAGAAG 2484 het 2484 ref 31 21 9 9 GCGGTAGCCAGGCAAT 1 0 373155 CASAVA_Build 17 20848674 22D CGGCCTTTCC TAGTGGAGCTGCGGGCAGCCAA/---------------------- TAGTGGAGCT 2613 hom 41 het 17 0 12 8 TAGTGGAGCTGCGGGCAGCCAA 2 1 373156 CASAVA_Build 17 20850298 2I TTGTTGAGAA --/AC ATTCAAAACA 3070 hom 117 het 43 0 38 5 AC 0 1 373157 CASAVA_Build 17 20853371 2D AAAGTGGGGA CC/-- CGGGTGCACT 3070 hom 111 het 38 0 35 3 C 3 1 373158 CASAVA_Build 17 20853593 6D GGCATGCTGG CTCACA/------ CCTGTAATCC 2688 het 2688 ref 15 7 7 1 CTCACA 1 0 373159 CASAVA_Build 17 20853878 2I AAAAAAAATT --/TA AAAAAAAAAA 213 het 213 ref 15 8 2 5 TA 0 1 373160 CASAVA_Build 17 20854475 3D CCAGCTACTC AGG/--- AGAATCACTT 3070 het 2656 hom 21 9 11 2 AGG 1 0 373161 CASAVA_Build 17 20862131 3I TCATTCATTC ---/AAG AAGCCAGAAC 3070 hom 135 het 50 0 46 4 AAG 1 2 373162 CASAVA_Build 17 20862347 1I TAGGGCCAGG -/T GCAGGGGCTC 3070 hom 60 het 24 0 20 4 T 0 1 373163 CASAVA_Build 17 20862610 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAGAAAA 3070 het 20 hom 29 1 22 6 A 5 6 373164 CASAVA_Build 17 20863574 2I CAAAATATTC --/AA AGAGAGTGGT 3070 hom 151 het 51 0 51 0 A 1 3 373165 CASAVA_Build 17 20871161 80D CCACTGCACT CCAGCCTGGACTCCAGACAAAGCGAGACCCTGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAGACACACTATCTGTGTCGTCAG/-------------------------------------------------------------------------------- CCTCAGTTAA 2750 het 2750 ref 25 25 6 10 CCAGCCTGGACTCCAGACAAAGCGAGACCCTGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAGACACACTATCTGTGTCGTCAG 1 0 373166 CASAVA_Build 17 20872855 31D CCCACCTCCT GCTCCTGATCCTGATGGGCACCCCAAGCCCA/------------------------------- GCTCCCATCC 3049 het 3049 ref 27 26 11 1 GCTCCTGATCCTGATGGGCACCCCAAGCCCA 1 0 373167 CASAVA_Build 17 20884324 1I5M3I GCTTAAGGGC -TCCTT---/TTGCTTAAG GCTGGCACAC 3070 het 3070 ref 28 13 10 6 N/A 0 0 373168 CASAVA_Build 17 20888511 1D TATTTACTTA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 36 het 16 0 12 4 T 8 7 373169 CASAVA_Build 17 20889422 1D ATTTATTATC T/- TTTTTTTTAT 3070 hom 81 het 32 0 28 5 T 9 8 373170 CASAVA_Build 17 20890465 1I GTGCCTGTTG -/T TTAATAAGGG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 T 2 3 373171 CASAVA_Build 17 20890757 1I GTGATGGCAC -/G CATTGTAGTC 3070 hom 27 het 11 0 10 1 G 0 1 373172 CASAVA_Build 17 20897125 1I TTTGCATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 669 hom 29 2 19 8 T 12 13 373173 CASAVA_Build 17 20899248 1I CTTCTCTACT -/A AAAAATACAA 1701 het 832 hom 10 3 5 2 A 5 6 373174 CASAVA_Build 17 20900512 1D TACCATCTCC A/- AAAAAAAAAA 2793 het 108 hom 23 2 12 9 A 17 16 373175 CASAVA_Build 17 20915946 4D GGAGTCTCAC TCTG/---- TCTGTCCCCC 3070 hom 72 het 27 0 23 4 TCTG 2 1 373176 CASAVA_Build 17 20927420 1D AGTAAGCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 10 hom 28 2 19 7 T 11 10 373177 CASAVA_Build 17 20928028 1I GATCTCAGCT -/C ACTGCAACCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 0 1 373178 CASAVA_Build 17 20928727 1D TTTCCTTCTG T/- TGTCTGGCAC 3070 hom 86 het 31 0 26 5 T 2 1 373179 CASAVA_Build 17 20936381 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2870 het 2870 ref 31 14 10 7 T 13 12 373180 CASAVA_Build 17 20938943 1D CTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 658 hom 35 5 13 17 T 17 16 373181 CASAVA_Build 17 20939592 1I GCCCTTACTA -/T TTTTTTTTTT 1049 het 1049 ref 39 30 4 5 T 11 12 373182 CASAVA_Build 17 20968721 1I GCCTGGCTGA -/T TTTTTTTGTA 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 T 7 8 373183 CASAVA_Build 17 20970061 1D CTTTTCATGC T/- TTTTTTTTTT 2155 het 1837 hom 33 8 6 19 T 15 14 373184 CASAVA_Build 17 20976242 2D CCCATCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 1638 het 1307 hom 13 5 4 4 A 13 11 373185 CASAVA_Build 17 21000817 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2843 het 833 hom 20 3 11 6 A 15 16 373186 CASAVA_Build 17 21010446 1D ATTTGAGACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 335 hom 34 3 15 16 A 13 12 373187 CASAVA_Build 17 21014766 1I GGAAGCAGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 33 0 27 6 T 10 11 373188 CASAVA_Build 17 21023668 1D TTTCACTTTC T/- TTTTTTTTTT 2328 het 1857 hom 25 8 7 10 T 15 14 373189 CASAVA_Build 17 21025784 5I TATATAGAAT -----/CATGC CATCTGCAAA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 CATGC 0 1 373190 CASAVA_Build 17 21029761 2D CCTGGCTAAC TT/-- TTGTATTTTT 1340 het 1340 ref 9 3 4 2 T 4 2 373191 CASAVA_Build 17 21037243 1D TTCTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 32 3 17 12 T 12 11 373192 CASAVA_Build 17 21041185 1D TTTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 73 het 38 0 20 18 T 15 14 373193 CASAVA_Build 17 21047406 1D CAGATCACTT G/- ATGTCAGGAG 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 G 1 0 373194 CASAVA_Build 17 21049953 1D TGCTTTTTTT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 2090 hom 30 10 13 7 G 10 9 373195 CASAVA_Build 17 21056256 22D GTCAAGCTGA CAGGTGATTTGAGTCAAGCTGT/---------------------- CAGGTGATTT 3070 het 3070 hom 48 19 19 16 CAGGTGATTTGAGTCAAGCTGT 2 1 373196 CASAVA_Build 17 21056778 4I GGTCCAATCT ----/AAGA AATACCAGGC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 AAGA 0 1 373197 CASAVA_Build 17 21073654 1D CAGTAAATTC T/- TTTTTTTTTT 1237 het 589 hom 26 5 6 15 T 17 16 373198 CASAVA_Build 17 21080677 1D CAATGGCTGG A/- AAAAAATGGG 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 7 6 373199 CASAVA_Build 17 21083142 1D CGAGGCAGGA C/- CCCCCCGCAG 3070 het 46 hom 30 0 11 19 C 7 6 373200 CASAVA_Build 17 21083327 2I CCCCCGACTC --/TG AGCCTCAGTA 3070 hom 60 het 22 0 20 2 TG 0 1 373201 CASAVA_Build 17 21087328 1D ACGAAGTCCA G/- GGGCGGCCTG 3070 hom 30 het 24 0 12 12 G 4 3 373202 CASAVA_Build 17 21103517 1I CTTTACTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 11 11 T 10 11 373203 CASAVA_Build 17 21104970 1D GTGTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 291 hom 31 1 24 7 T 12 11 373204 CASAVA_Build 17 21105898 1D AATAAAACAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 510 hom 20 2 14 4 A 15 14 373205 CASAVA_Build 17 21105913 1D AAAAAAAAAA G/- AATGACCACC 3070 het 554 hom 27 4 16 8 G 1 0 373206 CASAVA_Build 17 21114414 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2440 het 754 hom 10 3 5 2 T 13 12 373207 CASAVA_Build 17 21129805 1I AAAAGGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 38 1 22 15 T 12 13 373208 CASAVA_Build 17 21137230 1D TCCTTCCCTC T/- CCAGCGAGGC 3070 het 3070 hom 51 18 24 9 T 1 0 373209 CASAVA_Build 17 21139699 2D GCTTGGTGAA GG/-- GGGGGCCACA 3070 het 2980 hom 41 11 12 19 G 7 5 373210 CASAVA_Build 17 21139970 1I CTTAGGGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 60 22 29 9 T 10 11 373211 CASAVA_Build 17 21141910 1D ACCTGCAGCT A/- ATGAAGCCCC 3070 het 306 hom 45 4 34 9 A 2 1 373212 CASAVA_Build 17 21142976 1D CTGCGCTGCT G/- GCTGTGTGGC 3070 het 3070 hom 66 28 25 14 G 2 1 373213 CASAVA_Build 17 21143621 16D GGCACGGTGG CTCACGCCTGTAAGCC/---------------- CAGCACTTTG 540 het 540 ref 10 9 2 6 CTCACGCCTGTAAGCC 1 0 373214 CASAVA_Build 17 21145174 4D CAGTTCTGTC TGTG/---- TGACCATTCG 3070 het 3070 ref 75 38 25 16 TG 3 1 373215 CASAVA_Build 17 21145535 1D TCAGCATCCT C/- TGTGCCAGCC 3070 het 3070 hom 55 16 25 14 C 1 0 373216 CASAVA_Build 17 21147640 2D GGTGTGGTCT CA/-- GTTTGTTCCT 3070 het 3070 ref 90 44 33 13 CA 1 0 373217 CASAVA_Build 17 21147935 24D CAAACACGCA GATCCTGCCTCCCAGGCTTTAATT/------------------------ GATCCTGCTG 3070 het 3070 ref 50 29 16 11 GATCCTGCCTCCCAGGCTTTAATT 1 0 373218 CASAVA_Build 17 21150399 3D TCATGGAATT TTG/--- TTGTTTTTGA 3070 het 3070 ref 67 33 15 20 TTG 2 1 373219 CASAVA_Build 17 21150765 1D ATCGCAGCTC A/- CTGCAGCCTT 3070 het 3070 ref 61 30 18 14 A 1 0 373220 CASAVA_Build 17 21151106 1I GCAGCCCCAT -/C CTGAGGCTGT 3070 het 3070 ref 78 36 23 19 C 1 2 373221 CASAVA_Build 17 21151334 1D CAGATGCGGA G/- GCCTCTGCAA 3070 het 3070 ref 70 40 18 12 G 2 1 373222 CASAVA_Build 17 21151519 10I GCAGGTGTTG ----------/TGGGTTTTAC TGGGTTTTAC 1005 het 1005 ref 62 41 4 17 TGGGTTTTAC 1 2 373223 CASAVA_Build 17 21153352 2I TAACATAAAA --/AC ATAGAGGCAC 3070 het 3070 hom 51 22 24 5 AC 0 1 373224 CASAVA_Build 17 21156028 1I GGGCCTCTGA -/C CCCCCTGTCC 3070 het 3070 hom 50 17 17 16 C 5 6 373225 CASAVA_Build 17 21157121 1D GAGCATTGCA G/- CCCCATTTTG 3070 het 3070 ref 70 35 24 11 G 1 0 373226 CASAVA_Build 17 21157611 3D TACCTGGCTC CCT/--- CCTCCCTCCT 3070 het 3070 hom 58 22 28 9 CCT 2 1 373227 CASAVA_Build 17 21158763 2I ATTCACCTTT --/TC CGTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 69 22 24 23 TC 0 1 373228 CASAVA_Build 17 21158974 1I AGCTCACTCT -/C CCCTGAGGAC 3070 het 3070 ref 46 17 19 10 C 3 4 373229 CASAVA_Build 17 21159458 1I ACAGCCAGGT -/G CACAGAGCAG 3070 het 3070 ref 64 31 20 13 G 0 1 373230 CASAVA_Build 17 21159547 1D CAGATGGGAA C/- AACAGACCCA 3070 het 3070 ref 73 36 25 14 C 1 0 373231 CASAVA_Build 17 21161213 1I GGGAGCGGCC -/A GCCCCCCCCT 2193 het 2018 hom 36 11 11 14 A 0 1 373232 CASAVA_Build 17 21163146 3I AGAAAAGAAT ---/AAA GAAGAAGAAA 3070 het 3070 hom 80 15 51 14 A 0 3 373233 CASAVA_Build 17 21163984 1D GAAATTCTTT C/- CTTGTCTGCC 3070 het 3070 ref 79 52 16 11 C 2 1 373234 CASAVA_Build 17 21164069 2D3M5I TGACAGCAGG GCCTT-----/--CTTGACCC ATCTGGGTTG 3070 het 3070 hom 79 35 37 17 N/A 0 0 373235 CASAVA_Build 17 21166065 1I GGAGGTTGAC -/A GTTGTGGAAA 3070 het 3070 ref 84 38 36 10 A 0 1 373236 CASAVA_Build 17 21166864 8D CCGTCTCGAA AAACACAC/-------- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 48 27 10 16 AAACACAC 1 0 373237 CASAVA_Build 17 21167458 1D CGTCGGAGGT G/- GGGAAAAGGA 1860 het 1860 ref 81 43 10 28 G 4 3 373238 CASAVA_Build 17 21167635 1I AGGAGGGGTT -/A GGGGCGTTTC 3070 het 3070 hom 70 26 31 13 A 0 1 373239 CASAVA_Build 17 21168193 1I GTTGATTTAT -/A TCCTTCTAGC 3070 het 3070 hom 77 29 36 14 A 0 1 373240 CASAVA_Build 17 21169475 1I20M1D AACAAAATAT -AAAAAAAGGAAAATAGAATTA/AAAAAAAAGGAAAATAGAATT- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 92 70 13 20 N/A 0 0 373241 CASAVA_Build 17 21169572 3D CTCTTCCTCT TCC/--- TCTTCTTCTT 3070 het 3070 ref 79 38 29 20 TCC 1 0 373242 CASAVA_Build 17 21170369 1I AAAAATTAGC -/A CGGCGTGGTA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 0 1 373243 CASAVA_Build 17 21171442 1D TTTATTTATT C/- TTTATCTGAG 3070 het 3070 ref 80 60 13 7 C 1 0 373244 CASAVA_Build 17 21173439 4D TTTCTCCCTT CTTC/---- CCTCCCTCCC 3070 het 3070 ref 92 53 17 27 CTTC 1 0 373245 CASAVA_Build 17 21173708 1D ATGCCCAGTT A/- ATTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 62 48 11 6 A 2 1 373246 CASAVA_Build 17 21174473 1D GCCCACAGAC T/- GACCGGTGGG 3070 het 3070 ref 55 28 14 13 T 1 0 373247 CASAVA_Build 17 21175153 4I TTAATCTGTC ----/CTGA CTAACACAGG 3070 het 3070 ref 75 37 30 8 CTGA 0 1 373248 CASAVA_Build 17 21176893 1D59M1I GCTTCAGGAG TTTTTTAATCCACAGGCTTTTTAAGCTATTTTGTCATCAAACGTGTCAGTCTATTCTTTT-/-TTTTTAATCCACAGGCTTTTTAAACTATTTTGTCATCAAACGTGTCAGTCTATTATTTTG CGGCTTGTCT 2895 het 2895 ref 57 47 7 22 N/A 0 0 373249 CASAVA_Build 17 21177376 1D AACTGCTTTA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 56 14 36 8 T 9 8 373250 CASAVA_Build 17 21181191 36D TAAGGAACCA GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT/------------------------------------ GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 65 48 13 15 GT 25 7 373251 CASAVA_Build 17 21181325 1I AGAGAACTCA -/C CCCATGCACC 3070 het 3070 ref 61 25 25 11 C 3 4 373252 CASAVA_Build 17 21184969 3I CTCCATCTCC ---/AAA AAAAAAAAAA 2737 het 2737 ref 50 20 12 18 A 11 14 373253 CASAVA_Build 17 21186971 2I AAGATTAATT --/GA GTTAATGCAC 3070 het 3070 ref 86 54 18 14 GA 0 1 373254 CASAVA_Build 17 21188206 4D TCCCTTTGAA CTGT/---- CTGTCTGTCT 3070 het 3070 hom 90 26 42 28 CTGT 3 2 373255 CASAVA_Build 17 21189047 1D TCTTCCCCAG A/- GACTCCAGGT 3070 het 3070 ref 90 64 17 10 A 1 0 373256 CASAVA_Build 17 21189627 2D CAGTCTCAGC TG/-- TCTGCAACCT 1508 het 1508 ref 23 18 4 3 TG 1 0 373257 CASAVA_Build 17 21190662 1D GTTCTTTGTG C/- TGTAGCTGCA 3070 het 3070 ref 74 35 9 34 C 1 0 373258 CASAVA_Build 17 21191109 1D GCCCTTCCCG C/- CCCCTGGTCC 2130 het 2130 ref 63 47 9 8 C 5 4 373259 CASAVA_Build 17 21195230 1D CCTGTAGTGC T/- TGGGATTACA 3070 het 3070 ref 61 36 21 4 T 2 1 373260 CASAVA_Build 17 21203381 2D CCTCAAGGAG AA/-- AAACAGTGTT 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 5 3 373261 CASAVA_Build 17 21209492 2D CTGGATTCCC CT/-- GTGGAGGCTT 3070 het 3070 ref 48 24 14 11 CT 1 0 373262 CASAVA_Build 17 21244158 1I16M1I GAGCGGCCTG -CCCCACCCTGTCCCCT-/CCCCCACGCTGTCCCCTC TCAGAGCTCA 3070 het 3070 hom 70 23 33 23 N/A 0 0 373263 CASAVA_Build 17 21245113 25D GGGGTCTGGG GACCAAGGAAGGGCATCCCGACTGT/------------------------- GACCTGAGCT 3070 het 3070 ref 53 28 19 18 GACCAAGGAAGGGCATCCCGACTGT 1 0 373264 CASAVA_Build 17 21246246 1I10M1D CTTTTTTTTT -CCTCAGCCTGT/CCCTCAGCCTG- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 74 22 27 30 N/A 0 0 373265 CASAVA_Build 17 21257453 1I GCTCCTCCGT -/G CGGGGCTAAT 3070 het 3070 ref 66 33 11 23 G 0 1 373266 CASAVA_Build 17 21258893 1I GGCAGGCACT -/G GTTAGATTCA 3070 het 3070 ref 78 37 20 21 G 1 2 373267 CASAVA_Build 17 21260244 3D CGTGCTCTTC GAG/--- GAGAAGAACC 3070 het 3070 ref 68 40 14 17 GAG 2 1 373268 CASAVA_Build 17 21261012 4I6M5D CATGCAATTG ----AAAAAATTTTT/GAGAAAAAAA----- TTTTAATTCA 3070 het 3070 ref 58 28 16 22 N/A 0 0 373269 CASAVA_Build 17 21264714 5I TAGCATCTGT -----/CTCCA CTTCACTCAA 3070 het 3070 ref 74 32 30 12 CTCCA 0 1 373270 CASAVA_Build 17 21265404 5D AGGCCCCCAC AGGGT/----- AGTTCCTCAA 3070 het 3070 ref 87 55 28 14 AGGGT 1 0 373271 CASAVA_Build 17 21265845 1D TCCTTGCCCG C/- TTCACCTCTG 3070 het 3070 ref 64 32 22 11 C 1 0 373272 CASAVA_Build 17 21266756 1I TTCTGGTGCA -/G GGGAAGGATA 3070 het 3070 hom 83 26 40 19 G 3 4 373273 CASAVA_Build 17 21267375 1D CCCAGCTCCT C/- CCCGGCCTCC 3070 het 3070 ref 68 48 15 10 C 4 3 373274 CASAVA_Build 17 21267446 1I GGAGCAGGAC -/T TTTTTGTTCT 3070 het 3070 hom 81 27 39 15 T 5 6 373275 CASAVA_Build 17 21268247 2D GCCCGCCCCA AC/-- CCCCAGCCCC 3070 het 3070 ref 87 51 20 21 AC 1 0 373276 CASAVA_Build 17 21268690 1D TCTAGCTGCC A/- TGATCTGGGG 3070 het 3070 ref 55 24 12 19 A 1 0 373277 CASAVA_Build 17 21268936 8I CCCTGGGACT --------/AGGGTAGG GGGCTGAGTG 2655 het 2655 ref 72 45 11 16 AGGGTAGG 0 1 373278 CASAVA_Build 17 21269665 1D TTAAATTTTT C/- TTAAAGTGGG 3070 het 3070 ref 88 57 20 13 C 1 0 373279 CASAVA_Build 17 21269877 1D GGAGAGGGCA C/- GGGGGTGGAA 3070 het 3070 ref 83 52 23 18 C 1 0 373280 CASAVA_Build 17 21269957 1D GGTTGGATGA G/- GCAGAAAGAC 3070 het 3070 hom 79 30 41 8 G 2 1 373281 CASAVA_Build 17 21271112 1I GGAAAAAGGG -/A AGCTAGAGCC 3070 het 3070 ref 78 34 30 14 A 1 2 373282 CASAVA_Build 17 21272403 1D GCATCCTTAA T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 54 28 20 6 T 9 8 373283 CASAVA_Build 17 21273085 1I GGCACTTTTC -/G AAATTATCTG 3070 het 3070 ref 54 30 19 5 G 0 1 373284 CASAVA_Build 17 21273805 4I ACCATGTGAG ----/GACT GACACAGGGA 3070 het 3070 ref 68 36 26 7 GACT 0 1 373285 CASAVA_Build 17 21274198 1I CTCAGGCAAA -/G GGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 77 43 24 10 G 2 3 373286 CASAVA_Build 17 21274985 1D CCAGACTAAA G/- GGGAAAATTT 3070 het 3070 ref 67 47 15 6 G 4 3 373287 CASAVA_Build 17 21275449 3I ACAGGCTCTT ---/CTC CTGATGGTCT 3070 het 3070 ref 80 53 18 9 CTC 0 1 373288 CASAVA_Build 17 21276010 3D ATGGAATCAC ACA/--- ACATGTGGCC 3070 het 3070 ref 78 51 12 17 ACA 2 1 373289 CASAVA_Build 17 21276762 1I TTTGGTTCCA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 84 64 17 3 T 6 7 373290 CASAVA_Build 17 21277059 4D GTTGAGCAGG GACC/---- GACCCCCTGC 3070 het 3070 hom 47 20 21 7 GACC 2 1 373291 CASAVA_Build 17 21277414 1I TATATATGTA -/T GTATGTATTT 3070 het 3070 hom 61 13 39 9 T 0 1 373292 CASAVA_Build 17 21277514 1D CTCAATGAAA C/- CCATGTAAGA 3070 het 3070 ref 78 48 24 8 C 3 2 373293 CASAVA_Build 17 21278415 1D AAGGACAGTG T/- TTTTTCCTCT 2162 het 2162 ref 86 70 7 10 T 6 5 373294 CASAVA_Build 17 21278859 1D GAGACCAGAA C/- CTTTACATAT 3070 het 3070 ref 81 58 16 7 C 2 1 373295 CASAVA_Build 17 21279368 1I TACTTACCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 88 26 46 16 A 9 10 373296 CASAVA_Build 17 21282087 12D CACACACACA CACACACACACG/------------ CACACACACA 3070 het 3070 ref 69 41 28 8 CACACACACACG 1 0 373297 CASAVA_Build 17 21282856 1I TCAAACCCAA -/C CCACACCCCA 3070 het 2413 hom 68 8 49 11 C 2 3 373298 CASAVA_Build 17 21283907 4D AATCTTCTGA TAAT/---- TAGTCACATA 3070 het 3070 ref 76 52 19 9 TAAT 1 0 373299 CASAVA_Build 17 21284627 1D CTAATTATAA T/- AAACTTTTGA 3070 het 3070 ref 61 45 12 4 T 1 0 373300 CASAVA_Build 17 21284720 1I TGCCTGTATT -/G AATATGCTCT 3070 het 3070 hom 70 30 37 3 G 0 1 373301 CASAVA_Build 17 21285985 1D GGGGAGGGCT G/- GGGGGGCAAG 3070 het 3070 ref 64 42 13 10 G 7 6 373302 CASAVA_Build 17 21287442 1D GCATGAAAAC A/- ACATTAATCT 3070 het 3070 ref 67 50 11 7 A 2 1 373303 CASAVA_Build 17 21287636 2D AAGCACAGGC AG/-- AGTTAATTTA 3070 het 3070 ref 78 54 12 13 AG 2 1 373304 CASAVA_Build 17 21288207 1D TTTCAAAAAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 71 45 13 14 T 10 9 373305 CASAVA_Build 17 21288781 4D AAACTTCAGG TTCT/---- TTGTCAATGA 3070 het 3070 ref 56 29 20 10 TTCT 1 0 373306 CASAVA_Build 17 21289628 3I ACTCTCACCT ---/TTC TTTTTAAAAA 3070 het 3070 ref 54 29 15 12 TTC 0 1 373307 CASAVA_Build 17 21289917 1I TGTTTCTGCC -/T TAGTTTGCTA 3070 het 3070 hom 71 29 34 8 T 1 2 373308 CASAVA_Build 17 21290393 1I GATATTGAGC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 55 37 13 6 T 8 9 373309 CASAVA_Build 17 21291758 2I CCATCATACA --/TG TGTGCCCTTG 3070 het 3070 ref 78 46 16 16 TG 2 3 373310 CASAVA_Build 17 21292166 3I GTCAGTTACA ---/TCT TCTTTTGGTA 3070 het 3070 ref 75 35 11 29 TCT 1 2 373311 CASAVA_Build 17 21292200 13I GGGGGTGCCC -------------/CTGAAGACACCAG CTGAGCTTCC 3070 het 3070 ref 72 36 17 19 CTGAAGACACCAG 0 1 373312 CASAVA_Build 17 21293334 4D GTTTTTATAC TTTT/---- TGACCTAGTA 3070 het 3070 ref 65 43 18 6 T 5 1 373313 CASAVA_Build 17 21293900 1I AAGAACTGTA -/T TGTAGCTTGA 3070 het 3070 ref 63 30 29 5 T 1 2 373314 CASAVA_Build 17 21305578 5I ATGAGTATCT -----/TATCA TATCACACTG 3070 het 3070 hom 56 27 28 1 TATCA 1 2 373315 CASAVA_Build 17 21311745 4D GAGCAGAGAC AAAG/---- AAGCCACAGG 3070 het 3070 ref 41 17 12 15 AAAG 1 0 373316 CASAVA_Build 17 21318528 1I TAATTTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 490 hom 33 2 23 8 T 13 14 373317 CASAVA_Build 17 21321163 1D CACCCCTCCC G/- GGCCTTCTGC 3070 hom 72 het 32 0 21 12 G 3 2 373318 CASAVA_Build 17 21325205 1I TAAAATCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 913 hom 27 4 15 8 A 14 15 373319 CASAVA_Build 17 21343346 1I AACATTATGA -/T TTTTTTTTTT 2827 het 2827 ref 29 15 8 6 T 10 11 373320 CASAVA_Build 17 21387229 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2450 het 854 hom 19 4 10 5 T 12 13 373321 CASAVA_Build 17 21389799 3D CTGACCTCAC GTT/--- GTGGGCACTG 3070 het 3070 ref 40 17 14 10 GTT 1 0 373322 CASAVA_Build 17 21390250 1I CACCTTCTGG -/A ATGAGACAAA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 A 1 2 373323 CASAVA_Build 17 21427728 1D TCCATCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 8 4 A 11 10 373324 CASAVA_Build 17 21428157 1D GTCATTTTGA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 ref 24 17 7 0 T 9 8 373325 CASAVA_Build 17 21429183 1I TTATAATTTT -/C CAGAGATGAT 1872 het 1872 ref 28 19 4 5 C 1 2 373326 CASAVA_Build 17 21447722 1D CAGGAGTGGC A/- AAGCTGAGAT 3070 het 3070 hom 79 21 42 17 A 3 2 373327 CASAVA_Build 17 21448227 2I ATGCTGATAC --/AT ATATATATAC 3070 het 3070 ref 52 26 11 15 AT 4 5 373328 CASAVA_Build 17 21448577 3D10M3D GAGAGGACAA AACAACAAAACATATC/---AACAAACCAT--- ATCAAGTAAC 3070 het 3070 ref 54 37 10 12 N/A 0 0 373329 CASAVA_Build 17 21448834 6D TAAAATATTA TTAAAT/------ TTAAATTAAA 3070 het 3070 ref 41 23 16 4 TTAAAT 2 1 373330 CASAVA_Build 17 21448959 4I TGTAAATCTA ----/ACTG TACTAGTAAC 3070 het 3070 ref 69 37 29 3 ACTG 0 1 373331 CASAVA_Build 17 21449466 4I TTAGACATTT ----/AAAG AACACTGTAA 3070 het 3070 hom 51 21 24 7 AAAG 0 1 373332 CASAVA_Build 17 21449725 3D TACTTTAAAA ATT/--- AAAGATAAAA 1047 het 1047 ref 37 12 3 23 ATT 1 0 373333 CASAVA_Build 17 21450050 4I CACTAAACTT ----/AAAG AAATAAAAAA 3070 het 3070 ref 65 45 14 6 AAAG 0 1 373334 CASAVA_Build 17 21450131 1I CAAATTCTAA -/G GAAAGGTTCA 3070 het 3070 ref 39 21 12 6 G 1 2 373335 CASAVA_Build 17 21450194 4D GTAAAGAGAT AAAG/---- TTAGTAATCA 3070 het 3070 ref 49 32 11 9 AAAG 1 0 373336 CASAVA_Build 17 21450320 1I TGCAAAAAAA -/G AAAGAGAATA 3070 het 3070 ref 39 24 15 0 G 0 1 373337 CASAVA_Build 17 21450392 1D CAATAGCATC A/- AAAAAAAAAA 2126 het 401 hom 40 5 9 26 A 16 15 373338 CASAVA_Build 17 21450502 5I TACATAAAAC -----/ATATA ATATACTATA 3070 het 3070 ref 49 25 21 4 ATATA 1 2 373339 CASAVA_Build 17 21450590 4I TCAATTATAT ----/TGAG TTTCATTTTC 3070 het 3070 ref 60 42 11 7 TGAG 0 1 373340 CASAVA_Build 17 21450665 1I CCTAGACTCA -/T TATCTGGACT 3070 het 3070 ref 64 50 12 2 T 1 2 373341 CASAVA_Build 17 21450846 4D AAATGATACC ATCA/---- ATCAAAAAGA 3070 het 3070 ref 91 68 15 11 ATCA 2 1 373342 CASAVA_Build 17 21451093 2I CTCATGTAAC --/TT TATCTAGAAA 3070 het 3070 ref 50 23 9 18 T 1 3 373343 CASAVA_Build 17 21451186 6I AATCTGTGTT ------/AGTTAA TGTTAGTATA 3070 het 3070 ref 27 18 9 0 AGTTAA 0 1 373344 CASAVA_Build 17 21451479 2I45M2I GTATTTTCAG --ATGAGTACACACAATGAAAACAATTAAAAAAACAAAATTACCATT--/ATATGAATACACACAATGAAAACAACTAAAAAGACAAAATTACCATTCA CAGTTTGCCT 3070 het 3070 ref 60 45 24 16 N/A 0 0 373345 CASAVA_Build 17 21451567 1I GTCATATAAA -/C CATAGTTTAT 1433 het 1433 ref 57 42 4 11 C 1 2 373346 CASAVA_Build 17 21452069 8D29M1D AGGGATATTA ATTAACTGAAAGGGTTTTTGTGCTTACTTTAGACAATA/--------AAAGGATTTTTGTGCTTACTTTAGACAAT- AAGAAATTAT 3070 het 3070 ref 37 31 10 12 N/A 0 0 373347 CASAVA_Build 17 21452167 8I CAAAGTATGA --------/CATTCTTT CCTAAATGTC 3070 het 3070 ref 57 25 28 4 CATTCTTT 0 1 373348 CASAVA_Build 17 21452235 4D TTTATTCACC TAAA/---- TAGACTGTTT 2370 het 2370 ref 80 66 8 7 TAAA 1 0 373349 CASAVA_Build 17 21452550 1D TCAGATTTTT C/- AAGAGTTGGA 3070 het 3070 ref 69 53 8 9 C 1 0 373350 CASAVA_Build 17 21452649 1D GAATAAGAAT A/- AAAGCTGATG 1544 het 1544 ref 62 37 5 20 A 4 3 373351 CASAVA_Build 17 21453003 2D TAGACGTGTT AC/-- ACCTTTTGAG 3070 het 3070 ref 68 49 8 14 AC 2 1 373352 CASAVA_Build 17 21453038 2I TTCATATCTG --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 64 33 16 16 GT 8 9 373353 CASAVA_Build 17 21453258 6I TTTAATAAAG ------/GTAAAT ATAAAGTACA 3070 het 3070 ref 87 64 13 11 GTAAAT 0 1 373354 CASAVA_Build 17 21453368 2D AGTTTATCTG TA/-- TATATTATGA 3070 het 3070 ref 72 35 29 9 TA 3 2 373355 CASAVA_Build 17 21453469 3D TGGTCATATA CTT/--- CTTAAGCCAA 3070 het 3070 ref 76 52 19 8 CTT 2 1 373356 CASAVA_Build 17 21453547 2I ACTTAAAGCA --/AC ACATTATGAA 3070 het 3070 ref 71 37 28 7 AC 1 2 373357 CASAVA_Build 17 21453878 3D GACTGATTCT CTC/--- CTAACTAGTT 3070 het 3070 ref 50 36 9 6 CTC 1 0 373358 CASAVA_Build 17 21453966 4I TTTATAAAGC ----/TAGT TAACCACCTA 3070 het 3070 ref 77 48 25 6 TAGT 0 1 373359 CASAVA_Build 17 21454042 3I AATGAATTCC ---/CCA CTTCAACCCC 3070 het 2722 hom 40 6 28 6 CCA 0 1 373360 CASAVA_Build 17 21454314 1D CAGGGCTGTT A/- AAAGTATATA 2459 het 2459 ref 25 18 6 2 A 4 3 373361 CASAVA_Build 17 21455151 1D ATTAAAAAAA T/- CTACCCCAAA 3070 het 3070 ref 47 29 9 9 T 1 0 373362 CASAVA_Build 17 21456665 1I GGCCTAGAGG -/T TTTTTCTCTC 2253 het 2253 ref 24 17 5 2 T 5 6 373363 CASAVA_Build 17 21456921 3I GGAGAGCGGT ---/CAG CAGCAGCAGG 3070 het 3070 ref 70 30 16 24 CAG 3 4 373364 CASAVA_Build 17 21457771 1I GGCGATTTTC -/T TCTGCTCGAG 3070 het 3070 ref 64 32 25 8 T 1 2 373365 CASAVA_Build 17 21458642 3D CCTCCCCCTT CTC/--- CTGCAATCTC 3070 het 3070 ref 92 56 19 24 CTC 1 0 373366 CASAVA_Build 17 21458730 4D ACAAAATTTA GAGG/---- GTGACTATTT 3070 het 3070 ref 89 45 40 11 GAGG 1 0 373367 CASAVA_Build 17 21458880 2D TTCCATTGTG TA/-- TTTTCTTCTC 3070 het 3070 ref 80 44 10 27 TA 1 0 373368 CASAVA_Build 17 21458924 3I TCTTTTGCTA ---/CTG CTACTATTTC 3070 het 3070 hom 44 15 21 8 CTG 0 1 373369 CASAVA_Build 17 21458995 1D TAGCCTTAAC A/- AACCAAAACT 3070 het 3070 ref 69 40 18 13 A 3 2 373370 CASAVA_Build 17 21459085 1D TGAGGAAAAA G/- AAATCAGTTG 3070 het 3070 ref 86 56 23 9 G 1 0 373371 CASAVA_Build 17 21459242 1I GCAAAAATTC -/A AAAAATTGCA 3070 het 3070 hom 85 35 44 16 A 5 6 373372 CASAVA_Build 17 21459439 2D43M1I ATTCCCTTCA TTTTTTTTTTCTGCCACCATTTTCAAGAGTATTGTCATCTGCATG-/--TTTTTTTTCTGCCACCATTTTCAAGAGTATTATCATCTGCATGA GCAAAGGGTT 3070 het 3070 ref 74 59 19 35 N/A 0 0 373373 CASAVA_Build 17 21459958 4I CTGCGTATAG ----/TCCT TTGTTTATAG 3045 het 3045 ref 44 28 10 6 TCCT 0 1 373374 CASAVA_Build 17 21460651 4I AGATGTATTT ----/ATGG ATGGTAAGAA 3070 het 3070 ref 91 52 20 19 ATGG 1 2 373375 CASAVA_Build 17 21460834 1I AGAAAAACTT -/A ACCACTGCTA 3070 het 3070 ref 86 59 17 10 A 1 2 373376 CASAVA_Build 17 21461196 8D TGTTTTGCCT ACTTTCAG/-------- ACTTCCGGAT 3070 het 3070 ref 45 28 8 13 ACTTTCAG 1 0 373377 CASAVA_Build 17 21461494 3I CTGATCTCGA ---/GCT ACTGGCCTCA 3070 het 3070 hom 53 18 29 7 GCT 0 1 373378 CASAVA_Build 17 21461918 4I AGAAGAATTT ----/TTTG TTTGTTTTTT 3070 het 3070 hom 60 17 37 6 TTTG 1 2 373379 CASAVA_Build 17 21462082 2I ATGTATATTT --/TC TTTTTCTAGA 3070 het 3070 ref 58 37 13 9 TC 0 1 373380 CASAVA_Build 17 21462628 1D TCCTCCCACC T/- TGGCCTCCTG 3070 het 3070 ref 55 34 14 7 T 2 1 373381 CASAVA_Build 17 21462699 1I TTTAAAAAAG -/A AAAAAAAATT 3070 het 1984 hom 62 7 45 10 A 8 9 373382 CASAVA_Build 17 21464115 2D AAATCAAAAC TT/-- ATGCTATCTA 3070 het 3070 ref 54 42 10 4 T 2 0 373383 CASAVA_Build 17 21464374 1D ATTCTTCCAG T/- TTTTTTTTCT 486 het 486 ref 48 29 4 15 T 9 8 373384 CASAVA_Build 17 21464499 1I41M2D ACAGCAACTT -AATACCCCATTTCTAGTACATGAAAATACCATAATTTGCCAGC/AAATACCCCATTTCTAGTACATGAAAATACCATAATTTGCCA-- GGCACGGTGA 3070 het 3070 ref 67 37 17 37 N/A 0 0 373385 CASAVA_Build 17 21464867 2D GGTCACTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 76 22 22 33 T 13 11 373386 CASAVA_Build 17 21464906 4D TGTAAACAAT TGTG/---- TGTGTGTGTA 3070 het 3070 ref 76 29 13 36 TG 6 4 373387 CASAVA_Build 17 21466272 3I CCTCCCAAAG ---/TGT TGTTGGGATT 1615 het 1615 ref 38 15 4 20 TGT 1 2 373388 CASAVA_Build 17 21466536 2I41M1I GCTGTGACTC --ATTAATTTATTGATGTGACTTTTGTGTTTTGTGCTCAAAGT-/TTGTTAATTTATTTATGTGACTTTTGTGTTTTGTGCTCTACTTA AGACTTTCCT 3070 het 3070 ref 51 51 10 3 N/A 0 0 373389 CASAVA_Build 17 21467171 1I TTCATTACTC -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 84 70 12 2 T 8 9 373390 CASAVA_Build 17 21467557 1D GAATATACTC A/- AATAAAATGA 3070 het 3070 ref 67 48 13 7 A 3 2 373391 CASAVA_Build 17 21467920 5D AGTAGTTGAG ACTTT/----- ATTTGCAGTG 3070 het 3070 ref 74 62 9 9 ACTTT 1 0 373392 CASAVA_Build 17 21468705 3I ATTAAAATTT ---/TTC TTATCTTAAT 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 TTC 0 1 373393 CASAVA_Build 17 21468922 1D TTCCTGAGTA G/- GTGGGATTAC 1903 het 1903 ref 27 16 6 5 G 2 1 373394 CASAVA_Build 17 21470300 5D TCAGCTTTCT TTAAA/----- TTATCCCCAG 2705 het 2705 ref 88 76 7 10 TTAAA 1 0 373395 CASAVA_Build 17 21471122 3D ATTTGAAATT CTG/--- TTGTTGCAAG 3070 het 3070 ref 71 49 14 8 CTG 1 0 373396 CASAVA_Build 17 21471313 2I ATGACAGTGA --/TG CATAATTATT 3070 het 3070 hom 89 10 71 8 TG 0 1 373397 CASAVA_Build 17 21472232 11D TAGAAAAAAA TGGGATGACCC/----------- TGGGTTAAAA 1350 het 1350 ref 59 37 7 27 TGGGATGACCC 1 0 373398 CASAVA_Build 17 21472260 3D AAATCTTTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 2686 hom 57 11 13 35 T 17 14 373399 CASAVA_Build 17 21475284 4I ATACTCCCAT ----/ATGA ATTATGTATA 3070 het 3070 hom 76 26 44 6 ATGA 0 1 373400 CASAVA_Build 17 21475763 1D CGGCTCACTG C/- AACCTCTGCC 2941 het 2622 hom 15 7 7 1 C 1 0 373401 CASAVA_Build 17 21476741 3D AAATTGCACG TGT/--- TTTTTGTGTT 3070 het 3070 ref 84 61 20 3 TGT 1 0 373402 CASAVA_Build 17 21477408 1D GGGCATTCTT A/- ACGTTGTTCC 3070 het 3070 ref 85 47 31 7 A 2 1 373403 CASAVA_Build 17 21477543 1D25M3D TCATGATTGG ATGTTGAATTTTGCTTGTGTTGTCCCCCT/-TGTTGAATTTTGCTTGTGTTGTCCC--- CCTACACCAG 3070 het 3070 ref 84 74 14 13 N/A 0 0 373404 CASAVA_Build 17 21477942 1I AACTTTGAAG -/T TTAGTTTATA 3070 het 3070 ref 43 30 10 3 T 2 3 373405 CASAVA_Build 17 21478095 8D2M1D CTTGGCACCC ACCCGTGTCAG/--------CA- TCCTCCTCTC 2405 het 2405 ref 70 45 14 21 N/A 0 0 373406 CASAVA_Build 17 21478294 1I TATTGTTGAG -/T ATGGGTATAC 3070 het 3070 ref 80 59 9 12 T 0 1 373407 CASAVA_Build 17 21478480 1D GTCCGATGTA C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 23 12 6 C 1 0 373408 CASAVA_Build 17 21479809 2D TCAATTTTTC TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 57 23 14 20 T 10 8 373409 CASAVA_Build 17 21480438 1I TTAAAGTGAG -/A TGTGTTGTGT 3070 het 3070 ref 90 54 29 7 A 0 1 373410 CASAVA_Build 17 21480698 2D ATTTGTTAGA TT/-- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 47 20 14 16 T 10 8 373411 CASAVA_Build 17 21480772 2D AAAATTACCT AC/-- AGTTTTACCA 2350 het 2350 ref 57 39 5 15 AC 1 0 373412 CASAVA_Build 17 21480883 4D TTTTTCTTTC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2472 het 1569 hom 33 13 9 12 T 16 12 373413 CASAVA_Build 17 21481113 4I ACTGATTAAA ----/TAGT TATTTATTTA 2691 het 2691 ref 38 11 8 19 TAGT 0 1 373414 CASAVA_Build 17 21481500 4D ATTATTTAGG TTGT/---- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 55 17 18 20 TTGT 1 0 373415 CASAVA_Build 17 21481962 3D15M4D TGTCTCAAAA AATAAAAAAAATAAATAAAAAT/---AAAAAAAATAAATAA---- AAATAAAGGT 1453 het 1453 ref 20 19 5 7 N/A 0 0 373416 CASAVA_Build 17 21482074 6I28M1I GATTGTTTTT ------AACTTACTATTTGTTAGTAAAATGTAAC-/AAATTAAACGTATTATTTGTTAGTAAAATTTAACA TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 64 39 11 28 N/A 0 0 373417 CASAVA_Build 17 21482497 1I TAGTAGAGAT -/G GGGTTTTACC 2105 het 2057 hom 11 6 5 0 G 3 4 373418 CASAVA_Build 17 21483228 1I TCTCATAATG -/A AAGAAAAAGG 3070 het 3070 ref 51 26 15 10 A 2 3 373419 CASAVA_Build 17 21483476 1D CAAATCTGAC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 58 40 10 8 T 9 8 373420 CASAVA_Build 17 21484700 4D TGGTATCTTC CTTT/---- GTCATGATTG 3070 het 3070 ref 81 56 19 9 CTTT 1 0 373421 CASAVA_Build 17 21485398 4D20M1D GAGAGTGAAA TTTGTTTGTCCATTCTGTTTTTGAT/----TTTGTCCATTCTATTTTTGA- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 70 41 25 14 N/A 0 0 373422 CASAVA_Build 17 21485905 1D GCATTTTTTT C/- CCCACATTTC 3070 het 3070 ref 63 42 12 10 C 4 3 373423 CASAVA_Build 17 21486458 1I CATGTACTCG -/T TTTTGTGTGG 3070 het 3070 ref 74 26 28 22 T 4 5 373424 CASAVA_Build 17 21486530 1D TATGTTTAAA T/- TTTTTGAAAA 975 het 975 ref 55 48 4 7 T 6 5 373425 CASAVA_Build 17 21486692 6D AAGTGGTATC TAGTTG/------ TAGTTTTCAT 3070 het 3070 ref 86 48 11 34 TAGTTG 1 0 373426 CASAVA_Build 17 21487175 1D CCCACTGGGG T/- TTATTAAGGT 3070 het 3070 ref 52 32 15 5 T 3 2 373427 CASAVA_Build 17 21487673 1D TGTTTTTTTT C/- GCCTTTTAAA 1747 het 1747 ref 61 36 4 22 C 1 0 373428 CASAVA_Build 17 21488364 9I AGACAACTAG ---------/AGAAAACAA AGAAATATGC 3070 het 3070 hom 82 26 41 15 AGAAAACAA 0 1 373429 CASAVA_Build 17 21492727 10D TACCCTCAGG GTCCTCCCCT/---------- GTCCTCCCCT 3070 het 3070 ref 91 39 39 18 GTCCTCCCCT 2 1 373430 CASAVA_Build 17 21495774 4D AATAGAAAAA TTAT/---- TAAAGTGATT 3070 het 3070 ref 77 49 17 17 TTAT 1 0 373431 CASAVA_Build 17 21495814 3I ATTCTCCTTC ---/ATA TTTTTTTATT 2971 het 2971 ref 70 28 9 33 ATA 0 1 373432 CASAVA_Build 17 21501765 1I CTCTAGCAAC -/T TGGGAATATT 2100 het 2100 ref 61 45 6 10 T 1 2 373433 CASAVA_Build 17 21501842 5D TAATAATTAT ATCAC/----- AAGATATAAT 3070 het 3070 ref 83 60 14 13 ATCAC 1 0 373434 CASAVA_Build 17 21503571 1I AAAGGCATAC -/T TTTTTTGACA 3070 het 3070 ref 87 40 17 30 T 6 7 373435 CASAVA_Build 17 21503596 1I CGTATGTAAT -/A AAAATAGTTA 3070 het 3070 ref 92 42 17 33 A 4 5 373436 CASAVA_Build 17 21504038 2D TTGATGTAAC AT/-- AGAATGTATG 3070 het 3070 ref 81 59 10 14 AT 1 0 373437 CASAVA_Build 17 21505726 1D GACCCTTTTT G/- TGGAGGTGTC 3070 het 3070 hom 63 27 30 8 G 1 0 373438 CASAVA_Build 17 21506510 1D ATTACAAAGA T/- TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 82 55 13 14 T 8 7 373439 CASAVA_Build 17 21607308 4I19M2D ATGGAAATCA ----ATCTATCTATATATTCCACAT/ACCTATCTATCCATATATTCCAC-- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 49 28 12 11 N/A 0 0 373440 CASAVA_Build 17 21607406 2D CAATATATAT AA/-- AATGCTAAAT 3070 het 3070 ref 51 26 19 10 A 4 2 373441 CASAVA_Build 17 21607743 4D22M5I TTCTTAATAT AAAAAAGTTTCTTTTATATATAAAAA-----/----AAGTTTCTTTTATATATAAAAAGTTAT GTTATTTTAG 3070 het 3070 hom 66 26 47 10 N/A 0 0 373442 CASAVA_Build 17 21607858 2D GCAGTTGTAC AA/-- CATATTAGGT 3070 het 3070 hom 81 26 47 11 A 2 0 373443 CASAVA_Build 17 21608558 5I TATGCATAAT -----/TAAAC TAGTGGATAG 3070 het 3070 ref 51 26 16 9 TAAAC 0 1 373444 CASAVA_Build 17 21608824 1I CAGAAAAAAA -/C ATTCCATGAG 3070 het 3070 ref 62 37 20 8 C 0 1 373445 CASAVA_Build 17 21609155 4I ATTTTAAGGC ----/AGTA AGGTTTTATT 3070 het 3070 hom 80 28 41 11 AGTA 0 1 373446 CASAVA_Build 17 21609504 1I ATGATACTAA -/C TACAATTTTT 997 het 997 ref 53 28 3 22 C 0 1 373447 CASAVA_Build 17 21611966 2I GCTTTTTGAC --/TA TTTTAAAATT 3070 het 3070 hom 23 9 11 3 TA 0 1 373448 CASAVA_Build 17 21614801 5I TCAATTGAGT -----/TATAA TATAAATTCT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TATAA 1 2 373449 CASAVA_Build 17 21621640 4I ACATATGCAT ----/TAGA TAGAGATATC 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TAGA 1 2 373450 CASAVA_Build 17 21628337 2I AATAATAAAC --/TG TGGTTTTCCA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 TG 1 2 373451 CASAVA_Build 17 21640571 1I ATCTTGTGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 T 10 11 373452 CASAVA_Build 17 21644736 2D AATATACATC AG/-- GGGTATTTTA 3070 het 3070 ref 18 11 7 1 AG 1 0 373453 CASAVA_Build 17 21650437 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 11 19 7 A 10 12 373454 CASAVA_Build 17 21651548 1I TTTAAAATTT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2010 hom 21 6 12 3 A 9 10 373455 CASAVA_Build 17 21652622 1D ATTCAGCCAA T/- TTTTTTTTTT 3006 het 1313 hom 22 6 10 6 T 16 15 373456 CASAVA_Build 17 21672984 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1764 het 371 hom 14 2 7 5 A 13 14 373457 CASAVA_Build 17 21679486 1I CCATTAAGGG -/A AATAAATTTC 2636 het 2636 ref 21 14 6 1 A 2 3 373458 CASAVA_Build 17 21695619 1I TAGATTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2899 het 2899 ref 22 10 7 5 A 10 11 373459 CASAVA_Build 17 21706645 1I TCACTGATAG -/T TTTTTTTCAA 3070 het 3070 hom 28 12 15 1 T 7 8 373460 CASAVA_Build 17 21711541 7I TCCAGCCTGC -------/TGAATCA AAACAAGGGT 3070 het 3070 ref 45 27 15 3 TGAATCA 0 1 373461 CASAVA_Build 17 21722017 1D TCCCCCCCCC A/- CAACTATGTG 2819 hom 26 het 11 0 9 2 A 1 0 373462 CASAVA_Build 17 21730661 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 550 hom 26 3 13 10 A 15 14 373463 CASAVA_Build 17 21731050 1D ACCATATGGG A/- TAGGTTTTAT 3070 het 3070 ref 37 18 14 6 A 1 0 373464 CASAVA_Build 17 21733910 1D18M1D AGCTGCTGGC AAAAAAAACATTTTACTCTC/-AAAAAAACATTTTACTCT- TGCTTGTTAA 3070 hom 96 het 30 0 33 7 N/A 0 0 373465 CASAVA_Build 17 21735131 1I AAATATTTCA -/T TTTTTTTCAG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 7 8 373466 CASAVA_Build 17 21740049 2D CGATACTGCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2011 hom 27 6 15 7 T 12 10 373467 CASAVA_Build 17 21770325 1I CCTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2096 hom 26 9 10 7 A 14 15 373468 CASAVA_Build 17 21770945 1I AGCCACCGCA -/C CCAGCCTAGC 3070 hom 63 het 26 0 22 4 C 2 3 373469 CASAVA_Build 17 21783486 1I CCATGCCCAG -/C TAATTTATGT 3070 hom 63 het 22 0 18 4 C 0 1 373470 CASAVA_Build 17 21793269 1D TGCCACTGCA C/- CCCCAGCGTG 3070 hom 84 het 33 0 26 9 C 5 4 373471 CASAVA_Build 17 21809872 1D ATAAATATGT A/- AAAAATAATA 3070 het 3070 ref 52 33 16 3 A 6 5 373472 CASAVA_Build 17 21810283 4D ACTTGAGACT CACA/---- CAGATTGGAT 3062 het 3062 ref 35 23 9 4 CA 3 1 373473 CASAVA_Build 17 21810675 1D CAGAACTTCA G/- TAGCTTAAGA 2814 het 2814 ref 46 39 6 1 G 1 0 373474 CASAVA_Build 17 21812004 2D GTTGGTTTTT TC/-- TCTTTGCCAT 3070 het 3070 ref 33 24 7 2 TC 2 1 373475 CASAVA_Build 17 21900393 1I CATGTGCAGG -/A CATGCAGGTT 3070 hom 54 het 22 0 19 3 A 0 1 373476 CASAVA_Build 17 21958070 4D TCCTACTAGG TCAA/---- AAAGTATAAA 2269 het 2269 ref 53 46 5 6 TCAA 1 0 373477 CASAVA_Build 17 21979344 1D AAATTAAATT A/- AAAAAAAAAA 1932 hom 12 het 8 0 5 3 A 12 11 373478 CASAVA_Build 17 21991076 1D CCAGAAAAAA T/- ATGTGAGAGA 3070 het 3070 ref 61 46 9 6 T 1 0 373479 CASAVA_Build 17 21997101 4D CTGTCCCAGC CACA/---- CACACACCAG 2100 het 2100 ref 28 20 5 4 CA 5 3 373480 CASAVA_Build 17 21999324 4D TCATCTCTTT TTGA/---- TTGATGGTAT 3070 het 3070 ref 42 21 19 5 TTGA 2 1 373481 CASAVA_Build 17 22049197 1D TATAATTATT C/- TTGCTCTGAA 3070 het 3070 hom 30 12 12 6 C 1 0 373482 CASAVA_Build 17 22088526 1I TTAAATCTGT -/G GAGTTAAATC 3070 het 3070 ref 44 34 8 2 G 1 2 373483 CASAVA_Build 17 22088919 5D TTTTTTCTTG TTTTT/----- TTTTTTTTTT 1484 het 1257 hom 27 8 6 15 T 21 16 373484 CASAVA_Build 17 22093147 1I CAGGTCATCA -/G GGAAGCACTC 2471 het 2471 ref 37 27 6 4 G 2 3 373485 CASAVA_Build 17 22103521 1D TGCTGAAGTT A/- AAAAAAAAAA 1162 het 1162 ref 15 10 3 2 A 13 12 373486 CASAVA_Build 17 22114669 1D TAGGTTCTAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 36 0 32 4 A 10 9 373487 CASAVA_Build 17 22121662 1D TCTTTTGCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 39 0 24 15 T 11 10 373488 CASAVA_Build 17 22130495 4D AATTTGTGTC TTGT/---- TTGTTTCCTC 307 het 307 ref 13 11 2 2 TTGT 2 1 373489 CASAVA_Build 17 22132178 2D TCAATGACAC CT/-- TCTGCGGCAG 1735 het 1735 ref 91 74 4 15 CT 1 0 373490 CASAVA_Build 17 22132324 3D CCTTCAATCA TCT/--- TCTTGTTCTT 3070 het 3070 ref 91 63 10 22 TCT 2 1 373491 CASAVA_Build 17 22132352 1D TTTGACTCCC T/- GTTTTATTCT 3070 het 3070 ref 86 60 11 17 T 1 0 373492 CASAVA_Build 17 22132677 1I TCATCCTGAG -/C TTTTTGGTAC 3070 het 3070 ref 83 38 39 6 C 0 1 373493 CASAVA_Build 17 22132971 2D GTTCTAGTTC CA/-- GTTCTGTCCC 1611 het 1611 ref 82 61 4 18 CA 1 0 373494 CASAVA_Build 17 22136977 17D ATGATTGCCC CTTGCCTAGCTGTAGCA/----------------- CAAAGTCAAT 1564 het 1564 ref 44 37 6 12 CTTGCCTAGCTGTAGCA 1 0 373495 CASAVA_Build 17 22140513 1D AAACAAAAAA C/- CAGCCTCCAG 1705 het 1705 ref 33 25 4 4 C 2 1 373496 CASAVA_Build 17 22142124 1D TTTTTTGACC A/- ACCACTTTCC 3070 het 3070 ref 72 51 10 12 A 2 1 373497 CASAVA_Build 17 22147416 1I ATCTTCACAT -/A AAAAACCAGA 2134 het 2134 ref 34 22 6 6 A 5 6 373498 CASAVA_Build 17 22172919 1I CAGAATCTTC -/T TTGTGATGTT 3070 het 3070 ref 54 19 27 8 T 2 3 373499 CASAVA_Build 17 22292868 1D GATGGAAGAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 52 29 12 11 A 9 8 373500 CASAVA_Build 17 22293394 4I TGAAATTTTA ----/TAGT TAAAGTAACA 3070 het 3070 hom 59 12 44 4 TAGT 0 1 373501 CASAVA_Build 17 22295132 5D GACAATATAA ATATT/----- ATAAGTATTT 3070 het 3070 ref 43 30 9 7 ATATT 1 0 373502 CASAVA_Build 17 22295409 1I AAGAACTTTG -/A GCTGTCAACC 3070 het 3070 ref 59 42 9 8 A 0 1 373503 CASAVA_Build 17 22295950 3I TTAGTGACTG ---/GAT TTACACTATT 1655 het 1655 ref 75 33 13 30 GAT 0 1 373504 CASAVA_Build 17 22296259 1D TAGAGGGAAG A/- AAAAGGTTAT 3070 het 3070 hom 56 19 29 10 A 5 4 373505 CASAVA_Build 17 22297659 4D TAACACAAAC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 3070 ref 50 28 10 16 AT 7 5 373506 CASAVA_Build 17 22298853 12D CTTGACAATT TCCAGTTCTAAC/------------ CCTCACAGTT 3070 het 3070 hom 33 18 15 5 TCCAGTTCTAAC 1 0 373507 CASAVA_Build 17 22300837 1I CAATTCTATC -/A GTTTCATCTT 3070 het 3070 ref 68 29 10 32 A 0 1 373508 CASAVA_Build 17 22301346 9D CCAGGTTTCT CTTGAACTC/--------- CTTGAACTCC 3070 het 3070 ref 51 25 18 13 CTTGAACTC 2 1 373509 CASAVA_Build 17 22302321 2I CTCCCTCATA --/CC CACAGAGATC 3070 het 3070 hom 81 29 40 13 C 1 3 373510 CASAVA_Build 17 22303157 5D CCATGTAACC TAACA/----- TATTTGTAGG 3070 het 3070 ref 77 57 18 4 TAACA 1 0 373511 CASAVA_Build 17 22303733 4D ATGGGAGAAA AAGG/---- AAAGAAAGCA 2985 het 2985 ref 70 50 10 23 AAGG 1 0 373512 CASAVA_Build 17 22304502 4D GATGTAATTC TTAT/---- TTATTTTTGT 2423 het 2423 ref 51 27 7 18 TTAT 2 1 373513 CASAVA_Build 17 22304520 1D TTTTGTTCTA T/- TTGAGATTCT 2372 het 2372 ref 35 22 5 8 T 3 2 373514 CASAVA_Build 17 22305676 1D GAGACTAAGC T/- TTTTTTGTGT 3070 het 3070 ref 91 78 7 7 T 7 6 373515 CASAVA_Build 17 22307253 2I AATGTATTGT --/GA TAAGGTAATC 3070 het 3070 hom 63 16 42 9 GA 0 1 373516 CASAVA_Build 17 22307752 4D GATACTAATG GATT/---- GAAAGTAAAA 2603 het 2603 ref 79 61 7 14 GATT 1 0 373517 CASAVA_Build 17 22307846 1D ACAGACTATT A/- AAAATGTGAA 3070 het 3070 ref 59 41 12 7 A 5 4 373518 CASAVA_Build 17 22308735 1D28M5D CTGACTGGTC TGGGGGATACCTAAAGGACTAATGAAAGGTTTTT/-GGGGGATACCTAAAGGACTAATGAAAGG----- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 73 51 8 43 N/A 0 0 373519 CASAVA_Build 17 22310083 3I CCTTTCTCTT ---/TTC TTTTCTTTCA 3070 het 3070 ref 83 23 29 31 TTC 0 1 373520 CASAVA_Build 17 22310414 1I AATATTTGTG -/A AAAGAATGTA 3070 het 3070 ref 77 52 13 12 A 3 4 373521 CASAVA_Build 17 22310674 1I AGCAGATCTC -/A AGGGAGAAAG 3070 het 3070 hom 62 28 31 3 A 1 2 373522 CASAVA_Build 17 22311391 5I CCCAAGAACA -----/AAAGT AAATCATCAC 3070 het 3070 ref 45 21 22 2 AAAGT 0 1 373523 CASAVA_Build 17 22312170 1I TCTTGTGTGC -/A AAAAAAAAGA 1814 het 1814 ref 69 45 4 20 A 8 9 373524 CASAVA_Build 17 22315152 1I AGTCAAGGTG -/T TTGAGACCAA 3070 het 3070 hom 80 27 41 14 T 2 3 373525 CASAVA_Build 17 22315866 2D CTATTTATAT AA/-- GTCTGTATTT 3070 het 3070 ref 72 40 18 14 A 2 0 373526 CASAVA_Build 17 22316203 2I GAGAAAGACC --/TG TGTTTAAAAT 3070 het 3070 hom 80 19 50 11 TG 1 2 373527 CASAVA_Build 17 22319246 1I GCTTTCAGAA -/C CATATAAAGA 3070 het 3070 ref 91 38 30 28 C 1 2 373528 CASAVA_Build 17 22319322 4D CAAATTTGCC TAAA/---- TATTCTTCAG 3070 het 3070 ref 78 58 16 8 TAAA 1 0 373529 CASAVA_Build 17 22320011 2I CCACTAAATA --/AC AGTGCCTTGA 3070 het 3070 hom 71 18 49 6 AC 0 1 373530 CASAVA_Build 17 22320096 3D AAAGAATTAT ACA/--- ATATCTTTCA 3070 het 3070 ref 70 45 20 19 ACA 1 0 373531 CASAVA_Build 17 22323651 1I TTATTTTAAA -/T TTTTTTTACA 3070 het 3070 ref 77 54 8 16 T 7 8 373532 CASAVA_Build 17 22328380 10D TTGTGATTCA GAATATGAAT/---------- GGTATTTAAT 3070 het 3070 ref 54 47 12 4 GAATATGAAT 1 0 373533 CASAVA_Build 17 22329716 2I AGCCACTTGC --/AT AGAGTTAAAG 3070 het 3070 ref 77 27 34 17 AT 0 1 373534 CASAVA_Build 17 22329957 1D TTGGAGAAAA G/- AAACATGATG 3070 het 3070 ref 86 44 34 8 G 1 0 373535 CASAVA_Build 17 22330039 1D CTACAAGATA C/- TTTAGGCTGC 3070 het 3070 ref 70 54 12 4 C 1 0 373536 CASAVA_Build 17 22331391 2D ACAATAGCAT CA/-- AAAAAAGAAA 1758 het 1758 ref 85 69 4 15 CA 1 0 373537 CASAVA_Build 17 22331470 4D GTTTAAAGAA GATC/---- TAAATAATTA 1741 het 1741 ref 81 67 4 10 GATC 1 0 373538 CASAVA_Build 17 22332754 1D TCTATTTAGA T/- TGAAAATAGA 3070 het 3070 ref 37 26 9 2 T 2 1 373539 CASAVA_Build 17 22336313 3D CATCCTGTGT GTG/--- TGTGTGTGTA 1690 het 1690 ref 26 17 7 3 GTG 1 0 373540 CASAVA_Build 17 22336641 1D CTATTAATTG T/- TAAGTCGTAG 3070 het 3070 ref 64 38 22 5 T 2 1 373541 CASAVA_Build 17 22337204 1I TATCGAAAGT -/C CCAGTGGGAT 3070 het 3070 ref 87 46 33 8 C 2 3 373542 CASAVA_Build 17 22339666 1D GGGAGGCAGA G/- GGAGATTTTA 3070 het 3070 ref 52 37 13 2 G 3 2 373543 CASAVA_Build 17 22341901 1I TTTGGTTCCA -/T TTTTTTCATT 3070 het 3070 ref 74 46 20 8 T 6 7 373544 CASAVA_Build 17 22342343 1D TGCTGGCCTC T/- GGCAGGCTGG 3070 het 3070 ref 63 38 16 9 T 1 0 373545 CASAVA_Build 17 22343267 3I TCCACACAAT ---/AAG AAGGTCACAG 3070 het 3070 hom 63 19 33 11 AAG 1 2 373546 CASAVA_Build 17 22343532 1D AAGGACAGTG T/- TTTTTCCTCT 1203 het 1203 ref 56 47 4 5 T 6 5 373547 CASAVA_Build 17 22344535 1I TGCAATTTTG -/A AAAAACAAGG 3070 het 3070 ref 43 30 8 5 A 5 6 373548 CASAVA_Build 17 22350830 1D AAAGATACAA T/- TCTCCCTTTT 3070 het 3070 ref 48 31 8 11 T 2 1 373549 CASAVA_Build 17 22352506 1D GCATGAAAAC A/- ACATTAATCT 3070 het 3070 ref 65 37 17 11 A 2 1 373550 CASAVA_Build 17 22352591 1I GAAGAGAATC -/T TTTTTTTCTG 3070 het 3070 ref 80 63 8 9 T 7 8 373551 CASAVA_Build 17 22352699 2D GAGCACAGGC AG/-- AGTTAATTTA 2857 het 2857 ref 50 37 8 7 AG 2 1 373552 CASAVA_Build 17 22353270 1I TTTCAAAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 64 33 15 16 T 11 12 373553 CASAVA_Build 17 22353417 1D CTCTTCCTTT C/- CCCCTGATCA 3070 het 3070 ref 52 28 20 5 C 5 4 373554 CASAVA_Build 17 22355030 1I GACGATCTCA -/T TTTTTATGGC 3070 het 3070 ref 67 39 17 11 T 5 6 373555 CASAVA_Build 17 22357848 4I TCTTGATCAG ----/TTTA TTTGTTTCTG 3070 het 3070 hom 55 27 25 5 TTTA 0 1 373556 CASAVA_Build 17 22360872 2I15M5I CGTATGTCCC --TGTGTCTGTATGTGA-----/TGTGTGTCTGTATGTGATCATG CGTGTCCACG 1485 het 1485 ref 55 50 5 8 N/A 0 0 373557 CASAVA_Build 17 22373929 1D AATCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2071 het 2071 ref 35 24 5 6 A 13 12 373558 CASAVA_Build 17 22398921 1I GCTATTCAAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 39 16 15 8 A 9 10 373559 CASAVA_Build 17 22444269 1D AACTCTATGT A/- AACATGAATT 3070 het 3070 hom 56 21 29 6 A 3 2 373560 CASAVA_Build 17 22526597 1I AAGTTAAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 T 11 12 373561 CASAVA_Build 17 22561229 1I TTTTTTTTTT -/A TTATTATTAC 2525 het 2525 ref 37 25 6 6 A 0 1 373562 CASAVA_Build 17 22578276 6D TCAGAACATA TCTCTG/------ TTGCTAAGTG 3070 het 3070 hom 43 19 20 8 TCTCTG 1 0 373563 CASAVA_Build 17 22595647 1D AGGGACAACA C/- CCCCCGACGG 3070 hom 86 het 31 0 27 4 C 6 5 373564 CASAVA_Build 17 22612172 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 91 hom 26 2 16 8 A 17 16 373565 CASAVA_Build 17 22629200 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2904 het 1989 hom 19 5 8 6 A 13 14 373566 CASAVA_Build 17 22631338 1D ATTATTAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 13 12 373567 CASAVA_Build 17 22635809 1I TGAGACTTTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 796 hom 25 3 15 7 A 13 14 373568 CASAVA_Build 17 22640451 2D TATATGTATA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 39 21 15 6 TG 6 5 373569 CASAVA_Build 17 22642017 1I CGAAAGAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 15 6 A 11 12 373570 CASAVA_Build 17 22642352 1D TCTCAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 A 12 11 373571 CASAVA_Build 17 22643003 1I ATCGTGCCAC -/T TGCACTCCAG 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 T 1 2 373572 CASAVA_Build 17 22651119 3D CTCAGGCTTT TTG/--- TTTTTGCTTT 3070 het 3070 ref 49 24 23 3 TTG 1 0 373573 CASAVA_Build 17 22652044 1I TTTTAGCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2786 hom 29 9 7 13 T 10 11 373574 CASAVA_Build 17 22653652 2D CTAACAAGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 33 12 13 9 TA 7 6 373575 CASAVA_Build 17 22659361 1D GTCTGTGCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 14 11 3 A 12 11 373576 CASAVA_Build 17 22661590 1I CTTACAGAGA -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 44 18 18 8 T 6 7 373577 CASAVA_Build 17 22663232 1D TGGTTAGTTC T/- TCCTGGTTGG 3070 het 3070 hom 56 21 32 3 T 2 1 373578 CASAVA_Build 17 22702905 1I TGTGTGGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 21 6 A 11 12 373579 CASAVA_Build 17 22703417 1D CAATGCAGTA C/- AGGAAGACAG 3070 het 3070 hom 43 17 21 6 C 1 0 373580 CASAVA_Build 17 22703594 3D CAGTAACTGT AGG/--- AGGACAATTC 3070 het 3070 hom 42 18 23 2 AGG 2 1 373581 CASAVA_Build 17 22714448 1I AATGTTTTTA -/T TTTTTTATTT 2928 het 2928 ref 18 11 7 0 T 6 7 373582 CASAVA_Build 17 22718092 1D GGGGCCTGAA C/- CAAAGCCCCA 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 C 2 1 373583 CASAVA_Build 17 22718439 1I TGAGACACAG -/C GACCCAAATC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 C 0 1 373584 CASAVA_Build 17 22718797 3I TGGGCTGGTG ---/CCA AAAGGGGAGG 3070 het 3070 ref 32 18 11 3 CCA 0 1 373585 CASAVA_Build 17 22722180 9D TTACACTGTC TTCTTTTCT/--------- TTCTTTCTTT 3070 het 3070 ref 39 20 18 1 TTCTTTTCT 1 0 373586 CASAVA_Build 17 22722756 1I TTTTTTTAAA -/T TTTTTTTGTA 2013 het 2013 ref 21 8 7 6 T 7 8 373587 CASAVA_Build 17 22728050 1I GTTTTGTTTG -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 42 17 18 7 T 7 8 373588 CASAVA_Build 17 22737681 4D GTCTCGGTAA TAGT/---- TAGACTCAGG 3070 het 3070 ref 55 23 24 10 TAGT 1 0 373589 CASAVA_Build 17 22742292 2D AAAGGGACTT TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 ref 34 15 11 9 TA 9 8 373590 CASAVA_Build 17 22746707 1I TATGTTTTTA -/T CTTTTACATG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 0 1 373591 CASAVA_Build 17 22747516 1D ATTTGAATGC T/- TGTGTCCCCT 3070 het 3070 ref 39 23 13 4 T 2 1 373592 CASAVA_Build 17 22749033 13I GGTGGCACAT -------------/GCCCGTAATCCCA GCTACCCAGG 3070 hom 60 het 22 0 21 3 GCCCGTAATCCCA 0 1 373593 CASAVA_Build 17 22751894 2D TGGAGATACT GA/-- GAGACATTTT 3070 het 3070 hom 40 16 21 3 GA 3 2 373594 CASAVA_Build 17 22752266 2D TGACCACGCC AG/-- AGTACTGGGC 3070 hom 91 het 36 0 26 11 AG 2 1 373595 CASAVA_Build 17 22755530 1I ATAATAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 A 11 12 373596 CASAVA_Build 17 22761335 1D GGAAGTATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 404 hom 44 1 33 12 T 11 10 373597 CASAVA_Build 17 22763624 1I AGGCTGAGGA -/G GGGCAGATCA 3070 het 3070 ref 25 14 10 1 G 3 4 373598 CASAVA_Build 17 22769893 4D TATTTCTTTC TCTG/---- TCTGATCCTC 3070 hom 78 het 28 0 27 2 TCTG 2 1 373599 CASAVA_Build 17 22774818 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 317 hom 46 2 34 10 A 10 9 373600 CASAVA_Build 17 22789145 1I ATCTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 2797 het 2797 ref 28 14 9 5 A 13 14 373601 CASAVA_Build 17 22790419 12D ACCTTGTCTC AAATAAATAAAT/------------ AAATAAATAA 3070 het 230 hom 13 1 9 6 AAAT 8 5 373602 CASAVA_Build 17 22797265 4D ATCTCCCTTC AAGA/---- AAGAAAGAAG 3070 het 3070 hom 34 13 16 8 AAGA 3 2 373603 CASAVA_Build 17 22799072 1I TCTGGGCCCC -/G GGGGGAGAGA 3065 het 3065 ref 26 13 10 3 G 5 6 373604 CASAVA_Build 17 22801977 1D TGTGGGTGTC T/- TTTTTTTTTT 2991 het 2991 ref 32 12 8 13 T 13 12 373605 CASAVA_Build 17 22803216 10D GGCCTTCACT TTGTTCCTGG/---------- AGTATGCCAA 3070 het 3070 ref 49 27 14 13 TTGTTCCTGG 1 0 373606 CASAVA_Build 17 22815944 1I AAGATAATGT -/C AAAAATTCTT 1588 het 1588 ref 24 18 4 2 C 0 1 373607 CASAVA_Build 17 22816201 3I CTAGTGTCTT ---/GTC GTCCGTTTTG 3070 het 3070 hom 91 38 48 5 GTC 1 2 373608 CASAVA_Build 17 22816322 1D CTGTTTGTCA T/- TTGCATTGAA 3070 het 3070 ref 56 32 15 9 T 3 2 373609 CASAVA_Build 17 22822024 1D ATTCAGTGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 12 11 373610 CASAVA_Build 17 22834074 2I TACATGTCTC --/AT GTGTTGGGGG 3070 hom 81 het 32 0 28 4 AT 0 1 373611 CASAVA_Build 17 22840919 3I GCTGTGAAAT ---/GAG GAGACCAGAT 2724 het 2724 ref 22 8 7 7 GAG 1 2 373612 CASAVA_Build 17 22856746 1I AGCAAGCTGC -/T GATCTCCCTG 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 0 1 373613 CASAVA_Build 17 22861510 1I ATCTCTAAAA -/G GGGAGTGTTG 3070 hom 138 het 50 0 44 6 G 3 4 373614 CASAVA_Build 17 22872488 1D AGGCCATTCC T/- TTTTTTTTTT 772 het 772 ref 36 19 7 10 T 19 18 373615 CASAVA_Build 17 22874797 4D TCTCACACAT AAAA/---- GAAGTCTGGA 3070 het 3070 ref 46 22 21 4 A 4 0 373616 CASAVA_Build 17 22882709 1D GGGCGAGTGC T/- TGGGGGAGAA 3032 het 3032 ref 35 18 12 5 T 2 1 373617 CASAVA_Build 17 22906254 1D ATGGTTTACA T/- TATTTTGATT 3070 het 3070 ref 56 30 21 6 T 2 1 373618 CASAVA_Build 17 22925611 1I TTTTGGTGTG -/A ATCATGCTAA 3070 het 3070 hom 45 18 22 5 A 1 2 373619 CASAVA_Build 17 22947221 4D CCTGGGCTAA TACT/---- TACTTATAAC 3070 het 3070 ref 44 26 15 6 TACT 2 1 373620 CASAVA_Build 17 22957068 1I GAAGTTCTAA -/T TAGAGGCATA 3070 het 3070 hom 31 11 10 10 T 1 2 373621 CASAVA_Build 17 22959775 4D CTGTGTCCAA GGCC/---- ACAGAGTGAG 3070 het 3070 ref 39 19 17 4 GGCC 1 0 373622 CASAVA_Build 17 22979157 2D AAGATCACAC AA/-- GAATTAAATG 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 A 2 0 373623 CASAVA_Build 17 22984451 9D CCTCATGGAC ACACATGGA/--------- TCCAAATGCC 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 ACACATGGA 1 0 373624 CASAVA_Build 17 22987272 2I ACGGTGCCAG --/GT GTGTGTACAC 3070 het 2735 hom 28 8 13 7 GT 3 4 373625 CASAVA_Build 17 23004677 1D GGCCGGCACC T/- TCAGCCCACA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 T 2 1 373626 CASAVA_Build 17 23012820 10D GATGTAAAAG CACAGGTGGC/---------- CACAGGTTAC 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 CACAGGTGGC 1 0 373627 CASAVA_Build 17 23026476 2I ATGTGTAGAC --/TT TGTTCCTGTC 3070 het 3070 hom 56 24 28 4 T 1 3 373628 CASAVA_Build 17 23037874 1D CTCATCTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 5 T 11 10 373629 CASAVA_Build 17 23043233 1D TCCCATTGTG C/- CAGTAAATCT 3070 het 3070 ref 42 22 18 2 C 2 1 373630 CASAVA_Build 17 23054121 1I CAAGGTGGGT -/G GATCACTTAA 1679 hom 12 het 5 0 4 1 G 1 2 373631 CASAVA_Build 17 23058636 1D CCTTAATATG T/- TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 52 30 18 6 T 8 7 373632 CASAVA_Build 17 23064485 4D CTAAGGACTT TAAC/---- TAACAGGTTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 TAAC 2 1 373633 CASAVA_Build 17 23070024 1D TCACCTACCA C/- CCCCCATTAT 3070 hom 102 het 39 0 35 6 C 6 5 373634 CASAVA_Build 17 23093228 2D GCTCCAGGGG AA/-- AGAATCTGTT 3070 het 3070 ref 38 17 17 4 A 3 1 373635 CASAVA_Build 17 23102428 1I CAGGGCCTAC -/A AGGCCCCATC 1298 het 1298 ref 23 7 5 11 A 1 2 373636 CASAVA_Build 17 23112465 1D CACACCACGG C/- CCTCCTTGGA 3070 hom 37 het 16 0 10 6 C 3 2 373637 CASAVA_Build 17 23119322 2I5M4D CCCGCCTCAG --TCCCGTACC/CCTCCTG---- TGTAGCTGAG 3070 het 3070 ref 34 18 9 8 N/A 0 0 373638 CASAVA_Build 17 23130884 1I CCAGTGTCAG -/A AAGCTGGGGT 3070 het 3070 hom 62 26 34 2 A 2 3 373639 CASAVA_Build 17 23170257 3D GCCAGATGAC GCT/--- AGATGCCTAG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 GCT 1 0 373640 CASAVA_Build 17 23181052 2I AAGAAAAGTT --/TA GCCTTTGTAT 3070 hom 45 het 19 0 14 5 TA 0 1 373641 CASAVA_Build 17 23183014 1I ATGCCAACTC -/T TGTCATGAGC 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 1 2 373642 CASAVA_Build 17 23190941 1D ACATTTTGGC A/- ATTTCCACCT 2967 hom 18 het 7 0 7 1 A 2 1 373643 CASAVA_Build 17 23191099 2I TATACAAAGG --/TT CAACTTTTCT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 T 0 2 373644 CASAVA_Build 17 23195254 4I ACAAAAACAA ----/AAAC AAACAAAGGA 3070 hom 120 het 46 0 41 5 AAAC 1 2 373645 CASAVA_Build 17 23195409 1I AACACTGCTG -/A TTTTTTTTGT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 A 0 1 373646 CASAVA_Build 17 23208673 1I ATTCTATGGA -/G GAAGGATTAC 3070 hom 93 het 35 0 29 6 G 1 2 373647 CASAVA_Build 17 23215594 1D CTTTGCATGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 12 16 16 T 14 13 373648 CASAVA_Build 17 23224123 4D TTGGCTAATC TACT/---- TTCTTTCTCC 2782 het 2782 ref 32 17 8 9 TACT 1 0 373649 CASAVA_Build 17 23232967 1D GTAATATTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 29 0 22 7 T 12 11 373650 CASAVA_Build 17 23237807 1D TCTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 50 het 23 0 15 8 T 13 12 373651 CASAVA_Build 17 23250121 6I ATCTCAAAAA ------/AAAAAG AAAAAGAAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 AAAAAG 2 3 373652 CASAVA_Build 17 23259761 1I AGACCAGCCT -/G GCCAACATGG 3070 hom 59 het 21 0 18 3 G 1 2 373653 CASAVA_Build 17 23263297 1D GCTCATAACA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 10 9 373654 CASAVA_Build 17 23277719 1D TTCAACTTGC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 10 9 373655 CASAVA_Build 17 23300723 3D GAAATTCTCA TCT/--- TCTCTCCGTT 3070 hom 90 het 35 0 30 6 TCT 2 1 373656 CASAVA_Build 17 23309327 1D AATTTTGGTC T/- TTTTTTTAAT 3070 hom 141 het 55 0 48 8 T 8 7 373657 CASAVA_Build 17 23309805 1D ATGAATTTAA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 187 hom 32 2 21 10 T 9 8 373658 CASAVA_Build 17 23318105 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 T 10 11 373659 CASAVA_Build 17 23331743 2I GGAAGAAAAC --/AT ATGCAGCTGC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 AT 1 2 373660 CASAVA_Build 17 23346447 1D CTACTATAAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 21 10 5 T 10 9 373661 CASAVA_Build 17 23349592 1D GCCAGAAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 14 7 A 11 10 373662 CASAVA_Build 17 23368877 1D CTGTCTTAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 A 10 9 373663 CASAVA_Build 17 23472545 1D AGAAGGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 932 hom 36 2 23 11 A 13 12 373664 CASAVA_Build 17 23485989 1I ACTCTTATTT -/A TAAAAGTACA 3070 het 3070 hom 30 13 12 5 A 0 1 373665 CASAVA_Build 17 23519325 1D TAAATAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 11 5 A 15 14 373666 CASAVA_Build 17 23533611 12D CACATGAGAC CTGTTTATGTTG/------------ CTGTTCATGC 3070 het 3070 ref 48 30 14 9 CTGTTTATGTTG 1 0 373667 CASAVA_Build 17 23553841 1I CTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2013 het 1870 hom 16 6 6 4 T 15 16 373668 CASAVA_Build 17 23591233 1I TATAAATGGA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 7 8 373669 CASAVA_Build 17 23649034 1D AAACTACATG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 A 8 7 373670 CASAVA_Build 17 23656037 1D AAATTTAGAC T/- TTTTTTTTTT 1255 het 1255 ref 27 20 4 4 T 11 10 373671 CASAVA_Build 17 23656886 1I GAACTTAAAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 36 19 13 4 T 9 10 373672 CASAVA_Build 17 23657473 2D GTTGTTGTTG TT/-- TTTTTTTTTT 628 het 628 ref 42 20 3 20 T 15 13 373673 CASAVA_Build 17 23660883 1I AGAGTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 2244 het 2244 ref 21 9 8 4 A 11 12 373674 CASAVA_Build 17 23670562 1I GGCTCTCCCG -/C GCGCTGCGTC 3070 hom 36 het 13 0 12 1 C 0 1 373675 CASAVA_Build 17 23673979 1I TGAGTCAAAT -/G AGAGTCAGGT 3070 hom 111 het 39 0 38 1 G 0 1 373676 CASAVA_Build 17 23693373 1I CTCACTCCCA -/G GCCGCTTGGC 3070 hom 75 het 30 0 23 7 G 1 2 373677 CASAVA_Build 17 23696073 1I CTGTGCAGAA -/G GGCTACTGCC 3070 hom 81 het 29 0 28 1 G 2 3 373678 CASAVA_Build 17 23696488 1I TCTGGCTTTG -/C CAGCCTGGCC 3070 hom 92 het 37 0 29 8 C 1 2 373679 CASAVA_Build 17 23700501 1I GGCCATTTGG -/C CTGGGCCTTT 3070 hom 66 het 23 0 20 3 C 1 2 373680 CASAVA_Build 17 23700837 1D CACACATGCT G/- GCGGGGACCA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 G 2 1 373681 CASAVA_Build 17 23708518 1I CACAGAGCGG -/C CTTTGCCACC 2429 hom 36 het 13 0 10 3 C 1 2 373682 CASAVA_Build 17 23710787 1I CGGGCACGGC -/G GCTCATGCCT 3070 hom 84 het 32 0 28 4 G 1 2 373683 CASAVA_Build 17 23711612 1I GAGGGCTGAG -/C CCAGACTGTC 3070 hom 57 het 26 0 20 6 C 2 3 373684 CASAVA_Build 17 23712026 1I GGGCAGGGTG -/C CCCTGGTGGG 3070 hom 75 het 28 0 25 3 C 3 4 373685 CASAVA_Build 17 23716352 1I GGCCATGCCA -/G GGCTGTGCCC 3070 hom 47 het 19 0 14 5 G 2 3 373686 CASAVA_Build 17 23726518 1I CCCAGGCGGG -/C AGATTGCCTG 3070 hom 54 het 20 0 17 3 C 0 1 373687 CASAVA_Build 17 23728004 1D GCACGATCTT G/- GGCTCACTGC 2973 hom 21 het 10 0 8 2 G 3 2 373688 CASAVA_Build 17 23733987 1D CACGCACCAC A/- ATCCCCCAGC 3070 hom 86 het 37 0 29 8 A 2 1 373689 CASAVA_Build 17 23738661 1I TGGGCCACTG -/C CCCTGGCCTA 3070 hom 38 het 14 0 12 2 C 3 4 373690 CASAVA_Build 17 23749002 3I CTTAAAGCTG ---/GCT GCGCCCCCAG 3070 hom 62 het 25 0 18 7 GCT 0 1 373691 CASAVA_Build 17 23751849 1D TGAGTTGAAG A/- ATGCCGGAGG 3070 hom 102 het 46 0 31 15 A 2 1 373692 CASAVA_Build 17 23768355 1D CACCATTACA G/- GTGGCTGGTG 2410 het 2410 ref 71 49 8 14 G 2 1 373693 CASAVA_Build 17 23875498 3I GAAATCGGGG ---/CTT CCAAGGGTAG 3070 hom 75 het 27 0 24 3 CTT 0 1 373694 CASAVA_Build 17 23879622 1I CCTGGACCGA -/G GGTGACTCAG 3070 hom 123 het 50 0 38 12 G 2 3 373695 CASAVA_Build 17 23947346 1D TGAGACTCTC A/- AAAAAAAAAA 1359 het 1359 ref 17 14 3 2 A 13 12 373696 CASAVA_Build 17 23970614 1D CTTTGTCTCT A/- AAAAAAAAAA 2116 het 2116 ref 28 16 5 7 A 13 12 373697 CASAVA_Build 17 24018355 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1277 hom 17 het 10 0 5 5 A 13 14 373698 CASAVA_Build 17 24049626 12D GCTCTGTCTC CTGCTCTGCCTG/------------ CTGCTCTGCC 3070 hom 88 het 40 0 29 16 CTGCTCTGCCTG 2 1 373699 CASAVA_Build 17 24096696 1D ACCTTCTTGG C/- CCCCCTCTCT 3038 hom 30 het 12 0 10 3 C 6 5 373700 CASAVA_Build 17 24110580 1I GATACCCTGA -/G GGTGCTGCAG 3070 hom 41 het 17 0 14 3 G 2 3 373701 CASAVA_Build 17 24136342 1I ATTGAATCTC -/T TGTCTTAGTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 T 1 2 373702 CASAVA_Build 17 24205922 2I CGTTTACAAA --/CG ACTTTGGCAG 3070 het 3070 hom 46 15 24 7 CG 0 1 373703 CASAVA_Build 17 24213131 10I AGGATCTGTC ----------/CCTTCCTCTT CCTCAAGCTG 3070 hom 158 het 56 0 48 8 CCTTCCTCTT 0 1 373704 CASAVA_Build 17 24217199 2I TGCATGACTC --/AA AGAGGAACAG 3070 hom 129 het 49 0 42 7 A 1 3 373705 CASAVA_Build 17 24220120 3I TACAGGCATG ---/CAC CACCACTCCT 3070 hom 52 het 21 0 16 5 CAC 2 3 373706 CASAVA_Build 17 24226753 7D ACACACTCAA GCAATCT/------- GCAATCTGCC 3070 hom 78 het 33 0 27 9 GCAATCT 2 1 373707 CASAVA_Build 17 24229771 14I TATCTAACAT --------------/TATCTAAAAATTAA ACTGTACGTT 3070 hom 126 het 49 0 43 6 TATCTAAAAATTAA 0 1 373708 CASAVA_Build 17 24246053 4D TATTTGTTTA TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TTAT 5 4 373709 CASAVA_Build 17 24270495 23D GTGGAACAGC CTCCCCTCCTTGATCCTAACATT/----------------------- CTCCCCTCCT 3070 hom 71 het 33 0 22 16 CTCCCCTCCTTGATCCTAACATT 2 1 373710 CASAVA_Build 17 24274494 1I TGTATAATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 11 12 373711 CASAVA_Build 17 24322743 1I ATTTCAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 11 10 2 A 11 12 373712 CASAVA_Build 17 24364842 15D TAGCTGTAAG CCTTTGAGCAAATCA/--------------- CCTTTGAGCA 3070 hom 87 het 40 0 29 12 CCTTTGAGCAAATCA 2 1 373713 CASAVA_Build 17 24388286 3D TGCATCTGAT GAG/--- GAGAACTAAG 3070 hom 147 het 54 0 49 5 GAG 2 1 373714 CASAVA_Build 17 24391805 2I TTTCTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 13 6 TC 0 1 373715 CASAVA_Build 17 24398835 1I TCTTTGGATT -/A AAAAAAAATC 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 8 9 373716 CASAVA_Build 17 24400539 1D GTCTAAGCAG A/- AAAAAAGAAG 3070 hom 74 het 27 0 24 3 A 7 6 373717 CASAVA_Build 17 24421211 1D AAGCCCCACT G/- GGCATCAACT 3070 hom 72 het 26 0 24 2 G 3 2 373718 CASAVA_Build 17 24424278 5D ACGGAAGGAG GAAGA/----- GAAGAGAAGA 3070 hom 42 het 22 0 14 10 GAAGA 4 3 373719 CASAVA_Build 17 24459961 1D GTGCTATAGT G/- CGGTGGCTGG 3070 hom 58 het 25 0 12 13 G 1 0 373720 CASAVA_Build 17 24486583 1I TATCATGAAT -/G AATAGTTAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 G 0 1 373721 CASAVA_Build 17 24497401 1D GACTCCATCT C/- AAAAAAATAA 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 1 0 373722 CASAVA_Build 17 24522842 1D AGTCGGAGAC A/- AGCCTGGGCA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 2 1 373723 CASAVA_Build 17 24533603 1I ATCCACATGC -/A AAAAAAAAAA 2790 het 3 hom 28 0 15 13 A 13 14 373724 CASAVA_Build 17 24552807 34D AATATGTTAT TCACCATCTAGGTATGATACTGCCAACTAAAACA/---------------------------------- TACTGTAAAC 2565 het 2565 ref 21 24 6 4 TCACCATCTAGGTATGATACTGCCAACTAAAACA 1 0 373725 CASAVA_Build 17 24555318 3D GTTGCTGCAT ACA/--- ACATTTTTTG 3070 het 3070 hom 39 11 24 5 ACA 2 1 373726 CASAVA_Build 17 24560785 2D TCAATATGGA TT/-- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 33 16 15 2 T 9 7 373727 CASAVA_Build 17 24584336 1D CAACTGGTAA T/- TTTTTTTTTT 794 het 794 ref 22 14 4 4 T 15 14 373728 CASAVA_Build 17 24584649 1I CTTCCACCCT -/C CCCCTCCTGA 3070 hom 87 het 32 0 28 4 C 4 5 373729 CASAVA_Build 17 24601039 1D ATGGGAGCCC A/- TAAGTCCTTG 2584 het 2584 ref 44 30 7 7 A 1 0 373730 CASAVA_Build 17 24606099 3I GCTCAAGTGA ---/TCC TCCTGCCTCA 3070 het 3070 ref 29 14 13 2 TCC 1 2 373731 CASAVA_Build 17 24613546 1I ATTTTTATTT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 7 8 373732 CASAVA_Build 17 24613874 2D TAAGTTATTT TA/-- TATATATATA 1931 het 1147 hom 12 3 4 5 TA 9 8 373733 CASAVA_Build 17 24619078 2I AGTTTCGCTC --/TT TGTTACCCAG 3070 hom 47 het 19 0 14 5 T 1 3 373734 CASAVA_Build 17 24626187 3D TGTTTTTTTG AGA/--- AGGAGTTTCA 3070 het 3070 ref 27 13 11 3 AGA 1 0 373735 CASAVA_Build 17 24629719 36D GGTAAAAGTT GCTTGGAATGAAACTGCTACTACTATGATAGTAATA/------------------------------------ GCTTGGAATG 3070 hom 42 het 15 0 14 7 GCTTGGAATGAAACTGCTACTACTATGATAGTAATA 2 1 373736 CASAVA_Build 17 24632636 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAGA 2615 het 2615 ref 25 18 6 3 A 9 8 373737 CASAVA_Build 17 24634011 1D AGTTAACTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 14 23 7 A 10 9 373738 CASAVA_Build 17 24636674 1D GGTGGAGGTT G/- CAGTGGGCCG 3070 het 2793 hom 20 7 11 2 G 1 0 373739 CASAVA_Build 17 24638885 1D AAAAAGGATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 A 11 10 373740 CASAVA_Build 17 24643074 1D AATCTGCAAT A/- AAAAAGCACT 3070 het 3070 hom 48 18 24 6 A 6 5 373741 CASAVA_Build 17 24646128 1I AGTGGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1894 hom 28 6 15 7 T 14 15 373742 CASAVA_Build 17 24647811 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 70 het 34 0 26 9 A 13 12 373743 CASAVA_Build 17 24654438 1D AAGAAGCTAT A/- AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 A 8 7 373744 CASAVA_Build 17 24656915 16I2M2D4M14I GTATTTTTAG ----------------CCAAATAT--------------/TGGAGATGGGGTTTCACC--ATGTTGGCCAGGCTGGTC TTGATTTCCT 3070 hom 21 het 9 0 7 2 N/A 0 0 373745 CASAVA_Build 17 24659743 5D TGCCTGGCTA ATTTC/----- ATTTATTTTA 3070 het 3070 ref 24 12 8 4 ATTTC 1 0 373746 CASAVA_Build 17 24659835 1I CAGTCTTCCT -/G CCTCGGCCTC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 0 1 373747 CASAVA_Build 17 24704708 1I AAACTCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 21 1 15 5 A 15 16 373748 CASAVA_Build 17 24715700 1D TTTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 1459 het 1459 ref 17 10 4 3 A 14 13 373749 CASAVA_Build 17 24735836 1D CATGCCTGGC T/- TAATTTTTGT 3041 hom 18 het 7 0 7 0 T 2 1 373750 CASAVA_Build 17 24774913 1D GTTTCAGGCT G/- GGGCGTGGTG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 G 4 3 373751 CASAVA_Build 17 24817936 3D TTCTTAAAAA GTT/--- GTCTGTTTCA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 GTT 1 0 373752 CASAVA_Build 17 24834487 1I CTCCCGCAGT -/G GGGGGGATTT 3070 het 2544 hom 22 7 11 4 G 6 7 373753 CASAVA_Build 17 24839923 2I AAACTAAAAC --/AA AGAGCAAATT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 A 1 3 373754 CASAVA_Build 17 24841281 1D TTTGATTGGA G/- GGATGGTTTA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 G 3 2 373755 CASAVA_Build 17 24847920 1I TAGTAGAGAC -/G CGGTTTCGCT 3070 hom 89 het 32 0 30 2 G 0 1 373756 CASAVA_Build 17 24857805 4D GGATATGTTA GATT/---- GATTTAATTT 3070 hom 135 het 46 0 46 2 GATT 2 1 373757 CASAVA_Build 17 24864872 1D CAAATCACAA G/- GTCAGGAGTT 3070 hom 26 het 11 0 8 3 G 2 1 373758 CASAVA_Build 17 24869898 3D3M3D TTTTTACTTT ATCTATTTA/---TAT--- TTTATTTATT 1928 het 292 hom 8 2 6 0 N/A 0 0 373759 CASAVA_Build 17 24870665 1I TGCATCTCAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 118 hom 21 1 16 4 A 9 10 373760 CASAVA_Build 17 24876620 2I GCATGATCTT --/GG CTCACTGCAA 3070 hom 24 het 10 0 8 2 G 0 2 373761 CASAVA_Build 17 24882633 1D AGGCTGCGCG C/- CAGTGGCTCA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 2 1 373762 CASAVA_Build 17 24882936 1D CAGATAAGAC T/- TTTTAGGCAG 3070 hom 30 het 14 0 9 5 T 5 4 373763 CASAVA_Build 17 24896430 2I GTAAAATGAC --/AA GAGAGAGCTT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 0 2 373764 CASAVA_Build 17 24902149 2D TTTTTTATTT AA/-- AAAAAAAAAG 82 het 68 hom 21 1 2 18 A 11 9 373765 CASAVA_Build 17 24916400 1D GAGACTGTCT A/- AAAAAAAAAA 2977 het 1539 hom 15 4 7 4 A 11 10 373766 CASAVA_Build 17 24950531 1I CCTGGCAACC -/A GGGGAGCAGC 3070 het 1836 hom 25 4 12 9 A 0 1 373767 CASAVA_Build 17 24974061 1I GAGGGCGGGG -/C CTAGCATAGG 2027 hom 33 het 14 0 9 5 C 1 2 373768 CASAVA_Build 17 24977517 1D ATTTCCCTGT G/- GGCTTACTGA 3070 het 1905 hom 26 5 15 6 G 3 2 373769 CASAVA_Build 17 24979224 2I AGATTATAAA --/AG AGTCTGAAGA 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 AG 1 2 373770 CASAVA_Build 17 24985688 6D TTTCCTTTTG ATTATT/------ ATTATTATTA 2911 het 1929 hom 17 5 8 4 ATT 8 6 373771 CASAVA_Build 17 24986693 3D GGACTACAGG CGC/--- CGCCCGCCAC 1115 het 113 hom 4 1 3 0 CGC 2 1 373772 CASAVA_Build 17 24991501 1I ATTATAGGCG -/T TGAGCCACCA 3070 het 857 hom 17 3 10 4 T 1 2 373773 CASAVA_Build 17 25040302 1D TGAGACTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 435 hom 28 1 18 9 A 14 13 373774 CASAVA_Build 17 25042640 1D ATTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 25 0 17 8 T 13 12 373775 CASAVA_Build 17 25043311 1D AATAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1198 hom 20 5 10 5 A 13 12 373776 CASAVA_Build 17 25053497 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2968 het 539 hom 12 2 9 1 A 13 12 373777 CASAVA_Build 17 25054798 1I CGGCTCACTG -/C CAACAACCTC 1701 het 318 hom 13 2 5 6 C 1 2 373778 CASAVA_Build 17 25065793 1D TGTCTCAAAA T/- TTTCTCATCC 3070 het 3070 hom 46 20 24 3 T 4 3 373779 CASAVA_Build 17 25072467 4I TAGAACGGAC ----/ATTG ATTGCAGTAT 3070 het 3070 ref 53 24 22 7 ATTG 1 2 373780 CASAVA_Build 17 25087393 1I ATTAAATCTG -/A CCAGCAAAAG 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 A 0 1 373781 CASAVA_Build 17 25089416 3D CTTTTTTATG GCT/--- GCATAGTATT 1458 het 604 hom 5 2 3 0 GCT 1 0 373782 CASAVA_Build 17 25091593 1D TATTACCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 19 14 8 T 12 11 373783 CASAVA_Build 17 25092756 11D ATCCCCCTCC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 het 2121 hom 38 11 15 14 T 21 10 373784 CASAVA_Build 17 25094557 1I GCTAGATTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 21 11 9 T 10 11 373785 CASAVA_Build 17 25096975 2I GATGAGGAAA --/CT AAGGTTTAGG 3070 het 3070 hom 53 15 29 9 CT 0 1 373786 CASAVA_Build 17 25104937 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1907 het 477 hom 15 3 6 6 A 17 16 373787 CASAVA_Build 17 25117240 3D TATTATTATT ATC/--- ATCATCATCA 3070 het 3070 ref 31 18 8 7 ATC 5 4 373788 CASAVA_Build 17 25123253 1D AAAGATGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 47 17 21 9 T 11 10 373789 CASAVA_Build 17 25149030 2D AGACTCTAAA AT/-- TAAATAAATA 683 het 683 ref 37 23 3 11 AT 1 0 373790 CASAVA_Build 17 25161342 4I GCAAACACCC ----/TGAT TGATTTAAAA 3070 het 3070 ref 45 21 20 4 TGAT 1 2 373791 CASAVA_Build 17 25188406 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1730 het 1730 ref 24 17 5 2 A 15 14 373792 CASAVA_Build 17 25193284 7I TTAACTGGAG -------/GGGGGGT GAGACCCTGT 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 GGGGGGT 0 1 373793 CASAVA_Build 17 25199866 1I CTTCCCAGAC -/T ATTTGGCTGA 3070 het 3070 hom 37 17 19 1 T 0 1 373794 CASAVA_Build 17 25206731 2I TTTGGGAGTA --/AG AGCTTTTAAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 AG 1 2 373795 CASAVA_Build 17 25211896 1D ACTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1887 het 1174 hom 13 5 7 1 T 12 11 373796 CASAVA_Build 17 25212715 1I AATCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 10 11 373797 CASAVA_Build 17 25214887 1I ATTCTGGTAC -/T TTCAAAAGAA 3070 hom 120 het 51 0 41 10 T 2 3 373798 CASAVA_Build 17 25221423 1D CAGAATAGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 A 13 12 373799 CASAVA_Build 17 25227342 1D AGGTAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 16 16 11 A 15 14 373800 CASAVA_Build 17 25261471 1I TGTAACCTAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 32 hom 32 1 28 3 A 9 10 373801 CASAVA_Build 17 25262429 1I AGAAACTGTG -/T CCCCTCAGAC 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 T 0 1 373802 CASAVA_Build 17 25270910 1I AGGTGTTTTT -/G TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 39 20 13 6 G 0 1 373803 CASAVA_Build 17 25273537 3D ACAAACTGAA AAG/--- AATAGCTCAT 3070 het 3070 ref 44 21 21 2 AAG 1 0 373804 CASAVA_Build 17 25279954 1I GGTAACCTGA -/T TGATTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 T 1 2 373805 CASAVA_Build 17 25281753 1D AGGGCTCCGC G/- GAGTTTCAAA 3070 het 2348 hom 21 9 10 4 G 2 1 373806 CASAVA_Build 17 25286855 1I TAAGGGCTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 29 hom 29 1 23 5 A 11 12 373807 CASAVA_Build 17 25289457 1I CTTTTTTGCT -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 ref 38 17 14 7 A 6 7 373808 CASAVA_Build 17 25294186 4D CATCTCCAAA ATAT/---- ATATATATAT 2924 het 896 hom 11 2 7 3 AT 11 9 373809 CASAVA_Build 17 25302658 1I ATTTTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1210 het 48 hom 10 1 7 2 T 11 12 373810 CASAVA_Build 17 25306946 1D TCACAGAACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 441 hom 29 2 23 4 A 12 11 373811 CASAVA_Build 17 25359213 1I AAGTCAATAG -/C CAATCTAATG 3070 het 3070 ref 31 20 8 3 C 1 2 373812 CASAVA_Build 17 25359734 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1753 het 718 hom 7 2 4 1 A 12 11 373813 CASAVA_Build 17 25360556 1D CCTCCAGCCC T/- AGGCAGCCAC 3070 het 3070 hom 56 19 29 8 T 1 0 373814 CASAVA_Build 17 25372087 22I CAAATTATTG ----------------------/TAATAAAGGTTACACTAGAAGA TATCAGCATG 3070 het 3070 ref 46 25 21 2 TAATAAAGGTTACACTAGAAGA 0 1 373815 CASAVA_Build 17 25411382 1I AAAAAAATTT -/A AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 A 8 9 373816 CASAVA_Build 17 25431695 1D TCCAAGCTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 13 8 9 T 14 13 373817 CASAVA_Build 17 25436864 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 567 hom 23 7 13 3 A 19 17 373818 CASAVA_Build 17 25450573 1I TTAATCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 9 9 6 A 11 12 373819 CASAVA_Build 17 25451910 1I GACTCCGTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 47 22 12 13 A 11 12 373820 CASAVA_Build 17 25455696 1D AAAGCAAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1770 hom 28 6 15 9 A 11 10 373821 CASAVA_Build 17 25458953 5D TCCACTCTTA CTTTT/----- CTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 14 11 CTTTT 2 1 373822 CASAVA_Build 17 25467440 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2245 het 2245 ref 16 9 6 1 A 10 11 373823 CASAVA_Build 17 25479802 5D TCAGAAATTG ATATA/----- ATATATTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 11 2 ATATA 2 1 373824 CASAVA_Build 17 25482693 1I CATTATAGCT -/A AAAAAAATGC 3070 het 405 hom 35 1 33 1 A 7 8 373825 CASAVA_Build 17 25496467 2D TGGCTCACAC CT/-- CTCTAATCCC 3070 het 3070 hom 17 8 7 2 CT 3 2 373826 CASAVA_Build 17 25497147 1D GTGCATGCCA C/- CATGCCCAGC 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 C 2 1 373827 CASAVA_Build 17 25513169 1D TAGCCATGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 27 5 11 12 T 15 14 373828 CASAVA_Build 17 25527145 2D AGACTCCGAA CC/-- CCCCCCCCAA 3070 het 2688 hom 27 11 11 5 C 10 8 373829 CASAVA_Build 17 25532742 1I GTGTGTGTGG -/T TTTTTTTTTT 1747 het 1109 hom 19 8 5 6 T 12 13 373830 CASAVA_Build 17 25534376 1I AAAAAAAAAA -/G TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 38 10 19 9 G 0 1 373831 CASAVA_Build 17 25541527 3I TGATCTTGAA ---/CTC CTGGCCTCAT 2335 het 2335 ref 22 12 5 5 CTC 0 1 373832 CASAVA_Build 17 25546963 1D AGCATAACAA T/- TTTTTTTTTT 2650 het 1360 hom 28 6 8 14 T 17 16 373833 CASAVA_Build 17 25573538 1D AGCCACTGGA C/- TCTCATCTTG 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 C 1 0 373834 CASAVA_Build 17 25580835 1I TGAGATTACA -/G GCATGAGCCA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 G 1 2 373835 CASAVA_Build 17 25593502 16I GCTGATCACC ----------------/CTCACCCTTGACGTCT GCGTTCACTG 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 CTCACCCTTGACGTCT 0 1 373836 CASAVA_Build 17 25599577 2D CAGAGATGTG CA/-- CACCCCACAG 3070 het 3070 ref 65 36 22 9 CA 2 1 373837 CASAVA_Build 17 25635972 2D TTTCAGCCAC AT/-- GATTCCCTGA 3070 het 3070 hom 46 18 22 9 AT 1 0 373838 CASAVA_Build 17 25676709 1D TTTCTCATGT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 A 10 9 373839 CASAVA_Build 17 25677068 1I ATAGACAGTC -/A AACACATCTA 3070 het 3070 hom 63 27 34 2 A 2 3 373840 CASAVA_Build 17 25678887 1I ACACACCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 T 11 12 373841 CASAVA_Build 17 25680113 1I60M1D ACTCTGTCTC -AAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAGAGAAAAGA/AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAGAGAAAAG- AAAAAAAGAA 3070 het 2943 hom 13 9 9 17 N/A 0 0 373842 CASAVA_Build 17 25682465 1I TGTACTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 14 6 T 11 12 373843 CASAVA_Build 17 25685626 1D TACCACTAGT A/- ACCCAAGCCC 3070 het 3070 hom 56 23 27 6 A 2 1 373844 CASAVA_Build 17 25708838 4D CTTTAAACTT TAGA/---- TAGTAGAATC 2714 het 2714 ref 18 11 6 2 TAGA 1 0 373845 CASAVA_Build 17 25718077 3D CCCAATTTCT TGC/--- TGTTTTTACT 3070 het 3070 hom 51 22 27 2 TGC 1 0 373846 CASAVA_Build 17 25723093 1D AAACAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 24 10 6 A 11 10 373847 CASAVA_Build 17 25752392 6D GCTGCTGCTT CTTCTC/------ CTTCTCCTTC 3070 het 3070 ref 46 18 12 18 CTTCTC 3 2 373848 CASAVA_Build 17 25755849 2D TCCTTTGTCA TC/-- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 13 6 TC 2 1 373849 CASAVA_Build 17 25760274 1D GTTTTTGTCA T/- TTGGTTGTGT 3070 het 13 hom 28 1 25 2 T 3 2 373850 CASAVA_Build 17 25762095 4I TCTTCACAGC ----/ATGA ATGAATGGTC 3070 het 3070 ref 41 27 12 2 ATGA 1 2 373851 CASAVA_Build 17 25766128 1I GTAGATCATG -/T TTTAAAACCA 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 T 3 4 373852 CASAVA_Build 17 25769325 1I ATTAATATCA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 34 15 15 4 T 7 8 373853 CASAVA_Build 17 25776270 2D CTTTAGTCTC TT/-- GCAATTTTTC 3070 het 3070 ref 45 19 22 4 T 2 0 373854 CASAVA_Build 17 25776800 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 93 hom 26 1 16 9 A 17 16 373855 CASAVA_Build 17 25788919 2D TTATTTGATA AG/-- AGAGTGATGG 3070 het 3070 hom 41 19 21 4 AG 3 2 373856 CASAVA_Build 17 25790062 1I CTTTCCAGTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 52 24 18 10 T 9 10 373857 CASAVA_Build 17 25794152 1I AGTCTGTGAG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 T 8 9 373858 CASAVA_Build 17 25821318 2I41M2D TTTCTCTCTC --TCTATATATATATATGTATGTATATGTACATACATACACACGT/TATATATATATATATATGTATGTATATGTATATACATACACAC-- GTATATGTAT 2773 het 2520 hom 18 9 9 4 N/A 0 0 373859 CASAVA_Build 17 25835785 1I ATTTTGATTG -/T TTTTTTTTTT 2297 het 2297 ref 25 16 6 3 T 10 11 373860 CASAVA_Build 17 25849300 1I ATTCAAATCC -/T TTTTTTTTTT 2079 het 2079 ref 17 11 5 1 T 11 12 373861 CASAVA_Build 17 25859399 2D TTTAGTAGTT TA/-- TTTCATTTAT 3070 het 3070 ref 35 18 13 6 TA 1 0 373862 CASAVA_Build 17 25862677 1D AACATTTGTA T/- TTTTTTTTTT 2856 het 2856 ref 33 15 8 10 T 15 14 373863 CASAVA_Build 17 25869582 1D CTCTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 8 A 15 14 373864 CASAVA_Build 17 25875681 1I ATTGTTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 T 10 11 373865 CASAVA_Build 17 25878978 16I GGTGGAGAAC ----------------/CACTACTCTAGAGTGT CACGCTCTAT 3070 het 3070 ref 34 20 12 2 CACTACTCTAGAGTGT 0 1 373866 CASAVA_Build 17 25879500 1D TTCTTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1148 hom 34 7 17 10 T 13 12 373867 CASAVA_Build 17 25879822 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 1560 het 1560 ref 18 9 5 4 T 9 10 373868 CASAVA_Build 17 25880257 1I GATATTCTCC -/T TTTTTTTTTT 2103 het 2103 ref 32 22 7 3 T 13 14 373869 CASAVA_Build 17 25900052 1D TTCCATATTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 37 17 10 10 T 10 9 373870 CASAVA_Build 17 25917145 1I ATGTTTGATA -/C CCCCCTTCTG 3070 hom 45 het 19 0 16 3 C 5 6 373871 CASAVA_Build 17 25931121 4I TCCACTGATG ----/CCAC CTGTGCTGTC 3070 hom 87 het 35 0 30 5 CCAC 0 1 373872 CASAVA_Build 17 25931430 2D AGAAATATAA AT/-- ATGTGTCTGC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 AT 2 1 373873 CASAVA_Build 17 25973919 4D TCAAAAAAAT AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 2954 hom 19 7 12 1 AAAG 3 2 373874 CASAVA_Build 17 26018783 1I CGCAGACAGC -/G GGCCCCAGGG 1126 hom 30 het 12 0 4 8 G 2 3 373875 CASAVA_Build 17 26052864 1D TCATACAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 26 0 19 7 T 14 13 373876 CASAVA_Build 17 26077282 4I AAAATAATAA ----/TAAT TATTATTATT 3004 het 3004 ref 18 9 7 2 TAAT 0 1 373877 CASAVA_Build 17 26213288 1I AGACCAGCCT -/G GCCAACATGG 3070 hom 18 het 8 0 7 1 G 1 2 373878 CASAVA_Build 17 26218265 1I CTGTGAGCAG -/T TGGGTACAGT 3070 hom 75 het 28 0 25 3 T 1 2 373879 CASAVA_Build 17 26219115 1I ATGTATTTTT -/C CCCAATGGTG 3070 hom 87 het 33 0 29 4 C 3 4 373880 CASAVA_Build 17 26287771 1I CAGATCCTTT -/C CCCATATTGG 3070 hom 55 het 22 0 19 3 C 3 4 373881 CASAVA_Build 17 26299553 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2483 het 999 hom 14 4 8 2 A 14 15 373882 CASAVA_Build 17 26343516 1D CTGGCCTCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1616 hom 32 10 13 9 T 17 16 373883 CASAVA_Build 17 26352858 1I TCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1568 het 892 hom 25 3 7 15 T 15 16 373884 CASAVA_Build 17 26442086 1D CCAGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 8 12 1 A 11 10 373885 CASAVA_Build 17 26448082 2I GTAGAAAAGA --/CT CTCTGTAATT 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 CT 2 3 373886 CASAVA_Build 17 26453492 3D TCTTTATAGC TTA/--- TTATTATTAT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 TTA 5 4 373887 CASAVA_Build 17 26487935 5D CTGTGTCTTA TAAAT/----- TAAACTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 13 7 TAAAT 1 0 373888 CASAVA_Build 17 26494011 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1308 hom 17 5 9 3 A 15 14 373889 CASAVA_Build 17 26498720 2I AATTGCTGAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 32 9 18 5 TG 7 8 373890 CASAVA_Build 17 26503319 1I TCTAATTTTT -/G GGGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 12 9 4 G 3 4 373891 CASAVA_Build 17 26528580 1D AAAAAGGCTG A/- AAAAAAAACG 3070 het 3070 ref 38 19 12 7 A 9 8 373892 CASAVA_Build 17 26532946 1I ATACGATTGA -/T TTTTTTTTTT 1938 het 1938 ref 26 8 9 9 T 16 17 373893 CASAVA_Build 17 26540478 1I GTCTCCTAGC -/T TTTTTTGGTC 3070 het 3070 ref 46 21 20 5 T 6 7 373894 CASAVA_Build 17 26546851 1D GATTTCATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 35 15 14 7 T 10 9 373895 CASAVA_Build 17 26547773 1D GTTGAAAATA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 9 8 373896 CASAVA_Build 17 26551377 1I AGAAAAAGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 3 T 8 9 373897 CASAVA_Build 17 26557812 15D TCCTTAAAAC TTTTGAACAAAAATA/--------------- TTTTGATTAG 3070 het 3070 ref 23 13 11 6 TTTTGAACAAAAATA 1 0 373898 CASAVA_Build 17 26568460 1D TATATTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 15 het 33 1 22 10 T 12 11 373899 CASAVA_Build 17 26570114 1I GATTTATTTA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 7 8 373900 CASAVA_Build 17 26587200 2I CGCTGTTTTT --/TG TGTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 TG 1 2 373901 CASAVA_Build 17 26589183 4D AGACAGGTAA ATGT/---- ATACAGAGAA 3070 het 3070 hom 47 21 23 5 ATGT 1 0 373902 CASAVA_Build 17 26589412 1D TCCCTTTATG C/- TTTGGGCAGG 3070 het 3070 hom 32 13 13 6 C 1 0 373903 CASAVA_Build 17 26608450 1D TAAACAGCAG T/- TTAGCCGCAC 3070 het 3070 ref 49 37 12 0 T 3 2 373904 CASAVA_Build 17 26608688 1I AGGGAAAATC -/A ATCCATTTTA 2330 het 2330 ref 42 34 5 3 A 1 2 373905 CASAVA_Build 17 26622515 1I TATTAACACA -/T TTCATGAAAT 3070 het 3070 hom 40 19 19 2 T 2 3 373906 CASAVA_Build 17 26625875 12D TATATAGTTG GTAATAGTAATA/------------ GTAATAGTAA 3070 het 583 hom 32 6 16 15 GTAATA 5 3 373907 CASAVA_Build 17 26628085 1D AACTACTAAT A/- AGACTGTTGA 3070 het 3070 ref 37 23 12 3 A 2 1 373908 CASAVA_Build 17 26629552 1D ATTTTTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1831 hom 31 12 13 6 T 22 21 373909 CASAVA_Build 17 26632561 1I ATAATGCTAG -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 54 25 25 4 A 6 7 373910 CASAVA_Build 17 26639667 14D TTTTGCTTTG TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1570 hom 26 8 14 4 T 24 10 373911 CASAVA_Build 17 26644883 1I ATTCTGCCTT -/A ACGTCTCACA 3070 het 3070 hom 40 14 23 3 A 1 2 373912 CASAVA_Build 17 26651018 1D CATCTTGGAG T/- TTTCTCTTTG 3070 het 3070 hom 24 8 14 3 T 4 3 373913 CASAVA_Build 17 26659780 1D AAGGGTGTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 48 17 23 9 T 10 9 373914 CASAVA_Build 17 26664013 1I TGCAGTTTTT -/A ATTTGCCCAT 3070 het 3070 hom 39 13 22 4 A 1 2 373915 CASAVA_Build 17 26670900 1D AAATCTGAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1721 hom 27 8 13 6 A 15 14 373916 CASAVA_Build 17 26672857 1D CACAGGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 13 3 A 13 12 373917 CASAVA_Build 17 26678120 21D GCCTAGGCTG GAGTGCAGTGGCGTGATCTCA/--------------------- GAGTGCAGTG 2827 het 2827 ref 22 9 6 11 GAGTGCAGTGGCGTGATCTCA 2 1 373918 CASAVA_Build 17 26685349 8D AGGAGAATGG TGTGAACC/-------- TGTGAACCCG 2925 het 2094 hom 15 6 8 2 TGTGAACC 2 1 373919 CASAVA_Build 17 26699283 4D GTCTGATATG AGGA/---- AGGAAAATTG 2898 het 2898 ref 29 23 6 0 AGGA 2 1 373920 CASAVA_Build 17 26702369 1D TTTCTGATTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 30 11 18 1 A 8 7 373921 CASAVA_Build 17 26703005 1I TTTTTTGGGG -/T TTTTTTTTTT 1471 het 1471 ref 28 13 6 9 T 15 16 373922 CASAVA_Build 17 26723577 2D GTCTAATTTT GG/-- GGGTAAATTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 G 5 3 373923 CASAVA_Build 17 26726157 2D GTATAGTAAT TA/-- TATATATATA 3070 het 1490 hom 16 4 10 3 TA 8 7 373924 CASAVA_Build 17 26736820 2D CACTGTAGAG TC/-- TGCAAAGTTC 3070 het 3070 ref 40 16 18 7 TC 1 0 373925 CASAVA_Build 17 26739204 2D ACCCTAACTA TG/-- TGTGTATGGG 3070 het 3070 hom 56 24 27 7 TG 3 2 373926 CASAVA_Build 17 26775721 1D ACCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1043 het 149 hom 10 1 4 5 T 17 16 373927 CASAVA_Build 17 26786160 1I TGAGACCCCG -/T TCTCTACATA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 T 1 2 373928 CASAVA_Build 17 26794773 1I AGTGAGGTTT -/G GCCCGGTGCA 3070 het 3070 ref 39 16 17 6 G 1 2 373929 CASAVA_Build 17 26795494 1I TGTTTCAACA -/C CCCCCCCCAC 2906 het 2906 ref 29 9 10 10 C 8 9 373930 CASAVA_Build 17 26796492 3D TGTGCATACA TAC/--- TACTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 18 13 1 TAC 2 1 373931 CASAVA_Build 17 26806786 15I AGGGAGTGGG ---------------/AAGCGGAGCATCCTC TCTGCTCTGA 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 AAGCGGAGCATCCTC 0 1 373932 CASAVA_Build 17 26807441 2D GGCCCAGCCT TC/-- TAGGCTCAAG 3070 het 1387 hom 29 4 17 8 TC 1 0 373933 CASAVA_Build 17 26823307 1D AGTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 999 hom 15 het 6 0 4 3 A 15 14 373934 CASAVA_Build 17 26833430 1I GTCATTCCCA -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 70 het 29 0 23 6 T 8 9 373935 CASAVA_Build 17 26844005 1I GCATTGATGA -/C CAAGAGCTCA 3070 hom 83 het 32 0 28 4 C 1 2 373936 CASAVA_Build 17 26854175 3I TATTATTATT ---/TTG TTGTTGTTTG 3070 hom 22 het 18 0 14 4 TTG 2 3 373937 CASAVA_Build 17 26859858 1I AGTCCCTCTG -/C TCAGCCTCAG 3070 hom 117 het 44 0 38 6 C 0 1 373938 CASAVA_Build 17 26860417 1I GCCTGCTTGC -/T TTCTCATGTG 3070 het 177 hom 40 1 35 4 T 2 3 373939 CASAVA_Build 17 26878769 16D ATAATTTACT ATTTTGCTTACAAATA/---------------- GTCCTTACTA 3070 hom 84 het 27 0 29 3 ATTTTGCTTACAAATA 1 0 373940 CASAVA_Build 17 26887778 1D GGCCATGCCG T/- TCAGTGGATG 3070 hom 97 het 39 0 31 9 T 2 1 373941 CASAVA_Build 17 26895516 1I TTGCAGCTGC -/A ATCCAGCTGA 3070 hom 117 het 45 0 38 7 A 1 2 373942 CASAVA_Build 17 26898463 2I CGGGCAAAGA --/AG GAGGGTGGGA 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 AG 0 1 373943 CASAVA_Build 17 26901499 1I CCGCGCCGCG -/C TGCGCCCTCG 1606 hom 39 het 15 0 6 9 C 0 1 373944 CASAVA_Build 17 26901970 1I TCTTCAATTG -/T TAACACTCCC 3070 het 3070 ref 51 27 21 3 T 1 2 373945 CASAVA_Build 17 26911917 1I TTATTTGTCC -/T TTTGTTTGTG 3070 het 3070 ref 29 12 12 5 T 3 4 373946 CASAVA_Build 17 26913363 3D CCCTGTCCTG CCT/--- ACTGGGAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 13 3 CCT 1 0 373947 CASAVA_Build 17 26914228 4D TTCTTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTTTT 3065 het 667 hom 21 2 8 11 TTTC 2 1 373948 CASAVA_Build 17 26915421 2I GTCGAGACTC --/AG AGGGGAAGAG 3070 het 3070 hom 39 14 18 7 AG 1 2 373949 CASAVA_Build 17 26940471 1I AGATACTGGA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 T 8 9 373950 CASAVA_Build 17 26954820 1D TCCCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 13 8 A 11 10 373951 CASAVA_Build 17 26968535 1I TGTCTCTACT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 22 0 18 4 A 11 12 373952 CASAVA_Build 17 26981578 1I GTCCTTCCTC -/G GTCCCCAGTG 3070 het 3070 hom 39 15 18 6 G 1 2 373953 CASAVA_Build 17 26981844 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAGAA 1549 het 627 hom 8 3 5 0 A 8 7 373954 CASAVA_Build 17 26995576 1D TGAACGATGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2736 hom 19 7 9 3 A 10 9 373955 CASAVA_Build 17 26999884 1I ATGAAACATC -/A ACATGACACA 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 A 1 2 373956 CASAVA_Build 17 27001006 1D CATGGTGAAA C/- CCCCCCCCCC 1305 hom 15 het 6 0 5 1 C 11 10 373957 CASAVA_Build 17 27004308 4D GGGGTGGGGG GAGA/---- GAGAGAGAGA 1899 het 1899 ref 19 8 7 5 GA 8 6 373958 CASAVA_Build 17 27013957 1I ATGTCCCCCC -/T ATCACTTACC 3070 hom 93 het 36 0 30 6 T 0 1 373959 CASAVA_Build 17 27015641 1D TGTCTCAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 74 het 31 0 28 4 A 11 10 373960 CASAVA_Build 17 27022051 2I CCACTGTCTG --/AC AAGCCCCAGT 3070 hom 69 het 26 0 22 4 AC 0 1 373961 CASAVA_Build 17 27030832 1I GATGGTTTGA -/T TCTAGCTCCA 3070 hom 68 het 30 0 22 8 T 1 2 373962 CASAVA_Build 17 27032143 1D AAAAGATACA T/- TAAAAACACA 3070 hom 75 het 28 0 26 4 T 2 1 373963 CASAVA_Build 17 27033159 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 269 hom 35 1 21 13 T 12 11 373964 CASAVA_Build 17 27039600 1D GCCTGGCTCA T/- TTTTTTTTTT 2869 het 215 hom 12 1 8 3 T 17 16 373965 CASAVA_Build 17 27039840 1I TTTGAATACA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 55 het 22 0 19 3 T 7 8 373966 CASAVA_Build 17 27041231 1I GTCTAGTTTT -/G TATTTTTTGT 3070 hom 63 het 28 0 20 11 G 0 1 373967 CASAVA_Build 17 27042606 12D CCATCTCTTC CTCCCAGGAAGG/------------ CTGCCCACAG 3070 het 3070 hom 48 19 24 9 CTCCCAGGAAGG 1 0 373968 CASAVA_Build 17 27050364 2D AAACAAAAAC TG/-- AGGGAATTTG 3070 het 3070 ref 38 18 14 7 TG 1 0 373969 CASAVA_Build 17 27056162 1I TTCTATATAT -/A AGATTGTGTC 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 1 2 373970 CASAVA_Build 17 27057946 1D CCAAGTGAAC T/- AAAACATATG 3070 het 3070 hom 46 20 21 5 T 1 0 373971 CASAVA_Build 17 27062170 4I AAAGAATACG ----/TATA TATATATATA 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 TA 6 8 373972 CASAVA_Build 17 27062605 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2033 het 1466 hom 24 7 7 11 A 12 11 373973 CASAVA_Build 17 27066961 1I TAAATATATA -/T TTTTTTTAAT 3070 het 2462 hom 22 7 12 3 T 7 8 373974 CASAVA_Build 17 27067398 1D CCTGTTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1023 hom 23 4 10 9 A 17 16 373975 CASAVA_Build 17 27074824 1D TACTTCATCC T/- TTTTTTTTTT 788 het 788 ref 24 17 2 5 T 11 10 373976 CASAVA_Build 17 27078084 1D TCACATTTTC T/- TTTTTTTTTT 1440 het 1440 ref 32 23 5 4 T 12 11 373977 CASAVA_Build 17 27097579 9D CAGAAGCAAG CAGAGTTCT/--------- CAACTTAGAG 3070 het 3070 ref 35 19 14 8 CAGAGTTCT 1 0 373978 CASAVA_Build 17 27128664 1D AGGCCAAGGT G/- GGTGGATCAC 3070 hom 60 het 24 0 21 4 G 3 2 373979 CASAVA_Build 17 27138743 1I CTCCCTAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 10 11 373980 CASAVA_Build 17 27175865 1I CATAAGTCAG -/C CCCCCCCCAA 2922 het 2922 ref 22 12 8 2 C 8 9 373981 CASAVA_Build 17 27179832 1I ATAACCAATT -/A AAAAAAAGTC 3070 hom 66 het 24 0 22 2 A 7 8 373982 CASAVA_Build 17 27185396 1D ATTAGCTGGG C/- ATGATGGCAT 3070 het 3070 hom 31 13 17 1 C 1 0 373983 CASAVA_Build 17 27186236 1D AGCACACAGT A/- ATAGACATCA 3070 het 3070 ref 39 22 16 2 A 2 1 373984 CASAVA_Build 17 27207777 1I AAGCTCCAAG -/C CAAGGCTTCC 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 C 1 2 373985 CASAVA_Build 17 27209775 3D GGTTTCAGTA AGG/--- AGAAGGGGGA 3070 het 3070 hom 32 12 14 8 AGG 1 0 373986 CASAVA_Build 17 27225426 1D CATTTGCAAT C/- CCAGCACTTT 3070 het 3070 ref 34 18 14 2 C 3 2 373987 CASAVA_Build 17 27235027 2D TCTCAAACCC CT/-- GAGCTCAAGG 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 CT 1 0 373988 CASAVA_Build 17 27235875 2I AACTCCCCAC --/AT GATTTAATTA 3070 hom 102 het 44 0 35 9 AT 0 1 373989 CASAVA_Build 17 27236019 3D AACCTCATCT CTA/--- CTACAAGTAC 3070 het 3070 ref 37 16 14 9 CTA 2 1 373990 CASAVA_Build 17 27240202 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1412 het 974 hom 9 3 4 2 A 11 12 373991 CASAVA_Build 17 27242650 1I AATAGGTGCT -/G GAGGCCCCTC 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 G 1 2 373992 CASAVA_Build 17 27257456 1D TATCAACTCA T/- AGAAGGAGCC 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 T 1 0 373993 CASAVA_Build 17 27258007 1D TTTCAACATA T/- TGAAGCTCTT 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 2 1 373994 CASAVA_Build 17 27259224 1I AAAAAAATAC -/A AAAAAGGAAA 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 A 5 6 373995 CASAVA_Build 17 27261426 1D AAATGTTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 18 13 5 A 16 15 373996 CASAVA_Build 17 27261862 1D GAAATTGAAA T/- TTTTTTTTTT 1891 het 1891 ref 33 15 5 13 T 17 16 373997 CASAVA_Build 17 27301329 1D CCCACCTCAG C/- CCTCCCAAAG 3070 hom 30 het 11 0 11 1 C 3 2 373998 CASAVA_Build 17 27312801 3D ATTTTCAGTG TGT/--- TGTTAGTAGT 3070 het 3070 ref 39 22 14 4 TGT 2 1 373999 CASAVA_Build 17 27434235 1I GGTGGGGTAA -/T AAGACCCAAG 3070 het 344 hom 25 2 17 6 T 0 1 374000 CASAVA_Build 17 27446682 1D AACATAAAGC A/- AAAAAAAACA 2435 het 2435 ref 22 10 5 8 A 9 8 374001 CASAVA_Build 17 27451129 1D ATAAAAATAG A/- AAAAAAAAAA 2473 het 2473 ref 31 15 8 8 A 11 10 374002 CASAVA_Build 17 27455134 3D GGCCACCTTC ACA/--- ACAATAGCTC 1562 het 1562 ref 24 7 7 11 ACA 2 1 374003 CASAVA_Build 17 27460383 1I CCAGCACTTT -/G GGGAGGCCTA 3070 het 3070 ref 23 10 10 3 G 3 4 374004 CASAVA_Build 17 27501489 1D GCTAATGAAC T/- TTTTTTTTTT 2985 het 2985 ref 34 23 7 4 T 13 12 374005 CASAVA_Build 17 27514202 4D TAGGGATAGA TTAT/---- TTATGATATT 3070 het 3070 hom 33 12 16 5 TTAT 2 1 374006 CASAVA_Build 17 27574107 1I CTTCTCTGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 T 9 10 374007 CASAVA_Build 17 27604555 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 9 16 6 T 9 10 374008 CASAVA_Build 17 27607522 1D TACGATTGTG C/- CCCAGGAACC 3070 het 3070 hom 52 21 26 6 C 4 3 374009 CASAVA_Build 17 27614431 1D CTAACTGCTG C/- CGCCCTTGTG 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 C 2 1 374010 CASAVA_Build 17 27615379 1D GTTGGATATG T/- TGATAAGAGC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 T 2 1 374011 CASAVA_Build 17 27653028 1D TTTATTTGGA T/- TTTTTTTAAG 3070 het 3070 ref 42 27 12 3 T 8 7 374012 CASAVA_Build 17 27653479 1D GAAAGTCTGC T/- TTTTTTTAGT 3070 het 2178 hom 21 6 10 5 T 8 7 374013 CASAVA_Build 17 27682494 1D TAGAATTACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 14 8 T 11 10 374014 CASAVA_Build 17 27690386 2D AATGAAAATA AG/-- AGAGTATCTG 3070 het 3070 ref 39 21 14 5 AG 3 2 374015 CASAVA_Build 17 27694438 1D GTGTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 15 9 T 12 11 374016 CASAVA_Build 17 27715165 3I CCATTTTCTT ---/TTC TTCTTCTTTT 2246 het 2246 ref 32 12 14 6 TTC 2 3 374017 CASAVA_Build 17 27735681 4D ATAAACAGTT TGTC/---- TGATGGCTTT 3070 het 3070 ref 49 25 21 7 TGTC 1 0 374018 CASAVA_Build 17 27744654 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2938 hom 32 8 15 9 A 10 9 374019 CASAVA_Build 17 27750183 3I AGTGCATGAT ---/GAA GAAGAATACA 3070 het 3070 ref 47 28 17 2 GAA 2 3 374020 CASAVA_Build 17 27750939 1D TCATGAGTAT A/- AAAAAAAAAA 1742 het 1742 ref 23 13 5 5 A 15 14 374021 CASAVA_Build 17 27755659 2I AAGGAGGGAG --/AC ACATATGATT 3070 het 3070 ref 60 29 25 6 AC 1 2 374022 CASAVA_Build 17 27781014 1I AGTCCCCACT -/G GGGCACTGCC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 G 3 4 374023 CASAVA_Build 17 27781428 1I TTGACTTTAC -/A AAGCTCGTCG 2714 het 2714 ref 28 15 7 6 A 2 3 374024 CASAVA_Build 17 27786518 1I TGGGCGGCCG -/C CCCTGCGGCT 3070 hom 54 het 19 0 18 1 C 3 4 374025 CASAVA_Build 17 27790891 4I TCCTGCAACC ----/TTTT TTTTGGAGGG 3070 het 3070 hom 37 14 19 4 T 4 8 374026 CASAVA_Build 17 27799293 3D TCCAGGTGTG AGC/--- CATTGTGCCC 3070 het 3070 ref 20 11 7 2 AGC 1 0 374027 CASAVA_Build 17 27812713 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2126 hom 25 8 12 5 A 11 12 374028 CASAVA_Build 17 27819551 4D AGCCACAGGG ATTT/---- ATTTCTGTTT 3070 het 3070 ref 26 13 10 5 ATTT 2 1 374029 CASAVA_Build 17 27820835 1I TATTCAGCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 14 14 15 T 11 12 374030 CASAVA_Build 17 27821149 1D TTGTTTTTAC T/- TTTTTTTTTT 1736 het 1736 ref 42 24 4 14 T 13 12 374031 CASAVA_Build 17 27844003 1D AAAAGTGCTT G/- TCCTGTGGCC 3070 het 3070 ref 39 17 12 11 G 1 0 374032 CASAVA_Build 17 27873930 8I AGGCTCCTCA --------/GTCTTAGT GTCTTAGTGT 3070 het 1748 hom 23 7 9 7 GTCTTAGT 1 2 374033 CASAVA_Build 17 27889414 1D ATAAATCATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 518 hom 33 2 20 11 T 15 14 374034 CASAVA_Build 17 27889599 2D TTATTATTAT TA/-- TTTTTTTTTT 2800 het 1489 hom 22 6 11 5 TA 1 0 374035 CASAVA_Build 17 27898207 1I TAATTAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 42 1 34 7 T 11 12 374036 CASAVA_Build 17 27900495 1D CCAAAGTGCT G/- GGATTACAGG 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 3 2 374037 CASAVA_Build 17 27902105 1D TCAAAAAAAA G/- AGAAAGAAAT 3070 hom 53 het 25 0 21 4 G 1 0 374038 CASAVA_Build 17 27906396 1D GATATTACAA G/- CTGTGCTGGA 3070 het 2352 hom 29 6 15 8 G 1 0 374039 CASAVA_Build 17 27913128 1I CTTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2571 het 2571 ref 23 10 9 4 T 10 11 374040 CASAVA_Build 17 27913492 24I ATTTCATTTC ------------------------/ATAATTTCATATCATTATTTAGAT ATTCTTTAAT 3070 het 3070 hom 27 11 14 2 ATAATTTCATATCATTATTTAGAT 0 1 374041 CASAVA_Build 17 27916161 1I TGGAGATGGC -/T TTCTTGCTCT 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 2 3 374042 CASAVA_Build 17 27917326 1I GATGTTAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 17 12 8 A 9 10 374043 CASAVA_Build 17 27918095 17D GACTGAGGGC AGAACGGTTGATTCCAA/----------------- AGCCCGTGCT 2095 het 2095 ref 21 15 9 2 AGAACGGTTGATTCCAA 1 0 374044 CASAVA_Build 17 27924210 4D TTGAAAAAAT ACTG/---- ACTATTATCA 3070 het 3070 ref 39 20 17 5 ACTG 1 0 374045 CASAVA_Build 17 27933783 10D AATGGTAACT AGTTCAACTC/---------- AGTTCAACTC 3070 het 3070 hom 38 15 20 5 AGTTCAACTC 2 1 374046 CASAVA_Build 17 27943838 2I ACAATCTAGC --/TG TGTTACAAAT 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TG 1 2 374047 CASAVA_Build 17 27944253 2I TTACTCTGGC --/CA CAGTTATTGA 3070 het 3070 ref 31 13 15 3 CA 1 2 374048 CASAVA_Build 17 27948621 1D CCATTTTTGT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 31 16 8 8 A 10 9 374049 CASAVA_Build 17 27956609 1I TGCTCAGTGA -/C CCCCCTGACT 3070 het 3070 ref 31 15 14 2 C 5 6 374050 CASAVA_Build 17 27962595 1I AGAATAAAGG -/A AAAAAATCTT 3070 het 3070 ref 25 12 11 2 A 6 7 374051 CASAVA_Build 17 27974238 4I ATGGCTGCTC ----/CCTT AACAGGAGCC 3070 het 3070 ref 34 13 12 9 CCTT 0 1 374052 CASAVA_Build 17 27992388 1I CCTACAAAGG -/T ACATGAACTC 3070 hom 18 het 7 0 7 0 T 0 1 374053 CASAVA_Build 17 28003758 1I TATTTTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 24 12 9 3 T 10 11 374054 CASAVA_Build 17 28012787 1D ACCCTGTCCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 28 2 19 9 A 12 11 374055 CASAVA_Build 17 28014050 1D CTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2568 het 93 hom 23 2 8 13 T 17 16 374056 CASAVA_Build 17 28029386 1I AATATATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 164 hom 18 1 14 3 T 11 12 374057 CASAVA_Build 17 28045427 1D CTCATCCTGA C/- CCAACTTTAA 3070 hom 85 het 32 0 29 3 C 3 2 374058 CASAVA_Build 17 28051761 4I TGATGAAGAT ----/AAAG AAAAAAATTA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 AAAG 0 1 374059 CASAVA_Build 17 28056275 1D CTCATACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 24 9 14 1 T 11 10 374060 CASAVA_Build 17 28056568 1I TTTTTTGTAC -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 23 11 9 3 T 8 9 374061 CASAVA_Build 17 28058689 1D AGGGAAGACT A/- ATGGGGGTCC 3070 het 3070 ref 32 17 11 5 A 2 1 374062 CASAVA_Build 17 28060526 1I GGAATCTACC -/A AAAAAAACCC 3070 het 3070 ref 41 18 17 6 A 7 8 374063 CASAVA_Build 17 28077551 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2747 hom 16 7 8 1 A 10 11 374064 CASAVA_Build 17 28104384 1I TCCAAAAGCA -/G GGGGGTGAGA 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 G 5 6 374065 CASAVA_Build 17 28106044 7D AATTACTACA GATATGT/------- GATCTGTTTA 3070 het 3070 ref 58 31 24 5 GATATGT 1 0 374066 CASAVA_Build 17 28114242 1D GCATGAACCC G/- GAAGGCAGAG 2463 het 1223 hom 12 3 7 3 G 2 1 374067 CASAVA_Build 17 28117934 11I AAAAGAAAAC -----------/AAAACAAAAAA AAAACAACAA 3070 hom 67 het 28 0 23 5 AAAACAAAAAA 0 1 374068 CASAVA_Build 17 28120924 1D CTTAGGAAGC A/- AAAAAAAAAA 1812 het 1812 ref 27 18 4 6 A 11 10 374069 CASAVA_Build 17 28126415 4D CTGGATGACA GAGT/---- GAGACTCTGT 2192 het 2192 ref 16 7 7 4 GAGT 1 0 374070 CASAVA_Build 17 28177432 1D ATCAACACCT C/- CCATCCCCAC 3070 hom 93 het 34 0 32 3 C 3 2 374071 CASAVA_Build 17 28189104 5D TTTCATATAA TACTT/----- TACAACATTT 3070 het 3070 ref 35 21 12 4 TACTT 1 0 374072 CASAVA_Build 17 28191539 1I ACAGCTTTTT -/A ACCTGGGTTC 3070 hom 86 het 38 0 27 11 A 1 2 374073 CASAVA_Build 17 28192908 4D CTATTGCAAC AGGA/---- AGGAAGGAAG 3070 het 3070 ref 49 26 15 12 AGGA 3 2 374074 CASAVA_Build 17 28200945 1I AAAGTATAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 32 hom 21 1 18 2 A 9 10 374075 CASAVA_Build 17 28202059 1D TTATGAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 21 12 5 T 11 10 374076 CASAVA_Build 17 28202860 17D GCATTAGAGT CTCATAAGGAGTGTGCA/----------------- CTCATAAGGA 3070 het 3070 ref 36 18 9 12 CTCATAAGGAGTGTGCA 2 1 374077 CASAVA_Build 17 28212326 3I CAGCCTCCCG ---/AGT AGCTGGGACT 3070 het 1884 hom 20 5 13 2 AGT 0 1 374078 CASAVA_Build 17 28253971 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2730 het 2629 hom 14 7 6 2 A 13 12 374079 CASAVA_Build 17 28259123 9D AGAAGGGTTC CTTAGCCCA/--------- GAGGCTAAGG 2996 het 2996 ref 28 20 8 1 CTTAGCCCA 1 0 374080 CASAVA_Build 17 28271820 1I AAACCATGAT -/G TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 45 23 19 3 G 0 1 374081 CASAVA_Build 17 28272104 1D TGAATATTCC T/- TTTTTTTTTT 1422 het 1422 ref 26 10 7 9 T 17 16 374082 CASAVA_Build 17 28281523 4I AAATTCTGTG ----/CACA CACTAGTATA 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 CA 1 3 374083 CASAVA_Build 17 28281862 2D GGGATTACTA AT/-- ATGTCCACTT 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 AT 2 1 374084 CASAVA_Build 17 28283213 2D TGTTTCTCTC TT/-- TGCACAGCAG 2718 het 2718 ref 26 12 10 4 T 3 1 374085 CASAVA_Build 17 28296982 1D TGTTTTCTTA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 44 23 17 4 T 8 7 374086 CASAVA_Build 17 28302815 1I CTCCTCTCCA -/G GTCCCTTCCC 3070 het 3070 ref 60 31 18 11 G 1 2 374087 CASAVA_Build 17 28304241 5I ATACCTTTGT -----/TAAAA TAAAAACTTC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 TAAAA 1 2 374088 CASAVA_Build 17 28310852 8D CCTTCCTTCC TTCCCTCT/-------- CTTTCTTTCT 3070 het 3070 ref 42 23 14 6 TTCCCTCT 1 0 374089 CASAVA_Build 17 28311421 1D TTGGCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 10 12 3 A 12 11 374090 CASAVA_Build 17 28322344 1I CAAGGATCAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 9 10 374091 CASAVA_Build 17 28344813 1I ACAAGCGGGA -/G GGGAGAAAGT 3070 het 3070 ref 36 19 10 7 G 3 4 374092 CASAVA_Build 17 28347842 1I GCAGGTGGGA -/G GGCACCTGCC 3070 het 19 hom 36 2 28 6 G 2 3 374093 CASAVA_Build 17 28363968 2D TGTGGGTCCA GG/-- GCAGCCTCCT 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 G 3 1 374094 CASAVA_Build 17 28368107 2D AGAAGGCTGA CC/-- CCAGCTCTGG 3070 hom 87 het 33 0 27 7 C 4 2 374095 CASAVA_Build 17 28369416 15D TCTTCAGATA CCCCTGCATCCAACT/--------------- CTCCTGGAAG 3070 het 3070 ref 28 16 13 1 CCCCTGCATCCAACT 1 0 374096 CASAVA_Build 17 28379341 1I GCAGATCCCA -/G GGGCCCTGTG 3070 hom 116 het 44 0 36 8 G 3 4 374097 CASAVA_Build 17 28439694 1I TCCCCTGGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 718 hom 33 2 21 10 A 12 13 374098 CASAVA_Build 17 28460239 1I GGGTGGGTGT -/G GGGTGAGGCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 G 3 4 374099 CASAVA_Build 17 28476082 12D CACATGCACA GTTCACAATAGG/------------ GTTCACGCTC 3070 hom 36 het 14 0 12 4 GTTCACAATAGG 1 0 374100 CASAVA_Build 17 28494871 1I CAATTTTTCC -/A AAAAAAACCC 3070 hom 105 het 46 0 37 9 A 7 8 374101 CASAVA_Build 17 28515579 3I GTAATTGGAT ---/GTG GCAGAGTTTC 3070 het 3070 ref 33 14 11 8 GTG 0 1 374102 CASAVA_Build 17 28526596 1I64M1D TATTTTATTG -TTTTTTTTTTCCTGTGTAGGACTAGAGAGAAAAAAAGGATTCACAAATAAGAAAAATACCCTACT/TTTTTTTTTTTCCTGTGTAGGACTAGAGAGAAAAAAAGGATTCACAAATAAGAAAAATACCCTAC- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 31 27 12 13 N/A 0 0 374103 CASAVA_Build 17 28562256 1D AGTGGAAAAT G/- GGGACAGTTC 3070 hom 153 het 54 0 49 5 G 4 3 374104 CASAVA_Build 17 28565188 1D TGCCAAGTGT G/- GGGTTAAGTT 3070 hom 134 het 49 0 41 8 G 4 3 374105 CASAVA_Build 17 28565813 3I CTGCCTTTAT ---/AAC AAGTTCCCAG 3070 hom 157 het 55 0 53 2 AAC 0 1 374106 CASAVA_Build 17 28573000 4I CCGATAGATG ----/TTTA TTTAAACCAT 3070 hom 129 het 44 0 44 0 TTTA 1 2 374107 CASAVA_Build 17 28578140 1I GGTCAATAAC -/T TTTTTTTTCA 3070 hom 36 het 14 0 13 1 T 8 9 374108 CASAVA_Build 17 28590422 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1222 het 1222 ref 22 14 4 4 A 11 12 374109 CASAVA_Build 17 28597161 2I ACCTCTACTT --/AA AAAAAAAAAA 2897 hom 33 het 21 0 15 6 A 14 16 374110 CASAVA_Build 17 28612959 1D AGGTGAACGT G/- GGGGGTGCTG 3070 hom 87 het 35 0 25 10 G 6 5 374111 CASAVA_Build 17 28614886 1D GAAAGGGGGG C/- CCACCCGCTG 3070 het 2470 hom 29 12 12 5 C 3 2 374112 CASAVA_Build 17 28623183 1D TCTTCTGCCC A/- GAGCACCTTG 3070 het 3070 ref 47 24 18 6 A 1 0 374113 CASAVA_Build 17 28625774 1I55M1I CCATGCTTGG -TTTGACCCCAAGCCAGTGAAATCAGAATCTCTGGGGGTTGAGCTTGGGCTTTAGC-/TTTTGACCCCAAGCCAGTGAAATCAGAATCTCTGGGGGTTGAGCTTGGGCTTTAGCA ATTAAAAAAC 3070 het 3070 hom 36 22 17 14 N/A 0 0 374114 CASAVA_Build 17 28629621 2D CCTGTATCAG AA/-- AAAAAAAAAA 2978 het 2978 ref 22 10 7 6 A 14 12 374115 CASAVA_Build 17 28650671 1I CCTCACTCTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 18 24 8 T 9 10 374116 CASAVA_Build 17 28658951 5I CATAAAGATT -----/AAATA AAATAACACA 3070 het 3070 ref 40 24 13 3 AAATA 1 2 374117 CASAVA_Build 17 28670369 1I TCAAAAAAAT -/A AAACCCCCAA 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 A 3 4 374118 CASAVA_Build 17 28675427 1D AGAGCAAGGG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 55 24 23 10 T 9 8 374119 CASAVA_Build 17 28679276 8D CATTTTGTTA CAGCAGCT/-------- CTACTAGGAA 3070 het 3070 ref 46 27 19 1 CAGCAGCT 1 0 374120 CASAVA_Build 17 28680209 1I CAGAATTCAA -/G GGGGAAATAA 2584 het 2584 ref 39 21 10 8 G 4 5 374121 CASAVA_Build 17 28686703 1D GGAGGTAGAA G/- GGTGAGTCAA 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 G 3 2 374122 CASAVA_Build 17 28687512 1I TCTTAACAGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 114 het 47 0 39 8 T 9 10 374123 CASAVA_Build 17 28688208 1I TGTGCTCCTG -/A GGGGTCCTGC 3070 hom 99 het 38 0 33 5 A 0 1 374124 CASAVA_Build 17 28688566 1D TTAACCTTGC G/- GTGGTCTGAA 3070 hom 135 het 57 0 46 13 G 2 1 374125 CASAVA_Build 17 28689478 1D GGGTAAGACA G/- GGGAGACAGT 3070 het 3070 hom 46 16 22 8 G 4 3 374126 CASAVA_Build 17 28722121 4D AGGAGGAACA CGCC/---- CACTCTAGGT 3070 hom 84 het 30 0 29 4 CGCC 1 0 374127 CASAVA_Build 17 28722828 1D TACTTTGGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 28 7 T 11 10 374128 CASAVA_Build 17 28724818 1D TCTTTTTTTT C/- TCTTTTCTCA 3070 hom 48 het 19 0 17 2 C 1 0 374129 CASAVA_Build 17 28727012 1D AGTGAGTAGC A/- GCTAACTAAG 3070 hom 135 het 57 0 46 11 A 1 0 374130 CASAVA_Build 17 28732703 1D TATGTGCCCC G/- GGGGGGCACT 3070 het 3070 ref 43 26 13 4 G 7 6 374131 CASAVA_Build 17 28745582 1I CACATATGGA -/T TTTTTTTTGA 3070 het 3070 ref 34 16 9 9 T 8 9 374132 CASAVA_Build 17 28749391 1I ATCTCCAGCA -/T TTTAGAATGG 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 T 3 4 374133 CASAVA_Build 17 28754442 1I CACACAGCTT -/C CTACCTCCAC 3070 het 3070 hom 48 14 27 7 C 1 2 374134 CASAVA_Build 17 28762074 1I CATAGAAGAC -/A AGCATAACAT 3070 het 3070 ref 49 27 18 4 A 1 2 374135 CASAVA_Build 17 28774832 2I AAACCAGTGA --/CT CTCTCTTGGG 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 CT 3 4 374136 CASAVA_Build 17 28782617 1D CACCTGTAAT C/- CCAGCTACTC 3070 het 1498 hom 24 5 13 6 C 3 2 374137 CASAVA_Build 17 28794712 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 1354 hom 10 het 4 0 4 0 T 9 8 374138 CASAVA_Build 17 28798418 1D AAAAGCAGAG C/- CAGAGTCTGT 3070 het 3070 hom 37 17 17 3 C 2 1 374139 CASAVA_Build 17 28802192 1I GTACATGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 19 hom 27 1 16 10 T 12 13 374140 CASAVA_Build 17 28808378 1D TTTGTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 14 13 374141 CASAVA_Build 17 28814810 2I CTGTGGAACT --/AA AGATAGACTC 2867 het 2867 ref 35 21 8 6 A 1 3 374142 CASAVA_Build 17 28815149 1I CACAAAACAA -/T TCCAGTTTTG 3070 het 3070 hom 66 28 29 9 T 1 2 374143 CASAVA_Build 17 28816231 2D CAGTTCCTGG AT/-- AACTTCAGGA 3070 het 3070 ref 37 19 14 5 AT 1 0 374144 CASAVA_Build 17 28826424 1D GTTTCAGGTC T/- TTTTTTAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 11 11 T 7 6 374145 CASAVA_Build 17 28832653 3I ATCCATTCAC ---/AAG AAGAAAGAGT 3070 het 3070 ref 44 23 18 3 AAG 1 2 374146 CASAVA_Build 17 28843031 1D CTTAAATCTC A/- TGCCTTATAT 3070 het 3070 ref 33 14 15 6 A 1 0 374147 CASAVA_Build 17 28857128 1D ATGTGATCAG A/- CAGGTTTTTG 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 1 0 374148 CASAVA_Build 17 28882205 1D AATTTATTAA C/- TTATTGACTA 1646 het 1646 ref 12 8 4 0 C 1 0 374149 CASAVA_Build 17 28882241 2I ACACAGCTTG --/AC AAGGTTTGAA 2319 het 2319 ref 15 8 5 2 AC 0 1 374150 CASAVA_Build 17 28887316 3I TCCAAAATTG ---/ACC ACCACTCCCT 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 ACC 1 2 374151 CASAVA_Build 17 28901268 1I GCTCAGTGGA -/C GTTCTGCACA 3070 het 3070 ref 42 24 16 2 C 0 1 374152 CASAVA_Build 17 28904519 4I TGTCACAACT ----/TAAA TAAAGGGGTA 3070 het 3070 hom 39 15 22 2 TAAA 1 2 374153 CASAVA_Build 17 28906556 1I CAAAGTGAGA -/C CCCCCCAGCA 3070 het 3070 ref 46 24 17 5 C 6 7 374154 CASAVA_Build 17 28910976 1D GATATAACTA T/- TTTTGAGTAA 3070 het 3070 hom 57 22 30 5 T 5 4 374155 CASAVA_Build 17 28913354 2D TTGTAACACA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2993 hom 35 10 16 10 T 12 10 374156 CASAVA_Build 17 28915968 1I CTTAAATGCA -/G TCTTAAGCCA 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 G 0 1 374157 CASAVA_Build 17 28927918 1D AAGGGCACCT G/- GTTCTTTGAG 3070 het 3070 hom 62 23 31 8 G 2 1 374158 CASAVA_Build 17 28929926 5D ATCCTAAGAT TAGTC/----- TAGTCACAGT 3070 het 3070 hom 36 16 16 7 TAGTC 2 1 374159 CASAVA_Build 17 28930238 1I CCAACATGGT -/G GAAACCCCGT 2980 het 1942 hom 16 5 9 2 G 1 2 374160 CASAVA_Build 17 28934450 4D TGATGAGATT GTCA/---- GTCACTTGCC 3070 het 3070 ref 40 21 17 4 GTCA 2 1 374161 CASAVA_Build 17 28935823 5D AGTCAGATCT TGGGG/----- TGGGGTTTGA 3070 het 3070 ref 51 18 18 17 TGGGG 2 1 374162 CASAVA_Build 17 28936362 16I ATCAGGGCAA ----------------/GAGCCAGGCAGGCCAC GAGCCAGGCA 2345 het 2345 ref 40 15 10 15 GAGCCAGGCAGGCCAC 1 2 374163 CASAVA_Build 17 28942587 1D TGGCTTCTGA C/- CTTTTCTCAG 3070 het 3070 ref 42 16 13 13 C 2 1 374164 CASAVA_Build 17 28944515 1D AGCACATTGT G/- GCTAGGTTAT 3070 het 3070 hom 43 17 23 3 G 2 1 374165 CASAVA_Build 17 28980465 4D GGCACTTAGG AATT/---- AATTGTCTGA 3070 hom 81 het 31 0 27 8 AATT 2 1 374166 CASAVA_Build 17 28988012 2D CACACACACC CA/-- CACACACACA 847 het 847 ref 51 36 4 12 CA 8 7 374167 CASAVA_Build 17 28994280 1D ATGCTCATTT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 C 10 9 374168 CASAVA_Build 17 29040737 1D ATTAGATTGA G/- ATGATTCCCC 3070 hom 72 het 26 0 25 2 G 1 0 374169 CASAVA_Build 17 29076854 1D TATTAAGAAA C/- CCCCCCCCCC 3070 het 141 hom 26 2 11 13 C 11 10 374170 CASAVA_Build 17 29096540 1D AAATTTACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 17 23 10 A 11 10 374171 CASAVA_Build 17 29097567 10D TATATGAATA TGTATATATG/---------- TGTATATATG 3070 het 3070 hom 25 13 12 2 TGTATATATG 2 1 374172 CASAVA_Build 17 29102534 1I CCTTCTAGAA -/C TAAACAGAAA 3070 hom 69 het 30 0 24 6 C 0 1 374173 CASAVA_Build 17 29103513 1I TTTCATTAGC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 394 hom 25 1 21 3 A 8 9 374174 CASAVA_Build 17 29106149 3I GTTGCCTTGT ---/ATA ATAACAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 ATA 1 2 374175 CASAVA_Build 17 29107827 12D AAACACTTAG AGAACCTCTTTA/------------ AGAAGGTAAA 3070 hom 117 het 45 0 39 8 AGAACCTCTTTA 1 0 374176 CASAVA_Build 17 29111297 1D ATAATGACTC A/- AAAAAAAATG 3070 hom 54 het 19 0 19 0 A 9 8 374177 CASAVA_Build 17 29115681 2D ATGAGGACTC TG/-- TAGAGTCTCA 3070 hom 106 het 38 0 35 5 TG 1 0 374178 CASAVA_Build 17 29140808 2I TAATTTCCTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 88 het 38 0 27 11 TG 6 7 374179 CASAVA_Build 17 29175912 1I CTTGCAAGCC -/A CCATGCAAGA 3070 hom 141 het 51 0 48 3 A 0 1 374180 CASAVA_Build 17 29181687 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 10 9 374181 CASAVA_Build 17 29215025 15D CAGTTACCTC TTTTTTTGTTTTTTT/--------------- TTTTTTTGTT 2198 het 2198 ref 25 17 5 7 TTTTTTTGTTTTTTT 1 0 374182 CASAVA_Build 17 29215226 1D GTAGAGACTG A/- GTTTTTCCAT 3070 het 3070 hom 35 11 20 4 A 1 0 374183 CASAVA_Build 17 29219637 1D AAACTATTAG A/- AAAAAATATA 3070 hom 81 het 29 0 28 1 A 7 6 374184 CASAVA_Build 17 29226598 1I GAGACAGCTG -/A AAAATGAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 13 6 A 4 5 374185 CASAVA_Build 17 29235018 1I AACAATTAGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 17 21 7 T 9 10 374186 CASAVA_Build 17 29237872 1I TCTTTCTACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 26 11 12 A 10 11 374187 CASAVA_Build 17 29242052 1I TTGGTAAGCA -/C GCAGACACTC 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 374188 CASAVA_Build 17 29251757 1I CCTCACAACT -/G CAATGCTTAG 3070 hom 102 het 40 0 35 5 G 0 1 374189 CASAVA_Build 17 29263837 16D TAGGGCCGGG TGAGGTGTCTCACGCC/---------------- TGTAATCCCA 3070 het 3070 ref 21 9 10 2 TGAGGTGTCTCACGCC 1 0 374190 CASAVA_Build 17 29321238 3D TTTTGGGCTC ATT/--- AATTCTTTGT 3070 het 3070 hom 46 18 15 15 ATT 1 0 374191 CASAVA_Build 17 29363851 1I CAGAGAATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2169 hom 28 6 14 8 T 11 12 374192 CASAVA_Build 17 29380508 1D TGCTAAAACC A/- AAAAAAAAAA 1407 het 566 hom 18 3 5 10 A 19 18 374193 CASAVA_Build 17 29387691 1D ATAAAAATAT A/- AAAAAAGCAC 1888 hom 12 het 8 0 5 3 A 7 6 374194 CASAVA_Build 17 29392087 4D TCAGGGAGAT TAAG/---- TAATTTGCAC 3070 het 3070 ref 46 26 16 4 TAAG 1 0 374195 CASAVA_Build 17 29406697 3D TACCAATTAA CCC/--- CCAAGAAACA 3070 het 3070 hom 50 21 23 6 C 5 2 374196 CASAVA_Build 17 29408311 2D CTATTTACAC AT/-- AGAGACATGT 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 AT 1 0 374197 CASAVA_Build 17 29409068 3I CCTGCAGTAG ---/CCA TAACAAACCT 3070 het 3070 ref 50 27 16 7 CCA 0 1 374198 CASAVA_Build 17 29409835 2I GTGGATCCCC --/CT GTTTTCTTTG 3070 het 3070 ref 51 21 20 10 CT 0 1 374199 CASAVA_Build 17 29412898 4D AACAGCAGTT GAAA/---- GAGACAAAGA 3070 het 3070 hom 39 20 19 2 GAAA 1 0 374200 CASAVA_Build 17 29422960 1D AGACTCCATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 26 0 17 11 A 13 12 374201 CASAVA_Build 17 29431126 1I AGGGAAGATG -/T ATCCCCACTT 3070 hom 160 het 62 0 54 8 T 0 1 374202 CASAVA_Build 17 29450587 4D GAAAGAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAG 1436 het 1436 ref 20 11 6 4 AAAG 3 2 374203 CASAVA_Build 17 29459120 1D TATTTTCCAG T/- TTATCCTTCT 3070 het 3070 hom 37 15 20 4 T 3 2 374204 CASAVA_Build 17 29460167 4D TGTTGATTTA TTTT/---- ATTTTATTTT 627 het 419 hom 10 2 3 5 T 4 0 374205 CASAVA_Build 17 29473136 1I GCACTCAGTG -/C CTTTGCTGCA 3070 hom 117 het 43 0 39 4 C 1 2 374206 CASAVA_Build 17 29479525 1D AAGGGAACCA T/- GAACCTCCCT 3070 het 3070 ref 74 31 34 9 T 1 0 374207 CASAVA_Build 17 29482242 1D AGTGGGGAAA G/- AAAGCCTTCG 3070 het 3070 hom 41 18 16 7 G 1 0 374208 CASAVA_Build 17 29484428 1I GGTGTAGGGG -/A AAGGGGTAGT 3070 hom 57 het 21 0 18 3 A 2 3 374209 CASAVA_Build 17 29490715 2I ATAATAAAAA --/AG GAAAAATATG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AG 0 1 374210 CASAVA_Build 17 29500247 2I TTTTCTTTTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1244 hom 21 6 9 7 T 10 12 374211 CASAVA_Build 17 29504060 1I TCCAGGAGGG -/A AAAAAACGTG 3070 het 3070 ref 66 31 22 13 A 6 7 374212 CASAVA_Build 17 29510529 1I CCGCCCTCCT -/C CCCCAGCAGC 3070 het 3070 ref 32 11 13 8 C 4 5 374213 CASAVA_Build 17 29515318 4D TTTAATTCAC TTTA/---- TTTATTTCCT 3070 het 3070 hom 27 8 16 5 TTTA 2 1 374214 CASAVA_Build 17 29519447 2I GGGAGCAATA --/AC AGTGCCCACC 3070 het 3070 hom 51 20 25 6 AC 0 1 374215 CASAVA_Build 17 29519780 1D TCCCTGAGAT G/- GGGGGGGACA 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 G 8 7 374216 CASAVA_Build 17 29521106 1D CTGGCTGACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 13 14 10 T 11 10 374217 CASAVA_Build 17 29523132 1D CCGTTTTTTT G/- TTTTGTTTTG 3070 het 2581 hom 32 11 18 5 G 1 0 374218 CASAVA_Build 17 29523385 1I AGAAGAAGAT -/G GGCTGAGGAG 3070 het 3070 hom 40 18 19 3 G 2 3 374219 CASAVA_Build 17 29523516 4I GAGAAAGAGT ----/TTAA TTAATGCAGA 3070 hom 116 het 45 0 38 7 TTAA 1 2 374220 CASAVA_Build 17 29529266 4D CAACATGGTA AAAC/---- AAACAAATAA 3070 het 3070 hom 39 13 15 11 AAAC 2 1 374221 CASAVA_Build 17 29530687 1I GGCTATTTAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 T 10 11 374222 CASAVA_Build 17 29538924 1D ACGGACTAAA G/- GGTCTTTTAA 1364 het 1364 ref 38 33 3 2 G 3 2 374223 CASAVA_Build 17 29539131 1I CTGTGCCCCC -/A AAAAAAACTT 3070 hom 23 het 12 0 8 4 A 7 8 374224 CASAVA_Build 17 29556999 11I CTCTTTCTTT -----------/TTTTTTTTTTC TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 31 0 22 9 TTTTTTTTTTC 0 1 374225 CASAVA_Build 17 29569369 1I ATAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1931 het 1266 hom 22 6 12 4 A 15 16 374226 CASAVA_Build 17 29582365 1I TCAAAAAGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 28 0 21 7 A 10 11 374227 CASAVA_Build 17 29590972 4D AAAAGAAAGA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 2446 hom 23 8 13 2 AAAG 6 5 374228 CASAVA_Build 17 29607111 14D CTAGCTTTAA CAGCTCCTCCTTCT/-------------- CTCTGTCCAT 3070 hom 141 het 45 0 45 8 CAGCTCCTCCTTCT 1 0 374229 CASAVA_Build 17 29611961 1I AATACAACTG -/T TTCACCATCC 3070 hom 129 het 47 0 44 3 T 2 3 374230 CASAVA_Build 17 29614581 1D AGGGTCCAGC T/- TTTTTTTTTT 2208 het 224 hom 16 1 8 7 T 13 12 374231 CASAVA_Build 17 29639661 11D AGGCTAGGTG ACCTTTGACCA/----------- GAGGTTTAGG 1089 het 1089 ref 52 17 6 32 ACCTTTGACCA 1 0 374232 CASAVA_Build 17 29686917 1D TATATATCTG T/- TTTTTGTACC 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 6 5 374233 CASAVA_Build 17 29691338 1I TCTAGCTATT -/G GTCTGTCAAT 3070 hom 99 het 39 0 33 6 G 1 2 374234 CASAVA_Build 17 29692237 1I TAGCAACCCC -/T GCTTTTTTAT 3070 hom 87 het 37 0 29 8 T 0 1 374235 CASAVA_Build 17 29696919 1I AAACAGAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 73 hom 34 1 27 6 T 11 12 374236 CASAVA_Build 17 29701392 3D GAGAGGTATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 85 het 36 0 25 12 A 15 12 374237 CASAVA_Build 17 29702729 4D CAGTTTTCTC TTTG/---- TTTGTTTATG 3070 hom 78 het 27 0 27 2 TTTG 2 1 374238 CASAVA_Build 17 29706208 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2035 het 1996 hom 24 8 6 10 T 13 12 374239 CASAVA_Build 17 29713976 19D TTCCTTGGGT CTGGATGAAGCAGAGCCTC/------------------- CTTGTACTGA 3070 hom 111 het 36 0 36 7 CTGGATGAAGCAGAGCCTC 1 0 374240 CASAVA_Build 17 29714922 1I CTATTTTTTT -/C AATCCTCAAC 3070 hom 110 het 39 0 36 3 C 0 1 374241 CASAVA_Build 17 29727236 1I CTATACTTCT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 A 9 10 374242 CASAVA_Build 17 29746659 2D AGAAACCAAG AA/-- AAGACACTGA 3070 het 3070 ref 42 19 14 9 A 4 2 374243 CASAVA_Build 17 29746946 1I TACAGCTTAC -/T TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 21 12 4 T 8 9 374244 CASAVA_Build 17 29750281 3I GTCACAAGTC ---/AGA AGAAGCTGAG 3070 het 3070 hom 51 23 24 4 AGA 1 2 374245 CASAVA_Build 17 29756476 2I TATTAATATC --/TG TTTTACAGTT 3070 het 3070 hom 35 15 15 5 TG 0 1 374246 CASAVA_Build 17 29771901 1I CCACACATCT -/C CTTAAATGCC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 C 1 2 374247 CASAVA_Build 17 29783538 1D ATGTTTGGGG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 19 0 12 7 T 10 9 374248 CASAVA_Build 17 29784215 1I CAAAGCAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 24 15 4 A 11 12 374249 CASAVA_Build 17 29784317 1D AGTTCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 17 14 5 T 12 11 374250 CASAVA_Build 17 29786468 1D TTTCCCTCTT C/- CCCCCCTTGC 3070 hom 105 het 40 0 32 8 C 7 6 374251 CASAVA_Build 17 29789126 1D ATTAAATAAT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 3070 ref 28 11 10 8 G 10 9 374252 CASAVA_Build 17 29790885 2I TCCCCTCCTT --/TC TCTCTCTCTT 2593 het 181 hom 19 2 13 4 TC 4 5 374253 CASAVA_Build 17 29797173 1I CCATATCTCA -/T TTTCCTGCAT 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 3 4 374254 CASAVA_Build 17 29799218 2I GAGCCAACCC --/TT GGCTCTTTGT 3070 hom 135 het 52 0 46 6 T 0 2 374255 CASAVA_Build 17 29802140 4D GCCCCCAACC TATA/---- GTGACATTCT 3070 het 3070 ref 45 23 20 5 TA 2 0 374256 CASAVA_Build 17 29805304 1I TGCTTCTAGA -/C CCCCCCTAGA 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 C 6 7 374257 CASAVA_Build 17 29806112 1D TATTGAAATT A/- AAAAAAAAAA 3048 het 3048 ref 34 18 9 8 A 11 10 374258 CASAVA_Build 17 29814747 1I TGATTGCTGT -/G GGGTCAGTAG 3070 hom 132 het 48 0 41 7 G 3 4 374259 CASAVA_Build 17 29819639 1D CAGAGATAAA T/- ACAGATTCTC 3070 het 3070 hom 46 18 21 8 T 1 0 374260 CASAVA_Build 17 29824832 1I TCTCACTCAT -/C GGGAGGGGCC 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 C 0 1 374261 CASAVA_Build 17 29826998 3I TAACATTTAT ---/CTG GCTGAAAAGA 3070 het 3070 ref 49 27 17 5 CTG 0 1 374262 CASAVA_Build 17 29829327 1D AGGACGTGAG C/- TTCGCAGCAG 3070 het 3070 ref 46 21 18 7 C 1 0 374263 CASAVA_Build 17 29837878 2D TATATTTCCT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 28 0 24 4 A 12 10 374264 CASAVA_Build 17 29859945 1I TAACTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 31 1 27 3 A 11 12 374265 CASAVA_Build 17 29862968 26I TAAATTACAG --------------------------/ATCATGATTTTCCTTGAAGCAAATAA ACAGGGTGTT 3070 hom 138 het 50 0 47 4 ATCATGATTTTCCTTGAAGCAAATAA 0 1 374266 CASAVA_Build 17 29899204 1D TCTGTTTTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 65 hom 22 1 16 5 A 12 11 374267 CASAVA_Build 17 29909233 1I TCTACTTATT -/A AAAAAAAATG 3070 het 411 hom 41 1 31 9 A 8 9 374268 CASAVA_Build 17 29911368 1D TCTGAAAGTT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 36 16 18 5 A 9 8 374269 CASAVA_Build 17 29917705 3D AGAGCTGTGA TGG/--- TGGTGATGAT 3070 het 3070 ref 69 35 32 6 TGG 2 1 374270 CASAVA_Build 17 29920407 1D GTATCCATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 8 22 7 A 11 10 374271 CASAVA_Build 17 29933647 1D GGTAACACCA G/- GGGGGGTTGT 3070 hom 48 het 19 0 16 3 G 7 6 374272 CASAVA_Build 17 29937940 1D AATTCAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 A 11 10 374273 CASAVA_Build 17 29942110 1I ACAAAGAGCT -/C CACCGTTAGA 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 C 1 2 374274 CASAVA_Build 17 29944379 2I TCTCTACATT --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 9 11 374275 CASAVA_Build 17 29966272 31D TTCCCTCCCT GGGTTTCCCCAGGAGCAGGACTAGGAGGCCA/------------------------------- GTTCAGGGGC 3070 hom 78 het 22 0 22 6 GGGTTTCCCCAGGAGCAGGACTAGGAGGCCA 1 0 374276 CASAVA_Build 17 29981047 1I TCTGAGGAGT -/G GGGGGGGGAG 3070 hom 7 het 25 1 17 7 G 8 9 374277 CASAVA_Build 17 29986586 15D TCTGGATAGA AATCATCTACCTAAG/--------------- AAACTGTTGT 3070 het 3070 hom 49 20 30 3 AATCATCTACCTAAG 1 0 374278 CASAVA_Build 17 30011955 1D ATTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1854 hom 20 5 11 4 T 11 10 374279 CASAVA_Build 17 30013379 1I CTAAGATTTC -/T TTTTTTTTTT 1045 het 1045 ref 35 19 4 12 T 15 16 374280 CASAVA_Build 17 30025310 1I GGCTCTTCCT -/C CGGCACTCCC 3070 hom 75 het 30 0 23 7 C 1 2 374281 CASAVA_Build 17 30035255 2I TTAGGTAGGG --/AC ACAGCCAAAC 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 AC 1 2 374282 CASAVA_Build 17 30036037 3D CTTCTGGACA CTC/--- CCACCTGAGA 3070 het 3070 ref 40 21 13 10 CTC 1 0 374283 CASAVA_Build 17 30037186 1D ATAAAAAAAA T/- ATTTGAAAGG 3070 het 3070 hom 28 14 11 3 T 1 0 374284 CASAVA_Build 17 30037810 1I CAAATAAATT -/C CTGTTGTGTA 3070 het 3070 hom 52 20 27 5 C 1 2 374285 CASAVA_Build 17 30040341 1D ATAAAGTAAA T/- TTTTAAATCA 3070 het 3070 ref 29 14 10 6 T 5 4 374286 CASAVA_Build 17 30040515 1D GACACATTAC A/- AAAAAAAAAA 2443 het 2443 ref 22 10 7 5 A 11 10 374287 CASAVA_Build 17 30041017 4D AGATGACTGA TTGT/---- TTATGTAGAA 3070 het 3070 ref 29 16 11 3 TTGT 1 0 374288 CASAVA_Build 17 30043100 1D CAAGAATGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 18 19 11 A 11 10 374289 CASAVA_Build 17 30044174 4I CTCTCTCCCA ----/TCTC TCTCTCTCTC 3070 het 3070 ref 60 30 19 11 TC 7 9 374290 CASAVA_Build 17 30060052 1D AAGGAGTGAA T/- TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 T 6 5 374291 CASAVA_Build 17 30067822 6I AGGGGCAGTG ------/GCTCAC GCCTGTCATC 3070 hom 57 het 21 0 18 3 GCTCAC 0 1 374292 CASAVA_Build 17 30086170 3D TTTTTGTTGC TGT/--- TGTTGTTGTT 3070 het 2314 hom 29 10 15 4 TGT 4 3 374293 CASAVA_Build 17 30093299 1D AAGGGACGGA G/- CCCAGCAGGA 3070 het 3070 hom 30 14 12 5 G 1 0 374294 CASAVA_Build 17 30094180 1D TAAGCTTTAA C/- ATGTATAGAT 2645 het 2645 ref 24 13 7 4 C 1 0 374295 CASAVA_Build 17 30094950 3I CTCCAAGGTA ---/GCT GCTGGGACTA 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 GCT 1 2 374296 CASAVA_Build 17 30098538 3D CTAGTTTCTT AAG/--- AAGGAATCTA 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 AAG 2 1 374297 CASAVA_Build 17 30099038 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2885 hom 19 8 10 1 A 12 11 374298 CASAVA_Build 17 30106126 2D AGTTTGTAAA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 53 23 20 10 GT 8 7 374299 CASAVA_Build 17 30129128 1D ATAATCAACA T/- TTTTAAAAGT 3070 het 3070 hom 27 12 13 2 T 5 4 374300 CASAVA_Build 17 30138773 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 12 5 A 11 10 374301 CASAVA_Build 17 30170273 1I AGACTCTTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 30 hom 32 1 19 12 A 12 13 374302 CASAVA_Build 17 30173958 6D TCTCAGTAGT TTAACA/------ TTATAACACC 3070 het 3070 ref 48 29 15 7 TTAACA 1 0 374303 CASAVA_Build 17 30175944 1I GCCTCAACCT -/C CCCTGGACCA 3070 hom 126 het 50 0 39 11 C 3 4 374304 CASAVA_Build 17 30182317 1I AAAAAGAATG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 9 10 374305 CASAVA_Build 17 30191916 4D TGTCCATGAC TCTA/---- TATCAAATGG 3070 hom 93 het 34 0 29 6 TCTA 1 0 374306 CASAVA_Build 17 30214096 1I CCCCCACCCC -/T AGTCCATGGA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 T 0 1 374307 CASAVA_Build 17 30253861 1I GGCAAAGCTG -/T GACCCCAGGT 3070 hom 97 het 37 0 31 6 T 0 1 374308 CASAVA_Build 17 30259401 1D AATGATCAAG A/- AAAAAAAAAA 840 het 840 ref 23 15 3 5 A 12 11 374309 CASAVA_Build 17 30262359 1I GATGGAGCTG -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 16 12 5 T 7 8 374310 CASAVA_Build 17 30272855 2D TTTAATGGGT AC/-- AGAGTTTTAG 2513 het 2513 ref 32 22 7 3 AC 1 0 374311 CASAVA_Build 17 30277429 2I TTAGCCAGGC --/GT GGTGGCAGGC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 GT 0 1 374312 CASAVA_Build 17 30302443 1D TGATATTTAC A/- GGTGGTATAT 3070 hom 105 het 41 0 36 5 A 1 0 374313 CASAVA_Build 17 30308276 2D TTTCTTTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 1577 het 75 hom 16 1 4 11 T 18 16 374314 CASAVA_Build 17 30340147 1D TTCTGACCAC T/- TTTTTTTTTT 1381 het 1381 ref 38 24 3 11 T 11 10 374315 CASAVA_Build 17 30396009 1I TCTCATAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1906 hom 31 7 10 14 T 13 14 374316 CASAVA_Build 17 30437615 1D CATCTCAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 851 hom 35 4 19 13 A 15 14 374317 CASAVA_Build 17 30448037 1D CTTCTTTAAG C/- CTAGGTTTTG 3070 hom 83 het 30 0 28 2 C 2 1 374318 CASAVA_Build 17 30448265 1I TATATATATA -/T TTTTTTAGAT 3070 het 2489 hom 23 6 13 4 T 6 7 374319 CASAVA_Build 17 30453575 1D ACCTGGCCTA T/- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 19 10 8 1 T 9 8 374320 CASAVA_Build 17 30477741 2I TTCAAGCAAT --/TC TCTCCTGCCT 3070 het 3070 hom 20 7 10 3 TC 2 3 374321 CASAVA_Build 17 30491731 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 65 het 25 0 22 3 T 10 9 374322 CASAVA_Build 17 30493994 1I GTATCCTTTT -/A AAAAATGGAT 3070 hom 45 het 18 0 14 4 A 5 6 374323 CASAVA_Build 17 30526216 2D AGAAAGAAAG AA/-- AGAGAAAGAA 961 het 961 ref 28 8 7 13 A 3 1 374324 CASAVA_Build 17 30531035 1D TTAAAGTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 16 3 A 11 10 374325 CASAVA_Build 17 30536449 1D TTTATTTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3049 hom 27 10 12 5 T 9 8 374326 CASAVA_Build 17 30541079 1D CTTTTTTTTT A/- TATAGAAATG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 A 1 0 374327 CASAVA_Build 17 30547912 4I TCCCCTATGT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 1562 hom 34 9 20 5 TTTC 2 3 374328 CASAVA_Build 17 30556246 3D TTTGTATAGT TTG/--- TTGTTATCTC 3070 het 3070 ref 47 27 17 4 TTG 2 1 374329 CASAVA_Build 17 30565808 1I AAGGTCCCCC -/T GAGCCTTCTG 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 T 0 1 374330 CASAVA_Build 17 30575163 1D AATATTTGCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 35 13 16 7 T 10 9 374331 CASAVA_Build 17 30585279 1I TATATATTTC -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 ref 26 12 8 6 T 8 9 374332 CASAVA_Build 17 30586330 6D TCTCCTTCTC CTTCTT/------ CTTCTTTTTA 1877 het 1877 ref 25 14 6 7 CTT 4 2 374333 CASAVA_Build 17 30596960 2D GGACATATGC TT/-- TTTTTTTTTT 1872 het 453 hom 46 8 6 32 T 14 12 374334 CASAVA_Build 17 30598190 1I CTGGGAAGCC -/A AAACACAACT 3070 het 3070 ref 47 22 16 9 A 3 4 374335 CASAVA_Build 17 30601791 1I GACTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2690 het 55 hom 15 1 9 5 A 15 16 374336 CASAVA_Build 17 30603753 1D TTCCTCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 11 20 5 T 11 10 374337 CASAVA_Build 17 30608682 1I AGTAAAGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 44 11 16 17 T 13 14 374338 CASAVA_Build 17 30624118 2I ATATTCAAAC --/AT GTGTGAAATA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 AT 0 1 374339 CASAVA_Build 17 30636816 1D GGAGGGGAAT G/- GGGGAGTTGG 3070 hom 129 het 50 0 44 6 G 5 4 374340 CASAVA_Build 17 30670103 2D TAGGAATTTC AT/-- ATAATCCTGG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 AT 2 1 374341 CASAVA_Build 17 30703318 1I ACCGCTGCTG -/A AAAGGGTTGG 3070 hom 76 het 30 0 24 6 A 3 4 374342 CASAVA_Build 17 30716590 1D CTAATTCTTT A/- AAAATTTTTT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 A 5 4 374343 CASAVA_Build 17 30717045 1I CAGAGGTTAC -/A AATAAGGATG 3070 hom 75 het 27 0 26 1 A 2 3 374344 CASAVA_Build 17 30742981 1D ATATTTCCTG C/- CCCCCCCCAT 1528 het 1528 ref 27 8 6 13 C 9 8 374345 CASAVA_Build 17 30786015 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAGAAAAA 234 het 234 ref 27 16 3 8 A 5 4 374346 CASAVA_Build 17 30788510 1I GTCTTCTCGA -/G GGGGGGGGTC 2625 het 2625 ref 32 13 11 8 G 8 9 374347 CASAVA_Build 17 30788917 1I3M7D CTTTCTGTAC -TATGCTTGCA/ATAT------- ACTTTTCTAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 N/A 0 0 374348 CASAVA_Build 17 30790187 2D CCAGCAGGGT GG/-- GGGGGGGGGT 3070 hom 44 het 19 0 15 5 G 11 9 374349 CASAVA_Build 17 30791357 2I GTCACATAAA --/AG AGAACTCGAG 3070 hom 83 het 30 0 27 3 AG 1 2 374350 CASAVA_Build 17 30799000 5D TTCTGTTTTG TTGTT/----- TTGTTTTGTT 3070 het 1132 hom 28 8 12 9 TTGTT 5 4 374351 CASAVA_Build 17 30799718 1I GGCCGGAGCT -/G GGGGGGCGGG 1249 het 1182 hom 17 6 8 3 G 6 7 374352 CASAVA_Build 17 30800378 3D TTCCCCCTAC AAA/--- AAAAAAAAAA 2652 het 2316 hom 22 10 7 6 A 15 12 374353 CASAVA_Build 17 30801437 2D TATTCAGACC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 360 hom 23 1 14 8 A 16 14 374354 CASAVA_Build 17 30803461 1D ATCCCTAGAG A/- AAAAAATATT 3070 hom 78 het 35 0 27 8 A 7 6 374355 CASAVA_Build 17 30813830 1I CCATAACTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 41 15 19 7 T 12 13 374356 CASAVA_Build 17 30818818 1I CAATATCAAA -/C CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 C 8 9 374357 CASAVA_Build 17 30827045 2I AAAATTCTAC --/AT ATATATATAT 1575 het 492 hom 8 1 4 3 AT 6 7 374358 CASAVA_Build 17 30838849 2I AAAGAAAAAG --/AA AGAACGAACC 3070 hom 76 het 33 0 26 7 A 1 3 374359 CASAVA_Build 17 30844102 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAC 3070 het 377 hom 29 1 27 1 C 1 0 374360 CASAVA_Build 17 30845361 2I AATATAATGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 14 3 A 10 12 374361 CASAVA_Build 17 30865641 1D TTTAATCTCA T/- GTTTTAGAAA 3070 hom 123 het 43 0 42 2 T 1 0 374362 CASAVA_Build 17 30883574 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 280 hom 21 2 12 7 A 15 14 374363 CASAVA_Build 17 30902929 1I AATCGTCACC -/A AAAAAGTTAA 3070 hom 69 het 27 0 22 5 A 5 6 374364 CASAVA_Build 17 30906504 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2712 het 442 hom 10 1 7 2 A 15 14 374365 CASAVA_Build 17 30906684 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2786 het 1715 hom 18 7 7 4 A 15 14 374366 CASAVA_Build 17 30925529 1I AAGTTTTAAT -/A TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 31 13 16 2 A 0 1 374367 CASAVA_Build 17 30926031 4D AAAATCTACT TAAG/---- TGTTTCATAG 3070 het 3070 hom 27 12 12 4 TAAG 1 0 374368 CASAVA_Build 17 30927587 3I ATTATATAGA ---/CCT CCTCCCTTTT 3070 het 3015 hom 38 10 19 9 CCT 1 2 374369 CASAVA_Build 17 30927635 1D AAAAAAAAAA C/- CCAATTCACT 2064 het 2064 ref 28 8 8 12 C 3 2 374370 CASAVA_Build 17 30930961 5D AGCTTTTCTT AAGTG/----- AATAGCAAAA 3070 het 3070 ref 43 21 21 2 AAGTG 1 0 374371 CASAVA_Build 17 30944582 3I ACTAAAAATT ---/AAA AAAAAAATTC 3070 hom 66 het 29 0 23 6 A 7 10 374372 CASAVA_Build 17 30955699 7I GGACTAGCCT -------/GGCTAAC GGCTAACATG 2223 het 1523 hom 12 5 6 1 GGCTAAC 1 2 374373 CASAVA_Build 17 30957375 1D ATTTGATTAA T/- TTTTTTTTTT 880 het 880 ref 22 13 4 5 T 15 14 374374 CASAVA_Build 17 30961275 7I GTACCTTTTA -------/TTTATTT TTTATTTTTT 3070 het 3070 hom 39 15 14 10 TTTATTT 2 3 374375 CASAVA_Build 17 30970614 1I GTTTCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 19 18 7 A 10 11 374376 CASAVA_Build 17 30987725 1D ATCGGAAACA T/- TAAAATGGTT 3070 het 3070 ref 48 28 14 8 T 2 1 374377 CASAVA_Build 17 30993441 7D TCAAATGAAA GTACCAT/------- GTGGAGATAA 3070 het 3070 ref 39 21 18 2 GTACCAT 1 0 374378 CASAVA_Build 17 30995677 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 1184 het 693 hom 8 5 3 0 T 18 16 374379 CASAVA_Build 17 30997528 1D GTTTGAGCAG T/- TAGGAGATTC 3070 het 3070 hom 50 24 26 1 T 2 1 374380 CASAVA_Build 17 30999024 1I TGGGGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 2586 het 2586 ref 36 13 14 9 T 13 14 374381 CASAVA_Build 17 31007401 16I TGTGAACCAT ----------------/AGGGGGCCAGGGGGCC AGGGGGCCAA 3070 het 3070 hom 36 15 14 7 AGGGGGCC 1 3 374382 CASAVA_Build 17 31009415 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 26 11 9 6 T 13 14 374383 CASAVA_Build 17 31027925 2I TATTGGTCAT --/TC ATATATCTTT 3070 het 3070 ref 31 17 13 1 TC 0 1 374384 CASAVA_Build 17 31030524 1D ACTTGCTACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 13 13 13 T 14 13 374385 CASAVA_Build 17 31030720 1I TTTCTTTGAC -/T AGTAGTTTTG 3070 het 3070 ref 54 28 22 4 T 0 1 374386 CASAVA_Build 17 31044893 3D AAGCACAGAA CTT/--- CTCGATTCCA 3070 het 3070 ref 50 24 21 7 CTT 1 0 374387 CASAVA_Build 17 31052305 2I CATAGTGTAT --/AC ACACACACAA 3070 het 3070 hom 44 13 23 8 AC 4 5 374388 CASAVA_Build 17 31054967 20I TTGAAATAAA --------------------/AGTTAAATTTTTTAAAAAAG AGTTCAGTTT 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 AGTTAAATTTTTTAAAAAAG 0 1 374389 CASAVA_Build 17 31069796 2D CCTGGGTAAC AT/-- AGTGAGACCT 3070 het 2913 hom 28 9 12 8 AT 1 0 374390 CASAVA_Build 17 31073738 1I GATAGTCTCA -/C CTTTTGCACT 3070 het 3070 ref 26 14 10 2 C 1 2 374391 CASAVA_Build 17 31081647 3I TCGATGACTT ---/CCC CCCATCCAGC 2603 het 2603 ref 30 17 7 6 C 3 6 374392 CASAVA_Build 17 31124464 1I CCGGCTCCGG -/C AGATGCTCAG 3070 hom 58 het 30 0 17 13 C 0 1 374393 CASAVA_Build 17 31235022 1D ACAAAAAGCC T/- TTTTTTTTTT 2227 het 1979 hom 25 10 7 8 T 17 16 374394 CASAVA_Build 17 31253214 3D TGTTTAAGCT AAA/--- ATGATGAAGC 3070 het 3070 ref 64 31 18 16 A 4 1 374395 CASAVA_Build 17 31312887 3D CTAAAAAGAC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 20 0 15 5 A 14 11 374396 CASAVA_Build 17 31315997 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2674 hom 21 het 8 0 8 0 A 13 12 374397 CASAVA_Build 17 31318951 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 42 het 17 0 15 3 A 10 9 374398 CASAVA_Build 17 31319452 1D GCCCAATTAA T/- TTCTGTATTT 3070 hom 27 het 11 0 10 2 T 3 2 374399 CASAVA_Build 17 31319668 1I AATTTTTGTG -/T GTTTTTTTTT 2700 hom 18 het 7 0 7 0 T 0 1 374400 CASAVA_Build 17 31320209 1D TTCTTATTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 42 het 18 0 15 5 T 10 9 374401 CASAVA_Build 17 31320579 12I TAGAACCTGA ------------/TGATGTGTATGT TTGTGCGTGG 3070 hom 103 het 37 0 35 2 TGATGTGTATGT 0 1 374402 CASAVA_Build 17 31321307 2D GGATTCCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 50 1 35 14 T 14 12 374403 CASAVA_Build 17 31321590 3D CCACATTATG AAA/--- AAAAAAAATG 3070 hom 38 het 17 0 13 4 A 11 8 374404 CASAVA_Build 17 31323019 22D AGGAAACTGG GCTCAGAAAGGTTAAGGCTATT/---------------------- GCTCATAAAT 3070 hom 93 het 32 0 31 13 GCTCAGAAAGGTTAAGGCTATT 1 0 374405 CASAVA_Build 17 31325785 3D CAGTTAATTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 hom 38 het 18 0 13 5 T 13 10 374406 CASAVA_Build 17 31327122 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 2586 het 194 hom 10 1 7 2 T 7 6 374407 CASAVA_Build 17 31352760 7D AGGAAGTCCC AGGGCAG/------- AGGGCAGAGG 3070 hom 57 het 20 0 19 4 AGGGCAG 2 1 374408 CASAVA_Build 17 31354392 1I TTGGAGTTAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 400 hom 29 1 26 2 T 9 10 374409 CASAVA_Build 17 31359458 1I TTCTCCAGCT -/C CCCATTCATC 3070 hom 92 het 34 0 30 4 C 3 4 374410 CASAVA_Build 17 31365767 1I ATGAAAACAC -/T GTGTTGACTC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 T 0 1 374411 CASAVA_Build 17 31382710 1I AATAAGTTGG -/T TCTTTCTAAA 3070 het 3070 ref 50 23 19 8 T 1 2 374412 CASAVA_Build 17 31393331 1I GCAAATATTT -/G GGGGGGGGTT 3070 hom 53 het 25 0 16 9 G 8 9 374413 CASAVA_Build 17 31400995 1I AATTTTTTTT -/A ATTTTTTTTT 2235 hom 15 het 6 0 6 0 A 1 2 374414 CASAVA_Build 17 31412972 1D TGGATTTTGA G/- GGTGCTTGAT 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 G 3 2 374415 CASAVA_Build 17 31420493 1D CAGCTACTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 24 3 A 13 12 374416 CASAVA_Build 17 31434800 1D CCAATTTAAA T/- TGCCTATGAT 3070 het 3070 hom 45 10 26 9 T 2 1 374417 CASAVA_Build 17 31457529 3D CTTCATCATC TTA/--- TTATTATTAT 3070 hom 93 het 33 0 32 2 TTA 4 3 374418 CASAVA_Build 17 31461177 2D TATATCAGAG AT/-- ATTTGTGCAT 3070 het 3070 ref 69 40 21 8 AT 2 1 374419 CASAVA_Build 17 31471168 1I TAATGTGTAG -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 60 34 19 7 T 8 9 374420 CASAVA_Build 17 31473053 5I ATAGATGCAG -----/CAAAC CAAACCACCA 3070 het 3070 hom 47 14 28 6 CAAAC 1 2 374421 CASAVA_Build 17 31473141 2D AATAATAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 45 hom 33 2 11 20 A 13 11 374422 CASAVA_Build 17 31476189 1D AAAAGTAAAT A/- TTTGTATACA 3070 het 3070 hom 63 17 37 11 A 1 0 374423 CASAVA_Build 17 31479799 1D GCTTTCCATC T/- TATAACCCAA 3070 het 3070 ref 89 50 25 15 T 2 1 374424 CASAVA_Build 17 31480078 10D CTCTGTCTGT GGTACCCTGA/---------- GGCTTTCCTG 3070 het 3070 ref 64 42 14 13 GGTACCCTGA 1 0 374425 CASAVA_Build 17 31482955 2D AAGGGAAACT AA/-- AAAAAAAAAA 1530 het 1530 ref 39 14 4 23 A 12 10 374426 CASAVA_Build 17 31485232 4I CCACCCCCTC ----/GATT GATTGATTGG 3070 het 3070 ref 69 38 16 15 GATT 2 3 374427 CASAVA_Build 17 31489922 1I AGCTTTGGGT -/G GGGACACAGC 3070 het 3070 ref 43 25 15 3 G 3 4 374428 CASAVA_Build 17 31491173 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2534 hom 83 het 45 0 24 21 TTTC 5 4 374429 CASAVA_Build 17 31498970 1D TAGATTTATC T/- CTAGGTAATT 3070 het 3070 ref 45 28 15 2 T 1 0 374430 CASAVA_Build 17 31499607 1D GGACCTCTTC T/- TTTTTTTTTC 1331 het 1331 ref 64 40 5 19 T 10 9 374431 CASAVA_Build 17 31500188 1D CACATACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 49 18 17 14 A 16 15 374432 CASAVA_Build 17 31501958 2I AAAACATCAC --/TT ATTAATTTTA 3070 het 3070 ref 48 34 11 3 T 0 2 374433 CASAVA_Build 17 31511075 1D TACATTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 281 hom 42 2 13 27 T 16 15 374434 CASAVA_Build 17 31520963 1D GGGTCGGGCC A/- GGGGAACAGG 2929 het 1553 hom 12 5 7 0 A 1 0 374435 CASAVA_Build 17 31609007 1D GGGTCGGGCC A/- GGGGAACAGG 2447 hom 15 het 7 0 6 1 A 1 0 374436 CASAVA_Build 17 31620022 10D TATGTGCATC TGTGTGCATG/---------- TGTGTGCATG 3070 hom 18 het 7 0 7 0 TGTGTGCATG 2 1 374437 CASAVA_Build 17 31641923 1I AACAGGGGGG -/C CATCGTGAAT 1893 hom 15 het 7 0 6 1 C 1 2 374438 CASAVA_Build 17 31803548 1D CAAACAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 17 13 8 A 13 12 374439 CASAVA_Build 17 31804464 1I TCTAGAACTT -/C TAGTCTCCAG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 0 1 374440 CASAVA_Build 17 31842914 1I ACTCTGATGA -/T TTTTTTTTTT 1391 hom 7 het 5 0 3 2 T 15 16 374441 CASAVA_Build 17 31870762 3D GATCTTGGGA CAG/--- GTACGAGAAG 1652 het 422 hom 6 1 4 1 CAG 1 0 374442 CASAVA_Build 17 31888518 1I ATCTCTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 11 12 374443 CASAVA_Build 17 31888726 1D ACCTAGCAAA G/- AGAAATGGGA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 G 1 0 374444 CASAVA_Build 17 31899975 4D CTGTTAGGAT ACAG/---- ACAATGACCG 3070 het 3070 ref 38 23 14 3 ACAG 1 0 374445 CASAVA_Build 17 31912416 8I CAACGTCACT --------/CACTTTAA CACCTGAATT 3070 het 3070 hom 44 15 24 5 CACTTTAA 0 1 374446 CASAVA_Build 17 31913776 1I TAGTAGAGAC -/G GGGGTTTCAC 1493 het 367 hom 8 1 5 2 G 4 5 374447 CASAVA_Build 17 31918619 5D ATATAAAGCC TCCTA/----- TTGGTTGATT 3070 het 3070 ref 37 19 16 3 TCCTA 1 0 374448 CASAVA_Build 17 31919563 4D GAGAAGTGTC TGTT/---- TGGCTCATTT 2247 het 1603 hom 17 4 6 10 TGTT 1 0 374449 CASAVA_Build 17 31919582 1D CATTTGCCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 27 het 23 0 9 14 T 15 14 374450 CASAVA_Build 17 31929462 6D CTTTAAAAAC TTTTTT/------ TTTTGTTTTG 3070 het 3070 hom 30 16 13 4 T 10 4 374451 CASAVA_Build 17 31934866 1I GCTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1848 het 1848 ref 25 12 7 6 A 17 18 374452 CASAVA_Build 17 31941529 2I CATGGCCCAA --/GT GTGCCCATCT 3070 het 3070 ref 48 23 16 9 GT 1 2 374453 CASAVA_Build 17 31949954 1I CTTTTTTTCC -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 84 het 38 0 28 10 T 7 8 374454 CASAVA_Build 17 31962974 3I AGTCGTTGGT ---/GAG GAGGAGAGGC 3070 hom 157 het 58 0 50 8 GAG 2 3 374455 CASAVA_Build 17 31965153 21D TGTGCGAGTG CGGCGGAGTGTTGTGCGAGTC/--------------------- CGGCGGAGTG 2591 hom 47 het 20 0 11 13 CGGCGGAGTGTTGTGCGAGTC 2 1 374456 CASAVA_Build 17 31969569 1D CCCTGTCTAC A/- AAAAAAAAAA 2091 het 2091 ref 25 12 5 8 A 11 10 374457 CASAVA_Build 17 31979569 4I CTAGACACAC ----/ACAT AGATACAGTT 3070 het 3070 hom 28 10 14 4 ACAT 0 1 374458 CASAVA_Build 17 31982492 4D GAAAGTGCTT ATAA/---- CAATGTCTAA 3070 het 3070 ref 37 24 13 1 ATAA 1 0 374459 CASAVA_Build 17 31988715 1D GGCTGAGGTC T/- TTTTTTTTTT 2739 het 2739 ref 24 10 8 6 T 11 10 374460 CASAVA_Build 17 31989158 2I AGGCTGAGAC --/AG GGGAATCGCT 2941 het 2941 ref 19 8 7 4 AG 0 1 374461 CASAVA_Build 17 31990567 1D GTGTTGAAAT A/- ACGTGAGTGC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 A 2 1 374462 CASAVA_Build 17 31996967 1I AAATAAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 22 15 4 A 10 11 374463 CASAVA_Build 17 32010752 4D TTTCTTTTCT TTTC/---- TTTTTTTTTT 87 het 87 ref 13 8 2 3 TTTC 1 0 374464 CASAVA_Build 17 32030699 2D TTGTACCTTC CA/-- CAGATTGGAG 3070 het 3070 ref 52 20 19 15 CA 2 1 374465 CASAVA_Build 17 32034108 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1480 hom 17 4 11 2 T 12 11 374466 CASAVA_Build 17 32035886 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2258 hom 22 6 11 5 T 11 12 374467 CASAVA_Build 17 32036957 2D TGATGGATAA TT/-- TTTTTTTTTT 1367 het 1184 hom 27 7 7 14 T 18 16 374468 CASAVA_Build 17 32042509 1I CACACACACA -/G TTGGTTCTGT 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 G 0 1 374469 CASAVA_Build 17 32050625 1D GTTGTAGGAG T/- TCCTTATATA 3070 het 3070 hom 33 13 15 5 T 2 1 374470 CASAVA_Build 17 32055047 3D GTTAGATGAA CTT/--- CTTCTTTGTG 3070 het 3070 hom 40 15 22 3 CTT 3 2 374471 CASAVA_Build 17 32069545 1I GAGGTGGCTG -/C CCCTGGATGT 2481 het 2481 ref 24 14 9 1 C 3 4 374472 CASAVA_Build 17 32069913 1I TCTTCCTCTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 2645 hom 27 10 9 8 T 9 10 374473 CASAVA_Build 17 32071276 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2022 hom 24 6 11 7 T 13 14 374474 CASAVA_Build 17 32084702 2D GACAACAGCT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 104 het 60 1 47 13 AC 9 8 374475 CASAVA_Build 17 32087317 1I CCACTCTGAC -/G GGAGGGATAT 3070 het 3070 hom 33 11 15 7 G 2 3 374476 CASAVA_Build 17 32087993 2I CACACACAGG --/CA CACACACACA 312 het 312 ref 47 21 3 23 CA 5 6 374477 CASAVA_Build 17 32088322 1D TCCTTGGGCC A/- AAAAAAAGAG 3070 hom 31 het 21 0 13 8 A 8 7 374478 CASAVA_Build 17 32095688 1D AGGGAGAGAT G/- GGGGGTGGGA 3070 hom 75 het 30 0 25 6 G 6 5 374479 CASAVA_Build 17 32100381 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2740 het 537 hom 33 2 15 16 A 17 18 374480 CASAVA_Build 17 32101237 1I TCCTTCCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 375 hom 38 3 29 6 T 11 12 374481 CASAVA_Build 17 32105721 4I CAGCAATAGG ----/TAAC TGACCCACAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TAAC 0 1 374482 CASAVA_Build 17 32110116 15D GTGCAGTGAC AATAGAGGATTGTTA/--------------- AATAAGGAGT 3070 het 3070 ref 36 21 17 3 AATAGAGGATTGTTA 1 0 374483 CASAVA_Build 17 32112734 5D TCTGCCTCAC AGAGA/----- AGAGAAGGGG 3070 hom 150 het 57 0 49 12 AGAGA 2 1 374484 CASAVA_Build 17 32114816 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAGAAGGGGG 3070 hom 64 het 25 0 20 6 AAG 3 2 374485 CASAVA_Build 17 32115030 1D GCAACATAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 398 hom 36 1 28 8 T 14 13 374486 CASAVA_Build 17 32118461 1I GTTACCACTG -/T TGAGTTGTTG 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 T 1 2 374487 CASAVA_Build 17 32120959 2D GCTCTGGAGG CT/-- CTATGGCATT 3070 hom 81 het 32 0 24 9 CT 2 1 374488 CASAVA_Build 17 32134933 2I AAGGCATGGG --/GA GGGGGGGGTG 3070 hom 105 het 39 0 35 4 GA 0 1 374489 CASAVA_Build 17 32135672 3I TTCTCATTCG ---/CTT CTTTTTTTTT 3070 hom 64 het 28 0 20 8 CTT 1 2 374490 CASAVA_Build 17 32149745 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 16 0 13 3 A 13 12 374491 CASAVA_Build 17 32152581 2I TGGTTTACTC --/TT TTTTTTTTTT 1428 het 874 hom 40 3 6 31 T 12 14 374492 CASAVA_Build 17 32157600 3I CTTCCTCTAA ---/TCT TCTACCCGCA 3070 hom 96 het 36 0 31 5 TCT 1 2 374493 CASAVA_Build 17 32169614 3I GGAGGTGTTC ---/TAT TGTTGCACAG 3070 het 2821 hom 18 7 9 2 TAT 0 1 374494 CASAVA_Build 17 32171708 4I32M4D GCATGTGTGT ----GAGTGTGTGCTGGTGTGTAAGAGTGTGTGCTGGTGT/GTGAGAGTGTGTGCTGGTGTGTAAGAGTGTGTGCTG---- GTGTATGTGT 3070 het 3070 ref 65 46 42 10 N/A 0 0 374495 CASAVA_Build 17 32171994 2D GTGTGTAAGA GT/-- GTGCTGGTGT 3070 het 3070 ref 81 38 35 9 GT 2 1 374496 CASAVA_Build 17 32172197 1D AGAGGGAGAT G/- GGGGATGTGT 3070 het 3070 hom 73 29 33 12 G 5 4 374497 CASAVA_Build 17 32173500 1D CTGTCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 2032 het 1012 hom 36 11 8 17 T 17 16 374498 CASAVA_Build 17 32174611 2D CATAGATGAG AT/-- AAAAAATTTC 3070 het 3070 hom 51 19 24 8 AT 1 0 374499 CASAVA_Build 17 32175601 1I ACACATACAG -/A AAAGTGGATT 3070 het 3070 hom 33 13 19 1 A 3 4 374500 CASAVA_Build 17 32179869 2D AATGGAACTC AG/-- AGTTTGGATT 3070 het 3070 ref 30 15 10 6 AG 2 1 374501 CASAVA_Build 17 32184491 1D TAGTCAAGGA G/- GGGCCTCATT 3070 hom 132 het 48 0 45 3 G 4 3 374502 CASAVA_Build 17 32191883 4D ATGTGGATGT GTGA/---- GTGTGTATAT 3070 het 3070 ref 60 29 23 10 GTGA 1 0 374503 CASAVA_Build 17 32192348 4D TAGGTGTGTA TAGT/---- GAGTGTGCTA 3070 het 3070 ref 71 30 26 17 TAGT 1 0 374504 CASAVA_Build 17 32218322 1D AGAAGGAAAG A/- AAAAAAGAAG 214 hom 5 het 7 0 2 6 A 7 6 374505 CASAVA_Build 17 32218374 2I16M4D AAGAAGAAAG --AAGAAAGAAAGGAAAGAGAA/AAAAGAAAGAAAGGAAAG---- AGAAAGAAGA 3070 hom 55 het 18 0 19 3 N/A 0 0 374506 CASAVA_Build 17 32218639 1I TTATAATAGC -/A AAAAAAATGG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 A 7 8 374507 CASAVA_Build 17 32219028 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAACAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 7 8 374508 CASAVA_Build 17 32220753 1D TGCTAGATTA C/- AGGCATGAGC 3070 hom 83 het 32 0 27 5 C 1 0 374509 CASAVA_Build 17 32220842 1I TACAAAAAAA -/T TTTTTTTGAG 3070 hom 58 het 25 0 20 5 T 7 8 374510 CASAVA_Build 17 32228534 1I TTTTTAAAAA -/T ATTCTTTAAC 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 T 0 1 374511 CASAVA_Build 17 32229816 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 24 0 19 5 T 13 12 374512 CASAVA_Build 17 32234953 1I TACTACAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 28 1 18 9 T 15 16 374513 CASAVA_Build 17 32236614 1I CCTATATGGC -/T TTTTTTTTTT 2702 het 31 hom 16 1 10 5 T 11 12 374514 CASAVA_Build 17 32237556 1D ATAAATAAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 25 11 8 6 A 12 11 374515 CASAVA_Build 17 32241734 15D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAA/--------------- AAAAAAAAGA 3070 hom 37 het 31 1 27 7 A 23 8 374516 CASAVA_Build 17 32265362 2D TCTTTTCATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 18 15 9 A 13 11 374517 CASAVA_Build 17 32270273 4D TCTGTCTCAA AAAT/---- AAATAAATAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 AAAT 4 3 374518 CASAVA_Build 17 32271940 3I CTCTTCTCAG ---/CTT CTTCTCCCAG 3070 het 3070 hom 57 23 33 1 CTT 1 2 374519 CASAVA_Build 17 32275536 4D AGAAAGAAAG AAGA/---- AAGAAAGAAA 394 het 394 ref 25 10 7 9 AAGA 5 4 374520 CASAVA_Build 17 32292172 2D ATTTATTTTA TT/-- TTATTTTTTT 3070 hom 62 het 24 0 20 6 T 4 2 374521 CASAVA_Build 17 32296877 1D AAAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 98 hom 23 3 16 4 A 13 12 374522 CASAVA_Build 17 32297615 1D GGCTCCCCCC T/- GGTCTCCTTC 3070 hom 97 het 41 0 32 9 T 1 0 374523 CASAVA_Build 17 32303074 3D GTCTTTGAAT AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 88 het 35 0 30 5 AAC 4 3 374524 CASAVA_Build 17 32306493 8D ATAATAAAAT AAAATAAA/-------- ATAAAATAAA 3070 hom 39 het 14 0 14 1 AAAATAAA 1 0 374525 CASAVA_Build 17 32306841 3D CCTGTCTCAA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 48 het 21 0 17 5 AAC 5 4 374526 CASAVA_Build 17 32311446 4D AAGCCGCCAG CCGC/---- CCGCCCGCCC 2552 hom 34 het 14 0 8 6 CCGC 4 3 374527 CASAVA_Build 17 32313812 1I TCACTACACT -/C CCCCACCCCC 3070 het 3070 hom 41 17 18 6 C 4 5 374528 CASAVA_Build 17 32330596 8I10M2I AGAAGGGAAG --------GAAAGAAAGA--/AAAGAAAAGAAAGAAAGAAG AAAGAAAGAA 2877 het 1483 hom 26 7 9 10 N/A 0 0 374529 CASAVA_Build 17 32347137 1D ACACAGCCAT A/- AAAAAAATGA 1598 het 1598 ref 18 13 4 1 A 8 7 374530 CASAVA_Build 17 32352978 3D CAAGTCTCAT CTC/--- CTCCTGCCCA 3070 hom 116 het 43 0 36 7 CTC 2 1 374531 CASAVA_Build 17 32355974 1D GGGGAGCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 22 0 17 5 A 13 12 374532 CASAVA_Build 17 32356927 5D GGAGACTGGG CAGAA/----- CAGTCTCCTG 3070 het 3070 ref 59 36 22 4 CAGAA 1 0 374533 CASAVA_Build 17 32359581 1D AAGGAGCAGC G/- GGGGGGCTGG 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 G 7 6 374534 CASAVA_Build 17 32401947 12D TCTTTCTTTC TTTTTTCTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 TTTTTTCTTTTT 1 0 374535 CASAVA_Build 17 32404084 3D GGAGTAAACA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 16 15 12 T 15 12 374536 CASAVA_Build 17 32404540 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 26 12 14 0 T 6 7 374537 CASAVA_Build 17 32405481 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2387 het 1925 hom 19 6 8 5 A 13 14 374538 CASAVA_Build 17 32418566 2D TGCCTGGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 690 het 687 hom 17 6 3 9 T 18 16 374539 CASAVA_Build 17 32431121 1D GAAGTGATGG T/- TACTGTTTTA 3070 het 3070 hom 51 20 23 9 T 2 1 374540 CASAVA_Build 17 32434410 5I ATTATCTTGG -----/AAACA AAACAAAACA 3070 het 3070 ref 32 19 7 6 AAACA 3 4 374541 CASAVA_Build 17 32436556 1D TGGGGTGCTG C/- CCCAGACTCC 3070 het 3070 ref 33 18 13 2 C 4 3 374542 CASAVA_Build 17 32440524 1I GTTAAATGGC -/T TTTTTTGTTT 3070 het 3070 hom 40 16 22 2 T 6 7 374543 CASAVA_Build 17 32445039 1I AAGGGAGGAC -/T TTCATCTATG 3070 het 3070 ref 39 24 13 2 T 2 3 374544 CASAVA_Build 17 32461439 1I TGTGGTTTGG -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 37 19 12 6 T 8 9 374545 CASAVA_Build 17 32467083 14I ATTGGTCAGT --------------/CTGGTCTCTAATTC CTGACCTCAG 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 CTGGTCTCTAATTC 0 1 374546 CASAVA_Build 17 32472159 1D TAAAATGCTT C/- CCCCCCCACG 3070 het 3070 hom 26 12 12 2 C 8 7 374547 CASAVA_Build 17 32508766 2D TTTTTGAGGC AG/-- AGTCTCGCTG 2761 het 2761 ref 22 12 7 3 AG 2 1 374548 CASAVA_Build 17 32510325 1D TTTGACAGCA T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 T 9 8 374549 CASAVA_Build 17 32515558 2D AGTGTTTACA CT/-- GAGTTATCAG 3070 het 3070 ref 39 21 10 9 CT 1 0 374550 CASAVA_Build 17 32532145 1I AAAAAAAAAA -/C AAAAAAAAAG 1941 het 160 hom 18 4 10 4 C 0 1 374551 CASAVA_Build 17 32533023 2I GGATCACATA --/TC TCATAATCAC 3070 het 3070 hom 62 22 33 7 TC 1 2 374552 CASAVA_Build 17 32537200 1D TAAGATAGGT A/- AAAAAAAAAA 3068 het 3068 ref 21 12 7 2 A 12 11 374553 CASAVA_Build 17 32546238 1I CTGCTAATTA -/C ACAACTGCTG 3070 hom 108 het 40 0 37 3 C 0 1 374554 CASAVA_Build 17 32548837 1I ACTAGTAGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 T 12 13 374555 CASAVA_Build 17 32556257 1I TCAGGTAAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 221 hom 27 1 17 9 T 10 11 374556 CASAVA_Build 17 32561630 1I ATAAAAAATT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 9 10 374557 CASAVA_Build 17 32561924 1D AAAAGGATTA T/- TTTTTTCCTT 3070 het 3070 hom 36 16 19 2 T 7 6 374558 CASAVA_Build 17 32575850 1I GAGTATAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 15 9 T 11 12 374559 CASAVA_Build 17 32581579 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2230 het 2230 ref 16 6 5 5 A 12 11 374560 CASAVA_Build 17 32585955 3I TTATTAATTG ---/ATA ATAATCAATG 3070 hom 69 het 28 0 23 5 ATA 1 2 374561 CASAVA_Build 17 32587446 2I GTGACATCTC --/TA TTAAAGATAT 3070 het 3070 ref 31 18 11 2 TA 0 1 374562 CASAVA_Build 17 32602725 2D AAAATATAAC TT/-- TTAGAGCAAA 3070 het 3070 ref 42 27 13 3 T 4 2 374563 CASAVA_Build 17 32617229 2I AACTGTAAAG --/TA TATGTTTTAG 3070 het 3070 ref 49 24 18 7 TA 1 2 374564 CASAVA_Build 17 32630880 2D TTATAGGGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2299 hom 20 6 10 4 A 13 11 374565 CASAVA_Build 17 32632488 1D AGACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1109 het 1109 ref 29 17 3 9 A 13 12 374566 CASAVA_Build 17 32633725 2D CTTTTCTTTC AT/-- ATATATATAT 2618 hom 18 het 10 0 7 3 AT 10 9 374567 CASAVA_Build 17 32643111 2D GGGCCGCCTG CA/-- CAGTTTCTTA 3070 het 2681 hom 20 7 11 4 CA 2 1 374568 CASAVA_Build 17 32644841 1D AGAGTTGCCG C/- CTGCTAGCTG 3070 het 3070 hom 37 13 16 8 C 2 1 374569 CASAVA_Build 17 32652494 4D ATTTTTTAAA AAAG/---- AAAGAAACTA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 AAAG 2 1 374570 CASAVA_Build 17 32668795 2I ATATTTTCAG --/TC TCTCTTTTTT 3070 het 3070 hom 23 10 12 1 TC 2 3 374571 CASAVA_Build 17 32678404 8D TGTGAATTTC TTTTTTTT/-------- TTTTTTTTTT 2744 het 2744 ref 26 13 8 6 T 18 10 374572 CASAVA_Build 17 32682895 2D TCAACATCCC CT/-- CTCTTTCTTG 3070 het 3070 hom 40 15 21 7 CT 3 2 374573 CASAVA_Build 17 32685168 4I GATTGTAAGG ----/AAGA AAGAACATAA 3070 het 3070 ref 48 25 18 5 AAGA 1 2 374574 CASAVA_Build 17 32697438 1I TCAAGAAAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1783 hom 19 6 11 2 A 11 12 374575 CASAVA_Build 17 32698780 1D CTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2850 hom 37 9 17 11 T 15 14 374576 CASAVA_Build 17 32705987 1D AGTACTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 46 17 22 7 A 14 13 374577 CASAVA_Build 17 32721772 3I GGCCACACTG ---/GAA GAAGAAGAAT 3070 het 2391 hom 31 10 15 6 GAA 3 4 374578 CASAVA_Build 17 32738986 1I TAACAAGTAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 11 21 8 A 10 11 374579 CASAVA_Build 17 32742451 2D GGGTTACAAA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 hom 43 14 21 9 AC 7 6 374580 CASAVA_Build 17 32768612 1I GGGCTCAAGC -/A ATCCTCCAAC 3070 hom 57 het 21 0 17 4 A 1 2 374581 CASAVA_Build 17 32770934 4D CTAGAGAGAA AAAG/---- AGAGAAAGAT 3070 het 3070 ref 27 15 11 2 AAAG 1 0 374582 CASAVA_Build 17 32772767 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 720 hom 31 2 23 6 A 15 16 374583 CASAVA_Build 17 32797763 1D ACCTTGTGAT C/- CCACCCGCCT 1946 hom 14 het 12 0 9 3 C 3 2 374584 CASAVA_Build 17 32798283 1D TTGGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1191 het 1191 ref 30 22 3 5 A 13 12 374585 CASAVA_Build 17 32804313 1I GCAGGCTGAC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 68 het 28 0 22 6 T 9 10 374586 CASAVA_Build 17 32819551 2D AGCTCACCCT CA/-- CACCCCCTCC 3070 het 3070 ref 42 20 17 6 CA 2 1 374587 CASAVA_Build 17 32824212 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2401 het 316 hom 20 1 12 7 A 14 13 374588 CASAVA_Build 17 32824888 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 612 hom 29 4 16 9 A 12 13 374589 CASAVA_Build 17 32832592 1I GTTGTTCCTG -/A AACCTACAGG 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 2 3 374590 CASAVA_Build 17 32840677 1D CTGGAGAGGC A/- GCCACGGCTC 1770 het 1770 ref 25 12 8 5 A 1 0 374591 CASAVA_Build 17 32843968 1D ACTTAGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 27 het 16 0 10 6 A 10 9 374592 CASAVA_Build 17 32846055 4D AAATAAAATC AATT/---- AATACATATT 3070 het 3070 ref 34 23 9 2 AATT 1 0 374593 CASAVA_Build 17 32847747 1D TATTTTTTAA T/- TTTTTTTATT 3070 het 2494 hom 22 7 11 4 T 8 7 374594 CASAVA_Build 17 32866387 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 22 7 12 3 T 10 9 374595 CASAVA_Build 17 32878617 1I TTATAGGTGC -/A ATGCTACTGT 2541 het 2541 ref 29 20 6 3 A 1 2 374596 CASAVA_Build 17 32902952 1D ATACTGCATA T/- AAGCATAGCA 3070 het 3070 hom 52 21 23 8 T 1 0 374597 CASAVA_Build 17 32914893 3I ATTAAAAAAA ---/AAG AAAGAATGCT 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 AAG 0 1 374598 CASAVA_Build 17 32920570 3I TGCTTTTTCT ---/CTC CTTTTTGCTT 3070 het 3070 hom 45 18 23 4 CTC 0 1 374599 CASAVA_Build 17 32942518 2D GCCTCACCTC AG/-- AAAGGCAACT 3070 het 3070 hom 30 13 12 7 AG 1 0 374600 CASAVA_Build 17 32947513 1D GAAGGTTGAT A/- ACCAGCTTCA 3070 het 3070 ref 35 17 14 4 A 2 1 374601 CASAVA_Build 17 32947779 4D TGCTCTCCAG TAAC/---- TAACTAACTA 2746 het 2746 ref 26 16 8 3 TAAC 4 3 374602 CASAVA_Build 17 32948114 4D CAAGTAACAA AAAC/---- AAACAATGGC 3070 het 3070 ref 34 16 16 4 AAAC 2 1 374603 CASAVA_Build 17 32949625 2I TGAAAATGTC --/AA AGTTTATTAA 3070 het 3070 ref 43 26 13 5 A 1 3 374604 CASAVA_Build 17 32956421 2D CCAGTCACTC TG/-- TTGCTCAGGC 3070 het 3070 ref 38 22 14 3 TG 1 0 374605 CASAVA_Build 17 32963755 6D TATATTTTAC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 het 2411 hom 36 9 24 6 A 16 10 374606 CASAVA_Build 17 32991121 4D CAAGTATTGC TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 37 13 15 11 TTTG 4 3 374607 CASAVA_Build 17 32998498 1D AGGCCCTTCA G/- GGTCTTATGT 3070 hom 93 het 33 0 31 2 G 3 2 374608 CASAVA_Build 17 32999479 1I ACTCCGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 23 0 19 4 A 13 14 374609 CASAVA_Build 17 33004584 1I CAAGGCTGTA -/C CAATAAGCCT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 2 374610 CASAVA_Build 17 33009670 1I AATTAAAAAT -/A AATTTTTTTT 3070 het 3070 hom 21 9 10 2 A 2 3 374611 CASAVA_Build 17 33014506 1I ACAAAAGAAC -/T TTTTTTTTTT 1775 het 1775 ref 30 11 8 11 T 15 16 374612 CASAVA_Build 17 33032870 1I CTAACAACTG -/T TTAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 2 3 374613 CASAVA_Build 17 33044289 1D TTTTTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1938 hom 30 10 12 8 T 15 14 374614 CASAVA_Build 17 33060388 1D TTATCATACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2727 hom 33 10 17 7 A 12 11 374615 CASAVA_Build 17 33062832 1D CTGTGAATCT A/- AAAAAAAAAA 1747 het 1747 ref 36 27 4 8 A 11 10 374616 CASAVA_Build 17 33075314 1D GAGGCGGAGG A/- AGGGTGGATC 3070 hom 38 het 16 0 12 4 A 2 1 374617 CASAVA_Build 17 33088012 1D CAGAATATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 18 11 7 T 12 11 374618 CASAVA_Build 17 33101716 1D ATTCAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 30 0 22 8 T 11 10 374619 CASAVA_Build 17 33104204 1I ATTTATTATT -/A TTTTTTTGAG 3070 het 2732 hom 19 6 10 3 A 0 1 374620 CASAVA_Build 17 33104413 1I GGCTGGTCTC -/A AAACTCCTGA 1924 het 1146 hom 11 3 4 4 A 3 4 374621 CASAVA_Build 17 33109730 1I CCCTAAGCCC -/G TGAATGGATT 2821 het 64 hom 17 1 11 5 G 0 1 374622 CASAVA_Build 17 33109745 1D GGATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 757 het 750 hom 20 5 4 11 T 14 13 374623 CASAVA_Build 17 33112480 51D TCTTGTTACC ATCCATGTTTCCTGGACAAGACAACCTATTTTATGAAAATAATGATGAATT/--------------------------------------------------- ATAATGGAAA 3070 hom 102 het 34 0 35 6 ATCCATGTTTCCTGGACAAGACAACCTATTTTATGAAAATAATGATGAATT 1 0 374624 CASAVA_Build 17 33126298 1D GATTCTTGGC A/- GCGAGAAGTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 A 1 0 374625 CASAVA_Build 17 33126733 4D TCATTCATTC ATTT/---- GTTCGTTCAT 3070 hom 135 het 47 0 45 5 ATTT 1 0 374626 CASAVA_Build 17 33128618 1D CTTTGGCAAT G/- GGTAACAGGC 2437 het 2437 ref 16 9 6 1 G 3 2 374627 CASAVA_Build 17 33134232 1I ACACAGCTGG -/T TAAGTATCAC 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 T 1 2 374628 CASAVA_Build 17 33134337 1I CATGATTCCT -/C CCCAAACTCC 3070 hom 96 het 36 0 30 6 C 3 4 374629 CASAVA_Build 17 33168892 1D TCTTAATATC T/- TTTTTTTTTT 2252 het 2252 ref 36 19 9 8 T 17 16 374630 CASAVA_Build 17 33190915 1I GCGTGAGCCA -/C CATGCTTCAC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 C 1 2 374631 CASAVA_Build 17 33196149 2D ACAAAACAAA AC/-- AAAAAAAAAC 1025 het 1025 ref 22 6 6 10 AC 1 0 374632 CASAVA_Build 17 33198313 1I AGGTTCTACA -/T TGGTAAAAAT 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 T 1 2 374633 CASAVA_Build 17 33199230 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2916 het 2916 ref 28 17 7 4 T 10 11 374634 CASAVA_Build 17 33205757 1I TATACCACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 17 9 6 T 12 13 374635 CASAVA_Build 17 33209575 3D GACACTGCTG CTT/--- CTTCTTCCTG 3070 het 3070 hom 35 16 17 4 CTT 3 2 374636 CASAVA_Build 17 33216278 1D TAAAAGGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 12 11 374637 CASAVA_Build 17 33217681 1D AGCTAGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2809 hom 21 8 11 2 T 13 12 374638 CASAVA_Build 17 33230910 3D AGCCTCTCAG CCA/--- CCACACTCCT 3070 hom 86 het 35 0 28 8 CCA 2 1 374639 CASAVA_Build 17 33234516 2I CAGCAACAAC --/AA AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 36 0 28 8 A 8 10 374640 CASAVA_Build 17 33238138 2I CCAGCCAATT --/AA AAAAATTTTT 2654 het 2654 ref 19 11 7 1 A 5 7 374641 CASAVA_Build 17 33239111 1I AATCCAAAAC -/T TTTTTTTTTT 2435 het 2435 ref 31 12 8 11 T 13 14 374642 CASAVA_Build 17 33242119 1D TCATTGTCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2555 hom 33 13 13 7 T 13 12 374643 CASAVA_Build 17 33242194 2I TTGCCGTGGT --/AA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 32 14 10 8 A 9 11 374644 CASAVA_Build 17 33245722 8I ATGTGGCTTG --------/CCAGTTTT CCAGTTTTCC 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 CCAGTTTT 1 2 374645 CASAVA_Build 17 33264724 1D ACTTCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2384 het 1140 hom 31 6 9 16 A 17 16 374646 CASAVA_Build 17 33272023 1I GACCTGCCAC -/T TTTTTTTTTT 2505 het 2505 ref 29 14 10 5 T 11 12 374647 CASAVA_Build 17 33284632 8I CTCCCTTCCT --------/TCCTTCTC TCTTTCCTTC 2395 het 2395 ref 28 9 8 11 TCCTTCTC 0 1 374648 CASAVA_Build 17 33291380 1D TCAATTTGGT A/- AAAAAAAAAA 2982 het 1782 hom 30 10 9 12 A 17 16 374649 CASAVA_Build 17 33292428 2I CTCTCAAACC --/CT GTCTCCTGAT 2899 het 2899 ref 24 13 7 4 CT 0 1 374650 CASAVA_Build 17 33294427 1I AAAAAAAAAA -/C GTGCCAATCA 1394 het 1060 hom 31 7 7 17 C 0 1 374651 CASAVA_Build 17 33302549 2D ACAATGGAAA GC/-- ATAGATTATT 3070 het 3070 ref 21 9 9 5 GC 1 0 374652 CASAVA_Build 17 33310097 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAG 2339 het 2339 ref 21 11 8 2 A 9 10 374653 CASAVA_Build 17 33311966 3I CCTGTCTCAA ---/AAC AACAACAACA 1896 het 1896 ref 28 12 5 11 AAC 3 4 374654 CASAVA_Build 17 33316910 5D CAGGTGTCAG GCAGC/----- GCACCCAGCC 3070 het 3070 hom 32 15 16 1 GCAGC 1 0 374655 CASAVA_Build 17 33319159 2D55M2D TATACATATA TGTGTGTGTGTGTGTGTTGATTATATATGTATATATACACACACACATTTTATATATAC/--TGTGTGTGTGTGTGTTGATTATATATGTATATATACACACACACATTTTATATAT-- ACACACACTA 3070 het 3070 ref 27 26 12 6 N/A 0 0 374656 CASAVA_Build 17 33323914 1I TGTTATAACC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 21 9 10 3 A 9 10 374657 CASAVA_Build 17 33334978 3I TGTGTATAGT ---/ATA ACCCACACCC 3070 het 3070 ref 40 26 11 3 ATA 0 1 374658 CASAVA_Build 17 33352599 2D CCAGGAAGAC AG/-- GGGCACAGGA 3070 het 3070 ref 60 39 14 8 AG 1 0 374659 CASAVA_Build 17 33383557 3D TTTTAAACTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1951 het 1951 ref 70 34 5 31 T 21 18 374660 CASAVA_Build 17 33385978 1D TGTTCCATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 57 28 14 17 T 13 12 374661 CASAVA_Build 17 33386999 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTGTGTTTC 1432 het 1432 ref 37 22 4 11 T 5 3 374662 CASAVA_Build 17 33396475 1D CATTTCTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 74 58 14 2 A 10 9 374663 CASAVA_Build 17 33399555 4D TTTCTTCTCC TTTT/---- TTTGCCTCAG 3070 het 3070 ref 85 69 8 8 T 7 3 374664 CASAVA_Build 17 33400043 18D GAGACGGGGT CTCCCCATGTTGCCCAGG/------------------ CTGGTCTCCA 2872 het 2872 ref 53 48 10 11 CTCCCCATGTTGCCCAGG 1 0 374665 CASAVA_Build 17 33407901 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAAAG 2545 het 2545 ref 86 44 13 29 G 0 1 374666 CASAVA_Build 17 33428817 1I AGCTAATCAT -/G TTTAAATATG 3070 hom 235 het 80 0 79 1 G 0 1 374667 CASAVA_Build 17 33558737 1D CATCTCTTTT G/- TTTTTTTTTT 1169 het 1169 ref 29 21 3 5 G 1 0 374668 CASAVA_Build 17 33558947 1D ACCTAGCAAA G/- AGAAATGGGA 1431 het 844 hom 6 3 3 0 G 1 0 374669 CASAVA_Build 17 33615331 1I AAAAAGAAAG -/A AAAAAGAGGC 2258 het 2258 ref 77 32 14 31 A 5 6 374670 CASAVA_Build 17 33615858 8D ATTTTTGTTT ATATTTTA/-------- ACATTTCAAC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 ATATTTTA 1 0 374671 CASAVA_Build 17 33622513 1I ATTCCAGCAC -/T TTTGGGAGGC 3070 het 3070 ref 51 23 12 16 T 3 4 374672 CASAVA_Build 17 33630223 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2870 het 2870 ref 50 21 15 16 A 15 14 374673 CASAVA_Build 17 33650347 1D AGACTCTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 64 28 22 14 A 13 12 374674 CASAVA_Build 17 33651526 4I AAGTAAAATA ----/AATT GTGACATTTA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 AATT 0 1 374675 CASAVA_Build 17 33651972 10D CACACACACA CACGCACCCC/---------- CCCCACATAT 3070 het 1601 hom 33 9 20 8 CACGCACCCC 1 0 374676 CASAVA_Build 17 33652864 2I AATTAGGAGG --/GT GTGCTGGTAC 3070 hom 96 het 45 0 31 14 GT 1 2 374677 CASAVA_Build 17 33654658 1D CTCAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 85 51 22 14 A 11 10 374678 CASAVA_Build 17 33655162 21I ACCTTGCTTA ---------------------/AAACAAAACTTGTTTTGTTTT AAACAAAACT 3070 het 3070 hom 85 25 50 11 AAACAAAACTTGTTTTGTTTT 0 1 374679 CASAVA_Build 17 33655389 1D GATCTTCCAA T/- TTTTTTTTTT 2677 het 2677 ref 79 22 13 44 T 17 16 374680 CASAVA_Build 17 33675685 1D CTAGCCCTCC T/- TTTTTTTTTT 2853 het 438 hom 44 6 10 28 T 19 18 374681 CASAVA_Build 17 33680622 4D AGTTTTCTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 33 het 15 0 12 5 TTTC 5 4 374682 CASAVA_Build 17 33682634 1I GGCAAATATC -/T TTTTCTGGAG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 4 5 374683 CASAVA_Build 17 33688672 1I AAAATACACT -/A AAAATAATTT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 4 5 374684 CASAVA_Build 17 33690625 1I ATCTCTACTT -/A AAAAAAAAAA 2507 hom 24 het 10 0 9 1 A 10 11 374685 CASAVA_Build 17 33693648 2D AAAAAAAACA AC/-- AAAAAAAATT 2609 het 2609 ref 35 26 6 3 AC 1 0 374686 CASAVA_Build 17 33701195 4I CTAAGTAACT ----/AACC AATTAACTAA 3070 hom 32 het 27 0 19 8 AACC 0 1 374687 CASAVA_Build 17 33705792 2D AGTCAATCTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 T 19 17 374688 CASAVA_Build 17 33734868 1I ATTCTTGGGC -/G GGGAGGGGTG 864 hom 15 het 8 0 5 3 G 3 4 374689 CASAVA_Build 17 33751527 1D CTCTGTCTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 14 6 A 11 10 374690 CASAVA_Build 17 33765652 14D CCAGTTGGGT GTGGTAGTGTGCAC/-------------- CTGTAGTCCC 1776 het 1776 ref 21 20 6 1 GTGGTAGTGTGCAC 1 0 374691 CASAVA_Build 17 33782458 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 12 5 5 3 A 12 11 374692 CASAVA_Build 17 33783432 1D ATTAGCCAGG C/- CTGGTGGCAC 3070 het 3070 hom 23 9 9 5 C 2 1 374693 CASAVA_Build 17 33794794 2I TTTTTTTCTT --/TC TTTTTTTTTT 1056 het 1056 ref 19 6 5 8 TC 0 1 374694 CASAVA_Build 17 33815987 1D TATGCTGTTG T/- TAAGTGTGTA 3070 het 3070 ref 36 17 13 7 T 2 1 374695 CASAVA_Build 17 33816490 1I TTTCTTAAGA -/T CACCAATAAG 3070 het 3070 ref 27 12 8 7 T 0 1 374696 CASAVA_Build 17 33819394 1I CTTCCTGCTT -/C CTGTTTCTCC 3070 het 3070 hom 24 8 13 3 C 1 2 374697 CASAVA_Build 17 33819902 1D TTGTAGAGAC A/- AGTGTCTCAC 3070 het 3070 ref 41 23 15 4 A 2 1 374698 CASAVA_Build 17 33821330 4D GGAGAGAGAG AGGA/---- AGGAAGGAAG 778 het 332 hom 11 2 3 7 AGGA 5 4 374699 CASAVA_Build 17 33823919 2D ATGTGTGTCA TC/-- TCTCTCTCTC 957 het 957 ref 29 17 3 9 TC 10 9 374700 CASAVA_Build 17 33827211 1I AGCTATTTGA -/G AGGCCCAGCA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 G 0 1 374701 CASAVA_Build 17 33837236 1I GACCCTGCCG -/A AAAAAAAAAA 1111 het 383 hom 17 2 8 7 A 12 13 374702 CASAVA_Build 17 33846166 1I CTACCCCCCC -/A AAAAAAAACG 3070 hom 30 het 17 0 11 6 A 8 9 374703 CASAVA_Build 17 33847565 1I GCATAACGAA -/G GGGGGGGGAG 2907 hom 33 het 20 0 11 9 G 8 9 374704 CASAVA_Build 17 33848427 1I ATGGGAGCTG -/A AAACTGGAGG 3070 hom 108 het 40 0 35 5 A 3 4 374705 CASAVA_Build 17 33896000 1D GGTTTTACTC T/- TTTTTTTTTT 2859 hom 13 het 16 0 10 6 T 15 14 374706 CASAVA_Build 17 33900848 1I AGTGATCGGA -/T TTATTTCCCA 3070 het 1512 hom 23 6 11 6 T 2 3 374707 CASAVA_Build 17 33902981 1D TGTTTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 2456 het 2456 ref 30 18 7 5 T 10 9 374708 CASAVA_Build 17 33903793 2D GAGGCTGTTC TG/-- TGTGTTACAG 3070 het 3070 ref 23 11 10 2 TG 3 2 374709 CASAVA_Build 17 33906078 2D AAATCTACAA TT/-- TTTTTTTTTT 2704 het 1874 hom 20 5 7 8 T 13 11 374710 CASAVA_Build 17 33980394 1I ATCAGACTCA -/G GGTACCTTGT 3070 het 3070 ref 59 27 20 12 G 2 3 374711 CASAVA_Build 17 34028061 1D AAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 3070 het 375 hom 24 2 16 6 G 1 0 374712 CASAVA_Build 17 34032934 1D TGGACAACAG A/- GCGAGATCCT 3070 het 3070 ref 36 18 14 5 A 1 0 374713 CASAVA_Build 17 34034331 12D AGTCTGTCTC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 1835 het 1177 hom 12 5 5 4 A 22 10 374714 CASAVA_Build 17 34035561 3D AAAGGTAAAT AAA/--- AAGAAGCAAG 3070 het 3070 ref 34 21 12 4 A 5 2 374715 CASAVA_Build 17 34036344 1D ATTTTTATTT A/- TTTTTTTTAT 1048 het 492 hom 5 1 4 0 A 1 0 374716 CASAVA_Build 17 34044322 1D ATGCTTTTTT A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 8 7 374717 CASAVA_Build 17 34048977 1I TTAAAAATGC -/A AAAAAATTAG 2940 het 2940 ref 16 7 8 2 A 6 7 374718 CASAVA_Build 17 34054882 2I AAATTGAATC --/AT GTGTAAGTAG 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AT 0 1 374719 CASAVA_Build 17 34060170 1D AAAGTTTGGT C/- CCTTTGAGGC 3070 het 3070 hom 32 14 12 8 C 3 2 374720 CASAVA_Build 17 34062676 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 2205 het 1612 hom 33 8 10 15 T 13 12 374721 CASAVA_Build 17 34071811 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTA 1684 het 428 hom 6 1 4 1 T 9 10 374722 CASAVA_Build 17 34078200 1D GCAGGGGCGA T/- TTTTTTTTGA 3070 het 3070 hom 32 12 13 7 T 9 8 374723 CASAVA_Build 17 34085284 1D CAAGATGAAC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 6 A 8 7 374724 CASAVA_Build 17 34114097 2I CCCACACAGG --/TC TTGGGAAGAA 3070 het 3070 hom 26 10 10 6 TC 0 1 374725 CASAVA_Build 17 34142993 5I GCTCCTGCAG -----/CCTGC CCTGCCCTGC 3070 hom 54 het 28 0 17 11 CCTGC 3 4 374726 CASAVA_Build 17 34163871 1I GGGTACTGGT -/G GCCTGAGGAG 3070 hom 114 het 42 0 38 4 G 1 2 374727 CASAVA_Build 17 34181217 4I GCGAGCTCTC ----/TAAG TCTAATGGGG 3070 hom 69 het 26 0 23 3 TAAG 0 1 374728 CASAVA_Build 17 34188485 1I CAGGGAGGAG -/A CAGGACACTC 3070 hom 129 het 45 0 43 2 A 0 1 374729 CASAVA_Build 17 34249684 2D TTGGGACTAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 93 het 33 0 30 4 AC 6 5 374730 CASAVA_Build 17 34259876 2D ATGGGTTTAG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 11 9 374731 CASAVA_Build 17 34265521 2D TCTTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2535 het 164 hom 13 2 7 4 T 12 10 374732 CASAVA_Build 17 34266610 1D ATTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 401 hom 22 3 10 9 A 17 16 374733 CASAVA_Build 17 34273858 4I ATTTTTCTCT ----/TTTC TTTCTTTCTG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 TTTC 2 3 374734 CASAVA_Build 17 34293519 4D AGGGGCAGGC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2964 het 541 hom 30 7 8 15 T 18 14 374735 CASAVA_Build 17 34298660 1D CCCTCTTCCT G/- GGGACCAGGC 3070 hom 86 het 35 0 28 7 G 4 3 374736 CASAVA_Build 17 34321224 1I TGACATTGAC -/T TACCTCAGAG 3070 het 3070 hom 51 18 23 10 T 1 2 374737 CASAVA_Build 17 34323617 1I CCTGTCTCTA -/C TTAAAATACA 2199 het 1419 hom 10 4 6 0 C 0 1 374738 CASAVA_Build 17 34327178 1D TTTATTTTTC T/- TTTTTTTTTC 1927 het 1927 ref 41 32 6 4 T 10 9 374739 CASAVA_Build 17 34346373 2D TGTGTGTGTC TA/-- TATATATATA 3070 het 2933 hom 31 11 12 8 TA 7 6 374740 CASAVA_Build 17 34391919 1D ATTCAGTGCT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 40 26 13 1 A 9 8 374741 CASAVA_Build 17 34394513 1D GTGTTACATT A/- AAAAAATTTA 3070 het 3070 ref 37 18 16 4 A 7 6 374742 CASAVA_Build 17 34394695 1D TCATTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 20 7 T 14 13 374743 CASAVA_Build 17 34395369 4D TAGTGGCCCG GTTT/---- GTACCCTTCG 2322 het 2322 ref 25 13 7 6 GTTT 1 0 374744 CASAVA_Build 17 34397861 1I AGACACTGTA -/T TCCATCAAAC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 T 1 2 374745 CASAVA_Build 17 34398283 1D CTATGTCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2597 hom 19 8 8 3 T 12 11 374746 CASAVA_Build 17 34406967 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2934 het 78 hom 27 1 10 16 T 17 16 374747 CASAVA_Build 17 34500667 2D TCTCCCTCTG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 99 het 45 0 38 9 TC 6 5 374748 CASAVA_Build 17 34501104 1D ACACACCCAC T/- GACTCCCATG 3070 hom 98 het 37 0 29 8 T 1 0 374749 CASAVA_Build 17 34503924 1D CAGGTGCCCC T/- GAGTGATGCC 3070 hom 108 het 43 0 35 9 T 1 0 374750 CASAVA_Build 17 34523629 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 17 10 11 A 13 14 374751 CASAVA_Build 17 34576254 1I AGAGAGATCC -/T TCCGGCTGGA 3070 het 3070 ref 51 21 20 10 T 1 2 374752 CASAVA_Build 17 34583342 2D GGAGAGACAG GT/-- AAGTGAAGGG 3070 het 3070 hom 30 12 12 8 GT 1 0 374753 CASAVA_Build 17 34587954 1I GCATGGAGAG -/T CCAGTGTCAA 3070 het 2437 hom 27 6 8 13 T 0 1 374754 CASAVA_Build 17 34597854 14I CAGGTGGATC --------------/ACTTGAGACCAGGA GTTTGAGACC 2975 het 2975 ref 21 12 7 2 ACTTGAGACCAGGA 0 1 374755 CASAVA_Build 17 34598349 1D TGAGACTCCG T/- CAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 T 1 0 374756 CASAVA_Build 17 34612526 9I TGCCTGTTAC ---------/ACCCACATT ACCCACATTC 3070 het 3070 ref 64 33 23 8 ACCCACATT 1 2 374757 CASAVA_Build 17 34636691 6I GGCTCAAGCG ------/ATCTTC ATCTTCTCAC 3070 het 3070 ref 27 14 13 0 ATCTTC 1 2 374758 CASAVA_Build 17 34644641 1I AGAATCGTTT -/G TACCCAGAAG 3070 het 3070 ref 20 10 9 1 G 0 1 374759 CASAVA_Build 17 34656756 2I GTGGGTGTCC --/TA TGTCTTTAAA 3070 het 3070 ref 47 23 19 5 TA 0 1 374760 CASAVA_Build 17 34680641 1D ATATTCTGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1443 hom 33 6 20 7 A 16 15 374761 CASAVA_Build 17 34693700 7I AGCCATGATA -------/TCCCGGT TCAAGTTCAT 3070 het 3070 hom 49 20 27 2 TCCCGGT 0 1 374762 CASAVA_Build 17 34694728 1D TTTTTTTTTG T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 8 7 374763 CASAVA_Build 17 34702420 2I TCTTTTTTTT --/GA GAGAGTTTTT 3070 het 3070 hom 41 15 18 8 GA 2 3 374764 CASAVA_Build 17 34703610 1I GTAGCCTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 19 18 8 T 12 13 374765 CASAVA_Build 17 34712696 1D TCTGAAACTA T/- TTTTTTTTTT 653 het 653 ref 33 24 2 7 T 13 12 374766 CASAVA_Build 17 34713835 1D ACAAAGGCAG T/- TCTTTAGAAG 3070 het 3070 ref 52 30 17 7 T 2 1 374767 CASAVA_Build 17 34717076 1I TGAGTACTAT -/A AAAAAACATA 3070 het 3070 hom 35 15 18 2 A 6 7 374768 CASAVA_Build 17 34730033 6I AAAATCAACT ------/TAAAGA TAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 TAAAGA 0 1 374769 CASAVA_Build 17 34730937 1I CATGCTGTAT -/A AAAACTAATC 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 A 4 5 374770 CASAVA_Build 17 34733336 4I CCTCTTTCTT ----/CTTA CTTTACAATC 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 CTTA 0 1 374771 CASAVA_Build 17 34736626 7I AGGATGGTCT -------/TGAACTC TGAACTCCTG 2937 het 2937 ref 21 8 7 6 TGAACTC 1 2 374772 CASAVA_Build 17 34736662 1D CTGTCTTGGC T/- TTTTTTTTTT 1533 het 930 hom 21 6 4 11 T 17 16 374773 CASAVA_Build 17 34744309 1I CATGCTTGCC -/A ATTTCAGTTC 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 A 1 2 374774 CASAVA_Build 17 34749437 1D TTCACAGAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 13 12 374775 CASAVA_Build 17 34755323 7D AAGAATAATT TTAATAA/------- TTTTTTTTTT 100 het 100 ref 31 17 2 12 TTAATAA 1 0 374776 CASAVA_Build 17 34756435 4D GTTTCAGTGC AACA/---- AACAGACTAC 3070 het 3070 hom 44 17 21 7 AACA 2 1 374777 CASAVA_Build 17 34758247 1I CAAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 2798 het 2411 hom 24 10 10 4 A 10 11 374778 CASAVA_Build 17 34766602 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2059 het 2059 ref 17 7 5 5 T 13 14 374779 CASAVA_Build 17 34775418 1D CTCTCAGTCC A/- AAAATAGAGC 3070 het 3070 ref 41 22 16 4 A 5 4 374780 CASAVA_Build 17 34805790 1D TTTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2492 hom 24 9 11 4 T 15 14 374781 CASAVA_Build 17 34808996 2I AATTCTCAAT --/GA GAGATCTGCT 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 GA 2 3 374782 CASAVA_Build 17 34828136 2I TGGGCAACAT --/AG AGAGAGACCC 3070 het 3070 hom 39 14 20 5 AG 3 4 374783 CASAVA_Build 17 34841061 1D AAGTCTTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 462 hom 31 3 10 19 T 13 12 374784 CASAVA_Build 17 34853589 9I CCATCCATGC ---------/AAAGGAAGA AAAATCCATA 3070 het 3070 ref 34 17 15 2 AAAGGAAGA 0 1 374785 CASAVA_Build 17 34859294 1D ATTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1857 het 728 hom 18 5 5 8 T 15 14 374786 CASAVA_Build 17 34874184 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2491 het 2016 hom 28 13 10 5 T 12 11 374787 CASAVA_Build 17 34874569 1D TCTCTACAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 13 12 374788 CASAVA_Build 17 34877905 2I AAACTCTTGA --/CT TCAGGGTGAT 2654 het 1974 hom 14 5 6 3 CT 0 1 374789 CASAVA_Build 17 34907791 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 21 8 8 6 T 10 9 374790 CASAVA_Build 17 34910987 1I TTCAGCATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 14 4 T 10 11 374791 CASAVA_Build 17 34920374 5D TATTTTTTTC TCTCT/----- TCTCTTCTCT 1954 het 1954 ref 28 11 8 10 TCTCT 3 2 374792 CASAVA_Build 17 34939642 1D GCTATAGTGA T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 22 9 7 6 T 9 8 374793 CASAVA_Build 17 34942854 1I TGCATTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2248 hom 28 5 12 11 A 12 13 374794 CASAVA_Build 17 34951142 14D AGTTTGGCTC TTTTTTTTTTTTTT/-------------- TTTTTTTTTG 3070 het 1258 hom 20 4 11 5 T 23 9 374795 CASAVA_Build 17 34951384 10I GACCTCGTGA ----------/TCAGCCCGCC TCAGCCTCCC 2066 het 1762 hom 13 5 6 2 TCAGCCCGCC 0 1 374796 CASAVA_Build 17 34951930 2D TTATATATAC AT/-- ATATATATGT 2038 het 2038 ref 22 10 7 5 AT 5 4 374797 CASAVA_Build 17 34979186 4D AGAAGACACT CACA/---- CACAACATAC 3070 het 3070 ref 67 36 22 12 CA 4 2 374798 CASAVA_Build 17 34980332 3D GAATTCTGGG AGA/--- AGTTGTTGAG 3070 het 3070 hom 57 27 27 5 AGA 1 0 374799 CASAVA_Build 17 34988295 1I CAGGAGACAA -/C CCCCCAAAAC 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 C 5 6 374800 CASAVA_Build 17 34999348 4I TCCAGCTCAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 18 9 8 1 AAAT 2 3 374801 CASAVA_Build 17 35020549 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 962 het 962 ref 25 12 3 10 A 15 16 374802 CASAVA_Build 17 35084824 4D ACAGCACCAC CCCA/---- CCCGGGCCCA 1647 het 1647 ref 22 6 6 11 CCCA 1 0 374803 CASAVA_Build 17 35150421 1I GAGCCTCAGG -/C CCCACATCCT 3070 hom 68 het 26 0 19 7 C 3 4 374804 CASAVA_Build 17 35183726 1D CGTGTGTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 11 10 374805 CASAVA_Build 17 35228741 5I TGATCATATC -----/TTCTA TTCTCTATCA 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 TTCTA 0 1 374806 CASAVA_Build 17 35258456 4D GTAGGTAAAG ATTT/---- ATTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 36 18 15 6 ATTT 2 1 374807 CASAVA_Build 17 35273585 1I GATTATTCCA -/C CCCCAGATTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 C 4 5 374808 CASAVA_Build 17 35289293 3D CCTTTCACAG AGA/--- AGAAGTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 14 6 AGA 2 1 374809 CASAVA_Build 17 35293088 4D GTACTCTGTT AACA/---- ATGTCCAGAA 3070 het 3070 ref 36 16 13 9 AACA 1 0 374810 CASAVA_Build 17 35293867 1I CCGTCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 A 13 14 374811 CASAVA_Build 17 35309448 2I CTCAGTAAGA --/TT TTTTTTTTTT 2673 het 2673 ref 26 9 10 7 T 14 16 374812 CASAVA_Build 17 35311307 3D CTGGTTTTTC TTG/--- TTGTTGTTGT 1941 het 1941 ref 28 9 9 11 TTG 7 6 374813 CASAVA_Build 17 35316469 1I GTCCAGGCCA -/C CACCCCCACA 3070 het 3070 hom 23 9 12 2 C 1 2 374814 CASAVA_Build 17 35317507 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAATTAA 3070 het 2430 hom 15 5 9 1 A 7 6 374815 CASAVA_Build 17 35341558 1D CCTCCCGAGT G/- GGCTGGGATT 3070 hom 59 het 23 0 17 6 G 3 2 374816 CASAVA_Build 17 35347291 1D CAAGTCCCAA T/- GCATCCATGG 2371 het 1932 hom 21 8 6 7 T 1 0 374817 CASAVA_Build 17 35347917 1I TCTCAACAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 33 10 12 11 A 9 10 374818 CASAVA_Build 17 35373125 1I AATGAGGGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 387 hom 27 1 18 8 A 11 12 374819 CASAVA_Build 17 35379749 3I GGATTAGGGA ---/CAC GTTTATATAT 3070 hom 72 het 32 0 25 7 CAC 0 1 374820 CASAVA_Build 17 35381708 1D TGGATGATAG A/- AAGTAGTGTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 A 3 2 374821 CASAVA_Build 17 35382111 1I CTCAACTTTA -/G GAAAGACAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 G 1 2 374822 CASAVA_Build 17 35382565 1D11M9I GCAGTGGAAA GGGGGGAGTCTT---------/-GGGGGAGTCTTTGGACAAGA TGCCCAGGTG 3070 hom 143 het 48 0 44 12 N/A 0 0 374823 CASAVA_Build 17 35383344 2D CCTGGCCTAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 18 0 15 4 A 16 14 374824 CASAVA_Build 17 35386056 1D TGTAAGCAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 538 hom 25 3 15 7 T 19 18 374825 CASAVA_Build 17 35387441 1I CAAAACTGAG -/A AAAAAAAGAA 3070 het 88 hom 29 1 24 4 A 7 8 374826 CASAVA_Build 17 35391625 1D TGTAATACTC A/- ACCTTTGGCC 3070 hom 99 het 36 0 34 2 A 2 1 374827 CASAVA_Build 17 35397006 1D TTCTACCACT C/- CCCCAGCTAG 3070 hom 117 het 44 0 40 4 C 5 4 374828 CASAVA_Build 17 35397895 1D ACAAATAAAT A/- AAGTATACTA 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 3 2 374829 CASAVA_Build 17 35402559 3I TCAGGCGGCC ---/CTG GTTCCTGTCT 3070 hom 96 het 33 0 31 2 CTG 0 1 374830 CASAVA_Build 17 35407241 2I TGGAAGGGCT --/GA GAGCTGCTCT 3070 hom 74 het 29 0 23 6 GA 1 2 374831 CASAVA_Build 17 35419939 1I TCCAAGGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 172 hom 40 1 31 8 T 10 11 374832 CASAVA_Build 17 35422588 1I CCCTCTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 566 hom 34 2 20 12 A 13 14 374833 CASAVA_Build 17 35426500 1I CATGCTGTCA -/G CCCCCAGCAT 3070 hom 48 het 21 0 16 5 G 0 1 374834 CASAVA_Build 17 35431471 1I GGGTAAGGGA -/G GGGGCAGGAG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 G 4 5 374835 CASAVA_Build 17 35437032 1I CAGCCCGGGT -/G GGGCACCTGG 3070 hom 60 het 24 0 19 5 G 3 4 374836 CASAVA_Build 17 35440444 1I TTTATTTATT -/A TATTTTTTTT 3070 hom 44 het 17 0 15 2 A 0 1 374837 CASAVA_Build 17 35468083 3I24M7I TCCCAGCACA ---AAGAGAAGTGCTGTGATCCTGAGG-------/GAGAAGAGAAGTGCTGTGATCCTGAGGCCCAGAC CCGACAGTGG 3070 hom 93 het 28 0 25 8 N/A 0 0 374838 CASAVA_Build 17 35468726 2D ACAAACAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 A 12 10 374839 CASAVA_Build 17 35508789 1I TTTTGGTGAT -/G GGGGGAGGGG 858 het 511 hom 17 1 5 11 G 5 6 374840 CASAVA_Build 17 35512656 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 13 12 374841 CASAVA_Build 17 35556212 1D GTACGATTTC T/- TTTTTTTTTT 925 het 925 ref 30 16 4 10 T 17 16 374842 CASAVA_Build 17 35577031 1D AGCCACCACG C/- CCGGCCAAGA 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 C 3 2 374843 CASAVA_Build 17 35578293 1D TGAGAGAACA T/- TTTCAGTGCC 3070 hom 111 het 44 0 38 7 T 4 3 374844 CASAVA_Build 17 35598800 2D TGAGTGGCTC AG/-- GGGGACATAT 2687 het 2687 ref 21 13 6 2 AG 1 0 374845 CASAVA_Build 17 35611429 1D TATAATCCCA G/- GACTTTGGGA 3070 het 1242 hom 18 5 12 1 G 2 1 374846 CASAVA_Build 17 35617533 6D GCTCACTGCA GCCTCT/------ GCCTCTGCAT 2540 het 2540 ref 14 6 6 3 GCCTCT 2 1 374847 CASAVA_Build 17 35622748 1I TACTAAAAAC -/A AAAAAAAAAA 2240 het 2240 ref 28 15 7 6 A 10 11 374848 CASAVA_Build 17 35633312 1I TGTTTTTAGG -/A AAAAAAAAAA 2306 het 2306 ref 27 13 9 5 A 10 11 374849 CASAVA_Build 17 35635041 4I TCTTTTCTCA ----/CTCT CAAGCCATTG 2506 het 1245 hom 25 8 7 10 CT 0 2 374850 CASAVA_Build 17 35641717 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 1408 hom 28 9 13 6 C 0 1 374851 CASAVA_Build 17 35647848 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 2192 het 1186 hom 14 4 5 7 A 11 10 374852 CASAVA_Build 17 35655027 3D TTCTTACACT AGA/--- ATGTAAGCTC 3070 het 3070 ref 35 19 11 7 AGA 1 0 374853 CASAVA_Build 17 35685348 1D ACACTCTAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 9 7 T 12 11 374854 CASAVA_Build 17 35694887 2I ATAAAAAGTC --/TT TTTTTTTTTT 1558 het 775 hom 18 5 7 6 T 14 16 374855 CASAVA_Build 17 35738916 1D CTCATTGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 14 13 11 T 13 12 374856 CASAVA_Build 17 35805764 1D GTATTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 24 het 13 0 9 4 T 12 11 374857 CASAVA_Build 17 35809110 8I TCAAATCATA --------/TATGAGGC TATGATCAAA 3070 hom 105 het 36 0 36 1 TATGAGGC 0 1 374858 CASAVA_Build 17 35862958 2I ATGTGCATAG --/AC ACACACACAC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 AC 7 8 374859 CASAVA_Build 17 35884857 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 T 13 12 374860 CASAVA_Build 17 35901110 1D CATTGCTTGT A/- TTAGCTCCTT 3070 het 3070 hom 59 25 30 4 A 1 0 374861 CASAVA_Build 17 35912222 3I GTCTGGGAGC ---/GCT GGTCTGAAGT 3070 hom 75 het 29 0 25 5 GCT 0 1 374862 CASAVA_Build 17 35998646 3I CTCCATGAGG ---/AAA GTTCTTAGCT 3070 het 2490 hom 22 7 11 4 A 0 3 374863 CASAVA_Build 17 36001474 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 1387 hom 7 het 3 0 3 1 T 5 6 374864 CASAVA_Build 17 36012141 1D CTATCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 442 hom 26 3 13 10 A 15 14 374865 CASAVA_Build 17 36024168 1I TTTCTTTAAT -/A ACCCATCATG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 1 2 374866 CASAVA_Build 17 36025274 1I TGCTGTGTAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 612 hom 30 2 21 7 T 14 15 374867 CASAVA_Build 17 36026384 4D CAGTCTTCAC TTTG/---- TTTGGCAGAG 3070 hom 101 het 40 0 32 9 TTTG 2 1 374868 CASAVA_Build 17 36028379 2I CAACAGAGAC --/TG TCTCAAAAAA 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TG 0 1 374869 CASAVA_Build 17 36035359 2I GCCTGTTCAC --/AT GAGAAACCAA 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AT 0 1 374870 CASAVA_Build 17 36035700 3I GAATTTAAAA ---/CTG CTGTTAGAAA 3070 hom 87 het 35 0 28 7 CTG 1 2 374871 CASAVA_Build 17 36037497 2D CTTTTTTTCA TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 80 het 33 0 29 4 T 11 9 374872 CASAVA_Build 17 36054124 1D TAAGGGAACT A/- AAAAAAAAAA 1637 het 1637 ref 22 14 4 4 A 13 12 374873 CASAVA_Build 17 36060589 1D GGCCCTTTCT A/- AAAAAAAAAA 2724 het 36 hom 21 1 13 7 A 15 14 374874 CASAVA_Build 17 36064805 4I TCTGGTTGAA ----/ATAT ATATATATAT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 AT 5 7 374875 CASAVA_Build 17 36067355 1I ATATTGCTTG -/T TTTTTTTTCG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 8 9 374876 CASAVA_Build 17 36070536 1I ATTCTTACTG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 32 hom 28 2 23 3 A 9 10 374877 CASAVA_Build 17 36080874 1D GCTAACTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 894 hom 46 2 32 12 T 13 12 374878 CASAVA_Build 17 36083006 1I75M1I CAATTCATGA -TTTTTTTCTAGCTTAGCAGACTATAGGCATCTTCCAAAACTATTCAGAATTTTCTCCATTCCTTTTTTATCTGGA-/TTTTTTTTCTAGCTTAGCAGACTATAGGCATCTTCCAAAACTATTCAGAATTTTCTCCATTCCTTTTTTATCTGGAG GTGCGTTAAG 3070 hom 164 het 47 1 69 8 N/A 0 0 374879 CASAVA_Build 17 36086127 1I CAGAATAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 117 het 46 0 38 8 A 10 11 374880 CASAVA_Build 17 36093671 1I TATCTGAGAT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 G 0 1 374881 CASAVA_Build 17 36094668 2D GAGATGAAAT AA/-- AGAGTCATTT 3070 het 3070 ref 59 30 25 7 A 3 1 374882 CASAVA_Build 17 36095246 1D GCCACTTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 49 22 21 6 T 10 9 374883 CASAVA_Build 17 36098046 16D TCACATAGTG TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 3070 het 1422 hom 25 10 10 7 T 30 14 374884 CASAVA_Build 17 36100734 2I AGGTAATTTT --/TG TGTGTTTTTA 1881 het 1881 ref 18 7 5 6 TG 2 3 374885 CASAVA_Build 17 36108654 1D GCCCAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1011 het 1011 ref 21 8 4 9 T 19 18 374886 CASAVA_Build 17 36111661 1D CCAATCTGGC A/- TTGTCAATGT 2864 het 2864 ref 24 13 7 5 A 1 0 374887 CASAVA_Build 17 36126910 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2033 hom 23 5 10 8 A 10 11 374888 CASAVA_Build 17 36133133 1D CCTTCTTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 232 hom 34 1 26 7 T 13 12 374889 CASAVA_Build 17 36134539 1D ATCTCTTTCC T/- TTATAAATTA 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 3 2 374890 CASAVA_Build 17 36198595 1D CATAAATCTT G/- GGTTTTTGTT 3070 hom 135 het 53 0 45 8 G 3 2 374891 CASAVA_Build 17 36213166 1I TCTTTTTGTC -/T TTTTTTTTAA 3070 hom 98 het 38 0 34 4 T 8 9 374892 CASAVA_Build 17 36214559 1D TAAAATAAAG T/- TTTTTTCTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 7 6 374893 CASAVA_Build 17 36217639 1D GTTTTTTTTT G/- TGTGTGTGCA 3070 hom 102 het 38 0 35 3 G 1 0 374894 CASAVA_Build 17 36220929 1D TTAATTTTCA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 43 20 15 8 T 9 8 374895 CASAVA_Build 17 36222524 1D AAAGAGAGAG A/- AAAAAAAGAA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 A 8 7 374896 CASAVA_Build 17 36234992 3D GAGATGCCAC ATA/--- ATAATTCTAC 3070 hom 123 het 45 0 42 3 ATA 2 1 374897 CASAVA_Build 17 36246053 2I ATTGGTTTTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 hom 71 het 36 0 23 13 TG 6 7 374898 CASAVA_Build 17 36247475 3I TTCAAATGAA ---/TGT TGAGCCATTT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TGT 0 1 374899 CASAVA_Build 17 36248924 2I GGTTGAAATA --/TC TCTCTGCACT 3070 hom 105 het 41 0 34 7 TC 2 3 374900 CASAVA_Build 17 36253805 4I CACACACACA ----/CACT CACACACACA 3070 hom 61 het 37 0 25 12 CACT 0 1 374901 CASAVA_Build 17 36266904 1I CGCCCAGCCA -/G GGTTAGTTTA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 G 2 3 374902 CASAVA_Build 17 36269285 1I ACCCGACTAA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 31 het 13 0 11 2 T 9 10 374903 CASAVA_Build 17 36270681 10D CTTGACTGCA TGAATGATGG/---------- TGCTAGAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 3 TGAATGATGG 1 0 374904 CASAVA_Build 17 36273833 1D ACATTAAAAC T/- TTTTTAACCT 3070 het 2969 hom 23 7 16 0 T 6 5 374905 CASAVA_Build 17 36274542 1I GGTCTGGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 83 het 37 0 26 11 A 10 11 374906 CASAVA_Build 17 36277336 1I CTGAATGGAT -/A ACGTTAAATA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 2 374907 CASAVA_Build 17 36282289 1D CTTCAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 24 17 7 T 12 11 374908 CASAVA_Build 17 36291658 3I TCTTTCTTCC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 9 15 8 T 11 14 374909 CASAVA_Build 17 36312353 6I GGGGCTGATT ------/AGAACC ACAGATCTCA 3070 het 3070 hom 36 17 14 5 AGAACC 0 1 374910 CASAVA_Build 17 36315654 1I GCGCCTCCCA -/C CCCCCCGTGT 3070 het 3070 ref 33 13 13 7 C 6 7 374911 CASAVA_Build 17 36318305 1D TTAATGCTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 45 19 20 7 T 10 9 374912 CASAVA_Build 17 36318546 1D GTTAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 13 14 8 A 11 10 374913 CASAVA_Build 17 36319168 3I ACTTGTATGG ---/GTA TTGATCTTTG 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 GTA 0 1 374914 CASAVA_Build 17 36319308 2D GGGTGAAACT GG/-- TTTGTGAGTC 3070 het 3070 hom 33 13 18 3 G 2 0 374915 CASAVA_Build 17 36319498 1I TGAATTACCT -/G GGGGGAAAAG 3070 het 3070 ref 51 24 22 5 G 5 6 374916 CASAVA_Build 17 36319741 1I CGGGATGGAC -/T TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 39 10 3 26 T 11 12 374917 CASAVA_Build 17 36325666 2I AGGAACTAAA --/AG AGAGAGTCAA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 AG 3 4 374918 CASAVA_Build 17 36325881 7D TGCTTTTCTC TTGAAAG/------- TTTTGATGTC 3070 het 3070 hom 50 17 29 6 TTGAAAG 1 0 374919 CASAVA_Build 17 36334774 2D CATATGCATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2281 hom 28 11 11 6 T 13 11 374920 CASAVA_Build 17 36337403 1I TGCTTATGAC -/A CATGCTAAGC 3070 het 3070 hom 49 22 23 4 A 0 1 374921 CASAVA_Build 17 36354542 1I AAAAGGCCTG -/T TGCAGTGATT 3070 het 3070 hom 54 23 22 9 T 1 2 374922 CASAVA_Build 17 36355015 3D ACTCAAATAT TGC/--- TGCTTCTTCT 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 TGC 2 1 374923 CASAVA_Build 17 36357776 1I TATATTGGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 60 29 23 8 A 11 12 374924 CASAVA_Build 17 36357869 4D TGGCTGTGGC ACTA/---- ACTATCTGTG 3070 het 3070 hom 65 28 31 6 ACTA 2 1 374925 CASAVA_Build 17 36358809 3D ACTCCGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 127 het 127 ref 9 2 2 5 A 17 14 374926 CASAVA_Build 17 36358835 1D AGGTGGAAGA G/- GGAAGTAGAA 3070 het 2107 hom 23 10 11 2 G 3 2 374927 CASAVA_Build 17 36363369 6D GATTCTTTTT TGTTTC/------ TGTTTTTTTT 40 het 40 ref 24 14 2 11 TGTTTC 1 0 374928 CASAVA_Build 17 36374549 5I TTGTTGTTGT -----/TAAAA TAAAAAATCC 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 TAAAA 1 2 374929 CASAVA_Build 17 36376658 1I CTTTAGTTTG -/T TTCCAGGTCT 3070 het 3070 ref 42 26 11 5 T 2 3 374930 CASAVA_Build 17 36377691 1I CTTTTCATCC -/T TTTTTTTTTT 2139 het 2139 ref 27 7 7 13 T 12 13 374931 CASAVA_Build 17 36379164 1I TTAAAATAAG -/A AAAAAATGCT 3070 het 3070 hom 53 19 28 6 A 6 7 374932 CASAVA_Build 17 36379506 1D TTCAATACTG T/- TTTTTCAATA 3070 het 3070 hom 52 22 25 5 T 6 5 374933 CASAVA_Build 17 36381956 1I TTTCATTACC -/A AAACCTTTTG 3070 het 3070 ref 39 18 16 5 A 3 4 374934 CASAVA_Build 17 36398825 3I TAATTTCCTC ---/ATT GTTTTCTATT 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 ATT 0 1 374935 CASAVA_Build 17 36400612 1I TCTTTTTGTG -/A CTGGCTTACT 3070 het 3070 ref 40 21 17 2 A 0 1 374936 CASAVA_Build 17 36401384 8D TTGTTTTTTG TATTTATT/-------- TATTTATTTA 969 het 969 ref 15 5 4 6 TATT 7 5 374937 CASAVA_Build 17 36401488 1I TGATTAGTGA -/T GTGATGCTGA 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 T 0 1 374938 CASAVA_Build 17 36401803 1D ATTTTCCTCT G/- ACATCCATTT 3070 het 3070 hom 29 8 17 4 G 1 0 374939 CASAVA_Build 17 36403159 1D CAGAGTTAAG A/- AACGCATTTA 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 A 3 2 374940 CASAVA_Build 17 36404659 2D ATTGCACTTC TA/-- TGTTACTTTA 3070 het 1965 hom 16 4 7 5 TA 1 0 374941 CASAVA_Build 17 36405302 2D CTTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTG 3070 het 59 hom 36 2 17 17 T 11 9 374942 CASAVA_Build 17 36405786 1I CACATGTGAT -/A AAAAAGGGTG 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 A 5 6 374943 CASAVA_Build 17 36405907 5I CATAGTCAAA -----/AGAAG AGAAGAAAAG 3070 het 3070 hom 31 14 15 2 AGAAG 1 2 374944 CASAVA_Build 17 36406046 4D CATATAAATT AACA/---- AACCTAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 AACA 1 0 374945 CASAVA_Build 17 36410305 1D ATTCTATGGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 44 14 22 8 T 10 9 374946 CASAVA_Build 17 36411538 4I TTTGGTGTCC ----/CAAA CAAAGAATTG 3070 het 3070 ref 41 23 13 5 CAAA 1 2 374947 CASAVA_Build 17 36412977 1D ATGTTTGCAT C/- CTTTTCTCTG 3070 het 3070 ref 43 21 16 6 C 2 1 374948 CASAVA_Build 17 36413222 4D ATTAAAAAGG TATT/---- TATTTATTTT 3070 het 3070 hom 26 11 13 4 TATT 3 2 374949 CASAVA_Build 17 36414991 1I42M1I AGTCGCTGTG -CCTGGCCTCAATAACAATTTGAAGGAAAAATGAAATATCTTG-/CCCTGGCCTCAATAACAATTTGAAGGAAAAATGAAATATCTTGT TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 23 23 9 11 N/A 0 0 374950 CASAVA_Build 17 36415325 6I AGAAAACAGA ------/GCTGCT GAAAACAACA 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 GCT 0 2 374951 CASAVA_Build 17 36418885 3I TTGAGTTGAG ---/AGA AGAAGTCTGT 3070 het 3070 ref 42 25 9 8 AGA 1 2 374952 CASAVA_Build 17 36440918 1D CATTCAGAAG A/- AATGAAATTA 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 A 3 2 374953 CASAVA_Build 17 36443646 1I ACACTCAATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 19 6 A 10 11 374954 CASAVA_Build 17 36476881 1I GTGTCTGAGA -/G GCTAGAGAAG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 G 1 2 374955 CASAVA_Build 17 36491661 1I CCAGTTACCC -/T TTTTTCTTTC 3070 het 2062 hom 28 7 15 6 T 5 6 374956 CASAVA_Build 17 36493229 1D TGTCAATGAA T/- AATCCATCAT 3070 het 3070 ref 28 15 11 2 T 1 0 374957 CASAVA_Build 17 36495376 1D TTCTGCTGAG A/- AAAAAAAAGC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 A 9 8 374958 CASAVA_Build 17 36501139 3I TCTATAAGTC ---/ATA ATAAGAGGAT 3070 het 3070 ref 30 16 12 2 ATA 1 2 374959 CASAVA_Build 17 36507862 1I GAGTTGACCA -/T TGGTGTCAGA 3070 het 3015 hom 22 10 10 2 T 1 2 374960 CASAVA_Build 17 36512832 1D CCAGTTACCC T/- TTTTTCTTTC 2112 het 2112 ref 52 42 6 4 T 6 5 374961 CASAVA_Build 17 36517394 3I GATAAATGCA ---/TAT CTGATTGCCT 3070 het 3070 ref 36 24 11 1 TAT 0 1 374962 CASAVA_Build 17 36524535 1D TTCCAGCACA C/- GTGCACTCCA 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 C 1 0 374963 CASAVA_Build 17 36534248 14D CATTGTTTGA TTGGATTTCATAAG/-------------- TTAATTCTTT 3070 het 3070 hom 38 20 20 3 TTGGATTTCATAAG 1 0 374964 CASAVA_Build 17 36535493 1D TAAAGTAAAA T/- TTAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 13 11 7 T 3 2 374965 CASAVA_Build 17 36535761 1D AAAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1842 het 1156 hom 20 8 5 7 A 17 16 374966 CASAVA_Build 17 36546097 4D TTGCCTCACA TAGT/---- TAGTTGCCTT 3070 het 3070 ref 32 16 10 7 TAGT 2 1 374967 CASAVA_Build 17 36553094 3D AAAGGGGGTC TTG/--- TTATGTGGAT 3070 het 3070 ref 40 25 12 4 TTG 1 0 374968 CASAVA_Build 17 36575712 1I GTTAGTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 36 het 16 0 13 4 T 9 10 374969 CASAVA_Build 17 36578683 2I ACACACACAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 38 10 17 11 AC 8 9 374970 CASAVA_Build 17 36581440 1D TTTTTAAGTG A/- AAAAATATAC 3070 hom 69 het 28 0 24 4 A 6 5 374971 CASAVA_Build 17 36589976 2I CAAATTAGTT --/AA CACCTCCACC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 A 0 2 374972 CASAVA_Build 17 36590358 6D TAACATTTCA GTGTGT/------ GTGTGTGTGT 3070 hom 116 het 52 0 39 16 GT 11 8 374973 CASAVA_Build 17 36591308 1D CATTTATGAC T/- TTTTTTTGAT 3070 het 331 hom 34 1 32 1 T 8 7 374974 CASAVA_Build 17 36594001 3D GAGGTCTGAA TGC/--- TGCTGGGAAG 3070 hom 163 het 56 0 55 4 TGC 2 1 374975 CASAVA_Build 17 36596046 1I ATTAATTTTT -/A AAAAAAAGAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 A 7 8 374976 CASAVA_Build 17 36604507 1D TGAAATGGGG A/- AAAAAATAGA 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 7 6 374977 CASAVA_Build 17 36605303 2I ACTCCATCTG --/GA AAAAAAAAAA 2564 het 1496 hom 19 6 8 5 GA 0 1 374978 CASAVA_Build 17 36608682 1I TGGAAGTAAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 12 11 7 T 9 10 374979 CASAVA_Build 17 36619882 2I GCAGAGATTA --/GG GTCTGCCAGC 3070 hom 93 het 36 0 31 5 G 1 3 374980 CASAVA_Build 17 36625943 2D TCGGGTGCCT AC/-- ACCACCACGG 3070 hom 117 het 42 0 37 5 AC 2 1 374981 CASAVA_Build 17 36635814 3D TTCTACCCAC CTG/--- CTTTGGTCTA 3070 het 3070 ref 45 25 17 3 CTG 1 0 374982 CASAVA_Build 17 36649020 1D TCAACATAGT A/- GAAATGACAT 3070 het 3070 ref 35 22 13 0 A 1 0 374983 CASAVA_Build 17 36656411 1D AGAAAAAAAC G/- TATTTAGTTG 3070 het 3070 ref 32 20 10 2 G 1 0 374984 CASAVA_Build 17 36657338 4D39M3D AGGAAGGAAA AAAGAAAGAAAGAAAGATAAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAAAG/----AAAGAAAGAAAGATAAAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGA--- AAAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 20 29 9 8 N/A 0 0 374985 CASAVA_Build 17 36661934 1D TACAGCTAGG A/- AAAAAAGTAT 3070 het 3070 ref 34 20 11 4 A 7 6 374986 CASAVA_Build 17 36662798 1D TAAAGGAACC A/- AAAAAAAACA 1831 het 1831 ref 38 13 7 19 A 9 8 374987 CASAVA_Build 17 36670586 2I CACAAAATTT --/AA AAAAAAAAAC 2077 het 2077 ref 20 12 5 3 A 9 11 374988 CASAVA_Build 17 36678885 2D AAAGAAAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 48 het 18 0 17 2 AG 6 5 374989 CASAVA_Build 17 36682394 13I AATCTCCTGT -------------/ATTTGCAGGTAAC ATTTGCAGAT 2270 het 2270 ref 21 15 5 1 ATTTGCAGGTAAC 0 1 374990 CASAVA_Build 17 36686483 1I TCACATGGTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 43 13 23 7 T 9 10 374991 CASAVA_Build 17 36686835 3I ATATGGCTTC ---/CTT CTTCTTCTCC 3070 hom 108 het 43 0 37 6 CTT 2 3 374992 CASAVA_Build 17 36687204 2I TTTCACACTG --/TA TATATATATA 2499 het 2499 ref 21 12 6 3 TA 7 8 374993 CASAVA_Build 17 36687376 1D TTTTCTGGAC A/- AAAAAAGAAC 3070 het 3070 ref 28 15 9 4 A 7 6 374994 CASAVA_Build 17 36690425 2D ATGTGCTGCA AG/-- ACCACCTGCT 3070 het 3070 hom 32 11 13 8 AG 1 0 374995 CASAVA_Build 17 36692300 2D CCCAAAGTGG GA/-- GCTAGACTTT 3070 het 3070 ref 35 19 15 1 GA 1 0 374996 CASAVA_Build 17 36696979 2D TGACTGACTC TT/-- AATTCTGTTT 3070 het 3070 ref 35 17 17 2 T 2 0 374997 CASAVA_Build 17 36699789 7I TCTCTACTTA -------/AAAAAAT AAAAAATAAA 1947 het 1947 ref 18 9 5 4 AAAAAAT 2 3 374998 CASAVA_Build 17 36700791 4I CAAGAGCGAC ----/AGAG AGATTTTAAT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AG 1 3 374999 CASAVA_Build 17 36703135 2I AAAACACAGA --/CT CAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 37 10 22 5 CT 0 1 375000 CASAVA_Build 17 36706944 1I GTAGATGGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 10 8 A 10 11 375001 CASAVA_Build 17 36712100 13D TGGACTAGCT GTACAGATGGTTG/------------- GTAGGCAAGA 3070 het 3070 ref 57 30 23 10 GTACAGATGGTTG 1 0 375002 CASAVA_Build 17 36723883 2D ATCAACTGTC TT/-- TTGAGTTTTA 3070 het 3070 hom 39 13 21 6 T 4 2 375003 CASAVA_Build 17 36726379 2I CACTTTTTTT --/AA AAGAGTTCGA 3070 het 3070 hom 36 13 18 5 A 2 4 375004 CASAVA_Build 17 36731053 1D ACCTGGCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 11 7 A 11 10 375005 CASAVA_Build 17 36731795 2I CCTAGTGTTT --/TA TGTTTCAAAA 3070 hom 69 het 28 0 23 5 TA 0 1 375006 CASAVA_Build 17 36741957 1I TGGACCCTGT -/G GGGTGCTGTC 3070 hom 99 het 39 0 32 7 G 3 4 375007 CASAVA_Build 17 36752323 2I CGTTCATAGA --/CT CTCTGCAGGG 3070 het 3070 ref 37 18 14 5 CT 2 3 375008 CASAVA_Build 17 36764014 1I ATGAGTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 A 11 12 375009 CASAVA_Build 17 36826191 1D GGATCTGGTT A/- AAAAGAGTTT 3070 het 3070 ref 31 15 15 2 A 5 4 375010 CASAVA_Build 17 36826653 4D CATTTTCTTT TTTG/---- TTTGTTTATT 3070 het 3070 hom 27 10 15 2 TTTG 2 1 375011 CASAVA_Build 17 36836509 1D TAAACTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 42 10 24 8 A 13 12 375012 CASAVA_Build 17 36837381 1D CCACAGTTTC T/- TTTTTTTTTT 1927 het 1735 hom 24 10 6 8 T 15 14 375013 CASAVA_Build 17 36839957 1D GAAGGCTTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 191 hom 20 1 13 6 A 14 13 375014 CASAVA_Build 17 36840045 1I ATTTTAAGTA -/T TTTTTAAATT 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 5 6 375015 CASAVA_Build 17 36841072 1D ACTCAACTGT A/- AAAAATAATT 3070 het 3070 ref 30 14 13 3 A 6 5 375016 CASAVA_Build 17 36841249 1D GGCTACTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 82 het 46 0 30 16 A 13 12 375017 CASAVA_Build 17 36842171 2D TTACAAATGC TT/-- TTTTTTTTTT 2268 het 1640 hom 27 8 9 10 T 18 16 375018 CASAVA_Build 17 36843266 24I TTTGAAAGGT ------------------------/TCTGAAGGTCAAGTCTATCCCTGA GATTTTATAT 3070 hom 78 het 34 0 28 8 TCTGAAGGTCAAGTCTATCCCTGA 0 1 375019 CASAVA_Build 17 36846894 1D GTGCAATTTT A/- AATCATGCCG 3070 het 3070 hom 45 20 21 4 A 3 2 375020 CASAVA_Build 17 36848461 1D TGGTTCTATA C/- CCCCCCCACT 3070 het 3070 ref 37 15 10 12 C 8 7 375021 CASAVA_Build 17 36854730 1I TTGTGAGTTA -/G TAAGAGTTAG 3070 het 3070 ref 40 18 18 4 G 0 1 375022 CASAVA_Build 17 36857345 1D TAATTTTTGT A/- TTTTCAGTAG 3070 het 2873 hom 20 10 10 0 A 1 0 375023 CASAVA_Build 17 36859440 1I ATTATCTGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3008 hom 36 11 13 12 A 14 15 375024 CASAVA_Build 17 36860720 1I38M4D TTGTCTAAAC -GTGGCAGATAAGCATCCAAGCCAGTGGCCTGTCTTTCAGCAT/AGTGGCAGATAAGCATCCAAGCCAGTGGCCTGTCTTTCA---- GCATGCCTCT 3070 het 3070 ref 37 33 10 10 N/A 0 0 375025 CASAVA_Build 17 36868372 1D GCAAGACCCC T/- TGAGGCCTTC 3070 het 2468 hom 29 7 18 4 T 2 1 375026 CASAVA_Build 17 36868507 1I AAGCCTTTCA -/G GATCCTCTCA 3070 het 3070 ref 51 31 19 1 G 1 2 375027 CASAVA_Build 17 36878188 1D TGTGGCAGAT G/- GGGAAGGCTC 3070 het 3070 hom 39 11 21 9 G 4 3 375028 CASAVA_Build 17 36881513 1D AAATATATTT C/- TTAGGTAATA 3070 het 3070 ref 34 17 13 4 C 1 0 375029 CASAVA_Build 17 36882711 1I8M10D AAAAAAAAAA -AAAAAAGAAAGAAAAAAG/GAAAAAAGA---------- AAAAAAAAAC 2873 het 1910 hom 23 8 10 8 N/A 0 0 375030 CASAVA_Build 17 36884167 2I GCAAACAGAG --/AA AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 31 16 13 2 A 8 10 375031 CASAVA_Build 17 36885208 1D GATAGAAAAG A/- AAAAAAGTGG 3070 het 3070 hom 32 8 20 4 A 7 6 375032 CASAVA_Build 17 36890208 1D GGGTCGCTTA C/- CCAGCCTGAA 3070 het 3070 hom 48 14 22 12 C 3 2 375033 CASAVA_Build 17 36892172 1I GCCTTCCCCC -/T GAAGTCTGGC 3070 hom 105 het 42 0 29 13 T 0 1 375034 CASAVA_Build 17 36892534 1I TTCCTACTTC -/T TTTTTTTTTT 1737 het 1076 hom 26 4 6 16 T 16 17 375035 CASAVA_Build 17 36892709 4I TTTTTCTTTT ----/TTTC TTTTTTTTTT 2011 hom 15 het 7 0 6 1 TTTC 0 1 375036 CASAVA_Build 17 36916869 1D AGGATCCTGA G/- ATGTGGCTGA 3070 hom 105 het 38 0 36 2 G 1 0 375037 CASAVA_Build 17 36918216 2D TTGTAATTCC CT/-- GAGTAATAAG 3070 hom 154 het 58 0 52 6 CT 1 0 375038 CASAVA_Build 17 36941317 3I AAGGTTTATC ---/ACA ACACCTGGCA 3070 het 3070 hom 30 13 13 4 ACA 1 2 375039 CASAVA_Build 17 36943594 1I AATGTCATCA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 358 hom 51 1 44 6 T 8 9 375040 CASAVA_Build 17 36950947 7I GACAGCAGGT -------/GCAGGAA TTCCTGAGGC 3070 het 3070 hom 39 16 18 5 GCAGGAA 0 1 375041 CASAVA_Build 17 36953869 2D CCCAAATATA TT/-- TATATATATA 2359 het 2027 hom 13 6 6 1 T 3 1 375042 CASAVA_Build 17 36971712 1D CACAAAGTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 481 hom 36 2 29 5 T 12 11 375043 CASAVA_Build 17 36972564 1D CTCTGCCCAA C/- CTTGTTCCTG 3070 hom 69 het 25 0 23 2 C 2 1 375044 CASAVA_Build 17 37001099 1D TCTGTCTCCC A/- AAAAAAAAAA 2997 het 2997 ref 25 10 8 8 A 13 12 375045 CASAVA_Build 17 37002272 2I GTTGTCCCCC --/CG CCCAAAACCA 3070 het 3070 hom 34 13 18 3 CG 0 1 375046 CASAVA_Build 17 37007994 3I TGGTGATGAT ---/GTG GTGGTGGTGG 1331 het 586 hom 28 4 5 19 GTG 3 4 375047 CASAVA_Build 17 37015792 1I CCATTGAAAC -/A GCTTATTCTC 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 A 0 1 375048 CASAVA_Build 17 37016493 1I AAAGTTAAAG -/A AATTTCTCAG 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 2 3 375049 CASAVA_Build 17 37018480 2I GACTCCGTCT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 946 hom 24 2 11 11 A 12 14 375050 CASAVA_Build 17 37041636 2D ACCCCCTCCC CA/-- AGACCCCACT 3070 hom 78 het 30 0 25 5 CA 1 0 375051 CASAVA_Build 17 37059690 4I TCACAGGCTG ----/ACAC ACACACACTC 3070 het 3070 ref 78 40 27 11 AC 4 6 375052 CASAVA_Build 17 37074867 1D CTTCACTTTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 22 9 11 3 T 10 9 375053 CASAVA_Build 17 37102327 3D ACACAATAAG ATT/--- ATAATACTGT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 ATT 1 0 375054 CASAVA_Build 17 37107984 1D ATCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 7 het 22 1 18 3 A 14 13 375055 CASAVA_Build 17 37115969 1D CCATGCCTAT A/- AATCCCAGGG 3070 het 3070 hom 32 11 15 6 A 3 2 375056 CASAVA_Build 17 37119325 4D TTTGTTTGTC TGTT/---- TGTTTGAGAC 3070 het 3070 hom 39 11 20 10 TGTT 2 1 375057 CASAVA_Build 17 37127267 1D TCTTTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 192 hom 20 2 14 4 A 12 11 375058 CASAVA_Build 17 37129471 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 140 hom 21 1 17 5 A 12 11 375059 CASAVA_Build 17 37133256 3D GCCAGGCAGC AGA/--- AGGAGGGGCC 3070 hom 69 het 25 0 20 6 AGA 1 0 375060 CASAVA_Build 17 37138725 4D GGTTTGTTGG TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 93 het 39 0 30 9 TTTA 4 3 375061 CASAVA_Build 17 37140694 1D GAGACCCACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 320 hom 37 3 15 19 T 13 12 375062 CASAVA_Build 17 37156523 1D CTTGCCTCCA G/- TTCCCAGACT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 G 1 0 375063 CASAVA_Build 17 37159085 4D GGCATAGATG TTAT/---- TTATTTATTT 3070 hom 63 het 29 0 22 7 TTAT 5 4 375064 CASAVA_Build 17 37160327 1I CAAAGTGCTT -/G GATTACAGGT 3070 hom 48 het 19 0 15 4 G 1 2 375065 CASAVA_Build 17 37165786 1I GTGGGCCTGA -/C CCCCTCCCCA 3070 hom 59 het 23 0 15 8 C 4 5 375066 CASAVA_Build 17 37178183 2I ATCTCAAAAC --/AA AAAAAAAAAT 3070 hom 33 het 14 0 12 2 A 9 11 375067 CASAVA_Build 17 37179686 1I ATCAAGGGAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 14 14 8 T 15 16 375068 CASAVA_Build 17 37188338 2I ACCCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 1382 het 1382 ref 20 8 3 9 A 12 14 375069 CASAVA_Build 17 37189611 1D GCTTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1597 het 445 hom 14 1 4 10 T 17 16 375070 CASAVA_Build 17 37196346 2D AACGATACCT GC/-- GCCCCCGATA 760 het 500 hom 6 3 3 0 GC 2 1 375071 CASAVA_Build 17 37199199 8D AGAATAAACC GTGTGTGT/-------- GTGTGTGTGT 3070 het 237 hom 38 5 16 20 GT 18 14 375072 CASAVA_Build 17 37201421 1D TAATTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 11 10 375073 CASAVA_Build 17 37206470 1I TTGTTCCCAA -/G GGGAGTTTCT 3070 hom 75 het 31 0 26 5 G 3 4 375074 CASAVA_Build 17 37207989 2I ACCATGTTGA --/CC CCAGGCTGGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 C 2 4 375075 CASAVA_Build 17 37226723 23D ACACCTGGCT ATAGGGAGGGGGGATTGTGTGCG/----------------------- TGTGTGCAGG 3070 het 3070 ref 44 24 19 6 ATAGGGAGGGGGGATTGTGTGCG 1 0 375076 CASAVA_Build 17 37227414 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 306 hom 27 1 21 5 T 11 12 375077 CASAVA_Build 17 37232794 3D CTAAAGAAGG CTC/--- CTTTCCCTAA 3070 hom 54 het 21 0 18 6 CTC 1 0 375078 CASAVA_Build 17 37235990 8D CTGGACTGAA TTTCTTTC/-------- TTTCTTTCTT 3070 hom 48 het 21 0 16 6 TTTC 6 4 375079 CASAVA_Build 17 37236778 1D ACTCTATCTC A/- AAAAAAAAAA 2258 het 59 hom 11 1 9 1 A 17 16 375080 CASAVA_Build 17 37243100 1D18M1I TCATGTACAA TTTTTTTTTTTTTTGAGAC-/-TTTTTTTTTTTTTGAGACA AAGTCTCACT 3070 het 325 hom 34 2 25 7 N/A 0 0 375081 CASAVA_Build 17 37245394 4I GGGAGGATAA ----/TATC GGCCCTAGGT 3070 hom 42 het 17 0 14 3 TATC 0 1 375082 CASAVA_Build 17 37249664 1I CTAATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2665 hom 27 het 15 0 10 5 T 11 12 375083 CASAVA_Build 17 37266498 1D AAGTCTCTTT A/- AAAAAAAGGC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 A 8 7 375084 CASAVA_Build 17 37272020 1D GCACCTGCCA C/- CCACGCCCTG 3070 hom 24 het 9 0 9 0 C 3 2 375085 CASAVA_Build 17 37275613 3D TCGTTATCCG TTT/--- TTTTTTTTGT 3070 hom 12 het 28 1 14 13 T 11 8 375086 CASAVA_Build 17 37310167 1I GAAAAAAAAG -/A AAAAAAAATT 1819 hom 15 het 7 0 6 1 A 8 9 375087 CASAVA_Build 17 37326320 1D GCCCATCTAA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 8 7 375088 CASAVA_Build 17 37351290 1D CGCCTGTAAT C/- CCCAGCATTT 3070 hom 38 het 18 0 13 5 C 4 3 375089 CASAVA_Build 17 37355681 1D ATACAGTCTC A/- AAAAAAAACC 3070 hom 63 het 23 0 21 2 A 9 8 375090 CASAVA_Build 17 37355974 2D CACCATTTTG TC/-- TCTTAATGTG 3070 het 3070 ref 52 29 17 6 TC 2 1 375091 CASAVA_Build 17 37358928 3I AGTCTGACTT ---/ATG ATGAACACAA 3070 hom 77 het 30 0 25 5 ATG 1 2 375092 CASAVA_Build 17 37382006 1I TTTTATTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 20 het 20 0 13 7 T 10 11 375093 CASAVA_Build 17 37405958 1D CCACCAGGAC T/- TGGCAGCTAC 3070 hom 67 het 27 0 22 5 T 2 1 375094 CASAVA_Build 17 37440172 1I AAAAAAAAAA -/G TACAAAATTA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 G 0 1 375095 CASAVA_Build 17 37445087 1D CCCACAGGGT G/- GGGGGGGTTG 2588 hom 36 het 14 0 8 7 G 8 7 375096 CASAVA_Build 17 37454486 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 22 0 17 5 A 14 12 375097 CASAVA_Build 17 37455716 3D TGGGAGCAGG AAC/--- AACTTGACAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 3 AAC 2 1 375098 CASAVA_Build 17 37504371 1D CCTGGCAGGG T/- TGGGTGTGAG 2721 het 1765 hom 18 7 10 1 T 2 1 375099 CASAVA_Build 17 37506526 1D GCTATGTTCA T/- TATCTTGATC 3070 het 3070 ref 35 19 14 2 T 2 1 375100 CASAVA_Build 17 37512912 2I CCCGACTATT --/TA AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 TA 0 1 375101 CASAVA_Build 17 37520987 1I TGCTCTAGTG -/C CCCCCCCCAG 658 het 316 hom 10 1 5 4 C 8 9 375102 CASAVA_Build 17 37530180 1D AAGACCAACC A/- AAAAAAACCC 3070 hom 93 het 35 0 30 5 A 8 7 375103 CASAVA_Build 17 37540513 3I CAAATTCTTT ---/TTC TTTTTTCTTA 3070 hom 12 het 25 0 16 9 TTC 0 1 375104 CASAVA_Build 17 37547709 2D ATAACCTCTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 53 het 27 0 16 12 A 15 13 375105 CASAVA_Build 17 37648733 1D AAAAATAAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 20 het 10 0 7 4 A 10 9 375106 CASAVA_Build 17 37755601 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2325 hom 24 7 12 6 A 13 12 375107 CASAVA_Build 17 37758079 2D GGCCATTAGA TC/-- TCTCTTACAA 3070 het 3070 hom 43 17 20 9 TC 3 2 375108 CASAVA_Build 17 37771923 4I TGTCTTCAAA ----/ATGT ATCTGGAAGT 3070 het 3070 ref 33 17 10 7 ATGT 0 1 375109 CASAVA_Build 17 37778401 4D TAAAAAATAA TAAT/---- AATAAAATAA 3070 het 1938 hom 24 5 18 3 TAAT 1 0 375110 CASAVA_Build 17 37782390 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 431 hom 28 2 24 3 A 12 11 375111 CASAVA_Build 17 37786125 1I GACGGGGGGG -/T GTCTCACTCT 1087 het 276 hom 8 1 6 2 T 0 1 375112 CASAVA_Build 17 37795135 1D GCTCAGCTAA C/- CCCTGACATA 3070 het 3070 hom 31 10 16 5 C 4 3 375113 CASAVA_Build 17 37802066 1D AGCTCTTGAA G/- GGCTACCAGG 3070 hom 51 het 21 0 17 4 G 3 2 375114 CASAVA_Build 17 37806728 3I CCATCATGGG ---/AGC AGCCCCACCC 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AGC 1 2 375115 CASAVA_Build 17 37807133 4D GAGAGAGAGG GAGA/---- GAGACAGAGG 3070 het 46 hom 20 2 16 3 GA 4 2 375116 CASAVA_Build 17 37814037 1I TGTTTTTTAG -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 80 het 31 0 26 5 T 7 8 375117 CASAVA_Build 17 37821921 2I AAGAAAGAAG --/AA AGAGAGAGAG 3070 hom 44 het 18 0 14 4 A 1 3 375118 CASAVA_Build 17 37829879 1D ACCAGCCTGG C/- CCAAGATGGT 1199 hom 7 het 5 0 3 2 C 3 2 375119 CASAVA_Build 17 37855572 1I AATGATCAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2127 hom 17 6 9 2 A 10 11 375120 CASAVA_Build 17 37858177 5D ATCAAAAGAT TAGTC/----- TGGTTTGGTG 3070 het 3070 ref 26 13 11 4 TAGTC 1 0 375121 CASAVA_Build 17 37872691 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 188 hom 28 1 16 11 A 13 12 375122 CASAVA_Build 17 37878099 1D AAACCCCGTC T/- TCTACTAAAA 2709 hom 18 het 7 0 7 0 T 2 1 375123 CASAVA_Build 17 37890397 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 25 0 15 11 T 15 14 375124 CASAVA_Build 17 37895038 3D AGAGTAGTAA ATG/--- ATAAGGATCC 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 ATG 1 0 375125 CASAVA_Build 17 37900917 1I TTAGAAATGA -/T TTTTTTTTTT 2192 het 2192 ref 42 25 7 10 T 14 15 375126 CASAVA_Build 17 37904644 1D GCTTTTGTGT A/- AAGAAATCAT 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 3 2 375127 CASAVA_Build 17 37912219 2D TGGGATCTGT GA/-- GACTTAACTC 3070 het 3070 hom 34 12 20 2 GA 2 1 375128 CASAVA_Build 17 37936804 1I GGGCTAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2835 hom 38 9 13 16 T 11 12 375129 CASAVA_Build 17 37951159 1I CAGCCTCCAT -/C CCCCCCAAAC 1573 hom 19 het 11 0 5 6 C 6 7 375130 CASAVA_Build 17 37951308 12D TGAGCTCCAG CAATCCCCTTGC/------------ CTTGGCCTCC 3070 het 2487 hom 22 6 11 6 CAATCCCCTTGC 1 0 375131 CASAVA_Build 17 37953002 1I AGGGACCGGG -/C CCCGGAGCTC 2261 hom 35 het 17 0 7 10 C 3 4 375132 CASAVA_Build 17 37955330 4D ATGTGTAAAG AAGA/---- AAGAGGGCTA 2295 het 2295 ref 21 16 5 1 AAGA 2 1 375133 CASAVA_Build 17 37961557 4D ATGTGTAAAG AAGA/---- AAGAGGGCTA 3070 het 2406 hom 29 6 20 6 AAGA 2 1 375134 CASAVA_Build 17 37962079 1I CCCCTACCTC -/T GGATGAGGGT 1480 het 1480 ref 29 22 4 3 T 0 1 375135 CASAVA_Build 17 37980257 34D CCCTCCCTCC CTCCTTCCCCCTCCCTTTCCCTCTCTCTTTCTCT/---------------------------------- CTCTTTCTCC 3070 het 56 hom 19 2 17 4 CTCCTTCCCCCTCCCTTTCCCTCTCTCTTTCTCT 1 0 375136 CASAVA_Build 17 37988514 1D CTCCCCTTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 T 10 9 375137 CASAVA_Build 17 38007861 1I ACTCCGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 12 13 375138 CASAVA_Build 17 38008126 1D AAGGCTGTCC A/- ATTTATGTTC 3070 het 3070 ref 27 13 12 3 A 2 1 375139 CASAVA_Build 17 38009557 1D GATGTGTAGA T/- TTTTTTTAAC 3070 hom 33 het 12 0 12 0 T 8 7 375140 CASAVA_Build 17 38010807 1D TTCTGATGGG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 296 hom 48 1 41 7 T 9 8 375141 CASAVA_Build 17 38017382 2D CCTGGGAGAA AG/-- AGAGAGACTC 3070 hom 57 het 22 0 18 4 AG 4 3 375142 CASAVA_Build 17 38021091 2D TTTCCACATC AG/-- AGTGTCTGAT 3070 hom 84 het 35 0 24 11 AG 2 1 375143 CASAVA_Build 17 38025413 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAACATTCCA 2622 hom 39 het 15 0 12 3 AG 1 0 375144 CASAVA_Build 17 38027927 1I ATTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 20 hom 24 1 18 5 A 13 14 375145 CASAVA_Build 17 38048300 1D9M1I CAGGCAGAAG CCCCCCTCAA-/-CCCCCTCAAC TTCCTGCCCC 1939 hom 36 het 13 0 13 1 N/A 0 0 375146 CASAVA_Build 17 38059326 1D TAAAAAAAAA G/- AGAGAGAGAG 3070 hom 53 het 19 0 17 2 G 1 0 375147 CASAVA_Build 17 38063231 1D ACTTAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 15 14 375148 CASAVA_Build 17 38070898 1D GCCTCAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 13 0 12 2 T 11 10 375149 CASAVA_Build 17 38080052 3D GGATTGAGGA AGG/--- AGGAGTCACA 3070 hom 61 het 24 0 18 8 AGG 2 1 375150 CASAVA_Build 17 38089346 1I CTGACTAACA -/T GTCGGTTTCC 2685 hom 36 het 13 0 10 3 T 0 1 375151 CASAVA_Build 17 38108061 1I AGTGCTGCCG -/T TGGGGCCTGG 3070 hom 117 het 46 0 38 8 T 1 2 375152 CASAVA_Build 17 38117190 1I ATTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2110 hom 25 het 11 0 8 3 A 15 16 375153 CASAVA_Build 17 38117435 9D GGTGGAGGGA GCAGCAGCT/--------- GCAGCAGCTG 2610 hom 76 het 39 0 14 25 GCAGCAGCT 2 1 375154 CASAVA_Build 17 38127224 1D CTAGGGTAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2621 hom 20 7 10 3 A 12 11 375155 CASAVA_Build 17 38128918 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2832 het 1179 hom 21 4 11 6 A 13 14 375156 CASAVA_Build 17 38132040 3I AATAATAATG ---/ATA ATAATTTATT 3070 hom 39 het 15 0 14 1 ATA 1 2 375157 CASAVA_Build 17 38144076 1I ATTTTTTTTA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 334 hom 16 1 12 3 T 9 10 375158 CASAVA_Build 17 38164799 1I CATATTGTCC -/T TTTTTTTTTT 1675 het 1623 hom 24 8 7 9 T 15 16 375159 CASAVA_Build 17 38229838 1I AAAACTTCCG -/C CCGAGACCGG 3070 hom 42 het 17 0 14 3 C 2 3 375160 CASAVA_Build 17 38294669 1D GCCTCGGCCT C/- CCCAAAGTGC 3070 hom 36 het 14 0 12 2 C 4 3 375161 CASAVA_Build 17 38318514 8D ATTTTTATAT TTTTAGAA/-------- TTTTAGAAGA 3070 het 1205 hom 16 4 9 5 TTTTAGAA 2 1 375162 CASAVA_Build 17 38325345 5D CAAACAAAAA AAAAC/----- AAACAGGAAT 3070 het 3070 hom 29 12 16 4 AAAAC 1 0 375163 CASAVA_Build 17 38330431 1I CCTCAGTTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 11 12 375164 CASAVA_Build 17 38331654 1I TCTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2158 het 2126 hom 23 7 8 8 T 13 14 375165 CASAVA_Build 17 38333112 2D AATTTCTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 2384 het 2384 ref 34 15 9 10 T 18 16 375166 CASAVA_Build 17 38335682 1D CTCAAAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 33 het 12 0 12 0 A 13 12 375167 CASAVA_Build 17 38338279 1D GCTGAGATCG T/- TGCCACTGCA 3070 hom 33 het 13 0 11 2 T 2 1 375168 CASAVA_Build 17 38351221 4D ACAAGCAGAC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 23 0 15 11 A 18 14 375169 CASAVA_Build 17 38352203 1I CCACAGCGCC -/T GGCCCTGAAT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 0 1 375170 CASAVA_Build 17 38366658 1D TAGAGAACCC A/- AACTACGTCT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 A 3 2 375171 CASAVA_Build 17 38369818 6D CCCCGACCCC AGCCCT/------ AGCCCTAGCC 3070 hom 81 het 30 0 26 7 AGCCCT 3 2 375172 CASAVA_Build 17 38374737 1D ATCCTGGGGG C/- GGGGGGGAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 C 1 0 375173 CASAVA_Build 17 38376313 4D TGGGAGGCTG AGAC/---- AGACAGATCA 3070 hom 48 het 17 0 17 1 AGAC 2 1 375174 CASAVA_Build 17 38383957 2D TCTCACACAA AC/-- ACACACACAA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 AC 5 4 375175 CASAVA_Build 17 38384254 1I ACTTTAAGTT -/A AAAAAATAAG 3070 hom 30 het 17 0 10 7 A 6 7 375176 CASAVA_Build 17 38390324 1D GAACAAAAAC A/- AAAGACTTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 7 A 4 3 375177 CASAVA_Build 17 38391705 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 71 het 32 0 24 8 T 10 11 375178 CASAVA_Build 17 38400507 1D AGCCGTCTAA G/- GTGCTCTCCA 3070 hom 123 het 43 0 42 1 G 2 1 375179 CASAVA_Build 17 38400659 2D TTGGAGAGAC TG/-- TTAAAATATA 3070 hom 102 het 37 0 33 4 TG 1 0 375180 CASAVA_Build 17 38402488 4I CATCTCTACC ----/AAAA AAAAAAAAGT 3070 hom 30 het 15 0 10 5 A 8 12 375181 CASAVA_Build 17 38403991 1D CCTTTTTGCT G/- GTAGGGCCGG 3070 hom 65 het 24 0 18 7 G 2 1 375182 CASAVA_Build 17 38407008 6I ATCTCTACTA ------/AAAAAT AAAAAAATTA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 AAAAAT 0 1 375183 CASAVA_Build 17 38483304 1I TGAGATGGAG -/T TTTGCTCTTG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 T 3 4 375184 CASAVA_Build 17 38571029 1I ATATAAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 19 0 16 3 T 10 11 375185 CASAVA_Build 17 38581211 2I TGTTCATTGC --/TG TGTCTCCCAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TG 1 2 375186 CASAVA_Build 17 38582843 1D ATATTTTTCG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 313 hom 21 2 11 8 T 12 11 375187 CASAVA_Build 17 38587075 2I GCCGGGCGTG --/GT GGCGGGTGCC 1880 hom 12 het 6 0 5 1 GT 0 1 375188 CASAVA_Build 17 38734888 2I TCTCAAAAAA --/AT AAAATAAAAT 3070 het 3070 hom 28 14 13 1 AT 0 1 375189 CASAVA_Build 17 38735066 1D AAGTTTTTAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 69 32 30 7 T 10 9 375190 CASAVA_Build 17 38738086 1D TGGCGAGACC T/- CCTTAAAAAT 2189 het 2189 ref 39 29 6 4 T 1 0 375191 CASAVA_Build 17 38738146 1D CCAGCTACCC A/- AGGAGGCTGA 3070 het 3070 ref 34 19 13 2 A 2 1 375192 CASAVA_Build 17 38742932 1D AACCTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 2810 het 52 hom 38 1 12 25 T 19 18 375193 CASAVA_Build 17 38755192 8D9M1D ATGAGACCGC CGTCTCTACTAAAAATAG/--------CTAAAAATA- GAAAAATTTG 2500 het 2500 ref 27 23 6 1 N/A 0 0 375194 CASAVA_Build 17 38819056 40D43M1D AGCCATCCTC CCACCTGGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCCGGACTGAAGATATCCTTTAGAGAAAGAAGCAGC/----------------------------------------CCACTGTGCCCGGCCTGAAGACAGCCTTTAGAGAAAGAAGCAG- GGGTAGTTTT 3070 het 3070 ref 58 58 27 5 N/A 0 0 375195 CASAVA_Build 17 38822118 3D11M19D CGACGGATAG GGCGTAATGAGCACGACACACGCAATCAGAGAG/---GTGATGAGCAC------------------- GACGCAGTTA 1468 het 1468 ref 48 46 9 9 N/A 0 0 375196 CASAVA_Build 17 38879558 1I AAAATTTCGT -/G GTTTTTAGTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 G 1 2 375197 CASAVA_Build 17 38884415 1I CTCGGCTCGC -/T ACAACCTCCA 3070 hom 39 het 16 0 13 3 T 0 1 375198 CASAVA_Build 17 38897695 1I ACGTCAGCTG -/T TTTGTAAATA 3070 hom 117 het 49 0 39 10 T 3 4 375199 CASAVA_Build 17 38905184 4D CTTTTTTAAT TTAA/---- TTTTTTTTTT 9 het 9 ref 25 16 1 9 TTAA 1 0 375200 CASAVA_Build 17 38917128 7D TGAGGGAAGC GGAAGGA/------- GGAAGGAGGA 3070 hom 106 het 40 0 35 7 GGAAGGA 3 2 375201 CASAVA_Build 17 38922310 3D TGTTCATGTC TCT/--- TCTTTTCTGA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 TCT 2 1 375202 CASAVA_Build 17 38952417 1I GGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 216 hom 38 1 24 13 T 11 12 375203 CASAVA_Build 17 38955957 1D ACTCCGTCCC A/- AAAAAAAAAA 2339 het 463 hom 20 2 9 9 A 17 16 375204 CASAVA_Build 17 39002908 5I GCCTCCTGAG -----/CCTGT TAGCTGGGCT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 CCTGT 0 1 375205 CASAVA_Build 17 39008066 2I CTTTAGAAAC --/AG GGGAGTCACA 3070 hom 120 het 41 0 40 1 AG 0 1 375206 CASAVA_Build 17 39058468 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2653 het 234 hom 15 2 7 6 A 14 13 375207 CASAVA_Build 17 39070168 4D AAACAAAACA AAAC/---- AAAAAAAAAA 618 het 618 ref 26 4 5 17 AAAC 1 0 375208 CASAVA_Build 17 39079508 4I AAATTGAGGA ----/AAAC AATTTCACCT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 AAAC 0 1 375209 CASAVA_Build 17 39095784 4I TCTTGATGCC ----/CAAT CAGTCTTCCT 3070 hom 86 het 31 0 27 4 CAAT 0 1 375210 CASAVA_Build 17 39097062 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 77 het 27 0 25 2 T 10 9 375211 CASAVA_Build 17 39102818 1I GGCTGCCGGA -/G GGGCCCAGGG 3070 hom 60 het 24 0 20 4 G 3 4 375212 CASAVA_Build 17 39177293 1D AGAAGCTGGG C/- CAGTGTGAAT 3070 hom 72 het 27 0 22 5 C 2 1 375213 CASAVA_Build 17 39194812 1D ATTTCTGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 29 0 20 9 T 11 10 375214 CASAVA_Build 17 39195128 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1999 het 727 hom 13 2 8 3 A 15 16 375215 CASAVA_Build 17 39195255 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1066 hom 30 3 17 10 T 14 15 375216 CASAVA_Build 17 39195406 3I TTCCAGAAAA ---/CTC AGCCCAGTCC 3070 hom 96 het 39 0 32 7 CTC 0 1 375217 CASAVA_Build 17 39196094 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 8 9 375218 CASAVA_Build 17 39197006 1D GAACAGCTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 35 het 38 1 24 13 T 12 11 375219 CASAVA_Build 17 39201699 1D TCTAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1527 het 1527 ref 26 17 4 5 A 12 11 375220 CASAVA_Build 17 39212448 1I GTTTGCAGGG -/A AAAAAAAAAA 1163 het 1163 ref 28 12 4 12 A 13 14 375221 CASAVA_Build 17 39287499 4D ATCTCCTTGG GAGA/---- GAGAAAGGAC 3070 het 3070 ref 38 19 11 10 GA 4 2 375222 CASAVA_Build 17 39299147 1I TTTCCCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 139 hom 26 2 15 9 T 13 14 375223 CASAVA_Build 17 39303789 1I GGTGCAGGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 963 hom 34 4 25 5 T 10 11 375224 CASAVA_Build 17 39304749 18I AGTACAGGAG ------------------/TGAGCCACCACGCCCAGC CAATTTCACT 3070 hom 42 het 19 0 14 6 TGAGCCACCACGCCCAGC 0 1 375225 CASAVA_Build 17 39309569 4D ACACGCACAC ACAT/---- ACACACAACC 3070 hom 103 het 37 0 31 7 ACAT 1 0 375226 CASAVA_Build 17 39317699 1I TCCTTCTACA -/T TTATTGGCAT 3070 hom 66 het 26 0 23 3 T 2 3 375227 CASAVA_Build 17 39319945 1D TTTTGCATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 40 1 26 13 A 16 15 375228 CASAVA_Build 17 39320708 1D TATTGTTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 10 9 375229 CASAVA_Build 17 39323715 1I CACATGGAAA -/G GGGGTCTGGC 3070 hom 138 het 56 0 46 10 G 4 5 375230 CASAVA_Build 17 39327732 8D AGGAGGCTAA GGCAGGAG/-------- GGCAGGAGGA 3070 hom 57 het 22 0 20 4 GGCAGGAG 2 1 375231 CASAVA_Build 17 39330417 4D CCTCCCTGAT ACTC/---- ACAGAAGGAT 3070 hom 84 het 31 0 28 4 ACTC 1 0 375232 CASAVA_Build 17 39332141 6D ACTCCGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAGA 3070 hom 51 het 18 0 18 1 A 14 8 375233 CASAVA_Build 17 39332287 2D AGTACAGGCC CA/-- GAGTCAAGCA 3070 hom 69 het 27 0 18 10 CA 1 0 375234 CASAVA_Build 17 39337983 1I AGGCAGGGGG -/A ATCTCTTGAG 3070 het 1454 hom 21 5 10 6 A 1 2 375235 CASAVA_Build 17 39338071 1I AACCTGTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2572 hom 24 9 11 4 A 11 12 375236 CASAVA_Build 17 39342763 4I TGTGATACTG ----/AGAT AGATAAGGGC 3070 hom 120 het 43 0 39 4 AGAT 1 2 375237 CASAVA_Build 17 39345502 1I TGAAGAGGGG -/A ATCAAAGCAG 3070 het 3070 ref 53 26 18 9 A 1 2 375238 CASAVA_Build 17 39345988 2D20M2I TAACACTCAT ACACACATTTACCCATTTGAGT--/--ACACATTTACCCATTTGAGTAC ACACACACTC 3070 het 3070 hom 70 14 39 37 N/A 0 0 375239 CASAVA_Build 17 39364406 1I GGAGAGCTGT -/G CCCTTGGCTC 3070 hom 78 het 30 0 25 5 G 0 1 375240 CASAVA_Build 17 39373480 10I ACAGACTTGC ----------/TGAAGGACCA TGAAGGACCA 3070 hom 113 het 47 0 35 12 TGAAGGACCA 1 2 375241 CASAVA_Build 17 39376699 1I CCTGGCTCTG -/C CATTGGCTGG 3070 hom 78 het 31 0 25 6 C 1 2 375242 CASAVA_Build 17 39383260 1D ATTCCACCTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 T 10 9 375243 CASAVA_Build 17 39389826 1I CAGGCGTGGT -/G GCTCACGCCT 3070 hom 12 het 19 1 15 3 G 1 2 375244 CASAVA_Build 17 39394413 1I AGGCCCTTGG -/C CTCTGTTTTG 3070 hom 65 het 25 0 17 8 C 1 2 375245 CASAVA_Build 17 39396708 1I CCAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2932 het 2932 ref 22 12 7 3 A 11 12 375246 CASAVA_Build 17 39396947 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTGGG 3070 het 3070 hom 30 11 11 8 T 8 7 375247 CASAVA_Build 17 39411215 1D AAGGAAGGAA G/- GGAAGGGAAG 3070 het 3070 ref 46 27 15 4 G 3 2 375248 CASAVA_Build 17 39417823 3D CTCTTCTAAA GTT/--- GTAGAAAAGT 3070 het 3070 ref 38 21 13 6 GTT 1 0 375249 CASAVA_Build 17 39421664 1D TCTTTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2705 hom 27 6 17 4 T 11 10 375250 CASAVA_Build 17 39431140 1D AACCCACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 44 het 29 0 20 9 T 15 14 375251 CASAVA_Build 17 39434402 3D TCACACTCTT CTC/--- CTCCAGAAAG 3070 het 3070 ref 44 23 17 7 CTC 2 1 375252 CASAVA_Build 17 39434663 1I GAAGCCCCCA -/G TCTGAGGGAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 G 0 1 375253 CASAVA_Build 17 39441199 5D TGAGGATAAA ATGAG/----- ATAACACACA 3070 het 3070 hom 46 20 24 4 ATGAG 1 0 375254 CASAVA_Build 17 39442028 1D TTTTTTTTTT A/- AAGACAGGAT 1452 het 1452 ref 26 14 5 7 A 3 2 375255 CASAVA_Build 17 39443916 4D TTAAAAAAAA AAAG/---- AAAGAGAGAG 1549 hom 10 het 13 0 4 10 AAAG 2 1 375256 CASAVA_Build 17 39456731 2I CACTGCAGGT --/CA CAGTCACGTG 3070 hom 90 het 33 0 29 4 CA 1 2 375257 CASAVA_Build 17 39457296 1I AAAGCCCTGG -/A AGGCGCCAGC 3070 hom 66 het 28 0 20 8 A 1 2 375258 CASAVA_Build 17 39461085 1I AAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTAG 3070 hom 54 het 29 0 25 4 T 8 9 375259 CASAVA_Build 17 39475498 15I TCGCTCTGTC ---------------/GCCCAGGCTGACAGA GCCCAGGCTG 1860 hom 14 het 7 0 6 1 GCCCAGGCTGACAGA 0 1 375260 CASAVA_Build 17 39480637 1I GTTTGTTCTG -/T TTTTTTTTTT 2850 het 2005 hom 20 7 11 2 T 13 14 375261 CASAVA_Build 17 39493817 4D AGAAAATCAC CTCT/---- CTTTCAGATC 3070 het 3070 ref 33 18 9 7 CT 3 1 375262 CASAVA_Build 17 39497149 2D TCGTATAATA CT/-- CTCTGTGTCT 3070 het 3070 ref 41 22 16 3 CT 3 2 375263 CASAVA_Build 17 39506834 1I GAGGGTTAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 19 12 10 A 10 11 375264 CASAVA_Build 17 39527641 4D TGTGTACGTA TGTG/---- TGTGTATATA 3070 hom 78 het 29 0 26 4 TG 4 2 375265 CASAVA_Build 17 39530352 1I CCATGTCCTG -/C CCCCAGCACC 3070 hom 134 het 49 0 42 7 C 4 5 375266 CASAVA_Build 17 39537698 6D TCACTGAGCC CCACTG/------ CAGGTGACAC 1573 het 1573 ref 27 18 4 6 CCACTG 1 0 375267 CASAVA_Build 17 39566833 1I TAGCCAGCCA -/C CTGCTAGAGG 3070 hom 69 het 27 0 24 3 C 1 2 375268 CASAVA_Build 17 39567923 3D CAGGGTGGAC ATT/--- ATTATTATTA 3070 hom 93 het 46 0 31 15 ATT 7 6 375269 CASAVA_Build 17 39576802 1I CTTTGCCCCC -/T TTTCTTCCCT 3070 het 3070 ref 35 13 15 7 T 3 4 375270 CASAVA_Build 17 39616775 1I GTGAAACCCT -/G TCCCTACTAA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 G 0 1 375271 CASAVA_Build 17 39625099 1I CTACATGGTA -/G GGGGGGGCAC 3070 het 3070 ref 33 13 14 6 G 7 8 375272 CASAVA_Build 17 39647547 3I AGACAGCTGG ---/CTT CTTTTTTGGG 3070 het 3070 ref 37 19 15 3 CTT 1 2 375273 CASAVA_Build 17 39648003 1D GTGTGCGTGG A/- GAAGTGCACT 3070 het 3070 ref 58 31 21 6 A 1 0 375274 CASAVA_Build 17 39656456 1I GAACTTGAGA -/C CCCCCCCCCA 1382 het 1382 ref 42 19 7 16 C 9 10 375275 CASAVA_Build 17 39656565 8I TTTCGGTAAA --------/GTGCTTTG GTGCTTTGGA 3070 het 3070 ref 42 19 13 10 GTGCTTTG 1 2 375276 CASAVA_Build 17 39673967 6D CGAAACTGTT AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 2412 het 2412 ref 27 15 6 8 A 19 13 375277 CASAVA_Build 17 39689131 1D CAATTGACAT G/- GAAACAGAGG 3070 het 3070 ref 42 22 17 3 G 2 1 375278 CASAVA_Build 17 39725525 1D TCCCTCTCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1736 hom 28 10 11 8 T 13 12 375279 CASAVA_Build 17 39739788 9D CTGTCTCAAA AACAACAAC/--------- AACAACAACA 3070 het 3070 ref 31 13 13 10 AAC 9 6 375280 CASAVA_Build 17 39765120 24I13M1I CTCCCAAGTA ------------------------CACGCCCAGCTAA-/GCTGGGATTACAGGCACCCACCATCACGCCTGTCTAAT TTTTGTATTT 2371 het 2371 ref 15 10 5 2 N/A 0 0 375281 CASAVA_Build 17 39778278 1I CCAGGGGCCC -/G GCCAGGGCCA 3070 hom 85 het 33 0 24 9 G 1 2 375282 CASAVA_Build 17 39799721 6D TCTTTTCTTT TCTCTC/------ TCTCTCTCTC 2094 het 2094 ref 21 8 7 7 TC 10 7 375283 CASAVA_Build 17 39803737 1I CAAAGTGCTA -/G GATTACAGGC 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 G 1 2 375284 CASAVA_Build 17 39806808 1D TATTTTTTTC T/- TTTTTTTTTG 2915 het 440 hom 10 1 7 2 T 10 9 375285 CASAVA_Build 17 39810093 1I ATTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2528 het 713 hom 21 5 11 5 T 13 14 375286 CASAVA_Build 17 39810549 9D GGTTATTCAT GAGCCCCTG/--------- GTGGAGACCC 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 GAGCCCCTG 1 0 375287 CASAVA_Build 17 39825322 10D TAAAAAACAA TTTTTTTTTT/---------- TTTTTTTTTT 2470 het 1874 hom 22 8 6 9 T 26 16 375288 CASAVA_Build 17 39841137 2D GAGTGCAGTG GT/-- GTGTGATCTT 3070 het 1759 hom 18 4 10 4 GT 3 2 375289 CASAVA_Build 17 39849214 1D CTTCAGCAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 40 20 13 7 T 9 8 375290 CASAVA_Build 17 39854606 4D AGTGTGTAAC CTTT/---- CTTTCTTTTT 1272 het 1272 ref 21 12 4 5 CTTT 3 2 375291 CASAVA_Build 17 39857917 3D GTTGGAGAAA AAC/--- AACAACAACA 3070 het 3070 hom 52 22 23 10 AAC 4 3 375292 CASAVA_Build 17 39863540 1I CACTGTTGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 T 11 12 375293 CASAVA_Build 17 39864468 2I ATAACAAGAA --/TT TGTCAAATGA 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 T 1 3 375294 CASAVA_Build 17 39869641 1I CCTTGGCTGA -/C CGTCCAGTTG 3070 het 3070 hom 41 10 25 6 C 1 2 375295 CASAVA_Build 17 39870552 1D TCCCAACCCC A/- AAAAAAACTT 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 8 7 375296 CASAVA_Build 17 39874285 1I TCTCTGCTGC -/T TTTCCCCTTA 3070 het 3070 hom 43 19 20 4 T 3 4 375297 CASAVA_Build 17 39877149 1I ACTTTCAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 244 hom 36 2 26 8 A 12 13 375298 CASAVA_Build 17 39879733 1I ATTTCATCTA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 T 9 10 375299 CASAVA_Build 17 39883480 8I TACATTTGAA --------/AAGATATT ATACTACATA 3070 het 3070 hom 39 18 18 3 AAGATATT 0 1 375300 CASAVA_Build 17 39886826 1D GTTTAACCTC A/- AAAAAAAAAA 1371 het 1371 ref 24 12 6 6 A 12 11 375301 CASAVA_Build 17 39894757 1D ACTAATTTTT G/- GGGGGTGGGG 3070 het 1992 hom 21 8 13 0 G 6 5 375302 CASAVA_Build 17 39897988 6I GGTTTAAAAA ------/AATAAT AATAATATAT 1083 het 1083 ref 13 7 3 3 AAT 2 4 375303 CASAVA_Build 17 39909105 1D CTGTTTTACC T/- TTTTTTTTTT 1958 het 1958 ref 43 26 5 12 T 12 11 375304 CASAVA_Build 17 39910893 7D TAGTAGAGAT GGGGTGG/------- GGGGTGGGGG 3070 het 464 hom 14 3 8 4 GGGGTGG 2 1 375305 CASAVA_Build 17 39920928 1D GCGATTCTCC T/- GCCTCAGCCT 2767 het 66 hom 8 1 7 0 T 1 0 375306 CASAVA_Build 17 39967807 1I GTGCCCACCA -/C CATGCCTGGC 3070 hom 42 het 17 0 15 2 C 1 2 375307 CASAVA_Build 17 39973363 1I CCCTCCCTAA -/C CCTTTGTACT 3070 hom 126 het 52 0 40 12 C 2 3 375308 CASAVA_Build 17 39978415 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2631 het 1355 hom 18 4 8 6 A 15 16 375309 CASAVA_Build 17 39988138 1I GGGTGGCTGG -/A GAGGGGATAA 3070 hom 73 het 36 0 23 13 A 0 1 375310 CASAVA_Build 17 39993260 1I TCCCGCAGCC -/A AAAAATCTCT 3070 hom 63 het 27 0 22 5 A 5 6 375311 CASAVA_Build 17 39996026 1I CTCTTCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 10 11 375312 CASAVA_Build 17 40000130 1D AGAGATAGGG T/- TTTACCATAT 3070 het 3070 ref 27 14 13 1 T 4 3 375313 CASAVA_Build 17 40000338 4D GTTTACTTTC TTGT/---- TTGTTTGTTT 3070 hom 102 het 38 0 35 3 TTGT 3 2 375314 CASAVA_Build 17 40004871 1I TATGGATTAT -/A ATTTTTTTTT 2573 het 74 hom 34 1 20 13 A 1 2 375315 CASAVA_Build 17 40007140 6D ACTCCATCTC AAAAAA/------ AAAAAAAGAA 3070 hom 78 het 27 0 27 1 A 13 7 375316 CASAVA_Build 17 40008463 3D CTCACTTGCC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 38 1 26 11 A 16 13 375317 CASAVA_Build 17 40010540 12I AAAAAACAAA ------------/ACAAAAAACAAC ACAAAATCTC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 ACAAAAAACAAC 0 1 375318 CASAVA_Build 17 40012481 4I CTGTTTTCTG ----/TTTA TTTGTTTAAA 3070 hom 96 het 36 0 32 4 TTTA 0 1 375319 CASAVA_Build 17 40016581 11I GGAGAATGTG -----------/TTTTTTTGTGT TTTTTTTTTG 3070 hom 87 het 37 0 29 9 TTTTTTTGTGT 0 1 375320 CASAVA_Build 17 40031370 2D CAGCCATCCC TA/-- GACCACCCCT 2826 het 2826 ref 44 26 11 7 TA 1 0 375321 CASAVA_Build 17 40031600 1D ACATAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 2647 het 133 hom 29 1 10 18 T 17 16 375322 CASAVA_Build 17 40035229 1D GACGGGTGGC G/- GGGGTCACAG 3070 het 2676 hom 22 10 11 1 G 5 4 375323 CASAVA_Build 17 40035439 3I ATGTTTCTCT ---/CTC CTCCCAACTC 3070 hom 75 het 29 0 23 6 CTC 1 2 375324 CASAVA_Build 17 40038329 1I GATCTGAGGG -/A ATCAGCTCAT 3070 het 3070 ref 41 25 11 5 A 1 2 375325 CASAVA_Build 17 40038501 15D GCTGCAGCCT ACACTACTGCAGCCC/--------------- ACACTACTGC 2686 het 2686 ref 39 24 12 15 ACACTACTGCAGCCC 2 1 375326 CASAVA_Build 17 40038909 5I ACCTCAGGAG -----/ATCCA TCCGCCTTGG 3070 het 2795 hom 20 7 10 3 ATCCA 0 1 375327 CASAVA_Build 17 40039024 2I GAGGGAGAGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 49 20 21 8 GT 7 8 375328 CASAVA_Build 17 40042213 2D TGTGTGTGGC TG/-- TGTGTGTGCC 3070 het 2959 hom 49 15 20 15 TG 5 4 375329 CASAVA_Build 17 40042623 13I8M1I TGATGGCACA -------------CGCTACTT-/TGCCTGTAATCTCAGCTACTTG GGAGGCTGAG 3070 het 3070 ref 24 13 11 2 N/A 0 0 375330 CASAVA_Build 17 40043082 8I CTCTGGCCCT --------/GAAGAGGA GAAGAGGAAA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 GAAGAGGA 1 2 375331 CASAVA_Build 17 40044653 3D TAGTCTCTCA TCC/--- TCTGGTGCTT 2568 het 2568 ref 25 14 9 3 TCC 1 0 375332 CASAVA_Build 17 40046814 1D ACTCCAGCCT G/- GGGCAACAGA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 G 4 3 375333 CASAVA_Build 17 40047611 5D TGTGCTGGCC TGTTT/----- TGTTTTGTTT 3070 het 3070 ref 40 17 13 10 TGTTT 5 4 375334 CASAVA_Build 17 40049747 1D TTCTTTGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2595 hom 32 9 17 6 T 11 10 375335 CASAVA_Build 17 40050899 1I GCTCCGTCTC -/A AAAAAAAGAA 3070 hom 102 het 41 0 35 6 A 7 8 375336 CASAVA_Build 17 40052137 1I ATAAACTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 T 13 14 375337 CASAVA_Build 17 40052601 1I GCCCAGCCAA -/T TTTTTTTTTT 2068 hom 18 het 12 0 7 5 T 11 12 375338 CASAVA_Build 17 40054398 1I TGCCCTAGAG -/T TTTTTCCTGG 3070 het 3070 hom 48 17 23 8 T 5 6 375339 CASAVA_Build 17 40058900 1I AAAAAAAACC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 38 15 15 8 T 9 10 375340 CASAVA_Build 17 40059019 2D TTGTTTTTTT TG/-- TTTTGTTTTG 3068 het 3068 ref 25 11 12 2 TG 1 0 375341 CASAVA_Build 17 40067472 1I TCACCCAGTC -/T GGAGTGCAAT 3070 hom 45 het 18 0 16 2 T 0 1 375342 CASAVA_Build 17 40072386 1D TATTTGCTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 15 26 5 T 11 10 375343 CASAVA_Build 17 40083193 23D AAAACAGCCC GGCCAACATGGTGAAAACAGCAT/----------------------- GGCCAACATG 1596 het 1596 ref 17 12 4 6 GGCCAACATGGTGAAAACAGCAT 1 0 375344 CASAVA_Build 17 40083725 1D GTGAGACTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2271 hom 23 9 10 4 A 13 12 375345 CASAVA_Build 17 40103673 5D GCTCAAGCAA TCCAC/----- CTGCCTCAGC 3070 het 3070 ref 27 14 12 1 TCCAC 1 0 375346 CASAVA_Build 17 40118816 1D GCCCATGTTC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2691 hom 24 10 9 5 T 10 9 375347 CASAVA_Build 17 40120351 2D CATAAAACAT AA/-- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 23 9 13 2 A 10 8 375348 CASAVA_Build 17 40146609 1D ATTTTCTTTG T/- TTTTTTATGT 3070 hom 102 het 40 0 34 7 T 7 6 375349 CASAVA_Build 17 40154111 1I ACTAATTCTT -/C CCCCCCCCCT 3070 hom 70 het 26 0 21 5 C 9 10 375350 CASAVA_Build 17 40196616 1D GTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 858 hom 22 6 8 8 T 13 12 375351 CASAVA_Build 17 40203392 3D TCCCCCCCCC CCG/--- CCCCCACTGC 3070 hom 33 het 13 0 11 2 CCG 1 0 375352 CASAVA_Build 17 40217744 1I AAAAATTAGC -/T GATGTGGTGG 3070 hom 33 het 15 0 13 2 T 0 1 375353 CASAVA_Build 17 40217987 1D TGGTACATCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 T 11 10 375354 CASAVA_Build 17 40229699 2D GATCTAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 84 het 33 0 29 5 AC 9 8 375355 CASAVA_Build 17 40237195 1I TTCTCATACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 10 5 A 12 13 375356 CASAVA_Build 17 40258674 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 10 4 A 15 14 375357 CASAVA_Build 17 40260246 1I AACAAACAAA -/C AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 C 0 1 375358 CASAVA_Build 17 40260758 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 1888 hom 19 5 12 4 A 10 9 375359 CASAVA_Build 17 40264942 1D GGAGTGCAGT G/- GGCGCCATCT 3070 het 3070 ref 24 12 9 4 G 3 2 375360 CASAVA_Build 17 40266780 4I GTAGAATGGC ----/TAGA TAAATTGTGT 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 TAGA 0 1 375361 CASAVA_Build 17 40296003 1D TATTCTCCTC T/- TTTTTTTTTT 1235 het 1235 ref 38 22 3 14 T 13 12 375362 CASAVA_Build 17 40310596 3I GCTGCCTGGG ---/ACC AGGCTGAGGC 1188 het 1187 ref 12 5 4 3 ACC 0 1 375363 CASAVA_Build 17 40323291 1D CAATATAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 19 11 7 1 A 11 10 375364 CASAVA_Build 17 40333180 1D ACAGAGCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 20 0 12 8 A 13 12 375365 CASAVA_Build 17 40347268 2I TGCACACACA --/CC CACACACACA 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 C 1 3 375366 CASAVA_Build 17 40356933 2D TGCAGTGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 het 3070 hom 37 11 22 4 CT 2 1 375367 CASAVA_Build 17 40357752 4D CCCTTTACAC TTTA/---- TTTTACACTG 3070 het 3070 hom 42 19 19 4 TTTA 1 0 375368 CASAVA_Build 17 40378955 1D CTCTACTTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1480 hom 26 7 12 7 A 15 14 375369 CASAVA_Build 17 40379985 2D CCTGGGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 1329 hom 7 het 11 0 7 4 AG 6 5 375370 CASAVA_Build 17 40389660 1D AGACTCTATC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 17 het 23 1 15 8 A 17 16 375371 CASAVA_Build 17 40410172 1D CACCTGTTGG T/- GGCAAGGGCC 3070 het 3070 hom 37 18 19 1 T 1 0 375372 CASAVA_Build 17 40415872 4D TTTCTGTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 48 14 22 14 TTTG 5 4 375373 CASAVA_Build 17 40419511 2I ACTCTTTAAT --/AA AAGATATTTA 3070 het 3070 hom 44 16 23 5 A 2 4 375374 CASAVA_Build 17 40420634 2D TTGAATTTCT AA/-- AGTCTTCAGT 2601 het 2423 hom 19 9 7 3 A 3 1 375375 CASAVA_Build 17 40421951 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 283 hom 25 5 10 11 A 16 14 375376 CASAVA_Build 17 40440419 1I TTTTTTGTTT -/G TTTTTTTTGA 3070 het 62 hom 21 2 17 2 G 0 1 375377 CASAVA_Build 17 40445570 1I AGGAGAATCG -/C TTGAATTCTG 3070 het 1903 hom 22 6 9 7 C 0 1 375378 CASAVA_Build 17 40453208 2D TCTTGAGGGC CA/-- GAGGCAGGAG 3070 het 2896 hom 26 9 12 7 CA 1 0 375379 CASAVA_Build 17 40465652 1I ACTCCAGCCT -/G GGTGACAGAG 1835 het 1835 ref 30 9 8 13 G 2 3 375380 CASAVA_Build 17 40478982 1D CGGCCTCCCA C/- AAGTGCTAGG 3070 het 3070 hom 18 8 9 3 C 1 0 375381 CASAVA_Build 17 40480026 1D GATATTGCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 546 hom 35 2 22 11 A 13 12 375382 CASAVA_Build 17 40481997 1I ATTACATTAG -/A AAAAAACTTC 2799 het 2799 ref 27 17 6 4 A 6 7 375383 CASAVA_Build 17 40483569 2D AAAATGAGCA CT/-- CTCCCTCCTG 3070 het 3070 hom 53 26 23 5 CT 2 1 375384 CASAVA_Build 17 40485286 3D GGTGGATACT ATC/--- ATCATCCCCA 3070 het 3070 hom 37 12 20 7 ATC 3 2 375385 CASAVA_Build 17 40487145 1I GACAGTTTTA -/T TTTATTTTTT 3070 het 980 hom 24 8 12 4 T 3 4 375386 CASAVA_Build 17 40518484 1I GATGGGATTG -/T TGGGTGTTTA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 1 2 375387 CASAVA_Build 17 40518714 1I CCTTTAACTC -/T TTTTTTTTTT 1991 het 1991 ref 30 12 9 9 T 13 14 375388 CASAVA_Build 17 40523293 10I CGAGATCATG ----------/TCGTTCTTCT TCGTTCTTCT 3070 het 3070 hom 46 16 23 7 TCGTTCTTCT 1 2 375389 CASAVA_Build 17 40525292 1D CCACAGATTA T/- CATTCTGGGA 3070 het 3070 ref 22 9 7 7 T 1 0 375390 CASAVA_Build 17 40528005 2D GCGCCCAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 1118 hom 8 het 7 0 3 4 T 14 12 375391 CASAVA_Build 17 40543342 6I GTCTCAAAAG ------/AAAGAA AAAAAAAAAA 2157 het 2157 ref 26 10 7 9 AAAGAA 0 1 375392 CASAVA_Build 17 40548076 1I GGTGCAGGGT -/C CGCAGGCGGG 2459 hom 30 het 13 0 8 5 C 1 2 375393 CASAVA_Build 17 40552741 1D ACACAGAGGT C/- TGCCATGGGC 3070 het 3070 ref 44 20 11 13 C 1 0 375394 CASAVA_Build 17 40553693 1I CCTCAGGACA -/G GGGCCCTGCC 2693 hom 27 het 10 0 9 1 G 3 4 375395 CASAVA_Build 17 40554853 1I GCGTCTTAAC -/A AAAAAAAAAA 2006 het 2006 ref 38 18 10 10 A 15 16 375396 CASAVA_Build 17 40579942 1D AAAATGGCAC G/- GGGGGGGTCA 3070 het 3070 ref 29 9 8 12 G 8 7 375397 CASAVA_Build 17 40583550 4I CCCCCTGGCT ----/TTGG TTGGTTTCGT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 TTGG 1 2 375398 CASAVA_Build 17 40615215 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 14 0 12 2 T 15 14 375399 CASAVA_Build 17 40619098 1I CACCACGCCC -/A GGCCATATGA 3070 het 3070 hom 26 9 12 5 A 0 1 375400 CASAVA_Build 17 40682476 1D CTGTTGGGCT G/- GAGCTGAAGA 3070 het 3070 ref 34 19 11 4 G 2 1 375401 CASAVA_Build 17 40689569 4D GTCATCTCTA AGAC/---- AGAAGAAGAC 2241 het 2241 ref 23 11 7 6 AGAC 1 0 375402 CASAVA_Build 17 40692185 1I TTCTCATAGC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 27 9 12 6 T 9 10 375403 CASAVA_Build 17 40708633 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2609 hom 28 11 12 6 A 12 11 375404 CASAVA_Build 17 40720077 1I AGGCAGAGCC -/G GCCGTAGGCC 2987 hom 27 het 12 0 10 2 G 1 2 375405 CASAVA_Build 17 40736001 1I GCTGGGCCGC -/T AAAACAGAAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 T 0 1 375406 CASAVA_Build 17 40806390 2I AGGCCCAGAC --/TG AGGTCATGGT 3070 hom 66 het 26 0 20 6 TG 0 1 375407 CASAVA_Build 17 40817418 1I AAAGACAGAT -/A GGGGGAAGGA 3070 het 3070 hom 59 20 30 9 A 0 1 375408 CASAVA_Build 17 40822392 1D GTGGCCAGTA T/- GATGCAGTGG 3070 het 3070 ref 52 29 14 9 T 1 0 375409 CASAVA_Build 17 40823236 4D AGTCATAGAC TGAG/---- TGTTTGTGCC 3070 het 3070 ref 35 18 13 6 TGAG 1 0 375410 CASAVA_Build 17 40831883 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 31 0 24 7 A 13 12 375411 CASAVA_Build 17 40847255 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 108 hom 32 3 15 15 A 13 12 375412 CASAVA_Build 17 40899646 2D GATAAATATA CT/-- ATTTTTGTCC 1355 het 1355 ref 31 27 3 2 CT 1 0 375413 CASAVA_Build 17 40904493 2D ATATTAGTGG GT/-- GGGGGATGTA 3070 hom 75 het 27 0 26 1 GT 1 0 375414 CASAVA_Build 17 41007689 1D CAAGAAGCCA T/- TATTTCTAGT 3070 het 3070 hom 90 37 47 8 T 2 1 375415 CASAVA_Build 17 41008520 1I ACTTAATTTT -/C TTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 86 40 38 8 C 0 1 375416 CASAVA_Build 17 41009516 2D AAAGATACCT AA/-- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 67 27 35 5 A 11 9 375417 CASAVA_Build 17 41010643 1I ACTCTGTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 45 14 24 16 A 11 12 375418 CASAVA_Build 17 41010974 1D GTCTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 83 30 33 22 A 12 11 375419 CASAVA_Build 17 41013807 16D GTGGTTGCAA TTTTATACTAAAAAGT/---------------- TGTCATCCTT 3070 het 3070 ref 57 35 25 11 TTTTATACTAAAAAGT 1 0 375420 CASAVA_Build 17 41014457 1D AGAAATAAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 50 19 25 7 A 10 9 375421 CASAVA_Build 17 41015326 1I TTGAGACCAG -/C CCTGACCAAC 3070 het 3070 hom 44 12 28 5 C 2 3 375422 CASAVA_Build 17 41015536 4D AAAAAAAGAA AAAC/---- AAAATGTCAC 3070 het 3070 ref 87 48 38 5 AAAC 1 0 375423 CASAVA_Build 17 41017359 2I TCCAGAAAAC --/TA TACCAAAACA 3070 het 3070 ref 68 36 29 3 TA 1 2 375424 CASAVA_Build 17 41038137 1I TCCCAGGTTC -/A AGTGATTCTC 1553 hom 12 het 6 0 5 1 A 1 2 375425 CASAVA_Build 17 41039877 1D ATAAATCCCC T/- TTTTTTTTTT 2354 het 83 hom 21 1 7 13 T 15 14 375426 CASAVA_Build 17 41085488 1D ATTTTAAGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 859 hom 31 2 12 17 T 13 12 375427 CASAVA_Build 17 41088564 8D TCACTGTGAC CCCTATGT/-------- CCACCCAGAG 3070 hom 90 het 32 0 30 3 CCCTATGT 1 0 375428 CASAVA_Build 17 41106705 1I TTTTTTTTTT -/A AATTTTCTGG 3070 hom 40 het 28 0 22 6 A 2 3 375429 CASAVA_Build 17 41107345 1I CCTATAGCCT -/G TCTTCATTTT 3070 hom 69 het 31 0 24 7 G 0 1 375430 CASAVA_Build 17 41128842 1I TTTTTACAGG -/A AAAAAAAAAA 1209 het 1209 ref 33 23 3 7 A 11 12 375431 CASAVA_Build 17 41140147 1D GAACCGCACT G/- GCAAAGGCCC 3070 het 3070 hom 56 22 29 5 G 2 1 375432 CASAVA_Build 17 41145172 7D CAACTGCCTG GATCTCA/------- GATCTCAGTT 3070 hom 126 het 46 0 42 7 GATCTCA 2 1 375433 CASAVA_Build 17 41146382 1D CCCATCTCTG A/- AAAAAAAAAA 1177 het 1177 ref 34 22 5 7 A 12 11 375434 CASAVA_Build 17 41154132 3I TGTTTGAGAT ---/TTG TTGTTGTTGT 3070 hom 144 het 54 0 48 6 TTG 3 4 375435 CASAVA_Build 17 41155634 7I CCCCCAGTAA -------/GCGGTGG AAGCACTTGC 2307 het 2307 ref 25 8 11 6 GCGGTGG 0 1 375436 CASAVA_Build 17 41160556 2D TCAAAGCCTT CC/-- AGGCCTACAG 3070 het 3070 ref 43 23 12 8 C 2 0 375437 CASAVA_Build 17 41208529 1D TAACACCTCC T/- TTTCCCTCCC 3070 hom 142 het 61 0 45 16 T 4 3 375438 CASAVA_Build 17 41249571 1D CCTTGGCCGG A/- ATATCTTGCT 3070 hom 108 het 42 0 33 9 A 2 1 375439 CASAVA_Build 17 41284410 2D CCAACACGTG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 58 24 19 16 CA 8 7 375440 CASAVA_Build 17 41289158 1D ATGCCTTCCT C/- CCCCAGCCTC 3070 hom 126 het 47 0 41 7 C 5 4 375441 CASAVA_Build 17 41290536 1I TGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 28 1 22 5 T 11 12 375442 CASAVA_Build 17 41303052 1D CAAATGTCCC A/- GGGGCAAAAT 3070 hom 72 het 28 0 23 6 A 1 0 375443 CASAVA_Build 17 41315058 1I TGTGGAGGGA -/C CCCCAACAAA 3070 het 3070 ref 46 25 13 8 C 4 5 375444 CASAVA_Build 17 41322918 1I AAGGGACAGA -/G GGCTGAAGCC 3070 hom 90 het 34 0 29 5 G 2 3 375445 CASAVA_Build 17 41391061 1D AATTTGCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 14 13 6 A 11 10 375446 CASAVA_Build 17 41451571 1D ACACCATTCT A/- AAAGGAGTCT 3070 hom 66 het 25 0 23 3 A 4 3 375447 CASAVA_Build 17 41452512 1D CCATGATTCA G/- TTACCTCCCA 1786 het 1786 ref 14 6 5 3 G 1 0 375448 CASAVA_Build 17 41458528 1D CAGTCACCCC T/- GTCTGCGCCG 3070 hom 102 het 37 0 33 7 T 1 0 375449 CASAVA_Build 17 41459292 2D TGACTATGAT AG/-- TGAAAAGAAA 1707 het 670 hom 29 5 8 18 AG 1 0 375450 CASAVA_Build 17 41460459 1D TCCCCCTTGT G/- GGGGCAGGCT 3070 hom 49 het 24 0 19 5 G 5 4 375451 CASAVA_Build 17 41462640 1I CTCAAACAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 18 20 5 A 11 12 375452 CASAVA_Build 17 41476137 1D AATGAAAACA T/- AACATTTGCT 3070 hom 135 het 50 0 46 6 T 1 0 375453 CASAVA_Build 17 41476524 1I TGAAGCCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 14 8 A 10 11 375454 CASAVA_Build 17 41498325 1I CACAGCAGGC -/T TTTTTTTTTT 1545 het 1545 ref 24 8 5 11 T 13 14 375455 CASAVA_Build 17 41511709 1D ATTTCTACCT A/- ACTTGGCAGC 3070 hom 102 het 40 0 33 8 A 2 1 375456 CASAVA_Build 17 41522811 7I GCAGCATGGA -------/AAATATG AAATATGAAC 3070 het 3037 hom 45 7 29 9 AAATATG 1 2 375457 CASAVA_Build 17 41546785 1D GAGTTGGACT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 54 1 42 12 A 11 10 375458 CASAVA_Build 17 41547506 6I ACTCCCTCTC ------/AAACAA AAACAAAAAC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 AAACAA 2 3 375459 CASAVA_Build 17 41548589 2D TAAAGCTATC GA/-- GAGTGTCAAC 3070 het 3070 hom 36 9 23 4 GA 2 1 375460 CASAVA_Build 17 41554323 1I CCCCTAACTC -/T TTTTTTTTTT 1815 het 1815 ref 60 25 11 24 T 14 15 375461 CASAVA_Build 17 41560922 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 15 11 11 A 13 14 375462 CASAVA_Build 17 41568411 1I TGGTCTAGAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 26 11 12 A 11 12 375463 CASAVA_Build 17 41577823 1I ACTACATAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 63 19 26 18 A 10 11 375464 CASAVA_Build 17 41584015 1D GCATTATGGC T/- TTTATAAACA 1419 het 1419 ref 33 23 4 6 T 4 3 375465 CASAVA_Build 17 41609835 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1316 hom 45 9 21 17 A 17 16 375466 CASAVA_Build 17 41625454 1D TCTTTAGTTT A/- AAAAAAAAAA 1125 het 1125 ref 54 39 4 11 A 13 12 375467 CASAVA_Build 17 41646271 1I AGTGCCCAGT -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 ref 63 33 20 10 A 8 9 375468 CASAVA_Build 17 41652394 4D CTTGTCTCAT AAAA/---- AAAAAAAAAG 3009 het 3009 ref 20 13 7 1 A 13 9 375469 CASAVA_Build 17 41655642 1D CCCCATGCAA C/- CCCTCCAACT 3070 het 345 hom 28 1 24 4 C 4 3 375470 CASAVA_Build 17 41660426 3D AAAATGGGGC AAA/--- AAAAAAAATA 1365 het 1365 ref 29 25 3 1 A 11 8 375471 CASAVA_Build 17 41679068 4D AAGGAAAGAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 hom 30 het 14 0 11 3 AAAG 4 3 375472 CASAVA_Build 17 41680994 2I AGATAATGGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 79 het 45 0 29 16 A 12 14 375473 CASAVA_Build 17 41685358 1D GATTCATTGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 46 19 21 6 T 10 9 375474 CASAVA_Build 17 41690964 1D GGCCCATGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 656 hom 30 3 15 12 A 14 13 375475 CASAVA_Build 17 41692397 3D CTGTGGCAGA GGG/--- GGGAAGGTAT 3070 hom 42 het 15 0 14 2 G 6 3 375476 CASAVA_Build 17 41698762 1I GCTGGGACCA -/C AGGCGTGAGC 3070 hom 39 het 16 0 13 3 C 0 1 375477 CASAVA_Build 17 41709934 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2403 het 2403 ref 38 17 7 14 T 17 16 375478 CASAVA_Build 17 41716554 1D TGAAAAAGTA G/- GCATTCTTAT 1259 het 1259 ref 54 46 3 5 G 2 1 375479 CASAVA_Build 17 41721757 1D CATATTTTTT A/- AAAAAAGTTT 2244 het 2244 ref 33 22 6 6 A 7 6 375480 CASAVA_Build 17 41777425 1D AGTCTTTAAC A/- AAAAAAAAAA 1099 het 1099 ref 61 50 6 7 A 13 12 375481 CASAVA_Build 17 41800419 3I AGGCTGAAGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 36 het 13 0 13 0 AGG 0 1 375482 CASAVA_Build 17 41828316 1I TTGTTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1057 het 578 hom 18 2 9 7 A 15 16 375483 CASAVA_Build 17 41872192 1D ACATAGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1283 hom 34 8 8 18 A 17 16 375484 CASAVA_Build 17 41930430 1D ATCTACATAC A/- TATACAATGC 3070 het 3070 hom 25 9 16 0 A 1 0 375485 CASAVA_Build 17 41932968 1I CTGAGGCATC -/T TTTTTGCTTC 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 T 5 6 375486 CASAVA_Build 17 41983454 10I TAAGAAGTCG ----------/ATATAATAGC AAAATTTCTC 3070 het 3070 hom 54 7 37 10 ATATAATAGC 0 1 375487 CASAVA_Build 17 42114108 1D TCTCGTCTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 58 hom 27 2 24 1 A 11 10 375488 CASAVA_Build 17 42192999 1D CCTCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 16 9 A 13 12 375489 CASAVA_Build 17 42213761 1D CCCCCCAACC A/- AAAAAAAAAA 888 het 888 ref 23 17 4 2 A 12 11 375490 CASAVA_Build 17 42218587 1D TTCTTACCCA C/- CCCCCCCACC 1290 hom 18 het 10 0 6 5 C 8 7 375491 CASAVA_Build 17 42224343 1D ATTTCGAGGC A/- GGGGGATCAC 3070 het 3070 hom 31 12 14 6 A 1 0 375492 CASAVA_Build 17 42233051 1D GCTGACTCTT A/- ACACTGGGAA 3070 het 3070 ref 48 29 13 6 A 2 1 375493 CASAVA_Build 17 42235870 1D TTGAGACCAG C/- CCTTGCCAAC 3070 hom 114 het 50 0 38 12 C 3 2 375494 CASAVA_Build 17 42244555 1D AGCCTCTCAC T/- GAGAGCAGGG 2857 het 2857 ref 25 12 9 4 T 1 0 375495 CASAVA_Build 17 42261259 2I CCCAAGAGGC --/AG AGAGGTTGCA 3070 het 2432 hom 29 8 12 9 AG 2 3 375496 CASAVA_Build 17 42295489 1I GAGGGCGTGG -/C CACAGGCAGC 3070 hom 49 het 20 0 12 8 C 1 2 375497 CASAVA_Build 17 42362403 1I TGGTTTTTTG -/T TTTTTTTTCA 485 het 485 ref 33 19 4 10 T 8 9 375498 CASAVA_Build 17 42364023 6I CTTGCCACCT ------/CCACCC CCACCCCCAG 3070 het 3070 ref 23 12 8 3 CCACCC 1 2 375499 CASAVA_Build 17 42365997 1I TGGCATAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 372 hom 39 1 25 13 T 14 15 375500 CASAVA_Build 17 42404462 1I GCTTTATGTT -/C CTATAGAGAC 3070 hom 61 het 29 0 20 9 C 1 2 375501 CASAVA_Build 17 42406182 2D GCATGCGTGC GA/-- CACATGTGTA 2539 het 2539 ref 26 16 9 4 GA 1 0 375502 CASAVA_Build 17 42408258 4I AAGAAAGATA ----/AAGG AAGGAAGGAA 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 AAGG 3 4 375503 CASAVA_Build 17 42410759 2I ACAAACAAAC --/AA AAAAAAAACT 2267 het 2071 hom 20 7 7 6 A 8 10 375504 CASAVA_Build 17 42412166 1I TTTTTCTTTC -/T TTTTTTACAC 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 6 7 375505 CASAVA_Build 17 42412242 1I ACTTTATAAT -/C CTGCCTCCTA 3057 het 3057 ref 18 10 8 0 C 1 2 375506 CASAVA_Build 17 42413653 1D TGTTGAAAAC T/- TGACCCCCAA 3070 hom 99 het 35 0 31 6 T 2 1 375507 CASAVA_Build 17 42422039 14D ATTGGCTTTG GCCAGTGGGACAAC/-------------- TGAAAGCGTA 3070 het 3070 hom 45 20 23 5 GCCAGTGGGACAAC 1 0 375508 CASAVA_Build 17 42425395 2I44M1D ATGCCCAAAC --TGACAGTGGCCATCTCTGTAGGCTGGGACTAGGAGAGATTTTGAT/ATTGACAGTGGCCATCTCTGTAGGCTGGGACTAGGAGAGATTTTGA- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 25 0 21 16 N/A 0 0 375509 CASAVA_Build 17 42426245 2D GATGAGGCTC AG/-- AGAGTTGAAG 3070 het 3070 ref 44 29 12 3 AG 3 2 375510 CASAVA_Build 17 42427190 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAACAC 3070 hom 60 het 28 0 21 7 A 8 7 375511 CASAVA_Build 17 42427887 1D AATTCTGGGG A/- AAAAAAGGAG 3070 hom 60 het 23 0 19 4 A 7 6 375512 CASAVA_Build 17 42431275 2D ACTTCAGATA CT/-- GTCATCATGG 3070 het 3070 ref 43 20 14 12 CT 1 0 375513 CASAVA_Build 17 42433768 2D ACCAGATGCT GG/-- GGGGTTCTCA 3070 hom 72 het 28 0 25 4 G 6 4 375514 CASAVA_Build 17 42434750 2I TATTTTTATT --/TA TTTATTTTTT 2063 hom 15 het 10 0 6 4 TA 0 1 375515 CASAVA_Build 17 42436089 1I TATATTTGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 12 12 10 T 10 11 375516 CASAVA_Build 17 42452116 1I AGAGGCTCCG -/C CAAGTGCCTG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 C 1 2 375517 CASAVA_Build 17 42470359 6D CTCTCATTTC TAATTT/------ TAATAATTTG 3070 het 3070 ref 30 16 8 6 TAATTT 1 0 375518 CASAVA_Build 17 42483348 1I AAGTCAGGAG -/T TTTGAGACCA 1685 het 867 hom 10 3 4 3 T 3 4 375519 CASAVA_Build 17 42493417 1I ATTTTTACAG -/T TTTTTTTTAT 2785 het 2785 ref 25 11 7 7 T 8 9 375520 CASAVA_Build 17 42493719 4I CAGAGACAGG ----/CTTA CTTTGTTGCC 3070 het 3070 ref 37 18 13 6 CTTA 0 1 375521 CASAVA_Build 17 42524583 1D ACTCAGGCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 72 het 25 0 25 0 A 10 9 375522 CASAVA_Build 17 42534599 5I39M1D CCCAGGCTGG -----AGTGGCACGATCTTGGCTCCCTGCAAGCTCTGCCCCCCCA/AGTACAGTGGCACGATCTTGGCTCCCTGCAAGCTCTGCCCCCCC- AGGTTCAAGT 3070 hom 30 het 11 0 10 4 N/A 0 0 375523 CASAVA_Build 17 42543637 3I CTGTATGCTT ---/TTC TTAATACACA 2894 het 2894 ref 21 11 7 3 TTC 0 1 375524 CASAVA_Build 17 42562361 3I AAACTGTGTT ---/AAA AACACTCCTG 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 2 5 375525 CASAVA_Build 17 42564209 1D AATTTTTAAA T/- TTTTTTTGTA 2316 het 2316 ref 14 7 5 2 T 8 7 375526 CASAVA_Build 17 42564459 4I AATTCTGTGA ----/TTTT TTTTTTATGC 3070 het 3070 hom 39 16 16 7 T 6 10 375527 CASAVA_Build 17 42570171 1I ATTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 13 16 19 T 13 14 375528 CASAVA_Build 17 42589760 1I CTGTGAAGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2316 hom 39 9 17 13 A 13 14 375529 CASAVA_Build 17 42589955 3I AGCTGTAAAT ---/TTA GAAAATAAAC 3070 het 3070 ref 47 22 21 4 TTA 0 1 375530 CASAVA_Build 17 42590986 1D TTATTCTTAA T/- TTTTTTTTTT 1497 het 1497 ref 32 16 5 11 T 17 16 375531 CASAVA_Build 17 42595592 1I ACAAAAAGAC -/A AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 41 20 18 3 A 8 9 375532 CASAVA_Build 17 42610919 2D TAAAAATAAG AA/-- AAAAAAAAAA 2913 het 2482 hom 15 7 7 2 A 15 13 375533 CASAVA_Build 17 42611700 1I ATATTGTCCA -/G CCAAGAAAAC 3070 het 3070 ref 42 25 15 2 G 0 1 375534 CASAVA_Build 17 42620217 1I CAGCCAGAAT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 60 het 25 0 21 4 A 9 10 375535 CASAVA_Build 17 42629458 12D CCTTAAAGGG TTTTTTTTTTTT/------------ TTTTTTTTTT 2236 het 1382 hom 14 4 6 4 T 24 12 375536 CASAVA_Build 17 42630046 2I AATACATGAG --/AT ATTCAGCACT 3070 het 3070 ref 59 28 26 5 AT 1 2 375537 CASAVA_Build 17 42631682 1D AAAAAAAAAA C/- CCCAGAAAAA 2507 het 2507 ref 25 15 8 2 C 4 3 375538 CASAVA_Build 17 42643097 11I GCAAGGGACA -----------/GGAGTTAAGGT GGAACTGCTT 3070 het 3070 ref 35 17 12 7 GGAGTTAAGGT 0 1 375539 CASAVA_Build 17 42646103 1D ACTTCCCTTT G/- GGGGGCCTTT 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 G 6 5 375540 CASAVA_Build 17 42649532 1I GTAAAAAAGA -/T TAAATCCTGC 3070 hom 38 het 14 0 13 1 T 1 2 375541 CASAVA_Build 17 42671078 1D GTCCCACCCA C/- GCCGTGTGAT 3070 hom 66 het 26 0 20 6 C 1 0 375542 CASAVA_Build 17 42676375 3D CCCTCCTTTC TTT/--- TTTTTCTTTC 2432 het 2218 hom 19 8 8 3 T 8 5 375543 CASAVA_Build 17 42688839 1D CAGAGTAATA C/- CCCCCCCCCC 1029 het 1029 ref 27 11 6 10 C 11 10 375544 CASAVA_Build 17 42692440 2I TATGTTTATT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 TG 7 8 375545 CASAVA_Build 17 42692705 1D CCTGCCCCTT C/- CCCACCACCT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 C 4 3 375546 CASAVA_Build 17 42693162 1D AGTTTATTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2548 hom 35 10 20 5 T 11 10 375547 CASAVA_Build 17 42695841 1D CTATTCCCCG C/- CCCCCCCACC 3070 het 1261 hom 25 6 11 8 C 8 7 375548 CASAVA_Build 17 42704720 1I CGCTTGGCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 9 13 3 T 10 11 375549 CASAVA_Build 17 42719390 5D CATGGCTGAA TTTGT/----- TTTGTCTCCT 3070 het 3070 ref 44 25 17 3 TTTGT 2 1 375550 CASAVA_Build 17 42731397 12D TATTCAGAAA AGGGCAAGAGAG/------------ AGGGCAAGAG 2580 het 2580 ref 31 16 8 8 AGGGCAAGAGAG 1 0 375551 CASAVA_Build 17 42740881 1I TTTCTTTCTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 15 9 5 T 9 10 375552 CASAVA_Build 17 42752481 1D CTCTTACTGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 14 10 16 T 12 11 375553 CASAVA_Build 17 42753377 1D AAAAAAAAGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 2118 hom 20 8 11 1 A 10 9 375554 CASAVA_Build 17 42770924 2I TTACTACTAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 12 6 T 11 13 375555 CASAVA_Build 17 42771261 1I ATAAGTCAGT -/A AAAAAAGAGC 3070 het 3070 ref 19 11 8 0 A 6 7 375556 CASAVA_Build 17 42773830 1I TCAAGCGATT -/C TTATGCCTCA 3070 het 2282 hom 22 5 13 4 C 0 1 375557 CASAVA_Build 17 42778415 3D AAATTTTATT GTG/--- GTAAAAATAT 3070 het 3070 ref 30 16 11 3 GTG 1 0 375558 CASAVA_Build 17 42778806 1I TTACCCCCCC -/G CCCCATTTAT 3070 het 45 hom 28 3 18 7 G 0 1 375559 CASAVA_Build 17 42779783 1D CAGAAGAATG A/- AAAAATCTTG 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 A 6 5 375560 CASAVA_Build 17 42782967 1I TGTGTGTGTG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 42 17 19 6 T 9 10 375561 CASAVA_Build 17 42788470 1D ATCCTGTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 25 14 5 T 11 10 375562 CASAVA_Build 17 42791987 1D TTTTTTTCAA T/- TTTTTTTTTA 3047 het 2104 hom 16 6 7 3 T 10 9 375563 CASAVA_Build 17 42804281 2D GCCCGGCCTC TG/-- TGTCTATTTT 2463 het 2463 ref 18 10 6 2 TG 2 1 375564 CASAVA_Build 17 42808705 1I TTAAAACCTT -/G GGTTAAAGGA 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 G 2 3 375565 CASAVA_Build 17 42811929 1I ATATGGTTTG -/T TTTTTTTTTT 1129 het 1129 ref 35 25 3 7 T 11 12 375566 CASAVA_Build 17 42812466 1I TTTATTATAC -/T TTTAAGTTCT 3070 het 3070 ref 32 15 10 7 T 3 4 375567 CASAVA_Build 17 42821281 4D CAACACTTGA TTTT/---- TTTTTTTATT 3070 het 3070 hom 39 14 23 3 T 11 7 375568 CASAVA_Build 17 42822306 4D TGTATCTTGC TGTA/---- TGTACTATTT 3070 het 3070 hom 32 12 19 3 TGTA 2 1 375569 CASAVA_Build 17 42822604 2D AAAACTTATT GA/-- GAGAGGGGTA 3070 het 3070 ref 39 20 16 3 GA 3 2 375570 CASAVA_Build 17 42825467 1I TGAGATACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 12 22 10 A 10 11 375571 CASAVA_Build 17 42827227 2D TTATTAGCAC AG/-- AGTTATATAG 3070 het 3070 ref 50 26 19 6 AG 2 1 375572 CASAVA_Build 17 42833482 1I AATACTGCAA -/T AAAGACATGC 3070 het 3070 ref 51 25 24 2 T 0 1 375573 CASAVA_Build 17 42839430 1D ATGATTCTCT A/- AAATGGGTGA 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 A 4 3 375574 CASAVA_Build 17 42842484 1I TAATTTGTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 12 15 10 A 12 13 375575 CASAVA_Build 17 42845611 1D TCTGCTTTCA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 30 17 9 4 T 10 9 375576 CASAVA_Build 17 42846605 2I TGACTGTGTA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 TG 6 7 375577 CASAVA_Build 17 42850740 1I GGATACATAC -/G TTTCTCCTCA 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 0 1 375578 CASAVA_Build 17 42860493 2D AAACATTGAC TA/-- TGATTTTTGA 3070 het 3070 ref 39 18 18 3 TA 1 0 375579 CASAVA_Build 17 42860689 1I ATGATTTACT -/C CTTTATTTTA 3070 het 3070 hom 49 20 22 7 C 1 2 375580 CASAVA_Build 17 42865792 3I CCCCATGCTC ---/AAG AAGAAGAAAA 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 AAG 2 3 375581 CASAVA_Build 17 42866680 1D CAACAGCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 39 24 9 6 A 10 9 375582 CASAVA_Build 17 42868089 2I GTAAACAATC --/AT ATCATCTGCA 3070 het 3070 ref 37 21 10 6 AT 1 2 375583 CASAVA_Build 17 42879248 1I GGACACTGTC -/A AGAGTCTAAA 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 A 1 2 375584 CASAVA_Build 17 42880904 4D TTAAAAAAGC ATAT/---- ATATATATAT 2213 het 1208 hom 19 4 7 8 AT 11 9 375585 CASAVA_Build 17 42883676 2D AATGGAAAAC AT/-- AGATTATTCA 2440 het 2440 ref 40 27 6 8 AT 1 0 375586 CASAVA_Build 17 42884754 1I GTTTGTTCTC -/T TTTTTTTTTT 2938 het 2938 ref 24 13 8 4 T 10 11 375587 CASAVA_Build 17 42893440 4I GATTCAATAA ----/AAGC AATAGAGAGG 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 AAGC 0 1 375588 CASAVA_Build 17 42897879 1D CTACCGCCCC A/- AAAAGGCTTT 3070 het 3070 ref 46 21 18 8 A 5 4 375589 CASAVA_Build 17 42899381 1I AAGAATATTT -/G GAAAGGAATA 3070 het 3070 ref 24 10 12 2 G 1 2 375590 CASAVA_Build 17 42906953 5I GAATAAAAGT -----/AAAAA AAAAGAGATC 2960 het 2960 ref 28 15 7 6 A 4 9 375591 CASAVA_Build 17 42909192 3D TAGCTCACCA CAG/--- CCTCAAAAAT 3070 het 3070 ref 29 14 10 7 CAG 1 0 375592 CASAVA_Build 17 42909894 1D CCTGGGTGAC A/- AGAGTGAAAC 2897 het 2818 hom 19 7 8 4 A 2 1 375593 CASAVA_Build 17 42911638 1D TCTCAAAAAA C/- AAAAACAAAA 2255 het 2255 ref 16 8 8 0 C 1 0 375594 CASAVA_Build 17 42913529 4D GTCTATCTCA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 14 7 7 0 AAAC 5 4 375595 CASAVA_Build 17 42914459 1I TTGTCTCTAC -/A AAAAAAAAGT 2827 het 2278 hom 13 5 6 2 A 8 9 375596 CASAVA_Build 17 42918682 2D CTGAGACTCC CT/-- CTCAAAAAAA 2381 het 760 hom 22 4 10 9 CT 2 1 375597 CASAVA_Build 17 42923285 4D GACTTCGTGC TTAA/---- TTAAATATTA 3070 het 3070 ref 26 14 11 2 TTAA 2 1 375598 CASAVA_Build 17 42925665 4I TCTCAAAAAA ----/AAAC AAAAAAAGAG 2119 het 2119 ref 36 25 5 6 AAAC 0 1 375599 CASAVA_Build 17 42929509 5I AAAAAATAAA -----/TAAAT TAAATAAATG 3070 het 3070 hom 21 8 11 2 TAAAT 1 2 375600 CASAVA_Build 17 42939962 1D ACCTGGCCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 20 0 13 7 T 11 10 375601 CASAVA_Build 17 42956493 1D CAACATGGTG A/- AACCCCCTCT 1578 het 29 hom 6 0 4 2 A 3 2 375602 CASAVA_Build 17 42965448 1D GTTGTCTTTG A/- AAAACCAAGA 1322 het 1322 ref 39 32 3 4 A 5 4 375603 CASAVA_Build 17 42971861 1D32M1D TAACGTTTTG CCCCATTTTCATCAGACTGTGCATGCTTTTTTTG/-CCCATTTTCATCAGACTGTGCATGCTTTTTTT- GGGGGGGAAT 3070 het 3070 ref 28 15 14 7 N/A 0 0 375604 CASAVA_Build 17 42975181 1D AAAATAAATG C/- ATATAAGCAA 3070 het 3070 ref 52 29 19 4 C 1 0 375605 CASAVA_Build 17 42978409 16D CATATGTGGG GTGTGTGTGTGTGTGT/---------------- GTGTGTGTGT 347 het 347 ref 38 18 4 22 GT 15 7 375606 CASAVA_Build 17 42978864 5D TATTGTGAAA TAAAG/----- TAAATGTCAC 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 TAAAG 1 0 375607 CASAVA_Build 17 42983267 1D GCTGGGATTA C/- CAGGCATGAG 3070 het 3070 ref 41 28 10 3 C 2 1 375608 CASAVA_Build 17 42995151 2I AGTTAATTGT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 14 9 10 A 12 14 375609 CASAVA_Build 17 42998185 2I ACCCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 1107 het 1107 ref 34 9 7 18 A 14 16 375610 CASAVA_Build 17 43000947 4D5M1D AAATAAGCAG TCTCTTCTCA/----TTCTC- TTCCTGGCAG 3070 het 2867 hom 14 6 8 2 N/A 0 0 375611 CASAVA_Build 17 43004408 1I GTGAGCGGGC -/A AGCCACTCTC 1399 het 1399 ref 25 13 6 6 A 1 2 375612 CASAVA_Build 17 43007531 2I CCAGTCTACC --/CT GTCTTCTTTC 3070 het 3070 ref 46 27 16 3 CT 0 1 375613 CASAVA_Build 17 43010969 3D TTGCTCTTAT ACA/--- ACAATAGAAT 3070 het 3070 ref 36 18 15 4 ACA 2 1 375614 CASAVA_Build 17 43012770 1I CTCTAAACAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 45 33 10 2 T 9 10 375615 CASAVA_Build 17 43014782 2I CTGTTCTGTG --/CT CTGTGTTGTG 3070 het 3070 ref 58 33 22 3 CT 1 2 375616 CASAVA_Build 17 43015661 1D AAAAGCAAAA G/- GTCTTGGGCT 3070 het 3070 hom 82 31 48 3 G 2 1 375617 CASAVA_Build 17 43019571 2I TAAATTTGTT --/TC TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 22 11 9 TC 1 2 375618 CASAVA_Build 17 43024428 1I GGGATAAGGT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 A 9 10 375619 CASAVA_Build 17 43029533 5D CATACCCACT TATAA/----- TATCAATTGT 3070 het 3070 ref 37 22 12 5 TATAA 1 0 375620 CASAVA_Build 17 43032192 1D GAAATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 11 11 T 12 11 375621 CASAVA_Build 17 43039110 27I GCTGGTCCCA ---------------------------/GCTTCTATGTCTTTTCTTCATTGATTC AACAAATATT 3070 hom 57 het 21 0 20 3 GCTTCTATGTCTTTTCTTCATTGATTC 0 1 375622 CASAVA_Build 17 43046347 1I TATTATTATT -/A TTTTTTTTTT 3070 het 3038 hom 33 12 18 3 A 0 1 375623 CASAVA_Build 17 43047439 9D ACTTTCTTTC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2310 het 1698 hom 19 7 7 5 T 23 14 375624 CASAVA_Build 17 43049980 4I TTTTTATAAG ----/TAAT TACAGTATTC 3070 het 3070 ref 34 18 12 4 TAAT 0 1 375625 CASAVA_Build 17 43050242 1D CAAAGCATCA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 39 18 13 8 T 10 9 375626 CASAVA_Build 17 43053059 1D ATTTCTAAAA G/- GTCTATGTTT 3070 het 3070 ref 42 20 18 4 G 2 1 375627 CASAVA_Build 17 43054791 1D TCCAAGTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 T 13 12 375628 CASAVA_Build 17 43055384 3I ACAGTATATC ---/CTA CTAATAAGCC 3070 het 3070 hom 37 13 20 4 CTA 1 2 375629 CASAVA_Build 17 43056027 1D GAACTCAGAA T/- TTTGCAATCA 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 4 3 375630 CASAVA_Build 17 43070430 1D CCTAGATCAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1554 hom 26 6 15 6 T 10 9 375631 CASAVA_Build 17 43075627 1I TCTGCCACCA -/C CCGCCCCCCA 3070 het 3070 hom 27 11 10 6 C 2 3 375632 CASAVA_Build 17 43080675 1D AAAATCTTCA T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 45 het 17 0 15 2 T 8 7 375633 CASAVA_Build 17 43088625 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 10 11 2 A 11 10 375634 CASAVA_Build 17 43089209 3D ATCTTTTGTC TTT/--- TTTTTTGGTG 3070 het 3070 hom 45 20 22 5 T 9 6 375635 CASAVA_Build 17 43101386 1I GAATTCAGTC -/T TTCAGTCTTT 3070 het 3070 ref 26 12 9 5 T 2 3 375636 CASAVA_Build 17 43109569 1D TAAATATCGA C/- CAGGCTGGGC 3070 hom 60 het 21 0 20 1 C 2 1 375637 CASAVA_Build 17 43115958 1D CAAACAGGAT A/- AATTAAATGT 3070 het 3070 ref 29 17 11 2 A 3 2 375638 CASAVA_Build 17 43116105 1D AAAGTGTGTG T/- TGTGTGAATA 3070 het 293 hom 31 1 23 7 T 2 1 375639 CASAVA_Build 17 43118408 4D CATTGTCCTC TGTT/---- TGTGCCTATT 3070 het 3070 ref 45 22 19 6 TGTT 1 0 375640 CASAVA_Build 17 43135359 2D GCGGGGGGGG GA/-- ACTTCTTGAA 2309 hom 28 het 14 0 9 5 GA 1 0 375641 CASAVA_Build 17 43137170 2I TCGTTTCCAG --/AA AAGTGTGTGA 3070 hom 119 het 43 0 40 3 A 2 4 375642 CASAVA_Build 17 43171847 1I AGTATGGCCT -/G GGCGCGGTGG 3070 hom 27 het 12 0 9 3 G 2 3 375643 CASAVA_Build 17 43201010 1D TCATCACAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 11 11 15 T 15 14 375644 CASAVA_Build 17 43212939 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 607 het 607 ref 19 12 2 5 A 13 12 375645 CASAVA_Build 17 43213193 1D CCCCAGAGTT G/- GGGGGGGGGG 3070 het 166 hom 32 4 13 15 G 12 11 375646 CASAVA_Build 17 43229844 1D TTGAGCTTTG T/- TAACTCTTTT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 2 1 375647 CASAVA_Build 17 43232692 4I TAGTGAATAT ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 hom 90 het 40 0 31 10 TTTC 3 4 375648 CASAVA_Build 17 43233392 1I GGGGCAGGTG -/C CCATTTCTGC 3070 hom 68 het 28 0 22 6 C 2 3 375649 CASAVA_Build 17 43244875 4D CATTGTCCAC CTCA/---- CTAACTGGCA 3070 hom 102 het 38 0 34 5 CTCA 1 0 375650 CASAVA_Build 17 43258351 1D TAAAAATACG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 78 hom 16 1 12 3 A 12 11 375651 CASAVA_Build 17 43262260 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 19 0 15 4 A 13 14 375652 CASAVA_Build 17 43307451 5D CCACCCGGCT TCTTC/----- TCTTCTCAGA 2273 het 2273 ref 23 10 7 8 TCTTC 2 1 375653 CASAVA_Build 17 43327407 2D TTTTTGTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1479 hom 45 14 23 9 T 20 18 375654 CASAVA_Build 17 43337079 1I TTGAAATTTG -/T TTTTACTGTT 2360 het 2360 ref 22 16 5 1 T 4 5 375655 CASAVA_Build 17 43347580 1I ATTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 14 13 11 A 13 14 375656 CASAVA_Build 17 43351368 2I AGATGCAAAT --/AC ACACACACAC 3070 hom 54 het 29 0 17 12 AC 6 7 375657 CASAVA_Build 17 43354890 2D GACCAGAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 2954 het 1982 hom 26 10 11 5 T 12 10 375658 CASAVA_Build 17 43356705 1I TCTCCCTATA -/T TGCCCAGGCT 3070 hom 90 het 35 0 27 8 T 1 2 375659 CASAVA_Build 17 43360792 2I TTGCCTTATA --/CT CTCTACTTCA 3070 hom 90 het 38 0 31 7 CT 2 3 375660 CASAVA_Build 17 43365800 2I ACCCCTCTGC --/AG AGTCAGAGGG 3070 hom 99 het 37 0 33 4 AG 1 2 375661 CASAVA_Build 17 43384962 4D GTCTGGCTCA CTCT/---- CTCCATTCCC 3070 het 3070 hom 40 14 20 8 CT 3 1 375662 CASAVA_Build 17 43393312 1D AACTCTGTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2575 hom 20 8 9 4 A 15 14 375663 CASAVA_Build 17 43393448 1D CCTAAGGGAG C/- CCCAAGGACC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 4 3 375664 CASAVA_Build 17 43405036 1I TCATTGAGGG -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 41 0 35 6 T 9 10 375665 CASAVA_Build 17 43418791 14I CTAATCCACC --------------/CTTTCAGTGTTGCT CTGGGCCTTT 3070 hom 68 het 27 0 22 5 CTTTCAGTGTTGCT 0 1 375666 CASAVA_Build 17 43437944 1D AATACCCAGC T/- TTTTTTTTTT 1857 het 555 hom 22 5 7 10 T 19 18 375667 CASAVA_Build 17 43438930 3D TGTTGCAAGA ATT/--- ATTATTATAG 2560 het 2560 ref 24 14 9 1 ATT 3 2 375668 CASAVA_Build 17 43450001 6D ACAGGGCAGA AAGAGG/------ AAGAGGTAAG 3070 hom 84 het 29 0 26 3 AAGAGG 2 1 375669 CASAVA_Build 17 43452049 1D TCTCCCTACC A/- AAAAAAAAAA 3059 hom 16 het 25 0 13 13 A 12 11 375670 CASAVA_Build 17 43452404 1D TAGACTTGTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 30 het 16 0 9 7 T 9 8 375671 CASAVA_Build 17 43455644 2D AGAGGTAAGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 28 15 10 4 T 12 10 375672 CASAVA_Build 17 43457198 1D CCGAATACTC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 91 hom 46 3 40 3 T 9 8 375673 CASAVA_Build 17 43470808 4D TGGTCTAAGT CTAA/---- CTAAGACAAG 3070 het 3070 ref 50 29 18 6 CTAA 2 1 375674 CASAVA_Build 17 43479390 1D ACTAGCTCAG A/- AGTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 36 15 15 6 A 2 1 375675 CASAVA_Build 17 43481492 1D GAAGTTGGTA G/- ATGGGTCACA 3070 het 3070 hom 50 21 24 5 G 1 0 375676 CASAVA_Build 17 43486209 1I TGAAAGGGGA -/G GGGGGGACAT 3070 het 3070 hom 40 12 19 9 G 6 7 375677 CASAVA_Build 17 43487939 1D CCTGGGGTAT G/- GTGAGGGAAT 3070 het 597 hom 39 3 18 19 G 2 1 375678 CASAVA_Build 17 43487955 2D GGAATGAGAG CA/-- CTGGTGTAGG 3070 het 1694 hom 40 5 19 17 CA 1 0 375679 CASAVA_Build 17 43489236 2I GACTCTTTCA --/CT CTCTCTTCTG 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 CT 3 4 375680 CASAVA_Build 17 43497656 5I GTGTGAAACT -----/TAACA TTACAAGTTC 3070 het 3070 hom 47 17 26 4 TAACA 0 1 375681 CASAVA_Build 17 43505487 1I TGTCTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 12 15 6 A 10 11 375682 CASAVA_Build 17 43507715 1I GCCACCACGT -/C CAGCTAATTT 3070 het 3070 ref 21 12 7 2 C 1 2 375683 CASAVA_Build 17 43509618 1I TACAGCAAAC -/T TTTTTTTTTT 2008 het 2008 ref 25 8 6 11 T 15 16 375684 CASAVA_Build 17 43517923 1I TGGCTCTGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 13 10 A 13 14 375685 CASAVA_Build 17 43534821 1I AACTTCGTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2729 hom 18 7 10 1 A 11 12 375686 CASAVA_Build 17 43542355 8D AGATGTATGA GCTCCACT/-------- GAGTGGATGA 3070 het 3070 ref 32 25 8 0 GCTCCACT 1 0 375687 CASAVA_Build 17 43552097 8I ATTGGCATAA --------/GCCACTGT GCCTGGCCTA 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 GCCACTGT 0 1 375688 CASAVA_Build 17 43555783 1I CTACTCAGCC -/A AAAAAAACAG 3070 het 3070 ref 36 16 15 5 A 7 8 375689 CASAVA_Build 17 43569190 1D ACCTGACTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2591 hom 20 7 9 4 T 12 11 375690 CASAVA_Build 17 43599230 1D CAATTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2728 het 2728 ref 22 10 7 5 T 12 11 375691 CASAVA_Build 17 43601465 1D CATGAGGAAC A/- AAAGGTTTTT 3070 het 3070 hom 40 13 17 10 A 4 3 375692 CASAVA_Build 17 43616361 2I AGGAAACAAT --/AC ACACACACAT 3070 het 3070 ref 35 17 11 7 AC 4 5 375693 CASAVA_Build 17 43662446 1I ATGCCCCTTT -/G GGTTAGAATG 3070 het 3070 ref 36 17 14 5 G 2 3 375694 CASAVA_Build 17 43663907 1I ATGAGTTAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 10 11 7 A 10 11 375695 CASAVA_Build 17 43667796 2I TAGCTTTCAC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 50 20 19 11 T 12 14 375696 CASAVA_Build 17 43670281 1D TTGGTTCAGA T/- TTTTTTTTTT 2010 het 2010 ref 38 15 7 16 T 17 16 375697 CASAVA_Build 17 43672785 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAAAGCA 3070 het 3070 ref 30 20 9 2 A 8 7 375698 CASAVA_Build 17 43705784 1D TTTATCACTG T/- TTTTTTTTTT 3064 het 3064 ref 31 15 9 7 T 13 12 375699 CASAVA_Build 17 43714713 1D TTTTTTTAAC T/- TTGTACTTTG 3070 het 3070 ref 31 18 9 6 T 3 2 375700 CASAVA_Build 17 43724506 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 3070 het 2661 hom 25 9 13 4 AAG 1 0 375701 CASAVA_Build 17 43734674 1D ATAAATATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 35 20 13 2 T 10 9 375702 CASAVA_Build 17 43741930 2D CTATGCACAG AT/-- ATAAATATAT 3070 het 3070 ref 35 17 15 5 AT 2 1 375703 CASAVA_Build 17 43743141 1D AAAGATGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 A 11 10 375704 CASAVA_Build 17 43769058 4I CTATATTTGA ----/TAAT TAATTAAATG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 TAAT 1 2 375705 CASAVA_Build 17 43782578 1I TTTAAGCATT -/A AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 39 20 17 2 A 7 8 375706 CASAVA_Build 17 43786259 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2250 hom 12 het 8 0 5 3 A 15 14 375707 CASAVA_Build 17 43788452 1I TTATGTCTAC -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 34 15 14 5 A 6 7 375708 CASAVA_Build 17 43790492 1I GTGGAAAGAT -/A ACTTAACAAT 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 1 2 375709 CASAVA_Build 17 43817684 1D TGCACAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 26 11 12 4 A 12 11 375710 CASAVA_Build 17 43824146 1D TACCTCTTCC T/- TTTTTTTTTT 1630 het 1630 ref 40 19 5 17 T 19 18 375711 CASAVA_Build 17 43826258 1D TAGGTTACCA C/- CCCCCCCAAA 3070 hom 78 het 27 0 25 2 C 8 7 375712 CASAVA_Build 17 43833338 1D AACTTGGAAA T/- GTAAGGAATC 3070 het 3070 hom 21 8 12 2 T 1 0 375713 CASAVA_Build 17 43878678 1D GCCTGGGCAA C/- ATGGCGAAAC 3070 het 2214 hom 18 6 9 3 C 1 0 375714 CASAVA_Build 17 43883502 4D GTCTGGGCTC AAAT/---- AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 32 15 14 6 AAAT 4 3 375715 CASAVA_Build 17 43886623 14I AAGGTACAAA --------------/TCTAATTTATGAGG GCTCCACCAT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 TCTAATTTATGAGG 0 1 375716 CASAVA_Build 17 43907153 1I GCCTGTAGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 460 hom 31 4 19 8 T 16 17 375717 CASAVA_Build 17 43912861 19D TACACTCCAG CCTGGACAACAGAGCAAGA/------------------- CCTTGTCTCA 3070 hom 30 het 16 0 10 7 CCTGGACAACAGAGCAAGA 1 0 375718 CASAVA_Build 17 43928932 1D TTTAAAAAAA G/- TTAGCTGGGC 2723 het 451 hom 9 1 6 3 G 1 0 375719 CASAVA_Build 17 43939617 9I TCTCTCCCTC ---------/TTTTTTTTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 30 11 11 8 T 9 18 375720 CASAVA_Build 17 43947250 1D TAGAAACTGG A/- ACCTTCAACT 3070 het 3070 hom 40 14 18 8 A 2 1 375721 CASAVA_Build 17 43952350 1D TCTCCCTAGG A/- GGGGGGTCCT 2657 het 2657 ref 17 10 7 0 A 1 0 375722 CASAVA_Build 17 43954155 2D GTCTCTAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 55 het 42 0 22 22 A 16 14 375723 CASAVA_Build 17 43955012 5I CTCCACCCAA -----/CCCTC CTATTTCCAT 3070 hom 129 het 50 0 44 6 CCCTC 0 1 375724 CASAVA_Build 17 43955110 5D ATAATTTAAC TTATA/----- TTAAAGACTG 3070 het 3070 hom 37 17 18 6 TTATA 1 0 375725 CASAVA_Build 17 43959066 1D CTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 42 0 34 8 T 10 9 375726 CASAVA_Build 17 43959261 5I TTTGGCTGCC -----/TCTTT TCCCTCGAAA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 TCTTT 0 1 375727 CASAVA_Build 17 43967244 1D CATGGTGAAA C/- CCCCATCTCT 3070 hom 50 het 19 0 17 2 C 5 4 375728 CASAVA_Build 17 43976695 1D AGAGAGACAG A/- AAAAAAAAAA 2856 het 2481 hom 24 7 8 9 A 11 10 375729 CASAVA_Build 17 43977302 1D GGGGGCTGCT G/- GGGGGGGCGT 671 het 571 hom 9 3 3 4 G 8 7 375730 CASAVA_Build 17 43981811 4I CCCTGCCTGG ----/GACA GACAGTTTGT 3070 hom 83 het 38 0 26 12 GACA 1 2 375731 CASAVA_Build 17 43982261 1D ATAATTGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 36 0 29 7 A 11 10 375732 CASAVA_Build 17 43985569 3D CACCAGGAAG ACA/--- ACAACAGCCT 3070 het 3070 ref 49 25 21 6 ACA 3 2 375733 CASAVA_Build 17 43992761 1D AGCTCTTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 30 0 28 2 T 10 9 375734 CASAVA_Build 17 43997387 3D GGAGTTTGAG GGA/--- GGAGATGTGG 3070 hom 66 het 23 0 23 1 GGA 2 1 375735 CASAVA_Build 17 44000999 2D GACGCGCACG CA/-- CACACACGCG 3070 het 2290 hom 35 10 17 8 CA 4 3 375736 CASAVA_Build 17 44001427 1I TCTCTCCCCC -/T CTCTCTTTTT 3070 het 3070 hom 21 8 9 4 T 0 1 375737 CASAVA_Build 17 44006512 1I CATAGAAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2906 hom 28 11 14 3 T 10 11 375738 CASAVA_Build 17 44009512 1D TGAGGGAGAG C/- GGGGAAAAAC 3070 hom 68 het 34 0 21 13 C 1 0 375739 CASAVA_Build 17 44030771 1D CCTATCAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 35 0 24 11 T 11 10 375740 CASAVA_Build 17 44042439 1I CTTATCCGAG -/C TGGGGCAGGG 3070 hom 44 het 17 0 12 5 C 0 1 375741 CASAVA_Build 17 44093959 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 359 het 85 hom 13 1 6 6 T 16 15 375742 CASAVA_Build 17 44101068 3D GTTCACCATT CTC/--- CTGCCTCAGC 3070 hom 30 het 11 0 11 1 CTC 1 0 375743 CASAVA_Build 17 44113682 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 14 0 12 2 T 12 11 375744 CASAVA_Build 17 44118593 1D GCATAAATTC A/- ATGTTTGATA 3070 hom 143 het 50 0 48 2 A 2 1 375745 CASAVA_Build 17 44134403 4D GGAGTGGGTG TTTC/---- TCATTACTGC 3070 hom 124 het 47 0 40 9 TTTC 1 0 375746 CASAVA_Build 17 44140560 1D AAAATTATCT C/- CCGCATTATT 3070 hom 111 het 40 0 37 3 C 3 2 375747 CASAVA_Build 17 44141427 1D CCCATTTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 59 het 36 0 28 8 A 14 13 375748 CASAVA_Build 17 44146930 2D CTACAAGAAA TG/-- TGATTCAATT 3070 hom 90 het 34 0 30 5 TG 2 1 375749 CASAVA_Build 17 44150502 1D TTTGAGGCTC T/- TTTTTTTTTT 2605 het 103 hom 17 1 9 7 T 15 14 375750 CASAVA_Build 17 44169258 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2889 het 38 hom 11 1 8 2 A 11 10 375751 CASAVA_Build 17 44171717 1I GAACTGAGCC -/G GGGACGGTGG 3070 hom 60 het 22 0 18 4 G 3 4 375752 CASAVA_Build 17 44215799 1D AAAAATATTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 40 het 18 0 13 5 T 13 12 375753 CASAVA_Build 17 44219193 6D TTCTGTCATC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 27 0 17 10 T 20 14 375754 CASAVA_Build 17 44235845 1I ATTCCGTGTC -/A AAAAAAAAAA 380 het 380 ref 28 13 6 9 A 11 12 375755 CASAVA_Build 17 44236972 1D CAGATCATCG A/- AAGTAGATTC 3070 hom 102 het 42 0 35 7 A 3 2 375756 CASAVA_Build 17 44238180 1I TTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 35 het 15 0 10 5 A 9 10 375757 CASAVA_Build 17 44238471 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2920 het 692 hom 15 2 10 3 A 15 14 375758 CASAVA_Build 17 44241507 1D CCACTTGTTT C/- TTTCTCTTTC 3070 hom 111 het 40 0 38 3 C 1 0 375759 CASAVA_Build 17 44243430 1D ATTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1654 het 280 hom 20 4 8 8 T 19 18 375760 CASAVA_Build 17 44245704 1I AGCACTTGAG -/C CCAGGGGTTT 3070 hom 72 het 29 0 25 4 C 2 3 375761 CASAVA_Build 17 44256939 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 736 hom 22 2 13 7 A 13 14 375762 CASAVA_Build 17 44265908 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 145 hom 20 2 10 9 A 16 15 375763 CASAVA_Build 17 44288225 1D CAGCTAAACC A/- AAAAAAAAAA 2992 het 1282 hom 45 10 12 23 A 19 18 375764 CASAVA_Build 17 44306542 1D TTTTTCTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 31 0 20 11 T 12 11 375765 CASAVA_Build 17 44322809 1I AAAAATTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 12 3 A 12 13 375766 CASAVA_Build 17 44328139 1D GAGGCTCCAT G/- GGGGGGTCAC 3070 hom 64 het 24 0 20 4 G 7 6 375767 CASAVA_Build 17 44361371 1I AGTTTTTTTG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 93 het 37 0 31 6 T 8 9 375768 CASAVA_Build 17 44370851 1I7M1D GAGCAAAACT -CCATCTCA/CCCATCTC- AAAAAAAAAA 2595 het 75 hom 17 1 14 3 N/A 0 0 375769 CASAVA_Build 17 44375970 4D CTCCCTCAAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 99 het 42 0 33 10 AAAC 6 5 375770 CASAVA_Build 17 44378433 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 35 het 20 0 10 11 A 15 14 375771 CASAVA_Build 17 44383399 4D GCCTAGTCCC TTTT/---- TTTTTTTTTT 2211 het 408 hom 40 7 8 25 T 20 16 375772 CASAVA_Build 17 44399721 5D TTCCTTTTTC TTTTT/----- TTTTTTTTTT 3070 hom 52 het 28 0 18 10 T 18 13 375773 CASAVA_Build 17 44407509 1I TGCCCGGTCA -/T TTTATTTTTT 3070 hom 42 het 18 0 15 3 T 3 4 375774 CASAVA_Build 17 44418212 2D AAAAAAAAAA AC/-- GAAGCAATAT 3070 hom 90 het 33 0 31 2 AC 1 0 375775 CASAVA_Build 17 44433302 1I53M1I AAGACTGGGT -AAAAAAAAAAAATCTGTCCACACCCATATTAAATTAGATCTTTTATGTGTTCT-/AAAAAAAAAAAAATCTGTCCACACCCATATTAAATTAGATCTTTTATGTGTTCTC CCCCTTCCTG 3070 het 474 hom 35 3 20 34 N/A 0 0 375776 CASAVA_Build 17 44436668 7D CCCCCTCACC GGCTGCG/------- GGCTGCGGGC 3070 hom 62 het 23 0 17 7 GGCTGCG 2 1 375777 CASAVA_Build 17 44441739 2I CTTTGGAAAC --/TT TTAGGTTTTT 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 2 4 375778 CASAVA_Build 17 44445587 4D TTCTCACCCC CAAA/---- CAAATGTCCT 3070 hom 114 het 45 0 39 7 CAAA 2 1 375779 CASAVA_Build 17 44453332 1D TCTACAAATT A/- AAAAAAAAAA 1462 het 384 hom 28 2 9 17 A 19 18 375780 CASAVA_Build 17 44464368 1D TGGGTGCGGT G/- GGGGGGGGTT 2472 hom 27 het 11 0 8 4 G 9 8 375781 CASAVA_Build 17 44464819 1D TGTGGGGTCC T/- TTTAGTCCCA 3070 hom 156 het 56 0 52 4 T 4 3 375782 CASAVA_Build 17 44469304 5D TCTCAAGAAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 hom 51 het 20 0 18 5 AAAAC 3 2 375783 CASAVA_Build 17 44480076 1D CAACTTCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 37 1 17 19 T 17 16 375784 CASAVA_Build 17 44492999 1I GCGTGTCCGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 187 hom 24 1 15 8 T 12 13 375785 CASAVA_Build 17 44493069 1D GGAAAAGCAA G/- GCAGAGGGTA 3070 hom 37 het 16 0 9 8 G 2 1 375786 CASAVA_Build 17 44537797 2D AGACTTAGCA AC/-- ATGATGATCA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 AC 1 0 375787 CASAVA_Build 17 44550599 1D2M3D TTGACTGATG TCAGTT/-CA--- TAAACTTATT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 N/A 0 0 375788 CASAVA_Build 17 44557038 2I CATTATATTA --/GT GTGCTATTAA 3070 hom 54 het 21 0 19 2 GT 1 2 375789 CASAVA_Build 17 44561552 2D AGAGAGAGAC AG/-- AGAGAGAGAG 3070 hom 47 het 26 0 13 13 AG 9 8 375790 CASAVA_Build 17 44561980 6I TTCTGGCCGA ------/TTTTTT TTTTTTGGTC 1769 hom 24 het 25 0 7 18 T 6 12 375791 CASAVA_Build 17 44562074 2I TTTCTGTGTG --/GC GGGGGGGAAG 3070 hom 61 het 23 0 20 3 GC 0 1 375792 CASAVA_Build 17 44563021 1I TGTCTAGTTG -/A TGTATTACTC 3070 hom 123 het 49 0 41 9 A 0 1 375793 CASAVA_Build 17 44594043 1I AAAGTACTAG -/A AAAAAAAACC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 A 8 9 375794 CASAVA_Build 17 44595818 1D CATTTCAACT C/- CTAATATTAA 3070 hom 66 het 24 0 22 2 C 2 1 375795 CASAVA_Build 17 44606225 10D ATATTTATTT GAGCTTTATG/---------- GACTTGCTTT 3070 het 3070 hom 31 14 15 7 GAGCTTTATG 1 0 375796 CASAVA_Build 17 44618231 1D ACACAGGGTC A/- AAGGAGATTA 3070 het 3070 ref 32 17 13 2 A 3 2 375797 CASAVA_Build 17 44626037 1D GAGAGGGTGA G/- GGGGGGGAGG 3070 het 1553 hom 29 4 16 10 G 8 7 375798 CASAVA_Build 17 44644311 1I CCAGCCAGCC -/T TTTTTTTTTT 2021 het 1242 hom 20 6 7 8 T 13 14 375799 CASAVA_Build 17 44647856 1I CATGGAAAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 20 11 3 T 10 11 375800 CASAVA_Build 17 44671483 1D CTTCCTATCT G/- ACTCCAGTCC 3070 het 3070 ref 50 26 20 5 G 1 0 375801 CASAVA_Build 17 44671732 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 22 0 18 4 T 11 10 375802 CASAVA_Build 17 44672517 3D CCTCCAGCAT TTC/--- TTCCATTCCT 3070 het 3070 hom 39 12 20 9 TTC 2 1 375803 CASAVA_Build 17 44731346 1D GTGCTCAAGC T/- TTTTTTTTTT 1022 het 1022 ref 33 22 4 7 T 11 10 375804 CASAVA_Build 17 44762816 6D ACAGCTAATG TTTAAT/------ TTTAATTTTA 3070 hom 72 het 30 0 25 7 TTTAAT 3 2 375805 CASAVA_Build 17 44774916 5D AACAGATAAA GGGGG/----- GGGGGGGGGG 3070 hom 3 het 31 1 28 3 G 17 12 375806 CASAVA_Build 17 44776562 1D ACTCCGTTTC A/- AAAAAAAAAA 2992 hom 21 het 8 0 8 0 A 12 11 375807 CASAVA_Build 17 44778912 4D AACTCCGTCT CAAA/---- CAAACAAACA 3070 hom 87 het 34 0 30 5 CAAA 4 3 375808 CASAVA_Build 17 44799562 2D8M5I AGGTCAGGAG TTTGAGACCA-----/--TGAGACCAGCCTG CCCAACATGG 3070 hom 95 het 29 0 29 5 N/A 0 0 375809 CASAVA_Build 17 44801973 1I CTCACTTCAG -/T TTTTTTTTGT 3070 hom 80 het 32 0 25 7 T 8 9 375810 CASAVA_Build 17 44806720 1I GTTTCAAAGT -/A TGTGGCGCCA 2020 hom 21 het 10 0 5 5 A 0 1 375811 CASAVA_Build 17 44807627 1D ATAAAATAAT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 27 het 14 0 10 4 A 10 9 375812 CASAVA_Build 17 44849782 1D AATATTTATC A/- CGAAGGATGT 3070 hom 48 het 23 0 17 6 A 1 0 375813 CASAVA_Build 17 44853802 2D GTCCATTTGG TC/-- TGGAGTATAG 3070 hom 69 het 25 0 23 4 TC 1 0 375814 CASAVA_Build 17 44861776 2I GAATATTGCT --/GA GAGAAATTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 GA 2 3 375815 CASAVA_Build 17 44883380 1D AAACCACAGG C/- CCCCCTCCCA 1951 hom 24 het 12 0 8 4 C 6 5 375816 CASAVA_Build 17 44897764 2D AGGTGTGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 1287 het 1287 ref 24 12 8 5 GT 7 6 375817 CASAVA_Build 17 44898266 1I CTTTTACCCC -/T CTTTCCACAC 3070 het 3070 ref 36 16 13 7 T 0 1 375818 CASAVA_Build 17 44901962 2D TTGACCAGTC AT/-- ATTAGAGTCC 3070 het 3070 ref 44 25 15 4 AT 2 1 375819 CASAVA_Build 17 44915536 9D GGCCACTCTC TCCACGTGG/--------- TCCATCTCTT 3070 het 3070 ref 39 22 12 7 TCCACGTGG 1 0 375820 CASAVA_Build 17 44950973 3D GTTGTAGCCA TCC/--- TCCTCCTCCT 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 TCC 5 4 375821 CASAVA_Build 17 44958595 5D CACTTTGGGT CTTTA/----- CTTTACATCT 3070 het 3070 ref 20 10 8 3 CTTTA 2 1 375822 CASAVA_Build 17 44959817 1I CCATCTTTGT -/A AAAAAATAAC 2116 het 2116 ref 23 11 7 5 A 6 7 375823 CASAVA_Build 17 44973969 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1822 het 1822 ref 24 10 7 7 T 12 11 375824 CASAVA_Build 17 44994668 1D TGTTTCTACC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 29 het 28 1 19 8 A 12 11 375825 CASAVA_Build 17 45019817 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2527 het 65 hom 12 2 8 3 A 11 10 375826 CASAVA_Build 17 45020688 2D CAGCTGAGTG CA/-- CAGATTCTGA 3070 hom 87 het 32 0 27 5 CA 2 1 375827 CASAVA_Build 17 45023598 2D AGCCACTGAC CT/-- TATTTCCACT 3070 hom 153 het 53 0 51 3 CT 1 0 375828 CASAVA_Build 17 45041263 1D AGCTCTGCCA T/- TTTTTTTTTT 1684 het 1684 ref 46 31 5 10 T 13 12 375829 CASAVA_Build 17 45043881 4I GCCAGCAGAT ----/AGAG AGACGACTTT 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AG 1 3 375830 CASAVA_Build 17 45051586 1D CAAAGAGGAG A/- ACATTTACCC 3070 het 3070 ref 43 22 19 2 A 2 1 375831 CASAVA_Build 17 45062969 5I TTTTGTTTTC -----/TTTCT TTTAAATTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TTTCT 0 1 375832 CASAVA_Build 17 45070945 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 63 het 25 0 19 6 A 13 12 375833 CASAVA_Build 17 45085150 3D ATTCGCTTCA AAT/--- AATACTTAAG 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 AAT 2 1 375834 CASAVA_Build 17 45113534 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1190 het 1190 ref 23 16 3 5 A 13 12 375835 CASAVA_Build 17 45117518 1D GAGGTTTTAA C/- CTGGGAAATG 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 C 2 1 375836 CASAVA_Build 17 45196839 1D GACGTCAGGC T/- GAGCTGGAGA 3070 hom 72 het 28 0 22 6 T 1 0 375837 CASAVA_Build 17 45203848 1D ATTTCTCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 71 hom 37 1 31 6 A 12 11 375838 CASAVA_Build 17 45221808 14I CCTCTCAGGC --------------/CAGTTGCCTCCAAG CAGTTGCCTC 3070 hom 57 het 20 0 20 0 CAGTTGCCTCCAAG 0 1 375839 CASAVA_Build 17 45228413 1D CAGCTTTGAA T/- TTTCCTTCAT 3070 hom 63 het 26 0 21 5 T 4 3 375840 CASAVA_Build 17 45248780 4D TCCATTCTGA TATT/---- TATTTAGAGC 3070 hom 102 het 40 0 35 6 TATT 2 1 375841 CASAVA_Build 17 45265495 3D GTCCAGGTCA TGT/--- TGTTACCATT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 TGT 2 1 375842 CASAVA_Build 17 45278640 1D TGTTACCTCA T/- TTTTTTTTTT 3042 het 539 hom 29 3 13 13 T 16 15 375843 CASAVA_Build 17 45282534 1D GGAGTGTTTG A/- AGGGAGGACT 3070 hom 96 het 34 0 29 5 A 2 1 375844 CASAVA_Build 17 45310714 1D CTGTGCAACA T/- TAACGAGACC 3070 hom 48 het 18 0 16 3 T 2 1 375845 CASAVA_Build 17 45317255 2D CCAAAGAGCA CC/-- CCCCCCACCC 3070 hom 66 het 26 0 21 5 C 8 6 375846 CASAVA_Build 17 45327484 1D TGGAGGGAGG A/- AGGGAAGTCA 3070 hom 55 het 20 0 16 4 A 2 1 375847 CASAVA_Build 17 45331515 7I AGGCTCGCCC -------/CGAGAAG CGAGAAGCGG 3070 het 2538 hom 34 8 12 14 CGAGAAG 1 2 375848 CASAVA_Build 17 45341680 4I CCCAAGGGTA ----/TTAG TTCAAAATGC 3070 het 3070 hom 37 15 12 10 TTAG 0 1 375849 CASAVA_Build 17 45371015 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 157 hom 24 2 17 5 A 17 16 375850 CASAVA_Build 17 45373546 1D CTGACTCCCC A/- ATCCAGCCTT 3070 het 3070 hom 36 12 19 6 A 2 1 375851 CASAVA_Build 17 45374304 2I TCCTTGTCTC --/AA AAAATTTTTT 3070 het 2598 hom 27 9 11 7 A 4 6 375852 CASAVA_Build 17 45378017 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2036 hom 26 9 16 1 A 13 12 375853 CASAVA_Build 17 45380688 1D GGCTGGTCTC A/- AAACTCCTGA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 A 4 3 375854 CASAVA_Build 17 45384389 9D3M16D TGGCCAGCCA GGCAAGCTGGCTGGGAGCACAGTTGGGG/---------GCT---------------- TGTCTGGCTC 3070 het 3070 ref 28 16 10 7 N/A 0 0 375855 CASAVA_Build 17 45393979 4I AAAGAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAG 3070 hom 87 het 34 0 30 6 AAAG 2 3 375856 CASAVA_Build 17 45397031 1I GGAAATGAGG -/C GGGAACTCCA 3070 hom 41 het 17 0 10 7 C 0 1 375857 CASAVA_Build 17 45411814 1I GTAGGCGGGG -/C GGGGGCAGTC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 C 0 1 375858 CASAVA_Build 17 45427719 2D CTATGCTCTC CT/-- CTCTCTCTCT 3070 het 54 hom 23 2 10 14 CT 8 7 375859 CASAVA_Build 17 45431480 1D ACAGGGATGA G/- GGAAAGGAGA 2357 het 2357 ref 31 18 10 3 G 3 2 375860 CASAVA_Build 17 45433959 7I AGCTGGCTTT -------/CATTGAG CATTGAGTGC 3070 het 3070 ref 39 17 15 7 CATTGAG 1 2 375861 CASAVA_Build 17 45449666 1D ATAATGGAAG T/- TTTTTTTTTT 1501 het 746 hom 26 9 6 11 T 17 16 375862 CASAVA_Build 17 45450724 1I CTTCAGAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1122 hom 38 4 20 14 A 13 14 375863 CASAVA_Build 17 45451340 2I AGACTCCATT --/AA AAAAAAAAAA 2819 het 2819 ref 18 10 7 1 A 10 12 375864 CASAVA_Build 17 45452768 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 492 hom 27 2 23 2 A 12 13 375865 CASAVA_Build 17 45455699 3D TATATAGAGT TCA/--- TCACAGCAAC 3070 het 3070 hom 41 13 23 6 TCA 2 1 375866 CASAVA_Build 17 45455827 2D CGTATATATG TA/-- TACACACACA 3070 hom 80 het 63 2 52 11 TA 2 1 375867 CASAVA_Build 17 45456298 3D TGTCTTGCTG TGA/--- TGAACTCTAT 3070 het 3070 ref 35 16 9 10 TGA 2 1 375868 CASAVA_Build 17 45456350 4I TATACATATA ----/TAAT TGTGTATATA 3070 hom 63 het 29 0 22 7 TAAT 0 1 375869 CASAVA_Build 17 45456668 48D TGCACATATA CATATGCATGTGTGCATACATACATGCATTTACATGCATGCATGCATG/------------------------------------------------ CATACATGTA 3070 het 3070 ref 51 44 20 11 CATATGCATGTGTGCATACATACATGCATTTACATGCATGCATGCATG 1 0 375870 CASAVA_Build 17 45456821 2I20M1I ACATGTATGC --ATGTGTAAACACGCATGCAT-/ATATGTGTATACACGCATGCATG TATACATACA 3070 hom 134 het 55 0 47 12 N/A 0 0 375871 CASAVA_Build 17 45456927 1D TACATGCATA C/- ATACATGTAT 3070 het 2060 hom 63 10 36 18 C 1 0 375872 CASAVA_Build 17 45457969 2I GAAAATTTAG --/AT ATATATATAT 2082 het 2082 ref 13 7 6 0 AT 6 7 375873 CASAVA_Build 17 45460789 1I TGAAATCTCT -/C CCACCCCACC 3070 hom 48 het 18 0 16 2 C 2 3 375874 CASAVA_Build 17 45463219 1D CAAAGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 582 hom 36 2 26 8 T 13 12 375875 CASAVA_Build 17 45472596 2I TTTAAAGTGT --/AC ACAGTTTCGC 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 AC 1 2 375876 CASAVA_Build 17 45538777 1I TTCACTATGA -/T TTTTTGAGAA 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 T 5 6 375877 CASAVA_Build 17 45541131 3I GGAGGCTTCT ---/CTC CTCCTCACTC 3005 het 3005 ref 30 16 8 6 CTC 2 3 375878 CASAVA_Build 17 45554173 1I CTGGCCCTGG -/A CCCAGATGGC 3070 het 2638 hom 32 10 16 6 A 0 1 375879 CASAVA_Build 17 45559464 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1464 het 849 hom 11 2 3 6 A 13 12 375880 CASAVA_Build 17 45565270 1I TGGGGGTGCT -/G GCCACTCATC 3070 hom 110 het 40 0 34 6 G 1 2 375881 CASAVA_Build 17 45567647 1D GGGAGGGAGG A/- ACAATGGGAG 1214 hom 10 het 5 0 3 2 A 2 1 375882 CASAVA_Build 17 45584074 5I CAAAACTGCC -----/GTTTA GAAGTCTGGA 1212 het 1212 ref 24 15 3 6 GTTTA 0 1 375883 CASAVA_Build 17 45591102 1I CCTGAATCAG -/A AATGGGGTTC 3070 het 3070 ref 37 21 8 8 A 2 3 375884 CASAVA_Build 17 45595420 4D AGGAAAGTAT GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 hom 76 het 31 0 22 12 GAAG 5 4 375885 CASAVA_Build 17 45617181 4I TGCTTTGTCG ----/TGCT TGGCCCTTCC 2740 het 1244 hom 18 3 9 6 TGCT 0 1 375886 CASAVA_Build 17 45631004 1I GACATTCCTG -/C CAAAGATGCA 3070 hom 129 het 47 0 44 3 C 1 2 375887 CASAVA_Build 17 45645433 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 24 0 15 9 A 15 14 375888 CASAVA_Build 17 45645557 1I TGCTGGGGCT -/C TCCCCCCTGG 3070 hom 48 het 27 0 22 5 C 0 1 375889 CASAVA_Build 17 45650364 1I TGGCTGGGCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1516 hom 47 5 29 13 A 14 15 375890 CASAVA_Build 17 45651491 7I TGGGAGGCAG -------/AGGCTGC AGGCTGCAGT 3070 hom 67 het 26 0 20 6 AGGCTGC 1 2 375891 CASAVA_Build 17 45655098 1D TTCAAGAGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 29 0 21 8 A 11 10 375892 CASAVA_Build 17 45660517 1D CAAGATCTGA T/- TTTTTTTATA 3070 hom 68 het 26 0 23 4 T 8 7 375893 CASAVA_Build 17 45664989 3I GACAAATAAC ---/TTT TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 46 0 25 21 T 15 18 375894 CASAVA_Build 17 45672524 1I TGTCTCGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2424 hom 27 9 15 3 T 13 14 375895 CASAVA_Build 17 45678748 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1797 het 791 hom 28 8 6 14 T 17 16 375896 CASAVA_Build 17 45703547 4I TTGGTGTCAT ----/GGAA GGAACTGGGG 3070 het 2775 hom 28 11 9 8 GGAA 1 2 375897 CASAVA_Build 17 45706528 1D TAGTGGAGAC G/- GGGGGTCTCA 1022 het 1022 ref 8 5 3 0 G 6 5 375898 CASAVA_Build 17 45715270 4I CAAAACAAAT ----/AAAC AAACAAACAA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AAAC 3 4 375899 CASAVA_Build 17 45724812 1D ATCTCTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 18 8 A 12 11 375900 CASAVA_Build 17 45729409 1I TCTGATGTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 T 11 12 375901 CASAVA_Build 17 45730121 1D CTGTAATCCC A/- AGCACTTTGG 3070 hom 78 het 31 0 23 8 A 2 1 375902 CASAVA_Build 17 45730628 1D AGCACCGCTC A/- AAAGTGTTGT 3070 hom 96 het 36 0 31 5 A 4 3 375903 CASAVA_Build 17 45731038 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 1219 het 1219 ref 10 5 5 0 T 13 14 375904 CASAVA_Build 17 45731668 2D TGTCGCCTTT TC/-- TTTCTCTTCT 1642 het 1642 ref 14 6 6 2 TC 1 0 375905 CASAVA_Build 17 45731912 4D TATATATATA TTTT/---- TTTATTTTGT 3070 hom 27 het 11 0 10 2 T 7 3 375906 CASAVA_Build 17 45739568 1D CCCCTTGATC T/- TTTTTTTTTT 2470 het 3 hom 31 1 12 18 T 17 16 375907 CASAVA_Build 17 45739919 3D TGGTAGAGAT GGG/--- GGGGGGGGGG 3070 hom 27 het 21 0 12 9 G 13 10 375908 CASAVA_Build 17 45741504 8D TATCCCAGCT CCAGGAGG/-------- CCAGGAGGGC 3070 hom 81 het 30 0 27 3 CCAGGAGG 2 1 375909 CASAVA_Build 17 45747726 1D CAAGCAATAT G/- GGGGGGGGAA 3070 hom 61 het 30 0 26 5 G 9 8 375910 CASAVA_Build 17 45754132 1I TGCAACCTAC -/A AAATATATTC 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 A 3 4 375911 CASAVA_Build 17 45761896 1I ATGTTGACCA -/G GCTGGTCTCG 3070 hom 4 het 26 1 24 1 G 1 2 375912 CASAVA_Build 17 45787042 1I GGTAGCCTAG -/A GAGGGAAACT 3070 hom 98 het 37 0 31 6 A 0 1 375913 CASAVA_Build 17 45795522 3I CTGTCCTTCT ---/CCA CCACCATATT 3070 hom 81 het 34 0 26 8 CCA 2 3 375914 CASAVA_Build 17 45817126 2I ACTCTGTCTC --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 22 0 18 4 A 15 17 375915 CASAVA_Build 17 45818495 1D GCACTGACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 22 0 17 5 T 12 11 375916 CASAVA_Build 17 45819489 1I AAAAATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 212 hom 27 1 24 2 A 10 11 375917 CASAVA_Build 17 45825774 1D ACCATTCATA G/- GATCTGTCAA 3070 hom 147 het 55 0 48 9 G 2 1 375918 CASAVA_Build 17 45839528 1D AGGTGGGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 322 hom 27 2 18 7 A 12 11 375919 CASAVA_Build 17 45841386 1D TATTTTTAAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 48 het 19 0 17 3 A 10 9 375920 CASAVA_Build 17 45843099 1I TCCAGCATGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 411 hom 26 1 17 8 T 10 11 375921 CASAVA_Build 17 45844009 2D ACTTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 28 0 19 9 T 13 11 375922 CASAVA_Build 17 45844361 5I TTCATTCCAT -----/TTGGC TTGGAATGTC 3070 hom 150 het 54 0 49 5 TTGGC 0 1 375923 CASAVA_Build 17 45854007 1I TTTATTAGCC -/T TTTTTTTTTA 3061 het 3061 ref 27 16 9 2 T 9 10 375924 CASAVA_Build 17 45860850 6I AAAAATAAAT ------/AAATAA AAATAAAAAT 2880 hom 17 het 12 0 6 6 AAATAA 2 3 375925 CASAVA_Build 17 45867719 1I ACTTTGTAGC -/T TTTTTTTCAT 3070 het 2815 hom 23 8 11 4 T 7 8 375926 CASAVA_Build 17 45867962 1I TCATAGAGAT -/G GGATGGCACT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 G 2 3 375927 CASAVA_Build 17 45883315 2D TGTTTGAGAC AG/-- AGTTTCACTC 3070 het 3070 hom 40 15 21 6 AG 2 1 375928 CASAVA_Build 17 45897139 1I TGGGGGGGGG -/T GTCTCAGCAA 2705 het 14 hom 17 1 8 8 T 0 1 375929 CASAVA_Build 17 45898624 1I TTTTTTTGTA -/T TTTTTTTAGT 3070 het 638 hom 14 2 11 1 T 7 8 375930 CASAVA_Build 17 45918984 1D TACAAAAAAG A/- AAAAAAAATA 556 het 556 ref 20 17 2 2 A 9 8 375931 CASAVA_Build 17 45921936 5D GTTTTCCCAG TTTCT/----- TTTCTTTTCT 3070 het 3070 ref 26 15 10 3 TTTCT 3 2 375932 CASAVA_Build 17 45923207 1I TCCTTTTTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 10 11 375933 CASAVA_Build 17 45927074 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2396 het 488 hom 21 2 9 10 A 18 17 375934 CASAVA_Build 17 45936025 1I TCCTAAGAAG -/C GTCCCAGAGT 3070 het 3070 ref 53 33 15 5 C 0 1 375935 CASAVA_Build 17 45943421 1I GTGAGGAGGG -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 29 12 13 4 A 8 9 375936 CASAVA_Build 17 45945750 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1134 hom 17 3 13 1 A 11 10 375937 CASAVA_Build 17 45947770 4I ATTAAATGAA ----/ATAG TATGCAATAA 3070 het 3070 ref 45 28 15 2 ATAG 0 1 375938 CASAVA_Build 17 45951499 1I CCATGGAGGA -/G GGGGGCGGGG 838 het 838 ref 14 7 4 3 G 5 6 375939 CASAVA_Build 17 45966173 1I CTGCCCTCTC -/T GTCATCTCTG 3070 hom 86 het 32 0 29 3 T 0 1 375940 CASAVA_Build 17 45976453 1D TGTTTCCCAC A/- AAAAAAGTTG 3070 hom 55 het 22 0 17 6 A 7 6 375941 CASAVA_Build 17 45978049 1I AGATCTAACT -/G GGTAACCCTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 G 2 3 375942 CASAVA_Build 17 45989551 1D ATGAGTTGCG A/- AGGCAGTTAC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 A 2 1 375943 CASAVA_Build 17 45990080 1I TCATTCTGAG -/C CACCCCCCTT 3070 hom 57 het 21 0 18 3 C 1 2 375944 CASAVA_Build 17 46020720 9I15M8D6M13D13M1D TGACTTTGAA ---------CATCATACCTGTGCGGTCCATGTTCATTTTAATCTAATCCAAGGCCCGAAAACACG/TTGGTCACCCTCCATCTCTTGGCG--------TCTTTT-------------GCCCCTATGAGAC- GCGAGTGGCA 222 het 222 ref 30 38 2 12 N/A 0 0 375945 CASAVA_Build 17 46023021 1D AGTTGAGGAA T/- GGTAGCAGGG 1678 het 1678 ref 21 12 6 3 T 1 0 375946 CASAVA_Build 17 46038753 4I CTCAATGACC ----/TGGA TGGAGCAGCT 3070 hom 117 het 44 0 36 8 TGGA 1 2 375947 CASAVA_Build 17 46039862 1I CTAAAAAAAG -/A AAAAAATAAT 3070 hom 93 het 35 0 29 6 A 6 7 375948 CASAVA_Build 17 46043613 1D GACTCCATTT A/- AAAAAAAAAA 1732 hom 27 het 11 0 10 1 A 19 18 375949 CASAVA_Build 17 46051879 16I TCTTTGTTGC ----------------/TGTGTGTGTGTTTGTG TGTGTGTGTT 2870 het 2870 ref 34 19 7 8 TGTGTGTGTGTTTGTG 0 1 375950 CASAVA_Build 17 46080511 1I AGTAAGGAAT -/A AAAGAATGTA 3070 het 3070 hom 51 19 24 8 A 3 4 375951 CASAVA_Build 17 46081303 3I GGCAAAACCC ---/CAT CTCTACTAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 CAT 0 1 375952 CASAVA_Build 17 46081946 3D TTGTCAAAAA AAG/--- AAGGAGAGGA 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 AAG 2 1 375953 CASAVA_Build 17 46084763 1I GCTTTTAAGA -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 117 het 43 0 40 3 T 7 8 375954 CASAVA_Build 17 46092061 1I TGGGGACACT -/G GGGGCCGGGT 3070 het 3070 hom 26 11 11 4 G 4 5 375955 CASAVA_Build 17 46102153 1D AGAGCATCAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2583 hom 36 8 17 11 T 11 10 375956 CASAVA_Build 17 46135505 1D TCTGCTTTGC A/- AATGCAAGAG 3070 hom 117 het 44 0 40 5 A 3 2 375957 CASAVA_Build 17 46137319 1D CTAAAAATAC A/- AAAAATTAGC 3070 hom 33 het 12 0 11 1 A 6 5 375958 CASAVA_Build 17 46152210 1I CGCGGGCCTT -/G GGCCTGAGCC 1143 hom 17 het 8 0 4 4 G 2 3 375959 CASAVA_Build 17 46156012 1D CTGCTCCCTG C/- CCCCCCCCCT 3070 het 34 hom 30 1 11 18 C 10 9 375960 CASAVA_Build 17 46161268 4I ATTTTAAATT ----/AATC AATATTTGTA 3070 hom 63 het 24 0 22 2 AATC 0 1 375961 CASAVA_Build 17 46175562 1D CTGTCTTTCC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 T 8 7 375962 CASAVA_Build 17 46191012 1I CCTCAAAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 65 het 25 0 22 3 A 9 10 375963 CASAVA_Build 17 46192308 1I GAAAAAAAAA -/G AAAAGGAGTT 3070 het 548 hom 22 3 13 6 G 0 1 375964 CASAVA_Build 17 46195144 1D TGGGTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 943 hom 21 2 14 5 T 11 10 375965 CASAVA_Build 17 46212757 1D TGCCCGGTAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 36 het 14 0 12 3 T 9 8 375966 CASAVA_Build 17 46220742 1I ACTGACACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 36 0 26 10 T 11 12 375967 CASAVA_Build 17 46222468 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 289 hom 21 2 16 3 A 15 16 375968 CASAVA_Build 17 46225433 2I AGGACAGGGC --/AA AATTCCTTCA 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 A 2 4 375969 CASAVA_Build 17 46227745 1I AAAAACAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 A 9 10 375970 CASAVA_Build 17 46233404 3D GGAGGAGGAA GAG/--- GAGGAAGAGG 2416 het 2416 ref 30 9 10 11 GAG 2 1 375971 CASAVA_Build 17 46236271 1I TGTGCTATCG -/A AGCTTCATTT 3070 het 3070 ref 53 33 18 2 A 1 2 375972 CASAVA_Build 17 46236806 2I TTTCTCTCTC --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 1476 hom 26 4 10 12 T 10 12 375973 CASAVA_Build 17 46242754 2D26M1D TTTGTATGTC TGTGTGTGTGTGTGTTTTTCTTTTCCCAT/--TGTGTGTGTGTGTTTTTCTTTTCCCA- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 24 20 7 N/A 0 0 375974 CASAVA_Build 17 46247337 1I ATATACCACA -/T TTTGTTTATT 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 3 4 375975 CASAVA_Build 17 46250503 1I GGGAATCACC -/A AGGAAGAGGT 3070 hom 72 het 31 0 24 7 A 1 2 375976 CASAVA_Build 17 46250989 1I CACCTGGGAG -/T TTTTTTTTTA 2778 het 1580 hom 15 7 6 2 T 9 10 375977 CASAVA_Build 17 46252002 1D AAGGTGGAGA G/- GGTGTGGTGG 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 G 3 2 375978 CASAVA_Build 17 46257096 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 28 10 15 3 A 8 9 375979 CASAVA_Build 17 46258981 4D CTAAAGAAAG AAAT/---- AAATAGTCAT 3070 het 2057 hom 23 7 11 6 AAAT 2 1 375980 CASAVA_Build 17 46267895 1D TTCCAGCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 259 hom 20 1 12 7 T 13 12 375981 CASAVA_Build 17 46271511 6D AGGAAAACTT TTCCTC/------ TTAGAGTCTT 3070 hom 96 het 37 0 32 6 TTCCTC 1 0 375982 CASAVA_Build 17 46293191 1D TGGGAGGTGG A/- AGGTTGCAGT 3070 hom 73 het 28 0 24 5 A 2 1 375983 CASAVA_Build 17 46316250 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 22 0 16 8 A 15 14 375984 CASAVA_Build 17 46330969 1D CCCCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 30 0 27 4 A 11 10 375985 CASAVA_Build 17 46334925 1D GCCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 19 0 11 9 A 16 15 375986 CASAVA_Build 17 46343730 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2640 hom 21 6 11 5 A 11 10 375987 CASAVA_Build 17 46346474 1I CAAAATTTAA -/T TTTTTGATTG 3070 hom 57 het 23 0 20 3 T 5 6 375988 CASAVA_Build 17 46353277 11D TTGCTGGTTT TCCAGGAAGAA/----------- TCCTAAAGTA 3070 het 3070 ref 32 14 13 10 TCCAGGAAGAA 1 0 375989 CASAVA_Build 17 46353941 4D AACCACACTC AGAT/---- AGATAGTTTT 3070 het 3070 ref 26 13 12 1 AGAT 2 1 375990 CASAVA_Build 17 46354487 18D AACCCTTAGG CTTGAGTGATCCTCCTGC/------------------ CTTGGTCTCC 2636 het 2636 ref 29 16 7 12 CTTGAGTGATCCTCCTGC 1 0 375991 CASAVA_Build 17 46354783 1I TAGGAAGCGG -/T TTTTTTTTTT 1805 het 1805 ref 40 16 10 14 T 10 11 375992 CASAVA_Build 17 46362895 5D TTCTTTTTCT TTTTC/----- TTTTTTTTTT 488 het 488 ref 36 24 3 9 TTTTC 1 0 375993 CASAVA_Build 17 46373909 1I CGTGCACCTG -/T TAATCCCAGC 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 T 1 2 375994 CASAVA_Build 17 46375003 1D GAAGTCCTCT G/- GGTCTCAGTT 3070 het 3070 hom 35 14 11 10 G 3 2 375995 CASAVA_Build 17 46377819 4I GCCACCATGC ----/CCAG CCAGCTAATT 3070 het 3070 ref 27 15 10 3 CCAG 1 2 375996 CASAVA_Build 17 46380985 14D ATTTTCAATC GTGTGTGTGTCTGT/-------------- GTGTGTGTGT 3070 hom 57 het 28 0 20 15 GTGTGTGTGTCTGT 2 1 375997 CASAVA_Build 17 46390114 3I TTTTTACTTC ---/TTA TTATTTTTTC 3070 hom 75 het 27 0 23 4 TTA 1 2 375998 CASAVA_Build 17 46413139 14D GGGAGGACTA TTTGAGCCCAGGAG/-------------- TTTGAGGCCA 3070 het 3070 ref 49 25 21 8 TTTGAGCCCAGGAG 1 0 375999 CASAVA_Build 17 46435127 3I TAAAAAACAA ---/AAC AACAACAACA 3070 het 3070 hom 59 20 22 17 AAC 5 6 376000 CASAVA_Build 17 46446258 4D ACACACATAC ACAT/---- ACACACACAC 3070 het 430 hom 26 5 14 9 ACAT 1 0 376001 CASAVA_Build 17 46479845 1I TTAAAGAAAG -/A AAAAAATACA 3070 hom 87 het 34 0 30 4 A 6 7 376002 CASAVA_Build 17 46499251 1I AGTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2990 het 2990 ref 28 15 8 5 A 11 12 376003 CASAVA_Build 17 46504566 27D CAAGTAGGTG GGATTACAGGCATGCGCCACCACACCT/--------------------------- GGCTAATTTT 3070 hom 60 het 19 0 21 1 GGATTACAGGCATGCGCCACCACACCT 1 0 376004 CASAVA_Build 17 46512655 1D TCCTTAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 56 24 12 20 T 17 16 376005 CASAVA_Build 17 46524176 1I AGACACCGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 12 12 7 A 13 14 376006 CASAVA_Build 17 46524713 2I AAAGAACCAT --/TA TATATAAAGA 3070 hom 102 het 39 0 35 4 TA 3 4 376007 CASAVA_Build 17 46532681 11I AGTTAAAACT -----------/CTTTAGTTTTA AGGGTCAGGC 3070 het 3070 ref 24 11 10 3 CTTTAGTTTTA 0 1 376008 CASAVA_Build 17 46543954 1I TCTTTTGTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 50 17 23 10 T 9 10 376009 CASAVA_Build 17 46548013 1D CAACATGCAG A/- AACCCCAACT 3070 het 2495 hom 18 7 9 3 A 3 2 376010 CASAVA_Build 17 46564288 1I CGCCTGTAAT -/C CCAGCACTTT 3070 hom 42 het 16 0 13 3 C 2 3 376011 CASAVA_Build 17 46580627 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2463 hom 18 7 7 4 T 12 11 376012 CASAVA_Build 17 46592066 1I AGGAGTTTGA -/T TTTTTTTTTA 2462 het 2462 ref 27 16 8 3 T 9 10 376013 CASAVA_Build 17 46594772 1D CTGTCTCACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2082 hom 30 9 11 10 A 13 12 376014 CASAVA_Build 17 46607979 1D TCAATAAACC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 10 15 8 T 11 10 376015 CASAVA_Build 17 46610306 3D CACGCAAAAT TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 ref 32 14 14 5 TAA 5 4 376016 CASAVA_Build 17 46621533 1I TATTTGCTTT -/A AAAAATGTTT 3070 het 3070 ref 18 7 9 2 A 5 6 376017 CASAVA_Build 17 46623621 3D AAAGAATTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1194 het 630 hom 15 3 5 7 T 17 14 376018 CASAVA_Build 17 46625643 1D AAAGAAAATA T/- TTATATTGTT 3070 het 3070 hom 39 18 20 1 T 3 2 376019 CASAVA_Build 17 46645014 1I AATACCCAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 89 hom 29 1 22 6 A 9 10 376020 CASAVA_Build 17 46645908 1D AAAGCACATT A/- AAAAAAAAAA 1581 het 1581 ref 36 21 5 11 A 13 12 376021 CASAVA_Build 17 46646500 6I ACATACACAT ------/ACACAC ACACTTTTGT 3070 het 3070 ref 39 19 16 4 AC 2 5 376022 CASAVA_Build 17 46657737 2D GCTTTGAGAC AG/-- AGTCTCGCTC 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 AG 2 1 376023 CASAVA_Build 17 46663096 3I AGGTATGGGA ---/GAT GAGGTCAGAG 3070 het 3070 ref 30 14 10 6 GAT 0 1 376024 CASAVA_Build 17 46663802 1D GCTGTTAGTA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 10 9 376025 CASAVA_Build 17 46664169 1D TCTGAAGTGA T/- TTTTTTTTTT 1606 het 1606 ref 29 22 4 3 T 11 10 376026 CASAVA_Build 17 46667499 1I TAGGATGCAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 10 13 6 T 10 11 376027 CASAVA_Build 17 46669133 1D TTTAGTGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 16 4 A 10 9 376028 CASAVA_Build 17 46685094 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 2876 hom 27 8 13 6 A 9 10 376029 CASAVA_Build 17 46696968 1D TTTTTTTTTT C/- CAGACTCTGT 3070 het 3070 ref 29 17 10 2 C 2 1 376030 CASAVA_Build 17 46705959 1I TATGTTATTG -/T TTTTTTTTTT 2527 het 2527 ref 16 8 6 2 T 12 13 376031 CASAVA_Build 17 46707600 1I AAAATTTAAC -/T TTGGTGGTTA 3070 het 3070 ref 32 15 13 4 T 2 3 376032 CASAVA_Build 17 46708501 2D CAGAAGTGAC AG/-- AGTTCATTTA 3070 het 3070 hom 48 18 22 9 AG 2 1 376033 CASAVA_Build 17 46714868 4D AAGGAAAGAT GGAA/---- GGAAGGAAGG 2025 het 2025 ref 26 14 10 3 GGAA 5 4 376034 CASAVA_Build 17 46715228 2D CTTCTTCTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1556 het 523 hom 23 8 5 10 T 19 17 376035 CASAVA_Build 17 46719339 1I CCTCCCCCTT -/C CCCCCCCCGA 891 het 891 ref 9 4 3 2 C 8 9 376036 CASAVA_Build 17 46721561 2D GTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 1453 het 1453 ref 23 8 4 11 T 14 12 376037 CASAVA_Build 17 46730325 2D TCCACCCCCA AC/-- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 48 20 19 9 AC 7 6 376038 CASAVA_Build 17 46730979 2I GAGAGAAGTC --/AG GGCGGAGGAG 3070 het 3070 ref 52 25 19 8 AG 0 1 376039 CASAVA_Build 17 46731664 5D ATCCTGTGTC TTGTA/----- TTGTAATGTT 3070 het 3070 hom 46 17 21 9 TTGTA 2 1 376040 CASAVA_Build 17 46731932 4I GGGTATACTT ----/TGAG TGATAAATCG 3070 het 3070 ref 58 27 23 8 TGAG 0 1 376041 CASAVA_Build 17 46732783 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2713 het 2713 ref 24 11 6 7 A 10 11 376042 CASAVA_Build 17 46736386 1D CATCTCTACT A/- AAAAAAAACA 831 hom 7 het 3 0 3 0 A 9 8 376043 CASAVA_Build 17 46745224 1D AGAGAAATGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 348 hom 27 1 10 16 T 10 9 376044 CASAVA_Build 17 46749839 7D TGTTTTCCAT TTTTTTC/------- TTTTTTCTTT 3070 hom 66 het 25 0 22 3 TTTTTTC 2 1 376045 CASAVA_Build 17 46807313 3D ACCTTGCAGT AGG/--- AGAAGCCAGG 3070 het 3070 hom 39 17 18 7 AGG 1 0 376046 CASAVA_Build 17 46808091 4D53M4D AAAAAAAAAC AAAAAACAACCAGAAACAAAGCAAAACAGCAATTTTATATACCACAATCATAAAACTACAC/----AACAACCAGAAACAAAGCAAAACAGCAATTTTATATACCACAATCATAAAACT---- ACACACACAC 3070 het 3070 ref 32 38 10 18 N/A 0 0 376047 CASAVA_Build 17 46810031 1D CCTTGCAATG A/- AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 33 17 15 1 A 8 7 376048 CASAVA_Build 17 46810755 1I AGAACAAGCT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2231 hom 40 13 18 9 G 0 1 376049 CASAVA_Build 17 46819585 1D TGCTTTCTTG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 38 13 18 7 T 10 9 376050 CASAVA_Build 17 46838040 1D ATTTTATTTA T/- TTTTTTTTAG 3070 hom 44 het 20 0 15 5 T 9 8 376051 CASAVA_Build 17 46847340 1D ATGATCCAGG A/- AAAAATATCT 3070 het 3070 hom 36 15 18 3 A 6 5 376052 CASAVA_Build 17 46850578 1D AAGGTTTCTT G/- GGGGAGGTGA 3070 het 3070 ref 45 22 14 9 G 5 4 376053 CASAVA_Build 17 46853328 2D TGGTTATCCT TA/-- TTTTACCATT 3070 het 3070 hom 48 22 21 6 TA 1 0 376054 CASAVA_Build 17 46856606 4I GGGAATGCAC ----/AGAA AGAATGCATT 3070 het 3070 hom 42 14 20 8 AGAA 1 2 376055 CASAVA_Build 17 46862320 1D CTACTATGTA C/- CCCTGGTGAT 3070 het 3070 ref 46 26 13 8 C 4 3 376056 CASAVA_Build 17 46870721 1D ACTTGACTCA C/- CCCCTATTAG 3070 het 3070 ref 48 25 16 7 C 5 4 376057 CASAVA_Build 17 46873126 1I TAACCTGAAA -/T GTCAATGGTG 3070 het 3070 hom 40 15 20 5 T 0 1 376058 CASAVA_Build 17 46878166 3I CTGAAATAAA ---/AAT AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 AAT 0 1 376059 CASAVA_Build 17 46878629 2D CTGTACAGCC TG/-- TGTTTCACCA 3070 het 3070 ref 43 22 18 3 TG 2 1 376060 CASAVA_Build 17 46880195 5I CGCTGGTGAT -----/AACTC AGGCAAACAG 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 AACTC 0 1 376061 CASAVA_Build 17 46883495 1D TTCAACATAG T/- TATTGGAAGT 2653 het 2653 ref 19 10 6 4 T 2 1 376062 CASAVA_Build 17 46892707 6D TGCCTATTGA TATAAT/------ TATATACTTT 3070 het 3070 ref 46 27 19 2 TATAAT 1 0 376063 CASAVA_Build 17 46902702 1D AGAAACGCCC G/- GGGGGGCTTA 3070 het 2686 hom 23 7 12 4 G 7 6 376064 CASAVA_Build 17 46920240 2I CAGGTAATAA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 38 12 14 12 TG 8 9 376065 CASAVA_Build 17 46921918 2D TTCCACAATG TA/-- TATATATATA 3070 het 3070 hom 19 8 9 3 TA 8 7 376066 CASAVA_Build 17 46922490 1D TACAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2590 het 2568 hom 20 8 8 4 A 13 12 376067 CASAVA_Build 17 46953750 1D GACCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 12 11 376068 CASAVA_Build 17 46966677 1D ATTATTAGGC T/- TTTTTTTTTA 1231 het 1231 ref 33 26 3 4 T 10 9 376069 CASAVA_Build 17 47079353 4I GGCCAGGATC ----/TCTT TCTTTATCTT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 TCTT 1 2 376070 CASAVA_Build 17 47085364 1I GTAATTAGTA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 259 hom 18 1 14 3 T 9 10 376071 CASAVA_Build 17 47092804 1I CTGCTGCAAG -/C AGGCTTCCAA 3070 hom 127 het 53 0 41 12 C 0 1 376072 CASAVA_Build 17 47093589 4D ATCAAGGCAG AAAT/---- AAATAATTGT 3070 hom 123 het 46 0 41 7 AAAT 2 1 376073 CASAVA_Build 17 47094730 5D AAATAAATAG GTGAA/----- GTGAAGACAT 3070 het 3070 ref 49 25 17 9 GTGAA 2 1 376074 CASAVA_Build 17 47095895 1D TCTTCTGGTC T/- TCTTTGAACT 3070 hom 108 het 39 0 37 3 T 2 1 376075 CASAVA_Build 17 47099066 4I AATTTGAATA ----/TCTG TCTGAGTATT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 TCTG 1 2 376076 CASAVA_Build 17 47106329 1D GAATGTCCTT C/- CCCCCCAGGT 3070 hom 112 het 43 0 35 8 C 7 6 376077 CASAVA_Build 17 47110245 4D TAGGTATACA CCCC/---- CCCCCCCACC 3070 het 359 hom 27 6 16 7 C 11 7 376078 CASAVA_Build 17 47115160 3D ACGTGGGGCA AAG/--- AAGGGAAACC 3070 het 3070 ref 51 27 21 4 AAG 2 1 376079 CASAVA_Build 17 47124456 1I AGTTCAGATG -/T TTTAACAATA 3070 hom 117 het 42 0 40 2 T 3 4 376080 CASAVA_Build 17 47129445 1I CAACGTAATG -/A AAAAAAAAAA 1683 het 1683 ref 32 23 5 4 A 13 14 376081 CASAVA_Build 17 47136303 1I ACTTGGATAA -/G GAAGGATGTC 3070 hom 108 het 40 0 35 5 G 1 2 376082 CASAVA_Build 17 47150571 18D CCAATAATTT ATGAAAAAAAGATTTAAA/------------------ ATGAAAAAAA 2981 het 2981 ref 19 9 8 6 ATGAAAAAAAGATTTAAA 2 1 376083 CASAVA_Build 17 47151983 1I GTGGTGGCTT -/A TGCTTGAAAT 3070 het 3070 hom 38 14 16 8 A 0 1 376084 CASAVA_Build 17 47153225 1I TAATAATGTA -/T TGTATACTTT 3070 het 3070 ref 47 23 21 3 T 1 2 376085 CASAVA_Build 17 47155938 6D TGTATAATAT CAAGGA/------ ATGACATACA 3070 het 3070 hom 40 19 22 1 CAAGGA 1 0 376086 CASAVA_Build 17 47158342 1I GAGTCATTCA -/C CCTGTCGGGG 3070 hom 66 het 28 0 23 5 C 2 3 376087 CASAVA_Build 17 47159759 1I ACCAAGACGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 51 19 19 13 T 11 12 376088 CASAVA_Build 17 47164384 3D GGTTGACATC ATT/--- ATTATTATTA 3070 het 3070 hom 45 11 26 8 ATT 5 4 376089 CASAVA_Build 17 47166403 9I TCAATATTGC ---------/AAGCATCAT GACAAGAAAA 3070 het 3070 ref 41 21 14 6 AAGCATCAT 0 1 376090 CASAVA_Build 17 47167916 1D GAAATTATTT G/- GAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 44 22 17 5 G 2 1 376091 CASAVA_Build 17 47180907 10I TGACTGTGAC ----------/CTCAGCACTT CTCAACAACA 3070 het 3070 hom 57 24 26 7 CTCAGCACTT 0 1 376092 CASAVA_Build 17 47182862 1D GCCCTTTCAC T/- TTTTCATTAT 3070 het 3070 hom 33 14 17 2 T 5 4 376093 CASAVA_Build 17 47191851 4D ATATTTAATA TATT/---- TATTTTTTTT 1358 het 1282 hom 8 3 5 0 TATT 2 1 376094 CASAVA_Build 17 47199666 1I13M1I TTTTTAGTAC -TCATCCTCAGTGA-/TTCATCCTCAGTGAC CTCTGGCTTT 3070 hom 123 het 40 0 42 2 N/A 0 0 376095 CASAVA_Build 17 47202482 1D GCCTCTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3004 hom 31 9 13 9 T 12 11 376096 CASAVA_Build 17 47205027 1D GAGAGAAGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 36 19 13 6 T 13 12 376097 CASAVA_Build 17 47235888 1D TCATGGAAAA C/- TGTTGGTTTA 3070 het 3070 hom 40 16 23 1 C 1 0 376098 CASAVA_Build 17 47243655 1I GAGTGGCTGA -/T TTTTTTTATT 2871 het 2871 ref 33 16 9 8 T 7 8 376099 CASAVA_Build 17 47252545 1D CTGAGCGCCG C/- CCCCCCCCCC 3070 het 107 hom 22 1 13 8 C 13 12 376100 CASAVA_Build 17 47254787 1D AAAACAAAAC A/- AAAACAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 A 5 4 376101 CASAVA_Build 17 47294785 1D AACTGGAGTC T/- TTTTTTTTTT 1556 het 1556 ref 41 25 5 11 T 12 11 376102 CASAVA_Build 17 47313324 1D GGCCGGGCGC G/- GGTGGCTCAC 3070 hom 29 het 21 0 19 2 G 3 2 376103 CASAVA_Build 17 47327825 1I AAGCAACAAC -/A AAAATCTTCA 3070 het 3070 hom 40 19 21 0 A 4 5 376104 CASAVA_Build 17 47340959 1I CTTTAGACAC -/T TTTGGTATTA 3070 hom 118 het 45 0 39 6 T 3 4 376105 CASAVA_Build 17 47342683 1I GGTAACTGAT -/A AACAACGAAA 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 A 2 3 376106 CASAVA_Build 17 47346000 13I CAAGAGTGGA -------------/GTAGAATGCTGTT GTGTTAGAGA 3070 hom 102 het 38 0 33 6 GTAGAATGCTGTT 0 1 376107 CASAVA_Build 17 47346616 1D GCTGCAGAGG A/- GACAGAGAGA 3070 het 3070 ref 40 19 18 3 A 1 0 376108 CASAVA_Build 17 47348501 2I GCTGCTGGAA --/AC ACAGTGTCAT 3070 hom 96 het 34 0 31 3 AC 1 2 376109 CASAVA_Build 17 47361584 1I TGTGTTGACA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 389 hom 42 1 38 3 T 7 8 376110 CASAVA_Build 17 47362053 4D TTCACGACTT TAAA/---- TAAATAATTC 3070 hom 78 het 30 0 27 4 TAAA 2 1 376111 CASAVA_Build 17 47362494 1I GAGCCCAATG -/A ACCCAAACCC 3070 hom 102 het 41 0 34 7 A 1 2 376112 CASAVA_Build 17 47362587 5I TCCATTTCTC -----/TTGAG TTAACAATAG 3070 hom 84 het 31 0 29 2 TTGAG 0 1 376113 CASAVA_Build 17 47362927 2D GTGATTTTTG TC/-- TGTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 32 15 15 2 TC 1 0 376114 CASAVA_Build 17 47365263 1D TCTAAACTAC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 8 het 34 2 28 4 T 8 7 376115 CASAVA_Build 17 47366731 1D TCTAAACCCC T/- TCCTCTCCAG 3070 hom 105 het 39 0 36 4 T 2 1 376116 CASAVA_Build 17 47374898 2D TTGCAGGCAT TA/-- TATATATATA 3070 hom 42 het 19 0 15 4 TA 8 7 376117 CASAVA_Build 17 47384914 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 34 hom 27 1 18 10 A 12 11 376118 CASAVA_Build 17 47388531 1D TTGATTCAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 72 het 33 0 25 8 T 9 8 376119 CASAVA_Build 17 47390617 4D AATAACTGAG TTTT/---- TTTTTTTTTT 2068 het 2068 ref 25 13 9 6 T 16 12 376120 CASAVA_Build 17 47393800 2D GCAAAGAAAA AG/-- AGAAATGTCA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 AG 2 1 376121 CASAVA_Build 17 47402747 1D AGTTTTATTA T/- TTTTTTGTTC 3070 hom 63 het 25 0 22 4 T 7 6 376122 CASAVA_Build 17 47403967 2D GGAGTGAAAG TT/-- AATCTTATTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 2 0 376123 CASAVA_Build 17 47408961 1D CAGTTAAAGC A/- GTTCGTCTGG 3070 het 3070 hom 35 11 19 6 A 1 0 376124 CASAVA_Build 17 47415966 4D TATTTCACCT TTTA/---- TTTGTTTACT 3070 het 3070 hom 41 17 21 5 TTTA 1 0 376125 CASAVA_Build 17 47422790 1I TTTCCTAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 19 20 10 A 9 10 376126 CASAVA_Build 17 47426615 1D AATCCAAGAG T/- TTTTTTCCCC 3070 het 3070 hom 56 24 25 7 T 7 6 376127 CASAVA_Build 17 47427197 1D ATTAGACCCT A/- AAAACACCTA 3070 het 3070 hom 26 11 13 4 A 5 4 376128 CASAVA_Build 17 47428708 1I TCTCTTCTGT -/C AATGAACTAG 3070 hom 137 het 50 0 46 4 C 0 1 376129 CASAVA_Build 17 47433448 1D CTTAGTCTAC G/- AAGACCTGGT 3070 het 3070 hom 52 17 30 5 G 1 0 376130 CASAVA_Build 17 47443172 4D GTGCTGTTTC AGTT/---- AGACTCAGAA 3070 het 2558 hom 23 6 14 5 AGTT 1 0 376131 CASAVA_Build 17 47443601 3D TTATTATGAG GAT/--- GATGATGAAA 3070 het 3070 hom 46 19 19 10 GAT 3 2 376132 CASAVA_Build 17 47445186 1D TGTTAATTAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 8 17 12 A 11 10 376133 CASAVA_Build 17 47451232 1D TTTGGGTCAC G/- GGGGTAGATC 3070 het 3070 ref 42 19 15 8 G 5 4 376134 CASAVA_Build 17 47456057 1I ACAGAATGGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 178 hom 32 1 24 7 A 11 12 376135 CASAVA_Build 17 47462214 5D AAAGCTATGT AACTG/----- AACTAAAAAG 3070 het 3070 hom 36 14 21 4 AACTG 1 0 376136 CASAVA_Build 17 47467718 2I CTCTCATCCG --/TC TCCCCTTTTC 3070 het 3070 ref 51 29 18 4 TC 1 2 376137 CASAVA_Build 17 47475109 5D TAAATCTGAA TTCAT/----- TTCAACTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 23 4 TTCAT 1 0 376138 CASAVA_Build 17 47477131 6I ACAGAAACTA ------/TTAAAC TTAAAGTGCA 3070 hom 87 het 32 0 29 3 TTAAAC 0 1 376139 CASAVA_Build 17 47478668 1I AGCTTCTAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 16 10 5 A 11 12 376140 CASAVA_Build 17 47484659 2D TTTTTTTTTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 21 0 15 6 A 17 15 376141 CASAVA_Build 17 47489808 4D TTTATTTTCT CTAG/---- CTTTGTTTAT 3070 het 3070 hom 43 19 22 3 CTAG 1 0 376142 CASAVA_Build 17 47492031 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 35 13 17 7 A 10 9 376143 CASAVA_Build 17 47496926 1D ATCATGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 24 9 T 13 12 376144 CASAVA_Build 17 47502696 5I13M3D AATTGTCTCC -----CTCAAGCAGATACCAA/CTCTTCTCAAGCAGATAC--- CAACAATTGA 3070 hom 178 het 54 0 60 6 N/A 0 0 376145 CASAVA_Build 17 47504899 1I CTCCCTTCCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1234 hom 38 3 32 3 T 10 11 376146 CASAVA_Build 17 47506978 2I TCAAATTTTG --/TT TTACATTAAG 3070 hom 87 het 33 0 30 3 T 2 4 376147 CASAVA_Build 17 47514395 4D TATTTTGCTA TTAC/---- TTCTCTCTCC 3070 het 3070 hom 33 13 16 6 TTAC 1 0 376148 CASAVA_Build 17 47516267 1I TAATTATTTC -/T TTTTTTAGAG 3070 het 3070 hom 38 14 19 5 T 6 7 376149 CASAVA_Build 17 47516815 2I CTGGGCTTTC --/CA CACAAGCCAA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 CA 2 3 376150 CASAVA_Build 17 47517175 1D ACAGACTATA T/- TAGCCATATC 3070 het 3070 ref 46 23 17 6 T 2 1 376151 CASAVA_Build 17 47526282 14D TGGTAAGTTG GAAAGCTGGGGCCT/-------------- GAAAGCAAGA 3070 het 3070 ref 29 18 10 3 GAAAGCTGGGGCCT 1 0 376152 CASAVA_Build 17 47532801 1I CAGGACTCTC -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 8 9 376153 CASAVA_Build 17 47548450 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2371 hom 25 8 12 5 A 15 14 376154 CASAVA_Build 17 47565883 1I TGTTAACAAG -/A AAAAAAAAAA 1690 het 1690 ref 43 25 6 12 A 10 11 376155 CASAVA_Build 17 47569451 1D GATGTGGGGA T/- TTTTTTTTTT 1275 het 1275 ref 26 16 3 7 T 12 11 376156 CASAVA_Build 17 47571811 1D GACAAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 16 12 T 15 14 376157 CASAVA_Build 17 47591535 1I ATATTGGAGA -/T TTTTTTTGCA 3070 het 2880 hom 24 7 11 6 T 7 8 376158 CASAVA_Build 17 47593255 1D AGGGAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 11 11 2 A 12 11 376159 CASAVA_Build 17 47593801 1I ATGTGTGAAG -/C ATTCTGAATC 3070 het 3070 ref 44 26 14 4 C 0 1 376160 CASAVA_Build 17 47594421 1I ATAACTCAGT -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 41 26 13 2 A 9 10 376161 CASAVA_Build 17 47600037 1I AAAGTAATTG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 44 23 16 5 A 9 10 376162 CASAVA_Build 17 47604669 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1723 hom 21 6 13 2 A 13 12 376163 CASAVA_Build 17 47627817 1I TGTACCTGAT -/A ACCCCTATGT 3070 het 3070 ref 38 17 11 10 A 1 2 376164 CASAVA_Build 17 47631620 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAACCTG 3070 hom 110 het 44 0 38 6 AC 0 1 376165 CASAVA_Build 17 47640917 1D ATCTAGTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 19 17 7 T 13 12 376166 CASAVA_Build 17 47654568 1I TAATTATCTC -/T GTTGCATTTG 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 0 1 376167 CASAVA_Build 17 47668671 11I TGACATGCAA -----------/TTCTCATAAAC TTCCCACATT 3070 hom 51 het 25 0 18 7 TTCTCATAAAC 0 1 376168 CASAVA_Build 17 47668767 2D TATTATCTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 638 hom 37 7 13 17 T 14 12 376169 CASAVA_Build 17 47669177 1D TGGCCTCAGG A/- AAAAAAAAAG 1689 het 1689 ref 36 26 4 7 A 10 9 376170 CASAVA_Build 17 47679745 1I AATAGAAGAG -/A AAAAAAGAGA 3070 het 3070 ref 35 19 10 6 A 6 7 376171 CASAVA_Build 17 47680690 7D ATAATGTAAA TATTGAT/------- TATTGATTAA 3070 het 3070 ref 34 18 13 5 TATTGAT 2 1 376172 CASAVA_Build 17 47681456 1D TGAAAAAAAA T/- CAATTGTTTA 3070 het 3070 hom 37 14 17 6 T 1 0 376173 CASAVA_Build 17 47682166 3D CTCCTGGGCA GAC/--- GAGATTGTCT 3070 het 3070 hom 40 14 23 5 GAC 1 0 376174 CASAVA_Build 17 47700812 1D ATGTTGAGGG T/- TTTTTTTTTT 1520 het 1520 ref 47 33 5 9 T 11 10 376175 CASAVA_Build 17 47702287 2I TATAAAAGTA --/AC ACATAATTTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AC 1 2 376176 CASAVA_Build 17 47714405 1I CTGGATAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 17 24 7 T 11 12 376177 CASAVA_Build 17 47716974 2I AATAAAACAC --/AG GGGCGTGGTG 3070 hom 102 het 35 0 35 0 AG 0 1 376178 CASAVA_Build 17 47719094 3I TCTGAGAAAG ---/TTC TTCTGCCTTC 3070 hom 70 het 31 0 21 10 TTC 1 2 376179 CASAVA_Build 17 47719484 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2329 hom 15 het 12 0 7 5 A 16 15 376180 CASAVA_Build 17 47721068 1D AAAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 61 het 28 0 23 5 A 10 9 376181 CASAVA_Build 17 47723304 4D GTAAAAAAAA TTAG/---- TTAAAGAGTA 3070 hom 45 het 17 0 16 3 TTAG 1 0 376182 CASAVA_Build 17 47735677 1D TCAGTGAGCC T/- TTTTTTTTGA 862 het 862 ref 38 31 2 6 T 9 8 376183 CASAVA_Build 17 47739282 5D CTGGAGATTC TATTA/----- TATTAGCTGT 3070 het 3070 ref 44 22 20 3 TATTA 2 1 376184 CASAVA_Build 17 47749102 1D AGTTAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 10 9 376185 CASAVA_Build 17 47749835 1I GCTTTTTTTT -/C CCCCCCTATT 3070 het 3070 hom 30 10 16 4 C 6 7 376186 CASAVA_Build 17 47761724 1D CTCCAGGTGA T/- TTTTTTTTTT 2580 het 2580 ref 27 13 7 8 T 11 10 376187 CASAVA_Build 17 47762530 1I TTAGAAAAAA -/G CATGATATCA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 G 0 1 376188 CASAVA_Build 17 47763209 3I TGGAAAGTTA ---/AAG AAGGACCAGA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 AAG 1 2 376189 CASAVA_Build 17 47770189 4D AACCAGTGAC ACTT/---- ACTCACACTT 3070 het 3070 ref 48 21 23 5 ACTT 1 0 376190 CASAVA_Build 17 47772911 1D ATCCATGTTG T/- TTGCAAATGA 3070 het 3070 hom 49 18 26 6 T 3 2 376191 CASAVA_Build 17 47774422 1D TGTATGTTGA T/- TTTTTTTTTA 2573 hom 21 het 11 0 8 3 T 10 9 376192 CASAVA_Build 17 47776402 1D TGGTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 1182 het 628 hom 9 3 5 1 T 15 14 376193 CASAVA_Build 17 47777014 3D TGATGATAGT TTC/--- TTTTGCTGTA 3070 het 3070 ref 33 18 9 6 TTC 1 0 376194 CASAVA_Build 17 47783034 1I AATATTATAA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 2014 hom 22 6 10 6 T 9 10 376195 CASAVA_Build 17 47783481 3D GCTTCTACTC TGA/--- TGATTTTATT 3070 het 3070 ref 34 17 16 4 TGA 2 1 376196 CASAVA_Build 17 47794906 1D GGGAGAAAAT A/- ATTTTTGAAA 3070 het 3070 hom 40 14 19 7 A 2 1 376197 CASAVA_Build 17 47798432 5I AAAATGCACA -----/TATAT TATATAACTT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 TATAT 1 2 376198 CASAVA_Build 17 47800489 4D ATTTGGAAAC AATG/---- AATGCATAGA 3070 het 3070 ref 36 19 9 9 AATG 2 1 376199 CASAVA_Build 17 47819408 1D ATTCACTTGT G/- GGGTTAAGAG 3070 het 3070 ref 36 22 13 1 G 4 3 376200 CASAVA_Build 17 47826597 2D AGCATAAATC AT/-- AGTTTTGCTT 3070 het 3070 ref 39 21 13 8 AT 1 0 376201 CASAVA_Build 17 47828766 4I ATATTATATA ----/TTAT TTATTTTCAA 3070 het 3070 ref 25 13 8 4 TTAT 1 2 376202 CASAVA_Build 17 47871714 7I TTTGGTTGAA -------/TGGTAAT TGGTAATTCT 3070 het 3070 hom 44 15 26 3 TGGTAAT 1 2 376203 CASAVA_Build 17 47872022 2D ATGGTTTGGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 39 1 18 20 T 13 11 376204 CASAVA_Build 17 47872102 19D ATAGTTTGCA AATATTTTCTCCCATTCTG/------------------- TAGGTTGTCT 3070 het 3070 ref 34 20 18 1 AATATTTTCTCCCATTCTG 1 0 376205 CASAVA_Build 17 47874923 4D GCCCCAAAAC TGAT/---- TGTGAAACAT 3070 het 3070 hom 43 15 26 4 TGAT 1 0 376206 CASAVA_Build 17 47881928 1I TGTCTCCCCC -/T AGCCCTGACC 3070 hom 30 het 34 1 28 5 T 0 1 376207 CASAVA_Build 17 47887038 2I AAAGCGACTC --/AT GTGGACATGA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 AT 0 1 376208 CASAVA_Build 17 47888501 1I GATTCAGGAC -/A AAAAAATTGA 3070 het 3070 ref 44 21 16 7 A 6 7 376209 CASAVA_Build 17 47896697 3D CACCAATTAT TAG/--- TAGTTCTTTA 3070 het 3070 ref 49 25 20 4 TAG 2 1 376210 CASAVA_Build 17 47897748 2D GATAGAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 101 hom 20 3 10 7 A 12 10 376211 CASAVA_Build 17 47900868 1D GTATAATAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 85 het 31 0 29 2 A 10 9 376212 CASAVA_Build 17 47918381 3I TTCTTCCTTC ---/TTA TTCTTCTTCC 2362 het 2362 ref 29 15 8 6 TTA 0 1 376213 CASAVA_Build 17 47919909 5I TAAAGATGAC -----/TAGAA TTGGTTATAG 3070 hom 90 het 34 0 31 3 TAGAA 0 1 376214 CASAVA_Build 17 47926898 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAGAAAGAA 3070 het 101 hom 24 3 11 10 AG 0 1 376215 CASAVA_Build 17 47927550 1I AAAAACCTAG -/T TTAAAAAAAA 2951 het 2627 hom 18 8 9 1 T 2 3 376216 CASAVA_Build 17 47929022 5I CACATGCTCC -----/TGTTT TGTTTTGTTT 3070 hom 62 het 26 0 21 5 TGTTT 2 3 376217 CASAVA_Build 17 47939449 2D AGTGAAAAAG AA/-- AGTTTGGTAG 3070 het 3070 hom 28 12 12 5 A 3 1 376218 CASAVA_Build 17 47941526 4D ATATACCACC CTTT/---- CTAAGTTTAT 2508 het 2508 ref 19 12 6 1 CTTT 1 0 376219 CASAVA_Build 17 47945290 2D GTCACTTAAA TT/-- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 37 23 14 0 T 10 8 376220 CASAVA_Build 17 47945972 2D TAAAATTAAC TT/-- TTAGAATACA 3070 het 3070 hom 32 14 16 2 T 4 2 376221 CASAVA_Build 17 47949991 6D CACAGCCAGG CCAACA/------ CCTTGATTCT 3070 het 3070 ref 47 27 20 2 CCAACA 1 0 376222 CASAVA_Build 17 47956021 1D AGACTCAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 37 0 14 25 A 11 10 376223 CASAVA_Build 17 47960974 5I GCATAAATAT -----/ATATA ATATAATATA 3070 het 94 hom 21 1 13 7 ATATA 2 3 376224 CASAVA_Build 17 47972143 1D AGTAGAGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 T 11 10 376225 CASAVA_Build 17 47977506 4D TCAACACTTT TTTA/---- GTTACTTTTG 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 TTTA 1 0 376226 CASAVA_Build 17 47977999 1D ACAGAAAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 35 13 17 5 A 13 12 376227 CASAVA_Build 17 47978997 1D ATAGCACGAG T/- TTTTTTCTGG 3070 hom 102 het 37 0 32 7 T 7 6 376228 CASAVA_Build 17 47979845 3D TCTTGTTAGA GAG/--- GAGAACAGTA 3070 het 3070 ref 43 23 14 8 GAG 2 1 376229 CASAVA_Build 17 47999069 3D AAGCTACAGG TTT/--- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 37 13 20 6 T 11 8 376230 CASAVA_Build 17 48011447 1I TGGATAGAAG -/C CCTTCCCCTG 3070 het 3070 ref 44 25 15 6 C 2 3 376231 CASAVA_Build 17 48015144 16D CATACATATT TATACACACACATATA/---------------- TATACACACA 3070 het 3070 hom 44 15 22 8 TATACACACACATATA 1 0 376232 CASAVA_Build 17 48019074 2I AATTTTAGAC --/AT ATTATCTGAA 3070 het 3070 ref 32 16 11 5 AT 1 2 376233 CASAVA_Build 17 48019599 2D ATTTATAATT TA/-- TATGTTTTGA 3070 het 3070 ref 48 26 19 5 TA 2 1 376234 CASAVA_Build 17 48020057 4D CTCAAAAACA AGAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 38 17 19 8 AGAC 1 0 376235 CASAVA_Build 17 48030085 1I TCAGTCACAG -/C CCCCCTGCTC 3070 hom 88 het 35 0 27 8 C 5 6 376236 CASAVA_Build 17 48033449 1D ATACCTGTCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 T 10 9 376237 CASAVA_Build 17 48036839 4D TATTTTTAAT GTAC/---- GTAATATTTT 2941 het 2941 ref 20 10 7 3 GTAC 1 0 376238 CASAVA_Build 17 48037100 1I GTAACTGGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 20 11 5 T 10 11 376239 CASAVA_Build 17 48042130 2D AGGAAAAATC AT/-- ATAAACTAGT 3070 het 3070 hom 33 9 20 5 AT 2 1 376240 CASAVA_Build 17 48045679 2D ATTCATATTG GT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 GT 1 0 376241 CASAVA_Build 17 48046224 6D AATTCCCAAT TAATAA/------ TAATAATAAT 3070 het 383 hom 33 4 15 17 TAA 5 3 376242 CASAVA_Build 17 48046988 1D AGCATTTATT C/- TCAAATGTCG 3036 het 3036 ref 27 14 8 6 C 1 0 376243 CASAVA_Build 17 48057027 5I AAGCCTTATA -----/TTATC TTTTTTATTA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 TTATC 0 1 376244 CASAVA_Build 17 48058889 21D AAACTTTTCC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT/--------------------- TTTTTTTTTT 3070 het 951 hom 26 6 13 9 T 35 14 376245 CASAVA_Build 17 48062464 1I ATTCTTCCAG -/T TATACAACCC 3070 het 3070 ref 36 22 10 4 T 1 2 376246 CASAVA_Build 17 48062676 11D TCCAAATGAG CCCACTGGCTC/----------- CCCAGCAATG 3070 het 3070 hom 36 17 21 3 CCCACTGGCTC 1 0 376247 CASAVA_Build 17 48069258 2D TAGATTGGAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 26 hom 36 2 19 17 A 12 10 376248 CASAVA_Build 17 48070500 1I ACTCAGGAGA -/C AAAGAAGAGG 3070 het 3032 hom 22 8 14 0 C 0 1 376249 CASAVA_Build 17 48078788 4D ATGTGAGATA GATT/---- ATTATAATTT 3070 het 3070 ref 44 22 19 5 GATT 1 0 376250 CASAVA_Build 17 48081686 1D ATAACAGAAA C/- TAAGTCCAAG 3070 hom 123 het 46 0 40 7 C 1 0 376251 CASAVA_Build 17 48086850 1I AGGAAGTCAA -/G TAATAAGGAA 3070 het 3070 hom 31 13 13 5 G 0 1 376252 CASAVA_Build 17 48093962 2D ACTCTTACCC TA/-- GAGTTCTAGT 3070 het 3070 hom 43 20 20 4 TA 1 0 376253 CASAVA_Build 17 48094870 7D TTGAGGCTTG AAGTTGT/------- AATTCAACAT 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 AAGTTGT 1 0 376254 CASAVA_Build 17 48096145 3I GCCTTAAATT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 13 10 4 A 11 14 376255 CASAVA_Build 17 48100612 1I TCAGTGGGGA -/C TCTGTGTGGG 3070 hom 103 het 39 0 34 5 C 0 1 376256 CASAVA_Build 17 48101224 1I GAACAAATAG -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 32 17 10 5 A 8 9 376257 CASAVA_Build 17 48103233 4D AATAAATAAG AAAC/---- AAAATTTAAT 3070 het 3070 hom 28 12 13 4 AAAC 1 0 376258 CASAVA_Build 17 48103424 6I72M1I AGAATAAGAG ------CATGTATTTTGTGAGGTAAGCCTCATTAACAAATCCAAACAAGTACTATTCAAGGAAAGAAAAATTGACACT-/AGTTCCCATGTATTTTGTGAGGTAAGCCTCATTAACAAATCCAAACAAGTACTATTCAAGGAAAGAAAAATTGACACTA ACCAAGATAA 3070 hom 205 het 42 0 69 8 N/A 0 0 376259 CASAVA_Build 17 48104588 2D TGTGAGAAAC AA/-- AAAAATTAGA 3070 het 3070 hom 42 20 20 2 A 7 5 376260 CASAVA_Build 17 48106010 1I TGTAATTCCC -/T TTTTTAAAGG 3070 het 3070 ref 42 20 19 3 T 5 6 376261 CASAVA_Build 17 48112793 1D CACTATCATG A/- AAAACATGTG 3070 het 3070 ref 36 19 12 9 A 5 4 376262 CASAVA_Build 17 48113898 2I GATATTTTTC --/TT TGTTTGCATT 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 T 1 3 376263 CASAVA_Build 17 48114612 1D CCAAGAGAAG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 19 5 A 8 7 376264 CASAVA_Build 17 48114974 1D TGCCTTATCC T/- TTCACTGTTG 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 T 3 2 376265 CASAVA_Build 17 48117770 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 744 het 197 hom 12 1 3 8 T 17 16 376266 CASAVA_Build 17 48119719 12D ACACTTGGTA CTAGTATACTGG/------------ CTAGTTTGCC 1107 het 1107 ref 49 29 9 15 CTAGTATACTGG 1 0 376267 CASAVA_Build 17 48123114 1I ATTTCATACT -/A AATAATACGA 3070 het 3070 hom 42 14 24 4 A 2 3 376268 CASAVA_Build 17 48155615 4I TGTTTAGATT ----/GATG GATGGATGTT 3070 het 3070 hom 42 11 21 10 GATG 2 3 376269 CASAVA_Build 17 48159965 4D GGAGGGAAAT CTTA/---- CTTCCTGCCA 3070 het 3070 ref 46 23 23 0 CTTA 1 0 376270 CASAVA_Build 17 48163219 1I TTTGTCAGTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 8 5 A 11 12 376271 CASAVA_Build 17 48165893 1I ATAAACAAAA -/G AGGTTTAATT 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 G 0 1 376272 CASAVA_Build 17 48170923 1D CTGAAACTGA T/- TTTTTTTCTA 3070 het 3070 hom 43 17 21 5 T 8 7 376273 CASAVA_Build 17 48205679 1D GAATCCATAA T/- ATAAGTAGTC 3070 het 3070 ref 37 18 15 4 T 1 0 376274 CASAVA_Build 17 48207303 1D AAATGTCTTC T/- TTTGAGAAGC 3070 het 3070 hom 30 14 16 0 T 4 3 376275 CASAVA_Build 17 48210361 1D CATTATACTG T/- TAAGTATTTT 3070 het 2666 hom 23 7 13 3 T 2 1 376276 CASAVA_Build 17 48211196 1I AGTTGCAAAA -/G AAAAATGATG 3070 het 3070 ref 42 20 16 6 G 0 1 376277 CASAVA_Build 17 48211307 1D GTGATAAGAC A/- AGGAAGAACC 3070 het 3070 ref 41 18 18 5 A 2 1 376278 CASAVA_Build 17 48215551 3I AAGTTTTTTT ---/TTG TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 TTG 0 1 376279 CASAVA_Build 17 48215777 1D GATTTTTACA T/- TTTTAAAGGA 3070 het 3070 ref 40 22 17 1 T 5 4 376280 CASAVA_Build 17 48220324 1D TCACTTAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 18 15 5 A 11 10 376281 CASAVA_Build 17 48222396 2D ATTGTTAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2020 hom 33 12 8 14 T 16 14 376282 CASAVA_Build 17 48223442 3I ACTACAATTT ---/TTA TTATTGCACT 3070 het 3070 ref 33 17 16 0 TTA 1 2 376283 CASAVA_Build 17 48232695 1D ATTCATTTTA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 1314 hom 17 3 11 3 T 10 9 376284 CASAVA_Build 17 48232933 4D TTCTTTTTTA TGAC/---- TGACTATTAC 3070 het 3070 hom 34 11 19 7 TGAC 2 1 376285 CASAVA_Build 17 48240313 4D CAGTTAAAAC AACA/---- AACAAAGAAA 3070 het 3070 hom 40 19 17 5 AACA 2 1 376286 CASAVA_Build 17 48264351 1I AAACTAGCTC -/T TATTTGATTT 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 T 1 2 376287 CASAVA_Build 17 48264934 3I AGGGTTAGGG ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 15 3 A 9 12 376288 CASAVA_Build 17 48272812 2D ATAAATTGAC TG/-- TGAAGAATAG 3070 het 3070 ref 38 20 17 1 TG 2 1 376289 CASAVA_Build 17 48273038 1I AAAACATCAG -/C CCGTCTCTTC 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 C 2 3 376290 CASAVA_Build 17 48281225 4D TAATCTGATA GAGT/---- GAGTTTTTAT 3070 hom 81 het 32 0 28 6 GAGT 2 1 376291 CASAVA_Build 17 48285672 1I AACCTATTAC -/A AAAAAACTAC 3070 het 3070 hom 31 14 16 1 A 6 7 376292 CASAVA_Build 17 48285862 1I TGCTTTCCAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 21 hom 34 1 26 7 T 11 12 376293 CASAVA_Build 17 48287416 2I TTATGAAATA --/AT ATATATATAT 3070 hom 111 het 41 0 38 3 AT 5 6 376294 CASAVA_Build 17 48288253 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 23 15 8 0 A 10 9 376295 CASAVA_Build 17 48288456 2D ACCCTATCTC AA/-- AAAAAAAATA 2122 het 2122 ref 19 12 5 4 A 10 8 376296 CASAVA_Build 17 48288898 1I CATTTTGTAC -/T TTTTTTTTGT 3070 het 2799 hom 22 8 9 5 T 8 9 376297 CASAVA_Build 17 48291035 7D TTAACTAAAC TAGTTAA/------- TAGTTAATAG 3070 hom 6 het 25 1 16 11 TAGTTAA 3 2 376298 CASAVA_Build 17 48293230 2D AAAATCTGAT AA/-- AAAAAAATTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 A 9 7 376299 CASAVA_Build 17 48294747 1I ATTCTTGAAG -/T CAATGAGACG 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 T 0 1 376300 CASAVA_Build 17 48295041 3D51M2D ATTTTAACTC ATTATATACAAAATATTGTTTTATCGTGTAATTAATATAAGAAATGAGATATTCTA/---ATATACAAAATATTGTTTTATCGTGTAATTAATATAAGAAATGAGATATTC-- TGTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 38 37 18 17 N/A 0 0 376301 CASAVA_Build 17 48296017 1I GAATTTACTC -/T TATGTTAAAT 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 T 1 2 376302 CASAVA_Build 17 48300638 3I AAATAAATAA ---/AAT AATAATGTAT 3070 hom 30 het 18 0 11 7 AAT 2 3 376303 CASAVA_Build 17 48304404 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTGTG 3070 hom 90 het 37 0 31 6 T 7 8 376304 CASAVA_Build 17 48306644 1I TGGTCTTTTT -/A ACCTAATTTC 3070 het 3070 hom 45 21 19 5 A 1 2 376305 CASAVA_Build 17 48309954 1D TAAAGTGTGG A/- AAAAAATCTA 3070 het 3070 hom 50 23 22 5 A 7 6 376306 CASAVA_Build 17 48313708 2I AGTTTGACAC --/TT TTCTCTATTT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 2 4 376307 CASAVA_Build 17 48321194 1I GTAGACAATT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 9 10 376308 CASAVA_Build 17 48328375 1I10M1I CAAAAAAAAT -AAAGAAATGC-/AAAAGAAATGCA AAAAAAAAAA 3070 het 1341 hom 40 9 13 20 N/A 0 0 376309 CASAVA_Build 17 48345392 1I GTTTTTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 22 het 14 0 10 4 A 10 11 376310 CASAVA_Build 17 48360530 1I GCAATTCTTC -/T GATTTTCTGT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 0 1 376311 CASAVA_Build 17 48365295 1I ACTAATTTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2113 hom 38 7 19 12 A 12 13 376312 CASAVA_Build 17 48381099 5D AATTTATTTT GTTAA/----- GTTATGTTTT 3070 het 3070 hom 31 12 18 3 GTTAA 1 0 376313 CASAVA_Build 17 48389255 2D CTATATATAT TA/-- TATATATATA 3070 het 866 hom 13 3 8 2 TA 7 6 376314 CASAVA_Build 17 48390966 13I CTCAGAGCCT -------------/TCTCATTTATGAC TCTCATTTAT 3070 het 3070 ref 34 16 10 8 TCTCATTTATGAC 1 2 376315 CASAVA_Build 17 48392380 1I GATCACCTGA -/G GGTCAGGAGT 3070 het 2616 hom 18 6 9 3 G 2 3 376316 CASAVA_Build 17 48395377 1D GGGAGAAGAG T/- TTTTGCAATC 3070 het 3070 ref 27 15 9 3 T 5 4 376317 CASAVA_Build 17 48395688 3I TTTACACTGT ---/TGG TGGGAGTGTA 3070 het 3070 hom 24 9 11 4 TGG 1 2 376318 CASAVA_Build 17 48395839 2D ACATTCACAC AT/-- ATGTTTATTG 3070 het 3070 hom 36 16 17 4 AT 2 1 376319 CASAVA_Build 17 48396139 1I ATAATTTCTG -/T TTTTTTCTAA 3070 het 3070 hom 36 13 22 1 T 6 7 376320 CASAVA_Build 17 48397068 4I TTGGTGATGT ----/TTCC TTCCTGTGAC 3070 het 3070 ref 43 19 20 4 TTCC 1 2 376321 CASAVA_Build 17 48397859 1I GGTGTAATTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 39 15 15 9 T 7 8 376322 CASAVA_Build 17 48414906 3D TCAGTCTCCT TCC/--- TCCTCCTCCT 2525 het 2212 hom 24 9 8 7 TCC 7 6 376323 CASAVA_Build 17 48417605 1D AATCCCTAGG C/- AGTAGTGAGA 3070 het 3070 ref 33 18 12 3 C 1 0 376324 CASAVA_Build 17 48422717 1D GCTCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 2216 het 2216 ref 33 16 8 9 A 15 14 376325 CASAVA_Build 17 48423473 1I CTCAGGCCTA -/T GGTGTTTTTT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 T 0 1 376326 CASAVA_Build 17 48425488 1I ACATACGATG -/T TTAATTTTAT 3070 hom 42 het 15 0 15 0 T 2 3 376327 CASAVA_Build 17 48433545 2D AATTAATAAC AA/-- GAGGAATTTT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 A 2 0 376328 CASAVA_Build 17 48442954 1D AACCCAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 16 13 5 A 11 10 376329 CASAVA_Build 17 48446712 3I TTCATTATGA ---/TTT TTTTTGTTAT 3070 het 3070 hom 44 17 23 4 T 5 8 376330 CASAVA_Build 17 48449480 1I TGCTAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 1777 het 1777 ref 23 10 7 6 A 12 13 376331 CASAVA_Build 17 48453323 2D AATTAAAAAC AT/-- ATTGTGAATT 3070 het 3070 hom 46 18 23 5 AT 2 1 376332 CASAVA_Build 17 48456819 1I AAGATAGGAT -/A AAAACAGAAA 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 4 5 376333 CASAVA_Build 17 48459629 1D CTCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1431 hom 29 6 13 10 A 17 16 376334 CASAVA_Build 17 48460215 4I TAAAATGTAC ----/AATA AATATTATTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 AATA 1 2 376335 CASAVA_Build 17 48461138 1D ACTTAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 14 11 10 T 11 10 376336 CASAVA_Build 17 48465402 2I ATTATCAGGC --/AG AGAGTCTTGT 3070 het 3070 hom 42 17 17 8 AG 2 3 376337 CASAVA_Build 17 48466864 2I CATTTTGGAC --/AT CTTTTATCAG 3070 het 3070 hom 36 10 24 2 AT 0 1 376338 CASAVA_Build 17 48476549 1D CATATATTGA G/- GGGAGTGATT 3070 hom 96 het 33 0 33 0 G 4 3 376339 CASAVA_Build 17 48489005 1D CGATTAGAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 A 11 10 376340 CASAVA_Build 17 48490954 6D TAACAATTAC TTTAAA/------ TATAAATTTA 3070 hom 75 het 26 0 26 5 TTTAAA 1 0 376341 CASAVA_Build 17 48494867 3I AATTCTTTCT ---/TTC TTTTTTTTTT 2397 hom 27 het 17 0 10 7 TTC 0 1 376342 CASAVA_Build 17 48494919 1D ACGTTGGAGT G/- CAATGGTGCA 3070 hom 39 het 21 0 14 7 G 1 0 376343 CASAVA_Build 17 48499999 4I ATAAGTAATT ----/ATTA ATTTGTGTGT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 ATTA 0 1 376344 CASAVA_Build 17 48501662 1I ACAAAAAAAA -/C CTTTCAGCTG 3070 het 87 hom 18 1 13 4 C 1 2 376345 CASAVA_Build 17 48520765 1D CATTAACCAC T/- TTTTTTTTCA 3070 hom 60 het 25 0 21 4 T 9 8 376346 CASAVA_Build 17 48532374 1I AAAGAGAGCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 255 hom 40 2 33 5 T 10 11 376347 CASAVA_Build 17 48533431 1I TTTTTTTTTT -/C TTTTCACAAA 3070 het 746 hom 25 2 16 8 C 0 1 376348 CASAVA_Build 17 48541359 5D CAGATGTAGC TAGAG/----- TAGTCAGCCA 3070 hom 99 het 37 0 34 8 TAGAG 1 0 376349 CASAVA_Build 17 48549448 2I ATATTTCAAG --/TT TTGTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 16 5 T 2 4 376350 CASAVA_Build 17 48555995 1I TTCCAGCCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1361 hom 37 6 20 11 T 13 14 376351 CASAVA_Build 17 48556988 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 69 het 34 0 24 10 TA 9 8 376352 CASAVA_Build 17 48569601 12D GCCTTCTAGA CTTGGGCTGAAT/------------ CTTAGGTTTA 3070 hom 90 het 31 0 31 1 CTTGGGCTGAAT 1 0 376353 CASAVA_Build 17 48574838 1I CTTGGATGAG -/A AAAAATTATC 3070 hom 105 het 37 0 36 1 A 5 6 376354 CASAVA_Build 17 48581736 1D TTACATTTAG A/- ATAAAAATAG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 2 1 376355 CASAVA_Build 17 48584026 1D ATTGCTGGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 12 11 376356 CASAVA_Build 17 48587194 1I TGGAAACTGA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 363 hom 36 1 28 7 T 7 8 376357 CASAVA_Build 17 48595921 5I TAATTTTATT -----/TAAAG TATAGTTCAA 3070 hom 126 het 46 0 43 3 TAAAG 0 1 376358 CASAVA_Build 17 48602115 1D GTAGTTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 523 hom 41 2 29 10 A 13 12 376359 CASAVA_Build 17 48606083 1I CCTTTTGTAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 34 23 9 2 T 7 8 376360 CASAVA_Build 17 48630398 2D ACATGAACAG AC/-- ACTCTCCAAA 3070 hom 105 het 43 0 36 8 AC 2 1 376361 CASAVA_Build 17 48647945 5I CCCATTTTTC -----/TATGG TATTGCCTTT 3070 hom 90 het 37 0 31 6 TATGG 0 1 376362 CASAVA_Build 17 48649671 1D TTTATATGGA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 63 het 23 0 21 2 T 10 9 376363 CASAVA_Build 17 48655464 1I GAGCACAACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 406 hom 40 1 32 7 A 10 11 376364 CASAVA_Build 17 48662179 1D TTGGATGTAG T/- TCACCTAAAG 3070 hom 93 het 33 0 32 1 T 2 1 376365 CASAVA_Build 17 48664168 1D GATAAGTTGC A/- ATTTTTTTAA 3070 hom 69 het 32 0 24 8 A 2 1 376366 CASAVA_Build 17 48689721 2I ACTGGATGAC --/AT AGAGAAACAG 3070 hom 102 het 37 0 35 2 AT 0 1 376367 CASAVA_Build 17 48702229 11D AATGCATCTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 21 0 14 7 T 25 14 376368 CASAVA_Build 17 48705557 1D TTAACTCCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 53 het 42 1 31 11 T 10 9 376369 CASAVA_Build 17 48705938 1I CAAACTATAC -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 69 het 29 0 24 5 T 9 10 376370 CASAVA_Build 17 48718946 1I TTTATTAAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 12 11 9 T 11 12 376371 CASAVA_Build 17 48719678 5D ACTAGAAACC TACAA/----- TACATGAAAT 3070 het 3070 ref 35 21 11 5 TACAA 1 0 376372 CASAVA_Build 17 48731654 1I AATTTAGAAA -/T TTCTACCAAT 3070 het 3070 hom 31 11 15 5 T 2 3 376373 CASAVA_Build 17 48737786 1D ATGAAACTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 75 het 31 0 21 10 T 11 10 376374 CASAVA_Build 17 48739958 1I ACATGAATAG -/A ATAAAAAAAG 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 1 2 376375 CASAVA_Build 17 48740866 4D ACAAACAGAC ATAA/---- ATAAATGAAA 3070 het 3070 ref 60 33 24 6 ATAA 2 1 376376 CASAVA_Build 17 48743690 1I ACTAAAAAAA -/T AAAAAAAAAA 3070 het 1446 hom 22 7 9 6 T 0 1 376377 CASAVA_Build 17 48744657 4D ATGTTGGTCA AAAC/---- AAACAAAGTT 3070 hom 87 het 35 0 30 7 AAAC 2 1 376378 CASAVA_Build 17 48744844 1I AATGTATACA -/C ATATGAAAAC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 0 1 376379 CASAVA_Build 17 48744954 1I ATACTGTGGG -/A AAAAAAGTCT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 A 6 7 376380 CASAVA_Build 17 48747705 4I TAAAGCAAGC ----/ACAG ACAAACAATC 3070 hom 111 het 46 0 36 10 ACAG 0 1 376381 CASAVA_Build 17 48749819 1I CCAGTTTTCA -/T TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 40 17 18 5 T 8 9 376382 CASAVA_Build 17 48765379 2D GTTTTCTGTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 34 het 28 1 23 5 A 16 14 376383 CASAVA_Build 17 48775998 1D AAAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 31 0 15 16 A 12 11 376384 CASAVA_Build 17 48795181 5D AAATTTAAAC TTTTG/----- TTTATGAGAT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 TTTTG 1 0 376385 CASAVA_Build 17 48831525 2D GCCAGGAATT AC/-- AGTCATCAAC 3070 het 3070 hom 53 19 29 5 AC 1 0 376386 CASAVA_Build 17 48851155 1D CCTGTCTTAG C/- CTCCCGAGTA 1341 het 1341 ref 13 8 3 2 C 2 1 376387 CASAVA_Build 17 48891886 1D TTTTTTTTTT G/- TGTGTGTGTG 1576 het 1576 ref 41 25 5 12 G 1 0 376388 CASAVA_Build 17 48920191 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 552 hom 32 2 21 9 T 12 13 376389 CASAVA_Build 17 48981590 1D CTTTTGTCCA T/- TTTTTAATCA 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 T 6 5 376390 CASAVA_Build 17 49000944 2D AAAAAAAAAA AG/-- GAAGGAAGAA 3070 het 767 hom 33 10 15 8 AG 1 0 376391 CASAVA_Build 17 49004824 2D TTTAGAAAAC AT/-- ATTAAATGCT 3070 het 3070 hom 30 14 15 2 AT 2 1 376392 CASAVA_Build 17 49005352 1I CTATAGGGAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 10 11 376393 CASAVA_Build 17 49007723 1I CATGCCATAT -/C CAATATTAAT 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 C 1 2 376394 CASAVA_Build 17 49023867 1I TTAGTTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 18 8 13 A 10 11 376395 CASAVA_Build 17 49036660 1I ACCATATGTG -/T TTTTTTTTAC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 8 9 376396 CASAVA_Build 17 49044075 2D TTTATGGTCA TT/-- TTAATTAACA 3070 het 3070 ref 34 18 15 2 T 4 2 376397 CASAVA_Build 17 49047195 1I ATAGTGACAA -/T TTTTTATACA 3070 hom 93 het 32 0 32 0 T 5 6 376398 CASAVA_Build 17 49049362 2I CATAAATGTG --/TA TATATATATA 1110 het 1110 ref 22 11 7 4 TA 7 8 376399 CASAVA_Build 17 49049706 2D TCAATAATGC TT/-- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 18 18 1 T 9 7 376400 CASAVA_Build 17 49050949 1D TCTGGGTCCC G/- GGTTCAAGCA 3070 het 1250 hom 15 3 10 2 G 3 2 376401 CASAVA_Build 17 49056494 1D AATAAATAAC A/- ACACGGAATG 3070 het 3070 hom 40 17 20 3 A 2 1 376402 CASAVA_Build 17 49059025 3I TTTCTGTATT ---/GGC ACTTTGTGAT 3070 hom 117 het 41 0 40 1 GGC 0 1 376403 CASAVA_Build 17 49060068 21I ATAATTTACA ---------------------/ATTGCATGAGTCAATTGCATG ACTCAATTGC 3070 het 3070 ref 50 25 20 6 ATTGCATGAGTCAATTGCATG 0 1 376404 CASAVA_Build 17 49070437 30D GCCAGGTGGC ATTTGCTGCAGATGTTATATTTAAAATCTT/------------------------------ ATTAGGTATG 3070 het 3070 ref 31 18 11 9 ATTTGCTGCAGATGTTATATTTAAAATCTT 1 0 376405 CASAVA_Build 17 49075443 1D TCGTCTTCAA T/- TTTTTTCATT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 7 6 376406 CASAVA_Build 17 49102962 1D AAAATAATGC A/- AAAATCTTAT 3070 het 3070 ref 28 16 7 5 A 5 4 376407 CASAVA_Build 17 49108666 3I TACTTGGAAT ---/GTG GTGATTTTAA 3070 het 3070 hom 40 12 24 4 GTG 1 2 376408 CASAVA_Build 17 49110341 1I TTCATTTGTC -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 45 14 22 9 T 9 10 376409 CASAVA_Build 17 49111126 14D GACTGCCTTT TCTCCATTGAGTGG/-------------- TCTCCATTGA 3070 hom 132 het 49 0 43 12 TCTCCATTGAGTGG 2 1 376410 CASAVA_Build 17 49142707 1D GTAGACACAC A/- ATGTGCTACT 3070 het 3070 hom 50 16 27 7 A 2 1 376411 CASAVA_Build 17 49155263 1I TTCTCATATA -/T TTTTCTGGGA 3070 het 3070 ref 45 25 13 7 T 4 5 376412 CASAVA_Build 17 49160855 4I TGAAAATATA ----/CAGT CAGAGGAGGA 3070 het 3070 ref 30 17 12 1 CAGT 0 1 376413 CASAVA_Build 17 49177752 1D ACATAAATAT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 33 21 9 3 A 10 9 376414 CASAVA_Build 17 49183963 1D TCTTCAATCA G/- ATGGTTGTAG 3068 het 3068 ref 20 8 7 5 G 1 0 376415 CASAVA_Build 17 49187138 2I ATATTGCATA --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 271 hom 28 1 25 2 TG 5 6 376416 CASAVA_Build 17 49195461 1I TCTCCATCTT -/C AGAATTGTTT 3070 hom 90 het 31 0 31 0 C 0 1 376417 CASAVA_Build 17 49196365 4I AATTTATGAA ----/TTTG TTTATCATTT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 TTTG 0 1 376418 CASAVA_Build 17 49197578 1I GTTAGGACAA -/T TTTATAGTGT 3070 hom 151 het 56 0 51 5 T 3 4 376419 CASAVA_Build 17 49200305 1D CTTTTTCACC T/- CTCCAATTTG 3070 hom 81 het 33 0 28 5 T 1 0 376420 CASAVA_Build 17 49201370 1I TAAGGGCCAC -/A AAAAATGCCC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 A 5 6 376421 CASAVA_Build 17 49205804 1I TGGGTTGTTA -/G TTTATTTGTT 3070 hom 93 het 36 0 32 4 G 0 1 376422 CASAVA_Build 17 49212800 1D GGGCAGGGCA T/- TCTCTGAAAG 2641 hom 24 het 10 0 8 2 T 2 1 376423 CASAVA_Build 17 49216535 1D CAAACATATG A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 54 het 19 0 19 1 A 9 8 376424 CASAVA_Build 17 49228649 1D GTTTGTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 39 0 28 11 T 12 11 376425 CASAVA_Build 17 49232568 2D CTCTGACTAT AC/-- ACTCTCCTTT 3070 hom 99 het 37 0 33 5 AC 2 1 376426 CASAVA_Build 17 49232865 5D ATATCATGTG TCATA/----- CATCACGTAT 3070 hom 87 het 30 0 30 1 TCATA 1 0 376427 CASAVA_Build 17 49235587 1I TAGAAAAATT -/A AAAAAAAGGT 3070 hom 84 het 31 0 29 2 A 7 8 376428 CASAVA_Build 17 49237387 1D ACAAATTGTT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 8 7 376429 CASAVA_Build 17 49238043 1I AATTATAAAG -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 84 het 34 0 29 5 T 8 9 376430 CASAVA_Build 17 49239402 1D TCTTTTAATG T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 63 het 33 0 22 12 T 10 9 376431 CASAVA_Build 17 49240159 2I CTTTAGTATA --/CT CTCTGTGAGA 3070 hom 138 het 50 0 47 3 CT 2 3 376432 CASAVA_Build 17 49248121 1I ATTTAAAAAG -/A AAACCATGAA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 A 3 4 376433 CASAVA_Build 17 49252166 1D GTTACTGTTA T/- TTTTCACCAA 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 5 4 376434 CASAVA_Build 17 49257492 3I AAACTGTCCA ---/AAT AATTATCTAA 3070 hom 120 het 45 0 41 4 AAT 1 2 376435 CASAVA_Build 17 49258884 4I TGTAACAAAA ----/AAAG AAGGGTCTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 AAAG 0 1 376436 CASAVA_Build 17 49262696 4D AAGTTACAAA TACT/---- TAAGTATTCT 3070 hom 75 het 30 0 26 5 TACT 1 0 376437 CASAVA_Build 17 49262934 6I TGTTCGGTAC ------/TTTGTA TTTGTATGCC 3070 hom 102 het 46 0 35 11 TTTGTA 1 2 376438 CASAVA_Build 17 49263420 6I TGTGTCCCTG ------/TGAGAC TGAGACTGCA 3070 hom 134 het 50 0 43 7 TGAGAC 1 2 376439 CASAVA_Build 17 49263771 1D GACATTAGTA T/- TTTTTTCCTG 3070 hom 60 het 24 0 21 3 T 7 6 376440 CASAVA_Build 17 49264525 4I ATTTATAAAC ----/TGTT TGTTTAATTC 3070 hom 72 het 25 0 25 0 TGTT 1 2 376441 CASAVA_Build 17 49269067 2I AAAAGAAATG --/CT GTTATTCTTT 3070 hom 84 het 34 0 29 5 CT 0 1 376442 CASAVA_Build 17 49296164 19I TTGCCTGCTG -------------------/CCATGTAAGATGCACCTTT CACCTTCCAC 3070 hom 54 het 20 0 19 1 CCATGTAAGATGCACCTTT 0 1 376443 CASAVA_Build 17 49314260 1I TTCATCTCAG -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 A 9 10 376444 CASAVA_Build 17 49328187 1I TTTGAAAGAG -/T TTTAAATTTA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 3 4 376445 CASAVA_Build 17 49343108 1D GTTTATTCCT C/- CCCCATCCTC 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 5 4 376446 CASAVA_Build 17 49370213 1D27M1I AAAAATACTT AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAACTTCCT-/-AAAAAAAAAAGAAAAAGAAAACTTCCTC CCCCCCGAAA 2683 het 301 hom 18 2 10 13 N/A 0 0 376447 CASAVA_Build 17 49377664 1D AATAACAGGC A/- AAAAAAAAGC 3070 hom 132 het 49 0 45 5 A 9 8 376448 CASAVA_Build 17 49390352 1D ACTTAACCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1515 hom 32 4 19 9 A 13 12 376449 CASAVA_Build 17 49390505 1I AAGGATATGC -/A AAAAAAAAAA 1688 het 1688 ref 35 20 6 9 A 15 16 376450 CASAVA_Build 17 49397577 1D CCATCTCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 604 hom 31 2 21 9 A 14 13 376451 CASAVA_Build 17 49420498 1D ACAGTTTGCT G/- GGGGGGAGTG 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 7 6 376452 CASAVA_Build 17 49423483 2D TTCTTCTAAC AT/-- GTGTAAATAG 3070 hom 96 het 37 0 33 5 AT 1 0 376453 CASAVA_Build 17 49435376 1D AGTTGGTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 27 1 20 6 T 12 11 376454 CASAVA_Build 17 49437117 3D CATACTTCCC ATA/--- ATATTTCCTT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 ATA 2 1 376455 CASAVA_Build 17 49438083 1D TGTATAGCAC T/- TTCTTTTTCA 3070 hom 105 het 37 0 36 2 T 3 2 376456 CASAVA_Build 17 49444622 4D CCATAAACAA ACAC/---- ACACACACAC 3070 hom 101 het 41 0 33 8 AC 11 9 376457 CASAVA_Build 17 49444735 1D TGCTTAATGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 50 29 9 12 A 15 14 376458 CASAVA_Build 17 49445629 1D CTGCTGTGCA C/- TTTCCCCCAC 3070 hom 95 het 36 0 31 5 C 1 0 376459 CASAVA_Build 17 49454759 1D GCTTTGAATA T/- TTTTTGACCC 3070 hom 140 het 51 0 47 4 T 6 5 376460 CASAVA_Build 17 49551600 1D TTACAATTTC T/- TTTTTCTTTT 694 het 445 hom 33 4 9 20 T 6 5 376461 CASAVA_Build 17 49584463 4D CTTTCTTTCT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 134 het 50 0 44 7 TTTC 3 2 376462 CASAVA_Build 17 49654507 4I CTGTTCAAAC ----/AAAT ATTTATTGAT 3070 hom 99 het 36 0 34 2 AAAT 0 1 376463 CASAVA_Build 17 49655237 2D AGCAACATGT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 21 10 9 3 A 13 11 376464 CASAVA_Build 17 49658811 1I43M1D CTACAGCAGG -TAAAAGTACATAGAAAAAAAATTGCTCCTTAAATTTTCTTTTCT/TTAAAAGTACATAGAAAAAAAATTGCTCCTTAAATTTTCTTTTC- TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 28 14 21 2 N/A 0 0 376465 CASAVA_Build 17 49658962 2D CTGCACTAAC TA/-- TATATATATA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 TA 6 5 376466 CASAVA_Build 17 49664536 5D ATGTGCATAT ATATA/----- ATATAATATA 3070 het 1824 hom 17 5 10 3 ATATA 3 2 376467 CASAVA_Build 17 49676615 2D GACCTGCCAG GC/-- TCCTTCTTTG 3070 hom 75 het 29 0 25 5 GC 1 0 376468 CASAVA_Build 17 49690537 1D TTCACCTCTT A/- AGACTCAAGT 3070 het 3070 ref 25 11 11 4 A 2 1 376469 CASAVA_Build 17 49732061 1I TTAAAAAAAG -/A AAAAAAATTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 A 7 8 376470 CASAVA_Build 17 49759734 1I TTGTTTTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3060 hom 28 10 16 2 T 14 15 376471 CASAVA_Build 17 49772479 1I TTTCATGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 43 18 15 10 A 11 12 376472 CASAVA_Build 17 49772820 1I AGGACTAAGG -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 T 8 9 376473 CASAVA_Build 17 49773478 1I TTGTCAGAAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 A 10 11 376474 CASAVA_Build 17 49906554 4D CTGGCCTACT CTGG/---- CTATTTTTTA 3070 hom 60 het 23 0 21 3 CTGG 1 0 376475 CASAVA_Build 17 49907975 1I GCATGCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 26 1 22 3 T 10 11 376476 CASAVA_Build 17 49913148 1D TTGCTTTTTT G/- TTGTTGTTTA 3070 hom 81 het 35 0 28 7 G 1 0 376477 CASAVA_Build 17 49917298 3I AAAAATAAAG ---/ATA ATGACATCTA 3070 hom 102 het 43 0 35 8 ATA 0 1 376478 CASAVA_Build 17 49931628 1I ATAAAAAAAA -/C AATAACATTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 C 0 1 376479 CASAVA_Build 17 49932802 1I ACCCACCCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 327 hom 25 1 16 8 A 10 11 376480 CASAVA_Build 17 49945289 1D TAAAATGTCC T/- ACTTCCCTAA 3070 het 3070 ref 44 20 19 5 T 1 0 376481 CASAVA_Build 17 49950479 1I CTCAGCACAG -/T TTTTTTTATT 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 T 7 8 376482 CASAVA_Build 17 49956543 1D AACTAAAGAG T/- TTTTAATGGC 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 T 5 4 376483 CASAVA_Build 17 49958308 7D AAGATAGTTA TTATTTT/------- TACCTTTGCA 3070 het 3070 ref 31 18 14 3 TTATTTT 1 0 376484 CASAVA_Build 17 49964609 1I TGGCACTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2892 hom 29 6 16 7 T 10 11 376485 CASAVA_Build 17 49989153 1D AAAACCCTAT A/- AAAAAATAAA 3070 het 2568 hom 17 6 10 1 A 7 6 376486 CASAVA_Build 17 49994872 1D GTGTGGATAG A/- AAAAAAAAAG 1114 het 1114 ref 36 28 3 5 A 10 9 376487 CASAVA_Build 17 50006284 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 A 10 11 376488 CASAVA_Build 17 50011332 3I AGAAAGATAC ---/TTT TTTTTTTTTT 2064 het 2064 ref 35 18 10 7 T 11 14 376489 CASAVA_Build 17 50012641 5I GACTAAACAA -----/TAAAC TAATAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 12 10 5 TAAAC 0 1 376490 CASAVA_Build 17 50013819 2D TAAAAGTTAG AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 40 20 16 5 A 10 8 376491 CASAVA_Build 17 50014229 1D ATTCCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 A 11 10 376492 CASAVA_Build 17 50018142 4D CATATCAACA GAAG/---- GAAGGACAAA 3070 het 3070 hom 36 16 19 3 GAAG 2 1 376493 CASAVA_Build 17 50018545 1I TAGAATTTAT -/A AAACAAATTC 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 A 3 4 376494 CASAVA_Build 17 50018668 1D TAATAGCCCC A/- AATTAAATTA 3070 het 3070 ref 31 15 12 4 A 3 2 376495 CASAVA_Build 17 50019758 1D GTGAGAAGGT G/- GGGAAAAGGG 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 G 4 3 376496 CASAVA_Build 17 50020405 3I GTTAAAAATA ---/AAT AATGATTATT 3070 het 3070 ref 18 9 8 1 AAT 1 2 376497 CASAVA_Build 17 50026887 1I CTATCCCATA -/C CCTTAATATC 3070 het 3070 ref 40 25 9 6 C 2 3 376498 CASAVA_Build 17 50027649 2I GGTATTATGC --/AT AGAGTCACTA 3070 het 3070 ref 41 21 16 4 AT 0 1 376499 CASAVA_Build 17 50030171 1I TCTTCTATGG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 A 9 10 376500 CASAVA_Build 17 50031731 5D GTAACAAATG TACTA/----- TACAAGTATA 3070 het 3070 hom 22 8 11 4 TACTA 1 0 376501 CASAVA_Build 17 50031828 1D ATTACAAAAG A/- AAAAAATAGA 3070 het 2699 hom 32 8 20 5 A 7 6 376502 CASAVA_Build 17 50033877 1D CAAGTCTTCA G/- GGGCAGAGCA 3070 het 3070 ref 46 23 20 3 G 4 3 376503 CASAVA_Build 17 50034559 4D TTTCTTTATC TTTG/---- TTTATTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 19 5 TTTG 1 0 376504 CASAVA_Build 17 50039125 1D GTAATAATAC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 34 13 20 1 T 10 9 376505 CASAVA_Build 17 50041742 3D ACTGAAAGAT GAG/--- GAGAAGGAGA 3070 het 3070 hom 41 17 21 6 GAG 2 1 376506 CASAVA_Build 17 50043098 1I TAGTCAGAGC -/A AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 27 11 12 4 A 8 9 376507 CASAVA_Build 17 50045778 5I CCACCAAAGG -----/AATAA AATAAAACAT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 AATAA 1 2 376508 CASAVA_Build 17 50047383 2I CTATATATAT --/AC ACAACACAAA 3070 het 3070 hom 39 15 21 3 AC 1 2 376509 CASAVA_Build 17 50048625 7I TACCACATTC -------/TTTCTGG TTGCAGGACA 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 TTTCTGG 0 1 376510 CASAVA_Build 17 50049766 1I TACAAATATA -/T CAAAAAATAG 3070 het 2407 hom 19 7 10 2 T 0 1 376511 CASAVA_Build 17 50051498 1I TGCTAATCTA -/T AACAGAGTGA 3070 het 3070 ref 42 18 16 8 T 0 1 376512 CASAVA_Build 17 50052456 1I TTAGACCTGT -/A AGGACCCAGG 3070 het 3070 hom 49 21 23 5 A 1 2 376513 CASAVA_Build 17 50055770 5I GAATTGTCTA -----/TTTAT TTTATTTTAA 3070 het 3070 hom 37 15 18 4 TTTAT 1 2 376514 CASAVA_Build 17 50060176 50D TACCACTAAA AATCATCTGCTTGCAGTATATTTGCAGAAACCAAATAATCAAAGGGACTT/-------------------------------------------------- AGTTATCATG 3070 het 3070 ref 38 34 17 2 AATCATCTGCTTGCAGTATATTTGCAGAAACCAAATAATCAAAGGGACTT 1 0 376515 CASAVA_Build 17 50062477 1I TGAAATTCCT -/G GGGGGGCTTT 3070 hom 56 het 26 0 19 7 G 6 7 376516 CASAVA_Build 17 50064043 1D CTATTTGGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 17 6 A 11 10 376517 CASAVA_Build 17 50077702 1D AAAGTACAAT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 A 10 9 376518 CASAVA_Build 17 50080242 1I GCTCAACAAC -/T CTATAAGGAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 0 1 376519 CASAVA_Build 17 50082931 1I TCTTTTTAAA -/T TTTTTTTTAT 3070 hom 31 het 27 1 25 1 T 8 9 376520 CASAVA_Build 17 50083017 4D AATGTGAAAT ACTC/---- ACAGCATAGA 3070 het 3070 ref 38 21 16 2 ACTC 1 0 376521 CASAVA_Build 17 50085251 4I ATGCTCAGTG ----/AGAT AGATATCTGA 3070 het 3070 hom 42 17 23 2 AGAT 1 2 376522 CASAVA_Build 17 50087478 2D CTCCATGCCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 2001 hom 37 7 23 9 T 12 10 376523 CASAVA_Build 17 50087719 2I CTATCAAACA --/CT CTTTCCAGGT 3070 het 3070 ref 58 28 23 7 CT 1 2 376524 CASAVA_Build 17 50090749 1D ATGGGGTTGA T/- TTTTTTCTTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 7 6 376525 CASAVA_Build 17 50096537 1D AACATCCAGT G/- GATGAATAGC 3070 het 3070 ref 36 19 12 5 G 2 1 376526 CASAVA_Build 17 50098260 1D GGTTCCCACC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 31 8 16 7 T 10 9 376527 CASAVA_Build 17 50102494 2D AAAAGCAATC AA/-- AGAGTTACCA 3070 het 3070 ref 44 26 14 5 A 3 1 376528 CASAVA_Build 17 50104877 1I6M5I CCAAATATAA -TTTTCT-----/TTTTTCTTATAA TATATATCCA 3070 het 3070 hom 19 8 10 2 N/A 0 0 376529 CASAVA_Build 17 50105088 3D TGATACACCC TTA/--- TTATTTTTAA 3070 het 3070 hom 26 8 13 5 TTA 2 1 376530 CASAVA_Build 17 50133289 1I AAAAAGCTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 40 17 15 8 A 10 11 376531 CASAVA_Build 17 50136058 3D TTTTACTGGA TTG/--- TTGTTACATT 3070 hom 81 het 32 0 28 6 TTG 2 1 376532 CASAVA_Build 17 50146934 3I GAGCAATAAA ---/CTT CTTCTTTTTT 3070 hom 57 het 25 0 18 7 CTT 2 3 376533 CASAVA_Build 17 50151152 3D AAATGTAATC CAT/--- CACATAAACA 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 CAT 1 0 376534 CASAVA_Build 17 50165267 1D ACCTACAGAT G/- GGGGAATATA 3070 het 2728 hom 27 8 17 3 G 5 4 376535 CASAVA_Build 17 50168954 1I TGTTTAAGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 16 10 3 T 10 11 376536 CASAVA_Build 17 50174086 1I TCAATTCTTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 19 11 5 A 13 14 376537 CASAVA_Build 17 50175958 1D AGCATTTGGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 10 10 A 15 14 376538 CASAVA_Build 17 50177353 1I ATATTTACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1265 hom 32 4 23 5 A 12 13 376539 CASAVA_Build 17 50186071 1D GTGAGTGCAC A/- AAAAAGATTC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 A 6 5 376540 CASAVA_Build 17 50187072 7I CTCCTGCCCT -------/GCCAGGG GTCCAACTCT 3070 hom 59 het 22 0 16 6 GCCAGGG 0 1 376541 CASAVA_Build 17 50202371 1D CCCAAAGATT G/- GGGTTGAATA 3070 het 3070 hom 40 11 22 8 G 4 3 376542 CASAVA_Build 17 50225939 1I CTCAAGTGAC -/T TTTTTTTGTT 3070 hom 113 het 40 0 38 2 T 7 8 376543 CASAVA_Build 17 50228000 1I GATTGATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 T 10 11 376544 CASAVA_Build 17 50242398 1I AGAGCACTAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 62 hom 29 1 25 3 A 10 11 376545 CASAVA_Build 17 50244887 1D AGATGAACCC A/- ACTATGAGTA 3070 hom 141 het 54 0 47 7 A 2 1 376546 CASAVA_Build 17 50252698 12D AGATGAGGGG AAAATATTTCCA/------------ AGTCATCTAT 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AAAATATTTCCA 1 0 376547 CASAVA_Build 17 50253239 1I CCTAGCCAAA -/G GAAGCCATGA 3070 hom 57 het 23 0 19 4 G 1 2 376548 CASAVA_Build 17 50261135 2D TAATCTTTAC AT/-- ATATATTAAT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AT 4 3 376549 CASAVA_Build 17 50262324 1I TGAGCTTTAA -/G TCAACACGGC 3070 hom 120 het 43 0 41 2 G 0 1 376550 CASAVA_Build 17 50270986 1I CAAATGACTC -/A AAATTTTTTA 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 3 4 376551 CASAVA_Build 17 50275326 3I AAATCTCTCC ---/TCA TCATAACTGC 3070 hom 96 het 38 0 33 5 TCA 1 2 376552 CASAVA_Build 17 50278395 1I AAATTCAATA -/G CCTCCTCCTT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 0 1 376553 CASAVA_Build 17 50280284 1D AAAATGCCAG A/- AAAAAAAATT 3070 het 53 hom 32 1 26 6 A 9 8 376554 CASAVA_Build 17 50285239 1I ACAGGAGATG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 33 hom 43 2 34 7 A 10 11 376555 CASAVA_Build 17 50285813 6D TGAAGTACAT ACACAC/------ ACACACACAC 3070 hom 75 het 36 0 26 11 AC 12 9 376556 CASAVA_Build 17 50287526 2I GTATATATGG --/AT ATATATATAT 3070 hom 84 het 30 0 29 1 AT 5 6 376557 CASAVA_Build 17 50306332 6D TCTTTCTTTC TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 14 0 14 0 T 16 10 376558 CASAVA_Build 17 50306877 1D AAACTAGACC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 90 het 35 0 31 4 A 9 8 376559 CASAVA_Build 17 50312701 2I ATTCTCCATA --/CT AATAGAAAAT 3070 hom 68 het 27 0 23 4 CT 0 1 376560 CASAVA_Build 17 50346026 6D ACTCTGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 8 het 17 0 9 10 A 20 14 376561 CASAVA_Build 17 50347128 1D CATTGCATTT A/- ATTGATGTCT 3070 hom 144 het 51 0 49 2 A 2 1 376562 CASAVA_Build 17 50352163 1D TGACAAATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 10 9 376563 CASAVA_Build 17 50353317 2I ACCGACGCTG --/AC ACATGATTTG 3070 hom 144 het 56 0 48 8 AC 1 2 376564 CASAVA_Build 17 50357111 2I ATCATTCAGT --/AA AAACAGGCTT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 3 5 376565 CASAVA_Build 17 50357636 1D AGAATAATGT G/- GGGGAGGGCA 3070 hom 96 het 36 0 33 4 G 5 4 376566 CASAVA_Build 17 50358271 6I TCAAACAAAA ------/AACAAC AACAACAACA 3070 hom 99 het 41 0 32 9 AAC 3 5 376567 CASAVA_Build 17 50359002 1D TAACCAGTTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 231 hom 30 1 21 8 A 14 13 376568 CASAVA_Build 17 50360728 1I GAAAAAAACC -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 66 het 46 1 40 5 A 9 10 376569 CASAVA_Build 17 50369232 5I CTTAATGTTA -----/TTAAG TTAACGTTAA 3070 hom 135 het 48 0 46 2 TTAAG 0 1 376570 CASAVA_Build 17 50371155 2D AATTAATCTC TT/-- TTATTTGGTG 3070 hom 103 het 39 0 35 6 T 4 2 376571 CASAVA_Build 17 50381823 5D TCTCAGTAAT AAAAG/----- AAAAGCTTAA 3070 hom 132 het 49 0 45 8 AAAAG 2 1 376572 CASAVA_Build 17 50385584 1I ACAAACAAAC -/A AAAAAAATCA 3070 hom 105 het 36 0 36 0 A 7 8 376573 CASAVA_Build 17 50390381 12D GCATTAATGC TGAGGCCTGCAA/------------ TTCTTAGTTA 3070 hom 105 het 35 0 35 1 TGAGGCCTGCAA 1 0 376574 CASAVA_Build 17 50390494 1D AAGGAAATGG A/- AATGCTAAAA 3070 hom 97 het 34 0 32 2 A 3 2 376575 CASAVA_Build 17 50394325 1D AATTTAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 11 10 376576 CASAVA_Build 17 50396892 7D GAATTTATAC TTTAACT/------- TTTAAGTTAC 3070 hom 72 het 28 0 25 3 TTTAACT 1 0 376577 CASAVA_Build 17 50403342 1I AATGACAACT -/A AAATATTTTG 3070 hom 135 het 53 0 46 7 A 3 4 376578 CASAVA_Build 17 50407201 2D GCAGTTTTGC AA/-- ACTCATAGTT 3070 hom 117 het 42 0 38 4 A 3 1 376579 CASAVA_Build 17 50412391 2I GACAGGTGTC --/TA TGTGTGTGTG 3070 hom 114 het 41 0 39 2 TA 0 1 376580 CASAVA_Build 17 50413296 1D TTTTTTTGCG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 72 het 30 0 25 6 T 10 9 376581 CASAVA_Build 17 50413534 1I TTCTTCAATT -/A ATTTGTAAAT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 1 2 376582 CASAVA_Build 17 50414061 1I AAAGATTCAT -/A AAGTTAGCCA 3070 hom 78 het 30 0 25 5 A 2 3 376583 CASAVA_Build 17 50415968 5I GAACTCTGCA -----/TTTCT TTTCTTTTCT 3070 hom 81 het 36 0 25 11 TTTCT 2 3 376584 CASAVA_Build 17 50422647 9D TGTTAGGAAT CAGGCGACA/--------- CAGCAGGAGG 3070 hom 86 het 30 0 27 9 CAGGCGACA 1 0 376585 CASAVA_Build 17 50534490 1D TGAACTCTCA T/- TTTTTTTTTT 1294 het 1294 ref 44 33 4 8 T 13 12 376586 CASAVA_Build 17 50544451 1D AATTTTACTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 84 het 37 0 29 8 T 10 9 376587 CASAVA_Build 17 50549019 1I TAATTATATG -/A CAGTTATAAC 3070 hom 117 het 45 0 40 5 A 0 1 376588 CASAVA_Build 17 50549960 1I GCACTAATCG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2333 hom 55 5 42 8 A 11 12 376589 CASAVA_Build 17 50550933 4D TGGGATGGAG AAAT/---- AAATGTAAGA 3070 hom 120 het 42 0 41 3 AAAT 2 1 376590 CASAVA_Build 17 50553176 1I AGAAAGAGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 393 hom 52 1 37 14 T 10 11 376591 CASAVA_Build 17 50560761 1D GTACCAGAGA T/- TGCTTGGATG 3070 hom 105 het 42 0 35 7 T 2 1 376592 CASAVA_Build 17 50567301 1I TCAGAGTTAG -/C AATGTAAGAG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 C 0 1 376593 CASAVA_Build 17 50579087 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 19 0 15 5 A 12 11 376594 CASAVA_Build 17 50585921 1I AAATTAGTTG -/A AAAAATATGT 3070 hom 78 het 27 0 26 1 A 5 6 376595 CASAVA_Build 17 50594931 1D CTCTTGATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 41 0 29 12 A 13 12 376596 CASAVA_Build 17 50596197 1I CTAGAAAAGG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 47 het 35 1 30 4 A 8 9 376597 CASAVA_Build 17 50600484 4I ATTACTTCTC ----/TGAA TGATAAAAGT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 TGAA 0 1 376598 CASAVA_Build 17 50600607 2D ATATACACAC CA/-- CACACACACA 3070 het 27 hom 40 1 34 6 CA 10 9 376599 CASAVA_Build 17 50602625 2D TCCTGAAAAC AG/-- GGGAATGTCT 3070 het 3070 hom 33 13 17 3 AG 1 0 376600 CASAVA_Build 17 50612924 1I CCACCAGTCT -/A AAAGAATTAC 3070 hom 120 het 44 0 40 4 A 3 4 376601 CASAVA_Build 17 50614523 2D GGCAAGAATC AA/-- GAGAAAACAG 3070 hom 132 het 47 0 45 3 A 2 0 376602 CASAVA_Build 17 50621530 1D TATATTTGGC A/- AAAAAAATGC 3070 hom 96 het 39 0 33 7 A 8 7 376603 CASAVA_Build 17 50636291 3D TACAGAGATA TTC/--- TTCTTTGTTA 3070 hom 108 het 42 0 37 7 TTC 2 1 376604 CASAVA_Build 17 50639218 2D TCCGTCTCAG AA/-- AAAAAAAAAA 744 het 390 hom 33 6 7 21 A 20 18 376605 CASAVA_Build 17 50644623 15I CCCTGGACTA ---------------/TAAACTCTATCAGGG TAGGGTCATG 3070 hom 51 het 19 0 18 1 TAAACTCTATCAGGG 0 1 376606 CASAVA_Build 17 50645185 2D ATTAAAACTG GA/-- GAGGTGGGGA 3070 het 3070 ref 46 24 18 5 GA 2 1 376607 CASAVA_Build 17 50652690 3D TTCCTTGTTG CTT/--- CTTCTTCCTG 3070 het 3070 hom 32 14 15 5 CTT 3 2 376608 CASAVA_Build 17 50655393 1I CATTCCCAAG -/C TACACGGCCA 3070 het 3070 hom 47 16 22 9 C 0 1 376609 CASAVA_Build 17 50658772 1D CTGATGAGAG C/- CCCTTGGAAC 3070 het 3070 hom 23 10 10 6 C 4 3 376610 CASAVA_Build 17 50685476 1I GCTTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 1615 het 1615 ref 19 7 5 7 T 9 10 376611 CASAVA_Build 17 50701098 1D TGTTCTTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 55 24 22 10 T 13 12 376612 CASAVA_Build 17 50710901 6I GATTTGAGTG ------/GGAAAA GCGAAGGTTT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 GGAAAA 0 1 376613 CASAVA_Build 17 50713017 3D CTGTCCTCTA GTT/--- GTTGTTGATG 3070 het 3070 ref 34 17 14 5 GTT 3 2 376614 CASAVA_Build 17 50719749 2D TGCATTACTC AT/-- GTGTAGATTA 3070 het 3070 hom 46 18 21 7 AT 1 0 376615 CASAVA_Build 17 50721116 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 28 hom 23 1 10 12 A 13 14 376616 CASAVA_Build 17 50722451 1D CCTCAGTGCT G/- GAAAATGAAA 3070 hom 91 het 34 0 31 3 G 2 1 376617 CASAVA_Build 17 50723969 1D CAAGAAGATT A/- ATGTTATTTT 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 A 2 1 376618 CASAVA_Build 17 50725616 1I ACATTTTTTT -/A AATTAAGATT 3070 het 3070 ref 25 13 10 2 A 2 3 376619 CASAVA_Build 17 50726413 1D TCCTTCTGAT A/- ACGGTCTTAA 3070 hom 154 het 55 0 51 4 A 2 1 376620 CASAVA_Build 17 50742876 1I AACAAGCCTT -/A TATATTGAAG 3070 het 3070 hom 41 14 25 2 A 0 1 376621 CASAVA_Build 17 50743435 3D AAATGCCAAA TAT/--- TATTATATTT 3070 het 3070 hom 19 8 9 2 TAT 3 2 376622 CASAVA_Build 17 50755918 1D CCAGGAGAGG T/- TTCAGAAACC 3070 het 3070 hom 35 15 18 3 T 3 2 376623 CASAVA_Build 17 50762415 2D CTGCTGACTT AA/-- AAAGCAGGGC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 A 5 3 376624 CASAVA_Build 17 50763856 3I ATGATCAAAG ---/TTC TTCTCCAAAT 3070 het 3070 ref 34 15 16 3 TTC 1 2 376625 CASAVA_Build 17 50773067 2D ACACACAGGG AC/-- ACACACATGC 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 AC 4 3 376626 CASAVA_Build 17 50784076 2I AATAAAAAAT --/TA TATGAGACAT 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 TA 1 2 376627 CASAVA_Build 17 50784428 1D CAGCTACTGG T/- TGAGGCTGAG 3070 het 3070 hom 30 11 17 2 T 2 1 376628 CASAVA_Build 17 50797856 1D ATTCGGGGGG A/- AAACAAACAT 3070 het 3070 ref 50 23 21 6 A 4 3 376629 CASAVA_Build 17 50807148 1D TCAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2243 hom 24 9 13 4 A 11 10 376630 CASAVA_Build 17 50813145 3I TTCTTGTCTT ---/CTC AACACCACTG 3070 het 3070 ref 40 21 14 5 CTC 0 1 376631 CASAVA_Build 17 50816993 9D GGCTTACAGG ACGCTGTGT/--------- ACCCCGGCAT 3070 het 3070 ref 39 24 15 3 ACGCTGTGT 1 0 376632 CASAVA_Build 17 50819945 1I TTTGTTCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 16 11 T 10 11 376633 CASAVA_Build 17 50825612 1D TTTTTCTAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 61 het 31 0 20 12 A 15 14 376634 CASAVA_Build 17 50830472 4D TTATTTCTTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 26 0 19 7 A 18 14 376635 CASAVA_Build 17 50831607 1D GTTCAGAGCC A/- AAAAAACAGT 3070 hom 96 het 35 0 33 3 A 7 6 376636 CASAVA_Build 17 50834339 15D TGAGGCAGGA GAATGGCGTGAACCC/--------------- GAATGGCGTG 2075 hom 27 het 15 0 9 6 GAATGGCGTGAACCC 2 1 376637 CASAVA_Build 17 50844056 1D AAACAGATGG T/- TTTTTTTTTT 1593 het 1593 ref 39 26 5 8 T 12 11 376638 CASAVA_Build 17 50870136 19I CCCAAGTGCC -------------------/ATTCCTCTTGGGTAGAAAG ATTTCCTTTC 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 ATTCCTCTTGGGTAGAAAG 0 1 376639 CASAVA_Build 17 50874436 1I ATTTCTTTCC -/T TTTTTTTTTT 1909 het 1601 hom 27 8 6 13 T 15 16 376640 CASAVA_Build 17 50878590 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 22 0 14 8 A 19 18 376641 CASAVA_Build 17 50880395 4D AATCTTTCAT TATA/---- TATATATATA 3070 hom 69 het 30 0 24 9 TA 9 7 376642 CASAVA_Build 17 50880603 2I TCCCTGGCAT --/AA AAGTTATTTA 1070 hom 7 het 3 0 3 0 A 2 4 376643 CASAVA_Build 17 50902342 1D AACTCCATCT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 84 het 29 0 29 0 A 10 9 376644 CASAVA_Build 17 50903868 1D AGACCCCAAT C/- CCCACCACCA 3070 het 3070 hom 34 15 17 2 C 4 3 376645 CASAVA_Build 17 50906901 1D ATTTGAGTGG A/- AGCGTGGCCT 3070 hom 93 het 34 0 32 2 A 2 1 376646 CASAVA_Build 17 50908928 1D ATGGTCACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 137 hom 23 2 17 4 T 12 11 376647 CASAVA_Build 17 50910212 1D AACCTATTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 29 0 22 8 T 15 14 376648 CASAVA_Build 17 50923245 1D GTGATTTCCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 116 het 42 0 41 2 T 12 11 376649 CASAVA_Build 17 50932296 2I GCAAGTAAAC --/AG ATCATGCTGT 3070 hom 72 het 26 0 25 1 AG 0 1 376650 CASAVA_Build 17 50933090 11I TTTTTAAAAG -----------/AATATGAAGTA AACATTCATT 2860 hom 15 het 6 0 6 0 AATATGAAGTA 0 1 376651 CASAVA_Build 17 50934254 5I AGCCGAAGCA -----/GGGCG AGGCATTGCC 1637 hom 15 het 6 0 5 1 GGGCG 0 1 376652 CASAVA_Build 17 50942577 10D GTTTTAGTTG TATGCATTCC/---------- TTATTCTGTC 3070 hom 63 het 22 0 21 3 TATGCATTCC 1 0 376653 CASAVA_Build 17 50948524 1I GAAGACACAG -/A AAAAAAATAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 7 8 376654 CASAVA_Build 17 50970741 1I ATATATACTA -/T TTTTTTTCCC 3070 het 155 hom 19 1 16 2 T 7 8 376655 CASAVA_Build 17 50972987 1D GAATGATTAA T/- TTTTACCATA 3070 hom 90 het 35 0 30 6 T 5 4 376656 CASAVA_Build 17 50977738 5I TCTCAAAAAA -----/AAAAT AAAAAAAATT 3070 hom 35 het 14 0 12 2 AAAAT 0 1 376657 CASAVA_Build 17 50986003 3D TTTTTCTGTT TTC/--- TTTTCTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 22 2 TTC 1 0 376658 CASAVA_Build 17 50996162 1I CCTAGTGGAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 482 hom 38 3 26 9 A 12 13 376659 CASAVA_Build 17 50997088 3I TTGGCATGCT ---/TTA TTATTATTAT 3070 hom 108 het 43 0 37 6 TTA 3 4 376660 CASAVA_Build 17 50999009 1D CATTCTTTCA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 392 hom 38 1 28 10 T 10 9 376661 CASAVA_Build 17 51091556 1D GGATTCTCAC T/- TCTGTTGCCC 3070 hom 93 het 35 0 31 4 T 2 1 376662 CASAVA_Build 17 51176049 1D CAAAATGGTG T/- TTTTTTTCTG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 8 7 376663 CASAVA_Build 17 51176807 1I GCTGTTTGGG -/T ATTTTCCACT 3070 hom 111 het 43 0 37 6 T 0 1 376664 CASAVA_Build 17 51178611 1D CAACCACAAT A/- ACATTTTTTA 3070 hom 87 het 33 0 30 3 A 2 1 376665 CASAVA_Build 17 51178909 1I AGGTGATATT -/A ATAAACTTAT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 A 1 2 376666 CASAVA_Build 17 51179079 2D CAATCAAATG AA/-- AAGTCTAATC 3070 hom 99 het 38 0 34 5 A 4 2 376667 CASAVA_Build 17 51179277 1I TCTTCCCTAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 657 hom 30 2 23 5 T 9 10 376668 CASAVA_Build 17 51180081 2D TATTGACTAA TG/-- TTGTTGAGCA 3070 hom 99 het 35 0 34 1 TG 1 0 376669 CASAVA_Build 17 51189930 2D TGTGTGTGTG TA/-- TATATACTAA 3070 hom 135 het 51 0 45 7 TA 4 3 376670 CASAVA_Build 17 51199833 1D CTTGCTTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 T 10 9 376671 CASAVA_Build 17 51224686 1D TAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 2946 het 1772 hom 14 5 6 4 A 10 9 376672 CASAVA_Build 17 51290726 1D AGCATAAAGC A/- AAAAAAAAAA 1211 het 1211 ref 31 22 4 5 A 13 12 376673 CASAVA_Build 17 51293582 1D GGAGAAAATT A/- AAAAGAAGCT 1825 het 1825 ref 34 26 4 4 A 5 4 376674 CASAVA_Build 17 51415728 1I TAAAAAAAAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 46 19 15 12 A 9 10 376675 CASAVA_Build 17 51428242 1I GGTTTTTTTT -/G TTTTTGTTGT 3070 hom 30 het 26 1 22 3 G 0 1 376676 CASAVA_Build 17 51429566 4D AAAAGTGTTT AACA/---- AACAAATGAC 3070 hom 117 het 49 0 41 11 AACA 2 1 376677 CASAVA_Build 17 51430718 1D AATTTATCTA G/- CATGCTCATC 3070 hom 90 het 37 0 30 7 G 1 0 376678 CASAVA_Build 17 51432745 5D TAATATATAC ATAAT/----- ATAATTATAT 2915 hom 18 het 8 0 7 3 ATAAT 2 1 376679 CASAVA_Build 17 51443746 3I TAAGAAAATT ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 80 het 36 0 28 8 A 10 13 376680 CASAVA_Build 17 51444744 55D CAGAGAAATA TGAGATATTGTATTTCTTAGTATATCTGAGTAAAGTACAAATAAATCTACAAACT/------------------------------------------------------- TGAGATATTG 3070 hom 49 het 35 0 17 28 TGAGATATTGTATTTCTTAGTATATCTGAGTAAAGTACAAATAAATCTACAAACT 2 1 376681 CASAVA_Build 17 51447664 1D TTATTAACAC T/- ATTATAAATA 3070 hom 99 het 40 0 34 7 T 1 0 376682 CASAVA_Build 17 51450997 1D CCTCACTCCT C/- CGTCCTCTAA 3070 hom 114 het 42 0 38 6 C 2 1 376683 CASAVA_Build 17 51451393 1D TTATTAATGA T/- TTTTTTTCAT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 8 7 376684 CASAVA_Build 17 51451871 1I AAAAAAAAAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 69 het 33 0 23 10 A 8 9 376685 CASAVA_Build 17 51462157 1D ACCAGTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 322 hom 38 4 27 7 T 13 12 376686 CASAVA_Build 17 51465314 1D TCCCACAAAC T/- TTTTTTTTTT 703 het 703 ref 31 13 3 15 T 13 12 376687 CASAVA_Build 17 51480609 1I TTGCTTATAG -/T TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 T 7 8 376688 CASAVA_Build 17 51481755 2I TGATAAATGA --/TT TTTTTTTTTA 3070 hom 68 het 33 0 22 11 T 9 11 376689 CASAVA_Build 17 51490145 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 30 0 27 4 A 12 11 376690 CASAVA_Build 17 51490991 2I GTTCCGCTCC --/CT GTGTCCAAGT 3070 hom 84 het 31 0 28 3 CT 0 1 376691 CASAVA_Build 17 51503097 1I CTCTTTTGTA -/T TTTTTTTCTT 3070 hom 75 het 30 0 25 5 T 7 8 376692 CASAVA_Build 17 51509891 1I CTGTGTGTGA -/T TTTTTTACCC 3070 het 3070 ref 44 24 15 5 T 6 7 376693 CASAVA_Build 17 51514800 1I TCACACACAC -/A ACAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 15 12 5 A 1 2 376694 CASAVA_Build 17 51516705 1I CCTTCTTCCC -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 111 het 46 0 37 9 T 6 7 376695 CASAVA_Build 17 51517078 6D TGTTTTCTCC TTGGAT/------ TTTCTGGAAC 3070 het 3070 ref 40 19 17 4 TTGGAT 1 0 376696 CASAVA_Build 17 51529636 9D AACTTAAAAA TGAAGATTT/--------- TGAAGATTGT 3070 het 3070 hom 55 25 27 8 TGAAGATTT 1 0 376697 CASAVA_Build 17 51531230 4I CGTGTGTGCA ----/TGTG TGTGTGTGTG 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 TG 7 9 376698 CASAVA_Build 17 51534991 2D CTTCCTAGCC TT/-- TTTTTTTTTT 2191 het 2191 ref 28 13 7 8 T 12 10 376699 CASAVA_Build 17 51546216 4D TGATTAGGAG AGAT/---- AGATGTTAGA 3070 het 3070 ref 52 28 21 5 AGAT 2 1 376700 CASAVA_Build 17 51558660 4I AAAGGGGGGG ----/CTAA CTATTTCTTG 3070 het 2674 hom 29 9 14 6 CTAA 0 1 376701 CASAVA_Build 17 51561848 1D ACCACTCCAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 41 12 23 7 A 12 11 376702 CASAVA_Build 17 51565999 2D CATTCCATCA CT/-- CTACATTTCC 3070 het 3070 hom 42 13 23 7 CT 2 1 376703 CASAVA_Build 17 51570873 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1530 het 962 hom 24 6 6 13 T 15 14 376704 CASAVA_Build 17 51583221 1I ACTTGAGTCA -/C ATATTGGCAA 3070 het 3070 ref 66 32 26 8 C 0 1 376705 CASAVA_Build 17 51584352 1D TATTAAAGAG T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 132 het 51 0 43 8 T 8 7 376706 CASAVA_Build 17 51587003 1D TGCCAACACC A/- AAAAAAAAAA 1402 het 1402 ref 44 19 4 21 A 17 16 376707 CASAVA_Build 17 51618286 1D AATTAAAGTG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 9 13 6 A 10 9 376708 CASAVA_Build 17 51636373 4D AATCAGGCAC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 het 2265 hom 19 7 8 5 TGTT 5 4 376709 CASAVA_Build 17 51644548 1D TCATAGAAGG C/- TTTTATTACC 3070 het 3070 ref 32 16 14 2 C 1 0 376710 CASAVA_Build 17 51666704 1D TCCTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 11 10 376711 CASAVA_Build 17 51668794 1D TTCCTAGATA T/- TTTATTCTTT 3070 het 3070 ref 29 17 9 3 T 4 3 376712 CASAVA_Build 17 51683330 1D AGATTGGTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 34 15 13 7 T 10 9 376713 CASAVA_Build 17 51740598 1D AAAGTATAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2912 hom 19 8 7 5 A 12 11 376714 CASAVA_Build 17 51751242 2D AAGATAGCAT AA/-- AGATAGGTCA 3070 het 3070 hom 38 13 21 4 A 3 1 376715 CASAVA_Build 17 51761137 1D ATGTTCCTTT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 190 hom 29 4 17 8 A 10 9 376716 CASAVA_Build 17 51769978 1D AAGAAAAAAA G/- CAACCCCATC 3070 hom 24 het 9 0 9 0 G 1 0 376717 CASAVA_Build 17 51771539 1D TTCTTTATTT C/- ATTTCCATTT 3070 hom 54 het 21 0 19 5 C 1 0 376718 CASAVA_Build 17 51779093 1I TGACGTACTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2213 hom 36 7 19 10 T 10 11 376719 CASAVA_Build 17 51781754 1I TAAAAGCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 11 12 376720 CASAVA_Build 17 51783809 1I GGAAAAATAT -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 99 het 37 0 33 4 A 9 10 376721 CASAVA_Build 17 51803309 1I TGTGTATGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 952 hom 37 3 23 11 T 10 11 376722 CASAVA_Build 17 51804900 2D TTCCCAGGCA TT/-- TTTTTTTTTT 1906 het 109 hom 38 1 6 32 T 16 14 376723 CASAVA_Build 17 51809822 1I TTCTGAATTT -/C CCCCTGAATG 3070 hom 135 het 50 0 45 5 C 4 5 376724 CASAVA_Build 17 51832794 1D GATGAGGTTG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 30 het 11 0 10 1 T 8 7 376725 CASAVA_Build 17 51841286 1I GCTTTTAAGA -/T TTTTTTTTTT 2272 het 1958 hom 27 9 7 11 T 16 17 376726 CASAVA_Build 17 51841452 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTGTATT 3070 hom 69 het 24 0 23 1 T 5 6 376727 CASAVA_Build 17 51842248 1I TAACCCCTCT -/G GCCTCAATTT 3070 hom 60 het 24 0 21 3 G 1 2 376728 CASAVA_Build 17 51854702 12I GTTTTATACC ------------/AAATATTTTGAT AAATATTTTG 3070 hom 54 het 26 0 19 8 AAATATTTTGAT 1 2 376729 CASAVA_Build 17 51866739 1D TTCTAGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 115 hom 37 4 13 20 A 17 16 376730 CASAVA_Build 17 51867142 2I GGCACGTCCT --/TC TCTCTCTCTC 3070 hom 54 het 25 0 15 10 TC 8 9 376731 CASAVA_Build 17 51868109 2I TTATGAGGTG --/TT TTTTTTTTTT 1643 het 1196 hom 33 4 4 25 T 10 12 376732 CASAVA_Build 17 51872449 1I ATCAAGGCTC -/A AAAAAAACTG 3070 het 387 hom 44 1 39 4 A 7 8 376733 CASAVA_Build 17 51876573 1I TTTAAAAAAA -/C ATTGTGTGGA 3070 hom 105 het 37 0 36 1 C 0 1 376734 CASAVA_Build 17 51899601 2I TTCTAAATTG --/TA TATATATATG 3070 hom 99 het 42 0 33 9 TA 4 5 376735 CASAVA_Build 17 51923296 1I ATCCCCAGAG -/A AAAAAAAAGC 3070 hom 110 het 45 0 36 9 A 8 9 376736 CASAVA_Build 17 51932759 1D TACCAAATAA C/- AAAATATTTA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 C 1 0 376737 CASAVA_Build 17 51935496 1D GCAGCAGCAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 28 het 46 1 26 20 T 12 11 376738 CASAVA_Build 17 51938401 5D AGTGACATTA TTTGT/----- TTTTTTTGTT 3070 hom 69 het 26 0 24 3 TTTGT 1 0 376739 CASAVA_Build 17 51953572 4D ACGCAGATCT CTCA/---- CTCACACACA 3070 hom 157 het 56 0 53 6 CTCA 2 1 376740 CASAVA_Build 17 51962044 4I TATGACTGTT ----/ACTC AGGAGAGTAA 3070 hom 144 het 54 0 49 5 ACTC 0 1 376741 CASAVA_Build 17 51964085 1D CAGCTAATGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 12 16 8 A 15 14 376742 CASAVA_Build 17 51970944 1I GACTCCATCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 A 10 11 376743 CASAVA_Build 17 51979099 3D GAGGCAGTTT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 100 het 43 0 32 12 A 13 10 376744 CASAVA_Build 17 51983591 1D ACTCTGCCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 A 13 12 376745 CASAVA_Build 17 51989950 1D GGGTAGGGGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 40 0 32 10 A 11 10 376746 CASAVA_Build 17 51997513 1D AGTGAGCAAG A/- AATTAGCAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 3 A 3 2 376747 CASAVA_Build 17 51998579 1I AAATGGCCTT -/A CACGCAGTAA 3070 het 3070 ref 46 22 20 4 A 0 1 376748 CASAVA_Build 17 52013358 11D GACCTTGGTC AGGTCACTTGA/----------- CCTCTCTGAG 3070 het 3070 ref 34 22 14 4 AGGTCACTTGA 1 0 376749 CASAVA_Build 17 52016749 1D ATCATATCTC A/- AAAAAAGTCC 3070 hom 78 het 30 0 26 5 A 7 6 376750 CASAVA_Build 17 52018180 3D AGCTTCTCTC TCT/--- TCGTCACCTC 3070 het 3070 hom 34 13 20 2 TCT 1 0 376751 CASAVA_Build 17 52019278 1D GTGAGCCGAG A/- ATGATGCCAC 3070 hom 33 het 16 0 11 5 A 2 1 376752 CASAVA_Build 17 52019328 7D CTCTTTCTGG AAAAAAA/------- AAAAAAAAAG 3070 hom 21 het 24 0 15 10 A 16 9 376753 CASAVA_Build 17 52030685 1I CTTTCAATGT -/C CCCCCCCCAC 3070 hom 76 het 31 0 24 7 C 8 9 376754 CASAVA_Build 17 52032431 1D TTCTTAAATA G/- GGCAGGGACC 3070 het 3070 ref 40 18 15 8 G 3 2 376755 CASAVA_Build 17 52033491 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 344 hom 26 1 22 3 A 11 12 376756 CASAVA_Build 17 52035058 1I AATTGAGGGG -/A AAAAAAATTG 3070 hom 87 het 40 0 30 10 A 7 8 376757 CASAVA_Build 17 52038509 3I TACTGGTCAC ---/TAA TAATAATAAT 3070 het 3070 ref 51 27 20 4 TAA 3 4 376758 CASAVA_Build 17 52060565 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 52 het 23 0 18 5 A 10 11 376759 CASAVA_Build 17 52076905 1I CAGGTCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 31 0 24 7 A 11 12 376760 CASAVA_Build 17 52077183 1I CAACTGCAAA -/G CTTCCAAGCC 3070 hom 110 het 44 0 32 12 G 0 1 376761 CASAVA_Build 17 52088727 2D AGAGTGTTCT TC/-- TCTCTTTTCA 3070 het 3070 hom 50 24 24 2 TC 3 2 376762 CASAVA_Build 17 52094864 3I TAGACACAAA ---/TCT TCTTTATGCC 3070 hom 96 het 38 0 32 6 TCT 1 2 376763 CASAVA_Build 17 52098378 2D ACACGCACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 81 het 41 0 30 11 AC 10 9 376764 CASAVA_Build 17 52099869 1D TGCTTAGCTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 66 het 25 0 22 3 T 8 7 376765 CASAVA_Build 17 52116213 4I TTTTTTTCTT ----/CCTC AGTTTAAAGA 3070 hom 96 het 35 0 33 2 CCTC 0 1 376766 CASAVA_Build 17 52137831 1D TTTCAAACCG C/- CCCCCCCCGC 3070 het 1195 hom 28 8 12 8 C 9 8 376767 CASAVA_Build 17 52156973 1I GCGTCAAAGT -/G GCCCAGCCCA 3070 hom 105 het 43 0 35 8 G 1 2 376768 CASAVA_Build 17 52187675 3I TTTCAATGTT ---/AAA AAAAAAAAAG 3070 hom 34 het 23 0 14 9 A 9 12 376769 CASAVA_Build 17 52202885 4D TCCTCCATCC ATCT/---- ATCCATCATC 3070 het 3070 ref 63 34 22 7 ATCT 1 0 376770 CASAVA_Build 17 52212639 1D CATTAATTAA T/- TTTTTTTTTT 1532 het 1532 ref 21 11 4 6 T 11 10 376771 CASAVA_Build 17 52224986 5D31M18D GGTGATAATG GTGATGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGCTGATGGTGGTGATGGTGATGATGGGGT/-----GTGGTGGTGGTGGTGATGGTGCTGATGGTGG------------------ TGATGGTGAT 2150 het 1184 hom 31 9 10 25 N/A 0 0 376772 CASAVA_Build 17 52225551 4D CTAGAATCAT AAGG/---- AAGGAGCCAT 3070 het 3070 ref 42 23 15 5 AAGG 2 1 376773 CASAVA_Build 17 52228948 1D TCTCCATCTA C/- TCAGGAACCC 3070 het 3070 ref 34 16 13 5 C 1 0 376774 CASAVA_Build 17 52229227 1D TGACCCAAAA G/- GGGTCAAAGG 2767 hom 27 het 11 0 9 2 G 4 3 376775 CASAVA_Build 17 52231034 1D CCAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 109 het 40 0 36 6 A 11 10 376776 CASAVA_Build 17 52245925 1I CTTATTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1104 het 1104 ref 35 24 3 8 A 13 14 376777 CASAVA_Build 17 52252385 1I TGATGTACTA -/C TTGAAGGCAT 3070 hom 95 het 37 0 30 7 C 0 1 376778 CASAVA_Build 17 52261214 1D CAGTGATGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 156 hom 30 3 10 17 A 17 16 376779 CASAVA_Build 17 52263525 2D GACAGTCATT CA/-- AGGGTGAGAA 3070 hom 77 het 34 0 22 12 CA 1 0 376780 CASAVA_Build 17 52268574 1I ATTTTTTTAA -/T TTTTTTTTGC 3070 hom 96 het 35 0 33 2 T 8 9 376781 CASAVA_Build 17 52271041 1I TTGTTAAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 190 hom 41 1 35 5 T 10 11 376782 CASAVA_Build 17 52278451 2D AAGTGAAAAC AT/-- ATTTCTCACA 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AT 2 1 376783 CASAVA_Build 17 52279024 4I TTTTAAAGAC ----/AAAT AACCCATTGT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 AAAT 0 1 376784 CASAVA_Build 17 52279588 1I GCACTGGTGA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 49 het 27 0 18 9 T 9 10 376785 CASAVA_Build 17 52284965 1D CTTTGATTTA T/- TTTAAAAAAA 3070 het 2859 hom 26 9 16 1 T 4 3 376786 CASAVA_Build 17 52286430 4I AACCAGTCAC ----/AGAG AGACAAATAT 3070 hom 108 het 38 0 37 1 AG 1 3 376787 CASAVA_Build 17 52287553 1I TGTTTATGGG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 10 11 376788 CASAVA_Build 17 52291523 1I GTATAAATAC -/A AAAAAAAAAA 2714 het 8 hom 16 1 10 5 A 13 14 376789 CASAVA_Build 17 52293205 2I AGGAAGGAAA --/GT GACAAGCGCT 3070 hom 174 het 66 0 58 8 GT 0 1 376790 CASAVA_Build 17 52293640 1I GAGGGGAAGA -/T TGTTACTCTT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 1 2 376791 CASAVA_Build 17 52301406 11I GTAACTTAAC -----------/ACTGGGCAGTT ACTTGTTCTT 3070 hom 144 het 49 0 49 1 ACTGGGCAGTT 0 1 376792 CASAVA_Build 17 52302045 1I CATGTAATGA -/T TCCATGTTTG 3070 hom 99 het 39 0 34 5 T 1 2 376793 CASAVA_Build 17 52303756 1I TCTAAATTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 135 hom 32 1 25 6 A 11 12 376794 CASAVA_Build 17 52311662 2D GGGTGACAGA GT/-- GAGACTCAGT 1611 het 289 hom 6 1 4 2 GT 1 0 376795 CASAVA_Build 17 52315474 1I AACTGAGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1348 hom 34 3 26 5 T 10 11 376796 CASAVA_Build 17 52315894 1I AAAAAAAGAA -/G AAAAAAAAAA 3070 het 549 hom 36 3 30 3 G 0 1 376797 CASAVA_Build 17 52328708 1I AGGGAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 24 het 34 1 28 5 A 11 12 376798 CASAVA_Build 17 52338579 1I TCTTATCACA -/G GGGTTTGACC 3070 hom 78 het 29 0 26 3 G 3 4 376799 CASAVA_Build 17 52338688 1I GGCTCCAGAA -/C CTTTGAGCCA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 C 1 2 376800 CASAVA_Build 17 52408537 1D TCATCCCACC T/- TGGTCTCCCA 3070 het 3070 hom 24 10 13 1 T 2 1 376801 CASAVA_Build 17 52409898 1D ATCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 A 10 9 376802 CASAVA_Build 17 52420558 1I AATTCTGTGT -/A AATTCCTTTT 3070 hom 108 het 41 0 37 4 A 2 3 376803 CASAVA_Build 17 52423098 1I GGGCTCAAGT -/G ATCCTCCTGC 3070 hom 78 het 27 0 23 4 G 0 1 376804 CASAVA_Build 17 52456211 1D TACTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 428 hom 19 1 11 7 A 13 12 376805 CASAVA_Build 17 52460179 1D AAGCTCTTTC A/- TATAGAAACA 3070 het 3070 ref 30 18 10 2 A 1 0 376806 CASAVA_Build 17 52462007 1I GCCCTATTTC -/T TTTTTTTTTT 2073 het 122 hom 25 3 10 12 T 11 12 376807 CASAVA_Build 17 52463780 1I TTTATTTAAC -/G GGGCATTATA 2959 hom 18 het 10 0 7 3 G 3 4 376808 CASAVA_Build 17 52464142 2I GTAAATATCA --/TT TTTTTTAACA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 6 8 376809 CASAVA_Build 17 52464823 1D AGCGATCCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2077 hom 31 7 14 10 A 15 14 376810 CASAVA_Build 17 52468149 13D CTGATGTTTC TGATGATGTTTCT/------------- GTCTTTTTCA 3070 hom 75 het 28 0 26 3 TGATGATGTTTCT 1 0 376811 CASAVA_Build 17 52470067 1I ATTTTGTTTA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 75 het 31 0 26 5 T 8 9 376812 CASAVA_Build 17 52470757 1I TGAACAGGTC -/T TCATTTTAGC 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 1 2 376813 CASAVA_Build 17 52471512 2I ACCCGGCTAC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 42 het 20 0 14 6 T 9 11 376814 CASAVA_Build 17 52473977 1D ACAATGCATA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 115 het 44 0 38 7 T 7 6 376815 CASAVA_Build 17 52478867 4I AAACCGCGGG ----/GACT GACTTTCCCA 2251 hom 23 het 9 0 7 2 GACT 1 2 376816 CASAVA_Build 17 52479728 1D TACAAAGATT A/- AAAAAAAAAA 1595 het 1595 ref 32 22 4 6 A 12 11 376817 CASAVA_Build 17 52480180 5D AGCGCTGAAT AAGAC/----- AAGACAAGAC 3070 het 3070 ref 39 16 16 7 AAGAC 3 2 376818 CASAVA_Build 17 52484548 5D CAGATCTTCA CAAAG/----- CAAAGAGAAG 3070 het 3070 ref 67 36 30 4 CAAAG 2 1 376819 CASAVA_Build 17 52485542 1D TAAAAATTTT A/- AAAAAAAATT 3070 hom 21 het 9 0 8 1 A 9 8 376820 CASAVA_Build 17 52490078 1D ATCAAAGAAC A/- AAAGGTCAAC 3070 hom 96 het 37 0 33 5 A 4 3 376821 CASAVA_Build 17 52500467 1D TACTCTAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 111 het 41 0 34 7 A 12 11 376822 CASAVA_Build 17 52500763 1D AGCAACATTG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 15 het 34 1 15 19 C 11 10 376823 CASAVA_Build 17 52507277 1I GGCCTGTGAC -/T TTTTTTTGAC 3070 hom 108 het 45 0 37 8 T 7 8 376824 CASAVA_Build 17 52522686 4I TTTTTTTTTT ----/CTAA CTGTGTCATT 3070 het 3070 ref 34 19 9 6 CTAA 0 1 376825 CASAVA_Build 17 52545230 1I TCCTGGCTCT -/G CCCCCTGGGC 3070 hom 95 het 37 0 30 7 G 0 1 376826 CASAVA_Build 17 52545752 1I CTCCTTCGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3030 hom 41 13 16 12 T 10 11 376827 CASAVA_Build 17 52547263 1I TAATTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 167 hom 37 1 27 9 T 10 11 376828 CASAVA_Build 17 52558943 1I AACATCACTT -/C ATAGAAGTCC 3070 het 3070 hom 29 13 12 4 C 0 1 376829 CASAVA_Build 17 52598987 1D ATTATTCTTT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 hom 42 19 20 3 A 9 8 376830 CASAVA_Build 17 52613454 1D GCAGCCTCGG C/- CCCCCCATGT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 C 7 6 376831 CASAVA_Build 17 52627416 3D TCTAGAGTCC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 18 14 9 T 15 12 376832 CASAVA_Build 17 52664142 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 1019 het 1019 ref 33 24 3 6 A 13 14 376833 CASAVA_Build 17 52671936 2D ACCCGGGAGG GT/-- GGGAGGTTGC 3070 hom 42 het 16 0 14 2 GT 1 0 376834 CASAVA_Build 17 52680042 1D TAGTGGAGAT G/- GGGGTTTTAC 3070 hom 66 het 24 0 23 1 G 5 4 376835 CASAVA_Build 17 52713175 1I ATAGGATGAG -/A AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 39 15 20 4 A 7 8 376836 CASAVA_Build 17 52721846 1I TGAATTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 40 0 31 9 A 11 12 376837 CASAVA_Build 17 52726270 1I GCCCAGCCTG -/T TTTTTTTTTT 2364 het 570 hom 21 3 12 6 T 15 16 376838 CASAVA_Build 17 52734140 1D ATATTCTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 989 hom 31 3 22 6 T 12 11 376839 CASAVA_Build 17 52803869 1I42M6D TTTTCATGGC -AAAAAAAAAAAAGGGCAAAAAATTATATAGAGACACAGGTATACACAC/AAAAAAAAAAAAAGGGCAAAAAATTATATAGAGACACAGGTAT------ ACACACACAC 3070 het 840 hom 35 5 31 16 N/A 0 0 376840 CASAVA_Build 17 52805588 1I CCAGCCTGTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 32 0 27 5 A 12 13 376841 CASAVA_Build 17 52821506 1D ACCCAACCAA T/- TTTTGAATTT 3070 hom 24 het 10 0 8 2 T 5 4 376842 CASAVA_Build 17 52832608 1D GTCATTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 T 12 11 376843 CASAVA_Build 17 52842954 1I TAATTAAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 40 hom 30 1 25 4 A 10 11 376844 CASAVA_Build 17 52853902 3D CCCATTCATT CTC/--- CTCCTCCTCC 3070 hom 107 het 42 0 30 12 CTC 5 4 376845 CASAVA_Build 17 52859759 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 24 0 20 4 A 12 11 376846 CASAVA_Build 17 52877912 1D ACAGGGCGGT G/- GGGGGGGGTG 3070 hom 55 het 23 0 19 5 G 9 8 376847 CASAVA_Build 17 52893894 2D AACTCTTGGA TT/-- TTTTTTTTTT 1413 hom 33 het 21 0 9 12 T 18 16 376848 CASAVA_Build 17 52899150 1I TCTTTATTGA -/T TTTTTTTAAG 3070 hom 69 het 31 0 24 7 T 7 8 376849 CASAVA_Build 17 52904346 3I TCTAGATTTT ---/GAG GAGGAGCAGA 3070 hom 91 het 34 0 27 7 GAG 2 3 376850 CASAVA_Build 17 52904871 1I TGGGAAGGGA -/G GGGGGCCAGT 3070 hom 99 het 35 0 33 2 G 5 6 376851 CASAVA_Build 17 52905404 1I AGGCGCCTGA -/T CACCATGTCT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 376852 CASAVA_Build 17 52920577 3D ACTGGTATAT AAC/--- AACATCAGCT 3070 hom 78 het 33 0 27 7 AAC 2 1 376853 CASAVA_Build 17 52923253 1I TTCCCCTCTG -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 T 7 8 376854 CASAVA_Build 17 52946572 1I AGCTAAGGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 hom 75 het 32 0 25 7 T 9 10 376855 CASAVA_Build 17 52953777 1D TGGTGATGGG A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 39 18 14 7 A 8 7 376856 CASAVA_Build 17 52954574 3D GCATAATGCC TGT/--- TAAGCCTGAC 3070 het 3070 ref 47 24 20 3 TGT 1 0 376857 CASAVA_Build 17 52959624 4D GGACTCATCC CCCA/---- CCCACCCACC 3070 het 367 hom 17 1 11 5 CCCA 4 3 376858 CASAVA_Build 17 52959832 1I GTCGGCGGGG -/A GCTCTTGAAG 3070 het 2222 hom 36 13 14 9 A 0 1 376859 CASAVA_Build 17 52966968 1I CCAGCCACCC -/G GGGAGGCTGA 3070 het 7 hom 17 1 16 0 G 3 4 376860 CASAVA_Build 17 52968453 1D TCTATTACTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 739 hom 36 2 29 6 A 11 10 376861 CASAVA_Build 17 52972104 1I CCCTGGTCTG -/A AAAAGAAGCC 3070 hom 101 het 39 0 31 8 A 4 5 376862 CASAVA_Build 17 52998034 1D TCGACTAACA C/- CCATGCCTGG 3070 het 3070 hom 35 13 12 10 C 3 2 376863 CASAVA_Build 17 53005695 1D GTGCTCTGTG C/- CAAGTGCCCT 3070 het 3070 ref 36 22 14 1 C 2 1 376864 CASAVA_Build 17 53023704 2D CCTTAAAAAC AT/-- ATGTCAAATA 3070 het 3070 hom 36 13 19 4 AT 2 1 376865 CASAVA_Build 17 53045852 1D TCCTTTTATT A/- AAAAAAAAAA 2983 het 2983 ref 24 12 8 4 A 11 10 376866 CASAVA_Build 17 53050002 1I GTGAAATCAA -/C CCTGAAAGAA 3070 het 3070 ref 27 14 9 4 C 2 3 376867 CASAVA_Build 17 53054608 13I CCCTCAGACT -------------/TTGCGGCACTGCC TTGCGGCACC 3070 het 3070 ref 35 18 12 6 TTGCGGCACTGCC 0 1 376868 CASAVA_Build 17 53071087 11D CTGTCTCAAC AAAATATTTAA/----------- AAAATATTTA 3070 het 3070 ref 23 10 10 7 AAAATATTTAA 2 1 376869 CASAVA_Build 17 53072117 2D TTCCCTTAGT GG/-- GGAACCTGCT 3070 het 3070 ref 40 18 15 8 G 4 2 376870 CASAVA_Build 17 53079218 1I TTCCCAAACA -/G GAGGAGCATA 3070 hom 90 het 35 0 30 5 G 1 2 376871 CASAVA_Build 17 53086297 1I CAGTCACACA -/T TTTTTTTTTT 2642 het 579 hom 20 3 10 7 T 15 16 376872 CASAVA_Build 17 53099215 1D TTCTTTTTTG A/- AAAAAAGAGA 3070 het 3070 hom 51 20 22 10 A 7 6 376873 CASAVA_Build 17 53100980 1D ATGCACAGAC A/- ACTCACCATG 3070 hom 152 het 55 0 48 10 A 2 1 376874 CASAVA_Build 17 53112313 1I TCTTAAAACA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 370 hom 35 1 30 4 T 9 10 376875 CASAVA_Build 17 53114164 5D AAAACAACAA AACAT/----- AAGTTTTATT 3070 het 3070 ref 30 16 13 4 AACAT 1 0 376876 CASAVA_Build 17 53116806 1I TATATATGTA -/T CTATCTATAT 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 0 1 376877 CASAVA_Build 17 53119556 6I AGCTGTACTC ------/AGAGTA AAAATGTAAG 3070 hom 57 het 21 0 20 1 AGAGTA 0 1 376878 CASAVA_Build 17 53119653 1I AATAGCAACC -/A AAAAAAACTA 3070 het 3070 hom 25 9 12 4 A 7 8 376879 CASAVA_Build 17 53121540 1I GGGTTTTCTC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 140 hom 31 1 25 5 T 9 10 376880 CASAVA_Build 17 53123093 9D AGTCTTTGGC TATTCTCTT/--------- TATTCTCTTA 3070 het 3070 ref 35 16 15 4 TATTCTCTT 2 1 376881 CASAVA_Build 17 53125260 1D ATGCATGGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 T 13 12 376882 CASAVA_Build 17 53125590 7D7M3I TCGCCCAGGC CAGAGTGCAGTGGC---/-------CAGTGGCCTG GCGATCTTGG 3070 het 3070 hom 24 10 14 4 N/A 0 0 376883 CASAVA_Build 17 53129511 20I AGGACACACA --------------------/CACACATACACACACACACT CACACACACA 3070 hom 107 het 48 0 32 16 CACACATACACACACACACT 0 1 376884 CASAVA_Build 17 53143490 2D ATATATAAAC AT/-- GTGTTGAAAA 3070 het 3070 ref 45 27 15 4 AT 1 0 376885 CASAVA_Build 17 53162533 2D GGAACCTGGC GG/-- GGGGGGGGGT 3070 het 1380 hom 29 5 16 8 G 11 9 376886 CASAVA_Build 17 53172490 1I ACCTGGTGTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 39 17 15 7 A 9 10 376887 CASAVA_Build 17 53179592 1D GGTTTTTAGC A/- TAATAAAGTG 3070 het 3070 hom 59 25 27 7 A 1 0 376888 CASAVA_Build 17 53180454 1D TCCATGGTGC T/- TTTTAATGAC 3070 het 3070 ref 32 20 9 5 T 5 4 376889 CASAVA_Build 17 53203463 1D TCAGAAATAG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 38 14 18 7 A 10 9 376890 CASAVA_Build 17 53203975 1I ACACACACAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 14 0 13 1 A 13 14 376891 CASAVA_Build 17 53227197 1I CTCCGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 1603 hom 16 het 13 0 8 5 A 15 16 376892 CASAVA_Build 17 53227957 1D CAATTGTTTT A/- TGTGTGAACA 3070 hom 117 het 44 0 39 5 A 1 0 376893 CASAVA_Build 17 53228425 2I TGAGCTAATA --/CT CTGTTAAGAT 3070 hom 78 het 28 0 26 2 CT 1 2 376894 CASAVA_Build 17 53229578 1D ATTTTCAAAG T/- TGTTTTGGCT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 2 1 376895 CASAVA_Build 17 53230212 4D ATTTTATTTC CTCA/---- CTCTTCTGGA 2485 hom 24 het 11 0 9 2 CTCA 1 0 376896 CASAVA_Build 17 53230884 4D GTTTTTTGTC TGTT/---- TGTTTTGCTT 3070 hom 120 het 45 0 41 6 TGTT 2 1 376897 CASAVA_Build 17 53231426 13D AGGTGATCTG CCCACTTCAGCCT/------------- CCCAAAGTGC 3070 hom 78 het 30 0 26 7 CCCACTTCAGCCT 1 0 376898 CASAVA_Build 17 53234370 1D GATGTAGATA T/- AAATATTTCA 3070 hom 60 het 27 0 21 8 T 1 0 376899 CASAVA_Build 17 53237480 6D ACTAATTTAA TTTTTT/------ TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 19 13 376900 CASAVA_Build 17 53238174 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 39 het 17 0 14 3 A 12 11 376901 CASAVA_Build 17 53241070 1D TATTAAAAAT A/- AAAAAAATTT 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 8 7 376902 CASAVA_Build 17 53241715 1D ATTATTTTTT A/- AAAAAAGAAT 3070 hom 57 het 23 0 20 3 A 7 6 376903 CASAVA_Build 17 53241991 1D CTAACAGTAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 54 het 26 0 18 8 A 7 6 376904 CASAVA_Build 17 53253747 4I GGTAAGAACA ----/AGAT AGATTGTTAG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 AGAT 1 2 376905 CASAVA_Build 17 53259494 1D TGCACTCCAG C/- CTGGGTGACA 3070 het 3070 hom 30 10 17 3 C 2 1 376906 CASAVA_Build 17 53263017 8I TTCTCTCACA --------/TACAAAAG TAGGAAAGTT 3070 het 3070 hom 38 14 21 4 TACAAAAG 0 1 376907 CASAVA_Build 17 53265179 1I CTGTGTTTAG -/A ACGAGTGGCT 3070 het 3070 ref 39 26 13 0 A 1 2 376908 CASAVA_Build 17 53270168 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 1350 hom 17 4 10 3 A 9 10 376909 CASAVA_Build 17 53276965 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1502 het 246 hom 14 2 7 5 A 17 16 376910 CASAVA_Build 17 53278444 1I GACATCTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 26 0 18 8 T 12 13 376911 CASAVA_Build 17 53280360 1I CCTGGCCCAG -/A AAAAAAAAAA 1302 het 1302 ref 18 6 6 6 A 10 11 376912 CASAVA_Build 17 53311867 1I TGTTCTTTGA -/G AATATACTGA 3070 hom 114 het 40 0 34 6 G 0 1 376913 CASAVA_Build 17 53313194 10I CTTGAACTCC ----------/TGACCTCAAG TGATCCACCA 3070 hom 42 het 17 0 13 5 TGACCTCAAG 0 1 376914 CASAVA_Build 17 53319861 1I GATACAGAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 5 het 29 1 17 11 T 15 16 376915 CASAVA_Build 17 53346034 1I CATTTCTGCC -/T CCCCATCCCA 3070 hom 91 het 37 0 29 8 T 0 1 376916 CASAVA_Build 17 53352993 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 2076 het 482 hom 22 2 8 12 T 17 16 376917 CASAVA_Build 17 53364642 14D ACTGTGTCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAGG 3070 hom 45 het 18 0 14 6 A 22 8 376918 CASAVA_Build 17 53365692 2D TGGTCGGTTC CT/-- CCATTAGACC 3070 hom 81 het 31 0 27 7 CT 1 0 376919 CASAVA_Build 17 53377263 1D ATATTCCACG A/- AAACACACCA 3070 het 3070 hom 39 17 20 2 A 4 3 376920 CASAVA_Build 17 53399972 4D CTGTCTCCTT TCTC/---- TCTCTCTTCG 3070 hom 90 het 36 0 29 8 TC 5 3 376921 CASAVA_Build 17 53520465 1I TTTTGGGTGT -/G GAGCCAAGGG 3070 hom 90 het 40 0 30 10 G 1 2 376922 CASAVA_Build 17 53526694 3D TAGAAATGGG TGA/--- TGATGATGAT 3070 het 3070 hom 51 17 24 10 TGA 6 5 376923 CASAVA_Build 17 53540007 5D GTTCTCTCTC TCCTT/----- TCCTGTCCTT 3070 het 3070 hom 31 11 18 8 TCCTT 1 0 376924 CASAVA_Build 17 53555341 1D TAATTTTGTG T/- TTTTTTTTTA 3070 het 1752 hom 18 4 12 2 T 10 9 376925 CASAVA_Build 17 53582583 4D CCCTGAAATC CTAA/---- CTAAGTACAA 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 CTAA 2 1 376926 CASAVA_Build 17 53587459 4D TTTCATTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 43 17 19 8 TTTG 4 3 376927 CASAVA_Build 17 53590810 1D CCCACGCCCA C/- CCCCCCCCCA 2556 het 2556 ref 21 9 8 4 C 10 9 376928 CASAVA_Build 17 53600561 1I CTTCTTCTTC -/T TTTTTTTTTT 1619 het 1619 ref 25 9 5 11 T 10 11 376929 CASAVA_Build 17 53605835 1I CATTCTTCTT -/C CCTTTAATTC 3070 het 3070 hom 30 9 18 3 C 2 3 376930 CASAVA_Build 17 53606102 4D21M1D TGAGTTGCAG TTGTTTGTTTAGTGACTTTTAAAACT/----TTGTTTAGTGACTTTTAAAAC- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 29 11 21 3 N/A 0 0 376931 CASAVA_Build 17 53620684 1D GCGCCTCCTG C/- CCCTGTTAGC 3070 het 3070 ref 42 18 19 6 C 4 3 376932 CASAVA_Build 17 53621948 4I TGACATGAGG ----/AGGA AGGAGTGCTT 3070 het 3070 ref 35 16 12 7 AGGA 1 2 376933 CASAVA_Build 17 53628059 2I CACACTCTCT --/CA CACACACACA 3070 het 3070 hom 51 15 21 15 CA 6 7 376934 CASAVA_Build 17 53658099 1D GAACATTGGA T/- TGGGAGTGGG 3070 hom 139 het 51 0 42 9 T 2 1 376935 CASAVA_Build 17 53691390 1D TTGGTGGGGG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 41 20 19 2 T 10 9 376936 CASAVA_Build 17 53720039 1D CATCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 24 16 7 T 11 10 376937 CASAVA_Build 17 53723252 1I AACCTCCGTC -/T TTTTTTTTTT 1475 het 1475 ref 16 8 6 2 T 13 14 376938 CASAVA_Build 17 53724242 4D AATATGAAAC ACTT/---- ACGGATAAAT 3070 het 3070 ref 47 29 13 5 ACTT 1 0 376939 CASAVA_Build 17 53727701 6I CAAATGTACT ------/CTAAAA CTAAATCTAA 3070 het 3070 hom 40 14 24 2 CTAAAA 0 1 376940 CASAVA_Build 17 53736592 1I TCCCTGGACT -/A ACAGTGGGAA 3070 het 3070 hom 45 15 22 8 A 1 2 376941 CASAVA_Build 17 53762517 2I TGGTTTGATT --/TA TATATATATA 3070 het 1989 hom 47 6 39 2 TA 6 7 376942 CASAVA_Build 17 53773456 6D TGGAACACCT ATTACC/------ ATTACCCAAC 3070 het 3070 ref 38 28 10 2 ATTACC 2 1 376943 CASAVA_Build 17 53774326 4I AAAGAAAATA ----/AAAG AAAGAAAGAA 1855 het 1635 hom 33 9 9 15 AAAG 4 5 376944 CASAVA_Build 17 53777603 3D TTCTACAATC ACA/--- ACAATCCTGA 3070 het 3070 hom 39 18 19 2 ACA 2 1 376945 CASAVA_Build 17 53782127 1I ACATTATGTT -/A GGTGAAAGAA 3070 het 3070 ref 44 29 11 4 A 0 1 376946 CASAVA_Build 17 53801073 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2244 het 1054 hom 15 4 6 5 A 15 14 376947 CASAVA_Build 17 53806552 1I TAGAGATTAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 35 17 12 6 A 9 10 376948 CASAVA_Build 17 53821064 1I AGGATTTGTC -/A AAGGAGATGG 3070 het 3070 hom 40 18 18 4 A 2 3 376949 CASAVA_Build 17 53831781 17D AGGGAACTGA GAGTCTTAGAGACTTGC/----------------- GGGATAATTT 3070 het 3070 ref 37 22 17 3 GAGTCTTAGAGACTTGC 1 0 376950 CASAVA_Build 17 53856748 1D CGAGGCAGGC A/- GATCACAAGG 3070 het 1953 hom 18 5 12 1 A 1 0 376951 CASAVA_Build 17 53868706 1D ATTAAAAAAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 18 15 12 T 13 12 376952 CASAVA_Build 17 53873301 1I TGAGAGGTTT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 hom 24 9 10 5 A 7 8 376953 CASAVA_Build 17 53875273 1I AATTTTTGCA -/T TTTTTTTTTT 2481 het 632 hom 12 3 7 2 T 13 14 376954 CASAVA_Build 17 53881096 3D GTTAAATGTG CAA/--- CAAGAAAACA 3070 het 3070 ref 35 20 15 0 CAA 2 1 376955 CASAVA_Build 17 53885236 1D TGGGGAAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 30 0 23 8 A 11 10 376956 CASAVA_Build 17 53889409 1D ACCTGAGGTC A/- GGAGTTCAAG 3070 het 2382 hom 23 6 10 7 A 1 0 376957 CASAVA_Build 17 53893076 2D TCACCGTGTT AA/-- CCAGGATGGT 1227 hom 10 het 4 0 4 0 A 2 0 376958 CASAVA_Build 17 53903982 1I CTTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 12 13 376959 CASAVA_Build 17 53912761 3D GTTTGGTAAA AAC/--- AAGTTCAGAA 3070 het 3070 hom 36 16 18 3 AAC 1 0 376960 CASAVA_Build 17 53914481 4I ATAAATAAAT ----/AAAC AAATAAATAA 3070 het 3070 hom 35 14 19 2 AAAC 0 1 376961 CASAVA_Build 17 53915477 1I GATGCTCGCA -/T GTCAACACTA 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 T 0 1 376962 CASAVA_Build 17 53924842 2I CCTGTTTTTT --/GA GTCATACTAA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 GA 0 1 376963 CASAVA_Build 17 53931603 1I TTTTTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 1587 het 1587 ref 27 8 7 13 A 13 14 376964 CASAVA_Build 17 53962163 1D TGTTCATTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2422 hom 40 12 11 17 T 15 14 376965 CASAVA_Build 17 54002528 1D AAAGATATGC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 24 11 12 1 A 10 9 376966 CASAVA_Build 17 54018701 3D AAAGGCAGCA AAC/--- AACTTACAGA 3070 het 3070 ref 60 30 27 6 AAC 2 1 376967 CASAVA_Build 17 54039864 1I TCTACTATCT -/G GTTTAGCCCC 3070 hom 139 het 52 0 44 8 G 1 2 376968 CASAVA_Build 17 54048799 1I GCACTGGGCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 837 hom 26 4 14 8 T 13 14 376969 CASAVA_Build 17 54053214 1I TGGCCAGAGT -/G GGCACGCAGC 3070 het 2973 hom 37 15 11 11 G 2 3 376970 CASAVA_Build 17 54056104 3D AGGGAAAAAA AAG/--- AAGAAGAAAG 1801 het 1080 hom 17 7 6 6 AAG 3 2 376971 CASAVA_Build 17 54062603 4D TTTTTAGTAG AGGC/---- AGGGTTTCAC 3070 het 453 hom 15 1 14 1 AGGC 1 0 376972 CASAVA_Build 17 54064103 4D GAGAGAACAC AAAT/---- ATCTCCCTCT 3070 het 3070 hom 39 18 16 5 AAAT 1 0 376973 CASAVA_Build 17 54070717 1D ACAATAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 62 het 31 0 24 7 A 12 11 376974 CASAVA_Build 17 54071707 3D ATAAGGTGCC AGT/--- AGTGTATACT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 AGT 2 1 376975 CASAVA_Build 17 54075929 1D CTCAAAAATG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 75 het 33 0 26 7 A 10 9 376976 CASAVA_Build 17 54090917 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTGTAT 3070 hom 54 het 19 0 18 1 T 7 6 376977 CASAVA_Build 17 54091596 11I GCAAACACAT -----------/CCCAAACACAA AGTAAAAACC 3070 hom 81 het 33 0 27 6 CCCAAACACAA 0 1 376978 CASAVA_Build 17 54110092 1D CCTGCCCGGT A/- AAGTGGAAGG 3070 hom 79 het 38 0 33 5 A 3 2 376979 CASAVA_Build 17 54111797 3I CATCAATCTC ---/TCG TCGCTATTCC 3070 het 3070 hom 59 24 29 6 TCG 1 2 376980 CASAVA_Build 17 54112442 1D GTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 37 22 10 6 T 9 8 376981 CASAVA_Build 17 54114623 1I AGAGTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 2338 het 1547 hom 33 7 8 18 T 13 14 376982 CASAVA_Build 17 54118439 1D GGAGGATCAT G/- GTGGCTCGCA 3070 het 3070 ref 32 16 10 6 G 2 1 376983 CASAVA_Build 17 54134362 1I TATTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1036 hom 25 3 16 6 T 11 12 376984 CASAVA_Build 17 54137473 2I CCTGGGAGAC --/AG AGAGAGACTC 3070 hom 36 het 14 0 13 1 AG 3 4 376985 CASAVA_Build 17 54141062 1I TTTTTGCTTT -/G GGGGGGGGCT 3070 het 3070 hom 24 11 10 3 G 8 9 376986 CASAVA_Build 17 54147675 3D TTAGCCAGTT GTG/--- GTGGCAGGTG 2110 het 830 hom 7 2 5 0 GTG 2 1 376987 CASAVA_Build 17 54169064 1D TAATTGAATA T/- TAAATATTGT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 T 2 1 376988 CASAVA_Build 17 54178197 1D CAGGCATGAG C/- CCGCTGTGCC 3070 hom 93 het 38 0 26 12 C 3 2 376989 CASAVA_Build 17 54197429 2D GTTTTTGTTG GT/-- GTGTGTTTAT 3070 hom 78 het 32 0 27 7 GT 4 3 376990 CASAVA_Build 17 54204053 1D AGTATTCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 10 9 376991 CASAVA_Build 17 54205335 1D TTTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 219 hom 35 3 11 21 T 13 12 376992 CASAVA_Build 17 54207219 1D TGGGTAGTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2108 hom 27 7 10 10 T 12 11 376993 CASAVA_Build 17 54218336 1I CAGCATATGA -/T TTTTTTTCTT 2442 het 2442 ref 16 8 5 3 T 7 8 376994 CASAVA_Build 17 54223255 1I AGATAATAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 25 het 29 1 20 8 T 13 14 376995 CASAVA_Build 17 54228971 4D ATCTTTTAAT TAAG/---- TATTATTTAC 3070 het 3070 hom 26 13 12 1 TAAG 1 0 376996 CASAVA_Build 17 54242394 1D TTTTACAGTC T/- TTTTTTGTAC 3070 het 3070 ref 40 23 15 2 T 7 6 376997 CASAVA_Build 17 54258665 1D ACTCGATCTC A/- AAAAAAAAAA 2367 het 57 hom 19 2 9 10 A 17 16 376998 CASAVA_Build 17 54259629 1D TCCCAAGTAG C/- TGTGATTATA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 C 1 0 376999 CASAVA_Build 17 54271204 1I TGGTATTTTA -/G GGTGGTGAAA 3070 hom 93 het 38 0 32 6 G 2 3 377000 CASAVA_Build 17 54294069 1D GAGATACTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 24 0 19 5 A 10 9 377001 CASAVA_Build 17 54296609 1I CATGGTGAAA -/C CCTGTCTGTA 3070 hom 66 het 23 0 22 1 C 2 3 377002 CASAVA_Build 17 54298733 15D TAATAACCAC TCATTGTAAATGCTG/--------------- TCATTGTAAA 3070 het 3070 ref 63 39 20 10 TCATTGTAAATGCTG 2 1 377003 CASAVA_Build 17 54311049 1D CTGCATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 12 14 2 A 12 11 377004 CASAVA_Build 17 54311419 1I CTCCACATAC -/A TATATATAAT 3070 hom 21 het 11 0 8 3 A 0 1 377005 CASAVA_Build 17 54314010 3D AAGAAAAGAA AAG/--- AAATACAGGC 2844 het 2844 ref 20 12 7 1 AAG 1 0 377006 CASAVA_Build 17 54320440 1D ACTTCGTCTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 534 hom 33 2 25 6 T 10 9 377007 CASAVA_Build 17 54339388 1D GACTCCATCT A/- AAAAAAAAAA 2366 het 2366 ref 24 13 7 5 A 12 11 377008 CASAVA_Build 17 54339540 3D AATGCATGTT TTA/--- TGGCCCAGAA 3070 het 3070 ref 37 23 11 4 TTA 1 0 377009 CASAVA_Build 17 54355254 1I CATGGCAAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 47 het 19 0 16 3 C 3 4 377010 CASAVA_Build 17 54367393 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 278 hom 29 2 20 7 A 14 13 377011 CASAVA_Build 17 54370560 2D AAGTTTTAGG TC/-- TCTCTCGTGT 3070 het 3070 hom 37 16 20 2 TC 4 3 377012 CASAVA_Build 17 54371958 1D AAAACTTTCC T/- TTTGTTCTCA 3070 het 3070 ref 31 16 11 4 T 4 3 377013 CASAVA_Build 17 54374981 1D AAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 45 het 19 0 16 4 A 10 9 377014 CASAVA_Build 17 54388599 1I AAAAAACAAA -/C AAACAAAAAA 2991 het 346 hom 15 3 10 2 C 0 1 377015 CASAVA_Build 17 54413902 1D CTTTTGGTGG A/- AATTTTTATT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 A 3 2 377016 CASAVA_Build 17 54419347 9D TTTTCCAAAT GAGTAACTG/--------- GAGTTTAACT 3070 het 3070 ref 41 25 16 3 GAGTAACTG 1 0 377017 CASAVA_Build 17 54424466 2D ACATATGTAA AT/-- ATATATATAT 2246 hom 12 het 5 0 5 0 AT 10 9 377018 CASAVA_Build 17 54435789 1I GAGTCTTATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1904 hom 38 9 12 17 A 17 18 377019 CASAVA_Build 17 54436487 4I GGTATGACAT ----/TAAG TATTTATATT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 TAAG 0 1 377020 CASAVA_Build 17 54439796 3D TGAAAGAAAA AAT/--- AAGTCAACCT 3070 het 3070 hom 42 20 20 3 AAT 1 0 377021 CASAVA_Build 17 54462131 10D AAAAACAGAT ATTCATCAGG/---------- ATTATGTTCC 3070 het 3070 ref 32 20 13 2 ATTCATCAGG 1 0 377022 CASAVA_Build 17 54478714 2I AGAGTCTCAA --/CT CTGTCGCCCA 1995 het 1995 ref 25 9 8 8 CT 1 2 377023 CASAVA_Build 17 54504891 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1679 hom 23 6 9 8 A 14 15 377024 CASAVA_Build 17 54527361 1D TCGGTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 1599 het 1599 ref 30 25 4 2 A 12 11 377025 CASAVA_Build 17 54528707 1D AAAAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1261 het 413 hom 14 3 4 7 A 13 12 377026 CASAVA_Build 17 54529696 1D ATGCTTAGGG A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 ref 34 14 11 9 A 10 9 377027 CASAVA_Build 17 54538049 4D CATATCCTAC ATAT/---- CCCAACTATT 3070 het 3070 hom 43 19 24 1 AT 2 0 377028 CASAVA_Build 17 54539053 1I CGCTGTGGGA -/G GGGGAAAGGA 3070 het 1573 hom 31 7 12 12 G 4 5 377029 CASAVA_Build 17 54550736 1D ATATACATAC T/- TTTTTTTGCA 3070 het 3070 hom 42 19 18 5 T 8 7 377030 CASAVA_Build 17 54570147 1I AAATCAGCCT -/C CCTGGAAGCC 3070 het 3070 hom 35 14 20 1 C 2 3 377031 CASAVA_Build 17 54581674 1D AAATATTGCT A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 43 18 22 3 A 10 9 377032 CASAVA_Build 17 54584747 17I TTTCCTTTTA -----------------/AATAGTCAATGCTAGTT CCTTGACAAA 3070 het 3070 ref 30 17 13 0 AATAGTCAATGCTAGTT 0 1 377033 CASAVA_Build 17 54638032 2I CTACCAAAAA --/AC AAATATATAA 3070 het 825 hom 12 3 7 2 AC 0 1 377034 CASAVA_Build 17 54641989 1I CCGCAGTAGT -/C CCCAGTTTTG 3070 hom 53 het 20 0 18 2 C 3 4 377035 CASAVA_Build 17 54667118 1D AGTGTTGATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 T 13 12 377036 CASAVA_Build 17 54671906 1D ATATGTATAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1903 hom 24 8 11 5 T 14 13 377037 CASAVA_Build 17 54676337 1I GTTGGGATAC -/T TCCGGGGTCT 3070 het 3070 ref 40 18 17 5 T 1 2 377038 CASAVA_Build 17 54678261 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1650 het 1650 ref 19 12 4 4 A 12 11 377039 CASAVA_Build 17 54744802 1I ATTCTGTTTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 G 0 1 377040 CASAVA_Build 17 54751246 1I GCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2374 het 2374 ref 30 12 10 8 T 14 15 377041 CASAVA_Build 17 54792882 2D TTTGGGGCTC GT/-- GTAAAGTATA 3070 het 3070 ref 44 18 20 6 GT 2 1 377042 CASAVA_Build 17 54795305 6D ATATATATAT AGAGAG/------ AGAGAGAGAC 3070 het 3070 ref 38 17 20 1 AG 7 4 377043 CASAVA_Build 17 54802892 12I GCCATGGCAC ------------/ACAGAGGAAGGG ACAGAGGAGG 3019 het 3019 ref 48 20 12 16 ACAGAGGAAGGG 0 1 377044 CASAVA_Build 17 54810449 1I AGGGAATTTG -/A AAAGTCTGAT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 3 4 377045 CASAVA_Build 17 54814526 3D ATCCTCCACC CCG/--- CCTCTCTCTA 3070 het 3024 hom 26 11 11 4 CCG 1 0 377046 CASAVA_Build 17 54818306 1D TCTCTATAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1215 hom 26 5 16 6 T 13 12 377047 CASAVA_Build 17 54821330 1D ATTTCCTTCC A/- GCTGAGATAT 3070 het 3070 hom 30 12 17 1 A 1 0 377048 CASAVA_Build 17 54824054 1D AAAAACAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1662 hom 23 8 11 4 A 12 11 377049 CASAVA_Build 17 54827382 2I GCACAGAGAC --/AG GGAATAATGA 3070 het 3070 hom 44 21 20 3 AG 0 1 377050 CASAVA_Build 17 54829179 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 14 5 A 10 9 377051 CASAVA_Build 17 54832630 1D ATGTTTTCAG T/- TTTTTTTTTT 1673 het 1673 ref 21 12 4 5 T 14 13 377052 CASAVA_Build 17 54835305 1I ACCCTGTCTT -/A AAAAAAAACA 3070 het 3070 ref 38 19 11 8 A 8 9 377053 CASAVA_Build 17 54846262 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2265 hom 30 10 12 8 T 12 11 377054 CASAVA_Build 17 54862635 11D CGGCCAGTTC TTTTTTTTTTT/----------- TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 30 0 22 14 T 23 12 377055 CASAVA_Build 17 54872780 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 13 hom 28 1 15 12 A 13 12 377056 CASAVA_Build 17 54896295 2I7M1I AAGAGCTAAA --CTGTCTC-/CTCTGTCTCA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 16 11 8 N/A 0 0 377057 CASAVA_Build 17 54915110 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2380 hom 19 6 8 5 A 10 11 377058 CASAVA_Build 17 54934715 1I ATATATGTTC -/T TAAATATTAT 3070 hom 51 het 18 0 18 0 T 1 2 377059 CASAVA_Build 17 54942948 3I GGATGACAGA ---/TGT TGGTGTCTAG 3070 het 3070 hom 44 19 23 2 TGT 0 1 377060 CASAVA_Build 17 54950811 1D CTAAGAATAA T/- TTTTACTCAA 3070 het 3070 hom 31 15 16 0 T 5 4 377061 CASAVA_Build 17 54955968 7D ACTCTGTCTC AAAAACA/------- AAAAACAAAA 2153 het 2153 ref 12 6 6 1 AAAAACA 3 2 377062 CASAVA_Build 17 54959663 2I CCTTATCTAA --/AT GTGCCCCAAT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 AT 0 1 377063 CASAVA_Build 17 54960375 1D GTTTTTGTAA C/- TACATCCCTG 3070 het 3070 ref 49 31 14 4 C 1 0 377064 CASAVA_Build 17 54961672 1I CTCACACAGG -/C CTGGAGTGCA 3070 het 1018 hom 19 3 8 8 C 1 2 377065 CASAVA_Build 17 54985313 1I AAAATAAAGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 24 9 9 6 A 11 12 377066 CASAVA_Build 17 54992110 1D GCATACATAT A/- AAAGCACAAT 3070 het 3070 ref 39 21 15 4 A 4 3 377067 CASAVA_Build 17 54997629 1D GGAAATCCCT G/- GGGGGTGGAG 2439 het 2439 ref 36 15 11 10 G 6 5 377068 CASAVA_Build 17 55000981 2D TGGAAGGTGC AT/-- ATATATATAT 1965 het 582 hom 8 3 5 0 AT 8 7 377069 CASAVA_Build 17 55008040 1I GATTGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2455 het 2455 ref 27 12 6 9 T 10 11 377070 CASAVA_Build 17 55019363 3D TTCAAAGACA TCT/--- TCTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 15 11 7 TCT 2 1 377071 CASAVA_Build 17 55023503 2D AAAACCTATT AC/-- AGAGTATTGA 1449 het 1449 ref 7 4 3 1 AC 1 0 377072 CASAVA_Build 17 55032478 1D CTGATGAGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 12 15 7 A 11 10 377073 CASAVA_Build 17 55032610 1I GTATATGCTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 16 17 7 T 10 11 377074 CASAVA_Build 17 55037824 1I AAGGGTGAGT -/A AAATCATTTG 3070 het 3070 ref 55 27 20 8 A 3 4 377075 CASAVA_Build 17 55051827 4D GGGGGGAGAA AGAG/---- AAGACTGGCG 2721 het 2721 ref 23 13 8 4 AG 2 0 377076 CASAVA_Build 17 55059217 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTGTA 3070 hom 53 het 23 0 15 8 T 8 7 377077 CASAVA_Build 17 55065172 20D TCATGGTGGT TGTCATTTTAATCATTTTAA/-------------------- TGTCATTTTA 3070 het 3070 ref 30 18 11 10 TGTCATTTTAATCATTTTAA 2 1 377078 CASAVA_Build 17 55065814 1D GTAGAAAGAT A/- ACATGAATAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 A 2 1 377079 CASAVA_Build 17 55070651 3D CAACCTTTTT GGC/--- GGCACCAGGG 3070 hom 36 het 16 0 13 3 GGC 2 1 377080 CASAVA_Build 17 55071947 1I CCTGTCTCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 253 hom 22 1 17 4 A 15 16 377081 CASAVA_Build 17 55078008 1I TTAAGCTTCC -/T TTCAGACTCT 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 2 3 377082 CASAVA_Build 17 55082032 1I AAACATAAGG -/C CAGGACATTT 3070 hom 117 het 45 0 39 6 C 1 2 377083 CASAVA_Build 17 55087709 1I AAGATTCATC -/T TGCACTGCAA 3070 het 3070 hom 51 23 22 6 T 1 2 377084 CASAVA_Build 17 55088543 1I ACAGACTATT -/C TTTTTAAGGA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 C 0 1 377085 CASAVA_Build 17 55093210 5D AAATTTGTAC TTAAT/----- TTAATATGAA 3070 hom 90 het 37 0 31 8 TTAAT 2 1 377086 CASAVA_Build 17 55097370 1D TCTCAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 19 5 A 12 11 377087 CASAVA_Build 17 55102421 1D GGGTGTTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 47 het 21 0 15 6 T 11 10 377088 CASAVA_Build 17 55104594 2D TGATCCATAC TT/-- TTTTGATGTT 3070 hom 87 het 32 0 30 2 T 6 4 377089 CASAVA_Build 17 55105243 1D AAATGCTGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 34 hom 35 1 26 8 T 11 10 377090 CASAVA_Build 17 55110526 2I TGATTCTTGC --/TT TTAAACCATT 3070 het 3070 hom 44 13 25 6 T 2 4 377091 CASAVA_Build 17 55111002 1D ATGATTAGCT G/- GGGGGAGGTG 3070 hom 99 het 37 0 34 3 G 6 5 377092 CASAVA_Build 17 55116167 2D CTCAAGACTC AT/-- AAAGTTATGT 3070 het 3070 ref 49 20 20 11 AT 1 0 377093 CASAVA_Build 17 55118476 5D TAATTGCCTT ATAAC/----- ATTCACTATT 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 ATAAC 1 0 377094 CASAVA_Build 17 55119631 1D CTTTTTGGGG T/- TTTTTTTTTT 1213 het 1213 ref 28 19 3 6 T 13 12 377095 CASAVA_Build 17 55124467 5I AAAAAATAAT -----/AATAA AATAAACTGG 3070 hom 57 het 26 0 20 6 AATAA 1 2 377096 CASAVA_Build 17 55127816 4D CTCAAAAAAC AAAA/---- AAACCTATTT 3070 het 3070 ref 29 15 10 5 A 7 3 377097 CASAVA_Build 17 55127986 3D AGAAAAAAAA AAT/--- AATAATAGTA 3070 hom 75 het 28 0 26 7 AAT 3 2 377098 CASAVA_Build 17 55128669 6I AAGAAGGCTT ------/AAAGAA AAATAGTTTC 3070 hom 117 het 41 0 39 2 AAAGAA 0 1 377099 CASAVA_Build 17 55131294 2D TCCTGTATCT GC/-- GCCTGTCAAC 3070 hom 151 het 54 0 51 4 GC 2 1 377100 CASAVA_Build 17 55133844 1I TTGGGGTTTT -/G TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 27 8 17 2 G 0 1 377101 CASAVA_Build 17 55143563 3D GTGGAAATGA ACT/--- CTAGATTAGA 3070 het 3070 hom 39 14 22 3 ACT 1 0 377102 CASAVA_Build 17 55148928 1I CTAGTTGGAA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 29 12 14 3 T 9 10 377103 CASAVA_Build 17 55158435 1I GTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2018 het 2018 ref 16 8 7 1 T 11 12 377104 CASAVA_Build 17 55164696 4D TCATTTGTTT GTTA/---- ATCACCATAT 3070 het 3070 ref 27 13 12 7 GTTA 1 0 377105 CASAVA_Build 17 55183787 5I CTTGGGAGGC -----/TGAGG TGAGGTGAGA 1113 het 1113 ref 9 5 4 0 TGAGG 1 2 377106 CASAVA_Build 17 55187122 2I TTTATACTAG --/CC CCCCCCCCGC 1953 hom 24 het 14 0 6 8 C 8 10 377107 CASAVA_Build 17 55191521 5D TGTCTCAAAA AAAAT/----- AAAATAAAGA 3070 het 2716 hom 21 7 12 3 AAAAT 2 1 377108 CASAVA_Build 17 55192266 1D ACCCTTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 12 11 377109 CASAVA_Build 17 55193967 2I TAGAGTTCCT --/TC TCTCTGTGTA 3070 hom 81 het 32 0 27 5 TC 2 3 377110 CASAVA_Build 17 55200253 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 13 3 A 10 9 377111 CASAVA_Build 17 55203310 1I ACATTACACC -/T TTTTTTTTTT 2965 het 2965 ref 21 10 8 3 T 12 13 377112 CASAVA_Build 17 55206565 8D TAAAAAAAAA AAAGAAAG/-------- AAAGAAAGAA 3070 het 292 hom 28 5 10 16 AAAG 5 3 377113 CASAVA_Build 17 55214940 1D CTGTAGTAGA G/- TAAGTTTATC 3070 het 3070 hom 26 10 13 3 G 1 0 377114 CASAVA_Build 17 55233559 1I CAGCTAATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 11 12 377115 CASAVA_Build 17 55235057 1D GCCCGGCTAA T/- TTTGTATTTT 3070 het 1805 hom 22 5 16 1 T 4 3 377116 CASAVA_Build 17 55236093 1I ATAAAAGGGA -/T TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 8 9 377117 CASAVA_Build 17 55237805 1D AAATAAAAGC A/- AAAAAAAAAA 2474 het 2474 ref 34 23 7 4 A 13 12 377118 CASAVA_Build 17 55238859 1I AGTTTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2204 het 2204 ref 23 8 7 8 A 17 18 377119 CASAVA_Build 17 55247608 3D AGGGCAGAGA TTT/--- TTGTCTGTTG 3070 het 3070 ref 39 19 16 5 T 5 2 377120 CASAVA_Build 17 55247833 1D CGTCTCTACT A/- AAAAAAATAC 2571 het 84 hom 9 1 8 0 A 8 7 377121 CASAVA_Build 17 55251302 3D AGTGTGGATT ATA/--- ACTTGTACAC 2928 het 2928 ref 23 13 6 7 ATA 1 0 377122 CASAVA_Build 17 55255591 1D GATATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1475 het 1204 hom 16 4 5 8 A 17 16 377123 CASAVA_Build 17 55261359 1D ATAACTAGAT C/- CTTTTTTACT 3070 het 3070 ref 49 23 19 7 C 2 1 377124 CASAVA_Build 17 55263945 1I CATTCCTGAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 767 hom 27 3 17 7 T 10 11 377125 CASAVA_Build 17 55268863 1I GGCAGTTTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 48 20 10 18 T 14 15 377126 CASAVA_Build 17 55276004 1I AAAAATGTAG -/C CAGGCACGGT 3070 het 3070 hom 21 11 9 1 C 1 2 377127 CASAVA_Build 17 55280270 2D GTTTTTTTTG TT/-- TTTTTTTTGT 3070 het 2937 hom 34 11 17 6 T 10 8 377128 CASAVA_Build 17 55281174 1D ATTTCTGTAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 16 9 7 T 11 10 377129 CASAVA_Build 17 55282209 1D GCTACTAAGA T/- TTTTTTTTTT 2916 het 2146 hom 18 6 11 1 T 11 10 377130 CASAVA_Build 17 55282867 2D AAAATGAGAA AG/-- AGAGAGAGAG 3070 het 1550 hom 21 4 8 9 AG 9 8 377131 CASAVA_Build 17 55293339 1I CCCCACAAAA -/T TTTTTTTTTT 1614 het 1614 ref 25 7 9 9 T 15 16 377132 CASAVA_Build 17 55299686 1D TCTGCTTCTT A/- AAAAAATTAG 3070 het 3070 hom 40 17 20 4 A 7 6 377133 CASAVA_Build 17 55304104 1I ATGCCCAGCA -/T TTTTTTTTTT 953 het 953 ref 20 12 3 5 T 11 12 377134 CASAVA_Build 17 55308327 1I GCATGAATTC -/T TTTTTTTTTT 2552 het 2552 ref 25 13 8 4 T 10 11 377135 CASAVA_Build 17 55313825 1I CTTTAAGCTA -/T TTTTCTTTTT 2177 het 2177 ref 24 12 7 6 T 4 5 377136 CASAVA_Build 17 55322193 6I AGCTACTCAG ------/GAGGCT GAGACCTGTG 2675 het 2675 ref 25 17 6 2 GAGGCT 0 1 377137 CASAVA_Build 17 55323512 6D GACCTCGTGA TCCACC/------ TCCACCTACC 3070 het 2977 hom 23 9 13 3 TCCACC 2 1 377138 CASAVA_Build 17 55333769 1D CCTGTCTCTG A/- AAAAAAAAAA 2736 het 449 hom 17 3 9 5 A 21 20 377139 CASAVA_Build 17 55339684 1I CTTTGGTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2507 hom 39 11 13 15 T 15 16 377140 CASAVA_Build 17 55346928 3D AAGCAATCAT ATC/--- ATATTTTTAA 3070 het 3070 ref 50 22 22 7 ATC 1 0 377141 CASAVA_Build 17 55350495 5I CCTCTGAGAG -----/TTTTA TTTTATTTTT 3070 het 2851 hom 21 7 9 5 TTTTA 1 2 377142 CASAVA_Build 17 55356473 1D CTCTGTCTAG A/- AAAAAAAAAT 2808 het 2808 ref 15 9 6 0 A 10 9 377143 CASAVA_Build 17 55360532 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2982 hom 30 9 12 9 T 10 11 377144 CASAVA_Build 17 55367551 1I AATATTGAAC -/A AAAAAAGTCT 3070 het 3070 ref 25 10 9 6 A 6 7 377145 CASAVA_Build 17 55379007 2I AAGGTGAAAC --/AA GACTCAAAAT 3070 het 3070 ref 50 26 20 4 A 0 2 377146 CASAVA_Build 17 55382653 4I TAAATTTATT ----/TTCA TTAACATGTC 3070 het 3070 ref 43 22 16 5 TTCA 0 1 377147 CASAVA_Build 17 55383392 4D TATGTAATCA CATT/---- CATTAAGAAA 3070 het 3070 ref 22 11 9 3 CATT 2 1 377148 CASAVA_Build 17 55386422 2D GATACAAACA TC/-- TCAAAGCTGA 3070 het 3070 hom 32 14 15 5 TC 2 1 377149 CASAVA_Build 17 55393061 4D ATAAGAATTT AATA/---- AATTAATGTT 3070 het 3070 ref 20 10 8 2 AATA 1 0 377150 CASAVA_Build 17 55404708 1D GTCTCAATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 826 hom 39 3 27 9 A 13 12 377151 CASAVA_Build 17 55413835 2D CGAATTAAAG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 T 17 15 377152 CASAVA_Build 17 55414692 1D TGAATAAACC T/- TAACATACAT 3070 het 3070 hom 35 9 20 6 T 2 1 377153 CASAVA_Build 17 55418598 4I TGGTGGAAGA ----/ACAG ACAGACAATC 3070 het 3070 hom 33 16 13 4 ACAG 1 2 377154 CASAVA_Build 17 55446797 1I CCCCAGCTCC -/T CCAGGGTGGT 3070 het 3070 ref 35 19 9 7 T 0 1 377155 CASAVA_Build 17 55465764 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1908 het 1908 ref 19 9 4 6 A 11 12 377156 CASAVA_Build 17 55466890 1I CAAAAAAACC -/A AAAAGACTTG 3070 het 3070 ref 33 20 8 5 A 4 5 377157 CASAVA_Build 17 55479737 1I GGAATGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1231 het 1231 ref 32 23 3 6 A 13 14 377158 CASAVA_Build 17 55521520 1I ACTCCCGTTG -/T TTTTTTTTTT 2852 hom 36 het 22 0 13 9 T 11 12 377159 CASAVA_Build 17 55562484 2D ATTTTTTACT AC/-- AGTCACTCTG 3070 hom 87 het 31 0 30 2 AC 1 0 377160 CASAVA_Build 17 55562982 1I ATTTTTAGTC -/T TTTGAGGAAC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 3 4 377161 CASAVA_Build 17 55563830 1I CCCGGCCTTA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 11 12 377162 CASAVA_Build 17 55568836 1D TGCACACCCG C/- CCCCCCCCCC 3070 hom 74 het 26 0 23 3 C 16 15 377163 CASAVA_Build 17 55598867 1D GGGAGGCCAA G/- GGGGGGGCGG 3070 hom 51 het 20 0 17 3 G 8 7 377164 CASAVA_Build 17 55632996 4D TTAATTCATT TTTG/---- TTTGTTTGTT 1401 het 1401 ref 28 21 3 4 TTTG 3 2 377165 CASAVA_Build 17 55706840 1I AAAGTACAGA -/T TTTTTTTTTT 836 het 836 ref 47 35 2 10 T 11 12 377166 CASAVA_Build 17 55708058 1D GTCTCTATTT A/- AAAAAAAAAA 1321 het 1321 ref 20 9 4 7 A 15 14 377167 CASAVA_Build 17 55759123 1I AGGAAAGGGA -/T GGGGGAGGAA 3070 hom 93 het 41 0 32 9 T 0 1 377168 CASAVA_Build 17 55794008 2D AAGATACATG TA/-- TATATATATA 1176 het 1176 ref 47 35 4 8 TA 6 5 377169 CASAVA_Build 17 55811979 2D TCACAATCAT AC/-- AGACACACCA 3070 het 3070 ref 57 38 11 9 AC 1 0 377170 CASAVA_Build 17 55950212 1D TACAATTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 382 hom 37 3 20 14 T 17 16 377171 CASAVA_Build 17 56010140 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1810 het 1810 ref 28 12 7 9 T 15 14 377172 CASAVA_Build 17 56035907 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 60 hom 23 1 16 6 A 12 11 377173 CASAVA_Build 17 56106067 1D CATAATATTC T/- TTTTTTTTTG 1768 hom 16 het 8 0 6 2 T 10 9 377174 CASAVA_Build 17 56139849 4D TTTTAAAAAT AAAA/---- TAACTATTGC 3070 hom 102 het 36 0 35 3 A 4 0 377175 CASAVA_Build 17 56183667 19D TTTTAATTTG TTTCTTTTTTTTCTTTTTC/------------------- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 23 0 25 2 TTTCTTTTTTTTCTTTTTC 1 0 377176 CASAVA_Build 17 56184566 1D GTGTATTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 344 hom 27 1 23 3 T 11 10 377177 CASAVA_Build 17 56184881 4I GTCTACCAAC ----/ATTT ATTTATACAT 3070 hom 72 het 27 0 25 2 ATTT 1 2 377178 CASAVA_Build 17 56185175 1I TTTTGTAGAG -/A TGAGGTCTTG 3070 hom 93 het 32 0 31 2 A 0 1 377179 CASAVA_Build 17 56185764 1D ATGTTAGCCA G/- GATGGTCTCG 3070 hom 60 het 25 0 20 5 G 2 1 377180 CASAVA_Build 17 56186204 2D TGAGACAGGG TC/-- TCTCTCTCTC 3070 hom 75 het 37 0 26 19 TC 6 5 377181 CASAVA_Build 17 56187006 4I TAAATGGCTA ----/AACT AACTATGAGA 3070 hom 108 het 40 0 37 3 AACT 1 2 377182 CASAVA_Build 17 56188254 1D TTCCATGGAT G/- GGGGGCGTGG 3070 hom 84 het 33 0 28 5 G 6 5 377183 CASAVA_Build 17 56207726 1D TCAGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 11 10 377184 CASAVA_Build 17 56537921 1I GAGAAAATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1229 hom 33 4 25 4 A 10 11 377185 CASAVA_Build 17 56578005 1I ACATATTTCA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 297 hom 42 1 34 7 T 9 10 377186 CASAVA_Build 17 56591488 1D AAAATGTTCA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 38 0 31 7 T 10 9 377187 CASAVA_Build 17 56592138 1D20M2I GCATCTTTGA TTTTTTTTTTTTTGTAGTGAC--/-TTTTTTTTTTTTGTAGTGACAG AGTCTCGCTG 3070 hom 57 het 23 0 20 4 N/A 0 0 377188 CASAVA_Build 17 56592327 1I AGCAGGGTGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 290 hom 24 2 18 4 T 11 12 377189 CASAVA_Build 17 56595574 1I CTCAGAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 398 hom 18 2 13 3 A 15 16 377190 CASAVA_Build 17 56596239 1D AAGACATGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 126 hom 25 1 17 7 T 19 18 377191 CASAVA_Build 17 56603511 1I AACCAAAAAG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 A 7 8 377192 CASAVA_Build 17 56605593 1I CTCTGTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 23 1 13 9 A 13 14 377193 CASAVA_Build 17 56608514 2D TTTTTCTTCC TA/-- TATTTTTGTT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 TA 2 1 377194 CASAVA_Build 17 56614018 1I TTTTTCCTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 108 hom 40 3 26 11 T 11 12 377195 CASAVA_Build 17 56616499 1I TTTAAATGAC -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 117 het 46 0 40 6 A 8 9 377196 CASAVA_Build 17 56627690 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 714 hom 23 4 15 4 C 0 1 377197 CASAVA_Build 17 56631865 6I4M1D5M3I AATTTTGATA ------GGATCCCTAT---/TCATAGGGAT-CCTATCAA GATCTTTGTA 3070 het 3070 hom 32 14 17 3 N/A 0 0 377198 CASAVA_Build 17 56643813 1I CATTTCTCCA -/T TAAAAAAAAA 3070 het 130 hom 44 3 30 11 T 1 2 377199 CASAVA_Build 17 56652440 8I CCATCTCAAA --------/AAACAAAC AAACAAACAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AAAC 2 4 377200 CASAVA_Build 17 56667032 4I ATTTATTTAC ----/TTAT TTATTTATTT 3070 het 2238 hom 21 6 11 5 TTAT 4 5 377201 CASAVA_Build 17 56667844 1I TGAATTGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 179 hom 33 3 19 11 A 14 15 377202 CASAVA_Build 17 56674988 1I GGAATTCTTT -/A AAAAAAAAAC 3070 het 6 hom 29 1 25 3 A 9 10 377203 CASAVA_Build 17 56677954 1I TCATTGAAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 39 19 15 5 A 9 10 377204 CASAVA_Build 17 56684724 1I TGAAGGACTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1199 hom 34 3 26 5 A 13 14 377205 CASAVA_Build 17 56694526 1D ATAGGGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 29 3 12 14 T 15 14 377206 CASAVA_Build 17 56697551 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2797 hom 27 11 11 5 A 13 12 377207 CASAVA_Build 17 56697842 2I ATTCTTTTTT --/CC CCCCCCCATC 3070 het 3070 hom 34 13 16 5 C 7 9 377208 CASAVA_Build 17 56750118 1I CCATACGCAA -/G GCTGTTCTGG 3070 het 3070 hom 35 10 18 7 G 1 2 377209 CASAVA_Build 17 56761935 9I CCTCGGCGCT ---------/CACCCTTAC CACCTCCTCC 3070 hom 81 het 29 0 27 2 CACCCTTAC 0 1 377210 CASAVA_Build 17 56777060 2I GATCGGAAAT --/AC ACACACACAC 3070 het 3070 hom 45 14 14 17 AC 8 9 377211 CASAVA_Build 17 56782778 2D TTATTCAGTC TT/-- TTTTTTTTTT 2197 het 719 hom 17 5 7 5 T 16 14 377212 CASAVA_Build 17 56791644 1I CAAGGTTTTG -/T TTTTTTTTTT 2462 het 2462 ref 34 11 12 11 T 12 13 377213 CASAVA_Build 17 56805236 2D AAAGTATTCC TT/-- TTTTTTTTTT 1250 het 474 hom 23 3 4 16 T 14 12 377214 CASAVA_Build 17 56805873 4I CGATGCCCAG ----/CCCC CCCCTGTTTA 3070 hom 42 het 16 0 15 1 C 4 8 377215 CASAVA_Build 17 56816104 1D TCTTCCAGGC T/- TTCAGGGCTG 3070 hom 54 het 23 0 18 5 T 3 2 377216 CASAVA_Build 17 56818917 1I TTCCTTACTG -/T TTTTTTTTTG 2194 het 39 hom 27 1 12 14 T 9 10 377217 CASAVA_Build 17 56830590 7I GGTCAATGTT -------/GGATGTG GGATGTACGC 3070 hom 84 het 31 0 28 3 GGATGTG 0 1 377218 CASAVA_Build 17 56836948 1D AGGGAGGTGG C/- GGCGGGGGGT 2280 hom 29 het 11 0 10 1 C 1 0 377219 CASAVA_Build 17 56838890 1D GGTGGGGGGG T/- GGGGGGTTGG 3070 hom 66 het 25 0 23 2 T 1 0 377220 CASAVA_Build 17 56847923 1D TCCAGGATAG C/- CCCCCCACCC 3070 hom 73 het 31 0 21 10 C 7 6 377221 CASAVA_Build 17 56854716 1I GAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 9 10 377222 CASAVA_Build 17 56857503 2D ACATCTGGCA AT/-- ATGTTTGGAG 3070 het 3070 ref 41 18 15 8 AT 2 1 377223 CASAVA_Build 17 56863321 1D GCCCTGCTAA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 39 het 17 0 13 4 T 7 6 377224 CASAVA_Build 17 56865803 1D TCTATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 12 8 T 11 10 377225 CASAVA_Build 17 56875856 1D CCAAGATGGT G/- GGGGGGGGGC 758 het 10 hom 17 0 5 13 G 10 9 377226 CASAVA_Build 17 56877934 1I CTAATTTGCC -/T TTTTTTTGTC 3070 het 3070 hom 44 16 22 6 T 7 8 377227 CASAVA_Build 17 56928120 1I TTCTTTCTTT -/C CCCCCCGCCT 3070 hom 70 het 28 0 23 5 C 6 7 377228 CASAVA_Build 17 56945630 1D TTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 23 het 28 0 16 12 T 12 11 377229 CASAVA_Build 17 56946414 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 916 het 916 ref 11 4 3 4 A 13 14 377230 CASAVA_Build 17 56946641 1D GAGAGAAGAT A/- AAAAAAAAAG 1283 het 1283 ref 43 36 3 4 A 10 9 377231 CASAVA_Build 17 56954679 1I TCGTTTTTTT -/G TTGTTTTGTT 3070 het 818 hom 33 13 14 6 G 0 1 377232 CASAVA_Build 17 56955764 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 975 het 975 ref 24 18 5 1 A 13 14 377233 CASAVA_Build 17 56969498 1D CCCAAGAAAC T/- TAAGTAACAG 3070 het 3070 hom 45 20 22 3 T 2 1 377234 CASAVA_Build 17 56975449 1I TGTCTCAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 87 het 34 0 29 5 A 10 11 377235 CASAVA_Build 17 56983773 1I ACAGGTTTTT -/C TTTTTTGTTG 3070 het 3070 ref 34 14 12 8 C 0 1 377236 CASAVA_Build 17 56990594 3I CAATGACAAG ---/AAC AACAGATTTG 3070 het 3070 ref 51 22 22 7 AAC 1 2 377237 CASAVA_Build 17 56990909 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 1376 hom 7 het 3 0 3 0 A 6 7 377238 CASAVA_Build 17 56993339 1D ATCATAGAGC T/- TTTTTAAAAA 3070 hom 55 het 35 1 32 2 T 6 5 377239 CASAVA_Build 17 56997896 1I AATAAAAAAA -/T ATATATATAT 3070 hom 45 het 16 0 16 0 T 0 1 377240 CASAVA_Build 17 57007719 4I TTTTTCTAGA ----/AGAC AAATTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 14 14 5 AGAC 0 1 377241 CASAVA_Build 17 57008896 3D AATTATTATC CTT/--- CTGTCATCTT 3070 het 3070 hom 50 24 24 3 CTT 1 0 377242 CASAVA_Build 17 57009437 5D TCAATAAAAC TTATT/----- TTATTTTATT 2869 het 2485 hom 13 7 6 0 TTATT 3 2 377243 CASAVA_Build 17 57011134 1I TGTGAAGTTT -/A AAAAAGCAGA 2928 het 2928 ref 35 19 7 9 A 5 6 377244 CASAVA_Build 17 57018055 1I TAACTCATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 8 13 8 T 11 12 377245 CASAVA_Build 17 57019430 1I AAACAGGTAG -/A AAAAATGGAT 3070 het 3070 hom 34 16 16 2 A 5 6 377246 CASAVA_Build 17 57026540 1I CCACGCGGAG -/C CACTACTTCC 3070 hom 54 het 27 0 18 9 C 1 2 377247 CASAVA_Build 17 57029602 1D AAAAAATAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 751 hom 14 2 11 2 T 11 10 377248 CASAVA_Build 17 57037114 4I AAAATCAATA ----/TGAT TGATTAACCT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 TGAT 1 2 377249 CASAVA_Build 17 57041885 1D CGCATTTTAG A/- AAAAAAAAAA 1886 het 1731 hom 11 5 4 2 A 12 11 377250 CASAVA_Build 17 57045378 2D CACACATGCG CA/-- CACACACACA 3070 het 8 hom 24 1 21 4 CA 9 8 377251 CASAVA_Build 17 57053411 1I ATCTTTATAA -/T TTTGTCATTT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 T 3 4 377252 CASAVA_Build 17 57057375 1I CACCCAGCTA -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 72 het 30 0 24 6 T 9 10 377253 CASAVA_Build 17 57066802 11D TGAAGTCCCC TACTATTATTG/----------- TATTATAGTC 3070 hom 102 het 35 0 35 1 TACTATTATTG 1 0 377254 CASAVA_Build 17 57068441 1D AATGCATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 777 hom 42 3 18 22 T 17 16 377255 CASAVA_Build 17 57089211 6I ATCTTGCTCC ------/TGATAT TAAGGGGGAA 3070 hom 78 het 26 0 27 2 TGATAT 0 1 377256 CASAVA_Build 17 57099379 1I16M1D TTCTCATTGT -GATTGCATGTAACCATA/AAATTCTATGGTTACAT- GAATTTATAA 3070 hom 36 het 10 0 13 3 N/A 0 0 377257 CASAVA_Build 17 57100613 1D TCTCAGGATG T/- TGTAGTAGTT 3070 hom 117 het 42 0 38 5 T 2 1 377258 CASAVA_Build 17 57110828 1D AACAAAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 56 het 45 1 30 14 T 15 14 377259 CASAVA_Build 17 57113354 4D TCTGGCTGGG GACA/---- TAGCCAAACC 3070 hom 90 het 31 0 31 1 GACA 1 0 377260 CASAVA_Build 17 57128342 2D TGTTTTATGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 43 0 29 14 T 15 13 377261 CASAVA_Build 17 57134994 1D TTGAACAGTA C/- TTCTGCTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 5 C 1 0 377262 CASAVA_Build 17 57139487 1I CTTTATCCCC -/T GGTACTTGGA 3070 hom 87 het 36 0 29 7 T 0 1 377263 CASAVA_Build 17 57140414 1D TCATACATTT A/- AAAATGCATG 3070 hom 108 het 41 0 37 5 A 5 4 377264 CASAVA_Build 17 57141506 10D ATTTTGAGGG GGTGAAGAGT/---------- AACATAAATG 3070 hom 78 het 28 0 26 3 GGTGAAGAGT 1 0 377265 CASAVA_Build 17 57161588 1I AAAAGCAGAG -/T TAAGTGAGGT 3070 hom 96 het 37 0 33 4 T 1 2 377266 CASAVA_Build 17 57166008 1D TTAATCATTG T/- AAGGGCACTT 3070 hom 96 het 36 0 33 3 T 1 0 377267 CASAVA_Build 17 57178480 3D TATTGAAATG ATA/--- ATAATGTCTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 ATA 2 1 377268 CASAVA_Build 17 57178731 1D CACAAGAGAC A/- AAAAAAAAGG 3070 hom 99 het 42 0 34 9 A 9 8 377269 CASAVA_Build 17 57182852 3D TTGAATGATT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 42 19 14 11 A 14 11 377270 CASAVA_Build 17 57190981 1D CCCTATCTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 20 0 14 6 A 12 11 377271 CASAVA_Build 17 57192032 1D TTAATTTATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 11 12 8 A 12 11 377272 CASAVA_Build 17 57214862 1D ATATTTCTCC A/- AAAAAAGACA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 A 7 6 377273 CASAVA_Build 17 57218072 1I CAGCTGGGTT -/G GGGGGGGGTA 2668 het 2668 ref 30 16 8 6 G 8 9 377274 CASAVA_Build 17 57219541 1D TAGTATATAT A/- TTTATATAAA 1317 hom 7 het 3 0 3 0 A 1 0 377275 CASAVA_Build 17 57227014 5D GGAGAATCAG AAGAA/----- AAGAAATATC 3070 het 3070 ref 28 18 9 2 AAGAA 2 1 377276 CASAVA_Build 17 57231567 2D CATAAGCAAC AG/-- AGATTCTAGG 3070 hom 108 het 43 0 37 6 AG 2 1 377277 CASAVA_Build 17 57233305 1I AAATTAAAGC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 48 25 20 3 A 8 9 377278 CASAVA_Build 17 57235242 1I TTCTATTACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 12 8 T 11 12 377279 CASAVA_Build 17 57238838 4I ATGTATGTTT ----/TTGG TTGGTTGGTT 3070 het 3070 hom 36 11 14 13 TTGG 3 4 377280 CASAVA_Build 17 57247258 1D GAAGTGCTGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 14 11 12 A 15 14 377281 CASAVA_Build 17 57248905 1D TAAAAAGGGG A/- AAAAGAAGAC 3070 het 3070 hom 30 14 12 4 A 5 4 377282 CASAVA_Build 17 57251329 2D AATTTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2861 het 1924 hom 19 9 8 2 A 16 14 377283 CASAVA_Build 17 57259236 1I ATGTAGCCAT -/A AAAAAAAATG 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 8 9 377284 CASAVA_Build 17 57262072 1D AGTTTCAATC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 956 hom 27 5 16 6 T 11 10 377285 CASAVA_Build 17 57285377 2D TATAATTCCA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 18 18 5 T 12 10 377286 CASAVA_Build 17 57285530 1D ATGTCTCTCT C/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 40 19 16 6 C 1 0 377287 CASAVA_Build 17 57291382 1D TAAAGGATTT C/- CCCCCCCAAA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 8 7 377288 CASAVA_Build 17 57316145 1D TTCCCTAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2970 hom 23 8 10 5 A 11 10 377289 CASAVA_Build 17 57326983 1D AAAGTGAGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 13 14 2 A 12 11 377290 CASAVA_Build 17 57341265 1I ATTATTTTTC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 hom 31 8 10 13 T 9 10 377291 CASAVA_Build 17 57360306 4D TCCTTTTAGA CAAG/---- CAAGCCACTG 1984 het 1984 ref 25 14 8 5 CAAG 2 1 377292 CASAVA_Build 17 57361763 2D TCGTATAATA AC/-- ACACACACTA 3070 het 3070 ref 42 19 16 9 AC 5 4 377293 CASAVA_Build 17 57374160 1D AGACTATAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 A 15 14 377294 CASAVA_Build 17 57391148 1D ACTGCCCCTC T/- TTTTTTTTTT 1655 het 1655 ref 35 24 4 7 T 12 11 377295 CASAVA_Build 17 57406694 1I ATGTACCCAT -/G AACCTAAAAG 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 G 0 1 377296 CASAVA_Build 17 57420053 1I GCCCAGTTAA -/T TTTTTTTTTT 1480 het 1480 ref 33 21 7 5 T 13 14 377297 CASAVA_Build 17 57424894 1I29M1I ATTCTTACAG -TAACAAGTAAGTAGTATGCTTATTATTAC-/TTAACAAGTAAGTAGTATGCTTATTATTACT TTTTTTTTGA 3070 hom 137 het 50 0 45 5 N/A 0 0 377298 CASAVA_Build 17 57425008 1I8M1I GCCTCCTAGG -TCAAGTGA-/TTCAAGTGAT TCTCCTGCCT 3070 hom 63 het 23 0 22 2 N/A 0 0 377299 CASAVA_Build 17 57426092 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 2734 het 2712 hom 19 9 8 2 A 11 10 377300 CASAVA_Build 17 57435335 1D TATAGAACAA T/- TTATATTCCA 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 T 3 2 377301 CASAVA_Build 17 57452375 1D GCAGCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 20 14 3 T 11 10 377302 CASAVA_Build 17 57455883 2D TCAATGTATG CC/-- CCCCAACCTC 3070 het 3070 ref 45 21 21 3 C 6 4 377303 CASAVA_Build 17 57477183 1D TAACAACATA T/- TTTTTCCATA 3070 het 3070 ref 31 19 9 3 T 6 5 377304 CASAVA_Build 17 57483779 4I AAGTTTGAAA ----/AAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 hom 37 13 17 7 AAAC 3 4 377305 CASAVA_Build 17 57488747 1I TCCAAAAAAC -/T TTTTTTTAGT 3070 het 3070 ref 34 18 10 6 T 7 8 377306 CASAVA_Build 17 57520145 1D TCTATAGGGC T/- TTTTTTTTTT 2294 het 817 hom 35 6 9 21 T 15 14 377307 CASAVA_Build 17 57520742 1I CTTGGGAATC -/T TTTTTTTTCT 3070 het 2382 hom 24 8 15 1 T 8 9 377308 CASAVA_Build 17 57539540 1I ATTCCATCTG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 10 11 377309 CASAVA_Build 17 57542380 1I AGAAGAAAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 8 9 377310 CASAVA_Build 17 57550038 1I ACTCCCTCTC -/A AAAAAAAAAA 918 het 918 ref 30 19 3 8 A 13 14 377311 CASAVA_Build 17 57553988 1I CGCCTGTAAT -/C CCAGCATTTT 2980 het 2980 ref 28 17 10 1 C 2 3 377312 CASAVA_Build 17 57557026 4I TCGCCCAGGC ----/TGAA TGAAGTGCAG 3070 het 3070 hom 28 10 12 6 TGAA 1 2 377313 CASAVA_Build 17 57569056 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 11 12 377314 CASAVA_Build 17 57575350 4D ACCTTATGAT TTTA/---- TTTTCTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 14 4 TTTA 1 0 377315 CASAVA_Build 17 57609202 1I ATCATGAACC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 11 14 10 T 11 12 377316 CASAVA_Build 17 57609780 3I ACAAATACAT ---/AAG AAGATGCCTT 3070 het 3070 ref 43 19 17 7 AAG 1 2 377317 CASAVA_Build 17 57619557 1D CCAGGCTGGT G/- GTGCAATGGT 3070 hom 45 het 20 0 16 4 G 2 1 377318 CASAVA_Build 17 57619915 21I TAAAGTGCTG ---------------------/GGATTACAGGCATGAGCTACT GCATCTGGCC 2422 het 2422 ref 20 12 5 3 GGATTACAGGCATGAGCTACT 0 1 377319 CASAVA_Build 17 57648008 1I CCCCAAAAGC -/A CCCCCTCATA 3070 het 3070 ref 49 27 13 9 A 0 1 377320 CASAVA_Build 17 57674995 2D TGAGAATGCT TC/-- TGTTAGGAAC 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 TC 1 0 377321 CASAVA_Build 17 57678498 10I ATCAGCCGGG ----------/TATGGTGGCA TATGCCTGTA 3070 het 1288 hom 15 3 8 4 TATGGTGGCA 0 1 377322 CASAVA_Build 17 57684915 2D GTGGGGGGTG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3057 hom 21 9 10 3 GT 6 5 377323 CASAVA_Build 17 57685209 4D GGACAAACAC CTCA/---- CTCATTCCAG 3070 hom 51 het 18 0 18 0 CTCA 2 1 377324 CASAVA_Build 17 57694163 5D GTCAGTCTTT GAAAG/----- GAGAGGACAG 3070 het 3070 ref 37 20 15 2 GAAAG 1 0 377325 CASAVA_Build 17 57696132 1I AGTGTTTCTC -/A AACGGTGCTC 2402 het 2402 ref 12 7 5 0 A 2 3 377326 CASAVA_Build 17 57707675 1I GGAAGAGAGC -/T AGGTCACGCT 2808 het 2808 ref 30 18 8 4 T 0 1 377327 CASAVA_Build 17 57725998 1I AGGCTAAAAA -/G TCACCTAAAA 3070 het 3070 ref 26 16 8 2 G 0 1 377328 CASAVA_Build 17 57735079 2D ATGCATATAC AT/-- ATATATATAT 700 het 25 hom 4 1 3 0 AT 6 5 377329 CASAVA_Build 17 57737528 1D ATGGGCATTT G/- GGGTTGGTTC 3070 hom 85 het 34 0 26 8 G 4 3 377330 CASAVA_Build 17 57741732 1D ACATGGCAAG A/- AAAAAAAAAA 1826 het 1826 ref 44 34 6 7 A 12 11 377331 CASAVA_Build 17 57747726 3D CTCAACTGGT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 47 2 22 23 A 17 14 377332 CASAVA_Build 17 57748784 2I AAAAAAAAAA --/AG AAAAGAAAAA 3070 het 2298 hom 32 13 11 8 AG 0 1 377333 CASAVA_Build 17 57767806 1D TCTATTTATC A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 37 15 19 4 A 9 8 377334 CASAVA_Build 17 57777764 1I TTCCTAAGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 37 16 11 10 T 12 13 377335 CASAVA_Build 17 57784842 3D8M1I CTTGAACTTC CTTTGACCTCA-/---TGACCTCAG GTGATCCACC 3070 hom 57 het 21 0 19 3 N/A 0 0 377336 CASAVA_Build 17 57785856 1I TTTGTGCTGA -/T TTTTTTAGTC 3070 hom 108 het 44 0 37 7 T 6 7 377337 CASAVA_Build 17 57787144 1D TTTTTAGCAT C/- ATAATGAAGT 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 1 0 377338 CASAVA_Build 17 57787832 1D AATAATTTAA C/- CCTACTTAAT 3070 hom 123 het 46 0 42 4 C 3 2 377339 CASAVA_Build 17 57800134 1I TCAAAAAAAT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 7 hom 24 1 19 4 A 9 10 377340 CASAVA_Build 17 57802195 1D TTAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 18 het 29 1 23 5 A 12 11 377341 CASAVA_Build 17 57820922 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTCTGT 3070 hom 30 het 13 0 11 3 T 7 6 377342 CASAVA_Build 17 57830282 1D AGCCAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 89 het 39 0 32 8 T 12 11 377343 CASAVA_Build 17 57831316 1I CACATACTTC -/T TTTTTTTTCT 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 8 9 377344 CASAVA_Build 17 57863996 4D GAGCCATGAT CACA/---- CACACCACTG 3070 hom 45 het 18 0 15 6 CA 4 2 377345 CASAVA_Build 17 57876890 1D CTGTCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 537 het 537 ref 24 15 3 6 A 13 12 377346 CASAVA_Build 17 57891848 1D TGCTCTTGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 45 het 20 0 16 4 T 10 9 377347 CASAVA_Build 17 57897150 2D GTATTAGATA AT/-- ATATAGCAGC 3070 hom 42 het 16 0 12 4 AT 3 2 377348 CASAVA_Build 17 57903963 2D TGCCTGATCT GA/-- GAGAAAACAT 1297 het 1297 ref 35 28 3 6 GA 3 2 377349 CASAVA_Build 17 57904097 1D ACTTACAAGC A/- AAAAAATAAC 2146 het 2146 ref 34 23 5 7 A 7 6 377350 CASAVA_Build 17 57938618 10D TCTTTACTGG AGTATGGGGT/---------- AGTTTGACTT 1250 het 1250 ref 39 35 3 3 AGTATGGGGT 1 0 377351 CASAVA_Build 17 57949421 2D TAAAACAAAT AA/-- GAGGTATAAA 1256 het 1256 ref 28 25 3 0 A 2 0 377352 CASAVA_Build 17 57957788 2I CTTGTCCTGG --/TA TAAATGACAG 3070 hom 60 het 25 0 21 4 TA 1 2 377353 CASAVA_Build 17 57972862 2I GCAACTAGAG --/AT TGCACCACAG 3070 hom 47 het 19 0 16 3 AT 0 1 377354 CASAVA_Build 17 57978772 16I TTTGGAAACA ----------------/TCACACTGAATCACTT TCTAACACCC 2820 het 2820 ref 56 44 7 5 TCACACTGAATCACTT 0 1 377355 CASAVA_Build 17 57978865 1I GTAAAGGGCC -/T TTTGGATCCC 2028 het 2028 ref 47 35 5 7 T 3 4 377356 CASAVA_Build 17 57983662 1D TCCTTTGGAA G/- GTGCTTTAAC 3070 het 3070 hom 31 10 19 3 G 2 1 377357 CASAVA_Build 17 57985970 1D ACCCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 276 hom 18 1 14 3 A 15 14 377358 CASAVA_Build 17 57990393 2D CAAAGCAAAC AT/-- AAAATTCAGT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 AT 1 0 377359 CASAVA_Build 17 57991644 1I TTAAAAAATT -/A AAAGTTGTCA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 A 3 4 377360 CASAVA_Build 17 58000125 2D GCTGGTTGTG GT/-- GTGGCTCATG 3070 hom 51 het 21 0 17 4 GT 2 1 377361 CASAVA_Build 17 58002517 1D TGCAGCCATC T/- TTTTTTTTTC 1747 het 1747 ref 45 37 4 5 T 10 9 377362 CASAVA_Build 17 58005617 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 330 hom 27 1 16 11 T 12 11 377363 CASAVA_Build 17 58011547 3I TCGTGGAATT ---/ATG ATGATTTTTA 3070 hom 96 het 39 0 32 7 ATG 1 2 377364 CASAVA_Build 17 58018879 4D GGCACACCGT AGTG/---- AGTGCCAGGA 3070 het 3070 hom 40 17 21 2 AGTG 2 1 377365 CASAVA_Build 17 58020158 1I GAAAATAAAA -/G GGTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 29 11 17 1 G 2 3 377366 CASAVA_Build 17 58031337 1D ACGGAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 302 hom 40 1 31 9 A 11 10 377367 CASAVA_Build 17 58039948 1I TAAAAAACTC -/A GTGAGGCAAA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 A 0 1 377368 CASAVA_Build 17 58070436 4D GACTTTGTCT TAAA/---- TAAATAAATA 3070 hom 123 het 42 0 42 2 TAAA 4 3 377369 CASAVA_Build 17 58074435 1I AAAAAAAAAA -/G AAAAAAGAAA 3070 het 945 hom 22 4 17 1 G 0 1 377370 CASAVA_Build 17 58104085 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2448 het 2427 hom 22 7 8 7 A 13 14 377371 CASAVA_Build 17 58116260 1D AAAAACCACA C/- AAAAAAAAAA 3070 hom 47 het 26 0 22 4 C 1 0 377372 CASAVA_Build 17 58121686 1D GGGGACTCTG C/- CCCCCCCGGA 3070 hom 68 het 27 0 18 11 C 8 7 377373 CASAVA_Build 17 58124841 1D ACCCCCGATC T/- TTAGGAGCTC 3070 het 3070 hom 30 9 15 6 T 3 2 377374 CASAVA_Build 17 58125759 3D GAAGCTCTTG TAA/--- TAATTCAGGC 3070 het 3070 hom 42 13 26 5 TAA 2 1 377375 CASAVA_Build 17 58130847 1D CTGGAACATA T/- CGGAAGAGTG 3070 het 3070 ref 30 16 11 4 T 1 0 377376 CASAVA_Build 17 58132061 2D TTAAACAAAA AC/-- ACACACACAC 3070 hom 5 het 21 1 17 3 AC 9 8 377377 CASAVA_Build 17 58151698 1D AAATGGTTAC T/- TTCCCCCTCC 3070 het 3070 hom 48 20 23 5 T 3 2 377378 CASAVA_Build 17 58152458 1D ATTACCCCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1817 hom 23 8 8 8 T 11 10 377379 CASAVA_Build 17 58159291 1I CTAATTTTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 T 10 11 377380 CASAVA_Build 17 58173791 8D TTCTTTTTTC TTTTTTCT/-------- TTTTTTTTTT 2505 het 2505 ref 27 11 11 9 TTTTTTCT 1 0 377381 CASAVA_Build 17 58183730 1D TTCCCTCTGC T/- TTTTTTTTTT 2103 het 1315 hom 18 8 6 4 T 13 12 377382 CASAVA_Build 17 58195706 1D TGCCACCTTC A/- AGAGCACTGT 3070 het 3070 ref 73 36 32 6 A 2 1 377383 CASAVA_Build 17 58196286 1D CTGAAAATAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 A 10 9 377384 CASAVA_Build 17 58197131 1I TACAAAAAAT -/A AAAAAAAAAT 3043 het 3043 ref 23 9 9 5 A 9 10 377385 CASAVA_Build 17 58198365 4D GCAAATTTGC CAGT/---- CAAATAATCT 3070 het 3070 ref 42 23 12 7 CAGT 1 0 377386 CASAVA_Build 17 58229011 1I AGGTATACTT -/G GGCAGGACTT 3070 hom 78 het 31 0 27 4 G 2 3 377387 CASAVA_Build 17 58232187 5D TACAGTGTTT ATTTC/----- ATTTCATTTT 3070 hom 90 het 33 0 31 3 ATTTC 2 1 377388 CASAVA_Build 17 58237002 1D CCTCAAAAAT A/- AAAAAAAATA 2100 hom 15 het 8 0 6 2 A 9 8 377389 CASAVA_Build 17 58263048 2D TACAGTATAT TA/-- TATATATATA 1960 het 598 hom 6 2 4 0 TA 8 7 377390 CASAVA_Build 17 58266693 1D CCCTATCAAG A/- AAAAAAAAAA 2232 het 2232 ref 27 11 9 7 A 13 12 377391 CASAVA_Build 17 58269704 3D CCATTATATA ATG/--- ATAAAAGGGT 3070 het 3070 hom 26 11 14 2 ATG 1 0 377392 CASAVA_Build 17 58274903 1D GGTGGGAGGA G/- GGGGGAGGAG 3070 hom 78 het 32 0 26 7 G 6 5 377393 CASAVA_Build 17 58285831 1I AATTTGGGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2533 hom 24 10 11 3 T 12 13 377394 CASAVA_Build 17 58288094 124D GGTTCAGCAA ACAAAATTTCCCCCCGCCCTTTTCATACAGCACCTTCTATATAACATCAGGGGTAGAAGAGACTGTAGCAGTGATCTCATCCATAGCCTCTTTTACAGTTGAAGAAAATGAAGTACAGAGAGGG/---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- TGAATGGTTT 1882 het 1882 ref 16 25 6 9 ACAAAATTTCCCCCCGCCCTTTTCATACAGCACCTTCTATATAACATCAGGGGTAGAAGAGACTGTAGCAGTGATCTCATCCATAGCCTCTTTTACAGTTGAAGAAAATGAAGTACAGAGAGGG 1 0 377395 CASAVA_Build 17 58289976 1I AAAAAAAAAA -/T AAAATAAGAA 3070 het 2270 hom 36 14 20 2 T 0 1 377396 CASAVA_Build 17 58303996 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1376 het 1352 hom 13 6 3 4 T 15 14 377397 CASAVA_Build 17 58325070 1D AGGTAGGGAT G/- GGGGAGGCGG 3070 het 1155 hom 21 5 11 5 G 5 4 377398 CASAVA_Build 17 58326041 10D GTCTCTAAAT TAATATAATA/---------- TAATATAATA 1807 het 1489 hom 8 3 5 0 TAATA 6 4 377399 CASAVA_Build 17 58329965 3I CACAAATTAT ---/AGA AGGTTTGGGC 3070 het 3070 ref 42 21 17 4 AGA 0 1 377400 CASAVA_Build 17 58332821 1D CAAATGTGTG T/- GGCAGGCACT 3070 het 3070 ref 43 18 17 10 T 1 0 377401 CASAVA_Build 17 58333541 1D CATCTCAATG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2999 hom 34 11 15 8 A 12 11 377402 CASAVA_Build 17 58335630 1D CATGGCCATC T/- TTTGTTTGAG 3070 het 3070 ref 50 23 21 8 T 4 3 377403 CASAVA_Build 17 58335779 1D CCCTGTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 16 14 9 T 11 10 377404 CASAVA_Build 17 58340189 1D CCTCAAACCC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 32 13 11 8 T 10 9 377405 CASAVA_Build 17 58341856 1D AACATTAAAC T/- TTTTCTATCC 3070 het 3070 ref 47 23 20 4 T 5 4 377406 CASAVA_Build 17 58361996 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 985 het 985 ref 18 9 4 5 T 15 14 377407 CASAVA_Build 17 58366274 1D AAATTTAAAT G/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 29 13 13 3 G 1 0 377408 CASAVA_Build 17 58401628 4I TCTTAAGTGA ----/CTCT GTATGAATTA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 CT 0 2 377409 CASAVA_Build 17 58402264 1D GTTTAAAATG A/- AAAAAAAAAT 1797 het 1797 ref 49 39 4 6 A 10 9 377410 CASAVA_Build 17 58430650 1D AAACAAATTA C/- TTAGAGACTT 3070 het 3070 ref 31 14 11 6 C 1 0 377411 CASAVA_Build 17 58443651 1I CTTAGATATG -/C CCCATATATT 3070 het 3070 ref 48 19 18 11 C 3 4 377412 CASAVA_Build 17 58446837 1D AAATTTTCTT A/- AAAAAAAACC 3070 hom 60 het 22 0 21 2 A 9 8 377413 CASAVA_Build 17 58450305 4D ATTTTTAATG TTAT/---- TTATTTATTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 TTAT 5 4 377414 CASAVA_Build 17 58450444 1I CTGAGTACCT -/G GGGATTACAG 3070 het 3070 hom 27 11 13 3 G 3 4 377415 CASAVA_Build 17 58450915 2D ATTGGATGTA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 72 het 32 0 24 10 TG 7 6 377416 CASAVA_Build 17 58460547 2I GAAAGTCATA --/AC ATTATTCTGG 3070 hom 75 het 26 0 26 0 AC 0 1 377417 CASAVA_Build 17 58462211 5D AACCAACCAG CAGAT/----- CATCCCAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CAGAT 1 0 377418 CASAVA_Build 17 58467322 1D GTCATAAAGA T/- TTCTCCTGTG 3070 het 3070 ref 26 15 8 4 T 3 2 377419 CASAVA_Build 17 58486507 1I AAAAAACAGC -/A AGTATTCTCT 3070 het 3070 ref 36 15 14 7 A 1 2 377420 CASAVA_Build 17 58487323 1D ATTTTAATTA T/- TTTTTTTAAA 1416 het 1416 ref 22 14 3 6 T 8 7 377421 CASAVA_Build 17 58490705 1I CAAAGCTTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 19 6 T 11 12 377422 CASAVA_Build 17 58491714 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 33 14 16 3 A 10 9 377423 CASAVA_Build 17 58528671 1D AAAAAATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 13 17 10 A 15 14 377424 CASAVA_Build 17 58530587 1I TCTTGACACT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 10 14 8 A 10 11 377425 CASAVA_Build 17 58533508 1D GATTGCAGGA T/- TTTTTTTTTT 1403 het 1403 ref 10 5 3 3 T 13 12 377426 CASAVA_Build 17 58562626 1D ATTACTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 17 7 6 T 13 12 377427 CASAVA_Build 17 58581199 1D ACTTTTTACA G/- GGTCTTTTAG 3070 het 3070 ref 30 18 9 5 G 3 2 377428 CASAVA_Build 17 58596369 1I GACCCTATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2693 hom 30 9 15 6 A 10 11 377429 CASAVA_Build 17 58597403 6D TAGATAGCAC AGAGAG/------ AGAGAGAGAG 3070 het 3070 ref 38 19 13 9 AG 10 7 377430 CASAVA_Build 17 58604896 1D ACATACATAC A/- CAAAATAAAT 3070 het 3070 hom 34 15 16 4 A 1 0 377431 CASAVA_Build 17 58614166 1D TAATAGGACC T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 51 30 17 4 T 8 7 377432 CASAVA_Build 17 58621440 1D CCTAGAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 26 14 9 3 A 9 8 377433 CASAVA_Build 17 58632919 1D GACTGTTGGA G/- GGCTCATTCA 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 G 3 2 377434 CASAVA_Build 17 58635378 1I CCAAGGAGGC -/A AAAAAAAAAA 1455 het 1455 ref 38 26 4 8 A 13 14 377435 CASAVA_Build 17 58651797 1D AATCAGTCTC A/- AAAAAAAAAA 971 het 461 hom 5 1 2 3 A 17 16 377436 CASAVA_Build 17 58654680 2D ATATATAGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 2530 hom 20 8 12 0 TA 8 7 377437 CASAVA_Build 17 58660649 3D TGGTCCTGGG TTT/--- TTTTTTTTTT 1816 het 1410 hom 20 7 6 8 T 16 13 377438 CASAVA_Build 17 58676086 3D TAAACCTCTT CTC/--- CTGTGTAAAT 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 CTC 1 0 377439 CASAVA_Build 17 58677337 1I TGGCCAGAAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 13 10 10 T 10 11 377440 CASAVA_Build 17 58681169 1D GATGAAATCT A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 32 15 17 0 A 8 7 377441 CASAVA_Build 17 58696899 1D TACACTTTCT G/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 29 14 9 8 G 1 0 377442 CASAVA_Build 17 58699358 1D AGGTTGAGCA T/- CCCTAATCTG 3070 het 3070 ref 44 28 12 5 T 1 0 377443 CASAVA_Build 17 58702182 11D GAAGTTGATT CCATGTCTTTG/----------- CTGTTGTGAA 3070 het 3070 ref 59 32 23 8 CCATGTCTTTG 1 0 377444 CASAVA_Build 17 58702530 1D GCTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1499 het 958 hom 18 6 7 5 T 15 14 377445 CASAVA_Build 17 58702908 5D AATTAAATTT CTTAA/----- CTTAAAGTTC 3070 het 2810 hom 19 6 12 2 CTTAA 2 1 377446 CASAVA_Build 17 58704082 1I TTATACTCAT -/A AAAAAAATTA 3070 het 3070 ref 33 17 12 4 A 7 8 377447 CASAVA_Build 17 58708615 1I CTCTGTCTTA -/C AGTTATCATT 3070 het 3070 ref 42 24 15 3 C 0 1 377448 CASAVA_Build 17 58708892 1D TTAATTCAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 11 10 377449 CASAVA_Build 17 58710518 2D67M1D TGCAAAAGGT CACAGAGTTGTTATGTCTGAGCATATAACCTACCCTGATATAATACCTGTGGTTAAATGATCTTAGGGGC/--CAGAGTTGTTATGTCTGAGCATATAACCTACCCTGATATAATACCTGTGGTTAAATGATCTTAGGGG- TATAAATTAG 3070 het 3070 ref 34 27 16 16 N/A 0 0 377450 CASAVA_Build 17 58716375 4D TTATCCTATC TATT/---- CCTTGTTCTC 3070 het 3070 ref 37 17 14 7 TATT 1 0 377451 CASAVA_Build 17 58717494 1I AGTTGACAGA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 T 8 9 377452 CASAVA_Build 17 58721232 3D TACTTTTCCC CTT/--- CTTCTGCTAG 3070 het 3070 hom 49 19 27 4 CTT 2 1 377453 CASAVA_Build 17 58726278 11D TTCTGGGCTG TACAGACACCA/----------- TTTTTGGTGT 3070 het 3070 ref 56 37 15 5 TACAGACACCA 1 0 377454 CASAVA_Build 17 58741064 1D CCTTTGGGGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 A 10 9 377455 CASAVA_Build 17 58753317 1I CTCTTCTTTA -/G GAACAGTTAG 2872 het 2872 ref 19 12 6 1 G 1 2 377456 CASAVA_Build 17 58773765 1D GCTACTCGGG A/- GGCTGAGGCA 3070 het 193 hom 14 1 11 2 A 1 0 377457 CASAVA_Build 17 58796475 2D TTTGTTTCCA TC/-- TCTCATGATC 3070 het 3070 hom 54 27 26 4 TC 3 2 377458 CASAVA_Build 17 58831904 1D ACCTGACTAA T/- TTTTTTTTTT 2411 het 1015 hom 13 5 7 1 T 14 13 377459 CASAVA_Build 17 58846929 1I AAATCAAGTC -/T TAAGTACAAT 3070 het 3070 hom 64 24 36 4 T 1 2 377460 CASAVA_Build 17 58902229 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1151 het 749 hom 8 2 3 3 A 11 12 377461 CASAVA_Build 17 58916223 1I GGTAGGGACA -/G GGGCAGGGTA 3070 het 1462 hom 30 7 10 13 G 3 4 377462 CASAVA_Build 17 58929187 2I AGCTCCATGA --/CT CTCTGCTCGG 3070 het 3070 hom 33 14 15 4 CT 2 3 377463 CASAVA_Build 17 58933384 1D AGTAGAGGCC A/- AAGCACGGTG 3070 hom 51 het 21 0 16 5 A 3 2 377464 CASAVA_Build 17 58933670 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 6 hom 21 1 19 1 A 11 10 377465 CASAVA_Build 17 58934754 1I ATTTTCCCCC -/T AGCAATGCAC 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 0 1 377466 CASAVA_Build 17 58947868 1D ACAACCTCCA C/- CTCCTGGGAT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 C 2 1 377467 CASAVA_Build 17 58967744 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 1921 het 1645 hom 11 6 4 1 A 9 10 377468 CASAVA_Build 17 58968849 2D ATCTTTATTG TA/-- TTTTTACAAC 3070 het 3070 hom 18 7 11 0 TA 1 0 377469 CASAVA_Build 17 58997464 2D ACTCTGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 2054 het 1005 hom 14 5 5 6 A 13 11 377470 CASAVA_Build 17 58998056 4D TTTAAGCTTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 2023 het 2023 ref 25 11 6 8 TTTC 4 3 377471 CASAVA_Build 17 59014622 1D TAGCCGGGCC G/- GGGGGTGGCA 3070 hom 90 het 34 0 29 5 G 6 5 377472 CASAVA_Build 17 59017855 1D ACCCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 982 het 982 ref 19 11 3 5 A 13 12 377473 CASAVA_Build 17 59026643 2I CCTGGAAAAC --/AT ACACAGAGAG 3070 hom 108 het 42 0 37 5 AT 0 1 377474 CASAVA_Build 17 59060673 4D AAAAAAACAA AAAC/---- AAAACCTCAA 3070 het 3070 hom 43 20 17 6 AAAC 1 0 377475 CASAVA_Build 17 59076863 10D GAAGCTAGAA ACAGCATGTC/---------- ACAGCATAGC 3070 het 3070 ref 47 29 16 5 ACAGCATGTC 1 0 377476 CASAVA_Build 17 59082521 1D GCCGTTATCA T/- TGCCACTGCA 2917 het 2150 hom 20 6 10 4 T 2 1 377477 CASAVA_Build 17 59087533 1D AGTCTCTACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2045 hom 28 10 12 6 A 15 14 377478 CASAVA_Build 17 59089827 1D ATTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1315 het 355 hom 21 5 3 13 T 17 16 377479 CASAVA_Build 17 59093945 1I AGATGGGGTT -/G GGGCGGGGGG 2129 het 459 hom 10 2 6 2 G 3 4 377480 CASAVA_Build 17 59103376 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 990 het 990 ref 19 12 5 2 A 18 17 377481 CASAVA_Build 17 59104500 1I AGAAACAAAC -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 hom 38 17 19 2 A 8 9 377482 CASAVA_Build 17 59105172 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1062 het 1062 ref 35 25 5 5 A 15 14 377483 CASAVA_Build 17 59106358 1D ATTGAGAAAG A/- AAAAAAGTTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 3 A 7 6 377484 CASAVA_Build 17 59113689 1D CAGAATTCAG T/- TTTTTTGTGG 3070 het 3070 ref 48 23 21 5 T 7 6 377485 CASAVA_Build 17 59114637 1D TTTGACTCCC A/- GTGAGGACAG 3070 het 3070 hom 34 14 16 5 A 1 0 377486 CASAVA_Build 17 59127937 1I GATCCAGGCC -/T GGGGCACCAT 3070 het 3070 hom 35 12 13 10 T 0 1 377487 CASAVA_Build 17 59135064 6I AACCAGAACT ------/AGAACC AGAACCAGAA 3070 het 3070 hom 41 15 17 9 AGAACC 2 3 377488 CASAVA_Build 17 59135713 1D TGTAGCGGGT G/- GGGGGGGGGG 3070 hom 43 het 16 0 15 1 G 12 11 377489 CASAVA_Build 17 59159102 1I ACAACCTCAC -/G GGGGGGTCAT 3070 het 3070 ref 29 15 12 2 G 6 7 377490 CASAVA_Build 17 59160034 3D GAAATTTGTC ATT/--- ATATGGTTTT 2607 het 2607 ref 16 8 6 3 ATT 1 0 377491 CASAVA_Build 17 59167930 1D TTCCCCCCAC G/- CCCCCCCCAC 1827 het 443 hom 21 4 8 10 G 1 0 377492 CASAVA_Build 17 59168495 1D TACAATACTG T/- TAAGTGCTCA 3070 hom 105 het 40 0 35 5 T 2 1 377493 CASAVA_Build 17 59172218 5I GGCAGAGAGG -----/TTAGT TTAGTTCCCT 3070 het 3070 ref 39 17 16 6 TTAGT 1 2 377494 CASAVA_Build 17 59173413 1D CCTCAGTATC T/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 ref 30 10 10 10 T 9 8 377495 CASAVA_Build 17 59174751 2I GTATAACTCT --/TC TTTTTTTTTT 2742 hom 43 het 20 0 12 8 TC 0 1 377496 CASAVA_Build 17 59176127 5I ATGGAGTCTT -----/AACTC AAGAGGTGGA 3070 hom 104 het 39 0 34 5 AACTC 0 1 377497 CASAVA_Build 17 59182890 7I TTCTTCTTTA -------/TAGTGTT TAGTGTTATC 3070 hom 105 het 45 0 33 12 TAGTGTT 1 2 377498 CASAVA_Build 17 59188290 1D CCATCTGTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1153 hom 23 4 13 6 A 15 14 377499 CASAVA_Build 17 59188469 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 2253 het 1779 hom 31 9 15 8 A 15 14 377500 CASAVA_Build 17 59192789 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 649 hom 33 2 23 8 A 13 14 377501 CASAVA_Build 17 59212935 2D ACCCCGTCTC TA/-- CTAAAAATAC 1969 hom 10 het 5 0 4 1 TA 1 0 377502 CASAVA_Build 17 59215873 1I TAAAAAAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 37 12 21 4 T 11 12 377503 CASAVA_Build 17 59216629 1D AGATGTGAGA G/- GGGGGGGTCT 3070 hom 9 het 20 1 17 4 G 8 7 377504 CASAVA_Build 17 59226028 1D ACTCCATCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 16 hom 17 1 10 6 A 17 16 377505 CASAVA_Build 17 59226616 1D GCTAATTTTT A/- GAAAATATTT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 A 1 0 377506 CASAVA_Build 17 59228614 1D TTCCTGTGTA T/- TGTAGAATGT 3070 het 3070 ref 38 18 15 6 T 2 1 377507 CASAVA_Build 17 59231399 2D GTTCTTCTGA AT/-- ATTGCTATTA 3070 het 3070 ref 55 29 22 4 AT 2 1 377508 CASAVA_Build 17 59231991 26D CTTTCTTTCT CTTTCTTTCTTTTCTTTCCTTCCTTC/-------------------------- CTTTCTTTCT 3070 hom 36 het 21 0 12 10 CTTTCTTTCTTTTCTTTCCTTCCTTC 2 1 377509 CASAVA_Build 17 59232088 4I TTTCTCTTTC ----/CTTT CTTTTTTTCC 3070 hom 48 het 20 0 17 3 CTTT 1 2 377510 CASAVA_Build 17 59234003 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 161 hom 16 1 13 2 A 15 16 377511 CASAVA_Build 17 59237334 1I CATTGAACAA -/T TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 13 15 2 T 8 9 377512 CASAVA_Build 17 59242946 1I ATGCAGGTAG -/A AAATATAATG 3070 hom 126 het 50 0 42 8 A 3 4 377513 CASAVA_Build 17 59250452 12I TTGGTACATA ------------/TTAAGCTGGGAC TTAAGAATAG 3070 hom 66 het 29 0 23 6 TTAAGCTGGGAC 0 1 377514 CASAVA_Build 17 59251796 19I AAGGAGAATC -------------------/GCTTGAACCTGGAAGACGG AGGCTGCAGT 3070 hom 36 het 14 0 13 1 GCTTGAACCTGGAAGACGG 0 1 377515 CASAVA_Build 17 59253923 2D TGTTTATCAC AT/-- ATGAGGGATT 3070 het 3070 ref 53 30 21 4 AT 2 1 377516 CASAVA_Build 17 59258070 14D GCACCAGATT CCACTTCCAGTTTC/-------------- CCACTTCCAG 3070 hom 51 het 25 0 16 13 CCACTTCCAGTTTC 2 1 377517 CASAVA_Build 17 59258198 1I TGCAGCTAAC -/G TACTTCCGCT 3070 hom 93 het 36 0 30 6 G 0 1 377518 CASAVA_Build 17 59261788 1D TTGATGTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 224 hom 30 1 14 16 T 12 11 377519 CASAVA_Build 17 59266827 1D AGTCCCAGCC T/- TTTTTTTTTT 1828 het 1828 ref 24 6 6 12 T 12 11 377520 CASAVA_Build 17 59276591 1I TCTCTCTCAA -/T TTTATCTTTT 3070 hom 75 het 29 0 26 3 T 3 4 377521 CASAVA_Build 17 59277738 1D TTTTTACCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 53 het 36 1 26 9 T 13 12 377522 CASAVA_Build 17 59280346 1I ATCAGGAAAA -/T CCGCTCTCCG 1635 hom 21 het 11 0 6 5 T 0 1 377523 CASAVA_Build 17 59283366 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1410 het 17 hom 9 1 6 3 A 19 18 377524 CASAVA_Build 17 59288694 1D TTTTCATTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 888 hom 24 2 18 4 T 13 12 377525 CASAVA_Build 17 59297178 4D GGAAAGCAAG ACAA/---- ACAAGTATGT 3070 hom 57 het 23 0 19 4 ACAA 2 1 377526 CASAVA_Build 17 59300086 6D TCTGCCCTGT GTGGTG/------ GTGCACGCTT 3070 hom 42 het 17 0 15 4 GTG 3 1 377527 CASAVA_Build 17 59301116 1I AGGCGCTGGA -/G CATTGTCATT 3070 het 1463 hom 20 3 14 3 G 0 1 377528 CASAVA_Build 17 59306507 4D CTTCTTTCTT TTTC/---- TTTCTTTCTT 3070 hom 24 het 18 0 9 10 TTTC 5 4 377529 CASAVA_Build 17 59312697 1I TTTTTTTTTT -/C TCTCTCTCTC 2594 het 486 hom 7 1 6 0 C 0 1 377530 CASAVA_Build 17 59313460 3I CTTTTGCTGA ---/CTC CTCCTGGGCT 3070 hom 30 het 12 0 11 1 CTC 1 2 377531 CASAVA_Build 17 59316847 1I AGGGGGTGAA -/G GTAGGGAGGG 3070 hom 30 het 11 0 10 1 G 1 2 377532 CASAVA_Build 17 59329925 1I TCTTCCCCCC -/T GAGTTTAAGA 3070 hom 30 het 12 0 11 1 T 0 1 377533 CASAVA_Build 17 59342689 1I GTCCTTGAGA -/C CCCCTATCGA 1074 het 1074 ref 41 32 3 6 C 4 5 377534 CASAVA_Build 17 59355534 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 410 hom 15 1 10 4 A 10 11 377535 CASAVA_Build 17 59357553 1D ACAAACTCAA T/- TTTTTTTTTT 1495 het 1495 ref 38 22 4 12 T 15 14 377536 CASAVA_Build 17 59370173 2I TGTAGATGTG --/CA CACACACACA 3070 het 301 hom 62 1 47 14 CA 6 7 377537 CASAVA_Build 17 59376392 1I TACAACGAGA -/G GGACCGGGGT 3070 hom 91 het 36 0 24 12 G 2 3 377538 CASAVA_Build 17 59383291 1D CTTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 1376 het 1376 ref 31 20 5 6 T 12 11 377539 CASAVA_Build 17 59398060 2D TGTGTGAGAA TG/-- TGTGTGTTTC 3070 hom 123 het 47 0 38 10 TG 4 3 377540 CASAVA_Build 17 59419965 1D GCCGCCAGCA C/- CCCCCACCCC 1838 het 1381 hom 19 7 9 3 C 6 5 377541 CASAVA_Build 17 59423922 2I AGGAGCCATG --/GT GTGTCTCCTT 3070 hom 93 het 36 0 31 5 GT 2 3 377542 CASAVA_Build 17 59430442 1I TCCAGGAAGG -/T TAGGCACCCT 3070 het 3070 hom 41 15 21 5 T 1 2 377543 CASAVA_Build 17 59440797 1I GCATGCTCTC -/T GACCTGCTTC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 T 0 1 377544 CASAVA_Build 17 59452568 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 45 het 21 0 12 9 T 13 12 377545 CASAVA_Build 17 59456591 1I CCCCTTCAGA -/C CCCCCCCTCA 3070 hom 60 het 23 0 20 3 C 7 8 377546 CASAVA_Build 17 59460508 1D TATTCAGTTA T/- TTTTTTTGAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 8 7 377547 CASAVA_Build 17 59460698 2D GTATTTATTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 19 0 16 3 A 14 12 377548 CASAVA_Build 17 59461011 1D GCTGTCTTAA T/- TATAATATTA 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 2 1 377549 CASAVA_Build 17 59479906 2I CCTAGGTCAC --/CA ACAAGTAGTT 3070 het 3070 ref 33 18 10 5 CA 0 1 377550 CASAVA_Build 17 59483630 1D CCAACCAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 316 hom 37 1 30 7 A 12 11 377551 CASAVA_Build 17 59484122 3I CAACCCCAGG ---/CCT CCTCCTCCAA 3070 hom 105 het 41 0 34 7 CCT 2 3 377552 CASAVA_Build 17 59488454 3D GACTTTTTTT TTC/--- TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 18 0 13 8 TTC 1 0 377553 CASAVA_Build 17 59507697 1D GGGCATCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 365 hom 24 2 14 8 T 15 14 377554 CASAVA_Build 17 59513943 2I AGAACTGTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 28 10 9 T 10 12 377555 CASAVA_Build 17 59515623 1D ATCAGTAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 A 10 9 377556 CASAVA_Build 17 59568309 1D AGAGGCACAA G/- GAGGATCTGA 3070 het 3070 ref 33 17 10 7 G 2 1 377557 CASAVA_Build 17 59572055 1I GGTTACAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 17 18 10 T 14 15 377558 CASAVA_Build 17 59576122 2D ACTGTCACAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 75 het 28 0 26 3 AC 7 6 377559 CASAVA_Build 17 59585438 1D ACAGCCCAAG T/- TAACAGGGAA 3070 het 3070 ref 31 14 12 5 T 2 1 377560 CASAVA_Build 17 59585779 4D TGGAATTTAA ACAG/---- ACCACTGACC 3070 het 3070 ref 33 17 12 6 ACAG 1 0 377561 CASAVA_Build 17 59605462 3I GGGGAAGGTG ---/GGC TCTACCTACT 3070 hom 126 het 44 0 39 5 GGC 0 1 377562 CASAVA_Build 17 59610862 1I AGTCTCATTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 88 het 36 0 28 8 A 11 12 377563 CASAVA_Build 17 59612203 4I AACATTATTT ----/TTAA AAAACAGTTT 3070 hom 63 het 24 0 22 2 TTAA 0 1 377564 CASAVA_Build 17 59613903 2D CATAATAAAC TT/-- ATTTTTATTG 3070 hom 108 het 38 0 37 1 T 2 0 377565 CASAVA_Build 17 59617386 1I TGTAGAAAAG -/T TTTTATATCA 3070 hom 123 het 44 0 39 5 T 4 5 377566 CASAVA_Build 17 59617918 1I ACCTTGTCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 34 15 15 4 A 9 10 377567 CASAVA_Build 17 59619571 1D TAAGCGGACT C/- CCTGAGAAAA 3070 hom 60 het 26 0 21 5 C 3 2 377568 CASAVA_Build 17 59619908 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 870 het 486 hom 9 1 3 5 A 17 16 377569 CASAVA_Build 17 59620208 3I TCCAAAGATG ---/TCA TCTTTCATTC 3070 hom 132 het 50 0 45 5 TCA 0 1 377570 CASAVA_Build 17 59625623 1D TACCGCAGAA T/- CACCACACAT 3070 het 3070 ref 46 23 18 6 T 1 0 377571 CASAVA_Build 17 59630350 1D TTTTTTTGAG A/- TGGAGTCTCG 3070 het 3070 hom 22 8 13 1 A 1 0 377572 CASAVA_Build 17 59633192 2D GGTAAAAATG CA/-- CAAAATAGCA 3070 het 3070 ref 43 21 20 2 CA 2 1 377573 CASAVA_Build 17 59639314 6D AGCTTTACTG TTTTGT/------ TTTTGTTTTT 3070 het 3070 ref 33 12 11 14 TTTTGT 4 3 377574 CASAVA_Build 17 59651683 1I AGCAAAAAAA -/C ATATGAAAAA 3070 hom 51 het 18 0 18 0 C 0 1 377575 CASAVA_Build 17 59654450 1D TGAATCTGGC T/- TTTTTTTTTT 2198 het 1126 hom 34 9 7 18 T 17 16 377576 CASAVA_Build 17 59655686 3D TTTCCCATTA GTT/--- GTTAGGTTCC 3070 het 2314 hom 37 8 15 15 GTT 2 1 377577 CASAVA_Build 17 59655703 1I GGTTCCCAGG -/C CCCCTACTCA 3070 het 324 hom 31 2 15 14 C 4 5 377578 CASAVA_Build 17 59656795 10D TTTTCTTTTC TTTTCTTTTT/---------- TTTTGTTTGT 3070 het 3070 ref 39 18 16 8 TTTTCTTTTT 1 0 377579 CASAVA_Build 17 59676890 1I GGAGCCCCCA -/G GCACAACAGA 3070 hom 111 het 44 0 37 7 G 1 2 377580 CASAVA_Build 17 59680642 1I TTTTCAATTG -/T TATTTTTTGA 3070 het 3070 ref 33 15 14 4 T 1 2 377581 CASAVA_Build 17 59684426 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2856 het 16 hom 26 1 9 17 T 14 13 377582 CASAVA_Build 17 59689856 1D GAAGAGAGAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 90 hom 17 1 11 5 T 15 14 377583 CASAVA_Build 17 59691563 1I TGCCTGGCCC -/A AAAAAGCACG 3070 hom 141 het 54 0 48 7 A 5 6 377584 CASAVA_Build 17 59709212 9D17M1D GTTTCTGTTC TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA/---------TTTTTTTTTTTTTTGAG- ACAGAATCTG 2292 het 751 hom 21 4 10 10 N/A 0 0 377585 CASAVA_Build 17 59709295 1D CCAGCTCACT G/- CAGCCTCCAC 3070 het 1806 hom 21 7 11 3 G 1 0 377586 CASAVA_Build 17 59710295 19D AAAAAAAAGT AAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAA 1147 het 1147 ref 15 10 4 5 A 33 14 377587 CASAVA_Build 17 59711097 1D TATTTTAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 38 15 13 10 T 11 10 377588 CASAVA_Build 17 59713281 1D ACTCTTAGAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 17 0 15 2 A 13 12 377589 CASAVA_Build 17 59723405 1D CTGGTGGGAG A/- GGGGGGGGAA 3070 hom 60 het 21 0 20 1 A 1 0 377590 CASAVA_Build 17 59730971 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2886 hom 31 het 14 0 11 3 A 17 16 377591 CASAVA_Build 17 59746724 4D TGGCTTTCAA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 87 het 36 0 30 7 AAAC 4 3 377592 CASAVA_Build 17 59752687 1D TCATCTCTGC A/- AAAAAAAAAT 2486 hom 32 het 13 0 10 3 A 10 9 377593 CASAVA_Build 17 59753819 1I TGTTTTTTGT -/C TTTTTTTGAG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 C 0 1 377594 CASAVA_Build 17 59761845 1I CTGTTGATAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1566 hom 34 4 22 8 T 10 11 377595 CASAVA_Build 17 59763458 2D CTGGAACCTC TT/-- TCCCAACAGC 3070 hom 108 het 41 0 36 7 T 3 1 377596 CASAVA_Build 17 59764061 1I CCTGGCCAAC -/A ATGGTGAAAC 3070 hom 66 het 26 0 23 3 A 1 2 377597 CASAVA_Build 17 59766214 1D AGTGGGGTGC T/- GCCAAACTAT 3070 hom 93 het 34 0 31 3 T 1 0 377598 CASAVA_Build 17 59767973 4D AGAAAAGAAA GAAG/---- GAAGGAAGGA 3070 hom 51 het 23 0 18 6 GAAG 3 2 377599 CASAVA_Build 17 59768749 1D CAAGAGTGGG T/- TTCTACGATG 3070 hom 99 het 38 0 34 5 T 3 2 377600 CASAVA_Build 17 59788472 1D TTCCACCTGG A/- AGCCCGGCCA 3070 hom 86 het 32 0 27 5 A 2 1 377601 CASAVA_Build 17 59807211 1D AAATAAGTAT A/- AAAAAAGAGA 3070 hom 72 het 26 0 25 1 A 7 6 377602 CASAVA_Build 17 59814938 2D AGGCAGTGGG AA/-- AGAGTCGCTC 3070 hom 78 het 32 0 26 6 A 3 1 377603 CASAVA_Build 17 59834593 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2011 het 98 hom 10 1 6 3 A 14 13 377604 CASAVA_Build 17 59845871 1I ACGCTTTTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 140 hom 25 1 20 4 C 0 1 377605 CASAVA_Build 17 59846115 1D CACCTGGCCA C/- CCCCAACACC 3070 hom 78 het 31 0 25 6 C 5 4 377606 CASAVA_Build 17 59848888 1I CCCAGCTACT -/A GGGGGGCTGA 3070 het 3070 ref 20 11 8 1 A 0 1 377607 CASAVA_Build 17 59849175 1I AGATTTGGTT -/A AAAGTCAGGC 3070 hom 129 het 49 0 43 6 A 3 4 377608 CASAVA_Build 17 59857503 1D GCCAAATCCA T/- TTTTTTTTTT 2419 het 1065 hom 24 8 8 8 T 19 18 377609 CASAVA_Build 17 59891159 1D TCCTTCTTAT A/- AAAAGTCCAG 3070 hom 66 het 25 0 22 4 A 5 4 377610 CASAVA_Build 17 59892372 1I CATGATTTTG -/T TTTTTTTTTC 1310 het 1310 ref 61 50 3 8 T 9 10 377611 CASAVA_Build 17 59903425 1I AAATTAAAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 28 0 23 5 A 11 12 377612 CASAVA_Build 17 59904860 3D GAAGAACCGC ATA/--- ATAACCTCAG 3070 hom 93 het 34 0 32 2 ATA 2 1 377613 CASAVA_Build 17 59908546 4I TACTATGTCT ----/ACTC ACTCACTAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 ACTC 1 2 377614 CASAVA_Build 17 59909491 1I AAACTCATTT -/A AACTCACCTG 3070 hom 69 het 29 0 23 6 A 2 3 377615 CASAVA_Build 17 59912941 1I AAGGTAACAC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 30 0 22 8 T 13 14 377616 CASAVA_Build 17 59926115 1D AAAAAAAAAA C/- CAAACAAAAA 3070 het 3 hom 34 1 25 8 C 2 1 377617 CASAVA_Build 17 59931573 6I TCTCTCTCTC ------/TCTCCT TCTCAACAGC 3070 hom 92 het 35 0 31 4 TCTCCT 0 1 377618 CASAVA_Build 17 59966688 1D GACTCCTACC A/- AAAAAAAAAG 1718 het 1718 ref 32 23 4 5 A 10 9 377619 CASAVA_Build 17 59971025 1D ACATCAATGT A/- AAAAAAAACT 3070 hom 102 het 37 0 35 3 A 9 8 377620 CASAVA_Build 17 59987378 1I CCATCTCTAC -/A AAAAAAAAAA 2815 het 218 hom 16 1 10 5 A 13 14 377621 CASAVA_Build 17 59992193 1I ACATGAAGGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 537 hom 37 3 29 5 A 11 12 377622 CASAVA_Build 17 60003693 1I CATGCACACG -/T TATGTTTATT 2515 het 2515 ref 20 8 7 5 T 1 2 377623 CASAVA_Build 17 60009483 1I TTGGCCAATA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 527 hom 25 2 18 5 T 13 14 377624 CASAVA_Build 17 60022335 1I TAAGTACAAG -/A AAAGATGTTC 3070 hom 96 het 37 0 33 4 A 3 4 377625 CASAVA_Build 17 60028508 2D TATGTGTGTG TA/-- TATATATATA 3070 hom 24 het 11 0 9 2 TA 7 6 377626 CASAVA_Build 17 60038693 2D AAGCTCATAC TT/-- TTATAAACAC 3070 hom 102 het 40 0 35 6 T 4 2 377627 CASAVA_Build 17 60039090 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 14 het 13 0 11 2 A 15 14 377628 CASAVA_Build 17 60039340 1I ACCAATTCTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 75 het 30 0 26 4 A 9 10 377629 CASAVA_Build 17 60053513 1D GTATTCCCCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 32 0 23 9 A 12 11 377630 CASAVA_Build 17 60063367 1I TCAAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 832 hom 27 3 22 2 A 13 14 377631 CASAVA_Build 17 60063710 1I ATCTAAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 189 hom 23 1 12 10 T 15 16 377632 CASAVA_Build 17 60071187 2D AAAAAAAAAA AG/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1078 hom 21 5 12 6 AG 1 0 377633 CASAVA_Build 17 60077796 2I TATTTTTGTG --/TA TATATATATA 1670 het 1670 ref 13 6 4 3 TA 5 6 377634 CASAVA_Build 17 60080053 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 14 14 T 11 10 377635 CASAVA_Build 17 60110864 1I AGCACTGGGC -/T CCCACGGTGG 3070 het 3070 ref 33 15 13 5 T 0 1 377636 CASAVA_Build 17 60122234 1I GACATGATCT -/C ACTGTGTCAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 C 0 1 377637 CASAVA_Build 17 60126830 4D CCTTCCTTCC TTCT/---- TTCTTTCTTT 3070 het 2788 hom 40 17 14 9 TTCT 3 2 377638 CASAVA_Build 17 60135382 1I AGCTGTGGTA -/T TTTTTTTCTT 3070 het 3070 ref 37 23 10 4 T 7 8 377639 CASAVA_Build 17 60147267 1I AAAAAACTAC -/A AAACAACTCA 3070 het 3070 ref 62 39 13 11 A 3 4 377640 CASAVA_Build 17 60148155 1D TGGATAAACA G/- AATGTGGTAT 3070 het 3070 ref 86 46 30 10 G 1 0 377641 CASAVA_Build 17 60148562 4I ACACACACAC ----/ACAT GGAGAATCTT 3070 het 3070 ref 76 44 29 3 ACAT 0 1 377642 CASAVA_Build 17 60149028 4I8M9D TGCACCGCCA ----TACCTAATTTTTTTTTC/CACCTGCCTAAT--------- TTTTTTTTTT 1227 het 1227 ref 22 18 3 2 N/A 0 0 377643 CASAVA_Build 17 60151359 1D TAGAAAACAG T/- TTGGCAGTTT 3070 het 3070 ref 55 28 22 5 T 3 2 377644 CASAVA_Build 17 60184222 2I GAAATAAACC --/AG AAATGGGCTG 3070 hom 75 het 27 0 24 3 AG 0 1 377645 CASAVA_Build 17 60187476 2D CTGGGGGAAC CG/-- GGTTTCTAGT 3070 het 3070 ref 23 12 10 1 CG 1 0 377646 CASAVA_Build 17 60189447 1I AAGTTAAAAG -/C TAAAGCTAAT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 C 0 1 377647 CASAVA_Build 17 60239568 1D TCAGATCCTT G/- GGGGGAGATG 3070 hom 81 het 31 0 28 3 G 6 5 377648 CASAVA_Build 17 60243320 1I AAAAAAAAAA -/G AGTAACTGAT 1759 het 1759 ref 17 10 4 3 G 0 1 377649 CASAVA_Build 17 60243724 3D26M1I ATTAGTTGGG GGTGGTGGTGGTGCGCACCTGTAATCCCA-/---TGTGGTGGTGCGCACCTGTAATCCCAG CTACTTGGGG 1949 hom 21 het 10 0 6 4 N/A 0 0 377650 CASAVA_Build 17 60244539 1I TAATAAGGGT -/G GGCAAAGATG 3070 het 3070 ref 49 31 16 2 G 2 3 377651 CASAVA_Build 17 60282392 1I AAAAGAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 32 9 7 A 9 10 377652 CASAVA_Build 17 60323944 2D CAGGGCACTC TT/-- ATGTCACAAT 3070 het 3070 ref 49 25 15 10 T 2 0 377653 CASAVA_Build 17 60326617 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3058 hom 32 10 9 13 T 13 12 377654 CASAVA_Build 17 60338917 4I GAAAGTGTAT ----/ATAG ATATATACAC 3070 het 3070 ref 38 26 9 3 ATAG 0 1 377655 CASAVA_Build 17 60339178 1D GAAACCCCCC A/- AAAAAAGAAA 3070 het 2782 hom 19 9 8 3 A 7 6 377656 CASAVA_Build 17 60341857 3I ACAGTGAAAA ---/AAG AAGGTGTGGA 3070 het 3070 ref 60 40 11 9 AAG 1 2 377657 CASAVA_Build 17 60346713 3D AGTGAGACTC CTT/--- CTCAAAAAAT 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 CTT 1 0 377658 CASAVA_Build 17 60347077 1D ACTAGGTCTC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 58 21 32 6 A 10 9 377659 CASAVA_Build 17 60348201 3D ATCATTTTTA AAC/--- AACTTTAGAA 3070 het 3070 ref 68 33 31 10 AAC 2 1 377660 CASAVA_Build 17 60348721 7I TATTTTAAAA -------/ATACATT ATACATTTTA 3070 het 3070 ref 52 25 22 5 ATACATT 1 2 377661 CASAVA_Build 17 60348815 1D ATAGGGTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 45 20 21 5 T 12 11 377662 CASAVA_Build 17 60351657 1I TCTAAAAGAA -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 45 het 17 0 16 1 T 5 6 377663 CASAVA_Build 17 60374887 1I AATCTGTCTA -/C CCTCTGATTT 3070 hom 114 het 40 0 39 1 C 2 3 377664 CASAVA_Build 17 60404833 2D GGTCAACATA GG/-- GGGAGACCCC 3070 hom 69 het 27 0 23 4 G 5 3 377665 CASAVA_Build 17 60410320 1I GTGTCCCCCC -/A AAATTTCTAT 3070 hom 63 het 27 0 21 6 A 3 4 377666 CASAVA_Build 17 60414475 1D TCTTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 54 hom 18 1 10 7 T 12 11 377667 CASAVA_Build 17 60415116 1I ACCCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2424 het 459 hom 28 3 18 7 A 17 18 377668 CASAVA_Build 17 60428664 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2260 het 327 hom 20 1 8 11 T 17 16 377669 CASAVA_Build 17 60429546 1D CTGACTCTAC A/- AAAAAAAAAT 3070 het 345 hom 20 1 15 4 A 10 9 377670 CASAVA_Build 17 60456204 1I GCACTTACGG -/T TTTATACCAC 3070 hom 117 het 41 0 39 2 T 3 4 377671 CASAVA_Build 17 60459391 1D TTTTCTCTGG A/- AAAAAAACAC 3070 hom 69 het 24 0 24 0 A 8 7 377672 CASAVA_Build 17 60464983 3D ACACCATCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 14 0 9 5 A 15 12 377673 CASAVA_Build 17 60476998 2D GGAGCATCTC TA/-- TGTGTCAGGT 3070 hom 120 het 46 0 39 7 TA 1 0 377674 CASAVA_Build 17 60484355 2I TGGCTCACTC --/AT GTGCATTCCA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 AT 0 1 377675 CASAVA_Build 17 60488856 1I GTGTCAAAAA -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 105 het 41 0 36 5 T 8 9 377676 CASAVA_Build 17 60492873 1D CAGCAATAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 96 het 42 0 32 10 A 11 10 377677 CASAVA_Build 17 60494509 1D TGGTCAACAT G/- GGTGAAACCC 3070 hom 63 het 24 0 22 2 G 3 2 377678 CASAVA_Build 17 60494668 1D GCTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 752 het 752 ref 16 8 3 5 A 16 15 377679 CASAVA_Build 17 60504339 1I AGCGAGACTC -/T GTTTCAATTA 3070 hom 47 het 18 0 12 6 T 0 1 377680 CASAVA_Build 17 60507802 1I ATATCCTTAC -/T TTTTTTTTTT 2507 hom 18 het 10 0 7 3 T 13 14 377681 CASAVA_Build 17 60511182 3D CAAAAAAATA AAC/--- AACAACAACA 3070 hom 108 het 49 0 36 13 AAC 7 6 377682 CASAVA_Build 17 60518185 1I AAGTCATTCT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 215 hom 35 2 26 7 A 13 14 377683 CASAVA_Build 17 60522208 1I TTTATTTACT -/A AAATTTAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 0 A 3 4 377684 CASAVA_Build 17 60530363 1I CTGTCTCTCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 829 hom 30 3 22 5 A 10 11 377685 CASAVA_Build 17 60531849 3I GATGATGCTT ---/TTC TTTTTTTTTT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 TTC 0 1 377686 CASAVA_Build 17 60532746 1D CAGAGATTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 11 10 377687 CASAVA_Build 17 60533559 2D TTCCATACTC TT/-- TCCCTCCTTG 3070 hom 114 het 40 0 38 3 T 3 1 377688 CASAVA_Build 17 60534863 1I ATATTAGATG -/T TTTTTTTCCT 3070 hom 102 het 43 0 35 8 T 7 8 377689 CASAVA_Build 17 60539777 1I TTCTTTCTTT -/C TTTTTTTTTT 3070 het 395 hom 18 1 11 6 C 0 1 377690 CASAVA_Build 17 60543029 1I AGTTAACAAA -/T TTTTTTTAGC 3070 hom 57 het 25 0 20 5 T 7 8 377691 CASAVA_Build 17 60543726 4D GGAAAGGACC TCAG/---- TCAGAGGTCA 3070 hom 145 het 52 0 46 7 TCAG 2 1 377692 CASAVA_Build 17 60546215 1I GGTCTGGAAC -/T AAACTAATGT 3070 hom 111 het 42 0 38 4 T 0 1 377693 CASAVA_Build 17 60546806 1D AGCGGAGGCA G/- GGTGGTCAGT 3070 hom 123 het 45 0 41 5 G 3 2 377694 CASAVA_Build 17 60547604 3I ATTTTATTCT ---/ATA ATGTCAGAGC 3070 hom 152 het 55 0 52 3 ATA 0 1 377695 CASAVA_Build 17 60548393 4D TCTTTTCTTT TCCC/---- TCCCTCCCTC 95 hom 5 het 13 0 2 11 TCCC 4 3 377696 CASAVA_Build 17 60548442 10D TGTCTCTCTC TCTCTCTCTT/---------- TTTCTTATTT 1524 hom 14 het 16 0 5 12 TCTCTCTCTT 1 0 377697 CASAVA_Build 17 60548838 1I CTTGGTAAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 379 hom 31 1 27 3 T 11 12 377698 CASAVA_Build 17 60556709 1I AAAAAATAAA -/T AATAAAAATA 2389 hom 26 het 11 0 9 2 T 0 1 377699 CASAVA_Build 17 60558984 1D TTTTTGGTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 444 hom 27 1 18 8 T 13 12 377700 CASAVA_Build 17 60783881 2D TGCAGGCAGG GA/-- GAGAGAGAGA 3070 hom 96 het 39 0 30 9 GA 7 6 377701 CASAVA_Build 17 60844842 1I ACAACAGAAA -/C AACTTCTCTC 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 C 0 1 377702 CASAVA_Build 17 60849761 3I TCGTGGTAAT ---/ATC ATATTTCAAC 3070 het 3070 hom 40 14 22 4 ATC 0 1 377703 CASAVA_Build 17 60849909 1I AATTGTAGGG -/A AAAAAATGCA 3070 het 3070 hom 32 12 17 3 A 6 7 377704 CASAVA_Build 17 60879865 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 25 11 12 3 A 12 11 377705 CASAVA_Build 17 60880080 1D TTGGTGGGGA G/- GGGGGGATGT 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 G 7 6 377706 CASAVA_Build 17 60886570 1I ATTCCACAGA -/T TTTTTTTACT 2352 het 2352 ref 26 10 6 10 T 7 8 377707 CASAVA_Build 17 60931497 1I CCATCTCTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 82 hom 28 1 20 7 A 10 11 377708 CASAVA_Build 17 60932175 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1426 hom 32 4 16 12 A 15 16 377709 CASAVA_Build 17 60938977 4D ACTCCATCTC AAAA/---- AAAAAAAAAA 2605 het 108 hom 26 3 11 12 A 19 15 377710 CASAVA_Build 17 60939829 1D TTCAAAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 226 hom 16 1 12 3 T 14 13 377711 CASAVA_Build 17 60945929 1I ACAAATTGAA -/G GGGGGGAAAA 3070 hom 111 het 42 0 38 4 G 6 7 377712 CASAVA_Build 17 60951571 1I TAGCCCAATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 457 hom 21 1 15 5 T 11 12 377713 CASAVA_Build 17 60952621 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 450 hom 20 2 12 7 A 15 14 377714 CASAVA_Build 17 60957775 1I TTTTCCCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 581 hom 27 2 23 2 A 13 14 377715 CASAVA_Build 17 60966835 1D GATGTCCCAA G/- GGGGGGCAGA 3070 hom 160 het 62 0 51 11 G 7 6 377716 CASAVA_Build 17 60967461 4D ATAAACCTCT TTTC/---- TTTGTTTTTT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 TTTC 1 0 377717 CASAVA_Build 17 60977881 9D AGGACTAGGT AAAGGGAAA/--------- AAAGGGAAAG 3070 hom 75 het 30 0 24 7 AAAGGGAAA 2 1 377718 CASAVA_Build 17 60978620 1D CCTCCTGGGA T/- TTTTTTGGTG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 T 7 6 377719 CASAVA_Build 17 60990044 2D AAAAGAAAAG AA/-- AAAAAGAGGA 1253 het 1253 ref 25 13 5 8 A 7 5 377720 CASAVA_Build 17 60991710 1D TGCTCACTCG C/- CCCCCCGCTC 3070 hom 96 het 38 0 33 6 C 7 6 377721 CASAVA_Build 17 61040749 2I GATTGTCTTG --/CC GAAGATAAAA 3070 het 3070 hom 38 12 19 7 C 0 2 377722 CASAVA_Build 17 61042044 2I GCCTGGCCCG --/CA CACTCTTAAG 1654 het 1654 ref 20 8 7 5 CA 1 2 377723 CASAVA_Build 17 61044654 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 2229 het 1161 hom 22 6 6 10 T 17 16 377724 CASAVA_Build 17 61069881 1D ATCCCTGGTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 27 15 8 4 T 10 9 377725 CASAVA_Build 17 61073754 1D TTGATTCTTG T/- TTTTTTTTTT 1861 het 287 hom 23 3 6 15 T 17 16 377726 CASAVA_Build 17 61148425 1I TAGCATAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 A 11 12 377727 CASAVA_Build 17 61152919 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 15 8 A 10 11 377728 CASAVA_Build 17 61158529 1D AAGTTGGAAT C/- AACTTCTTCC 3070 het 3070 ref 39 22 14 3 C 1 0 377729 CASAVA_Build 17 61162125 8D6M5D TAAGGTGAAA ATGTACTTAATATCCTGAT/--------ACTATC----- TAACCTATCG 3070 het 3070 ref 51 32 25 6 N/A 0 0 377730 CASAVA_Build 17 61162774 1D GTTTTCTCTA G/- GAACTGACCT 3070 het 3070 ref 30 15 13 2 G 2 1 377731 CASAVA_Build 17 61195990 1D ACAGAAATAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 48 23 19 7 A 9 8 377732 CASAVA_Build 17 61199996 1I TAAGAGGCCA -/T TTTTTTTATA 3070 het 3070 hom 47 22 22 3 T 7 8 377733 CASAVA_Build 17 61202091 1D TTAAATTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 42 het 20 0 15 5 T 9 8 377734 CASAVA_Build 17 61203361 4D AGAGATTTTT ATAA/---- ATATTGTCAC 3070 hom 102 het 38 0 35 7 ATAA 1 0 377735 CASAVA_Build 17 61204602 3I TACCTCAATC ---/ATT ATTAGCCCAT 3070 het 3070 hom 45 21 21 3 ATT 1 2 377736 CASAVA_Build 17 61205583 1D12M1D TTATCTCTTT AAAAAAAAAGGCAT/-AAAAAAAAGGCA- TTTTTTGTCT 3070 het 142 hom 18 1 8 13 N/A 0 0 377737 CASAVA_Build 17 61216277 9I ATTTGAACAT ---------/CATCTCCTC CAGGAAGTCT 3070 hom 102 het 37 0 35 2 CATCTCCTC 0 1 377738 CASAVA_Build 17 61219165 1I AAAACTCTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 120 het 45 0 40 5 A 10 11 377739 CASAVA_Build 17 61232897 1I AGAAAGTGAT -/G GGGGGATATT 3070 het 3070 hom 47 19 19 9 G 5 6 377740 CASAVA_Build 17 61247694 1D ATACATTCTG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 124 het 47 0 41 6 A 11 10 377741 CASAVA_Build 17 61258521 1D ATAATTGGAC A/- AAAAACAATC 3070 het 3070 ref 34 18 13 4 A 6 5 377742 CASAVA_Build 17 61271583 2D CAGAACAAGA CT/-- CTGTCTCAAA 1773 het 1662 hom 10 4 6 1 CT 2 1 377743 CASAVA_Build 17 61286972 3D TTAAAACTTC AAG/--- AAGAGCTTTC 3070 het 3070 ref 32 15 14 4 AAG 2 1 377744 CASAVA_Build 17 61289743 1D TTATAAATTC A/- AAAAAATACA 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 A 7 6 377745 CASAVA_Build 17 61290330 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2034 het 38 hom 12 1 8 3 A 11 12 377746 CASAVA_Build 17 61294517 1I TAATGTTGAA -/G GGGGAAAAAA 3070 hom 63 het 22 0 22 0 G 4 5 377747 CASAVA_Build 17 61296160 2D ATAAACTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 767 het 228 hom 27 6 3 18 T 18 16 377748 CASAVA_Build 17 61301791 3D CAAACCACAG AAT/--- ATAATTCTTT 3070 het 3070 ref 27 13 12 4 AAT 1 0 377749 CASAVA_Build 17 61305414 1I GCTCTTCCCT -/A AAAAAAAAAA 2272 het 2272 ref 37 11 12 14 A 14 15 377750 CASAVA_Build 17 61306659 1I AACCTTGTGG -/T TTTTGTGCTA 3070 het 3070 ref 43 23 16 4 T 4 5 377751 CASAVA_Build 17 61315080 1I TAAGATGATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 50 20 23 7 T 10 11 377752 CASAVA_Build 17 61321915 3D CCATAAATAC TTG/--- TTGTTGTTGT 3070 het 3070 ref 56 28 21 8 TTG 7 6 377753 CASAVA_Build 17 61326277 1I GGAAGGGAAG -/C AGCAAACAAA 3070 het 3038 hom 27 8 13 6 C 0 1 377754 CASAVA_Build 17 61329613 1I CCGAGACCAA -/G GGCCTGGTTG 3070 hom 94 het 34 0 29 5 G 2 3 377755 CASAVA_Build 17 61330437 1I AACCAATCAC -/A AAAAAACACA 3070 het 3070 ref 26 15 10 1 A 6 7 377756 CASAVA_Build 17 61335275 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 27 0 25 2 A 11 12 377757 CASAVA_Build 17 61337057 1D AAGGAAGAGG C/- CCATCATTAA 3070 het 3070 ref 50 26 19 5 C 3 2 377758 CASAVA_Build 17 61356226 2I GTTTGTAATG --/TC TCTCTCCTGC 3070 het 3070 hom 56 24 26 6 TC 3 4 377759 CASAVA_Build 17 61357436 1D GGTCTTTTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 42 18 19 6 T 11 10 377760 CASAVA_Build 17 61363266 2D TAAAAACCAC AT/-- GATTATCTCA 3070 het 1558 hom 14 4 7 3 AT 1 0 377761 CASAVA_Build 17 61365399 1D TCAAAAAAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 12 11 5 T 11 10 377762 CASAVA_Build 17 61368371 1I TGTTTTGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 17 15 12 T 10 11 377763 CASAVA_Build 17 61368762 4D TGTTGGCATT AGGA/---- AGATTCTCAC 3070 het 3070 ref 39 19 11 10 AGGA 1 0 377764 CASAVA_Build 17 61373835 1I TTATAATCAT -/A ACACCTTTAT 3070 het 3070 hom 35 13 18 4 A 1 2 377765 CASAVA_Build 17 61375291 3D TATAAATTAG ATT/--- ATTTAAGCAA 2639 het 2639 ref 19 12 6 2 ATT 2 1 377766 CASAVA_Build 17 61375643 2I CAAATAATGA --/CT CTGCTGATTG 3070 het 3070 ref 41 23 16 2 CT 1 2 377767 CASAVA_Build 17 61380254 1I GGTGAGGCCT -/G TGACTGCTGG 3070 het 3070 ref 37 21 13 3 G 0 1 377768 CASAVA_Build 17 61389308 4I TTCTCATGAT ----/AGTG AGTGAGTCTA 3070 het 2969 hom 18 7 9 2 AGTG 1 2 377769 CASAVA_Build 17 61390183 2D CAAGACTCTC TT/-- GTCCCTTTAC 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 T 2 0 377770 CASAVA_Build 17 61391286 6D TTGATGAAAG GGTGCT/------ GTGGCACTGT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 GGTGCT 1 0 377771 CASAVA_Build 17 61392617 1D GGACTGAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 38 16 17 5 T 10 9 377772 CASAVA_Build 17 61394458 6D AAATTATCCT TAAAGA/------ TAAAGCAGTC 3070 het 3070 ref 43 21 21 3 TAAAGA 1 0 377773 CASAVA_Build 17 61395446 1D TATTAACTTA C/- CATTTCATAT 3070 het 3070 hom 33 14 16 4 C 2 1 377774 CASAVA_Build 17 61395663 3D TGTGTGTGGA TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 1693 hom 30 14 9 7 T 17 14 377775 CASAVA_Build 17 61396415 3D TTACAAGCAT ATC/--- ATCTATATAT 3070 het 3070 hom 78 33 39 8 ATC 2 1 377776 CASAVA_Build 17 61396784 2I16M19D TGCTGCATGC --ATGTCATGCATGCATATACCATGCATATATGCATG/ATATGTCATGCATGCATA------------------- TATATTACAT 3070 het 3070 ref 83 69 34 8 N/A 0 0 377777 CASAVA_Build 17 61396891 2I TGTGTATCTC --/AT ATATGTAAAA 3070 het 3070 ref 84 45 33 6 AT 2 3 377778 CASAVA_Build 17 61397743 11D CATGTACATT ACATGTACAGC/----------- ACATGTACAG 3070 het 3070 ref 54 35 9 25 ACATGTACAGC 2 1 377779 CASAVA_Build 17 61397996 28I CACCCATGCA ----------------------------/GCACATATATTGGATGCATGTGATGTAT GCATGCTGCA 3070 het 3070 ref 63 45 13 5 GCACATATATTGGATGCATGTGATGTAT 0 1 377780 CASAVA_Build 17 61398060 2I ATCATGCATG --/TA TATGACATGA 3070 het 3070 ref 63 31 19 13 TA 1 2 377781 CASAVA_Build 17 61398174 11D60M2D ATTACATGCA TGCATATTGTGTGCATATTATATGTATATCCCATGCATATTGCGTTATATTGCATGCATGTCACATGCATGTA/-----------TGCATATTATATGTATATCCCATGCATATTGCATTATATTGCATGCATGCCACATGCATG-- TGTTACATGC 3070 het 3070 ref 56 57 16 29 N/A 0 0 377782 CASAVA_Build 17 61399940 5D ACATCTATCT AATAA/----- AAGACTGGTA 3070 het 3070 ref 31 16 15 2 AATAA 1 0 377783 CASAVA_Build 17 61400833 1I TTTTTTTGCA -/T TTTTTTGTAG 3070 het 3070 hom 32 11 16 5 T 6 7 377784 CASAVA_Build 17 61404837 8I TCCTATCTCT --------/AAAAGAAA AAAAGAAAAT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 AAAAGAAA 1 2 377785 CASAVA_Build 17 61405799 4D TTTTAGGCAT TTTG/---- TTTATTTTTA 3070 het 3070 hom 27 12 13 4 TTTG 1 0 377786 CASAVA_Build 17 61408152 1I TGGTTTTTGA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 3070 ref 52 21 18 15 T 7 8 377787 CASAVA_Build 17 61410768 1D GGTTTTTTTT A/- AACTGGCTGC 3070 het 3070 ref 36 20 13 3 A 3 2 377788 CASAVA_Build 17 61413257 13D14M5D TATACGATTC ATTATTTCATTCAAAAAATCAAAGACTTATAA/-------------AAAAATCAAAGACT----- TATAAGTTAT 3070 het 3070 hom 29 13 16 1 N/A 0 0 377789 CASAVA_Build 17 61415127 1I AATTCATAAA -/T TTATCAGAGA 3070 het 3070 ref 43 21 15 7 T 2 3 377790 CASAVA_Build 17 61415311 1I TTGAGAGGAG -/A AAAAAAGAAA 3070 het 3070 ref 35 18 14 3 A 6 7 377791 CASAVA_Build 17 61415826 7D AAAAAAAAAA AAAAAAG/------- AAAGAAAGAA 2370 het 1833 hom 26 10 13 5 AAAAAAG 1 0 377792 CASAVA_Build 17 61418083 3D CAGCACCATA TCT/--- TCTTTATTAA 3070 het 3070 hom 26 9 14 4 TCT 2 1 377793 CASAVA_Build 17 61418604 1D ATGTTCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 13 8 A 11 10 377794 CASAVA_Build 17 61419519 7D TTGTTTTTTA TTTTTAC/------- TTTTAAGTTC 3070 het 3070 ref 35 20 14 2 TTTTTAC 1 0 377795 CASAVA_Build 17 61422952 2D ATTTATACTT CA/-- GATTTCCATT 3070 het 3070 hom 26 7 16 3 CA 1 0 377796 CASAVA_Build 17 61424371 4D CCCTAAACAT CCCC/---- CCCCCCACAC 3070 het 219 hom 35 3 19 15 C 10 6 377797 CASAVA_Build 17 61425131 1D CTTTAAAAAG A/- AAAAAAACTG 3070 het 3070 hom 39 16 21 2 A 8 7 377798 CASAVA_Build 17 61426356 6I TGTGTCCATG ------/TGTTCT TGTTCTTATC 3070 het 3070 hom 36 17 18 1 TGTTCT 1 2 377799 CASAVA_Build 17 61426847 3I CCATTTTGAC ---/TGA TGTAAGATGG 3070 hom 28 het 17 0 12 5 TGA 0 1 377800 CASAVA_Build 17 61426925 1I GCTTTTTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 22 12 8 2 T 10 11 377801 CASAVA_Build 17 61428790 1D TGCTTGGAGA G/- AGTATAAATA 3070 het 3070 ref 57 32 20 5 G 1 0 377802 CASAVA_Build 17 61430571 7I TCCTTAGATT -------/TATAAAA TATAAATCAA 2923 het 2923 ref 24 13 8 3 TATAAAA 0 1 377803 CASAVA_Build 17 61432090 1I TTTTTCTTTT -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 A 8 9 377804 CASAVA_Build 17 61432509 5I AATGATTTCA -----/ATACT ATACTATACT 3070 het 3070 ref 44 19 15 10 ATACT 2 3 377805 CASAVA_Build 17 61439702 5D ATATCCTATA TTATT/----- TTATTTTATT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 TTATT 3 2 377806 CASAVA_Build 17 61440172 1I CAAAGTTGGG -/A ACCTGCTGTG 3070 het 3070 ref 49 26 16 7 A 1 2 377807 CASAVA_Build 17 61441966 1D TTCTTGAGTA T/- TTTTTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 13 14 4 T 8 7 377808 CASAVA_Build 17 61445888 6D CTGTAACACT AACAAC/------ AACAACAACA 3070 hom 102 het 40 0 33 9 AAC 6 4 377809 CASAVA_Build 17 61446929 1I GATTTAAAAG -/A AGCACTCATG 3070 het 3070 hom 68 21 31 16 A 1 2 377810 CASAVA_Build 17 61451152 1I CAATAGTTAT -/A AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 25 16 8 1 A 8 9 377811 CASAVA_Build 17 61453051 1D TTCTTTTGTT A/- AAATGTTTAA 3070 hom 93 het 36 0 32 5 A 4 3 377812 CASAVA_Build 17 61453956 1I GACTCTGTCT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 A 9 10 377813 CASAVA_Build 17 61454563 4D AAGAAAGAGG GAAA/---- GAAAGAGAGA 3070 het 3070 ref 24 14 10 0 GAAA 2 1 377814 CASAVA_Build 17 61454717 1I CTACATCTCA -/T AAGCATCAAT 3070 hom 51 het 23 0 18 5 T 0 1 377815 CASAVA_Build 17 61455455 2I CTTTTAAGAC --/TT TGGCACTTAA 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 T 1 3 377816 CASAVA_Build 17 61455898 6I TGAAATTTTT ------/TAATCA TAATCAGCTA 3070 het 3070 hom 51 22 20 9 TAATCA 1 2 377817 CASAVA_Build 17 61456288 4D36M5D GTCTCTAAAT AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAGCAGTATTTAGA/----AAATAAATAAACAAACAAACAAACAAACAGCAGTAT----- TTAGAAACTT 3070 het 1228 hom 25 5 15 18 N/A 0 0 377818 CASAVA_Build 17 61457208 6D CTTCCACAGT ATTAAG/------ ATTATCACTC 3070 het 3070 ref 24 13 9 4 ATTAAG 1 0 377819 CASAVA_Build 17 61457925 6D CAAGATAAAC TAAAAA/------ TAGAAATGCA 3070 het 3070 ref 33 22 9 4 TAAAAA 1 0 377820 CASAVA_Build 17 61459632 1D ATGCTGAATG A/- AAAAAATCAC 3070 het 3070 hom 37 14 21 2 A 7 6 377821 CASAVA_Build 17 61459867 4I ATATACAAAT ----/AGAA AGAGTATACT 3070 hom 120 het 47 0 41 6 AGAA 0 1 377822 CASAVA_Build 17 61461179 4I TGTGAATAAT ----/TAAA TACAGTGGAG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 TAAA 0 1 377823 CASAVA_Build 17 61462959 6D TTACCACAAT AAAAAG/------ AAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 47 22 19 8 AAAAAG 2 1 377824 CASAVA_Build 17 61464184 3D ATGATTTTTC TTA/--- TAATACTACA 3070 het 3070 ref 47 26 16 8 TTA 1 0 377825 CASAVA_Build 17 61467285 1I TGGCCAGGCT -/G GTCTCAAACT 3070 het 3070 hom 24 10 11 3 G 1 2 377826 CASAVA_Build 17 61467679 1I ATGGCTTGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 68 het 28 0 23 5 A 11 12 377827 CASAVA_Build 17 61467831 1I TCACCAAAAT -/A AAGTATTGTA 3070 het 3070 hom 29 12 12 5 A 2 3 377828 CASAVA_Build 17 61467926 1I TTAATTTATT -/A AAAAAACACC 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 A 6 7 377829 CASAVA_Build 17 61469423 1D TAAAACTATT A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 A 8 7 377830 CASAVA_Build 17 61470009 3D TGAATATTTT AAC/--- AACTGTAACT 3070 het 3070 hom 30 10 19 4 AAC 2 1 377831 CASAVA_Build 17 61472477 1I AAGACATAAA -/T TTGCCTATTT 3070 hom 81 het 31 0 27 4 T 2 3 377832 CASAVA_Build 17 61472614 4D CGTTAAAAAG TTTT/---- TTTTTTCTTT 2922 het 2846 hom 22 10 10 4 T 10 6 377833 CASAVA_Build 17 61473397 2I AAATGTTGAC --/AG AGCAGGACTG 3070 hom 123 het 46 0 41 5 AG 1 2 377834 CASAVA_Build 17 61474681 1D ATCATTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 28 14 12 2 T 11 10 377835 CASAVA_Build 17 61475805 12D TTTTCCCCAA TATGCGTAAGAG/------------ TAACTTATAA 3070 het 3070 ref 36 22 14 11 TATGCGTAAGAG 1 0 377836 CASAVA_Build 17 61476589 1D CAGAACTAAA T/- TAAAAAACTC 3070 het 3070 ref 34 16 11 7 T 2 1 377837 CASAVA_Build 17 61478462 1I CCAATAAACC -/T TATCATTAAG 3070 het 3070 hom 53 25 24 4 T 1 2 377838 CASAVA_Build 17 61479365 1D TCTTCCATTT A/- AAAAAAAATG 3070 het 3070 ref 34 14 16 5 A 9 8 377839 CASAVA_Build 17 61480083 3D TAAAAGTAAA AAT/--- AATAATAATA 3070 het 28 hom 19 1 13 5 AAT 5 4 377840 CASAVA_Build 17 61484738 1D GTATAACTAG A/- AAAAAAAGCT 3070 het 3070 hom 36 11 15 11 A 8 7 377841 CASAVA_Build 17 61485079 1I TTAGAAAAAA -/T GATTCTAAGA 3070 het 3070 ref 33 16 14 3 T 0 1 377842 CASAVA_Build 17 61487475 1I AAAAGCAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 12 12 6 A 11 12 377843 CASAVA_Build 17 61487526 2I TTCTGCATGG --/AA AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 36 20 9 7 A 9 11 377844 CASAVA_Build 17 61493161 2D ACACACACAG AC/-- ACACACACAC 3070 hom 119 het 56 0 39 19 AC 9 8 377845 CASAVA_Build 17 61502830 3D AGACTCCACA GGC/--- GGCGGGGTAA 3070 hom 64 het 24 0 20 6 GGC 2 1 377846 CASAVA_Build 17 61528211 1D TAAAAATTGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 30 0 25 6 A 11 10 377847 CASAVA_Build 17 61530239 3D GCACCTTCAT AAG/--- AAGAAAAAAT 3070 het 3070 hom 49 19 22 9 AAG 2 1 377848 CASAVA_Build 17 61539027 1D ATATAAAAAA T/- ATAAAGTAAT 3070 het 3070 ref 26 14 9 4 T 1 0 377849 CASAVA_Build 17 61545473 4D TCCATCAAAC AAAA/---- AAAAATCCCT 3070 het 3070 hom 29 10 18 1 A 9 5 377850 CASAVA_Build 17 61547445 1D TCTACTTTAA T/- CTTTATTATT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 1 0 377851 CASAVA_Build 17 61547857 1I ACTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2975 het 2975 ref 31 14 10 7 A 14 15 377852 CASAVA_Build 17 61551149 1D GCCAAGAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 22 13 9 A 11 10 377853 CASAVA_Build 17 61554121 5D GAGGCCCACA TTACT/----- TTAATTTCCT 3070 hom 102 het 39 0 34 6 TTACT 1 0 377854 CASAVA_Build 17 61567989 4I GTTTTTTTCT ----/TTTA TTTATTGTGG 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 TTTA 1 2 377855 CASAVA_Build 17 61576945 1I GCCCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2790 het 2790 ref 32 16 7 9 T 9 10 377856 CASAVA_Build 17 61577705 1D TGGCTCTTGC T/- TTTTTTATCC 3070 hom 63 het 24 0 22 3 T 7 6 377857 CASAVA_Build 17 61580758 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAGGG 1664 het 1663 ref 14 7 5 2 A 8 7 377858 CASAVA_Build 17 61588478 1I ATTACACTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 10 11 377859 CASAVA_Build 17 61601227 6D AAAAAACCTA TTTAAG/------ TTTAATACTC 3070 het 3070 ref 34 19 16 1 TTTAAG 1 0 377860 CASAVA_Build 17 61606901 1I GGTCCAGGGC -/T TTTCCTTTGC 3070 het 3070 hom 21 9 11 1 T 3 4 377861 CASAVA_Build 17 61608096 2I CATCTAATTT --/TG TGTGTGTGTG 3070 het 1089 hom 18 4 11 3 TG 7 8 377862 CASAVA_Build 17 61613756 2D AGCCTCATCA TC/-- TGTCTCCCTA 3070 het 3070 ref 45 16 15 15 TC 1 0 377863 CASAVA_Build 17 61613816 2D GTTCCAGAAT GA/-- GTTTCCTAAT 3070 het 3070 ref 38 16 13 12 GA 1 0 377864 CASAVA_Build 17 61615165 4D TATCATGCTG TTTT/---- TTTTTTTTTT 3070 hom 62 het 25 0 21 5 T 15 11 377865 CASAVA_Build 17 61615300 4I CTCATCATTT ----/TTTG TTTGTTTGGT 3070 hom 102 het 41 0 35 6 TTTG 2 3 377866 CASAVA_Build 17 61629199 1D CCTTGATTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 21 het 23 0 14 10 T 13 12 377867 CASAVA_Build 17 61635246 1D TGGATCAAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 53 25 19 9 A 12 11 377868 CASAVA_Build 17 61637323 1I CATAAAGAGA -/G GGGTTTGTCC 3070 het 3070 hom 47 24 20 3 G 3 4 377869 CASAVA_Build 17 61637666 1I TGAGTTTCTC -/T TTTTTTTCCA 3070 het 3070 ref 38 16 15 7 T 7 8 377870 CASAVA_Build 17 61641504 1D CATTTCAGTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 12 18 A 16 15 377871 CASAVA_Build 17 61644896 1I ACAGAATGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2945 hom 36 9 13 14 T 12 13 377872 CASAVA_Build 17 61649942 1D TTAAGTGGTG A/- CAGTCCCTGA 3070 het 3070 ref 54 23 23 9 A 1 0 377873 CASAVA_Build 17 61656692 1D CTCGAAGAAG A/- AAAAAAAACT 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 A 9 8 377874 CASAVA_Build 17 61662677 1I GCAGGCTCCG -/C CCCCTGGGTT 3070 hom 33 het 12 0 12 0 C 4 5 377875 CASAVA_Build 17 61673584 1I AAAAAATGGA -/T TTTTTTTCTT 3019 het 3019 ref 32 14 10 8 T 7 8 377876 CASAVA_Build 17 61677979 1D AGATTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 13 9 12 A 15 14 377877 CASAVA_Build 17 61680423 1D TATCAGACTT A/- AAAGTCTGCA 3070 het 3070 hom 41 17 19 5 A 4 3 377878 CASAVA_Build 17 61680815 1I CAGGCGCATG -/C CACCATGACT 3070 hom 90 het 32 0 30 2 C 1 2 377879 CASAVA_Build 17 61712535 5D TTTGTGTTTG TATTT/----- TATTTTATTT 2825 het 2825 ref 16 8 6 2 TATTT 3 2 377880 CASAVA_Build 17 61713102 3I GGTTTTGCCC ---/TAT CTTGAGTTGT 3070 hom 81 het 29 0 27 2 TAT 0 1 377881 CASAVA_Build 17 61713251 5D TTTAGCTCTC TACTT/----- TGTTTTGTTT 3070 hom 114 het 43 0 39 7 TACTT 1 0 377882 CASAVA_Build 17 61713366 1I ACAGATGAAT -/A AGGGCTCCAG 3070 hom 81 het 34 0 28 6 A 1 2 377883 CASAVA_Build 17 61714223 1I CATGGCAAAA -/C CCCATCTCTA 3070 hom 45 het 16 0 16 0 C 3 4 377884 CASAVA_Build 17 61717987 1D CTGTCTCTAT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 10 9 377885 CASAVA_Build 17 61719383 1I TTGAGTCACA -/T TTTTTTTTTT 2913 het 222 hom 19 2 8 9 T 17 18 377886 CASAVA_Build 17 61723602 1D GAAACCCCGT C/- TCTACTAAAA 3070 hom 42 het 15 0 15 1 C 1 0 377887 CASAVA_Build 17 61724785 2D ACATATAATT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 163 hom 30 4 13 13 A 14 12 377888 CASAVA_Build 17 61725545 2D TATTCAAGAC AT/-- AAAGTGGGTT 3070 het 3070 hom 28 9 17 3 AT 1 0 377889 CASAVA_Build 17 61730084 1I CGTTCGGGGT -/G GGGGGGGTTG 1959 hom 22 het 10 0 8 2 G 7 8 377890 CASAVA_Build 17 61731463 3I GTTAAGAGGA ---/GGT GGTCAGCTGT 3070 hom 96 het 35 0 33 2 GGT 1 2 377891 CASAVA_Build 17 61731738 3D CACGGGGATT GTC/--- TTTTTCAGTT 3070 het 3070 hom 31 13 16 3 GTC 1 0 377892 CASAVA_Build 17 61735468 1D TCTAATTTTG T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 T 10 9 377893 CASAVA_Build 17 61745545 1D TACAAAAAAA T/- ATTTTTTGTA 3070 hom 24 het 16 0 8 8 T 1 0 377894 CASAVA_Build 17 61746316 1D CATATACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 29 12 11 7 T 12 11 377895 CASAVA_Build 17 61782889 1D TATCATCCAC T/- TTTTTAAAAG 3070 het 3070 ref 28 18 7 3 T 6 5 377896 CASAVA_Build 17 61789254 1D GCCTTGCAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 250 hom 29 1 20 9 T 15 14 377897 CASAVA_Build 17 61792175 11D AAATAGATTA ACTCTTTGTAT/----------- ACTCTTTGGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 7 ACTCTTTGTAT 1 0 377898 CASAVA_Build 17 61801648 1D ATCTTTATCC T/- TTCTGCATGG 3070 hom 93 het 36 0 32 4 T 3 2 377899 CASAVA_Build 17 61805481 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 620 het 620 ref 23 9 4 10 A 15 16 377900 CASAVA_Build 17 61807524 1I TTTATTTTTC -/T TTTTTTTTTT 2156 het 2156 ref 24 9 6 9 T 13 14 377901 CASAVA_Build 17 61809980 1I GAAAAGCCTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 46 21 14 11 T 11 12 377902 CASAVA_Build 17 61813377 1D TCTAAAAGCC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 47 17 24 6 T 10 9 377903 CASAVA_Build 17 61816810 1D CTCAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 96 het 38 0 33 6 A 10 9 377904 CASAVA_Build 17 61817501 4I AAGGAACCAA ----/CTCT GTAGCAGAGG 3070 hom 126 het 48 0 43 5 CT 0 2 377905 CASAVA_Build 17 61818815 1D GTCTCAACAA C/- AACAAAAAAA 2982 het 37 hom 17 1 13 3 C 1 0 377906 CASAVA_Build 17 61822637 1I GGTTTAACTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1014 hom 37 4 31 2 T 12 13 377907 CASAVA_Build 17 61836788 1I CCAACAGAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 76 het 35 0 26 9 T 12 13 377908 CASAVA_Build 17 61838435 4I CTGAGCAATG ----/GGCC GGCCGCCTAC 3070 hom 90 het 37 0 31 6 GGCC 1 2 377909 CASAVA_Build 17 61838582 1D AAAAAAAATC T/- TTTTTTTTTT 1398 het 1165 hom 25 9 9 8 T 16 15 377910 CASAVA_Build 17 61842352 1I CCTTTTTTGC -/T GTCTGCTTCC 3070 hom 114 het 46 0 39 7 T 0 1 377911 CASAVA_Build 17 61846229 1I TATATGTGAA -/T TTTTTTTTGG 3070 het 3070 ref 31 18 13 0 T 8 9 377912 CASAVA_Build 17 61849692 1D ACCTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 36 13 13 11 A 11 10 377913 CASAVA_Build 17 61860855 4D GATGGGAGTG TGAA/---- TGGAAGACAG 3070 het 3070 hom 52 19 26 10 TGAA 1 0 377914 CASAVA_Build 17 61861229 2D TGTTCCTAGG CA/-- CACGCCTTTT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 CA 2 1 377915 CASAVA_Build 17 61864911 4I GTCTCTTGCC ----/GCAA ATGGGTAGCT 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 GCAA 0 1 377916 CASAVA_Build 17 61868017 1I CCTGAGGGGG -/A AACCTACTTC 3070 hom 107 het 42 0 35 7 A 2 3 377917 CASAVA_Build 17 61870343 1I GGGGGAGAAG -/T TTAGCTAATA 3070 hom 108 het 42 0 36 6 T 2 3 377918 CASAVA_Build 17 61875439 1D AGATTCTGGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2549 hom 24 8 13 3 A 13 12 377919 CASAVA_Build 17 61877376 2I GCCCCTGTAC --/TT TAGTACATTT 3070 hom 129 het 47 0 42 5 T 1 3 377920 CASAVA_Build 17 61885067 1D TTTATTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 25 0 16 10 T 11 10 377921 CASAVA_Build 17 61896974 1I ATGCCCGTCT -/A ATTTTTGTAT 2587 hom 18 het 9 0 7 2 A 1 2 377922 CASAVA_Build 17 61899438 1I AGACCATAGC -/T TTTTTTTGCC 3070 het 3070 hom 43 18 18 7 T 7 8 377923 CASAVA_Build 17 61900810 1D AGGAACCCAA T/- AACACCGATG 3070 hom 89 het 37 0 29 8 T 1 0 377924 CASAVA_Build 17 61904535 11D CCAACTTAGT TGTTCCCTCTC/----------- TAAACCAAAA 3070 het 3070 hom 31 11 18 3 TGTTCCCTCTC 1 0 377925 CASAVA_Build 17 61905338 1I AGACAGCCCC -/T GTATCACGTT 3070 hom 54 het 21 0 19 2 T 0 1 377926 CASAVA_Build 17 61906579 3D42M3D CCCTGAACTT AAAAAAAAAAAAAAACATTTTGGTTTTAGAATTCTGAATAACAATTCA/---AAAAAAAAAAAACATTTTGGTTTTAGAATTCTGAATAACAAT--- TCATATTTAT 3070 het 3070 hom 32 11 21 21 N/A 0 0 377927 CASAVA_Build 17 61907362 1D TATATGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 A 12 11 377928 CASAVA_Build 17 61914061 1I GCAGTGAATA -/T TGGGATTACA 3070 het 3070 ref 58 31 20 7 T 1 2 377929 CASAVA_Build 17 61917887 1I CCAGAGGTGA -/C CCAAAGTCTT 3070 hom 141 het 49 0 48 1 C 2 3 377930 CASAVA_Build 17 61918349 1D AATGTCTTCA T/- TAGATTATCT 2045 het 2045 ref 27 18 5 4 T 2 1 377931 CASAVA_Build 17 61923508 10D CAGGTGTGAG CCACTGGGCC/---------- CTGCCACCCT 3070 het 3070 ref 30 19 10 2 CCACTGGGCC 1 0 377932 CASAVA_Build 17 61925729 1I ATTCCTATGA -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 9 10 377933 CASAVA_Build 17 61932447 1D TATTTACTTA T/- TTTGAATTTT 3070 hom 90 het 32 0 31 1 T 4 3 377934 CASAVA_Build 17 61938264 1I TATAGTGAAC -/T TTTTTTTTTT 1104 het 1104 ref 22 7 5 10 T 15 16 377935 CASAVA_Build 17 61960286 1D TGCCGCCCCC A/- CTGGCCAGGC 3070 het 3070 hom 36 13 12 12 A 1 0 377936 CASAVA_Build 17 61975389 1D TTTCGGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 30 1 17 12 T 13 12 377937 CASAVA_Build 17 61977209 2D AGCCTGGGTG AC/-- AGAGTGAGAC 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 AC 1 0 377938 CASAVA_Build 17 61980820 2D CGTCTCTATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 12 11 9 A 14 12 377939 CASAVA_Build 17 61981164 4D CCGAAGGTAA GGTG/---- GGTGACCTGT 3070 het 3070 ref 35 17 14 7 GGTG 2 1 377940 CASAVA_Build 17 61982311 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 23 12 9 2 T 10 11 377941 CASAVA_Build 17 61986822 1I AATCAGGAAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 20 8 A 10 11 377942 CASAVA_Build 17 61989166 4I CTAAGTTTTG ----/TTTT TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 43 22 13 8 T 9 13 377943 CASAVA_Build 17 61995907 1D CCAGCACTTT G/- GAGGCCGAGG 3070 hom 27 het 14 0 10 4 G 2 1 377944 CASAVA_Build 17 61996186 2I GATCAGTAAG --/AA AAAGACAATC 3070 hom 69 het 24 0 23 1 A 3 5 377945 CASAVA_Build 17 61998189 18D TAATGAACTT AAATTTAATTGAACAACC/------------------ TTCCTCAATC 3070 het 3070 hom 34 14 21 3 AAATTTAATTGAACAACC 1 0 377946 CASAVA_Build 17 62004819 1D GGCCAGCACT C/- TGGAAAGACG 3070 het 3070 ref 35 15 11 9 C 1 0 377947 CASAVA_Build 17 62005139 5D TACCTGGGGC TGGTT/----- TGGTTTGGTT 3070 het 3070 ref 55 23 19 16 TGGTT 3 2 377948 CASAVA_Build 17 62007510 1D AGATTTGTTG C/- CCCCCCCCAT 3070 het 3070 hom 57 22 27 8 C 9 8 377949 CASAVA_Build 17 62009207 2I ATTAAACCTC --/TT TTTCCTTTAT 3070 hom 99 het 41 0 34 7 T 3 5 377950 CASAVA_Build 17 62010857 3I GCTGGAGTGC ---/AGT AGTGGCTTGA 3070 het 696 hom 20 5 13 2 AGT 1 2 377951 CASAVA_Build 17 62011645 2D AATGCATGGG GA/-- GGGGGGGGTG 3070 het 3070 ref 31 16 7 10 GA 1 0 377952 CASAVA_Build 17 62012931 1D ATTAACTATT A/- ACTGAAAGAT 3070 het 3070 hom 43 14 24 5 A 2 1 377953 CASAVA_Build 17 62021189 1I TGCAACATGT -/G GGGTTTTTTT 3070 hom 9 het 19 0 11 8 G 3 4 377954 CASAVA_Build 17 62054997 6D TGTGACACTG ATTTAT/------ ATTTAATGAC 3070 hom 81 het 29 0 28 2 ATTTAT 1 0 377955 CASAVA_Build 17 62069363 1D GATTTCCACC A/- TTTAATCCCA 3070 hom 60 het 29 0 20 10 A 1 0 377956 CASAVA_Build 17 62073042 1I CCTTGCACTT -/G GGGGTCCCTG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 4 5 377957 CASAVA_Build 17 62073698 12I GTTCCTCGGG ------------/GGCCATGAGCTA GGCCATGAGA 3070 hom 93 het 39 0 32 7 GGCCATGAGCTA 0 1 377958 CASAVA_Build 17 62076938 1I GGTGTCGGGG -/T TTTTTTTTTC 3070 het 641 hom 30 2 21 7 T 9 10 377959 CASAVA_Build 17 62077021 1D TAGGAGTAGT A/- AAAAAAAAAT 1392 het 1392 ref 31 24 3 5 A 10 9 377960 CASAVA_Build 17 62080991 3I GAAAAATGCT ---/ATC ATCATCATCA 3070 hom 93 het 42 0 28 14 ATC 3 4 377961 CASAVA_Build 17 62082448 1I GCCACATGGC -/T TCTGGGATCC 3070 hom 132 het 49 0 45 4 T 1 2 377962 CASAVA_Build 17 62083112 3I AGGAACTTTA ---/TCT TCTTCTGGAA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 TCT 2 3 377963 CASAVA_Build 17 62086283 8I GAGCCAAGAT --------/TGCACCAC TGCACTCCAG 3070 hom 72 het 28 0 24 4 TGCACCAC 0 1 377964 CASAVA_Build 17 62092085 7I GGCAAGAGGG -------/GGTCTCA GGTCCAAGTA 3070 hom 108 het 41 0 36 5 GGTCTCA 0 1 377965 CASAVA_Build 17 62095683 1D CCCTCTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 361 hom 29 1 23 5 A 13 12 377966 CASAVA_Build 17 62130378 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 11 12 377967 CASAVA_Build 17 62149747 1I GCAGGTCACA -/G GGTTTCTGGT 3070 hom 122 het 43 0 40 3 G 2 3 377968 CASAVA_Build 17 62153783 1D GAAAATAGTG A/- AAAATATGGA 3070 hom 87 het 31 0 30 2 A 5 4 377969 CASAVA_Build 17 62161479 1D GTTCACTGTG T/- TGTTACTATT 3070 hom 123 het 47 0 42 6 T 2 1 377970 CASAVA_Build 17 62165498 1I GGAAACTTCC -/T TTTTTTCCCC 3070 het 141 hom 33 1 28 5 T 6 7 377971 CASAVA_Build 17 62166734 2D GGTGGTTTGA GG/-- GGGGAGATTC 3070 hom 117 het 40 0 39 1 G 6 4 377972 CASAVA_Build 17 62183803 1D GCAAAGACTG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 622 hom 35 4 22 9 A 15 14 377973 CASAVA_Build 17 62192959 1I ATGGCTTTCC -/A AATTCGGACA 3070 hom 101 het 43 0 34 9 A 2 3 377974 CASAVA_Build 17 62193389 1D ACTCCTTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 886 hom 24 3 12 10 A 19 18 377975 CASAVA_Build 17 62197587 1I GCAATGTGTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 433 hom 21 2 12 7 T 15 16 377976 CASAVA_Build 17 62199079 1D CTGGGCCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 78 het 34 0 27 9 A 12 11 377977 CASAVA_Build 17 62201747 1I ATGACCCTGT -/G GGTCAGTGCC 3070 hom 81 het 32 0 24 8 G 2 3 377978 CASAVA_Build 17 62206961 5D TCATAATTTG AAAAT/----- AATATAAGAG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 AAAAT 1 0 377979 CASAVA_Build 17 62216978 22D GTCAGCCCTG CACACTGATTTCAGGGGGGTCT/---------------------- CACGGGCTCC 3070 hom 63 het 25 0 21 6 CACACTGATTTCAGGGGGGTCT 1 0 377980 CASAVA_Build 17 62217572 1I TGTTTGCTGG -/T TTTTTTTTTT 3064 het 189 hom 16 1 10 5 T 14 15 377981 CASAVA_Build 17 62230217 1D CCAGCCGTGC A/- ATTCCCACCC 3070 hom 79 het 30 0 23 7 A 2 1 377982 CASAVA_Build 17 62231237 1I CAGTTTAAAC -/A AAAAAAACCT 3070 het 3070 ref 55 24 20 11 A 7 8 377983 CASAVA_Build 17 62240439 4D TACAGAGATG CACA/---- CACACACATG 3070 het 3070 ref 46 23 17 8 CA 6 4 377984 CASAVA_Build 17 62255699 1D CTTTCAAAGC T/- TTTTTTTTTC 1083 het 1083 ref 40 31 4 6 T 10 9 377985 CASAVA_Build 17 62274154 1I ACCTCCCCCT -/G GGTCCCTCCC 2860 het 2860 ref 32 18 10 4 G 2 3 377986 CASAVA_Build 17 62287214 1I CACTTGACAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 41 14 10 17 A 12 13 377987 CASAVA_Build 17 62300517 2D TCACAAGCTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 36 het 37 0 19 18 T 16 14 377988 CASAVA_Build 17 62307014 1I GTCTGGGGAA -/C CCCTGCAGGG 3070 hom 90 het 35 0 29 6 C 3 4 377989 CASAVA_Build 17 62326078 3D AGGCTGAGAA GAG/--- GAGGCTGAGT 3070 het 3070 ref 35 18 12 7 GAG 2 1 377990 CASAVA_Build 17 62334350 1D AAAATCCTCC T/- TTTTTTTTTT 2145 het 2145 ref 32 17 7 8 T 12 11 377991 CASAVA_Build 17 62354789 1D AGCCGATCAC A/- CCACTGCACT 3070 het 2596 hom 18 9 8 1 A 1 0 377992 CASAVA_Build 17 62356236 1I TAGGAGTTGC -/T TTTCTAACTT 3070 hom 99 het 40 0 34 6 T 3 4 377993 CASAVA_Build 17 62359977 1D GCTGTTTAGC A/- GCCATAAGGA 3070 hom 159 het 57 0 52 6 A 1 0 377994 CASAVA_Build 17 62360191 1D GTGAGCTAGG A/- TCTGCATGGT 3070 hom 108 het 40 0 37 3 A 1 0 377995 CASAVA_Build 17 62371282 1I TGAGGCTGTG -/C CTTCGGGAAG 3070 hom 102 het 42 0 34 8 C 1 2 377996 CASAVA_Build 17 62376692 1D ACTTAACACA G/- GGGGGAAAAA 3070 het 3070 hom 30 10 17 4 G 6 5 377997 CASAVA_Build 17 62378151 1D CGGATGGCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 37 15 12 10 A 13 12 377998 CASAVA_Build 17 62380037 1I GCAGGCCTGT -/C CCCTCCCCTG 3070 het 944 hom 20 3 9 8 C 3 4 377999 CASAVA_Build 17 62383340 10D CCGCGCCCGG CTAATTTTTT/---------- CTAATTTTTT 1810 het 1525 hom 7 4 4 0 CTAATTTTTT 2 1 378000 CASAVA_Build 17 62399240 1I GCGGTGACTC -/A ACGCCTGTAA 2748 het 2254 hom 23 8 8 7 A 1 2 378001 CASAVA_Build 17 62405955 2D ATTATTTTAA CT/-- CTGTGATTAT 3070 het 3070 hom 39 13 24 3 CT 2 1 378002 CASAVA_Build 17 62409087 1D GATTGGCGTG T/- TTTACAATCG 3070 het 3070 hom 28 8 11 10 T 4 3 378003 CASAVA_Build 17 62418739 1D CCAAGCTCCT G/- GGGGGGGGGG 2233 het 884 hom 27 5 6 16 G 12 11 378004 CASAVA_Build 17 62422832 1I GCAGAGTGGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 47 21 14 12 T 9 10 378005 CASAVA_Build 17 62426995 1I ATTTACTGTT -/G TTTTTTTTTT 3070 het 2519 hom 34 12 17 5 G 0 1 378006 CASAVA_Build 17 62435944 2D CCTCCAGTCC CT/-- CTTCTGAAAC 3070 het 3070 ref 51 23 19 10 CT 2 1 378007 CASAVA_Build 17 62447869 1I CAGGGCTCTG -/C CCTCCGGGTG 3070 hom 101 het 39 0 31 8 C 2 3 378008 CASAVA_Build 17 62525977 3D AGAGATTCTG TGA/--- AGTTCAGTAT 3070 hom 63 het 23 0 22 4 TGA 1 0 378009 CASAVA_Build 17 62559726 1D GAAATGTATG T/- TTTTTTTTCA 3070 het 3070 ref 30 14 9 7 T 9 8 378010 CASAVA_Build 17 62589983 4I ACTTAGTATC ----/TTTT TTTTTCTTTT 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 5 9 378011 CASAVA_Build 17 62635699 1D CTGGGGAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1100 hom 17 5 9 3 A 15 14 378012 CASAVA_Build 17 62652543 1I CAGATCTGAA -/C ATATAAAGAA 3070 hom 72 het 29 0 24 5 C 0 1 378013 CASAVA_Build 17 62673011 1D CTCCAGTTGC T/- TTTTTTTTTT 705 het 705 ref 22 12 3 8 T 12 11 378014 CASAVA_Build 17 62690922 1D35M1D GCAGTGAGCC AAAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAG/-AAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAA- GAAGCAAAAC 3070 hom 99 het 34 0 32 12 N/A 0 0 378015 CASAVA_Build 17 62691634 6D TCTACTAAAA AATAAT/------ AATAATACAA 3070 hom 54 het 20 0 17 3 AAT 4 2 378016 CASAVA_Build 17 62707256 1I CAATATAACA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 ref 54 24 21 9 T 9 10 378017 CASAVA_Build 17 62714499 2I ATACACACAA --/AC ACACACACAC 3070 het 2794 hom 18 8 8 2 AC 7 8 378018 CASAVA_Build 17 62723154 2D TTATATATTT TA/-- TATATATATA 3070 hom 21 het 13 0 8 5 TA 10 9 378019 CASAVA_Build 17 62724359 2I CATTATTCAC --/AT GTTTCTGGTG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 AT 0 1 378020 CASAVA_Build 17 62726358 1D TTACTAAATG A/- AAAAAGTTTA 3070 hom 63 het 24 0 22 3 A 6 5 378021 CASAVA_Build 17 62730089 1I TTGTAATAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 736 hom 49 3 39 7 A 10 11 378022 CASAVA_Build 17 62731383 1I CAGGCGCCCG -/C CACCACGCCG 1930 hom 18 het 7 0 6 1 C 1 2 378023 CASAVA_Build 17 62765861 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 2963 het 2963 ref 20 11 7 2 T 8 9 378024 CASAVA_Build 17 62779936 1D TCTGTCGCCC A/- GGCTAGAGTG 3034 het 3034 ref 30 13 8 9 A 1 0 378025 CASAVA_Build 17 62784507 1I TATCTTGTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 714 hom 32 3 23 6 T 11 12 378026 CASAVA_Build 17 62788559 8I TGTTCCATTA --------/CTGGAACG CTGGAACGCT 3070 het 2913 hom 19 6 12 1 CTGGAACG 1 2 378027 CASAVA_Build 17 62789146 3D ACGCCGAGGC AGG/--- AGAATTCCTT 2642 het 2642 ref 20 11 7 2 AGG 1 0 378028 CASAVA_Build 17 62790811 1I ACACTGGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 19 9 5 A 11 12 378029 CASAVA_Build 17 62794453 1D AAATTTTACC T/- TTTTTTTATT 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 8 7 378030 CASAVA_Build 17 62794827 1I GCTCTTATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 32 17 9 6 T 10 11 378031 CASAVA_Build 17 62798129 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTGTT 3070 het 2955 hom 21 8 11 2 T 7 8 378032 CASAVA_Build 17 62812326 1D AAAGCTCCGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 77 hom 35 2 23 10 T 11 10 378033 CASAVA_Build 17 62823558 4D TAAATTTATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 het 3070 ref 15 7 7 1 TTTA 3 2 378034 CASAVA_Build 17 62835379 2D GTAGTAAGAA AG/-- GGGGAAAGAA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 AG 1 0 378035 CASAVA_Build 17 62837661 1D CTCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 4 het 18 0 8 11 A 16 15 378036 CASAVA_Build 17 62842489 1D ACGCTTACCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 25 0 19 6 A 13 12 378037 CASAVA_Build 17 62845751 1D AGGAAGGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 99 het 41 0 32 9 A 11 10 378038 CASAVA_Build 17 62852278 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 14 0 11 3 T 10 11 378039 CASAVA_Build 17 62853303 5D TCCCAGAACT TAAAA/----- TAAAAATAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 4 TAAAA 2 1 378040 CASAVA_Build 17 62855566 1D TTACAGGCAT A/- GTGCCACCAC 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 1 0 378041 CASAVA_Build 17 62871586 1I ATATGTCTTG -/T TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 52 24 21 7 T 8 9 378042 CASAVA_Build 17 62872134 3D TAACTAATTT CTC/--- CTTTAGTAGC 3070 het 3070 ref 42 19 18 6 CTC 1 0 378043 CASAVA_Build 17 62876954 1D AGACTTCGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 27 12 10 5 A 12 11 378044 CASAVA_Build 17 62889765 4D ATTCAGACTT ATAA/---- ATACTTCTGC 3070 het 3070 ref 28 17 7 6 ATAA 1 0 378045 CASAVA_Build 17 62927227 1D12M1D TATATCTCAA TTTTTTTTTAAGAT/-TTTTTTTTAAGA- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 29 0 26 4 N/A 0 0 378046 CASAVA_Build 17 62929807 1D AGGTTGTACT G/- GGGGTTGGGG 3070 hom 81 het 31 0 27 4 G 5 4 378047 CASAVA_Build 17 62943576 1I CTCTGTTCCT -/A ACCCCTTGCA 3070 hom 141 het 55 0 47 8 A 1 2 378048 CASAVA_Build 17 62947713 1I AGCAACAGCA -/G GGATAGAGGT 3070 hom 154 het 57 0 52 5 G 2 3 378049 CASAVA_Build 17 62949204 4I34M4I AATTGTGATC ----AAATATACATATCATAAAATTTACCATTTTAATC----/AAATAAATATACATATCATAAAATTTACCATTTTAATCTTTT TTTTTTTTTT 3070 het 3028 hom 30 12 18 16 N/A 0 0 378050 CASAVA_Build 17 62950072 1D AATTTTTAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 571 hom 27 2 22 3 T 13 12 378051 CASAVA_Build 17 62953794 1D TCACGAGGCC T/- AGATTTTTAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 T 1 0 378052 CASAVA_Build 17 62960081 3I GAGTGAGGCC ---/CTT CTTGAAAAAA 3070 hom 105 het 38 0 35 3 CTT 1 2 378053 CASAVA_Build 17 62964394 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 hom 28 het 11 0 8 3 A 7 6 378054 CASAVA_Build 17 62972874 4D ACTATATATG TATA/---- TATATATATA 2438 hom 19 het 11 0 7 4 TA 10 8 378055 CASAVA_Build 17 62977758 1I CACTGTTCTC -/T TAAGTTTTGC 3070 hom 57 het 21 0 20 1 T 1 2 378056 CASAVA_Build 17 62995692 2I CAGAAATAAG --/GA GGCTGCCAGC 3070 het 3070 ref 41 25 12 4 GA 0 1 378057 CASAVA_Build 17 62999331 1D TACCATGGCC A/- AAAAAAAAAA 301 het 301 ref 28 17 1 10 A 15 14 378058 CASAVA_Build 17 62999385 4D GGGGGAGTGG ACCT/---- ACCTAGATTT 3070 hom 75 het 29 0 23 7 ACCT 2 1 378059 CASAVA_Build 17 63010359 1D TGCAAGCTCC G/- GCCTTCCAGG 820 het 200 hom 5 1 2 2 G 2 1 378060 CASAVA_Build 17 63017543 3D AAAAAAAAAA AAG/--- AAAGAAAGAA 223 het 223 ref 24 12 2 11 AAG 1 0 378061 CASAVA_Build 17 63029897 1I CTTCAAGAGT -/A AAGAAGTAAT 3070 hom 111 het 44 0 37 7 A 2 3 378062 CASAVA_Build 17 63066658 1I TGTTATTATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 18 13 3 T 11 12 378063 CASAVA_Build 17 63079429 1I GGGTTTGTGT -/C CCCCCCAGAA 3070 het 3070 hom 39 13 20 6 C 6 7 378064 CASAVA_Build 17 63080303 1D TCATTCCTCT C/- CCAATGAATG 3070 hom 114 het 42 0 39 3 C 3 2 378065 CASAVA_Build 17 63094249 1D GATTAAACTT A/- AAAAAAAAAA 714 het 714 ref 24 15 2 7 A 15 14 378066 CASAVA_Build 17 63095382 6I GGAGCTTGCA ------/GTGAGC GTGAGCCGAG 3070 hom 33 het 13 0 12 1 GTGAGC 1 2 378067 CASAVA_Build 17 63096071 1D ATTTCTTTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 T 11 10 378068 CASAVA_Build 17 63107179 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 14 hom 26 2 18 7 A 17 16 378069 CASAVA_Build 17 63123452 1D CCTCTTGATG T/- TTTTTGCTTT 3070 hom 148 het 53 0 50 4 T 6 5 378070 CASAVA_Build 17 63132788 1D GAAGCTGCGG C/- TGAAAAATCC 3070 het 3070 hom 30 12 16 3 C 1 0 378071 CASAVA_Build 17 63138779 1D AGTACTTGGC A/- ACCTACTCCA 3070 hom 111 het 40 0 38 3 A 2 1 378072 CASAVA_Build 17 63140558 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2529 hom 39 het 15 0 12 3 A 11 12 378073 CASAVA_Build 17 63144070 2D GAGTTTACCT AC/-- AGAGATAAAT 3070 hom 99 het 36 0 34 3 AC 1 0 378074 CASAVA_Build 17 63149261 1D AAATTTCTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 90 het 38 0 31 10 A 12 11 378075 CASAVA_Build 17 63155679 1D GTTGTTGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 42 het 19 0 15 4 T 11 10 378076 CASAVA_Build 17 63157221 1D TAGTTTTTCA T/- TTTTTTAATT 3070 hom 108 het 39 0 37 2 T 7 6 378077 CASAVA_Build 17 63167479 1D AAATAACTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 23 4 T 11 10 378078 CASAVA_Build 17 63171784 2I AAAAAAAAAA --/AC AAAAAACCAT 3070 hom 52 het 21 0 18 3 AC 0 1 378079 CASAVA_Build 17 63171896 12D TATTTATTTC ATTTATTTATTT/------------ ATTTATTTAT 3070 hom 27 het 18 0 10 8 ATTT 10 7 378080 CASAVA_Build 17 63183878 4D CCTTTGTACC TTTT/---- TTTTTTTTTT 1632 het 75 hom 28 1 8 19 T 21 17 378081 CASAVA_Build 17 63185654 1D AGGTTTTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 94 het 35 0 30 5 T 11 10 378082 CASAVA_Build 17 63208279 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAG 2243 hom 15 het 6 0 6 0 A 10 9 378083 CASAVA_Build 17 63211904 1D ATTAAAAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 23 5 A 12 11 378084 CASAVA_Build 17 63220102 1I ACCTTGCTTC -/A AAAAAAAAAA 1505 het 1505 ref 28 17 4 7 A 12 13 378085 CASAVA_Build 17 63244302 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 75 hom 14 1 12 1 T 12 11 378086 CASAVA_Build 17 63261821 1I ATGAAAAGTT -/C AGTTTCTCCT 1303 het 1303 ref 47 39 3 6 C 0 1 378087 CASAVA_Build 17 63339935 2I TTGGCCAACT --/GG AATGTACTAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 G 0 2 378088 CASAVA_Build 17 63359841 1D CGTCTGAAGG A/- AAAAAAAAAA 1872 het 1872 ref 25 16 5 4 A 13 12 378089 CASAVA_Build 17 63368902 1D AAAGAAAAAC A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 87 het 37 0 30 8 A 10 9 378090 CASAVA_Build 17 63371503 3I ACAGCCAAGA ---/GTG AGCAGGGCCC 3070 hom 69 het 25 0 23 2 GTG 0 1 378091 CASAVA_Build 17 63376259 2D ATATACACAC AG/-- ACATACATAT 2436 het 80 hom 26 3 15 9 AG 1 0 378092 CASAVA_Build 17 63380703 6D44M1D CAGCTGGGAC TACGGGTACGGGCGAATGCCATGCCACCCTGTCTGGCTAATTTTGGGGTGT/------TACGGGCGAATGCCATGCCACCCTGTCTGGCTAATTTTGGGGTG- TTTTTGTTGT 3070 hom 80 het 31 0 26 16 N/A 0 0 378093 CASAVA_Build 17 63382025 1D AATTTTGGCA G/- GGGGGAATCA 3070 hom 69 het 27 0 24 4 G 6 5 378094 CASAVA_Build 17 63386924 1D TAAGCAGTTG T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 99 het 39 0 34 6 T 9 8 378095 CASAVA_Build 17 63387850 1I ATTATTTTGT -/G GTTATTTTAT 1351 het 1351 ref 33 26 3 4 G 1 2 378096 CASAVA_Build 17 63388713 8D ACAGCGAGAC AAAAGAAA/-------- AAAAGAAAAA 3070 hom 27 het 11 0 10 4 AAAAGAAA 2 1 378097 CASAVA_Build 17 63393001 1I TAGGTAACTA -/T TTACTAGAGC 3070 hom 75 het 34 0 24 10 T 2 3 378098 CASAVA_Build 17 63396138 3D CCTATGTAAA TCT/--- TCTTCGAAAA 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TCT 2 1 378099 CASAVA_Build 17 63398062 1D CGCTGTCTTT A/- AAAAAAAAAA 1129 het 1129 ref 16 12 3 1 A 15 14 378100 CASAVA_Build 17 63400868 1D GCTCTACAGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 11 10 11 A 11 10 378101 CASAVA_Build 17 63402651 1D AAATATCTTT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 18 0 17 1 A 10 9 378102 CASAVA_Build 17 63417972 3D TATAAAACTT TAA/--- TACTTGTCCT 3070 hom 75 het 26 0 26 1 TAA 1 0 378103 CASAVA_Build 17 63432080 1I ACCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 12 0 10 2 A 13 14 378104 CASAVA_Build 17 63434195 2I AAAGTCTTGC --/TA TGTTGCCCAG 3070 hom 45 het 20 0 15 5 TA 0 1 378105 CASAVA_Build 17 63436270 2D TTAGTAGAGA CG/-- GTGTTTCACC 3070 hom 39 het 21 0 14 10 CG 1 0 378106 CASAVA_Build 17 63467406 1I ATTTTTTTTT -/G GGGGGGTGGG 3070 hom 37 het 16 0 12 4 G 6 7 378107 CASAVA_Build 17 63479308 2I ATAAATCTTA --/CT CTACTGCTTA 3070 hom 90 het 33 0 31 2 CT 1 2 378108 CASAVA_Build 17 63483988 1I AAAAACAAAC -/A AAACGAACAA 3070 hom 93 het 34 0 31 3 A 3 4 378109 CASAVA_Build 17 63493373 5D TATATATATA TTTTT/----- TTTTTTTTTT 509 hom 5 het 7 0 2 5 T 15 10 378110 CASAVA_Build 17 63587661 9D CTCCAGCACT GAATCCTTC/--------- GAATCCTTCA 3070 hom 51 het 19 0 13 10 GAATCCTTC 2 1 378111 CASAVA_Build 17 63590503 2D CGTCTCTATT TA/-- AAGTCCAACT 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TA 1 0 378112 CASAVA_Build 17 63591762 1D GTGCCCGGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 18 0 15 3 T 11 10 378113 CASAVA_Build 17 63608089 4D TGAGCTGTAA CACT/---- CACCACGTAA 3070 hom 101 het 35 0 31 5 CACT 1 0 378114 CASAVA_Build 17 63610029 7D AAGGAGCCCG ACGCTGC/------- CTCCCGGGGC 1954 hom 27 het 10 0 9 1 ACGCTGC 1 0 378115 CASAVA_Build 17 63619336 1D AGTTTTAAGC A/- TATTTTAATG 3070 het 3070 ref 35 19 16 0 A 1 0 378116 CASAVA_Build 17 63628516 6I TCTCAAAAAT ------/AAATAA AAATAAAAAA 2541 het 2541 ref 29 15 7 7 AAATAA 1 2 378117 CASAVA_Build 17 63631805 2I GAGACAAAAC --/TA TGATTATTTG 3070 het 3070 ref 36 17 15 4 TA 0 1 378118 CASAVA_Build 17 63644426 2I TACAAAGAAG --/GC CAGGCATGGT 2478 hom 15 het 7 0 6 1 GC 0 1 378119 CASAVA_Build 17 63649817 1D ACAGTTAAGG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 A 10 9 378120 CASAVA_Build 17 63650621 5D TCCCTCCCTC CTTGT/----- CCTCCCTCCC 780 het 780 ref 20 13 3 4 CTTGT 1 0 378121 CASAVA_Build 17 63671715 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 390 hom 16 1 10 5 A 11 12 378122 CASAVA_Build 17 63696069 4D GAGGTAAATG AAGA/---- AAGAAGAGTT 3070 hom 60 het 22 0 21 7 AAGA 2 1 378123 CASAVA_Build 17 63708778 1I TGCCAGCCAG -/C CAGGCAGCTT 3070 hom 38 het 14 0 12 2 C 1 2 378124 CASAVA_Build 17 63708894 7I ATTCTCTGTC -------/CTGGTGA CTGTAGGAGG 3020 hom 27 het 10 0 8 2 CTGGTGA 0 1 378125 CASAVA_Build 17 63718694 2D CAAAAAAAAA GG/-- GGGGGGGGGA 1649 het 1293 hom 23 10 6 7 G 11 9 378126 CASAVA_Build 17 63720441 2D TAGCTAGGAT TA/-- TACAGGTGCA 3070 het 3070 ref 27 13 10 7 TA 2 1 378127 CASAVA_Build 17 63721773 1D TAATGACAGG T/- TTTTTTTTTT 2330 het 2003 hom 14 6 5 3 T 11 10 378128 CASAVA_Build 17 63721830 1D CTTCCTATTC T/- TTTTTTTTTT 1828 het 1828 ref 17 10 4 3 T 12 11 378129 CASAVA_Build 17 63722525 1I TCTTTAACAA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2617 hom 27 7 13 7 T 13 14 378130 CASAVA_Build 17 63722660 19D GCTGGGACTA CAGGTGTGTGACACCACGC/------------------- CCGGCTAATT 3070 het 3070 ref 34 17 16 8 CAGGTGTGTGACACCACGC 1 0 378131 CASAVA_Build 17 63724966 5I CTCAGATGAC -----/TTTTT AAATACCTGT 3070 het 3070 ref 28 14 13 1 T 0 5 378132 CASAVA_Build 17 63728064 4I TATGCCTCCC ----/CTTG CTTGCTTTAC 3070 het 3070 hom 29 11 15 3 CTTG 1 2 378133 CASAVA_Build 17 63732763 1D AAAAAAAAAA C/- ACACACACAC 2644 het 2644 ref 26 11 11 4 C 1 0 378134 CASAVA_Build 17 63732927 1I ACTCTGTCTT -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 ref 33 17 14 2 A 7 8 378135 CASAVA_Build 17 63743570 2D AAAATCTTAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1620 hom 23 6 10 7 T 13 11 378136 CASAVA_Build 17 63747537 1I CACACAGAAC -/C CCCCCACCAG 3070 het 3070 ref 30 20 9 1 C 6 7 378137 CASAVA_Build 17 63750615 1I CCCTCTCTAC -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 A 7 8 378138 CASAVA_Build 17 63752937 1I CTTCTAATGT -/A AAAAAAAAAA 1153 het 1153 ref 20 9 8 3 A 15 16 378139 CASAVA_Build 17 63754711 1I ACCGGGGTGC -/G GGGGGGGTGG 1024 het 1024 ref 13 7 3 3 G 7 8 378140 CASAVA_Build 17 63759022 8I ATATTTAAAA --------/CTGTATAG TATTTTCAGT 3070 het 3070 hom 22 9 9 4 CTGTATAG 0 1 378141 CASAVA_Build 17 63770977 1D GAGAGTCATT A/- ACGAGAACTG 1846 het 1846 ref 25 17 5 3 A 2 1 378142 CASAVA_Build 17 63775484 1D GTGTGACTCC A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 ref 37 19 14 4 A 9 8 378143 CASAVA_Build 17 63782521 1D AGTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 192 hom 23 1 14 8 T 13 12 378144 CASAVA_Build 17 63802858 3D CTGGGGGATT GAG/--- GAGGATGGCG 3070 het 3070 hom 50 16 26 10 GAG 2 1 378145 CASAVA_Build 17 63809466 2D TCCTCTCTGA CT/-- CTAATCCCTG 3070 het 3070 hom 34 13 18 4 CT 2 1 378146 CASAVA_Build 17 63825838 2D TCTGTCTTGG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 45 het 20 0 16 4 A 15 13 378147 CASAVA_Build 17 63830376 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAG 3070 het 2250 hom 20 7 10 3 A 10 9 378148 CASAVA_Build 17 63850095 2D TATGTATGTG TT/-- TTTTTTTTTT 2251 het 204 hom 12 2 6 4 T 13 11 378149 CASAVA_Build 17 63860081 2D ATAGTAAGTG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 10 12 A 14 12 378150 CASAVA_Build 17 63871204 1I CTTTTGTTTC -/T TTTCTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 21 10 7 T 3 4 378151 CASAVA_Build 17 63873981 1D GGCAAAAAAA T/- AAAATAAAAT 1835 het 1835 ref 14 6 6 2 T 1 0 378152 CASAVA_Build 17 63878711 1D TTGTCTCCAG T/- TCTTACAAGA 3070 hom 90 het 37 0 29 8 T 2 1 378153 CASAVA_Build 17 63880614 16D GAAATGCTGA TTTTTTTTTTTTTTTT/---------------- TTTTTTTTTT 2312 hom 14 het 31 0 9 22 T 32 16 378154 CASAVA_Build 17 63880806 1I TTTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3065 het 1279 hom 15 4 9 2 T 9 10 378155 CASAVA_Build 17 63882081 9D GCTAAAAGTC CAGAAGGTG/--------- CAGAAGGTGT 3070 hom 54 het 22 0 18 5 CAGAAGGTG 2 1 378156 CASAVA_Build 17 63903752 1I TTTTTTTTTG -/T TTTTTTTTTT 1961 het 457 hom 24 6 12 6 T 11 12 378157 CASAVA_Build 17 63926181 3D GTAGGCAAAG ACA/--- ACAACTATTA 3070 het 3070 ref 53 26 21 7 ACA 2 1 378158 CASAVA_Build 17 63928998 1D AACAAAAAAA T/- ATATAAAAAC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 T 1 0 378159 CASAVA_Build 17 63945980 8I GCACGTTCTG --------/GCAGCCCT GCAGCCCTGC 3070 het 3070 hom 40 15 18 7 GCAGCCCT 1 2 378160 CASAVA_Build 17 63953247 1I GCTTCGGCCC -/T CATTTGAACA 3070 het 1351 hom 19 4 12 3 T 0 1 378161 CASAVA_Build 17 63957900 1I AAAATGCTAC -/A AAAAAAAACA 3070 hom 75 het 33 0 25 8 A 8 9 378162 CASAVA_Build 17 63964237 4D TGAAAATAGG GAAA/---- GAAACAGGCG 3070 het 3070 ref 47 27 15 5 GAAA 2 1 378163 CASAVA_Build 17 63966677 2I TATGTATGTG --/TA TATATATATA 3070 het 3070 ref 35 14 12 9 TA 7 8 378164 CASAVA_Build 17 63968879 1I GATTTTGGCC -/T TTTCTCTTTC 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 3 4 378165 CASAVA_Build 17 63972424 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 559 het 197 hom 27 4 5 19 A 11 10 378166 CASAVA_Build 17 63972829 1D GCCCGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 2934 het 275 hom 11 1 10 0 T 13 12 378167 CASAVA_Build 17 63985434 1I TTTATTCTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 491 hom 22 2 19 1 T 11 12 378168 CASAVA_Build 17 63994123 4D TCTTTCTTTC TCTT/---- TCTTTCTTTC 2792 hom 9 het 31 1 15 15 TCTT 7 6 378169 CASAVA_Build 17 63998819 4I AAAATGATTA ----/TTTC TTTCTTTCTT 3070 het 614 hom 24 7 12 5 TTTC 3 4 378170 CASAVA_Build 17 64008838 3D CATACTCCTC CTT/--- GACGGTGGAT 3070 het 3070 hom 38 19 19 0 CTT 1 0 378171 CASAVA_Build 17 64019402 1D CACCCCCGGC G/- GGGGAGAGCG 3070 hom 35 het 16 0 10 6 G 5 4 378172 CASAVA_Build 17 64020867 1D CCCAATTTTG C/- CCCCCTGAGG 2892 het 2892 ref 42 17 9 16 C 6 5 378173 CASAVA_Build 17 64033782 2I AGCGAATATT --/TC TTTCTTTTAA 3070 het 3070 hom 40 17 22 1 TC 0 1 378174 CASAVA_Build 17 64052448 1D ACCGTTACAG C/- ACAACCCTCC 3070 het 3070 ref 34 17 12 5 C 1 0 378175 CASAVA_Build 17 64055761 3D CATTTCAATA TTG/--- TTGTGTCTTA 3070 het 3070 ref 38 22 9 9 TTG 2 1 378176 CASAVA_Build 17 64076536 1D CAGGTTTATC T/- CTTCATCTCA 3070 het 3070 hom 35 12 21 2 T 1 0 378177 CASAVA_Build 17 64087746 3I TTAATAGTTT ---/TAA GCATTTGCAT 3070 het 3070 hom 55 22 27 6 TAA 0 1 378178 CASAVA_Build 17 64089318 1D TCTTTTTTCC T/- TTTTTTTTTT 2890 hom 21 het 11 0 8 3 T 14 13 378179 CASAVA_Build 17 64090703 1D GCCCAGCTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 20 hom 17 1 13 3 T 13 12 378180 CASAVA_Build 17 64093060 4I CACTATGTTT ----/ATTA ATTAATATCC 3070 hom 93 het 38 0 32 6 ATTA 1 2 378181 CASAVA_Build 17 64093188 1D GCTTTATTTA T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 75 het 30 0 26 4 T 10 9 378182 CASAVA_Build 17 64098667 1D CCAGACCTGG C/- CCAATGAGCA 3070 het 3070 ref 37 17 16 4 C 3 2 378183 CASAVA_Build 17 64105127 1D GGCATCCACA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 31 0 20 11 T 12 11 378184 CASAVA_Build 17 64121221 1D TTTTCATTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 34 15 9 12 A 15 14 378185 CASAVA_Build 17 64129470 1D AAGAGAGATT G/- GGGGGGGTGC 3070 hom 80 het 32 0 27 6 G 8 7 378186 CASAVA_Build 17 64136226 2D TCCTCAAAAC TG/-- TTTATCTTTC 3070 het 3070 ref 49 27 21 2 TG 1 0 378187 CASAVA_Build 17 64144061 1D ACCCTCAACG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 230 hom 31 2 16 14 T 17 16 378188 CASAVA_Build 17 64145906 1I CCTCTCACAA -/T ATGTGAGAAT 3070 het 3070 ref 28 19 8 1 T 0 1 378189 CASAVA_Build 17 64166255 1I CAAACTTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 919 hom 28 2 19 7 A 13 14 378190 CASAVA_Build 17 64172494 1I CATGAGAAAC -/A CACATTTTCA 3070 hom 135 het 50 0 46 4 A 0 1 378191 CASAVA_Build 17 64180062 1I TACCTCTGAT -/C GGGGGGGGAA 3070 het 3070 ref 30 16 10 4 C 0 1 378192 CASAVA_Build 17 64180988 1I CTCCTAGCTC -/T TTTTGAGACC 3070 hom 111 het 41 0 37 4 T 4 5 378193 CASAVA_Build 17 64185322 1I ATTGTGTGTT -/C CCCAGGCCTC 3070 het 3070 hom 45 20 20 5 C 3 4 378194 CASAVA_Build 17 64185754 1I TTTTTCATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2376 hom 26 6 15 5 T 11 12 378195 CASAVA_Build 17 64192919 1D AAACTAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 39 14 15 11 A 12 11 378196 CASAVA_Build 17 64202973 1D CTGGGAGGGT G/- GGGGTGTGCT 3070 het 3070 ref 43 19 17 8 G 5 4 378197 CASAVA_Build 17 64205235 1D TATTATTATT A/- TTTTTTACTT 3070 het 3070 hom 23 10 10 3 A 1 0 378198 CASAVA_Build 17 64210989 1D ATTGGTGATC T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 57 25 23 10 T 9 8 378199 CASAVA_Build 17 64226367 1I GAGATTTCAA -/C CCAAAAAATC 3070 het 3070 ref 49 26 19 4 C 2 3 378200 CASAVA_Build 17 64226462 1I AGTTTTGATG -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 ref 42 21 13 8 T 8 9 378201 CASAVA_Build 17 64229121 2I ATACAAAATG --/TA TATATATATA 2413 het 2413 ref 17 8 6 3 TA 6 7 378202 CASAVA_Build 17 64250272 1D TTTTTCTAAG A/- AAAAAGAGAA 3070 het 3070 ref 34 20 10 5 A 6 5 378203 CASAVA_Build 17 64271423 1D GTCTGACCAA C/- CCTATTTATC 3070 het 3070 hom 60 20 29 11 C 3 2 378204 CASAVA_Build 17 64273518 4I AAAATAAAAT ----/AATA AATAAATAAA 1301 het 1301 ref 12 7 3 2 AATA 4 5 378205 CASAVA_Build 17 64276487 1D AGGAAGCCCT G/- GGAAAGTTCC 3070 het 3070 ref 55 25 16 15 G 3 2 378206 CASAVA_Build 17 64280352 1D TGATCCTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 17 9 12 T 11 10 378207 CASAVA_Build 17 64284732 1D CCATTTTCTG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 111 het 41 0 38 4 T 10 9 378208 CASAVA_Build 17 64304149 2I TATCCTTGAG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 30 het 16 0 11 5 T 12 14 378209 CASAVA_Build 17 64306489 9D CCTTGTCCCT ACAAAAAAA/--------- AAAAAAAAAA 789 het 789 ref 16 9 6 6 ACAAAAAAA 1 0 378210 CASAVA_Build 17 64309239 1D TAGCAAACAA T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 78 het 30 0 26 4 T 9 8 378211 CASAVA_Build 17 64310920 1D AGGGAAAAAG T/- TTTTTTACAA 3070 hom 105 het 40 0 36 4 T 7 6 378212 CASAVA_Build 17 64312611 1I AGCTTTGTGG -/T TTTTCTCTGT 3070 hom 138 het 49 0 47 2 T 4 5 378213 CASAVA_Build 17 64321446 1D CATTGATTTA T/- TTTTTAAATT 3070 hom 108 het 39 0 36 3 T 6 5 378214 CASAVA_Build 17 64321686 9I TTATTGCTCC ---------/TATTTAACT GTAAATATGT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 TATTTAACT 0 1 378215 CASAVA_Build 17 64332897 1D TAGTATTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1282 hom 30 6 15 9 T 13 12 378216 CASAVA_Build 17 64340880 1I GTAAGGACAA -/T GAGCAAGTAG 3070 het 3070 hom 37 14 18 5 T 0 1 378217 CASAVA_Build 17 64345755 1D AGATAGTGTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 43 15 14 15 A 15 14 378218 CASAVA_Build 17 64347818 2D GACTGGTGTC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 392 hom 27 4 14 9 T 17 15 378219 CASAVA_Build 17 64350508 2I CAACATGGTG --/AA AAACCCCGTC 3070 het 2986 hom 20 9 10 1 A 3 5 378220 CASAVA_Build 17 64355055 4D ATTGATTCTC TGAT/---- TGGGGAACAT 3070 het 3070 ref 40 19 17 6 TGAT 1 0 378221 CASAVA_Build 17 64366448 2I CAGGCCCTCA --/AG AATGATGCTA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 AG 0 1 378222 CASAVA_Build 17 64387036 4D TATGAAAGAT TAAA/---- TATTACATAC 3070 het 3070 ref 39 23 15 2 TAAA 1 0 378223 CASAVA_Build 17 64401458 1I TCATATTCTC -/T TTTTTTTTTT 2478 het 1863 hom 17 6 6 5 T 13 14 378224 CASAVA_Build 17 64422633 2I AAATTATACT --/AC AGAGTTGTAA 3070 het 3070 ref 29 18 10 1 AC 0 1 378225 CASAVA_Build 17 64432985 1D GAGAATGACT A/- TTGGATACCT 3070 het 3070 ref 35 23 12 2 A 1 0 378226 CASAVA_Build 17 64435185 1D TCTGGGGAGA T/- TTTTTTTTAA 3070 het 3070 ref 41 21 16 5 T 9 8 378227 CASAVA_Build 17 64453070 1I ACTCAGTTGA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 39 21 13 5 T 9 10 378228 CASAVA_Build 17 64459449 3I TTCTGATAAT ---/AAC ATGGAGACAC 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 AAC 0 1 378229 CASAVA_Build 17 64465932 2D GGTAGTACAC AT/-- GTTTTAGAAA 3070 het 3070 hom 37 14 20 3 AT 1 0 378230 CASAVA_Build 17 64468329 3D TCTCAACCTC CTT/--- CTTGTTGTGG 3070 het 3070 ref 39 27 11 4 CTT 2 1 378231 CASAVA_Build 17 64470860 2D AAGACCACTC CT/-- CTCATAAAAT 3004 het 3004 ref 24 12 9 4 CT 2 1 378232 CASAVA_Build 17 64474664 3I CATTCCTACA ---/TTG CTGTTGTTCT 3070 hom 60 het 27 0 21 6 TTG 0 1 378233 CASAVA_Build 17 64475445 1D TCAGCATCTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 T 12 11 378234 CASAVA_Build 17 64479571 2D CACCCCAGAA AG/-- AGAGACTTCA 3070 het 3070 hom 29 13 14 4 AG 3 2 378235 CASAVA_Build 17 64483291 4D TTAATCAAAA AAAT/---- AAATAAGAAA 3070 het 3070 ref 20 8 9 3 AAAT 2 1 378236 CASAVA_Build 17 64484774 3D GGAAACATGT GAA/--- GAAGAAATAC 3070 het 3070 hom 39 16 22 3 GAA 3 2 378237 CASAVA_Build 17 64500562 1D AAAAAAAAAA G/- GGGGGGGGTC 2294 het 588 hom 33 8 8 18 G 9 8 378238 CASAVA_Build 17 64503435 1D CCTTTGACTT G/- TCATAAACCA 3070 het 3070 ref 41 20 17 4 G 1 0 378239 CASAVA_Build 17 64549915 2D AACTTGCCTC TA/-- CTGTCATCTC 3070 het 3070 hom 47 24 19 6 TA 1 0 378240 CASAVA_Build 17 64552678 1I TTGTTCAGGT -/G TTTTTTTAGG 3070 hom 108 het 39 0 37 2 G 0 1 378241 CASAVA_Build 17 64556163 1I GCATGGACTT -/A ACGCCACATT 3070 het 3070 ref 57 31 19 7 A 1 2 378242 CASAVA_Build 17 64557772 4D AAGAACCTAG TTAA/---- TTATTTAGTT 3070 het 3070 ref 46 22 20 6 TTAA 1 0 378243 CASAVA_Build 17 64561517 2D CAGTAATGAC TG/-- AGAATTTCCC 3070 het 3070 ref 32 18 12 2 TG 1 0 378244 CASAVA_Build 17 64568258 4D GTAAAATTAA AAAC/---- AAACAAAGAA 3070 het 3070 hom 36 15 17 5 AAAC 2 1 378245 CASAVA_Build 17 64570653 1I TAATGTACAC -/T TTTTTTTGGC 3070 het 3070 hom 38 12 17 9 T 7 8 378246 CASAVA_Build 17 64570914 2D TTTGCATATA TC/-- TCTGTTTATT 3070 het 3070 hom 49 23 23 4 TC 2 1 378247 CASAVA_Build 17 64575338 4D GAGAAAGAAA AAAG/---- AAAGAAAGAA 1858 het 1858 ref 24 9 8 7 AAAG 5 4 378248 CASAVA_Build 17 64607685 1I GGCTTCATTT -/C CTAATCCTGC 3070 hom 123 het 48 0 41 7 C 1 2 378249 CASAVA_Build 17 64608089 3D GTGAATAAAT AAA/--- TCAACAGATA 3070 hom 120 het 44 0 41 4 A 3 0 378250 CASAVA_Build 17 64608368 1D ACTTGGCAGG A/- AAAAAAAATC 3070 hom 87 het 35 0 30 7 A 9 8 378251 CASAVA_Build 17 64638053 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2559 hom 35 9 15 11 A 13 12 378252 CASAVA_Build 17 64639310 1D CTATCTTGCT A/- AAAAACAAAG 3070 het 3070 ref 34 16 13 6 A 6 5 378253 CASAVA_Build 17 64640610 2I ACATACATGA --/GT GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 58 22 29 7 GT 5 6 378254 CASAVA_Build 17 64652502 4I CTTCCTTCTT ----/TTTC TTTCTCTTTT 3070 het 3070 hom 51 23 22 6 TTTC 1 2 378255 CASAVA_Build 17 64664489 4D AAACAAAAAC AAAT/---- AAATAAATGA 3070 het 3070 ref 21 11 9 2 AAAT 3 2 378256 CASAVA_Build 17 64678024 2D ATTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 12 0 10 2 A 16 14 378257 CASAVA_Build 17 64680539 3I TTAAAAGCAG ---/GTT GTTAAGTCTG 3070 het 3070 hom 46 21 21 4 GTT 1 2 378258 CASAVA_Build 17 64687363 1I CAGAACAGTC -/A AAAAGGAAAG 3070 het 3070 ref 45 21 19 5 A 4 5 378259 CASAVA_Build 17 64699394 2I AGTTATTTTA --/TG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 51 19 26 6 TG 4 5 378260 CASAVA_Build 17 64707003 5I GCTCTACTAC -----/TTCTT TTATCAGTTA 3070 het 3070 hom 46 15 22 9 TTCTT 0 1 378261 CASAVA_Build 17 64710515 2I TTAAATGGAC --/TT ATATCTATTA 3070 het 3070 ref 36 19 14 3 T 0 2 378262 CASAVA_Build 17 64717061 5D CTAATTAGAG AATTC/----- AATTCATTTC 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 AATTC 2 1 378263 CASAVA_Build 17 64717455 1I ACCTTCTGAG -/A AATGTGTCAT 3070 het 3070 ref 49 26 20 3 A 2 3 378264 CASAVA_Build 17 64718342 5I CCCAAAGTTC -----/ATTAT ATTATTCACA 3070 het 3070 hom 34 15 16 3 ATTAT 1 2 378265 CASAVA_Build 17 64737452 4D GAAGCATACT TTAA/---- TTGCTTTCCT 1934 het 1934 ref 33 13 7 14 TTAA 1 0 378266 CASAVA_Build 17 64745896 1D AGACTCTGTC A/- AAAAAAAAAA 1538 het 596 hom 17 5 6 6 A 17 16 378267 CASAVA_Build 17 64757353 1D TAAAAATTGT A/- AAAGGTTTAC 3070 het 3070 hom 44 17 24 3 A 4 3 378268 CASAVA_Build 17 64769285 3D TTACAAAAGA CAT/--- GTAACATTTT 3070 het 3070 hom 38 16 18 5 CAT 1 0 378269 CASAVA_Build 17 64791489 2D CTTCCTGATG AT/-- ATAATCTAAG 3070 het 3070 ref 38 21 13 4 AT 2 1 378270 CASAVA_Build 17 64791555 4I TATCACTATC ----/AGTA AGTATCTCAT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 AGTA 1 2 378271 CASAVA_Build 17 64793057 1D ATTTCTTTTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 10 9 378272 CASAVA_Build 17 64806428 1D TACAAAAATC A/- ACTCAAGATA 3070 het 3070 hom 27 10 17 0 A 2 1 378273 CASAVA_Build 17 64812719 2I GTAATTAAAA --/AT ATAGTATTGG 3070 hom 96 het 35 0 33 2 AT 1 2 378274 CASAVA_Build 17 64815868 3I GAAAATATGA ---/CTT CTTTTTTATC 3070 hom 111 het 39 0 38 1 CTT 1 2 378275 CASAVA_Build 17 64821160 2I ATGAATAAAA --/AG TAAAAGCAAT 3070 hom 33 het 16 0 12 4 AG 0 1 378276 CASAVA_Build 17 64824227 1D TGTCTCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 31 9 15 8 A 11 10 378277 CASAVA_Build 17 64840627 1D ATCTTAAAAT C/- AAGGAGATTT 3070 hom 120 het 47 0 41 7 C 1 0 378278 CASAVA_Build 17 64840899 4D GTTGAACTTC TGTT/---- TGTTTGTTTG 3070 hom 102 het 49 0 35 15 TGTT 6 5 378279 CASAVA_Build 17 64849931 4D AAAAAAAAAC AAAT/---- GAACACAGAA 3070 het 52 hom 33 2 14 17 AAAT 1 0 378280 CASAVA_Build 17 64850659 1D ACCATGAAGA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 233 hom 24 1 18 5 T 10 9 378281 CASAVA_Build 17 64857695 2D ATGAGCTAAT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 30 15 11 4 A 13 11 378282 CASAVA_Build 17 64860097 1D TGATGGTGGA C/- CCCCCCAGCC 3070 het 3070 ref 45 23 12 10 C 7 6 378283 CASAVA_Build 17 64862159 1D AGGCTTAACC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 36 17 12 7 A 13 12 378284 CASAVA_Build 17 64863797 1D AATTAAGTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 16 14 7 A 13 12 378285 CASAVA_Build 17 64864136 2D GTATATGGAC TA/-- TATATATATA 3070 het 267 hom 29 2 15 13 TA 8 7 378286 CASAVA_Build 17 64876561 4D CAGTAGACTT AAGA/---- GAAAGACTTA 3070 het 3070 hom 34 13 20 2 AAGA 1 0 378287 CASAVA_Build 17 64900726 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 117 hom 14 1 13 0 A 12 13 378288 CASAVA_Build 17 64905629 1D TTTTATTTTA T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 T 9 8 378289 CASAVA_Build 17 64954597 2D AAGAATAAGG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 88 het 37 0 28 10 T 14 12 378290 CASAVA_Build 17 64955981 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 438 hom 30 2 16 12 T 14 13 378291 CASAVA_Build 17 64962772 1D ACTATTATTA T/- TTTTTTTTTT 2800 hom 28 het 19 0 8 11 T 15 14 378292 CASAVA_Build 17 64971245 2I CACACATATG --/TA TATATATATA 2934 het 1983 hom 18 7 8 3 TA 6 7 378293 CASAVA_Build 17 65001517 2I AAAAAAAAAA --/AT ATATATGTAT 3070 het 1904 hom 22 6 10 6 AT 3 4 378294 CASAVA_Build 17 65003818 1D CTACTAGGAC T/- TTTTTTTTTT 1347 het 1347 ref 38 28 4 7 T 12 11 378295 CASAVA_Build 17 65005738 26D AGGGTGCAAT GCTTGTATTGCACATCACACATACCC/-------------------------- GCTGTTATTA 3070 het 3070 ref 39 28 17 5 GCTTGTATTGCACATCACACATACCC 1 0 378296 CASAVA_Build 17 65006023 4D GTAAAACAAG ACAA/---- ACAAACAAAC 3070 het 3070 hom 48 13 20 17 ACAA 5 4 378297 CASAVA_Build 17 65008492 1I ATTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2213 het 2213 ref 27 9 8 10 A 10 11 378298 CASAVA_Build 17 65011899 3I TTTAATTGGT ---/TTC TTAAGTTTCT 3070 het 3070 hom 45 17 22 6 TTC 0 1 378299 CASAVA_Build 17 65014038 3D AAAGGAACAC TTT/--- TTTTTTATTA 3070 het 3070 ref 48 21 21 6 T 9 6 378300 CASAVA_Build 17 65014145 2D CTCCTTCTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 42 14 15 14 T 14 12 378301 CASAVA_Build 17 65018538 1D TGTGACATCC T/- TTTTTTTTTT 2147 het 2147 ref 54 41 5 8 T 11 10 378302 CASAVA_Build 17 65024520 2I ATCCTCAGTG --/TT GTGTGTGATT 3070 het 3070 ref 37 19 11 7 T 0 2 378303 CASAVA_Build 17 65085777 4I AATATCATAC ----/AATA AATATTAAGT 3070 hom 69 het 28 0 24 4 AATA 1 2 378304 CASAVA_Build 17 65099512 1I CTTTTACTGC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 747 hom 42 3 27 12 A 12 13 378305 CASAVA_Build 17 65100532 4D TCTTTCTTTC CTTT/---- CTTTCTTTCT 3070 hom 57 het 29 0 19 11 CTTT 4 3 378306 CASAVA_Build 17 65105909 3I TTGCACAGTT ---/TTA TTAACTCACC 3070 hom 126 het 47 0 43 4 TTA 1 2 378307 CASAVA_Build 17 65109242 1D CATAAAATCA G/- CTATGGATGA 3070 hom 72 het 25 0 25 1 G 1 0 378308 CASAVA_Build 17 65112947 1I ACAAAAAAAA -/C CCTAAAGGTT 3070 hom 78 het 33 0 26 7 C 2 3 378309 CASAVA_Build 17 65125557 2I TAGGATAGGA --/GT GTGACCCAAT 3070 hom 30 het 11 0 11 0 GT 1 2 378310 CASAVA_Build 17 65125903 8I GGGCTATGTA --------/TCTTTTGG TCTATTCTAG 3070 hom 48 het 22 0 17 5 TCTTTTGG 0 1 378311 CASAVA_Build 17 65126446 2I TTCGTCTTCT --/TC TTTTTTTTTG 3070 hom 120 het 43 0 41 2 TC 0 1 378312 CASAVA_Build 17 65128735 2D TATATGATCA TT/-- TTTTTTTTTT 1457 het 295 hom 25 3 3 21 T 14 12 378313 CASAVA_Build 17 65130044 3D CTATTTCTGT TAA/--- TAATGACACT 3070 hom 129 het 45 0 44 5 TAA 2 1 378314 CASAVA_Build 17 65135103 1I AAAATAATAG -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 19 0 18 1 T 9 10 378315 CASAVA_Build 17 65161071 1D CATGTGATTC T/- TTTTTTTTTT 905 het 905 ref 36 23 5 8 T 15 14 378316 CASAVA_Build 17 65175633 1D GTACAAACTC T/- TTTTTTTTTT 1874 het 1366 hom 41 14 7 20 T 19 18 378317 CASAVA_Build 17 65192942 1D TGTTTTTTAA T/- TTTTTTTTTT 1880 het 1880 ref 27 13 7 7 T 17 16 378318 CASAVA_Build 17 65299960 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 28 11 15 2 A 11 10 378319 CASAVA_Build 17 65379172 2D AAAAAAAAGC AA/-- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 12 17 5 A 10 8 378320 CASAVA_Build 17 65380874 1D CTTAAACACA T/- TTTTTTTCCT 3070 het 3070 ref 36 16 16 4 T 8 7 378321 CASAVA_Build 17 65381360 6I CACATAAAAC ------/TGACTA TGACTAAAAG 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 TGACTA 1 2 378322 CASAVA_Build 17 65383941 4I TGTTAAAAAA ----/ACAC AAACACACAC 3070 het 3070 hom 45 19 21 5 AC 0 2 378323 CASAVA_Build 17 65385774 1I ATTATAATTG -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 31 13 11 7 T 9 10 378324 CASAVA_Build 17 65386390 1I TGAAAATACT -/A AAAAAGCACT 3070 hom 117 het 44 0 40 4 A 5 6 378325 CASAVA_Build 17 65387860 1I CAAGAAATTC -/A AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 34 14 16 4 A 8 9 378326 CASAVA_Build 17 65392117 1I CACATTTAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 17 23 6 A 9 10 378327 CASAVA_Build 17 65394245 10I GAAGTTAATC ----------/ATTTCACTGT AAATCACAGA 3070 het 3070 ref 35 16 16 3 ATTTCACTGT 0 1 378328 CASAVA_Build 17 65394616 2I TCAATAAAAC --/TG AGGAATCTTT 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 TG 0 1 378329 CASAVA_Build 17 65395790 1D CACTGCCTTA T/- TTTTTTTCTC 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 T 8 7 378330 CASAVA_Build 17 65397072 1I TGAAATCCAT -/A GGAAGTAGGT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 0 1 378331 CASAVA_Build 17 65397329 5D ATTAAAACTA AAATT/----- AAAATAAGTT 3070 het 3070 ref 30 13 11 8 AAATT 1 0 378332 CASAVA_Build 17 65398200 1I CTTCTAAAAA -/G ATCTGATTGC 3070 het 3070 ref 40 26 12 2 G 0 1 378333 CASAVA_Build 17 65398392 1I GCAAGTCAAT -/A AAGGCGGCGA 3070 het 3070 ref 46 27 18 1 A 2 3 378334 CASAVA_Build 17 65411244 1I CCAAAGAGTT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 hom 50 21 25 4 A 7 8 378335 CASAVA_Build 17 65424001 5I CACAAATTCC -----/AAATG AACTGAGTCT 3070 hom 105 het 36 0 35 1 AAATG 0 1 378336 CASAVA_Build 17 65427128 1D CAAAGTTTTG T/- TTTGTTTTTC 3070 hom 98 het 42 0 33 10 T 4 3 378337 CASAVA_Build 17 65428026 1I ACAAACCTCC -/A TTACACAAGT 3070 het 3070 ref 45 23 17 5 A 0 1 378338 CASAVA_Build 17 65428082 1I CTTAAAAGTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 149 hom 36 1 26 9 A 12 13 378339 CASAVA_Build 17 65429059 1I TTTTTTTTTT -/C CCCCACACAG 3070 het 232 hom 45 2 35 8 C 4 5 378340 CASAVA_Build 17 65430468 1I TGTAGAATTC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 466 hom 34 2 28 4 T 10 11 378341 CASAVA_Build 17 65436058 8D AAATGTGTTT ACACACAC/-------- ACACACACAC 3070 hom 50 het 26 0 15 13 AC 21 17 378342 CASAVA_Build 17 65442192 1D TGTCCCGAAT A/- AGTTCTTAAT 3070 hom 111 het 43 0 36 7 A 2 1 378343 CASAVA_Build 17 65454171 1I ACCATTTAGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 25 0 18 7 T 12 13 378344 CASAVA_Build 17 65460419 6D AATAGAGAAG GAGAGA/------ GAGAGAGAGA 3070 hom 43 het 23 0 16 9 GA 12 9 378345 CASAVA_Build 17 65461889 1I ATTTATTCTA -/T TTTTTTATAC 3070 hom 66 het 28 0 23 5 T 6 7 378346 CASAVA_Build 17 65463857 12D TCATCCCACC AAAAAAAAAAAA/------------ AAAAAAAAAA 3070 hom 16 het 38 1 28 15 A 23 11 378347 CASAVA_Build 17 65476215 1I ATTGTTTGGA -/T TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 33 11 19 3 T 8 9 378348 CASAVA_Build 17 65529940 1I CTTTCTGGGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 105 het 43 0 36 7 A 9 10 378349 CASAVA_Build 17 65534243 1D CATTATTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 12 11 378350 CASAVA_Build 17 65538097 1D ACTCTCTTAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 77 het 34 0 26 9 A 12 11 378351 CASAVA_Build 17 65559401 1I AGGAAACTGA -/G GCTCATAGAG 3070 hom 129 het 48 0 44 4 G 1 2 378352 CASAVA_Build 17 65570560 1I ATCCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 301 hom 24 2 15 7 A 12 13 378353 CASAVA_Build 17 65572433 1D CCTTATTTTC T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 111 het 40 0 38 4 T 7 6 378354 CASAVA_Build 17 65575260 1I TGTGTGTGTG -/T TGTGTTTCCA 3070 hom 99 het 37 0 34 3 T 1 2 378355 CASAVA_Build 17 65578001 1D TGAGAGGGAG A/- AAAAAAAAGG 3070 het 3070 hom 33 13 16 6 A 9 8 378356 CASAVA_Build 17 65579135 1D AATCTCCTGC A/- ATGTTGGGAA 3070 hom 120 het 44 0 41 3 A 2 1 378357 CASAVA_Build 17 65580172 1D ATTAAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 60 het 24 0 21 3 A 11 10 378358 CASAVA_Build 17 65583579 1D ACACGTTAAC T/- TTTTTTTATA 3070 hom 75 het 28 0 26 2 T 8 7 378359 CASAVA_Build 17 65583704 2D CCTCTAAAGC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 33 0 23 10 T 12 10 378360 CASAVA_Build 17 65584184 5D AGAGTTCAAT TCAAA/----- TCAAAAGAGA 3070 hom 135 het 47 0 46 7 TCAAA 2 1 378361 CASAVA_Build 17 65585411 2D TTAGGCTGTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 109 het 51 0 37 14 T 12 10 378362 CASAVA_Build 17 65586091 1D AACTCCGCAT A/- AAAAAAAGGT 3070 hom 108 het 42 0 37 5 A 8 7 378363 CASAVA_Build 17 65591090 4I CTGTATTGTG ----/TGTA TGTATGTATG 3070 hom 54 het 24 0 19 5 TGTA 3 4 378364 CASAVA_Build 17 65598734 5D CCTCCACTTC TCTTA/----- TATGACTCCA 3070 hom 123 het 43 0 41 6 TCTTA 1 0 378365 CASAVA_Build 17 65602364 3I GGTGGGGGGA ---/ATG ATAACATATA 3070 hom 72 het 28 0 25 3 ATG 0 1 378366 CASAVA_Build 17 65603009 1I TAAGACAAAA -/T CAACTTTGAC 3070 hom 123 het 42 0 42 0 T 0 1 378367 CASAVA_Build 17 65604205 4I TAATTTTTAA ----/TTTG TTTATTTAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 TTTG 0 1 378368 CASAVA_Build 17 65609325 2I TGCAGATTTC --/TT TTTTTTTTTG 3070 hom 59 het 27 0 20 7 T 9 11 378369 CASAVA_Build 17 65609530 7D TTTTTAAAGA TTTAAGT/------- ATTAAGCATT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 TTTAAGT 1 0 378370 CASAVA_Build 17 65612707 1D CAGAAGGGTA C/- TAACAGGGCC 3070 hom 114 het 43 0 39 4 C 1 0 378371 CASAVA_Build 17 65635199 1D GTAAAACAGG T/- TTTTGAGCAA 3070 hom 153 het 57 0 51 8 T 5 4 378372 CASAVA_Build 17 65663812 1I ATCAGCAAAC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 14 7 T 9 10 378373 CASAVA_Build 17 65698998 2I TTTTTTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 2641 het 494 hom 41 10 14 17 TC 0 1 378374 CASAVA_Build 17 65703377 2I AAGTTTTTTT --/TG TTTTTTTTTT 3070 het 1468 hom 38 11 17 10 TG 0 1 378375 CASAVA_Build 17 65710444 3D GACCAGAGAG AGA/--- AGATCAGAAA 3070 het 3070 ref 34 15 13 8 AGA 2 1 378376 CASAVA_Build 17 65714162 1I GGTAGCAAAC -/A GAGACTCTTT 3070 het 3070 ref 36 18 16 2 A 0 1 378377 CASAVA_Build 17 65718050 2I ATGCGCAAAC --/CT CTATCGATCA 3070 het 3070 hom 34 16 17 1 CT 1 2 378378 CASAVA_Build 17 65727470 1I TCAAAATCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 18 15 15 A 13 14 378379 CASAVA_Build 17 65728883 1D TGCATGGACT A/- TATCTTCATC 3070 hom 99 het 35 0 34 1 A 1 0 378380 CASAVA_Build 17 65738973 4I AATGGCACTT ----/AAAC AATGTTTCAA 3070 het 3070 hom 44 15 23 6 AAAC 0 1 378381 CASAVA_Build 17 65740581 5I AATGAAAACA -----/GAAAG GAGAGATTCC 3070 het 3070 hom 50 19 26 5 GAAAG 0 1 378382 CASAVA_Build 17 65742731 1D CACCCTATTG A/- AAAAAATCAG 3070 hom 57 het 21 0 20 2 A 7 6 378383 CASAVA_Build 17 65757428 5D CATACTGTTG ACCCA/----- ACCCAACCAC 3070 het 3070 hom 32 13 15 7 ACCCA 2 1 378384 CASAVA_Build 17 65768854 1I TGCTTAGTAA -/C TGGGTTAAGA 3070 het 3070 ref 43 29 12 2 C 0 1 378385 CASAVA_Build 17 65771982 16D TCCTTCCTTC CCCCCTCTCTCTCTCT/---------------- CCCTCTCTCT 2491 het 2491 ref 23 10 8 5 CCCCCTCTCTCTCTCT 1 0 378386 CASAVA_Build 17 65773382 1D TACTGGAAAG A/- AAAAAAAAAA 2049 het 2049 ref 38 26 5 7 A 13 12 378387 CASAVA_Build 17 65786132 2I AAGGTATTGA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 44 16 19 9 T 12 14 378388 CASAVA_Build 17 65787469 1I ATGTGACATT -/A TTCTTTATCA 3070 het 3070 ref 41 19 15 7 A 0 1 378389 CASAVA_Build 17 65788130 1I CTCAAAAAAC -/A AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 36 14 16 6 A 8 9 378390 CASAVA_Build 17 65789353 2I TGCCAAAGAA --/AC ACACACACAA 3070 het 3070 ref 42 21 15 6 AC 4 5 378391 CASAVA_Build 17 65793223 22D ACCCAAAACC ATAAAAGCATTAGAAGAAAACT/---------------------- ATAAAAGCAT 3070 het 3070 ref 36 27 13 4 ATAAAAGCATTAGAAGAAAACT 1 0 378392 CASAVA_Build 17 65794002 1D AATTTAACTG A/- AAAAAAAAGT 3070 het 3070 hom 36 12 20 4 A 9 8 378393 CASAVA_Build 17 65806608 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2609 het 1126 hom 13 4 7 3 A 11 10 378394 CASAVA_Build 17 65806991 1I44M1I AACCAAATTG -AAAGAACTTGCAAAATAGAGAGCTAAGCACGTAACCTTGGGGGG-/AAAAGAACTTGCAAAATAGAGAGCTAAGCACGTAACCTTGGGGGGA AAAAAAACCA 3070 het 3070 ref 46 30 25 4 N/A 0 0 378395 CASAVA_Build 17 65808878 3D GTTTTTTTTT TTG/--- TGTGTGTGTG 3070 het 3070 hom 33 14 13 6 TTG 1 0 378396 CASAVA_Build 17 65809298 3D CTTTCTTTGA TTT/--- TTTTTTCTAT 3070 het 3070 ref 48 22 20 6 T 9 6 378397 CASAVA_Build 17 65813693 1I TGGGGAAACC -/A AAAAAAAAAA 2095 het 2095 ref 32 19 6 7 A 16 17 378398 CASAVA_Build 17 65815634 1D ACATCCTCTA T/- TTTTTTTTTT 2481 het 2481 ref 22 9 6 7 T 13 12 378399 CASAVA_Build 17 65824851 1I CTTAAATATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2234 hom 36 10 16 10 A 13 14 378400 CASAVA_Build 17 65827445 2I CCTAATCCGT --/GA GAAATTGACC 3070 het 3070 hom 56 23 31 2 GA 1 2 378401 CASAVA_Build 17 65829540 3I TCAATCACTT ---/CTC CTCCCAAATT 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 CTC 1 2 378402 CASAVA_Build 17 65836105 1D TTAGAATTTC T/- TTTTTTTTTT 1045 het 1045 ref 32 25 4 3 T 15 14 378403 CASAVA_Build 17 65858863 1I AGCCTTTTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 32 15 14 3 A 10 11 378404 CASAVA_Build 17 65859524 1I TGGGGCTTTG -/A AGGGCTGGGT 3070 het 3070 hom 39 14 16 9 A 1 2 378405 CASAVA_Build 17 65869687 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 202 hom 24 2 16 6 T 15 14 378406 CASAVA_Build 17 65872491 1D AAAGAATGAC A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 hom 38 14 20 4 A 8 7 378407 CASAVA_Build 17 65896652 2I GATGGGCTAC --/TT TTTTTTTTTT 1181 het 919 hom 20 3 10 7 T 16 18 378408 CASAVA_Build 17 65899977 3D CACCCTAATG ACT/--- ACATTTTAAC 3070 het 3070 hom 44 18 23 5 ACT 1 0 378409 CASAVA_Build 17 65910378 1D AAAACCAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1592 hom 45 13 18 14 A 15 14 378410 CASAVA_Build 17 65921358 1D TTTTCTCTCC T/- TTTTTTTTTT 1101 het 1101 ref 34 27 4 3 T 11 10 378411 CASAVA_Build 17 65952646 2D CAGATGTGTT TG/-- TGTGTGTGTG 845 het 845 ref 70 55 3 13 TG 7 6 378412 CASAVA_Build 17 65977580 1D TACAAATAGC T/- TTTTTTTTTT 2338 het 2338 ref 36 19 6 11 T 17 16 378413 CASAVA_Build 17 65983298 3D CAAAAGAGTT GAG/--- AAGGGAAAAC 3070 het 3070 hom 29 11 18 2 GAG 1 0 378414 CASAVA_Build 17 65999607 1I TGTACAGATG -/C ATTTATGAGA 3070 hom 87 het 35 0 30 5 C 0 1 378415 CASAVA_Build 17 66032459 1D GTTTTTGAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 34 21 8 6 T 11 10 378416 CASAVA_Build 17 66045315 3D ACAAAGCAAA AAG/--- AAAGCCAGAG 3070 het 3070 hom 49 18 29 3 AAG 1 0 378417 CASAVA_Build 17 66077930 1D TGGATAATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2486 hom 36 11 15 10 T 15 14 378418 CASAVA_Build 17 66079435 1D TCATGAAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 T 12 11 378419 CASAVA_Build 17 66080585 1D AGAGTTGTTC A/- AACATAAACT 3070 het 3070 hom 36 16 17 3 A 3 2 378420 CASAVA_Build 17 66090611 1D GATCTACTAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 13 13 8 T 10 9 378421 CASAVA_Build 17 66091118 1I GCAACAGCCC -/T TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 42 21 16 5 T 9 10 378422 CASAVA_Build 17 66100052 4D7M1I AACCAAATAC ACTAACTAGCA-/----ACTAGCAT TTTAGAATGA 3069 het 3069 ref 15 8 7 3 N/A 0 0 378423 CASAVA_Build 17 66115413 4D GAGTTTAAGA CTAT/---- CTATATAAGA 3070 het 3070 hom 30 13 13 7 CTAT 2 1 378424 CASAVA_Build 17 66118736 2D CTTATGTGTG TA/-- TATATATATA 2252 hom 24 het 11 0 9 2 TA 9 8 378425 CASAVA_Build 17 66129807 1I CAAAGAAGTA -/T TTTTTTTTAT 3070 het 3070 hom 39 14 21 4 T 8 9 378426 CASAVA_Build 17 66137781 4D TATATACTGC ATAT/---- ATATATATAT 3070 het 2046 hom 22 6 13 4 AT 8 6 378427 CASAVA_Build 17 66142649 1I GAATTTTTTT -/C ATCCATGTGT 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 C 0 1 378428 CASAVA_Build 17 66142794 1D CCTACAAACG C/- CAAGTGCTAG 3070 het 3070 ref 42 21 17 5 C 2 1 378429 CASAVA_Build 17 66147096 1I ATACTCCTAG -/A TAGAAAATTT 3070 het 3070 ref 41 20 15 6 A 0 1 378430 CASAVA_Build 17 66159465 3I TGTCCACAGT ---/AAA AAAAAAAAAA 2792 het 2792 ref 25 12 9 4 A 11 14 378431 CASAVA_Build 17 66160611 1I GACCTAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 30 17 10 3 A 10 11 378432 CASAVA_Build 17 66190702 1D TTTGTTTTTT G/- TTTTTTTTGG 2503 het 2068 hom 21 8 10 3 G 1 0 378433 CASAVA_Build 17 66191757 11D TCGTTCTAGT ATACCTGAAAA/----------- TGCAAACTTG 3070 het 3070 hom 57 28 28 9 ATACCTGAAAA 1 0 378434 CASAVA_Build 17 66194344 3D AAATTCTCAG AAA/--- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 28 13 12 4 A 12 9 378435 CASAVA_Build 17 66199630 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1753 hom 17 5 9 3 A 11 10 378436 CASAVA_Build 17 66201274 1I GATCTTATTC -/T TTTTTTCTGA 3070 het 3070 hom 34 12 16 6 T 6 7 378437 CASAVA_Build 17 66202443 1I TTTAAGATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 35 15 12 8 T 12 13 378438 CASAVA_Build 17 66209314 1D TAAAAGCATG T/- TTTTTTTTAG 3070 het 3070 ref 43 23 16 6 T 9 8 378439 CASAVA_Build 17 66214836 1D ACACTATGAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 26 13 11 2 A 12 11 378440 CASAVA_Build 17 66215209 4I AATAATTCAC ----/AATT AAATATGCCC 3070 het 3070 ref 37 21 14 2 AATT 0 1 378441 CASAVA_Build 17 66222330 3I GTAAAGAATG ---/ATA CCCAATTTTG 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 ATA 0 1 378442 CASAVA_Build 17 66225324 1D GAATCCATCA T/- TTTTTTTCTT 3070 het 3070 hom 35 14 15 6 T 8 7 378443 CASAVA_Build 17 66239459 4I ATAAGAAGAA ----/AGAC AGAGGAAAGG 3070 het 3070 hom 44 17 25 2 AGAC 0 1 378444 CASAVA_Build 17 66257804 1D TCCATCATCA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 11 10 378445 CASAVA_Build 17 66258013 1D TCACCCTGTT A/- AAAAGGTTGG 3070 hom 101 het 35 0 34 1 A 5 4 378446 CASAVA_Build 17 66262010 2D CGGGGAATGC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 42 hom 43 1 28 14 A 18 16 378447 CASAVA_Build 17 66262985 1D CAAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 51 het 20 0 13 7 A 10 9 378448 CASAVA_Build 17 66274616 5D CAAAGGAATT TATTC/----- TATGATATTT 3070 hom 81 het 29 0 28 2 TATTC 1 0 378449 CASAVA_Build 17 66275232 1I ATTAAGAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 17 4 A 10 11 378450 CASAVA_Build 17 66294709 3D TAGTTTCATT TTC/--- TTTTAAATTA 3070 hom 69 het 24 0 24 3 TTC 1 0 378451 CASAVA_Build 17 66309627 2I ATAGGTGTGT --/AC ACACACACAC 3070 hom 24 het 41 1 32 8 AC 6 7 378452 CASAVA_Build 17 66328799 1I TTGGCTACAG -/C CCATGAATGG 3070 hom 54 het 23 0 19 4 C 2 3 378453 CASAVA_Build 17 66339389 1D TAAATTAGAC T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 35 25 7 3 T 10 9 378454 CASAVA_Build 17 66342426 1D AATATCTATC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 67 het 31 0 23 8 T 11 10 378455 CASAVA_Build 17 66358299 1D AATTTTTGTA T/- TTTTAGCAGA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 T 5 4 378456 CASAVA_Build 17 66358476 5D AATTATGTAT TAATA/----- TAATATAATT 3070 hom 45 het 19 0 16 6 TAATA 2 1 378457 CASAVA_Build 17 66360996 1D ATAAGTGTAA T/- TTTTTTTATT 3070 hom 69 het 28 0 24 5 T 8 7 378458 CASAVA_Build 17 66376916 2D TGTATGTAAA AT/-- ATATATATAT 3070 hom 36 het 16 0 13 4 AT 7 6 378459 CASAVA_Build 17 66393109 5I AATTTTATAC -----/ACACT ACACTATTCA 3070 hom 157 het 61 0 53 8 ACACT 1 2 378460 CASAVA_Build 17 66394160 1I AGAAATGAGA -/G GCAATATTCA 3070 hom 111 het 41 0 37 4 G 1 2 378461 CASAVA_Build 17 66394831 1I AATCCATATA -/T TTTTTTCTTT 3070 hom 90 het 35 0 31 4 T 6 7 378462 CASAVA_Build 17 66395569 25D CTCAAAAAAT AAATAAATATAAATAAATTAAAAAA/------------------------- AAATAAATAT 3070 hom 30 het 14 0 11 4 AAATAAATATAAATAAATTAAAAAA 1 0 378463 CASAVA_Build 17 66399863 38D TTAAAAAAAT AAAACTGTTTGTTAGATCCTGTCCAATTCTGTTTCAGA/-------------------------------------- AAAACTGTTT 2869 het 2869 ref 35 21 7 14 AAAACTGTTTGTTAGATCCTGTCCAATTCTGTTTCAGA 2 1 378464 CASAVA_Build 17 66404412 3I TAGAAATACT ---/ATA ATAATATACA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 ATA 2 3 378465 CASAVA_Build 17 66406210 3D GCAGAGTGTT AAC/--- AACACTTGCA 3070 het 3070 ref 46 24 19 3 AAC 2 1 378466 CASAVA_Build 17 66410425 4I ATTTTAGTTT ----/CAAA CAAACAATGC 3070 het 3070 ref 38 19 14 5 CAAA 1 2 378467 CASAVA_Build 17 66411627 1I TGCTAGGTGC -/T TTTCTTTTCT 3070 het 3070 hom 36 15 17 4 T 3 4 378468 CASAVA_Build 17 66411860 4D GTTAGTTCCC ACTT/---- ACTTACATAA 3070 het 2296 hom 25 6 18 3 ACTT 2 1 378469 CASAVA_Build 17 66418045 2D AATGTAAGAC TA/-- AAAAGCATAA 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 TA 1 0 378470 CASAVA_Build 17 66418532 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 2693 het 1755 hom 15 5 7 3 A 9 10 378471 CASAVA_Build 17 66423537 2I TTGGCTAAAG --/TT TTTAAAAAGG 3070 hom 84 het 33 0 29 4 T 3 5 378472 CASAVA_Build 17 66423825 1D TTAGCACCAT C/- CCCTTGGTGC 3070 het 3070 ref 33 16 13 4 C 4 3 378473 CASAVA_Build 17 66423906 6D TCCCCCCTCT CTCTTG/------ CTCTTGCTCT 3070 hom 56 het 25 0 19 9 CTCTTG 3 2 378474 CASAVA_Build 17 66427225 1D CAGCTCCAGC T/- CCAGCCCTGG 287 het 287 ref 39 19 1 19 T 1 0 378475 CASAVA_Build 17 66428607 2I CACGTAACAA --/TT TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 39 15 14 10 T 12 14 378476 CASAVA_Build 17 66433929 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 419 hom 15 1 12 2 A 9 8 378477 CASAVA_Build 17 66435867 1D9M5D7M1D TTGATTGACT GATATGTTAGCCCCTAGACTGAT/-AGATGGTGG-----TGATTGA- GTATCTTAGA 3070 het 3070 ref 46 28 24 4 N/A 0 0 378478 CASAVA_Build 17 66437458 2D20M1I TCGGTCCAGC CTCTGTTTTTCTCATATTGGCA-/--CTGTTTTTCTCATATTGGCAT TTTTTTTTTT 2939 het 2939 ref 30 20 10 1 N/A 0 0 378479 CASAVA_Build 17 66439498 2D CTTTGAAAAC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 48 16 19 14 T 12 10 378480 CASAVA_Build 17 66448414 1D GTAGCCCCAG T/- TTTTAGGTAG 3070 het 3070 hom 47 15 24 8 T 5 4 378481 CASAVA_Build 17 66454202 3D CATAATTTCA AGG/--- AGGATTATAT 3070 het 3070 ref 42 20 17 7 AGG 2 1 378482 CASAVA_Build 17 66462310 2D TATATCTCTC TT/-- GTTCATATAT 1387 het 1387 ref 27 11 3 13 T 2 0 378483 CASAVA_Build 17 66464323 1D CAAACACACA C/- CCCCCCCACA 3070 hom 108 het 40 0 36 5 C 8 7 378484 CASAVA_Build 17 66465812 1I GATGTTGAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 25 8 9 8 T 13 14 378485 CASAVA_Build 17 66474313 2D61M1D AGCATAAGAA CTCTCAGCAGGCTAGGAATATTAGAGGACTTCCTAAACATGATACAGGGCATACATAGGAATTA/--CTCAGCAGGCTAGGAATATTAGAGGACTTCCTAAACATGATACAGGGCATACATAGGAATT- AAAAAAAATA 3070 hom 163 het 37 0 55 7 N/A 0 0 378486 CASAVA_Build 17 66477078 1D AAGTCAAGAA T/- TTAGAGTGAT 3070 hom 111 het 42 0 37 5 T 3 2 378487 CASAVA_Build 17 66481549 1I ATAGGTTGTT -/C CTACAGTAAA 3070 hom 126 het 44 0 41 3 C 1 2 378488 CASAVA_Build 17 66495567 1D CTAAGAAGAA G/- GGGGAAAAAA 3070 het 1907 hom 32 6 22 4 G 5 4 378489 CASAVA_Build 17 66502959 1D GTATGAATAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 18 16 4 T 12 11 378490 CASAVA_Build 17 66506872 1D AATGCAACAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1247 hom 31 11 14 6 T 19 18 378491 CASAVA_Build 17 66507903 5I GGAATGGCAA -----/CTTGT CTTGGCTGAA 3070 hom 121 het 49 0 37 12 CTTGT 0 1 378492 CASAVA_Build 17 66510399 1D AAAGAGTTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 30 15 10 5 T 11 10 378493 CASAVA_Build 17 66515429 1I TTTTTTTTTT -/A AAATAGCAAC 3070 hom 108 het 42 0 36 6 A 3 4 378494 CASAVA_Build 17 66516524 4I CAAAAGCCAT ----/CAAA CAAAGAAAAA 3070 hom 120 het 47 0 40 7 CAAA 1 2 378495 CASAVA_Build 17 66522663 5I TATGCTGGTG -----/TTGAT TTATTTTTAA 3070 hom 114 het 45 0 38 7 TTGAT 0 1 378496 CASAVA_Build 17 66530340 3D AGGCTGAGGC AGG/--- AGAATTGCTT 3070 hom 78 het 30 0 27 4 AGG 1 0 378497 CASAVA_Build 17 66542293 1I TGTAATATGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 997 hom 34 4 25 5 A 14 15 378498 CASAVA_Build 17 66545797 1D TTCTTCCCCC G/- CCACGTCCCC 3070 hom 81 het 29 0 28 3 G 1 0 378499 CASAVA_Build 17 66546004 1I TGCAATTGAG -/A AAAAAAAATG 3070 hom 123 het 47 0 42 5 A 8 9 378500 CASAVA_Build 17 66561165 1I AAAGTATGAC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 276 hom 36 1 28 7 T 12 13 378501 CASAVA_Build 17 66562208 1D TATGCCGATA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 93 het 33 0 32 2 T 10 9 378502 CASAVA_Build 17 66564333 2D CCATCTCTAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 518 hom 21 3 13 5 A 13 11 378503 CASAVA_Build 17 66576560 1D GAAAACCAGT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 106 het 38 0 35 3 A 11 10 378504 CASAVA_Build 17 66579434 1D AATGCTATTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 102 het 39 0 35 4 T 13 12 378505 CASAVA_Build 17 66580475 1D AATGCTATTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 99 het 34 0 34 1 T 10 9 378506 CASAVA_Build 17 66583468 1D CCCTGAAGAG A/- TTACTTCTAT 3070 hom 114 het 41 0 38 4 A 1 0 378507 CASAVA_Build 17 66590206 1D GCACTCGAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 111 het 40 0 38 2 A 10 9 378508 CASAVA_Build 17 66590829 4I AACAGAAAGT ----/TATC TAACTTGATT 3070 het 3070 ref 37 24 12 1 TATC 0 1 378509 CASAVA_Build 17 66591315 4D TATAAAAAAA AGTT/---- AGTCTATTTC 3070 het 3070 hom 32 12 16 4 AGTT 1 0 378510 CASAVA_Build 17 66592212 1D ATCGCCATCA G/- GAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 43 20 18 6 G 2 1 378511 CASAVA_Build 17 66593321 6I TCTGAGACAG ------/GCTAAA GCACATGTAA 3070 het 3070 ref 53 31 19 3 GCTAAA 0 1 378512 CASAVA_Build 17 66593737 2D TGACAAACAC TT/-- ATTCCTTTTC 3070 het 3070 ref 48 23 22 3 T 2 0 378513 CASAVA_Build 17 66594756 1D AGTAGGTAGG T/- TTTTTTTCAT 3070 het 3070 ref 40 25 12 3 T 8 7 378514 CASAVA_Build 17 66595158 7I ATAATCACAA -------/TTCTACT TTCTACTTTT 2949 het 2949 ref 30 18 8 4 TTCTACT 1 2 378515 CASAVA_Build 17 66597218 3D GCAATCACTC TTT/--- TTTTGCATGA 3070 het 3070 hom 32 13 18 2 T 7 4 378516 CASAVA_Build 17 66597559 1I TCATTTCCCC -/T GTCTTGATCA 3070 het 3070 hom 51 20 22 9 T 0 1 378517 CASAVA_Build 17 66617596 1D TTTTGGTGAG T/- TTTTTTTAAA 3070 het 3070 hom 27 13 11 3 T 8 7 378518 CASAVA_Build 17 66622815 2D AGGTGTCGGC AA/-- ACTGCAACCA 3070 het 3070 ref 33 20 10 3 A 3 1 378519 CASAVA_Build 17 66626251 1D TCAAAGTGTG T/- TTTTTTTTTT 2926 het 2926 ref 24 10 7 7 T 12 11 378520 CASAVA_Build 17 66629128 4I TTTTTAAAGG ----/TTAT TTGTCAGTAT 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 TTAT 0 1 378521 CASAVA_Build 17 66629705 1I TTTAAAAAAA -/G GAATGCCCAA 3070 het 3070 hom 39 17 16 6 G 1 2 378522 CASAVA_Build 17 66631184 1I CTGTTGATTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 10 22 3 T 10 11 378523 CASAVA_Build 17 66632872 1D CTGCTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 10 18 6 A 11 10 378524 CASAVA_Build 17 66636070 1D TATAATAATC A/- AATTTAAAAA 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 A 3 2 378525 CASAVA_Build 17 66638115 1D GACTTTTTTT A/- AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 32 14 17 1 A 8 7 378526 CASAVA_Build 17 66638351 4D ATGTTTTCTT CTTA/---- CTTATTAATT 3070 het 3070 hom 45 21 22 6 CTTA 2 1 378527 CASAVA_Build 17 66638615 1D GTTTGTATAA C/- TTTTTTTTTT 1655 het 1655 ref 38 17 8 13 C 1 0 378528 CASAVA_Build 17 66639779 1D CTGGGGTATG A/- AAAAAAACTC 2352 het 864 hom 10 3 6 1 A 8 7 378529 CASAVA_Build 17 66640977 1I ATCCACAGGT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 946 hom 29 4 17 8 A 13 14 378530 CASAVA_Build 17 66643556 2I GGCAAGGTGA --/CT CTGTAGCTGA 3070 het 3070 ref 58 26 25 7 CT 1 2 378531 CASAVA_Build 17 66644869 1D TCCCTCTGTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 13 10 7 T 12 11 378532 CASAVA_Build 17 66656923 3D TTCAAGGACC ATG/--- ATATCGGGGT 3070 het 3070 ref 43 25 14 4 ATG 1 0 378533 CASAVA_Build 17 66672677 5D TGATGAGATT TTTTC/----- TTTTTTCTTT 3070 het 3070 ref 38 17 17 8 TTTTC 1 0 378534 CASAVA_Build 17 66675847 1D CAAGCTGATG A/- AAAAAAATGC 3070 het 3070 ref 48 21 20 8 A 8 7 378535 CASAVA_Build 17 66688816 1D GCACTACAGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 13 8 T 11 10 378536 CASAVA_Build 17 66691238 2I AAAAATATAC --/AG ACTCTGTAAA 3070 het 3070 hom 46 20 20 6 AG 0 1 378537 CASAVA_Build 17 66702019 1D GGGCCATACT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2252 hom 26 9 14 3 A 13 12 378538 CASAVA_Build 17 66707780 4D TTATTGTCTC ACTT/---- ACTCCCCAAA 3070 het 3070 ref 39 21 15 5 ACTT 1 0 378539 CASAVA_Build 17 66711460 5D AGACTTGTCC AAAAA/----- AAAAAAAAAA 3070 het 1159 hom 30 6 13 11 A 23 18 378540 CASAVA_Build 17 66720116 1I TGAGATGAAC -/A AAAATTGAGA 3070 het 3070 hom 35 12 19 4 A 4 5 378541 CASAVA_Build 17 66727495 1D CAAAGCAAAC A/- AAAAACAAAT 3070 het 3070 ref 45 26 15 4 A 6 5 378542 CASAVA_Build 17 66731668 1D CTCGTGGCTC T/- TTTTTTTTTT 2345 het 2345 ref 29 16 6 8 T 11 10 378543 CASAVA_Build 17 66731944 1D CTGATAGTTT C/- TGTAGCATTT 3070 het 3070 hom 49 20 23 6 C 1 0 378544 CASAVA_Build 17 66733998 1D TTTTTTTTTT C/- TGCAATTGAC 3070 het 3070 ref 39 19 13 8 C 1 0 378545 CASAVA_Build 17 66735364 5D CTTACTCTTA CTCTT/----- TTCTTTTCTT 3070 het 3070 ref 43 26 15 3 CTCTT 1 0 378546 CASAVA_Build 17 66750910 1D ATACTTGTTG T/- TTATTTTCAT 3070 het 3070 ref 42 22 17 4 T 3 2 378547 CASAVA_Build 17 66755110 3I TCTCACTGTT ---/CAA CAACTCCCAC 2578 het 2578 ref 19 9 7 3 CAA 1 2 378548 CASAVA_Build 17 66757822 1D TGAGATTTTC T/- TTTTTTTTTT 2902 het 2902 ref 21 9 9 3 T 12 11 378549 CASAVA_Build 17 66758041 1D ACCACATGAC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2066 hom 23 5 16 2 T 10 9 378550 CASAVA_Build 17 66764760 2I ACTCCATCTC --/AA AAAAAAAAAA 2287 het 1179 hom 16 5 8 3 A 12 14 378551 CASAVA_Build 17 66770468 1I TGGTGCATGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 38 13 17 8 A 13 14 378552 CASAVA_Build 17 66773537 1I TATCAATGTC -/A ACCAATTTTT 3070 het 3070 ref 45 21 16 8 A 1 2 378553 CASAVA_Build 17 66778898 6I ACGTGTTACA ------/TTTTCT TTATCCACTC 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 TTTTCT 0 1 378554 CASAVA_Build 17 66806833 1D CTAATACCAG T/- TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 34 15 14 6 T 9 8 378555 CASAVA_Build 17 66809075 2I TTCTCTTTCT --/TC TCTCTTTCCT 3070 hom 45 het 19 0 14 5 TC 2 3 378556 CASAVA_Build 17 66816374 1D AATTAAAAAC A/- AAAAAAATCA 3070 het 3070 ref 33 22 9 3 A 8 7 378557 CASAVA_Build 17 66819440 1I TTTACACTAC -/T TTTTTCCCCC 3070 het 3070 hom 43 19 22 2 T 5 6 378558 CASAVA_Build 17 66821444 1I CTGGAAGGAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 A 9 10 378559 CASAVA_Build 17 66825406 2D ATATATATAT AC/-- ACACACACAC 2746 het 2746 ref 28 10 12 6 AC 6 5 378560 CASAVA_Build 17 66827780 1D GGTGTTCTGG T/- TTTTTTTTTT 2790 het 2064 hom 40 12 13 15 T 17 16 378561 CASAVA_Build 17 66846098 1I TTTTTCTTCC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 47 18 15 14 T 13 14 378562 CASAVA_Build 17 66848456 4D ATGATCTTAG CTCA/---- CTCACTGCAA 2197 het 2197 ref 13 6 6 1 CTCA 2 1 378563 CASAVA_Build 17 66849245 4I CAGGGGAGGT ----/ATAA ATAAATATTC 3070 het 3070 ref 39 18 15 6 ATAA 1 2 378564 CASAVA_Build 17 66857122 1I AGGACAGTAC -/A AAAAGGGATG 3070 het 3070 ref 41 19 16 6 A 4 5 378565 CASAVA_Build 17 66857290 1D TTAGCAACAG A/- AAAAAAAAAA 3004 het 713 hom 30 6 8 16 A 15 14 378566 CASAVA_Build 17 66871708 5I CACCCGCCCT -----/CTTCA CTTCCCTACT 3070 het 3070 hom 37 16 13 8 CTTCA 0 1 378567 CASAVA_Build 17 66871895 1I AAAAGAAAGG -/A AAAAAAATTC 3070 hom 89 het 33 0 30 3 A 7 8 378568 CASAVA_Build 17 66876930 1D GTTTTCAGGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1785 hom 43 7 21 15 T 17 16 378569 CASAVA_Build 17 66886337 1I CATATCAGGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 33 21 8 4 T 10 11 378570 CASAVA_Build 17 66901334 1D CCTCTGGGGT A/- AAAAAAAATC 3070 het 3070 ref 36 20 9 9 A 9 8 378571 CASAVA_Build 17 66908614 5D GTCCACTGAT ATCTC/----- AGAAAACCAT 3070 het 3070 ref 22 11 9 2 ATCTC 1 0 378572 CASAVA_Build 17 66909248 1I TTTCACACAC -/A CAAAAAAACC 3070 hom 93 het 35 0 32 3 A 0 1 378573 CASAVA_Build 17 66909435 5D TATGTTTTTG TTTGT/----- TTTGTTTTGT 3070 het 3070 hom 35 12 16 7 TTTGT 5 4 378574 CASAVA_Build 17 66909783 7D TTTAAAAAAA AAAAAAC/------- AAAAAAAACT 3070 het 118 hom 34 2 21 13 AAAAAAC 1 0 378575 CASAVA_Build 17 66912164 1D CACTCAATAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 23 8 7 T 11 10 378576 CASAVA_Build 17 66913212 1D CATAGGTAAG A/- AAAACTCAAA 3070 hom 114 het 43 0 38 6 A 5 4 378577 CASAVA_Build 17 66914009 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 177 hom 27 3 10 14 T 12 11 378578 CASAVA_Build 17 66917396 4D ATAAATAAAC AAAT/---- AAAAGTCATG 3070 het 3070 ref 24 13 11 1 AAAT 1 0 378579 CASAVA_Build 17 66917555 1D27M1I TTATTGCATT AAAAAAAAGCAAGTGTATGTGAGATGGT-/-AAAAAAAGCAAGTGTATGTGAGACGGTA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 14 15 8 N/A 0 0 378580 CASAVA_Build 17 66919783 1D CAATAATGCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 399 hom 38 1 35 2 T 11 10 378581 CASAVA_Build 17 66921669 1D GGCTACACGT G/- TTATATATAT 3070 het 3070 hom 37 13 20 5 G 1 0 378582 CASAVA_Build 17 66929422 1D CCTTTCTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 32 13 9 11 A 12 11 378583 CASAVA_Build 17 66945169 1I ATTCTGAGGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 304 hom 27 1 19 7 T 12 13 378584 CASAVA_Build 17 66945272 1I CCTTCCTCTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 24 0 16 9 T 11 12 378585 CASAVA_Build 17 66956347 1D TATTGTCTGG A/- AAGCAAAACT 3070 hom 111 het 40 0 37 4 A 3 2 378586 CASAVA_Build 17 66958989 1I TTTTCTATGT -/A AAAAAAATGT 3070 het 3070 ref 24 14 9 1 A 7 8 378587 CASAVA_Build 17 66963903 1D AAACAAATTT G/- AAATATCATC 3070 het 3070 ref 39 18 17 4 G 1 0 378588 CASAVA_Build 17 66968313 3D54M4D CTCCAGGTAA TGTTGATGTTGCTGGGATCAGGCATTCAGCAGTCACCTGCTGAAGTTTAGCGTGCGTGCGC/---TGATGTTGCTGGGATCAGGCATTCAGCAGTCACCTGCTGAAGTTTAGCGCGCGT---- GCACACACAC 3070 het 3070 ref 18 15 10 5 N/A 0 0 378589 CASAVA_Build 17 66987574 1D TTACTGAAAT A/- AAAAAAAAAA 924 het 924 ref 25 19 3 3 A 13 12 378590 CASAVA_Build 17 67001995 1D AATGCAATGG A/- AAAAAAAAAA 1404 het 1404 ref 40 34 4 2 A 11 10 378591 CASAVA_Build 17 67004848 1D ACACCCAGTT A/- AAAAAAATAA 3070 hom 78 het 30 0 27 3 A 8 7 378592 CASAVA_Build 17 67008520 1D ACATTGAGTT A/- AAACTTATGA 3070 hom 99 het 40 0 34 6 A 4 3 378593 CASAVA_Build 17 67009861 4D ATATATATAT ATAC/---- ACACACACAC 3070 hom 57 het 25 0 21 6 ATAC 1 0 378594 CASAVA_Build 17 67015151 2D GATGGAATGA TT/-- TTTTTTTTTT 2042 het 1458 hom 30 7 8 15 T 18 16 378595 CASAVA_Build 17 67024191 1D ATAGAGCTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 408 hom 43 1 26 16 T 13 12 378596 CASAVA_Build 17 67030290 1D AATGCAGATC A/- AAACCACAAT 3070 hom 105 het 38 0 36 2 A 4 3 378597 CASAVA_Build 17 67041760 2I GTACATATAT --/AC ATATATGCAC 3070 hom 99 het 39 0 34 5 AC 0 1 378598 CASAVA_Build 17 67059011 3D CATGCCTATT TAA/--- TAATAATAAT 3070 het 3070 hom 43 15 24 4 TAA 4 3 378599 CASAVA_Build 17 67061077 1I GAAGGAAAGT -/G TTGGCTTTGG 3070 het 3070 hom 38 16 19 3 G 0 1 378600 CASAVA_Build 17 67061189 1D TTAGAGTTTG A/- GACAGGTTGA 3070 het 3070 ref 36 17 15 5 A 1 0 378601 CASAVA_Build 17 67065889 5I GCATAATTCC -----/CTTTT CCCCAGAAAA 3070 het 3070 ref 40 21 13 6 CTTTT 0 1 378602 CASAVA_Build 17 67079710 1I ACCCCATCTC -/A AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 41 12 21 8 A 9 10 378603 CASAVA_Build 17 67080441 1I AATAATAATT -/A AAAAAAAAGA 939 het 173 hom 12 1 7 4 A 8 9 378604 CASAVA_Build 17 67081152 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 11 10 378605 CASAVA_Build 17 67086775 2D AGAAAATACT TC/-- TCCCAAGATT 3070 hom 81 het 29 0 28 1 TC 2 1 378606 CASAVA_Build 17 67090337 5D22M5D AATGGGGTGA TTACTTTGATAGGTTTGGTTTTCAAATATTAA/-----TTGATAGGTTTGGTTTTCAAAT----- ATTAATATTC 3070 het 3070 hom 35 21 23 4 N/A 0 0 378607 CASAVA_Build 17 67099722 2I TATTGGAGAT --/AA AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 40 15 19 6 A 10 12 378608 CASAVA_Build 17 67119463 1D AAAAGAAAAG A/- AAAAAAAACC 3070 het 3070 ref 39 22 15 4 A 9 8 378609 CASAVA_Build 17 67132476 1I CTGTCTCTAC -/A AAAAATACAA 3070 het 3070 hom 37 17 16 4 A 5 6 378610 CASAVA_Build 17 67137969 21D TGTAAACTTC CAAAAGAAAATATAAAACTTT/--------------------- CAAAAGAAAA 3070 het 3070 ref 23 11 10 5 CAAAAGAAAATATAAAACTTT 1 0 378611 CASAVA_Build 17 67144725 1D GCAAATACTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 9 20 3 T 12 11 378612 CASAVA_Build 17 67149605 1I AAAACAACAT -/C CCCCCCCCAA 3070 het 3070 hom 29 9 17 3 C 8 9 378613 CASAVA_Build 17 67156508 2D GGGGCTTCTT GC/-- GCGCAAGTGA 3070 het 3070 ref 33 19 11 5 GC 3 2 378614 CASAVA_Build 17 67175509 1I GGCATTGCAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 A 9 10 378615 CASAVA_Build 17 67180262 4D TGAAACCAAA CTCT/---- CTCTCTCTCT 2281 het 481 hom 12 3 6 3 CT 10 8 378616 CASAVA_Build 17 67195089 9D TTATAAGAAG TTTTTATAA/--------- TTTTTATGTA 3070 het 3070 hom 35 16 18 1 TTTTTATAA 1 0 378617 CASAVA_Build 17 67223922 1I CAACAACATG -/T TATCTAATCT 3070 het 3070 ref 35 16 13 6 T 1 2 378618 CASAVA_Build 17 67226992 12D ATACTGAATA ACACACACACAC/------------ ACACACACAC 3070 het 3070 ref 27 14 11 4 AC 13 7 378619 CASAVA_Build 17 67239701 1D CCAGTGGGCC T/- TTTTTTTTTT 1080 het 1080 ref 33 20 6 7 T 13 12 378620 CASAVA_Build 17 67250965 3I GTGGAGAATT ---/ATC ATATTTTTGT 3070 hom 87 het 31 0 30 1 ATC 0 1 378621 CASAVA_Build 17 67269620 1D TTTTGGCTTG T/- TTTTAGAGAT 3070 hom 120 het 43 0 39 6 T 5 4 378622 CASAVA_Build 17 67301794 22D TATGTGTGTG TGTATATATATATATATATATA/---------------------- TGTGTGTGTA 3070 hom 57 het 15 0 20 1 TGTATATATATATATATATATA 1 0 378623 CASAVA_Build 17 67328790 4I AAAGTGGAGA ----/TTAT TTATTTTATA 3070 het 3070 ref 45 22 18 5 TTAT 1 2 378624 CASAVA_Build 17 67360821 1I TTTGTAATAG -/A AAAAAAATGG 3070 hom 114 het 41 0 38 3 A 7 8 378625 CASAVA_Build 17 67370407 8D CTAGATATAG ATATAGAT/-------- ATATAGATAT 3070 het 3070 ref 25 11 8 8 ATATAGAT 3 2 378626 CASAVA_Build 17 67377871 1I GACAAAAAAG -/A AAAAAAAAAT 3070 het 2020 hom 16 5 8 3 A 9 10 378627 CASAVA_Build 17 67378881 1I TCTTTTTTTT -/C CCTTTATAAA 3070 het 3070 hom 29 14 13 2 C 2 3 378628 CASAVA_Build 17 67401940 2D CACATGCATG CA/-- CACACACACA 1167 het 1167 ref 51 40 4 8 CA 6 5 378629 CASAVA_Build 17 67404730 1I GTTTCAGTTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 48 25 13 10 A 13 14 378630 CASAVA_Build 17 67416510 1D TATTTCAGTT A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 55 20 23 12 A 10 9 378631 CASAVA_Build 17 67440562 1D GGTTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 660 het 660 ref 36 26 3 7 A 11 10 378632 CASAVA_Build 17 67441419 1D AAAATGCAAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 950 hom 37 3 28 6 T 13 12 378633 CASAVA_Build 17 67442652 4D TTCCTGTATT GATA/---- GATCAAAGAG 3070 hom 123 het 43 0 41 5 GATA 1 0 378634 CASAVA_Build 17 67449875 13D CTCATTCCCG CCTCCTCTCCACA/------------- CCTCCTCTCC 3070 het 1994 hom 22 6 10 12 CCTCCTCTCCACA 2 1 378635 CASAVA_Build 17 67475268 1D GACTCCTTCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 75 het 29 0 26 3 A 12 11 378636 CASAVA_Build 17 67479549 1D ATTGTGAGGC T/- TCCCCAGACA 3070 hom 103 het 36 0 31 5 T 2 1 378637 CASAVA_Build 17 67490469 1I TATGCAAATC -/T TTTTGTGTGA 3070 hom 80 het 30 0 27 3 T 4 5 378638 CASAVA_Build 17 67490721 1I ACATCATTCC -/T TTTTTTTTTT 2997 het 324 hom 23 2 15 6 T 15 16 378639 CASAVA_Build 17 67493788 1D GCTCCCTACT A/- AAAAAAAACG 3070 hom 107 het 40 0 34 12 A 9 8 378640 CASAVA_Build 17 67495464 1I AATGCCAACG -/C CCCCCCCCTC 3070 hom 51 het 24 0 16 8 C 8 9 378641 CASAVA_Build 17 67506754 3D CCATCTTATA GAT/--- GAGAAAAATA 3070 hom 96 het 37 0 32 5 GAT 1 0 378642 CASAVA_Build 17 67521335 1D TCGTGATCTA C/- CCCCCCTTGG 3070 hom 65 het 24 0 19 5 C 7 6 378643 CASAVA_Build 17 67529368 1I TGGCTATTAT -/A AAAAAACTTT 3070 het 3070 hom 33 15 15 3 A 6 7 378644 CASAVA_Build 17 67533367 1D TTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 ref 31 15 10 6 A 9 8 378645 CASAVA_Build 17 67535516 2I CTGCCTTTTT --/TC TTTTTTTTTT 3070 het 2006 hom 26 6 13 7 TC 0 1 378646 CASAVA_Build 17 67537447 4I GCAGACATAA ----/ATAG ATAGATAGTC 3070 het 3070 hom 50 21 22 7 ATAG 2 3 378647 CASAVA_Build 17 67545318 1I TTAAGTTTTT -/G GGGGGGTCAA 3070 het 3070 hom 40 16 16 8 G 6 7 378648 CASAVA_Build 17 67548075 1I AGCACCCCCC -/G CCACGGACCA 3070 het 3070 hom 42 16 19 7 G 0 1 378649 CASAVA_Build 17 67555465 1D TAGACTCAAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 685 hom 50 2 42 8 A 10 9 378650 CASAVA_Build 17 67556502 3I CACTAGACAA ---/AAT AATAATAAGA 3070 het 158 hom 33 3 24 6 AAT 2 3 378651 CASAVA_Build 17 67569803 1D GGGAGTGGAA G/- GGGGGGGTGA 3070 het 3070 hom 45 18 20 7 G 8 7 378652 CASAVA_Build 17 67596019 1I TATGAAATCC -/T TGTATGATAG 3070 hom 90 het 39 0 30 9 T 1 2 378653 CASAVA_Build 17 67608096 1I AAACCTCCAC -/A AAAAAAAAAA 763 het 763 ref 43 29 4 10 A 15 16 378654 CASAVA_Build 17 67620166 1I TGTAAGTGGC -/A ATAAGGAGCC 3070 het 3070 hom 44 19 20 5 A 1 2 378655 CASAVA_Build 17 67633054 2D CAGTCTTAAG AA/-- AGAGGTAAAA 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 3 1 378656 CASAVA_Build 17 67634256 1I GATGTTTTTG -/T TTTTTTATCA 3070 het 3070 ref 38 18 14 6 T 6 7 378657 CASAVA_Build 17 67635308 1D AAAATCTCTA T/- TTTTTTTTTC 3070 het 179 hom 37 1 14 23 T 10 9 378658 CASAVA_Build 17 67638917 2I TGCTCATTAG --/TC TACAGATTGT 3070 het 3070 ref 50 32 16 2 TC 0 1 378659 CASAVA_Build 17 67686793 1D TTTGCTTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 391 hom 22 1 15 7 A 15 14 378660 CASAVA_Build 17 67709181 1I CTCAAAAGAT -/G TCATGATAAG 3070 hom 117 het 42 0 39 3 G 0 1 378661 CASAVA_Build 17 67720526 2D TATTTATTTT AA/-- AAAAAAAAAC 1969 het 1969 ref 23 12 5 6 A 11 9 378662 CASAVA_Build 17 67720600 4D ACAGGCATAC AATG/---- AATGCATAAT 2360 het 2360 ref 19 12 6 3 AATG 2 1 378663 CASAVA_Build 17 67731226 2D TACGAGCAGA AT/-- ATATATATAT 3070 het 1887 hom 26 7 11 8 AT 10 9 378664 CASAVA_Build 17 67734266 1D ACTTTGACAG T/- TTTGAGGGAT 3070 het 3070 ref 36 21 11 4 T 4 3 378665 CASAVA_Build 17 67734830 1D TGTTGACATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 202 hom 29 1 23 5 A 11 10 378666 CASAVA_Build 17 67749043 1D TCTTTTAATG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 48 het 19 0 17 2 T 10 9 378667 CASAVA_Build 17 67750889 1D CTCTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 28 0 21 7 A 15 14 378668 CASAVA_Build 17 67770622 1I TTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 982 het 982 ref 34 24 4 6 A 13 14 378669 CASAVA_Build 17 67774567 10D3M8D4M8D TCTTTGGGTG GGCTGTGACAGTGGTATCCACAGGTATCCACAC/----------GTG--------AGGT-------- CACAGGTGTG 3070 hom 123 het 32 0 40 3 N/A 0 0 378670 CASAVA_Build 17 67777334 4D TTCTTTTCTT AAAC/---- AAACACCAAA 3070 het 3070 hom 41 18 20 6 AAAC 2 1 378671 CASAVA_Build 17 67802491 1D CAAGAAAAAA T/- TTTTTATCAT 3070 hom 117 het 44 0 39 5 T 6 5 378672 CASAVA_Build 17 67806405 2D AAAGGGACTC AA/-- ACGTCTGATT 3070 hom 92 het 33 0 29 5 A 3 1 378673 CASAVA_Build 17 67810654 1D CGCAGCTTGA T/- TTTTGTAAAT 3070 hom 92 het 37 0 30 8 T 5 4 378674 CASAVA_Build 17 67812681 4I TGTGCATATA ----/TGTT TGAGTGTGTG 3070 hom 98 het 42 0 34 8 TGTT 0 1 378675 CASAVA_Build 17 67814488 1I CCCACACAAA -/C TGGACCCCCA 3070 hom 108 het 39 0 36 3 C 0 1 378676 CASAVA_Build 17 67829166 1I ACAGTTACTC -/A AAAAAAACAA 3070 het 3070 hom 32 14 15 3 A 7 8 378677 CASAVA_Build 17 67829477 2D ATAGATTCTC TT/-- TGTCTCCGCT 3070 het 3070 ref 32 16 13 4 T 3 1 378678 CASAVA_Build 17 67838131 2I TATATGTGTG --/TA TGTATATATA 1196 het 1111 hom 11 7 3 1 TA 0 1 378679 CASAVA_Build 17 67838161 2D TATGTATGTG TA/-- TATATATATA 3070 het 333 hom 22 2 17 3 TA 6 5 378680 CASAVA_Build 17 67855508 1D TGTATTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 45 1 28 16 T 12 11 378681 CASAVA_Build 17 67856594 1D TAAAAATACC A/- AAAAAAAAAA 2518 hom 20 het 15 0 11 8 A 16 15 378682 CASAVA_Build 17 67859171 1D CAGGATACCC A/- TCTCGCCATG 3070 hom 99 het 43 0 33 11 A 1 0 378683 CASAVA_Build 17 67859417 5D GCACAGCACC TGGCA/----- CGTGGTAAGT 3070 hom 135 het 50 0 44 7 TGGCA 1 0 378684 CASAVA_Build 17 67865755 1D GTAACAGAGC T/- TTTTTTTTTT 761 het 761 ref 41 25 2 15 T 11 10 378685 CASAVA_Build 17 67866728 1I TGAATAGACA -/G GCCAAGCAGG 3070 hom 93 het 34 0 31 3 G 1 2 378686 CASAVA_Build 17 67876044 3D AGACTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 1081 het 1081 ref 21 10 7 6 A 21 18 378687 CASAVA_Build 17 67882324 1D CACACTCAGC A/- AATGCAATGT 3070 het 3070 ref 46 25 17 5 A 3 2 378688 CASAVA_Build 17 67888862 3D TTATTTTATT TTA/--- TTTTTTTTTT 3036 het 3036 ref 18 7 9 2 TTA 1 0 378689 CASAVA_Build 17 67900467 1I TGCTTTCTAC -/A AAAAAAAAAA 1640 het 1640 ref 25 7 8 10 A 13 14 378690 CASAVA_Build 17 67906126 1D CCCCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 1610 het 1610 ref 17 9 4 4 A 15 14 378691 CASAVA_Build 17 67919631 11D AAGGGGGTGT AGAGAAGAGGA/----------- GGAGAAAAGG 3070 hom 71 het 26 0 24 4 AGAGAAGAGGA 1 0 378692 CASAVA_Build 17 67923955 3D GTTTTTTTTT TTG/--- TTCTCTCTCC 2785 het 2015 hom 20 6 9 7 TTG 1 0 378693 CASAVA_Build 17 67933059 10D TCCTGTTCTC ATGGTAGTGA/---------- ATAAGCCTCA 3070 het 3070 ref 40 21 21 1 ATGGTAGTGA 1 0 378694 CASAVA_Build 17 67940817 1I CTGGGGGTTT -/C CCCTGCGGAA 3070 hom 114 het 43 0 38 5 C 3 4 378695 CASAVA_Build 17 67942641 1D AAGTGTACTT A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 111 het 43 0 38 5 A 10 9 378696 CASAVA_Build 17 67945811 1I CACTGTGCTT -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 26 11 11 4 A 9 10 378697 CASAVA_Build 17 67946888 1I AGTTTTAACA -/C CCCCCCCCAG 3070 het 2536 hom 35 11 8 16 C 8 9 378698 CASAVA_Build 17 67950543 5I AAATAAAAAA -----/AAAAG AAAAGAAAAG 3070 hom 78 het 30 0 27 3 AAAAG 2 3 378699 CASAVA_Build 17 67952677 8I TGTTCTAGCA --------/CCTTCCAC CCTTCCACCG 3070 het 3070 hom 38 13 20 5 CCTTCCAC 1 2 378700 CASAVA_Build 17 67964906 1D GTTACATTTC T/- TTTTTTTTTT 2156 het 2156 ref 25 8 8 9 T 15 14 378701 CASAVA_Build 17 67983574 1D TCTTTTTGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 239 hom 34 1 18 15 A 14 13 378702 CASAVA_Build 17 67985575 1D AGATCACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 32 het 31 0 15 16 T 15 14 378703 CASAVA_Build 17 67999167 1D16M1D ACAATCTGCA TTTTTTTTTTAAGAGATG/-TTTTTTTTTAAGAGAT- GGGGGTCTCA 3070 het 718 hom 30 5 13 12 N/A 0 0 378704 CASAVA_Build 17 68029418 1I CTTTTTTTTT -/C CTTTTTAAGA 3070 het 3070 hom 36 14 18 4 C 1 2 378705 CASAVA_Build 17 68029736 1D AAAGAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 748 hom 19 3 15 1 A 13 12 378706 CASAVA_Build 17 68034398 8D AAAAGCGCAC ACATACAT/-------- ACATACATAC 3070 het 3070 ref 49 23 16 12 ACAT 5 3 378707 CASAVA_Build 17 68056153 2I TAGTCCCCCC --/CT CCAAGAAATA 3070 het 3070 hom 40 17 16 7 CT 0 1 378708 CASAVA_Build 17 68058740 1D TCCTTTTACA T/- TTTTTTTTCC 3070 het 2446 hom 18 6 12 0 T 9 8 378709 CASAVA_Build 17 68061726 2D TACACCTGGG CA/-- CACACACACA 583 het 583 ref 73 54 3 16 CA 8 7 378710 CASAVA_Build 17 68063405 1I TTGGACACTT -/C CCCCTCCAGG 3070 hom 111 het 41 0 38 3 C 4 5 378711 CASAVA_Build 17 68065204 4D ACACACCCAG ACAC/---- ACACACACCA 3070 het 3070 ref 58 24 20 17 AC 6 4 378712 CASAVA_Build 17 68065394 2D ACACACTCAT AC/-- ACACACAGGC 3070 het 3070 ref 69 37 25 9 AC 4 3 378713 CASAVA_Build 17 68070014 2I AAAATCAGGG --/AA GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 27 11 11 5 A 0 2 378714 CASAVA_Build 17 68084083 1I TTCTTCTCCT -/C CCCCCTCCCC 3070 het 1296 hom 17 6 10 1 C 5 6 378715 CASAVA_Build 17 68114758 1D CTGTTGGCTT A/- AAAATCAGGC 3070 het 3070 ref 58 33 20 5 A 5 4 378716 CASAVA_Build 17 68119915 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 1029 het 244 hom 5 1 3 1 A 13 12 378717 CASAVA_Build 17 68120685 1D TCTGTGTGTC T/- TTTTTTTTGG 3070 het 3070 hom 32 13 12 7 T 9 8 378718 CASAVA_Build 17 68153065 1D TAATAGACCC T/- TTTTTTTTTT 1952 het 1952 ref 45 35 5 5 T 12 11 378719 CASAVA_Build 17 68154328 1I AAGAGTTTTT -/G GTCAGATTAT 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 G 1 2 378720 CASAVA_Build 17 68170368 2D AAGAGAAGAA AG/-- AGAGAAAGAA 3070 het 3070 ref 32 17 10 7 AG 3 2 378721 CASAVA_Build 17 68182700 1D CGTTCATTGG A/- AAAAAAAGTG 3070 het 3070 ref 51 21 16 16 A 8 7 378722 CASAVA_Build 17 68183426 4I ATGTCCCAAT ----/TGTG TGTGTGTGTA 3070 het 3070 hom 31 9 15 7 TG 4 6 378723 CASAVA_Build 17 68185319 2D GGGCAAATGA GG/-- GTTTGTGAGT 3070 het 3070 hom 50 21 23 7 G 3 1 378724 CASAVA_Build 17 68187776 19D ACTCTGTCTC AAAAAAAAAAAAAAAAAAA/------------------- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 14 10 9 1 A 29 10 378725 CASAVA_Build 17 68201037 1I AGCTGCAGGG -/A AACACTGACC 2625 het 600 hom 12 2 8 2 A 2 3 378726 CASAVA_Build 17 68202722 1D AGACCTTCCC T/- TGACCCTTCT 3070 het 3070 ref 44 21 18 5 T 2 1 378727 CASAVA_Build 17 68212450 1I GCAGTTCCCT -/G GGGGGGTCCT 3070 hom 102 het 41 0 34 7 G 6 7 378728 CASAVA_Build 17 68226819 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 2986 hom 10 het 23 1 15 7 A 13 12 378729 CASAVA_Build 17 68239274 1D CCTTATGCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 39 het 16 0 14 3 T 11 10 378730 CASAVA_Build 17 68244802 2I CTGAGGTCAG --/GA GAGTTCGAGA 3070 hom 81 het 31 0 27 4 GA 1 2 378731 CASAVA_Build 17 68246864 2D GAATTTCGGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 25 2 18 5 T 16 14 378732 CASAVA_Build 17 68249937 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 54 het 20 0 18 2 A 9 10 378733 CASAVA_Build 17 68254195 1I ACAAAAAATT -/A AAAAAATTGG 3070 hom 39 het 16 0 13 3 A 6 7 378734 CASAVA_Build 17 68258242 1D GAGGAAAGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 27 0 21 6 T 12 11 378735 CASAVA_Build 17 68258523 1D TTAATGGAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 36 0 29 7 A 11 10 378736 CASAVA_Build 17 68262805 1I GGGGACACTC -/T CAGGACTGGT 3070 hom 129 het 51 0 42 9 T 0 1 378737 CASAVA_Build 17 68317819 1D CAAAAACAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 81 hom 28 3 16 9 A 15 14 378738 CASAVA_Build 17 68324195 1I CGAAACATTT -/G AAAAGCTGTG 3070 hom 108 het 46 0 37 9 G 0 1 378739 CASAVA_Build 17 68324837 4D ATATAAAGGA ATAC/---- ATACCCCAGG 3070 het 3070 hom 37 15 20 5 ATAC 2 1 378740 CASAVA_Build 17 68338064 1I TGACTGTGTA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 20 18 8 T 11 12 378741 CASAVA_Build 17 68340992 1I TGTAGCGATT -/A ATTAATAACC 3070 het 3070 ref 44 21 20 3 A 1 2 378742 CASAVA_Build 17 68341833 1I GTGAAGTTAC -/T TTTTTTTTGC 3070 het 3070 ref 50 21 21 8 T 8 9 378743 CASAVA_Build 17 68344081 2I GGCCTCGGGC --/TT TTTTTTTTTT 2422 het 1435 hom 29 6 12 11 T 12 14 378744 CASAVA_Build 17 68347252 1D TGCAGAAGCT G/- GAAGAGGCCA 3070 het 3070 hom 52 23 26 3 G 2 1 378745 CASAVA_Build 17 68347865 1I TCCCTGAAAC -/A AAAAAATCAC 3070 hom 75 het 28 0 26 2 A 6 7 378746 CASAVA_Build 17 68356821 4I AGGAATTCAT ----/AAGA AAGATAACAT 3070 het 3070 ref 49 25 17 7 AAGA 1 2 378747 CASAVA_Build 17 68358201 1I AAAGAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 A 10 11 378748 CASAVA_Build 17 68363476 1I TAAAAAATAC -/A AAAAAATTAG 3070 hom 48 het 17 0 17 0 A 6 7 378749 CASAVA_Build 17 68367087 1I GTGTAAGTAT -/A TCCCACATAT 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 A 0 1 378750 CASAVA_Build 17 68378063 1I GATTTAGGTA -/C TGCTGTCCCA 3070 hom 132 het 47 0 45 2 C 0 1 378751 CASAVA_Build 17 68381192 1D CCATCCTTCC A/- ACTTGGCTGG 3070 het 3070 ref 37 22 13 2 A 2 1 378752 CASAVA_Build 17 68393062 2I TCTGTGCAGC --/TG TGAGTCTATT 3070 het 3070 ref 43 19 18 6 TG 1 2 378753 CASAVA_Build 17 68393404 3I CTGGATCCAG ---/TTC TTCTTTAGTA 3070 het 3070 ref 50 25 17 8 TTC 1 2 378754 CASAVA_Build 17 68395524 1D TTTAGAAACG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 46 16 19 11 A 10 9 378755 CASAVA_Build 17 68397271 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1660 hom 20 6 10 6 A 14 12 378756 CASAVA_Build 17 68399769 1D AGATAAGACT A/- TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 22 8 10 5 A 1 0 378757 CASAVA_Build 17 68399986 1D TACTAAAAGT A/- AAAAAAAATT 3070 het 3070 hom 31 14 14 4 A 9 8 378758 CASAVA_Build 17 68406772 3D CGGCTGCACT CTC/--- CTAAGCTTTA 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 CTC 1 0 378759 CASAVA_Build 17 68408127 16D AGGAGGGTGC CAGGATTATGAGGATG/---------------- CAGGATTATG 3070 het 3070 ref 44 22 12 14 CAGGATTATGAGGATG 2 1 378760 CASAVA_Build 17 68408710 5D AAACAAACAA ACAAC/----- AAAAAAAAAA 569 het 569 ref 27 17 2 9 ACAAC 1 0 378761 CASAVA_Build 17 68410178 1I TTGAGCCTTC -/A AGAGGGAGCA 3070 het 3070 ref 35 20 11 4 A 1 2 378762 CASAVA_Build 17 68410686 1I TTGTAGTTAG -/A AAAAAAAAGT 3070 het 2898 hom 17 8 7 2 A 8 9 378763 CASAVA_Build 17 68417485 7D TTCTTTTTTC TTTTTTT/------- TTTTTTGAGA 3038 het 749 hom 16 4 8 5 T 13 6 378764 CASAVA_Build 17 68418507 1I CTAAAAATAT -/A AAAAAATAGC 3070 het 3070 hom 26 14 10 2 A 6 7 378765 CASAVA_Build 17 68420303 8I CAAAGAGCTG --------/GGATTACA GGAGCCTGCC 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 GGATTACA 0 1 378766 CASAVA_Build 17 68421528 1I ATAGACTCTG -/C TATCTCAGTC 3070 het 3070 ref 45 23 20 2 C 0 1 378767 CASAVA_Build 17 68428073 1I CATTTTATTT -/C CCCCCTTCCT 3070 het 3070 ref 36 16 12 8 C 5 6 378768 CASAVA_Build 17 68444519 1D AACCGTTCCA C/- CCTCCGATCA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 C 3 2 378769 CASAVA_Build 17 68445190 4D GAGTCCGTCT AAAC/---- AAACAAACAA 3070 hom 64 het 26 0 21 6 AAAC 3 2 378770 CASAVA_Build 17 68447193 2I TTCCGTCTCG --/AA AAAAAAAAAA 2864 het 719 hom 12 2 10 0 A 12 14 378771 CASAVA_Build 17 68449291 1I CAGGACTGTG -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 24 1 16 7 T 15 16 378772 CASAVA_Build 17 68449796 1I TGTATTATTA -/T TTATTTTTTT 1187 hom 7 het 3 0 3 0 T 2 3 378773 CASAVA_Build 17 68452265 2I CTTGCCTTTC --/GA AAACACACAC 3070 het 788 hom 26 2 22 2 GA 0 1 378774 CASAVA_Build 17 68458832 2I CCCATTTCTT --/AA AAAAAAAAAA 2708 het 2230 hom 24 8 12 4 A 14 16 378775 CASAVA_Build 17 68465553 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2450 het 1959 hom 15 7 6 3 A 12 11 378776 CASAVA_Build 17 68474314 1D GTTGTTGTTC T/- TTTTTTTGAG 3070 hom 42 het 17 0 13 4 T 8 7 378777 CASAVA_Build 17 68477345 8D TCCCCATCTT TCTCTCTC/-------- TCTCTCTCAC 3070 hom 54 het 23 0 18 7 TC 8 4 378778 CASAVA_Build 17 68479472 1I CCGGGATGCC -/A ACCCCCACAG 2138 het 2138 ref 22 13 6 3 A 1 2 378779 CASAVA_Build 17 68487089 5I GTCTGAAAAC -----/AGACT AGACTAATAC 3070 hom 69 het 29 0 23 6 AGACT 1 2 378780 CASAVA_Build 17 68489581 1D TTAGGAAAGA C/- CAACCATGGA 3070 het 3070 hom 36 13 21 3 C 2 1 378781 CASAVA_Build 17 68489816 1D ATCTCTAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1647 hom 25 5 12 8 T 15 14 378782 CASAVA_Build 17 68492113 1D TCAGACATTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2306 hom 31 10 16 5 A 15 14 378783 CASAVA_Build 17 68518484 1D CAAATTTCAG A/- TTAAGCTTTT 3070 hom 114 het 41 0 39 2 A 1 0 378784 CASAVA_Build 17 68518812 8I GGCCCCCGGT --------/ACACAGGC ACACAGGCAC 3070 hom 99 het 38 0 32 6 ACACAGGC 1 2 378785 CASAVA_Build 17 68521052 3I GAACTCCTGA ---/CCT CCTCCGGCGA 3070 hom 92 het 36 0 28 9 CCT 1 2 378786 CASAVA_Build 17 68521427 1D GGTTTTGTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 44 1 36 7 T 12 11 378787 CASAVA_Build 17 68527781 3D AATCACACTC CTT/--- CTCCTTCTAT 3070 het 3070 ref 39 18 16 7 CTT 1 0 378788 CASAVA_Build 17 68529081 1D TCTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 19 20 7 T 11 10 378789 CASAVA_Build 17 68534252 1D AAACTACATC A/- AAAAAAAAAA 2983 het 526 hom 31 6 8 17 A 17 16 378790 CASAVA_Build 17 68536853 1D CGCCGTCACA C/- ACACACAAAA 3070 hom 39 het 18 0 14 4 C 1 0 378791 CASAVA_Build 17 68544749 4D2M2I TTTCACTTGG TTTTTA--/----TAAC ATGCATTTAA 3070 hom 111 het 39 0 37 4 N/A 0 0 378792 CASAVA_Build 17 68558689 1I TTGTCAATGG -/A AAGAATAAGG 3070 het 3070 hom 47 21 20 6 A 2 3 378793 CASAVA_Build 17 68567389 1D AACTGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 21 0 10 11 A 15 14 378794 CASAVA_Build 17 68567440 1D ATATGCAAGG A/- AAAAAAAGAT 3070 het 3070 hom 28 11 12 5 A 8 7 378795 CASAVA_Build 17 68568407 1D CGAATTAGGC T/- TATTTAGTAT 3070 het 3070 hom 42 16 22 5 T 2 1 378796 CASAVA_Build 17 68570348 1I TAGAAACTTT -/C CCATGTAGAA 3070 het 3070 ref 44 22 16 6 C 2 3 378797 CASAVA_Build 17 68571032 3I AGATCCATTC ---/TCA TCACTGGGAT 3070 het 3070 ref 33 17 13 3 TCA 1 2 378798 CASAVA_Build 17 68572063 1D ACAAGCTATT A/- AAAAAGTTTC 3070 het 3070 ref 47 21 19 7 A 6 5 378799 CASAVA_Build 17 68586675 2I GTTACATTTT --/AC ACACACACAC 3070 het 211 hom 35 2 27 6 AC 8 9 378800 CASAVA_Build 17 68590591 1D CTAAAACCAC A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 40 het 18 0 11 8 A 10 9 378801 CASAVA_Build 17 68591450 1D TACTAGCATG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 90 het 38 0 31 7 A 10 9 378802 CASAVA_Build 17 68593087 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAATA 3070 het 2116 hom 18 5 12 1 A 9 8 378803 CASAVA_Build 17 68624531 1I ATTGGTGACA -/T TGTGCCTGTA 3070 het 3070 hom 28 9 17 2 T 1 2 378804 CASAVA_Build 17 68632997 1I GCCCGGCCAA -/T TTTTTTTTTT 1902 het 57 hom 12 1 8 3 T 17 18 378805 CASAVA_Build 17 68635273 1D CCAGATAGCA C/- CAATGGGTGA 3070 hom 84 het 32 0 29 4 C 2 1 378806 CASAVA_Build 17 68639895 2I AGTAAATCCC --/CT GTTCCCTTTT 3070 hom 75 het 30 0 24 6 CT 0 1 378807 CASAVA_Build 17 68653133 1I GGAAAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1398 het 1398 ref 48 38 5 5 A 11 12 378808 CASAVA_Build 17 68655274 6D GTGTGTGTGT GTGCGC/------ GCGCGCGCGC 3070 hom 52 het 24 0 16 10 GTGCGC 1 0 378809 CASAVA_Build 17 68691226 1D TATTTACGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 81 het 34 0 28 6 T 12 11 378810 CASAVA_Build 17 68698712 1I TTTCTTTTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 15 6 T 11 12 378811 CASAVA_Build 17 68699514 1D CTTTTGTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 424 hom 43 2 31 10 T 12 11 378812 CASAVA_Build 17 68704903 4D CAGAGCGTCC TCTG/---- TCTTTCACTT 3070 het 3070 hom 39 16 17 7 TCTG 1 0 378813 CASAVA_Build 17 68705802 1I TTTTAGGTGG -/C AATAGATCCC 3070 hom 120 het 48 0 38 10 C 0 1 378814 CASAVA_Build 17 68705924 1I AGCTAATTGC -/A ATGTTCGGAC 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 1 2 378815 CASAVA_Build 17 68707075 1I CCCCCAGGAC -/T TGCATAGCAC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 T 1 2 378816 CASAVA_Build 17 68710080 2D CTCAAAAAAA AC/-- TTTTTCATTC 3070 hom 51 het 20 0 18 2 AC 1 0 378817 CASAVA_Build 17 68713695 1I TAGACAGAAC -/A GGGGGAAAGG 3070 hom 122 het 47 0 40 7 A 0 1 378818 CASAVA_Build 17 68716502 1D TTTGTAGGAC A/- AAAAGTCATT 3070 het 3070 hom 49 18 20 13 A 5 4 378819 CASAVA_Build 17 68720243 1D GGATTTGCAG C/- CAGCTGCAAC 3070 hom 96 het 38 0 33 6 C 2 1 378820 CASAVA_Build 17 68720968 2I CAAAGCAAGA --/CT CTGTCTCAAA 1644 hom 15 het 16 0 6 10 CT 1 2 378821 CASAVA_Build 17 68722051 1D AACCAGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 44 1 26 17 A 15 14 378822 CASAVA_Build 17 68726215 1D TTAGTATCAC T/- TTCACTTTGT 3070 hom 87 het 34 0 30 4 T 3 2 378823 CASAVA_Build 17 68728924 1D AGCCACCGGG C/- CCCAGCCAAA 3070 hom 45 het 18 0 16 2 C 4 3 378824 CASAVA_Build 17 68731381 1D TCTTAGAATT A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 84 het 34 0 29 6 A 10 9 378825 CASAVA_Build 17 68733521 13D TGAGATTCCC AACTATTACATTA/------------- AACAAAGCTC 1042 het 1042 ref 10 6 3 1 AACTATTACATTA 1 0 378826 CASAVA_Build 17 68735020 1D TCACAAGGAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 608 hom 38 3 11 24 A 13 12 378827 CASAVA_Build 17 68738140 1D CTGAAAACCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 33 0 20 13 T 12 11 378828 CASAVA_Build 17 68740669 18D CATCCACTCC GCAGAATCAGAACAGCTG/------------------ GCAGAATCAG 3070 hom 50 het 20 0 13 12 GCAGAATCAGAACAGCTG 1 0 378829 CASAVA_Build 17 68741607 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 35 0 32 4 A 11 12 378830 CASAVA_Build 17 68742056 2I GGTATAAATG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 55 het 26 0 20 6 T 10 12 378831 CASAVA_Build 17 68742193 1D TGGAAGGCCG A/- AGGCGGGCAG 3070 hom 28 het 14 0 9 5 A 2 1 378832 CASAVA_Build 17 68742862 2I AGGCTGAGAC --/AA GAGAATTGCT 3070 hom 78 het 29 0 26 3 A 0 2 378833 CASAVA_Build 17 68745996 23D GGCAGGGTGA TTGTAAAGTAGCATACCTGTCGT/----------------------- TTGTAAAGTA 3070 hom 54 het 23 0 18 10 TTGTAAAGTAGCATACCTGTCGT 2 1 378834 CASAVA_Build 17 68748610 1D GATGAATGGG T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 96 het 35 0 33 3 T 10 9 378835 CASAVA_Build 17 68750245 1I TTTTGGAGTT -/C GGACATAATT 3070 hom 114 het 44 0 39 5 C 0 1 378836 CASAVA_Build 17 68752441 1D ACTTCTTAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 69 het 26 0 24 2 A 11 10 378837 CASAVA_Build 17 68760737 1I CCTGGAGGAC -/T TGCATGGATA 3070 hom 114 het 45 0 39 6 T 1 2 378838 CASAVA_Build 17 68766781 2I TCTTTAATTT --/TA ATTTATTTAT 2836 het 354 hom 43 4 12 27 TA 0 1 378839 CASAVA_Build 17 68767089 1D TTCCTTTTTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 15 0 13 3 A 12 11 378840 CASAVA_Build 17 68769879 1D CAAACGTGGC G/- TGCACACAGA 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 G 1 0 378841 CASAVA_Build 17 68770673 5D ACTCCAGATC AGAAA/----- AGAAAATAGC 3070 het 3070 ref 36 18 11 10 AGAAA 2 1 378842 CASAVA_Build 17 68779735 1D TGGTGGATCA C/- CTTGAAGTCA 3070 hom 36 het 15 0 13 2 C 2 1 378843 CASAVA_Build 17 68788907 1D CTCGGAAAAG A/- AAAAAAAAAA 1736 het 911 hom 13 5 4 4 A 11 10 378844 CASAVA_Build 17 68797310 1D AGAAAAAAAA C/- CACCAAAAAG 3070 het 2844 hom 22 8 10 5 C 2 1 378845 CASAVA_Build 17 68797547 4D AAAGAAAGAG AGAA/---- AGAAAAAGAA 3070 het 2825 hom 23 12 10 2 AGAA 2 1 378846 CASAVA_Build 17 68802086 1D ATTCTGTCTC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 9 8 378847 CASAVA_Build 17 68802718 1I AATTTTTGTA -/T TTTTTTTTAG 3070 het 2544 hom 26 6 15 5 T 8 9 378848 CASAVA_Build 17 68823442 4D GGCCGCTGGG GCCT/---- GCCTGCCTCT 3070 hom 79 het 30 0 22 9 GCCT 3 2 378849 CASAVA_Build 17 68828453 6D GCATGTGTGC ATGTGT/------ GTGTGTGTGT 1658 het 1658 ref 27 13 9 8 ATGTGT 1 0 378850 CASAVA_Build 17 68847257 5D TCCCTGGCAA ATTTT/----- ATTTTCTTTC 3070 hom 45 het 16 0 15 1 ATTTT 2 1 378851 CASAVA_Build 17 68860825 1I ACTCAGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 A 10 11 378852 CASAVA_Build 17 68862496 2D GCACCTCCAG TC/-- TCTCACATGC 3070 hom 92 het 35 0 30 6 TC 3 2 378853 CASAVA_Build 17 68882063 6D CGTCTCAAAC CAAACA/------ CATCTGGAAC 3070 het 3070 ref 38 19 18 3 CAAACA 1 0 378854 CASAVA_Build 17 68884055 39I ATCTAAGCTC ---------------------------------------/ACATTGTCCCTGCTCACTGCGTTATTCCCAGCTCTGAGA ACAATGCTGG 3070 het 3070 ref 39 19 15 9 ACATTGTCCCTGCTCACTGCGTTATTCCCAGCTCTGAGA 0 1 378855 CASAVA_Build 17 68885899 1I AATGGCTCCA -/T CATGGCCTAC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 0 1 378856 CASAVA_Build 17 68887550 1I TTTGAGACTG -/A AAACCACTAT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 A 3 4 378857 CASAVA_Build 17 68889953 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 2417 het 283 hom 24 1 12 12 A 17 16 378858 CASAVA_Build 17 68899691 4D TGCACCACTC CTCT/---- CTCTCTCTAG 3070 hom 64 het 28 0 17 12 CT 6 4 378859 CASAVA_Build 17 68916130 2D TTTTTTTTTT TA/-- ATATTTTTAG 1029 hom 10 het 5 0 4 1 TA 1 0 378860 CASAVA_Build 17 68917588 4I TCTGTCTCTG ----/TCTC TCTCTCTCTT 3070 hom 54 het 21 0 18 3 TC 4 6 378861 CASAVA_Build 17 68918038 6I GTAATATTCC ------/TTTTTG TTTTTGTTTT 3070 hom 105 het 38 0 34 4 TTTTTG 2 3 378862 CASAVA_Build 17 68919523 2D ATTACTGCTA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 58 hom 29 2 12 15 T 16 14 378863 CASAVA_Build 17 68929017 1D GATTGTTTGA C/- CCCAGTGGTG 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 C 4 3 378864 CASAVA_Build 17 68929443 3D TTACAGGCGC CCA/--- CCACCACACC 3070 het 2782 hom 19 7 11 3 CCA 3 2 378865 CASAVA_Build 17 68931566 1D TGGGGATCTG A/- AAAAAGGGAC 3070 het 3070 ref 44 18 13 13 A 6 5 378866 CASAVA_Build 17 68941023 1D AAGGATGCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2429 hom 25 8 10 7 T 12 11 378867 CASAVA_Build 17 68944324 1I AAAAAAAAAA -/T AAAAAAAAAA 166 het 90 hom 13 3 4 6 T 0 1 378868 CASAVA_Build 17 68945354 1I GCCAGACAGA -/G CTCTCTGCCT 3070 het 3070 ref 44 22 15 7 G 0 1 378869 CASAVA_Build 17 68947843 7D GCCCATACTC TTTTTTT/------- TTTTTTTTTG 3070 het 1678 hom 25 8 10 8 T 16 9 378870 CASAVA_Build 17 68950615 1I TAGCAATTCC -/T TTTTTTTTAT 3070 het 157 hom 27 1 20 6 T 8 9 378871 CASAVA_Build 17 68970182 4D GTATATATAT ATAC/---- ACACACACAT 3070 hom 172 het 66 0 57 12 ATAC 1 0 378872 CASAVA_Build 17 68990004 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 343 het 343 ref 36 15 4 17 A 11 12 378873 CASAVA_Build 17 68995759 1I TGACTGTCCC -/T TTTTTTTTTG 1808 het 1808 ref 33 16 7 10 T 9 10 378874 CASAVA_Build 17 69009064 1D TGTTCTTCCT C/- CCCCCCACCA 3070 hom 89 het 36 0 26 10 C 7 6 378875 CASAVA_Build 17 69010175 1I GGAACATTTT -/G TTGAGCCCAA 3070 hom 105 het 46 0 36 10 G 0 1 378876 CASAVA_Build 17 69012003 4D34M2D TGTGTGTGAA AGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAAAGAAAGAGAGAGGGAAAG/----AGAGAGAGAGAGAGGGAAAGAAAGAGAGAGGGAA-- AGAGAGAGAG 3070 het 165 hom 13 1 10 6 N/A 0 0 378877 CASAVA_Build 17 69012455 2D CCTGCAGGAG AA/-- AAAAAAGTTT 3070 hom 48 het 19 0 17 4 A 8 6 378878 CASAVA_Build 17 69012786 1D CCAAGTGCGC G/- CTCATCTATT 3070 het 3070 ref 46 22 18 6 G 1 0 378879 CASAVA_Build 17 69020877 1I TTCTGCCTGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1379 hom 47 5 34 8 A 11 12 378880 CASAVA_Build 17 69027301 1D TGAGCAGCGC A/- TGTTTACCCA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 1 0 378881 CASAVA_Build 17 69028222 1D TGGGAGTAGT G/- GGGGGGTGCA 3070 het 3070 hom 35 12 15 8 G 7 6 378882 CASAVA_Build 17 69029488 6D CAGACTGCTC GAGACA/------ GAGTCAACAC 3070 het 3070 ref 33 17 13 7 GAGACA 1 0 378883 CASAVA_Build 17 69029883 2I GGCCGGTGTC --/TG ATCAAAGACC 3070 het 3070 ref 33 14 14 5 TG 0 1 378884 CASAVA_Build 17 69047551 1I AGAGACACAC -/A GGGGGGAATG 3070 het 3070 ref 22 10 8 4 A 0 1 378885 CASAVA_Build 17 69122714 1D AATAGAAGAT A/- AAAAAAAAAA 1068 het 1068 ref 22 9 5 8 A 17 16 378886 CASAVA_Build 17 69133808 2D TGAGCGAGAC AG/-- AGCCGTCTCT 3070 het 3070 ref 37 18 10 10 AG 2 1 378887 CASAVA_Build 17 69140854 1D CTGTATCTAC A/- AAAAAAATAA 3070 het 3070 ref 24 12 10 3 A 8 7 378888 CASAVA_Build 17 69154033 2I ACTCTCTCTC --/TT GTGGTCCTAC 3070 hom 110 het 43 0 34 9 T 0 2 378889 CASAVA_Build 17 69162562 1I TCCTGCCAAA -/T TTTCTTGAAT 3070 het 3070 hom 48 20 24 4 T 3 4 378890 CASAVA_Build 17 69186799 1I ATCTGCCCCC -/T GGCCCCTGCC 3070 hom 96 het 37 0 32 5 T 0 1 378891 CASAVA_Build 17 69196887 8I CTTTGTGAAT --------/AAAAAGAC AAAAAGACAA 3070 het 3070 hom 28 12 16 0 AAAAAGAC 2 3 378892 CASAVA_Build 17 69206197 1D TGAGGGTATT G/- GGGGGCCCTA 3070 het 3070 hom 42 16 21 5 G 6 5 378893 CASAVA_Build 17 69211879 2I TCCATCCTTC --/CT CTCTCTCTTC 2639 het 2639 ref 32 12 10 10 CT 4 5 378894 CASAVA_Build 17 69211948 1D TTCCTTCCTT C/- CTCCCTTCCT 3070 het 1585 hom 19 7 8 5 C 2 1 378895 CASAVA_Build 17 69251467 3I CCCTCCTCCT ---/CCC CCTCTTCTTT 1412 het 1412 ref 23 8 5 10 C 2 5 378896 CASAVA_Build 17 69251741 1I ACAGCTGTCA -/C TCTGAACTTT 3070 het 3070 hom 30 11 13 6 C 0 1 378897 CASAVA_Build 17 69264096 1I CACCCCTATC -/T GGTGAAGCTG 3070 hom 120 het 46 0 41 5 T 0 1 378898 CASAVA_Build 17 69266013 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTG 2819 het 2819 ref 25 13 8 4 T 10 9 378899 CASAVA_Build 17 69266475 1D AAAGAGAGAG A/- AAAAAAAAAA 597 het 597 ref 15 6 4 5 A 11 10 378900 CASAVA_Build 17 69275014 1I ACATGGAGAC -/T TTTTTAAAAA 3070 hom 51 het 21 0 18 3 T 5 6 378901 CASAVA_Build 17 69281062 1I TAGCCCCATA -/G GATTGAAACT 3070 hom 93 het 37 0 32 6 G 1 2 378902 CASAVA_Build 17 69282629 3D GGACAAGGTG AGA/--- AGAAGAGGAA 3070 het 3070 hom 37 11 16 12 AGA 3 2 378903 CASAVA_Build 17 69288959 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 591 hom 14 3 10 1 T 12 11 378904 CASAVA_Build 17 69301016 1D GGAGAGGAAT C/- CCCCCCCAGG 3070 hom 101 het 37 0 32 8 C 8 7 378905 CASAVA_Build 17 69303407 1I CTGGGGGCTT -/A TGTGGAACAA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 A 0 1 378906 CASAVA_Build 17 69351983 3D TCACCCTCCC AAA/--- GAAAGCCTTT 3070 het 3070 ref 39 20 17 3 A 3 0 378907 CASAVA_Build 17 69357642 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1152 het 1152 ref 18 7 3 8 A 11 10 378908 CASAVA_Build 17 69370884 1I GACCTGAGAG -/C CCCAAGGTGG 3070 hom 99 het 38 0 33 5 C 3 4 378909 CASAVA_Build 17 69374254 1D CCTGGACCAG C/- CAGCATCAGC 3070 het 3070 hom 38 13 17 9 C 2 1 378910 CASAVA_Build 17 69407221 1D TAGCTCCCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 4 het 31 1 18 12 T 13 12 378911 CASAVA_Build 17 69420228 4I CTTCCTCCCT ----/TCCC TTCCTTCCTC 3070 hom 72 het 29 0 23 6 TCCC 0 1 378912 CASAVA_Build 17 69420666 1D AAGCAATCCA C/- CCATCTTGGC 3070 hom 81 het 28 0 28 0 C 3 2 378913 CASAVA_Build 17 69430532 1D ACACACTCAG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 26 het 13 0 9 4 T 16 15 378914 CASAVA_Build 17 69446241 1D TGTTTTCCTT A/- AAAAAAAAAG 3070 hom 90 het 35 0 31 6 A 10 9 378915 CASAVA_Build 17 69451566 2D2M6I TCAGCAGAGA GGGT------/--GTTAAAAC CGTGTTAAAA 3070 hom 115 het 40 0 32 10 N/A 0 0 378916 CASAVA_Build 17 69452345 1I CCTCTGCAGC -/A AAGCTCTTGT 3070 het 3070 hom 26 12 13 1 A 2 3 378917 CASAVA_Build 17 69461094 2D GAAACGCAGA CC/-- CCCCCCCCTC 3070 hom 119 het 44 0 30 16 C 10 8 378918 CASAVA_Build 17 69461211 3I ACACCCCCCC ---/ACA CACACCCTCA 3070 hom 156 het 59 0 52 7 ACA 0 1 378919 CASAVA_Build 17 69473211 1I TTCCAGTTGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 829 hom 40 2 31 7 T 10 11 378920 CASAVA_Build 17 69476061 3D TGTCTCTAAA AAT/--- AAAGAGAGAA 3070 het 3070 hom 32 12 16 5 AAT 1 0 378921 CASAVA_Build 17 69481598 1D CTGGGTCCCG C/- CCCCCCCCAG 3070 het 1956 hom 29 10 11 9 C 9 8 378922 CASAVA_Build 17 69482662 1D CCTGGACCCA T/- TTTAGATCAA 3070 het 3070 hom 29 11 16 2 T 4 3 378923 CASAVA_Build 17 69499970 3D GTGTATTCTC CTT/--- GAGACTTTTC 1220 het 1220 ref 31 19 6 6 CTT 1 0 378924 CASAVA_Build 17 69500477 1D CCCCGGCCAG C/- CTGCTCGCCC 3070 het 3070 hom 30 12 13 5 C 2 1 378925 CASAVA_Build 17 69502795 2D CGTGTCCTCC CT/-- CTTTTTTCAA 3070 het 3070 ref 45 23 21 1 CT 2 1 378926 CASAVA_Build 17 69507979 14I TCCATACCTT --------------/CCTTGGGTAGACAC CCTCCTGAAA 3070 hom 81 het 35 0 27 8 CCTTGGGTAGACAC 0 1 378927 CASAVA_Build 17 69508378 2D AGAGAGAGAT TC/-- TGTTTTTCGA 3070 het 3070 ref 27 14 9 5 TC 1 0 378928 CASAVA_Build 17 69508612 2I CACACCCCCC --/CA CACCACCACC 3070 hom 114 het 43 0 37 6 CA 1 2 378929 CASAVA_Build 17 69516869 1D GAGGTTTTGA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 hom 34 10 19 5 T 10 9 378930 CASAVA_Build 17 69518024 3D GCAACTCTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 14 11 5 T 13 10 378931 CASAVA_Build 17 69520160 1D TTTCTTTCCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 34 14 19 1 T 12 11 378932 CASAVA_Build 17 69543912 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAC 511 het 511 ref 18 10 4 4 A 10 9 378933 CASAVA_Build 17 69552725 1I AGGGAGGCAA -/G GGGGCAGCCC 3070 hom 43 het 19 0 13 6 G 4 5 378934 CASAVA_Build 17 69554251 1D AGCCAAAGAT G/- ATGAGAGAAA 3070 hom 72 het 27 0 24 3 G 1 0 378935 CASAVA_Build 17 69554341 4I GGTCCATAGA ----/TTTT TTTTTTCATT 3070 hom 60 het 22 0 21 4 T 6 10 378936 CASAVA_Build 17 69555576 4I TCATTCATTC ----/ATTT GTTGGACAAG 3070 hom 72 het 35 0 24 11 ATTT 0 1 378937 CASAVA_Build 17 69556336 2D CTAGATCATA AG/-- AGGGAATCCC 3070 het 3070 ref 30 18 8 4 AG 2 1 378938 CASAVA_Build 17 69562582 14D49M4D TGTCTCCCTT TGTTTCCCTCTTTCTCCCTTTCCCTCTTTTTCCCTCTTTCTCTGTCTCACTCTCTCCCTCTTTCTCC/--------------TCTGTTTCCCTCTTTTTCCCTCTTTCTCTGTCTCACTCTCTCCCTCTTT---- CTCTCCCTCT 2452 het 79 hom 22 1 8 21 N/A 0 0 378939 CASAVA_Build 17 69566269 1D CTGAAGGTGA C/- CCTGTTAGTC 3070 hom 117 het 45 0 39 7 C 3 2 378940 CASAVA_Build 17 69567590 3D CACTAGTACT TTA/--- TTGCCTATAA 3070 het 3070 ref 48 25 19 4 TTA 1 0 378941 CASAVA_Build 17 69592204 1D ACTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 2428 het 423 hom 13 3 7 3 A 15 14 378942 CASAVA_Build 17 69606512 2I ACTAACACTC --/AA AGACACATTC 3070 het 3070 ref 88 51 31 6 A 1 3 378943 CASAVA_Build 17 69607217 2D TCTCTGCACC CT/-- CTCTGAGTCC 2695 het 2695 ref 41 17 9 15 CT 3 2 378944 CASAVA_Build 17 69611321 1I TCTCTGGGCC -/A AAAAACCGGG 3070 het 3070 hom 34 10 20 4 A 5 6 378945 CASAVA_Build 17 69613858 1D ATGAATTACG T/- TTTTTTTTTT 1170 het 1170 ref 30 21 3 6 T 12 11 378946 CASAVA_Build 17 69618018 2I ACTGCCTAAC --/TT TTGTAATGTT 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 T 2 4 378947 CASAVA_Build 17 69618132 3I CACAGAGCAT ---/ATC ATGCGTTGGC 2931 het 2931 ref 25 12 9 4 ATC 0 1 378948 CASAVA_Build 17 69619294 2D GGAGCTTGCA GT/-- GAGCCAACAT 3070 het 3070 hom 26 11 13 2 GT 1 0 378949 CASAVA_Build 17 69619874 1D AGTGAGACTC T/- TGTCTCAAAA 3070 het 3070 ref 29 14 11 4 T 2 1 378950 CASAVA_Build 17 69634397 1I AGACAGTAGC -/T TTGTCCACGG 3070 het 3070 hom 40 15 14 11 T 2 3 378951 CASAVA_Build 17 69649202 1I AATCCTAATT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 56 het 24 0 18 6 A 10 11 378952 CASAVA_Build 17 69677190 1I ATTGGAGAGG -/A AAAAAAACAT 3070 het 3070 ref 41 19 18 4 A 7 8 378953 CASAVA_Build 17 69703651 2I GGGACAGGGA --/CT CAGCCCTTCT 1896 het 1896 ref 29 19 6 4 CT 0 1 378954 CASAVA_Build 17 69706832 1I TTCAGTTTCT -/A AAAAAAACAC 3070 het 3070 ref 24 11 9 4 A 7 8 378955 CASAVA_Build 17 69707189 1I GCTCTGTCTC -/A AAAAAAATAA 3070 het 3070 hom 25 11 11 3 A 7 8 378956 CASAVA_Build 17 69710216 1D GAAAGGAAGG T/- TAAGTTAAAT 3070 het 3070 hom 33 14 13 7 T 2 1 378957 CASAVA_Build 17 69737992 2I CATTTTTTCA --/TT TTTTTTTTTT 2450 het 2450 ref 29 15 8 6 T 11 13 378958 CASAVA_Build 17 69752332 1I AAAATGGCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 11 13 9 A 11 12 378959 CASAVA_Build 17 69758661 6I ATTTTATATC ------/ACAGAA CAGTATGTCA 3070 het 3070 ref 73 36 32 5 ACAGAA 0 1 378960 CASAVA_Build 17 69758789 2D TGCGTGTGTC TG/-- TGTGTGTGTG 1069 het 1069 ref 68 37 7 25 TG 6 5 378961 CASAVA_Build 17 69758816 3D9M21D GTGTGCACTT GTGGTGTATATGTCTGTGCGTGTGTGGTGTGTT/---GTGTATATG--------------------- TCTGCGGTTG 3070 het 3070 ref 63 50 11 19 N/A 0 0 378962 CASAVA_Build 17 69759082 12D GGTGTGTGTG GTGCATGTGTGT/------------ GTGCATGTGG 3070 het 3070 hom 45 18 22 14 GTGCATGTGTGT 1 0 378963 CASAVA_Build 17 69759391 1I GTGGCCTCTT -/C CCCACTTTCT 3070 het 3070 hom 35 12 17 6 C 3 4 378964 CASAVA_Build 17 69761916 2D TTTATTTATT TA/-- TTTATTTTTT 3043 het 3043 ref 29 15 11 3 TA 1 0 378965 CASAVA_Build 17 69764439 1I GCTGGAGTAC -/A GTGGTGCAAT 3070 het 3070 hom 30 13 11 6 A 0 1 378966 CASAVA_Build 17 69767792 1D TCTGAGAAGT C/- CCCGGCACCT 3070 het 3070 ref 48 20 20 9 C 4 3 378967 CASAVA_Build 17 69772244 1I TGGTTGAGGA -/C TTTTTTTGAG 3070 het 2363 hom 24 6 10 8 C 0 1 378968 CASAVA_Build 17 69773737 1D AATTTTTGTA T/- TTTTTTTTTT 3025 het 1039 hom 21 6 10 5 T 13 12 378969 CASAVA_Build 17 69774226 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 84 hom 19 2 13 4 A 15 14 378970 CASAVA_Build 17 69778741 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAG 2500 het 2500 ref 19 10 6 4 A 10 9 378971 CASAVA_Build 17 69781485 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2096 het 766 hom 11 2 7 2 A 13 14 378972 CASAVA_Build 17 69782019 10D GGAGCACCGG AGCCGCGACC/---------- GTGGATTGAA 2245 het 1911 hom 15 8 7 1 AGCCGCGACC 1 0 378973 CASAVA_Build 17 69790048 1I CTGGGAGACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 46 17 18 11 T 10 11 378974 CASAVA_Build 17 69793327 1D TTGCCAGTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 29 11 13 5 A 12 11 378975 CASAVA_Build 17 69801890 5D TCTATTTACA TTAAT/----- TTAATTACTG 3070 het 3070 ref 35 18 13 9 TTAAT 2 1 378976 CASAVA_Build 17 69803381 1D TGTCTTATAA T/- TTTTTTTTTA 3070 het 3070 ref 25 11 10 4 T 10 9 378977 CASAVA_Build 17 69811364 2I AGTCTCACTC --/TG TTGCCCAGGC 3070 het 879 hom 21 3 12 6 TG 0 1 378978 CASAVA_Build 17 69817712 2D AACTTTGCTC CT/-- CTCTCCTCTA 3070 hom 84 het 31 0 29 2 CT 3 2 378979 CASAVA_Build 17 69823383 1I CCATCTCTAT -/A AAAAAATACA 3070 het 3070 ref 21 8 8 5 A 6 7 378980 CASAVA_Build 17 69833185 1D ACCAGAATCC A/- AGTTTTCCCA 3070 het 3070 ref 36 16 10 10 A 2 1 378981 CASAVA_Build 17 69834593 16D GATGGGGCCC GGAGTGCCTGGTTCTT/---------------- GGGCTGCAAC 1263 het 1263 ref 23 16 6 3 GGAGTGCCTGGTTCTT 1 0 378982 CASAVA_Build 17 69849760 1D AGGAGCCCCT C/- CCCCACCCTT 3070 hom 56 het 24 0 15 9 C 5 4 378983 CASAVA_Build 17 69856319 4D CCTGAGGGCT GTAA/---- GTTTTATTCC 3070 het 3070 hom 43 14 21 10 GTAA 1 0 378984 CASAVA_Build 17 69877928 7I ACAAGTGCCC -------/CCGTGAT CCTGTTTCAG 2963 het 1191 hom 16 5 9 2 CCGTGAT 0 1 378985 CASAVA_Build 17 69879227 1D TCCATGTGCA C/- TTACCTGTGC 3070 het 3070 ref 37 17 14 6 C 1 0 378986 CASAVA_Build 17 69893078 1I GGAAGGTAAG -/T TTTTTGTTTG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 T 5 6 378987 CASAVA_Build 17 69895511 1D AAGAAAAAAA G/- ACTATCTGTG 3070 hom 95 het 39 0 32 8 G 1 0 378988 CASAVA_Build 17 69898225 4D CCCTTCCTTT CTTC/---- CTTCCTTCCT 1543 hom 27 het 15 0 9 7 CTTC 3 2 378989 CASAVA_Build 17 69898272 2I CTTTTTTTTT --/TG TTTGTTTTTT 3070 het 45 hom 16 1 10 5 TG 0 1 378990 CASAVA_Build 17 69920641 1I TGGGGTGTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 1344 hom 27 3 21 3 T 11 12 378991 CASAVA_Build 17 69924213 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 45 het 24 0 15 9 A 10 9 378992 CASAVA_Build 17 69945364 1I ATGGACAGAA -/T TTTTTTTTTT 913 het 913 ref 33 24 3 6 T 15 16 378993 CASAVA_Build 17 69951404 1D CCCCCAAGTT G/- GCCACTCCTG 3070 hom 75 het 28 0 22 6 G 2 1 378994 CASAVA_Build 17 69955508 1D GAGCCTTGAG C/- CAGGTGGCTC 3070 hom 97 het 43 0 33 10 C 2 1 378995 CASAVA_Build 17 69957435 3I CAAGCTGTGG ---/TTC TTCAGATTGC 3070 hom 95 het 34 0 29 5 TTC 1 2 378996 CASAVA_Build 17 69973145 2D TGTGTGAATG TT/-- TGTGTGTGTG 3070 het 421 hom 69 6 30 33 T 3 1 378997 CASAVA_Build 17 69998185 1I GTTAAAGGCA -/T TCAGTTTTAT 3070 hom 48 het 17 0 17 0 T 1 2 378998 CASAVA_Build 17 69999687 1D TTAATTTTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 6 hom 31 1 22 8 T 13 12 378999 CASAVA_Build 17 70005080 3D ACGAATATGT ATG/--- ATATTTTTCC 3070 hom 108 het 40 0 36 4 ATG 1 0 379000 CASAVA_Build 17 70005883 1I TATTTGTTGT -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 41 het 21 0 14 7 A 10 11 379001 CASAVA_Build 17 70006704 4D ATGTCTCTTA ACAC/---- ACACACAAAA 3070 hom 69 het 29 0 24 5 AC 5 3 379002 CASAVA_Build 17 70014778 4D TGGGGTTTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 31 14 12 5 TTTG 3 2 379003 CASAVA_Build 17 70019209 1D TTTAGGACCC T/- TTTTTTTATC 3070 het 3070 ref 39 22 11 6 T 8 7 379004 CASAVA_Build 17 70022080 15D ATAGGTGATG TCATGTGATCGACGA/--------------- TCATGTGATG 1934 het 1934 ref 83 38 9 48 TCATGTGATCGACGA 1 0 379005 CASAVA_Build 17 70024121 1D ATCAAAGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 15 11 T 13 12 379006 CASAVA_Build 17 70025431 1I GACTCATATC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 43 11 15 17 T 11 12 379007 CASAVA_Build 17 70025740 1D CTAAAACAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 25 het 52 1 40 11 A 12 11 379008 CASAVA_Build 17 70026536 4D AAGCTCTCTC TCTT/---- TGCCTGCTGC 2684 het 2684 ref 19 10 8 1 TCTT 1 0 379009 CASAVA_Build 17 70035437 1I GTCTGTTGCT -/G GCTTTGAAGT 3070 het 3070 hom 46 18 20 8 G 1 2 379010 CASAVA_Build 17 70036369 1I TGCTCCTCAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 2848 hom 35 11 11 13 T 11 12 379011 CASAVA_Build 17 70044796 3I AAAGAAGAAA ---/AGG AGGAGGAGGA 2763 het 2121 hom 25 6 9 10 AGG 5 6 379012 CASAVA_Build 17 70049949 5D AGGAATTAAT GAATG/----- GACAGCTCAG 3070 het 3070 hom 37 13 22 3 GAATG 1 0 379013 CASAVA_Build 17 70052162 1D ACCACACCAC A/- ACTCCTATGC 3070 hom 107 het 43 0 32 12 A 2 1 379014 CASAVA_Build 17 70059124 3D AGCACACACA CAC/--- CACACCTGCG 3070 het 3070 hom 44 18 19 8 CAC 2 1 379015 CASAVA_Build 17 70061374 1D GGTATGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 74 het 30 0 24 6 T 11 10 379016 CASAVA_Build 17 70063360 1I TCGTAAATGT -/A CGGCTCAGCA 3070 hom 65 het 32 0 23 9 A 0 1 379017 CASAVA_Build 17 70073088 3D GTTTTGGCAA AAT/--- ACCAAGCTCC 3070 het 3070 ref 30 18 11 1 AAT 1 0 379018 CASAVA_Build 17 70073137 12D TCTACCTATC AACTATCTATCT/------------ ATCTATCTAT 2368 het 491 hom 26 5 8 15 AACTATCTATCT 1 0 379019 CASAVA_Build 17 70077393 1I TAGCAAAACT -/C CCTAATCCCA 3070 hom 135 het 52 0 46 6 C 2 3 379020 CASAVA_Build 17 70083080 1I ACTCTATCTC -/A AAAAAAAAAA 2222 het 2222 ref 22 8 9 5 A 12 13 379021 CASAVA_Build 17 70085757 1I TAATGTTGTT -/A AAAAACAAGA 3070 het 3070 ref 29 14 10 5 A 5 6 379022 CASAVA_Build 17 70091741 13D ACCTGCCTCA GCCTTAACAAAGT/------------- GCTGGGATTA 1425 het 1425 ref 13 8 6 1 GCCTTAACAAAGT 1 0 379023 CASAVA_Build 17 70095654 1I TGGGGTCATT -/G AAGAGATCCC 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 G 0 1 379024 CASAVA_Build 17 70097035 1D TTAATCACCC T/- GAATGAATCC 3070 het 3070 ref 49 20 18 12 T 1 0 379025 CASAVA_Build 17 70103530 1I AGTGGGACCA -/C TGCCTTGTTT 3070 hom 102 het 36 0 34 2 C 0 1 379026 CASAVA_Build 17 70107497 1D30M1I GTAACTAAAG AAAAAAAAAGGAAGCAGTTGAGAAAACAAAC-/-AAAAAAAAGGAAGCAGTTGAGAAAACAAACA AAAAAAAATG 3070 hom 90 het 30 0 31 3 N/A 0 0 379027 CASAVA_Build 17 70115035 1D CTTTAAATAC T/- TTTTTTTGAA 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 7 379028 CASAVA_Build 17 70141994 2D TGTGTCTAAG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 5 hom 35 2 22 11 A 17 15 379029 CASAVA_Build 17 70143572 1D AGACTGTCAG C/- CCCCTCCTTG 3070 hom 75 het 30 0 25 6 C 5 4 379030 CASAVA_Build 17 70148262 2I CTAGCTAGGA --/CC CCCCCCACCC 2484 het 2484 ref 23 13 7 3 C 6 8 379031 CASAVA_Build 17 70149702 1I TACAACTTCC -/A AAAAACAGAC 3070 het 3070 ref 43 21 14 8 A 5 6 379032 CASAVA_Build 17 70153721 1D ACACCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1157 hom 19 5 11 4 A 12 11 379033 CASAVA_Build 17 70160472 5I CTTCTTCAGT -----/TCCTA TCCCTCTATT 3070 het 2970 hom 25 8 12 5 TCCTA 0 1 379034 CASAVA_Build 17 70162843 1D ACATTATTCC T/- TTTTTTTTTT 1145 het 1145 ref 35 13 3 19 T 15 14 379035 CASAVA_Build 17 70163497 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 46 het 19 0 15 4 A 12 11 379036 CASAVA_Build 17 70166991 2D TTCTTTTTTC TT/-- TTTTTTTTTT 1758 het 81 hom 18 1 5 12 T 17 15 379037 CASAVA_Build 17 70177717 4D CACAGGCTGA AAAC/---- AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 35 9 10 17 AAAC 5 4 379038 CASAVA_Build 17 70180028 9D TCTCTCAGGA TAACAGTTT/--------- TAATTCAAAA 3070 hom 123 het 43 0 42 4 TAACAGTTT 1 0 379039 CASAVA_Build 17 70187712 1D GCTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1456 het 16 hom 15 1 6 8 A 17 16 379040 CASAVA_Build 17 70188576 1I TTCTTCCTCC -/A ATCTCACTCA 3070 het 3070 ref 48 20 18 10 A 1 2 379041 CASAVA_Build 17 70192000 1D GCCCTGTTAA T/- TTTTTTTTTT 601 het 601 ref 25 16 3 6 T 17 16 379042 CASAVA_Build 17 70197584 1D AACTCAGTAG T/- TTTTTTTTCT 3070 het 3070 hom 38 15 18 5 T 9 8 379043 CASAVA_Build 17 70215451 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 2208 het 567 hom 14 2 7 5 A 15 16 379044 CASAVA_Build 17 70225428 1D CTGTAATCCC A/- GCTACTCAGG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 A 1 0 379045 CASAVA_Build 17 70233363 1I TATCAGTAGA -/T TTTTTTTTTT 1204 het 1204 ref 27 12 4 11 T 13 14 379046 CASAVA_Build 17 70241220 5I25M1D8M6I19M19D GGTGTGAGGT -----GTGTGGTGTGATTTGAGGTGTGTGTGGTGAGGTG------TGTGGTGTGATTTGAGGGGTGAGGTGTGTATGGTCTGA/GTGTGGTGTGGTGTGATGTGAGGTGTGTGT-GTGAGGTGTGTGTCTGTGATGTTATTTGAGGGG------------------- GGTGTGTGTG 2930 het 2930 ref 78 94 16 22 N/A 0 0 379047 CASAVA_Build 17 70277640 1I TCCAGTGCCA -/G GGGGAAAACA 3070 het 3070 hom 38 11 18 9 G 4 5 379048 CASAVA_Build 17 70292701 1I CTTTTTTTTT -/A AAAAACCCTG 3070 het 3070 hom 38 15 20 3 A 5 6 379049 CASAVA_Build 17 70294077 9D GAGATGGGAA GGAGCACCT/--------- GGAAACACCT 3070 het 3070 ref 37 24 10 5 GGAGCACCT 1 0 379050 CASAVA_Build 17 70302684 1I AGAAGAAGAA -/G AAAAAAAAAA 3070 hom 93 het 33 0 32 1 G 0 1 379051 CASAVA_Build 17 70306765 1D GTGTCACTCT C/- CCCCTGGGAT 3070 hom 85 het 34 0 24 10 C 5 4 379052 CASAVA_Build 17 70308530 1I GCCCGGGATT -/G GAGTGAAGTG 3070 het 3070 hom 30 11 14 5 G 1 2 379053 CASAVA_Build 17 70335646 1I CCCCTTCCGA -/T GGCCCAGCTA 3028 het 3028 ref 29 13 9 7 T 0 1 379054 CASAVA_Build 17 70339809 1I GGGGCCAGAC -/A AAGGGGGTGG 1316 het 1316 ref 24 7 5 12 A 2 3 379055 CASAVA_Build 17 70344578 1I GTTCTCCCCA -/C CCCACCTTCC 3070 het 3070 hom 36 16 16 4 C 3 4 379056 CASAVA_Build 17 70354290 4D AGGCTGAACT TTGA/---- TTGGCACCAC 3070 het 3070 hom 42 16 23 5 TTGA 1 0 379057 CASAVA_Build 17 70356881 3D TTCCGTGGCT GAG/--- GAGCCTGCTC 3070 het 2521 hom 28 8 14 9 GAG 2 1 379058 CASAVA_Build 17 70393042 2I AAAAAAAAAA --/AT AAATAAATAA 3070 hom 63 het 32 0 22 10 AT 0 1 379059 CASAVA_Build 17 70394099 1D GGTAAGAGAA T/- TCACTGAAAC 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 2 1 379060 CASAVA_Build 17 70400137 1D CAGCGGCCTG C/- CCCCCGTGGG 3070 hom 67 het 27 0 21 6 C 6 5 379061 CASAVA_Build 17 70405034 3D ACTCCGTTTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 54 het 23 0 18 7 A 18 15 379062 CASAVA_Build 17 70406830 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAATAC 3070 hom 60 het 22 0 21 1 A 7 8 379063 CASAVA_Build 17 70407072 1I CCTCCTGCTT -/G GGCTGGAGTG 3070 hom 97 het 37 0 33 4 G 2 3 379064 CASAVA_Build 17 70413154 5D TCTCTCATCT TTTTA/----- TTTTATTTTA 3070 hom 69 het 29 0 23 6 TTTTA 4 3 379065 CASAVA_Build 17 70425392 1D GGGAGAGGCC T/- ACGGCGCCCG 3070 hom 54 het 19 0 17 3 T 1 0 379066 CASAVA_Build 17 70443909 4I ACAGCAGAAA ----/GTGG GCGCGGAGGC 2260 hom 30 het 13 0 10 3 GTGG 0 1 379067 CASAVA_Build 17 70453675 1D TTTTTTGTGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 426 hom 19 1 16 2 T 11 10 379068 CASAVA_Build 17 70462547 1D TTTCAGTTCC A/- ACATCCCACC 3070 hom 102 het 40 0 34 6 A 2 1 379069 CASAVA_Build 17 70463192 1D CGCCGTCGGG A/- AAAAAAAAAA 1636 het 135 hom 17 2 5 10 A 13 12 379070 CASAVA_Build 17 70469275 1I ACTTTTTAAC -/T TTTTTTAATT 3070 hom 33 het 21 0 12 9 T 6 7 379071 CASAVA_Build 17 70469558 1D CCAAGGGCCC T/- TCACCTGTTC 3070 hom 54 het 22 0 17 5 T 2 1 379072 CASAVA_Build 17 70476856 4D CCTCCACCCA GCCC/---- GCCCAAGGAA 3070 hom 54 het 22 0 19 3 GCCC 2 1 379073 CASAVA_Build 17 70499419 4I AAAAAGAAAA ----/AAAG AAAGAAAGAA 3070 hom 48 het 18 0 17 1 AAAG 2 3 379074 CASAVA_Build 17 70506063 1D ACCACCTTTC T/- TTTTTTTTTA 3070 hom 68 het 27 0 23 4 T 10 9 379075 CASAVA_Build 17 70512118 1D ATCAGTTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 349 hom 23 1 13 9 T 15 14 379076 CASAVA_Build 17 70523751 1I CTGGGATTAC -/A GGCGTGAGCC 3070 hom 35 het 14 0 10 4 A 0 1 379077 CASAVA_Build 17 70525619 1I GTCTCAGACG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 867 hom 26 2 19 5 A 12 13 379078 CASAVA_Build 17 70526820 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 3 het 32 1 21 10 A 14 13 379079 CASAVA_Build 17 70537392 1I GTATGACCAT -/G GAACAGGAGA 3070 hom 63 het 23 0 22 1 G 1 2 379080 CASAVA_Build 17 70539518 1D GCAATGGCGC A/- ATCTCGGGTC 3070 hom 59 het 22 0 20 2 A 2 1 379081 CASAVA_Build 17 70583614 1D TCAAAAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 97 het 37 0 32 6 A 11 10 379082 CASAVA_Build 17 70587677 2D CCTTCTGTGA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 32 hom 27 2 14 12 T 17 15 379083 CASAVA_Build 17 70605668 3D TCCAGCCACT CTC/--- CTCCTCTCCC 2923 het 2441 hom 29 11 11 10 CTC 3 2 379084 CASAVA_Build 17 70614893 3I AGGAGGCAGA ---/GGT GGTGGGAGGA 3070 hom 98 het 39 0 32 7 GGT 1 2 379085 CASAVA_Build 17 70620433 2D GCCCAGCTAA TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 26 0 22 4 T 14 12 379086 CASAVA_Build 17 70634278 1D TTTGTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 1339 het 1339 ref 41 24 3 14 T 12 11 379087 CASAVA_Build 17 70638342 1D CCTAGGACAG T/- GAAAGACAGC 3070 hom 59 het 23 0 18 6 T 1 0 379088 CASAVA_Build 17 70645015 4I TTTTAGTTTT ----/TTTG TTTGTTTGTT 3070 hom 66 het 35 0 22 13 TTTG 3 4 379089 CASAVA_Build 17 70650576 2D ATATGAAAAT AC/-- ACACACACAC 3070 hom 96 het 44 0 33 12 AC 8 7 379090 CASAVA_Build 17 70651076 7I ATGGTGAAAC -------/CTCGTCT CTCGTCTCTA 3070 hom 74 het 26 0 25 1 CTCGTCT 1 2 379091 CASAVA_Build 17 70651753 1I GACTTCTGGA -/T TAACTGAACA 3070 hom 123 het 45 0 41 4 T 1 2 379092 CASAVA_Build 17 70663373 1D TTTTCCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 145 hom 39 2 23 14 T 12 11 379093 CASAVA_Build 17 70673371 5I CAGTTTTATA -----/GTTTT GTCACCGTCT 3070 hom 93 het 32 0 32 0 GTTTT 0 1 379094 CASAVA_Build 17 70685435 2D AGCACTTTGG GA/-- GGCCGAGGTG 1589 het 1589 ref 18 10 5 3 GA 1 0 379095 CASAVA_Build 17 70685527 4I TACGAAAAAT ----/ACAA AAATTAGCCG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 ACAA 0 1 379096 CASAVA_Build 17 70689597 3D CCAACCTAAA GTT/--- GTCCAAAATC 3070 hom 42 het 17 0 14 4 GTT 1 0 379097 CASAVA_Build 17 70698627 1D ACTTCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2986 hom 6 het 14 0 8 7 A 15 14 379098 CASAVA_Build 17 70704132 1D TAATAAAATT A/- AAAAAAAAAT 2668 hom 18 het 8 0 7 1 A 10 9 379099 CASAVA_Build 17 70707850 2D TGTGTAGTAC TT/-- TTCTTTTTTT 3070 het 3070 hom 40 12 23 6 T 4 2 379100 CASAVA_Build 17 70710423 1I CTCTGGCCTC -/A AGTCTCCTTC 3070 hom 63 het 26 0 21 5 A 1 2 379101 CASAVA_Build 17 70722547 4D ACTCTGTCTC AAAA/---- AAAAAAACAA 3070 hom 27 het 10 0 10 0 A 11 7 379102 CASAVA_Build 17 70729732 4D TGTGTTTTGT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 hom 138 het 55 0 45 14 TTTG 5 4 379103 CASAVA_Build 17 70743413 1D TGTATATAGA T/- TTTTTTAAAA 3070 hom 114 het 43 0 39 5 T 7 6 379104 CASAVA_Build 17 70745606 14I TCTTTAGAGA --------------/CTCCCACCCCCCAC CCCCCACCCC 3070 hom 48 het 19 0 14 5 CTCCCACCCCCCAC 0 1 379105 CASAVA_Build 17 70767449 3I TACAGTTCAC ---/ATT ATTAAGTCGT 3070 hom 126 het 45 0 42 3 ATT 1 2 379106 CASAVA_Build 17 70772890 1I AATTTTTGCA -/T TTTTAGTAGA 3070 hom 45 het 18 0 16 4 T 4 5 379107 CASAVA_Build 17 70774862 13I AGCCTGTCTC -------------/CAAACCACTTCTT CAAACCACTT 3070 hom 109 het 48 0 33 15 CAAACCACTTCTT 1 2 379108 CASAVA_Build 17 70788626 1D AACAACAACC A/- AAAAAAAAAA 1132 het 1079 hom 26 7 5 14 A 17 16 379109 CASAVA_Build 17 70813069 1I CCTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 1090 het 377 hom 15 2 7 6 T 15 16 379110 CASAVA_Build 17 70814458 1D GATCCGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 66 het 27 0 22 5 A 11 10 379111 CASAVA_Build 17 70822225 1D CAGGAATGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 21 1 14 6 A 12 11 379112 CASAVA_Build 17 70822767 1I AATTGTACTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 21 0 17 5 T 10 11 379113 CASAVA_Build 17 70823374 3I CGCTGTGGGT ---/CAC CACCATCTCC 3070 hom 57 het 22 0 17 5 CAC 1 2 379114 CASAVA_Build 17 70823767 1I ATGAGGCTAA -/T ATGAGTCACC 3070 hom 105 het 38 0 35 3 T 0 1 379115 CASAVA_Build 17 70824380 4I TGAGAGAGGT ----/CTCA CTGTCTCTCA 2993 hom 35 het 20 0 13 7 CTCA 0 1 379116 CASAVA_Build 17 70826871 1D CCACTCCTGC T/- TTGTCTCCTT 3070 hom 62 het 26 0 18 8 T 3 2 379117 CASAVA_Build 17 70827272 3I CAGGTGCGTG ---/CCA CCACACCCGG 3070 hom 31 het 13 0 11 2 CCA 1 2 379118 CASAVA_Build 17 70828846 9D ACAACAAATC TTTTTTTTT/--------- TTTTTTTTTT 2483 hom 30 het 24 0 10 14 T 25 16 379119 CASAVA_Build 17 70830500 2D TGGCCGGGCA CT/-- CTCGGCATTC 3070 hom 69 het 28 0 23 6 CT 2 1 379120 CASAVA_Build 17 70832956 2I AGTAAAAAAC --/AT ATGGAAATAA 3070 hom 81 het 30 0 28 2 AT 1 2 379121 CASAVA_Build 17 70838384 1D AACAAAAAAC A/- AAAAAAAAAA 1176 het 1176 ref 24 18 4 2 A 12 11 379122 CASAVA_Build 17 70842532 2D TCAAAATATC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 37 het 26 0 12 14 T 16 14 379123 CASAVA_Build 17 70846365 1D TGTTTTTTGG T/- TTTTTTTTGC 3070 hom 101 het 40 0 34 6 T 9 8 379124 CASAVA_Build 17 70851363 1I GCATAGACAA -/T ACCCCAAAAT 3070 hom 78 het 28 0 27 1 T 0 1 379125 CASAVA_Build 17 70852069 1D CTGTAGCTAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 277 hom 32 1 16 15 T 17 16 379126 CASAVA_Build 17 70857723 1I TAAAACAACC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1709 hom 41 5 26 10 A 13 14 379127 CASAVA_Build 17 70861140 1I CTATGCCCTT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 291 hom 31 2 24 5 A 10 11 379128 CASAVA_Build 17 70861707 2D CAGAGCGAGA CT/-- CTGTCTCAAA 3070 hom 57 het 21 0 19 3 CT 2 1 379129 CASAVA_Build 17 70867875 2D TGATTTTTTA CT/-- CTGTTTTATT 3070 hom 63 het 25 0 22 4 CT 2 1 379130 CASAVA_Build 17 70868657 1D CTATTGAACA G/- GGCTGGTCTC 3070 hom 119 het 41 0 37 4 G 3 2 379131 CASAVA_Build 17 70869795 1D CACCCTCAGG C/- CCAGTTTTAG 3070 hom 78 het 30 0 26 4 C 3 2 379132 CASAVA_Build 17 70871319 2I GTGGATCACC --/AA AAGTCAAGAG 3070 hom 33 het 13 0 11 2 A 2 4 379133 CASAVA_Build 17 70875543 2D TAAAATACTC TT/-- TAGATTTTTT 3070 hom 65 het 25 0 21 4 T 3 1 379134 CASAVA_Build 17 70883064 1I AATCTTCAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 565 hom 32 2 23 7 A 10 11 379135 CASAVA_Build 17 70887087 5D AAAAAAAAAA AAAAG/----- AAAGACAGGG 3070 hom 28 het 17 0 14 4 AAAAG 1 0 379136 CASAVA_Build 17 70889899 1D CTCCGTCTCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 838 hom 26 2 18 6 A 11 10 379137 CASAVA_Build 17 70894664 21I ATCCTGGCTA ---------------------/ACACAGTGAAACCCCGTCTCT ACTAAAAACA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 ACACAGTGAAACCCCGTCTCT 0 1 379138 CASAVA_Build 17 70895128 1D ACTCTGTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 23 0 16 7 A 17 16 379139 CASAVA_Build 17 70896984 1I CCTGTTCTCC -/T TACAAGGTTC 3070 hom 147 het 52 0 49 3 T 1 2 379140 CASAVA_Build 17 70899484 6D ACTCCATCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 1582 hom 15 het 11 0 5 6 A 22 16 379141 CASAVA_Build 17 70901580 1D CAGGCAACAG C/- CCCCCCCCGC 3070 hom 23 het 24 0 11 13 C 9 8 379142 CASAVA_Build 17 70903517 1D ACTTTTTGTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 685 hom 31 3 18 10 T 13 12 379143 CASAVA_Build 17 70910825 1I AACTTTGACC -/A AAAAAAAATA 1950 hom 12 het 6 0 5 1 A 8 9 379144 CASAVA_Build 17 70912637 1I TTTCAAATAG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 298 hom 18 1 12 5 T 11 12 379145 CASAVA_Build 17 70916449 2D TCTTTTCTTT TC/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 43 het 22 0 18 4 TC 1 0 379146 CASAVA_Build 17 70917530 1I TCTTTGTTTG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 408 hom 21 1 17 3 T 9 10 379147 CASAVA_Build 17 70926225 1I TCCATCTCCG -/A AAAAAAAAAC 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 9 10 379148 CASAVA_Build 17 70926788 1I CTCAAAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 34 0 26 8 A 11 12 379149 CASAVA_Build 17 70927064 1I TGTAAATTTC -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 29 het 38 1 25 12 T 11 12 379150 CASAVA_Build 17 70928266 1D CTCAGGCAAT C/- CCCCCCGCCT 3070 hom 36 het 16 0 10 6 C 7 6 379151 CASAVA_Build 17 70946097 11D CATAATAGCC AAAAAAAAAAA/----------- AAAAAAAAAA 3070 hom 91 het 41 0 32 11 A 21 10 379152 CASAVA_Build 17 70950729 1I AGTTAGGAGC -/T TTTTTTTTTG 3070 het 188 hom 39 1 33 5 T 9 10 379153 CASAVA_Build 17 70951512 1I AATTTTTGGA -/T TTTTTAGTAG 3070 hom 39 het 14 0 13 1 T 5 6 379154 CASAVA_Build 17 70952014 1I AGCCTCTCAG -/A AAAAAAGTAT 3070 hom 96 het 43 0 31 12 A 6 7 379155 CASAVA_Build 17 70959687 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 2615 hom 21 het 8 0 8 0 T 10 11 379156 CASAVA_Build 17 70963198 4D AAGCGTAGGG AACC/---- AACCATGTGA 3070 hom 77 het 31 0 23 8 AACC 2 1 379157 CASAVA_Build 17 70968308 1I TTCCACCTTA -/G CCCCCTGAGT 3070 hom 93 het 38 0 29 9 G 0 1 379158 CASAVA_Build 17 70970845 14D TATGTGTGTG TGTGTGTGTGTATA/-------------- TATATATATA 2508 hom 15 het 6 0 6 2 TGTGTGTGTGTATA 1 0 379159 CASAVA_Build 17 70975070 4D GCTTTGCACC TTTA/---- TTTGTTTTAG 3070 hom 18 het 8 0 7 2 TTTA 1 0 379160 CASAVA_Build 17 70983408 2D CGGGCAGCCT CA/-- TGGGCCCAGC 3070 hom 105 het 41 0 32 10 CA 1 0 379161 CASAVA_Build 17 70993706 1D CCCAACCTCT C/- CAGCTGTGCT 1999 hom 37 het 14 0 9 5 C 2 1 379162 CASAVA_Build 17 71018204 1I TACACAGAGT -/C CCCAGGCCCT 3070 hom 66 het 27 0 22 5 C 3 4 379163 CASAVA_Build 17 71018462 4D GAGATGGCAT CTTA/---- CTATGTTGCC 3070 hom 84 het 29 0 27 2 CTTA 1 0 379164 CASAVA_Build 17 71019589 1D TTGACCAAGG C/- CCCACTGGGC 3070 hom 59 het 27 0 19 8 C 4 3 379165 CASAVA_Build 17 71020876 4D TACTAGGAGG CCTA/---- CCTAGGTGGG 3070 hom 102 het 35 0 34 2 CCTA 2 1 379166 CASAVA_Build 17 71036824 2I AGAGTGAGAC --/TT TGTCTCAAAA 3070 hom 24 het 9 0 9 0 T 1 3 379167 CASAVA_Build 17 71038322 1D CGAGACTCCA T/- TTCAAAAAAA 564 het 111 hom 17 1 5 11 T 3 2 379168 CASAVA_Build 17 71059805 1I CTCTGTCTTT -/A AAAAAAAAAG 3070 hom 33 het 16 0 12 5 A 9 10 379169 CASAVA_Build 17 71094666 2I AAACAAAATG --/CT CTGTCACCCA 3070 hom 90 het 32 0 31 1 CT 1 2 379170 CASAVA_Build 17 71114158 1I ACTCAGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 36 het 15 0 12 3 T 9 10 379171 CASAVA_Build 17 71121639 2I GCTCCCACGG --/CC CAGATTCTAA 1140 het 1140 ref 20 12 4 4 C 1 3 379172 CASAVA_Build 17 71124238 1I GAAGAAGCCA -/T TGAAGCAAGG 3070 hom 56 het 24 0 16 8 T 1 2 379173 CASAVA_Build 17 71126458 1I TTGCCACCTC -/T TGAACGCTCC 3070 het 3070 hom 39 15 23 1 T 1 2 379174 CASAVA_Build 17 71130729 1D AGCAGGGGCC G/- GGCGCGGCGG 757 het 757 ref 19 8 5 6 G 3 2 379175 CASAVA_Build 17 71153855 1D GGAAGCCTCA G/- GGGGGGAGCA 3070 hom 81 het 33 0 28 5 G 7 6 379176 CASAVA_Build 17 71155820 1D TGAATATGCT G/- TGTTCTCTCC 3070 het 3070 ref 43 22 18 4 G 1 0 379177 CASAVA_Build 17 71178192 5D TATTCATAAC TCTTT/----- TCTTTAGTAC 3070 het 3070 hom 35 13 20 5 TCTTT 2 1 379178 CASAVA_Build 17 71193624 1I TTGAATCAAA -/T TGTAGATTGT 3070 het 3070 ref 46 25 16 5 T 1 2 379179 CASAVA_Build 17 71202304 1I TGGCCGGCCC -/T AAGGGGGCGA 3070 hom 81 het 31 0 22 9 T 0 1 379180 CASAVA_Build 17 71204052 1I TACTAAAAAT -/A CCAAAAAAAA 3070 het 929 hom 30 3 16 11 A 0 1 379181 CASAVA_Build 17 71211726 1D CAGCAAAGAA G/- ATGGAACGTC 3070 het 3070 ref 54 28 23 3 G 1 0 379182 CASAVA_Build 17 71215759 1D CTAAATCCAA T/- TTTTTTTTGT 2856 het 2856 ref 29 16 9 4 T 9 8 379183 CASAVA_Build 17 71235049 1D ATGGGTGCTG C/- CCCCCAGTGA 3070 hom 52 het 20 0 15 6 C 6 5 379184 CASAVA_Build 17 71270634 1D TGGGCACACT C/- CCACCCAGGA 3070 hom 87 het 32 0 28 4 C 3 2 379185 CASAVA_Build 17 71273648 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 919 het 919 ref 24 15 3 6 A 12 11 379186 CASAVA_Build 17 71275450 1I TCACTGCTAC -/A AAAAAAAAAA 2105 het 1424 hom 39 9 10 20 A 17 18 379187 CASAVA_Build 17 71278390 1I CAGGCGTGAG -/C TACCACACCC 2657 hom 18 het 8 0 7 1 C 0 1 379188 CASAVA_Build 17 71284905 3D GCTGAAAAGC TTA/--- TTAATATACT 3070 het 3070 ref 43 24 18 1 TTA 2 1 379189 CASAVA_Build 17 71285331 1D CTCCCCCACA C/- CAAGTTTTTA 3070 het 3070 hom 44 15 28 1 C 2 1 379190 CASAVA_Build 17 71290112 1D TAGTAGAGAC A/- AGGGTTTCAC 3062 het 473 hom 8 1 7 0 A 2 1 379191 CASAVA_Build 17 71303997 1D TATTTAAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1067 hom 31 8 15 8 T 16 15 379192 CASAVA_Build 17 71324777 31D GGCAGTCCCC AGAGCCTGTGCTGATGAGCCTGTAGGACTGG/------------------------------- TGGCAGGGAC 3070 hom 59 het 13 0 19 3 AGAGCCTGTGCTGATGAGCCTGTAGGACTGG 1 0 379193 CASAVA_Build 17 71344683 26I GAATCGCCTC --------------------------/CCTCCTCCAGGGCCCCTGGTGGAGAA CCATCCACCA 3070 het 3070 hom 29 9 12 8 CCTCCTCCAGGGCCCCTGGTGGAGAA 0 1 379194 CASAVA_Build 17 71360903 1I TTTGTGTTTA -/C GTAGAGACGA 3070 het 3010 hom 27 7 17 3 C 0 1 379195 CASAVA_Build 17 71364003 6D TCCGGTACTC GTTAAT/------ GTTAAGGAAT 3070 het 3070 ref 36 15 16 7 GTTAAT 1 0 379196 CASAVA_Build 17 71364486 8D TGGTGACTCG GTATGTCA/-------- GTATGCATTG 3070 het 2542 hom 20 8 11 1 GTATGTCA 1 0 379197 CASAVA_Build 17 71372693 2D CTTCAAACCC TT/-- TTTTTTTTTT 3070 het 1474 hom 25 10 9 6 T 13 11 379198 CASAVA_Build 17 71374025 1I TGTATATACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 45 20 12 13 T 11 12 379199 CASAVA_Build 17 71378394 1D CTGATTAAGG T/- GTTGGCAGGG 3070 het 3070 ref 29 13 12 4 T 1 0 379200 CASAVA_Build 17 71384565 1I GGCCTTGCCA -/G GGGGAGAGAA 3070 het 3070 ref 42 15 16 11 G 4 5 379201 CASAVA_Build 17 71396576 1D TCGTGGGAGG T/- TTTTTTTTTT 2436 het 2436 ref 27 11 7 9 T 12 11 379202 CASAVA_Build 17 71399403 21D ATACGAACAT GCACACACACACGTGCTCACA/--------------------- GCACACACAG 3070 het 3070 ref 52 28 15 11 GCACACACACACGTGCTCACA 1 0 379203 CASAVA_Build 17 71415078 1D AAAAATATAT G/- GGGGTCTCAC 3070 het 1766 hom 17 4 10 4 G 5 4 379204 CASAVA_Build 17 71421203 4I AATAGTGTTC ----/CTCT CTCTATTTCT 3070 het 3070 ref 29 15 11 3 CT 2 4 379205 CASAVA_Build 17 71421297 2D TAACTGGAGC GG/-- CTGGAGGAGG 3070 het 3056 hom 25 14 9 2 G 2 0 379206 CASAVA_Build 17 71425200 1D AGGGCGTGGT G/- GGGGGCCTGG 2628 het 24 hom 20 1 10 9 G 6 5 379207 CASAVA_Build 17 71425561 1D AGCAGCTGCT C/- CCCCTTCCCA 2915 hom 35 het 15 0 11 6 C 5 4 379208 CASAVA_Build 17 71431734 1I CTAAAAACAC -/A AAAAAAATTA 3070 het 1866 hom 17 5 9 3 A 7 8 379209 CASAVA_Build 17 71446552 1I AAAAAAAAAA -/G AAGATGTAGG 3070 het 2231 hom 31 11 15 5 G 0 1 379210 CASAVA_Build 17 71455363 6D TTATTCTATT TGTGTG/------ TGTGTGTGTG 2381 het 866 hom 23 3 12 8 TG 10 7 379211 CASAVA_Build 17 71483530 2D ATGGAAATGC AG/-- AGAGAGAGAG 1015 het 1015 ref 19 12 4 4 AG 10 9 379212 CASAVA_Build 17 71499904 1I GTCTTAAAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 59 het 31 0 20 11 T 12 13 379213 CASAVA_Build 17 71511648 3D TGGTCTTGAA CTC/--- CTCAGGTGAT 3070 het 944 hom 17 2 13 3 CTC 2 1 379214 CASAVA_Build 17 71528291 2I TTCTCAACCG --/TT TTTTTTTTTT 3070 hom 51 het 27 0 18 9 T 10 12 379215 CASAVA_Build 17 71550450 2D TTGTAGAGAC AG/-- AGTTTCGCCA 3070 het 3070 ref 20 9 8 3 AG 2 1 379216 CASAVA_Build 17 71553155 1I AAGAGTGAGG -/A AAAAAAAAAA 2361 het 2361 ref 25 12 9 4 A 10 11 379217 CASAVA_Build 17 71555465 1I ATCCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2245 het 2245 ref 23 13 7 3 A 11 12 379218 CASAVA_Build 17 71574140 1I AAAAAAAAAA -/T ACACACCACT 2782 het 2782 ref 25 11 8 8 T 0 1 379219 CASAVA_Build 17 71576689 2I AAATAAATAA --/AT ATATATATAT 1479 het 660 hom 9 2 4 3 AT 7 8 379220 CASAVA_Build 17 71587723 1D CCCTCCTTTT C/- CCCCATCTAC 3070 het 3070 hom 37 12 19 6 C 5 4 379221 CASAVA_Build 17 71602425 1D TTTCAAAGTC T/- TTTTTTTTTT 2797 het 1646 hom 19 5 8 6 T 15 14 379222 CASAVA_Build 17 71606382 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 1845 het 845 hom 7 2 4 1 A 11 10 379223 CASAVA_Build 17 71634707 1I CTGAGATTGG -/A GGTTTATTTT 3070 hom 124 het 44 0 38 6 A 0 1 379224 CASAVA_Build 17 71697844 3D TGCTTGCTCT CTC/--- TTTTTTTTTT 587 het 587 ref 28 8 6 14 CTC 1 0 379225 CASAVA_Build 17 71721246 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 2091 het 1228 hom 17 7 7 3 A 18 17 379226 CASAVA_Build 17 71728062 1D AATGATATCT A/- AAAAAAAAAA 1248 het 1118 hom 38 13 5 20 A 19 18 379227 CASAVA_Build 17 71760513 1I ACTCTGGGAA -/T TTTTTTTTCC 3070 hom 75 het 31 0 25 6 T 8 9 379228 CASAVA_Build 17 71778831 14D GGGGACTTGA CTGCCCTGGGCGCC/-------------- CTGCCCCTCC 2748 het 2748 ref 28 17 9 4 CTGCCCTGGGCGCC 1 0 379229 CASAVA_Build 17 71779357 1D TCAGCTTCCC G/- GGGGCAGTAT 3070 het 1370 hom 25 4 14 7 G 5 4 379230 CASAVA_Build 17 71792158 1I AACTCACCTG -/A AAAAAATGGA 3070 het 3070 hom 28 8 15 5 A 6 7 379231 CASAVA_Build 17 71812696 4D CACAGATGCG CACA/---- CACACTCTCA 3070 het 3070 hom 33 13 16 5 CA 4 2 379232 CASAVA_Build 17 71829561 2D TATTACTGAT AC/-- AGAGAAGTTT 2771 het 2771 ref 31 16 10 5 AC 1 0 379233 CASAVA_Build 17 71831728 3I AAGCTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 54 het 20 0 19 1 AGG 0 1 379234 CASAVA_Build 17 71832279 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 1479 hom 17 6 8 3 A 12 10 379235 CASAVA_Build 17 71834076 1D TACAAAGAGG A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 hom 40 13 22 7 A 10 9 379236 CASAVA_Build 17 71842304 6D TATGATTAAA AAAAAC/------ AAAAACAAAA 3070 het 3070 hom 30 11 14 6 AAAAAC 3 2 379237 CASAVA_Build 17 71848176 1D GCACTCTTGG T/- TACCATGTGA 3070 het 3070 ref 40 20 16 4 T 2 1 379238 CASAVA_Build 17 71848911 3D CTTTTTTTTG TTT/--- TTTTTTTTTT 3070 het 622 hom 48 10 27 11 T 21 18 379239 CASAVA_Build 17 71871149 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTCTTT 3070 het 3070 hom 29 12 13 4 T 6 7 379240 CASAVA_Build 17 71875062 3I CTGCTGGCTG ---/TCT TCTTGGCTGT 3070 het 2179 hom 35 10 17 8 TCT 1 2 379241 CASAVA_Build 17 71886932 4I TCAAAAAAAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 57 het 22 0 20 2 AAAT 2 3 379242 CASAVA_Build 17 71902732 1I TTGTATTTTT -/A AGTAGAGACA 1665 het 1271 hom 7 3 4 0 A 1 2 379243 CASAVA_Build 17 71913001 1D TCCTGGGGGA G/- GGGAGGAGAC 3070 hom 82 het 31 0 22 9 G 4 3 379244 CASAVA_Build 17 71918446 1D GGAGCACTCT C/- CCTCCACGGC 3070 hom 57 het 20 0 18 2 C 3 2 379245 CASAVA_Build 17 71925384 8D CGACTACAGG AGGAAAGA/-------- ATGCTAAGCA 3070 het 3070 ref 38 19 15 9 AGGAAAGA 1 0 379246 CASAVA_Build 17 71929079 2D AGTTTCGCTC TT/-- GTTGCCCAGG 3070 het 3070 hom 28 11 11 6 T 2 0 379247 CASAVA_Build 17 71939330 4I GAAAAGAAAG ----/ACTA ACTATTAGGG 3070 hom 45 het 16 0 16 0 ACTA 1 2 379248 CASAVA_Build 17 71941285 2D TCAATAAACC TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 51 het 25 0 18 7 T 11 9 379249 CASAVA_Build 17 71949773 1D GGGTTCTTAC A/- GGGGAAATGC 3070 het 3070 hom 49 22 22 5 A 1 0 379250 CASAVA_Build 17 71951272 1D AGTCAGAACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1094 hom 22 4 13 7 T 14 13 379251 CASAVA_Build 17 71954140 1D AAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 35 14 13 8 A 11 10 379252 CASAVA_Build 17 71963310 4I TAGTAAGTTG ----/GATT GATATTACAG 3070 het 3070 ref 50 26 13 11 GATT 0 1 379253 CASAVA_Build 17 71964119 1I GGATCAGGGT -/G GGTTGTCAAT 3070 het 3070 ref 41 19 19 3 G 2 3 379254 CASAVA_Build 17 71985189 1I TGGGGGCCCA -/G GCAGCTCCAC 2796 het 2796 ref 29 10 8 11 G 1 2 379255 CASAVA_Build 17 71992261 1D TCAAGCCCCC T/- GAGACTGATC 3070 het 3070 hom 33 12 16 6 T 1 0 379256 CASAVA_Build 17 71993229 8D CGCCACTGCA CTCCAGGC/-------- CTCCAGCCTG 2110 het 833 hom 12 3 7 7 CTCCAGGC 1 0 379257 CASAVA_Build 17 71997386 1D CCGGGCAGGA T/- TTAAGTCCTT 3070 hom 53 het 23 0 18 6 T 3 2 379258 CASAVA_Build 17 72011309 2I CGGTGGGGGG --/TT GGGCCTCACT 3070 hom 81 het 30 0 26 4 T 0 2 379259 CASAVA_Build 17 72055321 2D CACACACATT CA/-- CACACACACA 3070 hom 100 het 45 0 32 14 CA 10 9 379260 CASAVA_Build 17 72068111 1D CTGATGAGCT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 95 het 45 0 40 5 A 12 11 379261 CASAVA_Build 17 72069399 1D GGCTCCATGG T/- TTTTTTTTTG 3070 het 134 hom 44 1 40 3 T 10 9 379262 CASAVA_Build 17 72072853 1D CCTGTGAAGA C/- CCCCCTCCTC 3070 hom 75 het 29 0 25 5 C 6 5 379263 CASAVA_Build 17 72073251 1D CTACCCAGCC A/- AAAAAAAAAA 1636 het 1636 ref 50 32 5 14 A 13 12 379264 CASAVA_Build 17 72077449 1I ATCACCAAGC -/G GGGGGTGGGG 3070 hom 75 het 29 0 17 12 G 5 6 379265 CASAVA_Build 17 72088399 2I TCCATCTCAA --/AG AAAAAAAAAG 3070 hom 105 het 38 0 35 3 AG 0 1 379266 CASAVA_Build 17 72090064 13I TTGCCATGTT -------------/GCCCAGTCTGGTC TCAAACTCCT 2813 hom 19 het 11 0 7 4 GCCCAGTCTGGTC 0 1 379267 CASAVA_Build 17 72094943 4D CAGGAATGGC CATT/---- CAGTCCATCC 3070 hom 119 het 44 0 37 7 CATT 1 0 379268 CASAVA_Build 17 72095332 1D TGGCCCCCAC A/- CACAGCCCAG 3070 hom 30 het 19 0 11 8 A 1 0 379269 CASAVA_Build 17 72096827 1D ACTGCAAGCT C/- CACCTCCCGG 2449 het 413 hom 9 1 7 1 C 2 1 379270 CASAVA_Build 17 72100471 1D ATGGGAAGAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 69 het 29 0 24 6 T 9 8 379271 CASAVA_Build 17 72106366 3D16M1I CTTCTCTGTT TTGTTTTTTTTTTTTGTTT-/---TTTTTTTTGTTTGTTTG TTTGTTTTTT 3070 het 815 hom 26 6 15 8 N/A 0 0 379272 CASAVA_Build 17 72106504 7D TGAGTAGCTG GGACTAA/------- GGTATGCACC 2207 het 2207 ref 23 16 6 1 GGACTAA 1 0 379273 CASAVA_Build 17 72119129 5I CGGCCATCTG -----/GATGT GATGTGTACG 3070 hom 106 het 40 0 33 8 GATGT 1 2 379274 CASAVA_Build 17 72122048 4D GCAAAGAGCA AAAC/---- AAACAAAGCA 3070 hom 54 het 25 0 19 6 AAAC 2 1 379275 CASAVA_Build 17 72123729 1I40M4D TAGCTATATG -AAAAAAAAAGACTCTGTCTCAAAAAAAACACAAACGAAAAAAAC/AAAAAAAAAAGACTCTGTCTCAAAAAAAACACAAACGAAAA---- AAGAGAAAGA 3070 hom 70 het 21 0 19 13 N/A 0 0 379276 CASAVA_Build 17 72128419 1I TGCCCAGCTA -/T TTTTTTTTAA 3070 het 1648 hom 17 5 10 3 T 8 9 379277 CASAVA_Build 17 72149691 2I ATGATATATA --/TG TGTGTATATA 3070 hom 63 het 26 0 22 4 TG 2 3 379278 CASAVA_Build 17 72152204 1D TTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 1677 het 37 hom 12 1 5 6 T 12 11 379279 CASAVA_Build 17 72158109 1D36M1I AAAACACCAC AAAAAAACAAAAACACAGCAACTTCATAGACAAAAAA-/-AAAAAACAAAAACACAGCAACTTCATAGACAAAAAAG GGAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 17 11 8 4 N/A 0 0 379280 CASAVA_Build 17 72159728 4I GACGAGGAAC ----/AATG AATGCAAAGA 3070 het 3070 ref 28 12 11 5 AATG 1 2 379281 CASAVA_Build 17 72160021 1I AACTCCTGTT -/A ATGTTGATAT 3070 het 3070 ref 42 23 13 6 A 1 2 379282 CASAVA_Build 17 72174380 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 63 het 24 0 21 3 T 9 10 379283 CASAVA_Build 17 72181371 1D TTTTCAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 666 hom 33 2 24 8 A 12 11 379284 CASAVA_Build 17 72183461 1I AATGGTCAGC -/A AAGAAACAAA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 A 2 3 379285 CASAVA_Build 17 72183587 1D ACTGCTCCAC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 96 het 36 0 33 6 T 9 8 379286 CASAVA_Build 17 72184968 4I GACTCCATCT ----/CAAA CAAACAAACA 3070 hom 90 het 36 0 31 5 CAAA 3 4 379287 CASAVA_Build 17 72197687 8I ACTGCATCTT --------/AAAAAAAG AAAAAAAGAA 1651 het 1651 ref 17 6 7 4 AAAAAAAG 1 2 379288 CASAVA_Build 17 72200313 1I TAGTATTGTT -/A AAAAAAAAAA 1477 het 1477 ref 27 9 8 10 A 15 16 379289 CASAVA_Build 17 72200360 1D AGTTTGAGGC T/- TTAATAACTT 3070 het 3070 ref 33 14 10 9 T 3 2 379290 CASAVA_Build 17 72200695 1D AATTAAAATG A/- AAAAATCTAG 3070 het 3070 ref 37 19 14 6 A 6 5 379291 CASAVA_Build 17 72208120 1D CTCTCTGGGG C/- ATAACATAAC 3070 het 3070 hom 28 9 16 3 C 1 0 379292 CASAVA_Build 17 72211305 1I TTGTTTTTTG -/T TTTTTTAAAG 3070 het 3070 ref 41 20 14 7 T 6 7 379293 CASAVA_Build 17 72211418 1I GTCCTAGCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 39 15 15 9 A 10 11 379294 CASAVA_Build 17 72214364 8D CACATGGTTA AGACAGAC/-------- AGATGAAGGC 3070 het 3070 hom 31 14 15 4 AGAC 2 0 379295 CASAVA_Build 17 72223755 1I ACCCCCCCAC -/A AAAAAAATAC 3070 het 3070 hom 40 12 25 3 A 7 8 379296 CASAVA_Build 17 72225510 1D TACTAAAAAT A/- AAAAAAAATT 2216 het 453 hom 9 1 5 5 A 9 8 379297 CASAVA_Build 17 72226971 1D AAAGACAGAA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 387 hom 36 1 25 10 T 13 12 379298 CASAVA_Build 17 72230595 22I TACACATACA ----------------------/CAAAGACAATAGGTAACTACTG CAAACAAAGA 2471 hom 15 het 6 0 5 1 CAAAGACAATAGGTAACTACTG 0 1 379299 CASAVA_Build 17 72233563 1I CTGTCCAGTT -/A AAAAAAAAAA 1659 het 1659 ref 26 8 7 11 A 15 16 379300 CASAVA_Build 17 72236137 2I TCACCCAGAC --/TG GAGTGCAGTG 3070 hom 38 het 18 0 11 9 TG 0 1 379301 CASAVA_Build 17 72246954 11D AATGCATGTA AAGCACTTGGC/----------- ACAGTGCATG 3070 hom 151 het 52 0 51 4 AAGCACTTGGC 1 0 379302 CASAVA_Build 17 72247851 2D GCTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1196 het 449 hom 21 7 4 10 A 20 18 379303 CASAVA_Build 17 72256403 1D TGCGTAATTT G/- CATCTCTGAG 3070 hom 99 het 38 0 34 4 G 1 0 379304 CASAVA_Build 17 72260713 1I CTTGTTCCAT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 404 hom 33 2 22 9 A 12 13 379305 CASAVA_Build 17 72261811 1I CAGGAACAAC -/T TCGGCATTTG 3070 hom 111 het 49 0 38 11 T 1 2 379306 CASAVA_Build 17 72265994 1I CAGTGGTTCA -/T TGCCTGTAAT 3070 hom 57 het 24 0 20 4 T 1 2 379307 CASAVA_Build 17 72277147 1D CTAATTGCCT C/- CAAAAGGCCC 3070 het 3070 ref 36 17 16 3 C 2 1 379308 CASAVA_Build 17 72305568 1I CAGGAAAACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 12 10 4 T 11 12 379309 CASAVA_Build 17 72307821 1I TTAGTAGAGA -/G CGGGTTTCAC 3070 het 3070 hom 24 8 11 5 G 0 1 379310 CASAVA_Build 17 72308753 1D ACTCGGTCTG A/- AAAAAAAAAA 883 het 883 ref 22 16 3 3 A 12 11 379311 CASAVA_Build 17 72311840 1D TCTTTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 454 hom 18 1 12 5 T 13 12 379312 CASAVA_Build 17 72312568 4I GGTAATGAGG ----/TGAT TGATACTAAG 3070 hom 102 het 37 0 34 3 TGAT 1 2 379313 CASAVA_Build 17 72315458 2D TCGTATCCTC AT/-- GTGATGGCTC 3070 hom 89 het 36 0 28 8 AT 1 0 379314 CASAVA_Build 17 72317857 1I TTGGTTTTTC -/T GTTAACTATC 3070 hom 60 het 27 0 21 6 T 0 1 379315 CASAVA_Build 17 72320330 5I CCATGGGCTG -----/GGTGT GGTGTCTGAC 3070 hom 87 het 34 0 30 4 GGTGT 1 2 379316 CASAVA_Build 17 72324055 1I18M2D CCCGGGCAAC -AGAGCAAAACGCTGTCTGAA/AAGAGCAAAACGCTGTCTG-- AAAAAAAAAA 3070 hom 84 het 28 0 29 5 N/A 0 0 379317 CASAVA_Build 17 72328650 1I CACCCTGAGC -/A AAAGGTGTAA 3070 hom 96 het 40 0 33 7 A 3 4 379318 CASAVA_Build 17 72328914 3I TTTTTTTTTT ---/TTC CTTTTTTTTT 3070 hom 61 het 29 0 22 7 TTC 0 1 379319 CASAVA_Build 17 72331632 1I TGGTTCCCCC -/T GCTCCTGCTC 3070 hom 76 het 31 0 25 6 T 0 1 379320 CASAVA_Build 17 72331721 3I CCCGACCCCA ---/GCT GCCCTTCCTG 3070 hom 73 het 28 0 22 6 GCT 0 1 379321 CASAVA_Build 17 72334639 1D ACAGAGAATT G/- GAAATGCCCT 3070 het 3070 hom 32 12 18 2 G 2 1 379322 CASAVA_Build 17 72337688 1I CTATGGGTCA -/G GAATTTGGGC 3070 hom 82 het 32 0 28 4 G 1 2 379323 CASAVA_Build 17 72341758 1D TCTTGGACTT C/- CCAGCCTCCA 3070 hom 72 het 33 0 26 7 C 3 2 379324 CASAVA_Build 17 72343793 1I TTAAAAGAGG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 38 20 15 3 T 10 11 379325 CASAVA_Build 17 72345595 3I AGGCTGAGAC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 hom 24 het 9 0 9 0 AGG 0 1 379326 CASAVA_Build 17 72359973 1I TTACTTCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 46 21 14 11 A 15 16 379327 CASAVA_Build 17 72360562 19D GAGGTTACAG TGAGCTGAGATCATGCCAC/------------------- TGCATTCCAG 2724 het 2724 ref 26 17 9 2 TGAGCTGAGATCATGCCAC 1 0 379328 CASAVA_Build 17 72368607 1D AACCTCTGCA T/- TTTTTTTTTT 2509 het 1193 hom 22 4 10 8 T 17 16 379329 CASAVA_Build 17 72378154 5I GTCCTCGCCC -----/CTTCT CTTCCGACCC 2982 het 814 hom 25 5 11 9 CTTCT 0 1 379330 CASAVA_Build 17 72389724 1I GGTTGGTGCT -/G GGGGGACTTT 2414 het 2414 ref 25 9 10 6 G 5 6 379331 CASAVA_Build 17 72391751 5D TTAGCTGACA TTTAC/----- TCAAAACACA 3070 het 3070 hom 58 28 27 5 TTTAC 1 0 379332 CASAVA_Build 17 72393629 1D CCTGTGGCTT A/- AAAAAAACAC 3070 het 3070 hom 39 10 18 11 A 8 7 379333 CASAVA_Build 17 72394723 14I TCTGTCTCAC --------------/AAAACAAAAAACAA AAAACAAAAA 3070 het 3070 hom 43 13 14 16 AAAACAA 1 3 379334 CASAVA_Build 17 72405734 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1771 hom 21 5 14 2 A 11 10 379335 CASAVA_Build 17 72409080 1I TTAATGTGTT -/A AAAAAAAAAA 2716 het 2716 ref 28 9 8 11 A 13 14 379336 CASAVA_Build 17 72431059 4D CTCCTGCAGA GCTG/---- GCTGGCACCT 3070 het 3070 ref 30 15 11 4 GCTG 2 1 379337 CASAVA_Build 17 72439318 1D TCGGGCGGAC T/- TTGGCATATG 3070 het 3070 ref 43 17 20 6 T 3 2 379338 CASAVA_Build 17 72439763 2D36M9I TCCTCCTCCT CCCCCCCCCCTTCTTCGTCTTTGTCTTCGTCTTCTTTG---------/--CCCCCCCCTTCTTCGTCTTTGTCTTCGTCTTCTTTGTCTTCTCCT TCTTCTCCTT 1929 het 1929 ref 18 10 5 11 N/A 0 0 379339 CASAVA_Build 17 72443107 15I5M16I TTTTTTAAAA ---------------GTTAT----------------/AGGTGGTCATGCCATTTTATAGTCCTACCAGCAATG TACGAGGCTT 3070 het 3070 ref 31 20 13 3 N/A 0 0 379340 CASAVA_Build 17 72447190 4I ACTCCGTCTC ----/AAAA AAAATTTTTT 3070 het 3070 ref 23 10 11 2 A 4 8 379341 CASAVA_Build 17 72447534 1I TGATTTTGTT -/C TTTTTTTATG 3070 hom 117 het 42 0 40 2 C 0 1 379342 CASAVA_Build 17 72451927 3I GAACGTCGTC ---/GTT GTCGTCGTTG 2326 het 2106 hom 31 8 5 18 GTT 0 1 379343 CASAVA_Build 17 72458004 1D TTTTTCTCTC T/- TTTTTTTAAA 3070 hom 37 het 14 0 13 1 T 8 7 379344 CASAVA_Build 17 72462114 3D AAGTCACAGC AGA/--- AGAAGTGCTC 3070 het 3070 hom 41 18 17 7 AGA 2 1 379345 CASAVA_Build 17 72464569 1I AAAGGGAATC -/A ACGTATTCCC 3070 het 3070 ref 38 13 9 16 A 1 2 379346 CASAVA_Build 17 72478091 28D CCACCCTGAT TCATTCTGATCACCTGCTCCACCCTGAC/---------------------------- TCATTCTGAT 3070 hom 60 het 20 0 19 6 TCATTCTGATCACCTGCTCCACCCTGAC 2 1 379347 CASAVA_Build 17 72500686 1D CCAGCGTTGA G/- GGTTAATTGA 3070 het 3070 ref 36 19 16 1 G 3 2 379348 CASAVA_Build 17 72507451 1I GCACTCTCCT -/G GAGTTCTGTA 2451 het 2451 ref 28 18 7 3 G 1 2 379349 CASAVA_Build 17 72507519 1D AAATTCATAG C/- AAGCTGGTCT 3070 het 3070 hom 31 10 13 8 C 1 0 379350 CASAVA_Build 17 72515680 4I CTGCCCCTGA ----/GCCC GGCCCCGCAG 3070 het 3070 ref 30 18 9 3 GCCC 0 1 379351 CASAVA_Build 17 72520269 1D CTAAATATTC T/- TTTTTTTTTT 2974 het 2974 ref 35 16 10 9 T 13 12 379352 CASAVA_Build 17 72521609 1D CAGGACTATT A/- AAAAAATTTG 3070 het 3070 hom 44 20 20 4 A 7 6 379353 CASAVA_Build 17 72522256 1D AAACCCTACC A/- AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 37 19 13 5 A 10 9 379354 CASAVA_Build 17 72522678 4I CTTCGTCTCA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 het 3070 ref 18 9 7 2 AAAT 2 3 379355 CASAVA_Build 17 72530052 1D CCATCTCAAG A/- AAAAAAAAAA 2975 het 57 hom 21 1 11 9 A 15 14 379356 CASAVA_Build 17 72531051 1D AGCCAGATGT G/- GTGGCACATG 3070 het 1232 hom 15 3 9 3 G 2 1 379357 CASAVA_Build 17 72535683 1D ACCTGCTGTG C/- CCCCCCCGTT 3070 het 3070 hom 42 15 16 11 C 8 7 379358 CASAVA_Build 17 72537032 14D AGGCTCATGC CACCACACTCAGCT/-------------- CATTTTTGTA 3070 het 3070 hom 27 13 13 1 CACCACACTCAGCT 1 0 379359 CASAVA_Build 17 72545485 7D GGGGCCACGC AATCCCT/------- GACCTTGAGG 2499 het 2499 ref 30 15 10 7 AATCCCT 1 0 379360 CASAVA_Build 17 72545642 1I ACACATGGCA -/C CCAATACTGG 3070 het 3070 ref 38 21 11 6 C 2 3 379361 CASAVA_Build 17 72551352 1D CAAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 A 12 11 379362 CASAVA_Build 17 72552681 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 33 14 12 7 A 10 11 379363 CASAVA_Build 17 72555968 5I AAAAGGCTAG -----/CTTTT TTTTTTTTTT 382 het 382 ref 19 12 2 5 CTTTT 0 1 379364 CASAVA_Build 17 72561772 6D TCGGGCCACC GTCTAT/------ ATCTTCTTCT 3070 het 3070 ref 33 18 10 8 GTCTAT 1 0 379365 CASAVA_Build 17 72583867 2I CTCCTGTCAT --/TC TCTCTACCCG 3070 het 3070 hom 32 11 18 3 TC 2 3 379366 CASAVA_Build 17 72587552 2I CCATCTTAAA --/AC ACACACACAC 3070 het 7 hom 30 1 23 6 AC 8 9 379367 CASAVA_Build 17 72587619 7D AGGGGGTGGC AGTTGGG/------- AGTTGGGAGG 2556 het 2556 ref 28 13 8 11 AGTTGGG 2 1 379368 CASAVA_Build 17 72596822 1D GTTACTTTTT C/- CCCCAAGGTT 3070 het 3070 ref 38 20 12 7 C 5 4 379369 CASAVA_Build 17 72604232 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAAAA 2236 het 1503 hom 17 4 8 5 A 11 12 379370 CASAVA_Build 17 72623594 1D TTGACTCTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 932 hom 30 8 14 9 T 15 14 379371 CASAVA_Build 17 72634634 1I CAGGGATTTC -/T TTTTTTTTCT 1768 het 1768 ref 16 6 6 4 T 8 9 379372 CASAVA_Build 17 72640311 4D AGAAAATACG AAGT/---- AAGTGCCCCT 3070 het 3070 ref 33 16 12 9 AAGT 2 1 379373 CASAVA_Build 17 72640529 1D CCAATCCTCC T/- TTTTTTTTTT 2577 het 1280 hom 29 5 11 13 T 12 11 379374 CASAVA_Build 17 72644030 3D TCCTTTCTCT TTC/--- TTTTTTCTTT 3070 hom 31 het 15 0 12 4 TTC 1 0 379375 CASAVA_Build 17 72650782 1D TACAGTAGTA T/- TTTTTTCCAG 3070 hom 123 het 52 0 41 11 T 7 6 379376 CASAVA_Build 17 72655051 1I CAGTACCATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 54 23 19 12 A 10 11 379377 CASAVA_Build 17 72659269 1D ATTTACCTGG T/- TTTTATAAAA 3070 hom 111 het 41 0 38 3 T 5 4 379378 CASAVA_Build 17 72666899 1D TGAGCCACCA C/- CACCTGGCTA 2349 het 54 hom 8 1 5 2 C 2 1 379379 CASAVA_Build 17 72670508 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 29 0 25 4 A 12 11 379380 CASAVA_Build 17 72671069 25I TAAGACTGGT -------------------------/TTTTCTCAGCACCATCCCTCCCTCA TCAGTCAGAG 3070 hom 84 het 29 0 29 4 TTTTCTCAGCACCATCCCTCCCTCA 0 1 379381 CASAVA_Build 17 72706050 1D ATTTACGATC T/- TTGTGAAAGT 3070 het 3070 ref 44 21 17 7 T 3 2 379382 CASAVA_Build 17 72706825 2I GGGACTACAG --/GC GCGTGCACCA 2124 het 2124 ref 18 10 6 2 GC 1 2 379383 CASAVA_Build 17 72710614 1D ATAAAAAAAT A/- AAAAAAAAAA 2677 het 424 hom 20 2 11 8 A 16 15 379384 CASAVA_Build 17 72714934 2D TTATGGAGAC AG/-- GGTCCGGCTC 2157 hom 23 het 10 0 6 5 AG 1 0 379385 CASAVA_Build 17 72730551 4I CCTGGGTGAC ----/AGAG AGAGACCATC 3070 hom 123 het 49 0 40 9 AG 2 4 379386 CASAVA_Build 17 72733904 1I TTAGTAGAGA -/C GGGGTTTCAC 3070 hom 66 het 23 0 21 2 C 0 1 379387 CASAVA_Build 17 72753219 2I49M4I CTTTGGCCTG --GTGTGTGTGTGTGTGTGCATATGTTTATATGAGTATGTATGTCAGTATG----/GTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATGTTTATATGAGTATGAATGTCAGTATGTGTA TGTATGAGCA 3070 het 147 hom 57 2 41 36 N/A 0 0 379388 CASAVA_Build 17 72753471 2D TGTGTATGAA TG/-- TGTGCATATG 3070 hom 66 het 43 0 23 23 TG 3 2 379389 CASAVA_Build 17 72753500 4D GTATGTGTGT GTGC/---- GTGTTTACGT 3070 hom 81 het 46 0 27 21 GTGC 1 0 379390 CASAVA_Build 17 72753615 2I37M8D TGTCTGTGCA --TGTCTATATACATGTATATGAACGTGTGCATATAAGCAGGTGTAT/TGTGTCTATATACATGTATATGAACGTGTGCATATAAGC-------- GTGTGTGCAT 3070 hom 84 het 31 0 28 5 N/A 0 0 379391 CASAVA_Build 17 72753951 4I TGTGCGTGTA ----/TGTC TGTGCATGTG 3070 hom 211 het 80 0 71 9 TGTC 0 1 379392 CASAVA_Build 17 72768404 1D TAATTTTAAA T/- TTTTTTTTGT 3070 hom 63 het 28 0 22 6 T 9 8 379393 CASAVA_Build 17 72777562 1D CCCTCTACCT G/- GATGACTCAC 3070 het 3070 ref 40 21 16 3 G 2 1 379394 CASAVA_Build 17 72779635 1D TGAAACCCCC T/- GTCTACTAAA 2440 het 1247 hom 12 3 8 1 T 1 0 379395 CASAVA_Build 17 72796941 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTGTATT 2626 hom 18 het 7 0 7 0 T 5 6 379396 CASAVA_Build 17 72802267 1D TGTTTTTTTC T/- TTTTTTTTAA 3070 hom 102 het 37 0 34 3 T 9 8 379397 CASAVA_Build 17 72803795 1I GGAAAAATGA -/C CGGAGGACAC 3070 hom 93 het 38 0 30 8 C 1 2 379398 CASAVA_Build 17 72808018 6D GATGAATAAA TTGACT/------ TTGATCCACA 3070 hom 86 het 33 0 28 6 TTGACT 1 0 379399 CASAVA_Build 17 72818275 1D CCCAGGTGGA T/- TTGGCTGGGC 3070 het 3070 hom 35 14 18 3 T 3 2 379400 CASAVA_Build 17 72820181 1I AGCTGACTCA -/G GTGACTTTGG 3070 hom 78 het 32 0 26 6 G 1 2 379401 CASAVA_Build 17 72835413 1D GCCACCCTCC T/- CTTTTTTTTT 1565 het 1565 ref 24 9 5 10 T 1 0 379402 CASAVA_Build 17 72839978 1I ACAAAACCAC -/A AAAAAAGAAA 3070 het 138 hom 35 1 29 5 A 6 7 379403 CASAVA_Build 17 72841612 1I ACTTCTTTTT -/A AAAATTATGT 3070 hom 90 het 36 0 31 5 A 4 5 379404 CASAVA_Build 17 72843683 1I GTATATGTAC -/A TGTATACATG 3070 het 1942 hom 35 6 20 9 A 0 1 379405 CASAVA_Build 17 72846105 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTGA 3070 hom 36 het 18 0 12 6 T 9 8 379406 CASAVA_Build 17 72847192 1D GTCTCAATGA T/- TTTTTTTTTT 1490 het 1490 ref 23 12 6 5 T 15 14 379407 CASAVA_Build 17 72847502 1I TGTTTTTTTT -/G TTGTTGTTGT 3070 hom 51 het 18 0 17 1 G 0 1 379408 CASAVA_Build 17 72851862 1D GCCACAAAAC A/- AAAAAAAACA 3070 hom 107 het 45 0 34 13 A 9 8 379409 CASAVA_Build 17 72865057 1D GAAAATGTTC A/- AAACACATGG 3070 hom 131 het 48 0 39 10 A 4 3 379410 CASAVA_Build 17 72868254 1I GTTTCTTTTT -/C TTTTTTGAGA 2407 het 1041 hom 21 8 7 7 C 0 1 379411 CASAVA_Build 17 72883723 1D TTCCGAATCA G/- GGTAGAGAAA 3070 het 3070 ref 45 27 13 5 G 3 2 379412 CASAVA_Build 17 72888054 1D GCTTCTCGTA T/- TTTTTTGTTT 1743 het 1059 hom 10 5 4 2 T 7 6 379413 CASAVA_Build 17 72891153 1D ATCCATCACT C/- CCCCACTGTG 3070 het 3070 hom 29 10 16 3 C 5 4 379414 CASAVA_Build 17 72900208 14D CCTGGGCAGT CAGTAACCTTTGGC/-------------- CACCAAGCTG 3070 het 3070 hom 38 13 18 8 CAGTAACCTTTGGC 1 0 379415 CASAVA_Build 17 72905657 1I GTTTTGGTTG -/T TTTTTTTTTT 3070 het 333 hom 26 1 16 9 T 12 13 379416 CASAVA_Build 17 72931647 1I GCCAGGGCAT -/G GTCGCTGGGA 3070 het 3070 ref 38 19 16 3 G 1 2 379417 CASAVA_Build 17 72931890 3I ACTACTGCAG ---/AGA AGAAGGCACC 3070 hom 87 het 34 0 29 5 AGA 1 2 379418 CASAVA_Build 17 72975205 1I CCACTCCCCT -/C CCCACCGGGC 2540 hom 30 het 12 0 11 1 C 3 4 379419 CASAVA_Build 17 72990902 1I TCCTGCCCAG -/C CTCTGTGGAC 2439 het 2397 hom 25 9 9 7 C 1 2 379420 CASAVA_Build 17 72992108 9D ATGTGGGTGA TGGTGATGG/--------- TGGTGATGGT 3070 hom 154 het 67 0 44 23 TGGTGATGG 2 1 379421 CASAVA_Build 17 72996732 1D ACCCCTATGC A/- AGTGTCCTGC 3070 hom 52 het 20 0 17 4 A 2 1 379422 CASAVA_Build 17 73000878 1I TGCCCCACCC -/A AGAGGGAGGG 3070 hom 99 het 36 0 31 5 A 1 2 379423 CASAVA_Build 17 73001699 4D ATCTGCCCAC CTTG/---- CTTGGCCTCC 3070 hom 48 het 17 0 17 3 CTTG 2 1 379424 CASAVA_Build 17 73020747 1I TCATTTAAGA -/T TTTTTTTTTC 3070 het 3070 hom 28 9 18 1 T 9 10 379425 CASAVA_Build 17 73021167 1D TACAATGGAA T/- TTGACTTAGC 3070 het 3070 ref 41 18 20 4 T 3 2 379426 CASAVA_Build 17 73026758 1D TTTTTCTGAG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 17 8 T 12 11 379427 CASAVA_Build 17 73033199 4D AGACCTTCAC AGTG/---- AGTGTTACAG 3070 het 3070 ref 28 16 8 5 AGTG 2 1 379428 CASAVA_Build 17 73035381 9D TCCTGCACAA TGCCAAGAG/--------- TGCCAAGAGT 3070 het 3070 hom 30 12 15 4 TGCCAAGAG 2 1 379429 CASAVA_Build 17 73051167 1D GAGTGGCATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 359 hom 32 1 22 10 A 13 12 379430 CASAVA_Build 17 73055266 1D TTTTTTTGTA T/- TTTTTTTAGT 1307 het 1307 ref 13 5 4 4 T 8 7 379431 CASAVA_Build 17 73056173 11I GCATGCGGCA -----------/TGGTCATCCTC TGGCCTCAGC 2568 het 1638 hom 23 7 10 6 TGGTCATCCTC 0 1 379432 CASAVA_Build 17 73065578 1I TGGCGGGGAA -/T TCACGGGGCA 3070 hom 81 het 28 0 28 0 T 1 2 379433 CASAVA_Build 17 73067714 1I TCCTGGTGGG -/C ATGCATTCTT 3070 het 3070 ref 39 21 15 3 C 0 1 379434 CASAVA_Build 17 73075389 2D TTAAAACCAC AT/-- GAGATAGCAT 3070 het 3070 ref 30 14 9 8 AT 1 0 379435 CASAVA_Build 17 73080962 1D ATTGGAGGGT G/- GGTGGCTCTT 3070 het 3070 hom 43 17 24 3 G 3 2 379436 CASAVA_Build 17 73081563 1I TAGTTAAGCG -/T TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 41 13 18 10 T 9 10 379437 CASAVA_Build 17 73083312 1D ATTTTTATTG T/- TTTTTCCTTC 3070 hom 99 het 35 0 33 3 T 6 5 379438 CASAVA_Build 17 73087839 1D CTTTTCTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 36 13 12 11 T 13 12 379439 CASAVA_Build 17 73114831 1I GAGGGAAGGG -/A ATGAGCAACA 3070 het 3070 ref 38 22 14 2 A 1 2 379440 CASAVA_Build 17 73118776 3I GCGCCTGCCC ---/CAT CATCCTCCCT 2127 het 921 hom 17 6 8 3 CAT 1 2 379441 CASAVA_Build 17 73123881 1D ATGCATTTCT A/- AAGTCAGACA 3070 hom 111 het 38 0 38 1 A 3 2 379442 CASAVA_Build 17 73128070 16I AGGAAAAAGG ----------------/GTTTAATGGACTTACA GTTCCACATG 3070 het 3070 hom 36 14 20 3 GTTTAATGGACTTACA 0 1 379443 CASAVA_Build 17 73132848 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTGT 2534 het 843 hom 18 3 6 9 T 9 8 379444 CASAVA_Build 17 73133809 1D CAAATTTATG T/- GCGTAGAGTT 3070 het 3070 ref 42 21 14 7 T 1 0 379445 CASAVA_Build 17 73135179 1I TGCACACTGG -/A AAAAAAATCT 3070 het 3070 ref 39 20 15 4 A 7 8 379446 CASAVA_Build 17 73136876 1D CTTAGAGTGT G/- GAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 49 26 19 5 G 2 1 379447 CASAVA_Build 17 73137693 3D TGTTAATATA ATT/--- AATTATAATT 1437 het 1437 ref 12 9 3 0 ATT 1 0 379448 CASAVA_Build 17 73143188 1I CACAGACATT -/C CAGGCCTGAT 3070 hom 86 het 35 0 27 8 C 1 2 379449 CASAVA_Build 17 73151258 2D TCTTTTGACT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 72 het 29 0 24 6 A 13 11 379450 CASAVA_Build 17 73156320 1D TGTTTGTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 90 het 38 0 28 10 T 11 10 379451 CASAVA_Build 17 73169564 1D CAAAGAAAGG A/- AAAAAAAAAA 2747 hom 30 het 21 0 10 12 A 15 14 379452 CASAVA_Build 17 73176309 1D TTAAGTGGAC T/- TTTTTTTTTT 1222 het 1222 ref 19 10 4 5 T 13 12 379453 CASAVA_Build 17 73207782 1D ACTTTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 1030 het 877 hom 22 8 4 10 A 19 18 379454 CASAVA_Build 17 73209881 3D GATGGCAGGA AGG/--- AGAAGGGCTG 3070 het 3070 ref 33 16 15 2 AGG 1 0 379455 CASAVA_Build 17 73218382 1D AAGGCCACAG T/- AGGTTTTCCT 3070 het 3070 hom 36 18 16 2 T 1 0 379456 CASAVA_Build 17 73226256 2D CAGTGTGTCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 86 39 32 15 GT 6 5 379457 CASAVA_Build 17 73257595 4I CCCATCTAGG ----/GAGA GACTCTCCCT 3070 het 3070 hom 36 12 14 10 GA 1 3 379458 CASAVA_Build 17 73277190 1D GGACGGGACC T/- GTCTATACCA 3070 het 3070 ref 40 14 11 15 T 1 0 379459 CASAVA_Build 17 73278717 3D CCAGGACAGG AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 17 12 9 A 13 10 379460 CASAVA_Build 17 73309732 4I GCGCGCAAAT ----/ACAC ACGTGTGCGC 3070 het 3070 hom 58 21 27 10 AC 1 3 379461 CASAVA_Build 17 73314082 1D ACAGATTTTT C/- TTCTGCCTCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 C 1 0 379462 CASAVA_Build 17 73329493 1D ACAAACAAAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 81 het 30 0 25 5 A 12 11 379463 CASAVA_Build 17 73330091 1D ACGCCTCCCC T/- TAATCTCCTC 3070 hom 61 het 26 0 17 9 T 2 1 379464 CASAVA_Build 17 73346019 1D GCCTCCAAGA T/- TTCGGGCCGT 1886 het 1886 ref 33 17 7 10 T 3 2 379465 CASAVA_Build 17 73349115 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAATTAG 3070 het 2910 hom 14 7 7 0 A 7 6 379466 CASAVA_Build 17 73349274 1I CCATCTCAAG -/A AAAAAAAAAA 2219 het 1235 hom 14 4 6 5 A 13 14 379467 CASAVA_Build 17 73353177 8D AGGACAAGAC CCAAGCAG/-------- CCAAGCAGGT 3070 hom 36 het 14 0 13 2 CCAAGCAG 2 1 379468 CASAVA_Build 17 73368593 1I GCTCCCACAG -/C AGCTGGCACT 3070 het 3070 hom 44 17 22 5 C 0 1 379469 CASAVA_Build 17 73374085 3I AGACTGAGGC ---/AGG AGAATTGCTT 3070 het 2538 hom 18 7 10 1 AGG 0 1 379470 CASAVA_Build 17 73380725 10I ATGCACACAC ----------/AAATACACAT ACAAACACAT 3070 het 3070 ref 61 23 19 19 AAATACACAT 0 1 379471 CASAVA_Build 17 73383985 1I TTCACAAGCC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 44 17 21 6 A 10 11 379472 CASAVA_Build 17 73405608 1D CAAAGCCGCC A/- AAACTGGGCA 3070 het 3070 hom 35 13 15 7 A 4 3 379473 CASAVA_Build 17 73441585 1I GTCTCAAAGG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 363 hom 30 1 21 8 A 11 12 379474 CASAVA_Build 17 73474190 1I TAGGGTACTT -/A ACTGCTCTTC 3070 het 3070 hom 40 16 20 4 A 1 2 379475 CASAVA_Build 17 73479545 1D TAAGTGAGTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 1785 hom 35 7 22 6 A 15 14 379476 CASAVA_Build 17 73481191 1I GGAAAGTAAT -/A AAAGGCACCT 3070 hom 105 het 39 0 35 4 A 3 4 379477 CASAVA_Build 17 73481426 3D ACATCAAAAG CAA/--- CTAAATCCTG 3070 het 3070 ref 47 28 18 1 CAA 1 0 379478 CASAVA_Build 17 73482693 5I TCAAAGAAAG -----/AAATT AAATAAGCCA 3070 het 3070 ref 40 17 17 6 AAATT 0 1 379479 CASAVA_Build 17 73494103 3I AAAAAAAAAA ---/AAG AAGAAGAAGA 3070 hom 57 het 25 0 17 8 AAG 4 5 379480 CASAVA_Build 17 73546986 2D TCAAATCTTG CC/-- CCCCCCCCCC 3070 hom 22 het 34 0 14 20 C 12 10 379481 CASAVA_Build 17 73570028 1I TTCTTAGAAT -/A AAGAGTATCA 3070 hom 126 het 49 0 43 6 A 2 3 379482 CASAVA_Build 17 73583915 1I AAAAGAAAAA -/G AAAAAAAGGA 3070 het 3070 hom 30 14 13 3 G 0 1 379483 CASAVA_Build 17 73584775 1I ATCCATCCAC -/G GCCTCCTCTG 3070 het 3070 hom 35 14 14 7 G 1 2 379484 CASAVA_Build 17 73593519 1D TGGTTTTTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 33 13 16 4 T 12 11 379485 CASAVA_Build 17 73595159 1D TGCCGCTGCC A/- ATAATACTCT 3070 het 3070 ref 29 15 14 0 A 2 1 379486 CASAVA_Build 17 73596636 15D TTATCGTTAC TTTTTTTTTTTTTTT/--------------- TTTTTTTTTT 2701 het 2263 hom 33 10 9 14 T 26 11 379487 CASAVA_Build 17 73599003 1I ACTCCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1787 hom 23 8 10 5 A 15 16 379488 CASAVA_Build 17 73616169 2D AGGGGCAAAC TG/-- TACCCGTGCC 3070 het 3070 hom 34 11 14 10 TG 1 0 379489 CASAVA_Build 17 73618619 16I CGGTGGGTCC ----------------/AGAGACAGAACAAATA GGAGACAGAA 2236 het 2236 ref 26 13 6 7 AGAGACAGAACAAATA 0 1 379490 CASAVA_Build 17 73627074 1D TAATCCTGCC T/- CCGAGGACCC 3070 het 1169 hom 24 5 11 8 T 1 0 379491 CASAVA_Build 17 73649010 3D TTTTATTGTG TTT/--- TTTATAATAT 3070 het 3070 ref 26 16 9 1 T 6 3 379492 CASAVA_Build 17 73706316 8D GCTCTGTCTC AAAAAAAA/-------- AAAAAAAAAA 1079 het 984 hom 16 5 5 7 A 20 12 379493 CASAVA_Build 17 73707063 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTG 2872 het 2031 hom 23 7 10 6 T 9 10 379494 CASAVA_Build 17 73707662 2D TTCTGAAAAC TG/-- TGTTATGTAA 3070 het 3070 ref 32 17 12 3 TG 2 1 379495 CASAVA_Build 17 73714260 1I TTATTCAATG -/T TTTTGTAGAG 2946 het 2946 ref 26 13 8 5 T 4 5 379496 CASAVA_Build 17 73714367 1I CCTCCCCCTA -/C CCCCCCCTTC 2120 het 1082 hom 18 5 8 5 C 7 8 379497 CASAVA_Build 17 73715769 2D ACCACACCGC CT/-- CTTTCTCTCA 2752 het 2752 ref 26 10 11 5 CT 2 1 379498 CASAVA_Build 17 73716210 1D AGTAAAAGTT G/- GGGGGGGGGG 1159 het 274 hom 23 3 3 18 G 11 10 379499 CASAVA_Build 17 73736120 1D ATCTCTGGGG A/- AAAAAAAAAA 2356 het 2356 ref 38 14 9 15 A 13 12 379500 CASAVA_Build 17 73765779 1D TAGCTGAGAC G/- CCTCATTCTC 3070 het 3070 ref 33 20 9 4 G 1 0 379501 CASAVA_Build 17 73772728 1D TATTTATTTA T/- TTTTTTGGAG 3070 hom 42 het 16 0 15 1 T 7 6 379502 CASAVA_Build 17 73781389 1I ACTCTGTCTC -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 66 het 23 0 23 0 A 9 10 379503 CASAVA_Build 17 73782262 1I TTTAGTAGAT -/A ACGGGGTTTT 1768 het 132 hom 7 1 4 2 A 1 2 379504 CASAVA_Build 17 73782805 1D GTCTAACCTG T/- TTTTTTTCCC 3070 hom 84 het 32 0 29 3 T 8 7 379505 CASAVA_Build 17 73783363 2I AACATATCTC --/TT TGAGTCTCTG 3070 hom 105 het 39 0 36 3 T 1 3 379506 CASAVA_Build 17 73788949 1D AAGGTGGATG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 102 het 38 0 33 5 T 10 9 379507 CASAVA_Build 17 73789388 6I CCCGGTCAGC ------/GCCACT GCCACTCGTT 3070 hom 113 het 40 0 34 6 GCCACT 1 2 379508 CASAVA_Build 17 73794948 1I AAAATAGGCC -/G GGGGGTGGTG 1421 hom 9 het 4 0 3 1 G 5 6 379509 CASAVA_Build 17 73796078 1D CCTTTTTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 78 het 32 0 27 5 T 13 12 379510 CASAVA_Build 17 73797759 6I GTGTGTGTGT ------/TGAGTG TGAGTGTGAG 3070 hom 121 het 61 0 32 29 TGAGTG 2 3 379511 CASAVA_Build 17 73798855 1I TCTTTCTTTC -/T TTTTTTTTTT 1573 het 1573 ref 19 6 5 8 T 10 11 379512 CASAVA_Build 17 73803357 1I ATATTGACTC -/T TTTTTTTTTT 2667 het 2667 ref 26 10 9 8 T 11 12 379513 CASAVA_Build 17 73804034 12D CATGGAAACC TCCCTCTGGGGG/------------ TCCCTCTGGC 2273 het 2273 ref 24 10 7 9 TCCCTCTGGGGG 1 0 379514 CASAVA_Build 17 73810353 5D CTTATATTTT TATTC/----- TATTATATTT 2308 hom 15 het 8 0 5 3 TATTC 1 0 379515 CASAVA_Build 17 73810520 17I ATGATCTTGG -----------------/CTCACTGCAACCTTCAC CTCCTGGGTT 1694 hom 12 het 4 0 4 1 CTCACTGCAACCTTCAC 0 1 379516 CASAVA_Build 17 73811726 3I CATAGGCGCG ---/CAC CACCACGCCC 3070 hom 29 het 15 0 9 6 CAC 2 3 379517 CASAVA_Build 17 73816270 6I GAACTCCAGG ------/GCTCAA GCTCAAGTGA 3070 hom 66 het 26 0 23 3 GCTCAA 1 2 379518 CASAVA_Build 17 73820013 6D AAAGAAAGAA AGAAAG/------ AAAGGCTTTG 3070 hom 51 het 26 0 17 9 AGAAAG 1 0 379519 CASAVA_Build 17 73820686 1I AATAGTAAGG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 410 hom 34 1 31 2 A 9 10 379520 CASAVA_Build 17 73823543 1D TCCTCCTGGG T/- CTCTCTCTTT 3070 hom 63 het 24 0 19 5 T 1 0 379521 CASAVA_Build 17 73824778 1D TTCTTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 66 het 24 0 23 1 T 12 11 379522 CASAVA_Build 17 73829599 2I TAGTAGAGAC --/AG GGTTTCACTG 2479 hom 15 het 8 0 6 2 AG 0 1 379523 CASAVA_Build 17 73829734 4D TAAATTTATT TTTA/---- TTTATTTATT 3070 hom 30 het 13 0 11 2 TTTA 4 3 379524 CASAVA_Build 17 73831602 9I CCCAAAGCCC ---------/TCTTCTCTT TCTTCTCTCT 3070 hom 57 het 21 0 19 2 TCTTCTCTT 0 1 379525 CASAVA_Build 17 73833110 7D TTGCCGTGAG CCAAGGA/------- CCAAGGACGG 3070 hom 105 het 40 0 32 9 CCAAGGA 2 1 379526 CASAVA_Build 17 73841856 1D TCCCTGTAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2099 hom 31 8 15 8 T 11 10 379527 CASAVA_Build 17 73843773 1I CAATAGACTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 81 het 32 0 28 4 A 9 10 379528 CASAVA_Build 17 73846439 1I CTCCCCCCCC -/T CAACTGGAAG 3070 het 117 hom 37 1 29 7 T 0 1 379529 CASAVA_Build 17 73847596 1D CATAGGGAGA C/- CCCCCCCCCA 3070 hom 38 het 16 0 12 4 C 10 9 379530 CASAVA_Build 17 73862397 1I CGAAATATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 44 het 19 0 15 4 A 10 11 379531 CASAVA_Build 17 73863300 1I AGAGAAGACG -/T TTTTTTGCTA 3070 hom 86 het 38 0 29 9 T 6 7 379532 CASAVA_Build 17 73890928 1D TTTTCTTTCC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 32 12 15 5 T 13 12 379533 CASAVA_Build 17 73896177 1D GCCTGGCTAA T/- TTTTTTTTTT 1162 het 1162 ref 28 19 3 7 T 12 11 379534 CASAVA_Build 17 73897299 1I GCTCGGCCCC -/T TTTTTTTTTG 2084 het 2084 ref 17 8 7 2 T 9 10 379535 CASAVA_Build 17 73898005 3D CGGGGGTGGG GGA/--- GGAACAGCTG 2020 het 911 hom 24 6 11 10 GGA 2 1 379536 CASAVA_Build 17 73901589 2D CAGGCGTGGT GG/-- GGCCTATGCC 3070 hom 119 het 43 0 40 5 G 4 2 379537 CASAVA_Build 17 73902728 1D TTCCCTGCCA T/- CTGGGCTGAA 3070 het 3070 ref 44 14 14 16 T 1 0 379538 CASAVA_Build 17 73905271 3I CGCCACCCCC ---/CCG CCAGCTAATT 2927 het 1843 hom 21 6 9 6 CCG 0 1 379539 CASAVA_Build 17 73909720 3D5M1D AGGCTCAGGG TGTGCGCAG/---GCTCA- GGCCCCCCGG 2338 het 2338 ref 22 13 8 2 N/A 0 0 379540 CASAVA_Build 17 73913718 12D GCCGGCCAGG CGCGGTGGCTCA/------------ CGCCTGTAAT 3070 het 3070 hom 30 14 14 6 CGCGGTGGCTCA 1 0 379541 CASAVA_Build 17 73915785 4D TATCTATCAA TCAG/---- TCAATCAGTC 3070 het 3070 hom 54 20 29 8 TCAG 1 0 379542 CASAVA_Build 17 73917998 3I TCAGCTACTC ---/AGG AGGAGGCTGA 1550 het 1385 hom 9 4 4 1 AGG 2 3 379543 CASAVA_Build 17 73922750 1I GGGTGTGGCT -/G GGGGGCCCAG 3070 hom 66 het 27 0 21 6 G 5 6 379544 CASAVA_Build 17 73929080 4I AGGAGTCACT ----/GTCA GTCACCCTTC 3070 hom 141 het 52 0 48 4 GTCA 1 2 379545 CASAVA_Build 17 73929646 2D GTTCCAGTCC CT/-- GTGTTCCCCG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 CT 1 0 379546 CASAVA_Build 17 73938867 1D GTCTCATGAC T/- TTTTTACTCA 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 6 5 379547 CASAVA_Build 17 73943077 1D AGGCCCACAG C/- CCCCTCCGAG 3070 hom 109 het 46 0 32 14 C 5 4 379548 CASAVA_Build 17 73949762 1I TCCATCTCAG -/A AAAAAAAAAA 3070 hom 51 het 25 0 17 8 A 11 12 379549 CASAVA_Build 17 73951223 6D AAGGGAATTC TTTTTA/------ TTTTTATTTT 3070 hom 60 het 28 0 20 9 TTTTTA 3 2 379550 CASAVA_Build 17 73960657 3I TACCAAATGC ---/TCT TCAATTGTGT 3070 hom 123 het 45 0 41 4 TCT 0 1 379551 CASAVA_Build 17 73975757 2D TTAAACTAGC TG/-- TGTGTGGGGA 3070 hom 30 het 15 0 10 5 TG 4 3 379552 CASAVA_Build 17 73975838 1I GAAAATTGTT -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 39 het 16 0 14 2 A 9 10 379553 CASAVA_Build 17 73993005 1I CTGGCCATCA -/T AAACCCCATC 3070 hom 54 het 21 0 17 4 T 0 1 379554 CASAVA_Build 17 73995752 1I GCAGAGGCTG -/A CTGCTTTCTG 3070 het 3070 hom 48 18 22 8 A 0 1 379555 CASAVA_Build 17 74004044 1D TGGGGGGAAG A/- AAAAAAAATA 2303 het 2303 ref 19 12 6 2 A 9 8 379556 CASAVA_Build 17 74007099 1I TGCATGTTTT -/A CTCAGCCCTT 3070 het 3070 hom 48 19 22 7 A 0 1 379557 CASAVA_Build 17 74007220 1D CCCACCTGGG C/- CAATCAGAAG 3070 het 3070 ref 29 16 9 5 C 2 1 379558 CASAVA_Build 17 74012149 9D GATGCTGTCA CCACCCCAC/--------- CCACCCCACC 3070 hom 76 het 31 0 24 8 CCACCCCAC 2 1 379559 CASAVA_Build 17 74018429 3I GGAATTGCGG ---/CCC CCCCCCCGCA 3070 hom 64 het 26 0 18 8 C 7 10 379560 CASAVA_Build 17 74020255 1D GTCCTCCCCC T/- ATTTGCCTAC 3070 hom 60 het 25 0 19 6 T 1 0 379561 CASAVA_Build 17 74023186 1I ACTCCATCTC -/A AAAAAAAATA 3070 het 3070 ref 25 14 9 2 A 8 9 379562 CASAVA_Build 17 74027792 1I CTGTTTCAAG -/A AAAAAAAAAG 3070 het 3070 ref 33 15 15 3 A 9 10 379563 CASAVA_Build 17 74032295 4I AGGAATAAAA ----/TGTT TGTTGTTTAT 3070 het 3070 ref 32 16 12 4 TGTT 1 2 379564 CASAVA_Build 17 74036628 1I GCATTTTGTA -/T TTTTTTTTTT 1923 het 693 hom 16 3 10 3 T 15 16 379565 CASAVA_Build 17 74040837 2D CGAGATGACT CA/-- CACATTGATT 3070 het 3070 ref 42 22 18 3 CA 3 2 379566 CASAVA_Build 17 74044865 4I AAAAAAAAAA ----/AAAG AAAGAAAAAA 3070 hom 57 het 23 0 18 5 AAAG 1 2 379567 CASAVA_Build 17 74047890 1I ATTATTTTAT -/C TTGTCTTTGT 3070 het 367 hom 21 2 11 8 C 0 1 379568 CASAVA_Build 17 74049793 2D CACTGGAAAC CG/-- CCCCCCCCAA 3070 hom 29 het 19 0 11 8 CG 1 0 379569 CASAVA_Build 17 74050792 5D AAGATCATAG GTTTT/----- GTTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 28 12 9 8 GTTTT 4 3 379570 CASAVA_Build 17 74052742 1D14M3D TCACTCTTAT CATTTACGGACTCTACAT/-TTTTACGGACTCTA--- CATCAATTCA 3070 het 3070 ref 38 20 16 9 N/A 0 0 379571 CASAVA_Build 17 74054589 1I CTCAAGAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 14 9 5 A 11 12 379572 CASAVA_Build 17 74061613 1I GCTCAGACCC -/T TTTCCCTGGT 3070 het 3070 hom 35 11 22 2 T 3 4 379573 CASAVA_Build 17 74063849 1I CTATATAATC -/T TATCCATCCA 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 T 1 2 379574 CASAVA_Build 17 74065409 3I TCACTATCTT ---/TGC TGCTGCTATT 3070 hom 78 het 30 0 27 3 TGC 2 3 379575 CASAVA_Build 17 74068157 1D AAGACTTTTT C/- CCCCCCCCCA 3070 het 2764 hom 28 9 15 4 C 10 9 379576 CASAVA_Build 17 74089712 1D TCTCAAAAAA T/- AATAACAACA 3070 het 3070 ref 28 15 12 2 T 1 0 379577 CASAVA_Build 17 74090969 7D CCCAGAGGCT GCTCATA/------- GCTCGTTGGC 3070 het 3070 ref 50 30 15 7 GCTCATA 1 0 379578 CASAVA_Build 17 74093281 4I TTTCCTTTCA ----/GTTT GTTTGTGTTT 3070 het 3070 ref 49 25 19 5 GTTT 1 2 379579 CASAVA_Build 17 74103411 3D AGGGGTCAGG TTT/--- TTTTTTTTTT 2537 het 1007 hom 27 10 15 2 T 24 21 379580 CASAVA_Build 17 74122144 4D GCAGCATGAG AACA/---- AACCAATACA 3070 hom 99 het 35 0 31 5 AACA 1 0 379581 CASAVA_Build 17 74129638 1I CCTCCCCAGG -/C CCAGGATGCC 3070 hom 78 het 33 0 27 6 C 2 3 379582 CASAVA_Build 17 74130120 2I AAATAAATAT --/AA GTTACCCAGA 3070 het 3070 ref 37 17 15 5 A 0 2 379583 CASAVA_Build 17 74130868 3D ACGCTTGCGC CTT/--- CGTTTCCTTA 3070 hom 110 het 39 0 34 6 CTT 1 0 379584 CASAVA_Build 17 74136887 4I CCTCTCTGCG ----/TGCC TGCCTGAGGC 3070 hom 56 het 23 0 16 7 TGCC 1 2 379585 CASAVA_Build 17 74138947 12D CCATCTCTAC AAACAAACAAAG/------------ AAACAAACAA 3070 hom 42 het 24 0 15 9 AAACAAACAAAG 2 1 379586 CASAVA_Build 17 74139540 8D AGGGAGGGAG GGAAGGAA/-------- GGAAGGAAAC 431 het 431 ref 13 4 1 9 GGAA 4 2 379587 CASAVA_Build 17 74139581 1I AGAGCCTGGA -/G GGGGGTCCTG 3070 hom 34 het 15 0 12 3 G 5 6 379588 CASAVA_Build 17 74142549 3D CATTTTTAAA AAG/--- AAGAATGTTC 3070 het 3070 ref 35 22 10 3 AAG 2 1 379589 CASAVA_Build 17 74150512 2I TAATATATGC --/TA TATGTTATAT 3070 het 3070 hom 21 10 10 1 TA 1 2 379590 CASAVA_Build 17 74151079 1I ACAGAAGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 412 hom 26 1 17 8 T 11 12 379591 CASAVA_Build 17 74151634 1D TTTTTTAATT A/- AAAAAAAAAA 1364 het 97 hom 11 1 8 2 A 14 13 379592 CASAVA_Build 17 74159809 3I TACAAAATAT ---/AAG AAAATTAGCT 3070 hom 63 het 25 0 22 3 AAG 0 1 379593 CASAVA_Build 17 74183309 1D GTTCTCTCTT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 254 hom 23 1 15 7 A 13 12 379594 CASAVA_Build 17 74216952 23D GTAAGCGGCA GAGCCAGAGCCAGGGCGTGGGCC/----------------------- GAGCTTCGCC 3070 hom 84 het 29 0 27 7 GAGCCAGAGCCAGGGCGTGGGCC 1 0 379595 CASAVA_Build 17 74221841 1D GCGGTGCACA C/- CTGTAATCCC 3070 hom 53 het 20 0 16 4 C 2 1 379596 CASAVA_Build 17 74247612 3I GGAGCTGCTA ---/TCT TCTTTTCTTT 3070 hom 90 het 38 0 29 10 TCT 1 2 379597 CASAVA_Build 17 74258479 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 28 2 19 7 A 14 13 379598 CASAVA_Build 17 74259152 1I ACAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 3070 het 1738 hom 43 4 34 5 A 13 14 379599 CASAVA_Build 17 74276823 1D ACTATGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 67 het 30 0 23 7 A 13 12 379600 CASAVA_Build 17 74296717 1I TCTATTAAAA -/G TATGAAAATT 3070 hom 69 het 25 0 24 1 G 0 1 379601 CASAVA_Build 17 74310144 6D CTGCTTTCTT TTTTTC/------ TTTTTCTTTT 3070 hom 42 het 20 0 15 5 TTTTTC 3 2 379602 CASAVA_Build 17 74312173 2D AAACAAAAAC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 26 het 16 0 12 4 A 13 11 379603 CASAVA_Build 17 74320948 5I GAAAGCAAGA -----/GAGAC ACCTCAAACA 3070 hom 114 het 44 0 34 10 GAGAC 0 1 379604 CASAVA_Build 17 74341511 1I TTCTTTCTCG -/C CATTTTCCTT 3070 hom 80 het 36 0 27 9 C 1 2 379605 CASAVA_Build 17 74355296 3I CCGAGTAGCT ---/GAG ATTACAGGTG 3070 hom 48 het 19 0 17 3 GAG 0 1 379606 CASAVA_Build 17 74356429 1I GAACCCCAGA -/G GTGGAGATTG 3070 hom 48 het 20 0 16 4 G 1 2 379607 CASAVA_Build 17 74358961 1D ACTCTGTCTG A/- AAAAAAAAAA 1429 het 1429 ref 31 15 5 11 A 15 14 379608 CASAVA_Build 17 74377677 1I CCAAGGCTGA -/G GGAAGAGAGA 3070 hom 90 het 33 0 28 5 G 2 3 379609 CASAVA_Build 17 74381009 4D AATACAAGCT CTCA/---- CTCTGTCACC 2368 hom 27 het 15 0 8 7 CTCA 1 0 379610 CASAVA_Build 17 74381965 1D TGCTTTTGGC T/- TTTTTTTTCC 3070 hom 102 het 45 0 31 14 T 9 8 379611 CASAVA_Build 17 74384591 1I CAGCTAAAAT -/A AGCCCTTTTC 3070 hom 81 het 31 0 26 5 A 1 2 379612 CASAVA_Build 17 74388213 1I AACAAAATAC -/A AAAAAACAAA 3070 het 4 hom 29 1 16 12 A 6 7 379613 CASAVA_Build 17 74389647 4D CTCCATATCC TCTT/---- TTTTTTTTGA 3070 hom 98 het 39 0 34 5 TCTT 1 0 379614 CASAVA_Build 17 74408222 1D ACTCCATTTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 733 hom 31 2 24 5 A 15 14 379615 CASAVA_Build 17 74431362 2I TTGTGGAAAC --/TG TGACACAGGC 3070 hom 98 het 37 0 30 7 TG 1 2 379616 CASAVA_Build 17 74440196 2I CATGGCGAAG --/CC CCCCATCTCT 3070 hom 63 het 24 0 20 4 C 4 6 379617 CASAVA_Build 17 74444098 2D CTTGCTACTT AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 11 0 11 1 A 17 15 379618 CASAVA_Build 17 74446209 1D TGTAGAGAGA G/- GGGGTCCCCC 3070 hom 55 het 22 0 18 5 G 5 4 379619 CASAVA_Build 17 74448393 1D ATTTGTAGCC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 72 het 33 0 24 10 T 12 11 379620 CASAVA_Build 17 74455945 6D ACTCTGTCTC AAAAAA/------ AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 26 0 17 9 A 17 11 379621 CASAVA_Build 17 74467715 1D GGCGCTTCTG T/- CCCCCTGGAG 3070 hom 48 het 18 0 17 1 T 1 0 379622 CASAVA_Build 17 74476256 1I TTTTGTTTTG -/T TTTTTTTTGA 3070 hom 53 het 25 0 18 7 T 8 9 379623 CASAVA_Build 17 74491620 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTGA 3070 het 1165 hom 21 5 11 5 T 8 9 379624 CASAVA_Build 17 74514065 6D ATCATCTCAC TACTTT/------ AAGGCCGGCT 3070 het 3070 ref 32 16 14 3 TACTTT 1 0 379625 CASAVA_Build 17 74515838 2I GCCTTTCAGC --/AG AGGGGCGTGT 3070 het 3070 ref 46 17 19 10 AG 1 2 379626 CASAVA_Build 17 74522821 1D TAATGACCTA G/- GTGTATGTTA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 2 1 379627 CASAVA_Build 17 74579667 1I CAAAAAATTA -/G CCAGGCGTGA 3070 hom 36 het 17 0 12 5 G 0 1 379628 CASAVA_Build 17 74612602 24I TGCTGAGCAA ------------------------/CGGTGACCTGAACCCAGGCCCTGC CTGTTCAGGT 3070 hom 62 het 26 0 20 6 CGGTGACCTGAACCCAGGCCCTGC 0 1 379629 CASAVA_Build 17 74614562 1I GCCAGATTCT -/C CCCCACCCTT 3070 hom 75 het 31 0 22 9 C 4 5 379630 CASAVA_Build 17 74626492 3D TACAAAAAAT AAA/--- AAAAAAAAAA 2549 het 276 hom 17 4 8 6 A 14 11 379631 CASAVA_Build 17 74630387 1D TGAGTATGTT C/- CCAAAAGAAA 3070 het 3070 hom 39 15 16 8 C 3 2 379632 CASAVA_Build 17 74632341 1D TTGCGGGGGT G/- GGTGGCCAGG 3070 hom 37 het 24 0 13 11 G 3 2 379633 CASAVA_Build 17 74646387 1I CATGCGTTCA -/T CACCCCCTCA 3070 het 1592 hom 63 10 17 36 T 0 1 379634 CASAVA_Build 17 74652051 1D GGCGGGAGAC G/- CCTACCACAG 3070 het 1779 hom 22 10 9 3 G 1 0 379635 CASAVA_Build 17 74660136 1D GGACTAGGGT G/- GGGGGGTATC 3070 het 2738 hom 24 11 9 4 G 7 6 379636 CASAVA_Build 17 74665797 4D TAGGACATAG ACAC/---- ACACAGACAG 3070 het 3070 hom 46 18 24 5 AC 4 2 379637 CASAVA_Build 17 74669448 1I AATTTTTGTA -/T TTTTCCTAGA 3070 hom 57 het 21 0 19 2 T 4 5 379638 CASAVA_Build 17 74673830 1D CCCTCCTGTT C/- CCCCCCCGGG 3070 hom 50 het 22 0 14 9 C 8 7 379639 CASAVA_Build 17 74679329 4I AAAAAAAAAT ----/AGAG AGATCTTGCC 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 AG 1 3 379640 CASAVA_Build 17 74691796 2D GTGATGTAAT CC/-- GAGGGCATCT 2597 hom 49 het 22 0 10 14 C 2 0 379641 CASAVA_Build 17 74694356 1I TTCACTACTT -/A AAAAAAAAGA 3070 hom 59 het 24 0 20 4 A 8 9 379642 CASAVA_Build 17 74702292 1D GTCTCAAAAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2229 hom 20 7 12 1 A 11 10 379643 CASAVA_Build 17 74706308 1D TCTCTCTCTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 368 hom 35 1 26 8 T 13 12 379644 CASAVA_Build 17 74707157 3D ACTTGAGGAA GAG/--- GAGAAGGCCA 3070 het 3070 ref 34 19 9 9 GAG 2 1 379645 CASAVA_Build 17 74714224 6D GTGGGCGGGA GCGGAT/------ GCCTCCTGTG 3070 het 3070 hom 39 16 17 10 GCGGAT 1 0 379646 CASAVA_Build 17 74720668 1I AGTAGCTGGG -/C ATTACAGGCA 1728 hom 12 het 5 0 5 0 C 0 1 379647 CASAVA_Build 17 74724517 1D TGCCAAGTGG C/- AGAGCCAGAT 2731 het 2731 ref 35 17 10 8 C 1 0 379648 CASAVA_Build 17 74736711 1I TCAAGACCAG -/C CTGGCCAATA 3070 hom 24 het 10 0 9 1 C 1 2 379649 CASAVA_Build 17 74740377 1D AGCATAGGCG A/- AAAAAAATCT 3070 hom 8 het 33 1 14 18 A 8 7 379650 CASAVA_Build 17 74745617 1D ATTTGGGGGA T/- TTTTTTCTAT 3070 hom 134 het 54 0 47 9 T 7 6 379651 CASAVA_Build 17 74748664 1I TAAAAAAAAA -/T TTTTTTTTGA 2605 het 2604 ref 15 7 6 2 T 8 9 379652 CASAVA_Build 17 74750721 2D GTGTTTTTCT GG/-- GGTTATGCCA 3070 het 3070 hom 48 18 21 11 G 4 2 379653 CASAVA_Build 17 74750880 1I TGAGTTTGCG -/T CGAGACCCAC 3070 hom 102 het 37 0 33 4 T 0 1 379654 CASAVA_Build 17 74752377 7I CCTAGAGCCT -------/TCCCTTC TCCCTTCCCT 3070 hom 69 het 32 0 24 8 TCCCTTC 1 2 379655 CASAVA_Build 17 74753694 1D38M1I AGCATGTCAG AAAAAAAAAAAATTGTTGCTCAACCTTACTGGTTGTATC-/-AAAAAAAAAAATTGTTGCTCAACCTTACTGGTTGTATCA AAAAAGCCCC 3070 het 3070 ref 34 18 16 13 N/A 0 0 379656 CASAVA_Build 17 74755395 1I TGGGGCATCT -/G CCACTCTTCC 3070 het 3070 hom 37 15 17 5 G 0 1 379657 CASAVA_Build 17 74759967 1I GGGTCCAACC -/T TTTTGCTTCC 3070 hom 126 het 49 0 42 7 T 4 5 379658 CASAVA_Build 17 74764626 1D AAAACAAAAC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 A 10 9 379659 CASAVA_Build 17 74772052 1D CAAGCCTGGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1825 hom 20 8 11 1 T 12 11 379660 CASAVA_Build 17 74775071 1I ACTCTCTCTC -/T TTTTTTTTTT 2491 het 2491 ref 25 8 13 4 T 10 11 379661 CASAVA_Build 17 74775838 3D GAGTGGCTTC TCG/--- TCTGCGAGTC 3070 het 3070 hom 37 11 15 12 TCG 1 0 379662 CASAVA_Build 17 74777293 1D TCTCTGTTCT C/- CCCCTACCTG 3070 het 3070 hom 41 16 18 7 C 5 4 379663 CASAVA_Build 17 74778761 3I AAGATTTTTT ---/TTC TTTTTTTTTG 3070 hom 33 het 23 1 21 2 TTC 0 1 379664 CASAVA_Build 17 74779434 1I CACTGGTCCT -/A AAAGGGTACA 3070 hom 63 het 25 0 22 3 A 3 4 379665 CASAVA_Build 17 74780601 1I TCTAGGGCCA -/C CCCCAGTACC 3070 hom 81 het 32 0 26 6 C 4 5 379666 CASAVA_Build 17 74780826 1D GTGGACGGGT G/- GCACTGCCCT 3070 het 3070 ref 40 17 14 9 G 2 1 379667 CASAVA_Build 17 74784939 9D TCTTTCAAAG CTCCAAGGC/--------- CTCCAAGGCC 1293 het 768 hom 24 4 7 13 CTCCAAGGC 2 1 379668 CASAVA_Build 17 74784984 3I GTGGGGAGGG ---/GGT GGGGGGTAGT 997 het 997 ref 19 5 4 10 GGT 0 1 379669 CASAVA_Build 17 74786230 1D AGCATGCAGA C/- CCCCCACCCT 3070 hom 58 het 28 0 18 10 C 6 5 379670 CASAVA_Build 17 74787915 2D CGCACACATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 ref 74 31 26 18 CA 7 6 379671 CASAVA_Build 17 74792221 1I AGAGACTCGC -/T TTTTTTTTTT 3066 het 3066 ref 43 16 11 16 T 11 12 379672 CASAVA_Build 17 74796155 1I TTCTCTGCAG -/C CCCCCCCCAG 3027 het 1663 hom 27 6 12 9 C 8 9 379673 CASAVA_Build 17 74800497 1D CATTTGGGGG A/- AAAAATCACC 3070 hom 103 het 40 0 34 6 A 6 5 379674 CASAVA_Build 17 74805151 1I GCCATCCCCC -/T GGTACCACTG 3070 hom 66 het 29 0 21 8 T 0 1 379675 CASAVA_Build 17 74806829 1D ATCTCGGTGC T/- GGCAAAACAG 3070 hom 48 het 21 0 17 4 T 1 0 379676 CASAVA_Build 17 74814568 1D AGGCTGGGGG A/- AAAGGGAACC 3070 hom 60 het 22 0 20 3 A 4 3 379677 CASAVA_Build 17 74815175 1D ATACTCGCTG A/- TTTGCATTTT 3070 hom 51 het 21 0 18 3 A 1 0 379678 CASAVA_Build 17 74817026 1D TCCTCTCCCA C/- CCCGTGGCTC 3070 hom 50 het 22 0 16 6 C 4 3 379679 CASAVA_Build 17 74822568 4D12M1D ACTTGGACTT TGTCTGTGATCCTTCCT/----TGTGATCCTTCC- TTTTTTTTTT 3070 hom 69 het 23 0 24 2 N/A 0 0 379680 CASAVA_Build 17 74829937 2I GGAAAGAAGG --/GA GAGAGAGAGA 3070 hom 84 het 33 0 25 8 GA 5 6 379681 CASAVA_Build 17 74838134 1D CCTGTTGTGG T/- TTTTTTTCTT 3070 hom 96 het 37 0 31 6 T 8 7 379682 CASAVA_Build 17 74838255 1I CAGGGTGGCA -/G GGGGGTCTGA 3070 hom 70 het 28 0 19 9 G 5 6 379683 CASAVA_Build 17 74840028 3D CTGCCAGGGA GGT/--- GGTGTTTTGT 3070 hom 63 het 24 0 22 3 GGT 2 1 379684 CASAVA_Build 17 74840607 2D AGAAAGACAG AT/-- AGACAGACAC 3070 hom 93 het 36 0 32 4 AT 1 0 379685 CASAVA_Build 17 74846741 1D TTTTCTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 14 15 10 T 12 11 379686 CASAVA_Build 17 74865480 1I CTCAAGGGTG -/T TTTTTTTTTT 2457 het 2457 ref 22 9 8 5 T 10 11 379687 CASAVA_Build 17 74865618 3D CCAAACAAGC TAT/--- TATTATTATT 1873 het 1147 hom 11 3 6 3 TAT 6 5 379688 CASAVA_Build 17 74867411 1D ATTTGGGTCA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1941 hom 23 5 10 8 T 12 11 379689 CASAVA_Build 17 74875974 2I GCAGCTGAGG --/AA AGAGACCTCC 3070 hom 96 het 37 0 30 7 A 1 3 379690 CASAVA_Build 17 74878311 4D ACATACACTA ACAT/---- ACATACATAT 3070 hom 224 het 84 0 73 14 ACAT 3 2 379691 CASAVA_Build 17 74888937 3D ACTCTGTCTC AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 65 het 24 0 23 1 A 15 12 379692 CASAVA_Build 17 74895679 2D GAATGTGTAC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 83 32 30 23 GT 7 6 379693 CASAVA_Build 17 74895743 2D GCACTGTGCA GT/-- GTGTGTGCCT 3070 het 3070 ref 77 40 29 9 GT 4 3 379694 CASAVA_Build 17 74908319 1I TTAACCACAG -/A TTTTAAGAAT 3070 hom 90 het 33 0 30 3 A 0 1 379695 CASAVA_Build 17 74912023 1I TGAGGTGAGC -/A AGTCTACACT 3070 het 3070 ref 29 13 14 2 A 1 2 379696 CASAVA_Build 17 74913085 1D TTTGTTTACA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 84 het 33 0 27 6 T 10 9 379697 CASAVA_Build 17 74930377 4I GCACCCTGGC ----/TCTT TCTTCTCCAT 3070 hom 80 het 30 0 20 10 TCTT 1 2 379698 CASAVA_Build 17 74958219 1I GGACTTCTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 ref 26 10 9 7 T 11 12 379699 CASAVA_Build 17 74981798 1D GTCAATGCAG A/- AAAAAAAAAA 1110 het 1110 ref 41 26 4 12 A 13 12 379700 CASAVA_Build 17 74985236 1D CCGTCACCGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2206 hom 29 7 14 9 A 11 10 379701 CASAVA_Build 17 74991659 5I TTAATTTACT -----/CCAAC CCAACCCAAA 3070 het 3070 ref 38 17 12 9 CCAAC 1 2 379702 CASAVA_Build 17 74993209 1I CTGCTCTTGC -/T TCCTCCCCCA 3070 het 3070 hom 28 13 11 4 T 1 2 379703 CASAVA_Build 17 74996038 1D ACTACCCCCT C/- CCCGGGGCCT 3070 hom 79 het 33 0 27 6 C 4 3 379704 CASAVA_Build 17 75006147 4D CCCATTCACT CATC/---- CATCCATCCA 3070 hom 122 het 50 0 33 20 CATC 4 3 379705 CASAVA_Build 17 75214339 2I ATGGAGACAG --/AC TTTCCATGGG 1872 hom 10 het 4 0 4 0 AC 0 1 379706 CASAVA_Build 17 75273499 6I CTGCCCTGTG ------/GGAGGA CATTGGCCTT 3070 het 3070 hom 35 15 17 3 GGA 0 2 379707 CASAVA_Build 17 75276502 9D3M4D AAAGCCACCT CCCCAGGCAGGGCGCA/---------GGG---- GGAGCAGCTA 3070 het 3070 ref 41 20 20 8 N/A 0 0 379708 CASAVA_Build 17 75282094 2D CACGTGTGCA TG/-- TGTGTGTGTG 3070 hom 27 het 52 1 28 24 TG 7 6 379709 CASAVA_Build 17 75282109 2D GTGTGTGTGT AC/-- ATGTGTGCAT 3070 het 2979 hom 62 18 31 13 AC 1 0 379710 CASAVA_Build 17 75301015 2I25M3D ACTGTGACTC --AAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTGAAAAG/AAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTGAA--- AGACTAGGCA 2136 het 2136 ref 19 12 7 5 N/A 0 0 379711 CASAVA_Build 17 75303345 1I CTCTTCCCCC -/T GATCTTTTGG 2242 het 1086 hom 14 3 7 4 T 0 1 379712 CASAVA_Build 17 75309092 1D CCCCCATCCT C/- TCTCTCCCCA 3070 het 3070 ref 33 17 11 5 C 1 0 379713 CASAVA_Build 17 75338778 1D AAGACGATGC A/- GCTTCCATGC 3070 hom 78 het 28 0 27 1 A 1 0 379714 CASAVA_Build 17 75341702 1D AGTCTGCCTC A/- AAAAAAAAAA 1230 het 1230 ref 19 9 3 7 A 19 18 379715 CASAVA_Build 17 75344500 1I TAGTAGAGAT -/G GGGGTTTCAC 3070 hom 21 het 16 0 15 1 G 4 5 379716 CASAVA_Build 17 75349614 1D TAATAATAAT A/- ATAATAATAA 3070 hom 27 het 10 0 9 1 A 2 1 379717 CASAVA_Build 17 75353081 2D CTGTCTCTAT AA/-- AAAAAAAATA 3070 het 20 hom 10 1 8 2 A 10 8 379718 CASAVA_Build 17 75369456 1D TTCTGGGGGC G/- GGGGGGGTAC 2628 het 2628 ref 23 9 9 5 G 8 7 379719 CASAVA_Build 17 75377722 4I CAGGAAAGGG ----/TTCC TTCCCCCTGC 3070 het 3070 hom 31 12 13 6 TTCC 1 2 379720 CASAVA_Build 17 75400595 1D GGAATGCGGA C/- CCCCGGATGT 2655 het 2655 ref 28 17 9 2 C 5 4 379721 CASAVA_Build 17 75415129 1D GAGCTTGACA T/- TAATTGTCCT 3070 hom 123 het 48 0 40 9 T 2 1 379722 CASAVA_Build 17 75416116 1D GTGTGTGTGT G/- GGGGGGGGGT 3070 het 47 hom 27 1 18 9 G 10 9 379723 CASAVA_Build 17 75438921 1I CCCAGCTAAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 19 het 20 1 18 1 T 13 14 379724 CASAVA_Build 17 75463875 1D TTTCTTTGTG A/- AAAAACTTCC 3070 hom 48 het 18 0 17 1 A 6 5 379725 CASAVA_Build 17 75468940 1D TTTGATAAAG A/- GGGGGGAATA 3070 hom 69 het 27 0 24 3 A 1 0 379726 CASAVA_Build 17 75470135 1I TGGCTTTATG -/A AATAGATCAT 3070 het 3070 hom 47 19 23 5 A 2 3 379727 CASAVA_Build 17 75476323 1D TTTTTTTAAC T/- TTTTTTTTTT 2152 het 2152 ref 22 10 6 6 T 12 11 379728 CASAVA_Build 17 75497724 1D GCTTAAGTGA C/- CCCCCCCCAT 3070 het 3070 ref 24 11 7 7 C 9 8 379729 CASAVA_Build 17 75502984 1D TGCCCTTCCT C/- CCTTCCACCA 2345 het 2345 ref 25 14 10 1 C 3 2 379730 CASAVA_Build 17 75503735 1I TGTCTCGTGC -/T GCTTCTGTCC 3070 hom 108 het 44 0 31 13 T 0 1 379731 CASAVA_Build 17 75504087 3I AGAGGGACGC ---/AGG AGGAGGAGGA 3070 het 2731 hom 29 11 12 6 AGG 4 5 379732 CASAVA_Build 17 75546251 1D AACATCTATT A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 21 0 17 4 A 12 11 379733 CASAVA_Build 17 75547233 1I AGGAACAAGG -/C TAAGAATGCC 3070 het 3070 hom 38 17 17 4 C 0 1 379734 CASAVA_Build 17 75551445 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 983 het 983 ref 11 6 3 2 A 15 14 379735 CASAVA_Build 17 75552373 4D TGTGTGTGTC TGTT/---- TGTTTGTTTT 3070 het 3070 ref 34 16 14 5 TGTT 3 2 379736 CASAVA_Build 17 75553480 1I TCTGTATTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 hom 69 het 28 0 24 4 T 9 10 379737 CASAVA_Build 17 75562633 1D TTCCATTTAA T/- TTTTTTTTTC 3070 hom 39 het 18 0 14 4 T 10 9 379738 CASAVA_Build 17 75585746 1D CTCCCGGTAC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 41 12 18 11 T 13 12 379739 CASAVA_Build 17 75613299 2I GCATAAACAT --/CA CACACACACA 3070 het 243 hom 65 1 54 11 CA 5 6 379740 CASAVA_Build 17 75613742 1D AGGCGGATCC G/- GGGCCGCAGG 2927 hom 27 het 16 0 10 6 G 4 3 379741 CASAVA_Build 17 75622621 2D TGAGACATAG AA/-- TGTTGCTCTA 3070 hom 37 het 20 0 14 6 A 2 0 379742 CASAVA_Build 17 75622783 1I TAGTAGATAT -/G GGGGGGTTTC 3070 hom 63 het 27 0 19 8 G 6 7 379743 CASAVA_Build 17 75623631 1D TTTCTTTTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 59 hom 28 3 19 6 T 13 12 379744 CASAVA_Build 17 75631257 1D TGTTGGGTTG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 370 hom 40 1 28 11 T 13 12 379745 CASAVA_Build 17 75641000 2I CACACCAAAA --/TG TGAGTTACCA 3070 het 3070 ref 28 14 11 3 TG 1 2 379746 CASAVA_Build 17 75642538 4D AATTGACTTG ATAA/---- ATAAACTGCT 3070 het 3070 ref 49 24 21 4 ATAA 2 1 379747 CASAVA_Build 17 75643369 1D ACACTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 24 10 12 2 A 12 11 379748 CASAVA_Build 17 75646270 1I ATTTCGTCTC -/A AAAAAAAAAA 2869 het 2449 hom 24 7 10 7 A 13 14 379749 CASAVA_Build 17 75650527 4I TACAGTGAAT ----/AGAG AGAGACTCAT 3070 het 2419 hom 23 6 11 6 AG 2 4 379750 CASAVA_Build 17 75662270 1D TTGTATGTTA G/- TAGAGACAGG 3070 hom 48 het 17 0 17 1 G 1 0 379751 CASAVA_Build 17 75664184 1I CAAAATATCA -/C CCTTTAATGG 3070 hom 51 het 22 0 18 4 C 2 3 379752 CASAVA_Build 17 75675810 5D AAAGAGACCC CCTGT/----- CCTCTCCTCT 3070 hom 78 het 30 0 24 9 CCTGT 1 0 379753 CASAVA_Build 17 75677903 4D ATATCCCTGT TCTC/---- TCTCTCTCTG 3070 hom 74 het 29 0 24 6 TC 6 4 379754 CASAVA_Build 17 75679949 4I CTTCTGCCTT ----/TTTG TTCTCCTCAG 3070 hom 66 het 25 0 21 4 TTTG 0 1 379755 CASAVA_Build 17 75698019 1D AAACACAGAC T/- TTTTTCTTTC 3070 hom 51 het 21 0 18 4 T 6 5 379756 CASAVA_Build 17 75698100 6D GGTTTAAAGA AAAGGT/------ AAAGGTAAAG 3070 hom 57 het 21 0 20 2 AAAGGT 2 1 379757 CASAVA_Build 17 75699536 1D GGGAAAGGGG C/- GGGGGGGGGA 2948 hom 48 het 20 0 11 11 C 1 0 379758 CASAVA_Build 17 75713282 2D GGGCTGGAAG CA/-- CAGTCAGAAC 3070 hom 117 het 47 0 40 7 CA 2 1 379759 CASAVA_Build 17 75715465 6D TGTAATCCCA ACACTG/------ GGAGACCGGG 3070 hom 44 het 16 0 14 2 ACACTG 1 0 379760 CASAVA_Build 17 75753944 1I CCGCACCCAG -/C CTAATTTTTG 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 1 2 379761 CASAVA_Build 17 75758296 1D GCAATGTCTA G/- CTGTGGGACT 3070 hom 96 het 33 0 31 2 G 1 0 379762 CASAVA_Build 17 75788119 2D CTAAAAATAC AA/-- AAAAAAAAAA 1067 het 446 hom 10 3 3 4 A 16 14 379763 CASAVA_Build 17 75793022 1D CTGTCTCAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2113 hom 21 6 13 2 A 12 11 379764 CASAVA_Build 17 75805101 4D ACTAAGTGTT TACA/---- TACAAAGCAT 3070 het 3070 hom 52 23 20 9 TACA 2 1 379765 CASAVA_Build 17 75812595 2D GAGTGTGTGT GA/-- GTGTGTGAAT 3070 het 3070 hom 62 25 27 11 GA 1 0 379766 CASAVA_Build 17 75819429 1I CAAAGAACCA -/G CCTTTGGTTT 3070 het 3070 ref 25 12 10 3 G 0 1 379767 CASAVA_Build 17 75837234 1D CAGCCAGTGG C/- TGCTGCAGCA 3070 het 2081 hom 29 10 15 4 C 1 0 379768 CASAVA_Build 17 75842619 3D AGGTCCCTTG CCT/--- CCTCCCATTT 475 het 475 ref 25 11 4 10 CCT 2 1 379769 CASAVA_Build 17 75856219 1I TTTTCTTTTC -/T TTTTTTTTTT 1849 het 1849 ref 27 10 7 10 T 13 14 379770 CASAVA_Build 17 75883851 1D TGGGGCACGG A/- ATGGGGTCTG 3070 hom 75 het 30 0 23 7 A 2 1 379771 CASAVA_Build 17 75893734 1D CCACCACGCC T/- GGCTAATTTA 2812 het 1297 hom 11 4 6 1 T 1 0 379772 CASAVA_Build 17 75912965 1D CTTTGAACCT A/- AAGGAAGAAA 3070 het 3070 hom 36 14 20 2 A 3 2 379773 CASAVA_Build 17 75923012 1D CACAGAGAGG T/- TTTTTTTTTT 3070 het 1009 hom 22 6 13 3 T 12 11 379774 CASAVA_Build 17 75927354 1I AAAAAAAATT -/A AAAAAAAAAA 1838 het 601 hom 9 2 5 2 A 15 16 379775 CASAVA_Build 17 75953832 4I CCCACGCTCC ----/TTCT GTCTTGTCCC 2608 het 2608 ref 26 9 7 10 TTCT 0 1 379776 CASAVA_Build 17 75955064 1D GGCTCAAAAT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 22 11 10 1 A 13 12 379777 CASAVA_Build 17 75955527 1D TCATGAAGAG A/- ATGAGTTGCA 3070 het 3070 ref 39 25 13 1 A 2 1 379778 CASAVA_Build 17 75959405 1D TGAATATGGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 14 17 4 T 11 10 379779 CASAVA_Build 17 75963938 1I CTACTAAAAG -/A AAAAAAAAAA 3070 het 2855 hom 21 8 10 3 A 11 12 379780 CASAVA_Build 17 75979115 2D ATTCTAATTT TA/-- TAACAAGTAG 3070 het 3070 ref 21 12 7 3 TA 2 1 379781 CASAVA_Build 17 75984670 5I AAAAAATAAA -----/ATAAC ATAAGGACCT 3070 het 3070 hom 31 12 18 1 ATAAC 0 1 379782 CASAVA_Build 17 75987690 1D TAATTAAAGG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 34 14 17 3 A 11 10 379783 CASAVA_Build 17 75989569 1D TTTCTGCTGA C/- CCATCTGACC 3070 het 3070 ref 40 24 12 4 C 3 2 379784 CASAVA_Build 17 75989791 1D TGAAGGCATA T/- GTCAGGGTAC 3070 hom 69 het 27 0 22 5 T 1 0 379785 CASAVA_Build 17 75991396 1D ATTTTACCTG T/- TCCAAAAACT 3070 hom 99 het 35 0 31 6 T 2 1 379786 CASAVA_Build 17 75993251 5D ACCGCAGTCA TTTCT/----- TCTCTTCTGT 3070 het 3070 ref 28 14 9 8 TTTCT 1 0 379787 CASAVA_Build 17 75995973 20I CTTCTAACAA --------------------/CCCCACAATATCATCCCTTG CCCCAAAATC 1992 het 1992 ref 28 18 6 5 CCCCACAATATCATCCCTTG 0 1 379788 CASAVA_Build 17 76018771 4D ATTTCACATA TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 hom 25 8 13 5 TTTG 3 2 379789 CASAVA_Build 17 76023515 2D AGAAGTTCTT TA/-- TATGTTCTGA 3070 hom 90 het 34 0 31 4 TA 2 1 379790 CASAVA_Build 17 76027143 1I GACCCCAGCT -/G GTCCTGCGTC 3070 hom 63 het 25 0 20 5 G 1 2 379791 CASAVA_Build 17 76037507 1D CTCATTTGTT A/- ATGGCAGCCC 3070 het 3070 ref 30 13 13 4 A 2 1 379792 CASAVA_Build 17 76044023 4I TTTGGTTTAA ----/AAAT AAATAAATAA 3070 hom 87 het 32 0 30 2 AAAT 2 3 379793 CASAVA_Build 17 76049830 4D TCTCAAAAAT AAAG/---- AAAGAAAGAA 3070 het 2631 hom 24 6 13 5 AAAG 6 5 379794 CASAVA_Build 17 76050725 13D AATGGTGTGT CAGGGCCGAGTTC/------------- CAGGGCCAGC 3070 het 3070 ref 31 16 11 11 CAGGGCCGAGTTC 1 0 379795 CASAVA_Build 17 76073353 4D TTCTGAATTC CATT/---- CATTCATTCA 3070 hom 65 het 31 0 22 9 CATT 6 5 379796 CASAVA_Build 17 76085845 2D AAGAGGTGGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 52 24 18 12 GT 8 7 379797 CASAVA_Build 17 76098931 1I AATGTGCCCC -/T GTGCCACCCT 3070 hom 95 het 36 0 28 8 T 0 1 379798 CASAVA_Build 17 76112069 3D CACAGGGAGG GGT/--- GGTGAGAATT 3070 hom 97 het 37 0 32 6 GGT 2 1 379799 CASAVA_Build 17 76126589 1D TAAGCAATTC T/- CATGCCCCAG 2591 het 2015 hom 15 6 7 2 T 1 0 379800 CASAVA_Build 17 76127437 1I CTTATTATAT -/A AAAAAAATGA 3070 het 3070 ref 35 22 8 5 A 7 8 379801 CASAVA_Build 17 76131051 1D TAAAAACTGC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 28 13 10 5 A 13 12 379802 CASAVA_Build 17 76134925 1D TCATAAAACA C/- CCATCTATTT 3070 hom 132 het 46 0 45 2 C 3 2 379803 CASAVA_Build 17 76142146 1I TTTTTTTTTC -/T TTTTTTTTTA 3070 hom 57 het 27 0 20 7 T 9 10 379804 CASAVA_Build 17 76144415 1I ATCTAAAAAG -/T TTTTTTGTTT 2410 het 1096 hom 26 5 17 4 T 6 7 379805 CASAVA_Build 17 76145934 4I TAACTCAATA ----/AATC AATCAATAAA 3070 hom 33 het 15 0 12 3 AATC 1 2 379806 CASAVA_Build 17 76149323 3D CCCTGAGAAG AGA/--- AGAACTGAGA 3070 hom 81 het 31 0 28 3 AGA 2 1 379807 CASAVA_Build 17 76151154 1I ACCCCATCCT -/G GGCAACAGAG 3070 hom 90 het 36 0 30 6 G 2 3 379808 CASAVA_Build 17 76153004 1D ACCCAACAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2960 hom 37 11 19 8 T 13 12 379809 CASAVA_Build 17 76160809 1I TTCTTTTTTT -/A TAAAAAAATG 2653 het 2653 ref 17 9 7 1 A 0 1 379810 CASAVA_Build 17 76165429 1I GTCATAATTC -/T TTTTTTTTTT 2166 het 2166 ref 28 12 7 9 T 15 16 379811 CASAVA_Build 17 76168610 5D ATTATAACTC ATGTT/----- ATGATGAGAC 3070 het 3070 ref 43 25 15 5 ATGTT 1 0 379812 CASAVA_Build 17 76175259 9D TTTTGCCATG TGTGATAGC/--------- TGTTCCTGTT 3070 het 3070 ref 26 14 9 7 TGTGATAGC 1 0 379813 CASAVA_Build 17 76176145 2I GAGCTTATTA --/AC ACAACCATCA 3006 het 3006 ref 46 22 9 15 AC 1 2 379814 CASAVA_Build 17 76176170 1D CATATGTATC T/- TTTTTTTTTT 1642 het 1642 ref 43 18 4 21 T 12 11 379815 CASAVA_Build 17 76183855 1D GCAGACAGGG T/- TTTTCCCCCC 3070 het 3070 hom 36 15 16 5 T 5 4 379816 CASAVA_Build 17 76184573 9D ATTTTAAGAA AATTGGTTT/--------- TTTGCTGCCT 3070 het 3070 ref 39 21 19 4 AATTGGTTT 1 0 379817 CASAVA_Build 17 76188684 1D CCACCAAGTG T/- TTTTAAAGAA 2896 het 2896 ref 36 20 7 9 T 5 4 379818 CASAVA_Build 17 76193328 1D TTTTTTCCCC T/- TTTTTTTTTG 3070 het 2412 hom 30 10 13 7 T 10 9 379819 CASAVA_Build 17 76200152 1D TTTATAGCTG T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 8 het 44 2 36 6 T 13 12 379820 CASAVA_Build 17 76205159 1D AGGAGTGGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 het 3070 hom 34 14 18 2 A 10 9 379821 CASAVA_Build 17 76214723 28D TGGGATTACA GGCCAATTTTCTACTTTATTACACGCCC/---------------------------- GGCCAATTTT 3070 het 3070 ref 18 15 8 2 GGCCAATTTTCTACTTTATTACACGCCC 1 0 379822 CASAVA_Build 17 76215761 4D TAGCTGTACA TTTC/---- TTTAAGTTTT 3070 het 3070 ref 48 28 16 7 TTTC 1 0 379823 CASAVA_Build 17 76242435 1D CCAGGGGCAA G/- GGGAGTGTGT 3070 hom 87 het 33 0 29 4 G 4 3 379824 CASAVA_Build 17 76243867 2I TGATGCAGTC --/AT AGCTTACTGC 3070 hom 45 het 17 0 16 1 AT 0 1 379825 CASAVA_Build 17 76247698 1D AATCCAAGAA G/- GGTTAGGAAT 3070 het 3070 ref 26 13 10 3 G 3 2 379826 CASAVA_Build 17 76256513 7D CAGCAGTAAA CAGTTAC/------- CACATTTCCC 3070 het 3070 ref 46 19 19 9 CAGTTAC 1 0 379827 CASAVA_Build 17 76257382 1D GCTGCCTCCC G/- GGTGCTTCTC 3070 het 3070 hom 29 12 13 5 G 3 2 379828 CASAVA_Build 17 76260762 1D GCAAAGGTTC T/- TTTTTTTTTT 2746 het 167 hom 23 1 10 12 T 19 18 379829 CASAVA_Build 17 76266183 2I CCAAGAAAGA --/TG TCTACTCCTT 3070 hom 129 het 48 0 44 4 TG 0 1 379830 CASAVA_Build 17 76270510 1I GGTCCCCCCC -/A CCCACCCCAA 3070 het 1294 hom 31 7 18 6 A 0 1 379831 CASAVA_Build 17 76275378 5D CTCTTGTTCT TTCAG/----- TTCAGTAACC 3070 het 3070 hom 33 14 15 6 TTCAG 2 1 379832 CASAVA_Build 17 76278738 6I ACACACACAT ------/ACACAC ACACACACAC 3070 het 3070 ref 42 17 17 8 AC 6 9 379833 CASAVA_Build 17 76285567 1I GAGGGGACAT -/G GGGGGCGGTC 3070 het 3070 ref 39 20 12 7 G 5 6 379834 CASAVA_Build 17 76286324 1D GAGGGACACA T/- TCCTGTGACC 3070 hom 63 het 28 0 19 11 T 2 1 379835 CASAVA_Build 17 76288766 1D AGAAATAGAT A/- AGTGGTGGTG 3070 het 3070 ref 49 21 23 5 A 2 1 379836 CASAVA_Build 17 76304109 1I TTATCCCTCG -/C CCCCCTCCCA 3070 hom 57 het 21 0 20 1 C 5 6 379837 CASAVA_Build 17 76311606 3I AGTTGTTATT ---/TTC TTCTTTATAA 3070 het 3070 ref 54 24 22 8 TTC 1 2 379838 CASAVA_Build 17 76314869 1I GCATCTCAGA -/C ATTTAAAATG 3070 het 3070 hom 44 15 20 9 C 0 1 379839 CASAVA_Build 17 76316157 1I AATTTTCAGC -/T TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 35 13 16 6 T 10 11 379840 CASAVA_Build 17 76317134 1D GCTCTTGTGC T/- TTTTTTTTTC 3070 het 2745 hom 31 7 19 5 T 10 9 379841 CASAVA_Build 17 76324592 1I TTCAGCCCAT -/G GGATCATGGG 3070 het 3070 hom 38 14 18 6 G 2 3 379842 CASAVA_Build 17 76327359 1D20M1I GAGCTTTCCC AAAAATTCTTAGAGTTTAACC-/-AAAATTCTTAGAGTTTAACCT TTTTTTTTGT 3070 het 3070 ref 40 28 17 5 N/A 0 0 379843 CASAVA_Build 17 76327834 6I CATCTTTTCT ------/TGAAGA TGAAGTGATC 3070 het 3070 ref 54 26 20 8 TGAAGA 0 1 379844 CASAVA_Build 17 76333915 3D TATTAAAAAT ATG/--- ATTTCTGCTT 3070 het 3070 ref 39 26 11 3 ATG 1 0 379845 CASAVA_Build 17 76335325 2I AAAAATGCTA --/TT GGTTCTGGGT 3070 het 3070 hom 35 11 18 6 T 0 2 379846 CASAVA_Build 17 76341376 2I TTTACGTGAC --/AA AAGTCTCATT 3070 het 3070 hom 44 20 23 1 A 2 4 379847 CASAVA_Build 17 76341774 1I TCACGCCTGT -/A AATCCCAGCA 3070 het 386 hom 14 1 9 4 A 2 3 379848 CASAVA_Build 17 76343525 2D CTCTGCCTCT GC/-- AGCCAAGTCC 3070 het 3070 hom 32 11 15 8 GC 1 0 379849 CASAVA_Build 17 76344585 1I AGGTTAGTTA -/T TGTGAGAGCA 3070 het 3070 hom 60 27 26 7 T 1 2 379850 CASAVA_Build 17 76348075 1D ACCACCAGGG T/- TTTTTTTTTT 1208 het 1208 ref 41 31 4 7 T 11 10 379851 CASAVA_Build 17 76364441 1I ACATAGAACC -/T TTCCTTAGCT 3070 hom 114 het 40 0 38 2 T 2 3 379852 CASAVA_Build 17 76372636 1D GGCATGAGCC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 434 hom 28 1 18 9 A 11 10 379853 CASAVA_Build 17 76383959 1D TAAAGGTTTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 2299 hom 30 8 14 8 T 12 11 379854 CASAVA_Build 17 76389773 2D GCCTGCCAAG CA/-- CCACACCATT 1793 het 1793 ref 31 13 10 8 CA 1 0 379855 CASAVA_Build 17 76411191 4I ATGTGTGTGC ----/GTGT GTGTATTTGT 3070 hom 126 het 55 0 41 14 GT 2 4 379856 CASAVA_Build 17 76421512 1I GGGGCGGGCG -/C CGCTCTGACT 3070 hom 50 het 23 0 14 9 C 1 2 379857 CASAVA_Build 17 76427966 1D CACAAACCTT G/- GGGGGCAATG 3070 hom 79 het 34 0 23 12 G 6 5 379858 CASAVA_Build 17 76430729 1D TGATTACTGA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 356 hom 28 1 20 8 T 11 10 379859 CASAVA_Build 17 76431825 1D CAAAAAAAAA T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 32 1 28 3 T 11 10 379860 CASAVA_Build 17 76439896 1D AATGTTTGAG A/- AAAAAAAAAC 3070 hom 62 het 23 0 20 4 A 10 9 379861 CASAVA_Build 17 76476279 1D TTTTGAACTT C/- AACCTGTCTT 3070 het 3070 hom 37 12 16 9 C 1 0 379862 CASAVA_Build 17 76485498 1I TGTCTCTACT -/A ATAAAAAAAT 3070 hom 45 het 20 0 16 7 A 1 2 379863 CASAVA_Build 17 76493575 2D TGCTCTCTTG TT/-- TTTTTTTTTA 3070 hom 93 het 35 0 32 3 T 11 9 379864 CASAVA_Build 17 76497626 1I CCTTCTTCCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 48 het 20 0 17 3 T 10 11 379865 CASAVA_Build 17 76517855 5D TAAAACAGAC TAAAA/----- TACCATTTTT 3070 hom 107 het 38 0 35 4 TAAAA 1 0 379866 CASAVA_Build 17 76518414 6D13M11D17M6D CCTCAGCTCA TCCCTGGCTCATCCCCAGCTCATCCTCAGTTCAGTTCAGCTCATCCTCATCCC/------ACTCATCCCCAGC-----------TCAGCTCAGCTCATTCT------ CAGCTCATCC 178 het 178 ref 50 64 3 6 N/A 0 0 379867 CASAVA_Build 17 76523416 1D ACCCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 19 het 30 0 15 16 A 15 14 379868 CASAVA_Build 17 76528583 2D ATAAAAAAAC AA/-- ATGTAAATAA 3070 hom 105 het 39 0 36 3 A 3 1 379869 CASAVA_Build 17 76542905 1I AAGCAATCCT -/C CTGTCTCGGC 3070 hom 54 het 22 0 19 3 C 1 2 379870 CASAVA_Build 17 76544618 2D CTTCTCTATG AA/-- AAAAAAAAAA 3070 het 2825 hom 31 9 13 9 A 14 12 379871 CASAVA_Build 17 76557251 5I CACAGGGCAC -----/GAGCA GTTGCCATGG 3070 hom 65 het 23 0 22 1 GAGCA 0 1 379872 CASAVA_Build 17 76565938 1D TGGTATTTTT C/- TTTTCTTTTC 560 het 560 ref 23 7 5 12 C 1 0 379873 CASAVA_Build 17 76571987 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 3070 hom 37 het 14 0 11 3 A 14 12 379874 CASAVA_Build 17 76574199 2D ACTGTCTCAC AA/-- AAAAAAAAAA 1727 hom 26 het 13 0 7 6 A 14 12 379875 CASAVA_Build 17 76578955 1I GTAGCAAGTC -/T TTTTTTTTTT 2543 hom 10 het 27 0 11 16 T 14 15 379876 CASAVA_Build 17 76597285 4I ACAGCCCATC ----/TCTT TCTTTCTTTC 2662 het 2662 ref 24 9 7 9 TCTT 3 4 379877 CASAVA_Build 17 76598123 2I ATGGGCATTT --/AA AAAAAAAAAA 3070 hom 57 het 32 0 19 13 A 14 16 379878 CASAVA_Build 17 76598883 1D GTTAAACTTA T/- TTTTCTTATA 2332 het 2332 ref 17 7 8 2 T 5 4 379879 CASAVA_Build 17 76599374 18D GGAGACAGGA TGATGAGGAAGAAGAATT/------------------ TGATGAGGAA 3070 het 3070 ref 31 18 17 4 TGATGAGGAAGAAGAATT 1 0 379880 CASAVA_Build 17 76607242 2D GTTCGAACTC TG/-- TGCGTTTTTG 3070 het 3070 ref 29 13 12 6 TG 2 1 379881 CASAVA_Build 17 76607337 1D AACACAAAAC T/- TTTTTTTTTT 1968 het 1938 hom 20 6 5 9 T 13 12 379882 CASAVA_Build 17 76616858 2D TACTCTCTGC GA/-- GAGGAGAGAG 3033 het 3033 ref 33 15 8 11 GA 2 1 379883 CASAVA_Build 17 76618257 1D AAAAAAAAAA T/- TTTTTTTGTA 3070 het 1181 hom 23 4 13 7 T 8 7 379884 CASAVA_Build 17 76619821 3I CCAGGCAGAA ---/TCT GGTGGGAGGG 3070 het 3070 ref 32 13 13 6 TCT 0 1 379885 CASAVA_Build 17 76627294 2D GCCTTCCTGG GT/-- GGGGGGGGCA 3070 hom 81 het 32 0 28 5 GT 1 0 379886 CASAVA_Build 17 76630708 1I GCCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 57 het 28 0 21 7 T 11 12 379887 CASAVA_Build 17 76636037 2D GCACAGGTAA AC/-- ACGCAGCTCA 3070 hom 135 het 60 0 42 20 AC 2 1 379888 CASAVA_Build 17 76639117 10D CACACACGCA CACAAATGTG/---------- CACATGCACA 3070 het 3070 ref 50 26 20 7 CACAAATGTG 1 0 379889 CASAVA_Build 17 76641621 1D TGGTAATTGA T/- GTGTTGAGCA 3070 hom 96 het 39 0 29 10 T 1 0 379890 CASAVA_Build 17 76652345 5I GGGTGGAGGT -----/GCTCA GCTCAGCTCA 3070 hom 64 het 28 0 18 10 GCTCA 2 3 379891 CASAVA_Build 17 76652998 1I CCAGAGAGTC -/T TTTTTTTGCT 3070 hom 67 het 26 0 17 9 T 7 8 379892 CASAVA_Build 17 76677974 15I GCACCTGTTT ---------------/CTCAGGTGGGGGACA CCCAACGGCT 2456 hom 27 het 11 0 7 4 CTCAGGTGGGGGACA 0 1 379893 CASAVA_Build 17 76691127 1D CGGGGATGAG T/- TGGGGGGAGC 2440 het 2440 ref 30 17 6 7 T 2 1 379894 CASAVA_Build 17 76712572 1D GTGGGGGCGG T/- TGGGGAAGCA 1959 hom 23 het 9 0 6 3 T 2 1 379895 CASAVA_Build 17 76726316 4I GGCACACGTG ----/CACA CACACAGCCA 3070 hom 144 het 53 0 42 11 CA 3 5 379896 CASAVA_Build 17 76726851 2I GATGCATGTG --/CA CACACACACC 3070 hom 153 het 64 0 47 17 CA 4 5 379897 CASAVA_Build 17 76727049 2D CACACATACC CA/-- CACACATATC 3070 hom 142 het 53 0 45 9 CA 4 3 379898 CASAVA_Build 17 76737198 4D CATATGCACA CACT/---- CACGCGCACA 3070 het 3070 hom 61 22 27 12 CACT 1 0 379899 CASAVA_Build 17 76737302 3D CCCTGCTAGT GAG/--- GAGCTTGGGA 3070 het 3070 ref 37 16 12 10 GAG 2 1 379900 CASAVA_Build 17 76742474 5D TCCATCTCAA AAAAC/----- AAAACAAAAC 3070 het 2008 hom 20 6 14 0 AAAAC 4 3 379901 CASAVA_Build 17 76745325 1I GGCCCTGGGC -/G GGGGTACGGC 3070 hom 53 het 25 0 15 10 G 4 5 379902 CASAVA_Build 17 76752475 14D GGTCTCTGTC CCAGCACCACCACT/-------------- CCAGCACAGA 2999 het 2999 ref 31 17 9 8 CCAGCACCACCACT 1 0 379903 CASAVA_Build 17 76757763 1I GGGAGGCCAA -/G GGGGGGCGGA 3070 het 789 hom 19 2 15 2 G 6 7 379904 CASAVA_Build 17 76758141 4I GTGTGTGTAC ----/GTAT GTGTCTATGT 3070 het 3070 hom 54 20 21 13 GTAT 0 1 379905 CASAVA_Build 17 76793285 1I ATTTGGGTGG -/T TGTGAATAAC 3070 het 3070 ref 33 15 12 6 T 1 2 379906 CASAVA_Build 17 76802952 1I ACTTCATCTC -/A AAAAAAGAAA 1981 het 1981 ref 19 11 6 2 A 6 7 379907 CASAVA_Build 17 76804024 1D CCAGGCTGGT C/- TCGAACTCCT 3070 hom 42 het 18 0 14 4 C 1 0 379908 CASAVA_Build 17 76807661 1D GAGCTCATCA C/- CCCTCCCCAC 3070 hom 48 het 21 0 13 9 C 4 3 379909 CASAVA_Build 17 76810692 6D CCAGGGTGGG CTGACC/------ CTGACCCTGA 2368 het 1994 hom 33 9 10 14 CTGACC 4 3 379910 CASAVA_Build 17 76818723 7D CAGTGTACTG TGAGTGC/------- TGCAGAGTTT 3070 het 2622 hom 27 6 12 11 TGAGTGC 1 0 379911 CASAVA_Build 17 76819431 3D CCTCCGCACG CCC/--- CCCGACACAC 3070 het 3070 hom 45 15 23 9 C 6 3 379912 CASAVA_Build 17 76819535 3D CACACACACA CAG/--- ATGTGTGCAT 3070 het 3070 ref 48 30 13 7 CAG 1 0 379913 CASAVA_Build 17 76828903 1D CCGTCTCTAC A/- AAAAAAAAGA 3070 het 3070 hom 29 12 11 6 A 9 8 379914 CASAVA_Build 17 76831932 15I CCCGCTCCAG ---------------/CAACAGCAGCCATCT CAACAGAAAG 3070 het 2372 hom 35 7 16 12 CAACAGCAGCCATCT 0 1 379915 CASAVA_Build 17 76834096 3D GTTAAGGCCA ATG/--- ATGACCCCAT 1409 het 1409 ref 21 13 4 6 ATG 2 1 379916 CASAVA_Build 17 76852625 1I CCTCAGTGGC -/A GGGGGAAGCC 2753 het 1130 hom 30 5 14 11 A 0 1 379917 CASAVA_Build 17 76856742 1D ACCCCAGGAC A/- AAAAAACAAG 3070 het 3070 ref 30 15 9 6 A 7 6 379918 CASAVA_Build 17 76857179 1D AAGTTGAAAG T/- TTTCCCTCAA 3070 het 3070 hom 35 13 20 3 T 4 3 379919 CASAVA_Build 17 76884721 3D GCCTGCGTTC TTT/--- TTTTTTTTTT 1809 het 1809 ref 25 13 6 6 T 14 11 379920 CASAVA_Build 17 76909755 1D CTAAAAATAC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 36 het 13 0 13 0 A 11 10 379921 CASAVA_Build 17 76915866 2I TGGCGCTCTC --/GT GTCTGCACCA 1022 het 1022 ref 35 20 9 6 GT 1 2 379922 CASAVA_Build 17 76916166 1D TAGTGGAGAT G/- GGGTTTCACC 1344 het 593 hom 5 2 3 0 G 4 3 379923 CASAVA_Build 17 76916316 1D CCCCACTTGC T/- TTTTCAATCC 3032 het 1884 hom 18 5 8 5 T 5 4 379924 CASAVA_Build 17 76932402 2I ATGGCTTGTT --/GA GTTTTATTTT 3070 hom 39 het 14 0 12 2 GA 0 1 379925 CASAVA_Build 17 76941614 1D TTCTAATCAG C/- CCCAACTCAT 3070 hom 27 het 12 0 8 5 C 4 3 379926 CASAVA_Build 17 76947534 2D ACTCCGTCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1726 het 454 hom 15 4 4 7 A 16 14 379927 CASAVA_Build 17 76948727 3D TCCCACCAGT AAC/--- ACACAAGTAA 3070 hom 78 het 29 0 27 4 AAC 1 0 379928 CASAVA_Build 17 76949250 2D GTTTGTTTTG TT/-- TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 24 0 19 5 T 12 10 379929 CASAVA_Build 17 76962161 2D GGCTGGGCCC CT/-- GTCTGGAGCG 3070 hom 56 het 24 0 14 11 CT 1 0 379930 CASAVA_Build 17 76966476 1D TGGCTCAGTA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 432 hom 28 1 16 11 T 13 12 379931 CASAVA_Build 17 76984054 1I ATTGCTTTCA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 10 11 379932 CASAVA_Build 17 76987002 1D TCTGAAAGCA C/- CCCCCCCACA 1100 hom 17 het 7 0 5 2 C 8 7 379933 CASAVA_Build 17 76990221 2I CAGGTCAGCA --/CT CTCTCCCTGA 3070 hom 84 het 31 0 27 4 CT 2 3 379934 CASAVA_Build 17 76991877 1D CGCCAATCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 hom 42 het 18 0 14 6 A 13 12 379935 CASAVA_Build 17 77004966 2D GTGTATGTGC GT/-- GTGTGTGTGT 3070 hom 159 het 60 0 50 11 GT 6 5 379936 CASAVA_Build 17 77010410 1I CCTCTCGTGA -/T TTTTTTTTTT 3070 hom 11 het 22 1 15 6 T 11 12 379937 CASAVA_Build 17 77038567 1D TATCTGACCA C/- CCCCCCCAGC 3070 hom 58 het 27 0 16 11 C 8 7 379938 CASAVA_Build 17 77040617 1D AGGGTGCCAG C/- CGCCTGGGGA 3067 hom 35 het 16 0 9 7 C 2 1 379939 CASAVA_Build 17 77048698 1I CGCTGAGTAA -/G GGGGGCTGCT 3070 hom 45 het 18 0 13 5 G 5 6 379940 CASAVA_Build 17 77051841 1D TCTGTCTCAG A/- AAAAAAAAAA 3070 het 67 hom 28 2 14 12 A 12 11 379941 CASAVA_Build 17 77055076 1I TCACCTCCCT -/C CCCCCCCAGC 3070 hom 72 het 28 0 20 8 C 7 8 379942 CASAVA_Build 17 77074163 1I TTGAGCGTCT -/G GTTACTGAGG 3070 hom 78 het 28 0 24 4 G 1 2 379943 CASAVA_Build 17 77080117 7D GGTGGAGGTT GCGGTTA/------- GCCGAGATCA 2081 hom 13 het 7 0 5 5 GCGGTTA 1 0 379944 CASAVA_Build 17 77084432 3I CCAGCACTTG ---/GCA GCCCACGTGC 3070 hom 73 het 31 0 21 10 GCA 0 1 379945 CASAVA_Build 17 77085192 1I TCTCAAAAAG -/A AAAAAAAAGG 3070 hom 39 het 17 0 13 4 A 8 9 379946 CASAVA_Build 17 77085568 5D GAAAGAAAAG AAGAA/----- AAGAAAAGAA 2259 het 2153 hom 16 9 6 1 AAGAA 3 2 379947 CASAVA_Build 17 77106368 1D ATAGCCTCCC T/- TGGGCAGTGT 3070 hom 81 het 32 0 27 5 T 2 1 379948 CASAVA_Build 17 77107189 1D TAAAAAATAC A/- AAAAAAATTA 3070 hom 27 het 13 0 9 4 A 8 7 379949 CASAVA_Build 17 77112534 1I GGCCCAGGCC -/G GGGCATGTGG 3070 hom 99 het 36 0 24 12 G 3 4 379950 CASAVA_Build 17 77144684 4I AAAAAATTAA ----/TCTT TCTATCAACA 3070 hom 104 het 41 0 34 7 TCTT 0 1 379951 CASAVA_Build 17 77173416 3D ATGCTGTTAA GTT/--- GTTCAGAATT 3070 hom 81 het 30 0 28 2 GTT 2 1 379952 CASAVA_Build 17 77183675 4D TCTCTAAGGA GCCG/---- GCCGTTTTCT 3070 hom 68 het 27 0 22 6 GCCG 2 1 379953 CASAVA_Build 17 77184303 4I GAGAAGCAAC ----/TTAA TTAAACATCA 3070 hom 113 het 44 0 38 6 TTAA 1 2 379954 CASAVA_Build 17 77190203 1D TAAAATAAAC A/- AATGTACATA 3070 hom 105 het 44 0 35 9 A 3 2 379955 CASAVA_Build 17 77190597 3D ATAAAAAGCT AAA/--- AAAAAAAAAA 3070 hom 43 het 26 0 21 8 A 15 12 379956 CASAVA_Build 17 77192048 28I AGACTTAAGG ----------------------------/GTTTCTGCTTGTCTCTGAAGCTACTGAC GTACTGCTTT 3070 hom 93 het 30 0 31 5 GTTTCTGCTTGTCTCTGAAGCTACTGAC 0 1 379957 CASAVA_Build 17 77194200 3I ACTCCATCTC ---/AAA AAAAAAAAAA 3070 hom 48 het 24 0 16 8 A 11 14 379958 CASAVA_Build 17 77207611 1D TACTTTGGGG A/- AAAAAAAAAA 1314 het 1314 ref 35 21 5 9 A 16 15 379959 CASAVA_Build 17 77432159 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 486 het 486 ref 12 5 5 2 A 17 16 379960 CASAVA_Build 17 77448174 1I ATTTTTATTT -/A TTTATTTATT 1994 hom 12 het 6 0 5 1 A 0 1 379961 CASAVA_Build 17 77487398 1I TTCTTTATTA -/T TTTTTTTTTT 1713 het 1079 hom 14 6 6 2 T 13 14 379962 CASAVA_Build 17 77515197 2I TCCCCAGAAC --/CT CTCTGCCCTT 3070 het 3070 hom 38 15 19 4 CT 2 3 379963 CASAVA_Build 17 77518906 1D CTGGGGGAGG A/- AGGGCATGGG 1343 het 1343 ref 33 13 4 16 A 2 1 379964 CASAVA_Build 17 77535028 1I GCATCTCATG -/T TTTTTTTTTT 2854 het 1373 hom 19 4 7 8 T 13 14 379965 CASAVA_Build 17 77557377 2D ATGTGCACAG GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 ref 55 20 18 19 GT 10 9 379966 CASAVA_Build 17 77571971 1D GGCAAGTGCA T/- TTTGGAGCTA 3070 het 3048 hom 25 11 10 4 T 4 3 379967 CASAVA_Build 17 77584262 1D ATTGCGATAC G/- GGTTCTGCCT 3070 hom 74 het 27 0 23 4 G 3 2 379968 CASAVA_Build 17 77586293 4I GATCATTAAC ----/AATT AAATTATAGA 3070 het 3070 ref 38 19 15 4 AATT 0 1 379969 CASAVA_Build 17 77589814 6D AGATATAAAA ATGATC/------ ATGATCATGG 1949 het 1949 ref 9 5 4 1 ATGATC 2 1 379970 CASAVA_Build 17 77607562 2I TGAAGGTGGG --/CC CCCCGCCTGG 2535 het 2258 hom 29 9 11 9 C 4 6 379971 CASAVA_Build 17 77610436 1I GTGGCCTGGT -/G GGGGGGCAGT 2870 het 2461 hom 33 12 11 10 G 6 7 379972 CASAVA_Build 17 77615946 1I TTCCAGGACC -/G GGGAACCCAA 3070 hom 53 het 24 0 14 10 G 3 4 379973 CASAVA_Build 17 77650886 4I CTGATTCAGG ----/GTGA GTGAGGCCCT 1681 het 465 hom 13 1 5 7 GTGA 1 2 379974 CASAVA_Build 17 77654463 8I CCCCGTTGGG --------/GTCACACA GTCACACAGT 1702 het 1692 hom 21 7 5 9 GTCACACA 1 2 379975 CASAVA_Build 17 77662422 1D CACCATGCCC A/- AGCTAATTTT 2745 hom 18 het 7 0 7 0 A 2 1 379976 CASAVA_Build 17 77670317 1I TGAGAAATTA -/T GTCGTATTTT 1831 hom 15 het 8 0 6 2 T 0 1 379977 CASAVA_Build 17 77676544 1I CTCTACTAAA -/T TTTTTTTTTT 1140 het 1140 ref 19 10 5 5 T 15 16 379978 CASAVA_Build 17 77677451 2D ATCTCAAAGG AA/-- AAAAAAAAAA 2244 het 2244 ref 19 7 7 5 A 14 12 379979 CASAVA_Build 17 77685016 2I10M4I CAGAGCAAGA --CTGTCTCAAA----/CTCTGTCTCAAAAAAC AAACAAACAA 3070 het 3070 ref 23 13 11 0 N/A 0 0 379980 CASAVA_Build 17 77685959 8D AAAAAGCAAG CAAACAAA/-------- CAAACAAAAG 3070 het 3070 hom 27 16 14 4 CAAA 4 2 379981 CASAVA_Build 17 77686273 1D GAAACAGACA T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 30 10 15 5 T 11 10 379982 CASAVA_Build 17 77687762 1I AAAAAAAAAA -/G AAAGAAAACT 2212 het 1861 hom 23 10 8 5 G 0 1 379983 CASAVA_Build 17 77688226 4D TCATCCAGGC TGGA/---- TGGAGTGCAG 1395 het 1395 ref 18 8 3 7 TGGA 2 1 379984 CASAVA_Build 17 77690508 2D TTTTGTCATC CA/-- CAGTTTTTTT 3070 het 3070 ref 25 13 9 3 CA 2 1 379985 CASAVA_Build 17 77690855 9I TGATGCTCCC ---------/CAGAAAGCT CAGAAAGCTC 3070 het 3070 ref 33 13 9 11 CAGAAAGCT 1 2 379986 CASAVA_Build 17 77694316 1D AAACTCCGTC A/- AAAAAAAAAA 2409 het 2409 ref 26 9 8 9 A 12 11 379987 CASAVA_Build 17 77694638 12D GGTGCTCTTA CACACACACAGG/------------ CACACACACA 3070 het 3070 ref 33 19 11 5 CACACACACAGG 1 0 379988 CASAVA_Build 17 77695751 1D CCACTGTGGT A/- AACAGGGAAC 3070 het 3070 hom 29 14 14 3 A 3 2 379989 CASAVA_Build 17 77700424 1D ATGGATGGAT G/- GGGGGGGTGG 3070 het 2262 hom 33 9 12 12 G 8 7 379990 CASAVA_Build 17 77707456 1D ACTCTGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 2150 hom 21 8 9 4 A 12 11 379991 CASAVA_Build 17 77708261 1D TCCTTCACAG C/- CTTTCCCTCT 3070 het 3070 ref 32 17 11 4 C 2 1 379992 CASAVA_Build 17 77710055 1I GTCTTGCTCT -/G TCGCCCAAGC 3070 hom 42 het 17 0 14 3 G 0 1 379993 CASAVA_Build 17 77711179 1I TAGGAAGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 31 13 12 6 A 11 12 379994 CASAVA_Build 17 77713172 1D ATTAAAAAAA T/- TTTTTTTTTG 3070 het 3070 ref 33 19 14 0 T 10 9 379995 CASAVA_Build 17 77714872 1I AGGGTCAAAG -/A AAAAAAATCA 3070 het 3070 hom 36 13 20 3 A 7 8 379996 CASAVA_Build 17 77717290 1I ATCTCTGATT -/A AAAAAAAAAA 3070 het 3070 ref 44 20 17 7 A 10 11 379997 CASAVA_Build 17 77718550 2D ATTTTTGCTC TT/-- GTAGCCCAGG 3070 het 943 hom 16 3 9 4 T 2 0 379998 CASAVA_Build 17 77719914 1I44M1D AATGTTGCCA -GACAAAGAGGAAGATTACGTAACAATATAAGGGTCAATTATCCTA/GGACAAAGAGGAAGATTACGTAACAATATAAGGGTCAATTATCCT- AAAAAAAAAA 3070 het 2644 hom 20 8 17 8 N/A 0 0 379999 CASAVA_Build 17 77724996 3D GCTCCGGTGC AGG/--- AGGAGAGACA 3070 het 2830 hom 31 9 16 6 AGG 2 1 380000 CASAVA_Build 17 77750158 1D ACTCCATCTC A/- AAAAAAAAAA 620 het 285 hom 12 4 4 4 A 17 16 380001 CASAVA_Build 17 77757235 2I CAAGAAGGAC --/CA CATGAAGCTT 1714 het 1714 ref 26 9 9 8 CA 1 2 380002 CASAVA_Build 17 77760787 1I AGCTGGGACT -/A CAGACACACG 3070 het 3070 hom 31 12 15 4 A 0 1 380003 CASAVA_Build 17 77785208 12D GGTTTCACCG TGTTAGCCAGGA/------------ TGGTCTCGAT 1533 hom 15 het 6 0 6 0 TGTTAGCCAGGA 1 0 380004 CASAVA_Build 17 77793688 3I GGGGGCAGCT ---/CTC CTCCTGCTCT 3070 hom 63 het 29 0 21 8 CTC 1 2 380005 CASAVA_Build 17 77862723 1I CTAAAAATAC -/A AAAAAAAAAA 1115 het 755 hom 19 6 5 8 A 15 16 380006 CASAVA_Build 17 77922479 3I CAGGGGCGGG ---/GTC GTCAAGGCCC 3062 hom 39 het 16 0 12 4 GTC 1 2 380007 CASAVA_Build 17 77967845 1I TTTATTATTT -/A TTTTTTTTGA 1926 het 1286 hom 13 6 6 1 A 0 1 380008 CASAVA_Build 17 78008179 1I TCTCAAAAAC -/A AAAAACAAAA 355 het 355 ref 25 13 5 7 A 5 6 380009 CASAVA_Build 17 78009056 4D CAGACATGTT CTTA/---- CTTCTCATTT 3070 het 3070 ref 40 20 17 4 CTTA 1 0 380010 CASAVA_Build 17 78011031 1D GACTCCGTCT A/- AAAAAATAAA 3070 het 2504 hom 21 8 9 4 A 7 6 380011 CASAVA_Build 17 78045966 1I CTGGCTATAA -/G GGGGGGAGCC 3070 het 3070 ref 25 10 10 5 G 6 7 380012 CASAVA_Build 17 78102495 1D AAAAAAAATT A/- AAAAAAAAAT 2989 het 1564 hom 15 5 9 1 A 10 9 380013 CASAVA_Build 17 78130240 1D TCCCCGCTTA G/- GAGGACTGGT 3070 het 3070 hom 54 23 21 12 G 2 1 380014 CASAVA_Build 17 78152013 1D TGCGGGTGGT G/- GGGGGGCGAG 3070 hom 40 het 21 0 13 9 G 7 6 380015 CASAVA_Build 17 78160476 1D TGTCTCTACC A/- AAAAAAAAAA 1488 het 1488 ref 28 12 5 11 A 15 14 380016 CASAVA_Build 17 78170416 3D ACCCACATCA TCT/--- ACTACTTAAC 3070 hom 84 het 31 0 28 6 TCT 1 0 380017 CASAVA_Build 17 78184328 2D ACTCCATCTC AA/-- AAAAAAAAAA 1969 het 27 hom 18 1 7 10 A 19 17 380018 CASAVA_Build 17 78193122 1D GAAAAAAGAG A/- AAAAAAAAAT 3070 hom 57 het 22 0 20 2 A 10 9 380019 CASAVA_Build 17 78195059 1D GGTTAAATTT A/- AGACTCCGAG 3070 hom 93 het 33 0 32 2 A 2 1 380020 CASAVA_Build 17 78198745 4D ATGGGAAAAG AAGT/---- AAGATTTCCC 3070 het 3070 ref 21 11 8 2 AAGT 1 0 380021 CASAVA_Build 17 78206065 1I AGAGAAGAAA -/G GTGTGTAAGA 3070 hom 81 het 34 0 28 6 G 1 2 380022 CASAVA_Build 17 78216424 1D TTTCTTCTTC T/- TTTTTTTTTT 3070 hom 54 het 23 0 17 7 T 12 11 380023 CASAVA_Build 17 78217415 4D CCACAATACA TTTT/---- TTTTTTTTGA 3070 hom 21 het 8 0 8 0 T 12 8 380024 CASAVA_Build 17 78224627 1D TCCCTCTCTT A/- AGCTGACTCC 3070 hom 78 het 29 0 27 2 A 2 1 380025 CASAVA_Build 17 78232186 14D ACTCCATCTC AAAAAAAAAAAAAA/-------------- AAAAAAAAAA 3070 hom 30 het 18 0 15 6 A 30 16 380026 CASAVA_Build 17 78251322 1I TGCAGCCACA -/T TTTTTTTTTT 3070 het 866 hom 32 3 18 11 T 13 14 380027 CASAVA_Build 17 78256641 1D GCCCACCCCA T/- TAGAGCCTGG 3070 hom 57 het 22 0 19 3 T 2 1 380028 CASAVA_Build 17 78259667 2I GTGAAACCCC --/GT GTCTCTACTA 2487 hom 18 het 8 0 7 1 GT 1 2 380029 CASAVA_Build 17 78264045 9D TATGGCGTCC AGGCTGATT/--------- GTGCCAAGGA 1749 het 1749 ref 26 10 9 9 AGGCTGATT 1 0 380030 CASAVA_Build 17 78268708 2I CAAGGTGAAA --/CC CCCCCGTCTC 3070 hom 27 het 10 0 10 0 C 5 7 380031 CASAVA_Build 17 78269488 1D GTGTGGTGAG C/- CAGGGGGACC 3070 hom 98 het 43 0 32 11 C 2 1 380032 CASAVA_Build 17 78271918 3I CATGTCTGAC ---/CTT CTTTCCAGAG 3070 het 3070 hom 54 24 28 2 CTT 1 2 380033 CASAVA_Build 17 78274307 5I TTAACAAATG -----/TTTTA TTTTAGGTAT 3070 hom 87 het 33 0 30 3 TTTTA 1 2 380034 CASAVA_Build 17 78276141 1I GCCCGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 2299 hom 12 het 8 0 5 3 T 9 10 380035 CASAVA_Build 17 78287511 4I ACCATCCTGG ----/CCAA CCAACATGGT 2819 het 2819 ref 15 9 6 0 CCAA 1 2 380036 CASAVA_Build 17 78289482 1I CGTCTCCGAC -/G GGGGGGCCCC 1146 het 1146 ref 22 8 5 9 G 6 7 380037 CASAVA_Build 17 78290107 3D ATATATATAT ATA/--- TATTTTTTTT 816 hom 7 het 4 0 3 2 ATA 1 0 380038 CASAVA_Build 17 78299668 1D CCTTTCAAGC T/- TTTTTTTTTT 3070 het 3070 hom 39 13 17 9 T 13 12 380039 CASAVA_Build 17 78310649 1I AGACTGTCTC -/A AAAAAAAAAA 1230 het 1230 ref 42 27 4 11 A 13 14 380040 CASAVA_Build 17 78312129 1D TTTTTCAGTC T/- TTTTTTTTTT 1858 het 1858 ref 30 18 5 7 T 13 12 380041 CASAVA_Build 17 78323089 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 2725 het 559 hom 10 2 6 2 A 12 11 380042 CASAVA_Build 17 78329906 1I AGCTCCACTG -/C AACCTCTGCC 3070 hom 39 het 15 0 14 1 C 0 1 380043 CASAVA_Build 17 78331318 23D TTCGCGAGTT CCCTTGGCTCCCTTCTGCCCTGG/----------------------- GCCCTGGCTC 3070 het 3070 hom 29 12 13 9 CCCTTGGCTCCCTTCTGCCCTGG 1 0 380044 CASAVA_Build 17 78349917 1I CCTAATTCTC -/T TTAATTTATT 3070 het 3070 hom 34 14 15 5 T 2 3 380045 CASAVA_Build 17 78353940 5I CAGATTCACA -----/TGCTT TGCTGGTCCA 3070 het 3070 hom 41 12 20 9 TGCTT 0 1 380046 CASAVA_Build 17 78361710 1I GTGGGTGGTA -/G AGTTGTGGGC 3070 hom 76 het 30 0 23 7 G 0 1 380047 CASAVA_Build 17 78364242 1D CTTGCCTCGG T/- TTCCCAAAGT 3070 het 3070 ref 34 17 11 6 T 3 2 380048 CASAVA_Build 17 78372278 1I GCTGCACTGG -/A AAAAAAAAAT 3070 hom 14 het 25 1 18 6 A 9 10 380049 CASAVA_Build 17 78372513 21I TGAGCATATT ---------------------/TAAAGCTGTTGATTTAAAGTC TTTGTCTAAG 3070 hom 105 het 40 0 36 5 TAAAGCTGTTGATTTAAAGTC 0 1 380050 CASAVA_Build 17 78374364 1I AGGCTCTTGT -/G GGGGGGCCCT 3070 het 2598 hom 31 11 11 9 G 6 7 380051 CASAVA_Build 17 78375215 5D CATGTCTGGC TTATT/----- TTATTTAGCA 3070 het 3070 hom 27 12 13 3 TTATT 2 1 380052 CASAVA_Build 17 78379717 1D ATGGAATGTG C/- CCCCCCCGAT 3070 het 3070 hom 43 15 17 11 C 8 7 380053 CASAVA_Build 17 78379917 2D CCCAGAGATG CA/-- CACACACACA 3070 het 3070 hom 46 17 19 10 CA 6 5 380054 CASAVA_Build 17 78380585 1I ATTGACTGTT -/A ACGGCAAAAT 3070 het 3070 hom 42 15 20 7 A 1 2 380055 CASAVA_Build 17 78381161 4D TGGAGGGTTT TTTG/---- TTTGTTTGTT 3070 het 3070 ref 40 18 12 11 TTTG 5 4 380056 CASAVA_Build 17 78385114 1I ACAAAGGCTG -/T TTTTTCTTTT 2576 het 988 hom 22 4 13 5 T 5 6 380057 CASAVA_Build 17 78386583 4D TTTATTCATA TTTC/---- TTTCTTTCTT 3054 het 3054 ref 20 8 8 4 TTTC 4 3 380058 CASAVA_Build 17 78399531 4D AACCCTGAGC TATG/---- TATGGCTTGT 3070 hom 85 het 34 0 24 10 TATG 2 1 380059 CASAVA_Build 17 78402423 2I GTCTCAGGAG --/AA GTTTTAAAAT 3070 hom 72 het 30 0 25 5 A 0 2 380060 CASAVA_Build 17 78409086 1D TTTGTTTTAG T/- TTTTTTTTTG 3070 hom 60 het 23 0 21 2 T 10 9 380061 CASAVA_Build 17 78418348 1I GGCCTGGGGT -/G GGGGGGTCTG 3070 hom 32 het 15 0 10 5 G 6 7 380062 CASAVA_Build 17 78422400 2I CATGCAAAAC --/AG ATGTGTCCCC 3070 hom 110 het 41 0 36 5 AG 0 1 380063 CASAVA_Build 17 78432093 6I GGCGGAACTC ------/CTTCCA GGGGAAGGAG 2958 het 2958 ref 26 14 8 4 CTTCCA 0 1 380064 CASAVA_Build 17 78434227 4I CACATTTAGC ----/TTGT TTAACAGCAG 3070 hom 102 het 39 0 34 5 TTGT 0 1 380065 CASAVA_Build 17 78437554 1I CTGACATTGC -/A AAGAAGACAT 3070 het 3070 hom 44 19 18 7 A 2 3 380066 CASAVA_Build 17 78448683 1D ACTCCGTCTC A/- AAAAAAAAAA 3070 het 147 hom 22 2 11 9 A 17 16 380067 CASAVA_Build 17 78449804 1I GTTGTTTTTT -/C CAGATTTGTT 3070 hom 80 het 32 0 24 8 C 1 2 380068 CASAVA_Build 17 78463569 2I GTAGAACACA --/TT TTTTAGACTG 3070 het 3070 ref 28 14 12 2 T 4 6 380069 CASAVA_Build 17 78463780 1I GGAAGCTTGG -/A AAAAATCGCG 3070 het 3070 hom 28 9 10 9 A 5 6 380070 CASAVA_Build 17 78470295 1D AGTAGTTTAC G/- GGGGGGGCCC 1513 het 1513 ref 19 7 5 7 G 8 7 380071 CASAVA_Build 17 78485548 1I ACTGACCTTC -/T TTACACCTGC 3070 het 3070 hom 36 12 17 7 T 2 3 380072 CASAVA_Build 17 78486239 3I AAAAAAAAAA ---/ATT TTTTTTTTCC 3070 het 3070 hom 30 12 15 3 ATT 0 1 380073 CASAVA_Build 17 78488777 1D CCTGGCGGGA G/- GGGAGGCTCC 3070 het 875 hom 30 6 14 10 G 4 3 380074 CASAVA_Build 17 78491918 1I TTTACAATGA -/T TTTTTTTAAA 3070 het 3070 ref 33 15 16 2 T 7 8 380075 CASAVA_Build 17 78493064 3I AGCCCGTCAC ---/TCT TCTTCTAAAG 3070 hom 55 het 21 0 15 6 TCT 2 3 380076 CASAVA_Build 17 78495434 4I GGCCACTGCC ----/TCTT TCTTTCCCAC 3070 het 3070 ref 46 16 15 15 TCTT 1 2 380077 CASAVA_Build 17 78510629 2D TGCACGTGCA GT/-- GTGTGTGTGT 3070 het 3070 hom 60 18 25 17 GT 8 7 380078 CASAVA_Build 17 78510864 1D AGAAGAAAGC G/- GGGGGCCTCT 3070 hom 42 het 20 0 12 9 G 6 5 380079 CASAVA_Build 17 78518930 6D CAACTCTACA AATAAT/------ AATAATAATA 3070 het 1245 hom 17 4 12 1 AAT 6 4 380080 CASAVA_Build 17 78519726 1I GGAAGGGAGG -/C CAGTCACCAG 3070 het 3070 ref 53 28 15 10 C 1 2 380081 CASAVA_Build 17 78535259 1I GTGAGCACAC -/G GGGGGAGAGA 1952 het 1952 ref 42 19 6 17 G 5 6 380082 CASAVA_Build 17 78537035 3D AGCATTAAAA ATC/--- ATCGTGTATT 3070 het 3070 hom 28 13 13 2 ATC 2 1 380083 CASAVA_Build 17 78550129 1D AGCTAAAATT A/- AAAAAAAAAA 3070 het 3070 hom 37 14 16 7 A 13 12 380084 CASAVA_Build 17 78551436 1D GAGAGATCAC T/- TTTTTACTGT 3070 het 3070 hom 23 8 11 4 T 6 5 380085 CASAVA_Build 17 78552735 4I AGCAAACGTA ----/AACC AACCAGTCTA 2694 het 798 hom 11 3 7 1 AACC 1 2 380086 CASAVA_Build 17 78552920 1D GAAGCATAAC T/- TTTGACAAAT 3070 het 3070 hom 22 9 10 3 T 4 3 380087 CASAVA_Build 17 78567704 7D AGGGTGGAGA AGGGAGG/------- AGGGAGTAGG 1850 het 1079 hom 15 3 7 7 AGGGAGG 1 0 380088 CASAVA_Build 17 78572504 1D AAGAATATGC A/- AAAAAAAAAC 3070 het 3070 hom 43 14 25 4 A 10 9 380089 CASAVA_Build 17 78572613 1D AAAAATACTT A/- AGAGATATAT 3070 het 3070 ref 37 20 12 5 A 2 1 380090 CASAVA_Build 17 78597462 1I ACCTGGCTAA -/T TTTTTTTTTG 3070 het 1594 hom 13 5 8 0 T 9 10 380091 CASAVA_Build 17 78604562 1D ACAGGGCCGT G/- GGGGTCAATA 2805 het 2805 ref 27 13 10 4 G 5 4 380092 CASAVA_Build 17 78607046 6D GCTGGGTGGG GAGACA/------ GAGGTTCCCT 1881 het 1881 ref 28 15 6 11 GAGACA 1 0 380093 CASAVA_Build 17 78607542 1D GACAGTAGAC T/- TAAGTGCGGA 3070 het 3070 ref 27 13 12 2 T 2 1 380094 CASAVA_Build 17 78614975 1I GTCAGGTAAT -/A ATTCAGGCCC 3070 hom 99 het 38 0 34 4 A 1 2 380095 CASAVA_Build 17 78620813 30D GCTCCCACAC ACTTCCACATGCTCCCACACGCTCCCACAT/------------------------------ GCGCACACAC 3070 het 3070 ref 34 22 14 9 ACTTCCACATGCTCCCACACGCTCCCACAT 1 0 380096 CASAVA_Build 17 78623972 1I AGGCACATGG -/A GTCCTCAGGT 2781 het 1746 hom 22 8 10 4 A 0 1 380097 CASAVA_Build 17 78640245 2I GGGCAGGGGC --/TA TATGGGGCCA 2006 het 1752 hom 23 5 9 9 TA 1 2 380098 CASAVA_Build 17 78654091 1D CGTGGCCTGT C/- GGCCCCATGC 2874 hom 27 het 12 0 8 4 C 1 0